JPH07500012A - メイズ(maize)における強化殺虫活性をもつ合成DNA配列 - Google Patents

メイズ(maize)における強化殺虫活性をもつ合成DNA配列

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JPH07500012A
JPH07500012A JP5507123A JP50712393A JPH07500012A JP H07500012 A JPH07500012 A JP H07500012A JP 5507123 A JP5507123 A JP 5507123A JP 50712393 A JP50712393 A JP 50712393A JP H07500012 A JPH07500012 A JP H07500012A
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クロスランド,ライル ディー.
ライト,マーサ エス.
マーリン,エリス ジェイ.
ローニス,カレン エル.
ロスステイン,スティーブン ジェイ.
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ノバルティス アクチェンゲゼルシャフト
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】
メイズ(maize)における強化殺虫活性をもつ合成りNA配列本出願は、1 991年10月4日に出願された米国の第772.027号の一部係属出願であ り、その開示を全体として本明細書中に取り込む。 発明の分野 本発明は、殺虫性蛋白をコードしているDNA配列、及び植物内でのこれらの配 列の発現に関する。 発明の背景 植物内でのバチルス・スリンギエンシス(Bacillus thuringi ensis)(Bt)から得られる殺虫性蛋白(IP)遺伝子の発現は、非常に 困難であることが証明されている。植物内でキメラ・プロモーター/at IP 遺伝子組み合わせ物を発現させるための試みが行われてきた。典型的には、低い レベルの蛋白のみがトランスジェニック植物内で得ら低い発現の原因についての lっの仮定された説明は、偶然の転写プロセシング部位(fortuitiou s transcription processing 5ites)がBt  [P mRNA転写の異常型の(aberrant)形態を作り出すというも のである。これらの異常にプロセシングされた転写は、殺虫性蛋白を生産すると いう意味において、植物内で非機能的である。可能なプロセシング部位は、ポリ アゾニレ−ジョン部位、イントロン・スプライシング部位、転写終止シグナル及 びトランスポート・シグナルを含む。大部分の遺伝子は、その遺伝子が正常な宿 主生物における遺伝子発現に有害に作用するであろう部位を含んでぃない。しか しながら、コード領域におけるこのようなプロセシング部位の偶然の発生は、ト ランスジェニック宿主内のその遺伝子の発現を複雑にし生性結晶蛋白をコードし ている領域は、この遺伝子が植物内で適当にプロセシングされることを防ぐ部位 を含むがもじれない。 存在する。生来のBt IP遺伝子のコドンの用い方が植物遺伝子の典型である ものから有意に異なっていることが発見されている。特に、生来のBt [P遺 伝子のコドンの用い方は、ノイズ遺伝子のものと非常に異なっている。その結果 として、この遺伝子からのmRNAを、有効に使用することはてきない。コドン の用い方は、翻訳又は転写又はmRNAプロセシングのレベルにおいて遺伝子の 発現に影響を与えることかできる。植物内での発現のための殺虫性遺伝子を最適 化するために、その遺伝子を、可能な限り、形質転換されるへき宿主植物内に天 然に含まれる遺伝子に似せるように変更するための試みが行われてきた。 Adang et al、、 EP 0359472 (1990)は、合成バ チルス・スリンギエンシス・テネブリオニス(Bacillus thurin giensis tenebrionis)(Bit)遺伝子であって生来のB tt遺伝子に85%の相同性をもち、そして一般的にその植物内に見いだされる ものとはとんと同しA+T含量をもつように設計されているものに関する。Ad ang et al、の表1は、双子葉(dicot)遺伝子の正常コドン分散 により近く似るように作られた合成りtt遺伝子のコドン配列について示してい る。Adanget al、は、類似の方法を通して単子葉植物内での強化発現 にために、IPのための合成遺伝子を最適化することができることを述へており 、表1中に、より高く発現された単子葉蛋白のコドンの用い方の頻度を表してい る。9ページにおいて、Adang et al、は、その合成りit遺伝子を 55%のA十T含量(そして、暗に、45%のG+C含量)をもつように設計す ることを述べている。20ページにおいて、Adanget al、は、その合 成遺伝子を、その遺伝子のコード領域内でそれぞれのアミノ酸のための双子葉遺 伝子により好まれるコドンの全体分散を反映させるように、生来のBt遺伝子内 で個々のアミノ酸のコドンを変更させることにより、設計することを述へている 。Adang etal、は、さらに、生来のBit遺伝子コドンのほんのいく つかが、双子葉蛋白において使用されるコドンの全体分散が保存されるように、 それぞれのアミノ酸のための最も好ましい植物コドンにより、置き換えられるで あろうということを述へている。 Fischoff et at、、 EP 0385962 (1990)は、 バチルス・スリンギエンシス(Bacillus thuringiensis )の結晶蛋白毒素をコードしている植物遺伝子に関する。表Vにおいて、Fis choff et al、は、それぞれのアミノ酸のためのコドンについてのパ ーセント用い方について開示している。8ページにおいて、Fischoff  et al、は、推定ポリアゾニレ−ジョン・シグナル及びATTTA配列の除 去による生来のBt遺伝子の修飾について示唆している。Fischoff e t a[、は、さらに、推定の植物ポリアゾニレ−ジョン・シグナルを同定する ために、4以上の連続したアデニン又はチミン分子をもつ領域について生来のB t遺伝子配列を走査すること示唆している。 Fischoff et al、は、このヌクレオチド配列が、1以上の推定ポ リアデニレーノヨン・シグナルが互いのlOヌクレオチド内で同定される場合に 、変更されるへきであることを述へている。9ページにおいては、Fischo ff et al、は、そのG+C含量を約50%に好ましくは調整するように コドンを選択する努力か行われるへきであることる。表1中の3325ページに おいて示されるように、Perlak et al。 の部分的に修飾されたcry[A(b)遺伝子は、生来のcrylA(b)遺伝 子(1743ヌクレオチドの中の1681)に約96%の相同性をもち、41% のG+C含量、18から7まて減少された植物ポリアゾニレ−ジョン・シグナル 配列(PPSS)数、及び13から7まで減少されたATTTA配列数をもって いる。Perlak et al、の全体として修飾されたcrylA(b)遺 伝子は、全体が合成的なものとして開示されている( 3325ページ、カラム 1)。この遺伝子は、生来のCrYIA(b)遺伝子(+845ヌクレオチドの 中の1455)に約79%の相同性をもち、49%のG+C含量、lまで減少さ れた植物ボリアデニレーンヨン・シグナル配列(PPSS)数、及び全ATTT A配列が除去されているものをもつ。 Barton et at、、 EP 0431829 (1991)は、植物 内の殺虫性毒素の発現に関する。カラムlOにおいて、Barton et a l、は、その書類の図1中に示されたチャートに従うそれぞれのアミノ酸のため の最も好ましいコドンを使用したサソリ毒素をコードしている合成AalT昆虫 毒素遺伝子の構築について記載している。 本発明を、植物細胞内での異種遺伝子の発現を強化するための方法に対して得た 。一般的には、問題の遺伝子又はコード領域を植物に特異的な好ましいコドン配 列を提供するために構築する。このやり方において、特定の蛋白のためのコドン の用い方を、特定の植物内で発現を増加させるために変更する。このような植物 最適化コード配列は、植物細胞内てそのコード配列の発現に向けることができる プロモーターに作用可能な状態で結合されることができる。 特に、本発明の1つの目的は、植物内での発現について最適化されている合成殺 虫性蛋白遺伝子を提供することである。 本発明の他の目的は、植物、好ましくはメイズ植物内でのBt蛋白の発現を最適 化するための、合成りt殺虫性蛋白遺伝子を提供することである。本発明の1つ の特徴は、合成りt IP遺伝子を、その全合成遺伝子の構築のための結合部位 を提供するのに必要な変更を除き、最も好ましいメイズ・コドンを使用して構築 することである。 上記の目的に従って、我々は、合成りt殺虫性結晶蛋白遺伝子であってその中で そのコドンの用い方が植物、特にメイズ内での発現を増加させるように変更され ているものを、合成した。しかしながら、全体的なコドン分散の意味において、 メイズ遺伝子に似るようにそのコドンの用い方を変更するよりはむしろ、我々は 、その合成遺伝子の合成においてメイズ内で最も好ましいコドン(ノイズ好適コ ドン(maize preferres codons))を使用することによ り、そのコドンの用い方(usage)を最適化した。その最適化されたノイズ 好適コドンの用い方は、高いレベルのBt殺虫性蛋白の発現に有効である。これ は、メツセンジャーRNA5の与えられた集団から翻訳されるBt殺虫性蛋白の 量を最大化する結果となることができた。また、ノイズ好適コドンを使用したB t IP遺伝子の合成は、生来のコード配列内で生しることができる偶然のプロ セシング部位を取り除く傾向がある。 この合成遺伝子の発現は、生来のIP旧遺伝子のものよりもノイズ細胞内で有意 に高い。 好ましい合成の、本発明のメイズ最適化DNA配列は、バチルス・スリンギエン シス(Bacillus thuringiensis)var、 kurst aki、 HD−1内のcrylA(b)遺伝子によりコードされている蛋白か ら得られ:Ge1se23 (+988)により記載されている。生来のkur staki HD−1crylA(b)コシ穿孔性動物)を含む様々な鱗翅目( Lepidopteran)昆虫に対して活性がある。本発明は、メイズ最適化 旧蛋白遺伝子の合成により例示されるけれども、その方法を植物内でいかなる蛋 白の発現をも最適化するために使用することができることが認識される。 本最適化遺伝子を、様々なプロモーターであって構成的な、誘導性の、一時的に 調節された、発展的に調節された、組織好適(tissue−preferre d)の、そして組織特異的な(t 1ssue−specif ic)プロモー ターと融合させ、組換えDNA分子、すなわち、キメラ遺伝子を作ることかでき る。このノイズ最適化遺伝子(コード配列)は、非−メイズ最適化遺伝子と比へ て、形質転換植物内で、実質的に高いレベルの発現を提供する。したがって、鞘 翅目の(Coleopteran)害虫又は鱗翅目の害虫、例えば、欧州トウモ ロコシ穿孔性動物及びサトウキビ穿孔性動物(sugarcane boare r)に対して抵抗性の植物を、作ることができる。 本発明の他の目的は、組織好適の及び組織特異的なプロモーターであって、他の 部分の実質的な排除に対する植物の1つの特異的な部分又は複数の部分内での、 問題の作用関連構造遺伝子の発現を促進するものを提供する。 本発明の他の目的は、髄(pith)−好適プロモーターを提供することである 。”髄−好適(pi th−preferred)”は、そのプロモーターが、 その根(roots) 、外鞘(outer 5heath)、及び支詩板(b race roots)内よりも植物の靴内での多量の作用関連構造遺伝子の発 現に向けられることができ、そして実質的に種(seed)内で全く発現されな いということを意図している。 本発明のさらに他の目的は、花粉(pollen)−特異的プロモーターを提供 することである。“花粉−特異的(pollen−specific)”は、そ のプロモーターが、植物の花粉内で実質的に限定的に問題の作用関連構造遺伝子 の発現に向けられることができ、他の植物の部分のいずれかにおいてはご(わず かに発現するということを意図している。 ”ごくわずかに(negligible)“は、機能的に有意差がないことを意 味する。 本発明のさらに他の目的は、問題の構造遺伝子、特に殺虫性蛋白をコードしてい る構造遺伝子、に作用可能な状態で会合した又は結合した組織好適プロモーター 又は組織特異的プロモーターを含んで成る組換えDNA分子、並びに植物内での その組換え分子の発現を提供する。 本発明のさらなる目的は、組織好適又は組織特異的発現パターンにおいて作用可 能な状態で少な(とも1つの問題の構造遺伝子を発現するトランスジェニック植 物を提供することである。 本明細書中で開示されそして請求された本発明の1つの特定の態様においては、 この組織好適又は組織特異的なプロモーターを、殺虫性蛋白をコードしている構 造遺伝子に作用可能な状態で結合さあせ、そして植物を、少なくとも1つの上記 のような組換え分子により安定的に形質転換させる。得られた植物は、その中で その遺伝子が発現されるところの植物の部分を食へる特定の昆虫に対して抵抗性 となるであろう。好ましい構造遺伝子は、B、t、殺虫性蛋白をコードしている 。より好ましくは、ノイズの最適化されたB、 t、 IPP伝子である。 図面の簡単な説明 図1は、完全長の生来のBt crylA(b)遺伝子[BTHKURHD ] 、完全長の合成ノイズ最適化層crylA(b)遺伝子[f 11synbt、  f in]及び切り詰められた合成メイズ最適化Bt crylA(b)遺伝 子[bssynJの比較である。この図は、完全長の合成メイズ最適化Bt c rY[A(b)遺伝子の配列が、3468ヌクレオチドからの約2354におい て(約68%の相同性)その生来のcrylA(b)遺伝子のものと適合してい ることを示している。 図2は、切り詰められた生来のBt crylA(b)遺伝子[BTHKURH D ]及び切り詰められた合成ノイズ最適化Bt遺伝子[bssynlの比較で ある。 この図は、切り詰められた合成メイズ最適化crylA(b)遺伝子の配列が、 1947ヌクレオチドからの約1278において(約66%の相同性)その生来 のcrylA(b)遺伝子のものと適合していることを示している。 図3は、純粋なメイズ最適化層遺伝子配列[5ynlT、 mze] と、切り 詰められた合成メイズ最適化Bt遺伝子[bssynl及びその遺伝子の構築を 容易にするための制限部位を含むように修飾されている完全長の合成ノイズ最適 化層遺伝子[5ynfu1.mod]との比較である。この図は、切り詰められ た合成メイズ最適化crYIA(b)遺伝子の配列が、1947ヌクレオチドか らの約1913において(約98%の相同性)その純粋なメイズ最適化cryl A(b)遺伝子のものとマツチしていることを示している。 図4は、生来の切り詰められたBt cry[A(b)遺伝子[BTHKtJR HD ]と、されている切り詰められた合成crylA(b)遺伝子及び切り詰 められた合成ノイズ最適化Bt遺伝子[bssynl との比較である。この図 は、PMONBT遺伝子配列が、1845ヌクレオチドからの約1453におい て(約79%の相同性)その生来のcry IA(b)遺伝子のものと適合して おり、一方、切り詰められた合成メイズ最適化Bt crylA(b)遺伝子か 、1845ヌクレオチドからの約1209において(約66%の相同性)その生 来のcrylA(b)遺伝子と適合していることを示している。 図5は、Perlak et al、、 PNAS IJsA、 88:332 4−3328 (1991)[P^1ONBT1中に記載されている切り詰めら れた合成crylA(b)遺伝子及び切り詰められた合成ノイズ最適化層cry lA(b)遺伝子[bssynlの比較である。この図は、PMONBT遺伝子 配列が、1845ヌクレオチドからの約1410において(約77%の相同性) その切り詰められた合成メイズ最適化Bt crylA(b)遺伝子のものと適 合していることを示している。 図6は、完全長のメイズ最適化Cry IB遺伝子である。 図7は、完全長のハイブリッドの、Cry[A(b)の部分的なメイズ最適化D NA配列であってpcIB4434中に含まれるものである。この合成領域は、 ヌクレオチド1−1938(アミノ酸1−646)からのものであり、そしてそ の生来の領域は、ヌクレオチド1939−4368(アミノ酸647−1155 )からのものである。合成と生来コード配列との融合点を、配列中スラッシュ( 1)により示す。 図8は、pcIB4434のマツプである。 図9は、完全長のハイブリットの、熱安定性のCryrA(b)の蛋白をコード しているメイズ最適化DNA配列であってpcI85511中に含まれるもので ある。 図1Oは、pCIB5511のマツプである。 図11は、完全長のハイブリッドの、熱安定性のCrylA(b)の蛋白をコー ドしているノイズ最適化DNA配列であってpci85512中に含まれるもの である。 図12は、pci85512のマツプである。 図13は、完全長の、熱安定性のCrylA(b)の蛋白をコードしているノイ ズ最適化DNA配列であってpcI85513中に含まれるものである。 図14は、pcIB5513のマツプである。 図15は、完全長の、熱安定性のCrylA(b)の蛋白をコートしているノイ ズ最適化DNA配列てあってpci85514中に含まれるものである。 図16は、pcI85514のマツプである。 図17は、pc[84418のマツプである。 図18は、pcrB4420のマツプである。 図19は、pC[B4429のマツプである。 図20は、pclB4431のマツプである。 図2■は、pcI84428のマツプである。 図22は、1)CI84430のマツプである。 図23Aは、トランスジェニック・メイズ内のcrylA(b)蛋白レベルのデ ータを含む表である。 図23Bは、メイズ最適化CrylA(b)遺伝子を含むメイズ子孫からの葉材 材に対する0strinia及びDiatraeaの生物検定の結果を要約した 表である。 [m 23Cは、トランスジェニック・メイズ内のcry[A(b)蛋白レベル のデータを含む表である。 図230は、髄プロモーターに作用可能な状態で結合された合成層図23Eは、 髄好適プロモーターを使用したトランスジェニック・メイズ内のcry[A(b )遺伝子の発現の対するデータを含む表である。 図24は、ノイズのトリプトファン・シンターゼ−アルファ・サブユニット遺伝 子の完全なゲノムDNA配列である。イントロン、エクソン、転写開始及び翻訳 開始、cDNAの開始及び終止を、示す。$・cDNAの開始及び終止:+1= 転写開始;733本本本本本本本ニプライマー長プライマー、+1・翻訳の開始 :+++=終止コドン;塩基対1495−99=CCAATホックス:塩基対1 593−1598=TATAAボックス;塩基対3720−3725・ポリA付 加部位:#上記の下線配列は、PCRプライマーである。 図25A 、25B 、25C及び25Dは、ノーザン・プロット分析であって 、それぞれ、2時間、4時間、18時間、及び48時間の間隔における、DuP ont Cronex増感スクリーンによる一80°Cにおける、ノイズ組織内 のメイズTrpAサブユニット遺伝子の分化発現を示すものである。P=髄:C =穂軸(cob) ;BR=支持根;ES=穂の葉柄(ear 5hank): LP=髄下部下部ower pith) :MP髄空中央部UP−髄上部、S= 種:L=葉:R−根:そしてP(左上戸全髄。 図26は、ノーザン・プロット検定であり、その中の2つの左のレーンが、Fu nk同系211D及び5N984の葉(い及び髄(P)内てメイズTrρA遺伝 子発現を示す。右の5つのレーンは、Funk 211D種の全RNAの不在を 示している。S(1,2,3,4及び5戸受粉後1,2.3.4及び5週目にお ける種。し=葉、P=髄:S#=種#種籾受粉後。 図27は、メイズTrpA cDNA 8−2(pc[B5600)によりプロ ーブした、ゲノムDNA Funk系211Dのサザン・プロット検定であり、 図中、BはBamHIを表し、EはEcoRlを表し、EVはEcoRVを表し 、Hは旧ND111を表し、そしてSはSac [を表す。IX、5x及びIO Xは、再構築遺伝子のコピー当量である。 図28Aは、メイズTrpAサブユニット遺伝子の転写開始及び配列決定ラダー を示すプライマー伸長分析である。レーン+1及び+2は、プライマー伸長反応 のIX + 0.5Xサンプルである。 図28Bは、Dupont Cronex増感スクリーンによる一80°Cにお けるフィルムに対する16時間露出における42°C148°C及び54°Cの アニーリング温度における+2塩基対から+387塩基対までのRNase保護 の分析である。 図29は、元のタイプ11花粉特異的cDNAクローンのマツプである。 3つのEcoR[断片をpBluescriptベクター中にサブクローニング し、pcI83168、pcI83169及び11−.6を作り出すことを説明 している。 図30は、元のタイプII cDNAクローンの1. Okb及び0.5kb断 片内に含まれるような、ノイズの花粉特異的カルシウム依存性蛋白キナーゼ遺伝 子cDNAのDNA配列を示している。この1. Okbと0.5kb断片を分 けるEcoR1部位を、示す。このcDNAは、そのmRNA開始部位かそのc DNAクローンの末端の上流の490塩基対にマツピングしているのて完全長で ない。 図31は、花粉CDPK mRNAの組織好適発現について説明している。 示されたメイズ2111)組織からのRNAを、変性させ、アガロース・ゲル上 で電気泳動し、ニトロセルロースに移し、そして花粉CDPK cDNAo、5 kb断片によりプローブした。二のmRNAは、花粉内においてのみ検出され、 強いシグナルが見られる。 図32は、花粉CDPK誘導蛋白配列及びTobimatsu et al、、  J、 Biol。 Chem、 263:16082−16086 (1988)中に開示されたラ ット蛋白キナーゼ2蛋白配列のアミノ酸配列比較である。DNA5tarソフト ウェア−・パッケージの整列プログラム(AIlign program)を、 この配列を評価するために使用した。蛋白キナーゼに対する相同性は、この遺伝 子の5゛の2/3内で1、すなわち、1. Okb断片内で、生じている。 hem、 263:17055−17062(1988)中に開示されたヒト・ カルモジュリン蛋白配列のアミノ酸配列比較である。カルモジュリンに対するそ う相同性は、その遺伝子の3゛の173内で、すなわち、0.5kb断片内て生 じている。 図34は、花粉CDPK誘導蛋白配列及び大豆CDPKのアミノ酸配列比較であ る。相同性は、遺伝子全体にわたり生じている。 図35は、メイズ花粉特異的CDPK遺伝子の配列について説明している。その mRNA開始部位に先立つ1.4kbの配列を示す。7つのエクソン(exon s)及び6つのイントロン(introns)の部分を、その対応するDNA配 列の下に表す。このcDNA内のポリアゾニレ−ジョンの部位を示す。 図36は、pci84433のマツプである。 図37は、完全長のハイブリッドの、熱安定性crylA(b)蛋白をコードし ているノイズ最適化DNA配列である。 図38は、pci85515のマツプである。 配列の説明。 配列番号lは、完全長の生来のBt crylA(b)遺伝子のDNA配列であ る。 配列番号2は、完全長の純粋メイズ最適化合成りt crylA(b)遺伝子の 1)NA配列である。 配列番号3は、約2Kbの切り詰められた合成メイズ最適化Bt Cry’IA (b)遺伝子のDNA配列である。 配列番号4は、完全長の合成メイズ最適化Bt cry[A(b)遺伝子のDN A配列である。 配列番号5は、Perlak et al、に記載の約2Kbの合成りt遺伝子 のDNA配列である。 発明の詳細な説明 本発明を記載するために明細書及び請求の範囲の中でそれらを使用するとき、そ の用諸に関して明瞭性を提供するために以下の定義を与える。 ノイズ好適コドン(Maize preffered codon) 好ましい コドンとは、与えられたアミノ酸を特定するためのヌクレオチド・コドンの用い 方において特定の宿主細胞により示される好ましさをいう。特定の宿主について のアミノ酸のための好ましいコドンは、その宿主内でそのアミノ酸を最も頻繁に コードしている単一のコドンである。特定のアミノ酸のためのメイズ好適コドン は、メイズ由来の知られた遺伝子配列から得られる。例えば、ノイズ植物からの 28遺伝子のた引用により本明細書中に取り込む。例えば、アラニンのためのメ イズ好適コドンは、GCCである。なせなら、λ1urray et al、、 唾y中の、26のメイズ遺伝子のプールされた配列に従って、そのコドンか、G CG(24%)、GCA(13%)、及びGCT(27%)に比へてアラニンを 同時期(こ36%コードしているからである。 純粋なメイズ最適化配列(pure maize optimized 5eq uence):最適化遺伝子又はDNA配列とは、その中て生来の遺伝子のヌク レオチド配列がメイズのための好ましいコドンを使用するために修飾されている ところの遺伝子をいう。例えば、合成メイズ最適化層cry[A(b)遺伝子は 、その中で、その生来のBt crylA(b)遺伝子のヌクレオチド配列が、 使用されるコドンが先に記載したようなメイズ好適コドンであるように修飾され ている遺伝子である。純粋なノイズ最適化遺伝子は、その中で、そのヌクレオチ ド配列が特定のポリペプチドのためのメイズ好適コドン配列の100パーセント を含んで成る遺伝子である。例えば、純粋なメイズ最適化Bt cry[A(b )遺伝子は、その中で、そのヌクレオチド配列が100パーセントのメイズ好適 コドン配列のを含んで成り、そしてその生来のBt cry[A(b)遺伝子に より作られるものと同一のアミノ酸配列をもつポリペプチドをコードしている遺 伝子である。最適化遺伝子の純粋なヌクレオチド配列は、例えば、ヌクレオチド を変更し制限部位を創出又は削除することにより、その遺伝子の操作を許容する ように変動されてもよい。また、最適化遺伝子の純粋なヌクレオチド配列は、潜 在的に有害なプロセシング部位、例えば、潜在的なポリアゾニレ−ジョン部位又 はイントロン認識部位を削除するように変動されてもよい。 ”部分的なメイズ最適化(partially maize optimize d)”配列を使用することができることも認識される。部分的なノイズ最適化と は、その遺伝子のコード領域が、生来の殺虫性遺伝子から得られる配列及びメイ ズ内での発現のための最適化されている配列を含んで成る、キメラ(ハイブリッ ド)であることを意味している。部分的な最適化遺伝子は、昆虫の害虫を制御す るのに十分なレベルにおいて殺虫性蛋白を発現し、そしてこのような発現が、生 来の配列のみを使用して達成されるよりも高いレベルにある。部分的なメイズ最 適化配列は、少なくとも約5%の最適化配列を含むものである。 完全長Bt遺伝子ことは、生来のBt遺伝子により作られるポリペプチドをコー ドするのに必要なヌクレオチド配列の全体を含んで成るDNA配列をいう。例え ば、この生来のBt crylA(b)遺伝子は、長さ約3、5kbてあり、そ して長さ約1150アミノ酸であるポリペプチドをコードしている。完全長の合 成crylA(b) Bt遺伝子は、少な(とも約3、5kbの長さをてあろう 。 切り詰められたB
【遺伝子(Truncated Bt Gene)とは、生来 のBt遺伝子により作られるポリペプチドをコードするのに必要なヌクレオチド 配列の全てよりも少ないものを含んで成るDNA配列であるが、そのポリペプチ ドの活性な毒素部分をコートしているものをいう。例えば、約1.9KbO切り 詰められた合成りt遺伝子は、その蛋白か殺虫活性を示すようにポリペプチドの 活性毒素部分をコードしている。 組織好適プロモーター(Tissue−preferred promoter ):用語”組織好適プロモーター”は、与えられた調節DNA配列が、慣用のR NA又は蛋白検定のいずれかにより示されるように、より高いレベルの関連構造 遺伝子又はDNAコード配列の転写を、又は関連遺伝子の生成物の発現を、促進 するであろうし、又は与えられたDNA配列がいくつかの特異な効果(diff erential effect)を現すてあろうということを示すために使用 され:すなわち、その関連DNA配列の転写又は遺伝子生成物の発現がその植物 の他の組織のすべての内においてよりも幾つかの組織内でより大きなものである ということを示すために使用される。 ”組織特異的プロモーター(Tissue−specific promote r)″は、与えられた調節DNA配列が、植物の1以上の組織内、又は1つのタ イプの組織、例えば、紗組織(green tissue)内で、関連コードD NA配列を本質的に完全に転写することを促進するであろうし、一方、その関連 コードDNA配列の転写がその植物の組織の他のすべての組織又はタイプにおい て本質的に全く生じないということを示すために使用される。 本発明は、植物内、特にノイズ植物内での発現のために最適化されたDNA配列 を提供する。本発明の好ましい態様においては、そのDNA配列は、殺虫性毒素 、好ましくは、バチルス・スリンギエンシス(Bacillus thurin giensis)により正常に生産される殺虫性結晶蛋白毒素のアミノ酸配列と 実質的に分かち合うポリペプチドの生産をコードしている。この合成遺伝子は、 切り詰められた又は完全長の殺虫性蛋白をコートすることができる。特に好まし いものは、合成りNA配列であって鱗翅目及び鞘翅目の昆虫に対して有効なポリ ペプチドをコートしているもの、並びに合成りNA配列であってバチルス・スリ ンギエンシス(Bacillus thuringiensis)変種kurs taki、 HD−1の結晶蛋白毒素の中の1つと本質的に同しアミノ酸配列を もつポリペプチドをコードしているものである。 本発明は、植物、好ましくはメイズのプロトプラスト、植物細胞及び植物内の活 性な殺虫性蛋白の高い発現を作り出すのに有効な合成りNA配列を提供する。本 発明の合成りNA配列を修飾し、コドンの用い方及びG+C含量の意味において ノイズ遺伝子に似せた。これらの修飾の結果として、本発明の合成りNA配列は 、その生来の遺伝子内に存在する潜在的なプロセシング部位を含まない。得られ た合成りNA配列(合成旧IPコード配列)及びこの合成りNA配列(合成りt IP遺伝子)を含む植物の形質転換ベクターは、驚くへきことに、植物、特にノ イズ内の殺虫性蛋白に生産の意味において、その生来のBt [P遺伝子に比較 して、その合成りt IP遺伝子の増加された発現をもたらす。高いレベルの発 現は、鱗翅目昆虫、好ましくは欧州トウモロコシ穿孔性動物及びDiatrea  5accharalis 、サトウキビ穿孔性動物に対する抵抗性を示すメイ ズ細胞及び植物をもたらす。 いるが、G+C含量及びコドンの用い方の意味において、ノイズ内の記載されて いるメイズのコドンの用い方を、最も好ましいノイズのれる毒素のアミノ酸配列 を逆翻訳するために使用する。この逆翻訳されたDNA配列を、純粋なメイズ最 適化配列として表し、そして配列番号4として示す。この配列は、不所望の制限 エンドヌクレアーゼ部位を取り除くように、そして所望の制限エンドヌクレアー ゼ部位を作り出すように修飾されている。これらの修飾は、そのコドンの用い方 又はそのメイズ最適化配列を相当に変更することなくその遺伝子のクローニング を容易にするように設計されている。このクローニング手順の間に、この遺伝子 のクローニングを容易にするために、他の修飾を、そのポリメラーゼ連鎖反応( PCR)によるクローニングの間に誘導されるエラ一対して特に感受性であるよ うな領域内で行う。このノイズ最適化合成旧IP遺伝子の最後の配列を、配列番 号2中に示す。このメイズ最適化合成りt [P遺伝子とその生来のkurst aki crylA(b) Bt遺伝子との比較を、図1中に示す。 本発明の好ましい態様においては、この合成りNA配列により生産される蛋白は 、その他の鱗翅目又は鞘翅目の昆虫に対して有効である。より好ましい態様にお いては、この合成りNA配列によりコード性蛋白の完全長の又は切り詰められた アミノ酸配列から本質的に成る。特定の態様においては、この合成りNA配列は 、上記のBt CrylA(b)蛋白の切り詰められたアミノ酸配列から本質的 に成るポリペプチドをコードしている。 本発明の殺虫性蛋白は、昆虫害虫を制御するのに十分な量において、すなわち、 昆虫制御量において植物内で発現される。昆虫を制御するのに必要な殺虫性蛋白 の発現の量は、植物の種、昆虫のタイプ、環境因子等に依存して変動することが できる。一般的に、その昆虫集団は、植物から植物へ変動する経済的な閾値より 低く保たれるであろう。 例えば、メイズにおいて欧州トウモロコシ穿孔性動物 を制御するためには、その経済的な閾値は、約10幼虫(larvae)/植物 (plant)に翻訳されるo、 5eggmass(卵の塊)/植物である。 本発明の方法は、植物の根を食う昆虫の幼虫(rootworms) 、ネキリ ムシ(cutworms)、アワヨトウの幼虫(armyworms) 、特に 秋のヒート(beet)のアワヨトウの幼虫、コメツキムシの幼虫(wirew orms)、アブラムシ(aphids)、トウモロコシ穿孔性動物(corn  borers) 、特に欧州トウモロコシ穿孔性動物(European c orn borers)、サトウキビ穿孔性動物(sugarcane bor ers)、マダラメイガ(lesser corn 5talk borer)  、南西部トウモロコシ穿孔性動物(Southwestern corn b orers)等を含むがこれに限定されない多種多様な昆虫を制御it(con trolling)するために有用である。 本発明の好ましい態様においては、メイズ内での発現のために最適化された合成 コードDNA配列は、その生来のcry[A(b)遺伝子のものより大きなG十 〇パーセンテージを含んで成る。このG+Cパーセンテージが少なくとも約50 パーセント、そしてより好ましくは少なくとも約60パーセントであることが好 ましい。このG+C含量が約64パーセントであることが特に好ましい。 本発明の他の好ましい態様においては、ノイズ内での発現のために最適化された 合成コード開A配列は、その生来のバチルス・スリンギエンシス(Bacill us thuringiensis) cry[A(b)蛋白の“純粋な(pu re)”ノイズ最適化ヌクレオチド配列と少なくとも約90パーセントの相同性 を、より好ましくは少なくとも約95パーセントの相同性を、そしてより好まし くは少なくとも約98パーセントの相同性をもっヌクレオチド配列を含んで成る 。 本発明の他の好ましい態様は、本質的に配列番号4のDNA配列をもつ合成りN A配列、並びにそれらの突然変異体又は変異体;本質的に配列番号4のDNA配 列を含んで成る形質転換ベクター:及び、プラスミド11cIB4406、pc [B4407、pcI84413、pcIB4414、pc[B4416、pC [B4417、pC(B441B、pci84419、pcIB4420、pC (B4421. pcIB4423、pc[84434、pCI84429、p ci84431. pcI84433から得られた単離されたDNA配列を含む 。最も好ましいものは、プラスミドpcI84418並びにpC184420、 pcI84434、pci84429、pcI84431及びpc[B4433 である。 本発明のノイズ最適化DNA配列の中の1つを構築するために、約80ヌクレオ チドの平均長さをもつ合成りNAオリゴヌクレオチドを、作る。これらのオリゴ ヌクレオチドは、ハイブリダイズされ、その切り詰められた毒素遺伝子の様々な (クォーター(quarter))を含んで成る断片を作るように設計されてい る。与えられたクォーターのためのオリゴヌクレオチドを、ハイブリダイズし、 そしてPCRを使用して増幅する。次にそのクォーターをクローン化し、そして このクローン化クォーターを所望の配列を含むものを見つけるために配列決定す る。1つの場合、第四クォーターにおいては、ハイブリダイズされたオリゴヌク レオチドをPCR増幅なしに直接クローン化する。4つのクォーターのすべての クローンがオーブン・リーディング・フレームを含んでいることが一旦見つかれ ば、活性な殺虫性蛋白をコードしている無傷の遺伝子を集合させる。この集めら れた遺伝子を次に欧州トウモロコシ穿孔性動物(ECB)及びサトウキビ穿孔性 動物を含む問題の昆虫のいくつかに対する殺虫活性についてテストすることがで きる(それぞれ、例5A及び5B)。完全に作用する遺伝子を得たとき、その− 次構造を確認するために再びそれを配列決定する。完全に作用する遺伝子は、E CBに対して生物検定したとき100%死亡率を与えることが分かった。また、 この完全に作用する遺伝子をメイズ内の発現のために修飾する。 ノイズ最適化遺伝子を過渡的発現検定において、例えば、ノイズ発現検定におい てテストする。活性殺虫性毒素のための生来のBt Cry[A(b)コード配 列は、ノイズ過渡的発現系においては検出可能なレベルにおいて発現されない。 したがって、合成遺伝子の発現のレベルを、測定することができる。本方法によ り、形質転換植物内の蛋白の発現は、少なくとも約100倍〜約50.000倍 、より特に少なくとも約1.000倍〜少なくとも約20.000倍、増加され ることができる。 有効レベルまでの殺虫性遺伝子の発現の増加は、その完全配列に沿った生来の遺 伝子の操作を必要としない。有効な発現は、増加した発現を得るために必要な配 列の一部だけを操作することにより達成されることができる。その生来のCry lA(b)配列の蛋白を含む、完全長のメイズ最適化crylA(b)遺伝子を 、調製することができる。例えば、図7は、合成−生来のハイブリッドである完 全長のメイズ最適化crylA(b)遺伝子について説明している。すなわち、 約2kbの遺伝子(ヌクレオチド1−1938)は、メイズ最適化された、すな わち、合成のものである。その残りの、C−末端のヌクレオチド647−115 5は、そのCry[A(b)遺伝子の対応する生来の配列と同一である。 本明細書中に記載した方法の使用により、様々な合成/生来ハイブリッドを構築 し、そして発現についてテストすることができることが認められている。ハイブ リッド構築物の重要な態様は、その蛋白が昆虫害虫を制御するのに十分な量にお いて生産されるということである。このやり方においては、その遺伝子の決定的 な領域を、同定し、そしてこのような領域を好ましいコドンを使用して合成する ことができる。この合成配列を、以下の例中に表すような生来の配列と結合させ ることができる。一般的に、N−末端の部分又はプロセシング部位を、合成し、 そして植物内の発現を増強するためにその生来のコート配列内で置換させること ができる。 本発明の他の態様においては、crylA(b)蛋白をコードしているメイズ最 適化遺伝子を、そのコート蛋白をその生来のcryrA(b)蛋白に比べてより 熱安定性又は温度安定性にするために操作することができる。バチルス・スリン ギエンシス(Bacillus thuringiensis)kurstak i HD−1内にあるcry[A(b)遺伝子か、そのcrylA(a)及びc rylA(c)蛋白と比へたとき、その蛋白の−COOH半分内で、26アミノ 酸の欠失を含むことが示されている。この欠失は、温度感受性cry[A(b) 蛋白を導く。M、 Ge1ser、 EP O440581,名称’Tempe raturstabiles BaciA(c)蛋白からのその対応領域の上記 の欠失の修復は、その修復された蛋白の温度安定性を改善する。完全長修飾cr ylA(b)合成遺伝子の構築物を、その読み取り枠を変更することなく、そし てその蛋白配列の残りを変更することなく、その配列内の適切な場所に失ったア ミノ酸をコードする配列を挿入するように設計する。その遺伝子の完全長の合成 変異体を、一連の2本鎖DNAカセットであってそれぞれサイズ約300塩基対 であるものを、DNA合成及び酵素反応の標準的な技術を使用して、合成するこ とにより、組み立てる。この修復された遺伝子は、”熱安定性”又は”温度安定 性“crylA(b)蛋白をコードしていることを表している。なぜなら、それ は、高い温度に晒されたときその生来の片割れよりもより生物活性を保持してい るからである。温度安定蛋白をコードしているメイズ最適化熱安定性crylA (b)遺伝子の特異的な配列を、図9.11.13、及び15中に記載し、そし てまた、以下の例7中にも記載する。 本発明は、他のポリペプチドをコードしているメイズ最適化コー含むものを包含 する。例えば、cry[B遺伝子は、ノイズ最適化され、そして次に、植物、特 にメイズ中に安定的に導入されることができる。本発明に従って構築されたメイ ズ最適化crylB遺伝子の配列を、図6中に記載する。 本発明に記載のメイズ好適コドンの用い方を使用したメ・rズ内の発現のための Bt [P遺伝子を最適化することは、その殺虫性遺伝子の発現における有意な 増加をもたらす。他の遺伝子は、メイズ又は他の植物内でのそれらの発現を改善 するための植物コドン選択物(preference)を使用して合成されるこ とができる。メイズ・コドン選択物の使用は、メイズ内の外来遺伝子の発現を最 適化し、そして最大化する有望な方法である。このような遺伝子は、メイズ形質 転換における選択性(selectable)又は獲得性(scoreable )マーカーとして使用される遺伝子、除草剤耐性を与える遺伝子、疾患抵抗性を 与える遺伝子、そして昆虫抵抗性を与える他の遺伝子を含む。 合成crYIA(b)遺伝子を、広い範囲の双子葉植物の種の形質転換のために 作用であるアグロバクテリウム(Agrobacterium)ベクター中に挿 入することもてきる(例44)。合成(rylA(b)アグロバクテリウム(A grobacterium)ベクターにより安定的に形質転換された植物は、殺 虫活性を示す。 生来のBt cry[A(b)遺伝子は、非常にA+Tが豊富である。完全長の 生来のBt cry[A(b)遺伝子のG+C含量は、約39%である。長さ約 2kbの切り詰められたBt crylA(b)遺伝子のG+C含量は、約37 %である。一般的には、メイズのコート領域は、優勢的にG+C豊富である。こ のBt cry[A(b)遺伝子に対して行われた修飾は、50%より大きなG +C含量をもつ合成[Pコード領域をもたらし、そしてその生来のcrylA( b)遺伝子とそのDNAレベルにおいて約65%の相同性をもつ。 この合成CrylA(b)遺伝子によりコートされている蛋白は、その生来の蛋 白と100%の相同性をもち、そしてそれ故、殺虫活性の意味において完全な機 能を保持している。この切り詰められた合成CrylA(b)IP遺伝子は、長 さ約2kbてあり、そしてその遺伝子は、その生来のBt kurstaki  CrylA(b)殺虫性蛋白の活性毒素領域をコードしている。この切り詰めら れた合成CrylA(b) IP遺伝子によりコートされている蛋白の長は、6 48アミノ酸である。 本発明の合成遺伝子は、トランスジェニック植物における最も好ましくは形質転 換されたノイズにおける発現強化に有用である。本発明のトランスジェニック植 物は、高レベルにおける殺虫性CrylA(b)蛋白であって、昆虫害虫、好ま しくは鱗翅目又は鞘翅目昆虫、そして最も好ましくは欧州トウモロコシ穿孔性動 物(PCB)及びサトウキビ穿孔性動物に対する抵抗性をもたらすものを発現さ せるために使用されることかできる。 本発明においては、合成メイズ最適化遺伝子のDNAコード配列は調節要素、例 えば、そのコード配列の発現に向けられるプロモーターの制御下にあることがで きる。このような調節要素は、そのノイズ植物の様々な部分内でその遺伝子の発 現を提供するために、例えば、単子葉又はメイズ及び他の単子葉の機能的プロモ ーターを含む。 この調節要素は、構成的であることができる。すなわち、それは、そおの遺伝子 の連続的なそして安定的な発現を促進させることができる。このようなプロモー ターは、CaMV 35Sプロモーター:CaMV 19Sプロモーター; A 、 tumefaciensプロモーター、例えば、オクトビン・シンターゼ( octopine 5ynthase)プロモーター、マンノピン・シンターゼ (mannopine 5ynthase)プロモーター、ツバリン・シンター ゼ(nopaline 5ynthase)プロモーター、又は他のオパイン・ シンターゼ(opine 5ynthase)プロモーター;ユビキチン(ub iquitin)プロモーター、アクチン・プロモーター、ヒストン・プロモー ター及びチュブリン・プロモーターを含むがこれに限定されない。この調節要素 は、組織優先(tissue−preferential)プロモーターである ことがてき、すなわち、それは、他の中においてよりも植物のいくつかの組織内 において高い発現を促進する。好ましくは、組織優先プロモーターは、種の中よ りも葉、茎、根及び/又は花粉の中においてその合成遺伝子の高い発現に向けら れることができる。また、その調節要素は、例えば、熱ストレス、水ストレス、 昆虫摂食又は化学誘導により誘導されることもでき、又は 発展的に調節される こともできる。その発現が組織特異的なやり方において変動することが知られて いる多数のプロモーターが、当業者に知られてりう。このような例の1つは、メ イズのホスホエノール・ピルベート・カルボキシラーゼ(PEPC)であって縁 組織特異的(green tissue−specific織特異的プロモータ ーは、クロロフィルa/b結合性蛋白プロモーター及びRubisCO小サブユ ニット・プロモーターを含む。 また、本発明は、単離されたそして精製された髄(pith)−好適プロモータ ーを提供する。好ましい髄好適プロモーターは、イネ科(graminaceo us)の単子葉植物、例えば、サトウキビ(sugarcane) 、米、小麦 、サトウモロコシ(sorghum) 、大麦、ライ麦(rye)及びノイズ( maize)から単離され;より好ましいものは、メイズ植物から単離されたも のである。 好ましい態様においては、髄好適プロモーターは、植物TrpA遺伝子から単離 され:最も好ましい態様においては、それは、メイズTrpA遺伝子から単離さ れる。すなわち、その生来の状態におけるプロモーターは、メイズのトリプトフ ァン・シンターゼ−アルファ・サブユニット遺伝子(以下、”TrpA”)と作 用的に関連している。コードされた蛋白は、約38kDの分子質量をもっている 。他のアルファ・サブユニット及び2つのベータ・サブユニットと一緒になって 、TrpAは、多量体酵素、トリプトファン・シンターゼを形成する。それぞれ のサブユニットは、別々に働くことかできるが、それらは、−緒になってより効 果的に機能する。TrpAは、インドール・グリセロール・ホスフェートのイン ドールへの変換を触媒する。メイズTrpA遺伝子又はそのコードされた蛋白の いずれも全く、出願人の発明のhalinaのトリプトファン・シンターゼ・ベ ータ・サブユニット遺伝子を、Wright et al、、 The Pla nt Ce11.4ニア1l−719(1992)中に記載されているようにク ローン化した。このメイズTrpA遺伝子は、そのベータ・サブユニット・コー ド遺伝子に全く相同性をもっていない本発明は、植物カルシウム依存性ホスフェ ート・キナーゼ(CDPK)遺伝子から得られる精製花粉特異的プロモーターを も提供する。すなわち、その生来の状態においては、そのプロモーターは、植物 のCDPK遺伝子に作用可能な状態で結合されている。好ましい態様においては 、そのプロモーターを、メイズCDPK遺伝子から単離する。”花粉特異的(p ol fen−specif ic)”は、問題の作用関連構造遺伝子の発現が 植物の花粉内に実質的に限定されており(すなわち、本質的に全部であり)、そ して他の植物部分のすへて内でほとんどないことを意味している。”CDPK“ は、カルモジュリンでなくカルシウムについて高いアフィニティーをもち、その 触媒活性のために、カルモジュリンでなくカルシウムを必要とする植物蛋白キナ ーゼを意味している。 組織好適又は組織特異的プロモーターを得るために、組織特異的メツセンジャー RNA(mRNA)をコートしている遺伝子を、cDNAライブラリーの差異ス クリーニング(differential screening)により得るこ とができる。例えば、髄好適cDNAを、髄から得られたcDNAプローブ及び 種mRNAを使用する差異スクリーニングに髄cDNAライブラリーを供するこ とにより得ることがてきる。助1ecular Cloning、 A Lab oratory Manual、 Sambrook et al、 eds、  Co1d Spring )Iarbor Press: New York  (1989)を参照のこと。 あるいは、組織特異的プロモーターを、組織特異的蛋白を得て、そのN−末端を 配列決定し、オリゴヌクレオチド・プローブを合成し、モしてcDNAライブラ リーをスクリーニングするためにそのプローブを使用することにより、得ること ができる。このような手順を、花粉特異的プロモーターの単離のための本実験セ クション中に例示する。髄特異的及び花粉特異的プロモーターに関しての本発明 の範囲は、完全長プロモーターの機能的に活性な断片であって、関連構造遺伝子 のそれぞれ髄好適又は花粉特異的転写に向けることもできるものを包含する。プ ロモーターDNA配列の機能的に活性な断片は、幾つかの当分野において認めら れた手順により、例えば、制限酵素を使用したプロモーターDNA配列の解裂、 その配列に従ったそのプロモーターDNA配列の合成により、プロモーターDN A配列から得ることができ、又はPCR技術の使用を通して得ることができる。 例えば、Mullis et at、、λIeth、 Enzymol、 15 5:335−350 (1987)+ Erlich本発明の範囲内にさらに含 まれるものは、完全長プロモーターに“等価な(equivalent)”髄好 適及び花粉特異的プロモーターである。 すなわち、異なるヌクレオチド、又はヌクレオチドの群を、公知の手順に従って プロモーター活性を破壊しないやり方で、修飾、付加又は欠失させることかでき る。 メイズTrpA遺伝子から得られる髄好適プロモーターを、図24中に示す。当 業者は、手に入れた本配列情報により、メイズTrpA構造遺伝子から得られる プローブによりこれらの植物からの髄ライブラリーをプロービングすることによ り、本発明の範囲内に含まれる髄好適プロモーターを他の植物から得ることかで きることを、認識するであろう。例17中に一般的に討議するように、様々な種 のTrpAサブユニット遺伝子の中に高く保存される配列から設計されたプロー ブが、好ましい。他の、花粉特異的プロモーターであってそおれらの生来の状態 においてメイズ以外の植物CDPK遺伝子に結合するものを、花粉ライブラリー をプローブするために、メイズCDPK遺伝子の保存領域から得られたプローブ を使用して、類似の方法で、単離することができる。 本発明の他の態様においては、髄好適又は花粉特異的なプロモーターを、DNA 配列、すなわち、問題の蛋白をコードしている構造遺伝子に作用可能な状態で結 合し、組換えDNA分子又はキメラ遺伝子を形成させる。語句”に作用可能な状 態で結合する(operably 1inked to)”は、本分野で認めら れる意味をもち;それは、”と作用関連の(operatively asso ciated with)”、”に結合した(linked to)”又は”に 融合した(fused to)”と互いに交換可能なものとして使用されてもよ い。 構造遺伝子は、プロモーターの起点(origin)及び/又はその中にそれが 形質転換されるところの標的植物に関して、同種のものであり又は異種性のもの であってもよい。相対的な起点にかかわらず、その関連DNA配列は、それが結 合するところのプロモーターの発現の性質に従って形質転換植物内で発現される であろう。それ故、関連DNA配列の選択は、上記の方法により発現される配列 をもつ必要性から開放されるべきである。異種DNA配列の例は、殺虫性蛋白、 例えば、昆虫又は他の植物寄生性の節足動物(arthropods)、あるい は植物病因原、例えば、菌類、バクテリア及び線虫類(nematodes)に 対して毒性又は阻害的な蛋白又はポリペプチドをコードしているものを含む。こ れらの異種DNA配列は、蛋白、例えば、マガイニン−576(1983):メ リチン(melittin)、グラミシジンS(gramicidin S)。 ラム・チャンネル蛋白及び合成断片、 0iki et at、 PNAS U SA、 85:2methicin)及び各種の合成両親媒性(amphipa thic)ペプチド、 Kais−68(1986)+プロテアーゼ及びアミラ ーゼ阻害剤;及びバチルス・バクテリア又は菌類(fungi)からのデルタ− エンドトキシン(delta−endotoxins)を、コードしている。 本発明の好ましい態様においては、メイズTrpAサブユニット遺伝子から得ら れた髄好適プロモーター又はノイズCDPK遺伝子から得られた花粉特異的プロ モーターを、バチルス・スリンギエンシス迩111us thuringien sis)(”B、ビ)殺虫性蛋白をコードしている異種DNA配列に作用可能な 状態で結合させる。これらの蛋白及びその対応する構造遺伝子は、当技術分野に おいてよく知られている。Hofteand Whiteley、 Micro biol、 Reviews、 53:242−255 (1989)を参照の こと。 発現に向けられることかできるいずれかのプロモーターを利用することができる ことは認められているが、問題の蛋白の生来のプロモーターよりもむしろ異種の プロモーターを使用することが好ましいてあろう。このやり方において、形質転 換されるへき植物並びに昆虫害虫に基つき決定されるっこおとかてきる、キメラ のヌクレオチド配列を構築することができる。例えば、ノイズにおける昆虫害虫 を制御するために、単子葉又はノイズのプロモーターを、作用可能な状態て旧蛋 白に結合することができる。このノイズのプロモーターを、組織好適及び組織特 異的プロモーター、例えば、それぞれ本明細書中に開示するような、髄好適及び 花粉特異的プロモーターから選択することができる。 いくつかの場合には、1以上のキメラ遺伝子構築物によりその植物細胞を形質転 換することが好ましいかもしれない。それ故、例えば、単一植物を、Bt蛋白に 作用可能な状態で結合された髄好適プロモーター並びにBt蛋白に作用可能な状 態で結合された花粉特異的プロモーターにより、形質転換することができるであ ろう。 形質転換された植物は、その植物の髄及び花粉内で、そしてより少ない程度にお いて根、外鞘及び支持根内で、Bt蛋白を発現するであろう。 様々な他の理由のために、特に潜在的な昆虫抵抗性を殺虫性蛋白発現植物に発達 させるのために、同一の植物内で1以上の殺虫性蛋白(IP)を発現させること が有利である。ある者は、同一の組織内に2つの異なる遺伝子(例えば、標的昆 虫の牛腸(midgut)内の異なるることができたし、又はある者は、組織特 異的プロモーターを使用して同一植物の異なる組織内で2つの毒素を選択的に発 現させることができている。3つの異なる組織特異的プロモーターを使用して同 −植物内で2つのBt遺伝子(又はいずれかの2つの殺虫性遺伝子)を発現させ ることは、所望の発現型を発現する植物の生産についての問題を現す。2つの異 なる遺伝子を動かす3つの異なるプロモーターは、同時にその植物内に導入され ることが必要な6つの異なる殺虫性遺伝子を作り出す。また、この形質転換に必 要なものは、形質転換植物の同定において助けとなる選択マーカーである。この ことは、同時に、7つの異なる遺伝子をその植物中に導入することを意味する。 全ての遺伝子、特に殺虫性遺伝子が、単一遺伝子の習性(trait)として、 そしてそれらが商業的なハイブリッドの栽培の間に追跡することがより難しくな るであろう且つ多遺伝子の習性としててはなく振る舞うように、同一の座におい てその植物ゲノム中に組み込まれることが最も要求される。遺伝子の全数を、異 なる殺虫性蛋白の差異に基づ< (differential)組織特異的な発 現を使用することにより、減少させることができる。 例えば、crylA(b)を、その花粉及びPEPカルボキシラーゼ・プロモー ターと融合させることにより、ある者は、縁組織及び花粉内でこの遺伝子の発現 を得ることができるであろう。髄好適プロモーターをバチルス・スリンギエンシ ス(Bacillus thuringie口5is)からのcrylBデルタ ・エンドトキシンと融合することは、形質転換植物の種組織内ではなく髄内て最 も豊富な上記の殺虫性蛋白の発現を生じさせるであろう。3つの遺伝子、すなわ ち、PEPカルボキシラーターcry[A(b) 、花粉/crylA(b)  、及び髄/crylBによる植物の形質転換は、同一の植物の異なる組織内で2 つの異なるBt殺虫性エンドトキシンを発現する植物を作り出す。CrylA( b)は、植物の“外側(outside)”の組織内で、すなわち、欧州トウモ ロコシ穿孔性動物が鼾化(hatching)後最初に食へるような組織内で、 発現されるであろう。ECBがcrylA(b)に抵抗性であり、そして葉組織 及び/又は花粉を食へた後その植物の葉柄(stalk)中に穴を掘る(bur row)ことができる場合には、その時は、それは、crylBデルタ−エンド トキシンに遭遇し、そして第二の殺虫性成分に晒されることができる。このよう なやり方で、ある者は、同一の植物内に2つの異なる殺虫性成分を差異に基づい て発現させ、単一殺虫性成分への抵抗性の発展に対する保護を同時に提供しなが ら単一の遺伝的単位として導入される必要がある遺伝子の全体数を減少させるこ とができる。 同様に、植物を、様々な昆虫を制御するために、1以上のタイプの殺虫性蛋白を コードしている構築物により形質転換することができる。このように、多数の変 種が当業者によって構築されることができる。 本発明の組換えDNA分子は、適当な方向でそれらを配置するための様々な要素 を操作することにより調製することができる。したがって、アダプター(ada pters)及びリンカ−(tinkers)をDNA断片を結合するために使 用することができる。その他の操作を、慣用の制限部位の提供、制限部位又は余 分のDNAの除去、のために行うことができる。これらの操作を、当分野で認め られる方法により行うこ1989を参照のこと。例えば、方法、例えば、制限酵 素処理、平滑末端(blunt ends)を提供するための突出(overh angs)のチューイング・バック(chewing back)又はフィル・ イン(filling in)、リンカ−の結合(liigation) 、D NA断片の相補的末端を、連結(joining)及び結合のために提供するこ とができる。Sambrook et al、、帆Eを参照のこと。 他の機能的なりNA配列は、その分子がその標的植物ゲノム中に取り込まれるで あろう方法に依存して、その組換えDNA分子内に含まれることができる。例え ば、アグロバクテリウム(Agrobacteriuml仲介形質転換の場合に おいては、Ti−又はRドブラスミドを植物細胞を形質転換するために使用場合 には、そのT1−又はRi−プラスミドのT−DNAの右及び左の縁(bord er)をその発現カセットのフランキング領域として連結することができる。植 物のアグロバクテリウム・チュメファシエンス(Agrobacterium  tumefaciens)−仲介形質転換は、 Horsch et al、、 5cience、225:1229 (1985): Marton、Ce11  Cunters B、V、、 Alblasserdam、 1985. C hapter V Fraley、 et al、、 Cr1t、 Rev、  Plant Sci、、 4:1−46+及びAn et al、、 EMBO J、、 4:277−284 (1985)中に記載されている。 本発明の組換えDNA分子は、組換え植物細胞における選択を容易にするために マーカー遺伝子を含む。マーカーの例は、殺生剤、例えば、抗生物質、例えば、 カナマイシン(kanamycin) 、/%イグロマイシン(hygromy c i n)、クロラムフェニコール(chloramphenicol)、パ ラモマインン(paramomycin) 、メトトレキサート(methot rexate)及びプレオマイシン(bleomycin) 、又は除草剤、例 えば、イミダシロン(imidazolones)、スルホニルウレア(sul fonulureas) 、グリフォセート(glyphosate)、ホスフ ィノトリシン(phosphinothricin)、又はバイアラフオス(b ialaphs)に対する抵抗性を含む。マーカー遺伝子は、当業者によく知ら れている。 本発明の他の態様においては、本明細書中で先に記載したような組換えDNA分 子又はキメラ遺伝子により安定的に形質転換された植物を提供する。得られたト ランスジェニック植物は、そのゲノム中に安定的に取り込まれた形質転換された 遺伝子を含み、そしてそれぞれの流儀でそのプロモーターに作用可能な状態て結 合した構造遺伝子を発現するであろう。 本発明により包含されるトランスジェニック植物は、単子葉及び双子葉植物の両 方を含む。代表的な例は、ノイズ、タバコ、トマト、綿、ナタネ(rape 5 eed) 、大豆、小麦、米、アルファルファ、ポテト及びヒマワリを含む。[ 他は?1°好ましい植物は、メイズ、特に同系のメイズ植物(inbred m aize plants)を含む。 本発明により包含される形質転換植物のすべては、当業者に知られた幾つかの方 法により生産される。A、 tumefaciens−仲介形質転換は、先に開 示されている。他の方法は、プロトプラスト中への直接遺伝子伝達(direc t gene transfer)、 Paszkowski et al、、  EMBOJ、、 12:2717 (1984); Loerz et al 、、 Mo1. Gen、 & Genet、、 1199:178 (198 5); Fromm et al、、 Nature 319ニア19 (19 86);マイクロプロジェクタイル・ホンバードメント(microproje ctile bombardment)。 Klein et al、、Bio/Technology、6:559−56 3 (1988)+プロトプラスト、培養細胞及び組織中へのインジェクション 、 Re1ch et al、、B43−50 (1986): Hooyka as−Van Slogteren et al、、 Nature、 311 ニア63−764 (1984): Grimsley et al、、 Bi o/Technology、 6:185 (1988);及びGrimsle y et al、、 Nature、 325:177 (1988)により記 載されているような分裂組織(meristematic tissue)又は 苗木(seedlings)及び植物中へのインジェクション:及びエレクトロ ポレーション。 W092109696を含む。 本組織好適又は組織特異的プロモーターと作用可能な状態で結合した構造遺伝子 のそれを含む形質転換植物内での発現ノくターンは、その構造遺伝子が殺虫性蛋 白をコードしている場合においては決定的である。例えば、今般開示する髄好適 発現、<ターンは、そのトランスジェニック植物か、その植物の主として髄、そ してまたその支持根、外鞘及び葉を攻撃する病原体(pathogens)及び 草食動物(herbivores)に耐えそして阻止することを可能にするであ ろう。何故なら、その蛋白が、より少ない程度であるが、これらの植物部分内て 昆虫を制御する量において発現されるであろうからであり、そしてさらに両方の タイプのプロモーターの場合においては、その蛋白が影響を受けていない植物の 種に残されるであろうからである。 例 以下の例は、本発明の実施において使用される材料及び方法についてさらに記載 している。それらは、説明により提供されているものであり、限定によるもので はない。 例1: 一般的方法 DNA操作は、本分野において標準的な手順を使用して行った。これらの手順は 、その結果を実質的に変更することなくしばしば修正及び/又は置き換えられる ことができる。他の文献を示さない限り、これらの手順のほとんとは、Samb rook et al、、 Mo1ecular Cloning: A La boratory Manual、 Co1d Spring Harbor  Laboratory Press。 5econd edition、 1989中に記載されている。 DNAオリゴマーの合成: 約20から約90までの、好ましくは約60から約80までの長さのヌクレイチ ドである開Aオリゴマーを、Applied Biosystems mode l 380B DNAシンセサイザー及び標準的な手順を使用して合成する。こ のオリゴマーは、0.2μモル、床孔、小規模ABIカラム上で最新5SCAF 3サイクルを使用して作る。最終手順を、トリチルを除き行い、そしてそのオリ ゴマーを380Bの自動解裂サイクルを使用してそのカラムから解裂させる。次 にこのオリゴマーを、55℃で8−12時間において過剰の水酸化アンモニウム (NH40H)中で脱ブロックする。次にこのオリゴマーを、窒素ガスを使用し てエバポレーター内で乾燥させる。終了後、このオリゴマーを、0.25−0. 5mlの脱イオン水中に再懸濁させる。 合成オリゴマーの精製: それぞれのオリゴマーの部分を、0.05%ブロモフェノール・ブルー、0.0 5%キシレン・シアツールFF、及び25%ホルムアミドを含む最終溶液との等 容量のブルー染料/ホルムアミドと混合する。この混合物を、95°Cで10分 間加熱し、このオリゴマーを変性させる。次にサンプルを、7Mウレアを含む1 2%のポリアクリルアミド−ウレア・ゲル(Sambrook et al、) に供給する。o Vertical 5tab Gel Unit(Hoefe r 5cientific Instruments、 San Franci sco、 CA)を使用して300−400ボルトで3−4時間の電気泳動の後 、Uv影付けを、そのゲル中の正確なサイズの断片を位置決めするために使用し 、次にゲルを、レーザー・ブレードを使用して切断した。精製された断片を、細 かく刻みそして37°Cで一夜、0.4M LiC1,1mM EDTA (p H8)バッファー中てインキュベートした。 2つの方法の中のいずれかを、そのポリアクリルアミド・ゲル残存物からそのオ リゴマーを分離するために使用する:Gene/X25μM小孔性ポリエチレン ・フィルター装置又はMillipore’s ulltrafree−MC0 ,45μ^(フィルター装置。精製されたオリゴマーをエタノール沈殿させ、4 °Cで20分間マイクロフユージ内で遠心分離により回収し、そして最後にTE (10mM Tris、 1mM EDTA、 pH8,0)中で再懸濁させる 。濃度を、260nmにおける吸収の読みに基づき50Pg/μlに調整する。 サイズ決定のためのオリゴマーのキナーゼ分解:配列決定ゲル上でオリゴマーの いくつかのサイズをチェックするために、キナーゼ標識付は反応を、それぞれの 代表的なサイズ:4゜マー(40mers)、60マー、70マー、80マー、 及び90マーの精製合成オリゴマーを使用して行う。それぞれ20μIのキナー ゼ分解反応において、1ピコモルの精製オリゴマーを、7.0mM Tris  pH7,5,10mMKCl、 1mM MgCL 、0.5mM DTT 、 50Pg/ml BSA、3000μC1(3ピコモル)の32P−ガンマAT P 、及び8ユニツトの14ポリヌクレオチド・キナーゼのバッファー中で使用 する。このキナーゼ反応を、37°Cて1時間インキュベートし、その後、フェ ノール/クロロホルム抽出及び担体としてのグリコーゲンによる3回のエタノー ル沈殿(Tracy。 Prep、 Biochem、II:251−268 (1981))を行う。 それぞれの反応の2つのゲル充填材(loadingXl ツはIOoocpm を含み、他方は2000cpmを含む)を、25%ホルムアミド、0.05%ブ ロモフェノール・ブルー、及び0.05%キシレン・シアツールFFにより調製 した。キナーゼ分解(kinased)オリゴマーを、6%ポリアクリルアミド 、7Mウレア配列決定ゲル(BRL Gel Mix TM6. BRL、 G aithersburg、 MD)上への供給の前、5分間沸騰させた。プラス ミドpUcI8の配列決定反応を、同一ゲル上で行いサイズマーカーを提供した 。 電気泳動の後、ゲルを乾燥させ、そして診断X−線フィルム(Kodak。 X−OMAT AR)に露出させた。得られたオートラジオグラフは、正確なサ イズを有すへくテストされた精製オリゴマーのすへてを示す。 配列決定ゲル上で直接サイズ分画されたオリゴマーを、6%ポリアクリルアミド 、7八1ウレア・ゲル(BRL Gel Mix TM6)上で、サイズ・マー カーとしてサイズ分画されたオリゴマーを使用して、走らせた。 オリゴマーのすべてを、ゲル上への供給前に100°Cて5分間、25%ホルム アミドにより最初に変性させる。このポリアクリルアミド・ゲルの臭化エチジウ ム染色は、そのオリゴマーのすへてかサイズ決定のために可視化されることを可 能にする。 直接クローニングのためのオリゴマーのハイプリダイジング:ハイブリダイズさ れるへきオリゴマーを、−緒にプールしくlμgから20Pg全DNAまで)、 そして30mM Tris−HCI pH7,8,10mλl MgC11,1 0mM DTT、及びl mM dATPを含むIX Promega結合バッ ファー中で37℃で1時間、キナーゼ分解する。20ユニツトの中のlのT4ポ リヌクレオチド・キナーゼを、存在する全DNAの量に依存して、その反応中で 使用する。このキナーゼ反応を、5分間沸騰水浴内にその反応を置くことにより 終了させる。ハイブリダイズした分子の5′末端を形成するためのオリゴマーを 、キナーゼ分解せず、加熱後の追加のハイブリダイゼーション・バッファーと一 緒のキナーゼ分解オリゴマーに添加する。このプールされたオリゴマーは、最終 塩濃度を100mM NaC1,120mM Tris pH7,5、及び10 mM MgCl 2に調整するために使用される添加されたハイブリダイゼーシ ョン・バッファーを含み50−100μlの容量にある。このキナーゼ分解及び 非−キナーゼ分解すリボマーを、−緒にプールし、そして5分間沸騰水浴内で加 熱し、そして約4時間にわたり室温までゆっくりと冷却する。 次にハイブリダイズされたオリゴマーを、フェノール/クロロホルム抽出し、エ タノール沈殿させ、そして17μlのTE(10mM Tris、 1mM E DTA、 pH8,0)中に再懸濁させる。この17μlを使用して、最終容量 20μmをもつ結合反応物を結合させる(最終濃度=30mM Tris−He l pH7,8、10mλ(MgC12、10mM DTT、1mM ATP  、及び3ユニツトのT4 DNAリガーゼ(Promega、 Madison  Wl))。この結合物を、室温において約2時間インキュベートする。ハイブ リダイズ/結合断片を、ベクター中へのクローニングに先立って制限酵素による 切断の前及び/又は後に2%Nus 1eveゲル上で一般的に精製する。20 μm容量の結合反応物(legation reaction)を、30+nM  Tris−)1cI p)l 7.8.10mλ1MgC12,10mM D TT、 ImM ATP 、及び3ユニツトのT4 DNAリガーセ(Prom ega、 1iladison Wl)中のおおよそ等モル量のDNAをもツ1 100n〜500ngのそれぞれの断片を使用して結合させる。この結合物を、 室温において約2時間インキュベートする。結合後、DNAを、標準的な手順( Sambrook et al、)を使用して、凍結コンピテント大腸菌m1ア ンピシリンを含むしB−寒天上で選択する(以下参照)。 大腸菌(E、coli)内のクローンのスクリーニングのためのPCR反応正確 なりNA挿入物を含む大腸菌コロニーを、PCRを使用して同定する(一般的に 、5andhu et al、、 BioTechniques 7:689− 690 (1989)を参照のこと。)。つまようじを使用して、コロニーを、 −夜プレートからこそげ取り、そして約50ピコモルのそれぞれのハイブリダイ ズジング・プライマー(pHYB2#6中のSac I l断片の方向を選択す るためにプライマーMK23A28及びMK25A28を使用する例を参照のこ と) 、 200μm〜400μmのそれぞれのdNTP、及びIX反応バッフ −r−(Perkin Elmer Cetus、 Norwalk、 CT) を含む20μm〜45μlのPCR反応混合物に添加する。10分間沸騰水浴内 で大腸菌/PCR混合物全金物全金物後、IX反応バッファー中の5μmのTa qポリメラーゼ(0,5ユニツト)(Perkin Elmer Cetus、  Norwalk、 Conn、)を添加する。 このPCR反応のパラメーターは、一般的に、30〜36サイクルにわたる、9 4°C30秒間の変性段階、55°C45秒間のアニーリング、及び72°C4 5秒間の伸長、により設定される。PCR反応生成物を、アガロース又はNus ieveアガロース(FMC)ゲル上て走らせ、増幅された正確な断片サイズを 検出する。 結合(Ligat 1ons) : 制限酵素消化断片を、本分野において標準的な技術を使用して1%LGT(低ゲ ル化温度アガロース、FMC)、2%Nus ieve(FMC)、又は0.7 5%アガロース中でいずれかの精製を行う。DNAバンドを臭化エチジウムによ り可視化し、そしてバンドを、レーザー・ブレードによる切除によりゲルから回 収する。LGTから単離された断片を、LGT中で直接結合させる。それぞれの 回収されたDNA断片の10マイクロリツターを、その結合反応物と結合させる ために使用し、約23μlの最終結合反応物容量を作り出す。レーサー・ブレー ドによる切除の後、所望のDNA断片を含む回収されたゲル・バンドを溶融させ 、そしてlxリガーセ・バッファーにもっていき、そして3ユニットのT4 D NAリガーゼ(Promega)を先に記載したように添加する。普通のアガロ ース又はNus 1eveアガロースのいずれががら単離した断片を、ultr afree−MCO,45uMフィルター装置Qli 11ipore)を使用 してそのアガロースから精製し、そしてその断片を、先に記載したように結合さ せる。結合反応物を、標準的な手順(Sambrook et al、)を使用 し形質転換 株DH5アルファ又はHBIO+の凍結コンピテント大腸菌(E、coli)細 胞を、標準的な手順(Sambrook et al、)を使用して調製し、そ して形質転換させる。大腸菌(E、coli)“5URE(確かな)”コンピテ ント細胞を、Stratagene (La Jolla、 CA)から得る。 LGTアガロース中て行われる結合のために、結合反応が終了した後、50mM  CaC12を、約150μlの最終容量に添加し、そしてその溶液を、そのア ガロースを完全に溶融するために約65°Cて約10分間加熱する。次に、この 溶液を、約200μlのコンピテント細胞であって氷上で解凍されているものの 添加の前に、約10分間、氷上で混合し、そして冷凍する。 この混合物を、氷上で30分間インキュベートする。次にこの混合物を、2分間 氷上で冷凍する前に42°Cて60秒間、熱ショックを与える。。次に、800 μmのSOC培地(20%トリプトン、0.5%酵母エキス、10mM NaC 1,2,5mM KCIであってによりpH8に調整されているもの、5 N  Na0t(、20mM MgC1□+Mg5O、混合物、及び20mλ1 グル コース: Sambrook et at、)を、添加し、そしてその細胞を振 とうしなから37°Cにおいて、選択培地プレート上へのブレーティング前約1 時間、インキュベートする。プレートは、典型的には、100μg/mlアンピ シリンを含むL−寒天(Sambrook et al、)である。 結合がアガロースを含まない溶液中で行われるとき、典型的には、200μlの 凍結コンピテント大腸菌(lE、coli)細胞(株DH5アルファ(BRL、  Gaithersburg、 h山)又は確かな細胞、 Stratagen e、 La Jolla。 CA)を、氷上で解凍し、そして5μlの結合混合物を添加する。この反応物を 、約40〜60分間氷上てインキュベートし、次にこの細胞を、約90秒間42 °Cで熱ショックを与える。約10分間室温において回収した後、800μlの SOC培地を添加し、そしてその細胞を、次に、振とうしなから37°Cて1時 間インキュベートし、そして上記のようにブレーティングする。 使用される標準的なベクターのいくつかのにおいてベーターガラクトノダーゼ遺 伝子中への挿入についてスクリーニングするとき、200μlの回収した形質転 換混合物を、0.008%X−gal、80μ!tl IPTG、及び100  μg/mlアンピシリン(Sambrook et al、)を含むLB−寒天 プレート上にブレーティングする。このプレートを、37°Cて一夜インキュベ ートし、形質転換細胞の選択及び培養に供する。 DNAのミニスクリーニング: 選択培地プレートからの形質転換細胞を、培養し、そしてそれらのプラスミド構 造を、標準的なプラスミド・ミニ−スクリーニング手順(Sambrook e t al、)を使用して検査及び確認する。典型的には、”沸騰(boilin g)”手順を、分析のための少量のプラスミドDNAを作るために使用する(S ambrook et al、)。あるいは、酢酸アンモニウム手順を、いくつ かの場合において使用する。この手順は、Shing−yi Lee et a l、、 Biotechniques 9:676−679 (1990)によ り報告されたものを修正したものである。 l)−夜選択プレートからの単一バクテリア・コロニーを、5m1(踊lまでの スケール・ダウンが可能)のTB(Sambrook et at、)培地中に 接種し、そして適当な抗生物質の存在中で増殖させる。 2)ローラー上て37°Cにおいて一夜インキユベートする。 3)プラスチックのOakridgeチューブ内に5mlのバクテリア細胞を回 収し、そして5orvall SSローター内て5000rpmにおいて4°C において5分間回転させる。 4)その上澄液を除去する。 5)ImMの溶菌バッファ (50mMグルコース、25mM Tris−HC l[pH8,0] 、10mM EDTA及び5mg/mlのりゾチーム)中に 上記のペレットを再懸濁させ、5秒間混合し、そして室温において5分間インキ ュベートする。 6)2mlの新たに調製したアルカリ溶液(0,2N NaC1,1%ドデシル 硫酸ナトリウム)を添加し、きつく蓋を締め、5回引っ繰り返すことにより混合 し、そして5分間水浴内のチューブ内に入れる。 7) 1.5mlの水冷7.5M酢酸アンモニウム(pH7,6)を上記溶液に 添加し、穏やかに5回そのチューブを引っ繰り返すことにより混合し、そして5 分間氷水浴上に置く。 8)室温において9000rpmて10分間遠心分離する。 9)透明の上澄液を15m1 Corexチューブに移し、そして0.6容量の イソプロパツール(約2.5m1)を添加する。室温において10分間放置する 。 10)室温において9000rpmて1o分間遠心分離し、その上澄液を捨てる 。 +1)そのペレットを300μmのTEバッファー中に再懸濁させる。 6μlのRNase A & TIのストック(18oμlのRNase A[ 3254−Lニット/mg蛋白、5.6mg蛋白/ml ]及び20μlのRN ase Tl [481ユ= ット/mg蛋白、1.2mg蛋白/ml ]を添 加することにより200μlとして作ったもの)を添加する。これらのストック を、USB(US Biochemical)がら購入することができる。マイ クロ遠心分離チューブに移し、そして37°Cで15分間インキュベートする。 +2)75μmの蒸留水及び100μlの7.5M酢酸アンモニウムを添加し、 そして10分間氷水浴内てインキュベートする。 13)その混合物をBeckmanメイクロフユージ内て14. OOOrpm において10分間4°Cて遠心分離する。 +4)2.5容量の100%EtOH(約11)を添加することにより沈殿させ 、そして10分間氷水浴内でインキュベートする。 15)マイクロフユーシ内て14.00Orpmにおいて10分間回転させる。 16)(0,5m1−1m1を使用して) 70% エタノールによりペレット を洗浄する。そのペレットを乾燥させ、そして100μlのIX New En gland Biolabs制限酵素バッフy −4[20mM Tris−H CI(pH7,9)、10mM酢酸マグネシウム、50mM酢酸カリウム、1m M DTT]中に再懸濁させる。 濃度を測定し、そして吸光度260及び280nmにおける分光光度計により精 製度をチェックする。 組換えプラスミドを宿す特定のバクテリアのコロニーであるか否かについてのよ り迅速な決定のために、PCRミニスクリーン手順を、(Sandhu、 G、 S、 et al、、 1989. BioTechnique、 7:689 −690)により記載された方法を修正したものを使用して行う。簡単に言えば 、以下の混合物; 100μmの先のプライマー混合物、20μMのそれぞれのプライマー、 100μlのdNTP混合物(それぞれ2.5mM)、lOOμlのIOX A mpliTaqバッファ −(Perkin−Elmer Cetus、IXバ ッファ −=10 mM Tris−HCI pH8,3,50mM KCI  、 1.5o1口1gc1.、及び0.01%ゼラチン)、 700μlの脱イオン水、 を調製する。 20μlの上記の混合物を、0.5mlのポリプロピレンPCRチューブ内に入 れる。形質転換されたバクテリアのコロニーを、つまようじで拾い上げ、そして その混合物中に再懸濁させる。このチューブを、沸騰水浴内に10分間置き、そ して次に、以下に記載する5μlの混合物: 265μmの脱イオン水、 30μlのIOX AmpliTaqバッファー(Perkin−Elmer  Cetus、IXバッフy −=10 mM Tris−HC1pH8,3,5 0mM KCI 、 1.5mM MgC1z 、及び0.01%ゼラチン)、 7.5μlのTaqポリメラーゼ、 を添加する前に室温まで冷却する。 このサンプルを50μmの鉱油により重層し、そしてPCRを、以下のパラメー ター二 変性、94°C,1分間 アニーリング=55°C,1分間 伸長、72°C145秒間、 を使用して、30サイクルにわたり行う。 PCR増幅後、lμlの充填染料(30%グリセロール、0.25%ブロムフェ ノール・ブルー、0.25%キシレン・ンアノール)を、その反応物全体に添加 し、そして20μlの混合物を、所望のサイズのPCR生成物か在るかどうかを 見るために、2%Nusieve 、1%アガロース・ゲル上に装填する。 この手順を、最初のスクリーンとして使用する。ミニ調製(1旧preps)を 、その後、スクリーニングに先立ってそのプラスミドの構造及びその挿入物を確 認するために行う。 例2: それぞれのクォーターの増幅及び組み立て合成りt crylA(b) 遺伝子の断片のクローニング:合成遺伝子を、4つの片であってそれぞれがその 遺伝子のたいたいIクォーターであるものの内において、クローン化されるよう に設計した。それぞれのりオーターのだめのオリゴマーを、PCR、ハイブリダ イゼーション、又はハイブリダイゼーションの組み合わせその後の他で記載され るようなPCR増幅のいずれかにより、組み立てられるようにプールした。合成 りオーターを、第−及び第二、第二及び第三、そして第三及び第四の間において 、それぞれ、制限部位Aatll 、Nco[、及びApalを重複させること により一緒に片とした。 遺伝子のそれぞれのクォーター(約500塩基対を表す)を、その好適なオリゴ マーとハイブリダイズさせ、そして所望の断片を、そのクォーターの末端に特異 的なPCRプライマーを使用して増幅することにより、結合させた。わずかに異 なるプライマーの2セツトを使用するPCR反応の2つの異なるセットを使用し た。この2つの反応のPCII生成物は、第一反応においてそのコード領域の5 ゛末端における追加のAATTが存在し、そして第二反応において与えられたり オーターめ3゛末端においてAGCT配列が存在することを除き、同一のものと して設計された。特定のクォーターのためのこの2つの反応の生成物が(そのポ リメラーゼ、プライマー及び不完全生成物を除去した後に)混合、変性、そして その後の再アニーリングを行われたとき、特定の比(理論的には50%)のアニ ール生成物は非同種の突出(overhanging)末端をもつはずである。 これらの末端は、その分子の5゛末端におけるEcoRIによる、その3′末端 における旧nd[I[による制限消化の間に形成される“付着末端(stick y ends)“に対応するように設計された。得られた分子を、リン酸化し、 EcoR[/Hi nd I I I消化及びホスファターゼ処理Bluscr iptベクター中へ結合し、そして凍結コンピテント大腸菌(E、coli)株 DH5アルファ中へ形質転換した。選択後、所望の断片を含む大腸菌(E、 c oli)コロニーをそのDNAの制限消化パターンにより同定した。その合成遺 伝子の挿入を表す部分を、次に精製し、そして標準的な手順を使用して配列決定 する。 すへての場合において、多数のPCR反応からのクローンを、作りそして配列決 定する。次に、このクォーターを、その完全な遺伝子を得るためにその連結点( junctions)におけるユニーク制限部位を使用して一緒に連結する。 クローン化りオーターを、ミニ−スクリーン手順により同定し、そしてその遺伝 子断片を配列決定する。最も多(はそのPCR増幅段階の間にその配列中に誤り がしばしば導入されることが見つかっている。このような誤りのほんの少しを含 むクローン内でこのような誤りを正すために、ハイブリダイズされたオリゴマー を使用する。 ハイブリダイズされた断片は、その断片内の制限酵素認識部位において消化され 、そしてその合成遺伝子内でその突然変異した領域を置き換られる。ハイブリダ イズされた断片は、長さ90塩基対(例えば、第二クォーター内の5ac11部 位間の断片を置き換える領域)から約350塩基対の、第四クォーター断片であ ってその遺伝子の第四クォーター内で2つのPCR誘導突然変異を置き換えるも の、まての範囲にある。 高い誤り率のPCRのために、オーブン・リーディング・フレームを含むクロー ン化遺伝子断片の選択を可能にするプラスミドを、設計し、そして構築する。こ のプラスミドを、オーブン・リーディング・フレームがそのクローニング部位中 に導入される場合に、その形質転換されたバクテリアがカナマイシンの存在中で 増殖することができるようなやり方で、設計する。このベクターの構築を、以下 、詳細に記載する。この選択系は、多数の独立したクローンの配列決定を行う必 要なくオーブン・リーディング・フレームをもつクローンを迅速に同定すること を可能にすることにより、非常にその進行を速めるものである。合成りオーター を、様々なプラスミドてあって、 BSSK(Stratagene; La  Jolla、Ca)、 pUc18(Sambrook et at、)、及び Km−発現ベクターを含むものの中で、組み立てた。pLlcペースのプラスミ ドを含む他の好適なプラスミドは、当業者によく知られており、そしてこれも使 用することかできる。 クローン化断片の完全な配列決定、クローン化遺伝子生成物のウェスタン・プロ ット分析、及び完全に作用する合成りt cry[A(b)遺伝子をM認するテ スト昆虫として欧州トウモロコシ穿孔性動物を使用した昆虫検定を、得た。 オーブン・リーディング・フレームを選択するためのKm−発現ベクターの構築 : Km−発現ベクターを、オーブン・リーディング・フレームを含む合成遺伝子の 断片について選択するために設計した。ヌクレオチド13におけるTn5開始か らのNPTII遺伝子(Reiss et al、、 EMBOJ、3゜331 7−3322 (+984)をpUcI8と融合し、そしてそのDNAセグメン ト間に有用な制限部位を導入することができるPCRオリゴマーを設計した。こ のポリリンカー領域は、フレーム内にKm−遺伝子をもつ様々な合成上IP断片 をクローニングすることかできる制限部位を含む。 このポリリンカー領域を含む88塩基対の5°オリゴマーを、オリゴマー PA GE精製のために先に記載したように6%ポリアクリルアミド・ゲル上で精製す る。PCR反応物を、Tn5から得られたNPT[l遺伝子を含むlKbのBg lll/Sma[テンプレート断片と結合させる。このPCR反応混合物は、1 00ピコモルのオリゴマーKE72A2B及びKE74A28(以下の配列を参 照のこと)をもつ1100nのテンプレート、200nM dNTP、及び2, 5ユニツトのTaqポリメラーゼを、すへて50μl容量中に含み、等容量の鉱 油で重層される。このプライマーの配列は:KE74A28 5−GCAGATCTGG ATCCATGCACGCCGTGAAGG GC CCTTCTAG AAGGCCTATCGATAAAGAGCTCCCCGG GGA TGGATTGCACGCAGGTTC−3’KE72A28 5’ −GCGTTAACAT GTCGACTCAG AAGAACTCGT  CAAGAAGGCG−3゜使用するPCRパラメーターは:94°C145 秒間、55°C145秒間、及び72°C155秒間、てあって、段階3におい て3秒間の伸長、20サイクルにわたるものである。すべてのPCR反応を、P erkin−Elmer Cetus thermocycler内で行う。増 幅されたPCR生成物は800塩基対てあり、そして翻訳開始部位その後の、そ の翻訳終止因子を通して走る塩基#13からのKm遺伝子とフレーム内融合した ユニーク制限部位をもつポリリンカー領域を含む。pUc:KM74は、にm− 発現カセットであってP[JC18ベクター内でクローン化された800塩基対 のBg([15a11ポリリン力−/Km断片から組み立てられたものである。 この1acZプロモーターは、二〇Km遺伝子が大腸菌(E、coli)内で発 現されることを可能にする。pUc:KM74誘導体は、25μg/mlカナマ イシン/[PTGを含むしB−寒天プレート上でその後スクリーニングされるこ とがてきる突然変異細胞を選択されるために、最初に100 ug/mlアンピ シリンを含むLB−寒天プレート上にブレーティングされなければならい。合成 りt IP遺伝子断片を、Km−カセット内のそれぞれのクォーターから組み立 て、オーブン・リーディング・フレーム含有断片の片のクローニングについて確 認する。この第一のPCB活性合成りt [P遺伝子断片、pBt:Km#16 は、Km抵抗性を示すBt [P遺伝子である。 この断片は、その後、第三及び第四クォーター内に突然変異を含むことか発見さ れ、それはその後修復されるものである。 以下の手順を、合成旧crylA(b)遺伝子をコードしている合成りNA配列 の第一クォーターをクローン化するための、手本とする。同一の手順を、他のク ォーターの合成及びクローニングのための手本とする。但し、プライマー及び制 限部位について述へるときを除く。 クォーター1のためのテンプレート 等量の精製オリゴマーU+−U7とL1〜 L7との混合物 PCRプライマー・ 前進(Forward) : PI(a) :5’ −GTCGACAAGG ATCCAACAAT GG− 3゜PI(b) :5’ −AATTGTCGACAAGGATCCAA CA ATGG−3’復帰(reverse) : P2(a) :5−ACACGCTGACGTCGCGCAGCACG−3゜P 2(b):5−AGCTACACGCTGACGTCGCG CAG−3゜プラ イマー対A1:Pl(b) + P2(a)プライマー対A2:P1(a) +  P2(b)合成メイズ最適化Bt IP遺伝子の第一クォーターを含んで成る オリゴマーを含むPCR反応物を、以下のように述べる:200ngのオリゴ混 合物(oligo m1x)(重量に基づく等量において混合されたりオーター のためのすへてのオリゴ)lOμlのプライマー混合物(primer m1x )(20μMにおけるそれぞれの1:lの混合物;プライマーは先に記載のもの と同じである)5μlのIOX PCRバッファー。 使用するPCRバッファーは、 (a)IX a度= 10mM KCISlomM (NHm ) 2 SO4 ,20mM Tris−HCI 。 pH8,0,2mM 111g5O4、及び0.1%Triton X−100 、又は、(b)IX濃度= 10mM Tris−HCI 、 pf(8,3, 50mM KCI、1.5mMλIgclz、0、O1%wt/volセラチン 、 のいずれかであることがてきる。 成分を混合し、5分間沸騰水浴内で加熱し、そして65°Cて10分間インキュ ベートする。 次に、以下の試薬・ 8μlのdNTPs混合物(反応における最終濃度=それぞれ0.2mM)、 5ユニツトのポリメラーゼ、 を添加する。 最終反応容量は、50マイクロリツターである。 次に、オリゴマーを、72°Cにおいて3分間インキュベートし、そして次に、 PCRサイクルを走らせる。このPCR反応を、以下のような段階サイクル手順 に基づきPerkin Elmer thermocycler内て走らせる: 変性(denaturat 1on)サイクル・94°C11分間、アニーリン グ・サイクル:60”C11分間、伸長サイクル(extenssion cy cle)ニア2°C145秒間(lサイクル当たり+3秒間)、 サイクル数:15゜ 反応終了後、lOμlのPCR反応物を、2%Nusieve−GTG(FMC ) 、I%アガロース分析ゲル上に供給し、その反応物を監視した。残りの40 μlを、以下に記載するように、遺伝子断片をクローン化するために使用する。 PCR生成物 様々なプライマー対に対応する2本領PCR生成物の末端を示す(上側の鎖のみ )・ A2 GTCGACGCGTGTAGCT(554塩基対)第一クォーター。 ハイブリダイゼーション 先に記載したようなPCR反応物のそれぞれの40μlを、製造者の指示に従っ てクロマスピン(chromaspin)400カラム(C1onetech、  Pato AIto、 CA)を使用して精製する。担体DNAの5μgをそ のカラムに供給する前に反応物に添加した。(このことは、はとんどのクローニ ングについて行われる。しかしながら、い(っかの反応物においては、PCR反 応物は、標準的な手順(Sambrook et al、)を使用して、フェノ ール:クロロホルム抽出され、Taqポリメラーゼを除去され、そしてPCR生 成りNAを、標準的なエタノール沈降を使用してその水相から回収する。この担 体DNAは、PCR生成断片と共には溶出しない。それぞれのクォーターのため のAI及びA2反応の片割れ(Counterparts)を混合し、10分間 、沸騰水浴内で加熱し、そして次に、65°Cて一夜インキユベートする。次に 、その反応物を、65°Cの浴から取り出し、そして担体としてのlμl(2o ng)のヌクレアーゼ不含存グリコーゲン(Tracy、 prep、 Bio chem、 11:251−268 (1981)によりエタノール沈降させた 。このペレットを、40μmの脱イオン水中に再懸濁させる。 リン酸化反応 リン酸化反応を、以下のように行う: 40μl DNA 2.5 μl 20mλi ATP O,5u l IOX BSA/DTT (IX=5mM DTT 、0.5m g/ml BSA)1.0μl IOXポリヌクレオチド・キナーゼ・バッファ ー(lX=70Mm Tris−HCI SpH7,6,0,1M KCI 、  10mM MgC12)2.0μ+ポリヌクレオチド・キナーゼ(New E ngland Biolabs、20ユニツト)。 インキュベーションは、37°Cて2時間である。 次にこの反応を、l:1フェノール:クロロホルムで1回、次にクロロホルムで 1回抽出し、そして標準的な手順を使用してその水相をエタノール沈降させる。 このペレットを10μlのTH中に再懸濁させる。 制限消化 2ongのBluescriptベクター(BSSK+、 Stratagen e、 La Jolla。 CA) 10μl IOX制限バッフ−r −(IX=20mMTris−HCI pH 8,0、lOmλ口1gcl 2.100mM NaCI) 5 μl EcoRr(New England Biolabs) 100ユ −ット5 uI Hindlll(New England Biolabs)  I00ユニット最終反応物容量は、100μlである。 インキュベーションは、37°Cで3時間である。 終了時、こん反応物を、等容量のTE飽和フェノール(10mM Tris−H Cl pH8,0及びEDTA)により抽出する。遠心分離後、この水相を、等 容量の(TE飽和)フェノール:クロロホルムのl:l混合物(この“クロロホ ルム”は、24・lの比のクロロホルム:イソアミル・アルコール中で混合され ている。)により抽出し、最後に、この抽出物からの水相を、等容量のクロロホ ルムにより抽出する。最後の水相を、(10μmの3M酢酸ナトリウム及び25 0μlの無水エタノールを添加することにより)エタノール沈降し、4°Cで1 0分間放置し、そして最大速度でlO分間マイクロフユージ内で遠心分離する。 このペレットを、70%エタノール中で濯ぎ、そして室温で5−1O分間乾燥さ せ、そして100μmのlomM Tris−HCI(pH8,3)中に再懸濁 させる。 ホスファターゼ反応 ベクターDNAを、ホスファターゼにより定例的に処理し、挿入物をもたずに得 られたコロニーの数を減少させる。ウシ腸アルカリ性ホスファターゼを、典型的 に使用するが(Sambrook et at、) 、他のホスファターゼ酵素 も本段階のために使用することができる。 典型的なホスファターゼ反応を、以下のように設定する:90μlの先に記載し た消化DNA 10μlのIOXウシ腸アルカリ性ホスファターゼ・バッファー(lX=50m M Tris−HCI (pH8,3)、10mM MgC12,1mM Zn CIz 、 10mMスペルミジン(spermidine)) lμl (lユニット)のウシ腸アルカリ性ホスファターゼ(CAP。 Boehringer Mannheim、Indianapolis、IN) インキュベーションは、37°Cで1時間である。 次にこのDNAを、(1%低ゲル化温度(LGT)のアガロース・ゲル上で)ゲ ル精製し、そしてそのペレットを、50μI TH中で再懸濁させた。電気泳動 後、適当なバンドを、レーザー・ブレードを使用してそのゲルから切除し、65 °Cで5分間融解し、そしてTHによりl:1に希釈した。この溶液を、フェノ ールにより2回、上記のフェノール:クロロホルム混合物により1回、そしてク ロロホルムにより1回抽出する。最終水相をエタノール沈降させ、そしてTEバ ッファー中で再懸濁させる。 結合: 合成遺伝子の断片をベクター中に結合させるために、以下の条件を典型的に使用 する。 5μlのリン酸化挿入DNA 。 2μlのホスファターゼ処理EcoRI/Hindlll消化Bluescri ptベクターであって65°Cて5分間加熱し、そして次に冷却したもの、1  μl IOXリガーゼ・バッフy (IXバッファ −=30mλl Tris −HCl (pH7,8) 、 10mM MgC12,10mM DTT、  1mM ATP)、1 μl BSA(1mg/ml)、 lμl リガーゼ(3ユニツト、Promega、 Madison、 Wis c、)、リガーゼ反応を、典型的に、16°Cで一夜、又は2時間室温において インキュベートする。 形質転換。 大腸菌(E、coli)中への結合DNA断片の形質転換を、先に記載したよう な標準的な手順(Sambrook et at、)を使用して行う。 組換細胞の同定 形質転換プレートの一夜のインキュベーションから生じた白色又は明るい青色の コロニーを選択した。この形質転換細胞内のプラスミドを標準的なミニ−スクリ ーン手順(Sambrook et al、)又は先に記載したようなものを使 用して特徴ずけする。以下に列記する3つの手順の中の1つは、典型的に、 (1)沸騰DNA ミニ調製方法(boiling DNA m1niprep  method)(2)PCRミニスクリーン (3)酢酸アンモニウムミニ調製 を使用している。 第一りオーターを含むと信じられている組換えプラスミドの制限消化は、以下の ように設定される: (a)Bam H1/Aat IIl消化lOμl DNA + 10μl I X New England Bio1abs制限酵素バッファー4゜ 0.5 μl Bam Hl (10ユ=ツト)、0.5 μl Aat Hl  (10−L−ット)、インキュベーションは、37°Cて2時間である。 所望の制限パターンをもつものとして同定されたクローンを、別々の反応におい てPvu I I及びBglllにより消化する。3つの酵素消化のすべてによ る所望の制限パターンをもつクローンのみを、さらに配列決定について行う。 クローン化遺伝子断片の配列決定・ 配列決定を、5equenase 2キツト(United 5tates B iochemical Corp、、 C1eveland、 OH)による2 本鎖DNAを使用するSanger’ sのジデオキシ連鎖停止法(Sange r’ s dideoxy chain termination metho d)(Sambrook et al、)を使用して行う。すへての中で、6つ の第一りオーター・クローンを配列決定する。この配列決定されたクローンの中 で、2つのクローンてあってpQAI及びpQA5と命名されたもののみが、そ れぞれたった1つの欠失を含むことが見つかっている。これらの欠失は、それぞ れ、pQAI内の452位及びpQAS内の297位において配置された1つの 塩基対のものである。 プラスミドpQAlを、(以下に記載するような)pPl−8と共に使用して。 期待される配列をもつ第一クォーターを得る。 テンプレートオリゴマー[8−tJ14及びLa−L14PCRプライマー二 前進: P3(a) :5−GCTGCGCGACGTCAGCGTGT TCGG−3 ’P3(b) :5−AATTGCTGCG CGACGTCAGCGTG−3 ゜復帰: P4(a):5’−GGCGTTGCCCATGGTGCCGT ACAGG− 3’P4(b) :5’ −AGCTGGCGT TGCCCATGGT GC CG−3’プライマー対Bl :P3(b)+P4(a)プライマー対B2:P 3(a)+P4(b)EcoRI/Hindlllにより消化されたBlues cript内の上記DNA断片の、ハイブリダイゼーション、PCR増幅、スピ ン・カラム・サイズ分画(spin column 5ize fractio nation)、及びクローニングを、第一クォーターについて先に記載(例2 A)シたように行う。本クォーターのPCR生成物は、サイズ約529塩基対で あって本遺伝子の第二クォーター(ヌクレオチド531〜1050)を代表する 。形質転換は、先(こ記載した標準的な手順(sambrook et al、 )を使用して凍結コンピテント大腸菌(E、 cal i)細胞(DH5アルフ ァ)中へのものである。 pQB クローンのミニスクリーン・ ミニ調製DNAを、先に記載したように調製し、そして(a)Aatll/Nc o[、(b)Pvul[及び(c)Bgllにより消化し、配列決定の前にベク ター内の構造挿入物について確認する。 配列決定を、Sanger(Sambrook et at、)のジデオキシ法 を使用して先に記載したように行う。 本クォーターの13クローンの全てを、配列決定する。第二クォーターは、88 4と887位の間に1以上の欠失を一貫して含む。はとんとの場合において、8 84位のGが欠失している。 プラスミドpQB5は、884位においてたった1つの欠失をもってしまた。こ の領域は、2つのSac [1部位(859と949位)の間に横tこわつてい る。この欠失を正したものを例3中に記載する。 第一半分(1−1050塩基対)のクローン1本領DNA断片としての合成りt メイズ遺伝子の第一半分(クォーター1及び2)をクローニングするための断片 を、PCR反応生成物であって第一クォーター及び第二クォーターを含んで成る ものの制限消化により得る。制限エンドヌクレアーゼAatlrを、20μl反 応において(フェノール抽出及びエタノール沈降後に)DNAを切断するために 使用する。それぞれのAat[[消化クォーターの15μmを混合し、そして室 温において2時間、(5μmのIOXリガーゼ・バッファー(IX=30mM  Tris−HCI pH7,8、lomMλIgcI 2.10mM DTT、 1mM ATP)、14μmの脱イオン水及びlμlのT4 DNAリガーゼ、 3ユニツト、Progema、 Madison、 Wlを添加することにより 、50μl容量中で)結合する。結果物は、標準的な条件(Sambrook  et al、)を使用して走らせた1%アガロース・ゲル上の電気泳動により判 断されるような約1kbの断片である。10μlの結合生成物を、先に記載した 条件を使用してPCRにより増幅する。但し、5サイクルのみを走らせた。 プライマー対:HA=P1(a)+P4(b)プライマー対:HB=P1(b) +P4(a)。 これらの反応の生成物を、個々のクォーターについて記載するようにBlues cript(Stratagene、 La Jolla、 CA)中にクロー ン化する。 この手順を、1回だけ行い、すなわち、DNA挿入物のすへてを、単一のPCR 反応からの特定の領域内で得る。 36のコロニーを、Sal[消化及びPvu [l消化によりミニスクリーンす る。4つを除くすべてのクローンは、サイズ約1kbの挿入物を含み、その中の 少なくとも2020は、正しいPvull消化パターンを含む。 このクローン、PI−8の中の1つは、EcoN1部位(396塩基対)とDr a 111部位(640塩基対)との間の所望の配列をもっている。このクロー ンを、pQAl(先に記載した452塩基対位における欠失をもつ第一クォータ ー)と共に第二クォーター内の叶a(11部位(640塩基対)までの所望の配 列をもつプラスミドを得るために使用する。 テンプレート、オリゴ015−[20及びLi2−L21PCRプライマー二 前進 P5(a):5’ −TTCCCCCTGT ACGGCACCAT GGGC AACGCCGC−3’P5(b) :5−AATTGTACGG CACCA TGGGCAAC−3゜復帰・ P6(a):5’ −GAAGCCGGGG CCCTTCACCA CGCT GG−3’P6(b)・5’ −AGCTGAAGCCGGGGCCCTTCA CC−3’プライマー対Cl :P5(b)+P6(a)プライマー対C2:P 5(a)+P6(b)PCR反応、正確なサイズのDNA断片のスピン・カラム 回収、及びベクター中への結合を、EcoRI/Hind[[Iにより切断され たBluescriptベクターを使用して先に記載したように(例2A)行う 。約479塩基対のPCR生成物は、合成遺伝子の第三クォーターを現している (ヌクレオチド1021〜1500)。 凍結コンピテント大腸菌(E、coli)株DH5アルファ細胞中への形質転換 、形質転換細胞の選択及び同定、ミニ−スクリーン生成物による形質転換細胞の 特徴すけ、及びそのベクター内の合成遺伝子断片の配列決定は、先に記載したも のとすべて同じである。 pQCクローンのミニスクリーン: 第三クォーターを、標準的な手順(Sambrook et al、)を使用し てミニスクリーンする。ミニ調製DNAを、(a)Ncol/Apa[及び(b )Pvul[により切断する。正しい制限消化パターンを含むクローンを、標準 的な手順を使用して配列決定する。第三クォーターの22クローンの全てを、配 列決定する。第三クォーター内の3つの主要な欠失“ホットスポット”を、(a ) 1083位、(b) 1290−1397位の間、及び(c)1356−1 362位の間において同定する。1つ、すなわちpQC8を除いてすべてのクロ ーンにおいて、1365位においてCの挿入がこれもまた一貫しである。これら の突然変異の付加において、この第三クォーターは、多数の他の明らかにランダ ムな欠失を含む。第三クォーター内の3つの突然変異性”ホットスポット”及び 第二りオーター内の1つのものに対する共通要素は、約80%C+Gである配列 によるいずれがの剥土にこれらの領域が全て隣接しているとついことである。列 内に5〜9のC−Gを含む他の領域は、影響されていない。015 、[16, 018、[19、Li2 、Li2 、Li2及びLi2内のオリゴマーは、こ れらの領域内のC十G含量を減少させるように再設計されている。修飾されたオ リゴマーを使用したPCR反応からのそれぞれの5つのクローンを、配列決定す る。 プラスミドpQCN103は、1326位における変更を除き第三りオーターに ついての正しい配列をもっている。GをCと置換するこの変更は、1つのアミノ 酸(ロイシン)を元のもの(フェニルアラニン)と置き換えることをもたらす。 この遺伝子の第四クォーターを、その遺伝子の第三及び第四りオーターを含んて 成るように元々設計されているクローンから得る。 合成遺伝子の”第二半分”を、PCR反応がら得て、第三及び第四クォーターを 融合する。これらの反応を、第三クォーターのために先に記載したPCRプライ マーP5(a)及びP6(a)並びにプライマーP7(a)及びP8(a)(以 下に記載する)と共に走らせる。復帰プライマーを、5acl部位及び終止コド ンを含むように修飾する。それぞれのりオーターのための別個の反応を、先に記 載した条件を使用して3oサイクルにわたり走らせる。この2つのクォーターを 、PCRを重複させることにより一緒に結合し、そしてその後、制限酵素Nco l及び5aclにより消化する。得られた953塩基対断片を、pcIB305 4てあってNco115acIにより切断されそしてアルカリ性ホスファターゼ により処理されているものの中に直接的にクローン化する。 pci83054を、pcIB246(例4中に詳細に記載する)のユニークH pa 1部位内にPEPカルボキシラーターイントロン#9(PEPCivs  #9)を挿入することにより構築する。pcIB246をHpa [により切断 し、そして例2A中に記載する標準的な手順を使用してCIPによりホスファタ ーゼ処理する。PEPCivs #9を、テンプレートとしてpPEP−10を 使用したPCRにより得る。pPEP−10は、C4光合成酵素をコードしてい るメイズPEPカルボキシラーゼ遺伝子の全体に加え、約2.2Kbの5゜−フ ランキング及び1.8Kbの3′−フランキングDNAを含むゲノムのサブクロ ーンである。この10Kb DNAを、pUc18のHind111部位内で結 合させる(Hudspeth et al、、 Plant Mo1ecula r Biology、 12:576−589 (1989)) 、 PEPC ivs #9を得るために使用される前進PCRプライマーは、GTACAAA AACCAGCAACTCてあり、そして復帰プライマーは、CTGCACAA AGTGGAGTAGTである。PCR生成物は、PEPカルボキシラーゼのイ ントロン#9配列のみを含む108塩基対の断片である。PCR反応物を、フェ ノール及びクロロホルムにより抽出し、エタノール沈降させ、ポリヌクレオチド ・キナーゼによりリン酸化し、そしてT4ボリメラーセにより処理し、標準的な 手順を使用してPCR生成物内このキナーゼ断片は、pC[B246のHpa1 部位中に、先に記載した標準的な手順を使用して、平滑末端クローン化する。 第四クォーターの増幅及び組み立て テンプレート: 021−026及びL22−L28PCRプライマー: 前進 P7(a) +5−TGGTGAAGGG CCCCGGCTTCACCGG− 3’復帰: P8(a):5’ −ATCATCGATG AGCTCCTACA CCTG ATCGAT GTGGTA−3’プライマー対4:P7(a)+P8(a)プ ライマー対3 :P5(a) 十P6(a)重複PCRのためのプライマー対: P7(a)+P8(a)PCR生成物 第三りオーターTTCCCCCTGTA−−−−−−−−−TTCACCGG( 484塩基対)第二半分GGTGAA−−−−−−−−−CATGATGAT( 953塩基対)4つの陽性クローンを、プラスミド・ミニスクリーンにより同定 し、そして次に1!!!的な手順を使用して配列決定する。 プラスミド旧、P2#lは、2つの突然変異を除きおおよそ正しい第四クォータ ー配列を含んでいる。これらの突然変異は、1523位におけるもの(AをGに 置換しており、HisをArgに置換するアミノ酸の変更をもたらすもの)、そ して1634位におけるもの(TをCに置換しており、SetのThrへのアミ ノ酸の置換をもたらすもの)である。 プラスミドBt、P2S5は、以下に記載するpc184414の構築において 使用される。(この間違えは、第四クォーターのいすへてのオリゴのハイブリダ イゼーション、Apal/Bst E IIによる消化及びpclB4414内 のその領域の置き換えにより最終的に訂正される。それ故、1842−1960 位からの配列のみがその最終構築物内のBt、P2#lを有して残る。) 例3・最後の合成遺伝子の組み立て及び修複合成メイズ最適化Bt crylA (b)遺伝子を、クォーター内でクローン化されるへく設計する。しかしながら 、PCR技術を使用して、突然変異であって殆との場合にフレーム・シフトをも たらす欠失となるものをもたらす。個々のクォーターを含むプラスミドを、それ 故、配列決定し、そして正しい部分を、標準的な手順を使用して一緒に結合する 。 殆との所望の配列をもつ第−及び第二クォーターを得た後、プラスミドpEBI Q#4及びpEBIQ#5を、構築し、その塩基対634においてDra111 部位までの合成旧遺伝子の所望の配列を得るために構築する(この突然変異は、 この叶allI部位を破壊する。)。このpEBIQ横築物を、pPl−8から の3.9kb Eco Nl/Bam H1断片とpQAlからの400塩基対 の断片とを結合させることにより、作る。pEBIQ#5は、Dra111部位 までの所望の配列をもつが、pEBIQ#4は、塩基対位378における突然変 異をもっている。 プラスミドplHIM4及び9181M5を構築し、pEBIQ#4及びpEB IQ#5内の叶alI[部位を修復する。プラスミドpEBIQ#4及びpEB IQ#5を、pHBIQ#4及びpEBIQ#5のそれぞれからの3.5Kb  Nco I/Aat II断片を結合することにより作る。プラスミドplH1 λ(5は、合成りt遺伝子の第二りオーター内の884位におけるSac I  1部位間の突然変異を含む。プラスミドplHIM4は、その前駆体構築物pE BIQ#4内に記載したような追加の突然変異を含む。 9181M4のBluescr i ptベクター領域内のSac [1部位を 、Not l及びSac Iによる9181M4の切断し、そしてこれらの部位 をT4 DNAポリメラーゼを使用して、9181M4 Sを作るだめのの3. 9Kb断片を結合させる前に標準的な条件下で変換させることにより欠失させる 。このベクター領域内の5acl1部位の欠失は、9181M4 Sの第二クォ ーター内の884位における突然変異をもつ90塩基対の5acl[断片が90 塩基対のSac[[断片との置換に先立って除去されることを可能にする。オリ ゴ7−U/L12及び13を、Sac、l Iによる切断及び2%Nusiev eゲル上の90塩基対断片の単離の前に、(先に記載したように)キナーゼ処理 し、そしてハイブリダイズする。このSac[I断片を、約3.8KbのSac  [[切断pH(1M4 SベクターてあっってCIPによりホスファターゼ処 理されているものの中に結合する。この修復されたSac l I断片を、pH YB2#6という。pHYB2#6内の5acll断片の方向を、以下のプライ マーを使用して先に記載したようなPCRスクリーニングにより検出する: MK23A28=5−GGGGCTGCGGATGCTGCCCT−3’Mに2 5A28=5−GAGCTGACCCTGACCGTGCT−3’MK26A2 8=5’ −CACCTGATGGACATCCTGAA−3’ブライマ−MK 23A28及び乳1に25A28の50ピコモルによりPCR反応を走らせるこ とは、約180塩基対の断片を作り、pHYB2#6内の5acl[部位により 結合される挿入断片が正しい方向にあることを示している。PCRスクリーニン グにおけるプライマーλ1に25A28及びMK26A28は、陰性対照として 作用し、間違った方向のSac l I結合断片を含む構築物内にのみ約180 塩基対の断片を作る。pHYB2#6配列を、標準的な手順を使用して決定する 。 pHYB2#6は、378位において1つの突然変異であって所望の配列を含む 第一りオーターを得るために修復される必要があるものをもっている。 プラスミドlHG#6は、合成旧遺伝子の完全な第一半分の所望の配列を含んて いる。plHG#6を、pi(YB2#6からの500塩基対のAat If/ Ncot断片に結合されたplH1t+5#2の3.4Kb Aat[[/Nc ol断片から作る。 オーブン・リーディング・フレームを含む合成遺伝子のクローン又は部分クロー ンを同定するために、(先に記載したような)カナマイシン選択ヘクターを使用 する。合成旧遺伝子の第四クォーターを、カナマイシン・カセット中に最初に入 れる。pKM74−4は、Apal/CIa[により切断されたpUc:KM7 4に結合されている、プラスミドBtP2からの約500塩基対のAral/C 1al断片(これは、C1alにより切断に形質転換されている)を含む。プラ スミドpKM74−4は、カナマイシン抵抗性を示すが、後に1523及び16 34位において2つの置換突然変異を含むことか見つかっている(突然変異は、 第四りオーターのクローニングについてのセクション内て先に記載されており: それらは、置換であり、欠失又は挿入ではない。)。 プラスミドplHG#6からの合成りt遺伝子の正しい第一半分を、プラスミド pKM74−4中に挿入する。pKm124という得られたプラスミドを、pl HG#6からのIKbのApal/Bam旧断片に結合されているpKM74− 4から得られた約3.9KbのApa[/Bam旧断片から作る。pKm124 は、カナマイシン抵抗性を示す。このプラスミドは、合成遺伝子の第一、第二、 及び第四りオーターを含み単一のオーブン・リーディング・フレームを形成する 。 合成遺伝子の第三クォーターを、次に、pKMI24中にクローン化する。 プラスミドpBt :Km#6内の第一の機能的クローンは、Km−カセットて あってカナマイシン抵抗性を示すが第三と第四クォーターとの間の欠失突然変異 を含むものの中の切り詰められた合成crylA(b)遺伝子の機能的コピーで ある。プラスミドpBt:Km#6を、pQcN103からの約500塩基対の Apal/Nco[断片に結合されている約5KbのApa[/Ne。 + 124ベクタ一断片から得る( pQcN103は、その後に修復される1 326位におけるミスマツチ突然変異を含んでいる。)。ヌクレアーゼ活性の汚 染がpBt:Km#6内の第三と第四りオーターとの間のApa1部位を欠失さ せたようである。プラスミドpBT:Km#6内の合成遺伝子によりコードされ ているBt遺伝子は、ECBに対する生来の蛋白の活性の約50−60%をもっ ている。pBT:Km#6からの2Kb Sma[/Bam旧断片を、35S: Bt6といわれるプラスミドを作るために3589発現カセット中に挿入する。 それぞれ突然変異をもつ、2つの機能的な合成りtクローンpBT:KM#6及 びpCI84414を、最初に得る。生来の遺伝子に比へて欧州トウモロコシ穿 孔性動物に対する昆虫生物検定内で100%の活性をもつpci84414は、 1323.1523、及び1634位において第三及び第四クォーター内に置換 突然変異を含む。 pcI84414を、先に記載したような2つのプラスミドMG3.G4#18 及びIHGから構築する。MG3. G4#18を、プラスミド旧、 P2#  1内のApal/Kpn l断片をpQcN103中にクローニングすることに より(上記と同じ制限部位を使用して)得る。この手順は、本遺伝子の第三及び 第四クォーターを含むプラスミドを作り出す。プラスミドIHGからの合成遺伝 子の第一半分を、BamHl及びNco tにより切断し、そして(本遺伝子の 第三及び第四りオーターを含む)MG、G4#]8中に動かす。 得られたプラスミドpci84414は、合成遺伝子の機能的変異体を含む。 機能的ではあるけれとも、このプラスミド中の合成遺伝子は、3つの誤り:13 26位(Cに置換されたG)、1523位(Gに置換されたA)、及び1634 位(Cに置換されたT)におけるものを含んでいる。 pcIB4414内の第四クォーターを、先に記載したように第四クォーターを ハイブリダイズし、結合し、そして制限解裂することから、そして2%アガロー ス・ゲルからその断片を単離することから得られた354塩基対の第四クォータ ーのApal/Bst E IIl断片置き換える。 pcI84408は、1)CI84414内の第四りオーター断片をハイブリダ イズされた第四クォーター断片と置き換えることにより得られる合成りt遺伝子 クローンである。この合成旧遺伝子の前にCaMV 35Sプロモーターを挿入 するために、pcI84406を、プラスミドp35SBt6からの4KbEc oNI/Kpn l断片から、そしてpci84408からの1.8Kb Ec oNI/Kpn l断片から作る。 pcI84406は、(その生来の遺伝子からの蛋白と比較して)ECBに対し て100%活性であるがロイシンのフェニルアラニンへのアミノ酸置換をもたら す1323位における合成遺伝子の第三クォーター内の置換突然変異を含む。プ ラスミドpBs1231113を、この突然変異を修復するために使用する。 プラスミドpB3123#13内の第三断片を、約479塩基対のハイブリダイ ズされたオリゴマー生成断片から作る。第三オリゴマーL115−020及びL i2−L21を、先に記載したようにキナーゼ処理し、ハイブリダイズし、そし て結合させる。PCR反応を、プライマーP5(a)及びP6(b)により15 サイクルのわたり先に記載したように行う。このPCR生成物を、約95μmの 容量中で最終濃度約50μg/mlにおいて37℃で30分間、その後65°C でIO分間ブロテイナカーKにより処理する(Crobe ej al、、 N ucle+c ACld Re5earch 19:184.1991.) o 次に、この生成物を、フェノール/クロロホルム抽出し、そして制限酵素Apa 1及びNco Iによる切断の前に標準的な手順を使用してエタノール沈降させ る。 約450塩基対のApal/Nco[PCR断片を、pit(Ga4からの3. 8KbのApa[/Nco[ベクター断片に結合させ、pBsI23#13を作 る。プラスミドpBs123#13は、そのNsp[部位における1319位か ら1493位におけるApa[部位まてのメイズ最適化crylA(b)遺伝子 の第三クォーターのための所望の配列を含む。プラスミドpBs123#13か らのこの170塩基対のN5pl/Apal断片を、プラスミドpci8441 8内の完全に活性な合成CryIA(b)遺伝子内で使用する。 ウェスタン・プロット分析: 様々な形質転換細胞のウェスタン・プロット分析を、選択プレート上で増殖させ た大腸菌(E、 coli)から得られた粗抽出物を使用して行う。つまようじ を使用して、集落を、37°Cにおいて一夜増殖させた問題の形質転換細胞を含 む新たなプレートからこそげ取る。大腸菌(E、coli)内の旧遺伝子の発現 のための陽性対照は、pci83069という構築物であり、植物発現性CaM V 35Sプロモーターと融合された生来のBt−に遺伝子を含む。また、pc IB3069は、ハイグロマイシン耐性遺伝子に作用可能な状態で結合されてい る35Sプロモーターを含み、この35Sプロモーターは、GtJS遺伝子に作 用可能な状態で結合されているAdhイントロン#1をもち、そして生来のBt  crylA(b) IPの生産をコードしている遺伝子に作用可能な状態で結 合されている。Bt遺伝子を含まない大腸菌(E、coli)の陰性対照も、こ の分析において含まれる。集落を、62mM Tris−HCI pH6,8, 1%SDS、0.0025%ブロモフェノール・ブルー、10%グリセロール及 び7.5%メルカプトメタノールを含む100μlの供給バッファ −(loa ding buffer)中に再懸濁させる。この混合物を、95°Cにおいて 10分間加熱した後、この調製物を、l−3秒間音波破砕する。この死骸を、室 温において約5分間マイクロフユージ内で遠心分離し、そして10〜15μmの それぞれのサンプルを、6%スタッキング・ゲル(stacking gel) の下方の10%ランニング・ゲルをもつアクリルアミド・ゲル上に供給する(L aemmIiu、 Nature 227+680−685(1970))。I OmAmpSにおいて一夜、電気泳動の後、蛋白を、そのゲルから踊mobil on膜(Mi 11ipore)に転移させる。この転移を、電気泳動Blot ting Llnit(American BioNuclear。 Emeryville、 CA)を使用して転移バッフy (20mM Tri s、 150mMグリシン、及び20%メタノール)中で1.5時間450mA mpsにおいて行う。 ウェスタン・プロッティングのためのバッファーはニブロッキング・バッファー :2%Tween−2030mM Tris−HCI pH10,2150mM  NaC1 洗浄バッフ−r−0,05%TWeen−2030mM Tris−HCI p H10,2150mM NaC1 展開バッフ−r −: 100mM Tris−HCI pH9,6100mM  NaC1 10mM MgC1を 転移終了後、この膜を、上記のブロッキング・バッファー中で約10分間インキ ュベートする。洗浄バッファーによる3回の15分間の洗浄を、第一抗体処理の 前に行う。第一抗体は、抗原としてCrylA(b)蛋白を使用して調製した免 疫アフィニティー精製されたウサギ又はヤギ抗体(Ciba−Geigy、 R TP、 N、C,: Rockland Inc、、 G11bertsvi1 1e、 PA、 : and Berkeley Antibody CO,、 Richmond、 CA、)である。 このcry[A(b)特異的抗体を、5μgの抗体を含む1ml容量中のBio −Radからの大腸菌(E、coli)溶菌物、その洗浄バッファー溶液中の5 0μlの大腸菌(E、 cot i)溶菌物により、使用直前に処理する。この 混合物を、洗浄バッファーによるl : 6000の最終希釈のためにそれを1 〜30に希釈する前に室温において1時間インキュベートする。第一抗体とのそ の膜のインキュベーションは、室温において1.5時間である。 3回の10分間洗浄を、第一と題意に抗体処理の間に行う。第二抗体は、ウサギ 抗−ヤギ又はヤギ抗−ウサギ/アルカリ性ホスファターゼ抱合体(conjug ate)(Sigma、 St、 Louis、λ(0)のどちらかである。 のアルカリ性ホスファターゼ抱合体とのインキュベーションを、洗浄バッファー 中の1〜6000希釈を使用して室温において1時間行う。 6回の10分間の洗浄を、第二抗体処理とウェスタン・プロット展開との間に行 う。このウェスタン・プロットを、70%ジメチル・ホルムアミド中の440μ mのニトロブルー・テトラゾリウム(nitrobluetetrazoliu m)(75mg/ml)及び100%ジメチル・ホルムアミド中の330μmの 5−ブロモ−4−クロロ−インドールイル−ホスフェ−) (50mg/ral )を含む100m1の展開(developing)バッファー中で展開させる 。 15〜30分間の展開後、この膜を水中で洗浄し、そして風乾させる。 例4.形質転換ベクターの構築 pcI8710及び誘導体の構築。 Ca、MV 35Sプロモーター・カセット・プラスミドpcI8709及びp cIB710をRothstein et al、、 Gene 53:153 −161(1987)中に示されるように構築する。pcIB710は、35S  RNA転写のためのCaMVプロモーター及び転写終止配列を含む[Cove y et al、、 Nucl、 Ac1ds、 Res、、 9:6735− 6747 (1981)] 。CaMV DNAの1149塩基対のBglil 制限断片[Hohn et at、、Current Topics in M icrobiology and Immunology、 96:194−2 20 and Appendices A to G (1982)中の塩基対 6494−76431を、先に記載したような分離用アガロース・ゲル電気泳動 によりCaMV DNAから単離する。この断片を、BamH−解裂プラスミド ptJc19 DNAと混合し、T4 DNAリガーゼにより処理し、そして大 腸菌(E、coli)に形質転換する(得られたプラスミド内のBamH[制限 部位がBgll+付着末端をBamHl付着末端に結合させることにより破壊さ れていることに注意のこと。)。 pUc+9/35Sという、得られたプラスミドを、次にオリゴヌクレオチド− 特異的インヒドロ突然変異誘発において使用し、このBamt([認識配列GG ATCCを、Hohnの文献中のCaMVヌクレオチド7483の直後に挿入す る。得られたプラスミドpcI8710は、BamH[制限部位により分けられ たCaMV 35Sプロモーター領域及び転写終止領域を含む。このBam81 部位中に挿入されたDNA配列は、これらのCaMV転写調節配列により植物内 で発現されるであろう。(pcIB710が転写の開始とBamH1部位との間 にいずれのATG翻訳開始コドンを含んでいないことにも注意のこと。) pcIB710を、BamH1部位内にpLG90からのハイグロマイシン・ホ スホトランスフェラーゼのためのコード配列を含むBamH1断片[Roths tein et al、、 Gene、53:153−161(1987)]を 挿入することにより修飾し、pcIB709を作る。 pcI8709を、標準的な突然変異誘発技術を使用してハイグロマイシン・ホ スホトランスフェラーゼの開始コドンから丁度上流のATGを除去し、一方この 位置においてBglll制限部位を挿入することにより、修飾し、pcI899 6を作る。得られたプラスミドpC!8996を、さらに修飾し、その開始コド ンのための、その開始コドンの5′に配置された5′未翻訳リーダー領域内のB amt([、Smal及びBg111部位を除去する。結果は、−TATAAG GATCCCGGGGGCA AGATCTGAGA TATG−Hygから− TATAAGGATCTGAGATATG−)1ygへのDNA塩基配列の変更 である。 得られたプラスミドは、pcI83073として知られている。 あるいは、pcI8710を、以下のパート4中に記載する645アミノ酸Bt コ一ド配列を含む、pc[B10/35SBtのBamt(I−Bcl [断片 を、pcIB710のBamH1部位中に挿入し、pc[B10/35SBtを 作ることにより、修飾し、11CI8900を作る。抗生物質耐性マーカーを導 入するために、pci8709を、5ailにより切断し、Kpn115alt アダプターを結合させ、そして得られた結合生成物をKpn Iにより切断する 。35S/ハイグロマイシン耐性遺伝子を含むpc[B709のKpn断片をp cIB710/35SBtのKpn]部位中に挿入し、pc[B900を作る。 選択マーカー遺伝子として有用な遺伝子は、Rothstein et al、 。 Gene、53:153−161(1987)中に記載されたハイグロマイシン 耐性遺伝子を含む。この文献中に記載されたハイグロマイシン遺伝子を。pUC プラスミド例えば、pcI8710又はI)CI8709中に移し、そしてこの ハイグロマイシン・ホスホトランスフェラーゼ・コード配列から上流の”余分な (extra)”ATGを除去し、I]C[8996を作る。この修飾されたp C[B996遺伝子を、さらに修飾し、分子生物学の標準的な技術を使用してそ の遺伝子の5′領域からBglll 、 Bam1(I及びSma [部位を除 去し、pcIB3073を作る。 pc[B932は、pUc19−ペースのプラスミドてあってキメラ遺伝子Pe p−C・プロモーター/Bt/Pep−C:ターミネーターを含むものである。 それは、pPEP−10、すなわち、ゲノム・クローン、旧−ラムダ−14,P NAS tJsA、 83・2884−2888(1986)の、光合成におけ るPEPカルボキシラーター素活性をコードしているメイズ遺伝子の、Hind lllサブクローンから、そしてpUc!8のBam81部位内のcrylAb エンドトキシン遺伝子の645アミノ酸の切り詰められた形態を含むBamHI 断片であるpcI8930から得られる断片から成る。 PEPカルボキシラーター伝子からのポリA付加部位を含むpPEP−10から の2.6kb EcoR[−Xho[断片を、単離し、そしてpstr及びt( incllにより消化する。この制限消化物を、Pstl/Hincll消化p Uc18により結合させ、大腸菌(E、coli)中に形質転換し、そして形質 転換細胞をplJc+8内に412塩基対のPs t 1−Hlnc [I挿入 物を含むものについてスクリーンし、そしてその挿入物を配列決定により確認す る。得られたプラスミドを、pcI8931 という。 ホスホエノールビルヘート・カルボキシラーゼ・アイソザイム(”Pep−C”  )をコードしている核遺伝子は、Hudspeth et al、、 Pla nt Mo1ecular BiologY、 12:579−589 (19 f39)中に記載されている。pcI8932を3つの断片の結合により構築す る。二〇PEP−C転写ターミネータ−を含む第一断片を、Hind目1により 、部分的にsph+によりpCI8931を完全に消化することにより作り、そ して3098塩基対の断片を単離する。Btエントトキソフンコート配列を含む 第二断片を、pC1B930をNco I及びSph[により消化することによ り作り、そして1950塩基対の断片を単離する。PEP−Cプロモーターを含 む第三断片を、Hind[[lにより、部分的にNco [によりpPEP−1 0を完全に消化することにより作り、そして2.3kbの断片を単離する。この 結合混合物を、大腸菌(E、coli)中に形質転換し、正しい挿入物をもつ形 質転換細胞を同定し、そしてこの挿入物を配列決定により確認する。 pcrB932を、Pvu[Iにより切断し、メイズPep−C:プロモーター /8t/Pep−C:ターミネータ−を含む4.9Kb断片を作り、そしてIX  TAE中の1%しGTアガロース・ゲル上で精製する。この線状のp(: [ 83079ベクター及びpc[B932からの4.9Kb挿入物をLGT中のT 4 DNAリガーゼを使用して結合し、pc[B4401を作る。。pcIB4 401は、キメラ遺伝子:35S:プロモーター/FAT/35S : ターミ ネータ−1Pep−C:プロモーター/at/Pep−C:ターミネーター、及 び35S:プロモーター/Adhl #lイントロン/GUS/35S : タ ーミネータ−を含むメイズの形質転換ベクターである。 pcIB246(35S−GLIS−35S)の構築CaMV 35Sプロモー ター・カセット、pc[B246を以下のように構築する。 CaMVゲノムのヌクレオチド位7482におけるDde [制限部位[Fra ncket al、、 Ce11.21:285−294(1980)]を、N eo [(CCATGG)部位、Sa l [(GTCGAC)部位、及びSs  t [(GAGCTC)部位を含む幾つかの制限酵素部位を含む48塩基対の オリゴヌクレオチドを挿入することにより修飾する。 この変更されたCaMV 35Sプロモーターを、そのベクターの5stl及び 5ail部位を破壊するように修飾されているpUc19ベクター中に挿入する 。したがって、l)C[B1500のCaMV 35Sプロモーターは、クロー ニングのためのユニーク5stl及び5ail部位を含む。 pclB1500を、5stl/Ncolにより消化し、そしてpB[221が ら得られるGUS遺伝子(Clontech Laboratories、 I nc、、 Pa1o Alto、 CA)と結合する。このNeo [部位を、 そのNco 1部位のATGがGUS遺伝子の翻訳のための開始コドンとして機 能するように、GUs遺伝子に融合させる。CaMV 35Sポリアゾニレ−ジ ョン及び終止シグナルを、このキメラ遺伝子の3゛末端のために使用する。 pc[B5069(35S−Adhl−GUS−35S)の構築pci8246 を、ノイズ・アルコール・デヒドロゲナーゼ遺伝子Adhlイントロン番号1( Adhl)(Dennis et at、、 Nucleic Ac1ds R e5earch。 12:3983−4000(1984))をpcI8246の5ail部位中に 付加することにより修飾し、プラスミドpcI83007を作る。Ad旧イント ロンを、Ba11/Pstl断片としてメイズAdhl遺伝子から切除し、Sm a[/Pstlにより切断されたpLlc18中にサブクローンし、Adh 1 026というプラスミドを作る。Adh +026を、Pvu I I/Sac  I Iにより切断し、その断片を、T4 DNAポリメラーゼにより平滑末端 とし、5ailリンカ−を、標準的な手順を使用して添加し、そして約560塩 基対の断片を、3%Nusieveゲルから回収し、そして5all切断/ホス フアタ一ゼ処理puctg中に結合する。得られたプラスミド内の5ail線型 化Adhイントロン#lを、5ailにより切り出し、ゲル精製し、そして5a il切断/ホスフアターゼ処理pci8246中に結合させ、プラスミドpci 83007を作る。 pcrB3007を、Pstlにより切断し、そしてその末端を供給者の仕様書 に従ってT4 DNAポリメラーゼ(New England Biolabs )を使用して平滑とする。得られた平滑末端分子を、5phlにより切断し、そ して1つの平滑末端及び1つのSp旧末端をもつ約5.8Kb断片を、標準的な 手順を使用して低ゲル化温度(LGT)アガロース・ゲル上で精製する。pcI B900を、Sma115phlにより切断し、そして35S/旧遺伝子を含む 断片を、LGTアガロース・ゲル上で精製する。この2つのゲル精製断片を、標 準的な条件に従ってT4 DNAリガーゼを使用してLGTアガロース中で結合 する。得られた結合断片を、標準的な手順を使用して大腸菌(E、coli)中 に形質転換し、そして得られたプラスミドをpcI83062という。2つの変 異体のpc183062が在る。pciB3062#1は、再生されたSma1 部位をもち、ここては、SmaI部位及びT4ポリメラーゼ平滑末端が結合され ている。この大部分は、たぶん、平滑化反応の間にPst1部位からの少ない塩 基対を少しずつかみ取るT4ボリメラーセから生じる。pC1B5062#3は 、このSma 1部位をもっていない。 pclB3062#3を、Kpn Iにより切断し、そしてT4 DNAポリメ ラーゼを使用して平滑末端とし、そして次に、Pvu I Iにより切断し、3 5S/GUS及び35S/B を遺伝子を含む平滑末端をもつ6.4にbの断片 を作る。この平滑末端断片を、Sma I切断pcIB3073中に結合させ、 pcIB3063及びpC[B5069を作る。pcIB3069は、pcIB 3063を作るために使用される同一断片を含むが、pc[B5069内のキメ ラ遺伝子はすべて、pci83063内のものと異なり、同一の相対的方向にあ る。これらの遺伝子は、先に記載したように、a)35Sプロモーターであって ハイグロマイシン耐性遺伝子に作用可能な状態で結合されているもの:b)35 SプロモーターであってGUS遺伝子に作用可能な状態て結合されているAdh イントロン#lをもつもの:及びc)35Sプロモーターであってバチルス・ス リンギエンシス(Bacillus thuringiensis)からの合成 crylA(b)殺虫性蛋白の生産をコードしている遺伝子に作用可能な状態で 結合されているもの、を含む。 GUS検定: GLIS検定を、Jefferson、 Plant Mo1. Bio、 R eporeter、5:387−405 (1987)中に記載されたよう本質 的に行う。先に示したように、プラスミドpcIB246は、G[JS遺伝子と 融合したCaMV 35Sプロモーターを含む。このキメラ遺伝子の5°未翻訳 リーダーは、メイズAdhlイントロン#1のコピーを含む。これを、ここては 、形質転換対照として使用する。同一量のpcIB246を、それぞれの形質転 換に添加するけれとも、計算された活性は、テストした81構築物の中で変動し た。 以下に報告する値は、3回繰り返しの平均である。pclB4407を、2回テ ストした。 pc[B5069 28nM MU/ ug1分間pciB4407 0.7o M MtJ/ μg/分間、2.3oM MU/ μg/分間。 手順書に従って欧州トウモロコツ穿孔性動物に対する殺虫活性について検定する 。 溶融人工昆虫食物を、60mmのGellmanのスナップ・キャップのペトリ 皿中に濯ぐ。凝固後、0.1%Triton X−100中に懸濁された大腸菌 (E、coli)細胞を、3 X 107細胞/cm 2の濃度においてその表 面上に拡げる。このプレートを風乾させる。10の第−令の(first 1n star)の欧州トウモロコシ穿孔性動物、0strinia nubilal isであって生後12時間未満のものを、次にその食事表面上に置く。テストを 、30°Cにおいて完全な暗闇内で2−5日間インキュベートする。このテスト の最後において、死亡率のパーセントを記録する。陽性クローンを、対照大腸菌 (E、 coli)細胞が0−10%の背景死亡率を与えるとき、50%以上の 死亡率を与えるものとして定める。 比較のために、pc183069内の生来のcrYIA(b)遺伝子を、上記と 同じ濃度においてテストする。クローンを、3 x 107細胞/cm ’食事 (diet) ; クローン当たり20昆虫においてテストする。 以下の結果を観察する。 クローン パーセント死亡率 対照 O pc 183069 100 pcrB4414 100 これらの結果は、合成crylA(b)遺伝子により生産された殺虫性結晶蛋白 がその生来のcrylA(b)により生産されたIPのものに比較しての欧州ト ウモロコシ穿孔性動物に対する活性を証明した。合成cry IA(b)遺伝子 を含む他のプラスミドを、同様のやり方で検定した。 たように、欧州トウモロコシ穿孔性動物のために使用したものと同し手順に従っ て、サトウキビ穿孔性動物(Diatrea 5accharalis)に対す る殺虫活性について検定する。結果を表中に要約する。 蛋白濃度(ng/g) パーセント死亡率crylA(b)LC50380 95%CI 249−646 上記の結果は、メイズ最適化Bt遺伝子により生産された殺虫性蛋白がサトウキ ビ穿孔性動物に対して有効であることを示している。 Cry[A(b)蛋白の最高濃度、すなわち、250ng/g−11000n/ gが、本発明に従ってトランスジェニック・ノイズ植物内で達成可能である。 例6: ノイズ・プロブラストの単離及び合成旧遺伝子による形質転合成りt遺 伝子の発現を、過渡的に形質転換されたメイズ・プロトプラスト内で検定する。 プロトプラスト単離手順: 1.10の2BaCtwo day old)のメイズ2717系6懸濁培養物 の中身を、ピペットて50m1の無菌チューブ内に入れ、そして沈殿させる。 培養基を次に取り出し、そして捨てる。 2、 細胞(3−5ml Packed Ce11 Volume)を、30m 1のプロトプラスト酵素溶液中に再懸濁させる。配合表(recipe)は以下 のようである。 3%セルラーゼR3 KMCバッファー中の1%macerozyme RIOKMCバッファー(l リッターのための配合表)KCI 8.65g MgC1□−682016,47g CaC12−2H2012,50g MES 5.0g pH5,6、滅菌濾過物 3、 細胞をよく混合し、そして100 x 25mmのペトリ皿中に、プレー ト当たり約15m1に部分分けする。旋回振どう機上で4時間振とうし、消化さ せる。 4、 使用のためにそれぞれ100ミクロン篩を通して10m1 KMCをピペ ットで取る。篩を通して皿の内容物を濾過する。等容量のKMCにより篩を洗浄 する。 5、 篩ったプロトプラストを注意して50m1のチューブ内にピペットで入れ 、そしてBeckman TJ−6遠心分離機内で10分間1000rp100 0rp g)により回転させる。 6、 上澄を取り除き、そしてペレットを10m1 KMC中で注意して再懸濁 させる。3つのチューブを合わせて1つにし、モしてKMCにより50m1まて の容量にする。 7、 上記の段階を繰り返すことにより再び、回転及び洗浄を行う。 8、 洗浄したプロトプラストのすべてを50m1 KMC中に再懸濁させる。 血球計数器(hemocytometer)内て計数を行う。プロトプラストを 回転させ、そして再懸濁バッファー(RSバッファー)中で8 x 10’/m lにおいて再懸濁させる。 RSバッファー(500mlのための配合表)マニトール 27.33g CaCL (0,1Mストック) 75m1MES O,5g pH5,8、滅菌濾過物 プロトプラスト形質転換手順: 1.50μgのプラスミドDNA(Bt IP構築物、合成(pC[B4407 )及び生来(pcIB3069)の両方)を15m1のポリスチレン培養チュー ブ内に部分分けする(Aliquot) o また、25μgGUS−含有ブラ スミドDNA(Bt IPを含まないもの)(pc[B246)をすべてのチュ ーブに部分分けする。 3回の繰り返しを、テストされるへき構築物毎に使用し、1回は、対照としてD NAを全く含んでいない。 旧構築物: G[JS構築物・ pCrB3069 pc [B246 pc[B4407 2、 プロトプラストを穏やかによく混合し、そしてチューブ毎に0.5mlを 部分分けする。 3、 それぞれのチューブに0.5ml PEG−40を添加する。 PEG−40: 0.4M マニトール 0、 IM Ca(NOx ) 2−4H20pH8,0、無菌濾過物 4、穏やかに混合し、プロトプラストとPEGとを一緒にする。30分間待つ。 5、 順次、1ml 、2ml 、及び5mlのW5溶液を、5分間の間隔をあ けて添加する。 W5溶液: 154mM NaC1 125mM CaCIz −H20 5mM KCl 5mMグルコース pH7,0、無菌濾過物 6、Beckman TJ−6遠心分離機内で10分間約1000rpm100 0rpにおいて回転させる。上澄液を取り除く。 7、1.5mlのFW培地中で穏やかにペレットを再懸濁させ、そして35 X  10mmベトリ皿内に注意してブレーティングする。 FW培地(lリッターのための配合表):MS塩 4.3g 200X 85 vies、 5ml シュクロース aog プロリン 1.5g マニトール 54g 2.4D 3mg pH5,7、無菌濾過物 8、 室温において暗室内で一夜インキユベートする。 9、 以下に記載するように、プロトプラスト抽出物に対して、GO3検定、昆 虫生物検定、及びEL I SA検定を行う。 ズ最適化配列を示している。先に記載した切り詰められた変異体は、第一の、約 2kbの上記遺伝子を現している。完全長遺伝子の残りを、先に記載したような 手順を使用してクローン化する。簡単に言えば、この手順は、長さ40〜9ON TのDNAオリゴマーの合成を、典型的には平均サイズとして80merの使用 を必要とする。このオリゴマーを、HPLCの標準的な手順又はポリアクリルア ミド・ゲルからの回収を使用して精製する。精製されたオリゴマーを、キナーゼ 処理し、そしてハイブリダイズさせ、約500塩基対の断片を作る。このハイブ リダイズしたオリゴマーを、標準的な条件下てPCRを使用して増幅することが できる。ハイブリダイゼーションから直接、PCR増幅から、あるいはハイブリ ダイゼーション又はPCR増幅のいずれかの後のアガロース・ゲルから、のいず れかから回収された500塩基対の断片を、次に、プラスミド中にクローン化し 、そして標準的な手順を使用して大腸菌(E、coli)中に形質転換させる。 所望の挿入物を含む組換えプラスミドを、PCR及び/又は標準的なミニスクリ ーン手順を使用して先に記載したように同定する。それらのPCR及び/又は制 限酵素のプロフィールに基づき正しいと思われる挿入物を、次に配列決定し、所 望のオープン・リーディング適化合成crylA(b)遺伝子であってノイズ内 の高レベルのCry[A(b)蛋白の発現に有用なものを作り出す。 生来及び合成りt遺伝子のG+C含量:完全長生来 38.8% 切り詰められた生来 37.2% 完全長合成 64.8% 切り詰められた合成 64.6%。 ”純粋な”メイズのコドンの用い方の遺伝子に比較しての、Bt遺伝子の最終的 な切り詰められた変異体の%相同性: 98.25%。 例8: 植物発現性完全長ハイブリッドの、部分的メイズ最適化cry IA( b)遺伝子の構築 pc184434は、約2Kbの合成メイズ最適化cry[A(b)遺伝子を含 んで成り、この遺伝子の残り(COO)(末端コード領域)は生来の遺伝子から 得られる。したがって、このコード領域は、合成遺伝子と生来の遺伝子との間の キメラであるが、得られた蛋白は、生来のcry[A(b)蛋白と同一である。 この合成領域は、ヌクレオチド1−1938(アミノ酸l〜646)からのもの であり、そしてその生来のコード配列は、ヌクレオチド1−3468(アミノ酸 647〜+155)がらのものである。この遺伝子の配列を、図7中に記載する 。pcUB4434のマツプを、図8中に示す。 以下のオリゴを、IIC[84434を作るために設計した:KEI34A28 =5’ −CGTGACCGACTACCACATCG ATCAAGTATC CAATTTAGTTGAGT−3’ KE l 35A28・5−ACTCAACTAA ATTGGATACT T GATCGATGT GGTAGTCGGTCACG−3’ KEI36A28・5’ −GCAGATCTGA GCTCTTAGGT A CCCAATAGCGTAACGT−3゜にE137A28=5−GCTGAT TATG CATCAGCCTAT−3゜にE138A28・5−GCAGAT CTGA GCTCTTATTCCTCCATAAGA AGTAATTC−3 ゜MKO5A28=5−CAAAGGTACCCAATAGCGTA ACG− 3’MK35A28=5−AACGAGGTGT ACATCGACCG−3゜ pci84434を、pcI84418からの5.7kb断片、346塩基対の sst E II/Kpn I PCR生成合成:生来融合断片、pc[B13 15からの108塩基対のKpn I/Nsi [生来CrylA(b)断片、 及び224塩基対のNsi [/Bgl II PCR生成断片の、4方結合を 使用して作る。結合及び形質転換のための標準的な条件は、先に記載したような ものと同じである。 合成・生来遺伝子融合断片を、PCRを使用して2段階で作る。第一の253塩 基対のPCR融合断片を、200nmのそれぞれのdNTP、 I XPCRバ ッファ −(Perkin Elmer Cetus)、20%グリセロール、 及び5ユニツトのTaqボリメラーターPerkin Elmer Cetus )を含む100μ+中に約200ngの生来のcrytA(b)テンプレートと 共に100ピコモルのオリゴKE134A28及びMKO4A28を使用して作 る。このPCR反応を、以下のパラメーターにより走らせる:94°Cて1分間 、55°Cで1分間、72°Cて45秒間、伸長3.3秒間、25サイクル。こ の第−PCR反応の分画(1%)を、200ngの合成crylA(b) DN Aと一緒にテンプレートとして使用し、完全な351塩基対の合成:生来融合断 片を作る。この第二PCR反応においてPCRプライマーとして使用するオリゴ は、50ピコモルのMK35A28.50ピコモルのMKO4A28 、及び2 5ピコモルのKE135A28である。このPCR反応混合物及びパラメーター は、先に列記したものと同じである。得られた351塩基対の合成:生来融合断 片を、50gg/mlの全濃度においてプロフィ−ルKにより処理し、そして標 準的な手順を使用してBst E II/Kpn [による切断の前にフェノー ル/クロロホルム抽出、その後のエタノール沈降を行う。 pcIB4434の調製において使用された224塩基対のNpi l/Bal  II PCR断片を、上記と同じPCR反応混合物及び先に列記したようなパ ラメーターを含む100μl容量中でテンプレートとして、100ピコモルのオ リゴKE137A28及びにE138A28及び200ngの生来のcrylA (b)遺伝子を使用して作る。230塩基対のPCR生来crylA(b)断片 を、プロティカーゼKにより処理し、フェノール/クロロホルム抽出し、そして Nsi [/Bal [1による切断の前に先に記載したようにエタノール沈殿 させる。 pC4B4434を、先に記載したようにメイズ・プロトプラスト中に形質転換 した。系62717ブロトブラストを、比較のための対照としてpcIB443 4及びpC/IB4419と共に使用した。結果を以下に示す:ng Bt/m g蛋白 4419(35S) 14.400±2.1004434(完全長)2.200 ± 900背景・未形質転換プロトプラストについて、13ng Bt/ mg 蛋白上記の結果は、pclB4434がpc[B4419の約15%のレベルに おいて発現していることを示している。 ウェスタン・プロット分析は、本系内のpcI84434により生産されたcr ylA(b)蛋白の少なくとも3分の1がサイズ約130kDであることを示す 。それ故、有意な量の完全長crylA(b)蛋白が、pci84434の発現 からノイズ細胞内で生産される。 例7: 温度耐性crylA(b)蛋白をコートしている完全長、crylA( b)遺伝子の構築 完全長のcrylA(b)遺伝子をそれぞれか含む構築物pcIB5511−5 515を、以下に記載する。これらの配列内ては、cry[A(a)及びcry lA(c)内には存在するがcrylA(b)内には存在しないアミノ酸793 及び794の間の26アミノ酸の欠失、KCGEPNRCAPHLEWNPDL DC3CRDGEか修復されていた。pcI85513内の遺伝子は、合成のも のであり;たの4つの遺伝子は、ハイブリットてあり、そしてそれ故、部分的に メイズ最適化されている。 pcI85511の構築 このプラスミドは、pci85511の誘導体である。pci85511のマツ プを図1O中に示す。2165と2590との間のDNAの435塩基対のセグ メン1〜を、切り詰められたcrylA(b)遺伝子の構築について先に記載し たように、上及び下ストランド(upper and lower 5tran d)を現すように設計された合成オリゴマーのハイブリダイゼーションにより構 築した。合成りNAのこのセグメントは、当業者に知られた標準的な技lus  thuringiensis) kurstaki HD−1内においてはcr YIA(b)蛋白内で天然に生しることか見つかっている上記の26アミノ酸の 欠失を含んでいる。DNAの完全な挿入セグメントは、アミノ酸をコードするた めのメイズ最適化コドン選択物を使用している。天然の欠失を修復するために使 用される26アミノ酸は、上記の断片内に含まれる。それらは、pcIB443 4のnt 2170におけるKpn [部位とnt 2058 (pcIB55 11内の2586)におけるXba 1部位との間の2387位において開始を 挿入されている。pci85511を、Sph[及びKpn [によるpc[8 4434の制限消化により得られた3、 2Kb断片、5phl及びXba l によるpci84434の消化により得られた3、 8Kb断片、及びKpn  l及びXba lにより、先に記載した合成りNAの消化により得られた416 塩基対の断片を使用した3方結合を介して構築する。酵素反応を、標準的な条件 下で行う。結合後、ンを含むL−寒天上で選択する。形質転換細胞内のプラスミ ドを、標準的なミニ−スクリーン手順を使用して特徴ずける。cry[A(b) 温度(熱)安定性蛋白をコードしている修復crylA(b)遺伝子の配列を、 図9中に記載する。 pci85512の構築 このプラスミド構築物は、pci84434の誘導体である。pcI85512 のマツプを、図12中に示す。26アミノ酸欠失を修復するためのDNAを、D NA合成及び酵素反応の標準的な技術を使用して調製する。3つの2本鎖DNA カセット、pGFcasl 、pGFcas2及びpGFcas3であってそれ ぞれ約300塩基対のサイズのものを、調製する。これらのカセットは、メイズ 最適化コドンを含みながら殺虫性蛋白と100%同じアミノ酸を維持するように 設計されている。これらのカセットは、1824位における制限部位BstEl lと2058位におけるXba Iとの間の領域を置き換えるために使用され、 そして失われた26アミノ酸(pcI84434中でpcI85511について 先に記載したもの)をコードしている追加の78塩基対の挿入を含んでいる。こ れらのカセットのそれぞれを、標準的な技術によりベクターBluescrip t(Stratagene)のEcoRV部位中に部位−ン化する。3つのカセ ットは、重複した制限部位を含むように設計されている。カセットlは、5′末 端における制限部位BstEI[及び3゛末端におけるEcoRVをもち;カセ ット2は、5′末端におけるEcoRV及び3゛末端におけるC1aIをもち、 そしてカセット3は、5゛末端におけるC1al及び3′末端におけるXba  Iをもつ。pCI85512を、この762塩基対断片を使用して結合させ、そ してBstEIIによるpCIB4434の完全消化及びXba Iによる部分 消化により得られた6、65にb断片とそれを結合する。あるいは、上記と同じ ベクターを使用した4方結合及び特異的酵素により消化した3つのカセットを使 用することができる。酵素反応を、標準的な条件下て行う。結合後、DNA混合 物を、標準的な手順を使用してコンピテント大腸菌(E、coli)細胞中に形 質転換させる。形質転換細胞を、100μg/mlアンピシリンを含むし一寒天 上で選択する。形質転換細胞内のプラスミドを、標準的なミニ−スクリーン手順 を使用して特徴ずける。得られたプラスミドは、pCI85512である。修復 crylA(b)遺伝子の配列を、図11中に例示する。 この修復されたcrylA(b)は、pci85511内で行われたものとは異 なっており、pc[B5511内ては、cry[A(b)コード領域のより大き な領域がメイズ好適コドンの使用によりノイズの発現のために最適化されている 。 pci85513の構築 このプラスミドは、pc185512から得られた修復されたcrYIA(b) 遺伝子を含んでいる。p(4B5513のマツプを、図14中に示す。2586 位におけるXba 1部位からこの遺伝子の末端(3572位における5g1u 部位)までの3′領域を、メイズ最適化コドンにより完全に置き換える。 この領域を、4つの2本鎖DNAカセット(カセット#4.5.6.7)として 、当業者に知られたDNA合成及び酵素反応の標準的な技術を使用して、合成す る。隣接するカセットは、カセット間の結合を容易にするための重複した制限部 位をもっている。これらは、カセット4の5゛及び3°におけるXba [及び Xho[:カセット5の、5゛及び3゛末端におけるそれぞれXho[及び5a ck:カセット6の、5′及び3゛末端におけるそれぞれSac I及びBst XI;及び、カセット7の、5′及び3°末端におけるそれぞれBstXI及び Bglllである。pcI85512のために記載したように、このカセットを 、Bluescriptベクター(S t ra tagene)の平滑末端E coRV部位中に部位−ン化し、そして完全長の“修復された”crylA(b )遺伝子を、Bluescript内の先のカセットの順次結合、その後の完全 967塩基対合成領域と、BglllによるpcI85512の完全消化及びX ba Iによる部分消化により得られた6448塩基対の断片との結合のいずれ かにより、クローン化する。あるいは、完全長遺伝子を含むプラスミドを、上記 の4つのカセットのそれぞれ(適当な酵素による解裂の後に)と上記と同じベク ターとの5−力結合により得る。二の完全長の、”修復された”crylA(b )遺伝子を、図13中に記載する。様々な合成及び合成/生来コード領域キメラ によりコードされている蛋白は、同一の蛋白をコードしている。この蛋白は、こ の相同的な領域をcry[A(a)又はcry[A(c)バチルス・スリンギエ ンシス(Bacillus thuringiensis)デルタ−エンドトキ シン(endotoxin(内毒素乃のいずれかと比較したとき、バチルス・ス リンギエンシス(Bacillus thuringiensis) からのc ry[A(b)遺伝子内に見つけられる天然の26アミノ酸欠失を修復すること により作られるcrylA(b)の熱安定性の変異体である。 pc[85514の構築 本プラスミドは、pcIB4434の誘導体である。pci85514のマツプ を図16中に示す。これを、26アミノ酸の熱安定性領域内にあるClal部位 (2396位)とpci84434内の2508位(pcIB5511内の25 86)におけるXba1部位との間の領域のメイズ最適化配列を含む合成りNA カセット#3(上記参照のこと)を使用して作る。pcI84434のnt 2 113と上記の熱安定性領域の連結部との間の領域を、以下のプライマーをもつ テンプレートとしてpcI84434を使用することによりPCR増幅する。 前進:5’ −GCACCGATATCACCATCCAAGGAGGCGAT GACGTATTCAAAG−3゜復帰:5−AGCGCATCGATTCGG CTCCCCGCACTTGCCGATTGGACTTGGGGCTGAAAG −3゛ PCR生成物を次に制限酵素kpnl及びC1alにより消化し、そしてC1a [及びXba [によるカセット3の消化により得られた189塩基対の断片、 5phl及びKpnlにより消化されたpci84434の3.2Kb断片、及 びsp旧及びXbaによる消化により得られたpc[84434の3.8にb断 片による4部反応において結合する。酵素反応を、標準的な条件の下で行う。 結合生成物を、アンピシリンにより選択されたコンピテント大腸菌(E、col i)中に形質転換し、そして先に記載したような標準的な手順を使用してスクリ ーンする。pcI85514内に含まれる修復されたcry [A(b)遺伝子 の配列を、図15中に示す。 pci85515の構築 pc[B4434を、先に記載した78塩基対のGe1ser熱安定性因子(G eiser TSE)を、生来のBtk領域内のKpn 1部位(2170塩基 対)とXba1部位(2508塩基対)との間に添加することにより修飾した。 正確な挿入部位は、ヌクレオチド#2379において開始される。Ge1ser  TSEを含む領域を、2セツトのPCR反応物、すなわち、にpnl−Gei ser TSE断片及びGe1ser TSE−Xbal断片により増幅した。 PCRブライv −#I:(Kpn1部位)5’ −ATTACGTTACGC TATTGGGT ACCTTTGATG−3’PCRブライ7−#2:(Ge iser TSEボトム)5−TCCCCGTCCCTGCAGCTGCA G TCTAGGTCCGGGTTCCACTCCAGGTGCGG AGCGCA TCGA TTCGGCTCCCCGCACTTGCCGATTGGACTT  GGGGCTGA−3゜PCRブライv−#3:(Geiser TSE )  ツブ)5’ −CAAGTGCGGG GAGCCGAATCGATGCGCT CCGCACCTGGAGTGGAACCCGG ACCTAGACTG CA GCTGCAGG GACGGGGAAAAATGTGCCCA TCATTC CC−3’PCRブライ7−#4:(Xba1部位)5°−TGGTTTCTC T TCGAGAAATT CTAGATTTCC−3’増幅後、PCR断片を 、それぞれ(Kpnl + C1al)及び(CIa[+ XbaI)により消 化させた。これらの2つの断片を、Kpnl及びXba [消化pc[B443 4に結合させた。得られた構築物pc[B5515は、Ge1ser TSEを もツpc[B4434であり、そして余分なClal部位がKpn I及びXb a [に隣接している。pcIB5515のマツプを、図38中に例示する。本 明細書中に含まれるcrylA(b)遺伝子であって熱安定性の(rylA(b )蛋白をコードしているものを、図37中に示す。 以下に述べる例9−20は、髄−好適(pith−preferred)プロモ ーターの単離及び特徴付けに向けられている。 例9: RNA単離及びノーザン・プロットRNAのすへてを、グリーンtzr ”tス条件下で栽培した植物から単離する。全RNAを、Kramer et  al、、 Plant Physiol、、 90:1214−1220中に記 載されたように、Funkメイズ系5N9840以下の組織から単離した・8、 比15.25.35.40、及び60日口のグリ−ジノ1ウスの葉、8、比15 .25.35.39.46.60及び70日口の髄;Funkメイズ系5N98 4からの60及び70日口の支詩板、60及び70日口の5N984鞘及び穂の ストック。また、RNAを、14日口の211D根から、そして受粉後1〜5週 間の間、1週間毎の発育種から単離した。ポリA + RNAを、Sambro ok et al、、 Mo1ecular Cloning: A Labo ratory Manual (2nd ed。 )、 +989により記載されているようなオリゴ−dTを使用して単離し、そ してまた、Sambrook et al、により、全RNA(30μg)又は ポlJA+RNA(2−10μg)のいずれかを使用してノーザン・プロ・ソト を行った。 電気泳動の後、RNAを、N1troplus 2000膜(Micron 5 eparationsInc)上にプロットした。このRNAを、Strata linker(Stratagene)を使用して0.2mジュールにおいてそ のフィルターに結合させた。このノーザンを、TBEバッファー系中の0.8% の低融点アガロースを使用して単離した1200塩基対のEcoRl髄(Trp A)8−2 CDNA断片によりプローブした。ノーザンをハイブリダイズさせ 、そして洗浄し、そしてこのフィルターをcDNAクローンの単離において記載 したようにフィルムに露出させた。 例10: cDNAクローンの単離 第一ストランドcDNA合成を、供給者(Life Technologies 、 Inc、。 Gaithersburg、 MD)により特記された条件を使用してBRL  AMV逆転写酵素を使用して行った。特に、50mM Tris−HCI pH 8,3,20mM KCI、1mM DTT 、 6mMλIgc12.1mλ (のそれぞれのdNTP、 O,1mMオリゴ(dt)12−18.2 μgの 髄ポリ(A+)RNA 、 100 μg/mlのBSA 、 50μg/ml のアクチノマイシンD、8ユニツトの胎盤性(place口tal)RNase インヒビター、トレーサーとしてのI u I (10mM Ci/ml) ”  P dCTP>3000 mCi/mM、及び30ユニツトのAMV逆転写酵 素を含む25μmの反応物を、42°Cにおいて30分間インキュベートした。 追加のKCIを、50mMの濃度まで添加し、そしてインキュベーションを42 °Cにおいてさらに30分間続けた。KCIを、再び添加し、100mMの最終 濃度にする。 他の成分に追加のlOユニットを加えたものの出発濃度を維持するために追加の AMV逆転写酵素反応バッファーを添加し、そしてインキュベーションを、42 °Cてさらに30分間続けた。第二ストランド合成を、EcoRI リンカ−を 含むRiboclone cDNA合成系(Promega、λ1adis。 n、 W[)を使用して行う。2本!JIcDNAは、Sambrook et  al、、中に開示されたようなTris−ボレー1− EDTAバッファーを 使用して1%アガロース・ゲル上でサイズ決定され、そして平均サイズ約1.2 Kbを示していた。このcDNAを、供給者(Schleicher and  5chuell)により特定された条件を使用して約1000以上の塩基対のそ れらの分子を保持するようにNA45 DEAE膜を使用してサイズ分画した。 サイズ分画されたcDNAを、Lambda Zap[[ベクター(Strat agene、 La Jolla、 CA)中に結合し、そしてGigapac k II Plus(Stratagene、 La Jolla、 CA)を 使用してラムダ粒子中にパッケージングした。この未増幅ライブラリーは、31 5.000pfuのタイターをもち、一方、増幅されたライブラリーは、PLK −F’細胞を使用して3.5ピリオン/mlのタイターをもっていた。 組換えファージを、150 x 15mm L−寒天プレート上に5000 p fuの密度においてブレーティングした。50.000ファージの全部を、それ ぞれのプレートから2連リフトを使用してスクリーンし、そして第一ストランド DNAのプローブを髄誘導mRNA又は種誘導mRNAのいずれかから作った。 このリフトを、ニトロセルロース・フィルターを使用してSambrook e t al、中に記載したように行った。DNAを、0.2mジュールにおいてS tratalinker(Stratagene、 La Jolla、 CA )を使用してtJV架橋形成によりこのフィルターに固定した。このフィルター の前ハイブリダイゼーション及びハイブリダイゼーションを、10XDenha rdts溶液、150 μg/ml剪断サケ精子DNA 、1%SDS 、50 mMリン酸ナトリウムpH7,5mM EDTA、6X 5SC10,05%ピ ロリン酸ナトリウムの溶液中で行った。前ハイブリダイゼーションは、62°C において4時間であり、そしてハイブリダイゼーションは、40m1の容量にお ける1 ミリオンcpm/mlにより、62°Cにおいて18時間(−夜)であ った。フィルターを、室温において15分間、2X 5SC10,5%SDSの 500m1中で、次に30分間、O,1X5SC10,5%SDS中で63°C において洗浄した。 放射ラベルされたDNAプローブを、BRLランダム・プライム標識付は装置を 使用して行い、そして非取り込みカウントを、N1ckカラム(Pharmac  ia)を使用して除去した。フィルターを、−80°Cにおける(Dupon t)Cornex Lightning Plus増感スクリーンにより、Ko dakX−Omat ARX−線フィルムに一夜露出させた。種誘導プローブと ではなく髄誘導プローブとのハイブリダイゼーションを示すプラークを、さらに 特徴付けするためにプラーク精製した。 例11ニゲツム・クローンの単離 Funk同系メイズ系211DからのゲノムDNAを、5hure et al l、 Ce11゜35:225−233(1988)により記載されているよう に単離した。このDNAを、Sau 3Aにより部分的に消化し、そして次にB eckman 5W40ローター内て22.00Orpmにおいて20時間、2 0″Cにおいて遠心分離した、1゜−40%シュクロース・グラジェント上でサ イズ分画した。9−23にbのレンジ内の両分をプールし、そしてエタノール沈 降させた。BamH[により切断されたしambda Dash l[(Str atagene)を、供給者により記載されているように使用した。このライブ ラリーを、未増輻スクリーンし、そして300.000pfuのすべてを、先に 記載した条件を使用してスクリーンした。このライブラリーを、髄特異的(Tr pA)cDNAクローン8−2を使用してプローブし、pcIB5600を、c DNAライブラリーの差異に基づくスクリーンにおいて同定した。単離されたク ローンを、プラーク精製し、そして大規模ファージ調製を、供給者により記載さ れているようなLambdasorb(From+4a)を使用して作った。単 離したゲノム・クローンを、EcoRIにより消化し、そして4.8kbのEc oRI断片を、BlueSCriptベクター(Stratagene)中にサ ブクローニングした。 例12: DNA配列及びコンピューター分析ヌクレオチド配列決定を、San ger et al、、 PNAS、74:5463−5467(1977)中 に開示さあれでいるようなジデオキシ連鎖停止法を使用して行った。配列決定プ ライマーを、標準的な条件を使用してAppliedBiosystems m odel 380B DNAシンセサイザー上で合成した。配列決定反応を、5 equence装置(US Biochemicaal Corp、)を使用し て行った。ゲル分析を、Tris−ボレート−EDTAバッファー中の7M尿素 を含む6%ポリアクリルアミドの40cmゲル(BRL Get−Mix 6) 上で行った。 配列の分析及びGeneBank内の配列との比較を、WiSConsin大学 のGenetic Computer Group 5equence Ana lysis Software(UWGCG)を使用して行った。 例13: 転写開始部位のマツプ作成 プライマー伸長を、Metraux et all、 PNAS、86:896 −900(1988)の手順に従って行った。簡単に言えば、30μgのメイズ 髄全RNAを、50mM Tris pH7°5.40m^IKcI、3mM  MgC12(RTバッファー)中で80°Cまて10分間加熱し、そして42° Cまで冷却することによりプライマーとアニーリングさせた。このRNA/プラ イマー混合物を、−夜ハイブリダイゼーションに供した。追加のRTバッファー 、6mMまでのDTT 、O,]mg/mlまてのBSA 、 4 U/mlに おけるRNA5in及び1mλ(におけるdNTP’ sをそれぞれ添加した。 次に、8ユニツトのAMV逆転写酵素を、添加し、そして反応物を、37°Cに おいて1時間静置した。使用したプライマーは、5−CCGTTCGTTCCT CCTTTCGTCGAGG−3°てあり、これは、上記の転写開始に比較して +90塩基対において開始させる。図29Aを参照のこと。プライマー伸長反応 におけるものと同じプライマーを使用した配列決定ラダ一つを、4.8Kbゲノ ム・クローンを使用して作り、その転写開始部位の決定を可能にした。この配列 決定反応を、例12中に記載したように行った。 RNase保護を、+2から+373塩基対(cDNAの開始)までの371塩 基対の配列が連続しているか又はそれが1以上のイントロンを含むかどうかを決 定するために使用した。図298に見られる転写開始に比較して+2塩基対〜+ 387塩基対にわたる385塩基対の5phl−Nco[断片を、pGEλl− 5Zf (+) (Promega)中にクローン化し、そしてSP6プロモー ターからのRiboprobe Gem1ni system(Promega )を使用して転写し、供給者により記載されているように放射性アンチセンスR NAプローブを作った。RNase保護を、Sambrook et al、中 に記載されているように行った。(Hpa [Eにより切断され、そして2”P −dCTPにより標識されている)pBR322及びKlenow断片を、分子 量マーカーとして使用した。ゲルは、6%アクリルアミド/7Mウレア(BRL  Ge1−Mlx 6)てあり、そして60ワツト定電力において走らせた。 例14ニゲツムのサザン・プロット ゲノムDNAを、5hure et al、前記の手順を使用してノイズ系21 】Dから単離した。8μgのゲノムDNAを、それぞれの制限酵素消化のために 使用した。以下の酵素を、供給者により提案されたバッファー中で使用した:  BamHr、EcoRr 、 EcoRV 、 Hind[[I 、及びSac  [。髄cDNAクローン数8−2を、遺伝子コピー数を推定するために使用し た。 消化したDNAを、Tris−ボレート−EDTAバッファー系を使用して0゜ 7%アガロース・ゲル上で走らせた。このゲルを、250mM HCIにより1 5分間、前処理し、高分子量DNAの転写を容易にした。このDNAを、Ni  troplus 2000Mに転写し、そして次に髄cDNA 8−2によりプ ローブした。このプロットを、例10中に記載したように洗浄した。 例15: PCRの材料及び方法 PCR反応を、GeneAmp DNA増幅試薬キット及びAmpliTaq組 換えTaq DNAポリメラーゼ(Perkin Elmer Cetus)を 使用して行った。反応条件は、以下のようなものであった:反応毎に使用する0 、1〜0.5μMのそれぞれの上記の2つのプライマー、Bluescript 内の25ngの髄4.8Kb EcoRI断片、加えて0.5mL GeneA mp反応チューブ(PerkinElmer Cetus)内の全容量50μl のための供給者により記載されているようなPCR混合物。DNA Therm al Cycler(Perkin Elmer Cetus)は、94°C6 0秒間の解裂、55°C60秒間のアニール、及び72°C45秒間、その後の 全30サイクルの間のサイクル当たり3秒間の伸長のために、設定された5te p−Cycleプログラムを使用していた。以下のプライマーのセットを使用し た: 1.83184.−429塩基対〜−2塩基対:1L49 X 73.− 69塩基対〜+91塩基対: IIl、 38 x 41. +136塩基対〜 +258塩基対:及びlV、 40 X 75. +239塩基対〜+372塩 基対。これらを、図24上にマークした。 例16:髄好適遺伝子の単離 cDNAライブラリーを、Lambda Zap中(−、クローン化された髄m RNAから得て、そして髄又は種mRNAから得られた第一ストランドcDNA を使用っしてスクリーンした。髄プローブのみと7%イブリダイズしたクローン をプラーク精製し、そして再びスクリーンした。第ニスクリーンを通過したクロ ーンを、各種ノイズ組織からのRNAを含む、ノーザン・プロットにおけるプロ ーブとして使用した。 例17:遺伝子構造及び配列分析 cDNAクロー:/8−2の1.2Kb挿入物を、Sanger et al、 、前記のジデオキシ法を使用して配列決定した。同様に、I)CI85601と して名付けたBluescript内の4.8にb EcoRI断片上に含まれ るゲノムの等傷物を、配列決定した。この情報は、このコード領域のゲノムのコ ピーがl。 7 Kbにわたり、そして5つのイントロンを含んでいることっを明らかにした 。このmRNA転写物は、6つのエクソンを現した。これを、図24中に示す。 このエクソンは、43塩基対から313塩基対までのサイズ内に範囲にあり、そ してイントロンは、76塩基対から130塩基対までのサイズ内で変動している 。この遺伝子の完全な配列及びその対応する推理アミノ酸配列を、図24中に示 す。 この遺伝子は、約38 kDの分子質量をもつ346アミノ酸の蛋白をコードし ている。表1中に示すように、予想される蛋白は。シュードモナス・アエルギノ サ(Pseudomonas aeruginosa)のサブユニット蛋白との 62%類似性(similarity)及び41%同一性(identity) を示しており、そして他の生物からのtrpA蛋白と高い相同性をもっている。 メイズTrpA遺伝子と他の生物との間のTrpA配列の保存比較生物 %アミ ノ酸 %アミノ酸 類似性 同一性 へ0フエラブクス・ fランノ (Haloferax volancii) 56.4 36.1メタノコフカ ス ・ ボルタエ (Methanococcus voltae) 58.1 35.1ツユ−ト モナス ・ アウルギノサ サブ力0ミセス ・ セレビシェ 類似性及び同一性は、tJWGcGからのGAPプログラムを使用して行った。 Crawford et al、、 Ann、 Rev、 Microbiol 、、 43:567−600 (1989)であって本明細書中に引用により取 り込むものは、バクテリアtrpA遺伝子内の変換されたアミノ酸の領域を発見 した。TrpB配列内に見られるよりも大きな変異性(variabi 11t Y)を示す、遺伝子の休止をもつ、アミノ酸49〜58、アミノ酸181−18 4 、及びアミノ酸213〜216が存在する。メイズTrpA蛋白(示されて いない)をもつ知られたtrpA蛋白の列は、ノイズ遺伝子と他のけpA蛋白と の間の相同性がかなりのものであることを説明している。また、それは、他のT rpA蛋白が互いにCrawford et al、、前記中に記載されたよう に比較されたとき、観察される相同性のレベルに匹敵する。 転写開始部位の位置を、そしてこの領域にイントロンが存在するかどうかを決定 するために、領域−429塩基対から+372塩基対までの約122塩基対〜4 27塩基対の4つのポリメラーゼ連鎖反応(PCR)生成断片をJメーザ2分析 のために使用した。ノーザンの結果は、PCRプローブ11、+11 、[Vが 髄の全RNAにハイブリダイズし、そしてPCRプローブIがハイブリダイズし ないことを示した。これは、その転写開始が一69塩基対〜+90塩基対の領域 内にあることを示していた。その転写開始部位をより正確に位置決めするために 、プライマー伸長を使用した。図29Aは、転写開始に比較して+90塩基対に 位置するプライマー(#73)がプライマー伸長のために使用されるとき、その てんしゃあ開始部位が+11すなわち、そのゲノム配列上の726塩基対に位置 していることを示している。 転写開始部位からの第一のATGは、+114塩基対にある。これは、翻訳開始 のための部位として役立つと予想されるであろうATGである。このATGは、 cDNAクローン内で見つかったオーブン・リーディング・フレーム中に走り込 むオープン・リーディングを開始させる。 この予言オーブン・リーディング・フレームの第一の60アミノ酸は、クロロプ ラスト過渡的ペプチドに強く類似している。BerLyn et at。 、 5:9−13 (1986)を参照のこと。この結果は、この蛋白がブラス チドに対して標的化されており、そしてたぶん活性蛋白を作るように加工される ということを示唆している。trpAプロモーターにより駆動されたメイズ最適 化B、 t、遺伝子を使用したメイズ葉肉(mesophyll)プロトプラス ト系における過渡的発現検定は、+114塩基対におけるATGがその融合点と して使用されるとき、最も高いレベルの発現が得られるということを示していた 。その配列内の次の2つのATGのいずれかの使用は、そのリポータ−遺伝子の 発現のレベルを実質的に減少させる。+390塩基対におけるATGは、いくっ がの活性を与えるが、+114 ATGよりも非常に低いレベルであり、そして +201塩基対におけるATGは、活性を全く与えない。 多数のTATA様ボックスが+1塩基対における転写開始部位の上流に配置され ているけれども、−132塩基対におけるTATAATは、TATAAAの植物 コンセンサスに非常に類似している。Joshi、 Nuc、 Ac1ds R es、。 15:6643−6653 (+987)を参照のこと。仮定のCCAAT様ホ ックスは、−231塩基対において発見された。ATG開始の周囲のヌクレオチ ド配(1983)中に記載されているような他のメイズ翻訳開始に対する相同性 をもつか、植物内のコンセンサス配列と考えられるもの(ANNATGGC)と は異なっている。Joshi、上記を参照のこと。仮定のポリ(A)付加シグナ ルは、そのゲノム配列上の3719塩基対、cDNAの末端から522229− 2240 (+986)を参照のこと。そのcDNAの3°未翻訳配列は、その ゲノム配列上の3775塩基対において終了する。 図28は、髄遺伝子8−2 cDNAを使用して再構築されるときの、おおよそ の遺伝子コピー数をもつメイズ211DゲノムDNAのサザン・プロットを示し ている。制限消化及び再構築からは、ハブロイド・ゲノム毎に存在するl−2コ ピーの遺伝子が存在するよっである。この遺伝子と低いレベルの相同性をもつ他 の遺伝子は存在しないようである。それ故、これは、メイズ内においてユニーク 又は少数の遺伝子ファミリーを現している。 例18: RNase保護 mRNAの5゛末端の構造を、RNase保護を使用して決定した。RNase 保護を、+2塩基対から+387塩基対までの385ntを現しているプローブ を使用して行った。このゲノム・クローンからの上記領域を、RNA転写ベクタ ーpGEM−5Zf (+)内に配置し、そしてj2p標識RNAプローブをS P6ポリメラーゼを使用して作った。このプローブ及び多クローニング部位から の余分の塩基は、461 ntの転写を作り出す。このプローブを、金儲RNA とハイブリダイズし、そしてその後RNaseAとTIとの混合物により消化し 、そして保護断片を、変性ポリアクリルアミド・ゲル上で分析した。このゲルの 分析は、約355 ntの保護断片及び約160 ntの他の断片を示している 。図29Bを参照のこと。 +80塩基対におけるプライマー(#73)を使用したプライマー伸長が長さ9 0 ntの生成物を作り出すという事実は、その転写の5′末端が+I塩基対の 位置にあるということを立証している。この領域内のプライマーからのプライマ ー伸長は、生成物を作り出し、そのように、ある者は、これがまたRNase保 護検定により検出されることを予想するであろう。このプライマーは、RNas e保護プローブの5′領域内に位置している。このcDNAクローンは、RNa se保護プローブの3′末端内に存在する配列を含み、そしてこの故にこの検定 において保護されることが予想された。ただ1つのバンドが、これらの配列の両 方を説明することができるであろうゲルの上に存在するので、我々は、保護断片 が実際、より大きなバンドであり、そしてより小さな単一バンドか人工産物であ ることを確信している。この領域内にイントロンがある場合には、それぞれの末 端からの断片は、そのプローブ内に存在するであろうし、そしてこれ故にそのゲ ル上で検出可能であろう。観察された2つのバンドの中で、それらの中の1つは 、完全な5°領域を現しているようであり、それ故、我々は、この領域内に位置 するイントロンがあることを信じていない。 例19:髄cDNA 8−2による大腸菌(E、 coli)TrpA突然変異 体の相補性であってMayer et al、、λlo1. Gen、 Gen et、、 137:131−142(1975)中に記載されているような染色 体マーカーglnA3 、TrpA9825、I−、IN(rrnD−rrnE ) 、thi−1をもつものを、髄(TrpA)cDNA 8−2又はSamb r。 ok et al、、前記中に記載されているようなり1uescriptプラ スミド(Stratagene)のいずれかにより形質転換した。TrpA c DNA 8−2を含む形質転換細胞は、最小培地上のトリプトファンの存在なし て増殖する能力をもち、一方、Bluescriptプラスミド(Strata gene)による形質転換細胞又は非形質転換対照は、トリプトファンなしては 増殖することができなかった。メイズTrpA遺伝子により形質転換された細胞 は、非常にゆっくり増殖し、コロニーは、室温において数日間の増殖の後見える ようになった。すべての株を、20μg/mlのグルタミンの有無にかかわらず 200μg/mlグルタミン、0.O1μg/mlチアミンを補われたM9最小 培地上で増殖させた。形質転換細胞のすべてを、制限酵素分析により適切なプラ スミドの存在についてチェックした。 トリプトファンの存在中で増殖するコロニーは、すへて、サザン・ハイブリダイ ゼーションにより確認するように(データを示さず)、推定のメイズTrpA遺 伝子のためのcDNAを含むクローン8−2を含んでいた。これらの結果は、こ れがノイズ・トリプトファン・シンターゼ・サブユニットA蛋白であるという結 論を支持している。 例20:遺伝子発現 植物の全体にわたる髄−選択的(pi th−preferential)遺伝 子の発現パターンを、調査した。また、異なるノイズ遺伝子型を、この遺伝子の 発現のパターンについて調査した。以下の組織を、これらの研究のためのRNA 源として使用した:遺伝子型5N984内の、髄の上部、中央、及び下部(up per、 m1ddle、 and lower pith) 、支詩板(br ace [oats) 、穂(ear) 、葉柄(shank) 、穂軸(co b) ;遺伝子型211D内の、植物全体からの、髄の上部、中部、及び下部、 10日目の葉(lOday old 1eaves) 、14日目の根及び髄、 そして受粉後1〜5週間の1週間毎に収穫された遺伝子型2110からの種。髄 下部は、支詩板の上方の2つの部間(internode)から生じており、す なわち、構成されており:髄中部は、次の3つの部間から生じており;髄上部は 、60及び70日目の植物の雄穂(tassel)の前の最後の2つの部間を現 している。2つの部間のみが、39日目の植物内に存在し、そして46日目の植 物については3つの部間が在る。ノーザン・プロット分析は、髄cDNAから得 られたプローブとハイブリダイズする転写物が若い髄及び若い葉内て急激に蓄積 することを示している。植物の齢が増し、そしてそれが茎(stalk)まて成 長したとき、検出される転写の量における存意な減少が在る。図25A−Dを参 照のこと。種誘導体RNA内で検出されたの遺伝子からのメツセージ、すなわち 、全RNA又はポリA + RNAのいずれかは、全くない。図26を参照のこ と。また、転写は、根、穂葉柄、及び靴内て検出されたが、髄及び幼葉組織内で 検出されたような高いレベルではなかった。図25B 、25Cを参照のこと。 いくつかのメツセージは、支持機内で検出されるが、非常に低いレベルであった 。図25Dを参照のこと。6つのノイズ未分化カルス系を、ノーザン・プロット により分析し、そしていずれのカルス・サンプル内においてもこの遺伝子につい ての発現は全くなかった(データを示さず)。この遺伝子の発現のレベルは、非 常に高い。 なぜなら、TrpA遺伝子8−2からのプローブに対する非常に強いシグナルを 、フィルムに対するこのプロットの露出の後の2時間程の少ない時間の間に髄及 び葉内て検出することができる(図21A)。作られたmRNAの量は、Hud speth et al、、 Plant Mo1. Biology、12: 579−589 (+989)、他の高発現ノイズ遺伝子(Hudspethを 引用により本明細書中に取り込む)中に開示されているようなノイズ・ホスホエ ノールピルベート・カルボキシラーゼ遺伝子から生じたものに匹敵する。 この遺伝子の発現パターンは、一時的に一定ではない。発現は、60日日目満の 植物の髄下部及び中部内で非常に高く、そしてその植物の頂上付近で急激に減少 している。植物が成熟に達したとき、例えば、70日ID超えるとき、この発現 は、髄下部及び穂葉柄を除き、はとんど検出できないレベルまで低下する。幼葉 内の転写物の蓄積は、髄下部内で見られるものとほとんど同じ程高いが、発現は 急激に減少し、そして40日齢を超える葉内では検出てきない。葉内の発現は、 それが成長するときの季節に依存して変動することが見つけられた。 以下に述へる例21−39は、本発明に記載の花粉特異的プロモーターの単離、 特徴付は及び発現に向けたものである。 花粉特異的蛋白の同定 例21: メイズ植物の成長 メイズ植物(Zea mays Funk 1nbred 211D)を、グリ ーンハウス内でバーミキュライト/砂混合物内で、明16時間/暗8時間の管理 下で種から栽培した。 例22:全花粉蛋白の単離 成熟した花粉を、最大花粉はしけ軸aximum pollen 5hed)の 時間においてメイズ植物から単離した。それを、殻を除去するために篩、液体窒 素内で凍結させ、そして3−4m1容量の凍結花粉を、すり鉢内で粉砕し、そし て等容量の75−150μmのガラス・ビーズで擦った。 40m1の粉砕バッフ−r−(2mM EDTA 、 5mM DDT 、 0 .1%SDS、 100mM Hepes pH8)を添加し、そしてこの混合 物を再び粉砕した。ガラス・ビーズ及び無傷の花粉粒を、低速遠心分離によりペ レット化し、そして混合物を、10.000 gで15分間、遠心分離により清 澄化した。蛋白を、90%までアセトンを添加することによりその上澄液から沈 殿させた。 9−178 (1985)中に記載されているようなノイズ2110はじけ花粉 から単離した。 例24:葉蛋白の単離 幼葉(約60%成長)を、ノイズ植物から切り、その中央脈(midrib)を 除去した。全蛋白を、花粉についてと同じように単離した。但し、その材料を、 凍結せず、そして粉砕は、ガラス・ビーズを伴わないWaringブレンダー内 でのターであった。 例25:粒(kernel)蛋白の単離穂が十分に成長しているが未だ湿ってい る粒を、その植物から取り除き、そしてその粒を、メス(scalpel)で切 断した。全蛋白を、葉についてと同しように単離した。 ew York (1989)中に記載されているようにSOSポリアクリルア ミド・ゲル上て分離した。Coomasieブルーによる染色の後、花粉、葉及 び粒からの蛋白バンドを、比較し、そして約10 kD 、 13kD、20k D、45kD、55kD及び57kDの大量の蛋白が花粉特異的であることが測 定された。 花粉特異的cDNAクローンの同定 例27 花粉特異的蛋白の部分的配列の決定花粉特異的であることが決定された 蛋白バンドを、PVDF膜上のポリアクリルアミド・ゲルからのエレクトロブロ ッティング(λ1atsudaira、 P、、 J、 Biol、 Chem 、 261+10035−10038(1987))により又は逆相HPLCに より精製した。この精製された蛋白のN−末端配列を、Applied Bio systems 470A気相シーケンサ−による自動エドマン分解により決定 した。フェニルチオヒダントイン(PTH)アミノ酸を、Applied Bi osystems 120A PTHアナライザーを使用して同定した。内部配 列を得るために、蛋白を、酵素:基質比1:10を使用して室温において、0. 1M Tris−HCI 、 p)I 8.5中で、24時間、エンドプロティ カーゼLys−C(Boehringer Mannheim)により消化した 。得られたペプチドを、0.1%TFA中の、線型アセトニトリル/イソプロパ ツール(1:l比)グラジェント(0〜60%)による溶出させるAquapo re C−8カラムを使用したHPLCにより単離した。単離したLys−Cペ プチドの配列を、上記のように決定した。以下の配列を、13kDの花粉特異的 蛋白について決定した: N−末端: TTPLTFQVGKGSKPGHLILTPNVATrLysC 61: KPGHLILTPNVATISDVVIにLysC54: 5GGT R[ADDVIPADFKLysC49: EHGGDDFSFTLKLysC 43: EGPTGTWTLDTK合成 低コドン冗長性(codon redundancy)をもツ13kD蛋白内の ペプチド配列の領域を、選択し、そしてこれらの領域をコードしている遺伝子の ための好適なオリゴヌクレオチド・プローブを、Applied Biosys tems 380Aシンセサイザー上で合成した。以下のオリゴヌクレオチドを 、合成した: すりゴ#51 5’ −AA ATCATCACCACCATG TTC−3゜ GGGC 才IJゴ#58 5−CCTTT ACCCACTTG AAA−3’CG C G に こで、ヌクレオチドの列は、そのオリゴ内の図示した位置において等しい割合で ランダムに取り込まれている塩基を表している。オリゴ#51は、ペプチド1y sc 49内て見っがったアミノ酸配列EHGGDDEをコードしており、そし てオリゴ#58は、ペプチドN−末端内で見つかったアミノ酸配列PQVGKG をコードしている。花粉特異的遺伝子のためのcDNAライブラリーをスクリー ンするためのこれらの混合オリゴヌクレオチドの使用を以下に記載する。 匹η:メイズ花粉cDNAライブラリーの構築ノイズ21+Dはじけ花粉からの 全メイズRNAを、G11isen et al、 Biochemistry  13:2633−2637 (1974)中に記載されているように単離した 。ポリA + mRNAを、Sambrook et al、中に記載されてい るように全RNAから精製した。このmRNAを使用して、cDNAを、そのキ ットと共に供給された手順書に従って、Promegaから購入したcDNA合 成キットを使用して調製した。このEcoRI リンカ−を、このcDNAに添 加し、そしてそれを、Stratageneから購入したクローニング・ベクタ ー・ラムダZap中に、製造者により供給された手順書に従って結合させた。こ の結合生成物を、これもまたStratageneがら購入したcol丑BB4 細胞に感染させるために使用した。 ノイズ花粉cDNAライブラリーを、Sambrook et al、中に記載 されているように、13kD蛋白遺伝子に特異的な合成オリゴヌクレオチド・プ ローブを使用してプローブした。簡単に言えば、花粉cDNAライブラリーの約 100.000のファージ・プラークを、ブレーティングし、そしてニトロセル ロース・フィルターに移す。このフィルターを、ポリヌクレオチド・キナーゼを 使用して22p末端標識されているオリゴヌクレオチド#51及び#58を使用 してプローブした。このプローブを、低いストリンジエンシー(IM NaC1 ,10%硫酸デキストラン。 0.5%SO3中、50°C)においてそのフィルターにハイブリダイズし、室 温において、そして次に、6X SSC,0,1%SDS中で45℃において3 0分間洗浄し、そして陽性クローンを同定するためにX−線フィルムに露出させ た。推定クローンを、4ラウンドのプラーク・ハイブリダイゼーションを通して 精製した。3クラスのcDNAクローンを、単離した。タイプ1は、0.2kb 及び1.8kbのEcoRI断片を含んでいた。 タイプ11は、0.6kb、0.5kb及び1.okbのEcoRI断片を含ん でおり、そしてタイプlr[は、2.3KbのEcoRI断片を含んでいた。 (M31 花粉特異的cDNAクローンの特徴付はタイプIf cDNAクロー ンのEcoRI断片を、Stratageneがら購入したプラスミド・ベクタ ーpBluescript SK+中にサブクローン化した。 図30を参照のこと。pBIuescript内の0.6kb断片を、11−. 6と名付け、pBIuescript内の0.5kb断片を、[[−15と名付 け(その後、pCIB3169と名付けた)、そしてpBIuescript内 の1.Okb断片を、rl−1,0と名付けた(その後、pC[B5168と名 付けた)。以下に記載するように、この0.5kb及び0.6kbの断片は、メ イズ花粉特異的CDPK遺伝子をコードしている。Fj(anther)、花粉 、葉、根、毛(silk)からのRNAを、グリオキサル(glyoxal)に より変性させ、1%アガロース・ゲル上で電気泳動にかけ、ニトロセルロースに 転写し、そしてsambrook et al、 Mo1ecular Clo ning、 A Laboratory Manual、 Co1d Spri ng Harbor Laboratory Press: New York  (1989)中に記載されておるように、ランダム・プライマー伸長により2 xpにより標識されている3つのEcoRI断片により別々にプローブした。こ のプロットを、X−線フィルムに露出させ、そして約1.5kbのmRNAバン ドを、0.6kb断片プローブにより同定し、一方、0.5kb及び1.Okb 断片を、約2゜Okb mRNAとハイブリダイズした。すへての場合において 、ハイブリダイゼーションは、花粉RNAレーン内てのみ見られた。但し、0゜ 6 kl)断片は、1mRNA内でわずかなシグナルを示した。これらのデータ からの結論は、元のcDNAクローンは、2つの異なるmRNA5から生じた融 合cDNA分子であったということである。この0.6kb断片は、1.5kb 花扮特異的mRNAの部分的cDNAてあり、そしてこのmRNAは、ペプチド LysC49及びN−末端をコードしている。1.0及び0.5kb断片は、そ のペプチド及びプローブとして使用されたオリゴヌクレオチド・プローブに無関 係な2.Okb花粉特異的mRNAの部分的cDNAを含んて成る。この結論は 、その断片をSambrook et al、中に記載されているようなジデオ キシ連鎖停止法を使用して配列決定したときに確認された。このcDNAを図3 1中に示す。 例32: mRNA発現の特異性の測定cDNAクローンpci83169及び pci83168により表される2、Okb RNAか花粉内にたけ存在するか どうかを決定するために。全RNAを、メイズ211Dの、根、葉、花粉、朽又 は毛から単離した。このRNA5を、グリオキサルにより変性させ、1%アガロ ース・ゲル上で電気泳動にかけ、ニトロセルロースに転写し、そしてすへて、s ambrook et al。 Mo1ecular Cloning、 A Laboratory Manu al、 Co1d Spring Harbor Laboratory Pr ess: New York (1989)中に記載されておるような標準的な 技術を使用して、プラスミドpctB3168又はpc[B5169からの11 1p標識EcoR[挿入物によりプローブした。このプロットを写真フィルムに 露出させることは、これらの2つのクローンにより表された遺伝子が花粉内で転 写についてのみ活性であるということを証明している(図32)。 花粉特異的プロモーターの同定 例33: メイズ・ゲノムDNAライブラリーの構築メイズ系211D幼い苗条 (shoot)からのゲノムDNAを、5hure et al、 Ce113 5:225−233 (1983)中に記載されているように単離した。 このDNAを、Stratageneに提供し、そこで、ゲノムDNAライブラ リーを、5au3A I部分消化DNAをStratagene’s Lamb da Dashクローニング・ベクター中にクローニングすることにより構築し た。 メイズ系2110からのゲノムDNAを、多数の制限酵素により消化し、個々の 消化物をアガロース・ゲル上で電気泳動にかけ、ニトロセルロースに転写し。そ してSambrook et al、中に記載されているような標準的な技術を 使用してプラスミドpc[B5168(1,oi<b断片’) 、pcIB31 69(0,5kb断片)又はクローンIt−,6からの32p−標識EcoR[ 挿入物によりプローブした。10以上のバンドを、最も多い消化物条の[[−。 6ブローブにより検出し、このcDNAが大きな多遺伝子ファミリーから生じて いることを示している。1.Okb断片によるブロービングは、3から6までの バンドを検出し、そして0.5kb断片によるブロービングは、1.Okb断片 により検出されたもののサブセットである1から3までのバンドのみを検出した 。この1.Okb及び0.5kb断片により検出された、より小さな遺伝子ファ ミリーのサイズのため、それらに対応するゲノム・クローンの単離を試みること を決定した。 例35・花粉特異的ゲノム・クローンの単離Stratageneメイズ211 Dゲノムライブラリーを、そのライブラリーと一緒に、Stratageneマ ニュアル中に記載されているような標準的な手順を使用してプラスミドpcI8 3168(+、 Okb断片)及びpclB3]69(0゜5kb断片)からの 32p−標識EcoRI挿入物によりプラーク・リフト(plaque 1if ts)をブロービングすることにより、スクリーニングした。 この戦略を使用して、ラムダ・クローンMG14を、単離し、そしてそれを両方 のプローブとハイブリダイズさせた。これもまた両方のプローブにハイブリダイ ズするMG14の9.Okb Bam旧断片を、pBluescript SK +のBamH1部位中にサブクローン化し、プラスミドpci8379を作った 。cDNA配列に対応する領域内の1800塩基対のpcIB379を、先に記 載したように配列決定した。cDNAとゲノム配列との比較は、たった91%の 同一性を示した。pci8379挿入物は、関連花粉特異的遺伝子を表している 。 第二ノイズ2+1Dゲノム・ライブラリーを、Promegaマニュアル中に記 載せれている手順を使用して、Promegaから購入したベクター・ラムダG EM−11中に構築した。上記のようにこの未増幅ライブラリーをスクリーニン グすることは、クローンGEMII−1を作り出し、これを、0.5と1.Ok bとの間のプローブにハイブリダイズさせた。両方のプローブにもハイブリダイ ズするGEMII−1の20kb旧ndlll断片を、pBluescript  Sに+のHind[11部位中にサブクローン化し、pcIB3166を作っ た。4. lkbのpc183166のDNA配列が、決定され(図36)、そ してそのゲノム・クローン内の6つのイントロンを数えた後、pci83168 及びpcIB3169のcDNA配列と100%同じであった。Genbank /KMBLデータベースとpci83166との比較は、その5°部分が3つの エクソンを通して、そのアミノ酸レベルにおいてラットのカルモジュリン依存性 蛋白キナーゼ11に34.6%同してあったということを(図33)、一方、第 7エクソンを通しての第四がラットのカルモジュリンと39゜4%同じであった ということを明らかにした(図34を参照のこと)。 他の花粉特異的キナーゼは、全く記載されておらず、そしてこの時、この、キナ ーゼとカルモジュリン・ドメインとを結合する蛋白は、知られていなかった。そ の後、Harper et al、、 5cience 252;951−95 4 (1991)か、大豆からの類似の蛋白のcDNA配列を開示したが、この 遺伝子は、発現において花粉特異的ではない。大豆カルシウム依存性蛋白キナー ゼ(CDPK)とノイズ花粉CDPKとの比較は、そのアミノ酸レベルにおいて 38%同じてあった。図35を参照のこと。 気凹ニプライマー伸長によるプロモーターの転写開始部位の同定以下の配列をも つオリゴヌクレオチドPH51を、プライマーとして合成した・ 5’ −TGGCCCATGGCTGCGGCGGGGAACGAGTGCGG C−3’。プライマー伸長分析を、Metraux et al、、 PNAS  tlsA 86:896−890(1989)中に記載されているようにポリ A十花粉mRNA上で行った。この転写開始部位は、図36中に示すpc183 166の部分配列上の塩基1415と1425との間にあることが決定された。 トランスジェニック植物内におけるプロモーター機能のテスト花粉CDPKプロ モーターがトランスジェニック植物内の結合遺伝子の発現を駆動することがてき るとういことを証明するために、大腸菌(E、coli)のヘーターグルクロニ ダーゼ遺伝子への花粉CDPKプロモーターの遺伝子融合物を、以下のように構 築した。第一エクソンを含むラムダGEMIIIからの10kb Bam旧断片 及び花粉CDPK遺伝子の第一イントロンの部分これに加えてこの遺伝子の9k b上流を、pBluescript Sに+のBam81部位中にサブクローン 化し、プラスミドpci83167を作った。pcIB3167からの2.3k bのBamHI−Hind[[1部位を、pBluescript SK+のB amHI及び旧ndll[部位中にサブクローン化し、プラスミドpsK105 を作った。このpsKI05を、Ava[及びHindl[Iにより消化し、そ してこの1.75kbのHindlll−Ava[断片を、アガロース・ゲル上 で単離した。PCR反応を、Sambrook et at、中に記載せれてい るような標準的な条件下でテンプレートとして無傷のpsK105及び以下のプ ライマーを使用して走らせた:#42: 5−AGCGGTCGACCTGCA GGCATGCGATCTGCAGCTCCCGCCG−3“#43: 5’− ATGGGCAAGGAGCTCGGG−3’二〇PCR反応生成物を、Ava  I及び5allにより消化し、そして得られた断片をアガロース・ゲル上で単 離した。pBluescript SK+を、Hindlll及び5ailによ り消化した。この1.75 kb Hindllr−Aval断片、PCR誘導 体Aval−5al[断片、及び旧ndlll及び5alt末端をもツpBlu eSCriptベクターを、3方において結合し、プラスミドpsKIIOを作 った。 psK1]0内のプロモーター断片とベーターグルクロニダーゼ(GUS)遺伝 子との融合を、psKI 10をHind[II及び5allにより消化し、そ の1、9kb断片をアガロース・ゲル上で単離し、そしてそれをpcIB305 4のHind[II及び5al1部位中に結合することにより、作りだし、プラ スミドpKL2を作った。このプラスミドは、GLIS遺伝子その後のメイズP EPC遺伝子からの植物イントロン及びカリフラワー・モザイク・ウィルス(c auliflower mosaic virus)からのポリAシグナルを含 むpUc19から得られる。このプロモーター融合物は、おそらく、GUS遺伝 子ATGに先行するリーダー配列内のフレームから外れたATGコドンの存在を 理由として、植物内では不活性であった。 このプロモーターの機能の融合は、先行の融合連結を除去するために、pKL2 をXba[及び5ailにより消化することにより作られた。新たな融合連結を 、テンプレートとしてのpsK105及び以下のプライマーを使用してPCR反 応において作った:#5に50: 5’−CCCTTCAAAATCTAGAA ACCT−3’#5に49: 5−TAATGTCGACGAACGGCGAG AGATGGA−3゜二〇PCR生成物を、Xba I及び5ailにより消化 し、そしてアガロース・ゲル上で精製した。この精製断片を、pKL2のXba !及び5al1部位中に結合し、プラスミドpci83171を作った。このプ ラスミドは、花粉CDPKプロモーターと、花粉内で限定的にGtlS遺伝子を 発現することに向けられているGUSとの機能的融合物を含む。 −タ−GUS融合物を含むベクターを作るために、その融合遺伝子を、Hind lll及びSal[による消化によりpc[B5171から単離した。得られた 断片を、pBllol(C1ontechから購入)の旧ndlll及び5al 1部位中に結合させ、プラスミドI)CI83175を作った。 例38・ トランスジェニック植物の生産pc[B5175を、ヘルパー・プラ スミドpcIB542を含むアグロバクテリウム・チュームファシエンス(Ag robacterium tumefaciens)中に形質転換させ、そして 得られた集落を、Horsch et al、、 5cience 227:1 229−1231 (+985)により記載されているようにタンくコ苗条先端 培養物からの葉の皿(leaf disks)を形質転換するために使用した。 但し、培養集落(nurse culteres)を無視し、そして選択を10 0mg/lカナマイシン上で行った。トランスジェニック植物を、再生し、そし てPCRにより転移遺伝子の存在について確認した。 例39: cus遺伝子発現分析 最初の形質転換細胞及びそれらの子孫からの花粉を、Guerrero et  al、、 Mo1. Gen、 Genet、 224:161−168 (1 990)により記載されているようなGUS遺伝子の発現について組織化学的に 分析した。X−g lucバッファー中での青色染色により示されるような、G [JS遺伝子を発現している花粉粒状物(grains)のパーセンテージを、 以下の表中(こ示す。 植物番号 %青色の花粉 PP1−5128% PP1−5454% PP1−55無し PP1−61非常に少ない PP1−6351% PP1−6715% PP1−8010% PP1−8312% 単一の花粉CDPKプロモータ−GUS遺伝子が組み込まれている最初の形質転 換細胞は、その単一の遺伝子の分泌により、最大50%のGtJS陽性花粉を生 産するであろう。 蛍光定量法GUS検定を、選択植物の花粉、茎、根、葉及びめしへ(pisti l)の組織状で行い、花粉CDPKプロモーター発現の特異性について証明した 。検定を、Jefferson、 Plant Mo1. Biol、 14: 995−1006 (1990)中に記載されているように行い、そしてGtl S活性値を、nモルMU/μg蛋白/分間として表した。 植物番号 組織 GUS活性 非形質転換 正味GUS植物GUS活性 活性 PP1−51茎 0.01 0.02 0葉 OOO 根 0.15 0.10 0.05 めしべ 0.02 0.01 0.0+花粉 0.24 0.02 0.22 PPI−54茎 0.01 0.02 0葉 0 0 0 根 0.13 0.1 0.03 めしべ 0.01 0.01 0 花粉 0.60 0.02 0.58 PPI−63茎 0.0+ 0.02 0葉 0 0 0 根 0.07 0.1 0 めしへ 0.01 0.01 0 花粉 0.57 0.02 0.55 例4叶50は、キメラ構築物、すなわち、組換えDNA分子であってそれの挿入 、ベクターを含むトランスジエニ・ツク植物の生産、並びにそのトランスジェニ ック植物の」」ユ蛋白の発現レベル(こ、主)こ向けられている。 pC及び髄特異的プロモーターを、PCRを使用して合成りt cry[A(b )遺伝子に融合させる。二〇PCR融合のため(こ設計された第1ノコ゛マーは : (PEPC) KE99A28・5’ −TGCGGTTACCGCCGATCACATG−3 ゜KE97A28・5°−GCGGTACCGCGTCGACGCGG ATC CCGCGGCGGGAAGCTAAG−3’(髄) KE100A28 = 5°−GTCGTCGACCGCAACA−3’KE9 8A28 = 5°−GCGGTACCGCGTTAACGCGG ATCCT GTCCG ACACCGGAC−3゜KE104A28・5’ −GATGT CGTCG ACCGCAACAC−3’KE103A28 = 5’ −GC GGTACCGCGGATCCTGTCCGACACCGGA CGGCT−3 ゜である。 PCRプライマーを、これらの組織特異的遺伝子のそれぞれの5°未翻訳リーダ ー領域内のNco 1部位を、BamH[部位により置き換えるように設計し、 その合成crylA(b)遺伝子のこのBam旧部位中へのクローニングを容易 にする。この合成cryIA(b)遺伝子に融合された組織特異的プロモーター を含み、そしてまた35S:PAT:35Sマーカー遺伝子を含むベクターのそ の後の構築は、幾つかの中間体の構築を含む。 1、 pcIB4406(35S+合成−crylA(b):pepCivs# 9:35S)pc[B4406は、CaMV 35Sプロモーター(Roths tein et al、、 Gene 53:153−161 (1987)) と融合した2 Kb BamHI/C1a 1合成crYIA(b)遺伝子を含 む。また、この遺伝子は、その遺伝子の3′未翻訳領域内のメイズPEPカルポ キシターセ遺伝子(ivs#9)から得られたイントロン#6を含み、これは、 CaMV 3°末端を使用している。(PNAS USA、 83:2882− 2888 (1986)、Hudspeth et at、、Plant Mo 1ecular Biology。 12: 579−589 (1989乃。pclB4406を、結合させ、先に 記載したような大腸菌(E、 coli)細胞の”確かな(SURE)”株(S tratagene、 La Jolla、 CA)中に形質転換させる。1つ の突然変異が、アミノ酸#436におけるpcIB4406のcry[A(b) 遺伝子内で見つかり、これは、所望のPheがしeuに変換されていることをも たらしていた。I)CIB4406は、昆虫生物検定においてテストしたとき、 欧州トウモロコシ穿孔性動物に対して十分に活性があり、そしてウェスタン・プ ロット分析により決定されるように予想されたサイズのCrylA(b)蛋白を 生産する。 2、 pci84407 (35S:合成−cry[A(b):pepCivs #935s + 35S:pat:35S)pc[B4407を、35S :  PAT : 35S遺伝子を含む約4 Kb Hind[II/EcoR[断片 、並びにpci84406からの3.I Kb/Hind[[[/EcoRI  35S:合成−crylA(b) :353遺伝子から作る。pc[B4407 を、結合させ、そして標準的な手順(Sambrook et al、)を使用 して大腸菌(E、 cot i)の”確がな”DH5アルファ、及び88101 株の中に形質転換させる。この合成crylA(b)遺伝子は、その前駆体pc i84406と同じ性質をもっている。 3、pcIB4416 (35S:合成−crylA(b)+pepCivs# 9:35S + 35S:PAT:35S+ 35S:Adhイントロン:GL IS : 35S、 ’)pcIB4407を、EcoRIにより切断し、そし て標準的な条件下(Sambrook et al、)でウシ腸アルカリ性ホス ファターゼ(CIP)により処理し、約7.2Kb断片を作り、これを、3.4  Kb EcoRI 35S:Adh/GLIS:35S断片と結合させ、pc [84416を作る。結合及び”確かな”細胞への形質転換は、先に記載したも のと同しである。pci84416内の合成cry IA(b)遺伝子は、pc IB4406内の遺伝子と同じ性質をもっている。 4、 pcI84418 (35S 合成−cry[A(b):pepCivs #9:35S)pCI84406を、Apal及びBamHIにより消化し、そ してCAPにより処理する。pcIB4406を、BamHI及びN5plによ り消化する。pBsI23#I3を、Nsp[及びApa Iにより消化する。 I]C[B12O3からの4.3Kb Apal/Bam旧断片、pci844 06からの1.3にb Bam1(1/N5pl断片、及びpBs123#I3 からの170塩基対のN5pl/Apal断片を含む3方結合を、行い、pci 8445、pclB4419 (35S:合成−crylA(b):pepCi vs#9:35S + 35S:PAT:35S+ 35S:Adhイントロン :GUS:35S)pcI84416及びI)CI84418を、BstεI+ 及びEco Nlにより消化し、そしてpcI84416の断片を、CIPによ り処理する。I)CIB4416からの9.IKb断片を、pci84418か らの1.4にb断片に結合させ、pci84419を作る。 HBIOIコンピテント大腸菌(E、 coli)細胞内に形質転換されたpC I84419は、欧州トウモロコシ穿孔性動物に対する昆虫生物検定における十 分な活性を証明している。 6、9c[B4420 (髄:合成−crylA(b):PEPCivs#9: 35S + 35S:FAT:353pci84420の調製における中間体構 築物は、pBTinl、 pBtin2、p4420A及びpBtin3である 。pBtinl(髄プロモーター:合成りt遺伝子の第二半分+35S:PAT :35S)を、プラスミド髄(3−1)からの2. IKb Xbal/Nca l髄プロモーター断片とpcIB4407からの5.2Kb Xbar/Nco [断片とを結合させることにより作る。pBtin2は、先に列記したプライマ ーKE100A28及びKE98A28を使用して作った210塩基対のPCR 断片により修飾された髄プロモーターを含む中間体構築物である。PCR反応混 合物は、100ピコモルのそれぞれのオリゴマー、200nMのそれぞれのdN TP、 IXバッファー(Cetus)及び2.5ユニツトの熱安定性ポリメラ ーゼと共に約1100nの2. ]Kb bam)II/Ncol髄プロモータ ー断片を含む。このTmが比較的低い(40°Cと50°Cとの間)ので、PC R反応を以下のパラメーターにより走らせた: 解裂サイクル・94°C,1分間、 アニーリング・サイクル:37°C,1分間、伸長サイクルニア2°C145秒 間(+サイクル毎3秒間)サイクル数=25 PCR反応物を、5ail/Kpn[による切断に先立って先に記載したような プロティカーゼKにより処理し、その後、フェノール/クロロホルム抽出し、そ して先に記載したようにエタノール沈降させた。 この210塩基対の断片を、2%Nusieveゲル上で精製し、そしてそのゲ ルからMi11iporeフィルター装置を使用して抽出した。この210Kb  5ail/Kpn I断片を、髄(1−3)からの4.9 Kb 5all/ Kpnl断片に結合させ、pBtin2を作る。p4420A(髄:合成−旧: Pepイントロン:35S +35S:PAT:35S)を、pBtin2から の700塩基対のN5il/Bam旧断片、pCI84418からの1.8Kb のBamHI/Bst E It断片、及びpBtinlからの5.9KbのB st E 11/Nsi I断片から成る3方結合により作る。p4420Aを 作った後、pBtin2内で3つの突然変異が発見される。第二PCR断片を、 プライマーKE104A28及びKEI03A28を使用して約65°Cの釦値 で髄リーダー内のNco1部位を修飾するために作る。のPCR反応混合物は、 先に列記したものと同じてあり、20%までグリセロールを添加し、G+Fil e [: 94°C:3分間、lサイクル、File It: 60°C:1分 間、94℃:1分間、 25サイクル、 File III: 72°C15分間、lサイクル、PCR反応物を、上記に ように処理し、そして制限エンドヌクレアーゼSa1[及びKpnlにより切断 する。この210Kbの5all/Kpn[PCR(反応中のグリセロール)断 片を、プラスミド(3−1)からの4.9Kb 5ail/Kpn I断片に結 合させ、pBtin3を作る。pBtin3−G#1上のデータは、二〇PCR 生成断片が正しいものであることを示している。 pBt 1n3−G#Iを、pci84420(p4420B″G#6−ともい う)を作るために使用する。pCI84420を、pBtin3−G#Iからの 700塩基対のNsi[/Bam旧断片、I)CIB4418からの1.8Kb のBamHI/Bst E II断片、及びpBtinlからの5.9 Kb  Bst E II/Nsi I断片を使用した3方結合により構築する。 pcI84420は、葉肉プロトプラスト実験において使用され、そして欧州ト ウモロコシ穿孔性動物に対する合成crylA(b)遺伝子の十分な活性を証明 している。 7、 pci84413 (PEPC:合成−Bt(Phe突然変異):PEP Cイントロン:35S、 )融合断片を、pGL134.5からの2.3 Kb  Hindll115allテンプレートと共にプライマーKE99A28及び KE97A28を使用したPCRにより作り出した。このPCR混合物は、先に 記載したものと同じ濃度の、・プライマー、テンプレート、dNTPs 、塩、 及び熱安定性ポリメラーゼを含む。PCRパラメーターは: 解裂サイクル=94°C,1分間、 アニーリング・サイクル:55℃、1分間、伸長サイクル=72°C145秒間 (サイクル毎に+3秒間)サイクル数=30 である。 終了後、PCR反応物を、先に記載したように、制限エンドヌクレアーゼBam HI及びBst E IIによる切断に先立って、プロティカーゼKにより処理 し、その後フェノール/クロロホルム抽出し、そしてエタノール沈降させた。 pcIB4413を、210塩基対のBamH[/Bst E II PCR断 片、pc[84406からの4.7Kb BamHI/Hindlll断片、及 びpGU54.5からの2.2Kb Hindll[/Bst E II断片を 使用した3方結合により作る。 8、pcIB442](PEPC:合成−crylA(b):PEPCインドO :/ :35S)pcIB4421を、pci84413内のPhe突然変異を 含む合成crY[A(b)遺伝子を、pcI84419からの合成cry [A (b)遺伝子と置き換えるために作る。 pci84421を、pcI84413からの5.2KbのBamHI/Sac [断片とpCIB4419がらの1.9KbのBamHI15acl断片と結合 させることにより作る。 9、pclB4423(PEPC:合成−crylA(b) :pepCインド ロン:35S + 35S:PAT・35S) pclB4421からの2.4KbのBamH1/Hind[lI PEPCプ ロモーター断片を、pci84420内の6.2Kb BamH[/Hind1 1[断片と結合させ、I)CI84423を作る。このHind111部位は、 pclB4423のクローニングにおいてエンドヌクレアーゼにより欠失される 。pc[B4423は、PEPCプロモーターの制御下の合成cry[A(b) 遺伝子を含み、このFAT遺伝子は、35Sプロモーターの制御下にある。 10、アグロバクテリウム(Agrobacterium)株内の合成cryl A(b)遺伝子 合成crylA(b)遺伝子により作られたアグロバクテリウム株は、双子葉植 物の範囲内でこの遺伝子の伝達を可能にする。アグロバクテリウム・ベクターp ci84417は、pBI]oI (C1ontech)からの14Kb Hi nd[II/EcoR[断片に結合されているpc[B1203(Phe突然変 異)からの3,3Kb Hindl[[/εcoR135S:合成−CrylA (b):pepC:ivs#9:35S断片を含む。 200ngのpc[B4417及び40μmの氷上解凍LBA4404 :+ン ピテント細胞を、前冷却0.2cmエレクトロポレーション・キュベツト(Bi o−RadLaboratories Ltd、)内てエレクトロポレーション にかける。Pu1se Controller装置(Bio Rad)によるG ene Pulser−TMを使用して、電気パルスを、直ちに、2.5kVに おける電圧設定、及び25μFにおける静電容量設定により、加える。パルス後 、細胞を、直ちに、1mlのYEB培地に移し、そしてABmin :Km50 プレート上に10μlをブレーティングする前に、27°Cて3時間、振どうす る。約60時間28°Cにおいてインキュベートした後、コロニーを、ミニスク リーン調製のために選択し、制限酵素分析を行う。最終的なアグロバクテリウム 株をpcIB4417:LBA4404という。 例41:形質転換メイズ・プロトプラストのELISA検定cry[A(b)毒 素蛋白の存在を、酵素結合イムノソルベント・アッセイ(EL[SA)を利用し て検出する。ELISAは、非常に感度が良(、抗原物質に特異的な検定である 。ELISA検定は、ポリペプチド遺伝子生成物の発現を測定するのに有用であ る。これらの検定のための抗血清を、Fデシル硫酸ナトリウムにより可溶化した グラジェント精製旧結晶[Ang et al、、 Applied Envi ron、 Microbiol、、 36:625−626(1978)]によ るウサギの免疫化に対する応答において作り出す。過渡的形質転換メイズ細胞か らの抽出物のELISA検定を、標準的な手順を使用して行う(例えば、Har low、 E、、 and Lane、 D、 in″Antibodies:  A Laboratory Manual”、 Co1d Spring H arbor Laboratory P72:248 (1976)中に記載さ れている。したがって、これらの手順は、当業者によく知られている。これらの 文献の開示を、ここで、引用により本明細書中に取り込む。 ELISA検定を、メイズ・プロトプラスト内のCrylA(b)蛋白を検出す るために行う。作られた蛋白を、全蛋白mg当たりのBtのng(ng et/ mg)として以下に報告する。それぞれの構築物を、2回テストした。 1)CIB3069 検出可能な旧無しく両テスト)pcIB440721.9 00 ng Bt/mg全蛋白、21.000 ng Bt/mg全蛋白。 上記の形質転換されたメイズ細胞は、ノイズ最適化Bt遺伝子により形質転換さ れたとき、全可溶化蛋白mg当たり約20.000ngのBt Cry[A(b )蛋白のオーダーに基づく、高いレベルのBt [Pを作りだす。 これらのELISAヘースの検定の検出レベルは、mg蛋白当たり約1〜5ng  CrylA(b)蛋白である。それ故、メイズ最適化Bt遺伝子は、ノイズ細 胞内のこの蛋白の発現において約20.000倍と大きな増加を作り出している 。 ウェスタン・プロット検定を、また、メイズ最適化遺伝子を発現させるだめのD NAにより過渡的に形質転換されているノイズ細胞から得られた抽出物を使用し て行う。ウェスタン・プロットにより検査するとき、この蛋白は、大腸菌(E、  coli)内で生産された蛋白と同一のもののよっである。反対に、上記の例 6中に示したように、検出可能なりt cryIA(b)殺虫性蛋白は、生来の Bt誘導コード領域を発現することを試みられる競合ベクターにより形質転換さ れたノイズ細胞によっては、全く作られていない。 定性的な昆虫毒性テストを、収穫したプロトプラストを使用して行うことができ る。懸濁液を、すべての生物検定においてテストしたそれぞれの複製物について 調製した。複製物は、その対照よりも有意に高い死亡率を引き起こす場合には、 陽性と考えられる。例えば、複製物を、欧州トウモロコシ穿孔性動物、0str inia口ubilalisを使用して鱗翅目内の昆虫に対するそれらの活性に ついてテストする。0.1%Triton X−100中のlOOμlのプロト プラスト懸濁液を、50mm x 10mmスナップ−キャップ・ペトリ皿内の 人より1ackネキリムシ(cutworm)餌(Bioserv、 Inc、 、 Frenchtown、 Nに F9240)の表面上にピペットで移した 。IOの新生の幼虫を、それぞれのプレートに添加する。約40径死亡率を記録 する。この蛋白が欧州トウモロコシ穿孔性動物に食べられたとき、それは100 %の死亡率をもたらす。 トウモロコシ葉肉プロトプラストの単離のための一般的な手順を5heen e t al、、 The Plant Ce11.2:1027−1038 (1 990)から改良する。 5henn et al、中で使用されるプロトプラスト形質転換システムを、 エレクトロポレーションよりもむしろPEG仲介形質転換を使用して修飾する。 この手順並びにその単離手順において行われる変更を、以下に記載する。 メイズ葉肉プロトプラスト単離/形質転換1、 葉材料のためのトウモロコシの 種(corn 5eeds)を、滅菌し、そして発芽させる。苗木(seedl ing)を、25°Cにおいて明かりの中で生育させる。 2.5%C1oroxにより、5分間、10−12日口の苗木の葉の片を表面滅 菌し、その後、無菌蒸留水により洗浄する。 3、 酵素溶液(以下の配合表を参照のこと)を部分分けする:25m1/皿( 100x 25 mmベト9皿)。 4、業から過剰の水を除去し、そして酵素のそれぞれの皿の中に6−8つの2イ ンチ片を入れる。14のプレートは、約100の苗木からの葉材材により普通に は設定させる。 5、 可能な限り長いストリップにその葉を切断する(2−5mm)。 6.25℃において6.5〜7時間ゆっくり振とうする。インキュベーションが 暗い中で起こるようにプレートを覆う。 7、 プロトプラストを濾過する前に、100μm篩をIOmI O,6λ1マ ニトールにより洗浄する。プロトプラストをゆっくりと篩からピペットにとる。 皿内に残ったプロトプラストのいずれをも集めるために0.6Mマニトールによ りプレートを洗浄する。 8、 濾過した液体を注意して50m1の滅菌チューブ内にピペットで入れる。 9、 卓上遠心分離機(Beckman Model TJ−6)内で1000  rpm1500gにおいて10分間回転させる。 10、酵素溶液を除去し、そして捨てる。ペレットを注意して5m1m1マート ール中懸濁させる。いくつかのペレットをプールする。 0.6Mマニトールにより50m1までの容量とし、そして回転させる。 11、既知容量(50ml)に再懸濁させ、そして計数を行う。 12、計数及びペレット化の後、再懸濁バッファー(以下の配合表)中、2ミリ オン/mlにおいてプロトプラストを再懸濁させる。 形質転換の前に少なくとも30分間、再懸濁バッファー中で、プロトプラストを インキュベーションに供する。 形質転換: 1、 プラスミドをチューブ(Fisherbrandポリスチレン17 x  100mmスナップ・キャップ培養チューブ)に部分分け(Aliquot)  I、 :処理当たり少なくとも3回繰り返し1等しい遺伝子コピー数が比較され るように等モル量のプラスミドを使用する。 2、0.5mlのプロトプラストを添加し、そして0.5mlの40%PEGを 0.6Mマニトールにより調製する。 3、 ゆるやかに混合するまて振とうし、そして30分間25°Cにおいてイン キュベートする。 4.5分間の間隔においてプロトプラスト培養基を添加するl:1.2.5ml  a 5、1000rp1000rpにおいて10分間回転させる。 6、 ペレットから液体を除去し、そして1mlの培養基(BMV培地)中に再 懸濁させる。 7、−夜、暗い中て25°Cにおいてインキュベートする。 配合表: 酵素溶液 0.6Mマニトール 10mM MESSp)15.7 I mM CaC12 1mM MgC12 0,1%BSA 滅菌濾過、 上記の溶液に、以下の酵素を添加する11%Ce11ulase R31及び0 .1%Macerozyme RIO洗浄バッファー:0.6Mマニトール、滅 菌濾過、再懸濁バッファー・0.6Mマニトール、20mM KCI、滅菌濾過 、培養基 BMV培地であって0kuno et al、、 Phytopat hology 67:610−615(1977)からの配合表 0.6Mマニトール 4mM MES 、 pH5,7 0,2mkl KH2PO4 1mM KNO3 ImM MgSOa 10mM CaC12 IX K3マイクロニュートリエンド(micronutrients)滅菌濾 過。 形質転換されたプロトプラストのELISA検定を、形質転換後1日目に行う。 EL I SAを先に記載したように行う。以下の3つの実験を、ノイズ同系2 ] IDにより行う。もちろん、他の系のメイズを使用してもよい。50μgの プラスミドpcIB4419及び等モル量の他のプラスミドを使用する。全可溶 性蛋白を、BioRad蛋白検定を使用して決定する(Bradford、 A nal、 Biochem、 72:248(1976))。 形質転換実験: テスト構築物: 1、 pcIB4419(CaMV 35Sプロモーターの制御下の合成りt並 びに35S/PAT及び35/G[JSマーカー遺伝子を含む構築物)2、 p cIB4420(髄プロモーターの制御下の合成りt及びFATマーカー遺伝子 を含む構築物) 3、 pc184421(PEPCプロモーターの制御下の合成りtを含む構築 物)4、PCl34423(PEPCプロモーターの制御下の合成りt及びFA Tマーカー遺伝子を含む構築物) (PEPC:合成−crylA(b) :PepCイントロン+35S + 3 5S:PAT:35S)以下の実験において、10又は111日目2I10苗木 を、Biorad蛋白検定においてBt Cry[A(b)の生産について分析 する:実験+(111日目苗木): pcIB441915,000±3.000 ng Bt/mg蛋白pcIB4 420280±65 ng Bt/mg蛋白pc[B44219.000±80 0 ng Bt/mg蛋白実験2(100日目苗木)。 pcIB44195.000±270 ng Bt/mg蛋白pCIB4420 80±14 ng Bt/mg蛋白1)C[B44211.600±220 n g Bt/mg蛋白実験3(111日目苗木)。 pc[B441921.500±1,800 ng Bt/mg蛋白pc[B4 420260±50 ng Bt/mg蛋白pci8442111.900±4 .000 ng Bt/mg蛋白pc[B44237.200±3.400 n g Bt/mg蛋白上記の実験は、CaMV 35S及びPEPCプロモーター の両方が非常に高いレベルにおいて合成りt CrylA(b)蛋白を発現する ことを確信させた。より少ない効率であるが髄プロモーターも、合成Cry[A (b)蛋白の発現について有効である。 例44: レタス内における合成りtの安定的な発現アグロバクテリウム・ベク ターpcIB4417内の合成りt遺伝子を、しactuca 5ativa  cv、 Redprize(レタス)中に形質転換させる。使用する形質転換の 手順は、Enomoto et al、、 Plant Ce11 Repor ts、 9:6−9(1990)中に記載されているものである。 形質転換手順: レタスの種を、5%C1orox中て5分間滅菌し、その後無菌蒸留水中で数回 洗浄する。表面滅菌された種を、半強度MS培地(Murash igeand  Skoog、 Physiol、 Plant、 15:473−497 ( 1962))上にブレーティングする。25°Cにおいて16時間、3,000  lxの明かりの下で成長させた6日目のtiedprize苗木の子葉を、ア グロバクテリウム感染の外植体(explants)として使用する。それぞれ の子葉の基及び先端を、メスで除去する。この外植体を、28°Cにおいて適当 な抗生物質を含むAB最小培地中で48時間培養したバクテリア溶液中に10分 間、浸漬した。滅菌フィルター紙上で過剰のバクテリア溶液を吸い取った後、そ の外植体を、MS培地(0,1mg/ml BA及び0.1mg/I NAA) 上に2日間ブレーティングした。次に外植体を、500mg/Iカルベニシリン (carbenicill in)及び50mg/Iのカナマイラン(kana mycin)を含む選択培地に移す。外植体を、新たな培地に一週間毎に継代培 養する。培養室条件は、25°C,16時間、2,000 lxである。約4週 間後、ELISAを、継代培養されている4つのプレートのそれぞれから健康に 見えるカルスに対して行う。このELISA手順は、プロトプラストについて先 に記載したものと同しである:可溶性蛋白を、先に記載したようなり1orad 検定により再び測定する。 結果。 pcI83021(カナマイラン対照) 0pci84417(プレー1−1) O pc184417(プレー)2) 505 ng Bt/mg蛋白pc[B44 17(プレート3) 45 ng Bt/mg蛋白pc[84417(プレート 4) 1,200 ng Bt/mg蛋白本例は、双子葉植物も、最適化された 殺虫性遺伝子の増加された発現を示すことを示している。 例45: pC(84429の構築 pc[B4429は、メイズ最適化cry[A(b)遺伝子と融合した好ましい メイズ花粉特異的プロモーターを含む。この構築において使用される花粉特異的 ノイズ・プロモーターを、例37中に記載したプラスミドpKL2から得た。こ のメイズ最適化crylA(b)遺伝子を、これもまた例37中に記載したプラ スミドpci84418から得た。 pKL2は、大腸菌(E、coli)のベーターグルクロニダーゼ(be ta −g 1ucuronidase)遺伝子と融合している好ましいメイズ花粉特 異的プロモーターを含むプラスミドである。これを、プラスミドpsK110及 びpC[B5054から構築した。psKlloは、花粉特異的メイズ・プロモ ーターを含む。pcIB3054、pUc19誘導体は、カリフラワー・モザイ ク・ウィルス(CaMV) 35Sプロモーターと融合した大腸菌(E、 co li)ベーターグルクロニダーゼ(GtJS)遺伝子を含む。その構築を、本明 細書中の他の場所に記載する。このプロモーターを、5all/Hind[l[ により切断することにより上記のプラスミドから取り出し、GUS遺伝子、バク テリアのアンピシリン耐性遺伝子及びCo1E[複製起点を含む断片を作ること ができる。この第二断片は、CaλIV 35Sプロモーターを含む。 pc[83054を、標準的な条件を使用して、室温において2時間、制限酵素 5ail及びHindl[Iにより切断した。次に、この反応物を、標準的な条 件を使用してフェニール/クロロホルムにより抽出し、そしてそのDNAを、標 準的な条件を使用してエタノール沈降により回収した。回収したDNAを、ウシ 腸アルカリ性ホスファターゼ(CIP)を含む反応に適切なバッファー中に再懸 濁させ、そして37℃において一夜、2.5ユニツトのCAPと反応させた。こ のCIP反応の後、このDNAを、本明細書中で他の場所に記載したような標準 的な条件を使用してアガロース・ゲル上で精製した。psKlloを、室温にお いて2時間標準的な条件下てSa目/Hind目Iにより切断し、そしてその後 、そのDNAを、標準的な条件下でアガロース・ゲル上で精製した。回収したD NA断片を、室温において2時間標準的な条件を使用して結合させ、そしてその 後、標準的な条件を使用してコンピテント大腸菌(E、 col i)株HBI OI細胞中に形質転換させる。形質転換細胞を、100μgアンピシリン/ml を含むL−寒天上で選択した。形質転換細胞を、標準的なプラスミドのミニ−ス クリーン手順を使用して所望のプラスミド横築物として特徴付けた。正しい構築 物を、pKL2と名付けた。 pci84429を作るために、3方結合を、当業者に知られた標準的な条件を 使用し行った。これらの3つの断片は、以下のものてあった1) cry[A( b)遺伝子、バクテリアのアンピシリン耐性遺伝子、及びCo1E1複製起点を 含むサイズ約4.7Kbの、pcIB4418からのHind111/Bam旧 断片、 2)サイズ約1.3KbのpKL2からのHindlll/Xbar断片であっ てメイズからの花粉特異的プロモーターを含むもの、3)転写開始から下流に導 入されたBamH1部位をもつ花粉プロモーターから得られたPCR生成断片。 この断片は、約120塩基討てあり、そして制限酵素Xbal/BamH[によ り切断された末端をもっている。 このPCR断片を、100μm反応容量及び先に記載したような標準的な条件を 使用して作った。使用したプライマーは:5に50: 5’〜CCCTTCAA A ATCTAG AAA CCT−3’KE127: 5−GCG GAT  CCG GCT GCG GCG GGG AACGA−3’であった。 上記のプライマーを、PCR反応においてプラスミドpsK105てあってメイ ズからの花粉特異的プロモーターを含むものと混合した。 このPCR反応終了後、10、μlの反応物を、標準的な条件を使用してアガロ ース・ゲル上で走らせ、その反応物が予想サイズの生成物を作ることを確認した 。残りの90μlを最終濃度50μg/mlにおいて30分間37°Cにおいて プロティカーゼKにより処理した、次にこの反応物を、65°Cにおいて10分 間加熱し、次に標準的な手順を使用してフェノール/クロロホルム抽出した。こ のDNAを、標準的な条件を使用して2容量のエタノールにより沈殿させること によりその上澄液から回収した。沈殿後、このDNAを、マイクロフユージ内て 遠心分離により回収した。このベレットを、70%エタノールで1回濯ぎ(本技 術分野において標準的である)、すへてのエタノールを除去するために簡単に乾 燥させ、そしてそのペレットを17μl TEバッファー中に再懸濁させた。2 μlのIOX制限酵素バッファーを、0゜5 a l BamH[及び0.5  μl Xbalとなるように添加した。このDNAを、2時間37°Cにおいて 消化し、Xbal/Ban旧により切断されたDNA断片を作った。制限酵素に よる消化の後、この断片を、2%Nusieve(FMC)71%アガロース・ ゲルから成るアガロース・ゲル上で精製した。 Milliporeフィルター装置を、製造者の指示を使用してそのアガロース ・ゲルからそのDNAを溶出させるために使用した。溶出後、このDNAを、先 に記載したような3方結合において使用した。 結合後、DNAを、標準的な技術を使用してコンピテント大腸菌(E。 coli)株HBIOI細胞中に形質転換させた。形質転換細胞を、アンピッリ ンを100μg/mlて含むL−寒天上て選択した。選択条件下で増殖させたコ ロ−ニーを、本技術分野において標準的な技術を使用してプラスミド挿入物につ いて特徴付けた。 fN46: pc[B4431 、すなわち植物内の合成cry[A(b)遺伝 子の組織特異的発現のためのベクターの構築 pcI84431は、メイズを形質転換させるために設計されたベクターである 。それは、ノイズ内で発現可能な2つのキメラのBtエントトキンン遺伝子を含 んでいる。これらの遺伝子は、PEP/カルポキンラーセターロモーター/合成 −crylA(b)及び花粉プロモーター/合成−crylA(b)である。こ のベクター内のPEPカルボキシラーターcrylA(b)遺伝子は、先に記載 したpc[84421から得られる。花粉プロモーターも先に記載されている。 図20は、プラスミドpcIB4431のマツプである。pc[84431を、 pC[84429からの花粉/合成−cry[A(b)を含む約3.5にbのに pn[/H1nd[[l断片、約4.5KbのHindl[l/EcoRI(P EPC/合成−crylA(b乃及びベクターBluescriptからの約2 .6KbのKpn [/EcoRl断片を使用した3部結合を介して構築した。 花粉プロモーター/合成CrylA(b)キメラ遺伝子を含む他のベクターは、 pcIB4428及びI+C[84430を含む。図21及び22を参照のこと 。pCI84430も、先に記載したようなPEPC/合成−Bt遺伝子を含む 。 例470合成メイズ最適化Cry[A(b)遺伝子を含むトランスジェニック・ ノイズ植物の生産 以下の例は、そこから形質転換細胞か作られるところの、メイズ細胞中にDNA 被覆粒子を導入するためにBiolisticsを使用する。 実験KC−65 組織特異的プロモーターを使用した合成cry[A(b)遺伝子を発現するトラ ンスジェニック・ノイズ植物の生産組織 長さ約1.5−2.5mmの、未成熟のメイズ胚(embryos)を、受粉後 14−15日目の遺2子型6N615の穂から切除した。母植物(mother  plant)を、グリーンハウス内で生育させた。切除前、その穂を、20% C1oroxにより20分間表面滅菌し、そして滅菌水により3回濯いだ。個々 の胚を、カルス開始培地、すなわち、2DG4 + 5クロランベン(chlo ramben)培地(5mg/Iクロランベン、20mg/ lグルコース、及 びオートクレーブ後に添加した10m1 G4添加物(表1)を含む、N6主要 塩、B5微量塩、MS鉄、2%シュクロース)上に、2平方cmの面積内に胚盤 (Scutellum)側を上に向けて、すねわち1つのプレートに対し36の 胚において、置いた。 カゼイン加水分解産物 0.5 gm プロリン 1.38 ’gm ニコチン酸 0.2 mg ピリドキシン−HCl 0.2 mg チアミン−HCl 0.5 mg コリン−HCl 0.1 mg リポフラヒン 0.05 mg ヒオチン 0.1 mg 葉酸(folic acid) 0.05 mgパントテン酸Ca O,1mg p−アミノ安息香酸 0.05 mg BI2 0. +36μg 爆撃 組織を、PDS−1000He Biolistics装置を使用して爆撃(b ombarded) した。この組織を、その停止スクリーン棚の下8cmの棚 の上に置いた。この組織を、1回、DNA/金マイクロキャリアー溶液により射 ち、10μlをそのマイクロキャリアー上で乾燥させた。使用した終止スクリー ンを、10 X 10ステンレス鋼メツンユ・スクリーンを使用してABRUに おいて手で孔を開けた。1550ρS1値の破裂板を使用した。爆撃後、胚を、 暗い中で25°Cにおいて培養した。 デリバリ−のためのDNAの調製 このマイクロキャリアーを、Biolistic装置と共に提供された指示に本 質的に従って調製した。50μlを混合する間、1.0μの金マイクロキャリア ー(gold m1crocarrier)を、5μlのpc[B4431(1 ,23μg/μl)[#898] + 2μlのpc 183064 (0,8 95μg/μl)[#456]、その後に、50μmの2.5M CaC12、 次に、20μmのO,1Mスペルミジン(SpermidineX遊離塩基、T Cグレード)を添加した。得られた混合物を3分間攪拌し、そして10秒間マイ クロフユーシした。この上澄液を、除去し、そのマイクロキャリアーを、手短に 混合し、遠心分離し、そしてその上澄液を除去することにより、250μIの1 00%EtOH(HPLCグレード)により2回洗浄した。このマイクロキャリ アーを65μIの100%EtOH中に再懸濁させた。 カルス形成 胚を、爆撃1日後に3mg/ IのPPTを含むカルス開始培地に移した。 胚を、爆撃後2及び3週間後にカルス開始を獲得した。いくつかの反応物を、カ ルス維持培地、2DG4 + 0.52.4−D培地であって3mg/LPPT を含むものに移した。カルス維持培地は、0.5mg/lの2.4−D、20m g/ lグルコース、及びオートクレーブ後に添加した10m1 G4添加物を 含む、N6主要塩、B5微量塩、MS鉄、2%シュクロースである。胚形成カル スを、2週間毎に、3mg/I PPTを含む新たな維持培地に継代培養した。 全てのカルスを、暗い中で25℃においてインキュベートした。 タイプIのカルス形成反応は、15%であった。個々の事件が個々の系を生しさ せるように、カルスを作るそれぞれの胚を培養した。 再生 選択の間の12週間後、組織を、PPTを含むカルス維持培地から取り出し、そ して再生培地上に置いた。再生培地は、2週間の0.25M53S5BA(0, 25mg/ lの2.40.5mg/l BAP 、 MS塩、3%シュクロー ス)であり、その後の植物の再生のためにMS3S培地に継代培養した。4〜l O週間後、植物を、取り出し、そしてGA7’S中に置いた。#176 BT事 件となった我々の系KC650−6は、38の植物の全体を作り出した。 検定 それらかGA7’ sにおいて確立されるようになったとき、全植物を、199 1年9月13日に出願された米国特許出願第07/759.243号(この関連 部分を、ここで、引用により本明細書中に取り込む)中に記載されているように PPTに対する抵抗性についてクロロフェノール・レット(CR)によりテスト した。この検定は、細胞かPPTの存在中で増殖していることを示すためにpH 感受性指示染料を使用する。増殖細胞は、その培地中のpHの変更を作り出し、 そしてこの指示薬を(赤から)黄色に変える。PPTに対する耐性遺伝子を発現 する植物は、このテストにより容易に観察される。(#176・8陽性/30陰 性)。CRテストにより陽性な植物を、合成りt遺伝子の存在についてPCRに より検定した。(#176・5陽性/2陰性/1致死)。 合成−BT遺伝子についてのPCRによる陽性の植物を、フィトトロン(phy totro口)に送った。一旦、フィトトロン内で確立されれば、それらを、昆 虫生物検定及びELISA分析を使用して特徴付けした。 植物を、標準的な欧州トウモロコシ穿孔性検定を使用して昆虫生物検定を行い( 例5A中に記載している)、ここで、植物から摘み取った葉の小片を、多数のE CB新生幼虫が入った小さいペトリ皿内に置いた。植物を、典型的には、約6イ ンチの高さにおいて検定した。 本検定においてECBに対し100%の死亡率を示す植物を、以下に示す。 陽性植物を、グリーンハウス内に移した。 グリーンハウス/結実 植物番号#176−11を、野性型6N615花粉により受粉させた。1つの雄 穂(tassel ear)及び1つの穂苗(ear 5hoot)を作った。 雄穂(11)からの胚の全て及び穂lからの56粒(kernels)を、救出 した(rescued)。294粒は、その穂の上に残り、そして乾燥して自然 に落下した。 #176−11からの花粉を、各種のメイズ遺伝型5N984.5NA89 、 及び3N961に対し外部交配させた(outcrossed)。胚を、3つの 外部交配の(5N984・45: 5NA89・30: 3N961・8)のす べてから救出した。その仁の大部分が、グリーンハウス内の植物上の穂の上に残 り、そして乾燥して自然に落下した。DNAを、標準的な技術を使用して植物# 176−11から単離し、そしてサザン・プロット検定を使用して分析した。こ れは、合成cry[A(b)遺伝子から作られたプローブ及びFAT遺伝子から 作られたプローブとハイブリダイズする配列を含むことが発見された。これらの 結果は、これらの遺伝子がメイズのゲノム中に取り込まれていることを示した。 実験KC−64 構成的プロモーターを使用した、合成(rylA(b)遺伝子を発現するトラン スジェニック・ノイズ植物の生産 机卓 長さ約1.5−2.5mmの、未成熟のメイズ胚を、受粉後+4−15日目の遺 2子ff16N615の穂から切除した。母植物を、グリーンハウス内で生育さ せた。切除前、その穂を、20%C1oroxにより20分間表面滅菌し、そし て滅菌水により3回濯いた。個々の胚を、カルス開始培地、すなわち、20G4  + 5クロランヘン培地(5mg/lクロランベン、20mg/ ]グルコー ス、及びオートクレーブ後に添加した10m1 G4添加物(表1)を含む、N 6主要塩、B5微量塩、MS鉄、2%シュクロース)上に、2平方cmの面積内 に胚u(scutel Ium)側を上に向けて、すねゎち1つのプレートに対 し36の胚において、置いた。 カセイン加水分解産物 0.5 gm プロリン 1.38 gm ニコチン酸 0.2 mg ビリトキンンーHCI 0.2 mg チアミン−MCI 0.5 mg コリン−HCl 0.1 mg リホフラヒン 0.05 mg ヒオチン 0.1 mg 葉酸 0.05 mg パントテン酸Ca O,1mg p−アミノ安息香酸 0.05 mg 812 0、136μg 爆撃 組織を、PDS−1000He Biolistics装置を使用して爆撃(b ombarded)シた。この組織を、その停止スクリーン棚の下8cmの棚の 上に置いた。この組織を、1回、DNA/金マイクロキャリアー溶液により射ち 、lOμlをそのマイクロキャリアー上で乾燥させた。使用した終止スクリーン を、10 X 10ステンレス鋼メツシユ・スクリーンを使用してABRUにお いて手で孔を開けた。1550psi値の破裂板を使用した。爆撃後、胚を、暗 い中で25°Cにおいて培養した。 デリバリ−のためのDNAの調製 このマイクロキャリアーを、Biolistic装置と共に提供された指示に本 質的に従って調製した。50μlを混合する間、1.0μの金マイクロキャリア ーを、3.2μlのpclB4418(0,85μg/μm)[#905] + 2μmのpcIB3064(0,895μg/μl)[#456] + 1.6 μlのpcIB3007A(1゜7 μg/μl[#+52] 、その後に、5 0μlの2°5M CaC12、次に、20μlの0.1Mスペルミジン(遊離 塩基、TCグレード)を添加した。得られた混合物を3分間攪拌し、そしてlO 秒間マイクロフユージした。 この上澄液を、除去し、そのマイクロキャリアーを、手短に混合し、遠心分離し 、そしてその上澄液を除去することにより、250μlの+00%EtOH(H PLCグレート)により2回洗浄した。このマイクロキャリアーを65μmの1 00%EtOl(中に再懸濁させた。 胚を、爆撃1日後に3mg/ IのPPTを含むカルス開始培地に移した。 胚を、爆撃後2及び3週間後にカルス開始を獲得した。いくつかの反応物を、カ ルス維持培地、20G4 + o、52.4−D培地であって3mg/LPPT を含むものに移した。カルス維持培地は、o、5mg/lの2.4−D、20m g/ Iグルコース、及びオート・クレープ後に添加したloml G4添加物 を含む、N6主要塩、B5微量塩、MS鉄、2%シュクロースである。胚形成カ ルスを、2週間毎に、3mg/l PPTを含む新たな維持培地に継代培養した 。全てのカルスを、暗い中で25°Cにおいてオンキュベートした。 タイプIのカルス形成反応は、18%であった。個々の事件が個々の系を生じさ せるように、カルスを作るそれぞれの胚を培養した。 再生 選択の間の12週間後、組織を、I’PTを含むカルス維持培地から取り出し、 そして再生培地上に置き、16時間の明かり(50με・m −2・s−’)/ 8時間の暗闇の光期間(photoperiod)を使用して25°Cにおいて インキュベートした。再生培地は、2週間の0.25M53S5BA(0,25 mg/ lの2.40.5mg/l BAP 、 IAS塩、3%シュクロース )であり、その後の植物の再生のためにMS3S培地に継代培養した。4〜lO 週間後、植物を、取り出し、そしてGA7’S中に置いた。11170 BT事 件となった我々の系KC640−1は、55の植物を作り出した。#171 B T事件となった我々の系KC640−7系は、全部で33植物を作り出した。 検定 それらがGA7’ sにおいて確立されるようになったとき、11の植物を、上 記の5hillito et alによるPPTに対する抵抗性についてクロロ フェノール・レッド(CR)によりテストした。この検定は、細胞がPPTの存 在中で増殖していることを示すためにpH感受性指示染料を使用する。増殖細胞 は、その培地中のpHの変更を作り出し、そしてこの指示薬を(赤から)黄色に 変える。PPTに対する耐性遺伝子を発現する植物は、このテストにより容易に 観察される。CRテストにより陽性な植物を、合成りT遺伝子の存在についてP CRにより検定した。(事件170 =37陽性/1B陰性;#171・25陽 性/8陰性)。 合成−Bt遺伝子についてのPCRによる陽性の植物を、フィトトロンに送った 。一旦、フィトトロン内で確立されれば、それらを、昆虫生物検定及びELIS A分析を使用して特徴付けした。植物を、標準的な欧州トウモロコシ穿孔性動物 検定(以下を参照のこと)を使用して昆虫生物検定を行い、ここで、植物から摘 み取った葉の小片を、多数のECB新生幼虫が入った小さいベトリ皿内に置いた 。植物を、典型的には、約6インチの高さにおいて検定した。本検定においてE CBに対し100%の死亡率を示す植物を、さらに特徴付けする。εLISAデ ータを以下に示す。陽性植物を、グリーンハウス内に移す。 Ba5taスクリーニング #170事件からの成熟植物の中の8つを、Ba5ta(Hoechstl耐性 の評価について選択した。植物毎に1つの中央の葉上て、約10−14 cm長 さX 葉幅の面積を、0.0.4.1.0又は2.0%(脱イオン水により10 0m1に希釈された200g/lの10m1)の水性Ba5taであって2滴の Tween 20/loOmlを含むものを塗布した。2つの植物を、レベル毎 にテストした。同一の概齢の8つの野性型6N615植物を、対照として処理し た。すべての植物を、4及び7日目に観察した。対照植物のすべてが最終的に死 に至った。本研究を通して、#170植物は、その除草剤によるダメージのいず れについても全く示さなかった。 受粉 #170及び#171植物上の、すべての雄穂(tassel ear)、第− 穂(first ear) 、入手可能な場合には、第二穂(second e ar)を、野性型6N615花粉により受粉させた。この植物の少なくとも90 %は、雌の結実能力があった。 #171植物からの花粉を、遺伝型6N615.5N984.5NA89.6F O10、5NA56.2N2+7AP 、2NDO1及び3N961に対し外部 交配させた。この植物の少なくとも90%は、雄の結実能力があることが示され た。 胚救出(Embryo Re5cue)#171事件からの胚を、”救出“した 。受粉後166日目日目14の、25−50粒をもつ穂の先端(ear trp )を、糸のこ(coping saw)によりその穂から切断した。切断に先立 って、皮(fusks)を、穏やかに剥きその穂の上の部分を露出させた。その 植物上の穂の切断端を、Captan殺菌剤て塗布し、そして皮を被せた。その 植物上に残った種を、自然に乾燥させた。 摘出した穂片を、20%C1oroxにより20分間表面滅菌し、そして無菌水 て3回濯いだ。個々の胚を、摘出し、そして胚盤側を上にして2%シュクロース を含むB5培地[Gamborg]上に置いた。B5ビタミンを、オートクレー ブ後にその培地に添加した。4つの胚を、GA7容器毎に入れ、そしてその容器 を、暗い中でインキュベートした。発芽か生じるとき、この容器を、明るい培養 室に移し、そして16時間明かり(50μE −m−”・s −’) /8時間 暗い光期間を使用して25°Cにおいてインキュベートした。この発芽の頻度は 、94%である。#171事件の中の15M物及び#176事件の中の2からの 子孫を、標準的な胚救出技術を使用して救出し、そして評価した。すべての植物 を、昆虫検定により評価した。#171事件からの植物を、組織化学的GUS検 定においてもテストした。昆虫検定及びGUS検定の両方において、転移遺伝子 の分離比は、単−座挿入事件について予想されるように、l:lてあった。 例48ニドランスジェニック植物ELISA検定の分析トランスジェニック・ノ イズ内でのcrylA(b)遺伝子発現の検出を、欧州トウモロコシ穿孔性動物 (ECB)昆虫生物検定並びに得られたcry[A(b)蛋白レベルの定量的測 定についてのEL[SA分析を使用して監視した。トランスジェニック植物の葉 内のcry[A(b) IPの定量的測定を、C1ark M F、 Li5t er RM、 Bar−Joseph M: ELrSA Technique s。 In: Wessbach A、Weissbach H(eds) Meth ods in Enzymology 118ニア42−766、 Acade mic Press、 Florida (1986)中に開示されているよう な酵素結合イムノソルベント検定(ELISA)を使用して行った。 免疫アフィニティー精製ポリクロナール・ウサギ及びヤギ抗体であ白mg当たり のIPのngを測定するために使用した。この2重すンドイッチELISAの感 度は、ELISAマイクロタイター皿well当たりの50μgの全蛋白を使用 して可溶性蛋白mg当たり1l−5n IPである。 トウモロコシ抽出物を、抽出バッフ −r (50mM Nat COs pH 9,5゜100mM NaC1,0,05%Triton、 0.05%Twe en 、 1mM PMSF及び1 μM ロイペプチン)の存在中で手でもっ たボール−ベアリング・ホモゲナイザー(AGDrA、 Elkart IN、 )を使用して細線プラスチック容器内で葉組織を破砕することにより調製した。 蛋白測定を、Bio−Rad(Richmond、 CA)蛋白検定を使用して 行った。 上記の手順を使用して、先に記載したような主要なメイズ形質転換体を、ELI SAを使用してcry[A(b)蛋白の存在について分析した。 これらの植物を、分析のときに、6インチから約3フイートまでの高さ内でばら ついていた。 植物 Bt ng/mg可溶性蛋白 5/27/91171−4A 59 171−14A 43 +71−15 55 171−16A 13 176−30 1160 ・ +71−31 166 +71−30 370 7]−14 #lO葉 26 1葉 17 植物171−16 49葉 40 41葉 120 欧州トウモロコシ穿孔性動物検定 1、1〜404cmセクションを、トウモロコシ植物の広がった葉から切断する 。 2、 それぞれの葉片を、50 x 9mmペトリ皿内の湿らせたフィルター・ ディスク上に置く。 3.5匹の新生欧州トウモロコシ穿孔性動物を、それぞれの葉片の上に置く。( 植物当たり全部で5−20幼虫とする)4、 ペトリ皿を、29.5°Cにおい てインキュベートする。 5、 葉の食べられたダメージ及び死亡率データを、24.48、及び72時間 目において得る。 酔:形質転換メイズ植物の子孫内でのStエンドトキシンの発現形質転換メイズ 植物を、十分に結実させ、そしてい(っかの遺伝子型のノイズと交配させた。こ れらの交配からの子孫を、標準的なECB生物検定(直前に記載したもの)にお ける欧州トウモロコシ穿孔性動物(ECB)のそれらの殺生能力につい云、並び に先に記載したようなELrSAを使用したcrylA(b)蛋白の存在につい て分析した。PCB殺生能力とcrylA(b)蛋白生産とは相関があった。こ れらの特性(traits)は、その子孫にl=1の比で分離され、その合成遺 伝子の活性コピーについて単一部位の挿入でることを示している。このl:lの 比は、構成的プロモーター/合成−crylA(b)植物及び組織特異的プロモ ーター/合成−crylA(b)植物(データを示さず)の両方につぃて真実で あった。 図23Aは、分析した子孫の全体数の小さなサブセットを含む表である。この表 は、多数の交配の代表である。 昆虫検定を、メイズ最適化CrYIA(b)遺伝子を含むトランスジエニ果を、 図238中に示す。これらは、形質転換メイズ内のメイズ最適pcI84431 から得られたキメラ花粉プロモーター/合成crylA(b)遺伝子を含む形質 転換メイズ植物の子孫を、畑において成熟まで成長させた。花粉を回収し、そし て他の場所で先に記載したような標準的なELrSA技術を使用してcrylA (b)蛋白の存在について分析した。 高いレベルのcrylA(b)蛋白を、その花粉内で検出した。35Sプロモ一 ター/合成crylA(b)形質転換植物からの子孫を、グリーンハウス内で成 長させた。これらの植物からの花粉を、EL[SAを使用して分析し、モしてc rylA(b)蛋白を検出した。 結果を、図23C中に示す。 植物系、植物遺伝型、合成配列、等の選択を含む要因も発現に影響することがで きることを認識した。 例51:髄好適プロモーターに融合されたcrylA(b)遺伝子の発現1)C [B4433(図36)は、ノイズから単離された髄好適プロモーターに融合さ れたメイズ最適化Cry [A(b)遺伝子を含むプラスミドである。 このプラスミドを、以下の。 1)BstEII及びBamHIにより切断されたpc[B4418; 1.8 Kb断片、2)Nsil及びBstEIIにより切断されたpBtinl; 5 .9Kb断片、(pBtinlは、本明細書中で他の場所に記載したものである 。)3)本明細書中で他の場所に記載したような標準的な条件を使用したPCR 反応において作られたPCR断片Vl−151゜から成る3方結合を使用して構 築した。 PCRプライマーは: KE150A28: 5−ATT CGCATG CAT GTT TCA T TA TC−3゜KE151A28: 5−GCT GGT ACCACG G AT CCG TCG CTT CTG TGCAACAACC−3゛ であった。 PCR反応後、このDNAを、アガロース・ゲル上でチェクし、その反応が適切 に進行下かどうかを確認した。DNAを、他の場所に記載したような標準的な条 件を使用したPCR反応から最終し、そしてその後標準的な条件を使用して制限 酵素Nsi[及びBamHIにより切断した。切断後、断片を、2%NuSie veゲル上で走らせ、そして所望のバンドを、他の場所に記載したように回収し た。DNAを、先に記載したような結合において使用した。 形質転換を、本質的に本明細書中で他の場所に記載したようなマイクロプロジェ クタイル・ボンバードメント(microprojectile bombar dment)を使用して行った。胚を、マイクロプロジェクタイル・ボンバード メントの24時間後、100μg/mlのPPTを含む培地に移した。得られた カルスを、4週間後、40μg/mlのPPTを含む培地に移した。植物は、選 択なしに再生された。 植物小サンプル(3−5)を、それぞれの事件についてPCRにより検・定した 。さらなるコートを、上記のマイクロプロジェクタイル・ホンバードメント装置 に関して、胚の異なる位置及び距離を示すために付加した。植物を、以下のコー ドをもつグリーンハウスに送った: JS21A TOP 植物B、t、 PCR陽性JS2+A MID 植物B、 t、 PCR陽性JS21CBOT 植物B、t、 PCR陽性JS22D M ID 植物B、t、 PCR陽性JS23B MID 植物B、t、 PCR陰 性(対照のためのもの)再生植物からの葉サンプルを1例48中に記載したよう に欧州トウモロコシ穿孔性動物に対する殺虫活性について生物検定した。結果を 、図23D中に示す。 葉内て発現されたCrylA(b)蛋白のレベルを定量するための葉サンプルの ELISA分析を、例48中に記載したように行った。結果を、図24E中に示 す。 寄託 以下のプラスミドを、ブタペスト条約の規定の下、AgriculturalR esearch Cu1ture Co11ection (NRRL)(18 18N、 University St、。 Peoria、 rL 61604)に寄託した:pCIB4418 、pcI B4420、pcIB4429、pc[B4431. pC[B4433、pc [B5601Spc[B5166及びpci83171゜本発明は、それらの特 異的な態様を参照しながら記載してきた;しかしながら、多くの変更、修正、及 び態様が可能であることは明らかであろう。したがって、このような変更、修正 、及び態様のすべてが、本発明の核心及び範囲内にあるものとして認識されるべ きである。 配列表 (い一般情報 (i)出願人: Evola、 5tephen V。 Crossland、 Lyle D。 Wright、 Marjha S。 Merlin、 Ellis J。 Launis、 にaren L。 Rothstein、 5teven J。 (1、発明の名称・メイズ内において強化された殺虫活性をもつ合成りNA(口 1)配列数5 (iv)通信住所。 (A)チバーガイギー・コーポレーション(CIBA−GEIGY Corpo ration)(B)番地: 75kyline Drive(C)市: Ha wthorne (D)州: New York (E)国: USA (F)郵便番号(ZIP) +10532(V)コンピューター読込形態: (A)媒体形式 フロッピーディスク (B)コンピューター:IBMPC互換性(C)オペレーティング・システム: PC−DOS/MS−DOS(D)ソフトウェアー:Patent[n Re1 ease H,0,version 11.25(vi)先行出願データ: (A)出願番号・US (B)出願口: (C)分類 (viii)代理人/ニーツエン)憤報CGGGGCCAGA ATTCAC丁 丁丁τ CCGCTATAτG GAACTATGGG 入AATGcAGcT  CCACAACMb+200 CACTAGCTCG TGTGAA入AGA GCGC−ACAAAA AA TGcACAGA CAAACGTCAA AAATTGG`AT 2760 GGCAAACAAA τATτGτTTAT AAACAGGCAA AAG AATCTGT AGATGCT?TA TTTGTAAAbT 2120 CATGTATAτCCτGGGTCAGG TGG’rτGTにCA C入A AC丁GCAG 、4360(2)配列番号 2 (1)配列の特徴 <A)配列の長さ 3474塩基対 (B)配列の梨 核酸 (C)鎖の数 一本領 (D)トポロン−直鎖状 (11)配列の種類 DNA (iii)ハイボセティカル 存り (1v)アンチ−センス 否 (vl)起源 (A)生物名 純粋なノイズ最適化合成りT CrylA(b)遺伝子(xi) 配列の記載 配列番号2 AACAGCATCA CCATCTACACCCACGCCCACCGCGG CCAGT ACTACTGCAG CGGCCACCAG@94;0 ATCAτGGCC入 GCCCCGTGGG CττCAGCGGCCCCC AGττCA CCττCCCCCT GTACGGC入Cb1020 GAGCACAAGCCCCTGGTGGG CCAGGCCCTG GCCC GCGTGA AGCGCGCCCA CAACAAGTGf 、2580 (cccAcAAcc GCGAG)JkGCT GGAGTGGG)+G A CCAACATCG 丁GTACAAGGA GGCCA^fCAG 2640 (2)配列番号 3 (1)配列の特徴 (^)配列の長さ 1961塩基対 (8)配列の型 核酸 (C)鎖の数・一本領 (D)トポロジー 直鎖状 (11)配列の種類 DNA (V蓄)起d1 CACACCAGCA TCGACGGCCG CCCCATCAACCAGG GCAACT TCAGCGCCACCAT(−AGCAGb,1680 GGCAGCAACCTGCAGAGCGG CAGCττCCGCACCGτ GGGCT TCACCACCCCCTτCAAC丁丁C1V40 (2)配列番号 ] (1)配列の特徴 (A)配列の長さ 3508塩基対 (B)配列の盟 核酸 (C)鎖の数 一本領 (0)トポロジー・直鎖状 (目)配ダクの種類 DNA (1v)アノチーセンス 否 (vl)起源 GTG丁GGGG丁C’l:ccAcAGccG CCACTGGATCAGG 丁ACAACCAGT丁CCGCCG CGAGC丁GACb720 CTGACC’;丁Gこ τGGACATCGT CAGCCTGTTCCCC AACTACG ACAGCCGCACCTACCCC入丁b711(I AGCCAGGACCTにGAGA丁C丁ACCτG入TCCGCTACλAC GCC入 AGこACCACACCGTGAACC;丁G Q340 CCCGGCACCG GCAGCCTGTに GCCCCTGAGCGCCC CCAGCCCCATCGGCAA GTGCGCCCACQ<o。 ATGTGATAGT ACにτAAGCTCCAG(s入子Cτ 35o8( 2)配列番号 5 (1)配列の特徴 (A)配列Iの長さ 1845塩基対 (B)配列の型 核酸 (C)鎖の数 一本領 (D)トポロジー 直鎖状 (11)配列の種類 DNA (1■)アンチ−センス 否 (vl)起源 (A)生物名 切り詰めemだ合成りT遺伝子(Perlak e4 al、) (xi)配列の記載 配列番号5 CGTATTCAGT ττGTGCCTGCCC,υ心τTACCττCCA GGCτGAGτAC1845370 :]80 390 400 410 4 20430 440 450 460 470 4B010301040105 010601[170108010901100111011201DO114 011501160117011[]0 1190 +2001270 128 0 1290 1’100 1310 1320葺1夏璽蔓棗 2940 2950 2960 2970 29B0 2990FIG、11 頁 1 1 1 1 1 夏 I 夏 I 葺 蒐 3360 3:370 3380 3390 3400 3410葺lI夏葺葺 葺 +0 20 30 40 50 60 I 葺 I 葺 I 菟 BTHKURHD A丁[11GATAACAATCCGMC^TC品TGMT GCATTCCTTATMTTGTTTMGTM口CCTG`A bssyn 、、、 、、C,、、、、C,、C,、、、、、、、C,、G、、 、、、C,、C,、C,、C,、CC,G、 、C,、、、AC,、C 70809010011012[I I It I 璽 麦 夏 BTHKURHD GTAGAAGTATTAGGTGGAGMAGMTAGA MCTGGTTACACCCCAATCG八TATTTCCsTG bssyn 、 、G、 、G。、GC,G、、C,、C,、GC,へ、、C, 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40 50 60東  1 1 電 ! 蒐 70 80 90 100 110’ 120FIG、3A FIG、3B 790800810820830E140II!夏葺璽 9+0 920 9:10 940 950 960i i i i 璽 1 970 980 990 1000 1oi010201 1 W 葺 蔓 夏 10:10 1040 1050 1060 1070 1080鼠 I 夏  夏 夏 夏 109[111011111(11120113011401150116Q  1170 118θ 119Q 12QQ1210 +220 1230 12 40 1250 12601270 1280 1290 1300 1310  +:3201:130 1340 1350 1360 1370 1380 D90 1400 1410 1420 1430 +440蚕 葺 夏 !  璽 1 1510 1520 15:10 1540 1550 15601 I 璽  1 1 1 16’10 1640 1650 1660 1670 +6801690 口 GO1710172(11730174017501760+770 17fl lO+790 1800葺蚕葺葺葺葺 2(+’s(1286G 2(170208020902100蚕I葺葺鼠葺 !葺I鷹II 2170 2180 2+90 2200 2210 222022]0 22 40 225[] 2260 2270 2280夏III葺璽 葺 ! 葺 蚕 葺 葺 葺夏葺葺I葺 夏夏夏璽11 頁葺夏東葺葺 璽 I W I 葺 葺 3010 3020 30:10 3040 3050 3060葺葺l璽夏! I璽璽葺葺葺 3250 3260 3270 3280 :]290 33003110 3 32[133:10 3340 3350 3360I 寮 寮 1 1 1 3370 3380 3390 :]400 3410 3420FIG、3J PHロNBT 、、、、、、、、C,、、、JC,CC,C,、G、、^、、、 、、、、、、、、、、、、、、C,、、、、、、、、、、CC、。 bssyn 、、C,、C,、C,、C,、CC,GC,C,、G、、、、、、 、、C,、C,、G、、、、、C5,、、、、、、、、、CC、。 PHロNBT T、G、、C,、A、、、、、C,、AT、G、、C,、、、、 C,、G、、C,、C,、、、、、、、、、、C,、G、、b,、G bssyn 、 、G、 、C,、、、、C,、C,、C,、G、 、C,、C ,、G、 、G、 、C,、C,、G、 、G、 、C,、fC,GAGC,、 G 四口NBT 、、C,、、、、、、、A、汀、 、 、C,T、 、CC,CA GC,、GCJC,、、、C,、、AGC,、、、、、、、f、 、 。 bssyn 、 、C,、G、 、G、 、C,、C,、CC,G、 、CC, GAGC,、GC,、C,C,、C,、CA[iC,、、、AC,、C,、G PHロNBT 、、、、、、、、、、、C,、、、、T、。八、、C,、、、、 、、、C,、、、、C,、C,、CCJ、、、、、、、、GA、。 bssyn C,C,、、、、C,、C,、C,、、、、C,、C,、、、、C ,、C,、C,、C,、C,、CC,G、、CC,C,、GA、C 6106206’lO640650660PHロNBT 1、^、、、、、C, 、C,、C,、C,、、、J、汀、、、、、、、、C,、T、、C,、G、、、 、、、、、C,、、、AT b5syn 、、、、、、、 、C,、C,、C,、C,、C,、G、 、、、 、、 、 、 、、 、C,、C,、CC,G、 、、 、@、C,、G、 、 、、 J 670 680 690 700 7+0 720bssyn 、、C,、CA GCC,C,、C,、、、、C,、G、、C,、C,、G、、CC,CC,C, 、GC,G、、C,、G、、CC、C PHロNBT 、、G、、C,、T、、G、、、、、C,、C,、、、、、、、 、、、CTCC,、、、、C,、C,、T、、C,、T、、A、、G bssyn C,G、、C,、、、、GAGC,、G、、C,、C,、、、、C ,、C,、CC,C,、C,、C,、C,、C,、C,、CC、C PM[INB丁 、、 、 、、、CJ、 、C,、、、、、、、C,、、、、 T、、 、、、、、 JCJ、 、G、 、C,、C,、CC、、、、C,、C bssyn AG、、、GC,G、、CC,C,、G、、、、、C,、C,、、 、、C,、GC,G、、G、、C,、C,、C,、C,、CC、C B50 860 870 880 890 900PHONBT 、J、汀、汀 、 、C,、A、 、T、 、C,、、、、CTCC,、C,、、、、C,、、 、、(、、、、、、、、、C,ACT、G bssyn 、 、C,、、AGC,、C,、、、、、、、C,、G、 、C, 、C,、CC,C,、C,、C,、CC,、、、、、、C,AC,、C 9109209]0 940 950 %0bssyn 、 、、、、C,、C ,、、、、、、、C,、C,、C,、C,、CC,C,、C,、G、 、C,、 C,、、!、 、C,、b,、C 97098099010001010+020夏 蔓 蚕 1 1 1 bssyn 、、C,、、、、CAGC,、C,、C,、C,、CAGC,、C ,、C,、G、、、、、C,、C,、C,、G、、C,、CC、C 10:io 1040 1050 1060 1070 10B01 1 棗  葺 1 1 bssyn 、、、、、C,、C,J、、A、J、、G、、G、、C,、C,、 G、、A、、G、、G、、C,、、、、A、、、、、CC,b 10901100111011201DO1140葺葺葺11棗 bssyn 、、、C,C,、G、 、、、、C,、C,、G、 、CAGC, 、、、、C,、G、 、C,、C,汀、、、、、C,、、、A、、、。 1270 12EIO12901300131013201 1 葺 葺 璽  葺 +500 1510 1520 1530 1540 1550璽111葺夏 bssyn 、G、 、CC,C,、CAGC,、C,、、、、、、、CAGC ,、、C,GC,C,、G、 、C,、C,、C,、C,、bC,GA 111夏棗葺 葺璽I璽璽璽 BTH囮四It CMTT[i^CGG^^GACCT^TT^^TCAGGG G^^TTnTCACiCAACTATG^GTAGT[ifGAGTA PMONBT 、C,、C,、、、、、、、G、、、、、C,、、、、、、汀、 、C,、C,、C,、、、、C,、、TCAl、C,、C,AC。 bssyn GC,、C,、、、、CC,C,、C,、C,、C,、、、、C, 、C,、CAGC,、C,、C,、、、、C,、C,、C,AC。 PM[]NET 、C,、G、、A、、、、、C,、、、、C,、^、、C,、 C,、、、、C,、、、、、、、T、 、C,、、、、C,AT、、C。 bssyn 、CC,G、 、 、八G、 、、C,、、、、CC,C,、C, 、G、 、C,、C,、C,、C,、C,、C,、、、、C`GC,、C。 PMONBT 、、、、、、、C,、T、、C,、CCJ、、C,、、、、、、 、G、、、、、、、汀、、、、、、、、、、、G、、C,汀B bssyn 、CAGC,、C,、G、 、C,、CC,G、 、C,、C,、 C,、G、 、 、 、 、CAGC,、、、、C,、G、@、G、 、C,、 C。 bssyn 、C,、C,、C,、G、、C,、G、、C,、C,、G、、G、 、、、、C,、、、、C,、G、、CGACCTGGAGAfGG bssyn CTCAGMGGCCGTGAACGAGCTGTTCACCAG CAGCAACCAGATCGGCCTGAAG^CCGAbG bssyn TGACC[1ACTACCACATCGATCA(lGTGTA GFIG、4F +0 20 30 40 50 60 I蒐藁葺!蒐 bssyn C,、、、、、、C,、C,、、、、CC,、、、、、、C,、G 、、、、、、、、、、、G、、G、、C,、GC,、AG、A、。 bssyn 、、、、、G、 、G、、C,、C,、C,、G、 、、、、G、  、、、、、、、G、 、C,、、、、C,、、、、、、、b,、C,、G bss辿 c、c、、、、、c、、、、、c、、c、、c、。、、、、、、C, 、、、、C,、、、、、、、、、、G、、CC,C,、、、AC bssyn 、、C,、、、、、、、、、、、、、、、、C,、(J、、C,、 、、、、、、、、、C,、、C,、、、、、、C,、G、、A、、。 裏 ! 璽 葺 1 1 夏葺葺!葺璽 PMONBT TT印ACATTCiTGTCTCTCTTC[1,CGAAC TATGACTCC^G晶CCTACCCTATCCGTAbAGTG bssyn C,、、、、、、C,、、AGC,、G、 、、、、C,、、、、 C,、、AG、C,C,、、、、、、、C,、、、、C,、b,、。 790 800 810 820 830 B40I 葺 璽 I 葺 I b5syn AG、、、G、、G、、、C,C1,[l+、汀、、C,、C,、 、、、C,、G、、G、、、、、、、、、、、、、、C,、A、、。 850 860 870 8B’l 890 9001 1 葺 葺 1 1 PH1PBT CGTGGTTCT[lCCCMG[JTATCGAA[1GC TCCATCAGGA[JCCCACACTTGAT[J[iACATCTTG bssyn 、、C,、CAGC,、、、、G、、C,、、、、G、、、AG、 、、、C,C1,、、、C,、、C,、、、、、、、、、、b,。 葺 夏 夏 夏 I 璽 PMONBT AACAGCATAACTATCτACAGCGATGCτCA CAGAG[l+AGAGT^TTACTG[1TCTGG`CACCAG bssyn 、、、、、、、、C,、C,、、、、、、C,、、C,、C,、、 C,C,、C,、、、、C,、、、、、AGC,、C,、、A、。 bssyn 、 、 、 、 、 、 、 、 、ACC,、C,、C,、C, 、、、、、、、C,、、、、、、、C,、、、、C,、C,AG、 、C,、C ,、C 葺夏夏葺11 PM[1NBT ATGGG^八^CGCへGCTCCACAACAACGTA TCGTTGCTC^^CTAGGTCAGGGTGTCT`CAGA bssyn 、 、、、、C,、、、J、 、A、 、T、 、G、 、G、  、C,、、、、G、 、A、 、G、 、G5.C,、、、A^、、[i、、、 C,C 10901100111011201130+140璽 葺 蚕 葺 璽 葺 PMONBT ACC丁T[1TCTTCCACCTTGTACAGAAGAC CCnCA^■^TCGGTATCMCMCCAGCMCTs bssyn 、 、 、C,、AGCAG、 、 、、C,、、、、C,TC, 、、J、 、、、、C,、、、、C1,、、、、、、、、、A、、G、、G 1150 1160 1+70 11[]0 1190 1200bssyn  AG、、、G、、G、、、、、C,、C,、、、、、、、、、、C,、C,、、 AGCAGC,、、C,、、、CAG、、、CC、G 蔓 ! 夏 ! I 棗 bssyn 、 、 、C,C,、、、、、、、C,、、、、G、 、CAG、 C,、、、、、、G、 、、 、、C,、T、 、、、 、A、 、 、、 、 C,、。 1270 1280 1290 +300 1:110 1320bssyn  、 、 、 、 、TC,^、、G、、C,、、AG、、、、CJC,、、、、 、、、、、、八G、、、、、、、、、CAGTA、C,、。 1:130 1:]40 1350 1360 1370 1380bssyn  、、、、、、、、CAG、、、、、、、、、、、、、C,T、、A、、、、、 、、、、^GC,,,,,,,,C,,C,,、A、C bssyn 、 、、、、 、、、、、、C,、、、、C,、CAG、AGC, 、G、 、、、、、 、、G、 、、、、CC,、、、、、A、^[JC,、C 1棗 ■ 夏 1 1 PつBT MCCTTGGATCTG5AACTTCTGTCGTGAAAGG ACCAGGCTTCACAGGAGGTGATATTCnbssyn 、、、 、、G、、CAGC,、C,、CAGC,、G、、、、、G、、C,、C,、、 、、、、、C,、C,、C,、C,、CC、G 1510 1520 1530 1540 1550 [5601111葺! 門開BT AGMGMCTTCTCCTGGCCAGATTAGCACCCTC AGAGTTMC^TCACTGCACC^CTTTCTbssyn C,CC ,C,、CAGC,、C,、、、、、、、C,、、、、、、、GC,C,、G、  、、、 、 、、 、C,、C,、b,、GAGC 葺冨聚I璽璽 PMONBT CAAAG^TATCGTGTCAGGATTC[iTTACG CATCTACCACTMCTTGCMTTCCAC^口CsCC bssyn 、 、GC,C,、C,、C,、、C,C,、C,、C,、、、、 CAGC,、、、、C,、、C,、、、G、 、、、、、、A 、AG。 16:10 1640 1650 +660 1670 1680夏 夏 1  1 1 1 bssyn 、、、、、、、、CC,C,、C,、、、、C,、、、、C,、、 、、、八G、、、C1,、、、、AGC,、、、、、、、、A、。 1690 1700 1710 1720 +730 1740葺I蔓11蔓 PMONBT TTGCAATCCGGCAGCnCAGAACCGTCGGT nCACTACTCCTnCMCTTCTCTMCGGAbssyn C,、、 、GAG、、、、、、、、、、C,C,、、、、G、、C,、、、、C,、C, 、C,、、、、、、、、AGC,、、A、C 17501760+770 1780 1790 1800葺葺葺葺璽葺 PM[]NBT TCAAGCGTTTTCACCCTTAGCGCTCATG TGnCMnCTGGCMTGAAGTGTACATTGAb bssyn AGC,、、、、G、、、、、、、、G、、、、、C,、C,、、 、、、、、CAGC,、、、、C,、G、、、、、、、、CC、。 bssyn 、、C,、C,、、、、C,、、、、C1,、、、G、、G、、、 、、、、、、、、C,、、、、CGACCTGGAGAGGfCT bssyn CAGMGGCCGTG^ACGAGCTG丁TCACCAGCA GCMCCAGATC[lGCCTGMGACCGAC[IsG bssyn ACCGACTACCACATCG^TCAGGTGTAGLeu rleAsn GlnGInlle ThrGluAsnAlc ArgAsn Thr^1nLeuAIu ArgLeuGlnGI■ 364C取1GCGACA GCTTCC凹GCCTACCAGCAG AGC CTGGAGG^CT凹CTGG^G晶CCGCG醍LeuGIyAsp Se rPheilrg^1aTyrGlnGIn 5erLeuGlu AspTr pLeu GIuAsnArg^Tp 424 [1ACGCCCGCA CCCGCAGCGT GCTGTACAC CCAGT^CATCG CCCTGG^印T [lGACsTCCTG AspAlaArg ThrArgSer VclLeuTyrT)y GIn Tyrllp^InLeuGIu LeuAspPhpLe■ 484 AACGCCATGCCCCTGTTCGCCATCCGCAACCA GGAGGTGCCCCTGCTGAT GGTGT^CGbC AsnAIaMet ProLeuPheAIc+IIeArgAsn GIn GluVnl ProLeuLt+u MetVn[Tyr`Ia 544 CAGGCCGCCA ACCTGCACCT GCTGCTGCTG  CGCGACGCCA GCCTGTTCGCi CAGbGAGTTC GlnAlaAln^5nLeu)IIs LeuLeuLeuLeu Arg ^5PAIQ 5erLeuPhe GlySerGIuP■■ 604 GGCCTGACCA GCCAGGAG^T CCAGCGCTAC TACGAGCGCCAGGTGGAGCG CACCCGbGAC GIyLeuThr 5erGlnGlu IleGInArg丁yr Tyr GIuArg GInVcilGlu ArgThrArg`sp 664 TACAGCGACT ACTGCGTGGA GTGGTACAAC ACC(i(iCCTGA ACAGCCTGCG CGGbA匡鯖C TyrSerAsp 丁yrCysVcl GluTrpTyr^sn Thr GlyLeu Asn5erLeu ^rgGIyThr^Tn ^1(L^IaSpr TrpVclArg TyrAsnGlnPhp Ar gArg^sp LeuT)yLeu GlyVclLeu`sp 784 CTGGTGGCCCTGnCCCCAG CTACGACACCCG CACCTACCCCATCAACACCA[11C(lcbcAG しeuVnlAIn LeuPhePro XerTyrAspThr Arg ThrTyr Prol IeAsn ThrSerAInfIn 844 CTGACCCGCG AGGTGTACACC[1ACGCCATC GGCGCCACCG GCGTGAACAT GGCCAfCATG LeuThr^rg GluVa1丁yr 丁hrAsp^1alle Gly ^IaThr GlyVclAsn MetAluSerM■■ 904 ^ACT[1GTACA ACMCAACGCCCCCAGCTTCA GCGCCATCG AGGCCIff、GCいTCC[l撃b^GC 八5nTrへTyr AsnAsnAsn AIQProSerPhe 5er Alαllp GIuAldln Alulle^rgSe■ 964 CCCCACCTGCTGGACTTCCT GGAGCAGCTG  ACCATCTTCA GCGCCAGCAG CC[1CsGGAGC ProH1sLeu LeuAspPhe LeuGluGlnLeu Thr l 1ePhe 5erAlcSer SerArgTrprpr 1024 AACACCC[ICCACATGACCTA CTGGCGCGG CCACACCATCCAGAGCCGCCCC^TC[1PGC(IGc ^5nThrf!rg HlsMet丁hr TyrTrpArgGIy Hl sThrlle GlnSerArg ProlleGlyfIy 1084 GGCCTGAACA CCAGCACCCA CGGCGCCAC CAACACCAGC^ TCAACCCCGT GACCbTGCGC GlyLeuAsn ThrSt+rThr HlsGlyAlcThrへ5n Thrser IIeAsnPro VnlThrLeuA窒■ 1144 丁TC[l+CCAGCCGCGACGTGTA CCGCACCG AG AGCTACGCCG GCGTGCTGCT GTfGGGCATC PheAIcSpr ArgAspVcl TyrArgThrGIu 5er TyrAln GlyValLeu LeuTrpGlyl撃■ 1204 TACC丁GGAGCCC^TCCACGG CGTGCCCACC GTGCGCTTCA ACTTCACCAA CCCCC`GAAC TyrLpuGlu Prol 1e)IIs GlyValProThr V clArgPheAsnPhpThr AsnProGlnO5n 1264 ^TCAGCGACCGCGGCACCGCCAACTACAGCC AGCCCTACG AGAGCCCCGG CCTGCAfCTG lleSerAsp ArgGlyThr ^1nAsnTyrser Gln ProTyr GIuSerPro GIyLeuGlnL■■ 1324 AAGGACAGCG AGACCGAGCT GCCCCCCGA G ACCACCGAGCGCCCCAACTA CGAG`GCTAC しy5へ5pspr GluThrGlu LeuProProGlu Thr ThrGIu ArgProAsn TyrGIuSerT凾■ l:184 AGCCACCG[、CTGAGCCACAT CGGCATCA TCCTGCAGAGCCGCGTGAACGT GCCCfT[IT^C 3prH1s#g LeuSerH+s 11eGlyllelle LpuG lnSpr #gVnl^sn VnlProVclTyrFIG、6D 961 ATCATG[11CCA GCCCCGTCGG CTTCAGCG GCCCCGAGTTCA CCnCCCCCT 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べξ沓講ミミ吋寡51.j、、AV2日 リロリド3訂6a訂じ韮島韮璽5u 葺ぎ 蛙=9ζす纂ミョミU髄3S目 璽3 FIG、31 内部葉鞘 (inner 1eaf 5heath)内部葉輪生 (inner 1eaf wharf)緑葉(green 1eaf) 毛(silk) 仁(kernel) 髄(p i th) 根(root) FIG、12 oo[C0P(pl* YSPGKELGQGQfCVτ−LCTHRTSCt (L^CK月A(IIKLAAREOvOOVRREVOImHHLSI:0P NVVCLRCAY[+62マ CLC,Cr v : (τS ム(1(L、 AILQ(l L PNvL−o争om2DI++vOLFc[Lc(CArS VVRRCVK(TSτCRY^&(1+kT(KLSAROM・G(L[R[ A111bRLL(・NPNIVIILNC5i5g1DolC:PKp=n二 (O5vI4LVMELCAC1;[LFDR11^RCCYTERCA&[L LR^lVOIVMTCH5MCVlH1ttlltPENFLLLS(DCD A232Lv L :ccεLF 1 A3 マ[^ l:: VI M :: :MRO:cl’EN:LL5に、:iPc+j Dk2 tufi EE(i FMYLV「0LVTclJLFεDIVAR[YYS[^OASHCIHOI LESVNHIMOlOIVMllQLKP[NLLLAS(CKCA Is’ oo−COP(6+*jLl&TDrCLSVl’T([CfLLR−01VC SムママiムP[VL(11に一マcpCムO1’11SVbVNLマ1rLA cVPPrVAIN[’1c3oCKIDfCL::1..:::+JY::P tVL::マ(F、OIW+CV:LY嘗り、CPPrvε’0Zpk2o+^ ^vcLaorcLa+tvoctooAwcrムC?PCYLSP[VLRK OPYGKllVDIVACCVILYhLLV(iYPPrWO[DOH(2 2DolCDPxpan!rTAILRCOLDLSS[PWPHISPCA( OLV(KMLll:Hρ(ERLT&rロVLNHPシl(m0COAPOτ PLDmVVLOllL37(!lCO::S’W::PAK:L:::WLI NPQ:IAOL:’AP’d:’:: ニーL・a+912Hニー+−”00 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HlsVcil SerMetPhe ArgSerGlyohe 1321 AGCAACAGCA GCGTGAGCAT C^TCCGTGC A CCTATGTTCA GCTGGATTCA CCGbAGTGCC Ser^5nspr 5erValSpr IIelleArgAln Pro HetPhe 5erTrpHe Hls^rgSerへ(■ GluPheAsn Asn11elle ProSerSt+rGIn 11 eThrGIn IIPProLeu T)yLyssershr +441 AAff、TGG[3CA GCGGCACCA[li C(iTG GT[iMG G[1CCCCGGCT TCACCGGCfG CGACAT CCTG ^5nLeu[ily 5erGIyThr 5erValVclLys Gl yProGIy PheThrGly GlyAspIIekeu GlnArgTyr ArgVnlArg IIeArgTyrAla 5er ThrT)y^5nLeuGIn PheH1sThrSe■ 1621 ^TCGACGGCCGCCCCATCM CCAGGGCMCTT CAGCGCCA CCATGAGCAG CG匡AGC品b 11eAspGly ArgProlle AsnGInGIyAsn Php Ser^(a ThrMetSer 5erGIySerA唐■ 1681 CT[JCA[IAGCG GCAGCTTCCG CACCGTG GGCTTCACCACCCCCTTCMCTT CAGC`ACG(iC LeuGlnSer GIySerPhe ArgThrValGly Php ThrThr ProPheAsn PheSerAsnG撃■ 1741 AGCAGC[1TGT TCACCCTG^(i CGCCCAC [JTG TTCAACAGCG GCAAC品GGT GsAC^TC晶C 3erSt+rVcl PheThrLeu 5prAlaH1sVal Ph eAsnSt>r GlyAsnGlu ValTyrll■`sp 1801 C[ICATCGAGT TCGTGC[1,CGCCGAGGTG ACCTTCIIIAGGCCG AGTACG^匡TGGOAG邪CT Argl IpGlu PheValPro AlcGluValThr Ph pGIuAlc GIuTyrAsp LeuGluArgOIQ 1861 CAGAAGGCCG TGAACGAGCT GTTCACCAG CAGCMCCAGA TCIJ(IccTIJM GACbGACG丁6 GInLysAlc+ VclAsnGIu LeuPheThrSer 5e rAsnGln I 1eGlyLeu LysThrAs垂ual +921 ACC[IACTACCACATCGATCA AGTATCCMT  TTAGnGA[iT GTTTATCTG^ 丁GA^snTGT ThrAspTyr Hlsl 1eAsp GlnValSerAsn LE ILIVlllGILJ CysLeuSer^spG I浮ohpCys 1981 CTGGATGAAA AAAAAGAATT GTCCGAGAA A GTCMAC^TG CGMGCGACT TAGTGOTGAG LeuAspGlu LysLysGlu LeuSerGluLys VQI LY5HIS AlaLysArg Lt+uSerAspflu 2041 CGGMTTTACTTCAAGATCCAAACTTTAGA G GG^TCAATA [iACMCTAGA CCGTGGbTG[i Arg^5吐eu LpuGInAsp Pro^snPheArg Glyl leAsn ArgGInLeu AspArgGIyTr■ ArgGIySer ThrAspI le Thrl 1eGlnGly G lyAspAsp VclPheLys GluAsnTy窒un1 2161 ACGCTAnGG GTACCnTGA TGAGTGCTAT  CCAACGTATT T^TATCMM^^■^GAT[hAG 丁hrLeuLeu GlyThrPhe AspGIuCysTyr Pro ThrTyr LeuTyrGIn LyslleAspG撃■ 2221 TCG^^ATTAA MGCCTATACCCGTTACC^^T TAAGAGGGT^■^TCGAAGA T^GTCAAfAC St+rLysLeu Lys^1nTyr ThrArgTyrGIn Le uArgGIy TyrlleGIu AspSerGIn`sp 2281 TT^弘晶TCT ATTT品TTCG CTACA^TGCCAA ACACGAAA CAGTA^^TGT [1CCACifTACG LeuGlulle TyrLeulle ArgTyrAsnAlci Ly sHIsGlu ThrVnlAsn ValProGIyshr 2341 GGTTCCTTAT GGCCGCnTCAGCCCCAAGT  CCAATCGG^^A^TGTGGGGA GCCG^^sCGA GlySerLeu 丁rpProLeu Ser^1nProser Pro lleGly LysCysGly GluPro^snA窒■ CysAIaHis HlsSerHIs HlsPheSerLeu Asp HeAsp VclGlyCys ThrAspLeu^5■ 2521 GAGGACTTAG GTGT^TGGGT GATATTCMG  AnMGACGCAAGAT6GCCA TGCMGACs^ GluAspLeu GIyVclTrp V+1+11ePheLys I  IeLysThr GInAspGly Hls^lcAr■keu 3541GAA丁Aへ Glu−−− FIG、37E フロントページの続き (81)指定国 EP(AT、BE、CH,DE。 DK、ES、FR,GB、GR,IE、IT、LU、MC,NL、SE)、0A (BF、BJ、CF、CG、CI、 CM、 GA、 GN、 ML、 MR, SN、 TD、 TG)、 AU、 BB、 BG、 BR,CA、 C3,F I、 HU。 JP、 KP、 KR,LK、 MG、 MN、 MW、 No、 PL、 R O,RU、 SD、 US (72)発明者 ルイス、ケリー ニス。 アメリカ合衆国、ノース カロライナ 27278 、ヒルズボロー、ラトーニ ドライブ1508 (72)発明者 クラマー、パンス シー。 アメリカ合衆国、ノース カロライナ 27278 、 ヒルズポロー、ダナ コート 608(72)発明者 ウォー レン、グレゴリ−ダブリュ。 アメリカ合衆国、ノース カロライナ 27513 、キャリー、ボン〜ド レイク ドライブ 324 (72)発明者 エボラ、ステイーブン ブイ。 アメリカ合衆国、ノース カロライナ 27502 、アペックス、イースト ビーチモント サークル 1013 (72)発明者 クロスランド、ライル ディー。 アメリカ合衆国、ノース カロライナ 27514 、チャペル ヒル、ピンチヨツトレーン 108 (72)発明者 ライト、マーサ ニス。 アメリカ合衆国、ノース カロライナ 27511、キャリー、プリンス ウィリアムレーン 106 (72)発明者 マーリン、エリス ジェイ。 アメリカ合衆国、ノース カロライナ 27615 、 ラレイ、ストーンゲイト ドライブ8605 (72)発明者 ローニス、カレン エル。 アメリカ合衆国、ノース カロライナ 27525 、フランクリントン、サドルビューレーン 104 (72)発明者 ロススティン、ステイーブン ジエイ。 カナダ国、オンタリオ エフ1ニー lニー5.ギュールフ、フィールドストー ン′ ロード 15

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.昆虫を殺すことができる蛋白をコードしているメイズ最適化コード配列を含 んで成るヌクレオチド配列。 2.コード配列がB.t.蛋白をコードしている、請求項1に記載のヌクレオチ ド配列。 3.コード配列がCryIA(b)蛋白をコードしている、請求項2に記載のヌ クレオチド配列。 4.コード配列が、配列番号3、配列番号4、又は図7中に記載した配列を含ん で成る、請求項3に記載のヌクレオチド配列。 5.コード配列が生来のCryIA(b)蛋白と比較して熱安定性であるCry IA(b)蛋白をコードしている、請求項3に記載のヌクレオチド配列。 6.コード配列が、図9、図11、図13及び図15から成る配列群から選ばれ た配列を含んで成る、請求項5に記載のヌクレオチド配列。 7.コード配列がCryIB蛋白又はCryIA(c)蛋白をコードしている、 請求項2に記載のヌクレオチド配列。 8.コード配列が図6中に記載したCryIB蛋白をコードしている配列を含ん で成る、請求項7に記載のヌクレオチド配列。 9.植物細胞内でヌクレオチド配列を発現させることに向けられることができる 第一プロモーターであってそのコード配列に作用可能な状態で結合されているも のをさらに含んで成る、請求項1に記載のヌクレオチド配列。 10.プロモーターをメイズ細胞内でその結合されたコード配列を発現させるこ とに向けることができる、請求項9に記載のヌクレオチド配列。 11.プロモーターが誘導性プロモーター、構成的プロモーター、一時的なプロ モーター又は発展的に調節されたプロモーター、組織好適プロモーター、及び組 織特異的プロモーターから成る群から選ばれている、請求項9に記載のヌクレオ チド配列。 12.CaMV35Sプロモーター、CaMV19Sプロモーター、PEPカル ボキシラーゼ・プロモーター、髄好適プロモーター、及び花粉特異的プロモータ ーから成る群から選ばれている、請求項9に記載のヌクレオチド配列。 13.プロモーターが図24中に記載されたDNA配列を含んで成る髄特異的プ ロモーターである、請求項9に記載のヌクレオチド配列。 14.プロモーターが図35中に記載されたDNA配列を含んで成る花粉特異的 プロモーターである、請求項9に記載のヌクレオチド配列。 15.植物細胞内で関連コード配列を発現させることに向けられることができる 第二プロモーターであって第二コード配列に作用可能な状態で結合されているも のをさらに含んで成る、請求項9に記載のヌクレオチド配列。 17.第二プロモーターが誘導性プロモーター、構成的プロモーター、一時的な プロモーター又は発展的に調節されたプロモーター、組織好適プロモーター、及 び組織特異的プロモーターから成る群がら選ばれている、請求項15に記載のヌ クレオチド配列。 18.第二プロモーターがCaMV35Sプロモーター、CaMV19Sプロモ ーター、PEPカルボキシラーゼ・プロモーター、髄好適プロモーター、及び花 粉特異的プロモーターから成る群から選ばれている、請求項15に記載のヌクレ オチド配列。 21.第二コード配列が昆虫を殺すことができる蛋白をコードしている植物最適 化コード配列である、請求項15に記載のヌクレオチド配列。 22.第二コード配列がB.t.蛋白をコードしている、請求項21に記載のヌ クレオチド配列。 23.第二コード配列がCryIA(b)蛋白をコードしている、請求項22に 記載のヌクレオチド配列。 29.第二コード配列がマーカー遺伝子である、請求項15に記載のヌクレオチ ド配列。 30.請求項9に記載のヌクレオチド配列を含んで成る、組換えベクター。 31.請求項9に記載のヌクレオチド配列であってそのコード配列がB.t.蛋 白をコードしているものを含んで成る、組換えベクター。 32.B.t.蛋白がCrylA(b)蛋白である、請求項31に記載の組換え ベクター。 33.請求項15に記載のヌクレオチド配列を含んで成る、組換えベクター。 34.請求項18に記載のヌクレオチド配列を含んで成る、組換えベクター。 35.請求項22に記載のヌクレオチド配列を含んで成る、組換えベクター。 36.請求項9に記載のヌクレオチド配列により安定的に形質転換された植物。 37.請求項12に記載のヌクレオチド配列により安定的に形質転換された植物 。 38.第二コート配列がB.t.蛋白をコートしている、請求項36に記載の植 物。 39.蛋白がその植物内で鱗翅目又は鞘翅目の昆虫を制御するのに十分な量で発 現されている、請求項36に記載の植物。 40.B.t.蛋白がCrylA(b)蛋白である、請求項38に記載の植物。 41.B.t.殺虫性蛋白を鱗翅目又は鞘翅目の害虫を制御するのに十分な鼠で 発現している、請求項38に記載の植物。 42.その量が、欧州トウモロコシ穿孔性動物(Europeancornbo rer)、サトウキビ穿孔性動物(sugarcaneborer)、マダラメ イガ(stalkborer)、ネキリムシ(cutworms)、アワヨトウ の幼虫(armywormS)、植物の根を食う昆虫の幼虫(rootworm s)、コメツキムシの幼虫(wireworms)及びアブラムシ(aphid s)から成る群から選ばれた昆虫を制御するのに十分なものである、請求項38 に記載の植物。 43.請求項15に記載のヌクレオチド配列により安定的に形質転換された植物 。 44.請求項18に記載のヌクレオチド配列により安定的に形質転換された植物 。 45.第一コード配列及び第二コード配列のそれぞれがB.t.蛋白をコードし ている、請求項43に記載の植物。 46.B.t.殺虫性蛋白を鱗翅目又は鞘翅目の害虫を制御するのに十分な量で 発現している、請求項38に記載の植物。 47.その量が、マダラメイガ(stalkborer)を制御するのに十分な ものである、請求項46に記載の植物。 48.植物内で結合構造遺伝子の髄好適発現に向けられることがきる単離及び精 製されたプロモーター。 49.単子葉から単離された、請求項48に記載のプロモーター。 50.メイズ(maize)植物から単離された、請求項48に記載のプロモー ター。 51.植物のトリプトファン・シンターゼーアルファ(TrpA)サブユニツト 遺伝子から単離された、請求項48に記載のプロモーター。 52.メイズのトリプトファン・シンターゼーアルファ(TrpA)サブユニッ ト遺伝子から単離された、請求項51に記載のプロモーター53.図24中に記 載された配列を含んで成る、請求項48に記載のプロモーター。 54.請求項48に記載のプロモーターであって問題の蛋白をコードしている構 造遺伝子と作用可能な状態で結合しているものを含んで成る組換えDNA分子。 55.構造遺伝子が殺虫性蛋白をコードしている、請求項54に記載の組換えD NA分子。 56.構造遺伝子がバチルス・スリンギエンシス(Bacillusthuri ngiensis)の蛋白をコードしている、請求項55に記載の組換えDNA 分子。 57.請求項54に記載の組換えDNA分子を含んで成る、ベクター58.構造 遺伝子が殺虫性蛋白をコードしている、請求項57に記載の組換えDNA分子。 59.構造遺伝子がバチルス・スリンギエンシス(BaciIIusthuri ngiensis)の蛋白をコードしている、請求項57に記載の組換えDNA 分子。 60.少なくとも2つの請求項54に記載の組換えDNA分子を含んで成るベク ターであって、その2つの構造遺伝子の中の少なくとも1つが殺虫性蛋白をコー ドしているベクター。 61.請求項54に記載の組換えDNA分子により安定的に形質転換されている 植物。 62.メイズ植物である、請求項61に記載の植物。 63.植物内で結合構造遺伝子の花粉特異的発現に向けられることができる精製 プロモーターであって、植物のカルシウム−依存性ホスフェート・キナーゼ(C DPK)遺伝子から単離されているプロモーター64.単子葉CDPK遺伝子か ら単離されている、請求項63に記載のプロモーター。 65.メイズCDPK遺伝子から単離されている、請求項63に記載のプロモー ター。 66.図35中に記載された配列を含んで成る、請求項65に記載のプロモータ ー。 67.請求項63に記載のプロモーターであって問題の蛋白をコードしている構 造遺伝子と作用可能な状態で結合しているものを含んで成る組換えDNA分子。 68.構造遺伝子が殺虫性蛋白をコードしている、請求項67に記載の組換えD NA分子。 69.構造遺伝子がバチルス・スリンギエンシス(BaciIIusthuri ngiensis)の蛋白をコードしている、請求項68に記載の組換えDNA 分子。 70.少なくとも1つの請求項67に記載の組換えDNA分子を含んで成るベク ター。 71.構造遺伝子が殺虫性蛋白をコードしている、請求項70に記載のベクター 。 72.構造遺伝子がバチルス・スリンギエンシス(BaciIIusthuri ngiensis)の蛋白をコードしている、請求項71に記載のベクター。 73.2つの組換えDNA分子を含んで成る請求項70に記載のベクターであっ て、その2つの構造遺伝子の中の少なくとも1つが殺虫性蛋白をコードしている ベクター。 74.請求項67に記載の組換えDNA分子により安定的に形質転換されている 植物。 75.メイズ植物である、請求項74に記載の植物。 76.少なくとも1つの組換えDNA分子により安定的に形質転換されているメ イズ植物であって; そのDNA分子が殺虫性蛋白をコードしているヌクレオチド配列に作用可能な状 態で結合されているプロモーターを含んで成り、そのプロモーターがそのメイズ 植物内でその遺伝子の組織好適発現又は組織特異的発現に向けられることができ る、ようなメイズ植物。 77.その遺伝子がバチルス・スリンギエンシス(BaciIIusthuri ngiensis)の蛋白をコードしている、請求項76に記載のメイズ植物7 8.そのプロモーターが単子葉から得られる、請求項76に記載のメイズ植物。 79.その単子葉がメイズである、請求項78に記載のメイズ植物80.そのプ ロモーターがそのメイズ植物内でその遺伝子の髄好適発現に向けられることがで きる、請求項76に記載のメイズ植物。 81.そのプロモーターが植物のトリプトファン・シンターゼーアルファ・サブ ユニット遺伝子から得られる、請求項76に記載の植物82.そのプロモーター がメイズのトリプトファン・シンターゼーアルファ・サブユニット遺伝子から得 られる、請求項76に記載の植物。 83.そのプロモーターが図24中に記載した配列を含んで成る、請求項82に 記載の植物。 84.そのプロモーターがそのメイズ植物内でその遺伝子の緑組織特異的発現に 向けられることができる、請求項76に記載のメイズ植物。 85.そのプロモーターがPEPカルボキシラーゼ・プロモーターである、請求 項84に記載のメイズ植物。 86.そのプロモーターがそのメイズ植物内でその遺伝子の花粉特異的発現に向 けられることができる、請求項76に記載のメイズ植物。 87.そのプロモーターが植物のカルシウム依存性ホスフェート・キナーゼ遺伝 子から得られている、請求項76に記載のメイズ植物88.そのプロモーターが メイズのカルシウム依存性ホスフェートキナーゼ遺伝子から得られている、請求 項76に記載のメイズ植物。 89.そのプロモーターが図35中に記載した配列を含んで成る、請求項76に 記載のメイズ植物。 90.殺虫性B.t.蛋白のためのメイズ最適化コード配列を生産する方法であ って: 所定の殺虫性B.t.蛋白のアミノ酸配列を決定し、そして、メイズ内で最も好 ましいコドンと対応する生来のコドンとを置き換えることによりその蛋白のコー ド配列を変更する、ことを含んで成る方法。 91.少なくとも1つの昆虫害虫に対してメイズ植物を保護する方法であって: メイズ植物を、少なくとも1つの請求項9に記載のヌクレオチド配列であってそ のコード配列が殺虫性蛋白をコードしているものにより安定的に形質転換し;そ れにより、この形質転換されたメイズ植物が、その害虫に対してその植物を保護 するのに十分な量でその殺虫性蛋白を発現する、 ことを含んで成る方法。 92.その殺虫性蛋白がB.t.蛋白である、請求項91に記載の方法。 93.そのプロモーターが組織特異的プロモーター又は組織好適プロモーターで ある、請求項91に記載の方法。 94.ヌクレオチド配列により安定的に形質転換されている植物であって、その ヌクレオチド配列が、殺虫性蛋白のためのメイズ最適化コード配列を含んで成り 、その蛋白が、生来のコード配列を使用してその蛋白が発現されるよりも少なく とも100倍の大きさでその形質転換された植物内で発現されているような植物 。
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