JP7177127B2 - 共役(conjugated)アンチセンス化合物およびそれらの使用 - Google Patents

共役(conjugated)アンチセンス化合物およびそれらの使用 Download PDF

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本出願は、配列表とともに電子形式で出願されている。この配列表は、2014年5月1日に作成された692KbのサイズのCORE0115WOSEQ_ST25.txtという名前のファイルとして提供される。この配列表の電子形式の情報は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
アンチセンス技術の背後にある原理は、アンチセンス化合物が標的核酸にハイブリダイズし、標的核酸の量、活性、および/または機能を調節することである。例えば、ある特定の事例において、アンチセンス化合物は、標的の転写または翻訳の変化をもたらす。発現のそのような調節は、例えば、標的mRNA分解または占有に基づく阻害によって達成され得る。分解によるRNA標的機能の調節の一例には、DNA様アンチセンス化合物とのハイブリダイゼーション時の標的RNAのRNase Hに基づく分解がある。標的分解による遺伝子発現の調節のもう1つの例には、RNA干渉(RNAi)がある。RNAiは、RNA誘導サイレンシング複合体(RISC)を利用する機構を介したアンチセンス媒介性遺伝子サイレンシングを指す。RNA標的機能の調節のさらなる例は、マイクロRNAによって自然に用いられる機構等の占有に基づく機構によるものである。マイクロRNAは、タンパク質コードRNAの発現を調整する小非コードRNAである。マイクロRNAへのアンチセンス化合物の結合は、そのマイクロRNAのそのメッセンジャーRNA標的への結合を防ぎ、それ故にマイクロRNAの機能を妨げる。マイクロRNA模倣物は、生来のマイクロRNA機能を高めることができる。ある特定のアンチセンス化合物は、プレmRNAのスプライシングを変化させる。特異的機構にかかわらず、配列特異性は、標的の検証および遺伝子の機能化の手段、ならびに疾患の発病に関与する遺伝子の発現を選択的に調節する治療薬としてアンチセンス化合物を魅力的なものにする。
アンチセンス技術は、1つ以上の特異的な遺伝子産物の発現を調節するのに効果的な手段であり、それ故に、多くの治療的用途、診断的用途、および研究用途に一意的に有用であることが判明し得る。化学修飾ヌクレオシドは、アンチセンス化合物に組み込まれ、標的核酸のヌクレアーゼ耐性、薬物動態、または親和性等の1つ以上の特性を強化することができる。1998年、アンチセンス化合物であるVitravene(登録商標)(ホミビルセン、Isis Pharmaceuticals Inc.(Carlsbad,CA)によって開発されたもの)が、アメリカ食品医薬品局(FDA)の販売許可を得た最初のアンチセンス薬物であり、現在、AIDS患者におけるサイトメガロウイルス(CMV)誘導性網膜炎の治療薬である。別の例として、ApoBを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドであるKYNAMRO(商標)が、ホモ接合性家族性高コレステロール血症(HoFH)を有する患者における低密度リポタンパク質コレステロール(LDL-C)、ApoB、総コレステロール(TC)、および非高密度リポタンパク質コレステロール(非HDL-C)を低下させるための脂質低下薬および食生活の補助治療薬としてアメリカ食品医薬品局(FDA)の承認を受けている。
新たな化学修飾は、アンチセンス化合物の強度および有効性を改善しており、経口送達の可能性を見出し、皮下投与を強化し、副作用の可能性を減少させ、患者の利便性の向上につながっている。アンチセンス化合物の強度を増加させる化学修飾は、低用量の投与を可能にし、毒性の可能性を減少させ、全体の治療費を削減する。分解に対する耐性を増加させる修飾は、体内からのより緩徐な排除をもたらし、投薬頻度の低下を可能にする。異なる種類の化学修飾を1個の化合物内で組み合わせて、化合物の有効性をさらに最適化す
ることができる。
ある特定の実施形態において、本開示は、共役(conjugated)アンチセンス化合物を提供する。ある特定の実施形態において、本開示は、核酸転写物に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンス化合物を提供する。ある特定の実施形態において、本開示は、細胞を核酸転写物に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンス化合物と接触させることを含む方法を提供する。ある特定の実施形態において、本開示は、細胞をアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンス化合物と接触させることと、細胞内の核酸転写物の量または活性を低減させることと、を含む方法を提供する。
アシアロ糖タンパク質受容体(ASGP-R)が以前に説明されている。例えば、Park et al.,PNAS vol.102,No.47,pp17125-17129(2005)を参照されたい。そのような受容体は、肝臓細胞、具体的には、肝細胞上で発現する。さらに、3個のN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)リガンドのクラスターを含む化合物はASGP-Rに結合することができ、細胞内への化合物の取り込みをもたらすことが示されている。例えば、Khorev et al.,Bioorganic and Medicinal Chemistry,16,9,pp5216-5231(May 2008)を参照されたい。したがって、そのようなGalNAcクラスターを含む共役体を用いて、肝臓細胞、具体的には、肝細胞へのある特定の化合物の取り込みを促進している。例えば、ある特定のGalNAc含有共役体が生体内で肝臓細胞における二本鎖siRNA化合物の活性を増加させることが示されている。そのような事例において、GalNAc含有共役体は、典型的には、siRNA二本鎖のセンス鎖に結合される。アンチセンス鎖が最終的に標的核酸とハイブリダイズする前にセンス鎖が処分されるため、共役体が活性を妨げるといった懸念はほとんどない。典型的には、共役体は、siRNAのセンス鎖の3’末端に結合される。例えば、米国特許第8,106,022号を参照されたい。本明細書に記載されるある特定の共役基は、以前に説明された共役基よりも活性であり、かつ/または合成し易い。
本発明のある特定の実施形態において、共役体は、プレmRNA標的核酸のスプライシングを変化させるRNase Hベースのアンチセンス化合物およびアンチセンス化合物を含むが、これらに限定されない一本鎖アンチセンス化合物に結合される。そのような実施形態において、共役体は、利益(細胞内への取り込みの改善)を提供するのに十分な期間、アンチセンス化合物に結合したままであるべきであるが、切断されるか、またはさもなければスプライシングまたはスプライシング調節に関連した標的核酸へのハイブリダイゼーションおよびRNase Hまたは酵素との相互作用等の活性に必要なその後のステップを妨げないか、のいずれかであるべきである。このような特性のバランスは、siRNA化合物よりも一本鎖アンチセンス化合物状況下においてより重要であり、共役体は、単にセンス鎖に結合され得る。共役体を欠く同一のアンチセンス化合物と比較して、生体内で肝臓細胞の強度が向上している共役体一本鎖アンチセンス化合物が本明細書に開示される。これらの化合物の要求される特性バランスを考慮すると、そのような強度の向上は、驚くべきことである。
ある特定の実施形態において、本明細書における共役基は、切断可能な部分を含む。上述のように、機構によって束縛されることを望むことなく、共役体が、取り込みの強化を提供するのに十分長い期間、化合物に残存したままであるべきだが、その後、共役体の一部、または理想的には、共役体のすべてが切断されて、親化合物(例えば、アンチセンス化合物)をその最も活性な形態で放出することが望ましいことは論理的である。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、切断可能なヌクレオシドである。そのような実施形態は、ホスホジエステル結合等の1個以上の切断可能な結合によってヌクレオシドを
介して共役体の残り(クラスター)をアンチセンスオリゴヌクレオチドに結合させることによって、細胞内の内因性ヌクレアーゼをうまく利用する。ある特定の実施形態において、クラスターは、ホスホジエステル結合によって切断可能なヌクレオシドに結合される。ある特定の実施形態において、切断可能なヌクレオシドは、ホスホジエステル結合によってアンチセンスオリゴヌクレオチド(アンチセンス化合物)に結合される。ある特定の実施形態において、共役基は、2個または3個の切断可能なヌクレオシドを含み得る。そのような実施形態において、そのような切断可能なヌクレオシドは、切断可能な結合(ホスホジエステル結合等)によって、互いに、アンチセンス化合物に、かつ/またはクラスターに連結される。本明細書におけるある特定の共役体は、切断可能なヌクレオシドを含まず、代わりに切断可能な結合を含む。オリゴヌクレオチドからの共役体の十分な切断が、細胞における切断に対して脆弱な少なくとも1個の結合(切断可能な結合)によって提供されることが示される。
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、プロドラッグである。そのようなプロドラッグは、動物に投与され、最終的により活性な形態に代謝される。例えば、共役アンチセンス化合物は、切断されて、共役体のすべてまたは一部を除去し、共役体のすべてまたは一部を欠くアンチセンス化合物の活性(またはより活性な)形態をもたらす。
ある特定の実施形態において、共役体は、オリゴヌクレオチドの5’末端で結合される。ある特定のそのような5’共役体は、3’末端で結合される同様の共役基を有する対応物よりも効率的に切断される。ある特定の実施形態において、活性の改善は、切断の改善と相関し得る。ある特定の実施形態において、5’末端に共役体を含むオリゴヌクレオチドの有効性は、3’末端に共役体を含むオリゴヌクレオチドよりも高い(例えば、実施例56、81、83、および84を参照のこと)。さらに、5’結合は、より単純なオリゴヌクレオチド合成を可能にする。典型的には、オリゴヌクレオチドは、3’から5’の方向に固体支持体上で合成される。3’共役オリゴヌクレオチドを作製するために、典型的には、プレ共役3’ヌクレオシドを固体支持体に結合させ、その後、オリゴヌクレオチドを通常通りに構築する。しかしながら、その共役ヌクレオシドを固体支持体に結合させることは、合成を複雑にする。さらに、この手段を用いることにより、共役体は、次いでオリゴヌクレオチドの合成を通じて存在し、その後のステップ中で分解された状態になり得るか、または使用され得る反応物および試薬の種類を限定し得る。本明細書に記載される5’共役オリゴヌクレオチドの構造および技術を用いることにより、標準の自動化技術を用いてオリゴヌクレオチドを合成して、最終(最も5’側の)ヌクレオシドとの共役体を導入することができるか、またはオリゴヌクレオチドが固体支持体から切断された後にオリゴヌクレオチドを合成することができる。
当技術分野および本開示を考慮して、当業者であれば、本明細書の共役体および共役オリゴヌクレオチドのうちのいずれかを容易に作製することができる。さらに、本明細書に開示されるある特定のそのような共役体および共役オリゴヌクレオチドの合成は、以前に開示された共役体の合成よりも容易であり、かつ/またはわずかなステップしか必要とせず、それ故に安価であり、製造において利点を提供する。例えば、ある特定の共役基の合成は、以前に説明された共役基と比較して、より少ない合成ステップからなり、収率の増加をもたらす。実施例46のGalNAc3-10および実施例48のGalNAc3-7等の共役基は、より多くの化学中間体の構築を必要とする米国特許第8,106,022号または米国特許第7,262,177号に記載される共役体等の以前に説明された共役体よりもはるかに単純である。したがって、本明細書に記載されるこれらおよび他の共役体は、一本鎖オリゴヌクレオチドおよび二本鎖オリゴヌクレオチド(例えば、siRNA)のいずれかの鎖を含む任意のオリゴヌクレオチドと併せて用いる際に、以前に説明された化合物よりも有利である。
同様に、GalNAcリガンドを1つまたは2つしか有しない共役基が本明細書に開示される。示されるように、そのような共役基は、アンチセンス化合物の活性を改善する。そのような化合物は、3個のGalNAcリガンドを含む共役体よりも調製が簡単である。1つまたは2個のGalNAcリガンドを含む共役基は、一本鎖オリゴヌクレオチドおよび二本鎖オリゴヌクレオチド(例えば、siRNA)のいずれかの鎖を含む任意のアンチセンス化合物に結合され得る。
ある特定の実施形態において、本明細書における共役体は、ある程度の耐容性を実質的に変化させない。例えば、共役アンチセンス化合物の免疫原性が非共役親化合物の免疫原性よりも低いことが本明細書に示される。強度が改善されるため、耐容性が同一のままである(または強度の増加と比較して耐容性がほんのわずか低下した場合でさえも同一のままである)実施形態は、改善された治療特性を有する。
ある特定の実施形態において、共役は、共役の不在下においてあまり魅力的ではない結果を有する方法でアンチセンス化合物を変化させることを可能にする。例えば、ある特定の実施形態において、完全なホスホロチオエートアンチセンス化合物の1個以上のホスホロチオエート結合をホスホジエステル結合に置換することで、ある程度の耐容性の改善をもたらす。例えば、ある特定の事例において、1個以上のホスホジエステルを有するそのようなアンチセンス化合物の免疫原性は、各結合がホスホロチオエート結合である同一の化合物の免疫原性よりも低い。しかしながら、ある特定の事例において、実施例26に示されるように、1個以上のホスホロチオエート結合のホスホジエステル結合への同様な置換は、細胞取り込みの低下および/または強度の損失もまたもたらす。ある特定の実施形態において、本明細書に記載される共役アンチセンス化合物は、完全なホスホロチオエート共役対応物と比較して、取り込みおよび強度をほとんどまたはまったく失うことなくそのような結合の変化に耐える。実際、ある特定の実施形態において、例えば、実施例44、57、59、および86において、共役体および少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含むオリゴヌクレオチドは、同様に同一の共役体を含む完全なホスホロチオエート対応物と比較した場合でも、生体内における強度の増加を実際に示す。さらに、共役が取り込み/強度の実質的な増加をもたらすため、その実質的な増加のわずかな損失は、耐容性の改善を達成するには許容範囲内であり得る。したがって、ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、少なくとも1個のホスホジエステル結合を含む。
ある特定の実施形態において、本明細書におけるアンチセンス化合物の共役は、肝細胞における送達、取り込み、および活性の増大をもたらす。したがって、より多くの化合物が肝臓組織に送達される。しかしながら、ある特定の実施形態において、そのような送達の増大だけでは、全体の活性増大を明白にしない。ある特定のそのような実施形態において、より多くの化合物が肝細胞に入る。ある特定の実施形態において、そのような肝細胞取り込みの増大でさえも、全体の活性増大を明白にしない。そのような実施形態において、共役化合物の生産的な取り込みが増大する。例えば、実施例102に示されるように、GalNAc含有共役体のある特定の実施形態は、非実質細胞と比較して、肝細胞におけるアンチセンスオリゴヌクレオチドの濃縮を増大させる。この濃縮は、肝細胞において発現される遺伝子を標的とするオリゴヌクレオチドに有益である。
ある特定の実施形態において、本明細書における共役アンチセンス化合物は、腎臓曝露の低下をもたらす。例えば、実施例20に示されるように、GalNAc含有共役体のある特定の実施形態を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドの濃度は、腎臓において、GalNAc含有共役体を欠くアンチセンスオリゴヌクレオチドの濃度よりも低い。これは、いくつかの有益な治療的意味を有する。腎臓における活性が要求されない治療的指標にお
いて、腎臓への曝露は、腎毒性の危険性を有し、それに見合う利益がない。さらに、腎臓における高濃度は、典型的には、尿への化合物の損失をもたらし、より迅速なクリアランスをもたらす。したがって、非腎臓標的の場合、腎臓内での蓄積は望ましくない。
ある特定の実施形態において、本開示は、以下の式によって表される共役アンチセンス化合物を提供し、
Figure 0007177127000001
式中、
Aは、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bは、切断可能な部分であり、
Cは、共役リンカーであり、
Dは、分岐基であり、
各Eは、テザーであり、
各Fは、リガンドであり、
qは、1~5の整数である。
本明細書における上述の図および同様の図において、分岐基「D」は、「q」で示される(E~F)基の数を収容するのに必要なだけ分岐を繰り返す。したがって、q=1の場合、式は、以下のものであり、
Figure 0007177127000002
q=2の場合、式は、以下のものであり、
Figure 0007177127000003
q=3の場合、式は、以下のものであり、
Figure 0007177127000004
q=4の場合、式は、以下のものであり、
Figure 0007177127000005
q=5の場合、式は、以下のものである。
Figure 0007177127000006
ある特定の実施形態において、以下の構造を有する共役アンチセンス化合物が提供される。
Figure 0007177127000007
ある特定の実施形態において、以下の構造を有する共役アンチセンス化合物が提供される。
Figure 0007177127000008
ある特定の実施形態において、以下の構造を有する共役アンチセンス化合物が提供される。
Figure 0007177127000009
ある特定の実施形態において、以下の構造を有する共役アンチセンス化合物が提供される。
Figure 0007177127000010
本開示は、以下の非限定的な番号付けされた実施形態を提供する。
実施形態1. 12~30個の連結したヌクレオシドを含むアンチセンスオリゴヌクレオチドと、共役基と、を含む、共役アンチセンス化合物であって、該共役基が、切断可能な部分と、共役リンカーと、細胞標的部分と、を含む、共役アンチセンス化合物。
実施形態2. 前記切断可能な部分が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドに共有結合され、
前記共役リンカーが前記切断可能な部分に共有結合され、
前記細胞標的部分が前記共役リンカーに共有結合される、実施形態1の共役アンチセンス化合物。
実施形態3. 前記細胞標的部分が分岐基を含む、実施形態1または2の共役アンチセンス化合物。
実施形態4. 前記分岐基が前記共役リンカーに共有結合される、実施形態3の共役アンチセンス化合物。
実施形態5. 前記細胞標的部分が少なくとも1個のテザーを含む、実施形態1~4のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態6. 前記少なくとも1個のテザーが前記分岐基に共有結合される、実施形態5の共役アンチセンス化合物。
実施形態7. 前記細胞標的部分が少なくとも1個のリガンドを含む、実施形態1~6のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態8. 前記少なくとも1個のリガンドの各々がテザーに共有結合される、実施形態7の共役アンチセンス化合物。
実施形態9. 前記化合物が、以下の式Iによって表される構造を有し、
Figure 0007177127000011
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
Cが、前記共役リンカーであり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
実施形態1~8の共役アンチセンス化合物。
実施形態10. 前記切断可能な部分が1~4個の連結した切断可能な部分のヌクレオシドを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドと第1の切断可能な部分のヌクレオシドとの間の結合がホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態1~9のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態11. 前記連結した切断可能な部分のヌクレオシドの各々の間の各ヌクレオシド間結合がホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態10の共役アンチセンス化合物。
実施形態12. 前記切断可能な部分が1~3個の連結した切断可能な部分のヌクレオシドを含む、実施形態10または11の共役アンチセンス化合物。
実施形態13. 前記切断可能な部分が1~2個の連結した切断可能な部分のヌクレオシドを含む、実施形態10または11の共役アンチセンス化合物。
実施形態14. 前記切断可能な部分が1個の切断可能な部分のヌクレオシドを含む、実施形態10の共役アンチセンス化合物。
実施形態15. 前記切断可能な部分が、プリン、置換プリン、ピリミジン、または置換ピリミジンからなる群から選択される切断可能な部分のヌクレオシドである、実施形態1~14のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態16. 前記切断可能な部分が、シチジン、ウリジン、アデノシン、チミジン、およびグアノシンから選択される切断可能な部分のヌクレオシドである、実施形態1~14のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態17. 前記切断可能な部分が、デオキシアデノシン、デオキシグアノシン、デオキシイノシン、チミジン、デオキシウリジン、およびデオキシシチジンから選択される
切断可能な部分のデオキシヌクレオシドである、実施形態1~14のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態18. 前記切断可能な部分がデオキシアデノシンを含む、実施形態1~17のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態19. 前記切断可能な部分がデオキシアデノシンである、実施形態1~18のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態20. 前記切断可能な部分が、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000012
式中、Bx、Bx、Bx、およびBxの各々が独立して複素環式塩基部分である、
実施形態1~19のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態 21. 前記複素環式塩基部分が、ウラシル、チミン、シトシン、5-メチルシトシン、アデニン、またはグアニンの中から選択される、実施形態20の共役アンチセンス化合物。
実施形態22. 前記切断可能な部分が、以下の構造を有する、実施形態1~19のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000013
実施形態23. 前記共役リンカーがピロリジンを含む、実施形態1~22のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態24. 前記共役リンカーがPEGを含む、実施形態1~23のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態25. 前記共役リンカーがアミドを含む、実施形態1~24のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態26. 前記共役リンカーがポリアミドを含む、実施形態1~25のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態27. 前記共役リンカーがアミンを含む、実施形態1~26のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態28. 前記共役リンカーが1個以上のジスルフィド結合を含む、実施形態1~27のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態29. 前記共役リンカーがタンパク質結合部分を含む、実施形態1~28のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態30. 前記タンパク質結合部分が脂質を含む、実施形態29の共役アンチセンス化合物。
実施形態31. 前記タンパク質結合部分が、コレステロール、コール酸、アダマンタン酢酸、1-ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、1,3-ビス-O(ヘキサデシル)グリセロール、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデシルグリセロール、ボルネオール、メントール、1,3-プロパンジオール、ヘプタデシル基、パルミチン酸、ミリスチン酸、O3-(オレオイル)リトコール酸、O3-(オレオイル)コレン酸、ジメチルトリチル、またはフェノキサジン)、ビタミン(例えば、葉酸塩、ビタミンA、ビタミンE、ビオチン、ピリドキサール)、ペプチド、炭水化物(例えば、単糖、二糖、三糖、四糖、オリゴ糖、多糖)、エンドソーム溶解成分、ステロイド(例えば、ウバオール、ヘシゲニン、ジオスゲニン)、テルペン(例えば、トリテルペン、サルササポゲニン、フリーデリン、エピフリーデラノール誘導体化リトコール酸)、またはカチオン性脂質の中から選択される、実施形態30の共役アンチセンス化合物。
実施形態32. 前記タンパク質結合部分が、C16~C22長鎖飽和もしくは不飽和脂肪酸、コレステロール、コール酸、ビタミンE、アダマンタン、または1-ペンタフルオロプロピルである、実施形態1~31のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態33. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000014
式中、nが1~20であり、pが1~6である、
実施形態1~32のいずれかの共役アンチセンス化合物。2つ以上のnを有するそのような実施形態において、各nは、独立して選択される。
実施形態34. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000015
式中、nが、1~20である、
実施形態1~33のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態35. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、



;および


Figure 0007177127000016
式中、nが、1~20である、
実施形態1~33のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態36. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有する、実施形態1~33のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000017
実施形態37. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有する、実施形態1~33のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000018
実施形態38. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000019
式中、nが、1~20である、
実施形態1~33のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態 39. 前記共役リンカーが、以下の構造を有する、実施形態1~33のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000020
実施形態40. 前記細胞標的部分が炭水化物を含む、実施形態1~39のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態41. 前記細胞標的部分が炭水化物クラスターを含む、実施形態1~40のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態42. 前記細胞標的部分が細胞表面受容体リガンドを含む、実施形態1~41のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態43. 前記標的部分が少なくとも1個のN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)を含む、実施形態1~42のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態44. 前記標的部分が分岐基を含む、実施形態1~43のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態45. 前記分岐基がエーテルを含む、実施形態44の共役アンチセンス化合物。
実施形態46. 前記分岐基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000021
各nが、独立して、1~20であり、
mが、2~6である、
実施形態44または45の共役アンチセンス化合物。
実施形態47. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態44または45の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000022
実施形態48. 前記分岐基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000023
式中、各Aが、独立して、O、S、C=O、またはNHであり、
各nが、独立して、1~20である、
実施形態44または45の共役アンチセンス化合物。
実施形態49. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態44または45の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000024
実施形態50. 前記細胞標的部分が1個のテザーを含む、実施形態1~49のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態51. 前記細胞標的部分が2個のテザーを含む、実施形態1~49のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態52. 前記細胞標的部分が3個のテザーを含む、実施形態1~49のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態53. 前記細胞標的部分が4個以上のテザーを含む、実施形態1~49のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態54. 少なくとも1個のテザーがPEGを含む、実施形態1~53のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態55. 少なくとも1個のテザーがアミドを含む、実施形態1~54のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態56. 少なくとも1個のテザーがポリアミドを含む、実施形態1~55のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態57. 少なくとも1個のテザーがアミンを含む、実施形態1~56のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態58. 少なくとも2個のテザーが互いに異なる、実施形態1~57のいずれか
の共役アンチセンス化合物。
実施形態59. 前記テザーのすべてが互いに同一である、実施形態1~57のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態60. 各テザーが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000025
各nが、独立して、1~20であり、
各pが、1~約6である、
実施形態1~59のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態61. 各テザーが、以下の中から選択される、実施形態1~60のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000026
実施形態62. 各テザーが、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000027
式中、各nが、独立して、1~20である、
実施形態1~61のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態63. 各テザーが、以下の構造を有する、実施形態1~61のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000028
実施形態64. 前記細胞標的部分が少なくとも1個のリガンドを含む、実施形態1~63のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態65. 前記細胞標的部分が1個のリガンドを含む、実施形態64の共役アンチセンス化合物。
実施形態66. 前記標的部分が2個のリガンドを含む、実施形態64の共役アンチセンス化合物。
実施形態67. 前記標的部分が3個のリガンドを含む、実施形態64の共役アンチセンス化合物。
実施形態68. 1個のリガンドが各テザーに共有結合される、実施形態64~67のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態69. 少なくとも1個のリガンドがN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)である、実施形態1~68のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態70. 各リガンドがN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)である、実施形態1~69のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態71. 前記リガンドが、多糖、修飾多糖、マンノース、ガラクトース、マンノース誘導体、ガラクトース誘導体、D-マンノピラノース、L-マンノピラノース、D-アラビノース、L-ガラクトース、D-キシロフラノース、L-キシロフラノース、D-グルコース、L-グルコース、D-ガラクトース、L-ガラクトース、α-D-マンノフラノース、β-D-マンノフラノース、α-D-マンノピラノース、β-D-マンノピラノース、α-D-グルコピラノース、β-D-グルコピラノース、α-D-グルコフラノース、β-D-グルコフラノース、α-D-フルクトフラノース、α-D-フルクトピラノース、α-D-ガラクトピラノース、β-D-ガラクトピラノース、α-D-ガラクトフラノース、β-D-ガラクトフラノース、グルコサミン、シアル酸、α-D-ガラクトサミン、N-アセチルガラクトサミン、2-アミノ-3-O-[(R)-1-カルボキシエチル]-2-デオキシ-β-D-グルコピラノース、2-デオキシ-2-メチルアミノ-L-グルコピラノース、4,6-ジデオキシ-4-ホルムアミド-2,3-ジ-O-メチル-D-マンノピラノース、2-デオキシ-2-スルホアミノ-D-グルコピラノース、N-グリコロイル-α-ノイラミン酸、5-チオ-β-D-グルコピラノース、メチル2,3,4-トリ-O-アセチル-1-チオ-6-O-トリチル-α-D-グルコピラノシド、4-チオ-β-D-ガラクトピラノース、エチル3,4,6,7-テトラ-O-アセチル-2-デオキシ-1,5-ジチオ-α-D-グルコ-ヘプトピラノシド、2,5-アンヒドロ-D-アロノニトリル、リボース、D-リボース、D-4-チオリボース、L-リボース、L-4-チオリボースの中から選択される、実施形態1~70のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態72. 前記リガンドがガラクトースである、実施形態1~71のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態73. 前記リガンドがマンノース-6-ホスフェートである、実施形態1~71のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態74. 各リガンドが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000029
式中、各Rが、OHおよびNHCOOHから選択される、
実施形態1~71のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態75. 各リガンドが、以下の中から選択される、実施形態1~71のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000030
実施形態76. 各リガンドが、以下の構造を有する、実施形態1~71のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000031
実施形態77. 各リガンドが、以下の構造を有する、実施形態1~71のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000032
実施形態78. 前記細胞標的基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000033
式中、各nが、独立して、1~20である、
実施形態1~77のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態79. 前記細胞標的基が、以下の構造を有する、実施形態1~77のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000034
実施形態80. 前記共役体が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000035
式中、各nが、独立して、1~20であり、
Zが、Hまたは結合固体支持体であり、
Qが、前記アンチセンス化合物であり、
Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
実施形態1~79のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態81. 前記共役体が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000036
式中、Zが、Hまたは結合固体支持体であり、
Qが、前記アンチセンス化合物である、
実施形態1~79のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態82. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの2’位に結合される、実施形態1~81のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態83. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの3’位に結合される、実施形態1~81のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態84. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの5’位に結合される、実施形態1~81のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態85. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオシドに結合される、実施形態1~82のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態86. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの3’末端ヌクレオシドに結合される、実施形態1~84のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態87. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの内部ヌクレオシドに結合される、実施形態1~84のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態88. 前記共役基が、非共役アンチセンス化合物と比較して、肝細胞への前記共役アンチセンス化合物の取り込みを増加させる、実施形態1~87のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態89. 前記共役基が、非共役アンチセンス化合物と比較して、肝臓細胞への前記共役アンチセンス化合物の取り込みを増加させる、実施形態1~88のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態90. 前記共役基が、非共役アンチセンス化合物と比較して、肝臓における前記共役アンチセンス化合物の蓄積を増加させる、実施形態1~89のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態91. 前記共役基が、非共役アンチセンス化合物と比較して、腎臓における前
記共役アンチセンス化合物の蓄積を減少させる、実施形態1~90のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態92. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、実施形態1~91のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態93. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1~92のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態94. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態1~93のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態95. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが一本鎖である、実施形態1~94のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態96. 少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが修飾糖部分を含む、実施形態93~95の共役アンチセンス化合物。
実施形態97. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含む糖モチーフを有する、実施形態96の共役アンチセンス化合物。
実施形態98. 前記5’領域が2個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態97の共役アンチセンス化合物。
実施形態99. 前記5’領域が3個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態97の共役アンチセンス化合物。
実施形態100. 前記5’領域が4個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態97の共役アンチセンス化合物。
実施形態101. 前記5’領域が5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態97の共役アンチセンス化合物。
実施形態102. 前記3’領域が2個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態97~101のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態103. 前記3’領域が3個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態97~101のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態104. 前記3’領域が4個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態97~91のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態105. 前記3’領域が5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態97~101のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態106. 前記中央領域が5個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態97~105のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態107. 前記中央領域が6個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態97~105のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態108. 前記中央領域が7個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態97~105のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態109. 前記中央領域が8個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態97~105のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態110. 前記中央領域が9個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態97~105のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態111. 前記中央領域が10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態97~105のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態112. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが14~26個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1~111のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態113. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが15~25個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1~111のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態114. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1~111のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態115. 各修飾ヌクレオシドが、独立して、2’-置換糖部分または二環式糖部分を含む、実施形態1~114のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態116. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが2’-置換糖部分を含む、実施形態115の共役アンチセンス化合物。
実施形態117. 2’-置換糖部分を含む各修飾ヌクレオシドが、ハロゲン、任意に置換されたアリル、任意に置換されたアミノ、アジド、任意に置換されたSH、CN、OCN、CF、OCF、O、S、もしくはN(Rm)-アルキル;O、S、もしくはN(Rm)-アルケニル;O、S、もしくはN(Rm)-アルキニル;任意に置換されたO-アルキレニル-O-アルキル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアルカリル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたO-アルカリル、任意に置換されたO-アラルキル、O(CHSCH、O-(CH-O-N(Rm)(Rn)、またはO-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn)の中から独立して選択される2’置換基を含み、式中、各RmおよびRnが、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換C~C10アルキルであり、
各任意に置換された基が、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル
、フェニル、ニトロ(NO)、チオール、チオアルコキシ(S-アルキル)、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル、およびアルキニルの中から独立して選択される置換基で任意に置換される、実施形態116の共役アンチセンス化合物。
実施形態118. 各2’置換基が、ハロゲン、OCH、OCHF、OCHF、OCF、OCHCH、O(CHF、OCHCHF、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH、O(CH-SCH、O(CH-OCF、O(CH-N(R)(R)、O(CH-ON(R)(R)、O(CH-O(CH-N(R)(R)、OCHC(=O)-N(R)(R)、OCHC(=O)-N(R)-(CH-N(R)(R)、およびO(CH-N(R)-C(=NR)[N(R)(R)]の中から独立して選択され、式中、R、R、R、およびRが各々、独立して、HまたはC~Cアルキルである、実施形態116の共役アンチセンス化合物。
実施形態119. 各2’置換基が、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から独立して選択される、実施形態116の共役アンチセンス化合物。
実施形態120. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-MOE糖部分を含む、実施形態116の共役アンチセンス化合物。
実施形態121. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-OMe糖部分を含む、実施形態116の共役アンチセンス化合物。
実施形態122. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-F糖部分を含む、実施形態116の共役アンチセンス化合物。
実施形態123. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、糖代理物を含む少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1~122のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態124. 前記修飾ヌクレオシドがF-HNA糖部分を含む、実施形態123の共役アンチセンス化合物。
実施形態125. 前記修飾ヌクレオシドがHNA糖部分を含む、実施形態123の共役アンチセンス化合物。
実施形態126. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、二環式糖部分を含む少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1~125のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態127. 前記二環式糖部分がcEt糖部分である、実施形態126の共役アンチセンス化合物。
実施形態128. 二環式糖部分がLNA糖部分である、実施形態126の共役アンチセンス化合物。
実施形態129. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態1~128のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態130. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態129の共役アンチセンス化合物。
実施形態131. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、少なくとも1個の修飾結合および少なくとも1個の非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態129の共役アンチセンス化合物。
実施形態132. 少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合がホスホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態129~131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態133. 各修飾ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態129~122のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態134. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも2個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~133のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態135. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも3個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~133のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態136. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも4個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~132のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態137. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも5個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~132のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態138. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~132のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態139. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも7個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~132のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態140. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも8個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~132のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態141. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも9個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~132のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態142. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも10個のホスホジ
エステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~132のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態143. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが16個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~142のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態144. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが15個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~142のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態145. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが14個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~142のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態146. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが13個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~142のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態147. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが12個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~142のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態148. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが11個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~142のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態149. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが10個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~142のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態150. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが9個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~142のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態151. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが8個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~142のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態152. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが7個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~142のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態153. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが6個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態129~142のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態154. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの各末端ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態129~153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態155. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの2個のデオキシヌクレオシドを結合する各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態129~154のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態156. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの2個の修飾ヌクレオシドを結合する各非末端ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態129~155のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態157. 修飾ヌクレオシドの3’である前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの各非末端ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態129~156のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態158. デオキシヌクレオシドの3’である前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態129~157のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態159. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM、および
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
の中から選択される化学モチーフを有し、
式中、各Mが、独立して、修飾ヌクレオシドであり、各Dが、デオキシヌクレオシドであり、各sが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合であり、各yが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかであるが、但し、少なくとも1つのyが、ホスホジエステルヌクレオチド間結合であることを条件とする、
実施形態1~158のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態160. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM、および
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
の中から選択される化学モチーフを有し、
式中、各Mが、独立して、修飾ヌクレオシドであり、各Dが、デオキシヌクレオシドであり、各oが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合であり、各sが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、
実施形態1~158のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態161. 各Mが、2’-MOEヌクレオシドおよび二環式ヌクレオシドの中から独立して選択される、実施形態159または160の共役アンチセンス化合物。
実施形態162. 各Mが、2’-MOEヌクレオシド、cEtヌクレオシド、およびLNAヌクレオシドの中から独立して選択される、実施形態161の共役アンチセンス化合物。
実施形態163. 各Mが2’-MOEヌクレオシドである、実施形態159または160の共役アンチセンス化合物。
実施形態164. 各MがcEtヌクレオシドである、実施形態159または160の共役アンチセンス化合物。
実施形態165. 各MがLNAヌクレオシドである、実施形態159または160の共役アンチセンス化合物。
実施形態166. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも8個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態1~165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態167. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも10個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態1~165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態168. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも12個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態1~165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態169. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも14個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態1~165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態170. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも16個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態1~165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態171. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも18個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態1~165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態172. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも90%相補的である、実施形態1~171のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態173. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも95%相補的である、実施形態1~171のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態174. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的核酸に対して100%相補的である、実施形態1~171のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態175. 前記標的核酸がプレmRNAである、実施形態166~174のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態176. 前記標的核酸がmRNAである、実施形態166~174のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態177. 前記標的核酸が肝臓において発現される、実施形態166~176のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態178. 前記標的核酸が肝細胞において発現される、実施形態177の共役アンチセンス化合物。
実施形態179. 前記標的核酸が、アンドロゲン受容体、アポリポタンパク質(a)、アポリポタンパク質B、アポリポタンパク質C-III、C反応性タンパク質、eIF-4E、第VII因子、第XI因子、グルココルチコイド受容体、グルカゴン受容体、タンパク質チロシンホスファターゼ1B、STAT3、およびトランスサイレチンから選択されるタンパク質をコードする、実施形態177または178の共役アンチセンス化合物。
実施形態180. 前記標的核酸がウイルス核酸である、実施形態166~179の共役アンチセンス化合物。
実施形態181. 前記ウイルス核酸が肝臓において発現される、実施形態180の共役アンチセンス化合物。
実施形態182. 前記標的核酸がB型肝炎ウイルス核酸である、実施形態181の共役アンチセンス化合物。
実施形態183. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17、18、19、20、21、22、23、または24のうちのいずれか1個の核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態184. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号25、26、27、28、29、または30のうちのいずれか1個の核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態185. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号31の核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態186. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号32の核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態187. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号33の核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態188. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号34の核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態189. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号35、36、37、38、39、40、41、42、または43のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態190. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号44、45、46、47、または48の核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態191. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、または59のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態192. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号60、61、62、63、64、65、66、または67のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態193. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号69、70、71、または72のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態194. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号73の核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態195. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号74、75、76、77、78、79、80、または81のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態196. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号68の核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態197. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号82~103のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態1~179のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態198. 細胞内の標的核酸の量または活性を低減させる方法であって、細胞を実施形態1~197のいずれかの共役アンチセンス化合物と接触させることを含む、方法。
実施形態199. 前記細胞が肝臓細胞である、実施形態198の方法。
実施形態200. 前記細胞が肝細胞である、実施形態199の方法。
実施形態201. 前記細胞が生体外に存在する、実施形態198~200のいずれかの方法。
実施形態202. 前記細胞が動物内に存在する、実施形態198~200のいずれかの方法。
実施形態203. 前記動物がマウスである、実施形態202の方法。
実施形態204. 前記動物がヒトである、実施形態202の方法。
実施形態205. 実施形態1~197のうちのいずれかに従う共役アンチセンス化合物と、薬剤的に許容される担体または希釈剤と、を含む、医薬組成物。
実施形態206. 前記薬剤的に許容される担体または希釈剤が、滅菌水および滅菌生理食塩水の中から選択される、実施形態205の医薬組成物。
実施形態207. 動物における疾患または状態を治療する方法であって、実施形態205または206の医薬組成物を前記動物に投与することを含み、それにより前記動物における前記疾患または状態を治療する、方法。
実施形態208. 前記動物がマウスである、実施形態207の方法。
実施形態209. 前記動物がヒトである、実施形態207の方法。
実施形態210. 前記疾患または状態が肝臓疾患または状態である、実施形態207~209のいずれかの方法。
実施形態211. 前記投与が非経口投与による、実施形態207~210のいずれかの方法。
実施形態212. 前記投与が皮下注入による、実施形態211の方法。
実施形態213. 前記投与が静脈内注入による、実施形態211の方法。
実施形態214. 前記投与が筋肉内注入による、実施形態211の方法。
実施形態215. 前記共役アンチセンス化合物が1~10mg/kgの用量で提供される、実施形態207~214のいずれかの方法。
実施形態216. 前記共役アンチセンス化合物が1mg/kg未満の用量で提供される、実施形態207~214のいずれかの方法。
実施形態217. 前記共役アンチセンス化合物が10mg/kgを超える用量で提供される、実施形態207~216のいずれかの方法。
実施形態218. 前記共役アンチセンス化合物が少なくとも2ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態207~217のいずれかの方法。
実施形態219. 前記共役アンチセンス化合物が少なくとも4ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態207~217のいずれかの方法。
実施形態220. 前記共役アンチセンス化合物が少なくとも6ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態207~217のいずれかの方法。
実施形態221. 前記共役アンチセンス化合物が1週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態207~217のいずれかの方法。
実施形態222. 前記共役アンチセンス化合物が2週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態207~217のいずれかの方法。
実施形態223. 前記共役アンチセンス化合物が3週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態207~217のいずれかの方法。
実施形態224. 前記共役アンチセンス化合物が4週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態207~217のいずれかの方法。
実施形態225. 前記共役アンチセンス化合物が5週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態207~217のいずれかの方法。
実施形態226. 前記共役アンチセンス化合物が6週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態207~217のいずれかの方法。
実施形態227. 前記共役アンチセンス化合物が7週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態207~217のいずれかの方法。
実施形態228. 前記共役アンチセンス化合物が8週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態207~217のいずれかの方法。
実施形態229. 12~30個の連結したヌクレオシドを含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンス化合物であって、前記共役基が少なくとも1個の細胞標的部分を含む、共役アンチセンス化合物。
実施形態230. 前記共役基が2個の細胞標的部分を含む、実施形態229の共役アンチセンス化合物。
実施形態231. 前記共役基が3個の細胞標的部分を含む、実施形態229の共役アンチセンス化合物。
実施形態232. 前記共役基が4個の細胞標的部分を含む、実施形態229の共役アンチセンス化合物。
実施形態233. 各細胞標的部分が切断可能な結合を含む、実施形態229~232のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態234. 各細胞標的部分がテザーおよびリガンドを含む、実施形態229~233のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態235. 前記リガンドが細胞表面受容体リガンドである、実施形態234の共役アンチセンス化合物。
実施形態236. 少なくとも1個のテザーが切断可能な結合を含む、実施形態235の共役アンチセンス化合物。
実施形態237. 各テザーが切断可能な結合を含む、実施形態235の共役アンチセンス化合物。
実施形態238. 前記共役基が共役リンカーを含む、実施形態229~237のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態239. 前記共役リンカーが1個以上の切断可能な結合を含む、実施形態238の共役アンチセンス化合物。
実施形態240. 前記共役基が分岐基を含む、実施形態229~239のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態241. 前記分岐基が1個以上の切断可能な結合を含む、実施形態240の共役アンチセンス化合物。
実施形態242. 前記共役基が切断可能な部分を含む、実施形態229~241のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態243. 前記切断可能な部分が1個以上の切断可能な結合を含む、実施形態242の共役アンチセンス化合物。
実施形態244. 前記共役基が少なくとも1個の切断可能な結合を含む、実施形態229~243のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態245. 前記共役基が少なくとも2個の切断可能な結合を含む、実施形態229~243のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態246. 前記共役基が少なくとも3個の切断可能な結合を含む、実施形態229~243のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態247. 前記共役基が少なくとも4個の切断可能な結合を含む、実施形態229~243のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態248. 前記共役基が少なくとも5個の切断可能な結合を含む、実施形態229~243のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態249. アミド、ポリアミド、エステル、エーテル、ホスホジエステル、リン酸エステル、カルバメート、ジスルフィド、またはペプチドの中から選択される切断可能な結合を含む、実施形態229~248のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態250. 前記ペプチドがジペプチドである、実施形態249の共役アンチセンス化合物。
実施形態251. 前記ペプチドがトリペプチドである、実施形態249の共役アンチセ
ンス化合物。
実施形態252. 前記ペプチドがリジンである、実施形態249の共役アンチセンス化合物。
実施形態253. 前記ペプチドがリジン誘導体である、実施形態249の共役アンチセンス化合物。
実施形態254. 1個以上のペプチドがリジンである、実施形態250または251のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態255. 2個以上のペプチドがリジンである、実施形態250または251のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態256. 前記共役基が、
Figure 0007177127000037
Figure 0007177127000038
Figure 0007177127000039
Figure 0007177127000040
または
Figure 0007177127000041
を含み、
式中、各jが、1~3の整数であり、
式中、各nが、1~20の整数である、実施形態229~255のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態257. 前記共役基が、
Figure 0007177127000042
Figure 0007177127000043
Figure 0007177127000044
Figure 0007177127000045
または
Figure 0007177127000046
を含む、実施形態229~255のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態258. 前記分岐基が、
Figure 0007177127000047
Figure 0007177127000048
Figure 0007177127000049
Figure 0007177127000050
または
Figure 0007177127000051
を含み、
式中、各jが、1~3の整数であり、
式中、各nが、1~20の整数である、実施形態229~257のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態259. 前記分岐基が、
Figure 0007177127000052
Figure 0007177127000053
Figure 0007177127000054
Figure 0007177127000055
または
Figure 0007177127000056
を含む、実施形態229~257のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態260. 前記細胞標的部分が炭水化物を含む、実施形態229~259のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態261. 前記細胞標的部分が炭水化物クラスターを含む、実施形態229~259のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態262. 前記細胞標的部分が細胞表面受容体リガンドを含む、実施形態229~259のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態263. 前記細胞標的部分が少なくとも1個のN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)を含む、実施形態229~259のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態264. 前記切断可能な部分が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドに共有結合され、
前記共役リンカーが前記切断可能な部分に共有結合され、
前記細胞標的部分が前記共役リンカーに共有結合される、
実施形態229~263のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態265. 前記細胞標的部分が分岐基を含む、実施形態229~264のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態266. 前記分岐基が前記共役リンカーに共有結合される、実施形態265の共役アンチセンス化合物。
実施形態267. 前記細胞標的部分が少なくとも1個のテザーを含む、実施形態229~266のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態268. 前記少なくとも1個のテザーが前記分岐基に共有結合される、実施形態229~267のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態269. 前記細胞標的部分が少なくとも1個のリガンドを含む、実施形態229~267のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態270. 前記少なくとも1個のリガンドの各々がテザーに共有結合される、実施形態269の共役アンチセンス化合物。
実施形態271. 前記化合物が、以下の式Iによって表される構造を有し、
Figure 0007177127000057
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
Cが、前記共役リンカーであり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
実施形態229~270のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態272. 前記切断可能な部分が1~4個の連結した切断可能な部分のヌクレオシドを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドと第1の切断可能な部分のヌクレオシドとの間の結合がホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態229~271のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態273. 前記連結した切断可能な部分のヌクレオシドの各々の間の各ヌクレオシド間結合がホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態272の共役アンチセンス化合物。
実施形態274. 前記切断可能な部分が1~3個の連結した切断可能な部分のヌクレオシドを含む、実施形態271または272の共役アンチセンス化合物。
実施形態275. 前記切断可能な部分が1~2個の連結した切断可能な部分のヌクレオシドを含む、実施形態271または272の共役アンチセンス化合物。
実施形態276. 前記切断可能な部分が1個の切断可能な部分のヌクレオシドを含む、実施形態271の共役アンチセンス化合物。
実施形態277. 前記切断可能な部分が、プリン、置換プリン、ピリミジン、または置換ピリミジンからなる群から選択される切断可能な部分のヌクレオシドである、実施形態229~276のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態278. 前記切断可能な部分が、シチジン、ウリジン、アデノシン、チミジン、およびグアノシンから選択される切断可能な部分のヌクレオシドである、実施形態229~276のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態279. 前記切断可能な部分が、デオキシアデノシン、デオキシグアノシン、デオキシイノシン、チミジン、デオキシウリジン、およびデオキシシチジンから選択される切断可能な部分のデオキシヌクレオシドである、実施形態229~276のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態280. 前記切断可能な部分がデオキシアデノシンを含む、実施形態229~280のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態281. 前記切断可能な部分がデオキシアデノシンである、実施形態229~
280のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態282. 前記切断可能な部分が、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000058
式中、Bx、Bx、Bx、およびBxの各々が独立して複素環式塩基部分である、
実施形態229~276のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態283. 前記複素環式塩基部分が、ウラシル、チミン、シトシン、5-メチルシトシン、アデニンまたはグアニンの中から選択される、実施形態282の共役アンチセンス化合物。
実施形態284. 前記切断可能な部分が、以下の構造を有する、実施形態229~276のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000059
実施形態285. 前記共役リンカーがピロリジンを含む、実施形態229~285のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態286. 前記共役リンカーがPEGを含む、実施形態229~286のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態287. 前記共役リンカーがアミドを含む、実施形態229~287のいずれ
かの共役アンチセンス化合物。
実施形態288. 前記共役リンカーがポリアミドを含む、実施形態229~288のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態289. 前記共役リンカーがアミンを含む、実施形態229~289のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態290. 前記共役リンカーが1個以上のジスルフィド結合を含む、実施形態229~290のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態291. 前記共役リンカーがタンパク質結合部分を含む、実施形態229~291のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態292. 前記タンパク質結合部分が脂質を含む、実施形態292の共役アンチセンス化合物。
実施形態293. 前記タンパク質結合部分が、コレステロール、コール酸、アダマンタン酢酸、1-ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、1,3-ビス-O(ヘキサデシル)グリセロール、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデシルグリセロール、ボルネオール、メントール、1,3-プロパンジオール、ヘプタデシル基、パルミチン酸、ミリスチン酸、O3-(オレオイル)リトコール酸、O3-(オレオイル)コレン酸、ジメチルトリチル、またはフェノキサジン)、ビタミン(例えば、葉酸塩、ビタミンA、ビタミンE、ビオチン、ピリドキサール)、ペプチド、炭水化物(例えば、単糖、二糖、三糖、四糖、オリゴ糖、多糖)、エンドソーム溶解成分、ステロイド(例えば、ウバオール、ヘシゲニン、ジオスゲニン)、テルペン(例えば、トリテルペン、例えば、サルササポゲニン、フリーデリン、エピフリーデラノール誘導体化リトコール酸)、またはカチオン性脂質の中から選択される、実施形態293の共役アンチセンス化合物。
実施形態294. 前記タンパク質結合部分が、C16~C22長鎖飽和もしくは不飽和脂肪酸、コレステロール、コール酸、ビタミンE、アダマンタン、または1-ペンタフルオロプロピルである、実施形態229~293のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態295. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000060
式中、各nが、独立して、1~20であり、pが、1~6である、
実施形態229~294のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態296. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000061
式中、各nが、独立して、1~20である、
実施形態229~295のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態297. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000062
式中、各nが、独立して、1~20である、実施形態229~295のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態298. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有する、実施形態229~295のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000063
実施形態299. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有する、実施形態229~295のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000064
実施形態300. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000065
式中、nが、1~20である、
実施形態229~295のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態301. 前記共役リンカーが、以下の構造を有する、実施形態229~295のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000066
実施形態302. 前記細胞標的部分が炭水化物を含む、実施形態229~301のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態303. 前記細胞標的部分が炭水化物クラスターを含む、実施形態229~302のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態304. 前記細胞標的部分が細胞表面受容体リガンド含む、実施形態229~303のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態305. 前記標的部分が少なくとも1個のN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)を含む、実施形態229~304のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態306. 前記標的部分が分岐基を含む、実施形態229~305のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態307. 前記分岐基がエーテルを含む、実施形態306の共役アンチセンス化合物。
実施形態308. 前記分岐基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000067
各nが、独立して、1~20であり、
mが、2~6である、
実施形態306または307の共役アンチセンス化合物。
実施形態309. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態306または307の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000068
実施形態310. 前記分岐基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000069
式中、各Aが、独立して、O、S、C=O、またはNHであり、
各nが、独立して、1~20である、
実施形態306または307の共役アンチセンス化合物。
実施形態311. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態306または307の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000070
実施形態312. 前記分岐基が、
Figure 0007177127000071
Figure 0007177127000072
Figure 0007177127000073
Figure 0007177127000074
または
Figure 0007177127000075
を含み、
式中、各jが、1~3の整数であり、
式中、各nが、1~20の整数である、
実施形態306または307のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態313. 前記分岐基が、
Figure 0007177127000076
Figure 0007177127000077
Figure 0007177127000078
Figure 0007177127000079
または
Figure 0007177127000080
を含む、実施形態306または307のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態314. 前記細胞標的部分が1個のテザーを含む、実施形態229~313のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態315. 前記細胞標的部分が2個のテザーを含む、実施形態229~313のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態316. 前記細胞標的部分が3個のテザーを含む、実施形態229~313のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態317. 前記細胞標的部分が4個以上のテザーを含む、実施形態229~313のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態318. 少なくとも1個のテザーがPEGを含む、実施形態229~317のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態319. 少なくとも1個のテザーがアミドを含む、実施形態229~318のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態320. 少なくとも1個のテザーがポリアミドを含む、実施形態229~319のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態321. 少なくとも1個のテザーがアミンを含む、実施形態229~320のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態322. 少なくとも2個のテザーが互いに異なる、実施形態229~321のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態323. 前記テザーのすべてが互いに同一である、実施形態229~321のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態324. 各テザーが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000081
各nが、独立して、1~20であり、
各pが、1~約6である、
実施形態229~323のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態325. 各テザーが、以下の中から選択される、実施形態229~324のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000082
実施形態326. 各テザーが、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000083
式中、各nが、独立して、1~20である、
実施形態229~324のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態327. 各テザーが、以下の構造を有する、実施形態229~324のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000084
実施形態328. 前記細胞標的部分が少なくとも1個のリガンドを含む、実施形態229~328のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態329. 前記細胞標的部分が1個のリガンドを含む、実施形態328の共役アンチセンス化合物。
実施形態330. 前記標的部分が2個のリガンドを含む、実施形態328の共役アンチセンス化合物。
実施形態331. 前記標的部分が3個のリガンドを含む、実施形態328の共役アンチセンス化合物。
実施形態332. 1個のリガンドが各テザーに共有結合される、実施形態328~331のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態333. 少なくとも1個のリガンドがN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)である、実施形態229~332のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態334. 各リガンドがN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)である、実施形態229~332のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態335. 前記リガンドが、多糖、修飾多糖、マンノース、ガラクトース、マンノース誘導体、ガラクトース誘導体、D-マンノピラノース、L-マンノピラノース、D-アラビノース、L-ガラクトース、D-キシロフラノース、L-キシロフラノース、D-グルコース、L-グルコース、D-ガラクトース、L-ガラクトース、α-D-マンノフラノース、β-D-マンノフラノース、α-D-マンノピラノース、β-D-マンノピラノース、α-D-グルコピラノース、β-D-グルコピラノース、α-D-グルコフラノース、β-D-グルコフラノース、α-D-フルクトフラノース、α-D-フルクトピラノース、α-D-ガラクトピラノース、β-D-ガラクトピラノース、α-D-ガラクトフラノース、β-D-ガラクトフラノース、グルコサミン、シアル酸、α-D-ガラクトサミン、N-アセチルガラクトサミン、2-アミノ-3-O-[(R)-1-カルボキシエチル]-2-デオキシ-β-D-グルコピラノース、2-デオキシ-2-メチルアミノ-L-グルコピラノース、4,6-ジデオキシ-4-ホルムアミド-2,3-ジ-O-メチル-D-マンノピラノース、2-デオキシ-2-スルホアミノ-D-グルコピラノース、N-グリコロイル-α-ノイラミン酸、5-チオ-β-D-グルコピラノース、メチル2,3,4-トリ-O-アセチル-1-チオ-6-O-トリチル-α-D-グルコピラノシド、4-チオ-β-D-ガラクトピラノース、エチル3,4,6,7-テトラ-O-アセチル-2-デオキシ-1,5-ジチオ-α-D-グルコ-ヘプトピラノシド、2,5-アンヒドロ-D-アロノニトリル、リボース、D-リボース、D-4-チオリボース、L-リボース、L-4-チオリボースの中から選択される、実施形態229~332のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態336. 前記リガンドがガラクトースである、実施形態229~332のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態337. 前記リガンドがマンノース-6-ホスフェートである、実施形態229~332のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態338. 各リガンドが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000085
式中、各Rが、OHおよびNHCOOHから選択される、
実施形態229~332のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態339. 各リガンドが、以下の中から選択される、実施形態229~332のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000086
実施形態340. 各リガンドが、以下の構造を有する、実施形態229~332のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000087
実施形態341. 各リガンドが、以下の構造を有する、実施形態229~332のいず
れかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000088
実施形態342. 前記細胞標的基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000089
式中、各nが、独立して、1~20である、
実施形態229~332のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態343. 前記細胞標的基が、以下の構造を有する、実施形態229~336のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000090
実施形態344. 前記共役体が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000091
式中、各nが、独立して、1~20であり、
Zが、Hまたは結合固体支持体であり、
Qが、前記アンチセンス化合物であり、
Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、実施形態229~336のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態345. 前記共役体が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000092
式中、Zが、Hまたは結合固体支持体であり、
Qが、前記アンチセンス化合物である、
実施形態229~336のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態346. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの2’位に結合される、実施形態229~345のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態347. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの3’位に結合される、実施形態229~345のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態348. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのヌクレオシド
の5’位に結合される、実施形態229~345のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態349. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオシドに結合される、実施形態229~345のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態350. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの3’末端ヌクレオシドに結合される、実施形態229~350のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態351. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの内部ヌクレオシドに結合される、実施形態229~350のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態352. 前記共役基が、非共役アンチセンス化合物と比較して、肝細胞への前記共役アンチセンス化合物の取り込みを増加させる、実施形態229~351のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態353. 前記共役基が、非共役アンチセンス化合物と比較して、肝臓細胞への前記共役アンチセンス化合物の取り込みを増加させる、実施形態229~352のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態354. 前記共役基が、非共役アンチセンス化合物と比較して、肝臓における前記共役アンチセンス化合物の蓄積を増加させる、実施形態229~353のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態355. 前記共役基が、非共役アンチセンス化合物と比較して、腎臓における前記共役アンチセンス化合物の蓄積を減少させる、実施形態229~354のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態356. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、実施形態229~355のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態357. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態229~356のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態358. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態229~357のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態359. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが一本鎖である、実施形態229~358のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態360. 少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが修飾糖部分を含む、実施形態357~359の共役アンチセンス化合物。
実施形態361. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との
間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、を含む糖モチーフを有する、実施形態359の共役アンチセンス化合物。
実施形態362. 前記5’領域が2個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態361の共役アンチセンス化合物。
実施形態363. 前記5’領域が3個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態361の共役アンチセンス化合物。
実施形態364. 前記5’領域が4個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態361の共役アンチセンス化合物。
実施形態365. 前記5’領域が5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態361の共役アンチセンス化合物。
実施形態366. 前記3’領域が2個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態361~365のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態367. 前記3’領域が3個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態361~365のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態368. 前記3’領域が4個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態361~365のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態369. 前記3’領域が5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態361~365のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態370. 前記中央領域が5個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態361~369のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態371. 前記中央領域が6個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態361~369のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態372. 前記中央領域が7個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態361~369のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態373. 前記中央領域が8個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態361~369のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態374. 前記中央領域が9個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態361~369のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態375. 前記中央領域が10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態361~369のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態376. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが14~26個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態229~376のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態377. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが15~25個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態229~376のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態378. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態229~376のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態379. 各修飾ヌクレオシドが、独立して、2’-置換糖部分または二環式糖部分を含む、実施形態229~378のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態380. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが2’-置換糖部分を含む、実施形態379の共役アンチセンス化合物。
実施形態381. 2’-置換糖部分を含む各修飾ヌクレオシドが、ハロゲン、任意に置換されたアリル、任意に置換されたアミノ、アジド、任意に置換されたSH、CN、OCN、CF3、OCF3、O、S、もしくはN(Rm)-アルキル;O、S、もしくはN(Rm)-アルケニル;O、S、もしくはN(Rm)-アルキニル;任意に置換されたO-アルキレニル-O-アルキル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアルカリル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたO-アルカリル、任意に置換されたO-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn)、またはO-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn)の中から独立して選択される2’置換基を含み、式中、各RmおよびRnが、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換C~C10アルキルであり、
各任意に置換された基が、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ(NO)、チオール、チオアルコキシ(S-アルキル)、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル、およびアルキニルの中から独立して選択される置換基で任意に置換される、実施形態380の共役アンチセンス化合物。
実施形態382. 各2’置換基が、ハロゲン、OCH、OCHF、OCHF、OCF、OCHCH、O(CHF、OCHCHF、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH、O(CH-SCH、O(CH-OCF、O(CH-N(R)(R)、O(CH-ON(R)(R)、O(CH-O(CH-N(R)(R)、OCHC(=O)-N(R)(R)、OCHC(=O)-N(R)-(CH-N(R)(R)、およびO(CH-N(R)-C(=NR)[N(R)(R)]の中から独立して選択され、式中、R、R、R、およびRが各々、独立して、HまたはC~Cアルキルである、実施形態380の共役アンチセンス化合物。
実施形態383. 各2’置換基が、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から独立して選択される、実施形態380の共役アンチセンス化合物。
実施形態384. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-MOE糖部分を含む、実施形態380の共役アンチセンス化合物。
実施形態385. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-OMe糖部分を含む、実施形態380の共役アンチセンス化合物。
実施形態386. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-F糖部分を含む、実施形態380の共役アンチセンス化合物。
実施形態387. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、糖代理物を含む少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態229~386のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態388. 前記修飾ヌクレオシドがF-HNA糖部分を含む、実施形態387の共役アンチセンス化合物。
実施形態389. 前記修飾ヌクレオシドがHNA糖部分を含む、実施形態387の共役アンチセンス化合物。
実施形態390. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、二環式糖部分を含む少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態229~389のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態391. 前記二環式糖部分がcEt糖部分である、実施形態390の共役アンチセンス化合物。
実施形態392. 二環式糖部分がLNA糖部分である、実施形態390の共役アンチセンス化合物。
実施形態393. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態1~392のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態394. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態393の共役アンチセンス化合物。
実施形態395. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、少なくとも1個の修飾結合および少なくとも1個の非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態394の共役アンチセンス化合物。
実施形態396. 少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合がホスホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態393~395のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態397. 各修飾ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態393~396のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態398. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも2個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態399. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも3個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態400. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも4個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396のいずれかの共役アンチセン
ス化合物。
実施形態401. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも5個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態402. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態403. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも7個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態404. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも8個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態405. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも9個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態406. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも10個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態407. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが16個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396または398~406のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態408. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが15個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396または398~406のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態409. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが14個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396または398~406のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態410. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが13個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396または398~406のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態411. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが12個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396または398~406のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態412. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが11個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396または398~406のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態413. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが10個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396または398~406のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態414. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが9個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396または398~406のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態415. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが8個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396または398~406のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態416. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが7個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396または398~406のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態417. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが6個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態393~396または398~406のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態418. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの各末端ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態393~418のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態419. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの2個のデオキシヌクレオシドを結合する各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態393~396または398~418のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態420. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの2個の修飾ヌクレオシドを結合する各非末端ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態393~396または398~419のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態421. 修飾ヌクレオシドの3’である前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの各非末端ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態393~396または398~420のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態422. デオキシヌクレオシドの3’である前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態393~396または398~418のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態423. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
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MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
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MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
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MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM、および
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
の中から選択される化学モチーフを有し、
式中、各Mが、独立して、修飾ヌクレオシドであり、各Dが、デオキシヌクレオシドであり、各sが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合であり、各yが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかであるが、但し、少なくとも1つのyが、ホスホジエステルヌクレオチド間結合であることを条件とする、実施形態229~422のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態424. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
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MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM、および
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
の中から選択される化学モチーフを有し、
式中、各Mが、独立して、修飾ヌクレオシドであり、各Dが、デオキシヌクレオシドであり、各oが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合であり、各sが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態229~422のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態425. 各Mが、2’-MOEヌクレオシドおよび二環式ヌクレオシドの中から独立して選択される、実施形態423または424の共役アンチセンス化合物。
実施形態426. 各Mが、2’-MOEヌクレオシド、cEtヌクレオシド、およびLNAヌクレオシドの中から独立して選択される、実施形態425の共役アンチセンス化合物。
実施形態427. 各Mが2’-MOEヌクレオシドである、実施形態425または426の共役アンチセンス化合物。
実施形態428. 各MがcEtヌクレオシドである、実施形態425または426の共役アンチセンス化合物。
実施形態429. 各MがLNAヌクレオシドである、実施形態425または426の共
役アンチセンス化合物。
実施形態430. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも8個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態229~429のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態431. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも10個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態229~429のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態432. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも12個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態229~429のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態433. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも14個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態229~429のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態434. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも16個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態229~429のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態435. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも18個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態229~429のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態436. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも90%相補的である、実施形態229~435のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態437. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも95%相補的である、実施形態229~435のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態438. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的核酸に対して100%相補的である、実施形態229~435のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態439. 前記標的核酸がプレmRNAである、実施形態430~438のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態440. 前記標的核酸がmRNAである、実施形態430~438のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態441. 前記標的核酸が肝臓において発現される、実施形態430~440のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態442. 前記標的核酸が肝細胞において発現される、実施形態441の共役アンチセンス化合物。
実施形態443. 前記標的核酸が、アンドロゲン受容体、アポリポタンパク質(a)、アポリポタンパク質B、アポリポタンパク質C-III、C反応性タンパク質、eIF-4E、第VII因子、第XI因子、グルココルチコイド受容体、グルカゴン受容体、タン
パク質チロシンホスファターゼ1B、STAT3、およびトランスサイレチンから選択されるタンパク質をコードする、実施形態441または442の共役アンチセンス化合物。
実施形態444. 前記標的核酸がウイルス核酸である、実施形態430~440の共役アンチセンス化合物。
実施形態445. 前記ウイルス核酸が肝臓において発現される、実施形態444の共役アンチセンス化合物。
実施形態446. 前記標的核酸がB型肝炎ウイルス核酸である、実施形態445の共役アンチセンス化合物。
実施形態447. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17、18、19、20、21、22、23、または24のうちのいずれか1個の核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態448. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号25、26、27、28、29、または30のうちのいずれか1個の核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態449. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号31の核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態450. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号32の核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態451. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号33の核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態452. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号34の核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態453. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号35、36、37、38、39、40、41、42、または43のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態454. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号44、45、46、47、または48の核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態455. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、または59のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態456. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号60、61、62、63、64、65、66、または67のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態457. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号69、70、71、または72のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれ
かの共役アンチセンス化合物。
実施形態458. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号73の核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態459. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号74、75、76、77、78、79、80、または81のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態460. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号68の核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態461. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号82~103のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態229~443のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態462. 細胞内の標的核酸の量または活性を低減させる方法であって、細胞を実施形態229~461のいずれかの共役アンチセンス化合物と接触させることを含む、方法。
実施形態463. 前記細胞が肝臓細胞である、実施形態462の方法。
実施形態464. 前記細胞が肝細胞である、実施形態462の方法。
実施形態465. 前記細胞が生体外に存在する、実施形態462~464のいずれかの方法。
実施形態466. 前記細胞が動物内に存在する、実施形態462~464のいずれかの方法。
実施形態467. 前記動物がマウスである、実施形態466の方法。
実施形態468. 前記動物がヒトである、実施形態466の方法。
実施形態469. 実施形態229~469のうちのいずれかに従う共役アンチセンス化合物と、薬剤的に許容される担体または希釈剤と、を含む、医薬組成物。
実施形態470. 前記薬剤的に許容される担体または希釈剤が、滅菌水および滅菌生理食塩水の中から選択される、実施形態469の医薬組成物。
実施形態471. 動物における疾患または状態を治療する方法であって、実施形態469または470の医薬組成物を前記動物に投与することを含み、それにより前記動物における前記疾患または状態を治療する、方法。
実施形態472. 前記動物がマウスである、実施形態471の方法。
実施形態473. 前記動物がヒトである、実施形態471の方法。
実施形態474. 前記疾患または状態が肝臓疾患または状態である、実施形態471~473のいずれかの方法。
実施形態475. 前記投与が非経口投与による、実施形態471~474のいずれかの方法。
実施形態476. 前記投与が皮下注入による、実施形態475の方法。
実施形態477. 前記投与が静脈内注入による、実施形態475の方法。
実施形態478. 前記投与が筋肉内注入による、実施形態475の方法。
実施形態479. 前記共役アンチセンス化合物が1~10mg/kgの用量で提供される、実施形態471~478のいずれかの方法。
実施形態480. 前記共役アンチセンス化合物が1mg/kg未満の用量で提供される、実施形態471~478のいずれかの方法。
実施形態481. 前記共役アンチセンス化合物が10mg/kgを超える用量で提供される、実施形態471~480のいずれかの方法。
実施形態482. 前記共役アンチセンス化合物が少なくとも2ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態471~481のいずれかの方法。
実施形態483. 前記共役アンチセンス化合物が少なくとも4ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態471~481のいずれかの方法。
実施形態484. 前記共役アンチセンス化合物が少なくとも6ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態471~481のいずれかの方法。
実施形態485. 前記共役アンチセンス化合物が1週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態471~481のいずれかの方法。
実施形態486. 前記共役アンチセンス化合物が2週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態471~481のいずれかの方法。
実施形態487. 前記共役アンチセンス化合物が3週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態471~481のいずれかの方法。
実施形態488. 前記共役アンチセンス化合物が4週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態471~481のいずれかの方法。
実施形態489. 前記共役アンチセンス化合物が5週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態471~481のいずれかの方法。
実施形態490. 前記共役アンチセンス化合物が6週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態471~481のいずれかの方法。
実施形態491. 前記共役アンチセンス化合物が7週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態471~481のいずれかの方法。
実施形態492. 前記共役アンチセンス化合物が8週間毎に1回用量の投薬頻度で提供
される、実施形態471~481のいずれかの方法。
実施形態493. 少なくとも1個のリン結合基または中性結合基と、1個以上のリガンドと、を含む、共役化合物。
実施形態494. 2個以上のリガンドを含む、実施形態493の共役化合物。
実施形態495. 3個のリガンドを含む、実施形態493の共役化合物。
実施形態496. 前記リガンドが、多糖、修飾多糖、マンノース、ガラクトース、マンノース誘導体、ガラクトース誘導体、D-マンノピラノース、L-マンノピラノース、D-アラビノース、L-ガラクトース、D-キシロフラノース、L-キシロフラノース、D-グルコース、L-グルコース、D-ガラクトース、L-ガラクトース、α-D-マンノフラノース、β-D-マンノフラノース、α-D-マンノピラノース、β-D-マンノピラノース、α-D-グルコピラノース、β-D-グルコピラノース、α-D-グルコフラノース、β-D-グルコフラノース、α-D-フルクトフラノース、α-D-フルクトピラノース、α-D-ガラクトピラノース、β-D-ガラクトピラノース、α-D-ガラクトフラノース、β-D-ガラクトフラノース、グルコサミン、シアル酸、α-D-ガラクトサミン、N-アセチルガラクトサミン、2-アミノ-3-O-[(R)-1-カルボキシエチル]-2-デオキシ-β-D-グルコピラノース、2-デオキシ-2-メチルアミノ-L-グルコピラノース、4,6-ジデオキシ-4-ホルムアミド-2,3-ジ-O-メチル-D-マンノピラノース、2-デオキシ-2-スルホアミノ-D-グルコピラノース、N-グリコロイル-α-ノイラミン酸、5-チオ-β-D-グルコピラノース、メチル2,3,4-トリ-O-アセチル-1-チオ-6-O-トリチル-α-D-グルコピラノシド、4-チオ-β-D-ガラクトピラノース、エチル3,4,6,7-テトラ-O-アセチル-2-デオキシ-1,5-ジチオ-α-D-グルコ-ヘプトピラノシド、2,5-アンヒドロ-D-アロノニトリル、リボース、D-リボース、D-4-チオリボース、L-リボース、L-4-チオリボースの中から選択される、実施形態493~495のいずれかの共役化合物。
実施形態497. 前記リガンドがN-アセチルガラクトースアミンである、実施形態493~495のいずれかの共役化合物。
実施形態498. 共役基が、以下の中から選択される構造を含む、実施形態493~497のいずれかの共役化合物。
Figure 0007177127000093
Figure 0007177127000094
実施形態499. 前記共役化合物が、以下の中から選択される構造を有するテザーを有し、
Figure 0007177127000095
式中、Lが、リン結合基または中性結合基のいずれかであり、
が、C(=O)O-Rであり、
が、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキであり、
が、H、C~Cアルキルまたは置換C~Cアルキであり、
各mが、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmが、各テザーに対して0を超える、実施形態493~498のいずれかの共役化合物。
実施形態500. 前記テザーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000096
式中、Zが、HまたはCHであり、
各mが、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmが、各テザーに対して0を超える、実施形態499の共役化合物。
実施形態501. 前記共役化合物がオリゴヌクレオチドに共有結合される、実施形態493~500のいずれかの共役化合物。
実施形態502. オリゴヌクレオチド少なくとも1個の共役基を含むオリゴマー化合物であって、前記少なくとも1個の共役基が、実施形態493~500のいずれかの共役化合物である、オリゴマー化合物。
実施形態503. 式(I)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000097
式中、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヒドロキシル、水素、ヒドロキシル保護基、リン部分、または反応性リン基である、化合物。
実施形態504. 式(II)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000098
式中、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヒドロキシル、水素、ヒドロキシル保護基、リン部分、または反応性リン基である、化合物。
実施形態505. 前記リン部分が、以下の式を有し、
Figure 0007177127000099
式中、
nが、0または1であり、
およびRが各々、独立して、OH、SH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルコキシ、置換C~Cアルコキシ、アミノ、または置換アミノであり、
が、OまたはSである、
実施形態503または504のいずれかの化合物。
実施形態506. オリゴヌクレオチドおよび少なくとも1個の共役基を含むオリゴマー化合物であって、前記少なくとも1個の共役基が、式(III)の共役化合物であり、
Figure 0007177127000100
式中、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物に結合されるヌクレオシド間結合基である、オリゴマー化合物。
実施形態507. オリゴヌクレオチドおよび少なくとも1個の共役基を含むオリゴマー化合物であって、前記少なくとも1個の共役基が、式(IV)の共役化合物であり、
Figure 0007177127000101
式中、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物に結合されるヌクレオシド間結合基である、オリゴマー化合物。
実施形態508. 前記複素環式塩基部分が、ピリミジン、置換ピリミジン、プリン、または置換プリンである、実施形態503~507のいずれかの化合物またはオリゴマー化合物。
実施形態509. Bxが、ウラシル、チミン、シトシン、5-メチルシトシン、アデニン、またはグアニンである、実施形態503~507のいずれかの化合物またはオリゴマー化合物。
実施形態510. Bxがアデニンである、実施形態503~507のいずれかの化合物またはオリゴマー化合物。
実施形態511. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000102
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
Cが、前記共役リンカーであり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態512. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000103
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
Cが、前記共役リンカーであり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
が、0または1であり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態513. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000104
式中、各Lが、独立して、リン結合基または中性結合基であり、
各nが、独立して、1~20である、
実施形態511または512の共役アンチセンス化合物。
実施形態514. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有する、実施形態511または512の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000105
実施形態515. 前記共役リンカーが、以下の構造を有する、実施形態511または512の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000106
実施形態516. 前記共役リンカーが、以下から選択される構造のうちの1つを有する、実施形態511または512の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000107
実施形態517. 前記共役リンカーが、以下から選択される構造のうちの1つを有する、実施形態511または512の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000108
実施形態518. 前記共役リンカーが、以下から選択される構造のうちの1つを有する、実施形態511または512の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000109
実施形態519. 前記共役リンカーがピロリジンを含む、実施形態511または518のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態520. 前記共役リンカーがピロリジンを含まない、実施形態511または519のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態521. 前記共役リンカーがPEGを含む、実施形態511または520のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態522. 前記共役リンカーがアミドを含む、実施形態511または521のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態523. 前記共役リンカーがアミドを含まない、実施形態511または522のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態524. 前記共役リンカーがポリアミドを含む、実施形態511または523
のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態525. 前記共役リンカーがアミンを含む、実施形態511または524のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態526. 前記共役リンカーが1個以上のジスルフィド結合を含む、実施形態511または525のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態527. 前記共役リンカーがタンパク質結合部分を含む、実施形態511または526のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態528. 前記タンパク質結合部分が脂質を含む、実施形態527の共役アンチセンス化合物。
実施形態529. 前記タンパク質結合部分が、コレステロール、コール酸、アダマンタン酢酸、1-ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、1,3-ビス-O(ヘキサデシル)グリセロール、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデシルグリセロール、ボルネオール、メントール、1,3-プロパンジオール、ヘプタデシル基、パルミチン酸、ミリスチン酸、O3-(オレオイル)リトコール酸、O3-(オレオイル)コレン酸、ジメトキシトリチル、またはフェノキサジン)、ビタミン(例えば、葉酸塩、ビタミンA、ビタミンE、ビオチン、ピリドキサール)、ペプチド、炭水化物(例えば、単糖、二糖、三糖、四糖、オリゴ糖、多糖)、エンドソーム溶解成分、ステロイド(例えば、ウバオール、ヘシゲニン、ジオスゲニン)、テルペン(例えば、トリテルペン、例えば、サルササポゲニン、フリーデリン、エピフリーデラノール誘導体化リトコール酸)、またはカチオン性脂質の中から選択される、実施形態528の共役アンチセンス化合物。
実施形態530. 前記タンパク質結合部分が、C16~C22長鎖飽和もしくは不飽和脂肪酸、コレステロール、コール酸、ビタミンE、アダマンタン、または1-ペンタフルオロプロピルである、実施形態527~529のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態531. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000110
式中、各nが、独立して、1~20であり、pが、1~6である、
実施形態511または512のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態532. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000111
式中、各nが、独立して、1~20である、実施形態511または512のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態533. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有する、実施形態511または512のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000112
実施形態534. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000113
式中、nが、1~20である、
実施形態511または512のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態535. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000114
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態536. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000115
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、共役アンチセンス化合物。
実施形態537. 前記分岐基が、以下の構造のうちの1つを有し、
Figure 0007177127000116
式中、各Aが、独立して、O、S、C=O、またはNHであり、
各nが、独立して、1~20である、
実施形態511~536の共役アンチセンス化合物。
実施形態538. 前記分岐基が、以下の構造のうちの1つを有し、
Figure 0007177127000117
式中、各Aが、独立して、O、S、C=O、またはNHであり、
各nが、独立して、1~20である、
実施形態511~536の共役アンチセンス化合物。
実施形態539. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態511~536の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000118
実施形態540. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態511~536の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000119
実施形態541. 前記分岐基がエーテルを含む、実施形態511~536のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態542. 前記分岐基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000120
各nが、独立して、1~20であり、
mが、2~6である、
実施形態511~536の共役アンチセンス化合物。
実施形態543. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態511~536の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000121
実施形態544. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態511~536の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000122
実施形態545. 前記分岐基が、
Figure 0007177127000123
Figure 0007177127000124
Figure 0007177127000125
Figure 0007177127000126
または
Figure 0007177127000127
を含み、
式中、各jが、1~3の整数であり、
式中、各nが、1~20の整数である、
実施形態511~536のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態546. 前記分岐基が、
Figure 0007177127000128
Figure 0007177127000129
Figure 0007177127000130
Figure 0007177127000131
または
Figure 0007177127000132
を含む、実施形態511~536のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態547. 各テザーが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000133
式中、Lが、リン結合基および中性結合基から選択され、
が、C(=O)O-Rであり、
が、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキであり、
が、H、C~Cアルキルまたは置換C~Cアルキであり、
各mが、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmが、各テザーに対して0を超える、
実施形態511~546の共役アンチセンス化合物。
実施形態548. 各テザーが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000134
式中、Zが、HまたはCHであり、
各mが、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmが、各テザーに対して0を超える、
請求項511~546の共役アンチセンス化合物。
実施形態549. 少なくとも1個のテザーがPEGを含む、実施形態511~546のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態550. 少なくとも1個のテザーがアミドを含む、実施形態511~546のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態551. 少なくとも1個のテザーがポリアミドを含む、実施形態511~546のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態552. 少なくとも1個のテザーがアミンを含む、実施形態511~546のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態553. 少なくとも2個のテザーが互いに異なる、実施形態511~546のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態554. 前記テザーのすべてが互いに同一である、実施形態511~546のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態555. 各テザーが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000135
各nが、独立して、1~20であり、
各pが、1~約6である、
実施形態511~546のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態556. 各テザーが、以下の中から選択される、実施形態511~546のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000136
実施形態557. 各テザーが、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000137
式中、各nが、独立して、1~20である、
実施形態511~546のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態558. 各テザーが、以下の構造を有する、実施形態511~546のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000138
実施形態559. 前記細胞標的部分が、以下の構造を有する、実施形態493~502または511~558のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000139
実施形態560. 前記細胞標的部分が、以下の構造を有する、実施形態493~502または511~558のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000140
実施形態561. 前記細胞標的部分が少なくとも1個のリガンドを含む、実施形態493~502または511~558のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態562. 前記細胞標的部分が1個のリガンドを含む、実施形態493~502または511~558の共役アンチセンス化合物。
実施形態563. 前記標的部分が2個のリガンドを含む、実施形態493~502または511~558の共役アンチセンス化合物。
実施形態564. 前記標的部分が3個のリガンドを含む、実施形態493~502または511~558の共役アンチセンス化合物。
実施形態565. 各リガンドが各テザーに共有結合される、実施形態561~564のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態566. 少なくとも1個のリガンドがN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)である、実施形態561~564のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態567. 各リガンドがN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)である、実施形態561~564のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態568. 前記リガンドが、多糖、修飾多糖、マンノース、ガラクトース、マンノース誘導体、ガラクトース誘導体、D-マンノピラノース、L-マンノピラノース、D-アラビノース、L-ガラクトース、D-キシロフラノース、L-キシロフラノース、D-グルコース、L-グルコース、D-ガラクトース、L-ガラクトース、α-D-マンノフラノース、β-D-マンノフラノース、α-D-マンノピラノース、β-D-マンノピラノース、α-D-グルコピラノース、β-D-グルコピラノース、α-D-グルコフラノース、β-D-グルコフラノース、α-D-フルクトフラノース、α-D-フルクトピラノース、α-D-ガラクトピラノース、β-D-ガラクトピラノース、α-D-ガラクトフラノース、β-D-ガラクトフラノース、グルコサミン、シアル酸、α-D-ガラクトサミン、N-アセチルガラクトサミン、2-アミノ-3-O-[(R)-1-カルボキシエチル]-2-デオキシ-β-D-グルコピラノース、2-デオキシ-2-メチルアミ
ノ-L-グルコピラノース、4,6-ジデオキシ-4-ホルムアミド-2,3-ジ-O-メチル-D-マンノピラノース、2-デオキシ-2-スルホアミノ-D-グルコピラノース、N-グリコロイル-α-ノイラミン酸、5-チオ-β-D-グルコピラノース、メチル2,3,4-トリ-O-アセチル-1-チオ-6-O-トリチル-α-D-グルコピラノシド、4-チオ-β-D-ガラクトピラノース、エチル3,4,6,7-テトラ-O-アセチル-2-デオキシ-1,5-ジチオ-α-D-グルコ-ヘプトピラノシド、2,5-アンヒドロ-D-アロノニトリル、リボース、D-リボース、D-4-チオリボース、L-リボース、L-4-チオリボースの中から選択される、実施形態561~564のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態569. 前記リガンドがガラクトースである、実施形態561~564のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態570. 前記リガンドがマンノース-6-ホスフェートである、実施形態561~564のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態571. 各リガンドが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000141
式中、各Rが、OHおよびNHCOOHから選択される、
実施形態561~564のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態572. 各リガンドが、以下の中から選択される、実施形態561~564のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000142
実施形態573. 各リガンドが、以下の構造を有する、実施形態561~564のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000143
実施形態574. 各リガンドが、以下の構造を有する、実施形態561~564のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000144
実施形態575. 前記細胞標的部分が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000145
式中、各nが、独立して、1~20である、
実施形態493~502または511~574のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態576. 前記細胞標的部分が、以下の構造を有する、実施形態493~502または511~574のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000146
実施形態577. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000147
式中、各nが、独立して、1~20であり、
Qが、前記アンチセンス化合物であり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
実施形態493~502または511~574のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態578. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000148
式中、各nが、独立して、1~20であり、
Qが、前記アンチセンス化合物であり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
実施形態493~502または511~574のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態579. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000149
式中、各nが、独立して、1~20であり、
Qが、前記アンチセンス化合物であり、
Zが、Hまたは結合固体支持体であり、
Bxが、複素環式塩基部分である、実施形態493~502または511~574のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態580. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000150
式中、各nが、独立して、1~20であり、
Qが、前記アンチセンス化合物であり、
Zが、Hまたは結合固体支持体であり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
実施形態493~502または511~574のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態581. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000151
式中、Qが、前記アンチセンス化合物である、
実施形態493~502または511~574のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態582. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000152
式中、Qが、前記アンチセンス化合物である、
実施形態493~502または511~574のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態583. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000153
式中、Qが、前記アンチセンス化合物であり、
Zが、Hまたは結合固体支持体である、
実施形態493~502または511~574のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態584. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000154
式中、Qが、前記アンチセンス化合物であり、
Zが、Hまたは結合固体支持体である、
実施形態493~502または511~574のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態585. オリゴヌクレオチドおよび共役基を含む共役オリゴヌクレオチドであって、前記共役基が実施形態493~584のいずれかの任意の共役基である、共役オリゴヌクレオチド。
実施形態586. 前記オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態585の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態587. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが修飾塩基を含む、実施形態586の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態588. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが糖代理物を含む、実施形態586または587の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態589. 前記糖代理物がテトラヒドロピランである、実施形態588の共役オ
リゴヌクレオチド。
実施形態590. 前記テトラヒドロピランがF-HNAである、実施形態589のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態591. 前記オリゴヌクレオチドの残りが、修飾糖を含む少なくとも1個のヌクレオシドを含む、実施形態586~590のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態592. 修飾糖を含む前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが、二環式ヌクレオシドおよび2’-修飾ヌクレオシドから選択される、実施形態591の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態593. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが二環式ヌクレオシドである、実施形態586の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態594. 前記二環式ヌクレオシドが(4’-CH-O-2’)BNAヌクレオシドである、実施形態593の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態595. 前記二環式ヌクレオシドが(4’-(CH-O-2’)BNAヌクレオシドである、実施形態593の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態596. 前記二環式ヌクレオシドが(4’-C(CH)H-O-2’)BNAヌクレオシドである、実施形態593の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態597. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが2’-修飾ヌクレオシドである、実施形態586の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態598. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが、2’-Fヌクレオシド、2’-OCHヌクレオシド、および2’-O(CHOCHヌクレオシドから選択される、実施形態597の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態599. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-Fヌクレオシドである、実施形態598の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態600. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-OCHヌクレオシドである、実施形態598の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態601. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-O(CHOCHヌクレオシドである、実施形態598の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態602. 前記オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の非修飾ヌクレオシドを含む、実施形態585~601のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態603. 前記非修飾ヌクレオシドがリボヌクレオシドである、実施形態602の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態604. 前記非修飾ヌクレオシドがデオキシリボヌクレオシドである、実施形態602の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態605. 前記オリゴヌクレオチドが少なくとも2個の修飾ヌクレオシドを含む
、実施形態585~604のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態606. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドが同一の修飾を含む、実施形態605の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態607. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドが異なる修飾を含む、実施形態605の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態608. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドのうちの少なくとも1つが糖代理物を含む、実施形態605~607のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態609. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドのうちの少なくとも1つが2’-修飾を含む、実施形態605~608のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態610. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が、2’-Fヌクレオシド、2’-OCHヌクレオシド、および2’-O(CHOCHヌクレオシドから独立して選択される、実施形態609の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態611. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が2’-Fヌクレオシドである、実施形態610の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態612. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が2’-OCHヌクレオシドである、実施形態610の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態613. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が2’-O(CHOCHヌクレオシドである、実施形態610の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態614. 前記オリゴヌクレオチドの本質的にすべてのヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態586~613のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態615. 前記オリゴヌクレオチドのすべてのヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態586~601または606~613のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態616. 前記オリゴヌクレオチドが一本鎖である、実施形態586~615のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態617. 前記オリゴヌクレオチドが二本鎖である、実施形態586~615のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態618. 前記オリゴヌクレオチドがアンチセンス化合物である、実施形態586~615のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態619. 前記オリゴヌクレオチドがRISCベースのオリゴヌクレオチドである、実施形態586~615のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態620. 前記オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、実施形態586~615のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態621. 前記オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合
物である、実施形態586~615のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態622. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオシドに結合される、実施形態586~621のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態623. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの3’末端ヌクレオシドに結合される、実施形態586~621のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態624. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの内部ヌクレオシドに結合される、実施形態586~621のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態625. 前記共役基が、非共役オリゴヌクレオチド化合物と比較して、肝細胞への前記共役オリゴヌクレオチド化合物の取り込みを増加させる、実施形態586~624のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態626. 前記共役基が、非共役オリゴヌクレオチド化合物と比較して、肝臓細胞への前記共役オリゴヌクレオチド化合物の取り込みを増加させる、実施形態586~624のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態627. 前記共役基が、非共役オリゴヌクレオチド化合物と比較して、肝臓における前記共役オリゴヌクレオチド化合物の蓄積を増加させる、実施形態586~626のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態628. 前記共役基が、非共役オリゴヌクレオチド化合物と比較して、腎臓における前記共役オリゴヌクレオチド化合物の蓄積を減少させる、実施形態586~627のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態629. 前記共役オリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含む糖モチーフを有する、実施形態586~628の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態630. 前記5’領域が2個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態629の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態631. 前記5’領域が3個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態629の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態632. 前記5’領域が4個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態629の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態633. 前記5’領域が5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態629の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態634. 前記3’領域が2個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態629~633のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態635. 前記3’領域が3個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態629~633のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態636. 前記3’領域が4個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態629~633のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態637. 前記3’領域が5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態629~633のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態638. 前記中央領域が5個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態629~633のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態639. 前記中央領域が6個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態629~633のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態640. 前記中央領域が7個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態629~633のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態641. 前記中央領域が8個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態629~633のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態642. 前記中央領域が9個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態629~633のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態643. 前記中央領域が10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態629~633のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態644. 前記共役オリゴヌクレオチドが14~26個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態629~644のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態645. 前記共役オリゴヌクレオチドが15~25個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態629~644のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態646. 前記共役オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態629~644のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態647. 各修飾ヌクレオシドが、独立して、2’-置換糖部分または二環式糖部分を含む、実施形態629~644のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態648. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが2’-置換糖部分を含む、実施形態647の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態649. 2’-置換糖部分を含む各修飾ヌクレオシドが、ハロゲン、任意に置換されたアリル、任意に置換されたアミノ、アジド、任意に置換されたSH、CN、OCN、CF、OCF、O、S、もしくはN(Rm)-アルキル;O、S、もしくはN(Rm)-アルケニル;O、S、もしくはN(Rm)-アルキニル;任意に置換されたO-アルキレニル-O-アルキル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアルカリル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたO-アルカリル、任意に置換されたO-アラルキル、O(CHSCH、O-(CH-O-N(Rm)(Rn)、またはO-CH-C(=O)-N(Rm)(Rn)の中から独立して選択される2’置換基を含み、式中、各RmおよびRnが、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換C~C10アルキルであり、
各任意に置換された基が、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ(NO)、チオール、チオアルコキシ(S-アルキル)、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル、およびアルキニルの中から独立して選択される置換基で任意に置換される、実施形態648の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態650. 各2’置換基が、ハロゲン、OCH、OCHF、OCHF、OCF、OCHCH、O(CHF、OCHCHF、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH、O(CH-SCH、O(CH-OCF、O(CH-N(R)(R)、O(CH-ON(R)(R)、O(CH-O(CH-N(R)(R)、OCHC(=O)-N(R)(R)、OCHC(=O)-N(R)-(CH-N(R)(R)、およびO(CH-N(R)-C(=NR)[N(R)(R)]の中から独立して選択され、式中、R、R、R、およびRが各々、独立して、HまたはC~Cアルキルである、実施形態648の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態651. 各2’置換基が、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHから独立して選択される、実施形態648の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態652. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-MOE糖部分を含む、実施形態648の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態653. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-OMe糖部分を含む、実施形態648の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態654. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-F糖部分を含む、実施形態648の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態655. 前記共役オリゴヌクレオチドが、糖代理物を含む少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態629~644のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態656. 前記修飾ヌクレオシドがF-HNA糖部分を含む、実施形態655の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態657. 前記修飾ヌクレオシドがHNA糖部分を含む、実施形態655の共役
オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態658. 前記共役オリゴヌクレオチドが、二環式糖部分を含む少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態629~657のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態659. 前記二環式糖部分がcEt糖部分である、実施形態658の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態660. 二環式糖部分がLNA糖部分である、実施形態658の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態661. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態585~660のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態662. 前記共役オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態661の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態663. 前記共役オリゴヌクレオチドが、少なくとも1個の修飾結合および少なくとも1個の非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態661の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態664. 少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合がホスホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態661~663のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態665. 各修飾ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態661~663のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態666. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも2個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または662のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態667. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも3個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または662のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態668. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも4個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または662のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態669. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも5個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または662のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態670. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または662のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態671. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも7個のホスホジエステルヌ
クレオシド間結合を含む、実施形態661または662のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態672. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも8個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または662のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態673. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも9個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または662のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態674. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも10個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または662のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態675. 前記共役オリゴヌクレオチドが16個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または663~674のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態676. 前記共役オリゴヌクレオチドが15個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または663~674のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態677. 前記共役オリゴヌクレオチドが14個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または663~674のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態678. 前記共役オリゴヌクレオチドが13個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または663~674のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態679. 前記共役オリゴヌクレオチドが12個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または663~674のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態680. 前記共役オリゴヌクレオチドが11個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または663~674のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態681. 前記共役オリゴヌクレオチドが10個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または663~674のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態682. 前記共役オリゴヌクレオチドが9個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または663~674のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態683. 前記共役オリゴヌクレオチドが8個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または663~674のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態684. 前記共役オリゴヌクレオチドが7個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または663~674のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態685. 前記共役オリゴヌクレオチドが6個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態661または663~674のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態686. 前記共役オリゴヌクレオチドの各末端ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態585~685のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態687. 前記共役オリゴヌクレオチドの2個のデオキシヌクレオシドを結合する各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態585~662または665~686のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態688. 前記共役オリゴヌクレオチドの2個の修飾ヌクレオシドを結合する各非末端ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態585~662または665~687のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態689. 修飾ヌクレオシドの3’である前記共役オリゴヌクレオチドの各非末端ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態585~662または665~688のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態690. デオキシヌクレオシドの3’である前記共役オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態585~662または665~689のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態691. 前記共役オリゴヌクレオチドが、
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM、および
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
の中から選択される化学モチーフを有し、
式中、各Mが、独立して、修飾ヌクレオシドであり、各Dが、デオキシヌクレオシドであり、各sが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合であり、各yが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかであるが
、但し、少なくとも1つのyが、ホスホジエステルヌクレオチド間結合であることを条件とする、
実施形態585~662または665~690のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態692. 前記共役オリゴヌクレオチドが、
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM、および
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
の中から選択される化学モチーフを有し、
式中、各Mが、独立して、修飾ヌクレオシドであり、各Dが、デオキシヌクレオシドであり、各oが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合であり、各sが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、
実施形態585~662または665~690のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態693. 各Mが、2’-MOEヌクレオシドおよび二環式ヌクレオシドの中から独立して選択される、実施形態691または692の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態694. 各Mが、2’-MOEヌクレオシド、cEtヌクレオシド、およびLNAヌクレオシドの中から独立して選択される、実施形態693の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態695. 各Mが2’-MOEヌクレオシドである、実施形態693または694の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態696. 各MがcEtヌクレオシドである、実施形態693または694の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態697. 各MがLNAヌクレオシドである、実施形態693または694の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態698. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも8個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態585~697のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態699. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも10個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態585~697のい
ずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態700. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも12個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態585~697のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態701. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも14個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態585~697のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態702. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも16個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態585~697のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態703. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも18個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態585~697のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態704. 前記共役オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも90%相補的である、実施形態585~697のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態705. 前記共役オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも95%相補的である、実施形態585~697のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態706. 前記共役オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して100%相補的である、実施形態585~697のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態707. 前記標的核酸がプレmRNAである、実施形態698~706のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態708. 前記標的核酸がmRNAである、実施形態698~706のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態709. 前記標的核酸がマイクロRNAである、実施形態698~706のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態710. 前記標的核酸が肝臓において発現される、実施形態698~709のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態711. 前記標的核酸が肝細胞において発現される、実施形態698~709のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態712. 前記標的核酸が、アンドロゲン受容体、アポリポタンパク質(a)、アポリポタンパク質B、アポリポタンパク質C-III、C反応性タンパク質、eIF-4E、第VII因子、第XI因子、グルココルチコイド受容体、グルカゴン受容体、タンパク質チロシンホスファターゼ1B、STAT3、およびトランスサイレチンの中から選択されるタンパク質をコードする、実施形態698~709のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態713. 前記標的核酸がウイルス核酸である、実施形態698~709のいず
れかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態714. 前記ウイルス核酸が肝臓において発現される、実施形態713の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態715. 前記標的核酸がB型肝炎ウイルス核酸である、実施形態714の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態716. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号17、18、19、20、21、22、23、または24のうちのいずれか1個の核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態717. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号25、26、27、28、29、または30のうちのいずれか1個の核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態718. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号31の核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態719. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号32の核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態720. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号33の核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態721. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号34の核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態722. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号35、36、37、38、39、40、41、42、または43のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態723. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号44、45、46、47、または48の核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態724. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、または59のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態725. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号60、61、62、63、64、65、66、または67のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態726. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号69、70、71、または72のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態727. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号73の核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態728. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号74、75、76、77、78、79、80、または81のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態729. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号68の核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態730. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号82~103のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態585~708のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態731. 前記共役オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態585~731のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態732. 細胞内の標的核酸の量または活性を低減させる方法であって、細胞を実施形態493~731のいずれかの化合物または共役アンチセンス化合物と接触させることを含む、方法。
実施形態733. 前記細胞が肝臓細胞である、実施形態732の方法。
実施形態734. 前記細胞が肝細胞である、実施形態732の方法。
実施形態735. 前記細胞が生体外に存在する、実施形態732~734のいずれかの方法。
実施形態736. 前記細胞が動物内に存在する、実施形態732~734のいずれかの方法。
実施形態737. 前記動物がマウスである、実施形態736の方法。
実施形態738. 前記動物がヒトである、実施形態736の方法。
実施形態739. 実施形態493~731のいずれかに従う化合物または共役オリゴヌクレオチドと、薬剤的に許容される担体または希釈剤と、を含む、医薬組成物。
実施形態740. 前記薬剤的に許容される担体または希釈剤が、滅菌水および滅菌生理食塩水の中から選択される、実施形態739の医薬組成物。
実施形態741. 動物における疾患または状態を治療する方法であって、実施形態739または740の医薬組成物を動物に投与することを含み、それにより前記動物における前記疾患または状態を治療する、方法。
実施形態742. 前記動物がマウスである、実施形態741の方法。
実施形態743. 前記動物がヒトである、実施形態741の方法。
実施形態744. 前記疾患または状態が肝臓疾患または状態である、実施形態741~743のいずれかの方法。
実施形態745. 前記投与が非経口投与による、実施形態741~743のいずれかの方法。
実施形態746. 前記投与が皮下注入による、実施形態745の方法。
実施形態747. 前記投与が静脈内注入による、実施形態745の方法。
実施形態748. 前記投与が筋肉内注入による、実施形態745の方法。
実施形態749. 前記共役オリゴヌクレオチドが1~10mg/kgの用量で提供される、実施形態741~748のいずれかの方法。
実施形態750. 前記共役オリゴヌクレオチドが1mg/kg未満の用量で提供される、実施形態741~748のいずれかの方法。
実施形態751. 前記共役オリゴヌクレオチドが10mg/kgを超える用量で提供される、実施形態741~748のいずれかの方法。
実施形態752. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも2ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態741~751のいずれかの方法。
実施形態753. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも4ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態741~751のいずれかの方法。
実施形態754. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも6ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態741~751のいずれかの方法。
実施形態755. 前記共役オリゴヌクレオチドが1週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態741~751のいずれかの方法。
実施形態756. 前記共役オリゴヌクレオチドが2週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態741~751のいずれかの方法。
実施形態757. 前記共役オリゴヌクレオチドが3週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態741~751のいずれかの方法。
実施形態758. 前記共役オリゴヌクレオチドが4週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態741~751のいずれかの方法。
実施形態759. 前記共役オリゴヌクレオチドが5週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態741~751のいずれかの方法。
実施形態760. 前記共役オリゴヌクレオチドが6週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態741~751のいずれかの方法。
実施形態761. 前記共役オリゴヌクレオチドが7週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態741~751のいずれかの方法。
実施形態762. 前記共役オリゴヌクレオチドが8週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態741~751のいずれかの方法。
実施形態763. 12~30個の連結したヌクレオシドを含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンス化合物であって、前記共役基が少なくとも1個の細胞標的部分を含む、共役アンチセンス化合物。
実施形態764. 細胞におけるアポリポタンパク質C-IIIタンパク質の活性または量を減少させる方法であって、細胞を実施形態493~731のいずれかの少なくとも1個の共役アンチセンス化合物と接触させることを含み、それにより前記細胞における前記アポリポタンパク質C-IIIタンパク質の活性または量を減少させる、方法。
実施形態765. 総コレステロールを低下させる方法であって、細胞を実施形態493~731のいずれかの少なくとも1個の化合物と接触させることを含み、それにより総コレステロールを低下させる、方法。
実施形態766. トリグリセリドを低下させる方法であって、細胞を実施形態493~731のいずれかの少なくとも1個の化合物と接触させることを含み、それによりトリグリセリドを低下させる、方法。
実施形態767. LDLを減少させる方法であって、細胞を実施形態493~731のいずれかの少なくとも1個の化合物と接触させることを含み、それによりLDLを減少させる、方法。
実施形態768. HDLを増加させる方法であって、細胞を実施形態493~731のいずれかの少なくとも1個の化合物と接触させることを含み、それによりHDLを増加させる、方法。
実施形態769. 前記細胞が生体外に存在する、実施形態764~768のいずれかの方法。
実施形態770. 前記細胞が動物内に存在する、実施形態764~768のいずれかの方法。
実施形態771. 前記動物がヒトである、実施形態764~768のいずれかの方法。
実施形態772. 実施形態1~771のいずれかの化合物もしくは共役オリゴヌクレオチド、またはそのプロドラッグ。
実施形態773. 以下の構造を含むアンチセンス化合物のプロドラッグであって、
Figure 0007177127000155
式中、ASOが、実施形態1~771のいずれかのアンチセンスオリゴヌクレオチドを表す、プロドラッグ。
実施形態774. 以下の構造を含むアンチセンス化合物のプロドラッグであって、前記プロドラッグの1個以上の代謝物が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000156
式中、ASOが、実施形態1~771のいずれかのアンチセンスオリゴヌクレオチドを表す、プロドラッグ。
実施形態775. アンチセンス化合物のプロドラッグであって、前記プロドラッグの1個以上の代謝物が、実施形態1~771のいずれかのアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む、プロドラッグ。
実施形態776. プロドラッグであって、
Figure 0007177127000157
を含み、
式中、ASOが、請求項1~731のいずれかのアンチセンスオリゴヌクレオチドを表す、プロドラッグ。
実施形態777. 実施形態1~771のいずれかのアンチセンスオリゴヌクレオチドを製造する方法。
実施形態778. 実施形態1~771のいずれかのアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製する方法。
実施形態779. 少なくとも1個のリン結合基または中性結合基と、1個以上のリガンドと、を含む、共役化合物。
実施形態780. 2個以上のリガンドを含む、実施形態779の共役化合物。
実施形態781. 3個のリガンドを含む、実施形態779の共役化合物。
実施形態782. 前記リガンドが、多糖、修飾多糖、マンノース、ガラクトース、マンノース誘導体、ガラクトース誘導体、D-マンノピラノース、L-マンノピラノース、D-アラビノース、L-ガラクトース、D-キシロフラノース、L-キシロフラノース、D-グルコース、L-グルコース、D-ガラクトース、L-ガラクトース、α-D-マンノフラノース、β-D-マンノフラノース、α-D-マンノピラノース、β-D-マンノピラノース、α-D-グルコピラノース、β-D-グルコピラノース、α-D-グルコフラノース、β-D-グルコフラノース、α-D-フルクトフラノース、α-D-フルクトピラノース、α-D-ガラクトピラノース、β-D-ガラクトピラノース、α-D-ガラクトフラノース、β-D-ガラクトフラノース、グルコサミン、シアル酸、α-D-ガラクトサミン、N-アセチルガラクトサミン、2-アミノ-3-O-[(R)-1-カルボキシエチル]-2-デオキシ-β-D-グルコピラノース、2-デオキシ-2-メチルアミノ-L-グルコピラノース、4,6-ジデオキシ-4-ホルムアミド-2,3-ジ-O-メチル-D-マンノピラノース、2-デオキシ-2-スルホアミノ-D-グルコピラノース、N-グリコロイル-α-ノイラミン酸、5-チオ-β-D-グルコピラノース、メチル2,3,4-トリ-O-アセチル-1-チオ-6-O-トリチル-α-D-グルコピラノシド、4-チオ-β-D-ガラクトピラノース、エチル3,4,6,7-テトラ-O-アセチル-2-デオキシ-1,5-ジチオ-α-D-グルコ-ヘプトピラノシド、2,5-アンヒドロ-D-アロノニトリル、リボース、D-リボース、D-4-チオリボース、L-リボース、L-4-チオリボースの中から選択される、実施形態779~781のいずれかの共役化合物。
実施形態783. 前記リガンドがN-アセチルガラクトースアミンである、実施形態779~781のいずれかの共役化合物。
実施形態784. 共役基が、以下の中から選択される構造を含む、実施形態779~783のいずれかの共役化合物。
Figure 0007177127000158
Figure 0007177127000159
実施形態785. 前記共役化合物が、以下の中から選択される構造を有するテザーを有し、
Figure 0007177127000160
式中、Lが、リン結合基または中性結合基のいずれかであり、
が、C(=O)O-Rであり、
が、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキであり、
が、H、C~Cアルキルまたは置換C~Cアルキであり、
各mが、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmが、各テザーに対して0を超える、
実施形態779~784のいずれかの共役化合物。
実施形態786. 前記テザーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000161
式中、Zが、HまたはCHであり、
各mが、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmが、各テザーに対して0を超える、
実施形態785の共役化合物。
実施形態787. 前記共役化合物がオリゴヌクレオチドに共有結合される、実施形態779~786のいずれかの共役化合物。
実施形態788. オリゴヌクレオチドおよび少なくとも1個の共役基を含むオリゴマー化合物であって、少なくとも1個の共役基が、実施形態780~786のいずれかの共役化合物である、オリゴマー化合物。
実施形態789. 式(V)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000162
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、またはGalNAc-11aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分である、化合物。
実施形態790. 式(VIII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000163
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態791. 式(IX)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000164
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態792. 式(X)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000165
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態793. 式(XI)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000166
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態794. 式(XII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000167
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態795. 式(XIII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000168
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態796. 式(XIV)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000169
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態797. 式(XV)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000170
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態798. 以下の式(I)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000171
式中、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヒドロキシル、水素、ヒドロキシル保護基、リン部分、または反応性リン基である、化合物。
実施形態799. 以下の式(II)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000172
式中、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヒドロキシル、水素、ヒドロキシル保護基、リン部分、または反応性リン基である、化合物。
実施形態800. 前記リン部分が、以下の式を有し、
Figure 0007177127000173
式中、
nが、0または1であり、
およびRが各々、独立して、OH、SH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルコキシ、置換C~Cアルコキシ、アミノ、または置換アミノであり、
が、OまたはSである、
実施形態798または799のいずれかの化合物。
実施形態801. オリゴヌクレオチドおよび少なくとも1個の共役基を含むオリゴマー化合物であって、前記少なくとも1個の共役基が、以下の式(III)の共役化合物であ
り、
Figure 0007177127000174
式中、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物に結合されるヌクレオシド間結合基である、オリゴマー化合物。
実施形態802. オリゴヌクレオチドおよび少なくとも1個の共役基を含むオリゴマー化合物であって、前記少なくとも1個の共役基が、以下の式(IV)の共役化合物であり、
Figure 0007177127000175
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物に結合されるヌクレオシド間結合基である、オリゴマー化合物。
実施形態803. 前記複素環式塩基部分が、ピリミジン、置換ピリミジン、プリンまたは置換プリンである、実施形態798~802のいずれかの化合物またはオリゴマー化合物。
実施形態804. Bxが、ウラシル、チミン、シトシン、5-メチルシトシン、アデニン、またはグアニンである、実施形態798~802のいずれかの化合物またはオリゴマー化合物。
実施形態805. Bxがアデニンである、実施形態798~802のいずれかの化合物またはオリゴマー化合物。
実施形態806. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000176
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
Cが、前記共役リンカーであり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態807. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000177
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
Cが、前記共役リンカーであり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
が、0または1であり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態808. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000178
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
Cが、前記共役リンカーであり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態809. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000179
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Cが、前記共役リンカーであり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態810. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000180
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Cが、前記共役リンカーであり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態811. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000181
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態812. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000182
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態813. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000183
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態814. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000184


および


式中、各Lが、独立して、リン結合基または中性結合基であり、
各nが、独立して、1~20である、
実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態815. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有する、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000185
実施形態816. 前記共役リンカーが、以下の構造を有する、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000186
実施形態817. 前記共役リンカーが、以下から選択される構造のうちの1つを有する、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000187
実施形態818. 前記共役リンカーが、以下から選択される構造のうちの1つを有する、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000188
実施形態819. 前記共役リンカーが、以下から選択される構造のうちの1つを有する、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000189
実施形態820. 前記共役リンカーがピロリジンを含む、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態821. 前記共役リンカーがピロリジンを含まない、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態822. 前記共役リンカーがPEGを含む、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態823. 前記共役リンカーがアミドを含む、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態824. 前記共役リンカーがアミドを含まない、実施形態806~810のい
ずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態825. 前記共役リンカーがポリアミドを含む、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態826. 前記共役リンカーがアミンを含む、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態827. 前記共役リンカーが1個以上のジスルフィド結合を含む、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態828. 前記共役リンカーがタンパク質結合部分を含む、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態829. 前記タンパク質結合部分が脂質を含む、実施形態828の共役アンチセンス化合物。
実施形態830. 前記タンパク質結合部分が、コレステロール、コール酸、アダマンタン酢酸、1-ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、1,3-ビス-O(ヘキサデシル)グリセロール、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデシルグリセロール、ボルネオール、メントール、1,3-プロパンジオール、ヘプタデシル基、パルミチン酸、ミリスチン酸、O3-(オレオイル)リトコール酸、O3-(オレオイル)コレン酸、ジメチルトリチル、またはフェノキサジン)、ビタミン(例えば、葉酸塩、ビタミンA、ビタミンE、ビオチン、ピリドキサール)、ペプチド、炭水化物(例えば、単糖、二糖、三糖、四糖、オリゴ糖、多糖)、エンドソーム溶解成分、ステロイド(例えば、ウバオール、ヘシゲニン、ジオスゲニン)、テルペン(例えば、トリテルペン、例えば、サルササポゲニン、フリーデリン、エピフリーデラノール誘導体化リトコール酸)、またはカチオン性脂質の中から選択される、実施形態829の共役アンチセンス化合物。
実施形態831. 前記タンパク質結合部分が、C16~C22長鎖飽和もしくは不飽和脂肪酸、コレステロール、コール酸、ビタミンE、アダマンタン、または1-ペンタフルオロプロピルである、実施形態828~830のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態832. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000190
式中、各nが、独立して、1~20であり、pが、1~6である、
実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態833. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000191
式中、各nが、独立して、1~20である、
実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態834. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有する、実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000192
実施形態835. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000193
式中、nが、1~20である、
実施形態806~810のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態836. 前記分岐基が、以下の構造のうちの1つを有し、
Figure 0007177127000194
式中、各Aが、独立して、O、S、C=O、またはNHであり、
各nが、独立して、1~20である、
実施形態806~835の共役アンチセンス化合物。
実施形態837. 前記分岐基が、以下の構造のうちの1つを有し、
Figure 0007177127000195
式中、各Aが、独立して、O、S、C=O、またはNHであり、
各nが、独立して、1~20である、
実施形態806~835の共役アンチセンス化合物。
実施形態838. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態806~835の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000196
実施形態839. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態806~835の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000197
実施形態840. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態806~835の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000198
実施形態841. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態806~835の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000199
実施形態842. 前記分岐基がエーテルを含む、実施形態806~835のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態843. 前記分岐基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000200
各nが、独立して、1~20であり、
mが、2~6である、
実施形態806~835の共役アンチセンス化合物。
実施形態844. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態806~835の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000201
実施形態845. 前記分岐基が、以下の構造を有する、実施形態806~835の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000202
実施形態846. 前記分岐基が、
Figure 0007177127000203
Figure 0007177127000204
Figure 0007177127000205
Figure 0007177127000206
または
Figure 0007177127000207
を含み、
式中、各jが、1~3の整数であり、
式中、各nが、1~20の整数である、
実施形態806~835のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態847. 前記分岐基が、
Figure 0007177127000208
Figure 0007177127000209
Figure 0007177127000210
Figure 0007177127000211
または
Figure 0007177127000212
を含む、実施形態806~835のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態848. 各テザーが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000213
式中、Lが、リン結合基および中性結合基から選択され、
が、C(=O)O-Rであり、
が、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキであり、
が、H、C~Cアルキルまたは置換C~Cアルキであり、
各mが、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmが、各テザーに対して0を超える、
実施形態806~847の共役アンチセンス化合物。
実施形態849. 各テザーが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000214
式中、Zが、HまたはCHであり、
各mが、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmが、各テザーに対して0を超える、
実施形態806~847の共役アンチセンス化合物。
実施形態850. 少なくとも1個のテザーがPEGを含む、実施形態806~847のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態851. 少なくとも1個のテザーがアミドを含む、実施形態806~847のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態852. 少なくとも1個のテザーがポリアミドを含む、実施形態806~847のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態853. 少なくとも1個のテザーがアミンを含む、実施形態806~847のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態854. 少なくとも2個のテザーが互いに異なる、実施形態806~847のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態855. 前記テザーのすべてが互いに同一である、実施形態806~847のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態856. 各テザーが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000215
各nが、独立して、1~20であり、
各pが、1~約6である、
実施形態806~847のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態857. 各テザーが、以下の中から選択される、実施形態806~847のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000216
実施形態858. 各テザーが、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000217
式中、各nが、独立して、1~20である、
実施形態806~847のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態859. 各テザーが、以下の構造を有する、実施形態806~847のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000218
実施形態860. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、実施形態806~860のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000219
実施形態861. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、実施形態806~860のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000220
実施形態862. 前記細胞標的部分が少なくとも1個のリガンドを含む、実施形態806~859のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態863. 前記細胞標的部分が1個のリガンドを含む、実施形態806~859のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態864. 前記標的部分が2個のリガンドを含む、実施形態806~859のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態865. 前記標的部分が3個のリガンドを含む、実施形態806~859のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態866. 各リガンドが各テザーに共有結合される、実施形態806~859のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態867. 少なくとも1個のリガンドがN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)である、実施形態862~866のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態868. 各リガンドがN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)である、実施形態862~866のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態869. 前記リガンドが、多糖、修飾多糖、マンノース、ガラクトース、マンノース誘導体、ガラクトース誘導体、D-マンノピラノース、L-マンノピラノース、D-アラビノース、L-ガラクトース、D-キシロフラノース、L-キシロフラノース、D-グルコース、L-グルコース、D-ガラクトース、L-ガラクトース、α-D-マンノフラノース、β-D-マンノフラノース、α-D-マンノピラノース、β-D-マンノピラノース、α-D-グルコピラノース、β-D-グルコピラノース、α-D-グルコフラノース、β-D-グルコフラノース、α-D-フルクトフラノース、α-D-フルクトピラノース、α-D-ガラクトピラノース、β-D-ガラクトピラノース、α-D-ガラクトフラノース、β-D-ガラクトフラノース、グルコサミン、シアル酸、α-D-ガラクトサミン、N-アセチルガラクトサミン、2-アミノ-3-O-[(R)-1-カルボキシエチル]-2-デオキシ-β-D-グルコピラノース、2-デオキシ-2-メチルアミ
ノ-L-グルコピラノース、4,6-ジデオキシ-4-ホルムアミド-2,3-ジ-O-メチル-D-マンノピラノース、2-デオキシ-2-スルホアミノ-D-グルコピラノース、N-グリコロイル-α-ノイラミン酸、5-チオ-β-D-グルコピラノース、メチル2,3,4-トリ-O-アセチル-1-チオ-6-O-トリチル-α-D-グルコピラノシド、4-チオ-β-D-ガラクトピラノース、エチル3,4,6,7-テトラ-O-アセチル-2-デオキシ-1,5-ジチオ-α-D-グルコ-ヘプトピラノシド、2,5-アンヒドロ-D-アロノニトリル、リボース、D-リボース、D-4-チオリボース、L-リボース、L-4-チオリボースの中から選択される、実施形態862~866のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態870. 前記リガンドがガラクトースである、実施形態862~866のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態871. 前記リガンドがマンノース-6-ホスフェートである、実施形態862~866のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態872. 各リガンドが以下の中から選択され、
Figure 0007177127000221
式中、各Rが、OHおよびNHCOOHから選択される、
実施形態862~866のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態873. 各リガンドが以下の中から選択される、実施形態862~866のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000222
実施形態874. 各リガンドが、以下の構造を有する、実施形態862~866のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000223
実施形態875. 各リガンドが、以下の構造を有する、実施形態862~866のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000224
実施形態876. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含み、
Figure 0007177127000225
式中、各nが、独立して、1~20である、
実施形態806~860のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態877. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、実施形態806~860のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000226
実施形態878. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、実施形態806~860のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000227
実施形態879. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、実施形態806~860のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000228
実施形態880. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、実施形態806~860のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000229
実施形態881. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、実施形態806~860のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000230
実施形態882. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、実施形態806~860のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000231
実施形態883. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、実施形態806~860のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000232
実施形態884. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、実施形態806~860のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000233
実施形態885. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、実施形態806~860のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000234
実施形態886. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、実施形態806~860のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000235
実施形態887. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000236
式中、各nが、独立して、1~20であり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態888. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000237
式中、各nが、独立して、1~20であり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態889. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000238
式中、各nが、独立して、1~20であり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Zが、Hまたは結合固体支持体であり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態890. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000239
式中、各nが、独立して、1~20であり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Zが、Hまたは結合固体支持体であり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態891. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000240
式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、
実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態892. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000241
式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、
実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態893. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000242
式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Zが、Hまたは結合固体支持体である、
実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態894. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000243
式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Zが、Hまたは結合固体支持体である、
実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態895. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000244
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態896. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000245
、式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態897. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000246
、式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態898. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000247
式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態899. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000248
、式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態900. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000249
、式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態901. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000250
、式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態902. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000251
、式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態903. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000252
、式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態904. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000253
、式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態905. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000254
、式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態906. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000255
、式中、Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態779~789のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態907. オリゴヌクレオチドおよび共役基を含む共役オリゴヌクレオチドであって、前記共役基が、実施形態779~907のいずれかの任意の共役基である、共役オリゴヌクレオチド。
実施形態908. 前記オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態907の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態909. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが修飾塩基を含む、実施形態908の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態910. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが糖代理物を含む、実施形態908または909の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態911. 前記糖代理物がテトラヒドロピランである、実施形態910の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態912. 前記テトラヒドロピランがF-HNAである、実施形態911のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態913. 前記オリゴヌクレオチドの残りが、修飾糖を含む少なくとも1個のヌクレオシドを含む、実施形態908~912のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態914. 修飾糖を含む前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが、二環式ヌクレオシドおよび2’-修飾ヌクレオシドから選択される、実施形態913の共役オリゴヌ
クレオチド。
実施形態915. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが二環式ヌクレオシドである、実施形態914の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態916. 前記二環式ヌクレオシドが(4’-CH-O-2’)BNAヌクレオシドである、実施形態915の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態917. 前記二環式ヌクレオシドが(4’-(CH-O-2’)BNAヌクレオシドである、実施形態915の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態918. 前記二環式ヌクレオシドが(4’-C(CH)H-O-2’)BNAヌクレオシドである、実施形態915の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態919. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが2’-修飾ヌクレオシドである、実施形態914の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態920. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが、2’-Fヌクレオシド、2’-OCHヌクレオシド、および2’-O(CHOCHヌクレオシドから選択される、実施形態919の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態921. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-Fヌクレオシドである、実施形態920の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態922. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-OCHヌクレオシドである、実施形態920の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態923. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-O(CHOCHヌクレオシドである、実施形態920の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態924. 前記オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の非修飾ヌクレオシドを含む、実施形態907~923のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態925. 前記非修飾ヌクレオシドがリボヌクレオシドである、実施形態924の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態926. 前記非修飾ヌクレオシドがデオキシリボヌクレオシドである、実施形態924の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態927. 前記オリゴヌクレオチドが少なくとも2個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態907~926のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態928. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドが同一の修飾を含む、実施形態927の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態929. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドが異なる修飾を含む、実施形態927の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態930. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドのうちの少なくとも1つが糖代理物を含む、実施形態927~929のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態931. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドのうちの少なくとも1つが2’-修飾を含む、実施形態927~930のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態932. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が、2’-Fヌクレオシド、2’-OCHヌクレオシド、および2’-O(CHOCHヌクレオシドから独立して選択される、実施形態931の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態933. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が2’-Fヌクレオシドである、実施形態932の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態934. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が2’-OCHヌクレオシドである、実施形態932の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態935. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が2’-O(CHOCHヌクレオシドである、実施形態932の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態936. 前記オリゴヌクレオチドの本質的にすべてのヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態907~935のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態937. 前記オリゴヌクレオチドのすべてのヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態907~927または930~936のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態938. 前記オリゴヌクレオチドが一本鎖である、実施形態907~937のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態939. 前記オリゴヌクレオチドが二本鎖である、実施形態907~937のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態940. 前記オリゴヌクレオチドがアンチセンス化合物である、実施形態907~937のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態941. 前記オリゴヌクレオチドがRISCベースのオリゴヌクレオチドである、実施形態907~937のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態942. 前記オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、実施形態907~937のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態943. 前記オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、実施形態907~937のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態944. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオシドに結合される、実施形態907~943のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態945. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの3’末端ヌクレオシドに結合される、実施形態907~943のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態946. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの内部ヌクレオシドに結合される、実施形態907~943のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態947. 前記共役基が、非共役オリゴヌクレオチド化合物と比較して、肝細胞への前記共役オリゴヌクレオチド化合物の取り込みを増加させる、実施形態907~943のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態948. 前記共役基が、非共役オリゴヌクレオチド化合物と比較して、肝臓細胞への前記共役オリゴヌクレオチド化合物の取り込みを増加させる、実施形態907~943のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態949. 前記共役基が、非共役オリゴヌクレオチド化合物と比較して、肝臓における前記共役オリゴヌクレオチド化合物の蓄積を増加させる、実施形態907~943のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態950. 前記共役基が、非共役オリゴヌクレオチド化合物と比較して、腎臓における前記共役オリゴヌクレオチド化合物の蓄積を減少させる、実施形態907~943のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態951. 前記共役オリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含む糖モチーフを有する、実施形態907~935または938~950の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態952. 前記5’領域が2個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態951の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態953. 前記5’領域が3個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態951の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態954. 前記5’領域が4個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態951の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態955. 前記5’領域が5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態951の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態956. 前記3’領域が2個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態951~955のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態957. 前記3’領域が3個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態951~955のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態958. 前記3’領域が4個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態951~955のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態959. 前記3’領域が5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態951~955のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態960. 前記中央領域が5個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態951~959のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態961. 前記中央領域が6個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態951~959のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態962. 前記中央領域が7個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態951~959のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態963. 前記中央領域が8個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態951~959のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態964. 前記中央領域が9個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態951~959のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態965. 前記中央領域が10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態951~959のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態966. 前記共役オリゴヌクレオチドが14~26個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態951~965のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態967. 前記共役オリゴヌクレオチドが15~25個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態951~965のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態968. 前記共役オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態951~965のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態969. 各修飾ヌクレオシドが、独立して、2’-置換糖部分または二環式糖部分を含む、実施形態951~968のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態970. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが2’-置換糖部分を含む、実施形態969の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態971. 2’-置換糖部分を含む各修飾ヌクレオシドが、ハロゲン、任意に置換されたアリル、任意に置換されたアミノ、アジド、任意に置換されたSH、CN、OCN、CF3、OCF3、O、S、もしくはN(Rm)-アルキル;O、S、もしくはN(Rm)-アルケニル;O、S、もしくはN(Rm)-アルキニル;任意に置換されたO-アルキレニル-O-アルキル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアルカリル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたO-アルカリル、任意に置換されたO-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn)、またはO-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn)の中から独立して選択される2’
置換基を含み、式中、各RmおよびRnが、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換C~C10アルキルであり、
各任意に置換された基が、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ(NO)、チオール、チオアルコキシ(S-アルキル)、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル、およびアルキニルの中から独立して選択される置換基で任意に置換される、実施形態970の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態972. 各2’置換基が、ハロゲン、OCH、OCHF、OCHF、OCF、OCHCH、O(CHF、OCHCHF、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH、O(CH-SCH、O(CH-OCF、O(CH-N(R)(R)、O(CH-ON(R)(R)、O(CH-O(CH-N(R)(R)、OCHC(=O)-N(R)(R)、OCHC(=O)-N(R)-(CH-N(R)(R)、およびO(CH-N(R)-C(=NR)[N(R)(R)]の中から独立して選択され、式中、R、R、R、およびRが各々、独立して、HまたはC~Cアルキルである、実施形態970の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態973. 各2’置換基が、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から独立して選択される、実施形態970の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態974. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-MOE糖部分を含む、実施形態970の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態975. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-OMe糖部分を含む、実施形態970の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態976. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-F糖部分を含む、実施形態970の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態977. 前記共役オリゴヌクレオチドが、糖代理物を含む少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態951~968のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態978. 前記修飾ヌクレオシドがF-HNA糖部分を含む、実施形態977の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態979. 前記修飾ヌクレオシドがHNA糖部分を含む、実施形態977の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態980. 前記共役オリゴヌクレオチドが、二環式糖部分を含む少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態951~968のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態981. 前記二環式糖部分がcEt糖部分である、実施形態980の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態982. 二環式糖部分がLNA糖部分である、実施形態980の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態983. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態907~982のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態984. 前記共役オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態908の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態985. 前記共役オリゴヌクレオチドが、少なくとも1個の修飾結合および少なくとも1個の非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態983の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態986. 少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合がホスホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態983~985のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態987. 各修飾ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態983~985のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態988. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも2個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態983~984のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態989. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも3個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態983~984のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態990. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも4個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態983~984のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態991. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも5個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態983~984のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態992. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態983~984のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態993. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも7個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態983~984のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態994. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも8個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態983~984のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態995. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも9個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態983~984のいずれかの共役オリゴヌクレオチド
化合物。
実施形態996. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも10個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態983~984のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態997. 前記共役オリゴヌクレオチドが16個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態983または985~996のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態998. 前記共役オリゴヌクレオチドが15個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態983または985~996のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態999. 前記共役オリゴヌクレオチドが14個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態983または985~996のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1000. 前記共役オリゴヌクレオチドが13個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態983または985~996のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1001. 前記共役オリゴヌクレオチドが12個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態983または985~996のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1002. 前記共役オリゴヌクレオチドが11個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態983または985~996のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1003. 前記共役オリゴヌクレオチドが10個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態983または985~996のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1004. 前記共役オリゴヌクレオチドが9個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態983または985~996のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1005. 前記共役オリゴヌクレオチドが8個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態983または985~996のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1006. 前記共役オリゴヌクレオチドが7個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態983または985~996のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1007. 前記共役オリゴヌクレオチドが6個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態983または985~996のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1008. 前記共役オリゴヌクレオチドの各末端ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態907~1007のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1009. 前記共役オリゴヌクレオチドの2個のデオキシヌクレオシドを結合する各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態907~984または997~1008のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1010. 前記共役オリゴヌクレオチドの2個の修飾ヌクレオシドを結合する各非末端ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態907~984または997~1009のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1011. 修飾ヌクレオシドの3’である前記共役オリゴヌクレオチドの各非末端ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態907~984または997~1010のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1012. デオキシヌクレオシドの3’である前記共役オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態907~984または997~1011のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1013. 前記共役オリゴヌクレオチドが、
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM、および
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
の中から選択される化学モチーフを有し、
式中、各Mが、独立して、修飾ヌクレオシドであり、各Dが、デオキシヌクレオシドであり、各sが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合であり、各yが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかであるが、但し、少なくとも1つのyが、ホスホジエステルヌクレオチド間結合であることを条件とする、
実施形態907~984または997~1012のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1014. 前記共役オリゴヌクレオチドが、
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM、および
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
の中から選択される化学モチーフを有し、
式中、各Mが、独立して、修飾ヌクレオシドであり、各Dが、デオキシヌクレオシドであり、各oが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合であり、各sが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、
実施形態907~984または997~1012のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1015. 各Mが、2’-MOEヌクレオシドおよび二環式ヌクレオシドの中から独立して選択される、実施形態1013または1014の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1016. 各Mが、2’-MOEヌクレオシド、cEtヌクレオシド、およびLNAヌクレオシドの中から独立して選択される、実施形態1015の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1017. 各Mが2’-MOEヌクレオシドである、実施形態1015または1016の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1018. 各MがcEtヌクレオシドである、実施形態1015または1016の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1019. 各MがLNAヌクレオシドである、実施形態1015または1016の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1020. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも8個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態907~1019のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1021. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも10個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態907~1019のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1022. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも12個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態907~1019のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1023. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも14個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態907~1019
のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1024. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも16個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態907~1019のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1025. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも18個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態907~1019のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1026. 前記共役オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも90%相補的である、実施形態907~1019のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1027. 前記共役オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも95%相補的である、実施形態907~1019のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1028. 前記共役オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して100%相補的である、実施形態907~1019のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1029. 前記標的核酸がプレmRNAである、実施形態1020~1028のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1030. 前記標的核酸がmRNAである、実施形態1020~1028のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1031. 前記標的核酸がマイクロRNAである、実施形態1020~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1032. 前記標的核酸が肝臓において発現される、実施形態1020~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1033. 前記標的核酸が肝細胞において発現される、実施形態1020~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1034. 前記標的核酸が、アンドロゲン受容体、アポリポタンパク質(a)、アポリポタンパク質B、アポリポタンパク質C-III、C反応性タンパク質、eIF-4E、第VII因子、第XI因子、グルココルチコイド受容体、グルカゴン受容体、タンパク質チロシンホスファターゼ1B、STAT3、SRB-1、およびトランスサイレチンの中から選択されるタンパク質をコードする、実施形態1020~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1035. 前記標的核酸がウイルス核酸である、実施形態1020~1031のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1036. 前記ウイルス核酸が肝臓において発現される、実施形態1035の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1037. 前記標的核酸がB型肝炎ウイルス核酸である、実施形態1036の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1038. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号17、18、19、20、21、22、23、または24のうちのいずれか1個の核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1039. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号25、26、27、28、29、または30のうちのいずれか1個の核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1040. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号31の核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1041. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号32の核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1042. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号33の核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1043. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号34の核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1044. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号35、36、37、38、39、40、41、42、または43のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1045. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号44、45、46、47、または48の核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1046. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、または59のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1047. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号60、61、62、63、64、65、66、または67のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1048. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号69、70、71、または72のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1049. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号73の核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1050. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号74、75、76、77、78、79、80、または81のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1051. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号68の核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1052. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号82~103、111、または113のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態907~1030のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1053. 前記共役オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態907~1052のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1054. 実施形態779~1053のいずれかに従う化合物または共役オリゴヌクレオチドと、薬剤的に許容される担体または希釈剤と、を含む、医薬組成物。
実施形態1055. 前記薬剤的に許容される担体または希釈剤が、滅菌水および滅菌生理食塩水の中から選択される、実施形態1054の医薬組成物。
実施形態1056. 細胞内の標的核酸の量または活性を低減させる方法であって、細胞を、実施形態779~1053のいずれかの化合物もしくは共役アンチセンス化合物、または実施形態1054もしくは1055の医薬組成物と接触させることを含む、方法。
実施形態1057. 前記細胞が肝臓細胞である、実施形態1056の方法。
実施形態1058. 前記細胞が肝細胞である、実施形態1056の方法。
実施形態1059. 前記細胞が生体外に存在する、実施形態1056~1058のいずれかの方法。
実施形態1060. 前記細胞が動物内に存在する、実施形態1056~1058のいずれかの方法。
実施形態1061. 前記動物がマウスである、実施形態1060の方法。
実施形態1062. 前記動物がヒトである、実施形態1060の方法。
実施形態1063. 動物における疾患または状態を治療する方法であって、実施形態1054または1056の医薬組成物を動物に投与することを含み、それにより前記動物における前記疾患または状態を治療する、方法。
実施形態1064. 前記動物がマウスである、実施形態1063の方法。
実施形態1065. 前記動物がヒトである、実施形態1063の方法。
実施形態1066. 前記疾患または状態が肝臓疾患または状態である、実施形態1063~1065のいずれかの方法。
実施形態1067. 前記投与が非経口投与による、実施形態1063~1065のいずれかの方法。
実施形態1068. 前記投与が皮下注入による、実施形態1067の方法。
実施形態1069. 前記投与が静脈内注入による、実施形態1067の方法。
実施形態1070. 前記投与が筋肉内注入による、実施形態1067の方法。
実施形態1071. 前記共役オリゴヌクレオチドが1~10mg/kgの用量で提供される、実施形態741~748のいずれかの方法。
実施形態1072. 前記共役オリゴヌクレオチドが1mg/kg未満の用量で提供される、実施形態1056~1070のいずれかの方法。
実施形態1073. 前記共役オリゴヌクレオチドが10mg/kgを超える用量で提供される、実施形態1056~1070のいずれかの方法。
実施形態1074. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも2ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態1056~1073のいずれかの方法。
実施形態1075. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも4ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態1056~1073のいずれかの方法。
実施形態1076. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも6ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態1056~1073のいずれかの方法。
実施形態1077. 前記共役オリゴヌクレオチドが1週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1056~1073のいずれかの方法。
実施形態1078. 前記共役オリゴヌクレオチドが2週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1056~1073のいずれかの方法。
実施形態1079. 前記共役オリゴヌクレオチドが3週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1056~1073のいずれかの方法。
実施形態1080. 前記共役オリゴヌクレオチドが4週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1056~1073のいずれかの方法。
実施形態1081. 前記共役オリゴヌクレオチドが5週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1056~1073のいずれかの方法。
実施形態1082. 前記共役オリゴヌクレオチドが6週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1056~1073のいずれかの方法。
実施形態1083. 前記共役オリゴヌクレオチドが7週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1056~1073のいずれかの方法。
実施形態1084. 前記共役オリゴヌクレオチドが8週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1056~1073のいずれかの方法。
実施形態1085. 12~30個の連結したヌクレオシド、および共役基を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンス化合物であって、前記共役基が少なくとも1個の細胞標的部分を含む、共役アンチセンス化合物。
実施形態1086. 細胞におけるアポリポタンパク質C-IIIタンパク質の活性または量を減少させる方法であって、細胞を実施形態779~1055のいずれかの少なくとも1個の共役アンチセンス化合物と接触させることを含み、それにより前記細胞における
前記アポリポタンパク質C-IIIタンパク質の活性または量を減少させる、方法。
実施形態1087. 総コレステロールを低下させる方法であって、細胞を実施形態779~1055のいずれかの少なくとも1個の化合物と接触させることを含み、それにより総コレステロールを低下させる、方法。
実施形態1088. トリグリセリドを低下させる方法であって、細胞を実施形態779~1055のいずれかの少なくとも1個の化合物と接触させることを含み、それによりトリグリセリドを低下させる、方法。
実施形態1089. LDLを減少させる方法であって、細胞を実施形態779~1055のいずれかの少なくとも1個の化合物と接触させることを含み、それによりLDLを減少させる、方法。
実施形態1090. HDLを増加させる方法であって、細胞を実施形態779~1055のいずれかの少なくとも1個の化合物と接触させることを含み、それによりHDLを増加させる、方法。
実施形態1091. 前記細胞が生体外に存在する、実施形態1086~1090のいずれかの方法。
実施形態1092. 前記細胞が動物内に存在する、実施形態1086~1090のいずれかの方法。
実施形態1093. 前記動物がヒトである、実施形態1086~1090のいずれかの方法。
実施形態1094. 実施形態1~1055のいずれかの化合物もしくは共役オリゴヌクレオチド、またはそのプロドラッグ。
実施形態1095. 実施形態1~1055のいずれかのアンチセンスオリゴヌクレオチドを製造する方法。
実施形態1096. 実施形態1~1055のいずれかのアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製する方法。
実施形態1097. 実施形態1~1055のいずれか1つの共役アンチセンス化合物を製造するための工程であって、前記方法が、ヒト使用のために前記共役アンチセンス化合物を製剤化することと、製剤化された共役アンチセンス化合物のクロマトグラム分析を実行することと、販売に備えて前記共役アンチセンス化合物を包装することと、を含む、工程。
実施形態1098. 少なくとも1個のリン結合基または中性結合基と、1個以上のリガンドと、を含む、共役化合物。
実施形態1099. 2個以上のリガンドを含む、請求項1098の共役化合物。
実施形態1100. 3個のリガンドを含む、請求項1098の共役化合物。
実施形態1101. 前記リガンドが、多糖、修飾多糖、マンノース、ガラクトース、マ
ンノース誘導体、ガラクトース誘導体、D-マンノピラノース、L-マンノピラノース、D-アラビノース、L-ガラクトース、D-キシロフラノース、L-キシロフラノース、D-グルコース、L-グルコース、D-ガラクトース、L-ガラクトース、α-D-マンノフラノース、β-D-マンノフラノース、α-D-マンノピラノース、β-D-マンノピラノース、α-D-グルコピラノース、β-D-グルコピラノース、α-D-グルコフラノース、β-D-グルコフラノース、α-D-フルクトフラノース、α-D-フルクトピラノース、α-D-ガラクトピラノース、β-D-ガラクトピラノース、α-D-ガラクトフラノース、β-D-ガラクトフラノース、グルコサミン、シアル酸、α-D-ガラクトサミン、N-アセチルガラクトサミン、2-アミノ-3-O-[(R)-1-カルボキシエチル]-2-デオキシ-β-D-グルコピラノース、2-デオキシ-2-メチルアミノ-L-グルコピラノース、4,6-ジデオキシ-4-ホルムアミド-2,3-ジ-O-メチル-D-マンノピラノース、2-デオキシ-2-スルホアミノ-D-グルコピラノース、N-グリコロイル-α-ノイラミン酸、5-チオ-β-D-グルコピラノース、メチル2,3,4-トリ-O-アセチル-1-チオ-6-O-トリチル-α-D-グルコピラノシド、4-チオ-β-D-ガラクトピラノース、エチル3,4,6,7-テトラ-O-アセチル-2-デオキシ-1,5-ジチオ-α-D-グルコ-ヘプトピラノシド、2,5-アンヒドロ-D-アロノニトリル、リボース、D-リボース、D-4-チオリボース、L-リボース、L-4-チオリボースの中から選択される、請求項1098~1100のいずれかの共役化合物。
実施形態1102. 前記リガンドがN-アセチルガラクトースアミンである、請求項1098~1101のいずれかの共役化合物。
実施形態1103. 共役基が、以下の中から選択される構造を含み、
Figure 0007177127000256
Figure 0007177127000257
Figure 0007177127000258
式中、nが、1~12であり、
mが、1~12である、
請求項1098~1102のいずれかの共役化合物。
実施形態1104. 前記共役化合物が、以下の中から選択される構造を有するテザーを有し、
Figure 0007177127000259
式中、Lが、リン結合基または中性結合基のいずれかであり、
が、C(=O)O-Rであり、
が、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキであり、
が、H、C~Cアルキルまたは置換C~Cアルキであり、
各mが、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmが、各テザーに対して0を超える、
請求項1098~1102のいずれかの共役化合物。
実施形態1105. 前記テザーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000260
式中、Zが、HまたはCHであり、
各mが、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmが、各テザーに対して0を超える、
請求項1104の共役化合物。
実施形態1106. 前記テザーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000261
式中、nが、1~12であり、
mが、1~12である、
請求項1098~1102のいずれかの共役化合物。
実施形態1107. 前記共役化合物がオリゴヌクレオチドに共有結合される、請求項1098~1106のいずれかの共役化合物。
実施形態1108. オリゴヌクレオチドおよび少なくとも1個の共役基を含むオリゴマー化合物であって、少なくとも1個の共役基が、請求項1098~1108のいずれかの
共役化合物である、オリゴマー化合物。
実施形態1109. 式(V)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000262
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、またはGalNAc-22aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分である、化合物。
実施形態1110. 式(Va)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000263
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、またはGalNAc-22aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、Q13が、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から選択される、化合物。
実施形態1111. Bが、アデニン、グアニン、チミン、ウラシル、またはシトシンから選択される、請求項1109または1110に記載の化合物。
実施形態1112. Q13O(CH-OCHである、請求項1109~1111のいずれかの化合物。
実施形態1113. 式(XVI)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000264
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1114. 式(XVII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000265
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1115. 式(XVIII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000266
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1116. 式(XIX)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000267
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1117. 式(XX)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000268
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1118. 式(XXI)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000269
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1119. 式(XXII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000270
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1120. 式(XXIII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000271
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1121. 式(XXIIIa)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000272
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1122. 式(XXIV)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000273
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1123. 式(XXIVa)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000274
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1124. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000275
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
Cが、前記共役リンカーであり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態1125. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000276
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
Cが、前記共役リンカーであり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
が、0または1であり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態1126. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000277
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
Cが、前記共役リンカーであり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態1127. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000278
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Cが、前記共役リンカーであり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態1128. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000279
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Cが、前記共役リンカーであり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態1129. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000280
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態1130. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000281
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bが、前記切断可能な部分であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態1131. 以下の式によって表される構造を有する共役アンチセンス化合物であって、
Figure 0007177127000282
式中、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Dが、前記分岐基であり、
各Eが、テザーであり、
各Fが、リガンドであり、
qが、1~5の整数である、
共役アンチセンス化合物。
実施形態1132. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000283


式中、各Lが、独立して、リン結合基または中性結合基であり、
各nが、独立して、1~20である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1133. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有する、請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000284
実施形態1134. 前記共役リンカーが、以下の構造を有する、請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000285
実施形態1135. 前記共役リンカーが、以下から選択される構造のうちの1つを有する、請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000286
実施形態1136. 前記共役リンカーが、以下から選択される構造のうちの1つを有する、請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000287
実施形態1137. 前記共役リンカーが、以下から選択される構造のうちの1つを有する、請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000288
実施形態1138. 前記共役リンカーがピロリジンを含む、請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1139. 前記共役リンカーがピロリジンを含まない、請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1140. 前記共役リンカーがPEGを含む、請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1141. 前記共役リンカーがアミドを含む、請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1142. 前記共役リンカーがアミドを含まない、請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1143. 前記共役リンカーがポリアミドを含む、請求項1124~1131
のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1144. 前記共役リンカーがアミンを含む、請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1145. 前記共役リンカーが1個以上のジスルフィド結合を含む、請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1146. 前記共役リンカーがタンパク質結合部分を含む、請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1147. 前記タンパク質結合部分が脂質を含む、請求項1146の共役アンチセンス化合物。
実施形態1148. 前記タンパク質結合部分が、コレステロール、コール酸、アダマンタン酢酸、1-ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、1,3-ビス-O(ヘキサデシル)グリセロール、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデシルグリセロール、ボルネオール、メントール、1,3-プロパンジオール、ヘプタデシル基、パルミチン酸、ミリスチン酸、O3-(オレオイル)リトコール酸、O3-(オレオイル)コレン酸、ジメチルトリチル、またはフェノキサジン)、ビタミン(例えば、葉酸塩、ビタミンA、ビタミンE、ビオチン、ピリドキサール)、ペプチド、炭水化物(例えば、単糖、二糖、三糖、四糖、オリゴ糖、多糖)、エンドソーム溶解成分、ステロイド(例えば、ウバオール、ヘシゲニン、ジオスゲニン)、テルペン(例えば、トリテルペン、例えば、サルササポゲニン、フリーデリン、エピフリーデラノール誘導体化リトコール酸)、またはカチオン性脂質の中から選択される、請求項1146の共役アンチセンス化合物。
実施形態1149. 前記タンパク質結合部分が、C16~C22長鎖飽和もしくは不飽和脂肪酸、コレステロール、コール酸、ビタミンE、アダマンタン、または1-ペンタフルオロプロピルである、請求項1146または1147のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1150. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000289
式中、各nが、独立して、1~20であり、pが、1~6である、
請求項1124~1128のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1151. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000290
式中、各nが、独立して、1~20である、
請求項1124~1128のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1152. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有する、請求項1124~1128のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000291
実施形態1153. 前記共役リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000292
式中、nが、1~20である、
請求項1124~1128のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1154. 前記分岐基が、以下の構造のうちの1つを有し、
Figure 0007177127000293
式中、各Aが、独立して、O、S、C=O、またはNHであり、
各nが、独立して、1~20である、
請求項1124~1154の共役アンチセンス化合物。
実施形態1155. 前記分岐基が、以下の構造のうちの1つを有し、
Figure 0007177127000294
式中、各Aが、独立して、O、S、C=O、またはNHであり、
各nが、独立して、1~20である、
請求項1124~1154の共役アンチセンス化合物。
実施形態1156. 前記分岐基が、以下の構造を有する、請求項1124~1154の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000295
実施形態1157. 前記分岐基が、以下の構造を有する、請求項1124~1154の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000296
実施形態1158. 前記分岐基が、以下の構造を有する、請求項1124~1154の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000297
実施形態1159. 前記分岐基が、以下の構造を有する、請求項1124~1154の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000298
実施形態1160. 前記分岐基がエーテルを含む、請求項1124~1154のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1161. 前記分岐基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000299

各nが、独立して、1~20であり、
mが、2~6である、
請求項1124~1154の共役アンチセンス化合物。
実施形態1162. 前記分岐基が、以下の構造を有する、請求項1124~1154の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000300
実施形態1163. 前記分岐基が、以下の構造を有する、請求項1124~1154の共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000301
実施形態1164. 前記分岐基が、
Figure 0007177127000302
Figure 0007177127000303
Figure 0007177127000304
Figure 0007177127000305
または
Figure 0007177127000306
を含み、
式中、各jが、1~3の整数であり、
式中、各nが、1~20の整数である、
請求項1124~1154のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1165. 前記分岐基が、
Figure 0007177127000307
Figure 0007177127000308
Figure 0007177127000309
Figure 0007177127000310
または
Figure 0007177127000311
を含む、請求項1124~1154のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1166. 各テザーが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000312
式中、Lが、リン結合基および中性結合基から選択され、
が、C(=O)O-Rであり、
が、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキであり、
が、H、C~Cアルキルまたは置換C~Cアルキであり、
各mが、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmが、各テザーに対して0を超える、
請求項1124~1165の共役アンチセンス化合物。
実施形態1167. 各テザーが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000313
式中、Zが、HまたはCHであり、
各mが、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmが、各テザーに対して0を超える、
請求項1124~1165の共役アンチセンス化合物。
実施形態1168. 各テザーが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000314
式中、nが、1~12であり、
mが、1~12である、
請求項1124~1165の共役アンチセンス化合物。
実施形態1169. 少なくとも1個のテザーがPEGを含む、請求項1124~1165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1170. 少なくとも1個のテザーがアミドを含む、請求項1124~1165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1171. 少なくとも1個のテザーがポリアミドを含む、請求項1124~1165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1172. 少なくとも1個のテザーがアミンを含む、請求項1124~1165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1173. 少なくとも2個のテザーが互いに異なる、請求項1124~1165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1174. 前記テザーのすべてが互いに同一である、請求項1124~1165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1175. 各テザーが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000315
各nが、独立して、1~20であり、
各pが、1~約6である、
請求項1124~1165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1176. 各テザーが、以下の中から選択される、請求項1124~1165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000316
実施形態1177. 各テザーが、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000317
式中、各nが、独立して、1~20である、
請求項1124~1165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1178. 各テザーが、以下の構造を有する、請求項1124~1165のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000318
実施形態1179. 前記細胞標的部分が少なくとも1個のリガンドを含む、請求項1124~1178のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1180. 前記細胞標的部分が1個のリガンドを含む、請求項1124~1178のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1181. 前記標的部分が2個のリガンドを含む、請求項1124~1178のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1182. 前記標的部分が3個のリガンドを含む、請求項1124~1178のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1183. 各リガンドが各テザーに共有結合される、請求項1179~1182のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1184. 少なくとも1個のリガンドがN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)である、請求項1179~1182のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1185. 各リガンドがN-アセチルガラクトサミン(GalNAc)である、請求項1179~1182のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1186. 前記リガンドが、多糖、修飾多糖、マンノース、ガラクトース、マンノース誘導体、ガラクトース誘導体、D-マンノピラノース、L-マンノピラノース、D-アラビノース、L-ガラクトース、D-キシロフラノース、L-キシロフラノース、D-グルコース、L-グルコース、D-ガラクトース、L-ガラクトース、α-D-マンノフラノース、β-D-マンノフラノース、α-D-マンノピラノース、β-D-マンノピラノース、α-D-グルコピラノース、β-D-グルコピラノース、α-D-グルコフラノース、β-D-グルコフラノース、α-D-フルクトフラノース、α-D-フルクトピラノース、α-D-ガラクトピラノース、β-D-ガラクトピラノース、α-D-ガラクトフラノース、β-D-ガラクトフラノース、グルコサミン、シアル酸、α-D-ガラクトサミン、N-アセチルガラクトサミン、2-アミノ-3-O-[(R)-1-カルボキシエチル]-2-デオキシ-β-D-グルコピラノース、2-デオキシ-2-メチルアミノ-L-グルコピラノース、4,6-ジデオキシ-4-ホルムアミド-2,3-ジ-O-メチル-D-マンノピラノース、2-デオキシ-2-スルホアミノ-D-グルコピラノース、N-グリコロイル-α-ノイラミン酸、5-チオ-β-D-グルコピラノース、メチル2,3,4-トリ-O-アセチル-1-チオ-6-O-トリチル-α-D-グルコピラノシド、4-チオ-β-D-ガラクトピラノース、エチル3,4,6,7-テトラ-O-アセチル-2-デオキシ-1,5-ジチオ-α-D-グルコ-ヘプトピラノシド、2,5-アンヒドロ-D-アロノニトリル、リボース、D-リボース、D-4-チオリボース、L-リボース、L-4-チオリボースの中から選択される、請求項1179~1182のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1187. 前記リガンドがガラクトースである、請求項1179~1182のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1188. 前記リガンドがマンノース-6-ホスフェートである、請求項1179~1182のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1189. 各リガンドが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000319
式中、各Rが、OHおよびNHCOOHから選択される、
請求項1179~1182のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1190. 各リガンドが、以下の中から選択される、請求項1179~1182のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000320
実施形態1191. 各リガンドが、以下の構造を有する、請求項1179~1182のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000321
実施形態1192. 各リガンドが、以下の構造を有する、請求項1179~1182のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000322
実施形態1193. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000323
実施形態1194. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000324
実施形態1195. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含み、
Figure 0007177127000325
式中、各nが、独立して、1~20である、
請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1196. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000326
実施形態1197. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000327
実施形態1198. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000328
実施形態1199. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000329
実施形態1200. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000330
実施形態1201. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000331
実施形態1202. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000332
実施形態1203. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000333
実施形態1204. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1
124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000334
実施形態1205. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000335
実施形態1206. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000336
実施形態1207. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000337
実施形態1208. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000338
実施形態1209. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000339
実施形態1210. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000340
実施形態1211. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000341
実施形態1212. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000342
実施形態1213. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000343
実施形態1214. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000344
実施形態1215. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000345
実施形態1216. 前記共役基が、以下の構造を有する細胞標的部分を含む、請求項1124~1153のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000346
実施形態1217. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000347
式中、各nが、独立して、1~20であり、
13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1218. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000348
式中、各nが、独立して、1~20であり、
13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1219. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000349
式中、各nが、独立して、1~20であり、
13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Zが、Hまたは結合固体支持体であり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1220. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000350
式中、各nが、独立して、1~20であり、
13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Zが、Hまたは結合固体支持体であり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1221. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000351
式中、Q13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1222. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000352
式中、Q13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1223. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000353
式中、Q13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1224. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000354
式中、Q13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1225. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000355
式中、Q13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1226. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000356
式中、Q13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1227. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000357
式中、Q13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1228. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000358
式中、Q13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1229. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000359
式中、Q13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1230. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000360
式中、Q13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1231. 前記共役基が、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000361
式中、Q13が、HまたはO(CH-OCHであり、
Aが、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bxが、複素環式塩基部分である、
請求項1124~1131のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1232. Bが、アデニン、グアニン、チミン、ウラシル、またはシトシンの中から選択される、請求項1217~1231のいずれかの化合物。
実施形態1233. Bがアデニンである、請求項1217~1231のいずれかの化合物。
実施形態1234. Bがチミンである、請求項1217~1231のいずれかの化合物。
実施形態1235. Q13がO(CH-OCHである、請求項1217~1234のいずれかの化合物。
実施形態1236. Q13がHである、請求項1217~1234のいずれかの化合物。
実施形態1237. オリゴヌクレオチドおよび共役基を含む共役オリゴヌクレオチドであって、前記共役基が請求項1098~1236のいずれかの任意の共役基である、共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1238. 前記オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、請求項1237の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1239. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが修飾塩基を含む、請求項1237の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1240. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが糖代理物を含む、請求項1238または1239の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1241. 前記糖代理物がテトラヒドロピランである、請求項1240の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1242. 前記テトラヒドロピランがF-HNAである、請求項1241のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1243. 前記オリゴヌクレオチドの残りが、修飾糖を含む少なくとも1個のヌクレオシドを含む、請求項1238~1242のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1244. 修飾糖を含む前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが、二環式ヌクレオシドおよび2’-修飾ヌクレオシドから選択される、請求項1243の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1245. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが二環式ヌクレオシドである、請求項1244の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1246. 前記二環式ヌクレオシドが(4’-CH-O-2’)BNAヌクレオシドである、請求項1245の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1247. 前記二環式ヌクレオシドが(4’-(CH-O-2’)BNAヌクレオシドである、請求項1245の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1248. 前記二環式ヌクレオシドが(4’-C(CH)H-O-2’)BNAヌクレオシドである、請求項1245の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1249. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが2’-修飾ヌクレオシドである、請求項1244の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1250. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが、2’-Fヌクレオシド、2’-OCHヌクレオシド、および2’-O(CHOCHヌクレオシドから選択される、請求項1249の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1251. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-Fヌクレオシドである、請求項1250の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1252. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-OCHヌクレオシドである、請求項1250の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1253. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-O(CHOCHヌクレオシドである、請求項1250の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1254. 前記オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の非修飾ヌクレオシドを含む、請求項1237~1253のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1255. 前記非修飾ヌクレオシドがリボヌクレオシドである、請求項1254の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1256. 前記非修飾ヌクレオシドがデオキシリボヌクレオシドである、請求項1254の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1257. 前記オリゴヌクレオチドが少なくとも2個の修飾ヌクレオシドを含む、請求項1237~1256のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1258. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドが同一の修飾を含む、請求項1257の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1259. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドが異なる修飾を含む、請求項1257の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1260. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドのうちの少なくとも1つが糖代理物を含む、請求項1257~1259のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1261. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドのうちの少なくとも1つが2’-修飾を含む、請求項1257~1260のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1262. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が、2’-Fヌクレオシド、2’-OCHヌクレオシド、および2’-O(CHOCHヌクレオシドから独立して選択される、請求項1261の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1263. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が2’-Fヌクレオシドである、請求項1262の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1264. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が2’-OCHヌクレオシドである、請求項1262の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1265. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が2’-O(CHOCHヌクレオシドである、請求項1262の共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1266. 前記オリゴヌクレオチドの本質的にすべてのヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、請求項1237~1265のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1267. 前記オリゴヌクレオチドのすべてのヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、請求項1237~1257または1260~1266のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1268. 前記オリゴヌクレオチドが一本鎖である、請求項1237~1267のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1269. 前記オリゴヌクレオチドが二本鎖である、請求項1237~1267のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1270. 前記オリゴヌクレオチドがアンチセンス化合物である、請求項1237~1267のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1271. 前記オリゴヌクレオチドがRISCベースのオリゴヌクレオチドである、請求項1237~1267のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1272. 前記オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、請求項1237~1267のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1273. 前記オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、請求項1237~1267のいずれかの共役オリゴヌクレオチド。
実施形態1274. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端ヌクレオシドに結合される、請求項1237~1273のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1275. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの3’末端ヌクレオシドに結合される、請求項1237~1273のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1276. 前記共役基が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの内部ヌクレオシドに結合される、請求項1237~1273のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1277. 前記共役基が、非共役オリゴヌクレオチド化合物と比較して、肝細胞への前記共役オリゴヌクレオチド化合物の取り込みを増加させる、請求項1237~1273のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1278. 前記共役基が、非共役オリゴヌクレオチド化合物と比較して、肝臓細胞への前記共役オリゴヌクレオチド化合物の取り込みを増加させる、請求項1237~1273のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1279. 前記共役基が、非共役オリゴヌクレオチド化合物と比較して、肝臓における前記共役オリゴヌクレオチド化合物の蓄積を増加させる、請求項1237~1273のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1280. 前記共役基が、非共役オリゴヌクレオチド化合物と比較して、腎臓における前記共役オリゴヌクレオチド化合物の蓄積を減少させる、請求項1237~1273のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1281. 前記共役オリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含む糖モチーフを有する、請求項1237~1265または1268~1280の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1282. 前記5’領域が2個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、請求項1281の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1283. 前記5’領域が3個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、請求項1281の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1284. 前記5’領域が4個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、請求項1281の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1285. 前記5’領域が5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、請求項1281の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1286. 前記3’領域が2個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、請求項1281~1285のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1287. 前記3’領域が3個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、請求項1281~1285のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1288. 前記3’領域が4個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、請求項1281~1285のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1289. 前記3’領域が5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、請求項1281~1285のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1290. 前記中央領域が5個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、請求項1281~1289のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1291. 前記中央領域が6個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、請求項1281~1289のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1292. 前記中央領域が7個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、請求項1281~1289のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1293. 前記中央領域が8個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、請求項1281~1289のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1294. 前記中央領域が9個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、請求項1281~1289のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1295. 前記中央領域が10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、請求項1281~1289のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1296. 前記共役オリゴヌクレオチドが14~26個の連結したヌクレオシドからなる、請求項1281~1295のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1297. 前記共役オリゴヌクレオチドが15~25個の連結したヌクレオシドからなる、請求項1281~1295のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1298. 前記共役オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、請求項1281~1295のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1299. 各修飾ヌクレオシドが、独立して、2’-置換糖部分または二環式糖部分を含む、請求項1281~1298のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1300. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが2’-置換糖部分を含む、請求項1299の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1301. 2’-置換糖部分を含む各修飾ヌクレオシドが、ハロゲン、任意に置換されたアリル、任意に置換されたアミノ、アジド、任意に置換されたSH、CN、OCN、CF3、OCF3、O、S、もしくはN(Rm)-アルキル;O、S、もしくはN(Rm)-アルケニル;O、S、もしくはN(Rm)-アルキニル;任意に置換されたO-アルキレニル-O-アルキル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアルカリル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたO-アルカリル、任意に置換されたO-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn)、またはO-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn)の中から独立して選択される2’置換基を含み、式中、各RmおよびRnが、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換C~C10アルキルであり、
各任意に置換された基が、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ(NO)、チオール、チオアルコキシ(S-アルキル)、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル、およびアルキニルの中から独立して選択される置換基で任意に置換される、
請求項1300の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1302. 各2’置換基が、ハロゲン、OCH、OCHF、OCHF、OCF、OCHCH、O(CHF、OCHCHF、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH、O(CH-SCH、O(CH-OCF、O(CH-N(R)(R)、O(CH-ON(R)(R)、O(CH-O(CH-N(R)(R)、OCHC(=O)-N(R)(R)、OCHC(=O)-N(R)-(CH-N(R)(R)、およびO(CH-N(R)-C(=NR)[N(R)(R)]の中から独立して選択され、式中、R、R、R、およびRが各々、独立して、HまたはC~Cアルキルである、請求項1300の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1303. 各2’置換基が、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から独立して選択される、請求項1300の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1304. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-MOE糖部分を含む、請求項1300の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1305. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-OMe糖部分を含む、請求項1300の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1306. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-F糖部分を含む、請求項1300の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1307. 前記共役オリゴヌクレオチドが、糖代理物を含む少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、請求項1281~1298のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1308. 前記修飾ヌクレオシドがF-HNA糖部分を含む、請求項1307の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1309. 前記修飾ヌクレオシドがHNA糖部分を含む、請求項1307の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1310. 前記共役オリゴヌクレオチドが、二環式糖部分を含む少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、請求項1281~1298のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1311. 前記二環式糖部分がcEt糖部分である、請求項1310の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1312. 二環式糖部分がLNA糖部分である、請求項1310の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1313. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、請求項1237~1312のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1314. 前記共役オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、請求項1238の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1315. 前記共役オリゴヌクレオチドが、少なくとも1個の修飾結合および少なくとも1個の非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、請求項1313の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1316. 少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合がホスホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項1313または1315のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1317. 各修飾ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項1313または1315のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1318. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも2個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1314のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1319. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも3個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1314のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1320. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも4個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1314のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1321. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも5個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1314のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1322. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも6個のホスホジエステル
ヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1314のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1323. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも7個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1314のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1324. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも8個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1314のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1325. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも9個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1314のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1326. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも10個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1314のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1327. 前記共役オリゴヌクレオチドが16個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1315~1326のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1328. 前記共役オリゴヌクレオチドが15個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1315~1326のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1329. 前記共役オリゴヌクレオチドが14個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1315~1326のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1330. 前記共役オリゴヌクレオチドが13個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1315~1326のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1331. 前記共役オリゴヌクレオチドが12個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1315~1326のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1332. 前記共役オリゴヌクレオチドが11個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1315~1326のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1333. 前記共役オリゴヌクレオチドが10個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1315~1326のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1334. 前記共役オリゴヌクレオチドが9個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1315~1326のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1335. 前記共役オリゴヌクレオチドが8個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1315~1326のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1336. 前記共役オリゴヌクレオチドが7個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1315~1326のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1337. 前記共役オリゴヌクレオチドが6個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、請求項1313または1315~1326のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1338. 前記共役オリゴヌクレオチドの各末端ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項1237~1337のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1339. 前記共役オリゴヌクレオチドの2個のデオキシヌクレオシドを結合する各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項1237~1314または1327~1338のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1340. 前記共役オリゴヌクレオチドの2個の修飾ヌクレオシドを結合する各非末端ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、請求項1237~1314または1327~1339のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1341. 修飾ヌクレオシドの3’である前記共役オリゴヌクレオチドの各非末端ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、請求項1237~1314または1327~1340のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1342. デオキシヌクレオシドの3’である前記共役オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項1237~1314または1327~1341のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1343. 前記共役オリゴヌクレオチドが、
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM、および
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
の中から選択される化学モチーフを有し、
式中、各Mが、独立して、修飾ヌクレオシドであり、各Dが、デオキシヌクレオシドであり、各sが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合であり、各yが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかであるが、但し、少なくとも1つのyが、ホスホジエステルヌクレオチド間結合であることを条件とする、
請求項1237~1314または1327~1342のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1344. 前記共役オリゴヌクレオチドが、
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM、および
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
の中から選択される化学モチーフを有し、
式中、各Mが、独立して、修飾ヌクレオシドであり、各Dが、デオキシヌクレオシドであり、各oが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合であり、各sが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、
請求項1237~1314または1327~1342のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1345. 各Mが、2’-MOEヌクレオシドおよび二環式ヌクレオシドの中から独立して選択される、請求項1343または1344の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1346. 各Mが、2’-MOEヌクレオシド、cEtヌクレオシド、およびLNAヌクレオシドの中から独立して選択される、請求項1345の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1347. 各Mが2’-MOEヌクレオシドである、請求項1345または1346の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1348. 各MがcEtヌクレオシドである、請求項1345または1346の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1349. 各MがLNAヌクレオシドである、請求項1345または1346の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1350. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも8個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、請求項1237~1349のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1351. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも10個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、請求項1237~1349のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1352. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも12個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、請求項1237~1349のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1353. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも14個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、請求項1237~1349のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1354. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも16個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、請求項1237~1349のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1355. 前記共役オリゴヌクレオチドが、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも18個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、請求項1237~1349のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1356. 前記共役オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも90%相補的である、請求項1237~1349のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1357. 前記共役オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも95%相補的である、請求項1237~1349のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1358. 前記共役オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して100%相補的である、請求項1237~1349のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1359. 前記標的核酸がプレmRNAである、請求項1350~1358のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1360. 前記標的核酸がmRNAである、請求項1350~1358のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1361. 前記標的核酸がマイクロRNAである、請求項1350~1358のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1362. 前記標的核酸が肝臓において発現される、請求項1350~1358のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1363. 前記標的核酸が肝細胞において発現される、請求項1350~1358のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1364. 前記標的核酸が、α1-抗トリプシン、アンドロゲン受容体、アポ
リポタンパク質(a)、アポリポタンパク質B、アポリポタンパク質C-III、C反応性タンパク質、eIF-4E、第VII因子、第XI因子、グルココルチコイド受容体、グルカゴン受容体、タンパク質チロシンホスファターゼ1B、STAT3、SRB-1、およびトランスサイレチンの中から選択されるタンパク質をコードする、請求項1350~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1365. 前記標的核酸がウイルス核酸である、請求項1350~1361のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1366. 前記ウイルス核酸が肝臓において発現される、請求項1365の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1367. 前記標的核酸がB型肝炎ウイルス核酸である、請求項1366の共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1368. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号17、18、19、20、21、22、23、または24のうちのいずれか1個の核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1369. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号25、26、27、28、29、または30のうちのいずれか1個の核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1370. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号31の核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1371. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号32の核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1372. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号33の核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1373. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号34の核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1374. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号35、36、37、38、39、40、41、42、または43のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1375. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号44、45、46、47、または48の核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1376. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、または59のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1377. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号60、61、62、63、64、65、66、または67のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1378. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号69、70、71、または72のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1379. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号73の核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1380. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号74、75、76、77、78、79、80、または81のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1381. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号68の核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1382. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号82~103、111、または113のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、請求項1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1383. 前記共役オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項1237~1382のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1384. 請求項1098~1383のいずれかに従う化合物または共役オリゴヌクレオチドと、薬剤的に許容される担体または希釈剤と、を含む、医薬組成物。
実施形態1385. 前記薬剤的に許容される担体または希釈剤が、滅菌水および滅菌生理食塩水の中から選択される、請求項1384の医薬組成物。
実施形態1386. 細胞内の標的核酸の量または活性を低減させる方法であって、細胞を、請求項1098~1383のいずれかの化合物もしくは共役アンチセンス化合物、または請求項1384もしくは1385の医薬組成物と接触させることを含む、方法。
実施形態1387. 前記細胞が肝臓細胞である、請求項1386の方法。
実施形態1388. 前記細胞が肝細胞である、請求項1386の方法。
実施形態1389. 前記細胞が生体外に存在する、請求項1386~1388のいずれかの方法。
実施形態1390. 前記細胞が動物内に存在する、請求項1386~1388のいずれかの方法。
実施形態1391. 前記動物がマウスである、請求項1060の方法。
実施形態1392. 前記動物がヒトである、請求項1060の方法。
実施形態1393. 動物における疾患または状態を治療する方法であって、請求項1384または1386の医薬組成物を動物に投与することを含み、それにより前記動物における前記疾患または状態を治療する、方法。
実施形態1394. 前記動物がマウスである、請求項1393の方法。
実施形態1395. 前記動物がヒトである、請求項1393の方法。
実施形態1396. 前記疾患または状態が肝臓疾患または状態である、請求項1393~1395のいずれかの方法。
実施形態1397. 前記投与が非経口投与である、請求項1393~1395のいずれかの方法。
実施形態1398. 前記投与が皮下注入による、請求項1397の方法。
実施形態1399. 前記投与が静脈内注入による、請求項1397の方法。
実施形態1400. 前記投与が筋肉内注入による、請求項1397の方法。
実施形態1401. 前記共役オリゴヌクレオチドが1~10mg/kgの用量で提供される、請求項1393~1400のいずれかの方法。
実施形態1402. 前記共役オリゴヌクレオチドが1mg/kg未満の用量で提供される、請求項1393~1400のいずれかの方法。
実施形態1403. 前記共役オリゴヌクレオチドが10mg/kgを超える用量で提供される、請求項1393~1400のいずれかの方法。
実施形態1404. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも2ヶ月の投薬期間にわたって提供される、請求項1393~1403のいずれかの方法。
実施形態1405. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも4ヶ月の投薬期間にわたって提供される、請求項1393~1403のいずれかの方法。
実施形態1406. 前記共役オリゴヌクレオチドが少なくとも6ヶ月の投薬期間にわたって提供される、請求項1393~1403のいずれかの方法。
実施形態1407. 前記共役オリゴヌクレオチドが1週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、請求項1393~1403のいずれかの方法。
実施形態1408. 前記共役オリゴヌクレオチドが2週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、請求項1393~1403のいずれかの方法。
実施形態1409. 前記共役オリゴヌクレオチドが3週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、請求項1393~1403のいずれかの方法。
実施形態1410. 前記共役オリゴヌクレオチドが4週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、請求項1393~1403のいずれかの方法。
実施形態1411. 前記共役オリゴヌクレオチドが5週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、請求項1393~1403のいずれかの方法。
実施形態1412. 前記共役オリゴヌクレオチドが6週間毎に1回用量の投薬頻度で提
供される、請求項1393~1403のいずれかの方法。
実施形態1413. 前記共役オリゴヌクレオチドが7週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、請求項1393~1403のいずれかの方法。
実施形態1414. 前記共役オリゴヌクレオチドが8週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、請求項1393~1403のいずれかの方法。
実施形態1415. 12~30個の連結したヌクレオシドを含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンス化合物であって、前記共役基が少なくとも1個の細胞標的部分を含む、共役アンチセンス化合物。
実施形態1416. 細胞におけるアポリポタンパク質C-IIIタンパク質の活性または量を減少させる方法であって、細胞を請求項1098~1385のいずれかの少なくとも1個の共役アンチセンス化合物と接触させることを含み、それにより前記細胞における前記アポリポタンパク質C-IIIタンパク質の活性または量を減少させる、方法。
実施形態1417. 総コレステロールを低下させる方法であって、細胞を請求項1098~1385のいずれかの少なくとも1個の化合物と接触させることを含み、それにより総コレステロールを低下させる、方法。
実施形態1418. トリグリセリドを低下させる方法であって、細胞を請求項1098~1385のいずれかの少なくとも1個の化合物と接触させることを含み、それによりトリグリセリドを低下させる、方法。
実施形態1419. LDLを減少させる方法であって、細胞を請求項1098~1385のいずれかの少なくとも1個の化合物と接触させることを含み、それによりLDLを減少させる、方法。
実施形態1420. HDLを増加させる方法であって、細胞を請求項1098~1385のいずれかの少なくとも1個の化合物と接触させることを含み、それによりHDLを増加させる方法。
実施形態1421. 前記細胞が生体外に存在する、請求項1416~1420のいずれかの方法。
実施形態1422. 前記細胞が動物内に存在する、請求項1416~1420のいずれかの方法。
実施形態1423. 前記動物がヒトである、請求項1416~1420のいずれかの方法。
実施形態1424. 請求項1~1385のいずれかの化合物もしくは共役オリゴヌクレオチド、またはそのプロドラッグ。
実施形態1425. 請求項1~1385のいずれかのアンチセンスオリゴヌクレオチドを製造する方法。
実施形態1426. 請求項1~1385のいずれかのアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製する方法。
実施形態1427. 請求項1~1385のいずれか1項の共役アンチセンス化合物を製造するための工程であって、前記方法が、ヒト使用のために前記共役アンチセンス化合物を製剤化することと、製剤化された共役アンチセンス化合物のクロマトグラム分析を実行することと、販売に備えて前記共役アンチセンス化合物を包装することと、を含む、工程。
実施形態1428. 前記共役オリゴヌクレオチドが、配列番号117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、または127のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態1237~1360のいずれかの共役オリゴヌクレオチド化合物。
実施形態1429. 式(V)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000362
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、またはGalNAc-23aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分である、化合物。
実施形態1430. 式(Va)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000363
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、Ga
lNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、またはGalNAc-23aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、Q13が、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から選択される、化合物。
実施形態1431. 式(XXV)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000364
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1432. 式(XXVI)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000365
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む、化合物。
実施形態1433. 式(XXVII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000366
式中、
CMが切断可能な部分を表し、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1434. 式(XXVIII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000367
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1435. 式(XXIX)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000368
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1436. 式(XXX)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000369
式中、
CMが切断可能な部分を表し、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1437. 式(XXXI)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000370
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1438. 式(XXXII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000371
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1439. 式(XXXIII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000372
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1440. 式(XXXIV)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000373
式中、
CMが切断可能な部分を表し、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1441. 式(XXXV)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000374
式中、
が、リンカー、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1442. 式(XXXVI)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000375
式中、
CMが切断可能な部分を表し、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1443. 式(XXXVII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000376
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1444. 式(XXXVIII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000377
式中、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1445. 式(XXXIX)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000378
式中、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1446. 式(XL)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000379
式中、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1447. 式(XLI)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000380
式中、各Yが、O、S、置換もしくは非置換C~C10アルキル、アミノ、置換アミノ、アジド、アルケニル、またはアルキニルから選択され、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1448. 式(XLII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000381
式中、各Yが、O、S、置換もしくは非置換C~C10アルキル、アミノ、置換アミノ、アジド、アルケニル、またはアルキニルから選択され、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカ
ー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1449. 式(XLIII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000382
式中、Yが、O、S、置換もしくは非置換C~C10アルキル、アミノ、置換アミノ、アジド、アルケニル、またはアルキニルから選択され、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1450. 式(XLIV)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000383
式中、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1451. 式(XLV)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000384
式中、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1452. 式(XLV)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000385
式中、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1453. 式(XLV)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000386
式中、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1454. TまたはTが、以下の中から選択され、
Figure 0007177127000387
Figure 0007177127000388
Figure 0007177127000389
Figure 0007177127000390
または
Figure 0007177127000391
式中、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、H、ヒドロキシル保護基、または反応性リン基であり、
Xが、OまたはSであり、
Zが、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、アシル、置換アシル、置換アミド、チオール、または置換チオであり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、
実施形態1432~1453のいずれかの化合物。
実施形態1455. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000392
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
Qが、H、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から選択され、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1456. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000393
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1457. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000394
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1458. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000395
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1459. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000396
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1460. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000397
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
Zが、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、アシル、置換アシル、または置換アミドであり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1461. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000398
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
Qが、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から選択され、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1462. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000399
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1463. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000400
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1464. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000401
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1465. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000402
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1466. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000403
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
Zが、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、アシル、置換アシル、または置換アミドであり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1467. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000404
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
Qが、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から選択され、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1468. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000405
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1469. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000406
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1470. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000407
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
Zが、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、アシル、置換アシル、または置換アミドであり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1471. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000408
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1472. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000409
式中、Xが、OまたはSであり、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
Zが、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、アシル、置換アシル、または置換アミドであり、
が、ヌクレオシド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1473. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000410
、および、式中、Aが、前記修飾オリゴヌクレオチドである、化合物。
実施形態1474. 式(V)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000411
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSの中から選択される、化合物。
実施形態1475. 式(Va)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000412
またはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、Q13が、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH
-N(H)-C(=NH)NHの中から選択され、
Xが、OまたはSの中から選択される、化合物。
実施形態1476. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000413
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSの中から選択される、化合物。
実施形態1477. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000414
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、
Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSの中から選択される、化合物。
実施形態1478. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000415
式中、Zが、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、ハロゲン、アシル、置換アシル、置換アミド、チオール、または置換チオであり、
またはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSの中から選択される、化合物。
実施形態1479. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000416
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16
a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、
Qが、水素、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から選択され、
Xが、OまたはSの中から選択される、化合物。
実施形態1480. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000417
またはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、QまたはQ13が、水素、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から選択され、
Xが、OまたはSの中から選択される、化合物。
実施形態1481. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000418
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、
Qが、水素、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から選択され、
Xが、OまたはSの中から選択される、化合物。
実施形態1482. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000419
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc
-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、
Qが、水素、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から選択され、
Xが、OまたはSの中から選択される、化合物。
実施形態1483. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000420
式中、Zが、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、ハロゲン、アシル、置換アシル、置換アミド、チオール、または置換チオであり、
またはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、
Qが、水素、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OC
-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から選択され、
Xが、OまたはSの中から選択される、化合物。
実施形態1484. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000421
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSの中から選択され、
Zが、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、ハロゲン、水素、アシル、置換アシル、置換アミド、チオール、または置換チオである、化合物。
実施形態1485. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000422
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、Q13が、水素、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から選択され、
Xが、OまたはSの中から選択され、
Zが、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、ハロゲン、水素、アシル、置換アシル、置換アミド、チオール、または置換チオである、化合物。
実施形態1486. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000423
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSの中から選択され、
Zが、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、ハロゲン、水素、アシル、置換アシル、置換アミド、チオール、または置換チオである、化合物。
実施形態1487. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000424
式中、TまたはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSの中から選択され、
Zが、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、ハロゲン、水素、アシル、置換アシル、置換アミド、チオール、または置換チオである、化合物。
実施形態1488. 以下の式を有する化合物であって、
Figure 0007177127000425
式中、Zが、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、アシル、置換アシル、置換アミド、チオール、または置換チオであり、
またはTのうちの一方が、GalNAc-1a、GalNAc-2a、GalNAc-3a、GalNAc-4a、GalNAc-5a、GalNAc-6a、GalNAc-7a、GalNAc-8a、GalNAc-9a、GalNAc-10a、GalNAc-11a、GalNAc-12a、GalNAc-13a、GalNAc-14a、GalNAc-15a、GalNAc-16a、GalNAc-17a、GalNAc-18a、GalNAc-19a、GalNAc-20a、GalNAc-21a、GalNAc-22a、GalNAc-23a、GalNAc-24a、GalNAc-25a、GalNAc-26a、GalNAc-27a、GalNAc-28a、GalNAc-29a、GalNAc-30a、GalNAc-31a、およびGalNAc-32aの中から選択され、
またはTのうちの他方が、ヒドロキシル、ヒドロキシル保護基、ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物の中から選択され、Bxが、複素環式塩基部分であり、
Xが、OまたはSであり、
Zが、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、置換C~Cアルキル、置換C~Cアルケニル、置換C~Cアルキニル、ハロゲン、水素、アシル、置換アシル、置換アミド、チオール、または置換チオである、化合物。
実施形態1489. Bが、アデニン、グアニン、チミン、ウラシル、シトシン、または5-メチルシトシンから選択される、実施形態1474~1488のいずれかの化合物。
実施形態1490. QまたはQ13がO(CH-OCHである、実施形態1474~1483または1485のいずれかの化合物。
実施形態1491. 式(XVI)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000426
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1492. 式(XVII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000427
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1493. 式(XVIII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000428
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1494. 式(XIX)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000429
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1495. 式(XX)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000430
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物
を含む基である、化合物。
実施形態1496. 式(XXI)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000431
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1497. 式(XXII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000432
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、化合物。
実施形態1498. 式(XXIII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000433
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1499. 式(XXIIIa)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000434
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1500. 式(XXIV)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000435
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1501. 式(XXIVa)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000436
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1502. 前記オリゴマー化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、実施形態1432~1502のいずれかの化合物。
実施形態1503. 前記修飾オリゴヌクレオチドがギャップマーである、実施形態1502の化合物。
実施形態1504. 前記修飾オリゴヌクレオチドが相補的標的核酸に結合されるとRNase Hを活性化する、実施形態1502の化合物。
実施形態1505. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1502~1504のいずれかの化合物。
実施形態1506. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが修飾塩基を含む、実施形態1505の化合物。
実施形態1507. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが糖代理物を含む、実施形態1505または1506の化合物。
実施形態1508. 前記糖代理物がテトラヒドロピランである、実施形態1507の化合物。
実施形態1509. 前記テトラヒドロピランがF-HNAである、実施形態1508の化合物。
実施形態1510. 前記修飾オリゴヌクレオチドの残りが、修飾糖を含む少なくとも1個のヌクレオシドを含む、実施形態1505~1509のいずれかの化合物。
実施形態1511. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖を含む少なくとも1個のヌクレオシドを含む、実施形態1502~1510のいずれかの実施形態の化合物。
実施形態1512. 修飾糖を含む前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが、二環式ヌクレオシドおよび2’-修飾ヌクレオシドから選択される、実施形態1511の化合物。
実施形態1513. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが二環式ヌクレオシドである、実施形態1512の化合物。
実施形態1514. 前記二環式ヌクレオシドが(4’-CH-O-2’)BNAヌクレオシドである、実施形態1513の化合物。
実施形態1515. 前記二環式ヌクレオシドが(4’-(CH-O-2’)BNAヌクレオシドである、実施形態1513の化合物。
実施形態1516. 前記二環式ヌクレオシドが(4’-C(CH)H-O-2’)BNAヌクレオシドである、実施形態1513の化合物。
実施形態1517. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが2’-修飾ヌクレオシドである、実施形態1513の化合物。
実施形態1518. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが、2’-Fヌクレオシド、2’-OCHヌクレオシド、および2’-O(CHOCHヌクレオシドから選択される、実施形態1512の化合物。
実施形態1519. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-Fヌクレオシドである、実施形態1518の化合物。
実施形態1520. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-OCHヌクレオシドである、実施形態1518の化合物。
実施形態1521. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-O(CH
OCHヌクレオシドである、実施形態1518の化合物。
実施形態1522. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の非修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1502~1521のいずれかの化合物。
実施形態1523. 前記非修飾ヌクレオシドがリボヌクレオシドである、実施形態1522の化合物。
実施形態1524. 前記非修飾ヌクレオシドがデオキシリボヌクレオシドである、実施形態1522の化合物。
実施形態1525. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも2個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1502~1524のいずれかの化合物。
実施形態1526. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドが同一の修飾を含む、実施形態1525の化合物。
実施形態1527. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドが異なる修飾を含む、実施形態1525の化合物。
実施形態1528. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドのうちの少なくとも1つが糖代理物を含む、実施形態1525~1527のいずれかの化合物。
実施形態1529. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドのうちの少なくとも1つが2’-修飾を含む、実施形態1525~1528のいずれかの化合物。
実施形態1530. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が、2’-Fヌクレオシド、2’-OCHヌクレオシド、および2’-O(CHOCHヌクレオシドから独立して選択される、実施形態1529の化合物。
実施形態1531. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が2’-Fヌクレオシドである、実施形態1530の化合物。
実施形態1532. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が2’-OCHヌクレオシドである、実施形態1530の化合物。
実施形態1533. 前記少なくとも2個の修飾ヌクレオシドの各々が2’-O(CHOCHヌクレオシドである、実施形態1530の化合物。
実施形態1534. 前記修飾オリゴヌクレオチドの実質的にすべてのヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態1502~1533のいずれかの化合物。
実施形態1535. 前記修飾オリゴヌクレオチドのすべてのヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態1502~1522または1525~1534のいずれかの化合物。
実施形態1536. 前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも4個のヌクレオシドがデオキシリボヌクレオシドである、実施形態1502~1533のいずれかの化合物。
実施形態1537. 前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも5個のヌクレオシドがデ
オキシリボヌクレオシドである、実施形態1520~1533のいずれかの化合物。
実施形態1538. 前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも6個のヌクレオシドがデオキシリボヌクレオシドである、実施形態1502~1533のいずれかの化合物。
実施形態1539. 前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも7個のヌクレオシドがデオキシリボヌクレオシドである、実施形態1502~1533のいずれかの化合物。
実施形態1540. 前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも8個のヌクレオシドがデオキシリボヌクレオシドである、実施形態1502~1533のいずれかの化合物。
実施形態1541. 前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも9個のヌクレオシドがデオキシリボヌクレオシドである、実施形態1502~1533のいずれかの化合物。
実施形態1542. 前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも10個のヌクレオシドがデオキシリボヌクレオシドである、実施形態1502~1533のいずれかの化合物。
実施形態1543. 前記修飾オリゴヌクレオチドの前記デオキシリボヌクレオシドの各々が、ヌクレオシド間結合によって連続的に連結される、実施形態1536~1542のいずれかの化合物。
実施形態1544. 前記修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖である、実施形態1502~1543のいずれかの化合物。
実施形態1545. 前記修飾オリゴヌクレオチドが二本鎖である、実施形態1502~1543のいずれかの化合物。
実施形態1546. 前記修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンス化合物である、実施形態1502~1543のいずれかの化合物。
実施形態1547. 前記修飾オリゴヌクレオチドがRISCベースのオリゴヌクレオチドである、実施形態1502~1543のいずれかの化合物。
実施形態1548. 前記修飾オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、実施形態1502~1543のいずれかの化合物。
実施形態1549. 前記オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、実施形態1502~1547のいずれかの化合物。
実施形態1550. 前記化合物が、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中
央領域と、
を含む糖モチーフを有する、実施形態1502~1534または1536~1546のいずれかの化合物。
実施形態1551. 前記5’領域が2個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550の化合物。
実施形態1552. 前記5’領域が3個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550の化合物。
実施形態1553. 前記5’領域が4個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550の化合物。
実施形態1554. 前記5’領域が5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550の化合物。
実施形態1555. 前記3’領域が2個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550~1554のいずれかの化合物。
実施形態1556. 前記3’領域が3個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550~1554のいずれかの化合物。
実施形態1557. 前記3’領域が4個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550~1554のいずれかの化合物。
実施形態1558. 前記3’領域が5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550~1554のいずれかの化合物。
実施形態1559. 前記中央領域が5個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550~1558のいずれかの化合物。
実施形態1560. 前記中央領域が6個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550~1558のいずれかの化合物。
実施形態1561. 前記中央領域が7個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550~1558のいずれかの化合物。
実施形態1562. 前記中央領域が8個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550~1558のいずれかの化合物。
実施形態1563. 前記中央領域が9個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550~1558のいずれかの化合物。
実施形態1564. 前記中央領域が10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態1550~1558のいずれかの化合物。
実施形態1565. 前記化合物が14~26個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1550~1564のいずれかの化合物。
実施形態1566. 前記化合物が15~25個の連結したヌクレオシドからなる、実施
形態1550~1564のいずれかの化合物。
実施形態1567. 前記化合物が16~20個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1550~1564のいずれかの化合物。
実施形態1568. 各修飾ヌクレオシドが、独立して、2’-置換糖部分または二環式糖部分を含む、実施形態1550~1567のいずれかの化合物。
実施形態1569. 前記少なくとも1個の修飾ヌクレオシドが2’-置換糖部分を含む、実施形態1568の化合物。
実施形態1570. 2’-置換糖部分を含む各修飾ヌクレオシドが、ハロゲン、任意に置換されたアリル、任意に置換されたアミノ、アジド、任意に置換されたSH、CN、OCN、CF3、OCF3、O、S、もしくはN(Rm)-アルキル;O、S、もしくはN(Rm)-アルケニル;O、S、もしくはN(Rm)-アルキニル;任意に置換されたO-アルキレニル-O-アルキル、任意に置換されたアルキニル、任意に置換されたアルカリル、任意に置換されたアラルキル、任意に置換されたO-アルカリル、任意に置換されたO-アラルキル、O(CH2)2SCH3、O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn)、またはO-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn)の中から独立して選択される2’置換基を含み、式中、各RmおよびRnが、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換C~C10アルキルであり、
各任意に置換された基が、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ(NO)、チオール、チオアルコキシ(S-アルキル)、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル、およびアルキニルの中から独立して選択される置換基で任意に置換される、実施形態1569の化合物。
実施形態1571. 各2’置換基が、ハロゲン、OCH、OCHF、OCHF、OCF、OCHCH、O(CHF、OCHCHF、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH、O(CH-SCH、O(CH-OCF、O(CH-N(R)(R)、O(CH-ON(R)(R)、O(CH-O(CH-N(R)(R)、OCHC(=O)-N(R)(R)、OCHC(=O)-N(R)-(CH-N(R)(R)、およびO(CH-N(R)-C(=NR)[N(R)(R)]の中から独立して選択され、式中、R、R、R、およびRが各々、独立して、HまたはC~Cアルキルである、実施形態1569の化合物。
実施形態1572. 各2’置換基が、ハロゲン、OCH、OCF、OCHCH、OCHCF、OCH-CH=CH、O(CH-OCH(MOE)、O(CH-O(CH-N(CH、OCHC(=O)-N(H)CH、OCHC(=O)-N(H)-(CH-N(CH、およびOCH-N(H)-C(=NH)NHの中から独立して選択される、実施形態1569の化合物。
実施形態1573. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-MOE糖部分を含む、実施形態1569の化合物。
実施形態1574. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-OMe糖部分を含む、実施形態1569の化合物。
実施形態1575. 前記少なくとも1個の2’-修飾ヌクレオシドが2’-F糖部分を含む、実施形態1569の化合物。
実施形態1576. 前記化合物が、糖代理物を含む少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1550~1575のいずれかの化合物。
実施形態1577. 前記修飾ヌクレオシドがF-HNA糖部分を含む、実施形態1576の化合物。
実施形態1578. 前記修飾ヌクレオシドがHNA糖部分を含む、実施形態1576の化合物。
実施形態1579. 前記化合物が、二環式糖部分を含む少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1550~1578のいずれかの化合物。
実施形態1580. 前記二環式糖部分がcEt糖部分である、実施形態1579の化合物。
実施形態1581. 二環式糖部分がLNA糖部分である、実施形態1579の化合物。
実施形態1582. 前記化合物が少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態1502~1581のいずれかの化合物。
実施形態1583. 前記化合物の各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態1582の化合物。
実施形態1584. 前記化合物が、少なくとも1個の修飾結合および少なくとも1個の非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1582の化合物。
実施形態1585. 少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合がホスホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1582または1584のいずれかの化合物。
実施形態1586. 各修飾ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1584または1585のいずれかの化合物。
実施形態1587. 前記化合物が少なくとも2個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1585のいずれかの化合物。
実施形態1588. 前記化合物が少なくとも3個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1585のいずれかの化合物。
実施形態1589. 前記化合物が少なくとも4個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1585のいずれかの化合物。
実施形態1590. 前記化合物が少なくとも5個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1585のいずれかの化合物。
実施形態1591. 前記化合物が少なくとも6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1585のいずれかの化合物。
実施形態1592. 前記化合物が少なくとも7個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1585のいずれかの化合物。
実施形態1593. 前記化合物が少なくとも8個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1585のいずれかの化合物。
実施形態1594. 前記化合物が少なくとも9個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1585のいずれかの化合物。
実施形態1595. 前記化合物が少なくとも10個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1585のいずれかの化合物。
実施形態1596. 前記化合物が16個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1595のいずれかの化合物。
実施形態1597. 前記化合物が15個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1595のいずれかの化合物。
実施形態1598. 前記化合物が14個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1595のいずれかの化合物。
実施形態1599. 前記化合物が13個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1595のいずれかの化合物。
実施形態1600. 前記化合物が12個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1595のいずれかの化合物。
実施形態1601. 前記化合物が11個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1595のいずれかの化合物。
実施形態1602. 前記化合物が10個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1595のいずれかの化合物。
実施形態1603. 前記化合物が9個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1595のいずれかの化合物。
実施形態1604. 前記化合物が8個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1595のいずれかの化合物。
実施形態1605. 前記化合物が7個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1595のいずれかの化合物。
実施形態1606. 前記化合物が6個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1584または1595のいずれかの化合物。
実施形態1607. 前記化合物の各末端ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1502~1605のいずれかの化合物。
実施形態1608. 前記化合物の2個のデオキシヌクレオシドを結合する各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1502~1605のいずれかの化合物。
実施形態1609. 前記化合物の2個の修飾ヌクレオシドを結合する各非末端ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態1502~1605のいずれかの化合物。
実施形態1610. 修飾ヌクレオシドの3’である前記化合物の各非末端ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態1502~1605のいずれかの化合物。
実施形態1611. デオキシヌクレオシドの3’である前記化合物の各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1502~1605のいずれかの化合物。
実施形態1612. 前記化合物が、
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM、および
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
の中から選択される化学モチーフを有し、
式中、各Mが、独立して、修飾ヌクレオシドであり、各Dが、デオキシヌクレオシドであり、各sが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合であり、各yが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかであるが、但し、少なくとも1つのyが、ホスホジエステルヌクレオチド間結合であることを条件とする、
実施形態1502~1588のいずれかの化合物。
実施形態1613. 前記化合物が、
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM、および
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
の中から選択される化学モチーフを有し、
式中、各Mが、独立して、修飾ヌクレオシドであり、各Dが、デオキシヌクレオシドであり、各oが、ホスホジエステルヌクレオシド間結合であり、各sが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、
実施形態1502~1588のいずれかの化合物。
実施形態1614. 各Mが、2’-MOEヌクレオシドおよび二環式ヌクレオシドの中から独立して選択される、実施形態1612または1613の化合物。
実施形態1615. 各Mが、2’-MOEヌクレオシド、cEtヌクレオシド、およびLNAヌクレオシドの中から独立して選択される、実施形態1614の化合物。
実施形態1616. 各Mが2’-MOEヌクレオシドである、実施形態1612または1613の化合物。
実施形態1617. 各MがcEtヌクレオシドである、実施形態1612または1613の化合物。
実施形態1618. 各MがLNAヌクレオシドである、実施形態1612または1613の化合物。
実施形態1619. 前記化合物が、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも8個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態1502~1618のいずれかの化合物。
実施形態1620. 前記化合物が、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも10個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態1502~1618のいずれかの化合物。
実施形態1621. 前記化合物が、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも12個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態1502~1618のいずれかの化合物。
実施形態1622. 前記化合物が、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも14個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態1502~1618のいずれかの化合物。
実施形態1623. 前記化合物が、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも16個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態1502~1618のいずれかの化合物。
実施形態1624. 前記化合物が、標的核酸の等長部分に相補的な少なくとも18個の核酸塩基部分を含む核酸塩基配列を有する、実施形態1502~1618のいずれかの化合物。
実施形態1625. 前記化合物が標的核酸に対して少なくとも90%相補的である、実施形態1502~1618のいずれかの化合物。
実施形態1626. 前記化合物が標的核酸に対して少なくとも95%相補的である、実施形態1502~1618のいずれかの化合物。
実施形態1627. 前記化合物が標的核酸に対して100%相補的である、実施形態1502~1618のいずれかの化合物。
実施形態1628. 前記標的核酸がプレmRNAである、実施形態1627の化合物。
実施形態1629. 前記標的核酸がmRNAである、実施形態1627の化合物。
実施形態1630. 前記標的核酸がマイクロRNAである、実施形態1627の化合物。
実施形態1631. 前記標的核酸が肝臓において発現される、実施形態1627の化合物。
実施形態1632. 前記標的核酸が肝細胞において発現される、実施形態1627の化合物。
実施形態1633. 前記標的核酸が、α1-抗トリプシン、アンドロゲン受容体、アポリポタンパク質(a)、アポリポタンパク質B、アポリポタンパク質C-III、C反応性タンパク質、eIF-4E、第VII因子、第XI因子、グルココルチコイド受容体、グルカゴン受容体、タンパク質チロシンホスファターゼ1B、STAT3、SRB-1、およびトランスサイレチンの中から選択されるタンパク質をコードする、実施形態1627の化合物。
実施形態1634. 前記標的核酸がウイルス核酸である、実施形態1627の化合物。
実施形態1635. 前記ウイルス核酸が肝臓において発現される、実施形態1634の化合物。
実施形態1636. 前記標的核酸がB型肝炎ウイルス核酸である、実施形態1634の化合物。
実施形態1637. 前記化合物が、配列番号17、18、19、20、21、22、23、または24のうちのいずれか1個の核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1638. 前記化合物が、配列番号25、26、27、28、29、または30のうちのいずれか1個の核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1639. 前記化合物が、配列番号31の核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1640. 前記化合物が、配列番号32の核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1641. 前記化合物が、配列番号33の核酸塩基配列を含む、実施形態15
02~1627のいずれかの化合物。
実施形態1642. 前記化合物が、配列番号34の核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1643. 前記化合物が、配列番号35、36、37、38、39、40、41、42、または43のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1644. 前記化合物が、配列番号44、45、46、47、または48の核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1645. 前記化合物が、配列番号49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、または59のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1646. 前記化合物が、配列番号60、61、62、63、64、65、66、または67のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1647. 前記化合物が、配列番号69、70、71、または72のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1648. 前記化合物が、配列番号73の核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1649. 前記化合物が、配列番号74、75、76、77、78、79、80、または81のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1650. 前記化合物が、配列番号68の核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1651. 前記化合物が、配列番号82~103、111、または113のうちのいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1652. 前記化合物がアンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態1502~1627のいずれかの化合物。
実施形態1653. 実施形態1502~1652のいずれかに従う化合物または化合物と、薬剤的に許容される担体または希釈剤と、を含む、医薬組成物。
実施形態1654. 前記薬剤的に許容される担体または希釈剤が、滅菌水および滅菌生理食塩水の中から選択される、実施形態1653の医薬組成物。
実施形態1655. 細胞内の標的核酸の量または活性を低減させる方法であって、細胞を、実施形態1498~1648のいずれかの化合物もしくは共役アンチセンス化合物、または実施形態1653~1654の医薬組成物と接触させることを含む、方法。
実施形態1656. 前記細胞が肝臓細胞である、実施形態1655の方法。
実施形態1657. 前記細胞が肝細胞である、実施形態1655の方法。
実施形態1658. 前記細胞が生体外に存在する、実施形態1655~1657のいずれかの方法。
実施形態1659. 前記細胞が動物内に存在する、実施形態1655~1657のいずれかの方法。
実施形態1660. 前記動物がマウスである、実施形態1659の方法。
実施形態1661. 前記動物がヒトである、実施形態1659の方法。
実施形態1662. 動物における疾患または状態を治療する方法であって、実施形態1653または1654の医薬組成物を動物に投与することを含み、それにより前記動物における前記疾患または状態を治療する、方法。
実施形態1663. 前記動物がマウスである、実施形態1662の方法。
実施形態1664. 前記動物がヒトである、実施形態1662の方法。
実施形態1665. 前記疾患または状態が肝臓疾患または状態である、実施形態1662~1664のいずれかの方法。
実施形態1666. 前記投与が非経口投与である、実施形態1662~1665のいずれかの方法。
実施形態1667. 前記投与が皮下注入による、実施形態1662~1665のいずれかの方法。
実施形態1668. 前記投与が静脈内注入による、実施形態1662~1665のいずれかの方法。
実施形態1669. 前記投与が筋肉内注入による、実施形態1662~1665のいずれかの方法。
実施形態1670. 前記化合物が1~10mg/kgの用量で提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1671. 前記化合物が1mg/kg未満の用量で提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1672. 前記化合物が10mg/kgを超える用量で提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1673. 前記化合物が少なくとも2ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1674. 前記化合物が少なくとも4ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1675. 前記化合物が少なくとも6ヶ月の投薬期間にわたって提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1676. 前記化合物が1週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1677. 前記化合物が2週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1678. 前記化合物が3週間毎に約1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1679. 前記化合物が4週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1680. 前記化合物が5週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1681. 前記化合物が6週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1682. 前記化合物が7週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1683. 前記化合物が8週間毎に1回用量の投薬頻度で提供される、実施形態1662~1669のいずれかの方法。
実施形態1684. 実施形態1~1652のいずれかの化合物もしくは化合物、またはそのプロドラッグ。
実施形態1685. 実施形態1~1652のいずれかのアンチセンスオリゴヌクレオチドを製造する方法。
実施形態1686. 実施形態1~1652のいずれかのアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製する方法。
実施形態1687. 実施形態1~1652のいずれか1つの共役アンチセンス化合物を製造するための工程であって、前記方法が、ヒト使用のために前記共役アンチセンス化合物を製剤化することと、製剤化された共役アンチセンス化合物のクロマトグラム分析を実行することと、販売に備えて前記共役アンチセンス化合物を包装することと、を含む、工程。
実施形態1688. 前記テザーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000437
または
Figure 0007177127000438
式中、各nが、独立して、0、1、2、3、4、5、6、または7である、
実施形態1179~1182のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1689. 前記テザーが、以下の構造を有する、実施形態1179~1182のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000439
実施形態1690. 前記リンカーが、以下の中から選択される構造を有する、実施形態1179~1182または1688~1689のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000440
実施形態1691. 前記リンカーが、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000441
式中、各nが、独立して、0、1、2、3、4、5、6、または7である、
実施形態1179~1182または1688~1689のいずれかの共役アンチセンス化合物。
実施形態1692. 前記リンカーが、以下の構造を有する、実施形態1179~1182または1688~1689のいずれかの共役アンチセンス化合物。
Figure 0007177127000442
実施形態1693. 式(XXVI)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000443
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1694. 前記リンカーが、アミン、アミド、エステル、エーテル、ピロリジン、PEG、ポリアミド、またはジスルフィド結合を含む、実施形態1693の化合物。
実施形態1695. 前記リンカーがピロリジンを含まない、実施形態1693または1694の化合物。
実施形態1696. 前記リンカーが、以下の式を有する、実施形態1693~1695のいずれかの化合物。
Figure 0007177127000444
実施形態1697. Tが、以下の式を有し、
Figure 0007177127000445
式中、
CMが、切断可能な部分であり、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、
実施形態1693~1696のいずれかの化合物。
実施形態1698. Tが、以下の式を有し、
Figure 0007177127000446
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、
実施形態1693~1697のいずれかの化合物。
実施形態1699. TまたはTがオリゴマー化合物を含む基であり、前記オリゴマー化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、実施形態1693~1698のいずれかの化合物。
実施形態1700. 前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなり、少なくとも1個のヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態1699の化合物。
実施形態1701. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、(4’-CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-(CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-C(CH)H-O-2’)二環式ヌクレオシド、およびモルフォリノの中から選択される少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1699または1700の化合物。
実施形態1702. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含むギャップマー糖モチーフを有する、実施形態1699~1701のいずれかの化合物。
実施形態1703. 各5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、実施形態1702の化合物。
実施形態1704. 前記5’領域が2~5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなり、前記3’領域が2~5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなり、前記中央領域が8~10個の中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態1702~1704のいずれかの化合物。
実施形態1705. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1699~1704のいずれかの化合物。
実施形態1706. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1699~1705のいずれかの化合物。
実施形態1707. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合またはホスホジエステルヌクレオシド間結合のいずれかである、実施形態1699~1706のいずれかの化合物。
実施形態1708. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端で前記化合物の残りに結合される、実施形態1699~1707のいずれかの化合物。
実施形態1709. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端で前記化合物の残りに結合される、実施形態1699~1707のいずれかの化合物。
実施形態1710. 前記修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態1699~1709のいずれかの化合物。
実施形態1711. 前記修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖である、実施形態1699~1710のいずれかの実施形態の化合物。
実施形態1712. 前記修飾オリゴヌクレオチドが二本鎖である、実施形態1699~1710のいずれかの化合物。
実施形態1713. 前記修飾オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、実施形態1699~1712のいずれかの化合物。
実施形態1714. 前記修飾オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、実施形態1699~1712のいずれかの化合物。
実施形態1715. 前記修飾オリゴヌクレオチドが標的プレmRNAのスプライシングを変化させる、実施形態1699~1712のいずれかの化合物。
実施形態1716. 前記修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に相補的である、実施形態1699~1715のいずれかの化合物。
実施形態1717. 前記標的核酸が、プレmRNA、マイクロRNA、または長い非コードRNAの中から選択される、実施形態1716の化合物。
実施形態1718. 前記修飾オリゴヌクレオチドが12~30個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1699~1717のいずれかの化合物。
実施形態1719. 前記修飾オリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1699~1717のいずれかの化合物。
実施形態1720. 前記修飾オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシ
ドからなる、実施形態1699~1717のいずれかの化合物。
実施形態1721. 実施形態1693~1720のいずれかの化合物を動物に投与する方法。
実施形態1722. 代謝性障害を治療する方法であって、実施形態1693~1720のいずれかの化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
実施形態1723. 心血管障害を治療する方法であって、実施形態1693~1720のいずれかの化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
実施形態1724. 式(XXXI)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000447
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1725. 前記リンカーが、アミン、アミド、エステル、エーテル、ピロリジン、PEG、ポリアミド、またはジスルフィド結合を含む、実施形態1724の化合物。
実施形態1726. 前記リンカーがピロリジンを含まない、実施形態1724または1725の化合物。
実施形態1727. 前記リンカーが、以下のものである、実施形態1724~1726のいずれかの化合物。
Figure 0007177127000448
実施形態1728. Tが、以下の式を有し、
Figure 0007177127000449
式中、
CMが切断可能な部分を表し、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、
実施形態1724~1727のいずれかの化合物。
実施形態1729. Tが、以下の式を有し、
Figure 0007177127000450
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、
実施形態1724~1728のいずれかの化合物。
実施形態1730. TまたはTがオリゴマー化合物を含む基であり、前記オリゴマー化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、実施形態1724~1729のいずれかの化合物。
実施形態1731. 前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなり、少なくとも1個のヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態1730の化合物。
実施形態1732. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、(4’-CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-(CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-C(CH)H-O-2’)二環式ヌクレオシド、およびモルフォリノの中から選択される少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1730または1731の化合物。
実施形態1733. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含むギャップマー糖モチーフを有する、実施形態1730~1732のいずれかの化合
物。
実施形態1734. 各5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、実施形態1733の化合物。
実施形態1735. 前記5’領域が2~5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなり、前記3’領域が2~5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなり、前記中央領域が8~10個の中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態1733または1734のいずれかの化合物。
実施形態1736. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1730~1735のいずれかの化合物。
実施形態1737. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1730~1736のいずれかの化合物。
実施形態1738. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合またはホスホジエステルヌクレオシド間結合のいずれかである、実施形態1730~1737のいずれかの化合物。
実施形態1739. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端で前記化合物の残りに結合される、実施形態1730~1738のいずれかの化合物。
実施形態1740. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端で前記化合物の残りに結合される、実施形態1730~1738のいずれかの化合物。
実施形態1741. 前記修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態1730~1740のいずれかの化合物。
実施形態1742. 前記修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖である、実施形態1730~1741のいずれかの実施形態の化合物。
実施形態1743. 前記修飾オリゴヌクレオチドが二本鎖である、実施形態1730~1741のいずれかの化合物。
実施形態1744. 前記修飾オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、実施形態1730~1743のいずれかの化合物。
実施形態1745. 前記修飾オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、実施形態1730~1743のいずれかの化合物。
実施形態1746. 前記修飾オリゴヌクレオチドが標的プレmRNAのスプライシングを変化させる、実施形態1730~1743のいずれかの化合物。
実施形態1747. 前記修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に相補的である、実施形態1730~1746のいずれかの化合物。
実施形態1748. 前記標的核酸が、プレmRNA、マイクロRNA、または長い非コードRNAの中から選択される、実施形態1747の化合物。
実施形態1749. 前記修飾オリゴヌクレオチドが12~30個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1730~1748のいずれかの化合物。
実施形態1750. 前記修飾オリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1730~1748のいずれかの化合物。
実施形態1751. 前記修飾オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1730~1748のいずれかの化合物。
実施形態1752. 実施形態1724~1751のいずれかの化合物を動物に投与する方法。
実施形態1753. 代謝性障害を治療する方法であって、実施形態1724~1751のいずれかの化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
実施形態1754. 心血管障害を治療する方法であって、実施形態1724~1751のいずれかの化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
実施形態1755. 式(XXXII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000451
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1756. 前記リンカーが、アミン、アミド、エステル、エーテル、ピロリジン、PEG、ポリアミド、またはジスルフィド結合を含む、実施形態1755の化合物。
実施形態1757. 前記リンカーがピロリジンを含まない、実施形態1755または1756の化合物。
実施形態1758. 前記リンカーが、以下のものである、実施形態1755~1757のいずれかの化合物。
Figure 0007177127000452
実施形態1759. Tが、以下の式を有し、
Figure 0007177127000453
式中、
CMが、切断可能な部分であり、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、
実施形態1755~1758のいずれかの化合物。
実施形態1760. Tが、以下の式を有し、
Figure 0007177127000454
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、
実施形態1755~1759のいずれかの化合物。
実施形態1761. TまたはTがオリゴマー化合物を含む基であり、前記オリゴマー化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、実施形態1755~1760のいずれかの化合物。
実施形態1762. 前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなり、少なくとも1個のヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態1761の化合物。
実施形態1763. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、(4’-CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-(CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-C(CH)H-O-2’)二環式ヌクレオシド、およびモルフォリノの中から選択される少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1761または1762の化合物。
実施形態1764. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシド
が修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含むギャップマー糖モチーフを有する、実施形態1761~1763のいずれかの化合物。
実施形態1765. 各5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、実施形態1764の化合物。
実施形態1766. 前記5’領域が2~5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなり、前記3’領域が2~5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなり、前記中央領域が8~10個の中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態1764または1765のいずれかの化合物。
実施形態1767. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1761~1766のいずれかの化合物。
実施形態1768. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1761~1767のいずれかの化合物。
実施形態1769. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合またはホスホジエステルヌクレオシド間結合のいずれかである、実施形態1761~1768のいずれかの化合物。
実施形態1770. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端で前記化合物の残りに結合される、実施形態1761~1769のいずれかの化合物。
実施形態1771. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端で前記化合物の残りに結合される、実施形態1761~1769のいずれかの化合物。
実施形態1772. 前記修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態1761~1771のいずれかの化合物。
実施形態1773. 前記修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖である、実施形態1761~1772のいずれかの実施形態の化合物。
実施形態1774. 前記修飾オリゴヌクレオチドが二本鎖である、実施形態1761~1772のいずれかの化合物。
実施形態1775. 前記修飾オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、実施形態1761~1774のいずれかの化合物。
実施形態1776. 前記修飾オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、実施形態1761~1774のいずれかの化合物。
実施形態1777. 前記修飾オリゴヌクレオチドが標的プレmRNAのスプライシングを変化させる、実施形態1761~1774のいずれかの化合物。
実施形態1778. 前記修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に相補的である、実施形態1761~1777のいずれかの化合物。
実施形態1779. 前記標的核酸が、プレmRNA、マイクロRNA、または長い非コードRNAの中から選択される、実施形態1779の化合物。
実施形態1780. 前記修飾オリゴヌクレオチドが12~30個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1761~1779のいずれかの化合物。
実施形態1781. 前記修飾オリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1761~1779のいずれかの化合物。
実施形態1782. 前記修飾オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1761~1779のいずれかの化合物。
実施形態1783. 実施形態1755~1782のいずれかの化合物を動物に投与する方法。
実施形態1784. 代謝性障害を治療する方法であって、実施形態1755~1782のいずれかの化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
実施形態1785. 心血管障害を治療する方法であって、実施形態1755~1782のいずれかの化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
実施形態1786. 式(XXXVIII)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000455
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1787. 前記リンカーが、アミン、アミド、エステル、エーテル、ピロリジン、PEG、ポリアミド、またはジスルフィド結合を含む、実施形態1786の化合物。
実施形態1788. 前記リンカーがピロリジンを含まない、実施形態1786または1787の化合物。
実施形態1789. 前記リンカーが、以下のものである、実施形態1786~1788のいずれかの化合物。
Figure 0007177127000456
実施形態1790. Tが、以下の式を有し、
Figure 0007177127000457
式中、
CMが、切断可能な部分であり、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、
実施形態1786~1789のいずれかの化合物。
実施形態1791. Tが、以下の式を有し、
Figure 0007177127000458
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、
実施形態1786~1790のいずれかの化合物。
実施形態1792. TまたはTがオリゴマー化合物を含む基であり、前記オリゴマー化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、実施形態1786~1791のいずれかの化合物。
実施形態1793. 前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなり、少なくとも1個のヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態1792の化合物。
実施形態1794. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、(4’-CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-(CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-C(CH)H-O-2’)二環式ヌクレオシド、およびモルフォリノの中から選択される少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1792または1793の化合物。
実施形態1795. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシド
が修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含むギャップマー糖モチーフを有する、実施形態1792~1794のいずれかの化合物。
実施形態1796. 各5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、実施形態1795の化合物。
実施形態1797. 前記5’領域が2~5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなり、前記3’領域が2~5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなり、前記中央領域が8~10個の中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態1795または1796のいずれかの化合物。
実施形態1798. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1792~1797のいずれかの化合物。
実施形態1799. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1792~1798のいずれかの化合物。
実施形態1800. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合またはホスホジエステルヌクレオシド間結合のいずれかである、実施形態1792~1799のいずれかの化合物。
実施形態1801. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端で前記化合物の残りに結合される、実施形態1792~1800のいずれかの化合物。
実施形態1802. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端で前記化合物の残りに結合される、実施形態1792~1800のいずれかの化合物。
実施形態1803. 前記修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンス化合物である、実施形態1792~1802のいずれかの化合物。
実施形態1804. 前記修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖である、実施形態1792~1803のいずれかの実施形態の化合物。
実施形態1805. 前記修飾オリゴヌクレオチドが二本鎖である、実施形態1792~1803のいずれかの化合物。
実施形態1806. 前記修飾オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、実施形態1792~1805のいずれかの化合物。
実施形態1807. 前記修飾オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、実施形態1792~1805のいずれかの化合物。
実施形態1808. 前記修飾オリゴヌクレオチドが標的プレmRNAのスプライシングを変化させる、実施形態1792~1805のいずれかの化合物。
実施形態1809. 前記修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に相補的である、実施形態1792~1808のいずれかの化合物。
実施形態1810. 前記標的核酸が、プレmRNA、マイクロRNA、または長い非コードRNAの中から選択される、実施形態1809の化合物。
実施形態1811. 前記修飾オリゴヌクレオチドが12~30個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1792~1810のいずれかの化合物。
実施形態1812. 前記修飾オリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1792~1810のいずれかの化合物。
実施形態1813. 前記修飾オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1792~1810のいずれかの化合物。
実施形態1814. 実施形態1786~1813のいずれかの化合物を動物に投与する方法。
実施形態1815. 代謝性障害を治療する方法であって、実施形態1786~1813のいずれかの化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
実施形態1816. 心血管障害を治療する方法であって、実施形態1786~1813のいずれかの化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
実施形態1817. 式(XL)を有する化合物であって、
Figure 0007177127000459
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
実施形態1818. 前記リンカーが、アミン、アミド、エステル、エーテル、ピロリジン、PEG、ポリアミド、またはジスルフィド結合を含む、実施形態1817の化合物。
実施形態1819. 前記リンカーがピロリジンを含まない、実施形態1817または1818の化合物。
実施形態1820. 前記リンカーが、以下のものである、実施形態1817~1819
のいずれかの化合物。
Figure 0007177127000460
実施形態1821. Tが、以下の式を有し、
Figure 0007177127000461
式中、
CMが、切断可能な部分であり、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、
実施形態1817~1820のいずれかの化合物。
実施形態1822. Tが、以下の式を有し、
Figure 0007177127000462
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、
実施形態1817~1821のいずれかの化合物。
実施形態1823. TまたはTがオリゴマー化合物を含む基であり、前記オリゴマー化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、実施形態1817~1822のいずれかの化合物。
実施形態1824. 前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなり、少なくとも1個のヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態1823の化合物。
実施形態1825. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、(4’-CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-(CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-C(CH)H-O-2’)二環式ヌクレオシド、およびモルフォリノの中から選択される少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1824の化合物。
実施形態1826. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との
間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含むギャップマー糖モチーフを有する、実施形態1824または1825のいずれかの化合物。
実施形態1827. 各5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、実施形態1826の化合物。
実施形態1828. 前記5’領域が2~5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなり、前記3’領域が2~5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなり、前記中央領域が8~10個の中央領域ヌクレオシドからなる、実施形態1825または1826のいずれかの化合物。
実施形態1829. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態1824~1828のいずれかの化合物。
実施形態1830. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1824~1829のいずれかの化合物。
実施形態1831. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合またはホスホジエステルヌクレオシド間結合のいずれかである、実施形態1824~1830のいずれかの化合物。
実施形態1832. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端で前記化合物の残りに結合される、実施形態1824~1831のいずれかの化合物。
実施形態1833. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端で前記化合物の残りに結合される、実施形態1824~1831のいずれかの化合物。
実施形態1834. 前記修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、実施形態1824~1833のいずれかの化合物。
実施形態1835. 前記修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖である、実施形態1824~1834のいずれかの実施形態の化合物。
実施形態1836. 前記修飾オリゴヌクレオチドが二本鎖である、実施形態1824~1834のいずれかの化合物。
実施形態1837. 前記修飾オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、実施形態1824~1836のいずれかの化合物。
実施形態1838. 前記修飾オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、実施形態1824~1836のいずれかの化合物。
実施形態1839. 前記修飾オリゴヌクレオチドが標的プレmRNAのスプライシング
を変化させる、実施形態1824~1836のいずれかの化合物。
実施形態1840. 前記修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に相補的である、実施形態1824~1839のいずれかの化合物。
実施形態1841. 前記標的核酸が、プレmRNA、マイクロRNA、または長い非コードRNAの中から選択される、実施形態1840の化合物。
実施形態1842. 前記修飾オリゴヌクレオチドが12~30個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1824~1841のいずれかの化合物。
実施形態1843. 前記修飾オリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1824~1841のいずれかの化合物。
実施形態1844. 前記修飾オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1824~1841のいずれかの化合物。
実施形態1845. 実施形態1817~1844のいずれかの化合物を動物に投与する方法。
実施形態1846. 代謝性障害を治療する方法であって、実施形態1817~1844のいずれかの化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
実施形態1847. 心血管障害を治療する方法であって、実施形態1817~1844のいずれかの化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
実施形態1848. 共役アンチセンス化合物を動物に投与することを含む方法であって、前記共役アンチセンス化合物が、ギャップマー糖モチーフを有する修飾オリゴヌクレオチドおよびGalNAcを含む共役体を含む、方法。
実施形態1849. 動物における細胞内の標的核酸の量または活性を低減させる方法であって、前記動物に、修飾オリゴヌクレオチドおよび共役体を含む共役アンチセンス化合物を投与することであって、前記修飾オリゴヌクレオチドがギャップマー糖モチーフを有し、前記共役体がGalNAcを含む、投与することを含み、それにより前記動物における前記細胞内の前記標的核酸の量または活性を低減させる、方法。
実施形態1850. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1848または1849の方法。
Figure 0007177127000463
実施形態1851. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1848または1849の方法。
Figure 0007177127000464
実施形態1852. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1848または1849の方法。
Figure 0007177127000465
実施形態1853. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1848または1849の方法。
Figure 0007177127000466
実施形態1854. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1848または1849の方法。
Figure 0007177127000467
実施形態1855. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1848または1849の方法。
Figure 0007177127000468
実施形態1856. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1848または1849の方法。
Figure 0007177127000469
実施形態1857. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1848または1849の方法。
Figure 0007177127000470
実施形態1858. 前記共役体が、以下の構造から選択される分岐基を有する、実施形態1848または1849の方法。
Figure 0007177127000471
Figure 0007177127000472
Figure 0007177127000473
または
Figure 0007177127000474
実施形態1859. 前記共役体が、以下の構造から選択されるリンカーを有し、
Figure 0007177127000475
式中、各nが、0、1、2、3、4、5、6、または7から独立して選択される、実施形態1848または1849の方法。
実施形態1860. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態1848~1859のいずれかの方法。
実施形態1861. 前記修飾ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1860の方法。
実施形態1862. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1860または1861の方法。
実施形態1863. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも2個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1860または1861の方法。
実施形態1864. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも3個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1860または1861の方法。
実施形態1865. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも4個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1860または1861の方法。
実施形態1866. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも5個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1860または1861の方法。
実施形態1867. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1860または1861の方法。
実施形態1868. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも7個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1860または1861の方法。
実施形態1869. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合およびホスホロチオエートヌクレオシド間結合から選択される、実施形態1848~1868のいずれかの方法。
実施形態1870. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1869の方法。
実施形態1871. 修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも80%相補的である、実施形態1848~1870のいずれかの方法。
実施形態1872. 修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも85%相補的である、実施形態1848~1870のいずれかの方法。
実施形態1873. 修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも90%相補的である、実施形態1848~1870のいずれかの方法。
実施形態1874. 修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して100%相補的である、実施形態1848~1870のいずれかの方法。
実施形態1875. 前記標的核酸が肝臓において発現される、実施形態1848~1874のいずれかの方法。
実施形態1876. 前記標的核酸が肝細胞において発現される、実施形態1848~1875のいずれかの方法。
実施形態1877. 前記標的核酸が、アンドロゲン受容体、アポリポタンパク質(a)、アポリポタンパク質B、アポリポタンパク質C-III、C反応性タンパク質、eIF-4E、第VII因子、第XI因子、グルココルチコイド受容体、グルカゴン受容体、タンパク質チロシンホスファターゼ1B、STAT3、およびトランスサイレチンの中から選択されるタンパク質をコードする、実施形態1848~1876のいずれかの方法。
実施形態1878. 細胞内のプレmRNA標的核酸のスプライシングを調節する方法であって、前記細胞を共役アンチセンス化合物と接触させることであって、前記共役アンチセンス化合物が修飾オリゴヌクレオチドおよび共役体を含み、前記共役体がGalNacを含む、接触させることを含み、それにより前記細胞内の前記プレmRNA標的核酸のスプライシングを調節する、方法。
実施形態1879. 前記プレmRNA標的核酸が肝細胞において発現される、実施形態1878の方法。
実施形態1880. 前記細胞が生体外に存在する、実施形態1878または1879の方法。
実施形態1881. 前記細胞が生体内に存在する、実施形態1878または1879の方法。
実施形態1882. 前記細胞が動物内に存在する、実施形態1878または1879の方法。
実施形態1883. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態1878~1882のいずれかの方法。
実施形態1884. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-O(CHOCH修飾を含む少なくとも1個のヌクレオシドを含む、実施形態1883の方法。
実施形態1885. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-OCH修飾を含む少なくとも1個のヌクレオシドを含む、実施形態1883または1884の方法。
実施形態1886. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の二環式ヌクレオシドを含む、実施形態1878~1885のいずれかの方法。
実施形態1887. (4’-CH-O-2’)BNAヌクレオシドを含む、実施形態1886の方法。
実施形態1888. (4’-(CH-O-2’)BNAヌクレオシドを含む、実施形態1886または1887の方法。
実施形態1889. (4’-C(CH)H-O-2’)BNAヌクレオシド、実施形態1886~1888のいずれかの実施形態の方法。
実施形態1890. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、実施形態1878~1889のいずれかの方法。
実施形態1891. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各修飾ヌクレオシドが同一の修飾を含む、実施形態1890の方法。
実施形態1892. 前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも2個の修飾ヌクレオシドが互いに異なる修飾を含む、実施形態1890の方法。
実施形態1893. 前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオチドである、実施形態1878~1889または1891~1892のいずれかの方法。
実施形態1894. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1878~1893のいずれかの方法。
Figure 0007177127000476
実施形態1895. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1878~1893のいずれかの方法。
Figure 0007177127000477
実施形態1896. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1878~1893のいずれかの方法。
Figure 0007177127000478
実施形態1897. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1878~1893のいずれかの方法。
Figure 0007177127000479
実施形態1898. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1878~1893のいずれかの方法。
Figure 0007177127000480
実施形態1899. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1878~1893のいずれかの方法。
Figure 0007177127000481
実施形態1900. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1878~1893のいずれかの方法。
Figure 0007177127000482
実施形態1901. 前記共役体が、以下の構造を含む、実施形態1878~1893のいずれかの方法。
Figure 0007177127000483
実施形態1902. 前記共役体が、以下の構造から選択される分岐基を有する、実施形態1878~1893のいずれかの方法。
Figure 0007177127000484
Figure 0007177127000485
Figure 0007177127000486
または
Figure 0007177127000487
実施形態1903. 前記共役体が、以下の構造から選択されるリンカーを有し、
Figure 0007177127000488
式中、各nが、0、1、2、3、4、5、6、または7から独立して選択される、実施形態1878~1893のいずれかの方法。
実施形態1904. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシド
間結合を含む、実施形態1878~1903のいずれかの方法。
実施形態1905. 前記修飾ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1904の方法。
実施形態1906. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1904または1905の方法。
実施形態1907. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも2個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1904または1905の方法。
実施形態1908. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも3個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1904または1905の方法。
実施形態1909. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも4個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1904または1905の方法。
実施形態1910. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも5個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1904または1905の方法。
実施形態1911. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1904または1905の方法。
実施形態1912. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも7個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1904または1905の方法。
実施形態1913. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合およびホスホロチオエートヌクレオシド間結合から選択される、実施形態1904または1905のいずれかの方法。
実施形態1914. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態1913の方法。
実施形態1915. 前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシドがモルフォリノヌクレオシドである、実施形態1878~1913のいずれかの方法。
実施形態1916. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドがモルフォリノヌクレオシドである、実施形態1878~1913のいずれかの方法。
実施形態1917. アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含むプロドラッグであって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがRNAe Hベースのアンチセンスオリゴヌクレオチドである、プロドラッグ。
実施形態1918. 前記RNase Hベースのアンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマーである、実施形態1917のプロドラッグ。
実施形態1919. 前記共役体が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端で前記アンチセンスオリゴヌクレオチドに結合される、実施形態1917または1918のプロドラッグ。
実施形態1920. アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含むプロドラッグであって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがプレmRNAのスプライシングを変化させるアンチセンスオリゴヌクレオチドである、プロドラッグ。
実施形態1921. 前記プロドラッグの生体内代謝が、前記共役体を欠く前記アンチセンスオリゴヌクレオチドをもたらす、実施形態1917~1920のいずれかのプロドラッグ。
実施形態1922. 前記プロドラッグが、前記共役体を欠く前記アンチセンスオリゴヌクレオチドよりも生体内で少なくとも5倍強力である、実施形態1917~1921のいずれかのプロドラッグ。
実施形態1923. 前記プロドラッグが、前記共役体を欠く前記アンチセンスオリゴヌクレオチドよりも生体内で少なくとも8倍強力である、実施形態1917~1921のいずれかのプロドラッグ。
実施形態1924. 前記プロドラッグが、前記共役体を欠く前記アンチセンスオリゴヌクレオチドよりも生体内で少なくとも10倍強力である、実施形態1917~1921のいずれかのプロドラッグ。
実施形態1925. 実施形態1917~1924のいずれかのプロドラッグを動物に投与することを含む方法。
実施形態1926. アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含む化合物であって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマー糖モチーフを有し、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、マウスRafキナーゼC、マウスFas受容体、またはヒトホスファターゼ・テンシンホモログ(PTEN)の中から選択される標的核酸に対して100%相補的ではない、化合物。
実施形態1927. 前記共役体が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、実施形態1926の化合物。
実施形態1928. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの前記ヌクレオシド間結合が、少なくとも1個のホスホジエステル結合および少なくとも1個のホスホロチオエート結合を含む、実施形態1926または1927の化合物。
実施形態1929. 前記共役基がコランを含まない、実施形態1926~1928のいずれかの化合物。
実施形態1930. 前記分岐基が四級炭素またはアミノ酸を含む、実施形態1926~1929のいずれかの化合物。
実施形態1931. アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含む化合物であって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマー糖モチーフを有し、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、代謝性障害または心血管障害の前記治療のために調節され得る標的核酸に相補的である、化合物。
実施形態1932. 前記共役体が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、実施形態1931の化合物。
実施形態1933. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの前記ヌクレオシド間結合が、少なくとも1個のホスホジエステル結合および少なくとも1個のホスホロチオエート結合を含む、実施形態1931または1932のいずれかの化合物。
実施形態1934. 前記共役基がコランを含まない、実施形態1931~1933のいずれかの化合物。
実施形態1935. 前記分岐基が四級炭素またはアミノ酸を含む、実施形態1931~1934のいずれかの化合物。
実施形態1936. アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含む化合物であって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステル結合および少なくとも1個のホスホロチオエート結合を含む、化合物。
実施形態1937. 前記共役体が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、実施形態1936の化合物。
実施形態1938. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマー糖モチーフを有する、実施形態1936または1937のいずれかの化合物。
実施形態1939. 前記共役基がコランを含まない、実施形態1936~1938のいずれかの化合物。
実施形態1940. 前記分岐基が四級炭素またはアミノ酸を含む、実施形態1936~1939のいずれかの化合物。
実施形態1941. アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含む化合物であって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記共役基がコランを含まず、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマー糖モチーフを有する、化合物。
実施形態1942. 前記共役体が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、実施形態1941の化合物。
実施形態1943. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの前記ヌクレオシド間結合が、少なくとも1個のホスホジエステル結合および少なくとも1個のホスホロチオエート結合を含む、実施形態1941または1942のいずれかの化合物。
実施形態1944. 前記分岐基が四級炭素またはアミノ酸を含む、実施形態1941~1943のいずれかの化合物。
実施形態1945. アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含む化合物であって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマー糖モチーフを有し、前記分岐基が四級炭素またはアミノ酸を含む、化合物。
実施形態1946. 前記共役体が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、実施形態1945の化合物。
実施形態1947. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの前記ヌクレオシド間結合が、少なくとも1個のホスホジエステル結合および少なくとも1個のホスホロチオエート結合を含む、実施形態1945または1946のいずれかの化合物。
実施形態1948. 前記共役基がコランを含まない、実施形態1945~1957のいずれかの化合物。
実施形態1949. アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含む化合物であって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがプレmRNAのスプライシングを変化させる、化合物。
実施形態1950. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1926~1949のいずれかの化合物。
実施形態1951. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1926~1949のいずれかの化合物。
実施形態1952. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1926~1949のいずれかの化合物。
実施形態1953. 前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1926~1949のいずれかの方法。
実施形態1954. 前記修飾オリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1926~1949のいずれかの方法。
実施形態1955. 前記修飾オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態1848~1916のいずれかの方法。
実施形態1956. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000489
式中、Xが、6~11個の連続結合原子の置換または非置換テザーである、化合物。
実施形態1957. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000490
式中、Xが、10個の連続結合原子の置換または非置換テザーである、化合物。
実施形態1958. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000491
式中、Xが、4~11個の連続結合原子の置換または非置換テザーであり、前記テザーが、正確に1個のアミド結合を含む、化合物。
実施形態1959. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000492
式中、YおよびZが、C~C12置換もしくは非置換アルキル、アルケニル、もしくはアルキニル基、またはエーテル、ケトン、アミド、エステル、カルバメート、アミン、ピペリジン、ホスフェート、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、トリアゾール、ピロリジン、ジスルフィド、もしくはチオエーテルを含む基から独立して選択される、化合物。
実施形態1960. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000493
式中、YおよびZが、C~C12置換もしくは非置換アルキル基、または正確に1個のエーテルもしくは正確に2個のエーテル、アミド、アミン、ピペリジン、ホスフェート、ホスホジエステル、もしくはホスホロチオエートを含む基から独立して選択される、化合物。
実施形態1961. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000494
式中、YおよびZが、C~C12置換または非置換アルキル基から独立して選択される、化合物。
実施形態1962. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000495
式中、mおよびnが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、および12から独立して選択される、化合物。
実施形態1963. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000496
式中、mが、4、5、6、7、または8であり、nが、1、2、3、または4である、化合物。
実施形態1964. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000497
式中、Xが、4~13個の連続結合原子の置換または非置換テザーであり、Xが、エーテル基を含まない、化合物。
実施形態1965. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000498
式中、Xが、8個の連続結合原子の置換または非置換テザーであり、Xが、エーテル基を含まない、化合物。
実施形態1966. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000499
式中、Xが、4~13個の連続結合原子の置換または非置換テザーであり、前記テザーが、正確に1個のアミド結合を含み、Xが、エーテル基を含まない、化合物。
実施形態1967. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000500
式中、Xが、4~13個の連続結合原子の置換または非置換テザーであり、前記テザーが、アミド結合および置換または非置換C~C11アルキル基からなる、化合物。
実施形態1968. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000501
式中、Yが、C~C12置換もしくは非置換アルキル、アルケニル、もしくはアルキニル基、またはエーテル、ケトン、アミド、エステル、カルバメート、アミン、ピペリジン、ホスフェート、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、トリアゾール、ピロリジン、ジスルフィド、もしくはチオエーテルを含む基から選択される、化合物。
実施形態1969. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000502
式中、Yが、C~C12置換もしくは非置換アルキル基、またはエーテル、アミン、ピペリジン、ホスフェート、ホスホジエステル、もしくはホスホロチオエートを含む基から選択される、化合物。
実施形態1970. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000503
式中、Yが、C~C12置換または非置換アルキル基から選択される、化合物。
実施形態1971. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000504
式中、nが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12である、化合物。
実施形態1972. 以下の構造を有する細胞標的部分を含む化合物であって、
Figure 0007177127000505
式中、nが、4、5、6、7、または8である、化合物。
実施形態1973. 共役基およびアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、前記共役基が正確に1個のGalNAcを含み、前記共役基が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1974. 共役基およびアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、前記共役基が正確に2個のGalNAcリガンドを含み、前記共役基が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1975. 共役基およびアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、前記共役基が正確に1個のGalNAcを含み、前記共役基が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの3’末端に結合される、共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1976. 共役基およびアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、前記共役基が正確に2個のGalNAcリガンドを含み、前記共役基が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの3’末端に結合される、共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1977. 共役基およびアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、前記共役基が1~4個のGalNAcリガンドを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマーである、共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1978. 前記共役基が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、実施形態1977の共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1979. 前記共役基がジスルフィドを含まないリンカーを含む、実施形態1977または1978のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1980. 前記共役基がチオエーテルを含まないリンカーを含む、実施形態1977~1979のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1981. 前記共役基がピロリジンを含まないリンカーを含む、実施形態1977~1980のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1982. 前記共役基が多環式部分を含まない、実施形態1977~1981のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1983. 前記共役基が多環式部分を含まない分岐基を含む、実施形態1977~1981のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1984. 前記共役基が脂質部分を含まないリンカーを含む、実施形態1977~1983のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1985. 前記共役基と前記アンチセンスオリゴヌクレオチドとの結合がホスホロチオエート基ではない、実施形態1977~1984のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1986. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含み、前記修飾ヌクレオシドが2’-O-メトキシエチル(MOE)修飾ヌクレオシドである、実施形態1977~1985のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1987. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含み、前記修飾ヌクレオシドがcEt修飾ヌクレオシドである、実施形態1977~1986のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1988. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、少なくとも1個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合および少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態1977~1987のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1989. 前記ギャップマーのウィングが少なくとも2つの異なる糖修飾を含む、実施形態1977~1987のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1990. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの配列が配列番号17~159から選択される、実施形態1977~1989のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1991. 共役基およびアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、前記共役基が実施形態1956~1972のいずれかの細胞標的部分を含む、共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1992. 共役基およびアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、前記共役基が実施形態1956~1972のいずれかの細胞標的部分を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマーを含む、共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1993. 共役基およびアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、前記共役基が実施形態1956~1972のいずれかの細胞標的部分を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの前記糖が均一に修飾される、共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1994. 共役基およびアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、前記共役基が実施形態1956~1972のいずれか
の細胞標的部分を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが一本鎖である、共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1995. 共役基およびアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、前記共役基が実施形態1956~1972のいずれかの細胞標的部分を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが二本鎖である、共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1996. 前記共役体が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、実施形態1991~1995のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1997. 前記共役体が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの3’末端に結合される、実施形態1991~1995のいずれかの共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
実施形態1998. 共役基およびアンチセンスオリゴヌクレオチドを含む共役アンチセンスオリゴヌクレオチドであって、前記共役基が1~4個のGalNAcリガンドを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの前記糖が均一に修飾される、共役アンチセンスオリゴヌクレオチド。
特定の変数のうちの2つ以上(例えば、2つ以上の「m」または「n」)を有する実施形態において、別途示されない限り、各々のそのような特定の変数は、独立して選択される。したがって、2つ以上のnを有する構造の場合、各nは、独立して選択さるため、互いに同一であり得るか、同一であり得ない。
前記一般的な説明および以下の詳細な説明は両方とも例示的かつ説明的であるのみであって、本開示を限定するものではないことを理解されたい。本明細書において、単数形の使用は、別途明確に記述されない限り、複数形を含む。本明細書で使用されるとき、「または(or)」の使用は、別途記述されない限り、「および/または(and/or)」を意味する。さらに、「~を含む(including)」という用語、ならびに「~を含む(includes)」および「含まれる(included)」等の他の形態の使用は、限定的ではない。また、「要素」または「成分」等の用語は、別途明確に記述されない限り、1つのユニットを含む複数の要素および複数の成分と2つ以上のサブユニットを含む複数の要素および複数の成分の両方を包含する。
本明細書で使用される節の見出しは、構成目的のみのためであり、記載される主題を限定するものと解釈されるべきではない。特許、特許出願、記事、書籍、および論文を含むが、これらに限定されない本出願において引用されるすべての文書または文書の一部は、参照によりそれらの全体があらゆる目的のために本明細書に明確に組み込まれる。
A. 定義
特定の定義が提供されない限り、本明細書に記載される分析化学、合成有機化学、ならびに医化学および製薬化学に関連して用いられる学名、ならびにそれらの手順および技法は、周知であり、当技術分野で一般に使用されるものである。標準の技法は、化学合成および化学分析において使用され得る。ある特定のそのような技法および手順は、例えば、“Carbohydrate Modifications in Antisense
Research”Edited by Sangvi and Cook,American Chemical Society,Washington D.C.,19
94、“Remington’s Pharmaceutical Sciences,”Mack Publishing Co.,Easton,Pa.,21st edition,2005、および“Antisense Drug Technology,Principles,Strategies,and Applications”Edited by Stanley T.Crooke,CRC Press,Boca
Raton,Florida、ならびにSambrook et al.,“Molecular Cloning,A laboratory Manual,”2nd Edition,Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989において見出すことができ、これらは、あらゆる目的のために参照により本明細書に組み込まれる。許容される場合、本開示を通して参照されるすべての特許、出願、公開された出願、および他の出版物、ならびに他のデータは、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
別途示されない限り、以下の用語は、以下の意味を有する。
本明細書で使用されるとき、「ヌクレオシド」とは、核酸塩基部分および糖部分を含む化合物を意味する。ヌクレオシドには、天然に存在するヌクレオシド(DNAおよびRNAに見られるもの)ならびに修飾ヌクレオシドが含まれるが、これらに限定されない。ヌクレオシドは、ホスフェート部分に連結され得る。
本明細書で使用されるとき、「化学修飾」とは、天然に存在する対応物と比較した場合の化合物の化学的相違を意味する。オリゴヌクレオチド化学修飾は、ヌクレオシド修飾(糖部分修飾および核酸塩基修飾を含む)ならびにヌクレオシド間結合修飾を含む。オリゴヌクレオチドに関して、化学修飾は、核酸塩基配列においてのみ相違を含まない。
本明細書で使用されるとき、「フラノシル」とは、4個の炭素原子と1個の酸素原子とを含む5員環を含む構造を意味する。
本明細書で使用されるとき、「天然に存在する糖部分」とは、天然に存在するRNAに見られるリボフラノシルまたは天然に存在するDNAに見られるデオキシリボフラノシルを意味する。
本明細書で使用されるとき、「糖部分」とは、ヌクレオシドの天然に存在する糖部分または修飾糖部分を意味する。
本明細書で使用されるとき、「修飾糖部分」とは、置換糖部分または糖代理物を意味する。
本明細書で使用されるとき、「置換糖部分」とは、天然に存在する糖部分ではないフラノシルを意味する。置換糖部分には、2’位、3’位、5’位、および/または4’位に置換基を含むフラノシルが含まれるが、これらに限定されない。ある特定の置換糖部分は、二環式糖部分である。
本明細書で使用されるとき、「2’-置換糖部分」とは、HまたはOH以外の2’位に置換基を含むフラノシルを意味する。別途示されない限り、2’-置換糖部分は、二環式糖部分ではない(すなわち、2’-置換糖部分の2’-置換基は、フラノシル環の別の原子への橋を形成しない)。
本明細書で使用されるとき、「MOE」とは、-OCHCHOCHを意味する。
本明細書で使用されるとき、「2’-Fヌクレオシド」は、2’位にフッ素を含む糖を含むヌクレオシドを指す。別途示されない限り、2’-Fヌクレオシドにおけるフッ素は、(天然リボースのOHを置換する)リボ位に存在する。
本明細書で使用されるとき、「糖代理物」という用語は、結果として生じるヌクレオシドサブユニットが一緒に結合し、かつ/または他のヌクレオシドに結合して、相補的なオリゴマー化合物にハイブリダイズすることができるオリゴマー化合物を形成することができるように、フラノシルを含まず、かつヌクレオシドの天然に存在する糖部分を置換することができる構造を意味する。そのような構造は、フラノシル(例えば、4、6、もしくは7員環)とは異なる数の原子、フラノシルの酸素の非酸素原子(例えば、炭素、硫黄、もしくは窒素)への置換、または原子の数の変化および酸素の置換の両方を含む環を含む。そのような構造はまた、置換糖部分(例えば、さらなる置換基を任意に含む6員炭素環式二環式糖代理物)について記載された置換に対応する置換も含み得る。糖代理物はまた、より複雑な糖置換物(例えば、ペプチド核酸の非環系)も含む。糖代理物には、モルフォリノ、シクロヘキセニル、およびシクロヘキシトールが含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用されるとき、「二環式糖部分」とは、4~7員環の2個の原子をつないで第2の環を形成して、二環式構造をもたらす橋を含む4~7員環(フラノシルを含むが、これに限定されない)を含む修飾糖部分を意味する。ある特定の実施形態において、4~7員環は、糖環である。ある特定の実施形態において、4~7員環は、フラノシルである。ある特定のそのような実施形態において、橋は、フラノシルの2’-炭素と4’-炭素とをつなぐ。
本明細書で使用されるとき、「ヌクレオチド」とは、ホスフェート結合基をさらに含むヌクレオシドを意味する。本明細書で使用されるとき、「連結したヌクレオシド」は、ホスフェート結合によって連結されてもされなくてもよく、それ故に、「連結したヌクレオチド」を含むが、これに限定されない。本明細書で使用されるとき、「連結したヌクレオシド」は、連続した配列において連結されるヌクレオシドである(すなわち、さらなるヌクレオシドは、連結される配列間に存在しない)。
本明細書で使用されるとき、「核酸塩基」とは、糖部分に連結されてオリゴヌクレオチドに組み込むことができるヌクレオシドを作成することができる原子団を意味し、この原子団は、別のオリゴヌクレオチドまたは核酸の相補的な天然に存在する核酸塩基と結合することができる。核酸塩基は、天然に存在し得るか、または修飾され得る。
本明細書で使用されるとき、「非修飾核酸塩基」または「天然に存在する核酸塩基」という用語は、RNAまたはDNAの天然に存在する複素環式核酸塩基を意味し、プリンは、アデニン(A)およびグアニン(G)をベースとし、ピリミジンは、チミン(T)、シトシン(C)(5-メチルCを含む)、およびウラシル(U)をベースとする。
本明細書で使用されるとき、「修飾核酸塩基」とは、天然に存在する核酸塩基ではない任意の核酸塩基を意味する。
本明細書で使用されるとき、「修飾ヌクレオシド」とは、天然に存在するRNAまたはDNAヌクレオシドと比較して、少なくとも1つの化学修飾を含むヌクレオシドを意味する。修飾ヌクレオシドは、修飾糖部分および/または修飾核酸塩基を含む。
本明細書で使用されるとき、「二環式ヌクレオシド」または「BNA」とは、二環式糖部分を含むヌクレオシドを意味する。
本明細書で使用されるとき、「拘束エチルヌクレオシド」または「cEt」とは、4’-CH(CH)-O-2’橋を含む二環式糖部分を含むヌクレオシドを意味する。
本明細書で使用されるとき、「ロックド酸ヌクレオシド」または「LNA」とは、4’-CH-O-2’橋を含む二環式糖部分を含むヌクレオシドを意味する。
本明細書で使用されるとき、「2’-置換ヌクレオシド」とは、HまたはOH以外の2’位に置換基を含むヌクレオシドを意味する。別途示されない限り、2’-置換ヌクレオシドは、二環式ヌクレオシドではない。
本明細書で使用されるとき、「デオキシヌクレオシド」とは、天然に存在するデオキシリボヌクレオシド(DNA)に見られる2’-Hフラノシル糖部分を含むヌクレオシドを意味する。ある特定の実施形態において、2’-デオキシヌクレオシドは、修飾核酸塩基を含み得るか、またはRNA核酸塩基(例えば、ウラシル)を含み得る。
本明細書で使用されるとき、「オリゴヌクレオチド」とは、複数個の連結したヌクレオシドを含む化合物を意味する。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、1個以上の非修飾リボヌクレオシド(RNA)および/または非修飾デオキシリボヌクレオシド(DNA)および/または1個以上の修飾ヌクレオシドを含む。
本明細書で使用されるとき、「オリゴヌクレオシド」とは、ヌクレオシド間結合のうちのいずれもリン原子を含有しないオリゴヌクレオチドを意味する。本明細書で使用されるとき、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオシドを含む。
本明細書で使用されるとき、「修飾オリゴヌクレオチド」とは、少なくとも1個の修飾ヌクレオシドおよび/または少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合を含むオリゴヌクレオチドを意味する。
本明細書で使用されるとき、「結合」または「結合基」とは、2個以上の他の原子団を一緒に結合する原子団を意味する。
本明細書で使用されるとき、「ヌクレオシド間結合」とは、オリゴヌクレオチド中の隣接したヌクレオシド間の共有結合を意味する。
本明細書で使用されるとき、「天然に存在するヌクレオシド間結合」とは、3’から5’へのホスホジエステル結合を意味する。
本明細書で使用されるとき、「修飾ヌクレオシド間結合」とは、天然に存在するヌクレオシド間結合以外の任意のヌクレオシド間結合を意味する。
本明細書で使用されるとき、「末端ヌクレオシド間結合」とは、オリゴヌクレオチドまたはその定義された領域の最後の2個のヌクレオシド間の結合を意味する。
本明細書で使用されるとき、「リン結合基」とは、リン原子を含む結合基を意味する。リン結合基には、以下の式を有する基が含まれるが、これに限定されず、
Figure 0007177127000506
式中、
およびRが各々、独立して、O、S、CH、NH、またはNJであり、Jが、C~Cアルキルまたは置換C~Cアルキルであり、
が、OまたはSであり、
が、OH、SH、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルコキシ、置換C~Cアルコキシ、アミノ、または置換アミノであり、
が、Rが、OまたはSである。
リン結合基には、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホネート、ホスホラミデート、ホスホロチオアミデート、チオノアルキルホスホネート、ホスホトリエステル、チオノアルキルホスホトリエステル、およびボラノホスフェートが含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用されるとき、「ヌクレオシド間リン結合基」とは、2個のヌクレオシドを直接結合するリン結合基を意味する。
本明細書で使用されるとき、「非ヌクレオシド間リン結合基」とは、2個のヌクレオシドを直接結合しないリン結合基を意味する。ある特定の実施形態において、非ヌクレオシド間リン結合基は、ヌクレオシドをヌクレオシド以外の基に結合させる。ある特定の実施形態において、非ヌクレオシド間リン結合基は、2個の基を結合するが、これらはいずれもヌクレオシドではない。
本明細書で使用されるとき、「中性結合基」とは、荷電されていない結合基を意味する。中性結合基には、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、MMI(-CH-N(CH)-O-)、アミド-3(-CH-C(=O)-N(H)-)、アミド-4(-CH-N(H)-C(=O)-)、ホルムアセタール(-O-CH-O-)、およびチオホルムアセタール(-S-CH-O-)が含まれるが、これらに限定されない。さらに、中性結合基には、シロキサン(ジアルキルシロキサン)、カルボン酸エステル、カルボキサミド、硫化物、スルホン酸エステル、およびアミドを含む非イオン性結合が含まれる(例えば、Carbohydrate Modifications in Antisense Research;Y.S.Sanghvi and P.D.Cook
Eds.ACS Symposium Series 580;Chapters 3
and 4(pp.40-65)を参照されたい)。さらに、中性結合基は、混合されたN、O、S、およびCH成分部分を含む非イオン性結合を含む。
本明細書で使用されるとき、「ヌクレオシド間中性結合基」とは、2個のヌクレオシドを直接結合する中性結合基を意味する。
本明細書で使用されるとき、「非ヌクレオシド間中性結合基」とは、2個のヌクレオシドを直接結合しない中性結合基を意味する。ある特定の実施形態において、非ヌクレオシド間中性結合基は、ヌクレオシドをヌクレオシド以外の基に結合させる。ある特定の実施形態において、非ヌクレオシド間中性結合基は、2個の基を結合するが、これらはいずれもヌクレオシドではない。
本明細書で使用されるとき、「オリゴマー化合物」とは、2つ以上の下部構造を含む重合体構造を意味する。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物は、オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物は、1個以上の共役基および/または末端基を含む。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物は、オリゴヌクレオチドからなる。オリゴマー化合物はまた、天然に存在する核酸も含む。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物は、1個以上の連結した単量体サブユニットの骨格を含み、各連結した単量体サブユニットは、複素環式塩基部分に直接的または間接的に結合される。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物はまた、複素環式塩基部分に連結されない単量体サブユニットも含み得、それにより脱塩基部位を提供し得る。ある特定の実施形態において、単量体サブユニット、糖部分または代理物、および複素環式塩基部分を結び付ける結合は、独立して修飾され得る。ある特定の実施形態において、複素環式塩基を含み得るか、または含み得ない結合糖単位は、ペプチド核酸における単量体等の模倣物と置換され得る。
本明細書で使用されるとき、「末端基」とは、オリゴヌクレオチドの3’末端もしくは5’末端のいずれか、またはこれら両方に結合される1個以上の原子を意味する。ある特定の実施形態において、末端基は、共役基である。ある特定の実施形態において、末端基は、1個以上の末端基ヌクレオシドを含む。
本明細書で使用されるとき、「共役体」または「共役基」とは、オリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物に結合される原子または原子団を意味する。概して、共役基は、薬力学的特性、薬物動態学的特性、結合特性、吸収特性、細胞分布特性、細胞取り込み特性、電荷特性、および/またはクリアランス特性を含むが、これらに限定されない、それらが結合する化合物の1つ以上の特性を修飾する。
本明細書で使用されるとき、共役基との関連での「共役リンカー」または「リンカー」とは、任意の原子または原子団を含む共役基の一部を意味し、(1)オリゴヌクレオチドを共役基の別の部分と共有結合させるか、または(2)共役基の2個以上の部分を共有結合させる。
共役基は、本明細書においてラジカルとして示され、アンチセンスオリゴヌクレオチド等のオリゴマー化合物への共有結合を形成するための結合を提供する。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物における結合点は、オリゴマー化合物の3’末端ヌクレオシドの3’-ヒドロキシル基の3’-酸素原子である。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物における結合点は、オリゴマー化合物の5’末端ヌクレオシドの5’-ヒドロキシル基の5’-酸素原子である。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物への結合を形成するための結合は、切断可能な結合である。ある特定のそのような実施形態において、そのような切断可能な結合は、切断可能な部分のすべてまたは一部を構成する。
ある特定の実施形態において、共役基は、切断可能な部分(例えば、切断可能な結合または切断可能なヌクレオシド)およびGalNAcクラスター部分等の炭水化物クラスター部分を含む。そのような炭水化物クラスター部分は、標的部分と、任意に、共役リンカーを含む。ある特定の実施形態において、炭水化物クラスター部分は、リガンドの数および同一性によって特定される。例えば、ある特定の実施形態において、炭水化物クラスター部分は、3個のGalNAc基を含み、「GalNAc」と表記される。ある特定の実施形態において、炭水化物クラスター部分は、4個のGalNAc基を含み、「GalNAc」と表記される。特定の炭水化物クラスター部分(特異的テザー、分岐、および共役リンカー基を有する)は、本明細書に記載され、ローマ数字、続いて下付き文字「a
」で表記される。したがって、「GalNac3-1」は、3個のGalNac基、ならびに特異的に特定されたテザー、分岐、および結合基を有する共役基の特定の炭水化物クラスター部分を指す。そのような炭水化物クラスター断片は、切断可能な結合または切断可能なヌクレオシド等の切断可能な部分を介してオリゴマー化合物に結合される。
本明細書で使用されるとき、「切断可能な部分」とは、生理学的条件下で切断され得る結合または基を意味する。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、エンドソームまたはリソソーム等の細胞または細胞内コンパートメント内で切断される。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ヌクレアーゼ等の内因性酵素によって切断される。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、1個、2個、3個、4個、または4個以上の切断可能な結合を有する原子団を含む。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスホジエステル結合である。
本明細書で使用されるとき、「切断可能な結合」とは、破壊され得る任意の化学結合を意味する。ある特定の実施形態において、切断可能な結合は、アミド、ポリアミド、エステル、エーテル、ホスホジエステルの一方もしくは両方のエステル、リン酸エステル、カルバメート、ジスルフィド、またはペプチドの中から選択される。
本明細書で使用されるとき、「炭水化物クラスター」とは、足場またはリンカー基に結合される1個以上の炭水化物残基を有する化合物を意味する(例えば、炭水化物共役クラスターの例として、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Maier et al.,“Synthesis of Antisense Oligonucleotides Conjugated to a Multivalent Carbohydrate Cluster for Cellular Targeting,”Bioconjugate Chemistry,2003,(14):18-29、またはRensen et al.,“Design and Synthesis of Novel N-Acetylgalactosamine-Terminated Glycolipids for Targeting of Lipoproteins to the Hepatic Asiaglycoprotein Receptor,”J.Med.Chem.2004、(47):5798-5808を参照のこと)。
本明細書で使用されるとき、「修飾炭水化物」とは、天然に存在する炭水化物と比較して、1つ以上の化学修飾を有する任意の炭水化物を意味する。
本明細書で使用されるとき、「炭水化物誘導体」とは、出発物質または中間体として炭水化物を用いて合成され得る任意の化合物を意味する。
本明細書で使用されるとき、「炭水化物」とは、天然に存在する炭水化物、修飾炭水化物、または炭水化物誘導体を意味する。
本明細書で使用されるとき、「保護基」とは、当業者に既知の任意の化合物または保護基を意味する。保護基の非限定的な例は、“Protective Groups in
Organic Chemistry”,T.W.Greene,P.G.M.Wuts,ISBN 0-471-62301-6,John Wiley & Sons,Inc,New Yorkにおいて見出され得、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用されるとき、「一本鎖」とは、その相補体にハイブリダイズされず、かつ安定した自己二本鎖を形成するのに十分な自己相補性を欠くオリゴマー化合物を意味する。
本明細書で使用されるとき、「二本鎖」とは、互いにハイブリダイズされるオリゴマー化合物の対またはヘアピン構造を形成する単一の自己相補的なオリゴマー化合物を意味する。ある特定の実施形態において、二本鎖オリゴマー化合物は、第1および第2のオリゴマー化合物を含む。
本明細書で使用されるとき、「アンチセンス化合物」とは、オリゴヌクレオチドを含むか、またはそれからなる化合物を意味し、その少なくとも一部は、それがハイブリダイズすることができる標的核酸に相補的であり、少なくとも1つのアンチセンス活性をもたらす。
本明細書で使用されるとき、「アンチセンス活性」とは、アンチセンス化合物のその標的核酸へのハイブリダイゼーションに起因する任意の検出可能および/または測定可能な変化を意味する。ある特定の実施形態において、アンチセンス活性は、標的核酸転写物(例えば、mRNA)の量または活性の調節を含む。ある特定の実施形態において、アンチセンス活性は、プレmRNAのスプライシングの調節を含む。
本明細書で使用されるとき、「RNase Hベースのアンチセンス化合物」とは、アンチセンス化合物のアンチセンス活性の少なくとも一部が、アンチセンス化合物の標的核酸へのハイブリダイゼーションおよびその後のRNase Hによる標的核酸の切断に起因するアンチセンス化合物を意味する。
本明細書で使用されるとき、「RISCベースのアンチセンス化合物」とは、アンチセンス化合物のアンチセンス活性の少なくとも一部が、RNA誘導サイレンシング複合体(RISC)に起因するアンチセンス化合物を意味する。
本明細書で使用されるとき、「検出」または「測定」とは、検出または測定のための試験またはアッセイが実行されることを意味する。そのような検出および/または測定は、ゼロの値をもたらし得る。したがって、検出または測定のための試験が活性なし(ゼロの活性)の知見をもたらす場合、活性を検出または測定するステップは、それでもやはり実行されている。
本明細書で使用されるとき、「検出可能および/または測定可能な活性」とは、ゼロではない統計的に有意な活性を意味する。
本明細書で使用されるとき、「本質的に不変」とは、はるかに変化する別のパラメータと特に比較して、特定のパラメータに変化がほとんどまたは全くないことを意味する。ある特定の実施形態において、あるパラメータが5%未満変化するとき、そのパラメータは、本質的に不変である。ある特定の実施形態において、あるパラメータが2倍未満変化する場合、そのパラメータは、本質的に不変である一方で、別のパラメータは、少なくとも10倍変化する。例えば、ある特定の実施形態において、アンチセンス活性は、標的核酸の量の変化である。ある特定のそのような実施形態において、非標的核酸の量の変化が標的核酸の量の変化よりもはるかに小さい場合、それは本質的に不変であるが、変化がゼロである必要はない。
本明細書で使用されるとき、「発現」とは、遺伝子が最終的にタンパク質をもたらす工程を意味する。発現には、転写、転写後修飾(例えば、スプライシング、ポリアデニル化、5’-キャップの付加)、および翻訳が含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用されるとき、「標的核酸」とは、アンチセンス化合物がハイブリダイズ
して所望のアンチセンス活性をもたらすよう意図される核酸分子を意味する。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、生理学的条件下でハイブリダイゼーションを可能にするのに十分なそれらの標的核酸に対する相補性を有する。
本明細書で使用されるとき、核酸塩基に関して「核酸塩基相補性」または「相補性」とは、別の核酸塩基と塩基対合することができる核酸塩基を意味する。例えば、DNAにおいて、アデニン(A)は、チミン(T)に相補的である。例えば、RNAにおいて、アデニン(A)は、ウラシル(U)に相補的である。ある特定の実施形態において、相補的核酸塩基とは、その標的核酸の核酸塩基と塩基対合することができるアンチセンス化合物の核酸塩基を意味する。例えば、アンチセンス化合物のある特定の位置の核酸塩基が、標的核酸のある特定の位置の核酸塩基と水素結合することができる場合、オリゴヌクレオチドと標的核酸との間の水素結合の位置は、その核酸塩基対において相補的であると見なされる。ある特定の修飾を含む核酸塩基は、対応する核酸塩基と対合する能力を維持し得、それ故に、依然として核酸塩基相補性を有することができる。
本明細書で使用されるとき、核酸塩基に関して「非相補的な」とは、互いに水素結合を形成しない核酸塩基の対を意味する。
本明細書で使用されるとき、オリゴマー化合物(例えば、連結したヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、または核酸)に関して「相補的な」とは、そのようなオリゴマー化合物またはそれらの領域が核酸塩基相補性を介して別のオリゴマー化合物またはそれらの領域にハイブリダイズする能力を意味する。相補的なオリゴマー化合物は、各ヌクレオシドで核酸塩基相補性を有する必要はない。むしろ、いくつかのミスマッチが許容される。ある特定の実施形態において、相補的なオリゴマー化合物または領域は、核酸塩基の70%で相補的である(70%相補的である)。ある特定の実施形態において、相補的なオリゴマー化合物または領域は、80%相補的である。ある特定の実施形態において、相補的なオリゴマー化合物または領域は、90%相補的である。ある特定の実施形態において、相補的なオリゴマー化合物または領域は、95%相補的である。ある特定の実施形態において、相補的なオリゴマー化合物または領域は、100%相補的である。
本明細書で使用されるとき、「ミスマッチ」とは、第1および第2のオリゴマー化合物が整列するときに、第2のオリゴマー化合物の対応する位置で核酸塩基と対合することができない第1のオリゴマー化合物の核酸塩基を意味する。第1および第2のオリゴマー化合物のいずれかまたは両方ともにオリゴヌクレオチドであり得る。
本明細書で使用されるとき、「ハイブリダイゼーション」とは、相補的なオリゴマー化合物(例えば、アンチセンス化合物およびその標的核酸)の対合を意味する。特定の機構に限定されないが、最も一般的な対合機構には水素結合が含まれ、これは、相補的核酸塩基間のワトソン・クリック水素結合、フーグスティーン水素結合、または逆フーグスティーン水素結合であり得る。
本明細書で使用されるとき、「特異的にハイブリダイズする」とは、オリゴマー化合物が、ある核酸部位にハイブリダイズするよりも高い親和性で別の核酸部位にハイブリダイズする能力を意味する。
本明細書で使用されるとき、オリゴヌクレオチドまたはその部分に関して「完全に相補的な」とは、オリゴヌクレオチドまたはその部分の各核酸塩基が、相補的な核酸またはその連続した部分の核酸塩基と対合することができることを意味する。したがって、完全に相補的な領域は、いずれの鎖でもミスマッチまたは非ハイブリダイズ核酸塩基を含まない。
本明細書で使用されるとき、「パーセント相補性」とは、標的核酸の等長部分に相補的なオリゴマー化合物の核酸塩基の割合を意味する。パーセント相補性は、標的核酸の対応する位置の核酸塩基に相補的なオリゴマー化合物の核酸塩基の数をオリゴマー化合物の全長で割ることによって計算される。
本明細書で使用されるとき、「パーセント同一性」とは、第1の核酸の核酸塩基の総数で割った、第2の核酸の対応する位置の核酸塩基と同一の(化学修飾から独立した)種類の第1の核酸の核酸塩基の数を意味する。
本明細書で使用されるとき、「調節」とは、調節前の分子、機能、もしくは活性の量または質と比較した、分子、機能、もしくは活性の量または質の変化を意味する。例えば、調節は、遺伝子発現における増加(刺激もしくは誘導)または減少(阻害もしくは低減)のいずれかの変化を含む。さらなる例として、発現の調節は、調節の不在下における量と比較した、特定のスプライス変異体の絶対量または相対量の変化をもたらすプレmRNA処理のスプライス部位選択の変化を含み得る。
本明細書で使用されるとき、「化学モチーフ」とは、オリゴヌクレオチドまたはその領域における化学修飾のパターンを意味する。モチーフは、オリゴヌクレオチドのある特定のヌクレオシドおよび/またはある特定の結合基での修飾によって定義され得る。
本明細書で使用されるとき、「ヌクレオシドモチーフ」とは、オリゴヌクレオチドまたはその領域におけるヌクレオシド修飾のパターンを意味する。そのようなオリゴヌクレオチドの結合は、修飾または非修飾であり得る。別途示されない限り、本明細書においてヌクレオシドのみを記載するモチーフは、ヌクレオシドモチーフであるよう意図される。したがって、そのような事例において、結合は限定されない。
本明細書で使用されるとき、「糖モチーフ」とは、オリゴヌクレオチドまたはその領域における糖修飾のパターンを意味する。
本明細書で使用されるとき、「結合モチーフ」とは、オリゴヌクレオチドまたはその領域における結合修飾のパターンを意味する。そのようなオリゴヌクレオチドのヌクレオシドは、修飾または非修飾であり得る。別途示されない限り、本明細書において結合のみを記載するモチーフは、結合モチーフであるよう意図される。したがって、そのような事例において、ヌクレオシドは限定されない。
本明細書で使用されるとき、「核酸塩基修飾モチーフ」とは、オリゴヌクレオチドに沿った核酸塩基への修飾のパターンを意味する。別途示されない限り、核酸塩基修飾モチーフは、核酸塩基配列から独立している。
本明細書で使用されるとき、「配列モチーフ」とは、オリゴヌクレオチドまたはその部分に沿って整列した核酸塩基のパターンを意味する。別途示されない限り、配列モチーフは、化学修飾から独立しており、それ故に、化学修飾なしを含む化学修飾の任意の組み合わせを有し得る。
本明細書で使用されるとき、ヌクレオシドまたはある「種類」のヌクレオシドに関する「修飾の種類」とは、ヌクレオシドの化学修飾を意味し、修飾および非修飾ヌクレオシドを含む。したがって、別途示されない限り、「第1の種類の修飾を有するヌクレオシド」は、非修飾ヌクレオシドであり得る。
本明細書で使用されるとき、「別々に修飾された」とは、修飾の不在を含む、互いに異なる化学修飾または化学置換基を意味する。したがって、例えば、MOEヌクレオシドおよび非修飾DNAヌクレオシドは、DNAヌクレオシドが修飾されていなくても「別々に修飾される」。同様に、DNAおよびRNAは、これら両方ともに天然に存在する非修飾ヌクレオシドであっても「別々に修飾される」。同一であるが、異なる核酸塩基を含むヌクレオシドは、別々に修飾されない。例えば、2’-OMe修飾糖および非修飾アデニン核酸塩基を含むヌクレオシドと2’-OMe修飾糖および非修飾チミン核酸塩基を含むヌクレオシドは、別々に修飾されない。
本明細書で使用されるとき、「同一の種類の修飾」とは、修飾の不在を含む、互いに同一の修飾を指す。したがって、例えば、2個の非修飾DNAヌクレオシドは、DNAヌクレオシドが修飾されていなくても「同一の種類の修飾」を有する。同一の種類の修飾を有するそのようなヌクレオシドは、異なる核酸塩基を含み得る。
本明細書で使用されるとき、「別個の領域」とは、オリゴヌクレオチドの部分を意味し、任意の隣接する部分の化学修飾または化学修飾のモチーフは、別個の領域が互いに区別されることを可能にする少なくとも1つの相違点を含む。
本明細書で使用されるとき、「薬剤的に許容される担体または希釈剤」とは、動物への投与における使用に好適な任意の物質を意味する。ある特定の実施形態において、薬剤的に許容される担体または希釈剤は、滅菌生理食塩水である。ある特定の実施形態において、そのような滅菌生理食塩水は、医薬品グレードの生理食塩水である。
本明細書で使用されるとき、「代謝性障害」という用語は、主に代謝(食物を分解してエネルギーを生成することに関連した一連の複雑な化学反応)の異常調節を特徴とする疾患または状態を意味する。
本明細書で使用されるとき、「心血管障害」という用語は、主に心臓または血管の機能障害を特徴とする疾患または状態を意味する。
本明細書で使用されるとき、「単環式または多環式環系」という用語は、単環式または多環式ラジカル環系から選択されるすべての環系を含むよう意図されており、前記環は、縮合または連結され、脂肪族、脂環式、アリール、ヘテロアリール、アラルキル、アリールアルキル、複素環式、ヘテロアリール、ヘテロ芳香族、およびヘテロアリールアルキルから個別に選択される単一環系および混合環系を含むよう意図される。そのような単環式および多環式構造は、各々が同一のレベルの飽和を有するか、または各々が独立して、完全に飽和、部分的に飽和、もしくは完全に不飽和を含む様々な程度の飽和を有する環を含有し得る。各環は、複素環式環、および例えばベンズイミダゾール等の混合モチーフに存在し得るC環原子のみを含む環を生じさせるために、C、N、O、およびSから選択される環原子を含み得、1個の環は、炭素環原子のみを有し、縮合環は、2個の窒素原子を有する。単環式または多環式環系は、例えば、前記環のうちの1個に結合される2個の=O基を有するフタルイミド等の置換基とさらに置換され得る。単環式または多環式環系は、環原子を介した直接結合、複数の環原子を介した縮合、置換基を介した結合、または二機能性結合部分を介した結合等の様々な戦略を用いて親分子に結合され得る。
本明細書で使用されるとき、「プロドラッグ」とは、対象に投与されると、代謝して活性化合物またはより活性の化合物(例えば、薬物)を形成する化合物の不活性形態または活性の低い形態を意味する。
本明細書で使用されるとき、「置換基(substituent)」および「置換基(
substituent group)」とは、指名された親化合物の原子または基を置換する原子または基を意味する。例えば、修飾ヌクレオシドの置換基は、天然に存在するヌクレオシドに見られる原子または基とは異なる任意の原子または基である(例えば、修飾された2’-置換基は、HまたはOH以外のヌクレオシドの2’位の任意の原子または基である)。置換基は、保護されても保護されなくてもよい。ある特定の実施形態において、本開示の化合物は、親化合物の1つの位置または2つ以上の位置に置換基を有する。置換基は、他の置換基ともさらに置換され得、親化合物に直接結合され得るか、またはアルキル基もしくはヒドロカルビル基等の結合基を介して結合され得る。
同様に、本明細書で使用されるとき、化学官能基に関する「置換基」とは、指名された官能基に通常存在する原子または原子団とは異なる原子または原子団を意味する。ある特定の実施形態において、置換基は、官能基の水素原子を置換する(例えば、ある特定の実施形態において、置換メチル基の置換基は、非置換メチル基の水素原子のうちの1個を置換する水素以外の原子または基である)。別途示されない限り、置換基としての使用に従順な基には、ハロゲン、ヒドロキシル、アルキル、アルケニル、アルキニル、アシル(-C(O)Raa)、カルボキシル(-C(O)O-Raa)、脂肪族基、脂環式基、アルコキシ、置換オキシ(-O-Raa)、アリール、アラルキル、複素環式ラジカル、ヘテロアリール、ヘテロアリールアルキル、アミノ(-N(Rbb)(Rcc))、イミノ(=NRbb)、アミド(-C(O)N(Rbb)(Rcc)または-N(Rbb)C(O)Raa)、アジド(-N)、ニトロ(-NO)、シアノ(-CN)、カルバミド(-OC(O)N(Rbb)(Rcc)または-N(Rbb)C(O)ORaa)、ウレイド(-N(Rbb)C(O)N(Rbb)(Rcc))、チオウレイド(-N(Rbb)C(S)N(Rbb)(Rcc))、グアニジニル(-N(Rbb)C(=NRbb)N(Rbb)(Rcc))、アミジニル(-C(=NRbb)N(Rbb)(Rcc)または-N(Rbb)C(=NRbb)(Raa))、チオール(-SRbb)、スルフィニル(-S(O)Rbb)、スルホニル(-S(O)bb)、およびスルホンアミジル(-S(O)N(Rbb)(Rcc)または-N(Rbb)S(O)bb)が含まれるが、これらに限定されない。式中、各Raa、Rbb、およびRccは、独立して、H、任意に連結された化学官能基、またはアルキル、アルケニル、アルキニル、脂肪族、アルコキシ、アシル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、脂環式、複素環式、およびヘテロアリールアルキルを含むが、これらに限定されない好ましいリストを有するさらなる置換基である。本明細書に記載される化合物内の選択された置換基は、再帰的程度まで存在する。
本明細書で使用されるとき、本明細書で使用される「アルキル」とは、最大24個の炭素原子を含有する飽和直鎖または分岐鎖炭化水素ラジカルを意味する。アルキル基の例として、メチル、エチル、プロピル、ブチル、イソプロピル、n-ヘキシル、オクチル、デシル、ドデシル等が挙げられるが、これらに限定されない。アルキル基は、典型的には、1~約24個の炭素原子、より典型的には、1~約12個の炭素原子(C~C12アルキル)を含み、1~約6個の炭素原子がより好ましい。
本明細書で使用されるとき、「アルケニル」とは、最大24個の炭素原子を含有し、かつ少なくとも1個の炭素-炭素二重結合を有する直鎖または分岐鎖炭化水素鎖ラジカルを意味する。アルケニル基の例として、エテニル、プロペニル、ブテニル、1-メチル-2-ブテン-1-イル、1,3-ブタジエン等のジエン等が挙げられるが、これらに限定されない。アルケニル基は、典型的には、2~約24個の炭素原子、より典型的には、2~約12個の炭素原子を含み、2~約6個の炭素原子がより好ましい。本明細書で使用されるアルケニル基は、1個以上のさらなる置換基を任意に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「アルキニル」とは、最大24個の炭素原子を含有し、か
つ少なくとも1個の炭素-炭素三重結合を有する直鎖または分岐鎖炭化水素ラジカルを意味する。アルキニル基の例として、エチニル、1-プロピニル、1-ブチニル等が挙げられるが、これらに限定されない。アルキニル基は、典型的には、2~約24個の炭素原子、より典型的には、2~約12個の炭素原子を含み、2~約6個の炭素原子がより好ましい。本明細書で使用されるアルキニル基は、1個以上のさらなる置換基を任意に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「アシル」とは、有機酸からのヒドロキシル基の除去によって形成されたラジカルを意味し、一般式-C(O)-Xを有し、式中、Xは、典型的には、脂肪族、脂環式、または芳香族である。例として、脂肪族カルボニル、芳香族カルボニル、脂肪族スルホニル、芳香族スルフィニル、脂肪族スルフィニル、芳香族ホスフェート、脂肪族ホスフェート等が挙げられる。本明細書で使用されるアシル基は、さらなる置換基を任意に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「脂環式」とは、環式環系を意味し、前記環は、脂肪族である。前記環系は、1個以上の環を含み得、少なくとも1個の環は、脂肪族である。好ましい脂環式基は、環内に約5~約9個の炭素原子を有する環を含む。本明細書で使用される脂環式基は、さらなる置換基を任意に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「脂肪族」とは、最大24個の炭素原子を含有する直鎖または分岐鎖炭化水素ラジカルを意味し、任意の2個の炭素原子の間の飽和は、一重、二重、または三重結合である。脂肪族基は、好ましくは、1~約24個の炭素原子、より典型的には、1~約12個の炭素原子を含有し、1~約6個の炭素原子がより好ましい。脂肪族基の直鎖または分岐鎖は、窒素、酸素、硫黄、およびリンを含む1個以上のヘテロ原子で中断され得る。ヘテロ原子によって中断されるそのような脂肪族基には、ポリアルコキシ、例えば、ポリアルキレングリコール、ポリアミン、およびポリイミンが含まれるが、これらに限定されない。本明細書で使用される脂肪族基は、さらなる置換基を任意に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「アルコキシ」とは、アルキル基と酸素原子との間に形成されたラジカルを意味し、前記酸素原子を用いて、アルコキシ基を親分子に結合させる。アルコキシ基の例として、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、イソプロポキシ、n-ブトキシ、sec-ブトキシ、tert-ブトキシ、n-ペントキシ、ネオペントキシ、n-ヘキソキシ等が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書で使用されるアルコキシ基は、さらなる置換基を任意に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「アミノアルキル」とは、アミノ置換されたC~C12アルキルラジカルを意味する。前記ラジカルのアルキル部分は、親分子と共有結合を形成する。アミノ基は、任意の位置に位置し得、アミノアルキル基は、アルキルおよび/またはアミノ部分のさらなる置換基で置換され得る。
本明細書で使用されるとき、「アラルキル」および「アリールアルキル」とは、C~C12アルキルラジカルに共有結合される芳香族基を意味する。結果として生じるアラルキル(またはアリールアルキル)基のアルキルラジカル部分は、親分子と共有結合を形成する。例として、ベンジル、フェネチル等が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書で使用されるアラルキル基は、ラジカル基を形成するアルキル、アリール、またはこれら両方の基に結合されるさらなる置換基を任意に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「アリール」および「芳香族」とは、1個以上の芳香族環を有する単環式または多環式炭素環式環系ラジカルを意味する。アリール基の例として、
フェニル、ナフチル、テトラヒドロナフチル、インダニル、イデニル等が挙げられるが、これらに限定されない。好ましいアリール環系は、1個以上の環内に約5~約20個の炭素原子を有する。本明細書で使用されるアリール基は、さらなる置換基を任意に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「ハロ」および「ハロゲン」とは、フッ素、塩素、臭素、およびヨウ素から選択される原子を意味する。
本明細書で使用されるとき、「ヘテロアリール」および「ヘテロ芳香族」とは、単環式もしくは多環式芳香族環、環系、または縮合環系を含むラジカルを意味し、前記環のうちの少なくとも1つは、芳香族であり、1個以上のヘテロ原子を含む。ヘテロアリールは、縮合環のうちの1個以上がヘテロ原子を含有しない系を含む縮合環系もまた含むよう意図される。ヘテロアリール基は、典型的には、硫黄、窒素、または酸素から選択される1個の環原子を含む。ヘテロアリール基の例として、ピリジニル、ピラジニル、ピリミジニル、ピロリル、ピラゾリル、イミダゾリル、チアゾリル、オキサゾリル、イソオキサゾリル、チアジアゾリル、オキサジアゾリル、チオフェニル、フラニル、キノリニル、イソキノリニル、ベンズイミダゾリル、ベンゾオキサゾリル、キノキサリニル等が挙げられるが、これらに限定されない。ヘテロアリールラジカルは、親分子に直接結合され得るか、または脂肪族基もしくはヘテロ原子等の結合部分を介して結合され得る。本明細書で使用されるヘテロアリール基は、さらなる置換基を任意に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「共役化合物」とは、共役基としての使用に好適な任意の原子、原子団、または結合原子団を意味する。ある特定の実施形態において、共役化合物は、薬力学的特性、薬物動態学的特性、結合特性、吸収特性、細胞分布特性、細胞取り込み特性、電荷特性、および/またはクリアランス特性を含むが、これらに限定されない1つ以上の特性を有し得るか、または付与し得る。
本明細書で使用されるとき、別途示されないか、または修正されない限り、「二本鎖」という用語は、互いにハイブリダイズされる2個の別個のオリゴマー化合物を指す。そのような二本鎖化合物は、一方もしくは両方の鎖(オーバーハング)の一方もしくは両方の末端に1個以上のヌクレオシドまたはハイブリダイズしていないヌクレオシドを有し得、かつ/または1個以上のハイブリダイズしていない内部ヌクレオシド(ミスマッチ)を有し得るが、但し、生理学的関連条件下でハイブリダイゼーションを維持するのに十分な相補性が存在することを条件とする。
B. ある特定の化合物
ある特定の実施形態において、本発明は、アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含む共役アンチセンス化合物を提供する。
a. ある特定のアンチセンスオリゴヌクレオチド
ある特定の実施形態において、本発明は、アンチセンスオリゴヌクレオチドを提供する。そのようなアンチセンスオリゴヌクレオチドは、連結したヌクレオシドを含み、各ヌクレオシドは、糖部分および核酸塩基を含む。そのようなアンチセンスオリゴヌクレオチドの構造は、化学的特徴(例えば、修飾および修飾パターン)ならびに核酸塩基配列(例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチドの配列、同一性、および標的核酸の配列)の点から考慮され得る。
i. ある特定の化学的特徴
ある特定の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、1つ以上の修飾を含む。ある特定のそのような実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、1
個以上の修飾ヌクレオシドおよび/または修飾ヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、修飾ヌクレオシドは、修飾糖部分および/または修飾核酸塩基を含む。1. ある特定の糖部分
ある特定の実施形態において、本開示の化合物は、修飾糖部分を含む1個以上の修飾ヌクレオシドを含む。1個以上の糖修飾ヌクレオシドを含むそのような化合物は、天然に存在する糖部分を含むヌクレオシドのみを含むオリゴヌクレオチドと比較して、ヌクレアーゼ安定性の強化または標的核酸との結合親和性の増大等の望ましい特性を有し得る。ある特定の実施形態において、修飾糖部分は、置換糖部分である。ある特定の実施形態において、修飾糖部分は、糖代理物である。そのような糖代理物は、置換糖部分の置換に対応する1つ以上の置換を含み得る。
ある特定の実施形態において、修飾糖部分は、2’位および/または5’位の置換基を含むが、これらに限定されない1個以上の非架橋糖糖置換基を含む置換糖部分である。2’位に好適な糖置換基の例として、2’-F、2’-OCH(「OMe」または「O-メチル」)、および2’-O(CHOCH(「MOE」)が挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、2’位の糖置換基は、アリル、アミノ、アジド、チオ、O-アリル、O~C~C10アルキル、O~C~C10置換アルキル、OCF、O(CHSCH、O(CH-O-N(Rm)(Rn)、およびO-CH-C(=O)-N(Rm)(Rn)から選択され、式中、各RmおよびRnは、独立して、Hまたは置換もしくは非置換C~C10アルキルである。5’位の糖置換基の例には、5’-メチル(RまたはS)、5’-ビニル、および5’-メトキシが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、置換糖は、2個以上の非架橋糖置換基、例えば、2’-F-5’-メチル糖部分を含む(さらなる5’,2’-ビス置換糖部分およびヌクレオシドについては、例えば、PCT国際出願第WO2008/101157号を参照のこと)。
2’-置換糖部分を含むヌクレオシドは、2’-置換ヌクレオシドと称される。ある特定の実施形態において、2’-置換ヌクレオシドは、ハロ、アリル、アミノ、アジド、SH、CN、OCN、CF、OCF、O、S、もしくはN(R)-アルキル;O、S、もしくはN(R)-アルケニル;O、S、もしくはN(R)-アルキニル;O-アルキレニル-O-アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O-アルカリル、O-アラルキル、O(CHSCH、O-(CH-O-N(R)(R);またはO-CH-C(=O)-N(R)(R)から選択される2’-置換基を含み、式中、各RおよびRは、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換C~C10アルキルである。これらの2’-置換基は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ(NO)、チオール、チオアルコキシ(S-アルキル)、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル、およびアルキニルから独立して選択される1個以上の置換基とさらに置換され得る。
ある特定の実施形態において、2’-置換ヌクレオシドは、F、NH、N、OCF、O-CH、O(CHNH、CH-CH=CH、O-CH-CH=CH、OCHCHOCH、O(CHSCH、O-(CH-O-N(R)(R)、O(CHO(CHN(CH、およびN-置換アセトアミド(O-CH-C(=O)-N(R)(R)から選択される2’-置換基を含み、式中、各RおよびRは、独立して、H、アミノ保護基、または置換もしくは非置換C~C10アルキルである。
ある特定の実施形態において、2’-置換ヌクレオシドは、F、OCF、O-CH、OCHCHOCH、O(CHSCH、O-(CH-O-N(CH
、-O(CHO(CHN(CH、およびO-CH-C(=O)-N(H)CHから選択される2’-置換基を含む糖部分を含む。
ある特定の実施形態において、2’-置換ヌクレオシドは、F、O-CH、およびOCHCHOCHから選択される2’-置換基を含む糖部分を含む。
ある特定の修飾糖部分は、第2の環を形成して二環式糖部分をもたらす架橋糖置換基を含む。ある特定のそのような実施形態において、二環式糖部分は、4’フラノース環原子と2’フラノース環原子との間に橋を含む。そのような4’から2’の糖置換基の例には、-[C(R)(R)]-、-[C(R)(R)]-O-、-C(R)-N(R)-O-、または-C(R)-O-N(R)-;4’-CH-2’、4’-(CH-2’、4’-(CH-2’、4’-(CH)-O-2’(LNA);4’-(CH)-S-2’;4’-(CH-O-2’(ENA);4’-CH(CH)-O-2’(cEt);および4’-CH(CHOCH)-O-2’;ならびにこれらの類似体(例えば、2008年7月15日に発行された米国特許第7,399,845号を参照のこと);4’-C(CH)(CH)-O-2’およびその類似体、(例えば、2009年1月8日に公開された国際公開第WO2009/006478号を参照のこと);4’-CH-N(OCH)-2’およびその類似体(例えば、2008年12月11日に公開された国際公開第WO2008/150729号を参照のこと);4’-CH-O-N(CH)-2’(例えば、2004年9月2日に公開された米国特許第US2004/0171570号を参照のこと);4’-CH-O-N(R)-2’、ならびに4’-CH-N(R)-O-2’-(式中、各Rが、独立して、H、保護基、またはC~C12アルキルである);4’-CH-N(R)-O-2’(式中、Rが、H、C~C12アルキル、または保護基である)(2008年9月23日に発行された米国特許第7,427,672号を参照のこと);4’-CH-C(H)(CH)-2’(例えば、Chattopadhyaya,et al.,J.Org.Chem.,2009,74,118-134を参照のこと);ならびに4’-CH-C(=CH)-2’およびその類似体(2008年12月8日に公開されたPCT国際出願第WO2008/154401号を参照のこと)が挙げられるが、これらに限定されない。
ある特定の実施形態において、そのような4’から2’の橋は、独立して、-[C(R)(R)]-、-C(R)=C(R)-、-C(R)=N-、-C(=NR)-、-C(=O)-、-C(=S)-、-O-、-Si(R-、-S(=O)-、および-N(R)-から独立して選択される1~4個の結合基を含み、
式中、
xは、0、1、または2であり、
nは、1、2、3、または4であり、
各RおよびRは、独立して、H、保護基、ヒドロキシル、C~C12アルキル、置換C~C12アルキル、C~C12アルケニル、置換C~C12アルケニル、C~C12アルキニル、置換C~C12アルキニル、C~C20アリール、置換C~C20アリール、複素環式ラジカル、置換複素環式ラジカル、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、C~C脂環式ラジカル、置換C~C脂環式ラジカル、ハロゲン、OJ、NJ、SJ、N、COOJ、アシル(C(=O)-H)、置換アシル、CN、スルホニル(S(=O)-J)、またはスルホキシル(S(=O)-J)であり、
各JおよびJは、独立して、H、C~C12アルキル、置換C~C12アルキル、C~C12アルケニル、置換C~C12アルケニル、C~C12アルキニル、置換C~C12アルキニル、C~C20アリール、置換C~C20アリール、アシル(C(=O)-H)、置換アシル、複素環式ラジカル、置換複素環式ラジカル、C
12アミノアルキル、置換C~C12アミノアルキル、または保護基である。
二環式糖部分を含むヌクレオシドは、二環式ヌクレオシドまたはBNAと称される。二環式ヌクレオシドには、以下に示される、(A)α-L-メチレンオキシ(4’-CH-O-2’)BNA、(B)β-D-メチレンオキシ(4’-CH-O-2’)BNA(ロックド核酸またはLNAとも称される)、(C)エチレンオキシ(4’-(CH-O-2’)BNA、(D)アミノオキシ(4’-CH-O-N(R)-2’)BNA、(E)オキシアミノ(4’-CH-N(R)-O-2’)BNA、(F)メチル(メチレンオキシ)(4’-CH(CH)-O-2’)BNA(拘束エチルまたはcEtとも称される)、(G)メチレン-チオ(4’-CH-S-2’)BNA、(H)メチレン-アミノ(4’-CH2-N(R)-2’)BNA、(I)メチル炭素環式(4’-CH-CH(CH)-2’)BNA、および(J)プロピレン炭素環式(4’-(CH-2’)BNAが含まれるが、これらに限定されず、
Figure 0007177127000507
Figure 0007177127000508
式中、Bxは、核酸塩基部分であり、Rは、独立して、H、保護基、またはC~C12アルキルである。
さらなる二環式糖部分は、当技術分野で既知であり、例えば、Singh et al.,Chem.Commun.,1998,4,455-456、Koshkin et
al.,Tetrahedron,1998,54,3607-3630、Wahlestedt et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,2000,97,5633-5638、Kumar et al.,Bioorg.Med.Chem.Lett.,1998,8,2219-2222、Singh et al.,J.Org.Chem.,1998,63,10035-10039、Srivastava et al.,J.Am.Chem.Soc.,129(26)8362-8
379(Jul.4,2007)、Elayadi et al.,Curr.Opinion Invens.Drugs,2001,2,558-561、Braasch et al.,Chem.Biol.,2001,8,1-7、Orum et al.,Curr.Opinion Mol.Ther.,2001,3,239-243、米国特許第7,053,207号、同第6,268,490号、同第6,770,748号、同第6,794,499号、同第7,034,133号、同第6,525,191号、同第6,670,461号、および同第7,399,845号、国際公開第WO2004/106356号、同第WO1994/14226号、同第WO2005/021570号、および同第WO2007/134181号、米国特許公開第US2004/0171570号、同第US2007/0287831号、および同第US2008/0039618号、米国特許第12/129,154号、同第60/989,574号、同第61/026,995号、同第61/026,998号、同第61/056,564号、同第61/086,231号、同第61/097,787号、および同第61/099,844、ならびにPCT国際出願第PCT/US2008/064591号、同第PCT/US2008/066154号、および同第PCT/US2008/068922号である。
ある特定の実施形態において、二環式糖部分およびそのような二環式糖部分を組み込むヌクレオシドは、異性体配置によってさらに定義される。例えば、4’-2’メチレン-オキシ橋を含むヌクレオシドは、α-L配置またはβ-D配置であり得る。以前に、α-L-メチレンオキシ(4’-CH-O-2’)二環式ヌクレオシドが、アンチセンス活性を示すアンチセンスオリゴヌクレオチドに組み込まれている(Frieden et al.,Nucleic Acids Research,2003,21,6365-6372)。
ある特定の実施形態において、置換糖部分は、1個以上の非架橋糖置換基および1個以上の架橋糖置換基(例えば、5’-置換および4’-2’架橋糖)を含む(2007年11月22日に公開されたPCT国際出願第WO2007/134181号(LNAが例えば5’-メチルまたは5’-ビニル基で置換されている)を参照のこと)。
ある特定の実施形態において、修飾糖部分は、糖代理物である。ある特定のそのような実施形態において、天然に存在する糖の酸素原子は、例えば、硫黄、炭素、または窒素原子で置換される。ある特定のそのような実施形態において、そのような修飾糖部分は、上述の架橋および/または非架橋置換基も含む。例えば、ある特定の糖代理物は、4’-硫黄原子ならびに2’位(例えば、2005年6月16日に公開された米国特許出願第US2005/0130923号を参照のこと)および/または5’位での置換を含む。さらなる例として、4’-2’橋を有する炭素環式二環式ヌクレオシドが記載されている(例えば、Freier et al.,Nucleic Acids Research,1997,25(22),4429-4443、およびAlbaek et al.,J
.Org.Chem.,2006,71,7731-7740を参照のこと)。
ある特定の実施形態において、糖代理物は、5個の原子以外を有する環を含む。例えば、ある特定の実施形態において、糖代理物は、モルフォリノを含む。モルフォリノ化合物およびオリゴマー化合物におけるそれらの使用は、多数の特許および公開論文(例えば、Braasch et al.,Biochemistry,2002,41,4503-4510、ならびに米国特許第5,698,685号、同第5,166,315号、同第5,185,444号、および同第5,034,506号を参照のこと)で報告されている。本明細書で使用されるとき、「モルフォリノ」という用語は、以下の構造を有する糖代理物を意味する。
Figure 0007177127000509
ある特定の実施形態において、モルフォリノは、例えば、上述のモルフォリノ構造由来の様々な置換基を付加または変更することによって修飾され得る。そのような糖代理物は、本明細書において「修飾モルフォリノ」と称される。
別の例として、ある特定の実施形態において、糖代理物は、6員テトラヒドロピランを含む。そのようなテトラヒドロピランは、さらに修飾または置換され得る。そのような修飾テトラヒドロピランを含むヌクレオシドには、ヘキシトール核酸(HNA)、アニトール核酸(ANA)、マニトール核酸(MNA)(Leumann,CJ.Bioorg.& Med.Chem.(2002)10:841-854を参照のこと)、フルオロHNA(F-HNA)、および以下の式VIを有する化合物が含まれるが、これらに限定されず、
Figure 0007177127000510
式中、独立して、式VIの前記少なくとも1個のテトラヒドロピランヌクレオシド類似体の各々について、
Bxは、核酸塩基部分であり、
およびTは各々、独立して、テトラヒドロピランヌクレオシド類似体をアンチセンス化合物に結合させるヌクレオシド間結合基であるか、またはTおよびTのうちの一方は、テトラヒドロピランヌクレオシド類似体をアンチセンス化合物に結合させるヌクレオシド間結合基であり、TおよびTのうちの他方は、H、ヒドロキシル保護基、結合共役基、または5’もしくは3’-末端基であり、
、q、q、q、q、q、およびqは各々、独立して、H、C~Cアルキル、置換C~Cアルキル、C~Cアルケニル、置換C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、または置換C~Cアルキニルであり、
およびRの各々は、水素、ハロゲン、置換または非置換アルコキシ、NJ、SJ、N、OC(=X)J、OC(=X)NJ、NJC(=X)NJ、およびCNの中から独立して選択され、式中、Xは、O、S、またはNJであり、各J、J、およびJは、独立して、HまたはC~Cアルキルである。
ある特定の実施形態において、式VIの修飾THPヌクレオシドが提供され、式中、q、q、q、q、q、q、およびqは各々、Hである。ある特定の実施形態において、q、q、q、q、q、q、およびqのうちの少なくとも1つは、H以外である。ある特定の実施形態において、q、q、q、q、q、q、およびqのうちの少なくとも1つは、メチルである。ある特定の実施形態において、式VIのTHPヌクレオシドが提供され、式中、RおよびRのうちの一方がFである。
ある特定の実施形態において、Rがフルオロであり、RがHであり、Rがメトキシであり、RがHであり、Rがメトキシエトキシであり、RがHである。
アンチセンス化合物への組み込みのためにヌクレオシドを修飾するために用いられ得る多くの他のビシクロおよびトリシクロ糖代理物環系も当技術分野で既知である(例えば、総説:Leumann,J.C,Bioorganic & Medicinal Chemistry,2002,10,841-854を参照のこと)。
2’-F-5’-メチル置換ヌクレオシド(他の開示された5’,2’-ビス置換ヌクレオシドについては、2008年8月21日に公開されたPCT国際出願第WO2008/101157号を参照のこと)、ならびにリボシル環酸素原子のSとの置換および2’位でのさらなる置換(2005年6月16日に公開された米国特許出願第US2005-0130923号を参照のこと)、またはあるいは二環式核酸の5’-置換(4’-CH-O-2’二環式ヌクレオシドが5’位で5’-メチルまたは5’-ビニル基でさらに置換される、2007年11月22日に公開されたPCT国際出願第WO2007/134181号を参照のこと)等であるが、これらに限定されない修飾の組み合わせも提供される。炭素環式二環式ヌクレオシドのオリゴマー化および生化学的研究に加えて、それらの合成および調製も記載されている(例えば、Srivastava et al.,J.Am.Chem.Soc.2007,129(26),8362-8379を参照のこと)。
ある特定の実施形態において、本開示は、修飾ヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドを提供する。これらの修飾ヌクレオチドは、修飾糖、修飾核酸塩基、および/または修飾結合を含み得る。特異的修飾は、結果として生じるオリゴヌクレオチドが望ましい特徴を有するように選択される。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、1個以上のRNA様ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、1個以上のDNA様ヌクレオチドを含む。

2. ある特定の核酸塩基修飾
ある特定の実施形態において、本開示のヌクレオシドは、1個以上の非修飾核酸塩基を含む。ある特定の実施形態において、本開示のヌクレオシドは、1個以上の修飾核酸塩基を含む。
ある特定の実施形態において、修飾核酸塩基は、本明細書で定義されるユニバーサル塩基、疎水性塩基、乱交雑塩基、サイズ拡大塩基、およびフッ素化塩基から選択される。5-置換ピリミジン、6-アザピリミジン、ならびにN-2、N-6、およびO-6置換プリンには、本明細書で定義される、2-アミノプロピルアデニン、5-プロピニルウラシル;5-プロピニルシトシン;5-ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、2-アミノアデニン、6-メチルならびにアデニンおよびグアニンの他のアルキル誘導体、2-プロピルならびにアデニンおよびグアニンの他のアルキル誘導体、2-チオウラシル、2-チオチミンおよび2-チオシトシン、5-ハロウラシルおよびシトシン、5-プロピニル(-CoC-CH)ウラシルならびにシトシンおよびピリミジン塩基の
他のアルキニル誘導体、6-アゾウラシル、シトシンおよびチミン、5-ウラシル(シュードウラシル)、4-チオウラシル、8-ハロ、8-アミノ、8-チオール、8-チオアルキル、8-ヒドロキシルならびに他の8-置換アデニンおよびグアニン、5-ハロ、特に、5-ブロモ、5-トリフルオロメチルならびに他の5-置換ウラシルおよびシトシン、7-メチルグアニンおよび7-メチルアデニン、2-F-アデニン、2-アミノ-アデニン、8-アザグアニンおよび8-アザアデニン、7-デアザグアニンおよび7-デアザアデニン、3-デアザグアニンおよび3-デアザアデニン、ユニバーサル塩基、疎水性塩
基、乱交雑塩基、サイズ拡大塩基、およびフッ素化塩基が含まれる。さらに、修飾核酸塩基には、三環式ピリミジン、例えば、フェノキサジンシチジン([5,4-b][1,4]ベンゾオキサジン-2(3H)-オン)、フェノチアジンシチジン(1H-ピリミド[5,4-b][1,4]ベンゾチアジン-2(3H)-オン)、G-クランプ、例えば、置換フェノキサジンシチジン(例えば、9-(2-アミノエトキシ)-H-ピリミド[5,4-b][1,4]ベンゾオキサジン-2(3H)-オン)、カルバゾールシチジン(2H-ピリミド[4,5-b]インドール-2-オン)、ピリドインドールシチジン(H-ピリド[3’,2’:4,5]ピロロ[2,3-d]ピリミジン-2-オン)が含まれる。修飾核酸塩基には、プリンまたはピリミジン塩基が、他の複素環、例えば、7-デアザ-アデニン、7-デアザグアノシン、2-アミノピリジン、および2-ピリドンに置換される塩基も含まれ得る。さらに、核酸塩基には、米国特許第3,687,808号に開示される塩基、The Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engineering,Kroschwitz,J.I.,Ed.,John Wiley & Sons,1990,858-859に開示される塩基、Englisch et al.,Angewandte Chemie,International Edition,1991,30,613によって開示される塩基、およびSanghvi,Y.S.,Chapter 15,Antisense Research and Applications,Crooke,S.T.and Lebleu,B.,Eds.,CRC Press,1993,273-288によって開示される塩基が含まれる。
上述の修飾核酸塩基ならびに他の修飾核酸塩基のある特定の調製を教示する代表的な米国特許には、米国特許第3,687,808号、同第4,845,205号、同第5,130,302号、同第5,134,066号、同第5,175,273号、同第5,367,066号、同第5,432,272号、同第5,457,187号、同第5,459,255号、同第5,484,908号、同第5,502,177号、同第5,525,711号、同第5,552,540号、同第5,587,469号、同第5,594,121号、同第5,596,091号、同第5,614,617号、同第5,645,985号、同第5,681,941号、同第5,750,692号、同第5,763,588号、同第5,830,653号、および同第6,005,096号が含まれるが、これらに限定されず、これらのある特定の特許は、本出願と共同所有されており、これらの各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
3. ある特定のヌクレオシド間結合
ある特定の実施形態において、本開示は、連結したヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドを提供する。そのような実施形態において、ヌクレオシドは、任意のヌクレオシド間結合を用いて一緒に連結され得る。ヌクレオシド間結合基の2つの主なクラスは、リン原子の存在または不在によって定義される。代表的なリン含有ヌクレオシド間結合は、ホスホジエステル(PO)、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ホスホラミデート、およびホスホロチオエート(PS)を含むが、これらに限定されない。代表的な非リン含有ヌクレオシド間結合基は、メチレンメチルイミノ(-CH-N(CH)-O-CH-)、チオジエステル(-O-C(O)-S-)、チオノカルバメート(-O-C(O)(NH)-S-)、シロキサン(-O-Si(H)-O-)、およびN,N’-ジメチルヒドラジン(-CH-N(CH)-N(CH)-)を含むが、これらに限定されない。修飾結合は、天然ホスホジエステル結合と比較して、オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性を変化させる、典型的には、増加させるために用いられ得る。ある特定の実施形態において、キラル原子を有するヌクレオシド間結合は、ラセミ混合物として、または別個の鏡像異性体として調製され得る。代表的なキラル結合は、アルキルホスホネートおよびホスホロチオエートを含むが、これらに限定されない。リン含有および非リン含有ヌクレオシド間結合の調製方法は、当業者に周知である。
本明細書に記載されるオリゴヌクレオチドは、1つ以上の不斉中心を含有し、それ故に、絶対立体化学の点で、(R)もしくは(S)、糖アノマー等の場合、αもしくはβ、またはアミノ酸等の場合(D)もしくは(L)と定義され得る、鏡像異性体、ジアステレオマー、および他の立体異性体配置を生じさせる。本明細書に提供されるアンチセンス化合物には、すべてのそのような考えられる異性体、ならびにそれらのラセミ形態および光学的に純粋な形態が含まれる。
中性ヌクレオシド間結合には、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、MMI(3’-CH-N(CH)-O-5’)、アミド-3(3’-CH-C(=O)-N(H)-5’)、アミド-4(3’-CH-N(H)-C(=O)-5’)、ホルムアセタール(3’-O-CH-O-5’)、およびチオホルムアセタール(3’-S-CH-O-5’)が非限定的に含まれる。さらに、中性ヌクレオシド間結合には、シロキサン(ジアルキルシロキサン)、カルボン酸エステル、カルボキサミド、硫化物、スルホン酸エステル、およびアミドを含む非イオン性結合が含まれる(例えば、Carbohydrate Modifications in Antisense Research;Y.S.Sanghvi and P.D.Cook,Eds.,ACS Symposium Series 580;Chapters 3 and 4,40-65を参照のこと)。さらに、中性ヌクレオシド間結合には、混合したN、O、S、およびCH成分部分を含む非イオン性結合が含まれる。
4. ある特定のモチーフ
ある特定の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、1個以上の修飾ヌクレオシド(例えば、修飾糖および/または修飾核酸塩基を含むヌクレオシド)ならびに/または1個以上の修飾ヌクレオシド間結合を含む。オリゴヌクレオチドにおけるそのような修飾のパターンは、本明細書においてモチーフと称される。ある特定の実施形態において、糖、核酸塩基、および結合モチーフは、互いに独立している。
a. ある特定の糖モチーフ
ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、定義されたパターンまたは糖修飾モチーフでオリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って配置された1種類以上の修飾糖部分および/または天然に存在する糖部分を含む。そのようなモチーフは、本明細書で論じられる糖修飾および/または他の既知の糖修飾のうちのいずれかを含み得る。
ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、2個の外部領域または「ウィング」および中央もしくは内部領域または「ギャップ」を含むギャップマー糖モチーフを有する領域を含むか、またはそれからなる。ギャップマー糖モチーフの3個の領域(5’-ウィング、ギャップ、および3’-ウィング)は、ヌクレオシドの連続した配列を形成し、これらのウィングの各々のヌクレオシドの糖部分の少なくとも一部は、このギャップのヌクレオシドの糖部分の少なくとも一部とは異なる。具体的には、少なくとも、ギャップに最も近い(5’-ウィングの最も3’側のヌクレオシドおよび3’-ウィングの最も5’側のヌクレオシド)各ウィングのヌクレオシドの糖部分が、隣接するギャップヌクレオシドの糖部分とは異なり、それ故に、ウィングとギャップとの間の境界を定義する。ある特定の実施形態において、ギャップ内の糖部分は、互いに同一である。ある特定の実施形態において、ギャップは、ギャップの1個以上の他のヌクレオシドの糖部分とは異なる糖部分を有する1個以上のヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、2個のウィングの糖モチーフは、互いに同一である(対称性糖ギャップマー)。ある特定の実施形態において、5’-ウィングの糖モチーフは、3’-ウィングの糖モチーフとは異なる(不斉糖ギャップマー)。
i. ある特定の5’-ウィング
ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、1~8個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、1~7個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、1~6個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、1~5個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、2~5個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、3~5個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、4または5個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、1~4個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、1~3個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、1または2個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、2~4個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、2または3個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、3または4個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、1個のヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、2個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、3個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、4個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、5個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、6個の連結したヌクレオシドからなる。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも2個の二環式ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも3個の二環式ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも4個の二環式ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個のLNAヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングの各ヌクレオシドは、二環式ヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングの各ヌクレオシドは、拘束エチルヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングの各ヌクレオシドは、LNAヌクレオシドである。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の非二環式修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の2’-置換ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の2’-MOEヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の2’-OMeヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングの各ヌクレオシドは、非二環式修飾ヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングの各ヌクレオシドは、2’-置換ヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングの各ヌクレオシドは、2’-MOEヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングの各ヌクレオシドは、2’-OMeヌクレオシドである。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングの各ヌクレオシドは、2’-デオキシヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個のリボヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングの各ヌクレオシドは、リボヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、5’-ウィングのヌクレオシドのうちの1個、2個以上、または各々は、RNA様ヌクレオシドである。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシドおよび少なくとも1個の非二環式修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-置換ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-MOEヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-OMeヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシドおよび少なくとも1個の非二環式修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-置換ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-MOEヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-OMeヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの5’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。
ii. ある特定の3’-ウィング
ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、1~8個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、1~7個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、1~6個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、1~5個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、2~5個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、3~5個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、4または5個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、1~4個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、1~3個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、1または2個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、2~4個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、2または3個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、3または4個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、1個のヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャッ
プマーの3’-ウィングは、2個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、3個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、4個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、5個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、6個の連結したヌクレオシドからなる。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個のLNAヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングの各ヌクレオシドは、二環式ヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングの各ヌクレオシドは、拘束エチルヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングの各ヌクレオシドは、LNAヌクレオシドである。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の非二環式修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも2個の非二環式修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも3個の非二環式修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも4個の非二環式修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の2’-置換ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の2’-MOEヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の2’-OMeヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングの各ヌクレオシドは、非二環式修飾ヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングの各ヌクレオシドは、2’-置換ヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングの各ヌクレオシドは、2’-MOEヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングの各ヌクレオシドは、2’-OMeヌクレオシドである。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングの各ヌクレオシドは、2’-デオキシヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個のリボヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングの各ヌクレオシドは、リボヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、5’-ウィングのヌクレオシドのうちの1個、2個以上、または各々は、RNA様ヌクレオシドである。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシドおよび少なくとも1個の非二環式修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-置換ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-MOEヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-OMeヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシドおよび少なくとも1個の非二環式修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-置換ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-MOEヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-OMeヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個のLNAヌクレオシドおよび少なくとも1個の非二環式修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個のLNAヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-置換ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個のLNAヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-MOEヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個のLNAヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-OMeヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個のLNAヌクレオシドおよび少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシド、少なくとも1個の非二環式修飾ヌクレオシド、および少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシド、少なくとも1個の非二環式修飾ヌクレオシド、および少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個のLNAヌクレオシド、少なくとも1個の非二環式修飾ヌクレオシド、および少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシド、少なくとも1個の2’-置換ヌクレオシド、および少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシド、少なくとも1個の2’-置換ヌクレオシド、および少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個のLNAヌクレオシド、少なくとも1個の2’-置換ヌクレオシド、および少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシド、少なくとも1個の2’-MOEヌクレオシド、および少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシド、少なくとも1個の2’-MOEヌクレオシド、および少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個のLNAヌクレオシド、少なくとも1個の2’-MOEヌクレオシド、および少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。
ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の二環式ヌクレオシド、少なくとも1個の2’-OMeヌクレオシド、および少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個の拘束エチルヌクレオシド、少なくとも1個の2’-OMeヌクレオシド、および少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーの3’-ウィングは、少なくとも1個のLNAヌクレオシド、少なくとも1個の2’-OMeヌクレオシド、および少なくとも1個の2’-デオキシヌクレオシドを含む。
iii. ある特定の中央領域(ギャップ)
ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、6~20個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、6~15個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、6~12個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、6~10個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、6~9個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、6~8個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、6または7個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、7~10個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、7~9個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、7または8個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、8~10個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、8または9個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、6個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、7個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、8個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、9個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、10個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、11個の連結したヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップは、12個の連結したヌクレオシドからなる。
ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップの各ヌクレオシドは、2’-デオキシヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ギャップは、1個以上の修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップの各ヌクレオシドは、2’-デオキシヌクレオシドであるか、または「DNA様」の修飾ヌクレオシドである。そのような実施形態において、「DNA様」とは、ギャップマーおよびRNA分子を含む二本鎖がRNase Hを活性化することができるようにヌクレオシドがDNAと同様の特徴を有することを意味する。例えば、ある特定の条件下で、2’-(ara)-Fは、RNase Hの活性化を支援することが示されており、それ故に、DNA様である。ある特定の実施形態において、ギャップマーのギャップの1個以上のヌクレオシドは、2’-デオキシヌクレオシドではなく、DNA様でもない。ある特定のそのような実施形態において、ギャップマーは、それでもやはり、RNase Hの活性化を支援する(例えば、非DNAヌクレオシドの数または設置のおかげで)。
ある特定の実施形態において、ギャップは、1個以上の修飾ヌクレオシドによって中断された一続きの非修飾2’-デオキシヌクレオシドを含み、それ故に、3個のサブ領域(2つの一続きの、1個以上の2’-デオキシヌクレオシドおよび一続きの1個以上の中断
修飾ヌクレオシド)をもたらす。ある特定の実施形態において、いずれの一続きの非修飾2’-デオキシヌクレオシドも、5、6、または7個のヌクレオシドより短い。ある特定の実施形態において、そのような短い続きは、短いギャップ領域を用いることによって達成される。ある特定の実施形態において、短い一続きは、より長いギャップ領域を中断することによって達成される。
ある特定の実施形態において、ギャップは、1個以上の修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップは、cEt、FHNA、LNA、および2-チオ-チミジンの中から選択される1個以上の修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップは、1個の修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップは、5’-Meおよび5’-(R)-Meの中から選択される5’-置換糖部分を含む。ある特定の実施形態において、ギャップは、2個の修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップは、3個の修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップは、4個の修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップは、2個以上の修飾ヌクレオシドを含み、各修飾ヌクレオシドは同一である。ある特定の実施形態において、ギャップは、2個以上の修飾ヌクレオシドを含み、各修飾ヌクレオシドは異なる。
ある特定の実施形態において、ギャップは、1個以上の修飾結合を含む。ある特定の実施形態において、ギャップは、1個以上のメチルホスホネート結合を含む。ある特定の実施形態において、ギャップは、2個以上の修飾結合を含む。ある特定の実施形態において、ギャップは、1個以上の修飾結合および1個以上の修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップは、1個の修飾結合および1個の修飾ヌクレオシドを含む。ある特定の実施形態において、ギャップは、2個の修飾結合および2個以上の修飾ヌクレオシドを含む。
b. ある特定のヌクレオシド間結合モチーフ
ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、定義されたパターンまたは修飾ヌクレオシド間結合モチーフでオリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って配置された修飾ヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、交互のヌクレオシド間結合モチーフを有する領域を含む。ある特定の実施形態において、本開示のオリゴヌクレオチドは、均一に修飾されたヌクレオシド間結合の領域を含む。ある特定のそのような実施形態において、オリゴヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合によって均一に連結された領域を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合によって均一に連結される。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合は、ホスホジエステルおよびホスホロチオエートから選択される。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合は、ホスホジエステルおよびホスホロチオエートから選択され、少なくとも1個のヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエートである。
ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも6個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも7個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも8個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも9個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも10個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも11個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも12個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態にお
いて、オリゴヌクレオチドは、少なくとも13個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも14個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。
ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも6個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間結合の少なくとも1個のブロックを含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも7個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間結合の少なくとも1個のブロックを含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも8個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間結合の少なくとも1個のブロックを含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも9個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間結合の少なくとも1個のブロックを含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも10個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間結合の少なくとも1個のブロックを含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、少なくとも1個の12個の連続したホスホロチオエートヌクレオシド間結合の少なくとも1個のブロックを含む。ある特定のそのような実施形態において、少なくとも1個のそのようなブロックは、オリゴヌクレオチドの3’末端に位置する。ある特定のそのような実施形態において、少なくとも1個のそのようなブロックは、オリゴヌクレオチドの3’末端の3個のヌクレオシド内に位置する。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、15個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、14個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、13個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、12個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、11個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、10個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、9個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、8個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、7個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、6個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、5個未満のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む。
c. ある特定の核酸塩基修飾モチーフ
ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、定義されたパターンまたは核酸塩基修飾モチーフでオリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って配置された核酸塩基に対する化学修飾を含む。ある特定のそのような実施形態において、核酸塩基修飾は、ギャップモチーフで配置される。ある特定の実施形態において、核酸塩基修飾は、交互のモチーフで配置される。ある特定の実施形態において、各核酸塩基が修飾される。ある特定の実施形態において、核酸塩基のうちのいずれも化学修飾されない。
ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基のブロックを含む。ある特定のそのような実施形態において、ブロックは、オリゴヌクレオチドの3’末端に存在する。ある特定の実施形態において、ブロックは、オリゴヌクレオチドの3’末端の3個のヌクレオチド内に存在する。ある特定のそのような実施形態において、ブロックは、オリゴヌクレオチドの5’末端に存在する。ある特定の実施形態において、ブロックは、オリゴヌクレオチドの5’末端の3個のヌクレオチド内に存在する。
ある特定の実施形態において、核酸塩基修飾は、オリゴヌクレオチドの特定の位置にお
ける天然塩基の機能である。例えば、ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドの各プリンまたは各ピリミジンが修飾される。ある特定の実施形態において、各アデニンが修飾される。ある特定の実施形態において、各グアニンが修飾される。ある特定の実施形態において、各チミンが修飾される。ある特定の実施形態において、各シトシンが修飾される。ある特定の実施形態において、各ウラシルが修飾される。
ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドのシトシン部分のうちのいくつかもしくはすべてが5-メチルシトシン部分であるか、またはいずれも5-メチルシトシン部分ではない。本明細書において、5-メチルシトシンは、「修飾核酸塩基」ではない。したがって、別途示されない限り、非修飾核酸塩基は、5-メチルを有するシトシン残基および5-メチルを欠くシトシン残基の両方を含む。ある特定の実施形態において、すべてまたはいくつかのシトシン核酸塩基のメチル化状態が特定される。
ある特定の実施形態において、核酸塩基に対する化学修飾は、ある特定の共役基の核酸塩基への結合を含む。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドの各プリンまたは各ピリミジンは、共役基を含むように任意に修飾され得る。
d. ある特定の全長
ある特定の実施形態において、本開示は、様々な範囲の長さのうちのいずれかのオリゴヌクレオチドを提供する。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、X~Y個の連結したヌクレオシドからなり、ここで、Xは、その範囲の最小数のヌクレオシドを表し、Yは、その範囲の最大数のヌクレオシドを表す。ある特定のそのような実施形態において、XおよびYは各々、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、および50から独立して選択されるが、但し、XがY以下であることを条件とする。例えば、ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、8~9、8~10、8~11、8~12、8~13、8~14、8~15、8~16、8~17、8~18、8~19、8~20、8~21、8~22、8~23、8~24、8~25、8~26、8~27、8~28、8~29、8~30、9~10、9~11、9~12、9~13、9~14、9~15、9~16、9~17、9~18、9~19、9~20、9~21、9~22、9~23、9~24、9~25、9~26、9~27、9~28、9~29、9~30、10~11、10~12、10~13、10~14、10~15、10~16、10~17、10~18、10~19、10~20、10~21、10~22、10~23、10~24、10~25、10~26、10~27、10~28、10~29、10~30、11~12、11~13、11~14、11~15、11~16、11~17、11~18、11~19、11~20、11~21、11~22、11~23、11~24、11~25、11~26、11~27、11~28、11~29、11~30、12~13、12~14、12~15、12~16、12~17、12~18、12~19、12~20、12~21、12~22、12~23、12~24、12~25、12~26、12~27、12~28、12~29、12~30、13~14、13~15、13~16、13~17、13~18、13~19、13~20、13~21、13~22、13~23、13~24、13~25、13~26、13~27、13~28、13~29、13~30、14~15、14~16、14~17、14~18、14~19、14~20、14~21、14~22、14~23、14~24、14~25、14~26、14~27、14~28、14~29、14~30、15~16、15~17、15~18、15~19、15~20、15~21、15~22、15~23、15~24、15~25、15~26、15~27、15~28、15~29、15~30、16~17、16~18、16~19、16~20、16~21、16~22、16~23、16~24、16~25、16~26、16~27、16~28、
16~29、16~30、17~18、17~19、17~20、17~21、17~22、17~23、17~24、17~25、17~26、17~27、17~28、17~29、17~30、18~19、18~20、18~21、18~22、18~23、18~24、18~25、18~26、18~27、18~28、18~29、18~30、19~20、19~21、19~22、19~23、19~24、19~25、19~26、19~29、19~28、19~29、19~30、20~21、20~22、20~23、20~24、20~25、20~26、20~27、20~28、20~29、20~30、21~22、21~23、21~24、21~25、21~26、21~27、21~28、21~29、21~30、22~23、22~24、22~25、22~26、22~27、22~28、22~29、22~30、23~24、23~25、23~26、23~27、23~28、23~29、23~30、24~25、24~26、24~27、24~28、24~29、24~30、25~26、25~27、25~28、25~29、25~30、26~27、26~28、26~29、26~30、27~28、27~29、27~30、28~29、28~30、または29~30個の連結したヌクレオシドからなり得る。ある範囲またはある特定の数にかかわらず、化合物のオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの数が限定される実施形態において、この化合物は、それでもやはり、さらなる他の置換基をさらに含み得る。例えば、8~30個のヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドは、31個のヌクレオシドを有するオリゴヌクレオチドを除外するが、別途示されない限り、そのようなオリゴヌクレオチドは、例えば、1個以上の共役基、末端基、または他の置換基をさらに含み得る。
さらに、オリゴヌクレオチドが全長範囲および特定の長さを有する領域によって説明され、かつそれらの領域の特定の長さの合計が全長範囲の上限未満である場合、オリゴヌクレオチドは、特定の領域の長さを超えてさらなるヌクレオシドを有し得るが、但し、ヌクレオシドの総数が全長範囲の上限を超えないことを条件とする。
5. ある特定のアンチセンスオリゴヌクレオチドの化学的モチーフ
ある特定の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドの化学構造的特徴は、それらの糖モチーフ、ヌクレオシド間結合モチーフ、核酸塩基修飾モチーフ、および全長によって特徴付けられる。ある特定の実施形態において、そのようなパラメータは各々、互いに独立している。したがって、ギャップマー糖モチーフを有するオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合は、修飾されても修飾されなくてもよく、糖修飾のギャップマー修飾パターンに従っても従わなくてもよい。したがって、糖ギャップマーのウィング領域内のヌクレオシド間結合は、互いに同一であるか、または異なり得、ギャップ領域のヌクレオシド間結合と同一であるか、または異なり得る。同様に、そのような糖ギャップマーオリゴヌクレオチドは、糖修飾のギャップマーパターンから独立して1個以上の修飾核酸塩基を含み得る。当業者であれば、そのようなモチーフが組み合わされて様々なオリゴヌクレオチドを作成し得ることを認識する。
ある特定の実施形態において、ヌクレオシド間結合およびヌクレオシド修飾の選択は、互いに独立していない。
i. ある特定の配列および標的
ある特定の実施形態において、本発明は、標的核酸に相補的な配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供する。そのようなアンチセンス化合物は、標的核酸にハイブリダイズすることができ、少なくとも1つのアンチセンス活性をもたらす。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、1個以上の標的核酸に特異的にハイブリダイズする。ある特定の実施形態において、特異的にハイブリダイズするアンチセンス化合物は、標的核酸に対して、ハイブリダイゼーションを可能にし、かつアンチセンス活性をもたらすのに十分な相補性と、任意の非標的に対して、特異的ハイブリダイゼーションが所望
される条件下(例えば、生体内または治療的使用のために生理学的条件下、かつ生体外アッセイの場合、アッセイが実行される条件下)で非標的核酸配列への非特異的ハイブリダイゼーションを回避するか、または減少させるのに不十分な相補性とを有する領域を含む核酸塩基配列と、を有する。ある特定の実施形態において、標的および非標的が両方ともに標的配列を含むが、オリゴヌクレオチドは、標的と非標的との間で選択的である。そのような実施形態において、選択性は、一方の核酸分子と比較した他方の核酸分子の標的領域の相対近接性に起因し得る。
ある特定の実施形態において、本開示は、オリゴヌクレオチドの全長にわたって標的核酸に完全に相補的なオリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物を提供する。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、標的核酸に99%相補的である。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、標的核酸に95%相補的である。ある特定の実施形態において、そのようなオリゴヌクレオチドは、標的核酸に90%相補的である。
ある特定の実施形態において、そのようなオリゴヌクレオチドは、標的核酸に85%相補的である。ある特定の実施形態において、そのようなオリゴヌクレオチドは、標的核酸に80%相補的である。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、標的核酸に完全に相補的であり、かつオリゴヌクレオチドの全長にわたって標的核酸に少なくとも80%相補的な領域を含む。ある特定のそのような実施形態において、完全な相補性の領域は、6~14核酸塩基長である。
ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、ハイブリダイズ領域および末端領域を含む。ある特定のそのような実施形態において、ハイブリダイズ領域は、12~30個の連結したヌクレオシドからなり、標的核酸に完全に相補的である。ある特定の実施形態において、ハイブリダイズ領域は、標的核酸と比較して、1つのミスマッチを含む。ある特定の実施形態において、ハイブリダイズ領域は、標的核酸と比較して、2つのミスマッチを含む。ある特定の実施形態において、ハイブリダイズ領域は、標的核酸と比較して、3つのミスマッチを含む。ある特定の実施形態において、末端領域は、1~4個の末端ヌクレオシドからなる。ある特定の実施形態において、末端ヌクレオシドは、3’末端に存在する。ある特定の実施形態において、末端ヌクレオシドのうちの1個以上は、標的核酸に相補的ではない。
アンチセンス機構は、標的核酸とのオリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーションを伴う任意の機構を含み、このハイブリダイゼーションは、生物学的効果をもたらす。ある特定の実施形態において、そのようなハイブリダイゼーションは、例えば、標的核酸の翻訳、転写、またはスプライシングを伴う細胞機構の同時に起こる阻害または刺激による標的核酸分解または占有のいずれかをもたらす。
標的RNAの分解を伴う一種のアンチセンス機構は、RNase H媒介アンチセンスである。RNase Hは、RNA:DNA二本鎖のRNA鎖を切断する細胞性エンドヌクレアーゼである。「DNA様」の一本鎖アンチセンス化合物が哺乳類細胞におけるRNase H活性を誘発することが当技術分野で既知である。したがって、RNase Hの活性化は、RNA標的の切断をもたらし、それにより遺伝子発現のDNA様オリゴヌクレオチド媒介阻害の効率を大幅に向上させる。
ある特定の実施形態において、共役基は、切断可能な部分を含む。ある特定の実施形態において、共役基は、1個以上の切断可能な結合を含む。ある特定の実施形態において、共役基は、リンカーを含む。ある特定の実施形態において、リンカーは、タンパク質結合部分を含む。ある特定の実施形態において、共役基は、細胞標的部分(細胞標的基とも称
される)を含む。ある特定の実施形態において、細胞標的部分は、分岐基を含む。ある特定の実施形態において、細胞標的部分は、1個以上のテザーを含む。ある特定の実施形態において、細胞標的部分は、炭水化物または炭水化物クラスターを含む。
ii. ある特定の切断可能な部分
ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、切断可能な結合である。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、切断可能な結合を含む。ある特定の実施形態において、共役基は、切断可能な部分を含む。ある特定のそのような実施形態において、切断可能な部分は、アンチセンスオリゴヌクレオチドに結合する。ある特定のそのような実施形態において、切断可能な部分は、細胞標的部分に直接結合する。ある特定のそのような実施形態において、切断可能な部分は、共役リンカーに結合する。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスフェートまたはホスホジエステルを含む。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、切断可能なヌクレオシドまたはヌクレオシド類似体である。ある特定の実施形態において、ヌクレオシドまたはヌクレオシド類似体は、プリン、置換プリン、ピリミジン、または置換ピリミジンから選択される任意に保護された複素環式塩基を含む。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ウラシル、チミン、シトシン、4-N-ベンゾイルシトシン、5-メチルシトシン、4-N-ベンゾイル-5-メチルシトシン、アデニン、6-N-ベンゾイルアデニン、グアニン、および2-N-イソブチリルグアニンから選択される任意に保護された複素環式塩基を含むヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスホジエステル結合によってアンチセンスオリゴヌクレオチドの3’位に結合され、かつホスホジエステルまたはホスホロチオエート結合によってリンカーに結合される2’-デオキシヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスホジエステル結合によってアンチセンスオリゴヌクレオチドの3’位に結合され、かつホスホジエステルまたはホスホロチオエート結合によってリンカーに結合される2’-デオキシアデノシンである。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスホジエステル結合によってアンチセンスオリゴヌクレオチドの3’位に結合され、かつホスホジエステル結合によってリンカーに結合される2’-デオキシアデノシンである。
ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、アンチセンスオリゴヌクレオチドの3’位に結合される。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’位に結合される。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、アンチセンスオリゴヌクレオチドの2’位に結合される。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスホジエステル結合によってアンチセンスオリゴヌクレオチドに結合される。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスホジエステル結合またはホスホロチオエート結合のいずれかによってリンカーに結合される。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスホジエステル結合によってリンカーに結合される。ある特定の実施形態において、共役基は、切断可能な部分を含まない。
ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、標的細胞によって内部に取り入れられた後にのみ、複合体が動物に投与された後に切断される。細胞内で切断可能な部分が切断され、それにより活性アンチセンスオリゴヌクレオチドを放出する。理論によって束縛されることを望むものではないが、切断可能な部分が細胞内で1個以上のヌクレアーゼによって切断されることが考えられる。ある特定の実施形態において、1個以上のヌクレアーゼは、切断可能な部分とリンカーとの間のホスホジエステル結合を切断する。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、以下
Figure 0007177127000511
の中から選択される構造を有し、
式中、Bx、Bx、Bx、およびBxの各々は、独立して複素環式塩基部分である。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000512
iii. ある特定のリンカー
ある特定の実施形態において、共役基は、リンカーを含む。ある特定のそのような実施形態において、リンカーは、切断可能な部分に共有結合される。ある特定のそのような実施形態において、リンカーは、アンチセンスオリゴヌクレオチドに共有結合される。ある特定の実施形態において、リンカーは、細胞標的部分に共有結合される。ある特定の実施形態において、リンカーは、固体支持体への共有結合をさらに含む。ある特定の実施形態において、リンカーは、タンパク質結合部分への共有結合をさらに含む。ある特定の実施形態において、リンカーは、固体支持体への共有結合をさらに含み、タンパク質結合部分への共有結合もさらに含む。ある特定の実施形態において、リンカーは、テザーリガンドの結合のために複数の位置を含む。ある特定の実施形態において、リンカーは、テザーリガンドの結合のために複数の位置を含み、分岐基に結合されない。ある特定の実施形態において、リンカーは、1個以上の切断可能な結合をさらに含む。ある特定の実施形態において、共役基は、リンカーを含まない。
ある特定の実施形態において、リンカーは、アルキル、アミド、ジスルフィド、ポリエチレングリコール、エーテル、チオエーテル(-S-)、およびヒドロキシルアミノ(-O-N(H)-)基から選択される基を含む少なくとも1個の線状基を含む。ある特定の実施形態において、線状基は、アルキル、アミド、およびエーテル基から選択される基を
含む。ある特定の実施形態において、線状基は、アルキルおよびエーテル基から選択される基を含む。ある特定の実施形態において、線状基は、少なくとも1個のリン結合基を含む。ある特定の実施形態において、線状基は、少なくとも1個のホスホジエステル基を含む。ある特定の実施形態において、線状基は、少なくとも1個の中性結合基を含む。ある特定の実施形態において、線状基は、細胞標的部分および切断可能な部分に共有結合される。ある特定の実施形態において、線状基は、細胞標的部分およびアンチセンスオリゴヌクレオチドに共有結合される。ある特定の実施形態において、線状基は、細胞標的部分、切断可能な部分、および固体支持体に共有結合される。ある特定の実施形態において、線状基は、細胞標的部分、切断可能な部分、固体支持体、およびタンパク質結合部分に共有結合される。ある特定の実施形態において、線状基は、1個以上の切断可能な結合を含む。
ある特定の実施形態において、リンカーは、足場基に共有結合される線状基を含む。ある特定の実施形態において、足場は、アルキル、アミド、ジスルフィド、ポリエチレングリコール、エーテル、チオエーテル、およびヒドロキシルアミノ基から選択される基を含む分岐状脂肪族基を含む。ある特定の実施形態において、足場は、アルキル、アミド、およびエーテル基から選択される基を含む分岐状脂肪族基を含む。ある特定の実施形態において、足場は、少なくとも1個の単環式または多環式環系を含む。ある特定の実施形態において、足場は、少なくとも2個の単環式または多環式環系を含む。ある特定の実施形態において、線状基は、足場基に共有結合され、足場基は、切断可能な部分およびリンカーに共有結合される。ある特定の実施形態において、線状基は、足場基に共有結合され、足場基は、切断可能な部分、リンカー、および固体支持体に共有結合される。ある特定の実施形態において、線状基は、足場基に共有結合され、足場基は、切断可能な部分、リンカー、およびタンパク質結合部分に共有結合される。ある特定の実施形態において、線状基は、足場基に共有結合され、足場基は、切断可能な部分、リンカー、タンパク質結合部分、および固体支持体に共有結合される。ある特定の実施形態において、足場基は、1個以上の切断可能な結合を含む。
ある特定の実施形態において、リンカーは、タンパク質結合部分を含む。ある特定の実施形態において、タンパク質結合部分は、例えば、コレステロール、コール酸、アダマンタン酢酸、1-ピレン酪酸、ジヒドロテストステロン、1,3-ビス-O(ヘキサデシル)グリセロール、ゲラニルオキシヘキシル基、ヘキサデシルグリセロール、ボルネオール、メントール、1,3-プロパンジオール、ヘプタデシル基、パルミチン酸、ミリスチン酸、O3-(オレオイル)リトコール酸、O3-(オレオイル)コレン酸、ジメトキシトリチル、またはフェノキサジン)、ビタミン(例えば、葉酸塩、ビタミンA、ビタミンE、ビオチン、ピリドキサール)、ペプチド、炭水化物(例えば、単糖、二糖、三糖、四糖、オリゴ糖、多糖)、エンドソーム溶解成分、ステロイド(例えば、ウバオール、ヘシゲニン、ジオスゲニン)、テルペン(例えば、トリテルペン、例えば、サルササポゲニン、フリーデリン、エピフリーデラノール誘導体化リトコール酸)、またはカチオン性脂質を含むが、これらに限定されない脂質である。ある特定の実施形態において、タンパク質結合部分は、C16~C22長鎖飽和もしくは不飽和脂肪酸、コレステロール、コール酸、ビタミンE、アダマンタン、または1-ペンタフルオロプロピルである。
ある特定の実施形態において、リンカーは、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000513
式中、各nは、独立して、1~20であり、pは、1~6である。
ある特定の実施形態において、リンカーは、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000514
式中、各nは、独立して、1~20である。
ある特定の実施形態において、リンカーは、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000515
式中、nは、1~20である。
ある特定の実施形態において、リンカーは、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000516
式中、各Lは、独立して、リン結合基または中性結合基であり、
各nは、独立して、1~20である。
ある特定の実施形態において、リンカーは、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000517
Figure 0007177127000518
ある特定の実施形態において、リンカーは、以下の中から選択される構造を有する。

Figure 0007177127000519
ある特定の実施形態において、リンカーは、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000520
ある特定の実施形態において、リンカーは、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000521
式中、nは、1~20である。
ある特定の実施形態において、リンカーは、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000522
ある特定の実施形態において、リンカーは、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000523
ある特定の実施形態において、リンカーは、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000524
ある特定の実施形態において、共役リンカーは、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000525
ある特定の実施形態において、共役リンカーは、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000526
ある特定の実施形態において、リンカーは、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000527
ある特定の実施形態において、リンカーは、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000528
式中、各nは、独立して、0、1、2、3、4、5、6、または7である。
iv. ある特定の細胞標的部分
ある特定の実施形態において、共役基は、細胞標的部分を含む。ある特定のそのような細胞標的部分は、アンチセンス化合物の細胞取り込みを増加させる。ある特定の実施形態において、細胞標的部分は、分岐基、1個以上のテザー、および1個以上のリガンドを含む。ある特定の実施形態において、細胞標的部分は、分岐基、1個以上のテザー、1個以上のリガンド、および1個以上の切断可能な結合を含む。
1. ある特定の分岐基
ある特定の実施形態において、共役基は、分岐基および少なくとも2個のテザーリガンドを含む標的部分を含む。ある特定の実施形態において、分岐基は、共役リンカーを結合する。ある特定の実施形態において、分岐基は、切断可能な部分を結合する。ある特定の実施形態において、分岐基は、アンチセンスオリゴヌクレオチドを結合する。ある特定の実施形態において、分岐基は、リンカーおよびテザーリガンドの各々に共有結合される。ある特定の実施形態において、分岐基は、アルキル、アミド、ジスルフィド、ポリエチレングリコール、エーテル、チオエーテルおよびヒドロキシルアミノ基から選択される基を含む分岐状脂肪族基を含む。ある特定の実施形態において、分岐基は、アルキル、アミド、およびエーテル基から選択される基を含む。ある特定の実施形態において、分岐基は、アルキルおよびエーテル基から選択される基を含む。ある特定の実施形態において、分岐基は、単環式または多環式環系を含む。ある特定の実施形態において、分岐基は、1個以上の切断可能な結合を含む。ある特定の実施形態において、共役基は、分岐基を含まない。
ある特定の実施形態において、分岐基は、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000529
Figure 0007177127000530
式中、各nは、独立して、1~20であり、
jは、1~3であり、
mは、2~6である。
ある特定の実施形態において、分岐基は、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000531
各nは、独立して、1~20であり、
mは、2~6である。
ある特定の実施形態において、分岐基は、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000532
Figure 0007177127000533
ある特定の実施形態において、分岐基は、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000534
式中、各Aは、独立して、O、S、C=O、またはNHであり、
各nは、独立して、1~20である。
ある特定の実施形態において、分岐基は、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000535
式中、各Aは、独立して、O、S、C=O、またはNHであり、
各nは、独立して、1~20である。
ある特定の実施形態において、分岐基は、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000536
式中、Aは、O、S、C=O、またはNHであり、
各nは、独立して、1~20である。
ある特定の実施形態において、分岐基は、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000537
ある特定の実施形態において、分岐基は、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000538
ある特定の実施形態において、分岐基は、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000539
2. ある特定のテザー
ある特定の実施形態において、共役基は、分岐基に共有結合される1個以上のテザーを含む。ある特定の実施形態において、共役基は、結合基に共有結合される1個以上のテザーを含む。ある特定の実施形態において、各テザーは、任意の組み合わせで、アルキル、エーテル、チオエーテル、ジスルフィド、アミド、およびポリエチレングリコール基から選択される1個以上の基を含む線状脂肪族基である。ある特定の実施形態において、各テザーは、任意の組み合わせで、アルキル、置換アルキル、エーテル、チオエーテル、ジスルフィド、アミド、ホスホジエステルおよびポリエチレングリコール基から選択される1個以上の基を含む線状脂肪族基である。ある特定の実施形態において、各テザーは、任意の組み合わせで、アルキル、エーテル、およびアミド基から選択される1個以上の基を含む線状脂肪族基である。ある特定の実施形態において、各テザーは、任意の組み合わせで、アルキル、置換アルキル、ホスホジエステル、エーテル、およびアミド基から選択される1個以上の基を含む線状脂肪族基である。ある特定の実施形態において、各テザーは、
任意の組み合わせで、アルキルおよびホスホジエステルから選択される1個以上の基を含む線状脂肪族基である。ある特定の実施形態において、各テザーは、少なくとも1個のリン結合基または中性結合基を含む。
ある特定の実施形態において、テザーは、1個以上の切断可能な結合を含む。ある特定の実施形態において、テザーは、アミド基またはエーテル基のいずれかを介して分岐基に結合される。ある特定の実施形態において、テザーは、ホスホジエステル基を介して分岐基に結合される。ある特定の実施形態において、テザーは、リン結合基または中性結合基を介して分岐基に結合される。ある特定の実施形態において、テザーは、エーテル基を介して分岐基に結合される。ある特定の実施形態において、テザーは、アミド基またはエーテル基のいずれかを介してリガンドに結合される。ある特定の実施形態において、テザーは、エーテル基を介してリガンドに結合される。ある特定の実施形態において、テザーは、アミド基またはエーテル基のいずれかを介してリガンドに結合される。ある特定の実施形態において、テザーは、エーテル基を介してリガンドに結合される。
ある特定の実施形態において、各テザーは、リガンドと分岐基との間に約8~約20の原子鎖長を含む。ある特定の実施形態において、各テザー基は、リガンドと分岐基との間に約10~約18の原子鎖長を含む。ある特定の実施形態において、各テザー基は、約13の原子鎖長を含む。
ある特定の実施形態において、テザーは、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000540
各nは、独立して、1~20であり、
各pは、1~約6である。
ある特定の実施形態において、テザーは、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000541
ある特定の実施形態において、テザーは、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000542
式中、各nは、独立して、1~20である。
ある特定の実施形態において、テザーは、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000543
式中、Lは、リン結合基または中性結合基のいずれかであり、
は、C(=O)O-Rであり、
は、H、C~Cアルキル、または置換C~Cアルキであり、
は、H、C~Cアルキルまたは置換C~Cアルキであり、
各mは、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmは、各テザーに対して0を超える。
ある特定の実施形態において、テザーは、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000544
ある特定の実施形態において、テザーは、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000545
式中、Zは、HまたはCHであり、
各mは、独立して、0~20であり、少なくとも1つのmは、各テザーに対して0を超える。
ある特定の実施形態において、テザーは、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000546
Figure 0007177127000547
式中、各nは、独立して、0、1、2、3、4、5、6、または7である。
ある特定の実施形態において、テザーは、リン結合基を含む。ある特定の実施形態において、テザーは、いかなるアミド結合も含まない。ある特定の実施形態において、テザーは、リン結合基を含み、いかなるアミド結合も含まない。
3. ある特定のリガンド
ある特定の実施形態において、本開示は、各リガンドがテザーに共有結合されるリガンドを提供する。ある特定の実施形態において、各リガンドは、標的細胞において少なくとも1種類の受容体に対する親和性を有するように選択される。ある特定の実施形態において、哺乳類肝臓細胞の表面において少なくとも1種類の受容体に対する親和性を有するリガンドが選択される。ある特定の実施形態において、肝アシアロ糖タンパク質受容体(ASGP-R)に対する親和性を有するリガンドが選択される。ある特定の実施形態において、各リガンドは、炭水化物である。ある特定の実施形態において、各リガンドは、ガラクトース、N-アセチルガラクトースアミン、マンノース、グルコース、グルコサミン、およびフコースから独立して選択される。ある特定の実施形態において、各リガンドは、N-アセチルガラクトースアミン(GalNAc)である。ある特定の実施形態において、標的部分は、2~6個のリガンドを含む。ある特定の実施形態において、標的部分は、3個のリガンドを含む。ある特定の実施形態において、標的部分は、3個のN-アセチルガラクトースアミンリガンドを含む。
ある特定の実施形態において、リガンドは、炭水化物、炭水化物誘導体、修飾炭水化物、多価炭水化物クラスター、多糖、修飾多糖、または多糖誘導体である。ある特定の実施形態において、リガンドは、アミノ糖またはチオ糖である。例えば、アミノ糖は、当技術分野で既知の任意の数の化合物、例えば、グルコサミン、シアル酸、α-D-ガラクトサミン、N-アセチルガラクトサミン、2-アセトアミド-2-デオキシ-D-ガラクトピラノース(GalNAc)、2-アミノ-3-O-[(R)-1-カルボキシエチル]-2-デオキシ-β-D-グルコピラノース(β-ムラミン酸)、2-デオキシ-2-メチルアミノ-L-グルコピラノース、4,6-ジデオキシ-4-ホルムアミド-2,3-ジ-O-メチル-D-マンノピラノース、2-デオキシ-2-スルホアミノ-D-グルコピラノース、およびN-スルホ-D-グルコサミン、およびN-グリコロイル-α-ノイラミン酸から選択され得る。例えば、チオ糖は、5-チオ-β-D-グルコピラノース、メチル2,3,4-トリ-O-アセチル-1-チオ-6-O-トリチル-α-D-グルコピラノシド、4-チオ-β-D-ガラクトピラノース、およびエチル3,4,6,7-テトラ-O-アセチル-2-デオキシ-1,5-ジチオ-α-D-グルコ-ヘプトピラノシドからなる群から選択され得る。
ある特定の実施形態において、「GalNac」または「Gal-NAc」は、文献内で一般にN-アセチルガラクトサミンと称される2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-D-ガラクトピラノースを指す。ある特定の実施形態において、「N-アセチルガラク
トサミン」は、2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-D-ガラクトピラノースを指す。ある特定の実施形態において、「GalNac」または「Gal-NAc」は、2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-D-ガラクトピラノースを指す。ある特定の実施形態において、「GalNac」または「Gal-NAc」は、β形態:2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-β-D-ガラクトピラノースおよびα形態:2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-D-ガラクトピラノースの両方を含む、2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-D-ガラクトピラノースを指す。ある特定の実施形態において、β形態:2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-β-D-ガラクトピラノースおよびα形態:2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-D-ガラクトピラノースはどちらも、同義に使用され得る。したがって、1つの形態が示される構造において、これらの構造は、他の形態も同様に含むよう意図される。例えば、α形態:2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-D-ガラクトピラノースの構造が示される場合、この構造は、他の形態も同様に含むよう意図される。ある特定の実施形態において、ある特定の好ましい実施形態において、β形態:2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-D-ガラクトピラノースが好ましい実施形態である。
Figure 0007177127000548
Figure 0007177127000549
Figure 0007177127000550
ある特定の実施形態において、1個以上のリガンドは、以下の中から選択される構造を有し、
Figure 0007177127000551
式中、各Rは、OHおよびNHCOOHから選択される。
ある特定の実施形態において、1個以上のリガンドは、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000552
ある特定の実施形態において、1個以上のリガンドは、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000553
ある特定の実施形態において、1個以上のリガンドは、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000554
i. ある特定の共役体
ある特定の実施形態において、共役基は、上述の構造的特徴を含む。ある特定のそのよ
うな実施形態において、共役基は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000555
式中、各nは、独立して、1~20である。
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000556
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000557
式中、各nは、独立して、1~20であり、
Zは、Hまたは結合固体支持体であり、
Qは、アンチセンス化合物であり、
Xは、OまたはSであり、
Bxは、複素環式塩基部分である。
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000558
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000559
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000560
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000561
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000562
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000563
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000564
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000565
ある特定の実施形態において、共役体は、ピロリジンを含まない。
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000566
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000567
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000568
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000569
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000570
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000571
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000572
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000573
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000574
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000575
ある特定のそのような実施形態において、共役基は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000576
ある特定の実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000577
式中、Xは、6~11個の連続結合原子の置換または非置換テザーである。
ある特定の実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000578
式中、Xは、10個の連続結合原子の置換または非置換テザーである。
ある特定の実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000579
式中、Xは、4~11個の連続結合原子の置換または非置換テザーであり、前記テザーは、正確に1個のアミド結合を含む。
ある特定の実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000580
式中、YおよびZは、C~C12置換もしくは非置換アルキル、アルケニル、もしくはアルキニル基、またはエーテル、ケトン、アミド、エステル、カルバメート、アミン、ピペリジン、ホスフェート、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、トリアゾール、ピロリジン、ジスルフィド、もしくはチオエーテルを含む基から独立して選択される。
ある特定のそのような実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000581
式中、YおよびZは、C~C12置換もしくは非置換アルキル基、または正確に1個のエーテルもしくは正確に2個のエーテル、アミド、アミン、ピペリジン、ホスフェート、ホスホジエステル、またはホスホロチオエートを含む基から独立して選択される。
ある特定のそのような実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し

Figure 0007177127000582
式中、YおよびZは、C~C12置換または非置換アルキル基から独立して選択される。
ある特定のそのような実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000583
式中、mおよびnは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、および12から独立して選択される。
ある特定のそのような実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000584
式中、mは、4、5、6、7、または8であり、nは、1、2、3、または4である。
ある特定の実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000585
式中、Xは、4~13個の連続結合原子の置換または非置換テザーであり、Xは、エーテル基を含まない。
ある特定の実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000586
式中、Xは、8個の連続結合原子の置換または非置換テザーであり、Xは、エーテル基を含まない。
ある特定の実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000587
式中、Xは、4~13個の連続結合原子の置換または非置換テザーであり、前記テザーは、正確に1個のアミド結合を含み、Xは、エーテル基を含まない。
ある特定の実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000588
式中、Xは、4~13個の連続結合原子の置換または非置換テザーであり、前記テザーは、アミド結合および置換または非置換C~C11アルキル基からなる。
ある特定の実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000589
式中、Yは、C~C12置換もしくは非置換アルキル、アルケニル、もしくはアルキニル基、またはエーテル、ケトン、アミド、エステル、カルバメート、アミン、ピペリジン、ホスフェート、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、トリアゾール、ピロリジン、ジスルフィド、もしくはチオエーテルを含む基から選択される。
ある特定のそのような実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000590
式中、Yは、C~C12置換もしくは非置換アルキル基、またはエーテル、アミン、ピペリジン、ホスフェート、ホスホジエステル、もしくはホスホロチオエートを含む基から選択される。
ある特定のそのような実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し

Figure 0007177127000591
式中、Yは、C~C12置換または非置換アルキル基から選択される。
ある特定のそのような実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000592
式中、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12である。
ある特定のそのような実施形態において、共役基の細胞標的部分は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000593
式中、nは、4、5、6、7、または8である。
b. ある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役体は、ヌクレオシドの2’、3’、または5’位でアンチセンスオリゴヌクレオチドのヌクレオシドに結合される。ある特定の実施形態にお
いて、共役アンチセンス化合物は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000594
式中、
Aは、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bは、切断可能な部分であり、
Cは、共役リンカーであり、
Dは、分岐基であり、
各Eは、テザーであり、
各Fは、リガンドであり、
qは、1~5の整数である。
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000595
式中、
Aは、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Cは、共役リンカーであり、
Dは、分岐基であり、
各Eは、テザーであり、
各Fは、リガンドであり、
qは、1~5の整数である。
ある特定のそのような実施形態において、共役リンカーは、少なくとも1個の切断可能な結合を含む。
ある特定のそのような実施形態において、分岐基は、少なくとも1個の切断可能な結合を含む。
ある特定の実施形態において、各テザーは、少なくとも1個の切断可能な結合を含む。
ある特定の実施形態において、共役体は、ヌクレオシドの2’、3’、または5’位でアンチセンスオリゴヌクレオチドのヌクレオシドに結合される。
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000596
式中、
Aは、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bは、切断可能な部分であり、
Cは、共役リンカーであり、
各Eは、テザーであり、
各Fは、リガンドであり、
qは、1~5の整数である。
ある特定の実施形態において、共役体は、ヌクレオシドの2’、3’、または5’位でアンチセンスオリゴヌクレオチドのヌクレオシドに結合される。ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000597
式中、
Aは、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Cは、共役リンカーであり、
各Eは、テザーであり、
各Fは、リガンドであり、
qは、1~5の整数である。
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000598
式中、
Aは、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Bは、切断可能な部分であり、
Dは、分岐基であり、
各Eは、テザーであり、
各Fは、リガンドであり、
qは、1~5の整数である。
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、以下の構造を有し、
Figure 0007177127000599
式中、
Aは、アンチセンスオリゴヌクレオチドであり、
Dは、分岐基であり、
各Eは、テザーであり、
各Fは、リガンドであり、
qは、1~5の整数である。
ある特定のそのような実施形態において、共役リンカーは、少なくとも1個の切断可能な結合を含む。
ある特定の実施形態において、各テザーは、少なくとも1個の切断可能な結合を含む。
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000600

ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000601
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、以下の中から選択される構造を有する。
Figure 0007177127000602
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000603
上述の共役体、共役アンチセンス化合物、テザー、リンカー、分岐基、リガンド、切断可能な部分、ならびに他の修飾のある特定の調製を教示する代表的な米国特許、米国特許出願公開物、および国際特許出願公開物には、米国特許第5,994,517号、同第6,300,319号、同第6,660,720号、同第6,906,182号、同第7,262,177号、同第7,491,805号、同第8,106,022号、同第7,723,509号、同第2006/0148740号、同第2011/0123520号、国際公開第WO2013/033230号、および同第WO2012/037254号が含まれるが、これらに限定されず、これらの各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
上述の共役体、共役アンチセンス化合物、テザー、リンカー、分岐基、リガンド、切断可能な部分、ならびに他の修飾のある特定の調製を教示する代表的な出版物には、BIESSEN et al.,“The Cholesterol Derivative of a Triantennary Galactoside with High Affinity for the Hepatic Asialoglycoprot
ein Receptor:a Potent Cholesterol Lowering Agent”J.Med.Chem.(1995)38:1846-1852、BIESSEN et al.,“Synthesis of Cluster Galactosides with High Affinity for the Hepatic Asialoglycoprotein Receptor”J.Med.Chem.(1995)38:1538-1546、LEE et al.,“New and more efficient multivalent glyco-ligands for asialoglycoprotein receptor of mammalian hepatocytes”Bioorganic & Medicinal Chemistry(2011)19:2494-2500、RENSEN et
al.,“Determination of the Upper Size Limit for Uptake and Processing of Ligands
by the Asialoglycoprotein Receptor on Hepatocytes in Vitro and in Vivo”J.Biol.Chem.(2001)276(40):37577-37584、RENSEN et al.,“Design and Synthesis of Novel N-Acetylgalactosamine-Terminated Glycolipids for Targeting of Lipoproteins to the Hepatic Asialoglycoprotein Receptor”J.Med.Chem.(2004)47:5798-5808、SLIEDREGT et al.,“Design and Synthesis of Novel Amphiphilic Dendritic Galactosides for Selective Targeting of Liposomes to the Hepatic Asialoglycoprotein Receptor”J.Med.Chem.(1999)42:609-618、およびValentijn et al.,“Solid-phase synthesis of lysine-based cluster
galactosides with high affinity for the
Asialoglycoprotein Receptor”Tetrahedron,1997,53(2),759-770が含まれるが、これらに限定されず、これらの各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、RNase Hベースのオリゴヌクレオチド(ギャップマー等)またはスプライス調節オリゴヌクレオチド(完全修飾オリゴヌクレオチド等)、および少なくとも1つ、2つ、または3個のGalNAc基を含む任意の共役基を含む。ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、以下の参考文献:Lee,Carbohydr Res,1978,67,509-514、Connolly et al.,J Biol Chem,1982,257,939-945、Pavia et al.,Int J Pep Protein Res,1983,22,539-548、Lee et al.,Biochem,1984,23,4255-4261、Lee et al.,Glycoconjugate
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08/0281044号、同第US2010/0240730号、同第US2003/0119724号、同第US2006/0183886号、同第US2008/0206869号、同第US2011/0269814号、同第US2009/0286973号、同第US2011/0207799号、同第US2012/0136042号、同第US2012/0165393号、同第US2008/0281041号、同第US2009/0203135号、同第US2012/0035115号、同第US2012/0095075号、同第US2012/0101148号、同第US2012/0128760号、同第US2012/0157509号、同第US2012/0230938号、同第US2013/0109817号、同第US2013/0121954号、同第US2013/0178512号、同第US2013/0236968号、同第US2011/0123520号、同第US2003/0077829号、同第US2008/0108801号、および同第US2009/0203132号のうちのいずれかにおいて見出される任意の共役基を含み、これらの各々は、参照によりその全体が組み込まれる。
C. ある特定の用途および特徴
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、生体内で標的RNAの強力な減少を示す。ある特定の実施形態において、非共役アンチセンス化合物は、腎臓に蓄積する。ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、肝臓に蓄積する。ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、良好な耐容性を示す。そのような特性は、共役アンチセンス化合物を、代謝性、心臓血管、および他の疾患、障害、または状態に関与する標的RNAを含むが、これらに限定されない多くの標的RNAの阻害に特に有用にする。したがって、肝臓組織を、そのような疾患、障害、または状態に関連したRNAを標的にする共役アンチセンス化合物と接触させることによって、そのような疾患、障害、または状態を治療する方法が本明細書に提供される。したがって、本発明の共役アンチセンス化合物を用いて、様々な代謝性、心臓血管、および他の疾患、障害、または状態のうちのいずれかを改善するための方法も提供される。
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、特定の組織濃度で非共役対応物よりも強力である。いかなる理論または機構によって束縛されることを望むことなく、ある特定の実施形態において、共役体は、共役アンチセンス化合物がより効率的に細胞に入るか、またはより生産的に細胞に入ることを可能にし得る。例えば、ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、その非共役対応物と比較して、より高い標的還元を示し得、共役アンチセンス化合物およびその非共役対応物は両方ともに、同一の濃度で組織に存在する。例えば、ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、その非共役対応物と比較して、より高い標的還元を示し得、共役アンチセンス化合物およびその非共役対応物は両方ともに、同一の濃度で肝臓に存在する。
オリゴヌクレオチドの生産的および非生産的な取り込みは、以前に論じられている(例えば、Geary,R.S.,E.Wancewicz,et al.(2009).“Effect of Dose and PlasmaConcentration on Liver Uptake and Pharmacologic Activity of a 2’-Methoxyethyl Modified Chimeric
Antisense Oligonucleotide Targeting PTEN.”Biochem.Pharmacol.78(3):284-91、およびKoller,E.,T.M.Vincent,et al.(2011).“Mechanisms of single-stranded phosphorothioate modified antisense oligonucleotide accumulation in hepatocytes.”Nucleic Acids Res.39(11):4795-807を参照のこと)。本明細書に記載される共役基は、生産的な取り込みを改善し得る。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される共役基は、特定の種類の細胞または組織に対する共役アンチセンス化合物の親和性を増加させることによって強度をさらに改善し得る。ある特定の実施形態において、本明細書に記載される共役基は、1個以上の細胞表面受容体による共役アンチセンス化合物の認識を増加させることによって強度をさらに改善し得る。ある特定の実施形態において、本明細書に記載される共役基は、共役アンチセンス化合物のエンドサイトーシスを促進することによって強度をさらに改善し得る。
ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、共役アンチセンス化合物が細胞に入った後に共役体がアンチセンスオリゴヌクレオチドから切断されることを可能にすることによって強度をさらに改善し得る。したがって、ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、非共役アンチセンスオリゴヌクレオチドに必要な用量よりも低い用量で投与され得る。
ホスホロチオエート結合は、以前にアンチセンスオリゴヌクレオチドに組み込まれている。そのようなホスホロチオエート結合は、ヌクレアーゼに耐性を示すため、オリゴヌクレオチドの安定性を改善する。さらに、ホスホロチオエート結合は、ある特定のタンパク質にも結合し、肝臓におけるアンチセンスオリゴヌクレオチドの蓄積をもたらす。より少ないホスホロチオエート結合を有するオリゴヌクレオチドは、肝臓にあまり蓄積せず、腎臓により多く蓄積する(例えば、Geary,R.,“Pharmacokinetic
Properties of 2’-O-(2-Methoxyethyl)-Modified Oligonucleotide Analogs in Rats,”Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics,Vol.296,No.3,890-897、およびPharmacological Properties of 2’-O-Methoxyethyl Modified Oligonucleotides in Antisense a Drug Technology,Chapter 10,Crooke,S.T.,ed.,2008を参照のこと)。ある特定の実施形態において、より少ないホスホロチオエートヌクレオシド間結合およびより多くのホスホジエステルヌクレオシド間結合を有するオリゴヌクレオチドは、肝臓にあまり蓄積せず、腎臓により多く蓄積する。肝臓における疾患を治療する際、これは、(1)薬物が所望の作用部位(肝臓)にあまり到達せず、(2)薬物が尿に流出し、(3)腎臓が比較的高い濃度の、腎臓に毒性をもたらし得る薬物に曝露される、といったいくつかの理由のため、望ましくない。したがって、肝臓疾患の場合、ホスホロチオエート結合は、重要な利益を提供する。
しかしながら、ある特定の実施形態において、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合によって均一に連結されたオリゴヌクレオチドの投与は、1つ以上の炎症誘発反応を誘導する(例えば、J Lab Clin Med.1996 Sep;128(3):329-38.“Amplification of antibody production by phosphorothioate oligodeoxynucleotides”.Branda et al.を参照されたく、例えば、Toxicologic Properties in Antisense a Drug Technology,Chapter 12,pages 342-351,Crooke,S.T.,ed.,2008も参照のこと)。ある特定の実施形態において、ヌクレオシド間結合の多くがホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含むオリゴヌクレオチドの投与は、1つ以上の炎症誘発反応を誘導する。
ある特定の実施形態において、炎症誘発作用の程度は、いくつかの可変物(例えば、骨格修飾、オフ標的作用、核酸塩基修飾、および/またはヌクレオシド修飾)に依存し得る
(例えば、Toxicologic Properties in Antisense
a Drug Technology,Chapter 12,pages 342-351,Crooke,S.T.,ed.,2008を参照されたい)。ある特定の実施形態において、炎症誘発作用の程度は、1つ以上の可変物を調整することによって軽減され得る。例えば、所与のオリゴヌクレオチドの炎症誘発作用の程度は、任意の数のホスホロチオエートヌクレオシド間結合をホスホジエステルヌクレオシド間結合に置き換え、それによりホスホロチオエートヌクレオシド間結合の総数を減少させることによって軽減され得る。
ある特定の実施形態において、ホスホロチオエート結合の数を減少させることが望ましく、そうすることで、安定性を失うことも、肝臓から腎臓への分布を変化させることもなく減少させることができる。例えば、ある特定の実施形態において、ホスホロチオエート結合の数は、ホスホロチオエート結合をホスホジエステル結合に置き換えることによって減少され得る。そのような実施形態において、より少ないホスホロチオエート結合およびより多くのホスホジエステル結合を有するアンチセンス化合物は、より低い炎症誘発反応を誘導するか、全く誘導しない。より少ないホスホロチオエート結合およびより多くのホスホジエステル結合を有するアンチセンス化合物はより低い炎症誘発反応を誘導するが、より少ないホスホロチオエート結合およびより多くのホスホジエステル結合を有するアンチセンス化合物は、肝臓に蓄積せず、より多くのホスホロチオエート結合を有するアンチセンス化合物と比較して、同一または同様の用量で有効性がより低くあり得る。したがって、ある特定の実施形態において、複数のホスホジエステル結合および複数のホスホロチオエート結合を有するが、安定性および肝臓への良好な分布も有するアンチセンス化合物を設計することが望ましい。
ある特定の実施形態において、ホスホロチオエート結合のうちのいくつかが炎症誘発性の低いホスホジエステルヌクレオシド間結合と置き換えられる場合でも、共役アンチセンス化合物は、非共役対応物と比較して、肝臓により多く蓄積し、腎臓にはあまり蓄積しない。ある特定の実施形態において、ホスホロチオエート結合のうちのいくつかが炎症誘発性の低いホスホジエステルヌクレオシド間結合と置き換えられる場合でも、共役アンチセンス化合物は、その非共役対応物と比較して、肝臓により多く蓄積し、その非共役対応物ほど尿に排泄されない。ある特定の実施形態において、共役体を使用することで、より強力でより良好な耐性のアンチセンス薬物を設計することが可能になる。実際には、ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、非共役対応物よりも大きい治療指数を有する。これは、炎症誘発応答の危険性がより低く、かつ腎毒性の危険性もより低いため、共役アンチセンス化合物がより高い絶対用量で投与されることを可能にする。このより高い用量は、排除(代謝)が同様であると見込まれるため、低頻度で投薬されることを可能にする。さらに、上述のように、化合物がより強力であるため、治療活性を失うことなく次の投薬の前に濃度をより低くすることができ、さらに長い投薬間期間を可能にする。
ある特定の実施形態において、いくつかのホスホロチオエート結合の包含がなお望ましい。例えば、末端結合がエキソヌクレアーゼに対して脆弱であるため、ある特定の実施形態において、これらの結合は、ホスホロチオエートまたは他の修飾結合である。2個のデオキシヌクレオシドを結合するヌクレオシド間結合がエンドヌクレアーゼに対して脆弱であるため、ある特定の実施形態において、これらの結合は、ホスホロチオエートまたは他の修飾結合である。デオキシヌクレオシドが結合デオキシヌクレオシドの5’側にある修飾ヌクレオシドとデオキシヌクレオシドとの間のヌクレオシド間結合がエンドヌクレアーゼに対して脆弱であるため、ある特定の実施形態において、これらの結合は、ホスホロチオエートまたは他の修飾結合である。修飾ヌクレオシドが結合の5’側にある、ある特定の種類の2個の修飾ヌクレオシド間、およびある特定の種類のデオキシヌクレオシドと修
飾ヌクレオシドとの間のヌクレオシド間結合がヌクレアーゼ消化に十分に耐性を示すため、この結合は、ホスホジエステルであり得る。
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、16個未満のホスホロチオエート結合を含む。ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、15個未満のホスホロチオエート結合を含む。ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、14個未満のホスホロチオエート結合を含む。ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、13個未満のホスホロチオエート結合を含む。ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、12個未満のホスホロチオエート結合を含む。ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、11個未満のホスホロチオエート結合を含む。ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、10個未満のホスホロチオエート結合を含む。ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、9個未満のホスホロチオエート結合を含む。ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、8個未満のホスホロチオエート結合を含む。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される1個以上の共役基を含むアンチセンス化合物は、そのような1個以上の共役基を欠く親アンチセンス化合物と比較して、増加した活性および/または強度および/または耐容性を有する。したがって、ある特定の実施形態において、そのような共役基のオリゴヌクレオチドへの結合が望ましい。そのような共役基は、オリゴヌクレオチドの5’末端および/または3’末端で結合され得る。ある特定の事例において、5’末端での結合が合成的に望ましい。典型的には、オリゴヌクレオチドは、当技術分野で周知の技法を用いて、3’末端ヌクレオシドの固体支持体への結合および3’から5’までのヌクレオシドの連続カップリングによって合成される。したがって、共役基が3’末端で所望される場合、(1)共役基を3’末端ヌクレオシドに結合させ、オリゴヌクレオチドのその後の調製のために、その共役ヌクレオシドを固体支持体に結合させるか、または(2)合成後に、共役基を完全なオリゴヌクレオチドの3’末端ヌクレオシドに結合させることができる。これらの手段のいずれもあまり効率的ではなく、それ故に、これらはいずれも費用のかかる手段である。具体的には、共役ヌクレオシドの固体支持体への結合は、本明細書の実施例において実証されるが、非効率的なプロセスである。ある特定の実施形態において、共役基を5’末端ヌクレオシドに結合させることは、3’末端での結合よりも合成的に容易である。特徴のはっきりした標準の反応を用いて、非共役3’末端ヌクレオシドを固体支持体に結合させ、このオリゴヌクレオチドを調製することができる。その後、最終カップリングステップで共役基を有する5’ヌクレオシドを結合させることのみを必要とする。ある特定の実施形態において、これは、3’-共役オリゴヌクレオチドを調製するために典型的に行われる共役ヌクレオシドの固体支持体への直接結合よりも効率的である。本明細書の実施例は、5’末端での結合を実証する。加えて、ある特定の共役基は、合成利点を有する。例えば、リン結合基を含むある特定の共役基は、以前に報告された共役基(例えば、国際公開第WO/2012/037254号)を含む他の共役基よりも合成的に単純であり、かつ効率的に調製される。
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、対象に投与される。そのような実施形態において、本明細書に記載される1個以上の共役基を含むアンチセンス化合物は、そのような1個以上の共役基を欠く親アンチセンス化合物と比較して、増加した活性および/または強度および/または耐容性を有する。機構によって束縛されることなく、共役基が、標的細胞または組織への分布、送達、および/または取り込みに役立つと考えられる。ある特定の実施形態において、標的細胞または組織に入ると、共役基のすべて
または一部が切断されて、活性オリゴヌクレオチドを放出することが望ましい。ある特定の実施形態において、すべての共役基がオリゴヌクレオチドから切断される必要はない。例えば、実施例20において、共役オリゴヌクレオチドをマウスに投与し、各々がオリゴヌクレオチドに残った共役基の異なる部分を含むいくつかの異なる化学種を検出した(表23a)。この共役アンチセンス化合物は、良好な強度を示した(表23)。したがって、ある特定の実施形態において、共役基の複数の部分的切断のそのような代謝物プロファイルは、活性/強度を妨げない。それにもかかわらず、ある特定の実施形態において、プロドラッグ(共役オリゴヌクレオチド)が単一の活性化合物を産出することが望ましい。ある特定の事例において、活性化合物の複数の形態が見出される場合、各形態の相対量および活性を決定する必要があり得る。ある特定の実施形態において、規制調査が要求される場合(例えば、USFDAまたは対応物)、単一の(または主に単一の)活性種を有することが望ましい。ある特定のそのような実施形態において、そのような単一の活性種が共役基の任意の部分を欠くアンチセンスオリゴヌクレオチドであることが望ましい。ある特定の実施形態において、5’末端の共役基は、共役基の完全な代謝をもたらす可能性が高い。機構によって束縛されることなく、5’末端(例えば、5’ヌクレアーゼ)の代謝に関与する内因性酵素が3’対応物よりも活性/効率的であり得る。ある特定の実施形態において、これらの特定の共役基は、単一の活性種への代謝により従順である。ある特定の実施形態において、ある特定の共役基は、オリゴヌクレオチドへの代謝により従順である。
D. アンチセンス
ある特定の実施形態において、本発明のオリゴマー化合物は、アンチセンス化合物である。そのような実施形態において、オリゴマー化合物は、標的核酸に相補的である。ある特定の実施形態において、標的核酸は、RNAである。ある特定の実施形態において、標的核酸は、非コードRNAである。ある特定の実施形態において、標的核酸は、タンパク質をコードする。ある特定の実施形態において、標的核酸は、mRNA、プレmRNA、マイクロRNA、小非コードRNAを含む非コードRNA、およびプロモーター指向性RNAから選択される。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物は、2個以上の標的核酸に少なくとも部分的に相補的である。例えば、本発明のオリゴマー化合物は、マイクロRNA模倣物であり、これは、典型的には、複数の標的に結合する。
ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、標的核酸の核酸塩基配列に少なくとも70%相補的な核酸塩基配列を有する部分を含む。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、標的核酸の核酸塩基配列に少なくとも80%相補的な核酸塩基配列を有する部分を含む。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、標的核酸の核酸塩基配列に少なくとも90%相補的な核酸塩基配列を有する部分を含む。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、標的核酸の核酸塩基配列に少なくとも95%相補的な核酸塩基配列を有する部分を含む。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、標的核酸の核酸塩基配列に少なくとも98%相補的な核酸塩基配列を有する部分を含む。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、標的核酸の核酸塩基配列に100%相補的な核酸塩基配列を有する部分を含む。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、アンチセンス化合物の全長にわたって、標的核酸の核酸塩基配列に少なくとも70%、80%、90%、95%、98%、または100%相補的である。
アンチセンス機構は、オリゴマー化合物の標的核酸とのハイブリダイゼーションを伴う任意の機構を含み、このハイブリダイゼーションは、生物学的効果をもたらす。ある特定の実施形態において、そのようなハイブリダイゼーションは、例えば、標的核酸の、または標的核酸が別の方法で相互作用し得る核酸の翻訳、転写、またはポリアデニル化を伴う細胞機構の同時に起こる阻害または刺激により、標的核酸の分解または占有のいずれかを
もたらす。
標的RNAの分解を伴う一種のアンチセンス機構は、RNase H媒介アンチセンスである。RNase Hは、RNA:DNA二本鎖のRNA鎖を切断する細胞性エンドヌクレアーゼである。「DNA様」の一本鎖アンチセンス化合物が哺乳類細胞におけるRNase H活性を誘発することが当技術分野で既知である。したがって、RNase Hの活性化は、RNA標的の切断をもたらし、それにより遺伝子発現のDNA様オリゴヌクレオチド媒介阻害の効率を大幅に向上させる。
アンチセンス機構には、RISC経路を利用するRNAi機構も含まれるが、これらに限定されない。そのようなRNAi機構には、siRNA、ssRNA、およびマイクロRNA機構が含まれるが、これらに限定されない。そのような機構は、マイクロRNA模倣物および/または抗マイクロRNAの作成を含む。
アンチセンス機構には、マイクロRNAまたはmRNA以外の非コードRNAをハイブリダイズさせるか、または模倣する機構も含まれるが、これに限定されない。そのような非コードRNAには、1個以上の核酸の転写または翻訳をもたらすプロモーター指向性RNAならびに短いRNAおよび長いRNAが含まれるが、これらに限定されない。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される共役体を含むオリゴヌクレオチドは、RNAi化合物である。ある特定の実施形態において、本明細書に記載される共役体を含むオリゴマーオリゴヌクレオチドは、ssRNA化合物である。ある特定の実施形態において、本明細書に記載される共役体を含むオリゴヌクレオチドは、第2のオリゴマー化合物と対合されて、siRNAを形成する。ある特定のそのような実施形態において、第2のオリゴマー化合物は、共役体も含む。ある特定の実施形態において、第2のオリゴマー化合物は、任意の修飾または非修飾核酸である。ある特定の実施形態において、本明細書に記載される共役体を含むオリゴヌクレオチドは、siRNA化合物におけるアンチセンス鎖である。ある特定の実施形態において、本明細書に記載される共役体を含むオリゴヌクレオチドは、siRNA化合物におけるセンス鎖である。共役オリゴマー化合物が二本鎖siRNAである実施形態において、共役体は、センス鎖に、アンチセンス鎖に、またはセンス鎖およびアンチセンス鎖の両方に存在し得る。
D. 標的核酸、領域および、セグメント
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、任意の核酸を標的とする。ある特定の実施形態において、標的核酸は、臨床的に関連する標的タンパク質をコードする。そのような実施形態において、標的核酸の調節は、臨床的利益をもたらす。ある特定の標的核酸には、表1に例証される標的核酸が含まれるが、これらに限定されない。
Figure 0007177127000604
標的プロセスは、アンチセンス相互作用が生じて所望の効果が結果的に生じるように、通常、標的核酸内の少なくとも1個の標的領域、セグメント、または部位の決定を含む。
ある特定の実施形態において、標的領域は、核酸の構造的に定義された領域である。例えば、ある特定のそのような実施形態において、標的領域は、3’UTR、5’UTR、エキソン、イントロン、コーディング領域、翻訳開始領域、翻訳終結領域、または他の定義された核酸領域もしくは標的セグメントを包含し得る。
ある特定の実施形態において、標的セグメントは、共役アンチセンス化合物が標的とされる標的領域の少なくとも約8核酸塩基部分である。標的セグメントは、標的セグメントのうちの1個の5’末端から少なくとも8個の連続した核酸塩基を含むDNAまたはRNA配列を含み得る(残りの核酸塩基は、標的セグメントの5’末端のすぐ上流で開始し、DNAまたはRNAが約8~約30個の核酸塩基を含むまで続く連続した一続きの同一のDNAまたはRNAである)。標的セグメントは、標的セグメントのうちの1個の3’末端から少なくとも8個の連続した核酸塩基を含むDNAまたはRNA配列によっても表される(残りの核酸塩基は、標的セグメントの3’末端のすぐ下流で開始し、DNAまたはRNAが約8~約30個の核酸塩基を含むまで続く連続した一続きの同一のDNAまたはRNAである)。標的セグメントは、標的セグメントの配列の内部部分から少なくとも8個の連続した核酸塩基を含むDNAまたはRNA配列によっても表され、共役アンチセン
ス化合物が約8~約30個の核酸塩基を含むまでいずれかの方向または両方向に延在し得る。
ある特定の実施形態において、表1に列記される核酸を標的にするアンチセンス化合物は、本明細書に記載されるように修飾され得る。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、本明細書に記載される修飾糖部分、非修飾糖部分、または修飾および非修飾糖部分の混合物を有し得る。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、本明細書に記載される修飾ヌクレオシド間結合、非修飾ヌクレオシド間結合、または修飾および非修飾ヌクレオシド間結合の混合物を有し得る。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、本明細書に記載される修飾核酸塩基、非修飾核酸塩基、または修飾および非修飾核酸塩基の混合物を有し得る。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、本明細書に記載されるモチーフを有し得る。
ある特定の実施形態において、表1に列記される核酸を標的にするアンチセンス化合物は、本明細書に記載されるように共役され得る。
1. アンドロゲン受容体(AR)
ARは、前立腺癌の駆動体と見なされる転写因子である。ARは、そのホルモンリガンド、すなわち、アンドロゲン、テストステロン、および/またはDHTへの結合によって活性化される。アンドロゲン遮断療法、別名、「化学的去勢」は、循環アンドロゲンのレベルを低下させ、それによりAR活性を阻害するホルモン感受性のアンドロゲン依存性前立腺癌に対する一次治療戦略である。しかしながら、アンドロゲン遮断療法は、多くの場合、「去勢耐性」進行性前立腺癌の出現および成長につながり、そこではリガンド結合から独立してARシグナル伝達が再活性化される。進行性前立腺癌における去勢耐性の基礎となる機構は、依然として不明である。
AR核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号1として本明細書に組み込まれるGENBANK(登録商標)受入番号NT_011669.17核酸塩基5079000~5270000の配列を有するAR核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号1に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号1を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号17~24のうちのいずれかの核酸塩基配列から選択される少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号1を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号17~24のうちのいずれかの核酸塩基配列から選択される核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000605
AR治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、AR核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象におけるARの発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、ARの発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中のAR核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、去勢耐性前立腺癌等の前立腺癌を有する。ある特定の実施形態において、対象は、MDV3100、別名、エンザルタミド(Enzalutamide)等のジアリールヒダントインアンドロゲン受容体(AR)阻害剤に耐性を示す前立腺癌を有する。MDV3100またはエンザルタミドは、去勢耐性前立腺癌の治療のためにMedivationによって開発された実験的アンドロゲン受容体拮抗薬である。ある特定の実施形態において、対象は、乳癌を有する。ある特定の態様において、対象の乳癌は、以下の特徴:成長するためにアンドロゲンに依存するアンドロゲン受容体陽性、成長するためにエストロゲンから独立しているエストロゲン受容体(ER)陰性、成長するためにプロゲステロンから独立しているプロゲステロン受容体(PR)陰性、またはHer2/neu陰性のうちの1つ以上を有し得る。ある特定の態様において、乳癌または乳癌細胞は、アポクリンである。
ある特定の実施形態において、本発明は、AR核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
2. アポリポタンパク質(a)(Apo(a))
1個のApo(a)タンパク質は、ジスルフィド結合を介して単一のApoBタンパク質に連結されて、リポタンパク質(a)(Lp(a))粒子を形成する。このApo(a)タンパク質は、特にクリングルIV2型反復ドメイン内のプラスミノーゲンと高度の相同性を共有する。Apo(a)のクリングル反復ドメインは、その血栓形成促進特性およ
び抗線維素溶解特性に関与し得、アテローム性動脈硬化進行を高める可能性があると考えられる。Apo(a)は、IL-6によって転写調整され、IL-6阻害剤(トシリズマブ)で治療されたリウマチ性関節炎患者の研究において、治療から3ヶ月後に血漿レベルが30%低下した。Apo(a)は、酸化リン脂質に優先的に結合し、血管炎症を増強することが示されている。さらに、研究は、Lp(a)粒子がまた、内皮透過性を刺激し、プラスミノーゲン活性化因子阻害剤1型発現を誘導し、マクロファージインターロイキン-8分泌を活性化し得ることを示唆する。重要なことに、最近の遺伝的関連研究は、Lp(a)が、心筋梗塞、脳卒中、末梢血管疾患、および腹部大動脈瘤の独立した危険因子であったことを明らかにした。さらに、早発性冠動脈疾患(PROCARDIS)研究において、Clarke et al.は、冠状動脈性心臓病と血漿中のLp(a)濃度との間の強固な独立した関連性を説明している。さらに、Solfrizzi et al.は、血清中のLp(a)の増加が、アルツハイマー病(AD)の危険性の増加に関係し得ることを示唆した。Apo(a)を標的とするアンチセンス化合物は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、国際公開第WO2005/000201号および米国特許第US61/651,539号に以前に開示されている。Apo(a)を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、ISIS-APOARxは、現在、第I相臨床試験においてその安全性プロファイルを試験するためのものである。
Apo(a)核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号2として本明細書に組み込まれるGENBANK(登録商標)受入番号NM_005577.2の配列を有するApo(a)核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号2に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号2を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号25~30のうちのいずれかの核酸塩基配列から選択される少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号2を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号25~30のうちのいずれかの核酸塩基配列から選択される核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000606
Apo(a)治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、Apo(a)核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象におけるApo(a)の発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、Apo(a)の発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中のApo(a)核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、心臓血管および/または代謝性疾患、障害、もしくは状態を有する。ある特定の実施形態において、対象は、高コレステロール血症、非家族性高コレステロール血症、家族性高コレステロール血症、ヘテロ接合性家族性高コレステロール血症、ホモ接合性家族性高コレステロール血症、混合脂質異常症、アテローム性動脈硬化症、アテローム性動脈硬化症を発症する危険性、冠状動脈性心臓病、冠状動脈性心臓病の病歴、早期発症性若年発症性冠状動脈性心臓病、冠状動脈性心臓病の1つ以上の危険因子、2型糖尿病、脂質異常症を伴う2型糖尿病、脂質異常症、高トリグリセリド血症、脂質異常
症、高脂肪酸血症、肝臓脂肪症、非アルコール性脂肪性肝炎、および/または非アルコール性脂肪肝疾患を有する。
ある特定の実施形態において、本発明は、Apo(a)核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
3. アポリポタンパク質B(ApoB)
ApoB(別名、アポリポタンパク質B-100(ApoB-100)、アポリポタンパク質B-48(ApoB-48)、およびAg(x)抗原)は、脂質の構築および分泌において、ならびに異なるクラスのリポタンパク質の輸送および受容体媒介取り込みおよび送達において不可欠な役割を果たす大きい糖タンパク質である。ApoBは、食物中の脂質の吸収および処理から循環リポタンパク質のレベルの調整まで様々な活性を行う(Davidson and Shelness,Annu.Rev.Nutr.,2000,20,169-193)。この後者の特性は、アテローム性動脈硬化症の感受性の点でその関連性の基礎となり、これは、ApoB含有リポタンパク質の環境濃度と高度に相関している(Davidson and Shelness,Annu.Rev.Nutr.,2000,20,169-193)。ApoB-100は、LDL-Cの主なタンパク質成分であり、このリポタンパク質種とLDL受容体との相互作用に必要なドメインを含有する。上昇したレベルのLDL-Cは、アテローム性動脈硬化症を含む心臓血管疾患の危険因子である。ApoBを標的とするアンチセンス化合物は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる国際公開第WO2004/044181号に以前に開示されている。ApoBを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、KYNAMRO(商標)は、ホモ接合性家族性高コレステロール血症(HoFH)を有する患者における低密度リポタンパク質コレステロール(LDL-C)、ApoB、総コレステロール(TC)、および非高密度リポタンパク質コレステロール(非HDL-C)を低下させるための脂質低下薬および食生活の補助治療薬としてアメリカ食品医薬品局(FDA)の承認を受けている。しかしながら、患者にさらなるより有力な治療選択肢を提供することが依然として必要とされている。
ApoB核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号3として本明細書に組み込まれるGENBANK(登録商標)受入番号NM_000384.1の配列を有するApoB核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号3に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号3を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号31の少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号3を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号31の核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000607
ApoB治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、ApoB核酸を標的にする共役アンチセンス
化合物を用いて対象におけるApoBの発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、ApoBの発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中のApoB核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、心臓血管および/または代謝性疾患、障害、もしくは状態を有する。ある特定の実施形態において、対象は、高コレステロール血症、非家族性高コレステロール血症、家族性高コレステロール血症、ヘテロ接合性家族性高コレステロール血症、ホモ接合性家族性高コレステロール血症、混合脂質異常症、アテローム性動脈硬化症、アテローム性動脈硬化症を発症する危険性、冠状動脈性心臓病、冠状動脈性心臓病の病歴、早期発症性若年発症性冠状動脈性心臓病、冠状動脈性心臓病の1つ以上の危険因子、2型糖尿病、脂質異常症を伴う2型糖尿病、脂質異常症、高トリグリセリド血症、脂質異常症、高脂肪酸血症、肝臓脂肪症、非アルコール性脂肪性肝炎、および/または非アルコール性脂肪肝疾患を有する。
ある特定の実施形態において、本発明は、ApoB核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
4. アポリポタンパク質C-III(ApoCIII)
ApoCIIIは、HDLおよびトリグリセリド(TG)豊富なリポタンパク質の構成要素である。ApoCIIIレベルの上昇は、TGレベルの上昇、ならびに心臓血管疾患、メタボリックシンドローム、肥満、および糖尿病等の疾患と関連している。TGレベルの上昇は、膵臓炎と関連している。ApoCIIIは、リポタンパク質リパーゼ(LPL)の阻害およびリポタンパク質の細胞表面グリコサミノグリカンマトリックスへの結合の妨害により脂肪分解を阻害することによってTG豊富なリポタンパク質の除去を遅延する。ApoCIIIを標的とするアンチセンス化合物は、各々が参照によりその全体が本明細書に組み込まれる国際公開第WO2004/093783号および同第WO2012/149495号に以前に開示されている。現在、ApoCIIIを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、ISIS-APOCIIIRxは、第II相臨床試験において糖尿病または高トリグリセリド血症のその治療有効性を評価するためのものである。しかしながら、患者にさらなるより有力な治療選択肢を提供することが依然として必要とされている。
ApoCIII核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号4として本明細書に組み込まれる、核酸塩基20262640から20266603まで切断されたGENBANK(登録商標)受入番号NT_033899.8の配列を有するApoCIII核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号4に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号5として本明細書に組み込まれるGENBANK(登録商標)受入番号NM_000040.1の配列を有するApoCIII核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号5に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
ある特定の実施形態において、配列番号5を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号32の少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号5を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号32の核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000608
ApoCIII治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、ApoCIII核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象におけるApoCIIIの発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、ApoCIIIの発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中のApoCIII核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、心臓血管および/または代謝性疾患、障害、もしくは状態を有する。ある特定の実施形態において、対象は、高トリグリセリド血症、非家族性高トリグリセリド血症、家族性高トリグリセリド血症、ヘテロ接合性家族性高トリグリセリド血症、ホモ接合性家族性高トリグリセリド血症、混合脂質異常症、アテローム性動脈硬化症、アテローム性動脈硬化症を発症する危険性、冠状動脈性心臓病、冠状動脈性心臓病の病歴、早期発症性冠状動脈性心臓病、冠状動脈性心臓病の1つ以上の危険因子、2型糖尿病、脂質異常症を伴う2型糖尿病、脂質異常症、脂質異常症、高コレステロール血症、高脂肪酸血症、肝臓脂肪症、非アルコール性脂肪性肝炎、膵臓炎および/または非アルコール性脂肪肝疾患を有する。
ある特定の実施形態において、本発明は、ApoCIII核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
5. C反応性タンパク質(CRP)
CRP(別名、PTX1)は、様々な炎症性サイトカインに応答して肝臓で産生される必須ヒト急性期反応物質である。1930年に初めて特定されたこのタンパク質は、高度に保存されており、感染または炎症状態の早期指標と見なされる。血漿CRPレベルは、感染、虚血、外傷、熱傷、および炎症状態に応答して1,000倍増加する。患者がスタチン療法等の脂質低下療法を受ける臨床試験において、LDL-CおよびCRPが両方ともに減少した患者は、LDL-Cのみが減少した患者と比較して、今後の冠動脈イベントの危険性が低下することが実証されている。CRPを標的とするアンチセンス化合物は、各々が参照によりその全体が本明細書に組み込まれる国際公開第WO2003/010284号および同第WO2005/005599号に以前に開示されている。CRPを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、ISIS-CRPRxは、現在、第II相臨床試験においてリウマチ性関節炎および発作性心房細動を有する対象を治療する際のその有効性を試験するためのものである。しかしながら、患者にさらなるより有力な治療選択肢を提供することが依然として必要とされている。
CRP核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号6として本明細書に組み込まれるGENBANK(登録商標)受入番号M11725.1の配列を有するCRP核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号6に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号6を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号33の少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号6を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号33の核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000609
CRP治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、CRP核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象におけるCRPの発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、CRPの発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中のCRP核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、心臓血管および/または代謝性疾患、障害、もしくは状態を有する。ある特定の実施形態において、対象は、高コレステロール血症、非家族性高コレステロール血症、家族性高コレステロール血症、ヘテロ接合性家族性高コレステロール血症、ホモ接合性家族性高コレステロール血症、混合脂質異常症、アテローム性動脈硬化症、アテローム性動脈硬化症を発症する危険性、冠状動脈性心臓病、冠状動脈性心臓病の病歴、早期発症性冠状動脈性心臓病、冠状動脈性心臓病の1つ以上の危険因子を有する。ある特定の実施形態において、個人は、発作性心房細動、急性冠不全症候群、血管損傷、動脈閉塞、不安定狭心症、末梢血管疾患後(post peripheral vascular disease)、心筋梗塞後(post myocardial infarction)(MI)、血栓症、深部静脈血栓症、末期腎不全(ESRD)、慢性腎不全、相補体活性化、うっ血性心不全、または全身性血管炎を有する。ある特定の実施形態において、個人は、脳卒中を有している。ある特定の実施形態において、個人は、選択的ステント留置術、血管形成術、経皮経管的血管形成術後(post percutaneous transluminal angioplasty)(PTCA)、心臓移植、腎臓透析、または心肺バイパスから選択される手術を受けている。ある特定の実施形態において、個人は、炎症性疾患を有する。ある特定のそのような実施形態において、炎症性疾患は、炎症性腸疾患、潰瘍性結腸炎、リウマチ性関節炎、または変形性関節症から選択される。
ある特定の実施形態において、本発明は、CRP核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
6. eIF4E
eIF4Eの過剰発現は、多くのヒト癌および癌由来の細胞株において報告されており
、動物モデルにおける細胞の発癌性形質転換および侵襲性/転移性表現型もまたもたらす。非形質転換培養細胞とは異なり、形質転換細胞株は、血清成長因子の存在とは無関係にeIF4Eを発現する(Rosenwald,Cancer Lett.,1995,98,77-82)。過剰なeIF4Eは、HeLa細胞の異常増殖および新生物形態につながり、足場非依存性増殖、培養物における形質転換巣の形成、およびヌードマウスにおける腫瘍形成によって判断されるNIH 3T3およびRat2線維芽細胞における腫瘍原性形質転換も引き起こす(De Benedetti et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U S A,1990,87,8212-8216、およびLazaris-Karatzas et al.,Nature,1990,345,544-547)。
eIF4Eの上昇は、非ホジキンリンパ腫、結腸腺腫、および癌腫、ならびに喉頭癌、頭頸部癌、前立腺癌、乳癌、および膀胱癌を含むが、これらに限定されないいくつかのヒト癌に見られる(Crew et al.,Br.J.Cancer,2000,82,161-166、Graff et al.,Clin.Exp.Metastasis,2003,20,265-273、Haydon et al.,Cancer,2000,88,2803-2810、Kerekatte et al.,Int.J.Cancer,1995,64,27-31、Rosenwald et al.,Oncogene,1999,18,2507-2517、Wang et al.,Am.J.Pathol.,1999,155,247-255)。eIF4Eの上方調節は、結腸癌発症における早期イベントであり、多くの場合、サイクリンD1レベルの増加を伴う(Rosenwald et al.,Oncogene,1999,18,2507-2517)。eIF4Eを標的とするアンチセンス化合物は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる国際公開第WO2005/028628号に以前に開示されている。eIF4Eを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、ISIS-eIF4ERxは、現在、第I/II臨床試験において癌を有する対象を治療する際のその有効性を試験するためのものである。
eIF4E核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号7として本明細書に組み込まれるGENBANK(登録商標)受入番号M15353.1の配列を有するeIF4E核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号7に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号7を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号34の少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号7を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号34の核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000610
eIF4E治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、eIF4E核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象におけるeIF4Eの発現を調節するための方法を提供する。ある
特定の実施形態において、eIF4Eの発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中のeIF4E核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、癌を有する。ある特定の態様において、癌は、前立腺癌である。
ある特定の実施形態において、本発明は、eIF4E核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
7. 第VII因子
第VII凝固因子(別名、血清プロトロンビン転化促進因子)は、組織因子凝固経路の主要な成分である。臨床医は、第VII因子活性レベルの上昇を、心臓発作等のいくつかの血栓疾患の予後不良、および癌患者における第2の死の主な原因である癌関連血栓症と結びつけている。前臨床研究において、第VII因子のアンチセンス阻害は、第VII因子の活性を3日間で急速に90パーセント超減少させ、現在利用可能な抗血栓薬の一般的な副作用である出血の増加は観察されなかった。第VII因子を標的とするアンチセンス化合物は、各々が参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、国際公開第WO2009/061851号、同第WO2012/174154号、およびPCT出願第PCT/US2013/025381号、に以前に開示されている。臨床研究は、患者が有害な血餅を発症しないように、急性臨床状況下で、例えば、外科手術後に、ISIS-FVIIRxを評価するよう計画されている。しかしながら、患者にさらなるより有力な治療選択肢を提供することが依然として必要とされている。
第VII因子核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号8として本明細書に組み込まれる、核酸塩基1255000から1273000まで切断されたGENBANK(登録商標)受入番号NT_027140.6の配列を有する第VII因子核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、配列番号8を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号8に少なくとも90%、少なくとも95%または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号8を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号35~43の少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号8を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号35~43の核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000611
Figure 0007177127000612
第VII因子治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、第VII因子核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象における第VII因子の発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、第VII因子の発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中の第VII因子核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、心臓発作、脳卒中、深部静脈血栓症、もしくは肺塞栓症等の血栓塞栓性状態を有するか、またはこれを発症する危険性がある。ある特定の実施形態において、対象は、血栓塞栓性状態を発症する危険性があり、かつ/またはさもなければ抗凝固療法を必要とする。そのような対象の例として、重大な整形外科手術を受ける対象および長期間の抗凝固薬治療を必要とする患者が挙げられる。ある特定の実施形態において、対象は、炎症性疾患、障害、もしくは状態を有するか、またはこれを発症する危険性がある。ある特定の実施形態において、対象は、アレルギー性疾患(例えば、アレルギー性鼻炎、慢性鼻副鼻腔炎)、自己免疫疾患(例えば、多発性硬化症、関節炎、強皮症、乾癬、セリアック病)、心臓血管疾患、結腸炎、糖尿病(例えば、インスリン依存性1型真性糖尿病)、過敏症(例えば、1、2、3、または4型過敏症)、感染性疾患(例えば、ウイルス感染、ミコバクテリア感染、蠕虫感染)、後部ブドウ膜炎、気道過敏症、喘息、アトピー性皮膚炎、結腸炎、子宮内膜症、甲状腺疾患(例えば、グレーブス病)、および膵臓炎を有するか、またはこれらを発症する危険性がある。
ある特定の実施形態において、本発明は、第VII因子核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
8. 第XI因子
第XI凝固因子(別名、血漿トロンボプラスチン前駆物質)は、凝固経路の重要なメンバーである。高レベルの第XI因子は、ほとんどの心臓発作および脳卒中に関与する異常な血餅形成を伴うプロセスである血栓症の危険性を増加させる。第XI因子レベルの増加は、外科手術後、具体的には、膝または股関節置換等の重大な整形外科処置後の一般的な問題である静脈血栓症の危険性も増加させる。第XI因子が不足している人々は、出血の危険性のわずかな増加を有する血栓塞栓イベントの発生率が低い。第XI因子を標的とするアンチセンス化合物は、各々が参照によりその全体が本明細書に組み込まれる国際公開第WO2010/045509号および同第WO2010/121074号に以前に開示されている。現在、第XI因子を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、ISIS-FXIRxは、第II相臨床研究において出血を増加させることなく膝関節全置換術後に患者における血栓イベントの数を減少させる際のISIS-FXIRxの有効性を評価するためのものである。しかしながら、患者にさらなるより有力な治療選択肢を提供することが依然として必要とされている。
第XI因子核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号9として本明細書に組み込まれるGENBANK(登録商標)受入番号NM_000128.3の配列を有する第XI因子核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号9に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号9を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号44~48の少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号9を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号44~48の核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000613
第XI因子治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、第XI因子核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象における第XI因子の発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、第XI因子の発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中の第XI因子核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、心臓発作、脳卒中、深部静脈血栓症、もしくは肺塞栓症等の血栓
塞栓性状態を有するか、またはこれを発症する危険性がある。ある特定の実施形態において、対象は、血栓塞栓性状態を発症する危険性があり、かつ/またはさもなければ抗凝固療法を必要とする。そのような対象の例として、重大な整形外科手術を受ける対象および長期間の抗凝固薬治療を必要とする患者が挙げられる。ある特定の実施形態において、対象は、炎症性疾患、障害、もしくは状態を有するか、またはこれを発症する危険性がある。ある特定の実施形態において、対象は、アレルギー性疾患(例えば、アレルギー性鼻炎、慢性鼻副鼻腔炎)、自己免疫疾患(例えば、多発性硬化症、関節炎、強皮症、乾癬、セリアック病)、心臓血管疾患、結腸炎、糖尿病(例えば、インスリン依存性1型真性糖尿病)、過敏症(例えば、1、2、3、または4型過敏症)、感染性疾患(例えば、ウイルス感染、ミコバクテリア感染、蠕虫感染)、後部ブドウ膜炎、気道過敏症、喘息、アトピー性皮膚炎、結腸炎、子宮内膜症、甲状腺疾患(例えば、グレーブス病)、および膵臓炎を有するか、またはこれらを発症する危険性がある。
ある特定の実施形態において、本発明は、第XI因子核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
9. グルココルチコイド受容体(GCCR)
ヒトグルココルチコイド受容体をコードする相補的DNAクローン(別名、核受容体サブファミリー3、グループC、メンバー1;NR3C1;GCCR;GCR;GRL;グルココルチコイド受容体、リンパ球)は、1985年に初めて単離された(Hollenberg et al.,Nature,1985,318,635-641、Weinberger et al.,Science,1985,228,740-742))。遺伝子は、ヒト染色体5q11-q13に位置し、9個のエキソンからなる(Encio and Detera-Wadleigh,J Biol Chem,1991,266,7182-7188、Gehring et al.,Proc Natl Acad Sci U S A,1985,82,3751-3755)。
ヒトグルココルチコイド受容体は、3つの主要なドメイン、N末端活性化ドメイン、中央のDNA結合ドメイン、およびC末端リガンド結合ドメインから成る(Giguere
et al.,Cell,1986,46,645-652)。リガンドの不在下において、グルココルチコイド受容体は、いくつかの他のタンパク質とともに大きい異種複合体を形成し、この複合体は、リガンド結合時にそれらの他のタンパク質から解離する。
肝臓において、グルココルチコイド作動薬は、グルココルチコイド受容体を活性化することにより肝臓におけるグルコース産生を増加させ、これは、その後、糖新生酵素ホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼ(PEPCK)およびグルコース-6-ホスファターゼの発現の増加につながる。糖新生により、グルコースは、乳酸塩、ピルビン酸塩、およびアラニン等の非ヘキソース前駆体により形成される(Link,Curr Opin Investig Drugs,2003,4,421-429)。
GCCRを標的とするアンチセンス化合物は、各々が参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、国際公開第WO2007/035759号、同第WO2005/071080号、およびPCT出願第PCT/US2012/061984号に以前に開示されている。GCCRを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、ISIS-GCCRRxは、近年、肯定的な結果のI相臨床試験を完了した。しかしながら、患者にさらなるより有力な治療選択肢を提供することが依然として必要とされている。
GCCR核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号10として本明細書に組み込まれる、核酸塩基3818000から3980000まで切断されたGENB
ANK受入番号NT_029289.10の相補体の配列を有するGCCR核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、配列番号10を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号10に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号10を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号49~59の少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号10を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号49~59の核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000614
GCCR治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、GCCR核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象におけるGCCRの発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、GCCRの発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中のGCCR核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、メタボリックシンドローム、真性糖尿病、インスリン耐性、糖尿病性脂質異常症、高トリグリセリド血症、肥満、および体重増加を含む代謝関連疾患を有する。
真性糖尿病は、多数の身体的および生理学的症状を特徴とする。2型糖尿病と関連した当業者に既知の任意の症状は、改善され得るか、またはさもなければ上述の方法に記載されるように調節され得る。ある特定の実施形態において、症状は、グルコースレベルの増加、体重増加、頻尿、異常な喉の渇き、極度の空腹感、極度の疲労感、視覚のぼけ、頻発する感染症、四肢のうずきまたはしびれ、乾燥敏感肌、体重減少、回復の遅い痛み、および歯茎の腫れからなる群から選択される身体的症状である。ある特定の実施形態において、症状は、インスリン耐性の増加、グルコースレベルの増加、脂肪量の増加、代謝率の低下、グルコースクリアランスの低下、グルコース耐性の低下、インスリン感受性の低下、肝臓におけるインスリン感受性の低下、脂肪組織の大きさおよび重量の増加、体脂肪の増加、ならびに体重の増加からなる群から選択される生理学的症状である。
ある特定の実施形態において、本発明は、GCCR核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
10. グルカゴン受容体(GCGR)
糖尿病は、インスリン分泌および/または作用不全を特徴とする慢性代謝性障害である。2型糖尿病(T2DM)において、インスリン耐性は、インスリンが糖新生酵素の活性を制御することを不能にし、多くの対象は、空腹および食後状態で不適切なレベルの循環グルカゴンも呈する。グルカゴンは、膵島のα細胞から分泌され、肝臓におけるグルコース産生を調節することによりグルコース恒常性を調整する(Quesada et al.,J.Endocrinol.2008.199:5-19)。グルカゴンは、その受容体(GCGR)の活性化により標的組織に対してその作用を発揮する。グルカゴン受容体は、受容体のクラスB G-タンパク質共役型ファミリーのメンバーである62kDaのタンパク質である(Brubaker et al.,Recept.Channels.2002.8:179-88)。GCGR活性化は、Gタンパク質(GαおよびG)によるシグナル変換につながり、それにより、Gαは、アデニル酸シクラーゼを活性化し、cAMP産生を引き起こし、タンパク質キナーゼAのレベルの増加をもたらす。肝臓におけるGCGRシグナル伝達は、グリコーゲン生成の阻害に加えてグリコーゲン分解および糖新生の誘導により肝臓におけるグルコース産生の増加をもたらす(Jiang
and Zhang.Am.J.Physiol.Endocrinol.Metab.2003.284:E671-E678)。GCGRは、心臓、腸平滑筋、腎臓、脳、および脂肪組織を含む肝臓外組織においても発現される(Hansen et al.,Peptides.1995.16:1163-1166)。
GCGRを標的とするアンチセンス化合物は、各々が参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、国際公開第WO2004/096996号、同第WO2004/096016号、同第WO2007/035771号、および同第WO2013/043817号に以前に開示されている。GCGRを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、ISIS-GCGRRxは、近年、肯定的な結果のI相臨床研究を完了した。しかしながら、患者にさらなるより有力な治療選択肢を提供することが依然として必要とされている。
GCGR核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号11として本明細書に組み込まれる核酸塩基16865000から16885000まで切断されたGENBANK(登録商標)受入番号NW_926918.1の配列を有するGCGR核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、配列番号11を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号11に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号11を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号60~67の少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号11を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号60~67の核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000615
GCGR治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、GCGR核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象におけるGCGRの発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、GCGRの発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中のGCGR核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、メタボリックシンドローム、真性糖尿病、インスリン耐性、糖尿病性脂質異常症、高トリグリセリド血症、肥満、および体重増加を含む代謝関連疾患を有する。
真性糖尿病は、多数の身体的および生理学的兆候および/または症状を特徴とする。2型糖尿病と関連した当業者に既知の任意の症状は、改善され得るか、またはさもなければ上述の方法に記載されるように調節され得る。ある特定の実施形態において、症状または兆候は、グルコースレベルの増加、体重増加、頻尿、異常な喉の渇き、極度の空腹感、極度の疲労感、視覚のぼけ、頻発する感染症、四肢のうずきまたはしびれ、乾燥敏感肌、体重減少、回復の遅い痛み、および歯茎の腫れ等の身体的症状または兆候である。ある特定の実施形態において、症状または兆候は、インスリン耐性の増加、グルコースレベルの増加、脂肪量の増加、代謝率の低下、グルコースクリアランスの低下、グルコース耐性の低下、インスリン感受性の低下、肝臓におけるインスリン感受性の低下、脂肪組織の大きさおよび重量の増加、体脂肪の増加、ならびに体重の増加からなる群から選択される生理学的症状または兆候である。
ある特定の実施形態において、本発明は、GCGR核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
11. B型肝炎(HBV)
B型肝炎は、血液および血液製剤、ならびに汚染された注射針等の汚染物質によって非経口的に、感染した母親または保菌者である母親からその子孫まで性的および縦関係的に伝染したウイルス性疾患である。世界保健機関は、世界中で20億を超える人々が感染しており、1年に約400万人が急性症例であり、1年に100万人が死亡し、3.5~4億人が慢性保菌者であると推定している(World Health Organization:Geographic Prevalence of Hepatitis B Prevalence,2004.http://www.who.int/vaccines-surveillance/graphics/htmls/hepbprev.htm)。
ウイルスであるHBVは、ヒトおよび非ヒト霊長類のみに感染する二本鎖肝臓指向性ウイルスである。ウイルス複製は、主に肝臓で起こり、程度は低いが、腎臓、膵臓、骨髄、および脾臓でも起こる(Hepatitis B virus biology.Microbiol Mol Biol Rev.64:2000;51-68)。ウイルスおよび免疫マーカーは、血液中で検出可能であり、特徴的な抗原-抗体パターンは、経時的に進化する。第1の検出可能なウイルスマーカーは、HBsAgであり、その後にB型肝炎e抗原(HBeAg)およびHBV DNAが続く。力価は、インキュベーション期間中は高くあり得るが、HBV DNAおよびHBeAgのレベルは、疾患の発病時に低下し始め、臨床的疾患のピーク時に検出不能になり得る(Hepatitis B virus infection-natural history and clinica
l consequences.N Engl J Med.350:2004;1118-1129)。HBeAgは、血液中で検出可能なウイルスマーカーであり、活性ウイルス複製、ひいては高ウイルス量および高感染性と相関する(Hepatitis B e antigen-the dangerous end game of hepa
titis B.N Engl J Med.347:2002;208-210)。抗HBsAbおよび抗HBcAb(IgG)の存在は、以前に感染した個人の回復および免疫力を示す。
米国肝臓病学会(AASLD)および欧州肝臓病学会(EASL)が現在推奨する慢性HBV感染療法には、インターフェロンα(INFα)、ペグ化インターフェロンα-2a(Peg-IFN2a)、エンテカビル、およびテノフォビルが含まれる。ヌクレオシドおよび核酸塩基療法であるエンテカビルおよびテノフォビルは、ウイルス量をうまく減少させるが、HBeAgセロコンバージョン率およびHBsAg損失率は、IFNα療法を用いて得られるものよりもさらに低い。ラミブジン(3TC)、テルビブジン(LdT)、およびアデフォビルを含む他の同様の療法も用いられるが、一般にヌクレオシド/核酸塩基療法の場合、耐性発生は、治療効果を制限する。
したがって、当技術分野における新たな抗ウイルス療法の発見および開発が必要とされている。さらに、HBeAgおよびHBsAgのセロコンバージョン率を増加させることができる新たな抗HBV療法が必要とされている。近年の臨床研究は、HBeAgのセロコンバージョンおよび減少(Fried et al(2008)Hepatology
47:428)とHBsAgの減少(Moucari et al(2009)Hepatology 49:1151)との間の相関を見出している。高レベルの抗原が免疫学的寛容を誘導すると考えられるため、抗原レベルの減少は、HBV感染の免疫学的制御を可能にしたかもしれない。現在のHBVに対するヌクレオシド療法は、HBVの血清レベルを劇的に減少させることができるが、HBeAgおよびHBsAgレベルにはほとんど影響を及ぼさない。
HBVを標的とするアンチセンス化合物は、各々が参照によりその全体が本明細書に組
み込まれる、国際公開第WO2011/047312号、同第WO2012/145674号、および同第WO2012/145697号に以前に開示されている。臨床研究は、患者におけるHBVを標的とするアンチセンス化合物の影響を評価するよう計画されている。しかしながら、患者にさらなるより有力な治療選択肢を提供することが依然として必要とされている。
HBV核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号12として本明細書に組み込まれるGENBANK(登録商標)受入番号U95551.1の配列を有するHBV核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、配列番号12を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号12に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号12を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号68の少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号12を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号68の核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000616
HBV治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、HBV核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象におけるHBVの発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、HBVの発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中のHBV核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、HBV関連状態を有する。ある特定の実施形態において、HBV関連状態には、慢性HBV感染、炎症、線維症、硬変、肝臓癌、血清肝炎、黄疸、肝臓癌、肝臓炎、肝線維症、肝硬変、肝不全、びまん性肝細胞炎症性疾患、血球貪食症候群、血清肝炎、およびHBVウイルス血症が含まれるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、HBV関連状態は、B型肝炎ウイルス、B型肝炎ウイルス抗原の存在についての陽性試験、またはB型肝炎ウイルス抗原に特異的な抗体の存在についての陽性試験と相まって、インフルエンザ様疾患、脱力感、疼痛、頭痛、発熱、食欲喪失、下痢、黄疸、嘔気および嘔吐、身体の肝臓領域の痛み、粘土色または灰色の便、体中の痒み、および暗色の尿のうちのいずれかまたはすべてを有し得、含み得る。ある特定の実施形態において、対象は、HBV関連状態の危険性がある。この対象には、B型肝炎ウイルスに感染した個人への性的曝露、生涯にわたるB型肝炎ウイルス感染を有する個人との同居、B型肝炎ウイルスに感染したヒト血液への曝露、不正薬物の注入、血友病を有する人との接触、およびB型肝炎がよく見られる地域への訪問を含む、HBV関連状態を発症する1つ以上の危険因子を有する対象が含まれる。ある特定の実施形態において、対象は、HBV関連状態の治療を必要とすると特定されている。
ある特定の実施形態において、本発明は、HBV核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
12. タンパク質チロシンホスファターゼ1B(PTP1B)
PTP1Bは、PTPのファミリーのメンバーであり(Barford,et al.,Science 1994.263:1397-1404)、細胞質内酵素である(Neel and Tonks,Curr.Opin.Cell Biol.1997.9:193-204)。PTP1Bは、遍在的(肝臓、筋肉、および脂肪等のインスリン代謝の主要な調節因子である組織を含む)に発現し(Goldstein,Receptor 1993.3:1-15)、PTP1Bは、主なPTP酵素である。
PTP1Bは、インスリンシグナル伝達の負の調節因子と見なされる。PTP1Bは、インスリン受容体と相互作用してそれを脱リン酸化し、それ故に、インスリンシグナル伝達変換を減弱させ、潜在的に終了させる(Goldstein et al.,J.Biol.Chem.2000.275:4383-4389)。インスリンシグナル伝達におけるPTP1Bの生理学的役割は、ノックアウトマウスモデルにおいて実証されている。PTP1B遺伝子を欠くマウスは、インスリン耐性および肥満から保護された(Elchebly et al.,Science 1999.283:1544-1548)。PTP1B欠損マウスは、低脂肪症を有し、基礎代謝率および総エネルギー消費量を増加させ、食事性肥満から保護された。インスリン刺激によるグルコース取り込みが骨格筋で増加した一方で、脂肪組織は影響を受けないままであり、PTP1B欠損マウスにおけるインスリン感受性の増加が組織特異的であるという証拠を提供した(Klaman et al.,Mol.Cell.Biol.2000.20:5479-5489)。これらのマウスは、表現型的には、正常であり、食事性肥満にも耐性を示し、インスリン耐性であり、高脂肪食で著しく低いトリグリセリドレベルを有した。したがって、2型糖尿病、メタボリックシンドローム、糖尿病性脂質異常症、または関連代謝性疾患に罹患している患者におけるPTP1Bの阻害が有益であった。
PTP1Bを標的とするアンチセンス化合物は、各々が参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、国際公開第WO2001/053528号、同第WO2002/092772号、同第WO2004/071407号、同第WO2006/044531号、同第WO2012/142458号、同第WO2006/044531号、および同第WO2012/142458号に以前に開示されている。PTP1Bを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、ISIS-PTP1BRxは、近年、肯定的な結果のI相臨床研究を完了した。しかしながら、患者にさらなるより有力な治療選択肢を提供することが依然として必要とされている。
PTP1B核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号13として本明細書に組み込まれるGENBANK(登録商標)受入番号NM_002827.2または配列番号14として本明細書に組み込まれる核酸塩基14178000から14256000まで切断されたGENBANK受入番号NT_011362.9の配列を有するPTP1B核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、配列番号13を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号13に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号13を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号69~72の少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号13を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号69~72の核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000617
PTP1B治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、PTP1B核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象におけるPTP1Bの発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、PTP1Bの発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中のPTP1B核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、メタボリックシンドローム、真性糖尿病、インスリン耐性、糖尿病性脂質異常症、高トリグリセリド血症、肥満、および体重増加を含む代謝関連疾患を有する。
真性糖尿病は、多数の身体的および生理学的症状を特徴とする。2型糖尿病と関連した当業者に既知の任意の症状は、改善され得るか、またはさもなければ上述の方法に記載されるように調節され得る。ある特定の実施形態において、症状は、グルコースレベルの増加、体重増加、頻尿、異常な喉の渇き、極度の空腹感、極度の疲労感、視覚のぼけ、頻発する感染症、四肢のうずきまたはしびれ、乾燥敏感肌、体重減少、回復の遅い痛み、および歯茎の腫れからなる群から選択される身体的症状である。ある特定の実施形態において、症状は、インスリン耐性の増加、脂肪量の増加、代謝率の低下、グルコースクリアランスの低下、グルコース耐性の低下、インスリン感受性の低下、肝臓におけるインスリン感受性の低下、脂肪組織の大きさおよび重量の増加、体脂肪の増加、ならびに体重の増加からなる群から選択される生理学的症状である。
ある特定の実施形態において、本発明は、PTP1B核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
13. STAT3
タンパク質のSTAT(転写のシグナル変換因子および活性化因子)ファミリーは、転写のシグナル変換と活性化の二役を果たすDNA結合タンパク質を含む。現在、STATファミリーには6つの異なるメンバー(STAT1、STAT2、STAT3、STAT4、STAT5、およびSTAT6)、ならびにいくつかのイソ型(STAT1α、STAT1β、STAT3α、およびSTAT3β)が存在する。STATの活性は、様々なサイトカインおよび増殖刺激によって調節される。サイトカインがその受容体に結合することにより、これらの受容体と会合したヤヌスタンパク質チロシンキナーゼ(JAK)の活性化がもたらされる。これは、STATをリン酸化し、核への転位およびSTAT応答性遺伝子の転写活性化をもたらす。STATの特定のチロシン残基におけるリン酸化は、それらの活性化をもたらし、特定の遺伝子プロモーター配列に結合するSTATのホモ二量体および/またはヘテロ二量体の形成をもたらす。STAT活性化によるサイトカインによって媒介される事象には、細胞増殖および分化ならびにアポトーシスの阻止が含まれる。
STAT活性化の特異性は、特異的サイトカインに起因し、すなわち、各STATは、少数の特異的サイトカインに応答する。増殖因子等の他の非サイトカインシグナル伝達分子もSTATを活性化することが見出されている。これらの因子がタンパク質チロシンキナーゼと会合した細胞表面受容体に結合することは、STATのリン酸化もまたもたらす。
特に、STAT3(さらに急性期応答因子(APRF))が、インターロイキン-6(IL-6)、ならびに上皮細胞増殖因子(EGF)に応答することが見出されている(Darnell,Jr.,J.E.,et al.,Science,1994,264,1415-1421)。加えて、STAT3がインターフェロンによるシグナル変換において重要な役割を果たすことが見出されている(Yang,C.-H.,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1998,95,5568-5572)。STAT3がMAPK経路によって調整され得ることを示唆する証拠が存在する。ERK2は、セリンリン酸化を誘導し、またSTAT3と会合する(Jain,N.,et
al.,Oncogene,1998,17,3157-3167)。
STAT3は、ほとんどの細胞型で発現する(Zhong,Z.,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1994,91,4806-4810)。これは、組織損傷および炎症への応答に関与する遺伝子の発現を誘導する。STAT3は、bcl-2の発現によりアポトーシスを阻止することも示されている(Fukada,T.,et al.,Immunity,1996,5,449-460)。
近年、STAT3は、形質転換細胞のミトコンドリア中で検出され、癌細胞と同様に、解糖系および酸化的リン酸化活性を促進することが示された(Gough,D.J.,et al.,Science,2009,324,1713-1716)。ミトコンドリアにおけるSTAT3の阻害は、活性化Rasによる悪性形質転換を妨げた。データは、その核の役割に加えて、ミトコンドリアにおけるSTAT3に対するRas媒介形質転換機能を裏付ける。
STAT3の異常な発現または構成的発現は、いくつかの疾患過程と関連している。
STAT3を標的とするアンチセンス化合物は、各々が参照によりその全体が本明細書に組み込まれる国際公開第WO2012/135736号および同第WO2005/083124号に以前に開示されている。STAT3を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、ISIS-STAT3Rxは、現在、第I/II相臨床試験において癌を有する対象を治療する際のその有効性を試験するためのものである。しかしながら、患者にさらなるより有力な治療選択肢を提供することが依然として必要とされている。
STAT3核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号15として本明細書に組み込まれるGENBANK(登録商標)受入番号NM_139276.2の配列を有するSTAT3核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、配列番号15を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号15に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号15を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号73の少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号15を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号73の核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチ
センス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000618
STAT3治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、STAT3核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象におけるSTAT3の発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、STAT3の発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中のSTAT3核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、過剰増殖性疾患、障害、または状態を有する。ある特定の実施形態において、そのような過剰増殖性疾患、障害、および状態には、癌、ならびに関連した悪性腫瘍および転移癌が含まれる。ある特定の実施形態において、そのような癌には、非小細胞肺癌(NSCLC)を含む肺癌、膵臓癌、結腸直腸癌、多発性骨髄腫、肝細胞癌(HCC)、神経膠芽腫、卵巣癌、骨肉腫、頭頸部癌、乳癌、扁平上皮癌、腸腺腫、前立腺癌、および胃癌が含まれる。
ある特定の実施形態において、本発明は、STAT3核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
14. トランスサイレチン(TTR)
TTR(別名、プレアルブミン、高サイロキシン血症、プレアルブミン異常、チロキシン;老人性全身性アミロイドーシス、アミロイド多発ニューロパチー、アミロイドーシスI、PALB;トランスサイレチン障害、HST2651;TBPA;プレアルブミン障害甲状腺機能正常性過剰サイロキシン血症)は、チロキシンおよびレチノールの輸送に関与する血清/血漿および脳脊髄液タンパク質である(Sakaki et al,Mol
Biol Med.1989,6:161-8)。構造的に、TTRは、ホモ四量体であり、タンパク質の点変異およびミスフォールディングは、アミロイド原線維の沈着につながり、老人性全身性アミロイドーシス(SSA)、家族性アミロイド多発ニューロパチー(FAP)、および家族性アミロイド心臓病(FAC)等の障害と関連している。
TTRは、主に肝臓および脳脈絡叢によって合成され、程度は低いが、ヒト網膜によっても合成される(Palha,Clin Chem Lab Med,2002,40,1292-1300)。肝臓で合成されるトランスサイレチンが血液中に分泌される一方で、脈絡叢に由来するトランスサイレチンは、CSFに向かう運命にある。脈絡叢において、トランスサイレチン合成は、全局所タンパク質合成の約20%に相当し、全CSFタンパク質の25%にも相当する(Dickson et al.,J Biol Chem,1986,261,3475-3478)。
遺伝子および免疫組織化学的診断試験を使用することで、TTRアミロイドーシスを有する患者は、世界各地で見つけられている。最近の研究は、TTRアミロイドーシスが以前に考えられていたような稀な風土病ではなく、高齢者人口の25%にも影響を及ぼし得ることを示している(Tanskanen et al,Ann Med.2008;40(3):232-9)。
生化学的レベルで、TTRは、FAP患者のアミロイド沈着における主要なタンパク質
成分と特定され(Costa et al,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 1978,75:4499-4503)、後に、タンパク質の30位でのメチオニンのバリンとの置換がその疾患を引き起こす最も一般的な分子欠損であることが見出された(Saraiva et al,J.Clin.Invest.1984,74:104-119)。FAPにおいて、TTR凝集体およびアミロイド原線維の広く行き渡った全身性細胞外沈着は、結合組織にわたって、特に末梢神経系で生じる(Sousa and Saraiva,Prog.Neurobiol.2003,71:385-400)。TTR沈着後、軸索変性が生じ、小径の無髄および有髄線維で始まり、および最終的に神経節部位でニューロンの損失につながる。
TTRを標的とするアンチセンス化合物は、各々が参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、米国特許第US2005/0244869号、国際公開第WO2010/017509号、および同第WO2011/139917号に以前に開示されている。TTRを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、ISIS-TTRRxは、現在、第II/III相臨床試験において家族性アミロイド多発ニューロパチーを有する対象を治療する際のその有効性を試験するためのものである。しかしながら、患者にさらなるより有力な治療選択肢を提供することが依然として必要とされている。
TTR核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号16として本明細書に組み込まれるGENBANK(登録商標)受入番号NM_000371.3の配列を有するTTR核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、配列番号16を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号16に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号16を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号74~81の少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号16を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号74~81の核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000619
TTR治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、TTR核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象におけるTTRの発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、TTRの発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中のTTR核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態
において、対象は、トランスサイレチン関連疾患、障害、もしくは状態、またはそれらの症状を有する。ある特定の実施形態において、トランスサイレチン関連疾患、障害、または状態は、トランスサイレチンアミロイドーシスである。「トランスサイレチン関連アミロイドーシス」または「トランスサイレチンアミロイドーシス」または「トランスサイレチンアミロイド疾患」とは、本明細書で使用されるとき、トランスサイレチン含有アミロイド原線維の形成をもたらすトランスサイレチンの機能不全または異常調節と関連したあらゆる病変または疾患である。トランスサイレチンアミロイドーシスには、遺伝性TTRアミロイドーシス、軟膜アミロイドーシス、家族性アミロイド多発ニューロパチー(FAP)、家族性アミロイド心筋症、家族性眼軟膜アミロイドーシス、老人性心アミロイドーシス、または老人性全身性アミロイドーシスが含まれるが、これらに限定されない。
ある特定の実施形態において、本発明は、TTR核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
15. PCSK9
PCSK9(別名、前駆タンパク質転換酵素サブチリシンケキシン9)は、サブチリシンセリンプロテアーゼファミリーのメンバーである。他の8個の哺乳類サブチリシンプロテアーゼであるPCSK1~PCSK8(別名、PC1/3、PC2、フーリン、PC4、PC5/6、PACE4、PC7、およびS1P/SKI-1)は、分泌経路内の多種多様のタンパク質を処理し、様々な生物学的プロセスに役立つ前駆タンパク質転換酵素である(Bergeron,F.(2000)J.Mol.Endocrinol.24,1-22,Gensberg,K.,(1998)Semin.Cell Dev.Biol.9,11-17,Seidah,N.G.(1999)Brain Res.848,45-62,Taylor,N.A.,(2003)FASEB J.17,1215-1227、およびZhou,A.,(1999)J.Biol.Chem.274,20745-20748)。PCSK9は、コレステロール代謝に役立つと提案されている。PCSK9 mRNA発現は、コレステロール生合成酵素および低密度リポタンパク質受容体(LDLR)と同様に、マウスにおいて食事性コレステロール摂取によって下方調節され(Maxwell,K.N.,(2003 J.Lipid Res.44,2109-2119)、スタチンによってHepG2細胞において上方調節され(Dubuc,G.,(2004)Arterioscler.Thromb.Vasc.Biol.24,1454-1459)、ステロール調節要素結合タンパク質(SREBP)トランスジェニックマウスにおいて上方調節される(Horton,J.D.,(2003)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 100,12027-12032)。さらに、PCSK9ミスセンス変異が常染色体優性高コレステロール血症(Hchola3)のある形態と関連していることが見出されている(Abifadel,M.,et al.(2003)Nat.Genet.34,154-156,Timms,K.M.,(2004)Hum.Genet.114,349-353,Leren,T.P.(2004)Clin.Genet.65,419-422)。単一ヌクレオチド多型(SNP)が日本の人口のコレステロールレベルと関連しているため、PCSK9は、一般人口のLDLコレステロールレベルの決定にも役立ち得る(Shioji,K.,(2004)J.Hum.Genet.49,109-114)。
PCSK9を標的とするアンチセンス化合物は、米国特許第8,084,437号、同第8,093,222号、同第8,664,190号、ならびに国際公開第WO2008/066776号および同第WO2009/148605号に以前に開示されている。しかしながら、患者にさらなるより有力な治療選択肢を提供することが依然として必要とされている。
PCSK9核酸を標的にするある特定の共役アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、配列番号160として本明細書に組み込まれるGENBANK(登録商標)受入番号の配列を有するPCSK9核酸を標的にする。ある特定のそのような実施形態において、配列番号160を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号160に少なくとも90%、少なくとも95%、または100%相補的である。
ある特定の実施形態において、配列番号160を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号156~159の少なくとも8連続核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、配列番号160を標的にする共役アンチセンス化合物は、配列番号156~159の核酸塩基配列を含む。ある特定の実施形態において、そのような共役アンチセンス化合物は、1~3個のGalNAcリガンドを含む共役体を含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、本明細書に開示される共役体を含む。
Figure 0007177127000620
PCSK9治療指標
ある特定の実施形態において、本発明は、PCSK9核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象におけるPCSK9の発現を調節するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、PCSK9の発現が低下する。
ある特定の実施形態において、本発明は、医薬組成物中のPCSK9核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて対象を治療するための方法を提供する。ある特定の実施形態において、対象は、PCSK9関連疾患、障害、もしくは状態、またはその症状を有する。ある特定の実施形態において、PCSK9関連疾患、障害、または状態は、代謝性または心臓血管疾患である。
ある特定の実施形態において、本発明は、PCSK9核酸を標的にする共役アンチセンス化合物を用いて薬剤を調製するための方法を提供する。
E. ある特定の核酸GalNAc共役体
ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、GalNAc共役体に結合される以下の表16におけるアンチセンス化合物の核酸塩基配列を有するアンチセンス化合物を含む。ある特定の実施形態において、共役アンチセンス化合物は、GalNAc共役体に結合される以下の表16におけるアンチセンス化合物の核酸塩基配列および化学修飾を有するアンチセンス化合物を含む。すべてのヌクレオシド間結合は、別途示されない限り、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。下付き文字「l」は、LNA二環式ヌクレオシドを示す。下付き文字「d」は、2’-デオキシヌクレオシドを示す。下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示す。下付き文字「v」は、2-アミノ-2’-デオキシアデノシンを示す。
Figure 0007177127000621
さらなる配列および本明細書における任意の共役体との共役に好適なオリゴヌクレオチド
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知の真核性開始因子4E(eIF4E)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、dIF4Eを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、dIF4Eを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なeIF4Eを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる米国特許第US7,425,544号に開示されるものが挙げられるが、これに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US7,425,544号に開
示される配列番号18~122のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US7,425,544に開示される配列番号212~459のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンス鎖と、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知の転写3のシグナル変換因子および活性化因子(STAT3)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、STAT3を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、STAT3を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なSTAT3を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる、国際公開第WO2012/135736号、同第WO2005/083124、および米国特許第US6,727,064号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2012/135736号に開示される、配列番号9~426、430~442、445~464、471~498、500~1034、1036~1512、および1541~2757のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2005/083124号に開示される、配列番号2~81、108~150、および159~381のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US6,727,064号に開示される、配列番号2~81および108~150のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知のグルココルチコイド受容体(GCCR)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、GCCRを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、GCCRを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なGCCRを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる、国際公開第WO2005/071080号、同第WO2007/035759号、および同第WO2007/136988号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2005/071080号に開示される、配列番号30~216および306~310のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2007/035759号に開示される、配列番号26~113のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に開示される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2007/136988号に開示される、配列番号413~485のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に開示される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知のグルカゴン受容体(GC
GR)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、GCGRを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、GCGRを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なGCGRを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる、米国特許第US7,750,142号、同第US7,399,853号、国際公開第WO2007/035771号、および同第WO2007/134014号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US7,750,142号に開示される、配列番号20~399のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US7,399,853号に開示される、配列番号20~399のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2007/035771号に開示される、配列番号2の核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2007/134014号に開示される、配列番号486~680のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知のタンパク質チロシンホスファターゼ1B(PTP1B)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、PTP1Bを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、PT1Bを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なPTP1Bを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる米国特許第US7,563,884号および国際公開第WO2007/131237号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US7,563,884号に開示される、配列番号17~96および244~389のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2007/131237号に開示される、配列番号886~1552のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知の線維芽細胞増殖因子受容体4(FGFR4)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、FGFR4を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、FGFR4を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なFGFR4を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる国際公開第WO2009/046141号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2009/046141号に開示される、配列番号21~24、28、29、36、38、39、43、48、51、54~56、58~60、64~66、および92~166のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載され
る共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知のα-1-抗トリプシン(A1AT)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、A1ATを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、A1ATを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なA1ATを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる国際公開第WO2013/142514号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2013/142514号に開示される、配列番号20~41のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知の第VII因子を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、第VII因子を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、第VII因子を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適な第VII因子を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる、国際公開第WO2013/119979号および同第WO2009/061851号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2013/119979号に開示される、配列番号21~659のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2009/061851号に開示される、配列番号4~159および168~611のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知の第XI因子を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、第XI因子を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、第XI因子を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適な第XI因子を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる、国際公開第WO2010/045509号および同第WO2010/121074号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2010/045509号に開示される、配列番号15~270のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2010/121074号に開示される、配列番号15~270のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知のB型肝炎ウイルス(HB
V)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、HBVを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、HBVを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なHBVを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる、国際公開第WO2012/145697号および同第WO2012/145697号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2012/145697号に開示される、配列番号5~310、321~802、804~1272、1288~1350、1364~1372、1375、1376、および1379のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2011/047312号に開示される、配列番号14~22のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知のトランスサイレチン(TTR)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、TTRを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、TTRを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なTTRを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる、国際公開第WO2011/139917号および米国特許第US8,101,743号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2011/139917号に開示される、配列番号8~160、170~177のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US8,101,743号に開示される、配列番号12~89のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US8,101,743号に開示される、配列番号90~133のうちのいずれかの好ましい標的セグメントに相補的な核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知のアポリポタンパク質(a)(apo(a))を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、apo(a)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、apo(a)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なapo(a)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる、国際公開第WO2013/177468号、米国特許第US8,673,632号、同第US7,259,150号、および米国特許出願公開第US2004/0242516号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2013/177468号に開示される、配列番号12~130、133、134のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施
形態において、化合物は、米国特許第US8,673,632号に開示される、配列番号11~45および85~96のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US7,259,150号に開示される、配列番号11~45のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許出願公開第US2004/0242516号に開示される、配列番号7~41のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知のアポリポタンパク質B(ApoB)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、ApoBを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、ApoBを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なApoBを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる、米国特許出願公開US2010/0331390号、同第US2009/0306180号、および同第US2005/0009088号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US2010/0331390号に開示される、配列番号20の核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US2009/0306180号に開示される、配列番号16~213のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US2005/0009088号に開示される、配列番号17~70、124~317、319~333、335~502、504~804、および864~887のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知のアポリポタンパク質C-III(ApoC-III)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、ApoC-IIIを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、ApoC-IIIを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なApoC-IIIを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる米国特許出願公開第US2013/0317085号に開示されるものが挙げられるが、これに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US2013/0317085号に開示される、配列番号19~96および209~221のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知の前駆タンパク質転換酵素サブチリシン/ケキシン9型(PCSK9)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、PCSK9を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRN
A)化合物である。ある特定の実施形態において、PCSK9を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なPCSK9を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる米国特許第US8,143,230号および同第US8,664,190号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US8,143,230号に開示される、配列番号329~403のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、米国特許第US8,664,190号に開示される、配列番号4~455および458~461のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、化合物は、当技術分野で既知のC反応性タンパク質(CRP)を標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、CRPを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNAi(siRNAまたはssRNA)化合物である。ある特定の実施形態において、CRPを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、RNase Hベースのアンチセンス化合物である。共役に好適なCRPを標的にするアンチセンスオリゴヌクレオチドの例として、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる、国際公開第WO2003/010284号、同第WO2005/005599号、および同第WO2007/143317号に開示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2003/010284号に開示される、配列番号10~63のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2005/005599号に開示される、配列番号19~72、76~259、および598~613のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。ある特定の実施形態において、化合物は、国際公開第WO2007/143317号に開示される、配列番号409~412のうちのいずれかの核酸塩基配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドと、本明細書に記載される共役基とを含む。前記参照される配列番号のうちのすべての核酸塩基配列が参照により本明細書に組み込まれる。
F. ある特定の医薬組成物
ある特定の実施形態において、本開示は、1個以上のアンチセンス化合物を含む医薬組成物を提供する。ある特定の実施形態において、そのような医薬組成物は、好適な薬剤的に許容される希釈剤または担体を含む。ある特定の実施形態において、医薬組成物は、滅菌生理食塩溶液および1個以上のアンチセンス化合物を含む。ある特定の実施形態において、そのような医薬組成物は、滅菌生理食塩溶液および1個以上のアンチセンス化合物からなる。ある特定の実施形態において、滅菌生理食塩水は、医薬品グレードの生理食塩水である。ある特定の実施形態において、医薬組成物は、1個以上のアンチセンス化合物および滅菌水を含む。ある特定の実施形態において、医薬組成物は、1個以上のアンチセンス化合物および滅菌水からなる。ある特定の実施形態において、滅菌生理食塩水は、医薬品グレードの水である。ある特定の実施形態において、医薬組成物は、1個以上のアンチセンス化合物およびリン酸緩衝生理食塩水(PBS)を含む。ある特定の実施形態において、医薬組成物は、1個以上のアンチセンス化合物および滅菌リン酸緩衝生理食塩水(PBS)からなる。ある特定の実施形態において、滅菌生理食塩水は、医薬品グレードのPBSである。
ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、医薬組成物または製剤を調製す
るために薬剤的に許容される活性および/または不活性物質と混合され得る。組成物および医薬組成物を製剤化するための方法は、投与経路、疾患の程度、または投与される用量を含むが、これらに限定されないいくつかの基準に依存する。
アンチセンス化合物を含む医薬組成物は、任意の薬剤的に許容される塩、エステル、またはそのようなエステルの塩を包含する。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物を含む医薬組成物は、ヒトを含む動物への投与時に、生物学的に活性な代謝物またはその残渣を(直接的または間接的に)提供することができる1個以上のオリゴヌクレオチドを含む。したがって、例えば、本開示は、アンチセンス化合物の薬剤的に許容される塩、プロドラッグ、そのようなプロドラッグの薬剤的に許容される塩、および他の生物学的等価物を対象とする。好適な薬剤的に許容される塩には、ナトリウム塩およびカリウム塩が含まれるが、これらに限定されない。
プロドラッグは、体内で内因性ヌクレアーゼによって切断されて活性アンチセンスオリゴヌクレオチドを形成するオリゴヌクレオチドの一方または両方の末端におけるさらなるヌクレオシドの組み込みを含み得る。
脂質部分は、様々な方法で核酸療法において用いられている。ある特定のそのような方法において、核酸は、カチオン性脂質と中性脂質の混合物から作られた事前形成されたリポソームまたはリポプレックスに導入される。ある特定の方法において、モノまたはポリカチオン性脂質とのDNA複合体は、中性脂質の存在なしで形成される。ある特定の実施形態において、脂質部分は、特定の細胞または組織への薬剤の分布を増加させるように選択される。ある特定の実施形態において、脂質部分は、脂肪組織への薬剤の分布を増加させるように選択される。ある特定の実施形態において、脂質部分は、筋肉組織への薬剤の分布を増加させるように選択される。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される医薬組成物は、1個以上の修飾オリゴヌクレオチドおよび1個以上の賦形剤を含む。ある特定のそのような実施形態において、賦形剤は、水、食塩水、アルコール、ポリエチレングリコール、ゼラチン、ラクトース、アミラーゼ、ステアリン酸マグネシウム、滑石、ケイ酸、粘性パラフィン、ヒドロキシメチルセルロース、およびポリビニルピロリドンから選択される。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される医薬組成物は、送達系を含む。送達系の例として、リポソームおよびエマルジョンが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の送達系は、疎水性化合物を含む医薬組成物を含むある特定の医薬組成物の調製に有用である。ある特定の実施形態において、ジメチルスルホキシド等のある特定の有機溶媒が用いられる。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される医薬組成物は、特定の組織または細胞型に本開示の1個以上の薬剤を送達するように設計された1個以上の組織特異的送達分子を含む。例えば、ある特定の実施形態において、医薬組成物は、組織特異的抗体でコーティングされたリポソームを含む。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される医薬組成物は、共溶媒系を含む。ある特定のそのような共溶媒系は、例えば、ベンジルアルコール、非極性界面活性剤、水混和性有機ポリマー、および水相を含む。ある特定の実施形態において、そのような共溶媒系は、疎水性化合物に用いられる。そのような共溶媒系の非限定的な例にはVPD共溶媒系があり、これは、3w/v%のベンジルアルコール、8w/v%の非極性界面活性剤ポリソルベート80(商標)、および65w/v%のポリエチレングリコール300を含む無水エタノールの溶液である。そのような共溶媒系の割合は、それらの溶解度および毒
性特性を著しく変化させることなく大幅に変化し得る。さらに、共溶媒成分の同一性は変化し得、例えば、他の界面活性剤をポリソルベート80(商標)の代わりに使用してもよく、ポリエチレングリコールの画分サイズは変化し得、他の生体適合性ポリマーは、ポリエチレングリコール、例えば、ポリビニルピロリドンに取って代わり得、他の糖または多糖は、デキストロースと置き換わり得る。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される医薬組成物は、経口投与のために調製される。ある特定の実施形態において、医薬組成物は、口腔投与のために調製される。
ある特定の実施形態において、医薬組成物は、注入による投与(例えば、静脈内、皮下、筋肉内等)のために調製される。ある特定のそのような実施形態において、医薬組成物は、担体を含み、水溶液、例えば、水または生理学的に相溶性の緩衝液、例えば、ハンクス溶液、リンガー溶液、または生理学的生理食塩水緩衝液等の中で製剤化される。ある特定の実施形態において、他の成分(例えば、溶解に役立つか、または防腐剤の役目を果たす成分)が含まれる。ある特定の実施形態において、注入可能な懸濁液は、適切な液体担体、懸濁化剤等を用いて調製される。注入用のある特定の医薬組成物は、単位剤形で、例えば、アンプル単位で提供されるか、または多用量容器内に提供される。注入用のある特定の医薬組成物は、油性または水性ビヒクル中の懸濁液、溶液、またはエマルジョンであり、懸濁化剤、安定化剤、および/または分散剤等の製剤化剤を含有し得る。注入用の医薬組成物における使用に好適なある特定の溶媒には、親油性溶媒および脂肪油、例えば、ゴマ油、合成脂肪酸エステル、例えば、オレイン酸エチルまたはトリグリセリド、およびリポソームが含まれるが、これらに限定されない。水性注入懸濁液は、カルボキシルメチルセルロースナトリウム、ソルビトール、またはデキストラン等の懸濁液の粘度を増加させる物質を含有し得る。任意に、そのような懸濁液は、好適な安定剤または高度に濃縮された溶液の調製を可能にする薬剤の溶解度を増加させる薬剤も含有し得る。
ある特定の実施形態において、医薬組成物は、経粘膜投与のために調製される。ある特定のそのような実施形態において、浸透する障壁に適切な浸透剤が製剤化において用いられる。そのような浸透剤は、一般に当技術分野で既知である。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される医薬組成物は、治療的に効果的な量のオリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態において、治療的に効果的な量は、疾患の症状を防止するか、疾患の症状を軽減するか、もしくは疾患の症状を改善するか、または治療される対象の生存期間を延長させるのに十分な量である。治療的に効果的な量の決定は、十分に当業者の能力の範囲内である。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される1個以上の修飾オリゴヌクレオチドは、プロドラッグとして製剤化される。ある特定の実施形態において、生体内投与時に、プロドラッグは、オリゴヌクレオチドの生物学的に、薬剤的に、または治療的により活性な形態に化学変換される。ある特定の実施形態において、プロドラッグは、対応する活性形態よりも投与し易いため、有用である。例えば、ある特定の事例において、プロドラッグは、対応する活性形態よりも生物学的に利用可能である(例えば、経口投与によって)。ある特定の事例において、プロドラッグは、対応する活性形態と比較して、改善された溶解度を有し得る。ある特定の実施形態において、プロドラッグは、対応する活性形態よりも水溶性が低い。ある特定の事例において、そのようなプロドラッグは、水溶解度が移動性に害を及ぼす細胞膜にわたって優れた透過性を有する。ある特定の実施形態において、プロドラッグは、エステルである。ある特定のそのような実施形態において、エステルは、投与時にカルボン酸に代謝的に加水分解される。ある特定の事例において、カルボン酸含有化合物は、対応する活性形態である。ある特定の実施形態において、プロドラッ
グは、酸基に結合される短ペプチド(ポリアミノ酸)を含む。ある特定のそのような実施形態において、ペプチドは、投与時に切断されて、対応する活性形態を形成する。
ある特定の実施形態において、本開示は、細胞内の標的核酸の量または活性を低減させる、組成物および方法を提供する。ある特定の実施形態において、細胞は、動物内に存在する。ある特定の実施形態において、動物は、哺乳動物である。ある特定の実施形態において、動物は、齧歯動物である。ある特定の実施形態において、動物は、霊長類である。ある特定の実施形態において、動物は、非ヒト霊長類である。ある特定の実施形態において、動物は、ヒトである。
ある特定の実施形態において、本開示は、本開示のオリゴヌクレオチドを含む医薬組成物を動物に投与する方法を提供する。好適な投与経路には、経口投与、直腸投与、経粘膜投与、腸内投与、経腸投与、局所投与、坐薬投与、吸入による投与、髄腔内投与、脳室内投与、腹腔内投与、鼻腔内投与、眼内投与、腫瘍内投与、ならびに非経口(例えば、静脈内、筋肉内、髄内、および皮下)投与が含まれるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、薬学的髄腔内薬が投与されて、全身曝露ではなく局所曝露を達成する。例えば、医薬組成物は、所望の罹患部に(例えば、肝臓に)直接注入され得る。
参照による非限定的な開示および組み込み
本明細書に記載されるある特定の化合物、組成物、および方法がある特定の実施形態に従って具体的に記載されているが、以下の実施例は、本明細書に記載される化合物を例証する役目のみを果たし、それを限定するようには意図されていない。本出願に列挙される参考文献、GenBank受入番号等の各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本明細書におけるある特定の化合物、組成物、および方法は、特定の数の特定の要素または特徴を「正確に含む」か、または「正確に含んでいる」とされる。そのような記述を用いて、化合物、組成物、または方法がさらなる他の要素を含み得るが、特定の要素または特徴の数が特定された数であることを示す。例えば、「正確に1個のGalNAcを含む共役体」は、唯一のGalNAcを含有する共役体であるが、その1個のGalNAcに加えて他の要素も含有し得る。
本出願に添付される配列表が必要に応じて各配列を「RNA」または「DNA」のいずれか一方と特定するが、実際には、それらの配列は、化学修飾の任意の組み合わせで修飾され得る。当業者であれば、修飾オリゴヌクレオチドを説明するための「RNA」または「DNA」のそのような指定が、ある特定の事例において、任意であることを容易に認識する。例えば、2’-OH糖部分およびチミン塩基を含むヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドは、修飾糖を有するDNA(DNAの天然2’-Hの場合、2’-OH)または修飾塩基を有するRNA(RNAの天然ウラシルの場合、チミン(メチル化ウラシル))と記載され得る。
したがって、配列表中のものを含むが、これらに限定されない本明細書に提供される核酸配列は、修飾核酸塩基を有するそのような核酸を含むが、これらに限定されない天然または修飾RNAおよび/またはDNAの任意の組み合わせを含有する核酸を包含するよう意図される。さらなる例であって制限するものではなく、核酸塩基配列「ATCGATCG」を有するオリゴヌクレオチドは、修飾または非修飾にかかわらず、RNA塩基、例えば、配列「AUCGAUCG」を有するオリゴヌクレオチド、ならびに「AUCGATCG」等のいくつかのDNA塩基およびいくつかのRNA塩基を有するオリゴヌクレオチド、ならびに「ATmeCGAUCG」等の他の修飾塩基を有するオリゴヌクレオチドを含むそのような化合物を含むが、これらに限定されないそのような核酸塩基配列を有する任
意のオリゴヌクレオチドを包含し、式中、meCは、5位にメチル基を含むシトシン塩基を示す。
実施例
以下の実施例は、本開示のある特定の実施形態を例証するものであり、限定するものではない。さらに、特定の実施形態が提供される場合、本発明者らは、それらの特定の実施形態の一般的適用を企図している。例えば、特定のモチーフを有するオリゴヌクレオチドの開示は、そのモチーフまたは同様のモチーフを有するさらなるオリゴヌクレオチドへの合理的な支持を提供する。同様に、例えば、特定の高親和性修飾が特定の位置に出現する場合、同一の位置での他の高親和性修飾は、別途示されない限り、好適であると見なされる。
実施例
以下の実施例は、本開示のある特定の実施形態を例証するものであり、限定するものではない。さらに、特定の実施形態が提供される場合、本発明者らは、それらの特定の実施形態一般的適用を企図している。例えば、特定のモチーフを有するオリゴヌクレオチドの開示は、そのモチーフまたは同様のモチーフを有するさらなるオリゴヌクレオチドへの合理的な支持を提供する。同様に、例えば、特定の高親和性修飾が特定の位置に出現する場合、同一の位置での他の高親和性修飾は、別途示されない限り、好適であると見なされる。
実施例1:ホスホラミダイト(化合物1、1a、および2)の調製のための一般的方法
Figure 0007177127000622
化合物1、1a、および2を、本明細書に記載される当技術分野で周知の手順通りに調製した(Seth et al.,Bioorg.Med.Chem.,2011,21(4),1122-1125,J.Org.Chem.,2010,75(5),1569-1581,Nucleic Acids Symposium Series,2008,52(1),553-554)、ならびに公開されたPCT国際出願(国際公開第WO2011/115818号、同第WO2010/077578号、同第WO2010/036698号、同第WO2009/143369号、同第WO2009/006478、および同第WO2007/090071号)、ならびに米国特許第7,569,686号も参照のこと)。
実施例2:化合物7の調製
Figure 0007177127000623
化合物3(2-アセトアミド-1,3,4,6-テトラ-O-アセチル-2-デオキシ-β-Dガラクトピラノースまたはガラクトサミンペンタアセテート)は、市販のものである。化合物5を公開された手順(Weber et al.,J.Med.Chem.,1991,34,2692)に従って調製した。
実施例3:化合物11の調製
Figure 0007177127000624
化合物8および9は、市販のものである。
実施例4:化合物18の調製
Figure 0007177127000625
化合物11を実施例3に例証される手順通りに調製した。化合物14は、市販のものである。化合物17を、Rensen et al.(J.Med.Chem.,2004,47,5798-5808)によって報告された同様の手順を用いて調製した。
実施例5:化合物23の調製
Figure 0007177127000626
化合物19および21は、市販のものである。
実施例6:化合物24の調製
Figure 0007177127000627
化合物18および23を実施例4および5に例証される手順通りに調製した。
実施例7:化合物25の調製
Figure 0007177127000628
化合物24を実施例6に例証される手順通りに調製した。
実施例8:化合物26の調製
Figure 0007177127000629
化合物24を実施例6に例証される手順通りに調製する。
実施例9:3’末端にGalNAc-1を含む共役ASO(化合物29)の一般的調製
Figure 0007177127000630
Figure 0007177127000631
保護されたGalNAc-1は、以下の構造を有する。
Figure 0007177127000632
共役基GalNAc-1(GalNAc-1)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を提供することができる。GalNAc-1は、以下の式を有する。
Figure 0007177127000633
固体支持体結合保護GalNAc-1(化合物25)を実施例7に例証される手順通りに調製した。3’末端にGalNAc-1を含むオリゴマー化合物29を、自動DNA/RNA合成における標準の手順を用いて調製した(Dupouy et al.,Angew.Chem.Int.Ed.,2006,45,3623-3627を参照のこと)。ホスホラミダイト構築ブロック(化合物1および1a)を実施例1に例証される手順通りに調製した。他のホスホラミダイト構築ブロックを用いて既定の配列および組成を有するオリゴマー化合物を調製することができるため、例証されるホスホラミダイトは、代表的なものであり、限定するようには意図されていない。固体支持体に添加されるホスホラミダイトの順序および量を調整して、本明細書に記載されるギャップトオリゴマー化合物を調製することができる。そのようなギャップトオリゴマー化合物は、任意の所与の標的によって指示される既定の組成および塩基配列を有し得る。
実施例10:5’末端にGalNAc-1を含む共役ASO(化合物34)の一般的調製
Figure 0007177127000634
Figure 0007177127000635
Unylinker(商標)30は、市販のものである。5’末端にGalNAc
1クラスターを含むオリゴマー化合物34を、自動DNA/RNA合成における標準の手順を用いて調製する(Dupouy et al.,Angew.Chem.Int.Ed.,2006,45,3623-3627を参照のこと)。ホスホラミダイト構築ブロック(化合物1および1a)を実施例1に例証される手順通りに調製した。他のホスホラミダイト構築ブロックを用いて既定の配列および組成を有するオリゴマー化合物を調製することができるため、例証されるホスホラミダイトは、代表的なものであり、限定するようには意図されていない。固体支持体に添加されるホスホラミダイトの順序および量を調整して、本明細書に記載されるギャップトオリゴマー化合物を調製することができる。そのようなギャップトオリゴマー化合物は、任意の所与の標的によって指示される既定の組成および塩基配列を有し得る。
実施例11:化合物39の調製
Figure 0007177127000636
Figure 0007177127000637
化合物4、13、および23を実施例2、4、および5に例証される手順通りに調製した。化合物35をRouchaud et al.,Eur.J.Org.Chem.,2011,12,2346-2353に公開された同様の手順を用いて調製する。
実施例12:化合物40の調製
Figure 0007177127000638
化合物38を実施例11に例証される手順通りに調製する。
実施例13:化合物44の調製
Figure 0007177127000639
Figure 0007177127000640
化合物23および36を実施例5および11に例証される手順通りに調製する。化合物41を、国際公開第WO2009082607号に公開された同様の手順を用いて調製する。
実施例14:化合物45の調製
Figure 0007177127000641
化合物43を実施例13に例証される手順通りに調製する。
実施例15:化合物47の調製
Figure 0007177127000642
化合物46は、市販のものである。
実施例16:化合物53の調製
Figure 0007177127000643
化合物48および49は、市販のものである。化合物17および47を実施例4および15に例証される手順通りに調製する。
実施例17:化合物54の調製
Figure 0007177127000644
化合物53を実施例16に例証される手順通りに調製する。
実施例18:化合物55の調製
Figure 0007177127000645
化合物53を実施例16に例証される手順通りに調製する。
実施例19:固相技法による3’位にGalNAc-1を含む共役ASOの調製のための一般的方法(ISIS647535、647536、および651900の調製)
別途明記されない限り、オリゴマー化合物の合成に用いるすべての試薬および溶液を商業的供給源から購入する。標準のホスホラミダイト構築ブロックおよび固体支持体を、例えば、T、A、G、およびC残基を含む、ヌクレオシド残基の組み込みのために用いる。無水アセトニトリル中のホスホラミダイトの0.1M溶液をb-D-2’-デオキシリ
ボヌクレオシドおよび2’-MOEに用いた。
カラムに充填されたGalNAc-1を充填したVIMAD固体支持体(110μmol/g、Guzaev et al.,2003)におけるホスホラミダイトカップリング方法を用いて、ASO合成を、ABI 394合成装置(1~2μmolの規模)またはGE Healthcare Bioscience AeKTAオリゴパイロット合成装置(40~200μmolの規模)上で実行した。このカップリングステップについて、固体支持体の充填に対して4倍超過したホスホラミダイトを送達し、ホスホラミダイト縮合を10分間行った。すべての他のステップは、製造業者から提供された標準のプロトコルに従った。トルエン中の6%ジクロロ酢酸の溶液を用いて、ヌクレオチドの5’-ヒドロキシル基からジメチルトリチル(DMT)基を除去した。カップリングステップ中、無水CHCN中の4,5-ジシアノイミダゾール(0.7M)を活性剤として用いた。ホスホロチオエート結合を、3分間の接触時間で、1:1のピリジン/CHCNのキサンタンヒドリドの0.1M溶液との硫化によって導入した。6%の水を含有するCH
CN中の20%のtert-ブチルヒドロペルオキシドの溶液を酸化剤として用いて、12分間の接触時間で、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を得た。
所望の配列が構築された後、シアノエチルホスフェート保護基を、45分間の接触時間で、トリエチルアミンとアセトニトリルの1:1(v/v)の混合物を用いて脱保護した。固体支持体結合ASOをアンモニア水(28~30重量%)中に懸濁し、55℃で6時間加熱した。
その後、非結合ASOを濾過し、アンモニアを沸去した。残渣を強力なアニオン交換カラム上での高圧液体クロマトグラフィーによって精製した(GE Healthcare
Bioscience、Source 30Q、30μm、2.54×8cm、A=30%CHCN水溶液中100mM酢酸アンモニウム、B=A中1.5M NaBr、60分後0~40%のB、流量14mL/分-1、λ=260nm)。残渣を逆相カラム上でのHPLCにより脱塩して、固体支持体への初期充填に基づいて15~30%の単離収率で所望のASOを得た。ASOを、Agilent 1100 MSDシステムを用いたイオン対HPLCカップリングMS分析によって特徴付けた。
当技術分野で周知の標準のオリゴヌクレオチド合成手順を用いて共役体を含まないアンチセンスオリゴヌクレオチドを合成した。
これらの方法を用いて、ApoC IIIを標的とする3個の別個のアンチセンス化合物を調製した。以下の表17に要約されるように、ApoC IIIを標的とする3個のアンチセンス化合物の各々は、同一の核酸塩基配列を有し、ISIS 304801は、すべてのホスホロチオエート結合を有する5-10-5MOEギャップマーであり、ISIS 647535は、GalNAc-1をその3’末端で共役させたことを除いて、ISIS 304801と同一であり、ISIS 647536は、その化合物のある特定のヌクレオシド間結合がホスホジエステル結合であることを除いて、ISIS 647535と同一であった。表17にさらに要約されるように、SRB-1を標的とする2個の別個のアンチセンス化合物を合成した。ISIS 440762は、すべてのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を有する2-10-2 cEtギャップマーであり、ISIS 651900は、その3’末端にGalNAc-1を含めたことを除いて、ISIS 440762と同一であった。
Figure 0007177127000646
下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「k」は、6’-(S)-CH二環式ヌクレオシド(例えば、cEt)を示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。上付き文字「m」は、5-メチルシトシンを示す
。「GalNAc-1」は、先に実施例9に示された構造を有する共役基を示す。GalNAc-1が、ASOを共役体の残りに連結させる切断可能なアデノシンを含み、「GalNAc-1」と指定されることに留意されたい。上述の表でこの命名法を用いて、共役体の一部であるアデノシンを含む全核酸塩基配列を示す。したがって、上述の表において、「Ado」を省略して「GalNAc-1」で終了する配列を列記することもできる。下付き文字「a」を用いて切断可能なヌクレオシドまたは切断可能な部分を欠く共役基の部分を示すこの慣例をこれらの実施形態にわたって用いる。切断可能な部分を欠く共役基のこの部分は、本明細書において「クラスター」または「共役クラスター」または「GalNAcクラスター」と称される。ある特定の事例において、これは、そのクラスターおよびその切断可能な部分を別々に提供することによって共役基を説明するのに好都合である。
実施例20:huApoC IIIトランスジェニックマウスにおけるヒトApoC IIIの用量依存的アンチセンス阻害
それぞれヒトApoC IIIを標的とし、かつ上に記載されるISIS 304801およびISIS 647535を別々に試験し、用量依存的試験において、ヒトApoC IIIトランスジェニックマウスにおけるヒトApoC IIIを阻害するそれらの能力について評価した。
処理
ヒトApoCIIIトランスジェニックマウスを12時間の明暗周期で維持し、Teklad実験食餌を不断給餌した。実験開始前に動物を研究施設で少なくとも7日間順化させた。ASOをPBS中に調製し、0.2ミクロンのフィルターを通して濾過して滅菌した。注入のためにASOを0.9%PBS中に溶解した。
ヒトApoC IIIトランスジェニックマウスに、ISIS 304801もしくは647535を、0.08、0.25、0.75、2.25、もしくは6.75μmol/kgで、または対照としてPBSを、週1回2週間、腹腔内に注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終用量の投与から48時間後に血液を各マウスから採取し、マウスを屠殺し、組織を収集した。
ApoC III mRNA分析
標準のプロトコルに従ってリアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いてマウスの肝臓におけるApoC III mRNAレベルを決定した。PBS処理対照に規準化する前に(Ribogreenを用いて)ApoC III mRNAレベルを全RNAに対して相対的に決定した。以下の結果は、PBS処理対照に規準化された各処理群のApoC III mRNAレベルの平均パーセントとして提示され、「%PBS」で表示される。各ASOの半数効果濃度(ED50)も以下の表18に示される。
例証されるように、PBS対照と比較して、両方のアンチセンス化合物がApoC III RNAを減少させた。さらに、GalNAc-1に共役されるアンチセンス化合物(ISIS 647535)は、GalNAc-1共役体を欠くアンチセンス化合物(ISIS 304801)よりもはるかに強力であった。
Figure 0007177127000647
ApoC IIIタンパク質分析(比濁アッセイ)
2013年3月29日の出版前にオンラインで公開されたGraham et al(Circulation Research)によって報告された手順を用いて、血漿ApoC IIIタンパク質分析を決定した。
マウスから単離した約100μLの血漿を、希釈することなく、Olympus臨床分析器および市販の比濁ApoC IIIアッセイ(Kamiya、カタログ番号KAI-006、Kamiya Biomedical,Seattle,WA)を用いて分析した。アッセイプロトコルを供給業者が説明する通りに実行した。
以下の表19に示されるように、PBS対照と比較して、両方のアンチセンス化合物がApoC IIIタンパク質を減少させた。さらに、GalNAc-1に共役されるアンチセンス化合物(ISIS 647535)は、GalNAc-1共役体を欠くアンチセンス化合物(ISIS 304801)よりもはるかに強力であった。
Figure 0007177127000648
血漿トリグリセリドおよびコレステロールを、Bligh and Dyerの方法(Bligh,E.G.and Dyer,W.J.Can.J.Biochem.Physiol.37:911-917、1959)(Bligh,E and Dyer,W,Can J Biochem Physiol,37,911-917,1959)(
Bligh,E and Dyer,W,Can J Biochem Physiol,37,911-917,1959)を用いて抽出し、Beckmann Coulter臨床分析器および市販の試薬を用いて測定した。
トリグリセリドレベルを、PBSを注入したマウスに対して相対的に測定し、「%PBS」で表示する。結果が表20に提示される。例証されるように、両方のアンチセンス化合物がトリグリセリドレベルを低下させた。さらに、GalNAc-1に共役されるアンチセンス化合物(ISIS 647535)は、GalNAc-1共役体を欠くアンチセンス化合物(ISIS 304801)よりも実質的にはるかに強力であった。
Figure 0007177127000649
血漿試料をHPLCによって分析して、総コレステロールの量およびコレステロール(HDLおよびLDL)の異なる画分の量を決定した。結果が表21および22に提示される。例証されるように、両方のアンチセンス化合物が総コレステロールレベルを低下させ、LDLを低下させ、HDLを上昇させた。さらに、GalNAc-1に共役されるアンチセンス化合物(ISIS 647535)は、GalNAc-1共役体を欠くアンチセンス化合物(ISIS 304801)よりも実質的にはるかに強力であった。HDLレベルの増加およびLDLレベルの減少は、ApoC IIIのアンチセンス阻害の心臓血管の有益な影響である。
Figure 0007177127000650
Figure 0007177127000651
薬物動態分析(PK)
ASOのPKも評価した。肝臓および腎臓試料を切り刻み、標準のプロトコルを用いて抽出した。試料をIP-HPLC-MSを利用するMSD1で分析した。全長ISIS 304801および647535の組織レベル(μg/g)を測定し、結果が表23に提供される。例証されるように、総全長アンチセンス化合物の肝臓濃度は、これら2個のアンチセンス化合物と同様であった。したがって、GalNAc-1共役アンチセンス化合物が肝臓でより活性であるが(上のRNAおよびタンパク質データによって実証されるように)、肝臓内で著しく高い濃度では存在しない。実際には、計算されたEC50(表23に提供される)は、共役化合物の強度の観察された増加が蓄積の増加に完全に起因するわけではないことを裏付ける。この結果は、共役体が、肝臓蓄積単独以外の機構によって、恐らくアンチセンス化合物の細胞への生産的な取り込みを改善することによって、強度を改善したことを示唆する。
結果は、腎臓におけるGalNAc-1共役アンチセンス化合物の濃度が、GalNAc共役体を欠くアンチセンス化合物の濃度よりも低いことも示す。これは、いくつかの有益な治療的意味を有する。腎臓における活性が要求されない治療的指標において、腎臓への曝露は、腎毒性の危険性を有し、それに見合う利益がない。さらに、腎臓における高濃度は、典型的には、尿への化合物の損失をもたらし、より迅速なクリアランスをもたらす。したがって、非腎臓標的の場合、腎臓蓄積は望ましくない。これらのデータは、GalNAc-1共役が腎臓蓄積を減少させることを示唆する。
Figure 0007177127000652
ISIS 647535の代謝物も特定し、それらの質量を高分解能質量分析によって確認した。観察された代謝物の切断部位および構造が以下に示される。標準の手順を用いて全長ASOの相対%を計算し、結果が表23に提示される。ISIS 647535の主な代謝物は、全共役体を欠く全長ASO(すなわち、ISIS 304801)であり、これは、以下に示される切断部位Aでの切断に由来する。さらに、他の切断部位に由来するさらなる代謝物も観察された。これらの結果は、細胞内の酵素によって切断され得るか、またはサイトゾルの還元環境下で切断し得るか、またはエンドソームおよびリゾソーム内の酸性pHに適応性のある、GalNAc-1糖とASOとの間のエステル、ペプチド、ジスルフィド、ホスホラミデート、またはアシルヒドラゾン等の他の切断可能な結合の導入も有用であり得ることを示唆する。
Figure 0007177127000653
Figure 0007177127000654
Figure 0007177127000655
Figure 0007177127000656
実施例21:単回投与試験におけるヒトApoC IIIトランスジェニックマウスにおけるヒトApoC IIIのアンチセンス阻害
それぞれヒトApoC IIIを標的とし、かつ表17に記載されるISIS 304801、647535、および647536を、単回投与試験において、ヒトApoC IIIトランスジェニックマウスにおけるヒトApoC IIIを阻害するそれらの能力についてさらに評価した。
処理
ヒトApoCIIIトランスジェニックマウスを12時間の明暗周期に維持し、Teklad実験食餌を不断給餌した。実験開始前に動物を研究施設で少なくとも7日間順化さ
せた。ASOをPBS中に調製し、0.2ミクロンのフィルターを通して濾過して滅菌した。注入のためにASOを0.9%PBS中に溶解した。
ヒトApoC IIIトランスジェニックマウスに、ISIS 304801、647535、もしくは647536(上述のもの)、またはPBS処理対照を、以下に示される投与量で1回、腹腔内注入した。処理群は、3匹の動物から成り、対照群は、4匹の動物から成った。治療前および最終用量後に血液を各マウスから採取し、血漿試料を分析した。最終投与の72時間後にマウスを屠殺した。
試料を収集し、分析して、肝臓におけるApoC III mRNAおよびタンパク質レベル、血漿トリグリセリド、ならびにHDLおよびLDL画分を含むコレステロールを決定し、上述(実施例20)のように評価した。これらの分析からのデータは、以下の表24~28に提示される。血清における肝臓トランスアミナーゼレベル、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)、およびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)を、標準のプロトコルを用いて、生理食塩水を注入したマウスに対して相対的に測定した。ALTおよびASTレベルは、アンチセンス化合物がすべての投与量で良好な耐性であったたことを示した。
これらの結果は、GalNAc-1共役体を欠くアンチセンス化合物(ISIS 304801)と比較して、3’末端にGalNAc-1共役体を含むアンチセンス化合物(ISIS 647535および647536)の強度の改善を示す。さらに、GalNAc-1共役体およびいくつかのホスホジエステル結合を含むISIS 647536は、同一の共役体を含むISIS 647535と同程度に強力であり、ASO内のすべてのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエート結合である。
Figure 0007177127000657
Figure 0007177127000658
Figure 0007177127000659
Figure 0007177127000660
Figure 0007177127000661
これらの結果は、GalNAc-1共役体がアンチセンス化合物の強度を改善することを裏付ける。これらの結果は、GalNAc-1共役アンチセンス化合物の同等の強度も示し、これらのアンチセンスオリゴヌクレオチドは、混合結合(6個のホスホジエステル結合を有するISIS 647536)および同一のアンチセンス化合物の完全なホスホロチオエートバージョン(ISIS 647535)を有する。
ホスホロチオエート結合は、アンチセンス化合物にいくつかの特性を提供する。例えば、これらは、ヌクレアーゼ消化に抵抗し、タンパク質に結合し、腎臓/尿ではなく肝臓における化合物の蓄積をもたらす。これらは、肝臓における兆候を治療する際に特に望ましい特性である。しかしながら、ホスホロチオエート結合は、炎症性応答とも関連している
。したがって、化合物におけるホスホロチオエート結合の数を減少させることにより、炎症の危険性の減少が見込まれるが、肝臓中の化合物の濃度も低下させ、腎臓および尿中の濃度を増加させ、ヌクレアーゼの存在下で安定性を低下させ、全体の強度を低下させる。これらの結果は、ある特定のホスホロチオエート結合がホスホジエステル結合に置換されたGalNAc-1共役アンチセンス化合物が、肝臓における標的に対して、完全なホスホロチオエート結合を有する対応物と同程度に強力であることを示す。そのような化合物は、より炎症誘発性が低いと見込まれる(PSの減少が炎症性効果の減少をもたらすことを示す実験を説明する実施例24を参照のこと)。
実施例22:生体内におけるSRB-1を標的とするGalNAc3-1共役修飾ASOの影響
それぞれSRB-1を標的とし、かつ表17に記載されるISIS 440762および651900を、用量依存的試験において、Balb/cマウスにおけるSRB-1を阻害するそれらの能力について評価した。
処理
6週齢の雄Balb/cマウス(Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)に、ISIS 440762、651900、またはPBS処理対照を、以下に示される投与量で1回、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の48時間後にマウスを屠殺して、標準のプロトコルに従ってリアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルを決定した。PBS処理対照に規準化する前に(Ribogreenを用いて)SRB-1 mRNAレベルを全RNAに対して相対的に決定した。以下の結果は、PBS処理対照に規準化された各処理群のSRB-1 mRNAレベルの平均パーセントとして提示され、「%PBS」で表示される。
表29に例証されるように、両方のアンチセンス化合物がSRB-1 mRNAレベルを低下させた。さらに、GalNAc-1共役体(ISIS 651900)を含むアンチセンス化合物は、GalNAc-1共役体を欠くアンチセンス化合物(ISIS 440762)よりもはるかに強力であった。これらの結果は、異なる標的に相補的であり、かつ異なる化学修飾ヌクレオシドを有するアンチセンスオリゴヌクレオチドを用いて、GalNAc-1共役体の強度利益が観察されることを実証し、この事例において、修飾ヌクレオシドは、拘束エチル糖部分(二環式糖部分)を含む。
Figure 0007177127000662
実施例23:ヒト末梢血単核細胞(hPBMC)アッセイプロトコル
BD Vautainer CPTチューブ法を用いてhPBMCアッセイを実行した。US HealthWorks clinic(Faraday & El Camino Real,Carlsbad)においてインフォームドコンセントを得た志願ドナー由来の全血試料を得て、4~15個のBD Vacutainer CPT8mLチューブ(VWRカタログ番号BD362753)内に収集した。PBMCアッセイデータシートを用いて、各ドナーのCPTチューブ内の開始合計全血量の近似値を記録した。
血液試料を、チューブの8~10回の穏やかな反転による遠心分離の直前に再度混合した。CPTチューブを、水平(スイングアウト)ローター内で、室温(18~25℃)で30分間、ブレーキオフで1500~1800RCFで遠心分離した(2700RPM、Beckman Allegra 6R)。細胞を(Ficollとポリマーゲル層との間の)バフィーコート界面から回収し、50mLの滅菌円錐チューブに移し、最大5個のCPTチューブ/50mLの円錐チューブ/ドナーをプールした。その後、細胞をPBS(Ca++、Mg++を含まない;GIBCO)で2回洗浄した。チューブを最大50mLまで満たし、数回反転させて混合した。その後、試料を、室温で15分間、330×gで遠心分離し(1215RPM、Beckman Allegra 6R)、ペレットを乱すことなくできるだけ多くの上澄みを吸引した。チューブを穏やかに回転させて細胞ペレットを取り除き、細胞をRPMI+10%FBS+pen/strep(約1mL/10mLの開始全血量)中に再懸濁した。60μLの試料を、600μLのVersaLyse試薬(Beckman Coulter、カタログ番号A09777)を有する試料バイアル(Beckman Coulter)にピペット注入し、10~15秒間穏やかにボルテックスした。試料を室温で10分間インキュベートさせ、係数前に再度混合した。PBMC細胞型を用いたVicell XR細胞生存率分析器(Beckman Coulter)で細胞懸濁液を計数した(1:11の希釈係数を他のパラメータで保存した)。生細胞/mLおよび生存率を記録した。細胞懸濁液をRPMI+10%FBS+pen/strep中で1×10生PBMC/mLに希釈した。
細胞を96ウェル組織培養プレート(Falcon Microtest)の50μL/ウェル中に5×10でプレーティングした。RPMI+10%FBS+pen/strep中で希釈した2倍濃度のオリゴ/対照の50μL/ウェルを実験テンプレートに従って添加した(合計100μL/ウェル)。プレートを振盪器に設置し、約1分間混合させた。37℃、5%COで24時間インキュベートした後、プレートを400×gで10分間遠心分離し、その後、MSDサイトカインアッセイ(すなわち、ヒトIL-6、IL-10、IL-8、およびMCP-1)のために上澄みを除去した。
実施例24:hPBMCアッセイにおけるGalNAc-1共役ASOの炎症誘発作用の評価
表30に列記されるアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)を、実施例23に記載されるプロトコルを用いたhPBMCアッセイにおいて炎症誘発作用について評価した。ISIS 353512は、このアッセイにおいてIL-6放出に対する高応答物として知られる内部標準物である。hPBMCを新鮮な志願ドナーから単離し、0、0.0128、0.064、0.32、1.6、8、40、および200μm濃度のASOで処理した。処理から24時間後、サイトカインレベルを測定した。
IL-6のレベルを一次読み出しとして用いた。標準の手順を用いてEC50およびEmaxを計算した。結果が2つのドナー由来のEmax/EC50の平均比率として表され、「Emax/EC50」で表示される。より低い比率は、炎症誘発応答の相対的減少を示し、より高い比率は、炎症誘発応答の相対的増加を示す。
試験化合物に関して、炎症誘発性が最も低い化合物は、PS/PO結合ASO(ISIS 616468)であった。GalNAc-1共役ASO(ISIS 647535)は、その非共役対応物(ISIS 304801)よりもわずかに炎症誘発性が低かった。これらの結果は、いくつかのPO結合の組み込みが炎症誘発反応を減少させ、GalNAc-1共役体の添加が化合物の炎症誘発性を高めず、炎症誘発応答を減少させ得ることを示す。したがって、混合PS/PO結合およびGalNAc-1共役体の両方を含むアンチセンス化合物が、完全PS結合アンチセンス化合物(GalNAc-1共役体の有無にかかわらず)と比較して、より低い炎症誘発応答をもたらすことが予想されるであろう。これらの結果は、GalNAc3-1共役アンチセンス化合物、特に減少したPS含有量を有するものの炎症誘発性がより低いことを示す。
総合して、これらの結果は、GalNAc-1共役化合物、特に減少したPS含有量を有するものを、対応物であるGalNAc-1共役体を欠く完全PSアンチセンス化合物よりも高い用量で投与することができることを示唆する。これらの化合物の半減期が実質的に異なることが予想されないため、そのようなより高い投与量は、結果として低頻度の投薬につながる。GalNAc-1共役化合物がより強力であり(実施例20~22を参照のこと)、化合物の濃度が所望のレベル未満に低下した時点で再投薬が必要であるため、実際には、そのような投与の頻度はさらに低く、そのような所望のレベルは、強度に基づく。
Figure 0007177127000663
下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「k」は、6’-(S)-CH二環式ヌクレオシド(例えば、cEt)を示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。上付き文字「m」は、5-メチルシトシンを示す。「Ado’-GalNAc-1」は、示されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドの3’末端に結合される、実施例9に示される構造GalNAc-1を有する共役体を示す。
Figure 0007177127000664
実施例25:生体外におけるヒトApoC IIIを標的とするGalNAc-1共役修飾ASOの影響
上述のISIS 304801および647535を生体外で試験した。トランスジェニックマウス由来の25,000細胞/ウェルの密度の初代肝細胞を、0.03,0.08、0.24、0.74、2.22、6.67、および20μm濃度の修飾オリゴヌクレオチドで処理した。約16時間の処理期間後、RNAを細胞から単離し、mRNAレベルを定量的リアルタイムPCRで測定し、hApoC III mRNAレベルをRIBOGREENで測定された全RNA含有量に従って調整した。
標準の方法を用いてIC50を計算し、結果が表32に提示される。例証されるように、対照ISIS 304801と比較して、同程度の強度がISIS 647535で処理した細胞において観察された。
Figure 0007177127000665
この実験において、生体内で観察されるGalNAc-1共役の大きな強度利益は、生体外では観察されなかった。生体外での初代肝細胞におけるその後の遊離取り込み実験は、GalNAc共役体を欠くオリゴヌクレオチドと比較して、様々なGalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドの強度の増加を示した(実施例60、82、および92を参照のこと)。
実施例26:ApoC III ASO 活性へのPO/PS結合の影響
ヒトApoC IIIトランスジェニックマウスに、ISIS 304801もしくはISIS 616468(両方ともに上述のもの)またはPBS処理対照を、25mg/kgで週1回2週間、腹腔内注入した。処理群は、3匹の動物から成り、対照群は、4匹の動物から成った。治療前および最終服用後に血液を各マウスから採取し、血漿試料を分析した。最終投与の72時間後にマウスを屠殺した。
試料を収集し、分析して、上述のように肝臓におけるApoC IIIタンパク質レベルを決定した(実施例20)。これらの分析からのデータが以下の表33に提示される。
これらの結果は、完全PS(ISIS 304801)と比較して、ウィングにPO/PSを有するアンチセンス化合物(ISIS 616468)の強度の減少を示す。
Figure 0007177127000666
実施例27:化合物56
Figure 0007177127000667
化合物56は、Glen Researchから市販されているか、またはShchepinov et al.,Nucleic Acids Research,1997,25(22),4447-4454によって報告された公開された手順に従って調製することができる。
実施例28:化合物60の調製
Figure 0007177127000668
化合物4を実施例2に例証される手順通りに調製した。化合物57は、市販のものである。化合物60を構造分析で確認した。
本明細書に提示されるものを含むが、これらに限定されない他の単保護された置換または非置換アルキルジオールを用いて既定の組成を有するホスホラミダイトを調製すること
ができるため、化合物57は、代表的なものであり、限定するようには意図されていない。
実施例29:化合物63の調製
Figure 0007177127000669
化合物61および62を、Tober et al.,Eur.J.Org.Chem.,2013,3,566-577、およびJiang et al.,Tetrahedron,2007,63(19),3982-3988によって報告された手順と同様の手順を用いて調製する。
あるいは、化合物63を、Kim et al.の科学文献および特許文献(Synlett,2003,12,1838-1840、およびKim et al.の公開されたPCT国際出願第WO2004063208号)に報告される手順と同様の手順を用いて調製する。
実施例30:化合物63bの調製
Figure 0007177127000670
化合物63aを、Hanessian et al.,Canadian Journal of Chemistry,1996,74(9),1731-1737によって報告された手順と同様の手順を用いて調製する。
実施例31:化合物63dの調製
Figure 0007177127000671
化合物63cを、Chen et al.,Chinese Chemical Letters,1998,9(5),451-453によって報告された手順と同様の手順を用いて調製する。
実施例32:化合物67の調製
Figure 0007177127000672
実施例2に例証される手順通りに化合物64を調製した。化合物65を、Or et al.の公開されたPCT国際出願第WO2009003009号によって報告された手順と同様の手順を用いて調製する。本明細書に提示されるものを含むが、これらに限定されない他の保護基を用いることができるため、化合物65に用いた保護基は、代表的なものであり、限定するようには意図されていない。
実施例33:化合物70の調製
Figure 0007177127000673
実施例2に例証される手順通りに化合物64を調製した。化合物68は、市販のものである。本明細書に提示されるものを含むが、これらに限定されない他の保護基を用いることができるため、化合物68に用いた保護基は、代表的なものであり、限定するようには意図されていない。
実施例34:化合物75aの調製
Figure 0007177127000674
化合物75をShchepinov et al.,Nucleic Acids Research,1997,25(22),4447-4454によって報告された公開された手順に従って調製する。
実施例35:化合物79の調製
Figure 0007177127000675
化合物76をShchepinov et al.,Nucleic Acids Research,1997,25(22),4447-4454によって報告された公開された手順に従って調製した。
実施例36:化合物79aの調製
Figure 0007177127000676
化合物77を実施例35に例証される手順通りに調製する。
実施例37:固体支持体による5’末端にホスホジエステル結合GalNAc-2共役体を含む共役オリゴマー化合物82の調製のための一般的方法(方法I)
Figure 0007177127000677
Figure 0007177127000678
GalNAc-2が、以下の構造を有する:
Figure 0007177127000679
共役基GalNAc-2(GalNAc-2)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と合わせて、様々な共役基を提供することができる。GalNAc-2は、以下の式を有する:
Figure 0007177127000680
VIMAD結合オリゴマー化合物79bを、自動DNA/RNA合成における標準の手
順を用いて調製した(Dupouy et al.,Angew.Chem.Int.Ed.,2006,45,3623-3627を参照のこと)。ホスホラミダイト化合物56および60を、それぞれ、実施例27および28にそれぞれ例証される手順通りに調製した。本明細書に提示されるものを含むが、これらに限定されない他のホスホラミダイト構築ブロックを用いて、5’末端にホスホジエステル結合共役基を有するオリゴマー化合物を調製することができるため、例証されるホスホラミダイトは、代表的なものであり、限定するようには意図されていない。固体支持体に添加されるホスホラミダイトの順序および量を調整して、任意の既定の配列および組成を有する本明細書に記載されるオリゴマー化合物を調製することができる。
実施例38:5’末端にホスホジエステル結合GalNAc-2共役体を含むオリゴマー化合物82の調製のための代替方法(方法II)
Figure 0007177127000681
VIMAD結合オリゴマー化合物79bを、自動DNA/RNA合成における標準の手順を用いて調製した(Dupouy et al.,Angew.Chem.Int.Ed.,2006,45,3623-3627を参照のこと)。GalNAc-2クラス
ターホスホラミダイト(化合物79)を実施例35に例証される手順通りに調製した。この代替方法は、合成の最終ステップでのホスホジエステル結合GalNAc-2共役体のオリゴマー化合物への一段階導入を可能にする。本明細書に提示されるものを含むが、これらに限定されない他のホスホラミダイト構築ブロックを用いて5’末端にホスホジエステル共役体を有するオリゴマー化合物を調製することができるため、例証されるホスホラミダイトは、代表的なものであり、限定するようには意図されていない。固体支持体に添加されるホスホラミダイトの順序および量を調整して、任意の既定の配列および組成を有する本明細書に記載されるオリゴマー化合物を調製することができる。
実施例39:固体支持体による5’末端にGalNAc-3共役体(5’末端結合のためにGalNAc-1修飾されたもの)を含むオリゴマー化合物83hの調製のための一般的方法
Figure 0007177127000682
Figure 0007177127000683
化合物18を実施例4に例証される手順通りに調製した。化合物83aおよび83bは、市販のものである。ホスホジエステル結合ヘキシルアミンを含むオリゴマー化合物83eを標準のオリゴヌクレオチド合成手順を用いて調製した。保護されたオリゴマー化合物をアンモニア水で処理することにより、5’-GalNAc-3共役オリゴマー化合物(83h)を提供した。
GalNAc-3が、以下の構造を有する:
Figure 0007177127000684
共役基GalNAc-3(GalNAc-3)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と合わせて、様々な共役基を提供することができる。GalNAc-3は、以下の式を有する:
Figure 0007177127000685
実施例40:固体支持体による3’末端にホスホジエステル結合GalNAc-4共役体を含むオリゴマー化合物89の調製のための一般的方法
Figure 0007177127000686
Figure 0007177127000687
Figure 0007177127000688
GalNAc-4が、以下の構造を有する:
Figure 0007177127000689
式中、CMは、切断可能な部分である。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、以下のものである:
Figure 0007177127000690
共役基GalNAc-4(GalNAc-4)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と合わせて、様々な共役基を提供することができる。GalNAc-4は、以下の式を有する:
Figure 0007177127000691
保護されたUnylinker機能化固体支持体化合物30は、市販のものである。化合物84を、文献に報告される手順と同様の手順を用いて調製する(Shchepinov et al.,Nucleic Acids Research,1997,25(22),4447-4454、Shchepinov et al.,Nucleic Acids Research,1999,27,3035-3041、およびHornet et al.,Nucleic Acids Research,1997,25,4842-4849を参照のこと)。
ホスホラミダイト構築ブロック(化合物60および79a)を実施例28および36に例証される手順通りに調製する。他のホスホラミダイト構築ブロックを用いて、既定の配列および組成を有する3’末端にホスホジエステル結合共役体を有するオリゴマー化合物を調製することができるため、例証されるホスホラミダイトは、代表的なものであり、限定するようには意図されていない。固体支持体に添加されるホスホラミダイトの順序および量を調整して、任意の既定の配列および組成を有する本明細書に記載されるオリゴマー化合物を調製することができる。
実施例41:固相技法による5’位にホスホジエステル結合GalNAc-2(Bxがアデニンである実施例37を参照のこと)共役体を含むASOの調製のための一般的方法(ISIS 661134の調製)
別途明記されない限り、オリゴマー化合物の合成に用いるすべての試薬および溶液を商業的供給源から購入する。標準のホスホラミダイト構築ブロックおよび固体支持体を、例えば、T、A、G、およびC残基を含む、ヌクレオシド残基の組み込みのために用いる。ホスホラミダイト化合物56および60を用いて、5’末端のホスホジエステル結合GalNAc-2共役体を合成した。無水アセトニトリル中のホスホラミダイトの0.1M溶液をb-D-2’-デオキシリボヌクレオシドおよび2’-MOEに用いた。
カラムに充填されたVIMAD固体支持体(110μmol/g、Guzaev et
al.,2003)におけるホスホラミダイトカップリング方法を用いて、ASO合成を、ABI 394合成装置(1~2μmolの規模)またはGE Healthcar
e Bioscience AeKTAオリゴパイロット合成装置(40~200μmolの規模)上で実行した。このカップリングステップについて、固体支持体の初期充填に対して4倍超過したホスホラミダイトを送達し、ホスホラミダイトカップリングを10分間行った。すべての他のステップは、製造業者から提供された標準のプロトコルに従った。トルエン中の6%ジクロロ酢酸の溶液を用いて、ヌクレオチドの5’-ヒドロキシル基からジメトキシトリチル(DMT)基を除去した。カップリングステップ中、無水CHCN中の4,5-ジシアノイミダゾール(0.7M)を活性剤として用いた。ホスホロチオエート結合を、3分間の接触時間で、1:1のピリジン/CHCNのキサンタンヒドリドの0.1M溶液との硫化によって導入した。6%の水を含有するCHCN中の20%のtert-ブチルヒドロペルオキシドの溶液を酸化剤として用いて、12分間の接触時間で、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を提供した。
所望の配列が構築された後、シアノエチルホスフェート保護基を、45分間の接触時間で、トルエン中の20%ジエチルアミン(v/v)を用いて脱保護した。固体支持体結合ASOをアンモニア水(28~30重量%)中に懸濁し、55℃で6時間加熱した。
その後、非結合ASOを濾過し、アンモニアを沸去した。残渣を強力なアニオン交換カラム上での高圧液体クロマトグラフィーによって精製した(GE Healthcare
Bioscience、Source 30Q、30μm、2.54×8cm、A=30%CHCN水溶液中100mM酢酸アンモニウム、B=A中1.5M NaBr、60分後0~40%のB、流量14mL/分-1、λ=260nm)。残渣を逆相カラム上でのHPLCにより脱塩して、固体支持体への初期充填に基づいて15~30%の単離収率で所望のASOを得た。ASOを、Agilent 1100 MSDシステムを用いたイオン対HPLCカップリングMS分析によって特徴付けた。
Figure 0007177127000692
下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「k」は、6’-(S)-CH二環式ヌクレオシド(例えば、cEt)を示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。上付き文字「m」は、5-メチルシトシンを示す。GalNAc-2の構造が実施例37に示される。
実施例42:固相技法による5’位にGalNAc-3共役体を含むASOの調製のための一般的方法(ISIS 661166の調製)
ISIS 661166の合成を、実施例39および41に例証される手順と同様の手順を用いて実行した。
ISIS 661166は、5’位がGalNAc-3共役体を含む5-10-5MOEギャップマーである。ASOを、Agilent 1100 MSDシステムを用いたイオン対HPLCカップリングMS分析によって特徴付けた。
Figure 0007177127000693
下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。上付き文字「m」は、5-メチルシトシンを示す。「5’-GalNAc-3a」の構造が実施例39に示される。
実施例43:生体内におけるSRB-1を標的とする5’末端でのホスホジエステル結合GalNAc-2の用量依存的試験(Bxがアデニンである実施例37および41を参照のこと)
5’末端にホスホジエステル結合GalNAc-2共役体を含むISIS 661134(実施例41を参照のこと)を、用量依存的試験においてマウスにおけるSRB-1のアンチセンス阻害について試験した。非共役ISIS 440762および651900(3’末端にGalNAc-1共役体、実施例9を参照のこと)を比較のために試験に含め、先の表17に記載する。
処理
6週齢の雄Balb/cマウス(Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)に、ISIS 440762、651900、661134、またはPBS処理対照を、以下に示される投与量で1回、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺して、リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルを標準プロトコルに従って決定した。PBS処理対照に規準化する前に(Ribogreenを用いて)SRB-1 mRNAレベルを全RNAに対して相対的に決定した。以下の結果は、PBS処理対照に規準化された各処理群のSRB-1 mRNAレベルの平均パーセントとして提示され、「%PBS」で表示される。前記方法と同様の方法を用いてED50を測定し、以下に提示する。
表35に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でSRB-1 mRNAレベルを低下させた。実際には、5’末端にホスホジエステル結合GalNAc-2共役体(ISIS 661134)または3’末端に連結されたGalNAc-1共役体(ISIS 651900)を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドは、非共役アンチセンスオリゴヌクレオチド(ISIS 440762)と比較して、強度の大幅な改善を示した。さらに、5’末端にホスホジエステル結合GalNAc-2共役体を含むISIS 661134は、3’末端にGalNAc-1共役体を含むISIS 651900と比較して、等効力であった。
Figure 0007177127000694
3’GalNAc-1および5’GalNAc-2の構造は、先の実施例9および37に記載されている。
薬物動態分析(PK)
高用量群(7mg/kg)のASOのPKを試験し、実施例20に例証される様式と同一の様式で評価した。肝臓試料を切り刻み、標準のプロトコルを用いて抽出した。661134(5’GalNAc-2)およびISIS 651900(3’GalNAc-1)の全長代謝物を特定し、これらの質量を高分解能質量分析によって確認した。結果は、5’末端にホスホジエステル結合GalNAc-2共役体を含むASO(ISIS
661134)に対して検出された主な代謝物が、ISIS 440762であったことを示した(データ示されず)。検出可能なレベルでさらなる代謝物は観察されなかった。その対応物とは異なり、先の表23aに報告された代謝物と同様のさらなる代謝物が、3’末端にGalNAc-1共役体を有するASO(ISIS 651900)で観察された。これらの結果は、ホスホジエステル結合GalNAc-1またはGalNAc-2共役体を有することで、それらの強度を損なうことなくASOのPKプロファイルを改善し得ることを示唆する。
実施例44:SRB-1を標的とする3’末端にGalNAc3-1共役体(実施例9を参照のこと)を含むASOのアンチセンス阻害へのPO/PS結合の影響
それぞれSRB-1を標的とする3’末端にGalNAc-1共役体を含むISIS
655861および655862を、単回投与試験においてマウスにおけるSRB-1を阻害するそれらの能力について試験した。親非共役化合物ISIS 353382を比較のために試験に含めた。
ASOは5-10-5MOEギャップマーであり、ギャップ領域は、10個の2’-デオキシリボヌクレオシドを含み、各ウィング領域は、5個の2’-MOE修飾ヌクレオシドを含む。ASOを先の実施例19に例証される方法と同様の方法を用いて調製し、以下の表36に示す。
Figure 0007177127000695
下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。上付き文字「m」は、5-メチルシトシンを示す。「GalNAc-1」の構造が実施例9に示される。
処理
6週齢の雄Balb/cマウス(Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)に、ISIS 353382、655861、655862、またはPBS処理対照を、以下に示される投与量で1回、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。治療前および最終服用後に血液を各マウスから採取し、血漿試料を分析した。最終投与の72時間後にマウスを屠殺して、リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルを決定した。PBS処理対照に規準化する前に(Ribogreenを用いて)SRB-1 mRNAレベルを全RNAに対して相対的に決定した。以下の結果は、PBS処理対照に規準化された各処理群のSRB-1 mRNAレベルの平均パーセントとして提示され、「%PBS」で表示される。前記方法と同様の方法を用いてED50を測定し、以下に報告する。
表37に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、PBS処理対照と比較して、用量依存的様式でSRB-1 mRNAレベルを低下させた。実際には、3’末端にGalNAc-1共役体を含むアンチセンスオリゴヌクレオチド(ISIS 655861および655862)は、非共役アンチセンスオリゴヌクレオチド(ISIS 353382)と比較して、強度の大幅な改善を示した。さらに、混合PS/PO結合を有するISIS 655862は、完全PS(ISIS 655861)と比較して、強度の改善を示した。
Figure 0007177127000696
血清における肝臓トランスアミナーゼレベル、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)、およびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)を、標準のプロトコルを用いて、生理食塩水を注入したマウスに対して相対的に測定した。臓器重量も評価した。結果は、PBS対照と比較して、ASOで処理したマウスにおいて、トランスアミナーゼレベル(表38)の増加も臓器重量(データ示されず)の増加も観察されなかったことを示した。さらに、混合PS/PO結合を有するASO(ISIS 655862)は、完全PS(ISIS 655861)と比較して、同様のトランスアミナーゼレベルを示した。
Figure 0007177127000697
実施例45:PFPエステル(化合物110a)の調製
Figure 0007177127000698
Figure 0007177127000699
化合物4(9.5g、28.8mmole)を化合物103aまたは103b(38mmole)で個別に処理し、ジクロロメタン(200mL)中のTMSOTf(0.5当量)および分子篩で処理し、室温で16時間撹拌した。この時点で、セライトを通して有機層を濾過し、その後、重炭酸ナトリウム、水、およびブラインで洗浄した。その後、有機層を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、減圧下で還元した。結果として生じた油をシリカゲルクロマトグラフィー(2%→10%メタノール/ジクロロメタン)によって精製して、80%超の収率で化合物104aおよび104bを得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。
化合物104aおよび104bを化合物100a~d(実施例47)と同一の条件で処理して、90%超の収率で化合物105aおよび105bを得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。
化合物105aおよび105bを化合物901a~dと同一の条件下で化合物90と個別に処理して、化合物106a(80%)および106b(20%)を得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。
化合物106aおよび106bを化合物96a~d(実施例47)と同一の条件で処理して、107a(60%)および107b(20%)を得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。
化合物107aおよび107bを化合物97a~d(実施例47)と同一の条件で処理して、40~60%の収率で化合物108aおよび108bを得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。
化合物108a(60%)および108b(40%)を化合物100a~d(実施例47)と同一の条件で処理して、80%超の収率で化合物109aおよび109bを得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。
化合物109aを化合物101a~d(実施例47)と同一の条件で処理して、30~60%の収率で化合物110aを得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。あるいは、化合物110bを化合物109bから開始して同様の様式で調製することができる。
実施例46:PFPエステル(オリゴヌクレオチド111)との共役のための一般的手順;ISIS 666881(GalNAc-10)の調製
標準の固相オリゴヌクレオチド手順を用いて5’-ヘキシルアミノ修飾オリゴヌクレオチドを合成し、精製した。5’-ヘキシルアミノ修飾オリゴヌクレオチドを0.1M四ホウ酸ナトリウム(pH8.5、200μL)中に溶解し、DMSO(50μL)中に溶解した3当量の選択されたPFPエステル化GalNAcクラスターを添加した。ASO溶液への添加時にPFPエステルが沈殿した場合、すべてのPFPエステルが溶液中に存在するまでDMSOを添加した。室温で約16時間混合した後、反応が完了した。結果として生じた溶液を水で希釈して12mLにし、その後、3000Daの質量カットオフでスピンフィルターに3000rpmで沈降させた。このプロセスを2回繰り返して、小分子不純物を除去した。その後、この溶液を凍結乾燥乾固させ、濃縮アンモニア水中に再溶解し、室温で2.5時間混合し、その後、真空内で濃縮して、アンモニアの大部分を除去した。共役オリゴヌクレオチドを精製し、RP-HPLCによって脱塩し、凍結乾燥させて、GalNAc共役オリゴヌクレオチドを得た。
Figure 0007177127000700
オリゴヌクレオチド111をGalNAc-10と共役する。共役基GalNAc-10(GalNAc-10)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を提供することができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、以下のGalNAc-10で合成されたオリゴヌクレオチド(ISIS 666881)に示される-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。GalNAc-10(GalNAc-10-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000701
この一般的手順に従って、ISIS 666881を調製した。標準の固相オリゴヌクレオチド手順を用いて5’-ヘキシルアミノ修飾オリゴヌクレオチド(ISIS 660254)を合成し、精製した。ISIS 660254(40mg、5.2μmol)を0.1M四ホウ酸ナトリウム(pH8.5、200μL)中に溶解し、DMSO(50μL)中に溶解した3当量のPFPエステル(化合物110a)を添加した。ASO溶液への添加時にPFPエステルが沈殿した場合、PFPエステルを完全に溶解するためにさらなるDMSO(600μL)が必要であった。室温で約16時間混合した後、反応が完了した。この溶液を水で希釈して全体積12mLにし、3000Daの質量カットオフでスピンフィルターに3000rpmで沈降させた。このプロセスを2回繰り返して、小分子不純物を除去した。この溶液を凍結乾燥乾固させ、濃縮アンモニア水中に再溶解し、室温で2.5時間混合し、その後、真空内で濃縮して、アンモニアの大部分を除去した。共役オリゴヌクレオチドを精製し、RP-HPLCによって脱塩し、凍結乾燥させて、90重量%の収率でISIS 666881(42mg、4.7μmol)を得た。
Figure 0007177127000702
大文字は、各ヌクレオシドの核酸塩基を示し、Cは、5-メチルシトシンを示す。下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。共役基は、太字で表示されている。
実施例47:GalNAc-8を含むオリゴヌクレオチド102の調製
Figure 0007177127000703
Figure 0007177127000704
Figure 0007177127000705
三酸90(4g、14.43mmol)をDMF(120mL)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(12.35mL、72mmole)中に溶解した。トリフルオロ酢酸ペンタフルオロフェニル(8.9mL、52mmole)をアルゴン下で滴加し、反応物を室温で30分間撹拌させた。Boc-ジアミン91aまたは91b(68.87mmol)をN,N-ジイソプロピルエチルアミン(12.35mL、72mmole)とともに添加し、反応物を室温で16時間撹拌させた。この時点で、DMFを減圧下で75%超還元し、その後、混合物をジクロロメタン中に溶解した。有機層を重炭酸ナトリウム、水、およびブラインで洗浄した。その後、有機層を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、減圧下で油に還元した。結果として生じた油をシリカゲルクロマトグラフィー(2%→10%メタノール/ジクロロメタン)によって精製して、約80%の収率で化合物92aおよび92bを得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。
化合物92aまたは92b(6.7mmole)を20mLのジクロロメタンおよび20mLのトリフルオロ酢酸で、室温で16時間処理した。結果として生じた溶液を蒸発させ、その後、メタノール中に溶解し、DOWEX-OH樹脂で30分間処理した。結果として生じた溶液を濾過し、減圧下で油に還元して、85~90%の収率の化合物93aおよび93bを得た。
化合物7または64(9.6mmole)をDMF(20mL)中のHBTU(3.7g、9.6mmole)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(5mL)で15分間処理した。これに、化合物93aまたは93b(3mmole)のいずれかを添加し、
室温で16時間撹拌させた。この時点で、DMFを減圧下で75%超還元し、その後、混合物をジクロロメタン中に溶解した。有機層を重炭酸ナトリウム、水、およびブラインで洗浄した。その後、有機層を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、減圧下で油に還元した。結果として生じた油をシリカゲルクロマトグラフィー(5%→20%メタノール/ジクロロメタン)によって精製して、20~40%の収率で化合物96a~dを得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。
化合物96a~d(0.75mmole)をラネーニッケル上で3時間、エタノール(75mL)中で個別に水素化した。この時点で、セライトを通して触媒を濾去し、エタノールを減圧下で除去して、80~90%の収率で化合物97a~dを得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。
化合物23(0.32g、0.53mmole)をDMF(30mL)中のHBTU(0.2g、0.53mmole)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.19mL、1.14mmole)で15分間処理した。これに、化合物97a~d(0.38mmole)を個別に添加し、室温で16時間撹拌させた。この時点で、DMFを減圧下で75%超還元し、その後、混合物をジクロロメタン中に溶解した。有機層を重炭酸ナトリウム、水、およびブラインで洗浄した。その後、有機層を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、減圧下で油に還元した。結果として生じた油をシリカゲルクロマトグラフィー(2%→20%メタノール/ジクロロメタン)によって精製して、30~40%の収率で化合物98a~dを得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。
化合物99(0.17g、0.76mmole)をDMF(50mL)中のHBTU(0.29g、0.76mmole)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.35mL、2.0mmole)で15分間処理した。これに、化合物97a~d(0.51mmole)を個別に添加し、室温で16時間撹拌させた。この時点で、DMFを減圧下で75%超還元し、その後、混合物をジクロロメタン中に溶解した。有機層を重炭酸ナトリウム、水、およびブラインで洗浄した。その後、有機層を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、減圧下で油に還元した。結果として生じた油をシリカゲルクロマトグラフィー(5%→20%メタノール/ジクロロメタン)によって精製して、40~60%の収率で化合物100a~dを得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。
化合物100a~d(0.16mmole)を、10%Pd(OH)/C上で3時間、メタノール/酢酸エチル(1:1、50mL)中で個別に水素化した。この時点で、セライトを通して触媒を濾去し、有機物を減圧下で除去して、80~90%の収率で化合物101a~dを得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。
化合物101a~d(0.15mmole)をDMF(15mL)およびピリジン(0.016mL、0.2mmole)中に個別に溶解した。トリフルオロ酢酸ペンタフルオロフェニル(0.034mL、0.2mmole)をアルゴン下で滴加し、反応物を室温で30分間撹拌させた。この時点で、DMFを減圧下で75%超還元し、その後、混合物をジクロロメタン中に溶解した。有機層を重炭酸ナトリウム、水、およびブラインで洗浄した。その後、有機層を分離し、硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過し、減圧下で油に還元した。結果として生じた油をシリカゲルクロマトグラフィー(2%→5%メタノール/ジクロロメタン)によって精製して、約80%の収率で化合物102a~dを得た。LCMSおよびプロトンNMRは、その構造と一致した。
Figure 0007177127000706
実施例46に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-8共役基を含むオリゴマー化合物102を調製した。共役基GalNAc-8(GalNAc-8)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を提供することができる。好ましい一実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。
GalNAc-8(GalNAc-8-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000707
実施例48:GalNAc-7を含むオリゴヌクレオチド119の調製
Figure 0007177127000708
Figure 0007177127000709
文献(J.Med.Chem.2004,47,5798-5808)に記載される手順に従って化合物112を合成した。
化合物112(5g、8.6mmol)を1:1メタノール/酢酸エチル(22mL/22mL)中に溶解した。炭素(0.5g)上水酸化パラジウムを添加した。反応混合物を室温で12時間、水素下で撹拌した。セライトパッドを通して反応混合物を濾過し、そのパッドを1:1メタノール/酢酸エチルで洗浄した。濾液と洗浄物を合わせ、濃縮乾固させて、化合物105a(定量的)を得た。この構造を、LCMSによって確認した。
化合物113(1.25g、2.7mmol)、HBTU(3.2g、8.4mmol)、およびDIEA(2.8mL、16.2mmol)を無水DMF(17mL)中に溶解し、反応混合物を室温で5分間撹拌した。これに、無水DMF(20mL)中の化合物105a(3.77g、8.4mmol)の溶液を添加した。反応物を室温で6時間撹拌した。溶媒を減圧下で除去して、油を得た。残渣をCHCl(100mL)中に溶解し、飽和NaHCO水溶液(100mL)およびブライン(100mL)で洗浄した。有機相を分離し、乾燥させ(NaSO)、濾過し、蒸発させた。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製し、ジクロロメタン中10~20%MeOHで溶出して、化合物114(1.45g、30%)を得た。この構造を、LCMSおよびH NMR分析によって確認した。
化合物114(1.43g、0.8mmol)を1:1メタノール/酢酸エチル(4mL/4mL)中に溶解した。炭素(湿性、0.14g)上パラジウムを添加した。反応混
合物を水素で洗い流し、室温で12時間、水素下で撹拌した。セライトパッドを通して反応混合物を濾過した。このセライトパッドをメタノール/酢酸エチル(1:1)で洗浄した。濾液と洗浄物を一緒に合わせ、減圧下で蒸発させて、化合物115(定量的)を得た。この構造を、LCMSおよびH NMR分析によって確認した。
化合物83a(0.17g、0.75mmol)、HBTU(0.31g、0.83mmol)、およびDIEA(0.26mL、1.5mmol)を無水DMF(5mL)中に溶解し、反応混合物を室温で5分間撹拌した。これに、無水DMF中の化合物115(1.22g、0.75mmol)の溶液を添加し、反応物を室温で6時間撹拌した。溶媒を減圧下で除去し、残渣をCHCl中に溶解した。有機層を飽和NaHCO水溶液およびブラインで洗浄し、無水NaSO上で乾燥させ、濾過した。有機層を濃縮乾固させ、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製し、ジクロロメタン中3~15%MeOHで溶出して、化合物116(0.84g、61%)を得た。この構造を、LC MSおよびH NMR分析によって確認した。
Figure 0007177127000710
化合物116(0.74g、0.4mmol)を1:1メタノール/酢酸エチル(5mL/5mL)中に溶解した。炭素(湿性、0.074g)上パラジウムを添加した。反応混合物を水素で洗い流し、室温で12時間、水素下で撹拌した。セライトパッドを通して反応混合物を濾過した。このセライトパッドをメタノール/酢酸エチル(1:1)で洗浄した。濾液と洗浄物を一緒に合わせ、減圧下で蒸発させて、化合物117(0.73g、98%)を得た。この構造を、LCMSおよびH NMR分析によって確認した。
化合物117(0.63g、0.36mmol)を無水DMF(3mL)中に溶解した。この溶液に、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(70μL、0.4mmol)およびトリフルオロ酢酸ペンタフルオロフェニル(72μL、0.42mmol)を添加した。反応混合物を室温で12時間撹拌し、飽和NaHCO水溶液に注いだ。この混合物をジクロロメタンで抽出し、ブラインで洗浄し、無水NaSO上で乾燥させた。このジ
クロロメタン溶液を濃縮乾固させ、シリカゲルカラムクロマトグラフィーで精製し、ジクロロメタン中5~10%MeOHで溶出して、化合物118(0.51g、79%)を得た。この構造を、LCMS、ならびにHおよびHおよび19F NMRによって確認した。
Figure 0007177127000711
実施例46に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-7共役基を含むオリゴマー化合物119を調製した。共役基GalNAc-7(GalNAc-7)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。
GalNAc-7(GalNAc-7-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000712
実施例49:GalNAc-5を含むオリゴヌクレオチド132の調製
Figure 0007177127000713
化合物120(14.01g、40mmol)およびHBTU(14.06g、37mmol)を無水DMF(80mL)中に溶解した。トリエチルアミン(11.2mL、80.35mmol)を添加し、5分間撹拌した。反応混合物を氷浴中で冷却し、無水DMF(20mL)中の化合物121(10g、mmol)の溶液を添加した。さらなるトリエチルアミン(4.5mL、32.28mmol)を添加し、反応混合物をアルゴン雰囲気下で18時間撹拌した。TLC(1:1の酢酸エチル:ヘキサン;Rf=0.47)によって反応を監視した。溶媒を減圧下で除去した。残渣をEtOAc(300mL)中に取り込み、1M NaHSO(3×150mL)、飽和NaHCO水溶液(3×150mL)、およびブライン(2×100mL)で洗浄した。有機層をNaSOで乾燥させた。乾燥剤を濾去し、有機層を回転蒸発によって濃縮した。粗混合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製し、ヘキサン中35~50%EtOAcを用いて溶出して、化合物122(15.50g、78.13%)を得た。この構造を、LCMSおよびH NMR分析によって確認した。質量(m/z)589.3[M+H]
水(20mL)およびTHF(10mL)中のLiOH(92.15mmol)の溶液を、メタノール(15mL)中に溶解した冷却した化合物122の溶液(7.75g、13.16mmol)に添加した。反応混合物を室温で45分間撹拌し、TLC(1:1のEtOAc:ヘキサン)によって監視した。反応混合物を減圧下で濃縮して、半分の体積にした。残りの溶液を氷浴中で冷却して、濃縮HClを添加して中和した。反応混合物を希釈し、EtOAc(120mL)で抽出し、ブライン(100mL)で洗浄した。エマルジョンを形成し、一晩静置した後に取り除いた。有機層を分離し、乾燥させ(NaSO4)、濾過し、蒸発させて、化合物123(8.42g)を得た。残留塩は、過剰な質量の推定原因である。LCMSは、この構造と一致した。この生成物をさらに精製することなく使用した。M.W.計算値:574.36、M.W.実測値:575.3[M+H]
Figure 0007177127000714
文献(J.Am.Chem.Soc.2011,133,958-963)に記載される手順に従って化合物126を合成した。
Figure 0007177127000715
Figure 0007177127000716
化合物123(7.419g、12.91mmol)、HOBt(3.49g、25.82mmol)、および化合物126(6.33g、16.14mmol)をDMF(40mL)中に溶解し、結果として生じた反応混合物を氷浴中で冷却した。これに、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(4.42mL、25.82mmol)、PyBop(8.7g、16.7mmol)、続いて、Bopカップリング試薬(1.17g、2.66mmol)をアルゴン雰囲気下で添加した。氷浴を除去し、溶液を室温まで温めた。1時間後に反応が完了し、TLC(89:10:1のDCM:MeOH:AA)によって決定した。反応混合物を減圧下で濃縮した。残渣をEtOAc(200mL)中に溶解し、1M NaHSO(3×100mL)、飽和NaHCO水溶液(3×100mL)、およびブライン(2×100mL)で洗浄した。有機相を分離し、乾燥させ(NaSO)、濾過し、濃縮した。残渣を50%ヘキサン/EtOAC:100%EtOAcの勾配でのシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、白色の発泡体として化合物127(9.4g)を得た。LCMSおよびH NMRは、その構造と一致した。質量(m/z)778.4[M+H]
トリフルオロ酢酸(12mL)をジクロロメタン(12mL)中の化合物127(1.57g、2.02mmol)の溶液に添加し、室温で1時間撹拌した。反応混合物を減圧下でトルエン(30mL)と共蒸発乾固させた。得られた残渣をアセトニトリル(30m
L)およびトルエン(40mL)と2回共蒸発させて、トリフルオロ酢酸塩として化合物128(1.67g)を得て、さらに精製することなく次のステップで使用した。LCMSおよびH NMRは、その構造と一致した。質量(m/z)478.2[M+H]
丸底フラスコ内で、化合物7(0.43g、0.963mmol)、HATU(0.35g、0.91mmol)、およびHOAt(0.035g、0.26mmol)を一緒に合わせ、減圧下で、P上で4時間乾燥させ、その後、無水DMF(1mL)中に溶解し、5分間撹拌した。これに無水DMF(0.2mL)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.2mL)中の化合物128(0.20g、0.26mmol)の溶液を添加した。反応混合物を室温で、アルゴン雰囲気下で撹拌した。30分間後に反応が完了し、LCMSおよびTLC(7%MeOH/DCM)によって決定した。反応混合物を減圧下で濃縮した。残渣をDCM(30mL)中に溶解し、1M NaHSO(3×20mL)、飽和NaHCO水溶液(3×20mL)、およびブライン(3×20mL)で洗浄した。有機相を分離し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、濃縮した。残渣をジクロロメタン中5~15%MeOHを用いたシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、化合物129(96.6mg)を得た。LC MSおよびH NMRは、この構造と一致する。質量(m/z)883.4[M+2H]
20mLのシンチレーションバイアル内で化合物129(0.09g、0.051mmol)をメタノール(5mL)中に溶解した。これに、少量の10%Pd/C(0.015mg)を添加し、反応容器をHガスで洗い流した。反応混合物を室温で18時間、H雰囲気下で撹拌した。セライトパッドを通して反応混合物を濾過し、このセライトパッドをメタノールで洗浄した。濾液洗浄物を一緒にプールし、減圧下で濃縮して、化合物130(0.08g)を得た。LCMSおよびH NMRは、その構造と一致した。この生成物をさらに精製することなく使用した。質量(m/z)838.3[M+2H]
10mLの先の尖った丸底フラスコに、化合物130(75.8mg、0.046mmol)、0.37Mピリジン/DMF(200μL)、および撹拌棒を添加した。この溶液に、0.7Mトリフルオロ酢酸ペンタフルオロフェニル/DMF(100μL)を撹拌しながら滴加した。1時間後に反応が完了し、LC MSによって決定した。溶媒を減圧下で除去し、残渣をCHCl(約10mL)中に溶解した。有機層をNaHSO(1M、10mL)、飽和NaHCO水溶液(10mL)、およびブライン(10mL)にそれぞれ3回分配した。有機相を分離し、NaSO上で乾燥させ、濾過し、濃縮して、化合物131(77.7mg)を得た。LCMSは、この構造と一致した。さらに精製することなく使用した。質量(m/z)921.3[M+2H]
Figure 0007177127000717
実施例46に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-5共役基を含むオリゴマー化合物132を調製した。共役基GalNAc-5(GalNAc-5)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。
GalNAc-5(GalNAc-5-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000718
実施例50:GalNAc-11を含むオリゴヌクレオチド144の調製
Figure 0007177127000719
Figure 0007177127000720
化合物134の合成。Merrifieldフラスコに、アセトニトリル、ジメチルホルムアミド、ジクロロメタン、およびアセトニトリルで洗浄したアミノメチルVIMAD樹脂(2.5g、450μmol/g)を添加した。この樹脂は、アセトニトリル(4mL)中で膨潤した。20(1.0mmol、0.747g)、TBTU(1.0mmol、0.321g)、アセトニトリル(5mL)、およびDIEA(3.0mmol、0.5mL)を添加して、化合物133を100mLの丸底フラスコ内で事前に活性化した。この溶液を5分間撹拌させ、その後、振盪しながらMerrifieldフラスコに添加した。懸濁液を3時間振盪させた。反応混合物を排出し、樹脂をアセトニトリル、DMF、およびDCMで洗浄した。DCM中500nm(消光係数=76000)でDMTカチオンの吸光度を測定することにより新たな樹脂充填を定量化し、238μmol/gであると決定した。無水酢酸溶液中で10分間3回懸濁することにより、この樹脂をキャップした。
反復性Fmocベースの固相ペプチド合成方法を用いて、固体支持体結合化合物141を合成した。少量の固体支持体を回収し、アンモニア水(28~30重量%)中に6時間懸濁した。切断された化合物をLC-MSによって分析し、観察された質量は、その構造と一致した。質量(m/z)1063.8[M+2H]
固相ペプチド合成方法を用いて、固体支持体結合化合物142を合成した。
Figure 0007177127000721
DNA合成装置において標準の固相合成を用いて、固体支持体結合化合物143を合成した。
固体支持体結合化合物143をアンモニア水(28-30重量%)中に懸濁し、55℃で16時間加熱した。溶液を冷却し、固体支持体を濾過した。濾液を濃縮し、残渣を水中に溶解し、強アニオン交換カラム上でHPLCによって精製した。全長化合物144を含有する画分を一緒にプールし、脱塩した。結果として生じたGalNAc-11共役オリゴマー化合物をLC-MSによって分析し、観察された質量は、その構造と一致した。
共役基GalNAc-11(GalNAc-11)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。
GalNAc-11(GalNAc-11-CM)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000722
実施例51:GalNAc-6を含むオリゴヌクレオチド155の調製
Figure 0007177127000723
文献(Analytical Biochemistry 1995,229,54-60)に記載されるように、化合物146を合成した。
Figure 0007177127000724
化合物4(15g、45.55mmol)および化合物35b(14.3グラム、57mmol)をCHCl(200mL)中に溶解した。活性化分子篩(4Å、2g、粉末)を添加し、反応物を窒素雰囲気下で30分間撹拌させた。TMS-OTfを添加し(4.1mL、22.77mmol)、反応物を室温で一晩撹拌させた。完了した時点で、飽和NaHCO水溶液(500mL)および粉砕氷(約150g)を注いで反応物を反応停止処理した。有機層を分離し、ブラインで洗浄し、MgSO上で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮してオレンジ色の油を得た。粗物質をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製し、CHCl中2~10%MeOHで溶出して、化合物112(16.53g、63%)を得た。LCMSおよびH NMRは、予想した化合物と一致した。
化合物112(4.27g、7.35mmol)を1:1のMeOH/EtOAc(40mL)中に溶解した。この溶液を通してアルゴン流を15分間泡立てて反応混合物をパージした。パールマン触媒(炭素上水酸化パラジウム、400mg)を添加し、この溶液を通して水素ガスを30分間泡立てた。完了した時点で(TLC(CHCl中10%MeOH)およびLCMS)、セライトパッドを通して触媒を濾去した。濾液を回転蒸発によって濃縮し、高真空下で短時間乾燥させて、化合物105a(3.28g)を得た。LCMSおよび1H NMRは、所望の生成物と一致した。
化合物147(2.31g、11mmol)を無水DMF(100mL)中に溶解した。N,N-ジイソプロピルエチルアミン(DIEA、3.9mL、22mmol)、続いて、HBTU(4g、10.5mmol)を添加した。反応混合物を窒素下で約15分間撹拌させた。これに、乾燥DMF中の化合物105a(3.3g、7.4mmol)の溶液を添加し、窒素雰囲気下で2時間撹拌した。反応物をEtOAcで希釈し、飽和NaHCO水溶液およびブラインで洗浄した。有機相を分離し、乾燥させ(MgSO)、濾過し、濃縮してオレンジ色のシロップを得た。粗物質をカラムクロマトグラフィー(CHCl中2~5%MeOH)によって精製して、化合物148(3.44g、73%)
を得た。LCMSおよびH NMRは、予想した生成物と一致した。
化合物148(3.3g、5.2mmol)を1:1のMeOH/EtOAc(75mL)中に溶解した。この溶液を通してアルゴン流を15分間泡立てて反応混合物をパージした。パールマン触媒(炭素上水酸化パラジウム)を添加した(350mg)。この溶液を通して水素ガスを30分間泡立てた。完了した時点で(TLC(DCM中10%MeOH)およびLCMS)、セライトパッドを通して触媒を濾去した。濾液を回転蒸発によって濃縮し、高真空下で短時間乾燥させて、化合物149(2.6g)を得た。LCMSは、所望の生成物と一致した。残渣を乾燥DMF(10mL)中に溶解し、次のステップで即座に使用した。
Figure 0007177127000725
化合物146(0.68g、1.73mmol)を乾燥DMF(20mL)中に溶解した。これに、DIEA(450μL、2.6mmol、1.5当量)およびHBTU(1.96g、0.5.2mmol)を添加した。反応混合物を室温で15分間、窒素下で撹拌させた。無水DMF(10mL)中の化合物149(2.6g)の溶液を添加した。DIEAを添加することにより(必要に応じて)、反応物のpHをpH=9~10に調整した。反応物を室温で2時間、窒素下で撹拌させた。完了した時点で、反応物をEtOAc(100mL)で希釈し、飽和NaHCO水溶液で洗浄し、続いて、ブラインで洗浄した。有機相を分離し、MgSO上で乾燥させ、濾過し、濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製し、CHCl中2~10%MeOHで溶出して、化合物150(0.62g、20%)を得た。LCMSおよびH NMRは、所望の生成物と一致した。
化合物150(0.62g)を1:1のMeOH/EtOAc(5L)中に溶解した。この溶液を通してアルゴン流を15分間泡立てて反応混合物をパージした。パールマン触
媒(炭素上水酸化パラジウム)を添加した(60mg)。この溶液を通して水素ガスを30分間泡立てた。完了した時点で(TLC(DCM中10%MeOH)およびLCMS)、触媒を濾去した(シリンジチップTeflonフィルター、0.45μm)。濾液を回転蒸発によって濃縮し、高真空下で短時間乾燥させて、化合物151(0.57g)を得た。LCMSは、所望の生成物と一致した。この生成物を4mLの乾燥DMF中に溶解し、次のステップで即座に使用した。
Figure 0007177127000726
化合物83a(0.11g、0.33mmol)を無水DMF(5mL)中に溶解し、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(75μL、1mmol)およびPFP-TFA(90μL、0.76mmol)を添加した。接触時に反応混合物は赤紫色になり、その後30分間かけて徐々にオレンジ色になった。TLCおよびLCMSによって反応の進行を監視した。完了した時点で(PFPエステルの形成)、DMFを中の化合物151(0.57g、0.33mmol)の溶液を添加した。N,N-ジイソプロピルエチルアミンを添加することにより(必要に応じて)、反応物のpHをpH=9~10に調整した。反応混合物を窒素下で約30分間撹拌した。完了した時点で、溶媒の大部分を減圧下で除去した。残渣をCHClで希釈し、飽和NaHCO水溶液で洗浄し、続いて、ブラインで洗浄した。有機相を分離し、MgSO上で乾燥させ、濾過し、濃縮してオレンジ色の
シロップを得た。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(CHCl中2~10%MeOH)によって精製して、化合物152(0.35g、55%)を得た。LCMSおよびH NMRは、所望の生成物と一致した。
化合物152(0.35g、0.182mmol)を1:1のMeOH/EtOAc(10mL)中に溶解した。この溶液を通してアルゴン流を15分間泡立てて反応混合物をパージした。パールマン触媒(炭素上水酸化パラジウム)を添加した(35mg)。この溶液を通して水素ガスを30分間泡立てた。完了した時点で(TLC(DCM中10%MeOH)およびLCMS)、触媒を濾去した(シリンジチップTeflonフィルター、0.45μm)。濾液を回転蒸発によって濃縮し、高真空下で短時間乾燥させて、化合物153(0.33g、定量的)を得た。LCMSは、所望の生成物と一致した。
化合物153(0.33g、0.18mmol)を窒素下で撹拌しながら無水DMF(5mL)中に溶解した。これに、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(65μL、0.37mmol)およびPFP-TFA(35μL、0.28mmol)を添加した。反応混合物を窒素下で約30分間撹拌した。接触時に反応混合物は赤紫色になり、徐々にオレンジ色になった。さらにN,-ジイソプロピルエチルアミンを添加することにより、反応混合物のpHをpH=9~10で維持した。TLCおよびLCMSによって反応の進行を監視した。完了した時点で、溶媒の大部分を減圧下で除去した。残渣をCHCl(50mL)で希釈し、飽和NaHCO水溶液で洗浄し、その後、ブラインで洗浄した。有機層をMgSO上で乾燥させ、濾過し、濃縮してオレンジ色のシロップを得た。残渣をカラムクロマトグラフィーによって精製し、CHCl中2~10%MeOHで溶出して、化合物154(0.29g、79%)を得た。LCMSおよびH NMRは、所望の生成物と一致した。
Figure 0007177127000727
実施例46に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-6共役基を含むオリゴマー化合物155を調製した。共役基GalNAc-6(GalNAc-6)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。
GalNAc-6(GalNAc-6-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000728
実施例52:GalNAc-9を含むオリゴヌクレオチド160の調製
Figure 0007177127000729
文献(J.Med.Chem.2004,47,5798-5808)に記載される手順に従って化合物156を合成した。
化合物156(18.60g、29.28mmol)をメタノール(200mL)中に溶解した。炭素(6.15g、10重量%、充填(乾燥ベース)、マトリックス炭素粉末、湿式)上パラジウムを添加した。反応混合物を室温で18時間、水素下で撹拌した。セライトパッドを通して反応混合物を濾過し、このセライトパッドをメタノールで完全に洗浄した。合わせた濾液を洗浄し、濃縮乾固させた。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラ
フィーによって精製し、ジクロロメタン中5~10%メタノールで溶出して、化合物157(14.26g、89%)を得た。質量(m/z)544.1[M-H]
化合物157(5g、9.17mmol)を無水DMF(30mL)中に溶解した。HBTU(3.65g、9.61mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(13.73mL、78.81mmol)を添加し、反応混合物を室温で5分間撹拌した。これに、化合物47(2.96g、7.04mmol)の溶液を添加した。反応物を室温で8時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO水溶液に注いだ。この混合物を酢酸エチルで抽出し、有機層をブラインで洗浄し、乾燥させ(NaSO)、濾過し、蒸発させた。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製し、ヘキサン中50%酢酸エチルで溶出して、化合物158(8.25g、73.3%)を得た。この構造を、MSおよびH NMR分析によって確認した。
化合物158(7.2g、7.61mmol)を減圧下でP上で乾燥させた。乾燥させた化合物を無水DMF(50mL)中に溶解した。これに、1H-テトラゾール(0.43g、6.09mmol)およびN-メチルイミダゾール(0.3mL、3.81mmol)および2-シアノエチル-N,N,N’,N’-テトライソプロピルホスホロジアミダイト(3.65mL、11.50mmol)を添加した。反応混合物をアルゴン雰囲気下で4時間撹拌した。反応混合物を酢酸エチル(200mL)で希釈した。反応混合物を飽和NaHCOおよびブラインで洗浄した。有機相を分離し、乾燥させ(NaSO)、濾過し、蒸発させた。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製し、ヘキサン中50~90%酢酸エチルで溶出して、化合物159(7.82g、80.5%)を得た。この構造を、LCMSおよび31P NMR分析によって確認した。
Figure 0007177127000730
標準のオリゴヌクレオチド合成手順を用いて、GalNAc-9共役基を含むオリゴマー化合物160を調製した。化合物159の3つの単位を固体支持体に、続いて、ヌクレオチドホスホラミダイトにカップリングした。保護されたオリゴマー化合物をアンモニア水で処理して、化合物160を得た。共役基GalNAc-9(GalNAc-9)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を提供することができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。GalNAc-9(GalNAc-9-CM)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000731
実施例53:化合物18(GalNAc-1aおよびGalNAc-3a)の調製のための代替手順
Figure 0007177127000732
ラクトン161をジアミノプロパン(3~5当量)またはMono-Boc保護ジアミノプロパン(1当量)と反応させて、アルコール162aまたは162bを得た。非保護
プロパンジアミンを上述の反応で用いた場合、過剰なジアミンを高真空下で蒸発させて除去し、CbzClを用いて162a中の遊離アミノ基を保護して、カラムクロマトグラフィーによって精製した後に、白色の固体として162bを得た。アルコール162bをTMSOTfの存在下で化合物4とさらに反応させ163aを得て、触媒水素化を用いてCbz基を除去することにより、これを163bに変換した。ペンタフルオロフェニル(PFP)エステル164を、三酸113(実施例48を参照のこと)をDMF(0.1~0.5M)中のPFPTFA(3.5当量)およびピリジン(3.5当量)と接触させることによって調製した。トリエステル164をアミン163b(3~4当量)およびDIPEA(3~4当量)と直接反応させて、化合物18を得た。上述の方法は、中間体精製を大幅に促進し、実施例4に記載される手順を用いて形成される副生成物の形成を最小限に抑える。
実施例54:化合物18(GalNAc-1aおよびGalNAc-3a)の調製のための代替手順
Figure 0007177127000733
先の実施例53に概説される手順を用いて酸113からトリPFPエステル164を調製し、モノBoc保護ジアミンと反応させて、本質的に定量的な収率で165を得た。Boc基を塩酸またはトリフルオロ酢酸で除去して、トリアミンを得て、これをDIPEA等の好適な塩基の存在下でPFP活性化酸166と反応させて、化合物18を得た。
DMF中のPFPTFA(1~1.2当量)およびピリジン(1~1.2当量)で処理することにより、PFP保護Gal-NAc酸166を対応する酸から調製した。次いで
、アセトニトリルおよび水中のTEMPO(0.2当量)およびBAIBを用いて酸化することにより、前駆酸を対応するアルコールから調製した。先の実施例47に記載される条件を用いて1,6-ヘキサンジオール(または1,5-ペンタンジオールもしくは他のn値の他のジオール)(2~4当量)およびTMSOTfと反応させることにより、前駆アルコールを糖中間体4から調製した。
実施例55:生体内におけるSRB-1を標的とする3’-共役基または5’-共役基のいずれかを含むオリゴヌクレオチド(GalNAc-1、3、8、および9の比較)の用量依存的試験
以下に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてマウスにおけるSRB-1のアンチセンス阻害について試験した。非共役ISIS 353382を標準物として含めた。様々なGalNAc共役基の各々は、ホスホジエステル結合2’-デオキシアデノシンヌクレオシド(切断可能な部分)によってそれぞれのオリゴヌクレオチドの3’末端または5’末端のいずれかで結合された。
Figure 0007177127000734
大文字は、各ヌクレオシドの核酸塩基を示し、Cは、5-メチルシトシンを示す。下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。共役基は、太字で表示されている。
GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示される。GalNAc-9の構造は、先の実施例52に示される。GalNAc-3の構造は、先の実施例39に示される。GalNAc-8の構造は、先の実施例47に示される。
処理
6週齢の雄Balb/cマウス(Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)に、ISIS 353382、655861、664078、661161、665001、または生理食塩水を、以下に示される投与量で1回、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺して、リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルを標準プロトコルに従って決定した。以下の結果は、生理食塩水(対照)に規準化された各処理群のSRB-1 mRNAレベルの平均パーセントとして提示される。
表40に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でSRB-1 mRNAレベルを低下させた。実際には、3’末端にホスホジエステル結合GalNAc-1およびGalNAc-9共役体(ISIS 655861およびISIS 664078)ならびに5’末端に連結されたGalNAc-3およびGalNAc-8共役体(ISIS 661161およびISIS 665001)を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドは、非共役アンチセンスオリゴヌクレオチド(ISIS 353382)と比較して、強度の大幅な改善を示した。さらに、3’末端にGalNAc-9共役体を含むISIS 664078は、3’末端にGalNAc-1共役体を含むISIS 655861と比較して、本質的に等効力であった。それぞれ、GalNAc-3またはGalNAc-9を含む5’共役アンチセンスオリゴヌクレオチドISIS 661161およびISIS 665001は、3’共役アンチセンスオリゴヌクレオチド(ISIS 655861およびISIS 664078)と比較して、強度を増加させた。
Figure 0007177127000735
血清における肝臓トランスアミナーゼレベル、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)、およびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)を、標準のプロトコルを用いて、生理食塩水を注入したマウスに対して相対的に測定した。総ビリルビンおよびBUNも評価した。体重の変化を評価し、生理食塩水群との有意な変化は見られなかった。ALT、AST、総ビリルビン、およびBUN値が、以下の表に示される。
Figure 0007177127000736
実施例56:生体内におけるSRB-1を標的とする3’-共役基または5’-共役基のいずれかを含むオリゴヌクレオチド(GalNAc-1、2、3、5、6、7、および10の比較)の用量依存的試験
以下に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてマウスにおけるSRB-1のアンチセンス阻害について試験した。非共役ISIS 353382を標準物として含めた。3’末端にGalNAc共役基を結合させたISIS 655861を除いて、様々なGalNAc共役基の各々は、ホスホジエステル結合2’-デオキシアデノシンヌクレオシド(切断可能な部分)によってそれぞれのオリゴヌクレオチドの5’末端で結合された。
Figure 0007177127000737
大文字は、各ヌクレオシドの核酸塩基を示し、Cは、5-メチルシトシンを示す。下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。共役基は、太字で表示されている。
GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示される。GalNAc-2の構造は、先の実施例37に示される。GalNAc-3の構造は、先の実施例39に示される。GalNAc-5の構造は、先の実施例49に示される。GalNAc-6の構造は、先の実施例51に示される。GalNAc-7の構造は、先の実施例48に示される。GalNAc-10の構造は、先の実施例46に示される。
処理
6週齢の雄Balb/cマウス(Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)に、ISIS 353382、655861、664507、661161、666224、666961、666981、666881、または生理食塩水を、以下に示される投与量で1回皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺して、リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルを決定した。以下の結果は、生理食塩水(対照)に規準化された各処理群のSRB-1 mRNAレベルの平均パーセントとして提示される。
表43に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でSRB-1 mRNAレベルを低下させた。実際には、共役アンチセンスオリゴヌクレオチドは、非共役アンチセンスオリゴヌクレオチド(ISIS 353382)と比較して、強度の大幅な改善を示した。5’共役アンチセンスオリゴヌクレオチドは、3’共役アンチセンスオリゴヌクレオチドと比較して、強度のわずかな増加を示した。
Figure 0007177127000738
血清における肝臓トランスアミナーゼレベル、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)、およびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)を、標準のプロトコルを用いて、生理食塩水を注入したマウスに対して相対的に測定した。総ビリルビンおよびBUNも評価した。体重の変化を評価し、生理食塩水群との有意な変化は見られなかった。ALT、AST、総ビリルビン、およびBUN値が、以下の表44に示される。
Figure 0007177127000739
実施例57:生体内におけるApoC IIIを標的とする3’-共役基を含むオリゴヌクレオチドの作用持続時間試験
マウスに以下に示される用量を1回注入し、ApoC-IIIおよび血漿トリグリセリド(血漿TG)レベルを42日間にわたって監視した。各群におけるヒトAPOC-IIIを発現する3匹のトランスジェニックマウスを用いて、この試験を実行した。
Figure 0007177127000740
大文字は、各ヌクレオシドの核酸塩基を示し、Cは、5-メチルシトシンを示す。下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。共役基は、太字で表示されている。
GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示される。
Figure 0007177127000741
上の表に見られるように、作用持続時間は、非共役オリゴヌクレオチドと比較して、3’-共役基の添加とともに増加した。共役完全PSオリゴヌクレオチド647535と比較して、共役混合PO/PSオリゴヌクレオチド647536の作用持続時間がさらに増加した。
実施例58:生体内におけるSRB-1を標的とする3’-共役基を含むオリゴヌクレオチド(GalNAc-1およびGalNAc-11の比較)の用量依存的試験
以下に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてマウスにおけるSRB-1のアンチセンス阻害について試験した。非共役ISIS 440762を非共役標準物として含めた。共役基の各々は、ホスホジエステル結合2’-デオキシアデノシンヌクレオシド(切断可能な部分)によってそれぞれのオリゴヌクレオチドの3’末端で結合された。
GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示される。GalNAc-11の構造は、先の実施例50に示される。

処理
6週齢の雄Balb/cマウス(Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)に、ISIS 440762、651900、663748、または生理食塩水を、以下に示される投与量で1回、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺して、リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルを決定した。以下の結果は、生理食塩水(対照)に規準化された各処理群のSRB-1 mRNAレベルの平均パーセントとして提示される。
表47に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でSRB-1 mRNAレベルを低下させた。3’末端にホスホジエステル結合GalNAc-1およびGalNAc-11共役体を含むアンチセンスオリゴヌクレオチド(ISIS 651900およびISIS 663748)は、非共役アンチセンスオリゴヌクレオチド(ISIS 440762)と比較して、強度の大幅な増加を示した。2個の共役オリゴヌクレオチド、GalNAc-1およびGalNAc-11は、等効力であった。
Figure 0007177127000742
大文字は、各ヌクレオシドの核酸塩基を示し、Cは、5-メチルシトシンを示す。下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「k」は、6’-(S)-CH二環式ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。共役基は、太字で表示されている。
血清における肝臓トランスアミナーゼレベル、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)、およびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)を、標準のプロトコルを用いて、生理食塩水を注入したマウスに対して相対的に測定した。総ビリルビンおよびBUNも評価した。体重の変化を評価し、生理食塩水群との有意な変化は見られなかった。ALT、AST、総ビリルビン、およびBUN値が、以下の表48に示される。
Figure 0007177127000743
実施例59:生体内におけるFXIを標的とするGalNAc-1共役ASOの影響
以下に列記されるオリゴヌクレオチドを、複数回投与試験においてマウスにおけるFXIのアンチセンス阻害について試験した。ISIS 404071を非共役標準物として含めた。共役基の各々は、ホスホジエステル結合2’-デオキシアデノシンヌクレオシドの切断可能な部分によってそれぞれのオリゴヌクレオチドの3’末端で結合された。
Figure 0007177127000744
大文字は、各ヌクレオシドの核酸塩基を示し、Cは、5-メチルシトシンを示す。下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。共役基は、太字で表示されている。
GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示される。
処理
6週齢の雄Balb/cマウス(Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)に、ISIS 404071、656172、656173、またはPBS処理対照を、以下に示される投与量で週2回3週間、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺して、リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルを決定した。ELISAを用いて血漿FXIタンパク質レベルも測定した。PBS処理対照に規準化する前に(RIBOGREEN(登録商標)を用いて)FXI mRNA
レベルを全RNAに対して相対的に決定した。以下の結果は、各処理群のFXI mRNAレベルの平均パーセントとして提示される。データをPBS処理対照に規準化し、「%PBS」で表示する。前記方法と同様の方法を用いてED50を測定し、以下に提示する。
Figure 0007177127000745
表50に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でFXI mRNAレベルを低下させた。3’-GalNAc-1共役基を含むオリゴヌクレオチドは、非共役アンチセンスオリゴヌクレオチド(ISIS 404071)と比較して、強度の大幅な増加を示した。PS結合のうちのいくつかをPO(ISIS
656173)と置き換えることによって、これら2個の共役オリゴヌクレオチドの間で強度の増加がさらに提供された。
表50aに例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でFXIタンパク質レベルを低下させた。3’-GalNAc-1共役基を含むオリゴヌクレオチドは、非共役アンチセンスオリゴヌクレオチド(ISIS 404071)と比較して、強度の大幅な増加を示した。PS結合のうちのいくつかをPO(ISIS 656173)と置き換えることによって、これら2個の共役オリゴヌクレオチドの間で強度の増加がさらに提供された。
Figure 0007177127000746
血清における肝臓トランスアミナーゼレベル、アラニンアミノトランスフェラーゼ(A
LT)、およびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)を、標準のプロトコルを用いて、生理食塩水を注入したマウスに対して相対的に測定した。総ビリルビン、総アルブミン、CRE、およびBUNも評価した。体重の変化を評価し、生理食塩水群との有意な変化は見られなかった。ALT、AST、総ビリルビン、およびBUN値が、以下の表に示される。
Figure 0007177127000747
実施例60:生体外におけるSRB-1を標的とする共役ASOの影響
以下に列記されるオリゴヌクレオチドを、複数回投与試験において初代マウス肝細胞におけるSRB-1のアンチセンス阻害について試験した。ISIS 353382を非共役標準物として含めた。共役基の各々は、ホスホジエステル結合2’-デオキシアデノシンヌクレオシドの切断可能な部分によってそれぞれのオリゴヌクレオチドの3’末端または5’末端で結合された。
Figure 0007177127000748
大文字は、各ヌクレオシドの核酸塩基を示し、Cは、5-メチルシトシンを示す。下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。共役基は、太字で表示されている。
GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示される。GalNAc-3aの構造は、先の実施例39に示される。GalNAc-8aの構造は、先の実施例47に示される。GalNAc-9aの構造は、先の実施例52に示される。GalNAc-6aの構造は、先の実施例51に示される。GalNAc-2aの構造は、先の実施例37に示される。GalNAc-10aの構造は、先の実施例46に示される。GalNAc-5aの構造は、先の実施例49に示される。GalNAc-7aの構造は、先の実施例48に示される。
処理
上に列記されるオリゴヌクレオチドを、25,000細胞/ウェルの密度でプレーティングし、かつ0.03、0.08、0.24、0.74、2.22、6.67、または20nMの修飾オリゴヌクレオチドで処理した初代マウス肝細胞において生体外で試験した。約16時間の治療期間後、RNAを細胞から単離し、mRNAレベルを定量的リアルタイムPCRによって測定し、RIBOGREEN(登録商標)によって測定された総RNA含有量に従ってSRB-1 mRNAレベルを調整した。
標準の方法を用いてIC50を計算し、結果を表53に提示する。結果は、オリゴヌクレオチドの細胞への進入を人工的に促進するために試薬も電気穿孔技法も用いない遊離取り込み条件下で、GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドは、GalNAc共役体を含まない親オリゴヌクレオチド(ISIS 353382)よりも肝細胞において著しく強力であったことを示す。
Figure 0007177127000749
複数回の実行の平均。
実施例61:GalNAc-12を含むオリゴマー化合物175の調製
Figure 0007177127000750
Figure 0007177127000751
Figure 0007177127000752
Figure 0007177127000753
化合物169は、市販のものである。ベンジル(ペルフルオロフェニル)グルタレートを化合物171に添加することによって化合物172を調製した。PFP-TFAおよびDIEAをDMF中の5-(ベンジルオキシ)-5-オキソペンタン酸に添加することによって、ベンジル(ペルフルオロフェニル)グルタレートを調製した。実施例46に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-12共役基を含むオリゴマー化合物175を化合物174から調製した。共役基GalNAc-12(GalNAc-12)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を提供することができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。GalNAc-12(GalNAc-12-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000754
実施例62:GalNAc-13を含むオリゴマー化合物180の調製
Figure 0007177127000755
Figure 0007177127000756
Figure 0007177127000757
実施例2に示される一般的手順を用いて、化合物176を調製した。実施例49に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-13共役基を含むオリゴマー化合物180を化合物177から調製した。共役基GalNAc-13(GalNAc-13)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を提供することができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。GalNAc-13(GalNAc-13-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000758
実施例63:GalNAc-14を含むオリゴマー化合物188の調製
Figure 0007177127000759
Figure 0007177127000760
化合物181および185は、市販のものである。実施例46に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-14共役基を含むオリゴマー化合物188を化合物187か
ら調製した。共役基GalNAc-14(GalNAc-14)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を提供することができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。GalNAc-14(GalNAc-14-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000761
実施例64:GalNAc-15を含むオリゴマー化合物197の調製
Figure 0007177127000762
Figure 0007177127000763
化合物189は、市販のものである。実施例31に示される一般的手順を用いて、化合物195を調製した。標準のオリゴヌクレオチド合成手順を用いて、GalNAc-15共役基を含むオリゴマー化合物197を化合物194および195から調製した。共役基GalNAc-15(GalNAc-15)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。GalNAc-15(GalNAc-15-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000764
実施例65:生体内におけるSRB-1を標的とする5’-共役基を含むオリゴヌクレオチド(GalNAc-3、12、13、14、および15の比較)の用量依存的試験
以下に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてマウスにおけるSR
B-1のアンチセンス阻害について試験した。非共役ISIS 353382を標準物として含めた。GalNAc共役基の各々は、ホスホジエステル結合2’-デオキシアデノシンヌクレオシド(切断可能な部分)によってそれぞれのオリゴヌクレオチドの5’末端で結合された。
Figure 0007177127000765
大文字は、各ヌクレオシドの核酸塩基を示し、Cは、5-メチルシトシンを示す。下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。共役基は、太字で表示されている。
GalNAc-3の構造は、先の実施例39に示される。GalNAc-12aの構造は、先の実施例61に示される。GalNAc-13aの構造は、先の実施例62に示される。GalNAc-14aの構造は、先の実施例63に示される。GalNAc-15aの構造は、先の実施例64に示される。
処理
6~8週齢のC57bl6マウス(Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)に、ISIS 353382、661161、671144、670061、671261、671262、または生理食塩水を、以下に示される投与量で1回または2回、皮下注入した。2回投与されたマウスは、第1の投与の3日後に第2の投与を受けた。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺して、リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルを標準プロトコルに従って決定した。以下の結果は、生理食塩水(対照)に規準化された各処理群のSRB-1 mRNAレベルの平均パーセントとして提示される。
表55に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でSRB-1 mRNAレベルを低下させた。単回用量を受けた動物と2回の用量を受けた動物との間で標的ノックダウンの著しい差は観察されなかった(ISIS 353382の投与量30および2×15mg/kg、ならびにISIS 661161の投与
量5および2×2.5mg/kgを参照のこと)。ホスホジエステル結合GalNAc-3、12、13、14、および15共役体を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドは、非共役アンチセンスオリゴヌクレオチド(ISIS 335382)と比較して、強度の大幅な増加を示した。
Figure 0007177127000766
血清における肝臓トランスアミナーゼレベル、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)、およびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)を、標準のプロトコルを用いて、生理食塩水を注入したマウスに対して相対的に測定した。総ビリルビンおよびBUNも評価した。体重の変化を評価し、生理食塩水群との有意な差は見られなかった(データ示されず)。ALT、AST、総ビリルビン、およびBUN値が、以下の表56に示される。
Figure 0007177127000767
実施例66:5’-GalNAcクラスターを含むSRB-1を標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害への様々な切断可能な部分の影響
以下に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてマウスにおけるSRB-1のアンチセンス阻害について試験した。GalNAc共役基の各々は、ホスホジエステルの連結したヌクレオシド(切断可能な部分(CM))によってそれぞれのオリゴヌクレオチドの5’末端で結合された。
Figure 0007177127000768
大文字は、各ヌクレオシドの核酸塩基を示し、Cは、5-メチルシトシンを示す。下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。共役基は、太字で表示されている。
GalNAc-3の構造は、先の実施例39に示した。GalNAc-13aの構造は、先の実施例62に示した。
処理
6~8週齢のC57bl6マウス(Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)に、ISIS 661161、670699、670700、670701、671165、または生理食塩水を、以下に示される投与量で1回、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺して、リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルを決定した。以下の結果は、生理食塩水(対照)に規準化された各処理群のSRB-1 mRNAレベルの平均パーセントとして提示される。
表58に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でSRB-1 mRNAレベルを低下させた。様々な切断可能な部分を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドはすべて、同様の強度を示した。
Figure 0007177127000769
血清における肝臓トランスアミナーゼレベル、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)、およびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)を、標準のプロトコルを用いて、生理食塩水を注入したマウスに対して相対的に測定した。総ビリルビンおよびBUNも評価した。体重の変化を評価し、生理食塩水群との有意な差は見られなかった(データ示されず)。ALT、AST、総ビリルビン、およびBUN値が、以下の表56に示される。
Figure 0007177127000770
実施例67:GalNAc-16を含むオリゴマー化合物199の調製
Figure 0007177127000771
実施例7および9に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-16共役基を含むオリゴマー化合物199を調製する。共役基GalNAc-16(GalNAc-16)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。GalNAc-16(GalNAc-16-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000772
実施例68:GalNAc-17を含むオリゴマー化合物200の調製
Figure 0007177127000773
実施例46に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-17共役基を含むオリゴマー化合物200を調製した。共役基GalNAc-17(GalNAc-17)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。GalNAc-17(GalNAc-17-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000774
実施例69:GalNAc-18を含むオリゴマー化合物201の調製
Figure 0007177127000775
実施例46に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-18共役基を含むオリゴマー化合物201を調製した。共役基GalNAc-18(GalNAc-18)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。GalNAc-18(GalNAc-18-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000776
実施例70:GalNAc-19を含むオリゴマー化合物204の調製
Figure 0007177127000777
実施例52に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-19共役基を含むオリゴマー化合物204を化合物64から調製した。共役基GalNAc-19(GalNAc-19)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。GalNAc-19(GalNAc-19-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000778
実施例71:GalNAc-20を含むオリゴマー化合物210の調製
Figure 0007177127000779
PFP-TFAおよびDIEAを、トリフリン酸無水物を6-アミノヘキサン酸に添加することによって調製したアセトニトリル中の6-(2,2,2-トリフルオロアセトアミド)ヘキサン酸に添加することによって、化合物205を調製した。反応混合物を80℃に加熱し、その後、室温まで下げた。実施例52に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-20共役基を含むオリゴマー化合物210を化合物208から調製した。共役基GalNAc-20(GalNAc-20)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(O
H)-である。GalNAc-20(GalNAc-20-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000780
実施例72:GalNAc-21を含むオリゴマー化合物215の調製
Figure 0007177127000781
化合物211は、市販のものである。実施例52に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-21共役基を含むオリゴマー化合物215を化合物213から調製した。共役基GalNAc-21(GalNAc-21)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。GalNAc-21(GalNAc-21-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000782
実施例73:GalNAc-22を含むオリゴマー化合物221の調製
Figure 0007177127000783
Figure 0007177127000784
ジイソプロピルアンモニウムテトラゾリドを用いて、化合物220を化合物219から調製した。実施例52に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-21共役基を
含むオリゴマー化合物221を化合物220から調製する。共役基GalNAc-22(GalNAc-22)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、-P(=O)(OH)-A-P(=O)(OH)-である。GalNAc-22(GalNAc-22-CM-)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000785
実施例74:5’-GalNAc共役体を含むSRB-1を標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害への様々な切断可能な部分の影響
以下に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてマウスにおけるSRB-1のアンチセンス阻害について試験した。GalNAc共役基の各々は、それぞれのオリゴヌクレオチドの5’末端で結合された。
Figure 0007177127000786
すべての表において、大文字は、各ヌクレオシドの核酸塩基を示し、Cは、5-メチルシトシンを示す。下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(P
O)を示し、「o’」は、-O-P(=O)(OH)-を示す。共役基は、太字で表示されている。
GalNAc-3の構造は、先の実施例39に示した。GalNAc-17aの構造は、先の実施例68に示し、GalNAc-18aの構造は、実施例69に示した。
処理
6~8週齢のC57BL/6マウス(Jackson Laboratory,Bar
Harbor,ME)に、表60に列記されるオリゴヌクレオチドまたは生理食塩水を、以下に示される投与量で1回、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺して、リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルを決定した。以下の結果は、生理食塩水(対照)に規準化された各処理群のSRB-1 mRNAレベルの平均パーセントとして提示される。
表61に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でSRB-1 mRNAレベルを低下させた。GalNAc共役体を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドは、同様の強度を示し、GalNAc共役体を欠く親オリゴヌクレオチドよりも著しく強力であった。
Figure 0007177127000787
血清における肝臓トランスアミナーゼレベル、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)、およびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)を、標準のプロトコルを用いて、生理食塩水を注入したマウスに対して相対的に測定した。総ビリルビンおよびBUNも評価した。体重の変化を評価し、生理食塩水群との有意な変化は見られなかっ
た(データ示されず)。ALT、AST、総ビリルビン、およびBUN値が、以下の表62に示される。
Figure 0007177127000788
実施例75:5’-共役基を含むオリゴヌクレオチドの薬物動態分析
実施例65、66、および74に記載される治療手順に従って得た肝臓試料を用いて、上の表54、57、および60におけるASOのPKを評価した。肝臓試料を切り刻み、標準のプロトコルを用いて抽出し、内部標準とともにIP-HPLC-MSによって分析した。適切なUVピークを統合することによってすべての代謝物の合わせた組織レベル(μg/g)を測定し、適切な抽出イオンクロマトグラム(EIC)を用いて、共役体(この場合、ISIS番号353382の「親」)を欠く全長ASOの組織レベルを測定した。
Figure 0007177127000789
上の表63における結果は、特にGalNAc共役基を有するオリゴヌクレオチドとGalNAc共役基を有しないオリゴヌクレオチドとの間の投薬の差を考慮に入れた場合、オリゴヌクレオチド投与の72時間後に、GalNAc共役基を含むオリゴヌクレオチドの肝臓組織レベルが、GalNAc共役基を含まない親オリゴヌクレオチド(ISIS 353382)の肝臓組織レベルよりも高かったを示す。さらに、72時間までに、GalNAc共役基を含む各オリゴヌクレオチドの40~98%が親化合物に代謝され、GalNAc共役基がオリゴヌクレオチドから切断されたことを示す。
実施例76:GalNAc-23を含むオリゴマー化合物230の調製
Figure 0007177127000790
Figure 0007177127000791
Figure 0007177127000792
Figure 0007177127000793
化合物222は、市販のものである。44.48mL(0.33mol)の化合物222をピリジン(500mL)中の塩化トシル(25.39g、0.13mol)で16時間処理した。その後、反応物を蒸発させて油にし、EtOAc中に溶解し、水、飽和NaHCO、ブラインで洗浄し、NaSO上で乾燥させた。酢酸エチルを濃縮乾固させ、カラムクロマトグラフィーによって精製し、EtOAc/ヘキサン(1:1)、続いて、CHCl中10%メタノールで溶出して、無色の油として化合物223を得た。LCMSおよびNMRは、その構造と一致した。10g(32.86mmol)の1-トシルトリエチレングリコール(化合物223)を、DMSO(100mL)中のアジ化ナトリウム(10.68g、164.28mmol)で、室温で17時間処理した。その後、反応混合物を水上に注ぎ、EtOAcで抽出した。有機層を水で3回洗浄し、NaSO上で乾燥させた。有機層を濃縮乾固させて、5.3gの化合物224(92%)を得た。LCMSおよびNMRは、その構造と一致した。1-アジドトリエチレングリコール(化合物224、5.53g、23.69mmol)および化合物4(6g、18.22mmol)を、4A分子篩(5g)およびジクロロメタン(100mL)中のTMSOTf(1.65mL、9.11mmol)で、不活性雰囲気下で処理した。14時間後、反応物を濾過して篩を除去し、有機層を飽和NaHCO、水、ブラインで洗浄し、NaSO上で乾燥させた。有機層を濃縮乾固させ、カラムクロマトグラフィーによって精製し、ジクロロメタン中2~4%メタノールの勾配で溶出して、化合物225を得た。LCMSおよびNMRは、その構造と一致した。化合物225(11.9g、23.59mmol)をパールマン触媒上で、EtOAc/メタノール(4:1、250mL)中で水素化した。8時間後、触媒を濾去し、溶媒を除去乾固して、化合物226を得た。LCMSおよびNMRは、その構造と一致した。
化合物227を生成するために、DMF(100mL)中のニトロメタントリスプロピオン酸(4.17g、15.04mmol)およびヒューニッヒ塩基(10.3mL、60.17mmol)の溶液をペンタフルオロトリフルオロアセテート(9.05mL、52.65mmol)で液滴処理した。30分間後、反応物を氷水上に注ぎ、EtOAcで抽出した。有機層を水、ブラインで洗浄し、NaSO上で乾燥させた。有機層を濃縮
乾固させ、その後、ヘプタンから再結晶化して、白色の固体として化合物227を得た。LCMSおよびNMRは、その構造と一致した。化合物227(1.5g、1.93mmol)および化合物226(3.7g、7.74mmol)をアセトニトリル(15mL)中で、室温で2時間撹拌した。その後、反応物を蒸発乾固し、カラムクロマトグラフィーによって精製し、ジクロロメタン中2~10%メタノールの勾配で溶出して、化合物228を得た。LCMSおよびNMRは、その構造と一致した。化合物228(1.7g、1.02mmol)をエタノール(100mL)中のラネーニッケル(約2g、湿性)で、水素雰囲気下で処理した。12時間後、触媒を濾去し、有機層を蒸発させて固体にし、これを次のステップで直接使用した。LCMSおよびNMRは、その構造と一致した。この固体(0.87g、0.53mmol)をDMF(5mL)中のベンジルグルタル酸(0.18g、0.8mmol)、HBTU(0.3g、0.8mmol)、およびDIEA(273.7μL、1.6mmol)で処理した。16時間後、DMFを減圧下で65℃で除去して油にし、この油をジクロロメタン中に溶解した。有機層を飽和NaHCO、ブラインで洗浄し、NaSO上で乾燥させた。有機層を蒸発させた後、化合物をカラムクロマトグラフィーによって精製し、ジクロロメタン中2~20%メタノールの勾配で溶出して、カップリング生成物を得た。LCMSおよびNMRは、その構造と一致した。ベンジルエステルをパールマン触媒で、水素雰囲気下で1時間脱保護した。その後、この触媒を濾去し、溶媒を除去乾固して、酸を得た。LCMSおよびNMRは、その構造と一致した。酸(486mg、0.27mmol)を乾燥DMF(3mL)中に溶解した。ピリジン(53.61μL、0.66mmol)を添加し、反応物をアルゴンでパージした。ペンタフルオロトリフルオロアセテート(46.39μL、0.4mmol)を反応混合物に緩徐に添加した。反応物の色が淡黄色からワイン色に変化し、少しの煙を発し、この煙をアルゴン流で吹き飛ばした。反応物を室温で1時間撹拌させた(反応の完了をLCMSによって確認した)。この溶媒を減圧下(回転蒸発)で70℃で除去した。残渣をDCMで希釈し、1N NaHSO、ブライン、飽和重炭酸ナトリウム、および再度ブラインで洗浄した。有機物をNaSO上で乾燥させ、濾過し、濃縮乾固させて、黄色の脆性発泡体として225mgの化合物229を得た。LCMSおよびNMRは、その構造と一致した。
実施例46に例証される一般的手順を用いて、GalNAc-23共役基を含むオリゴマー化合物230を化合物229から調製した。GalNAc-23共役基(GalNAc-23)のGalNAcクラスター部分を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を提供することができる。GalNAc-23(GalNAc-23-CM)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000794
実施例77:GalNAc共役体を含むSRB-1を標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
以下に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてマウスにおけるSR
B-1のアンチセンス阻害について試験した。
Figure 0007177127000795
GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示され、GalNAc-3は、実施例39に示され、GalNAc-9aは、実施例52に示され、GalNAc-10aは、実施例46に示され、GalNAc-19は、実施例70に示され、GalNAc-20は、実施例71に示され、GalNAc-23は、実施例76に示される。
処理
6~8週齢のC57BL/6マウス(Jackson Laboratory,Bar
Harbor,ME)の各々に、表64に列記されるオリゴヌクレオチドまたは生理食塩水を、以下に示される投与量で1回、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺して、リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルを決定した。以下の結果は、生理食塩水(対照)に規準化された各処理群のSRB-1 mRNAレベルの平均パーセントとして提示される。
表65に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でSRB-1 mRNAレベルを低下させた。
Figure 0007177127000796
標準のプロトコルを用いて、血清中の肝臓トランスアミナーゼレベル、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)、およびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)も測定した。総ビリルビンおよびBUNも評価した。体重の変化を評価し、生理食塩水群との有意な変化は見られなかった(データ示されず)。ALT、AST、総ビリルビン、およびBUN値が、以下の表66に示される。
Figure 0007177127000797
実施例78:GalNAc共役体を含むアンギオテンシノーゲンを標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
以下に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験において正常血圧のSprague Dawleyラットにおけるアンギオテンシノーゲン(AGT)のアンチセンス阻害について試験した。
Figure 0007177127000798
GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示した。
処理
6週齢の雄Sprague Dawleyラットの各々に、表67に列記されるオリゴヌクレオチドまたはPBSを、以下に示される投与量で週1回、合計3回の投与で、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にラットを屠殺した。リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるAGT mRNAレベルを決定した。全アンギオテンシノーゲンELISA(カタログ番号JP27412、IBL International,Toronto,ON)を用いて、1:20,000で希釈したAGT血漿タンパク質レベルを測定した。以下の結果は、PBS対照に規準化された各処理群の肝臓におけるAGT mRNAレベルまたは血漿におけるAGTタンパク質レベルの平均パーセントとして提示される。
表68に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式で肝臓におけるAGT mRNAおよび血漿タンパク質レベルを低下させ、GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドは、GalNAc共役体を欠く親オリゴヌクレオチドは、よりも著しく強力であった。
Figure 0007177127000799
標準のプロトコルを用いて、屠殺時に血漿中の肝臓トランスアミナーゼレベル、アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)、およびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)、ならびに体重も測定した。結果が以下の表69に示される。
Figure 0007177127000800
実施例79:GalNAc共役体を含むAPOC-IIIを標的とするオリゴヌクレオチドの生体内における作用持続時間
以下の表70に列記されるオリゴヌクレオチドを、単回投与試験においてマウスにおける作用持続時間について試験した。
Figure 0007177127000801
GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示され、GalNAc-3は、実施例39に示され、GalNAc-7は、実施例48に示され、GalNAc-10は、実施例46に示され、GalNAc-13は、実施例62に示される。
処理
ヒトAPOC-IIIを発現する6~8週齢のトランスジェニックマウスの各々に、表70に列記されるオリゴヌクレオチドまたはPBSを1回皮下注入した。各処理群は、3匹の動物から成った。投薬前に血液を採取して、ベースライン、ならびに投与後72時間、1週間、2週間、3週間、4週間、5週間、および6週間時点のレベルを決定した。実施例20に記載されるように、血漿トリグリセリドおよびAPOC-IIIタンパク質レベルを測定した。以下の結果は、ベースラインレベルに規準化された各処理群の血漿トリグリセリドおよびAPOC-IIIレベルの平均パーセントとして提示され、親オリゴヌクレオチドの投与量がGalNAc共役基を含むオリゴヌクレオチドの投与量の3倍であったにもかかわらず、GalNAc共役基を含むオリゴヌクレオチドが共役基(ISIS
304801)を有しない親オリゴヌクレオチドよりも長い作用持続時間を示したことを示す。
Figure 0007177127000802
実施例80:GalNAc共役体を含むα-1抗トリプシン(A1AT)を標的とする
オリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
以下の表72に列記されるオリゴヌクレオチドを、マウスにおけるA1ATの用量依存的阻害試験において試験した。
Figure 0007177127000803
GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示され、GalNAc-3は、実施例39に示され、GalNAc-7は、実施例48に示され、GalNAc-10は、実施例46に示され、GalNAc-13は、実施例62に示される。
処理
6週齢の雄C57BL/6マウス(Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)の各々に、表72に列記されるオリゴヌクレオチドまたはPBSを、以下に示される投与量で週1回、合計3回の投与で、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺した。リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるA1AT mRNAレベルを決定した。マウスα1-抗トリプシンELISA(カタログ番号41-A1AMS-E01、Alpco,Salem,NH)を用いて、A1AT血漿タンパク質レベルを決定した。以下の結果は、PBS対照に規準化された各処理群の肝臓におけるA1AT mRNAおよび血漿タンパク質レベルの平均パーセントとして提示される。
表73に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式で肝臓におけるA1AT mRNAおよびA1AT血漿タンパク質レベルを低下させた。GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドは、親(ISIS 476366)よりも著しく強力であった。
Figure 0007177127000804
標準のプロトコルを用いて、屠殺時に血漿中の肝臓トランスアミナーゼおよびBUNレベルを測定した。体重および臓器重量も測定した。結果が以下の表74に示される。体重は、ベースラインと比較した%として示される。臓器重量は、PBS対照群と比較した体重の%として示される。
Figure 0007177127000805
実施例81:生体内におけるGalNAcクラスターを含むA1ATを標的とするオリゴヌクレオチドの作用持続時間
表72に列記されるオリゴヌクレオチドを、単回投与試験においてマウスにおける作用持続時間について試験した。
処理
6週齢の雄C57BL/6マウスの各々に、表72に列記されるオリゴヌクレオチドまたはPBSを1回皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。投薬の前日に血液を採取して、ベースライン、ならびに投与後5、12、19、および25日時点のレベルを決定した。ELISAを用いて血漿A1ATタンパク質レベルを測定した(実施例80を参照のこと)。以下の結果は、ベースラインレベルに規準化された各処理群の血漿A1ATタンパク質レベルの平均パーセントとして提示される。結果は、GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドがGalNAc共役体を欠く親(ISIS 476366)よりも強力であり、かつより長い作用持続時間を有したことを示す。さらに、5’-GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチド(ISIS 678381、678382、678383、および678384)は、概して、3’-GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチド(ISIS 656326)よりもさらに強力であり、さらに長い作用持続時間を有した。
Figure 0007177127000806
実施例82:GalNAc共役体を含むSRB-1を標的とするオリゴヌクレオチドによる生体外におけるアンチセンス阻害
処理の2時間前に、初代マウス肝細胞を15,000細胞/ウェルで96ウェルプレートに播種した。表76に列記されるオリゴヌクレオチドをウィリアムE培地に2、10、50、または250nMで添加し、細胞を37℃、5%COで一晩インキュベートした。オリゴヌクレオチド添加の16時間後に細胞を溶解し、RNease 3000 BioRobot(Qiagen)を用いて全RNAを精製した。リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、SRB-1 mRNAレベルを標準のプロトコルに従って決定した。Prism 4ソフトウェア(GraphPad)を用いて、IC50値を決定した。結果は、様々な異なるGalNAc共役基および様々な異なる切断可能な部分を含むオリゴヌクレオチドが、生体外遊離取り込み実験において、GalNAc共役基を欠く親オリゴヌクレオチド(ISIS 353382および666841)よりも著しく強力であることを示す。
Figure 0007177127000807
Figure 0007177127000808
GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示され、GalNAc-3は、実施例39に示され、GalNAc-5は、実施例49に示され、GalNAc-6は、実施例51に示され、GalNAc-7は、実施例48に示され、GalNAc-8は、実施例47に示され、GalNAc-9は、実施例52に示され、GalNAc-10は、実施例46に示され、GalNAc-12は、実施例61に示され、GalNAc-13は、実施例62に示され、GalNAc-14は、実施例63に示され、GalNAc-15は、実施例64に示され、GalNAc-17は、実施例68に示され、GalNAc-18は、実施例69に示され、GalNAc-19は、実施例70に示され、GalNAc-20は、実施例71に示され、GalNAc-23は、実施例76に示される。
実施例83:GalNAcクラスターを含む、第XI因子を標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
以下の表77に列記されるオリゴヌクレオチドを、マウスにおける第XI因子の用量依存的阻害試験において試験した。
Figure 0007177127000809
GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示され、GalNAc-3は、実施例39に示され、GalNAc-7は、実施例48に示され、GalNAc-10は、実施例46に示され、GalNAc-13は、実施例62に示される。
処理
6~8週齢のマウスの各々に、以下に列記されるオリゴヌクレオチドまたはPBSを、
以下に示される投与量で週1回、合計3回の投与で、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺した。リアルタイムPCRを用いて肝臓における第XI因子mRNAレベルを測定し、標準のプロトコルに従ってシクロフィリンに規準化した。肝臓トランスアミナーゼ、BUN、およびビリルビンも測定した。以下の結果は、PBS対照に規準化された各処理群の平均パーセントとして提示される。
表78に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式で肝臓における第XI因子mRNAを低下させた。結果は、GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドが、GalNAc共役体を欠く親(ISIS 404071)よりも強力であったことを示す。さらに、5’-GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチド(ISIS 663086、678347、678348、および678349)は、3’-GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチド(ISIS 656173)よりもさらに強力であった。
Figure 0007177127000810
実施例84:GalNAc共役体を含む第XI因子を標的とするオリゴヌクレオチドの生体内における作用持続時間
表77に列記されるオリゴヌクレオチドを、単回投与試験においてマウスにおける作用持続時間について試験した。
処理
6~8週齢のマウスの各々に、表77に列記されるオリゴヌクレオチドまたはPBSを1回皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。投薬の前日に尾出血によって血液を採取して、ベースライン、ならびに投与後3、10、および17日間時点のレベルを決定した。R & D Systems(Minneapolis,MN)の第XI因子捕捉およびビオチン化検出抗体(それぞれ、カタログ番号AF2460およびBAF2460)、ならびにOptEIA試薬セットB(カタログ番号550534、BD Biosciences,San Jose,CA)を用いて、第XI因子血漿タンパク質レベルをELISAによって測定した。以下の結果は、ベースラインレベルに規準化された各処理群の第XI因子血漿タンパク質レベルの平均パーセントとして提示される。結果は、GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドが、GalNAc共役体を欠く親(ISI
S 404071)よりも強力であり、より長い作用持続時間を有したことを示す。さらに、5’-GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチド(ISIS 663086、678347、678348、および678349)は、3’-GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチド(ISIS 656173)よりもさらに強力であり、さらに長い作用持続時間を有した。
Figure 0007177127000811
実施例85:GalNAc共役体を含むSRB-1を標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
表76に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてマウスにおけるSRB-1のアンチセンス阻害について試験した。
処理
6~8週齢のC57BL/6マウスの各々に、表76に列記されるオリゴヌクレオチドまたは生理食塩水を、以下に示される投与量で週1回、合計3回の投与で、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の48時間後にマウスを屠殺して、リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、SRB-1 mRNAレベルを決定した。以下の結果は、生理食塩水(対照)に規準化された各処理群の肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルの平均パーセントとして提示される。
表80および81に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でSRB-1 mRNAレベルを低下させた。
Figure 0007177127000812
Figure 0007177127000813
標準のプロトコルを用いて、肝臓トランスアミナーゼレベル、総ビリルビン、BUN、および体重も測定した。各処理群の平均値が以下の表82に示される。
Figure 0007177127000814
実施例86:GalNAcクラスターを含むTTRを標的とするオリゴヌクレオチドの生体内におけるアンチセンス阻害
以下の表83に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてヒトTTR遺伝子を発現するトランスジェニックマウスにおけるヒトトランスサイレチン(TTR)のアンチセンス阻害について試験した。
処理
8週齢のTTRトランスジェニックマウスの各々に、以下の表に列記されるオリゴヌクレオチドおよび投与量またはPBSを、週1回3週間、合計3回の投与で、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺した。この実験を通して様々な時点で尾出血を実行し、血漿TTRタンパク質、ALT、およびASTレベルを測定し、表85~87に報告した。動物を屠殺した後、血漿ALT、AST、およびヒトTTRレベルを測定し、体重、臓器重量、および肝臓におおけるヒトTTR mRNAレベルも測定した。臨床分析器(AU480、Beckman Coulter,CA)を用いて、TTRタンパク質レベルを測定した。標準のプロトコルに従ってリアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるヒトTTR mRNAレベルを決定した。表84~87に提示される結果は、各処理群の平均値である。mRNAレベルは、PBS群の平均と比較した平均値である。血漿タンパク質レベルは、ベースラインでのPBS群の平均値と比較した平均値である。体重は、個々の処理群それぞれを屠殺するまでのベースラインからの平均体重変化率である。示される臓器重量は、動物の体重に規準化されており、各処理群の平均規準化臓器重量は、PBS群の平
均規準化臓器重量と比較して提示される。
表84~87において、「BL」は、第1の投与の直前に測定したベースラインを示す。表84および85に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でTTR発現レベルを低下させた。GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドは、GalNAc共役体を欠く親(ISIS 420915)よりも強力であった。さらに、GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドおよび混合PS/POヌクレオシド間結合は、GalNAc共役体および完全PS結合を含むオリゴヌクレオチドよりもさらに強力であった。
Figure 0007177127000815
表85の説明文を実施例74で見つけることができる。GalNAc-1の構造は、実施例9に示される。GalNAc-3の構造は、実施例39に示される。GalNAc-7の構造は、実施例48に示される。GalNAc-10の構造は、実施例46に示される。GalNAc-13の構造は、実施例62に示される。GalNAc-19の構造は、実施例70に示される。
Figure 0007177127000816
Figure 0007177127000817
Figure 0007177127000818
Figure 0007177127000819
実施例87:GalNAcクラスターを含むTTRを標的とするオリゴヌクレオチドの単回投与による生体内における作用持続時間
ISIS番号420915および660261(表83を参照のこと)を、単回投与試験においてマウスにおける作用持続時間について試験した。ISIS番号420915、682883、および682885(表83を参照のこと)も、単回投与試験においてマウスにおける作用持続時間について試験した。
処理
ヒトTTRを発現する8週齢の雄トランスジェニックマウスの各々に、100mg/kgのISIS番号420915または13.5mg/kgのISIS番号660261を1回皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。投薬前に尾出血を実行して、ベースライン、ならびに投与後3、7、10、17、24、および39日目のレベルを決定した。実施例86に記載されるように、血漿TTRタンパク質レベルを測定した。以下の結果は、ベースラインレベルに規準化された各処理群の血漿TTRレベルの平均パーセントとして提示される。
Figure 0007177127000820
処理
ヒトTTRを発現する雌トランスジェニックマウスの各々に、100mg/kgのISIS番号420915、10.0mg/kgのISIS番号682883、または10.0mg/kgの682885を1回皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。投薬前に尾出血を実行して、ベースライン、ならびに投与後3、7、10、17、24、および39日目のレベルを決定した。実施例86に記載されるように、血漿TTRタンパク質レベルを測定した。以下の結果は、ベースラインレベルに規準化された各処理群の血漿TTRレベルの平均パーセントとして提示される。
Figure 0007177127000821
表88および89における結果は、GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドが、共役体を欠く親オリゴヌクレオチド(ISIS 420915)よりも強力であり、より長い作用持続時間を有することを示す。
実施例88:GalNAc共役体を含むSMNを標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるスプライシング調節
表90に列記されるオリゴヌクレオチドを、マウスにおけるヒト運動ニューロン生存(SMN)のスプライシング調節について試験した。
Figure 0007177127000822
GalNAc-7の構造は、先の実施例48に示した。「X」は、Gene Tools(Philomath,OR)によって生成された5’一次アミンを示し、GalNAc-7は、以下に示されるリンカーの-NH~C-O部分を欠くGalNAc-7の構造を示す。
Figure 0007177127000823
ISIS番号703421および703422は、モルフォリノオリゴヌクレオチドであり、これら2個のオリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドは、モルフォリノヌクレオチドである。
処理
ヒトSMNを発現する6週齢のトランスジェニックマウスに、表91に列記されるオリゴヌクレオチドまたは生理食塩水を1回皮下注入した。各処理群は、2匹の雄および2匹の雌から成った。投与の3日後にマウスを屠殺して、標準のプロトコルに従ってリアルタイムPCRを用いて、エキソン7を有する場合とエキソン7を有しない場合の肝臓におけるヒトSMN mRNAレベルを決定した。Ribogreen試薬を用いて総RNAを測定した。SMN mRNAレベルを総mRNAに規準化し、生理食塩水処理群の平均に
さらに規準化した。結果として生じたエキソン7を含むSMN mRNAとエキソン7を欠くSMN mRNAとの平均比が、表91に示される。結果は、スプライシングを調節し、かつGalNAc共役体を含む完全修飾オリゴヌクレオチドが、GlaNAc共役体を欠く親オリゴヌクレオチドよりも肝臓におけるスプライシングの変化に著しく強力であることを示す。さらに、この傾向は、2’-MOEおよびモルフォリノ修飾オリゴヌクレオチドを含む複数の化学修飾において維持される。
Figure 0007177127000824
実施例89:GalNAc共役体を含むアポリポタンパク質A(Apo(a))を標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
以下の表92に列記されるオリゴヌクレオチドを、トランスジェニックマウスにおけるApo(a)の用量依存的阻害試験について試験した。
Figure 0007177127000825
GalNAc-7の構造は、実施例48に示される。
処理
8週齢の雌C57BL/6マウス(Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)の各々に、表92に列記されるオリゴヌクレオチドまたはPBSを、以下に示される投与量で週1回、合計6回の投与で、皮下注入した。各処理群は、3~4匹の動物から成った。第1の投与の前日に、かつ各投与後週1回、尾出血を実行して、血漿Apo(a)タンパク質レベルを決定した。最終投与の2日後にマウスを屠殺した。リアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるApo(a)mRNAレベルを決定した。ELISAを用いてApo(a)血漿タンパク質レベルを決定し、肝臓トランスアミナーゼレベルを決定した。表93におけるmRNAおよび血漿タンパク質の結果は、PBS処理群と比較した処理群の平均パーセントとして提示される。血漿タンパク質レベルをPBS群のベースライン(BL)値にさらに規準化した。平均絶対トランスアミナーゼレベルおよび体重(ベースライン平均と比較した%)が表94に報告される。
表93に例証されるように、オリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式で肝臓におけるApo(a)mRNAおよび血漿タンパク質レベルを低下させた。さらに、GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドは、GalNAc共役体を欠く親オリゴヌクレオチドよりも著しく強力であり、より長い作用持続時間を有した。表94に例証されるように、トランスアミナーゼレベルおよび体重はオリゴヌクレオチドの影響を受けず、オリゴヌクレオチドが良好な耐容性を示したことを示す。
Figure 0007177127000826
Figure 0007177127000827
実施例90:GalNAcクラスターを含むTTRを標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
以下の表95に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてヒトTTR遺伝子を発現するトランスジェニックマウスにおけるヒトトランスサイレチン(TTR)のアンチセンス阻害について試験した。
処理
TTRトランスジェニックマウスの各々に、表96に列記されるオリゴヌクレオチドおよび投与量またはPBSを、週1回3週間、合計3回の投与で、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。第1の投与の前に、尾出血を実行して、ベースライン(BL)での血漿TTRタンパク質レベルを決定した。最終投与の72時間後にマウスを屠殺した。臨床分析器(AU480、Beckman Coulter,CA)を用いて、TTRタンパク質レベルを測定した。標準のプロトコルに従ってリアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.Eugene,OR)を用いて、肝臓におけるヒトTTR mRNAレベルを決定した。表96に提示される結果は、各処理群の平均値である。mRNAレベルは、PBS群の平均と比較した平均値である。血漿タンパク質レベルは、ベースラインでのPBS群の平均値と比較した平均値である。「BL」は、第1の投与の直前に測定したベースラ
インを示す。表96に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でTTR発現レベルを低下させた。GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドは、GalNAc共役体を欠く親(ISIS 420915)よりも強力であり、ホスホジエステルまたはデオキシアデノシンの切断可能な部分を含むオリゴヌクレオチドは、共役体を欠く親と比較して、強度の著しい改善を示した(ISIS番号682883および666943対420915、ならびに実施例86および87を参照のこと)。
Figure 0007177127000828
表95の説明文を実施例74で見つけることができる。GalNAc-3の構造は、実施例39に示される。GalNAc-7の構造は、実施例48に示される。GalNAc-10の構造は、実施例46に示される。GalNAc-13の構造は、実施例62に示される。
Figure 0007177127000829
実施例91:非ヒト霊長類におけるGalNAc共役体を含む第VII因子を標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
以下の表97に列記されるオリゴヌクレオチドを、無限用量増加試験(non-terminal,dose escalation study)においてサルにおける第VII因子のアンチセンス阻害について試験した。
処理
処置した(non-naive)サルの各々に、増加用量の表97に列記されるオリゴ
ヌクレオチドまたはPBSを、0、15、および29日目に皮下注入した。各処理群は、4匹の雄および1匹の雌から成った。第1の投与の前とその後の様々な時点で、血液採取を実行して、血漿第VII因子タンパク質レベルを決定した。ELISAによって第VII因子タンパク質レベルを測定した。表98に提示される結果は、第1の投与の直前に測定したベースライン(BL)でのPBS群の平均値と比較した各処理群の平均値である。表98に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式で第VII因子の発現レベルを低下させ、GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドは、サルにおいてGalNAc共役体を欠くオリゴヌクレオチドよりも著しく強力であった。
Figure 0007177127000830
表97の説明文を実施例74で見つけることができる。GalNAc-10の構造は、実施例46に示される。
Figure 0007177127000831
実施例92:GalNAc共役体を含むApo-CIIIを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドによる初代肝細胞におけるアンチセンス阻害
初代マウス肝細胞を15,000細胞/ウェルで96ウェルプレートに播種し、マウス
ApoC-IIIを標的とする表99に列記されるオリゴヌクレオチドを、0.46、1.37、4.12、または12.35、37.04、111.11、もしくは333.33nMまたは1.00μmで添加した。オリゴヌクレオチドとともに24時間インキュベートした後、細胞を溶解し、RNeasy(Qiagen)を用いて総RNAを精製した。標準のプロトコルに従ってリアルタイムPCRおよびRIBOGREEN(登録商標)RNA定量化試薬(Molecular Probes,Inc.)を用いて、ApoC-III mRNAレベルを決定した。Prism 4ソフトウェア(GraphPad)を用いて、IC50値を決定した。結果は、切断可能な部分がホスホジエステル結合デオキシアデノシンかホスホジエステル結合デオキシアデノシンかにかかわらず、GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドが、共役体を欠く親オリゴヌクレオチドよりも著しく強力であったことを示す。
Figure 0007177127000832
GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示され、GalNAc-3は、実施例39に示され、GalNAc-7は、実施例48に示され、GalNAc-10は、実施例46に示され、GalNAc-13は、実施例62に示され、GalNAc-19は、実施例70に示される。
実施例93:混合ウィングおよび5’-GalNAc共役体を含むSRB-1を標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
表100に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてマウスにおけるSRB-1のアンチセンス阻害について試験した。
Figure 0007177127000833
GalNAc-3の構造は、先の実施例39に示され、GalNAc-7aの構造は、先の実施例48に示される。下付き文字「e」は、2’-MOE修飾ヌクレオシドを示し、「d」は、β-D-2’-デオキシリボヌクレオシドを示し、「k」は、6’-(S)-CH二環式ヌクレオシド(cEt)を示し、「s」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合(PS)を示し、「o」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合(PO)を示す。上付き文字「m」は、5-メチルシトシンを示す。
処理
6~8週齢のC57BL/6マウス(Jackson Laboratory,Bar
Harbor,ME)に、表100に列記されるオリゴヌクレオチドまたは生理食塩水を、以下に示される投与量で1回、皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺した。リアルタイムPCRを用いて、肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルを測定した。標準のプロトコルに従って、SRB-1 mRNAレベルをシクロフィリンmRNAレベルに規準化した。結果は、生理食塩水対照群と比較した各処理群のSRB-1 mRNAレベルの平均パーセントとして提示される。表101に例証されるように、アンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、用量依存的様式でSRB-1 mRNAレベルを低下させ、GalNAc共役体を含み、かつ完全cEtまたは混合糖修飾のいずれかのウィングを有するギャップマーオリゴヌクレオチドは、共役体を欠き、かつ完全cEt修飾ウィングを含む親オリゴヌクレオチドよりも著しく強力であった。
体重、肝臓トランスアミナーゼ、総ビリルビン、およびBUNも測定し、各処理群の平均値が表101に示される。体重は、オリゴヌクレオチド投与の直前に測定したベースライン体重(%BL)と比較した平均体重率として示される。
Figure 0007177127000834
実施例94:2’-糖修飾および5’-GalNAc共役体を含むSRB-1を標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
表102に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてマウスにおけるSRB-1のアンチセンス阻害について試験した。
Figure 0007177127000835
下付き文字「m」は、2’-O-メチル修飾ヌクレオシドを示す。完全な表の説明文については、実施例74を参照されたい。GalNAc-3の構造は、先の実施例39に示し、GalNAc-7aの構造は、先の実施例48に示した。
処理
実施例93に記載されるプロトコルを用いて試験を完了した。結果が以下の表103に示され、GalNAc共役体を含む2’-MOE修飾オリゴヌクレオチドと2’-OMe修飾オリゴヌクレオチドとが両方ともに、共役体を欠くそれぞれの親オリゴヌクレオチドよりも著しく強力であったことを示す。体重、肝臓トランスアミナーゼ、総ビリルビン、およびBUNの測定結果は、これらの化合物がすべて良好な耐容性を示したことを示す。
Figure 0007177127000836
実施例95:二環式ヌクレオシドおよび5’-GalNAc共役体を含むSRB-1を標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
表104に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてマウスにおけるSRB-1のアンチセンス阻害について試験した。
Figure 0007177127000837
下付き文字「g」は、フルオロ-HNAヌクレオシドを示し、下付き文字「l」は、2’-O-CH-4’橋を含むロックドヌクレオシドを示す。他の省略形については、実施例74の表の説明文を参照されたい。GalNAc-1の構造は、先の実施例9に示し、GalNAc-3の構造は、先の実施例39に示し、GalNAc-7aの構造は、先の実施例48に示した。
処理
実施例93に記載されるプロトコルを用いて試験を完了した。結果が以下の表105に
示され、GalNAc共役体および様々な二環式ヌクレオシド修飾を含むオリゴヌクレオチドが、共役体を欠くが二環式ヌクレオシド修飾を含む親オリゴヌクレオチドよりも著しく強力であったことを示す。さらに、GalNAc共役体およびフルオロ-HNA修飾を含むオリゴヌクレオチドは、共役体を欠くがフルオロ-HNA修飾を含む親よりも著しく強力であった。体重、肝臓トランスアミナーゼ、総ビリルビン、およびBUNの測定結果は、これらの化合物がすべて良好な耐容性であったことを示した。
Figure 0007177127000838
実施例96:GalNAc共役基を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドの血漿タンパク質結合
ApoC-IIIを標的とする表70に列記されるオリゴヌクレオチドおよびApo(a)を標的とする表106におけるオリゴヌクレオチドを限外濾過アッセイにおいて試験して、血漿タンパク質結合を評価した。
Figure 0007177127000839
表の説明文については、実施例74を参照されたい。GalNAc-7aの構造は、先の実施例48に示される。
Ultrafree-MC限外濾過ユニット(30,000NMWL、低結合再生セルロース膜、Millipore,Bedford,MA)を300μLの0.5%Tween 80で事前に条件付け、2000gで10分間遠心分離し、その後、HO中の300μLの300μg/mL対照オリゴヌクレオチド溶液で事前に条件付け、2000gで16分間遠心分離した。これらの試験で用いる表70および106の各試験オリゴヌクレオチドのフィルターへの非特異的結合を評価するために、300μLのHO中の250ng/mL溶液オリゴヌクレオチド(pH7.4)を事前に条件付けたフィルターに設置し、2000gで16分間遠心分離した。ELISAアッセイによって濾過していない試料および濾過した試料を分析して、オリゴヌクレオチド濃度を決定した。3つの複製物を用いて各試料の平均濃度を得た。濾過していない試料と比較した濾過した試料の平均濃度を用いて、血漿の不在下でフィルターによって回収されたオリゴヌクレオチドの割合(%回収)を決定する。
薬物を使用していない健常なヒト志願者、カニクイザル、およびCD-1マウス由来のK3-EDTA中に収集された凍結全血漿試料をBioreclamation LLC(Westbury,NY)から購入した。試験オリゴヌクレオチドを、2つの濃度(5μg/mLおよび150μg/mL)で血漿の1.2mLの一定分量に添加した。各スパイクした血漿試料の一定分量(300μL)を事前に条件付けられたフィルターユニット内に設置し、37°Cで30分間インキュベートした直後に2000gで16分間遠心分離した。ELISAによって、濾過してスパイクした血漿試料および濾過していないスパイクした血漿試料の一定分量を分析して、各試料中のオリゴヌクレオチドの濃度を決定した。1つの濃度毎に3つの複製物を用いて、各試料中の結合オリゴヌクレオチドおよび非結合オリゴヌクレオチドの平均割合を決定した。濾過していない試料の濃度と比較した濾過した試料の平均濃度を用いて、血漿タンパク質に結合されていない血漿中のオリゴヌクレオチドの割合(%非結合)を決定する。各オリゴヌクレオチドの%非結合を%回収で割ることによって、最終非結合オリゴヌクレオチド値を非特異的結合に対して補正する。最終%非結合値を100から差し引くことによって、最終%結合オリゴヌクレオチド値を決定する。各種の血漿において試験した2つの濃度のオリゴヌクレオチド(5μg/mLおよび150μg/mL)の結果が表107に示される。結果は、GalNAc共役基が血漿タンパク質結合に大きな影響を与えないことを示す。さらに、完全PSヌクレオシド間結合を有するオリゴヌクレオチドも混合PO/PS結合を有するオリゴヌクレオチドも血漿タンパク質に結合し、完全PS結合を有するオリゴヌクレオチドは、混合PO/PS結合を有するオリゴヌクレオチドよりも若干高い程度に血漿タンパク質に結合する。
Figure 0007177127000840
実施例97:GalNAc共役基を含むTTRを標的とする修飾オリゴヌクレオチド
GalNAc共役体を含む表108に示されるオリゴヌクレオチドを、TTRを標的とするように設計した。
Figure 0007177127000841
表108の説明文を実施例74で見つけることができる。GalNAc-1の構造は、実施例9に示した。GalNAc-3の構造は、実施例39に示した。GalNAc-7の構造は、実施例48にした。GalNAc-10の構造は、実施例46に示した。GalNAc-13の構造は、実施例62に示した。GalNAc-19の構造は、実施例70に示した。
実施例98:hPMBCアッセイにおけるGalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドの炎症誘発作用の評価
表109に列記されるオリゴヌクレオチドを、実施例23および24に記載されるようにhPMBCアッセイにおいて炎症誘発作用について試験した(オリゴヌクレオチドの説明については、表30、83、95、および108を参照のこと)。ISIS 353512は、正の対照として用いられる高応答物であり、他のオリゴヌクレオチドは、表83、95、および108に記載されるものである。1人の志願ドナー由来の血液を用いて表109に示される結果を得た。結果は、混合PO/PSヌクレオシド間結合を含むオリゴヌクレオチドが、完全PS結合を有する同一のオリゴヌクレオチドと比較して、著しく低い炎症誘発応答をもたらしたことを示す。さらに、GalNAc共役基は、このアッセイにおいて大きく影響しなかった。
Figure 0007177127000842
実施例99:アシアロ糖タンパク質受容体に対するGalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドの結合親和性
アシアロ糖タンパク質受容体に対する表110に列記されるオリゴヌクレオチド(オリゴヌクレオチドの説明については、表76を参照のこと)の結合親和性を、競合的受容体結合アッセイにおいて試験した。競合相手のリガンドであるα1-酸糖タンパク質(AGP)を、50mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH5)中で1Uノイラミニダーゼ-アガロースとともに37℃で16時間インキュベートし、シアル酸アッセイまたはサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)のいずれかで90%を超える脱シアル化を確認した。Atsma et al.(J Lipid Res.1991 Jan;32(1):173-81を参照のこと)の手順に従って、一塩化ヨウ素を用いてAGPをヨウ素化した。この方法において、脱シアル化α1-酸糖タンパク質(de-AGP)を、10mM塩化ヨウ素、Na125I、および0.25M NaOH中の1Mグリシンに添加した。室温で10分間インキュベートした後、3 KDMWCOスピンカラムを利用してこの混合物を2回濃縮することによって、125I標識de-AGPを遊離125Iから分離した。このタンパク質を、Agilent SEC-3カラム(7.8×300mm)およびβ-RAMカウンタを装備したHPLCシステムにおいて標識効率および純度について試験した。125I標識de-AGPおよびASOを含有する様々なGalNAcクラスターを利用した競合実験を以下の通りに実行した。ヒトHepG2細胞(10細胞/mL)を、2mLの適切な成長培地中の6ウェルプレートにプレーティングした。10%ウシ胎児血清(FBS)、2mM L-グルタミン、および10mM HEPESを補充したMEM培地を用いた。細胞を、それぞれ、5%および10%COで、37℃で16~20時間インキュベートした。実験前に細胞をFBSを有しない培地で洗浄した。細胞を、2%FBSを有する適切な成長培地を含有する1mLの競合混合物、10-8125I標識de-AGP、および10-11~10-5Mの範囲の濃度のASOを含有するGalNAcクラスターとともに、37℃で30分間インキュベートした。10-2M GalNAc糖の存在下で非特異的結合を決定した。細胞をFBSを有しない培地で2回洗浄して、非結合125I標識de-AGPおよび競合相手であるGalNAc ASOを除去した。1%β-メルカプトエタノールを含有するQiagenのRLT緩衝液を用いて、細胞を溶解した。10分間の短時間凍結/解凍サイクル後に溶解物を丸底アッセイチューブに移し、γ-カウンタでアッセイした。非特異的結合を差し引いた後に、125Iタンパク質カウントを最も低いGalNAc-ASO濃度カウントの値で割った。非線形回帰アルゴリズムを用いた単一部位競合結合等式に従って阻害曲線を当てはめて、結合親和性(K)を計算した。
表110における結果を5つの異なる日に実行した実験から得た。上付き文字「a」の付いたオリゴヌクレオチドの結果は、2つの異なる日に実行した実験の平均である。結果は、5’末端にGalNAc共役基を含むオリゴヌクレオチドがヒトHepG2細胞上のアシアロ糖タンパク質受容体に結合し、3’末端にGalNAc共役基を含むオリゴヌクレオチドよりも1.5~16倍高い親和性を有することを示す。
Figure 0007177127000843
実施例100:生体内におけるApo(a)を標的とするGalNAc共役基を含むオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
以下の表111aに列記されるオリゴヌクレオチドを、単回投与試験においてマウスにおける作用持続時間について試験した。
Figure 0007177127000844
GalNAc-7の構造は、実施例48に示した。
処理
ヒトApo(a)を発現する雌トランスジェニックマウスの各々に、表111bに列記されるオリゴヌクレオチドおよび投与量またはPBSを、週1回、合計6回の投与で、皮下注入した。各処理群は、3匹の動物から成った。投薬の前日に血液を採取して、血漿中のApo(a)タンパク質のベースラインレベル、ならびに第1の投与後72時間、1週間、および2週間時点のレベルを決定した。第1の投与後3週間、4週間、5週間、および6週間時点でさらに血液を採取する。ELISAを用いて血漿Apo(a)タンパク質レベルを測定した。表111bにおける結果は、ベースラインレベル(%BL)に規準化された各処理群の血漿Apo(a)タンパク質レベルの平均パーセントとして提示され、結果は、GalNAc共役基を含むオリゴヌクレオチドがApo(a)発現の強力な減少を示したことを示す。この強力な影響は、完全PSヌクレオシド間結合を含むオリゴヌクレオチドおよび混合POおよびPS結合を含むオリゴヌクレオチドにおいて観察された。
Figure 0007177127000845
実施例101:安定した部分を介して連結されたGalNAcクラスターを含むオリゴヌクレオチドによるアンチセンス阻害
表112に列記されるオリゴヌクレオチドを生体内におけるマウスAPOC-III発現の阻害について試験した。C57Bl/6マウスの各々に、表112に列記されるオリゴヌクレオチドまたはPBSを1回皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。ISIS 440670で処理した各マウスは、2、6、20、または60mg/kgの投与を受けた。ISIS 680772または696847で処理した各マウスは、0.6、2、6、または20mg/kgを受けた。ISIS 696847のGalNAc共役基は、安定した部分(容易に切断可能なホスホジエステル含有結合の代わりにホスホロチオエート結合)を介して連結されている。投与の72時間後に動物を屠殺した。リアルタイムPCRを用いて、肝臓におけるAPOC-III mRNAレベルを測定した。標準のプロトコルに従って、APOC-III mRNAレベルをシクロフィリンmRNAレベルに規準化した。結果は、生理食塩水対照群と比較した各処理群のAPOC-III
mRNAレベルの平均パーセントとして表112に提示される。結果は、GalNAc共役基を含むオリゴヌクレオチドが、共役基を欠くオリゴヌクレオチドよりも著しく強力であったことを示す。さらに、切断可能な部分を介してオリゴヌクレオチドに連結されたGalNAc共役基を含むオリゴヌクレオチド(ISIS 680772)は、安定した部分を介してオリゴヌクレオチドに連結されたGalNAc共役基を含むオリゴヌクレオチド(ISIS 696847)よりもさらに強力であった。
Figure 0007177127000846
GalNAc-7の構造は、実施例48に示した。
実施例102:GalNAc共役体を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドの肝臓における分布
GalNAc共役体を含まないISIS 353382(表36を参照のこと)およびGalNAc共役体を含むISIS 655861(表36を参照のこと)の肝臓における分布を評価した。雄balb/cマウスに、ISIS 353382または655861を、表113に列記される投与量で1回、皮下注入した。2匹の動物から成った18mg/kgのISIS 655861群を除いて、各処理群は、3匹の動物から成った。投与の48時間後に動物を屠殺して、オリゴヌクレオチドの肝臓における分布を決定した。1細胞当たりのアンチセンスオリゴヌクレオチド分子の数を測定するために、ルテニウム(II)トリス-ビピリジン標識(MSD TAG、Meso Scale Discovery)を、アンチセンスオリゴヌクレオチドを検出するために用いるオリゴヌクレオチドプローブに共役させた。表113に提示される結果は、1細胞当たり何百万ものオリゴヌクレオチド分子単位の各処理群のオリゴヌクレオチドの平均濃度である。結果は、等価用量で、GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドが、全肝臓および肝細胞において、GalNAc共役体を含まないオリゴヌクレオチドよりも高い濃度で存在したことを示す。さらに、GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドは、非実質肝臓細胞において、GalNAc共役体を含まないオリゴヌクレオチドよりも低い濃度で存在した。1細胞当たりの肝細胞および非実質肝臓細胞におけるISIS 655861の濃度が同様であった一方で、肝臓は、約80体積%肝細胞であった。したがって、肝臓内に存在するISIS 655861オリゴヌクレオチドの大部分が肝細胞内に見られる一方で、肝臓内に存在するISIS 353382オリゴヌクレオチドの大部分は、非実質肝臓細胞内に見られた。
Figure 0007177127000847
実施例103:GalNAc共役体を含むAPOC-IIIを標的とするオリゴヌクレオチドの生体内における作用持続時間
以下の表114に列記されるオリゴヌクレオチドを、単回投与試験においてマウスにおける作用持続時間について試験した。
Figure 0007177127000848
GalNAc-3の構造は、実施例39に示され、GalNAc-19は、実施例70に示される。
処理
ヒトAPOC-IIIを発現する雌トランスジェニックマウスの各々に、表114に列記されるオリゴヌクレオチドまたはPBSを1回皮下注入した。各処理群は、3匹の動物から成った。投薬前に血液を採取して、ベースライン、ならびに投与後3、7、14、21、28、35、および42日間のレベルを決定した。実施例20に記載されるように、血漿トリグリセリドおよびAPOC-IIIタンパク質レベルを測定した。表115における結果は、ベースラインレベルに規準化された各処理群の血漿トリグリセリドおよびAPOC-IIIレベルの平均パーセントとして提示される。実施例79の表71における結果と以下の表115における結果の比較は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合およびホスホロチオエートヌクレオシド間結合の両方を含むオリゴヌクレオチドが、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合のみを含む等価オリゴヌクレオチドよりも増加した作用持続時間を示したことを示す。
Figure 0007177127000849
実施例104:5’-GalNAc共役体を含むオリゴヌクレオチドの合成
Figure 0007177127000850
化合物120は市販されており、化合物126の合成は実施例49に記載されている。化合物120(1g、2.89mmol)、HBTU(0.39g、2.89mmol)、およびHOBt(1.64g、4.33mmol)を、DMF(10mL)中に溶解し、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(1.75mL、10.1mmol)を添加した。約5分後、アミノヘキサン酸ベンジルエステル(1.36g、3.46mmol)をこの反応物に添加した。3時間後、反応混合物を100mLの1M NaHSO4に注ぎ、2×50mL酢酸エチルで抽出した。有機層を合わせ、3×40mL飽和NaHCOおよび2倍ブラインで洗浄し、NaSOで乾燥させ、濾過し、濃縮した。この生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM:EA:Hex=1:1:1)によって精製して、化合物231を得た。LCMSおよびNMRは、その構造と一致した。化合物231(1.34g、2.438mmol)をジクロロメタン(10mL)中に溶解し、トリフルオロ酢酸(10mL)を添加した。室温で2時間撹拌した後、反応混合物を減圧下で濃縮し、トルエン(3×10mL)と共蒸発させた。残渣を減圧下で乾燥させて、トリフルオロ酢酸塩として化合物232を得た。化合物166の合成は、実施例54に記載される。化合物166(3.39g、5.40mmol)をDMF(3mL)中に溶解した。化合物232(1.3g、2.25mmol)の溶液をDMF(3mL)中に溶解し、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(1.55mL)を添加した。反応物を室温で30分間撹拌し、その後、水(80mL)に注ぎ、水層をEtOAc(2×100mL)で抽出した。有機相を分離し、飽和NaHCO水溶液(3×80mL)、1M NaHSO(3×80mL)、およびブライン(2×80mL)で洗浄し、その後、乾燥させ(NaSO)、濾過し、濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、化合物233を得た。LCMSおよびNMRは、その構造と一致した。化合物233(0.59g、0.48mmol)をメタノール(2.2mL)および酢酸エチル(2.2mL)中に溶解した。炭素上パラジウム(10重量%Pd/C、湿性、0.07g)を添加し、反応混合物を水素雰囲気下で3時間撹拌した。セライトパッドを通して反
応混合物を濾過し、濃縮して、カルボン酸を得た。カルボン酸(1.32g、1.15mmol、クラスター遊離酸)をDMF(3.2mL)中に溶解した。これに、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(0.3mL、1.73mmol)およびPFPTFA(0.30mL、1.73mmol)を添加した。室温で30分間撹拌した後、反応混合物を水(40mL)に注ぎ、EtOAc(2×50mL)で抽出した。上述のように標準の後処理を完了して、化合物234を得た。LCMSおよびNMRは、その構造と一致した。実施例46に記載される一般的手順を用いて、オリゴヌクレオチド235を調製した。共役基GalNAc-24のGalNAcクラスター部分(GalNAc-24)をオリゴヌクレオチド上に存在する任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を提供することができる。GalNAc-24(GalNAc-24-CM)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000851
実施例105:GalNAc-25共役体を含むオリゴヌクレオチドの合成
Figure 0007177127000852
化合物166の合成は、実施例54に記載される。実施例46に記載される一般的手順を用いて、オリゴヌクレオチド236を調製した。
あるいは、以下に示されるスキームを用いてオリゴヌクレオチド236を合成し、実施例10に記載される手順を用いて、化合物238を用いてオリゴヌクレオチド236を形成した。
Figure 0007177127000853
共役基GalNAc-25のGalNAcクラスター部分(GalNAc-25)をオリゴヌクレオチド上に存在する任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。GalNAc-25(GalNAc-25-CM)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000854
実施例106:5’-GalNAcまたは5’-GalNAc共役体を含むSRB-1を標的とするオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
表116および117に列記されるオリゴヌクレオチドを、用量依存的試験においてマウスにおけるSRB-1のアンチセンス阻害について試験した。
処理
6週齢の雄C57BL/6マウス(Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)に、2、7、もしくは20mg/kgのISIS番号440762;または0.2、0.6、2、6、もしくは20mg/kgのISIS番号686221、686222、もしくは708561;または生理食塩水を1回皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。最終投与の72時間後にマウスを屠殺した。リアルタイムPCRを用いて、肝臓におけるSRB-1 mRNAレベルを測定した。標準のプロトコルに従って、SRB-1 mRNAレベルをシクロフィリンmRNAレベルに規準化した。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、用量依存的様式でSRB-1 mRNAレベルを低下させ、ED50結果が、表116および117に提示される。以前の研究において、三価GalNAc共役オリゴヌクレオチドが二価GalNAc共役オリゴヌクレオチドよりも著しく強力であり、これは、次いで、一価GalNAc共役オリゴヌクレオチドよりも著しく強力であったことが示されたが(例えば、Khorev et al.,Bioorg.& Med.Chem.,Vol.16,5216-5231(2008)を参照のこと)、表116および117に示されるように、一価、二価、および三価GalNAcクラスターを含むアンチセンスオリゴヌクレオチドでの処理は、同様の強度でSRB-1 mRNAレベルを低下させた。
Figure 0007177127000855
表の説明文については、実施例93を参照されたい。GalNAc-13aの構造は、実施例62に示し、GalNAc-24aの構造は、実施例104に示した。
Figure 0007177127000856
表の説明文については、実施例93を参照されたい。GalNAc-25aの構造は、実施例105に示した。
実施例75に記載される手順を用いて、表116および117における肝臓中のオリゴヌクレオチドの濃度も評価した。以下の表117aおよび117bに示される結果は、肝臓組織のオリゴヌクレオチド(μg)/g単位のUVによって測定された各処理群の平均総アンチセンスオリゴヌクレオチド組織レベルである。結果は、GalNAc共役基を含むオリゴヌクレオチドがGalNAc共役基を欠く同一の用量のオリゴヌクレオチドよりも著しく高いレベルで肝臓に蓄積したことを示す。さらに、それらのそれぞれの共役基に1、2、または3個のGalNAcリガンドを含むアンチセンスオリゴヌクレオチドはすべて同様のレベルで肝臓に蓄積した。上記のKhorev et al.の文献参照を考慮すると、これは意外な結果であり、上の表116および117に示される活性データと一致する。
Figure 0007177127000857
Figure 0007177127000858
実施例107:GalNAc-26またはGalNAc-27共役体を含むオリゴヌクレオチドの合成
Figure 0007177127000859
DMF中HBTUおよびDIEAを用いて、オリゴヌクレオチド239を化合物47(実施例15を参照のこと)と酸64(実施例32を参照のこと)とのカップリングによって合成する。結果として生じたアミド含有化合物をホスフィチル化し、その後、実施例10に記載される手順を用いて、オリゴヌクレオチドの5’末端に付加する。共役基GalNAc-26のGalNAcクラスター部分(GalNAc-26)をオリゴヌクレオチド上に存在する任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。GalNAc-26(GalNAc-26-CM)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000860
GalNAc共役基をオリゴヌクレオチドの3’末端に付加するために、実施例7に記載される手順を用いて、化合物47と64の反応から形成されたアミドを固体支持体に付加する。その後、実施例9に記載される手順を用いて、オリゴヌクレオチド合成を完了して、オリゴヌクレオチド240を形成する。
Figure 0007177127000861
共役基GalNAc-27のGalNAcクラスター部分(GalNAc-27)をオリゴヌクレオチド上に存在する任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。GalNAc-27(GalNAc-27-CM)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000862
実施例108:生体内におけるApo(a)を標的とするGalNAc共役基を含むオリゴヌクレオチドによる生体内におけるアンチセンス阻害
以下の表118に列記されるオリゴヌクレオチドを、マウスにおける単回投与試験において試験した。
Figure 0007177127000863
GalNAc-7の構造は、実施例48に示される。
処理
ヒトApo(a)を発現する雄トランスジェニックマウスの各々に、表119に列記されるオリゴヌクレオチドおよび投与量またはPBSを1回皮下注入した。各処理群は、4匹の動物から成った。投薬の前日に血液を採取して、血漿中のApo(a)タンパク質のベースラインレベルおよび第1の投与後の1週間時点のレベルを決定した。週1回約8週間、さらに血液を採取する。ELISAを用いて血漿Apo(a)タンパク質レベルを測定した。表119における結果は、ベースラインレベル(%BL)に規準化された各処理群の血漿Apo(a)タンパク質レベルの平均パーセントとして提示され、結果は、アンチセンスオリゴヌクレオチドがApo(a)タンパク質の発現を低下させたことを示す。さらに、GalNAc共役基を含むオリゴヌクレオチドは、共役基を含まないオリゴヌクレオチドよりもさらに強力なApo(a)発現の減少を示した。
Figure 0007177127000864
実施例109:GalNAc-28またはGalNAc-29共役体を含むオリゴヌクレオチドの合成
Figure 0007177127000865
オリゴヌクレオチド241を実施例71に記載される手順と同様の手順を用いて合成して、ホスホラミダイト中間体を形成し、続いて、実施例10に記載される手順を用いてオリゴヌクレオチドを合成する。共役基GalNAc-28のGalNAcクラスター部分(GalNAc-28)をオリゴヌクレオチド上に存在する任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。GalNAc-28(GalNAc-28-CM)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000866
GalNAc共役基をオリゴヌクレオチドの3’末端に付加するために、実施例71に記載される手順と同様の手順を用いてヒドロキシル中間体を形成し、その後、実施例7に記載される手順を用いてこれを固体支持体に付加する。その後、実施例9に記載される手順を用いてオリゴヌクレオチド合成を完了させて、オリゴヌクレオチド242を形成する。
Figure 0007177127000867
共役基GalNAc-29のGalNAcクラスター部分(GalNAc-29)をオリゴヌクレオチド上に存在する任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。GalNAc-29(GalNAc-29-CM)の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000868
実施例110:GalNAc-30共役体を含むオリゴヌクレオチドの合成
Figure 0007177127000869
GalNAc-30共役基を含むオリゴヌクレオチド246(式中、Yが、O、S、置換もしくは非置換C~C10アルキル、アミノ、置換アミノ、アジド、アルケニル、またはアルキニルから選択される)を上に示されるように合成する。共役基GalNAc-30のGalNAcクラスター部分(GalNAc-30)を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、Yは、切断可能な部分の一部である。ある特定の実施形態において、Yは、安定した部分の一部であり、切断可能な部分は、オリゴヌクレオチド上に存在する。GalNAc-30の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000870
実施例111:GalNAc-31またはGalNAc-32共役体を含むオリゴヌクレオチドの合成
Figure 0007177127000871
GalNAc-31共役基を含むオリゴヌクレオチド250(式中、Yが、O、S、置換もしくは非置換C~C10アルキル、アミノ、置換アミノ、アジド、アルケニル、またはアルキニルから選択される)を上に示されるように合成する。共役基GalNAc-31のGalNAcクラスター部分(GalNAc-31)を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドの5’末端に直接隣接したY含有基は、切断可能な部分の一部である。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドの5’末端に直接隣接したY含有基は、安定した部分の一部であり、切断可能な部分は、オリゴヌクレオチド上に存在する。GalNAc-31の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000872
GalNAc-32共役体を含むオリゴヌクレオチドの合成は、以下に示される。
Figure 0007177127000873
Figure 0007177127000874
GalNAc-32共役基を含むオリゴヌクレオチド252(式中、Yが、O、S、置換もしくは非置換C~C10アルキル、アミノ、置換アミノ、アジド、アルケニル、またはアルキニルから選択される)を上に示されるように合成する。共役基GalNAc-32のGalNAcクラスター部分(GalNAc-32)を任意の切断可能な部分と組み合わせて、様々な共役基を得ることができる。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドの5’末端に直接隣接したY含有基は、切断可能な部分の一部である。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドの5’末端に直接隣接したY含有基は、安定した部分の一部であり、切断可能な部分は、オリゴヌクレオチド上に存在する。GalNAc-32の構造は、以下に示される:
Figure 0007177127000875
実施例112:GalNAc共役体を含む修飾オリゴヌクレオチド
SRB-1を標的とする表120のオリゴヌクレオチドをGalNAc共役基で合成して、GalNAcリガンドを含有する共役基を含むオリゴヌクレオチドの強度をさらに試験した。
Figure 0007177127000876

ある態様において、本発明は以下であってもよい。
[態様1]
式(XXVI)
Figure 0007177127000877

を有する化合物であって、
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
[態様2]
前記リンカーが、アミン、アミド、エステル、エーテル、ピロリジン、PEG、ポリアミド、またはジスルフィド結合を含む、態様1に記載の化合物。
[態様3]
前記リンカーがピロリジンを含まない、態様1または2に記載の化合物。
[態様4]
前記リンカーが、以下の式
Figure 0007177127000878

を有する、態様1または2に記載の化合物。
[態様5]
が、以下の式
Figure 0007177127000879

を有し、
式中、
CMが、切断可能な部分であり、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、態様1~4のいずれかに記載の化合物。
[態様6]
が、以下の式
Figure 0007177127000880

を有し、
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、態様1~5のいずれかに記載の化合物。
[態様7]
またはTがオリゴマー化合物を含む基であり、前記オリゴマー化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、態様1~6のいずれかに記載の化合物。
[態様8]
前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなり、少なくとも1個のヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、態様7に記載の化合物。
[態様9]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、(4’-CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-(CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-C(CH)H-O-2’)二環式ヌクレオシド、およびモルフォリノの中から選択される少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、態様8に記載の化合物。
[態様10]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシ
ドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含むギャップマー糖モチーフを有する、態様7~9のいずれかに記載の化合物。
[態様11]
各5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、態様10に記載の化合物。
[態様12]
前記5’領域が2~5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなり、前記3’領域が2~5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなり、前記中央領域が8~10個の中央領域ヌクレオシドからなる、態様10または11に記載の化合物。
[態様13]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、態様7~12のいずれかに記載の化合物。
[態様14]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様7~13のいずれかに記載の化合物。
[態様15]
前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合またはホスホジエステルヌクレオシド間結合のいずれかである、態様7~14のいずれかに記載の化合物。
[態様16]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端で前記化合物の残りに結合される、態様7~15のいずれかに記載の化合物。
[態様17]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端で前記化合物の残りに結合される、態様7~15のいずれかに記載の化合物。
[態様18]
前記修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、態様7~17のいずれかに記載の化合物。
[態様19]
前記修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖である、態様7~18のいずれかの態様に記載の化合物。
[態様20]
前記修飾オリゴヌクレオチドが二本鎖である、態様7~18のいずれかに記載の化合物。
[態様21]
前記修飾オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、態様7~20のいずれかに記載の化合物。
[態様22]
前記修飾オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、態様7~20のいずれかに記載の化合物。
[態様23]
前記修飾オリゴヌクレオチドが標的プレmRNAのスプライシングを変化させる、態様7~20のいずれかに記載の化合物。
[態様24]
前記修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に相補的である、態様18~22のいずれかに記載の化合物。
[態様25]
前記標的核酸が、プレmRNA、マイクロRNA、または長い非コードRNAの中から
選択される、態様24に記載の化合物。
[態様26]
前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなる、態様18~25のいずれかに記載の化合物。
[態様27]
前記修飾オリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、態様18~25のいずれかに記載の化合物。
[態様28]
前記修飾オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、態様18~25のいずれかに記載の化合物。
[態様29]
態様1~28のいずれかに記載の前記化合物を動物に投与する方法。
[態様30]
代謝性障害を治療する方法であって、態様1~28のいずれかに記載の前記化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
[態様31]
心血管障害を治療する方法であって、態様1~28のいずれかに記載の前記化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
[態様32]
式(XXXI)
Figure 0007177127000881

を有する化合物であって、
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
[態様33]
前記リンカーが、アミン、アミド、エステル、エーテル、ピロリジン、PEG、ポリアミド、またはジスルフィド結合を含む、態様32に記載の化合物。
[態様34]
前記リンカーがピロリジンを含まない、態様32または33に記載の化合物。
[態様35]
前記リンカーが、以下
Figure 0007177127000882

である、態様32~34のいずれかに記載の化合物。
[態様36]
が、以下の式
Figure 0007177127000883

を有し、
式中、
CMが切断可能な部分を表し、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、態様32~35のいずれかに記載の化合物。
[態様37]
が、以下の式
Figure 0007177127000884

を有し、
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、態様32~36のいずれかに記載の化合物。
[態様38]
またはTが、オリゴマー化合物を含む基であり、前記オリゴマー化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、態様32~37のいずれかに記載の化合物。
[態様39]
前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなり、少なくとも1個のヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、態様38に記載の化合物。
[態様40]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、(4’-CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-(CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-C(CH)H-O-2’)二環式ヌクレオシド、およびモルフォリノの中から選択される少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、態様39に記載の化合物。
[態様41]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含むギャップマー糖モチーフを有する、態様38~40のいずれかに記載の化合物。
[態様42]
各5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、態様41に記載の化合物。
[態様43]
前記5’領域が2~5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなり、前記3’領域が2~5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなり、前記中央領域が8~10個の中央領域ヌクレオシドからなる、態様41または42のいずれかに記載の化合物。
[態様44]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、態様38~43のいずれかに記載の化合物。
[態様45]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様38~44のいずれかに記載の化合物。
[態様46]
前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合またはホスホジエステルヌクレオシド間結合のいずれかである、態様38~45のいずれかに記載の化合物。
[態様47]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端で前記化合物の残りに結合される、態様38~46のいずれかに記載の化合物。
[態様48]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端で前記化合物の残りに結合される、態様38~46のいずれかに記載の化合物。
[態様49]
前記修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、態様38~48のいずれかに記載の化合物。
[態様50]
前記修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖である、態様38~49のいずれかの態様に記載の化合物。
[態様51]
前記修飾オリゴヌクレオチドが二本鎖である、態様38~49のいずれかに記載の化合物。
[態様52]
前記修飾オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、態様38~51のいずれかに記載の化合物。
[態様53]
前記修飾オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、態様38~51のいずれかに記載の化合物。
[態様54]
前記修飾オリゴヌクレオチドが標的プレmRNAのスプライシングを変化させる、態様38~51のいずれかに記載の化合物。
[態様55]
前記修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に相補的である、態様49~54のいずれかに記載の化合物。
[態様56]
前記標的核酸が、プレmRNA、マイクロRNA、または長い非コードRNAの中から選択される、態様55に記載の化合物。
[態様57]
前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなる、態様49~56のいずれかに記載の化合物。
[態様58]
前記修飾オリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、態様49~56のいずれかに記載の化合物。
[態様59]
前記修飾オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、態様49~56のいずれかに記載の化合物。
[態様60]
態様32~59のいずれかに記載の前記化合物を動物に投与する方法。
[態様61]
代謝性障害を治療する方法であって、態様32~59のいずれかに記載の前記化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
[態様62]
心血管障害を治療する方法であって、態様32~59のいずれかに記載の前記化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
[態様63]
式(XXXII)
Figure 0007177127000885

を有する化合物であって、
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
[態様64]
前記リンカーが、アミン、アミド、エステル、エーテル、ピロリジン、PEG、ポリアミド、またはジスルフィド結合を含む、態様63に記載の化合物。
[態様65]
前記リンカーがピロリジンを含まない、態様63または64に記載の化合物。
[態様66]
前記リンカーが、以下
Figure 0007177127000886

である、態様63~65のいずれかに記載の化合物。
[態様67]
が、以下の式
Figure 0007177127000887

を有し、
式中、
CMが、切断可能な部分であり、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、態様63~66のいずれかに記載の化合物。
[態様68]
が、以下の式
Figure 0007177127000888

を有し、
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、態様63~67のいずれかに記載の化合物。
[態様69]
またはTがオリゴマー化合物を含む基であり、前記オリゴマー化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、態様63~58のいずれかに記載の化合物。
[態様70]
前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなり、少なくとも1個のヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、態様69に記載の化合物。
[態様71]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、(4’-CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-(CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-C(CH)H-O-2’)二環式ヌクレオシド、およびモルフォリノの中から選択される少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、態様70に記載の化合物。
[態様72]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含むギャップマー糖モチーフを有する、態様69~71のいずれかに記載の化合物。
[態様73]
各5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、態様72に記載の化合物。
[態様74]
前記5’領域が2~5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなり、前記3’領域が2~5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなり、前記中央領域が8~10個の中央領域ヌクレオシドからなる、態様72または73のいずれかに記載の化合物。
[態様75]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、態様69~74のいずれかに記載の化合物。
[態様76]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様69~75のいずれかに記載の化合物。
[態様77]
前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合またはホスホジエステルヌクレオシド間結合のいずれかである、態様69~76のいずれかに記載の化合物。
[態様78]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端で前記化合物の残りに結合される、態様69~77のいずれかに記載の化合物。
[態様79]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端で前記化合物の残りに結合される、態様69~77のいずれかに記載の化合物。
[態様80]
前記修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、態様69~79のいずれかに記載の化合物。
[態様81]
前記修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖である、態様69~80のいずれかの態様に記載の化合物。
[態様82]
前記修飾オリゴヌクレオチドが二本鎖である、態様69~80のいずれかに記載の化合物。
[態様83]
前記修飾オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、態様69~82のいずれかに記載の化合物。
[態様84]
前記修飾オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、態様69~82のいずれかに記載の化合物。
[態様85]
前記修飾オリゴヌクレオチドが標的プレmRNAのスプライシングを変化させる、態様69~82のいずれかに記載の化合物。
[態様86]
前記修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に相補的である、態様80~85のいずれかに記載の化合物。
[態様87]
前記標的核酸が、プレmRNA、マイクロRNA、または長い非コードRNAの中から選択される、態様86に記載の化合物。
[態様88]
前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなる、態様80~87のいずれかに記載の化合物。
[態様89]
前記修飾オリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、態様80~87のいずれかに記載の化合物。
[態様90]
前記修飾オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、態様80~87のいずれかに記載の化合物。
[態様91]
態様63~90のいずれかに記載の前記化合物を動物に投与する方法。
[態様92]
代謝性障害を治療する方法であって、態様63~90のいずれかに記載の前記化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
[態様93]
心血管障害を治療する方法であって、態様63~90のいずれかに記載の前記化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
[態様94]
式(XXXVIII)
Figure 0007177127000889

を有する化合物であって、
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
[態様95]
前記リンカーが、アミン、アミド、エステル、エーテル、ピロリジン、PEG、ポリアミド、またはジスルフィド結合を含む、態様94に記載の化合物。
[態様96]
前記リンカーがピロリジンを含まない、態様94または95に記載の化合物。
[態様97]
前記リンカーが、以下
Figure 0007177127000890

である、態様94~96のいずれかに記載の化合物。
[態様98]
が、以下の式
Figure 0007177127000891

を有し、
式中、
CMが、切断可能な部分であり、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、態様94~97のいずれかに記載の化合物。
[態様99]
が、以下の式
Figure 0007177127000892

を有し、
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、態様94~98のいずれかに記載の化合物。
[態様100]
またはTがオリゴマー化合物を含む基であり、前記オリゴマー化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、態様94~99のいずれかに記載の化合物。
[態様101]
前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなり、少なくとも1個のヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、態様100に記載の化合物。
[態様102]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、(4’-CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-(CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-C(CH)H-O-2’)二環式ヌクレオシド、およびモルフォリノの中から選択される少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、態様101に記載の化合物。
[態様103]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含むギャップマー糖モチーフを有する、態様100~102のいずれかに記載の化合物。
[態様104]
各5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、態様103に記載の化合物。
[態様105]
前記5’領域が2~5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなり、前記3’領域が2~5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなり、前記中央領域が8~10個の中央領域ヌクレオシドからなる、態様103または104のいずれかに記載の化合物。
[態様106]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、態様101~105のいずれかに記載の化合物。
[態様107]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様101~106のいずれかに記載の化合物。
[態様108]
前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合またはホスホジエステルヌクレオシド間結合のいずれかである、態様101~107のいずれかに記載の化合物。
[態様109]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端で前記化合物
の残りに結合される、態様101~108のいずれかに記載の化合物。
[態様110]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端で前記化合物の残りに結合される、態様101~108のいずれかに記載の化合物。
[態様111]
前記修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンス化合物である、態様101~110のいずれかに記載の化合物。
[態様112]
前記修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖である、態様101~110のいずれかの態様に記載の化合物。
[態様113]
前記修飾オリゴヌクレオチドが二本鎖である、態様101~110のいずれかに記載の化合物。
[態様114]
前記修飾オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、態様101~113のいずれかに記載の化合物。
[態様115]
前記修飾オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、態様101~112のいずれかに記載の化合物。
[態様116]
前記修飾オリゴヌクレオチドが標的プレmRNAのスプライシングを変化させる、態様101~112のいずれかに記載の化合物。
[態様117]
前記修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に相補的である、態様100~116のいずれかに記載の化合物。
[態様118]
前記標的核酸が、プレmRNA、マイクロRNA、または長い非コードRNAの中から選択される、態様117に記載の化合物。
[態様119]
前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなる、態様100~118のいずれかに記載の化合物。
[態様120]
前記修飾オリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、態様100~118のいずれかに記載の化合物。
[態様121]
前記修飾オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、態様100~118のいずれかに記載の化合物。
[態様122]
態様94~121のいずれかに記載の前記化合物を動物に投与する方法。
[態様123]
代謝性障害を治療する方法であって、態様94~121のいずれかに記載の前記化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
[態様124]
心血管障害を治療する方法であって、態様94~121のいずれかに記載の前記化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
[態様125]
式(XL)
Figure 0007177127000893

を有する化合物であって、
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステル、リンカー、切断可能な部分、またはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
[態様126]
前記リンカーが、アミン、アミド、エステル、エーテル、ピロリジン、PEG、ポリアミド、またはジスルフィド結合を含む、態様125に記載の化合物。
[態様127]
前記リンカーがピロリジンを含まない、態様125または126に記載の化合物。
[態様128]
前記リンカーが、以下
Figure 0007177127000894

である、態様125または126のいずれかに記載の化合物。
[態様129]
が、以下の式
Figure 0007177127000895

を有し、
式中、
CMが、切断可能な部分であり、Tが、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、態様125~128のいずれかに記載の化合物。
[態様130]
が、以下の式
Figure 0007177127000896

を有し、
式中、
が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、態様125~129のいずれかに記載の化合物。
[態様131]
またはTがオリゴマー化合物を含む基であり、前記オリゴマー化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、態様125~130のいずれかに記載の化合物。
[態様132]
前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなり、少なくとも1個のヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、態様131に記載の化合物。
[態様133]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、(4’-CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-(CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-C(CH)H-O-2’)二環式ヌクレオシド、およびモルフォリノの中から選択される少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、態様132に記載の化合物。
[態様134]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、
2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
を含むギャップマー糖モチーフを有する、態様131~133のいずれかに記載の化合物。
[態様135]
各5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、態様134に記載の化合物。
[態様136]
前記5’領域が2~5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなり、前記3’領域が2~5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなり、前記中央領域が8~10個の中央領域ヌクレオシドからなる、態様134または135のいずれかに記載の化合物。
[態様137]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、態様131~136のいずれかに記載の化合物。
[態様138]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様131~137のいずれかに記載の化合物。
[態様139]
前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合またはホスホジエステルヌクレオシド間結合のいずれかである、態様131~138のいずれかに記載の化合物。
[態様140]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端で前記化合物の残りに結合される、態様131~139のいずれかに記載の化合物。
[態様141]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端で前記化合物の残りに結合される、態様131~139のいずれかに記載の化合物。
[態様142]
前記修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、態様131~141のいずれかに記載の化合物。
[態様143]
前記修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖である、態様131~142のいずれかの態様に
記載の化合物。
[態様144]
前記修飾オリゴヌクレオチドが二本鎖である、態様131~142のいずれかに記載の化合物。
[態様145]
前記修飾オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する、態様131~144のいずれかに記載の化合物。
[態様146]
前記修飾オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である、態様131~144のいずれかに記載の化合物。
[態様147]
前記修飾オリゴヌクレオチドが標的プレmRNAのスプライシングを変化させる、態様131~144のいずれかに記載の化合物。
[態様148]
前記修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に相補的である、態様131~147のいずれかに記載の化合物。
[態様149]
前記標的核酸が、プレmRNA、マイクロRNA、または長い非コードRNAの中から選択される、態様148に記載の化合物。
[態様150]
前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなる、態様131~149のいずれかに記載の化合物。
[態様151]
前記修飾オリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、態様131~149のいずれかに記載の化合物。
[態様152]
前記修飾オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、態様131~149のいずれかに記載の化合物。
[態様153]
態様125~152のいずれかに記載の前記化合物を動物に投与する方法。
[態様154]
代謝性障害を治療する方法であって、態様125~152のいずれかに記載の前記化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
[態様155]
心血管障害を治療する方法であって、態様125~152のいずれかに記載の前記化合物をそれを必要とする対象に投与することを含む、方法。
[態様156]
共役アンチセンス化合物を動物に投与することを含む方法であって、前記共役アンチセンス化合物が、ギャップマー糖モチーフを有する修飾オリゴヌクレオチドおよびGalNAcを含む共役体を含む、方法。
[態様157]
動物における細胞内の標的核酸の量または活性を低減させる方法であって、前記動物に、修飾オリゴヌクレオチドおよび共役体を含む共役アンチセンス化合物を投与することであって、前記修飾オリゴヌクレオチドがギャップマー糖モチーフを有し、前記共役体がGalNAcを含む、投与することを含み、それにより前記動物における前記細胞内の前記標的核酸の前記量または活性を低減させる、方法。
[態様158]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000897

を含む、態様156または157に記載の方法。
[態様159]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000898

を含む、態様156または157に記載の方法。
[態様160]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000899

を含む、態様156または157に記載の方法。
[態様161]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000900

を含む、態様156または157に記載の方法。
[態様162]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000901

を含む、態様156または157に記載の方法。
[態様163]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000902

を含む、態様156または157に記載の方法。
[態様164]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000903

を含む、態様156または157に記載の方法。
[態様165]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000904

を含む、態様156または157に記載の方法。
[態様166]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000905

Figure 0007177127000906

Figure 0007177127000907

または
Figure 0007177127000908

から選択される分岐基を有する、態様156または157に記載の方法。
[態様167]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000909

から選択されるリンカーを有し、
式中、各nが、0、1、2、3、4、5、6、または7から独立して選択される、態様156または157に記載の方法。
[態様168]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、態様156または167のいずれかに記載の方法。
[態様169]
前記修飾ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、態様168に記載の方法。
[態様170]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様168または169に記載の方法。
[態様171]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも2個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様168または169に記載の方法。
[態様172]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも3個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様168または169に記載の方法。
[態様173]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも4個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様168または169に記載の方法。
[態様174]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも5個のホスホジエステルヌクレオシド間結合
を含む、態様168または169に記載の方法。
[態様175]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様168または169に記載の方法。
[態様176]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも7個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様168または169に記載の方法。
[態様177]
前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合およびホスホロチオエートヌクレオシド間結合から選択される、態様168または176のいずれかに記載の方法。
[態様178]
前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、態様178に記載の方法。
[態様179]
修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも80%相補的である、態様168~178のいずれかに記載の方法。
[態様180]
修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも85%相補的である、態様168~178のいずれかに記載の方法。
[態様181]
修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して少なくとも90%相補的である、態様168~178のいずれかに記載の方法。
[態様182]
修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に対して100%相補的である、態様168~178のいずれかに記載の方法。
[態様183]
前記標的核酸が肝臓において発現される、態様168~182のいずれかに記載の方法。
[態様184]
前記標的核酸が肝細胞において発現される、態様168~183のいずれかに記載の方法。
[態様185]
前記標的核酸が、アンドロゲン受容体、アポリポタンパク質(a)、アポリポタンパク質B、アポリポタンパク質C-III、C反応性タンパク質、eIF-4E、第VII因子、第XI因子、グルココルチコイド受容体、グルカゴン受容体、タンパク質チロシンホスファターゼ1B、STAT3、およびトランスサイレチンの中から選択されるタンパク質をコードする、態様168~184のいずれかに記載の方法。
[態様186]
細胞内のプレmRNA標的核酸のスプライシングを調節する方法であって、前記細胞を共役アンチセンス化合物と接触させることであって、前記共役アンチセンス化合物が修飾オリゴヌクレオチドおよび共役体を含み、前記共役体がGalNacを含む、接触させることを含み、それにより前記細胞内の前記プレmRNA標的核酸のスプライシングを調節する、方法。
[態様187]
前記プレmRNA標的核酸が肝細胞において発現される、態様186に記載の方法。
[態様188]
前記細胞が生体外に存在する、態様186または187に記載の方法。
[態様189]
前記細胞が生体内に存在する、態様186または187に記載の方法。
[態様190]
前記細胞が動物内に存在する、態様186または187に記載の方法。
[態様191]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、態様186または190のいずれかに記載の方法。
[態様192]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-O(CHOCH修飾を含む少なくとも1個のヌクレオシドを含む、態様191に記載の方法。
[態様193]
前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-OCH修飾を含む少なくとも1個のヌクレオシドを含む、態様191または192に記載の方法。
[態様194]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の二環式ヌクレオシドを含む、態様191~193のいずれかに記載の方法。
[態様195]
(4’-CH-O-2’)BNAヌクレオシドを含む、態様194に記載の方法。
[態様196]
(4’-(CH-O-2’)BNAヌクレオシドを含む、態様194または195に記載の方法。
[態様197]
(4’-C(CH)H-O-2’)BNAヌクレオシド、態様194~196のいずれかの態様に記載の方法。
[態様198]
前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、態様194~197のいずれかに記載の方法。
[態様199]
前記修飾オリゴヌクレオチドの各修飾ヌクレオシドが同一の修飾を含む、態様198に記載の方法。
[態様200]
前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも2個の修飾ヌクレオシドが互いに異なる修飾を含む、態様198に記載の方法。
[態様201]
前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオチドである、態様194~198または200のいずれかに記載の方法。
[態様202]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000910

を含む、態様186または201に記載の方法。
[態様203]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000911

を含む、態様186~201のいずれかに記載の方法。
[態様204]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000912

を含む、態様186~201のいずれかに記載の方法。
[態様205]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000913

を含む、態様186~201のいずれかに記載の方法。
[態様206]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000914

を含む、態様186~201のいずれかに記載の方法。
[態様207]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000915

を含む、態様186~201のいずれかに記載の方法。
[態様208]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000916

を含む、態様186~201のいずれかに記載の方法。
[態様209]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000917

を含む、態様186~201のいずれかに記載の方法。
[態様210]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000918

Figure 0007177127000919

Figure 0007177127000920

または
Figure 0007177127000921

から選択される分岐基を有する、態様186~201のいずれかに記載の方法。
[態様211]
前記共役体が、以下の構造
Figure 0007177127000922

から選択されるリンカーを有し、
式中、各nが、0、1、2、3、4、5、6、または7から独立して選択される、態様186~201のいずれかに記載の方法。
[態様212]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、態様186~211のいずれかに記載の方法。
[態様213]
前記修飾ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、態様212に記載の方法。
[態様214]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様186~213のいずれかに記載の方法。
[態様215]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも2個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様186~213のいずれかに記載の方法。
[態様216]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも3個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様186~213のいずれかに記載の方法。
[態様217]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも4個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様186~213のいずれかに記載の方法。
[態様218]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも5個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様186~213のいずれかに記載の方法。
[態様219]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも6個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様186~213のいずれかに記載の方法。
[態様220]
前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも7個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様186~213のいずれかに記載の方法。
[態様221]
前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合およびホスホロチオエートヌクレオシド間結合から選択される、態様186~220のいずれかに記載の方法。
[態様222]
前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシ
ド間結合である、態様212に記載の方法。
[態様223]
前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも1個のヌクレオシドがモルフォリノヌクレオシドである、態様186~222のいずれかに記載の方法。
[態様224]
前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドがモルフォリノヌクレオシドである、態様186~223のいずれかに記載の方法。
[態様225]
アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含むプロドラッグであって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがRNAe Hベースのアンチセンスオリゴヌクレオチドである、プロドラッグ。
[態様226]
前記RNase Hベースのアンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマーである、態様225に記載のプロドラッグ。
[態様227]
前記共役体が、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端で前記アンチセンスオリゴヌクレオチドに結合される、態様225または226に記載のプロドラッグ。
[態様228]
アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含むプロドラッグであって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがプレmRNAのスプライシングを変化させるアンチセンスオリゴヌクレオチドである、プロドラッグ。
[態様229]
前記プロドラッグの生体内代謝が、前記共役体を欠く前記アンチセンスオリゴヌクレオチドをもたらす、態様225~228のいずれかに記載のプロドラッグ。
[態様230]
前記プロドラッグが、前記共役体を欠く前記アンチセンスオリゴヌクレオチドよりも生体内で少なくとも5倍強力である、態様225~228のいずれかに記載のプロドラッグ。
[態様231]
前記プロドラッグが、前記共役体を欠く前記アンチセンスオリゴヌクレオチドよりも生体内で少なくとも8倍強力である、態様225~228のいずれかに記載のプロドラッグ。
[態様232]
前記プロドラッグが、前記共役体を欠く前記アンチセンスオリゴヌクレオチドよりも生体内で少なくとも10倍強力である、態様225~228のいずれかに記載のプロドラッグ。
[態様233]
態様225~232のいずれかに記載の前記プロドラッグを動物に投与することを含む方法。
[態様234]
アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含む化合物であって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマー糖モチーフを有し、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、マウスRafキナーゼC、マウスFas受容体、またはヒトホスファターゼ・テンシンホモログ(PTEN)の中から選択される標的核酸に対して100%相補的ではない、化合物。
[態様235]
前記共役体が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、態様234に記載の化合物。
[態様236]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの前記ヌクレオシド間結合が、少なくとも1個のホスホジエステル結合および少なくとも1個のホスホロチオエート結合を含む、態様234または235のいずれかに記載の化合物。
[態様237]
前記共役基がコランを含まない、態様234~236のいずれかに記載の化合物。
[態様238]
前記分岐基が四級炭素またはアミノ酸を含む、態様234~237のいずれかに記載の化合物。
[態様239]
アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含む化合物であって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマー糖モチーフを有し、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、代謝性障害または心血管障害の前記治療のために調節され得る標的核酸に相補的である、化合物。
[態様240]
前記共役体が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、態様239に記載の化合物。
[態様241]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの前記ヌクレオシド間結合が、少なくとも1個のホスホジエステル結合および少なくとも1個のホスホロチオエート結合を含む、態様239または240のいずれかに記載の化合物。
[態様242]
前記共役基がコランを含まない、態様239~241のいずれかに記載の化合物。
[態様243]
前記分岐基が四級炭素またはアミノ酸を含む、態様239~242のいずれかに記載の化合物。
[態様244]
アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含む化合物であって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステル結合および少なくとも1個のホスホロチオエート結合を含む、化合物。
[態様245]
前記共役体が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、態様244に記載の化合物。
[態様246]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマー糖モチーフを有する、態様244または245のいずれかに記載の化合物。
[態様247]
前記共役基がコランを含まない、態様255~246のいずれかに記載の化合物。
[態様248]
前記分岐基が四級炭素またはアミノ酸を含む、態様244~247のいずれかに記載の化合物。
[態様249]
アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含む化合物であって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記共役基がコランを含まず、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマー糖モチーフを有する、化合物。
[態様250]
前記共役体が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、態様249に記載の化合物。
[態様251]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの前記ヌクレオシド間結合が、少なくとも1個のホスホジエステル結合および少なくとも1個のホスホロチオエート結合を含む、態様249または250のいずれかに記載の化合物。
[態様252]
前記分岐基が四級炭素またはアミノ酸を含む、態様249~251のいずれかに記載の化合物。
[態様253]
アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含む化合物であって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがギャップマー糖モチーフを有し、前記分岐基が四級炭素またはアミノ酸を含む、化合物。
[態様254]
前記共役体が前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの5’末端に結合される、態様253に記載の化合物。
[態様255]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの前記ヌクレオシド間結合が、少なくとも1個のホスホジエステル結合および少なくとも1個のホスホロチオエート結合を含む、態様253または254のいずれかに記載の化合物。
[態様256]
前記共役基がコランを含まない、態様254または255のいずれかに記載の化合物。
[態様257]
アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび共役体を含む化合物であって、前記共役体が少なくとも1個のGalNAcを含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドがプレmRNAのスプライシングを変化させる、化合物。
[態様258]
前記共役体が正確に1個のGalNAcリガンドを含む、態様234~257のいずれかに記載の化合物。
[態様259]
前記共役体が正確に2個のGalNAcリガンドを含む、態様234~257のいずれかに記載の化合物。
[態様260]
前記共役体が正確に3個のGalNAcリガンドを含む、態様234~257のいずれかに記載の化合物。
[態様261]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなる、態様234~260のいずれかに記載の化合物。
[態様262]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、態様234~260のいずれかに記載の化合物。
[態様263]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、態様234~260のいずれかに記載の化合物。
[態様264]
前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなる、態様156~224のいずれかに記載の方法。
[態様265]
前記修飾オリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる、態様156~224のいずれかに記載の方法。
[態様266]
前記修飾オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、態様156~224のいずれかに記載の方法。
[態様267]
前記オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、またはアンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される核酸塩基配列のうちのいずれかと少なくとも80%同一の核酸塩基配列を有する、態様1~28、32~59、63~90、94~121、125~152、または234~263のいずれかに記載の化合物。
[態様268]
前記オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、またはアンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列のうちのいずれかの少なくとも8個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、態様1~28、32~59、63~90、94~121、125~152、または234~263のいずれかに記載の化合物。
[態様269]
前記オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、またはアンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列のうちのいずれかの少なくとも10個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、態様1~28、32~59、63~90、94~121、125~152、または234~263のいずれかに記載の化合物。
[態様270]
前記オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、またはアンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列のうちのいずれかの少なくとも16個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、態様1~28、32~59、63~90、94~121、125~152、または234~263のいずれかに記載の化合物。
[態様271]
前記オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、またはアンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列のうちのいずれかの少なくとも18個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、態様1~28、32~59、63~90、94~121、125~152、または234~263のいずれかに記載の化合物。
[態様272]
前記オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、またはアンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列の中から選択される核酸塩基配列を有する、態様1~28、32~59、63~90、94~121、125~152、または234~263のいずれかに記載の化合物。
[態様273]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される核酸塩基配列のうちのいずれかと少なくとも80%同一の核酸塩基配列を有する、態様225~232のいずれかに記載のプロドラッグ。
[態様274]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列のうちのいずれかの少なくとも8個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、態様225~232のいずれかに記載のプロドラッグ。
[態様275]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列のうちのいずれかの少なくとも10個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、態様225~232のいずれかに記載のプロドラッグ。
[態様276]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列のうちのいずれかの少なくとも16個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、態様225~232のいずれかに記載のプロドラッグ。
[態様277]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列のうちのいずれかの少なくとも18個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、態様225~232のいずれかに記載のプロドラッグ。
[態様278]
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列の中から選択される核酸塩基配列を有する、態様225~232のいずれかに記載のプロドラッグ。
[態様279]
前記オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、またはアンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される核酸塩基配列のうちのいずれかと少なくとも80%同一の核酸塩基配列を有する、態様29~31、60~62、91~93、122~124、153~224、233、または264~266のいずれかに記載の方法。
[態様280]
前記オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、またはアンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列のうちのいずれかの少なくとも8個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、態様29~31、60~62、91~93、122~124、153~224、233、または264~266のいずれかに記載の方法。
[態様281]
前記オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、またはアンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列のうちのいずれかの少なくとも10個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、態様29~31、60~62、91~93、122~124、153~224、233、または264~266のいずれかに記載の方法。
[態様282]
前記オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、またはアンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列のうちのいずれかの少なくとも16個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、態様29~31、60~62、91~93、122~124、153~224、233、または264~266のいずれかに記載の方法。
[態様283]
前記オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、またはアンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列のうちのいずれかの少なくとも18個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、態様29~31、60~62、91~93、122~124、153~224、233、または264~266のいずれかに記載の方法。
[態様284]
前記オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、またはアンチセンスオリゴヌクレオチドが、配列番号17~159に列挙される配列の中から選択される核酸塩基配列を有する、態様29~31、60~62、91~93、122~124、153~224、233、または264~266のいずれかに記載の方法。
[態様285]
前記共役体が切断可能な部分を含む、態様234~263または267~272のいずれかに記載の化合物。
[態様286]
前記切断可能な部分が切断可能なヌクレオシドを含む、態様285に記載の化合物。
[態様287]
前記切断可能な部分が切断可能なヌクレオシドを含まない、態様285に記載の化合物。
[態様288]
前記切断可能な部分がエステル結合である、態様285に記載の化合物。
[態様289]
前記切断可能な部分が前記オリゴヌクレオチドに直接結合する、態様285~288の
いずれかに記載の化合物。
[態様290]
動物における前記切断可能な部分の切断が、前記共役体が一部たりとも残っていないオリゴヌクレオチドをもたらす、態様285~289のいずれかに記載の化合物。
[態様291]
前記共役体が切断可能な部分を含む、態様156~224または279~284のいずれかに記載の方法。
[態様292]
前記切断可能な部分が切断可能なヌクレオシドを含む、態様291に記載の方法。
[態様293]
前記切断可能な部分が切断可能なヌクレオシドを含まない、態様291に記載の方法。
[態様294]
前記切断可能な部分がエステル結合である、態様291に記載の方法。
[態様295]
前記切断可能な部分が前記オリゴヌクレオチドに直接結合する、態様291~294のいずれかに記載の方法。
[態様296]
動物における前記切断可能な部分の切断が、前記共役体が一部たりとも残っていないオリゴヌクレオチドをもたらす、態様291~295のいずれかに記載の方法。

Claims (21)

  1. 式(XXVI)
    Figure 0007177127000923
    を有する化合物であって、
    式中、
    が、ヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、反応性エステルまたはオリゴマー化合物を含む基である、化合物。
  2. が、さらにリンカーおよび/または切断可能な部分を含む、請求項1に記載の化合物。
  3. 前記リンカーが、アミン、アミド、エステル、エーテル、ピロリジン、PEG、ポリアミド、またはジスルフィド結合を含む、請求項に記載の化合物。
  4. 前記リンカーがピロリジンを含まない、請求項に記載の化合物。
  5. 前記リンカーが、以下の式
    Figure 0007177127000924
    を有する、請求項2~4のいずれかに記載の化合物。
  6. が、以下の式:
    Figure 0007177127000925
    を有し、式中、CMが切断可能な部分であり、Tがヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、請求項1~5のいずれかに記載の化合物。
  7. が、以下の式
    Figure 0007177127000926
    を有し、式中、Tがヌクレオシド、ヌクレオチド、単量体サブユニット、またはオリゴマー化合物である、請求項1~6のいずれかに記載の化合物。
  8. またはTがオリゴマー化合物を含む基であり、前記オリゴマー化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、請求項1~7のいずれかに記載の化合物。
  9. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも1個のヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである10~30個の連結したヌクレオシドからなる、請求項8に記載の化合物。
  10. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、2’-MOEヌクレオシド、2’-OMeヌクレオシド、2’-Fヌクレオシド、(4’-CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-(CH-O-2’)二環式ヌクレオシド、(4’-C(CH)H-O-2’)二環式ヌクレオシド、およびモルフォリノの中から選択される少なくとも1個の修飾ヌクレオシドを含む、請求項9に記載の化合物。
  11. 請求項8~10のいずれかに記載の化合物であって、
    前記修飾オリゴヌクレオチドが、
    2~8個の連結した5’領域ヌクレオシドからなる5’領域であって、少なくとも2個の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も3’側の5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、5’領域と、
    2~8個の連結した3’領域ヌクレオシドからなる3’領域であって、少なくとも2個の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、最も5’側の3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドである、3’領域と、
    5~10個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる前記5’領域と前記3’領域との間の中央領域であって、各々が修飾ヌクレオシドおよび非修飾デオキシヌクレオシドの中から独立して選択され、最も5’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであり、最も3’側の中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドである、中央領域と、
    を含むギャップマー糖モチーフを有し、
    場合により、各5’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各3’領域ヌクレオシドが修飾ヌクレオシドであり、各中央領域ヌクレオシドが非修飾デオキシヌクレオシドであることができる、化合物。
  12. 前記5’領域が2~5個の連結した5’領域ヌクレオシドからなり、前記3’領域が2~5個の連結した3’領域ヌクレオシドからなり、前記中央領域が8~10個の中央領域ヌクレオシドからなる、請求項11に記載の化合物。
  13. 前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む;および/または、
    前記修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも1個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む;および/または、
    前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合またはホスホジエステルヌクレオシド間結合のいずれかである、
    請求項8~12のいずれかに記載の化合物。
  14. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの5’末端で前記化合物の残りに結合される;または、
    前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記修飾オリゴヌクレオチドの3’末端で前記化合物の残りに結合される、
    請求項8~13のいずれかに記載の化合物。
  15. 前記修飾オリゴヌクレオチドがアンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項8~14のいずれかに記載の化合物。
  16. 前記修飾オリゴヌクレオチドが一本鎖である、または、前記修飾オリゴヌクレオチドが二本鎖である、請求項8~15のいずれかに記載の化合物。
  17. 前記修飾オリゴヌクレオチドがRISC経路を活性化する;または、
    前記修飾オリゴヌクレオチドがRNase Hベースのアンチセンス化合物である;または、
    前記修飾オリゴヌクレオチドが標的プレmRNAのスプライシングを変化させる、
    請求項8~16のいずれかに記載の化合物。
  18. 前記修飾オリゴヌクレオチドが標的核酸に相補的である、請求項15~17のいずれかに記載の化合物。
  19. 前記標的核酸が、プレmRNA、マイクロRNA、または長い非コードRNAの中から選択される、請求項18に記載の化合物。
  20. 前記修飾オリゴヌクレオチドが10~30個の連結したヌクレオシドからなる;または
    前記修飾オリゴヌクレオチドが18~22個の連結したヌクレオシドからなる;または
    前記修飾オリゴヌクレオチドが16~20個の連結したヌクレオシドからなる、請求項15~19のいずれかに記載の化合物。
  21. 代謝性障害または心血管障害の治療のための医薬組成物であって、請求項8~20のいずれか1項に記載の化合物を含有する、医薬組成物。
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