TW201303013A - Ｂ型肝炎病毒（ｈｂｖ）表現之調節 - Google Patents

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Abstract

本文揭示用於減少HBV mRNA、DNA及蛋白質表現之反義化合物及方法。該等方法、化合物及組合物適用於治療、預防或改善HBV相關疾病、病症或病狀。

Description

B型肝炎病毒(HBV)表現之調節
在某些實施例中，提供用於抑制B型肝炎病毒(HBV)mRNA及蛋白質在動物體內表現的方法、化合物及組合物。該等方法、化合物及組合物適用於治療、預防或改善HBV相關疾病及病症。
序列表
本申請案正連同呈電子格式之序列表一起申請。序列表係提供為2012年4月17日建立之大小為約12 Kb之題為BIOL0142TWSEQ.txt的檔案。電子格式之序列表中之資訊以全文引用之方式併入本文中。
B型肝炎為由被污染之物質(諸如血液及血液製品)、被污染之針非經腸傳播、性傳播及自感染或攜帶者母體垂直傳播至其後代的病毒性疾病。由世界衛生組織(World Health Organization)估計，在世界範圍內有超過20億人已受感染，其中每年有約400萬急性病例，每年有100萬例死亡，以及3.5-4億個慢性攜帶者(World Health Organization：Geographic Prevalence of Hepatitis B Prevalence,2004.http：//www.who.int/vaccines-surveillance/graphics/htmls/hepbprev.htm)。
病毒HBV為僅感染人類及非人類靈長類動物的雙股嗜 肝性病毒。病毒主要在肝臟中進行複製，且以較少程度在腎、胰臟、骨髓及脾中進行複製(Hepatitis B virus biology.Microbiol Mol Biol Rev.64：2000；51-68.)。病毒及免疫標記可在血液中偵測出，且特徵性抗原-抗體型態隨時間推移演變。首先可偵測之病毒標記為HBsAg，繼而為B型肝炎e抗原(HBeAg)及HBV DNA。滴度在潛伏期期間較高，但HBV DNA及HBeAg含量在疾病發作時開始下降且在臨床疾病最高點時可能不可偵測(Hepatitis B virus infection-natural history and clinical consequences.N Engl J Med..350：2004；1118-1129)。HBeAg為可在血液中偵測出之病毒標記且與活性病毒複製有關，且因此與高病毒負荷及感染性有關(Hepatitis B e antigen-the dangerous end game of hepatitis B.N Engl J Med.347：2002；208-210)。抗-HBsAb及抗-HBcAb(IgG)抗體之存在指示先前感染之個體恢復及免疫力。
當前由美國肝病研究協會(American Association for the Study of Liver Diseases，AASLD)及歐洲肝臟研究協會(European Association for the Study of the Liver，EASL)推薦之用於慢性HBV感染之療法包括干擾素α(INFα)、聚乙二醇化干擾素α-2a(Peg-IFN2a)、恩替卡韋(entecavir)及泰諾福韋(tenofovir)。核苷及核苷酸療法(即恩替卡韋及泰諾福韋)成功地降低病毒負荷，但HBeAg血清轉化及HBsAg喪失之速率甚至低於使用IFNα療法所獲得之速率。亦使用其他類似療法，包括拉米夫定(Iamivudine， 3TC)、替比夫定(telbivudine，LdT)及阿德福韋(adefovir)，但一般對於核苷/核苷酸療法而言，抗性之出現會限制治療功效。
因此，在此項技術中需要發現及研發新抗病毒療法。另外，需要能夠提高HBeAg及HBsAg血清轉化速率之新抗-HBV療法。新近臨床研究已發現血清轉化與HBeAg降低(Fried等人，(2008)Hepatology 47：428)及HBsAg降低(Moucari等人，(2009)Hepatology 49：1151)之間的相關性。抗原含量降低可允許免疫學控制HBV感染，因為高抗原含量被認為會誘導免疫耐受性。當前用於HBV之核苷療法能夠顯著降低HBV之血清含量，但對HBeAg及HBsAg含量幾乎無影響。
反義技術作為減少特定基因產物表現之有效方式出現且因此經證明可在多種治療、診斷及研究應用中獨特地用於調節HBV表現(參見美國專利公開案第2008/0039418號及第2007/0299027號)。反義療法與核苷療法不同之處在於其可直接靶向HBV抗原之轉錄物且因此降低血清HBeAg及HBsAg含量。由於在HBV感染時產生多種重疊轉錄物，所以單個反義寡聚物除HBeAg及HBsAg之外亦有可能減少HBV DNA。因此，反義技術作為減少某些基因產物表現之有效方式出現且因此經證明可在多種治療、診斷及研究應用中獨特地用於調節HBV。
本文提供調節HBV mRNA及蛋白質表現之方法、化合物及組合物。在某些實施例中，適用於調節HBV mRNA及蛋白質表現之化合物為反義化合物。在某些實施例中，反義化合物為反義寡核苷酸。
在某些實施例中，可在細胞或組織中進行調節。在某些實施例中，細胞或組織處於動物體內。在某些實施例中，動物為人類。在某些實施例中，減少HBV mRNA表現。在某些實施例中，降低HBV DNA含量。在某些實施例中，降低HBV蛋白含量。在某些實施例中，降低HBV抗原含量。在某些實施例中，降低HBV s-抗原(HBsAg)含量。在某些實施例中，降低HBV e-抗原(HBeAg)含量。該降低可以時間依賴性方式或以劑量依賴性方式出現。在某些實施例中，用於調節HBV mRNA及蛋白質表現之化合物為本文提供之嵌合間隔體。在某些實施例中，化合物為具有基元3-10-3之十六聚體間隔體。
亦提供適用於預防、治療及改善疾病、病症及病狀的方法、化合物及組合物。在某些實施例中，該等HBV相關疾病、病症及病狀為肝臟疾病。在某些實施例中，該等肝臟疾病、病症及病狀包括黃疸、肝癌、肝臟炎症、肝纖維化、炎症、肝硬化、肝臟衰竭、彌漫性肝細胞性發炎性疾病、噬血細胞性症候群、血清肝炎、HBV病毒血症及與移植相關之肝臟疾病。在某些實施例中，該等HBV相關疾病、病症及病狀為過度增殖性疾病、病症及病狀。在某些實施例中，該等過度增殖性疾病、病症及 病狀包括癌症以及相關惡性病及轉移。在某些實施例中，該等癌症包括肝癌及肝細胞癌(HCC)。
該等疾病、病症及病狀可共同具有一或多個風險因素、成因或結果。產生肝臟疾病或過度增殖性疾病之某些風險因素及成因包括逐漸變老；使用煙草；曝露於日光及電離輻射；與某些化學物質接觸；感染某些病毒及細菌；某些激素療法；癌症家族史；使用酒精；及某些生活方式選擇，包括不良膳食、缺乏身體運動及/或超重。某些與產生肝臟疾病或過度增殖性疾病有關之症狀及結果包括(但不限於)：流行性感冒樣疾病、虛弱、疼痛、頭痛、發繞、食欲喪失、腹瀉、黃疸、噁心及嘔吐、身體肝區疼痛、黏土色或灰色糞便、全身發癢及尿色深。
在某些實施例中，治療方法包括投與有需要之個體HBV反義化合物。在某些實施例中，治療方法包括投與有需要之個體HBV反義寡核苷酸。
應瞭解，以上一般描述及以下【實施方式】僅具例示性及說明性而不限制如所主張之本發明。在本文中，除非另外特定說明，否則單數之使用包括複數。除非另外說明，否則如本文所用「或」之使用意謂「及/或」。此外，術語「包括(including)」以及其他形式，諸如「包括(includes)」及「包括(included)」之使用不具限制性。並且，除非另外特定說明，否則諸如「元件」或「組件」 之術語涵蓋包含一個單元之元件及組件以及包含超過一個次單元之元件及組件。
本文所用之章節標題僅用於組織目的而不視為限制所述標的物。本申請案中引用之所有文獻或文獻之部分(包括(但不限於)專利、專利申請案、文章、書籍及論文)關於本文所述之文獻部分明確地以引用方式併入本文中以及以全文引用方式併入本文中。
定義
除非提供特定定義，否則關於本文所述之分析化學、合成有機化學及醫學及醫藥化學所用之命名及本文所述之分析化學、合成有機化學及醫學及醫藥化學之程序及技術為此項技術中熟知且常用者。可使用標準技術進行化學合成及化學分析。在允許的情況下，貫穿本文之揭示內容中所提及之所有專利、申請案、公開申請案及其他公開案、可經由資料庫(諸如美國國家生物技術資訊中心(National Center for Biotechnology Information，NCBI))獲得的GENBANK寄存編號及相關序列資訊及其他資料關於本文所述之文獻部分以引用方式併入本文中以及以全文引用方式併入本文中。
除非另外指示，否則以下術語具有以下含義：「3'目標位點」係指目標核酸中與特定反義化合物之3'最末端核苷酸互補的核苷酸。
「5'目標位點」係指目標核酸中與特定反義化合物之5'最末端核苷酸互補的核苷酸。
「5-甲基胞嘧啶」意謂經連接至5位之甲基修飾的胞嘧啶。5-甲基胞嘧啶為經修飾之核鹼基。
「約」意謂在值±7%範圍內。舉例而言，若說明「化合物將HBV抑制至少約70%」，則表示63%至77%範圍內之HBV含量得到抑制。
「可接受之安全性概況」意謂臨床上可接受之限度內的副作用型態。
「活性醫藥藥劑」意謂醫藥組合物中在投與個體時提供治療效益之物質。舉例而言，在某些實施例中，靶向HBV之反義寡核苷酸為活性醫藥藥劑。
「活性目標區」意謂一或多種活性反義化合物所靶向之目標區。「活性反義化合物」意謂降低目標核酸含量或蛋白含量的反義化合物。
「急性B型肝炎感染」在暴露於B型肝炎病毒之人開始產生病毒性肝炎之體征及症狀時產生。此稱作潛伏期之時段平均為90天，但可短至45天或長達6個月。對於大多數人，此感染將引起輕度至中度不適，但會因身體免疫反應成功戰勝病毒而自行消失。然而，有些人，尤其免疫系統受損之人，諸如患有AIDS、進行化學療法、服用免疫抑制藥物或服用類固醇之人會因急性HBV感染而產生極嚴重問題，且進展成更嚴重之病狀，諸如爆發性肝臟衰竭。
「並行投與」係指兩種藥劑以其兩者之藥理學作用在患者體內同時表現之任何方式共同投與。並行投與不需 要該兩種藥劑於單一醫藥組合物中、以相同劑型或藉由相同投藥途徑投與。兩種藥劑的作用本身無需同時表現。該等作用僅需重疊一段時間而無需共同延長。
「投與」意謂向個體提供醫藥藥劑，且包括(但不限於)由醫學專業人員投與及自行投與。
「藥劑」意謂在投與動物時可提供治療效益之活性物質。「第一藥劑」意謂本文所述之治療性化合物。舉例而言，第一藥劑可為靶向HBV之反義寡核苷酸。「第二藥劑」意謂本文所述之第二治療性化合物(例如靶向HBV之第二反義寡核苷酸)及/或非HBV治療性化合物。
「改善」係指減輕病狀或疾病嚴重性之至少一種指標。指標之嚴重性可藉由熟習此項技術者已知之主觀或客觀量度來確定。
「動物」係指人類或非人類動物，包括(但不限於)小鼠、大鼠、家兔、狗、貓、豬，及非人類靈長類動物，包括(但不限於)猴及黑猩猩。
「抗體」係指特徵在於與抗原以某種方式特異性反應的分子，其中抗體與抗原各自利用另一者來定義。抗體可指完全抗體分子或其任何片段或區域，諸如重鏈、輕鏈、Fab區及Fc區。
「反義活性」意謂可歸於反義化合物與其目標核酸雜交之任何可偵測或可量測活性。在某些實施例中，反義活性為目標核酸或由該目標核酸編碼之蛋白質的量或表現減少。
「反義化合物」意謂能夠與目標核酸經由氫鍵鍵結進行雜交的寡聚化合物。反義化合物之實例包括單股及雙股化合物，諸如反義寡核苷酸、siRNA、shRNA、snoRNA、miRNA及衛星重複序列。
「反義抑制」意謂在與目標核酸互補之反義化合物存在下目標核酸含量相較於在不存在反義化合物下之目標核酸含量有所減少。
「反義機制」為所有涉及化合物與目標核酸雜交之機制，其中雜交之結果或效應為標靶降解或標靶佔有，伴隨阻礙涉及例如轉錄或剪接之細胞機構。
「反義寡核苷酸」意謂具有允許與目標核酸之相應區域或區段雜交之核鹼基序列的單股寡核苷酸。
「鹼基互補性」係指反義寡核苷酸之核鹼基與目標核酸中之相應核鹼基進行準確鹼基配對(亦即雜交)的能力，且由相應核鹼基之間的沃森-克里克(Watson-Crick)、霍氏(Hoogsteen)或反霍氏氫鍵結合介導。
「雙環糖」意謂由兩個非偕位碳原子橋連修飾的呋喃醣環。雙環糖為經修飾之糖。「體重」係指動物全身重量，包括所有組織(包括脂肪組織)。
「體重」係指動物全身重量，包括所有組織(包括脂肪組織)。
「帽結構」或「末端帽部分」意謂已併入於反義化合物任一末端處之化學修飾。
「化學相異區」係指反義化合物中以某種方式在化學 上不同於同一反義化合物之另一區的區域。舉例而言，具有4'-CH2-O-2'核苷酸之區域在化學上與具有無4'-CH2-O-2'修飾之核苷酸的區域不同。
「嵌合反義化合物」意謂具有至少2個化學相異區之反義化合物，其中第一區具有至少一個次單元且第二區具有複數個次單元。
「慢性B型肝炎感染」在人最初患有急性感染，但接著不能抗擊感染時出現。疾病變成慢性疾病抑或完全消除主要視受感染之人的年齡而定。出生時感染之約90%嬰兒將進展成慢性疾病。然而，隨著人年齡增長，慢性感染之風險降低，因此20%至50%兒童及不到10%之年齡較大之兒童或成人將自急性感染進展成慢性感染。慢性HBV感染為本發明實施例之主要治療目標，但本發明之ASO組合物亦能夠治療HBV相關病狀，諸如炎症、纖維化、硬化、肝癌、血清肝炎及其他病狀。
「共同投與」意謂向個體投與兩種或兩種以上醫藥藥劑。兩種或兩種以上醫藥藥劑可在單個醫藥組合物中，或可在各別醫藥組合物中。兩種或兩種以上醫藥藥劑可各自經由相同或不同投藥途徑投與。共同投與涵蓋同時或依序投與。
「互補性」意謂第一核酸與第二核酸之核鹼基之間配對的能力。
「順應」意謂個體遵循推薦之療法。
「包含(comprise)」、「包含(comprises)」及「包含 (comprising)」應理解為表示包括所述步驟或要素或步驟或要素之群組，但不排除任何其他步驟或要素或步驟或要素之群組。
「連續核鹼基」意謂彼此緊鄰之核鹼基。
「治癒」意謂恢復健康之方法或過程或針對疾病所規定之治療。
「去氧核糖核苷酸」意謂在核苷酸之糖部分之2'位上具有氫之核苷酸。去氧核糖核苷酸可經任何多種取代基修飾。
「設計」或「經設計」係指設計與所選核酸分子特異性雜交之寡聚化合物的方法。
「稀釋劑」意謂組合物中缺乏藥理學活性，但為醫藥學上必需或所需之成分。舉例而言，在注射之藥物中，稀釋劑可為液體，例如生理食鹽水溶液。
「劑量單位」意謂提供醫藥藥劑之形式，例如藥丸、錠劑或此項技術中已知之其他劑量單位。
「劑量」意謂單次投藥中或指定時段內提供之醫藥藥劑的指定量。在某些實施例中，可以兩次或兩次以上快速注射(boluse)、錠劑或注射投與劑量。舉例而言，在某些實施例中，在需要皮下投與時，所需劑量需要不易由單次注射提供之體積。在該等實施例中，可使用兩次或兩次以上注射來達成所需劑量。在某些實施例中，可以兩次或兩次以上注射投與劑量以使個體之注射部位反應減至最小。在其他實施例中，醫藥藥劑藉由經長時段或 連續輸注來投與。劑量可規定為每小時、每天、每週或每個月之醫藥藥劑量。
「給藥方案」為經設計以達成一或多種所需作用之劑量組合。
「持續時間」意謂活性或事件持續之時段。在某些實施例中，治療之持續時間為投與醫藥藥劑之劑量的時段。
「有效量」在調節活性或治療或預防病狀之上下文中意謂向需要該調節、治療或防治之個體以單次劑量或一系列劑量之一部分形式投與該有效調節該效應，或治療或防治或改善該病狀之量的活性成分。有效量視以下因素而變化：所治療個體之健康及身體狀況、所治療個體之分類學群組、組合物之調配物、醫學病況之評定及其他相關因素。
「功效」意謂產生所需作用的能力。
「表現」包括基因密碼資訊藉以轉化成細胞中存在且起作用之結構的所有功能。該等結構包括(但不限於)轉錄及轉譯之產物。
「完全互補」或「100%互補」意謂第一核酸之各核鹼基在第二核酸中皆具有互補核鹼基。在某些實施例中，第一核酸為反義化合物且目標核酸為第二核酸。
「完全修飾之基元」係指反義化合物所包含之連續核苷序列中基本上各核苷均為具有均一修飾之糖經修飾之核苷。
「間隔體(gapmer)」意謂具有複數個有利於核糖核酸 酶H裂解之核苷的內部區域位於具有一或多個核苷之外部區域之間的嵌合反義化合物，其中構成內部區域之核苷在化學上與構成外部區域之核苷不同。內部區域可稱為「間隔區」且外部區域可稱為「翼區」。
「間隔加寬」意謂反義化合物具有位於具有1至6個具有經修飾糖部分之核苷酸的5'與3'翼段之間的具有12個或超過12個連續2'-去氧核糖核苷酸之間隔段。「HBV」意謂哺乳動物B型肝炎病毒，包括人類B型肝炎病毒。該術語涵蓋B型肝炎病毒，尤其人類B型肝炎病毒之地理學基因型，以及B型肝炎病毒之地理學基因型之變異病毒株。
「HBV」意謂哺乳動物B型肝炎病毒，包括人類B型肝炎病毒。該術語涵蓋B型肝炎病毒，尤其人類B型肝炎病毒之地理學基因型，以及B型肝炎病毒之地理學基因型之變異病毒株。
「HBV抗原」意謂任何B型肝炎病毒抗原或蛋白質，包括核心蛋白，諸如「B型肝炎核心抗原」或「HBcAG」及「B型肝炎E抗原」或「HBeAG」，及包膜蛋白，諸如「HBV表面抗原」或「HBsAg」或「HBsAG」。
「B型肝炎E抗原」或「HBeAg」或「HBeAG」為分泌之非微粒形式之HBV核心蛋白。HBV抗原HBeAg與HBcAg共有主要胺基酸序列，因此在T細胞層面上展示交叉反應性。HBeAg不需要病毒組裝或複製，但研究表明其可為產生慢性感染所需。新生兒HBeAg陰性突變體感染常 引起爆發性急性而非慢性HBV感染(Terezawa等人，(1991)Pediatr.Res.29：5)，而用WHeAg陰性突變體使幼年土撥鼠感染會引起低得多之慢性WHV感染率(Cote等人，(2000)Hepatology 31：190)。HBeAg可能藉由經由缺失或純系無反應性使核心特異性T細胞不活化而充當耐受原(Milich等人，(1998)J.Immunol.160：8102)。在抗病毒療法及HBeAg血清轉化時HBV病毒負荷及抗原減少與T細胞之抑制性漸進式死亡受體-1(PD-1；亦稱為PDCD1)(活化T細胞之負向調節因子)之表現減少之間存在正相關(Evans等人，(2008)Hepatology 48：759)。
「HBV mRNA」意謂由B型肝炎病毒表現之任何信使RNA。
「HBV核酸」或「HBV DNA」意謂編碼HBV之任何核酸。舉例而言，在某些實施例中，HBV核酸包括(不限於)編碼HBV基因組或其部分的任何病毒DNA序列、自病毒DNA轉錄之任何RNA序列，包括編碼HBV蛋白質之任何mRNA序列。
「HBV蛋白」意謂由B型肝炎病毒分泌之任何蛋白質。該術語涵蓋各種HBV抗原，包括核心蛋白，諸如「肝炎E抗原」、「HBeAg」或「HBeAG」，及包膜蛋白，諸如「HBV表面抗原」、「HBsAg」或「HBsAG」。
「HBV表面抗原」或「HBsAg」或「HBsAG」為感染性HBV病毒粒子之包膜蛋白，但亦分泌為非感染性粒子，其血清含量為HBV病毒粒子之1000倍。受感染之人或動 物的HBsAg血清含量可高達1000 μg/mL(Kann及Gehrlich(1998)Topley & Wilson's Microbiology and Microbial Infections，第9版，745)。在急性HBV感染中，HBsAg在血清中之半衰期或血清t½為8.3天(Chulanov等人(2003)J.Med.Virol.69：313)。由脊髓樹突狀細胞內化HBsAg會抑制共刺激分子(亦即B7)上調且抑制T細胞刺激能力(den Brouw等人(2008)Immunology 126：280)，且慢性感染之患者的樹突狀細胞在HBsAg存在下亦展示缺乏共刺激分子表現、IL-12分泌及對T細胞之刺激(Zheng等人(2004)J.Viral Hepatitis 11：217)。CHB患者之HBsAg特異性CD8細胞展示改變之四聚體結合。此等CD8細胞並非無反應性，但可具有賦予部分耐受性或忽視性的TCR拓撲(Reignat等人，(2002)J.Exp.Med.195：1089)。此外，在Peg-IFNα2a療法期間在第24週血清HBsAg降低>1 log對於持續病毒學反應(SVR-定義為治療後1年內不可由PCR偵測到HBV DNA)具有高預測值(92%)(Moucari等人(2009)Hepatology 49：1151)。
「B型肝炎相關病狀」或「HBV相關病狀」意謂由B型肝炎感染、暴露或疾病惡化、由B型肝炎感染、暴露或疾病所引起、與其相關、與其有關或可歸因於B型肝炎感染、暴露或疾病的任何疾病、生物學病狀、醫學病狀或事件。術語B型肝炎相關病狀包括慢性HBV感染、炎症、纖維化、硬化、肝癌、血清肝炎、黃疸、肝癌、肝臟炎症、肝纖維化、肝硬化、肝臟衰竭、彌漫性肝細 胞性發炎性疾病、噬血細胞性症候群、血清肝炎、HBV病毒血症、與移植相關之肝臟疾病，以及在結合針對B型肝炎病毒、B型肝炎病毒抗原之存在的陽性測試或針對B型肝炎病毒抗原特異性抗體之存在的陽性測試時，具有可包括以下任一者或全部之症狀的病狀：流行性感冒樣疾病、虛弱、疼痛、頭痛、發繞、食欲喪失、腹瀉、噁心及嘔吐、身體肝區疼痛、黏土色或灰色糞便、全身發癢及尿色深。
「雜交」意謂互補核酸分子黏接。在某些實施例中，互補核酸分子包括(但不限於)反義化合物與核酸標靶。在某些實施例中，互補核酸分子包括(但不限於)反義寡核苷酸與核酸標靶。
「鑒別患有HBV感染之動物」意謂鑒別已診斷感染有HBV之動物；或鑒別具有包括(但不限於)以下之HBV感染之任一症狀的動物：慢性HBV感染、炎症、纖維化、硬化、肝癌、血清肝炎、黃疸、肝癌、肝臟炎症、肝纖維化、肝硬化、肝臟衰竭、彌漫性肝細胞性發炎性疾病、噬血細胞性症候群、血清肝炎、HBV病毒血症、與移植相關之肝臟疾病，以及在結合針對B型肝炎病毒、B型肝炎病毒抗原之存在的陽性測試或針對B型肝炎病毒抗原特異性抗體之存在的陽性測試時，具有可包括以下任一者或全部之症狀的病狀：流行性感冒樣疾病、虛弱、疼痛、頭痛、發繞、食欲喪失、腹瀉、噁心及嘔吐、身體肝區疼痛、黏土色或灰色糞便、全身發癢及尿色深。
「緊鄰」意謂緊鄰元件之間不存在介入元件。
「個體」意謂選用於治療或療法之人類或非人類動物。
「個體順應性」意謂個體遵循推薦或規定之療法。
例如表示兩種狀態之間的定量差異的「誘導」、「抑制」、「增強」、「升高」、「增加」、「降低」或其類似術語指兩種狀態之間至少具統計顯著性差異。舉例而言，「有效抑制HBV活性或表現之量」意謂經處理樣品中HBV活性度或表現度與未經處理之細胞中HBV活性度或表現度具統計顯著性差異。該等術語適用於例如表現度及活性度。
「抑制HBV」意謂降低HBV mRNA、DNA及/或蛋白質之含量或表現。在某些實施例中，相較於在不存在HBV反義化合物(諸如反義寡核苷酸)下HBV mRNA、DNA及/或蛋白質之表現含量，HBV在靶向HBV之反義化合物(包括靶向HBV之反義寡核苷酸)存在下得到抑制。
「抑制表現或活性」係指降低、阻斷表現或活性且未必指示完全消除表現或活性。
「注射部位反應」意謂個體之注射部位處皮膚之炎症或異常發紅。
「核苷間鍵聯」係指核苷之間的化學鍵。
「腹膜內投藥」意謂經由輸注或注射於腹膜中來投藥。
「靜脈內投藥」意謂投與至靜脈內。
「延長」之反義寡核苷酸為相對於本文所揭示之反義寡核苷酸具有一或多個額外核苷的反義寡核苷酸。
「連接之去氧核苷」意謂由磷酸酯連接形成核苷酸的經去氧核糖取代的核酸鹼基(A、G、C、T、U)。
「連接之核苷」意謂由核苷間鍵聯連接於一起之相鄰核苷。
「鎖核酸」或「LNA」或「LNA核苷」意謂在核苷糖單元之4'位與2'位之間具有連接兩個碳原子，從而形成雙環糖之橋基的核酸單體。該雙環糖之實例包括(但不限於)A)α-L-亞甲氧基(4'-CH2-O-2')LNA；(B)β-D-亞甲氧基(4'-CH2-O-2')LNA；(C)伸乙氧基(4'-(CH2)2-O-2')LNA；(D)胺氧基(4'-CH2-O-N(R)-2')LNA；及(E)氧胺基(4'-CH2-N(R)-O-2')LNA，如下文所描繪。
如本文所用之LNA化合物包括(但不限於)在糖之4'位與2'位之間具有至少一個橋基的化合物，其中各橋基獨立地包含1個或2至4個獨立地選自以下之鍵聯基團：-[C(R1)(R2)]n-、-C(R1)=C(R2)-、-C(R1)=N-、-C(=NR1)-、-C(=O)-、-C(=S)-、-O-、-Si(R1)2-、-S(=O)x-及-N(R1)-；其中：x為0、1或2；n為1、2、3或4；各R1及R2獨立地為H、保護基、羥基、C1-C12烷基、經取代之C1-C12烷基、C2-C12烯基、經取代之C2-C12烯基、C2-C12炔基、經取代之C2-C12炔基、C5-C20芳基、經取代之C5-C20芳基、雜環基、經取代之雜環基、雜芳基、經取代之雜芳基、 C5-C7脂環基、經取代之C5-C7脂環基、鹵素、OJ1、NJ1J2、SJ1、N3、COOJ1、醯基(C(=O)-H)、經取代之醯基、CN、磺醯基(S(=O)2-J1)或亞磺醯基(S(=O)-J1)；且各J1及J2獨立地為H、C1-C12烷基、經取代之C1-C12烷基、C2-C12烯基、經取代之C2-C12烯基、C2-C12炔基、經取代之C2-C12炔基、C5-C20芳基、經取代之C5-C20芳基、醯基(C(=O)-H)、經取代之醯基、雜環基、經取代之雜環基、C1-C12胺基烷基、經取代之C1-C12胺基烷基或保護基。
LNA之定義內所涵蓋之4'-2'橋連基團之實例包括(但不限於)下式中之一者：-[C(R1)(R2)]n-、-[C(R1)(R2)]n-O-、-C(R1R2)-N(R1)-O-或-C(R1R2)-O-N(R1)-。此外，LNA定義中所涵蓋之其他橋連基團為4'-CH2-2'、4'-(CH2)2-2'、4'-(CH2)3-2'、4'-CH2-O-2'、4'-(CH2)2-O-2'、4'-CH2-O-N(R1)-2'及4'-CH2-N(R1)-O-2'-橋，其中各R1及R2獨立地為H、保護基或C1-C12烷基。
本發明之LNA之定義內亦包括如下LNA，其中核糖基糖環之2'-羥基連接至糖環之4'碳原子，從而形成亞甲氧基(4'-CH2-O-2')橋而形成雙環糖部分。橋基亦可為連接2'氧原子與4'碳原子之亞甲基(-CH2-)，對於其使用術語亞甲氧基(4'-CH2-O-2')LNA。此外，在於此位置上具有伸乙基橋連基團的雙環糖部分的狀況下，使用術語伸乙氧基(4'-CH2CH2-O-2')LNA。在如本文所用之LNA之定義內亦涵蓋α-L-亞甲氧基(4'-CH2-O-2')，其為亞甲氧基(4'-CH2-O-2')LNA之異構體。
「失配」或「非互補核鹼基」係指第一核酸之核鹼基不能與第二或目標核酸之相應核鹼基配對的狀況。「失配」或「非互補核鹼基」係指第一核酸之核鹼基不能與第二或目標核酸之相應核鹼基配對的狀況。
「經修飾之核苷間鍵聯」係指與天然存在之核苷間鍵(亦即磷酸二酯核苷間鍵)相比存在取代或任何變化。
「經修飾之核鹼基」意謂任何除腺嘌呤、胞嘧啶、鳥嘌呤、胸苷或尿嘧啶以外的核鹼基。「未經修飾之核鹼基」意謂嘌呤鹼基腺嘌呤(A)及鳥嘌呤(G)，以及嘧啶鹼基胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)及尿嘧啶(U)。
「經修飾之核苷」意謂獨立地具有經修飾之糖部分及/或經修飾之核鹼基的核苷。
「經修飾之核苷酸」意謂獨立地具有經修飾之糖部分、經修飾之核苷間鍵聯或經修飾之核鹼基的核苷酸。
「經修飾之寡核苷酸」意謂包含至少一個經修飾之核苷間鍵聯、經修飾之糖及/或經修飾之核鹼基的寡核苷酸。
「經修飾之糖」意謂與天然糖部分相比存在取代及/或任何變化。
「單體」係指寡聚物之單個單元。單體包括(但不限於)天然存在或經修飾之核苷及核苷酸。
「基元」意謂反義化合物中未經修飾及經修飾核苷之型態。
「天然糖部分」意謂DNA(2'-H)或RNA(2'-OH)中存在之 糖部分。
「天然存在之核苷間鍵聯」意謂3'至5'磷酸二酯鍵聯。
「非互補核鹼基」係指一對彼此不形成氫鍵或以其他方式有利於雜交的核鹼基。
「核酸」係指由單體核苷酸構成的分子。核酸包括(但不限於)核糖核酸(RNA)、去氧核糖核酸(DNA)、單股核酸、雙股核酸、小干擾核糖核酸(siRNA)及微小RNA(miRNA)。
「核鹼基」意謂能夠與另一核酸之鹼基配對的雜環部分。
「核鹼基互補性」係指核鹼基能夠與另一核鹼基進行鹼基配對。舉例而言，在DNA中，腺嘌呤(A)與胸腺嘧啶(T)互補。舉例而言，在RNA中，腺嘌呤(A)與尿嘧啶(U)互補。在某些實施例中，互補核鹼基係指反義化合物中能夠與其目標核酸之核鹼基進行鹼基配對的核鹼基。舉例而言，若反義化合物之某一位置上之核鹼基能夠與目標核酸之某一位置上之核鹼基進行氫鍵鍵結，則在該核鹼基對處寡核苷酸與目標核酸之間的氫鍵鍵結位置視作具互補性。
「核鹼基序列」意謂連續核鹼基之次序，而與任何糖、鍵聯及/或核鹼基修飾無關。
「核苷」意謂核鹼基連接至糖。
「核苷模擬物」包括用於在寡聚化合物之一或多個位置上置換糖或糖及鹼基且未必替換鍵聯的彼等結構，諸 如具有N-嗎啉基、環己烯基、環己基、四氫哌喃基、雙環或三環糖模擬物，例如非呋喃醣糖單元的核苷模擬物。核苷酸模擬物包括用於在寡聚化合物之一或多個位置上置換核苷及鍵聯的彼等結構，諸如肽核酸或N-嗎啉基(由-N(H)-C(=O)-O-或其他非磷酸二酯鍵聯連接的N-嗎啉基)。糖替代物與略微較廣泛之術語核苷模擬物相一致，但僅意欲指示置換糖單元(呋喃醣環)。本文提供之四氫哌喃基環說明糖替代物之實例，其中呋喃醣糖基已經四氫哌喃基環系統置換。「模擬物」係指替代糖、核鹼基及/或核苷間鍵聯的基團。一般而言，使用模擬物替代糖或糖-核苷間鍵聯組合，且維持核鹼基可與所選標靶雜交。
「核苷酸」意謂具有共價連接至核苷之糖部分之磷酸酯基的核苷。
「脫靶效應」係指與調節除預定目標核酸以外之基因之RNA或蛋白表現有關的不必要或有害之生物效應。
「寡聚化合物」意謂具有連接之單體次單元且能夠與核酸分子之至少一個區域雜交的聚合物。
「寡核苷」意謂核苷間鍵聯不含磷原子的寡核苷酸。
「寡核苷酸」意謂具有各自可彼此獨立地經修飾或未經修飾之連接之核苷的聚合物。
「非經腸投藥」意謂經由注射(例如快速注射)或輸注投藥。非經腸投藥包括皮下投藥、靜脈內投藥、肌肉內投藥、動脈內投藥、腹膜內投藥或顱內投藥，例如鞘內或 腦室內投藥。
「肽」意謂由至少兩個胺基酸由醯胺鍵連接而形成的分子。在無限制的情況下，如本文所用之「肽」係指多肽及蛋白質。
「醫藥學上可接受之載劑」意謂不干擾寡核苷酸結構的介質或稀釋劑。某些該等載劑使得醫藥組合物能夠調配成例如由個體經口攝取之錠劑、藥丸、糖衣藥丸、膠囊、液體、凝膠劑、糖漿、漿料、懸浮液及口含錠。
「醫藥學上可接受之衍生物」涵蓋本文所述之化合物的醫藥學上可接受之鹽、結合物、前藥或異構體。
「醫藥學上可接受之鹽」意謂反義化合物之生理學上及醫藥學上可接受之鹽，亦即保持母體寡核苷酸之所需生物活性且不賦予其不合需要之毒理學作用的鹽。
「醫藥藥劑」意謂在投與個體時可提供治療效益之物質。舉例而言，在某些實施例中，靶向HBV之反義寡核苷酸為醫藥藥劑。
「醫藥組合物」意謂適於投與個體之物質混合物。舉例而言，醫藥組合物可包含反義寡核苷酸及無菌水溶液。在某些實施例中，醫藥組合物在對某些細胞株之游離吸收分析中展示活性。
「硫代磷酸酯鍵聯」意謂核苷之間的鍵聯，其中磷酸二酯鍵係藉由一個非橋連氧原子經硫原子置換而修飾。硫代磷酸酯鍵聯為經修飾之核苷間鍵聯。
「部分」意謂核酸中確定數目之連續(亦即連接)核鹼 基。在某些實施例中，部分為目標核酸中確定數目之連續核鹼基。在某些實施例中，部分為反義化合物中確定數目之連續核鹼基。
「預防(Prevention)」或「預防(preventing)」係指延遲或預先阻止病狀或疾病發作或產生達數小時至數天，較佳數週至數月之時段。
「前藥」意謂以非活性形式製備且在身體或其細胞內在內源酶或其他化學物質及/或條件作用下轉化成活性形式(亦即藥物)的治療劑。
「防治有效量」係指醫藥藥劑向動物提供防治或預防效益之量。
「推薦之療法」意謂由醫學專業人員推薦用於治療、改善或預防疾病之治療方案。
「區」定義為目標核酸中具有至少一個可鑒別結構、功能或特徵的部分。
「核糖核苷酸」意謂在核苷酸之糖部分之2'位上具有羥基的核苷酸。核糖核苷酸可經任何多種取代基修飾。
「鹽」意謂反義化合物之生理學上及醫藥學上可接受之鹽，亦即保持母體寡核苷酸之所需生物活性且不賦予其不合需要之毒理學作用的鹽。
「區段」定義為目標核酸內區之較小部分或子部分。
「血清轉化」係定義為在監測HBeAg作為血清轉化之決定子的情況下血清HBeAg不存在而存在血清HBeAb，或定義為在監測HBsAg作為血清轉化之決定子的情況下 血清HBsAg不存在，如由市售ELISA系統之當前可達之偵測極限所決定。
本文所教示之反義寡核苷酸的「縮短」或「截短」型式有一個、兩個或兩個以上核苷缺失。
「副作用」意謂除所需作用以外的可歸因於治療之生理反應。在某些實施例中，副作用包括(不限於)注射部位反應、肝功能測試異常、腎功能異常、肝中毒、腎中毒、中樞神經系統異常及肌病。舉例而言，血清中之轉胺酶含量升高可指示肝中毒或肝功能異常。舉例而言，膽紅素增加可指示肝中毒或肝功能異常。
如本文所用之「位點」定義為目標核酸內之獨特核鹼基位置。
「減緩進展」意謂減少該疾病發展。
「可特異性雜交」係指反義化合物在反義寡核苷酸與目標核酸之間具有足夠之互補度以在需要特異性結合的條件下，亦即在活體內分析及治療性處理的狀況下於生理條件下誘導所需作用，而對非目標核酸展現極小之影響或無影響。「抑制素」意謂抑制HMG-CoA還原酶活性之藥劑。
「嚴格雜交條件」或「嚴格條件」係指寡聚化合物與其目標序列雜交，但與極少數目之其他序列雜交的條件。
「皮下投藥」意謂僅投與於皮膚下方。。
「個體」意謂選用於治療或療法之人類或非人類動物。
「標靶」係指需要調節之蛋白質。
「目標基因」係指編碼標靶之基因。
「靶向」意謂設計及選擇將與目標核酸特異性雜交且誘導所需作用之反義化合物的方法。
「目標核酸」、「目標RNA」、「目標RNA轉錄物」及「核酸標靶」皆意謂能夠由反義化合物靶向之核酸。
「目標區」意謂目標核酸中由一或多種反義化合物所靶向之部分。
「目標段」意謂目標核酸中由反義化合物所靶向之核苷酸序列。「5'目標位點」係指目標段之5'最末端核苷酸。「3'目標位點」係指目標段之3'最末端核苷酸。
「治療有效量」意謂醫藥藥劑向個體提供治療效益之量。
「治療」係指投與本文所述之組合物以改變或改善疾病或病狀。
「未經修飾」之核鹼基意謂嘌呤鹼基腺嘌呤(A)及鳥嘌呤(G)，以及嘧啶鹼基胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)及尿嘧啶(U)。
「未經修飾之核苷酸」意謂由天然存在之核鹼基、糖部分及核苷間鍵聯構成的核苷酸。在某些實施例中，未經修飾之核苷酸為RNA核苷酸(亦即β-D-核糖核苷)或DNA核苷酸(亦即β-D-去氧核糖核苷)。
「確定之目標段」定義為目標區中由活性寡聚化合物所靶向之具有至少8個核鹼基之部分(亦即8個連續核鹼基)。
「翼段」意謂複數個經修飾以賦予寡核苷酸以諸如抑制活性增強、對目標核酸之結合親和力增強或對由活體內核酸酶引起之降解具抗性之特性的核苷。
某些實施例
在某些實施例中，本文提供之化合物為或包含經修飾之寡核苷酸。在某些實施例中，該等化合物包含如本文所述之經修飾之寡核苷酸及結合物。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸為醫藥學上可接受之衍生物。
在某些實施例中，化合物或組合物包含長度為10至30個連接之核苷且靶向HBV之經修飾寡核苷酸。HBV標靶可具有SEQ ID NO：1中所述之序列或其部分或其變異體。在某些實施例中，該等化合物或經修飾之寡核苷酸靶向HBV之以下核苷酸區中之一者：CCTGCTGGTGGCTCCAGTTC(SEQ ID NO：2)；AGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGG(SE Q ID NO：3)；TGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCAT(SEQ ID NO：4)；CATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTT(SEQ ID NO：5)；CAAGGTATGTTGCCCGT(SEQ ID NO：6)；TGTATTCCCATCCCATC(SEQ ID NO：7)；CCTATGGGAGTGGGCCTCAG(SEQ ID NO：8)；TGGCTCAGTTTACTAGTGC(SEQ ID NO：9)；GGGCTTTCCCCCACTGT(SEQ ID NO：10)；TCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACTCCT(SEQ ID NO：11)；CGCACCTCTCTTTACGCGG(SEQ ID NO：12)； GGAGTGTGGATTCGCAC(SEQ ID NO：13)；或GAAGAAGAACTCCCTCGCCT(SEQ ID NO：14)。在某些實施例中，該等化合物或寡核苷酸具有含10個或超過10個連接之去氧核苷的間隔段。在某些實施例中，該間隔段處於兩個獨立地具有1-5個、1-4個、1-3個、2-5個、2-4個或2-3個連接之經修飾核苷的翼段之間。在某些實施例中，翼段中之一或多個經修飾核苷具有經修飾之糖。在某些實施例中，經修飾之糖為雙環糖。在某些實施例中，經修飾之核苷為LNA核苷。
在某些實施例中，該等化合物或組合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸由10至30個核苷組成且具有包含至少8個與SEQ ID NO：1-14之等長部分互補之連續核鹼基的核鹼基序列。
在某些實施例中，化合物或組合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸由10至30個連接之核苷組成且具有包含至少8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個或30個與SEQ ID NO：1-14之等長部分互補之連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，該等寡核苷酸具有含10個或超過10個連接之去氧核苷的間隔段。在某些實施例中，該間隔段處於兩個獨立地具有1-5個、1-4個、1-3個、2-5個、2-4個或2-3個連接之經修飾核苷的翼段之間。在某些實施例中，翼段中之一或多 個經修飾核苷具有經修飾之糖。在某些實施例中，經修飾之糖為雙環糖。在某些實施例中，經修飾之核苷為LNA核苷。
在某些實施例中，化合物或組合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸由10至30個連接之核苷組成且具有包含SEQ ID NO：18-35中任一者之至少8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個或20個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，該等寡核苷酸具有含10個或超過10個連接之去氧核苷的間隔段。在某些實施例中，該間隔段處於兩個獨立地具有1-5個、1-4個、1-3個、2-5個、2-4個或2-3個連接之經修飾核苷的翼段之間。在某些實施例中，翼段中之一或多個經修飾核苷具有經修飾之糖。在某些實施例中，經修飾之糖為雙環糖。在某些實施例中，經修飾之核苷為LNA核苷。
在某些實施例中，本發明之化合物或組合物可由10至30個連接之核苷組成且具有包含SEQ ID NO：18-35中任一者之至少8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個或20個連續核鹼基的核鹼基序列。
在某些實施例中，化合物或組合物包含經修飾寡核苷酸之鹽。
在某些實施例中，化合物或組合物進一步包含醫藥學上可接受之載劑或稀釋劑。
在某些實施例中，經修飾寡核苷酸之核鹼基序列與SEQ ID NO：1-14中之任一者至少70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%互補，如在經修飾之寡核苷酸整體範圍內所量測。
在某些實施例中，化合物或經修飾之寡核苷酸為單股化合物或經修飾寡核苷酸。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸由8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個或30個連接之核苷組成。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸由20個連接之核苷組成。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸由18個連接之核苷組成。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸由17個連接之核苷組成。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸由16個連接之核苷組成。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸由14個連接之核苷組成。
在某些實施例中，經修飾寡核苷酸之至少一個核苷間鍵聯為經修飾之核苷間鍵聯。在某些實施例中，各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯。
在某些實施例中，經修飾寡核苷酸之至少一個核苷包含經修飾之糖。
在某些實施例中，至少一個經修飾之糖為雙環糖。在某些實施例中，至少一個經修飾之糖為雙環糖，其包含4'-(CH2)n-O-2'橋，其中n為1或2。在某些實施例中，雙 環糖包含4'-CH2-O-2'橋。
在某些實施例中，該經修飾寡核苷酸之至少一個核苷包含經修飾之核鹼基。在某些實施例中，經修飾之核鹼基為5-甲基胞嘧啶。
在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸由單股經修飾寡核苷酸組成。
在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸包含：a)由連接之去氧核苷組成的間隔段；b)由連接之核苷組成的5'翼段；及c)由連接之核苷組成的3'翼段。間隔段位於5'翼段與3'翼段之間且各翼段之各核苷包含經修飾之糖。
在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸由16個連接之核苷組成，間隔段由10個連接之去氧核苷組成，5'翼段由3個連接之核苷組成，3'翼段由3個連接之核苷組成，各翼段之各核苷包含鎖核酸(LNA)，各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯且各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。
在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸由14個連接之核苷組成，間隔段由10個連接之去氧核苷組成，5'翼段由2個連接之核苷組成，3'翼段由2個連接之核苷組成，各翼段之各核苷包含鎖核酸(LNA)，各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯且各胞嘧啶為5-甲基胞嘧啶。
在某些實施例中，該等化合物或組合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸由16個連接之核苷組成且具有包含至少8個與SEQ ID NO：2-14中任一者之等長部分互補之連續核鹼基的核鹼基序列，其中該經修飾寡 核苷酸包含：a)由10個連接之去氧核苷組成的間隔段；b)由3個連接之核苷組成的5'翼段；及c)由3個連接之核苷組成的3'翼段。間隔段位於5'翼段與3'翼段之間，各翼段之各核苷包含鎖核酸(LNA)，各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。
在某些實施例中，該等化合物或組合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸由14個連接之核苷組成且具有包含至少8個與SEQ ID NO：2-14中任一者之等長部分互補之連續核鹼基的核鹼基序列，其中該經修飾寡核苷酸包含：a)由10個連接之去氧核苷組成的間隔段；b)由2個連接之核苷組成的5'翼段；及c)由2個連接之核苷組成的3'翼段。間隔段位於5'翼段與3'翼段之間，各翼段之各核苷包含鎖核酸(LNA)，各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯且各胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。
某些實施例提供抑制HBV表現之方法、化合物及組合物。在某些實施例中，所提供之方法、化合物及組合物抑制HBV mRNA表現及/或DNA含量及/或蛋白含量及/或抗原含量。
另一實施例提供治療哺乳動物之HBV相關疾病、病症及病狀的方法，該方法包括投與有需要之哺乳動物治療有效量之如上所述之任何醫藥組合物，以治療HBV相關疾病、病症及病狀。在相關實施例中，哺乳動物為人類且HBV相關疾病、病症及病狀為由人類B型肝炎病毒所致之B型肝炎病毒感染。更特定而言，人類B型肝炎病 毒可為任何人類地理學基因型：A型(西北歐(Northwest Europe)、北美洲(North America)、中美洲(Central America))；B型(印度尼西亞(Indonesia)、中國(China)、越南(Vietnam))；C型(東亞(East Asia)、韓國(Korea)、中國、日本(Japan)、波利尼西亞(Polynesia)、越南)；D型(地中海區(Mediterranean area)、中東(Middle East)、印度(India))；E型(非洲(Africa))；F型(美洲土著人(Native American)、波利尼西亞)；G型(美國(United States)、法國(France))；或H型(中美洲)。
在某些實施例中，靶向HBV核酸之反義化合物或寡核苷酸靶向SEQ ID NO：1之以下核苷酸區：258-274、258-273、259-272、260-273、414-429、414-432、414-430、415-30、417-432、415-432、415-428、416-429、416-426、418-431、602-617、603-616、639-654、639-658、639-655、640-658、640-653、640-655、641-654、643-658及644-657。在某些實施例中，該等寡核苷酸具有含10個或超過10個連接之去氧核苷的間隔段。在某些實施例中，該間隔段處於兩個獨立地具有1-5個、1-4個、1-3個、2-5個、2-4個或2-3個連接之經修飾核苷的翼段之間。在某些實施例中，翼段中之一或多個經修飾核苷具有經修飾之糖。在某些實施例中，經修飾之糖為雙環糖。在某些實施例中，經修飾之核苷為LNA核苷。
在某些實施例中，反義化合物或寡核苷酸靶向HBV核酸之區。在某些實施例中，該等靶向HBV核酸之區的化 合物或寡核苷酸具有與該區之等長核鹼基部分互補的連續核鹼基部分。舉例而言，該部分可為具有至少8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個或20個連續核鹼基且與本文所述之區之等長部分互補的部分。在某些實施例中，該等化合物或寡核苷酸靶向SEQ ID NO：1之以下核苷酸區：CCTGCTGGTGGCTCCAGTTC(SEQ ID NO：2)；AGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGG(SEQ ID NO：3)；TGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCAT(SEQ ID NO：4)；CATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTT(SEQ ID NO：5)；CAAGGTATGTTGCCCGT(SEQ ID NO：6)；TGTATTCCCATCCCATC(SEQ ID NO：7)；CCTATGGGAGTGGGCCTCAG(SEQ ID NO：8)；TGGCTCAGTTTACTAGTGC(SEQ ID NO：9)；GGGCTTTCCCCCACTGT(SEQ ID NO：10)；TCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACTCCT(SEQ ID NO：11)；CGCACCTCTCTTTACGCGG(SEQ ID NO：12)；GGAGTGTGGATTCGCAC(SEQ ID NO：13)；或GAAGAAGAACTCCCTCGCCT(SEQ ID NO：14)。在某些實施例中，該等寡核苷酸具有含10個或超過10個連接之去氧核苷的間隔段。在某些實施例中，該間隔段處於兩個獨立地具有1-5個、1-4個、1-3個、2-5個、2-4個或2-3個連接之經修飾核苷的翼段之間。在某些實施例中，翼段中之一或多個經修飾核苷具有經修飾之糖。在某些實 施例中，經修飾之糖為雙環糖。在某些實施例中，經修飾之核苷為LNA核苷。
在某些實施例中，如本文所述之化合物在向HepG2.2.15細胞傳遞時因具有如下至少一種活體外IC50而有效：低於20 μM、低於15 μM、低於10 μM、低於6 μM、低於5 μM、低於4 μM、低於3 μM、低於2 μM、低於1.9 μM、低於1.8 μM、低於1.75 μM之活體外IC50。
在某些實施例中，用引子探針組RTS3370量測抑制作用，其中該等化合物在向HepAD38細胞傳遞時因具有如下至少一種活體外IC50而有效：低於20 μM、低於15 μM、低於10 μM、低於6 μM、低於5 μM、低於4 μM、低於3 μM、低於2 μM、低於1.9 μM、低於1.8 μM、低於1.75 μM之活體外IC50。
在某些實施例中，如本文所述之化合物在如本文所述向HepAD38細胞傳遞且用引子探針組RTS3372量測時因具有如下至少一種活體外IC50而有效：低於20 μM、低於15 μM、低於10 μM、低於6 μM、低於5 μM、低於4 μM、低於3 μM、低於2 μM、低於1.9 μM、低於1.8 μM、低於1.7 μM、低於1.6 μM、低於1.5 μM、低於1.4 μM、低於1.3 μM、低於1.25 μM之活體外IC50。
在某些實施例中，如本文所述之化合物在如本文所述向HepAD38細胞傳遞且用引子探針組RTS3373MGB量測時因具有如下至少一種活體外IC50而有效：低於20 μM、低於15 μM、低於10 μM、低於6 μM、低於5 μM、低於 4 μM、低於3 μM、低於2.9 μM之活體外IC50。
在某些實施例中，該等化合物包括包含SEQ ID NO：18-35中任一者之核鹼基序列的化合物。
在某些實施例中，SEQ ID NO：1之以下核苷酸區由在如本文所述向HepG2.2.15細胞傳遞且用引子探針組RTS3370量測時具有低於20 μM之活體外IC50的反義化合物或寡核苷酸靶向：258-273、414-429、417-432、602-617、639-655、643-658。
在某些實施例中，SEQ ID NO：1之以下核苷酸區由在如本文所述向HepG2.2.15細胞傳遞且用引子探針組RTS3370量測時具有低於10 μM之活體外IC50的反義化合物或寡核苷酸靶向：258-274、414-429、415-432、418-431、602-616、640-655及643-658。
在某些實施例中，SEQ ID NO：1之以下核苷酸區由在如本文所述向HepG2.2.15細胞傳遞且用引子探針組RTS3370量測時具有低於5 μM之活體外IC50的反義化合物或寡核苷酸靶向：258-274、414-429、415-432及602-617。
在某些實施例中，SEQ ID NO：1之以下核苷酸區由在如本文所述向HepAD38細胞傳遞且用引子探針組RTS3372量測時具有低於20 μM之活體外IC50的反義化合物或寡核苷酸靶向：258-274、414-430、417-432、602-617、639-655及643-658。
在某些實施例中，SEQ ID NO：1之以下核苷酸區由在如 本文所述向HepAD38細胞傳遞且用引子探針組RTS3372量測時具有低於10 μM之活體外IC50的反義化合物或寡核苷酸靶向：258-274、414-429、415-429、417-432、602-617、639-655及643-658。
在某些實施例中，SEQ ID NO：1之以下核苷酸區由在如本文所述向HepAD38細胞傳遞且用引子探針組RTS3372量測時具有低於5 μM之活體外IC50的反義化合物或寡核苷酸靶向：414-429、417-432、602-617及643-658。
在某些實施例中，SEQ ID NO：1之以下核苷酸區由在如本文所述向HepAD38細胞傳遞且用引子探針組RTS3373MGB量測時具有低於20 μM之活體外IC50的反義化合物或寡核苷酸靶向：258-274、260-273、414-430、417-432、602-617、639-654及643-658。
在某些實施例中，SEQ ID NO：1之以下核苷酸區由在如本文所述向HepAD38細胞傳遞且用引子探針組RTS3373MGB量測時具有低於10 μM之活體外IC50的反義化合物或寡核苷酸靶向：259-274、260-273、414-429、415-432、602-617及643-658。
在某些實施例中，SEQ ID NO：1之以下核苷酸區由在如本文所述向HepAD38細胞傳遞且用引子探針組RTS3373MGB量測時具有低於5 μM之活體外IC50的反義化合物或寡核苷酸靶向：415-428、417-432及602-617。
某些實施例提供治療動物之HBV相關疾病、病症或病狀的方法，其包括投與有需要之動物本文所述之化合物 或組合物。在某些實施例中，該化合物或組合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸由10至30個連接之核苷組成且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：18-35中任一者之至少10個連續核鹼基的核鹼基序列。
某些實施例提供減少動物之HBV表現的方法，其包括投與該動物本文所述之化合物或組合物。在某些實施例中，該化合物或組合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸的長度為10至30個連接之核苷且靶向HBV並具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：18-35中任一者之至少10個連續核鹼基的核鹼基序列。
某些實施例提供預防、改善或治療動物之HBV相關疾病、病症或病狀的方法，其包括投與該動物本文所述之化合物或組合物。在某些實施例中，該化合物或組合物包含長度為10至30個連接之核苷且靶向HBV之經修飾寡核苷酸。在某些實施例中，經修飾之寡核苷酸具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：18-35中任一者之至少10個連續核鹼基的核鹼基序列。HBV相關疾病、病症或病狀之實例包括(但不限於)慢性HBV感染、黃疸、肝癌、肝臟炎症、肝纖維化、肝硬化、肝臟衰竭、彌漫性肝細胞性發炎性疾病、噬血細胞性症候群、血清肝炎、HBV病毒血症，以及在結合針對B型肝炎病毒、B型肝炎病毒抗原之存在的陽性測試或針對B型肝炎病毒抗原特異性抗體之存在的陽性測試時，具有可包括以下任一者或全部之症狀的病狀：流行性感冒樣疾病、虛弱、疼痛、頭痛、 發燒、食欲喪失、腹瀉、噁心及嘔吐、身體肝區疼痛、黏土色或灰色糞便、全身發癢及尿色深。
某些實施例提供減少動物之HBV mRNA表現的方法，其包括投與該動物本文所述之化合物或組合物。在某些實施例中，該化合物或組合物包含長度為10至30個連接之核苷且靶向HBV之經修飾寡核苷酸。在某些實施例中，減少動物之HBV mRNA表現可預防、改善或治療HBV相關疾病、病症或病狀。在某些實施例中，減少動物之HBV mRNA表現可預防、改善或治療肝臟疾病。在某些實施例中，HBV mRNA表現減少至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些實施例提供降低動物之HBV DNA含量的方法，其包括投與該動物本文所述之化合物或組合物。在某些實施例中，該化合物或組合物包含長度為10至30個連接之核苷且靶向HBV之經修飾寡核苷酸。在某些實施例中，降低動物之HBV DNA含量可預防、改善或治療HBV相關疾病、病症或病狀。在某些實施例中，哺乳動物可為人類，且B型肝炎病毒可為人類B型肝炎病毒。更特定而言，人類B型肝炎病毒可為任何人類地理學基因型：A型(西北歐、北美洲、中美洲)；B型(印度尼西亞、中國、越南)；C型(東亞、韓國、中國、日本、波利尼西亞、越南)；D型(地中海區、中東、印度)；E型(非洲)；F型(美洲土著人、波利尼西亞)；G型(美國、法國)；或 H型(中美洲)。在某些實施例中，降低動物之HBV DNA含量可預防、改善或治療肝臟疾病。在某些實施例中，HBV DNA含量降低至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些實施例提供降低動物之HBV蛋白含量的方法，其包括投與該動物本文所述之化合物或組合物。在某些實施例中，該化合物或組合物包含長度為10至30個連接之核苷且靶向HBV之經修飾寡核苷酸。在某些實施例中，降低動物之HBV蛋白含量可預防、改善或治療HBV相關疾病、病症或病狀。在某些實施例中，降低動物之HBV蛋白含量可預防、改善或治療肝臟疾病。在某些實施例中，HBV蛋白含量降低至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些實施例提供降低動物之HBV抗原含量的方法，其包括投與該動物本文所述之化合物或組合物。在某些實施例中，該化合物或組合物包含長度為10至30個連接之核苷且靶向HBV之經修飾寡核苷酸。在某些實施例中，抗原為HBsAG或HBeAG。在某些實施例中，降低動物之HBV抗原含量可預防、改善或治療HBV相關疾病、病症或病狀。在某些實施例中，降低動物之HBV抗原含量可預防、改善或治療肝臟疾病。在某些實施例中，HBV抗原含量降低至少5%、10%、20%、30%、35%、40%、 45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%。
某些實施例提供減少感染B型肝炎病毒之動物之HBV DNA及HBV抗原的方法，其包括投與該動物本文所述之化合物或組合物。在某些實施例中，該化合物或組合物包含長度為10至30個連接之核苷且靶向HBV之經修飾寡核苷酸。在某些實施例中，抗原為HBsAG或HBeAG。在某些實施例中，HBV抗原之量可充分降低以引起血清轉化，該血清轉化係定義為在監測HBeAg作為血清轉化之決定子的情況下血清HBeAg不存在而存在血清HBeAb，或定義為在監測HBsAg作為血清轉化之決定子的情況下血清HBsAg不存在，如由市售ELISA系統之當前可達之偵測極限所決定。
某些實施例提供治療患有HBV相關疾病、病症或病狀之動物的方法，其包括：a)鑒別該患有HBV相關疾病、病症或病狀之動物，及b)投與該動物治療有效量之包含經修飾之寡核苷酸的化合物，該經修飾之寡核苷酸由16至20個連接之核苷組成且具有如在該經修飾寡核苷酸整體範圍內所量測與SEQ ID NO：1、1273、1274、1275、1276、1277、1278、1279、1280、1281、1282、1283、1284、1285或1286中之任一者至少90%互補的核鹼基序列。在某些實施例中，投與該動物治療有效量之該化合物可治療或減輕該動物之HBV相關疾病、病症或病狀或其症狀。在某些實施例中，HBV相關疾病、病症或病 狀為肝臟疾病。在某些實施例中，相關疾病、病症或病狀為慢性HBV感染、黃疸、肝癌、肝臟炎症、肝纖維化、肝硬化、肝臟衰竭、彌漫性肝細胞性發炎性疾病、噬血細胞性症候群、血清肝炎、HBV病毒血症，或與移植相關之肝臟疾病。
在某些實施例中，HBV具有如GenBank寄存編號U95551.1中所述之序列(以SEQ ID NO：1形式併入本文中)或其任何變異體或片段。在某些實施例中，HBV具有如SEQ ID NO：1-14中所述之人類序列之截短部分。
在某些實施例中，動物為人類。
在某些實施例中，該等化合物或組合物指定為第一藥劑。在某些實施例中，該等方法包括投與第一藥劑及一或多種第二藥劑。在某些實施例中，該等方法包括投與第一藥劑及一或多種第二藥劑。在某些實施例中，共同投與第一藥劑與一或多種第二藥劑。在某些實施例中，依序或並行共同投與第一藥劑與一或多種第二藥劑。
在某些實施例中，一或多種第二藥劑亦為本文所述之化合物或組合物。在某些實施例中，一或多種第二藥劑不同於本文所述之化合物或組合物。一或多種第二藥劑之實例包括(但不限於)消炎劑、化學治療劑或抗感染劑。
在其他相關實施例中，其他治療劑可為HBV藥劑、HCV藥劑、化學治療劑、抗生素、鎮痛劑、非類固醇消炎劑(NSAID)、抗真菌劑、抗寄生物劑、止嘔劑、止瀉劑或免疫抑制劑。
在某些實施例中，一或多種第二藥劑為HBV藥劑。在某些實施例中，HBV藥劑可包括(但不限於)干擾素α-2b、干擾素α-2a及干擾素αcon-1(聚乙二醇化及非聚乙二醇化)、病毒唑(ribavirin)；HBV RNA複製抑制劑；第二反義寡聚物；HBV治療性疫苗；HBV防治性疫苗；拉米夫定(3TC)；恩替卡韋(ETV)；反丁烯二酸泰諾福韋酯(tenofovir diisoproxil fumarate，TDF)；替比夫定(LdT)；阿德福韋；或HBV抗體療法(單株或多株)。在某些實施例中，第二藥劑為HBV藥劑。在某些實施例中，HBV藥劑可包括(但不限於)干擾素α-2b、干擾素α-2a及干擾素αcon-1(聚乙二醇化及非聚乙二醇化)、病毒唑；HBV RNA複製抑制劑；第二反義寡聚物；HBV治療性疫苗；HBV防治性疫苗；拉米夫定(3TC)；恩替卡韋(ETV)；反丁烯二酸泰諾福韋酯(TDF)；替比夫定(LdT)；阿德福韋；或HBV抗體療法(單株或多株)。
在某些實施例中，第二藥劑為HCV藥劑。在某些實施例中，HBV藥劑可包括(但不限於)干擾素α-2b、干擾素α-2a及干擾素αcon-1(聚乙二醇化及非聚乙二醇化)；病毒唑；HCV RNA複製抑制劑(例如ViroPharma之VP50406系列)；HCV反義劑；HCV治療性疫苗；HCV蛋白酶抑制劑；HCV解螺旋酶抑制劑；或HCV單株或多株抗體療法。
在某些實施例中，第二藥劑為消炎劑(亦即炎症減弱療法)。在某些實施例中，炎症減弱療法可包括(但不限於)治療性生活方式改變、類固醇、NSAID或DMARD。類固 醇可為皮質類固醇。NSAID可為阿司匹靈(aspirin)、乙醯胺苯酚(acetaminophen)、布洛芬(ibuprofen)、萘普生(naproxen)、COX抑制劑、吲哚美辛(indomethacin)及其類似物。DMARD可為TNF抑制劑、嘌呤合成抑制劑、鈣調神經磷酸酶抑制劑、嘧啶合成抑制劑、柳氮磺胺吡啶(sulfasalazine)、甲胺喋呤(methotrexate)及其類似物。
在某些實施例中，第二藥劑為化學治療劑(亦即癌症治療劑)。化學治療劑可包括(但不限於)柔紅黴素(daunorubicin)、道諾黴素(daunomycin)、更生黴素(dactinomycin)、小紅莓(doxorubicin)、表柔比星(epirubicin)、伊達比星(idarubicin)、依索比星(esorubicin)、博來黴素(bleomycin)、馬磷醯胺(mafosfamide)、異環磷醯胺(ifosfamide)、胞嘧啶阿拉伯糖苷(cytosine arabinoside)、雙氯乙基亞硝基脲、白消安(busulfan)、絲裂黴素C(mitomycin C)、放線菌素D(actinomycin D)、光神黴素(mithramycin)、潑尼松(prednisone)、羥孕酮(hydroxyprogesterone)、睪固酮、他莫昔芬(tamoxifen)、達卡巴嗪(dacarbazine)、丙卡巴肼(procarbazine)、六甲三聚氰胺(hexamethylmelamine)、五甲三聚氰胺、米托蒽醌(mitoxantrone)、安吖啶(amsacrine)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)、甲基環己基亞硝基脲、氮芥(nitrogen mustard)、美法侖(melphalan)、環磷醯胺(cyclophosphamide)、6-巰基嘌呤、6-硫鳥嘌呤、阿糖胞苷(cytarabine，CA)、5-氮雜胞嘧啶核苷、羥基脲、 去氧柯福黴素(deoxycoformycin)、4-羥基過氧環磷醯胺、5-氟尿嘧啶(5-FU)、5-氟去氧尿苷(5-FUdR)、甲胺喋呤(MTX)、秋水仙鹼(colchicine)、紫杉醇(taxol)、長春新鹼(vincristine)、長春花鹼(vinblastine)、依託泊苷(etoposide)、三甲曲沙(trimetrexate)、替尼泊甙(teniposide)、順鉑(cisplatin)、吉西他濱(gemcitabine)及己烯雌酚(diethylstilbestrol，DES)。
在某些實施例中，第二藥劑為抗感染劑。抗感染劑之實例包括(但不限於)抗生素、抗真菌藥物及抗病毒藥物。
在某些實施例中，投藥包含非經腸投藥。
某一實施例提供降低感染B型肝炎病毒之哺乳動物之HBV mRNA、蛋白質之量及HBV抗原之量的方法，該方法包括投與有需要之哺乳動物治療有效量之如上所述之醫藥組合物，以使得B型肝炎病毒感染及B型肝炎抗原相較於哺乳動物在治療前之HBV mRNA、蛋白質之量及HBV抗原之量有所減少。在一些實施例中，哺乳動物可為人類，且B型肝炎病毒可為人類B型肝炎病毒。更特定而言，人類B型肝炎病毒可為任何人類地理學基因型：A型(西北歐、北美洲、中美洲)；B型(印度尼西亞、中國、越南)；C型(東亞、韓國、中國、日本、波利尼西亞、越南)；D型(地中海區、中東、印度)；E型(非洲)；F型(美洲土著人、波利尼西亞)；G型(美國、法國)；或H型(中美洲)。
在某些實施例中，提供降低感染B型肝炎病毒之哺乳 動物之HBV mRNA、DNA、蛋白質之量及/或HBV抗原之量的方法，該方法包括投與有需要之哺乳動物治療有效量之如上所述之醫藥組合物，以使得B型肝炎病毒感染及B型肝炎抗原相較於哺乳動物在治療之前的HBV mRNA、蛋白質之量及HBV抗原之量有所減少，其中mRNA之量相較於在投與經修飾反義寡核苷酸之前的量降低至少70%。在某些實施例中，提供降低感染B型肝炎病毒之哺乳動物之HBV mRNA、DNA、蛋白質之量及/或HBV抗原之量的方法，該方法包括投與有需要之哺乳動物治療有效量之如上所述之醫藥組合物，以使得B型肝炎病毒感染及B型肝炎抗原相較於哺乳動物在治療之前的HBV mRNA、蛋白質之量及HBV抗原之量有所減少，其中mRNA之量相較於在投與經修飾反義寡核苷酸之前的量降低至少75%。在某些實施例中，提供降低感染B型肝炎病毒之哺乳動物之HBV mRNA、DNA、蛋白質之量及/或HBV抗原之量的方法，該方法包括投與有需要之哺乳動物治療有效量之如上所述之醫藥組合物，以使得B型肝炎病毒感染及B型肝炎抗原相較於哺乳動物在治療之前的HBV mRNA、蛋白質之量及HBV抗原之量有所減少，其中mRNA之量相較於在投與經修飾反義寡核苷酸之前的量降低至少80%。在某些實施例中，提供降低感染B型肝炎病毒之哺乳動物之HBV mRNA、DNA、蛋白質之量及/或HBV抗原之量的方法，該方法包括投與有需要之哺乳動物治療有效量之如上所述之醫藥組合物，以使得B 型肝炎病毒感染及B型肝炎抗原相較於哺乳動物在治療之前的HBV mRNA、蛋白質之量及HBV抗原之量有所減少，其中mRNA之量相較於在投與經修飾反義寡核苷酸之前的量降低至少85%。在某些實施例中，提供降低感染B型肝炎病毒之哺乳動物之HBV mRNA、DNA、蛋白質之量及/或HBV抗原之量的方法，該方法包括投與有需要之哺乳動物治療有效量之如上所述之醫藥組合物，以使得B型肝炎病毒感染及B型肝炎抗原相較於哺乳動物在治療之前的HBV mRNA、蛋白質之量及HBV抗原之量有所減少，其中mRNA之量相較於在投與經修飾反義寡核苷酸之前的量降低至少90%。在某些實施例中，提供降低感染B型肝炎病毒之哺乳動物之HBV mRNA、DNA、蛋白質之量及/或HBV抗原之量的方法，該方法包括投與有需要之哺乳動物治療有效量之如上所述之醫藥組合物，以使得B型肝炎病毒感染及B型肝炎抗原相較於哺乳動物在治療之前的HBV mRNA、蛋白質之量及HBV抗原之量有所減少，其中mRNA之量相較於在投與經修飾反義寡核苷酸之前的量降低至少95%。在相關方法中，HBV抗原可為HBsAg或可為HBeAg，且更特定而言，HBV抗原之量可充分降低以引起血清轉化，該血清轉化係定義為在監測HBeAg作為血清轉化之決定子的情況下血清HBeAg不存在而存在血清HBeAb，或定義為在監測HBsAg作為血清轉化之決定子的情況下血清HBsAg不存在，如由市售ELISA系統之當前可達之偵測極限所決定。
某一實施例提供促進感染HBV之哺乳動物之B型肝炎病毒進行血清轉化的方法，該方法包括投與感染B型肝炎之哺乳動物治療有效量之如上所述之醫藥組合物；監測哺乳動物之血清樣品中HBeAg+HBeAb之存在，或監測哺乳動物之血清樣品中HBsAg之存在，從而在監測HBeAg作為血清轉化之決定子的情況下血清樣品中不存在HBeAg而存在HBeAb，或在監測HBsAg作為血清轉化之決定子的情況下血清樣品中不存在HBsAg(如由市售ELISA系統之當前偵測極限所決定)可指示哺乳動物體內進行血清轉化。
某些實施例提供如本文所述之化合物或組合物的用途，其用於預防、改善或治療動物之肝臟疾病或其症狀。在某些實施例中，該化合物或組合物包含長度為10至30個連接之核苷且靶向HBV之經修飾寡核苷酸。
某些實施例提供如本文所述之化合物或組合物的用途，其用於製造治療、改善、延遲或預防動物之HBV相關疾病、病症或病狀的藥物。
某些實施例提供如本文所述之化合物或組合物的用途，其用於製造治療、改善、延遲或預防動物之肝臟疾病的藥物。
某些實施例提供治療、預防或改善如本文所述之HBV相關疾病、病症或病狀或其症狀的套組，其中該套組包含：a)如本文所述之化合物或組合物；及視情況選用之b)如本文所述之其他藥劑或療法。該套組可進一步包括 使用該套組治療、預防或改善HBV相關疾病、病症或病狀的說明書或標簽。
在某些實施例中，用於所述用途或方法之化合物或組合物包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸具有10至30個連接之核苷及包含核鹼基序列SEQ ID NO：18-35中任一者之至少10個連續核鹼基的核鹼基序列。在某些實施例中，該等寡核苷酸具有含10個或超過10個連接之去氧核苷的間隔段。在某些實施例中，該間隔段處於兩個獨立地具有1-5個、1-4個、1-3個、2-5個、2-4個或2-3個連接之經修飾核苷的翼段之間。在某些實施例中，翼段中之一或多個經修飾核苷具有經修飾之糖。在某些實施例中，經修飾之糖為雙環糖。在某些實施例中，經修飾之核苷為LNA核苷。
反義化合物
寡聚化合物包括(但不限於)寡核苷酸、寡核苷、寡核苷酸類似物、寡核苷酸模擬物、反義化合物、反義寡核苷酸及siRNA。寡聚化合物可為目標核酸之「反義序列」，意謂其能夠與目標核酸經由氫鍵鍵結進行雜交。
在某些實施例中，反義化合物具有在按5'至3'方向書寫時包含其所靶向之目標核酸之目標段之反向互補序列的核鹼基序列。在某些該等實施例中，反義寡核苷酸具有在按5'至3'方向書寫時包含其所靶向之目標核酸之目標段之反向互補序列的核鹼基序列。
在某些實施例中，靶向HBV核酸之反義化合物的長度 為10至30個次單元。在某些實施例中，靶向HBV核酸之反義化合物的長度為12至30個次單元。在某些實施例中，靶向HBV核酸之反義化合物的長度為15至30個次單元。在某些實施例中，靶向HBV核酸之反義化合物的長度為16至30個次單元。在某些實施例中，靶向HBV核酸之反義化合物的長度為16個次單元。在其他實施例中，反義化合物為8至80個、12至50個、13至30個、13至50個、14至30個、14至50個、15至30個、15至50個、16至30個、16至50個、17至30個、17至50個、18至22個、18至24個、18至30個、18至50個、19至22個、19至30個、19至50個或20至30個連接之次單元。在某些該等實施例中，反義化合物的長度為8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個、30個、31個、32個、33個、34個、35個、36個、37個、38個、39個、40個、41個、42個、43個、44個、45個、46個、47個、48個、49個、50個、51個、52個、53個、54個、55個、56個、57個、58個、59個、60個、61個、62個、63個、64個、65個、66個、67個、68個、69個、70個、71個、72個、73個、74個、75個、76個、77個、78個、79個或80個連接之次單元，或處於由上述任何兩個值所界定的範圍內。在一些實施例中，反義化合物為反義寡核苷酸，且連接之次單 元為核苷酸。
在某些實施例中，靶向HBV核酸之反義寡核苷酸可為縮短或截短型反義寡核苷酸。舉例而言，單個次單元可自5'端缺失(5'截短)，或者自3'端缺失(3'截短)。靶向HBV核酸之縮短或截短型反義化合物可有兩個次單元自反義化合物之5'端缺失，或者可有兩個次單元自反義化合物之3'端缺失。或者，缺失之核苷可散佈於整個反義化合物中，例如在5'端有一個核苷缺失且3'端有一個核苷缺失的反義化合物中。
當單個額外次單元存在於延長之反義化合物中時，該額外次單元可位於反義化合物之5'端或3'端上。當存在兩個或兩個以上額外次單元時，所添加之次單元可彼此鄰近，例如在反義化合物之5'端上添加有兩個次單元(5'添加)或3'端上添加有兩個次單元(3'添加)的反義化合物中。或者，所添加之次單元可散佈於整個反義化合物中，例如在5'端上添加有一個次單元且3'端上添加有一個次單元的反義化合物中。
有可能增加或減少反義化合物(諸如反義寡核苷酸)之長度及/或引入失配鹼基而不消除活性。舉例而言，在Woolf等人(Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89：7305-7309,1992)中，測試長度為13至25個核鹼基之一系列反義寡核苷酸在卵母細胞注射模型中誘導目標RNA裂解的能力。長度為25個核鹼基且在接近反義寡核苷酸之末端處具有8或11個失配鹼基的反義寡核苷酸能夠導引目標mRNA特 異性裂解，但程度低於不含失配之反義寡核苷酸。同樣，標靶特異性裂解可使用具有13個核鹼基之反義寡核苷酸(包括具有1或3個失配者)達成。
Gautschi等人(J.Natl.Cancer Inst.93：463-471,2001年3月)表明與bcl-2 mRNA具有100%互補性且與bcl-xL mRNA具有3個失配之寡核苷酸在活體外及活體內減少bcl-2及bcl-xL兩者表現之能力。此外，此寡核苷酸展現有效之活體內抗腫瘤活性。
Maher及Dolnick(Nuc.Acid.Res.16：3341-3358,1988)分別測試一系列具有14個核鹼基之串聯反義寡核苷酸以及包含該等串聯反義寡核苷酸中之兩者或三者之序列的具有28個及42個核鹼基之反義寡核苷酸在家兔網狀紅血球分析中阻止人類DHFR轉譯的能力。3個具有14個核鹼基之反義寡核苷酸各自單獨能夠抑制轉譯，但程度相較於具有28個或42個核鹼基之反義寡核苷酸而言較適中。
在某些實施例中，該等化合物包括包含SEQ ID NO：18-35中任一者之核鹼基序列的化合物。
反義化合物基元
在某些實施例中，靶向HBV核酸之反義化合物具有排列成一定型態或基元之經化學修飾之次單元，以賦予反義化合物以諸如抑制活性增強、對目標核酸之結合親和力增強或對由活體內核酸酶引起之降解具抗性的特性。
嵌合反義化合物通常含有至少一個經修飾以賦予增強 之核酸酶降解抗性、增加之細胞吸收、增強之對目標核酸之結合親和力及/或增強之抑制活性的區。嵌合反義化合物之第二區可視情況用作細胞核酸內切酶核糖核酸酶H之受質，該酶裂解RNA：DNA雙螺旋體之RNA股。
具有間隔體基元之反義化合物被認為是嵌合反義化合物。在間隔體中，具有複數個有利於核糖核酸酶H裂解之核苷酸的內部區域位於具有複數個在化學上與內部區域之核苷不同之核苷酸的外部區域之間。在具有間隔體基元之反義寡核苷酸的狀況下，間隔段一般用作核酸內切酶裂解之受質，而翼段包含經修飾之核苷。在某些實施例中，間隔體之各區由構成各相異區之糖部分的類型來區分。用於區分間隔體之各區的糖部分之類型在一些實施例中可包括β-D-核糖核苷、β-D-去氧核糖核苷以及雙環糖修飾之核苷。在某些實施例中，翼區可包括若干經修飾之糖部分，包括例如LNA。在某些實施例中，翼區可包括若干經修飾及未經修飾之糖部分。在某些實施例中，翼區可包括LNA核苷及2'-去氧核苷之各種組合。
各相異區可包含均一糖部分、變化或交替之糖部分。翼區-間隔區-翼區基元常描述為「X-Y-Z」，其中「X」表示5'翼區之長度，「Y」表示間隔區之長度，且「Z」表示3'翼區之長度。「X」及「Z」可包含均一、變化或交替之糖部分。在某些實施例中，「X」及「Y」可包括一或多個2'-去氧核苷。「Y」可包含2'-去氧核苷。如本文所用之描述為「X-Y-Z」之間隔體具有一定組態以使間隔區經安置 而與5'翼區及3'翼區中之每一者緊鄰。因此，在5'翼區與間隔區之間，或間隔區與3'翼區之間不存在介入之核苷酸。本文所述之任何反義化合物可具有間隔體基元。在某些實施例中，「X」與「Z」相同；在其他實施例中，其不同。在某些實施例中，「Y」為8至15個核苷。X、Y或Z可為1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、25個、30個或超過30個核苷中之任一者。
在某些實施例中，本文提供之間隔體包括例如十六聚體。在某些實施例中，十六聚體具有含10個連接之核苷的間隔區。在某些實施例中，間隔體具有基元3-10-3。
在某些實施例中，本文提供之間隔體包括例如十四聚體。在某些實施例中，十四聚體具有含10個連接之核苷的間隔區。在某些實施例中，間隔體具有基元2-10-2。
在某些實施例中，靶向HBV核酸之反義化合物具有3-10-3間隔體基元。
在某些實施例中，靶向HBV核酸之反義化合物具有2-10-2間隔體基元。
目標核酸、目標區及核苷酸序列
編碼HBV之核苷酸序列包括(不限於)以下：GENBANK寄存編號U95551.1(以SEQ ID NO：1形式併入本文中)。
應瞭解，本文中所含之實例中之各SEQ ID NO中所述之序列與糖部分、核苷間鍵聯或核鹼基之任何修飾無 關。因而，由SEQ ID NO定義之反義化合物可獨立地包含糖部分、核苷間鍵聯或核鹼基之一或多處修飾。由Isis編號(Isis No)所述之反義化合物指示核鹼基序列與基元之組合。
在某些實施例中，目標區為目標核酸之結構明確之區。舉例而言，目標區可涵蓋3' UTR、5' UTR、外顯子、內含子、外顯子/內含子接合點、編碼區、轉譯起始區、轉譯終止區或其他明確之核酸區。HBV之結構明確之區可由來自序列資料庫(諸如NCBI)之寄存編號獲得，且該資訊以引用方式併入本文中。在某些實施例中，目標區可涵蓋自該目標區內之一個目標段之5'目標位點至同一目標區內之另一目標段之3'目標位點的序列。
靶向包括確定至少一個與反義化合物雜交，從而出現所需作用的目標段。在某些實施例中，所需作用為mRNA目標核酸含量降低。在某些實施例中，所需作用為由目標核酸編碼之蛋白質含量降低或與目標核酸有關之表型改變。
目標區可含有一或多個目標段。目標區內之多個目標段可重疊。或者，其可不相重疊。在某些實施例中，目標區內之目標段相隔至多約300個核苷酸。在某些實施例中，目標區內之目標段相隔目標核酸上一定數目之核苷酸，該數目為、為約、為至多、為至多約250個、200個、150個、100個、90個、80個、70個、60個、50個、40個、30個、20個或10個核苷酸，或為由前述任 何兩個值所界定之範圍。在某些實施例中，目標區內之目標段相隔目標核酸上之至多或至多約5個核苷酸。在某些實施例中，目標段為連續的。涵蓋由具有為本文所列之5'目標位點或3'目標位點中之任一者之起始核酸的範圍所界定之目標區。
適合之目標段可存在於5' UTR、編碼區、3' UTR、內含子、外顯子或外顯子/內含子接合點內。含有起始密碼子或終止密碼子之目標段亦為適合之目標段。適合之目標段可尤其排除某一結構明確之區，諸如起始密碼子或終止密碼子。
確定適合之目標段可包括將目標核酸之序列與整個基因組中之其他序列比較。舉例而言，可使用BLAST演算法來鑒別不同核酸當中具相似性之區域。此比較可防止選擇可能以非特異性方式與除所選目標核酸以外之序列(亦即非目標或脫靶序列)雜交的反義化合物序列。
反義化合物在活性目標區內之活性(例如如由目標核酸含量降低百分比所定義)可能不同。在某些實施例中，HBV mRNA含量降低可指示對HBV表現之抑制作用。HBV蛋白質含量降低亦可指示對目標mRNA表現之抑制作用。此外，表型改變可指示對HBV表現之抑制作用。在某些實施例中，疲勞減少、流行性感冒樣症狀減輕、食欲增加、噁心減少、關節疼痛減輕、黃疸減輕、腹部疼痛減輕、虛弱減輕、體重下降減少、男性乳房增大減少、手掌上之皮疹減少、凝血困難減輕、硬化減輕、皮膚上 蜘蛛樣血管減少、維生素A及維生素D吸收增加、腫瘤生長減少、腫瘤體積減小、頭痛減輕、發熱減輕、腹瀉減少、身體肝區疼痛減輕、黏土色或灰色糞便減少、發癢減輕、深色尿減少以及噁心及嘔吐減少可指示對HBV表現之抑制作用。在某些實施例中，與HBV相關病狀、疾病及病症有關之症狀改善可指示對HBV表現之抑制作用。在某些實施例中，硬化減輕可指示對HBV表現之抑制作用。在某些實施例中，肝癌標記減少可指示對HBV表現之抑制作用。
雜交
在一些實施例中，本文揭示之反義化合物與HBV核酸之間進行雜交。雜交之最常見機制涉及核酸分子之互補核鹼基之間的氫鍵鍵結(例如沃森-克里克、霍氏或反霍氏氫鍵鍵結)。
雜交可在不同條件下進行。嚴格條件具序列依賴性且由欲雜交之核酸分子之性質及組成決定。
確定序列是否可與目標核酸特異性雜交的方法在此項技術中為熟知的。在某些實施例中，本文提供之反義化合物可與HBV核酸特異性雜交。
互補性
當反義化合物中足夠數目之核鹼基可與目標核酸中之相應核鹼基進行氫鍵鍵結，從而出現所需作用(例如對目標核酸(諸如HBV核酸)之反義抑制作用)時，反義化合物與目標核酸彼此互補。
可容許反義化合物與HBV核酸之間的非互補性核鹼基，限制條件為該反義化合物仍能夠與目標核酸特異性雜交。此外，反義化合物可在HBV核酸之一或多個區段上雜交，因此介入或相鄰區段不涉及雜交事件(例如環結構、失配或髮夾結構)。
在某些實施例中，本文提供之反義化合物或其指定部分與HBV核酸、目標區、目標段或其指定部分具有或具有至少70%、80%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%互補性。反義化合物與目標核酸之互補性百分比可使用常規方法測定。
舉例而言，反義化合物中反義化合物之20個核鹼基中有18個核鹼基與目標區互補且因此特異性雜交將表示90%互補性。在此實例中，其餘非互補核鹼基可與互補核鹼基叢集或交替且不需要彼此相鄰或與互補核鹼基相鄰。因而，長度為18個核鹼基並具有4個非互補核鹼基且該等非互補核鹼基由與目標核酸完全互補之兩個區側接的反義化合物與目標核酸應具有77.8%總體互補性且因而屬本發明範疇內。反義化合物與目標核酸之區的互補性百分比可常規地使用此項技術中已知之BLAST程式(基本局部比對搜尋工具(basic local ajignment search tool))及PowerBLAST程式來測定(Altschul等人，J.Mol.Biol.,1990,215,403 410；Zhang及Madden,Genome Res.,1997,7,649 656)。同源性、序列一致性或互補性百分比 可藉由例如使用Smith及Waterman(Adv.Appl.Math.,1981,2,482 489)之演算法的Gap程式(威斯康星序列分析套件(Wisconsin Sequence Analysis Package)，用於Unix之版本8，Genetics Computer Group,University Research Park,Madison Wis.)使用預設設置來測定。
在某些實施例中，本文提供之反義化合物或其指定部分與目標核酸或其指定部分完全互補(亦即100%互補)。舉例而言，反義化合物可與HBV核酸或其目標區或目標段或目標序列完全互補。如本文所用之「完全互補」意謂反義化合物之各核鹼基皆能夠與目標核酸之相應核鹼基進行準確鹼基配對。舉例而言，具有20個核鹼基之反義化合物與長度為400個核鹼基之目標序列完全互補，只要目標核酸中有具有20個核鹼基之相應部分與反義化合物完全互補即可。完全互補亦可對於第一及/或第二核酸之指定部分來使用。舉例而言，具有30個核鹼基之反義化合物中具有20個核鹼基之部分可與長度為400個核鹼基之目標序列「完全互補」。具有30個核鹼基之寡核苷酸中具有20個核鹼基之部分在目標序列具有含20個核鹼基且各核鹼基與反義化合物中該具有20個核鹼基之部分互補之相應部分的情況下與目標序列完全互補。同時，整個具有30個核鹼基之反義化合物與目標序列可能完全互補或未必完全互補，視反義化合物之其餘10個核鹼基是否亦與目標序列互補而定。
非互補核鹼基之位置可處於反義化合物之5'端或3'端 處。或者，該或該等非互補核鹼基可處於反義化合物之內部位置上。當存在兩個或兩個以上非互補核鹼基時，其可為連續(亦即連接)或不連續的。在一個實施例中，非互補核鹼基位於間隔體反義寡核苷酸之翼段中。
在某些實施例中，長度為或為至多11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個或20個核鹼基的反義化合物相對於目標核酸(諸如HBV核酸)或其指定部分包含至多4個、至多3個、至多2個或至多1個非互補核鹼基。
在某些實施例中，長度為或為至多11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個、25個、26個、27個、28個、29個或30個核鹼基的反義化合物相對於目標核酸(諸如HBV核酸)或其指定部分包含至多6個、至多5個、至多4個、至多3個、至多2個或至多1個非互補核鹼基。
所提供之反義化合物亦包括與目標核酸之一部分互補的反義化合物。如本文所用之「部分」係指目標核酸之區或區段內確定數目之連續(亦即連接)核鹼基。「部分」亦可指反義化合物中確定數目之連續核鹼基。在某些實施例中，反義化合物與目標段中具有至少8個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，反義化合物與目標段中具有至少9個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，反義化合物與目標段中具有至少10個核鹼基之部分互補。在 某些實施例中，反義化合物與目標段中具有至少11個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，反義化合物與目標段中具有至少12個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，反義化合物與目標段中具有至少13個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，反義化合物與目標段中具有至少14個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，反義化合物與目標段中具有至少15個核鹼基之部分互補。在某些實施例中，反義化合物與目標段中具有至少16個核鹼基之部分互補。亦涵蓋與目標段中具有至少9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個或超過20個(或由此等值中之任何兩者所界定之範圍)核鹼基之部分互補的反義化合物。
一致性
本文提供之反義化合物亦可與特定核苷酸序列SEQ ID NO或由特定Isis編號表示之化合物或其部分具有確定之一致性百分比。如本文所用，若反義化合物具有相同核鹼基配對能力，則其與本文揭示之序列一致。舉例而言，在所揭示之DNA序列中含有尿嘧啶而非胸苷的RNA將視作與DNA序列一致，因為尿嘧啶及胸苷皆與腺嘌呤配對。亦涵蓋本文所述之反義化合物之縮短及延長型式以及相對於本文提供之反義化合物具有不一致鹼基的化合物。不一致鹼基可彼此相鄰或散佈於整個反義化合物中。反義化合物之一致性百分比係根據相對於與其比較之序列具有一致鹼基配對之鹼基的數目來計算。
在某些實施例中，反義化合物或其部分與本文揭示之一或多種反義化合物或SEQ ID NO或其部分具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致性。
在某些實施例中，將反義化合物之一部分與目標核酸之等長部分相比較。在某些實施例中，將具有8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個或25個核鹼基之部分與目標核酸之等長部分相比較。
在某些實施例中，將反義寡核苷酸之一部分與目標核酸之等長部分相比較。在某些實施例中，將具有8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、21個、22個、23個、24個或25個核鹼基之部分與目標核酸之等長部分相比較。
修飾
核苷為鹼基-糖組合。核苷之核鹼基(亦稱為鹼基)部分通常為雜環鹼基部分。核苷酸為進一步包括共價連接至核苷之糖部分之磷酸酯基的核苷。對於包括戊呋喃醣基糖之彼等核苷，磷酸酯基可連接至糖之2'、3'或5'羥基部分。寡核苷酸係經由相鄰核苷彼此共價鍵聯形成線性聚合寡核苷酸而形成。在寡核苷酸結構內，磷酸酯基通常視作形成寡核苷酸之核苷間鍵聯。
反義化合物之修飾涵蓋核苷間鍵聯、糖部分或核鹼基之取代或改變。經修飾之反義化合物常因具有諸如以下 之所需特性而優於原生形式：細胞吸收增強、對核酸標靶之親和力增強、在核酸酶存在下之穩定性增強或抑制活性增強。
經化學修飾之核苷亦可用於增強縮短或截短型反義寡核苷酸對其目標核酸之結合親和力。因此，常可以具有該等經化學修飾之核苷的較短反義化合物獲得類似結果。
經修飾之核苷間鍵聯
RNA及DNA之天然存在之核苷間鍵聯為3'至5'磷酸二酯鍵聯。相較於具有天然存在之核苷間鍵聯之反義化合物，具有一或多個經修飾(亦即非天然存在)之核苷間鍵聯的反義化合物常會因具有所需特性(諸如細胞吸收增強、對目標核酸之親和力增強及在核酸酶存在下之穩定性增強)而被優先選擇。
具有經修飾之核苷間鍵聯的寡核苷酸包括保留磷原子之核苷間鍵聯以及不具磷原子之核苷間鍵聯。代表性含磷核苷間鍵聯包括(但不限於)磷酸二酯、磷酸三酯、甲基膦酸酯、胺基磷酸酯及硫代磷酸酯。製備含磷鍵聯及不含磷鍵聯之方法為熟知的。
在某些實施例中，靶向HBV核酸之反義化合物包含一或多個經修飾之核苷間鍵聯。在某些實施例中，經修飾之核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯。在某些實施例中，反義化合物之各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯。
經修飾之糖部分
本文提供之寡聚化合物可包含一或多個具有經修飾之糖部分的單體，包括核苷或核苷酸。舉例而言，可以多種方式修飾核苷或核苷酸之呋喃醣基糖環，包括(但不限於)添加取代基及使兩個非偕位環原子橋連形成鎖核酸(LNA)。
在某些實施例中，寡聚化合物包含一或多個具有雙環糖之單體。在某些實施例中，單體為LNA。在某些該等實施例中，LNA包括(但不限於)(A)α-L-亞甲氧基(4'-CH2-O-2')LNA；(B)β-D-亞甲氧基(4'-CH2-O-2')LNA；(C)伸乙氧基(4'-(CH2)2-O-2')LNA；(D)胺氧基(4'-CH2-O-N(R)-2')LNA；及(E)氧胺基(4'-CH2-N(R)-O-2')LNA，如下文所描繪。
在某些實施例中，LNA化合物包括(但不限於)在糖之4'位與2'位之間具有至少一個橋基的化合物，其中各橋基獨立地包含1個或2至4個獨立地選自以下之鍵聯基團：-[C(R1)(R2)]n-、-C(R1)=C(R2)-、-C(R1)=N-、-C(=NR1)-、-C(=O)-、-C(=S)-、-O-、-Si(R1)2-、-S(=O)x-及-N(R1)-；其中：x為0、1或2；n為1、2、3或4； 各R1及R2獨立地為H、保護基、羥基、C1-C12烷基、經取代之C1-C12烷基、C2-C12烯基、經取代之C2-C12烯基、C2-C12炔基、經取代之C2-C12炔基、C5-C20芳基、經取代之C5-C20芳基、雜環基、經取代之雜環基、雜芳基、經取代之雜芳基、C5-C7脂環基、經取代之C5-C7脂環基、鹵素、OJ1、NJ1J2、SJ1、N3、COOJ1、醯基(C(=O)-H)、經取代之醯基、CN、磺醯基(S(=O)2-J1)或亞磺醯基(S(=O)-J1)；且各J1及J2獨立地為H、C1-C12烷基、經取代之C1-C12烷基、C2-C12烯基、經取代之C2-C12烯基、C2-C12炔基、經取代之C2-C12炔基、C5-C20芳基、經取代之C5-C20芳基、醯基(C(=O)-H)、經取代之醯基、雜環基、經取代之雜環基、C1-C12胺基烷基、經取代之C1-C12胺基烷基或保護基。
在一個實施例中，LNA化合物之各橋基獨立地為-[C(R1)(R2)]n-、-[C(R1)(R2)]n-O-、-C(R1R2)-N(R1)-O-或-C(R1R2)-O-N(R1)-。在另一實施例中，該等橋基各自獨立地為4'-CH2-2'、4'-(CH2)2-2'、4'-(CH2)3-2'、4'-CH2-O-2'、4'-(CH2)2-O-2'、4'-CH2-O-N(R1)-2'及4'-CH2-N(R1)-O-2'-，其中各R1獨立地為H、保護基或C1-C12烷基。
某些LNA已經製備且揭示於專利文獻以及科學文獻(參見例如：頒佈之美國專利第7,053,207號；第6,268,490號；第6,770,748號；第6,794,499號；第7,034,133號；第6,525,191號；第7,696,345號；第7,569,575號；第7,314,923號；第7,217,805號；及第7,084,125號，其以 全文引用方式併入本文中)中。
本文亦提供如下LNA，其中核糖基糖環之2'-羥基連接至4'碳原子，從而形成亞甲氧基(4'-CH2-O-2')橋而形成雙環糖部分(評述於Elayadi等人，Curr.Opinion Invens.Drugs,2001,2,558-561；Braasch等人，Chem.Biol.,2001,8 1-7；及Orum等人，Curr.Opinion Mol.Ther.,2001,3,239-243中；亦參見美國專利6,670,461)。此外，橋基亦可為連接糖環之2'氧原子與4'碳原子之亞甲基(-CH2-)，對於其使用術語亞甲氧基(4'-CH2-O-2')LNA。在於此位置上具有伸乙基橋連基團的雙環糖部分的狀況下，使用術語伸乙氧基(4'-CH2CH2-O-2')LNA(Singh等人，Chem.Commun.,1998,4,455-456；Morita等人，Bioorganic Medicinal Chemistry,2003,11,2211-2226)。亞甲氧基(4'-CH2-O-2')LNA及其他雙環糖類似物與互補DNA及RNA呈現極高之雙螺旋體熱穩定性(Tm=+3℃至+10℃)、針對3'-核酸外切降解之穩定性以及良好之溶解特性。包含LNA之有效且無毒之反義寡核苷酸已有所描述(Wahlestedt等人，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,2000,97,5633-5638)。
亦已經論述之亞甲氧基(4'-CH2-O-2')LNA之異構體為α-L-亞甲氧基(4'-CH2-O-2')LNA，其已經展示具有優良之針對3'-核酸外切酶的穩定性。α-L-亞甲氧基(4'-CH2-O-2')LNA已併入展示有效反義活性之反義間隔體及嵌合體中(Frieden等人，Nucleic Acids Research, 2003, 21,6365-6372)。
具有亞甲氧基(4'-CH2-O-2')橋之腺嘌呤、胞嘧啶、鳥嘌呤、5-甲基-胞嘧啶、胸腺嘧啶及尿嘧啶LNA之合成及製備以及其寡聚及核酸識別特性已有所描述(Koshkin等人，Tetrahedron,1998,54,3607-3630)。LNA及其製備亦描述於WO 98/39352及WO 99/14226中，該等專利以引用方式併入本文中。
具有4'至2'橋連基團(諸如4'-CH2-O-2'(亞甲氧基)及4'-CH2-S-2'(亞甲硫基))之各種LNA核苷之類似物亦已經製備(Kumar等人，Bioorg.Med.Chem.Lett.,1998,8,2219-2222)。構成作為核酸聚合酶之受質的寡去氧核糖核苷酸雙螺旋體之鎖核苷類似物的製備亦已有所描述(Wengel等人，WO 99/14226)。此外，2'-胺基-LNA(一種新穎之構形受限之高親和力寡核苷酸類似物)之合成在此項技術中已有所描述(Singh等人，J.Org.Chem.,1998,63,10035-10039)。另外，2'-胺基-LNA及2'-甲基胺基-LNA已經製備且其與互補RNA及DNA股之雙螺旋體的熱穩定性先前已有所報導。
在一個實施例中，反義寡聚物可包含至少兩個LNA單體，更特定而言，反義寡聚物可包含2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個或10個LNA單體。如下文所述，連續核苷酸序列可由LNA及DNA單元組成(包括鍵聯基團，諸如硫代磷酸酯鍵聯)，或可由LNA及其他核苷及核苷酸類似物組成。在一些實施例中，連續核苷酸 序列可包含6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個或16個DNA核苷，反義寡聚物中之其餘單體包含核苷類似物，諸如LNA。
如本文所用之「雙環核苷」係指包含連接糖環之兩個碳原子，從而形成雙環糖部分之橋基的核苷。在某些實施例中，橋基連接糖環之2'碳與另一碳。
如本文所用之「4'-2'雙環核苷」或「4'至2'雙環核苷」係指包含含連接糖環之2'碳原子與4'碳原子之橋基之呋喃醣環的雙環核苷。
一種具有4'-(CH2)3-2'橋及烯基類似物(即橋基4'-CH=CH-CH2-2')之碳環雙環核苷已有所描述(參見例如Freier等人，Nucleic Acids Research,1997,25(22),4429-4443；及Albaek等人，J.Org.Chem.,2006,71,7731-7740)。碳環雙環核苷之合成及製備以及其寡聚及生物化學研究亦已有所描述(參見例如Srivastava等人，J.Am.Chem.Soc.2007,129(26),8362-8379)。
製備經修飾糖之方法為熟習此項技術者所熟知。
組合物及調配醫藥組合物之方法
反義寡核苷酸可與醫藥學上可接受之活性或惰性物質混合以製備醫藥組合物或調配物。組合物及調配醫藥組合物之方法視許多準則而定，包括(但不限於)投藥途徑、疾病程度或所投與之劑量。
靶向HBV核酸之反義化合物可藉由將反義化合物與適合之醫藥學上可接受之稀釋劑或載劑組合而用於醫藥組 合物中。醫藥學上可接受之稀釋劑包括磷酸鹽緩衝生理食鹽水(PBS)。PBS為適用於非經腸傳遞之組合物中的稀釋劑。因此，在一個實施例中，在本文所述之方法中使用包含靶向HBV核酸之反義化合物及醫藥學上可接受之稀釋劑的醫藥組合物。在某些實施例中，醫藥學上可接受之稀釋劑為PBS。在某些實施例中，反義化合物為反義寡核苷酸。
包含反義化合物之醫藥組合物涵蓋在投與動物(包括人類)時能夠提供(直接或間接)其生物活性代謝物或殘餘物的任何醫藥學上可接受之鹽、酯或該等酯之鹽，或任何其他寡核苷酸。因此，例如，亦揭示反義化合物之醫藥學上可接受之鹽、前藥、該等前藥之醫藥學上可接受之鹽，及其他生物等效物。適合之醫藥學上可接受之鹽包括(但不限於)鈉鹽及鉀鹽。
前藥可包括在反義化合物之一端或兩端上併入可由體內內源性核酸酶裂解而形成活性反義化合物的額外核苷。
結合之反義化合物
反義化合物可共價連接至一或多個增強所得反義寡核苷酸之活性、細胞分佈或細胞吸收的部分或結合物。典型結合基團包括膽固醇部分及脂質部分。其他結合基團包括碳水化合物、磷脂、生物素、啡嗪、葉酸鹽、啡啶、蒽醌、吖啶、螢光素、若丹明(rhodamine)、香豆素及染料。
反義化合物亦可經修飾而具有一或多個穩定化基團，該一或多個穩定化基團一般連接至反義化合物之一端或兩端以增強諸如核酸酶穩定性之特性。在穩定化基團中包括帽結構。此等末端修飾保護具有末端核酸之反義化合物免遭核酸外切酶降解，且可有助於傳遞及/或定位於細胞內。帽可存在於5'端(5'帽)或3'端(3'帽)上，或可存在於兩端上。帽結構在此項技術中為熟知的且包括例如反轉去氧無鹼基帽。其他可用於對反義化合物之一端或兩端進行封端以賦予核酸酶穩定性的3'及5'穩定化基團包括2003年1月16日公開之WO 03/004602中所揭示者。
細胞培養及反義化合物處理
可在多種細胞類型中活體外測試反義化合物對HBV核酸之含量、活性或表現的作用。用於該等分析之細胞類型可獲自商業供應商(例如American Type Culture Collection,Manassus,VA；Zen-Bio,Inc.,Research Triangle Park,NC；Clonetics Corporation,Walkersville,MD)且根據供應商之說明書使用市售可得之試劑(例如Invitrogen Life Technologies,Carlsbad,CA)培養。說明性細胞類型包括(但不限於)HuVEC細胞、b.END細胞、HepG2細胞、Hep3B細胞及初級肝細胞。
活體外測試反義寡核苷酸
本文描述用反義寡核苷酸處理細胞之方法，該等方法可經適當修改以用於用其他反義化合物進行之處理。
可當細胞在培養中達到約60%至80%匯合度時，用反 義寡核苷酸處理細胞。
一種常用於將反義寡核苷酸引入培養細胞中之試劑包括陽離子型脂質轉染試劑脂質體(LIPOFECTIN)(Invitrogen,Carlsbad,CA)。可將反義寡核苷酸與脂質體在OPTI-MEM 1(Invitrogen,Carlsbad,CA)中混合以達成反義寡核苷酸之所需最終濃度及可在每100 nM反義寡核苷酸2至12 μg/mL範圍內之脂質體濃度。
另一用於將反義寡核苷酸引入培養細胞中之試劑包括脂染胺(LIPOFECTAMINE)(Invitrogen,Carlsbad,CA)。可將反義寡核苷酸與脂染胺在OPTI-MEM 1血清減少型培養基(Invitrogen,Carlsbad,CA)中混合以達成反義寡核苷酸之所需濃度及可在每100 nM反義寡核苷酸2至12 μg/mL範圍內之脂染胺濃度。
另一用於將反義寡核苷酸引入培養細胞中之技術包括電穿孔。
藉由常規方法用反義寡核苷酸處理細胞。可在反義寡核苷酸處理後16至24小時收集細胞，此時藉由此項技術中已知及本文所述之方法量測目標核酸之RNA或蛋白含量。一般而言，當在多次重複實驗中進行處理時，資料係呈現為重複處理之平均值。
所用之反義寡核苷酸濃度在細胞株之間有所不同。確定最佳用於特定細胞株之反義寡核苷酸濃度的方法在此項技術中為熟知的。當用脂染胺轉染時，通常使用濃度在1 nM至300 nM範圍內之反義寡核苷酸。當使用電穿 孔進行轉染時，使用625 nM至20,000 nM範圍內之較高濃度的反義寡核苷酸。
RNA分離
可對總細胞RNA或聚(腺苷酸)+mRNA進行RNA分析。RNA分離之方法在此項技術中為熟知的。RNA係使用此項技術中熟知之方法，例如使用TRIZOL試劑(Invitrogen,Carlsbad,CA)，根據製造商推薦之方案來製備。
分析對標靶含量或表現之抑制作用
對HBV核酸之含量或表現的抑制作用可以此項技術中已知之多種方式來分析。舉例而言，目標核酸含量可藉由例如北方墨點分析、競爭聚合酶鏈反應(PCR)或定量即時PCR來定量。可對總細胞RNA或聚(腺苷酸)+mRNA進行RNA分析。RNA分離之方法在此項技術中為熟知的。北方墨點分析在此項技術中亦為常規的。定量即時PCR宜使用市售可得之ABI PRISM 7600、7700或7900序列偵測系統(可獲自PE-Applied Biosystems,Foster City,CA且根據製造商說明書來使用)完成。
對目標RNA含量之定量即時PCR分析
可藉由定量即時PCR，使用ABI PRISM 7600、7700或7900序列偵測系統(PE-Applied Biosystems,Foster City,CA)根據製造商說明書來對目標RNA含量進行定量。定量即時PCR之方法在此項技術中為熟知的。
在即時PCR之前，使分離之RNA進行逆轉錄酶(RT)反應，產生互補DNA(cDNA)，其接著用作即時PCR擴增之 受質。在同一樣品孔中依序進行RT及即時PCR反應。RT及即時PCR試劑可獲自Invitrogen(Carlsbad,CA)。RT即時PCR反應係藉由為熟習此項技術者熟知之方法進行。
藉由即時PCR獲得之基因(或RNA)標靶量係使用表現恆定之基因(諸如親環素A(cyclophilin A))之表現含量或藉由使用RIBOGREEN(Invitrogen,Inc.Carlsbad,CA)定量總RNA來校正。親環素A表現係藉由即時PCR，藉由與標靶同時操作、複合操作或分開操作來定量。總RNA係使用RIBOGREEN RNA定量試劑(Invetrogen,Inc.Eugene,OR)來定量。藉由RIBOGREEN定量RNA之方法係教示於Jones,L.J.等人(Analytical Biochemistry,1998,265,368-374)中。使用CYTOFLUOR 4000儀器(PE Applied Biosystems)量測RIBOGREEN螢光。
探針及引子經設計以與HBV核酸雜交。設計即時PCR探針及引子之方法在此項技術中為熟知的，且可包括使用軟體，諸如PRIMER EXPRESS軟體(Applied Biosystems,Foster City,CA)。
對目標DNA含量之定量即時PCR分析
可藉由定量即時PCR，使用ABI PRISM 7600、7700或7900序列偵測系統(PE-Applied Biosystems,Foster City,CA)根據製造商說明書來對目標DNA含量進行定量。定量即時PCR之方法在此項技術中為熟知的。
藉由即時PCR獲得之基因(或DNA)標靶量係使用表現恆定之基因(諸如親環素A)之表現含量或藉由使用 RIBOGREEN(Invitrogen,Inc.Carlsbad,CA)定量總DNA來校正。親環素A表現係藉由即時PCR，藉由與標靶同時操作、複合操作或分開操作來定量。總DNA係使用RIBOGREEN RNA定量試劑(Invetrogen,Inc.Eugene,OR)來定量。藉由RIBOGREEN定量DNA之方法係教示於Jones,L.J.等人(Analytical Biochemistry,1998,265,368-374)中。使用CYTOFLUOR 4000儀器(PE Applied Biosystems)量測RIBOGREEN螢光。
探針及引子經設計以與HBV核酸雜交。設計即時PCR探針及引子之方法在此項技術中為熟知的，且可包括使用軟體，諸如PRIMER EXPRESS軟體(Applied Biosystems,Foster City,CA)。
分析蛋白含量
對HBV核酸之反義抑制作用可藉由量測HBV蛋白含量來評定。HBV之蛋白含量可以此項技術中熟知之多種方式來評估或定量，諸如免測沈澱法、西方墨點分析(免疫墨點法)、酶聯免疫吸附分析(ELISA)、定量蛋白質分析、蛋白質活性分析(例如卡斯蛋白酶活性分析)、免疫組織化學、免疫細胞化學或螢光活化細胞分選法(FACS)。針對標靶之抗體可經鑒別且獲自多種來源，諸如MSRS抗體目錄(Aerie Corporation,Birmingham,MI)，或可經由此項技術中熟知之習知單株或多株抗體產生方法來製備。
活體內測試反義化合物
在動物體內測試反義化合物(例如反義寡核苷酸)以評 定其抑制HBV表現及引起表型改變的能力。可在正常動物或實驗疾病模型中進行測試。為投與動物，在醫藥學上可接受之稀釋劑(諸如磷酸鹽緩衝生理食鹽水)中調配反義寡核苷酸。投藥包括非經腸投藥途徑，諸如腹膜內、靜脈內、皮下、鞘內及腦室內。計算反義寡核苷酸劑量及給藥頻率應在熟習此項技術者之能力範圍內，且視諸如投藥途徑及動物體重之因素而定。在用反義寡核苷酸處理一段時間後，自肝臟組織分離RNA且量測HBV核酸表現之改變。亦量測HBV DNA含量之改變。亦量測HBV蛋白含量之改變。
某些適應症
在某些實施例中，本文提供治療個體之方法、化合物及組合物，其包含投與本文提供之一或多種醫藥組合物。在某些實施例中，個體患有HBV相關病狀。在某些實施例中，炎症、纖維化、硬化、肝癌、血清肝炎、黃疸、肝癌、肝臟炎症、肝纖維化、肝硬化、肝臟衰竭、彌漫性肝細胞性發炎性疾病、噬血細胞性症候群、血清肝炎及HBV病毒血症。在某些實施例中，HBV相關病狀在結合針對B型肝炎病毒、B型肝炎病毒抗原之存在的陽性測試或針對B型肝炎病毒抗原特異性抗體之存在的陽性測試時可具有可包括以下任一者或全部的症狀：流行性感冒樣疾病、虛弱、疼痛、頭痛、發燒、食欲喪失、腹瀉、黃疸、噁心及嘔吐、身體肝區疼痛、黏土色或灰色糞便、全身發癢及尿色深。在某些實施例中，個體有 患HBV相關病狀之風險。此包括有產生HBV相關病狀之一或多種風險因素的個體，包括性暴露於感染B型肝炎病毒之個體、與患有終身B型肝炎病毒感染之個體居住在同一房屋中、暴露於感染B型肝炎病毒之人類血液、注射違禁藥物、為患有血友病之人及造訪B型肝炎流行之地區。在某些實施例中，個體已經鑒別為需要針對HBV相關病狀進行治療。在某些實施例中，本文提供防治性減少個體之HBV表現的方法。某些實施例包括藉由投與個體治療有效量之靶向HBV核酸之反義化合物來治療有需要之個體。
歸因於傳播途徑重疊，許多人已暴露於B型肝炎病毒(HBV)及C型肝炎病毒(HCV)兩者，且較小比例慢性感染兩種病毒，尤其在HBV流行之地區(諸如亞洲)。估計表明至多10%感染HCV之人亦可能感染HBV，而可能20%感染HBV之人合併感染HCV。然而，對B型肝炎或HBV-HCV合併感染之個體之B型肝炎的治療未得到深入研究。治療因如下事實而為複雜的：HCV與HBV看似彼此抑制對方複製(但並非所有研究皆觀測到此相互作用)。因此，完全抑制HBV之治療可能潛在地使得HCV再出現，或反之亦然。因此，本文所述之化合物及組合物可有利地用於治療感染HBV及HCV兩者的患者。用於C型肝炎(HCV)之例示性治療選擇方案包括干擾素，例如干擾素α-2b、干擾素α-2a及干擾素αcon-1。可使用聚乙二醇化干擾素(干擾素連接至顯著改良其藥物動力學 概況的聚乙二醇部分)來使得干擾素給藥頻率較低。以干擾素α-2b(聚乙二醇化及非聚乙二醇化)及病毒唑進行之組合療法亦已經展示可有效用於一些患者群體。當前正研發之其他藥劑包括HCV RNA複製抑制劑(例如ViroPharma之VP50406系列)、HCV反義劑、HCV治療性疫苗、HCV蛋白酶抑制劑、HCV解螺旋酶抑制劑及HCV抗體療法(單株或多株)。
在某些實施例中，以本文所述之方法、化合物及組合物進行之治療適用於預防與存在B型肝炎病毒有關之HBV相關病狀。在某些實施例中，以本文所述之方法、化合物及組合物進行的治療適用於預防HBV相關病狀。
在一個實施例中，投與治療有效量之靶向HBV核酸之反義化合物同時伴隨監測個體血清中之HBV含量以測定個體對投與反義化合物的反應。在某些實施例中，投與治療有效量之靶向HBV核酸之反義化合物同時伴隨監測個體血清中之HBV RNA含量以測定個體對投與反義化合物之反應。在某些實施例中，投與治療有效量之靶向HBV核酸之反義化合物同時伴隨監測個體血清中之HBV DNA含量以測定個體對投與反義化合物之反應。在某些實施例中，投與治療有效量之靶向HBV核酸之反義化合物同時伴隨監測個體血清中之HBV S抗原(HBsAg)含量以測定個體對投與反義化合物之反應。在某些實施例中，投與治療有效量之靶向HBV核酸之反義化合物同時伴隨監測個體血清中之HBV E抗原(HBeAg)含量以測定個體對投與 反義化合物之反應。個體對投與反義化合物之反應可由醫師用於確定治療性干預的量及持續時間。
在某些實施例中，投與靶向HBV核酸之反義化合物會使得HBV表現減少至少15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或99%，或由此等值中之任何兩者所界定之範圍。在某些實施例中，投與靶向HBV核酸之反義化合物會減少與HBV相關病狀有關之症狀且減少血液中之HBV相關標記。在某些實施例中，投與HBV反義化合物會使得HBV RNA含量、HBV DNA含量、HBsAg含量或HBeAg含量減少至少15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或99%，或由此等值中之任何兩者所界定之範圍。
在某些實施例中，包含靶向HBV之反義化合物的醫藥組合物係用於製備治療罹患或易患HBV相關病狀之患者的藥物。
某些組合療法
在某些實施例中，本文提供之一或多種醫藥組合物與一或多種其他醫藥藥劑共同投與。在某些實施例中，該一或多種其他醫藥藥劑經設計以與本文提供之一或多種醫藥組合物治療相同疾病、病症或條件。在某些實施例中，該一或多種其他醫藥藥劑經設計以與本文提供之一或多種醫藥組合物治療不同疾病、病症或條件。在某些 實施例中，該一或多種其他醫藥藥劑經設計以處理本文提供之一或多種醫藥組合物的不合需要之副作用。在某些實施例中，本文提供之一或多種醫藥組合物與另一醫藥藥劑共同投與以處理該另一醫藥藥劑之不合需要之作用。在某些實施例中，本文提供之一或多種醫藥組合物與另一醫藥藥劑共同投與以產生組合作用。在某些實施例中，本文提供之一或多種醫藥組合物與另一醫藥藥劑共同投與以產生協同作用。
在某些實施例中，本文提供之一或多種醫藥組合物與一或多種其他醫藥藥劑同時投與。在某些實施例中，本文提供之一或多種醫藥組合物與一或多種其他醫藥藥劑在不同時間投與。在某些實施例中，將本文提供之一或多種醫藥組合物與一或多種其他醫藥藥劑一起製備成單個調配物。在某些實施例中，本文提供之一或多種醫藥組合物與一或多種其他醫藥藥劑單獨製備。在某些實施例中，所揭示之反義寡核苷酸與HCV藥劑組合投與。在其他實施例中，HCV化合物與反義化合物同時投與；在其他實施例中，單獨投與HCV化合物，以使得HCV藥劑與反義化合物各自之給藥在時間上於患者體內重疊。在相關實施例中，HCV藥劑可選自干擾素α-2b、干擾素α-2a及干擾素αcon-1(聚乙二醇化及非聚乙二醇化)；病毒唑；HCV RNA複製抑制劑(例如ViroPharma之VP50406系列)；HCV反義劑；HCV治療性疫苗；HCV蛋白酶抑制劑；HCV解螺旋酶抑制劑；及HCV抗體療法(單株或多株)。
在其他實施例中，本發明之HBV反義化合物可與一或多種HBV治療劑組合投與感染HBV之患者，其中該一或多種HBV治療劑可與HBV ASO化合物在同一藥物調配物中投與，或可在各別調配物中投與。一或多種HBV治療劑可與ASO HBV化合物同時投與，或可單獨投與以使得HBV ASO化合物與HBV治療劑各自之給藥在時間上於患者體內重疊。在相關實施例中，一或多種HBV治療劑可選自干擾素α-2b、干擾素α-2a及干擾素αcon-1(聚乙二醇化及非聚乙二醇化)、病毒唑；HBV RNA複製抑制劑；第二HBV反義化合物；HBV治療性疫苗；HBV防治性疫苗；拉米夫定(3TC)；恩替卡韋；泰諾福韋；替比夫定(LdT)；阿德福韋；及HBV抗體療法(單株或多株)。
實例 非限制性揭示及以引用方式併入
雖然已根據某些實施例特定描述本文所述之某些化合物、組合物及方法，但以下實例僅用以說明本文所述之化合物而不意欲限制其。本申請案中所述之各參考文獻以全文引用之方式併入本文中。
實例1：由靶向B型肝炎病毒基因序列之反義寡核苷酸對病毒HBV RNA之劑量依賴性抑制反義嵌合反義寡核苷酸經設計以靶向B型肝炎病毒基因序列。表1中之嵌合反義寡核苷酸係設計為2-10-2 LNA或3-10-3 LNA間隔體。一種反義寡核苷酸(即ISIS 510167)經設計而具有在其整個長度上交替之去氧核糖及LNA單元，如表中所呈 現。2-10-2間隔體之長度為14個核苷，其中中心間隔段包含10個2'-去氧核糖核苷且在兩側上(在5'及3'方向上)由各自包含2個鎖核酸(LNA)之翼區側接。3-10-3間隔體之長度為16個核苷，其中中心間隔段包含10個2'-去氧核糖核苷且在兩側上(在5'及3'方向上)由各自包含3個鎖核酸(LNA)之翼區側接。整個各間隔體當中之核苷間鍵聯為硫代磷酸酯(P=S)鍵聯。整個各間隔體當中之所有胞嘧啶殘基為5-甲基胞嘧啶。表1中之各反義寡核苷酸靶向SEQ ID NO：1(GENBANK寄存編號U95551.1)。『起始位點』指示病毒基因序列中由間隔體靶向之5'最末端核苷。『終止位點』指示病毒基因序列中由間隔體靶向之3'最末端核苷。下標表示以下化學基元：『d』=2'-去氧核糖；『l』=LNA；『s』=硫代酯(thioate ester)。符號『m』=2'-O-甲基核糖。
在分析中包括4-8-4間隔體ISIS 510166作為比較物。在HepG2.2.15細胞中以各種劑量測試新設計之間隔體。以每孔25,000個細胞之密度接種細胞且使用電穿孔以740 nM、2,222 nM、6,666 nM及20,0000 nM濃度之反義寡核苷酸轉染，如表2中所說明。在處理約16小時時段後，自細胞分離RNA且藉由定量即時PCR量測HBV mRNA含量。使用病毒引子探針組RTS3370(正向序列：CTTGGTCATGGGCCATCAG，本文指定為SEQ ID NO：15；反向序列：CGGCTAGGAGTTCCGCAGTA，本文指定為SEQ ID NO：16；探針序列：TGCGTGGAACCTTTTCGGCTCC，本文指 定為SEQ ID NO：17)量測mRNA含量。RTS3370偵測全長mRNA及前S1區、前S2區及前C區mRNA轉錄物之第二部分。根據如由RIBOGREEN®所量測之總RNA含量調整HBV mRNA含量。結果呈現為相對於未經處理之對照細胞對HBV之抑制百分比。
各寡核苷酸之半數最大抑制濃度(IC50)亦呈現於表2中且藉由繪製所用寡核苷酸濃度對在各濃度下達成之對HBV mRNA表現之抑制百分比的關係圖且記錄相較於對照對HBV mRNA表現達成50%抑制作用的寡核苷酸濃度來計算。如表2中所說明，在經反義寡核苷酸處理之細胞中HBV mRNA含量以劑量依賴性方式顯著降低。
實例2：在HepAD38細胞中對病毒HBV RNA之劑量依賴性抑制
在人類肝癌HepAD38細胞中以各種劑量測試來自實例1中所述之研究的間隔體，在該等細胞中HBV在四環素(tetracycline)調節之啟動子控制下產生。以每孔45,000個細胞之密度接種細胞且使用電穿孔以740 nM、2,222 nM、6,666 nM及20,0000 nM濃度之反義寡核苷酸轉染， 如表3中所說明。在處理約16小時時段後，自細胞分離RNA且藉由定量即時PCR量測HBV mRNA含量。使用病毒引子探針組RTS3372(正向序列：ATCCTATCAACACTTCCGGAAACT，本文指定為SEQ ID NO：36；反向序列：CGACGCGGCGATTGAG，本文指定為SEQ ID NO：37；探針序列：AAGAACTCCCTCGCCTCGCAGACG，本文指定為SEQ ID NO：38)量測mRNA含量。RTS3372偵測全長基因組序列。根據如由RIBOGREEN®所量測之總RNA含量調整HBV mRNA含量。結果呈現為相對於未經處理之對照細胞對HBV之抑制百分比。
各寡核苷酸之半數最大抑制濃度(IC50)亦呈現於表3中。如表3中所說明，在經反義寡核苷酸處理之細胞中HBV mRNA含量以劑量依賴性方式顯著降低。
亦使用RTS3373MGB引子探針組(正向序列：CCGACCTTGAGGCATACTTCA，本文指定為SEQ ID NO：39；反向序列：AATTTATGCCTACAGCCTCCTAGTACA，本文指定為SEQ ID NO：40；探針序列：TTAAAGACTGGGAGGAGTTG，本文指定為SEQ ID NO：41)量測mRNA含量。RTS3373MGB偵測全長mRNA及前S1區、前S2區、前C區及前X區mRNA轉錄物之第二部分。結果呈現於表4中。
<110> Eric E.Swayze Robert Hamatake
<120> B型肝炎病毒(HBV)表現之調節
<130> BIOL0152TW
<160> 41
<170> FastSEQ for Windows Version 4.0
<210> 1
<211> 3182
<212> DNA
<213> B型肝炎病毒
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<212> DNA
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<223> 合成寡核苷酸
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<223> 合成寡核苷酸
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<223> 合成寡核苷酸
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<223> 合成寡核苷酸
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<223> 合成寡核苷酸
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<223> 合成寡核苷酸
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<223> 合成寡核苷酸
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<223> 引子
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<212> DNA
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<223> 探針
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<223> 合成寡核苷酸
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<223> 合成寡核苷酸
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<223> 合成寡核苷酸
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<223> 合成寡核苷酸
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<223> 合成寡核苷酸
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<400> 41

Claims (38)

  1. 一種化合物，其包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸由10至30個連接之核苷組成且具有包含核鹼基序列SEQ ID NO：18至35中任一者之至少8個連續核鹼基的核鹼基序列，其中該經修飾之寡核苷酸為嵌合寡核苷酸且其中該經修飾之寡核苷酸與SEQ ID NO：1至少95%互補。
  2. 如申請專利範圍第1項之化合物，其中該經修飾之寡核苷酸與SEQ ID NO：1至少99%互補。
  3. 如申請專利範圍第1項之化合物，其中該經修飾之寡核苷酸與SEQ ID NO：1 100%互補。
  4. 如申請專利範圍第1項之化合物，其由單股經修飾寡核苷酸組成。
  5. 如申請專利範圍第1項之化合物，其中至少一個核苷間鍵聯為經修飾之核苷間鍵聯。
  6. 如申請專利範圍第5項之化合物，其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯核苷間鍵聯。
  7. 如申請專利範圍第1項之化合物，其中該經修飾之寡核苷酸之至少一個核苷包含經修飾之糖。
  8. 如申請專利範圍第7項之化合物，其中該至少一個經修飾之糖為雙環糖。
  9. 如申請專利範圍第8項之化合物，其中該至少一個雙環糖各自包含4'-CH2-N(R)-O-2'橋，其中R獨立地為H、 C1-C12烷基或保護基。
  10. 如申請專利範圍第9項之化合物，其中該經修飾之糖包含4'-CH2-O-2'基團。
  11. 如申請專利範圍第1項之化合物，其中至少一個核苷包含經修飾之核鹼基。
  12. 如申請專利範圍第11項之化合物，其中該經修飾之核鹼基為5-甲基胞嘧啶。
  13. 如申請專利範圍第1項之化合物，其中該經修飾之寡核苷酸包含：由連接之去氧核苷組成的間隔段；由連接之核苷組成的5'翼段；及由連接之核苷組成的3'翼段；其中該間隔段位於該5'翼段與該3'翼段之間且其中各翼段之各核苷包含經修飾之糖。
  14. 如申請專利範圍第13項之化合物，其中該經修飾之寡核苷酸包含：由10個連接之去氧核苷組成的間隔段；由3個連接之核苷組成的5'翼段；及由3個連接之核苷組成的3'翼段；其中該間隔段位於該5'翼段與該3'翼段之間且其中各翼段之各核苷包含經修飾之糖。
  15. 如申請專利範圍第13項之化合物，其中該經修飾之寡核苷酸包含：由10個連接之去氧核苷組成的間隔段； 由2個連接之核苷組成的5'翼段；及由2個連接之核苷組成的3'翼段；其中該間隔段位於該5'翼段與該3'翼段之間且其中各翼段之各核苷包含經修飾之糖。
  16. 如申請專利範圍第13項之化合物，其中該經修飾之寡核苷酸包含：由10個連接之去氧核苷組成的間隔段；由2個連接之核苷組成的5'翼段；及由2個連接之核苷組成的3'翼段；其中該間隔段位於該5'翼段與該3'翼段之間且其中各翼段之各核苷包含雙環糖。
  17. 如申請專利範圍第13項之化合物，其中該經修飾之寡核苷酸包含：由10個連接之去氧核苷組成的間隔段；由3個連接之核苷組成的5'翼段；及由3個連接之核苷組成的3'翼段；其中該間隔段位於該5'翼段與該3'翼段之間，其中各翼段之各核苷包含4'-CH2-O-2'橋；且其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯。
  18. 如申請專利範圍第1項之化合物，其中該經修飾之寡核苷酸由16個連接之核苷組成。
  19. 如申請專利範圍第1項之化合物，其中該經修飾之寡核苷酸由14個連接之核苷組成。
  20. 如申請專利範圍第1項之化合物，其中該經修飾之寡 核苷酸由15至30個連接之核苷組成。
  21. 一種化合物，其包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸由10至30個連接之核苷組成且包含具有至少8個連續核鹼基且與SEQ ID NO：1之以下核苷酸互補的部分：核苷酸258至274、258至273、259至272、260至273、414至429、414至432、414至430、415至30、417至432、415至432、415至428、416至429、416至426、418至431、602至617、603至616、639至654、639至658、639至655、640至658、640至653、640至655、641至654、643至658或644至657，其中該經修飾之寡核苷酸與SEQ ID NO：1至少90%互補。
  22. 一種組合物，其包含如申請專利範圍第1項至第21項中任一項之化合物或其鹽以及至少一種醫藥學上可接受之載劑或稀釋劑。
  23. 一種方法，其包括投與動物如申請專利範圍第1項至第22項中任一項之化合物或組合物。
  24. 如申請專利範圍第23項之方法，其中該動物為人類。
  25. 如申請專利範圍第23項之方法，其中投與該化合物可預防、治療、改善HBV相關疾病、病症或病狀或減緩HBV相關疾病、病症或病狀進展。
  26. 如申請專利範圍第25項之方法，其中該疾病、病症或病狀為肝臟疾病。
  27. 如申請專利範圍第26項之方法，其中該疾病、病症或病狀為黃疸、肝臟炎症、肝纖維化、炎症、肝硬化、 肝臟衰竭、彌漫性肝細胞性發炎性疾病、噬血細胞性症候群、血清肝炎、HBV病毒血症或與移植相關之肝臟疾病。
  28. 如申請專利範圍第26項之方法，其中該疾病或病狀為過度增殖性病狀。
  29. 如申請專利範圍第28項之方法，其中該過度增殖性病狀為肝癌。
  30. 一種降低動物之抗原含量的方法，其包括投與該動物如申請專利範圍第1項之化合物。
  31. 如申請專利範圍第30項之方法，其中降低HBsAG含量。
  32. 如申請專利範圍第30項之方法，其中降低HBeAG含量。
  33. 如申請專利範圍第30項之方法，其中該動物為人類。
  34. 如申請專利範圍第23項之方法，其包括共同投與該化合物或組合物與第二藥劑。
  35. 如申請專利範圍第23項之方法，其包括共同投與該化合物或組合物與第二藥劑。
  36. 如申請專利範圍第35項之方法，其中該化合物或組合物與該第二藥劑並行投與。
  37. 一種化合物，其包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸由10至30個連接之核苷組成且具有包含含至少8個連續核鹼基且與SEQ ID NO：1之以下核鹼基之等長部分互補之部分的核鹼基序列：核鹼基258至274、 258至273、259至272、260至273、414至429、414至432、414至430、415至30、417至432、415至432、415至428、416至429、416至426、418至431、602至617、603至616、639至654、639至658、639至655、640至658、640至653、640至655、641至654、643至658或644至657，其中該經修飾之寡核苷酸之該核鹼基序列與SEQ ID NO：1互補。
  38. 一種化合物，其包含經修飾之寡核苷酸，該經修飾之寡核苷酸由10至30個連接之核苷組成且其所具有的核鹼基序列包含具有至少8個連續核鹼基且與SEQ ID NO：1之以下核鹼基之等長部分互補的部分：核鹼基258至274、258至273、259至272、260至273、414至429、414至432、414至430、415至30、417至432、415至432、415至428、416至429、416至426、418至431、602至617、603至616、639至654、639至658、639至655、640至658、640至653、640至655、641至654、643至658或644至657，其中該經修飾之寡核苷酸之該核鹼基序列與SEQ ID NO：1互補且包含：由10個連接之去氧核苷組成的間隔段；由3個連接之核苷組成的5'翼段；及由3個連接之核苷組成的3'翼段；其中該間隔段位於該5'翼段與該3'翼段之間，其中各翼段之各核苷包含4'-CH2-O-2'橋；且其中各核苷間鍵聯為硫代磷酸酯鍵聯。
TW101114285A 2011-04-21 2012-04-20 Ｂ型肝炎病毒（ｈｂｖ）表現之調節 TW201303013A (zh)

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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
BR112012008865A2 (pt) 2009-10-16 2019-09-24 Glaxo Group Ltd inibidores de hbv anti-sentido.
CN111172162A (zh) 2011-04-21 2020-05-19 葛兰素史克公司 乙型肝炎病毒(hbv)表达的调节
CN117126846A (zh) 2012-11-15 2023-11-28 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 寡核苷酸缀合物
JP6580993B2 (ja) 2013-01-30 2019-09-25 エフ．ホフマン−ラ ロシュ アーゲーＦ． Ｈｏｆｆｍａｎｎ−Ｌａ Ｒｏｃｈｅ Ａｋｔｉｅｎｇｅｓｅｌｌｓｃｈａｆｔ Ｌｎａオリゴヌクレオチド糖質コンジュゲート
EP3633039A1 (en) 2013-05-01 2020-04-08 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods
US9943604B2 (en) 2013-09-20 2018-04-17 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Targeted therapeutic nucleosides and their use
CN106255755B (zh) 2014-05-01 2020-07-24 Ionis制药公司 用于调节血管生成素样蛋白3表达的组合物和方法
PE20170010A1 (es) 2014-05-01 2017-03-04 Ionis Pharmaceuticals Inc Composiciones y metodos para modular la expresion del factor b del complemento
GB201408623D0 (en) 2014-05-15 2014-07-02 Santaris Pharma As Oligomers and oligomer conjugates
WO2015179693A1 (en) 2014-05-22 2015-11-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Conjugated antisense compounds and their use
JP2018531605A (ja) 2015-11-06 2018-11-01 アイオーニス ファーマシューティカルズ， インコーポレーテッドＩｏｎｉｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ． アポリポタンパク質（ａ）発現の調節
EP3522898A4 (en) 2016-10-06 2020-05-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. METHOD FOR CONJUGATING OLIGOMERIC COMPOUNDS
TW202340468A (zh) * 2022-01-10 2023-10-16 中國大陸商杭州浩博醫藥有限公司 B型肝炎病毒(hbv)表現之調節

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1200115C (zh) * 2002-10-14 2005-05-04 山东省医药生物技术研究中心 寡核苷酸芯片及其在乙型肝炎病毒突变位点检测中的应用
AU2009305636A1 (en) * 2008-10-15 2010-04-22 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of Factor 11 expression

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