JP7365052B2 - 核酸、当該核酸を含む組成物及び複合体ならびに調製方法と使用 - Google Patents

核酸、当該核酸を含む組成物及び複合体ならびに調製方法と使用 Download PDF

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Description

本開示は、核酸、当該核酸を含む組成物及び複合体ならびに調製方法と使用に関する。
脂質（血中脂質）異常は、高脂血症とも呼ばれ、脂肪代謝又は作動の異常により、血漿脂質が正常値より高くなる全身性疾患であり、全世界の患者の健康に深刻な脅威を与えている。従来の脂質異常治療薬としては、主にスタチン系、コレステロール吸収阻害剤、樹脂系、プロブコール、フィブラート系及びニコチン酸並びにその誘導体がある。
アポリポタンパクＣ３（ＡＰＯＣ３）は、脂質代謝において重要な役割を有しており、ＡＰＯＣ３突然変異遺伝子を保有するヒトの血液循環におけるＡＰＯＣ３の発現量は４６％低下し、血漿中トリグリセリドレベルが一般人よりも３９％低下するとともに、脂質レベルが低いため、ＡＰＯＣ３突然変異遺伝子の保有者が心臓病に罹患するリスクを、非保有者よりも３５．１％低下させることができる。したがって、遺伝子レベルで遺伝子発現をサイレンシングさせ、ＡＰＯＣ３の生成を遮断することを可能にすれば、最も理想的な治療手段となることが疑いない。また、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｍａｌｌ ｉｎｔｅｒｆｅｒｉｎｇ ＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ）は、ＲＮＡ干渉（ＲＮＡ ｉｎｔｅｒｆｅｒｅｎｃｅ、ＲＮＡｉ）という機構に基づき、興味あるいずれかの目的とする遺伝子の発現を配列特異的に抑制又は遮断し、疾患を治療する目的を達成することができる。
低分子ＲＮＡ薬物の開発では、ｓｉＲＮＡの安定化修飾及びその送達系は、２つのキー技術である。
いくつかの実施形態において、本開示は、式（１）に示される構造を有するｓｉＲＮＡ複合体（コンジュゲート）を提供する。
式中、
ｎ１は、１～３から選択される整数であり、ｎ３は、０～４から選択される整数であり、
ｍ１、ｍ２及びｍ３は独立して、２～１０から選択される整数であり、
Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４及びＲ１５は、それぞれ独立して、Ｈであり、又はＣ１－Ｃ１０アルキル基、Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基及びＣ１－Ｃ１０アルコキシ基からなる群から選択され、
Ｒ３は式Ａ５９に示される構造の基である。
式中、Ｅ１はＯＨ、ＳＨ又はＢＨ２であり、ＮｕはｓｉＲＮＡである。
前記ｓｉＲＮＡにおける各ヌクレオチドは、それぞれ独立して修飾又は未修飾のヌクレオチドであり、前記ｓｉＲＮＡは、センス鎖とアンチセンス鎖を含み、前記センス鎖は、配列番号１に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、３つ以下のヌクレオチド差異があるヌクレオチド配列１を含み、前記アンチセンス鎖は、配列番号２に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、３つ以下のヌクレオチド差異があるヌクレオチド配列２を含み、前記ヌクレオチド配列１と前記ヌクレオチド配列２とは、少なくとも一部で逆相補的に二本鎖領域を形成し、
５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺ－３’（配列番号１）、
５’－Ｚ’ＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧ－３’（配列番号２）
ただし、ＺはＡであり、Ｚ’はＵであり、
前記ヌクレオチド配列１に、位置がＺに対応するヌクレオチドＺＡが含まれ、前記ヌクレオチド配列２に、位置がＺ’に対応するヌクレオチドＺ’Ｂが含まれ、前記Ｚ’Ｂは、前記アンチセンス鎖の５’末端の１番目のヌクレオチドである。
Ｒ２は、長さ１～２０の炭素原子の直鎖アルキレン基であり、そのうちの１又は複数の炭素原子が、Ｃ（Ｏ）、ＮＨ、Ｏ、Ｓ、ＣＨ=Ｎ、Ｓ（Ｏ）２、Ｃ２－Ｃ１０アルケニレン基、Ｃ２－Ｃ１０アルキニレン基、Ｃ６－Ｃ１０アリーレン基、Ｃ３－Ｃ１８ヘテロシクリレン基及びＣ５－Ｃ１０ヘテロアリーレン基からなる群から選択される１又は複数で任意に置換され、Ｒ２は、Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、Ｃ６－Ｃ１０アリール基、Ｃ５－Ｃ１０ヘテロアリール基、Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、－ＯＣ１－Ｃ１０アルキル基、－ＯＣ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＯＨ、－ＯＣ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、－ＳＣ１－Ｃ１０アルキル基、－ＳＣ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＳＨ、－ＳＣ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、ハロゲン置換基、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＨ２、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＮＨ２、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、シアノ基、ニトロ基、－ＣＯ２Ｈ、－Ｃ（Ｏ）Ｏ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮＨ２、－ＮＨＣ（Ｏ）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨＣ（Ｏ）（フェニル基）、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル）Ｃ（Ｏ）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル）Ｃ（Ｏ）（フェニル基）、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０ハロアルキル基、－ＯＣ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、－ＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＳＯ２（フェニル基）、－ＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基）、－ＳＯ２ＮＨ２、－ＳＯ２ＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＳＯ２ＮＨ（フェニル基）、－ＮＨＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨＳＯ２（フェニル基）及び－ＮＨＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基）からなる群のいずれか１つ又は複数の置換基を任意に有してもよい。
各Ｌ１は、長さ１～７０の炭素原子の直鎖アルキレン基であり、そのうちの１又は複数の炭素原子が、Ｃ（Ｏ）、ＮＨ、Ｏ、Ｓ、ＣＨ=Ｎ、Ｓ（Ｏ）２、Ｃ２－Ｃ１０アルケニレン基、Ｃ２－Ｃ１０アルキニレン基、Ｃ６－Ｃ１０アリーレン基、Ｃ３－Ｃ１８ヘテロシクリレン基及びＣ５－Ｃ１０ヘテロアリーレン基からなる群から選択される１又は複数で任意に置換され、Ｌ１は、Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、Ｃ６－Ｃ１０アリール基、Ｃ５－Ｃ１０ヘテロアリール基、Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、－ＯＣ１－Ｃ１０アルキル基、－ＯＣ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＯＨ、－ＯＣ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、－ＳＣ１－Ｃ１０アルキル基、－ＳＣ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＳＨ、－ＳＣ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、ハロゲン置換基、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＨ２、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＮＨ２、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、シアノ基、ニトロ基、－ＣＯ２Ｈ、－Ｃ（Ｏ）Ｏ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮＨ２、－ＮＨＣ（Ｏ）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨＣ（Ｏ）（フェニル基）、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル）Ｃ（Ｏ）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル）Ｃ（Ｏ）（フェニル基）、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０ハロアルキル基、－ＯＣ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、－ＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＳＯ２（フェニル基）、－ＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基）、－ＳＯ２ＮＨ２、－ＳＯ２ＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＳＯ２ＮＨ（フェニル基）、－ＮＨＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨＳＯ２（フェニル基）及び－ＮＨＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基）からなる群のいずれか１つ又は複数の置換基を任意に有してもよい。
いくつかの実施形態において、各Ｌ１は、式Ａ１～Ａ２６の基から独立して選択される１又は複数の結合の組合せである。
ただし、ｊ１は１～２０の整数であり、ｊ２は１～２０の整数であり、
Ｒ’はＣ１－Ｃ１０のアルキル基であり、
Ｒａは、式Ａ２７～Ａ４５の基又はその任意の組合せからなる群から選択される。
ＲｂはＣ１－Ｃ１０のアルキル基であり、
は、基が分子の残りの部分に結合される部位を表し、
Ｍ１は標的基を表す。
いくつかの実施形態において、本開示は、ホスホルアミダイト固相合成の条件で、それぞれｓｉＲＮＡのセンス鎖及びアンチセンス鎖のヌクレオチド種類と順序により、３’から５’に向かってヌクレオシドモノマーを順に結合し、各ヌクレオシドモノマーの結合は脱保護、カップリング、キャッピング、酸化又は硫化の４つの反応を含み、ｓｉＲＮＡのセンス鎖及びアンチセンス鎖を単離し、アニールを行うことを含む複合体の調製方法を提供する。前記ｓｉＲＮＡにおける各ヌクレオチドは、それぞれ独立して修飾又は未修飾のヌクレオチドであり、前記ｓｉＲＮＡは、センス鎖とアンチセンス鎖を含み、前記センス鎖は、配列番号１に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、３つ以下のヌクレオチド差異があるヌクレオチド配列１を含み、前記アンチセンス鎖は、配列番号２に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、３つ以下のヌクレオチド差異があるヌクレオチド配列２を含み、前記ヌクレオチド配列１と前記ヌクレオチド配列２とは、少なくとも一部で逆相補的に二本鎖領域を形成し、
５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺ－３’（配列番号１）、
５’－Ｚ’ＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧ－３’（配列番号２）
ただし、ＺはＡであり、Ｚ’はＵであり、
前記ヌクレオチド配列１に、位置がＺに対応するヌクレオチドＺＡが含まれ、前記ヌクレオチド配列２に、位置がＺ’に対応するヌクレオチドＺ’Ｂが含まれ、前記Ｚ’Ｂは、前記アンチセンス鎖の５’末端の１番目のヌクレオチドである。
また、当該方法は、カップリング反応条件下及びカップリング試薬の存在下で、式（３２１）に示される化合物を、ヌクレオシドモノマー又は固相担体に結合されたヌクレオチド配列と接触させ、式（３２１）に示される化合物をカップリング反応させてヌクレオチド配列に結合することをさらに含む。以下に、式（３２１）に示される化合物は、複合分子とも呼ばれる。
式中、
Ｒ４は、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡに結合できる部分である。いくつかの実施形態において、Ｒ４は、共有結合によりＮｕに示されるｓｉＲＮＡに結合することができる部分である。いくつかの実施形態において、Ｒ４は、反応させてリン酸ジエステル結合によりＮｕに示されるｓｉＲＮＡの任意の官能基に複合されることができる部分であり、
各Ｓ１は、独立してＭ１において全ての活性ヒドロキシ基がＹＣＯＯ－基で置換された基であり、各Ｙは、メチル基、トリフルオロメチル基、ジフルオロメチル基、フルオロメチル基、トリクロロメチル基、ジクロロメチル基、クロロメチル基、エチル基、ｎ－プロピル基、イソプロピル基、フェニル基、ハロフェニル基及びアルキルフェニル基から独立して選択される１つである。
ｎ１、ｎ３、ｍ１、ｍ２、ｍ３、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４、Ｒ１５、Ｌ１、Ｍ１それぞれの定義と選択可能な範囲は、前述したとおりである。
いくつかの実施形態において、本開示は、ＡＰＯＣ３遺伝子発現を抑制できる修飾ｓｉＲＮＡを提供し、当該ｓｉＲＮＡは、センス鎖とアンチセンス鎖を含み、前記センス鎖及びアンチセンス鎖の各ヌクレオチドは、いずれも修飾ヌクレオチドであり、前記センス鎖及びアンチセンス鎖は、いずれもフルオロ修飾ヌクレオチド及び非フルオロ修飾ヌクレオチドを含み、前記センス鎖は、ヌクレオチド配列Ｉを含み、前記アンチセンス鎖は、ヌクレオチド配列ＩＩを含み、前記ヌクレオチド配列Ｉと前記ヌクレオチド配列ＩＩとは、少なくとも一部で逆相補的に二本鎖領域を形成し、前記ヌクレオチド配列Ｉは、配列番号１に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、３つ以下のヌクレオチド差異があるヌクレオチド配列Ａを含み、前記ヌクレオチド配列ＩＩは、配列番号２に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、３つ以下のヌクレオチド差異があるヌクレオチド配列Ｂを含み、
５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺ－３’（配列番号１）、
５’－Ｚ’ＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧ－３’（配列番号２）
ただし、ＺはＡであり、Ｚ’はＵであり、
前記ヌクレオチド配列Ａに、位置がＺに対応するヌクレオチドＺＡが含まれ、前記ヌクレオチド配列Ｂに、位置がＺ’に対応するヌクレオチドＺ’Ｂが含まれ、前記Ｚ’Ｂは、前記アンチセンス鎖の５’末端の１番目のヌクレオチドである。
前記フルオロ修飾ヌクレオチドは、ヌクレオチド配列Ａとヌクレオチド配列Ｂに位置し、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列Ａの第７、８、９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列Ｂの第２、６、１４、１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドである。
いくつかの実施形態において、本開示は、本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物及び／又はｓｉＲＮＡ複合体の、アポリポタンパクＣ３（ＡＰＯＣ３）の過剰発現による脂質異常の治療及び／又は予防のための薬物の調製への使用を提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物及び／又はｓｉＲＮＡ複合体の有効量を脂質異常に罹患している被験体に投与することを含む、脂質異常の治療方法を提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物及び／又はｓｉＲＮＡ複合体の有効量を肝細胞と接触させることを含む、前記肝細胞におけるＡＰＯＣ３遺伝子の発現の抑制方法を提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物及び／又はｓｉＲＮＡ複合体を含むキットを提供する。
［引用による組み込み］
本明細書で言及される全ての出版物、特許及び特許出願は、各々の出版物、特許及び特許出願が特別にかつ個別に引用により本明細書に組み込まれるのと同じ程度に、引用により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態において、本開示により提供されるｓｉＲＮＡ、当該ｓｉＲＮＡを含む組成物又はｓｉＲＮＡ複合体は、体内でより高い安定性及び／又はより高い活性を有することができる。いくつかの実施形態において、本開示により提供されるｓｉＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ組成物又はｓｉＲＮＡ複合体は、体内で少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％又は９５％の標的遺伝子発現抑制率を示す。いくつかの実施形態において、本開示により提供されるｓｉＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ組成物又はｓｉＲＮＡ複合体は、体内で少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％又は９５％のＡＰＯＣ３遺伝子発現抑制率を示す。いくつかの実施形態において、本開示により提供されるｓｉＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ組成物又はｓｉＲＮＡ複合体は、体内で少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％又は９５％の肝内ＡＰＯＣ３遺伝子発現抑制率を示す。いくつかの実施形態において、本開示により提供されるｓｉＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ組成物又はｓｉＲＮＡ複合体は、体内で少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％又は９５％の動物モデルにおける肝内ＡＰＯＣ３遺伝子発現抑制率を示す。いくつかの実施形態において、本開示により提供されるｓｉＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ組成物又はｓｉＲＮＡ複合体は、体内で少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％又は９５％のヒト被験体における肝内ＡＰＯＣ３遺伝子発現抑制率を示す。いくつかの実施形態において、本開示により提供されるｓｉＲＮＡ、当該ｓｉＲＮＡを含む組成物又はｓｉＲＮＡ複合体は、明らかなオフターゲット効果を示していない。オフターゲット効果は、例えば、標的遺伝子でない遺伝子の正常発現の抑制であってもよい。オフターゲット遺伝子発現の結合／抑制がオンターゲット遺伝子効果に比べて５０％、４０％、３０％、２０％又は１０％を下回る場合、当該オフターゲット効果が顕著ではないと考えられている。
いくつかの実施形態において、本開示により提供されるｓｉＲＮＡ複合体は、１ｍｇ／ｋｇの用量で高脂血症モデルマウスの肝臓における少なくとも８８％のＡＰＯＣ３遺伝子発現を抑制するという優れたＡＰＯＣ３遺伝子発現抑制特性を示す。特に、従来技術で提供される複合分子により形成された複合体に比べて、本開示により提供される修飾ｓｉＲＮＡとｓｉＲＮＡ複合体は、優れた遺伝子抑制率及び低いオフターゲット効果を示す。また、本開示により提供されるｓｉＲＮＡ複合体は、低用量、低投与頻度の場合に、１８９日間と長期間にわたって優れた脂質抑制作用を示し続けることができる。
このように、本明細書で提供されるｓｉＲＮＡ、薬物組成物及びｓｉＲＮＡ複合体は、標的細胞遺伝子の発現を効率的に低下させるとともに、優れた潜在的送達能力を示すことができる。
本開示の他の特徴と利点については、後述する発明を実施するための形態部分において詳しく説明する。
本発明の実施例及び従来技術の技術的解決手段をより明瞭に説明するために、以下に、実施例と従来技術に用いられる図面を簡単に説明する。以下に説明される図面は、単なる本発明のいくつかの実施例に過ぎず、当業者であれば、創造的な労力を要することなく、さらにこれらの図面により他の図面を得られることが明らかである。
複合体Ｆ１～Ｆ５の体外ｐｓｉＣＨＥＣＫ系における抑制活性を示す。 Ｄ１４日に複合体１によるヒトＡＰＯＣ３トランスジェニックマウス肝組織におけるＡＰＣＯ３ ｍＲＮＡ発現量に対する抑制率を示す。 異なる用量の複合体１による脂質に対する抑制率を示し、血清総コレステロール（ＣＨＯ）及びトリグリセリド（ＴＧ）で表す。 血清総コレステロール（ＣＨＯ）及びトリグリセリド（ＴＧ）を指標とし、異なる用量の複合体２による脂質に対する抑制率を示す。 血清中総コレステロール（ＣＨＯ）及びトリグリセリド（ＴＧ）を指標とし、異なる用量の複合体１～３による脂質に対する抑制率を示す。
以下に本開示の発明を実施するための形態を詳しく説明する。また、ここで説明される発明を実施するための形態は、本開示を説明又は解釈するためのものに過ぎず、本開示を制限するためのものではないと理解すべきである。
本開示において、ＡＰＯＣ３遺伝子とは、ｍＲＮＡ配列がＧｅｎｂａｎｋ登録番号ＮＭ＿００００４０．１に示される遺伝子を指す。前記標的ｍＲＮＡ配列は、ＮＭ＿００００４０．１に示される。
定義
文脈において、特に説明がない限り、大文字Ｃ、Ｇ、Ｕ、Ａは、ヌクレオチドの塩基組成を表し、小文字ｍは、当該文字ｍの左側に隣接する１つのヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドであることを表し、小文字ｆは、当該文字ｆの左側に隣接する１つのヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであることを表し、小文字ｓは、当該文字ｓの左右に隣接する２つのヌクレオチド間がチオリン酸エステル基により結合されていることを表し、Ｐ１は、当該Ｐ１の右側に隣接する１つのヌクレオチドが５’－リン酸ヌクレオチド又は５’－リン酸アナログ修飾ヌクレオチドであることを表し、組合せ文字ＶＰは、当該組合せ文字ＶＰの右側に隣接する１つのヌクレオチドがビニルリン酸エステル修飾ヌクレオチドであることを表し、組合せ文字Ｐｓは、当該組合せ文字Ｐｓの右側に隣接する１つのヌクレオチドがチオリン酸エステル修飾ヌクレオチドであることを表し、大文字Ｐは、当該文字Ｐの右側に隣接する１つのヌクレオチドが５’－リン酸ヌクレオチドであることを表す。
文脈において、前記「フルオロ修飾ヌクレオチド」とは、ヌクレオチドのリボース基の２’位のヒドロキシ基がフッ素で置換されたヌクレオチドを指し、「非フルオロ修飾ヌクレオチド」とは、ヌクレオチドのリボース基の２’位のヒドロキシ基が非フッ素化基で置換されたヌクレオチド又はヌクレオチドアナログを指す。「ヌクレオチドアナログ」とは、核酸においてヌクレオチドの代わりとなることができるが、アデニンリボヌクレオチド、グアニンリボヌクレオチド、シトシンリボヌクレオチド、ウラシルリボヌクレオチド又はチミンデオキシリボヌクレオチドと構造が異なる基を指し、例えば、イソヌクレオチド、架橋ヌクレオチド（ｂｒｉｄｇｅｄ ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄ、ＢＮＡと略称される）又は非環式ヌクレオチドがある。前記「メトキシ修飾ヌクレオチド」とは、リボース基の２’－ヒドロキシ基がメトキシで置換されたヌクレオチドを指す。
本明細書の文脈において、「相補」又は「逆相補」という用語は、互換的に使用されてもよく、当業者に周知の意味、即ち、二本鎖核酸分子において、一方の鎖の塩基と他方の鎖上の塩基とが相補的に対合するという意味を有する。ＤＮＡにおいて、プリン塩基であるアデニン（Ａ）は、常にピリミジン塩基であるチミン（Ｔ）（又は、ＲＮＡにおいてウラシル（Ｕ）である）と対合し、プリン塩基であるグアニン（Ｃ）は、常にピリミジン塩基であるシトシン（Ｇ）と対合する。各塩基対は、いずれも１つのプリンと１つのピリミジンを含む。一方の鎖上のアデニンが常に他方の鎖上のチミン（又はウラシル）と対合するとともに、グアニンが常にシトシンと対合する場合、両方の鎖同士が相補的である、またその相補鎖の配列から当該鎖の配列を推知できると考えられる。これに応じて、「ミスマッチ」は、本分野では、二本鎖核酸において、対応する位置での塩基が相補的に対合して存在しないことを意味する。
文脈において、特に説明がない限り、「基本的に逆相補的である」とは、関連する２つのヌクレオチド配列間に３つ以下の塩基ミスマッチが存在することを指し、「実質的に逆相補的である」とは、２つのヌクレオチド配列間に１つ以下の塩基ミスマッチが存在することを指し、「完全に相補的である」とは、２つのヌクレオチド配列間に塩基ミスマッチが存在しないことを指す。
文脈において、一方のヌクレオチド配列と他方のヌクレオチド配列に「ヌクレオチド差異」が存在するとは、前者が後者に比べて、同じ位置のヌクレオチドの塩基種類が変化したことを指し、例えば、後者において１つのヌクレオチド塩基がＡであるとき、前者の同じ位置での、対応するヌクレオチド塩基がＵ、Ｃ、Ｇ又はＴである場合に、当該位置で２つのヌクレオチド配列間にヌクレオチド差異が存在すると認められている。いくつかの実施形態において、元の位置のヌクレオチドの代わりに無塩基ヌクレオチド又はその等価物を用いる場合、当該位置でヌクレオチド差異が生じたとも考えられる。
文脈において、特に本開示のｓｉＲＮＡ、ｓｉＲＮＡを含む組成物又はｓｉＲＮＡ複合体の調製方法を説明する際に、特に説明がない限り、前記ヌクレオシドモノマー（ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅ ｍｏｎｏｍｅｒ）とは、調製するｓｉＲＮＡ又はｓｉＲＮＡ複合体におけるヌクレオチドの種類と順序に応じてホスホルアミダイト固相合成に用いられる修飾又は未修飾のヌクレオシドホスホルアミダイトモノマー（ｕｎｍｏｄｉｆｉｅｄ ｏｒ ｍｏｄｉｆｉｅｄ ＲＮＡ ｐｈｏｓｐｈｏｒａｍｉｄｉｔｅｓ。ＲＮＡ ｐｈｏｓｐｈｏｒａｍｉｄｉｔｅｓをＮｕｃｌｅｏｓｉｄｅ ｐｈｏｓｐｈｏｒａｍｉｄｉｔｅｓともいうことがある）を指す。ホスホルアミダイト固相合成は、当業者に公知のＲＮＡ合成に用いられる方法である。本開示に用いられるヌクレオシドモノマーは、いずれも市販品として購入可能である。
本開示の文脈において、特に説明がない限り、「複合」とは、それぞれ特定の機能を有する２つ以上の化学部分間が共有結合的に互いに結合することを指し、これに応じて、「複合体」とは、当該各化学部分間が共有結合的に結合することにより形成された化合物を指す。さらには、「ｓｉＲＮＡ複合体」は、特定の機能を有する１又は複数の化学部分がｓｉＲＮＡに共有結合的に結合して形成された化合物を表す。以下に、本開示のｓｉＲＮＡ複合体を単に「複合体」ともいうことがある。ｓｉＲＮＡ複合体は、文脈により、ｓｉＲＮＡ複合体の総称、第1種のｓｉＲＮＡ複合体又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体であると理解される。本開示の文脈において、「複合分子」は、反応させることによりｓｉＲＮＡに複合され、最終的に本開示のｓｉＲＮＡ複合体を形成することができる特定の化合物であると理解すべきである。
本明細書で用いられる場合、２つのアルファベット文字間又は記号間のものでないダッシュ（「－」）は、置換基の結合点の位置を示すために用いられている。例えば、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＮＨ２は、Ｃ１－Ｃ１０アルキル基により結合する。
本明細書で用いられる場合、「任意の」又は「任意に」とは、続いて記載する事象又は状況が発生してもよく、発生しなくてもよいこと、並びに前記記載が事象又は状況が発生した場合と発生しない場合を含むことを指す。例えば、「任意に置換されたアルキル」は、以下の文章で定義される「アルキル」及び「置換アルキル」を含む。１又は複数の置換基を含む任意の基に関して、これらの基が、立体的に非現実的な、合成上実行不可能な及び／又は本質的に不安定な、いかなる置換又は置換パターンも導入することは意図されないと、当業者に理解される。
本明細書で用いられる場合、「アルキル」とは、特定の数の炭素原子を有する直鎖と分岐鎖を指し、前記特定の数は、通常１～２０個の炭素原子、例えば、１～１０個の炭素原子、１～８個又は１～６個の炭素原子である。例えば、Ｃ１－Ｃ６アルキルは、１～６個の炭素原子の直鎖と分岐鎖アルキルを含む。特定の数の炭素を有するアルキル残基を命名する場合、当該数の炭素を有する全ての分岐鎖及び直鎖形式を含むことを意図する。したがって、例えば、「ブチル」は、ｎ－ブチル、ｓｅｃ－ブチル、イソブチル及びｔｅｒｔ－ブチルを含むことを意味し、「プロピル」は、ｎ－プロピル及びイソプロピルを含む。アルキレンは、アルキルのサブセットであり、アルキルと同じであるが２つの結合点を有する残基を指す。
本明細書で用いられる場合、「アルケニル」とは、少なくとも１つの炭素－炭素二重結合を有する不飽和分岐鎖又は直鎖アルキルを指し、前記炭素－炭素二重結合は、親アルキルの隣接する炭素原子から１つの水素分子を除去することにより得られる。当該基は、二重結合のシス又はトランス配置にあってもよい。典型的なアルケニルとしては、ビニルと、プロパ－１－エン－１－イル、プロパ－１－エン－２－イル、プロパ－２－エン－１－イル（アリル）、プロパ－２－エン－２－イル等のプロペニルと、ブタ－１－エン－１－イル、ブタ－１－エン－２－イル、２－メチルプロパ－１－エン－１－イル、ブタ－２－エン－１－イル、ブタ－２－エン－２－イル、ブタ－１，３－ジエン－１－イル、ブタ－１，３－ジエン－２－イル等のブテニルと、を含むが、これらに限定されない。ある実施形態において、アルケニルは２～２０個の炭素原子を有し、他の実施形態においては、２～１０個、２～８個又は２～６個の炭素原子を有する。アルケニレンは、アルケニルのサブセットであり、アルケニルと同じであるが２つの結合点を有する残基を指す。
本明細書で用いられる場合、「アルキニル」とは、少なくとも１つの炭素－炭素三重結合を有する不飽和分岐鎖又は直鎖アルキル基を指し、前記炭素－炭素三重結合は、親アルキルの隣接する炭素原子から２つの水素分子を除去することにより得られる。典型的なアルキニルとしては、エチニルと、プロパ－１－イン－１－イル、プロパ－２－イン－１－イル等のプロピニルと、ブタ－１－イン－１－イル、ブタ－１－イン－３－イル、ブタ－３－イン－１－イル等のブチニルと、を含むが、これらに限定されない。ある実施形態において、アルキニルは２～２０個の炭素原子を有し、他の実施形態においては、２～１０、２～８又は２～６個の炭素原子を有する。アルキニレンは、アルキニルのサブセットであり、アルキニルと同じであるが２つの結合点を有する残基を指す。
本明細書で用いられる場合、「アルコキシ」とは、酸素橋により結合した特定の数の炭素原子のアルキルを指し、例えば、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、イソプロポキシ、ｎ－ブトキシ、ｓｅｃ－ブトキシ、ｔｅｒｔ－ブトキシ、ペンチルオキシ、２－ペンチルオキシ、イソペンチルオキシ、ネオペンチルオキシ、ヘキシルオキシ、２－ヘキシルオキシ、３－ヘキシルオキシ、３－メチルペンチルオキシ等がある。アルコキシは、通常１～１０個、１～８個、１～６個又は１～４個の、酸素橋により結合した炭素原子を有する。
本明細書で用いられる場合、「アリール」とは、芳香族単環式又は多環式炭化水素環系から誘導される、環炭素原子から水素原子を除去して形成された基を指す。前記芳香族単環式又は多環式炭化水素環系は、水素及び６～１８個の炭素原子の炭素のみを含有し、この環系中の環の少なくとも１つは完全不飽和であり、即ち、それは、ヒュッケル理論に従う環状、非局在化（４ｎ＋２）π－電子系を含む。アリールとしては、フェニル、フルオレニル及びナフチル等の基を含むが、これらに限定されない。アリーレンは、アリールのサブセットであり、アリールと同じであるが２つの結合点を有する残基を指す。
本明細書で用いられる場合、「シクロアルキル」とは、通常３～７個の環状炭素原子を有する非芳香族炭素環を指す。環は、飽和であってもよいし、１又は複数の炭素－炭素二重結合を有してもよい。シクロアルキルの実例としては、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロペンテニル、シクロヘキシル及びシクロヘキセニル、並びにノルボルナン（ｎｏｒｂｏｒｎａｎｅ）等の架橋及びカゴ状環状基を含む。
本明細書で用いられる場合、「ハロゲン置換基」又は「ハロ」とは、フルオロ、クロロ、ブロモ及びヨードを指し、用語「ハロゲン」は、フッ素、塩素、臭素及びヨウ素を含む。
本明細書で用いられる場合、「ハロゲン化アルキル」とは、特定の数の炭素原子が１又は複数、最大許容数までのハロゲン原子で置換された、上記のように定義されるアルキル基を指す。ハロゲン化アルキルの実例としては、トリフルオロメチル、ジフルオロメチル、２－フルオロエチル及びペンタフルオロエチルを含むが、これらに限定されない。
「複素環基」とは、２～１２個の炭素原子と、窒素、酸素及び硫黄から選択される１～６個のヘテロ原子とを含む、安定した３～１８員非芳香族環状基を指す。明細書において特に説明がない限り、複素環基は、単環、二環、三環又は四環系であり、縮合環又は架橋環系を含んでもよい。複素環式ラジカルにおけるヘテロ原子は、任意に酸化されてもよい。１又は複数の窒素原子（存在する場合）は、任意に４級化される。複素環基は、一部飽和又は完全飽和である。複素環基は、環の任意の原子を介して分子の残りの部分に結合することができる。このような複素環基の実例としては、ジオキサニル、チオフェニル［１，３］ジスルホニル、デカヒドロイソキノリニル、イミダゾリニル、イミダゾリジニル、イソチアゾリジニル、イソオキサゾリジニル、モルホリニル、オクタヒドロインドール、オクタヒドロイソインドール、２－オキサピペラジニル、２－オキサピペリジル、２－オキサピリミジニル、オキサゾリジニル、ピペリジル、ピペラジニル、４－ピペリドニル、ピロリジニル、ピラゾリジル、キヌクリジニル、チアゾリジニル、テトラヒドロフリル、トリスルホニル、テトラヒドロピラニル、チオモルホリニル、チアモルホリニル、１－オキソチオモルホリニル及び１，１－ジオキソチオモルホリニルを含むが、これらに限定されない。
「ヘテロアリール」とは、２個～１７個の炭素原子と、窒素、酸素及び硫黄から選択される１～６個のヘテロ原子とを含む、３～１８員芳香環ラジカルから誘導される基を指す。本明細書で用いられる場合、ヘテロアリールは、単環、二環、三環又は四環系であってもよく、この環系中の環の少なくとも１つは完全不飽和であり、即ち、それは、ヒュッケル理論に従う環状非局在化（４ｎ＋２）π－電子系を含む。ヘテロアリールは、縮合環又は架橋環系を含む。ヘテロアリールにおけるヘテロ原子は任意に酸化される。１又は複数の窒素原子（存在する場合）は、任意に４級化される。ヘテロアリールは、環中の任意の原子を介して分子の残りの部分に結合する。ヘテロアリールの実例としては、アゼピニル、アクリジニル、ベンゾイミダゾリル、ベンゾインドール、１，３－ベンゾジオキサゾリル、ベンゾフリル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾ［ｄ］チアゾリル、ベンゾチアジアゾリル、ベンゾ［ｂ］［１，４］ジオキサゾリル、ベンゾ［ｂ］［１，４］オキサゾリル、１，４－ベンゾジオキサゾリル、ベンゾナフトフラニル、ベンゾジアゾリル、ベンゾジオキサフェニル、ベンゾピラニル、ベンゾピラノニル、ベンゾフリル、ベンゾフラノニル、ベンゾチオフェニル、ベンゾチエノ［３，２－ｄ］ピリミジニル、ベンゾトリアゾリル、ベンゾ［４，６］イミダゾ［１，２－ａ］ピリジル、カルバゾリル、シンノリル、シクロペンタ［ｄ］ピリミジニル、６，７－ジヒドロ－５Ｈ－シクロペンタ［４，５］チエノ［２，３－ｄ］ピリミジニル、５，６－ジヒドロベンゾ［ｈ］キナゾリニル、５，６－ジヒドロベンゾ［ｈ］シンノリニル、６，７－ジヒドロ－５Ｈ－ベンゾ［６，７］シクロヘプタ［１，２－ｃ］ピリダジニル、ジベンゾフリル、ジベンゾチオフェニル、フリル、フラノニル、フロ［３，２－ｃ］ピリジル、５，６，７，８，９，１０－ヘキサヒドロシクロヘプタ［ｄ］ピリミジニル、５，６，７，８，９，１０－ヘキサヒドロシクロオクタ［ｄ］ピリダジニル、５，６，７，８，９，１０－ヘキサヒドロシクロオクタ［ｄ］ピリジル、イソチアゾリル、インダゾリル、イミダゾリル、インドール、イソインドール、インドリニル、イソインドリニル、イソキノリル、インドリジニル、イソオキサゾリル、５，８－メタノ－５，６，７，８－テトラヒドロキナゾリニル、ナフチリジノニル、１，６－ナフチリジノニル、オキサジアゾリル、２－オキソアゼピニル、オキサゾリル、オキシラニル、５，６，６ａ，７，８，９，１０，１０ａ－オクタヒドロベンゾ［Ｈ］キナゾリニル、１－フェニル－１Ｈ－ピロリル、フェナジニル、フェノチアジニル、フェノキサジニル、フタロイル、プテリジニル、プリニル、ピロリル、ピラゾリル、ピラゾロ［３，４－ｄ］ピリミジニル、ピリジル、ピリド［３，２－ｄ］ピリミジニル、ピリド［３，４－ｄ］ピリミジニル、ピラジニル、ピリミジニル、ピリダジニル、ピロリル、キナゾリニル、キノキサリニル、キノリル、イソキノリル、テトラヒドロキノリル、５，６，７，８－テトラヒドロキナゾリニル、５，６，７，８－テトラヒドロベンゾ［４，５］チエノ［２，３－ｄ］ピリミジニル、６，７，８，９テトラヒドロ－５Ｈ－シクロヘプタ［４，５］チエノ［２，３－ｄ］ピリミジニル、５，６，７，８－テトラヒドロピリド［４，５－ｃ］ピリダジニル、チアゾリル、チアジアゾリル、トリアゾリル、テトラゾリル、トリアジニル、チエノ［２，３－ｄ］ピリミジニル、チエノ［３，２－ｄ］ピリミジニル、チエノ［２，３－ｃ］プリジニル及びチオフェニルを含むが、これらに限定されない。
本開示において各種のヒドロキシ保護基を用いることができる。一般的には、保護基は、化学官能性（ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓ）を特定の反応条件に不敏感にすることができ、且つ分子の残りの部分を実質的に損傷することなく分子中の当該官能性に付加する、及びそれから除去することができる。代表的なヒドロキシ保護基は、Ｂｅａｕｃａｇｅら、Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ １９９２，４８，２２２３～２３１１、及びＧｒｅｅｎｅａｎｄ Ｗｕｔｓ，Ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ Ｇｒｏｕｐｓ ｉｎ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，Ｃｈａｐｔｅｒ ２，２ｄ ｅｄ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９９１に開示されており、引用により、上記文献は、全体として本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態において、保護基は、塩基性条件で安定しているが、酸性条件で除去されることができる。いくつかの実施形態において、本明細書で使用できるヒドロキシ保護基の非排他的実例としては、ジメトキシトリチル（ＤＭＴ）、モノメトキシトリチル、９－フェニルキサンテン－９－イル（Ｐｉｘｙｌ）「９－ｐｈｅｎｙｌｘａｎｔｈｅｎ－９－ｙｌ（Ｐｉｘｙｌ）」及び９－（ｐ－メトキシフェニル）キサンテン－９－イル（Ｍｏｘ）「９－（ｐ－ｍｅｔｈｏｘｙｐｈｅｎｙｌ）ｘａｎｔｈｅｎ－９－ｙｌ（Ｍｏｘ）」を含む。いくつかの実施形態において、本明細書で使用できるヒドロキシ保護基の非排他的実例としては、Ｔｒ（トリチル）、ＭＭＴｒ（４－メトキシトリチル）、ＤＭＴｒ（４，４’－ジメトキシトリチル）及びＴＭＴｒ（４，４’，４’’－トリメトキシトリチル）を含む。
「被験体」という用語は、本明細書で用いられる場合、任意の動物、例えば、哺乳動物又は有袋動物を指す。本開示の主題としては、ヒト、非ヒト霊長類（例えば、アカゲザル又は他の種類のマカク属のサル）、マウス、ブタ、ウマ、ロバ、ウシ、ヒツジ、ラット及び任意の種類の家禽を含むが、これらに限定されない。
本明細書で用いられる場合、「治療方法」、「治療」、「軽減」、又は「改善」は、ここで互換的に使用されてもよい。これらの用語は、有益な又は所望の結果を得る方法を指し、治療効果を含むが、これに限定されない。「治療効果」は、治療される潜在的障害を根絶又は改善することを意味する。また、治療効果は、被験体が依然として潜在的障害の苦痛を受ける可能性があるにもかかわらず、潜在的障害に関連する１又は複数の生理的症状を根絶又は改善することにより、被験体に改善が観察されて得られる。
本明細書で用いられる場合、「防止」と「予防」は互換的に使用されてもよい。これらの用語は、有益又は所望の結果を得る方法を指し、予防効果を含むが、これに限定されない。「予防効果」を得るために、当該疾患に対する診断が行っていないかもしれないが、複合体又は組成物を特定の疾患に罹患するリスクのある被験体に投与し、又は疾患の１又は複数の病理学的症状が報告された被験体に投与することができる。
＜修飾ｓｉＲＮＡ＞
本開示のｓｉＲＮＡは、基本的な構造単位としてヌクレオチド基を含み、前記ヌクレオチド基がリン酸基、リボース基及び塩基を含むことは、当業者に公知であるので、ここでは説明を省略する。
本開示は、ＡＰＯＣ３遺伝子発現を抑制できる修飾ｓｉＲＮＡを提供する。前記修飾ｓｉＲＮＡは、センス鎖とアンチセンス鎖を含み、前記センス鎖及びアンチセンス鎖の各ヌクレオチドは、いずれも修飾ヌクレオチドであり、前記センス鎖及びアンチセンス鎖は、いずれもフルオロ修飾ヌクレオチド及び非フルオロ修飾ヌクレオチドを含み、前記センス鎖は、ヌクレオチド配列Ｉを含み、前記アンチセンス鎖は、ヌクレオチド配列ＩＩを含み、前記ヌクレオチド配列Ｉと前記ヌクレオチド配列ＩＩとは、少なくとも一部で逆相補的に二本鎖領域を形成し、前記ヌクレオチド配列Ｉは、配列番号１に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、３つ以下のヌクレオチド差異があるヌクレオチド配列Ａを含み、前記ヌクレオチド配列ＩＩは、配列番号２に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、３つ以下のヌクレオチド差異があるヌクレオチド配列Ｂを含み、
５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺ－３’（配列番号１）、
５’－Ｚ’ＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧ－３’（配列番号２）
ただし、ＺはＡであり、Ｚ’はＵである。
前記ヌクレオチド配列Ａに、位置がＺに対応するヌクレオチドＺＡが含まれ、前記ヌクレオチド配列Ｂに、位置がＺ’に対応するヌクレオチドＺ’Ｂが含まれ、前記Ｚ’Ｂは、前記アンチセンス鎖の５’末端の１番目のヌクレオチドであり、前記フルオロ修飾ヌクレオチドは、ヌクレオチド配列Ａとヌクレオチド配列Ｂに位置し、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列Ａの第７、８、９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列Ｂの第２、６、１４、１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列Ａにおけるフルオロ修飾ヌクレオチドが５個以下であり、前記ヌクレオチド配列Ｂにおけるフルオロ修飾ヌクレオチドが７個以下である。
文脈において、「位置が対応する」とは、ヌクレオチド配列の同一端から、ヌクレオチド配列において同じ位置にあることを指す。例えば、ヌクレオチド配列Ａの３’端の１番目のヌクレオチドは、位置が配列番号１の３’端の１番目のヌクレオチドに対応するヌクレオチドである。
いくつかの実施形態において、前記センス鎖は、ヌクレオチド配列Ｉのみを含み、前記アンチセンス鎖は、ヌクレオチド配列ＩＩのみを含む。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列Ａと配列番号１に示されるヌクレオチド配列との間に１つ以下のヌクレオチド差異があり、及び／又は前記ヌクレオチド配列Ｂと配列番号２に示されるヌクレオチド配列との間に１つ以下のヌクレオチド差異がある。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列Ｂと配列番号２に示されるヌクレオチド配列との間のヌクレオチド差異は、Ｚ’Ｂの位置での差異を含み、Ｚ’Ｂが、Ａ、Ｃ又はＧから選択される。いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド差異は、Ｚ’Ｂの位置での差異であり、Ｚ’ＢがＡ、Ｃ又はＧから選択される。いくつかの実施形態において、ＺＡは、Ｚ’Ｂと相補的なヌクレオチドである。これらのヌクレオチド差異により、ｓｉＲＮＡ複合体による標的遺伝子抑制能力を顕著に低下させることがなく、これらのヌクレオチド差異を含むｓｉＲＮＡ複合体も、本開示の保護範囲内にある。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列Ａと前記ヌクレオチド配列Ｂは、基本的に逆相補、実質的に逆相補的又は完全に逆相補的であり、前記基本的に逆相補的であるとは、２つのヌクレオチド配列間に３つ以下の塩基ミスマッチが存在することを指し、前記実質的に逆相補的であるとは、２つのヌクレオチド配列間に１つ以下の塩基ミスマッチが存在することを指し、完全に逆相補的であるとは、２つのヌクレオチド配列間にミスマッチがないことを指す。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列Ａは、配列番号６０に示されるヌクレオチド配列であり、ヌクレオチド配列Ｂは、配列番号６１に示されるヌクレオチド配列であり、
５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺＡ－３’（配列番号６０）、
５’－Ｚ’ＢＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧ－３’（配列番号６１）
ここで、前記Ｚ’Ｂは、アンチセンス鎖の５’末端の１番目のヌクレオチドであり、ＺＡは、Ａ、Ｕ、Ｇ又はＣから選択され、Ｚ’Ｂは、ＺＡと相補的なヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列Ａの第７、８、９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列Ｂの第２、６、１４、１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドである。
いくつかの実施形態において、当該ｓｉＲＮＡは、センス鎖とアンチセンス鎖を含み、前記センス鎖は、ヌクレオチド配列Ｉを含み、前記アンチセンス鎖は、ヌクレオチド配列ＩＩを含み、ヌクレオチド配列Ｉとヌクレオチド配列ＩＩは、逆相補的に二本鎖領域を形成し、ヌクレオチド配列Ｉは、配列番号６０に示されるヌクレオチド配列を含み、ヌクレオチド配列ＩＩは、配列番号６１に示されるヌクレオチド配列を含み、
５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺＡ－３’（配列番号６０）、
５’－Ｚ’ＢＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧ－３’（配列番号６１）
ここで、前記Ｚ’Ｂは、アンチセンス鎖の５’末端の１番目のヌクレオチドであり、ＺＡは、Ａ、Ｕ、Ｇ又はＣから選択され、Ｚ’Ｂは、ＺＡと相補的なヌクレオチドであり、いくつかの実施形態において、ＺＡはＡであり、Ｚ’ＢはＵである。
５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのセンス鎖における配列番号６０の第７、８、９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのセンス鎖において他の位置のヌクレオチドが非フルオロ修飾ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖における配列番号６１の第２、６、１４、１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖において他の位置のヌクレオチドが非フルオロ修飾ヌクレオチドである。
前記センス鎖とアンチセンス鎖とは、長さが同じか又は異なり、前記センス鎖の長さが１９～２３ヌクレオチドであり、アンチセンス鎖の長さが１９～２６ヌクレオチドである。このように、本開示により提供されるｓｉＲＮＡのセンス鎖とアンチセンス鎖の長さ比が、１９／１９、１９／２０、１９／２１、１９／２２、１９／２３、１９／２４、１９／２５、１９／２６、２０／２０、２０／２１、２０／２２、２０／２３、２０／２４、２０／２５、２０／２６、２１／２０、２１／２１、２１／２２、２１／２３、２１／２４、２１／２５、２１／２６、２２／２０、２２／２１、２２／２２、２２／２３、２２／２４、２２／２５、２２／２６、２３／２０、２３／２１、２３／２２、２３／２３、２３／２４、２３／２５又は２３／２６であってもよい。いくつかの実施形態において、前記ｓｉＲＮＡのセンス鎖とアンチセンス鎖の長さ比が１９／２１、２１／２３又は２３／２５である。
いくつかの実施形態において、前記センス鎖とアンチセンス鎖とは、長さが同じであり、前記ヌクレオチド配列Ｉは、ヌクレオチド配列ＩＩＩをさらに含み、前記ヌクレオチド配列ＩＩは、ヌクレオチド配列ＩＶをさらに含み、ヌクレオチド配列ＩＩＩとヌクレオチド配列ＩＶは、長さがそれぞれ独立して１～４ヌクレオチドであり、前記ヌクレオチド配列ＩＩＩは、ヌクレオチド配列Ａの５’末端に結合され、前記ヌクレオチド配列ＩＶは、ヌクレオチド配列Ｂの３’末端に結合され、前記ヌクレオチド配列ＩＩＩと前記ヌクレオチド配列ＩＶは、長さが等しい。
前記ヌクレオチド配列ＩＩＩとヌクレオチド配列ＩＶは、相補的であってもよく、相補的でなくてもよく、ｓｉＲＮＡの安定性を向上させるために、いくつかの実施形態において、ヌクレオチド配列ＩＩＩとヌクレオチド配列ＩＶは、少なくとも一部で相補的であり、いくつかの実施形態において、ヌクレオチド配列ＩＩＩとヌクレオチド配列ＩＶは、８０％以上又は９０％以上の塩基が相補的であり、いくつかの実施形態において、ヌクレオチド配列ＩＩＩとヌクレオチド配列ＩＶは、実質的に逆相補的又は完全に逆相補的である。前記実質的に逆相補的であるとは、２つのヌクレオチド配列間に１つ以下の塩基ミスマッチが存在することを指し、完全に逆相補的であるとは、２つのヌクレオチド配列間にミスマッチがないことを指し、いくつかの実施形態において、ヌクレオチド配列ＩＩＩとヌクレオチド配列ＩＶは完全に逆相補的である。これにより、前記ｓｉＲＮＡのセンス鎖とアンチセンス鎖は、長さが等しく、その長さ比が２０／２０、２１／２１、２２／２２又は２３／２３である。いくつかの実施形態において、前記ｓｉＲＮＡのセンス鎖とアンチセンス鎖の長さ比が２１／２１又は２３／２３である。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列ＩＩＩとヌクレオチド配列ＩＶは、長さがいずれも１ヌクレオチドであり、ヌクレオチド配列ＩＩＩの塩基がＣであり、ヌクレオチド配列ＩＶの塩基がＧであり、このとき、センス鎖とアンチセンス鎖の長さ比が２０／２０であり、或いは、ヌクレオチド配列ＩＩＩとＩＶは、長さがいずれも２ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、ヌクレオチド配列ＩＩＩの塩基が順にＣ、Ｃであり、ヌクレオチド配列ＩＶの塩基が順にＧ、Ｇであり、このとき、センス鎖とアンチセンス鎖の長さ比が２１／２１であり、或いは、ヌクレオチド配列ＩＩＩとＩＶは、長さがいずれも３ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、ヌクレオチド配列ＩＩＩの塩基が順にＵ、Ｃ、Ｃであり、ヌクレオチド配列ＩＶの塩基が順にＧ、Ｇ、Ａであり、このとき、センス鎖とアンチセンス鎖の長さ比が２２／２２であり、或いは、ヌクレオチド配列ＩＩＩとＩＶは、長さがいずれも４ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、ヌクレオチド配列ＩＩＩの塩基が順にＣ、Ｕ、Ｃ、Ｃであり、ヌクレオチド配列ＩＶの塩基が順にＧ、Ｇ、Ａ、Ｇであり、このとき、センス鎖とアンチセンス鎖の長さ比が２３／２３である。いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列ＩＩＩとヌクレオチド配列ＩＶは、長さが２ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、ヌクレオチド配列ＩＩＩの塩基が順にＣ、Ｃであり、ヌクレオチド配列ＩＶの塩基が順にＧ、Ｇであり、このとき、センス鎖とアンチセンス鎖の長さ比が２１／２１である。
いくつかの実施形態において、ヌクレオチド配列ＩＩＩとヌクレオチド配列ＩＶは、長さが同じであり、完全に逆相補的であるので、ヌクレオチド配列ＩＩＩの塩基が与えられると、ヌクレオチド配列ＩＶの塩基も決定される。
いくつかの実施形態において、前記センス鎖とアンチセンス鎖は、長さが異なり、前記ヌクレオチド配列ＩＩは、ヌクレオチド配列Ｖをさらに含み、ヌクレオチド配列Ｖは、長さが１～３ヌクレオチドであり、アンチセンス鎖の３’末端に結合され、アンチセンス鎖の３’オーバーハング末端を構成する。これにより、本開示により提供されるｓｉＲＮＡのセンス鎖とアンチセンス鎖の長さ比が、１９／２０、１９／２１、１９／２２、２０／２１、２０／２２、２０／２３、２１／２２、２１／２３、２１／２４、２２／２３、２２／２４、２２／２５、２３／２４、２３／２５又は２３／２６であってもよい。いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列Ｖは、長さが２ヌクレオチドであり、これにより、本開示により提供されるｓｉＲＮＡのセンス鎖とアンチセンス鎖の長さ比が、１９／２１、２１／２３又は２３／２５であってもよい。
前記ヌクレオチド配列Ｖにおける各ヌクレオチドは、任意のヌクレオチドであってもよく、合成しやすく合成コストを節約するために、前記ヌクレオチド配列Ｖは、連続した２個のチミンデオキシリボヌクレオチド（ＴＴ）又は連続した２個のウラシルリボヌクレオチド（ＵＵ）であり、ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖と標的ｍＲＮＡとの親和力を向上させるために、ヌクレオチド配列Ｖは、標的ｍＲＮＡの対応する位置のヌクレオチドと相補的である。
いくつかの実施形態において、前記センス鎖は、配列番号６０に示されるヌクレオチド配列を含み、前記アンチセンス鎖は、配列番号３に示されるヌクレオチド配列を含み、
５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺＡ－３’（配列番号６０）
５’－Ｚ’ＢＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧＧＧ－３’（配列番号３）
或いは、前記センス鎖は、配列番号４に示されるヌクレオチド配列を含み、前記アンチセンス鎖は、配列番号５に示されるヌクレオチド配列を含む。
５’－ＣＣＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺＡ－３’（配列番号４）
５’－Ｚ’ＢＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧＧＧＡＧ－３’（配列番号５）
ただし、前記Ｚ’Ｂは、アンチセンス鎖の５’末端の１番目のヌクレオチドであり、ＺＡは、Ａ、Ｕ、Ｇ又はＣから選択され、Ｚ’Ｂは、ＺＡと相補的なヌクレオチドである。
いくつかの実施形態において、本開示に記載されたｓｉＲＮＡは、ｓｉＡＰ１又はｓｉＡＰ２である。
ｓｉＡＰ１
センス鎖：５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＡ－３’（配列番号６）
アンチセンス鎖：５’－ＵＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧＧＧ－３’（配列番号７）
ｓｉＡＰ２
センス鎖：５’－ＣＣＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＡ－３’（配列番号８）
アンチセンス鎖：５’－ＵＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧＧＧＡＧ－３’（配列番号９）
いくつかの実施形態において、５’末端から３’末端に向かって、前記センス鎖において、前記ヌクレオチド配列Ａの第７、８、９位又は５、７、８、９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、前記センス鎖において他の位置のヌクレオチドが非フルオロ修飾ヌクレオチドであり、前記アンチセンス鎖において、前記ヌクレオチド配列Ｂの第２、６、１４、１６位又は第２、６、８、９、１４、１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、前記アンチセンス鎖において他の位置のヌクレオチドが非フルオロ修飾ヌクレオチドである。
フルオロ修飾ヌクレオチドとは、ヌクレオチドのリボース基の２’位のヒドロキシ基がフッ素で置換された、以下の式（１０７）に示される構造を有するヌクレオチドを指す。非フルオロ修飾ヌクレオチドとは、ヌクレオチドのリボース基の２’位のヒドロキシ基が非フッ素化基で置換されたヌクレオチド又はヌクレオチドアナログを指す。いくつかの実施形態において、各非フルオロ修飾ヌクレオチドは、ヌクレオチドのリボース基の２’位のヒドロキシ基が非フッ素化基で置換されたヌクレオチド又はヌクレオチドアナログのいずれかから独立して選択される１つである。
これらのリボース基の２’位のヒドロキシ基が非フッ素化基で置換されたヌクレオチドは、当業者に公知であり、これらのヌクレオチドは、２’－アルコキシ修飾ヌクレオチド、２’－置換アルコキシ修飾ヌクレオチド、２’－アルキル修飾ヌクレオチド、２’－置換アルキル修飾ヌクレオチド、２’－アミノ修飾ヌクレオチド、２’－置換アミノ修飾ヌクレオチド、２’－デオキシヌクレオチドから選択される１つであってもよい。
いくつかの実施形態において、２’－アルコキシ修飾ヌクレオチドは、式（１０８）に示される、メトキシ修飾ヌクレオチド（２’－ＯＭｅ）である。いくつかの実施形態において、２’－置換アルコキシ修飾ヌクレオチドは、例えば、式（１０９）に示される２’－Ｏ－メトキシエチル修飾ヌクレオチド（２’－ＭＯＥ）であってもよい。いくつかの実施形態において、２’－アミノ修飾ヌクレオチド（２’－ＮＨ２）は式（１１０）に示される。いくつかの実施形態において、２’－デオキシヌクレオチド（ＤＮＡ）は、式（１１１）に示される。
ヌクレオチドアナログとは、核酸においてヌクレオチドの代わりとなることができるが、アデニンリボヌクレオチド、グアニンリボヌクレオチド、シトシンリボヌクレオチド、ウラシルリボヌクレオチド又はチミンデオキシリボヌクレオチドと構造が異なる基を指す。いくつかの実施形態において、ヌクレオチドアナログは、イソヌクレオチド、架橋ヌクレオチド（ｂｒｉｄｇｅｄ ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄ、ＢＮＡと略称される）又は非環式ヌクレオチドであってもよい。
ＢＮＡとは、拘束された又は近づけないヌクレオチドを指す。ＢＮＡは、五員環、六員環、又は七員環の、「固定された」Ｃ３’－エンド糖パッカリングを有する架橋構造を含んでもよい。通常当該橋を当該リボースの２’－、４’－位に導入して２’，４’－ＢＮＡヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態において、ＢＮＡは、式（１１２）に示されるＬＮＡ、式（１１３）に示されるＥＮＡ、式（１１４）に示されるｃＥＴ ＢＮＡ等であってもよい。
非環式ヌクレオチドは、ヌクレオチドの糖環が開環されたヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、非環式ヌクレオチドは、式（１１５）に示されるアンロックド核酸（ＵＮＡ）、又は式（１１６）に示されるグリセロール核酸（ＧＮＡ）であってもよい。
上記式（１１５）及び式（１１６）中、Ｒは、Ｈ、ＯＨ又はアルコキシ（Ｏ－アルキル）から選択される。
イソヌクレオチドとは、ヌクレオチドにおいて塩基のリボース環における位置が変化した化合物を指す。いくつかの実施形態において、イソヌクレオチドは、式（１１７）又は（１１８）に示される、塩基がリボース環の１’－位から２’－位又は３’－位に移行した化合物であってもよい。
上記式（１１７）～式（１１８）の化合物において、Ｂａｓｅは、Ａ、Ｕ、Ｇ、Ｃ又はＴ等の塩基を表し、Ｒは、Ｈ、ＯＨ、Ｆ又は上述した非フッ素化基から選択される。
いくつかの実施形態において、ヌクレオチドアナログは、イソヌクレオチド、ＬＮＡ、ＥＮＡ、ｃＥＴ、ＵＮＡ及びＧＮＡから選択される１つである。いくつかの実施形態において、各非フルオロ修飾ヌクレオチドは、いずれもメトキシ修飾ヌクレオチドであり、文脈において、前記メトキシ修飾ヌクレオチドは、リボース基の２’－ヒドロキシ基がメトキシで置換されたヌクレオチドを指す。
文脈において、「フルオロ修飾ヌクレオチド」、「２’－フルオロ修飾ヌクレオチド」、「リボース基の２’－ヒドロキシ基がフッ素で置換されたヌクレオチド」及び「２’－フルオロリボース基」は、意味が同じであり、いずれもヌクレオチドの２’－ヒドロキシ基がフッ素で置換された、式（１０７）に示される構造を有する化合物を指し、「メトキシ修飾ヌクレオチド」、「２’－メトキシ修飾ヌクレオチド」、「リボース基の２’－ヒドロキシ基がメトキシで置換されたヌクレオチド」及び「２’－メトキシリボース基」は、意味が同じであり、いずれもヌクレオチドのリボース基の２’－ヒドロキシ基がメトキシで置換された、式（１０８）に示される構造を有する化合物を指す。
いくつかの実施形態において、本開示のｓｉＲＮＡは、以下の修飾を有するｓｉＲＮＡである。すなわち、５’末端から３’末端に向かって、前記センス鎖において、前記ヌクレオチド配列Ａの第７、８、９位又は第５、７、８、９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、前記センス鎖において他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドであり、前記アンチセンス鎖において、前記ヌクレオチド配列Ｂの第２、６、１４、１６位又は第２、６、８、９、１４、１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、前記アンチセンス鎖において他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドである。
いくつかの実施形態において、本開示のｓｉＲＮＡは、以下の修飾を有するｓｉＲＮＡである。すなわち、５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのセンス鎖におけるヌクレオチド配列Ａの第５、７、８及び９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのセンス鎖の他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドであり、また、５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖におけるヌクレオチド配列Ｂの第２、６、８、９、１４及び１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖の他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドであり、
或いは、５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのセンス鎖におけるヌクレオチド配列Ａの第７、８及び９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのセンス鎖の他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドであり、また、５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖におけるヌクレオチド配列Ｂの第２、６、１４及び１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖の他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドである。
言い換えれば、当該ｓｉＲＮＡのリン酸－糖骨格中のリボース基は、それぞれ以下の修飾基を有する。５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのセンス鎖におけるヌクレオチド配列Ａの第５、７、８及び９位のグリコシル基が２’－フルオロリボース基であり、ｓｉＲＮＡのセンス鎖の他の位置のヌクレオチドのグリコシル基が２’－メトキシリボース基であり、また、５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖におけるヌクレオチド配列Ｂの第２、６、８、９、１４及び１６位のグリコシル基が２’－フルオロリボース基であり、ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖の他の位置のヌクレオチドのグリコシル基が２’－メトキシリボース基であり、
或いは、５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのセンス鎖におけるヌクレオチド配列Ａの第７、８及び９位のグリコシル基が２’－フルオロリボース基であり、ｓｉＲＮＡのセンス鎖の他の位置のヌクレオチドのグリコシル基が２’－メトキシリボース基であり、また、５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖におけるヌクレオチド配列Ｂの第２、６、１４及び１６位のグリコシル基が２’－フルオロリボース基であり、ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖の他の位置のヌクレオチドのグリコシル基が２’－メトキシリボース基である。
いくつかの実施形態において、前記ｓｉＲＮＡ分子は、ｓｉＡＰ１－Ｍ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ１、ｓｉＡＰ１－Ｍ２、ｓｉＡＰ２－Ｍ２のいずれか１つである。
ｓｉＡＰ１－Ｍ１
センス鎖：５’－ＣｍＡｍＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１０）
アンチセンス鎖：５’－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍ－３’（配列番号１１）
ｓｉＡＰ２－Ｍ１
センス鎖：５’－ＣｍＣｍＣｍＡｍＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１２）
アンチセンス鎖：５’－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍＡｍＧｍ－３’（配列番号１３）
ｓｉＡＰ１－Ｍ２
センス鎖：５’－ＣｍＡｍＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１４）
アンチセンス鎖：５’－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍ－３’（配列番号１５）
ｓｉＡＰ２－Ｍ２
センス鎖：５’－ＣｍＣｍＣｍＡｍＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１６）
アンチセンス鎖：５’－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍＡｍＧｍ－３’（配列番号１７）
いくつかの実施形態において、本開示により提供されるｓｉＲＮＡのセンス鎖とアンチセンス鎖において、少なくとも１本の一本鎖のリン酸－糖骨格中のリン酸エステル基の少なくとも一部は、修飾基を有するリン酸エステル基である。いくつかの実施形態において、修飾基を有するリン酸エステル基は、リン酸エステル基におけるリン酸ジエステル結合の少なくとも１つの酸素原子が硫黄原子で置換されたチオリン酸エステル基である。いくつかの実施形態において、前記修飾基を有するリン酸エステル基は、式（１０１）に示される構造を有するチオリン酸エステル基である。
このような修飾により、ｓｉＲＮＡの二本鎖構造を安定化させ、塩基対合の高い特異性と高い親和力を維持することができる。
いくつかの実施形態において、本開示により提供されるｓｉＲＮＡにおいて、チオリン酸エステル基は、センス鎖又はアンチセンス鎖の任意の一端の１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、センス鎖又はアンチセンス鎖の任意の一端の２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間、又はそれらの任意の組合せからなる群より選ばれる少なくとも１つに結合されて存在する。いくつかの実施形態において、チオリン酸エステル基は、センス鎖の５’末端を除く全ての上記位置に結合されて存在する。いくつかの実施形態において、チオリン酸エステル基は、センス鎖の３’末端を除く全ての上記位置に結合されて存在する。いくつかの実施形態において、チオリン酸エステル基は、以下の位置のうち少なくとも一箇所に結合されて存在する。
前記センス鎖の５’末端から１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、
前記センス鎖の５’末端から２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間、
前記センス鎖の３’末端から１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、
前記センス鎖の３’末端から２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間、
前記アンチセンス鎖の５’末端から１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、
前記アンチセンス鎖の５’末端から２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間、
前記アンチセンス鎖の３’末端から１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、及び
前記アンチセンス鎖の３’末端から２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間。
いくつかの実施形態において、前記ｓｉＲＮＡは、ｓｉＡＰ１－Ｍ１Ｓ、ｓｉＡＰ２－Ｍ１Ｓ、ｓｉＡＰ１－Ｍ２Ｓ、ｓｉＡＰ２－Ｍ２Ｓのいずれか１つである。
ｓｉＡＰ１－Ｍ１Ｓ
センス鎖：５’－ＣｍｓＡｍｓＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１８）
アンチセンス鎖：５’－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍｓＧｍｓＧｍ－３’（配列番号１９）
ｓｉＡＰ２－Ｍ１Ｓ
センス鎖：５’－ＣｍｓＣｍｓＣｍＡｍＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号２０）
アンチセンス鎖：５’－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍｓＡｍｓＧｍ－３’（配列番号２１）
ｓｉＡＰ１－Ｍ２Ｓ
センス鎖：５’－ＣｍｓＡｍｓＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号２２）
アンチセンス鎖：５’－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍｓＧｍｓＧｍ－３’（配列番号２３）
ｓｉＡＰ２－Ｍ２Ｓ
センス鎖：５’－ＣｍｓＣｍｓＣｍＡｍＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号２４）
アンチセンス鎖：５’－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍｓＡｍｓＧｍ－３’（配列番号２５）
いくつかの実施形態において、前記ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖の５’末端のヌクレオチドは、５’－リン酸ヌクレオチド又は５’－リン酸アナログ修飾ヌクレオチドである。
慣用の前記５’－リン酸ヌクレオチド又は５’－リン酸アナログ修飾ヌクレオチドは、当業者に公知であり、例えば、５’－リン酸ヌクレオチドは、以下の構造を有してもよい。
また、例えば、Ａｎａｓｔａｓｉａ Ｋｈｖｏｒｏｖａ ａｎｄ Ｊｏｎａｔｈａｎ Ｋ． Ｗａｔｔｓ，Ｔｈｅ ｃｈｅｍｉｃａｌ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｔｈｅｒａｐｉｅｓ ｏｆ ｃｌｉｎｉｃａｌ ｕｔｉｌｉｔｙ． Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２０１７，３５（３）：２３８～４８には、以下の４種類の５’－リン酸アナログ修飾ヌクレオチドが開示されている。
ただし、ＲはＨ、ＯＨ、メトキシ又はフッ素から選択され、ＢａｓｅはＡ、Ｕ、Ｃ、Ｇ又はＴから選択される塩基を表す。
いくつかの実施形態において、５’－リン酸ヌクレオチドは、式（１０２）に示される、５’－リン酸修飾を含むヌクレオチドであり、５’－リン酸アナログ修飾ヌクレオチドは、式（１０３）に示される、ビニルリン酸エステル（５’－（Ｅ）－ｖｉｎｙｌｐｈｏｓｐｈｏｎａｔｅ、Ｅ－ＶＰ）修飾を含むヌクレオチドであり、又は、式（１０５）に示される、チオリン酸エステル修飾ヌクレオチドである。
いくつかの実施形態において、本開示により提供されるｓｉＲＮＡは、ｓｉＡＰ１－Ｍ１Ｐ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ１Ｐ１、ｓｉＡＰ１－Ｍ２Ｐ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ２Ｐ１、ｓｉＡＰ１－Ｍ１ＳＰ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ１ＳＰ１、ｓｉＡＰ１－Ｍ２ＳＰ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ２ＳＰ１のいずれか１つである。
ｓｉＡＰ１－Ｍ１Ｐ１
センス鎖：５’－ＣｍＡｍＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１０）
アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍ－３’（配列番号２６）
ｓｉＡＰ２－Ｍ１Ｐ１
センス鎖：５’－ＣｍＣｍＣｍＡｍＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１２）
アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍＡｍＧｍ－３’（配列番号２７）
ｓｉＡＰ１－Ｍ２Ｐ１
センス鎖：５’－ＣｍＡｍＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１４）
アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍ－３’（配列番号２８）
ｓｉＡＰ２－Ｍ２Ｐ１
センス鎖：５’－ＣｍＣｍＣｍＡｍＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１６）
アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍＡｍＧｍ－３’（配列番号２９）
ｓｉＡＰ１－Ｍ１ＳＰ１
センス鎖：５’－ＣｍｓＡｍｓＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１８）
アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍｓＧｍｓＧｍ－３’（配列番号３０）
ｓｉＡＰ２－Ｍ１ＳＰ１
センス鎖：５’－ＣｍｓＣｍｓＣｍＡｍＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号２０）
アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍｓＡｍｓＧｍ－３’（配列番号３１）
ｓｉＡＰ１－Ｍ２ＳＰ１
センス鎖：５’－ＣｍｓＡｍｓＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号２２）
アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍｓＧｍｓＧｍ－３’（配列番号３２）
ｓｉＡＰ２－Ｍ２ＳＰ１
センス鎖：５’－ＣｍｓＣｍｓＣｍＡｍＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号２４）
アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍｓＡｍｓＧｍ－３’（配列番号３３）
本開示の発明者は、本開示により提供されるｓｉＲＮＡが、顕著に向上した血漿とリソソーム安定性を有し、オフターゲット効果を低減させるだけでなく、非常に高い遺伝子抑制活性を維持することを見出した。
本開示により提供されるｓｉＲＮＡは、本分野における通常の核酸調製方法（例えば、固相合成方法及び液相合成方法）により得ることができる。ここで、固相合成は、既に商用カスタマイズサービスが行われている。対応する修飾を有するヌクレオシドモノマーを用いることにより修飾ヌクレオチド基を本開示に記載されたｓｉＲＮＡに導入することができ、対応する修飾を有するヌクレオシドモノマーを調製する方法、及び修飾ヌクレオチド基をｓｉＲＮＡに導入する方法も、当業者によく知られている。
＜薬物組成物＞
本開示は、上述した修飾ｓｉＲＮＡと、薬学的に許容可能な担体を含む薬物組成物を提供する。
前記薬学的に許容可能な担体は、ｓｉＲＮＡ投与分野で通常用いられる担体であってもよく、例えば、磁性ナノ粒子（ｍａｇｎｅｔｉｃ ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ、例えば、Ｆｅ３Ｏ４又はＦｅ２Ｏ３に基づくナノ粒子）、カーボンナノチューブ（ｃａｒｂｏｎ ｎａｎｏｔｕｂｅｓ）、メソポーラスシリコン（ｍｅｓｏｐｏｒｏｕｓ ｓｉｌｉｃｏｎ）、リン酸カルシウムナノ粒子（ｃａｌｃｉｕｍ ｐｈｏｓｐｈａｔｅ ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ）、ポリエチレンイミン（ｐｏｌｙｅｔｈｙｌｅｎｉｍｉｎｅ、ＰＥＩ）、ポリアミドアミンデンドリマー（ｐｏｌｙａｍｉｄｏａｍｉｎｅ （ＰＡＭＡＭ） ｄｅｎｄｒｉｍｅｒ）、ポリリジン（ｐｏｌｙ（Ｌ－ｌｙｓｉｎｅ）、ＰＬＬ）、キトサン（ｃｈｉｔｏｓａｎ）、１，２－ジオレオイル－３－トリメチルアンモニウムプロパン（１，２－ｄｉｏｌｅｏｙｌ－３－ｔｒｉｍｅｔｈｙｌａｍｍｏｎｉｕｍ－ｐｒｏｐａｎｅ、ＤＯＴＡＰ）、ポリＤ－又はＬ－乳酸／グリコール酸共重合体（ｐｏｌｙ（Ｄ＆Ｌ－ｌａｃｔｉｃ／ｇｌｙｃｏｌｉｃ ａｃｉｄ）ｃｏｐｏｌｙｍｅｒ、ＰＬＧＡ）、ポリ（アミノエチルエチレンリン酸エステル）（ｐｏｌｙ（２－ａｍｉｎｏｅｔｈｙｌ ｅｔｈｙｌｅｎｅ ｐｈｏｓｐｈａｔｅ）、ＰＰＥＥＡ）及びポリ（Ｎ，Ｎ－ジメチルアミノエチルメタクリレート）（ｐｏｌｙ（２－ｄｉｍｅｔｈｙｌａｍｉｎｏｅｔｈｙｌ ｍｅｔｈａｃｒｙｌａｔｅ）、ＰＤＭＡＥＭＡ）並びにこれらの誘導体の１又は複数があるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態において、前記薬物組成物におけるｓｉＲＮＡ及び薬学的に許容可能な担体の含有量に対して特段の要件はないが、いくつかの実施形態においては、ｓｉＲＮＡと薬学的に許容可能な担体との重量比が、１：（１～５００）であってもよい。いくつかの実施形態においては、上記重量比が１：（１～５０）である。
いくつかの実施形態において、前記薬物組成物には、薬学的に許容できる他の添加剤が含まれてもよく、当該添加剤は、本分野で通常採用される各種の製剤又は化合物の１種又は複数種であってもよい。例えば、前記薬学的に許容できる他の添加剤は、ｐＨ緩衝液、保護剤及び浸透圧調節剤の少なくとも１種を含んでもよい。
前記ｐＨ緩衝液は、ｐＨ７．５～８．５のトリスヒドロキシメチルアミノメタン塩酸塩緩衝液（ｔｒｉｓ（ｈｙｄｒｏｘｙｍｅｔｈｙｌ） ａｍｉｎｏｍｅｔｈａｎｅ ｈｙｄｒｏｃｈｌｏｒｉｄｅ ｂｕｆｆｅｒ）及び／又はｐＨ５．５～８．５のリン酸塩緩衝液であってもよく、例えば、ｐＨ５．５～８．５のリン酸塩緩衝液であってもよい。
前記保護剤は、イノシトール、ソルビトール、スクロース、トレハロース、マンノース、マルトース、ラクトース及びグルコースの少なくとも１種であってもよい。前記薬物組成物の全重量を基準とし、前記保護剤の含有量は０．０１～３０重量％であってもよい。
前記浸透圧調節剤は、塩化ナトリウム及び／又は塩化カリウムであってもよい。前記浸透圧調節剤の含有量は、前記薬物組成物の浸透圧が２００～７００ミリオスモル／キログラム（ｍＯｓｍ／ｋｇ）となるように決定される。所望の浸透圧により、当業者は、前記浸透圧調節剤の含有量を容易に決定することができる。
いくつかの実施形態において、前記薬物組成物は、注射液等の液体製剤であってもよく、凍結乾燥粉末注射剤として、投与時に液体添加剤と混合し、液体製剤としてもよい。前記液体製剤は、皮下、筋肉又は静脈注射投与に用いることができるが、これらに限定されず、噴霧により肺に投与し、或いは、噴霧により肺を通して他の臓器組織（例えば、肝臓）に投与することもできるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、前記薬物組成物は、静脈注射投与に用いられる。
いくつかの実施形態において、前記薬物組成物は、リポソーム製剤の形式であってもよい。いくつかの実施形態において、前記リポソーム製剤に用いられる薬学的に許容可能な担体は、アミン含有トランスフェクション化合物（以下、有機アミンともいう）、補助脂質及び／又はＰＥＧ化（ポリエチレングリコール化）脂質を含む。ここで、前記有機アミン、補助脂質及びＰＥＧ化脂質は、それぞれＣＮ１０３３８０１１３Ａ（引用によりその全体を本明細書に組み込む）に記載されたアミン含有トランスフェクション化合物又はその薬学的に許容できる塩又は誘導体、補助脂質及びＰＥＧ化脂質からそれぞれ選択される１種又は複数種であってもよい。
いくつかの実施形態において、前記有機アミンは、ＣＮ１０３３８０１１３Ａに記載された式（２０１）に示される化合物又はその薬学的に許容できる塩であってもよい。
式中、
Ｘ１０１及びＸ１０２はそれぞれ独立してＯ、Ｓ、Ｎ－Ａ又はＣ－Ａであり、Ａは水素又はＣ１－Ｃ２０炭化水素鎖であり、
Ｙ及びＺはそれぞれ独立してＣ＝Ｏ、Ｃ＝Ｓ、Ｓ＝Ｏ、ＣＨ－ＯＨ又はＳＯ２であり、
Ｒ１０１、Ｒ１０２、Ｒ１０３、Ｒ１０４、Ｒ１０５、Ｒ１０６及びＲ１０７はそれぞれ独立して水素、環式又は非環式の、置換又は無置換の、分岐鎖又は直鎖脂肪族基、環式又は非環式の、置換又は無置換の、分岐鎖又は直鎖ヘテロ脂肪族基、置換又は無置換の、分岐鎖又は直鎖アシル基、置換又は無置換の、分岐鎖又は直鎖アリール基、置換又は無置換の、分岐鎖又は直鎖ヘテロアリール基であり、
ｘが１～１０の整数であり、
ｎが１～３の整数であり、ｍが０～２０の整数であり、ｐが０又は１であり、ここで、ｍ＝ｐ＝０である場合、Ｒ１０２は水素であり、
ｎ又はｍの少なくとも１つが２である場合、Ｒ１０３と式（２０１）における窒素とが、式（２０２）又は式（２０３）に示される構造を形成する。
式中、ｇ、ｅ及びｆはそれぞれ独立して１～６の整数であり、「ＨＣＣ」は炭化水素鎖を表し、各＊Ｎは式（２０１）における窒素原子を表す。
いくつかの実施形態において、Ｒ１０３はポリアミンである。他の実施形態において、Ｒ１０３はケタールである。いくつかの実施形態において、式（２０１）におけるＲ１０１及びＲ１０２のそれぞれは、独立して、任意に置換又は無置換の、分岐鎖又は直鎖アルキル又はアルケニルであり、前記アルキル又はアルケニルは、３～約２０個の炭素原子、例えば、８～約１８個の炭素原子、及び０～４個の二重結合、例えば、０～２個の二重結合を有する。
いくつかの実施形態において、ｎとｍのそれぞれが独立して１又は３の値である場合、Ｒ１０３は、下記式（２０４）～式（２１３）のいずれか１つであってもよい。
式（２０４）～式（２１３）中、ｇ、ｅ及びｆはそれぞれ独立して１～６の整数であり、各「ＨＣＣ」は炭化水素鎖を表し、各＊はＲ１０３と式（２０１）における窒素原子との結合可能点を示し、任意の＊位置上の各Ｈは、式（２０１）における窒素原子との結合を実現するために置換されてもよい。
式（２０１）に示される化合物は、ＣＮ１０３３８０１１３Ａの記載により調製されてもよい。
いくつかの実施形態において、前記有機アミンは、式（２１４）に示される有機アミン及び／又は式（２１５）に示される有機アミンである。
前記補助脂質は、コレステロール、コレステロールのアナログ及び／又はコレステロールの誘導体であり、
前記ＰＥＧ化脂質は、１，２－ジパルミトアミド－ｓｎ－グリセロ－３－ホスファチジルエタノールアミン－Ｎ－［メトキシ（ポリエチレングリコール）］－２０００（１，２－ｄｉｐａｌｍｉｔｏｙｌ－ｓｎ－ｇｌｙｃｅｒｏ－３－ｐｈｏｓｐｈａｔｉｄｙｌｅｔｈａｎｏｌａｍｉｎｅ－Ｎ－［ｍｅｔｈｏｘｙ（ｐｏｌｙｅｔｈｙｌｅｎｅ ｇｌｙｃｏｌ）］－２０００）である。
いくつかの実施形態において、前記薬物組成物において、前記有機アミン、前記補助脂質及び前記ＰＥＧ化脂質のモル比は（１９．７～８０）：（１９．７～８０）：（０．３～５０）であり、例えば、（５０～７０）：（２０～４０）：（３～２０）であってもよい。
いくつかの実施形態において、本開示のｓｉＲＮＡと上記アミン含有トランスフェクション試薬により形成された薬物組成物粒子は、約３０ｎｍ～約２００ｎｍの平均径を有し、一般に約４０ｎｍ～約１３５ｎｍであり、より一般的には、当該リポソーム粒子の平均径は約５０ｎｍ～約１２０ｎｍ、約５０ｎｍ～約１００ｎｍ、約６０ｎｍ～約９０ｎｍ又は約７０ｎｍ～約９０ｎｍであり、例えば、当該リポソーム粒子の平均径は、約３０、４０、５０、６０、７０、７５、８０、８５、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０又は１６０ｎｍである。
いくつかの実施形態において、本開示のｓｉＲＮＡと上記アミン含有トランスフェクション試薬により形成された薬物組成物において、ｓｉＲＮＡと全脂質（例えば有機アミン、補助脂質及び／又はＰＥＧ化脂質）の重量比（重量／重量比）は、約１：１～約１：５０、約１：１～約１：３０、約１：３～約１：２０、約１：４～約１：１８、約１：５～約１：１７、約１：５～約１：１５、約１：５～約１：１２、約１：６～約１：１２又は約１：６～約１：１０の範囲内にあり、例えば、本開示のｓｉＲＮＡと全脂質の重量比は約１：５、１：６、１：７、１：８、１：９、１：１０、１：１１，１：１２、１：１３、１：１４、１：１５、１：１６、１：１７又は１：１８である。
いくつかの実施形態において、前記薬物組成物は、市販時に各成分が独立して存在してもよく、使用時に液体製剤として存在してもよい。いくつかの実施形態において、本開示により提供されるｓｉＲＮＡと上記薬学的に許容可能な担体により形成された薬物組成物は、既知の各種の方法に従い調製されてもよく、従来のｓｉＲＮＡの代わりに本開示により提供されるｓｉＲＮＡを用いればよい。いくつかの実施形態において、以下の方法に従い調製されてもよい。
有機アミン、補助脂質及びＰＥＧ化脂質を上記モル比でアルコールに懸濁させ均一に混合して脂質溶液を得る。アルコールの用量は、得られた脂質溶液の総質量濃度が２～２５ｍｇ／ｍＬ、例えば、８～１８ｍｇ／ｍＬとなるように決定される。前記アルコールは、薬学的に許容できるアルコール、例えば、エタノール、プロピレングリコール、ベンジルアルコール、グリセリン、ポリエチレングリコール２００、ポリエチレングリコール３００、ポリエチレングリコール４００など、室温付近で液体であるアルコールから選択される１種又は複数種であり、例えばエタノールであってよい。
本開示により提供されるｓｉＲＮＡを緩衝塩溶液に溶解し、ｓｉＲＮＡ水溶液を得る。緩衝塩溶液の濃度が０．０５～０．５Ｍであり、例えば、０．１～０．２Ｍであってもよく、緩衝塩溶液のｐＨを４．０～５．５に調節し、例えば、５．０～５．２であってもよく、緩衝塩溶液の用量は、ｓｉＲＮＡの濃度が０．６ｍｇ／ｍＬ以下、例えば、０．２～０．４ｍｇ／ｍＬとなるように決定される。前記緩衝塩は、可溶性酢酸塩、可溶性クエン酸塩から選択される１種又は複数種であり、例えば、酢酸ナトリウム及び／又は酢酸カリウムであってよい。
脂質溶液とｓｉＲＮＡ水溶液を混合した後、得られた生成物を４０～６０℃で少なくとも２分間、例えば、５～３０分間培養し、培養したリポソーム製剤を得る。脂質溶液とｓｉＲＮＡ水溶液の体積比は１：（２～５）、例えば、１：４であってよい。
培養したリポソーム製剤を濃縮又は希釈し、不純物を除去し、除菌し、本開示により提供される薬物組成物を得る。その物理化学的パラメーターとしては、ｐＨが６．５～８であり、封入効率が８０％以上であり、粒子径が４０～２００ｎｍであり、多分散指数が０．３０以下であり、浸透圧が２５０～４００ｍＯｓｍ／ｋｇであり、例えば、物理化学的パラメーターとしては、ｐＨが７．２～７．６、封入効率が９０％以上、粒子径が６０～１００ｎｍ、多分散指数が０．２０以下、浸透圧が３００～４００ｍＯｓｍ／ｋｇであってもよい。
ここで、濃縮又は希釈は、不純物を除去する前、不純物を除去した後又は同時に行われてもよい。不純物を除去する方法としては、従来の各種の方法を採用してもよく、例えば、タンジェンシャルフロー系、中空糸カラムを用い、１００ＫＤａの条件で限外濾過し、限外濾過交換溶液をｐＨ７．４のリン酸塩緩衝液（ＰＢＳ）としてもよい。除菌方法としては、従来の各種の方法を採用してもよく、例えば、０．２２μｍのフィルターで濾過して除菌してもよい。
＜第１種のｓｉＲＮＡ複合体＞
本開示は、上記ｓｉＲＮＡ及び当該ｓｉＲＮＡに複合して結合される複合基を含む第１種のｓｉＲＮＡ複合体を提供する。
一般的には、前記複合基は、薬学的に許容できる少なくとも１つの標的基及び任意のリンカー（ｌｉｎｋｅｒ）を含み、前記ｓｉＲＮＡ、前記リンカー及び前記標的基は順に結合されている。いくつかの実施形態において、前記標的基が１～６個である。いくつかの実施形態において、前記標的基が２～４個である。前記ｓｉＲＮＡ分子は、前記複合基に非共有結合的又は共有結合的に複合されてもよく、例えば、前記複合基に共有結合的に複合されてもよい。ｓｉＲＮＡと複合基との複合部位は、ｓｉＲＮＡのセンス鎖の３’端又は５’端にあってもよく、アンチセンス鎖の５’端にあってもよく、ｓｉＲＮＡの内部配列にあってもよい。いくつかの実施形態において、前記ｓｉＲＮＡと複合基との複合部位は、ｓｉＲＮＡのセンス鎖の３’末端にある。
いくつかの実施形態において、前記複合基は、ヌクレオチドのリン酸基、２’－位のヒドロキシ基又は塩基に結合されてもよい。いくつかの実施形態において、前記複合基は、３’－位のヒドロキシ基に結合されてもよく、この場合、ヌクレオチド間が２’－５’リン酸ジエステル結合により結合されている。複合基は、ｓｉＲＮＡ鎖の末端に結合される場合、通常ヌクレオチドのリン酸基に結合され、ｓｉＲＮＡの内部配列に結合される場合、通常リボース糖環或いは塩基に結合される。各種の結合方法については、Ｍｕｔｈｉａｈ Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ．ａｌ． ｓｉＲＮＡ ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ ｃａｒｒｙｉｎｇ ｓｅｑｕｅｎｔｉａｌｌｙ ａｓｓｅｍｂｌｅｄ ｔｒｉｖａｌｅｎｔ Ｎ－ａｃｅｔｙｌｇａｌａｃｔｏｓａｍｉｎｅ ｌｉｎｋｅｄ ｔｈｒｏｕｇｈ ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｓ ｅｌｉｃｉｔ ｒｏｂｕｓｔ ｇｅｎｅ ｓｉｌｅｎｃｉｎｇ ｉｎ ｖｉｖｏ ｉｎ ｈｅｐａｔｏｃｙｔｅｓ． ＡＣＳ Ｃｈｅｍｉｃａｌ ｂｉｏｌｏｇｙ，２０１５，１０ （５）：１１８１～７．を参照することができる。
いくつかの実施形態において、前記ｓｉＲＮＡと複合基との間が酸不安定又は還元可能な化学結合により結合されてもよく、細胞エンドソームの酸性環境で、これらの化学結合が分解され、ｓｉＲＮＡが遊離状態になることができる。分解できない複合方法については、複合基は、ｓｉＲＮＡのセンス鎖に結合され、複合によるｓｉＲＮＡ活性への影響をできるだけ低下させることができる。
いくつかの実施形態において、前記薬学的に許容できる標的基は、ｓｉＲＮＡ投与分野で通常用いられるリガンド、例えば、ＷＯ２００９０８２６０７Ａ２に記載された各種のリガンドであってもよく、引用によりその開示内容が全体として本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態において、前記薬学的に許容できる標的基は、コレステロール、胆汁酸、ビタミン（例えば、トコフェロール）、鎖長が異なる脂質分子等の親油性分子と、ポリエチレングリコール等のポリマーと、膜透過性ペプチド等のポリペプチドと、アプタマーと、抗体と、量子ドットと、ラクトース、ポリラクトース、マンノース、ガラクトース、Ｎ－アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）等の糖類と、葉酸（ｆｏｌａｔｅ）と、アシアロ糖タンパク質、アシアロ糖残基、リポタンパク（例えば、高比重リポタンパク、低比重リポタンパク等）、グルカゴン、神経伝達物質（例えば、アドレナリン）、成長因子、トランスフェリン等の肝実質細胞に発現する受容体リガンド等の標的分子又はその誘導体により形成されたリガンドから選択される１種又は複数種であってよい。
いくつかの実施形態において、前記各リガンドは、細胞表面の受容体と結合できるリガンドから独立して選択される。いくつかの実施形態において、少なくとも１つのリガンドは、肝細胞表面の受容体と結合できるリガンドである。いくつかの実施形態において、少なくとも１つのリガンドは、哺乳動物の細胞表面の受容体と結合できるリガンドである。いくつかの実施形態において、少なくとも１つのリガンドは、ヒト肝細胞表面の受容体と結合できるリガンドである。いくつかの実施形態において、少なくとも１つのリガンドは、肝表面のアシアロ糖タンパク質受容体（ＡＳＧＰＲ）と結合できるリガンドである。これらのリガンドの種類は、当業者に公知であり、その作用として、一般的に標的細胞表面の特異的受容体と結合し、リガンドに結合されるｓｉＲＮＡの標的細胞への送達を媒介する。
いくつかの実施形態において、前記薬学的に許容できる標的基は、哺乳動物の肝細胞表面におけるアシアロ糖タンパク質受容体（ＡＳＧＰＲ）と結合するいずれか１種のリガンドであってもよい。いくつかの実施形態において、各リガンドは、独立してアシアロ糖タンパク質、例えば、アシアロオロソムコイド（ａｓｉａｌｏｏｒｏｓｏｍｕｃｏｉｄ、ＡＳＯＲ）又はアシアロフェチュイン（ａｓｉａｌｏｆｅｔｕｉｎ、ＡＳＦ）である。いくつかの実施形態において、前記リガンドは、糖又は糖の誘導体である。
いくつかの実施形態において、少なくとも１つのリガンドは糖である。いくつかの実施形態において、各リガンドはいずれも糖である。いくつかの実施形態において、少なくとも１つのリガンドは、単糖、多糖、修飾単糖、修飾多糖又は糖誘導体である。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの前記リガンドは、単糖、二糖又は三糖であってもよい。いくつかの実施形態において、少なくとも１つのリガンドは修飾糖である。いくつかの実施形態において、各リガンドは、いずれも修飾糖である。いくつかの実施形態において、各リガンドは、いずれも独立して多糖、修飾多糖、単糖、修飾単糖、多糖誘導体又は単糖誘導体から選択される。いくつかの実施形態において、リガンドのそれぞれ又は少なくとも１つは、グルコース及びその誘導体、マンナン及びその誘導体、ガラクトース及びその誘導体、キシロース及びその誘導体、リボース及びその誘導体、フコース及びその誘導体、ラクトース及びその誘導体、マルトース及びその誘導体、アラビノース及びその誘導体、フルクトース及びその誘導体並びにシアル酸からなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、各前記リガンドは、Ｄ－マンノピラノース、Ｌ－マンノピラノース、Ｄ－アラビノース、Ｄ－キシロフラノース、Ｌ－キシロフラノース、Ｄ－グルコース、Ｌ－グルコース、Ｄ－ガラクトース、Ｌ－ガラクトース、α－Ｄ－マンノフラノース、β－Ｄ－マンノフラノース、α－Ｄ－マンノピラノース、β－Ｄ－マンノピラノース、α－Ｄ－グルコピラノース、β－Ｄ－グルコピラノース、α－Ｄ－グルコフラノース、β－Ｄ－グルコフラノース、α－Ｄ－フルクトフラノース、α－Ｄ－フルクトピラノース、α－Ｄ－ガラクトピラノース、β－Ｄ－ガラクトピラノース、α－Ｄ－ガラクトフラノース、β－Ｄ－ガラクトフラノース、グルコサミン、シアル酸、ガラクトサミン、Ｎ－アセチルガラクトサミン、Ｎ－トリフルオロアセチルガラクトサミン、Ｎ－プロピオニルガラクトサミン、Ｎ－ｎ－ブチリルガラクトサミン、Ｎ－イソブチリルガラクトサミン、２－アミノ－３－Ｏ－［（Ｒ）－１－カルボキシエチル］－２－デオキシ－β－Ｄ－グルコピラノース、２－デオキシ－２－メチルアミノ－Ｌ－グルコピラノース、４，６－ジデオキシ－４－ホルムアミド－２，３－ジ－Ｏ－メチル－Ｄ－マンノピラノース、２－デオキシ－２－スルホアミノ－Ｄ－グルコピラノース、Ｎ－グリコリル－α－ノイラミン酸、５－チオ－β－Ｄ－グルコピラノース、メチル２，３，４－トリス－Ｏ－アセチル－１－チオ－６－Ｏ－トリチル－α－Ｄ－グルコピラノシド（ｍｅｔｈｙｌ ２，３，４－ｔｒｉｓ－Ｏ－ａｃｅｔｙｌ－１－ｔｈｉｏ－６－Ｏ－ｔｒｉｔｙｌ－α－Ｄ－ｇｌｕｃｏｐｙｒａｎｏｓｉｄｅ）、４－チオ－β－Ｄ－ガラクトピラノース、エチル３，４，６，７－テトラ－Ｏ－アセチル－２－デオキシ－１，５－ジチオ－α－Ｄ－グルコヘプトピラノシド、２，５－アンヒドロ－Ｄ－アロニトリル、リボース、Ｄ－リボース、Ｄ－４－チオリボース、Ｌ－リボース又はＬ－４－チオリボースから独立して選択されてもよい。前記リガンドの他の選択肢は、例えば、ＣＮ１０５３７８０８２Ａの記載を参照してもよく、引用によりその開示内容が全体として本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態において、前記第１種のｓｉＲＮＡ複合体における、薬学的に許容できる標的基は、ガラクトース又はＮ－アセチルガラクトサミンであってもよく、ガラクトース又はＮ－アセチルガラクトサミン分子は、１価、２価、３価、４価であってもよい。ここでいう１価、２価、３価、４価は、それぞれｓｉＲＮＡ分子と、標的基としてのガラクトース又はＮ－アセチルガラクトサミン分子を含む複合基から形成されたｓｉＲＮＡ複合体におけるｓｉＲＮＡ分子とガラクトース又はＮ－アセチルガラクトサミン分子とのモル比が１：１、１：２、１：３又は１：４であることを指すと理解すべきである。いくつかの実施形態において、前記薬学的に許容できる標的基はＮ－アセチルガラクトサミンである。いくつかの実施形態において、本開示に記載されたｓｉＲＮＡがＮ－アセチルガラクトサミンを含む複合基と複合する場合、Ｎ－アセチルガラクトサミン分子は３価又は４価である。いくつかの実施形態において、本開示に記載されたｓｉＲＮＡがＮ－アセチルガラクトサミンを含む複合基と複合する場合、Ｎ－アセチルガラクトサミン分子は３価である。
標的基は、適切なリンカーを介してｓｉＲＮＡ分子に結合されてもよく、当業者は、標的基の具体的な種類により適切なリンカーを選択することができる。これらのリンカー、標的基の種類及びｓｉＲＮＡへの結合方法については、ＷＯ２０１５００６７４０Ａ２の開示内容を参照してもよく、引用によりその内容が全体として本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態において、前記標的基がＮ－アセチルガラクトサミンである場合、適切なリンカーは、式（３０１）に示される構造であってもよい。
式中、
ｋは１～３の整数であり、
ＬＡは、式（３０２）に示される構造を有するアミド結合を含む鎖状部であり、各前記ＬＡは、その両端でそれぞれ１つの前記標的基及び前記ＬＣ部にエーテル結合により結合される。
ＬＢは、式（３０３）に示される構造を有するＮ－アシルピロリジンを含む鎖状部であり、前記鎖状部は、その一端にカルボニル基を有し、前記ＬＣ部にアミド結合により結合され、他端に酸素基を有し、前記ｓｉＲＮＡにリン酸エステル結合により結合される。
ＬＣは、ヒドロキシメチルアミノメタン、ジヒドロキシメチルアミノメタン又はトリヒドロキシメチルアミノメタンに基づく２～４価のリンカー基であり、前記ＬＣは、酸素原子を介してエーテル結合により各前記ＬＡ部に結合されるとともに、窒素原子を介してアミド結合により前記ＬＢ部に結合される。
いくつかの実施形態において、ｎ＝３であり、ＬＣがトリヒドロキシメチルアミノメタンに基づく４価のリンカー基である場合、リンカーとしての－（ＬＡ）３トリヒドロキシメチルアミノメタン－ＬＢ－によりＮ－アセチルガラクトサミン分子とｓｉＲＮＡ分子を結合して形成された第１種のｓｉＲＮＡ複合体は、その構造が以下の式（３０４）に示される。
式中、二重螺旋構造はｓｉＲＮＡを表す。
同様に、ｓｉＲＮＡと複合基との複合部位は、ｓｉＲＮＡのセンス鎖の３’端又は５’端にあってもよく、アンチセンス鎖の５’端にあってもよく、ｓｉＲＮＡの内部配列にあってもよい。
いくつかの実施形態において、本開示に記載されたｓｉＲＮＡのセンス鎖の３’末端は、リンカー－（ＬＡ）３トリヒドロキシメチルアミノメタン－ＬＢ－により３個のＮ－アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）分子に共有結合的に複合され、ｓｉＲＮＡ分子とＧａｌＮＡｃ分子とのモル比が１：３である、構造が以下の式（３０５）に示される第１種のｓｉＲＮＡ複合体（以下、（ＧａｌＮＡｃ）３－ｓｉＲＮＡともいう）を得る。
式中、二重螺旋構造は前記ｓｉＲＮＡを表し、前記リンカーは前記ｓｉＲＮＡのセンス鎖の３’末端に結合される。
いくつかの実施形態において、前記標的基がＮ－アセチルガラクトサミンである場合、適切なリンカーは、式（３０６）に示される構造であってもよい。
式中、
ｌは０～３の整数であり、
＊は、リンカーにおいてエーテル結合により標的基に結合される部位を表し、
＃は、リンカーにおいてリン酸エステル結合によりｓｉＲＮＡに結合される部位を表す。
いくつかの実施形態において、ｌ＝２である場合、前記第１種のｓｉＲＮＡ複合体は、式（３０７）に示される構造を有する。
式中、二重螺旋構造は前記ｓｉＲＮＡを表し、前記リンカーは前記ｓｉＲＮＡのセンス鎖の３’末端に結合される。
上記複合体は、従来技術において既に詳しく記載された方法により合成されてもよい。例えば、ＷＯ２０１５００６７４０Ａ２には、複数種の複合体の調製方法が詳しく記載されている。当業者によく知られている方法により、本開示の第１種のｓｉＲＮＡ複合体を得る。例えば、ＷＯ２０１４０２５８０５Ａ１には、式（３０５）に示される構造の調製方法が記載されており、Ｒａｊｅｅｖらは、ＣｈｅｍＢｉｏＣｈｅｍ ２０１５，１６，９０３－９０８に式（３０７）に示される構造の調製方法を記載した。
＜第２種のｓｉＲＮＡ複合体＞
いくつかの実施形態において、本開示は、式（１）に示される構造を有する第２種のｓｉＲＮＡ複合体を提供する。
式中、
ｎ１は、１～３から選択される整数であり、ｎ３は、０～４から選択される整数であり、
ｍ１、ｍ２及びｍ３は独立して、２～１０から選択される整数であり、
Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４及びＲ１５は、それぞれ独立して、Ｈであり、又はＣ１－Ｃ１０アルキル基、Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基及びＣ１－Ｃ１０アルコキシ基からなる群から選択され、
Ｒ３は式Ａ５９に示される構造の基である。
式中、Ｅ１はＯＨ、ＳＨ又はＢＨ２であり、ＮｕはｓｉＲＮＡである。
Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡにおける各ヌクレオチドは、それぞれ独立して修飾又は未修飾のヌクレオチドであり、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡは、センス鎖とアンチセンス鎖を含み、前記センス鎖は、ヌクレオチド配列１を含み、前記アンチセンス鎖は、ヌクレオチド配列２を含み、前記ヌクレオチド配列１と前記ヌクレオチド配列２とは、少なくとも一部で逆相補的に二本鎖領域を形成し、前記ヌクレオチド配列１は、配列番号１に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、且つヌクレオチド差異が３つ以下であり、前記ヌクレオチド配列２は、配列番号２に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、且つヌクレオチド差異が３つ以下であり、
５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺ－３’（配列番号１）、
５’－Ｚ’ＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧ－３’（配列番号２）
ただし、ＺはＡであり、Ｚ’はＵであり、
前記ヌクレオチド配列１に、位置がＺに対応するヌクレオチドＺＡが含まれ、前記ヌクレオチド配列２に、位置がＺ’に対応するヌクレオチドＺ’Ｂが含まれ、前記Ｚ’Ｂは、前記アンチセンス鎖の５’末端の１番目のヌクレオチドである。
文脈において、「位置が対応する」とは、ヌクレオチド配列の同一端から、ヌクレオチド配列において同じ位置にあることを指す。例えば、ヌクレオチド配列１の３’端の１番目のヌクレオチドは、位置が配列番号１の３’端の１番目のヌクレオチドに対応するヌクレオチドである。
Ｒ２は、長さ１～２０の炭素原子の直鎖アルキレン基であり、１又は複数の炭素原子は、Ｃ（Ｏ）、ＮＨ、Ｏ、Ｓ、ＣＨ=Ｎ、Ｓ（Ｏ）２、Ｃ２－Ｃ１０アルケニレン基、Ｃ２－Ｃ１０アルキニレン基、Ｃ６－Ｃ１０アリーレン基、Ｃ３－Ｃ１８ヘテロシクリレン基及びＣ５－Ｃ１０ヘテロアリーレン基からなる群から選択される１又は複数で任意に置換され、Ｒ２は、Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、Ｃ６－Ｃ１０アリール基、Ｃ５－Ｃ１０ヘテロアリール基、Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、－ＯＣ１－Ｃ１０アルキル基、－ＯＣ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＯＨ、－ＯＣ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、－ＳＣ１－Ｃ１０アルキル基、－ＳＣ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＳＨ、－ＳＣ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、ハロゲン置換基、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＨ２、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＮＨ２、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、シアノ基、ニトロ基、－ＣＯ２Ｈ、－Ｃ（Ｏ）Ｏ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮＨ２、－ＮＨＣ（Ｏ）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨＣ（Ｏ）（フェニル基）、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル）Ｃ（Ｏ）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル）Ｃ（Ｏ）（フェニル基）、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０ハロアルキル基、－ＯＣ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、－ＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＳＯ２（フェニル基）、－ＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基）、－ＳＯ２ＮＨ２、－ＳＯ２ＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＳＯ２ＮＨ（フェニル基）、－ＮＨＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨＳＯ２（フェニル基）及び－ＮＨＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基）からなる群のいずれか１つ又は複数の置換基を任意に有してもよい。
各Ｌ１は、長さ１～７０の炭素原子の直鎖アルキレン基であり、１又は複数の炭素原子は、Ｃ（Ｏ）、ＮＨ、Ｏ、Ｓ、ＣＨ=Ｎ、Ｓ（Ｏ）２、Ｃ２－Ｃ１０アルケニレン基、Ｃ２－Ｃ１０アルキニレン基、Ｃ６－Ｃ１０アリーレン基、Ｃ３－Ｃ１８ヘテロシクリレン基及びＣ５－Ｃ１０ヘテロアリーレン基からなる群から選択される１又は複数で任意に置換され、Ｌ１は、Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、Ｃ６－Ｃ１０アリール基、Ｃ５－Ｃ１０ヘテロアリール基、Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、－ＯＣ１－Ｃ１０アルキル基、－ＯＣ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＯＨ、－ＯＣ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、－ＳＣ１－Ｃ１０アルキル基、－ＳＣ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＳＨ、－ＳＣ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、ハロゲン置換基、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＨ２、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＮＨ２、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、シアノ基、ニトロ基、－ＣＯ２Ｈ、－Ｃ（Ｏ）Ｏ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮＨ２、－ＮＨＣ（Ｏ）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨＣ（Ｏ）（フェニル基）、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル）Ｃ（Ｏ）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル）Ｃ（Ｏ）（フェニル基）、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０ハロアルキル基、－ＯＣ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、－ＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＳＯ２（フェニル基）、－ＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基）、－ＳＯ２ＮＨ２、－ＳＯ２ＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＳＯ２ＮＨ（フェニル基）、－ＮＨＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨＳＯ２（フェニル基）及び－ＮＨＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基）からなる群のいずれか１つ又は複数の置換基を任意に有してもよい。
いくつかの実施形態において、Ｌ１は、Ａ１～Ａ２６の基又はその任意の組合せからなる群から選択されてもよく、Ａ１～Ａ２６の構造と定義は以下のとおりである。
ただし、ｊ１は１～２０の整数であり、ｊ２は１～２０の整数であり、
Ｒ’はＣ１－Ｃ１０のアルキル基であり、
Ｒａは、式Ａ２７～Ａ４５の基又はその任意の組合せからなる群から選択される。
ＲｂはＣ１－Ｃ１０のアルキル基であり、
は、基が分子の残りの部分に結合される部位を表す。
便宜上、Ｌ１は、線形アルキレン基として定義されるが、例えば上述した取替及び／又は置換によって生じるアミンやアルケニル基で、線形基ではない、又は名称が異なる可能性があることは、当業者に理解される。本開示内容の目的のために、Ｌ１の長さは、２つの結合点を結合する鎖における原子数である。この目的のために、前記直鎖アルキレンの炭素原子を置換して得られた環（例えば、ヘテロシクリレン又はヘテロアリーレン）を、１個の原子とする。
Ｍ１は、標的基を表し、その定義と選択可能な範囲は上記標的基と同じである。いくつかの実施形態において、各Ｍ１は、哺乳動物の肝臓細胞表面におけるアシアロ糖タンパク質受容体に対して親和力を有するリガンドから独立して選択される１つである。
Ｍ１が哺乳動物の肝臓細胞表面におけるアシアロ糖タンパク質受容体に対して親和力を有するリガンドである場合、いくつかの実施形態において、ｎ１は、１～３の整数であってもよく、ｎ３は、０～４の整数であってもよく、前記複合体におけるＭ１標的基の個数が少なくとも２であることを確保する。いくつかの実施形態において、ｎ１＋ｎ３≧２であり、これにより、Ｍ１標的基の個数が少なくとも３であり、Ｍ１標的基と肝表面のアシアロ糖タンパク質受容体をより容易に結合させ、さらに前記複合体が細胞内取込み（エンドサイトーシス）作用により細胞に取り込まれることを促進することができる。実験から分かるように、Ｍ１標的基の個数が３個以上である場合、Ｍ１標的基と肝表面のアシアロ糖タンパク質受容体との結合の容易さの向上が明らかではないので、合成の容易さ、構造／プロセスコスト及び送達効率等の多方面を総合的に考慮すると、いくつかの実施形態において、ｎ１は１～２の整数であり、ｎ３は０～１の整数であり、かつ、ｎ１＋ｎ３＝２～３である。
いくつかの実施形態において、ｍ１、ｍ２及びｍ３は、独立して２～１０の整数から選択される場合、複数のＭ１標的基間の空間位置をＭ１標的基と肝表面のアシアロ糖タンパク質受容体との結合に適合させることができる。本開示により提供される複合体をより簡略化し、より合成しやすく、及び／又はコストを低下させるために、いくつかの実施形態において、ｍ１、ｍ２及びｍ３は、それぞれ独立して２～５の整数であり、いくつかの実施形態において、ｍ１＝ｍ２＝ｍ３である。
Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４及びＲ１５が、Ｈ、Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基及びＣ１－Ｃ１０アルコキシからそれぞれ独立して選択される１つである場合、いずれも本開示の複合体の性質を変化させることなく、本開示の目的を実現することができることは、当業者に理解され得る。いくつかの実施形態において、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４及びＲ１５は、それぞれ独立してＨ、メチル基及びエチル基から選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４及びＲ１５は、いずれもＨである。
Ｒ３は、式Ａ５９に示される構造の基であり、そのうち、Ｅ１はＯＨ、ＳＨ又はＢＨ２であり、調製原料の入手しやすさを考慮し、いくつかの実施形態において、Ｅ１はＯＨ又はＳＨである。
Ｒ２は、窒素含有骨格上のＮとＡ５９との結合を実現するために選択される。本開示の文脈において、「窒素含有骨格」とは、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４及びＲ１５が結合された炭素原子とＮが互いに結合している鎖状構造を指す。したがって、Ｒ２は、適当な方法でＡ５９基を窒素含有骨格上のＮに結合することができる任意のリンカー基であってもよい。いくつかの実施形態において、固相合成プロセスにより第２種のｓｉＲＮＡ複合体を調製する場合に、Ｒ２基には、窒素含有骨格上のＮに結合される結合部位及びＲ３におけるＰに結合される結合部位がともに含まれる必要がある。いくつかの実施形態において、Ｒ２における前記窒素含有骨格中のＮに結合される部位は、Ｎとアミド結合を形成し、前記Ｒ３上のＰに結合される部位は、Ｐとリン酸エステル結合を形成し、いくつかの実施形態において、Ｒ２は、Ｂ５、Ｂ６、Ｂ５’又はＢ６’であってもよい。
ただし、
は、基が共有結合的に結合する部位を表す。
ｑ２の値の範囲は、１～１０の整数であってもよく、いくつかの実施形態において、ｑ２は１～５の整数である。
Ｌ１は、Ｍ１標的基と窒素含有骨格上のＮを結合し、第２種のｓｉＲＮＡ複合体に肝標的機能を提供するという役割を果たす。いくつかの実施形態において、Ｌ１は、式Ａ１～Ａ２６基の１又は複数の結合の組合せから選択される。いくつかの実施形態において、Ｌ１は、Ａ１、Ａ４、Ａ５、Ａ６、Ａ８、Ａ１０、Ａ１１及びＡ１３の１又は複数の結合の組合せから選択される。いくつかの実施形態において、Ｌ１は、Ａ１、Ａ４、Ａ８、Ａ１０及びＡ１１の少なくとも２つの結合の組合せから選択される。いくつかの実施形態において、Ｌ１は、Ａ１、Ａ８、Ａ１０の少なくとも２つの結合の組合せから選択される。
いくつかの実施形態において、Ｌ１の長さは、３～２５個の原子、３～２０個の原子、４～１５個の原子又は５～１２個の原子であってもよい。いくつかの実施形態において、Ｌ１の長さは、３個、４個、５個、６個、７個、８個、９個、１０個、１１個、１２個、１３個、１４個、１５個、１６個、１７個、１８個、１９個、２０個、２１個、２２個、２３個、２４個、２５個、３０個、３５個、４０個、４５個、５０個、５５個、６０個の原子である。
便宜上、Ｌ１は、線形アルキレン基として定義されるが、例えば上述した取替及び／又は置換によって生じるアミンやアルケニル基で、線形基ではない、又は名称が異なる可能性があることは、当業者に理解される。本開示内容の目的のために、Ｌ１の長さは、２つの結合点を結合する鎖における原子数である。この目的のために、前記直鎖アルキレンの炭素原子を置換して得られた環（例えば、ヘテロシクリレン又はヘテロアリーレン）を、１個の原子とする。
いくつかの実施形態において、ｊ１は２～１０の整数であり、いくつかの実施形態において、ｊ１は３～５の整数である。いくつかの実施形態において、ｊ２は２～１０の整数であり、いくつかの実施形態において、ｊ２は３～５の整数である。Ｒ’はＣ１－Ｃ４のアルキル基であり、いくつかの実施形態において、Ｒ’は、メチル基、エチル基及びイソプロピル基の１つである。Ｒａは、Ａ２７、Ａ２８、Ａ２９、Ａ３０及びＡ３１の１つであり、いくつかの実施形態において、Ｒａは、Ａ２７又はＡ２８である。Ｒｂは、Ｃ１－Ｃ５のアルキル基であり、いくつかの実施形態において、Ｒｂは、メチル基、エチル基、イソプロピル基及びブチル基の１つである。いくつかの実施形態において、式Ａ１～Ａ２６においてそれぞれｊ１、ｊ２、Ｒ’、Ｒａ、Ｒｂを選択することにより、Ｍ１標的基と窒素含有骨格上のＮとの結合を実現し、Ｍ１標的基間の空間位置をＭ１標的基と肝表面のアシアロ糖タンパク質受容体との結合に更に適合させる。
いくつかの実施形態において、当該複合体は、式（３）、（４）、（５）、（６）、（７）、（８）、（９）、（１０）、（１１）、（１２）、（１３）、（１４）、（１５）、（１６）、（１７）、（１８）、（１９）、（２０）、（２１）又は（２２）に示される構造を有する。
いくつかの実施形態において、式Ａ５９におけるＰは、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡ配列における任意の可能な位置に結合されてもよく、例えば、式Ａ５９におけるＰは、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖又はアンチセンス鎖のいずれか１つのヌクレオチドに結合されてもよく、いくつかの実施形態において、式Ａ５９におけるＰは、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖のいずれか１つのヌクレオチドに結合されてもよい。いくつかの実施形態において、式Ａ５９におけるＰは、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖又はアンチセンス鎖の端部に結合され、いくつかの実施形態において、式Ａ５９におけるＰは、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖の端部に結合される。Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡの端部とは、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖又はアンチセンス鎖においてその一端から前の４個のヌクレオチドを指す。いくつかの実施形態において、式Ａ５９におけるＰは、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖又はアンチセンス鎖の末端に結合され、いくつかの実施形態において、式Ａ５９におけるＰは、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖の３’末端に結合される。Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖の上記位置に結合される場合に、第２種のｓｉＲＮＡ複合体は、細胞に入り込んだ後、巻き戻されるときに、単独のｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖を放出し、ＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡがタンパク質を翻訳する過程を遮断し、アポリポタンパクＣ３（ＡＰＯＣ３）遺伝子発現を抑制することができる。
いくつかの実施形態において、式Ａ５９におけるＰは、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡにおけるヌクレオチド上の任意の可能な位置、例えば、ヌクレオチドの５’位、ヌクレオチドの２’位、ヌクレオチドの３’位又はヌクレオチドの塩基に結合されてもよい。いくつかの実施形態において、式Ａ５９におけるＰは、リン酸ジエステル結合を形成することによりＮｕに示されるｓｉＲＮＡにおけるヌクレオチドの２’位、３’位又は５’位に結合されてもよい。いくつかの実施形態において、式Ａ５９におけるＰは、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖の３’末端のヌクレオチドの３’ヒドロキシ基を脱水素した酸素原子に結合され、或いは、式Ａ５９におけるＰは、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖における１つのヌクレオチドの２’－ヒドロキシ基中の水素を置換することによりヌクレオチドに結合され、或いは、式Ａ５９におけるＰは、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖の５’末端のヌクレオチドの５’ヒドロキシ基中の水素を置換することによりヌクレオチドに結合される。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列１と配列番号１に示されるヌクレオチド配列との間に１つ以下のヌクレオチド差異があり、及び／又は前記ヌクレオチド配列２と配列番号２に示されるヌクレオチド配列との間に１つ以下のヌクレオチド差異がある。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列２と配列番号２に示されるヌクレオチド配列との間のヌクレオチド差異は、Ｚ’Ｂの位置での差異を含み、Ｚ’Ｂが、Ａ、Ｃ又はＧから選択される。いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド差異は、Ａ、Ｃ又はＧから選択されるＺ’Ｂの位置の差異である。いくつかの実施形態において、ＺＡは、Ｚ’Ｂと相補的なヌクレオチドである。これらのヌクレオチド差異により、第２種のｓｉＲＮＡ複合体による標的遺伝子抑制能力を顕著に低下させることがなく、これらの特定のヌクレオチド差異を含む第２種のｓｉＲＮＡ複合体も、本開示の保護範囲内にある。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列１と前記ヌクレオチド配列２とは、基本的に逆相補、実質的に逆相補的又は完全に逆相補的であり、前記基本的に逆相補的であるとは、２つのヌクレオチド配列間に３つ以下の塩基ミスマッチが存在することを指し、前記実質的に逆相補的であるとは、２つのヌクレオチド配列間に１つ以下の塩基ミスマッチが存在することを指し、完全に逆相補的であるとは、２つのヌクレオチド配列間にミスマッチがないことを指す。
いくつかの実施形態において、前記センス鎖は、ヌクレオチド配列３をさらに含み、前記アンチセンス鎖は、ヌクレオチド配列４をさらに含み、前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４は、長さがそれぞれ独立して１～４ヌクレオチドであり、且つ前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４の位置が対応する。いくつかの実施形態において、ヌクレオチド配列４は、標的ｍＲＮＡの対応する位置のヌクレオチドと少なくとも一部で相補的であり、いくつかの実施形態において、ヌクレオチド配列４は、標的ｍＲＮＡの対応する位置のヌクレオチドと完全に相補的である。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列３は、前記ヌクレオチド配列１の５’末端に結合され、前記ヌクレオチド配列４は、前記ヌクレオチド配列２の３’末端に結合される。いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４は、長さが等しく、逆相補的である。したがって、前記センス鎖及びアンチセンス鎖の長さは、１９～２３ヌクレオチドであってもよい。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４は、長さがいずれも１ヌクレオチドであり、前記ヌクレオチド配列３の塩基がＣであり、このとき、前記二本鎖領域の長さは、２０ヌクレオチドであってもよく、即ち、前記センス鎖とアンチセンス鎖の長さの比が２０／２０であってもよく、或いは、
前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４は、長さがいずれも２ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、ヌクレオチド配列３の塩基が順にＣ及びＣであり、このとき、前記二本鎖領域の長さは、２１ヌクレオチドであってもよく、即ち、前記センス鎖とアンチセンス鎖の長さの比が２１／２１であってもよく、或いは、
前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４は、長さがいずれも３ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列３の塩基が順にＵ、Ｃ及びＣであり、このとき、前記二本鎖領域の長さは、２２ヌクレオチドであってもよく、即ち、前記センス鎖とアンチセンス鎖の長さの比が２２／２２であってもよく、或いは、
前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４は、長さがいずれも４ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列３の塩基が順にＣ、Ｕ、Ｃ及びＣであり、このとき、前記二本鎖領域の長さは、２３ヌクレオチドであってもよく、即ち、前記センス鎖とアンチセンス鎖の長さの比が２３／２３であってもよい。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列３の長さが２ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列３の塩基が順にＣ及びＣである。
前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４は、長さが同じであり、相補的であるので、ヌクレオチド配列３の塩基が与えられると、ヌクレオチド配列４の塩基も決定されると理解すべきである。
いくつかの実施形態において、式（１）においてＮｕに示されるｓｉＲＮＡには、長さが１～３ヌクレオチドであり、前記アンチセンス鎖の３’末端に結合され、前記アンチセンス鎖の３’オーバーハング端を構成するヌクレオチド配列５がさらに含まれる。いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列５の長さは、１又は２つのヌクレオチドである。このように、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖とアンチセンス鎖の長さの比が、１９／２０、１９／２１、２０／２１、２０／２２、２１／２２、２１／２３、２２／２３、２２／２４、２３／２４又は２３／２５であってもよい。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列５は、長さが２ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列５は、連続した２個のチミンデオキシリボヌクレオチド、連続した２個のウラシルリボヌクレオチド、又は標的ｍＲＮＡと相補的な２つのヌクレオチドである。したがって、いくつかの実施形態において、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖とアンチセンス鎖の長さの比が１９／２１又は２１／２３であり、このとき、当該ｓｉＲＮＡを含む複合体は、より良好なＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡサイレンシング活性を有する。
いくつかの実施形態において、前記センス鎖は、配列番号６０に示されるヌクレオチド配列を含み、前記アンチセンス鎖は、配列番号３に示されるヌクレオチド配列を含み、
５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺＡ－３’（配列番号６０）、
５’－Ｚ’ＢＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧＧＧ－３’（配列番号３）
或いは、前記センス鎖は、配列番号４に示されるヌクレオチド配列を含み、前記アンチセンス鎖は、配列番号５に示されるヌクレオチド配列を含み、
５’－ＣＣＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺＡ－３’（配列番号４）、
５’－Ｚ’ＢＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧＧＧＡＧ－３’（配列番号５）
ただし、前記Ｚ’Ｂは、アンチセンス鎖の５’末端の１番目のヌクレオチドであり、ＺＡは、Ａ、Ｕ、Ｇ又はＣから選択され、Ｚ’Ｂは、ＺＡと相補的なヌクレオチドである。
いくつかの実施形態において、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡは、ｓｉＡＰ１又はｓｉＡＰ２である。
ｓｉＡＰ１
センス鎖：５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＡ－３’（配列番号６）
アンチセンス鎖：５’－ＵＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧＧＧ－３’（配列番号７）
ｓｉＡＰ２
センス鎖：５’－ＣＣＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＡ－３’（配列番号８）
アンチセンス鎖：５’－ＵＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧＧＧＡＧ－３’（配列番号９）
前述したように、式（１）においてＮｕに示されるｓｉＲＮＡにおけるヌクレオチドは、それぞれ独立して修飾又は未修飾のヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡにおけるヌクレオチドは、未修飾ヌクレオチドであり、いくつかの実施形態において、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡにおけるヌクレオチドの一部又は全部は、修飾ヌクレオチドであり、ヌクレオチド基上のこれらの修飾により、本開示の第２種のｓｉＲＮＡ複合体がＡＰＯＣ３遺伝子発現を抑制する機能を明らかに弱める又は喪失させることがない。
いくつかの実施形態において、複合体におけるｓｉＲＮＡは、少なくとも１つの修飾ヌクレオチドを含む。本開示の文脈において、用いられる用語「修飾ヌクレオチド」とは、ヌクレオチドのリボース基の２’位のヒドロキシ基が他の基で置換されたヌクレオチド又はヌクレオチドアナログ、或いは、ヌクレオチド上の塩基が修飾された塩基であるヌクレオチドを指す。前記修飾ヌクレオチドにより、ｓｉＲＮＡ複合体が遺伝子発現を抑制する機能を明らかに弱める又は喪失させることがない。例えば、Ｊ．Ｋ． Ｗａｔｔｓ，Ｇ．Ｆ． Ｄｅｌｅａｖｅｙ，ａｎｄ Ｍ．Ｊ． Ｄａｍｈａ，Ｃｈｅｍｉｃａｌｌｙ ｍｏｄｉｆｉｅｄ ｓｉＲＮＡ：ｔｏｏｌｓ ａｎｄ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ． Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ Ｔｏｄａｙ，２００８，１３（１９－２０）：８４２－５５に開示された修飾ヌクレオチドを選択してもよい。
いくつかの実施形態において、前記センス鎖又は前記アンチセンス鎖は、少なくとも１つのヌクレオチドが修飾ヌクレオチドであり、及び／又は少なくとも１つのリン酸エステル基が、修飾基を有するリン酸エステル基である。言い換えれば、前記センス鎖と前記アンチセンス鎖において少なくとも１本の一本鎖のリン酸－糖骨格中のリン酸エステル基及び／又はリボース基の少なくとも一部は、修飾基を有するリン酸エステル基及び／又は修飾基を有するリボース基である。
いくつかの実施形態において、前記センス鎖及び／又は前記アンチセンス鎖におけるヌクレオチドは、全て修飾ヌクレオチドである。いくつかの実施形態において、センス鎖と前記アンチセンス鎖における各ヌクレオチドは、独立してフルオロ修飾ヌクレオチド又は非フルオロ修飾ヌクレオチドである。
本開示の発明者は、驚くべきことに、第２種のｓｉＲＮＡ複合体においてＮｕに示されるｓｉＲＮＡが以下のｓｉＲＮＡである場合、動物実験において血漿中安定性と遺伝子サイレンシング効率の高度なバランスが取られていることを見出した。
いくつかの実施形態において、前記フルオロ修飾ヌクレオチドは、ヌクレオチド配列１とヌクレオチド配列２に位置し、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列１の第７、８、９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列２の第２、６、１４、１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドである。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列１におけるフルオロ修飾ヌクレオチドは５個以下であり、いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチド配列２におけるフルオロ修飾ヌクレオチドは７個以下である。
いくつかの実施形態において、５’末端から３’末端に向かって、前記センス鎖において、前記ヌクレオチド配列１の第７、８、９位又は５、７、８、９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、前記センス鎖において他の位置のヌクレオチドが非フルオロ修飾ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記アンチセンス鎖において、前記ヌクレオチド配列２の第２、６、１４、１６位又は第２、６、８、９、１４、１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、前記アンチセンス鎖において他の位置のヌクレオチドが非フルオロ修飾ヌクレオチドである。
フルオロ修飾ヌクレオチド及び非フルオロ修飾ヌクレオチドのそれぞれの定義と選択可能な範囲は、前述したとおりである。
いくつかの実施形態において、５’末端から３’末端に向かって、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖におけるヌクレオチド配列１の第５、７、８及び９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのセンス鎖の他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドであり、また、５’末端から３’末端に向かって、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖におけるヌクレオチド配列２の第２、６、８、９、１４及び１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖の他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドであり、
或いは、５’末端から３’末端に向かって、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖におけるヌクレオチド配列１の第７、８及び９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのセンス鎖の他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドであり、また、５’末端から３’末端に向かって、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖におけるヌクレオチド配列２の第２、６、１４及び１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖の他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドである。
いくつかの実施形態において、前記ヌクレオチドは、リン酸基修飾を有する。いくつかの実施形態において、リン酸基修飾は、以下の式（１０１）に示されるチオリン酸（ｐｈｏｓｐｈｏｒｔｈｉｏａｔｅ）修飾であり、即ち、１つの硫黄原子でリン酸ジエステル結合における非架橋酸素原子を置換することにより、チオリン酸ジエステル結合でリン酸ジエステル結合を置換する。当該修飾により、ｓｉＲＮＡの構造を安定化させ、塩基対合の高い特異性と高い親和力を維持することができる。
いくつかの実施形態において、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡにおいて、チオリン酸エステル基は、センス鎖又はアンチセンス鎖の任意の一端の１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、センス鎖又はアンチセンス鎖の任意の一端の２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間、又はそれらの任意の組合せからなる群より選ばれる少なくとも１つに結合されて存在する。いくつかの実施形態において、チオリン酸エステル基は、センス鎖の５’末端を除く全ての上記位置に結合されて存在する。いくつかの実施形態において、チオリン酸エステル基は、センス鎖の３’末端を除く全ての上記位置に結合されて存在する。いくつかの実施形態において、チオリン酸エステル基は、以下の位置のうち少なくとも一箇所に結合されて存在する。
前記センス鎖の５’末端から１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、
前記センス鎖の５’末端から２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間、
前記センス鎖の３’末端から１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、
前記センス鎖の３’末端から２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間、
前記アンチセンス鎖の５’末端から１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、
前記アンチセンス鎖の５’末端から２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間、
前記アンチセンス鎖の３’末端から１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、及び
前記アンチセンス鎖の３’末端から２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間。
いくつかの実施形態において、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡ分子のアンチセンス鎖配列の５’末端のヌクレオチドは、５’－リン酸ヌクレオチド又は５’－リン酸アナログ修飾ヌクレオチドである。
５’－リン酸ヌクレオチドが以下の構造を有してもよいことは、当業者によく知られている。
同時に、慣用の前記５’－リン酸アナログ修飾ヌクレオチドの種類は、当業者に公知であり、例えば、Ａｎａｓｔａｓｉａ Ｋｈｖｏｒｏｖａ ａｎｄ Ｊｏｎａｔｈａｎ Ｋ． Ｗａｔｔｓ，Ｔｈｅ ｃｈｅｍｉｃａｌ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｔｈｅｒａｐｉｅｓ ｏｆ ｃｌｉｎｉｃａｌ ｕｔｉｌｉｔｙ． Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２０１７，３５（３）：２３８～４８には、以下の４種類のヌクレオチドが開示されている。
ただし、Ｒは、Ｈ、ＯＨ、Ｆ及びメトキシ基からなる群から選択される基を表し、
Ｂａｓｅは、Ａ、Ｕ、Ｃ、Ｇ又はＴから選択される塩基を表す。
いくつかの実施形態において、５’－リン酸ヌクレオチド又は５’－リン酸アナログ修飾ヌクレオチドは、式（１０２）に示される、５’－リン酸修飾を含むヌクレオチド、式（１０３）に示される、ビニルリン酸エステル（Ｅ－ｖｉｎｙｌｐｈｏｓｐｈｏｎａｔｅ、Ｅ－ＶＰ）を含むヌクレオチド、又は、式（１０５）に示される、５’－チオリン酸修飾を含むヌクレオチドである。
本開示の発明者は、本開示の第２種のｓｉＲＮＡ複合体が、顕著に向上した血漿中安定性、低いオフターゲット効果を有するとともに、明らかに低下していないＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡサイレンシング活性をさらに示し、さらに高い脂質抑制作用を有することを意外にも見出した。したがって、いくつかの実施形態において、本開示の第２種のｓｉＲＮＡ複合体においてＮｕに示されるｓｉＲＮＡは、表１に示される、ｓｉＡＰ１、ｓｉＡＰ２、ｓｉＡＰ１－Ｍ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ１、ｓｉＡＰ１－Ｍ２、ｓｉＡＰ２－Ｍ２、ｓｉＡＰ１－Ｍ１Ｓ、ｓｉＡＰ２－Ｍ１Ｓ、ｓｉＡＰ１－Ｍ２Ｓ、ｓｉＡＰ２－Ｍ２Ｓ、ｓｉＡＰ１－Ｍ１Ｐ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ１Ｐ１、ｓｉＡＰ１－Ｍ２Ｐ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ２Ｐ１、ｓｉＡＰ１－Ｍ１ＳＰ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ１ＳＰ１、ｓｉＡＰ１－Ｍ２ＳＰ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ２ＳＰ１の１つであってもよい。
本開示に記載されたｓｉＲＮＡ又はｓｉＲＮＡ複合体において、各隣接するヌクレオチド間がリン酸ジエステル結合又はチオリン酸ジエステル結合により結合され、リン酸ジエステル結合又はチオリン酸ジエステル結合における非架橋酸素原子又は硫黄原子は、負電荷を帯び、ヒドロキシ基又はスルフヒドリル基として存在してもよく、ヒドロキシ基又はスルフヒドリル基における水素イオンは、一部又は全部がカチオンで置換されてもよい。前記カチオンは、任意のカチオン、例えば、金属カチオン、アンモニウムイオンＮＨ４ ＋、有機アンモニウムカチオンの１つであってもよい。溶解性の向上を考慮して、１つの実施形態において、前記カチオンは、アルカリ金属イオン、第３級アミンにより形成されたアンモニウムカチオン及び４級アンモニウムカチオンから選択される１種又は複数種である。アルカリ金属イオンは、Ｋ＋及び／又はＮａ＋であってもよく、第３級アミンにより形成されたカチオンは、トリエチルアミンにより形成されたアンモニウムイオン、及び／又はＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンにより形成されたアンモニウムイオンであってもよい。したがって、本開示に記載されたｓｉＲＮＡ又は第１種や第２種のｓｉＲＮＡ複合体は、少なくとも一部が塩として存在してもよい。１つの態様において、リン酸ジエステル結合又はチオリン酸ジエステル結合における非架橋酸素原子又は硫黄原子は、少なくとも一部がナトリウムイオンに結合され、本開示に記載されたｓｉＲＮＡ又は第１種や第２種のｓｉＲＮＡ複合体は、ナトリウム塩又は部分ナトリウム塩として存在する。
当業者であれば明らかに知っているように、対応する修飾を有するヌクレオシドモノマーを用いることにより修飾ヌクレオチド基を前記ｓｉＲＮＡに導入することができる。対応する修飾を有するヌクレオシドモノマーを調製する方法、及び修飾ヌクレオチド基をｓｉＲＮＡに導入する方法も、当業者によく知られている。全ての修飾ヌクレオシドモノマーは、市販品を購入してもよく、既知の方法により調製してもよい。
＜第２種のｓｉＲＮＡ複合体の調製＞
任意の合理的な合成経路により第２種のｓｉＲＮＡ複合体を調製してもよい。
いくつかの実施形態において、第２種のｓｉＲＮＡ複合体は、以下の方法により調製することができる。当該方法は、ホスホルアミダイト固相合成の条件で、それぞれｓｉＲＮＡのセンス鎖及びアンチセンス鎖のヌクレオチド種類と順序により、３’から５’に向かってヌクレオシドモノマーを順に結合し、各ヌクレオシドモノマーの結合が脱保護、カップリング、キャッピング、酸化又は硫化の４つの反応を含み、ｓｉＲＮＡのセンス鎖及びアンチセンス鎖を単離し、アニールを行うことを含む。Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡにおける各ヌクレオチドは、それぞれ独立して修飾又は未修飾のヌクレオチドであり、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡは、センス鎖とアンチセンス鎖を含み、前記センス鎖は、ヌクレオチド配列１を含み、前記アンチセンス鎖は、ヌクレオチド配列２を含み、前記ヌクレオチド配列１と前記ヌクレオチド配列２とは、少なくとも一部で逆相補的に二本鎖領域を形成し、前記ヌクレオチド配列１は、配列番号１に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、且つヌクレオチド差異が３つ以下であり、前記ヌクレオチド配列２は、配列番号２に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、且つヌクレオチド差異が３つ以下であり、
５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺ－３’（配列番号１）、
５’－Ｚ’ＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧ－３’（配列番号２）
ただし、ＺはＡであり、Ｚ’はＵであり、
前記ヌクレオチド配列１に、位置がＺに対応するヌクレオチドＺＡが含まれ、前記ヌクレオチド配列２に、位置がＺ’に対応するヌクレオチドＺ’Ｂが含まれ、前記Ｚ’Ｂは、前記アンチセンス鎖の５’末端の１番目のヌクレオチドである。
また、当該方法は、カップリング反応条件下及びカップリング試薬の存在下で、式（３２１）に示される化合物を、ヌクレオシドモノマー又は固相担体に結合されたヌクレオチド配列と接触させ、式（３２１）に示される化合物をカップリング反応させてヌクレオチド配列に結合することをさらに含む。以下に、式（３２１）に示される化合物は、複合分子とも呼ばれる。
式中、
Ｒ４は、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡに結合できる部分である。いくつかの実施形態において、Ｒ４は、共有結合によりＮｕに示されるｓｉＲＮＡに結合することができる部分である。いくつかの実施形態において、Ｒ４は、反応を経てリン酸ジエステル結合によりＮｕに示されるｓｉＲＮＡの任意の官能基に複合されることができる部分であり、
各Ｓ１は、独立してＭ１において全ての活性ヒドロキシ基がＹＣＯＯ－基で置換された基であり、各Ｙは、メチル基、トリフルオロメチル基、ジフルオロメチル基、フルオロメチル基、トリクロロメチル基、ジクロロメチル基、クロロメチル基、エチル基、ｎ－プロピル基、イソプロピル基、フェニル基、ハロフェニル基及びアルキルフェニル基から独立して選択される１つであり、いくつかの実施形態において、Ｙはメチル基である。
ｎ１、ｎ３、ｍ１、ｍ２、ｍ３、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４、Ｒ１５、Ｌ１、Ｍ１それぞれの定義と選択可能な範囲は、前述したとおりである。
Ｒ４は、窒素含有骨格上のＮとの結合を実現し、第２種のｓｉＲＮＡ複合体の合成に適切な反応部位を提供するために選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ４には、Ｒ２リンカー基又は保護されたＲ２リンカー基、及び反応させることによりｓｉＲＮＡとＡ５９に示される構造を形成することができる官能基が含まれる。
いくつかの実施形態において、Ｒ４は、Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡ又はヌクレオシドモノマー上の基と亜リン酸エステルを形成することができる第１の官能基、及びヒドロキシ基又はアミノ基と反応させて共有結合を形成することができる第２の官能基を含み、或いは、前記共有結合により結合された固相担体を含む。いくつかの実施形態において、前記第１の官能基は、ホスホルアミダイト、ヒドロキシ基又は保護されたヒドロキシ基である。いくつかの実施形態において、前記第２の官能基は、ホスホルアミダイト、カルボン酸又はカルボン酸塩である。いくつかの実施形態において、前記第２の官能基は、共有結合を介して分子の他の部分に結合される固相担体であり、前記共有結合は、ヒドロキシ基又はアミノ基により形成されている。いくつかの実施形態において、前記固相担体は、リン酸エステル結合、カルボン酸エステル結合又はアミド結合を介して結合されている。いくつかの実施形態において、前記固相担体は樹脂である。
いくつかの実施形態において、前記第１の官能基は、ヒドロキシ基、－ＯＲｋ又は式（Ｃ３）に示される基を含み、前記第２の官能基は、式（Ｃ１）、（Ｃ２）、（Ｃ３）、（Ｃ１’）又は（Ｃ３’）に示される構造を含む。
式中、ｑ１は１～４の整数であり、ＸはＯ又はＮＨであり、Ｍ＋はカチオンであり、Ｒｋはヒドロキシ保護基であり、ＳＰＳは固相担体を表し、
は、基が分子の残りの部分に結合される部位を表す。
いくつかの実施形態において、前記第１の官能基は、式（Ｃ３）に示されるように、ホスホルアミダイト基を含み、当該ホスホルアミダイト基は、ヌクレオチド上の任意位置のヒドロキシ基、例えば、２’位のヒドロキシ基又は３’位のヒドロキシ基とカップリング反応して亜リン酸エステルを形成し、酸化又は硫化されて式Ａ５９に示されるリン酸ジエステル結合又はチオリン酸エステル結合を形成し、複合分子をｓｉＲＮＡに複合させることができる。この場合、前記第２の官能基が存在しなくても、式（３２１）の化合物は、ヌクレオチドに複合されることができ、第２種のｓｉＲＮＡ複合体の取得に影響することはない。この場合に、ホスホルアミダイト固相合成等の方法によりｓｉＲＮＡのセンス鎖又はアンチセンス鎖を得た後、式（３２１）の化合物と、ヌクレオチド配列において末端ヌクレオチド上のヒドロキシ基を反応させ、後の酸化又は硫化過程においてリン酸ジエステル結合結合又はチオリン酸エステル結合を形成し、式（３２１）の化合物をｓｉＲＮＡに複合させる。
いくつかの実施形態において、前記第１の官能基は、保護されたヒドロキシ基を含む。いくつかの実施形態において、前記第２の官能基は、固相担体と反応できる基を含み、前記反応により固相担体を含む複合分子を提供する。いくつかの実施形態において、前記第２の官能基は、式（Ｃ１）、（Ｃ２）又は（Ｃ３）に示されるように、カルボキシ基、カルボン酸塩又はホスホルアミダイトを含む。前記第２の官能基がカルボキシ基又はカルボン酸塩を含む場合、式（３２１）の化合物と固相担体、例えば、樹脂におけるヒドロキシ基又はアミノ基をエステル化反応又はアミド化反応させ、カルボン酸エステル結合により結合された、固相担体を含む複合分子を形成する。前記第２の官能基がホスホルアミダイト官能基を含む場合、式（３２１）の化合物と汎用の固相担体、例えば、樹脂におけるヒドロキシ基をカップリング反応させ、酸化されてリン酸ジエステル結合により結合された、固相担体を含む複合分子を形成する。その後、上記固相担体が結合された生成物を出発とし、ホスホルアミダイト固相合成方法に従いヌクレオシドモノマーを順に結合し、複合基が結合されたｓｉＲＮＡのセンス鎖又はアンチセンス鎖を得る。ホスホルアミダイト固相合成過程において、前記第１の官能基は、脱保護され、その後、カップリング反応条件下でヌクレオシドモノマーにおけるホスホルアミダイト基とカップリングさせる。
いくつかの実施形態において、前記第１の官能基は、ヒドロキシ基又は保護されたヒドロキシ基を含み、前記第２の官能基は、式（Ｃ１’）又は（Ｃ３’）に示されるように、カルボン酸エステル結合により結合された固相担体又はアミド結合により結合された固相担体、又はリン酸エステル結合により結合された固相担体を含む。この場合、出発として固相担体の代わりに式（３２１）の化合物を用い、ホスホルアミダイト固相合成方法に従いヌクレオシドモノマーを順に結合し、複合基が結合されたｓｉＲＮＡのセンス鎖又はアンチセンス鎖を得る。
いくつかの実施形態において、カルボン酸塩は、－ＣＯＯ－Ｍ＋で表されてもよく、ここで、Ｍ＋は、カチオンであり、例えば、金属カチオン、アンモニウムカチオンＮＨ４ ＋、有機アンモニウムカチオンから選択される１つである。１つの実施形態において、前記金属イオンは、アルカリ金属イオンから選択される１つであり、例えば、Ｋ＋又はＮａ＋である。溶解性を向上させ、反応をスムーズに行うことを考慮して、いくつかの実施形態において、有機アンモニウムイオンは、第３級アミンにより形成されたアンモニウムカチオン又は４級アンモニウムカチオン、例えば、トリエチルアミンにより形成されたアンモニウムイオン又はＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンにより形成されたアンモニウムイオンである。いくつかの実施形態において、カルボン酸塩は、トリエチルアミンカルボン酸塩又はＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンカルボン酸塩である。
いくつかの実施形態において、Ｒ４は、式（Ｂ９）、（Ｂ１０）、（Ｂ９’）、（Ｂ１０’）、（Ｂ１１）、（Ｂ１２）、（Ｂ１１’）又は（Ｂ１２’）に示される構造を含む。
式中、ｑ１は１～４の整数であり、ｑ２は１～１０の整数であり、ＸはＯ又はＮＨであり、Ｍ＋はカチオンであり、Ｒｋはヒドロキシ保護基であり、ＳＰＳは固相担体を表し、
は、基が分子の残りの部分に結合される部位を表す。いくつかの実施形態において、ｑ１は１又は２である。いくつかの実施形態において、ｑ２は１～５の整数である。いくつかの実施形態において、Ｒ４は、式（Ｂ９）又は（Ｂ１０）に示される構造を含む。いくつかの実施形態において、Ｒ４は、式（Ｂ１１）又は（Ｂ１２）に示される構造を含む。
いくつかの実施形態において、Ｒｋは、Ｔｒ（トリチル基）、ＭＭＴｒ（４－メトキシトリチル基）、ＤＭＴｒ（４，４’－ビスメトキシトリチル基）、ＴＭＴｒ（４，４’，４’－トリメトキシフェニルメチル基）の１又は複数である。いくつかの実施形態において、Ｒｋは、ＤＭＴｒ、即ち、４，４’－ビスメトキシトリチル（４，４’－ｄｉｍｅｔｈｏｘｙｔｒｉｔｙｌ）であってもよい。
Ｌ１の定義は、前述したとおりである。
いくつかの実施形態において、Ｌ１は、Ｍ１標的基を窒素含有骨格上のＮ原子に結合し、第２種のｓｉＲＮＡ複合体に肝標的機能を提供するために用いられる。いくつかの実施形態において、Ｌ１は、Ａ１～Ａ２６のいずれか１つ又はその組合せを含む。
上記記載により、当業者であれば容易に理解できるように、本分野で公知のホスホルアミダイト固相合成方法と比較して、上記第１の官能基及び任意の第２の官能基により、複合分子がヌクレオチド配列の任意の可能な位置、例えば、ヌクレオチド配列の端部、ヌクレオチド配列の末端に結合された、第２種のｓｉＲＮＡ複合体を得ることができる。これに応じて、特に説明がない限り、以下に複合体の調製に関する記載において、「脱保護」、「カップリング」、「キャッピング」、「酸化」、「硫化」等の反応に言及する場合、本分野で公知のホスホルアミダイト核酸の固相合成方法に係る反応条件と試薬もまた、同様にこれらの反応に適用されると理解すべきである。例示的な反応条件と試薬は、以下に詳細に説明する。
いくつかの実施形態において、各Ｓ１は、独立してＭ１である。いくつかの実施形態において、各Ｓ１は、独立してＭ１において少なくとも１つの活性ヒドロキシ基がヒドロキシ保護基で保護された基である。いくつかの実施形態において、各Ｓ１は、独立してＭ１に存在する活性ヒドロキシ基が全てヒドロキシ保護基で保護された基である。いくつかの実施形態において、当業者に既知のあらゆるヒドロキシ保護基を、Ｍ１における活性ヒドロキシ基を保護するために用いることができる。いくつかの実施形態において、保護されたヒドロキシ基は、式ＹＣＯＯ－で表されてもよく、各Ｙは、独立してＣ１－Ｃ１０アルキル基及びＣ６－Ｃ１０アリール基からなる群から選択され、前記Ｃ１－Ｃ１０アルキル基及びＣ６－Ｃ１０アリール基は、１又は複数の置換基で任意に置換され、前記置換基は、ハロゲン及びＣ１－Ｃ６アルキル基からなる群から選択される。いくつかの実施形態において、各Ｙは、独立して、メチル基、トリフルオロメチル基、ジフルオロメチル基、モノフルオロメチル基、トリクロロメチル基、ジクロロメチル基、クロロメチル基、エチル基、ｎ－プロピル基、イソプロピル基、フェニル基、ハロフェニル基及びＣ１－Ｃ６アルキルフェニル基からなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、各Ｓ１は、それぞれ独立して式Ａ４６～Ａ５４からなる群から選択される。
いくつかの実施形態において、Ｓ１は式Ａ４９又はＡ５０である。
いくつかの実施形態において、各Ｙは、メチル基、トリフルオロメチル基、ジフルオロメチル基、フルオロメチル基、トリクロロメチル基、ジクロロメチル基、クロロメチル基、エチル基、ｎ－プロピル基、イソプロピル基、フェニル基、ハロフェニル基及びアルキルフェニル基から独立して選択される１つであり、いくつかの実施形態において、Ｙはメチル基である。
前述したように、第２種のｓｉＲＮＡ複合体の調製方法は、ｓｉＲＮＡの他方の鎖を合成し（例えば、上記工程で、複合基が結合されたｓｉＲＮＡのセンス鎖を合成した場合、固相合成方法に従いｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖を合成することをさらに含み、その逆も同様である）、センス鎖及びアンチセンス鎖を単離し、かつ、アニールを行う工程をさらに含む。具体的には、単離工程において、ヌクレオチド配列及び／又は複合分子に結合される固相担体が切断されるとともに、必要な保護基が除去され（この場合、式（３２１）の化合物における各Ｓ１基が、対応するＭ１標的基に変換される）、複合基が結合されたｓｉＲＮＡのセンス鎖（又はアンチセンス鎖）及び対応するアンチセンス鎖（又はセンス鎖）が得られ、センス鎖とアンチセンス鎖をアニールして二本鎖ＲＮＡ構造を形成し、第２種のｓｉＲＮＡ複合体を得る。
いくつかの実施形態において、第２種のｓｉＲＮＡ複合体の調製方法は、カップリング反応条件下及びカップリング試薬の存在下で、式（３２１）に示される化合物をセンス鎖又はアンチセンス鎖の３’端の１番目のヌクレオシドモノマーと接触させ、式（３２１）に示される化合物を配列における１番目のヌクレオチドに結合させ、ホスホルアミダイト固相合成の条件で、所望のセンス鎖又はアンチセンス鎖のヌクレオチドの種類と順序により、３’から５’に向かってヌクレオシドモノマーを順に結合し、ｓｉＲＮＡのセンス鎖又はアンチセンス鎖を合成する工程であって、（３２１）の化合物は、Ｒ４に、保護されたヒドロキシ基を含む第１の官能基、及び式（Ｃ１’）又は（Ｃ３’）に示される構造を有する第２の官能基が含まれる、式（３２１）に示される化合物であり、１番目のヌクレオシドモノマーと結合する前に、式（３２１）の化合物を脱保護し、各ヌクレオシドモノマーの結合が脱保護、カップリング、キャッピング、酸化又は硫化の４つの反応を含み、複合基が結合された核酸のセンス鎖又はアンチセンス鎖を得る工程；ホスホルアミダイト固相合成の条件で、アンチセンス鎖又はセンス鎖のヌクレオチドの種類と順序により、３’から５’に向かってヌクレオシドモノマーを順に結合し、核酸のアンチセンス鎖又はセンス鎖を合成し、各ヌクレオシドモノマーの結合が脱保護、カップリング、キャッピング、酸化又は硫化の４つの反応を含み、保護基を除去して固相担体から切断し、単離精製して核酸のセンス鎖及びアンチセンス鎖を得、アニールを行う工程を含む。
いくつかの実施形態において、第２種のｓｉＲＮＡ複合体の調製方法は、当該二本鎖ｓｉＲＮＡにおけるセンス鎖又はアンチセンス鎖のヌクレオチドの種類と順序により、３’から５’に向かってヌクレオシドモノマーを順に結合し、センス鎖及びアンチセンス鎖を合成し、各ヌクレオシドモノマーの結合が脱保護、カップリング、キャッピング、酸化又は硫化の４つの反応を含み、固相担体に結合されたセンス鎖、及び固相担体に結合されたアンチセンス鎖を得る工程と、カップリング反応条件下及びカップリング試薬の存在下で、式（３２１）に示される化合物を、固相担体に結合されたセンス鎖又は固相担体に結合されたアンチセンス鎖と接触させ、Ｒ４にホスホルアミダイト基である第１の官能基が含まれる式（３２１）の化合物をセンス鎖又はアンチセンス鎖に結合させる工程と、保護基を除去して固相担体から切断し、それぞれ単離精製し、ｓｉＲＮＡのセンス鎖又はアンチセンス鎖を得、アニールを行う工程を含む。Ｎｕに示されるｓｉＲＮＡのセンス鎖又はアンチセンス鎖に複合基が結合されている。
いくつかの実施形態において、式Ａ５９におけるＰは、ｓｉＲＮＡにおけるセンス鎖の３’末端に結合され、第２種のｓｉＲＮＡ複合体の調製方法は、
（１）式（３２１）の化合物（式（３２１）の化合物は、Ｒ４に、保護されたヒドロキシ基ＯＲｋを含む第１の官能基、及び式（Ｃ１’）又は（Ｃ３’）に示される構造を有する第２の官能基が含まれる化合物である）におけるヒドロキシ保護基Ｒｋを除去し、カップリング反応条件下及びカップリング試薬の存在下で、脱保護された生成物をヌクレオシドモノマーと接触させ、複合分子により固相担体に結合されるヌクレオシドモノマーを得ること、
（２）当該複合分子により固相担体に結合されるヌクレオシドモノマーを出発とし、３’－５’の方向に従いホスホルアミダイト固相合成方法によりｓｉＲＮＡのセンス鎖を合成すること、
（３）ホスホルアミダイト固相合成方法により、ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖を合成すること、
（４）ｓｉＲＮＡのセンス鎖及びアンチセンス鎖を単離してアニールし、第２種のｓｉＲＮＡ複合体を得ること、を含む。
工程（１）において、式（３２１）の化合物における保護基Ｒｋを除去する方法は、脱保護条件で、式（３２１）の化合物を脱保護試薬と接触させることを含む。脱保護条件としては、温度が０～５０℃であり、いくつかの実施形態において、１５～３５℃であり、反応時間が３０～３００秒であり、いくつかの実施形態において、５０～１５０秒であり、脱保護試薬は、トリフルオロ酢酸、トリクロロ酢酸、ジクロロ酢酸、クロロ酢酸から選択される１種又は複数種であってよく、いくつかの実施形態において、ジクロロ酢酸である。脱保護試薬と式（３２１）の化合物とのモル比が１０：１～１０００：１であり、いくつかの実施形態において、５０：１～５００：１である。
前記カップリング反応条件とカップリング試薬としては、上記カップリング反応に適した任意の条件と試薬を用いてもよい。いくつかの実施形態において、採用される固相合成方法におけるカップリング反応と同じ条件と試薬を用いてもよい。
いくつかの実施形態において、前記カップリング反応の条件としては、反応温度が０～５０℃であり、いくつかの実施形態において、１５～３５℃である。式（３２１）の化合物とヌクレオシドモノマーとのモル比が１：１～１：５０であり、いくつかの実施形態において、１：２～１：５であり、式（３２１）の化合物とカップリング試薬とのモル比が１：１～１：５０であってもよく、いくつかの実施形態において、１：３～１：１０であり、反応時間が２００～３０００秒であり、いくつかの実施形態において、５００～１５００秒である。カップリング試薬は、１Ｈ－テトラゾール、５－エチルチオ１Ｈ－テトラゾール、５－ベンジルチオ１Ｈ－テトラゾールから選択される１種又は複数種であり、いくつかの実施形態においては、５－エチルチオ１Ｈ－テトラゾールである。前記カップリング反応は、有機溶剤で行われてもよく、前記有機溶剤は、無水アセトニトリル、無水ＤＭＦ、無水ジクロロメタンから選択される１種又は複数種であり、いくつかの実施形態においては、無水アセトニトリルである。式（３２１）の化合物に対して、前記有機溶剤の用量が３～５０Ｌ／ｍｏｌであり、いくつかの実施形態において、５～２０Ｌ／ｍｏｌである。
工程（２）において、ホスホルアミダイト核酸固相合成方法により、上記工程で調製された複合分子により固相担体に結合されるヌクレオシドモノマーを出発とし、３’－５’の方向に従い第２種のｓｉＲＮＡ複合体のセンス鎖Ｓを合成する。この場合、複合基は、得られたセンス鎖の３’末端に結合される。
工程（２）及び（３）における前記固相合成の他の条件としては、ヌクレオシドモノマーの脱保護条件、脱保護試薬の種類と用量、カップリング反応条件、カップリング試薬の種類と用量、キャッピング反応の条件、キャッピング試薬の種類と用量、酸化反応条件、酸化試薬の種類と用量、硫化反応条件、硫化試薬及び用量を含み、本分野で通常用いられる各種の試薬、用量及び条件を採用する。
例えば、いくつかの実施形態において、工程（２）及び（３）において、前記固相合成では、以下の条件を用いてもよい。
ヌクレオシドモノマーの脱保護条件としては、温度が０～５０℃であり、いくつかの実施形態において、１５～３５℃であり、反応時間が３０～３００秒であり、いくつかの実施形態において、５０～１５０秒であり、脱保護試薬は、トリフルオロ酢酸、トリクロロ酢酸、ジクロロ酢酸、クロロ酢酸から選択される１種又は複数種であってよく、いくつかの実施形態においては、ジクロロ酢酸である。脱保護試薬と固相担体における４，４’－ジメトキシトリチル保護基とのモル比は、２：１～１００：１であってもよく、いくつかの実施形態において、３：１～５０：１である。
カップリング反応条件としては、温度が０～５０℃であり、いくつかの実施形態において、１５～３５℃であり、固相担体に結合される核酸配列とヌクレオシドモノマーとのモル比が１：１～１：５０であってもよく、いくつかの実施形態において、１：５～１：１５であり、固相担体に結合される核酸配列とカップリング試薬とのモル比が１：１～１：１００であり、いくつかの実施形態において、１：５０～１：８０であり、反応時間とカップリング試薬の選択は、前記と同じである。
キャッピング反応条件としては、温度が０～５０℃であり、いくつかの実施形態において、１５～３５℃であり、反応時間が５～５００秒であり、いくつかの実施形態において、１０～１００秒であり、キャッピング試薬の選択は、前記と同じである。キャッピング試薬の総量と固相担体に結合される核酸配列とのモル比が１：１００～１００：１であり、いくつかの実施形態において、１：１０～１０：１である。キャッピング試薬として等モル量の酢酸無水物とＮ－メチルイミダゾールを用いる場合に、酢酸無水物、Ｎ－メチルイミダゾール及び固相担体に結合される核酸配列のモル比が１：１：１０～１０：１０：１であり、いくつかの実施形態において、１：１：２～２：２：１である。
酸化反応条件としては、温度が０～５０℃であり、いくつかの実施形態において、１５～３５℃であり、反応時間が１～１００秒であり、いくつかの実施形態において、５～５０秒であり、酸化試薬は、いくつかの実施形態において、ヨウ素である（いくつかの実施形態において、ヨウ素水として提供する）。酸化試薬と、カップリング工程において固相担体に結合される核酸配列とのモル比が、１：１～１００：１であってもよく、いくつかの実施形態において、５：１～５０：１である。いくつかの実施形態において、前記酸化反応は、テトラヒドロフラン：水：ピリジン＝３：１：１～１：１：３の混合溶剤で行われる。硫化反応条件としては、温度が０～５０℃であり、いくつかの実施形態において、１５～３５℃であり、反応時間が５０～２０００秒であり、いくつかの実施形態において、１００～１０００秒であり、硫化試薬は、いくつかの実施形態において、キサンタンヒドリドである。硫化試薬と、カップリング工程において固相担体に結合される核酸配列とのモル比が１０：１～１０００：１であり、いくつかの実施形態において、１０：１～５００：１である。いくつかの実施形態において、前記硫化反応は、アセトニトリル：ピリジン＝１：３～３：１の混合溶剤で行われる。
全てのヌクレオシドモノマーを結合した後、アニールする前、当該方法は、ｓｉＲＮＡのセンス鎖及びアンチセンス鎖を単離することをさらに含む。単離方法は、当業者に公知であり、一般的に、合成されたヌクレオチド配列を固相担体から切断し、塩基上、リン酸基上及びリガンド上の保護基を除去し、精製し脱塩することを含む。
合成されたヌクレオチド配列を固相担体から切断し、塩基上、リン酸基上及びリガンド上の保護基を除去するには、ｓｉＲＮＡ合成において通常の切断と脱保護方法により行われてもよい。例えば、得られた固相担体が結合されたヌクレオチド配列を濃アンモニア水と接触させ、脱保護過程において、Ａ４６～Ａ５４基の保護基ＹＣＯＯ－をヒドロキシ基に変換させ、Ｓ１基を対応するＭ１基に変換させ、式（１）に示される複合体を生成する。ここで、前記濃アンモニア水は、２５～３０重量％のアンモニア水であってもよく、濃アンモニア水の用量は、目的とするｓｉＲＮＡ配列に対して０．２ｍｌ／μｍｏｌ～０．８ｍｌ／μｍｏｌであってもよい。
合成されたヌクレオチド配列に少なくとも１つの２’－ＴＢＤＭＳ保護がある場合、前記方法は、固相担体が除去されたヌクレオチド配列をトリエチルアミン三フッ化水素酸塩と接触させることにより、当該２’－ＴＢＤＭＳ保護を除去することをさらに含む。この場合、得られた目的とするｓｉＲＮＡ配列には、遊離の２’－ヒドロキシ基の対応するヌクレオシドを有する。純粋なトリエチルアミン三フッ化水素酸塩の用量は、目的とするｓｉＲＮＡ配列に対して０．４ｍｌ／μｍｏｌ～１．０ｍｌ／μｍｏｌであってもよい。このように第２種のｓｉＲＮＡ複合体を得ることができる。
精製及び脱塩する方法は、当業者によく知られている。例えば、分取用イオンクロマトグラフィー精製カラムを用いて、ＮａＢｒ又はＮａＣｌの勾配溶出によって、核酸の精製を完成し、生成物を回収して合わせた後、逆相クロマトグラフィー精製カラムにより脱塩することができる。
このように得られた第２種のｓｉＲＮＡ複合体において、ヌクレオチド間のリン酸ジエステル結合又はチオリン酸ジエステル結合における非架橋酸素原子又は硫黄原子は、基本的にナトリウムイオンに結合されており、第２種のｓｉＲＮＡ複合体は、基本的にナトリウム塩として存在する。熟知のイオン交換方法により、水素イオン及び／又は他のカチオンで前記ナトリウムイオンを置換し、他の形式の第２種のｓｉＲＮＡ複合体を得ることができる。前記カチオンは、前述したとおりである。
合成過程において、常に核酸配列の純度と分子量を検出し、合成品質をよりよく制御することができる。このような検出方法は、当業者に公知である。例えば、イオン交換クロマトグラフィーにより核酸純度を検出し、液体クロマトグラフィータンデム質量分析により分子量を測定することができる。
アニール方法も、当業者によく知られている。例えば、簡単に合成されたセンス鎖（Ｓ鎖）とアンチセンス鎖（ＡＳ鎖）を等モル比で注射用水に混合して７０～９５℃に加熱し、その後室温で冷却し、水素結合により二本鎖構造を形成させることができる。このように第２種のｓｉＲＮＡ複合体を得ることができる。
前記複合体を得た後、いくつかの実施形態において、例えば、液体クロマトグラフィータンデム質量分析等の方法を用いて、分子量検出等により合成された第２種のｓｉＲＮＡ複合体の特徴を明らかにし、合成されたｓｉＲＮＡ複合体が、目的設計の第２種のｓｉＲＮＡ複合体であるとともに、合成されたｓｉＲＮＡの配列が、所望のｓｉＲＮＡの配列、例えば表１に示される配列の１つであると確認することもできる。
式（３２１）に示される化合物は、有機溶剤において、エステル化反応条件下及び塩基とエステル化触媒の存在下で、式（３１３）に示される化合物を環状酸無水物と接触させ、イオン交換を行い、単離して式（３２１）に示される化合物を得ることを含む調製方法により得ることができる。
式中、ｎ１、ｎ３、ｍ１、ｍ２、ｍ３、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４、Ｒ１５、Ｌ１、Ｓ１それぞれの定義と選択可能な範囲は、前述したとおりであり、
Ｒ６は、式（３２１）におけるＲ４を提供する基である。いくつかの実施形態において、Ｒ６は、式（Ａ６１）に示される構造を有する。
式中、Ｒｉは、窒素含有骨格上のＮとの結合を実現できる、ＲｋＯと結合して１つの遊離ヒドロキシ基が結合されている任意の基であり、Ｒｋはヒドロキシ保護基である。この場合、Ｒ４にヒドロキシ保護基としての第１の官能基と第２の官能基が含まれ、前記第２の官能基が式（Ｃ１）又は（Ｃ２）に示される構造を含む式（３２１）の化合物が得られる。
前記エステル化反応条件としては、反応温度が０～１００℃であり、反応時間が８～４８時間であり、いくつかの実施形態において、前記エステル化反応条件としては、反応温度が１０～４０℃であり、反応時間が２０～３０時間である。
いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、エポキシ類溶剤、エーテル類溶剤、ハロゲン化アルキル類溶剤、ジメチルスルホキシド、Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド及びＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンの１種又は複数種を含む。いくつかの実施形態において、前記エポキシ類溶剤は、ジオキサン及び／又はテトラヒドロフランであり、前記エーテル類溶剤は、エチルエーテル及び／又はメチルｔｅｒｔ－ブチルエーテルであり、前記ハロゲン化アルキル類溶剤は、ジクロロメタン、トリクロロメタン及び１，２－ジクロロエタンの１種又は複数種である。いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、ジクロロメタンである。前記式（３１３）に示される化合物に対して、前記有機溶剤の用量が３～５０Ｌ／ｍｏｌであり、いくつかの実施形態において、５～２０Ｌ／ｍｏｌである。
いくつかの実施形態において、前記環状酸無水物は、コハク酸無水物、グルタル酸無水物、アジピン酸無水物又はピメリン酸無水物の１つであり、いくつかの実施形態において、コハク酸無水物である。前記環状酸無水物と前記式（３１３）に示される化合物とのモル比が１：１～１０：１であり、いくつかの実施形態において、２：１～５：１である。
前記エステル化触媒は、当該エステル化反応を触媒する任意の触媒であってもよく、例えば、当該触媒は、４－ジメチルアミノピリジンであってもよい。前記触媒と式（３１３）に示される化合物とのモル比が１：１～１０：１であり、いくつかの実施形態において、２：１～５：１である。
いくつかの実施形態において、前記塩基は、任意の無機塩基、有機塩基又はこれらの組合せであってもよい。溶解性及び生成物の安定性を考慮すると、前記塩基は、例えば、第３級アミン類有機塩基であってもよい。いくつかの実施形態において、前記第３級アミン類有機塩基は、トリエチルアミン又はＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンである。前記第３級アミン類有機塩基と式（３１３）に示される化合物とのモル比が１：１～２０：１であり、いくつかの実施形態において、３：１～１０：１である。
前記イオン交換作用は、式（３２１）の化合物を所望のカルボン酸又はカルボン酸塩の形式に変換することであり、イオン交換方法は、当業者に公知であり、適切なイオン交換溶液と交換条件を用い、前述したカチオンがＭ＋である複合分子を得ることができ、ここで詳しい説明を省略する。いくつかの実施形態において、前記イオン交換反応は、トリエチルアミンリン酸塩溶液を用いて行われ、前記トリエチルアミンリン酸塩溶液の濃度が０．２～０．８Ｍであり、いくつかの実施形態において、前記トリエチルアミンリン酸塩溶液の濃度が０．４～０．６Ｍであり、式（３１３）の化合物に対して、前記トリエチルアミンリン酸塩溶液の用量が３～６Ｌ／ｍｏｌであり、さらなる実施形態において４～５Ｌ／ｍｏｌである。
任意の適切な単離方法により反応混合物から式（３２１）の化合物を単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を蒸発除去した後、クロマトグラフィー方法により式（３２１）の化合物を単離することができ、例えば、（１）順相精製シリカゲル：２００～３００メッシュのシリカゲル充填剤を、１重量‰トリエチルアミンを含むジクロロメタン：メタノール＝１００：１８～１００：２０で勾配溶出する、又は、（２）逆相精製：Ｃ１８、Ｃ８逆相充填剤を、メタノール：アセトニトリル＝０．１：１～１：０．１で勾配溶出するという２つのクロマトグラフィー条件で単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を直接に除去して式（３２１）の化合物の粗製品を得ることができ、当該粗製品は、そのまま後の反応に用いることができる。
いくつかの実施形態において、式（３２１）の化合物の調製方法は、縮合反応条件下で、有機溶剤において、縮合剤と第３級アミン類有機塩基の存在下で、上記イオン交換反応により得られた生成物を、さらにアミノ基又はヒドロキシ基を含む固相担体と接触させることをさらに含む。この場合、Ｒ４に第１の官能基及び第２の官能基が含まれ、第１の官能基がヒドロキシ保護基を含み、第２の官能基が式（Ｃ１’）に示される構造を含む式（３２１）の化合物が得られる。
前記固相担体は、ｓｉＲＮＡの固相合成に用いられる担体の１つであり、そのうちのいくつかは、当業者に公知である。例えば、前記固相担体は、活性ヒドロキシ基又はアミノ官能基を含む固相担体から選択されてもよく、いくつかの実施形態において、前記固相担体は、アミノ樹脂又はヒドロキシ樹脂である。いくつかの実施形態において、前記アミノ樹脂又はヒドロキシ樹脂は、粒子径１００～４００メッシュ（ｍｅｓｈ）、表面におけるアミノ基又はヒドロキシ基の担持量０．２～０．５ｍｍｏｌ／ｇというパラメーターを有する。前記式（３２１）に示される化合物と固相担体との用量比は１０～４００μｍｏｌ化合物／グラムの固相担体（μｍｏｌ／ｇ）である。いくつかの実施形態において、前記式（３２１）に示される化合物と固相担体との用量比は５０～２００μｍｏｌ／ｇである。
前記有機溶剤は、当業者に既知の任意の適切な溶剤又は混合溶剤であってもよい。いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、アセトニトリル、エポキシ類溶剤、エーテル類溶剤、ハロゲン化アルキル類溶剤、ジメチルスルホキシド、Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド及びＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンの１種又は複数種である。いくつかの実施形態において、前記エポキシ類溶剤は、ジオキサン及び／又はテトラヒドロフランであり、前記エーテル類溶剤は、エチルエーテル及び／又はメチルｔｅｒｔ－ブチルエーテルであり、前記ハロゲン化アルキル類溶剤は、ジクロロメタン、トリクロロメタン及び１，２－ジクロロエタンの１種又は複数種である。いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、アセトニトリルである。式（３２１）の化合物に対して、前記有機溶剤の用量は２０～２００Ｌ／ｍｏｌであり、いくつかの実施形態において、５０～１００Ｌ／ｍｏｌである。
いくつかの実施形態において、前記縮合剤は、（ベンゾトリアゾール－１－イルオキシ）トリピロリジノホスホニウムヘキサフルオロホスフェート、３－ジエトキシホスホリル－１，２，３－ベンゾオキサゾール４（３Ｈ）－オン及び／又はＯ－ベンゾトリアゾール－テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェートであってもよく、いくつかの実施形態において、前記縮合剤は、Ｏ－ベンゾトリアゾール－テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェートである。前記縮合剤と式（３２１）に示される化合物とのモル比は１：１～２０：１であり、さらなる実施形態において１：１～５：１である。
いくつかの実施形態において、前記第３級アミン類有機塩基は、トリエチルアミン及び／又はＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンであり、いくつかの実施形態において、Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンであり、前記第３級アミン類有機塩基と式（３２１）に示される化合物とのモル比は１：１～２０：１であり、いくつかの実施形態において、１：１～５：１である。
いくつかの実施形態において、式（３２１）の化合物の調製方法は、得られた縮合生成物をキャッピング反応条件下で、有機溶剤において、キャッピング試薬及びアシル化触媒と接触させ、単離して式（３２１）に示される化合物を得ることをさらに含んでもよい。前記キャッピング反応の作用は、後の反応において不必要な副生成物が生じることを避けるために、まだ完全に反応していないあらゆる活性反応官能基を除去することである。前記キャッピング反応の条件としては、反応温度が０～５０℃であり、いくつかの実施形態において、１５～３５℃であり、反応時間が１～１０ｈであり、いくつかの実施形態において、３～６ｈである。キャッピング試薬としては、当業者に公知の、ｓｉＲＮＡ固相合成に用いられるキャッピング試薬を用いてもよい。
いくつかの実施形態において、前記キャッピング試薬は、キャッピング試薬１（ｃａｐ１）及びキャッピング試薬２（ｃａｐ２）からなり、キャッピング試薬１は、Ｎ－メチルイミダゾールであり、いくつかの実施形態において、Ｎ－メチルイミダゾールのピリジン／アセトニトリル混合溶液として提供され、ピリジンとアセトニトリルとの体積比は１：１０～１：１であり、いくつかの実施形態において、１：３～１：１であり、ピリジンとアセトニトリルの総体積とＮ－メチルイミダゾールの体積との比は１：１～１０：１であり、いくつかの実施形態において、３：１～７：１である。前記キャッピング試薬２は、酢酸無水物である。いくつかの実施形態において、前記キャッピング試薬２は、酢酸無水物のアセトニトリル溶液として提供され、酢酸無水物とアセトニトリルとの体積比が１：１～１：１０であり、さらなる実施形態において１：２～１：６である。
いくつかの実施形態において、前記Ｎ－メチルイミダゾールのピリジン／アセトニトリル混合溶液の体積と式（３２１）の化合物の質量との比が５ｍｌ／ｇ～５０ｍｌ／ｇであり、いくつかの実施形態において、１５ｍｌ／ｇ～３０ｍｌ／ｇである。前記酢酸無水物のアセトニトリル溶液の体積と式（３２１）の化合物の質量との比は０．５ｍｌ／ｇ～１０ｍｌ／ｇであり、いくつかの実施形態において、１ｍｌ／ｇ～５ｍｌ／ｇである。
いくつかの実施形態において、キャッピング試薬としては、等モル量の酢酸無水物とＮ－メチルイミダゾールを用いる。いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、アセトニトリル、エポキシ類溶剤、エーテル類溶剤、ハロゲン化アルキル類溶剤、ジメチルスルホキシド、Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド及びＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンの１種又は複数種である。いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、アセトニトリルである。式（３２１）の化合物に対して、前記有機溶剤の用量が１０～５０Ｌ／ｍｏｌであり、いくつかの実施形態において、５～３０Ｌ／ｍｏｌである。
いくつかの実施形態において、前記アシル化触媒は、エステル化縮合又はアミド化縮合に使用できる任意の触媒、例えばアルカリ複素環化合物から選択されてもよい。いくつかの実施形態において、前記アシル化触媒は、４－ジメチルアミノピリジンである。前記触媒と式（３２１）に示される化合物との質量比が０．００１：１～１：１であり、いくつかの実施形態において、０．０１：１～０．１：１である。
いくつかの実施形態において、任意の適切な単離方法により反応混合物から式（３２１）の化合物を単離することができる。いくつかの実施形態において、有機溶剤で十分に洗浄し、濾過し、未反応の反応物、過剰なキャッピング試薬及び他の不純物を除去することにより、式（３２１）の化合物を得ることができる。前記有機溶剤は、アセトニトリル、ジクロロメタン、メタノールから選択され、いくつかの実施形態において、アセトニトリルである。
いくつかの実施形態において、式（３２１）に示される複合分子の調製方法は、有機溶剤において、カップリング反応条件下及びカップリング試薬の存在下で、式（３１３）に示される化合物をホスホルジアミダイトと接触させ、単離して式（３２１）に示される化合物を得ることを含む。この場合、Ｒ４に第１の官能基及び第２の官能基が含まれ、第１の官能基がヒドロキシ保護基を含み、第２の官能が式（Ｃ３）に示される構造を含む式（３２１）の化合物が得られる。
いくつかの実施形態において、カップリング反応条件としては、温度が０～５０℃であってもよく、例えば１５～３５℃であり、式（３１３）の化合物とホスホルジアミダイトとのモル比が１：１～１：５０であってもよく、例えば１：５～１：１５であり、式（３１３）の化合物とカップリング試薬とのモル比が１：１～１：１００であってもよく、例えば１：５０～１：８０であり、反応時間が２００～３０００秒であってもよく、例えば５００～１５００秒である。前記ホスホルジアミダイトは、例えばビス（ジイソプロピルアミノ）（２－シアノエトキシ）ホスフィンを用いてもよく、市販品として購入されてもよく、又は本分野で公知の方法により合成されてもよい。カップリング試薬は、１Ｈ－テトラゾール、５－エチルチオ１Ｈ－テトラゾール、５－ベンジルチオ１Ｈ－テトラゾールから選択される１種又は複数種であり、例えば、５－エチルチオ１Ｈ－テトラゾールである。前記カップリング反応は、有機溶剤で行われてもよく、前記有機溶剤は、無水アセトニトリル、無水ＤＭＦ、無水ジクロロメタンから選択される１種又は複数種であり、例えば無水アセトニトリルである。いくつかの実施形態において、式（３１３）の化合物に対して、前記有機溶剤の用量が３～５０Ｌ／ｍｏｌであり、例えば、５～２０Ｌ／ｍｏｌであってもよい。当該カップリング反応を行うことにより、式（３１３）の化合物におけるヒドロキシ基とホスホルジアミダイトを反応させてホスホルアミダイト基を形成する。いくつかの実施形態において、溶剤を直接に除去して式（３２１）の化合物の粗製品を得ることができ、当該粗製品は、そのまま後の反応に用いることができる。
いくつかの実施形態において、式（３２１）の化合物の調製方法は、カップリング反応条件下で、有機溶剤において、カップリング試薬の存在下で、単離して得られた生成物を、さらにヒドロキシ基含有固相担体と接触させる工程をさらに含む。その後、キャッピング反応、酸化反応を行い、単離して式（３２１）の化合物を得る。この場合、Ｒ４に第１の官能基及び第２の官能基が含まれ、第１の官能基がヒドロキシ保護基を含み、第２の官能基が式（Ｃ３’）に示される構造を有する式（３２１）の化合物が得られる。
いくつかの実施形態において、前記固相担体は、本分野で公知の核酸固相合成に使用できる固相担体であり、例えば、脱保護反応された市販の汎用の固相担体（ＮｉｔｔｏＰｈａｓｅ（登録商標）ＨＬ ＵｎｙＬｉｎｋｅｒＴＭ ３００ Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ Ｓｕｐｐｏｒｔ、Ｋｉｎｏｖａｔｅ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ社、構造が式Ｂ８０に示される）であってもよい。
脱保護反応は、当業者に公知である。いくつかの実施形態において、脱保護条件としては、温度が０～５０℃であり、例えば１５～３５℃であり、反応時間が３０～３００秒、例えば５０～１５０秒である。脱保護試薬は、トリフルオロ酢酸、トリクロロ酢酸、ジクロロ酢酸、クロロ酢酸から選択される１種又は複数種であってよく、いくつかの実施形態において、脱保護試薬は、ジクロロ酢酸である。脱保護試薬と固定相における－ＤＭＴｒ（４，４’－ジメトキシトリチル）保護基とのモル比が２：１～１００：１であり、例えば３：１～５０：１である。前記脱保護を行うことにより、前記固相担体の表面に反応活性を有する遊離ヒドロキシ基が得られ、次のカップリング反応を行いやすくする。
カップリング反応条件及びカップリング試薬の選択は、以上のとおりである。当該カップリング反応を行うことにより、脱保護反応で形成された遊離ヒドロキシ基とホスホルアミダイト基を反応させて亜リン酸エステル結合を形成する。
いくつかの実施形態において、キャッピング反応条件としては、温度が０～５０℃であり、例えば１５～３５℃であり、反応時間が５～５００秒であり、例えば１０～１００秒であり、前記キャッピング反応をキャッピング試薬の存在下で行う。キャッピング試薬の選択と用量は、以上のとおりである。
酸化反応条件としては、温度が０～５０℃であり、例えば、１５～３５℃であってもよく、反応時間が１～１００秒、例えば、５～５０秒であってもよく、酸化試薬は、例えば、ヨウ素であってもよい（いくつかの実施形態において、ヨウ素水として提供する）。いくつかの実施形態において、酸化試薬と亜リン酸エステル基とのモル比が１：１～１００：１であり、例えば、５：１～５０：１であってもよい。いくつかの実施形態において、前記酸化反応は、テトラヒドロフラン：水：ピリジン＝３：１：１～１：１：３の混合溶剤で行われる。
いくつかの実施形態において、Ｒ６は、式Ｂ７又はＢ８の基の１つである。
式中、ｑ２の定義は、前述したとおりである。
この場合、式（３１３）に示される化合物は、有機溶剤において、アミド化反応条件下及びアミド化反応縮合剤と第３級アミン類有機塩基の存在下で、式（３１４）に示される化合物を式（Ａ～１）に示される化合物又は式（Ａ～２）の化合物と接触させ、その後単離する、という調製方法により得ることができる。
式中、ｎ１、ｎ３、ｍ１、ｍ２、ｍ３、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４、Ｒ１５、Ｌ１、Ｓ１、ｑ２及びＲｋそれぞれの定義と選択可能な範囲は、前述したとおりである。
前記アミド化反応条件としては、反応温度が０～１００℃であり、反応時間が１～４８時間であってもよく、いくつかの実施形態において、前記アミド化反応条件としては、反応温度が１０～４０℃であり、反応時間が２～１６時間である。
いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、アルコール類溶剤、エポキシ類溶剤、エーテル類溶剤、ハロゲン化アルキル類溶剤、ジメチルスルホキシド、Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド及びＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンの１種又は複数種である。前記アルコール類溶剤は、いくつかの実施形態において、メタノール、エタノール、プロパノールの１種又は複数種であり、いくつかの実施形態において、エタノールである。前記エポキシ類溶剤は、いくつかの実施形態において、ジオキサン及び／又はテトラヒドロフランである。前記エーテル類溶剤は、いくつかの実施形態において、エチルエーテル及び／又はメチルｔｅｒｔ－ブチルエーテルである。前記ハロゲン化アルキル類溶剤は、いくつかの実施形態において、ジクロロメタン、トリクロロメタン及び１，２－ジクロロエタンの１種又は複数種である。いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、ジクロロメタンである。式（３１４）の化合物に対して、有機溶剤の用量が３～５０Ｌ／ｍｏｌであり、さらなる実施形態において３～２０Ｌ／ｍｏｌである。
いくつかの実施形態において、前記アミド化反応縮合剤は、（ベンゾトリアゾール－１－イルオキシ）トリピロリジノホスホニウムヘキサフルオロホスフェート、３－ジエトキシホスホリル－１，２，３－ベンゾオキサゾール４（３Ｈ）－オン、４－（４，６－ジメトキシトリアジン－２－イル）－４－メチルモルホリン塩酸塩（４－（４，６－ｄｉｍｅｔｈｏｘｙｔｒｉａｚｉｎ－２－ｙｌ）－４－ｍｅｔｈｙｌｍｏｒｐｈｏｌｉｎｅ ｈｙｄｒｏｃｈｌｏｒｉｄｅ）、２－エトキシ－１－エトキシカルボニル－１，２－ジヒドロキノリン（ＥＥＤＱ）又はＯ－ベンゾトリアゾール－テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェートであり、さらなる実施形態において、３－ジエトキシホスホリル－１，２，３－ベンゾオキサゾール４（３Ｈ）－オンである。前記アミド化反応縮合剤と式（３１４）に示される化合物とのモル比が１：１～１０：１であってもよく、いくつかの実施形態において、２．５：１～５：１である。
いくつかの実施形態において、前記第３級アミン類有機塩基は、トリエチルアミン又はＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンであり、さらなる実施形態において、Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンである。前記第３級アミン類有機塩基と式（３１４）に示される化合物とのモル比が３：１～２０：１であり、いくつかの実施形態において、５：１～１０：１である。
いくつかの実施形態において、式（Ａ～１）及び式（Ａ～２）の化合物は、任意の適当な方法により調製されてもよい。例えば、ＲｋがＤＭＴｒ基である場合、グリセリン酸カルシウムとＤＭＴｒＣｌを反応させて式（Ａ～１）の化合物を調製することができる。同様に、３－アミノ－１，２－プロパンジオールと環状酸無水物を接触させた後、ＤＭＴｒＣｌと反応させて式（Ａ～２）の化合物を調製することができ、前記環状酸無水物は、炭素原子数４～１３、いくつかの実施形態においては４～８の環状酸無水物であってもよい。当業者であれば容易に理解できるように、前記環状酸無水物の選択は、（Ａ～２）の化合物におけるｑ２の異なる値に対応しており、例えば、前記環状酸無水物がコハク酸無水物である場合、ｑ２＝１であり、前記環状酸無水物がグルタル酸無水物である場合、ｑ２＝２であり、類推してもよい。
いくつかの変形において、式（３１４）に示される化合物を、前記環状酸無水物、３－アミノ－１，２－プロパンジオール及びＤＭＴｒＣｌと順に反応させることにより、式（３１３）の化合物を調製することもできる。当業者であれば容易に理解できるように、これらの変形は、式（３１３）の化合物の構造と機能に影響を与えることがなく、かつ、当業者が上記方法により容易に実現するものである。
上記と同様に、任意の適切な単離方法により反応混合物から式（３１３）の化合物を単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を蒸発除去した後、クロマトグラフィー方法により式（３１３）の化合物を単離することができ、例えば、（１）順相精製シリカゲル：２００～３００メッシュのシリカゲル充填剤を、石油エーテル：酢酸エチル：ジクロロメタン：Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド＝１：１：１：０．５～１：１：１：０．６で勾配溶出する、（２）逆相精製：Ｃ１８、Ｃ８逆相充填剤を、メタノール：アセトニトリル＝０．１：１～１：０．１で勾配溶出するという２つのクロマトグラフィー条件で単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を直接に除去して式（３１３）の化合物の粗製品を得ることができ、当該粗製品は、そのまま後の反応に用いることができる。
いくつかの実施形態において、式（３１４）に示される化合物は、有機溶剤において、脱保護反応条件下で、式（３１５）に示される化合物をハロ酢酸と接触させた後、単離することを含む調製方法により得ることができる。
式中、Ｒ７は、式（３３０）、（３３１）、（３３２）又は（３３３）に示される基から選択され、いくつかの実施形態において、Ｒ７の構造が式（３３０）に示される。
ｎ１、ｎ３、ｍ１、ｍ２、ｍ３、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４、Ｒ１５、Ｌ１、Ｓ１それぞれの定義と選択可能な範囲は、前述したとおりである。
前記ハロ酢酸は、ジクロロ酢酸、トリクロロ酢酸、クロロ酢酸及びトリフルオロ酢酸から選択される１種又は複数種であり、いくつかの実施形態において、ジクロロ酢酸である。
前記脱保護反応条件としては、反応温度が０～１００℃であり、反応時間が０．１～２４時間であり、いくつかの実施形態において、反応温度が１０～４０℃であり、反応時間が０．５～１６時間である。
いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、エポキシ類溶剤、エーテル類溶剤、ハロゲン化アルキル類溶剤、ジメチルスルホキシド、Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド及びＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンの１種又は複数種である。前記エポキシ類溶剤は、いくつかの実施形態において、ジオキサン及び／又はテトラヒドロフランであり、前記エーテル類溶剤は、いくつかの実施形態において、エチルエーテル及び／又はメチルｔｅｒｔ－ブチルエーテルであり、前記ハロゲン化アルキル類溶剤は、いくつかの実施形態において、ジクロロメタン、トリクロロメタン及び１，２－ジクロロエタンの１種又は複数種であり、いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、ジクロロメタンである。式（３１５）の化合物に対して、有機溶剤の用量が３～５０Ｌ／ｍｏｌであり、さらなる実施形態において、５～２０Ｌ／ｍｏｌである。
前記ハロ酢酸と前記式（３１５）に示される化合物とのモル比が５：１～１００：１であり、いくつかの実施形態において、１０：１～５０：１である。
上記と同様に、任意の適切な単離方法により反応混合物から式（３１４）の化合物を単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を蒸発除去した後、クロマトグラフィー方法により式（３１４）の化合物を単離することができ、例えば、（１）順相精製シリカゲル：２００～３００メッシュのシリカゲル充填剤を、ジクロロメタン：メタノール＝１００：３０～１００：４０で勾配溶出する、（２）逆相精製：Ｃ１８、Ｃ８逆相充填剤を、メタノール：アセトニトリル＝０．１：１～１：０．１で勾配溶出するという２つのクロマトグラフィー条件で単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を直接に除去して式（３１４）の化合物の粗製品を得ることができ、当該粗製品は、そのまま後の反応に用いることができる。
式（３１５）に示される化合物は、有機溶剤において、アミド化反応縮合剤と第３級アミン類有機塩基の存在下及び縮合反応条件下で、式（３１７）に示される化合物を式（３１６）に示される化合物と接触させた後、単離することを含む調製方法により得ることができる。
式中、ｎ１、ｎ３、ｍ１、ｍ２、ｍ３、Ｒ７、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４、Ｒ１５、Ｌ１、Ｓ１それぞれの定義と選択可能な範囲は、前述したとおりである。
式（３１６）の化合物としては、例えば、Ｊ． Ａｍ． Ｃｈｅｍ． Ｓｏｃ． ２０１４，１３６，１６９５８－１６９６１に開示された化合物を用いてもよく、或いは、式（３１６）の化合物は、当業者が各種の方法により調製することができ、例えば、米国特許ＵＳ ８，１０６，０２２ Ｂ２の実施例１に開示された方法を参照していくつかの式（３１６）の化合物を調製することができ、引用により上記文献の全ての内容が全体として本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態において、前記縮合反応条件としては、反応温度が０～１００℃であり、反応時間が０．１～２４時間であり、いくつかの実施形態において、反応温度は１０～４０℃であり、反応時間は０．５～１６時間である。
前記式（３１６）に示される化合物と前記式（３１７）に示される化合物とのモル比が２：１～１０：１であってもよく、いくつかの実施形態において、２．５：１～５：１である。
いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、アセトニトリル、エポキシ類溶剤、エーテル類溶剤、ハロゲン化アルキル類溶剤、ジメチルスルホキシド、Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド及びＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンの１種又は複数種であり、前記エポキシ類溶剤は、いくつかの実施形態において、ジオキサン及び／又はテトラヒドロフランであり、前記エーテル類溶剤は、いくつかの実施形態において、エチルエーテル及び／又はメチルｔｅｒｔ－ブチルエーテルであり、前記ハロゲン化アルキル類溶剤は、いくつかの実施形態において、ジクロロメタン、トリクロロメタン及び１，２－ジクロロエタンの１種又は複数種であり、いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、アセトニトリルである。式（３１７）の化合物に対して、前記有機溶剤の用量は３～５０Ｌ／ｍｏｌであり、いくつかの実施形態において、５～２０Ｌ／ｍｏｌである。
いくつかの実施形態において、前記アミド化反応縮合剤は、（ベンゾトリアゾール－１－イルオキシ）トリピロリジノホスホニウムヘキサフルオロホスフェート、３－ジエトキシホスホリル－１，２，３－ベンゾオキサゾール４（３Ｈ）－オン（ＤＥＰＢＴ）、Ｏ－ベンゾトリアゾール－テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート又は４－（４，６－ジメトキシトリアジン－２－イル）－４－メチルモルホリン塩酸塩であり、さらなる実施形態において、４－（４，６－ジメトキシトリアジン－２－イル）－４－メチルモルホリン塩酸塩である。前記アミド化反応縮合剤と式（３１７）に示される化合物とのモル比は２：１～１０：１であってもよく、いくつかの実施形態において、２．５：１～５：１である。
前記第３級アミン類有機塩基は、Ｎ－メチルモルホリン、トリエチルアミン又はＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンであってもよく、いくつかの実施形態において、Ｎ－メチルモルホリンであり、前記第３級アミン類有機塩基と式（３１７）に示される化合物とのモル比が３：１～２０：１であってもよく、いくつかの実施形態において、５：１～１０：１である。
上記と同様に、任意の適切な単離方法により反応混合物から式（３１５）の化合物を単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を蒸発除去した後、クロマトグラフィー方法により式（３１５）の化合物を単離することができ、例えば、（１）順相精製シリカゲル：２００～３００メッシュのシリカゲル充填剤を、ジクロロメタン：メタノール＝１００：５～１００：７で勾配溶出する、（２）逆相精製：Ｃ１８、Ｃ８逆相充填剤を、メタノール：アセトニトリル＝０．１：１～１：０．１で勾配溶出するという２つのクロマトグラフィー条件で単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を直接に除去して式（３１５）の化合物の粗製品を得ることができ、当該粗製品は、そのまま後の反応に用いることができる。
いくつかの実施形態において、式（３１７）の化合物と十分な量の式（３１６）の化合物を一度反応させるだけで所望の式（３１５）の化合物を生成する。この場合、各Ｓ１－Ｌ１部分同士が同じである。いくつかの実施形態において、必要に応じて、式（３１７）の化合物を、異なる式（３１６）の化合物、即ち、Ｌ１及び／又はＳ１が異なる式（３１６）の化合物とバッチ反応させることにより、生成された式（３１５）の化合物に２種類以上のＳ１及び／又はＬ１を含ませることができる。例えば、１ｅｑの式（３１７）の化合物に対して、それを２ｅｑの第１の式（３１６）の化合物と接触させ、式（３１７）の化合物における２つの末端第一級アミン基に第１のＳ１－Ｌ１部分を結合した後、続いて（ｎ３＋ｎ１－１）ｅｑの第２の式（３１６）の化合物と接触させ、（ｎ３及びｎ１の定義と値の範囲は、前述したとおりである）、式（３１７）の化合物における（ｎ３＋ｎ１－１）個の第二級アミン基に第２のＳ１－Ｌ１部分を結合することができる。
いくつかの実施形態において、式（３１７）に示される化合物は、有機溶剤の存在下及び脱保護反応条件下で、式（３１８）に示される化合物をメチルアミン水溶液と接触させた後、単離することを含む調製方法により得ることができる。
式中、ｎ１、ｎ３、ｍ１、ｍ２、ｍ３、Ｒ７、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４、Ｒ１５それぞれの定義と選択可能な範囲は、前述したとおりである。
前記脱保護反応条件としては、反応温度が０～１５０℃であり、反応時間が５～７２時間であり、いくつかの実施形態において、反応温度が２０～８０℃であり、反応時間が１０～３０時間である。
前記有機溶剤は、アルコールから選択されてもよく、いくつかの実施形態において、メタノール、エタノール及びイソプロパノールの１つであり、いくつかの実施形態において、メタノールであり、式（３１８）の化合物に対して、前記有機溶剤の用量が１～２０Ｌ／ｍｏｌであり、いくつかの実施形態において、１．５～１０Ｌ／ｍｏｌである。
前記メチルアミン水溶液の濃度が３０～４０質量％であってもよく、メチルアミンと式（３１８）に示される化合物とのモル比が１０：１～５００：１であってもよく、いくつかの実施形態において、５０：１～２００：１である。
上記と同様に、任意の適切な単離方法により反応混合物から式（３１７）の化合物を単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を蒸発除去した後、クロマトグラフィー方法により式（３１７）の化合物を単離することができ、例えば、（１）順相精製シリカゲル：２００～３００メッシュのシリカゲル充填剤を、ジクロロメタン：メタノール：アンモニア水（２５重量％）＝１：１：０．０５～１：１：０．２５で勾配溶出する、（２）逆相精製：Ｃ１８、Ｃ８逆相充填剤を、メタノール：アセトニトリル＝０．１：１～１：０．１で勾配溶出するという２つのクロマトグラフィー条件で単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を直接に除去して式（３１７）の化合物の粗製品を得ることができ、当該粗製品は、そのまま後の反応に用いることができる。
いくつかの実施形態において、式（３１８）に示される化合物は、有機溶剤の存在下及び置換反応条件下で、式（３１９）に示される化合物を、トリフェニルクロロメタン（ＴｒＣｌ）、ジフェニルエチルフェニルクロロメタン、フェニルジエチルフェニルクロロメタン又はトリエチルフェニルクロロメタン、いくつかの実施形態においてトリフェニルクロロメタン（ＴｒＣｌ）と接触させた後、単離することを含む調製方法により得ることができる。
式中、ｎ１、ｎ３、ｍ１、ｍ２、ｍ３、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４、Ｒ１５それぞれの定義と選択可能な範囲は、前述したとおりである。
前記置換反応条件としては、反応温度が０～１００℃であり、反応時間が５～７２時間であってもよく、いくつかの実施形態において、反応条件としては、反応温度が１０～４０℃であり、反応時間が１０～３０時間である。
トリフェニルクロロメタン（ＴｒＣｌ）、ジフェニルエチルフェニルクロロメタン、フェニルジエチルフェニルクロロメタン又はトリエチルフェニルクロロメタンは、市販品を購入することができ、トリフェニルクロロメタン（ＴｒＣｌ）、ジフェニルエチルフェニルクロロメタン、フェニルジエチルフェニルクロロメタン又はトリエチルフェニルクロロメタンと式（３１９）に示される化合物とのモル比が１：１～１０：１であってもよく、いくつかの実施形態において、１：１～３：１である。
前記有機溶剤は、エポキシ類溶剤、エーテル類溶剤、ハロゲン化アルキル類溶剤、ジメチルスルホキシド、Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド及びＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンの１種又は複数種であってもよい。前記エポキシ類溶剤は、いくつかの実施形態において、ジオキサン及び／又はテトラヒドロフランであってもよく、前記エーテル類溶剤は、いくつかの実施形態において、エチルエーテル及び／又はメチルｔｅｒｔ－ブチルエーテルであってもよく、前記ハロゲン化アルキル類溶剤は、いくつかの実施形態において、ジクロロメタン、トリクロロメタン及び１，２－ジクロロエタンの１種又は複数種であってもよく、いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、ジクロロメタンである。式（３１９）の化合物に対して、前記有機溶剤の用量が３～５０Ｌ／ｍｏｌであってもよく、いくつかの実施形態において、５～２０Ｌ／ｍｏｌである。
上記と同様に、任意の適切な単離方法により反応混合物から式（３１８）の化合物を単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を蒸発除去した後、クロマトグラフィー方法により式（３１８）の化合物を単離することができ、例えば、（１）順相精製シリカゲル：２００～３００メッシュのシリカゲル充填剤を、メタノール：ジクロロメタン＝０．０１：１～０．５：１で、又はメタノール：ジクロロメタン：酢酸エチル：石油エーテル＝０．１：１：１：１～１：１：１：１で勾配溶出する、（２）逆相精製：Ｃ１８、Ｃ８逆相充填剤を、メタノール：アセトニトリル＝０．１：１～１：０．１で勾配溶出するという２つのクロマトグラフィー条件で単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を直接に除去して式（３１８）の化合物の粗製品を得ることができ、当該粗製品は、そのまま後の反応に用いることができる
いくつかの実施形態において、式（３１９）に示される化合物は、有機溶剤において、置換反応条件下で、式（３２０）に示される化合物をトリフルオロ酢酸エチルと接触させた後、単離することを含む調製方法により得ることができる。
式中、ｎ１、ｎ３、ｍ１、ｍ２、ｍ３、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４、Ｒ１５それぞれの定義と選択可能な範囲は、前述したとおりである。
いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、アセトニトリル、エポキシ類溶剤、エーテル類溶剤、ハロゲン化アルキル類溶剤、ジメチルスルホキシド、Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド及びＮ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミンの１種又は複数種である。いくつかの実施形態において、前記エポキシ類溶剤は、ジオキサン及び／又はテトラヒドロフランであり、いくつかの実施形態において、前記エーテル類溶剤は、エチルエーテル及び／又はメチルｔｅｒｔ－ブチルエーテルであり、いくつかの実施形態において、前記ハロゲン化アルキル類溶剤は、ジクロロメタン、トリクロロメタン及び１，２－ジクロロエタンの１種又は複数種であり、いくつかの実施形態において、前記有機溶剤は、アセトニトリルである。式（３２０）の化合物に対して、前記有機溶剤の用量が１～５０Ｌ／ｍｏｌであってもよく、いくつかの実施形態において、１～２０Ｌ／ｍｏｌである。
前記置換反応条件としては、反応温度が０～１００℃であり、反応時間が５～７２時間であってもよく、いくつかの実施形態において、前記置換反応条件としては、反応温度が１０～４０℃であり、反応時間が１０～３０時間である。
式（３２０）の化合物は、市販品を購入して、又は、当業者により既知の方法を用いて得ることができる。例えば、ｍ１＝ｍ２＝ｍ３＝３、ｎ１＝１、ｎ３＝２であり、Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４、Ｒ１５がいずれもＨである場合、式（３２０）の化合物は、アルファ・エイサー社から市販品として購入することができる。
前記トリフルオロ酢酸エチルと式（３２０）に示される化合物とのモル比が２：１～１０：１であり、いくつかの実施形態において、３：１～５：１である。
上記と同様に、任意の適切な単離方法により反応混合物から式（３１９）の化合物を単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を蒸発除去した後、クロマトグラフィー方法により式（３１９）の化合物を単離することができ、例えば、（１）順相精製シリカゲル：２００～３００メッシュのシリカゲル充填剤を、メタノール：ジクロロメタン＝０．０１：１～０．５：１で、又はメタノール：ジクロロメタン：酢酸エチル：石油エーテル＝０．１：１：１：１～１：１：１：１で勾配溶出する、（２）逆相精製：Ｃ１８、Ｃ８逆相充填剤を、メタノール：アセトニトリル＝０．１：１～１：０．１で勾配溶出するという２つのクロマトグラフィー条件で単離することができる。いくつかの実施形態において、溶剤を直接に除去して式（３１９）の化合物の粗製品を得ることができ、当該粗製品は、そのまま後の反応に用いることができる。
本開示の第１種又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体は、薬学的に許容できる他の添加剤と併用してもよく、当該添加剤は、本分野で通常採用される各種の製剤又は化合物の１種又は複数種であってもよく、詳細は、上述した本開示の薬物組成物に関する記載を参照のこと。
＜本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び第２種のｓｉＲＮＡ複合体の使用＞
いくつかの実施形態において、本開示は、修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体の、前記アポリポタンパクＣ３（ＡＰＯＣ３）の過剰発現による脂質異常の治療及び／又は予防のための薬物の調製への使用を提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、被験体に本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体の有効量を投与することを含む、アポリポタンパクＣ３（ＡＰＯＣ３）の過剰発現による脂質異常の治療方法を提供する。
本開示のｓｉＲＮＡ活性成分を、それを必要とする被験体に投与することにより、ＲＮＡ干渉機構により脂質異常を治療する目的を達成することができる。したがって、本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体は、脂質異常の予防及び／又は治療に用いられ、又は脂質異常の予防及び／又は治療のための薬物の調製に用いることができる。
前記脂質異常とは、肝細胞においてＡＰＯＣ３遺伝子の過剰発現による脂質異常を指し、通常、血中トリグリセリド、コレステロール等の脂質及び／又はリポタンパクのいずれか１つ又は全てのレベルの向上として表され、レベルの高い脂質は、高血圧、心血管疾患、糖尿病及び他の病理学的疾患に高度に関連する。高トリグリセリド血症は、アテローム性動脈硬化に関連し、膵炎にもつながる。本開示に記載された脂質異常は、高コレステロール血症、高トリグリセリド血症又はアテローム性動脈硬化を含むが、これらに限定されない。
本明細書で用いられる用語「薬剤投与／投与」とは、本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体を少なくとも一部、所望の部位に局在化することにより所望の効果を生じさせる方法又は経路により、本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体を被験体の体内に入れることを指す。本開示の方法に適した投与経路は、局所投与と全身投与を含む。一般的には、局所投与により、被験体全身よりも多くの本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体が特定の部位に送達されるが、全身投与により、本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体が被験体のほぼ全身に送達される。本開示が脂質異常の予防及び／又は治療手段を提供することを意図することを考慮すると、いくつかの実施形態において、薬物を肝臓に送達することができる投与方法である。
本分野で既知の任意の適切な経路で被験体に投与することができ、前記経路としては、経口投与又は胃腸外経路、例えば、静脈内投与、筋肉内投与、皮下投与、経皮投与、気管内投与（エアロゾル）、肺部投与、鼻部投与、直腸投与及び局所投与（口腔内投与と舌下投与を含む）を含むが、これらのみに限定されない。投与頻度は、１日、１週間、２週間、３週間、１ヶ月又は１年に１回若しくは複数回であってもよい。
本開示に記載されたｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体の用量は、本分野における通常の用量であってもよく、前記用量は、各種のパラメーター、特に被験体の年齢、体重及び性別により決定されてもよい。細胞培養又は実験動物で標準薬学的手順により毒性と治療効果を測定し、例えば、ＬＤ５０（５０％の群体を死亡させる用量）及びＥＤ５０（定量的反応において、５０％の最大反応強度を引き起こすことができる用量を指し、定性的反応において、５０％の実験対象に陽性反応が発生する場合の用量を指す）を測定してもよい。細胞培養分析及び動物研究により得られたデータに基づいてヒト用量の範囲を得ることができる。
本開示に記載されたｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体を投与する場合、例えば、雄性又は雌性、６～１２週齢、体重１８～２５ｇのＣ５７ＢＬ／６Ｊ又は３０～４５ｇのｏｂ／ｏｂマウスに対して、ｓｉＲＮＡの量として、（ｉ）第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体について、そのｓｉＲＮＡ用量が０．００１～１００ｍｇ／ｋｇ体重であってもよく、さらなる実施形態において、０．０１～５０ｍｇ／ｋｇ体重であり、より更なる実施形態において、０．０５～２０ｍｇ／ｋｇ体重であり、また更なる実施形態において、０．１～１０ｍｇ／ｋｇ体重であり、（ｉｉ）ｓｉＲＮＡ及び薬学的に許容可能な担体により形成された薬物組成物について、そのｓｉＲＮＡ用量が０．００１～５０ｍｇ／ｋｇ体重であってもよく、さらなる実施形態において、０．０１～１０ｍｇ／ｋｇ体重であり、より更なる実施形態において、０．０５～５ｍｇ／ｋｇ体重であり、また更なる実施形態において、０．１～３ｍｇ／ｋｇ体重である。
いくつかの実施形態において、本開示は、本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体の有効量を肝細胞と接触させ、本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体を前記肝細胞に導入し、ＲＮＡ干渉機構により肝細胞におけるＡＰＯＣ３遺伝子の発現を抑制する目的を達成することを含む、肝細胞におけるアポリポタンパクＣ３（ＡＰＯＣ３）遺伝子の発現の抑制方法を提供する。前記肝細胞は、Ｈｅｐ３Ｂ、ＨｅｐＧ２、Ｈｕｈ７等の肝がん細胞系又は単離した初代肝細胞から選択されてもよい。いくつかの実施形態において、前記細胞は、Ｈｕｈ７肝がん細胞である。
本開示により提供される方法により細胞におけるＡＰＯＣ３遺伝子の発現を抑制する。提供される修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体におけるｓｉＲＮＡ用量は、一般的に、標的遺伝子の発現を低減でき、標的細胞表面では１ｐＭ～１μＭ、０．０１ｎＭ～１００ｎＭ、０．０５ｎＭ～５０ｎＭ、又は０．０５ｎＭ～約５ｎＭの細胞外濃度となる量である。当該局所濃度を達成するのに必要な量は、送達方法、送達部位、送達部位と標的細胞又は組織との間の細胞層の数、送達するのが局所か全身か等を含む、各種の因子により変化する。送達部位における濃度は、標的細胞又は組織の表面における濃度よりも顕著に高くてもよい。
＜キット＞
本開示は、本開示の修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び第２種のｓｉＲＮＡ複合体の少なくとも１種の有効量を含むキットを提供する。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載されたキットは、容器で修飾ｓｉＲＮＡを提供することができる。いくつかの実施形態において、本明細書に記載されたキットは、薬学的に許容できる賦形剤を提供する容器を含んでもよい。いくつかの実施形態において、前記キットには、他の成分、例えば、安定化剤又は防腐剤等が含まれてもよい。いくつかの実施形態において、本明細書に記載されたキットは、本明細書に記載された修飾ｓｉＲＮＡを提供する容器とは別の容器で少なくとも１種の他の治療剤を含んでもよい。いくつかの実施形態において、前記キットは、修飾ｓｉＲＮＡと薬学的に許容可能な担体及び／又は添加剤又は他の成分（存在する場合）を混合するための説明書を含んでもよい。
本開示のキットにおいて、前記修飾ｓｉＲＮＡ及び薬学的に許容可能な担体及び／又は添加剤、並びに、前記修飾ｓｉＲＮＡ、薬物組成物、第１種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は第２種のｓｉＲＮＡ複合体及び／又は複合体、及び／又は薬学的に許容できる添加剤は、任意の形式、例えば、液体形式、乾燥形式又は凍結乾燥形式として提供されてもよい。いくつかの実施形態において、前記修飾ｓｉＲＮＡ及び薬学的に許容可能な担体及び／又は添加剤、並びに、前記薬物組成物、及び／又は複合体及び薬学的に許容できる任意の添加剤は、基本的にクリーン及び／又は無菌である。いくつかの実施形態において、本開示のキットで無菌水を提供することができる。
以下に調製例及び実施例により本開示をさらに説明するが、本開示は、これによって何ら制限されない。
以下に実施例により本開示を詳しく説明する。特に説明がない限り、以下の実施例で用いられる試薬、培地は、いずれも市販品であり、用いられる核酸電気泳動、ｒｅａｌ－ｔｉｍｅ ＰＣＲ等の操作は、いずれもＭｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ ＬＢｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ（１９８９））に記載された方法を参照して行われる。
ＨＥＫ２９３Ａ細胞は、北京大学分子医学研究所核酸技術実験室により提供され、２０％のウシ胎児血清（ＦＢＳ、Ｈｙｃｌｏｎｅ社）及び０．２体積％のペニシリン－ストレプトマイシン（Ｐｅｎｉｃｉｌｌｉｎ－Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｉｎ、Ｇｉｂｃｏ、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社）を含むＤＭＥＭ完全培地（Ｈｙｃｌｏｎｅ社）で細胞を３７℃で５％ＣＯ２／９５％空気含有インキュベーターにおいて培養した。
Ｈｕｈ７細胞は、中国科学院幹細胞バンクから購入され、１０％のウシ胎児血清（ＦＢＳ、Ｈｙｃｌｏｎｅ社）、１％非必須アミノ酸（ＮＥＡＡ、Ｃｏｒｎｉｎｇ社）を含むＤＭＥＭ完全培地（Ｈｙｃｌｏｎｅ社）で細胞を３７℃で５％ＣＯ２／９５％空気含有インキュベーターにおいて培養した。
本開示で合成されたＡＰＯＣ３遺伝子に対するｓｉＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ複合体又は陰性コントロールであるｓｉＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ複合体で細胞をトランスフェクションした場合、トランスフェクション試薬としてＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅＴＭ２０００（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を用い、具体的な操作については、メーカーにより提供される説明書を参照のこと。
別に説明がない限り、以下で提供される試薬割合は、いずれも体積比（ｖ／ｖ）として計算される。
用いられる動物モデルは以下のとおりである。
ヒトＡＰＯＣ３トランスジェニックマウス：Ｂ６、ＣＢＡ－Ｔｇ（ＡＰＯＣ３）３７０７Ｂｒｅｓ／Ｊ、米国Ｊａｃｋｓｏｎ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙから購入される。
カニクイザル：蘇州華測生物技術有限公司により提供される。
実験データは、いずれも
で表され、データ分析では、Ｇｒａｐｈｐａｄ ｐｒｉｓｍ５．０統計分析ソフトウェアを採用した。まずデータに対して正規分布と等分散性検定を行った。正規分布を満たす（ｐ＞０．２０）とともに分散が等しい（ｐ＞０．１０）場合、複数の群間の比較では、一元配置分散分析によるＬＳＤ法により多重比較し、ｐ＜０．０５である場合、統計学的に有意であるとみなした。正規分布を満たしておらず、又は分散が等しくない場合、複数の群間の比較では、ノンパラメトリック検定であるＫｒｕｓｋａｌ－Ｗａｌｌｉｓ Ｈ方法を採用し、Ｋｒｕｓｋａｌ－ｗａｌｌｉｓ Ｈ検定結果が有意（ｐ＜０．０５）である場合、データをランク変換した後、複数の群間の一対比較を行い、ｐ＜０．０５である場合、統計学的に有意であるとみなした。
（調製例１）複合体１～３の調製
本調製例では、複合体１～３（以下、それぞれＬ１０－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体、Ｌ１０－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＰ複合体及びＬ１０－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＰｓ複合体ともいう）を合成した。前記複合体は、Ｌ－９複合分子がそれぞれ番号ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ、ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＰ又はｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＰｓのｓｉＲＮＡと複合した後に形成された複合体であった。当該複合体に複合されたｓｉＲＮＡの配列は、表３に示される。
（１－１）Ｌ－１０化合物の合成
以下の方法に従い、Ｌ－１０化合物を合成した。
（１－１－１）複合末端セグメントＧＡＬ－５の合成
（１－１－１ａ）ＧＡＬ－２の合成
１００．０ｇのＧＡＬ－１（Ｎ－アセチル－Ｄ－ガラクトサミン塩酸塩、ＣＡＳ番号：１７７２－０３－８、寧波弘翔生化公司から購入、４６３．８ｍｍｏｌ）を１０００ｍｌの無水ピリジンに溶解させ、氷水浴下で５４０ｍｌの酢酸無水物（Ｅｎｏｘ社から購入、５５６５．６ｍｍｏｌ）を加え、室温で１．５時間攪拌反応した。反応液を１０Ｌの氷水に注入し、減圧吸引濾過し、ケーキを２Ｌの氷水で洗浄した後、完全に溶解するまでアセトニトリル／トルエン混合溶剤（アセトニトリル：トルエンの体積比＝１：１）を加え、溶剤を蒸発乾固し、１３０．０ｇの白色固形製品ＧＡＬ－２を得た。
（１－１－１ｂ）ＧＡＬ－３の合成
工程（１－１－１ａ）で得られたＧＡＬ－２（３５．１ｇ、９０．０ｍｍｏｌ）を２１３ｍｌの無水１，２－ジクロロエタンに溶解させ、氷水浴下で、窒素保護条件で、２４．０ｇのＴＭＳＯＴｆ（ＣＡＳ番号：２７６０７－７７－８、マックリン社から購入、１０８．０ｍｍｏｌ）を加え、室温で一晩反応させた。
反応液に４００ｍｌのジクロロメタンを加えて希釈し、珪藻土で濾過し、１Ｌの飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加え、均一に攪拌し、有機相を分離し、水相をジクロロエタンにより１回あたり３００ｍｌで２回抽出し、有機相をあわせ、それぞれ３００ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウム水溶液及び３００ｍｌの飽和食塩水で洗浄し、有機相を分離し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶剤を減圧蒸発乾固し、２６．９ｇの淡黄色の粘稠な水飴状製品ＧＡＬ－３を得た。
（１－１－１ｃ）ＧＡＬ－４の合成
工程（１－１－１ｂ）で得られたＧＡＬ－３（２６．９ｇ、８１．７ｍｍｏｌ）を１３６ｍｌの無水１，２－ジクロロエタンに溶解させ、乾燥した４Å分子篩粉３０ｇを加え、９．０ｇの５－ヘキセン－１－オール（ＣＡＳ番号：８２１－４１－０、Ａｄａｍａｓ－ｂｅｔａ社から購入、８９．９ｍｍｏｌ）を加え、室温で３０分間攪拌し、氷浴下で窒素保護下で９．０８ｇのＴＭＳＯＴｆ（４０．９ｍｍｏｌ）を加え、室温で一晩攪拌反応させた。４Å分子篩粉を濾過除去し、濾液に３００ｍｌのジクロロメタンを加えて希釈し、珪藻土で濾過し、５００ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加えて１０分間攪拌し洗浄し、有機相を分離し、水相を３００ｍｌのジクロロエタンで１回抽出し、有機相をあわせ、それぞれ３００ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウム水溶液及び３００ｍｌの飽和食塩水で洗浄し、有機相を分離し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶剤を減圧蒸発乾固し、４１．３ｇの黄色水飴状製品ＧＡＬ－４を得、精製することなく、そのまま次の酸化反応を行った。
（１－１－１ｄ）ＧＡＬ－５の合成
工程（１－１－１ｃ）に記載された方法により得られたＧＡＬ－４（１４．９ｇ、３４．７ｍｍｏｌ）を７７ｍｌのジクロロメタンと７７ｍｌのアセトニトリルの混合溶剤に溶解させ、それぞれ１０３ｍｌの脱イオン水及び２９．７ｇの過ヨウ素酸ナトリウム（ＣＡＳ番号：７７９０－２８－５、Ａｌａｄｄｉｎ社から購入、１３８．８ｍｍｏｌ）を加え、氷水浴下で１０分間攪拌し、塩化ルテニウム（ＩＩＩ）（ＣＡＳ番号：１４８９８－６７－０、Ｅｎｅｒｇｙ社から購入、２３８ｍｇ、１．１４５ｍｍｏｌ）を加え、室温で一晩反応させた。反応液に３００ｍｌの水を加えて希釈攪拌し、飽和炭酸水素ナトリウムを加えてｐＨを約７．５に調整し、有機相を分離して捨て、水相をジクロロメタンで１回あたり２００ｍｌで３回抽出し、有機相を捨てた。水相を固形クエン酸でｐＨを約３に調節し、ジクロロメタンで１回あたり２００ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶剤を減圧蒸発乾固し、６．８５ｇの白色泡状固形製品ＧＡＬ－５を得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ） δ １２．０１ （ｂｒ，１Ｈ），７．８３ （ｄ，Ｊ ＝ ９．２ Ｈｚ，１Ｈ），５．２１ （ｄ，Ｊ ＝ ３．２ Ｈｚ，１Ｈ），４．９６ （ｄｄ，Ｊ ＝ １１．２，３．２ Ｈｚ，１Ｈ），４．４９ （ｄ，Ｊ ＝ ８．４ Ｈｚ，１Ｈ），４．０７ － ３．９５ （ｍ，３Ｈ），３．９２ － ３．８５ （ｍ，１Ｈ），３．７４ － ３．６７ （ｍ，１Ｈ），３．４８ － ３．３９ （ｍ，１Ｈ），２．２０ （ｔ，Ｊ ＝ ６．８ Ｈｚ，２Ｈ），２．１１ （ｓ，３Ｈ），２．００ （ｓ，３Ｈ），１．９０ （ｓ，３Ｈ），１．７７ （ｓ，３Ｈ），１．５５ － １．４５ （ｍ，４Ｈ）．
（１－１－２）Ｍ－１１－Ｔ３の合成：
Ｊ－０（１．８８３ｇ、１０ｍｍｏｌ、アルファ・エイサー社から購入）を２５ｍｌのアセトニトリルに溶解させ、トリエチルアミン（４．０４８ｇ、４０ｍｍｏｌ）を加えて氷水浴で０℃まで冷却し、トリフルオロ酢酸エチル（５．６８３ｇ、４０ｍｍｏｌ）を加え、室温で２２ｈ反応させ、溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで１８ｈ発泡乾燥させ、５．３４２ｇの固形粗製品Ｍ－１１－Ｔ３を得、さらに精製することなく、そのまま後の反応に用いた。ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ１５Ｈ２２Ｆ９Ｎ４Ｏ３，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：４７７．３５、実測値：４７７．６５。
（１－１－３）Ｍ－１１－Ｔ３－Ｔｒの合成：
Ｍ－１１－Ｔ３粗製品（５．３４２ｇ、１０ｍｍｏｌ）を５０ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、反応液にＴｒＣｌ（３．３４５ｇ、１２ｍｍｏｌ）及びトリエチルアミン（１．５１８ｇ、１５ｍｍｏｌ）を加え、室温で２０ｈ攪拌反応させ、飽和炭酸水素ナトリウムで反応液を１回あたり２０ｍｌで２回洗浄し、２０ｍｌの飽和食塩水で１回洗浄し、有機相を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後に有機溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで一晩発泡乾燥させ、７．７６３ｇの固形粗製品Ｍ－１１－Ｔ３－Ｔｒを得た。ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ３４Ｈ３６Ｆ９Ｎ４Ｏ３，［Ｍ＋Ｎａ］＋、理論値：７４１．２５、実測値：７４１．５３。固形粗製品Ｍ－１１－Ｔ３－Ｔｒは、精製することなく、引き続き次のＭ－１８－Ｔｒの合成に使用した。
（１－１－４）Ｍ－１８－Ｔｒの合成：
工程（１－１－３）で得られたＭ－１１－Ｔ３－Ｔｒ粗製品（７．７６３ｇ、１０ｍｍｏｌ）を１００ｍｌのメタノールに溶解させ、１００ｍｌのメチルアミン水溶液（４０質量％）を加え、５０℃で２３ｈ攪拌反応させ、不溶性粒子を濾過除去し、溶剤を減圧蒸発乾固し、２００ｍｌの体積比１：１のジクロロメタン：メタノール混合溶剤を加え、５０ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウムで洗浄し、水相をジクロロメタン（ＤＣＭ）で１回あたり５０ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後に溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで一晩発泡乾燥させ、２００～３００メッシュの順相シリカゲルカラムで精製し、石油エーテルをカラムに入れ、１重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、ジクロロメタン：メタノール：アンモニア水（２５重量％）＝１：１：０．０５～１：１：０．２５で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで発泡乾燥させて２．８８７ｇの純粋なＭ－１８－Ｔｒを得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ） δ７．４７ － ７．３９ （ｍ，６Ｈ），７．３２ －７．２４ （ｍ，６Ｈ），７．１９ － ７．１２ （ｍ，３Ｈ），２．６０ － ２．４７ （ｍ，４Ｈ），２．４６ － ２．１９ （ｍ，１３Ｈ），１．７０ － １．５５ （ｍ，４Ｈ），１．４０ （ｐ，Ｊ ＝ ６．８ Ｈｚ，２Ｈ）． ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ２８Ｈ３９Ｎ４，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：４３１．６５、実測値：４３２．６１。
（１－１－５）Ｌ－５－Ｔｒの合成：
工程（１－１－４）で得られたＭ－１８－Ｔｒ（２．０２ｇ、４．６９ｍｍｏｌ）と工程（１－１－１）で得られたＧＡＬ－５（６．９３ｇ、１５．４８ｍｍｏｌ）とを混合して４７ｍｌのアセトニトリルに溶解させ、Ｎ－メチルモルホリン（３．１３ｇ、３０．９６ｍｍｏｌ）及び４－（４，６－ジメトキシトリアジン－２－イル）－４－メチルモルホリン塩酸塩（ＤＭＴＭＭ、４．２８ｇ、１５．４８ｍｍｏｌ）を加え、室温で２ｈ攪拌反応させた。２００ｍｌのジクロロメタンで反応液を希釈し、１００ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウム溶液で有機相を洗浄し、１００ｍｌの飽和食塩水で有機相を洗浄し、有機相を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後に溶剤を減圧蒸発乾固して粗製品を得た。２００～３００メッシュの順相シリカゲルカラムで精製し、石油エーテルをカラムに入れ、１重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、ジクロロメタン：メタノール＝１００：５～１００：７で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、減圧蒸発乾固して７．４９ｇの純粋なＬ－５－Ｔｒを得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ） δ７．８３ － ７．１０ （ｍ，４Ｈ），７．６７ － ７．６０ （ｍ，１Ｈ），７．４４ － ７．３４ （ｍ，６Ｈ），７．３３ － ７．２４ （ｍ，６Ｈ），７．２０ － ７．１５ （ｍ，３Ｈ），５．２２ （ｓ，３Ｈ），４．９７ （ｄ，Ｊ ＝ １１．３ Ｈｚ，３Ｈ），４．４９ （ｄ，Ｊ ＝ ８．４ Ｈｚ，３Ｈ），４．０６ － ３．０７ （ｍ，９Ｈ），３．９５ － ３．８３ （ｍ，３Ｈ），３．７７ － ３．６４ （ｍ，３Ｈ），３．４５ － ３．３５ （ｍ，３Ｈ），３．１２ － ２．８７ （ｍ，８Ｈ），２．３０ － ２．１５ （ｍ，３Ｈ），２．１１ － １．９８ （ｍ，２２Ｈ），１．９５ － １．８４ （ｍ，１１Ｈ），１．８１ － １．６１ （ｍ，１４Ｈ），１．５４ － １．３６ （ｍ，１４Ｈ）． ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ８５Ｈ１１９Ｎ７Ｏ３０，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：１７１８．８１、実測値：１７１８．０３。
（１－１－６）Ｌ－８の合成：
工程（１－１－５）で得られたＬ－５－Ｔｒ（５．９４ｇ、３．４５６ｍｍｏｌ）を６９ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、ジクロロ酢酸（１３．３６７ｇ、１０３．６７ｍｍｏｌ）を加え、室温で２ｈ反応させ、１００ｍｌのジクロロメタンを加えて反応液を希釈し、飽和炭酸水素ナトリウム溶液を加えて洗浄しｐＨ＝７～８になるように調節し、水相をジクロロメタンで１回あたり３０ｍｌで６回抽出し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後に溶剤を減圧蒸発乾固して粗製品を得た。精製には、２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用い、１０重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、１重量‰トリエチルアミンでカラムを平衡化し、ジクロロメタン：メタノール＝１００：３０～１００：４０で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固して４．２６ｇの純粋なＬ－８を得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ） δ ７．８４ （ｄ，Ｊ ＝ ９．０ Ｈｚ，３Ｈ），７．２７ － ７．２３ （ｍ，１Ｈ），７．１３ － ７．１８ （ｍ，１Ｈ），５．２２ （ｄ，Ｊ ＝ ３．１ Ｈｚ，３Ｈ），４．９７ （ｄｄ，Ｊ ＝ １１．３，３．１ Ｈｚ，３Ｈ），４．４８ （ｄ，Ｊ ＝ ８．４ Ｈｚ，３Ｈ），４．０９ － ３．９８ （ｍ，９Ｈ），３．８８ （ｄｄ，Ｊ ＝ １９．３，９．３ Ｈｚ，３Ｈ），３．７５ － ３．６６ （ｍ，３Ｈ），３．４４ － ３．３８ （ｍ，３Ｈ），３．１７ － ３．３０ （ｍ，４Ｈ），３．１０ － ２．９７ （ｍ，４Ｈ），２．３５ － ２．２０ （ｍ，６Ｈ），２．１５ － ２．０８ （ｍ，９Ｈ），２．０７ － １．９８ （ｍ，１３Ｈ），１．９４ － １．８７ （ｍ，９Ｈ），１．８１ － １．７４ （ｍ，９Ｈ），１．６５ － １．４２ （ｍ，１８Ｈ）． ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ８５Ｈ１１９Ｎ７Ｏ３０，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：１４７７．５９、実測値：１４７７．２３。
（１－１－７ａ）Ａ－１の合成
ＤＭＴｒＣｌ（４，４’－ビスメトキシトリチルクロリド、３８．１２ｇ、１１２．５ｍｍｏｌ）を４５０ｍｌの無水ピリジンに溶解させ、ＤＬ－グリセリン酸カルシウム水和物（１２．８８ｇ、４５．０ｍｍｏｌ）を加え、４５℃で２２ｈ反応させ、反応液を濾過し、ケーキを２００ｍｌのＤＣＭでリンスし、濾液を乾燥させるまで減圧濃縮し、残りを５００ｍｌのジクロロメタンに改めて溶解させ、０．５Ｍトリエチルアミンリン酸塩（ｐＨ＝７～８）で１回あたり２００ｍｌで２回洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり２００ｍｌで２回抽出し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、溶剤を減圧蒸発乾固し、２００～３００メッシュの順相シリカゲルカラムで精製し、石油エーテル：酢酸エチル：ジクロロメタン：メタノール＝１：１：１：０．３５～１：１：１：０．５５で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固し、５００ｍｌのジクロロメタンに改めて溶解させ、２００ｍｌの０．５Ｍトリエチルアミンリン酸塩で１回洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり２００ｍｌで２回抽出し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで一晩減圧し、２０．７ｇの白色固形製品Ａ－１を得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ－ｄ６） δ ７．４６ （ｄｄｄ，Ｊ ＝ ６．５，２．３，１．１ Ｈｚ，１Ｈ），７．４０ － ７．２８ （ｍ，７Ｈ），６．８９ － ６．８１ （ｍ，４Ｈ），４．８４ （ｄ，Ｊ ＝ ５．０ Ｈｚ，１Ｈ），４．３６ － ４．２４ （ｍ，１Ｈ），４．２９ （ｓ，６Ｈ），３．９２ （ｄｄ，Ｊ ＝ １２．４，７．０ Ｈｚ，１Ｈ），３．６７ （ｄｄ，Ｊ ＝ １２．３，７．０ Ｈｚ，１Ｈ），２．５２ （ｑ，Ｊ ＝ ６．３ Ｈｚ，６Ｈ），１．０３ （ｔ，Ｊ ＝ ６．３ Ｈｚ，９Ｈ）． ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ２４Ｈ２３Ｏ６，［Ｍ－Ｈ］－、理論値：４０７．１５、実測値：４０６．９２。
（１－１－７ｂ）Ｌ－７の合成：
工程（１－１－６）で得られたＬ－８（２．２６２ｇ、１．５３２ｍｍｏｌ）と工程（１－１－７ａ）で得られたＡ－１（２．３４２ｇ、４．５９６ｍｍｏｌ）とを混合し、１６ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、３－ジエトキシホスホリル－１，２，３－ベンゾオキサゾール４（３Ｈ）－オン（ＤＥＰＢＴ）（１．３７５ｇ、４．５９６ｍｍｏｌ）を加え、さらにジイソプロピルエチルアミン（１．１８８ｇ、９．１９１ｍｍｏｌ）を加え、２５℃で２ｈ攪拌反応させ、１０ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウムで有機相を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり１０ｍｌで３回抽出し、１０ｍｌの飽和食塩水で有機相を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり１０ｍｌで２回抽出し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後に溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで一晩発泡乾燥させ、４．９００ｇの粗製品を得た。カラム精製には、１２０ｇの２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用い、２０ｍｌのトリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、１重量％トリエチルアミンを含む石油エーテルでカラムを平衡化し、石油エーテル：酢酸エチル：ジクロロメタン：Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド＝１：１：１：０．５～１：１：１：０．６で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固して２．３３６ｇの純粋なＬ－７を得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ） δ７．９０ － ７．７８ （ｍ，４Ｈ），７．７５ － ７．６４ （ｍ，１Ｈ），７．３８ － ７．１８ （ｍ，９Ｈ），６．９１ － ６．８３ （ｍ，４Ｈ），５．２５ － ５．１０ （ｍ，４Ｈ），４．９７ （ｄｄ，Ｊ ＝ １１．２，３．２ Ｈｚ，３Ｈ），４．４８ － ４．３０ （ｍ，４Ｈ），４．０２ （ｓ，９Ｈ），３．９３ － ３．８４ （ｍ，３Ｈ），３．７６ － ３．６６ （ｍ，９Ｈ），３．４５ － ３．３５ （ｍ，３Ｈ），３．２４ － ２．９８ （ｍ，１０Ｈ），２．３０ － ２．２０ （ｍ，２Ｈ），２．１１ － １．８８ （ｍ，３１Ｈ），１．８０ － １．４０ （ｍ，２８Ｈ）． ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ９０Ｈ１２８Ｎ７Ｏ３５，［Ｍ－ＤＭＴｒ］＋、理論値：１５６４．６５、実測値：１５６４．８８。
（１－１－８）Ｌ－９の合成：
工程（１－１－７ｂ）で得られたＬ－７（２．３００ｇ、１．２６ｍｍｏｌ）、コハク酸無水物（０．３７８ｇ、３．７８ｍｍｏｌ）及び４－ジメチルアミノピリジン（ＤＭＡＰ、０．４６２ｇ、３．７８ｍｍｏｌ）を混合して１３ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、さらにジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＥＡ、０．８１４ｇ、６．３０ｍｍｏｌ）を加え、２５℃で２４ｈ攪拌し、５ｍｌの０．５Ｍトリエチルアミンリン酸塩で反応液を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり５ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ減圧蒸発乾固して２．７７４ｇの粗製品を得た。カラム精製には、６０ｇの２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用い、１重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、ジクロロメタンでカラムを平衡化し、１重量‰トリエチルアミンを含むジクロロメタン：メタノール＝１００：１８～１００：２０で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固して１．８７４ｇの純粋なＬ－９複合分子を得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ） δ ８．５８ （ｄ，Ｊ ＝ ４．２ Ｈｚ，１Ｈ），７．９４ － ７．８２ （ｍ，３Ｈ），７．４１ － ７．２９ （ｍ，５Ｈ），７．２２ （ｄ，Ｊ ＝ ８．１ Ｈｚ，５Ｈ），６．８９ （ｄ，Ｊ ＝ ８．３ Ｈｚ，４Ｈ），５．４９ － ５．３７ （ｍ，１Ｈ），５．２１ （ｄ，Ｊ ＝ ３．０ Ｈｚ，３Ｈ），４．９７ （ｄ，Ｊ ＝ １１．１ Ｈｚ，３Ｈ），４．４９ （ｄ，Ｊ ＝ ８．２ Ｈｚ，３Ｈ），４．０２ （ｓ，９Ｈ），３．８８ （ｄｄ，Ｊ ＝ １９．４、９．４ Ｈｚ，３Ｈ），３．７７ － ３．６５ （ｍ，９Ｈ），３．５０ － ３．３９ （ｍ，６Ｈ），３．１１ － ２．９０ （ｍ，５Ｈ），２．６１ － ２．５４ （ｍ，４Ｈ），２．４７ － ２．４１ （ｍ，２Ｈ），２．２６ － ２．１７ （ｍ，２Ｈ），２．１５ － １．９５ （ｍ，２２Ｈ），１．９２ － １．８４ （ｍ，９Ｈ），１．８０ － １．７０ （ｍ，１０Ｈ），１．６５ － １．３５ （ｍ，１７Ｈ）、１．３１ － １．１９ （ｍ，４Ｈ），０．９６ （ｔ，Ｊ ＝ ７．１ Ｈｚ，９Ｈ）． ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ９４Ｈ１３２Ｎ７Ｏ３８，［Ｍ－ＤＭＴｒ］＋、理論値：１６６４．７２、実測値：１６６５．０３。
（１－１－９）Ｌ－１０化合物の合成：
この工程において、Ｌ－９複合分子を固相担体に結合することにより、Ｌ－１０化合物を調製した。
工程（１－１－８）で得られたＬ－９複合分子（０．２３３ｇ、０．１１２６ｍｍｏｌ）、Ｏ－ベンゾトリアゾール－テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート（ＨＢＴＵ、０．０６４ｇ、０．１６８９ｍｍｏｌ）及びジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＥＡ、０．０２９ｇ、０．２２５２ｍｍｏｌ）を混合し、１９ｍｌのアセトニトリルに溶解させ、室温で５分間攪拌し、反応液にアミノメチル樹脂（０．９０１ｇ、１００～２００メッシュ、アミノ基担持量４００μｍｏｌ／ｇ、南開和成社から購入）を加え、２５℃でシェーカーで反応を行い、回転数２２０回転／分間、１５ｈ反応させた後に濾過し、ケーキをＤＣＭで１回あたり３０ｍｌで２回リンスし、アセトニトリルで１回あたり３０ｍｌで３回リンスし、３０ｍｌのエチルエーテルで１回リンスし、真空油ポンプで２ｈ乾燥させ、その後、表２に示す配合割合に従い原料（ＣａｐＡ、ＣａｐＢ、４－ジメチルアミノピリジン（ＤＭＡＰ）及びアセトニトリル）を加えてキャッピング反応を行った。２５℃でシェーカーに放置し、回転数２００回転／分間で５ｈ反応させ、反応液を濾過し、ケーキをアセトニトリルで１回あたり３０ｍｌで３回リンスし、乾燥させるまで吸引濾過し、真空油ポンプで一晩減圧乾燥させ、１．１００ｇ、担持量９０．８μｍｏｌ／ｇのＬ－１０化合物（即ち、固相担体に結合されたＬ－９複合分子）を得た。
ここで、ＣａｐＡとＣａｐＢは、キャッピング試薬溶液であり、ＣａｐＡは、２０体積％のＮ－メチルイミダゾールのピリジン／アセトニトリル混合溶液であり、ピリジンとアセトニトリルとの体積比が３：５であり、ＣａｐＢは、２０体積％酢酸無水物のアセトニトリル溶液であった。
（１－２）複合体１～３のセンス鎖の合成
複合体１～３のセンス鎖配列が同じであるので、その調製方法も同じであった。
固相ホスホルアミダイト法により、上記工程で調製されたＬ－１０化合物を出発として循環させ、センス鎖のヌクレオチドの並び順に従い３’－５’方向に一つずつヌクレオシドモノマーを結合した。ヌクレオシドモノマーを結合するごとに、脱保護、カップリング、キャッピング、酸化又は硫化の４つの反応を含む。２個のヌクレオチド間がリン酸エステルにより結合された場合、次のヌクレオシドモノマーを結合するとき、脱保護、カップリング、キャッピング、酸化の４つの反応を含む。２個のヌクレオチド間がチオリン酸エステルにより結合される場合、次のヌクレオシドモノマーを結合するとき、脱保護、カップリング、キャッピング、硫化の４つの反応を行った。合成条件は、以下のように規定された。
ヌクレオシドモノマーを０．１Ｍ濃度のアセトニトリル溶液で提供し、各脱保護反応の条件が同じであり、即ち、温度が２５℃であり、反応時間が７０秒であり、脱保護試薬は、ジクロロ酢酸のジクロロメタン溶液（３％ｖ／ｖ）であり、ジクロロ酢酸と固相担体における４，４’－ジメトキシトリチル保護基とのモル比が５：１であった。
各カップリング反応条件は、いずれも同じであり、温度が２５℃であり、固相担体に結合される核酸配列とヌクレオシドモノマーとのモル比が１：１０であり、固相担体に結合される核酸配列とカップリング試薬とのモル比が１：６５であり、反応時間が６００秒であり、カップリング試薬は、５－エチルチオ－１Ｈ－テトラゾールの０．５Ｍアセトニトリル溶液であった。
各キャッピング条件は、いずれも同じであり、温度が２５℃であり、反応時間が１５秒であった。キャッピング試薬溶液は、モル比が１：１であるＣａｐＡとＣａｐＢの混合溶液であり、キャッピング試薬と固相担体に結合される核酸配列とのモル比が、酢酸無水物：Ｎ－メチルイミダゾール：固相担体に結合される核酸配列＝１：１：１であった。
各酸化反応条件は同じであり、温度が２５℃であり、反応時間が１５秒であり、酸化試薬が濃度０．０５Ｍのヨウ素水であった。ヨウ素と、カップリング工程において固相担体に結合される核酸配列とのモル比が３０：１であった。反応をテトラヒドロフラン：水：ピリジン＝３：１：１の混合溶剤で行った。
各硫化反応の条件は同じであり、温度が２５℃であり、反応時間が３００秒であり、硫化試薬がキサンタンヒドリドであった。硫化試薬と、カップリング工程において固相担体に結合される核酸配列とのモル比が１２０：１であった。反応をアセトニトリル：ピリジン＝１：１の混合溶剤で行った。
切断と脱保護条件は以下のとおりである。合成された担体が結合されたヌクレオチド配列を、濃度２５重量％のアンモニア水に加え、アンモニア水の用量が０．５ｍｌ／μｍｏｌであり、５５℃で１６ｈ反応させ、液体を除去し、乾燥させるまで真空濃縮した。
精製と脱塩：分取用イオンクロマトグラフィー精製カラム（Ｓｏｕｒｃｅ １５Ｑ）により、ＮａＣｌによる勾配溶出で、核酸の精製を完成した。具体的には、溶出剤Ａ：２０ｍＭリン酸ナトリウム（ｐＨ ８．１）、溶剤が水／アセトニトリル＝９：１（体積比）であり、溶出剤Ｂ：１．５Ｍ塩化ナトリウム、２０ｍＭリン酸ナトリウム（ｐＨ ８．１）、溶剤が水／アセトニトリル＝９：１（体積比）であり、溶出勾配：溶出剤Ａ：溶出剤Ｂ＝１００：０～５０：５０で勾配溶出した。製品溶出液を回収してからあわせ、逆相クロマトグラフィー精製カラムにより脱塩し、具体的な条件としては、デキストランゲルカラムにより脱塩し、充填剤がデキストランゲルＧ２５であり、脱イオン水で溶出した。
検出：イオン交換クロマトグラフィー（ＩＥＸ－ＨＰＬＣ）を用いて純度を検出し、液体クロマトグラフィー質量分析（ＬＣ－ＭＳ）により分子量を分析した。センス鎖の分子量の理論値が７６４９．５５であり、複合体１のセンス鎖のバッチについて、実測値が７６４９．１であり、複合体２及び３のセンス鎖のバッチについて、実測値が７６４８．８であった。実測値が理論値に一致しており、３’末端にＬ－９複合分子が複合されたセンス鎖Ｓが合成されたことを示した。
（１－３）アンチセンス鎖の合成
（１－３Ａ）複合体１のアンチセンス鎖の調製
固相ホスホルアミダイト法により、汎用の固相担体（ＵｎｙＬｉｎｋｅｒＴＭ ｌｏａｄｅｄ ＮｉｔｔｏＰｈａｓｅ（登録商標）ＨＬ Ｓｏｌｉｄ Ｓｕｐｐｏｒｔｓ、Ｋｉｎｏｖａｔｅ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ社）を出発として循環させ、複合体１のアンチセンス鎖ＡＳを合成した。固相合成方法における脱保護、カップリング、キャッピング、酸化又は硫化の反応条件、切断と脱保護、精製と脱塩条件は、センス鎖の合成と同じであった。
検出：純度をイオン交換クロマトグラフィー（ＩＥＸ－ＨＰＬＣ）により検出し、分子量を液体クロマトグラフィー質量分析（ＬＣ－ＭＳ）により分析した。理論値６９９１．４６、実測値６９９１．０であった。実測値が理論値に一致しており、目的配列を有するアンチセンス鎖ＡＳが合成されたことを示した。
ここで、ビニルリン酸エステルで修飾された２’－メトキシ修飾ウラシルヌクレオシドモノマー（ＶＰ－Ｕｍ）（２’－ｍｅｔｈｏｘｙ ｍｏｄｉｆｉｅｄ ｕｒａｃｉｌ ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅ ｍｏｎｏｍｅｒ （ＶＰ－Ｕｍ））は、以下の方法に従い合成された。
（１－３－１）ＶＰ－Ｕ－２の合成
以下の方法に従い、ＶＰ－Ｕ－２分子を合成した。
２’－メトキシ修飾ウラシルヌクレオシド（２’－ｍｅｔｈｏｘｙ ｍｏｄｉｆｉｅｄ ｕｒａｃｉｌ ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅ）（２’－ＯＭｅ－Ｕ、５１．３０ｇ、９１．６ｍｍｏｌ）、ｔｅｒｔ－ブチルジフェニルクロロシラン（ＴＢＤＰＳＣｌ、５０．３５ｇ、１８３．２ｍｍｏｌ）、イミダゾール（１２．４７ｇ、１８３．２ｍｍｏｌ）を混合して４５０ｍｌのＮ，Ｎ－ジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）に溶解させ、室温で２０ｈ攪拌反応させた。ＤＭＦを留去し、６００ｍｌのジクロロメタンで溶解した後３００ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウムを加えて洗浄し、水相をジクロロメタン（ＤＣＭ）で１回あたり３００ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ、５％シュウ酸で水相をｐＨ＜５になるまで洗浄し、乾燥させるまで溶剤を蒸発した後ＶＰ－Ｕ－１粗製品を得、そのまま後のＶＰ－Ｕ－２の合成に用いた。
ＶＰ－Ｕ－１粗製品を１００ｍｌのジクロロメタンで溶解した後、氷浴を施して１０分間攪拌し、さらに、予め４℃の冷蔵庫で冷蔵された４５０ｍｌの２％ｐ－トルエンスルホン酸溶液（溶剤が、体積比３：７のメタノール－ジクロロメタン混合溶剤である）を加え、１０分間反応させた。さらに２００ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウムを加えて反応をクエンチングし、有機相に飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加えてｐＨ＝８になるまで洗浄した。水相をあわせ、ジクロロメタンで１回あたり２００ｍｌで２回抽出し、有機相をあわせ、さらに２００ｍｌの飽和食塩水で１回洗浄し、乾燥させるまで溶剤を蒸発した。２００～３００メッシュの順相シリカゲルカラムで精製し、石油エーテルをカラムに入れ、石油エーテル：酢酸エチル：ジクロロメタン：メタノール＝１：１：１：０．０５～１：１：１：０．２５で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで発泡乾燥させて計４０．００ｇの純粋なＶＰ－Ｕ－２を得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ－ｄ６） δ ７．９６ （ｄ，Ｊ ＝ ７．８ Ｈｚ，１Ｈ），７．６４ （ｄｔｄ，Ｊ ＝ ５．１，４．０，２．２ Ｈｚ，４Ｈ），７．４１－７．３０ （ｍ，６Ｈ），６．７９ （ｄ，Ｊ ＝ ４．７ Ｈｚ，１Ｈ），５．７３ （ｄ，Ｊ ＝ ７．６ Ｈｚ，１Ｈ），４．９４ （ｔ，Ｊ ＝ ７．０ Ｈｚ，１Ｈ），４．１２ （ｔｄ，Ｊ ＝ ４．６，３．９ Ｈｚ，１Ｈ），４．０５ （ｄｄ，Ｊ ＝ ４．８、４．０ Ｈｚ，１Ｈ），３．９６ （ｔ，Ｊ ＝ ４．７ Ｈｚ，１Ｈ），３．６８ （ｄｄｄ，Ｊ ＝ １１．８，７．０，４．６ Ｈｚ，１Ｈ），３．５７ － ３．４６ （ｍ，１Ｈ），３．３９ （ｓ，３Ｈ），１．０５ （ｓ，８Ｈ）． ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ２６Ｈ３３Ｎ２Ｏ６Ｓｉ，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：４９７．２１、実測値：４９７．４５。
（１－３－２）ＶＰ－Ｕ－４の合成：
ＶＰ－Ｕ－２（１９．８４ｇ、４０．０ｍｍｏｌ）、ジシクロヘキシルカルボジイミド（ＤＣＣ、１６．４８ｇ、８０．０ｍｍｏｌ）、ピリジン（４．２０ｇ、５３．２ｍｍｏｌ）、トリフルオロ酢酸（６．６１ｇ、５３．２ｍｍｏｌ）を混合して２００ｍｌのジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）に溶解させ、室温で２０ｈ攪拌反応させた。別に、メチレンジホスホン酸テトラエチル（２１．４４ｇ、７４．４ｍｍｏｌ）を１２０ｍｌのＴＨＦに溶解させ、氷浴で降温させ、氷浴温度でｔ－ＢｕＯＫ（１１．３６ｇ、１０１．２ｍｍｏｌ）を加え、氷浴温度で１０ｍｉｎ反応させた後、室温まで昇温して０．５ｈ反応させ、その後、約１ｈかけて前述した反応液に加え、氷浴温度で１ｈ反応させた後、室温まで昇温して１８ｈ反応させた。水を加えて反応をクエンチングし、水相をジクロロメタンで１回あたり２００ｍｌで３回抽出した。有機相をあわせ、２００ｍｌの飽和食塩水で１回洗浄した後に乾燥させるまで溶剤を蒸発した。２００～３００メッシュの順相シリカゲルカラムで精製し、石油エーテルをカラムに入れ、石油エーテル：酢酸エチル＝１：１～１：４で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで発泡乾燥させて計１４．００ｇの純粋なＶＰ－Ｕ－４を得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ－ｄ６） δ ７．９６ （ｄ，Ｊ ＝ ７．８ Ｈｚ，１Ｈ），７．６４ （ｄｔｄ，Ｊ ＝ ５．１，４．０，２．２ Ｈｚ，４Ｈ），７．４１ － ７．３０ （ｍ，６Ｈ），６．８２ － ６．７１ （ｍ，２Ｈ），５．９０ （ｄｄｄ，Ｊ ＝ ２５．９、１５．０，１．０ Ｈｚ，１Ｈ），５．７３ （ｄ，Ｊ ＝ ７．６ Ｈｚ，１Ｈ），４．３６ － ４．２１ （ｍ，３Ｈ），４．１８ （ｔ，Ｊ ＝ ４．９ Ｈｚ，１Ｈ），４．０５ （ｄｄｑ，Ｊ ＝ ９．７，８．５，６．９ Ｈｚ，２Ｈ），３．８７ （ｔ，Ｊ ＝ ４．８ Ｈｚ，１Ｈ），３．３９ （ｓ，３Ｈ），１．３２ （ｔｄ，Ｊ ＝ ６．９，０．７ Ｈｚ，６Ｈ），１．０５ （ｓ，８Ｈ）． ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ３１Ｈ４２Ｎ２Ｏ８ＰＳｉ，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：６２９．２４、実測値：６２９．５１。
（１－３－３）ＶＰ－Ｕ－５の合成：
ＶＰ－Ｕ－４（１４．００ｇ、２２．２９ｍｍｏｌ）を１００ｍｌのテトラヒドロフランに溶解させ、トリエチルアミン三フッ化水素酸（１７．９６ｇ、１１１．４５ｍｍｏｌ）を加え、室温で２０ｈ攪拌して完全に反応させた。そのまま乾燥させるまで溶剤を蒸発し、５０ｍｌのジクロロメタンで溶解した後で蒸発乾固する操作を２回繰り返し、粗製品を得た。２００～３００メッシュの順相シリカゲルカラムで精製し、石油エーテルをカラムに入れ、石油エーテル：酢酸エチル：ジクロロメタン：メタノール＝１：１：１：０．０５～１：１：１：０．２５で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで発泡乾燥させて計６．７０ｇの純粋なＶＰ－Ｕ－５を得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ－ｄ６） δ ７．９６ （ｄ，Ｊ ＝ ７．８ Ｈｚ，１Ｈ），６．７７ （ｄｄ，Ｊ ＝ １５．０，６．２ Ｈｚ，１Ｈ），５．９９ － ５．８２ （ｍ，２Ｈ），５．７３ （ｄ，Ｊ ＝ ７．６ Ｈｚ，１Ｈ），５．２７ （ｄ，Ｊ ＝ ５．１ Ｈｚ，１Ｈ），５．１０ （ｄｄ，Ｊ ＝ ５．３，４．７ Ｈｚ，１Ｈ），４．２９ （ｄｄｑ，Ｊ ＝ ９．８，８．６，７．０ Ｈｚ，２Ｈ），４．１７ （ｄｄｄ，Ｊ ＝ ６．２，５．２，１．０ Ｈｚ，１Ｈ），４．１２ － ３．９８ （ｍ，３Ｈ），３．３９ （ｓ，２Ｈ），１．３２ （ｔｄ，Ｊ ＝ ６．９，０．６ Ｈｚ，６Ｈ）． ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ１５Ｈ２４Ｎ２Ｏ８Ｐ，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：３９１．１３、実測値：３９１．３８。
（１－３－４）ＶＰ－Ｕ－６の合成：
アルゴン保護条件で１０ｍｌの無水ジクロロメタンにＶＰ－Ｕ－５（３９１ｍｇ、１．０ｍｍｏｌ）、ピリジントリフルオロアセテート（０．２３２ｇ、１．２ｍｍｏｌ）、Ｎ－メチルイミダゾール（０．０９９ｇ、１．２ｍｍｏｌ）、ビス（ジイソプロピルアミノ）（２－シアノエトキシ）ホスフィン（０．４５２ｇ、１．５ｍｍｏｌ）を加え、室温で５時間攪拌反応させた。乾燥させるまで溶剤を留去し、カラムクロマトグラフィーにより精製し（２００～３００メッシュの順相シリカゲルを、ジクロロメタン：アセトニトリル（０．５重量％トリエチルアミンを含む）＝３：１～１：３で勾配溶出した）、生成物溶出液を回収し、溶剤を濃縮除去し、計５０８ｍｇの目的生成物ＶＰ－Ｕ－６を得た。３１Ｐ ＮＭＲ （１６１ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ－ｄ６） δ １５０．３４，１５０．２９，１７．０７，１５．５０． ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ２４Ｈ４１Ｎ４Ｏ９Ｐ２，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：５９１．２３、実測値：５９１．５５。ＶＰ－Ｕ－６が目的生成物ＶＰ－Ｕｍであり、ヌクレオシドモノマーとしてＲＮＡ鎖の合成に関与することを示した。
（１－３Ｂ）複合体２のアンチセンス鎖の調製
複合体２のアンチセンス鎖と複合体１のアンチセンス鎖の区別は、５’－末端の１番目のヌクレオチド修飾が異なることのみにあった。固相ホスホルアミダイト法によりアンチセンス鎖を調製する場合、最後に結合されたヌクレオシドモノマーが２’－メトキシ修飾ウラシルヌクレオシドモノマー（Ｕｍ）であり、脱保護、カップリング、キャッピング、酸化の４つの反応を行ってＣＰＲ－Ｉモノマー（蘇州吉瑪、番号Ｃａｔ＃１３－２６０１－ＸＸ）をアンチセンス鎖の５’末端に結合し、５’－リン酸エステル修飾を形成した。
合成において用いられた汎用の固相担体、脱保護、カップリング、キャッピング、酸化又は硫化の反応条件、切断と脱保護、精製と脱塩条件は、センス鎖の合成と同じであった。
イオン交換クロマトグラフィー（ＩＥＸ－ＨＰＬＣ）により純度を検出し、液体クロマトグラフィー質量分析（ＬＣ－ＭＳ）により分子量を分析したところ、理論値６９９５．４７、実測値６９９４．８であった。実測値が理論値に一致しており、目的配列を有するアンチセンス鎖ＡＳが合成されたことを示した。
（１－３Ｃ）複合体３のアンチセンス鎖の調製
ＣＰＲ－Ｉモノマーを結合した場合、上記酸化反応条件の代わりに硫化反応条件を用いたこと以外、複合体２のアンチセンス鎖と同じ合成プロセスを採用し、５’－チオリン酸エステル修飾を有する複合体３のアンチセンス鎖を製造した。
イオン交換クロマトグラフィー（ＩＥＸ－ＨＰＬＣ）により純度を検出し、液体クロマトグラフィー質量分析（ＬＣ－ＭＳ）により分子量を分析したところ、理論値７０１１．５３、実測値７０１０．９であった。実測値が理論値に一致しており、目的配列を有するアンチセンス鎖ＡＳが合成されたことを示した。
（１－４）複合体１～３の合成
複合体１に対して、Ｓ鎖とＡＳ鎖をそれぞれ注射用水に溶解させ、４０ｍｇ／ｍＬの溶液を得、等モル比で混合し、５０℃で１５ｍｉｎ加熱し、室温で冷却した後、これらを水素結合により二本鎖構造を形成させた。超純水（Ｍｉｌｌｉ－Ｑ超純水装置で自作、抵抗率１８．２ＭΩ＊ｃｍ（２５℃））を用いて複合体を濃度が０．２ｍｇ／ｍＬになるまで希釈した後、液体クロマトグラフィー質量分析計（ＬＣ－ＭＳ、Ｌｉｑｕｉｄ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ－Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ、Ｗａｔｅｒｓ社から購入、型番：ＬＣＴ Ｐｒｅｍｉｅｒ）により分子量を検出した。実測値が理論値と一致しており、合成された複合体１が、Ｌ－９複合分子を含む目的設計の二本鎖核酸配列であることが示された。
複合体２～３に対して、同じ方法により調製し分子量を検出したところ、実測値が理論値と一致しており、合成された複合体が、Ｌ－９複合分子を含む目的設計の二本鎖核酸配列であることが示された。複合体１～４の構造は、式（３）に示される。
（調製例２）複合体４～２１及び比較複合体１～２の調製
１）前記ｓｉＲＮＡが、それぞれ表３に示される比較複合体１～２及び複合体４～２１に対応する配列であり、２）目的配列に未修飾ヌクレオチドが含まれる場合、切断と脱保護条件で、アンモニア水により処理した後、一本鎖核酸の量に対して、０．４ｍｌ／μｍｏｌのＮ－メチルピロリドンにより製品を溶解させた後、０．３ｍｌ／μｍｏｌのトリエチルアミン及び０．６ｍｌ／μｍｏｌのトリエチルアミン三フッ化水素酸塩を加え、リボースにおける２’－ＴＢＤＭＳ保護を除去したこと以外、調製例１と同じ方法により、比較複合体１～２を合成した。複合体４～２１を製造できると予期した。
（調製例３）Ｐ１０－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＰ複合体（複合体２２）の調製
（３－１）Ｐ－１０化合物の合成
以下の方法に従い、Ｐ－１０化合物を合成した。
（３－１－１）ＧＡＬ５－Ｃ４－１の合成
４０ｍｌのＮ，Ｎ－ジメチルホルムアミドに上記（１－１－１）に記載された方法により得られたＧＡＬ－５（１３．４３ｇ、３０．０ｍｍｏｌ）、４－アミノ酸ｔｅｒｔ－ブチルエステル塩酸塩（５．８７ｇ、３０．０ｍｍｏｌ）、Ｏ－ベンゾトリアゾール－テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート（１３．６５ｇ、３６．０ｍｍｏｌ）及びジイソプロピルエチルアミン（１１．６３ｇ、９０．０ｍｍｏｌ）を加え、均一に溶解させた後に室温で５時間攪拌反応させた。反応液に３００ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加え、酢酸エチルで１回あたり２００ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ、２００ｍｌの飽和食塩水で１回洗浄し、有機相を分離し、さらに無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、乾燥させるまで溶剤を減圧留去して３０．３ｇの油状物粗製品ＧＡＬ５－Ｃ４－１を得、そのまま次の反応を行った。
（３－１－２）ＧＡＬ５－Ｃ４－２の合成
工程（３－１－１）で得られたＧＡＬ５－Ｃ４－１粗製品（３０．３ｇ、３０ｍｍｏｌ）を１８０ｍｌギ酸に溶解させ、室温で１６時間攪拌反応させた。乾燥させるまで溶剤を蒸発し、カラムクロマトグラフィーにより精製し（２００～３００メッシュの順相シリカゲルを、ジクロロメタン：メタノール＝１００：１８～１００：２０で勾配溶出した）、反応溶出液を回収し、溶剤を濃縮除去し、計１４．８４ｇの目的生成物ＧＡＬ５－Ｃ４－２を得た。
（３－１－３）Ｐ－６の合成：
工程（１－１－４）に記載された方法により得られたＭ－１８－Ｔｒ（２．０２ｇ、４．６９ｍｍｏｌ）と工程（３－１－２）で得られたＧＡＬ５－Ｃ４－２（８．２４ｇ、１５．４８ｍｍｏｌ、２バッチの生成物をあわせたもの）を混合して４７ｍｌのアセトニトリルに溶解させ、さらにＮ－メチルモルホリン（３．１３ｇ、３０．９６ｍｍｏｌ）を加え、最後に４－（４，６－ジメトキシトリアジン－２－イル）－４－メチルモルホリン塩酸塩（ＤＭＴＭＭ、４．２８ｇ、１５．４８ｍｍｏｌ）を加え、室温で２ｈ攪拌反応させた。２０ｍｌのジクロロメタンで反応液を希釈し、１０ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウム溶液で有機相を洗浄し、１０ｍｌの飽和食塩水で有機相を洗浄し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後で溶剤を減圧蒸発乾固して粗製品を得、２００～３００メッシュの順相シリカゲルカラムで精製し、石油エーテルをカラムに入れ、１重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、ジクロロメタン：メタノール＝１００：５～１００：７で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、減圧蒸発乾固して計８．２７ｇの純粋なＰ－６を得た。
（３－１－４）Ｐ－７の合成：
上記（３－１－３）で得られたＰ－６（６．８２ｇ、３．４５６ｍｍｏｌ）を６９ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、ジクロロ酢酸（１３．３６７ｇ、１０３．６７ｍｍｏｌ）を加え、室温で２ｈ反応させた。１００ｍｌのジクロロメタンを加えて反応液を希釈し、さらに飽和炭酸水素ナトリウム溶液を加えて洗浄しｐＨ＝７～８になるように調節し、水相をジクロロメタンで１回あたり３０ｍｌで６回抽出し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後で溶剤を減圧蒸発乾固して粗製品を得た。２００～３００メッシュの順相シリカゲルで精製し、１０重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、１重量‰トリエチルアミンでカラムを平衡化し、ジクロロメタン：メタノール＝１００：３０～１００：４０で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固して計４．８２ｇのＰ－７を得た。ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ７８Ｈ１２７Ｎ１０Ｏ３３，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：１７３２．９１、実測値：１７３５．７３。
（３－１－５）Ｐ－８の合成：
Ｐ－７（２．６５３ｇ、１．５３２ｍｍｏｌ）とＡ－１（２．３４２ｇ、４．５９６ｍｍｏｌ）を混合して１６ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、３－ジエトキシホスホリル－１，２，３－ベンゾオキサゾール４（３Ｈ）－オン（ＤＥＰＢＴ）（１．３７５ｇ、４．５９６ｍｍｏｌ）を加え、さらにジイソプロピルエチルアミン（１．１８８ｇ、９．１９１ｍｍｏｌ）を加え、２５℃で２ｈ攪拌反応させた。１０ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウムで有機相を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり１０ｍｌで３回抽出し、１０ｍｌの飽和食塩水で有機相を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり１０ｍｌで２回抽出し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後で溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで一晩発泡乾燥させて粗製品を得た。カラム精製には、１２０ｇの２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用い、２０ｍｌのトリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、１重量％トリエチルアミンを含む石油エーテルでカラムを平衡化し、石油エーテル：酢酸エチル：ジクロロメタン：Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド＝１：１：１：０．５～１：１：１：０．６で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固して計２．７９３ｇの純粋なＰ－８を得た。
（３－１－６）Ｐ－９の合成：
Ｐ－８（４９０ｍｇ、０．２３１ｍｍｏｌ）、コハク酸無水物（６９ｍｇ、０．６９３ｍｍｏｌ）及び４－ジメチルアミノピリジン（ＤＭＡＰ、６８ｍｇ、０．５５４ｍｍｏｌ）を混合して２．３ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、さらにジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＥＡ、１４９ｍｇ、１．１５５ｍｍｏｌ）を加え、２５℃で２１ｈ攪拌反応させた。５０ｍｌのジクロロメタンで反応液を希釈し、さらに１００ｍｌの０．５Ｍトリエチルアミンリン酸塩を加えて反応液を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり１０ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ、減圧蒸発乾固して粗製品を得た。カラム精製には、８０ｇの２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用い、１重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、ジクロロメタンでカラムを平衡化し、１重量‰トリエチルアミンを含むジクロロメタン：メタノール＝１００：１８～１００：２０で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固して計２００ｍｇの純粋なＰ－９複合分子を得た。ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ１０６Ｈ１５３Ｎ１０Ｏ４１，［Ｍ－ＤＭＴｒ］＋、理論値：１９２１．０５、実測値：１９２０．９７。
（３－１－７）Ｐ－１０の合成：
Ｌ－９複合分子の代わりにＰ－９複合分子を用い、固相担体に結合されたＰ－９複合分子を得たこと以外、調製例１における工程（１－１－９）と同じ方法により、Ｐ－１０を調製した。
（３－２）Ｐ１０－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体の合成
出発としてＬ－１０化合物の代わりにＰ－１０化合物を用いてセンス鎖を合成したこと以外、調製例１における工程（１－２）、（１－３Ａ）、（１－４）と同じ方法により、複合体２２を調製した。構造が式（４）に示されるＰ１０－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体を得ることができると予期した。
（調製例４）Ｒ５－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体（複合体２３）の調製
（４－１）Ｒ－５化合物の合成
以下の方法に従い、Ｒ－５化合物を合成した。
（４－１－１）ＧＡＬ－Ｃ７－１の合成
工程（１－１－１ｂ）に記載された方法により得られたＧＡＬ－３（２６．４ｇ、８０．２ｍｍｏｌ）を１３４ｍｌの無水１，２－ジクロロエタンに溶解させ、６０ｇの４Å分子篩粉を加え、さらに７－オクテン－１－オール（１１．３ｇ、８８．２ｍｍｏｌ）を加え、室温で１０分間攪拌反応させ、氷浴下で窒素保護下でトリフルオロメタンスルホン酸トリメチルシリル（８．９ｇ、４０．１ｍｍｏｌ）を加え、室温で２４時間攪拌反応させた。４Å分子篩粉を濾過除去し、濾液に５００ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加えて洗浄し、有機相を分離し、水相を１００ｍｌのジクロロメタンで１回抽出し、有機相をあわせ、２５０ｍｌの飽和食塩水で１回洗浄し、有機相を分離し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、乾燥させるまで溶剤を減圧留去して３３．３ｇの黄色水飴状製品ＧＡＬ－Ｃ７－１を得、精製することなく、そのまま次の酸化反応を行った。
（４－１－２）ＧＡＬ－Ｃ７－２の合成
工程（４－１－１）で得られたＧＡＬ－Ｃ７－１（３３．３ｇ、７２．８ｍｍｏｌ）を１６０ｍｌのジクロロメタンと１６０ｍｌのアセトニトリルの混合溶剤に溶解させ、それぞれ２１６ｍｌの水及び固形過ヨウ素酸ナトリウム（６２．３ｇ、２９１．２ｍｍｏｌ）を加え、氷水浴下で１０分間攪拌し、触媒である塩化ルテニウム（ＩＩＩ）（４９８ｍｇ、２．４ｍｍｏｌ）を加えて自然に室温まで昇温し２３時間攪拌反応させた。反応液に２００ｍｌの水を加えて希釈攪拌し、飽和炭酸水素ナトリウムを加えてｐＨを７．５に調節し、有機相を分離し、水相をジクロロメタンで３回抽出し、有機相を捨て、水相を固形クエン酸でｐＨを約３に調節し、ジクロロメタンで１回あたり２００ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶剤を減圧留去した後でカラムクロマトグラフィー（２００～３００メッシュの順相シリカゲルを、ジクロロメタン：メタノール＝１００：１８～１００：２０で勾配溶出した）により精製して２２．４ｇの白色泡状固形製品ＧＡＬ－Ｃ７－２を得た。ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ２１Ｈ３２ＮＯ１１，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：４７６．５０、実測値：４７５．９４。
（４－１－３）Ｒ－１の合成：
工程（１－１－４）に記載された方法により得られたＭ－１８－Ｔｒ（２．０２ｇ、４．６９ｍｍｏｌ）とＧＡＬ－Ｃ７－２（７．３６ｇ、１５．４８ｍｍｏｌ）を混合して４７ｍｌのアセトニトリルに溶解させ、さらにＮ－メチルモルホリン（３．１３ｇ、３０．９６ｍｍｏｌ）を加え、最後に４－（４，６－ジメトキシトリアジン－２－イル）－４－メチルモルホリン塩酸塩（ＤＭＴＭＭ、４．２８ｇ、１５．４８ｍｍｏｌ）を加え、室温で２ｈ攪拌反応させた。２００ｍｌのジクロロメタンで反応液を希釈し、１００ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウム溶液で有機相を洗浄し、１００ｍｌの飽和食塩水で有機相を洗浄し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後で溶剤を減圧蒸発乾固して粗製品を得、２００～３００メッシュの順相シリカゲルカラムで精製し、石油エーテルをカラムに入れ、１重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、ジクロロメタン：メタノール＝１００：５～１００：７で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、減圧蒸発乾固して７．８２ｇの純粋なＲ－１を得た。
（４－１－４）Ｒ－２の合成：
Ｒ－１（６．２３ｇ、３．４５６ｍｍｏｌ）を６９ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、ジクロロ酢酸（１３．３６７ｇ、１０３．６７ｍｍｏｌ）を加え、室温で２ｈ反応させた。１００ｍｌのジクロロメタンを加えて反応液を希釈し、飽和炭酸水素ナトリウム溶液を加えて洗浄しｐＨ＝７～８になるように調節し、水相をジクロロメタンで１回あたり３０ｍｌで６回抽出し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後で溶剤を減圧蒸発乾固して粗製品を得た。２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用いて、１０重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、１重量‰トリエチルアミンでカラムを平衡化し、ジクロロメタン：メタノール＝１００：３０～１００：４０で勾配溶出し、溶剤を減圧蒸発乾固して４．４９ｇの純粋なＲ－２を得た。
（４－１－５）Ｒ－３の合成：
Ｒ－２（２．３９１ｇ、１．５３２ｍｍｏｌ）とＡ－１（２．３４２ｇ、４．５９６ｍｍｏｌ）を混合して１６ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、３－ジエトキシホスホリル－１，２，３－ベンゾオキサゾール４（３Ｈ）－オン（ＤＥＰＢＴ）（１．３７５ｇ、４．５９６ｍｍｏｌ）を加え、さらにジイソプロピルエチルアミン（１．１８８ｇ、９．１９１ｍｍｏｌ）を加え、２５℃で２ｈ攪拌反応させた。１０ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウムで有機相を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり１０ｍｌで３回抽出し、１０ｍｌの飽和食塩水で有機相を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり１０ｍｌで２回抽出し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後で溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで一晩発泡乾燥させて粗製品を得た。カラム精製には、１２０ｇの２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用い、２０ｍｌのトリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、１重量％トリエチルアミンを含む石油エーテルでカラムを平衡化し、石油エーテル：酢酸エチル：ジクロロメタン：Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド＝１：１：１：０．５～１：１：１：０．６で勾配溶出し、溶剤を減圧蒸発乾固して２．６４２ｇの純粋なＲ－３を得た。
（４－１－６）Ｒ－４の合成：
Ｒ－３（７９５ｍｇ、０．４０７４ｍｍｏｌ）、コハク酸無水物（８２ｍｇ、０．８１４８ｍｍｏｌ）及び４－ジメチルアミノピリジン（ＤＭＡＰ、１００ｍｇ、０．８１４８ｍｍｏｌ）を混合して４ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、さらにジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＥＡ、１００ｍｇ、０．８１４８ｍｍｏｌ）を加え、２５℃で１８ｈ攪拌反応させた。５ｍｌの０．５Ｍトリエチルアミンリン酸塩で反応液を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり５ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ減圧蒸発乾固して粗製品を得た。カラム精製には、３０ｇの２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用い、１重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、ジクロロメタンでカラムを平衡化し、１重量‰トリエチルアミンを含むジクロロメタン：メタノール＝１００：１８～１００：２０で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固して５０５ｍｇの純粋なＲ－４複合分子を得た。
（４－１－７）Ｒ－５複合分子の合成：
Ｌ－９複合分子の代わりにＲ－４複合分子を用い、固相担体に結合されたＲ－４複合分子を得たこと以外、調製例１における工程（１－１－９）と同じ方法により、Ｒ－５を調製した。
（４－２）Ｒ５－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体の合成
出発としてＬ－１０化合物の代わりにＲ－５化合物を用いてセンス鎖を合成したこと以外、調製例１における工程（１－２）、（１－３Ａ）、（１－４）と同じ方法により、複合体２３を調製した。構造が式（７）に示されるＲ５－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体を得ることができると予期した。
（調製例５）ＬＡ５－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体（複合体２４）の調製
以下のプロセス経路により、ＬＡ－５化合物を合成できると予期した。
出発としてＬ－１０化合物の代わりにＬＡ－５化合物を用いてセンス鎖を合成したこと以外、調製例１における工程（１－２）、（１－３Ａ）、（１－４）と同じ方法により、複合体２４を調製した。構造が式（１２）に示されるＬＡ５－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体を得ることができると予期した。
（調製例６）ＬＢ５－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体（複合体２５）の調製
（６－１）ＬＢ－５化合物の合成
以下の方法に従い、ＬＢ－５化合物を合成した。
（６－１－１）ＬＢ－１の合成：
工程（１－１－６）に記載された方法により得られたＬ－８（５．０ｇ、３．３８６ｍｍｏｌ）、アジピン酸無水物（８７０ｍｇ、６．７７２ｍｍｏｌ）及び４－ジメチルアミノピリジン（ＤＭＡＰ、８２７ｍｇ、６．７７２ｍｍｏｌ）を混合して１３０ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、さらにジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＥＡ、２．２ｇ、１６．９３１ｍｍｏｌ）を加え、２５℃で４ｈ攪拌反応させた。７０ｍｌのジクロロメタンを加えて反応液を希釈し、０．５Ｍトリエチルアミンリン酸塩で反応液を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり１０ｍｌで４回抽出し、有機相をあわせ減圧蒸発乾固して粗製品を得た。カラム精製には、１２０ｇの２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用い、１重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、ジクロロメタンでカラムを平衡化し、石油エーテル：酢酸エチル：ジクロロメタン：メタノール＝１：１：１：０．２～１：１：１：１で勾配溶出し、溶剤を減圧蒸発乾固して４．２６７ｇの純粋なＬＢ－１を得た。
（６－１－２）ＬＢ－２の合成：
工程（６－１－１）に記載された方法により得られたＬＢ－１（４．６９７ｇ、２．７５３ｍｍｏｌ、２バッチの生成物をあわせたもの）、３－アミノ－１，２－プロパンジオール（３１３ｍｇ、３．４４２ｍｍｏｌ）、４－（４，６－ジメトキシトリアジン－２－イル）－４－メチルモルホリン塩酸塩（ＤＭＴＭＭ、９５３ｍｇ、３．４４２ｍｍｏｌ）及びＮ－メチルモルホリン（７００ｍｇ、６．８８４ｍｍｏｌ）を順に３０ｍｌのアセトニトリルと３ｍｌのメタノールの混合液に加え、室温で一晩攪拌反応させた。乾燥させるまで溶剤を蒸発し、カラムクロマトグラフィー（２００～３００メッシュの順相シリカゲルをジクロロメタン：メタノール＝１：０．０７～１：０．５で勾配溶出した）により精製し、生成物溶出液を回収し、溶剤を濃縮除去し、３．２７ｇの目的生成物ＬＢ－２を得た。
（６－１－３）ＬＢ－３の合成：
ＬＢ－２（２．２７ｇ、１．３５３ｍｍｏｌ）を１４ｍｌの無水ピリジンで溶解させた。さらに４，４’－ビスメトキシトリチルクロリド（６８８ｍｇ、２．０３ｍｍｏｌ）を加えて室温で一晩攪拌反応させた。１５０ｍｌのメタノールを加えてクエンチングし、乾燥させるまで溶剤を蒸発した。カラムクロマトグラフィー（２００～３００メッシュの順相シリカゲルをジクロロメタン：メタノール＝１：０．０５～１：０．２で勾配溶出した）により精製し、生成物溶出液を回収し、溶剤を濃縮除去し、１．６４７ｇの目的生成物ＬＢ－３を得た。
（６－１－４）ＬＢ－４の合成：
ＬＢ－３（８２２ｍｇ、０．４１５ｍｍｏｌ）、コハク酸無水物（８３ｇ、０．８３ｍｍｏｌ）及び４－ジメチルアミノピリジン（ＤＭＡＰ、１０２ｍｇ、０．８３ｍｍｏｌ）を混合して４ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、さらにＤＩＥＡ（２７０ｍｇ、２．０７５ｍｍｏｌ）を加え、２５℃で一晩攪拌反応させた。０．５Ｍトリエチルアミンリン酸塩で反応液を３回洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり２ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ減圧蒸発乾固して粗製品を得た。カラム精製には、２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用い、５重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、石油エーテルでカラムを平衡化し、１重量‰トリエチルアミンを含むジクロロメタン：メタノール＝１００：５～１００：２０で勾配溶出し、溶剤を減圧蒸発乾固して７８７ｍｇの純粋なＬＢ－４複合分子を得た。
（６－１－５）ＬＢ－５の合成：
Ｌ－９複合分子の代わりにＬＢ－４複合分子を用い、固相担体に結合されたＬＢ－４複合分子を得たこと以外、調製例１における工程（１－１－９）と同じ方法により、ＬＢ－５を調製した。
（６－２）ＬＢ５－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体の合成
出発としてＬ－１０化合物の代わりにＬＢ－５化合物を用いてセンス鎖を合成したこと以外、調製例１における工程（１－２）、（１－３Ａ）、（１－４）と同じ方法により、複合体２５を調製した。構造が式（１３）に示されるＬＢ５－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰを得ることができると予期した。
（調製例７）Ｖ８－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体（複合体２６）の合成
以下のプロセス経路により、Ｖ－８化合物を合成できると予期した。
出発としてＬ－１０化合物の代わりにＶ－８化合物を用いてセンス鎖を合成したこと以外、調製例１における工程（１－２）、（１－３Ａ）、（１－４）と同じ方法により、複合体２６を調製した。構造が式（１４）に示されるＶ８－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰを得ることができると予期した。
（調製例８）Ｗ８－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体（複合体２７）の調製
（８－１）Ｗ－８化合物の合成
以下の方法に従い、Ｗ－８化合物を合成した。
（８－１－１）Ｗ－１の合成：
Ｗ－０（２．０２４ｇ、１０ｍｍｏｌ）を２５ｍｌのアセトニトリルに溶解させ、さらにトリエチルアミン（４．０４８ｇ、４０ｍｍｏｌ）を加え、氷水浴で０℃程度まで冷却し、トリフルオロ酢酸エチル（５．６８３ｇ、４０ｍｍｏｌ）を加え、室温で２２ｈ反応させた。溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで１８ｈ発泡乾燥させ、５．８３５ｇの固形粗製品Ｗ－１を得た。
（８－１－２）Ｗ－２の合成：
Ｗ－１粗製品（５．８３５ｇ、１０ｍｍｏｌ）を５０ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、反応液にＴｒＣｌ（３．３４５ｇ、１２ｍｍｏｌ）及びトリエチルアミン（１．５１８ｇ、１５ｍｍｏｌ）を加え、室温で２０ｈ攪拌反応させた。２０ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウムで反応液を２回洗浄し、２０ｍｌの飽和食塩水で１回洗浄し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後で有機溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで一晩発泡乾燥させ、８．０１２ｇの固形粗製品Ｗ－２を得た。処理されることなく、次の脱保護反応を行った。
（８－１－３）Ｗ－３の合成：
Ｗ－２粗製品（８．０１２ｇ、１０ｍｍｏｌ）を１００ｍｌのメタノールに溶解させ、さらに１００ｍｌのメチルアミン水溶液（４０重量％）を加え、５０℃で２３ｈ攪拌反応させた。不溶性粒子を濾過除去し、溶剤を減圧蒸発乾固し、２００ｍｌの体積比１：１のＤＣＭ－メタノール混合溶剤を加え、５０ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウムで有機相を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり５０ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後で溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで一晩発泡乾燥させ、２００～３００メッシュの順相シリカゲルカラムで精製し、石油エーテルをカラムに入れ、１重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、ジクロロメタン：メタノール：アンモニア水（２５重量％）＝１：１：０．０５～１：１：０．２５で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで発泡乾燥させて３．０６２ｇの純粋なＷ－３を得た。
（８－１－４）Ｗ－４の合成：
Ｗ－３（０．６７５ｇ、１．５１７ｍｍｏｌ）とＧＡＬ－Ｃ７－２（２．６０ｇ、５．４６ｍｍｏｌ）を混合して４７ｍｌのアセトニトリルに溶解させ、さらにジイソプロピルエチルアミン（１．５７ｇ、１２．１４ｍｍｏｌ）を加え、最後に３－ジエトキシホスホリル－１，２，３－ベンゾオキサゾール４（３Ｈ）－オン（ＤＥＰＢＴ、１．８１６ｇ、６．０４ｍｍｏｌ）を加え、室温で２．５ｈ攪拌反応させた。１００ｍｌのジクロロメタンで反応液を希釈し、８０ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウム溶液で有機相を洗浄し、８０ｍｌの飽和食塩水で有機相を洗浄し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後で溶剤を減圧蒸発乾固して粗製品を得、２００～３００メッシュの順相シリカゲルカラムで精製し、石油エーテルをカラムに入れ、１重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、ジクロロメタン：メタノール＝１００：５～１００：７で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、減圧蒸発乾固して１．６１０ｇの純粋なＷ－４を得た。
（８－１－５）Ｗ－５の合成：
Ｗ－４（１．６１ｇ、０．８８６ｍｍｏｌ）を１２５ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、さらにジクロロ酢酸（３．５ｍｌ、４２．４３ｍｍｏｌ）を加え、室温で１ｈ反応させた。１５０ｍｌのピリジンを加えて反応液を中和し、溶剤を減圧蒸発乾固して粗製品を得た。２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用いて、１０重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、１重量‰トリエチルアミンでカラムを平衡化し、ジクロロメタン：メタノール＝１００：３０～１００：４０で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固して１．２６ｇの純粋なＷ－５を得た。
（８－１－６）Ｗ－６の合成：
Ｗ－５（１．２５ｇ、０．７９３ｍｍｏｌ）と工程（１－１－７ａ）に記載された方法により得られたＡ－１（１．２１ｇ、２．３８ｍｍｏｌ）を混合して１２ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、３－ジエトキシホスホリル－１，２，３－ベンゾオキサゾール４（３Ｈ）－オン（ＤＥＰＢＴ、０．７１２ｇ、２．３８ｍｍｏｌ）を加え、さらにジイソプロピルエチルアミン（０．６１５ｇ、４．７６ｍｍｏｌ）を加え、２５℃で３ｈ攪拌反応させた。８０ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウムで有機相を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり１０ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ、１０ｍｌの飽和食塩水で洗浄し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後で溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで一晩発泡乾燥させて粗製品を得た。カラム精製には、１８５ｇの２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用い、２０ｍｌのトリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、１重量％トリエチルアミンを含む石油エーテルでカラムを平衡化し、石油エーテル：酢酸エチル：ジクロロメタン：Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド＝１：１：１：０．１～１：１：１：０．７で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固して１．５７ｇの純粋なＷ－６を得た。
（８－１－７）Ｗ－７の合成：
Ｗ－６（１．２３８ｇ、０．６３ｍｍｏｌ）、コハク酸無水物（０．１８９ｇ、１．８９ｍｍｏｌ）及び４－ジメチルアミノピリジン（ＤＭＡＰ、０．２３１ｇ、１．８９ｍｍｏｌ）を混合して７ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、さらにＤＩＥＡ（０．４０７ｇ、３．１５ｍｍｏｌ）を加え、２５℃で２４ｈ攪拌反応させた。５ｍｌの０．５Ｍトリエチルアミンリン酸塩で反応液を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり５ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ減圧蒸発乾固して粗製品を得た。カラム精製には、３０ｇの２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用い、１重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、ジクロロメタンでカラムを平衡化し、１重量‰トリエチルアミンを含むジクロロメタン：メタノール＝１００：１８～１００：２０で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固して１．０３３ｇの純粋なＷ－７複合分子を得た。ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ１０１Ｈ１４６Ｎ７Ｏ３８，［Ｍ－ＤＭＴｒ］＋、理論値：１７６３．９２、実測値：１７６３．２１。
（８－１－８）Ｗ－８の合成：
Ｌ－９複合分子の代わりにＷ－７複合分子を用い、固相担体に結合されたＷ－７複合分子を得たこと以外、調製例１における工程（１－１－９）と同じ方法により、Ｗ－８を調製した。
（８－２）Ｗ８－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体の合成
出発としてＬ－１０化合物の代わりにＷ－８化合物を用いてセンス鎖を合成したこと以外、調製例１における工程（１－２）、（１－３Ａ）、（１－４）と同じ方法により、複合体２７を調製した。構造が式（１５）に示されるＷ８－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰを得ることができると予期した。
（調製例９）Ｘ８－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体（複合体２８）の調製
以下のプロセス経路により、Ｘ－８化合物を合成できると予期した。
出発としてＬ－１０化合物の代わりにＸ－８化合物を用いてセンス鎖を合成したこと以外、調製例１における工程（１－２）、（１－３Ａ）、（１－４）と同じ方法により、複合体２８を調製した。構造が式（２１）に示されるＸ８－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰを得ることができると予期した。
（調製例１０）Ｚ５－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体（複合体２９）の調製
（１０－１）Ｚ－５化合物の合成
以下の方法に従い、Ｚ－５化合物を合成した。
（１０－１－１）Ｚ－１の合成：
工程（８－１－３）に記載された方法により得られたＷ－３（１．５０ｇ、３．３７ｍｍｏｌ）と工程（３－１－２）に記載された方法により得られたＧＡＬ５－Ｃ４－２（７．１８ｇ、１３．４８ｍｍｏｌ）を混合して３４ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、さらにジイソプロピルエチルアミン（３．４８ｇ、２６．９６ｍｍｏｌ）を加え、最後に３－ジエトキシホスホリル－１，２，３－ベンゾオキサゾール４（３Ｈ）－オン（ＤＥＰＢＴ、４．０４ｇ、１３．４８ｍｍｏｌ）を加え、室温で４．５ｈ攪拌反応させた。１００ｍｌのジクロロメタンで反応液を希釈し、８０ｍｌの飽和炭酸水素ナトリウム溶液で有機相を洗浄し、８０ｍｌの飽和食塩水で有機相を洗浄し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後で溶剤を減圧蒸発乾固して粗製品を得、２００～３００メッシュの順相シリカゲルカラムで精製し、石油エーテルをカラムに入れ、１重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、ジクロロメタン：メタノール＝３０：１～１５：１で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、減圧蒸発乾固して３．９７ｇの純粋なＺ－１を得た。ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ９８Ｈ１４３Ｎ１０Ｏ３３，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：１９８７．９８、実測値：１９８７．９０。
（１０－１－２）Ｚ－２の合成：
Ｚ－１（３．９７ｇ、２．００ｍｍｏｌ）を２５０ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、さらにジクロロ酢酸（１０．９４１ｇ、８４．８５ｍｍｏｌ）を加え、室温で１ｈ反応させた。ピリジンを加えて反応液を中性に中和し、溶剤を減圧蒸発乾固して粗製品を得た。２２０ｇの２００～３００メッシュの順相シリカゲルをカラムに入れ、１０％ピリジンでシリカゲルの酸性を中和し、１‰ピリジンでカラムを平衡化し、ジクロロメタン：メタノール＝１０：１～２：１で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固して３．４９ｇの純粋なＺ－２を得た。ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ７９Ｈ１２９Ｎ１０Ｏ３３，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：１７４６．９４、実測値：１７４６．９０。
（１０－１－３）Ｚ－３の合成：
Ｚ－２（３．４９ｇ、２．０ｍｍｏｌ）と工程（１－１－７ａ）に記載された方法により得られたＡ－１（３．０６ｇ、６．０ｍｍｏｌ）を混合して３０ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、３－ジエトキシホスホリル－１，２，３－ベンゾオキサゾール４（３Ｈ）－オン（ＤＥＰＢＴ、１．８０ｇ、６．０ｍｍｏｌ）を加え、さらにジイソプロピルエチルアミン（１．５５ｇ、１２．０ｍｍｏｌ）を加え、２５℃で３ｈ攪拌反応させた。１００ｍｌのジクロロメタンで反応液を希釈し、飽和炭酸水素ナトリウムで有機相を１回あたり３０ｍｌで２回洗浄し、水相を１０ジクロロメタンで抽出し、有機相をあわせ、５０ｍｌの飽和食塩水で洗浄し、有機相をあわせ無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過した後で溶剤を減圧蒸発乾固し、真空油ポンプで一晩発泡乾燥させて粗製品を得た。カラム精製には、２００ｇの２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用い、２０ｍｌのトリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、１重量％トリエチルアミンを含む石油エーテルでカラムを平衡化し、ジクロロメタン：メタノール＝２５：１～１５：１で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固して２．２ｇの純粋なＺ－３を得た。ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ１０３Ｈ１５１Ｎ１０Ｏ３８，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：２１３６．０２、実測値：２１３６．２０。
（１０－１－４）Ｚ－４の合成：
Ｚ－３（２．１０ｇ、０．９８３ｍｍｏｌ）をＤＩＥＡ（０．６３５ｇ、４．９１５ｍｍｏｌ）を含む１４．８ｍｌのジクロロメタンに溶解させ、４－ジメチルアミノピリジン（ＤＭＡＰ、２４０ｍｇ、１．９６６ｍｍｏｌ）を加え攪拌して清澄させた後、コハク酸無水物（１９７ｍｇ、１．９６６ｍｍｏｌ）を加え、２５℃で１８ｈ攪拌反応させた。５０ｍｌのジクロロメタンを加えて反応液を希釈し、８０ｍｌの０．５Ｍトリエチルアミンリン酸塩で有機相を洗浄し、水相をジクロロメタンで１回あたり５０ｍｌで２回抽出し、有機相をあわせ減圧蒸発乾固して粗製品を得た。カラム精製には、１８８ｇの２００～３００メッシュの順相シリカゲルを用い、１重量％トリエチルアミンでシリカゲルの酸性を中和し、ジクロロメタンでカラムを平衡化し、１重量‰トリエチルアミンを含むジクロロメタン：メタノール＝１０：１～３：１で勾配溶出し、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固して１．９５ｇの純粋なＺ－４複合分子を得た。ＭＳ ｍ／ｚ：Ｃ１０７Ｈ１５５Ｎ１０Ｏ４１，［Ｍ＋Ｈ］＋、理論値：１９３５．０７、実測値：１９３５．２９。
（１０－１－５）Ｚ－５の合成
Ｌ－９複合分子の代わりにＺ－４複合分子を用い、固相担体に結合されたＺ－４複合分子を得たこと以外、調製例１における工程（１－１－９）と同じ方法により、Ｚ－５を調製した。
（１０－２）Ｚ５－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体の合成
出発としてＬ－１０化合物の代わりにＺ－５化合物を用いてセンス鎖を合成したこと以外、調製例１における工程（１－２）、（１－３Ａ）、（１－４）と同じ方法により、複合体２９を調製した。構造が式（２２）に示されるＺ５－ｓｉＡＰ１Ｍ２ＳＶＰ複合体を得ることができると予期した。
（調製例１１）複合体Ｆ１～Ｆ５の調製
本調製例では、複合体Ｆ１～Ｆ５（以下、それぞれＦＩＮ－ｓｉＡＰ１Ｍ１ＳＶＰ、ＦＩＮ－ｓｉＡＰ１Ｍ１Ｓ、ＦＩＮ－ｓｉＡＰ２Ｍ１ＳＶＰ、ＦＩＮ－ｓｉＡＰ２Ｍ１Ｓ及びＦＩＮ－ｓｉＡＰ２Ｍ２Ｓ複合体ともいう）を合成した。当該複合体に複合されたｓｉＲＮＡの配列は、表３に示される。
（１１－１）ＦＩＮ－２複合分子の合成
Ｒａｊｅｅｖら、ＣｈｅｍＢｉｏＣｈｅｍ ２０１５，１６，９０３－９０８に記載された調製方法を参照し、以下のプロセス経路により、ＦＩＮ－２複合分子を合成した。
（１１－１－１）ＰＲＯ－１０の合成
（１１－１－１ａ）ＰＲＯ－７の合成
２．９３ｇのＰＲＯ－６（Ｌ－ヒドロキシプロリン、ＣＡＳ番号：５１－３５－４、Ｅｎｅｒｇｙ社から購入、２２．４ｍｍｏｌ）を２２．５ｍｌの１，４－ｄｉｏｘａｎｅ（１，４－ジオキサン、ＣＡＳ番号：１２３－９１－１）に溶解させ、３４ｍｌの１０％（ｗ／ｗ）Ｎａ２ＣＯ３の水溶液を加え、懸濁液状態にし、６．９５ｇのＦｍｏｃ－Ｃｌ（クロロギ酸－９－フルオレニルメチル、ＣＡＳ番号：２８９２０－４３－６、Ｅｎｅｒｇｙ社から購入、２６．８ｍｍｏｌ）を３４ｍｌの１，４－ｄｉｏｘａｎｅに溶解させ、氷浴下で上記懸濁液中に加え、自然に室温まで昇温し一晩反応させた。反応液を１５０ｍｌの氷水に注入し、メチルｔｅｒｔ－ブチルエーテルで１回あたり１００ｍｌで３回抽出し、有機相を捨て、水相を濃ＨＣｌでｐＨ≦５になるように調節し、１００ｍｌの酢酸エチルで２回抽出し、有機相をあわせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶剤を減圧蒸発乾固して７．８３ｇの白色泡状固形製品ＰＲＯ－７を得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ－ｄ６） δ ７．９１ （ｔ，Ｊ ＝ ７．２ Ｈｚ，２Ｈ），７．６７ （ｄ，Ｊ ＝ ７．５ Ｈｚ，２Ｈ），７．４８ － ７．３９ （ｍ，２Ｈ），７．３８ － ７．２７ （ｍ，２Ｈ），５．１７ （ｓ，１Ｈ），４．２７ （ｓ，２Ｈ），４．２３ － ４．１１ （ｍ，２Ｈ），３．５５ － ３．４１ （ｍ，３Ｈ），２．３１ － ２．１０ （ｍ，１Ｈ），２．０８ － １．８８ （ｍ，１Ｈ）． ＨＲＭＳ （ＥＳＩ） ｍ／ｚ 理論値 Ｃ２０Ｈ１９ＮＯ５ ［Ｍ－Ｈ］－３５２．１１９０、実測値 ３５２．１０３３．
（１１－１－１ｂ）ＰＲＯ－８の合成
７．８３ｇのＰＲＯ－７（２２．２ｍｍｏｌ）を８０ｍｌのＴＨＦ（ＣＡＳ番号：１０９－９９－９）に溶解させ、油浴で６５℃に加熱し、還流状態で３６．６ｍｌの２ｍｏｌ／ＬのＢＨ３－Ｍｅ２ＳのＴＨＦ溶液（ＣＡＳ番号１３２９２－８７－０、Ｊ＆Ｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ社から購入、７３．２ｍｍｏｌ）を加え、３時間還流反応を続けた。反応液を流出させ、メタノールで残りの固体を溶解させ、攪拌下で反応液に気体がなくなるまでメタノールを加え３０分間攪拌し続け、溶剤を減圧留去した後、石油エーテルで３回精製して７．１ｇの白色固形生成物ＰＲＯ－８を得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ－ｄ６） δ ７．９１ （ｔ，Ｊ ＝ ６．７ Ｈｚ，２Ｈ），７．６７ （ｄ，Ｊ ＝ ７．２ Ｈｚ，２Ｈ），７．４９ － ７．３９ （ｍ，２Ｈ），７．３８ － ７．２６ （ｍ，２Ｈ），５．１８ （ｄｄ，Ｊ ＝ ６．１，３．８ Ｈｚ，１Ｈ），４．２８ （ｓ，２Ｈ），４．２３ － ４．１３ （ｍ，２Ｈ），３．５５ － ３．３８ （ｍ，２Ｈ），２．３２ － ２．１１ （ｍ，１Ｈ），２．０８ － １．８９ （ｍ，１Ｈ）． ＨＲＭＳ （ＥＳＩ） ｍ／ｚ 理論値 Ｃ２０Ｈ２１ＮＯ４ ［Ｍ＋Ｎａ］＋３６２．１３６８、実測値 ３６２．１０１２．
（１１－１－１ｃ）ＰＲＯ－９の合成
７．１ｇのＰＲＯ－８（２１ｍｍｏｌ）を１００ｍｌのピリジンに溶解させ、１４．２ｇのＤＭＴｒ－Ｃｌ（４，４’－ビスメトキシトリチルクロリド、４２ｍｍｏｌ）を加え、室温で５時間攪拌反応させた。溶剤を減圧留去し、粗製品を酢酸エチルで溶解した後に塩類不純物を濾過除去し、溶剤を減圧留去した後でシリカゲルカラムで精製し、シリカゲルカラムを予めピリジンでアルカリ化してからＤＣＭで粗製品を溶解させ負荷し、１％（ｖ／ｖ）ピリジンを含むＤＣＭでＤＭＴｒ－Ｃｌを溶出させた後、酢酸エチルで生成物を溶出させ、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固し、８．２ｇの白色固形生成物ＰＲＯ－９を得た。ＨＲＭＳ （ＥＳＩ） ｍ／ｚ 理論値 Ｃ４１Ｈ３９ＮＯ６ ［Ｍ＋Ｎａ］＋６６４．２６７５、実測値６６４．２３４８，Ｃ１８ ＲＰ－ＨＰＬＣ（ロット番号ＪＪＳ１６０３２４－１）純度９４．２０％。
（１１－１－１ｄ）ＰＲＯ－１０の合成
８．２ｇのＰＲＯ－９（１２．８ｍｍｏｌ）を６４ｍｌのＤＭＦ（Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド）に溶解させ、４０ｍｌのピペリジン（３８４ｍｍｏｌ）を加え、室温で３０分間攪拌反応させた。反応液を３００ｍｌの氷水に注入し、酢酸エチルで１回あたり１５０ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ、２００ｍｌの飽和食塩水で洗浄した後、有機相を無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶剤を減圧留去した後でシリカゲルカラムで精製し、シリカゲルカラムを予めピリジンでアルカリ化してからＤＣＭで粗製品を溶解させ負荷し、１％（ｖ／ｖ）ピリジンを含むＤＣＭでＦｍｏｃを溶出させた後、酢酸エチルで生成物を溶出させ、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固し、４．６５ｇの白色固形生成物ＰＲＯ－１０を得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ－ｄ６） δ ７．４０ （ｄ，Ｊ ＝ ７．２ Ｈｚ，２Ｈ），７．３５ － ７．１８ （ｍ，７Ｈ），６．９３ － ６．８４ （ｍ，４Ｈ），４．５６ （ｄ，Ｊ ＝ ３．９ Ｈｚ，１Ｈ），４．１２ （ｓ，１Ｈ），３．７４ （ｓ，６Ｈ），３．４６ － ３．３７ （ｍ，１Ｈ），２．８８ （ｄｄｄ，Ｊ ＝ １８．５，１０．０，５．５ Ｈｚ，２Ｈ），２．７５ （ｄｄ，Ｊ ＝ ８．７，５．８ Ｈｚ，１Ｈ），２．６２ （ｄｄ，Ｊ ＝ １１．０，２．７ Ｈｚ，１Ｈ），１．７４ － １．６５ （ｍ，１Ｈ），１．４０ （ｄｄｄ，Ｊ ＝ １２．９，８．５，５．９ Ｈｚ，１Ｈ），ＨＲＭＳ （ＥＳＩ） ｍ／ｚ 理論値 Ｃ２６Ｈ２９ＮＯ４ ［Ｍ＋Ｎａ］＋４４２．１９９４、実測値４４２．１９９９，Ｃ１８ ＲＰ－ＨＰＬＣ（ロット番号ＪＪＳ１６０３２９－１）純度９７．０７％。
（１１－１－２）ＦＩＮ－１の合成
（１－１－１）に記載された方法により得られたＧＡＬ－５（４．５ｇ、１０ｍｍｏｌ）を４０ｍｌのＤＭＦに溶解させ、順に３．９ｇのＤＩＥＡ（Ｎ，Ｎ－ジイソプロピルエチルアミン、ＣＡＳ番号：７０８７－６８－５、Ａｌａｄｄｉｎ社から購入、３０ｍｍｏｌ）及び３．８ｇのＨＢＴＵ（ベンゾトリアゾール－Ｎ，Ｎ、Ｎ’，Ｎ’－テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート、ＣＡＳ番号：９４７９０～３７－２、Ａｌａｄｄｉｎ社から購入、１１ｍｍｏｌ）を加え、室温で１０分間攪拌し、工程（１１－１－１ｄ）で得られたＰＲＯ－１０（４．２ｇ、１０ｍｍｏｌ）を４０ｍｌのＤＭＦに溶解させた後、上記反応液に加え、反応液に無水硫酸ナトリウムを加えて乾燥させ、室温で２時間攪拌した。反応液を１２０ｍｌの氷水に注入し、酢酸エチルで１回あたり６０ｍｌで３回抽出し、有機相をあわせ、それぞれ２０ｍｌの水、２０ｍｌの飽和食塩水で洗浄し、有機相を分離し無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、溶剤を減圧留去し、シリカゲルカラムで精製し、シリカゲルカラムを予めピリジンでアルカリ化してからそれに試料を負荷し、１体積％トリエチルアミン及び１体積％メタノールを含むジクロロメタン（ＤＣＭ）溶液で溶出させ、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧蒸発乾固し、６．５ｇの淡黄色泡状固形製品ＦＩＮ－１を得た。１Ｈ ＮＭＲ （４００ ＭＨｚ，ＤＭＳＯ－ｄ６） δ ７．８３ （ｄ，Ｊ ＝ ９．２ Ｈｚ，１Ｈ），７．３２ （ｔ，Ｊ ＝ ６．６ Ｈｚ，４Ｈ），７．２０ （ｔｄ，Ｊ ＝ ８．９，３．５ Ｈｚ，５Ｈ），６．９３ － ６．８４ （ｍ，４Ｈ），５．２１ （ｄ，Ｊ ＝ ３．２ Ｈｚ，１Ｈ），５．０４ － ４．９０ （ｍ，２Ｈ），４．４９ （ｓ，１Ｈ），４．４０ （ｄ，Ｊ ＝ ４．４ Ｈｚ，０．８Ｈ），４．３１ （ｄ，Ｊ ＝ ５．０ Ｈｚ，０．２Ｈ），４．１５ （ｓ，１Ｈ），４．０３ （ｓ，３Ｈ），３．９３ （ｓ，１Ｈ），３．７４ （ｓ、７Ｈ）、３．５９ （ｄｔ，Ｊ ＝ １２．０，６．０ Ｈｚ，１Ｈ），３．５０ － ３．４０ （ｍ，１Ｈ），３．３９ － ３．２５ （ｍ，３Ｈ），３．１３ （ｄｄ，Ｊ ＝ ８．９，５．２ Ｈｚ，１Ｈ），３．００ （ｄｑ，Ｊ ＝ ９．３，５．３，４．３ Ｈｚ，１Ｈ），２．２２ （ｓ，２Ｈ），２．０７ （ｓ，３Ｈ），１．９９ （ｓ，３Ｈ），１．９０ （ｓ，４Ｈ），１．７４ （ｓ，３Ｈ），１．５０ （ｓ，３Ｈ），１．３６ （ｓ，１Ｈ）。Ｃ１８ ＲＰ－ＨＰＬＣ（ロット番号ＬＪ１６０４２２）純度９５．４５％。
（１１－１－３）ＦＩＮ－２の合成
工程（１１－１－２）で得られたＦＩＮ－１（３．０ｇ、３．５３ｍｍｏｌ）をアセトニトリルと共沸させて水を除去し、減圧吸引乾燥させ、１０ｍｌのＤＭＦに溶解させ、窒素保護下で２．１３ｇのＰＡ（ビス（ジイソプロピルアミノ）（２－シアノエトキシ）ホスフィン、Ａｄａｍａｓ社から購入、商品番号１１３５６Ｂ、７．０６ｍｍｏｌ）、３４６ｍｇのテトラゾール（ＣＡＳ番号：２８８－９４－８、Ａｌａｄｄｉｎ社から購入、４．９４ｍｍｏｌ）を加え、室温で攪拌反応させ、１０ｍｌのＤＭＦを追加し、１時間攪拌反応を続けた。溶剤を減圧留去した後でシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、シリカゲルカラムを予めピリジンでアルカリ化してからＤＣＭで粗製品を溶解させ負荷し、酢酸エチルで溶出させ、生成物溶出液を回収し、溶剤を減圧留去し、４．５ｇの無色シロップ状粗製品を得た。粗製品を５０体積％アセトニトリル水溶液で完全に溶解するまで溶解させ、Ｃ－１８、３３０ｇ、３００Å中圧精製カラムでサンプルを精製し、カラムをまず１体積％ピリジンのアセトニトリル溶液でアルカリ化し、勾配溶出させて製品のピークを回収し、溶剤を減圧留去して２．２ｇの白色粉末製品ＦＩＮ－２複合分子を得た。３１Ｐ ＮＭＲ （１６２ ＭＨｚ，ＣＤＣｌ３） δ １４８．０４，１４７．９４，１４７．６２，１４７．１９、リンスペクトル純度９２％、Ｃ１８ ＲＰ－ＨＰＬＣ純度９０．５４％。
（１１－２）ＦＩＮ－２複合分子の固相担体への結合
核酸固相合成方法により、工程（１１－１－３）で得られたＦＩＮ－２複合分子を３回循環させることにより、汎用の固相担体（ＵｎｙＬｉｎｋｅｒＴＭ ｌｏａｄｅｄ ＮｉｔｔｏＰｈａｓｅ（登録商標）ＨＬ Ｓｏｌｉｄ Ｓｕｐｐｏｒｔｓ）に結合し、複合基（ＦＩＮ＿ＦＩＮ＿ＦＩＮ）のＲＮＡセンス鎖の３’末端への結合を実現した。
Ｒａｊｅｅｖら、ＣｈｅｍＢｉｏＣｈｅｍ ２０１５，１６，９０３－９０８に記載された調製方法を参照して上記結合を行い、具体的には、まず、上記汎用の固相担体から始まり、固相担体におけるヒドロキシ保護基を除去し、カップリング反応条件及びカップリング試薬の存在下でＦＩＮ－２複合分子と接触させてカップリングさせ、キャッピング反応及び酸化反応を行った後、固相担体に結合されたＦＩＮ複合分子を得た。当該固相担体に結合されたＦＩＮ複合分子におけるヒドロキシ保護基ＤＭＴｒを除去し、ＦＩＮ－２複合分子と接触させてカップリングさせ、キャッピング反応及び酸化反応を行い、再び上記脱保護－カップリング－キャッピング－酸化工程を１回繰り返し、３番目のＦＩＮ－２複合分子を結合させ、固相担体に結合された複合基（ＦＩＮ＿ＦＩＮ＿ＦＩＮ）を得た。
上記反応において、上述した脱保護、カップリング、キャッピング、酸化は、反応条件、溶剤及び試薬用量が前述した工程（１－２）に記載された核酸固相合成方法と同じであった。
（１１－３）複合体Ｆ１～Ｆ５の合成
１）工程（１１－２）で得られた化合物を出発としてセンス鎖を合成し、２）複合ｓｉＲＮＡが表３に示される複合体Ｆ１～Ｆ５に対応する配列を有すること以外、調製例１における工程（１－２）、（１－３）、（１－４）と同じ方法により、表題複合体を調製した。
液体クロマトグラフィー質量分析計（ＬＣ－ＭＳ、Ｌｉｑｕｉｄ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ－Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ、Ｗａｔｅｒｓ社から購入、型番：ＬＣＴ Ｐｒｅｍｉｅｒ）により分子量を検出した。その結果、実測値が理論値に一致しており、合成された複合体は、構造が式（３０７）に示される目的設計の化合物であることが確認された。
（調製例１２）比較複合体３の調製
本調製例で比較複合体３を合成し、当該複合体に複合されたｓｉＲＮＡの配列は、表３に示される。当該複合体は、米国出願１５／５９７，２２５における化合物ＡＤ－６９５３５と構造が同じであった。
（１２－１）（ＧａｌＮＡｃ）３複合分子の合成
ＷＯ２０１４０２５８０５Ａ１に記載された調製方法により化合物３０、即ち、以上のようなリンカー－（ＬＡ）３トリヒドロキシメチルアミノメタン－ＬＢ－及び標的基であるＮ－アセチルガラクトサミン分子（ここで、各ＬＡに１つのＮ－アセチルガラクトサミン分子が結合できるので、１つのリンカーに３個のＮ－アセチルガラクトサミン分子が結合できる）を含む複合分子（（ＧａｌＮＡｃ）３複合分子とも呼ばれる）を合成し、前記化合物３０の構造は、下式に示される。
（１２－２）（ＧａｌＮＡｃ）３複合分子の固相担体への結合
調製例１における工程（１－１－９）と同じ方法により、（ＧａｌＮＡｃ）３複合分子を固相担体に結合し、固相担体に結合された（ＧａｌＮＡｃ）３複合分子を得た。
（１２－３）比較複合体１の合成
１）工程（１２－２）で得られた化合物を出発としてセンス鎖を合成し、２）複合ｓｉＲＮＡが表３において番号（ＧａｌＮＡｃ）３－６９５３５に示される配列を有すること以外、調製例１における工程（１－２）、（１－３）、（１－４）と同じ方法により、比較複合体１を調製した。
液体クロマトグラフィー質量分析計（ＬＣ－ＭＳ、Ｌｉｑｕｉｄ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ－Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ、Ｗａｔｅｒｓ社から購入、型番：ＬＣＴ Ｐｒｅｍｉｅｒ）により分子量を検出した。その結果、実測値が理論値に一致しており、合成された複合体は、構造が式（３０５）に示される目的設計の化合物であることが確認された。
上記本開示の複合体の調製が完了した後、使用のために、標準的な手段により固体粉末として凍結乾燥させて保存した。使用時、例えば注射用水を用いて改めて溶解させ所望の濃度の溶液として用いてもよい。
（実験例１）本実験では本開示のｓｉＲＮＡ複合体の体外（ｉｎ ｖｉｔｒｏ）での抑制活性を調べた
（実験例１－１）体外ｐｓｉＣＨＥＣＫ系におけるオンターゲット活性
本実験例では、複合体Ｆ１～Ｆ５の体外ｐｓｉＣＨＥＣＫ系におけるオンターゲット活性（ｏｎ－ｔａｒｇｅｔ ａｃｔｉｖｉｔｙ）を調べ、即ち、複合体Ｆ１～Ｆ５が、完全マッチした目的配列（そのヌクレオチド配列が前記複合体のアンチセンス鎖の全長ヌクレオチド配列と完全に相補的である）を標的する活性を測定した。
Ｋｕｍｉｃｏ Ｕｉ－Ｔｅｉ ｅｔ．ａｌ．，Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｄｉｓｓｅｃｔｉｏｎ ｏｆ ｓｉＲＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｂｙ ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃ ＤＮＡ ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎ：ｍｏｄｉｆｉｅｄ ｓｉＲＮＡ ｗｉｔｈ ａ ＤＮＡ ｓｅｅｄ ａｒｍ ｉｓ ａ ｐｏｗｅｒｆｕｌ ｔｏｏｌ ｆｏｒ ｍａｍｍａｌｉａｎ ｇｅｎｅ ｓｉｌｅｎｃｉｎｇ ｗｉｔｈ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ ｒｅｄｕｃｅｄ ｏｆｆ－ｔａｒｇｅｔ ｅｆｆｅｃｔ． Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２００８．３６（７），２１３６－２１５１に記載された方法により、検出プラスミドを構築し、被評価ｓｉＲＮＡ複合体と共にＨＥＫ２９３Ａ細胞にコトランスフェクションさせ、デュアルルシフェラーゼレポーター遺伝子の発現レベルにより、ｓｉＲＮＡ複合体のオンターゲット活性を反映した。
具体的な工程は以下のとおりである。
［１］検出プラスミドの構築
ｐｓｉＣＨＥＣＫＴＭ－２（ＰｒｏｍｅｇａＴＭ）プラスミドにより、被験複合体におけるアンチセンス鎖の２１個のヌクレオチド配列の全てと完全に相補的な目的配列を含むオンターゲットプラスミドを構築した。目的配列をｐｓｉＣＨＥＣＫＴＭ－２プラスミドのＸｈｏ Ｉ／Ｎｏｔ Ｉ部位にクローニングした。
［２］トランスフェクション
９６ウェルプレートに、ＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅＴＭ ２０００（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社）の使用説明書により、それぞれｓｉＲＮＡ複合体及び上記プラスミドをコトランスフェクションし、プラスミドをウェルあたり１０ｎｇずつトランスフェクションし、０．２μＬのＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅＴＭ ２０００を用い、複合体の最終濃度（ｓｉＲＮＡの濃度として算出される）は順に０．５ｎＭ、０．１ｎＭ及び０．０２ｎＭであった。各群では、複合体処理なしを対照とした。１群あたり３個の複製ウェルがあった。
ＮＣは、ＧｅｎｅＰｈａｒｍａ社からの、目的遺伝子配列と同源性のない汎用の陰性対照Ｂ０１００１であった。
［３］検出
２４時間コトランスフェクションした後、デュアルルシフェラーゼレポーター遺伝子検出キット（Ｄｕａｌ ｌｕｃｉｆｅｒａｓｅ ｒｅｐｏｒｔｅｒ ｇｅｎｅ ａｓｓａｙ ｋｉｔ、Ｐｒｏｍｅｇａ社、ｃａｔ．Ｅ２９４０）を用い、使用説明書によりＨＥＫ２９３Ａ細胞を溶解させ、デュアルルシフェラーゼレポーター遺伝子の発現レベルを検出した。ホタルルシフェラーゼタンパク質レベルに対するウミシイタケルシフェラーゼタンパク質レベルで標準化した。結果を図１に示した。
結果から明らかなように、複合体Ｆ１～Ｆ５はいずれも良好な体外抑制活性を有し、高濃度での各複合体による抑制率は８７％～９７％であった。
（実験例１－２）体外ｐｓｉＣＨＥＣＫ系におけるＩＣ５０の測定
本実験例では、複合体１の体外ｐｓｉＣＨＥＣＫ系におけるＩＣ５０を調べた。
実験例１－１と同じ方法により複合体１のオンターゲットプラスミドを構築し、複合体１の最終濃度（ｓｉＲＮＡの濃度として算出される）が１ｎＭから、０．００１ｎＭまで１１個の濃度に倍加希釈された。複合体の異なる濃度で測定された活性結果から、Ｇｒａｐｈｐａｄ ５．０ソフトウェアｌｏｇ（ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ） ｖｓ． ｒｅｓｐｏｎｓｅ－Ｖａｒｉａｂｌｅ ｓｌｏｐｅ機能により用量－効果曲線をフィッティングし、用量－効果曲線から複合体１のＩＣ５０値を算出した。
式中、
Ｙは、残存ｍＲＮＡの発現レベルであり、
Ｘは、トランスフェクションｓｉＲＮＡの濃度の対数値であり、
Ｂｏｔは、定常期の最低のＹ値であり、
Ｔｏｐは、定常期の最高のＹ値であり、
ＬｏｇＩＣ５０は、Ｙが最低と最高との間の半分にある場合のＸ値であり、ＨｉｌｌＳｌｏｐｅは、曲線の傾きである。
検出したところ、複合体１の体外ｐｓｉＣＨＥＣＫ系におけるＩＣ５０は０．０１７４ｎＭであり、本開示のｓｉＲＮＡ複合体が体外で高い活性を有することが示された。
（実験例１－３）体外細胞系におけるＩＣ５０の測定
本実験例では、複合体２による体外Ｈｕｈ７細胞におけるＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡ発現量に対する抑制効率を調べた。
ＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅＴＭ ２０００を用いて複合体２をヒト肝がん細胞株Ｈｕｈ７にトランスフェクションし、ｓｉＲＮＡ複合体の最終濃度（ｓｉＲＮＡの量として）が３ｎＭから、０．００４ｎＭまで７個の濃度に３倍希釈された。各濃度につき２つの複製ウェルがあった。
蛍光定量的リアルタイムＰＣＲ（Ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅ Ｒｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ）によりそれぞれ各濃度の複合体２がトランスフェクションされたＨｕｈ７細胞におけるＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡの発現量を検出した。具体的な工程としては、トランスフェクションした細胞を２４時間培養した後、Ｔｒｉｚｏｌ（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ社）を用いて全ＲＮＡ抽出の標準操作手順により細胞における全ＲＮＡを抽出し、それぞれ１μｇの全ＲＮＡをとり、逆転写キット（Ｐｒｏｍｅｇａ社、番号Ａ３５００）を用いてその説明書の操作方法により逆転写してｃＤＮＡを得た。２×Ｕｌｔｒａ ＳＹＢＲ Ｍｉｘｔｕｒｅ（ｗｉｔｈ ＲＯＸ）（北京康為世紀生物科技有限公司、番号ＣＷ０９５６）キットを用い、ｃＤＮＡをテンプレートとして説明書の工程によりＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡ発現量を検出した。ＡＰＯＣ３及び内因性参照遺伝子であるβ－ａｃｔｉｎの増幅のためのＰＣＲプライマーは、表４に示すとおりである。
ＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡ発現量は、ＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡ発現量＝［（試験群ＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡの発現量／試験群β－Ａｃｔｉｎ ｍＲＮＡの発現量）／（対照群ＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡの発現量／対照群β－Ａｃｔｉｎ ｍＲＮＡの発現量）］×１００％という等式により算出された。
複合体によるＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡ発現量に対する抑制率は、抑制率＝（１－ＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡ発現量）×１００％という等式により算出された。ここで、各試験群は、それぞれ各濃度の複合体２で処理されたＨｕｈ７細胞であり、対照群は、複合体２で処理されていないＨｕｈ７細胞であった。
異なる濃度の複合体２で測定されたＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡ発現量に対する抑制率から、実験例１－２と同じ方法によりＩＣ５０を算出したところ、複合体２の体外Ｈｕｈ７細胞におけるＩＣ５０は０．００８５ｎＭであり、本開示のｓｉＲＮＡ複合体が体外で高い活性を有することが示された。
（実験例２）本実験で本開示のｓｉＲＮＡ複合体による体内（ｉｎ ｖｉｖｏ）でのＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡ発現量に対する抑制効率を調べた
（実験例２－１）本実験例では、複合体１によるヒトＡＰＯＣ３トランスジェニックマウス体内での肝臓組織におけるＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡ発現量に対する抑制率を調べた。
トリグリセリドの含有量が２ｍｍｏｌ／Ｌ以上であるように、ヒトＡＰＯＣ３トランスジェニックマウス（Ｂ６、ＣＢＡ－Ｔｇ（ＡＰＯＣ３）３７０７Ｂｒｅｓ／Ｊ）を５匹／群でランダムに分け、それぞれ各群のマウスに複合体１、比較複合体１及び生理食塩水ＮＳを投与した。全ての動物について、体重に応じて投与量を算出し、皮下注射により単回投与し、ｓｉＲＮＡ複合体の用量（ｓｉＲＮＡの量として）は１ｍｇ／ｋｇ及び０．１ｍｇ／ｋｇの２つの用量群であり、複合体が、それぞれ濃度０．２ｍｇ／ｍｌ及び０．０２ｍｇ／ｍｌの０．９％塩化ナトリウム水溶液として提供され、投与体積が５ｍＬ／ｋｇであった。薬剤投与後１４日にマウスを死亡させ、肝臓を回収し、ＲＮＡ ｌａｔｅｒ（Ｓｉｇｍａ Ａｌｄｒｉｃｈ社）で保存し、その後、組織ホモジナイザーで肝組織をホモジナイズし、さらにＴｒｉｚｏｌ（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ社）で全ＲＮＡ抽出の標準操作手順により抽出して肝組織の全ＲＮＡを得た。
実験例１－３と同じ蛍光定量的リアルタイムＰＣＲ方法により肝組織におけるＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡの発現量を検出した。当該蛍光定量的ＰＣＲ法では、β－アクチン（β－ａｃｔｉｎ）遺伝子を内因性参照遺伝子とし、ＡＰＯＣ３に対するプライマー及びβ－アクチンに対するプライマーを用いてそれぞれＡＰＯＣ３及びβ－アクチンの発現量を検出した。
検出プライマーの配列を表５に示した。
肝臓におけるＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡの発現量及び複合体によるＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡに対する抑制率の算出は、実験例１－３と同じであった。対照群は、本実験において生理食塩水を加えた対照群マウスであり、各試験群は、それぞれ異なるｓｉＲＮＡ複合体が施された投与群マウスであった。結果を図２に示した。
結果から、複合体１は、トランスジェニックマウスにおけるヒトＡＰＯＣ３遺伝子に対して顕著な抑制作用を有することが示された。
（実験例２－２）本実験例では、複合体１によるカニクイザル体内での肝臓組織におけるＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡ発現量に対する抑制率、及び脂質レベルに対する影響を調べた。
当該実験例は、蘇州華測生物技術有限公司に委託して行われた。２～４ｋｇの年齢３～５歳のカニクイザルを１雄１雌／群で２群にランダムに分け、それぞれ複合体１及び比較複合体２を投与した。全ての動物について、体重に応じて投与量を算出し、皮下注射により単回投与し、ｓｉＲＮＡ複合体の用量（ｓｉＲＮＡの量として）が３ｍｇ／ｋｇであり、複合体がそれぞれ濃度３ｍｇ／ｍｌの塩化ナトリウム注射液（山東科倫薬業有限公司）として提供され、投与体積が１ｍＬ／ｋｇであった。最初投与当日を試験の１日目（Ｄ１）として定義し、薬剤投与前１日を０日目（Ｄ０）とした。
薬剤投与前と薬剤投与後の７、１４、２１、２８日目に動物に対して静脈採血を行い、各時点で血清における、脂質（総コレステロールＣＨＯ、トリグリセリドＴＧ）及びトランスアミナーゼ（アスパラギン酸アミノトランスフェラーゼＡＳＴ、アラニンアミノトランスフェラーゼＡＬＴ）である被験物の含有量を検出した。被験物を標準化処理し、各被験物の抑制率は、抑制率＝（１－薬剤投与後の試験群における被験物の含有量／薬剤投与前の試験群における被験物の含有量）×１００％という等式により算出された。トリグリセリドに対する抑制率を表６に示した。
薬剤投与後の各検出点でのトランスアミナーゼの含有量を検出したところ、肝機能異常は認められなかった。
薬剤投与後の２８日目に動物を死亡させ、肝臓を摘出した。だいたい観察したところ、顕著な異常が認められなかった。実験例２－１と同じ方法により肝組織ＲＮＡを抽出し、肝臓におけるＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡの発現量を検出した。検出プライマーの配列を表７に示した。
蛍光定量的リアルタイムＰＣＲにより検出したところ、比較複合体２に対して、複合体１は、雌性動物のＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡに対する抑制率が５５．３％であり、雄性動物のＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡに対する抑制率が７８．５％であった。
当該実験から、複合体１は、非ヒト霊長類におけるＡＰＯＣ３遺伝子に対して同様に顕著な抑制作用を有し、血清ＴＧに対しても顕著な抑制作用を有し、同時に肝機能異常が検出されなかったことが示された。
（実験例３）本実験で本開示のｓｉＲＮＡ複合体による体内（ｉｎ ｖｉｖｏ）での脂質の含有量に対する影響を調べた
（実験例３－１）本実験例では、複合体１によるヒトＡＰＯＣ３トランスジェニックマウス体内での血清中総コレステロール（ＣＨＯ）及びトリグリセリド（ＴＧ）の含有量に対する影響を調べた。
ＴＧ含有量＞２ｍｍｏｌ／Ｌであるように、ヒトＡＰＯＣ３トランスジェニックマウス（Ｂ６、ＣＢＡ－Ｔｇ（ＡＰＯＣ３）３７０７Ｂｒｅｓ／Ｊ）を７匹／群で、（１）生理食塩水対照群、（２）３ｍｇ／ｋｇの複合体１群、（３）１ｍｇ／ｋｇの複合体１群にランダムに分けた。全ての動物について、体重に応じて投与量を算出し、皮下注射により単回投与し、ｓｉＲＮＡ複合体がそれぞれ濃度０．６ｍｇ／ｍｌ及び０．２ｍｇ／ｍｌの０．９％塩化ナトリウム水溶液として提供され、投与体積が５ｍＬ／ｋｇであった。
それぞれ薬剤投与前（０日目と記録する）、及び薬剤投与後の７、１４、２１、２８、３５、４２、４９、６３、７７、９１、１１２、１３３、１４７、１５４、１６１、１７５、１８９日目にマウスに対して眼窩静脈叢採血を行い、各時点で血清におけるＣＨＯ及びＴＧレベルを検出した。
眼窩採血１回あたり約１００μＬとし、遠心後血清が２０μＬ以上とし、さらにＰＭ１Ｐ０００／３全自動血清生化学分析装置（ＳＡＢＡ、イタリア）を用いて血清中総コレステロール（ＣＨＯ）及びトリグリセリド（ＴＧ）の含有量を検出した。
標準化された脂質レベル＝（薬剤投与後の試験群における脂質の含有量／薬剤投与前の試験群における脂質の含有量）×１００％。
脂質レベルの抑制率＝（１－薬剤投与後の試験群における脂質の含有量／薬剤投与前の試験群における脂質の含有量）×１００％。脂質は、総コレステロール又はトリグリセリドを指す。
検出結果を図３Ａと３Ｂに示した。
図３Ａと３Ｂから分かるように、薬剤投与後の異なる時点で、複合体１は、１８９日間と長期間にわたって、明らかなマウス血清中ＴＧ及びＣＨＯの低下効果を示し、ＡＰＯＣ３遺伝子の発現を長期間安定的で効率的に抑制することができることが示された。
（実験例３－２）本実験例では、複合体２によるヒトＡＰＯＣ３トランスジェニックマウス体内での血清中総コレステロール（ＣＨＯ）及びトリグリセリド（ＴＧ）の含有量に対する影響を調べた。
８匹／群でマウスを分け、投与された複合体が複合体２であり、０．１、０．３、１、３、９ｍｇ／ｋｇの５つの用量群でそれぞれ投与し、投与体積を変化させず、複合体溶液の濃度を相応に調整し、薬剤投与後１１２日目まで試験を続けたこと以外、実験例３－１と同じ方法により検出した。結果を図４Ａと４Ｂに示した。
図４Ａと４Ｂの結果から分かるように、複合体２は、１１２日間と長期間にわたってトランスジェニックマウスにおけるＴＧ及びＣＨＯレベルを顕著に低下させることができ、当該低下効果は、明らかな用量依存効果があった。
（実験例３－３）本実験例で、複合体１～３によるヒトＡＰＯＣ３トランスジェニックマウス体内での血清中総コレステロール（ＣＨＯ）及びトリグリセリド（ＴＧ）の含有量に対する影響を比較した。
６匹／群でマウスを分け、それぞれ複合体１、２、３及び比較複合体３を投与し、各複合体を１ｍｇ／ｋｇ及び３ｍｇ／ｋｇの２つの用量群で投与し、投与体積を変化させず、複合体溶液の濃度を相応的に調整し、薬剤投与後１１２日目まで試験時間としたこと以外、実験例３－１と同じ方法によりマウスの血清総コレステロール（ＣＨＯ）及び総脂質（ＴＧ）を測定した。結果を図５Ａ～図５Ｄに示した。
図５Ａ～図５Ｄの結果から分かるように、１１２日間と長期間にわたって、本開示の複合体１～３は、異なる用量でいずれもトランスジェニックマウスにおける脂質に対して持続的な低下作用を示し、当該持続的な低下効果は、全体として比較複合体３よりも優れていた。
上記結果から明らかなように、本開示により提供される複合体は、肝臓におけるＡＰＯＣ３ ｍＲＮＡの発現を効率的に低下させ、血中総コレステロール、トリグリセリドの含有量を低下させることができ、脂質異常を予防及び／又は治療することができ、臨床への応用の将来性がある。
以上に本開示のいくつかの実施形態を詳しく記載したが、本開示は、上記実施形態の具体的な細部に限定されず、本開示の技術的思想の範囲で、本開示の技術的解決手段に対して複数種の簡単な変形をすることができ、これらの簡単な変形は、いずれも本開示の保護範囲に属する。
このほかに説明すべきこととして、上記いくつかの実施形態に記載された各具体的な技術的特徴は、矛盾がない場合、任意の適切な方法により組み合わせることができ、不必要な重複を避けるために、本開示では各種の可能な組合せ方法を別途説明しない。
また、本開示の各種の異なる実施形態は任意に組み合わせることもでき、本開示の精神から逸脱しない限り、その組み合わせも同様に、本開示に開示された内容とみなすべきである。

Claims (25)

  1. 式（１）に示される構造を有し、肝細胞におけるＡＰＯＣ３遺伝子の発現を抑制する、ｓｉＲＮＡ複合体：
    式中、
    ｎ１は、１～３から選択される整数であり、ｎ３は、０～４から選択される整数であり、ｍ１、ｍ２及びｍ３は独立して、２～１０から選択される整数であり、
    Ｒ１０、Ｒ１１、Ｒ１２、Ｒ１３、Ｒ１４及びＲ１５はそれぞれ独立して、Ｈであるか、又はＣ１－Ｃ１０アルキル基、Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基及びＣ１－Ｃ１０アルコキシ基からなる群から選択され、
    Ｒ３は式Ａ５９に示される構造の基であり、
    式中、Ｅ１はＯＨ、ＳＨ又はＢＨ２であり、ＮｕはｓｉＲＮＡであり、
    前記ｓｉＲＮＡにおける各ヌクレオチドはそれぞれ独立して修飾又は未修飾のヌクレオチドであり、前記ｓｉＲＮＡはセンス鎖とアンチセンス鎖を含み、前記センス鎖はヌクレオチド配列１を含み、前記アンチセンス鎖はヌクレオチド配列２を含み、前記ヌクレオチド配列１と前記ヌクレオチド配列２とが、少なくとも一部で逆相補的に二本鎖領域を形成し、前記ヌクレオチド配列１は、配列番号１に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、且つヌクレオチド差異が１つ以下であり、前記ヌクレオチド配列２は、配列番号２に示されるヌクレオチド配列と長さが等しく、且つヌクレオチド差異が１つ以下であり、
    ５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺ－３’（配列番号１）、
    ５’－Ｚ’ＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧ－３’（配列番号２）
    ただし、ＺはＡであり、Ｚ’はＵであり、
    前記ヌクレオチド配列１に、位置がＺに対応するヌクレオチドＺＡが含まれ、前記ヌクレオチド配列２に、位置がＺ’に対応するヌクレオチドＺ’Ｂが含まれ、前記Ｚ’Ｂは、前記アンチセンス鎖の５’末端の１番目のヌクレオチドであり、前記センス鎖とアンチセンス鎖とは、長さが同じか又は異なり、前記センス鎖の長さが１９～２３ヌクレオチドであり、前記アンチセンス鎖の長さが１９～２６ヌクレオチドであり、
    Ｒ２は、長さ１～２０の炭素原子の直鎖アルキレン基であり、そのうちの１又は複数の炭素原子が、Ｃ（Ｏ）、ＮＨ、Ｏ、Ｓ、ＣＨ=Ｎ、Ｓ（Ｏ）２、Ｃ２－Ｃ１０アルケニレン基、Ｃ２－Ｃ１０アルキニレン基、Ｃ６－Ｃ１０アリーレン基、Ｃ３－Ｃ１８ヘテロシクリレン基及びＣ５－Ｃ１０ヘテロアリーレン基からなる群から選択される１又は複数で任意に置換され、Ｒ２は、Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、Ｃ６－Ｃ１０アリール基、Ｃ５－Ｃ１０ヘテロアリール基、Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、－ＯＣ１－Ｃ１０アルキル基、－ＯＣ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＯＨ、－ＯＣ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、－ＳＣ１－Ｃ１０アルキル基、－ＳＣ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＳＨ、－ＳＣ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、ハロゲン置換基、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＨ２、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＮＨ２、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、シアノ基、ニトロ基、－ＣＯ２Ｈ、－Ｃ（Ｏ）Ｏ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮＨ２、－ＮＨＣ（Ｏ）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨＣ（Ｏ）（フェニル基）、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル）Ｃ（Ｏ）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル）Ｃ（Ｏ）（フェニル基）、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０ハロアルキル基、－ＯＣ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、－ＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＳＯ２（フェニル基）、－ＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基）、－ＳＯ２ＮＨ２、－ＳＯ２ＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＳＯ２ＮＨ（フェニル基）、－ＮＨＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨＳＯ２（フェニル基）及び－ＮＨＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基）からなる群のいずれか１つ又は複数の置換基を任意に有してもよく、
    各Ｌ１は、長さ１～７０の炭素原子の直鎖アルキレン基であり、そのうちの１又は複数の炭素原子が、Ｃ（Ｏ）、ＮＨ、Ｏ、Ｓ、ＣＨ=Ｎ、Ｓ（Ｏ）２、Ｃ２－Ｃ１０アルケニレン基、Ｃ２－Ｃ１０アルキニレン基、Ｃ６－Ｃ１０アリーレン基、Ｃ３－Ｃ１８ヘテロシクリレン基及びＣ５－Ｃ１０ヘテロアリーレン基からなる群から選択される１又は複数で任意に置換され、Ｌ１は、Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、Ｃ６－Ｃ１０アリール基、Ｃ５－Ｃ１０ヘテロアリール基、Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、－ＯＣ１－Ｃ１０アルキル基、－ＯＣ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＯＨ、－ＯＣ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、－ＳＣ１－Ｃ１０アルキル基、－ＳＣ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＳＨ、－ＳＣ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基、ハロゲン置換基、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＨ２、－Ｃ１－Ｃ１０アルキル－ＮＨ２、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、シアノ基、ニトロ基、－ＣＯ２Ｈ、－Ｃ（Ｏ）Ｏ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＣＯＮＨ２、－ＮＨＣ（Ｏ）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨＣ（Ｏ）（フェニル基）、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル）Ｃ（Ｏ）（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－Ｎ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル）Ｃ（Ｏ）（フェニル基）、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキルフェニル基、－Ｃ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０ハロアルキル基、－ＯＣ（Ｏ）Ｃ１－Ｃ１０アルキル基、－ＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＳＯ２（フェニル基）、－ＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基）、－ＳＯ２ＮＨ２、－ＳＯ２ＮＨ（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＳＯ２ＮＨ（フェニル基）、－ＮＨＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０アルキル基）、－ＮＨＳＯ２（フェニル基）及び－ＮＨＳＯ２（Ｃ１－Ｃ１０ハロゲン化アルキル基）からなる群のいずれか１つ又は複数の置換基を任意に有してもよく、
    は、基が分子の残りの部分に結合される部位を表し、
    Ｍ１は標的基を表す。
  2. 各Ｌ１が、式Ａ１～Ａ１９及びＡ２１～Ａ２６の基から独立して選択される１又は複数の結合の組合せである、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体：
    式中、ｊ１は１～２０の整数であり、ｊ２は１～２０の整数であり、
    Ｒ’はＣ１－Ｃ１０のアルキル基であり、
    Ｒａは、式Ａ２７～Ａ３１、Ａ３４～Ａ３６、Ａ４０、Ａ４３若しくはＡ４５の基又はその任意の組合せからなる群から選択され、
    ＲｂはＣ１－Ｃ１０のアルキル基である。
  3. Ｌ１が、Ａ１、Ａ４、Ａ５、Ａ６、Ａ８、Ａ１０、Ａ１１、Ａ１３から選択される１又は複数の結合の組合せである、又は、Ｌ１が、Ａ１、Ａ４、Ａ８、Ａ１０及びＡ１１から選択される少なくとも２つの結合の組合せである、請求項２に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  4. Ｌ１の長さが３～２５個又は４～１５個の原子である、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  5. ｍ１、ｍ２及びｍ３がそれぞれ独立して２～５の整数である、又は、ｍ１＝ｍ２＝ｍ３である、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  6. 各前記標的基が独立して哺乳動物の肝細胞表面のアシアロ糖タンパク質受容体（ＡＳＧＰＲ）と親和性のあるリガンドである、又は、
    各前記標的基が、Ｄ－マンノピラノース、Ｌ－マンノピラノース、Ｄ－アラビノース、Ｄ－キシロフラノース、Ｌ－キシロフラノース、Ｄ－グルコース、Ｌ－グルコース、Ｄ－ガラクトース、Ｌ－ガラクトース、α－Ｄ－マンノフラノース、β－Ｄ－マンノフラノース、α－Ｄ－マンノピラノース、β－Ｄ－マンノピラノース、α－Ｄ－グルコピラノース、β－Ｄ－グルコピラノース、α－Ｄ－グルコフラノース、β－Ｄ－グルコフラノース、α－Ｄ－フルクトフラノース、α－Ｄ－フルクトピラノース、α－Ｄ－ガラクトピラノース、β－Ｄ－ガラクトピラノース、α－Ｄ－ガラクトフラノース、β－Ｄ－ガラクトフラノース、グルコサミン、シアル酸、ガラクトサミン、Ｎ－アセチルガラクトサミン、Ｎ－トリフルオロアセチルガラクトサミン、Ｎ－プロピオニルガラクトサミン、Ｎ－ｎ－ブチリルガラクトサミン、Ｎ－イソブチリルガラクトサミン、２－アミノ－３－Ｏ－［（Ｒ）－１－カルボキシエチル］－２－デオキシ－β－Ｄ－グルコピラノース、２－デオキシ－２－メチルアミノ－Ｌ－グルコピラノース、４，６－ジデオキシ－４－ホルムアミド－２，３－ジ－Ｏ－メチル－Ｄ－マンノピラノース、２－デオキシ－２－スルホアミノ－Ｄ－グルコピラノース、Ｎ－グリコリル－α－ノイラミン酸、５－チオ－β－Ｄ－グルコピラノース、メチル２，３，４－トリス－Ｏ－アセチル－１－チオ－６－Ｏ－トリチル－α－Ｄ－グルコピラノシド、４－チオ－β－Ｄ－ガラクトピラノース、エチル３，４，６，７－テトラ－Ｏ－アセチル－２－デオキシ－１，５－ジチオ－α－Ｄ－グルコヘプトピラノシド、２，５－アンヒドロ－Ｄ－アロニトリル、リボース、Ｄ－リボース、Ｄ－４－チオリボース、Ｌ－リボース、Ｌ－４－チオリボースから独立して選択される１つである、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  7. Ｒ２には、窒素含有骨格中のＮに結合される部位及びＲ３におけるＰに結合される部位がともに含まれ、Ｒ２上の前記窒素含有骨格中のＮに結合される部位がＮとアミド結合を形成し、前記Ｒ３におけるＰに結合される部位がＰとリン酸エステル結合を形成し、
    Ｒ２がＢ５、Ｂ６、Ｂ５’又はＢ６’から選択され、
    式中、
    は、基が共有結合的に結合する部位を表し、ｑ２は１～１０の整数である、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  8. 式（３）、（４）、（５）、（６）、（７）、（８）、（９）、（１０）、（１１）、（１２）、（１３）、（１４）、（１５）、（１６）、（１７）、（１８）、（１９）、（２０）、（２１）又は（２２）に示される構造を有する、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体：
  9. 式Ａ５９におけるＰが前記ｓｉＲＮＡのセンス鎖の３’末端に結合される、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  10. 前記ヌクレオチド配列２と配列番号２に示されるヌクレオチド配列との間のヌクレオチド差異が、Ｚ’Ｂの位置での差異を含み、Ｚ’Ｂが、Ａ、Ｃ又はＧから選択される、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  11. 前記センス鎖がヌクレオチド配列３をさらに含み、前記アンチセンス鎖がヌクレオチド配列４をさらに含み、前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４の長さがそれぞれ１～４ヌクレオチドであり、前記ヌクレオチド配列３が前記ヌクレオチド配列１の５’末端に結合され、前記ヌクレオチド配列４が前記ヌクレオチド配列２の３’末端に結合され、前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４の長さが等しく、かつ実質的に逆相補的又は完全に逆相補的であり、前記実質的に逆相補的であるとは、２つのヌクレオチド配列間に１つ以下の塩基ミスマッチが存在することを指し、完全に逆相補的であるとは、２つのヌクレオチド配列間にミスマッチがないことを指し、
    前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４の長さがいずれも１ヌクレオチドであり、前記ヌクレオチド配列３の塩基がＣである、或いは、
    前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４の長さがいずれも２ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、ヌクレオチド配列３の塩基が順にＣ及びＣである、或いは、
    前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４の長さがいずれも３ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列３の塩基が順にＵ、Ｃ及びＣである、或いは、
    前記ヌクレオチド配列３と前記ヌクレオチド配列４の長さがいずれも４ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列３の塩基が順にＣ、Ｕ、Ｃ及びＣである、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  12. 前記ｓｉＲＮＡは、ヌクレオチド配列５をさらに含み、前記ヌクレオチド配列５は、長さが１～３ヌクレオチドであり、前記アンチセンス鎖の３’末端に結合され、前記アンチセンス鎖の３’オーバーハング端を構成する、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  13. 前記ヌクレオチド配列５は、長さが２ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、連続した２個のチミンデオキシリボヌクレオチド、連続した２個のウラシルリボヌクレオチド、又は標的ｍＲＮＡと相補的な２つのヌクレオチドである、請求項１２に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  14. 前記センス鎖が配列番号６０に示されるヌクレオチド配列を含み、前記アンチセンス鎖が配列番号３に示されるヌクレオチド配列を含み、
    ５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺＡ－３’（配列番号６０）、
    ５’－Ｚ’ＢＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧＧＧ－３’（配列番号３）
    或いは、前記センス鎖が配列番号４に示されるヌクレオチド配列を含み、前記アンチセンス鎖が配列番号５に示されるヌクレオチド配列を含み、
    ５’－ＣＣＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＺＡ－３’（配列番号４）、
    ５’－Ｚ’ＢＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧＧＧＡＧ－３’（配列番号５）
    ただし、前記Ｚ’Ｂがアンチセンス鎖の５’末端の１番目のヌクレオチドであり、ＺＡがＡ、Ｕ、Ｇ又はＣから選択され、Ｚ’ＢがＺＡと相補的なヌクレオチドである、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  15. 前記ｓｉＲＮＡがセンス鎖：５’－ＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＡ－３’（配列番号６）及びアンチセンス鎖：５’－ＵＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧＧＧ－３’（配列番号７）を有するｓｉＡＰ１、又は、センス鎖：５’－ＣＣＣＡＡＵＡＡＡＧＣＵＧＧＡＣＡＡＧＡＡ－３’（配列番号８）及びアンチセンス鎖：５’－ＵＵＣＵＵＧＵＣＣＡＧＣＵＵＵＡＵＵＧＧＧＡＧ－３’（配列番号９）を有するｓｉＡＰ２である、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  16. 前記センス鎖と前記アンチセンス鎖における各ヌクレオチドが独立してフルオロ修飾ヌクレオチド又は非フルオロ修飾ヌクレオチドであり、フルオロ修飾ヌクレオチドとは、ヌクレオチドのリボース基の２’位のヒドロキシ基がフッ素で置換されたヌクレオチドを指し、非フルオロ修飾ヌクレオチドとは、ヌクレオチドのリボース基の２’位のヒドロキシ基が非フッ素化基で置換されたヌクレオチド又はヌクレオチドアナログを指し、
    前記フルオロ修飾ヌクレオチドがヌクレオチド配列１とヌクレオチド配列２に位置し、
    ５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列１の第７、８及び９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、
    ５’末端から３’末端に向かって、前記ヌクレオチド配列２の第２、６、１４及び１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドである、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  17. 各非フルオロ修飾ヌクレオチドがいずれもメトキシ修飾ヌクレオチドであり、前記メトキシ修飾ヌクレオチドが、リボース基の２’－ヒドロキシ基がメトキシで置換されたヌクレオチドを指す、請求項１６に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  18. ５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのセンス鎖におけるヌクレオチド配列１の第５、７、８及び９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのセンス鎖の他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖におけるヌクレオチド配列２の第２、６、８、９、１４及び１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖の他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドである、又は、
    ５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのセンス鎖におけるヌクレオチド配列１の第７、８及び９位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのセンス鎖の他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドであり、５’末端から３’末端に向かって、前記ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖におけるヌクレオチド配列２の第２、６、１４及び１６位のヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであり、ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖の他の位置のヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドである、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  19. 前記ｓｉＲＮＡが、ｓｉＡＰ１－Ｍ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ１、ｓｉＡＰ１－Ｍ２、ｓｉＡＰ２－Ｍ２のいずれか１つである、請求項１～１８のいずれか１項に記載のｓｉＲＮＡ複合体：
    ｓｉＡＰ１－Ｍ１
    センス鎖：５’－ＣｍＡｍＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１０）
    アンチセンス鎖：５’－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍ－３’（配列番号１１）
    ｓｉＡＰ２－Ｍ１
    センス鎖：５’－ＣｍＣｍＣｍＡｍＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１２）
    アンチセンス鎖：５’－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍＡｍＧｍ－３’（配列番号１３）
    ｓｉＡＰ１－Ｍ２
    センス鎖：５’－ＣｍＡｍＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１４）
    アンチセンス鎖：５’－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍ－３’（配列番号１５）
    ｓｉＡＰ２－Ｍ２
    センス鎖：５’－ＣｍＣｍＣｍＡｍＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１６）
    アンチセンス鎖：５’－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍＡｍＧｍ－３’（配列番号１７）
    ただし、大文字Ｃ、Ｇ、Ｕ、Ａはヌクレオチドの塩基組成を表し、小文字ｍは、当該文字ｍの左側に隣接する１つのヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドであることを表し、小文字ｆは、当該文字ｆの左側に隣接する１つのヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであることを表す。
  20. 前記ｓｉＲＮＡにおいて、少なくとも１つのリン酸エステル基がチオリン酸エステル基であり、該チオリン酸エステル基が、
    前記センス鎖の５’末端から１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、
    前記センス鎖の５’末端から２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間、
    前記センス鎖の３’末端から１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、
    前記センス鎖の３’末端から２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間、
    前記アンチセンス鎖の５’末端から１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、
    前記アンチセンス鎖の５’末端から２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間、
    前記アンチセンス鎖の３’末端から１番目のヌクレオチドと２番目のヌクレオチドとの間、及び
    前記アンチセンス鎖の３’末端から２番目のヌクレオチドと３番目のヌクレオチドとの間からなる群より選ばれる少なくとも１つに結合されて存在する、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  21. 前記ｓｉＲＮＡが、ｓｉＡＰ１－Ｍ１Ｓ、ｓｉＡＰ２－Ｍ１Ｓ、ｓｉＡＰ１－Ｍ２Ｓ及びｓｉＡＰ２－Ｍ２Ｓのいずれか１つである、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体：
    ｓｉＡＰ１－Ｍ１Ｓ
    センス鎖：５’－ＣｍｓＡｍｓＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１８）
    アンチセンス鎖：５’－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍｓＧｍｓＧｍ－３’（配列番号１９）
    ｓｉＡＰ２－Ｍ１Ｓ
    センス鎖：５’－ＣｍｓＣｍｓＣｍＡｍＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号２０）
    アンチセンス鎖：５’－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍｓＡｍｓＧｍ－３’（配列番号２１）
    ｓｉＡＰ１－Ｍ２Ｓ
    センス鎖：５’－ＣｍｓＡｍｓＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号２２）
    アンチセンス鎖：５’－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍｓＧｍｓＧｍ－３’（配列番号２３）
    ｓｉＡＰ２－Ｍ２Ｓ
    センス鎖：５’－ＣｍｓＣｍｓＣｍＡｍＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号２４）
    アンチセンス鎖：５’－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍｓＡｍｓＧｍ－３’（配列番号２５）
    ただし、大文字Ｃ、Ｇ、Ｕ、Ａはヌクレオチドの塩基組成を表し、小文字ｍは、当該文字ｍの左側に隣接する１つのヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドであることを表し、小文字ｆは、当該文字ｆの左側に隣接する１つのヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであることを表し、小文字ｓは、当該文字ｓの左右に隣接する２つのヌクレオチド間がチオリン酸エステル基により結合されていることを表す。
  22. 前記アンチセンス鎖の５’末端のヌクレオチドが、５’－リン酸ヌクレオチド又は５’－リン酸アナログ修飾ヌクレオチドである、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体。
  23. 前記ｓｉＲＮＡが、ｓｉＡＰ１－Ｍ１Ｐ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ１Ｐ１、ｓｉＡＰ１－Ｍ２Ｐ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ２Ｐ１、ｓｉＡＰ１－Ｍ１ＳＰ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ１ＳＰ１、ｓｉＡＰ１－Ｍ２ＳＰ１、ｓｉＡＰ２－Ｍ２ＳＰ１のいずれか１つである、請求項１に記載のｓｉＲＮＡ複合体：
    ｓｉＡＰ１－Ｍ１Ｐ１
    センス鎖：５’－ＣｍＡｍＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１０）
    アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍ－３’（配列番号２６）
    ｓｉＡＰ２－Ｍ１Ｐ１
    センス鎖：５’－ＣｍＣｍＣｍＡｍＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１２）
    アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍＡｍＧｍ－３’（配列番号２７）
    ｓｉＡＰ１－Ｍ２Ｐ１
    センス鎖：５’－ＣｍＡｍＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１４）
    アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍ－３’（配列番号２８）
    ｓｉＡＰ２－Ｍ２Ｐ１
    センス鎖：５’－ＣｍＣｍＣｍＡｍＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１６）
    アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍＵｆＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍＡｍＧｍ－３’（配列番号２９）
    ｓｉＡＰ１－Ｍ１ＳＰ１
    センス鎖：５’－ＣｍｓＡｍｓＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号１８）
    アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍｓＧｍｓＧｍ－３’（配列番号３０）
    ｓｉＡＰ２－Ｍ１ＳＰ１
    センス鎖：５’－ＣｍｓＣｍｓＣｍＡｍＡｍＵｍＡｆＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号２０）
    アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｆＣｆＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍｓＡｍｓＧｍ－３’（配列番号３１）
    ｓｉＡＰ１－Ｍ２ＳＰ１
    センス鎖：５’－ＣｍｓＡｍｓＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号２２）
    アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍｓＧｍｓＧｍ－３’（配列番号３２）
    ｓｉＡＰ２－Ｍ２ＳＰ１
    センス鎖：５’－ＣｍｓＣｍｓＣｍＡｍＡｍＵｍＡｍＡｍＡｆＧｆＣｆＵｍＧｍＧｍＡｍＣｍＡｍＡｍＧｍＡｍＡｍ－３’（配列番号２４）
    アンチセンス鎖：５’－Ｐ１－ＵｍｓＵｆｓＣｍＵｍＵｍＧｆＵｍＣｍＣｍＡｍＧｍＣｍＵｍＵｆＵｍＡｆＵｍＵｍＧｍＧｍＧｍｓＡｍｓＧｍ－３’（配列番号３３）
    ただし、大文字Ｃ、Ｇ、Ｕ、Ａはヌクレオチドの塩基組成を表し、小文字ｍは、当該文字ｍの左側に隣接する１つのヌクレオチドがメトキシ修飾ヌクレオチドであることを表し、小文字ｆは、当該文字ｆの左側に隣接する１つのヌクレオチドがフルオロ修飾ヌクレオチドであることを表し、小文字ｓは、当該文字の左右２個のヌクレオチド間がチオリン酸エステル基により結合されていることを表し、Ｐ１は、当該文字Ｐ１の右側に隣接する１つのヌクレオチドが５’－リン酸ヌクレオチド又は５’－リン酸アナログ修飾ヌクレオチドであることを表す。
  24. 脂質異常の治療のために用いられる、請求項１～２３のいずれか１項に記載のｓｉＲＮＡ複合体を含有する組成物。
  25. 肝細胞におけるＡＰＯＣ３遺伝子の発現の抑制のために用いられる、請求項１～２３のいずれか１項に記載のｓｉＲＮＡ複合体を含有する組成物。
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