JPH03500530A - 新規な両親媒性核酸接合体 - Google Patents
新規な両親媒性核酸接合体Info
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- JPH03500530A JPH03500530A JP63505633A JP50563388A JPH03500530A JP H03500530 A JPH03500530 A JP H03500530A JP 63505633 A JP63505633 A JP 63505633A JP 50563388 A JP50563388 A JP 50563388A JP H03500530 A JPH03500530 A JP H03500530A
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
新規な両親媒性核酸接合体
止−!
狡止立国
この発明は、発現を抑制するための、溶解変調i負成分に接合した特異的ポリヌ
クレオチド結合ポリマーに関する。
者Jut避
細胞内発現の調節を可能とする試薬への興味と必要性力(増しつつあるが、この
試薬は、遺伝子と関連した様々な問題を解決する上で、至上の可能性をもつこと
になろう、そうし)ツた試薬、特に相補性核酸試薬は、ウィルス本来の遺(云子
の発現を抑制する抗ウィルス剤として使用できよう。また、これらは、抗新生物
剤としても作用し、ガン細胞の増殖率を丁番デたり、ガン全体の増殖を抑制する
可能性もある。これら試薬は、細胞内で未知の機序によって転写産物に結合し、
1季定の構造遺伝子の発現を抑制することになろう。
この可能性に関して相当の関心が持たれ、多くの培養実験によれば、この手法は
かなり有望視されること力(分力)ってきた。しかし、従来用いられていた数々
の手法にしま多くの欠点もある。治療用として有用な薬剤とするために番よ、こ
の試薬は、全身投与量を比較的低くできるように、低濃度で有効性を発揮せねば
ならない0次に、試薬は、比較的安定であって、様々なヌクレアーゼによる分解
に抵抗性を示す必要がある。
第三に、この試薬は、長いインキュベーション期間を回避するように、一度細胞
質に取り込まれたら迅速に拡散する必要があり、その相補的配列に極めて特異的
に結合しなければならない。第四に、試薬は、膜透過性があって、血中で濃度が
上昇しないように、低濃度で有効性を示さなければならない。
最後に、宿主の哺乳類への副作用が最小限であって、免疫反応を出来る限り押え
られるオリゴヌクレオチド試薬を提供する必要がある。こういった種々の基準は
、様々な程度で妥協が必要であるが、今まで製られた試薬は、一般的使用には逼
かに及ばなかった。
聚1文献
単一塩基のミスマツチへの高い感受性を保持し、最大の選択性が得られるような
、比較的短鎖のプローブの使用は、以下の論文に示唆されている。5zos t
akら、Methods Enzysol。
(1979) 68:419−429: Wu、 Nature New Bi
ology (1972) 236:198;ItakuraおよびRiggs
、 5cience (1980) 209:1401;Noyes、 J、B
iol、 Chel+1. (1979) 254: 7472−7475;
Noyesラット、 Proc、Natl、Acad、Sci、USA (19
79) 76:1770−1774;Agarwalら、 J、 Biol、
Chell、(1981) 256:1023−1028゜Tullisら、
Biochem、 Biophys、 Res、 Comm、(1980) 9
3:941;0rkinら、 J、 Cl1n、 Invst、(1983)
71ニア75; Connerら、Proc、 Natl、 Acad、 Sc
i、 USA (1983) 80:278; Piratsuら、New E
ng、 J、 Med、(1983) 309:284−287: Walla
ceら、 Gene(1981)16:21゜
ウィルスの複製を抑制する、特異的な核酸配列の使用に関する論文が、多数みら
れる。例えば、Zamecinkおよび5tephenson、Proc、Na
tl、Acad、Sci、USA (197B) 75:280−284HTu
llisら、 J、 Ce1lular Biochem、 5upp1. (
1984) 8A:58(要約); Kawasaki、 Nucl、 Ac1
ds、 Res、 (1985) 13:4991:Walderら、 5ci
ence (1986) 233:569−571; Zamecinkら、P
roc、 Natl、 Acad、 Sci、 USA (1986) 83:
4143−4146゜各種トリエステルおよびメチルホスホン酸などの修飾核酸
も、発現の抑制に有効と見られてきた。Millarら、Biochemstr
y(1974) 13:4887−4895HBarrettら、 上記の論文
(1974)13:4897−4906; Millerら、上記の論文(1
977)16:1988−1997;Millerら、Biochemistr
y (1985a、 b) 24:6132および6134;Sm1thら、
Proc、 ?Jat1. Acad、 Sci、 [ISA (1986)8
3:2787−91;Agrisら、 Biochemistry (1986
) 25:6268−6275;Millerら、Biochemistry
(1986) 25:5092−5097゜相補的配列への結合性を高める修飾
型核酸配列は、以下の論文に見られる。Vlassovら、Adv、 Eng、
Reg、 (1986):301−320; Summ、erton、 J、
Theor、 Biol、 (1979) 78ニア7−99; Knorr
e(1986) Adv、 Eng、 Reg、 1986:277−300゜
ポリエチレングリコールに結合するタンパク質の免疫源性の低下については、以
下の文献に記載されている。 TomasiおよびFallow、WO3610
4145(PCT10585102572); Abuchowskiら、Ca
ncer Biochem、 Biophys、 (1984) 7:175−
186 、米国特許第4.511.713号、および米国特許第4.587.0
44号も参照のこと。
主所少翌后
細胞内発現を調節するために、注目の配列に相補的な比較的短い核酸配列、リン
カ−1および最終産物に両親媒性、通常では親水性より疎水性(親水基によって
両親媒性が生じるような)を付与する基を含めて、新規な核酸複合体がいろいろ
と提供されている。核酸部分には、通常もしくは異なった糖、リン酸基もしくは
修飾リン酸基、または通常の塩基以外の塩基が含まれることがあり、そこでは、
修飾によって、対象の配列への結合が妨害されない、そういった組成物は、新生
物細胞、ウィルス感染細胞中でのウィルスタンパク質、ヒトならびに動物の病原
体の必須タンパク質(単数もしくは複数)なとで、tnRNAの成長および/ま
たは特定の構造遺伝子の発現を抑制するために用いられる。
豚!胆揉■脱ユ
この発明は、細胞内でのmRNAの成熟および/または構造遺伝子の発現を抑制
する、新規な核酸接合体を提供することを目的とする。各種の接合体には、比較
的短鎖のオリゴヌクレオチド配列、リンカ−1および両親媒性産物を形成するよ
うにHLB (親水性・親油性バランス)を変更する基が含まれている。生成物
の両親媒性は、細胞膜を介しての接合体の輸送に寄与し、核酸誘導体の水溶性の
増大(例えば、長鎖ホスホン酸メチルの水溶性を増大させるような両親媒性基の
使用)、およびエキソヌクレアーゼによる消化に対する正常核酸の安定性亢進な
どの利点がさらに得られる。
この発明の化合物は、はとんどが以下の一般式を有する。
Xは一般に、電子対、カルコゲン(酸素もしくはイオウ)、またはアミノ、特に
NHを示す。
Zは、天然型もしくは合成の糖残基を示し、それらは五炭糖の2’、3’ならび
に5′水酸基の2カ所および六炭糖での相当部位で結合したものである。一般に
、糖は、リボースもしくはデオキシリボース、またはその他、アラビノース、キ
シロース、グルコースもしくはガラクースなどの五炭糖もしくは六炭糖(特には
五炭糖)が適している。
Nは、天然のプリンもしくはピリミジンと結合やハイブリッド形成可能な天然も
しくは非天然塩基(プリンもしくはピリミジン)のいかなるものでもよく、これ
らプリンおよびピリミジンには、アデニン、シトシン、チミジン、グアニジンの
ような天然型デオキシリボースヌクレオシドのプリンおよびピリミジン、または
ウラシル、イノシンのような他のプリンおよびピリミジンなどが挙げられる。
Lは、少なくとも1原子の多機能基に由来するリンカ−であって、水素を除いた
約60個以下の原子、一般には約30個までの炭素原子を有する、水素を除いた
約30個以下の原子、通常では20個以下の炭素原子、および約10個までのへ
テロ原子、より一般には約6個までのへテロ原子、特にはカルコゲン、窒素、リ
ンなど、非オキソカルボ、ニル基(カルボキシカルボニル基)、オキソカルボニ
ル基(アルデヒドもしくはケトン)、またはそれらのイオウもしくは窒素含有原
子団、例えば、チオノ基、チオ基、イミジル基など、およびジスルフィド基、ア
ミノ基、ジアゾ基、ヒドラジノ基、オキシミノ基など、ホスフェート、ホスホノ
などを示す。
Mは、この分子に両親媒性、特にホスフェートに関して疎水性、ホスホネート(
これらの炭素:へテロ原子の比は、少なくとも2:1、通常では少なくとも3:
1、さらに20:工を越えるまで)に関して両親媒性を付与する溶解性調節成分
であって、少なくとも6個の炭素原子そして約30個以下の炭素原子を含む炭化
水素、ポリオキシ化合物(アルキレンオキシ化合物)を含むことがあり、これら
の化合物中では、酸素原子は約2ないし10個、通常では2ないし6個、好まし
くは2ないし3個の炭素原子と結合し、少な(とも約6単位、通常では約200
アルキレンオキシ単位以下、より一般には約100単位以下、好ましくは約60
単位以下であろう。
一方のYはLに対する結合子であって、他方のYは一価のオキシ、チオ、アミノ
、糖もしくはそれらの置換型官能基、または約20炭素原子未満のアルキル基、
通常では約6炭素原子未満、Pに結合した場合では、水素工ないし30原子、通
常では1ないし12原子のヒドロカルビル基もしくはアクリル基、または工ない
し4個のへテロ原子団(Zに結合する場合、オキシ、チオもしくはアミノ)を有
する置換型ヒドロカルビル基もしくはアクリル基である。
aは、少なくとも5、そして約50以下、通常では約35以下である。
リン成分には、ホスフェート、ホスホラミデート、ホスホルイミデート、ホスホ
ロチオエート、ホスホロチオネート、ホスホロチオレート、ホスホルアミドチオ
レート、ホスホネート、ホスホルイミデートなどが含まれる。
プリンおよびピリミジンには、チミジン、ウラシル、シトシン、6−メチルウラ
シル、4,6−シヒドロキシピリミジン、イソシトシン、ヒボキサンチン、キサ
ンチン、アデノシン、グアノシンなどが含まれる。
糖には、リボース、アラビノース、キシリロース、またはそれらのα−デオキシ
誘導体が挙げられる。その他のヌクレオシドとして、ヘキソースを利用すること
ができる。
多様なリンカ−を、末端ヌクレオチドの性質、リンカ−基がオリゴヌクレオチド
の合成中に存在するか否かで選択される官能基、溶解性調節成分上に存在する官
能基に応じて利用することができる。多数のリンカ−が市販されていて、多官能
化合物を連結するために用いられてきた。リンカ−には以下のようなものが含ま
れる。 0CHzCHJHCO(C)It)−CONH:0CHzCHzNHX
(CHz)−NH; OP(0)(OH)NHC)l(CHz)−CONH;
0CH2CHzN)IcOφS ; NH(CHり−NO; 0(CHz)−
0HO(CHzCHzNH)−: NH(CHり−5YN; Co(CHdll
COニー5cHzcnzco −; −0(CHzCHJH)a −; −NH
(CHz)acO; −3CHzC)lzCO; COφNYS ; (NCH
zCHz)−CRzN ;0(CO)NH(CHz)、、NH;通常では約50
0ないし2000ダルトンのポリグイシン、ポリリジン、ポリメチオニンなどの
アミノ酸のホモおよびコポリマー(電荷の有無に拘らない)。式中、Xは2.5
−キノンシルを示し、Yは、スクシニミジルを形成する(3−スクシンジオイル
)を示し、nは、通常では2ないし20の範囲、より一般には2ないし12であ
って、mは、1ないし10、通常では1ないし6である。
親油性/両親媒性基には、様々な原子団があり、脂肪族、芳香族、脂環式、複素
環式化合物、またはこれらの組み合わせが挙げられる。それらの化合物は、炭素
原子2個あたりへテロ原子1個または0個を有し、電荷の有無に拘らない、通常
では炭素数が少なくとも6、より一般には12、および約500以下、通常では
約200以下から成る。これらには以下のものが含まれる。炭素数が少なくとも
6、そして約30未満、通常では約24以下から成るアルキル基であって、炭素
数が少なくとも約6、通常では少なくとも約12、そして約24未満からなる脂
肪酸、脂肪酸の炭素数が一般には約12ないし24個の範囲にあるグリセリド(
それには、−mに2もしくは3位または再位置で1ないし2個の脂肪酸が付いて
いる)、1ないし4個の環を有する芳香族化合物、アルキレンの炭素数が2ない
し10、一般には2ないし6、より一般には2ないし3である、モノもしくはポ
リ環式、融合もしくは非融合のポリアルキレングリコール、通常では少なくとも
約6単位、より一般には少なくとも約10単位、そして一般には約500単位未
満、より一般には少なくとも約200単位未満、好ましくは約100単位未満で
あって、アルキレングリコールがホモポリマーまたはコポリマーであり得るもの
:アルキル基の炭素数が少なくとも約6、−mには少なくとも約10、および約
24以下、一般には約20以下のアルキルベンゾイル;アルキル基の炭素数が少
なくとも約6、一般には少なくとも約12、および約24以下、−iには約20
以下のアルキルホスフェートもしくはホスホネートなど。
溶解性調節成分は、生理的条件下で荷電しているかまたは非荷電(非荷電が好ま
しい)であって、通常では水素以外の原子10個の基あたり1電荷を有するもの
である。例えば、約40ないし50単位のポリエチレングリコール、エチレンと
プロピレングリコールとのコポリマー、ポリエチレングリコールのラウリル酸エ
ステル、トリフェニルメチル、ナフチルフェニルメチル、パルミテート、ジステ
アリルグリセリド、ジドデシルホスフプチジル、コレステリル、アラキトニル、
オクタデカニロキシ、テトラデシルチオなどの基が挙げられる。
可能性のある官能基には、オキソ、チオ、カルボニル基(オキソもしくは非オキ
ソ)、シアノ、ハロ、ニトロ、脂肪族の不飽和基などが含まれる。
以下の一般式のオリゴヌクレオチド接合体が、特に興味深い。
XIは、窒素または酸素を示す。
Zl は、3′および5′位で置換されたリボースまたデオキシリボースを示す
。
1個のYlはL′への結合であり、そして他のYlは炭素原子数0〜3のヒドロ
キシ、アルキル、アルコキシ又はアミノ(置換されたアミノ、例えばアルキル、
アシル等を含む)、又は5炭糖、特にリボース又はデオキシリボース(P及び水
素への結合の場合)、アルキル、又は炭素原子数1〜10個、通常1〜6個のア
シル、またはアルキル(Zlに結合する場合)である。
Nl は天然プリン及びピリミジンにハイブリダイズすることができる任意のプ
リン又はピリミジンであるが、好ましくは天然プリン又はピリミジンである。
L′は、炭素数が少なくとも約20、そして約30以下、一般には約20以下の
リンカ−を示し、酸素、窒素ならびにイオウ、特にはオキシ、アミノもしくはチ
オである0ないし10個、一般には工ないし6個のへテロ原子を有する。
Ml は、好ましくは少なくとも約20単位、そして約200単位以下、通常で
は約150単位以下のポリアルキレンオキシ基の溶解性調節成分であって、疎水
性または両親媒性を示し、そのアルキレン基は、炭素数が2ないし3から成る。
alは、少な(とも5、通常では少なくとも7、そして通常では約50以下、一
般には約30以下、より一般には約10ないし30、好ましくは約13ないし3
0である。
この発明の組成物を調製する際、上記のオリゴヌクレオチドおよび溶解性調節成
分は、通常では独立成分として存在し、リンカ−アームによって結合可能でる。
オリゴヌクレオチドは、任意の便利な合成法によって調製できる。組換え法は、
はとんど利用できないが、有用となる場合がある。ポリヌクレオチドを調製する
ための合成装置の各種市販品がAppliedBiosystems Inc、
、 Biosearch Inc、+およびPharmaciaなど多数の会社
から入手できる。トリエステル、ホスホラミディティ、ホスホネートなどとして
ブロックオリゴヌクレオチドを使用するために、数々の方法が知られており、環
化法が用いられると、個々のヌクレオチドは連続して添加される。
合成の終了時点では、様々なプロトコルを使用できる。殆どの場合で、末端のブ
ロック基を除去することができ、末端ヌクレオチドは、リンカ−の添加によって
修飾することができ、リンカ−が最終のオリゴヌクレオチドに特異的となり得る
。末端のブロック基がリンカ−の全体または一部として作用し得る場合もある。
また、オリゴヌクレオチドは担体から除いて、さらに操作することもでき、その
際、特に担体に対するリンカ−が疎水性の修飾域を結合するためのリンカ−とし
て使用可能である。オリゴヌクレオチドの5′または3′末端をさらに分画する
ための様々な方法が、ChuおよびOrgel。
DNA (1985) 4:327−331; ConnollyおよびRid
er、 Nucl、 Ac1dsRes、(1985) 13:4485−45
02に見られる。
官能基に応じて、アミン、エステル、無機ならびに有機の酸素ならびにイオウエ
ーテル、アミンなどを産出するために、様々な反応が利用できる。カルボキシル
基と作用させる場合、カルボニルジイミダゾール、カルボジイミド、スクシンイ
ミジルエステル、p−ニトロフェニルエステルなどの様々な活性基を使用できる
。
数々の活性な官能基、例えば、イソシアネート、ジアゾ基、塩化イミノ、イミノ
エステル、無水物、ハロゲン化スルフィニル、イソチオシアネート、塩化スルホ
ニルなどを使用できる。非核酸域成分核酸成分に結合する様々な反応を実施する
ための条件は、ChuおよびOrgel、 DNA (1985) 4:327
−331;Sm1thら、 Nucl、 Ac1ds、 Res、 (1985
) 13:2399−2412に見られる。
リンカ−のオリゴヌクレオチドへの添加の前後、またはそれと同時に、溶解性調
節成分をリンカ−に添加することができる。はとんどの場合、溶解性調節成分は
、オリゴヌクレオチドに対するリンカ−の反応の後に添加する。リンカ−へ溶解
性調節成分を結合させるほうが望ましい場合もあり、その際、リンカ−はオリゴ
ヌクレオチドに結合し、オリゴヌクレオチドは支持体に結合する。すでに指摘し
たように、リンカ−と溶解性調節成分との反応は、その際の特定官能基、疎水性
域の性質、要求される反応条件などとともに変化する。
はとんどの場合、反応は、温和であって、極性溶媒、極性もしくは非極性の組み
合わせ溶媒中で生じる。様々な溶媒を用いることができ、水、アセトニトリル、
ジメチルホルムアミド、ジエチルエーテル、塩化メチレンなどが含まれる。反応
温度は、はとんど約−10ないし60°Cの範囲である。通常では、複合体の成
分間の反応が終了した後に、得られた産物を精製工程にかける。
精製法は、オリゴヌクレオチドが支持体に結合しているか否かに応じて変えるこ
とができる0例えば、オリゴヌクレオチドが支持体に結合している場合では、オ
リゴヌクレオチドへのリンカ−の添加後に、未反応鎖を分解することができ、そ
の結果、得られた産物に夾雑物の入ることを防ぐことができる。そういった場合
、オリゴヌクレオチドへのリンカ−の結合は、合成支持体(例えば、濃アンモニ
ア)からの分解に耐えるために、十分安定でなければならない、オリゴヌクレオ
チドが支持体に結合していない場合、リンカ−との反応だけか、溶解性調節成分
の中間体に対する接合体もしくは最終産物としての反応において、各中間体また
は最終産物は、電気泳動、溶媒抽出、HPLC,クロマトグラフィーのような従
来の技術によって精製することができる。vcいて、精製産物は使用に備える。
この発明の生成物は、オリゴヌクレオチド配列が目的の配列に相補的となるよう
なものを選択する。目的の配列は、原核細胞もしくは真核細胞、ウィルス、正常
もしくは新生物細胞中に存在することがある。これらの配列には、細菌の配列、
プラスミドの配列、ウィルスの配列、染色体の配列、ミトコンドリアDNAの配
列、色素体DNAの配列などが挙げられる。これらの配列には、コードタンパク
質のためのオーブンリーディングフレーム、リポソームRNA 、 5nRNA
、 hnRNA 。
イントロン、非翻訳の5′末端ならびに3′末端隣接オープンリーデイングフレ
ームなどが含まれる。従って、この発明の配列は、RNA転写物の利用率の抑制
、特定タンパク質の発現の抑制、リプレッサー発現の抑制による特定タンパク質
の発現の促進、ウィルスもしくは新生物細胞の増殖の抑制などに関与することが
できる。細胞の表現型の修飾、ウィルス、細菌、タンパク質、マイコプラズマ、
クラミジアなどの病原体の増殖の抑制、または新生物細胞もしくは正常細胞の特
定のクラスに関する罹病率を低下させるために、in vitroまたはin
vivoで用いることができる。従って、この発明の組成物は、宿主への投与に
よって治療用に、またはある種の病態ではこの発明の1つ以上の化合物を、細胞
の天然遺伝子の転写および/または発現の抑制に使用することができる。この発
明の組成物は、哺乳動物の宿主における様々な病原体からの保護に使用すること
ができる。これら病原体には、腸内毒素細菌、肺炎球菌、淋菌など、シアルシア
属、アメーバ属など、癌腫、肉腫、リンパ腫のような新生物細胞など、ヘルパー
細胞、サプレッサー細胞、CTL 、 NK 、 ADCCのような特異的B細
胞、特異的T細胞などが挙げられる。
この発明の配列は、標的配列に対するこの発明の組成物の結合に関与した何らか
の機序によって、転写産物の成熟およびタンパク質の発現を抑制し得るように選
択することがある。
これらの機序には、修飾の抑制、核膜を介した輸送の阻害、エキソヌクレーゼに
よる分解などが含まれることがある。
この発明の配列は、増殖因子、リンホカイン、イムノグロブリン、Tel胞レセ
プタ部位、MMC抗原、DNAもしくはRNAポリメラーゼ、抗体耐性、重複薬
剤耐性(a+dr)、代謝過程でアミノ酸、核酸などの形成に関与する遺伝子、
DHPRなど、およびオープンリーディングフレームと会合するインドロンまた
は隣接配列を発現する配列のような配列に相補的であり得る。
以下の表に、この発明の組成物の別の応用を幾つか例示する。
合成りNAの治療面での応用
対象領域 特異的適用標的
この発明の組成物は、組成物がin vivoまたはin vitroで使用さ
れるか否に応じて、様々な方法で宿主に投与することができる。in vitr
oでは、細胞質および核などの細胞内部へ膜を介しての輸送によって特定遺伝子
の発現を調節するように、この組成物を栄養培地に添加することができる。この
発明の組成物には、マイコプラズマの培養物中で哺乳動物細胞を保護する上で、
数々の代謝過程(例えば、特定産物の産生)に関する様々な発現、産生の様々な
分布などの影響を評価するような特定の使用法がある。この発明の組成物の細胞
内輸送には特殊な添加物を必要としないが、この発明の組成物は、リポソームや
その他の粒子中へのカプセル化によって修飾が可能であり、例えば、非イオン性
界面活性剤、センダイウィルスなどの透過剤との結合に使用することもできる。
in vitro投与では、特定の目的に応じて、この発明の組成物を、注射、
注入、錠剤などの様々な方法で投与できるので、組成物は、経口、静脈内、腹腔
内、皮下、病巣内などで投与することができる0組成物は、様々な方法で製剤化
が可能であって、脱イオン水、水、リン酸塩添加生理食塩水、エタノール、水溶
性エタノールなどの様々な生理学的に安全な溶媒に懸濁ことかできる。またはリ
ポソームもしくはアルブミン微粒子に製剤化できる。
適用および投与法が多様であるので、特定の組成物を示唆することはできない、
むしろ、各適用において、この発明の組成物は、従来方法での試験が可能であっ
て、適切な濃度を実験的に決定することができる。安定剤、緩衝液、添加剤、界
面活性剤、賦形剤などを含めることもできる。これらの添加剤は従来からあり、
通常では約5重量%未満、一般には1重量%未満で含有し、適宜、有効量とする
。賦形剤については、活性物質の必要量に応じて99.9%を越えるまで含める
ことができる。
以下の実施例は、例示のために提供するものであって、限定するためではない。
l二」皇
スJL[吐l
Am1nolink(アミノ1ンク 、ベンゾキノンおよびビス−アミノへキシ
ル ボIエチレングTコール いた、DNAのポリエチレングリコール沃 の人
ミ イ ゛に DNA第1ゴ レオ ゛の ・ムDNAの化学的合成は、市販の
いかなるDNA合成装置により、従来のホスホラアミダイト法を若干変えて実施
した。
この方法は、Caru tbersらが記載した手法(Beaucageおよび
Caruthers、欧州特許出願第82/102570号)の変法である。
この方法では、無水アセトニトリルに溶解した0、 1 Mヌクレオシドホスホ
ラミダイトを等量の0.5Mテトラゾールと混合してから、コハク酸塩スペーサ
ーを介して対照の細穴ガラス支持体に結合した成長DNA鎖の5′水酸基末端の
ヌクレオチドにカップリングさせた(MatteucciおよびCaruthe
rs。
Tetrahedron Letters (1980)21ニア19−22)
、ヌクレオシドの添加後に、無水酢酸による未反応5′水酸基へのキャップ構造
の付加、ヨウ素酸化、およびトリクロロ酢酸−塩化メチレン中での5′脱トリチ
ル化を行った。続いて、樹脂結合オリゴマーを、無水アセトニトリル中での徹底
した洗浄によって乾燥させ、この工程を繰り返した。この方法を用いた正常の周
期は、98%を越える縮合効率で12分であった(トリチル基の離脱によって判
定)。
合成の最終段階として、産物のオリゴヌクレオチド鎖から除去し、A11nol
ink(Applied Biosystea+s、 Foster C1ty
、 CA)を用いてアミノエタノールホスホラミダイトを5′水酸基に付加した
。続いて、樹脂結合オリゴヌクレオチドは、脱保護し、ホスフェート型の結合に
適した方法を用いてカラムから除去した。
通常のホスホジエステルの場合、カラムからの除去および濃水酸化アンモニウム
中55°Cで一晩の加水分解が適していた。
続いて、産物を50%エタノールから数回凍結乾燥し、逆相肝LCC−8シリカ
充填カラムにより、5ないし50%のア七ト二トリル/ 25 mM酢酸アンモ
ニウム(pH6,8)の溶出液で直線勾配をかけて精製した。必要に応じて、こ
の物質は、20%アセトニトリル/25mM酢酸アンモニウム(pH6,5)を
溶出液に用いて、Nucleogen DEAE 60−7充填のイオン交換1
’1PLCによって一層の精製を行うことができる。次に、回収された産物は、
15%ポリアクリルアミドゲル電気泳動によってその特徴を調べた。この電気泳
動は、Maxa+a G11bert+Method of Enzymolo
gy (1980) 68:499−560に記載された通りに実施した。仕上
げ後のゲル中のオリゴヌクレオチドは、5tains−allを用いて視覚化し
た。この5tains−All法は、DNAメチルホスフェートまたはエチルト
リエステルなどの非電荷ヌクレオチドには作用しなかった。
完全に脱保護して精製した産物は、続いて、適切なカップリング法を用いて適当
なポリエチレングリコール誘導体に転化する。ベンゾキノン、カルボジイミド、
SMCC(スクシンイミジル4−(N−マレイミドメチル)−シクロヘキサン−
1−カルボキシレート)、5PDP (N−スクシンイミジル3−(2−ピリジ
ルジチオ)プロピオネート、カルボニルジイミダール、Am1nolink 、
ジスクシンイミジルスベリミデイトおよびフェニルイソチオシアネートを含む幾
つかの方法を用いることができる。
ベンゾキノンへの1ンカー言゛′DNAの力・・プ1ング およびビス アミノ
へキシル ポリエチレングリコールへの加最初の工程で、ビス(アミノヘキシル
)ポリエチレングリコールを、0.1M重炭酸ナトリウム溶液(pH8,5)に
溶解したベンゾキノンのモル比で100ないし1000倍過剰量と反応させる。
室温で1時間後、過剰な未反応ベンゾキノンをセファデックスG−25のカラム
クロマトグラフィーで除去する。続いて、活性化されたポリエチレングリコール
を0.1 M重炭酸ナトリウム溶液に添加し、モル比10:1で反応性のアミン
リンカ−鎖を含むDNAオリゴマーと反応させ、反応を完了させた。反応(通常
では一晩)の終了時、未反応オリゴマーをセファデックスc−iooのゲル濾過
によって除去し、複合体の特徴は、ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって調
べる(Maniatisら、Mo1ecular cloning、 A 1a
boratory manual(1982) Co1d Spring Ha
rbor、 NY 参照)。必要に応じて一層の精製を、イオン交換クロマトグ
ラフィーおよびゲル電気泳動を用いて行うことができる。
これらの反応産物の構造式は以下のとおりである。
ス去l辻i
Aminolinkおよびカルポニルジイミ ゛ゾールシ ポリエチレングリコ
ール いた DNAのポ1エチレング丁コニ五M盪鉢至金底
この実施例では、Am1nolinkオリゴヌクレオチドを、実施例1での記載
と同様に合成した。オリゴマーを支持体から除去し、アンモニア中で脱保護した
後、溶液を真空蒸発乾燥し、重炭酸ナトリウム溶液(pH8,5)で0.1 M
としてから、G25スパンカラム上で精製し、この物質をナトリウム塩に転化し
て低分子量の夾雑アミン含有物質を除去した。この溶液は、続いて、カルボニル
ジイミダゾール活性化ポリエチレングリコール(平均分子量=20.000)の
0.2M溶液とし、23°cで一晩反応させた。
未結合オリゴヌクレオチドをセファデックスG100のゲル濾過によって除去し
た。このカラムクロマトグラフィーにおいて、複合体がカラムの排除体積中に溶
出し、遊離のオリゴヌクレオチドおよび未結合ポリエチレングリコールは遅れて
溶出した。続いて、この物質を真空中で濃縮し、複合体の特徴をポリアクリルア
ミドゲル電気泳動にて解析した(Maniatisら、(1982)上記文献)
。
スクシンイミジルゝ ポリエチレングリコール たこの方法では、アミノリンク
ホスホロアミダイトのさらなる付加なしでトリチル基を除去すること以外は例1
のようにして、DNAを合成する。ポリアクリルアミドゲル電気泳動による精製
の後、標準法[Millerら、Nucl、Ac1ds Res、(1983)
11:6225−42; Maniatisら、(1982)、前掲;Maxa
mおよびG11bert。
Proc、Nat’l Acad、Sci、USA (1980)74:560
−5] に従って、T4ポリヌクレオチドキナーゼの前向き反応により、生成り
NAをリン酸化する。ラベル化されたオリゴマーは、DEAEクロマトグラフィ
ーおよびC−18逆相カラム(例えばWaters C−18SepPak )
により、未反応のATPから分離され得る。試料を、分析用の20%ポリアクリ
ルアミドゲル上で純度についてチェックする。
次いでリン酸化されたオリゴマーを、ChuおよびOrgel 、 DNA(1
985) 4:327−31の方法に従って、EDCカルボジイミド存在下で1
−メチルイミダゾ、−ルおよびヘキサンジアミンで処理する。この反応は、次の
構造を有するホスホロアミデート結合を介してジアミンリンカ−をオリゴヌクレ
オチドに共有結合でつなぐ。
そしてオリゴマーのアミンリンカ−アームを次のようにしてNH3−スクシニル
モノメトキシオキシポリエチレングリコール(MW−5000)と縮合させる。
オリゴヌクレオチドを、0.15M NaC1を含む50+aMリン酸ナトリウ
ム緩衝液、p)17.1中、リットル当り100オの最終濃度に溶解する。この
溶液に10倍モル過剰の5S−PEG(5000)を乾燥固体として添加し、溶
解させ、そしてその反応混合物を25°Cにて一晩インキユベートする0次いで
生成物を、水中の5ephadex G−100上でのゲル濾過クロマトグラフ
ィーにより精製し、そしてポリアクリルアミドゲル電気泳動により特徴付ける。
最終生成物の構造は下記のものである:イミ ゾール2 カルボン エスールお
よびビスーアミノアルキルボ1チレング1コール た DNAのボ1エチレング
1コール憬 の入
この例では、例1において与えられた方法に従ってDNAを合成した。合成後、
生成物は、該分子の5′一端からトリチルが遊離された状態で合成支持体上に保
持された。ついで該固体材料を無水アセトニトリルで十分に洗浄し、そして乾燥
アルゴンの流れのもとで風乾させる。プラスチックのシリンジを使って、無水ア
セトニトリル中に溶解された0、3Mカルボニルジイミダゾールl ccを、オ
リゴマーを結合した支持体を含む合成カラムを通して1時間に渡ってゆっくり押
出した。該カラム上の5′−カルボニルイミダゾール活性化オリゴマーを15d
のアセトニトリルで洗って過剰の試薬を無くし、続いてアセトニトリル中0.1
Mのビス(アミノへキシル)ポリエチレングリコール、水、アセトニトリルおよ
び塩化メチレンで16時間連続して処理した。ポリエチレンオリゴマー接合体を
、濃縮水酸化アンモニウムで溶出し、そして55℃での5時間のインキュベーシ
ョンにより同様に脱保護した。
次にその反応生成物を、10 mM Tris+pH7,5を1分当り0、5
mにて流すTSK G4000S−カラム上での高性能ゲル濾過クロマトグラフ
ィー(HPGFC)により精製する。アガロースゲル電気泳動によりさらに精製
を行ってもよい。この方法により合成された最終接合体の構造は次のようである
:この例では、例1において与えられた方法に従って、マウスのβ−グロブリン
mRNAの開始領域に相補的な20ヌクレオチドのDNAを合成した。生成物は
、該分子の5′一端からトリチルが遊離された状態で合成支持体上に保持された
。ついで固体材料を無水アセトニトリルで十分に洗浄し、そして乾燥アルゴンの
流れのもとで風乾させる。プラスチックのシリンジを使って、無水アセトニトリ
ル中に溶解された0、 3 Mカルボニルジイミダゾール1 ccを、支持体に
結合したオリゴマーを含む合成カラムを通して45分間ゆっくりと押出した。
酸カラム上の5′−カルボニルイミダゾール活性化オリゴマーを15afのアセ
トニトリルで洗って過剰の試薬を無くし、続いてアセトニトリル:水(10:1
)中0.2Mのデカンジアミンで30分間処理した。該カラム上の該物質をアセ
トニトリルおよび水で洗って未反応のデカンジアミンを無くし、濃水酸化アンモ
ニウムで溶出した。カラムからの溶出の後、オリゴマー接合体を含む水酸化アン
モニウム溶液を封管バイアル中に入れそして55℃にて5時間インキュベートし
た。
次いで、生成物を50%水性エタノールから数回凍結乾燥し、そして逆相HPL
CC−8シリカカラムにより、直線勾配において5〜50%アセトニトリル/2
51酢酸アンモニウム、pi(6,8で溶出して精製した。必要であれば、溶出
液として20%アセトニトリル/25+nM酢酸アンモニウム、pH6,5を使
ったNucleogen DEAR60−7上でのイオン交換クロマトグラフィ
ーにより、さらに精製してもよい。回収された生成物を、MaxawおよびG
i 1 ber tによりMeth、Enz mol、 (1980)68:4
99−560中に記載されたようにして行う15%ポリアクリルアミドゲル中で
のゲル電気泳動により特徴付けた。終了したゲル中のオリゴヌクレオチドは5t
ains−allを使って可視化された。
第一アミンの存在は、二つの方法により決定された。第一は、フルオレスカミン
との反応は第一アミンの存在に特徴的な蛍光生成物をもたらすが、アミンリンカ
−を欠く以外同じタイプの対照オリゴマーを同様に処理しても蛍光は全く観察さ
れなかった。第二は、デカン接合体を100 mの0.1 M炭酸水素ナトリウ
ム中に溶解し、これに1■のフルオレセインイソチオシアネート(FITC)を
加えた。1時間のインキュベーション後、5ephadex G−25スパンカ
ラム上でのゲル濾過により、未反応のFITCを除去した0次いで生成物を、前
述のようにポリアクリルアミドゲル電気泳動により分析し、そしてUV照明のも
とて生成物の蛍光バンドを可視化した。5tains−allでの次なる染色に
より可視化されたオリゴマーと一致する単一の蛍光バンドが観察された。
この反応の生成物は、製塩基への穏和な暴露に対し安定であるアルキルカルバメ
ートである。この方法により合成される最終接合体の構造は次のものである:こ
の方法により他のモノアミノアルキルおよびアリール誘導体が製造され得る。構
成されているこのシリーズの他の分子は、エチレンジアミンおよびヘキサンジア
ミンを使った誘導体を包含する。長鎖の付加は、必要濃度を達成するために溶媒
の極性を僅かな変更を必要とするかもしれない、また、反応時間を延長するなら
ば、低濃度を使うことができる。
劃−」−
イミ゛ゾール2 カルボン エスール ボッ1ジンiンカー DSSおよびBI
S−アミノアルキルポ1エチレング1コールを たDNAのボッエチレングリコ
ール銖 のム底
この例では、例1において与えられた方法に従って、マウスのβ−グロブリンm
RNAの開始領域に相補的な25ヌクレオチドDNAを合成する。合成後、合成
支持体を80%酢酸で30分間処理し、該分子の5′一端からトリチルを除去し
た。
ついで固体材料を無水アセトニトリルで徹底的に洗浄し、そして乾燥アルゴンの
流れのもとで風乾させ、そして例4に記載したようにして0.3 Mカルボニル
ジイミダゾールで処理した。該カラム上の5′−カルボニルイミダゾール活性化
オリゴマーを15mのアセトニトリルで洗って過剰の試薬を無くし、そして0.
1Mリン酸ナトリウム、pH8を含む50%アセトニトリル中に溶解された0、
2Mポリ−L−リジン(MW=1000)で室温にて16時間処理した。カラム
上の物質を、水およびアセトニトリルで洗って塩および未反応のポリリジンを除
き、そして濃水酸化アンモニウムでカラムから溶出した。
カラムからの離脱の後、オリゴマー接合体を含む水酸化アンモニウム溶液を、封
管されたガラスのバイアル中に入れそして55℃にて5時間インキュベートした
。
次いで、生成物を50%水性エタノールから数回凍結乾燥し、そして10mM)
リス緩衝液、pH7,5中、TSK G4000SW上でのゲル濾過クロマトグ
ラフィーにより精製した。第一アミンの比率は、フルオレスカミンとの反応によ
り決定された。
ポリアミンリンカ−を欠く対照のオリゴマーでは蛍光が全く観察されなかった。
ポリアミン接合体を負に荷電させるために、該複合体をFITCで処理して該分
子をラベルしそしてアミン上の正電荷を中和した。これは、該物質の一部を10
04の0.1M炭酸水素ナトリウムに溶解し、これに1■のFITCを添加する
ことにより達せられた。1時間のインキュベーションの後、未反応のFITCを
、5ephadex G−25スパンカラム上でのゲル濾過クロマトグラフィー
により除去した[Maniatis ら、(19B2)、前掲]。
次いでMaxamおよびG11bert(1980)前掲により記載されたよう
に行うポリアクリルアミドゲル電気泳動によって生成物を分析した。5tain
s−allで可視化されたDNAと一致するブロードな蛍光バンドが観察さた。
分子の5′一端に共有結合で連結されたポリリジンを含むオリゴマーを、次のよ
うにビス−(アミンヘキシル)ポリエチレングリコール(肚・3500)と架橋
させた。該ポリエチレンオリゴマーをまず0.1M炭酸ナトリウム、3M Na
C1に対して透析し、そしてCentricon 10装置(Amicon、D
anvers、N、J、)を使って4■/dの最終濃度に濃縮した。この溶液5
0J11に25uのジスクシンイミジルスベレート(DSS、10■/戚DMS
O中)を添加し、そしてその混合物を室温で10分間インキュベートした。次い
で未反応のDSSを5ephadex G25上でのクロマトグラフィーにより
直ぐに除去し、そしてCentricon 10膜で濃縮した。溶液をビス=(
アミノヘキシル)ポリエチレフグリコール中0.2 Mに作り、そして室温で一
晩インキユベートシて最終接合体を形成せしめた。前述のように操作してTSK
G4000S−カラム上で精製を行った。
この接合体は次の一般式を有する:
1、製品タイプI
上式中、Xは普通Hであるが、少なくとも1つのXが−Co (CHz) 1c
OHN−PEGs。。。である。
使われる反応過剰量またはポリエチレングリコールおよびポリリジンの分子量を
変更することにより、色々な大きさの置換基のサイズおよび電荷を存するポリマ
ー接合体を作製することが可能である。該複合体のこれらの性質を変えられるこ
とは、様々な適用における該化合物の利用を企画することを可能にする。
[
DNAメチルホスホネートのポIエチレング1コール憬体夏合底
DNAメチルホスホネート(MP)の化学合成は、Letsingerのホスホ
クロリグイト法の変法を使って行うことができる[Letsingerら、J、
Amer、Chem、Soc、(1975)97:3278; Letsing
erおよびLun5ford、 J、Amer、Chem、Soc、(1976
)98:3605−3661;TanakaおよびLetsinger、Nuc
l、Ac1ds Res、 (1982)益:3249−60] 。
この方法では、無水アセトニトリル2.6−ルチジン中に溶解された乾燥保護ヌ
クレオシドを化学量論量のメチルジクロロホスフィンによりその場でg活性化す
る。活性化されたヌクレオシドモノクロライドを、スクシネートスペーサーを媒
介して調節多孔質ガラスに結合した伸長DNA鎖のヌクレオチドの5′−水酸基
に順次付加せしめる[Matteucci及びCaruthers、 Tetr
ahed、Lett、 (1980)21ニア19−722]、各付加の後で、
無水酢酸による未反応5′−水酸基のブロック、ヨウ素酸化、および3%トリク
ロロ酢酸−塩化メチレン中での5′−説トリチル化を行う。
次いで、樹脂に結合したメチルホスホネートオリゴマーを無水アセトニトリル中
での十分な洗浄により乾燥し、そしてこの工程を繰返した。この方法を使った通
常のサイクル時間は23分であり、〉32%の縮合効率を伴う(トリチル脱離に
より判断)。塩基での開裂の際に5′一端のリン酸ジエステルを生じるシアノエ
チルホスホトリエステルとして最後の塩基を添加してもよい。この段階は、調製
の中間段階においてオリゴヌクレオチドを放射能ラベルし、ゲル電気泳動を使っ
て生成物を精製しそして配列決定することを可能にする[Narang ら、C
an、J、Biochem、 (1975)53:392−394;Mi 1l
er ら、Nucl、Ac1ds Res、 (1983)11:6225−6
242]。
アミン−末端リンカ−アームを次のように付加する。上記のようにトリチルを除
去し、そして0.2Mジメチルアミノピリジンを含む乾燥アセトニトリル中に溶
解された0、 2 Mill1inolink(Applied Biosys
tems、 Fostwer C1ty)で樹脂を5分間処理する。次いで上記
のようにリンカ−アームのオリゴヌクレオチドをヨウ素中で酸化しそしてアセト
ニトリル中で洗浄する。脱保護されたいずれの第一アミンも塩基−安定性アセト
アミドに修飾されそのためさらなる反応に無効であるので、無水酢酸でのブロッ
クは行わない。
合成の最後に、アミン末端のリンカ−アームのメチルホスホネートオリゴマーを
次のようにして脱保護する。DNAを含む樹脂をカラムから取り出し、ウォータ
ージャケット付ラム中に入れ、1〜2dのフェノール:エチレンジアミン(4:
1)中40’Cで10時間インキュベートする。フェノール:エチレンジアミン
中でのインキュベーションの後で、メタノール、水、メタノール及び塩化メチレ
ンを使って連続して樹脂を洗浄し、該フェノール試薬及び塩基保護基を除く。窒
素流での乾燥の後、塩基−脱保護された鎖を、EDA:エタノール(1: 1)
または水酸化アンモニウムによる室温での簡単な処理を使って支持体から開裂せ
しめる。
アミン−末端DNAメチルホスホネートの精製を次のように行う、該物質を50
%水性エタノールから数回凍結乾燥し、そして逆相HPLCC−8カラムを通し
て直線勾配において5−50%アセトニトリル/25mM酢酸アンモニウム、p
n6.sで溶出させて精製する。フルオレスカミン反応性により決定した、アミ
ン−含有フラクションをプールし、真空中での乾燥により生成物を回収し、そし
て20%アセトニトリル/251酢酸アンモニウム、pl’16.5で溶出させ
るNucleogen DEAE60−7上でのイオン交換クロマトグラフィー
によりさらに精製する。
ついで精製された生成物を、ヘテロ二価性架橋剤SMCCおよび5ATA (ス
クシンイミジルS−アセチルチオアセテート)を使って適当なポリエチレングリ
コール誘導体に変換する。ヌクレオシド塩基と反応しそして修飾する他の試薬(
例えばスルホニルクロライド、グルタルアルデヒド又は酸無水物)は、まだ合成
支持体と結合し十分にブロックされたオリゴヌクレオチドを用いて行わない限り
、推奨されない。
5′−末端の反応性アミンリンカ−アームを含むDNAメチルホスホネートをま
ずpH8,5(0,1M炭酸水素ナトリウム)にて100〜1000倍モル過剰
の5ATAと反応させる。室温で30分後、水中でのG−25カラムクロマトグ
ラフイーにより余分な未反応の5ATAを除去し、真空中で濃縮し、そして次の
反応の用意ができるまで冷却保存する。0.1Mリン酸緩衝液、pH6,9中で
の100〜1000倍モル過剰のSMCCとの室温での1時間の処理により、ポ
リエチレングリコールをマレイミド誘導体に変換する。5ephadex G−
100上でのクロマトグラフィーにより過剰の架橋剤を除去し、該物質を真空中
で濃縮し、そして次の反応の用意ができるまで冷却保存する。この物質は冷却保
存すれば約1週間の間安定である。次いで5ATA DNAメチルホスフェート
を、’0.1Mリン酸緩衝液中に溶解された塩酸ヒドロキシアミン(pHを7.
2に調整)で1−2時間処理する。
この処理は反応性のスルフヒドリルを遊離させるために提供する。この生成物を
10倍モル過剰のビス−(SMCCアミノヘキシル)と、オリゴマーを含む溶液
に後者を粉末として添加することにより反応させる。
次いで該複合体の精製を行う、非結合のオリゴヌクレオチドを、10n+M)リ
ス、pH7,5で溶出させる5ephadex G−100上でのゲル濾過また
はTSK G4000S−上でのHPGFCにより除去する。この手順の最終生
成物の概略的構造は、次のものである。
ホスホルアミシト いるDNAアルキルトリエステルのボ1エチレング1コール
迭 のム
表題の化合物のトリエステルの合成は、Zonらの方法(Galloら、Nuc
l、Ac1d Res、 (1986)14ニア405〜20; Surnme
rs ら、Nucl、Ac1d Res、(1986)14ニア421〜36)
に従って行なわれる。この合成方法は他の例に記載されているようなエチルトリ
エステルのその場での製造に用いられる方法と同じである。完全にブロックされ
たジメトキシトリチルヌクレオシドはベンゼンから繰り返し凍結乾燥することに
よって乾燥され、無水アセトニトリル/2,6−ルチジンに溶解され、−70°
Cで同じ溶媒中のクロロジイソプロピルアミノエトキシホスフィンの撹拌溶液に
滴下添加される。生成物は、水抽出、真空乾燥およびシリカゲルクロマトグラフ
ィーによって回収される。
DNAエチルトリエステル(ETE)の化学合成は、従来のホスホルアミシト法
をわずかに改良した方法を用いて行われる。
この方法において、無水アセトニトリルに溶解したヌクレオシドホスホルアミシ
トをテトラゾールと混合し、続いて5′−ヒドロキシ末端ヌクレオシド結合に結
合する。ヌクレオシド添加後、未反応5′−ヒドロキシルと無水酢酸との結合、
沃素酸化、およびトリクロロ酢酸−塩化メチレン中での5′−説トリチル化を行
なう。次いで樹脂結合オリゴマーを無水アセトニトリル中の大量洗浄によって乾
燥し、このプロセスを繰り返す。この方法を用いる通常の周期時間は、96%以
上の縮合効率で(トリチル放出により判断)、17分である。
放射ラベルおよび精製を促進するためジエステルとして末端残基を加えることが
都合がよい。HPLC精製を望む場合、5′−末端トリチル基が残っているが、
通常5′−末端トリチルは除去され、例1に記載のアミノ結合法を用いる。
合成の最後において、完全にブロックした生成物を以下のようにして塩基−説ブ
ロックする。完全に保護されたDNAを含む樹脂をカラムから取り出し、水−外
被クロマトグラフカラムに入れる0次いでこの樹脂を1〜2dのフェノール:エ
チレンジアミン(4:1)中に40゛Cで10時間インキュベートする。フェノ
ール:エチレンジアミン中でのインキュベーションの終了時に、フェノールを含
まない試薬で洗い、メタノール、水、メタノールおよび塩化メチレンを続l+7
田いて塩基保護基を分離する。窒素流下で乾燥後、EDA:エタノール(1:
1)を用いてまたは室温における水酸化アンモニウムによる簡単な処理を用いて
支持体より塩基−説ブロック化鎖を開裂する。
次いで、アミノリンクDNAエチルトリエステル生成物の精製を以下のようにし
て行なう。この物質をまず数回50%メタノール水溶液より凍結乾燥し、5−5
0%アセトニトリル/25mM酢酸ナトリウム、pH6,8の直線勾配で溶出す
る逆相HPLCC−8シリカカラムによって精製する。フルオレサミン反応性に
よって決定したアミン含有画分を貯め、真空乾燥により生成物を回収し、さらに
25%アセトニトリル/25mM酢酸アンモニウム、p)16.5で溶出するN
ucleogen DEAE 60−7のイオン交換HPLCによって精製する
。
生成物であるオリゴヌクレオチドは、前記のあらゆる方法によるポリエチレング
リコールへの結合に適当である。我々の実験において、SMCC、5PDP、カ
ルボニルイミダゾール、ジスクシンイミジルスベリミデートおよびフェニルイソ
シアネートを含む多くの方法が用いられた。
SMCC/5PDP結合反応は以下のとおりである。結合アームプルーブを過剰
の5PDPと結合させ、続いてジチオスレイトール(DTT)による還元、未反
応DTT除去および遊離スルフヒドリルによるビス(アミノヘキシル)ポリエチ
レングリコール(PEG)へあらかじめ結合したSMCCへの架橋を行なう。チ
オエーテル結合の形成は急速であり、選択的であり、形成した結合は種々の条件
に対し全く安定である。
DNA含有アミン結合アームをpH8,5において(0,1M重炭酸ナトリウム
) 、100〜1000倍モル過剰の5PDPと反応させる。室温で1時間後、
G−25カラムクロマトグラフイーで過剰の未反応試薬を除去し、プルーブ5P
DP共役体を真空上濃縮する。ビス(アミノヘキシル)ポリエチレングリコール
を前記例に記載されたようにしてマレイミド誘導体に転化する。
5PDP DNA )ジエステルを0.1 M燐酸バッファー(p)17.2)
に溶解した10+aMのメルカプトエタノールで1時間処理する。
この処理により5′−チオピリドンが分離され、反応性スルフヒドリルが形成す
る。過剰の還元剤は、末端SHの再酸化を防ぐためすべての分離を窒素上脱気し
た0、1M燐酸バッファー、pH6,8内で行なうことを除いて前記のようにG
−25カラムを用いて行なわれる。この方法において、マレイミジル化ポリエチ
レングリコールとのその後の反応を防ぐため、すべての過剰の還元剤を除去する
ことが重要である。
この方法において分離されたチオピリドンは、5′−末端SHの存在を定量する
便利な間接的方法を提供する。還元によって分離されたチオピリドンは343
nl11においてUV吸収を有する。この波長における溶液の吸収の増加追うこ
とにより、一連の還元が容易に追跡できる。次いで、8080のモル消衰係数を
用いてチオピリドンを定量する。次いで粉末あるいは濃厚溶液としてS)I末端
オリゴマートリエステルを含む溶液に加えることによって、生成物を10倍モル
過剰のビス(SMCC−アミノヘキシル)ポリエチレングリコールと一晩反応さ
せる。この反応を一晩25°Cで行なう。
次いで複合体の精製を行なう、10mHのTrts、 pH7,5で溶出する5
ephadex G−100またはTSK G4000S−のHPGFCによる
ゲル濾過によって、結合していないオリゴヌクレオチドを除去する。この方法の
最終生成物の構造は下式で表わされる。
” トリエステル法を いるDNAアルキル並びにアリールト1エスールのポ1
エーール悸 のA
々のアルキル〜Iびにア1−ル のホスホトリエステル第1ゴヌクレオチドの人
可変アルカン鎖長を有する種々のトリエステルの最も有効な製造方法は、b−ク
ロロフェニルホスフェートトリエステル(PTE)として望む配列を合成する従
来のホスフェートトリエステル化学による0合成の終了の際、合成支持体に結合
した完全に保護されたオリゴヌクレオチドクロロフェニルトリエステルをテトラ
ブチルアンモニウムフルオリドおよびアルコールの存在下エステル交換する。D
NAオリゴヌクレオチド構成の基本的方法は古典的DNA合成化学である。 G
a1tの01i onucleotide S nthesis : A Pr
actical A roach 、 IRLPress+ Washingt
on D、C,(1984)参照。
DNAp−あるいは0−クロロフェニルホスホトリエステルの化学合成は、Le
tsinger、 Tanaka、 Nucl、 Ac1ds Res、(19
82)25:3249〜60のホスホクロリント法の改良法を用いて行なわれた
。
無水アセトニトリル2,6−ルチジンに溶解し、クロロフェノキシジクロロホス
フィンによりその場で活性化された完全にブロックされたおよび乾燥したヌクレ
オシドを、前記例のスクシネートスペーサーにより制御細孔ガラス支持体に結合
した成長しているDNA鎖の5′−ヒドロキシ末端ヌクレオチドに加える。誘導
ガラス支持体、完全にブロックされたヌクレオシドおよび他の合成試薬はApp
lied Biosystems (SanFrancisco、 CA)また
はAmercan Bionuclear (Emeryville、 CA)
より市販入手可能である。ヌクレオシド添加に続き、無水酢酸による未反応5′
−ヒドロキシのキャッピング、沃素添加、およびトリクロロ酢酸−塩化メチレン
中での5′−説トリチル化を行なう。
樹脂結合オリゴマークロロフェニルトリエステルを無水アセトニトリル内で洗浄
することにより乾燥し、この操作を繰り返す、この方法を用いる通常の周期は1
3分であり、その縮合効果は92%以上である(トリチル放出により判断)。
最後の塩基をβ−シアノエチルホスホトリエステルとして加えると、塩基の開裂
の際に5′−末端ホスホジエステルを生ずる。このステップはオリゴヌクレオチ
ドの放射ラベルおよびゲル電気泳動を用いる生成物の精製を可能にする( Na
rangら、Can、J、Biochem、 (1975)53:392〜4;
Miller ら、Biochemistr(1986)25:5092〜9
7)。
合成支持体に結合した完全にブロックされた物質をテトラブチルアンモニウムフ
ルオリド(TBAF)およびアルコールの存在下無水条件でエステル交換する。
この方法により急速なおよび定量的アルコール交換が生ずる。この方法は安定な
生成物を形成できる大部分のアリール並びにアルキルアルコールに対し20分で
終了する。
この例において、最終濃度0.2MにTBAFを溶解するため無水n−プロパツ
ールを用いる。次いでこの溶液をゆっくりオリゴマークロロフェニルトリエステ
ルを含む樹脂上に注ぎ、約1時間室温で反応させる。次いでこの樹脂をメタノー
ル並びにアセトニトリルで洗い、乾燥アルゴン流下で乾燥する。
例8のようにアミン結合アーム添加、脱ブロック、および精製を行なう、ポリエ
チレングリコール結合を例7のようにして行なう。結合体の最終収率は、用いた
ヌクレオシド樹脂の約10%である。最終生成物の構造は下式で表わされる。
翌1−W
前行する例において与えられた合成法を用いて、通常タイプ及びエチルトリエス
テルタイプの両オリゴヌクレオチドを作製した。分子の5′末端に疎水性基を含
有する両親媒性DNA接合体の最も簡単な例において、合成の終りにトリチル基
を残した。このタイプの精製された物質を、ヘモグロビンを生産する様に誘導さ
れたマウス赤血白血病細胞でのヘモグロビンの特異的発現の防止におけるそれら
の有効性について試験した。これらの及び次の例において試験されたオリゴヌク
レオチドを第1表に示す。
これらの実験のために選択された細胞は、DMSO及び酪酸を包含する種々の薬
物によりヘモグロビンを合成するように誘導され得るFr1endネズミ赤血白
血病(MEL)細胞である(Gusella及び)louseman、 Ce1
1(1976)8:263−269を参照のこと〕。
MEL細胞はC(hインキュベーター中での常用技法を用いる培養中に増殖する
。
グロビンを発現する誘導された細胞は、ヘモグロビン産生細胞を青く染めるベン
ジジン処理により可視化され得る(Leder等、5cience (1975
) 190:893] 、細胞は、インキュベーション中1■/l〜1 n /
rnflの範囲の濃度で、選択されたオリゴヌクレオチド複合体に暴露された
。対照は模倣(mock)処理細胞及びランダム配列オリゴマー対照により処理
された細胞を用いた。処理された細胞を染色強度に基(グロビン生産について種
々の時間間隔においてスコアーし、そして結果を対照と比較した。対照細胞の約
50%が誘導性である。毒性及び細胞損傷の標示を得るため、トリバンプルー排
除により、処理による細胞死及び損傷をスコアーした。
得られた結果を第2表に示す。これらの結果は、トリチル末端オリゴマーが合成
阻害の所望の程度を生成せしめるのに一層効果的であることを示している。しか
しながら、トリチル末端オリゴマーは、療法剤としてのこれらの一般的使用を推
奨しないある程度の細胞損傷を示した。
]−」L−衷
マウス細胞におけるヘモグロビンの蓄積に対するトリチルオリゴマーの効果
立 にお番る −グロビン鳶 の人 に・ る 言゛アJレキJL/「第1ゴヌ
クレオチドの六先行例において与えられた合成法を用いて、5′−末端アミノア
ルカンに結合した15〜20塩基長のオリゴヌクレオチドを例5に記載したよう
にして作製した。このタイプの精製された物質を、ヘモグロビンを生産するよう
に誘導されたMEL細胞でのヘモグロビンの特異的発現の阻害におけるそれらの
有効性について試験した。この結果を第3表に示す。試験方法は例1Oに示した
通りである。
第一」L−表
培養細胞でのヘモグロビン合成の阻害におけるオリゴヌクレオチドの有効性に対
する疎水性の増加の効果第3表に示すように、得れた結果が示すところによれば
、アミノアルカン末端オリゴマーは、末端アルカンを欠くそれらの同族配列に比
べて、選択的合成阻害の所望の程度を生成する上で一層効果的である0例えば、
C1゜誘導体は、ヘモグロビン陽性細胞の数の減少において対照未修飾20マー
に比べて約60%多く効果的であった。一般に、アルキル鎖が長くなるに従って
、同じ程度(%)の阻害を行うのに必要なオリゴマーの濃度は低くなる。
例1に示した合成法を用いて、リンカ−としてエチレンジアミンを使用して5′
〜末端フルオレツセインに結合した15〜20塩基長のオリゴヌクレオチドを作
製した。細胞へのオリゴマーの取り込みを蛍光顕微鏡によりモニターすることが
でき、このことが生成物による細胞死の他の証拠を提供する点において、この物
質はさらなる利点を有する。精製された蛍光オリゴマーを、ヘモグロビンを生産
するようにRNされたMEL細胞でのヘモグロビンの特異的発現の阻害における
それらの有効性について試験した。結果を第4表に示す。
この試験の方法は例10に示した通りである。
1−土一表
件 でのヘモグロビン人 の に・ るFITCA の四来
オリゴマー31 生存細胞 ベンジジン+111(%) 細胞の阻害
第4表かられかるように、得られた結果が示すところによれば、フルオレンセイ
ン末端オリゴマーは、ヘモグロビン合成の選択的阻害の生成において、FITC
を欠(それらの同族対照配列と少なくとも同等に効果的である。さらに、処理さ
れた細胞の蛍光顕微鏡観察は、フルオレセインが結合したオリゴマーの取り込み
に暴く増強された蛍光を示した。次に、これらの細胞を単離し、生理的食塩水中
で数回洗浄し、そして水中での数回の凍結・解凍により溶解せしめた。生ずる溶
液を遠心して細胞破片を除去し、そして・存在するフルオレッセイン結合オリゴ
マーの量をアミンコ(Aminco)蛍光分光計で定量した。得られた結果が示
すところによれば、処理された細胞は細胞当り平均107分子のフルオレッセイ
ン結合オリゴマーを同化した。これは、類似のDNAオリゴマー(すなわち容解
性成分を欠く)の細胞当り細106分子の細胞取り込みに比べて約10信高い。
従って、オリゴマーへの疎水性成分(この場合フルオレセイン)の付加が、蛋白
質合成を選択的にブロックするその能力に影響を与えることな(オリゴマーの細
胞取り込みの実質的増加をもたらすことがわかる。
ングリコール 「オリゴヌクレオチドの六先行例に示した合成法を用いて、5′
−末端ポリエチレングリコールに結合した20塩基長のオリゴヌクレオチドを、
例4に記載したようにして作製した。これらの分子複合体を精製し、そして例1
0に記載したようにヘモグロビンの特異的発現の阻害におけるそれらの有効性に
ついて試験した。
男−」L−表
培養細胞でのヘモグロビン合成の阻害に対するポリエチレングリコール接合体の
効果
1″)第1表を参照のこと。
第5表に示すように、得られた結果が示すところによれば、ポリエチレングリコ
ールに結合したオリゴマーは所望の程度の選択的合成阻害の生成において、対照
より効果的であった。
この例におけるポリエチレングリコール接合体は、20マ一体とポリエチレンレ
ンゲリコールとの対照組み合わせよりも約10倍活性が高いことが見出された。
さらに、PEG接合体収ついて観察される増加した有効性と一致して、培地への
ポリエチレングリコールの単なる添加が、添加された対照アンチセンスオリゴマ
ーの有効性を増加せしめることに注目することは興味深い。
上記の結果から、本発明の新規な接合体が、転写機構を調節する効率の増強にお
いて実質的な利点を提供することが明らかである。この発明に従えば、広範な種
類の細胞性(原核性及び真核性の両方)、並びにウィルス性の、生理的過程が制
御され得る。この組成物はインビトロ及びインビボで使用することができる。前
者においては、哺乳類のマイコプラズマからの保護、表現型の変更等の機構を研
究することができる。後者においては、病原体の増殖阻害、ある種の細胞、例え
ばB−細胞及びT−細胞の選択的阻害等における療法のために組成物を使用する
ことができる。
この明細書に記載したすべての刊行物及び特許出願はこの発明が属する分野にお
ける通常の知識を有するものの技術水準を示すものである。すべての刊行物及び
特許出願は、各それぞれの刊行物又は特許出願が引用により組み含まれるべきこ
とが特定して且つ個別的に示されていたのと同様に、引用によりこの明細書に組
み込まれる。
前記の発明は理解を明瞭にするために説明により及び例示により幾分詳細に記載
されたが添付された詳細の範囲の範囲内において幾かの変化及び変更が行われ得
ることは自明であろう。
手続補正書(方式)
特許庁長官 吉 1)文 毅 殿
1、事件の表示
PCT/US88102009
2、発明の名称
新規な両親媒性核酸接合体
3、補正をする者
事件との関係 特許出願人
名称 シンセティック ジェネティクス4、代理人
住所 〒105東京M港区虎ノ門−丁目8番10号静光虎ノ門ビル 電話504
−07215、補正命令の日付
平成1年11月7日(発送日)
6、補正の対象
(1) 特許法第184条の5第1項の規定による書面の「特許出願人の代表者
」の欄
(2) 明細書及び請求の範囲の翻訳文(3)委任状
(4)法人証明書
7、補正の内容
(1) (3ン(4) 別紙の通り
(2)明細書、請求の範囲の翻訳文の浄書(内容に変更なし)
8、添付書類の目録
<11 訂正した特許法第184条の5第1項の規定による書面 1通
(2] 明細書及び請求の範囲の翻訳文 各1通(3) 委任状及びその翻訳文
各1通(4)法人証明書及びその翻訳文 各1通国際調査報告
t+r=/l+<all/nl;1fll’IQ
Claims (19)
- 1.細胞中でのメッセンジャーRNAの成熟及び翻訳を阻害する方法であって、 該細胞を、該細胞の転写生成物に相互的なオリゴヌクレオチド配列及び両親媒性 分子を得るために該オリゴヌクレオチド配列に共有結合により連結された基を含 んで成る組成物を接触せしめ、これにより該組成物を細胞内に移行せしめて前記 転写生成物の成熟及び/又は翻訳の阻害を生じさせる、ことを含んでなる方法。
- 2.前記細胞が培養されたものであり、そして前記組成物が栄養培地に導入され る、請求項1に記載の方法。
- 3.前記オリゴヌクレオチドが約6〜30ヌクレオチドから成るものである、請 求項1に記載の方法。
- 4.前記オリゴヌクレオチドの少なくとも1つがリン成分としてホスフェートを 有する、請求項3に記載の方法。
- 5.前記オリゴヌクレオチドの少なくとも1つがリン成分として1〜3個の炭素 原子のアルキル基を有するホスホネートを有する、請求項3に記載の方法。
- 6.前記基が疎水性芳香族基である、請求項1に記載の方法。
- 7.前記芳香族基がトリチル基である、請求項7に記載の方法。
- 8.前記芳香族基がフルオレッセイン基である、請求項7に記載の方法。
- 9.前記基がポリアルキレンオキシ基であり、ここで該アルキレンは2〜10個 の炭素原子から成るものである、請求項1に記載の方法。
- 10.前記ポリアルキレンオキシ基が約6〜200単位から成るものである、請 求項9に記載の方法。
- 11.細胞の転写生成物に相補的なオリゴヌクレオチド配列及び両親媒性を得る ために該オリゴヌクレオチドに共有結合された両親媒性又は疎水性基を含んで成 る組成物を含む細胞。
- 12.前記細胞が培養細胞である、請求項11に記載の細胞。
- 13.細胞の転写生成物に相補的な少なくとも6個のヌクレオチドから成るオリ ゴヌクレオチド配列;アルキレンが2〜10個の炭素原子を有するポリアルキレ ンオキシ基を含んで成る両親媒性基;並びに前記オリゴヌクレオチド配列及び前 記両親媒性基に共有結合した、少なくとも1個の炭素原子を有するリンカー;を 含んで成る組成物。
- 14.前記ヌクレオチドが6〜30ヌクレオチドから成るものである、請求項1 3に記載の組成物。
- 15.前記オリゴヌクレオチドの少なくとも1つがリン成分としてホスフェート を有する、請求項13に記載の組成物。
- 16.前記オリゴヌクレオチドの少なくとも1つがリン成分として1〜3個の炭 素原子を有するアルキル基を伴うホスホネートを有する、請求項13に記載の組 成物。
- 17.前記連結基が、アミノ、キノン、チオエーテル又はアミド基の少なくとも 1つを含む、請求項13に記載の組成物。
- 18.前記オリゴヌクレオチド配列が少なくとも部分的に非コード配列に相補的 である、請求項13に記載の組成物。
- 19.前記オリゴヌクレオチド配列が少なくとも部分的にコード配列に相補的で ある、請求項13に記載の組成物。
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