JPH06500322A - 慢性骨髄性白血病の治療剤としての、ソラーレンと結合したメチルりん酸オリゴヌクレオチド - Google Patents
慢性骨髄性白血病の治療剤としての、ソラーレンと結合したメチルりん酸オリゴヌクレオチドInfo
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
慢性骨髄性白血病の治療剤としての、ソラージンと結合したメチルりん酸オリゴ
ヌクレオチド
技術分野
ソラージンと結合(conjugate) L/たメチルりん酸オリゴマーは1
本鎖DNAおよびRNAと配列特異的な方法でクロスリンキングすることができ
ることが報告されている[ミラーら(P、 S、 Miller et al、
) 、 Biochemistry、 1988. vol、 27D p。
3197; Biochemistry、 1988. vol、 27. p
、 9113; Nucleic Ac1ds Res、 A 1988. V
Ol、 16゜
p、 10697; Bioconjugate Chemistry、 19
90. vol、 1. p、 82] oこれらの化合物■■■
の合成経路は3−[(2−アミノエチル)カルバモイル]ソラージンまたは4゛
−[(N−(アミノエチル)アミノ)メチル] −4,5’ 、8−トリメチル
ソラージンと、5′ −りん酸形のメチルりん酸オリゴマーとを、水および可溶
性カーポジイミドの存在下で反応させることからなる。これによりソラージン部
分とオリゴマーとの間のホスホラミダート(phosphoramidate)
結合が生じる。ミラーら(Miller)の方法が採用した化学の性質により、
ソラージンの結合は、オリゴマーの5°−末端にしか報告されていない。
ソラージンー結合メチルりん酸オリゴマーの標的DNAまたはRNAとのクロス
リンキングは365nm照射の間に起きる[総説、キメラら(C,D、 C1m
1no etal、)、^nn、 Rev、 Bioshem、 、 1985
. vol、 54. p、 1151)。簡単に言えば、ソラージンの4’、
5’(フラン側)および/または3,4(ピロン側)の炭素2重結合がピリミジ
ンと環付加反応することにより/クロブタン結合が形成され得る。これらの結合
は260nm照射の下で可逆的である。
通常のオリゴヌクレオチドのりん酸ジエステルのソラージン複合体も記載されて
いる。自動合成法でオリゴマーの5゛末端にカップリングし得る、4゛ −ヒド
ロキシメチル−4,5°、8−トリメチルソラージン類似のホスホラミダイト試
薬が開発された[ビールス(U、 Pieles)およびイングリッシュ[(U
、English) 。
Nucleic Ac1ds Res、、 1989.vol、 17.p、2
85] o水溶性カーポジイミドを用いて5° りん酸化オリゴマーと結合させ
るため、−級アミン内で終了する、開裂可能なジスルフィド結合をもった4′−
(アミノメチル)−4,5°、8−トリメチルソラーリン類似体が合成された[
テアラ(J、 Teara) およびウオジンツァイン(P、 follenz
ein) 、 Nucleic Ac1ds Res、 、 1990. vo
l、 1g、p、855] oこれ轤■獅■
は、いずれもそれらがソラージンの、オリゴマーの5゛末端への結合のみを可能
にするという欠点を有する。またデオキシアデノシンのC8位にソラージン類似
体を結合させてオリゴヌクレオチドに導入するためのホスホラミダイト試薬に変
換している[ビールスら(U、 Pieles et al、 ) 、 Nuc
leic Ac1ds Res、 、 1989. vatA 17゜
p、 8967]。後者の試薬ではアデニン位への結合のみが可能であり、塩基
対形成を妨害する可能性がある。
最初にがんに関連した染色体の特異的な異常として発見されたのは、発見地に由
来してフィラデルフィア染色体(Phりと命名された異常である。この小さい染
色体は、無制御な骨髄幹細胞の増殖を伴う、不変の致死性かんである慢性骨髄性
白血病(CML)患者の、少なくとも90%に報告されている。この染色体異常
はANLL (急性非リンパ性白血病)およびALL (急性リンパ性白血病)
等の他の型の白血病の患者にも見いだされている。PhIは9番染色体に関連す
る22番染色体の相互転座によって誘発される(染色体22番のロングアームの
一部が9番染色体に転座し、9番染色体のロングアームの先端の小さい断片が2
2番染色体に転座している)。かくして2つの異常な染色体(Ph’および9q
゛)が生成される。Ph1の生成には2つの染色体の切断が必要である。1つは
22番染色体の、bcr遺伝子内のブレイクポイントクラスター領域(”bcr
“)と呼ばれる領域で起こる。第2の開裂は9番染色体のabl遺伝子の5′側
半分で起こる。9番染色体と22番染色体とが融合してPhlが形成されると、
bar遺伝子の5°側半分は、ablの5°側で終結し、2つの遺伝子は同じ転
写方向性を有する。両遺伝子を含む大きい前駆体RNAがスプライシングされb
cr遺伝子の5′工クソン群がc−ablの中央の特定のエクソンと結合する。
abl遺伝子のアミノ酸配列は腫瘍遺伝子のチロシンキナーゼ類と相同性を有す
る。正常な原腫瘍遺伝子(プロトオンコゲン)、c−ablの生成物に含まれる
チロシンキナーゼ活性は通常、N−末端に見いだされるペプチド配列のダウンレ
ギュレーションを受けている。このペプチドを除去し、bcrペプチド片で置き
換えると酵素が活性化形に固定される。CML細胞に見いだされるbcr−ab
l融合タンパク質であるP210は検出可能なチロシンキナーゼ特異的キナーゼ
活性を有する。bcr遺伝子がablの活性化になんらかの役割を果していると
仮定された。さらに、bcrのablへの融合は、過剰生産され得る、正常でな
いab1融合タンパク質を惹起し、したがって、そのような細胞のがん化に関与
し得る。
P210””″b1タンパク質をコードするレトロウィルスに感染したマウスは
、ヒトの慢性骨髄性白血病(CML)と極めて類似した骨髄増殖症候群を発現し
、このことはP 210 be””’発現がCMLを誘発し得ることを示唆する
ものである[ダレ−ら(Daley、G、O,et al、) 、 5cien
ce 247:824−830(1990)コ。
発明の要約
1つの側面として、本発明は、4°−アミノメチル、4. 5’ 、8−1−リ
メチルソラージン類似体を、反応性1級アミノ基を有する第2の分子種と好都合
に力・ツブリングさせるための試薬を目的とする。本発明者らは該試薬が、リン
酸ジエステルオリゴマー、および、とりわけアルキル−およびアリール−りん酸
オリゴマーを含むソラージン結合オリゴマーの製造に適することを見いだした。
好ましいアルキル−およびアリール−りん酸オリゴマーにはメチルりん酸オリゴ
マーが含まれる。本発明の好ましい態様では、これらのオリゴマーは、本明細書
ならびに本願出願人による出願中の特許出願「オリゴマーのための改良された非
−ヌクレオチド基盤リンカ−試薬(Improved Non−nucleot
ide−based Linker Reagents)Jに記載の非ヌクレオ
チド試薬を用い、反応性アミンを含むように修飾されている。
1つの側面として、本発明のソラージン標識化剤は4°−アミノメチル−4゜5
°、8−トリメチルp−ソラーシンのアミノ基に、側鎖を介して結合したN−ヒ
ドロキシスクシンイミド(NHS)活性化エステル部分を含む。NH3活性化エ
ステルの機能性については1級アミンを含む生物分子に化学部分を結合させるこ
とが報告されている。本発明はまた新規な本発明のソラージン試薬の新規な製造
方法をも提供するものである。
本発明はまた、このソラージン試薬と1級アミンリンカ−で修飾したアルキル−
およびアリールりん酸オリゴマーとをカップリング反応させる方法をも提供する
。一度カノブリングすると、生成したソラージンー結合オリゴマーは、逆相高速
液体クロマトグラフィーにより、未反応オリゴマーから容易に単離される。
本発明は、縮合剤として、既存のカーポジイミド(不都合にも、ヌクレオチド塩
基との副反応で好ましくない副生成物を与える)を用いる方法に比較して、好都
合な、ソラージンのオリゴマーへの結合法を提供する。ボッシュら(Ghosh
S。
S、) 、 Nucl、 Ac1ds Res、 15(13):5353−5
372(1987)参照。
従って、本発明では、その1側面として、P 210 be”ゝlの発現を干渉
することを目的とするものであり、すなわち、ソラージンと結合したオリゴマー
をbcr−ablmRNAにハイブリダイズさせ、次いでオリゴマーをmRNA
とクロスリンキングさせることによりP210bc””’を介する形質転換およ
びCML−状態の誘導を妨害し得るものである。正常なabl遺伝子の領域に相
補的なオリゴマーは、bcr/ablに相補的なオリゴマー、および、特にbc
r/ab1連結部位に相補的なオリゴマーと同様、CML細胞内のP210チロ
シンキナーゼ活性のダウンレギュレーションに有用であり得る。フィラデルフィ
ア染色体のキメラbcr/ab1mRNAのbcr/abl領域に相補的なこれ
らのオリゴマー配列が合成された。mRNAのそれと相補的なソラージン標識オ
リゴマーの複合体はこれらオリゴヌクレオチドのmRNAの翻訳への阻害効果、
およびその対応するP210チロシンキナーゼへの発現の阻害効果を促進する。
この阻害は慢性骨髄性白血病患者の異常な細胞のダウンレギュレーションを目的
とする。
好ましい側面では、bcr/abl、好ましくはbcr/abl連結部位に相補
的なオリゴマー、そして選択的にキメラbc r/ab1mRNAとハイブリダ
イズするオリゴマーを選択する。そのようなオリゴマーはそれがキメラbcr/
ab1mRNAのみとハイブリダイズし正常なab1mRNA配列とはハイブリ
ダイズしないよう、十分な長さを有する。
定義
本明細書中、そうでないことが明記されていない限り、下記の語句は以下の意味
を有する。
「ヌクレオシド」という語句はヌクレオシド単位を含み、これらの語句は相互変
換可能に用いる。
「ヌクレオチド」という語句はりん酸基、5炭糖、および窒素含有塩基からなる
核酸のサブユニットを意味する。RNAにおいては5炭糖はリポースである。
DNAでは、それは2−デオキシリボースである。この語句はまた、そのような
サブユニットの類似体をも含む。
「ヌクレオチドマルチマー(多量体)」という語句はりん酸ジエステル結合によ
って結合したヌクレオチド鎖またはその類似体を指す。
「オリゴヌクレオチド」という語句は、通常、長さ約10〜100ヌクレオチド
長さのヌクレオチドマルチマーを指すが、長さ100ヌクレオチド以上であって
もよい。それらは通常、ヌクレオチドモノマーから合成されると考えられるが、
酵素的な手段で得られたものであってもよい。
「デオキシリボオリゴヌクレオチド」という語句はデオキシリボヌクレオチドモ
ノマーを含むオリゴヌクレオチドである。
「ポリヌクレオチド」とは通常、約100ヌクレオチドまたはそれ以上の長さの
ヌクレオチドマルチマーを指す。これらは一般に、生物学的な起源または酵素的
な手段で得られる。
「ヌクレオチドマルチマープローブ」とは第2のヌクレオチドマルチマーに含ま
れる標的ヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列であり、通常、ポリヌク
レオチドである。通常、プローブは好ましくは標的配列内の対応する塩基と相補
的であるように選択される。しかしながら、プローブ内の1またはそれ以上のヌ
クレオチドは標的配列内の対応する塩基と相補的でないことが適切であるか、む
しろ好ましい場合もある。
「非ヌクレオチドモノマーユニット」とはポリマーのハイブリダイゼーションに
重大な関与がないモノマー単位を指す。そのようなモノマー単位は、例えば、ヌ
クレオチドとの重要な水素結合に関与してはならず、その成分として5ヌクレオ
チド塩基またはその類似体の1つを有するものは除外されるであろう。
「ヌクレオチド/非ヌクレオチドポリマー」とはヌクレオチドおよび非ヌクレオ
チドモノマー単位からなるポリマーを指す。
「オリゴヌクレオチド/非ヌクレオチドマルチマー」とは通常、100ヌクレオ
チド以下の合成マルチマーを指すが、200ヌクレオチド以上を含むもの、およ
び1またはそれ以上の非ヌクレオチドモノマー単位を含むものも包含してよい。
「モノマーユニット」とは、ポリマーに寄与する、本発明のヌクレオチド試薬ま
たは非ヌクレオチド試薬のいずれかの単位を指す。
「ハイブリッド」とは相補的な塩基間におけるワトノンークリック塩基対形成に
よって形成された複合体である。
「オリゴマー」という語句はオリゴヌクレオチド、非イオン性オリゴヌクレオシ
ドアルキル−およびアリール−りん酸エステル類似体、オリゴヌクレオチドのホ
スホロチオラート類似体、オリゴヌクレオチドのホスホアミダート類似体、中性
りん酸エステルオリゴヌクレオチド類似体、例えば、りん酸トリエステルや他の
オリゴヌクレオチド類似体および他のオリゴヌクレオチド類似体および修飾した
オリゴヌクレオチド等を指し、ヌクレオチド/非ヌクレオチドポリマーも包含す
る。この語句はまた、モノマー単位間またはそれ以上のりん酸結合がカルバマー
ト結合等の非りん酸結合で置換されている、ヌクレオチド/非ヌクレオチドポリ
マーをも包含する。
「アルキル−またはアリール−りん酸化オリゴマー」という語句は、ホスホジエ
ステル結合が少なくとも1つのアルキル−またはアリール−りん酸結合で置換さ
れたヌクレオシド間(またはモノマー間)りん酸基結合を有するヌクレオチドオ
リゴマー(またはヌクレオチド/非ヌクレオチドポリマー)を指す。
「メチルりん酸オリゴマー」 (またはMP−オリゴマー)という語句は、ホス
ホンエステル結合が、少なくとも1つのメチルりん酸ヌクレオシド間結合で置換
された、ヌクレオシド間(またはモノマー間)りん酸基結合を有するヌクレオチ
ドオリゴマー(またはヌクレオチド/非ヌクレオチドポリマー)を指す。
本明細書に列挙した種々のオリゴマー配列のあるものでは、”p”、例えばAp
人におけるそれはりん酸ンエステル結合を指し、例えばC2Gにおけるπ”はメ
チルりん酸結合を表す。他のあるものは、りん酸ジエステル結合を表すためにp
または■を用いずに表現されている。そのような場合にはATCにおけるAはA
の3゛炭素とTの5′炭素とのンエステル結合を表し、他方ATCまたはATC
におけるAはAの3°炭素とTまたはTの5°炭素とのメチルりん酸結合を表す
。
「悪影響を及ぼさない条件」という語句は(反応または合成)条件であって、実
質上、ポリマー骨格およびその糖、塩基、リンカ−アームおよび標識成分にとっ
て不利益でなく、またモノマー試薬にとっても不利益でない条件を指す。当業者
はこれらの基準に適合する機能性、カップリング法、脱保護法および開裂条件を
容易に決定できる。
「税ブロッキング条件」という語句はリボースまたはデオキシリボースの5゛−
〇H基からプロ、キング(または保護)基を除去するために用いられる条件を指
す。
「脱保護条件」という語句はヌクレオシド塩基から保護基を除去するための条件
を指す。
「キメラmRNAJという語句は、通常は隣接していないが、染色体転座、組換
え等によって一緒になった2またはそれ以上の遺伝子配列部分の転写物であるメ
ッセンシャーRN Aを指す。
「タンデムオリゴヌクレオチド」または「タンデムオリゴマー」という語句は標
的核酸配列の5′または3゛配列に対して相補的であり、標的配列に相補的なオ
リゴマーと同時にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドまたはオリゴマーを指
す。タンデムオリゴマーは、標的核酸配列の2次構造を減少する等によって、そ
のようなオリゴマーが標的配列に接近し易(することにより、そのようなオリゴ
マーと標的とのハイブリダイゼーションを向上させることができる。
図面の簡単な説明
図IA、IBおよびICは本発明のソラーリン試薬と複合体化し得るFmo c
−保護リンカ−アームを有する非ヌクレオチド試薬を示す。
図2は、図IBの非ヌクレオチド試薬の合成反応式を示す。
図3は、図ICの非ヌクレオチド試薬の合成反応式を示す。
図4は、本発明の好ましいソラーリン試薬の合成反応式を示す。
図5は、好ましいソラーリン試薬と非ヌクレオチド試薬との複合体の合成反応式
を示す。
図6はbcr/ab1mRNA部分に相補的な、ソラーリンと結合した非ヌクレ
オチドモノマー単位を組み込むオリゴマーのヌクレオチド配列を示す。
本発明によれば、オリゴマーにソラーリン類似部分を結合させるための好ましい
試薬は、式:
(式中、kは0から】2の整数、Esは核性部分と力・ツブ1)ングすることカ
ベできる部分を表す)
で示される化合物を含む。例えば、Esは容易に第2の核性部分で置換される脱
離基を有する活性化エステルを含んでいてもよL)。kが2〜6である化合物力
く好ましい。好ましいEs基として、例えば、N−ヒドロキシスクシンイミド活
性化エステル類、ハロアセチル、イソチオシアナート、マレイミド等力(例示さ
れる。
特に好ましい化合物はkが2である化合物である。特1こ好ましし\Es基の1
.%Ilま下記で示される。
これらの本発明のソラーリン試薬は実施例1から3に記載の方法で好都合に製造
することができる。1つの好ましい側面では、これらの゛ノラーリン試薬j′!
、従来の水溶性カーポジイミドの使用と異なり、ヌクレオチド塩基へのil1反
応カベ最/JX限にとどまる条件下、求核性の非ヌクレオチド試薬で修飾した第
1ノコ゛マーと好都合にカップリングする。
好ましいオリゴマー
本発明のソラーリン試薬と結合させる上で好ましいオリコ′マー1こ1嘘、実施
!!Al4−11および出願中の特許出願[オリゴマーのための改良されたDr
−ヌクレオチドに基づくリンカ−試薬(Improved Non−nucle
otide−based Linker Reagents)Jに記載の非ヌク
レオチド試薬を用い、1またはそれ以上の非ヌクレオチドモノマー組み込むよう
修飾したオリゴマーが含まれる。特ζこ好ましL)オ’)ゴマ−1こ(ま、少な
くとも1個のそのような非ヌクレオチドを組み込むアルキル−ルーりん酸ヌクレ
オチドモノマーが含まれる。時に好ましL%アルキル−リール−りん酸オリゴマ
ーにはメチルりん酸第1ノゴマーカく含まれる。
有利なアルキル−およびアリール−りん酸オリゴマーは、細胞によるオリゴマー
の取り込みをより良くする非イオン性りん酸バックボーンを有する。また、その
ようなアルキル−およびアリール−りん酸オリゴマーのモノマー間のアルキル−
およびアリール−りん酸結合はヌクレアーゼに対して好都合に抵抗する。
オリゴマーがアルキル−またはアリール−りん酸オリゴマーを含有すると、それ
は修飾したリボシル部分を有するヌクレオシドモノマー単位の導入に役立つ。
これらのアルキル−またはアリール−りん酸オリゴマーに2′−〇ーアルキルー
および特に2′ −〇ーメチルー、リボシル部分を有するヌクレオチド単位を用
いることは、オリゴマーとそれに相補的な標的核酸配列とのハイブリダイゼーシ
ョンの改良に役立つであろう。
これらのソラーリン試薬と共に用いるのに好ましい非ヌクレオチド試薬は非ヌク
レオチドモノマー単位を含み、その骨格(スケルトン)は2から約10個までの
炭素原子のバックボーンを持ち、該バックボーンは少な(とも1個のヌクレオチ
ド/非ヌクレオチドポリマー内にカップリングしたとき純粋なキラル性を保持し
得る不斉炭素を少なくとも1個含有するものである。約3個の炭素原子のバック
ボーンを有するスケルトンが好ましく、それは部分的には、そのようなバックボ
ーンがデオキシリボース基の3−炭素間隔に類似するからである。
そのような好ましい非ヌクレオチド試薬群の1つは、オリゴマーに導入されたと
きキラル的に純粋な、式:
(式中、SKELは炭素数的1から約20個のキラル的に純粋な非ヌクレオチド
骨格を表し、ここにーNHL,YおよびZはSKELの炭素原子と共宵結合的に
結合しており、Lはリガンド、Yは一CH2−、−〇−、−S−または−NH−
、そしてZはーO−、−S−または−NH−を表す)で示される非ヌクレオチド
モノマー単位を含む、キラル的に純粋な11ヌクレオチド試薬を含有している。
好ましくは、SKELはさら1こYおよびZを分離する約1から約10?[1の
炭素原子のバックボーンを含有する。これらの好ましc)sKEL群を組み込む
非ヌクレオチドモノマー単位の例には以下のもの力(含まれる。
(式中、X6基は独立して水素またはアルキルから選択され、同一または異なっ
ていてよく、qおよびrは独立してOから10までの整数から選択される。)即
ち、1つの態様では、これらの好ましい非ヌクレオチド試薬は一般式。
[式中、−Y−Cp,は第1カツプリング基、−Z−CI)2はプロ・ツクされ
た第2カツプリング基、ここにり、YおよびZは上記定義に従い、そして(a)
第1カツプリング基、 Y − C p 1は下記の式:(式中、XIはハロゲ
ンまたは置換アミノ:X2は)10ゲン、アミノまたは1換アミノ、またはO−
;R.はアルキル、所望により置換されていてもよいアルコキシまたは所望によ
り置換されていてもよいアリールオキシ;そしてR,はアルキル所望により置換
されていてもよいアルコキン、所望により置換されて0てもよ(為アリールオキ
シ、またはX2がQ−のとき、所望により水素;Uは酸素、硫黄またはイミノ、
Wはアルキル、アリール、アルコキシ、アリールオキシ、アルキルチオ、アリー
ルチオ、S−、O−、アミンまたは置換アミノ、そしてVはアルコキン、アルキ
ルチす、アミノまたは置換アミノを表す。)から選択される。
(b)第2のブロックされたカップリング基−ZCpxにおいてCpzは脱プロ
ソキング条件下で開裂され第2カップリング基−XHを回収し得るブロッキング
基を表し、Zは一〇−1−NH−または−S−を表す。]で示される。
好ましいものはアルキル−またはアリール−りん酸、特にメチルりん酸、モノマ
ー単位間ジエステル結合を形成し得る非ヌクレオチド試薬なので、特に好ましい
非ヌクレオチド試薬は第1カツプリング基、−ycp、b<、(ここに、X、は
クロロまたは2級アミ人Rsはアルキル:X2は置換アミノ、ハロゲンまたはO
−、モしてR6はアルキルを表す)から選択される。]
で示される。
゛リガンド部分、Lは好ましくは機能的な部分または悪影響のない条件下で脱保
護され、ついで機能的な部分と結合し得る(悪影響のない条件下)、保護された
連結(リンキング)アームから選択される。
本発明の1つの好ましい面では、Lは保護基、Pr、またはソラーリンのような
りロスリンキング剤等の、悪影響のない条件下で脱保護され、次いで機能的な部
分と結合し得るリンカ−アーム、または薬物担体分子を含む。好ましいリンカ−
アームは以下の式:
(式中、nおよびmは独立して1から15、好ましくは1から5までの整数、P
rは悪影響のない条件下で脱保護され得る保護基を表す)で示されるものを1つ
含む。
特に好ましい非ヌクレオチド試薬の1群はアミノ酸スレオニンから導かれた骨格
を有する。これらの好ましい試薬は2個の不斉炭素を含む3−炭素バックボーン
を有し、それら不斉炭素の各々はヌクレオチド/非ヌクレオチドポリマーに導入
されたときキラル純粋性を保持している。加えて、スレオニンから導かれたバ・
ツクボーンを有するこれらの試薬は、1級および2級ヒドロキシル基を有し、そ
れらは反応性の相違にもとづいて、次の保護、脱保護、ブロッキング、脱プロ・
ツキング、および誘導体化工程での選択性および高収率を可能にするので好都合
である。本発明の1つの好ましい態様では、第1カツプリング基は2級ヒドロキ
シル基と会合し、第2のカップリング基は1級ヒドロキシル基と会合する。
このように、本発明の特に好ましい側面では、スレオニンに基づ(非ヌクレオチ
ド試薬は以下の式:
[式中、*Cはキラル的に純粋な不斉炭素であり、R1およびR2のいずれかは
水素であり、他は−NH−L、ここにLは以下に定義するりガント部分である;
R3およびR4の1方は水素であり、他は炭素原子数的1から約10個の低級ア
ルキル基であり、−Y−Cp、は第1カツプリング基、−ZCp、はブロックさ
れた第2カツプリング基を表す。)
を有する。ただし、
(a)第1カツプリング基、 Y Cp+ (ここにYは−CH2−l−5−1
−NH−または−〇−を表す)は、
(ここに、X、はハロゲンまたは置換アミン、X2はハロゲン、アミノまたは置
換アミノ、またはO−、R5はアルキル、所望により置換されていてもよいアル
コキシまたは所望により1換されていてもよいアリールオキシ、モしてR6はア
ルキル、所望により置換されていてもよいアルコキシ、所望により置換されてい
てもよいアリールオキジ、またはX2がO−のとき、所望により水素、T:は酸
素または硫黄、Wはアルキル、アリール、アルコキン、了り−ルオキシ、アルキ
ルチオ、アリールチオ、O\S−、アミノまたは置換アミノ、そしてVはアルコ
キン、アルキルチオ、アミンまたは置換アミノを表す。)から選択され
(b)第2のブロックされたカップリング基−ZCp、においてCI)2は脱プ
ロ・ノキング条件下で開裂され、第2カップリング基−ZHを回収し得る保護基
を表し、Zは一〇−1−NH−または−S−を表す。]で示される。
リガンド部分、Lは好ましくは機能的な部分または悪影響のない条件下で脱保護
され、ついで機能的な部分と結合し得る(悪影響のない条件下)、保護された連
結(リンキング)アームから選択される。
本発明のソラーリン試薬と共に用いるのに好ましい非ヌクレオチド試薬はC2お
よびC4リンカ−アームを有するものを含む。ソラーリンと結合した非ヌクレオ
チド試薬がオリゴマーの内部配列に導入されると、リンカ−アームを有するC2
およびC4非ヌクレオチド試薬はクロスリンキングを光道すると思われる。ソラ
ーリンと結合した非ヌクレオチド試薬がオリゴマーの3′末端または3′末端か
らモノマー1個程度前に導入されると、C4リンカ−アームを有する非ヌクレオ
チド試薬は相補的な核酸との有効なりロスリンキングに役立つ。
好ましいオリゴマーは、本発明のソラーリン試薬の1つが、非ヌクレオチドモノ
マー単位の末端アミンと反応しくアミンの脱保護の後)、ソラーリンと結合した
オリゴマーを与えるものである。ソラーリンと結合した非ヌクレオチドモノマー
単位と相補的な標的核酸とのクロスワンキングを促進するという観点から、好ま
しいオリゴマーはソラーリンと結合した非ヌクレオチドモノマー単位が相補鎖の
チミジン、ウリジンまたはシチジン塩基の側方または近くに導入されているか、
あるいは、相補鎖のチミジンまたはウリジン塩基との反応の便宜上、対応する非
センス鎖のアデニンまたはグアニン塩基の隣または近くに導入されていることが
好ましい。非ヌクレオチドモノマー単位が非センス鎖のアデニンおよびチミジン
塩基(5’ −3’ )の間に位置することがより好ましい。
即ち、好ましいオリゴマーは、上記構造の1つの非ヌクレオチドモノマー単位を
有し、適当なソラーリン試薬との反応の後、Lは、ps。
−Ps。
−C−(CH21,−NH−Pg 、およびo 0
−C−(CH2)、−NH−C−(CM、) l、−NH−Ps(ここに、nお
よびmは独:して約1から約15、好ましくは1から5までの整数、Psはソラ
ーリン部分を含む)
から選択されるものである。好ましくは、ソラーリン部分は式:(式中、kは0
から12の整数を表す)で示される。
好ましくは、オリゴマーは約6から約25ヌクレオチド、より好ましくは約12
から約20ヌクレオチドを含有する。そのようなオリゴマーは約1から約5まで
の独立して選択される非ヌクレオチドモノマー単位を有する。約20ヌクレオチ
ド以上を含有するオリゴマーも使用可能であるが、より長い配列に関する相補性
が要求され、溶解性および標的核酸(例えばmRNA)の2次構造の形成に抗し
て、細胞膜透過を最大にするためには、より短いタンデムオリゴマーを用いるほ
うが望ましい。
産業上の利用分野
本発明によれば、ソラーリンと結合した非ヌクレオチドモノマー単位を組み込む
、選択された標的核酸配列、RNAまたはDNAと相補的なオリゴマーを合成す
ることができる。標的核酸にソラーリンと結合したオリゴマーをハイブリダイズ
させた後、ソラーリン部分を、環付加反応によって相補的な核酸の標的ピリミジ
ン塩基とクロスリンキングさせる。そのようなオリゴマーと標的核酸とのクロス
リンキングは核酸の転写または翻訳機能を妨害する。例えば、標的核酸がmRN
Aであれば、オリゴマーのmRNAへのクロスリンキングはその翻訳を妨げ、し
たがって、それがコードするポリペプチドの発現を阻害する。さらに、そのよう
なオリゴマーとmRNAとのクロスリンキングはアンチセンスオリゴマーの相補
的標的配列へのハイブリダイゼーションの阻害を増強し得る。
このように、本発明は、さらにアンチセンス鎖の、アンチセンスソラーリンー結
合オリゴマーを標的の相補核酸とハイブリダイゼーションさせ、ソラーリン部分
と相補的標的核酸配列とのクロスリンキングを惹起することにより、アンチセン
スオリゴマーの核酸機能を干渉および/または阻害する効果を増強する方法を特
徴とする特に、これらのソラーリンー結合オリゴマーは、オリゴマーをmRNA
にハイブリダイゼーションさせ、次いで、ソラーリンとmRNAとのクロスリン
キングを惹起してその翻訳を妨害することにより、ある種のmRNAにコードさ
れているタンパク質の合成を阻害するために用い得る。
1つの応用では、フィラデルフィア染色体を有する細胞内に存在するキメラmR
,NAのbcrおよびabl連結部に相補的なソラーリンと結合したオリゴマー
を合成する。(異常な)フィラデルフィア染色体を生じる相互転座では、bcr
遺伝子(9番染色体から)がc−abl遺伝子(22番染色体から)と並置され
る。bcr/abl遺伝子のスプライシングでP210”’/”Iタンパク質を
コードするキメラmRNAが生成する。フィラデルフィア染色体の存在およびそ
れによるP 210 be”b+の発現は、ヒトでは慢性骨髄性白血病(CML
) 、動物(マウス)ではCML様症状をもたらすことが見い出された。ソラー
リンと結合したbcr/abl連結部に相補的なオリゴマーは、キメラmRNA
とのみハイブリダイズするであろう。したがって、もしもソラーリンと結合した
オリゴマーをまずbcr/ablキメラmRNAとハイブリダイズさせ、次いで
、mRNAとクロスリンキングさせれば、P210bC””b1タンパク質の発
現を阻害するであろう。
bcr/abl融合をもたらす転座はチロノンキナーゼをコードするc−abl
の5°末端を切除する。5° abl配列の除去の結果、この転座は、酵素のダ
ウンレギュレーションを喪失させる。さらに、bcrプロモーターの存在のため
に、P210タンパク質が過剰生産されるであろう。正常なabl領域に相補的
なオリゴマーはP210の過剰発現の防止に使用可能である。
本発明の理解を助けるために、以下に一連の実験の結果を示す実施例を示す。
本発明に関連する以下の実施例は、勿論、本発明を特に制限するものと考えるべ
きでなく、現在針かっている、または将来開発される本発明の変法であって、当
業者の予測の範囲内であるものは、後に特許請求する本発明の範囲に含まれるも
4°−クロロメチル−4,5’、8−トリメチルソラーリンをアイサックスら(
Issacs) (Biochemistry、 16. (1977)、 1
058−1064)の方法にしたがって合成した。
この化合物330mgを無水アセトニトリル100m1に溶解し、−10℃に冷
却した。この溶液に飽和するまで乾燥アンモニアを吹き込んだ。冷浴を取り除き
、反応混合物を室温まで昇温させ、次いで、1夜、撹拌した。溶媒を減圧下に蒸
発させ、残渣をテトラヒドロフラン/アセトン(3: 1)80+++1に溶解
し、濾過した。ろ液を乾燥し、上記標題の生成物300mg(定量的)を得た。
4゛−アミノメチル−4,5’ 、8−トリメチルソラーリン(300mg)を
無水ピリジンと共沸させて乾燥し、乾燥ピリジン30m1に溶解した。この溶液
に無水コハク酸500mgとジメチルアミノピリジン50mgとを加え、室温で
3時間撹拌した。反応をTLCで監視した。減圧下、ピリジンを蒸発させ、残渣
をジクロロメタン30m1に溶解し、メタノール5mlを加えた。生成物はこの
時点で析出し始めた。さらに追加のジクロロメタン30m1を加え、2時間後に
結晶を収集した、上記生成物370mgを得た。
4′−スクシンアミドメチル−4,5’、8−トリメチルソラーリン(100m
g)を無水ピリジンと共沸させて乾燥させた。乾燥した残渣を無水ジメチルホル
ミアミド(20mりと無水ジオキサン(201→に溶解した。この溶液に乾燥N
−ヒドロキシスクシンイミド700mgを加え、無水ジオキサン中、20%ジク
ロロヘキシルカーボンイミド(DCC)溶液2mlを加えた。反応混合物を室温
で1夜撹拌した。反応混合物をろ過し、ジオキサン30m1で洗浄した。ろ液を
蒸発乾固し、残渣を酢酸エチル40m1中で5分間音波処理した。スラリー状の
沈殿をろ過し、上記生成物110mgを得た。
実施例4 L−スレオニンメチルエステルの還元L−スレオニンメチルエステル
(Sigmaから購入)をスタンフィールドら(Stanfield) (J、
Org、 Chem、 (1981)、 46.4799)の方法にしたがっ
て還元した+500m1容の30フラスコに、L−スレオニンメチルエステル5
gと乾燥THF20QmIとを混合し、I M L i A I H4溶液50
m1をアルゴン雰囲気下、撹拌しながら滴下した。次いで、反応混合物をTHF
の沸点まで昇温させ、アルゴン雰囲気下、−夜還流させた。反応の終了は、シリ
カゲル上TLCにがけ、ニンヒドリンで観察するよってモニターした。反応混合
物を5−10℃に冷却し、0.25MNaOH(1001)を滴下して停止させ
た。混合物を蒸発させて90%以上のTHFを除去し、ろ過を容易にするために
残渣をジメチルホルムアミド100m1で希釈した。混合物をワットマン#1ろ
紙で真空アスピレータ−用いてろ過した。ろ液を蒸発乾固し、残渣をフラッシュ
シリカゲルカラムで精製した。カラムにジクロロメタンをバッキングし、生成物
をジクロロメタ2950%メタノールで溶離した。
以下の工程にしたがってFmoc−アミノ酪酸(C4リンカ−アームのため)を
調製した。(注意:他のFmoc−アミノカルボン酸は市販品を購入可能である
。例えば、Fmocアミノカプロン酸(C6リンカ−アームのため)およびFm
oc−グリシン(C2リンカ−アームのため)はBachem、 Inc、、
Torrance、 Ca1ifornia)から市販品を購入可能である。)
4−アミノ酪酸1.8gおよび炭酸水素ナトリウム124gの水/アセトン(5
0:50)35ml中混合物を調製し、Fmoc−スクシンイミジルカーボナ−
ト(N−フルオレニルメチルースクシンイミジルカーボナート) (Bache
m) 5gを加えた。反応混合物を室温で1夜撹拌した。IN MCIを用いて
反応混合物のpHを2に調整し、溶媒を減圧下除去し残渣をエタノール20m1
に溶解してろ過した。ろ液を蒸発乾固し、残渣をジクロロメタンにとり、ろ過し
、純粋な生成物4.8gを得た。
’HNMRin DMSO−ds、1゜61 (CH2) 、2.22 (CH
2)。
3、−01 (CHz N)、4.32 (CHz C=O)、4.22 (N
H)、725−7.95(8芳香族プロトン )実施例6 還元されたL−スレ
オニンのアミン部分のブロッキング上記Fmoc−アミノ酪酸の製造と票似の方
法で、還元したL−スレオニンのアミン部分を9−フルオレニルメトキシカルボ
ニル(Fmoc)基とカップリングさせた。1夜反応させた後、pHを調節する
必要はなかった。溶媒を除去し、残渣をジクロロメタン40m1に溶解し、水で
抽出した(2M50ml)。次いで、有機層を乾燥し、フラッシュシリカゲルク
ロマトグラフィーで精製した。生成物をジクロロメタン中2%メタノールで溶離
し生成物3.85 gを得た。
’HNMR,1,20(CHs) 、2.85 (NH) 、3.26 (CH
)、3゜4−8 (CH)、3.72 (OH)、7.3−7.9 (8芳香族
プ。ト−7)実施例7 Fmoc−ブロックリンカ−アームの製造・Fmoc−
グリシルアミド−カプロン酸(C8)、Fmoc−4−アミノブチリルアミド−
カプロン酸(CVIO)およびFmoc−カプロイルアミド−カプロン酸(CI
2)
上記のC8、C1OおよびC12リンカ−アームの合成のためにFmoc−グリ
シン、Fmoc−4−アミノ酪酸およびFmoc−アミノカプロン酸をアミノカ
プロン酸とカップリングさせた。所望のFmoc−アミノ酸(17mmol)を
乾燥ピリジン(3M30ml)と共沸蒸留することで乾燥した。次いで、乾燥物
を乾燥ジメチルホルムアミド30m1に溶解し、乾燥テトラヒドロフラン30m
1を加えた。溶液を0℃に冷却し、1当量(17mmol)のN、 N’ −ジ
イソプロピルエチルアミンを加えた。撹拌しながら、1当量のトリメチル酢酸ク
ロリドをO’Cで滴下し、45分間撹拌した。乾燥アミノカプロン酸1.2当量
を加え、反応混合物を室温まで昇温し、1夜撹拌した。反応の進行をTLCで監
視した。完了後、溶媒を減圧下、留去した。残渣を水50m1で再構築し、IN
HCIでpHを2に調節した。混合物を酢酸エチル100m1で抽出し、有機
層を水20m1で洗浄し、乾燥した(MgSO3)。次いで、混合物をろ過し、
容量約40111まで、溶媒を減圧下蒸留した。曇りが生じるまで、該溶液にへ
午サンを滴下し、加熱して清澄化した。次いで、生成物を1夜結晶化した。
上記実施例5または7に従って製造した所望のリンカ−アーム(llmmol)
[Fmoc−グリシン(C2) 、Fmoc、−4−アミノ酪酸(C4) 、
Fmoc−tブロン酸(C6) 、Fmo c−グリシルアミド−カプロン酸(
C8) 、Fmoc−4−アミノブチリルアミドカプロン酸(C10)およびF
moc−アミノカプロイルアミド−カプロン酸(C12)]をピリジン(3M3
0ml)と共沸蒸留することで乾燥した。次いで、乾燥した残渣を無水ジメチル
ホルムアミドと無水テトラヒドロフラン(1: 1) 混合物40m1に溶解し
た。溶液を水浴で冷却し1当量のジイソプロピルエチルアミンを加えた。撹拌し
ながら、1:1当量のトリメチル酢酸クロリドを滴下し、0℃で45分間撹拌し
た。1,5当量の還元しニスレ万ニン(上記実施例4)溶液を工え、反応混合物
を室温まで昇温し、1時間撹拌した。反応の進行をシリカゲルによるTLCに付
し、CH2C1z/ CHsOH/CH,C○○H(10:1・0.1)溶媒系
で展開することで監視した。
反応完了後、溶媒を減圧下、留去し、残渣を酢酸エチル5Qmlと混合した。飽
和炭酸水素アトリウム40m1で抽出し、水浴性物質を除云した。有機層を水2
0m1で洗浄し、乾燥した( M g S O4)。混合物を酢酸エチルから結
晶化した。
二と」す2九二 ’l(NMRin CH50−d6,1.0コ (04,、還
元L−xしt二y)、 コ、コ5 (OH)、3.3−145 (2CH)、3
.91 (NH)、’4.27(other NH)、 1.コ1. (OH)
、4.34 (C1(2)、4.63 (0M2 and CH2゜F’MOC
)、7j−7,9(8−−ffl族)e+ドア )−c、 1ノ′カー ’)I
掛αin CH50−d6,1.oコ (C)!3 還元L4に/オニン・)
、 162 (CM(2)、 2.144Cd2)、 2.91 (CBり、
2.97 (CM、)。
3.3−15 (2CM)、コ、6コ (Oi(l 、3.84 (OH)、4
.23 (CH)、4.33 (CHおよびc:q、、rMOC)、4.60
(NH)、6.コ2 (NT()、 7.コー7.9 (8−芳香族プロトンa
’H冶倶in DMSOd6 r l −0’3 (CHs 還元し−X レ
オニア)、 1.3−1.7 (コ C)!2’s)、2.52 (CH□、、
)l コ、12 (C::−C=O)。
3.8−3.9 (20H)、4.1−4.2 (2CH)、4.41 (CM
、、 FMOCI、5.22(茹)、6.48 (N”d)、7.コー7.9
(El−芳香族プロトン )。
e二 ’HNMRin CH50−d6 主要ジグfル(冊)、7.3−7.9
(8−芳香族プロトン )。
z四二畳ゴL二 ’2(冶Gin o態o−d6. 1.02 (CM、 ・y
1元L−x しtニア、1,1.3−1.50 (40M2’s)、3.64
(OH)、3.82 (OH)、4.g4(NH)、6.ココ (Ml()、6
.62 (NM)、7.3−7.9 (8−芳香族プロトン )。
C12す′カー ’HNMRin DFSO−d6. 主要ノブナル1.01
(O(3還元し一スレオニン )、1.コ〇−L50 (6C奪2’s) 、
3−C3(OH) 、 3−82 (OH) 、 4−62 (ドH)、6.コ
l (トH)。
6.63 (N’d)、7.3−7.9 (8−芳香族プロトン )。
実施例9 非ヌクレオチド試薬の1級ヒドロキシ部分のジメトキシトリチル化上
記、実施例6および8で調製した所望の非ヌクレオチド試薬(6mmol)を乾
燥ピリジンと共沸蒸留することで乾燥し、乾燥ピリジン15m1に溶解した。ジ
メトキシトリチルクロリド2.2gのCH2C1x/ピ’)ジン(1: 1)2
0ml中溶液20111を撹拌下、滴下した。室温で反応を45分間続けた。反
応の進行をTLCで監視した。反応完了後、メタノール2@1を加えてクエンチ
し、10分間撹拌した。溶媒を減圧下、留去し、残渣をジクロロメタン50m1
に溶解し、飽和炭酸水素ナトリウム(2X50ml) 、次いで、水(30ml
)で抽出した。
有機層を乾燥しくMg504)、ろ過した。溶媒の留去後、残渣をフラッシュカ
ラムクロマトグラフィーで精製した。生成物を0. 5%トリエチルアミン含有
ジクロロメタン中、2%メタノールで溶離した。
二と!L乙り二 ’HNXR,CDC1,、1,18(CM、、還元レースレオ
ニン)71.63 (OH)、2.83 (NH)l コ、77 (2CM、、
DMT)、3.82(CH2,FMOC)、5.48 (CH2−0−DMT
)、6.82−7.90 (21芳香族プoトン)。
−とニし’i−’H)rKR,CDCl、、Lu1l (CB3,1元+z−X
しtニア)/:]、7B (2CH!’s、 DMT)、4.35 (CH2−
0−DMT)、5.98()rH) 6.80−7.711 (2:L 芳香族
プロトン )。
fi ’HNMR,CDCl、(主要ピーク) 1.18 (CH3゜還元レー
スレオニン )、1+83 (CH2)、2.28 (CH2)、コ、74 (
2CH,。
DMT)、4.21 (OH)、4.38 (CH,、FMOC)、5−22
and 6.42 (2MHI、6.80−7.65 (21芳香族フロドア
)。
fi−ニア#−’HNMR,CDCl3 (主要ビー4) 112 (CHl。
還元レースレオニン )、Lロー1.6 (コ CH2’s)、175 (2C
H3゜DMT)、4.38 (CH,FMOC)、6.80−7.90 (21
芳香族プロトン)。
qLコし−41’HNKR,CDCl、(主fiピーク)1.12 (CH,、
ffi元レーしレオ’−7’ l、:1.80 (2CH3゜DMT)、 5.
42 (C)12. FMOC)、 6.18 and 6.321 (2NH
)、 6.82−7.80(21芳香族プロトン )・
Q二LJjニたユ ′Hめ伝、CDCl、、(主要ピーク)1・12 (CH,
還元レースレオニン )、 3.78 (2CH,。
Dlfr)、4.59 (CH2,FMOC)、6.8−7.8 (21芳香族
プロトン )。
9■Lニシク笠二’HNMR,CDCl、1.18 (CH37還元レースレを
ニア)。
17B (2CH,、DMT)、 4.40 (CH2,FMOC)、 6.8
−7.8 (21芳香族プロトン )
(全CH2およびCH(非芳香性)も説明されているが、帰属はされていない)
寒礁興1ユ 非ヌクレオチド試薬の2級ヒドロキシ紺盆9!チルホスユこヨと代
上記実施例9記載の方法に従って得られたDMTでブロッキングしたリンカ−ア
ーム(4waIol)を乾燥ピリジンと共沸蒸留することで乾燥し、残渣を無水
ジクロロメタン20m1に溶解した。密閉したアルゴン雰囲気下、ジイソプロピ
ルエチルアミン1.5当量を加え、N、N−ジイソプロピルメチルホスフィンア
ミド・塩化物[(CH3)zcH] zNP (CH3)C111,2当量を滴
下した。反応は45分間で終了した。溶媒を減圧下に除去し、残渣をシリカゲル
カラムによるフラッシュクロマトグラフィーで精製した。カラムに5%トリエチ
ルアミン含有酢酸エチル/ヘキサン(1:)をバッキングし、1%トリエチルア
ミン含有酢酸エチル/ヘキサンで洗浄した。次いで、反応混合物をカラムに負荷
し、生成物を1%トリエチルアミン含有酢酸エチル/ヘキサン(1: 1)で溶
離した。
他の非ヌクレオチド試薬は実施例9記載の方法に従って製造したリンカ−アーム
で修飾した試薬と、他のリン酸化剤、例えばN、 N−ジイソプロピルメチルホ
スホンアミド・塩化物[(CHz)tcH] 2NP (OCH3)CIおよび
2−シアノエチル N、N−ジイソプロピルクロロ−ホスホラミダイト等とのカ
ップリングによって製造される。
芳香族プロトン )。
実施例1106−リンカ−アームを有する非ヌクレオチド試薬の2級ヒドロキC
6−リンカ−アームを有するジメトキシトリチル(DMT)でブロッキングした
非ヌクレオチド試薬(本明細書の実施例9記載の方法で製造)を乾燥ピリジンと
共沸蒸留することで乾燥した。残渣を無水ジクロロメタン20m1に溶解した。
密閉したアルゴン雰囲気下、N、N−ジイソプロピルエチルアミン1.5当量を
加え;次いで、N、 N−ジイソプロピルメチルホスホンアミド・塩化物[(C
H3)zcH] 2NP (CI)OCR3]の1.2当量を滴下した。次いで
、反応混合物を実施例10記載の工程で後処理し、上記生成物3 、 2 mm
olを得た。
’HNMRin CDC] s、δppm: 1−1. 5 (5methyl
and 1 methylene)、 1.42(CH2)、1.73−an
dl、 73(2GHz)、 2.21 (CH2N)、3.15 (CH,−
C=○)、3.78 (CHs of DMT)、6゜80−7.85 (21
aromatic protons)その他の存在するプロトンシグナルは帰属
されなかった。
5’−TTT−AAG−CAG−AGT−TCA−AAA−GCC−CTT−C
AG−CG−(CB−リンカ−)を有するオリゴデオキシリボヌクレオチドりん
酸ジエステルを製造した。
C8メトキシホスホラミダイト非ヌクレオチド試薬(1−0−ジメトキシトリチ
ル−2−N [N’ −(N”−フルオレニルメトキンカルボニル−6−アミノ
ヘキサノイル)−2−アミノアセチル]−3−○−[N、 N−ジイソプロピル
メトキノホスフィニル]−2−アミノ−1,2−ジヒドロキシブタン)を濃度1
00mMで乾燥アセトンに溶解し、Bioserch Model 8750二
DNA 5ynthesizerを用い、業者の指示に従って、標準的なホスホ
ラミダイトの化学[カルサーら(M、 H,Caruthers、 et al
、) Methods of Enzymol、 154:287−313(1
985)]によってオリゴヌクレオチド配列にカップリングした。ローら(K、
M、 Lo) (1984Proc、 Natl、 Acad、 Sci。
USA、 81. pp、2285−2289)の記載に従い、5ep−Pak
T′C18カートリツジ(Millip。
re/Waters、 Bedford、 MA)による精製を可能とするため
、合成の最後まテ5゛ ジメトキシトリチル保護基を残しておいた。この工程の
間に、ジメトキシトリチル保護基を除去した。
本発明の非ヌクレオチド試薬が組み込まれたメチルりん酸オリゴマーを、ミラー
(P、 S、 MillerX1983. Nucleic Ac1ds Re
s、 、 11、pp、 d6225−6242)、ジャKーおよび
イングル(^、 Jager and J、 Engles) (1984,T
etrahedron Lett、 、 25. pp、 P437−1440
)
およびドルマン(M、A、Dorman) (1984,Tetrahedro
n、40. pp、95−102)が記載した化学的手法により、メチルホスホ
ンアミダイトモノマーおよび非ヌクレオチドメチルホスホンアミダイト非ヌクレ
オチド試薬を用いて合成した。Bioserch Mode18750 DNA
5ynthesizerを用い、業者の指示した方法を以下のように改変し、
固相合成を行った。“G”および“C”モノマーを濃度100mMでアセトニト
リル/ジクロロメタン(1・1)に溶解した。”A”および“T”モノマーは、
濃度100mMでアセトニトリルに溶解した。非ヌクレオチドリンカー試薬を濃
度120mMでアセトニトリルに溶解した。DEBLOCK試薬=ジクロ試薬ク
ジクロロメタン中2ロ酢酸。0XIDIZER試薬=2.5%水、25%2.6
−ルチジン、72.5%テトラヒドロフラン中25g/L沃素。CAP A=ニ
アセトニトリル10%無水酢酸。CAP B=ビピリジン中、625%N、 N
−ジメチルアミノピリジン。下記のごとく、オリゴマーの精製を容易にするため
に、5゛ ジメトキシトリチル保護基を合成の最後まで残しておいた。
粗製の保護非ヌクレオチド試薬を組み込んでいるメチルりん酸オリゴマーを、室
温で2時間、濃水酸化アンモニウムと混合することで固相支持体から除去した。
Econo Column”(Bio−Rad、 Richmond、 CA)
を用いて支持体から溶液を流しくドレイン)、支持体をアセトニトリル/水(1
: 1)で5回洗浄した。次いで、溶出したオリゴマーを室温で減圧下、蒸発乾
固した。次いで、室温で6時間、エチレンジアミン/アセトニトリル/水(50
:23.5:2.5)溶液を用い、塩基から保護基を除去した。次いで、得られ
た溶液を減圧下、蒸発乾固した。
(b)リンカ−で修飾したメチルりん酸オリゴマーの精製5゛ −ジメトキント
リチル(トリチル)含有オリゴマーをトリチル化に失敗した配列から、5ep−
PakT&IC18カートリツジ(Millipore/1laters、 B
edford、 MA)により、以下のごとく精製した:カートリッジをアセト
ニトリル、100mM炭酸水素トリエチルアンモニウム中50%アセトニトリル
(TEAB、pH7,5)、およびを25mM TEABで洗浄した。次いで、
粗メチルりん酸オリゴマーを少量のアセトニトリル/水(1,:1)に溶解し、
次いで、最終濃度が5%アセトニトリルとなるように25mM TEABで希釈
した。次いで、この溶液をカートリッジに通した。次いで、カートリッジを25
mMTEAB中15−20%アセトニトリルで洗浄した。次いで、カートリ7ノ
に結合したまま残っているオリゴマー上のトリチルを、25mM TEAB、2
%トリフルオロ酢酸、および25mM TEABの順番に洗浄することて脱トリ
チル化した。最後に、トリチル−選択オリゴマーを50%アセトニトリル/水で
カートリッジがら溶離し、室温で真空乾燥した。
上記工捏で得たリンカ−で修飾したメチルりん酸オリゴマーを下記のごとく逆相
HPLCクロマトグラフィーにかけ、さらに精製した。上記実施例で記載したB
eckman System Gold HPLCを、Hamilton PR
PIカラム(Reno、 NV、1011.7mm1.d、 x 3 Q 5o
o*長さ)と−緒に用いた。バッフ7 A=50mM酢酸トリエチルアンモニウ
ム(pH7):バッファーB=50mM酢酸トリエチルアンモニウム(pH7)
中50%アセトニトリル。少量の10−50%アセトニトリル/水に溶解した試
料を100%バッフ7− Aを2.5−3m1/分で流しながらカラムに負荷し
た。次いで、流速2.5−3m1/分でバッファーBの0−70%線状グラディ
エンドを30−50分間かけて流した。完全長さの非ヌクレオチド試薬を組み込
むメチルりん酸オリゴマーを含んでいるフラクションを真空蒸留し、50%アセ
トニトリル/水に再懸濁した。
bcr/abl連結領域の配列はゴスヴエルト(G、Grosveld) (1
986,Mo1eeular and Ce1lular Biol、、6.
p9.607−616)が記載したように、K562細胞系から得た。このmR
NAのbcr/abl連結部位に相補的な、下記配列で示される非ヌクレオチド
試薬を組み込むメチルりん酸オリゴマーを実施例13記載の方法に従って合成し
た。
5 ’ −匹g==GAAC?CTGC?? (h ) −3’下線はabl遺
伝子由来の配列であることを示す。↓または↓のいずれかに1個のソラーリンと
結合した非ヌクレオチドモノマー単位を組み込んだ。CO,C2、C4、C6ま
たはC8非ヌクレオチドモノマー単位のいずれかを↓に導入し、それぞれ、オリ
ゴマー1.2.3.4および5を得た。↓にC4非ヌクレオチドモノマー単位を
導入してオリゴマー6を得た。(表II参照)。注:オリゴマ−6のみが3゛末
端アデニン塩基を有する。
実施例153’5° タンデムオリゴマーの製造ホスホジエステルおよびメチル
りん酸オリゴマーを下記配列を用い、上記の方法(実施例12および13)に従
って製造した。これらのオリゴマーはRNAN玉鎖上ar/abl連結部位にお
ける2次構造の中断に用いられた。
5“ −タンデムオリゴマー+ 5’ −GCT−ACT−CCG−CGC−T
GA−^G3° −タンデムオリゴマー+ 5’ −AA人−TCC−AGT−
GGC−TGA−GTG−3゜メチルりん酸オリゴマーは、その溶解性を改善す
るために、その5゛末端に単一のホスホンエステル結合を有するよう調製された
。
非ヌクレオチドモノマーを組み込んでいるメチルりん酸オリゴマー(3−5mg
。
99−155 0. D、 260単位)を、1.5ml微量遠心管内で、l、
lアセトニトリル/水100μmに溶解した。次いで、オリゴマーの沈殿を避け
るために1つの試薬を加える度にポルテックスしながら以下の試薬を加えた・ジ
メチルスルホキシド(170μm)、水(100μl)、LM HEPESバッ
ファーpH8,0(50μl)およびジメチルスルホキシド(80μm)中50
mM ソラーリンーNH5試薬。総量:500μl0混合物を遮光して室温で2
−4時間反応させた。次いで、エタノール(1111)を加え、得られた溶液を
一20℃で一夜冷却し、ソラーリンで標識したオリゴマー産物を沈殿させた。次
いで、管を5分間微量遠心にかけ、上溝を吸引し、捨てた。得られたペレットを
アセトニトリル/水(1: 1)500μ+に再懸濁し、1:1. 22 μD
urapore”メンブランチろ過し、粒状物を除いた。
ソラーリンー標識メチルりん酸オリゴマーを下記のごとく逆相HPLCクロマト
グラフィーにかけて精製した。Model 1265olvent modul
eおよびIBMコンパチブルコンピューターに接続したModel 167検出
器と共に、Hamilton PRPIカラム(5μ、4.1mm1.d、x
250mm長さ)を備えたBeckman System Gold anal
ytycal HPLC系を用いた。使用バッファーは以下の通り:バッファー
人=50mM酢酸トリエチルアンモニウム(pH7):バッファーB=50rn
M酢酸ト’Jエチルアンモニウム(pH7)中50%アセトニトリル。粗製ソラ
ーリン標識オリゴマー各100μlを、5回、2分間隔、500μmサンプルル
ープで、カラムを10%バッファーBを流速1. 5511/分で流しながらカ
ラムに負荷した。
次いで、流速1.5ml/分でバッファーBの10−70%線状グラディエンド
を30分間かけて流した。これらの条件下、ソラーリンで標識されたオリゴマー
は対応する標識されていないオリゴマーから約5分開運れて溶出した。ソラーリ
ン修飾オリゴマーを含有するフラクシヨンをプールし、室温で、遮光しながら減
圧下、蒸発乾固させた。それらを次いで、最少量のアセトニトリル/水(1:1
.)に再懸濁し、260nmの吸収に基づいて定量した。回収した収率は16%
がら55%の範囲であった。
p G E Mベクタークローンから440虐基のb c r/a b I R
NAが得られた。
これはbcr/abl結合部位をその配列のほぼ中央に有する生物学的bcr/
ablを表す。
C4リンカ−アームを有する非ヌクレオチドモノマー単位を組み込む、ソラーリ
ン標識メチルりん酸オリゴマー3(“オリゴ3”)(配列については表II参照
)を[7−”P] −ATP (1000Ci/mmol)およびT4ポリヌク
レオチドキナーゼを用い、下記のごとく標識した。ソラーリンメチルりん酸オリ
ゴマー10pmolを、50μCiの[7−32P] ATPを含有する、5
Qma+ol Tris (pH7,8) 、10mM MgCl2.5mM
DTT、0.1mM EDTA、0゜1mMスペルミンンノン解した。T4ポリ
ヌクレオチドキナーゼ(4単位)を加え、溶液を室温で90分間インキュベート
した。放射能標識した生成物をNensorb−20TMカラム(New En
gland Nuclear、 Dupont)により、業者の指示に従い精製
した。
!p標標識ソラーシン修飾メチルん酸オリゴ3 (0,05μmol、約20.
00Q cpm)をRNA (1,5pIllol) 、10mM Tris
(pH7,2)中、タンデムりん酸ジエステルオリゴヌクレオチド(5pmo
l、実施例15参照)、領 1mMEDTA、0.03%ンディウム サルコシ
ラードの入った21容ホウケイ酸ガラス製自動サンプラーバイアルに入れた。R
NA標的上の同じ結合部位についてその放射能標識した対応物と競合させるよう
、放射能標識されていないソラーリンーオリコ3 (2μmol)と上記の試薬
とを用いて対照とした。バイアルを70℃で5分間加温した後、35℃で30分
間、室温で15分間加温した。次いで、砕水の上で、Model B−10OA
長波長紫外ランプ(UVP、 Inc、、San Gabriel、 CA)を
用い、15cmの距離から30分間、バイアルに365nmの光線を照射した。
この距離からの照射の強度は約60μw/100cm”であった。照射の最後に
、0.1%ブロモフェノール含有90%ホルムアミドおよびO,1M)リス−は
う酸−EDTAバッファー(pH8,2)を加え(5μm)、思料を6%ポリア
クリルアミド/7M尿素ゲル(0,5mm)に負荷した。ゲルを900Vで2時
間半電気泳動し、2枚の5aran Wrap”の間に挟み、XAR−5フイル
ム(Eastman−Kodk、 Rochster、 NY)に15分間暴露
した。オートラジオグラフィーの後、上方バンドの出現はRNA標的とのクロス
リンキングを示唆していた。このバンドは、競合的な非放射活性ソラーリンオリ
ゴ3を含有する対照ではほんのかすかにしか認められず、RNAへのクロスリン
キング部位が配列特異的であることを示していた。
これらのオリゴマーを32pで標識し、ハイブリダイズさせ、RNA転写物とク
ロスリンキングさせて実施例17記載の方法でゲル電気泳動によって分析した。
(オリゴマーの配列に関しては表II参照)。しかしながら、オートラジオグラ
フィーの前に、ゲルをプロッティング用紙に移し、ゲル乾燥装置内で80℃にお
いて真空乾燥した。次いで、スケールベルによるバンドの切除を容易にするため
に、オートランオグラフを乾燥ケル上の鋳型として用いた。切除したバンドをポ
リプロピレンノンチレーショノンバイアル(20ml)に入れ、10m1シンチ
レーシヨンカクテルを計数した(CytoscintTllICN Radio
pharmaceuticals、 Co5ta Mesa、 CA)。照射か
ら120分後のクロスリンキングの程度は以下の通りである。
ソラーリンオリゴ1 (CO−リンカ−):5.2%ソラーレリンリゴ3 (C
4−リンカ−)・14.0%ソラーレリンリゴ5 (C8−リンカ−)・ 4.
5%この観察に基づき、RNA標的にハイブリダイズしたとき、効果的なりロス
リンキングのためには、CO−およびC8−リンカ−はそれぞれ短かすぎ、また
は長すぎると結論した。
するソラーリンオリゴ2.3および4および6の比較これらのオリゴマーを上記
のごとく32Pで標識した。(配列に関しては表II参照)。放射性標識オリゴ
マー(0,05pmol、20−45. OOOcpm)を、5mMりん酸カリ
ウム10μm、pH7,4,0,1mM EDTASo、03%ポタシウムサル
コシラート中、標的RNA (lpmol)およびタンデムメチルりん酸オリゴ
マー(5pmol、上記)の入った2mlm水容ケイ酸ガラス製自動サンプラー
バイアルに入れた。(メチルりん酸タンデムオリゴマーは、これらの条件下、ソ
ラーリンと結合したオリゴマーのRNA標的とのハイブリダイゼーションおよび
クロスリンキングをより高度に促進することを見いだした)。管を70’Cで5
分間加熱した後35℃で30分間加熱した。次いで、実施例17に記載のごと(
、氷の上で管を60分間、365nm照射処理した。
ゲル分析、オートラジオグラフィー、およびバンドの放射能の測定によるクロス
リンキングの定量は上記の箇所で述べたと同様にして行った。RNA標的へのク
ロスリンキングの程度は以下の通りである。
ソラーリンオリゴ2 (C2−リンカ−):64.9%ソラーレリンリゴ3 (
C4−リンカ−):60.7%ソラーレリンリゴ4 (C6−リンカ−):34
.5%ソラーレリンリゴ6 (C4−リンカ−)ニア1.6%このデータは、オ
リゴマーの内部位置へのリンカ−の挿入には、結合したソラーリン部分のRNA
標的鎖へのクロスリンキングに関して、C4リンカ−よりもC2リンカ−の方が
僅かに好ましく:この位置についてはco−1c6−およびC8−リンカ−はあ
まり好ましくないことを示している。C4−リンカ−がオリゴマーの3“末端位
置にあるとクロスリンキングがさらに向上される。
実施例20 ソウレーン−NH3試薬とアミン−修飾メチルりん酸オリゴマーと
メチルりん酸オリゴマーは、別の特許出願明細書に記載の方法で、2個のデオキ
シアデノシン塩基の間に挿入されたC4−アミノリンカ一部分を用いて調製され
た。bcr/ablRNAに相補的なこのオリゴマーの配列は以下の式で示され
る。
5 ’ −GGC−T??−TGA−(L)−kcT−CTG−CTT−3’太
字体の塩基はメチルりん酸ジエステル結合を有するが、5゛−末端前項基はりん
酸ジエステル結合で結合している。”L”は、本明細書記載のC4アミノリンカ
−を有する非ヌクレオチドモノマー単位を表す。
続<NH3−ソラーリン試薬と非ヌクレオチドモノマー単位(オリゴマー内に存
在)のリンカ−アームとのカップリング反応は1.5mlのポリプロピレン微量
遠心管内で行った。オリゴマー約3. 41!g (980Dhg。単位)をア
セトニトリル/水(1: 1)100μlに溶解した。次いで、オリゴマーの沈
殿を避けるために1つの試薬を加える度にポルテックスしながら以下の試薬を加
えたニジメチルスルホキシド(170μm)、水(100μI) 、IM HE
PESバッファーpH8,0(50μ+)およびジメチルスルホキシド(80μ
l)中50mMソラーレンーリンS試薬。総量:500μm。混合物を遮光して
室温で2.5時間反応させた。次いで、エタノール(1ml)を加え、得られた
溶液を一20℃で一夜冷却した。次いで、管を5分間微量遠心にかけ、上清を吸
引し、捨てた。
得られたベレットをアセトニトリル/水(1: 1)500μlに再懸濁し、0
゜22μDuraporeTMメンプランでろ過し、粒状物質を除いた。
上記の粗製のソラーリンーオリゴマー複合体のHPLCによる精製は下記のごと
(行った。Hamilton PRP−1カラム(4,1x 250mm+長)
を備えたBeckmanSystem Gold analytycal HP
LC系を用いた。溶離に用いた使用パンファーは以下の通り:バッファーA−5
0mM酢酸トリエチルアンモニウム(pH7);バッファーB−50mM酢酸ト
リエチルアンモニウム(pH7)中50%アセトニトリル。試料を各100μl
づつ、5回、2分間隔、500μmサンプルループで、カラムを10%バッファ
ーBを流速1.5ml/分で流しながら、カラムに負荷した。次いで、流速1.
5ml/分でバッファーBの10−70%線状グラディエンドを30分間かけて
流した。0.5分間隔でフラクションを集めた。これらの条件下、ソラーリンで
修飾されていないオリゴマー、および修飾されたオリゴマーは、それぞれ17.
9分および21.7分に溶出した。ソラーリン修飾オリゴマーを含有するフラク
ションをプールし、蒸発させた。総数率は16%であった。
pGEMベクタークローンから440塩基のbcr/ablRNA転写物を得た
。このキメラmRNAはabl遺伝子のある領域が染色体のbcr遺伝子を含有
する他の領域に転座した結果生成したキメラ遺伝子生成物である。このRNA転
写物は配列のほぼ中央にbcr/abl連結部位を含有する生物学的bcr/a
b1mRNAの一部を表している。さらに、ソラーリンメチルりん酸オリゴマー
のいずれかの側に隣接した領域に相補的な配列をもった2個のメチルりん酸オリ
ゴマーを合成した。それぞれ塩基長さが17および18であるこれらタンデムオ
リゴマーを、RNAN玉鎖上cr/abl連結部位の領域内の2次構造の破壊に
用いた。
ソラーリンメチルりん酸オリゴマー複合体を[γ−32P] −ATP (30
00Ci /mmol)およびT4ポリヌクレオチドキナーゼを用い、下記のご
とく標識した。ソラーリンメチルりん酸オリゴヌクレオチドlQpmolを、5
0μCiの[γ−3”P] ATPを含有する、50mmol Tris (p
H7,8)1(bzL 10mMMgC12,5mM DTT、0.1mM E
DTA、Q、1mMスペルミジンに溶解し、T4ポリヌクレオチドキナーゼ(4
単位)を加え、溶液を室温で90分間インキュベートした。放射性標識した生成
物をNen5orb −20”カラム(New EngLand Nuclea
r/Dupont)により、業者の指示に従い精製した。
クロスリンキング実験の1例として、32p標識ソラ一レンオリゴマー複合体(
50,000CPM)を、RNA (lpmol) 、および5mM りん酸カ
リウム(pH7,4) 、0.1mM EDTAおよび0.03%3%ボタンラ
ムルコシルからなるバッファー10μl中のタンデムメチルりん酸オリゴマー(
5pmol)と−緒に2ml容ホウケイ酸ガラス製自動サンプラーバイアルに入
れた。バイアルを70℃で3分間加温した後、30℃で30分間インキュベート
した。次いで、バイアルを砕氷の上に置きModel B−100A長波長紫外
ランプ(UVP、 Inc、、San Gabriel、 CA)を用い、15
cmの距離から365nmの光線を照射した。照射の強度は平均60μW/10
0cm2であった。これらの条件下、クロスリンキングは、30分後、80−9
0%完了した。次いで、0゜1%ブロモフェノールブルーを含有する90%ホル
ムアミド(5μl)を加え、試料を7M尿素ゲル(0゜5mm)含有6%ポリア
クリルアミドゲルに付加した。ゲルを900ボルトで2時間電気泳動じた後、プ
ロッティングペーパーに移し、乾かした。5−12時間、XAR−5フイルム(
Eastman−Kodak、 Inc、)を用いてオートラジオグラフィーを
行った。ゲルを切除し、CytoscintTl″シンチレーションカクテル(
ICN Radiopharmaceuticals、 Inc、、 Co5t
a Mesa、 CA)の存在下、シンチレーションカウンターで計数してバン
ドの定量を行った。上方のバンドはRNA標的にクロスリンキングしたソラーリ
ンオリゴヌクレオチドと対応していた。
F/G、4
国際調査報告
フロントページの続き
(51) Int、 C1,5識別記号 庁内整理番号Cl2N 15/10
C12Q 1/68 A 7823−4B(72)発明者 アーノルド、ライル
・ジエイ、ジュニアアメリカ合衆国92117カリフオルニア、サノ・アイエコ
、ノア・ウェイ5439番I
Claims (83)
- 1.オリゴマーにソラーレン部分を結合させるための試薬であって、式:▲数式 、化学式、表等があります▼ (式中、kは0から12の整数、Esは求核部分とカップリングすることができ る部分を表す) で示される化合物を含んでいる試薬。
- 2.Esが、容易に求核部分で置換される脱離基を有する活性化エステルを含ん でいる請求項1の試薬。
- 3.Esが、N−ヒドロキシスクシンイミド活性化エステルである請求項1の試 薬。
- 4.kが2である請求項1の試薬。
- 5.Esが、 ▲数式、化学式、表等があります▼ を含んでいる請求項4の試薬。
- 6.フイラデルフィア染色体のキメラmRNA転写物のbcr/ab1に相補的 であり、少なくとも1個のそれに結合したソラーレン部分を有する非ヌクレオチ ドモノマー単位を組み込んでいるオリゴマー。
- 7.アルキル−またはアリール−りん酸オリゴマーを含んでいる請求項6のオリ ゴマー。
- 8.該非ヌクレオチドモノマー単位が、▲数式、化学式、表等があります▼ (ここに、SKELは炭素数約1から約20個のキラル的に純粋な非ヌクレオチ ド骨格を表し、ここに−NHL、YおよびZはSKELの炭素原子と共有結合的 に結合しており、Lはリガンド、Yは−CH2−、−O−、−S−または−NH −、そしてZは−O−、−S−または−NH−を表す)で示される請求項6のオ リゴマー。
- 9.SKELが、YおよびZ間に約1から約10個の炭素原子のバックボーンを 含んでいる請求項8のオリゴマー。
- 10.Lが、−Ps、 ▲数式、化学式、表等があります▼および▲数式、化学式、表等があります▼ (ここに、nおよびmは独立して約1から約15、好ましくは約1から約5まで の整数、Psはソラーレン部分を表す)から選択される請求項9のオリゴマー。
- 11.アルキル−またはアリール−りん酸オリゴマーを含んでいる請求項10の オリゴマー。
- 12.2′−O−アルキルリボシル部分を含むヌクレオチドモノマー単位を有す る請求項11のオリゴマー。
- 13.該非−ヌクレオチドモノマー単位が、▲数式、化学式、表等があります▼ (ここに、R1およびR2の1方が水素であって他は−NH−L、ここにLはソ ラーレン部分と結合したリンカーアーム;R3およびR4の1方が水素であって 他が炭素原子数約1から約10個の低級アルキル基;Zが−O−、−S−または −NH−:そしてYが−CH2−、−S−、−NH−または−O−である)で示 される請求項7のオリゴマー。
- 14.Lが−Psまたは、 ▲数式、化学式、表等があります▼および▲数式、化学式、表等があります▼ (ここに、nおよびmは独立して1から15の整数、Psはソラーレン部分を表 す) から選択されるソラーレン部分と結合しているリンカーアームを含む請求項13 のオリゴマー。
- 15.Lが、 ▲数式、化学式、表等があります▼ で示される請求項14のオリゴマー。
- 16.nが1または3である請求項15のオリゴマー。
- 17.−Psが4′−アミドメチル−4,5′,8−トリメチルソラーレン部分 を含む請求項14のオリゴマー。
- 18.該オリゴマーがP210bcr/ab1をコードする領域部分とハイブリ ダイズし得る請求項6のオリゴマー。
- 19.少なくとも1個の、それに結合しているソラーレン部分を有し、キメラm RNAのbcr/ab1とハイブリダイズすることができる非ヌクレオチドモノ マー単位を組み込んでいるオリゴマー。
- 20.P210の発現を干渉し得る請求項19のオリゴマー。
- 21.P210bcr/ab1の発現を阻害するために、慢性骨髄性白血病を有 する生物またはそれから単離された細胞を処置する方法であって、該生物または それから単離された細胞に治療上有効な、P210bcr/ab1の発現を阻害 するに効果的な量のbcr/ab1領域と相補的なオリゴマーを与えることから なる方法。
- 22.該細胞が、骨髄細胞を含む、請求項21の方法。
- 23.慢性骨髄性白血病細胞におけるP210bcr/ab1の発現を阻害する 方法であって、該細胞またはそれらの増殖環境を、治療上有効な量のソラーレン と結合したオリゴマーであって、選択的にbcr/ab1mRNAとハイブリダ イズするものと接触させ、次いで該ソラーレンと該mRNAとを反応させて該オ リゴマーと該mRNAとをクロスリンキングさせることからなる方法。
- 24.該細胞が骨髄細胞を含んでいる請求項23の方法。
- 25.該bcr/ab1mRNAがbcr/ab1連結部位を含んでいる請求項 23の方法。
- 26.該オリゴマーが少なくとも1個の非ヌクレオチドモノマー単位を含んでい る請求項23の方法。
- 27.該ソラーレンが該オリゴマーの非ヌクレオチドモノマー単位に共有結合的 に結合している請求項23の方法。
- 28.該オリゴマーがメチルりん酸オリゴマーを含有する請求項27の方法。
- 29.該オリゴマーが約6から約25個のヌクレオチドモノマー単位を含んでい る請求項27の方法。
- 30.該オリゴマーが約1から約5個の独立に選択された非ヌクレオチドモノマ ー単位を含んでいる請求項29の方法。
- 31.さらに少なくとも1つの、該mRNA上の、該ソラーレンと結合したオリ ゴマーに相補的な配列の5′または3′側配列に相補的な、タンデムオリゴマー をハイブリダイズさせることを含む請求項31の方法。
- 32.該タンデムオリゴマーがアルキル−またはアリール−りん酸オリゴマーを 含んでいる請求項31の方法。
- 33.該タンデムオリゴマーがメチルりん酸オリゴマーを含んでいる請求項31 の方法。
- 34.P210bcr/ab1の合成を干渉する方法であって、チロシンキナー ゼ活性を有するmRNAのbcr/ab1と相補的な、ソラーレン部分と結合し た非ヌクレオチドモノマー単位を少なくとも1個含有しているオリゴマーをハイ プリダイズさせ、該ソラーレン部分と該mRNAのピリミジン塩基とをクロスリ ンキングさせることからなる方法。
- 35.慢性骨髄性白血病を有する生物またはそれから単離された細胞のチロシン キナーゼ活性の発現をダウンレギュレーションする方法であって、該生物または 単離細胞に、治療上有効な、チロシンキナーゼの発現の減少に効果的な量の、a b1遺伝子またはmRNAのタンパク質をコードする核酸と相補的なオリゴマー を与えることからなる方法。
- 36.該オリゴマーが少なくとも1個のソラーレンと結合した非ヌクレオチドモ ノマー単位を含有する請求項35の方法。
- 37.さらに該ソラーレン部分と該mRNAのピリミジン塩基とのクロスリンキ ング反応を行わせることを含む請求項36の方法。
- 38.該オリゴマーがメチルりん酸オリゴマーを含む請求項36の方法。
- 39.相補的核酸配列に対するアンチセンスオリゴマーの阻害効果を増大する方 法であって、該相補的核酸配列に、少なくとも1個のソラーレン部分が結合した 非ヌクレオチドモノマー単位を有するアンチセンスオリゴマーをハイブリダイズ させ、該ソラーレン部分と該相補的配列のピリミジン塩基とをクロスリンキング させることからなる方法。
- 40.該オリゴマーがメチルりん酸オリゴマーを含む請求項39の方法。
- 41.アンチセンスオリゴマーの、相補的核酸配列のタンパク合成阻害効果を増 強する方法であって、該オリゴマーに少なくとも1個のソラーレンと結合した非 ヌクレオチドモノマー単位を導入することからなる方法。
- 42.該オリゴマーが該相補的核酸とハイブリダイズし、クロスリンキング反応 が該ソラーレンと該相補的核酸のピリミジン塩基との間で起きるものである請求 項41の方法。
- 43.該相補的核酸がmRNAを含む請求項42の方法。
- 44.該オリゴマーがメチルりん酸オリゴマーを含む請求項43の方法。
- 45.遺伝子転座の生成物である核酸配列の発現を阻害または干渉する方法であ って、該核酸配列に、少なくとも1個の、ソラーレン部分と結合しており、該核 酸配列に相補的であって選択的にハイブリダイゼーションする非ヌクレオチドモ ノマー単位を含むオリゴマーをハイブリダイズさせ、次いで該ソラーレン部分と 該核酸のピリミジン塩基とをクロスリンキングさせることからなる方法。
- 46.該核酸配列がmRNAを含む、請求項45の方法。
- 47.該非ヌクレオチドモノマー単位が、ZNHL SKEL Y (ここに、SKELは炭素原子約1から約20個のキラル的に純粋な非ヌクレオ チド骨格を表し、ここに−NHL、YおよびZは共有結合的にSKELの炭素原 子に結合しており、Lはリガンド、Yは−CH2−、−O−、−S−または−N H−:そしてZは−O−、−S−または−NH−を表す。)で示される、請求項 45の方法。
- 48.SKELがYおよびZの間に炭素原子約1から約10個のバックボーンを 有する請求項47の方法。
- 49.Lが−Ps、 ▲数式、化学式、表等があります▼および▲数式、化学式、表等があります▼ (ここに、nおよびmは独立して約1から約15の整数であり、Psはソラーレ ン部分を表す) から選択される請求項48の方法。
- 50.該オリゴマーがアルキル−またはアリール−りん酸オリゴマーを含む請求 項49の方法。
- 51.該オリゴマーがメチルりん酸オリゴマーを含む請求項49の方法。
- 52.該オリゴマーが2′−O−メチルリボシル部分を含むヌクレオチドモノマ ー単位を有する、請求項51の方法。
- 53.さらに、少なくとも1個の、該mRNA上の該ソラーレンと結合した配列 に相補的な配列の3′または5′側配列に相補的な、タンデムオリゴマーを該m RNAにハイブリダイズさせることを含む請求項51の方法。
- 54.該タンデムオリゴマーがメチルりん酸オリゴマーを含んでいる請求項53 の方法。
- 55.該オリゴマーが2′−O−メチル−リボシル部分を含んでいる請求項54 の方法。
- 56.該非ヌクレオチドモノマー単位が、▲数式、化学式、表等があります▼ (ここに、R1およびR2の1方は水素であって他は−NH−L、ここにしはソ ラーレン部分との直接結合またはソラーレン部分と結合したリンカーアーム;R 3およびR4の1方は水素であって他は炭素原子数的1から約10個の低級アル キル基;YおよびZは独立して−CH2−、−O−、−S−または−NH2−を 表す)で示される請求項45の方法。
- 57.Lが式−Ps、 ▲数式、化学式、表等があります▼および▲数式、化学式、表等があります▼ (ここに、nおよびmは独立して約1から約15の整数であり、Psはソラーレ ン部分を含む) から選択される請求項56の方法。
- 58.該オリゴマーがメチルりん酸オリゴマーを含有する請求項57の方法。
- 59.Lが、 ▲数式、化学式、表等があります▼ (ここに、nは1から5の整数である)を含む請求項58の方法。
- 60.該非ヌクレオチドモノマー単位がキラル的に純粋である、請求項59の方 法。
- 61.さらに、少なくとも1個の、該ソラーレンと結合したオリゴマーに相補的 な配列に相補的であるタンデムオリゴマーを該核酸配列にハイブリダイズさせる ことを含む請求項59の方法。
- 62.該タンデムオリゴマーがメチルりん酸オリゴマーを含んでいる請求項61 の方法。
- 63.少なくとも1個のソラーレン部分が結合している非ヌクレオチドモノマー 単位を有する、遺伝子転座の生産物である核酸配列に相補的なオリゴマー。
- 64.該非ヌクレオチドモノマー単位が、ZNHL SKEL Y (ここに、SKELは炭素原子数的1から約20のキラル的に純粋な非ヌクレオ チド骨格を有し、ここに−NHL、YおよびZはSKELの炭素原子と共有結合 的に結合しており、Lはリガンド、Yは−CH2−、−O−、−S−または−N H−;そしてZは−O−、−S−または−NH−を表す)を含んでいる請求項6 3のオリゴマー。
- 65.該SKELがYおよびZの間に炭素原子数約1から約10個のバックボー ンを有している請求項64の方法。
- 66.Lが、−Ps、 ▲数式、化学式、表等があります▼および▲数式、化学式、表等があります▼ (ここに、nおよびmは独立して約1から約15の整数、Psはソラーレン部分 を表す) から選択される請求項65のオリゴマー。
- 67.アルキル−またはアリール−りん酸オリゴマーを含んでいる請求項66の オリゴマー。
- 68.メチルりん酸オリゴマーを含んでいる請求項66のオリゴマー。
- 69.2′−O−アルキルリボシル部分を含むヌクレオシドモノマー単位を含ん でいる請求項68のオリゴマー。
- 70.約6から約31モノマー単位を含有する請求項68のオリゴマー。
- 71.約1から約5個の独立に選択された非−ヌクレオチドモノマー単位を含ん でいる請求項70のオリゴマー。
- 72.約6から約31個のモノマー単位を含む請求項66のオリゴマー。
- 73.約1から約5個の独立に選択された非ヌクレオチド単位を含んでいる請求 項72のオリゴマー。
- 74.Psが式 ▲数式、化学式、表等があります▼ (式中、kは0から12の整数である)で示される請求項73のオリゴマー。
- 75.kが2から6である請求項74のオリゴマー。
- 76.kが2である請求項75のオリゴマー。
- 77.該非ヌクレオチドモノマー単位が、▲数式、化学式、表等があります▼ (式中、R1およびR2の1方は水素であって他は−NH−L、ここにLはソラ ーレン部分との直接結合またはソラレーン部分と結合したリンカーアーム;R3 およびR4の1方が水素であって他が炭素原子数約1から約10個の低級アルキ ル基;YおよびZは独立して−CH2−、−O−、−S−または−NH2−を表 す)を含んでいる請求項63のオリゴマー。
- 78.Lが−Ps、 ▲数式、化学式、表等があります▼および▲数式、化学式、表等があります▼ (ここに、nおよびmは独立して約1から約15の整数、Psはソラーレン部分 を含有する) から選択される請求項77のオリゴマー。
- 79.メチルりん酸オリゴマーを含有する請求項78のオリゴマー。
- 80.Lが、 ▲数式、化学式、表等があります▼ (ここにnは1から5の整数を表す) で示される請求項79のオリゴマー。
- 81.約6から約31個のモノマー単位を含有する請求項80のオリゴマー。
- 82.約1から約5個の独立して選択された非ヌクレオチドモノマー単位を含ん でいる請求項81のオリゴマー。
- 83.該非ヌクレオチドモノマー単位がキラル的に純粋な請求項82のオリゴマ ー。
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