JPH06504067A - 主鎖修飾されたオリゴヌクレオチド類似体 - Google Patents

主鎖修飾されたオリゴヌクレオチド類似体

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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 主鎖 飾されたオリゴヌクレオチド類似体関連特許出願 本特許出願は、1991年5月218提出の米国特許出願第703.619号の 一部継続出願であり、米国特許出願第703.619号は、1990年8月13 日提出の米国特許出願第566、836号および1990年7月27日提出の米 国特許出願第558.663号の一部継続出願である。これらの特許出願はいず れも本特許出願の譲受人に譲渡されており、参照文献としてここに引用する。
発明の分野 本発明は、治療や診断用に適した、また学術研究用の試薬として適した耐ヌクレ アーゼ性のオリゴヌクレオチド類似体の設計、合成、および応用に関する。野生 型の核酸における糖量結合(inter−sugar linkage)として 通常作用するホスホロジエステル結合(phosphorodiesterbr +nd)の代わりに修飾された結合を有するオリゴヌクレオチド類似体が提供さ れる。このようなオリゴヌクレオチド類似体は、ヌクレアーゼ分解に対して抵抗 性があり、DNAとRNAの活性を調節することができる。さらに、これらのオ リゴヌクレオチド類似体を合成するための方法、および本発明のオリゴヌクレオ チド類似体を使用して蛋白質の生成を調節する方法、ならびに中間体組成物およ び方法が提供される。
発明の背景 よく知られているように、哺乳動物における肉体状態(疾病状態も含めて)の殆 どは蛋白質によって作用を受ける。こうした蛋白質は、直接作用する場合でも、 あるいは醪素機能を介して作用する場合でも、動物や人間に種々の疾病を引き起 こす一因となることが多い。
従来からの治療学は一般に、疾病を引き起こす作用または疾病を重くする作用を 和らげるよう検討を進めていく上で、蛋白質との相互作用を調べることに重点を 置いている。しかしながら最近では、蛋白質の合成を方向づける分子(すなわち 細胞内RNA)との相互作用によって、こうした蛋白質の実際の生成を和らげよ うとする検討がなされている。これらの相互作用には、相補的“アンチセンス” オリゴヌクレオチドまたはそれらの特定の類似体の、RNAに対するノ)イブリ ッド形成が含まれている。ハイブリッド形成は、オリゴヌクレオチドまたはオリ ゴヌクレオチド類似体の、RNAまたは一重鎖DNAに対する配列特異的水素結 合である。蛋白質の生成を妨げることによって、できるだけ高い効詣とできるだ け少ない副作用を示す治療学的結果が得られるものと期待される。同様に、オリ ゴヌクレオチド類似体は、生物による蛋白質の生成を調節することができる。
アンチセンスオリゴヌクレオチドおよびアンチセンスオリゴヌクレオチド類似体 の薬理学的活性は、他の治療の場合と同様、特定の細胞内標的においてこれらの 薬剤の有効濃度に影響を及ぼす種々の因子に依存する。オリゴヌクレオチドに関 する1つの重要な因子は、ヌクレアーゼの存在下における安定性である。未修飾 のオリゴヌクレオチドが有用な治療用薬剤になるとは考えられない。なぜなら、 未修飾のオリゴヌクレオチドはヌクレアーゼによって速やかに分解されるからで ある。したがって、オリゴヌクレオチドを耐ヌクレアーゼ性にするようこれに修 飾を施すことが必要となる。
耐ヌクレアーゼ性を高めるためのオリゴヌクレオチドの修飾は、一般には糖−リ ン酸主鎖のリン原子上で行われる。ホスホロチオエート、メチルホスホネート、 ホスホルアミデート、およびホスホトリエステルが、種々のレベルの耐ヌクレア ーゼ性を付与することが報告されている。しかしながら、一般にこのタイプのリ ン酸修飾オリゴヌクレオチドはハイブリッド形成特性がよくない[α)hen、  J、S、。
ed、 Olignnuclentides: Antisense Inhi bitors nf Gene Ex ression、(bRCP ress、 Inc、、 BtlcaRatnn FL、 1989) ]。
他の重要な因子は、疾病プロセスに関与している特定の細胞の形質膜をアンチ速 用薬剤にとっては不透過性である(filson、 D、B、 Ann、 Re v、 Biochem、 47:933−965(1978))。培養した哺乳 類細胞における天然オリゴヌクレオチドおよび修飾オリゴヌクレオチドの生物学 的効果と抗ウイルス効果が、文献により立証されている。したがって、これらの 薬剤は膜を透過して細胞内の標的に達することができると考えられる。天然オリ ゴヌクレオチドおよびある特定の耐ヌクレアーゼ性類似体(例えばアルキルトリ エステル類)を使用して、種々の哺乳類細胞(HL−60、ゴールデンハムスタ ーの繊維芽細胞、U937、L929、CV−1,およびATH8等の細胞)に よるアンチセンス化合物の取り込みが研究されている[ Miller、 P− 3,。
Braiterwn、 L、T、およびTs’O,P、O,P、、 町匹慝弘畦 α16:1988−1996(1977):メチルホスホネート、 Marcu s−3ekura、 C,H,、foerner、 A、M、、5hinozu ka、 K、、 Z。
n、G、、およびQuin就n、 GJ、、 Nuc、 Ac1d Res、  15:5749−5763(1987) : MillerB P、S、、 McParland、 K、B、、 Hayerman、 K、お よびTs’O,P、O,P、、 Biochemistry@16: 1988−1996(1977) ;ならびにLoke、 S、に−、5tei n、 C,、Zhang、 X、H,Avigan、 M、B Co)1en、 J、およびNeckers、 L、M、 Tn 、 Micr obiol、 Iwunol、 141: 282:289i19 88)]。
修飾オリゴヌクレオチドおよび修飾オリゴヌクレオチド類似体は、対応する天然 オリゴヌクレオチドに比べて簡単には取り込まれにくい場合が多い。このため、 従来より使用されている多くのアンチセンスオリゴヌクレオチドの活性は、実際 の治療目的、学術研究目的、または診断目的に対して充分であるとは言えない。
アンチセンス治療牛用に設計された従来技術のオリゴヌクレオチドが有する他の 2つの大きな欠点は、細胞内RNAに対するハイブリッド形成がよくないこと、 およびRNAの基本的な機能を停止させるための、明確な化学的または酵素仲介 による事象が欠如していることである。
アンチセンスオリゴヌクレオチドの有効性を高め、かつ上記の問題点を解消する ための修飾は、これまで多くの形態をとってきている。これらの修飾としては、 塩基環の修飾、糖部分の修飾、および糖−リン酸主鎖の修飾などがある。従来の 糖−リン酸主鎖修飾(特にリン原子上での)によれば、種々のレベルの耐ヌクレ アーゼ性が達成されている。しかしながら、アンチセンス方法論にとっては、ア ンチセンスオリゴヌクレオチドが特定のDNAまたはRNAと正確に結合する能 力が基本となるが、修飾リンオリゴヌクレオチドは一般にハイブリッド形成特性 が劣っている。
リン原子の置換は、プロキラルのリン酸部分の修飾に伴う問題点を避けようとホ モポリ7−=によるリン結合の置換が、方法論、生成する分子の溶解性、および ハイブリッド形成特性によって制約を受けているH Mazurら、 Tetr ahedrr+n 40:3949−3956(1984)、本文献によれば、 ホスホニック結合によるリン結合の置換は、ホモトリマー分子の合成以上には実 現されていない:および Goodchild、 J、、 暴いてリン酸結合を 置き換えるには不適切である。
リン主鎖に修飾を施すための有効な方法が限定されていることから、アンチセン スオリゴヌクレオチドによる診断、治療、および学術研究を進めることができる よう、耐ヌクレアーゼ性と満足できる/X<ブリッド形成特性を付与する他の修 飾法の開発が長年にわたって強く要望されている。
薬、および治療に使用するためのオリゴヌクレオチド類似体を提供することにあ 本発明の他の目的は、細胞内取り込みを高めたオリゴヌクレオチド類似体を提供 することにある。
本発明のさらに他の目的は、未修飾のアンチセンスオリゴヌクレオチドより高い 有効性を有するオリゴヌクレオチド類似体を提供することにある。
本発明のさらに他の目的は、このようなオリゴヌクレオチド類似体の合成法およ び使用法を提供することにある。
当業者にとっては、上記の目的および他の目的は、本明細書および特許請求の範 囲から明らかとなろう。
発明の要約 本発明にしたがってRNA分子またはDNA分子の活性を調節するのに有用な組 成物は一般に、修飾された主鎖結合を少なくとも一部有するオリゴヌクレオチド 類似体を含む。これらの修飾においては、野生型の核酸にみられる糖−リン酸主 鎖のホスホロジエステル結合が、種々の四原子結合基(four ato■l  ink inggroup)で償き喬えられる。このような四原子結合基は、あ る糖または糖類似体の3′−炭素とその隣接した糖または糖類似体の4′−炭素 との間に、所望の四原子空間配置を保持している。本発明の教示にしたがって製 造されるオリゴヌクレオチド類似体は、−重鎖または二重鎖のDNAもしくはR NAの、あらかじめ選定されたヌクレオチド配列と特異的にハイブリッド形成す ることが可能な選定された配列を含む。本発明のオリゴヌクレオチド類似体は、 公知の固相合成法により合成されるのが適切であり、RNAまたはDNAのあら かじめ選定されたヌクレオチド配列に対して相補的であるか、あるいは少なくと もその配列と特異的にハイブリッド形成が可能である。核酸合成器は市販されて おり、それらを使用することは、必要とされる妥当な長さをもった殆どすべての オリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド類似体を生成させる上で有効であ ることが、当業者によって一般的に認識されている。
本明細書において使用している“ヌクレオシド”とは、複素環塩基とその糖で構 成された単位を表している。“ヌクレオチド”とは、その3゛または5゛位の糖 ヒドロキシル基上にリン酸基を有するヌクレオシドを表している。したがってヌ クレオシドは、ヌクレオチドと異なってリン酸基をもたない。“オリゴヌクレオ チド”とは、天然に産する塩基と活性ホスホジエステル結合によって糖基を介し て結合し、たペントフラノシル基から、特定の配列にて形成された複数の連結ヌ ク1ノオチト単位を意味している。これらのヌクレオチド単位は、グアニン、ア デニン、シトシン、チミン、またはウラシル等の核酸塩基であってもよい。糖基 は、チオキシリボースまたはリボースのいずれであってもよい。この用語は、天 然産出化学種と天然に産するサブ、ユニットから形成される合成化学種の両方を 表している。
本発明に関して使用されている“オリゴヌクレオチド類似体”とは、オリゴヌク [/オチトと類似的に機能するが、天然には産し7ない部分を有する化合物を意 味している1、オリゴヌクレオチド類似体は、変化させた糖部分、変化させた塩 基部分、あるいは変化させた糖量結合を有することができる。あるいはまた、本 発明の目的のためには、非ホスホジエステル結合(すなわち、変化させた糖量結 合)を有するオリゴヌクレオチド類似体は“オリゴヌクレオシド”とみなすこと ができる。したがってこのようなオリゴヌクレオシドは、天然のホスホジエステ ル結合基以外の結合基によって連結された、複数の連結ヌクレオシド単位を意味 している。さらに、本発明の目的のためには、“オリゴマー”は、オリゴヌクレ オチド、オリゴヌクレオチド類似体、またはオリゴヌクレオシドを包含している と考えることができる。したがって“オリゴマー”について説明する際には、天 然ホスホジエステル結合を介して、または本発明の四原子結合基も含めた他の結 合を介して一緒に連結されている一連のヌクレオシドまたはヌクレオシド類似体 に対しても言及がなされているものとする。一般には、結合はある1つのヌクレ オシドの3゛炭素から別のヌクレオシドの5゛炭素までであるが、 “オリゴマ ー”は他の結合(例えば2’−5’結合)も含むことができる。
オリゴヌクレオチド類似体はさらに、本発明の精神と矛盾しない他の修飾、特に 、ある特定のオリゴヌクレオチドをアンチセンスの治療用、診断用、または学術 研究試薬用として使用するのを容易にするために、オリゴヌクレオチド組成物の 耐ヌクレアーゼ性を増大させるような修飾も含むことができる。例えば、ヌクレ オシドまたはヌクレオチドの糖部分が炭素環式化合物や他の化合物で置き換えら れると、もはや糖ではない。さらに、他の置換(例えば、糖量ホスホジエステル 結合に対する1換)がなされると、得られる物質はもはや真の核酸化学種ではな い。このような置換から得られる化合物もすべて類似体とみなす。本明細書の全 体にわたって、核酸化学種の糖部分に言及しているときは、真の糖または天然核 酸の糖の従来の空間配列をもった化学種のいずれかに言及しているものとする。
さらに、糖量結合への言及では、糖部分または糖類似体部分を天然核酸の態様に おいて一緒に連結するよう作用する化合物も含んでいるものとする。
本発明によれば、細胞内への取り込み、耐ヌクレアーゼ性、およびハイブリット 形成特性を高めるように、かっRNAの基本的な機能を停止させるための明確な 化学的または酵素仲介による事象を与えるように修飾された、新規タイプのアン チセンスオリゴヌクレオチド類似体およびオリゴヌクレオシドが提供される。
ある種類のオリゴヌクレオチド類似体組成物が、治療にとって有用であり、かつ 本発明の他の目的に対して有用であることが見いだされた。このようなオリゴヌ クレオチド類似体は、少なくとも一部が以下のような構造式を有するサブユニツ 1−から形成される。
上記の構造式において、B、は可変の塩基部分であり、QはO,CH2,C)( F。
またはCF、であり、XはH,OH,C,〜CIO低級アルキル、置換低級アル キル。
アルカリール、アラルキル、F、CI、Br、CN、CF、、、0CF7.OC N。
O−アルキル、S−アルキル、N−アルキル、0−アルケニル、S−アルケニル 。
N−アルケニル、5OCHz、SO,ICHi、0NO2,NO2,Ni+ N H2,ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリール、アミノアルキルアミ ノ、ポリアルキルアミノ、または置換シリルである。さらに、Xは、RNA開裂 基、オリゴヌクレオチドの薬物動態学的特性を改良するための基、またはオリゴ ヌクレオチドの薬力学的特性を改良するための基であってもよい。
LlおよびR4は互いに独立的に、CH2,C=O,C=S、C−NH2゜C− NHR3,C−OH,C−5H,C−0−R1,またはC−3−R,である。
R2およびL:は互いに独立的に、CR+ R2,C= CR+ R2、C=  N R1゜P (0) R,、P (S) R4+ C=0. C=S、 0. S、 SO,So、、 NR,、もしくはSiR5Rgであるか、あるいは−緒 になってアルケン、アルキン、芳香環、炭素環、もしくは複素環の一部を形成す る。L、、R2,L、、およびR4は、L。
がC=0まRはC=Sであるとぎは、R2はNR,ではなく、またR4がC=O またはC=−8であるときは、LlはNR1ではないという条件の下にある。さ らに、L、、L、Ll、およびり、は、−緒になって−CH=N−NH−CH, 一部分。
または−CH2−O−N=CH一部分を構成してもよい。
R1およびR2は互いに独立的に、H,OH,SH,NH2,C1〜C1゜アル キル。
置換アルキル、アルケニル、アルカリール、アラルキル、アルコキシ、チオアル コキシ、アルキルアミノ、アラルキルアミノ、置換アルキルアミノ、ヘテロシク ロアルキル、ヘテロシクロアルキルアミノ、アミノアルキルアミノ、ポリアルキ ルアミノ、ハロ、ホルミル、ケト、ベンゾキシ、カルボキサミド、チオカルポキ ’jミl’、エステル、チオエステル、カルボギサミジン、カルバミル、ウレイ ド。
またはグアニジノである。さらにR7およびR2は互いに独立的に、RNA開裂 基、オリゴヌクレオチドの薬物動態学的特性を改良するための基、またはオリゴ ヌクレオチドの薬力学的特性を改良するための基を構成してもよい。
R3は、H,OH,NH2,低級アルキル、置換低級アルキル、アルコキシ、低 級アルケニル、アラルキル、アルキルアミノ、アラルキルアミノ、置換アルキル アミノ、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルキルアミノ、アミノアルキル アミノ、ポリアルキルアミノ、RNA開裂基、オリゴヌクレオチドの薬物動態学 的特性を改良するための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改良す るための基である。R4は、O)I、SH,NH,、O−アルキル、S−アルキ ル。
NH−アルキル、0−アルキルへテロシクo、S−アルキルへテロシクロ、N− アルキルへテロシクロ、または窒素含有複素環である。
R1およびR6は、それぞれ独立的にCI−Csアルキルまたは01〜C6アル コキシである。ただし、R2がP (0)R4であり、R4がOHであり、Xが OHであり、かつ、B、がウラシルまたはアデニンであるときは、LlはOでは なく、またり、、R2,およびR4がCH2であり、XがHまたはOHであり、 かつ、QがOであるときは、L、はS、SO,またはS02ではない。
好ましい態様によれば、本発明のオリゴヌクレオチド類似体は糖部分を含んでも よい(Qが0である場合のように)。他の態様によれば、L、およびR4のそれ ぞれはCR−、R,である。R2およびり、は互いに独立的に、CR,R2,O 。
P (0)R4,P (s)R,、またはNR,であるのが好ましく、R2とL lの一方がCR,R,であり、R2とり、の他方がP (0)R,またはP ( S)R,であるのが特に好ましい。R2が0であって、L、がP (0)R4ま たはP (S)R4であるような組み合わせも好ましい。
他の態様によれば、本発明のオリゴヌクレオチド類似体は、R2およびLlのそ れぞれがNR7であり、ここでR9がHであるのが好ましい。
あるいはまた、本発明のオリゴヌクレオチド類似体は、R2とり、が−緒になっ て、シクロプロピル、シクロブチル、エチレンオキシ、エチルアジリジン、また は置換エチルアジリジン環の一部を形成しているものでもよい。さらに、R2と R3が一緒になって、C1〜C6炭素環、または4,5.もしくは6員構成の窒 素複素環を形成してもよい。
オリゴヌクレオチド類似体は、XがHもしくはOH1あるいはまたF、O−アル キル、またはO−アルケニルであって、そして特にQが0であるようなものが好 ましい。基B1は、アデニン、グアニン、ウラシル、チミン、シトシン、2−ア ミノアデノシン、または5−メチルシトシンであるのが好ましいが、天然に存在 しない他の化学種も使用することができる。
他の好ましい実施態様は、L、およびL4がそれぞれCH,であって、特にL2 およびL3がそれぞれNHであるようなオリゴヌクレオチド類似体である。ある いはまた、L2とL3の一方(好ましくはL3)が0であって、L2とり、の他 方がNHであるようなオリゴヌクレオチド類似体も好ましい。
本発明のオリゴヌクレオチド類似体は、与えられた構造を有するサブユニットを 約5〜50個含むのが好ましい。オリゴヌクレオチド類似体の実質的にそれぞれ のサブユニットが前記構造を有することができるが、実質的に交互のサブユニッ トが前記構造を有することも望ましい。
本発明のオリゴヌクレオチド類似体は、患者への治療投与ができるよう、医薬用 として許容しうるキャリヤー中に製剤するのが好ましい。本発明のオリゴヌクレ オチド類似体は、対応する天然のオリゴヌクレオチドに比べて、改良された耐ヌ クレアーXセ性を示すと考えられる。
本発明はさらに、生物中における蛋白質の生成と活性を調節する方法に関する。
この方法は、該蛋白質をコードする核酸配列の少なくとも一部と特異的にハイブ リッド形成することが可能なオリゴヌクレオチド類似体と該生物とを接触させる ことを含み、ここで前記類似体のサブユニットの少なくともい(つかが前記の構 造を有する。
本発明はさらに、蛋白質の望ましくない生成を特徴とする疾患を有する生物を処 置する方法に関する。この方法は、該蛋白質をコードする核酸配列の少な(とも 一部とハイブリッド形成することが可能なオリゴヌクレオチド類似体と該生物と を、単独もしくは医薬用として許容しつるキャリヤー中に製剤した形で接触させ ることを含み、ここで前記類似体のサブユニットの少なくともいくつかが前記の 構造を有する。
本発明はさらに、本発明の治療法の実施に有用なオリゴヌクレオチド類似体も含 めた、オリゴヌクレオチド類似体の合成法を提供する。これらの方法のうちのあ る特定の方法は、次の構造。
を含む第1の部分と、次の構造 を含む第2の部分(ここでB、は可変の塩基部分であり、QはO,CHl、CH F。
またはCFT、であり、モしてElおよびE2は同一または異なり請求電子反応 基である)を用意すること、および前記第1と第2の部分を、前記求電子反応基 を介して結合基とカップリングして、前記オリゴヌクレオチド類似体を形成させ ること、を含む1.好ましい方法によれば、第1の部分の電子反応基は、l\ロ メチル、トリフルオロメチル、スルホニルメチル、p−メチル−ベンゼンスルホ ニルメチル、または3’−C−ホルミルを含み、そして第2の部分の電子反応基 は、/″−ロゲンスルホニルメチル、p−メチル−ベンゼンスルホニルメチル、 またはアルデヒドを含む。結合基は、ヒドラジンまたはヒドロキシルアミンであ るのが好ましい。
本発明はさらに、上記オリゴヌクレオチド類似体のし2またはLlの窒素部分を 保護する方法を提供し、ここでL2とり、の一方はNR7であり、R3はHであ る。
この方法は、窒素部分をフェノキシアセチルクロライドでブロックすること、オ リゴヌクレオチド類似体をさらに反応させて該オリゴヌクレオチドを修飾するこ と、および水酸化アンモニウムで窒素部分を脱ブロックすること:を含む・本発 明はさらに、二官能のヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチド類似体を保護する 方法を提供し、ここで二官能価のうちの一つはアルデヒドである。この方法は、 アルデヒドとメトキシアミンとを反応させてアルデヒドのオキシム誘導体を形成 させること、ヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチド類似体をさらに反応させて 該ヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチド類似体を修飾すること、および該オキ シムをアセトアルデヒドと反応させてアルデヒドを再生させること、を含む。
本発明はさらに上記のオリゴヌクレオチド類似体を合成する方法を提供し、この 方法は、ペントフラノシルヌクレオシドの3′炭素原子においてラジカルを生成 させること、および別のペントフラノシルヌクレオシトの5゛位にペンダント状 態になっているオキシム部分と該ラジカルとを反応させること、を含む。前記オ リゴヌクレオチド頌似体の少なくとも一部を、別のオリゴヌクレオチド化学種に 組み込んで、天然のホスホジエステル結合とそのようにカンプリングされた区域 が実質的に交互に存在する状態の前記別のオリゴヌクレオチド類似体を得る、と いう形で治療用組成物を調製するのが有用である。組み込み(incC)rpc +ratinn)は、所望の配列を有するジヌクレオチドのホスホンエステル結 合によって達成するのが好ましく、このとき前記ジヌクレオチ1−はあらかじめ そのようにカップリングされている。。
を有するヌクレオシド前駆体も本発明によって意図されており、ここでB、は可 変の塩基部分であり、QはO,CH,、CHF、またはCF、であり、モしてX はH,OH,CI−C,o低級アルキル、置換低級アルキル、アルカリール、ア ラルキル、F、CI、Br、CN、CF1.0CF1.OCN、O−アルキル、 S−アルキル、N−アルキル、0−アルケニル、S−アルケニル、N−アルケニ ル。
5OCH1,So、CHl、○NO,,No4.N1.NH2,ヘテロシクロア ルキル。
ヘテロシクロアルカリール、アミノアルキルアミノ、ポリアルキルアミノ、l換 ノリル、RNA開裂基、オリゴヌクレオチドの薬物動態学的特性を改良するため の基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改良するための基である。
このような化学種においては、Yはヒドロキシ、アミノメチル、ヒドラジノメチ ル、ヒドロキシメチル、C−ホルミル、フタルイミドヒドロキシメチル、アリー ル置換イミダ192人アミノヒドロキシメチル、オルト−メチルアミノヘンセン チオ、メチルホスホネート、またはメチルアルキルホスホネートである。ZはH ,ヒドロキシル、アミノメチル、ヒドラジノメチル、ヒドロキシメチル、C−ホ ルミル、フタルイドヒドロキシメチル、アリール置換イミダゾリジノ、アミノヒ ドロキシメチル、オルトーメチルアミノヘンゼンチオ、メチルホスホネート、ま たはメチルアルキルホスホネートである。
上記のものはいずれも、QがOであり、Yがヒドロキシメチルであり、かつXが HまたはOHであるときは、2はHまたはC−ホルミルではないという条件の下 にあり、またQが0であり、XがHまたはOHであり、かつZがヒドロキシルで あるときは、Yはアミノヒドロキシメチル、ヒドラジノメチル、またはアリール 置換イミダゾリジノではないという条件の下にある。XがHまたはOHであって 、Qが0であるのが好ましい。
修飾された糖結合を有するオリゴヌクレオチド類似体は、本発明の目的を達成す るのに有効であることが見いだされている。オリゴヌクレオチド類似体は、約5 〜50個の長さの核酸塩基サブユニットを有するのが好ましい。本発明によるオ リゴヌクレオチド類似体は、−重鎮もしくは二重鎖のDNAおよびRNAの、あ らかじめ選定されたヌクレオチド配列とハイブリッド形成が可能である。本発明 を構成している核酸塩基は、ピリミジン類(例えば、チミン、ウラシル、または シトシン)でも、プリン類(例えば、グアニンやアデニン)でも、あるいはこれ らの修飾物(例えば5−メチルシトシン)でもよ(、いずれも選定された配列中 に配置されている。糖部分は、リポースタイプでも、デオキシリポースタイプで も、あるいは糖模倣体(sugar m1m1c) (例えば炭素環)でもよい 。本発明の1つの好ましい実施態様によれば、オリゴヌクレオチド類似体又はオ リゴヌクレオチドは、tat蛋白質をコードするHIV mRNA、またはHI V mRNAのTAR領域に対してハイブリダイズする。他の好ましい実施態様 においては、オリゴヌクレオチド類似体またはオリゴヌクレオシドは、HIV献 NAのTAR領域の二次構造を模倣して、(、を蛋白質に結合することができる 、他の好ましいア゛〉・チ七ンスオリゴヌクレオチド類似体またはオリゴヌクレ オ・ント配列(ツ、へ\ルベスウイルス、乳頭種ウィルスおよび他のウィルスに 対する相補的配列を含む。
本発明の修飾された結合は、天然に存在するホスホジエステル−5°−メチレン 結合を置き換えるために四原子結合基を使用することが好ましい。天然に存在す る結合を本発明の四原子結合体(four atOwAlinkCr)て】き換 えると、こつして得られたオリゴヌクし/オシド類似体には、耐ヌクレアーゼ性 および細胞内取り込みの増大が与えられる。結合した糖の1つの3°−チオ計シ 機能を四原子結合体内に含ませるのが好ましい。この四原子結合体は・−L 、 −R2−L、−L、−という構造を有し、こ、二でLlおよびり、はメチレン炭 素原子または置換炭素原子であり、R2およびLlはメチレオ炭素原子、置換炭 素原子、酸素原子、窒素原子、置換炭素原子、1換りン原子、イオウ原子、置換 イオウ原子、または置換ケイ素原子である1、修飾結合は、実質的にそれぞわの 結合場所において施されるのが好ましい3、あるいはまた、修飾結合は、すべて の結合場所より少ない形で(例えば、交互の結合場所において)施してもよい。
結合は、中性であっても、あるいは正もしくは負に帯電していてもよい、。
本発明はさらに、このようなオリゴヌケL・オシドを合成する方法に関する。本 発明は、二原子フラグメントまたは置換二原子フラグメントの付加による、3′ −デオキシ−3°4換(特にメチル置換)ヌクレオシドと5′−デオキシ−5′ −置換ヌクレオシドとのカッブリソゲを提供する。この付加反応は、種々の適切 な電子性化合物に対して個々のヌクレオシドの3°位置および5°位置を活性化 させること、次いで適切な結合基を加えて電子剤と反応させることを含む逐次手 順により行われる。あるいはまた、この手順は並行操作的に行うこともできる。
このような方法では、支持体を手操作することまたは他の方法により、DNA合 成器を介して固体支持体を使用することができる。
本発明はさらに、生物による蛋白質の生成を調節する方法に関する。この方法は 、これまでに説明してきた開示内容にしたがって配合した組成物と該生物とを接 触さぜることを含む。調節されるべきRNA部分またはDNA部分は、その形成 または活性が調節されるべき蛋白質をコードするDNAもしくはRNAの部分を 含むようあらかじめ選定するのが好ましい。したがって、使用される組成物の標 的部分は、DNAもしくはRNAのあらかじめ選定された部分に対して相補的で あるよう(すなわち、当該部分に対してアンチセンスのオリゴヌクレオチドであ るよう)選定される。
本発明はさらに、蛋白質の望ましくない生成を特徴とする疾患を有する生物を治 療する方法に関する。この方法は、これまでに説明してきた開示内容にしたがう 組成物と該生物とを接触させることを含む。本組成物は、その生成または活性が 調節されるべき蛋白質をフードするメツセンジャーRNAと特異的に結合するよ う設計されたものであるのが好ましい。本発明はさらに、生物または細胞中にお 番ブる異イなRNA分子の有無、あるいは正常なRNA分子の異常なもしくは不 適切な発現を検出するための診断法に関する。
本発明はさらに、学術研究用および診断用としてRNAを選択的に結合するため の方法に関する。こうした選択的かつ強力な結合は、分解を引き起こすヌクレア ーゼに対して抵抗性があり、そして公知のオリゴヌクレオチドまたはオリゴヌク レオチド類似体より強力かつ正確にハイブリッド形成する本発明の組成物と、こ のようなRNAまたはDNAとを相互作用させることによって達成される。
図面の簡単な説明 図1は本発明のある特定の実施態様にしたがった概略の合成スキームであり。
図2は本発明の他の実施態様にしたがった概略の合成スキームである。
好ましい実施態様の詳細な説明 従来使用されているアンチセンスオリゴヌクレオチドの生物学的活性は、一般に は、実際上の治療研究や診断での使用に対して充分であるとは言えない。本発明 は、修飾されたオリゴヌクレオチド(すなわち、オリゴヌクレオチド類似体やオ リゴヌクレオシド)およびこのような修飾を達成するための方法に関する。これ らの修飾オリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチド類似体は、天然に存在す る対応物質に比べて高い安定性を示す。細胞外ヌクレアーゼおよび細胞内ヌクレ フ −セly! 一般に、本発明の主鎖修飾オリゴヌク!、・オシド類似体やオ リゴヌクレオシドを認識せず、したがってこれらには結合しない。感受性のりン ー酸素結合の欠如のため、ヌクレアーゼI;よる主i−1のいかなる結合も、ヌ クレオシド結合の開裂を起6:すことはない。さら1こ、こうして得られる本発 明の新規な中性または正に帯電した主鎖は、蛋白質仲介による複雑なプロセスを 必要とするよりむしろ、1純な受動輸送によ−、て細胞中に取り込まれることが できる。本発明の他の利点は、負に帯電した主鎖がないことにより、標的RNA (負に帯電した主鎖を有し、したがって入ってくる同帯電のオリゴヌクレオチド に反発する)に対するオリゴヌクレオシド類似体またはオリゴヌクレオシドの配 列特異的な結合が容易になる、という点である11本発明のさらζこ他の利点は 、標的RNAの触媒作用開裂を開始させることのできる官能基を結び付けるだめ の部位がこれらの構造タイプ中に見いだされる、という2点である。
好ましい実施態様によれば、本発明は、糖量リン酸基を2き換えて、下記構造に みられるような結合を有するオリゴヌクし・オシドを生成させることに関する。
上記構造において、 B、は可変の塩基部分であり、 Qは0.CHz、C)(F、またはcFzであり、XはH,OH,C,−C,。
低級アルキル、置換低級アルキル、アルカリール、アラルキル、F、CI、Br 、CN、CF3,0CF3.OCN、O−アルキル。
S−アルギル、N−アルキル、O−アルケニル、S−アルケニル、N−アルケニ ル、5OCH3,5O2CH*、0NO2,NO2,N:l、NH2,ヘテロシ クロアルキル、ヘテロシクロアルカリール、アミノアルキルアミノ、ポリアルキ ルアミノ。
置換シリル、RNA開裂基、オリゴヌクレオチドの薬物動態学的特性を改良する ための基、またはオリゴヌク17オチトの薬力学的特性を改良するための基であ りり、およびR4は、互いに独立的にCH2,C=0.C=S、C−NH2゜C −NHR,、C−OH,C−5H,C−0−R,、またはC−3−R,であり。
R2およびり、は、互いに独立的にCR+ R2,C” CR+ R2,C=N  R1゜P (0) R4,P (S) R,、C=O,C=S、 0. S、  So、 so、、 NR*、または5iR5Rcであるか、あるいは−緒にな ってアルケン、アルキン、芳香環。
炭素環、または複素環を形成し。
L、、L、、Ll、およびR4は、−緒になって−CH=N−NH−CH2一部 分。
または−CH2−O−N=CH一部分を構成し。
R8およびR2は、互いに独立的にH,OH,SH,NH,、C,−CIOアル キル。
置換アルキル、アルケニル、アルカリール、アラルキル、アルコキシ、チオアル コキシ、アルキルアミノ、アラルキルアミノ、!換アルキルアミノ、ヘテロシク ロアルキル、ヘテロシクロアルギルアミノ、アミノアルキルアミノ、ポリアルギ ルアミノ、ハロ、ホルミル ナミド、エステル、チオエステル、カルボキサミジン、カルバミル、ウレイド。
グアニジノ、RNA開裂基,オリゴヌクレオチドの薬物動態学的特性を改良する ための基.またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改良するための基であり R1は,H,OH.NH,、低級アルキル、置換低級アルキル、アルコキシ、低 級アルケニル、アラルキル、アルキルアミノ、アラルキルアミノ、置換アルキル アミノ、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルキルアミノ、アミノアルキル アミノ、ポリアルキルアミノ、RNA開裂基、オリゴヌクレオチドの薬物動態学 的特性を改良するための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改良す るための基であり。
R4は、OH,SH,NH2,O−アルキル、S−アルキル、NH−アルキル。
O−アルキル複素環、S−アルキル複素環、N−アルキル複素環、または窒素含 有複素環であり、そして R5およびR6は、互いに独立的に01〜C6アルキルまたはC3〜C6アルコ キシである: ただし、L、がC=CまたはC=Sであるときは、R2はNR1ではなく、R4 がC=0またはC=Sであるときは、L、はNR7ではな(:R2またはLlの 一方がC=0またはC=Sであるときは、R2またはR3の他方はNR1ではな く:L2がP (0) F:;であり、R4がOHであり、XがOHであり、が っ、B、がウラシルまたはアデニンであるときは、L、はOではなく、またり、 、R2,およびR4がCH,であり、XがHまたはOHであり、かつ、Qが0で あるときは、LlはS。
SO9またはS02ではない。
本発明の好ましい実施態様によれば、Llおよびり、はメチレン基である。この ような好ましい実施態様においては、L、!とLlの一方がアミノ基を含んでも よく、また他方がアミノ基または酸素を含んでもよい。したがって特定の好まし い実施態様においては、R2とLlは一緒になってヒドラジノ、アミノヒドロキ シ、またはヒドロキシアミノである。他の好ましい実施態様では、LlまたはR 4の一方が、R2またはLlの一方と一緒になってCH=N基となり、そしてR 2またはR3の他方が酸素原子または窒素原子であり、したがってリンカ−はオ キシム基とヒドラゾン基を含む。このようなオキシム結合基またはヒドラゾン結 合基は、上述のアミノヒドロキシ基またはヒドラジン基に還元することができる 。
本発明の他の好ましい実施態様においては、R2およびり、は置換炭素、アミノ 、置換アミン、酸素、イオウ、イオウ酸化物、リン酸化物、またはケイ素酸化物 である。炭素上の置換基としては、水素、ヒドロキシ、チオ、アミノ、低級アル キル、置換低級アルキル、アルコキシ、チオアルコキシ、低級アルケニル、アラ ルキル、アルキルアミノ、アラルキルアミノ、置換アルキルアミノ、ヘテロシク ロアルキル、ヘテロシクロアルキルアミノ、アミノアルキルアミノ、ポリアルキ ルアミノ、ハロゲン、ホルミル、ケト、ベンゾキシ、エステル、チオエステル、 カルボキサミジン、グアニジノ、RNA開裂基、オリゴヌクレオチドの薬物動態 学的特性を改良するための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改良 するための基などがある。さらに他の好ましい実施態様では、R2とR3が一緒 になってC=Cを形成している。さらに他の好ましい実施態様では、R2とり、 が−緒になって、炭素環、芳香環、複素芳香環または複素環を含む環構造の、C −C。
C−C,C−N、またはN−C二原子対を形成している。本発明のさらに他の好 ましい実施態様では、LlおよびR4は、互いに独立にカルボキシ、チオカルボ キシ、メチルアミノ、メチルヒドロキシ、メチルチオ、エーテル、またはチオエ ーテルである7 本発明はまた、修飾された糖量結合をもつオリゴヌクレオシドの製造方法をも目 的としている。これらの修飾は、固体支持体を用いて、手で操作することができ るかまたは、DNA合成装置技術に習熟した人々には一般的に公知の方法論を用 いてDNA合成装置を用いて実施することができる。一般に、この手順には、選 択された配列中でお互いに隣接するであろう2つのヌクレオシドの糖部分を官能 化することが含まれる。5′から3′へという意味において、″上流”ヌクレオ シドは、一般に3“糖部位で修飾され、本明細書中でこの後“シンソン(syn thon)1”と呼ばれる。本発明の一方法では、アデニン、グアニン、シトシ ン、ウラシル、チミンのリボ−および2°−デオキシ−リボヌクレオシドおよび これらの類似体を修飾してその3° −デオキシ−3−ヒドロキシメチル類似体 とする。次にこれらの3゛ −ヒドロキシメチル基を種々の型の電子中心に変換 する。これは下記の好ましい反応工程のような種々の方法で達成することができ る。
出発物質の一つである3° −デオキシ−3° −ヒドロキシメチルリボヌクレ オシドは、タウンセンド(T own s e n d)外、テトラヘドロン・ レターズ(Tetrahedron Letters)、31:3101−31 04(1990)。
サマノ・ブイ(Samano、V、)およびエム・ソエイ・センス(M、J、  Morris)、ジャーナル・オブ・オーガニック・ケミストリイ (Jour naI of Organic Chemistry)、55:5186−51 88(1990)およびバーゲストロム、ディー・イー(Be rgs t r om、D。
E、)、ヌクレオサイズ・アンド・ヌクレオシドズ(Nuc 1eos 1de sand Nucleot 1des)8 (8):1529−1535 (1 989)によって開示されたようにして製造することができる。これらのヌクレ オシドの適当な公知の選択的糖ヒドロキシル保護とそれに続く標準的な2° − 脱酸素化手順により、2°、3′ −ジデオキシ−3°−ヒドロキシメチル−リ ボヌクレオシドか得られるであろう。この型のヌクレオシドは選択的に保護して 、3゛ −ヒドロキシメチル成分を官能化して種々の適当な電子部分にすること ができる。本発明の好走しい具体化に従えば、このような電子部分にはハロメチ ル、トリフルオロメチル、スルホニルメチル、p−メチルヘンセンスルホニルメ チル、ヒドラジノメチルまたは3’ −C−ホルミルがある。
“下流”ヌクレオシドは一般に5°糖部位で修飾され、本明細書中でこの後“シ ノソン(synthon)2”と呼ばれる。種々の型の電子中心に変換されたそ れらの5°−ヒドロキシメチレン基をもつ、アデニン、グアニン、シトシン、ウ ラシル、チミンのリボおよび2° −デオキシリボヌクレオシドおよびこれらの 類似体を生成するための修飾は、商業的に入手できるヌクレオシドを用いて種々 の手順によって達成することができる。例えば、5゛ −デオキシ−5’ −/ %ロヌクレオシド、5゛−デオキシ−5゛−トシルヌクレオシド、および5゛  −アルデヒド性ヌクレオシドは、ジョーンズ、シー・エイチ(Jones、G、 H,)およびン二イ・シー・モファゾト(1−G、Hoffatt)によりジャ ーナル・オブ・シ・アメリカン・ソサエティ (Journal of the  Ameriean Chemical 5ociety)90:5337−5 338(1963)において製造された。
一般に、ンフラン1は、構造 より成るものとして表わすことができ、一方シフラン2は一般に構造:(式中B x可変の塩基成分であり、Qは○、CH2,CI(FまたはCF2であり:そし てE+およびR2は同一または異なり請求電子反応基である)より成る。
2つのシンソンは請求電子反応基と反応性の結合基によるかまたは別の方法で結 合される。シンソン1とシンソン2との間の結合は段階的に、あるいは一致して 起こることができ、本発明の修飾された結合により結合したジヌクレオシドを生 ずることができるかまたはヌクレオシドの鎖を生ずることができ、これらは各々 上記の修飾された結合によって次のものに結合させることができる。
一致した作用による結合は、アンモニアまたはアンモニア誘導体の存在における ようなシンソン1およびシンソン2の電子中心の間で起こって、ジヌクレオシド を生成することができる。本発明の好ましい具体化は、ヒドラジンの付加により 公知のブロモメチル型シフランを結合させて、−CHzNHNHCH2−に等し い−LI R2−R3−R4−を有する好ましい結合を生成させるものである。
本発明のもう一つの好ましい具体化はヒドロキシルアミンの付加によりブロモメ チル型シンンンを結合させて、−CHz N HOCHz−または−CHzON HCH2−に等しい−L+ R2R3R4−を有する結合を生成させるものであ る。
糖量結合を修飾してオ明細隻中に記載さ第1rいるシヌクし、・オシド構造を与 えbこJができるもう一つの方法は、・ウィツテイヒ反応によるものである。奸 ま[7(は、4−のよ−)な反応の出発物質は、クラン七ンl” (T own  s e n d)外[テトラヘドロン・レターズ(Tetrahearon  Letters)31:31t)1−3104 (1990)] ;ザ7./・ ヴイ (Samario、V、)およびエム・シLイ・モリス(M、J、 Mo  r r i s) [ツヤ−ナル・オブ・オーガニック゛ケミストリイ (J ournal of Organic Chemistry)55 : 518 G−5188(1990) およびバーゲストロム・ディー ・4−(Be r  g s t r om、 D、E、 )外[ヌクレオシドス アンド・ヌクレ オクイズ(Nucleosides and Nucleotides)8(8 )1、529−1535 (]、、 989 )コにより開示されたようj;i −3’ −ケトヌクレオシド、または、ンッーンズ・シー・エイチ(J one  s、 G、 H)およびシエイ・シー ・モファット(J、G、Moffat t)[ジャーナル・オブ・シ・アメリカン・ケミカル・ソサエティ (Jour nal of the Americaan Chemical 5ociet y)90:5337−5338(1968)]によって開示されたような5゛− アルデヒド性ヌクレオシドである。出発物質は好ましくは、ペンシルまたはその 他の保護基を有するリンイリドと反応させる。本発明に有用な一つの好ましいイ リドはトリフェニルホスホラン−ベンジルオキシメチリジンである。本発明用に 好ましく使用されるもう−っのイリドは、トリフェニルホスホランーベンジルオ キシエチリジンである。ビニル基の還元およびベンジル保護基の水添分解は、グ アニン、アデニン、シトシン、チミン、ウラシルの所望のヌクレオシドまたはこ れらのヌクレオシドの類似体の5′ または3゛位に各々ヒドロキシメチルおよ びヒドロキシエチル部分を与える。
さらにウィツテイヒ反応を使用して炭素環ヌクレオシドの5′および3′ ヒド ロキシアルキル部分を得ることができる。
求電子中心を与えるためのヒドロキシル基の変換およびそれに続<3゛求電子中 心の請求核中心との結合により、本発明のジヌクレオシドが得られるであろう。
本発明の一具体化においては、ヒドロキシル基を変換してブロマイド、トリフレ ー!・、およびドア/レートのよう請求電子中心を与える。結合により、1また は2個のへテロ原子を有する炭素鎖によって連結させられたジヌクレオシドが得 られる。好ましくはこのようなヘテロ原子は、先に示した一般式に示されるよう にO,NH,NR3−S、So、SO2,P (0)R4,P (S)R4また は5iRsR6である。
3゛ または5°カルボニルヌクレオシドおよびトリフェニルホスホリンメチリ ジンジフェニルホスホネートを包含するウィツテイヒ反応から誘導することがで きると思われるその他の有用なジヌクレオシドは、ホスホネートジヌクレオシド である。この反応は、相当する5゛ −または3° ヒドロキシ基と縮合して3 ゛−または5゛ −ホスホネート結合したオリゴヌクレオシドを与えることがで きるホスホン酸メチルまたはエチルを与える。この型の化学はモファット、ジエ イ・ジー(Mof−fatt J、G、)外、ジャーナル・オブ・アメリカン・ ケミカル・ソサエティ (Journal of American Chem icalSac ie ty)92 : 5510−5513 (1970)お よびマズール、エイ(Mazur、A、)、ビー・イーートo7プ(B、E、T ropp)、およびアール・エンゲル(R,Enre L) 、テトラヘドロン (Tetrahedr。
n)40 : 3949−3956 (1984)の生化学的方法の研究のため のジヌクレオシドのホスホネートの製法中に開示された。このタイプの結合を使 用して、対称なビス(メチルトリフェニルホスファン)フェニルホスフェートを 用いて3° −ケトヌクレオシドを5゛−ヌクレオシドに結合させて、3’、5 ’ −ジメチルホスホネート結合したオリゴヌクレオチドとすることによって、 好ましい具体化か製造される。
ウィツテイヒ反応に加えて、3° −ヒドロキシメチルヌクレオシドはまた、ア ルファ炭素環ヌクレオシドの転化によって製造することもできる。これにより“ 下“またはアルファ面上に所望の3′ ヒドロキシメチル基が得られるであろう 。
この基は、保護することができる。3″−ヒドロキシル基(糖の3゛位に結合し た環外メチルを3”メチルと認定する)は、ヒドロキシメチル基またはより長い アルキル基に変換することができる。3”基を変換する一方法には、ケト基への 酸什とそれに続くトリフェニルホスホリンメチリジンジフェニルホスホネートを 用いるウィツテイヒ反応および還元が包含される。より長いヒドロキシアルキル 基は、こうして3”−位に配置することができる。この具体化はまた、4° − デスメチル−3゛−ヒトロキシメチルヌクレオシドシフランをも与える。2原子 結合剤を用いるこの4° −デスメチルヌクレオシドおよび普通の3“ −ヒド ロキシ−ヌクレオシドの間の結合により、先に出願中の1990年8月13日出 願の出aNo、566.836 にの出願は、本出願の譲受人に譲渡されている )中に開示されたようなシヌクレオシトシフランが得られるであろう。4゛ − デスメチルヒドロキシル基を適当な上記の3′ −シンランと結合させると、数 多くの他の型の新規シヌクレオシドシフランが得られるであろう。
さらにもう一つの3′ −デオキシ−3′ −メチルヌクレオシドのメチル基を 官能化するだめの方法は、3″−デオキシ−3° 〜シアノヌクレオシドから作 り出すことかできる。バークス・ケイ・イー・ビー(Parkes、に、E、B 、)、およびケイ・ティラー(K、Taylor)、 テトラヘドロン・レター ズ(Tetrahedron Letters)29:2995−2996(1 988)には、3゛−シアノヌクレオシド類の一般的な合成法が記載されている 。この方法では、5゛−トリチル保護された2゛ −デオキシヌクレオシドをヨ ウ化メチルトリフェニルホスホニウムで3′ −ヨウ素化する。次にこの物質を ヘキサメチルニヌズ、t−ブチル−イソニトリル、および2.2′ −アゾ−ビ スイソブチロニトリル(AIBN)で処理して、3′ −位にシアノ基のラジカ ル付加を起こさせろ。シアノ基のアルデヒドへの変換は、高収率で達成される。
続いて、この中間体をヒドロキシメチル官能基に変換するが、これは電子シンラ ン1への有用な前駆体である。
糖量結合を修飾し、でシヌ9 +、/オシドを与えることができる別の方法は、 シンラン】としての3’ −C−ホルミル誘導されたヌクレオシドおよびシンラ ン2としての5′−アミノヒドロキシ誘導されたヌクレオシドを使用する。シン ラン1および2を直接結合させると、オキシム結合によって結合したジヌクレオ シドが得られる。この場合には、オキシムはE/Z異性体として存在する。これ らの異性体化合物は、HPLCを用いて分離される。さらにこの場合に、オキシ ム窒素原子は、上流ヌクレオシドの3゛ −末端の炭素原子に隣接している。5 ゛ または下流ヌクレオシドの炭素原子に隣接するオキシム窒素を有するジヌク レオシドは、シンラン2としての5° −C−ホルミル誘導ヌクレオシドおよび シンラン1としての3° −デオキシ−3° −アミノヒドロキシメチル誘導ヌ クレオシドを使用して合成される。この場合には、オキシムE/Z異性体も得ら れる。両方の場合に、オキシム結合した二量体は、オリゴマーへの直接組み入れ に有用であるがまたは、次に還元して相当するヒドロキシアミノ結合ジヌクレオ シドとすることができる。
オリゴマー中のジヌクレオシドとしてのまたはジヌクレオシド部分としてのオキ シム結合ジヌクレオシドの、水素化シアノホウ素ナトリウム(sodium c yanoborohydride)を用いる還元により、相当するアミノヒドロ キシル結合化合物が得られる。ヒドロキシアミノ結合ジヌクレオシドまたは大オ リゴマーは、アミノヒドロキシル結合のアミノ部分でアルキル化して、相当する N−アルキルアミノ結合を得ることができるであろう。
3° −C−ホルミル誘導されたシンラン1は、いくつかの合成法によって形成 することができる。現行の好ましい方法では、相当する3′−デオキシ−3゛− ヨードヌクレオシドのラジカルカルボニル化を使用する。このヨード化合物をC o、AIBN、すなわち2.2′ −アゾビスイソブトリロニトリル、およびT TMS、すなわちトリス(トリメチルシリル)シランで処理する。別法として、 このものは3° −デオキシ−3゛ −シアノ糖またはヌクレオシドから合成す ることができる。5゛−C−ホルミル(または5° −アルデヒドとしても認定 される)および3° −C−ホルミル基の両方を、ブロック基として0−メチル アミノベンゼンチオールを使用して容易にブロックすることができる。この5゛ および3° −C−ホルミル基の両者は、硝酸銀醒化により脱ブロックすること ができる。
3” −〇−ホルミルヌクレオシド合成の別法においては、その製造のために1 −〇−メチルー3′ −デオキシ−3’ −0−メチルアミノベンゼンチオール −5’ −0−トリチル−β−り一エリトローベントフラノシドを使用すること ができる。このとき、この化合物はすべての3° −デオキシ−3’ −C−ポ ルミルヌりしノオシドのための前駆体としてはたらく。この1−0−メチル−3 ゛ −デオキシ−3゛−〇−メチルアミノベンゼンチオール−5’ −0−トリ チル−β−D−エリトロ−ベントフラノシドを標準的なグリコジル化条件を用い て適当な塩基と反応させ、続いて脱ブロックしてヌクレオシドを得る。さらにも う一つの別法においても、3° −デオキシ−3゛ −シアノヌクレオシドは相 当する3° −デオキシ−3゛ −ヨードヌクレオシドからか、または1−0− メチル−3゛ −デオキシ−3’ −〇−シアノー5° −0−トリチル−β− り一エリトローベントフラノシドとのグリコジル化反応によって製造される。
3”−〇−アミノー3”−ヒドロキシメチルヌクレオシドおよび相当する5゛− O−アミノヌクレオシドは、好都合には、N−ヒドロキシフタルイミド、トリフ ェニルホスフィンおよびジイソプロピルアゾジカルボキシレートを用いるミツノ ブ(MiJsunobu)条件により、保護されたフタルイミド中間体を経て製 造することかできる。この中間体は、ヌクレオシドの未保護ヒドロキシル基のミ ツノブ反応によって製造される。3”−〇−アミノー3”−ヒドロキシメチルヌ クレオシドを形成する際には、トリチルは、ヌクレオシドの5′ −ヒドロキシ ル基のためのブロック基としてはたらく。プリンおよびピリミジンヌクレオシド の両方について、N−ヒドロキシフタルイミドと反応させる前に3゛ −ヒドロ キシ基をTBDPSで保護する。ピリミジン塩基については5゛−〇−アミノヌ クレオシドを形成する際に、5゛位へのフタルイミドの導入後に、3′ −ヒド ロキシルをTBDPSブロック基で保護することができる。
糖量結合を修飾してホスホネート結合したジヌクレオチドを与えるための別の方 法は、3°−C−ホスホネートニ量体の形成のためのマズール(Mazur)外 、テトラヘドロン(Tetrahedron)、20:3949 (1984) のミカエリスーアルブゾフ(Michaelis−Arbuzov)法を使用す するであろう。これをN−ブロモスクシンイミドで処理して相当する3”−プロ セメチル誘導体を得る。シンラン2は5”−ホスファイトとして選択される。シ ンラン1および2の結合により、3゛−C−ホスホネート結合により結合したジ ヌクレオシドか得られる。相当する5° −C−ホスホネートニ量体は、最初に 適当なブロックされたホスファイトをシンランlと反応させ、次に脱ブロックし て3’ CH2−ホスファイト中間体を得ることによって得ることができる。シ ンラン2は、5゛ −ブロモヌクレオシドとして選択される。次に3’ −CH 2−ホスファイト中間体をシンラン2と反応させて5“−〇−ホスフエートニ量 体を得る。シンラン1への結合後にブロックされた亜リン酸エステルとして亜リ ン酸トリペンシルを選択することにより、ベンジル基を水添分解により除去する ことができる。別法として5′ −デオキシ−5゛−ブロモヌクレオシドを亜リ ン酸エステルと反応させて5°−ホスホネートとする。このものを次に、3゛  −ヒドロキシメチルヌクレオシドと反応させて、5′−〇−ホスホネート結合し た二量体を得る。
ヒドラジノ、ヒドロキシルアミンおよび本発明のその他の結合基によって結合し た上記の方法のいずれかから得られるジヌクレオシドは、5° −ヒドロキシル でジメトキシトリチル基によって保護され、3゛ −ヒドロキシルでシアノエチ ルジイソプロビルホスファイト部分と結合させるために活性化されることができ る。
これらの二量体は、ホスホアミダイト結合化学を用いる標準的な面相自動DNA 合成によって、あらゆる所望の配列内に挿入されることができる。このため、保 護されたジヌクレオシドは、通常のホスホジエステル結合を用いて特定のDNA 配列の単位と結合される。得られるオリゴヌクレオチド類似体またはオリゴマー は、混合主、1! (一部分は普通のホスホジエステル結合であり、一部分は本 発明の新規四側子結合)を有している。このようにして、7つのヒドロキシルア ミン、ヒドラジンまたはその他の型の結合を有するジヌクレオシドを含むような 15量体の配列特異的オリゴヌクレオチドを容易に合成することができる。この ような構造は、天然のホスホジエステル結合したオリゴヌクレオチドに比べて増 大した水溶性を与えるであろう。
均一な主鎖結合を含むオリゴヌクレオチドは、CPG−固体支持体および標準的 な核酸合成装置、すなわちアプライド・バイオシステムズ社(AppliedB iosystems Ine、)380Bおよび394およびミリゲン/ノ(イ オザーチ(Mi l l igcn/Biosearch)7500および88 00゜の使用によって合成することかできる。最初のヌクレオシド(3゛ 〜末 端の1番)を制御された細孔ガラス(controlled pare gla ss)のような固体支持体にとりつけ、各々の新規なヌクレオシドを、配列特異 性順序に手操作または自動合成装百システムによって結合させる。メチレンヒド ラジン結合の場合には、反復ヌクレオシド単位は2つの一般的な型のもの、例え ば、5゛−保護されたアルデヒド官能基および3゛ −デオキシ−3’ −C− ヒドラジノメチル基をもつヌクレオシド、または機工安定性基によって保護され た5′ −デオキシ−5゛ −ヒドラジノ基および3° −デオキシ−3° − C−ホルミル基を有するヌクレオシドであることかできる。各々の場合に、次に 続く配列が必要とする塩基を加えるために各サイクルについてくり返される条件 には次のものがある 5゛ −アルデヒド保護基を除去するための酸洗浄、各々 のヒドラジン塩結を形成するための3゛ −メチレンとドラジノ基をもつ次のヌ クレオシドの付加、および所望のメチレンヒドラジン結合したCPG−結合オリ ゴヌクレオシトを得るための種々の藁剤のいずれかを用いる還元。このような有 用な還元剤の一〇は、水素化シアノホウ素ナトリウムである。
奸ましい方法は図1に示されている。この方法には、保護された5゛部位をもつ シンラン2か結合している固体支持体を用いる。好ましくは、上記のシンランの 5゛部位はDMTで保護することができる。その後、シンラン2の5゛部位を緩 機で遊離させ、洗浄し、そして酸化して中間体生成物を生成する。一つの好まし い方法では、アルデヒド誘導体をN、 N〜ジフェニルエチレンジアミンと反応 させて、中間体生成物5゛ −ジフェニルイミダゾリジノ保護されたシンラン2 を生成する。より好ましい方法では、5゛ −ジフェニルイミダゾリジノ保護さ れたシンラン2を直接支持体上に載せる。どちらの方法についても、中間生成物 は次に脱ブロックされて請求核性の5゛位をもつシンラン2を与える。次に5゛  −ジフェニルイミダゾリジノ保護された3゛ −デオキシ−3° −C−ヒド ラジン塩基のような保護された5゛−、アルデヒド基をもつシンラン1を添n口 して、水素化シアノホウ素ナトリウムの添加等によって、結合したシンラン2と 反応させることができる。洗浄した後で、ヒドラジノ部分により結合したジヌク レオシドが形成される。その後で、このサイクルを所望に応じて、シンラン1の 化学種の付加とそれに続く酸/塩基脱保護によりくり返して、修飾された糖量結 合により結合したポリシンラン(結果として得られる所望の配列のオリゴマー) を生成することかできる。本発明のいくつかの好ましい具体化においては、シン ラン1の化学種は5° −DMT保護された3” −C−ヒドラジン塩基である ことができる。
この段階法の一つの好ましい具体化では、固体支持体への結合中、シンラン2の 電子中心を保護するためにジフェニルエチルシアミン付加物(1,3−ジ置換イ ミダゾリジノ)を使用する[モファット・シエイ・ジー(Moffatt。
J、 G、 )外、ジャーナル・オブ・アメリカン・ケミカル・ンサエティ(J ournsl of American Chemical 5ociety) 905337.5338 (1,968)]。シンソランは好ましくは、制御さ れた細孔ガラス支持体または当技術分野に習熟した人々には公知のその他の適当 な支持体のような固体支持体に結合させることができる。結合は標準法によって 行うことができる[ガイド・エム・ジェイ(Ga i t、 M、J、 )著、 オリゴヌクレオタイド・シンセシス、ア・プラクティカル・アプローチ(Of  igonuc le。
tide 5ynthesis、A Practical Approach) 。
アイ・アール・エル・プレス(IRL Press)1984]。別法として、 製造は、保護された結合ヌクレオシドを種々の標準的な酸化法で直接酸化するこ とによって行うことができる。結合シンラン2は、好ましくは、ヒドラジンと反 応させて、シッフ(Schiff’ s)塩基を生成させ、これを続いて還元す ることができる。ヒドロキシルアミンもまたこの方法に有用な好ましい反応体で ある。
均一な主鎖結合オリゴヌクレオシドを合成する別の方法が図2に示されている。
この方法もまた、保護された5゛部位をもつシンラン2が結合されている固体支 持体を使用する。この場合には、シンランの5゛部位はフタルイミド基で保護さ れる。その後、シンンン2の5゛部位をDCM中のメチルヒドラジンで遊離させ て、DCM メタノールで洗浄する。シンラン1の5゛位のアミノヒドロキシル 基もまた、フタルイミド基で保護される。このようなシンラン1は5° −フタ ルイミド保護された3° −デオキシ−3°−C−ホルミルヌクレオシドである 。シンラン1をシンラン2と反応させ、続いて5゛位を脱保護し、洗浄して次の 5゜−アミノヒドロキシ反応部位を遊離させる。このサイクルを、シンラン1の 別の付加について所望の配列か構成されるまで十分な回数くり返す。この配列の 各ヌクレオシドをオキシム結合で結合させる。所望のオリゴヌクレオシドの末端 ヌク1ノオシドを、5° −DMTブロックされた3′−デオキシ−3゛−C− ホルミルヌクレオシドとして配列に加える。オキシム結合したオリゴヌクレオシ ドは、支持体から除去することができる。もしアミノヒドロキシル結合したオリ ゴヌクレオシドか望ましいならば、オキシム結合を水素化シアノホウ素ナトリウ ムで還元オろ。別法として、オキシム結合したオリゴヌクレオシドがまだ支持体 に結合している間に還元を行なうことができる。
また、大発明に従えば、構造 (式中、Bxli、可変の塩基成分でJ5す;QはO,CH2,CHFまたはC F2であり:XはH;OH;C,〜CIO低級アルキル、置換低級アルキル、ア ルカリールまたはアラルキル;F :C1;Br ;CN;CFs;0CFs: OCN;O−アルキル、S−アルキル、またはN−アルキル、O−アルケニル、 S−アルケニル。
またはN−アルケニル; 5OCH3: SOzCHg:0NO2:NC)z: Ns;NH2、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリール、アミノアル キルアミノ:ポリアルキルアミノ、il!換シリル;RNA開裂基;オリゴヌク レオチドの薬物動態学的特性を改良するための基、またはオリゴヌクレオチドの 薬力学特性を改良するための基、である) を有するヌクレオシドか提供される。
このような種では、Yはヒドロキシル、アミノメチル、ヒドラジノメチル、ヒド ロキシメチル、C−ホルミル、フタルイミドヒドロキシメチル、アリール置換イ ミダゾリジノ、アミノヒドロキシメチル、メチルアミノベンゼンチオ、メチルホ スホネートおよびメチルアルキルホスホネートであり、そしてZはH,ヒドロキ シル、アミノメチル、ヒドラジノメチル、ヒドロキシルメチル、C−ホルミル、 フタルイミドヒドロキシメチル、アリール置換イミダゾリジノ、アミノヒドロキ シメチル、オルト−メチルアミノベンゼンチオ、メチルホスホネートまたはメチ ルアルキルホスホネート、である。
上述の基はすべて、QかOであり、Yがヒドロキシメチルであり、かつ、XがH またはOHであるときは、ZはHまたはC−ホルミルではなく、またQがOであ り、XがHまたはOHであり、かつ、Zがヒドロキシルであるときは、Yはアミ ノヒドロキシメチル、ヒドラジノメチルまたはアリール置換イミダブリジノでは ないという条件付きである。
本発明のオリゴヌクレオシド類似体は、診断、治療に、そして研究試薬およびキ ットとして使用することができる。治療用には、このオリゴヌクレオシド類似体 を、何らかの蛋白質によって調節される疾患を有する動物に投与される。このよ うな疾患を有すると思われる患者に、その病気の症状を弱めるために有効である 量のオリゴヌクレオシド類似体を投与するのが好ましい。当技術分野に習熟した 人は、このような治療養生のための最適用量および治療スケジュールを決定する ことができる。
本発明に従う治療薬を経口、静脈内、または筋肉内のように内部に投与するのが 一般に好ましい。経皮、局所、または病変内のようなその他の投与形も有用であ る。生薬内の封入も有用である。薬理学的に受容できるキャリヤーの使用も、い くつかの具体化のためには有用である。
実施例 下記の実施例は、本発明を具体的に説明するものであるが、制限するものではな い。これらの実施例においては、二量体およびその他のより高級なオリゴヌクレ オシドのNMRのために、二量体およびその他の高級オリゴヌクレオシドの単量 体単位に番号をつける。すなわち、5°末端ヌクレオシドから3′末端ヌクレオ シドに向かって、TI、T2−シたがってT−T二量体の5゛ ヌクレオシドは T、てあり、3゛ ヌクレオシドはT2である。
実施例1 メチレンヒドラジン、すなわち(3’ CHz −N H−N H− CH2−5°)結合したオリゴヌクレオシドのためのCPG−結合ヌクレオシド の合成ジフェニルイミダゾリジン保護された5゛ −アルデヒド性チミジンCP G−結合したヌクレオシド、ジフェニルイミダゾリジノ保護された5° −アル デヒド性チミジンおよび5° −デオキシ−5゛−ヒドラジノ−チミジンの含1 1ijj CPG−結合したチミジン[カリホルニア州、フォスター(Fost er)市、ABl、CPG支持体1グラム上のチミジン30マイクログラム)を 、周囲温度で、DM S O,ベンセン、DCC,ピリジン、およびトリフルオ ロ酢酸[15m1/15m1/2.48g10.4m110.2m1)の混合物 で、フィー/ツアー、ケイ・イー(Pfitzer、に、E、)およびジエイ・ ジー・モファットD、G、Moffatt)、ジャーナル・オブ・アメリカン・ ケミカル・ソサエティ (Journal of American Chem ical S。
c ie ty)85 : 3027 (1963)の酸化手順と同様に処理し て、5゛−アルデヒド性ヌクレオシドを得る。混合物を一晩貯蔵した後、濾過す る。支持体を蓚酸(ベンゼン/DM50.1対1.5ml中1.3g)で洗浄し て、1.2−ジアニリノエチレン(3,0g)で1時間処理し、濾過し、モして アセトニトリルで洗浄して、5゛ −ジフェニルイミダゾリジノ保護された5°  −アルデヒド性チミジンを得る。
5° −デオキシ−5゛ −ヒドラジノ−チミジン支持体と結合した5゛ −ア ルデヒドチミジンの、アセトニトリル中のヒドラジン水和物/水素化シアノホウ 素ナトリウムの溶液による処理により、CPG−3“ −結合した5° −デオ キシ−5゛−ヒドラジノチミジンが得られ、このものをその塩酸塩として貯蔵す る。
5゛ −ジフェニルイミダブリジノ保護された3′−デオキシ−3゛−C−ヒド ラジノメチルチミジン 商業的に入手可能な3′ −O−アセチルチミジンを酸化して、次にそのN、  N−ジフェニルエチレンジアミン誘導体(1,3−ジフェニルイミダゾリジノ) として保護した。これにより、公知の5゛ −デオキシ−5゛ −ジフェニルイ ミダゾリシノー3゛−0−アセチルチミジンが得られる。フィッツアー、ケイ・ イー(Pfitzer、に、E、)およびジエイ・シー・モア77トD、 G、  Mo f fatt)、ジャーナル・オブ・アメリカン・ケミカル・ソサエテ ィ (J o u r nal of American Chemica 5 ociety)85:3027 (1963)。この物質の加水分解を、周囲温 度で15時間、メタノール性アンモニア処理をすることによって達成した。5°  −デオキシ−5゛ −ジフェニルイミダゾリジノチミシン(4,5g)をDM F (100ml)に溶解させ、室温で15時間、沃化トリフェニルメチルホス ホニウムで処理した。溶媒を減圧下で除去し、得られる残留物をメタノールから 再結晶させて3° −デオキシ−3゛−ヨード誘導体を得た。3′ −デオキシ −3° −ヨード−5° −ジフェニルイミダゾリジノチミシンをトルエンに溶 解させて、ヘキサメチルニスズ、t−ブチルイソニトリル、およびAIBNで処 理した。このラジカル反応により、3° −デオキシ−3゛−シアノ誘導体を得 て、次にこのものを0℃でトルエン/THF中の水素化ジイソブチルアルミニウ ム(D I BAL−H)で還元して、3゛ −デオキシ−3′−〇−ホルミル ー5゛ −ジフェニルイミダブリジノチミジンを得た。
この物質を、アセトニトリル中のヒドラジン水和物及び水素化シアノホウ素ナト リウムで処理して、5゛ −ジフェニルイミダゾリジノ保護された3° −デオ キシ−3’−C−ヒドラジノメチルチミジンを得た。この物質は酢酸塩として都 合よく貯蔵される。
実施例2 DNA合成装置上での均一な(3” −CH2−NH−NH−CH2 −5゛)、すなわち、メチレンヒドラジン結合したオリゴヌクレオシドの合成3 ′ −末端ヌクレオシドになるであろう実施例1からのジフェニルイミダゾリジ ノ保護された5゛ −アルデヒドをもつCPG−結合したチミジンを、アプライ ド・バイオシステムズ社(Applied Biosystems、Inc)( ABi)のカラムに入れ(250mg、10マイクロモルの結合ヌクレオシド) ABI 380B自動DNA合55.装置にとりつける。デスメチルヌクレオシ ド単位を成長する鎖に結合させるために必要とされるサイクルの自動化(コンピ ューターへ制御された)段階は、下記の通りである。
段階 試薬または溶kx混合物 時間(分 秒〕1 3%ジクロロエタン中のD CA 3 : 002 ジクロロエタン洗浄 100 35° −デオキシ−5°−,(1,3−ジフェニルイミダゾリジノ)−3゛  −デオキシ−3’ −C−メチレンヒドランンヌクレオシド(第2のヌクレオシ ド)。
アセトニトリル30 m l中 20マイクロモル 2504 水素化ホウ素す トリウム(1:I THF/EtOH中50マイクロモル、50m1) 3°0 05 ジクロロエタン洗浄 200 6 段階1で始まるリサイクル(酸洗浄) 3:00この手順で、その生成物ヌ クレオシドとして5° −ジメチルオキシトリチル置換されたヌクレオシド単位 を得る。
合成が完了したら、標準法(Oligonucleotide 5ynthes is: a practical appr。
ach、 M、J、Ga1t、 IRL Press、 1984)により、塩 基脱保護および支持体からのオリゴマーの除去を行う。HPLC上のトリチル精 製に続く酢酸脱保護および沈殿により、オリゴヌクレオシドが酢酸塩として得ら れる。
実施例35′ −デオキシ−5゛ −ヒドラジノヌクレオシドの合成5゛ −デ オキシ−5゛ −ヒドラジノチミジン塩酸塩5゛ −ベンジルカルバシル−5° −デオキシチミジンを得るために、5“ −〇、−トシルチミジン(Nucle osides & Nucleotides 9:89 (1990)、1 9 8 g、5r!11mol)、ペンシルカルバジド(4,15g、25mmo  l) 、活性分子ふるい(3A、2g)、および無水ジメチルアセトアミド(1 00ml)を、110’C(浴温)で16時間、水分を排除しながら一緒に撹拌 した。生成物を冷却し、減圧下で濃縮した(浴温く50℃)。残留物を、溶媒と してCH2C12/MeOH(9・1.v/v)を用いてシリカゲルカラム(5 x45cm)上で精製した。
均質な分画をプールして、蒸発乾燥させ、泡沫をEtOHから再結晶させて、0 ゜7g(36%)の5° −ベンジルカルバジル−5゛ −デオキシチミジンを 得た。
融点201℃。
’ HNMR(M e 2 S Od 6)δ 1. 79 (s、3. CH 3)、2.0O−02N旦)、5. 03 (s、2. PhCH2)、5゜2  (d、1. C1旦)。
吸湿性粉末としての5゛ −デオキシ−5゛ −ヒドラジノチミジンの塩酸塩を 得るために、無水MeOH/HC1(30m1.重量で2%HCl)中の上記カ ルバゼート(carbazate)(0,78g、2ミリモル)および木炭上の パラジウム(10%、150mg)の混合物を、水素雰囲気下で室温で1.5時 間撹拌した。メタノール溶液をセライト(Celite)を通して濾過して、触 媒を除去した。フィルターケーキをEtOH(2X25ml)で洗浄した。濾液 を真空下で濃縮して、残留物を一晩乾燥させて痕跡のHCIを除去した。黄色残 留物をメタノール(3ml)に溶解させて迅速に撹拌している酢酸エチルの溶液 (150ml)に滴加した。濾過した沈殿を酢酸エチル(3X100ml)で洗 浄し、淡黄色の固体を真空乾燥させて、0.51g (88%)の5° −デオ キシ−5゜−ヒドラジノチミジン塩酸塩(吸湿性粉末)を得た:IHNMR(M e2SO−da)δ 1. 81 (s、3. CHり、2.02−ヒI・ラン ノおよび3’ −OHは、H20によってマスクされた。
実施例45゛ −川・リナルー1−[2,3−シチオキシー3.−Ciホルミル −β−1) −xlJz,o−ベントフラノシル]ーチミンおよび一ウラシルの 合成方法A 3゛−C−シアツー:3゛ −チオギシー5° −0−トリチルチミジン[以下 の調製はツー1−の中で行い、試薬の蒸気を吸入し5ないように注意しなさい。
−]3° −デオキシ−3′ −ヨード−5° −〇ートリチルチミジン(フエ ルノーイデン.J.P.H. (Verheyden.J.P.H.);モフy ・yl□.JG. (Mof fatt.J.G.)、J.Org.Chem. 35:2868 (1970))(60g.0.1モル)、ヘキサメチルシチン (36g.22.7m1、0. 11モル)、t−ブチルイソシアニド(16  6 g、225m1.2モル)、およびCNa/ヘンノフエエフエニン上したば かりの、2す・ントルの)トルエンに溶かした(AIBN (1.6g.IOこ リモル)の@濁液に30分間アルゴンを送り込むことによって徹底的に酸素を除 去して、次に38°Cで13時間加熱した。この反応混合物を60°Cに冷却し て、AIBN (1.6g,IOミ’Jモル)を加えて、そして24時間加熱を 続けた。この明間に3回同じ方法でAIBNの添加を繰り返した。反応混合物を 室温にまで冷却して、ブレツクツクのシリカゲルカラムの丘に移しく1. 5に .g.ヘキサンに懸濁しである)、ヘキサン類 Et20を用いて溶出した(各 回ごとに1リツトルの溶出液を用いて10%の勾配の変化を作り、100%ヘキ サン類−100%EtzO)。不純物の大部分は非極性化合物として勾配をかけ た溶出の間に除去した。Etzo(2リツトル)を用いて最後に溶出させて、適 当なフラクションを合わせて蒸発させて、集めた順に2つの化合物を得た。
(i)3° −C−シアノ−3゛ −デオキシ−5” −0−トリチルチミジン 12。
93g(25%)、白色粉末(トルエン/EtzOから結晶化させた、mp15 3−157℃)。
’H NMR (CDC 13)6 8. 83 (s. 1. NM)、7. 04−7。4(m. 18. 5. トルエン由来のTr旦.C6旦.および  領 5Ar旦)。
6、 10(da. 1, Hl,、J+,、2,=4. 1Hz. J+,、 z−=7. 1Hz) 。
3、33 3. 60 (m, 3. Hs= 、s−、s− )、2. 68  (m. 1, Ht−Jz.、z− =13. 8Hz) 、 2. 52  (m. 、1,旦z− ) 、 2. 28 (s. 1。
5、0.51−ルエン由来のCH.)、および1. 50 (s, 3, CH ,)。
CsoHztNsO40・5 C,H.()ルエンから結晶化させた)に対する 計算値:C,74、56;H.5.79;N,7.78。実測値:C, 74.  27:H。
5、78;N.7.66。
(10%)も得られた: ’H NM−R (CDCIg)δ 8. 72 (s. 1, NM)、7.  03−7. 44 (m. 18. 5, Tr旦,C.旦.およびトルエン 由来のQ,5Ar旦)36、13(擬似のt、1.、Ht− J+、、ト=6.  7Hz, J+,、fi+ =5. 7Hz) 、 4. 09 (m、1, Ha,Js,、r =6. 7Hz. J4,+S’ =4、9Hz)、3.5 6(m、2. 8s,s,、3. 28 (m. 1. Hs− Js− 、! ー=8.2Hz,Js− 、x− =5.2Hz)、2.70(m,1.Hl、 J!,+!−=14Hz)、2. 28 (s. 1. 5. トルエン由来の CH3)および1.60(s. 3, CH3)。
C,。H 2 7 N s O a 0. 5 C 、 H aに対する計算値 (トルエンから結晶化させた):C,74.56;H,s.79:N.7.78 。実測値+C.74.10;H. 5. 74;N, 7. 52。
エピマー化: メタノール(2 0m 1 )に懸濁させた1− (3’ −C −シアノ−2’ 、3’−ジデオキシ−5’−0−トリチル−β−見一スレオ− ペントフラノシル)チミン(0.30g.0.61ミリモル)の懸濁液に、溶液 のpHがおよそ9に到達するまでINのNaOMeの溶液を1滴づつ加えた。得 られた混合物を加熱して20時間還流した。その溶液を(0℃に)冷却して、I N HCI/MeOHを用いて中和して、減圧下で蒸発させた。残渣を上述のよ .うに精製して、(62%)を得た。(3゛ −デオキシ−3’−C−シフ/− 5’ −0−ト’)fkチミジン合成はTetrahedron Letter s 29:2995(198g)に報告されていた。この報告は、3′ −デオ キシ−3’ −C−シアノ−5’ −0−トリチルチミンは唯一の生成物として 形成されることを示唆したが、しかし、私達は混合物が生成することを見い出し た。上のエピマー化によって、この混合物のキシロの成分を、興味のある3゛− デオキシ−3’−C−シアノ−5°−0−トリチルチミジの化合物へ変換する。
)3゛−デオキシ−3′−C−ホルミル−5’−0−トリチルチミンD I B AL−H(トルエン中でLM、50m1,5時間の期間に5回に分けて)を、乾 燥THF (10ml)中の3゛一旦−シアノ−3′−デオキシ−5゛−0−ト リチルチミジン(9,92g、20ミリモル)の撹拌した溶液へアルゴン下で0 ℃で加えた。この溶液を室温で1時間撹拌して、再び0℃に冷却した。撹拌中に MeOH(25ml)を1滴づつ冷却した溶液に加えて、完全に添加が終わって から溶液を室温にする。飽和させた水性のNa1SO,溶液(11ml)を反応 混合物へ加えて、12時間撹拌した。粉末の無水NatSO4(30g)を反応 混合物へ加えて、懸濁液を30分間撹拌した。懸濁液を濾過して、全ての生成物 を洗浄するまで残渣を徹底的にMeOH: CH4C1! (1: 9v/v) を用いて洗浄した。濾液を合わせて真空下で濃縮して、粘着性の残渣を得た。残 渣を溶出のためにCH2Cl2:MeOH(100%CH,Cl 、−+9 :  1. v/v)を用いたシリカゲルクロマトグラフィーによって精製して、5 .45g (55%)の3′−デオキシ−3’−C−ホルミル−5’ −0−1 −リチルチミンを白色の泡として得た。
J+−x−=5.3 Hz、Jl、 、!、−6.6 Hz)、 4.31 ( m、1゜旦4− L□ +E =3. 3Hz、Jsl、4、=7Hz)、3. 28−3.55(m、 3.旦5・+5− 、s、) 、 2.69 (m、  1.旦z−) 、 2.28 (m、 1゜旦2− ) 、 1.48 (S、  3. CHs)。
C5oHzaNzOs−HzOに対する計算値:C,70,03;H,5,88 ;N。
5.44゜実測値:C,70,40:H,6,00;N、5.33゜1−[3− デオキシ−3−C−(ホルミル)−5−0−トリチル−β−り一エリスローベン トフラノシル]ウラシル 乾燥THF (20ml)中の3′−シアノ−2’ 、3’−ジデオキシ−5゛ −p−トリチルウリジン(0,96g、2ミリモル)(上記のチアジンのアナロ グの調製と同じ方法で調製する)の撹拌した溶液へアルゴン下で一10℃で10 分間以上の時間をかけてトルエン(アルドリッチ(Aldr i ch))中の DIBAL−Hの溶液を加えた。30分後に一10℃のMeOH(5ml)を用 いて反応を停止させた。さらにこの混合物を周囲の温度で30分間撹拌して、真 空で濃縮する前にCH,C1iC11(25を用いて希釈した。残っているTH Fを除去するためにCl[iC1! (3X25ml)を用いてこの過程を繰り 返した。残渣をシリカゲル(25g)のフラッシュクロマトグラフィーによって 精製した。cHICI ! (9: 1. v/v)を用いた溶出およびCHz C1z/MeOHからの結晶によって5’−0−)ジチル−3′−p−ホルミル −2°、3゛ −ジデオキシウリジル(0,53g、53%)を得た;mplo o℃;’HNMR(CD01s)δ 2. 25 2. 8 (m、2. CH J 、3. 4(m、1. C3,旦) 、 3.45−3.6 (m、 2.  C52C旦り、4.37(m、 1. C4一旦)、 5.4(d、 1.  co旦)、 6.1(m、 1. Cr、旦)、7.27、4 (m、 15.  Cs旦S)、 7.81 (d、 1. co旦)、7.95(br s、  1. NH)、 9.61 (s、 1.旦C=0)。
方法B 1−[3−デオキシ−3−C−(ポルミル)−5−0−トリチル−β−D−エリ スローペントフラノシル]チミン 1−メチノド5−0− (t−ブチルジフェニルシリル)−2,3−ジデオキシ −3−C−(ホルミル)一旦一エリスローベントフラノースは、Tetrahe dron、44:625 (1988)に記述したように1−メチル−5−(t −ブチルジフェニルシリル)−2,3−ジデオキシ−3−C−シアノ−D−エリ ス三ペントフラノースのDIBAL−H還元を用いて90%の収量でオイルとじ て得た。3一旦−ホルミル基はメトキシアミンを用いてオキシムへ誘導する。オ キシムで保護した中間体はシリル化したチミンを用いて配糖化して、標題の化合 物のαおよびβの混合物を得た。保護基をはずした後に、βアノマーを方法Aで 調製したそれと比較する。
方法C 1−[3−デオキシ−3−C−(tルミル) −5−0−トリチル−β−f)  −x +)スローペントフラノシル]−ウラシルおよび一チミン3′ −デオキ シ−3′−ヨード−5’ −0−1−リチルチミシン(0,59g。
4ミリモル)、トリス(トリメチルシリル)シラン(2,87g、1. 2ミリ モル)、AIBN (12mg、0.072ミリモル)、およびトルエン(20 ml)の混合物をガラスの容器の中で混合して、(室温で送り込んで)アルゴン で飽和させた。ガーラスの容器をステンレススチールの圧力反応器の中へ挿入し て、−酸化炭素を用いて圧力をかけて(80ps i) 、閉じてそして26時 間加熱した(90℃、熱浴)。この反応混合物を冷却して(0℃)、coを注意 深く逃がした(有ガス用フードの中で)。生成物1フ7シリカゲル(20g)上 のフラッシュカラムクロマトグラフィーによって精製した。EtOAc:ヘキサ ン類(2二1.゛V / V )を用いて溶出させて適当なフラクションを混合 して、泡沫として標題の化合物を0.30g (61%)を得た。
2’ 、3’−ジデオキシ−3−ヨード−5゛−トリチルウリジンに同様な方法 でラジカルによりカルボニル基を導入して3’−C−ホルミルウリジン誘導体を 得る。
実施例5 メチレンヒドラゾンが連結する(3’ −CH=NH−NH−CHI −5’)、メチレンヒドラジンが連結する(3’ CHr−NHNH−CH2− 5゛)およびメチ1ノン(ジメチルヒドラゾ)が連結する(3’ −CHt N  (C)(s) N (CHs) CH2−5’ )ジヌクレオチド類3’−テ (オキシホスフイニ))−3’ニエ況シぞ仁■下、えYと)]−15’ −o− hリチルチミジリル−(3′→5”) −5’ −デオキシチミジン乾燥CHz C1!/MeOH/AeOH(20ml/10m110.5m1)中45g、1 .30ミリモル)、5′ −デオキシ−5°−ヒドラジノチミジン塩酸塩(0, 397g、1.36ミリモル)の混合物を30分間室温で撹拌した。溶媒を真空 下で蒸発させて、ヒドラゾン中間体を’H−NMRによって分析した。
6、 8 (ld、It、1.旦C=N、2つの異性体)、6. 0−6. 1  (2m。
2、旦+−)、 5.30 (br t、1.0旦) 、 3.8−4. 2  (3m、 3゜3゛ −デ(オキシホスフィニコ) −3’ −[メチレン(ジ メチルヒドラゾ)]−5’−0−トリチルチミジリルー(3゛→5°)−5′  −デオキシチミジン上のヒドラゾンの二量体をAcOH(10ml)へ溶解させ て、これへ室温で30分間撹拌りながら少量(7)NaBHsCN (4XO, 12g、7.74ミリモル)を加えた。水性HCHO(20%、3.9m1.2 6ミ!Jモル) 、NaBHsCN(3,9ミリモル)、およびAcOH(10 ml)を添加する前に、この溶液をさらに15分間撹拌した。懸濁液をさらに1 5分間撹拌して、溶液を真空下で蒸発させた。残渣をMeOH(3X25ml) と−緒に蒸発させてメチレンヒドラゾの二量体を得た; IHNMR(CDC13)δ 6.8 7.8 (m、 15. TrH,2C a旦)、 6.12 (m、 2.2旦r、) 、 4.20 (m、 1.  T2 旦s、)、4゜05 (m、 1. T2 旦4.) 、 3.89 ( rn、 1. TI 旦、、 )、 3.80(S、 6.2 QCCa)、  3.21 3.53 (m、 2. TI Hs−、s−)。
2、11−2.75 (m、 10. T2 旦5’+l+一旦、Tl 旦s− 、Tl旦3・・3°−デ(オキシホスフィニコ)−3°−[メチレン(ジメチル ヒドラゾ)コーチミジリル−(3′→5’ ) −5’ −デオキシチミジン次 に上のヒドラジンの二量体をMeOH(25ml)中の37%水性HCI(1m l)とともに室温で24時間撹拌しまた。得られた混合物をNH,OHを用いて 中和して(pH: 8)乾燥するまで蒸発させた。残渣は逆相HPLC(スペル コシルLC18,5ml、HtO:CHxCN勾配)によって精製して、標題の メチレン(ジメチルヒドラジン)が連結するダイマー0.61g (89%)を 得た。
IHNMR(9Q°C,DMSO−d、+1滴のり、0)67.66および7、  43 (2s、2. 2 C1H) 、6. 02 (擬似t、1. T2  Hl、 。
JIl、x−=7. 2Hz、JI−+!” =7. 7Hz) 、5. 96  (擬似t、1゜T1 旦11. JI−、!−=5.6Hz、 Jll、z− =6.2Hz)、 4.12(m、 1.72 旦s、) 、 3.90 (m 、 1、T2 旦、、)、3.71(m。
C雪5HsaNaα1H,Oに対する計算値:C,51,10,H16,71, ;N。
15.54゜実測値:C,51,05;H,6,68;N、15.54゜MSF AB m/z523 (M+H)”。
実施例6 メチレン(ジメチルヒドラジン)が結合する(3’ CHt N(C Hs) CHs−5’ )5° −ジメトキシトリチル−3′ −β−シアノー エトキシジイソブロピルホスホラミジトジヌクレオシド3° −デ(オキシホス フィニコ) −3’ −[メチレン(ジメチルヒドラゾ)]−]チミジルルー5 ’−0−(ジメトキシトリフェニルメチル) −(3’→5”)−3” −0− (β−シアノエチル−N−ジイソプロビルアミノホスフィリル)ラミz 実施例5のメチレン(ジメチルヒドラジン)二量体を、オリゴヌクレオチドの合 成:実用的な方法、M、J、ガイド編集、IRL出版、1984年(Olig。
nucleotide 5ynthesis:a practical app roach、Ed、M、J、Ga1t、IRL Press、1984)にした がってジメトキシトリチル化して、均一な泡沫を得た。
’HNMR(CDC13)66. 8−7. 8(m、20. DMTr、2旦 6)。
6、 12 (m、2. 2H+−) 、4. 20 (m、1.72 Hs、 )、4.05(m、1. T2 H4−)、3. 89(m、1. TI H4 ,)、3. 80(8゜6.2 DMTrのOCCHs 、3.21−3.53 (m、 2. Tl 旦s、s−)。
2.11−2.75(m、 9. TI 旦S’ m” rHs−、T1 旦8 ・、2旦z□ z・) *これをオリゴヌクレオチド合成:実用的な方法、M、 J、ガイド編集、IRL出版、1984年(Oligonucleotide  5ynthesis:a practical approach、Ed、M、 J、Ga1t、IRLpress、1984)に記述された手順でホスフィチル 化することによって65%の収量で標題の化合物を得た。
’HNMR(CDCIりδ 6. 14 (m、1. T2 H+−) 、 6 .01(m、 1. Tl 旦+、)、 3.80(s、 6.2 0 CH3 )、2.23(m、 6.2 N−CHs)、1. 78および1.45 (2 s、 6.2 CH,)、および他のプロトン ” P NMR(CD C1s )δ 149.43および148.85ppm0 実施例7 断続するメチレン(ジメチルヒドラジン)(3’ −CH,−NCH 。
−NCHs CHz75’ )が連結するオリゴヌクレオシドの合成CPGに結 合したチミジン(または3′末端の塩基になる任意の他のヌクレオシド)をアプ ライド バイオシステムズ社(Applied Btosystems、Inc 、)(ABI)カラム(250mg、結合したヌクレオシド10マイクロモル) の中に置いて、ABI 380B自動DNA合成機に取り付けた。
メチレンヒドラジンチミジンニ量体を任意の希望の位置で配列へ導入するために 、ホスホラミダイト化学を用いる標準的な自動の(コンピューターが制御する) 段階を使用する。
実施例8 (3’ −CH,−NH−8−CH2−5”)の合成3′−デ(オキ シホスフィニコ)−3’ −[メチレン(メチルサルフェニル)]−]チミジリ ルー3゛→5”) −5’ −デオキシチミジン2つの中間体のヌクレオシドか ら標題の化合物は調製されるだろう。最初のヌクレオシドである3’ −0−ベ ンジル−5° −デオキシ−5′ −メルカプトチミジンは、J、 H,7リオ ツト(J、H,Marriott)ら、Tet、Letts、、31 ニア38 5 (1980)の手順に従って3段階で3°−Ω−ベンゾイルチミジンから、 5’ −S−[9−(4−メトキシフェニル)キサンチン−9−−イル]基の形 成およびその後の保護基の除去による5’ −NH基の生成を介して調製される だろ。2つ目のヌクレオシドである3° 一旦−メチルアミノ−5゜ミル基のN aBH4還元、その後のLiN5/DMFを用いたアジド基への変換および3°  CCH2NH2基を得るためのTBTH/トルエンを用いたその後の還元が含 まれる。3’ −C−メチルアミノ−5°−0−トリチルチミジンヌクレオシド (1−ミリモル)を水性次亜塩素酸(4ミリモル)溶液へ加えてクロルアミド中 間体を生成し、これを冷却して(0℃) 、3’ −0−ベンジル−5゛−デオ キシ−5°−メルカプトチミジンヌクレオシド(0,9ミリモル)と15分間反 応させて、その後に通常の操作およびクロマトグラフィーによる精製を行い、標 題の化合物を得るだろう。
実施例95’−0−フタルイミドヌクレオシドの合成5゛−0−フタルイミドチ ミジン 乾燥DMF (400ml)中のチミジン(24,22g、0.1モル)、N− ヒドロキシフタルイミド(21,75g、0.13モル)、トリフェニルホスフ ィン(34g、0.13モル)の撹拌した溶液に3時間以上の時間をかけて0℃ でアゾニカルボン酸ニイソプロピル(30m1.0.15モル)を加えた。完全 に加えた後で反応混合物を室温まで暖めて、12時間撹拌した。溶液を真空下で 濃縮して(0,1mm、<40℃)、オレンジ−赤の残渣を得た。ゴム性の残渣 をEt*oで数回洗浄し・て、洗浄液を捨てた。半固体の残渣をEtOH(50 0ml)に懸濁して、加熱して(90℃)、生成物を溶解させた。冷却して30 .98g(80%)の5′−〇−フタルイミドチミジンをmp233−235℃ (分解)の白色の結晶性の物質として3つに集めた:’HNMR(DMSOds ) 6 11.29 (s、 1. NH)、7.85(m。
4、ArH)、 7.58 (s、1. Ca旦)、 6.20(t、1.旦1 − 、 Jl、+2”=7.8Hz、 JI、+2” =6.5Hz) 、 5 .48 (d、 1. CH3・)。
C+aHitOtNs 0.7 H40に対する計算値:C,54,05;H, 4゜64;N、10.51゜実測値:C,53,81;H04,25:N、10 ゜39゜ 2′−デオキシ−5’−0−フタルイミドウリジン2′−デオキシウリジンを用 いて類似の反応を行って、対応する2′−チオキ(t−ブチルジフェニルシリル )ウリジンの合成3’−0−(t−ブチルジフェニルシリル)−5′−〇−フタ ルイミドチミジン5°−p−フタルイミドチミジン(8,54g、22ミリモル )、塩化t−ブチルジフェニルシリル(6,9m1.26.5ミリモル)、イミ ダゾール(3,9g、57. 3ミリモル)および乾燥DMF (130ml) の混合物を室温で16時間アルゴン下で撹拌した。反応混合物を氷水(600m l)中に注ぎ、溶液をCH*C1z (2X400ml)を用いて抽出した。有 機層を水(2X250rnl)で洗浄して乾燥した( M g S O4)。C HzCI2層を濃縮してゴム性の残渣を得て、これをシリカゲルカラムクロマト グラフィー(EtOAe:ヘキサン類;1:l、v/vを用いて溶出させた)に よって精製して12.65g (92%)の3’ −0−Ct−ブチルジフェニ ルシリル) −5’ −0−フタルイミドチミジンを結晶性の物質(mp172 −173.5℃)として得た。
’HNMR(DMSOda)δ 11. 31. (s、1. NH) 、7.  83(m、4.ArH)、7.59 (m、4.7BDPh旦)、7. 51  (s、1゜C6旦)、7.37−7.45 (m、6.TBDPh旦)、6.  30 (dd。
旦トs−) 、 2.06 2. 13 (m、2.旦2、+2” ) 、1. 97 (s、 3゜CHx) 、 1.03 (S、 9. C(CHs) s )。
Cs4HssOtN3Siに対する計算値:C,65,26:H,5,64;N 、 6゜71゜実測値:C,65,00;H,5,60;N、6,42゜3’− 0−(t−ブチルジフェニルシリル)−2′ −デオキシ−5′−〇−フタルイ ミドーウリジン 2′−デオキシ−5’ −0−フタルイミド−ウリジンを用いた類似の反応を行 って、対応する3’−0−(t−ブチルジフェニルシリル)−2゛ −デオキシ −5゛ −9−フタルイミド−ウリジンを得るだろう。
実施例11 5’−0−アミノヌクレオシドの合成5′−〇−アミノー3’−0 −(t−ブチルジフェニルシリル)チ2ジン乾燥CH−f l ! (100m  l )中の3′−9−(t−ブチルジフェニルシリル)−5゛ −9−フタル イミドチミジン(10g、16ミリモル)の撹拌した溶液へアルゴン下で室温で メチルヒドラジン(1,3ml、24ミリモル)を加えて、溶液を12時間撹拌 した。溶液を冷却して(0℃)、濾過した。白色の残渣をCHzClx (2X 25ml)を用いて洗浄して、濾液を合わせて蒸発させてゴム性の残渣を得た。
シリカゲルカラムクロマトグラフィー(CH2C1t : Me OH。
98 : 2.v/vを用いて溶出)による精製から得た残渣から7.03g( 89%)のCH,C1t/MeOHから結晶化させた、5′−〇−アミノー3° −0−(t−ブチルジフェニルシリル)チミジン、mp141−143℃を得た 。
’HNMR(DMSOda)δ 11. 29 (s、1. NH) 、7.  42−7.62 (m、11.TBDPh旦、C6旦)、 6.25 (dd、 1.旦1.。
Ll、t、=8. 4 Hz、Ll、z−=6. 3Hz)、6. 02 (S 、2. N旦り、4゜35 (m、 1.旦4.) 、 4.04 (m、 1 .旦s、 )、 3.34−3. 51 (m、2.旦s2.s−) 、2.  04 (m、2.旦z1.!−)、1. 73 (s、 3. CHs)、1. 03 (s、 9. C(CH,)S)。
CzsHssOsNsS i l:対tル計算(1: C,63,00; H, 6,71; N、8゜48゜実測値C,62,85;H,6,67;N、s、3 2゜実施例12 (3’ −CH=N−0−CHz−5’ ) が連結する。t !jゴ、i+りLzオシド(オキシムが連結する二量体) 3゛−デ(オキシホスフィニコ) −3’ −(メチルイジンニトリロ)チミジ リル(t−ブチルジフェニルシリル)チミジン(0,99g、2ミリモル)およ びAc0H(0,3m1)の混合物を1時間室温で撹拌した。溶媒を真空下で蒸 発させて、粗製の保護基をつけた3′−デ(オキシホスフィニコ’) −3’  −(メチルイジンニトリロ)チミジリルー(3゛→5’ ) −3’ −(t− ブチルジフェニルシリル)チミジンの生成物をTHF (20ml)に溶解した 。nBu4NF (IM、5m1)のTHF溶液を撹拌したこの反応混合物に室 温で加えた。1時間後に溶液をシーリカゲルカラムクロマトグラフィー(CH, C1□:MeOH:99:4v/vを用いた溶出)で精製して、3′の保護基の はずれた二量体を得た。この二量体を無水MeOH(50ml)に溶解して、こ れにMeOH/MCI溶液(0,14M、2.5m1)を加えた。この反応混合 物を室温で15時間撹拌した。無水ピリジン(ioml)を上の溶液へ加えて、 溶媒を蒸発させて乾燥させて、粗製のオキシムの二量体を得た。粗製の生成物を シリカゲルカラムクロマトグラフィ (CHzClz:MeOH;92:8.v /v)によって精製して、標題の化合物である、3°−デ(オキシホスフィニコ )−3’ −(メチルイジンニトリロ)チミジリルー(3′→5′)−チミジン (0,87g、89%)をE/Z異性体の混合物として得た。2つの幾何異性体 は逆層HPLC(スペルコシルLC18(Supelcosil LC18)、 5a HzO:CHs勾配)によって分離した。(標題の化合物のZ−異性体) ’HNMR(DMSOds)611. 28 (br s、2. 2NH)、7 ゜39および7.78(2s、2,2CsH)、6.92 (d、1.TI H 3−。
Jll、s−=6. 7Hz) 、6. 15 (擬似t、i、 T2 H+− 、Jl−、z・=7、78Hz、 Jl、、!−=6. 3Hz) 、 6.  04 (dd、 1. TI H+・ 。
JP、!−=7.1Hz、Jt−、!−=6.3Hz) 、 5.34 (d、  1. T2H,、、fi+ ) 、1. 73 (s、6. 2CH3)。
Cz+HztNsOe・H2Oに対する計算値:C,49,31:H,5,72 ;N。
13.69゜実測値:C,49,32;H,5,57;N、13.59゜(標題 の化合物のE−異性体) 旦+−、J+□ 、z−=7.6Hz、J+−+2” =5.4Hz)、6.0 4 (dd。
MS FAB +M/Z 494 (M+H)”。
実施例13 (3’ −CH=N−0−C4−5”)を含むホスホラミディトが 連結するオリゴヌクレオシドの合成 オリゴヌクレオシドの合成二実用的な方法、M、J、 Ga i を編集、IR L出版、1984年(Oligonucleotide 5ynthesfs: apractical approach、Ed、M、J、Ga1t、IRLP ress、1984)に記述された手順にしたがって実施例12の異性体の二量 体を5′末端のヌクレオシドの水酸基においてさらにジメトキシトリチル化しシ アノエチルジイソプロピルホスホラミダイト誘導体へ変換して、標題の化合物T I C旦+2.Z−異性体)、1.80および1.50 (2s、 6. 2  CH3)、および他のプロトン。
”P NMR(CDCIs)150.77および150.38 (Z−異性体) 。
150.57および150.38 (E−異性体)。
保護基をつけたこ量体は便利に保管できて、治療上の価値のあるオリゴマーの中 へ特異的4;導入する要求があるかぎり、自動DNA合成機(ABI 380B )を使用して結合させるために使用できる。さらに明細書の後の実施例により、 オキシムが連結する二量体を対応するヒドロキシルアミンの結合をもっ二量体へ 還元してこれを次にアルキル化してヒドロキシメチルアミンまたは他のヒドロキ シアルキルアミンの結合にすることができる。
実施例14 (3′−CH2NH−OCHz 5’ )が連結するオリゴヌクレ オシドの合成 氷AcOH(5ml)中の保護基をつけた二量体3′−デ(オキシホスフィニコ )−3’ −(メチルイジンニトリロ)チミジリルー(3゛ →5’ ”) − 3’ −0−(1−ブチルジフェニルシリル)チミジン(0,49g、1ミリモ ル)の撹拌した溶液へ3回に分けてN a B Hs CN (0、19g 、 3ミリモル)をアルゴン下で室温で加えた。溶液の泡立ちが終わるまで、懸濁液 を1時間撹拌した。同様な方法で追加のNaBH3CN (0,19g、3ミリ モル)を加えて、撹拌を1時間続けた。減圧下でAcOHを除去して、3′−デ (オキシホスフィニコ)−3゛ −(メチレンイミノ)チミジリルー(3゛ → 5’ >−3’ −0−(t−ブチルジフェニルシリル)チミジンを得た。以前 に記述したようにnBu、NF/THFおよびHCI/MeOHを用いてこの二 量体の保護基を除去して、標題の化合物である、3゛ −デ(オキシホスフィニ コ) −3’ −(メチレンイミノ)−チミジリル−(3゛→5′)−チミジン 、(0,44g、90%)を白色の粉末として得た。分析的に純粋なサンプルを 得るために(実施例12の3′−デ(オキシホスフィニコ)−3’−L(メチル イジンニトリロ)チミジリル−(3°→5“)−チミジンニ量体について記述し たように)この二量体をさらにHPLCで精製した。
’HNMR(DMSOds)δ 11.23 (br s、 2.2N旦)、7 ゜83および7.49 (2s、2,2Cs旦)、 6.82 (t、1. N HO)。
Jl5.x−=4.3Hz)、 5.28 (s、 1. T20旦)、5.0 8 (s。
1、TIO旦)、 4.18 (m、 1. T2 Hs、)、 3.89(m 、 1゜T1旦4− )、 3.54 3.78 (m、 5. TI T2  Hsl、a−、T2旦4.)、 2.76 2.94(m、 2. TI Hs −)、 2.42(m、 1゜T1 旦s−) 、 2.0 2.17 (m、  4. TI、72 Hz、+? ) 。
1.77および1.74 (2s、 6.2 CHI)。
MS FAB:M/Z 496(M+H)”。
C11HC11Hz* ・HsOi:対する計算値:c、49. 12;H,a 、09;N。
13.64゜実測値:C,48,99:I−1,5,96;N、13.49゜実 施例1.5 1千に化した[3’ CHx N (CHs)−0CHI−5’コ が連結するオリゴヌクレオシドの合成 3゛−デ(オキシホスフィニコ)−3’ −[メチレン(メチルイミノ)]]チ ミジリルー3′→5′)チミジン 氷AcOH(10ml)中の3′−デ(オキシホスフィニコ’) −3’ −( メチレンイミノ)チミジリルー(3゛→5°)−3’ −0−(t−ブチルジフ ェニルシリル)−チミジンの二量体(0,99g、1ミリモル)の撹拌した溶液 へ水性HCHO(20%、3m1)を加えた。溶液を室温で5分間撹拌して、こ れにアルゴン下で室温で3回に分けてNaBHsCN (0,19g、3ミリモ ル)を加えた。NaBH3CN (0,19g)の添加をもう1度繰り返して、 溶液をさらに1時間撹拌した。反応混合物を濃縮して粗製の3°−デ(オキシホ スフィニコ)−3’ −[メチレン(メチルイミノ)コチミジリル−(3゛→5 ’ ) −3’ −0−(1−ブチルジフェニルシリル)チミジンの二量体を得 て、これの保護基を除去して(nBunNF/THF、HCI/MeOH) 、 標題の化合物である、3゜−デ(オキシホスフィニコ)−3’ −[メチレン( メチルイミノ)コチミジリル−(3′→5゛)チミジン、(0,44g、87% )を白色の固体として得た。
分取用I(PLOによって、3゛ −デ(オキシホスフィニコ) −3’ −E メチレン(メチルイミノ)]チミジリルー(3′→5゛)チミジンの二量体をさ らに精製して、分析的に純粋なサンプルを得た。
’HNMR(DMSO−dg)δ 11.30および11.24 (2s、 2 ゜6.00(擬似t、1. Tl 旦r1. J+1.z−=4. 2Hz、J (、+g+ =6、1Hz)、 5.31 (m、 1. T2 0旦)、 5 .08 (m、 1.7IO旦) 、 4.17 (m、 1. T2 旦s− ) 、 3.88 (m、 1. T2 旦4・)。
3、57−3.83 (m、 5. TI T2 旦51188.TI 旦、、 )、2゜69(m、 2.7I Hs−)、 2.57(s、 3. N−CH 5>、 2.5゜(m、 1. TI Hs−ン、2.05−2.14(m、  4.TI T2 旦z、 、x−)。
1.79および1. 76 (2s、6. 2 CHs)。
MS FAB:M/Z 510(M+H)”。
CzsHs+N5Os HxOに対する計算値:C,50,09;H,6,31 ;N。
13.2&。実測値:C,50,05;H,6,21;N、13.08゜実施例 16 [3’−CHz−N(CH3)−0−CHI−5’ ]を含むホスホラミ ディトが連結するオリゴヌクレオシドの合成3゛−デ(オキシホスフィニコ)− 3’ −[メチレン(メチルイミノ)]−5’−O−(ジメトキシトリフェニル メチル)チミジリル−(3′→5’ ) −3° −1984年(Oligon ucleotide 5ynthesis:a practieal appr oach、Ed、M、J、Ga1t、IRL Press、1984)に記述さ れているように、実施例】5の3“−デ(オキシホスフィニコ) −3’ −( メチレン(メチルイミノ)]−]チミジリルー3°→5゛)チミジンの二量体の トリチル化およびホスフィル化を全体の収量82%で行った。
保護基をつけた二量体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(CHzCI2: MeOH: EtsN: 9 : 1 : 0.1.v/v)によって精製して 、均一なフラクションを合わせて蒸発させて、純粋な3゛−デ(オキシホスフィ ニコ)−3’−[メチレン(メチルイミノ)コーチミジリル−5’ −0−(ジ メトキシトリフェニルメチル) −(3’→5’ ) −3’ −0−(β−シ アノエチルジイソプロビルアミノホスフィリル)チミジンを白色の泡沫として得 た(DNA合成のようなものに使用する)。生成物はジアステレオマーの混合物 として単離した。
”P NMR(CDC13)δ 149.62および149.00 ppm:’  HNMR(CD CI g)δ 6.22(擬似t、1.T2 旦1’ −J +’ +2’ =J+−+1− =6.7Hz)、6.16 (擬似t、1.  Tl 旦1’ + J =1’ 、Z’=5. 8Hz) 、2. 58. 2 . 56 (2s、3. N−CH5) 、1. 82゜1、 49 (2s、 6. 2 C旦、)、及び他のプロトン。
上記の保護基をつけたホスホラミディトをもつ二量体は便利に保管することがで きて、治療上の価値あるオリゴマーの中へ特異的に導入する要求があるかぎり、 自動DNA合成機(ABI 380B)を使用して結合させるために使用できる 。
上で言及したメチルイジンニトリロ、すなわちオキシム、およびメチレンイミノ 、すなわちアミノヒドロキシは本発明の他の二量体の例として挙げたものであっ て、これらに限定するわけではないが、これらの二量体をこの実施例と同じ方法 で対応するホスホラミディトの誘導体へ変換して、以下に言及するような標準的 な方法でオリゴヌクレオシドの中へ導入する。ヌクレオシドの二量体を連結する オキシムをもつオリゴマーを還元して、ヌクレオシドの二量体を連結する対応す るヒドロキシアミンをもつオリゴマーへ変換する。他の実施例で言及したように 、CPGに結合したオリゴマーへの変換を伴って、またはCPGからの除去の後 に還元が行われる。
実施例17 断続する(3 ’ −CH= N −0−CH15°)、すなわち オキシム; (3’ CH2−NHOCH25’ ) 、すなわちアミノヒドロ キシ;(3’ −CHz−N (CHs)−0CHI 5’ ) 、すなわちN −メチル−アミノヒドロキシ; (3’ −CHz−0−N (CH3)−CH 2−5°)、すなわちN−メチル−ヒドロキシアミノ:または(3’ CHz  N (CHs)−N (CHs)−CHz−5’ ) 、N、N−ジメチル−ヒ ドラジノが連結するオリゴヌクレオシドの合成 オリゴヌクレオシドの3′ −末端のヌクレオシドにするつもりの適当な2′− デオキシヌクレオシドを、ABl 380B自動DNA合成機を使用するために CPGカラムに結合させる。(3’ CH−N−0−CHz 5’ ) 、すな わちオキシム; (3’ −CH5NH0−CH25’ ) 、すなわちアミノ ヒドロキシ; (3’ −CHz−N (CHs) OCHI 5’ ) 、す なわちN−メチル−アミノヒドロキシ: (3’ −CHz O−N (CHs )−CHz 5’ ) 、すなわちN−メチル−ヒドロキシアミノ:または(3 ’ CHz−N (CHs) N (CHs) CHt 5’ )、すなわちN 、 N”−ジメチルヒドラジノ結合をもつ二量体を配列中の希望した位置または 選択した位置へ導入するために、標準的なホスホラミダイト化学のプログラムの 段階を用いた。
実施例18 3つのヌクレオシドのサブユニットを使用した、ABI 3g0B  DNA合成機による、同一の(3’ −CH−N−0−CHt 5’ )また は(3’ −CHI−NH−0−CH,−5’ ”)が連結するオリゴヌクレオ シドの合成サブユニット1: Nucleic Ac1ds Re5earch 、18:3813 (1990)の手順にしたがって調製して、オリゴヌクレオ シドの合成のために3′−末端の単位として使用した、CPGに結合した5′− 〇−フタルイミドチミジン。
サブユニット2: 適当な塩基を用いた、メチル−3−デオキシ−3−C−シア ノ−5−0−(フタルイミド)−β一旦一エリスローベントフラノシドの標準的 な配着化およびヌクレオシド生成物のDIBAL−H還元によって誘導した、2 つの官能基をもつ(3’ −C−ホルミルおよび5’ −0−)、タルイミドデ オキシリボヌクレオシド)。
サブユニット3: 5’ −0−DMT−3’−C2−ホルミルチミジン、これ は最後の(オリゴヌクレオシドの5′−末端)のヌクレオシドの導入のために使 用した。
同一の結合(10gMスケールで:CPG上のユニット1をロードする)を合成 するために必要なサイクルの自動化した段階は以下の通りである:段階 試薬/ 溶媒 時間7分 I DCM中の5%メチルヒドラジン 102 DCM:MeOH(9:1.v /v) 53 DCMによる洗浄 2 43’−C−ホルミル−5゛−〇−フタルイミドーデオキシ 3リポヌクレオシ ド(ユニット2.20m1のDCM中の20gM) 5 DCM0Mニアセトニ(9: 1、v/v):キャップをする 26 0C Mによる洗浄 3 希望の配列および長さにしたがって、ヌクレオシドのユニットの添加ごとに前記 の1から6までの段階を繰り返す。次に最後のユニットを加える=8 最後のヌ クレオシド(20mlのDCM中の20gM) 5すなわちユニット3 実施例19 (3’ CH=N−OCHI−5’ )結合の(3°−CHI N H−0−CHI−5’ )への変換のための一般的なおよび特異的なN a B  Hs CN還元 二量体の還元 氷酢酸(AcOH)(5ml)中の二量体(0,49g、1ミリモル)の溶液へ 、AcOH(1ml)中のシアノボロハイドライドナトリウム(0,19g。
3ミリモル)をアルゴンのガスの下で、室温で加えた。懸濁液を1時間撹拌して 、AcOH(1ml)中のNaBH,CNを追加して、撹拌を1時間続けた。過 剰のAcOHを減圧下で室温で除去した。残渣をトルエン(2X50ml)とと もに蒸発させて、シリカゲル(25g)カラムクロマトグラフィーによって精製 した。CHzlC12:MeOH(9: 1.v/v)を用いて溶出させて、適 当なフラクションを合わせて、その後に蒸発させて0.36g (75%)の固 体の二量体を得た。
オリゴヌクレオシドの還元 CPGに結合したオリゴヌクレオシド(1μM)は1つ(またはそれ以上の)の 修飾された結合の骨格をもっており、これを合成のサイクルの完了後にDNA合 成機から取りはずす。THF:AcOH(10ml、1 : lv/v)中の1 ゜0M NaBHsCNの溶液をCPGに結合した物質から、30分間で注射器 の技術を用いた標準的な方法で汲み出す。THF (50ml)を用いてカラム を洗浄して、還元したオリゴヌクレオシドを標準的な方法で支持体のカラムから 放出上記の還元に代わるものとして、CPGの支持体から除去した後に還元を行 うこともできる。合成が完了したときに、オリゴヌクレオシドを標準的な手順で CPGの支持体から除去する。5°−o−トリチル−オン オリゴヌクレオシド をHPLCによって精製して、次に上に記述したようにNaBH3CN/AcO H/THFの方法によって還元する。
実施例20 5゛末端のヌクレオシドとして2°、3゛ −ジデヒドロヌクレオ シドをもち、(3’ CHt=N (CHs)−0CHz 5°)が連結するオ リゴヌクレオシドの合成 3゛−デ(オキシホスフィニコ)−2’ 、3°−ジデヒドロ−3°−しメチレ ン(メチルイミノ)]チミジリルー(3°→5゛)チミジン1− [5’ −0 −(MMTr)−β−ニーグリセロベントフラン−3° −ウロシル]チミン( 0,13ミリモル;’r、−c、ウー(T、 −C,Wu)ら、Tet rah edron、45 : 855 (1989)の手順にしたがって調製した)、 5’ −0−(メチレンアミノ’)−3’ −0−(t−ブチルジフェニルシリ ル)チミジン(0,13ミリモル:F、デパート(F、Debart)ら、Te t。
Letters、33.印刷中、(1992)の手順にしたがって調製した)、 エチレングリコール(0,5ミリモル)、およびHMPA (0,5m1)の撹 拌した溶液へTHF (Q、1モル、3ml、3ミリモル)中のSmIzを室温 で加えた。反応が進行するにつれて、Sm12の色が消えて、希望する付加物を 生成する。出発原料が完全になくなった後に、反応混合物を通常の方法で後処理 する。
(生成物は同定のためにンリカカラムクロマトグラフィーによって精製すること ができるだろう)。これらの実施例の他の所で記述したように、3゛ −エピマ ーの付加物の粗製の混合物を次にアルキル化した(HCHO/NaCNBH3/ Ac0H)、次にメチル化した生成物をピリジン中の塩化メチルスルホニルで処 理して、3° −エピマーのメシレートを得て、これを塩基で処理すると標題の 化合物を得るだろう。
実施例21 (3’ −CHz CH2NHCH25’ )が連結するオリゴヌ クレオシドの合成 3′ −デ(オキシホスフィニコ) −3’ −(1,2−エタンジイルイミノ )−チミジリル−5′−〇−(t−ブチルジメチルシリル)−(3’→5°)− 3’ −0−(t−プチルジフェニルンリル)−5゛ −デオキシチミジンアル デビト[2,5g、6. 5ミリモル、フィアンダー、J、(Fiand。
r、J、)およびタム、S、Y、(Tam、S、Y、)、Tetra、hedr 。
n Letts、、33:597 (1990)に記述されている手順にしたが って新しく調製した]、5°−アミノ−3’−0−(t−ブチルジフェニルシリ ル)−5゛−デオキシチミジン[3,13g、6. 5ミリモル、はた(Hat a)ら。
J、Chem、Soe、Perkin T、p、306 (1980)の方法に よる5゛ −アジド−5′ −デオキシチミジンの3’ −0−シリル化および 、ブーパイ] (Poopeiko)ら、Syn、Lett、、 p、342  (1991)の方法による、生成物の後の還元を介した2段階で調製した]の撹 拌した溶液に、ジクo口zタン(65ml)中のAcOH(0,39g、および 6.5ミリモル)を加えて、その後にアルゴン下でNaBH(OAc)s (2 ,759g、13゜08ミリモル)を加えた。懸濁液を3時間室温で撹拌した。
この反応混合物をCHtC1! (250ml)で希釈して、水(2X100m l)で洗浄した。有機層を乾燥させて(MgS04)、濃縮して、シロップとし て粗製の生成物を得た。
生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーで精製して、白色の泡沫として標 題の化合物を得た(3.5g、64%)。
’HNMR(CDC13)δ 0−1 [s、 6. Si (CHs)z]、 0.9お6、 05 (m、1. 1°旦)、 6. 28 (t、1. 1’ 旦)、7.1および7.57 (2s、2.Ca旦)、7. 35−7. 7  [2m、12. Si Ar旦)2]、および他の糖のプロトン。
3′ −デ(オキシホスフィニコ) −3’ −(1,2−エタンジイルイミノ )チミジリル−(3゛→5’ ) −5°−デオキシチミジンTHF中の(Bu )4NFを用いた標準的な手順にしたがって、保護基をつけた二量体から81% の収量で保護基をはずした。分析のために保護基をはずした二量体をHPLCに よって精製した。
LHNMR(DMSO−d、)δ 1.76および1. 78(2s、 6.  CHs)。
2、0−2.2 (3m、 4.2’ CHs) 、 3.15 (m、 2.  NCC20゜3、56(m、 2.4’旦、5゛C旦z)、 4.18 (b r s、 1,3’旦)。
5.17および5.22(2br s、 2.2 0H)、 5.95(t、1 ゜1′旦)、 6. 1 (t、1. 1’旦)、7.6および7.85 (2 s、 2□ 2(Ca旦))、11. 25 (br s、2 2N旦)および 他のプロトン。
実施例22 2つの官能基をもつヌクレオシドの合成実施例18のサブユニット 2の方法に代わる方法3°−デオキシ−3’−C−[(メトキシイミノ)メチル コーチミジン3゛−デオキシ−3゛−9−ホルミル−5’−0−トリチルチミジ ン(0,59g、1ミリモル、実施例4により、CHzClz:MeOH(2:  2.30体積)中で調製した)の撹拌した溶液へAeOH(0,5m1)およ びメトキシアミン塩酸’j(0,189g、2.2m1)を室温で加えた。混合 物を30分間撹拌して、真空下で濃縮して、残渣をMeOH(20ml)に溶解 した。この溶液へ濃縮したHCI (0,1rnl)を加えて1時間撹拌した。
この溶液をNH,OH(::2m1)で中和して、真空下で濃縮して、チミジン の3’ −C−[(メトキシイミド)メチル]誘導体を得た。
IHNMR(CDCI、)69. 67 (S、1. NH)、7. 67 ( s、1゜上記のチミジンと同様の方法で5−メチルシチジンのアナログを調製し た。
3” E 異性体、Js2.s−=6. 63Hz) 、6. 64 (d、領  34゜Ph、P、N−ヒドロキシ7タルイミドおよびDEAD (光延条件) を用いて’HNMR(CDCIg)68. 45 (br s、1. NH)、 7. 4−8(d、 0. 36.旦−3” Z異性体) 、 6. 15 ( m、1.旦−1′)。
36、旦−3’ Z異性体)、3. 92 (s、1. 08. QC旦、オキ シム3° −デオキシ−3’ −C−(ホルメルメチルオキシム)−5′ −フ タルイミド−5−メチルシチジン 上記のチミジンと同様の方法で5−メチルシチジンのオナログを調製した。
体)。
ルイミドチミジンをMeOH中のCH,CHOで処理して、3’ −C−ホルミ ル基を再生した。シノ力ゲル力ラムクロマトグラフィーによって精製して生成物 から、3段階の全体の収量81%で、均一な物質として標題の化合物を得た。
実施例23 溶液相化学を用いた、同一の3’ −CH=N OCHz 5’ま たは3° (CHx −N HO−CHz −5’ または3’ CHs N  (CHs)−0−CH,−5’が連結する四量体の合成施f!’!112に記述 したような)標準的な結合によって、3’ =y”(オキシホスフィニコ)−3 “ −(メチルイジンニトリロ)−チミジリルー5′−〇−フタルイミド−(3 ゛→5’ ) −3” −0−(t−ブチルジフェニルシリル)チミジンを得た 。メチルヒドラジンで処理したときの後半の生成物から(実施例11で記述し3 ’ −CH=N OCH2〜5’ −T=3’ CH=N−0=CHx−5’  −TN H−0−CH、−5’ −T −3’ −CH2−N H−0−CH*  −5’ −T 3 ’−CHz NHOCH2〜5’ −T−0−3’−TB DPSiを得た。Hσ■0/NaBHsCN/AcOHを用いて、還元した四量 体をさらに還元的にアルキル化して、5’ 0−Tr T 3’ CHz N( CHs) OCHz−5゛−T〜3° −CHz N (CHs) 0−CH2 5’ −T−3’ CH2N(CHs)−0−CHI−5’ T−3” −0− TBDPS iを得た。メチル化した四量体から、HCIを用いて最後に保護基 を除去して、n (Bu)4NF処理を行って全体の収量79%でフリーの四量 体である5°−0H−T−3’ −CH2−N (CHs)−0−CHg−5’  −T−3’ −CL−N (CHs) 0−CH25’ T 3’ CH2N  (CHs)−−OCHI−5° −T−3’ −OHを得た。逆層カラム(ス ペルコシルLC185u (Supelcosi I LC185μ)、15c rnX4.5cm)およびHzC)→CHsCN (H2O:CH3CN、95 :5.1分;8:2.20分;7二3,30分:2:8;40分/m l )勾 配を用いた溶出を使用したHPLCによって四量体を精製した。溶出した全体の 生成物の86%に相当する唯一の分離したピークとして、四量体は26.96分 後に溶出した。26−27.5分のフラクションをまとめて、凍結乾熾して、白 色の粉末を得た。四量体の正確な分子量をMS FABによって決定した:m/ z 11045(+H)”。上で言及したように、NMRデータに関しては5′ 末端から3′末端へ環の番号をつけた。
IHNMR(020,40℃)TOSEY(30,LOOM秒混合)ユニットT 、H−1° 6,26 上記の溶液相の反応物を容易にABI 380B DNA合成機に移して、上述 のように3−ヌクレオシドのサブユニットを使用することができる。
実施例24 (3’ CHl−ON=CH5’ )、(3’ −CH,−0−N HCHz 5’ )および(3’ −CHl−0−N (CHs)−CHx 5 ’ )結合のための単量体のユニットの合成 1− [3’ −デオキシ−3’ −C−(ヒドロキシメチル)−5° −0− ()リチル)−β−D−エリスローペントフラノシル]−チミンNaBH4(1 ,36g、9.6ミリモル)の懸濁液を、EtOH:H,0(22m1.3 :  1.v/v)混合液中の3′−9−ホルミルー5’ −0−トリチルチミジン の撹拌した溶液へ1滴づつ室温で加えた。3時間後に、EtOAc (300m l)を加えて、有機層をHtO(2x150ml)で洗浄した。乾燥した(Mg  S 04) E t OA c抽出物を減圧下で蒸発して、残渣をシリカゲル カラムクロマトグラフィーによって精製した。CHzCIt:MeOH(9:  1.v/v)(1,13g、83%)を得た。
’HNMR(CDCIs)δ 8. 29 (br s、1. NH)、7.  59 (s。
(m、1.H3,)、2.33−2.20 (m、2.Ht、Ht−)、1.9 1(br s、1. OH) 、1. 53 (s、3. CH3)。
1−〔3° −デオキシ−3’ −C−[0−(フタルイミドヒドロキシメチル )]−5° −〇−トリチルーβ−り一エリスロ〜ペントフラノシル]−チミン アゾニカルポン酸二イソプロピル(0,47m1,2.41ミリモル)を、乾燥 THF (10ml)中の3′−デオキシ−3’ −C−(ヒドロキシメチル) 5′−〇−トリチルーチミジン(0,8g、1.、 62ミリモル)、N−ヒド ロキシフタルイミド(0,35g、2.15ミリモル)、l・リフェニルホスフ ィン(,0,56g、2.15ミリモル)の撹拌した溶液へ室温で加えた。48 時間後に、生成物を濃縮して残渣をCH2C1z (2X100ml)で抽出し た。CH。
C12抽出物をN a HCOs (5%、100m1)T、次に水(100m l)で洗浄した。乾燥した(MgSOn)抽出物を減圧下で蒸発させて、残渣を 短いシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製した。EtOAc:ヘキ サン類(1: 1. v/v)で溶出して、適当なグラクシ3ンを合わせて濃縮 して、白色の泡沫として標題の化合物を得た。
IHNMR(CDC13)68.24(s、 1. NH)、 7.85−7. 20 (m。
20、Tr旦、Ar旦、C6旦)、 6.20(m、 1. H+−)、 4. 22−4゜16(m、 3.旦41.旦s−) 、 3.63 3.40 (m 、 2.旦s−、旦5.)。
Cs5HssNsOT・0.5 EtOAcに対する計算値+C,69゜86; H。
5.42;N、e、11゜実測値:C,70,19;H,5,27;N。
5.75゜ 1− [3’ −デオキシ−3’ −C−[0−(アミノヒドロキシメチル)] −]5’−〇−トリチルーβ−D−エリスローペントフラノシル−チミンメチル ヒドラジン(0,12m1,2.25ミリモル)を、乾燥CHICI !(9m 、l)中の3゛ −デオキシ−3’ −C−[0−(フタルイミドヒドロキシメ チル)] −5’ −0−トリチルチミジン(0,77g、1. 呼リモル)の 撹拌した溶液へ室温で加えた。1時間後に、沈殿を濾過して、残渣をCHzC1 gC2X10ml)で洗浄した。まとめた濾液を濃縮して、残渣を/す力ゲルカ ラムク07)グラフィ i:よッテ精製した。CH2Cl2:MeOH(97:  3.v/v)を用いて溶出して、適当なフラクシロンを合わせて蒸発させて、 白色の粉末として標題の化合物を得た(0.43g、70%)。
’HNMR(CDCl2)68.59(brs、1. NH) 、 7.66  (m。
、 3.65−3.20 (m、 4.旦s1. Hs−、旦8.)、2.81  (m、 1゜1(s−)、2. 21−2. 13 (m、2. Hz、、  Hz−)、1. 37 (s、3゜CH,)。
実施例25 (3’ −CH,−0−N=CH−5’ )、(3’ −CH2− 0−NH−CHI−5”Iおよび (3’ CHz ON(CHi) CHz  5’ )が連結するオリゴヌクレオチドの合成 3′−デ(オキシホスフィニコ) −3’ −[メチレンオキシ(メチルイミノ )]チミジリルー(3゛→5’ ) −5’ −デオキシチミジンl−[4−9 −ホルミルー3−O−(t−ブチルジフェニルシリル)−β−り一エリスローベ ントフラノシル]チミン[1ミリモル、Nucleosidesand Nuc leotides、9:533(1990)の手順にしたがって調整した]、3 ′ −デオキシ−3° −C−[(0−(アミノヒドロキシメチル)]−5’  −0−1−リチルチミジン(1ミリモル) 、AcOHCO,1m1) 、およ び乾燥CH2Cl! (25ml)の混合物を室温で1時間撹拌した。溶媒を蒸 発させて、残渣を氷AcOH(5ml)に溶解した。N a B Hs CN  (3ミリモル)を撹拌したAcOHの反応混合物へ加えた。1時間後に、NaB HsCN (3ミリモル)を追加して、混合物を1時間撹拌した。反応物を真空 下で濃縮して、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーによって精製して、 5’−0−Tr−T−3° CHl 0 NH−CHz 5’ −T 3’ O TBDPSiの二量体を得た。
’ HNMR(CD C13)δ 8.73 (br、 s、 2.2N旦)、 7.67旦)、 6.96 (s、1. C,旦)、6.23(擬似t、i、  T2 旦褒、)。
IHs−)。3. 23 (m、、1. TI H5°) 、2. 55−2.  76 (m。
3、TI H35,T2 旦s、Hs−) 、 2.33−2.27 (m、  1. T2旦x、) 、 2.23 2. 12 (m、 2. T2 旦2  旦、−)、1.95−1、85 (m、 1. T2 旦z−)、 1.83  (s、 3. CHi)、 1.45(s、 3. CHi)、1.06 (s 、 9. (C旦1)sC5i)。
HCHO/NaBH,CN/A、cOHを用いて最後の二量体をメチル化して、 最後に2段階でnBu4NF/THFおよびHF/CH,CNを用いて保護基を 除去して、標題の化合物を得た(収量65%)。
’HNMR(DMSOd@)δ 11. 27 (tar S、2. NH)、 7゜85 (s、 1. TI Ca旦)、 7.51 (s、 1.72 C a旦)、 6.154、 5Hz)、5.32(br s、1.0Hs−)、5 . 09(br s。
1、 OHs、)、4. 17 (m、1. T2 Hs−)、3. 90 ( m、1. T2旦4) 、 3,76 3.66(m、 4. Tl 旦4−  、 TI 旦51.C旦zs−)+3、60−3.52(m、1.T1 旦s− )、 2.82 (rn、 2. T2 旦5.。
旦s−) 、 2.57(s、 3. N−CHi) 、 2.47 (m、  1. TI 旦3.)。
2、23−2゜02(m、4、旦2.旦t−) 、 1.81 (s、 3.  CsC旦s)。
1、 78 (s、3. Cs CHz)。
C!zHs+N5Oe ・0.5 HzOに対する計算値:C,5096:H, 6,22;N、13.50゜実測値:C,51,01;H,6,22;N、13 . 19゜MS (FAB十、グリセロール)M十H”m/z=510゜実施例 26 (3’ −CHz−0−N (CHx) CHz 5’ )を含むホスホ ラミディトが連結するオリゴヌクレオシドの合成3′−デ(オキシホスフィニコ ) −3’ −[メチレンオキシ(メチルイミノ)]−チミジリル−5’ −0 −(ジメトキシトリフェニルメチル) −(3’→5°)−3’−(0−β−シ アノエチルジイソブロピルアミノホスフィリル)チミンオリゴヌクレオチドの合 成:実用的な方法、M、J、ガイド編集、IRL出版。
1984年(Oligonucleotide 5ynthesis:a pr aetical approach、Ed、M、J、Ga1t、IRL Pre ss、1984)に記述された手順にしたがって、二量体の5’ −0H−T− 3’ −CH2−0−N CHz CHt −5’ T −3’ −OHをジメ トキシトリチ(m、14.旦、、DMTr旦)、6.20(擬似t、2.旦1. )、4.3(m、 1. T2 旦s−) 、 4.15 (m、 1. T2  旦4− ) 、 4.00 (m。
1、 TI H4−) 、3.80 (s、 6.0C旦s)、 3.77 3 .23 (m。
4、 Tl 旦5・旦s−、CHz s−)、 2.89−2.50 (m、  3. T2H,・旦5・、TI 旦3’ ) 、 2.62 (s、 3. N −CHI)、2.48−2、08 (m、 4.旦2.旦2− ) 、 1.9  (S、 3. C5CHs) 、 1.48(s、3. CICH3)。
オリゴヌクレオチドの合成:実用的な方法、M、J、ガイド編集、IRL出版。
1984年(Oltgonucleotide 5ynthesis:a pr act、1eal approach、Ed、M、J、Ga1t、IRL Pr ess、1984)に記述された手順にしたがって、上記の化合物をホスフィチ ル化して、2段階に関しては70%の収量で標題の化合物を白色の粉末として得 た。
’HNMR(CDCIg)68.25 (br s、 2. NH)、 7.6 6 (s。
1、C5H)、7.15 7.45 (m、1.0.ArH,CgH)、6.8 −6、 9 (m、 4. ArH) 、6. 12 (m、2. 2C+、旦 )、 3.79 (s、6、 Ar0CHs) 、2. 56 (s、3、N− OH5) 、1.88. 1. 44(2s、6. 2 Cs CHs>、およ び他のプロトン。
”P NMR(CDCIs)149.42および148.75ppm。
実施例27 その中に位置して薬物動態学および薬力学の性質を含む結合をもつ オリゴヌクレオチドの合成 3°−デ(オキシホスフィニコ) −3’ −[メチレン(ベンジルイミノ)] −]チミジルルー5°−0ジメトキシトリフェニルメチル’) −(3’→5’  ) −3’−〇−β−(シアノエチルジイソプロピルアミノホスフィリル)チ ミジン実施例12に記述したように3° −デオキシ−3’ −C−ホルミル− 5’ −0−トリチルチミジン(1,5ミリモル)を5′−p−アミノ−3’− 0−(t−ブチルジフェニルシリル)チミジン(1,5ミリモル)と還元的に結 合して、5’ 0−Tr−T−3’ CHz NHOCHI 5°−T−3’  −0−TBDPS iの二量体を得た。上述のメチル化と同じ方法でCeH5C HO/NaBHs CN / A c OHを用いて二量体をベンジル化して、 N−ベンジル化二量体である、5’ −0−Tr−T 3’ CHz NBz− OCHI 5’ T−3’ −0−TBDPSiを得た。上記の実施例で記述し たようにn B u a N F / T HFおよびHC1/MeOHの方法 論を用いて、最後の二量体から保護基を除去して、保護基のはずれた二量体であ る、5 ’ OHT −3’ −CHz N B n −0−CHz 5’ − T 3’ −OHを得て、オリゴヌクレオチドの合成:実用的な方法、M、J、 ガイド編集、IRL出版、1984年(01igonucleotide 5y nthesis:a practical approach、Ed、M、J、 Ga1t、IRL Press、1984)に記述された手順にしたがって、こ れをジメトキシトリチル化して、その後にホスフィチル化して、標題の化合物を 得た(全体の収量45%)。
’ HNMR(CD CI s)δ 6.15(擬似t、1. T2 CI一旦 )、6゜09 (m、 1. TI CI一旦) 、 3.76 (s、 6. 20C旦s)、1.7および1. 48 (2s、6. 2−CH,)および他 のプロトン。
”P NMR(CDC1s) 149.59および149.23ppm。
オリゴヌクレオチドのDNA合成の前に、様々な薬物動態学および薬力学の性質 のある修飾基を骨格の結合中へ取り込ませる能力を説明した実施例8の方法で、 自動DNA合成機を用いてホスフィチル化した二量体をオリゴマーの中へうま( 導入した。
実施例28 (3’ CH,−NHCHt 5°)、(3’ CH2N(CH3 ) CHI−CHI−5’ ) 、およびホスホラミディト誘導体3′−デ(オ キシホスフィニコ)−3’−[(メチレンイミノ)]−5° −0−(ジメトキ シトリチル)チミジリルー(3゛→5°)−チミジンAcOHの存在下で1−[ 6°−アミノ−2’、5’、6’ −トリデオキシ−3’−0−(t−ブチルジ フェニルシリル)−β一旦−エリスローヘキソフラノシル]チミン[1,2ミリ モル、G、エト シルト(G、Et Zold)ら。
J、C,S、Chem、Comm5..422 (1968)の手順にしたがっ て調製した]を用いて3゛ −デオキシ−3°一旦−ホルミル−5° −o−ト リチルチミジン(1ミリモル)を還元的にアミン化して[A、F、アドベルーマ ジ・ラド(A、F、Adbel−Magid)ら、Tetrahedron L etts。
31 : 5595 (1990)の手順にしたがった]、保護基のついた二量 体であ去して5’ −0H−T−3’ −CHz−NH−CHi−CHz−5° −T−3’ −0)fの二量体を白色の粉末として得た(収量70%)。
’HNMR(DzO,pH5,6,20℃)δ T1チミジン単位ニア、78( S、1. CgH)、 6. 17(t、 1. Cs旦)、 4.45(m、 1. Cs2世。
4.08 (m、1.04一旦) 、 4.00.3.72(m、 2. Ce −、s一旦)。
2、9 (m、 2Ca・、a一旦) 、 2.34 (m、 2. Cs2. z旦)、1.77(s、3. CH,)、T2チミジン単位: 7.47 (s 、1. CgH)、6.07 (t、1. C,、旦)、 3.89 (m、  2. Cs、s−)、 3.79 (m、 1゜C4−H) 、2.89 (m 、1. Cs、旦) 、 2.38 (m、1. Cz一旦)。
2、32 (m、1. Cs=旦)、1.72 (s、 3. CH,)、およ び2.68骨格のアミ、ンのpKaの指標として、前記の二量体のN−Me基の プロトンのケミカルシフトの、pHの変化に応答した変化への反応性をNMRに よって測定した。アミノ基にプロトンが結合するにつれて、ケミカルシフトは低 磁場へ移動した。5’ −0H−T 3’ CHz NCHs CHt CHz −5’ T−3’−OHの二量体のサンプル4mgを30mMの重炭酸塩の緩衝 液Q、5mlに溶解した。0.IN NaOHを用いて6段階でpHを5,1か ら10.0の間で変動させた。N−メチルのプロトンのケミカルシフトは2.2 6ppmから2゜93ppmの間で変動し、pKaは7.8±0.1であると決 定した。私達は理論に縛られたくないのだが、したがって生理学的なpHではこ の骨格にはプロトンが結合していると信じる。
AcOH中のHCHO/ N a B Hs CNを用いて前述の二量体をメチ ル化して、5’ OHT 3’ −CHz−N(CHs) CHz CHI 5 °−T−3’ −OHを得て、オリゴヌクレオチドの合成二実用的な方法、M、 J、ガイド編集、IRL出版、1984年(Oligonucleotide  5ynthesisea practical approach、Ed、M、 J、Ga1t。
IRL Press、1984)に記述された手順にしたがって、これをジメト キシトリチル化およびホスフィチル化して、泡沫として標題の化合物を得た(6 8%)。
’HNMR(CDC1s’)δ 6゜12 (m、 2.2C+、旦)、 2.  15.2゜14 (2s、 3. N−CHI)、 1.88.1.45 ( 2s、 6.2 CsC旦、)および他のプロトン。
”P NMR(CDCIs) 149.49および148.96ppm。
実施例29 (3’ −CHI−NH−0−CHI−5’ )結合の再生のため の不安定なN−保護基をもつ3゛ −デ(オキシホスフィニコ) −3’ −( メチレンイミノ) −(3’→5′)結合を含んだ、(3’ −CHI−N ( 不安定な保護基)−〇−CH!−5°)の二量体およびホスホラミディト誘導体 −二量体0−CH2−5’ −T−3’ −〇−TBDPS i (1ミリモル 、F、デノく一ト(F、Debart)ら、Tetrahedron Lett s、、33:印刷中、1992年の手順にしたがって調製した)撹拌した溶液へ 塩化フェノキシアセチル(1,2ミリモル)を加えた。12時間後に、生成物を CHICI ! (200m1)で希釈して、飽和NaHCOs (2X500 ml) 、水(2X50ml)で洗浄して、乾燥させた(M g S O4)。
CH,CI 、抽出物を濃縮して、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー によって精製した。CHzClz:MeOH(9: 1. v/v)を用いて溶 出して、適当なフラクションを合わせて蒸発させ宜HNMR(DMSO−da)  δ 11. 35 (br s、2. NH)、7゜トリチル基を除去するた めにHF (48%)/CHsCN (5: 95.v/v)処理によって前記 の二量体から連続して保護基を除き、n B u 4 N F / T HFを 用いた処理の生成物からシリル基を除去して、白色の粉末として標題の化合物を 得た(3段階で70%)。
’HNMR(DMSO−d、)δ 11.35 (br s、1. NH)、1 1゜25(brs、1. NH) 、7.92 (s、 1. Cm旦)、 7 .5 (S、1゜C,H)、7.2−6.8(m、5.ArH)、6.23(擬 似t、1.旦1.)。
H,、、旦4・、旦s−Hs−、C旦zs−) 、 2.6 (m、 1. T l 旦3.)。
オリゴヌクレオチドの合成:実用的な方法、M、J、ガイド編集、IRL出版。
1984年(Oligonucleotide 5ynthesis:a pr actical approach、Ed、M、J、Ga1t、IRL Pre ss、1984)に記述された手順によって、最後の二量体をジメトキシトリチ ル化して、薄い黄色く色のついた泡沫として5’ −ODMT 3’ CHz− N (COCHxOPh) 0−CHz−5°−T−3’ −OHを得た。
IHNMR(DMSO−di)611. 3 (br s、2. NH)、7. 55 (s、1.0t旦) 、7.45 (s、1. Cm旦) 、 7.38 −6.75 (m。
2、 CHり 、 4.25 (m、 1. T2 旦s−) 、 4.18  (m、 1. T2旦s−) 、 4.05 (m、 1. T2 旦s−)  、 3.9 (m、 2. Ha、) 。
3、8−3.6 (m、 2. C旦t 3− ) 、 3.65 (s、 6 .20C旦、)。
3、2 (m、 2. TI、旦5.旦5.)、2.82 (m、 1. Tl  旦3.)。
2.3−2.05(m、 4.旦、2旦x、)、 1.6 (s、 3. T2  CHCH3) 。
1、38 (s、 3. TI CH,)。
オリゴヌクレオチドの合成:実用的な方法、M、J、ガイド編集、IRL出版。
1984年(Oligonucleotide 5ynthesis:a pr actical approach、Ed、M、J、Ga1t、IRL Pre SS、1984)に記述されている手順にしたがって上記の二量体をホスフィチ ル化してホスホラミディトの誘導体の二量体(DNA合成機の使用に適当である )を泡沫として得た(2段階で75%)。
IHNMR(CDCil)67.62 (s、 1. Cm旦)、 7.2−7 .45(2m、12.ArH) 、 6.77 7.05 (3m、 7. A rH,Cm旦)。
6.15(擬似t、i、 CI、旦)、6. 05 (t、1. CI・旦)、 4.7”P NMR(CDCIり 149.76および149.56ppm。
実施例30 オリゴヌクレオチド中の(3’ −CH,−N (不安定な保護基 )CH2CH25’ )結合からの(3’ CH2N H−0−CH2−5°) の結合の再生 実施例29のホスフィチル化した二量体を実施例8の手順によってオリゴヌクレ オチド中に導入するだろう。支持体上のオリゴヌクレオチドが完成した後に、標 準的な水酸化アンモニウムの条件を使用してオリゴヌクレオチドを支持体から切 断する。水酸化アンモニウム処理によって、支持体からの切断とともにさらに、 導入された(3’ CH2N (COCHzOPh)−0−CH2−5’ )オ リゴヌクレオチドの二量体のイミノ窒素からフェノキシアセチル保護基も切断さ れて、オリゴヌクレオチドの構造中で(3’ −CHz NH−0−CH2−5 ’ )が連結するオリゴヌクレオチドの二量体を得るだろう。
実施例31 (3’ CH2P (0) 2 0 CHz−5’ )および(3 ゛−C820P (OH) 2 CHz 5°)が連結するオリゴヌクレオシド の合成3° −C−ホスホネートニ量体の合成3′−ヒドロキシメチル−5’  −0−(t−ブチルジフェニルシリル)チミジンをNBSを用いた処理によって それの臭化物へ変換するだろう。この臭化物でアルブゾフ反応(Arbuzov  reaction)を行い、ホスホネートジエステルを得る。トリメチルブロ モシランを用いたホスホネートジエステルの切断によってフリーの酸を得て、ピ リジン中の3°−0−(t−ブチルジフェニルシリル)チミジンおよびDCCを 用いてこれを処理してその二量体を得る。
3’ −C−ホスホネートが連結するオリゴヌクレオシドの合成標準的なりNA 合成機の化学によってオリゴヌクレオシド中の希望する位置へ挿入するための5 ’−0−DMTおよび3′−〇−ホスホラマイトの誘導体として、二量体に適当 に保護基をつけてそれを活性化することによって、上記の二量体をオリゴヌクレ オシドの中へ導入するだろう。
5′−C−ホスホネートが連結するオリゴヌクレオシドの合成5° −デオキシ −5゛ −ブロモヌクレオシドを亜リン酸エステルと反応させて5′−ホスホネ ートが得られるので、対応する5゛−〇−ホスホネートの二量体を得るだろう。
これを順に3゛ −ヒドロキシメチルヌクレオシドと反応させて、評価 方法1 オリゴヌクレオチドの構造および完全性A、オリゴヌクレオチドの消化 オリゴヌクレオチドの酵素的消化 種々のアンチセンス・オリゴヌクレオチドにおける主鎖修飾の取り込みを、以下 の方法を用いて酵素的加水分解により確認した。この方法の配列リストにおいて は、「*」は配列中の本発明の結合の位置を示すために用い、同様にrpJは正 常なホスホジエステル結合の位置を示すために用いている。
修飾オリゴヌクレオチド (5°−GpCpGpTpTpTpTpT*TpTpTpTpTpGpCpG− 3’)(0,20D、 Azsons)を、0.1Mtris−HCI緩衝M( pH8,3,200μl)に溶解し、ヘビ毒ホスホジェステラーゼ(0,4Hg Lアルカリホスファターゼ(0,4μg)、および子ウシ牌臓ホスホジェステラ ーゼ(0゜4μg)で37℃において24−60時間処理した。得られた混合物 を希釈し、HPLCで分析した。カラム C−18ヌクレオシル(Nucleo sil) (5it )、流速・1ml/mi n、溶HA: 10mM酢酸ト リエチルアンモニウム、溶液Bアセトニトリル/水(1:1)、O%Bから50 %Bまで20分間の直線勾配。
ヌクレオシド成分の吸光係数に従い、ピーク面積に基づいてこの物質を定量化し た。ダイマーを含むそれぞれの修飾主鎖の間−性は、合成試料を完全に消化され たオリゴヌクレオチドと同時に注入することにより確認した。すべての場合にお いて、HPLC分析のピークの積分は、消化されたオリゴヌクレオチドの組成が 正しいことを示した。
B、主鎖結合の完全性 さらに、それぞれの修飾主鎖の取り込みの完全性は、同一のDNA合成器(AB I 380B)で製造されたcpT*”rpcyテトラマーの1Hおよび3IP  NMR分析によっても支持された。これは、合成器のコンピュータ・プログラ ムの間接的な確認である。
方法2 ハイブリダイゼーショノ分析 本発明のオリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオチド類似体、またはオリゴヌクレ オシドの、相補的核酸に結合する相対的能力は、特定のハイブリダイゼーション 複合体の融点を決定することにより比較することができる。融点(Tm)は、互 いに相補的な核酸の物理的性質であり、50%の2本鎖ヘリγクス形対コイル( ハイブリダイゼーションしていない)形が存在する温度を00で表わしたもので ある。Tmは、UVスペクトルを用いて、ハイブリダイゼーションの形成と分解 (溶融)を決定することにより測定する。ハイブリダイゼーションの間に生ずる ベーススタッキングは、UV吸収の減少を伴う(淡色性(hypochromi city))、したがって、UV吸収の減少は、より高いTmを示す。Tmが高 いほど、鎖の結合強度が大きくなる。非ワトラン・クリック塩基対は、Tmに対 して強い不安定化効果を有している。したがって、標的RNAに対するアンチセ ンス・オリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオシドの最適な結合を得るために は、塩基対の絶対的正確性が必要である。
A、オリゴヌクレオチド類似体のハイブリダイゼーションの熱力学の評価本発明 の選択されたオリゴヌクレオチド類似体が、これらに相補的なRNAまたはDN A配列にハイブリダイズする能力を、熱溶融分析により決定した。RNA相補鎖 は、T7RNAポリメラーゼおよび、核酸合成器(Applied Biosy stems、 Inc、)により合成されたテンプレート・プロモータDNAか ら合成した。RNA種は、FPLC(LKB Pharmacia。
Inc)を用いてイオン交換により精製する。アンチセンス・オリゴヌクレオチ ド類似体を化学量論的濃度でRNAまたはDNA相補鎖に加え、2本鎖からラン ダムコイルへの転移における吸収(260nm)深色性(hyperchrom icity)を、分光光度計(Gilford Re5ponse n)を用い てモニターする。これらの測定は、10mMリン酸ナトリウム(pH7,4)、 0.1mM EDTA、およびO,1Mまたは0.1Mのイオン強度を得るため のNaC1の緩衝液中で実施する。データは、1/Tm対In[Ct](ここで Ctは全オリゴヌクレオチド濃度)を表すグラフにより分析することができる。
本発明の選択されたオリゴヌクレオチド類似体のノ・イブリダイセーシジノの熱 力学的分析の結果を表1に示す。この表の配列リストにおいては、「*」は配列 中の本発明の結合の位置を示すために用い、同様に「p」は正常なホスホジエス テル結合の位置を示すために用いている。さらに、この表および後述の表におい ては、本発明の種々の主鎖結合についての一般化学名と構造の略記の間の相互参 照は以下のとおりである。オキシム、(3° −CH= N −OCH25°) 、アミノヒドロキシ6(3° CH2NH−OCH25’ )、N−メチル−ア ミノヒドロキシ: (3’ −CH2N (CH3)−0−CH2−5’ )  、N−メチル−ヒドロキシアミノ (3’ −CH2−0−N (CH3)−C H2−5°)、およびN、N’ −ジメチルヒドラジノ−(3° −CHz N  (CHA) N (CHs)−CH2−5°)。
表1 2本鎖の安定性(DNA−RNA) 配列 5°−GpCpGpTpTpTpTpT*TpTpTpTpTpGpCp G−3゜N−メチル−ヒドロキシアミノ 48. 9 −1. 3N−メチル− アミノヒドロキシ 49.4 −0.8N、N’ −ジメチル−ヒドラジノ 4 8. 3 −1. 9アミノヒドロキシ 47. 8 −2. 4配列 5’− GpCpGpTpTpTpT*TpT*TpTpTpTpGpCpG−3’*主 鎖 Tm (”C) 67m (’C)天然 502 N−メチル−ヒドロキシアミノ 47.5 −2.7N−メチル−アミノヒドロ キシ 49.7 −0.5N、N’ −ジメチル−ヒドラジノ 48.6 −1 .6アミノヒドロキシ 43. 7 −6. 4配列 5’−GpCpGpTp TpT*TpT*TpT*TpTpTpGpCpG−3’*主m Tm (’C ) 67m(’C)天然 50,2 N−メチル−ヒドロキシアミノ 44.2 −6.ON−メチル−アミノヒドロ キシ 48.2 −1.9N、N’ −ジメチル−ヒドラジノ 49.0 −1 .2アミノヒドロキシ 45. 3 −4. 9配列: 5’−GpCpGpT *TpTpTpT*TpTpTpT*TpGpCpG−3’*主鎖 Tm (’ C) 67m(’C)天然 50.2 N−メチル−アミノヒドロキシ 47. 8 −2. 4配列 5°−GpCp GpTpT*TpT*TpT*TpT*TpTpGpCpG−3’N−メチル− ヒドロキシアミノ 42. 3 −7. 9アミノヒドロキシ 45.5 −4 .7配列、5°−GpCpGpT*TpTpT*TpT*TpTpT*TpGp CpG−3゜N−メチル−アミノヒドロキシ 47.9 −2.3N、N’ − ジメチル−ヒドラジノ 47.3 −2.8アミノヒドロキシ 43.9 −6 .3配列:5°−GpCpGpT*TpT*TpT*TpT*TpT*TpGp CpG−3’N−メチル−ヒドロキシアミノ 40.0 −10.2N−メチル −アミノヒドロキシ 50. 8 +0. 64N、N’ −ジメチル−ヒドラ ジノ 51.3 +1.1アミノヒドロキシ 44.2 −6.0配列、5°− CpTpCpGpTpApCpCpT*TpTpCpCpGpGpTpCpC− 3’*主ta Tm (”C) ΔTm(’C)天然 63.4 オキシム 60.2 −3.2 N−メチル−アミノヒドロキシ 64. 9 +1. 5N、N’ −ジメチル −ヒドラジノ 64. 9 +−1,5アミノヒドロキシ 62.9 −0.5 配列 5’−CpTpCpGpTpApCpT*TpT*TpCpCpGpGp TpCpC−3’*主鎖 Tm(’C) ΔTm(’C)天然 56.7 N−メチル−ヒドロキシアミノ 54. 3 −2. 4N−メチル−アミノヒ ドロキシ 57.4 +0.7N、N’ −ジメチル−ヒドラジノ 57.0  +0.3アミノヒドロキシ 56.0 −0.7配列: 5’−CpGpApC pTpApTpGpCpApApTpT*TpC−3゜*主11 Tm (’C ) ΔTm (’C)天然 44.1 オキシム 41. 6 −2. 5 N−メチル−ヒドロキシアミノ 43.8 −0.3N−メチル−アミノヒドロ キシ 43. 6 −0. 5N、N’ −ジメチル−ヒドラジノ 42. 8  −1. 3アミノヒドロキシ 43. 4 −0. 7さらに、本発明の修飾 結合を有するオリゴヌクレオチドの塩基対特異性について調べた。この研究にお いては、配列(5°−CpTpCpGpTpApCpCpT*TpTpCpCp GpGpTpCpC−3°)中のTITダイマーの5°−Tの、RNA相補鎖の Aにマツチした時の結合(T:rA対)を、C,GまたはUとのミスマツチと比 較して測定した。すべての塩基対のミスマツチの平均を表2に示す。表2は、本 発明の主鎖結合の、相補鎖に対する本質的ワトランークリック塩基対特異性が弱 められていないことを示している。
表2 塩基対特異性 配列 5’−CpTpCpGpTpApCpCpT*TpTpCpCpGpGp TpCpC−3’N−メチル−アミノヒドロキシ −7,32N、 N’ −ジ メチル−ヒドラジノ −7,41アミノヒドロキシ −6,89 B、オリゴヌクレオチド類似体のハイブリダイゼーシヨンの正確性本発明のアン チセンス・オリゴヌクレオチド類似体の、絶対的特異性をもって標的mRNAと ハイブリダイズする能力は、全細胞RNAの存在下における精製標的mRNAの ノーザンプロット分析により示すことができる。標的mRNAは、T7RNAポ リメラーゼプロモーターの下流に配置された標的mRNAのcDNAを含むベク ターから合成する。合成したmRNAをアガロースゲル中で電気泳動し、適当な 支持膜にトロセルロース等)に転移させる。この支持膜をブロッキングして、” P−標1mしたオリゴヌクレオチド類似体をプローブとして用いる。
ストリンジエンシーは、プロットを繰り返し、より高い温度において、またはよ り低いイオン強度の洗浄1iiaにより洗浄することにより決定する。ヘテロ2 本鎖の形成の存在を評価するためにオートラジオグラフィーを行い、オートラジ オグラムをレーザー密度計(LKB Pharmacia、 fnc、)により 定量化する。全細胞RNAを標準的方法により単離し、アガロース電気泳動、膜 転移、および115mしたオリゴヌクレオチド類似体をプローブとして用いて分 析することにより、ハイブリット形成の特異性を決定する。ストリンジエンシー は修飾していないアンチセンス・オリゴヌクレオチドについてあらかじめ決定し 、特異的に標的とするmRNAのみかオリゴヌクレオチド類似体とへテロ2本鎖 を形成しうる条件を用いる。
方法3 ヌクレアーゼ耐性 A、血清および細胞質ヌクレアーゼに対するオリゴヌクレオチド類似体の耐性の 評価 血清ヌクレアーゼに対する本発明のオリゴヌクレオチド類似体の耐性は、このオ リゴヌクレオチド類似体を種々の濃度のウシ胎児血清を含む培養液中でインキュ ベートすることにより評価することができる。標識したオリゴヌクレオチド8体 を種々の時間インキュベートし、プロテアーゼにで処理し、次に20%ポリアク リルアミド尿素変性ゲルにおける電気泳動、およびそれに続くオートラジオグラ フィーによって分析する。オートラジオグラムをレーザー密度計で定量化する。
修飾結合の位置および既知のオリゴヌクレオチドの長さに基づいて、特定の修飾 かヌクレアーゼ分解に及ぼす影響を決定することができる。細胞質ヌクレアーゼ については、HL60細胞株を用いることができる。ポスト・ミトコンドリア上 清を密度差遠心分離により調製し、標識したオリゴヌクレオチド類似体をこの上 清中で種々の時間インキュベートする。インキュベートの後、血清核酸溶解分解 について上述したように、分解についてオリゴヌクレオチド類似体を評価する。
オートラジオグラフィーの結果を、未修飾と本発明のオリゴヌクレオチド類似体 との比較のために定量化する。
表3は、本発明のある種の結合の、10%ウシ胎児血清に対するヌクレアーゼ耐 性を示す。表3から明らかなように、試験されたすべての結合は、天然のオリゴ ヌクレオチドと比へてウシ胎児血清のヌクレアーゼに対して高い安定性を示した 。表3は、NからN−1への転移およびN−1からN−2への転移のL1/、を 示す。この表の配列リストにおいては、「水」は配列中の本発明の結合の位置を 示すために用い、同様にrpJは正常なホスホジエステル結合の位置を示すため に用いている。
表3 配列・5°−CpGpApCpTpApTpGpCpApApTpT*TpC− 3゜N−メチル−ヒドロキシアミノ 2.0 4.ON−メチル−アミノヒドロ キシ 5.5 12.5N、N’ −ジメチル−ヒドラジノ 20.5 36. 5アミノヒドロキシ 2.5 方法45−リポキシゲナーゼ分析、治療およびアッセイA、治療 治療に用いるためには、5−リポキシゲナーゼの過剰なまたは異常な供給により 特徴づけられる疾患を有すると疑われる動物を、本発明に従ってオリゴヌクレオ チド類似体を投与することにより処置する。当業者は、最適な投与量、投与方法 および反復速度を容易に決定することができる。このような処置は一般に、治癒 がなされるかまたは疾患状態の減縮が達成されるまで続けられる。いくつかの疾 患については、同様に長期処置が行われる。
B、研究試藁 本発明のオリゴヌクレオチド類似体はまた、粗細胞ライセード中、または部分的 にまたは完全に精製されたRNAFI製物中の、5−リポキシゲナーゼmRNA を切断あるいは調節するために用いられる場合、研究試薬用としても有用である 。
この本発明の応用は、例えば細胞を標準的方法により溶解し、最適にRNAを抽 出し、次にこれを緩衝液(例えば50mMIJン酸塩、pH約4〜約10)中の 、例えば約100〜約500ng/10mg全RNAの濃度の組成物を用いて、 約り0℃〜約50℃の温度において処理することにより行うことができる。切断 された5−リポキシゲナーゼRNAは、アガロースゲル電気泳動および放射性e JされたDNAプローブを用いるハイブリダイゼーション、あるいはその他の標 準的な方法により分析することができる。
C9診断 本発明のオリゴヌクレオチド類似体はまた、診断への応用において、特に種々の Mlllにおける特定のmRNA種の発現、あるいは異常または変異RNA種の 発現の決定にも有用である。この例においては、オリゴヌクレオチド類似体は、 異常な配列に相補的なように設計することによって、仮想の異常mRNAを標的 とするが、正常mRNAにはハイブリダイズせずこれを切断しない。
III!Iff本をホモジナイズし、tM単的な方法に従ってRNAを抽出する ことができる。粗ホモジネートまたは抽出物を処理して、例えば標的RNAを切 断することができる。次に、この生成物を、切断部位の5°側の傾城に相補的な オリゴヌクレオチドが結合されている固体支持体にハイブリダイズさせることが できる。
正常および異常のmRNAの5°領域はいずれも固体支持体に結合する。異常R NAの3゛領域は、本発明の化合物により切断されて、支持体に結合しないため 、正常RNAから分離される。
調節のための標的mRNA種は、5−リポキシゲナーゼに関係するものである。
しかし、当業者は、本発明がそのように制限されるものではなく、一般的に適用 しうろことを理解するであろう。5−リポキシゲナーゼ酵素の生成の阻害または 調節は、疾患の治療において顕著な治療の利益を有すると予想される。この組成 物の有効性を評価するために、1つまたは一連のアッセイが必要である。
D、インビトロアッセイ 5−リポキシゲナーゼの細胞性アッセイは、好ましくはヒト前骨髄性白血病細胞 株HL−60を用いて行う。これらの細胞は、種々の既知の試薬により誘導して 単球様細胞または好中球様細胞に分化させることができる。細胞を1.3%ジメ チルスルホキシド(DMSO)で処理することは、細胞の好中球への分化を促進 することが知られている。現在、基底H−60細胞が検出可能なレベルの5−リ ポキシゲナーゼ蛋白質を合成しないか、またはロイコトリエン(5−リポキシゲ ナーゼの下流生成物)を分泌しないことが知られている。DMSOによる細胞の 分化は、DMSOの添加から48時間後に5−リポキシゲナーゼ蛋白質の出現と ロイコトリエン生合成を引き起こす。したがって、5−リポキシゲナーゼ蛋白質 合成の誘導は、これらの細胞において5−リポキシゲナーゼ合成を阻害するアン チセンス・オリゴヌクレオチド類似体の分析のための試験システムとして利用す ることができる。
アンチセンス・オリゴヌクレオチドの第2の試験システムは、5−リポキシゲナ ーゼが「自殺」酵素である、すなわち、酵素が基質と反応することによってそれ 自身を不活性化するという事実を利用するものである。分化したHL−60また は5−リポキシゲナーゼを発現するその他の細胞を、10μMのA23187( カルシウム・イオノフオア)によって処理することは、5−リポキシゲナーゼの サイドシルから膜への移動およびそれに続く酵素の活性化を促進する。活性化お よび何回かの触媒作用の後、酵素は触媒的に不活性化する。したがって、カルシ ウム・イオノフオアによる細胞の処理は、内因性5−リポキシゲナーゼを不活性 化する。ロイコトリエンB、の合成能力により測定したところ、細胞がA231 87処理から回復するためには約24時間を要する。5−リポキシゲナーゼに対 するオリゴヌクレオチド類似体は、以下の定量的なアッセイを用いて、2つのH L−60モデル系において活性を測定することができる。これらのアッセイは、 生きた細胞における5−リポキシゲナーゼ活性の測定等の、より下流の事象と比 べて、生きた細胞における5−リポキシゲナーゼ蛋白質合成の阻害の最も直接的 な測定である。
生きた細胞においてオリゴヌクレオチド類似体が及ぼすことができ、容易に定量 化しつる最も直接的な効果は、5−リポキシゲナーゼ蛋白質合成の特異的な阻害 である。この方法を実施するためには、細胞を355−メチオニン(50μC1 /mL)で37℃において2時間標識し、新たに合成された蛋白質を標識する。
細胞を抽出して全細胞蛋白質を可溶化し、5−リポキシゲナーゼ抗体で5−リポ キシゲナーゼを免疫沈降させ、次にプロティンAセファロースビーズから溶出す る。免疫沈降した蛋白質を5DS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動により分離 し、オートラジオグラフィーのために感光を行う。免疫沈降した5−リポキシゲ ナーゼの量を走査密度計で定量化する。
これらの実験の結果は次のとおりである。対照細胞から免疫沈降された5−リボ キンゲナーゼ蛋白質の量を100%として標準とする。細胞を1μM、10μM および30μMの有効なオリゴヌクレオチド類似体によって48時間処理すると 、免疫沈降された5−リポキシゲナーゼはそれぞれ標準の5%、25%および7 5%減少する。
細胞ホモジネートにおける5−リポキシゲナーゼ酵素活性の測定もまた、ロイコ トリエンを合成しうる酵素の存在量を定量化するために用いることができる。
現在、逆相HPLCを用いて細胞ホモジネート中の5−リポキシゲナーゼ酵素を 定量化するための放射測定法が開発されている。細胞をプロテアーゼ阻害剤およ びEDTAを含む緩衝液中で超音波処理により破壊する。細胞ホモジネートを1 0、OOOxgで30分間遠心分離し、上清を5−リポキシゲナーゼ活性につい てアッセイする。サイドシル蛋白質を10μMの140−アラキドン酸、2mM ATP、50μMallF!カルシウム、1100u/mlホスファチジルコリ ン、および50mMb 1s−Tr 1sli衝液(pH7,0)とともに37 ℃において5分間インキュベートする。等量のアセトンを加えることにより反応 を停止させ、酢酸エチルで脂肪酸を抽出する。基質と反応生成物をツババックC 18カラム(Waters Inc、、Millford、MA)を用いて逆相 HPLCにより分離する。ラジオクロマトグラフィー検出機(Beckman  mode 1171)により、放射活性を有するピークを検出する。ジーHET Eおよびモノ−HETHに転換されたアラキドン酸の量を5−リポキシゲナーゼ 活性の測定値として用いる。
DMSO分化HL−60細胞を、有効なオリゴヌクレオチド類似体で1μM11 0μMおよび30μMの濃度において処理した結果は以下のとおりである。対照 細胞は200pmo115分/細胞106個のアラキドン酸を酸化する。1μM 、10μMおよび30μMの有効なオリゴヌクレオチド類似体で処理した細胞は 、それぞれ195pmo 1..140pmo lおよび60pmo115分/ 細胞106個のアラキドン酸を酸化する。
細胞中の全5−リポキシゲナーゼ蛋白質の測定のための定量的競合酵素免疫アッ セイ(ELISA)が開発されている。大腸菌で発現させ、抽出、Q−セファロ ース、ヒドロキシアパタイトおよび逆相HPLCにより精製したヒト5−リポキ シゲナーゼを標準として、およびマイクロタイタープレートの被覆のための第1 抗体として用いる。25ngの精製5−リポキシゲナーゼを4℃で一晩マイクロ タイタープレートに結合させる。ウェルを20mMTr i 5−HC1緩衝液 (pH7,4)および150mMNaC! (TBS)で希釈した5%ヤギ血清 で90分間被覆する。細胞抽出物(0,2%Triton X−400,12, 000Xg、30分間)または精11115−リポキシゲナーゼを、全量1.0 OaLの1:4000希釈抗5−リポキシゲナーゼポリクローナル抗体とともに 、マイクロタイターのウェル中で90分間インキュベートする。抗体は、精製ヒ ト組み換え5−リポキシゲナーゼでウサギを免疫して調製する。ウェルを0.0 5%tween20を含むTBS (TBST)で洗浄し、次に100μLの1  : 1000希釈ペルオキシダーゼ結合抗ウサギIgGヤギ抗体(Cappe l Laborat。
ries、Malvern、 PA)とともに25℃において60分間インキュ ベートする。ウェルをTBSTで洗浄し、テトラメチルベンジジンで発色させて ペルオキシダーゼ標識第2抗体の量を決定する。
1μM110μMおよび30μMの30塩基のオリゴヌクレオチド類似体を用い たそのようなアッセイの結果は、それぞれ細胞106個につき5−リポキシゲナ ーゼが30ng、18ngおよび5ngであり、処理していない細胞は約34n gの5−リポキシゲナーゼを含む。
5−リポキシゲナーセ生合成の阻害の正味の効果は、刺激された細胞から放出さ れたロイコトリエンの量の減少である。DMSO分化HL−60細胞は、カルシ ウム・イオノフオアA23187による刺激によりロイコトリエンB4を放出す る。細胞培養液に放出されたロイコトリエンは、商業的に入手可能な診断キット (New England Nuclear、 Boston、MA)を用いて 、ラジオイムノア7セイにより定量することができる。HL−60細胞における ロイコトリエンB4の産生は、DMSOを添加して細胞を好中球様細胞に分化さ せてから48時間後に検出することかできる。細胞(2×105個/mL)を1 .3%のDMSOの存在下で、増加する濃度のオリゴヌクレオチドi似体で48 −72時間処理する。細胞を洗浄し、1%脱脂ウシ血清アルブミンを含むダルヘ コリン酸緩衝液生理食塩水中に、2 x 10’@/mLの濃度で再懸濁する。
細胞を10μMカルシウム・イオノフオアA23187で15分間刺激し、5× 105個の細胞から産生されたLTB4の量を、製造者の記述にしたがってラジ オイムノア7セイにより決定する。
このアッセイを用いて、5−LOmRNAに対する、修飾された結合を含む15 塩基のアンチセンス・オリゴヌクレオチド(GCAAGGTCACTGAAG) について得られる結果は以下のとおりである。細胞を1μM、10μMまたは3 0μMのオリゴヌクレオチド類似体とともに、1.3%DMSOの存在下で72 時間処理する。5XLO’個の細胞から産生されるLTB4の量は、それぞれ約 75pg、sopgおよび35pgてあり、未処理の分化細胞は75pgのLT B4を産生する。
E、インビボアッセイ マウスにおける5−リポキシゲナーゼ産生の阻害は、以下の方法にしたがって示 すことができる。アラキドン酸を局所投与することにより、ロイコトリエンB4 、ロイコトリエンC4およびプロスタグランジンE2が皮膚において速やかに生 成し、続いて浮腫および細胞性?&潤が生しる。5−リポキシゲナーゼのある種 の阻害剤がこのアッセイにおいて活性を示すことが知られている。このアッセイ のために、2mgのアラキドン酸をマウスの耳に適用し、反対側の耳を対照とす る。
アラキドン酸投与から1時間後の生検試料から得たホモジネート中のミエロペル 3%、58%および90%であり、これに対しロイコトリエンB、の生成の阻害 はそれぞれ約15%、79%および99%である。
h FIG、! FIG、2 手続補正書 平成5年/−月7 日。

Claims (96)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.オリゴヌクレオチド類似体であって、該類似体の少なくとも−部のサブユニ ットが次の構造: ▲数式、化学式、表等があります▼ [式中、 Bxは可変の塩基部分であり; QはO,CH2,CHF,またはCF2であり;XはH,OH,C1〜C10低 級アルキル,置換低級アルキル,アルカリール,アラルキル,F,Cl,Br, CN,CF3,OCF3,OCN,O−アルキル,S−アルキル,N−アルキル ,O−アルケニル,S−アルケニル,N−アルケニル,SOCH3,SO2CH 3,ONO2,NO2,N3,NH2,ヘテロシクロアルキル,ヘテロシクロア ルカリール,アミノアルキルアミノ,ポリアルキルアミノ,置換シリル,RNA 開裂基、オリゴヌクレオチドの薬物動態学的特性を改良するための基、またはオ リゴヌクレオチドの薬力学的特性を改良するための基であり;L1およびL4は 互いに独立的に、CH2,C=O,C=S,C−NH2,C−NHR3,C−O H,C−SH,C−O−R1,またはC−S−R1であり;L2およびL3は互 いに独立的に、CR1R2,C=CR1R2,C=NR3,P(O)R4,P( S)R4,C=O,C=S,O,S,SO,SO2,NR3,もしくはSiR5 R6であるか、あるいは一緒になってアルケン、アルキン、芳香環、炭素環、も しくは複素環の一部を形成するか、あるいは、L1,L2,L3,およびL1は 、一緒になって−CH=N−NH−CH2−部分,または−CH2−O−N=C H−部分を構成し;R1よびR2は互いに独立的に、H,OH,SH,NH2, C1〜C10アルキル,置換アルキル,アルケニル,アルカリール,アラルキル ,アルコキシ,チオアルコキシ,アルキルアミノ,アラルキルアミノ,置換アル キルアミノ,ヘテロシクロアルキル,ヘテロシクロアルキルアミノ,アミノアル キルアミノ,ポリアルキルアミノ,ハロ,ホルミル,ケト,ベンゾキシ,カルボ キサミド,チオカルボキサミド,エステル,チオエステル,カルボキサミジン, カルバミル,ウレイド,グアニジノ,RNA開裂基、オリゴヌクレオチドの薬物 動態学的特性を改良するための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を 改良するための基であり; R3は、H,OH,NH2,低級アルキル,置換低級アルキル,アルコキシ,低 級アルケニル,アラルキル,アルキルアミノ,アラルキルアミノ,置換アルキル アミノ,ヘテロシクロアルキル,ヘテロシクロアルキルアミノ,アミノアルキル アミノ,ポリアルキルアミノ,RNA開裂基、オリゴヌクレオチドの薬物動態学 的特性を改良するための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改良す るための基であり; R4は、OH,SH,NH2,O−アルキル,S−アルキル,NH−アルキル, O−アルキルヘテロシクロ,S−アルキルヘテロシクロ,N−アルキルヘテロシ クロ,または窒素含有複素環であり; R5およびR6は、それぞれ独立的にC1〜C5アルキルまたはC1〜C6アル コキシである; ただし、L1がC=OまたはC=Sであるときは、L2はNR3ではなく;L4 がC=OまたはC=Sであるときは、L3はNR3ではなく:L2またはL3の 一方がC=OまたはC=Sであるときは、L2またはL3の他方はNR3ではな く;L2がP(O)R4であり,R4がOHであり,XがOHであり,かつ、B xがウラシルまたはアデニンであるときは,L3はOではなく;またL1,L2 .およびL1がCH2であり,XがHまたはOHであり,かつ、QがOであると きは,L3はS,SO,またはSO2ではない] を有する、オリゴヌクレオチド類似体。
  2. 2.QがOである、請求項1記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  3. 3.L1およびL4がそれぞれCR1R2である、請求項1記載のオリゴヌクレ オチド類似体。
  4. 4.R1およびR2がそれぞれHである、請求項3記載のオリゴヌクレオチド類 似体。
  5. 5.QがOである、請求項4記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  6. 6.L2およびL3か互いに独立的に、CR1R2,O,P(O)R4,P(S )R4,またはNR3である、請求項1記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  7. 7.L2とL3の一方がCR1R2であり、L2とL3の他方がP(O)R4ま たはP(S)R4である、請求項6記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  8. 8.L2がOであり、L3がP(O)R4またはP(S)R4である、請求項6 記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  9. 9.L2およびL3がそれぞれNR3である、請求項1記載のオリゴヌクレオチ ド類似体。
  10. 10.R3がHである、請求項9記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  11. 11.L1およびL4がそれぞれCH2であり、L2およびL3がそれぞれNR 3である、請求項1記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  12. 12.L2とL3が一緒になって、シクロプロピル、シクロブチル、エチレンオ キシ、エチルアジリジン、または置換エチルアジリジン環の一部を形成している 、請求項1記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  13. 13.L2とL3が一緒になって、C3〜C6炭素環、または4,5,もしくは 6員構成の窒素複素環を形成している、請求項1記載のオリゴヌクレオチド類似 体。
  14. 14.XがHである、請求項1記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  15. 15.XがOHである、請求項1記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  16. 16.XがH、OH、F、O−アルキル、またはO−アルケニルであり、かつ、 QがOである、請求項1記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  17. 17.Bxが、アデニン、グアニン、ウラシル、チミン、シトシン、2−アミノ アデノシン、または5−メチルシトシンである、請求項1記載のオリゴヌクレオ チド類似体。
  18. 18.QがOである、請求項17記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  19. 19.L1およびL4がそれぞれCH2である、請求項21記載のオリゴヌクレ オチド類似体。
  20. 20.L2およびL3がそれぞれNHである、請求項19記載のオリゴヌクレオ チド類似体。
  21. 21.L2とL3の一方がOであり、L2とL3の他方がNHである、請求項1 9記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  22. 22.L2がNHであり、L3がOである、請求項19記載のオリゴヌクレオチ ド類似体。
  23. 23.L2がOであり、L3がNHである、請求項21記載のオリゴヌクレオチ ド類似体。
  24. 24.前記の横這を有するサブユニットを約5〜50個含む、請求項1記載のオ リゴヌクレオチド類似体。
  25. 25.実質的にすべてのサブユニットが前記の構造を有する、請求項1記載のオ リゴヌクレオチド類似体。
  26. 26.実質的に交互のサブユニットが前記の構造を有する、請求項1記載のオリ ゴヌクレオチド類似体。
  27. 27.医薬用として許容しうるキャリヤー中に含まれる、請求項1記載のオリゴ ヌクレオチド類似体。
  28. 28.対応する天然のオリゴヌクレオチドに比べて、改良された耐ヌクレアーゼ 性を示す、請求項1記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  29. 29.生物中における蛋白質の生成と活性を調節する方法であって、該蛋白質を コードする核酸配列の少なくとも一部と特異的にハイブリッド形成することが可 能なオリゴヌクレオチド類似体と該生物とを接触させることを含み、ここで類似 体のサブユニットの少なくともいくつかが次の構造:▲数式、化学式、表等があ ります▼ [式中、 Bxは可変の塩基部分であり; QはO,CH2,CHF,またはCF2であり;XはH,OH,C1〜C10低 級アルキル,置換低級アルキル,アルカリール,アラルキル,F,Cl,Br, CN,CF3,OCF3,OCN,O−アルキル,S−アルキル,N−アルキル ,O−アルケニル,S−アルケニル,N−アルケニル,SOCH3,SO2CH 3,ONO2,NO2,N3,NH2,ヘテロシクロアルキル,ヘテロシクロア ルカリール,アミノアルキルアミノ,ポリアルキルアミノ,置換シリル,RNA 開裂基、オリゴヌクレオチドの薬物動態学的特性を改良するための基、またはオ リゴヌクレオチドの薬力学的特性を改良するための基であり;L1およびL4は 互いに独立的に、CH2,C=O,C=S,C−NH2,C−NHR3,C−O H,C−SH,C−O−R1,またはC−S−R1であり;L2およびL3は互 いに独立的に、CR1R2,C=CR1R2,C=NR3,P(O)R4,P( S)R4,C=O,C=S,O,S,SO,SO2,NR3,もしくはSiR5 R6であるか、あるいは一緒になってアルケン、アルキン、芳香環、炭素環、も しくは複素環の一部を形成するか、あるいは、L1,L2,L3,およびL4は 、一緒になって−CH=N−NH−CH2−部分,または−CH2−O−N=C H−部分を構成し;R1およびR2は互いに独立的に、H,OH,SH,NH2 ,C1〜C10アルキル,置換アルキル,アルケニル,アルカリール,アラルキ ル,アルコキシ,チオアルコキシ,アルキルアミノ,アラルキルアミノ,置換ア ルキルアミノ,ヘテロシクロアルキル,ヘテロシクロアルキルアミノ,アミノア ルキルアミノ,ポリアルキルアミノ,ハロ,ホルミル,ケト,ベンゾキシ,カル ボキサミド,チオカルボキサミド,エステル,チオエステル,カルボキサミジン ,カルバミル,ウレイド,グアニジノ,RNA開裂基、オリゴヌクレオチドの薬 物動態学的特性を改良すうための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性 を改良するための基であり; R3は、H,OH,NH2,低級アルキル,置換低級アルキル,アルコキシ,低 級アルケニル,アラルキル,アルキルアミノ,アラルキルアミノ,置換アルキル アミノ,ヘテロシクロアルキル,ヘテロシクロアルキルアミノ,アミノアルキル アミノ,ポリアルキルアミノ,RNA開裂基、オリゴヌクレオチドの薬物動態学 的特性を改良するための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改良す るための基であり; R4は、OH,SH,NH2,O−アルキル,S−アルキル,NH−アルキル, O−アルキル複素瑛,S−アルキル複素環,N−アルキル複素環,または窒素含 有複素環であり; R5およびR6は、それぞれ独立的にC1〜C6アルキルまたはC1〜C6アル コキシである; ただし、L1がC=OまたはC=Sであるときは、L2はNR3ではなく;L4 がC=OまたはC=Sであるときは、L3はNR3ではなく;L2またはL3の 一方がC=OまたはC=Sであるときは、L2またはL3の他方はNR3ではな く;L2がP(O)R4であり,R4がOHであり,XがOHであり,かつ、B xがウラシルまたはアデニンであるときは,L3はOではなく;またL1,L2 ,およびL4がCH2であり,XがHまたはOHであり,かつ、QがOであると きは,L3はS,SO,またはSO2ではない] を有することを特徴とする方法。
  30. 30.QがOである、請求項29記載の方法。
  31. 31.L1およびL4がそれぞれCR1R2である、請求項29記載の方法。
  32. 32.R1およびR2がそれぞれHである、請求項31記載の方法。
  33. 33.QがOである、請求項32記載の方法。
  34. 34.L2およびL3が互いに独立的に、CR1R2,O,P(O)R4,P( S)R4,またはNR3である、請求項29記載の方法。
  35. 35.L2とL3の一方がCR1R2であり、L2とL3の他方がP(O)R4 またはP(S)R4である、請求項34記載の方法。
  36. 36.L2がOであり、L3がP(O)R4またはP(S)R4である、請求項 34記載の方法。
  37. 37.L2およびL3がそれぞれNR3である、請求項29記載の方法。
  38. 38.R3がHである、請求項37記載のオリゴヌクレオチド類似体。
  39. 39.L1およびL4がそれぞれCH2であり、L2およびL3がそれぞれNR 3である、請求項29記載の方法。
  40. 40.L2とL3が一緒になって、シクロプロピル、シクロブチル、エチレンオ キシ、エチルアジリジン、または置換エチルアジリジン環の一部を形成している 、請求項29記載の方法。
  41. 41.L2とL3が一緒になって、C3〜C6炭素環、または4,5,もしくは 6員構成の窒素複素環を形成している、請求項29記載の方法。
  42. 42.XがHである、請求項29記載の方法。
  43. 43.XがOHである、請求項29記載の方法。
  44. 44.XがH、OH、F、O−アルキル、またはO−アルケニルであり、かつ、 QがOである、請求項29記載の方法。
  45. 45.Bxが、アデニン、グアニン、ウラシル、チミン、シトシン、2−アミノ アデノシン、または5−メチルシトシンである、請求項29記載の方法。
  46. 46.QがOである、請求項45記載の方法。
  47. 47.L1およびL4がそれぞれCH2である、請求項46記載の方法。
  48. 48.L2およびL3がそれぞれNHである、請求項47記載の方法。
  49. 49.L2とL3の一方がOであり、L2とL3の他方がNHである、請求項4 7記載の方法。
  50. 50.L2がNHであり、L3がOである、請求項47記載の方法。
  51. 51.L2がOであり、L3がNHである、請求項47記載の方法。
  52. 52.オリゴヌクレオチド類似体が前記の構造を有するサブユニットを約5〜5 0個含む、請求項29記載の方法。
  53. 53.オリゴヌクレオチド類似体の実質的にすべてのサブユニットが前記の構造 を有する、請求項29記載の方法。
  54. 54.オリゴヌクレオチド類似体の実質的に交互のサブユニットが前記の構造を 有する、請求項29記載の方法。
  55. 55.オリゴヌクレオチド類似体が医薬用として許容しうるキャリヤー中に含ま れる、請求項29記載の方法。
  56. 56.オリゴヌクレオチド類似体が対応する天然のオリゴヌクレオチドに比べて 、改良された耐ヌクレアーゼ性を示す、請求項29記載の方法。
  57. 57.蛋白質の望ましくない生成を特徴とする疾患を有する生物を処置する方法 であって、該蛋白質をコードする核酸配列の少なくとも一部とハイブリッド形成 することが可能なオリゴヌクレオチド類似体と該生物とを、単独もしくは医薬用 として許容しうるキャリやー中に製剤した形で接触させることを含み、ここで前 記類似体のサブユニットの少なくともいくつかが次の構造:▲数式、化学式、表 等があります▼ [式中、 Bxは可変の塩基部分であり; QはO,CH2,CHF,またはCF2であり;XはH,OH,C1〜C10低 級アルキル,置換低級アルキル,アルカリール,アラルキル,F,Cl,Br, CN,CF3,OCF3,OCN,O−アルキル,S−アルキル,N−アルキル ,O−アルケニル,S−アルケニル,N−アルケニル,SOCH3,SO2CH 3,ON02,NO2,N3,NH2,ヘテロシクロアルキル,ヘテロシクロア ルカリール,アミノアルキルアミノ,ポリアルキルアミノ,置換シリル,RNA 開裂基、オリゴヌクレオチドの薬物動態学的特性を改良するための基、またはオ リゴヌクレオチドの薬力学的特性を改良するための基であり;L1およびL4は 互いに独立的に、CH2,C=O,C=S,C−NH2,C−NHR3,C−O H,C−SH,C−O−R1,またはC−S−R1であり;L2およびL3は互 いに独立的に、CR1R2,C=CR1R2,C=NR3,P(O)R4,P( S)R4,C=O,C=S,O,S,SO,SO2,NR3,もしくはSiR5 R6であるか、あるいは一緒になってアルケン、アルキン、芳香環、炭素環、も しくは複素環の一部を形成するか、あるいは、L1,L2,L3,およびL4は 、一緒になって−CH=N−NH−CH2−部分,または−CH2−O−N=C H−部分を構成し:R1およびR2は互いに独立的に、H,OH,SH,NH2 ,C1〜C10アルキル,置換アルキル,アルケニル,アルカリール,アラルキ ル,アルコキシ,チオアルコキシ,アルキルアミノ,アラルキルアミノ,置換ア ルキルアミノ,ヘテロシクロアルキル,ヘテロシクロアルキルアミノ,アミノア ルキルアミノ,ポリアルキルアミノ,ハロ,ホルミル,ケト,ベンゾキシ,カル ボキサミド,チオカルボキサミド,エステル,チオエステル,カルボキサミジン ,カルバミル,ウレイド,グアニジノ,RNA開裂基、オリゴヌクレオチドの薬 物動態学的特性を改良するための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性 を改良するための基であり; R3は、H,OH,NH2,低級アルキル,置換低級アルキル,アルコキシ,低 級アルケニル,アラルキル,アルキルアミノ,アラルキルアミノ,置換アルキル アミノ,ヘテロシクロアルキル,ヘテロシクロアルキルアミノ,アミノアルキル アミノ,ポリアルキルアミノ,RNA開裂基、オリゴヌクレオチドの薬物動態学 的特性を改良するための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改良す るための基であり: R4は、OH,SH,NH2,O−アルキル,S−アルキル,NH−アルキル, O−アルキル複素環,S−アルキル複素環,N−アルキル複素環,または窒素含 有複素環であり; R5およびR6は、それぞれ独立的にC1〜C6アルキルまたはC1〜C6アル コキシである; ただし、L1がC=OまたはC=Sであるときは、L2はNR3ではなく;L4 がC=OまたはC=Sであるときは、L3はNR3ではなく;L2またはL3の 一方がC=OまたはC=Sであるときは、L2またはL3の他方はNR3ではな く;L2がP(O)R4であり,R4がOHであり,XがOHであり,かつ、B 2がウラシルまたはアデニンであるときは,L3はOではなく;またL1,L2 ,およびL4がCH2であり,XがHまたはOHであり,かつ、QがOであると きは,L3はS,SO,またはSO2ではない] を有することを特徴とする方法。
  58. 58.QがOである、請求項57記載の方法。
  59. 59.L1およびL4がそれぞれCR1R2である、請求項57記載の方法。
  60. 60.R1およびR2がそれぞれHである、請求項59記載の方法。
  61. 61.QがOである、請求項60記載の方法。
  62. 62.L2およびL3が互いに独立的に、CR1R2,O,P(O)R4,P( S)R4,またはNR3である、請求項57記載の方法。
  63. 63.L2とL3の一方がCR1R2であり、L2とL3の他方がP(O)R4 またはP(S)R4である、請求項62記載の方法。
  64. 64.L2がOであり、L3がP(O)R4またはP(S)R4である、請求項 62記載の方法。
  65. 65.L2およびL3がそれぞれNR3である、請求項57記載の方法。
  66. 66.R3がHである、請求項65記載の方法。
  67. 67.L1およびL4がそれぞれCH2であり、L2およびL3がそれぞれNR 3である、請求項57記載の方法。
  68. 68.L2とL3が一緒になって、シクロプロピル、シクロブチル、エチレンオ キシ、エチルアジリジン、または置換エチルアジリジン環の一部を形成している 、請求項57記載の方法。
  69. 69.L2とL3が一緒になって、C3〜C6炭素環、または4,5,もしくは 6員構成の窒素複素環を形成している、請求項57記載の方法。
  70. 70.XがHである、請求項57記載の方法。
  71. 71.XがOHである、請求項57記載の方法。
  72. 72.XがH、OH、F、O−アルキル、またはO−アルケニルであり、かつ、 QがOである、請求項57記載の方法。
  73. 73.Bxが、アデニン、グアニン、ウラシル、チミン、シトシン、2−アミノ アデノシン、または5−メチルシトシンである、請求項57記載の方法。
  74. 74.QがOである、請求項73記載の方法。
  75. 75.L1およびL4がそれぞれCH2である、請求項74記載の方法。
  76. 76.L2およびL3がそれぞれNHである、請求項75記載の方法。
  77. 77.L2とL3の一方がOであり、L2とL33の他方がNHである、請求項 75記載の方法。
  78. 78.L2がNHであり、L3がOである、請求項75記載の方法。
  79. 79.L2がOであり、L3がNHである、請求項75記載の方法。
  80. 80.オリゴヌクレオチド類似体が前記の構造を有するサブユニットを約5〜5 0個含む、請求項57記載の方法。
  81. 81.オリゴヌクレオチド類似体の実質的にすべてのサブユニットが前記の構造 を有する、請求項57記載の方法。
  82. 82.オリゴヌクレオチド類似体の実質的に交互のサブユニットが前記の構造を 有する、請求項57記載の方法。
  83. 83.オリゴヌクレオチド類似体が医薬用として許容しうるキャリヤー中に含ま れる、請求項57記載の方法。
  84. 84.オリゴヌクレオチド類似体が対応する天然のオリゴヌクレオチドに比べて 、改良された耐ヌクレアーゼ性を示す、請求項57記載の方法。
  85. 85.請求項1記載のオリゴヌクレオチド類似体を合成する方法であって、次の 構造: ▲数式、化学式、表等があります▼ を含む第1の部分と、次の構造: ▲数式、化学式、表等があります▼ を含む第2の部分[式中、Bxは可変の塩基部分であり、QはO,CH2,CH F,またはCF2であり、そしてE1およびE2は同一または異なり、求電子反 応基である]を用意すること:および 前記第1と第2の部分を、前記求電子反応基を介して結合基とカップリングして 、前記オリゴヌクレオチド類似体を形成させること;を含む方法。
  86. 86.第1の部分の求電子反応基が、ハロメチル、トリフルオロメチル、スルホ ニルメチル、p−メチル−ベンゼンスルホニルメチルまたは3′−C−ホルミル を含む、請求項85記載の方法。
  87. 87.第2の部分の求電子反応基が、ハロゲン、スルホニルメチル、p−メチル ーベンゼンスルホニルメチルまたはアルデヒドを含む、請求項85記載の方法。
  88. 88.結合基が、ヒドラジンまたはヒドロキシルアミンである、請求項85記載 の方法。
  89. 89.前記オリゴヌクレオチド類似体の少なくとも−部を、別のオリゴヌクレオ チド化学種に組み込んで、天然のホスホジエステル結合とそのようにカップリン グされた区域が実質的に交互に存在する状態の前記別のオリゴヌクレオチド類似 体を得る、請求項85記載の方法。
  90. 90.該組み込みが、所望の配列を有するジヌクレオチドのホスホジエステル結 合によって達成され、ここで前記ジヌクレオチドはあらかじめそのようにカップ リングされている、請求項85記載の方法。
  91. 91.次の構造: ▲数式、化学式、表等があります▼ [式中、 Bxは可変の塩基部分であり: QはO,CH2,CHF,またはCF2であり;XはH,OH,C1〜C10低 級アルキル,置換低級アルキル,アルカリール,アラルキル,F,Cl,Br, CN,CF3,OCF3,OCN,O−アルキル,S−アルキル,N−アルキル ,O−アルケニル,S−アルケニル,N−アルケニル,SOCH3,SO2CH 3,ONO2,NO2,N3,NH2,ヘテロシクロアルキル,ヘテロシクロア ルカリール,アミノアルキルアミノ,ポリアルキルアミノ,置換シリル,RNA 開裂基,オリゴヌクレオチドの薬物動態学的特性を改良するための基,またはオ リゴヌクレオチドの薬力学的特性を改良するための基であり;Yはヒドロキシ、 アミノメチル、ヒドラジノメチル、ヒドロキシメチル、C−ホルミル、フタルイ ミドヒドロキシメチル、アリール置換イミダゾリジノ、アミノヒドロキシメチル 、オルト−メチルアミノベンゼンチオ、メチルホスホネート、またはメチルアル キルホスホネートであり;ZはH、ヒドロキシル、アミノメチル、ヒドラジノメ チル、ヒドロキシメチル、C−ホルミル、フタルイミドヒドロキシメチル、アリ ール置換イミダゾリジノ、アミノヒドロキシメチル、オルト−メチルアミノベン ゼンチオ、メチルホスホネート、またはメチルアルキルホスホネートであり;た だし、QがOであり、Yがヒドロキシメチルであり、かつXがHまたはOHであ るときは、ZはHまたはC−ホルミルではなく;またQがOであり、XがHまた はOHであり、かつZがヒドロキシルであるときは、Yはアミノヒドロキシメチ ル、ヒドラジノメチル、またはアリール置換イミダゾリジノではない]を有する ヌクレオシド。
  92. 92.XがHまたはOHである、請求項91記載のヌクレオシド。
  93. 93.QがOである、請求項91記載のヌクレオシド。
  94. 94.請求項1記載のオリゴヌクレオチド類似体を合成する方法であって、ペン トフラノシルヌクレオシドの3′炭素原子においてラジカルを生成させること; および 別のペントフラノシルヌクレオシドの5′位にペンダント状態になっているオキ シム部分と該ラジカルとを反応させること;を含む方法。
  95. 95.請求項1記載のオリゴヌクレオチド類似体のL2またはL3の窒素部分を 保護する方法であって、ここでL2とL3の一方はNR3であり、R3はHであ り、窒素部分をフェノキシアセチルクロライドでブロックすること;オリゴヌク レオチド類似体をさらに反応させて該オリゴヌクレオチドを変性すること; および水酸化アンモニウムで窒素部分を脱ブロックすること;を含む方法。
  96. 96.二官能のヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチド類似体を保護する方法で あって、ここで二官能価のうちの一つはアルデヒドであり、アルデヒドとメトキ シアミンとを反応させてアルデヒドのオキシム誘導体を形成させること; ヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチド類似体をさらに反応させて該ヌクレオシ ドまたはオリゴヌクレオチド類似体を修飾すること;および該オキシムをアセト アルデヒドと反応させてアルデヒドを再生させること;を含む方法。
JP5500301A 1991-05-21 1992-05-21 主鎖修飾されたオリゴヌクレオチド類似体 Expired - Fee Related JP2711180B2 (ja)

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