TW202345911A - 用於治療杜興氏肌肉失養症(duchenne muscular dystrophy)之部分外顯子44、50及53之精確切除 - Google Patents
用於治療杜興氏肌肉失養症(duchenne muscular dystrophy)之部分外顯子44、50及53之精確切除 Download PDFInfo
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Abstract
本發明涵蓋用於治療杜興氏肌肉失養症(Duchenne Muscular Dystrophy,DMD)及切除DMD基因之小部分外顯子44、50及53的組合物及方法。
Description
肌肉失養症(MD)為一組超過30種的遺傳病,其特徵為控制運動之骨骼肌漸進性無力及退化。杜興氏肌肉失養症(DMD)為最嚴重的MD形式之一,其影響約五千分之一的男孩且以漸進性肌無力及過早死亡為特徵。心肌病及心臟衰竭係DMD的常見、不可治癒和致命的特徵。該疾病係由編碼肌肉萎縮蛋白的基因(
DMD)的突變引起,該等突變引起肌肉萎縮蛋白的表現損失,導致肌肉膜脆性及漸進性肌肉萎縮。
基於CRISPR的基因體編輯可使用Cas9及嚮導RNA對基因體DNA進行序列特異性裂解。舉例而言,可將編碼Cas9酶的核酸及編碼適當嚮導RNA的核酸設置於各別載體上或一同設置於單個載體上且活體內或活體外投與以例如敲除或校正基因突變。位於嚮導RNA的5'端的約20個核苷酸充當嚮導或間隔子序列,其可為與基因體目標位置的一個股互補的任何序列,該股具有相鄰的原間隔子序列相鄰模體(PAM)。PAM序列係與Cas9核酸酶切割位點相鄰的短序列,該Cas9核酸酶切割位點係Cas9分子進行適當結合所需的。嚮導RNA之嚮導或間隔子序列的3'核苷酸充當與Cas9相互作用的支架序列。當表現嚮導RNA及Cas9時,嚮導RNA將結合至Cas9且將其導引至與嚮導序列互補的序列,接著將在該序列中起始雙股斷裂(DSB)。為了修復此等斷裂,細胞通常利用容易出錯的非同源末端接合機制(NHEJ),該機制可經由密碼子插入或缺失、讀框移位而引起目標基因功能中斷,或促使過早終止密碼子觸發無義股介導的衰減。參見例如Kumar等人(2018) Front. Mol. Neurosci. 第11卷, 第413節。
儘管先前已研究了使用系統(例如CRISPR)治療DMD的基因編輯策略,但此等策略主要聚焦於:a)在多個不同位點處切割,以切除肌肉萎縮蛋白基因的大部分(例如一或多個外顯子)(參見例如Ousterout等人, 2015, Nat Commun. 6:6244);或b)在單個位點處切割以引入插入缺失(indel),該等插入缺失引起框移突變及/或破壞肌肉萎縮蛋白基因中之剪接受體/供體位點(參見例如Amoassi等人, 2018, Science, 362(6410):86-91)。然而,治療如DMD之類的疾病仍需要其他替代的有效基因編輯策略。
本文提供利用諸如金黃葡萄球菌(
Staphylococcus aureus) (SaCas9)及路鄧葡萄球菌(
Staphylococcus lugdunensis) (SluCas9)之Cas蛋白質治療DMD的組合物及方法。在一些實施例中,提供切除小部分DMD基因之嚮導RNA對,其中編碼嚮導RNA對之核酸可位於單個核酸分子上。
因此,提供以下非限制性實施例。
實施例1為一種組合物,其包含一或多個嚮導RNA或編碼一或多個嚮導RNA之核酸,其中該一或多個嚮導RNA包含i)表6之嚮導序列;ii)
表 6之嚮導序列的至少16、17、18、19或20個連續核苷酸;iii)與
表 6之嚮導序列至少90%一致的嚮導序列;或iv)
表 1B 、 1D 、 3B 、 3D 、 5B 及 5D中所示任何一對嚮導序列,視情況進一步包含SaCas9或編碼SaCas9之核酸(針對SEQ ID NO: 1-159)或SluCas9或編碼SluCas9之核酸(針對SEQ ID NO: 200-292、924-938或950-955)。
實施例2為一種組合物,其包含一對嚮導RNA或編碼一對嚮導RNA之核酸,其中該成對嚮導RNA包含第一嚮導序列及第二嚮導序列或由該等嚮導序列組成,其中該第一嚮導序列及該第二嚮導序列係選自以下任何一對嚮導序列:
a.對於具有SaCas9之外顯子44:SEQ ID NO: 1及3;110及120;110及121;110及122;110及123;110及124;110及125;111及112;111及113;111及114;111及115;111及116;111及117;111及118;111及119;111及120;111及121;111及122;111及123;111及124;111及125;112及113;112及114;112及115;112及116;112及117;112及118;112及119;112及120;112及121;112及122;112及123;112及124;112及125;113及114;113及115;113及116;113及117;113及118;113及119;113及120;113及121;113及122;113及123;113及124;113及125;114及115;114及116;114及117;114及118;114及119;114及120;114及121;114及122;114及123;114及124;114及125;115及116;115及117;115及118;115及119;115及120;115及121;115及122;115及123;115及124;115及125;116及117;116及118;116及119;116及120;116及121;116及122;116及123;116及124;116及125;117及118;117及119;117及120;117及121;117及122;117及123;117及124;117及125;118及119;118及120;118及121;118及122;118及123;118及124;118及125;119及120;119及121;119及122;119及123;119及124;119及125;120及121;120及122;120及123;120及124;120及125;121及122;121及123;121及124;121及125;122及123;122及124;122及125;123及124;123及125;或124及125;
b.對於具有SluCas9之外顯子44:SEQ ID NO: 200及201;200及202;200及203;200及204;200及205;200及206;200及207;200及208;201及202;201及203;201及204;201及205;201及206;201及207;201及208;202及203;202及204;202及205;202及206;202及207;202及208;203及204;203及205;203及206;203及207;203及208;204及205;204及206;204及207;204及208;205及206;205及207;205及208;206及207;206及208;207及208;
c.對於具有SaCas9之外顯子50:SEQ ID NO: 148及149;148及150;148及151;148及152;148及153;148及154;148及155;148及156;148及157;148及158;148及159;149及150;149及151;149及152;149及153;149及154;149及155;149及156;149及157;149及158;149及159;150及151;150及152;150及153;150及154;150及155;150及156;150及157;150及158;150及159;151及152;151及153;151及154;151及155;151及156;151及157;151及158;151及159;152及153;152及154;152及155;152及156;152及157;152及158;152及159;153及154;153及155;153及156;153及157;153及158;153及159;154及155;154及156;154及157;154及158;154及159;155及156;155及157;155及158;155及159;156及157;156及158;156及159;157及158;157及159;或158及159;
d.對於具有SluCas9之外顯子50:SEQ ID NO: 231及232;231及233;231及234;231及235;231及236;231及237;231及238;231及239;231及240;231及241;231及242;232及233;232及234;232及235;232及236;232及237;232及238;232及239;232及240;232及241;232及242;233及234;233及235;233及236;233及237;233及238;233及239;233及240;233及241;233及242;234及235;234及236;234及237;234及238;234及239;234及240;234及241;234及242;235及236;235及237;235及238;235及239;235及240;235及241;235及242;236及237;236及238;236及239;236及240;236及241;236及242;237及238;237及239;237及240;237及241;237及242;238及239;238及240;238及241;238及242;239及240;239及241;239及242;240及241;240及242;或241及242;
e.對於具有SaCas9之外顯子53:SEQ ID NO: 16及17;16及18;16及19;16及20;16及21;16及22;16及23;16及24;16及25;16及26;17及18;17及19;17及20;17及21;17及22;17及23;17及24;17及25;17及26;18及19;18及20;18及21;18及22;18及23;18及24;18及25;18及26;19及20;19及21;19及22;19及23;19及24;19及25;19及26;20及21;20及22;20及23;20及24;20及25;20及26;21及22;21及23;21及24;21及25;21及26;22及23;22及24;22及25;22及26;23及24;23及25;23及26;24及25;24及26;25及26;71及72;71及73;71及74;71及75;71及76;71及77;71及78;71及84;71及85;71及86;71及87;71及88;71及89;71及90;71及91;71及92;71及93;71及94;71及95;71及96;71及97;71及98;71及99;71及100;71及101;71及102;72及73;72及74;72及75;72及76;72及77;72及78;72及84;72及85;72及86;72及87;72及88;72及89;72及90;72及91;72及92;72及93;72及94;72及95;72及96;72及97;72及98;72及99;72及100;72及101;72及102;73及74;73及75;73及76;73及77;73及78;73及84;73及85;73及86;73及87;73及88;73及89;73及90;73及91;73及92;73及93;73及94;73及95;73及96;73及97;73及98;73及99;73及100;73及101;73及102;74及75;74及76;74及77;74及78;74及84;74及85;74及86;74及87;74及88;74及89;74及90;74及91;74及92;74及93;74及94;74及95;74及96;74及97;74及98;74及99;74及100;74及101;74及102;75及76;75及77;75及78;75及84;75及85;75及86;75及87;75及88;75及89;75及90;75及91;75及92;75及93;75及94;75及95;75及96;75及97;75及98;75及99;75及100;75及101;75及102;76及77;76及78;76及84;76及85;76及86;76及87;76及88;76及89;76及90;76及91;76及92;76及93;76及94;76及95;76及96;76及97;76及98;76及99;76及100;76及101;76及102;77及78;77及84;77及85;77及86;77及87;77及88;77及89;77及90;77及91;77及92;77及93;77及94;77及95;77及96;77及97;77及98;77及99;77及100;77及101;77及102;78及84;78及85;78及86;78及87;78及88;78及89;78及90;78及91;78及92;78及93;78及94;78及95;78及96;78及97;78及98;78及99;78及100;78及101;78及102;84及85;84及86;84及87;84及88;84及89;84及90;84及91;84及92;84及93;84及94;84及95;84及96;84及97;84及98;84及99;84及100;84及101;84及102;85及86;85及87;85及88;85及89;85及90;85及91;85及92;85及93;85及94;85及95;85及96;85及97;85及98;85及99;85及100;85及101;85及102;86及87;86及88;86及89;86及90;86及91;86及92;86及93;86及94;86及95;86及96;86及97;86及98;86及99;86及100;86及101;86及102;87及88;87及89;87及90;87及91;87及92;87及93;87及94;87及95;87及96;87及97;87及98;87及99;87及100;87及101;87及102;88及89;88及90;88及91;88及92;88及93;88及94;88及95;88及96;88及97;88及98;88及99;88及100;88及101;88及102;89及90;89及91;89及92;89及93;89及94;89及95;89及96;89及97;89及98;89及99;89及100;89及101;89及102;90及91;90及92;90及93;90及94;90及95;90及96;90及97;90及98;90及99;90及100;90及101;90及102;91及92;91及93;91及94;91及95;91及96;91及97;91及98;91及99;91及100;91及101;91及102;92及93;92及94;92及95;92及96;92及97;92及98;92及99;92及100;92及101;92及102;93及94;93及95;93及96;93及97;93及98;93及99;93及100;93及101;93及102;94及95;94及96;94及97;94及98;94及99;94及100;94及101;94及102;95及96;95及97;95及98;95及99;95及100;95及101;95及102;96及97;96及98;96及99;96及100;96及101;96及102;97及98;97及99;97及100;97及101;97及102;98及99;98及100;98及101;98及102;99及100;99及101;99及102;100及101;100及102;或101及102;
f.對於具有SluCas9之外顯子53:SEQ ID NO: 270及271;270及272;270及273;270及274;270及275;270及276;270及277;270及278;270及279;270及280;270及281;270及282;270及283;270及284;270及285;270及286;270及287;270及288;270及289;270及290;270及291;270及292;271及272;271及273;271及274;271及275;271及276;271及277;271及278;271及279;271及280;271及281;271及282;271及283;271及284;271及285;271及286;271及287;271及288;271及289;271及290;271及291;271及292;272及273;272及274;272及275;272及276;272及277;272及278;272及279;272及280;272及281;272及282;272及283;272及284;272及285;272及286;272及287;272及288;272及289;272及290;272及291;272及292;273及274;273及275;273及276;273及277;273及278;273及279;273及280;273及281;273及282;273及283;273及284;273及285;273及286;273及287;273及288;273及289;273及290;273及291;273及292;274及275;274及276;274及277;274及278;274及279;274及280;274及281;274及282;274及283;274及284;274及285;274及286;274及287;274及288;274及289;274及290;274及291;274及292;275及276;275及277;275及278;275及279;275及280;275及281;275及282;275及283;275及284;275及285;275及286;275及287;275及288;275及289;275及290;275及291;275及292;276及277;276及278;276及279;276及280;276及281;276及282;276及283;276及284;276及285;276及286;276及287;276及288;276及289;276及290;276及291;276及292;277及278;277及279;277及280;277及281;277及282;277及283;277及284;277及285;277及286;277及287;277及288;277及289;277及290;277及291;277及292;278及279;278及280;278及281;278及282;278及283;278及284;278及285;278及286;278及287;278及288;278及289;278及290;278及291;278及292;279及280;279及281;279及282;279及283;279及284;279及285;279及286;279及287;279及288;279及289;279及290;279及291;279及292;280及281;280及282;280及283;280及284;280及285;280及286;280及287;280及288;280及289;280及290;280及291;280及292;281及282;281及283;281及284;281及285;281及286;281及287;281及288;281及289;281及290;281及291;281及292;282及283;282及284;282及285;282及286;282及287;282及288;282及289;282及290;282及291;282及292;283及284;283及285;283及286;283及287;283及288;283及289;283及290;283及291;283及292;284及285;284及286;284及287;284及288;284及289;284及290;284及291;284及292;285及286;285及287;285及288;285及289;285及290;285及291;285及292;286及287;286及288;286及289;286及290;286及291;286及292;287及288;287及289;287及290;287及291;287及292;288及289;288及290;288及291;288及292;289及290;289及291;289及292;290及291;290及292;291及292;924及270;924及272;924及273;924及274;924及275;924及276;924及277;924及278;924及279;924及280;924及281;924及282;924及283;924及284;924及285;924及286;924及287;924及288;924及289;924及290;924及291;924及292;925及270;925及272;925及273;925及274;925及275;925及276;925及277;925及278;925及279;925及280;925及281;925及282;925及283;925及284;925及285;925及286;925及287;925及288;925及289;925及290;925及291;925及292;926及270;926及272;926及273;926及274;926及275;926及276;926及277;926及278;926及279;926及280;926及281;926及282;926及283;926及284;926及285;926及286;926及287;926及288;926及289;926及290;926及291;926及292;927及270;927及272;927及273;927及274;927及275;927及276;927及277;927及278;927及279;927及280;927及281;927及282;927及283;927及284;927及285;927及286;927及287;927及288;927及289;927及290;927及291;927及292;928及270;928及272;928及273;928及274;928及275;928及276;928及277;928及278;928及279;928及280;928及281;928及282;928及283;928及284;928及285;928及286;928及287;928及288;928及289;928及290;928及291;928及292;929及270;929及272;929及273;929及274;929及275;929及276;929及277;929及278;929及279;929及280;929及281;929及282;929及283;929及284;929及285;929及286;929及287;929及288;929及289;929及290;929及291;929及292;930及270;930及272;930及273;930及274;930及275;930及276;930及277;930及278;930及279;930及280;930及281;930及282;930及283;930及284;930及285;930及286;930及287;930及288;930及289;930及290;930及291;930及292;931及270;931及272;931及273;931及274;931及275;931及276;931及277;931及278;931及279;931及280;931及281;931及282;931及283;931及284;931及285;931及286;931及287;931及288;931及289;931及290;931及291;931及292;932及270;932及272;932及273;932及274;932及275;932及276;932及277;932及278;932及279;932及280;932及281;932及282;932及283;932及284;932及285;932及286;932及287;932及288;932及289;932及290;932及291;932及292;933及270;933及272;933及273;933及274;933及275;933及276;933及277;933及278;933及279;933及280;933及281;933及282;933及283;933及284;933及285;933及286;933及287;933及288;933及289;933及290;933及291;933及292;934及270;934及272;934及273;934及274;934及275;934及276;934及277;934及278;934及279;934及280;934及281;934及282;934及283;934及284;934及285;934及286;934及287;934及288;934及289;934及290;934及291;934及292;935及270;935及272;935及273;935及274;935及275;935及276;935及277;935及278;935及279;935及280;935及281;935及282;935及283;935及284;935及285;935及286;935及287;935及288;935及289;935及290;935及291;935及292;936及270;936及272;936及273;936及274;936及275;936及276;936及277;936及278;936及279;936及280;936及281;936及282;936及283;936及284;936及285;936及286;936及287;936及288;936及289;936及290;936及291;936及292;937及270;937及272;937及273;937及274;937及275;937及276;937及277;937及278;937及279;937及280;937及281;937及282;937及283;937及284;937及285;937及286;937及287;937及288;937及289;937及290;937及291;937及292;938及270;938及272;938及273;938及274;938及275;938及276;938及277;938及278;938及279;938及280;938及281;938及282;938及283;938及284;938及285;938及286;938及287;938及288;938及289;938及290;938及291;938及292;950及275;951及275;952及275;953及275;954及275;或955及275。
g.對於具有SluCas9之外顯子44:SEQ ID NO: 200及203;200及204;202及203;202及205;202及206;202及207;204及208;204及205;204及206;204及207;或204及208;
h.對於具有SluCas9之外顯子50:SEQ ID NO: 231及232;231及234;231及236;231及237;236及233;236及235;236及238;236及240;或236及241;
i.對於具有SaCas9之外顯子53:SEQ ID NO: 86及96;87及96;88及97;89及96;90及97;92及77;92及78;92及96;92及99;93及98;93及102;94及100;95及77;95及78;95及99;96及100;97及98;97及102;98及73;或102及73;及
j.對於具有SluCas9之外顯子53:SEQ ID NO: 278及290;278及292;281及291;283及290;283及292;287及291;272及290;290及291;或272及292。
實施例3為一種組合物,其包含:一或多個編碼以下之核酸分子:
a.SaCas9或SluCas9;及
b.第一嚮導序列及第二嚮導序列,其中該第一嚮導序列及該第二嚮導序列係選自以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO: 1及SEQ ID NO: 3;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 17;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 18;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 19;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 18;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 19;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 19;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 25;SEQ 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NO: 932;SEQ ID NO: 287及SEQ ID NO: 933;SEQ ID NO: 287及SEQ ID NO: 934;SEQ ID NO: 287及SEQ ID NO: 935;SEQ ID NO: 287及SEQ ID NO: 936;SEQ ID NO: 287及SEQ ID NO: 937;SEQ ID NO: 287及SEQ ID NO: 938;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 924;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 925;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 926;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 927;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 928;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 929;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 930;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 931;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 932;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 933;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 934;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 935;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 936;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 937;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 938;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 924;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 925;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 926;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 927;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 928;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 929;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 930;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 931;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 932;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 933;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 934;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 935;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 936;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 937;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 938;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 924;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 925;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 926;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 927;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 928;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 929;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 930;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 931;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 932;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 933;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 934;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 935;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 936;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 937;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 938;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 924;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 925;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 926;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 927;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 928;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 929;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 930;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 931;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 932;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 933;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 934;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 935;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 936;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 937;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 938;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 924;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 925;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 926;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 927;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 928;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 929;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 930;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 931;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 932;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 933;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 934;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 935;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 936;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 937;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 938;SEQ ID NO: 950及SEQ ID NO: 275;SEQ ID NO: 951及SEQ ID NO: 275;SEQ ID NO: 952及SEQ ID NO: 275;SEQ ID NO: 953及SEQ ID NO: 275;SEQ ID NO: 954及SEQ ID NO: 275;或SEQ ID NO: 955及SEQ ID NO: 275。
實施例4為一種組合物,其包含:
a.單個核酸分子,該核酸分子包含:
i.編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)及至少一個、至少兩個或至少三個嚮導RNA的核酸;或
ii.編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)及一至n個嚮導RNA的核酸,其中n不超過可自該核酸表現之嚮導RNA的最大數目;或
iii.編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)及1、2或3個嚮導RNA的核酸;
其中各嚮導RNA係選自
表 6,視情況其中該組合物包含至少一對嚮導RNA,其中該至少一對係選自
表 1B 、 1D 、 3B 、 3D 、 5B 或 5D中所示之成對;或
b.兩個核酸分子,其包含:
i.編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)的第一核酸;及
1.不編碼SaCas9或SluCas9但編碼以下中之任一者的第二核酸:
2.至少一個、至少兩個、至少三個、至少四個、至少五個或至少六個嚮導RNA;或
3.一至n個嚮導RNA,其中n不超過可自該核酸表現之嚮導RNA的最大數目;或
4.一至六個嚮導RNA;或
ii.編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)的第一核酸;及
1.至少一個、至少兩個或至少三個嚮導RNA;或
2.一至n個嚮導RNA,其中n不超過可自該核酸表現之嚮導RNA的最大數目;或
3. 1、2或3個嚮導RNA;及
不編碼SaCas9或SluCas9的第二核酸,視情況其中該第二核酸包含以下中之任一者:
1.至少一個、至少兩個、至少三個、至少四個、至少五個或至少六個嚮導RNA;或
2.一至n個嚮導RNA,其中n不超過可自該核酸表現之嚮導RNA的最大數目;或
3.一至六個嚮導RNA;或
iii.編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)及至少一個、至少兩個或至少三個嚮導RNA的第一核酸;及
不編碼SaCas9或SluCas9但編碼一至六個嚮導RNA的第二核酸;或
iv.編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)及至少兩個嚮導RNA之第一核酸,其中該至少兩個嚮導RNA之第一嚮導RNA結合在目標序列之上游且該至少兩個嚮導RNA之第二嚮導RNA結合在該目標序列之下游;及
不編碼SaCas9或SluCas9但編碼該第一核酸中所編碼之各嚮導RNA之至少一個其他複本的第二核酸;
其中各嚮導RNA係選自
表 6,視情況其中該組合物包含至少一對嚮導RNA,其中該至少一對係選自
表 1B 、 1D 、 3B 、 3D 、 5B 或 5D中所示之成對。
實施例5為如實施例1至4中任一項之組合物,其包含一對嚮導RNA,其中該成對嚮導RNA能夠自DMD基因中切除DNA片段;其中該DNA片段之長度在5至250個核苷酸之間。
實施例6為如實施例5之組合物,其中切除的DNA片段不包含該DMD基因之完整外顯子。
實施例7為一種組合物,其包含編碼一對嚮導RNA及Cas9的單個核酸分子,其中該單個核酸分子包含:
a.編碼該成對嚮導RNA之第一核酸,其中該成對嚮導RNA包含以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO: 1及3;16及17;16及18;16及19;16及20;16及21;16及22;16及23;16及24;16及25;16及26;17及18;17及19;17及20;17及21;17及22;17及23;17及24;17及25;17及26;18及19;18及20;18及21;18及22;18及23;18及24;18及25;18及26;19及20;19及21;19及22;19及23;19及24;19及25;19及26;20及21;20及22;20及23;20及24;20及25;20及26;21及22;21及23;21及24;21及25;21及26;22及23;22及24;22及25;22及26;23及24;23及25;23及26;24及25;24及26;25及26;110及120;110及121;110及122;110及123;110及124;110及125;111及112;111及113;111及114;111及115;111及116;111及117;111及118;111及119;111及120;111及121;111及122;111及123;111及124;111及125;112及113;112及114;112及115;112及116;112及117;112及118;112及119;112及120;112及121;112及122;112及123;112及124;112及125;113及114;113及115;113及116;113及117;113及118;113及119;113及120;113及121;113及122;113及123;113及124;113及125;114及115;114及116;114及117;114及118;114及119;114及120;114及121;114及122;114及123;114及124;114及125;115及116;115及117;115及118;115及119;115及120;115及121;115及122;115及123;115及124;115及125;116及117;116及118;116及119;116及120;116及121;116及122;116及123;116及124;116及125;117及118;117及119;117及120;117及121;117及122;117及123;117及124;117及125;118及119;118及120;118及121;118及122;118及123;118及124;118及125;119及120;119及121;119及122;119及123;119及124;119及125;120及121;120及122;120及123;120及124;120及125;121及122;121及123;121及124;121及125;122及123;122及124;122及125;123及124;123及125;124及125;148及149;148及150;148及151;148及152;148及153;148及154;148及155;148及156;148及157;148及158;148及159;149及150;149及151;149及152;149及153;149及154;149及155;149及156;149及157;149及158;149及159;150及151;150及152;150及153;150及154;150及155;150及156;150及157;150及158;150及159;151及152;151及153;151及154;151及155;151及156;151及157;151及158;151及159;152及153;152及154;152及155;152及156;152及157;152及158;152及159;153及154;153及155;153及156;153及157;153及158;153及159;154及155;154及156;154及157;154及158;154及159;155及156;155及157;155及158;155及159;156及157;156及158;156及159;157及158;157及159;158及159;71及72;71及73;71及74;71及75;71及76;71及77;71及78;71及84;71及85;71及86;71及87;71及88;71及89;71及90;71及91;71及92;71及93;71及94;71及95;71及96;71及97;71及98;71及99;71及100;71及101;71及102;72及73;72及74;72及75;72及76;72及77;72及78;72及84;72及85;72及86;72及87;72及88;72及89;72及90;72及91;72及92;72及93;72及94;72及95;72及96;72及97;72及98;72及99;72及100;72及101;72及102;73及74;73及75;73及76;73及77;73及78;73及84;73及85;73及86;73及87;73及88;73及89;73及90;73及91;73及92;73及93;73及94;73及95;73及96;73及97;73及98;73及99;73及100;73及101;73及102;74及75;74及76;74及77;74及78;74及84;74及85;74及86;74及87;74及88;74及89;74及90;74及91;74及92;74及93;74及94;74及95;74及96;74及97;74及98;74及99;74及100;74及101;74及102;75及76;75及77;75及78;75及84;75及85;75及86;75及87;75及88;75及89;75及90;75及91;75及92;75及93;75及94;75及95;75及96;75及97;75及98;75及99;75及100;75及101;75及102;76及77;76及78;76及84;76及85;76及86;76及87;76及88;76及89;76及90;76及91;76及92;76及93;76及94;76及95;76及96;76及97;76及98;76及99;76及100;76及101;76及102;77及78;77及84;77及85;77及86;77及87;77及88;77及89;77及90;77及91;77及92;77及93;77及94;77及95;77及96;77及97;77及98;77及99;77及100;77及101;77及102;78及84;78及85;78及86;78及87;78及88;78及89;78及90;78及91;78及92;78及93;78及94;78及95;78及96;78及97;78及98;78及99;78及100;78及101;78及102;84及85;84及86;84及87;84及88;84及89;84及90;84及91;84及92;84及93;84及94;84及95;84及96;84及97;84及98;84及99;84及100;84及101;84及102;85及86;85及87;85及88;85及89;85及90;85及91;85及92;85及93;85及94;85及95;85及96;85及97;85及98;85及99;85及100;85及101;85及102;86及87;86及88;86及89;86及90;86及91;86及92;86及93;86及94;86及95;86及96;86及97;86及98;86及99;86及100;86及101;86及102;87及88;87及89;87及90;87及91;87及92;87及93;87及94;87及95;87及96;87及97;87及98;87及99;87及100;87及101;87及102;88及89;88及90;88及91;88及92;88及93;88及94;88及95;88及96;88及97;88及98;88及99;88及100;88及101;88及102;89及90;89及91;89及92;89及93;89及94;89及95;89及96;89及97;89及98;89及99;89及100;89及101;89及102;90及91;90及92;90及93;90及94;90及95;90及96;90及97;90及98;90及99;90及100;90及101;90及102;91及92;91及93;91及94;91及95;91及96;91及97;91及98;91及99;91及100;91及101;91及102;92及93;92及94;92及95;92及96;92及97;92及98;92及99;92及100;92及101;92及102;93及94;93及95;93及96;93及97;93及98;93及99;93及100;93及101;93及102;94及95;94及96;94及97;94及98;94及99;94及100;94及101;94及102;95及96;95及97;95及98;95及99;95及100;95及101;95及102;96及97;96及98;96及99;96及100;96及101;96及102;97及98;97及99;97及100;97及101;97及102;98及99;98及100;98及101;98及102;99及100;99及101;99及102;100及101;100及102;或101及102;及編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)的第二核酸;或
b.編碼一對嚮導RNA之第一核酸,其中該成對嚮導RNA包含以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO:200及201;200及202;200及203;200及204;200及205;200及206;200及207;200及208;201及202;201及203;201及204;201及205;201及206;201及207;201及208;202及203;202及204;202及205;202及206;202及207;202及208;203及204;203及205;203及206;203及207;203及208;204及205;204及206;204及207;204及208;205及206;205及207;205及208;206及207;206及208;207及208;231及232;231及233;231及234;231及235;231及236;231及237;231及238;231及239;231及240;231及241;231及242;232及233;232及234;232及235;232及236;232及237;232及238;232及239;232及240;232及241;232及242;233及234;233及235;233及236;233及237;233及238;233及239;233及240;233及241;233及242;234及235;234及236;234及237;234及238;234及239;234及240;234及241;234及242;235及236;235及237;235及238;235及239;235及240;235及241;235及242;236及237;236及238;236及239;236及240;236及241;236及242;237及238;237及239;237及240;237及241;237及242;238及239;238及240;238及241;238及242;239及240;239及241;239及242;240及241;240及242;241及242;270及271;270及272;270及273;270及274;270及275;270及276;270及277;270及278;270及279;270及280;270及281;270及282;270及283;270及284;270及285;270及286;270及287;270及288;270及289;270及290;270及291;270及292;271及272;271及273;271及274;271及275;271及276;271及277;271及278;271及279;271及280;271及281;271及282;271及283;271及284;271及285;271及286;271及287;271及288;271及289;271及290;271及291;271及292;272及273;272及274;272及275;272及276;272及277;272及278;272及279;272及280;272及281;272及282;272及283;272及284;272及285;272及286;272及287;272及288;272及289;272及290;272及291;272及292;273及274;273及275;273及276;273及277;273及278;273及279;273及280;273及281;273及282;273及283;273及284;273及285;273及286;273及287;273及288;273及289;273及290;273及291;273及292;274及275;274及276;274及277;274及278;274及279;274及280;274及281;274及282;274及283;274及284;274及285;274及286;274及287;274及288;274及289;274及290;274及291;274及292;275及276;275及277;275及278;275及279;275及280;275及281;275及282;275及283;275及284;275及285;275及286;275及287;275及288;275及289;275及290;275及291;275及292;276及277;276及278;276及279;276及280;276及281;276及282;276及283;276及284;276及285;276及286;276及287;276及288;276及289;276及290;276及291;276及292;277及278;277及279;277及280;277及281;277及282;277及283;277及284;277及285;277及286;277及287;277及288;277及289;277及290;277及291;277及292;278及279;278及280;278及281;278及282;278及283;278及284;278及285;278及286;278及287;278及288;278及289;278及290;278及291;278及292;279及280;279及281;279及282;279及283;279及284;279及285;279及286;279及287;279及288;279及289;279及290;279及291;279及292;280及281;280及282;280及283;280及284;280及285;280及286;280及287;280及288;280及289;280及290;280及291;280及292;281及282;281及283;281及284;281及285;281及286;281及287;281及288;281及289;281及290;281及291;281及292;282及283;282及284;282及285;282及286;282及287;282及288;282及289;282及290;282及291;282及292;283及284;283及285;283及286;283及287;283及288;283及289;283及290;283及291;283及292;284及285;284及286;284及287;284及288;284及289;284及290;284及291;284及292;285及286;285及287;285及288;285及289;285及290;285及291;285及292;286及287;286及288;286及289;286及290;286及291;286及292;287及288;287及289;287及290;287及291;287及292;288及289;288及290;288及291;288及292;289及290;289及291;289及292;290及291;290及292;291及292;924及270;924及272;924及273;924及274;924及275;924及276;924及277;924及278;924及279;924及280;924及281;924及282;924及283;924及284;924及285;924及286;924及287;924及288;924及289;924及290;924及291;924及292;925及270;925及272;925及273;925及274;925及275;925及276;925及277;925及278;925及279;925及280;925及281;925及282;925及283;925及284;925及285;925及286;925及287;925及288;925及289;925及290;925及291;925及292;926及270;926及272;926及273;926及274;926及275;926及276;926及277;926及278;926及279;926及280;926及281;926及282;926及283;926及284;926及285;926及286;926及287;926及288;926及289;926及290;926及291;926及292;927及270;927及272;927及273;927及274;927及275;927及276;927及277;927及278;927及279;927及280;927及281;927及282;927及283;927及284;927及285;927及286;927及287;927及288;927及289;927及290;927及291;927及292;928及270;928及272;928及273;928及274;928及275;928及276;928及277;928及278;928及279;928及280;928及281;928及282;928及283;928及284;928及285;928及286;928及287;928及288;928及289;928及290;928及291;928及292;929及270;929及272;929及273;929及274;929及275;929及276;929及277;929及278;929及279;929及280;929及281;929及282;929及283;929及284;929及285;929及286;929及287;929及288;929及289;929及290;929及291;929及292;930及270;930及272;930及273;930及274;930及275;930及276;930及277;930及278;930及279;930及280;930及281;930及282;930及283;930及284;930及285;930及286;930及287;930及288;930及289;930及290;930及291;930及292;931及270;931及272;931及273;931及274;931及275;931及276;931及277;931及278;931及279;931及280;931及281;931及282;931及283;931及284;931及285;931及286;931及287;931及288;931及289;931及290;931及291;931及292;932及270;932及272;932及273;932及274;932及275;932及276;932及277;932及278;932及279;932及280;932及281;932及282;932及283;932及284;932及285;932及286;932及287;932及288;932及289;932及290;932及291;932及292;933及270;933及272;933及273;933及274;933及275;933及276;933及277;933及278;933及279;933及280;933及281;933及282;933及283;933及284;933及285;933及286;933及287;933及288;933及289;933及290;933及291;933及292;934及270;934及272;934及273;934及274;934及275;934及276;934及277;934及278;934及279;934及280;934及281;934及282;934及283;934及284;934及285;934及286;934及287;934及288;934及289;934及290;934及291;934及292;935及270;935及272;935及273;935及274;935及275;935及276;935及277;935及278;935及279;935及280;935及281;935及282;935及283;935及284;935及285;935及286;935及287;935及288;935及289;935及290;935及291;935及292;936及270;936及272;936及273;936及274;936及275;936及276;936及277;936及278;936及279;936及280;936及281;936及282;936及283;936及284;936及285;936及286;936及287;936及288;936及289;936及290;936及291;936及292;937及270;937及272;937及273;937及274;937及275;937及276;937及277;937及278;937及279;937及280;937及281;937及282;937及283;937及284;937及285;937及286;937及287;937及288;937及289;937及290;937及291;937及292;938及270;938及272;938及273;938及274;938及275;938及276;938及277;938及278;938及279;938及280;938及281;938及282;938及283;938及284;938及285;938及286;938及287;938及288;938及289;938及290;938及291;938及292;950及275;951及275;952及275;953及275;954及275;或955及275;及編碼路鄧葡萄球菌(SluCas9)之第二核酸;或
c.編碼一對嚮導RNA之第一核酸,其中該成對嚮導RNA包含靶向外顯子44之以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO: 200及203;200及204;202及203;202及205;202及206;202及207;204及208;204及205;204及206;204及207;或204及208;及編碼路鄧葡萄球菌(SluCas9)之第二核酸;或
d.編碼一對嚮導RNA之第一核酸,其中該成對嚮導RNA包含靶向外顯子50之以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO: 231及232;231及234;231及236;231及237;236及233;236及235;236及238;236及240;或236及241;及編碼路鄧葡萄球菌(SluCas9)之第二核酸;或
e.編碼一對嚮導RNA之第一核酸,其中該成對嚮導RNA包含靶向外顯子53之以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO: 86及96;87及96;88及97;89及96;90及97;92及77;92及78;92及96;92及99;93及98;93及102;94及100;95及77;95及78;95及99;96及100;97及98;97及102;98及73;或102及73;及編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)的第二核酸;或
f.編碼一對嚮導RNA之第一核酸,其中該成對嚮導RNA包含靶向外顯子53之以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO: 278及290;278及292;281及291;283及290;283及292;287及291;272及290;290及291;或272及292;及編碼路鄧葡萄球菌(SluCas9)之第二核酸。
實施例8為一種組合物,其包含一或多個編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)及第一嚮導RNA及第二嚮導RNA之核酸分子,其中該第一嚮導RNA及該第二嚮導RNA靶向DMD基因中之不同序列,且其中該第一嚮導RNA及該第二嚮導RNA各自包含與選自以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者的第一嚮導序列及第二嚮導序列至少90%一致的序列:
靶向外顯子53之以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者:SEQ ID NO: 86及96;87及96;88及97;89及96;90及97;92及77;92及78;92及96;92及99;93及98;93及102;94及100;95及77;95及78;95及99;96及100;97及98;97及102;98及73;或102及73。
實施例9為一種組合物,其包含一或多個編碼路鄧葡萄球菌(SluCas9)及第一嚮導RNA及第二嚮導RNA之核酸分子,其中該第一嚮導RNA及該第二嚮導RNA靶向DMD基因中之不同序列,且其中該第一嚮導RNA及該第二嚮導RNA各自包含與選自以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者的第一嚮導序列及第二嚮導序列至少90%一致的序列:
a.靶向外顯子44之以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者:SEQ ID NO: 200及203;200及204;202及203;202及205;202及206;202及207;204及208;204及205;204及206;204及207;或204及208;
b.靶向外顯子50之以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者:SEQ ID NO: 231及232;231及234;231及236;231及237;236及233;236及235;236及238;236及240;或236及241;
c.靶向外顯子53之以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者:SEQ ID NO: 278及290;278及292;281及291;283及290;283及292;287及291;272及290;290及291;或272及292。
實施例10為一種組合物,其包含一或多個編碼核酸內切酶及至少兩個嚮導RNA之核酸分子,其中該至少兩個嚮導RNA各自靶向DMD基因中之不同序列,且其中該至少兩個嚮導RNA各自包含與選自以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者之第一嚮導序列及第二嚮導序列至少90%一致的序列:
a.對於外顯子44:SEQ ID NO: 1及3;110及120;110及121;110及122;110及123;110及124;110及125;111及112;111及113;111及114;111及115;111及116;111及117;111及118;111及119;111及120;111及121;111及122;111及123;111及124;111及125;112及113;112及114;112及115;112及116;112及117;112及118;112及119;112及120;112及121;112及122;112及123;112及124;112及125;113及114;113及115;113及116;113及117;113及118;113及119;113及120;113及121;113及122;113及123;113及124;113及125;114及115;114及116;114及117;114及118;114及119;114及120;114及121;114及122;114及123;114及124;114及125;115及116;115及117;115及118;115及119;115及120;115及121;115及122;115及123;115及124;115及125;116及117;116及118;116及119;116及120;116及121;116及122;116及123;116及124;116及125;117及118;117及119;117及120;117及121;117及122;117及123;117及124;117及125;118及119;118及120;118及121;118及122;118及123;118及124;118及125;119及120;119及121;119及122;119及123;119及124;119及125;120及121;120及122;120及123;120及124;120及125;121及122;121及123;121及124;121及125;122及123;122及124;122及125;123及124;123及125;或124及125;
b.對於外顯子50:SEQ ID NO: 148及149;148及150;148及151;148及152;148及153;148及154;148及155;148及156;148及157;148及158;148及159;149及150;149及151;149及152;149及153;149及154;149及155;149及156;149及157;149及158;149及159;150及151;150及152;150及153;150及154;150及155;150及156;150及157;150及158;150及159;151及152;151及153;151及154;151及155;151及156;151及157;151及158;151及159;152及153;152及154;152及155;152及156;152及157;152及158;152及159;153及154;153及155;153及156;153及157;153及158;153及159;154及155;154及156;154及157;154及158;154及159;155及156;155及157;155及158;155及159;156及157;156及158;156及159;157及158;157及159;或158及159;
c.對於外顯子53:SEQ ID NO: 16及17;16及18;16及19;16及20;16及21;16及22;16及23;16及24;16及25;16及26;17及18;17及19;17及20;17及21;17及22;17及23;17及24;17及25;17及26;18及19;18及20;18及21;18及22;18及23;18及24;18及25;18及26;19及20;19及21;19及22;19及23;19及24;19及25;19及26;20及21;20及22;20及23;20及24;20及25;20及26;21及22;21及23;21及24;21及25;21及26;22及23;22及24;22及25;22及26;23及24;23及25;23及26;24及25;24及26;25及26;71及72;71及73;71及74;71及75;71及76;71及77;71及78;71及84;71及85;71及86;71及87;71及88;71及89;71及90;71及91;71及92;71及93;71及94;71及95;71及96;71及97;71及98;71及99;71及100;71及101;71及102;72及73;72及74;72及75;72及76;72及77;72及78;72及84;72及85;72及86;72及87;72及88;72及89;72及90;72及91;72及92;72及93;72及94;72及95;72及96;72及97;72及98;72及99;72及100;72及101;72及102;73及74;73及75;73及76;73及77;73及78;73及84;73及85;73及86;73及87;73及88;73及89;73及90;73及91;73及92;73及93;73及94;73及95;73及96;73及97;73及98;73及99;73及100;73及101;73及102;74及75;74及76;74及77;74及78;74及84;74及85;74及86;74及87;74及88;74及89;74及90;74及91;74及92;74及93;74及94;74及95;74及96;74及97;74及98;74及99;74及100;74及101;74及102;75及76;75及77;75及78;75及84;75及85;75及86;75及87;75及88;75及89;75及90;75及91;75及92;75及93;75及94;75及95;75及96;75及97;75及98;75及99;75及100;75及101;75及102;76及77;76及78;76及84;76及85;76及86;76及87;76及88;76及89;76及90;76及91;76及92;76及93;76及94;76及95;76及96;76及97;76及98;76及99;76及100;76及101;76及102;77及78;77及84;77及85;77及86;77及87;77及88;77及89;77及90;77及91;77及92;77及93;77及94;77及95;77及96;77及97;77及98;77及99;77及100;77及101;77及102;78及84;78及85;78及86;78及87;78及88;78及89;78及90;78及91;78及92;78及93;78及94;78及95;78及96;78及97;78及98;78及99;78及100;78及101;78及102;84及85;84及86;84及87;84及88;84及89;84及90;84及91;84及92;84及93;84及94;84及95;84及96;84及97;84及98;84及99;84及100;84及101;84及102;85及86;85及87;85及88;85及89;85及90;85及91;85及92;85及93;85及94;85及95;85及96;85及97;85及98;85及99;85及100;85及101;85及102;86及87;86及88;86及89;86及90;86及91;86及92;86及93;86及94;86及95;86及96;86及97;86及98;86及99;86及100;86及101;86及102;87及88;87及89;87及90;87及91;87及92;87及93;87及94;87及95;87及96;87及97;87及98;87及99;87及100;87及101;87及102;88及89;88及90;88及91;88及92;88及93;88及94;88及95;88及96;88及97;88及98;88及99;88及100;88及101;88及102;89及90;89及91;89及92;89及93;89及94;89及95;89及96;89及97;89及98;89及99;89及100;89及101;89及102;90及91;90及92;90及93;90及94;90及95;90及96;90及97;90及98;90及99;90及100;90及101;90及102;91及92;91及93;91及94;91及95;91及96;91及97;91及98;91及99;91及100;91及101;91及102;92及93;92及94;92及95;92及96;92及97;92及98;92及99;92及100;92及101;92及102;93及94;93及95;93及96;93及97;93及98;93及99;93及100;93及101;93及102;94及95;94及96;94及97;94及98;94及99;94及100;94及101;94及102;95及96;95及97;95及98;95及99;95及100;95及101;95及102;96及97;96及98;96及99;96及100;96及101;96及102;97及98;97及99;97及100;97及101;97及102;98及99;98及100;98及101;98及102;99及100;99及101;99及102;100及101;100及102;或101及102;及
編碼SaCas9之第二核酸。
實施例11為一種組合物,其包含第一核酸分子及第二核酸分子,其中該第一核酸分子編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)核酸內切酶及視情況第一嚮導RNA或第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,且該第二核酸分子包含第一嚮導RNA或第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,其中該第一嚮導RNA包含來自以下成對之第一序列及第二序列中之任一者的第一序列且該第二嚮導RNA包含來自以下成對之第一序列及第二序列中之任一者的第二序列:SEQ ID NO: 1及3;16及17;16及18;16及19;16及20;16及21;16及22;16及23;16及24;16及25;16及26;17及18;17及19;17及20;17及21;17及22;17及23;17及24;17及25;17及26;18及19;18及20;18及21;18及22;18及23;18及24;18及25;18及26;19及20;19及21;19及22;19及23;19及24;19及25;19及26;20及21;20及22;20及23;20及24;20及25;20及26;21及22;21及23;21及24;21及25;21及26;22及23;22及24;22及25;22及26;23及24;23及25;23及26;24及25;24及26;25及26;110及120;110及121;110及122;110及123;110及124;110及125;111及112;111及113;111及114;111及115;111及116;111及117;111及118;111及119;111及120;111及121;111及122;111及123;111及124;111及125;112及113;112及114;112及115;112及116;112及117;112及118;112及119;112及120;112及121;112及122;112及123;112及124;112及125;113及114;113及115;113及116;113及117;113及118;113及119;113及120;113及121;113及122;113及123;113及124;113及125;114及115;114及116;114及117;114及118;114及119;114及120;114及121;114及122;114及123;114及124;114及125;115及116;115及117;115及118;115及119;115及120;115及121;115及122;115及123;115及124;115及125;116及117;116及118;116及119;116及120;116及121;116及122;116及123;116及124;116及125;117及118;117及119;117及120;117及121;117及122;117及123;117及124;117及125;118及119;118及120;118及121;118及122;118及123;118及124;118及125;119及120;119及121;119及122;119及123;119及124;119及125;120及121;120及122;120及123;120及124;120及125;121及122;121及123;121及124;121及125;122及123;122及124;122及125;123及124;123及125;124及125;148及149;148及150;148及151;148及152;148及153;148及154;148及155;148及156;148及157;148及158;148及159;149及150;149及151;149及152;149及153;149及154;149及155;149及156;149及157;149及158;149及159;150及151;150及152;150及153;150及154;150及155;150及156;150及157;150及158;150及159;151及152;151及153;151及154;151及155;151及156;151及157;151及158;151及159;152及153;152及154;152及155;152及156;152及157;152及158;152及159;153及154;153及155;153及156;153及157;153及158;153及159;154及155;154及156;154及157;154及158;154及159;155及156;155及157;155及158;155及159;156及157;156及158;156及159;157及158;157及159;158及159;71及72;71及73;71及74;71及75;71及76;71及77;71及78;71及84;71及85;71及86;71及87;71及88;71及89;71及90;71及91;71及92;71及93;71及94;71及95;71及96;71及97;71及98;71及99;71及100;71及101;71及102;72及73;72及74;72及75;72及76;72及77;72及78;72及84;72及85;72及86;72及87;72及88;72及89;72及90;72及91;72及92;72及93;72及94;72及95;72及96;72及97;72及98;72及99;72及100;72及101;72及102;73及74;73及75;73及76;73及77;73及78;73及84;73及85;73及86;73及87;73及88;73及89;73及90;73及91;73及92;73及93;73及94;73及95;73及96;73及97;73及98;73及99;73及100;73及101;73及102;74及75;74及76;74及77;74及78;74及84;74及85;74及86;74及87;74及88;74及89;74及90;74及91;74及92;74及93;74及94;74及95;74及96;74及97;74及98;74及99;74及100;74及101;74及102;75及76;75及77;75及78;75及84;75及85;75及86;75及87;75及88;75及89;75及90;75及91;75及92;75及93;75及94;75及95;75及96;75及97;75及98;75及99;75及100;75及101;75及102;76及77;76及78;76及84;76及85;76及86;76及87;76及88;76及89;76及90;76及91;76及92;76及93;76及94;76及95;76及96;76及97;76及98;76及99;76及100;76及101;76及102;77及78;77及84;77及85;77及86;77及87;77及88;77及89;77及90;77及91;77及92;77及93;77及94;77及95;77及96;77及97;77及98;77及99;77及100;77及101;77及102;78及84;78及85;78及86;78及87;78及88;78及89;78及90;78及91;78及92;78及93;78及94;78及95;78及96;78及97;78及98;78及99;78及100;78及101;78及102;84及85;84及86;84及87;84及88;84及89;84及90;84及91;84及92;84及93;84及94;84及95;84及96;84及97;84及98;84及99;84及100;84及101;84及102;85及86;85及87;85及88;85及89;85及90;85及91;85及92;85及93;85及94;85及95;85及96;85及97;85及98;85及99;85及100;85及101;85及102;86及87;86及88;86及89;86及90;86及91;86及92;86及93;86及94;86及95;86及96;86及97;86及98;86及99;86及100;86及101;86及102;87及88;87及89;87及90;87及91;87及92;87及93;87及94;87及95;87及96;87及97;87及98;87及99;87及100;87及101;87及102;88及89;88及90;88及91;88及92;88及93;88及94;88及95;88及96;88及97;88及98;88及99;88及100;88及101;88及102;89及90;89及91;89及92;89及93;89及94;89及95;89及96;89及97;89及98;89及99;89及100;89及101;89及102;90及91;90及92;90及93;90及94;90及95;90及96;90及97;90及98;90及99;90及100;90及101;90及102;91及92;91及93;91及94;91及95;91及96;91及97;91及98;91及99;91及100;91及101;91及102;92及93;92及94;92及95;92及96;92及97;92及98;92及99;92及100;92及101;92及102;93及94;93及95;93及96;93及97;93及98;93及99;93及100;93及101;93及102;94及95;94及96;94及97;94及98;94及99;94及100;94及101;94及102;95及96;95及97;95及98;95及99;95及100;95及101;95及102;96及97;96及98;96及99;96及100;96及101;96及102;97及98;97及99;97及100;97及101;97及102;98及99;98及100;98及101;98及102;99及100;99及101;99及102;100及101;100及102;或101及102。
實施例12為一種組合物,其包含第一核酸分子及第二核酸分子,其中該第一核酸分子編碼路鄧葡萄球菌(SluCas9)核酸內切酶及視情況第一嚮導RNA或第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,且該第二核酸分子包含第一嚮導RNA或第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,其中該第一嚮導RNA包含來自以下成對之第一序列及第二序列中之任一者的第一序列且該第二嚮導RNA包含來自以下成對之第一序列及第二序列中之任一者的第二序列:SEQ ID NO: 200及201;200及202;200及203;200及204;200及205;200及206;200及207;200及208;201及202;201及203;201及204;201及205;201及206;201及207;201及208;202及203;202及204;202及205;202及206;202及207;202及208;203及204;203及205;203及206;203及207;203及208;204及205;204及206;204及207;204及208;205及206;205及207;205及208;206及207;206及208;207及208;231及232;231及233;231及234;231及235;231及236;231及237;231及238;231及239;231及240;231及241;231及242;232及233;232及234;232及235;232及236;232及237;232及238;232及239;232及240;232及241;232及242;233及234;233及235;233及236;233及237;233及238;233及239;233及240;233及241;233及242;234及235;234及236;234及237;234及238;234及239;234及240;234及241;234及242;235及236;235及237;235及238;235及239;235及240;235及241;235及242;236及237;236及238;236及239;236及240;236及241;236及242;237及238;237及239;237及240;237及241;237及242;238及239;238及240;238及241;238及242;239及240;239及241;239及242;240及241;240及242;241及242;270及271;270及272;270及273;270及274;270及275;270及276;270及277;270及278;270及279;270及280;270及281;270及282;270及283;270及284;270及285;270及286;270及287;270及288;270及289;270及290;270及291;270及292;271及272;271及273;271及274;271及275;271及276;271及277;271及278;271及279;271及280;271及281;271及282;271及283;271及284;271及285;271及286;271及287;271及288;271及289;271及290;271及291;271及292;272及273;272及274;272及275;272及276;272及277;272及278;272及279;272及280;272及281;272及282;272及283;272及284;272及285;272及286;272及287;272及288;272及289;272及290;272及291;272及292;273及274;273及275;273及276;273及277;273及278;273及279;273及280;273及281;273及282;273及283;273及284;273及285;273及286;273及287;273及288;273及289;273及290;273及291;273及292;274及275;274及276;274及277;274及278;274及279;274及280;274及281;274及282;274及283;274及284;274及285;274及286;274及287;274及288;274及289;274及290;274及291;274及292;275及276;275及277;275及278;275及279;275及280;275及281;275及282;275及283;275及284;275及285;275及286;275及287;275及288;275及289;275及290;275及291;275及292;276及277;276及278;276及279;276及280;276及281;276及282;276及283;276及284;276及285;276及286;276及287;276及288;276及289;276及290;276及291;276及292;277及278;277及279;277及280;277及281;277及282;277及283;277及284;277及285;277及286;277及287;277及288;277及289;277及290;277及291;277及292;278及279;278及280;278及281;278及282;278及283;278及284;278及285;278及286;278及287;278及288;278及289;278及290;278及291;278及292;279及280;279及281;279及282;279及283;279及284;279及285;279及286;279及287;279及288;279及289;279及290;279及291;279及292;280及281;280及282;280及283;280及284;280及285;280及286;280及287;280及288;280及289;280及290;280及291;280及292;281及282;281及283;281及284;281及285;281及286;281及287;281及288;281及289;281及290;281及291;281及292;282及283;282及284;282及285;282及286;282及287;282及288;282及289;282及290;282及291;282及292;283及284;283及285;283及286;283及287;283及288;283及289;283及290;283及291;283及292;284及285;284及286;284及287;284及288;284及289;284及290;284及291;284及292;285及286;285及287;285及288;285及289;285及290;285及291;285及292;286及287;286及288;286及289;286及290;286及291;286及292;287及288;287及289;287及290;287及291;287及292;288及289;288及290;288及291;288及292;289及290;289及291;289及292;290及291;290及292;291及292;924及270;924及272;924及273;924及274;924及275;924及276;924及277;924及278;924及279;924及280;924及281;924及282;924及283;924及284;924及285;924及286;924及287;924及288;924及289;924及290;924及291;924及292;925及270;925及272;925及273;925及274;925及275;925及276;925及277;925及278;925及279;925及280;925及281;925及282;925及283;925及284;925及285;925及286;925及287;925及288;925及289;925及290;925及291;925及292;926及270;926及272;926及273;926及274;926及275;926及276;926及277;926及278;926及279;926及280;926及281;926及282;926及283;926及284;926及285;926及286;926及287;926及288;926及289;926及290;926及291;926及292;927及270;927及272;927及273;927及274;927及275;927及276;927及277;927及278;927及279;927及280;927及281;927及282;927及283;927及284;927及285;927及286;927及287;927及288;927及289;927及290;927及291;927及292;928及270;928及272;928及273;928及274;928及275;928及276;928及277;928及278;928及279;928及280;928及281;928及282;928及283;928及284;928及285;928及286;928及287;928及288;928及289;928及290;928及291;928及292;929及270;929及272;929及273;929及274;929及275;929及276;929及277;929及278;929及279;929及280;929及281;929及282;929及283;929及284;929及285;929及286;929及287;929及288;929及289;929及290;929及291;929及292;930及270;930及272;930及273;930及274;930及275;930及276;930及277;930及278;930及279;930及280;930及281;930及282;930及283;930及284;930及285;930及286;930及287;930及288;930及289;930及290;930及291;930及292;931及270;931及272;931及273;931及274;931及275;931及276;931及277;931及278;931及279;931及280;931及281;931及282;931及283;931及284;931及285;931及286;931及287;931及288;931及289;931及290;931及291;931及292;932及270;932及272;932及273;932及274;932及275;932及276;932及277;932及278;932及279;932及280;932及281;932及282;932及283;932及284;932及285;932及286;932及287;932及288;932及289;932及290;932及291;932及292;933及270;933及272;933及273;933及274;933及275;933及276;933及277;933及278;933及279;933及280;933及281;933及282;933及283;933及284;933及285;933及286;933及287;933及288;933及289;933及290;933及291;933及292;934及270;934及272;934及273;934及274;934及275;934及276;934及277;934及278;934及279;934及280;934及281;934及282;934及283;934及284;934及285;934及286;934及287;934及288;934及289;934及290;934及291;934及292;935及270;935及272;935及273;935及274;935及275;935及276;935及277;935及278;935及279;935及280;935及281;935及282;935及283;935及284;935及285;935及286;935及287;935及288;935及289;935及290;935及291;935及292;936及270;936及272;936及273;936及274;936及275;936及276;936及277;936及278;936及279;936及280;936及281;936及282;936及283;936及284;936及285;936及286;936及287;936及288;936及289;936及290;936及291;936及292;937及270;937及272;937及273;937及274;937及275;937及276;937及277;937及278;937及279;937及280;937及281;937及282;937及283;937及284;937及285;937及286;937及287;937及288;937及289;937及290;937及291;937及292;938及270;938及272;938及273;938及274;938及275;938及276;938及277;938及278;938及279;938及280;938及281;938及282;938及283;938及284;938及285;938及286;938及287;938及288;938及289;938及290;938及291;938及292;950及275;951及275;952及275;953及275;954及275;或955及275。
實施例13為一種組合物,其包含第一核酸分子及第二核酸分子,其中該第一核酸分子編碼sRGN核酸內切酶(例如,sRGN3.1、sRGN3.3或sRGN4)及視情況第一嚮導RNA或第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,且該第二核酸分子包含第一嚮導RNA或第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,其中該第一嚮導RNA包含來自以下成對之第一序列及第二序列中之任一者的第一序列且該第二嚮導RNA包含來自以下成對之第一序列及第二序列中之任一者的第二序列:SEQ ID NO: 200及201;200及202;200及203;200及204;200及205;200及206;200及207;200及208;201及202;201及203;201及204;201及205;201及206;201及207;201及208;202及203;202及204;202及205;202及206;202及207;202及208;203及204;203及205;203及206;203及207;203及208;204及205;204及206;204及207;204及208;205及206;205及207;205及208;206及207;206及208;207及208;231及232;231及233;231及234;231及235;231及236;231及237;231及238;231及239;231及240;231及241;231及242;232及233;232及234;232及235;232及236;232及237;232及238;232及239;232及240;232及241;232及242;233及234;233及235;233及236;233及237;233及238;233及239;233及240;233及241;233及242;234及235;234及236;234及237;234及238;234及239;234及240;234及241;234及242;235及236;235及237;235及238;235及239;235及240;235及241;235及242;236及237;236及238;236及239;236及240;236及241;236及242;237及238;237及239;237及240;237及241;237及242;238及239;238及240;238及241;238及242;239及240;239及241;239及242;240及241;240及242;241及242;270及271;270及272;270及273;270及274;270及275;270及276;270及277;270及278;270及279;270及280;270及281;270及282;270及283;270及284;270及285;270及286;270及287;270及288;270及289;270及290;270及291;270及292;271及272;271及273;271及274;271及275;271及276;271及277;271及278;271及279;271及280;271及281;271及282;271及283;271及284;271及285;271及286;271及287;271及288;271及289;271及290;271及291;271及292;272及273;272及274;272及275;272及276;272及277;272及278;272及279;272及280;272及281;272及282;272及283;272及284;272及285;272及286;272及287;272及288;272及289;272及290;272及291;272及292;273及274;273及275;273及276;273及277;273及278;273及279;273及280;273及281;273及282;273及283;273及284;273及285;273及286;273及287;273及288;273及289;273及290;273及291;273及292;274及275;274及276;274及277;274及278;274及279;274及280;274及281;274及282;274及283;274及284;274及285;274及286;274及287;274及288;274及289;274及290;274及291;274及292;275及276;275及277;275及278;275及279;275及280;275及281;275及282;275及283;275及284;275及285;275及286;275及287;275及288;275及289;275及290;275及291;275及292;276及277;276及278;276及279;276及280;276及281;276及282;276及283;276及284;276及285;276及286;276及287;276及288;276及289;276及290;276及291;276及292;277及278;277及279;277及280;277及281;277及282;277及283;277及284;277及285;277及286;277及287;277及288;277及289;277及290;277及291;277及292;278及279;278及280;278及281;278及282;278及283;278及284;278及285;278及286;278及287;278及288;278及289;278及290;278及291;278及292;279及280;279及281;279及282;279及283;279及284;279及285;279及286;279及287;279及288;279及289;279及290;279及291;279及292;280及281;280及282;280及283;280及284;280及285;280及286;280及287;280及288;280及289;280及290;280及291;280及292;281及282;281及283;281及284;281及285;281及286;281及287;281及288;281及289;281及290;281及291;281及292;282及283;282及284;282及285;282及286;282及287;282及288;282及289;282及290;282及291;282及292;283及284;283及285;283及286;283及287;283及288;283及289;283及290;283及291;283及292;284及285;284及286;284及287;284及288;284及289;284及290;284及291;284及292;285及286;285及287;285及288;285及289;285及290;285及291;285及292;286及287;286及288;286及289;286及290;286及291;286及292;287及288;287及289;287及290;287及291;287及292;288及289;288及290;288及291;288及292;289及290;289及291;289及292;290及291;290及292;291及292;924及270;924及272;924及273;924及274;924及275;924及276;924及277;924及278;924及279;924及280;924及281;924及282;924及283;924及284;924及285;924及286;924及287;924及288;924及289;924及290;924及291;924及292;925及270;925及272;925及273;925及274;925及275;925及276;925及277;925及278;925及279;925及280;925及281;925及282;925及283;925及284;925及285;925及286;925及287;925及288;925及289;925及290;925及291;925及292;926及270;926及272;926及273;926及274;926及275;926及276;926及277;926及278;926及279;926及280;926及281;926及282;926及283;926及284;926及285;926及286;926及287;926及288;926及289;926及290;926及291;926及292;927及270;927及272;927及273;927及274;927及275;927及276;927及277;927及278;927及279;927及280;927及281;927及282;927及283;927及284;927及285;927及286;927及287;927及288;927及289;927及290;927及291;927及292;928及270;928及272;928及273;928及274;928及275;928及276;928及277;928及278;928及279;928及280;928及281;928及282;928及283;928及284;928及285;928及286;928及287;928及288;928及289;928及290;928及291;928及292;929及270;929及272;929及273;929及274;929及275;929及276;929及277;929及278;929及279;929及280;929及281;929及282;929及283;929及284;929及285;929及286;929及287;929及288;929及289;929及290;929及291;929及292;930及270;930及272;930及273;930及274;930及275;930及276;930及277;930及278;930及279;930及280;930及281;930及282;930及283;930及284;930及285;930及286;930及287;930及288;930及289;930及290;930及291;930及292;931及270;931及272;931及273;931及274;931及275;931及276;931及277;931及278;931及279;931及280;931及281;931及282;931及283;931及284;931及285;931及286;931及287;931及288;931及289;931及290;931及291;931及292;932及270;932及272;932及273;932及274;932及275;932及276;932及277;932及278;932及279;932及280;932及281;932及282;932及283;932及284;932及285;932及286;932及287;932及288;932及289;932及290;932及291;932及292;933及270;933及272;933及273;933及274;933及275;933及276;933及277;933及278;933及279;933及280;933及281;933及282;933及283;933及284;933及285;933及286;933及287;933及288;933及289;933及290;933及291;933及292;934及270;934及272;934及273;934及274;934及275;934及276;934及277;934及278;934及279;934及280;934及281;934及282;934及283;934及284;934及285;934及286;934及287;934及288;934及289;934及290;934及291;934及292;935及270;935及272;935及273;935及274;935及275;935及276;935及277;935及278;935及279;935及280;935及281;935及282;935及283;935及284;935及285;935及286;935及287;935及288;935及289;935及290;935及291;935及292;936及270;936及272;936及273;936及274;936及275;936及276;936及277;936及278;936及279;936及280;936及281;936及282;936及283;936及284;936及285;936及286;936及287;936及288;936及289;936及290;936及291;936及292;937及270;937及272;937及273;937及274;937及275;937及276;937及277;937及278;937及279;937及280;937及281;937及282;937及283;937及284;937及285;937及286;937及287;937及288;937及289;937及290;937及291;937及292;938及270;938及272;938及273;938及274;938及275;938及276;938及277;938及278;938及279;938及280;938及281;938及282;938及283;938及284;938及285;938及286;938及287;938及288;938及289;938及290;938及291;938及292;950及275;951及275;952及275;953及275;954及275;或955及275。
實施例14為如實施例13之組合物,其中該sRGN核酸內切酶包含與SEQ ID No: 7024、7026或7027中之任一者之序列至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列。
實施例15為如實施例13或14之組合物,其中該sRGN核酸內切酶由與SEQ ID No: 917、919或920中之任一者之序列至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核酸序列編碼。
實施例16為如前述實施例中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA便有助於肌肉萎縮蛋白基因之外顯子45、51或53之3n+1編輯,其中「n」為任何負整數(例如,-10與-75之間的任何整數)。
實施例17為如前述實施例中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA便靶向該肌肉萎縮蛋白基因之外顯子45、51或53且能夠切除長度為至少26、29、32、35、38、41、44、47、50、53、56、59、62、65、68、71、74、77、80、83、86、89、92、95、98、101、104、107、110、113、116、119、122、125、128、131、134、137、140、143、146、149、152、155、158、161、164、167、170、173、176、179、182、185、188、191、194、197、200、203、206、209、212、215或218個核苷酸的核酸。
實施例18為如前述實施例中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA有助於肌肉萎縮蛋白基因之外顯子44或50之3n+2編輯,其中「n」為任何負整數(例如,-10與-75之間的任何整數)。
實施例19為如前述實施例中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA便靶向該肌肉萎縮蛋白基因之外顯子44或50且能夠切除長度為至少25、28、31、34、37、40、43、46、49、52、55、58、61、64、67、70、73、76、79、82、85、88、91、94、97、100、103、106、109、112、115、118、121、124、127、130、133、136、139、142、145、148、151、154、157、160、163、166、169、172、175、178、181、184、187、190、193、196、199、202、205、208、211、214或217個核苷酸的核酸。
實施例20為如前述實施例中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA切除一部分外顯子,其中該外顯子之切除部分的尺寸為5與250個核苷酸之間的長度。
實施例21為如前述實施例中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA切除一部分外顯子,其中該外顯子之切除部分的尺寸在5與250、5與200、5與150、5與100、5與75、5與50、5與25、5與10、20與250、20與200、20與150、20與100、20與75、20與50、20與25、50與250、50與200、50與150、50與100及50與75個核苷酸之間。
實施例22為如前述實施例中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA切除一部分外顯子,其中該外顯子之切除部分的尺寸在8與167個核苷酸之間。
實施例23為如前述實施例中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA為sgRNA。
實施例24為如前述實施例中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA經修飾。
實施例25為如前述實施例中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA或核酸處於載體中。
實施例26為如實施例25之組合物,其中該載體為病毒載體。
實施例27為如實施例26之組合物,其中該病毒載體為AAV載體。
實施例28為如實施例27之組合物,其中該AAV載體為AAV9載體。
實施例29為如前述實施例中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA之啟動子為hU6c。
實施例30為如前述實施例中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA為SaCas9之嚮導RNA,且該一或多個嚮導RNA包含含有SEQ ID NO: 504之序列的支架。
實施例31為如前述實施例中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA為SluCas9之嚮導RNA,且該一或多個嚮導RNA包含含有SEQ ID NO: 901之序列的支架。
實施例32為如前述實施例中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA處於AAV載體中,其中該載體相對於正股自5'至3'包含:第一嚮導RNA支架序列之反向互補序列;編碼第一嚮導RNA序列之核酸的反向互補序列;用於表現編碼第一嚮導RNA序列之核酸之啟動子的反向互補序列;用於表現編碼SaCas9、SluCas9或sRGN之核酸的啟動子(例如,CK8e);編碼aSaCas9、SluCas9或sRGN (例如,sRGN3.1、sRGN3.3或sRGN4)之核酸;聚腺苷酸化序列;與SaCas9、SluCas9或sRGN之啟動子相同方向的用於表現第二嚮導RNA序列之啟動子;第二RNA嚮導序列;及第二嚮導RNA支架序列。
實施例33為實施例32之組合物,其中:
i)該第一嚮導RNA序列包含SEQ ID NO: 271或281之序列且該第二嚮導RNA序列包含SEQ ID NO: 275之序列;或
ii)該第一嚮導RNA序列包含SEQ ID NO: 283之序列且該第二嚮導RNA序列包含SEQ ID NO: 290之序列。
實施例34為如實施例32或33之組合物,其中用於表現編碼SaCas9、SluCas9或sRGN之核酸的啟動子為用於表現sRGN之啟動子;其中編碼aSaCas9、SluCas9或sRGN之該核酸編碼sRGN,且其中該sRGN包含與SEQ ID No: 7024、7026或7027中之任一者之序列至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列。
實施例35為如實施例34之組合物,其中該sRGN由與SEQ ID No: 917、919或920中之任一者之序列至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核酸序列編碼。
實施例36為如實施例1至35中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA序列、或該成對嚮導RNA之該第一嚮導RNA序列及/或該第二嚮導RNA序列之長度不超過16、不超過17、不超過18、不超過19、不超過20、不超過21或不超過22個核苷酸。
實施例37為一種治療杜興氏肌肉失養症(DMD)的方法,該方法包含將如實施例1至36中任一項之組合物遞送至細胞。
實施例38為一種切除一部分DMD基因之方法,該方法包含將如實施例1至36中任一項之組合物遞送至細胞,其中切除部分之尺寸小於約250個核苷酸。
本申請案主張2022年3月8日申請之美國臨時申請案第63/317,818號及2022年9月7日申請之美國臨時申請案第63/374,887號之優先權,兩者均以全文引用之方式併入本文中。
本申請案含有序列表,該序列表已以XML格式以電子方式提交且以全文引用之方式併入本文中。該XML複本創建於2023年3月6日,命名為01245-0034-00TW_Sequence_Listing且大小為2,228,224位元組。
現將詳細參考本發明之某些實施例,其實例在附圖中加以說明。儘管本發明結合所說明之實施例加以描述,但應理解其不意欲將本發明限於彼等實施例。相反,本發明意欲涵蓋所有替代例、潤飾及等效物,其可包括於如隨附申請專利範圍及所包括之實施例所定義的本發明內。
在詳細描述本教示內容之前,應瞭解,本發明不限於特定組合物或方法步驟,因而可加以改變。應注意,除非上下文另外明確規定,否則如本說明書及所附申請專利範圍中所用,單數形式「一(a/an)」及「該(the)」包括複數個參考物。因此,舉例而言,提及「一嚮導」包括複數個嚮導,及提及「一細胞」包括複數個細胞及其類似者。
數值範圍包括界定該範圍之數字。考慮到有效數位及與量測有關之誤差,所量測及可量測值應理解為大致的。此外,「包含(comprise/comprises/comprising)」、「含有(contain/contains/containing)」及「包括(include/includes/including)」之使用不希望具有限制性。應理解,前述一般描述與詳細描述僅為例示性及解釋性的且並不限制教示內容。
除非說明書中具體指出,否則本說明書中敍述「包含」各種組分之實施例亦設想為「由所敍述組分組成」或「基本上由所敍述組分組成」;本說明書中敍述「由各種組分組成」之實施例亦設想為「包含」所敍述組分或「基本上由所敍述組分組成」;且本說明書中敍述「基本上由各種組分組成」之實施例亦設想為「由所敍述組分組成」或「包含」所敍述組分(此互換性並不適用於此等術語在申請專利範圍中之使用)。除非上下文另外明確說明,否則術語「或(or)」以包括性意義使用,亦即等於「及/或(and/or)」。
本文所用之章節標題僅出於組織目的而不應解釋為以任何方式限制所需主題。在以引用的方式併入之任何材料與本說明書中所定義之任何術語或本說明書之任何其他表述內容相矛盾之情況下,以本說明書為準。儘管本發明之教示係與各種實施例結合描述,但並不意欲使本發明之教示限制於此類實施例。相反,如熟習此項技術者將瞭解,本教示內容涵蓋各種替代方案、修改及等效物。
I.定義
除非另外說明,否則如本文所用之以下術語及片語意欲具有以下含義:
「聚核苷酸」、「核酸」及「核酸分子」在本文中用於指包含核苷或核苷類似物的多聚體化合物,該等核苷或核苷類似物具有沿著主鏈連接在一起的含氮雜環鹼基或鹼基類似物,包括習知RNA、DNA、混合型RNA-DNA,及作為其類似物的聚合物。核酸「主鏈(backbone)」可由多個鍵聯組成,其包括糖-磷酸二酯鍵聯、肽-核酸鍵聯(「肽核酸」或PNA;PCT第WO 95/32305號)、硫代磷酸酯鍵聯、甲基膦酸酯鍵聯或其組合中之一或多者。核酸之糖部分可為核糖、去氧核糖,或具有取代(例如2'甲氧基或2'鹵基取代)之類似化合物。含氮鹼基可為習知鹼基(A、G、C、T、U)、其類似物(例如經修飾之尿苷,諸如5-甲氧基尿苷、假尿苷或N1-甲基假尿苷或其他)、肌苷、嘌呤或嘧啶之衍生物(例如N
4-甲基去氧鳥苷、去氮嘌呤或氮雜嘌呤、去氮嘧啶或氮雜嘧啶、在5位或6位處具有取代基之嘧啶鹼基(例如5-甲基胞嘧啶)、在2位、6位或8位處具有取代基之嘌呤鹼基、2-胺基-6-甲胺基嘌呤、O
6-甲基鳥嘌呤、4-硫基-嘧啶、4-胺基-嘧啶、4-二甲基肼-嘧啶,及O
4-烷基-嘧啶;美國專利第5,378,825號及PCT第WO 93/13121號)。對於一般論述,參見The Biochemistry of the Nucleic Acids 5-36, Adams等人編, 第11版, 1992)。核酸可包括一或多個「無鹼基」殘基,其中主鏈不包括針對聚合物位置之含氮鹼基(美國專利第5,585,481號)。核酸可僅包含習知RNA或DNA糖、鹼基及鍵聯,或可包括習知組分與取代(例如具有2'甲氧基鍵聯之習知鹼基,或含有習知鹼基與一或多個鹼基類似物的聚合物)。核酸包括「鎖定核酸」(LNA)、含有一或多種LNA核苷酸單體之類似物,該等單體具有模擬糖構形之鎖定於RNA中的雙環呋喃醣單元,其會增強對互補RNA及DNA序列之雜合親和性)Vester及Wengel, 2004, Biochemistry 43(42):13233-41)。RNA及DNA具有不同糖部分且不同之處可為在RNA中存在尿嘧啶或其類似物及在DNA中存在胸腺嘧啶或其類似物。
「嚮導RNA」及簡稱「引導物」在本文中互換使用來指代crRNA (亦稱為CRISPR RNA)或crRNA與trRNA (亦稱為tracrRNA)之組合任一者。crRNA及trRNA可以單個RNA分子(單嚮導RNA,sgRNA)或以兩個獨立RNA分子(雙嚮導RNA,dgRNA)形式締合。「嚮導RNA」係指各類型。trRNA可為天然存在之序列或與天然存在之序列相比具有修飾或變異之trRNA序列。為了清楚起見,除非另外具體說明,否則如本文所用,術語「嚮導RNA」或「嚮導」可以指RNA分子(包含A、C、G及U核苷酸)或編碼此類RNA分子的DNA分子(包含A、C、G及T核苷酸)或其互補序列。一般而言,在DNA核酸構築體編碼嚮導RNA的情況下,本文所描述之任一RNA序列中的U殘基可經T殘基置換,且在本文所描述之任一種DNA序列編碼嚮導RNA構築體的情況下,T殘基可經U殘基置換。
如本文所用,「間隔子序列」在本文中及文獻中有時亦稱為「間隔子」、「原間隔子」、「嚮導序列」或「目標序列」,係指嚮導RNA內之與目標序列互補且用於將嚮導RNA導引至目標序列以被Cas9裂解的序列。為了清楚起見,如本文所用,術語「間隔子序列」、「間隔子」、「前間隔子」、「嚮導序列」或「靶向序列」,且除非另外具體說明,否則其可指RNA分子(包含A、C、G及U核苷酸)或編碼此類RNA分子(包含A、C、G及T核苷酸)或其互補序列之DNA分子。嚮導序列可具有24、23、22、21、20個或更少個鹼基對的長度,例如在路鄧葡萄球菌(亦即,SluCas9)或金黃葡萄球菌(亦即,SaCas9)及相關Cas9同源物/直系同源物的情況下。在較佳實施例中,在SluCas9或SaCas9的情況下,嚮導/間隔子序列具有至少20個鹼基對的長度,或更具體言之,20至25個鹼基對範圍內的長度(參見例如Schmidt等人, 2021, Nature Communications,「Improved CRISPR genome editing using small highly active and specific engineered RNA-guided nucleases」)。較短或較長序列亦可用作例如長度為15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個核苷酸之引導物。舉例而言,在一些實施例中,嚮導序列包含至少16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個選自SEQ ID NO:1-159 (用於SaCas9,包括SaCas9KKH)及200-292、924-938或950-955 (用於SluCas9)之序列的連續核苷酸。在一些實施例中,嚮導序列包含選自SEQ ID NO:1-159、200-292、924-938或950-955之序列。在一些實施例中,目標序列處於例如基因中或染色體上,且與嚮導序列互補。在一些實施例中,嚮導序列與其相應目標序列之間的互補性或一致性之程度可為約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%。舉例而言,在一些實施例中,嚮導序列包含與選自SEQ ID NO:1-159、200-292、924-938或950-955之序列的至少16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個連續核苷酸具有約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致性的序列。在一些實施例中,嚮導序列包含與選自SEQ ID NO:1-159、200-292、924-938或950-955之序列具有約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致性的序列。在較佳實施例中,在SluCas9或SaCas9的情況下,嚮導/間隔子序列具有至少20個鹼基對的長度,或更具體言之,20至25個鹼基對範圍內的長度(參見例如Schmidt等人, 2021, Nature Communications,「Improved CRISPR genome editing using small highly active and specific engineered RNA-guided nucleases」)。在一些實施例中,嚮導序列與目標區域可為100%互補或一致的。在其他實施例中,嚮導序列及目標區域可含有至少一個錯配。舉例而言,嚮導序列及目標序列可含有1、2、3或4個錯配,其中目標序列之總長度為至少16、17、18、19、20個或更多個鹼基對。在一些實施例中,目標序列/嚮導之總長度不超過16、不超過17、不超過18、不超過19、不超過20、不超過22、不超過23或不超過24個核苷酸長度。在一些實施例中,嚮導序列及目標區域可含有1至4個錯配,其中嚮導序列包含至少16、17、18、19、20個或更多個核苷酸。在一些實施例中,嚮導序列及目標區域可含有1、2、3或4個錯配,其中嚮導序列包含20個核苷酸。在一些實施例中,嚮導序列及目標區域不含有任何錯配。
在一些實施例中,嚮導序列包含選自SEQ ID NO:1-159、200-292、924-938或950-955之序列,其中若5'端核苷酸不為鳥嘌呤,則在其5'端處向序列添加一或多個鳥嘌呤(g)。在一些實施例中,在一些情況下轉錄需要5' g或gg,例如RNA聚合酶III依賴性U6啟動子或T7啟動子的表現需要。在一些實施例中,5'鳥嘌呤添加至本文所揭示之任一嚮導序列或成對嚮導序列中。
Cas9s之目標序列包括基因體DNA之正股及負股(亦即,指定的序列及該序列之反向互補序列),因為Cas9之核酸受質為雙股核酸。因此,在稱嚮導序列「與目標序列互補」之情況下,應理解,嚮導序列可導引嚮導RNA結合至目標序列之反向互補序列。因此,在一些實施例中,在嚮導序列結合目標序列之反向互補序列之情況下,嚮導序列與目標序列(例如不包括PAM之目標序列)之某些核苷酸具有一致性,不同之處在於在嚮導序列中U取代T。
如本文所用,「核糖核蛋白」(RNP)或「RNP複合物」係指嚮導RNA以及Cas9。在一些實施例中,嚮導RNA將Cas9 (諸如SluCas9或SaCas9)導引至目標序列,且嚮導RNA與該目標序列雜交且該藥劑結合至目標序列,接著其可發生裂解或切割(在經修飾之「切口酶」Cas9的情形下)。
如本文所用,若第一序列與第二序列之比對顯示整個第二序列之X%或更多位置與第一序列匹配,則第一序列被視為「包含與第二序列具有至少X%一致性的序列」。舉例而言,序列AAGA包含與序列AAG具有100%一致性之序列,此係因為第二序列之全部三個位置均存在匹配,因此比對將得到100%一致性。RNA與DNA之間的差異(一般而言,尿苷交換為胸苷或反之亦然)及核苷類似物(諸如經修飾之尿苷)的存在不會造成聚核苷酸之間一致性或互補性的差異,只要相關核苷酸(諸如胸苷、尿苷或經修飾之尿苷)具有相同互補序列(例如對於胸苷、尿苷或經修飾之尿苷全體而言,為腺苷;另一實例為胞嘧啶及5-甲基胞嘧啶,兩者具有鳥苷或經修飾之鳥苷作為互補序列)。因此,舉例而言,序列5'-AXG (其中X為任何經修飾之尿苷,諸如假尿苷、N1-甲基假尿苷或5-甲氧基尿苷)視為與AUG具有100%一致性,因為兩者與同一序列(5'-CAU)完全互補。例示性比對演算法為所屬領域中熟知的史密斯-沃特曼(Smith-Waterman)及尼德曼-翁施(Needleman-Wunsch)演算法。所屬領域的技術人員將理解何種演算法選擇及參數設置適合於待比對之既定序列對;對於具有一般類似長度及針對胺基酸之>50%預期一致性或針對核苷酸之>75%預期一致性的序列而言,由EBI於www.ebi.ac.uk網站伺服器提供的尼德曼-翁施演算法介面之具有預設設置的尼德曼-翁施演算法通常為合適的。
「mRNA」在本文中用於指並非DNA且包含可轉譯成多肽之開讀框的聚核苷酸(亦即可充當藉由核糖體及胺基醯化tRNA進行轉譯之受質)。mRNA可包含磷酸酯-糖主鏈,其包括核糖殘基或其類似物,例如2'-甲氧基核糖殘基。在一些實施例中,mRNA磷酸酯-糖主鏈之糖基本上由核糖殘基、2'-甲氧基核糖殘基或其組合組成。
適用於本文所描述之嚮導RNA組合物及方法的嚮導序列顯示於例如
表 1 - 6及整個說明書中。
如本文所用,「目標序列」係指目標基因中之與嚮導RNA之嚮導序列的至少一部分具有互補性的核酸序列。目標序列與嚮導序列的相互作用導引Cas9結合,且潛在地在目標序列內或附近進行切割或裂解(視藥劑活性而定)。
如本文所用,「治療(treatment)」係指在個體中針對疾病或病症之治療劑的任何投與或施用,且包括抑制疾病或疾病發展(其可發生在正式診斷出疾病之前或之後,例如在個體之基因型可能或有可能引起疾病發展的情況下)、遏制其發展、減輕疾病之一或多種症狀、治癒疾病或預防疾病之一或多種症狀復發。舉例而言,DMD治療可包含緩解DMD症狀。
如本文所用,「緩解(ameliorating)」係指對於表型或症狀產生任何有益作用,諸如降低其嚴重程度、減慢或延遲其發展、遏制其發展或部分或完全逆轉或消除其。在定量表型(諸如表現量)之情況下,緩解涵蓋改變表現量,使得其更接近於健康或未感染細胞或個體中所見之表現量。
「醫藥學上可接受之賦形劑」係指醫藥調配物中所包括之不為活性成分的藥劑。醫藥學上可接受之賦形劑可例如有助於藥物遞送或支持或增強穩定性或生物可用性。
術語「約」或「大致」意謂如由一般熟習此項技術者所確定的特定值之可接受誤差,其部分視如何量測或確定該值而定。
如本文所用,「金黃葡萄球菌Cas9」亦可稱為SaCas9,且包括野生型SaCas9 (例如SEQ ID NO: 711)及其變異體。SaCas9變異體包含相較於SEQ ID NO: 711的一或多個胺基酸變化,包括一或多個胺基酸的插入、缺失或取代,或對一或多個胺基酸的化學修飾。為了清楚起見,SaCas9KKH為SaCas9變異體。
如本文所用,「路鄧葡萄球菌Cas9」亦可稱為SluCas9,且包括野生型SluCas9 (例如SEQ ID NO: 712)及其變異體。SluCas9變異體包含相較於SEQ ID NO: 712的一或多個胺基酸變化,包括一或多個胺基酸的插入、缺失或取代,或對一或多個胺基酸的化學修飾。
II.組合物
本文提供適用於治療杜興氏肌肉失養症(DMD)之包含嚮導RNA及嚮導RNA對的組合物。所提供之嚮導RNA對在與正確核酸內切酶一起使用時用於精確缺失DMD基因之外顯子44、45、50、51或53之小部分(例如,低於約250個核苷酸)。
表 6提供嚮導RNA之嚮導序列之清單,且
表 1A - 5D提供關於此等序列之詳細資訊。
嚮導及嚮導對 a)外顯子44: (1)
表 1A . 外顯子 44 SaCas9 嚮導:
(2)
表 1B . 外顯子 44 SaCas9 對 :
(3)表
1C . 外顯子 44 SluCas9 嚮導:
(4)
表 1D. 外顯子 44 SluCas9 對 :
b)外顯子45: (1)
表 2A. 外顯子 45 SaCas9 嚮導:
(2)
表 2B. 外顯子 45 SaCas9 對 :
(3)
表 2C. 外顯子 45 SluCas9 嚮導:
(4)
表 2D. 外顯子 45 SluCas9 對 :
c)外顯子50
:(1)
表 3A. 外顯子 50 SaCas9 嚮導:
(2)
表 3B. 外顯子 50 SaCas9 對 :
(3)
表 3C. 外顯子 50 SluCas9 嚮導:
(4)
表 3D. 外顯子 50 SluCas9 對 :
d)外顯子51: (1)
表 4A. 外顯子 51 SaCas9 嚮導:
(2)
表 4B. 外顯子 51 SaCas9 對 :
(3)
表 4C. 外顯子 51 SluCas9 嚮導:
(4)
表 4D. 外顯子 51 SluCas9 對 :
e)外顯子53: (1)
表 5A. 外顯子 53 SaCas9 嚮導:
(2)
表 5B. 外顯子 53 SaCas9 對 :
(3)
表 5C. 外顯子 53 SluCas9 嚮導:
(4)
表 5D. 外顯子 53 SluCas9 對 :
f)表6:所有嚮導序列(人類-hg38.12)
組合物
Seq ID No. | 嚮導ID或嚮導RNA名稱 | 嚮導序列 |
1 | E44Sa1 | ATTTAGCATGTTCCCAATTCTC |
2 | E44Sa3 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT |
104 | E44SaCas9KKH2 | TACCATTTGTATTTAGCATGTT |
105 | E44SaCas9KKH3 | ATTTAGCATGTTCCCAATTCTC |
106 | E44SaCas9KKH4 | AACTGTTCAGCTTCTGTTAGCC |
107 | E44SaCas9KKH5 | TTCAGCTTCTGTTAGCCACTGA |
108 | E44SaCas9KKH6 | CACTGATTAAATATCTTTATAT |
109 | E44SaCas9KKH7 | ATGAAAACGCCGCCATTTCTCA |
110 | E44SaCas9KKH8 | CCGCCATTTCTCAACAGATCTG |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG |
113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT |
114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA |
115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT |
116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG |
117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT |
118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC |
119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG |
120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA |
121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA |
122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT |
123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
嚮導 1 Seq ID No. | 嚮導 1 | 嚮導 1 序列 | 嚮導 2 Seq ID No. | 嚮導 2 | 嚮導 2 序列 |
1 | E44Sa1 | ATTTAGCATGTTCCCAATTCTC | 2 | E44Sa3 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT |
110 | E44SaCas9KKH8 | CCGCCATTTCTCAACAGATCTG | 120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA |
110 | E44SaCas9KKH8 | CCGCCATTTCTCAACAGATCTG | 121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA |
110 | E44SaCas9KKH8 | CCGCCATTTCTCAACAGATCTG | 122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT |
110 | E44SaCas9KKH8 | CCGCCATTTCTCAACAGATCTG | 123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
110 | E44SaCas9KKH8 | CCGCCATTTCTCAACAGATCTG | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
110 | E44SaCas9KKH8 | CCGCCATTTCTCAACAGATCTG | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
111 | E44SaCas9KKH9 | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | 113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | 114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | 115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | 116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | 117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | 118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | 119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | 120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | 121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | 122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | 123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
112 | E44SaCas9KKH14 | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT | 114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA |
113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT | 115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT |
113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT | 116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG |
113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT | 117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT |
113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT | 118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC |
113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT | 119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG |
113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT | 120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA |
113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT | 121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA |
113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT | 122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT |
113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT | 123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
113 | E44SaCas9KKH15 | ATGCTAAATACAAATGGTATCT | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA | 115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT |
114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA | 116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG |
114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA | 117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT |
114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA | 118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC |
114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA | 119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG |
114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA | 120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA |
114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA | 121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA |
114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA | 122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT |
114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA | 123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
114 | E44SaCas9KKH16 | AATTGGGAACATGCTAAATACA | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT | 116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG |
115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT | 117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT |
115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT | 118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC |
115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT | 119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG |
115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT | 120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA |
115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT | 121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA |
115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT | 122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT |
115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT | 123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
115 | E44SaCas9KKH17 | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG | 117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT |
116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG | 118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC |
116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG | 119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG |
116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG | 120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA |
116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG | 121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA |
116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG | 122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT |
116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG | 123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
116 | E44SaCas9KKH18 | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT | 118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC |
117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT | 119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG |
117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT | 120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA |
117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT | 121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA |
117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT | 122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT |
117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT | 123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
117 | E44SaCas9KKH19 | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC | 119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG |
118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC | 120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA |
118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC | 121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA |
118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC | 122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT |
118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC | 123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
118 | E44SaCas9KKH20 | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG | 120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA |
119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG | 121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA |
119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG | 122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT |
119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG | 123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
119 | E44SaCas9KKH21 | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA | 121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA |
120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA | 122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT |
120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA | 123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
120 | E44SaCas9KKH22 | CATTATGATATAAAGATATTTA | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA | 122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT |
121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA | 123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
121 | E44SaCas9KKH23 | TTTTCATTATGATATAAAGATA | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT | 123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT |
122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
122 | E44SaCas9KKH24 | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT | 124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG |
123 | E44SaCas9KKH25 | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
124 | E44SaCas9KKH26 | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG | 125 | E44SaCas9KKH27 | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG |
Seq ID No. | 嚮導ID或嚮導RNA名稱 | 嚮導序列 |
200 | E44Slu1 | TATTTAGCATGTTCCCAATTCT |
201 | E44Slu2 | AACAGATCTGTCAAATCGCCTG |
202 | E44Slu4 | TGCTAAATACAAATGGTATCTT |
203 | E44Slu5 | ATTGGGAACATGCTAAATACAA |
204 | E44Slu6 | AAAGACACAAATTCCTGAGAAT |
205 | E44Slu7 | GAAAGACACAAATTCCTGAGAA |
206 | E44Slu8 | ATGATATAAAGATATTTAATCA |
207 | E44Slu9 | TTGACAGATCTGTTGAGAAATG |
208 | E44Slu10 | GATTTGACAGATCTGTTGAGAA |
嚮導 1 Seq ID No. | 嚮導1 | 嚮導1 序列 | 嚮導 2 Seq ID No. | 嚮導 2 | 嚮導 2 序列 |
200 | E44SL1 | TATTTAGCATGTTCCCAATTCT | 201 | E44SL2 | AACAGATCTGTCAAATCGCCTG |
200 | E44SL1 | TATTTAGCATGTTCCCAATTCT | 202 | E44SL4 | TGCTAAATACAAATGGTATCTT |
200 | E44SL1 | TATTTAGCATGTTCCCAATTCT | 203 | E44SL5 | ATTGGGAACATGCTAAATACAA |
200 | E44SL1 | TATTTAGCATGTTCCCAATTCT | 204 | E44SL6 | AAAGACACAAATTCCTGAGAAT |
200 | E44SL1 | TATTTAGCATGTTCCCAATTCT | 205 | E44SL7 | GAAAGACACAAATTCCTGAGAA |
200 | E44SL1 | TATTTAGCATGTTCCCAATTCT | 206 | E44SL8 | ATGATATAAAGATATTTAATCA |
200 | E44SL1 | TATTTAGCATGTTCCCAATTCT | 207 | E44SL9 | TTGACAGATCTGTTGAGAAATG |
200 | E44SL1 | TATTTAGCATGTTCCCAATTCT | 208 | E44SL10 | GATTTGACAGATCTGTTGAGAA |
201 | E44SL2 | AACAGATCTGTCAAATCGCCTG | 202 | E44SL4 | TGCTAAATACAAATGGTATCTT |
201 | E44SL2 | AACAGATCTGTCAAATCGCCTG | 203 | E44SL5 | ATTGGGAACATGCTAAATACAA |
201 | E44SL2 | AACAGATCTGTCAAATCGCCTG | 204 | E44SL6 | AAAGACACAAATTCCTGAGAAT |
201 | E44SL2 | AACAGATCTGTCAAATCGCCTG | 205 | E44SL7 | GAAAGACACAAATTCCTGAGAA |
201 | E44SL2 | AACAGATCTGTCAAATCGCCTG | 206 | E44SL8 | ATGATATAAAGATATTTAATCA |
201 | E44SL2 | AACAGATCTGTCAAATCGCCTG | 207 | E44SL9 | TTGACAGATCTGTTGAGAAATG |
201 | E44SL2 | AACAGATCTGTCAAATCGCCTG | 208 | E44SL10 | GATTTGACAGATCTGTTGAGAA |
202 | E44SL4 | TGCTAAATACAAATGGTATCTT | 203 | E44SL5 | ATTGGGAACATGCTAAATACAA |
202 | E44SL4 | TGCTAAATACAAATGGTATCTT | 204 | E44SL6 | AAAGACACAAATTCCTGAGAAT |
202 | E44SL4 | TGCTAAATACAAATGGTATCTT | 205 | E44SL7 | GAAAGACACAAATTCCTGAGAA |
202 | E44SL4 | TGCTAAATACAAATGGTATCTT | 206 | E44SL8 | ATGATATAAAGATATTTAATCA |
202 | E44SL4 | TGCTAAATACAAATGGTATCTT | 207 | E44SL9 | TTGACAGATCTGTTGAGAAATG |
202 | E44SL4 | TGCTAAATACAAATGGTATCTT | 208 | E44SL10 | GATTTGACAGATCTGTTGAGAA |
203 | E44SL5 | ATTGGGAACATGCTAAATACAA | 204 | E44SL6 | AAAGACACAAATTCCTGAGAAT |
203 | E44SL5 | ATTGGGAACATGCTAAATACAA | 205 | E44SL7 | GAAAGACACAAATTCCTGAGAA |
203 | E44SL5 | ATTGGGAACATGCTAAATACAA | 206 | E44SL8 | ATGATATAAAGATATTTAATCA |
203 | E44SL5 | ATTGGGAACATGCTAAATACAA | 207 | E44SL9 | TTGACAGATCTGTTGAGAAATG |
203 | E44SL5 | ATTGGGAACATGCTAAATACAA | 208 | E44SL10 | GATTTGACAGATCTGTTGAGAA |
204 | E44SL6 | AAAGACACAAATTCCTGAGAAT | 205 | E44SL7 | GAAAGACACAAATTCCTGAGAA |
204 | E44SL6 | AAAGACACAAATTCCTGAGAAT | 206 | E44SL8 | ATGATATAAAGATATTTAATCA |
204 | E44SL6 | AAAGACACAAATTCCTGAGAAT | 207 | E44SL9 | TTGACAGATCTGTTGAGAAATG |
204 | E44SL6 | AAAGACACAAATTCCTGAGAAT | 208 | E44SL10 | GATTTGACAGATCTGTTGAGAA |
205 | E44SL7 | GAAAGACACAAATTCCTGAGAA | 206 | E44SL8 | ATGATATAAAGATATTTAATCA |
205 | E44SL7 | GAAAGACACAAATTCCTGAGAA | 207 | E44SL9 | TTGACAGATCTGTTGAGAAATG |
205 | E44SL7 | GAAAGACACAAATTCCTGAGAA | 208 | E44SL10 | GATTTGACAGATCTGTTGAGAA |
206 | E44SL8 | ATGATATAAAGATATTTAATCA | 207 | E44SL9 | TTGACAGATCTGTTGAGAAATG |
206 | E44SL8 | ATGATATAAAGATATTTAATCA | 208 | E44SL10 | GATTTGACAGATCTGTTGAGAA |
207 | E44SL9 | TTGACAGATCTGTTGAGAAATG | 208 | E44SL10 | GATTTGACAGATCTGTTGAGAA |
Seq ID No. | 嚮導ID或嚮導RNA名稱 | 嚮導序列 |
3 | E45Sa1 | TCAGGCTTCCCAATTTTTCCTG |
4 | E45Sa2 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT |
5 | E45Sa3 | TGGCATCTGTTTTTGAGGATTG |
6 | E45Sa4 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC |
7 | E45Sa6 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC |
8 | E45Sa7 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
9 | E45Sa8 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
126 | E45SaCas9KKH1 | TGTTTGCAGACCTCCTGCCACC |
127 | E45SaCas9KKH2 | CTGCCACCGCAGATTCAGGCTT |
128 | E45SaCas9KKH3 | TCAGGCTTCCCAATTTTTCCTG |
129 | E45SaCas9KKH4 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT |
130 | E45SaCas9KKH5 | TGGCATCTGTTTTTGAGGATTG |
131 | E45SaCas9KKH6 | AGGATTGCTGAATTATTTCTTC |
132 | E45SaCas9KKH7 | AATTATTTCTTCCCCAGTTGCA |
133 | E45SaCas9KKH8 | CAGTTGCATTCAATGTTCTGAC |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG |
135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC |
136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA |
137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA |
138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC |
139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC |
140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG |
141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT |
142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA |
143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC |
144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA |
145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA |
146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
嚮導1 Seq ID No. | 嚮導1 | 嚮導1 序列 | 嚮導2 Seq ID No. | 嚮導2 | 嚮導2 序列 |
3 | E45Sa1 | TCAGGCTTCCCAATTTTTCCTG | 4 | E45Sa2 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT |
3 | E45Sa1 | TCAGGCTTCCCAATTTTTCCTG | 5 | E45Sa3 | TGGCATCTGTTTTTGAGGATTG |
3 | E45Sa1 | TCAGGCTTCCCAATTTTTCCTG | 6 | E45Sa4 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC |
3 | E45Sa1 | TCAGGCTTCCCAATTTTTCCTG | 7 | E45Sa6 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC |
3 | E45Sa1 | TCAGGCTTCCCAATTTTTCCTG | 8 | E45Sa7 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
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4 | E45Sa2 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 6 | E45Sa4 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC |
4 | E45Sa2 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 7 | E45Sa6 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC |
4 | E45Sa2 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 8 | E45Sa7 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
4 | E45Sa2 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 9 | E45Sa8 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
5 | E45Sa3 | TGGCATCTGTTTTTGAGGATTG | 6 | E45Sa4 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC |
5 | E45Sa3 | TGGCATCTGTTTTTGAGGATTG | 7 | E45Sa6 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC |
5 | E45Sa3 | TGGCATCTGTTTTTGAGGATTG | 8 | E45Sa7 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
5 | E45Sa3 | TGGCATCTGTTTTTGAGGATTG | 9 | E45Sa8 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
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6 | E45Sa4 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | 9 | E45Sa8 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
7 | E45Sa6 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC | 8 | E45Sa7 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
7 | E45Sa6 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC | 9 | E45Sa8 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
8 | E45Sa7 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA | 9 | E45Sa8 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
126 | E45SaCas9KKH1 | TGTTTGCAGACCTCCTGCCACC | 127 | E45SaCas9KKH2 | CTGCCACCGCAGATTCAGGCTT |
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130 | E45SaCas9KKH5 | TGGCATCTGTTTTTGAGGATTG | 136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA |
130 | E45SaCas9KKH5 | TGGCATCTGTTTTTGAGGATTG | 137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA |
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130 | E45SaCas9KKH5 | TGGCATCTGTTTTTGAGGATTG | 143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC |
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133 | E45SaCas9KKH8 | CAGTTGCATTCAATGTTCTGAC | 136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA |
133 | E45SaCas9KKH8 | CAGTTGCATTCAATGTTCTGAC | 137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA |
133 | E45SaCas9KKH8 | CAGTTGCATTCAATGTTCTGAC | 138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC |
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133 | E45SaCas9KKH8 | CAGTTGCATTCAATGTTCTGAC | 145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA |
133 | E45SaCas9KKH8 | CAGTTGCATTCAATGTTCTGAC | 146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
133 | E45SaCas9KKH8 | CAGTTGCATTCAATGTTCTGAC | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | 135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | 136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | 137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | 138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | 139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | 140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | 141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | 142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | 143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | 144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | 145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | 146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
134 | E45SaCas9KKH9 | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | 136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA |
135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | 137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA |
135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | 138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC |
135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | 139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC |
135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | 140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG |
135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | 141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT |
135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | 142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA |
135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | 143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC |
135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | 144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA |
135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | 145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA |
135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | 146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
135 | E45SaCas9KKH10 | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA | 137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA |
136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA | 138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC |
136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA | 139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC |
136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA | 140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG |
136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA | 141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT |
136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA | 142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA |
136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA | 143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC |
136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA | 144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA |
136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA | 145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA |
136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA | 146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
136 | E45SaCas9KKH16 | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA | 138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC |
137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA | 139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC |
137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA | 140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG |
137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA | 141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT |
137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA | 142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA |
137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA | 143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC |
137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA | 144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA |
137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA | 145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA |
137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA | 146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
137 | E45SaCas9KKH17 | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC | 139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC |
138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC | 140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG |
138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC | 141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT |
138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC | 142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA |
138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC | 143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC |
138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC | 144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA |
138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC | 145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA |
138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC | 146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
138 | E45SaCas9KKH18 | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC | 140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG |
139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC | 141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT |
139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC | 142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA |
139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC | 143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC |
139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC | 144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA |
139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC | 145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA |
139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC | 146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
139 | E45SaCas9KKH19 | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG | 141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT |
140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG | 142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA |
140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG | 143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC |
140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG | 144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA |
140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG | 145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA |
140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG | 146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
140 | E45SaCas9KKH20 | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT | 142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA |
141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT | 143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC |
141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT | 144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA |
141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT | 145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA |
141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT | 146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
141 | E45SaCas9KKH21 | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA | 143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC |
142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA | 144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA |
142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA | 145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA |
142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA | 146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
142 | E45SaCas9KKH22 | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC | 144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA |
143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC | 145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA |
143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC | 146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
143 | E45SaCas9KKH23 | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA | 145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA |
144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA | 146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
144 | E45SaCas9KKH24 | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA | 146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA |
145 | E45SaCas9KKH25 | GAACATTGAATGCAACTGGGGA | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
146 | E45SaCas9KKH26 | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA | 147 | E45SaCas9KKH27 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
Seq ID No. | 嚮導ID或嚮導RNA名稱 | 嚮導序列 |
209 | E45Slu1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT |
210 | E45Slu2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA |
211 | E45Slu3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT |
212 | E45Slu4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC |
213 | E45Slu7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT |
214 | E45Slu8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG |
215 | E45Slu9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA |
216 | E45Slu10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG |
217 | E45Slu11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG |
218 | E45Slu12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG |
219 | E45Slu13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT |
220 | E45Slu14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT |
221 | E45Slu15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA |
222 | E45Slu16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
223 | E45Slu17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
224 | E45Slu18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
225 | E45Slu19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
226 | E45Slu20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
227 | E45Slu21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
228 | E45Slu22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
229 | E45Slu23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
230 | E45Slu24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
嚮導 1 Seq ID No. | 嚮導 1 | 嚮導1 序列 | 嚮導2 Seq ID No. | 嚮導2 | 嚮導2 序列 |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
209 | E45SL1 | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
210 | E45SL2 | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
211 | E45SL3 | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
212 | E45SL4 | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
213 | E45SL7 | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
214 | E45SL8 | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
215 | E45SL9 | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
216 | E45SL10 | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | 218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG |
217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | 219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT |
217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | 220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT |
217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | 221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA |
217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | 222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
217 | E45SL11 | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG | 219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT |
218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG | 220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT |
218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG | 221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA |
218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG | 222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
218 | E45SL12 | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT | 220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT |
219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT | 221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA |
219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT | 222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
219 | E45SL13 | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT | 221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA |
220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT | 222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
220 | E45SL14 | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA | 222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA |
221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
221 | E45SL15 | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA | 223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT |
222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
222 | E45SL16 | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT | 224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC |
223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
223 | E45SL17 | TGTCAGAACATTGAATGCAACT | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC | 225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA |
224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
224 | E45SL18 | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA | 226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA |
225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
225 | E45SL19 | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA | 227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT |
226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
226 | E45SL20 | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT | 228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA |
227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
227 | E45SL21 | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA | 229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG |
228 | E45SL22 | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
229 | E45SL23 | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG | 230 | E45SL24 | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC |
Seq ID No. | 嚮導ID或嚮導RNA名稱 | 嚮導序列 |
148 | E50SaCas9KKH1 | GGGATCCAGTATACTTACAGGC |
149 | E50SaCas9KKH2 | ATCCAGTATACTTACAGGCTCC |
150 | E50SaCas9KKH3 | CAGTATACTTACAGGCTCCAAT |
151 | E50SaCas9KKH4 | ATACTTACAGGCTCCAATAGTG |
152 | E50SaCas9KKH5 | CCAATAGTGGTCAGTCCAGGAG |
153 | E50SaCas9KKH6 | AGGCTGCTTTGCCCTCAGCTCT |
154 | E50SaCas9KKH7 | TTTGCCCTCAGCTCTTGAAGTA |
155 | E50SaCas9KKH8 | TTTACCGCCTTCCACTCAGAGC |
156 | E50SaCas9KKH10 | GGACTGACCACTATTGGAGCCT |
157 | E50SaCas9KKH11 | AAGATCTGAGCTCTGAGTGGAA |
158 | E50SaCas9KKH12 | AGGAAGTTAGAAGATCTGAGCT |
159 | E50SaCas9KKH13 | TTTTCTGTTAAAGAGGAAGTTA |
嚮導1 Seq ID No. | 嚮導1 | 嚮導1 序列 | 嚮導2 Seq ID No. | 嚮導2 | 嚮導2 序列 |
148 | E50SaCas9KKH1 | GGGATCCAGTATACTTACAGGC | 149 | E50SaCas9KKH2 | ATCCAGTATACTTACAGGCTCC |
148 | E50SaCas9KKH1 | GGGATCCAGTATACTTACAGGC | 150 | E50SaCas9KKH3 | CAGTATACTTACAGGCTCCAAT |
148 | E50SaCas9KKH1 | GGGATCCAGTATACTTACAGGC | 151 | E50SaCas9KKH4 | ATACTTACAGGCTCCAATAGTG |
148 | E50SaCas9KKH1 | GGGATCCAGTATACTTACAGGC | 152 | E50SaCas9KKH5 | CCAATAGTGGTCAGTCCAGGAG |
148 | E50SaCas9KKH1 | GGGATCCAGTATACTTACAGGC | 153 | E50SaCas9KKH6 | AGGCTGCTTTGCCCTCAGCTCT |
148 | E50SaCas9KKH1 | GGGATCCAGTATACTTACAGGC | 154 | E50SaCas9KKH7 | TTTGCCCTCAGCTCTTGAAGTA |
148 | E50SaCas9KKH1 | GGGATCCAGTATACTTACAGGC | 155 | E50SaCas9KKH8 | TTTACCGCCTTCCACTCAGAGC |
148 | E50SaCas9KKH1 | GGGATCCAGTATACTTACAGGC | 156 | E50SaCas9KKH10 | GGACTGACCACTATTGGAGCCT |
148 | E50SaCas9KKH1 | GGGATCCAGTATACTTACAGGC | 157 | E50SaCas9KKH11 | AAGATCTGAGCTCTGAGTGGAA |
148 | E50SaCas9KKH1 | GGGATCCAGTATACTTACAGGC | 158 | E50SaCas9KKH12 | AGGAAGTTAGAAGATCTGAGCT |
148 | E50SaCas9KKH1 | GGGATCCAGTATACTTACAGGC | 159 | E50SaCas9KKH13 | TTTTCTGTTAAAGAGGAAGTTA |
149 | E50SaCas9KKH2 | ATCCAGTATACTTACAGGCTCC | 150 | E50SaCas9KKH3 | CAGTATACTTACAGGCTCCAAT |
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149 | E50SaCas9KKH2 | ATCCAGTATACTTACAGGCTCC | 152 | E50SaCas9KKH5 | CCAATAGTGGTCAGTCCAGGAG |
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149 | E50SaCas9KKH2 | ATCCAGTATACTTACAGGCTCC | 156 | E50SaCas9KKH10 | GGACTGACCACTATTGGAGCCT |
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150 | E50SaCas9KKH3 | CAGTATACTTACAGGCTCCAAT | 152 | E50SaCas9KKH5 | CCAATAGTGGTCAGTCCAGGAG |
150 | E50SaCas9KKH3 | CAGTATACTTACAGGCTCCAAT | 153 | E50SaCas9KKH6 | AGGCTGCTTTGCCCTCAGCTCT |
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150 | E50SaCas9KKH3 | CAGTATACTTACAGGCTCCAAT | 156 | E50SaCas9KKH10 | GGACTGACCACTATTGGAGCCT |
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150 | E50SaCas9KKH3 | CAGTATACTTACAGGCTCCAAT | 158 | E50SaCas9KKH12 | AGGAAGTTAGAAGATCTGAGCT |
150 | E50SaCas9KKH3 | CAGTATACTTACAGGCTCCAAT | 159 | E50SaCas9KKH13 | TTTTCTGTTAAAGAGGAAGTTA |
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151 | E50SaCas9KKH4 | ATACTTACAGGCTCCAATAGTG | 159 | E50SaCas9KKH13 | TTTTCTGTTAAAGAGGAAGTTA |
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152 | E50SaCas9KKH5 | CCAATAGTGGTCAGTCCAGGAG | 154 | E50SaCas9KKH7 | TTTGCCCTCAGCTCTTGAAGTA |
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152 | E50SaCas9KKH5 | CCAATAGTGGTCAGTCCAGGAG | 156 | E50SaCas9KKH10 | GGACTGACCACTATTGGAGCCT |
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152 | E50SaCas9KKH5 | CCAATAGTGGTCAGTCCAGGAG | 159 | E50SaCas9KKH13 | TTTTCTGTTAAAGAGGAAGTTA |
153 | E50SaCas9KKH6 | AGGCTGCTTTGCCCTCAGCTCT | 154 | E50SaCas9KKH7 | TTTGCCCTCAGCTCTTGAAGTA |
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153 | E50SaCas9KKH6 | AGGCTGCTTTGCCCTCAGCTCT | 156 | E50SaCas9KKH10 | GGACTGACCACTATTGGAGCCT |
153 | E50SaCas9KKH6 | AGGCTGCTTTGCCCTCAGCTCT | 157 | E50SaCas9KKH11 | AAGATCTGAGCTCTGAGTGGAA |
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154 | E50SaCas9KKH7 | TTTGCCCTCAGCTCTTGAAGTA | 155 | E50SaCas9KKH8 | TTTACCGCCTTCCACTCAGAGC |
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154 | E50SaCas9KKH7 | TTTGCCCTCAGCTCTTGAAGTA | 158 | E50SaCas9KKH12 | AGGAAGTTAGAAGATCTGAGCT |
154 | E50SaCas9KKH7 | TTTGCCCTCAGCTCTTGAAGTA | 159 | E50SaCas9KKH13 | TTTTCTGTTAAAGAGGAAGTTA |
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155 | E50SaCas9KKH8 | TTTACCGCCTTCCACTCAGAGC | 158 | E50SaCas9KKH12 | AGGAAGTTAGAAGATCTGAGCT |
155 | E50SaCas9KKH8 | TTTACCGCCTTCCACTCAGAGC | 159 | E50SaCas9KKH13 | TTTTCTGTTAAAGAGGAAGTTA |
156 | E50SaCas9KKH10 | GGACTGACCACTATTGGAGCCT | 157 | E50SaCas9KKH11 | AAGATCTGAGCTCTGAGTGGAA |
156 | E50SaCas9KKH10 | GGACTGACCACTATTGGAGCCT | 158 | E50SaCas9KKH12 | AGGAAGTTAGAAGATCTGAGCT |
156 | E50SaCas9KKH10 | GGACTGACCACTATTGGAGCCT | 159 | E50SaCas9KKH13 | TTTTCTGTTAAAGAGGAAGTTA |
157 | E50SaCas9KKH11 | AAGATCTGAGCTCTGAGTGGAA | 158 | E50SaCas9KKH12 | AGGAAGTTAGAAGATCTGAGCT |
157 | E50SaCas9KKH11 | AAGATCTGAGCTCTGAGTGGAA | 159 | E50SaCas9KKH13 | TTTTCTGTTAAAGAGGAAGTTA |
158 | E50SaCas9KKH12 | AGGAAGTTAGAAGATCTGAGCT | 159 | E50SaCas9KKH13 | TTTTCTGTTAAAGAGGAAGTTA |
Seq ID No. | 嚮導ID或嚮導RNA名稱 | 序列 |
231 | E50Slu2 | AGTATACTTACAGGCTCCAATA |
232 | E50Slu3 | CAGGCTCCAATAGTGGTCAGTC |
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242 | E50Slu15 | AGTTAGAAGATCTGAGCTCTGA |
嚮導1 Seq ID No. | 嚮導1 | 嚮導1 序列 | 嚮導2 Seq ID No. | 嚮導2 | 嚮導2 序列 |
231 | E50SL2 | AGTATACTTACAGGCTCCAATA | 232 | E50SL3 | CAGGCTCCAATAGTGGTCAGTC |
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231 | E50SL2 | AGTATACTTACAGGCTCCAATA | 235 | E50SL6 | TTGCCCTCAGCTCTTGAAGTAA |
231 | E50SL2 | AGTATACTTACAGGCTCCAATA | 236 | E50SL9 | CTAGCTCCTGGACTGACCACTA |
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231 | E50SL2 | AGTATACTTACAGGCTCCAATA | 240 | E50SL13 | AGATCTGAGCTCTGAGTGGAAG |
231 | E50SL2 | AGTATACTTACAGGCTCCAATA | 241 | E50SL14 | AGAAGATCTGAGCTCTGAGTGG |
231 | E50SL2 | AGTATACTTACAGGCTCCAATA | 242 | E50SL15 | AGTTAGAAGATCTGAGCTCTGA |
232 | E50SL3 | CAGGCTCCAATAGTGGTCAGTC | 233 | E50SL4 | CAATAGTGGTCAGTCCAGGAGC |
232 | E50SL3 | CAGGCTCCAATAGTGGTCAGTC | 234 | E50SL5 | GTGGTCAGTCCAGGAGCTAGGT |
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232 | E50SL3 | CAGGCTCCAATAGTGGTCAGTC | 240 | E50SL13 | AGATCTGAGCTCTGAGTGGAAG |
232 | E50SL3 | CAGGCTCCAATAGTGGTCAGTC | 241 | E50SL14 | AGAAGATCTGAGCTCTGAGTGG |
232 | E50SL3 | CAGGCTCCAATAGTGGTCAGTC | 242 | E50SL15 | AGTTAGAAGATCTGAGCTCTGA |
233 | E50SL4 | CAATAGTGGTCAGTCCAGGAGC | 234 | E50SL5 | GTGGTCAGTCCAGGAGCTAGGT |
233 | E50SL4 | CAATAGTGGTCAGTCCAGGAGC | 235 | E50SL6 | TTGCCCTCAGCTCTTGAAGTAA |
233 | E50SL4 | CAATAGTGGTCAGTCCAGGAGC | 236 | E50SL9 | CTAGCTCCTGGACTGACCACTA |
233 | E50SL4 | CAATAGTGGTCAGTCCAGGAGC | 237 | E50SL10 | GCAAAGCAGCCTGACCTAGCTC |
233 | E50SL4 | CAATAGTGGTCAGTCCAGGAGC | 238 | E50SL11 | AAACCGTTTACTTCAAGAGCTG |
233 | E50SL4 | CAATAGTGGTCAGTCCAGGAGC | 239 | E50SL12 | TAAACCGTTTACTTCAAGAGCT |
233 | E50SL4 | CAATAGTGGTCAGTCCAGGAGC | 240 | E50SL13 | AGATCTGAGCTCTGAGTGGAAG |
233 | E50SL4 | CAATAGTGGTCAGTCCAGGAGC | 241 | E50SL14 | AGAAGATCTGAGCTCTGAGTGG |
233 | E50SL4 | CAATAGTGGTCAGTCCAGGAGC | 242 | E50SL15 | AGTTAGAAGATCTGAGCTCTGA |
234 | E50SL5 | GTGGTCAGTCCAGGAGCTAGGT | 235 | E50SL6 | TTGCCCTCAGCTCTTGAAGTAA |
234 | E50SL5 | GTGGTCAGTCCAGGAGCTAGGT | 236 | E50SL9 | CTAGCTCCTGGACTGACCACTA |
234 | E50SL5 | GTGGTCAGTCCAGGAGCTAGGT | 237 | E50SL10 | GCAAAGCAGCCTGACCTAGCTC |
234 | E50SL5 | GTGGTCAGTCCAGGAGCTAGGT | 238 | E50SL11 | AAACCGTTTACTTCAAGAGCTG |
234 | E50SL5 | GTGGTCAGTCCAGGAGCTAGGT | 239 | E50SL12 | TAAACCGTTTACTTCAAGAGCT |
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234 | E50SL5 | GTGGTCAGTCCAGGAGCTAGGT | 241 | E50SL14 | AGAAGATCTGAGCTCTGAGTGG |
234 | E50SL5 | GTGGTCAGTCCAGGAGCTAGGT | 242 | E50SL15 | AGTTAGAAGATCTGAGCTCTGA |
235 | E50SL6 | TTGCCCTCAGCTCTTGAAGTAA | 236 | E50SL9 | CTAGCTCCTGGACTGACCACTA |
235 | E50SL6 | TTGCCCTCAGCTCTTGAAGTAA | 237 | E50SL10 | GCAAAGCAGCCTGACCTAGCTC |
235 | E50SL6 | TTGCCCTCAGCTCTTGAAGTAA | 238 | E50SL11 | AAACCGTTTACTTCAAGAGCTG |
235 | E50SL6 | TTGCCCTCAGCTCTTGAAGTAA | 239 | E50SL12 | TAAACCGTTTACTTCAAGAGCT |
235 | E50SL6 | TTGCCCTCAGCTCTTGAAGTAA | 240 | E50SL13 | AGATCTGAGCTCTGAGTGGAAG |
235 | E50SL6 | TTGCCCTCAGCTCTTGAAGTAA | 241 | E50SL14 | AGAAGATCTGAGCTCTGAGTGG |
235 | E50SL6 | TTGCCCTCAGCTCTTGAAGTAA | 242 | E50SL15 | AGTTAGAAGATCTGAGCTCTGA |
236 | E50SL9 | CTAGCTCCTGGACTGACCACTA | 237 | E50SL10 | GCAAAGCAGCCTGACCTAGCTC |
236 | E50SL9 | CTAGCTCCTGGACTGACCACTA | 238 | E50SL11 | AAACCGTTTACTTCAAGAGCTG |
236 | E50SL9 | CTAGCTCCTGGACTGACCACTA | 239 | E50SL12 | TAAACCGTTTACTTCAAGAGCT |
236 | E50SL9 | CTAGCTCCTGGACTGACCACTA | 240 | E50SL13 | AGATCTGAGCTCTGAGTGGAAG |
236 | E50SL9 | CTAGCTCCTGGACTGACCACTA | 241 | E50SL14 | AGAAGATCTGAGCTCTGAGTGG |
236 | E50SL9 | CTAGCTCCTGGACTGACCACTA | 242 | E50SL15 | AGTTAGAAGATCTGAGCTCTGA |
237 | E50SL10 | GCAAAGCAGCCTGACCTAGCTC | 238 | E50SL11 | AAACCGTTTACTTCAAGAGCTG |
237 | E50SL10 | GCAAAGCAGCCTGACCTAGCTC | 239 | E50SL12 | TAAACCGTTTACTTCAAGAGCT |
237 | E50SL10 | GCAAAGCAGCCTGACCTAGCTC | 240 | E50SL13 | AGATCTGAGCTCTGAGTGGAAG |
237 | E50SL10 | GCAAAGCAGCCTGACCTAGCTC | 241 | E50SL14 | AGAAGATCTGAGCTCTGAGTGG |
237 | E50SL10 | GCAAAGCAGCCTGACCTAGCTC | 242 | E50SL15 | AGTTAGAAGATCTGAGCTCTGA |
238 | E50SL11 | AAACCGTTTACTTCAAGAGCTG | 239 | E50SL12 | TAAACCGTTTACTTCAAGAGCT |
238 | E50SL11 | AAACCGTTTACTTCAAGAGCTG | 240 | E50SL13 | AGATCTGAGCTCTGAGTGGAAG |
238 | E50SL11 | AAACCGTTTACTTCAAGAGCTG | 241 | E50SL14 | AGAAGATCTGAGCTCTGAGTGG |
238 | E50SL11 | AAACCGTTTACTTCAAGAGCTG | 242 | E50SL15 | AGTTAGAAGATCTGAGCTCTGA |
239 | E50SL12 | TAAACCGTTTACTTCAAGAGCT | 240 | E50SL13 | AGATCTGAGCTCTGAGTGGAAG |
239 | E50SL12 | TAAACCGTTTACTTCAAGAGCT | 241 | E50SL14 | AGAAGATCTGAGCTCTGAGTGG |
239 | E50SL12 | TAAACCGTTTACTTCAAGAGCT | 242 | E50SL15 | AGTTAGAAGATCTGAGCTCTGA |
240 | E50SL13 | AGATCTGAGCTCTGAGTGGAAG | 241 | E50SL14 | AGAAGATCTGAGCTCTGAGTGG |
240 | E50SL13 | AGATCTGAGCTCTGAGTGGAAG | 242 | E50SL15 | AGTTAGAAGATCTGAGCTCTGA |
241 | E50SL14 | AGAAGATCTGAGCTCTGAGTGG | 242 | E50SL15 | AGTTAGAAGATCTGAGCTCTGA |
Seq ID No. | 嚮導ID或嚮導RNA名稱 | 嚮導序列 |
11 | E51Sa1 | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC |
12 | E51Sa2 | GTTGTGTCACCAGAGTAACAGT |
13 | E51Sa4 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
14 | E51Sa5 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
15 | E51Sa6 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
27 | E51SaCas9KKH1 | TCATTTTTTCTCATACCTTCTG |
28 | E51SaCas9KKH2 | TTTTTTCTCATACCTTCTGCTT |
29 | E51SaCas9KKH3 | CCTTCTGCTTGATGATCATCTC |
30 | E51SaCas9KKH4 | ATGATCATCTCGTTGATATCCT |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG |
40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT |
41 | E51SaCas9KKH15 | AGGAAGATGGCATTTCTAGTTT |
42 | E51SaCas9KKH16 | ATGGCATTTCTAGTTTGGAGAT |
43 | E51SaCas9KKH17 | CTAGTTTGGAGATGGCAGTTTC |
44 | E51SaCas9KKH18 | GATGGCAGTTTCCTTAGTAACC |
45 | E51SaCas9KKH19 | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC |
46 | E51SaCas9KKH20 | CCACAGGTTGTGTCACCAGAGT |
47 | E51SaCas9KKH21 | GTTGTGTCACCAGAGTAACAGT |
48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC |
49 | E51SaCas9KKH23 | TCTGAGTAGGAGCTAAAATATT |
50 | E51SaCas9KKH24 | AGAAGGTATGAGAAAAAATGAT |
51 | E51SaCas9KKH25 | TCAAGCAGAAGGTATGAGAAAA |
52 | E51SaCas9KKH26 | TCATCAAGCAGAAGGTATGAGA |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
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嚮導1 Seq ID No. | 嚮導1 | 嚮導1 序列 | 嚮導2 Seq ID No. | 嚮導2 | 嚮導2 序列 |
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31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 41 | E51SaCas9KKH15 | AGGAAGATGGCATTTCTAGTTT |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 42 | E51SaCas9KKH16 | ATGGCATTTCTAGTTTGGAGAT |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 43 | E51SaCas9KKH17 | CTAGTTTGGAGATGGCAGTTTC |
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31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 45 | E51SaCas9KKH19 | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 46 | E51SaCas9KKH20 | CCACAGGTTGTGTCACCAGAGT |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 47 | E51SaCas9KKH21 | GTTGTGTCACCAGAGTAACAGT |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
31 | E51SaCas9KKH5 | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 41 | E51SaCas9KKH15 | AGGAAGATGGCATTTCTAGTTT |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 42 | E51SaCas9KKH16 | ATGGCATTTCTAGTTTGGAGAT |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 43 | E51SaCas9KKH17 | CTAGTTTGGAGATGGCAGTTTC |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 44 | E51SaCas9KKH18 | GATGGCAGTTTCCTTAGTAACC |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 45 | E51SaCas9KKH19 | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 46 | E51SaCas9KKH20 | CCACAGGTTGTGTCACCAGAGT |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 47 | E51SaCas9KKH21 | GTTGTGTCACCAGAGTAACAGT |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
32 | E51SaCas9KKH6 | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 41 | E51SaCas9KKH15 | AGGAAGATGGCATTTCTAGTTT |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 42 | E51SaCas9KKH16 | ATGGCATTTCTAGTTTGGAGAT |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 43 | E51SaCas9KKH17 | CTAGTTTGGAGATGGCAGTTTC |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 44 | E51SaCas9KKH18 | GATGGCAGTTTCCTTAGTAACC |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 45 | E51SaCas9KKH19 | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 46 | E51SaCas9KKH20 | CCACAGGTTGTGTCACCAGAGT |
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33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
33 | E51SaCas9KKH7 | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 41 | E51SaCas9KKH15 | AGGAAGATGGCATTTCTAGTTT |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 42 | E51SaCas9KKH16 | ATGGCATTTCTAGTTTGGAGAT |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 43 | E51SaCas9KKH17 | CTAGTTTGGAGATGGCAGTTTC |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 44 | E51SaCas9KKH18 | GATGGCAGTTTCCTTAGTAACC |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 45 | E51SaCas9KKH19 | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 46 | E51SaCas9KKH20 | CCACAGGTTGTGTCACCAGAGT |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 47 | E51SaCas9KKH21 | GTTGTGTCACCAGAGTAACAGT |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
34 | E51SaCas9KKH8 | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 41 | E51SaCas9KKH15 | AGGAAGATGGCATTTCTAGTTT |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 42 | E51SaCas9KKH16 | ATGGCATTTCTAGTTTGGAGAT |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 43 | E51SaCas9KKH17 | CTAGTTTGGAGATGGCAGTTTC |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 44 | E51SaCas9KKH18 | GATGGCAGTTTCCTTAGTAACC |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 45 | E51SaCas9KKH19 | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 46 | E51SaCas9KKH20 | CCACAGGTTGTGTCACCAGAGT |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 47 | E51SaCas9KKH21 | GTTGTGTCACCAGAGTAACAGT |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
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35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
35 | E51SaCas9KKH9 | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 41 | E51SaCas9KKH15 | AGGAAGATGGCATTTCTAGTTT |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 42 | E51SaCas9KKH16 | ATGGCATTTCTAGTTTGGAGAT |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 43 | E51SaCas9KKH17 | CTAGTTTGGAGATGGCAGTTTC |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 44 | E51SaCas9KKH18 | GATGGCAGTTTCCTTAGTAACC |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 45 | E51SaCas9KKH19 | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 46 | E51SaCas9KKH20 | CCACAGGTTGTGTCACCAGAGT |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 47 | E51SaCas9KKH21 | GTTGTGTCACCAGAGTAACAGT |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
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36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
36 | E51SaCas9KKH10 | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
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37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA |
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37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 41 | E51SaCas9KKH15 | AGGAAGATGGCATTTCTAGTTT |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 42 | E51SaCas9KKH16 | ATGGCATTTCTAGTTTGGAGAT |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 43 | E51SaCas9KKH17 | CTAGTTTGGAGATGGCAGTTTC |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 44 | E51SaCas9KKH18 | GATGGCAGTTTCCTTAGTAACC |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 45 | E51SaCas9KKH19 | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC |
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37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 47 | E51SaCas9KKH21 | GTTGTGTCACCAGAGTAACAGT |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA |
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37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
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37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
37 | E51SaCas9KKH11 | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 41 | E51SaCas9KKH15 | AGGAAGATGGCATTTCTAGTTT |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 42 | E51SaCas9KKH16 | ATGGCATTTCTAGTTTGGAGAT |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 43 | E51SaCas9KKH17 | CTAGTTTGGAGATGGCAGTTTC |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 44 | E51SaCas9KKH18 | GATGGCAGTTTCCTTAGTAACC |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 45 | E51SaCas9KKH19 | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 46 | E51SaCas9KKH20 | CCACAGGTTGTGTCACCAGAGT |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 47 | E51SaCas9KKH21 | GTTGTGTCACCAGAGTAACAGT |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
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38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
38 | E51SaCas9KKH12 | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 41 | E51SaCas9KKH15 | AGGAAGATGGCATTTCTAGTTT |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 42 | E51SaCas9KKH16 | ATGGCATTTCTAGTTTGGAGAT |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 43 | E51SaCas9KKH17 | CTAGTTTGGAGATGGCAGTTTC |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 44 | E51SaCas9KKH18 | GATGGCAGTTTCCTTAGTAACC |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 45 | E51SaCas9KKH19 | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 46 | E51SaCas9KKH20 | CCACAGGTTGTGTCACCAGAGT |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 47 | E51SaCas9KKH21 | GTTGTGTCACCAGAGTAACAGT |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
39 | E51SaCas9KKH13 | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT | 41 | E51SaCas9KKH15 | AGGAAGATGGCATTTCTAGTTT |
40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT | 42 | E51SaCas9KKH16 | ATGGCATTTCTAGTTTGGAGAT |
40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT | 43 | E51SaCas9KKH17 | CTAGTTTGGAGATGGCAGTTTC |
40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT | 44 | E51SaCas9KKH18 | GATGGCAGTTTCCTTAGTAACC |
40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT | 45 | E51SaCas9KKH19 | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC |
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40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT | 48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC |
40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT | 53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA |
40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT | 54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA |
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40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
40 | E51SaCas9KKH14 | CAACATCAAGGAAGATGGCATT | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
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41 | E51SaCas9KKH15 | AGGAAGATGGCATTTCTAGTTT | 53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA |
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48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
48 | E51SaCas9KKH22 | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
53 | E51SaCas9KKH27 | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
54 | E51SaCas9KKH28 | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
55 | E51SaCas9KKH29 | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
56 | E51SaCas9KKH30 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT |
57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
57 | E51SaCas9KKH31 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT | 59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG |
58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
58 | E51SaCas9KKH32 | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG | 60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG | 64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG |
59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
59 | E51SaCas9KKH33 | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA |
60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
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60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
60 | E51SaCas9KKH34 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA | 62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA |
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61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
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61 | E51SaCas9KKH35 | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA | 63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG |
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62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
62 | E51SaCas9KKH36 | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
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63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
63 | E51SaCas9KKH37 | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG | 65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT |
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64 | E51SaCas9KKH38 | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT | 66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC |
65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
65 | E51SaCas9KKH39 | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC | 67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT |
66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
66 | E51SaCas9KKH40 | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT | 68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC |
67 | E51SaCas9KKH41 | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
68 | E51SaCas9KKH42 | CTGTTACTCTGGTGACACAACC | 69 | E51SaCas9KKH43 | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC |
Seq ID No. | 嚮導ID或嚮導RNA名稱 | 嚮導序列 |
243 | E51Slu1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC |
244 | E51Slu2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG |
245 | E51Slu3 | AGTCGGTAAGTTCTGTCCAAGC |
246 | E51Slu4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG |
247 | E51Slu5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC |
248 | E51Slu6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG |
249 | E51Slu7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT |
250 | E51Slu8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG |
251 | E51Slu9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA |
252 | E51Slu10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG |
253 | E51Slu15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG |
254 | E51Slu16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
255 | E51Slu17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG |
256 | E51Slu18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
257 | E51Slu19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG |
258 | E51Slu20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG |
259 | E51Slu21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
260 | E51Slu22 | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA |
261 | E51Slu23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC |
262 | E51Slu24 | ACCTGCTCTGGCAGATTTCAAC |
263 | E51Slu25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA |
264 | E51Slu26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
265 | E51Slu27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
266 | E51Slu28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
267 | E51Slu29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
268 | E51Slu30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
269 | E51Slu31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
嚮導1 Seq ID No. | 嚮導1 | 嚮導1 序列 | 嚮導2 Seq ID No. | 嚮導2 | 嚮導2 序列 |
243 | E51SL1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | 244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG |
243 | E51SL1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | 245 | E51SL3 | AGTCGGTAAGTTCTGTCCAAGC |
243 | E51SL1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | 246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG |
243 | E51SL1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | 247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC |
243 | E51SL1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | 248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG |
243 | E51SL1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | 249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT |
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243 | E51SL1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | 263 | E51SL25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA |
243 | E51SL1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
243 | E51SL1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
243 | E51SL1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | 266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
243 | E51SL1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
243 | E51SL1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
243 | E51SL1 | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 245 | E51SL3 | AGTCGGTAAGTTCTGTCCAAGC |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 256 | E51SL18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 257 | E51SL19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 260 | E51SL22 | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 262 | E51SL24 | ACCTGCTCTGGCAGATTTCAAC |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 263 | E51SL25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
244 | E51SL2 | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
245 | E51SL3 | AGTCGGTAAGTTCTGTCCAAGC | 246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG |
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245 | E51SL3 | AGTCGGTAAGTTCTGTCCAAGC | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
245 | E51SL3 | AGTCGGTAAGTTCTGTCCAAGC | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | 247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC |
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246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | 250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG |
246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | 251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA |
246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | 252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG |
246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | 253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG |
246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | 254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | 255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG |
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246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | 266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
246 | E51SL4 | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 256 | E51SL18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 257 | E51SL19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 260 | E51SL22 | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 262 | E51SL24 | ACCTGCTCTGGCAGATTTCAAC |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 263 | E51SL25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
247 | E51SL5 | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 256 | E51SL18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 257 | E51SL19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 260 | E51SL22 | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 262 | E51SL24 | ACCTGCTCTGGCAGATTTCAAC |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 263 | E51SL25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
248 | E51SL6 | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 256 | E51SL18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 257 | E51SL19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 260 | E51SL22 | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 262 | E51SL24 | ACCTGCTCTGGCAGATTTCAAC |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 263 | E51SL25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
249 | E51SL7 | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 256 | E51SL18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 257 | E51SL19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 260 | E51SL22 | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 262 | E51SL24 | ACCTGCTCTGGCAGATTTCAAC |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 263 | E51SL25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
250 | E51SL8 | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 256 | E51SL18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 257 | E51SL19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 260 | E51SL22 | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 262 | E51SL24 | ACCTGCTCTGGCAGATTTCAAC |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 263 | E51SL25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
251 | E51SL9 | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 256 | E51SL18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 257 | E51SL19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 260 | E51SL22 | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 262 | E51SL24 | ACCTGCTCTGGCAGATTTCAAC |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 263 | E51SL25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
252 | E51SL10 | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG | 254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT |
253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG | 255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG |
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253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG | 258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG |
253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG | 259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
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253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG | 263 | E51SL25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA |
253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG | 266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
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253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
253 | E51SL15 | CAACGAGATGATCATCAAGCAG | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG |
254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 256 | E51SL18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 257 | E51SL19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG |
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254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA |
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254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
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254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
254 | E51SL16 | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG | 256 | E51SL18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG |
255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG | 257 | E51SL19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG |
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255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG | 266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
255 | E51SL17 | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
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256 | E51SL18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
256 | E51SL18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
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256 | E51SL18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
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256 | E51SL18 | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
257 | E51SL19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG | 258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG |
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257 | E51SL19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG | 260 | E51SL22 | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA |
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257 | E51SL19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
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257 | E51SL19 | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
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258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG | 266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
258 | E51SL20 | TGATCAAGTTATAAAATCACAG | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 260 | E51SL22 | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA |
259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC |
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259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG |
259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
259 | E51SL21 | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
260 | E51SL22 | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA | 261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC |
260 | E51SL22 | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA | 262 | E51SL24 | ACCTGCTCTGGCAGATTTCAAC |
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260 | E51SL22 | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
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261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC | 263 | E51SL25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA |
261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
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261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
261 | E51SL23 | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
262 | E51SL24 | ACCTGCTCTGGCAGATTTCAAC | 263 | E51SL25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA |
262 | E51SL24 | ACCTGCTCTGGCAGATTTCAAC | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
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262 | E51SL24 | ACCTGCTCTGGCAGATTTCAAC | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
263 | E51SL25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA | 264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT |
263 | E51SL25 | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA | 265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG |
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264 | E51SL26 | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
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265 | E51SL27 | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG | 267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT |
266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
266 | E51SL28 | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT | 268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT |
267 | E51SL29 | GGTGACACAACCTGTGGTTACT | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
268 | E51SL30 | TGTTACTCTGGTGACACAACCT | 269 | E51SL31 | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT |
Seq ID No. | 嚮導ID或嚮導RNA名稱 | 嚮導序列 |
16 | E53Sa1 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT |
17 | E53Sa2 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG |
18 | E53Sa3 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT |
19 | E53Sa4 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC |
20 | E53Sa5 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
21 | E53Sa6 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC |
22 | E53Sa7 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
23 | E53Sa8 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
24 | E53Sa9 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
25 | E53Sa10 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
26 | E53Sa11 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
70 | E53SaCas9KKH1 | AAAAGGTATCTTTGATACTAAC |
71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC |
72 | E53SaCas9KKH3 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT |
73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG |
74 | E53SaCas9KKH5 | AACATTTCATTCAACTGTTGCC |
75 | E53SaCas9KKH6 | TTCAACTGTTGCCTCCGGTTCT |
76 | E53SaCas9KKH7 | AGGTGTTCTTGTACTTCATCCC |
77 | E53SaCas9KKH8 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT |
78 | E53SaCas9KKH9 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC |
79 | E53SaCas9KKH10 | TTCTTTCAACTAGAATAAAAGG |
80 | E53SaCas9KKH11 | TTCAACTAGAATAAAAGGAAAA |
81 | E53SaCas9KKH12 | AGAATAAAAGGAAAAATAAATA |
82 | E53SaCas9KKH13 | GTTAGTATCAAAGATACCTTTT |
83 | E53SaCas9KKH14 | CACAGAAACCAAGGTTAGTATC |
84 | E53SaCas9KKH15 | AAAGAAAATCACAGAAACCAAG |
85 | E53SaCas9KKH16 | TCCAAAAGAAAATCACAGAAAC |
86 | E53SaCas9KKH17 | ATACAGTAGATGCAATCCAAAA |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA |
90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC |
92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA |
93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA |
94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA |
96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC |
98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA |
99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
103 | E53SaCas9KKH34 | ATATATTTATTTTTCCTTTTAT |
嚮導1 Seq ID No. | 嚮導1 | 嚮導1 序列 | 嚮導2 Seq ID No. | 嚮導2 | 嚮導2 序列 |
16 | E53Sa1 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 17 | E53Sa2 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG |
16 | E53Sa1 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 18 | E53Sa3 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT |
16 | E53Sa1 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 19 | E53Sa4 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC |
16 | E53Sa1 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 20 | E53Sa5 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
16 | E53Sa1 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 21 | E53Sa6 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC |
16 | E53Sa1 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 22 | E53Sa7 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
16 | E53Sa1 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 23 | E53Sa8 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
16 | E53Sa1 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 24 | E53Sa9 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
16 | E53Sa1 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 25 | E53Sa10 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
16 | E53Sa1 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 26 | E53Sa11 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
17 | E53Sa2 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 18 | E53Sa3 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT |
17 | E53Sa2 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 19 | E53Sa4 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC |
17 | E53Sa2 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 20 | E53Sa5 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
17 | E53Sa2 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 21 | E53Sa6 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC |
17 | E53Sa2 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 22 | E53Sa7 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
17 | E53Sa2 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 23 | E53Sa8 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
17 | E53Sa2 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 24 | E53Sa9 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
17 | E53Sa2 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 25 | E53Sa10 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
17 | E53Sa2 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 26 | E53Sa11 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
18 | E53Sa3 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT | 19 | E53Sa4 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC |
18 | E53Sa3 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT | 20 | E53Sa5 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
18 | E53Sa3 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT | 21 | E53Sa6 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC |
18 | E53Sa3 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT | 22 | E53Sa7 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
18 | E53Sa3 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT | 23 | E53Sa8 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
18 | E53Sa3 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT | 24 | E53Sa9 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
18 | E53Sa3 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT | 25 | E53Sa10 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
18 | E53Sa3 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT | 26 | E53Sa11 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
19 | E53Sa4 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC | 20 | E53Sa5 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
19 | E53Sa4 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC | 21 | E53Sa6 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC |
19 | E53Sa4 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC | 22 | E53Sa7 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
19 | E53Sa4 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC | 23 | E53Sa8 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
19 | E53Sa4 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC | 24 | E53Sa9 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
19 | E53Sa4 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC | 25 | E53Sa10 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
19 | E53Sa4 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC | 26 | E53Sa11 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
20 | E53Sa5 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 21 | E53Sa6 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC |
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20 | E53Sa5 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 24 | E53Sa9 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
20 | E53Sa5 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 25 | E53Sa10 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
20 | E53Sa5 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 26 | E53Sa11 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
21 | E53Sa6 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 22 | E53Sa7 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
21 | E53Sa6 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 23 | E53Sa8 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
21 | E53Sa6 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 24 | E53Sa9 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
21 | E53Sa6 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 25 | E53Sa10 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
21 | E53Sa6 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 26 | E53Sa11 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
22 | E53Sa7 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 23 | E53Sa8 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
22 | E53Sa7 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 24 | E53Sa9 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
22 | E53Sa7 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 25 | E53Sa10 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
22 | E53Sa7 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 26 | E53Sa11 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
23 | E53Sa8 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG | 24 | E53Sa9 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
23 | E53Sa8 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG | 25 | E53Sa10 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
23 | E53Sa8 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG | 26 | E53Sa11 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
24 | E53Sa9 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG | 25 | E53Sa10 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
24 | E53Sa9 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG | 26 | E53Sa11 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
25 | E53Sa10 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT | 26 | E53Sa11 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 72 | E53SaCas9KKH3 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT |
71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG |
71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 74 | E53SaCas9KKH5 | AACATTTCATTCAACTGTTGCC |
71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 75 | E53SaCas9KKH6 | TTCAACTGTTGCCTCCGGTTCT |
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71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 77 | E53SaCas9KKH8 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT |
71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 78 | E53SaCas9KKH9 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC |
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71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
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71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA |
71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA |
71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA |
71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC |
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71 | E53SaCas9KKH2 | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
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72 | E53SaCas9KKH3 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 74 | E53SaCas9KKH5 | AACATTTCATTCAACTGTTGCC |
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72 | E53SaCas9KKH3 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 76 | E53SaCas9KKH7 | AGGTGTTCTTGTACTTCATCCC |
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72 | E53SaCas9KKH3 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 85 | E53SaCas9KKH16 | TCCAAAAGAAAATCACAGAAAC |
72 | E53SaCas9KKH3 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 86 | E53SaCas9KKH17 | ATACAGTAGATGCAATCCAAAA |
72 | E53SaCas9KKH3 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA |
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73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 77 | E53SaCas9KKH8 | CTTGTACTTCATCCCACTGATT |
73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 78 | E53SaCas9KKH9 | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC |
73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 84 | E53SaCas9KKH15 | AAAGAAAATCACAGAAACCAAG |
73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 85 | E53SaCas9KKH16 | TCCAAAAGAAAATCACAGAAAC |
73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 86 | E53SaCas9KKH17 | ATACAGTAGATGCAATCCAAAA |
73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA |
73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA |
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73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC |
73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA |
73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA |
73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA |
73 | E53SaCas9KKH4 | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | 96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
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87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
87 | E53SaCas9KKH18 | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
88 | E53SaCas9KKH19 | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | 90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | 91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | 92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | 93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | 94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | 95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | 96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | 97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | 98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | 99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | 100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
89 | E53SaCas9KKH20 | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC |
90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA |
90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA |
90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA |
90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC |
90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA |
90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
90 | E53SaCas9KKH21 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA |
91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA |
91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA |
91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC |
91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA |
91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
91 | E53SaCas9KKH22 | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA | 93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA |
92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA | 94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA | 95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA |
92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA | 96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA | 97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC |
92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA | 98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA |
92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA | 99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA | 100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
92 | E53SaCas9KKH23 | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA | 94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA | 95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA |
93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA | 96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA | 97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC |
93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA | 98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA |
93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA | 99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA | 100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
93 | E53SaCas9KKH24 | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA |
94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC |
94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA |
94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
94 | E53SaCas9KKH25 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA | 96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG |
95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA | 97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC |
95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA | 98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA |
95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA | 99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA | 100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
95 | E53SaCas9KKH26 | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
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96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG | 98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA |
96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG | 99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG | 100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
96 | E53SaCas9KKH27 | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC | 98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA |
97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC | 99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC | 100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
97 | E53SaCas9KKH28 | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA | 99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA | 100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
98 | E53SaCas9KKH29 | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG | 100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA |
99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
99 | E53SaCas9KKH30 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA | 101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT |
100 | E53SaCas9KKH31 | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
101 | E53SaCas9KKH32 | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT | 102 | E53SaCas9KKH33 | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA |
Seq ID No. | 嚮導ID或嚮導RNA名稱 | 嚮導序列 |
270 | E53Slu2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT |
271 | E53Slu3 | CTTTTGGATTGCATCTACTGTA |
272 | E53Slu4 | TTTTGGATTGCATCTACTGTAT |
273 | E53Slu5 | ACCCTCCTTCCATGACTCAAGC |
274 | E53Slu6 | CTTCCATGACTCAAGCTTGGCT |
275 | E53Slu7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
276 | E53Slu8 | TCAACTGTTGCCTCCGGTTCTG |
277 | E53Slu10 | CCAAAAGAAAATCACAGAAACC |
278 | E53Slu11 | GCCAAGCTTGAGTCATGGAAGG |
279 | E53Slu12 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
280 | E53Slu13 | CAGAGCCAAGCTTGAGTCATGG |
281 | E53Slu14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC |
282 | E53Slu15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA |
283 | E53Slu16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT |
284 | E53Slu17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG |
285 | E53Slu18 | TTCAACACAATGGCTGGAAGCT |
286 | E53Slu19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG |
287 | E53Slu20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA |
288 | E53Slu21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
289 | E53Slu22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
290 | E53Slu23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
291 | E53Slu24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
292 | E53Slu25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
924 | E53SL3.1A-Cv5 | CATTTGGATTGCATCTACTGTA |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA |
926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA |
928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA |
929 | E53Sl3.2G-Cv5 | CTGTTGGATTGCATCTACTGTA |
930 | E53Sl3.3A-Cv5 | CTTATGGATTGCATCTACTGTA |
931 | E53Sl3.3C-Cv5 | CTTCTGGATTGCATCTACTGTA |
932 | E53Sl3.3G-Cv5 | CTTGTGGATTGCATCTACTGTA |
933 | E53Sl3.4A-Cv5 | CTTTAGGATTGCATCTACTGTA |
934 | E53Sl3.4C-Cv5 | CTTTCGGATTGCATCTACTGTA |
935 | E53Sl3.4G-Cv5 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA |
950 | E53SL3-21 | TTTTGGATTGCATCTACTGTA |
951 | E53SL3-20 | TTTGGATTGCATCTACTGTA |
952 | E53SL3-19 | TTGGATTGCATCTACTGTA |
953 | E53SL3-18 | TGGATTGCATCTACTGTA |
954 | E53SL3-17 | GGATTGCATCTACTGTA |
955 | E53SL3-16 | GATTGCATCTACTGTA |
嚮導1 Seq ID No. | 嚮導1 | 嚮導1 序列 | 嚮導2 Seq ID No. | 嚮導2 | 嚮導2 序列 |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 271 | E53SL3 | CTTTTGGATTGCATCTACTGTA |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 272 | E53SL4 | TTTTGGATTGCATCTACTGTAT |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 273 | E53SL5 | ACCCTCCTTCCATGACTCAAGC |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 274 | E53SL6 | CTTCCATGACTCAAGCTTGGCT |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 276 | E53SL8 | TCAACTGTTGCCTCCGGTTCTG |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 277 | E53SL10 | CCAAAAGAAAATCACAGAAACC |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 278 | E53SL11 | GCCAAGCTTGAGTCATGGAAGG |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 279 | E53SL12 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 280 | E53SL13 | CAGAGCCAAGCTTGAGTCATGG |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 282 | E53SL15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 283 | E53SL16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT |
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270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 285 | E53SL18 | TTCAACACAATGGCTGGAAGCT |
270 | E53SL2 | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | 286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG |
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274 | E53SL6 | CTTCCATGACTCAAGCTTGGCT | 283 | E53SL16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT |
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281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC | 283 | E53SL16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT |
281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC | 284 | E53SL17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG |
281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC | 285 | E53SL18 | TTCAACACAATGGCTGGAAGCT |
281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC | 286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG |
281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC | 287 | E53SL20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA |
281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC | 288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC | 289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
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281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
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282 | E53SL15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
282 | E53SL15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
282 | E53SL15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
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283 | E53SL16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT | 288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
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284 | E53SL17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG | 288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
284 | E53SL17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG | 289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
284 | E53SL17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
284 | E53SL17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
284 | E53SL17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
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286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG | 287 | E53SL20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA |
286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG | 288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG | 289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
287 | E53SL20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA | 288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
287 | E53SL20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA | 289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
287 | E53SL20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
287 | E53SL20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
287 | E53SL20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
924 | E53SL3.1A-Cv5 | CATTTGGATTGCATCTACTGTA | 272 | E53SL4 | TTTTGGATTGCATCTACTGTAT |
924 | E53SL3.1A-Cv5 | CATTTGGATTGCATCTACTGTA | 273 | E53SL5 | ACCCTCCTTCCATGACTCAAGC |
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924 | E53SL3.1A-Cv5 | CATTTGGATTGCATCTACTGTA | 285 | E53SL18 | TTCAACACAATGGCTGGAAGCT |
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924 | E53SL3.1A-Cv5 | CATTTGGATTGCATCTACTGTA | 289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
924 | E53SL3.1A-Cv5 | CATTTGGATTGCATCTACTGTA | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
924 | E53SL3.1A-Cv5 | CATTTGGATTGCATCTACTGTA | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
924 | E53SL3.1A-Cv5 | CATTTGGATTGCATCTACTGTA | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 272 | E53SL4 | TTTTGGATTGCATCTACTGTAT |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 273 | E53SL5 | ACCCTCCTTCCATGACTCAAGC |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 274 | E53SL6 | CTTCCATGACTCAAGCTTGGCT |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 276 | E53SL8 | TCAACTGTTGCCTCCGGTTCTG |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 277 | E53SL10 | CCAAAAGAAAATCACAGAAACC |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 278 | E53SL11 | GCCAAGCTTGAGTCATGGAAGG |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 279 | E53SL12 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 280 | E53SL13 | CAGAGCCAAGCTTGAGTCATGG |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 282 | E53SL15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 283 | E53SL16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT |
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925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 285 | E53SL18 | TTCAACACAATGGCTGGAAGCT |
925 | E53SL3.1C-Cv5 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | 286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG |
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926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | 274 | E53SL6 | CTTCCATGACTCAAGCTTGGCT |
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926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | 279 | E53SL12 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | 280 | E53SL13 | CAGAGCCAAGCTTGAGTCATGG |
926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | 281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC |
926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | 282 | E53SL15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA |
926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | 283 | E53SL16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT |
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926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | 285 | E53SL18 | TTCAACACAATGGCTGGAAGCT |
926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | 286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG |
926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | 287 | E53SL20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA |
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926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | 289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
926 | E53Sl3.1G-Cv5 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 272 | E53SL4 | TTTTGGATTGCATCTACTGTAT |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 273 | E53SL5 | ACCCTCCTTCCATGACTCAAGC |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 274 | E53SL6 | CTTCCATGACTCAAGCTTGGCT |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 276 | E53SL8 | TCAACTGTTGCCTCCGGTTCTG |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 277 | E53SL10 | CCAAAAGAAAATCACAGAAACC |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 278 | E53SL11 | GCCAAGCTTGAGTCATGGAAGG |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 279 | E53SL12 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 280 | E53SL13 | CAGAGCCAAGCTTGAGTCATGG |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 282 | E53SL15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 283 | E53SL16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 284 | E53SL17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 285 | E53SL18 | TTCAACACAATGGCTGGAAGCT |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG |
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927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | 272 | E53SL4 | TTTTGGATTGCATCTACTGTAT |
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928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | 274 | E53SL6 | CTTCCATGACTCAAGCTTGGCT |
928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | 276 | E53SL8 | TCAACTGTTGCCTCCGGTTCTG |
928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | 277 | E53SL10 | CCAAAAGAAAATCACAGAAACC |
928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | 278 | E53SL11 | GCCAAGCTTGAGTCATGGAAGG |
928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | 279 | E53SL12 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | 280 | E53SL13 | CAGAGCCAAGCTTGAGTCATGG |
928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | 281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC |
928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | 282 | E53SL15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA |
928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | 283 | E53SL16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT |
928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | 284 | E53SL17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG |
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928 | E53Sl3.2C-Cv5 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | 286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG |
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933 | E53Sl3.4A-Cv5 | CTTTAGGATTGCATCTACTGTA | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
933 | E53Sl3.4A-Cv5 | CTTTAGGATTGCATCTACTGTA | 276 | E53SL8 | TCAACTGTTGCCTCCGGTTCTG |
933 | E53Sl3.4A-Cv5 | CTTTAGGATTGCATCTACTGTA | 277 | E53SL10 | CCAAAAGAAAATCACAGAAACC |
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933 | E53Sl3.4A-Cv5 | CTTTAGGATTGCATCTACTGTA | 279 | E53SL12 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
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933 | E53Sl3.4A-Cv5 | CTTTAGGATTGCATCTACTGTA | 282 | E53SL15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA |
933 | E53Sl3.4A-Cv5 | CTTTAGGATTGCATCTACTGTA | 283 | E53SL16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT |
933 | E53Sl3.4A-Cv5 | CTTTAGGATTGCATCTACTGTA | 284 | E53SL17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG |
933 | E53Sl3.4A-Cv5 | CTTTAGGATTGCATCTACTGTA | 285 | E53SL18 | TTCAACACAATGGCTGGAAGCT |
933 | E53Sl3.4A-Cv5 | CTTTAGGATTGCATCTACTGTA | 286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG |
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934 | E53Sl3.4C-Cv5 | CTTTCGGATTGCATCTACTGTA | 286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG |
934 | E53Sl3.4C-Cv5 | CTTTCGGATTGCATCTACTGTA | 287 | E53SL20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA |
934 | E53Sl3.4C-Cv5 | CTTTCGGATTGCATCTACTGTA | 288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
934 | E53Sl3.4C-Cv5 | CTTTCGGATTGCATCTACTGTA | 289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
934 | E53Sl3.4C-Cv5 | CTTTCGGATTGCATCTACTGTA | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
934 | E53Sl3.4C-Cv5 | CTTTCGGATTGCATCTACTGTA | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
934 | E53Sl3.4C-Cv5 | CTTTCGGATTGCATCTACTGTA | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
935 | E53Sl3.4G-Cv5 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA | 272 | E53SL4 | TTTTGGATTGCATCTACTGTAT |
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935 | E53Sl3.4G-Cv5 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA | 282 | E53SL15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA |
935 | E53Sl3.4G-Cv5 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA | 283 | E53SL16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT |
935 | E53Sl3.4G-Cv5 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA | 284 | E53SL17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG |
935 | E53Sl3.4G-Cv5 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA | 285 | E53SL18 | TTCAACACAATGGCTGGAAGCT |
935 | E53Sl3.4G-Cv5 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA | 286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG |
935 | E53Sl3.4G-Cv5 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA | 287 | E53SL20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA |
935 | E53Sl3.4G-Cv5 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA | 288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
935 | E53Sl3.4G-Cv5 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA | 289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
935 | E53Sl3.4G-Cv5 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
935 | E53Sl3.4G-Cv5 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
935 | E53Sl3.4G-Cv5 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 272 | E53SL4 | TTTTGGATTGCATCTACTGTAT |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 273 | E53SL5 | ACCCTCCTTCCATGACTCAAGC |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 274 | E53SL6 | CTTCCATGACTCAAGCTTGGCT |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 276 | E53SL8 | TCAACTGTTGCCTCCGGTTCTG |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 277 | E53SL10 | CCAAAAGAAAATCACAGAAACC |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 278 | E53SL11 | GCCAAGCTTGAGTCATGGAAGG |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 279 | E53SL12 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 280 | E53SL13 | CAGAGCCAAGCTTGAGTCATGG |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 282 | E53SL15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 283 | E53SL16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 284 | E53SL17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 285 | E53SL18 | TTCAACACAATGGCTGGAAGCT |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 287 | E53SL20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 272 | E53SL4 | TTTTGGATTGCATCTACTGTAT |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 273 | E53SL5 | ACCCTCCTTCCATGACTCAAGC |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 274 | E53SL6 | CTTCCATGACTCAAGCTTGGCT |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 276 | E53SL8 | TCAACTGTTGCCTCCGGTTCTG |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 277 | E53SL10 | CCAAAAGAAAATCACAGAAACC |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 278 | E53SL11 | GCCAAGCTTGAGTCATGGAAGG |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 279 | E53SL12 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 280 | E53SL13 | CAGAGCCAAGCTTGAGTCATGG |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 282 | E53SL15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 283 | E53SL16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 284 | E53SL17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 285 | E53SL18 | TTCAACACAATGGCTGGAAGCT |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 287 | E53SL20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 272 | E53SL4 | TTTTGGATTGCATCTACTGTAT |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 273 | E53SL5 | ACCCTCCTTCCATGACTCAAGC |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 274 | E53SL6 | CTTCCATGACTCAAGCTTGGCT |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 276 | E53SL8 | TCAACTGTTGCCTCCGGTTCTG |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 277 | E53SL10 | CCAAAAGAAAATCACAGAAACC |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 278 | E53SL11 | GCCAAGCTTGAGTCATGGAAGG |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 279 | E53SL12 | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 280 | E53SL13 | CAGAGCCAAGCTTGAGTCATGG |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 281 | E53SL14 | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 282 | E53SL15 | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 283 | E53SL16 | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 284 | E53SL17 | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 285 | E53SL18 | TTCAACACAATGGCTGGAAGCT |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 286 | E53SL19 | GTTAAAGGATTCAACACAATGG |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 287 | E53SL20 | AAATGTTAAAGGATTCAACACA |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 288 | E53SL21 | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 289 | E53SL22 | TACAAGAACACCTTCAGAACCG |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 290 | E53SL23 | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 291 | E53SL24 | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG |
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | 292 | E53SL25 | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA |
950 | E53SL3-21 | TTTTGGATTGCATCTACTGTA | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
951 | E53SL3-20 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
952 | E53SL3-19 | TTGGATTGCATCTACTGTA | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
953 | E53SL3-18 | TGGATTGCATCTACTGTA | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
954 | E53SL3-17 | GGATTGCATCTACTGTA | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
955 | E53SL3-16 | GATTGCATCTACTGTA | 275 | E53SL7 | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT |
Seq ID No. | 嚮導RNA名稱或嚮導ID名稱 | 外顯子_id | 酶 | 股 | 嚮導序列 | pam |
1 | E44Sa1 | 44 | SaCas9 | + | ATTTAGCATGTTCCCAATTCTC | AGGAAT |
2 | E44Sa3 | 44 | SaCas9 | - | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT | GAGAAT |
3 | E45Sa1 | 45 | SaCas9 | + | TCAGGCTTCCCAATTTTTCCTG | TAGAAT |
4 | E45Sa2 | 45 | SaCas9 | + | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | GAGGAT |
5 | E45Sa3 | 45 | SaCas9 | + | TGGCATCTGTTTTTGAGGATTG | CTGAAT |
6 | E45Sa4 | 45 | SaCas9 | + | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | TGGAGT |
7 | E45Sa6 | 45 | SaCas9 | - | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC | CTGAAT |
8 | E45Sa7 | 45 | SaCas9 | - | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA | TTGAAT |
9 | E45Sa8 | 45 | SaCas9 | - | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC | CAGGAT |
10 | E50Sa2 | 50 | SaCas9 | - | AGGAAGTTAGAAGATCTGAGCT | CTGAGT |
11 | E51Sa1 | 51 | SaCas9 | + | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC | CAGAGT |
12 | E51Sa2 | 51 | SaCas9 | + | GTTGTGTCACCAGAGTAACAGT | CTGAGT |
13 | E51Sa4 | 51 | SaCas9 | - | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | GAGGAT |
14 | E51Sa5 | 51 | SaCas9 | - | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | GTGGGT |
15 | E51Sa6 | 51 | SaCas9 | - | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | GAGGGT |
16 | E53Sa1 | 53 | SaCas9 | + | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | TTGGAT |
17 | E53Sa2 | 53 | SaCas9 | + | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | TTGAAT |
18 | E53Sa3 | 53 | SaCas9 | + | CTTGTACTTCATCCCACTGATT | CTGAAT |
19 | E53Sa4 | 53 | SaCas9 | + | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC | TAGAAT |
20 | E53Sa5 | 53 | SaCas9 | - | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | GAGGGT |
21 | E53Sa6 | 53 | SaCas9 | - | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | TTGAGT |
22 | E53Sa7 | 53 | SaCas9 | - | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | AAGGAT |
23 | E53Sa8 | 53 | SaCas9 | - | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG | TTGAAT |
24 | E53Sa9 | 53 | SaCas9 | - | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG | TGGGAT |
25 | E53Sa10 | 53 | SaCas9 | - | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT | CAGAAT |
26 | E53Sa11 | 53 | SaCas9 | - | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA | AAGAAT |
27 | E51SaCas9KKH1 | 51 | SACAS9KKH | + | TCATTTTTTCTCATACCTTCTG | CTTGAT |
28 | E51SaCas9KKH2 | 51 | SACAS9KKH | + | TTTTTTCTCATACCTTCTGCTT | GATGAT |
29 | E51SaCas9KKH3 | 51 | SACAS9KKH | + | CCTTCTGCTTGATGATCATCTC | GTTGAT |
30 | E51SaCas9KKH4 | 51 | SACAS9KKH | + | ATGATCATCTCGTTGATATCCT | CAAGGT |
31 | E51SaCas9KKH5 | 51 | SACAS9KKH | + | AAGGTCACCCACCATCACCCTC | TGTGAT |
32 | E51SaCas9KKH6 | 51 | SACAS9KKH | + | ATCACCCTCTGTGATTTTATAA | CTTGAT |
33 | E51SaCas9KKH7 | 51 | SACAS9KKH | + | ATAACTTGATCAAGCAGAGAAA | GCCAGT |
34 | E51SaCas9KKH8 | 51 | SACAS9KKH | + | CTTGATCAAGCAGAGAAAGCCA | GTCGGT |
35 | E51SaCas9KKH9 | 51 | SACAS9KKH | + | ATCAAGCAGAGAAAGCCAGTCG | GTAAGT |
36 | E51SaCas9KKH10 | 51 | SACAS9KKH | + | CAGTCGGTAAGTTCTGTCCAAG | CCCGGT |
37 | E51SaCas9KKH11 | 51 | SACAS9KKH | + | GTAAGTTCTGTCCAAGCCCGGT | TGAAAT |
38 | E51SaCas9KKH12 | 51 | SACAS9KKH | + | AGCCCGGTTGAAATCTGCCAGA | GCAGGT |
39 | E51SaCas9KKH13 | 51 | SACAS9KKH | + | AGCAGGTACCTCCAACATCAAG | GAAGAT |
40 | E51SaCas9KKH14 | 51 | SACAS9KKH | + | CAACATCAAGGAAGATGGCATT | TCTAGT |
41 | E51SaCas9KKH15 | 51 | SACAS9KKH | + | AGGAAGATGGCATTTCTAGTTT | GGAGAT |
42 | E51SaCas9KKH16 | 51 | SACAS9KKH | + | ATGGCATTTCTAGTTTGGAGAT | GGCAGT |
43 | E51SaCas9KKH17 | 51 | SACAS9KKH | + | CTAGTTTGGAGATGGCAGTTTC | CTTAGT |
44 | E51SaCas9KKH18 | 51 | SACAS9KKH | + | GATGGCAGTTTCCTTAGTAACC | ACAGGT |
45 | E51SaCas9KKH19 | 51 | SACAS9KKH | + | TAGTAACCACAGGTTGTGTCAC | CAGAGT |
46 | E51SaCas9KKH20 | 51 | SACAS9KKH | + | CCACAGGTTGTGTCACCAGAGT | AACAGT |
47 | E51SaCas9KKH21 | 51 | SACAS9KKH | + | GTTGTGTCACCAGAGTAACAGT | CTGAGT |
48 | E51SaCas9KKH22 | 51 | SACAS9KKH | + | GAGTAACAGTCTGAGTAGGAGC | TAAAAT |
49 | E51SaCas9KKH23 | 51 | SACAS9KKH | + | TCTGAGTAGGAGCTAAAATATT | TTGGGT |
50 | E51SaCas9KKH24 | 51 | SACAS9KKH | - | AGAAGGTATGAGAAAAAATGAT | AAAAGT |
51 | E51SaCas9KKH25 | 51 | SACAS9KKH | - | TCAAGCAGAAGGTATGAGAAAA | AATGAT |
52 | E51SaCas9KKH26 | 51 | SACAS9KKH | - | TCATCAAGCAGAAGGTATGAGA | AAAAAT |
53 | E51SaCas9KKH27 | 51 | SACAS9KKH | - | TCAACGAGATGATCATCAAGCA | GAAGGT |
54 | E51SaCas9KKH28 | 51 | SACAS9KKH | - | GTGACCTTGAGGATATCAACGA | GATGAT |
55 | E51SaCas9KKH29 | 51 | SACAS9KKH | - | TGGGTGACCTTGAGGATATCAA | CGAGAT |
56 | E51SaCas9KKH30 | 51 | SACAS9KKH | - | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | GAGGAT |
57 | E51SaCas9KKH31 | 51 | SACAS9KKH | - | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | GTGGGT |
58 | E51SaCas9KKH32 | 51 | SACAS9KKH | - | AAGTTATAAAATCACAGAGGGT | GATGGT |
59 | E51SaCas9KKH33 | 51 | SACAS9KKH | - | ATCAAGTTATAAAATCACAGAG | GGTGAT |
60 | E51SaCas9KKH34 | 51 | SACAS9KKH | - | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | GAGGGT |
61 | E51SaCas9KKH35 | 51 | SACAS9KKH | - | CTTTCTCTGCTTGATCAAGTTA | TAAAAT |
62 | E51SaCas9KKH36 | 51 | SACAS9KKH | - | CCGACTGGCTTTCTCTGCTTGA | TCAAGT |
63 | E51SaCas9KKH37 | 51 | SACAS9KKH | - | ACTTACCGACTGGCTTTCTCTG | CTTGAT |
64 | E51SaCas9KKH38 | 51 | SACAS9KKH | - | GATGTTGGAGGTACCTGCTCTG | GCAGAT |
65 | E51SaCas9KKH39 | 51 | SACAS9KKH | - | AAATGCCATCTTCCTTGATGTT | GGAGGT |
66 | E51SaCas9KKH40 | 51 | SACAS9KKH | - | CCAAACTAGAAATGCCATCTTC | CTTGAT |
67 | E51SaCas9KKH41 | 51 | SACAS9KKH | - | AGGAAACTGCCATCTCCAAACT | AGAAAT |
68 | E51SaCas9KKH42 | 51 | SACAS9KKH | - | CTGTTACTCTGGTGACACAACC | TGTGGT |
69 | E51SaCas9KKH43 | 51 | SACAS9KKH | - | TAGCTCCTACTCAGACTGTTAC | TCTGGT |
70 | E53SaCas9KKH1 | 53 | SACAS9KKH | + | AAAAGGTATCTTTGATACTAAC | CTTGGT |
71 | E53SaCas9KKH2 | 53 | SACAS9KKH | + | CTTTGATACTAACCTTGGTTTC | TGTGAT |
72 | E53SaCas9KKH3 | 53 | SACAS9KKH | + | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | TTGGAT |
73 | E53SaCas9KKH4 | 53 | SACAS9KKH | + | TCCTTAGCTTCCAGCCATTGTG | TTGAAT |
74 | E53SaCas9KKH5 | 53 | SACAS9KKH | + | AACATTTCATTCAACTGTTGCC | TCCGGT |
75 | E53SaCas9KKH6 | 53 | SACAS9KKH | + | TTCAACTGTTGCCTCCGGTTCT | GAAGGT |
76 | E53SaCas9KKH7 | 53 | SACAS9KKH | + | AGGTGTTCTTGTACTTCATCCC | ACTGAT |
77 | E53SaCas9KKH8 | 53 | SACAS9KKH | + | CTTGTACTTCATCCCACTGATT | CTGAAT |
78 | E53SaCas9KKH9 | 53 | SACAS9KKH | + | ACTGATTCTGAATTCTTTCAAC | TAGAAT |
79 | E53SaCas9KKH10 | 53 | SACAS9KKH | + | TTCTTTCAACTAGAATAAAAGG | AAAAAT |
80 | E53SaCas9KKH11 | 53 | SACAS9KKH | + | TTCAACTAGAATAAAAGGAAAA | ATAAAT |
81 | E53SaCas9KKH12 | 53 | SACAS9KKH | + | AGAATAAAAGGAAAAATAAATA | TATAGT |
82 | E53SaCas9KKH13 | 53 | SACAS9KKH | - | GTTAGTATCAAAGATACCTTTT | TAAAAT |
83 | E53SaCas9KKH14 | 53 | SACAS9KKH | - | CACAGAAACCAAGGTTAGTATC | AAAGAT |
84 | E53SaCas9KKH15 | 53 | SACAS9KKH | - | AAAGAAAATCACAGAAACCAAG | GTTAGT |
85 | E53SaCas9KKH16 | 53 | SACAS9KKH | - | TCCAAAAGAAAATCACAGAAAC | CAAGGT |
86 | E53SaCas9KKH17 | 53 | SACAS9KKH | - | ATACAGTAGATGCAATCCAAAA | GAAAAT |
87 | E53SaCas9KKH18 | 53 | SACAS9KKH | - | AGGAGGGTCCCTATACAGTAGA | TGCAAT |
88 | E53SaCas9KKH19 | 53 | SACAS9KKH | - | ATGGAAGGAGGGTCCCTATACA | GTAGAT |
89 | E53SaCas9KKH20 | 53 | SACAS9KKH | - | AGTCATGGAAGGAGGGTCCCTA | TACAGT |
90 | E53SaCas9KKH21 | 53 | SACAS9KKH | - | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | GAGGGT |
91 | E53SaCas9KKH22 | 53 | SACAS9KKH | - | TTAGGACAGGCCAGAGCCAAGC | TTGAGT |
92 | E53SaCas9KKH23 | 53 | SACAS9KKH | - | TGGAAGCTAAGGAAGAAGCTGA | GCAGGT |
93 | E53SaCas9KKH24 | 53 | SACAS9KKH | - | AATGAAATGTTAAAGGATTCAA | CACAAT |
94 | E53SaCas9KKH25 | 53 | SACAS9KKH | - | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | AAGGAT |
95 | E53SaCas9KKH26 | 53 | SACAS9KKH | - | AGAACCGGAGGCAACAGTTGAA | TGAAAT |
96 | E53SaCas9KKH27 | 53 | SACAS9KKH | - | CCTTCAGAACCGGAGGCAACAG | TTGAAT |
97 | E53SaCas9KKH28 | 53 | SACAS9KKH | - | GAACACCTTCAGAACCGGAGGC | AACAGT |
98 | E53SaCas9KKH29 | 53 | SACAS9KKH | - | AAAGAATTCAGAATCAGTGGGA | TGAAGT |
99 | E53SaCas9KKH30 | 53 | SACAS9KKH | - | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG | TGGGAT |
100 | E53SaCas9KKH31 | 53 | SACAS9KKH | - | ATTCTAGTTGAAAGAATTCAGA | ATCAGT |
101 | E53SaCas9KKH32 | 53 | SACAS9KKH | - | TTTTATTCTAGTTGAAAGAATT | CAGAAT |
102 | E53SaCas9KKH33 | 53 | SACAS9KKH | - | TTTTTCCTTTTATTCTAGTTGA | AAGAAT |
103 | E53SaCas9KKH34 | 53 | SACAS9KKH | - | ATATATTTATTTTTCCTTTTAT | TCTAGT |
200 | E44Slu1 | 44 | SluCas9 | + | TATTTAGCATGTTCCCAATTCT | CAGG |
201 | E44Slu2 | 44 | SluCas9 | + | AACAGATCTGTCAAATCGCCTG | CAGG |
202 | E44Slu4 | 44 | SluCas9 | - | TGCTAAATACAAATGGTATCTT | AAGG |
203 | E44Slu5 | 44 | SluCas9 | - | ATTGGGAACATGCTAAATACAA | ATGG |
204 | E44Slu6 | 44 | SluCas9 | - | AAAGACACAAATTCCTGAGAAT | TGGG |
205 | E44Slu7 | 44 | SluCas9 | - | GAAAGACACAAATTCCTGAGAA | TTGG |
206 | E44Slu8 | 44 | SluCas9 | - | ATGATATAAAGATATTTAATCA | GTGG |
207 | E44Slu9 | 44 | SluCas9 | - | TTGACAGATCTGTTGAGAAATG | GCGG |
208 | E44Slu10 | 44 | SluCas9 | - | GATTTGACAGATCTGTTGAGAA | ATGG |
209 | E45Slu1 | 45 | SluCas9 | + | AGACCTCCTGCCACCGCAGATT | CAGG |
210 | E45Slu2 | 45 | SluCas9 | + | TCCCAATTTTTCCTGTAGAATA | CTGG |
211 | E45Slu3 | 45 | SluCas9 | + | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | GAGG |
212 | E45Slu4 | 45 | SluCas9 | + | TTTGCCGCTGCCCAATGCCATC | CTGG |
213 | E45Slu7 | 45 | SluCas9 | - | CTGTCAGACAGAAAAAAGAGGT | AGGG |
214 | E45Slu8 | 45 | SluCas9 | - | GCTGTCAGACAGAAAAAAGAGG | TAGG |
215 | E45Slu9 | 45 | SluCas9 | - | AACAGCTGTCAGACAGAAAAAA | GAGG |
216 | E45Slu10 | 45 | SluCas9 | - | AAGCCTGAATCTGCGGTGGCAG | GAGG |
217 | E45Slu11 | 45 | SluCas9 | - | GGGAAGCCTGAATCTGCGGTGG | CAGG |
218 | E45Slu12 | 45 | SluCas9 | - | AATTGGGAAGCCTGAATCTGCG | GTGG |
219 | E45Slu13 | 45 | SluCas9 | - | AAAAATTGGGAAGCCTGAATCT | GCGG |
220 | E45Slu14 | 45 | SluCas9 | - | GCCAGTATTCTACAGGAAAAAT | TGGG |
221 | E45Slu15 | 45 | SluCas9 | - | TGCCAGTATTCTACAGGAAAAA | TTGG |
222 | E45Slu16 | 45 | SluCas9 | - | AAAAACAGATGCCAGTATTCTA | CAGG |
223 | E45Slu17 | 45 | SluCas9 | - | TGTCAGAACATTGAATGCAACT | GGGG |
224 | E45Slu18 | 45 | SluCas9 | - | TTGTCAGAACATTGAATGCAAC | TGGG |
225 | E45Slu19 | 45 | SluCas9 | - | GTTGTCAGAACATTGAATGCAA | CTGG |
226 | E45Slu20 | 45 | SluCas9 | - | AACTCCAGGATGGCATTGGGCA | GCGG |
227 | E45Slu21 | 45 | SluCas9 | - | TACAGGAACTCCAGGATGGCAT | TGGG |
228 | E45Slu22 | 45 | SluCas9 | - | TTACAGGAACTCCAGGATGGCA | TTGG |
229 | E45Slu23 | 45 | SluCas9 | - | GGTATCTTACAGGAACTCCAGG | ATGG |
230 | E45Slu24 | 45 | SluCas9 | - | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC | CAGG |
231 | E50Slu2 | 50 | SluCas9 | + | AGTATACTTACAGGCTCCAATA | GTGG |
232 | E50Slu3 | 50 | SluCas9 | + | CAGGCTCCAATAGTGGTCAGTC | CAGG |
233 | E50Slu4 | 50 | SluCas9 | + | CAATAGTGGTCAGTCCAGGAGC | TAGG |
234 | E50Slu5 | 50 | SluCas9 | + | GTGGTCAGTCCAGGAGCTAGGT | CAGG |
235 | E50Slu6 | 50 | SluCas9 | + | TTGCCCTCAGCTCTTGAAGTAA | ACGG |
236 | E50Slu9 | 50 | SluCas9 | - | CTAGCTCCTGGACTGACCACTA | TTGG |
237 | E50Slu10 | 50 | SluCas9 | - | GCAAAGCAGCCTGACCTAGCTC | CTGG |
238 | E50Slu11 | 50 | SluCas9 | - | AAACCGTTTACTTCAAGAGCTG | AGGG |
239 | E50Slu12 | 50 | SluCas9 | - | TAAACCGTTTACTTCAAGAGCT | GAGG |
240 | E50Slu13 | 50 | SluCas9 | - | AGATCTGAGCTCTGAGTGGAAG | GCGG |
241 | E50Slu14 | 50 | SluCas9 | - | AGAAGATCTGAGCTCTGAGTGG | AAGG |
242 | E50Slu15 | 50 | SluCas9 | - | AGTTAGAAGATCTGAGCTCTGA | GTGG |
243 | E51Slu1 | 51 | SluCas9 | + | TGATCATCTCGTTGATATCCTC | AAGG |
244 | E51Slu2 | 51 | SluCas9 | + | TTGATCAAGCAGAGAAAGCCAG | TCGG |
245 | E51Slu3 | 51 | SluCas9 | + | AGTCGGTAAGTTCTGTCCAAGC | CCGG |
246 | E51Slu4 | 51 | SluCas9 | + | GCCCGGTTGAAATCTGCCAGAG | CAGG |
247 | E51Slu5 | 51 | SluCas9 | + | CAGAGCAGGTACCTCCAACATC | AAGG |
248 | E51Slu6 | 51 | SluCas9 | + | GGTACCTCCAACATCAAGGAAG | ATGG |
249 | E51Slu7 | 51 | SluCas9 | + | CAAGGAAGATGGCATTTCTAGT | TTGG |
250 | E51Slu8 | 51 | SluCas9 | + | AGATGGCATTTCTAGTTTGGAG | ATGG |
251 | E51Slu9 | 51 | SluCas9 | + | ATGGCAGTTTCCTTAGTAACCA | CAGG |
252 | E51Slu10 | 51 | SluCas9 | + | GTCACCAGAGTAACAGTCTGAG | TAGG |
253 | E51Slu15 | 51 | SluCas9 | - | CAACGAGATGATCATCAAGCAG | AAGG |
254 | E51Slu16 | 51 | SluCas9 | - | GAGGGTGATGGTGGGTGACCTT | GAGG |
255 | E51Slu17 | 51 | SluCas9 | - | ATAAAATCACAGAGGGTGATGG | TGGG |
256 | E51Slu18 | 51 | SluCas9 | - | TATAAAATCACAGAGGGTGATG | GTGG |
257 | E51Slu19 | 51 | SluCas9 | - | AGTTATAAAATCACAGAGGGTG | ATGG |
258 | E51Slu20 | 51 | SluCas9 | - | TGATCAAGTTATAAAATCACAG | AGGG |
259 | E51Slu21 | 51 | SluCas9 | - | TTGATCAAGTTATAAAATCACA | GAGG |
260 | E51Slu22 | 51 | SluCas9 | - | GGGCTTGGACAGAACTTACCGA | CTGG |
261 | E51Slu23 | 51 | SluCas9 | - | CTCTGGCAGATTTCAACCGGGC | TTGG |
262 | E51Slu24 | 51 | SluCas9 | - | ACCTGCTCTGGCAGATTTCAAC | CGGG |
263 | E51Slu25 | 51 | SluCas9 | - | TACCTGCTCTGGCAGATTTCAA | CCGG |
264 | E51Slu26 | 51 | SluCas9 | - | CTTGATGTTGGAGGTACCTGCT | CTGG |
265 | E51Slu27 | 51 | SluCas9 | - | AATGCCATCTTCCTTGATGTTG | GAGG |
266 | E51Slu28 | 51 | SluCas9 | - | AGAAATGCCATCTTCCTTGATG | TTGG |
267 | E51Slu29 | 51 | SluCas9 | - | GGTGACACAACCTGTGGTTACT | AAGG |
268 | E51Slu30 | 51 | SluCas9 | - | TGTTACTCTGGTGACACAACCT | GTGG |
269 | E51Slu31 | 51 | SluCas9 | - | AGCTCCTACTCAGACTGTTACT | CTGG |
270 | E53Slu2 | 53 | SluCas9 | + | CCTTGGTTTCTGTGATTTTCTT | TTGG |
271 | E53Slu3 | 53 | SluCas9 | + | CTTTTGGATTGCATCTACTGTA | TAGG |
272 | E53Slu4 | 53 | SluCas9 | + | TTTTGGATTGCATCTACTGTAT | AGGG |
273 | E53Slu5 | 53 | SluCas9 | + | ACCCTCCTTCCATGACTCAAGC | TTGG |
274 | E53Slu6 | 53 | SluCas9 | + | CTTCCATGACTCAAGCTTGGCT | CTGG |
275 | E53Slu7 | 53 | SluCas9 | + | ACATTTCATTCAACTGTTGCCT | CCGG |
276 | E53Slu8 | 53 | SluCas9 | + | TCAACTGTTGCCTCCGGTTCTG | AAGG |
277 | E53Slu10 | 53 | SluCas9 | - | CCAAAAGAAAATCACAGAAACC | AAGG |
278 | E53Slu11 | 53 | SluCas9 | - | GCCAAGCTTGAGTCATGGAAGG | AGGG |
279 | E53Slu12 | 53 | SluCas9 | - | AGCCAAGCTTGAGTCATGGAAG | GAGG |
280 | E53Slu13 | 53 | SluCas9 | - | CAGAGCCAAGCTTGAGTCATGG | AAGG |
281 | E53Slu14 | 53 | SluCas9 | - | AGGCCAGAGCCAAGCTTGAGTC | ATGG |
282 | E53Slu15 | 53 | SluCas9 | - | AGAAGCTGAGCAGGTCTTAGGA | CAGG |
283 | E53Slu16 | 53 | SluCas9 | - | AAGGAAGAAGCTGAGCAGGTCT | TAGG |
284 | E53Slu17 | 53 | SluCas9 | - | GGAAGCTAAGGAAGAAGCTGAG | CAGG |
285 | E53Slu18 | 53 | SluCas9 | - | TTCAACACAATGGCTGGAAGCT | AAGG |
286 | E53Slu19 | 53 | SluCas9 | - | GTTAAAGGATTCAACACAATGG | CTGG |
287 | E53Slu20 | 53 | SluCas9 | - | AAATGTTAAAGGATTCAACACA | ATGG |
288 | E53Slu21 | 53 | SluCas9 | - | GCAACAGTTGAATGAAATGTTA | AAGG |
289 | E53Slu22 | 53 | SluCas9 | - | TACAAGAACACCTTCAGAACCG | GAGG |
290 | E53Slu23 | 53 | SluCas9 | - | AAGTACAAGAACACCTTCAGAA | CCGG |
291 | E53Slu24 | 53 | SluCas9 | - | AGTTGAAAGAATTCAGAATCAG | TGGG |
292 | E53Slu25 | 53 | SluCas9 | - | TAGTTGAAAGAATTCAGAATCA | GTGG |
104 | E44SaCas9KKH2 | 44 | SaCas9KKH | + | TACCATTTGTATTTAGCATGTT | CCCAAT |
105 | E44SaCas9KKH3 | 44 | SaCas9KKH | + | ATTTAGCATGTTCCCAATTCTC | AGGAAT |
106 | E44SaCas9KKH4 | 44 | SaCas9KKH | + | AACTGTTCAGCTTCTGTTAGCC | ACTGAT |
107 | E44SaCas9KKH5 | 44 | SaCas9KKH | + | TTCAGCTTCTGTTAGCCACTGA | TTAAAT |
108 | E44SaCas9KKH6 | 44 | SaCas9KKH | + | CACTGATTAAATATCTTTATAT | CATAAT |
109 | E44SaCas9KKH7 | 44 | SaCas9KKH | + | ATGAAAACGCCGCCATTTCTCA | ACAGAT |
110 | E44SaCas9KKH8 | 44 | SaCas9KKH | + | CCGCCATTTCTCAACAGATCTG | TCAAAT |
111 | E44SaCas9KKH9 | 44 | SaCas9KKH | + | CAACAGATCTGTCAAATCGCCT | GCAGGT |
112 | E44SaCas9KKH14 | 44 | SaCas9KKH | - | TAAATACAAATGGTATCTTAAG | GTAAGT |
113 | E44SaCas9KKH15 | 44 | SaCas9KKH | - | ATGCTAAATACAAATGGTATCT | TAAGGT |
114 | E44SaCas9KKH16 | 44 | SaCas9KKH | - | AATTGGGAACATGCTAAATACA | AATGGT |
115 | E44SaCas9KKH17 | 44 | SaCas9KKH | - | GAGAATTGGGAACATGCTAAAT | ACAAAT |
116 | E44SaCas9KKH18 | 44 | SaCas9KKH | - | ATTCCTGAGAATTGGGAACATG | CTAAAT |
117 | E44SaCas9KKH19 | 44 | SaCas9KKH | - | TCTCAGAAAGACACAAATTCCT | GAGAAT |
118 | E44SaCas9KKH20 | 44 | SaCas9KKH | - | CTGAACAGTTTCTCAGAAAGAC | ACAAAT |
119 | E44SaCas9KKH21 | 44 | SaCas9KKH | - | AATCAGTGGCTAACAGAAGCTG | AACAGT |
120 | E44SaCas9KKH22 | 44 | SaCas9KKH | - | CATTATGATATAAAGATATTTA | ATCAGT |
121 | E44SaCas9KKH23 | 44 | SaCas9KKH | - | TTTTCATTATGATATAAAGATA | TTTAAT |
122 | E44SaCas9KKH24 | 44 | SaCas9KKH | - | GGCGGCGTTTTCATTATGATAT | AAAGAT |
123 | E44SaCas9KKH25 | 44 | SaCas9KKH | - | TGAGAAATGGCGGCGTTTTCAT | TATGAT |
124 | E44SaCas9KKH26 | 44 | SaCas9KKH | - | AGGCGATTTGACAGATCTGTTG | AGAAAT |
125 | E44SaCas9KKH27 | 44 | SaCas9KKH | - | GCTTTTACCTGCAGGCGATTTG | ACAGAT |
126 | E45SaCas9KKH1 | 45 | SaCas9KKH | + | TGTTTGCAGACCTCCTGCCACC | GCAGAT |
127 | E45SaCas9KKH2 | 45 | SaCas9KKH | + | CTGCCACCGCAGATTCAGGCTT | CCCAAT |
128 | E45SaCas9KKH3 | 45 | SaCas9KKH | + | TCAGGCTTCCCAATTTTTCCTG | TAGAAT |
129 | E45SaCas9KKH4 | 45 | SaCas9KKH | + | TAGAATACTGGCATCTGTTTTT | GAGGAT |
130 | E45SaCas9KKH5 | 45 | SaCas9KKH | + | TGGCATCTGTTTTTGAGGATTG | CTGAAT |
131 | E45SaCas9KKH6 | 45 | SaCas9KKH | + | AGGATTGCTGAATTATTTCTTC | CCCAGT |
132 | E45SaCas9KKH7 | 45 | SaCas9KKH | + | AATTATTTCTTCCCCAGTTGCA | TTCAAT |
133 | E45SaCas9KKH8 | 45 | SaCas9KKH | + | CAGTTGCATTCAATGTTCTGAC | AACAGT |
134 | E45SaCas9KKH9 | 45 | SaCas9KKH | + | TTCTGACAACAGTTTGCCGCTG | CCCAAT |
135 | E45SaCas9KKH10 | 45 | SaCas9KKH | + | TTGCCGCTGCCCAATGCCATCC | TGGAGT |
136 | E45SaCas9KKH16 | 45 | SaCas9KKH | - | AAACAGCTGTCAGACAGAAAAA | AGAGGT |
137 | E45SaCas9KKH17 | 45 | SaCas9KKH | - | GAAGCCTGAATCTGCGGTGGCA | GGAGGT |
138 | E45SaCas9KKH18 | 45 | SaCas9KKH | - | GAAAAATTGGGAAGCCTGAATC | TGCGGT |
139 | E45SaCas9KKH19 | 45 | SaCas9KKH | - | TCTACAGGAAAAATTGGGAAGC | CTGAAT |
140 | E45SaCas9KKH20 | 45 | SaCas9KKH | - | ACAGATGCCAGTATTCTACAGG | AAAAAT |
141 | E45SaCas9KKH21 | 45 | SaCas9KKH | - | TCAGCAATCCTCAAAAACAGAT | GCCAGT |
142 | E45SaCas9KKH22 | 45 | SaCas9KKH | - | AATAATTCAGCAATCCTCAAAA | ACAGAT |
143 | E45SaCas9KKH23 | 45 | SaCas9KKH | - | GCAACTGGGGAAGAAATAATTC | AGCAAT |
144 | E45SaCas9KKH24 | 45 | SaCas9KKH | - | CATTGAATGCAACTGGGGAAGA | AATAAT |
145 | E45SaCas9KKH25 | 45 | SaCas9KKH | - | GAACATTGAATGCAACTGGGGA | AGAAAT |
146 | E45SaCas9KKH26 | 45 | SaCas9KKH | - | GCGGCAAACTGTTGTCAGAACA | TTGAAT |
147 | E45SaCas9KKH27 | 45 | SaCas9KKH | - | TTTTGGTATCTTACAGGAACTC | CAGGAT |
148 | E50SaCas9KKH1 | 50 | SaCas9KKH | + | GGGATCCAGTATACTTACAGGC | TCCAAT |
149 | E50SaCas9KKH2 | 50 | SaCas9KKH | + | ATCCAGTATACTTACAGGCTCC | AATAGT |
150 | E50SaCas9KKH3 | 50 | SaCas9KKH | + | CAGTATACTTACAGGCTCCAAT | AGTGGT |
151 | E50SaCas9KKH4 | 50 | SaCas9KKH | + | ATACTTACAGGCTCCAATAGTG | GTCAGT |
152 | E50SaCas9KKH5 | 50 | SaCas9KKH | + | CCAATAGTGGTCAGTCCAGGAG | CTAGGT |
153 | E50SaCas9KKH6 | 50 | SaCas9KKH | + | AGGCTGCTTTGCCCTCAGCTCT | TGAAGT |
154 | E50SaCas9KKH7 | 50 | SaCas9KKH | + | TTTGCCCTCAGCTCTTGAAGTA | AACGGT |
155 | E50SaCas9KKH8 | 50 | SaCas9KKH | + | TTTACCGCCTTCCACTCAGAGC | TCAGAT |
156 | E50SaCas9KKH10 | 50 | SaCas9KKH | - | GGACTGACCACTATTGGAGCCT | GTAAGT |
157 | E50SaCas9KKH11 | 50 | SaCas9KKH | - | AAGATCTGAGCTCTGAGTGGAA | GGCGGT |
158 | E50SaCas9KKH12 | 50 | SaCas9KKH | - | AGGAAGTTAGAAGATCTGAGCT | CTGAGT |
159 | E50SaCas9KKH13 | 50 | SaCas9KKH | - | TTTTCTGTTAAAGAGGAAGTTA | GAAGAT |
924 | E53SL3.1A-Cv5 | 53 | SluCas9 | CATTTGGATTGCATCTACTGTA | ||
925 | E53SL3.1C-Cv5 | 53 | SluCas9 | CCTTTGGATTGCATCTACTGTA | ||
926 | E53Sl3.1G-Cv5 | 53 | SluCas9 | CGTTTGGATTGCATCTACTGTA | ||
927 | E53Sl3.2A-Cv5 | 53 | SluCas9 | CTATTGGATTGCATCTACTGTA | ||
928 | E53Sl3.2C-Cv5 | 53 | SluCas9 | CTCTTGGATTGCATCTACTGTA | ||
929 | E53Sl3.2G-Cv5 | 53 | SluCas9 | CTGTTGGATTGCATCTACTGTA | ||
930 | E53Sl3.3A-Cv5 | 53 | SluCas9 | CTTATGGATTGCATCTACTGTA | ||
931 | E53Sl3.3C-Cv5 | 53 | SluCas9 | CTTCTGGATTGCATCTACTGTA | ||
932 | E53Sl3.3G-Cv5 | 53 | SluCas9 | CTTGTGGATTGCATCTACTGTA | ||
933 | E53Sl3.4A-Cv5 | 53 | SluCas9 | CTTTAGGATTGCATCTACTGTA | ||
934 | E53Sl3.4C-Cv5 | 53 | SluCas9 | CTTTCGGATTGCATCTACTGTA | ||
935 | E53Sl3.4G-Cv5 | 53 | SluCas9 | CTTTGGGATTGCATCTACTGTA | ||
936 | E53Sl3.del2-Cv5 | 53 | SluCas9 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | ||
937 | E53Sl3.delT-Cv5 | 53 | SluCas9 | CTTTGGATTGCATCTACTGTA | ||
938 | E53Sl3.delT+A.-Cv5 | 53 | SluCas9 | ACTTTGGATTGCATCTACTGTA | ||
950 | E53SL3-21 | 53 | SluCas9 | TTTTGGATTGCATCTACTGTA | ||
951 | E53SL3-20 | 53 | SluCas9 | TTTGGATTGCATCTACTGTA | ||
952 | E53SL3-19 | 53 | SluCas9 | TTGGATTGCATCTACTGTA | ||
953 | E53SL3-18 | 53 | SluCas9 | TGGATTGCATCTACTGTA | ||
954 | E53SL3-17 | 53 | SluCas9 | GGATTGCATCTACTGTA | ||
955 | E53SL3-16 | 53 | SluCas9 | GATTGCATCTACTGTA |
在一些實施例中,提供一種組合物,其包含一或多個嚮導RNA,或編碼一或多個嚮導RNA之一或多個核酸,該一或多個嚮導RNA包含
表 6之一或多個嚮導序列(用於SaCas9之SEQ ID NO: 1-159及用於SluCas9之200-292、924-938、950及955)或由其組成。
表 6提供與各嚮導序列相關之核酸內切酶,使得對於本文所描述之各嚮導序列,可確定與嚮導配對(用於組合物)或與嚮導一起使用(用於方法/用途)之核酸內切酶類型。
在一些實施例中,提供一種組合物,其包含一或多個嚮導RNA或編碼一或多個嚮導RNA之一或多個核酸,其中該嚮導RNA包含
表 6之嚮導序列的至少16、17、18、19或20個連續核苷酸,或與包含
表 6之嚮導序列之至少16、17、18、19或20個核苷酸的嚮導序列至少70%、至少75%、至少80%、至少85%或至少90%一致。在特定實施例中,提供一種組合物,其包含一或多個嚮導RNA或編碼一或多個嚮導RNA之一或多個核酸,其中該嚮導RNA包含
表 6之嚮導序列的至少20個連續核苷酸,或與包含
表 6之嚮導序列之至少20個核苷酸的嚮導序列至少70%、至少75%、至少80%、至少85%或至少90%一致。在其他具體實施例中,提供一種組合物,其包含一或多個嚮導RNA或編碼一或多個嚮導RNA之一或多個核酸,其中該嚮導RNA包含
表 6之嚮導序列的不超過16、不超過17、不超過18、不超過19、不超過20、不超過21或不超過22個連續核苷酸,或與包含
表 6之嚮導序列之不超過16、不超過17、不超過18、不超過19、不超過20、不超過21或不超過22個連續核苷酸的嚮導序列至少70%、至少75%、至少80%、至少85%或至少90%一致。
在一些實施例中,提供一種包含兩個或更多個嚮導RNA或編碼兩個或更多個嚮導RNA之核酸的組合物,其中各嚮導RNA包含
表 6之嚮導序列,或
表 6之嚮導序列的至少16、17、18、19或20個連續核苷酸,或與包含選自
表 6之嚮導序列之至少16、17、18、19或20個核苷酸的嚮導序列至少70%、至少75%、至少80%、至少85%或至少90%一致。在特定實施例中,提供一種包含兩個或更多個嚮導RNA或編碼兩個或更多個嚮導RNA之核酸的組合物,其中各嚮導RNA包含
表 6之嚮導序列的至少20個連續核苷酸,或與包含選自
表 6之嚮導序列之至少20個核苷酸的嚮導序列至少70%、至少75%、至少80%、至少85%或至少90%一致。在其他具體實施例中,提供一種包含兩個或更多個嚮導RNA或編碼兩個或更多個嚮導RNA之核酸的組合物,其中該等兩個或更多個嚮導RNA中之至少一個,視情況各嚮導RNA包含
表 6之嚮導序列的不超過16、不超過17、不超過18、不超過19、不超過20、不超過21或不超過22個連續核苷酸,或與包含選自
表 6之嚮導序列之不超過16、不超過17、不超過18、不超過19、不超過20、不超過21或不超過22個連續核苷酸的嚮導序列至少70%、至少75%、至少80%、至少85%或至少90%一致。
在一些實施例中,提供一種組合物,其包含一對嚮導RNA或編碼一對嚮導RNA之核酸,其中該成對嚮導RNA包含來自
表 1B 、 1D 、 2B 、 2D 、 3B 、 3D 、 4B 、 4D 、 5B及
5D中所揭示任何一對的序列。在一些實施例中,提供一種組合物,其包含以下所揭示任何一對嚮導RNA序列:
表 1B 、 1D 、 2B 、 2D 、 3B 、 3D 、 4B 、 4D 、 5B及
5D。
在一些實施例中,提供一種組合物,其包含一或多種核酸分子,其中該等分子中之至少一者包含編碼以下之核酸:a) SaCas9或SluCas9;及b)包含第一嚮導序列及第二嚮導序列之第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,其中該第一嚮導序列及第二嚮導序列係選自以下任何一對嚮導序列:
表 1B 、 1D 、 2B 、 2D 、 3B 、 3D 、 4B 、 4D 、 5B 及 5D。
在一些實施例中,提供一種包含兩個核酸分子之組合物,其中分子中之至少一者包含編碼第一嚮導RNA及第二嚮導RNA之核酸,該第一嚮導RNA及第二嚮導RNA包含第一嚮導序列及第二嚮導序列,其中該第一嚮導序列及第二嚮導序列係選自表
1B 、 1D 、 2B 、 2D 、 3B 、 3D 、 4B 、 4D 、 5B及
5D中任何一對嚮導序列,視情況其中該核酸不包含編碼核酸內切酶之核酸。
在一些實施例中,提供一種包含一對嚮導RNA之組合物,其中該成對嚮導RNA包含外顯子44之
表 1B 或 1D中之任一者中任何一對嚮導序列或由其組成。在一些實施例中,提供一種組合物,其包含一對嚮導RNA或編碼一對嚮導RNA之核酸,其中該成對嚮導RNA包含外顯子45之
表 2B 或 2D中之任一者中任何一對嚮導序列或由其組成。在一些實施例中,提供一種包含一對嚮導RNA之組合物,其中該成對嚮導RNA包含外顯子50之
表 3B 或 3D中之任一者中任何一對嚮導序列或由其組成。在一些實施例中,提供一種包含一對嚮導RNA之組合物,其中該成對嚮導RNA包含外顯子51之
表 4B 或 4D中之任一者中任何一對嚮導序列或由其組成。在一些實施例中,提供一種包含一對嚮導RNA之組合物,其中該成對嚮導RNA包含外顯子53之
表 5B 或 5D中之任一者中任何一對嚮導序列或由其組成。在一些實施例中,提供一種組合物,其包含一或多個編碼一對嚮導RNA之核酸分子,其中該成對嚮導RNA包含外顯子44之
表 1B 或 1D中之任一者中任何一對嚮導序列或由其組成。在一些實施例中,提供一種組合物,其包含一或多個編碼一對嚮導RNA之核酸分子,其中該成對嚮導RNA包含外顯子45之
表 2B 或 2D中之任一者中任何一對嚮導序列或由其組成。在一些實施例中,提供一種組合物,其包含一或多個編碼一對嚮導RNA之核酸分子,其中該成對嚮導RNA包含外顯子50之
表 3B 或 3D中之任一者中任何一對嚮導序列或由其組成。在一些實施例中,提供一種組合物,其包含一或多個編碼一對嚮導RNA之核酸分子,其中該成對嚮導RNA包含外顯子51之
表 4B 或 4D中之任一者中任何一對嚮導序列或由其組成。在一些實施例中,提供一種組合物,其包含一或多個編碼一對嚮導RNA之核酸分子,其中該成對嚮導RNA包含外顯子53之
表 5B 或 5D中之任一者中任何一對嚮導序列或由其組成。
在一些實施例中,提供一種組合物,其包含一對嚮導RNA或編碼一對嚮導RNA之核酸,其中該嚮導RNA包含以下任何一對嚮導序列或由其組成:
a.對於外顯子44 (例如,具有SluCas9):SEQ ID NO: 200及203;200及204;202及203;202及205;202及206;202及207;204及208;204及205;204及206;204及207;或204及208;
b.對於外顯子45 (例如,具有SluCas9),SEQ ID NO: 223及230;或224及212。
c.對於具有SluCas9之外顯子50,SEQ ID NO: 231及232;231及234;231及236;231及237;236及233;236及235;236及238;236及240;或236及241;
d.對於外顯子51 (例如,具有SaCas9),SEQ ID NO: 28及57;31及57;31及46;32及69;33及57;33及69;34及57;36及69;37及69;37及46;39及46;40及46;46及35;46及62;46及65;46及67;47及57;48及57;49及57;51及57;53及46;54及46;55及46;58及46;59及46;60及46;61及69;或69及30;
e.對於外顯子51 (例如,具有SluCas9),SEQ ID NO: 243及252;245及252;252及253;252及254;252及256;252及257;252及258;252及262;252及264;252及265;或252及266;
f.對於外顯子53 (例如,具有SaCas9),SEQ ID NO: 86及96;87及96;88及97;89及96;90及97;92及77;92及78;92及96;92及99;93及98;93及102;94及100;95及77;95及78;95及99;96及100;97及98;97及102;98及73;或102及73;及
g.對於外顯子53 (例如,具有SluCas9),SEQ ID NO: 278及290;278及292;281及291;283及290;283及292;287及291;272及290;290及291;272及292;950及275;951及275;952及275;953及275;954及275;或955及275。
在一些實施例中,提供一種組合物,其包含:i) SaCas9-KKH或編碼SaCas9-KKH之核酸,及ii)第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,或編碼第一嚮導RNA及第二嚮導RNA之核酸,其中該第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 88之核苷酸序列,且其中該第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 97之核苷酸序列。在一些實施例中,提供一種組合物,其包含:i) SluCas9或編碼SluCas9之核酸,及ii)第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,或編碼第一嚮導RNA及第二嚮導RNA之核酸,其中該第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 283之核苷酸序列,且其中該第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 290之核苷酸序列。在一些實施例中,提供一種組合物,其包含:i) SluCas9或編碼SluCas9之核酸,及ii)第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,或編碼第一嚮導RNA及第二嚮導RNA之核酸,其中該第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 283之核苷酸序列,且其中該第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 292之核苷酸序列。
在一些實施例中,本發明提供一或多個編碼一對嚮導RNA之核酸分子,該成對嚮導RNA包含第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,其中該第一嚮導RNA及該第二嚮導RNA靶向外顯子53。在一些實施例中,嚮導RNA與SaCas9核酸內切酶一起使用。在一些實施例中,一或多個核酸分子亦編碼SaCas9核酸內切酶。在一些實施例中,一或多個核酸分子在進一步包含SaCas9核酸內切酶之組合物中。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 86之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 96之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 87之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 96之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 88之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 97之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 89之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 96之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 90之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 97之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 92之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 77之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 92之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 78之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 92之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 96之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 92之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 99之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 93之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 98之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 93之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 102之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 94之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 100之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 95之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 77之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 95之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 78之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 95之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 99之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 96之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 100之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 97之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 98之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 97之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 102之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 98之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 73之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 102之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 73之序列。在一些實施例中,嚮導RNA各自包含含有SEQ ID NO: 504之序列的支架序列。
在一些實施例中,本發明提供一或多個編碼一對嚮導RNA之核酸分子,該成對嚮導RNA包含第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,其中該第一嚮導RNA及該第二嚮導RNA靶向外顯子53。在一些實施例中,嚮導RNA與SluCas9核酸內切酶一起使用。在一些實施例中,該一或多個核酸分子亦編碼SluCas9核酸內切酶。在一些實施例中,該一或多個核酸分子處於進一步包含SluCas9核酸內切酶之組合物中。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 278之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 290之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 278之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 292之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 281之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 291之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 283之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 290之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 283之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 292之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 287之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 291之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 272之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 290之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 291之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 290之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 278之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 290之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 272之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 292之序列。在一些實施例中,嚮導RNA各自包含含有SEQ ID NO: 901之序列的支架序列。
在一些實施例中,本發明提供一或多個編碼一對嚮導RNA之核酸分子,該成對嚮導RNA包含第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,其中該第一嚮導RNA及該第二嚮導RNA靶向外顯子44。在一些實施例中,嚮導RNA與SluCas9核酸內切酶一起使用。在一些實施例中,該一或多個核酸分子亦編碼SluCas9核酸內切酶。在一些實施例中,該一或多個核酸分子處於進一步包含SluCas9核酸內切酶之組合物中。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 200之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 203之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 200之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 204之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 202之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 203之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 202之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 205之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 202之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 206之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 202之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 207之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 204之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 208之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 204之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 205之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 204之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 206之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 204之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 207之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 204之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 208之序列。在一些實施例中,嚮導RNA各自包含含有SEQ ID NO: 901之序列的支架序列。
在一些實施例中,本發明提供一或多個編碼一對嚮導RNA之核酸分子,該成對嚮導RNA包含第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,其中該第一嚮導RNA及該第二嚮導RNA靶向外顯子50。在一些實施例中,嚮導RNA與SluCas9核酸內切酶一起使用。在一些實施例中,該一或多個核酸分子亦編碼SluCas9核酸內切酶。在一些實施例中,該一或多個核酸分子處於進一步包含SluCas9核酸內切酶之組合物中。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 231之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 232之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 231之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 234之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 231之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 236之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 231之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 237之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 236之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 233之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 236之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 235之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 236之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 238之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 236之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 240之序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含SEQ ID NO: 236之序列且第二嚮導RNA包含SEQ ID NO: 241之序列。在一些實施例中,嚮導RNA各自包含含有SEQ ID NO: 901之序列的支架序列。
在一些實施例中,組合物進一步包含核酸內切酶或編碼核酸內切酶之核酸。與嚮導RNA或嚮導RNA對中之各者一起使用的例示性核酸內切酶提供於本文中,例如在
表 6中,在行「酶」處,或在「嚮導ID」名稱中,對於「SaCas9」為「Sa」、對於「SaCas9」為「SaCas9KKH」或對於「SluCas9」為「SL」。
在一些實施例中,提供一種組合物,其包含單個核酸分子,該核酸分子包含編碼本文所揭示之嚮導RNA中之任一者或本文所揭示之嚮導RNA對中之任一者的核酸及視情況選用的編碼核酸內切酶之核酸。
在一些實施例中,提供一種組合物,其包含至少兩個核酸分子,該等核酸分子包含編碼本文所揭示之嚮導RNA中之任一者或本文所揭示之嚮導RNA對中之任一者的核酸及視情況選用的編碼核酸內切酶之核酸,其中至少一個核酸分子不包含編碼核酸內切酶之核酸。
在一些實施例中,提供一種組合物,其包含單個核酸分子或由單個核酸分子組成,該核酸分子包含:i)編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)及至少一個、至少兩個或至少三個嚮導RNA的核酸;或ii)編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)及一至n個嚮導RNA的核酸,其中n不超過可自該核酸表現之嚮導RNA的最大數目;或iii)編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)之核酸及一至三個嚮導RNA,其中在各情況下,單個核酸分子包含編碼
表 6之至少一個、至少兩個或兩個嚮導序列之核酸。在一些實施例中,單個核酸分子包含編碼以下任何一對嚮導序列的核酸:
a.對於外顯子44 (具有例如SaCas9),SEQ ID NO:1及3;110及120;110及121;110及122;110及123;110及124;110及125;111及112;111及113;111及114;111及115;111及116;111及117;111及118;111及119;111及120;111及121;111及122;111及123;111及124;111及125;112及113;112及114;112及115;112及116;112及117;112及118;112及119;112及120;112及121;112及122;112及123;112及124;112及125;113及114;113及115;113及116;113及117;113及118;113及119;113及120;113及121;113及122;113及123;113及124;113及125;114及115;114及116;114及117;114及118;114及119;114及120;114及121;114及122;114及123;114及124;114及125;115及116;115及117;115及118;115及119;115及120;115及121;115及122;115及123;115及124;115及125;116及117;116及118;116及119;116及120;116及121;116及122;116及123;116及124;116及125;117及118;117及119;117及120;117及121;117及122;117及123;117及124;117及125;118及119;118及120;118及121;118及122;118及123;118及124;118及125;119及120;119及121;119及122;119及123;119及124;119及125;120及121;120及122;120及123;120及124;120及125;121及122;121及123;121及124;121及125;122及123;122及124;122及125;123及124;123及125;124及125;
b.對於外顯子44 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO:200及201;200及202;200及203;200及204;200及205;200及206;200及207;200及208;201及202;201及203;201及204;201及205;201及206;201及207;201及208;202及203;202及204;202及205;202及206;202及207;202及208;203及204;203及205;203及206;203及207;203及208;204及205;204及206;204及207;204及208;205及206;205及207;205及208;206及207;206及208;207及208;
c.對於外顯子45 (具有例如SaCas9),SEQ ID NO:3及4;3及5;3及6;3及7;3及8;3及9;4及5;4及6;4及7;4及8;4及9;5及6;5及7;5及8;5及9;6及7;6及8;6及9;7及8;7及9;8及9;126及127;126及128;126及129;126及130;126及131;126及132;126及133;126及134;126及135;126及136;126及137;126及138;126及139;126及140;126及141;126及142;126及143;126及144;126及145;126及146;126及147;127及128;127及129;127及130;127及131;127及132;127及133;127及134;127及135;127及136;127及137;127及138;127及139;127及140;127及141;127及142;127及143;127及144;127及145;127及146;127及147;128及129;128及130;128及131;128及132;128及133;128及134;128及135;128及136;128及137;128及138;128及139;128及140;128及141;128及142;128及143;128及144;128及145;128及146;128及147;129及130;129及131;129及132;129及133;129及134;129及135;129及136;129及137;129及138;129及139;129及140;129及141;129及142;129及143;129及144;129及145;129及146;129及147;130及131;130及132;130及133;130及134;130及135;130及136;130及137;130及138;130及139;130及140;130及141;130及142;130及143;130及144;130及145;130及146;130及147;131及132;131及133;131及134;131及135;131及136;131及137;131及138;131及139;131及140;131及141;131及142;131及143;131及144;131及145;131及146;131及147;132及133;132及134;132及135;132及136;132及137;132及138;132及139;132及140;132及141;132及142;132及143;132及144;132及145;132及146;132及147;133及134;133及135;133及136;133及137;133及138;133及139;133及140;133及141;133及142;133及143;133及144;133及145;133及146;133及147;134及135;134及136;134及137;134及138;134及139;134及140;134及141;134及142;134及143;134及144;134及145;134及146;134及147;135及136;135及137;135及138;135及139;135及140;135及141;135及142;135及143;135及144;135及145;135及146;135及147;136及137;136及138;136及139;136及140;136及141;136及142;136及143;136及144;136及145;136及146;136及147;137及138;137及139;137及140;137及141;137及142;137及143;137及144;137及145;137及146;137及147;138及139;138及140;138及141;138及142;138及143;138及144;138及145;138及146;138及147;139及140;139及141;139及142;139及143;139及144;139及145;139及146;139及147;140及141;140及142;140及143;140及144;140及145;140及146;140及147;141及142;141及143;141及144;141及145;141及146;141及147;142及143;142及144;142及145;142及146;142及147;143及144;143及145;143及146;143及147;144及145;144及146;144及147;145及146;145及147;146及147;
d.對於外顯子45 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO:209及210;209及211;209及212;209及213;209及214;209及215;209及216;209及217;209及218;209及219;209及220;209及221;209及222;209及223;209及224;209及225;209及226;209及227;209及228;209及229;209及230;210及211;210及212;210及213;210及214;210及215;210及216;210及217;210及218;210及219;210及220;210及221;210及222;210及223;210及224;210及225;210及226;210及227;210及228;210及229;210及230;211及212;211及213;211及214;211及215;211及216;211及217;211及218;211及219;211及220;211及221;211及222;211及223;211及224;211及225;211及226;211及227;211及228;211及229;211及230;212及213;212及214;212及215;212及216;212及217;212及218;212及219;212及220;212及221;212及222;212及223;212及224;212及225;212及226;212及227;212及228;212及229;212及230;213及214;213及215;213及216;213及217;213及218;213及219;213及220;213及221;213及222;213及223;213及224;213及225;213及226;213及227;213及228;213及229;213及230;214及215;214及216;214及217;214及218;214及219;214及220;214及221;214及222;214及223;214及224;214及225;214及226;214及227;214及228;214及229;214及230;215及216;215及217;215及218;215及219;215及220;215及221;215及222;215及223;215及224;215及225;215及226;215及227;215及228;215及229;215及230;216及217;216及218;216及219;216及220;216及221;216及222;216及223;216及224;216及225;216及226;216及227;216及228;216及229;216及230;217及218;217及219;217及220;217及221;217及222;217及223;217及224;217及225;217及226;217及227;217及228;217及229;217及230;218及219;218及220;218及221;218及222;218及223;218及224;218及225;218及226;218及227;218及228;218及229;218及230;219及220;219及221;219及222;219及223;219及224;219及225;219及226;219及227;219及228;219及229;219及230;220及221;220及222;220及223;220及224;220及225;220及226;220及227;220及228;220及229;220及230;221及222;221及223;221及224;221及225;221及226;221及227;221及228;221及229;221及230;222及223;222及224;222及225;222及226;222及227;222及228;222及229;222及230;223及224;223及225;223及226;223及227;223及228;223及229;223及230;224及225;224及226;224及227;224及228;224及229;224及230;225及226;225及227;225及228;225及229;225及230;226及227;226及228;226及229;226及230;227及228;227及229;227及230;228及229;228及230;229及230;
e.對於外顯子50 (具有例如SaCas9),SEQ ID NO: 148及149;148及150;148及151;148及152;148及153;148及154;148及155;148及156;148及157;148及158;148及159;149及150;149及151;149及152;149及153;149及154;149及155;149及156;149及157;149及158;149及159;150及151;150及152;150及153;150及154;150及155;150及156;150及157;150及158;150及159;151及152;151及153;151及154;151及155;151及156;151及157;151及158;151及159;152及153;152及154;152及155;152及156;152及157;152及158;152及159;153及154;153及155;153及156;153及157;153及158;153及159;154及155;154及156;154及157;154及158;154及159;155及156;155及157;155及158;155及159;156及157;156及158;156及159;157及158;157及159;158及159;
f.對於外顯子50 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO:231及232;231及233;231及234;231及235;231及236;231及237;231及238;231及239;231及240;231及241;231及242;232及233;232及234;232及235;232及236;232及237;232及238;232及239;232及240;232及241;232及242;233及234;233及235;233及236;233及237;233及238;233及239;233及240;233及241;233及242;234及235;234及236;234及237;234及238;234及239;234及240;234及241;234及242;235及236;235及237;235及238;235及239;235及240;235及241;235及242;236及237;236及238;236及239;236及240;236及241;236及242;237及238;237及239;237及240;237及241;237及242;238及239;238及240;238及241;238及242;239及240;239及241;239及242;240及241;240及242;241及242;
g.對於外顯子51 (具有例如SaCas9),SEQ ID NO:11及12;11及13;11及14;11及15;12及13;12及14;12及15;13及14;13及15;14及15;27及28;27及29;27及30;27及31;27及32;27及33;27及34;27及35;27及36;27及37;27及38;27及39;27及40;27及41;27及42;27及43;27及44;27及45;27及46;27及47;27及48;27及53;27及54;27及55;27及56;27及57;27及58;27及59;27及60;27及61;27及62;27及63;27及64;27及65;27及66;27及67;27及68;27及69;28及29;28及30;28及31;28及32;28及33;28及34;28及35;28及36;28及37;28及38;28及39;28及40;28及41;28及42;28及43;28及44;28及45;28及46;28及47;28及48;28及53;28及54;28及55;28及56;28及57;28及58;28及59;28及60;28及61;28及62;28及63;28及64;28及65;28及66;28及67;28及68;28及69;29及30;29及31;29及32;29及33;29及34;29及35;29及36;29及37;29及38;29及39;29及40;29及41;29及42;29及43;29及44;29及45;29及46;29及47;29及48;29及53;29及54;29及55;29及56;29及57;29及58;29及59;29及60;29及61;29及62;29及63;29及64;29及65;29及66;29及67;29及68;29及69;30及31;30及32;30及33;30及34;30及35;30及36;30及37;30及38;30及39;30及40;30及41;30及42;30及43;30及44;30及45;30及46;30及47;30及48;30及53;30及54;30及55;30及56;30及57;30及58;30及59;30及60;30及61;30及62;30及63;30及64;30及65;30及66;30及67;30及68;30及69;31及32;31及33;31及34;31及35;31及36;31及37;31及38;31及39;31及40;31及41;31及42;31及43;31及44;31及45;31及46;31及47;31及48;31及53;31及54;31及55;31及56;31及57;31及58;31及59;31及60;31及61;31及62;31及63;31及64;31及65;31及66;31及67;31及68;31及69;32及33;32及34;32及35;32及36;32及37;32及38;32及39;32及40;32及41;32及42;32及43;32及44;32及45;32及46;32及47;32及48;32及53;32及54;32及55;32及56;32及57;32及58;32及59;32及60;32及61;32及62;32及63;32及64;32及65;32及66;32及67;32及68;32及69;33及34;33及35;33及36;33及37;33及38;33及39;33及40;33及41;33及42;33及43;33及44;33及45;33及46;33及47;33及48;33及53;33及54;33及55;33及56;33及57;33及58;33及59;33及60;33及61;33及62;33及63;33及64;33及65;33及66;33及67;33及68;33及69;34及35;34及36;34及37;34及38;34及39;34及40;34及41;34及42;34及43;34及44;34及45;34及46;34及47;34及48;34及53;34及54;34及55;34及56;34及57;34及58;34及59;34及60;34及61;34及62;34及63;34及64;34及65;34及66;34及67;34及68;34及69;35及36;35及37;35及38;35及39;35及40;35及41;35及42;35及43;35及44;35及45;35及46;35及47;35及48;35及53;35及54;35及55;35及56;35及57;35及58;35及59;35及60;35及61;35及62;35及63;35及64;35及65;35及66;35及67;35及68;35及69;36及37;36及38;36及39;36及40;36及41;36及42;36及43;36及44;36及45;36及46;36及47;36及48;36及53;36及54;36及55;36及56;36及57;36及58;36及59;36及60;36及61;36及62;36及63;36及64;36及65;36及66;36及67;36及68;36及69;37及38;37及39;37及40;37及41;37及42;37及43;37及44;37及45;37及46;37及47;37及48;37及53;37及54;37及55;37及56;37及57;37及58;37及59;37及60;37及61;37及62;37及63;37及64;37及65;37及66;37及67;37及68;37及69;38及39;38及40;38及41;38及42;38及43;38及44;38及45;38及46;38及47;38及48;38及53;38及54;38及55;38及56;38及57;38及58;38及59;38及60;38及61;38及62;38及63;38及64;38及65;38及66;38及67;38及68;38及69;39及40;39及41;39及42;39及43;39及44;39及45;39及46;39及47;39及48;39及53;39及54;39及55;39及56;39及57;39及58;39及59;39及60;39及61;39及62;39及63;39及64;39及65;39及66;39及67;39及68;39及69;40及41;40及42;40及43;40及44;40及45;40及46;40及47;40及48;40及53;40及54;40及55;40及56;40及57;40及58;40及59;40及60;40及61;40及62;40及63;40及64;40及65;40及66;40及67;40及68;40及69;41及42;41及43;41及44;41及45;41及46;41及47;41及48;41及53;41及54;41及55;41及56;41及57;41及58;41及59;41及60;41及61;41及62;41及63;41及64;41及65;41及66;41及67;41及68;41及69;42及43;42及44;42及45;42及46;42及47;42及48;42及53;42及54;42及55;42及56;42及57;42及58;42及59;42及60;42及61;42及62;42及63;42及64;42及65;42及66;42及67;42及68;42及69;43及44;43及45;43及46;43及47;43及48;43及53;43及54;43及55;43及56;43及57;43及58;43及59;43及60;43及61;43及62;43及63;43及64;43及65;43及66;43及67;43及68;43及69;44及45;44及46;44及47;44及48;44及53;44及54;44及55;44及56;44及57;44及58;44及59;44及60;44及61;44及62;44及63;44及64;44及65;44及66;44及67;44及68;44及69;45及46;45及47;45及48;45及53;45及54;45及55;45及56;45及57;45及58;45及59;45及60;45及61;45及62;45及63;45及64;45及65;45及66;45及67;45及68;45及69;46及47;46及48;46及53;46及54;46及55;46及56;46及57;46及58;46及59;46及60;46及61;46及62;46及63;46及64;46及65;46及66;46及67;46及68;46及69;47及48;47及53;47及54;47及55;47及56;47及57;47及58;47及59;47及60;47及61;47及62;47及63;47及64;47及65;47及66;47及67;47及68;47及69;48及53;48及54;48及55;48及56;48及57;48及58;48及59;48及60;48及61;48及62;48及63;48及64;48及65;48及66;48及67;48及68;48及69;53及54;53及55;53及56;53及57;53及58;53及59;53及60;53及61;53及62;53及63;53及64;53及65;53及66;53及67;53及68;53及69;54及55;54及56;54及57;54及58;54及59;54及60;54及61;54及62;54及63;54及64;54及65;54及66;54及67;54及68;54及69;55及56;55及57;55及58;55及59;55及60;55及61;55及62;55及63;55及64;55及65;55及66;55及67;55及68;55及69;56及57;56及58;56及59;56及60;56及61;56及62;56及63;56及64;56及65;56及66;56及67;56及68;56及69;57及58;57及59;57及60;57及61;57及62;57及63;57及64;57及65;57及66;57及67;57及68;57及69;58及59;58及60;58及61;58及62;58及63;58及64;58及65;58及66;58及67;58及68;58及69;59及60;59及61;59及62;59及63;59及64;59及65;59及66;59及67;59及68;59及69;60及61;60及62;60及63;60及64;60及65;60及66;60及67;60及68;60及69;61及62;61及63;61及64;61及65;61及66;61及67;61及68;61及69;62及63;62及64;62及65;62及66;62及67;62及68;62及69;63及64;63及65;63及66;63及67;63及68;63及69;64及65;64及66;64及67;64及68;64及69;65及66;65及67;65及68;65及69;66及67;66及68;66及69;67及68;67及69;68及69;
h.對於外顯子51 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO:243及244;243及245;243及246;243及247;243及248;243及249;243及250;243及251;243及252;243及253;243及254;243及255;243及256;243及257;243及258;243及259;243及260;243及261;243及262;243及263;243及264;243及265;243及266;243及267;243及268;243及269;244及245;244及246;244及247;244及248;244及249;244及250;244及251;244及252;244及253;244及254;244及255;244及256;244及257;244及258;244及259;244及260;244及261;244及262;244及263;244及264;244及265;244及266;244及267;244及268;244及269;245及246;245及247;245及248;245及249;245及250;245及251;245及252;245及253;245及254;245及255;245及256;245及257;245及258;245及259;245及260;245及261;245及262;245及263;245及264;245及265;245及266;245及267;245及268;245及269;246及247;246及248;246及249;246及250;246及251;246及252;246及253;246及254;246及255;246及256;246及257;246及258;246及259;246及260;246及261;246及262;246及263;246及264;246及265;246及266;246及267;246及268;246及269;247及248;247及249;247及250;247及251;247及252;247及253;247及254;247及255;247及256;247及257;247及258;247及259;247及260;247及261;247及262;247及263;247及264;247及265;247及266;247及267;247及268;247及269;248及249;248及250;248及251;248及252;248及253;248及254;248及255;248及256;248及257;248及258;248及259;248及260;248及261;248及262;248及263;248及264;248及265;248及266;248及267;248及268;248及269;249及250;249及251;249及252;249及253;249及254;249及255;249及256;249及257;249及258;249及259;249及260;249及261;249及262;249及263;249及264;249及265;249及266;249及267;249及268;249及269;250及251;250及252;250及253;250及254;250及255;250及256;250及257;250及258;250及259;250及260;250及261;250及262;250及263;250及264;250及265;250及266;250及267;250及268;250及269;251及252;251及253;251及254;251及255;251及256;251及257;251及258;251及259;251及260;251及261;251及262;251及263;251及264;251及265;251及266;251及267;251及268;251及269;252及253;252及254;252及255;252及256;252及257;252及258;252及259;252及260;252及261;252及262;252及263;252及264;252及265;252及266;252及267;252及268;252及269;253及254;253及255;253及256;253及257;253及258;253及259;253及260;253及261;253及262;253及263;253及264;253及265;253及266;253及267;253及268;253及269;254及255;254及256;254及257;254及258;254及259;254及260;254及261;254及262;254及263;254及264;254及265;254及266;254及267;254及268;254及269;255及256;255及257;255及258;255及259;255及260;255及261;255及262;255及263;255及264;255及265;255及266;255及267;255及268;255及269;256及257;256及258;256及259;256及260;256及261;256及262;256及263;256及264;256及265;256及266;256及267;256及268;256及269;257及258;257及259;257及260;257及261;257及262;257及263;257及264;257及265;257及266;257及267;257及268;257及269;258及259;258及260;258及261;258及262;258及263;258及264;258及265;258及266;258及267;258及268;258及269;259及260;259及261;259及262;259及263;259及264;259及265;259及266;259及267;259及268;259及269;260及261;260及262;260及263;260及264;260及265;260及266;260及267;260及268;260及269;261及262;261及263;261及264;261及265;261及266;261及267;261及268;261及269;262及263;262及264;262及265;262及266;262及267;262及268;262及269;263及264;263及265;263及266;263及267;263及268;263及269;264及265;264及266;264及267;264及268;264及269;265及266;265及267;265及268;265及269;266及267;266及268;266及269;267及268;267及269;268及269;
i.對於外顯子53 (具有例如SaCas9),SEQ ID NO:16及17;16及18;16及19;16及20;16及21;16及22;16及23;16及24;16及25;16及26;17及18;17及19;17及20;17及21;17及22;17及23;17及24;17及25;17及26;18及19;18及20;18及21;18及22;18及23;18及24;18及25;18及26;19及20;19及21;19及22;19及23;19及24;19及25;19及26;20及21;20及22;20及23;20及24;20及25;20及26;21及22;21及23;21及24;21及25;21及26;22及23;22及24;22及25;22及26;23及24;23及25;23及26;24及25;24及26;25及26;71及72;71及73;71及74;71及75;71及76;71及77;71及78;71及84;71及85;71及86;71及87;71及88;71及89;71及90;71及91;71及92;71及93;71及94;71及95;71及96;71及97;71及98;71及99;71及100;71及101;71及102;72及73;72及74;72及75;72及76;72及77;72及78;72及84;72及85;72及86;72及87;72及88;72及89;72及90;72及91;72及92;72及93;72及94;72及95;72及96;72及97;72及98;72及99;72及100;72及101;72及102;73及74;73及75;73及76;73及77;73及78;73及84;73及85;73及86;73及87;73及88;73及89;73及90;73及91;73及92;73及93;73及94;73及95;73及96;73及97;73及98;73及99;73及100;73及101;73及102;74及75;74及76;74及77;74及78;74及84;74及85;74及86;74及87;74及88;74及89;74及90;74及91;74及92;74及93;74及94;74及95;74及96;74及97;74及98;74及99;74及100;74及101;74及102;75及76;75及77;75及78;75及84;75及85;75及86;75及87;75及88;75及89;75及90;75及91;75及92;75及93;75及94;75及95;75及96;75及97;75及98;75及99;75及100;75及101;75及102;76及77;76及78;76及84;76及85;76及86;76及87;76及88;76及89;76及90;76及91;76及92;76及93;76及94;76及95;76及96;76及97;76及98;76及99;76及100;76及101;76及102;77及78;77及84;77及85;77及86;77及87;77及88;77及89;77及90;77及91;77及92;77及93;77及94;77及95;77及96;77及97;77及98;77及99;77及100;77及101;77及102;78及84;78及85;78及86;78及87;78及88;78及89;78及90;78及91;78及92;78及93;78及94;78及95;78及96;78及97;78及98;78及99;78及100;78及101;78及102;84及85;84及86;84及87;84及88;84及89;84及90;84及91;84及92;84及93;84及94;84及95;84及96;84及97;84及98;84及99;84及100;84及101;84及102;85及86;85及87;85及88;85及89;85及90;85及91;85及92;85及93;85及94;85及95;85及96;85及97;85及98;85及99;85及100;85及101;85及102;86及87;86及88;86及89;86及90;86及91;86及92;86及93;86及94;86及95;86及96;86及97;86及98;86及99;86及100;86及101;86及102;87及88;87及89;87及90;87及91;87及92;87及93;87及94;87及95;87及96;87及97;87及98;87及99;87及100;87及101;87及102;88及89;88及90;88及91;88及92;88及93;88及94;88及95;88及96;88及97;88及98;88及99;88及100;88及101;88及102;89及90;89及91;89及92;89及93;89及94;89及95;89及96;89及97;89及98;89及99;89及100;89及101;89及102;90及91;90及92;90及93;90及94;90及95;90及96;90及97;90及98;90及99;90及100;90及101;90及102;91及92;91及93;91及94;91及95;91及96;91及97;91及98;91及99;91及100;91及101;91及102;92及93;92及94;92及95;92及96;92及97;92及98;92及99;92及100;92及101;92及102;93及94;93及95;93及96;93及97;93及98;93及99;93及100;93及101;93及102;94及95;94及96;94及97;94及98;94及99;94及100;94及101;94及102;95及96;95及97;95及98;95及99;95及100;95及101;95及102;96及97;96及98;96及99;96及100;96及101;96及102;97及98;97及99;97及100;97及101;97及102;98及99;98及100;98及101;98及102;99及100;99及101;99及102;100及101;100及102;101及102;
j.對於外顯子53 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO:270及271;270及272;270及273;270及274;270及275;270及276;270及277;270及278;270及279;270及280;270及281;270及282;270及283;270及284;270及285;270及286;270及287;270及288;270及289;270及290;270及291;270及292;271及272;271及273;271及274;271及275;271及276;271及277;271及278;271及279;271及280;271及281;271及282;271及283;271及284;271及285;271及286;271及287;271及288;271及289;271及290;271及291;271及292;272及273;272及274;272及275;272及276;272及277;272及278;272及279;272及280;272及281;272及282;272及283;272及284;272及285;272及286;272及287;272及288;272及289;272及290;272及291;272及292;273及274;273及275;273及276;273及277;273及278;273及279;273及280;273及281;273及282;273及283;273及284;273及285;273及286;273及287;273及288;273及289;273及290;273及291;273及292;274及275;274及276;274及277;274及278;274及279;274及280;274及281;274及282;274及283;274及284;274及285;274及286;274及287;274及288;274及289;274及290;274及291;274及292;275及276;275及277;275及278;275及279;275及280;275及281;275及282;275及283;275及284;275及285;275及286;275及287;275及288;275及289;275及290;275及291;275及292;276及277;276及278;276及279;276及280;276及281;276及282;276及283;276及284;276及285;276及286;276及287;276及288;276及289;276及290;276及291;276及292;277及278;277及279;277及280;277及281;277及282;277及283;277及284;277及285;277及286;277及287;277及288;277及289;277及290;277及291;277及292;278及279;278及280;278及281;278及282;278及283;278及284;278及285;278及286;278及287;278及288;278及289;278及290;278及291;278及292;279及280;279及281;279及282;279及283;279及284;279及285;279及286;279及287;279及288;279及289;279及290;279及291;279及292;280及281;280及282;280及283;280及284;280及285;280及286;280及287;280及288;280及289;280及290;280及291;280及292;281及282;281及283;281及284;281及285;281及286;281及287;281及288;281及289;281及290;281及291;281及292;282及283;282及284;282及285;282及286;282及287;282及288;282及289;282及290;282及291;282及292;283及284;283及285;283及286;283及287;283及288;283及289;283及290;283及291;283及292;284及285;284及286;284及287;284及288;284及289;284及290;284及291;284及292;285及286;285及287;285及288;285及289;285及290;285及291;285及292;286及287;286及288;286及289;286及290;286及291;286及292;287及288;287及289;287及290;287及291;287及292;288及289;288及290;288及291;288及292;289及290;289及291;289及292;290及291;290及292;291及292;924及270;924及272;924及273;924及274;924及275;924及276;924及277;924及278;924及279;924及280;924及281;924及282;924及283;924及284;924及285;924及286;924及287;924及288;924及289;924及290;924及291;924及292;925及270;925及272;925及273;925及274;925及275;925及276;925及277;925及278;925及279;925及280;925及281;925及282;925及283;925及284;925及285;925及286;925及287;925及288;925及289;925及290;925及291;925及292;926及270;926及272;926及273;926及274;926及275;926及276;926及277;926及278;926及279;926及280;926及281;926及282;926及283;926及284;926及285;926及286;926及287;926及288;926及289;926及290;926及291;926及292;927及270;927及272;927及273;927及274;927及275;927及276;927及277;927及278;927及279;927及280;927及281;927及282;927及283;927及284;927及285;927及286;927及287;927及288;927及289;927及290;927及291;927及292;928及270;928及272;928及273;928及274;928及275;928及276;928及277;928及278;928及279;928及280;928及281;928及282;928及283;928及284;928及285;928及286;928及287;928及288;928及289;928及290;928及291;928及292;929及270;929及272;929及273;929及274;929及275;929及276;929及277;929及278;929及279;929及280;929及281;929及282;929及283;929及284;929及285;929及286;929及287;929及288;929及289;929及290;929及291;929及292;930及270;930及272;930及273;930及274;930及275;930及276;930及277;930及278;930及279;930及280;930及281;930及282;930及283;930及284;930及285;930及286;930及287;930及288;930及289;930及290;930及291;930及292;931及270;931及272;931及273;931及274;931及275;931及276;931及277;931及278;931及279;931及280;931及281;931及282;931及283;931及284;931及285;931及286;931及287;931及288;931及289;931及290;931及291;931及292;932及270;932及272;932及273;932及274;932及275;932及276;932及277;932及278;932及279;932及280;932及281;932及282;932及283;932及284;932及285;932及286;932及287;932及288;932及289;932及290;932及291;932及292;933及270;933及272;933及273;933及274;933及275;933及276;933及277;933及278;933及279;933及280;933及281;933及282;933及283;933及284;933及285;933及286;933及287;933及288;933及289;933及290;933及291;933及292;934及270;934及272;934及273;934及274;934及275;934及276;934及277;934及278;934及279;934及280;934及281;934及282;934及283;934及284;934及285;934及286;934及287;934及288;934及289;934及290;934及291;934及292;935及270;935及272;935及273;935及274;935及275;935及276;935及277;935及278;935及279;935及280;935及281;935及282;935及283;935及284;935及285;935及286;935及287;935及288;935及289;935及290;935及291;935及292;936及270;936及272;936及273;936及274;936及275;936及276;936及277;936及278;936及279;936及280;936及281;936及282;936及283;936及284;936及285;936及286;936及287;936及288;936及289;936及290;936及291;936及292;937及270;937及272;937及273;937及274;937及275;937及276;937及277;937及278;937及279;937及280;937及281;937及282;937及283;937及284;937及285;937及286;937及287;937及288;937及289;937及290;937及291;937及292;938及270;938及272;938及273;938及274;938及275;938及276;938及277;938及278;938及279;938及280;938及281;938及282;938及283;938及284;938及285;938及286;938及287;938及288;938及289;938及290;938及291;938及292;950及275;951及275;952及275;953及275;954及275;或955及275;
k.對於外顯子44 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO: 200及203;200及204;202及203;202及205;202及206;202及207;204及208;204及205;204及206;204及207;或204及208;
l.對於外顯子45 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO: 223及230;或224及212。
m.對於外顯子50 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO: 231及232;231及234;231及236;231及237;236及233;236及235;236及238;236及240;或236及241;
n.對於外顯子51 (具有例如SaCas9),SEQ ID NO: 28及57;31及57;31及46;32及69;33及57;33及69;34及57;36及69;37及69;37及46;39及46;40及46;46及35;46及62;46及65;46及67;47及57;48及57;49及57;51及57;53及46;54及46;55及46;58及46;59及46;60及46;61及69;或69及30;
o.對於外顯子51 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO: 243及252;245及252;252及253;252及254;252及256;252及257;252及258;252及262;252及264;252及265;或252及266;
p.對於外顯子53 (具有例如SaCas9),SEQ ID NO: 86及96;87及96;88及97;89及96;90及97;92及77;92及78;92及96;92及99;93及98;93及102;94及100;95及77;95及78;95及99;96及100;97及98;97及102;98及73;或102及73;及
q.對於外顯子53 (例如,具有SluCas9),SEQ ID NO: 278及290;278及292;281及291;283及290;283及292;287及291;272及290;290及291;或272及292。
在一些實施例中,提供一種組合物,其包含至少兩個核酸分子或由其組成,該至少兩個核酸分子包含編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)之第一核酸及i)編碼至少一個、至少兩個或至少三個嚮導RNA之核酸;或ii)編碼一至n個嚮導RNA之核酸,其中n不超過可自該核酸表現之嚮導RNA的最大數目;或iii)編碼一至三個嚮導RNA之核酸;及不編碼SaCas9或SluCas9之第二核酸,視情況其中該第二核酸包含以下中之任一者:i)至少一個、至少兩個、至少三個、至少四個、至少五個或至少六個嚮導RNA;或ii)一至n個嚮導RNA,其中n不超過可自該核酸表現之嚮導RNA的最大數目;或iii)一至六個嚮導RNA,其中在各情況下,該等嚮導RNA包含編碼
表 6之至少一個、至少兩個或兩個嚮導序列之核酸。在一些實施例中,兩個核酸分子中之至少一者包含編碼以下任何一對嚮導序列的核酸:
a.對於外顯子44 (例如,具有SaCas9),SEQ ID NO: 1及3;110及120;110及121;110及122;110及123;110及124;110及125;111及112;111及113;111及114;111及115;111及116;111及117;111及118;111及119;111及120;111及121;111及122;111及123;111及124;111及125;112及113;112及114;112及115;112及116;112及117;112及118;112及119;112及120;112及121;112及122;112及123;112及124;112及125;113及114;113及115;113及116;113及117;113及118;113及119;113及120;113及121;113及122;113及123;113及124;113及125;114及115;114及116;114及117;114及118;114及119;114及120;114及121;114及122;114及123;114及124;114及125;115及116;115及117;115及118;115及119;115及120;115及121;115及122;115及123;115及124;115及125;116及117;116及118;116及119;116及120;116及121;116及122;116及123;116及124;116及125;117及118;117及119;117及120;117及121;117及122;117及123;117及124;117及125;118及119;118及120;118及121;118及122;118及123;118及124;118及125;119及120;119及121;119及122;119及123;119及124;119及125;120及121;120及122;120及123;120及124;120及125;121及122;121及123;121及124;121及125;122及123;122及124;122及125;123及124;123及125;124及125;
b.對於外顯子44 (例如,具有SluCas9),SEQ ID NO: 200及201;200及202;200及203;200及204;200及205;200及206;200及207;200及208;201及202;201及203;201及204;201及205;201及206;201及207;201及208;202及203;202及204;202及205;202及206;202及207;202及208;203及204;203及205;203及206;203及207;203及208;204及205;204及206;204及207;204及208;205及206;205及207;205及208;206及207;206及208;207及208;
c.對於外顯子45 (例如,具有SaCas9),SEQ ID NO: 3及4;3及5;3及6;3及7;3及8;3及9;4及5;4及6;4及7;4及8;4及9;5及6;5及7;5及8;5及9;6及7;6及8;6及9;7及8;7及9;8及9;126及127;126及128;126及129;126及130;126及131;126及132;126及133;126及134;126及135;126及136;126及137;126及138;126及139;126及140;126及141;126及142;126及143;126及144;126及145;126及146;126及147;127及128;127及129;127及130;127及131;127及132;127及133;127及134;127及135;127及136;127及137;127及138;127及139;127及140;127及141;127及142;127及143;127及144;127及145;127及146;127及147;128及129;128及130;128及131;128及132;128及133;128及134;128及135;128及136;128及137;128及138;128及139;128及140;128及141;128及142;128及143;128及144;128及145;128及146;128及147;129及130;129及131;129及132;129及133;129及134;129及135;129及136;129及137;129及138;129及139;129及140;129及141;129及142;129及143;129及144;129及145;129及146;129及147;130及131;130及132;130及133;130及134;130及135;130及136;130及137;130及138;130及139;130及140;130及141;130及142;130及143;130及144;130及145;130及146;130及147;131及132;131及133;131及134;131及135;131及136;131及137;131及138;131及139;131及140;131及141;131及142;131及143;131及144;131及145;131及146;131及147;132及133;132及134;132及135;132及136;132及137;132及138;132及139;132及140;132及141;132及142;132及143;132及144;132及145;132及146;132及147;133及134;133及135;133及136;133及137;133及138;133及139;133及140;133及141;133及142;133及143;133及144;133及145;133及146;133及147;134及135;134及136;134及137;134及138;134及139;134及140;134及141;134及142;134及143;134及144;134及145;134及146;134及147;135及136;135及137;135及138;135及139;135及140;135及141;135及142;135及143;135及144;135及145;135及146;135及147;136及137;136及138;136及139;136及140;136及141;136及142;136及143;136及144;136及145;136及146;136及147;137及138;137及139;137及140;137及141;137及142;137及143;137及144;137及145;137及146;137及147;138及139;138及140;138及141;138及142;138及143;138及144;138及145;138及146;138及147;139及140;139及141;139及142;139及143;139及144;139及145;139及146;139及147;140及141;140及142;140及143;140及144;140及145;140及146;140及147;141及142;141及143;141及144;141及145;141及146;141及147;142及143;142及144;142及145;142及146;142及147;143及144;143及145;143及146;143及147;144及145;144及146;144及147;145及146;145及147;146及147;
d.對於外顯子45 (例如,具有SluCas9),SEQ ID NO: 209及210;209及211;209及212;209及213;209及214;209及215;209及216;209及217;209及218;209及219;209及220;209及221;209及222;209及223;209及224;209及225;209及226;209及227;209及228;209及229;209及230;210及211;210及212;210及213;210及214;210及215;210及216;210及217;210及218;210及219;210及220;210及221;210及222;210及223;210及224;210及225;210及226;210及227;210及228;210及229;210及230;211及212;211及213;211及214;211及215;211及216;211及217;211及218;211及219;211及220;211及221;211及222;211及223;211及224;211及225;211及226;211及227;211及228;211及229;211及230;212及213;212及214;212及215;212及216;212及217;212及218;212及219;212及220;212及221;212及222;212及223;212及224;212及225;212及226;212及227;212及228;212及229;212及230;213及214;213及215;213及216;213及217;213及218;213及219;213及220;213及221;213及222;213及223;213及224;213及225;213及226;213及227;213及228;213及229;213及230;214及215;214及216;214及217;214及218;214及219;214及220;214及221;214及222;214及223;214及224;214及225;214及226;214及227;214及228;214及229;214及230;215及216;215及217;215及218;215及219;215及220;215及221;215及222;215及223;215及224;215及225;215及226;215及227;215及228;215及229;215及230;216及217;216及218;216及219;216及220;216及221;216及222;216及223;216及224;216及225;216及226;216及227;216及228;216及229;216及230;217及218;217及219;217及220;217及221;217及222;217及223;217及224;217及225;217及226;217及227;217及228;217及229;217及230;218及219;218及220;218及221;218及222;218及223;218及224;218及225;218及226;218及227;218及228;218及229;218及230;219及220;219及221;219及222;219及223;219及224;219及225;219及226;219及227;219及228;219及229;219及230;220及221;220及222;220及223;220及224;220及225;220及226;220及227;220及228;220及229;220及230;221及222;221及223;221及224;221及225;221及226;221及227;221及228;221及229;221及230;222及223;222及224;222及225;222及226;222及227;222及228;222及229;222及230;223及224;223及225;223及226;223及227;223及228;223及229;223及230;224及225;224及226;224及227;224及228;224及229;224及230;225及226;225及227;225及228;225及229;225及230;226及227;226及228;226及229;226及230;227及228;227及229;227及230;228及229;228及230;229及230;
e.對於外顯子50 (例如,具有SaCas9),SEQ ID NO: 148及149;148及150;148及151;148及152;148及153;148及154;148及155;148及156;148及157;148及158;148及159;149及150;149及151;149及152;149及153;149及154;149及155;149及156;149及157;149及158;149及159;150及151;150及152;150及153;150及154;150及155;150及156;150及157;150及158;150及159;151及152;151及153;151及154;151及155;151及156;151及157;151及158;151及159;152及153;152及154;152及155;152及156;152及157;152及158;152及159;153及154;153及155;153及156;153及157;153及158;153及159;154及155;154及156;154及157;154及158;154及159;155及156;155及157;155及158;155及159;156及157;156及158;156及159;157及158;157及159;158及159;
f.對於外顯子50 (例如,具有SluCas9),SEQ ID NO: 231及232;231及233;231及234;231及235;231及236;231及237;231及238;231及239;231及240;231及241;231及242;232及233;232及234;232及235;232及236;232及237;232及238;232及239;232及240;232及241;232及242;233及234;233及235;233及236;233及237;233及238;233及239;233及240;233及241;233及242;234及235;234及236;234及237;234及238;234及239;234及240;234及241;234及242;235及236;235及237;235及238;235及239;235及240;235及241;235及242;236及237;236及238;236及239;236及240;236及241;236及242;237及238;237及239;237及240;237及241;237及242;238及239;238及240;238及241;238及242;239及240;239及241;239及242;240及241;240及242;241及242;
g.對於外顯子51 (例如,具有SaCas9),SEQ ID NO: 11及12;11及13;11及14;11及15;12及13;12及14;12及15;13及14;13及15;14及15;27及28;27及29;27及30;27及31;27及32;27及33;27及34;27及35;27及36;27及37;27及38;27及39;27及40;27及41;27及42;27及43;27及44;27及45;27及46;27及47;27及48;27及53;27及54;27及55;27及56;27及57;27及58;27及59;27及60;27及61;27及62;27及63;27及64;27及65;27及66;27及67;27及68;27及69;28及29;28及30;28及31;28及32;28及33;28及34;28及35;28及36;28及37;28及38;28及39;28及40;28及41;28及42;28及43;28及44;28及45;28及46;28及47;28及48;28及53;28及54;28及55;28及56;28及57;28及58;28及59;28及60;28及61;28及62;28及63;28及64;28及65;28及66;28及67;28及68;28及69;29及30;29及31;29及32;29及33;29及34;29及35;29及36;29及37;29及38;29及39;29及40;29及41;29及42;29及43;29及44;29及45;29及46;29及47;29及48;29及53;29及54;29及55;29及56;29及57;29及58;29及59;29及60;29及61;29及62;29及63;29及64;29及65;29及66;29及67;29及68;29及69;30及31;30及32;30及33;30及34;30及35;30及36;30及37;30及38;30及39;30及40;30及41;30及42;30及43;30及44;30及45;30及46;30及47;30及48;30及53;30及54;30及55;30及56;30及57;30及58;30及59;30及60;30及61;30及62;30及63;30及64;30及65;30及66;30及67;30及68;30及69;31及32;31及33;31及34;31及35;31及36;31及37;31及38;31及39;31及40;31及41;31及42;31及43;31及44;31及45;31及46;31及47;31及48;31及53;31及54;31及55;31及56;31及57;31及58;31及59;31及60;31及61;31及62;31及63;31及64;31及65;31及66;31及67;31及68;31及69;32及33;32及34;32及35;32及36;32及37;32及38;32及39;32及40;32及41;32及42;32及43;32及44;32及45;32及46;32及47;32及48;32及53;32及54;32及55;32及56;32及57;32及58;32及59;32及60;32及61;32及62;32及63;32及64;32及65;32及66;32及67;32及68;32及69;33及34;33及35;33及36;33及37;33及38;33及39;33及40;33及41;33及42;33及43;33及44;33及45;33及46;33及47;33及48;33及53;33及54;33及55;33及56;33及57;33及58;33及59;33及60;33及61;33及62;33及63;33及64;33及65;33及66;33及67;33及68;33及69;34及35;34及36;34及37;34及38;34及39;34及40;34及41;34及42;34及43;34及44;34及45;34及46;34及47;34及48;34及53;34及54;34及55;34及56;34及57;34及58;34及59;34及60;34及61;34及62;34及63;34及64;34及65;34及66;34及67;34及68;34及69;35及36;35及37;35及38;35及39;35及40;35及41;35及42;35及43;35及44;35及45;35及46;35及47;35及48;35及53;35及54;35及55;35及56;35及57;35及58;35及59;35及60;35及61;35及62;35及63;35及64;35及65;35及66;35及67;35及68;35及69;36及37;36及38;36及39;36及40;36及41;36及42;36及43;36及44;36及45;36及46;36及47;36及48;36及53;36及54;36及55;36及56;36及57;36及58;36及59;36及60;36及61;36及62;36及63;36及64;36及65;36及66;36及67;36及68;36及69;37及38;37及39;37及40;37及41;37及42;37及43;37及44;37及45;37及46;37及47;37及48;37及53;37及54;37及55;37及56;37及57;37及58;37及59;37及60;37及61;37及62;37及63;37及64;37及65;37及66;37及67;37及68;37及69;38及39;38及40;38及41;38及42;38及43;38及44;38及45;38及46;38及47;38及48;38及53;38及54;38及55;38及56;38及57;38及58;38及59;38及60;38及61;38及62;38及63;38及64;38及65;38及66;38及67;38及68;38及69;39及40;39及41;39及42;39及43;39及44;39及45;39及46;39及47;39及48;39及53;39及54;39及55;39及56;39及57;39及58;39及59;39及60;39及61;39及62;39及63;39及64;39及65;39及66;39及67;39及68;39及69;40及41;40及42;40及43;40及44;40及45;40及46;40及47;40及48;40及53;40及54;40及55;40及56;40及57;40及58;40及59;40及60;40及61;40及62;40及63;40及64;40及65;40及66;40及67;40及68;40及69;41及42;41及43;41及44;41及45;41及46;41及47;41及48;41及53;41及54;41及55;41及56;41及57;41及58;41及59;41及60;41及61;41及62;41及63;41及64;41及65;41及66;41及67;41及68;41及69;42及43;42及44;42及45;42及46;42及47;42及48;42及53;42及54;42及55;42及56;42及57;42及58;42及59;42及60;42及61;42及62;42及63;42及64;42及65;42及66;42及67;42及68;42及69;43及44;43及45;43及46;43及47;43及48;43及53;43及54;43及55;43及56;43及57;43及58;43及59;43及60;43及61;43及62;43及63;43及64;43及65;43及66;43及67;43及68;43及69;44及45;44及46;44及47;44及48;44及53;44及54;44及55;44及56;44及57;44及58;44及59;44及60;44及61;44及62;44及63;44及64;44及65;44及66;44及67;44及68;44及69;45及46;45及47;45及48;45及53;45及54;45及55;45及56;45及57;45及58;45及59;45及60;45及61;45及62;45及63;45及64;45及65;45及66;45及67;45及68;45及69;46及47;46及48;46及53;46及54;46及55;46及56;46及57;46及58;46及59;46及60;46及61;46及62;46及63;46及64;46及65;46及66;46及67;46及68;46及69;47及48;47及53;47及54;47及55;47及56;47及57;47及58;47及59;47及60;47及61;47及62;47及63;47及64;47及65;47及66;47及67;47及68;47及69;48及53;48及54;48及55;48及56;48及57;48及58;48及59;48及60;48及61;48及62;48及63;48及64;48及65;48及66;48及67;48及68;48及69;53及54;53及55;53及56;53及57;53及58;53及59;53及60;53及61;53及62;53及63;53及64;53及65;53及66;53及67;53及68;53及69;54及55;54及56;54及57;54及58;54及59;54及60;54及61;54及62;54及63;54及64;54及65;54及66;54及67;54及68;54及69;55及56;55及57;55及58;55及59;55及60;55及61;55及62;55及63;55及64;55及65;55及66;55及67;55及68;55及69;56及57;56及58;56及59;56及60;56及61;56及62;56及63;56及64;56及65;56及66;56及67;56及68;56及69;57及58;57及59;57及60;57及61;57及62;57及63;57及64;57及65;57及66;57及67;57及68;57及69;58及59;58及60;58及61;58及62;58及63;58及64;58及65;58及66;58及67;58及68;58及69;59及60;59及61;59及62;59及63;59及64;59及65;59及66;59及67;59及68;59及69;60及61;60及62;60及63;60及64;60及65;60及66;60及67;60及68;60及69;61及62;61及63;61及64;61及65;61及66;61及67;61及68;61及69;62及63;62及64;62及65;62及66;62及67;62及68;62及69;63及64;63及65;63及66;63及67;63及68;63及69;64及65;64及66;64及67;64及68;64及69;65及66;65及67;65及68;65及69;66及67;66及68;66及69;67及68;67及69;68及69;
h.對於外顯子51 (例如,具有SluCas9),SEQ ID NO: 243及244;243及245;243及246;243及247;243及248;243及249;243及250;243及251;243及252;243及253;243及254;243及255;243及256;243及257;243及258;243及259;243及260;243及261;243及262;243及263;243及264;243及265;243及266;243及267;243及268;243及269;244及245;244及246;244及247;244及248;244及249;244及250;244及251;244及252;244及253;244及254;244及255;244及256;244及257;244及258;244及259;244及260;244及261;244及262;244及263;244及264;244及265;244及266;244及267;244及268;244及269;245及246;245及247;245及248;245及249;245及250;245及251;245及252;245及253;245及254;245及255;245及256;245及257;245及258;245及259;245及260;245及261;245及262;245及263;245及264;245及265;245及266;245及267;245及268;245及269;246及247;246及248;246及249;246及250;246及251;246及252;246及253;246及254;246及255;246及256;246及257;246及258;246及259;246及260;246及261;246及262;246及263;246及264;246及265;246及266;246及267;246及268;246及269;247及248;247及249;247及250;247及251;247及252;247及253;247及254;247及255;247及256;247及257;247及258;247及259;247及260;247及261;247及262;247及263;247及264;247及265;247及266;247及267;247及268;247及269;248及249;248及250;248及251;248及252;248及253;248及254;248及255;248及256;248及257;248及258;248及259;248及260;248及261;248及262;248及263;248及264;248及265;248及266;248及267;248及268;248及269;249及250;249及251;249及252;249及253;249及254;249及255;249及256;249及257;249及258;249及259;249及260;249及261;249及262;249及263;249及264;249及265;249及266;249及267;249及268;249及269;250及251;250及252;250及253;250及254;250及255;250及256;250及257;250及258;250及259;250及260;250及261;250及262;250及263;250及264;250及265;250及266;250及267;250及268;250及269;251及252;251及253;251及254;251及255;251及256;251及257;251及258;251及259;251及260;251及261;251及262;251及263;251及264;251及265;251及266;251及267;251及268;251及269;252及253;252及254;252及255;252及256;252及257;252及258;252及259;252及260;252及261;252及262;252及263;252及264;252及265;252及266;252及267;252及268;252及269;253及254;253及255;253及256;253及257;253及258;253及259;253及260;253及261;253及262;253及263;253及264;253及265;253及266;253及267;253及268;253及269;254及255;254及256;254及257;254及258;254及259;254及260;254及261;254及262;254及263;254及264;254及265;254及266;254及267;254及268;254及269;255及256;255及257;255及258;255及259;255及260;255及261;255及262;255及263;255及264;255及265;255及266;255及267;255及268;255及269;256及257;256及258;256及259;256及260;256及261;256及262;256及263;256及264;256及265;256及266;256及267;256及268;256及269;257及258;257及259;257及260;257及261;257及262;257及263;257及264;257及265;257及266;257及267;257及268;257及269;258及259;258及260;258及261;258及262;258及263;258及264;258及265;258及266;258及267;258及268;258及269;259及260;259及261;259及262;259及263;259及264;259及265;259及266;259及267;259及268;259及269;260及261;260及262;260及263;260及264;260及265;260及266;260及267;260及268;260及269;261及262;261及263;261及264;261及265;261及266;261及267;261及268;261及269;262及263;262及264;262及265;262及266;262及267;262及268;262及269;263及264;263及265;263及266;263及267;263及268;263及269;264及265;264及266;264及267;264及268;264及269;265及266;265及267;265及268;265及269;266及267;266及268;266及269;267及268;267及269;268及269;
i.對於外顯子53 (例如,具有SaCas9),SEQ ID NO: 16及17;16及18;16及19;16及20;16及21;16及22;16及23;16及24;16及25;16及26;17及18;17及19;17及20;17及21;17及22;17及23;17及24;17及25;17及26;18及19;18及20;18及21;18及22;18及23;18及24;18及25;18及26;19及20;19及21;19及22;19及23;19及24;19及25;19及26;20及21;20及22;20及23;20及24;20及25;20及26;21及22;21及23;21及24;21及25;21及26;22及23;22及24;22及25;22及26;23及24;23及25;23及26;24及25;24及26;25及26;71及72;71及73;71及74;71及75;71及76;71及77;71及78;71及84;71及85;71及86;71及87;71及88;71及89;71及90;71及91;71及92;71及93;71及94;71及95;71及96;71及97;71及98;71及99;71及100;71及101;71及102;72及73;72及74;72及75;72及76;72及77;72及78;72及84;72及85;72及86;72及87;72及88;72及89;72及90;72及91;72及92;72及93;72及94;72及95;72及96;72及97;72及98;72及99;72及100;72及101;72及102;73及74;73及75;73及76;73及77;73及78;73及84;73及85;73及86;73及87;73及88;73及89;73及90;73及91;73及92;73及93;73及94;73及95;73及96;73及97;73及98;73及99;73及100;73及101;73及102;74及75;74及76;74及77;74及78;74及84;74及85;74及86;74及87;74及88;74及89;74及90;74及91;74及92;74及93;74及94;74及95;74及96;74及97;74及98;74及99;74及100;74及101;74及102;75及76;75及77;75及78;75及84;75及85;75及86;75及87;75及88;75及89;75及90;75及91;75及92;75及93;75及94;75及95;75及96;75及97;75及98;75及99;75及100;75及101;75及102;76及77;76及78;76及84;76及85;76及86;76及87;76及88;76及89;76及90;76及91;76及92;76及93;76及94;76及95;76及96;76及97;76及98;76及99;76及100;76及101;76及102;77及78;77及84;77及85;77及86;77及87;77及88;77及89;77及90;77及91;77及92;77及93;77及94;77及95;77及96;77及97;77及98;77及99;77及100;77及101;77及102;78及84;78及85;78及86;78及87;78及88;78及89;78及90;78及91;78及92;78及93;78及94;78及95;78及96;78及97;78及98;78及99;78及100;78及101;78及102;84及85;84及86;84及87;84及88;84及89;84及90;84及91;84及92;84及93;84及94;84及95;84及96;84及97;84及98;84及99;84及100;84及101;84及102;85及86;85及87;85及88;85及89;85及90;85及91;85及92;85及93;85及94;85及95;85及96;85及97;85及98;85及99;85及100;85及101;85及102;86及87;86及88;86及89;86及90;86及91;86及92;86及93;86及94;86及95;86及96;86及97;86及98;86及99;86及100;86及101;86及102;87及88;87及89;87及90;87及91;87及92;87及93;87及94;87及95;87及96;87及97;87及98;87及99;87及100;87及101;87及102;88及89;88及90;88及91;88及92;88及93;88及94;88及95;88及96;88及97;88及98;88及99;88及100;88及101;88及102;89及90;89及91;89及92;89及93;89及94;89及95;89及96;89及97;89及98;89及99;89及100;89及101;89及102;90及91;90及92;90及93;90及94;90及95;90及96;90及97;90及98;90及99;90及100;90及101;90及102;91及92;91及93;91及94;91及95;91及96;91及97;91及98;91及99;91及100;91及101;91及102;92及93;92及94;92及95;92及96;92及97;92及98;92及99;92及100;92及101;92及102;93及94;93及95;93及96;93及97;93及98;93及99;93及100;93及101;93及102;94及95;94及96;94及97;94及98;94及99;94及100;94及101;94及102;95及96;95及97;95及98;95及99;95及100;95及101;95及102;96及97;96及98;96及99;96及100;96及101;96及102;97及98;97及99;97及100;97及101;97及102;98及99;98及100;98及101;98及102;99及100;99及101;99及102;100及101;100及102;101及102;
j.對於外顯子53 (例如,具有SluCas9),SEQ ID NO: 270及271;270及272;270及273;270及274;270及275;270及276;270及277;270及278;270及279;270及280;270及281;270及282;270及283;270及284;270及285;270及286;270及287;270及288;270及289;270及290;270及291;270及292;271及272;271及273;271及274;271及275;271及276;271及277;271及278;271及279;271及280;271及281;271及282;271及283;271及284;271及285;271及286;271及287;271及288;271及289;271及290;271及291;271及292;272及273;272及274;272及275;272及276;272及277;272及278;272及279;272及280;272及281;272及282;272及283;272及284;272及285;272及286;272及287;272及288;272及289;272及290;272及291;272及292;273及274;273及275;273及276;273及277;273及278;273及279;273及280;273及281;273及282;273及283;273及284;273及285;273及286;273及287;273及288;273及289;273及290;273及291;273及292;274及275;274及276;274及277;274及278;274及279;274及280;274及281;274及282;274及283;274及284;274及285;274及286;274及287;274及288;274及289;274及290;274及291;274及292;275及276;275及277;275及278;275及279;275及280;275及281;275及282;275及283;275及284;275及285;275及286;275及287;275及288;275及289;275及290;275及291;275及292;276及277;276及278;276及279;276及280;276及281;276及282;276及283;276及284;276及285;276及286;276及287;276及288;276及289;276及290;276及291;276及292;277及278;277及279;277及280;277及281;277及282;277及283;277及284;277及285;277及286;277及287;277及288;277及289;277及290;277及291;277及292;278及279;278及280;278及281;278及282;278及283;278及284;278及285;278及286;278及287;278及288;278及289;278及290;278及291;278及292;279及280;279及281;279及282;279及283;279及284;279及285;279及286;279及287;279及288;279及289;279及290;279及291;279及292;280及281;280及282;280及283;280及284;280及285;280及286;280及287;280及288;280及289;280及290;280及291;280及292;281及282;281及283;281及284;281及285;281及286;281及287;281及288;281及289;281及290;281及291;281及292;282及283;282及284;282及285;282及286;282及287;282及288;282及289;282及290;282及291;282及292;283及284;283及285;283及286;283及287;283及288;283及289;283及290;283及291;283及292;284及285;284及286;284及287;284及288;284及289;284及290;284及291;284及292;285及286;285及287;285及288;285及289;285及290;285及291;285及292;286及287;286及288;286及289;286及290;286及291;286及292;287及288;287及289;287及290;287及291;287及292;288及289;288及290;288及291;288及292;289及290;289及291;289及292;290及291;290及292;291及292;924及270;924及272;924及273;924及274;924及275;924及276;924及277;924及278;924及279;924及280;924及281;924及282;924及283;924及284;924及285;924及286;924及287;924及288;924及289;924及290;924及291;924及292;925及270;925及272;925及273;925及274;925及275;925及276;925及277;925及278;925及279;925及280;925及281;925及282;925及283;925及284;925及285;925及286;925及287;925及288;925及289;925及290;925及291;925及292;926及270;926及272;926及273;926及274;926及275;926及276;926及277;926及278;926及279;926及280;926及281;926及282;926及283;926及284;926及285;926及286;926及287;926及288;926及289;926及290;926及291;926及292;927及270;927及272;927及273;927及274;927及275;927及276;927及277;927及278;927及279;927及280;927及281;927及282;927及283;927及284;927及285;927及286;927及287;927及288;927及289;927及290;927及291;927及292;928及270;928及272;928及273;928及274;928及275;928及276;928及277;928及278;928及279;928及280;928及281;928及282;928及283;928及284;928及285;928及286;928及287;928及288;928及289;928及290;928及291;928及292;929及270;929及272;929及273;929及274;929及275;929及276;929及277;929及278;929及279;929及280;929及281;929及282;929及283;929及284;929及285;929及286;929及287;929及288;929及289;929及290;929及291;929及292;930及270;930及272;930及273;930及274;930及275;930及276;930及277;930及278;930及279;930及280;930及281;930及282;930及283;930及284;930及285;930及286;930及287;930及288;930及289;930及290;930及291;930及292;931及270;931及272;931及273;931及274;931及275;931及276;931及277;931及278;931及279;931及280;931及281;931及282;931及283;931及284;931及285;931及286;931及287;931及288;931及289;931及290;931及291;931及292;932及270;932及272;932及273;932及274;932及275;932及276;932及277;932及278;932及279;932及280;932及281;932及282;932及283;932及284;932及285;932及286;932及287;932及288;932及289;932及290;932及291;932及292;933及270;933及272;933及273;933及274;933及275;933及276;933及277;933及278;933及279;933及280;933及281;933及282;933及283;933及284;933及285;933及286;933及287;933及288;933及289;933及290;933及291;933及292;934及270;934及272;934及273;934及274;934及275;934及276;934及277;934及278;934及279;934及280;934及281;934及282;934及283;934及284;934及285;934及286;934及287;934及288;934及289;934及290;934及291;934及292;935及270;935及272;935及273;935及274;935及275;935及276;935及277;935及278;935及279;935及280;935及281;935及282;935及283;935及284;935及285;935及286;935及287;935及288;935及289;935及290;935及291;935及292;936及270;936及272;936及273;936及274;936及275;936及276;936及277;936及278;936及279;936及280;936及281;936及282;936及283;936及284;936及285;936及286;936及287;936及288;936及289;936及290;936及291;936及292;937及270;937及272;937及273;937及274;937及275;937及276;937及277;937及278;937及279;937及280;937及281;937及282;937及283;937及284;937及285;937及286;937及287;937及288;937及289;937及290;937及291;937及292;938及270;938及272;938及273;938及274;938及275;938及276;938及277;938及278;938及279;938及280;938及281;938及282;938及283;938及284;938及285;938及286;938及287;938及288;938及289;938及290;938及291;938及292;950及275;951及275;952及275;953及275;954及275;或955及275;
k.對於外顯子44 (例如,具有SluCas9),SEQ ID NO: 200及203;200及204;202及203;202及205;202及206;202及207;204及208;204及205;204及206;204及207;或204及208;
l.對於外顯子45 (例如,具有SluCas9),SEQ ID NO: 223及230;或224及212。
m.對於具有SluCas9之外顯子50,SEQ ID NO: 231及232;231及234;231及236;231及237;236及233;236及235;236及238;236及240;或236及241;
n.對於外顯子51 (例如,具有SaCas9),SEQ ID NO: 28及57;31及57;31及46;32及69;33及57;33及69;34及57;36及69;37及69;37及46;39及46;40及46;46及35;46及62;46及65;46及67;47及57;48及57;49及57;51及57;53及46;54及46;55及46;58及46;59及46;60及46;61及69;或69及30;
o.對於外顯子51 (例如,具有SluCas9),SEQ ID NO: 243及252;245及252;252及253;252及254;252及256;252及257;252及258;252及262;252及264;252及265;或252及266;
p.對於外顯子53 (例如,具有SaCas9),SEQ ID NO: 86及96;87及96;88及97;89及96;90及97;92及77;92及78;92及96;92及99;93及98;93及102;94及100;95及77;95及78;95及99;96及100;97及98;97及102;98及73;或102及73;及
q.對於外顯子53 (例如,具有SluCas9),SEQ ID NO: 278及290;278及292;281及291;283及290;283及292;287及291;272及290;290及291;或272及292。
本發明可在本文中提及「第一及第二間隔子」或「第一及第二嚮導RNA、gRNA或sgRNA」,繼之為一或多對特定序列。應注意,不希望該成對中的序列次序限於其呈現/描述的次序。舉例而言,片語「第一sgRNA及第二sgRNA包含SEQ ID NO: 10及15的序列」可意謂第一sgRNA包含SEQ ID NO: 10的序列且第二sgRNA序列包含SEQ ID NO: 15的序列,或此片語可意謂第一sgRNA包含SEQ ID NO: 15的序列且第二sgRNA序列包含SEQ ID NO: 10的序列。
在一些實施例中,第一核酸及/或第二核酸若存在則包含至少兩個嚮導RNA。在一些實施例中,第一核酸及/或第二核酸若存在則包含至少三個嚮導RNA。在一些實施例中,第一核酸及/或第二核酸若存在則包含至少四個嚮導RNA。在一些實施例中,第一核酸及/或第二核酸若存在則包含至少五個嚮導RNA。在一些實施例中,第一核酸及/或第二核酸若存在則包含至少六個嚮導RNA。在一些實施例中,第一核酸編碼核酸內切酶及至少一個、至少兩個或至少三個嚮導RNA。在一些實施例中,第一核酸包含核酸內切酶及一至n個嚮導RNA,其中n不超過可自該核酸表現之嚮導RNA的最大數目。在一些實施例中,第一核酸編碼核酸內切酶及一至三個嚮導RNA。在一些實施例中,第一核酸包含1、2、3、4、5或6個嚮導RNA,但不編碼核酸內切酶。
在一些實施例中,第二核酸若存在則編碼至少一個、至少兩個、至少三個、至少四個、至少五個或至少六個嚮導RNA。在一些實施例中,第二核酸若存在則編碼一至n個嚮導RNA,其中n不超過可自該核酸表現之嚮導RNA的最大數目。在一些實施例中,第二核酸若存在則編碼一至六個嚮導RNA。在一些實施例中,第二核酸若存在則編碼2-10、2-9、2-8、2-7、2-6、2-5、2-4或2-3個嚮導RNA。在一些實施例中,第二核酸若存在則編碼2、3、4、5或6個嚮導RNA。在一些實施例中,第二核酸包含1、2、3、4、5或6個嚮導RNA,但不編碼核酸內切酶。
在一些實施例中,本發明提供一種組合物,其包含至少兩個核酸分子,其中該第一核酸包含嚮導RNA且該第二核酸包含嚮導RNA,其中由該第一核酸及該第二核酸編碼之該嚮導RNA相同。在一些實施例中,本發明提供一種組合物,其包含至少兩個核酸分子,其中該第一核酸包含嚮導RNA且該第二核酸包含嚮導RNA,其中由該第一核酸及該第二核酸編碼之該嚮導RNA不同。在一些實施例中,本發明提供一種組合物,其包含至少兩個核酸分子,其中該第一核酸包含嚮導RNA且該第二核酸包含嚮導RNA,其中至少一個嚮導RNA結合至外顯子內之位於過早終止密碼子上游的目標序列,且其中至少一個嚮導RNA結合至外顯子內之位於過早終止密碼子下游之DMD基因中的目標序列。在一些實施例中,本發明提供一種組合物,其包含至少兩個核酸分子,其中該第一核酸包含嚮導RNA且該第二核酸包含嚮導RNA,其中該相同嚮導RNA由第一核酸分子及第二核酸分子之核酸編碼。在一些實施例中,本發明提供一種組合物,其包含至少兩個核酸分子,其中該第一核酸包含嚮導RNA且該第二核酸包含嚮導RNA,其中該第二核酸分子編碼結合至與該第一核酸分子中之該嚮導RNA相同之目標序列的嚮導RNA。在一些實施例中,本發明提供一種組合物,其包含至少兩個核酸分子,其中該第二核酸分子編碼至少2、至少3、至少4、至少5或至少6個嚮導RNA,其中該第二核酸分子中之嚮導RNA結合至與第一核酸分子中之嚮導RNA相同的目標序列。
在一些實施例中,本發明提供一種組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,i)各嚮導RNA靶向相同的基因體目標序列;ii)各嚮導RNA靶向不同的目標序列;或iii)至少一個嚮導RNA靶向一個序列且至少一個嚮導RNA靶向不同序列。
在一些實施例中,本發明提供一種組合物,其包含與DMD基因之外顯子結合的嚮導RNA,其中外顯子選自外顯子44、45、50、51及53。
在一些實施例中,本發明提供一種組合物,其包含至少兩個與DMD基因之外顯子結合的嚮導RNA,其中至少一個嚮導RNA與DMD基因之外顯子內的目標序列結合,且其中至少一個嚮導RNA與DMD基因之相同外顯子內的不同目標序列結合。
在一些實施例中,本發明提供一種包含至少兩個嚮導RNA之組合物,其中至少一個嚮導RNA結合至位於過早終止密碼子上游之外顯子內的目標序列,且其中至少一個嚮導RNA結合至位於過早終止密碼子下游之外顯子內的目標序列。
在一些實施例中,本發明提供一種包含至少兩個嚮導RNA之組合物,其中至少一個嚮導RNA結合至DMD基因之外顯子內的目標序列,且其中至少一個嚮導RNA結合至DMD基因之相同外顯子內的不同目標序列,其中當在活體外或活體內在適當核酸內切酶(例如,SaCas9或SluCas9)存在下表現時,切除一部分外顯子。在一些實施例中,本發明提供一種包含至少兩個嚮導RNA之組合物,其中一旦在適當核酸內切酶(例如,SaCas9或SluCas9)存在下活體外或活體內表現,核酸內切酶切除一部分外顯子。
在一些實施例中,本發明提供一種包含至少兩個嚮導RNA之組合物,其中一旦在適當核酸內切酶(例如,SaCas9或SluCas9)存在下活體外或活體內表現,該核酸內切酶切除一部分外顯子,且其中切除之後剩餘的部分外顯子在一個核苷酸插入下重新接合。在一些實施例中,本發明提供一種包含至少兩個嚮導RNA之組合物,其中一旦在適當核酸內切酶(例如,SaCas9或SluCas9)存在下活體外或活體內表現,該核酸內切酶切除一部分外顯子,其中切除之後剩餘的部分外顯子在無核苷酸插入下重新接合。
在一些實施例中,本發明提供一種包含至少兩個嚮導RNA之組合物,其中一旦在適當核酸內切酶(例如,SaCas9或SluCas9)存在下活體外或活體內表現,核酸內切酶切除肌肉萎縮蛋白基因之一部分(例如,外顯子)。在一些實施例中,切除之後剩餘的基因部分在一個核苷酸插入或兩個核苷酸插入下重新接合。在一些實施例中,切除之後剩餘的外顯子部分在無任何核苷酸插入下重新接合。「精確區段缺失」或「精確缺失」意謂雙重切割過程取出特定的缺失。此精確缺失可引起外顯子框架重構。在一些實施例中,被切除部分的尺寸在5與250、5與225、5與200、5與190、5與180、5與170、5與160、5與150、5與125、5與120、5與115、5與110、5與100、5與95、5與90、5與85、5與80、5與75、5與70、5與65、5與60、5與55、5與50、5與45、5與40、5與35、5與30、5與25、5與20、5與15及5-10個核苷酸之間。在一些實施例中,被切除部分的尺寸在20與250、20與225、20與200、20與190、20與180、20與170、20與160、20與150、20與125、20與120、20與115、20與110、20與100、20與95、20與90、20與85、20與80、20與75、20與70、20與65、20與60、20與55、20與50、20與45、20與40、20與35、20與30及20與25個核苷酸之間。在一些實施例中,被切除部分的尺寸在50與250、50與225、50與200、50與190、50與180、50與170、50與160、50與150、50與125、50與120、50與115、50與110及50與100個核苷酸之間。在一些實施例中,外顯子之被切除部分的尺寸在8與167個核苷酸之間。
在特定實施例中,若目標為肌肉萎縮蛋白基因之外顯子45、51或53,則精確缺失有助於肌肉萎縮蛋白基因之「3n+1」編輯,其中「n」為任何負整數(例如,-10與-75之間的任何負整數)。在一些實施例中,「n」為-10、-11、-12、-13、-14、-15、-16、-17、-18、-19、 -20、-21、-22、-23、-24、-25、-26、-27、-28、-29、-30、-31、-32、-33、-34、-35、-36、-37、-38、-39、-40、-41、-42、-43、-44、-45、-46、-47、-48、-49、-50、-51、-52、-53、-54、-55、-56、-57、-58、-59、-60、-61、-62、-63、-64、-65、-66、-67、-68、-69、-70、-71、-72、-73、-74、-75、-76、-77、-78、-79或-80。舉例而言,若「n」為10,則3n+1編輯將為-30個核苷酸+1核苷酸,亦即,-29個核苷酸,意謂實際切除產物之長度將為29個核苷酸。考慮到這一點,在一些實施例中,實際切除產物可為以下長度中之任一者:26、29、32、35、38、41、44、47、50、53、56、59、62、65、68、71、74、77、80、83、86、89、92、95、98、101、104、107、110、113、116、119、122、125、128、131、134、137、140、143、146、149、152、155、158、161、164、167、170、173、176、179、182、185、188、191、194、197、200、203、206、209、212、215或218個核苷酸長度。在特定實施例中,切除部分之長度為92個核苷酸。在其他實施例中,切除部分之長度為188個核苷酸。在特定實施例中,切除部分之長度為71個核苷酸。在其他實施例中,切除部分之長度為92個核苷酸。在其他實施例中,切除部分之長度為188個核苷酸。在其他實施例中,切除部分之長度為119個核苷酸。
在特定實施例中,若目標為肌肉萎縮蛋白基因之外顯子44或50,則精確缺失有助於肌肉萎縮蛋白基因之「3n+2」編輯,其中「n」為任何負整數(例如,-10與-75之間的任何負整數)。在一些實施例中,「n」為-10、-11、-12、-13、-14、-15、-16、-17、-18、-19、-20、 -21、-22、-23、-24、-25、-26、-27、-28、-29、-30、-31、-32、-33、-34、-35、-36、-37、-38、-39、-40、-41、-42、-43、-44、-45、-46、-47、-48、-49、-50、-51、-52、-53、-54、-55、-56、-57、-58、-59、-60、-61、-62、-63、-64、-65、-66、-67、-68、-69、-70、-71、-72、-73、-74、-75、-76、-77、-78、-79或-80。舉例而言,若「n」為-10,則3n+2編輯將為-30個核苷酸+2核苷酸,亦即,-28個核苷酸,意謂實際切除產物之長度將為28個核苷酸。考慮到這一點,在一些實施例中,實際切除產物可為以下長度中之任一者:25、28、31、34、37、40、43、46、49、52、55、58、61、64、67、70、73、76、79、82、85、88、91、94、97、100、103、106、109、112、115、118、121、124、127、130、133、136、139、142、145、148、151、154、157、160、163、166、169、172、175、178、181、184、187、190、193、196、199、202、205、208、211、214或217個核苷酸長度。
在一些實施例中,本發明提供一種包含至少兩個嚮導RNA之組合物,其中一旦在適當核酸內切酶(例如,SaCas9或SluCas9)存在下活體外或活體內表現,該核酸內切酶切除一部分外顯子,其中該外顯子之切除部分的尺寸在5、6、7、8、9、10、15或20及250個核苷酸長度之間。在一些實施例中,本發明提供一種包含至少兩個嚮導RNA之組合物,其中一旦在適當核酸內切酶(例如,SaCas9或SluCas9)存在下活體外或活體內表現,核酸內切酶切除一部分外顯子,其中該外顯子之切除部分的尺寸在150與250、100與250、5與250、5與200、5與150、5與100、5與75、5與50、5與25、5與10、20與250、20與200、20與150、20與100、20與75、20與50、20與25、50與250、50與200、50與150、50與100及50與75個核苷酸之間。
在一些實施例中,本發明提供一種包含至少兩個嚮導RNA之組合物,其中一旦在適當核酸內切酶(例如,SaCas9或SluCas9)存在下活體外或活體內表現,該核酸內切酶切除一部分外顯子,其中該外顯子之切除部分的尺寸在8與167個核苷酸之間。
在一些實施例中,嚮導RNA及Cas9經編碼於單個核酸分子上。在一些實施例中,單個核酸分子包含編碼嚮導RNA的核酸及編碼SaCas9或SluCas9的核酸。在一些實施例中,兩個嚮導RNA及一個Cas9編碼於單個核酸分子上。在一些實施例中,單個核酸分子包含編碼第一嚮導RNA的核酸、編碼第二嚮導RNA的核酸,及編碼SaCas9或SluCas9的核酸。在一些實施例中,第一與第二嚮導RNA的間隔子序列一致。在一些實施例中,第一與第二嚮導RNA的間隔子序列不一致。
在一些實施例中,單個核酸分子包含編碼一個Cas9的核酸及編碼兩個嚮導RNA的核酸,其中核酸分子編碼不超過兩個嚮導RNA。
在一些實施例中,單個核酸分子為單個載體或包含於單個載體中。在一些實施例中,單個載體表現兩個嚮導RNA及Cas9。在一些實施例中,一對嚮導RNA及Cas9提供於單個載體上。在一些實施例中,單個載體包含編碼一對嚮導RNA之核酸及編碼SaCas9或SluCas9之核酸。在一些實施例中,兩個嚮導RNA及Cas9在單個載體上編碼。在一些實施例中,單個載體包含編碼第一嚮導RNA的核酸、編碼第二嚮導RNA的核酸,及編碼SaCas9或SluCas9的核酸。在一些實施例中,第一與第二嚮導RNA的間隔子序列一致。在一些實施例中,第一與第二嚮導RNA的間隔子序列不一致。
在一些實施例中,第一核酸分子編碼Cas9分子且亦編碼第一嚮導RNA的一或多個複本及第二嚮導RNA的一或多個複本。在一些實施例中,第一核酸分子編碼Cas9分子,但不編碼任何嚮導RNA。在一些實施例中,第二核酸分子編碼第一嚮導RNA的一或多個複本及第二嚮導RNA的一或多個複本,其中第二核酸分子不編碼Cas9分子。
在一些實施例中,本發明提供一種組合物,其包含一或多個嚮導序列,或包含本文所揭示之編碼一或多個嚮導序列之核酸分子中之任一者。在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 1;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 2;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 3;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 4;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 5;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 6;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 7;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 8;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 9;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 10;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 11;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 12;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 13;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 14;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 15;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 16;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 17;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 18;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 19;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 20;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 21;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 22;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 23;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 24;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 25;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 26;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 27;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 28;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 29;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 30;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 31;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 32;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 33;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 34;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 35;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 36;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 37;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 38;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 39;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 40;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 41;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 42;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 43;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 44;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 45;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 46;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 47;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 48;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 49;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 50;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 51;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 52;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 53;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 54;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 55;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 56;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 57;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 58;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 59;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 60;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 61;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 62;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 63;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 64;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 65;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 66;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 67;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 68;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 69;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 70;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 71;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 72;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 73;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 74;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 75;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 76;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 77;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 78;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 79;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 80;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 81;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 82;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 83;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 84;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 85;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 86;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 87;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 88;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 89;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 90;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 91;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 92;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 93;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 94;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 95;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 96;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 97;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 98;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 99;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 100;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 101;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 102;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 103.在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 104;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 105;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 106;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 107;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 108;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 109;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 110;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 111;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 112;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 113;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 114;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 115;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 116;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 117;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 118;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 119;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 120;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 121;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 122;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 123;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 124;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 125;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 126;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 127;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 128;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 129;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 130;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 131;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 132;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 133;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 134;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 135;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 136;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 137;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 138;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 139;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 140;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 141;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 142;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 143;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 144;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 145;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 146;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 147;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 148;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 149;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 150;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 151;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 152;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 153;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 154;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 155;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 156;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 157;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 158;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 159;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 201;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 202;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 203;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 204;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 205;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 206;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 207;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 208;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 209;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 210;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 211;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 212;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 213;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 214;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 215;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 216;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 217;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 218;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 219;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 220;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 221;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 222;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 223;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 224;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 225;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 226;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 227;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 228;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 229;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 230;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 231;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 232;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 233;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 234;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 235;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 236;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 237;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 238;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 239;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 240;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 241;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 242;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 243;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 244;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 245;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 246;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 247;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 248;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 249;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 250;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 251;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 252;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 253;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 254;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 255;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 256;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 257;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 258;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 259;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 260;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 261;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 262;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 263;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 264;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 265;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 266;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 267;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 268;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 269;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 270;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 271;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 272;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 273;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 274;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 275;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 276;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 277;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 278;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 279;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 280;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 281;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 282;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 283;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 284;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 285;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 286;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 287;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 288;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 289;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 290;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 291;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 292;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 924;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 925;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 926;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 927;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 928;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 929;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 930;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 931;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 932;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 933;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 934;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 935;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 936;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 937;在一些實施例中,嚮導序列為SEQ ID NO: 938。
在一些實施例中,提供一種組合物,其包含:a)一或多個編碼SaCas9或SluCas9之核酸分子,及b)一對包含第一嚮導序列及第二嚮導序列之嚮導序列,其中該等對選自以下對中之任一者:SEQ ID NO: 1及SEQ ID NO: 3;SEQ ID NO: 3及SEQ ID NO: 4;SEQ ID NO: 3及SEQ ID NO: 5;SEQ ID NO: 3及SEQ ID NO: 6;SEQ ID NO: 3及SEQ ID NO: 7;SEQ ID NO: 3及SEQ ID NO: 8;SEQ ID NO: 3及SEQ ID NO: 9;SEQ ID NO: 4及SEQ ID NO: 5;SEQ ID NO: 4及SEQ ID NO: 6;SEQ ID NO: 4及SEQ ID NO: 7;SEQ ID NO: 4及SEQ ID NO: 8;SEQ ID NO: 4及SEQ ID NO: 9;SEQ ID NO: 5及SEQ ID NO: 6;SEQ ID NO: 5及SEQ ID NO: 7;SEQ ID NO: 5及SEQ ID NO: 8;SEQ ID NO: 5及SEQ ID NO: 9;SEQ ID NO: 6及SEQ ID NO: 7;SEQ ID NO: 6及SEQ ID NO: 8;SEQ ID NO: 6及SEQ ID NO: 9;SEQ ID NO: 7及SEQ ID NO: 8;SEQ ID NO: 7及SEQ ID NO: 9;SEQ ID NO: 8及SEQ ID NO: 9;SEQ ID NO: 11及SEQ ID NO: 12;SEQ ID NO: 11及SEQ ID NO: 13;SEQ ID NO: 11及SEQ ID NO: 14;SEQ ID NO: 11及SEQ ID NO: 15;SEQ ID NO: 12及SEQ ID NO: 13;SEQ ID NO: 12及SEQ ID NO: 14;SEQ ID NO: 12及SEQ ID NO: 15;SEQ ID NO: 13及SEQ ID NO: 14;SEQ ID NO: 13及SEQ ID NO: 15;SEQ ID NO: 14及SEQ ID NO: 15;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 17;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 18;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 19;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 18;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 19;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 19;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 20及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 20及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 20及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 20及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 20及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 20及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 21及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 21及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 21及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 21及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 21及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 22及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 22及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 22及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 22及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 23及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 23及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 23及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 24及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 24及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 25及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 110及SEQ ID NO: 120;SEQ ID NO: 110及SEQ ID NO: 121;SEQ ID NO: 110及SEQ ID NO: 122;SEQ ID NO: 110及SEQ ID NO: 123;SEQ ID NO: 110及SEQ ID NO: 124;SEQ ID NO: 110及SEQ ID NO: 125;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 112;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 113;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 114;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 115;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 116;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 117;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 118;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 119;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 120;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 121;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 122;SEQ 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在一個態樣中,提供一種包含編碼以下之單個核酸分子或兩個核酸分子的組合物,其中一個分子編碼1)一或多個包含選自SEQ ID NO:1-159中之任一者的嚮導序列之嚮導RNA;及2) SaCas9。在一個態樣中,提供一種包含編碼以下之單個核酸分子或兩個核酸分子的組合物,其中一個分子編碼1)一或多個包含選自SEQ ID NO:200-292、924-938或950-955中之任一者的嚮導序列之嚮導RNA;及2) SluCas9。
在一個態樣中,提供一種包含編碼以下之單個核酸分子或兩個核酸分子的組合物,其中一個分子編碼a)一或多個嚮導RNA,其包含與SEQ ID NO:1-159中之任一者至少99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%或90%一致之嚮導序列,及SaCas9;或b)一或多個嚮導RNA,其包含與SEQ ID NO:200-292、924-938或950-955中之任一者至少99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%或90%一致之嚮導序列;及SluCas9。在一個態樣中,提供一種包含編碼以下之單個核酸分子的組合物:a)一或多個嚮導RNA,其包含與1) SEQ ID NO:200-292、924-938或950-955中之任一者至少99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%或90%一致之嚮導序列,及SluCas9;或b)一或多個嚮導RNA,其包含與SEQ ID NO:1-159中之任一者至少99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%或90%一致之嚮導序列;及SaCas9。
在另一態樣中,提供一種包含編碼以下之單個核酸分子或兩個核酸分子的組合物,其中一個分子編碼a)一或多個嚮導RNA,其包含嚮導序列及SaCas9,該嚮導序列包含至少16、17、18、19或20個選自SEQ ID NO:1-159中之任一者之間隔子序列的連續核苷酸;或b)一或多個嚮導RNA,其包含嚮導RNA及SluCas9,該嚮導序列包含至少16、17、18、19或20個選自SEQ ID NO:200-292、924-938或950-955中之任一者之間隔子序列的連續核苷酸。在另一態樣中,提供一種包含編碼以下之單個核酸分子或兩個核酸分子的組合物,其中一個分子編碼a)一或多個嚮導RNA,其包含嚮導序列及SaCas9,該嚮導序列包含至少16、17、18、19或20個選自SEQ ID NO:1-159中之任一者之間隔子序列的連續核苷酸;或b)一或多個嚮導RNA,其包含嚮導RNA及SluCas9,該嚮導序列包含至少16、17、18、19或20個選自SEQ ID NO:200-292、924-938或950-955中之任一者之間隔子序列的連續核苷酸。
在一些實施例中,本文所揭示之嚮導中之任一者可用作研究工具,例如以研究細胞之運輸、表現及加工。
支架序列
表 6中所示之嚮導序列中之各者可進一步包含其他核苷酸以形成或編碼crRNA,例如使用適於正使用之Cas9的任何已知序列來形成或編碼crRNA。在一些實施例中,crRNA包含(5'至3')至少一個間隔子序列及第一互補域。第一互補域與第二互補域充分互補,第二互補域可為相同分子之一部分(在sgRNA之情況下)或存在於tracrRNA中(在雙重或模組化gRNA之情況下)以形成雙鏈體。關於包括第一及第二互補域之crRNA及gRNA域的詳細論述,參見例如US 2017/0007679。
單分子嚮導RNA (sgRNA)可以5'至3'方向包含視情況間隔子延長序列、間隔子序列、最小CRISPR重複序列、單分子嚮導連接子、最小tracrRNA序列、3' tracrRNA序列及/或視情況tracrRNA延長序列。視情況存在之tracrRNA延長序列可包含向嚮導RNA貢獻其他功能(例如穩定性)的元件。單分子嚮導連接子可使最小CRISPR重複序列與最小tracrRNA序列連接而形成髮夾結構。視情況存在之tracrRNA延長序列可包含一或多個髮夾。在特定實施例中,本發明提供包含間隔子序列及tracrRNA序列的sgRNA。
嚮導RNA可視為包含核酸內切酶結合所需之支架序列及結合至基因體目標序列所需之間隔子序列。在一些實施例中,嚮導RNA包含本文所揭示之支架序列中之任一者及本文所揭示之間隔子序列中之任一者。在一些實施例中,嚮導RNA包含本文所揭示之支架序列中之任一者及本文揭示之本文所揭示之間隔子序列中之任一者,在支架序列與間隔子序列之間無任何核苷酸。
在5'至3'取向上,位於嚮導序列之3'端之後、適合於與SaCas9一起使用的例示性支架序列為:GTTTAAGTACTCTGTGCTGGAAACAGCACAGAATCTACTTAAACAAGGCAAAATGCCGTGTTTATCTCGTCAACTTGTTGGCGAGA (SEQ ID NO: 500)。在一些實施例中,位於嚮導序列之3'端之後、與SaCas9一起使用的例示性支架序列為與SEQ ID NO: 500至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的序列,或與SEQ ID NO: 500相差不超過1、2、3、4、5、10、15、20或25個核苷酸的序列。
在一些實施例中,可使用SaCas9支架序列之變異體。在一些實施例中,位於嚮導序列之3'端之後的SaCas9支架稱為「Sa支架V1」且在5'至3'取向上,為:GTTTTAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTAAAACAAGGCAAAATGCCGTGTTTATCTCGTCAACTTGTTGGCGAGAT (SEQ ID NO: 501)。在一些實施例中,位於嚮導序列之3'端之後、與SaCas9一起使用的例示性支架序列為與SEQ ID NO: 501至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的序列,或與SEQ ID NO: 501相差不超過1、2、3、4、5、10、15、20或25個核苷酸的序列。
在一些實施例中,可使用SaCas9支架序列之變異體。在一些實施例中,位於嚮導序列之3'端之後的SaCas9支架稱為「Sa支架V2」且在5'至3'取向上,為:GTTTAAGTACTCTGTGCTGGAAACAGCACAGAATCTACTTAAACAAGGCAAAATGCCGTGTTTATCTCGTCAACTTGTTGGCGAGAT (SEQ ID NO: 502)。在一些實施例中,位於嚮導序列之3'端之後、與SaCas9一起使用的例示性支架序列為與SEQ ID NO: 502至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的序列,或與SEQ ID NO: 502相差不超過1、2、3、4、5、10、15、20或25個核苷酸的序列。
在一些實施例中,可使用SaCas9支架序列之變異體。在一些實施例中,位於嚮導序列之3'端之後的SaCas9支架稱為「Sa支架V3」且在5'至3'取向上,為:GTTTAAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTTAAACAAGGCAAAATGCCGTGTTTATCTCGTCAACTTGTTGGCGAGAT (SEQ ID NO: 503)。在一些實施例中,位於嚮導序列之3'端之後、與SaCas9一起使用的例示性支架序列為與SEQ ID NO: 503至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的序列,或與SEQ ID NO: 503相差不超過1、2、3、4、5、10、15、20或25個核苷酸的序列。
在一些實施例中,可使用SaCas9支架序列之變異體。在一些實施例中,位於嚮導序列之3'端之後的SaCas9支架稱為「Sa支架V5」且在5'至3'取向上,為:GTTTCAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTGAAACAAGGCAAAATGCCGTGTTTATCTCGTCAACTTGTTGGCGAGAT (SEQ ID NO: 504)。在一些實施例中,位於嚮導序列之3'端之後、與SaCas9一起使用的例示性支架序列為與SEQ ID NO: 504至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的序列,或與SEQ ID NO: 504相差不超過1、2、3、4、5、10、15、20或25個核苷酸的序列。
在5'至3'取向上,位於嚮導序列之3'端之後、適合於與SluCas9一起使用的兩個例示性支架序列為GTTTTAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTGAAACAAGACAATATGTCGTGTTTATCCCATCAATTTATTGGTGGGA(SEQ ID NO: 600)或GTTTAAGTACTCTGTGCTGGAAACAGCACAGAATCTACTGAAACAAGACAATATGTCGTGTTTATCCCATCAATTTATTGGTGGGA (SEQ ID NO: 601)。在一些實施例中,位於嚮導序列之3'端之後、與SluCas9一起使用的例示性支架序列為與SEQ ID NO: 600或SEQ ID NO: 601至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的序列,或與SEQ ID NO: 600或SEQ ID NO: 601相差不超過1、2、3、4、5、10、15、20或25個核苷酸的序列。
下文亦顯示位於嚮導序列之3'端之後、適合於與SluCas9一起使用的例示性支架序列(5'至3'取向):
表 7:
支架 ID | SEQ ID NO | 支架序列 ( 5 ' 至 3 ' ) | 與 Slu v5 的同源性 | 與 Slu v5 同源的劃線 ( 核苷酸數 ) |
野生型 | 900 | GTTTTAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTGAAACAAGACAATATGTCGTGTTTATCCCATCAATTTATTGGTGGGAT | N/A | N/A |
Slu-VCGT-4.5 | 601 | GTTTAAGTACTCTGTGCTGGAAACAGCACAGAATCTACTGAAACAAGACAATATGTCGTGTTTATCCCATCAATTTATTGGTGGGA | N/A | N/A |
Slu_v5 | 901 | GTTTCAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTGAAACAAGACAATATGTCGTGTTTATCCCATCAATTTATTGGTGGGAT | 100.00% | 77 |
Slu_v5-1 | 902 | GTTTggTaACcTaGGAAACTagATCTTaccAAACAAGACAATATGTCGTGTTTATCCCATCAATTTATTGGTGGGAT | 87.50% | 47 |
Slu_v5-2 | 903 | GTTTCAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTGAAACAAGgCAAaATGcCGTGTTTATCCCATCAATTTATTGGTGGGAT | 96.10% | 37 |
Slu_v5-3 | 904 | GTTTCAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTGAAACAAGACAATATGTCGcgcccaTCCCATCAATTTATTGGTGGGAT | 94.81% | 48 |
Slu_v5-4 | 905 | GTTTCAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTGAAACAAGACAATATGTCGTGTTTATgggTTgAATTTATTcGacccAT | 91.55% | 55 |
Slu_v5-5 | 906 | GTTTggTaACcTaGGAAACTagATCTTaccAAACAAGgCAAaATGcCGTGTTTATCCCATCAATTTATTGGTGGGAT | 83.75% | 31 |
Slu_v5-6 | 907 | GTTTggTaACcTaGGAAACTagATCTTaccAAACAAGACAATATGTCGcgcccaTCCCATCAATTTATTGGTGGGAT | 82.50% | 23 |
Slu_v5-7 | 908 | GTTTggTaACcTaGGAAACTagATCTTaccAAACAAGACAATATGTCGTGTTTATgggTTgAATTTATTcGacccAT | 78.38% | 25 |
Slu_v5-8 | 909 | GTTTCAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTGAAACAAGgCAAaATGcCGcgcccaTCCCATCAATTTATTGGTGGGAT | 90.91% | 37 |
Slu_v5-9 | 910 | GTTTCAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTGAAACAAGgCAAaATGcCGTGTTTATgggTTgAATTTATTcGacccAT | 87.32% | 37 |
Slu_v5-10 | 911 | GTTTCAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTGAAACAAGACAATATGTCGcgcccaTgggTTgAATTTATTcGacccAT | 82.89% | 48 |
Slu_v5-11 | 912 | GTTTggTaACcTaGGAAACTagATCTTaccAAACAAGgCAAaATGcCGcgcccaTCCCATCAATTTATTGGTGGGAT | 78.75% | 23 |
Slu_v5-12 | 913 | GTTTggTaACcTaGGAAACTagATCTTaccAAACAAGgCAAaATGcCGTGTTTATgggTTgAATTTATTcGacccAT | 74.32% | 9 |
Slu_v5-13 | 914 | GTTTggTaACcTaGGAAACTagATCTTaccAAACAAGACAATATGTCGcgcccaTgggTTgAATTTATTcGacccAT | 70.89% | 18 |
Slu_v5-14 | 915 | GTTTCAGTACTCTGGAAACAGAATCTACTGAAACAAGgCAAaATGcCGcgcccaTgggTTgAATTTATTcGacccAT | 78.95% | 37 |
Slu_v5-15 | 916 | GTTTggTaACcTaGGAAACTagATCTTaccAAACAAGgCAAaATGcCGcgcccaTgggTTgAATTTATTcGacccAT | 67.09% | 8 |
Slu v4 | 917 | GTTTCAGTACTCTGTGCTGGAAACAGCACAGAATCTACTGAAACAAGACAATATGTCGTGTTTATCCCATCAATTTATTGGTGGGAT | N/A | N/A |
在一些實施例中,在5'至3'取向上,位於嚮導序列之3'端之後、適合於與SaCas9一起使用的支架序列係選自SEQ ID NO: 500-504中之任一者。在一些實施例中,位於嚮導序列之3'端之後、與SaCas9一起使用的例示性序列為與SEQ ID NO: 500-504中之任一者至少65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的序列,或與SEQ ID NO: 500-504中之任一者相差不超過1、2、3、4、5、10、15、20或25個核苷酸的序列。
在一些實施例中,在5'至3取向上,位於嚮導序列之3'端之後、適合於與SluCas9一起使用的支架序列係選自SEQ ID NO: 900或601或901-917中之任一者。在一些實施例中,位於嚮導序列之3'端之後、與SluCas9一起使用的例示性序列為與SEQ ID NO: 900或601或901-917中之任一者至少65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的序列,或與SEQ ID NO: 900或601或901-917中之任一者相差不超過1、2、3、4、5、10、15、20或25個核苷酸的序列。
在一些實施例中,任何支架序列(例如,本文所揭示之支架序列中之任一者)適合於與本文所揭示之任何sRGN,諸如sRGN1、sRGN2、sRGN3、sRGN3.1、sRGN3.2、sRGN3.3、sRGN4中之任一者,或編碼其之核酸分子一起使用。在一些實施例中,適合於與sRGN,諸如在包含sRGN之表現載體(例如,如圖5A至圖5B中所示之表現載體)內之嚮導RNA序列之3'端處,一起使用的支架序列係選自SEQ ID NO: 500-504、601或900-917中之任一者。在一些實施例中,適合於與sRGN,諸如在包含sRGN之表現載體(例如,如圖5A至圖5B中所示之表現載體)內之嚮導RNA序列之3'端處,一起使用的支架序列為與SEQ ID NO: 500-504、601或900-917中之任一者至少65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的序列,或與SEQ ID NO: 500-504、601或900-917中之任一者相差不超過1、2、3、4、5、10、15、20或25個核苷酸的序列。
在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 500之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 501之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 502之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 503之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 504之序列。在包含一對gRNA的一些實施例中,gRNA中之一者包含選自SEQ ID NO: 500-504中之任一者的序列。在包含一對gRNA的一些實施例中,gRNA中之兩者包含選自SEQ ID NO: 500-504中之任一者的序列。在包含一對gRNA的一些實施例中,gRNA之嚮導序列的核苷酸3'為相同序列。在包含一對gRNA的一些實施例中,gRNA之嚮導序列的核苷酸3'為不同序列。
在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 900之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 601之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 900之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 901之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 902之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 903之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 904之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 905之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 906之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 907之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 908之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 909之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 910之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 911之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 912之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 913之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 914之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 915之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 916之序列。在一些實施例中,編碼gRNA之核酸包含含有SEQ ID NO: 917之序列。在包含一對gRNA的一些實施例中,gRNA中之一者包含選自SEQ ID NO: 900或601或901-917中之任一者的序列。在包含一對gRNA的一些實施例中,gRNA中之兩者包含選自SEQ ID NO: 900或601或901-917中之任一者的序列。在包含一對gRNA的一些實施例中,gRNA之嚮導序列的核苷酸3'為相同序列。在包含一對gRNA的一些實施例中,gRNA之嚮導序列的核苷酸3'為不同序列。
在一些實施例中,支架序列的莖環1相較於野生型SluCas9支架序列(例如包含序列SEQ ID NO: 900的支架)或參考SluCas9支架序列(例如包含序列SEQ ID NO: 901的支架)的莖環1包含一或多個變化。在一些實施例中,支架序列的莖環2相較於野生型SluCas9支架序列(例如包含序列SEQ ID NO: 900的支架)或參考SluCas9支架序列(例如包含序列SEQ ID NO: 901的支架)的莖環2包含一或多個變化。在一些實施例中,支架序列的四環相較於野生型SluCas9支架序列(例如包含序列SEQ ID NO: 900的支架)或參考SluCas9支架序列(例如包含序列SEQ ID NO: 901的支架)的四環包含一或多個變化。在一些實施例中,支架序列的重複區域相較於野生型SluCas9支架序列(例如包含序列SEQ ID NO: 900的支架)或參考SluCas9支架序列(例如包含序列SEQ ID NO: 901的支架)的重複區域包含一或多個變化。在一些實施例中,支架序列的抗重複區域相較於野生型SluCas9支架序列(例如包含序列SEQ ID NO: 900的支架)或參考SluCas9支架序列(例如包含序列SEQ ID NO: 901的支架)的抗重複區域包含一或多個變化。在一些實施例中,支架序列的連接子區域相較於野生型SluCas9支架序列(例如包含序列SEQ ID NO: 900的支架)或參考SluCas9支架序列(例如包含序列SEQ ID NO: 901的支架)的連接子區域包含一或多個變化。關於支架區域的描述,參見例如Nishimasu等人, 2015, Cell, 162:1113-1126。
在使用tracrRNA的情況下,在一些實施例中,其包含(5'至3')第二互補域及近端域。在sgRNA的情況下,嚮導序列連同其他核苷酸(例如SEQ ID No: 500-504 (對於SaCas9)及900或601或901-917 (對於SluCas9))一起形成或編碼sgRNA。在一些實施例中,sgRNA包含(5'至3')至少一個間隔子序列、第一互補域、連接域、第二互補域及近端域。sgRNA或tracrRNA可進一步包含尾域。連接域可為髮夾形成域。關於包括第二互補域、連接域、近端域及尾域之crRNA及gRNA域的詳細論述及實例,參見例如US 2017/0007679。
在一些實施例中,本發明提供編碼一或多種嚮導RNA組分(例如本文所揭示之間隔子及支架序列中的任一者)之特定核酸序列。本發明涵蓋本文所提供之任一種DNA序列的RNA等效物(亦即,其中「T」置換成「U」),或本文所提供之任一種RNA序列的DNA等效物(例如其中「U」置換成「T」),以及本文所揭示之任一種序列的互補序列(包括反向互補序列)。
在一些實施例中,提供一種組合物,其包含嚮導RNA或編碼嚮導RNA的核酸,其中該嚮導RNA進一步包含trRNA。在本文所描述之各組合物及方法實施例中,crRNA (包含間隔子序列)及trRNA可結合為單個RNA (sgRNA)或可處於各別RNA (dgRNA)上。在sgRNA之情形下,crRNA與trRNA組分可共價連接,例如經由磷酸二酯鍵或其他共價鍵共價連接。
載體
在包含編碼嚮導RNA及/或Cas9之核酸分子的任何實施例中,核酸分子可為載體。在一些實施例中,提供一種組合物,其包含編碼至少一個嚮導RNA及Cas9之單個核酸分子,其中該核酸分子為載體。在一些實施例中,提供一種組合物,其包含編碼至少一個嚮導RNA及Cas9之超過一個核酸分子,其中該核酸分子為載體。在一些實施例中,提供一種組合物,其包含超過一個核酸分子,其中一個分子編碼一或多個嚮導RNA,且另一分子編碼Cas9加或減至少一個嚮導RNA,其中該核酸分子為載體。
可使用任何類型之載體,諸如本文所描述之彼等載體中的任一者。在一些實施例中,載體為脂質奈米粒子。在一些實施例中,該載體係病毒載體。在一些實施例中,病毒載體為非整合型病毒載體(亦即,不將來自載體之序列插入宿主染色體中)。在一些實施例中,病毒載體為腺相關病毒載體(AAV)、慢病毒載體、整合酶缺乏型慢病毒載體、腺病毒載體、牛痘病毒載體、α病毒載體或單純疱疹病毒載體。在一些實施例中,載體包含肌肉特異性啟動子。例示性肌肉特異性啟動子包括肌肉肌酸激酶啟動子、結蛋白(desmin)啟動子、MHCK7啟動子或SPc5-12啟動子。參見US 2004/0175727 A1;Wang等人, Expert Opin Drug Deliv. (2014) 11, 345-364;Wang等人, Gene Therapy (2008) 15, 1489-1499。在一些實施例中,肌肉特異性啟動子為CK8啟動子。在一些實施例中,肌肉特異性啟動子為CK8e啟動子。在任一前述實施例中,載體可為腺相關病毒載體(AAV)。
在一些實施例中,載體為包含核酸內切酶(例如,本文所揭示之核酸內切酶中之任一者)及本文所揭示之嚮導RNA中之任一者或多者的脂質奈米粒子。在一些實施例中,載體為包含編碼核酸內切酶(例如,本文所揭示之核酸內切酶中之任一者)及本文所揭示之嚮導RNA中之任一者或多者之核酸的脂質奈米粒子。在一些實施例中,載體為脂質奈米粒子,其包含編碼核酸內切酶(例如,本文所揭示之核酸內切酶中之任一者)之核酸及編碼本文所揭示之嚮導RNA中之任一者中之一或多者的核酸。
在使用載體的情況下,其可為病毒載體,諸如非整合性病毒載體。在一些實施例中,病毒載體為腺相關病毒載體、慢病毒載體、整合酶缺乏型慢病毒載體、腺病毒載體、牛痘病毒載體、α病毒載體或單純疱疹病毒載體。在一些實施例中,病毒載體為腺相關病毒(AAV)載體。在一些實施例中,AAV載體為AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAVrh10 (參見例如US 9,790,472之SEQ ID NO: 81,該文獻以全文引用之方式併入本文中)、AAVrh74 (參見例如US 2015/0111955之SEQ ID NO: 1,該文獻以全文引用之方式併入本文中)或AAV9載體,其中AAV後之數字指示AAV血清型。在一些實施例中,AAV載體為單股AAV (ssAAV)。在一些實施例中,AAV載體為雙股AAV (dsAAV)。通用術語AAV載體、AAV1載體等涵蓋AAV載體或其血清型之任何變異體,諸如自我互補AAV (scAAV)載體。關於各種AAV載體之詳述論述,參見例如McCarty等人, Gene Ther. 2001;8:1248-54,Naso等人, BioDrugs 2017; 31:317-334,及其中所引用之參考文獻。在一些實施例中,利用自ITR至ITR (包括兩個ITR)的核苷酸長度量測AAV載體尺寸。在一些實施例中,AAV載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於5 kb。在特定實施例中,AAV載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.9 kb。在其他實施例中,AAV載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.85 kb。在其他實施例中,AAV載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.8 kb。在其他實施例中,AAV載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.75 kb。在其他實施例中,AAV載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.7 kb。在一些實施例中,載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸介於3.9-5 kb、4-5 kb、4.2-5 kb、4.4-5 kb、4.6-5 kb、4.7-5 kb、3.9-4.9 kb、4.2-4.9 kb、4.4-4.9 kb、4.7-4.9 kb、3.9-4.85 kb、4.2-4.85 kb、4.4-4.85 kb、4.6-4.85 kb、4.7-4.85 kb、4.7-4.9 kb、3.9-4.8 kb、4.2-4.8 kb、4.4-4.8 kb或4.6-4.8 kb之間。在一些實施例中,載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸介於4.4-4.85 kb之間。在一些實施例中,載體為AAV9載體。
在一些實施例中,載體(例如,病毒載體,諸如腺相關病毒載體)包含組織特異性(例如,肌肉特異性)啟動子,其例如可操作地連接至編碼嚮導RNA及/或Cas蛋白質之序列。在一些實施例中,肌肉特異性啟動子為肌肉肌酸激酶啟動子、結蛋白啟動子、MHCK7啟動子或SPc5-12啟動子。在一些實施例中,肌肉特異性啟動子為CK8啟動子。在一些實施例中,肌肉特異性啟動子為CK8e啟動子。肌肉特異性啟動子詳細描述於例如以下中:US2004/0175727 A1;Wang等人, Expert Opin Drug Deliv. (2014) 11, 345-364;Wang等人, Gene Therapy (2008) 15, 1489-1499。在一些實施例中,組織特異性啟動子為神經元特異性啟動子,諸如烯醇酶啟動子。關於組織特異性啟動子(包括神經元特異性啟動子)之詳細論述,參見例如Naso等人, BioDrugs 2017; 31:317-334;Dashkoff等人, Mol Ther Methods Clin Dev. 2016;3:16081,及其中所引用之參考文獻。
在一些實施例中,除嚮導RNA及Cas9序列之外,載體進一步包含不編碼嚮導RNA之核酸。不編碼嚮導RNA及Cas9的核酸包括(但不限於)啟動子、增強子及調控序列。在一些實施例中,載體包含一或多個編碼crRNA、trRNA或crRNA及trRNA之核苷酸序列。在一些實施例中,肌肉特異性啟動子為CK8啟動子。CK8啟動子具有以下序列(SEQ ID NO. 700):
在一些實施例中,肌肉細胞的細胞特異性啟動子為CK8啟動子變異體,稱為CK8e。在一些實施例中,CK8e啟動子的尺寸為436 bp。CK8e啟動子具有以下序列(SEQ ID NO. 701):
在一些實施例中,Ck8e啟動子包含與如下序列SEQ ID NO: 701至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列。
在一些實施例中,載體包含U6、H1或7SK啟動子中之一或多者。在一些實施例中,U6啟動子為人類U6啟動子(例如U6L啟動子或U6S啟動子)。在一些實施例中,該啟動子為鼠類U6啟動子。在一些實施例中,7SK啟動子為人類7SK啟動子。在一些實施例中,7SK啟動子為7SK1啟動子。在一些實施例中,7SK啟動子為7SK2啟動子。在一些實施例中,H1啟動子為人類H1啟動子(例如H1L啟動子或H1S啟動子)。在一些實施例中,載體包含多個嚮導序列,其中各嚮導序列處於各別啟動子的控制下。在一些實施例中,多個嚮導序列中之各者包含不同序列。在一些實施例中,多個嚮導序列中之各者包含相同序列(例如,多個嚮導序列中之各者包含相同的間隔子序列)。在一些實施例中,多種嚮導序列中之各者包含相同間隔子序列及相同支架序列。在一些實施例中,多種嚮導序列中之各者包含不同間隔子序列及不同支架序列。在一些實施例中,多種嚮導序列中之各者包含相同間隔子序列,但包含不同支架序列。在一些實施例中,多種嚮導序列中之各者包含不同間隔子序列及不同支架序列。在一些實施例中,各別啟動子各自包含相同核苷酸序列(例如U6啟動子序列)。在一些實施例中,各別啟動子各自包含不同核苷酸序列(例如U6、H1及/或7SK啟動子序列)。
在一些實施例中,U6啟動子包含與如下序列SEQ ID NO: 702至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
在一些實施例中,H1啟動子包含與SEQ ID NO: 703之序列至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
在一些實施例中,7SK啟動子包含與SEQ ID NO: 704之序列至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
在一些實施例中,U6啟動子為hU6c啟動子且包含與如下序列SEQ ID NO: 705至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
。
在一些實施例中,U6啟動子為hU6c啟動子之變異體。在一些實施例中,相較於序列SEQ ID NO: 705,hU6c啟動子之變異體包含替代核苷酸。在一些實施例中,hU6c啟動子之變異體包含的核苷酸比SEQ ID NO: 705之249個核苷酸少。在一些實施例中,hU6c啟動子之變異體在SEQ ID NO: 705之hU6c啟動子的核小體結合序列中具有較少核苷酸。在一些實施例中,hU6c啟動子之變異體缺乏與SEQ ID NO: 705之核苷酸96-125對應的所有核苷酸或至少一部分核苷酸(例如至少5、10、15、20、25或30個核苷酸)。在一些實施例中,hU6c啟動子之變異體缺乏與SEQ ID NO: 705之核苷酸81-140對應的所有核苷酸或至少一部分核苷酸(例如至少5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55或60個核苷酸)。在一些實施例中,hU6c啟動子之變異體缺乏與SEQ ID NO: 705之核苷酸66-150對應的所有核苷酸或至少一部分核苷酸(例如至少10、20、30、40、50、60、65、70、75、80或85個核苷酸)。在一些實施例中,hU6c啟動子之變異體缺乏與SEQ ID NO: 705之核苷酸51-170對應的所有核苷酸或至少一部分核苷酸(例如至少10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110或120個核苷酸)。在一些實施例中,hU6c啟動子之變異體缺乏與SEQ ID NO: 705之核苷酸96-125對應的核苷酸。在一些實施例中,hU6c啟動子之變異體包含129-219個核苷酸。在一些實施例中,hU6c啟動子之變異體包含219個核苷酸。在一些實施例中,hU6c啟動子之變異體包含189個核苷酸。在一些實施例中,hU6c啟動子之變異體包含159個核苷酸。在一些實施例中,hU6c啟動子之變異體包含129個核苷酸。
在一些實施例中,U6啟動子為hU6d30且包含與如下序列SEQ ID NO: 9001至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
。
在一些實施例中,U6啟動子為hU6d60啟動子且包含與如下序列SEQ ID NO: 9002至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
。
在一些實施例中,U6啟動子為hU6d90啟動子且包含與如下序列SEQ ID NO: 9003至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
。
在一些實施例中,U6啟動子為hU6d120啟動子且包含與序列SEQ ID NO: 9004至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
。
在一些實施例中,7SK啟動子為7SK2啟動子且包含與序列SEQ ID NO: 706至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
。
在一些實施例中,7SK啟動子為7SK2啟動子之變異體。在一些實施例中,相較於序列SEQ ID NO: 706,7SK2啟動子之變異體包含替代核苷酸。在一些實施例中,7SK2啟動子之變異體例如包含比SEQ ID NO: 706之243個核苷酸更少的核苷酸。在一些實施例中,7SK2啟動子之變異體在SEQ ID NO: 706之7SK2啟動子的核小體結合序列中具有較少核苷酸。在一些實施例中,7SK2啟動子之變異體缺乏對應於SEQ ID NO: 706之核苷酸95-124的所有或至少一部分核苷酸(例如,至少5、10、15、20、25或30個核苷酸)。在一些實施例中,7SK2啟動子之變異體缺乏對應於SEQ ID NO: 706之核苷酸81-140的所有或至少一部分核苷酸(例如,至少5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55或60個核苷酸)。在一些實施例中,7SK2啟動子之變異體缺乏對應於SEQ ID NO: 706之核苷酸67-156的所有或至少一部分核苷酸(例如,至少10、20、30、40、50、60、65、70、75、80、85或90個核苷酸)。在一些實施例中,7SK2啟動子之變異體缺乏對應於SEQ ID NO: 706之核苷酸52-171的所有或至少一部分核苷酸(例如,至少10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110或120個核苷酸)。在一些實施例中,7SK2啟動子之變異體包含123-213個核苷酸。在一些實施例中,7SK2啟動子之變異體包含213個核苷酸。在一些實施例中,7SK2啟動子之變異體包含183個核苷酸。在一些實施例中,7SK2啟動子之變異體包含153個核苷酸。在一些實施例中,7SK2啟動子之變異體包含123個核苷酸。
在一些實施例中,7SK啟動子為7SKd30啟動子且包含與序列SEQ ID NO: 9006至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
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在一些實施例中,7SK啟動子為7SKd60啟動子且包含與序列SEQ ID NO: 9007至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
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在一些實施例中,7SK啟動子為7SKd90啟動子且包含與序列SEQ ID NO: 9008至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
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在一些實施例中,7SK啟動子為7SKd120啟動子且包含與序列SEQ ID NO: 9009至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
CTGCAGTATTTAGCATGCCCCACCCATCTGCAAGGCATTCTGGATAGTGTCAGCAACTTGACCTAAGTGTAAAGTTGAGACTTCCTTCAGGTTTATATAGCTTGTGCGCCGCTTGGGTACCTC。
在一些實施例中,H1啟動子為H1m或mH1啟動子且包含與如下序列SEQ ID NO: 707至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
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在一些實施例中,啟動子為M11啟動子且包含與如下序列SEQ ID NO: 708至少90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核苷酸序列:
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在一些實施例中,載體包含多個反向末端重複序列(ITR)。此等ITR可為AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8或AAV9血清型。在一些實施例中,ITR為AAV2血清型。在一些實施例中,5' ITR包含與SEQ ID NO: 709之序列具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致性的序列:
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在一些實施例中,5' ITR包含與SEQ ID NO: 939之序列具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致性的序列:
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在一些實施例中,3'ITR包含與SEQ ID NO: 710之序列具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致性的序列:
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在一些實施例中,3'ITR包含與SEQ ID NO: 940之序列具有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致性的序列:
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在一些實施例中,提供一種載體,其包含編碼以下之單個核酸分子:1)包含
表 6之間隔子序列中之任何一或多者的兩個或更多個嚮導RNA;及2) SaCas9 (針對SEQ ID No: 1-159中之任何一或多者)或SluCas9 (針對SEQ ID NO:200-292、924-938或950-955中之任何一或多者)。在一些實施例中,載體為AAV載體。在一些實施例中,向個體投與AAV載體以治療DMD。在一些實施例中,由於使用適用於SaCas9或SluCas9之背景下的特定嚮導序列,因此需要僅一個載體。
在一些實施例中,載體包含編碼Cas9蛋白(例如SaCas9或SluCas9蛋白)的核酸且進一步包含編碼一或多個單嚮導RNA的核酸。在一些實施例中,編碼Cas9蛋白的核酸處於CK8e啟動子的控制下。在一些實施例中,編碼嚮導RNA序列的核酸處於hU6c啟動子的控制下。在一些實施例中,載體為AAV9。
在一些實施例中,載體包含編碼超過一種嚮導RNA之多種核酸。在一些實施例中,載體包含兩個編碼兩個不同嚮導RNA序列之核酸。
在一些實施例中,載體包含編碼Cas9蛋白(例如SaCas9蛋白或SluCas9蛋白)的核酸、編碼第一嚮導RNA的核酸,及編碼第二嚮導RNA的核酸。在一些實施例中,載體不包含編碼超過兩個嚮導RNA之核酸。在一些實施例中,編碼第一嚮導RNA之核酸與編碼第二嚮導RNA之核酸相同。在一些實施例中,編碼第一嚮導RNA之核酸不同於編碼第二嚮導RNA之核酸。在一些實施例中,載體包含單個核酸分子,其中該單個核酸分子包含編碼Cas9蛋白的核酸、編碼第一嚮導RNA的核酸,及作為第二嚮導RNA之編碼序列之反向互補序列的核酸。在一些實施例中,載體包含單個核酸分子,其中該單個核酸分子包含編碼Cas9蛋白的核酸、作為第一嚮導RNA之編碼序列之反向互補序列的核酸,及作為第二嚮導RNA之編碼序列之反向互補序列的核酸。在一些實施例中,編碼Cas9蛋白(例如SaCas9或SluCas9蛋白)的核酸處於CK8e啟動子的控制下。在一些實施例中,第一嚮導處於hU6c啟動子之控制下,且第二嚮導處於hU6c啟動子之控制下。在一些實施例中,第一嚮導處於7SK2啟動子的控制下,且第二嚮導處於H1m啟動子的控制下。在一些實施例中,第一嚮導處於H1m啟動子之控制下,且第二嚮導處於7SK2啟動子之控制下。在一些實施例中,第一嚮導處於hU6c啟動子之控制下,且第二嚮導處於H1m啟動子之控制下。在一些實施例中,第一嚮導處於H1m啟動子之控制下,且第二嚮導處於hU6c啟動子之控制下。在一些實施例中,編碼Cas9蛋白的核酸介於:a)編碼嚮導RNA的核酸之間;b)作為嚮導RNA之編碼序列之反向互補序列的核酸之間;c)編碼第一嚮導RNA的核酸與作為第二嚮導RNA之編碼序列之反向互補序列的核酸之間;d)編碼第二嚮導RNA之核酸與作為第一嚮導RNA之編碼序列之反向互補序列的核酸之間;e) 5'至編碼嚮導RNA的核酸;f) 5'至作為嚮導RNA之編碼序列之反向互補序列的核酸;g) 5'至編碼嚮導RNA之一的核酸及5'至作為其他嚮導RNA之編碼序列之反向互補序列的核酸;h) 3'至編碼嚮導RNA的核酸;i) 3'至作為嚮導RNA之編碼序列之反向互補序列的核酸;或j) 3'至編碼嚮導RNA之一的核酸及3'至作為其他嚮導RNA之編碼序列之反向互補序列的核酸。在一些實施例中,本文所揭示之載體中之任一者為AAV9。在較佳實施例中,AAV9載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於5 kb。在特定實施例中,AAV9載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.9 kb。在其他實施例中,AAV9載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.85 kb。在其他實施例中,AAV9載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.8 kb。在其他實施例中,AAV9載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.75 kb。在其他實施例中,AAV9載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.7 kb。在一些實施例中,載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸介於3.9-5 kb、4-5 kb、4.2-5 kb、4.4-5 kb、4.6-5 kb、4.7-5 kb、3.9-4.9 kb、4.2-4.9 kb、4.4-4.9 kb、4.7-4.9 kb、3.9-4.85 kb、4.2-4.85 kb、4.4-4.85 kb、4.6-4.85 kb、4.7-4.85 kb、4.7-4.9 kb、3.9-4.8 kb、4.2-4.8 kb、4.4-4.8 kb或4.6-4.8 kb之間。在一些實施例中,載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸介於4.4-4.85 kb之間。在一些實施例中,載體為AAV9載體。
在一些實施例中,本文中所揭示之任一種載體包含至少編碼第一嚮導RNA及第二嚮導RNA的核酸。在一些實施例中,核酸包含第一嚮導RNA的間隔子編碼序列、第一嚮導RNA的支架編碼序列、第二嚮導RNA的間隔子編碼序列,及第二嚮導RNA的支架編碼序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA的間隔子編碼序列(例如編碼本文中所揭示的任一種間隔子序列)與第二嚮導RNA的間隔子編碼序列一致。在一些實施例中,第一嚮導RNA的間隔子編碼序列(例如編碼本文中所揭示的任一種間隔子序列)不同於第二嚮導RNA的間隔子編碼序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列與第二嚮導RNA的支架編碼序列一致。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列不同於編碼第二嚮導RNA之核酸的支架編碼序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA之支架編碼序列包含選自由SEQ ID No: 500-504 (對於SaCas9)及601或900-917 (對於SluCas9)組成之群的序列,且第二嚮導RNA之支架編碼序列包含選自由SEQ ID No: 500-504 (對於SaCas9)及601或900-917 (對於SluCas9)組成之群的不同序列。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 500,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 501。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 500,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 502。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 500,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 503。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 500,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 504。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 501,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 502。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 501,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 503。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 501,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 504。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 502,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 503。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 502,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 504。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 503,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 504。在特定實施例中,用於第一嚮導RNA之支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 504,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 504。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 900。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 902。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 903。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 904。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 905。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 906。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 907。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 908。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 909。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 910。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 911。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 912。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 913。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 914。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 915。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 916。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 600,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 917。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 902。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 903。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 904。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 905。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 906。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 907。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 908。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 909。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 910。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 911。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 912。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 913。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 914。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 915。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 916。在一些實施例中,第一嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 917。在特定實施例中,用於第一嚮導RNA之支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901,且第二嚮導RNA的支架編碼序列包含序列SEQ ID NO: 901。在一些實施例中,第一嚮導RNA的間隔子編碼序列與第二嚮導RNA的間隔子編碼序列相同,且第一嚮導RNA的支架編碼序列不同於編碼第二嚮導RNA之核酸的支架編碼序列。
在一些實施例中,AAV載體呈特定組態。本文提供此等新穎AAV載體組態的一些實例,且此等例示性載體中的元件次序根據正股、以5'至3'方式提及。對於此等組態而言,應瞭解,所描述元件可以不直接鄰接,並且所描述元件之間可存在一或多個核苷酸或一或多個其他元件。然而,在一些實施例中,所描述元件之間可不存在核苷酸或其他元件。此外,除非另有說明,否則「用於表現元件X的啟動子」意謂啟動子以促進所描述元件X表現的方式定向。另外,除非另有說明,否則提及「sgRNA支架序列」或「嚮導RNA支架序列」與「編碼sgRNA支架序列的核苷酸序列/核酸」或「編碼嚮導RNA支架序列的核苷酸序列/核酸」同義。在一些實施例中,本發明提供編碼SaCas9 (例如SaCas9-KKH)或SluCas9的核酸。在一些實施例中,核酸編碼位於所編碼之SaCas9或SluCas9之C端上的一或多個核定位信號(例如,SV40 NLS及/或c-Myc NLS)。在一些實施例中,核酸編碼位於所編碼之SaCas9或SluCas9之C端上的一或多個NLS (例如SV40 NLS及/或c-Myc NLS),且核酸不編碼位於所編碼之SaCas9或SluCas9之N端上的NLS。在一些實施例中,核酸編碼位於所編碼之SaCas9或SluCas9之N端上的一或多個核定位信號(例如SV40 NLS及/或c-Myc NLS)。在一些實施例中,核酸編碼位於所編碼之SaCas9或SluCas9之N端上的一或多個NLS (例如SV40 NLS及/或c-Myc NLS),且核酸不編碼位於所編碼之SaCas9或SluCas9之C端上的NLS。在一些實施例中,核酸編碼位於所編碼之SaCas9或SluCas9之C端上的一或多個核定位信號(例如SV40 NLS及/或c-Myc NLS)且亦編碼位於所編碼之SaCas9或SluCas9之N端上的一或多個NLS (例如SV40 NLS及/或c-Myc NLS)。在一些實施例中,核酸編碼一個NLS。在一些實施例中,核酸編碼兩個NLS。在一些實施例中,核酸編碼三個NLS。一個、兩個或三個NLS皆可位於C端、N端,或C端與N端之任何組合。NLS可直接地與C端或N端或與另一NLS融合/連接,或可間接地經由連接子融合/連接。在一些實施例中,另一個域可在連接子存在或不存在下:a)與Cas蛋白(例如Cas9蛋白)之N端或C端融合;b)與NLS之N端融合,該NLS與Cas蛋白之N端融合;或c)與NLS之C端融合,該NLS與Cas蛋白之C端融合。在一些實施例中,NLS藉由連接子與Cas蛋白之N端及/或C端融合。在一些實施例中,NLS藉由連接子與Cas蛋白上之經N端融合之NLS的N端融合,及/或NLS藉由連接子與Cas蛋白上之經C端融合之NLS的C端融合。在一些實施例中,連接子為GSVD (SEQ ID NO: 550)或GSGS (SEQ ID NO: 551)。在一些實施例中,Cas蛋白包含視情況藉由連接子與Cas蛋白之N端(或與Cas蛋白上之經N端融合的NLS)融合的c-Myc NLS。在一些實施例中,Cas蛋白包含視情況藉由連接子與Cas蛋白之C端(或Cas蛋白上之經C端融合的NLS)融合的SV40 NLS。在一些實施例中,Cas蛋白包含視情況藉由連接子與Cas蛋白之C端(或與Cas蛋白上之經C端融合的NLS)融合的核質蛋白NLS。在一些實施例中,Cas蛋白包含:a)視情況藉由連接子與Cas蛋白之N端融合的c-Myc NLS;b)視情況藉由連接子與Cas蛋白之C端融合的SV40 NLS;及c)視情況藉由連接子與SV40 NLS之C端融合的核質蛋白NLS。在一些實施例中,Cas蛋白包含:a)視情況藉由連接子與Cas蛋白之N端融合的c-Myc NLS;b)視情況藉由連接子與Cas蛋白之C端融合的核質蛋白NLS;及c)視情況藉由連接子與核質蛋白NLS之C端融合的SV40 NLS。在一些實施例中,c-myc NLS與Cas的N端融合且SV40 NLS及/或核質蛋白NLS與Cas的C端融合。在一些實施例中,c-myc NLS融合至Cas之N端(例如,藉助於連接子,諸如GSVD),SV40 NLS融合至Cas之C端(例如,藉助於連接子,諸如GSGS)及核質蛋白NLS融合至SV-40 NLS之C端(例如,藉助於連接子,諸如GSGS)。
在一些實施例中,AAV載體就正股而言自5'至3'包含:第一sgRNA支架序列的反向互補序列、編碼第一sgRNA嚮導序列之核酸的反向互補序列、用於表現編碼第一sgRNA之核酸之啟動子的反向互補序列、用於表現編碼SaCas9之核酸的啟動子(例如CK8e)、編碼SaCas9的核酸、聚腺苷酸化序列、用於表現第二sgRNA之啟動子、第二sgRNA嚮導序列,及第二sgRNA支架序列。在一些實施例中,當在sgRNA表現分析中單獨比較時,例如在其中各嚮導使用相同啟動子分開評估(亦即,不在同一構築體中)之分析中,第一sgRNA與比第二sgRNA更弱的表現相關,相同的基因物質/載體/RNP之濃度在基本上相同的條件(例如,時間、pH、溫度、緩衝液條件)內。在一些實施例中,編碼第一sgRNA之核酸表現用的啟動子為本文中所揭示的任一種hU6c啟動子。在一些實施例中,用於表現編碼第一sgRNA之核酸的啟動子包含SEQ ID NO: 705。在一些實施例中,用於表現編碼第一sgRNA之核酸的啟動子包含SEQ ID NO: 9001。在一些實施例中,用於表現編碼第一sgRNA之核酸的啟動子包含SEQ ID NO: 9002。在一些實施例中,用於表現編碼第一sgRNA之核酸的啟動子包含SEQ ID NO: 9003。在一些實施例中,用於表現編碼第一sgRNA之核酸的啟動子包含SEQ ID NO: 9004。在一些實施例中,用於表現編碼第一sgRNA之核酸的啟動子為本文中所揭示之7SK2啟動子中之任一者。在一些實施例中,用於表現編碼第一sgRNA之核酸的啟動子包含SEQ ID NO: 705。在一些實施例中,用於表現編碼第一sgRNA之核酸的啟動子包含SEQ ID NO: 9006。在一些實施例中,用於表現編碼第一sgRNA之核酸的啟動子包含SEQ ID NO: 9007。在一些實施例中,用於表現編碼第一sgRNA之核酸的啟動子包含SEQ ID NO: 9008。在一些實施例中,用於表現編碼第一sgRNA之核酸的啟動子包含SEQ ID NO: 9009。在一些實施例中,編碼第二sgRNA之核酸表現用的啟動子為本文中所揭示的hU6c啟動子中之任一者。在一些實施例中,編碼第二sgRNA之核酸表現用的啟動子包含SEQ ID NO: 705。在一些實施例中,編碼第二sgRNA之核酸表現用的啟動子包含SEQ ID NO: 9001。在一些實施例中,編碼第二sgRNA之核酸表現用的啟動子包含SEQ ID NO: 9002。在一些實施例中,編碼第二sgRNA之核酸表現用的啟動子包含SEQ ID NO: 9003。在一些實施例中,編碼第二sgRNA之核酸表現用的啟動子包含SEQ ID NO: 9004。在一些實施例中,編碼第二sgRNA之核酸表現用的啟動子為本文中所揭示的7SK2啟動子中之任一者。在一些實施例中,編碼第二sgRNA之核酸表現用的啟動子包含SEQ ID NO: 705。在一些實施例中,編碼第二sgRNA之核酸表現用的啟動子包含SEQ ID NO: 9006。在一些實施例中,編碼第二sgRNA之核酸表現用的啟動子包含SEQ ID NO: 9007。在一些實施例中,編碼第二sgRNA之核酸表現用的啟動子包含SEQ ID NO: 9008。在一些實施例中,編碼第二sgRNA之核酸表現用的啟動子包含SEQ ID NO: 9009。在一些實施例中,用於表現編碼第二sgRNA之核酸的啟動子為本文中所揭示的H1m啟動子中之任一者。在一些實施例中,SaCas9的啟動子為CK8e啟動子。在一些實施例中,編碼SaCas9之核酸序列與編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,編碼SaCas9之核酸序列與兩個各編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,編碼SaCas9之核酸序列與三個各編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,一或多個NLS為SV40 NLS。在一些實施例中,一或多個NLS為c-Myc NLS。在一些實施例中,該一或多個NLS為核質蛋白NLS。在一些實施例中,NLS經由連接子與SaCas9融合。
在一些實施例中,AAV載體就正股而言自5'至3'包含:第一sgRNA支架序列的反向互補序列、編碼第一sgRNA嚮導序列之核酸的反向互補序列、編碼第一sgRNA之核酸表現用之hU6c啟動子的反向互補序列、編碼SaCas9之核酸表現用的啟動子(例如CK8e)、編碼SaCas9的核酸、聚腺苷酸化序列、第二sgRNA表現用的hU6c啟動子、第二sgRNA嚮導序列,及第二sgRNA支架序列。在一些實施例中,第一sgRNA及第二sgRNA係選自
表 6。在一些實施例中,編碼SaCas9之核酸序列與編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,編碼SaCas9之核酸序列與兩個各編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,編碼SaCas9之核酸序列與三個各編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,一或多個NLS為SV40 NLS。在一些實施例中,一或多個NLS為c-Myc NLS。在一些實施例中,NLS經由連接子與SaCas9融合。
在一些實施例中,AAV載體就正股而言自5'至3'包含:第一sgRNA支架序列的反向互補序列、編碼第一sgRNA嚮導序列之核酸的反向互補序列、用於表現編碼第一sgRNA之核酸之hU6c啟動子的反向互補序列、用於表現編碼SaCas9之核酸的啟動子(例如CK8e)、編碼SaCas9的核酸、聚腺苷酸化序列、用於表現第二sgRNA之7SK啟動子、第二sgRNA嚮導序列,及第二sgRNA支架序列。在一些實施例中,第一sgRNA及第二sgRNA係選自
表 6。在一些實施例中,編碼SaCas9之核酸序列與編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,編碼SaCas9之核酸序列與兩個各編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,編碼SaCas9之核酸序列與三個各編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,一或多個NLS為SV40 NLS。在一些實施例中,一或多個NLS為c-Myc NLS。在一些實施例中,NLS經由連接子與SaCas9融合。
在一些實施例中,AAV載體就正股而言自5'至3'包含:第一sgRNA支架序列的反向互補序列、編碼第一sgRNA嚮導序列之核酸的反向互補序列、用於表現編碼第一sgRNA之核酸之hU6c啟動子的反向互補序列、用於表現編碼Cas9之核酸的啟動子(例如CK8e)、編碼Cas9的核酸、聚腺苷酸化序列、用於表現第二sgRNA之H1m啟動子、第二sgRNA嚮導序列,及第二sgRNA支架序列。在一些實施例中,第一sgRNA及第二sgRNA係選自
表 6。在一些實施例中,編碼Cas9之核酸序列與編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,編碼Cas9之核酸序列與兩個各編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,編碼Cas9之核酸序列與三個各編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,一或多個NLS為SV40 NLS。在一些實施例中,一或多個NLS為c-Myc NLS。在一些實施例中,NLS經由連接子與Cas9融合。
在一些實施例中,AAV載體就正股而言自5'至3'包含:第一sgRNA支架序列的反向互補序列、編碼第一sgRNA嚮導序列之核酸的反向互補序列、用於表現編碼第一sgRNA之核酸之7SK啟動子的反向互補序列、用於表現編碼Cas9之核酸的啟動子(例如CK8e)、編碼Cas9的核酸、聚腺苷酸化序列、用於表現第二sgRNA之H1m啟動子、第二sgRNA嚮導序列,及第二sgRNA支架序列。在一些實施例中,第一sgRNA及第二sgRNA係選自
表 6。在一些實施例中,編碼Cas9之核酸序列與編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,編碼Cas9之核酸序列與兩個各編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,編碼Cas9之核酸序列與三個各編碼核定位序列(NLS)之核酸序列融合。在一些實施例中,一或多個NLS為SV40 NLS。在一些實施例中,一或多個NLS為c-Myc NLS。在一些實施例中,NLS經由連接子與Cas9融合。
在一些實施例中,本發明提供包含至少兩種核酸的組合物。在一些實施例中,組合物包含至少兩個核酸分子,其中該第一核酸分子包含編碼本文所揭示之核酸內切酶中之任一者(例如,SaCas9、SluCas9或sRGN)的序列,其中該第二核酸分子編碼第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,其中該第一嚮導RNA及該第二嚮導RNA不為相同序列,且其中該第二核酸分子不編碼核酸內切酶。在一些實施例中,第一核酸分子亦編碼第一嚮導RNA的複本及第二嚮導RNA的複本。在一些實施例中,第一核酸分子不編碼任何嚮導RNA。在一些實施例中,第二核酸分子編碼第一嚮導RNA的兩個複本及第二嚮導RNA的兩個複本。在一些實施例中,第二核酸分子編碼第一嚮導RNA的兩個複本及第二嚮導RNA的一個複本。在一些實施例中,第二核酸分子編碼第一嚮導RNA的一個複本,及第二嚮導RNA的兩個複本。在一些實施例中,第二核酸分子包含第一嚮導RNA的兩個複本,及第二嚮導RNA的三個複本。在一些實施例中,第二核酸分子包含第一嚮導RNA的三個複本,及第二嚮導RNA的兩個複本。在一些實施例中,第二核酸不編碼Cas蛋白質。在一些實施例中,第二核酸分子編碼第一嚮導RNA的三個複本及第二嚮導RNA的三個複本。在一些實施例中,第一核酸分子就正股而言自5'至3'包含:第一嚮導RNA支架序列的反向互補序列、編碼第一嚮導RNA序列之核苷酸序列的反向互補序列、用於表現編碼第一嚮導RNA序列之核苷酸序列之啟動子的反向互補序列、用於表現編碼核酸內切酶之核苷酸序列的啟動子、編碼核酸內切酶的核苷酸序列、聚腺苷酸化序列、以與核酸內切酶之啟動子相同的方向表現第二嚮導RNA的啟動子、第二嚮導RNA序列,及第二嚮導RNA支架序列。在一些實施例中,用於表現編碼第一核酸分子中之第一嚮導RNA序列之核苷酸序列的啟動子為U6啟動子且用於表現編碼第一核酸分子中之第二嚮導RNA之核苷酸序列的啟動子為U6啟動子。
在一些實施例中,AAV載體就正股而言自5'至3'包含:編碼第一sgRNA之核酸表現用的啟動子、編碼第一sgRNA嚮導序列的核酸、第一sgRNA支架序列、表現Cas9用的啟動子(例如CK8e)、編碼Cas9的核酸、聚腺苷酸化序列、表現第二sgRNA用的啟動子、第二sgRNA嚮導序列及第二sgRNA支架序列。參見
圖 5A的「設計1」。
在一些實施例中,AAV載體就正股而言自5'至3'包含:第一sgRNA支架序列的反向互補序列、編碼第一sgRNA嚮導序列之核酸的反向互補序列、用於表現編碼第一sgRNA之核酸之啟動子的反向互補序列、用於表現編碼Cas9之核酸的啟動子(例如CK8e)、編碼Cas9的核酸、聚腺苷酸化序列、用於表現第二sgRNA之啟動子、第二sgRNA嚮導序列,及第二sgRNA支架序列。參見
圖 5A的「設計2」。
在一些實施例中,AAV載體就正股而言自5'至3'包含:編碼第一sgRNA之核酸表現用的啟動子、編碼第一sgRNA嚮導序列的核酸、第一sgRNA支架序列、表現第二sgRNA用的啟動子、第二sgRNA嚮導序列及第二sgRNA支架序列、Cas9之啟動子(例如,CK8e)、編碼Cas9之核酸及聚腺苷酸化序列。參見
圖 5A的「設計3」。
在一些實施例中,AAV載體就正股而言自5'至3'包含:用於表現編碼Cas9之核酸的啟動子(例如CK8e)、編碼Cas9之核酸、聚腺苷酸化序列、用於表現編碼第一嚮導RNA之核酸的啟動子、編碼第一sgRNA嚮導序列之核酸、第一sgRNA支架序列、用於表現第二sgRNA之啟動子、第二sgRNA嚮導序列及第二sgRNA支架序列。參見
圖 5A的「設計4」。
在一些實施例中,AAV載體就正股而言自5'至3'包含:第一sgRNA支架序列(例如,V5)、編碼第一sgRNA嚮導序列之核酸(例如,Slu3或Slu7)、用於表現編碼第一sgRNA嚮導序列之核酸的啟動子(例如,U6)、用於表現(在編碼第一sgRNA嚮導序列之核酸的表現方向上)編碼aSluCas9之核酸的啟動子(例如,CK8e)、編碼第一NLS之核酸、編碼SluCas9之核酸、編碼第二NLS之核酸、編碼第三NLS之核酸、用於表現第二sgRNA嚮導序列(例如,Slu 7或Slu 3)(在與編碼SluCas9之核酸之表現相同的方向上)的啟動子(例如,U6)、編碼第二sgRNA嚮導序列之核酸,及第二sgRNA支架序列(例如,V5)。參見
圖 5B 的「設計5」及「設計6」。設計5及6為設計2之特定版本,如本文所描述。
在一些實施例中,AAV載體就正股而言自5'至3'包含:第一V5支架序列之反向互補序列、選自SEQ ID NO: 217或950-955之編碼Slu3嚮導RNA序列之核酸的反向互補序列、用於表現編碼Slu3嚮導RNA序列之核酸的U6啟動子之反向互補序列、用於表現編碼aSluCas9之核酸(沿表現編碼Slu3 sgRNA嚮導序列之核酸的相反方向)的CK8e啟動子、編碼c-Myc NLS之核酸、編碼SluCas9之核酸、編碼SV40 NLS之核酸、編碼NP NLS之核酸、用於表現(在與表現編碼SluCas9之核酸相同的方向上) SEQ ID NO: 275之Slu7嚮導RNA序列的U6啟動子、編碼Slu7嚮導RNA序列之核酸及第二V5支架序列。參見
圖 5B的「設計5」及「設計6」。設計5及6為設計2之特定版本,如本文所描述。
在一些實施例中,AAV載體就正股而言自5'至3'包含:第一V5支架序列之反向互補序列、SEQ ID NO: 275之編碼Slu7嚮導RNA序列之核酸的反向互補序列、用於表現編碼Slu7嚮導RNA序列之核酸的U6啟動子之反向互補序列、用於表現編碼SluCas9之核酸(沿表現編碼Slu7 sgRNA嚮導序列之核酸的相反方向)的CK8e啟動子、編碼c-Myc NLS之核酸、編碼SluCas9之核酸、編碼SV40 NLS之核酸、編碼NP NLS之核酸、用於表現(在與表現編碼SluCas9之核酸相同的方向上)選自SEQ ID NO: 217或950-955之Slu3嚮導RNA序列的U6啟動子、編碼Slu3嚮導RNA序列之核酸及第二V5支架序列。參見
圖 5B的「設計5」及「設計6」。設計5及6為設計2之特定版本,如本文所描述。
在一些實施例中,第一核酸分子處於第一載體(例如AAV9)中,且第二核酸處於各別的第二載體中。在一些實施例中,第一載體為AAV9。在一些實施例中,第二載體為AAV9。在較佳實施例中,AAV9載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於5 kb。在特定實施例中,AAV9載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.9 kb。在其他實施例中,AAV9載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.85 kb。在其他實施例中,AAV9載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.8 kb。在其他實施例中,AAV9載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.75 kb。在其他實施例中,AAV9載體自ITR至ITR (包括兩個ITR)的尺寸小於4.7 kb。在一些實施例中,第二載體就正股而言自5'至3'包含:用於表現第一嚮導RNA之第一複本的啟動子(例如U6啟動子)、編碼第一嚮導RNA之核苷酸序列的第一複本、編碼第一嚮導RNA支架之核苷酸序列的第一複本、用於表現第一嚮導RNA之第二複本的啟動子(例如H1啟動子)、編碼第一嚮導RNA之核苷酸序列的第二複本、編碼第一嚮導RNA支架之核苷酸序列的第二複本、用於表現第二嚮導RNA的啟動子(例如7SK啟動子)、編碼第二嚮導RNA的核苷酸序列,及編碼第二嚮導RNA支架的核苷酸序列。在一些實施例中,第二載體就正股而言自5'至3'包含:用於表現第一嚮導RNA的啟動子(例如U6啟動子)、編碼第一嚮導RNA的核苷酸序列、編碼第一嚮導RNA支架的核苷酸序列、用於表現第二嚮導RNA的啟動子(例如7SK啟動子)、編碼第二嚮導RNA的核苷酸序列,及編碼第二嚮導RNA支架的核苷酸序列。在一些實施例中,第二載體包含介於編碼第一嚮導支架序列之核苷酸序列與用於表現第二嚮導序列之啟動子之間的填充序列(例如3'UTR結蛋白序列)。在一些實施例中,第二載體就正股而言自5'至3'包含:編碼第一嚮導RNA支架之核苷酸序列的反向互補序列編碼第一嚮導RNA之核苷酸序列的反向互補序列、用於表現第一嚮導RNA之啟動子(例如U6c啟動子)的反向互補序列、用於表現第二嚮導RNA的啟動子(例如U6c啟動子)、編碼第二嚮導RNA的核苷酸序列,及編碼第二嚮導RNA支架的核苷酸序列。在一些實施例中,第二載體包含介於用於表現第一嚮導RNA之啟動子與用於表現第二嚮導RNA之啟動子之反向互補序列之間的填充序列(例如3'UTR結蛋白序列)。在一些實施例中,第二載體就正股而言自5'至3'包含:編碼第一嚮導RNA支架之第一複本之核苷酸序列的反向互補序列、編碼第一嚮導RNA之第一複本之核苷酸序列的反向互補序列、用於表現第一嚮導RNA之第一複本之啟動子(例如7SK2啟動子)的反向互補序列、編碼第一嚮導RNA支架之核苷酸序列之第二複本的反向互補序列、編碼第一嚮導RNA之核苷酸序列之第二複本的反向互補序列、用於表現編碼第一嚮導RNA之核苷酸序列之第二複本之啟動子(例如hU6c啟動子)的反向互補序列、用於表現第二嚮導RNA之第一複本的啟動子(例如hU6c啟動子)、編碼第二嚮導RNA之核苷酸序列的第一複本、編碼第二嚮導RNA支架之核苷酸序列的第一複本、用於表現第二嚮導RNA之第二複本的啟動子(例如7Sk2啟動子)、編碼第二嚮導RNA之核苷酸序列的第二複本,及編碼第二嚮導RNA支架之核苷酸序列的第二複本。在一些實施例中,第二載體包含介於用於表現第一嚮導RNA之第二複本之啟動子與用於表現第二嚮導RNA之第一複本之啟動子之反向互補序列之間的填充序列(例如3'UTR結蛋白序列)。在一些實施例中,第二載體就正股而言自5'至3'包含:編碼第一嚮導RNA支架之第一複本之核苷酸序列的反向互補序列、編碼第一嚮導RNA之核苷酸序列之第一複本的反向互補序列、用於表現第一嚮導RNA之第一複本之啟動子(例如7SK2啟動子)的反向互補序列、編碼第二嚮導RNA支架之核苷酸序列之第一複本的反向互補序列、編碼第二嚮導RNA之第一複本之核苷酸序列的反向互補序列、用於表現第二嚮導RNA之第一複本之啟動子(例如hU6c啟動子)的反向互補序列、用於表現第二嚮導RNA之第二複本的啟動子(例如hU6c啟動子)、編碼第二嚮導RNA之核苷酸序列的第二複本、編碼第二嚮導RNA支架之核苷酸序列的第二複本、用於表現第一嚮導RNA之第二複本的啟動子(例如7SK2啟動子)、編碼第一嚮導RNA之核苷酸序列的第二複本,及編碼第一嚮導RNA支架之核苷酸序列的第二複本。在一些實施例中,第二載體包含介於用於表現第二嚮導RNA之第一複本之啟動子與用於表現第一嚮導RNA之第二複本之啟動子之反向互補序列之間的填充序列(例如3'UTR結蛋白序列)。在一些實施例中,第二載體就正股而言自5'至3'包含:編碼第一嚮導RNA支架之核苷酸序列的反向互補序列、編碼第一嚮導RNA之核苷酸序列的反向互補序列、用於表現第一嚮導RNA之啟動子(例如hU6c啟動子)的反向互補序列、用於表現第二嚮導RNA的啟動子(例如hU6c啟動子)、編碼第二嚮導RNA的核苷酸序列,及編碼第二嚮導RNA支架的核苷酸序列。在一些實施例中,第二載體包含介於用於表現第一嚮導RNA之啟動子與用於表現第二嚮導RNA之啟動子之反向互補序列之間的填充序列(例如3'UTR結蛋白序列)。在特定實施例中,第一嚮導RNA不同於第二嚮導RNA。在一些實施例中,第一嚮導RNA包含
表 6之序列且第二嚮導RNA包含選自
表 6之不同序列。
在一些實施例中,若組合物包含編碼靶向RNA之核酸內切酶及一或多個嚮導RNA的一或多種核酸,則該一或多種核酸設計成使得其表現一或多個嚮導RNA的量相當於或高於(例如所表現之轉殖基因複本數目大於)靶向RNA之核酸內切酶的表現量。在一些實施例中,該一或多個核酸設計成其表現(例如平均100個細胞)一或多個嚮導RNA的量為靶向RNA之核酸內切酶之表現量的至少1.1、1.2、1.3、1.4或1.5倍(例如所表現之轉殖基因複本的數目更大)。在一些實施例中,該一或多個核酸經設計以使得其表現相比於靶向RNA之核酸內切酶的表現量高1.01-1.5、1.01-1.4、1.01-1.3、1.01-1.2、1.01-1.1、1.1-2.0、1.1-1.8、1.1-1.6、1.1-1.4、1.1-1.3、1.2-2.0、1.2-1.8、1.2-1.6、1.2-1.4、1.4-2.0、1.4-1.8、1.4-1.6、1.6-2.0、1.6-1.8或1.8-2.0倍(例如,更大量的表現之轉殖基因複本)的一或多個嚮導RNA。在一些實施例中,一或多個嚮導RNA設計成表現量高於靶向RNA之核酸內切酶,此如下達成:a)使用一或多個調節元件(例如啟動子或增強子),該一或多個調節元件表現一或多個嚮導RNA的量高於用於表現靶向RNA之核酸內切酶的調節元件(例如啟動子或增強子);及/或b)所表現之一或多個嚮導RNA的複本數多於靶向RNA之核酸內切酶的複本數(例如編碼一或多個嚮導RNA之核苷酸序列的複本數為編碼靶向RNA之核酸內切酶之核苷酸序列的複本數的2倍或3倍多)。舉例而言,在一些實施例中,組合物包含多個核酸分子(例如處於多個載體中),其中對於組合物中之核酸分子中之編碼靶向RNA之核酸內切酶的每個核苷酸序列而言,組合物中之核酸分子中存在編碼嚮導RNA之核苷酸序列的兩個或三個複本。在一些實施例中,組合物包含第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,其中第一嚮導RNA與第二嚮導RNA不相同(例如本文中所揭示之任一嚮導RNA對),且對於組合物中之核酸分子中之編碼靶向RNA之核酸內切酶的每種核苷酸序列而言,編碼第一嚮導RNA及/或第二嚮導RNA的核苷酸序列存在兩個或三個複本。
核酸內切酶
在一些實施例中,本文中所揭示的任一種核酸編碼靶向RNA的核酸內切酶。在一些實施例中,靶向RNA的核酸內切酶具有裂解酶活性,其亦可稱為雙股核酸內切酶活性。在一些實施例中,靶向RNA的核酸內切酶包含Cas核酸酶。Cas9核酸酶之實例包括II型CRISPR系統之彼等。
在一些實施例中,Cas蛋白質包含與SEQ ID NO: 941之序列(在本文中稱為SpCas9)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列:
。
在一些實施例中,編碼SaCas9的核酸編碼包含與如下序列SEQ ID NO: 711至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列的SaCas9:
。
在一些實施例中,編碼SaCas9的核酸包含SEQ ID NO: 9014之核酸:
。
在包含編碼SaCas9之核酸的一些實施例中,SaCas9包含胺基酸序列SEQ ID NO: 711。
在一些實施例中,SaCas9為胺基酸序列SEQ ID NO: 711之變異體。在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置781的位置處,SaCas9包含除E之外的胺基酸。在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置967的位置處,SaCas9包含除N之外的胺基酸。在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置1014的位置處,SaCas9包含除R之外的胺基酸。在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置781的位置處,SaCas9包含K。在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置967的位置處,SaCas9包含K。在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置1014的位置處,SaCas9包含H。在一些實施例中,SaCas9在對應於SEQ ID NO: 711之位置781的位置處包含除E之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 711之位置967的位置處包含除N之外的胺基酸;且在對應於SEQ ID NO: 711之位置1014的位置處包含除R之外的胺基酸。在一些實施例中,SaCas9在對應於SEQ ID NO: 711之位置781的位置處包含K;在對應於SEQ ID NO: 711之位置967的位置處包含K;且在對應於SEQ ID NO: 711之位置1014的位置處包含H。
在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置244的位置處,SaCas9包含除R之外的胺基酸。在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置412的位置處,SaCas9包含除N之外的胺基酸。在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置418的位置處,SaCas9包含除N之外的胺基酸。在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置653的位置處,SaCas9包含除R之外的胺基酸。在一些實施例中,SaCas9在對應於SEQ ID NO: 711之位置244的位置處包含除R之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 711之位置412的位置處,包含除N之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 711之位置418的位置處,包含除N之外的胺基酸;且在對應於SEQ ID NO: 711之位置653的位置處,包含除R之外的胺基酸。在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置244的位置處,SaCas9包含A。在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置412的位置處,SaCas9包含A。在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置418的位置處,SaCas9包含A。在一些實施例中,在對應於SEQ ID NO: 711之位置653的位置處,SaCas9包含A。在一些實施例中,SaCas9在對應於SEQ ID NO: 711之位置244的位置處包含A;在對應於SEQ ID NO: 711之位置412的位置處包含A;在對應於SEQ ID NO: 711之位置418的位置處包含A;且在對應於SEQ ID NO: 711之位置653的位置處包含A。
在一些實施例中,SaCas9在對應於SEQ ID NO: 711之位置244的位置處包含除R之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 711之位置412的位置處包含除N之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 711之位置418的位置處包含除N之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 711之位置653的位置處包含除R之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 711之位置781的位置處包含除E之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 711之位置967的位置處包含除N之外的胺基酸;且在對應於SEQ ID NO: 711之位置1014的位置處包含除R之外的胺基酸。在一些實施例中,SaCas9在對應於SEQ ID NO: 711之位置244的位置處包含A;在對應於SEQ ID NO: 711之位置412的位置處包含A;在對應於SEQ ID NO: 711之位置418的位置處包含A;在對應於SEQ ID NO: 711之位置653的位置處包含A;在對應於SEQ ID NO: 711之位置781的位置處包含K;在對應於SEQ ID NO: 711之位置967的位置處包含K;且在對應於SEQ ID NO: 711之位置1014的位置處包含H。
在一些實施例中,SaCas9包含與如下序列SEQ ID NO: 715 (在本文中稱為SaCas9-KKH或SACAS9KKH)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
。
在一些實施例中,SaCas9包含與如下序列SEQ ID NO: 716 (在本文中稱為SaCas9-HF)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
。
在一些實施例中,SaCas9包含與如下序列SEQ ID NO: 717 (在本文中稱為SaCas9-KKH-HF)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
。
在一些實施例中,編碼SluCas9的核酸編碼包含與如下序列SEQ ID NO: 712至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之胺基酸序列的SluCas9:
。
在一些實施例中,SluCas9為胺基酸序列SEQ ID NO: 712之變異體。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置781的位置處,包含除Q之外的胺基酸。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置1013的位置處包含除R之外的胺基酸。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置781的位置處包含K。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置966的位置處包含K。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置1013的位置處包含H。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置781的位置處包含除Q之外的胺基酸;且在對應於SEQ ID NO: 712之位置1013的位置處包含除R之外的胺基酸。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置781的位置處包含K;在對應於SEQ ID NO: 712之位置966的位置處包含K;且在對應於SEQ ID NO: 712之位置1013的位置處包含H。
在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置246的位置處包含除R之外的胺基酸。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置414的位置處包含除N之外的胺基酸。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置420的位置處包含除T之外的胺基酸。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置655的位置處包含除R之外的胺基酸。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置246的位置處包含除R之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 712之位置414的位置處包含除N之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 712之位置420的位置處包含除T之外的胺基酸;且在對應於SEQ ID NO: 712之位置655的位置處包含除R之外的胺基酸。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置246的位置處包含A。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置414的位置處包含A。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置420的位置處包含A。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置655的位置處包含A。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置246的位置處包含A;在對應於SEQ ID NO: 712之位置414的位置處包含A;在對應於SEQ ID NO: 712之位置420的位置處包含A;且在對應於SEQ ID NO: 712之位置655的位置處包含A。
在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置246的位置處包含除R之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 712之位置414的位置處包含除N之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 712之位置420的位置處包含除T之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 712之位置655的位置處包含除R之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 712之位置781的位置處包含除Q之外的胺基酸;在對應於SEQ ID NO: 712之位置966的位置處包含K;且在對應於SEQ ID NO: 712之位置1013的位置處包含除R之外的胺基酸。在一些實施例中,SluCas9在對應於SEQ ID NO: 712之位置246的位置處包含A;在對應於SEQ ID NO: 712之位置414的位置處包含A;在對應於SEQ ID NO: 712之位置420的位置處包含A;在對應於SEQ ID NO: 712之位置655的位置處包含A;在對應於SEQ ID NO: 712之位置781的位置處包含K;在對應於SEQ ID NO: 712之位置966的位置處包含K;且在對應於SEQ ID NO: 712之位置1013的位置處包含H。
在一些實施例中,SluCas9包含與如下序列SEQ ID NO: 718 (在本文中稱為SluCas9-KH或SLUCAS9KH)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,SluCas9包含與如下序列SEQ ID NO: 719 (在本文中稱為SluCas9-HF)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,SluCas9包含與如下序列SEQ ID NO: 720 (在本文中稱為SluCas9-HF-KH)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,Cas蛋白為以下文獻中所揭示之任一種工程化Cas蛋白:Schmidt等人, 2021, Nature Communications,「Improved CRISPR genome editing using small highly active and specific engineered RNA-guided nucleases」。
在一些實施例中,Cas9包含與如下序列SEQ ID NO:7021 (在本文中稱為sRGN1)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,Cas9包含與如下序列SEQ ID NO: 7022 (在本文中稱為sRGN2)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,Cas9包含與序列SEQ ID NO: 7023 (在本文中稱為sRGN3)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,Cas9包含與如下序列SEQ ID NO: 7024 (在本文中稱為sRGN3.1)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,Cas9包含由與如下序列SEQ ID NO: 918至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之核酸分子(編碼sRGN3.1之例示性核酸分子)編碼的胺基酸序列:
在一些實施例中,Cas9包含與如下序列SEQ ID NO: 7025 (在本文中稱為sRGN3.2)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,Cas9包含與如下序列SEQ ID NO: 7026 (在本文中稱為sRGN3.3)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,Cas9包含由與如下序列SEQ ID NO: 919至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之核酸分子(編碼sRGN3.3之例示性核酸分子)編碼的胺基酸序列:
在一些實施例中,Cas9包含與如下序列SEQ ID NO: 7027 (在本文中稱為sRGN4)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,Cas9包含由與如下序列SEQ ID NO: 920至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致之核酸分子(編碼sRGN4之例示性核酸分子)編碼的胺基酸序列:
在一些實施例中,Cas9包含與如下序列SEQ ID NO: 7028(在本文中稱為豬葡萄球菌Cas9或ShyCas9)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,Cas9包含與如下序列SEQ ID NO: 7029 (在本文中稱為田鼠葡萄球菌(Staphylococcus microti) Cas9或Smi Cas9)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,Cas9包含與如下序列SEQ ID NO: 7030 (在本文中稱為巴氏葡萄球菌(Staphylococcus pasteuri) Cas9或Spa Cas9)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,Cas蛋白包含與如下序列SEQ ID NO: 7031 (在本文中稱為Cas12i1)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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在一些實施例中,Cas蛋白包含與如下序列SEQ ID NO: 7032 (在本文中稱為Cas12i2)至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列:
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經修飾之嚮導RNA
在一些實施例中,嚮導RNA經化學修飾。包含一或多個經修飾之核苷或核苷酸的嚮導RNA稱為「經修飾」之嚮導RNA或「經化學修飾」之嚮導RNA,以描述替代典型A、G、C及U殘基使用或除其之外使用的非天然及/或天然存在之一或多種組分或組態的存在。在一些實施例中,經修飾之嚮導RNA係由非典型核苷或核苷酸合成,在此稱為「經修飾」。經修飾之核苷及核苷酸可包括以下中之一或多者:(i)磷酸二酯主鏈鍵聯中之非鍵聯磷酸氧中之一者或兩者及/或鍵聯磷酸氧中之一或多者之改變,例如置換(例示性主鏈修飾);(ii)核糖成分,例如核糖上之2'羥基之改變,例如置換(例示性糖修飾);(iii)用「去磷酸」連接子批量置換磷酸酯部分(例示性主鏈修飾);(iv)天然存在之核鹼基之修飾或置換,包括用非典型核鹼基(例示性鹼基修飾);(v)核糖-磷酸酯主鏈之置換或修飾(例示性主鏈修飾);(vi)寡核苷酸之3'端或5'端之修飾,例如末端磷酸酯基之移除、修飾或置換或部分、帽或連接子之結合(此類3'或5'帽修飾可包含糖及/或主鏈修飾);及(vii)糖之修飾或置換(例示性糖修飾)。
化學修飾(諸如上文所列的化學修飾)可加以組合,以提供經修飾之嚮導RNA,其包含可具有兩個、三個、四個或更多個修飾的核苷及核苷酸(統稱為「殘基」)。舉例而言,經修飾之殘基可具有經修飾之糖及經修飾之核鹼基,或經修飾之糖及經修飾之磷酸二酯。在一些實施例中,嚮導RNA中的每個鹼基經修飾,例如所有鹼基具有經修飾之磷酸酯基團,諸如硫代磷酸酯基團。在某些實施例中,嚮導RNA分子中的所有或基本上所有磷酸酯基團經硫代磷酸酯基團置換。在一些實施例中,經修飾之嚮導RNA在RNA之5'端處或附近包含至少一個經修飾之殘基。在一些實施例中,經修飾之嚮導RNA在RNA之3'端處或附近包含至少一個經修飾之殘基。
在一些實施例中,嚮導RNA包含一個、兩個、三個或更多個經修飾之殘基。在一些實施例中,經修飾之嚮導RNA中的至少5% (例如至少5%、至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或100%)位置為經修飾之核苷或核苷酸。
未經修飾之核酸可容易藉由例如細胞內核酸酶或血清中所發現之彼等核酸酶降解。舉例而言,核酸酶可使核酸磷酸二酯鍵水解。因此,在一個態樣中,本文所描述之嚮導RNA可含有一或多個經修飾之核苷或核苷酸,例如以向細胞內核酸酶或基於血清之核酸酶引入穩定性。在一些實施例中,本文所描述之經修飾的嚮導RNA分子當引入細胞群中時,在活體內與離體均可展現降低之先天免疫反應。術語「先天性免疫反應」包括針對外源性核酸(包括單股核酸)之細胞反應,其涉及誘導細胞介素(尤其干擾素)表現及釋放,及細胞死亡。
在主鏈修飾之一些實施例中,經修飾之殘基之磷酸酯基可藉由用不同取代基置換一或多個氧而經修飾。此外,經修飾之殘基,例如存在於經修飾之核酸中之經修飾之殘基可包括用如本文所描述之經修飾之磷酸酯基批量置換未經修飾之磷酸酯部分。在一些實施例中,磷酸酯主鏈之主鏈修飾可包括產生不帶電連接子或具有不對稱電荷分佈之帶電連接子的變化。
經修飾之磷酸酯基團之實例包括硫代磷酸酯、硒代磷酸酯、硼烷磷酸酯、硼烷磷酸酯、氫膦酸酯、胺基磷酸酯、膦酸烷酯及烷基磷酸三酯或膦酸芳酯及芳基磷酸三酯。未經修飾之磷酸根基團中之磷原子為非手性的。然而,用上述原子或原子基團之一置換非橋連氧之一可使得磷原子呈對掌性。立體對稱磷原子可具有「R」組態(本文中為Rp)或「S」組態(本文中為Sp)。主鏈亦可藉由用氮(橋聯胺基磷酸酯)、硫(橋聯硫代磷酸酯)及碳(橋聯亞甲基膦酸酯)替換橋聯氧(亦即連接磷酸酯與核苷之氧)而加以修飾。置換可發生在任一連接氧或兩個連接氧處。
在某些主鏈修飾中,磷酸酯基團可經不含磷之連接基團置換。在一些實施例中,帶電磷酸酯基可經中性部分置換。可置換磷酸酯基之部分之實例可包可置換磷酸酯基之部分之實例可包括(但不限於)例如膦酸甲酯、羥胺基、矽氧烷、碳酸酯、羧甲基、胺基甲酸酯、醯胺、硫醚、環氧乙烷連接子、磺酸酯、磺醯胺、硫代甲縮醛、甲縮醛、肟、亞甲基亞胺基、亞甲基甲基亞胺基、亞甲基肼、亞甲基二甲基肼及亞甲氧基甲基亞胺基。
亦可構築可模擬核酸之支架,其中磷酸酯連接子及核糖經核酸酶抗性核苷或核苷酸替代物置換。此類修飾可包含主鏈修飾及糖修飾。在一些實施例中,核鹼基可藉由替代主鏈繫栓。實例可包括(但不限於) N-𠰌啉基、環丁基、吡咯啶及肽核酸(PNA)核苷替代物。
經修飾之核苷及經修飾之核苷酸可包括一或多個針對糖基之修飾,亦即糖修飾。舉例而言,2'羥基(OH)可經修飾,例如經多個不同「氧基」或「去氧」取代基置換。在一些實施例中,針對2'羥基之修飾可增強核酸之穩定性,此係因為羥基可不再經去質子化以形成2'-烷氧離子。
2'羥基修飾之實例可包括烷氧基或芳氧基(OR,其中「R」可為例如烷基、環烷基、芳基、芳烷基、雜芳基或糖);聚乙二醇(polyethyleneglycol;PEG);O(CH
2CH
2O)
nCH
2CH
2OR,其中R可為例如H或視情況經取代之烷基,且n可為0至20之整數(例如0至4、0至8、0至10、0至16、1至4、1至8、1至10、1至16、1至20、2至4、2至8、2至10、2至16、2至20、4至8、4至10、4至16及4至20)。在一些實施例中,2'羥基修飾可為2'-O-Me。在一些實施例中,2'羥基修飾可為2'-氟修飾,此用氟置換2'羥基。在一些實施例中,2'羥基修飾可包括「鎖定」核酸(LNA),其中2'羥基可藉由例如C
1 - 6伸烷基或C
1 - 6伸雜烷基橋連接至同一核糖之4'碳,其中例示性橋可包括亞甲基、伸丙基、醚或胺基橋;O-胺基(其中胺基可為例如NH
2;烷基胺基、二烷基胺基、雜環基、芳基胺基、二芳基胺基、雜芳基胺基或二雜芳基胺基、乙二胺或聚胺基)及胺基烷氧基、O(CH
2)
n-胺基(其中胺基可為例如NH
2;烷基胺基、二烷基胺基、雜環基、芳基胺基、二芳基胺基、雜芳基胺基或二雜芳基胺基、乙二胺或聚胺基)。在一些實施例中,2'羥基修飾可包括「未鎖定」核酸(unlocked nucleic acid;UNA),其中核糖環缺乏C2'-C3'鍵。在一些實施例中,2'羥基修飾可包括甲氧基乙基(methoxyethyl group,MOE)(OCH
2CH
2OCH
3,例如PEG衍生物)。
「去氧」2'修飾可包括氫(亦即,去氧核糖,例如在部分dsRNA之突出部分處);鹵基(例如溴基、氯基、氟基或碘基);胺基(其中胺基可為例如NH
2;烷基胺基、二烷基胺基、雜環基、芳基胺基、二芳基胺基、雜芳胺基、二雜芳胺基或胺基酸);NH(CH
2CH
2NH)
nCH
2CH
2-胺基(其中胺基可例如如本文所描述)、-NHC(O)R (其中R可為例如烷基、環烷基、芳基、芳烷基、雜芳基或糖)、氰基;巰基;烷基-硫基-烷基;硫代烷氧基;及可視情況經例如如本文所描述之胺基取代的烷基、環烷基、芳基、烯基及炔基。
糖修飾可包含亦可含有一或多個碳之糖基,其具有與核糖中之對應碳相反的立體化學組態。因此,經修飾之核酸可包括含有例如阿拉伯糖作為糖的核苷酸。經修飾之核酸亦可包括無鹼基糖。此等無鹼基糖亦可進一步在一或多個組成性糖原子處經修飾。經修飾之核酸亦可包括一或多種呈L形式之糖,例如L-核苷。
可併入至經修飾之核酸中之本文所描述之經修飾之核苷及經修飾之核苷酸可包括經修飾之鹼基,亦稱為核鹼基。核鹼基之實例包括(但不限於)腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)及尿嘧啶(U))。此等核鹼基可經修飾或完全置換以得到可併入至經修飾之核酸中之經修飾之殘基。核苷酸之核鹼基可獨立地選自嘌呤、嘧啶、嘌呤類似物或嘧啶類似物。在一些實施例中,核鹼基可包括例如天然存在之鹼基衍生物及合成鹼基衍生物。
在採用雙嚮導RNA之實施例中,crRNA及tracr RNA中之每一者可含有修飾。此類修飾可處於crRNA及/或tracr RNA之一或兩個末端處。在包含sgRNA之實施例中,sgRNA之一端或兩端的一或多個殘基可經化學修飾,及/或內部核苷可經修飾,及/或整個sgRNA可經化學修飾。某些實施例包含5'端修飾。某些實施例包含3'端修飾。
涵蓋2'-O-甲基之修飾。
已顯示可影響核苷酸糖環之另一化學修飾為鹵素取代。舉例而言,核苷酸糖環上之2'-氟(2'-F)取代可增強寡核苷酸結合親和力及核酸酶穩定性。涵蓋2'-氟(2'-F)之修飾。
硫代磷酸酯(Phosphorothioate,PS)鍵聯或鍵係指硫取代磷酸二酯鍵聯,例如核苷酸鹼基之間的鍵中之一個非橋聯磷酸酯氧的鍵。當硫代磷酸酯用於產生寡核苷酸時,經修飾之寡核苷酸亦可被稱作S-寡核苷酸。
無鹼基核苷酸係指缺乏含氮鹼基之彼等核苷酸。
反向鹼基係指鍵聯相對於正常5'至3'鍵聯(亦即,5'至5'鍵或3'至3'鍵聯)呈反向之彼等鹼基。
無鹼基核苷酸可經由反向鍵聯連接。舉例而言,無鹼基核苷酸可經由5'至5'鍵聯連接至5'端核苷酸,或無鹼基核苷酸可經由3'至3'鍵聯連接至3'端核苷酸。5'端抑或3'端核苷酸處之倒轉無鹼基核苷酸亦可稱為倒轉無鹼基端帽。
在一些實施例中,對5'端之前三、四或五個核苷酸中之一或多者及3'端之最後三、四或五個核苷酸中之一或多者進行修飾。在一些實施例中,修飾為2'-O-Me、2'-F、倒轉無鹼基核苷酸、PS鍵或所屬領域中熟知的其他核苷酸修飾以增加穩定性及/或效能。
在一些實施例中,5'端處之前四個核苷酸,及3'端處之最後四個核苷酸與硫代磷酸酯(PS)鍵鍵聯。
在一些實施例中,5'端處之前三個核苷酸及3'端處之最後三個核苷酸包含2'-O-甲基(2'-O-Me)修飾之核苷酸。在一些實施例中,5'端處之前三個核苷酸及3'端處之最後三個核苷酸包含經2'-氟(2'-F)修飾之核苷酸。
核糖核蛋白複合物
在一些實施例中,所涵蓋的組合物包含:a)一或多個嚮導RNA,其包含
表 6的一或多個嚮導序列以及b) saCas9 (當與包含SEQ ID No: 1-159中之任一者或組合的gRNA組合時)或SluCas9 (當與包含SEQ ID No: 200-292、924-938或950-955中之任一者或組合的gRNA組合時),或本文中所揭示之任一種突變型Cas9蛋白。在一些實施例中,嚮導RNA連同Cas9一起稱為核糖核蛋白複合物(RNP)。
在一些實施例中,本發明提供一種RNP複合物,其中該嚮導RNA(例如,本文所揭示之嚮導RNA中之任一者)結合於或能夠結合於肌肉萎縮蛋白基因中之目標序列。
在一些實施例中,使用嵌合Cas9 (SaCas9或SluCas9)核酸酶,其中蛋白質之一個域或區域經不同蛋白質之一部分置換。在一些實施例中,Cas9核酸酶域可經來自不同核酸酶(諸如Fok1)之域置換。在一些實施例中,Cas9核酸酶可為經修飾之核酸酶。
在一些實施例中,Cas9經修飾以僅含一個核酸酶功能域。舉例而言,藥劑蛋白質可經修飾以使得核酸酶域中之一者經突變或完全或部分缺失以降低其核酸裂解活性。
在一些實施例中,Cas9蛋白核酸酶域內的保守胺基酸經取代以減少或改變核酸酶活性。在一些實施例中,Cas9核酸酶可在RuvC或RuvC樣核酸酶域中包含胺基酸取代。RuvC或類RuvC核酸酶域中之例示性胺基酸取代包括D10A (基於化膿性鏈球菌Cas9蛋白質)。參見例如Zetsche等人(2015) Cell 10月22日:163(3): 759-771。在一些實施例中,Cas9核酸酶可在HNH或HNH樣核酸酶域中包含胺基酸取代。HNH或HNH樣核酸酶域中之例示性胺基酸取代包括E762A、H840A、N863A、H983A及D986A (基於化膿性鏈球菌Cas9蛋白質)。參見例如Zetsche等人(2015)。其他例示性胺基酸取代包括D917A、E1006A及D1255A(基於新兇手弗朗西斯氏菌U112 Cpf1 (FnCpf1)序列(UniProtKB - A0Q7Q2 (CPF1_FRATN))。其他例示性胺基酸取代包括D10A及N580A (基於金黃葡萄球菌Cas9蛋白)。參見例如Friedland等人., 2015, Genome Biol., 16:257。
在一些實施例中,Cas9缺乏裂解酶活性。在一些實施例中,Cas9包含dCas DNA結合多肽。dCas多肽具有DNA結合活性,而基本上缺乏催化(裂解酶/切口酶)活性。在一些實施例中,dCas多肽為dCas9多肽。在一些實施例中,缺乏裂解酶活性之Cas9或dCas DNA結合多肽為Cas核酸酶的一種形式(例如上文論述的Cas9核酸酶),其中其核酸內切酶活性位點不活化,例如藉由其催化域之一或多種變化(例如點突變)而不活化。參見例如US 2014/0186958 A1;US 2015/0166980 A1。
在一些實施例中,Cas9包含一或多個異源功能域(例如為融合多肽或包含融合多肽)。
在一些實施例中,異源功能域可促進Cas9轉運至細胞核中。舉例而言,異源功能域可為核定位信號(NLS)。在一些實施例中,Cas9可與1至10個NLS融合。在一些實施例中,Cas9可與1至5個NLS融合。在一些實施例中,Cas9可與1至3個NLS融合。在一些實施例中,Cas9可與一個NLS融合。在使用一個NLS的情況下,NLS可在Cas9序列之N端或C端處連接,且可直接融合/連接。在一些實施例中,在使用超過一個NLS的情況下,一或多個NLS可在N端連接及/或一或多個NLS可在C端連接。在一些實施例中,一或多個NLS直接連接至Cas9。在一些實施例中,一或多個NLS藉由連接子連接至Cas9。在一些實施例中,連接子的長度在3至25個胺基酸之間。在一些實施例中,連接子的長度在3至6個胺基酸之間。在一些實施例中,連接子包含甘胺酸及絲胺酸。在一些實施例中,連接子包含序列GSVD (SEQ ID NO: 550)或GSGS (SEQ ID NO: 551)。其亦可插入Cas9序列內。在其他實施例中,Cas9可與多於一個NLS融合。在一些實施例中,Cas9可與2、3、4或5個NLS融合。在一些實施例中,Cas9可與兩個NLS融合。在某些情況下,兩個NLS可相同(例如,兩個SV40 NLS)或不同。在一些實施例中,Cas9蛋白質與一或多個SV40 NLS融合。在一些實施例中,SV40 NLS包含胺基酸序列SEQ ID NO: 713 (PKKKRKV)。在一些實施例中,Cas9蛋白質(例如,SaCas9或SluCas9蛋白質)融合至一或多個核質蛋白NLS。在一些實施例中,Cas蛋白質融合至一或多個c-myc NLS。在一些實施例中,Cas蛋白質融合至一或多個E1A NLS。在一些實施例中,Cas蛋白質融合至一或多個BP (二分) NLS。在一些實施例中,核質蛋白NLS包含胺基酸序列SEQ ID NO: 714 (KRPAATKKAGQAKKKK)。在一些實施例中,Cas9蛋白與c-Myc NLS融合。在一些實施例中,c-Myc NLS包含SEQ ID NO: 942之胺基酸序列(PAAKKKKLD)及/或由SEQ ID NO: 722之核酸序列(CCGGCAGCTAAGAAAAAGAAACTGGAT)編碼。在一些實施例中,Cas9與在羧基端連接的兩個SV40 NLS序列融合。在一些實施例中,Cas9可與兩個NLS融合,一個在N端連接且一個在C端連接。在一些實施例中,Cas9可與3個NLS融合。在一些實施例中,Cas9可與3個NLS融合,兩個在N端連接且一個在C端連接。在一些實施例中,Cas9可與3個NLS融合,一個在N端連接且兩個在C端連接。在一些實施例中,Cas9可不與NLS融合。在一些實施例中,Cas9可與一個NLS融合。在一些實施例中,Cas9可與NLS在C端融合且不包含在N端融合的NLS。在一些實施例中,Cas9可與NLS在N端融合且不包含在C端融合的NLS。在一些實施例中,Cas9蛋白與SV40 NLS融合且與核質蛋白NLS融合。在一些實施例中,Cas9蛋白質與SV40 NLS融合且與c-Myc NLS融合。在一些實施例中,SV40 NLS與Cas9的C端融合,而核質蛋白NLS與Cas9蛋白的N端融合。在一些實施例中,SV40 NLS與Cas9的C端融合,而c-Myc NLS與Cas9蛋白的N端融合。在一些實施例中,SV40 NLS與Cas9的N端融合,而核質蛋白NLS與Cas9蛋白的C端融合。在一些實施例中,SV40 NLS與Cas9的N端融合,而c-Myc NLS與Cas9蛋白的C端融合。在一些實施例中,SV40 NLS藉由連接子與Cas9蛋白融合。在一些實施例中,SV40 NLS及連接子係由核酸序列SEQ ID NO: 723 (ATGATGGCCCCAAAGAAGAAGCGGAAGGTCGGTATCCACGGAGTCCCAGCAGCC)編碼。在一些實施例中,核質蛋白NLS藉由連接子與Cas9蛋白融合。在一些實施例中,c-Myc NLS藉由連接子與Cas9蛋白融合。在一些實施例中,另一個域可以:a)與Cas蛋白(例如Cas9蛋白)之N端或C端融合;b)與NLS之N端融合,該NLS與Cas蛋白之N端融合;或c)與NLS之C端融合,該NLS與Cas蛋白之C端融合。在一些實施例中,NLS藉由連接子與Cas蛋白之N端及/或C端融合。在一些實施例中,NLS藉由連接子與Cas蛋白上之經N端融合之NLS的N端融合,及/或NLS藉由連接子與Cas蛋白上之經C端融合之NLS的C端融合。在一些實施例中,連接子為GSVD (SEQ ID NO: 550)或GSGS (SEQ ID NO: 551)。在一些實施例中,Cas蛋白包含視情況藉由連接子與Cas蛋白之N端(或與Cas蛋白上之經N端融合的NLS)融合的c-Myc NLS。在一些實施例中,Cas蛋白包含視情況藉由連接子與Cas蛋白之C端(或Cas蛋白上之經C端融合的NLS)融合的SV40 NLS。在一些實施例中,Cas蛋白包含視情況藉由連接子與Cas蛋白之C端(或與Cas蛋白上之經C端融合的NLS)融合的核質蛋白NLS。在一些實施例中,Cas蛋白包含:a)視情況藉由連接子與Cas蛋白之N端融合的c-Myc NLS;b)視情況藉由連接子與Cas蛋白之C端融合的SV40 NLS;及c)視情況藉由連接子與SV40 NLS之C端融合的核質蛋白NLS。在一些實施例中,Cas蛋白包含:a)視情況藉由連接子與Cas蛋白之N端融合的c-Myc NLS;b)視情況藉由連接子與Cas蛋白之C端融合的核質蛋白NLS;及c)視情況藉由連接子與核質蛋白NLS之C端融合的SV40 NLS。在一些實施例中,c-myc NLS與Cas9的N端融合且SV40 NLS及/或核質蛋白NLS與Cas9的C端融合。在一些實施例中,c-myc NLS融合至Cas9之N端(例如,藉助於連接子,諸如GSVD),SV40 NLS融合至Cas9之C端(例如,藉助於連接子,諸如GSGS)及核質蛋白NLS融合至SV-40 NLS之C端(例如,藉助於連接子,諸如GSGS)。
在一些實施例中,異源功能域能夠調節Cas9的細胞內半衰期。在一些實施例中,可延長Cas9半衰期。在一些實施例中,可縮短Cas9半衰期。在一些實施例中,異源功能域能夠增強Cas9穩定性。在一些實施例中,異源功能域能夠減小Cas9穩定性。在一些實施例中,異源功能域可充當蛋白質降解之信號肽。在一些實施例中,蛋白質降解可由蛋白水解酶介導,諸如蛋白酶體、溶酶體蛋白酶或鈣蛋白酶(calpain proteases)。在一些實施例中,異源功能域可包含PEST序列。在一些實施例中,可藉由添加泛素或聚泛素鏈來修飾Cas9。在一些實施例中,泛素可為泛素樣蛋白(UBL)。類泛素蛋白質之非限制性實例包括小類泛素修飾因子(SUMO)、泛素交叉反應蛋白(UCRP,亦稱為干擾素刺激基因-15 (ISG15))、泛素相關修飾因子-1 (URM1)、神經元-前驅體-細胞表現之發育下調蛋白-8 (NEDD8,在釀酒酵母(S. cerevisiae)中亦稱作Rub1)、人類白血球抗原F相關(FAT10)、自噬-8 (ATG8)及自噬-12 (ATG12)、Fau類泛素蛋白(FUB1)、膜錨定UBL (MUB)、泛素摺疊修飾因子-1 (UFM1)及類泛素蛋白-5 (UBL5)。
在一些實施例中,異源功能域可為標記域。標記域之非限制性實例包括螢光蛋白、純化標籤、抗原決定基標籤及報導基因序列。在一些實施例中,標記域可為螢光蛋白。適合之螢光蛋白之非限制實例包括綠色螢光蛋白(例如GFP、GFP-2、tagGFP、turboGFP、sfGFP、EGFP、Emerald、Azami綠(Azami Green)、單體Azami綠、CopGFP、AceGFP、ZsGreen1)、黃色螢光蛋白(例如YFP、EYFP、Citrine、Venus、YPet、PhiYFP、ZsYellow1)、藍色螢光蛋白(例如EBFP、EBFP2、Azurite、mKalamal、GFPuv、Sapphire、T-sapphire)、氰基螢光蛋白(例如ECFP、Cerulean、CyPet、AmCyan1、Midoriishi-Cyan)、紅色螢光蛋白(例如mKate、mKate2、mPlum、DsRed單體、mCherry、mRFP1、DsRed-Express、DsRed2、DsRed單體、HcRed-Tandem、HcRed1、AsRed2、eqFP611、mRasberry、mStrawberry、Jred),及橙色螢光蛋白(mOrange、mKO、Kusabira橙、單體Kusabira橙、mTangerine、tdTomato)或任何其他適合螢光蛋白。在其他實施例中,標記域可為純化標籤及/或抗原決定基標籤。非限制性之例示性標籤包括麩胱甘肽-S-轉移酶(glutathione-S-transferase,GST)、殼質結合蛋白(CBP)、麥芽糖結合蛋白(MBP)、硫氧還蛋白(thioredoxin,TRX)、聚(NANP)、串聯親和純化(tandem affinity purification,TAP)標籤、myc、AcV5、AU1、AU5、E、ECS、E2、FLAG、HA、nus、Softag 1、Softag 3、Strep、SBP、Glu-Glu、HSV、KT3、S、S1、T7、V5、VSV-G、6×His、8×His、生物素羧基載體蛋白(BCCP)、聚His及調鈣蛋白。非限制性之例示性報導基因包括麩胱甘肽-S-轉移酶(GST)、辣根過氧化酶(HRP)、氯黴素乙醯基轉移酶(CAT)、β-半乳糖苷酶、β-葡糖醛酸酶、螢光素酶或螢光蛋白。
在其他實施例中,異源功能域可使Cas9靶向特定細胞器、細胞類型、組織或器官。在一些實施例中,異源功能域可使Cas9靶向肌肉。
在其他實施例中,異源功能域可為效應域。當Cas9針對其目標序列時,例如當Cas9藉由嚮導RNA針對目標序列時,效應域可修飾或影響目標序列。在一些實施例中,效應域可選自核酸結合域或核酸酶域(例如非Cas核酸酶域)。在一些實施例中,異源功能域為核酸酶,諸如FokI核酸酶。參見例如美國專利第9,023,649號。
在一些實施例中,包含本文所揭示之任一種嚮導及/或核酸內切酶的本文所揭示之任一種組合物是無菌的及/或基本上不含熱原質。在特定實施例中,本文所揭示之任一種組合物包含醫藥學上可接受之載劑。片語「醫藥學上可接受」或「藥理學上可接受」係指當投與動物或人時不產生有害、過敏或其他不良反應之分子實體與組合物。如本文所用,「醫藥學上可接受之載劑」包括生理學上相容的任何及所有溶劑(例如水)、分散介質、塗料、抗細菌及抗真菌劑、等張劑及吸收延遲劑,及其類似物,包括醫藥學上可接受之細胞培養基。醫藥學上可接受之載劑包括無菌水溶液或分散液及用於即時製備無菌可注射溶液或分散液之無菌散劑。在一些實施例中,組合物包含防止微生物生長的防腐劑。
確定嚮導RNA之功效
在一些實施例中,當嚮導RNA連同形成RNP之其他組分一起遞送或表現時,確定該嚮導RNA的功效。在一些實施例中,嚮導RNA連同aSaCas9或SluCas9一起表現。在一些實施例中,嚮導RNA遞送至或表現於已穩定表現SaCas9或SluCas9的細胞株中。在一些實施例中,嚮導RNA作為RNP之一部分遞送至細胞。在一些實施例中,嚮導RNA連同編碼SaCas9或SluCas9的核酸(例如mRNA)一起遞送至細胞。
在一些實施例中,基於活體外模型來確定特定嚮導RNA的功效。在一些實施例中,活體外模型為細胞株。
在一些實施例中,根據嚮導RNA選擇過程,跨越多種活體外細胞模型確定特定嚮導RNA的功效。在一些實施例中,對細胞株使用所選嚮導RNA的資料進行比較。在一些實施例中,對多種細胞模型進行交叉篩選。
在一些實施例中,基於活體內模型來確定特定嚮導RNA的功效。在一些實施例中,活體內模型為嚙齒動物模型。在一些實施例中,嚙齒動物模型為表現突變肌肉萎縮蛋白基因之小鼠。在一些實施例中,活體內模型為非人類靈長類動物,例如食蟹獼猴。
III.基因編輯及治療DMD的方法
本發明提供基因編輯及治療杜興氏肌肉失養症(DMD)的方法。在一些實施例中,本文所描述之組合物中之任一者可向有需要之個體投與,用於製備雙股或單股斷裂,或在肌肉萎縮蛋白(DMD)基因之外顯子44、45、50、51或53中之任何一或多者中切除一部分(例如,低於約250個核苷酸)且治療DMD。在一些實施例中,可將本文所描述之任一種載體組態中的本文所描述之嚮導RNA對投與有需要之個體以製備雙股或單股斷裂,切除DMD的一部分,且治療DMD。在一些實施例中,可將本文所描述之任一種組合物投與有需要之個體用於治療DMD外顯子。在一些實施例中,將包含第一核酸及第二核酸的核酸分子投與個體以治療DMD,該第一核酸編碼
表 6的一或多個嚮導RNA,該第二核酸編碼SaCas9或SluCas9 (視嚮導而定)。在一些實施例中,將包含第一核酸及第二核酸的單個核酸分子(其可為載體,包括AAV載體)投與個體以治療DMD,該第一核酸編碼
表 6的一或多個嚮導RNA,該第二核酸編碼SaCas9或SluCas9 (視嚮導而定)。在一些實施例中,超過一個核酸分子(其可為載體,包括AAV載體)投與個體以治療DMD,其中編碼
表 6之一或多個嚮導RNA的第一核酸及編碼SaCas9或SluCas9之第二核酸(視嚮導而定)一起在一個核酸分子上或分開在不同的核酸分子上。
在一些實施例中,將本文所描述之任一種組合物投與有需要之個體以治療杜興氏肌肉失養症(DMD)。
在一些實施例中,向有需要之個體投與本文所描述之組合物中之任一者以誘導肌肉萎縮蛋白基因之外顯子44、45、50、51或53中之任一者或多者中的雙股或單股斷裂。
在一些實施例中,向有需要之個體投與本文所描述之組合物中之任一者以缺失肌肉萎縮蛋白基因之外顯子44、45、50、51或53中之任一者的一部分(例如,切除一部分)。
在一些實施例中,提供一種治療杜興氏肌肉失養症(DMD)的方法,該方法包含將本文所描述之任一種組合物遞送至細胞,其中該細胞包含已知與DMD相關之肌肉萎縮蛋白基因突變。
在一些實施例中,提供治療杜興氏肌肉失養症(DMD)之方法,該方法包含將至少一個包含一對嚮導RNA之核酸分子遞送至細胞,該一對嚮導RNA包含第一及第二間隔子序列,其中該第一及間隔子序列對係選自以下對中之任一者:SEQ ID NO: 1及SEQ ID NO: 3;SEQ ID NO: 3及SEQ ID NO: 4;SEQ ID NO: 3及SEQ ID NO: 5;SEQ ID NO: 3及SEQ ID NO: 6;SEQ ID NO: 3及SEQ ID NO: 7;SEQ ID NO: 3及SEQ ID NO: 8;SEQ ID NO: 3及SEQ ID NO: 9;SEQ ID NO: 4及SEQ ID NO: 5;SEQ ID NO: 4及SEQ ID NO: 6;SEQ ID NO: 4及SEQ ID NO: 7;SEQ ID NO: 4及SEQ ID NO: 8;SEQ ID NO: 4及SEQ ID NO: 9;SEQ ID NO: 5及SEQ ID NO: 6;SEQ ID NO: 5及SEQ ID NO: 7;SEQ ID NO: 5及SEQ ID NO: 8;SEQ ID NO: 5及SEQ ID NO: 9;SEQ ID NO: 6及SEQ ID NO: 7;SEQ ID NO: 6及SEQ ID NO: 8;SEQ ID NO: 6及SEQ ID NO: 9;SEQ ID NO: 7及SEQ ID NO: 8;SEQ ID NO: 7及SEQ ID NO: 9;SEQ ID NO: 8及SEQ ID NO: 9;SEQ ID NO: 11及SEQ ID NO: 12;SEQ ID NO: 11及SEQ ID NO: 13;SEQ ID NO: 11及SEQ ID NO: 14;SEQ ID NO: 11及SEQ ID NO: 15;SEQ ID NO: 12及SEQ ID NO: 13;SEQ ID NO: 12及SEQ ID NO: 14;SEQ ID NO: 12及SEQ ID NO: 15;SEQ ID NO: 13及SEQ ID NO: 14;SEQ ID NO: 13及SEQ ID NO: 15;SEQ ID NO: 14及SEQ ID NO: 15;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 17;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 18;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 19;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 18;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 19;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 19;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 20及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 20及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 20及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 20及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 20及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 20及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 21及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 21及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 21及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 21及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 21及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 22及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 22及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 22及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 22及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 23及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 23及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 23及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 24及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 24及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 25及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 110及SEQ ID NO: 120;SEQ ID NO: 110及SEQ ID NO: 121;SEQ ID NO: 110及SEQ ID NO: 122;SEQ ID NO: 110及SEQ ID NO: 123;SEQ ID NO: 110及SEQ ID NO: 124;SEQ ID NO: 110及SEQ ID NO: 125;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 112;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 113;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 114;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 115;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 116;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 117;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 118;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 119;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 120;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 121;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 122;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 123;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 124;SEQ ID NO: 111及SEQ ID NO: 125;SEQ ID NO: 112及SEQ ID NO: 113;SEQ ID NO: 112及SEQ ID NO: 114;SEQ ID NO: 112及SEQ ID NO: 115;SEQ ID NO: 112及SEQ ID NO: 116;SEQ ID NO: 112及SEQ ID NO: 117;SEQ ID NO: 112及SEQ ID NO: 118;SEQ ID NO: 112及SEQ ID NO: 119;SEQ ID NO: 112及SEQ ID NO: 120;SEQ ID NO: 112及SEQ ID NO: 121;SEQ ID NO: 112及SEQ ID NO: 122;SEQ ID NO: 112及SEQ ID NO: 123;SEQ ID NO: 112及SEQ ID NO: 124;SEQ ID NO: 112及SEQ ID NO: 125;SEQ ID NO: 113及SEQ ID NO: 114;SEQ ID NO: 113及SEQ ID NO: 115;SEQ ID NO: 113及SEQ ID NO: 116;SEQ ID NO: 113及SEQ ID NO: 117;SEQ ID NO: 113及SEQ ID NO: 118;SEQ ID NO: 113及SEQ ID NO: 119;SEQ ID NO: 113及SEQ ID NO: 120;SEQ ID NO: 113及SEQ ID NO: 121;SEQ ID NO: 113及SEQ ID NO: 122;SEQ ID NO: 113及SEQ ID NO: 123;SEQ ID NO: 113及SEQ ID NO: 124;SEQ ID NO: 113及SEQ ID NO: 125;SEQ ID NO: 114及SEQ ID NO: 115;SEQ ID NO: 114及SEQ ID NO: 116;SEQ ID NO: 114及SEQ ID NO: 117;SEQ ID NO: 114及SEQ ID NO: 118;SEQ ID NO: 114及SEQ ID NO: 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在一些實施例中,提供治療杜興氏肌肉失養症(DMD)之方法,該方法包含將至少一個包含一對嚮導RNA之核酸分子遞送至細胞,該一對嚮導RNA包含第一及第二間隔子序列,其中該第一及間隔子序列對係選自以下對中之任一者:SEQ ID NO: 200及SEQ ID NO: 201;SEQ ID NO: 200及SEQ ID NO: 202;SEQ ID NO: 200及SEQ ID NO: 203;SEQ ID NO: 200及SEQ ID NO: 204;SEQ ID NO: 200及SEQ ID NO: 205;SEQ ID NO: 200及SEQ ID NO: 206;SEQ ID NO: 200及SEQ ID NO: 207;SEQ ID NO: 200及SEQ ID NO: 208;SEQ ID NO: 201及SEQ ID NO: 202;SEQ ID NO: 201及SEQ ID NO: 203;SEQ ID NO: 201及SEQ ID NO: 204;SEQ ID NO: 201及SEQ ID NO: 205;SEQ ID NO: 201及SEQ ID NO: 206;SEQ ID NO: 201及SEQ ID NO: 207;SEQ ID NO: 201及SEQ ID NO: 208;SEQ ID NO: 202及SEQ ID NO: 203;SEQ ID NO: 202及SEQ ID NO: 204;SEQ ID NO: 202及SEQ ID NO: 205;SEQ ID NO: 202及SEQ ID NO: 206;SEQ ID NO: 202及SEQ ID NO: 207;SEQ ID NO: 202及SEQ ID NO: 208;SEQ ID NO: 203及SEQ ID NO: 204;SEQ ID NO: 203及SEQ ID NO: 205;SEQ ID NO: 203及SEQ ID NO: 206;SEQ ID NO: 203及SEQ ID NO: 207;SEQ ID NO: 203及SEQ ID NO: 208;SEQ ID NO: 204及SEQ ID NO: 205;SEQ ID NO: 204及SEQ ID NO: 206;SEQ ID NO: 204及SEQ ID NO: 207;SEQ ID NO: 204及SEQ ID NO: 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在一些實施例中,提供一種用於治療DMD之方法,其包含投與包含一或多個嚮導RNA之組合物,其中各嚮導RNA包含
表 6之嚮導序列,或包含嚮導序列,該嚮導序列包含
表 6之嚮導序列的至少16、17、18、19或20個連續核苷酸,或與選自
表 6之嚮導序列至少90%一致。在各情況下,組合物可包含編碼嚮導RNA之核酸。在一些實施例中,提供一種用於治療DMD之方法,其包含投與包含編碼一或多個嚮導RNA之一或多個核酸分子的組合物,其中各嚮導RNA包含
表 6之嚮導序列,或
表 6之嚮導序列之至少16、17、18、19或20個連續核苷酸,或與選自
表 6之嚮導序列至少90%一致。
在一些實施例中,提供一種治療DMD之方法,其包含投與包含嚮導RNA之組合物,其中該嚮導RNA包含
表 6之嚮導序列,或
表 6之嚮導序列的至少16、17、18、19或20個連續核苷酸,或與
表 6之嚮導序列至少90%一致。在各情況下,組合物可包含編碼嚮導RNA之核酸。
在一些實施例中,提供一種治療DMD之方法,其包含投與包含嚮導RNA之組合物,該嚮導RNA包含
表 6之嚮導序列的不超過16個、不超過17個、不超過18個、不超過19個、不超過20個、不超過21個或不超過22個連續核苷酸,或與
表 6之嚮導序列的不超過16、不超過17、不超過18、不超過19、不超過20、不超過21或不超過22個連續核苷酸至少90%一致。在各情況下,組合物可包含編碼嚮導RNA之核酸。
在一些實施例中,提供一種治療DMD之方法,其包含投與包含兩個或更多個嚮導RNA之組合物,其中各嚮導RNA包含
表 6之嚮導序列,或
表 6之嚮導序列的至少16、17、18、19或20個連續核苷酸,或與選自
表 6之嚮導序列至少90%一致。在各情況下,組合物可包含編碼嚮導RNA之核酸。
在一些實施例中,提供一種治療DMD之方法,其包含投與包含兩個或更多個嚮導RNA之組合物,其中該等兩個或更多個嚮導RNA中之至少一個,視情況各嚮導RNA包含
表 6之嚮導序列的不超過16個、不超過17個、不超過18個、不超過19個、不超過20個、不超過21個或不超過22個連續核苷酸,或與選自
表 6之嚮導序列的不超過16、不超過17、不超過18、不超過19、不超過20、不超過21或不超過22個連續核苷酸至少90%一致。在各情況下,組合物可包含編碼嚮導RNA之核酸。
在一些實施例中,提供一種用於治療DMD之方法,其包含投與包含SaCas9或SluCas9或一或多個編碼SaCas9或SluCas9之核酸分子及包含第一嚮導序列及第二嚮導序列之一對嚮導RNA的組合物,其中該第一嚮導序列及第二嚮導序列係選自以下之成對嚮導序列:
a.對於外顯子44 (具有例如SaCas9),SEQ ID NO: 1及3;110及120;110及121;110及122;110及123;110及124;110及125;111及112;111及113;111及114;111及115;111及116;111及117;111及118;111及119;111及120;111及121;111及122;111及123;111及124;111及125;112及113;112及114;112及115;112及116;112及117;112及118;112及119;112及120;112及121;112及122;112及123;112及124;112及125;113及114;113及115;113及116;113及117;113及118;113及119;113及120;113及121;113及122;113及123;113及124;113及125;114及115;114及116;114及117;114及118;114及119;114及120;114及121;114及122;114及123;114及124;114及125;115及116;115及117;115及118;115及119;115及120;115及121;115及122;115及123;115及124;115及125;116及117;116及118;116及119;116及120;116及121;116及122;116及123;116及124;116及125;117及118;117及119;117及120;117及121;117及122;117及123;117及124;117及125;118及119;118及120;118及121;118及122;118及123;118及124;118及125;119及120;119及121;119及122;119及123;119及124;119及125;120及121;120及122;120及123;120及124;120及125;121及122;121及123;121及124;121及125;122及123;122及124;122及125;123及124;123及125;124及125;
b.對於外顯子44 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO: 200及201;200及202;200及203;200及204;200及205;200及206;200及207;200及208;201及202;201及203;201及204;201及205;201及206;201及207;201及208;202及203;202及204;202及205;202及206;202及207;202及208;203及204;203及205;203及206;203及207;203及208;204及205;204及206;204及207;204及208;205及206;205及207;205及208;206及207;206及208;207及208;
c.對於外顯子45 (具有例如SaCas9),SEQ ID NO: 3及4;3及5;3及6;3及7;3及8;3及9;4及5;4及6;4及7;4及8;4及9;5及6;5及7;5及8;5及9;6及7;6及8;6及9;7及8;7及9;8及9;126及127;126及128;126及129;126及130;126及131;126及132;126及133;126及134;126及135;126及136;126及137;126及138;126及139;126及140;126及141;126及142;126及143;126及144;126及145;126及146;126及147;127及128;127及129;127及130;127及131;127及132;127及133;127及134;127及135;127及136;127及137;127及138;127及139;127及140;127及141;127及142;127及143;127及144;127及145;127及146;127及147;128及129;128及130;128及131;128及132;128及133;128及134;128及135;128及136;128及137;128及138;128及139;128及140;128及141;128及142;128及143;128及144;128及145;128及146;128及147;129及130;129及131;129及132;129及133;129及134;129及135;129及136;129及137;129及138;129及139;129及140;129及141;129及142;129及143;129及144;129及145;129及146;129及147;130及131;130及132;130及133;130及134;130及135;130及136;130及137;130及138;130及139;130及140;130及141;130及142;130及143;130及144;130及145;130及146;130及147;131及132;131及133;131及134;131及135;131及136;131及137;131及138;131及139;131及140;131及141;131及142;131及143;131及144;131及145;131及146;131及147;132及133;132及134;132及135;132及136;132及137;132及138;132及139;132及140;132及141;132及142;132及143;132及144;132及145;132及146;132及147;133及134;133及135;133及136;133及137;133及138;133及139;133及140;133及141;133及142;133及143;133及144;133及145;133及146;133及147;134及135;134及136;134及137;134及138;134及139;134及140;134及141;134及142;134及143;134及144;134及145;134及146;134及147;135及136;135及137;135及138;135及139;135及140;135及141;135及142;135及143;135及144;135及145;135及146;135及147;136及137;136及138;136及139;136及140;136及141;136及142;136及143;136及144;136及145;136及146;136及147;137及138;137及139;137及140;137及141;137及142;137及143;137及144;137及145;137及146;137及147;138及139;138及140;138及141;138及142;138及143;138及144;138及145;138及146;138及147;139及140;139及141;139及142;139及143;139及144;139及145;139及146;139及147;140及141;140及142;140及143;140及144;140及145;140及146;140及147;141及142;141及143;141及144;141及145;141及146;141及147;142及143;142及144;142及145;142及146;142及147;143及144;143及145;143及146;143及147;144及145;144及146;144及147;145及146;145及147;146及147;
d.對於外顯子45 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO: 209及210;209及211;209及212;209及213;209及214;209及215;209及216;209及217;209及218;209及219;209及220;209及221;209及222;209及223;209及224;209及225;209及226;209及227;209及228;209及229;209及230;210及211;210及212;210及213;210及214;210及215;210及216;210及217;210及218;210及219;210及220;210及221;210及222;210及223;210及224;210及225;210及226;210及227;210及228;210及229;210及230;211及212;211及213;211及214;211及215;211及216;211及217;211及218;211及219;211及220;211及221;211及222;211及223;211及224;211及225;211及226;211及227;211及228;211及229;211及230;212及213;212及214;212及215;212及216;212及217;212及218;212及219;212及220;212及221;212及222;212及223;212及224;212及225;212及226;212及227;212及228;212及229;212及230;213及214;213及215;213及216;213及217;213及218;213及219;213及220;213及221;213及222;213及223;213及224;213及225;213及226;213及227;213及228;213及229;213及230;214及215;214及216;214及217;214及218;214及219;214及220;214及221;214及222;214及223;214及224;214及225;214及226;214及227;214及228;214及229;214及230;215及216;215及217;215及218;215及219;215及220;215及221;215及222;215及223;215及224;215及225;215及226;215及227;215及228;215及229;215及230;216及217;216及218;216及219;216及220;216及221;216及222;216及223;216及224;216及225;216及226;216及227;216及228;216及229;216及230;217及218;217及219;217及220;217及221;217及222;217及223;217及224;217及225;217及226;217及227;217及228;217及229;217及230;218及219;218及220;218及221;218及222;218及223;218及224;218及225;218及226;218及227;218及228;218及229;218及230;219及220;219及221;219及222;219及223;219及224;219及225;219及226;219及227;219及228;219及229;219及230;220及221;220及222;220及223;220及224;220及225;220及226;220及227;220及228;220及229;220及230;221及222;221及223;221及224;221及225;221及226;221及227;221及228;221及229;221及230;222及223;222及224;222及225;222及226;222及227;222及228;222及229;222及230;223及224;223及225;223及226;223及227;223及228;223及229;223及230;224及225;224及226;224及227;224及228;224及229;224及230;225及226;225及227;225及228;225及229;225及230;226及227;226及228;226及229;226及230;227及228;227及229;227及230;228及229;228及230;229及230;
e.對於外顯子50 (具有例如SaCas9),SEQ ID NO: 148及149;148及150;148及151;148及152;148及153;148及154;148及155;148及156;148及157;148及158;148及159;149及150;149及151;149及152;149及153;149及154;149及155;149及156;149及157;149及158;149及159;150及151;150及152;150及153;150及154;150及155;150及156;150及157;150及158;150及159;151及152;151及153;151及154;151及155;151及156;151及157;151及158;151及159;152及153;152及154;152及155;152及156;152及157;152及158;152及159;153及154;153及155;153及156;153及157;153及158;153及159;154及155;154及156;154及157;154及158;154及159;155及156;155及157;155及158;155及159;156及157;156及158;156及159;157及158;157及159;158及159;
f.對於外顯子50 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO: 231及232;231及233;231及234;231及235;231及236;231及237;231及238;231及239;231及240;231及241;231及242;232及233;232及234;232及235;232及236;232及237;232及238;232及239;232及240;232及241;232及242;233及234;233及235;233及236;233及237;233及238;233及239;233及240;233及241;233及242;234及235;234及236;234及237;234及238;234及239;234及240;234及241;234及242;235及236;235及237;235及238;235及239;235及240;235及241;235及242;236及237;236及238;236及239;236及240;236及241;236及242;237及238;237及239;237及240;237及241;237及242;238及239;238及240;238及241;238及242;239及240;239及241;239及242;240及241;240及242;241及242;
g.對於外顯子51 (具有例如SaCas9),SEQ ID NO: 11及12;11及13;11及14;11及15;12及13;12及14;12及15;13及14;13及15;14及15;27及28;27及29;27及30;27及31;27及32;27及33;27及34;27及35;27及36;27及37;27及38;27及39;27及40;27及41;27及42;27及43;27及44;27及45;27及46;27及47;27及48;27及53;27及54;27及55;27及56;27及57;27及58;27及59;27及60;27及61;27及62;27及63;27及64;27及65;27及66;27及67;27及68;27及69;28及29;28及30;28及31;28及32;28及33;28及34;28及35;28及36;28及37;28及38;28及39;28及40;28及41;28及42;28及43;28及44;28及45;28及46;28及47;28及48;28及53;28及54;28及55;28及56;28及57;28及58;28及59;28及60;28及61;28及62;28及63;28及64;28及65;28及66;28及67;28及68;28及69;29及30;29及31;29及32;29及33;29及34;29及35;29及36;29及37;29及38;29及39;29及40;29及41;29及42;29及43;29及44;29及45;29及46;29及47;29及48;29及53;29及54;29及55;29及56;29及57;29及58;29及59;29及60;29及61;29及62;29及63;29及64;29及65;29及66;29及67;29及68;29及69;30及31;30及32;30及33;30及34;30及35;30及36;30及37;30及38;30及39;30及40;30及41;30及42;30及43;30及44;30及45;30及46;30及47;30及48;30及53;30及54;30及55;30及56;30及57;30及58;30及59;30及60;30及61;30及62;30及63;30及64;30及65;30及66;30及67;30及68;30及69;31及32;31及33;31及34;31及35;31及36;31及37;31及38;31及39;31及40;31及41;31及42;31及43;31及44;31及45;31及46;31及47;31及48;31及53;31及54;31及55;31及56;31及57;31及58;31及59;31及60;31及61;31及62;31及63;31及64;31及65;31及66;31及67;31及68;31及69;32及33;32及34;32及35;32及36;32及37;32及38;32及39;32及40;32及41;32及42;32及43;32及44;32及45;32及46;32及47;32及48;32及53;32及54;32及55;32及56;32及57;32及58;32及59;32及60;32及61;32及62;32及63;32及64;32及65;32及66;32及67;32及68;32及69;33及34;33及35;33及36;33及37;33及38;33及39;33及40;33及41;33及42;33及43;33及44;33及45;33及46;33及47;33及48;33及53;33及54;33及55;33及56;33及57;33及58;33及59;33及60;33及61;33及62;33及63;33及64;33及65;33及66;33及67;33及68;33及69;34及35;34及36;34及37;34及38;34及39;34及40;34及41;34及42;34及43;34及44;34及45;34及46;34及47;34及48;34及53;34及54;34及55;34及56;34及57;34及58;34及59;34及60;34及61;34及62;34及63;34及64;34及65;34及66;34及67;34及68;34及69;35及36;35及37;35及38;35及39;35及40;35及41;35及42;35及43;35及44;35及45;35及46;35及47;35及48;35及53;35及54;35及55;35及56;35及57;35及58;35及59;35及60;35及61;35及62;35及63;35及64;35及65;35及66;35及67;35及68;35及69;36及37;36及38;36及39;36及40;36及41;36及42;36及43;36及44;36及45;36及46;36及47;36及48;36及53;36及54;36及55;36及56;36及57;36及58;36及59;36及60;36及61;36及62;36及63;36及64;36及65;36及66;36及67;36及68;36及69;37及38;37及39;37及40;37及41;37及42;37及43;37及44;37及45;37及46;37及47;37及48;37及53;37及54;37及55;37及56;37及57;37及58;37及59;37及60;37及61;37及62;37及63;37及64;37及65;37及66;37及67;37及68;37及69;38及39;38及40;38及41;38及42;38及43;38及44;38及45;38及46;38及47;38及48;38及53;38及54;38及55;38及56;38及57;38及58;38及59;38及60;38及61;38及62;38及63;38及64;38及65;38及66;38及67;38及68;38及69;39及40;39及41;39及42;39及43;39及44;39及45;39及46;39及47;39及48;39及53;39及54;39及55;39及56;39及57;39及58;39及59;39及60;39及61;39及62;39及63;39及64;39及65;39及66;39及67;39及68;39及69;40及41;40及42;40及43;40及44;40及45;40及46;40及47;40及48;40及53;40及54;40及55;40及56;40及57;40及58;40及59;40及60;40及61;40及62;40及63;40及64;40及65;40及66;40及67;40及68;40及69;41及42;41及43;41及44;41及45;41及46;41及47;41及48;41及53;41及54;41及55;41及56;41及57;41及58;41及59;41及60;41及61;41及62;41及63;41及64;41及65;41及66;41及67;41及68;41及69;42及43;42及44;42及45;42及46;42及47;42及48;42及53;42及54;42及55;42及56;42及57;42及58;42及59;42及60;42及61;42及62;42及63;42及64;42及65;42及66;42及67;42及68;42及69;43及44;43及45;43及46;43及47;43及48;43及53;43及54;43及55;43及56;43及57;43及58;43及59;43及60;43及61;43及62;43及63;43及64;43及65;43及66;43及67;43及68;43及69;44及45;44及46;44及47;44及48;44及53;44及54;44及55;44及56;44及57;44及58;44及59;44及60;44及61;44及62;44及63;44及64;44及65;44及66;44及67;44及68;44及69;45及46;45及47;45及48;45及53;45及54;45及55;45及56;45及57;45及58;45及59;45及60;45及61;45及62;45及63;45及64;45及65;45及66;45及67;45及68;45及69;46及47;46及48;46及53;46及54;46及55;46及56;46及57;46及58;46及59;46及60;46及61;46及62;46及63;46及64;46及65;46及66;46及67;46及68;46及69;47及48;47及53;47及54;47及55;47及56;47及57;47及58;47及59;47及60;47及61;47及62;47及63;47及64;47及65;47及66;47及67;47及68;47及69;48及53;48及54;48及55;48及56;48及57;48及58;48及59;48及60;48及61;48及62;48及63;48及64;48及65;48及66;48及67;48及68;48及69;53及54;53及55;53及56;53及57;53及58;53及59;53及60;53及61;53及62;53及63;53及64;53及65;53及66;53及67;53及68;53及69;54及55;54及56;54及57;54及58;54及59;54及60;54及61;54及62;54及63;54及64;54及65;54及66;54及67;54及68;54及69;55及56;55及57;55及58;55及59;55及60;55及61;55及62;55及63;55及64;55及65;55及66;55及67;55及68;55及69;56及57;56及58;56及59;56及60;56及61;56及62;56及63;56及64;56及65;56及66;56及67;56及68;56及69;57及58;57及59;57及60;57及61;57及62;57及63;57及64;57及65;57及66;57及67;57及68;57及69;58及59;58及60;58及61;58及62;58及63;58及64;58及65;58及66;58及67;58及68;58及69;59及60;59及61;59及62;59及63;59及64;59及65;59及66;59及67;59及68;59及69;60及61;60及62;60及63;60及64;60及65;60及66;60及67;60及68;60及69;61及62;61及63;61及64;61及65;61及66;61及67;61及68;61及69;62及63;62及64;62及65;62及66;62及67;62及68;62及69;63及64;63及65;63及66;63及67;63及68;63及69;64及65;64及66;64及67;64及68;64及69;65及66;65及67;65及68;65及69;66及67;66及68;66及69;67及68;67及69;68及69;
h.對於外顯子51 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO: 243及244;243及245;243及246;243及247;243及248;243及249;243及250;243及251;243及252;243及253;243及254;243及255;243及256;243及257;243及258;243及259;243及260;243及261;243及262;243及263;243及264;243及265;243及266;243及267;243及268;243及269;244及245;244及246;244及247;244及248;244及249;244及250;244及251;244及252;244及253;244及254;244及255;244及256;244及257;244及258;244及259;244及260;244及261;244及262;244及263;244及264;244及265;244及266;244及267;244及268;244及269;245及246;245及247;245及248;245及249;245及250;245及251;245及252;245及253;245及254;245及255;245及256;245及257;245及258;245及259;245及260;245及261;245及262;245及263;245及264;245及265;245及266;245及267;245及268;245及269;246及247;246及248;246及249;246及250;246及251;246及252;246及253;246及254;246及255;246及256;246及257;246及258;246及259;246及260;246及261;246及262;246及263;246及264;246及265;246及266;246及267;246及268;246及269;247及248;247及249;247及250;247及251;247及252;247及253;247及254;247及255;247及256;247及257;247及258;247及259;247及260;247及261;247及262;247及263;247及264;247及265;247及266;247及267;247及268;247及269;248及249;248及250;248及251;248及252;248及253;248及254;248及255;248及256;248及257;248及258;248及259;248及260;248及261;248及262;248及263;248及264;248及265;248及266;248及267;248及268;248及269;249及250;249及251;249及252;249及253;249及254;249及255;249及256;249及257;249及258;249及259;249及260;249及261;249及262;249及263;249及264;249及265;249及266;249及267;249及268;249及269;250及251;250及252;250及253;250及254;250及255;250及256;250及257;250及258;250及259;250及260;250及261;250及262;250及263;250及264;250及265;250及266;250及267;250及268;250及269;251及252;251及253;251及254;251及255;251及256;251及257;251及258;251及259;251及260;251及261;251及262;251及263;251及264;251及265;251及266;251及267;251及268;251及269;252及253;252及254;252及255;252及256;252及257;252及258;252及259;252及260;252及261;252及262;252及263;252及264;252及265;252及266;252及267;252及268;252及269;253及254;253及255;253及256;253及257;253及258;253及259;253及260;253及261;253及262;253及263;253及264;253及265;253及266;253及267;253及268;253及269;254及255;254及256;254及257;254及258;254及259;254及260;254及261;254及262;254及263;254及264;254及265;254及266;254及267;254及268;254及269;255及256;255及257;255及258;255及259;255及260;255及261;255及262;255及263;255及264;255及265;255及266;255及267;255及268;255及269;256及257;256及258;256及259;256及260;256及261;256及262;256及263;256及264;256及265;256及266;256及267;256及268;256及269;257及258;257及259;257及260;257及261;257及262;257及263;257及264;257及265;257及266;257及267;257及268;257及269;258及259;258及260;258及261;258及262;258及263;258及264;258及265;258及266;258及267;258及268;258及269;259及260;259及261;259及262;259及263;259及264;259及265;259及266;259及267;259及268;259及269;260及261;260及262;260及263;260及264;260及265;260及266;260及267;260及268;260及269;261及262;261及263;261及264;261及265;261及266;261及267;261及268;261及269;262及263;262及264;262及265;262及266;262及267;262及268;262及269;263及264;263及265;263及266;263及267;263及268;263及269;264及265;264及266;264及267;264及268;264及269;265及266;265及267;265及268;265及269;266及267;266及268;266及269;267及268;267及269;268及269;
i.對於外顯子53 (具有例如SaCas9),SEQ ID NO: 16及17;16及18;16及19;16及20;16及21;16及22;16及23;16及24;16及25;16及26;17及18;17及19;17及20;17及21;17及22;17及23;17及24;17及25;17及26;18及19;18及20;18及21;18及22;18及23;18及24;18及25;18及26;19及20;19及21;19及22;19及23;19及24;19及25;19及26;20及21;20及22;20及23;20及24;20及25;20及26;21及22;21及23;21及24;21及25;21及26;22及23;22及24;22及25;22及26;23及24;23及25;23及26;24及25;24及26;25及26;71及72;71及73;71及74;71及75;71及76;71及77;71及78;71及84;71及85;71及86;71及87;71及88;71及89;71及90;71及91;71及92;71及93;71及94;71及95;71及96;71及97;71及98;71及99;71及100;71及101;71及102;72及73;72及74;72及75;72及76;72及77;72及78;72及84;72及85;72及86;72及87;72及88;72及89;72及90;72及91;72及92;72及93;72及94;72及95;72及96;72及97;72及98;72及99;72及100;72及101;72及102;73及74;73及75;73及76;73及77;73及78;73及84;73及85;73及86;73及87;73及88;73及89;73及90;73及91;73及92;73及93;73及94;73及95;73及96;73及97;73及98;73及99;73及100;73及101;73及102;74及75;74及76;74及77;74及78;74及84;74及85;74及86;74及87;74及88;74及89;74及90;74及91;74及92;74及93;74及94;74及95;74及96;74及97;74及98;74及99;74及100;74及101;74及102;75及76;75及77;75及78;75及84;75及85;75及86;75及87;75及88;75及89;75及90;75及91;75及92;75及93;75及94;75及95;75及96;75及97;75及98;75及99;75及100;75及101;75及102;76及77;76及78;76及84;76及85;76及86;76及87;76及88;76及89;76及90;76及91;76及92;76及93;76及94;76及95;76及96;76及97;76及98;76及99;76及100;76及101;76及102;77及78;77及84;77及85;77及86;77及87;77及88;77及89;77及90;77及91;77及92;77及93;77及94;77及95;77及96;77及97;77及98;77及99;77及100;77及101;77及102;78及84;78及85;78及86;78及87;78及88;78及89;78及90;78及91;78及92;78及93;78及94;78及95;78及96;78及97;78及98;78及99;78及100;78及101;78及102;84及85;84及86;84及87;84及88;84及89;84及90;84及91;84及92;84及93;84及94;84及95;84及96;84及97;84及98;84及99;84及100;84及101;84及102;85及86;85及87;85及88;85及89;85及90;85及91;85及92;85及93;85及94;85及95;85及96;85及97;85及98;85及99;85及100;85及101;85及102;86及87;86及88;86及89;86及90;86及91;86及92;86及93;86及94;86及95;86及96;86及97;86及98;86及99;86及100;86及101;86及102;87及88;87及89;87及90;87及91;87及92;87及93;87及94;87及95;87及96;87及97;87及98;87及99;87及100;87及101;87及102;88及89;88及90;88及91;88及92;88及93;88及94;88及95;88及96;88及97;88及98;88及99;88及100;88及101;88及102;89及90;89及91;89及92;89及93;89及94;89及95;89及96;89及97;89及98;89及99;89及100;89及101;89及102;90及91;90及92;90及93;90及94;90及95;90及96;90及97;90及98;90及99;90及100;90及101;90及102;91及92;91及93;91及94;91及95;91及96;91及97;91及98;91及99;91及100;91及101;91及102;92及93;92及94;92及95;92及96;92及97;92及98;92及99;92及100;92及101;92及102;93及94;93及95;93及96;93及97;93及98;93及99;93及100;93及101;93及102;94及95;94及96;94及97;94及98;94及99;94及100;94及101;94及102;95及96;95及97;95及98;95及99;95及100;95及101;95及102;96及97;96及98;96及99;96及100;96及101;96及102;97及98;97及99;97及100;97及101;97及102;98及99;98及100;98及101;98及102;99及100;99及101;99及102;100及101;100及102;101及102;
j.對於外顯子53 (具有例如SluCas9),SEQ ID NO: 270及271;270及272;270及273;270及274;270及275;270及276;270及277;270及278;270及279;270及280;270及281;270及282;270及283;270及284;270及285;270及286;270及287;270及288;270及289;270及290;270及291;270及292;271及272;271及273;271及274;271及275;271及276;271及277;271及278;271及279;271及280;271及281;271及282;271及283;271及284;271及285;271及286;271及287;271及288;271及289;271及290;271及291;271及292;272及273;272及274;272及275;272及276;272及277;272及278;272及279;272及280;272及281;272及282;272及283;272及284;272及285;272及286;272及287;272及288;272及289;272及290;272及291;272及292;273及274;273及275;273及276;273及277;273及278;273及279;273及280;273及281;273及282;273及283;273及284;273及285;273及286;273及287;273及288;273及289;273及290;273及291;273及292;274及275;274及276;274及277;274及278;274及279;274及280;274及281;274及282;274及283;274及284;274及285;274及286;274及287;274及288;274及289;274及290;274及291;274及292;275及276;275及277;275及278;275及279;275及280;275及281;275及282;275及283;275及284;275及285;275及286;275及287;275及288;275及289;275及290;275及291;275及292;276及277;276及278;276及279;276及280;276及281;276及282;276及283;276及284;276及285;276及286;276及287;276及288;276及289;276及290;276及291;276及292;277及278;277及279;277及280;277及281;277及282;277及283;277及284;277及285;277及286;277及287;277及288;277及289;277及290;277及291;277及292;278及279;278及280;278及281;278及282;278及283;278及284;278及285;278及286;278及287;278及288;278及289;278及290;278及291;278及292;279及280;279及281;279及282;279及283;279及284;279及285;279及286;279及287;279及288;279及289;279及290;279及291;279及292;280及281;280及282;280及283;280及284;280及285;280及286;280及287;280及288;280及289;280及290;280及291;280及292;281及282;281及283;281及284;281及285;281及286;281及287;281及288;281及289;281及290;281及291;281及292;282及283;282及284;282及285;282及286;282及287;282及288;282及289;282及290;282及291;282及292;283及284;283及285;283及286;283及287;283及288;283及289;283及290;283及291;283及292;284及285;284及286;284及287;284及288;284及289;284及290;284及291;284及292;285及286;285及287;285及288;285及289;285及290;285及291;285及292;286及287;286及288;286及289;286及290;286及291;286及292;287及288;287及289;287及290;287及291;287及292;288及289;288及290;288及291;288及292;289及290;289及291;289及292;290及291;290及292;291及292;924及270;924及272;924及273;924及274;924及275;924及276;924及277;924及278;924及279;924及280;924及281;924及282;924及283;924及284;924及285;924及286;924及287;924及288;924及289;924及290;924及291;924及292;925及270;925及272;925及273;925及274;925及275;925及276;925及277;925及278;925及279;925及280;925及281;925及282;925及283;925及284;925及285;925及286;925及287;925及288;925及289;925及290;925及291;925及292;926及270;926及272;926及273;926及274;926及275;926及276;926及277;926及278;926及279;926及280;926及281;926及282;926及283;926及284;926及285;926及286;926及287;926及288;926及289;926及290;926及291;926及292;927及270;927及272;927及273;927及274;927及275;927及276;927及277;927及278;927及279;927及280;927及281;927及282;927及283;927及284;927及285;927及286;927及287;927及288;927及289;927及290;927及291;927及292;928及270;928及272;928及273;928及274;928及275;928及276;928及277;928及278;928及279;928及280;928及281;928及282;928及283;928及284;928及285;928及286;928及287;928及288;928及289;928及290;928及291;928及292;929及270;929及272;929及273;929及274;929及275;929及276;929及277;929及278;929及279;929及280;929及281;929及282;929及283;929及284;929及285;929及286;929及287;929及288;929及289;929及290;929及291;929及292;930及270;930及272;930及273;930及274;930及275;930及276;930及277;930及278;930及279;930及280;930及281;930及282;930及283;930及284;930及285;930及286;930及287;930及288;930及289;930及290;930及291;930及292;931及270;931及272;931及273;931及274;931及275;931及276;931及277;931及278;931及279;931及280;931及281;931及282;931及283;931及284;931及285;931及286;931及287;931及288;931及289;931及290;931及291;931及292;932及270;932及272;932及273;932及274;932及275;932及276;932及277;932及278;932及279;932及280;932及281;932及282;932及283;932及284;932及285;932及286;932及287;932及288;932及289;932及290;932及291;932及292;933及270;933及272;933及273;933及274;933及275;933及276;933及277;933及278;933及279;933及280;933及281;933及282;933及283;933及284;933及285;933及286;933及287;933及288;933及289;933及290;933及291;933及292;934及270;934及272;934及273;934及274;934及275;934及276;934及277;934及278;934及279;934及280;934及281;934及282;934及283;934及284;934及285;934及286;934及287;934及288;934及289;934及290;934及291;934及292;935及270;935及272;935及273;935及274;935及275;935及276;935及277;935及278;935及279;935及280;935及281;935及282;935及283;935及284;935及285;935及286;935及287;935及288;935及289;935及290;935及291;935及292;936及270;936及272;936及273;936及274;936及275;936及276;936及277;936及278;936及279;936及280;936及281;936及282;936及283;936及284;936及285;936及286;936及287;936及288;936及289;936及290;936及291;936及292;937及270;937及272;937及273;937及274;937及275;937及276;937及277;937及278;937及279;937及280;937及281;937及282;937及283;937及284;937及285;937及286;937及287;937及288;937及289;937及290;937及291;937及292;938及270;938及272;938及273;938及274;938及275;938及276;938及277;938及278;938及279;938及280;938及281;938及282;938及283;938及284;938及285;938及286;938及287;938及288;938及289;938及290;938及291;938及292;950及275;951及275;952及275;953及275;954及275;或955及275;
k.對於具有SluCas9之外顯子44:SEQ ID NO: 200及203;200及204;202及203;202及205;202及206;202及207;204及208;204及205;204及206;204及207;或204及208;
l.對於具有SluCas9之外顯子45,SEQ ID NO: 223及230;或224及212。
m.對於具有SluCas9之外顯子50,SEQ ID NO: 231及232;231及234;231及236;231及237;236及233;236及235;236及238;236及240;或236及241;
n.對於具有SaCas9之外顯子51,SEQ ID NO: 28及57;31及57;31及46;32及69;33及57;33及69;34及57;36及69;37及69;37及46;39及46;40及46;46及35;46及62;46及65;46及67;47及57;48及57;49及57;51及57;53及46;54及46;55及46;58及46;59及46;60及46;61及69;或69及30;
o.對於具有SluCas9之外顯子51,SEQ ID NO: 243及252;245及252;252及253;252及254;252及256;252及257;252及258;252及262;252及264;252及265;或252及266;
p.對於具有SaCas9之外顯子53,SEQ ID NO: 86及96;87及96;88及97;89及96;90及97;92及77;92及78;92及96;92及99;93及98;93及102;94及100;95及77;95及78;95及99;96及100;97及98;97及102;98及73;或102及73;及
q.對於具有SluCas9之外顯子53,SEQ ID NO: 278及290;278及292;281及291;283及290;283及292;287及291;272及290;290及291;或272及292。
在一些實施例中,提供一種用於治療DMD之方法,其包含投與包含Cas蛋白質或編碼Cas蛋白質之核酸及一對嚮導RNA之組合物,其中該成對嚮導RNA包含以下或由以下組成:外顯子44之
表 1B或
1D、外顯子45之
表 2B或
2D、外顯子50之
表 3B或
3D、外顯子51之
表 4B或
4D及外顯子53之
表 5B或
5D中之任一者中任何一對嚮導序列。
在一些實施例中,提供一種用於治療DMD之方法,其包含投與包含Cas蛋白質或編碼Cas蛋白質之核酸及包含一或多個編碼一對嚮導RNA之核酸分子的組合物,其中該成對嚮導RNA包含一或多個編碼以下之核酸分子或由其組成:外顯子44之
表 1B或
1D、外顯子45之
表 2B或
2D、外顯子50之
表 3B或
3D、外顯子51之
表 4B或
4D及外顯子53之
表 5B或
5D中之任一者中任何一對嚮導序列。
在一些實施例中,提供一種用於治療DMD之方法,其包含投與Cas蛋白質或編碼Cas蛋白質之核酸及包含一對嚮導RNA之組合物,該成對嚮導RNA包含以下中之任一者中任何一對嚮導序列或由其組成:
a.對於具有SluCas9之外顯子44,SEQ ID NO: 200及203;200及204;202及203;202及205;202及206;202及207;204及208;204及205;204及206;204及207;或204及208;
b.對於具有SluCas9之外顯子45,SEQ ID NO: 223及230;或224及212;
c.對於具有SluCas9之外顯子50,SEQ ID NO: 231及232;231及234;231及236;231及237;236及233;236及235;236及238;236及240;或236及241;
d.對於具有SaCas9之外顯子51,SEQ ID NO: 28及57;31及57;31及46;32及69;33及57;33及69;34及57;36及69;37及69;37及46;39及46;40及46;46及35;46及62;46及65;46及67;47及57;48及57;49及57;51及57;53及46;54及46;55及46;58及46;59及46;60及46;61及69;或69及30;
e.對於具有SluCas9之外顯子51,SEQ ID NO: 243及252;245及252;252及253;252及254;252及256;252及257;252及258;252及262;252及264;252及265;或252及266;
f.對於具有SaCas9之外顯子53,SEQ ID NO: 86及96;87及96;88及97;89及96;90及97;92及77;92及78;92及96;92及99;93及98;93及102;94及100;95及77;95及78;95及99;96及100;97及98;97及102;98及73;或102及73;及
g.對於具有SluCas9之外顯子53,SEQ ID NO: 278及290;278及292;281及291;283及290;283及292;287及291;272及290;290及291;或272及292。
在一些實施例中,提供一種用於治療DMD之方法,其包含投與Cas蛋白質或編碼Cas蛋白質之核酸及包含一或多個編碼一對嚮導RNA之核酸分子的組合物,其中該成對嚮導RNA包含一或多個編碼以下中之任一者中任何一對嚮導序列的核酸分子或由其組成:
a.對於具有SluCas9之外顯子44,SEQ ID NO: 200及203;200及204;202及203;202及205;202及206;202及207;204及208;204及205;204及206;204及207;或204及208;
b.對於具有SluCas9之外顯子45,SEQ ID NO: 223及230;或224及212。
c.對於具有SluCas9之外顯子50,SEQ ID NO: 231及232;231及234;231及236;231及237;236及233;236及235;236及238;236及240;或236及241;
d.對於具有SaCas9之外顯子51,SEQ ID NO: 28及57;31及57;31及46;32及69;33及57;33及69;34及57;36及69;37及69;37及46;39及46;40及46;46及35;46及62;46及65;46及67;47及57;48及57;49及57;51及57;53及46;54及46;55及46;58及46;59及46;60及46;61及69;或69及30;
e.對於具有SluCas9之外顯子51,SEQ ID NO: 243及252;245及252;252及253;252及254;252及256;252及257;252及258;252及262;252及264;252及265;或252及266;
f.對於具有SaCas9之外顯子53,SEQ ID NO: 86及96;87及96;88及97;89及96;90及97;92及77;92及78;92及96;92及99;93及98;93及102;94及100;95及77;95及78;95及99;96及100;97及98;97及102;98及73;或102及73;及
g.對於具有SluCas9之外顯子53,SEQ ID NO: 278及290;278及292;281及291;283及290;283及292;287及291;272及290;290及291;或272及292。
在一些實施例中,用於治療DMD之方法進一步包含投與編碼核酸內切酶之核酸。與各嚮導RNA一起使用之核酸內切酶提供於本文中,例如
表 6中,行「酶」。
在一些實施例中,個體為哺乳動物。在一些實施例中,該個體為人類。
為了治療個體(例如人類),本文所揭示之任一種組合物可以與劑型調配物相容的方式且以治療上有效的量投與。組合物可容易以多種劑型(諸如可注射溶液)投與。舉例而言,以水溶液非經腸投與時,溶液通常宜緩衝,且首先用例如足夠的生理鹽水或葡萄糖來賦予液體稀釋劑等張性。此類水溶液可用於例如靜脈內、肌肉內、皮下及/或腹膜內投與。
組合療法
在一些實施例中,本發明包含組合療法,其包含本文所描述之任一種方法或用途以及適合於緩解DMD的另一種療法。
嚮導RNA組合物的遞送
本文所揭示的方法及用途可使用用於遞送本文所描述之嚮導RNA及組合物的任何適合方法。例示性遞送方法包括載體,諸如病毒載體;脂質奈米粒子;轉染;及電穿孔。在一些實施例中,與本文所揭示之單個載體嚮導RNA/Cas9結合的載體或LNP用於製備供治療DMD用的藥劑。
脂質奈米粒子(LNP)為用於遞送核苷酸及蛋白質負荷之已知方式,且可用於遞送本文所揭示之嚮導RNA、組合物或醫藥調配物。在一些實施例中,LNP遞送核酸、蛋白質、或核酸連同蛋白質一起。
電穿孔為遞送負荷之熟知方式,且任何電穿孔方法可用於遞送本文所揭示之單個載體。
在一些實施例中,本發明包含一種將本文所揭示之任一種單個載體遞送至離體細胞的方法,其中嚮導RNA係由與LNP結合或處於水溶液中的載體編碼。在一些實施例中,嚮導RNA/LNP或嚮導RNA亦與Cas9或編碼Cas9的序列結合(例如處於同一載體、LNP或溶液中)。
在一些實施例中,本發明提供在研究方法中使用本文所揭示之嚮導、核酸內切酶、細胞或組合物中之任一者的方法。舉例而言,本文所揭示之嚮導或核酸內切酶中的任一者可在實驗中、在不同參數(例如溫度、pH、細胞類型)下單獨或組合使用,或與其他試劑組合以評價嚮導及/或核酸內切酶的活性。
實例
提供以下實例以說明某些所揭示實施例且不應視為以任何方式限制本發明之範疇。
實例1:例示性DMD sgRNA
根據標準方法,以單個嚮導(sgRNA)形式製備包含
表 6中所示之嚮導序列的嚮導RNA。製備表現嚮導RNA及SaCas9 (用於具有SEQ ID NO: 1-159之嚮導序列)或SluCas9 (用於具有SEQ ID NO: 200-292、924-938或950-955之嚮導序列)中之一或多者的單個AAV載體或兩個AAV載體。向細胞活體外投與AAV載體以評估AAV表現嚮導RNA及Cas9之能力,編輯所靶向之外顯子(參見
表 6),且藉此治療DMD。
實例2:sgRNA對之評估 A.材料及方法 1. sgRNA選擇
選擇DMD基因內發現的SaCas9-KKH或SluCas9 sgRNA子集用於插入缺失頻率及分佈評價。成對評估之所選擇sgRNA展示於
表 6中且根據標準方法製備。除小鼠、犬及NHP同源對應物的存在之外,用於選擇此等sgRNA的準則亦包括其作為對來誘導外顯子框架重構及/或跳讀的潛力。此選擇包括位於外顯子45內的4個sgRNA、位於外顯子51內的43個sgRNA及位於外顯子53內的29個sgRNA。針對各sgRNA確定所預測脫靶位點之數目。
2.人類初級骨骼肌肌母細胞(HsMM)培養
在第一天,將冷凍HsMM小瓶(圖2、6及7A之批次20TL070666;圖7B之批次18TL269121)解凍且在37℃、5% CO
2、含濕氣培育箱中在T75燒瓶中生長於完全生長培養基中。在第二天,更新生長培養基。在第三天,使細胞繼代至T150燒瓶中。在第五天,改變各燒瓶中之培養基。在第6天,收穫細胞且用RNP電穿孔(核轉染)。
3. HsMM細胞核轉染
用於配對評估之所選擇sgRNA展示於
表 1A 至 1D及
2中且以化學方式合成(Sythego)。Cas9核酸酶為重組純化之SluCas9 (Aldevron)。使用Lonza 4D核轉染儀對HsMM細胞進行核轉染。對於各樣品,將經調配RNP及0.3x10
6個細胞混合於P5溶液中。對於含有兩種gRNA之雙重切割樣品,兩種獨立RNP與該成對中之任一gRNA一起調配。為了調配RNP,將gRNA及蛋白質在室溫下培育約20分鐘。對於圖2中所示之實驗,按18.75 pmols之sgRNA及6.25 pmols之Cas9;總共37.5 pmols之RNA組分及12.5 pmols之Cas9組分以3:1 gRNA:Cas9比率製備RNP。對於圖6中所示之實驗,按18.75 pmols之sgRNA及3.125 pmols之Cas9;總共37.5 pmols之RNA組分及6.25 pmols之Cas9組分以6:1 gRNA:Cas9比率製備RNP。對於圖7中所示之實驗,在三種不同總RNP劑量下:i)在75 pmol之sgRNA下具有12.5 pmols之Cas9的高劑量(H),ii)在37.5 pmol之sgRNA下具有6.25pmol之Cas9的中等劑量(M),及iii)在18.75 pmols之sgRNA及3.125 pmols之Cas9下的低劑量(L),以6:1 gRNA:Cas9比率製備RNP。對於雙RNP核轉染(圖7),總RNP劑量反映各RNP之和,例如高劑量包括37.5 pmols之sgRNA-1、6.25 pmol Cas9作為RNP1、37.5 pmols之sgRNA-2及6.25 pmol Cas9作為RNP2。電穿孔之後,向各樣品中添加80 µL完全生長培養基且將樣品在37℃、5% CO
2、含濕氣培育箱中培育10分鐘。在此回收之後,將樣品轉移至含有2 mL完全生長培養基之12孔盤中,該生長培養基先前已在37℃、5% CO
2、含濕氣培育箱中平衡。
4.細胞收集及gDNA提取
為了確定核轉染之後48小時的細胞存活率,用Hoechst及碘化丙錠(Life Technologies)將細胞染色。接著使用ImageXpress Micro (Molecular Devices)評估細胞存活率。一般而言,收集總體細胞存活率高於80%的樣品且針對插入缺失分析進行分析。為了自HsMM分離出基因體DNA,細胞用生理鹽水緩衝液洗滌,進行胰蛋白酶處理且離心。細胞集結粒用Maxwell RSC血液DNA套組(Promega #AS1400)中之溶解緩衝液處理,且使用Maxwell® RSC48儀器(Promega #AS8500)根據製造商說明書提取基因體DNA。使用Qubit™ 1x dsDNA HS分析套組(Thermo Fisher Scientific Q33231)、根據製造商說明書確定基因體DNA的濃度。
5.定序分析
對於圖6-8及圖10中之資料,在計算上表徵來自定序資料之編輯結果。切割位點之插入缺失頻率使用參考擴增子序列、前間隔子序列、裂解偏移及以切割位點為中心的定量窗口之尺寸列表。
對不佳品質樣品應用嚴格的一組QC準則。此等準則包括:
● 樣品中之平均鹼基品質
● 具有高定序品質之讀段的最小分數
● 修整後具有最小讀段長度之讀段的最小分數
● 去污染之後剩餘的讀段之最小分數(亦即,移除phiX讀段)
● 成功合併的讀段之最小分數
● 成功比對的讀段之最小分數
● 比對的讀段之最小數目
對於通過所有QC標準之樣品,所鑑別之插入缺失分為三種預期類型之插入缺失:
● 精確雙重切割:適當地框架重構由來自兩種gRNA之預期切割產生之轉錄物的編輯。
● 框架重構編輯:除適當地框架重構轉錄物之精確雙重切割以外的插入缺失。
● 其他編輯:未適當地框架重構轉錄物之插入缺失。
6.對於各樣品,報導總編輯%及各類型之預期插入缺失之編輯% (精確雙重切割、框架重構編輯、其他編輯)。HEK293FT細胞轉染 為評估插入缺失頻率及分佈,使用人類HEK293FT細胞株。HEK293FT細胞在12孔盤中用750 ng質體+ 2.5 µL脂染胺2000轉染。轉染之後的第三天,以胰蛋白酶處理細胞且根據綠色螢光蛋白(GFP)分選。將GFP陽性細胞直接分選至溶解緩衝液中,且根據製造商說明書,使用Maxwell RSC血液DNA套組(Promega #AS1400)及使用Maxwell® RSC48儀器(Promega #AS8500)對外顯子51進行DNA提取。隨後使用靶向相關切割位點的DMD外顯子53特異性引子對基因體DNA進行PCR。
7.擴增子深度定序庫製備及資料分析
對於圖1至圖3中之資料,藉由PCR擴增外顯子53或51且將該等產物用於使用MiSeq試劑套組V3製備定序庫。使用CRISPResso2 ±10-nt定量窗進行插入缺失分析。(參見例如Clement等人., Nat Biotechnol. 2019 Mar; 37(3):224-226)。插入缺失分析由六個相互排他性之插入缺失類別組成,描述如下:
NE:未編輯;
精確缺失(亦即,純淨切割);
RF.+1 (亦即,+1bp):引起框架重構之1-核苷酸(nt)插入;
RF.其他:除1-nt插入之外的引起框架重構的插入缺失:
缺失:不延伸至框架重構窗的外部
插入:<17-nt (亦即,<6個胺基酸);
外顯子跳讀:破壞外顯子/內含子邊界±6-nt窗的插入缺失,其引起潛在的外顯子跳讀(結果需要驗證):
插入缺失與剪接窗的重疊>=9-nt (破壞GT/AG剪接位點)
OE:其他插入缺失。
所選擇引子之以下序列用於擴增含有sgRNA靶向位點之特異性人類基因座(
表 8A 至 8B)。
表 8A.
用於擴增的引子 ( 人類 )
靶向外顯子 | 引子 ID | 序列 |
53 | hEX53_F1 | AAATGTGAGATAACGTTTGGAAG (SEQ ID NO: 804) |
hEX53_R1 | TTTCAGCTTTAACGTGATTTTCTG (SEQ ID NO: 805) |
表 8B . 引子 + MiSeq 接附子序列 ( 人類 )
8.雙重切割單個載體候選物的AAV組態
外顯子 | ID | 序列 |
53 | MiSeq_hEX53_F1 | TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGAAATGTGAGATAACGTTTGGAAG (SEQ ID NO: 810) |
MiSeq_hEX53_R1 | GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGTTTCAGCTTTAACGTGATTTTCTG (SEQ ID NO: 811) |
選擇啟動子取向、啟動子組態、NLS及支架的組合用於產生AAV質體及評價sgRNA轉殖基因表現、AAV可製造性以及活體外及活體內編輯效率。AAV質體組態列於
表 9中。
表
9
:
Pol III 啟動子 | 取向 | 組態 | NLS1 | 核酸內切酶 | NLS2 | NLS3 | 支架 |
hU6c:hU6c | ← → | hU6c-Cas9-hU6c | c-Myc-GSVD | SluCas9 | SV-40-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V5 |
← → | hU6c-Cas9-hU6c | c-Myc-GSVD | SaCas9-KKH | SV-40-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V2 | |
← → | hU6c-Cas9-hU6c | c-Myc-GSVD | SluCas9 | SV-40-MCS-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V5 | |
← → | hU6c-Cas9-hU6c | c-Myc-GSVD | SaCas9-KKH | SV-40-MCS-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V2 | |
hU6:7SK2 | ← → | hU6c-Cas9-7SK2 | c-Myc-GSVD | SluCas9 | SV-40-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V5 |
← → | hU6c-Cas9-7SK2 | c-Myc-GSVD | SaCas9-KKH | SV-40-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V2 | |
← → | hU6c-Cas9-7SK2 | c-Myc-GSVD | SluCas9 | SV-40-MCS-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V5 | |
← → | hU6c-Cas9-7SK2 | c-Myc-GSVD | SaCas9-KKH | SV-40-MCS-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V2 | |
hU6c:H1m | ← → | hU6c-Cas9-H1m | c-Myc-GSVD | SluCas9 | SV-40-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V5 |
← → | hU6c-Cas9-H1m | c-Myc-GSVD | SaCas9-KKH | SV-40-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V2 | |
7SK2:H1m | ← → | 7SK2-Cas9-H1m | SV-40-GS | SluCas9 | 核質蛋白 | N/A | V5 |
← → | 7SK2-Cas9-H1m | SV-40-GS | SaCas9-KKH | 核質蛋白 | N/A | V2 | |
← → | 7SK2-Cas9-H1m | SV-40 (+) | SluCas9 | 核質蛋白 | N/A | V5 | |
← → | 7SK2-Cas9-H1m | SV-40 (+) | SaCas9-KKH | 核質蛋白 | N/A | V2 | |
← → | 7SK2-Cas9-H1m | c-Myc-GSVD | SluCas9 | SV-40-MCS-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V5 | |
← → | 7SK2-Cas9-H1m | c-Myc-GSVD | SaCas9-KKH | SV-40-MCS-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V2 | |
← → | 7SK2-Cas9-H1m | c-Myc-GSVD | SluCas9 | SV-40-MCS-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V2 | |
H1m:M11 | ← → | H1m-Cas9-M11 | c-Myc-GSVD | SluCas9 | SV-40-MCS-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V5 |
← → | H1m-Cas9-M11 | c-Myc-GSVD | SaCas9-KKH | SV-40-MCS-GSGS | 核質蛋白-GSGS | V5 |
用於擴增含有sgRNA位點之特定人類基因座的所選擇引子序列展示於
表 10中。
表 10 :
* TIDE_hE45_F用於桑格定序。
9.結果
名稱 | 序列 |
MiSeq_hE45_F | TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAAGAGACAGGTCTTTCTGTCTTGTATCCTTTGG (SEQ ID NO: 724) |
MiSeq_hE45_R | GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATAAGAGACAGAATGTTAGTGCCTTTCACCC (SEQ ID NO: 725) |
TIDE_hE45_F* | GTCTTTCTGTCTTGTATCCTTTGG (SEQ ID NO: 726) |
選擇DMD基因內所發現的一組sgRNA用於評價插入缺失頻率及分佈。在此選擇中,4個sgRNA位於外顯子45內,43個sgRNA位於外顯子51內且29個sgRNA位於外顯子53內。
為評估插入缺失頻率及編輯分佈,在HEK293FT (
圖 1 、 3)及人類骨胳肌肉成肌細胞(HsMM)中進行質體轉染(
圖 2A 至 B)。
如
圖 1中所示,確定靶向DMD基因之外顯子51的所選擇SaCas9、SaCas9-KKH及SluCas9 sgRNA對之編輯頻率及插入缺失分佈。各堆疊條形圖表示sgRNA對,且條形圖高度描繪總編輯頻率平均值。各對sgRNA之不同插入缺失分佈由使用不同模式表示。誤差條指示各插入缺失組之標準差。
靶向DMD基因之外顯子51之sgRNA的平均插入缺失頻率在HEK294FT細胞(
圖 1)中確定,包括精確缺失。缺失尺寸顯示在底部。
在HsMM細胞中確定靶向DMD基因之外顯子45或外顯子51的sgRNA之平均插入缺失頻率(
圖 2A - B),如藉由CRISPR編輯(ICE)經由桑格定序信號分解(
圖 2A)及下一代定序(NGS)(
圖 2B)之推斷所計算。
靶向DMD基因之外顯子45 (左)及外顯子53 (右)之sgRNA的平均插入缺失頻率在HEK294FT細胞(
圖 3)中確定,包括精確缺失。缺失尺寸顯示在底部。
使用不同調配物(參見材料及方法:以上HsMM細胞之核轉染),再次確定HsMM細胞中靶向DMD基因之外顯子51的sgRNA之平均插入缺失頻率(
圖 6A - B),如藉由下一代定序(NGS)所計算。基於此等結果,選擇以下嚮導對用於額外表徵:Slu31-Slu5 (SEQ ID NO: 269及247)、Slu31-Slu7 (SEQ ID NO: 269及249)、Slu10-24 (SEQ ID NO: 252及262)、Slu10-26 (SEQ ID NO: 252及264)及Slu10-16 (SEQ ID NO: 252及254)。
所選擇嚮導對之核酸酶活性根據劑量函式評估(
圖 7A 至 B)。結果顯示Slu31-Slu5 (SEQ ID NO: 269及247) (
圖 7A)產生所選擇嚮導對之最高精確缺失含量,接著Slu10-Slu16 (SEQ ID NO: 252及254) (
圖 7B)。
精確缺失方案之穩固性係回應於RNP化學計量中之擾動而評估(
圖 8A 至 B)。相較於E51Slu16 (SEQ ID NO: 254)稀釋,雙重切割系統對於E51Slu10 (SEQ ID NO: 252)稀釋似乎更穩固,表明相較於若干所測試之其他對,具有Slu16-Slu10之AAV組態在較低劑量下可更有效。(
圖 8A)。雙重切割系統對E51Slu10或E51Slu26 (SEQ ID NO: 264)之稀釋展現出相等穩固性(
圖 8B)。
實例3:外顯子44及外顯子50之成對選擇 A.材料及方法
為獲得外顯子44及外顯子50之例示性嚮導對,偵測到框架重構窗。外顯子44及50之框架重構窗定義為其中框中之變化將不誘導過早終止密碼子的區域。藉由在突變外顯子序列中搜尋過早終止密碼子來計算框架重構窗,該序列藉由省略外顯子序列之第一鹼基來產生。由於外顯子44不在中性框中,自外顯子43之起點進行搜尋。隨後將最後過早終止密碼子與外顯子末端之間的窗確定為框架重構窗。隨後,將嚮導RNA對定位於至少一個嚮導RNA之切割位點在框架重構窗內之位置。使外顯子框架重構至所需框之候選純淨切割對為嚮導之子集,兩個嚮導之間的切割距離可由表達式「3n+2」表示。
圖 4A 及圖 4B中展示例示性框架重構。
實例4:外顯子53 HEK239FT sRGN靶上篩選 A.材料及方法 1.HEK293FT細胞轉染
為評估插入缺失頻率及分佈,使用人類HEK293FT細胞株。將約200k HEK293FT細胞在12孔盤之各孔中接種且轉染,其中每孔750 ng質體+ 2.5 µL脂染胺2000。各質體表現適當的核酸酶及兩個sgRNA用於雙重切割編輯。Slu_v5支架(SEQ ID NO: 901)用於所有樣品,E45Slu18/4樣品之一式三份除外。轉染之後的第三天,以胰蛋白酶處理細胞且根據綠色螢光蛋白(GFP)分選。直接分選約100k GFP陽性細胞至溶解緩衝液中,且使用Maxwell RSC血液基因體DNA純化套組進行DNA提取。
2.擴增子深度定序、庫製備及資料分析
為了確定基因編輯效率,使用側接DMD外顯子53基因體區域的引子擴增基因體DNA。使用以下引子序列:hEX53_F1 AAATGTGAGATAACGTTTGGAAG (SEQ ID NO: 804)及hEX53_R1 TTTCAGCTTTAACGTGATTTTCTG (SEQ ID NO: 805)。藉由在2% E-凝膠上分析少量PCR產物來驗證擴增子的尺寸。藉由AMPure XP珠粒純化PCR產物。使用包含條碼及Illumina轉接子之引子:i5_UDP0003 AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTATAGTAGCTTCGTCGGCAGCGTC(SEQ ID NO:921)及可變i7轉位引子CAAGCAGAAGACGGCATACGAGAT[可變_10nt_i7_條碼]GTCTCGTGGGCTCGG (CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATNNNN NNNNNNGTCTCGTGGGCTCGG,SEQ ID NO: 922)再次擴增純化的PCR產物。彙集多個條碼化樣品,與PhiX庫合併,且負載於Illumina Mi-Seq平台上。使用MiSeq試劑套組v3運作600個循環。
使用CRISPResso2 ±10-nt定量窗進行插入缺失分析。(參見例如Clement等人., Nat Biotechnol. 2019 Mar; 37(3):224-226)。使用下文互相排他性之插入缺失類別評估插入缺失分析:
a)精確缺失:sgRNA對之預測切割位點之間的DNA序列之精確缺失,其引起框架重構;
b) RF.其他:除精確缺失外之引起框架重構的插入缺失:
c) OE:其他插入缺失。
3.結果
外顯子53 HEK293FT sRGN靶上篩選之結果展示於圖9至圖11中。如圖10中所示,對於Slu14+7 (分別SEQ ID NO: 281及275)、Slu 16+23 (分別SEQ ID NO: 283及290)及Slu3+7 (分別SEQ ID NO: 271及275),所測試之三個sRGN (3.1、3.3及4)具有比SluCas9更高的精確缺失%。另外,sRGN3.3 E53SL3+7展現出最高精確缺失% (67.8%)。對於各嚮導對,sRGN3.3具有最高精確缺失%。
實例5:外顯子53 HsMM sRGN靶上篩選 A.材料及方法 1. HsMM細胞之轉染
為了評估插入缺失頻率及分佈,使用初代人類骨胳肌肉成肌細胞(HsMM供體編號20TL356515,Lonza)細胞。將核酸酶遞送為具有N1-甲基假尿苷取代之封端mRNA,其藉由GenScript之活體外轉錄產生。sgRNA作為由Synthego合成之經修飾ssRNA遞送。接種約50,000個HsMM細胞且在12孔盤之各孔中轉染。在各孔中,添加3000 ng質體+ 0.5 µL 12.5 μM各sgRNA以及脂染胺信使MAX轉染劑。Slu_v5支架(SEQ ID NO: 901)用於所有sgRNAs。轉染之後兩天,以胰蛋白酶處理細胞,且使用Maxwell RSC血液基因體DNA純化套組進行基因體DNA提取。
2.擴增子深度定序、庫製備及資料分析
為了確定基因編輯效率,使用側接DMD外顯子53基因體區域的引子擴增基因體DNA。使用以下引子序列:hEX53_F1 AAATGTGAGATAACGTTTGGAAG (SEQ ID NO: 804)及hEX53_R1 TTTCAGCTTTAACGTGATTTTCTG (SEQ ID NO: 805)。藉由在2% E-凝膠上分析少量PCR產物來驗證擴增子的尺寸。使用AMPure XP珠粒純化PCR產物。使用包含條碼及Illumina轉接子之引子:i5_UDP0003 AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTATAGTAGCTTCGTCGGCAGCGTC(SEQ ID NO:921)及可變i7轉位引子CAAGCAGAAGACGGCATACGAGAT[可變_10nt_i7_條碼]GTCTCGTGGGCTCGG (CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATNNN NNNNNNNGTCTCGTGGGCTCGG,SEQ ID NO: 922)再次擴增純化的PCR產物。彙集多個條碼化樣品,與PhiX庫合併,且負載於Illumina Mi-Seq平台上。使用MiSeq試劑套組v3運作600個循環。
使用CRISPResso2 ±10-nt定量窗進行插入缺失分析。(參見Clement等人., Nat Biotechnol. 2019 Mar; 37(3):224-226)。使用下文互相排他性之插入缺失類別評估插入缺失分析:
a)精確缺失:sgRNA對之預測切割位點之間的DNA序列之精確缺失,其引起框架重構;
b) RF.其他:除精確缺失外之引起框架重構的插入缺失:
c) OE:其他插入缺失。
3.結果
外顯子53 HsMM sRGN靶上篩選之結果展示於圖12中。對於Slu16+23 (分別SEQ ID NO: 283及290)及Slu3+7 (分別SEQ ID NO: 271及275),所測試之三個sRGN (3.1、3.3及4)展現出比SluCas9更高的精確缺失%,其中與具有Slu16+23之SluCas9相比,具有Slu16+23之三個sRGN的精確缺失%增加最大。
本說明書及例示性實施例不應視為限制性的。出於本說明書及所附申請專利範圍之目的,除非另外說明,否則表示數量、百分比或比例的所有數字,及說明書及申請專利範圍中所用之其他數值均應理解為在所有情況下藉由術語「約」修飾至其尚未如此修飾的程度。因此,除非有相反指示,否則本說明書及所附申請專利範圍中所闡述之數值參數為可視設法獲得之所需特性而變化的近似值。至少,且不試圖將均等論之應用限於申請專利範圍之範疇,各數值參數至少應根據所報導之有效數位之個數且藉由應用普通捨入技術來解釋。
應注意,如本說明書及申請專利範圍中所用,除非明確地且肯定地限於一個指示物,否則單數形式「一(a/an)」與「該」及任何字語之任何單數使用形式包括複數個指示物。如本文中所使用,術語「包括」及其語法變體意欲為非限制性的,以使得清單中之項之列舉不排除可取代或添加至所列項之其他類似項。
圖 1展示靶向HEK293FT細胞中之DMD基因之外顯子51的所選擇SaCas9、SaCas9-KKH及SluCas9 sgRNA對之編輯頻率及插入缺失分佈。各堆疊條形圖表示sgRNA對,且條形圖高度描繪總編輯頻率平均值。各對sgRNA之不同插入缺失分佈由使用如圖例中所示之不同模式表示。誤差條指示各插入缺失組之標準差。圖中之「嚮導ID」展示為編號,且一般對應於各提供之Cas9類型的
表 6之「嚮導RNA名稱列」中之最末數字。「RF +1」意謂藉由插入單個核苷酸進行框架重構編輯。「RF其他」意謂其他框架重構編輯。「外顯子跳讀」意謂1)與剪接受體(AG) (目標外顯子之5'端)重疊的插入缺失;2)與兩個嚮導中之一者的剪接窗口重疊≥ 9-nt的缺失;或3)在精確GT/AG剪接位點處插入且在兩個嚮導中之一者處具有長度≥ 9-nt。
圖 2A 及 2B展示靶向人類骨胳肌肉成肌細胞(HsMM)細胞之DMD基因之外顯子45或外顯子51的所選擇SaCas9及SluCas9 sgRNA對之編輯頻率及插入缺失分佈。各堆疊條形圖表示sgRNA對,且條形圖高度描繪總編輯頻率平均值。各對sgRNA之不同插入缺失分佈由使用不同模式表示。
圖 2A顯示編輯頻率及分佈,如藉由CRISPR編輯(ICE)經由桑格定序信號分解之干擾所計算。
圖 2B展示如藉由下一代定序(NGS)計算的編輯頻率及分佈。NA指示資料由於分析步驟下之QC不合格而不可用。誤差條指示各插入缺失組之標準差。圖中之「嚮導ID」展示為編號,且一般對應於各提供之Cas9類型的
表 6之「嚮導RNA名稱列」中之最末數字。「RF +1」意謂藉由插入單個核苷酸進行框架重構編輯。「RF其他」意謂其他框架重構編輯。「外顯子跳讀」意謂1)與剪接受體(AG) (目標外顯子之5'端)重疊的插入缺失;2)與兩個嚮導中之一者的剪接窗口重疊≥ 9-nt的缺失;或3)在精確GT/AG剪接位點處插入且在兩個嚮導中之一者處具有長度≥ 9-nt。
圖 3展示靶向HEK293FT細胞中之外顯子53內所選擇SaCas9、SaCas9-KKH及SluCas9 sgRNA對之編輯頻率及插入缺失分佈。各堆疊條形圖表示sgRNA或sgRNA對且條形圖高度描繪總插入缺失頻率平均值。各sgRNA的插入缺失分佈使用不同圖案顯示。誤差條=各插入缺失組之標準差。圖中所示之嚮導RNA一般對應於
表 6中之「嚮導RNA名稱列」(例如,圖3中之E53SL4對應於
表 6中之E53Slu4,圖3中之E53SL23對應於E53Slu23)。「+1 bp」意謂藉由插入單個核苷酸進行框架重構編輯。
圖 4A 至圖 4B展示確定外顯子44及50之例示性嚮導對的方法。
圖 4A展示基於鄰近外顯子之相應外顯子(44及50)的框架重構。
圖 4B展示外顯子44或50之框架重構窗及最後過早終止密碼子。
圖 5A 至圖 5B為展示六個代表性載體設計之示意圖。白色箭頭指示sgRNA表現方向,而黑色箭頭指示Cas9蛋白的方向。在一個特定實施例中,Cas9啟動子可為CK8e。「Pol III」係指表現sgRNA用的代表性啟動子,「g1」及「g2」各指嚮導序列,「支架」係指嚮導RNA的支架,且「pa」係指聚腺苷酸化序列。
圖 5A展示設計1至4。
圖 5B展示設計5及6,其為設計2之具體變型(一般展示於
圖 5A中),其中Cas9為具有特定嚮導序列、啟動子、支架及NLS序列之SluCas9。設計5及設計6僅在呈現嚮導序列之次序方面不同。設計5描繪在第一嚮導位置中之Slu7嚮導序列及在第二嚮導位置中之Slu3嚮導。設計6描繪在第一嚮導位置中之Slu3嚮導序列及在第二嚮導位置中之Slu7嚮導序列。
圖 6A 及圖 6B顯示靶向HsMM細胞中之DMD基因之外顯子45或外顯子51的所選擇SluCas9 sgRNA對之編輯頻率及插入缺失分佈。各堆疊條形圖表示sgRNA對,且條形圖高度描繪總編輯頻率平均值。各對sgRNA之不同插入缺失分佈由使用不同模式表示。
圖 6A展示如藉由下一代定序(NGS)針對嚮導對所計算之編輯頻率及分佈,其中E51Slu31靶向DMD基因之外顯子51的框架重構窗。
圖 6B展示如藉由下一代定序(NGS)針對嚮導對所計算之編輯頻率及分佈,其中E51Slu10靶向DMD基因之外顯子51的框架重構窗。誤差條指示各插入缺失組之標準差。圖中之「嚮導ID」展示為編號,且一般對應於各提供之Cas9類型的表2之「嚮導RNA名稱列」中之最末數字。「RF其他」意謂其他框架重構編輯。
圖 7A 及圖 7B顯示靶向HsMM細胞中之DMD基因之各種外顯子的所選擇SluCas9 sgRNA對之編輯頻率及插入缺失分佈。
圖 7A顯示靶向HsMM細胞中之DMD基因之外顯子51的所選擇SluCas9 sgRNA對之編輯頻率及插入缺失分佈。
圖 7B顯示靶向HsMM細胞中之DMD基因之外顯子45或外顯子51的所選擇SluCas9 sgRNA對之編輯頻率及插入缺失分佈。在圖7A及圖7B中,各堆疊條形圖表示sgRNA對,且條形圖高度描繪總編輯頻率平均值。各對sgRNA之不同插入缺失分佈由使用不同模式表示。編輯頻率及特徵如下計算:藉由三個嚮導對之下一代定序(NGS),以三次劑量之RNP;較高(H)、中等(M)及較低(L)。誤差條指示各插入缺失組之標準差。圖式中之「嚮導ID」展示為編號,且一般對應於各提供之Cas9類型的表2之「嚮導RNA名稱列」中之最末數位。「RF其他」意謂其他框架重構編輯。
圖 8A 及圖 8B顯示靶向HsMM細胞中之DMD基因之外顯子45或外顯子51的所選擇SluCas9 sgRNA對之編輯頻率及插入缺失分佈。各堆疊條形圖表示sgRNA對,且條形圖高度描繪總編輯頻率平均值。各對sgRNA之不同插入缺失分佈由使用不同模式表示。
圖 8A展示如藉由E51Slu10及E51Slu16嚮導對之下一代定序(NGS)計算的編輯頻率及分佈,其中核糖核蛋白(RNP)化學計量在整個樣品集中變化。
圖 8B展示如藉由E51Slu10及E51Slu26嚮導對之下一代定序(NGS)計算的編輯頻率及分佈,其中核糖核蛋白(RNP)化學計量在整個樣品集中變化。誤差條指示各插入缺失組之標準差。圖中之「嚮導ID」展示為編號,且一般對應於各提供之Cas9類型的表2之「嚮導RNA名稱列」中之最末數字。「RF其他」意謂其他框架重構編輯。
圖 9展示具有靶向人類HEK293FT細胞中之DMD基因之外顯子53的各種sgRNA對(Slu14/7、Slu16/23、Slu3/7)之若干核酸酶(SluCas9、sRGNs 3.1、3.3、4)之編輯頻率。包括DMD基因之外顯子45的一種高表現sgRNA作為參考(E45Slu18/4)。Slu_v5支架(SEQ ID NO: 901)用於所有樣品,E45Slu18/4樣品之一式三份除外。盒狀圖表示各sgRNA對之平均總插入缺失頻率。資料為2-3次重複實驗的平均值。一般而言,圖中之「gRNA」僅顯示為數目且一般對應於各提供之Cas9類型的表5C及5D之「嚮導RNA名稱列」中之最末數字。
圖 10顯示具有靶向人類HEK293FT細胞中之DMD基因之外顯子53的各種sgRNA對之若干種核酸酶的編輯頻率及插入缺失分佈。包括DMD基因之外顯子45的一種高表現sgRNA作為參考(E45Slu18/4)。每條表示sgRNA對,且條高度描繪平均總插入缺失頻率。各sgRNA之插入缺失分佈展示如下:黑色(精確缺失引起框架重構,有時稱為「精確缺失」);垂直線(引起框架重構的精確缺失以外的插入缺失,有時稱為「其他框架重構」);白色(所有其他插入缺失,有時稱為「其他插入缺失」)。資料為2-3次重複實驗的平均值。一般而言,圖中之「gRNA」僅顯示為數目且一般對應於各提供之Cas9類型的表5C及5D之「嚮導RNA名稱列」中之最末數字。
圖 11展示表示具有靶向人類HEK293FT細胞中之DMD基因之外顯子53的各種sgRNA對之若干核酸酶(SluCas9、sRGNs 3.1、3.3、4)之生產性插入缺失的條形圖。Y軸表示相對於總插入缺失之精度缺失百分比。資料為2-3次重複實驗的平均值。一般而言,圖中之「gRNA」僅顯示為數目且一般對應於各提供之Cas9類型的表5C及5D之「嚮導RNA名稱列」中之最末數字。
圖 12顯示條形圖,其表示若干核酸酶(SluCas9、sRGNs 3.1、3.3、4)之編輯頻率及插入缺失分佈,該等核酸酶具有兩種不同的靶向初級肌骨骼成肌細胞(HsMM)細胞中之DMD基因之外顯子53的sgRNA對(16+23及3+7)。每條表示sgRNA對,且條高度描繪平均總插入缺失頻率(%)。各sgRNA之插入缺失分佈展示如下:生黑色(精確缺失引起框架重構,有時稱為「精確缺失」);垂直線(引起框架重構的精確缺失以外的插入缺失,有時稱為「其他框架重構」);白色(所有其他插入缺失,有時稱為「其他插入缺失」)。資料為3次重複實驗的平均值。
TW202345911A_112108369_SEQL.xml
Claims (38)
- 一種組合物,其包含一或多個嚮導RNA或編碼一或多個嚮導RNA之核酸,其中該一或多個嚮導RNA包含i) 表 6之嚮導序列;ii) 表 6之嚮導序列的至少16、17、18、19或20個連續核苷酸;iii)與 表 6之嚮導序列至少90%一致的嚮導序列;或iv) 表 1B、 1D、 3B、 3D、 5B及 5D中所示任何一對嚮導序列,視情況進一步包含SaCas9或編碼SaCas9之核酸(針對SEQ ID NO: 1-159)或SluCas9或編碼SluCas9之核酸(針對SEQ ID NO: 200-292、924-938或950-955)。
- 一種組合物,其包含一對嚮導RNA或編碼一對嚮導RNA之核酸,其中該成對嚮導RNA包含第一嚮導序列及第二嚮導序列或由該等嚮導序列組成,其中該第一嚮導序列及該第二嚮導序列係選自以下任何一對嚮導序列: a.對於具有SaCas9之外顯子44:SEQ ID NO: 1及3;110及120;110及121;110及122;110及123;110及124;110及125;111及112;111及113;111及114;111及115;111及116;111及117;111及118;111及119;111及120;111及121;111及122;111及123;111及124;111及125;112及113;112及114;112及115;112及116;112及117;112及118;112及119;112及120;112及121;112及122;112及123;112及124;112及125;113及114;113及115;113及116;113及117;113及118;113及119;113及120;113及121;113及122;113及123;113及124;113及125;114及115;114及116;114及117;114及118;114及119;114及120;114及121;114及122;114及123;114及124;114及125;115及116;115及117;115及118;115及119;115及120;115及121;115及122;115及123;115及124;115及125;116及117;116及118;116及119;116及120;116及121;116及122;116及123;116及124;116及125;117及118;117及119;117及120;117及121;117及122;117及123;117及124;117及125;118及119;118及120;118及121;118及122;118及123;118及124;118及125;119及120;119及121;119及122;119及123;119及124;119及125;120及121;120及122;120及123;120及124;120及125;121及122;121及123;121及124;121及125;122及123;122及124;122及125;123及124;123及125;或124及125; b.對於具有SluCas9之外顯子44:SEQ ID NO: 200及201;200及202;200及203;200及204;200及205;200及206;200及207;200及208;201及202;201及203;201及204;201及205;201及206;201及207;201及208;202及203;202及204;202及205;202及206;202及207;202及208;203及204;203及205;203及206;203及207;203及208;204及205;204及206;204及207;204及208;205及206;205及207;205及208;206及207;206及208;207及208; c.對於具有SaCas9之外顯子50:SEQ ID NO: 148及149;148及150;148及151;148及152;148及153;148及154;148及155;148及156;148及157;148及158;148及159;149及150;149及151;149及152;149及153;149及154;149及155;149及156;149及157;149及158;149及159;150及151;150及152;150及153;150及154;150及155;150及156;150及157;150及158;150及159;151及152;151及153;151及154;151及155;151及156;151及157;151及158;151及159;152及153;152及154;152及155;152及156;152及157;152及158;152及159;153及154;153及155;153及156;153及157;153及158;153及159;154及155;154及156;154及157;154及158;154及159;155及156;155及157;155及158;155及159;156及157;156及158;156及159;157及158;157及159;或158及159; d.對於具有SluCas9之外顯子50:SEQ ID NO: 231及232;231及233;231及234;231及235;231及236;231及237;231及238;231及239;231及240;231及241;231及242;232及233;232及234;232及235;232及236;232及237;232及238;232及239;232及240;232及241;232及242;233及234;233及235;233及236;233及237;233及238;233及239;233及240;233及241;233及242;234及235;234及236;234及237;234及238;234及239;234及240;234及241;234及242;235及236;235及237;235及238;235及239;235及240;235及241;235及242;236及237;236及238;236及239;236及240;236及241;236及242;237及238;237及239;237及240;237及241;237及242;238及239;238及240;238及241;238及242;239及240;239及241;239及242;240及241;240及242;或241及242; e.對於具有SaCas9之外顯子53:SEQ ID NO: 16及17;16及18;16及19;16及20;16及21;16及22;16及23;16及24;16及25;16及26;17及18;17及19;17及20;17及21;17及22;17及23;17及24;17及25;17及26;18及19;18及20;18及21;18及22;18及23;18及24;18及25;18及26;19及20;19及21;19及22;19及23;19及24;19及25;19及26;20及21;20及22;20及23;20及24;20及25;20及26;21及22;21及23;21及24;21及25;21及26;22及23;22及24;22及25;22及26;23及24;23及25;23及26;24及25;24及26;25及26;71及72;71及73;71及74;71及75;71及76;71及77;71及78;71及84;71及85;71及86;71及87;71及88;71及89;71及90;71及91;71及92;71及93;71及94;71及95;71及96;71及97;71及98;71及99;71及100;71及101;71及102;72及73;72及74;72及75;72及76;72及77;72及78;72及84;72及85;72及86;72及87;72及88;72及89;72及90;72及91;72及92;72及93;72及94;72及95;72及96;72及97;72及98;72及99;72及100;72及101;72及102;73及74;73及75;73及76;73及77;73及78;73及84;73及85;73及86;73及87;73及88;73及89;73及90;73及91;73及92;73及93;73及94;73及95;73及96;73及97;73及98;73及99;73及100;73及101;73及102;74及75;74及76;74及77;74及78;74及84;74及85;74及86;74及87;74及88;74及89;74及90;74及91;74及92;74及93;74及94;74及95;74及96;74及97;74及98;74及99;74及100;74及101;74及102;75及76;75及77;75及78;75及84;75及85;75及86;75及87;75及88;75及89;75及90;75及91;75及92;75及93;75及94;75及95;75及96;75及97;75及98;75及99;75及100;75及101;75及102;76及77;76及78;76及84;76及85;76及86;76及87;76及88;76及89;76及90;76及91;76及92;76及93;76及94;76及95;76及96;76及97;76及98;76及99;76及100;76及101;76及102;77及78;77及84;77及85;77及86;77及87;77及88;77及89;77及90;77及91;77及92;77及93;77及94;77及95;77及96;77及97;77及98;77及99;77及100;77及101;77及102;78及84;78及85;78及86;78及87;78及88;78及89;78及90;78及91;78及92;78及93;78及94;78及95;78及96;78及97;78及98;78及99;78及100;78及101;78及102;84及85;84及86;84及87;84及88;84及89;84及90;84及91;84及92;84及93;84及94;84及95;84及96;84及97;84及98;84及99;84及100;84及101;84及102;85及86;85及87;85及88;85及89;85及90;85及91;85及92;85及93;85及94;85及95;85及96;85及97;85及98;85及99;85及100;85及101;85及102;86及87;86及88;86及89;86及90;86及91;86及92;86及93;86及94;86及95;86及96;86及97;86及98;86及99;86及100;86及101;86及102;87及88;87及89;87及90;87及91;87及92;87及93;87及94;87及95;87及96;87及97;87及98;87及99;87及100;87及101;87及102;88及89;88及90;88及91;88及92;88及93;88及94;88及95;88及96;88及97;88及98;88及99;88及100;88及101;88及102;89及90;89及91;89及92;89及93;89及94;89及95;89及96;89及97;89及98;89及99;89及100;89及101;89及102;90及91;90及92;90及93;90及94;90及95;90及96;90及97;90及98;90及99;90及100;90及101;90及102;91及92;91及93;91及94;91及95;91及96;91及97;91及98;91及99;91及100;91及101;91及102;92及93;92及94;92及95;92及96;92及97;92及98;92及99;92及100;92及101;92及102;93及94;93及95;93及96;93及97;93及98;93及99;93及100;93及101;93及102;94及95;94及96;94及97;94及98;94及99;94及100;94及101;94及102;95及96;95及97;95及98;95及99;95及100;95及101;95及102;96及97;96及98;96及99;96及100;96及101;96及102;97及98;97及99;97及100;97及101;97及102;98及99;98及100;98及101;98及102;99及100;99及101;99及102;100及101;100及102;或101及102; f.對於具有SluCas9之外顯子53:SEQ ID NO: 270及271;270及272;270及273;270及274;270及275;270及276;270及277;270及278;270及279;270及280;270及281;270及282;270及283;270及284;270及285;270及286;270及287;270及288;270及289;270及290;270及291;270及292;271及272;271及273;271及274;271及275;271及276;271及277;271及278;271及279;271及280;271及281;271及282;271及283;271及284;271及285;271及286;271及287;271及288;271及289;271及290;271及291;271及292;272及273;272及274;272及275;272及276;272及277;272及278;272及279;272及280;272及281;272及282;272及283;272及284;272及285;272及286;272及287;272及288;272及289;272及290;272及291;272及292;273及274;273及275;273及276;273及277;273及278;273及279;273及280;273及281;273及282;273及283;273及284;273及285;273及286;273及287;273及288;273及289;273及290;273及291;273及292;274及275;274及276;274及277;274及278;274及279;274及280;274及281;274及282;274及283;274及284;274及285;274及286;274及287;274及288;274及289;274及290;274及291;274及292;275及276;275及277;275及278;275及279;275及280;275及281;275及282;275及283;275及284;275及285;275及286;275及287;275及288;275及289;275及290;275及291;275及292;276及277;276及278;276及279;276及280;276及281;276及282;276及283;276及284;276及285;276及286;276及287;276及288;276及289;276及290;276及291;276及292;277及278;277及279;277及280;277及281;277及282;277及283;277及284;277及285;277及286;277及287;277及288;277及289;277及290;277及291;277及292;278及279;278及280;278及281;278及282;278及283;278及284;278及285;278及286;278及287;278及288;278及289;278及290;278及291;278及292;279及280;279及281;279及282;279及283;279及284;279及285;279及286;279及287;279及288;279及289;279及290;279及291;279及292;280及281;280及282;280及283;280及284;280及285;280及286;280及287;280及288;280及289;280及290;280及291;280及292;281及282;281及283;281及284;281及285;281及286;281及287;281及288;281及289;281及290;281及291;281及292;282及283;282及284;282及285;282及286;282及287;282及288;282及289;282及290;282及291;282及292;283及284;283及285;283及286;283及287;283及288;283及289;283及290;283及291;283及292;284及285;284及286;284及287;284及288;284及289;284及290;284及291;284及292;285及286;285及287;285及288;285及289;285及290;285及291;285及292;286及287;286及288;286及289;286及290;286及291;286及292;287及288;287及289;287及290;287及291;287及292;288及289;288及290;288及291;288及292;289及290;289及291;289及292;290及291;290及292;或291及292;924及270;924及272;924及273;924及274;924及275;924及276;924及277;924及278;924及279;924及280;924及281;924及282;924及283;924及284;924及285;924及286;924及287;924及288;924及289;924及290;924及291;924及292;925及270;925及272;925及273;925及274;925及275;925及276;925及277;925及278;925及279;925及280;925及281;925及282;925及283;925及284;925及285;925及286;925及287;925及288;925及289;925及290;925及291;925及292;926及270;926及272;926及273;926及274;926及275;926及276;926及277;926及278;926及279;926及280;926及281;926及282;926及283;926及284;926及285;926及286;926及287;926及288;926及289;926及290;926及291;926及292;927及270;927及272;927及273;927及274;927及275;927及276;927及277;927及278;927及279;927及280;927及281;927及282;927及283;927及284;927及285;927及286;927及287;927及288;927及289;927及290;927及291;927及292;928及270;928及272;928及273;928及274;928及275;928及276;928及277;928及278;928及279;928及280;928及281;928及282;928及283;928及284;928及285;928及286;928及287;928及288;928及289;928及290;928及291;928及292;929及270;929及272;929及273;929及274;929及275;929及276;929及277;929及278;929及279;929及280;929及281;929及282;929及283;929及284;929及285;929及286;929及287;929及288;929及289;929及290;929及291;929及292;930及270;930及272;930及273;930及274;930及275;930及276;930及277;930及278;930及279;930及280;930及281;930及282;930及283;930及284;930及285;930及286;930及287;930及288;930及289;930及290;930及291;930及292;931及270;931及272;931及273;931及274;931及275;931及276;931及277;931及278;931及279;931及280;931及281;931及282;931及283;931及284;931及285;931及286;931及287;931及288;931及289;931及290;931及291;931及292;932及270;932及272;932及273;932及274;932及275;932及276;932及277;932及278;932及279;932及280;932及281;932及282;932及283;932及284;932及285;932及286;932及287;932及288;932及289;932及290;932及291;932及292;933及270;933及272;933及273;933及274;933及275;933及276;933及277;933及278;933及279;933及280;933及281;933及282;933及283;933及284;933及285;933及286;933及287;933及288;933及289;933及290;933及291;933及292;934及270;934及272;934及273;934及274;934及275;934及276;934及277;934及278;934及279;934及280;934及281;934及282;934及283;934及284;934及285;934及286;934及287;934及288;934及289;934及290;934及291;934及292;935及270;935及272;935及273;935及274;935及275;935及276;935及277;935及278;935及279;935及280;935及281;935及282;935及283;935及284;935及285;935及286;935及287;935及288;935及289;935及290;935及291;935及292;936及270;936及272;936及273;936及274;936及275;936及276;936及277;936及278;936及279;936及280;936及281;936及282;936及283;936及284;936及285;936及286;936及287;936及288;936及289;936及290;936及291;936及292;937及270;937及272;937及273;937及274;937及275;937及276;937及277;937及278;937及279;937及280;937及281;937及282;937及283;937及284;937及285;937及286;937及287;937及288;937及289;937及290;937及291;937及292;938及270;938及272;938及273;938及274;938及275;938及276;938及277;938及278;938及279;938及280;938及281;938及282;938及283;938及284;938及285;938及286;938及287;938及288;938及289;938及290;938及291;938及292;950及275;951及275;952及275;953及275;954及275;或955及275; g.對於具有SluCas9之外顯子44:SEQ ID NO: 200及203;200及204;202及203;202及205;202及206;202及207;204及208;204及205;204及206;204及207;或204及208; h.對於具有SluCas9之外顯子50:SEQ ID NO: 231及232;231及234;231及236;231及237;236及233;236及235;236及238;236及240;或236及241; i.對於具有SaCas9之外顯子53:SEQ ID NO: 86及96;87及96;88及97;89及96;90及97;92及77;92及78;92及96;92及99;93及98;93及102;94及100;95及77;95及78;95及99;96及100;97及98;97及102;98及73;或102及73;及 j.對於具有SluCas9之外顯子53:SEQ ID NO: 278及290;278及292;281及291;283及290;283及292;287及291;272及290;290及291;或272及292。
- 一種組合物,其包含:一或多個編碼以下之核酸分子: a. SaCas9或SluCas9;及 b.第一嚮導序列及第二嚮導序列,其中該第一嚮導序列及該第二嚮導序列係選自以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO: 1及SEQ ID NO: 3;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 17;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 18;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 19;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 16及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 18;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 19;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 17及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 19;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 25;SEQ ID NO: 18及SEQ ID NO: 26;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 20;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 21;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 22;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 23;SEQ ID NO: 19及SEQ ID NO: 24;SEQ ID NO: 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NO: 287及SEQ ID NO: 932;SEQ ID NO: 287及SEQ ID NO: 933;SEQ ID NO: 287及SEQ ID NO: 934;SEQ ID NO: 287及SEQ ID NO: 935;SEQ ID NO: 287及SEQ ID NO: 936;SEQ ID NO: 287及SEQ ID NO: 937;SEQ ID NO: 287及SEQ ID NO: 938;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 924;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 925;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 926;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 927;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 928;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 929;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 930;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 931;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 932;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 933;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 934;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 935;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 936;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 937;SEQ ID NO: 288及SEQ ID NO: 938;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 924;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 925;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 926;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 927;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 928;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 929;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 930;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 931;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 932;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 933;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 934;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 935;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 936;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 937;SEQ ID NO: 289及SEQ ID NO: 938;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 924;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 925;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 926;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 927;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 928;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 929;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 930;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 931;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 932;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 933;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 934;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 935;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 936;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 937;SEQ ID NO: 290及SEQ ID NO: 938;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 924;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 925;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 926;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 927;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 928;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 929;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 930;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 931;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 932;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 933;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 934;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 935;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 936;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 937;SEQ ID NO: 291及SEQ ID NO: 938;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 924;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 925;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 926;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 927;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 928;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 929;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 930;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 931;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 932;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 933;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 934;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 935;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 936;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 937;SEQ ID NO: 292及SEQ ID NO: 938;SEQ ID NO: 950及SEQ ID NO: 275;SEQ ID NO: 951及SEQ ID NO: 275;SEQ ID NO: 952及SEQ ID NO: 275;SEQ ID NO: 953及SEQ ID NO: 275;SEQ ID NO: 954及SEQ ID NO: 275;或SEQ ID NO: 955及SEQ ID NO: 275。
- 一種組合物,其包含: a.單個核酸分子,該核酸分子包含: i.編碼金黃葡萄球菌( Staphylococcus aureus) Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌( Staphylococcus lugdunensis) (SluCas9)及至少一個、至少兩個或至少三個嚮導RNA的核酸;或 ii.編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)及一至n個嚮導RNA的核酸,其中n不超過可自該核酸表現之嚮導RNA的最大數目;或 iii.編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)及1、2或3個嚮導RNA的核酸; 其中各嚮導RNA係選自 表 6,視情況其中該組合物包含至少一對嚮導RNA,其中該至少一對係選自 表 1B、 1D、 3B、 3D、 5B或 5D中所示之成對;或 b.兩個核酸分子,其包含: i.編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)的第一核酸;及 不編碼SaCas9或SluCas9但編碼以下中之任一者的第二核酸: 1.至少一個、至少兩個、至少三個、至少四個、至少五個或至少六個嚮導RNA;或 2.一至n個嚮導RNA,其中n不超過可自該核酸表現之嚮導RNA的最大數目;或 3.一至六個嚮導RNA;或 ii.編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)的第一核酸;及 1.至少一個、至少兩個或至少三個嚮導RNA;或 2.一至n個嚮導RNA,其中n不超過可自該核酸表現之嚮導RNA的最大數目;或 3. 1、2或3個嚮導RNA;及 不編碼SaCas9或SluCas9的第二核酸,視情況其中該第二核酸包含以下中之任一者: 1.至少一個、至少兩個、至少三個、至少四個、至少五個或至少六個嚮導RNA;或 2.一至n個嚮導RNA,其中n不超過可自該核酸表現之嚮導RNA的最大數目;或 3.一至六個嚮導RNA;或 iii.編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)及至少一個、至少兩個或至少三個嚮導RNA的第一核酸;及 不編碼SaCas9或SluCas9但編碼一至六個嚮導RNA的第二核酸;或 iv.編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)或路鄧葡萄球菌(SluCas9)及至少兩個嚮導RNA之第一核酸,其中該至少兩個嚮導RNA之第一嚮導RNA結合在目標序列之上游且該至少兩個嚮導RNA之第二嚮導RNA結合在該目標序列之下游;及 不編碼SaCas9或SluCas9但編碼該第一核酸中所編碼之各嚮導RNA之至少一個其他複本的第二核酸; 其中各嚮導RNA係選自 表 6,視情況其中該組合物包含至少一對嚮導RNA,其中該至少一對係選自 表 1B 、 1D 、 3B 、 3D 、 5B 或 5D中所示之成對。
- 如請求項1至4中任一項之組合物,其包含一對嚮導RNA,其中該成對嚮導RNA能夠自DMD基因中切除DNA片段;其中該DNA片段之長度在5至250個核苷酸之間。
- 如請求項5之組合物,其中切除的DNA片段不包含該DMD基因之完整外顯子。
- 一種組合物,其包含編碼一對嚮導RNA及Cas9的單個核酸分子,其中該單個核酸分子包含: a.編碼該成對嚮導RNA之第一核酸,其中該成對嚮導RNA包含以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO: 1及3;16及17;16及18;16及19;16及20;16及21;16及22;16及23;16及24;16及25;16及26;17及18;17及19;17及20;17及21;17及22;17及23;17及24;17及25;17及26;18及19;18及20;18及21;18及22;18及23;18及24;18及25;18及26;19及20;19及21;19及22;19及23;19及24;19及25;19及26;20及21;20及22;20及23;20及24;20及25;20及26;21及22;21及23;21及24;21及25;21及26;22及23;22及24;22及25;22及26;23及24;23及25;23及26;24及25;24及26;25及26;110及120;110及121;110及122;110及123;110及124;110及125;111及112;111及113;111及114;111及115;111及116;111及117;111及118;111及119;111及120;111及121;111及122;111及123;111及124;111及125;112及113;112及114;112及115;112及116;112及117;112及118;112及119;112及120;112及121;112及122;112及123;112及124;112及125;113及114;113及115;113及116;113及117;113及118;113及119;113及120;113及121;113及122;113及123;113及124;113及125;114及115;114及116;114及117;114及118;114及119;114及120;114及121;114及122;114及123;114及124;114及125;115及116;115及117;115及118;115及119;115及120;115及121;115及122;115及123;115及124;115及125;116及117;116及118;116及119;116及120;116及121;116及122;116及123;116及124;116及125;117及118;117及119;117及120;117及121;117及122;117及123;117及124;117及125;118及119;118及120;118及121;118及122;118及123;118及124;118及125;119及120;119及121;119及122;119及123;119及124;119及125;120及121;120及122;120及123;120及124;120及125;121及122;121及123;121及124;121及125;122及123;122及124;122及125;123及124;123及125;124及125;148及149;148及150;148及151;148及152;148及153;148及154;148及155;148及156;148及157;148及158;148及159;149及150;149及151;149及152;149及153;149及154;149及155;149及156;149及157;149及158;149及159;150及151;150及152;150及153;150及154;150及155;150及156;150及157;150及158;150及159;151及152;151及153;151及154;151及155;151及156;151及157;151及158;151及159;152及153;152及154;152及155;152及156;152及157;152及158;152及159;153及154;153及155;153及156;153及157;153及158;153及159;154及155;154及156;154及157;154及158;154及159;155及156;155及157;155及158;155及159;156及157;156及158;156及159;157及158;157及159;158及159;71及72;71及73;71及74;71及75;71及76;71及77;71及78;71及84;71及85;71及86;71及87;71及88;71及89;71及90;71及91;71及92;71及93;71及94;71及95;71及96;71及97;71及98;71及99;71及100;71及101;71及102;72及73;72及74;72及75;72及76;72及77;72及78;72及84;72及85;72及86;72及87;72及88;72及89;72及90;72及91;72及92;72及93;72及94;72及95;72及96;72及97;72及98;72及99;72及100;72及101;72及102;73及74;73及75;73及76;73及77;73及78;73及84;73及85;73及86;73及87;73及88;73及89;73及90;73及91;73及92;73及93;73及94;73及95;73及96;73及97;73及98;73及99;73及100;73及101;73及102;74及75;74及76;74及77;74及78;74及84;74及85;74及86;74及87;74及88;74及89;74及90;74及91;74及92;74及93;74及94;74及95;74及96;74及97;74及98;74及99;74及100;74及101;74及102;75及76;75及77;75及78;75及84;75及85;75及86;75及87;75及88;75及89;75及90;75及91;75及92;75及93;75及94;75及95;75及96;75及97;75及98;75及99;75及100;75及101;75及102;76及77;76及78;76及84;76及85;76及86;76及87;76及88;76及89;76及90;76及91;76及92;76及93;76及94;76及95;76及96;76及97;76及98;76及99;76及100;76及101;76及102;77及78;77及84;77及85;77及86;77及87;77及88;77及89;77及90;77及91;77及92;77及93;77及94;77及95;77及96;77及97;77及98;77及99;77及100;77及101;77及102;78及84;78及85;78及86;78及87;78及88;78及89;78及90;78及91;78及92;78及93;78及94;78及95;78及96;78及97;78及98;78及99;78及100;78及101;78及102;84及85;84及86;84及87;84及88;84及89;84及90;84及91;84及92;84及93;84及94;84及95;84及96;84及97;84及98;84及99;84及100;84及101;84及102;85及86;85及87;85及88;85及89;85及90;85及91;85及92;85及93;85及94;85及95;85及96;85及97;85及98;85及99;85及100;85及101;85及102;86及87;86及88;86及89;86及90;86及91;86及92;86及93;86及94;86及95;86及96;86及97;86及98;86及99;86及100;86及101;86及102;87及88;87及89;87及90;87及91;87及92;87及93;87及94;87及95;87及96;87及97;87及98;87及99;87及100;87及101;87及102;88及89;88及90;88及91;88及92;88及93;88及94;88及95;88及96;88及97;88及98;88及99;88及100;88及101;88及102;89及90;89及91;89及92;89及93;89及94;89及95;89及96;89及97;89及98;89及99;89及100;89及101;89及102;90及91;90及92;90及93;90及94;90及95;90及96;90及97;90及98;90及99;90及100;90及101;90及102;91及92;91及93;91及94;91及95;91及96;91及97;91及98;91及99;91及100;91及101;91及102;92及93;92及94;92及95;92及96;92及97;92及98;92及99;92及100;92及101;92及102;93及94;93及95;93及96;93及97;93及98;93及99;93及100;93及101;93及102;94及95;94及96;94及97;94及98;94及99;94及100;94及101;94及102;95及96;95及97;95及98;95及99;95及100;95及101;95及102;96及97;96及98;96及99;96及100;96及101;96及102;97及98;97及99;97及100;97及101;97及102;98及99;98及100;98及101;98及102;99及100;99及101;99及102;100及101;100及102;或101及102;及編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)的第二核酸;或 b.編碼一對嚮導RNA之第一核酸,其中該成對嚮導RNA包含以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO: 200及201;200及202;200及203;200及204;200及205;200及206;200及207;200及208;201及202;201及203;201及204;201及205;201及206;201及207;201及208;202及203;202及204;202及205;202及206;202及207;202及208;203及204;203及205;203及206;203及207;203及208;204及205;204及206;204及207;204及208;205及206;205及207;205及208;206及207;206及208;207及208;231及232;231及233;231及234;231及235;231及236;231及237;231及238;231及239;231及240;231及241;231及242;232及233;232及234;232及235;232及236;232及237;232及238;232及239;232及240;232及241;232及242;233及234;233及235;233及236;233及237;233及238;233及239;233及240;233及241;233及242;234及235;234及236;234及237;234及238;234及239;234及240;234及241;234及242;235及236;235及237;235及238;235及239;235及240;235及241;235及242;236及237;236及238;236及239;236及240;236及241;236及242;237及238;237及239;237及240;237及241;237及242;238及239;238及240;238及241;238及242;239及240;239及241;239及242;240及241;240及242;241及242;270及271;270及272;270及273;270及274;270及275;270及276;270及277;270及278;270及279;270及280;270及281;270及282;270及283;270及284;270及285;270及286;270及287;270及288;270及289;270及290;270及291;270及292;271及272;271及273;271及274;271及275;271及276;271及277;271及278;271及279;271及280;271及281;271及282;271及283;271及284;271及285;271及286;271及287;271及288;271及289;271及290;271及291;271及292;272及273;272及274;272及275;272及276;272及277;272及278;272及279;272及280;272及281;272及282;272及283;272及284;272及285;272及286;272及287;272及288;272及289;272及290;272及291;272及292;273及274;273及275;273及276;273及277;273及278;273及279;273及280;273及281;273及282;273及283;273及284;273及285;273及286;273及287;273及288;273及289;273及290;273及291;273及292;274及275;274及276;274及277;274及278;274及279;274及280;274及281;274及282;274及283;274及284;274及285;274及286;274及287;274及288;274及289;274及290;274及291;274及292;275及276;275及277;275及278;275及279;275及280;275及281;275及282;275及283;275及284;275及285;275及286;275及287;275及288;275及289;275及290;275及291;275及292;276及277;276及278;276及279;276及280;276及281;276及282;276及283;276及284;276及285;276及286;276及287;276及288;276及289;276及290;276及291;276及292;277及278;277及279;277及280;277及281;277及282;277及283;277及284;277及285;277及286;277及287;277及288;277及289;277及290;277及291;277及292;278及279;278及280;278及281;278及282;278及283;278及284;278及285;278及286;278及287;278及288;278及289;278及290;278及291;278及292;279及280;279及281;279及282;279及283;279及284;279及285;279及286;279及287;279及288;279及289;279及290;279及291;279及292;280及281;280及282;280及283;280及284;280及285;280及286;280及287;280及288;280及289;280及290;280及291;280及292;281及282;281及283;281及284;281及285;281及286;281及287;281及288;281及289;281及290;281及291;281及292;282及283;282及284;282及285;282及286;282及287;282及288;282及289;282及290;282及291;282及292;283及284;283及285;283及286;283及287;283及288;283及289;283及290;283及291;283及292;284及285;284及286;284及287;284及288;284及289;284及290;284及291;284及292;285及286;285及287;285及288;285及289;285及290;285及291;285及292;286及287;286及288;286及289;286及290;286及291;286及292;287及288;287及289;287及290;287及291;287及292;288及289;288及290;288及291;288及292;289及290;289及291;289及292;290及291;290及292;291及292;924及270;924及272;924及273;924及274;924及275;924及276;924及277;924及278;924及279;924及280;924及281;924及282;924及283;924及284;924及285;924及286;924及287;924及288;924及289;924及290;924及291;924及292;925及270;925及272;925及273;925及274;925及275;925及276;925及277;925及278;925及279;925及280;925及281;925及282;925及283;925及284;925及285;925及286;925及287;925及288;925及289;925及290;925及291;925及292;926及270;926及272;926及273;926及274;926及275;926及276;926及277;926及278;926及279;926及280;926及281;926及282;926及283;926及284;926及285;926及286;926及287;926及288;926及289;926及290;926及291;926及292;927及270;927及272;927及273;927及274;927及275;927及276;927及277;927及278;927及279;927及280;927及281;927及282;927及283;927及284;927及285;927及286;927及287;927及288;927及289;927及290;927及291;927及292;928及270;928及272;928及273;928及274;928及275;928及276;928及277;928及278;928及279;928及280;928及281;928及282;928及283;928及284;928及285;928及286;928及287;928及288;928及289;928及290;928及291;928及292;929及270;929及272;929及273;929及274;929及275;929及276;929及277;929及278;929及279;929及280;929及281;929及282;929及283;929及284;929及285;929及286;929及287;929及288;929及289;929及290;929及291;929及292;930及270;930及272;930及273;930及274;930及275;930及276;930及277;930及278;930及279;930及280;930及281;930及282;930及283;930及284;930及285;930及286;930及287;930及288;930及289;930及290;930及291;930及292;931及270;931及272;931及273;931及274;931及275;931及276;931及277;931及278;931及279;931及280;931及281;931及282;931及283;931及284;931及285;931及286;931及287;931及288;931及289;931及290;931及291;931及292;932及270;932及272;932及273;932及274;932及275;932及276;932及277;932及278;932及279;932及280;932及281;932及282;932及283;932及284;932及285;932及286;932及287;932及288;932及289;932及290;932及291;932及292;933及270;933及272;933及273;933及274;933及275;933及276;933及277;933及278;933及279;933及280;933及281;933及282;933及283;933及284;933及285;933及286;933及287;933及288;933及289;933及290;933及291;933及292;934及270;934及272;934及273;934及274;934及275;934及276;934及277;934及278;934及279;934及280;934及281;934及282;934及283;934及284;934及285;934及286;934及287;934及288;934及289;934及290;934及291;934及292;935及270;935及272;935及273;935及274;935及275;935及276;935及277;935及278;935及279;935及280;935及281;935及282;935及283;935及284;935及285;935及286;935及287;935及288;935及289;935及290;935及291;935及292;936及270;936及272;936及273;936及274;936及275;936及276;936及277;936及278;936及279;936及280;936及281;936及282;936及283;936及284;936及285;936及286;936及287;936及288;936及289;936及290;936及291;936及292;937及270;937及272;937及273;937及274;937及275;937及276;937及277;937及278;937及279;937及280;937及281;937及282;937及283;937及284;937及285;937及286;937及287;937及288;937及289;937及290;937及291;937及292;938及270;938及272;938及273;938及274;938及275;938及276;938及277;938及278;938及279;938及280;938及281;938及282;938及283;938及284;938及285;938及286;938及287;938及288;938及289;938及290;938及291;938及292;950及275;951及275;952及275;953及275;954及275;或955及275;及編碼路鄧葡萄球菌(SluCas9)之第二核酸;或 c.編碼一對嚮導RNA之第一核酸,其中該成對嚮導RNA包含靶向外顯子44之以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO: 200及203;200及204;202及203;202及205;202及206;202及207;204及208;204及205;204及206;204及207;或204及208;及編碼路鄧葡萄球菌(SluCas9)之第二核酸;或 d.編碼一對嚮導RNA之第一核酸,其中該成對嚮導RNA包含靶向外顯子50之以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO: 231及232;231及234;231及236;231及237;236及233;236及235;236及238;236及240;或236及241;及編碼路鄧葡萄球菌(SluCas9)之第二核酸;或 e.編碼一對嚮導RNA之第一核酸,其中該成對嚮導RNA包含靶向外顯子53之以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO: 86及96;87及96;88及97;89及96;90及97;92及77;92及78;92及96;92及99;93及98;93及102;94及100;95及77;95及78;95及99;96及100;97及98;97及102;98及73或102及73;及編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)的第二核酸;或 f.編碼一對嚮導RNA之第一核酸,其中該成對嚮導RNA包含靶向外顯子53之以下任何一對嚮導序列:SEQ ID NO: 278及290;278及292;281及291;283及290;283及292;287及291;272及290;290及291;或272及292;及編碼路鄧葡萄球菌(SluCas9)之第二核酸。
- 一種組合物,其包含一或多個編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)及第一嚮導RNA及第二嚮導RNA之核酸分子,其中該第一嚮導RNA及該第二嚮導RNA靶向DMD基因中之不同序列,且其中該第一嚮導RNA及該第二嚮導RNA各自包含與選自以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者的第一嚮導序列及第二嚮導序列至少90%一致的序列: a.靶向外顯子53之以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者:SEQ ID NO: 86及96;87及96;88及97;89及96;90及97;92及77;92及78;92及96;92及99;93及98;93及102;94及100;95及77;95及78;95及99;96及100;97及98;97及102;98及73;或102及73。
- 一種組合物,其包含一或多個編碼路鄧葡萄球菌(SluCas9)及第一嚮導RNA及第二嚮導RNA之核酸分子,其中該第一嚮導RNA及該第二嚮導RNA靶向DMD基因中之不同序列,且其中該第一嚮導RNA及該第二嚮導RNA各自包含與選自以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者的第一嚮導序列及第二嚮導序列至少90%一致的序列: a.靶向外顯子44之以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者:SEQ ID NO: 200及203;200及204;202及203;202及205;202及206;202及207;204及208;204及205;204及206;204及207;或204及208; b.靶向外顯子50之以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者:SEQ ID NO: 231及232;231及234;231及236;231及237;236及233;236及235;236及238;236及240;或236及241; c.靶向外顯子53之以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者:SEQ ID NO: 278及290;278及292;281及291;283及290;283及292;287及291;272及290;290及291;或272及292。
- 一種組合物,其包含一或多個編碼核酸內切酶及至少兩個嚮導RNA之核酸分子,其中該至少兩個嚮導RNA各自靶向DMD基因中之不同序列,且其中該至少兩個嚮導RNA各自包含與選自以下成對之第一嚮導序列及第二嚮導序列中之任一者之第一嚮導序列及第二嚮導序列至少90%一致的序列: a.對於外顯子44:SEQ ID NO: 1及3;110及120;110及121;110及122;110及123;110及124;110及125;111及112;111及113;111及114;111及115;111及116;111及117;111及118;111及119;111及120;111及121;111及122;111及123;111及124;111及125;112及113;112及114;112及115;112及116;112及117;112及118;112及119;112及120;112及121;112及122;112及123;112及124;112及125;113及114;113及115;113及116;113及117;113及118;113及119;113及120;113及121;113及122;113及123;113及124;113及125;114及115;114及116;114及117;114及118;114及119;114及120;114及121;114及122;114及123;114及124;114及125;115及116;115及117;115及118;115及119;115及120;115及121;115及122;115及123;115及124;115及125;116及117;116及118;116及119;116及120;116及121;116及122;116及123;116及124;116及125;117及118;117及119;117及120;117及121;117及122;117及123;117及124;117及125;118及119;118及120;118及121;118及122;118及123;118及124;118及125;119及120;119及121;119及122;119及123;119及124;119及125;120及121;120及122;120及123;120及124;120及125;121及122;121及123;121及124;121及125;122及123;122及124;122及125;123及124;123及125;或124及125; b.對於外顯子50:SEQ ID NO: 148及149;148及150;148及151;148及152;148及153;148及154;148及155;148及156;148及157;148及158;148及159;149及150;149及151;149及152;149及153;149及154;149及155;149及156;149及157;149及158;149及159;150及151;150及152;150及153;150及154;150及155;150及156;150及157;150及158;150及159;151及152;151及153;151及154;151及155;151及156;151及157;151及158;151及159;152及153;152及154;152及155;152及156;152及157;152及158;152及159;153及154;153及155;153及156;153及157;153及158;153及159;154及155;154及156;154及157;154及158;154及159;155及156;155及157;155及158;155及159;156及157;156及158;156及159;157及158;157及159;或158及159; c.對於外顯子53:SEQ ID NO: 16及17;16及18;16及19;16及20;16及21;16及22;16及23;16及24;16及25;16及26;17及18;17及19;17及20;17及21;17及22;17及23;17及24;17及25;17及26;18及19;18及20;18及21;18及22;18及23;18及24;18及25;18及26;19及20;19及21;19及22;19及23;19及24;19及25;19及26;20及21;20及22;20及23;20及24;20及25;20及26;21及22;21及23;21及24;21及25;21及26;22及23;22及24;22及25;22及26;23及24;23及25;23及26;24及25;24及26;25及26;71及72;71及73;71及74;71及75;71及76;71及77;71及78;71及84;71及85;71及86;71及87;71及88;71及89;71及90;71及91;71及92;71及93;71及94;71及95;71及96;71及97;71及98;71及99;71及100;71及101;71及102;72及73;72及74;72及75;72及76;72及77;72及78;72及84;72及85;72及86;72及87;72及88;72及89;72及90;72及91;72及92;72及93;72及94;72及95;72及96;72及97;72及98;72及99;72及100;72及101;72及102;73及74;73及75;73及76;73及77;73及78;73及84;73及85;73及86;73及87;73及88;73及89;73及90;73及91;73及92;73及93;73及94;73及95;73及96;73及97;73及98;73及99;73及100;73及101;73及102;74及75;74及76;74及77;74及78;74及84;74及85;74及86;74及87;74及88;74及89;74及90;74及91;74及92;74及93;74及94;74及95;74及96;74及97;74及98;74及99;74及100;74及101;74及102;75及76;75及77;75及78;75及84;75及85;75及86;75及87;75及88;75及89;75及90;75及91;75及92;75及93;75及94;75及95;75及96;75及97;75及98;75及99;75及100;75及101;75及102;76及77;76及78;76及84;76及85;76及86;76及87;76及88;76及89;76及90;76及91;76及92;76及93;76及94;76及95;76及96;76及97;76及98;76及99;76及100;76及101;76及102;77及78;77及84;77及85;77及86;77及87;77及88;77及89;77及90;77及91;77及92;77及93;77及94;77及95;77及96;77及97;77及98;77及99;77及100;77及101;77及102;78及84;78及85;78及86;78及87;78及88;78及89;78及90;78及91;78及92;78及93;78及94;78及95;78及96;78及97;78及98;78及99;78及100;78及101;78及102;84及85;84及86;84及87;84及88;84及89;84及90;84及91;84及92;84及93;84及94;84及95;84及96;84及97;84及98;84及99;84及100;84及101;84及102;85及86;85及87;85及88;85及89;85及90;85及91;85及92;85及93;85及94;85及95;85及96;85及97;85及98;85及99;85及100;85及101;85及102;86及87;86及88;86及89;86及90;86及91;86及92;86及93;86及94;86及95;86及96;86及97;86及98;86及99;86及100;86及101;86及102;87及88;87及89;87及90;87及91;87及92;87及93;87及94;87及95;87及96;87及97;87及98;87及99;87及100;87及101;87及102;88及89;88及90;88及91;88及92;88及93;88及94;88及95;88及96;88及97;88及98;88及99;88及100;88及101;88及102;89及90;89及91;89及92;89及93;89及94;89及95;89及96;89及97;89及98;89及99;89及100;89及101;89及102;90及91;90及92;90及93;90及94;90及95;90及96;90及97;90及98;90及99;90及100;90及101;90及102;91及92;91及93;91及94;91及95;91及96;91及97;91及98;91及99;91及100;91及101;91及102;92及93;92及94;92及95;92及96;92及97;92及98;92及99;92及100;92及101;92及102;93及94;93及95;93及96;93及97;93及98;93及99;93及100;93及101;93及102;94及95;94及96;94及97;94及98;94及99;94及100;94及101;94及102;95及96;95及97;95及98;95及99;95及100;95及101;95及102;96及97;96及98;96及99;96及100;96及101;96及102;97及98;97及99;97及100;97及101;97及102;98及99;98及100;98及101;98及102;99及100;99及101;99及102;100及101;100及102;或101及102;及 編碼SaCas9之第二核酸。
- 一種組合物,其包含第一核酸分子及第二核酸分子,其中該第一核酸分子編碼金黃葡萄球菌Cas9 (SaCas9)核酸內切酶及視情況第一嚮導RNA或第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,且該第二核酸分子包含第一嚮導RNA或第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,其中該第一嚮導RNA包含來自以下成對之第一序列及第二序列中之任一者的第一序列且該第二嚮導RNA包含來自以下成對之第一序列及第二序列中之任一者的第二序列:SEQ ID NO: 1及3;6及17;16及18;16及19;16及20;16及21;16及22;16及23;16及24;16及25;16及26;17及18;17及19;17及20;17及21;17及22;17及23;17及24;17及25;17及26;18及19;18及20;18及21;18及22;18及23;18及24;18及25;18及26;19及20;19及21;19及22;19及23;19及24;19及25;19及26;20及21;20及22;20及23;20及24;20及25;20及26;21及22;21及23;21及24;21及25;21及26;22及23;22及24;22及25;22及26;23及24;23及25;23及26;24及25;24及26;25及26;110及120;110及121;110及122;110及123;110及124;110及125;111及112;111及113;111及114;111及115;111及116;111及117;111及118;111及119;111及120;111及121;111及122;111及123;111及124;111及125;112及113;112及114;112及115;112及116;112及117;112及118;112及119;112及120;112及121;112及122;112及123;112及124;112及125;113及114;113及115;113及116;113及117;113及118;113及119;113及120;113及121;113及122;113及123;113及124;113及125;114及115;114及116;114及117;114及118;114及119;114及120;114及121;114及122;114及123;114及124;114及125;115及116;115及117;115及118;115及119;115及120;115及121;115及122;115及123;115及124;115及125;116及117;116及118;116及119;116及120;116及121;116及122;116及123;116及124;116及125;117及118;117及119;117及120;117及121;117及122;117及123;117及124;117及125;118及119;118及120;118及121;118及122;118及123;118及124;118及125;119及120;119及121;119及122;119及123;119及124;119及125;120及121;120及122;120及123;120及124;120及125;121及122;121及123;121及124;121及125;122及123;122及124;122及125;123及124;123及125;124及125;148及149;148及150;148及151;148及152;148及153;148及154;148及155;148及156;148及157;148及158;148及159;149及150;149及151;149及152;149及153;149及154;149及155;149及156;149及157;149及158;149及159;150及151;150及152;150及153;150及154;150及155;150及156;150及157;150及158;150及159;151及152;151及153;151及154;151及155;151及156;151及157;151及158;151及159;152及153;152及154;152及155;152及156;152及157;152及158;152及159;153及154;153及155;153及156;153及157;153及158;153及159;154及155;154及156;154及157;154及158;154及159;155及156;155及157;155及158;155及159;156及157;156及158;156及159;157及158;157及159;158及159;71及72;71及73;71及74;71及75;71及76;71及77;71及78;71及84;71及85;71及86;71及87;71及88;71及89;71及90;71及91;71及92;71及93;71及94;71及95;71及96;71及97;71及98;71及99;71及100;71及101;71及102;72及73;72及74;72及75;72及76;72及77;72及78;72及84;72及85;72及86;72及87;72及88;72及89;72及90;72及91;72及92;72及93;72及94;72及95;72及96;72及97;72及98;72及99;72及100;72及101;72及102;73及74;73及75;73及76;73及77;73及78;73及84;73及85;73及86;73及87;73及88;73及89;73及90;73及91;73及92;73及93;73及94;73及95;73及96;73及97;73及98;73及99;73及100;73及101;73及102;74及75;74及76;74及77;74及78;74及84;74及85;74及86;74及87;74及88;74及89;74及90;74及91;74及92;74及93;74及94;74及95;74及96;74及97;74及98;74及99;74及100;74及101;74及102;75及76;75及77;75及78;75及84;75及85;75及86;75及87;75及88;75及89;75及90;75及91;75及92;75及93;75及94;75及95;75及96;75及97;75及98;75及99;75及100;75及101;75及102;76及77;76及78;76及84;76及85;76及86;76及87;76及88;76及89;76及90;76及91;76及92;76及93;76及94;76及95;76及96;76及97;76及98;76及99;76及100;76及101;76及102;77及78;77及84;77及85;77及86;77及87;77及88;77及89;77及90;77及91;77及92;77及93;77及94;77及95;77及96;77及97;77及98;77及99;77及100;77及101;77及102;78及84;78及85;78及86;78及87;78及88;78及89;78及90;78及91;78及92;78及93;78及94;78及95;78及96;78及97;78及98;78及99;78及100;78及101;78及102;84及85;84及86;84及87;84及88;84及89;84及90;84及91;84及92;84及93;84及94;84及95;84及96;84及97;84及98;84及99;84及100;84及101;84及102;85及86;85及87;85及88;85及89;85及90;85及91;85及92;85及93;85及94;85及95;85及96;85及97;85及98;85及99;85及100;85及101;85及102;86及87;86及88;86及89;86及90;86及91;86及92;86及93;86及94;86及95;86及96;86及97;86及98;86及99;86及100;86及101;86及102;87及88;87及89;87及90;87及91;87及92;87及93;87及94;87及95;87及96;87及97;87及98;87及99;87及100;87及101;87及102;88及89;88及90;88及91;88及92;88及93;88及94;88及95;88及96;88及97;88及98;88及99;88及100;88及101;88及102;89及90;89及91;89及92;89及93;89及94;89及95;89及96;89及97;89及98;89及99;89及100;89及101;89及102;90及91;90及92;90及93;90及94;90及95;90及96;90及97;90及98;90及99;90及100;90及101;90及102;91及92;91及93;91及94;91及95;91及96;91及97;91及98;91及99;91及100;91及101;91及102;92及93;92及94;92及95;92及96;92及97;92及98;92及99;92及100;92及101;92及102;93及94;93及95;93及96;93及97;93及98;93及99;93及100;93及101;93及102;94及95;94及96;94及97;94及98;94及99;94及100;94及101;94及102;95及96;95及97;95及98;95及99;95及100;95及101;95及102;96及97;96及98;96及99;96及100;96及101;96及102;97及98;97及99;97及100;97及101;97及102;98及99;98及100;98及101;98及102;99及100;99及101;99及102;100及101;100及102;或101及102。
- 一種組合物,其包含第一核酸分子及第二核酸分子,其中該第一核酸分子編碼路鄧葡萄球菌(SluCas9)核酸內切酶及視情況第一嚮導RNA或第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,且該第二核酸分子包含第一嚮導RNA或第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,其中該第一嚮導RNA包含來自以下成對之第一序列及第二序列中之任一者的第一序列且該第二嚮導RNA包含來自以下成對之第一序列及第二序列中之任一者的第二序列:SEQ ID NO: 200及201;200及202;200及203;200及204;200及205;200及206;200及207;200及208;201及202;201及203;201及204;201及205;201及206;201及207;201及208;202及203;202及204;202及205;202及206;202及207;202及208;203及204;203及205;203及206;203及207;203及208;204及205;204及206;204及207;204及208;205及206;205及207;205及208;206及207;206及208;207及208;231及232;231及233;231及234;231及235;231及236;231及237;231及238;231及239;231及240;231及241;231及242;232及233;232及234;232及235;232及236;232及237;232及238;232及239;232及240;232及241;232及242;233及234;233及235;233及236;233及237;233及238;233及239;233及240;233及241;233及242;234及235;234及236;234及237;234及238;234及239;234及240;234及241;234及242;235及236;235及237;235及238;235及239;235及240;235及241;235及242;236及237;236及238;236及239;236及240;236及241;236及242;237及238;237及239;237及240;237及241;237及242;238及239;238及240;238及241;238及242;239及240;239及241;239及242;240及241;240及242;241及242;270及271;270及272;270及273;270及274;270及275;270及276;270及277;270及278;270及279;270及280;270及281;270及282;270及283;270及284;270及285;270及286;270及287;270及288;270及289;270及290;270及291;270及292;271及272;271及273;271及274;271及275;271及276;271及277;271及278;271及279;271及280;271及281;271及282;271及283;271及284;271及285;271及286;271及287;271及288;271及289;271及290;271及291;271及292;272及273;272及274;272及275;272及276;272及277;272及278;272及279;272及280;272及281;272及282;272及283;272及284;272及285;272及286;272及287;272及288;272及289;272及290;272及291;272及292;273及274;273及275;273及276;273及277;273及278;273及279;273及280;273及281;273及282;273及283;273及284;273及285;273及286;273及287;273及288;273及289;273及290;273及291;273及292;274及275;274及276;274及277;274及278;274及279;274及280;274及281;274及282;274及283;274及284;274及285;274及286;274及287;274及288;274及289;274及290;274及291;274及292;275及276;275及277;275及278;275及279;275及280;275及281;275及282;275及283;275及284;275及285;275及286;275及287;275及288;275及289;275及290;275及291;275及292;276及277;276及278;276及279;276及280;276及281;276及282;276及283;276及284;276及285;276及286;276及287;276及288;276及289;276及290;276及291;276及292;277及278;277及279;277及280;277及281;277及282;277及283;277及284;277及285;277及286;277及287;277及288;277及289;277及290;277及291;277及292;278及279;278及280;278及281;278及282;278及283;278及284;278及285;278及286;278及287;278及288;278及289;278及290;278及291;278及292;279及280;279及281;279及282;279及283;279及284;279及285;279及286;279及287;279及288;279及289;279及290;279及291;279及292;280及281;280及282;280及283;280及284;280及285;280及286;280及287;280及288;280及289;280及290;280及291;280及292;281及282;281及283;281及284;281及285;281及286;281及287;281及288;281及289;281及290;281及291;281及292;282及283;282及284;282及285;282及286;282及287;282及288;282及289;282及290;282及291;282及292;283及284;283及285;283及286;283及287;283及288;283及289;283及290;283及291;283及292;284及285;284及286;284及287;284及288;284及289;284及290;284及291;284及292;285及286;285及287;285及288;285及289;285及290;285及291;285及292;286及287;286及288;286及289;286及290;286及291;286及292;287及288;287及289;287及290;287及291;287及292;288及289;288及290;288及291;288及292;289及290;289及291;289及292;290及291;290及292;291及292;924及270;924及272;924及273;924及274;924及275;924及276;924及277;924及278;924及279;924及280;924及281;924及282;924及283;924及284;924及285;924及286;924及287;924及288;924及289;924及290;924及291;924及292;925及270;925及272;925及273;925及274;925及275;925及276;925及277;925及278;925及279;925及280;925及281;925及282;925及283;925及284;925及285;925及286;925及287;925及288;925及289;925及290;925及291;925及292;926及270;926及272;926及273;926及274;926及275;926及276;926及277;926及278;926及279;926及280;926及281;926及282;926及283;926及284;926及285;926及286;926及287;926及288;926及289;926及290;926及291;926及292;927及270;927及272;927及273;927及274;927及275;927及276;927及277;927及278;927及279;927及280;927及281;927及282;927及283;927及284;927及285;927及286;927及287;927及288;927及289;927及290;927及291;927及292;928及270;928及272;928及273;928及274;928及275;928及276;928及277;928及278;928及279;928及280;928及281;928及282;928及283;928及284;928及285;928及286;928及287;928及288;928及289;928及290;928及291;928及292;929及270;929及272;929及273;929及274;929及275;929及276;929及277;929及278;929及279;929及280;929及281;929及282;929及283;929及284;929及285;929及286;929及287;929及288;929及289;929及290;929及291;929及292;930及270;930及272;930及273;930及274;930及275;930及276;930及277;930及278;930及279;930及280;930及281;930及282;930及283;930及284;930及285;930及286;930及287;930及288;930及289;930及290;930及291;930及292;931及270;931及272;931及273;931及274;931及275;931及276;931及277;931及278;931及279;931及280;931及281;931及282;931及283;931及284;931及285;931及286;931及287;931及288;931及289;931及290;931及291;931及292;932及270;932及272;932及273;932及274;932及275;932及276;932及277;932及278;932及279;932及280;932及281;932及282;932及283;932及284;932及285;932及286;932及287;932及288;932及289;932及290;932及291;932及292;933及270;933及272;933及273;933及274;933及275;933及276;933及277;933及278;933及279;933及280;933及281;933及282;933及283;933及284;933及285;933及286;933及287;933及288;933及289;933及290;933及291;933及292;934及270;934及272;934及273;934及274;934及275;934及276;934及277;934及278;934及279;934及280;934及281;934及282;934及283;934及284;934及285;934及286;934及287;934及288;934及289;934及290;934及291;934及292;935及270;935及272;935及273;935及274;935及275;935及276;935及277;935及278;935及279;935及280;935及281;935及282;935及283;935及284;935及285;935及286;935及287;935及288;935及289;935及290;935及291;935及292;936及270;936及272;936及273;936及274;936及275;936及276;936及277;936及278;936及279;936及280;936及281;936及282;936及283;936及284;936及285;936及286;936及287;936及288;936及289;936及290;936及291;936及292;937及270;937及272;937及273;937及274;937及275;937及276;937及277;937及278;937及279;937及280;937及281;937及282;937及283;937及284;937及285;937及286;937及287;937及288;937及289;937及290;937及291;937及292;938及270;938及272;938及273;938及274;938及275;938及276;938及277;938及278;938及279;938及280;938及281;938及282;938及283;938及284;938及285;938及286;938及287;938及288;938及289;938及290;938及291;或938及292;950及275;951及275;952及275;953及275;954及275;或955及275。
- 一種組合物,其包含第一核酸分子及第二核酸分子,其中該第一核酸分子編碼sRGN核酸內切酶(例如,sRGN3.1、sRGN3.3或sRGN4)及視情況第一嚮導RNA或第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,且該第二核酸分子包含第一嚮導RNA或第一嚮導RNA及第二嚮導RNA,其中該第一嚮導RNA包含來自以下成對之第一序列及第二序列中之任一者的第一序列且該第二嚮導RNA包含來自以下成對之第一序列及第二序列中之任一者的第二序列:SEQ ID NO: 200及201;200及202;200及203;200及204;200及205;200及206;200及207;200及208;201及202;201及203;201及204;201及205;201及206;201及207;201及208;202及203;202及204;202及205;202及206;202及207;202及208;203及204;203及205;203及206;203及207;203及208;204及205;204及206;204及207;204及208;205及206;205及207;205及208;206及207;206及208;207及208;231及232;231及233;231及234;231及235;231及236;231及237;231及238;231及239;231及240;231及241;231及242;232及233;232及234;232及235;232及236;232及237;232及238;232及239;232及240;232及241;232及242;233及234;233及235;233及236;233及237;233及238;233及239;233及240;233及241;233及242;234及235;234及236;234及237;234及238;234及239;234及240;234及241;234及242;235及236;235及237;235及238;235及239;235及240;235及241;235及242;236及237;236及238;236及239;236及240;236及241;236及242;237及238;237及239;237及240;237及241;237及242;238及239;238及240;238及241;238及242;239及240;239及241;239及242;240及241;240及242;241及242;270及271;270及272;270及273;270及274;270及275;270及276;270及277;270及278;270及279;270及280;270及281;270及282;270及283;270及284;270及285;270及286;270及287;270及288;270及289;270及290;270及291;270及292;271及272;271及273;271及274;271及275;271及276;271及277;271及278;271及279;271及280;271及281;271及282;271及283;271及284;271及285;271及286;271及287;271及288;271及289;271及290;271及291;271及292;272及273;272及274;272及275;272及276;272及277;272及278;272及279;272及280;272及281;272及282;272及283;272及284;272及285;272及286;272及287;272及288;272及289;272及290;272及291;272及292;273及274;273及275;273及276;273及277;273及278;273及279;273及280;273及281;273及282;273及283;273及284;273及285;273及286;273及287;273及288;273及289;273及290;273及291;273及292;274及275;274及276;274及277;274及278;274及279;274及280;274及281;274及282;274及283;274及284;274及285;274及286;274及287;274及288;274及289;274及290;274及291;274及292;275及276;275及277;275及278;275及279;275及280;275及281;275及282;275及283;275及284;275及285;275及286;275及287;275及288;275及289;275及290;275及291;275及292;276及277;276及278;276及279;276及280;276及281;276及282;276及283;276及284;276及285;276及286;276及287;276及288;276及289;276及290;276及291;276及292;277及278;277及279;277及280;277及281;277及282;277及283;277及284;277及285;277及286;277及287;277及288;277及289;277及290;277及291;277及292;278及279;278及280;278及281;278及282;278及283;278及284;278及285;278及286;278及287;278及288;278及289;278及290;278及291;278及292;279及280;279及281;279及282;279及283;279及284;279及285;279及286;279及287;279及288;279及289;279及290;279及291;279及292;280及281;280及282;280及283;280及284;280及285;280及286;280及287;280及288;280及289;280及290;280及291;280及292;281及282;281及283;281及284;281及285;281及286;281及287;281及288;281及289;281及290;281及291;281及292;282及283;282及284;282及285;282及286;282及287;282及288;282及289;282及290;282及291;282及292;283及284;283及285;283及286;283及287;283及288;283及289;283及290;283及291;283及292;284及285;284及286;284及287;284及288;284及289;284及290;284及291;284及292;285及286;285及287;285及288;285及289;285及290;285及291;285及292;286及287;286及288;286及289;286及290;286及291;286及292;287及288;287及289;287及290;287及291;287及292;288及289;288及290;288及291;288及292;289及290;289及291;289及292;290及291;290及292;291及292;924及270;924及272;924及273;924及274;924及275;924及276;924及277;924及278;924及279;924及280;924及281;924及282;924及283;924及284;924及285;924及286;924及287;924及288;924及289;924及290;924及291;924及292;925及270;925及272;925及273;925及274;925及275;925及276;925及277;925及278;925及279;925及280;925及281;925及282;925及283;925及284;925及285;925及286;925及287;925及288;925及289;925及290;925及291;925及292;926及270;926及272;926及273;926及274;926及275;926及276;926及277;926及278;926及279;926及280;926及281;926及282;926及283;926及284;926及285;926及286;926及287;926及288;926及289;926及290;926及291;926及292;927及270;927及272;927及273;927及274;927及275;927及276;927及277;927及278;927及279;927及280;927及281;927及282;927及283;927及284;927及285;927及286;927及287;927及288;927及289;927及290;927及291;927及292;928及270;928及272;928及273;928及274;928及275;928及276;928及277;928及278;928及279;928及280;928及281;928及282;928及283;928及284;928及285;928及286;928及287;928及288;928及289;928及290;928及291;928及292;929及270;929及272;929及273;929及274;929及275;929及276;929及277;929及278;929及279;929及280;929及281;929及282;929及283;929及284;929及285;929及286;929及287;929及288;929及289;929及290;929及291;929及292;930及270;930及272;930及273;930及274;930及275;930及276;930及277;930及278;930及279;930及280;930及281;930及282;930及283;930及284;930及285;930及286;930及287;930及288;930及289;930及290;930及291;930及292;931及270;931及272;931及273;931及274;931及275;931及276;931及277;931及278;931及279;931及280;931及281;931及282;931及283;931及284;931及285;931及286;931及287;931及288;931及289;931及290;931及291;931及292;932及270;932及272;932及273;932及274;932及275;932及276;932及277;932及278;932及279;932及280;932及281;932及282;932及283;932及284;932及285;932及286;932及287;932及288;932及289;932及290;932及291;932及292;933及270;933及272;933及273;933及274;933及275;933及276;933及277;933及278;933及279;933及280;933及281;933及282;933及283;933及284;933及285;933及286;933及287;933及288;933及289;933及290;933及291;933及292;934及270;934及272;934及273;934及274;934及275;934及276;934及277;934及278;934及279;934及280;934及281;934及282;934及283;934及284;934及285;934及286;934及287;934及288;934及289;934及290;934及291;934及292;935及270;935及272;935及273;935及274;935及275;935及276;935及277;935及278;935及279;935及280;935及281;935及282;935及283;935及284;935及285;935及286;935及287;935及288;935及289;935及290;935及291;935及292;936及270;936及272;936及273;936及274;936及275;936及276;936及277;936及278;936及279;936及280;936及281;936及282;936及283;936及284;936及285;936及286;936及287;936及288;936及289;936及290;936及291;936及292;937及270;937及272;937及273;937及274;937及275;937及276;937及277;937及278;937及279;937及280;937及281;937及282;937及283;937及284;937及285;937及286;937及287;937及288;937及289;937及290;937及291;937及292;938及270;938及272;938及273;938及274;938及275;938及276;938及277;938及278;938及279;938及280;938及281;938及282;938及283;938及284;938及285;938及286;938及287;938及288;938及289;938及290;938及291;938及292;950及275;951及275;952及275;953及275;954及275;或955及275。
- 如請求項13之組合物,其中該sRGN核酸內切酶包含與SEQ ID No: 7024、7026或7027中之任一者之序列至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列。
- 如請求項13或14之組合物,其中該sRGN核酸內切酶由與SEQ ID No: 917、919或920中之任一者之序列至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核酸序列編碼。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA即有助於肌肉萎縮蛋白基因之外顯子45、51或53之3n+1編輯,其中「n」為任何負整數(例如,-10與-75之間的任何整數)。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA即靶向該肌肉萎縮蛋白基因之外顯子45、51或53且能夠切除長度為至少26、29、32、35、38、41、44、47、50、53、56、59、62、65、68、71、74、77、80、83、86、89、92、95、98、101、104、107、110、113、116、119、122、125、128、131、134、137、140、143、146、149、152、155、158、161、164、167、170、173、176、179、182、185、188、191、194、197、200、203、206、209、212、215或218個核苷酸的核酸。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA有助於該肌肉萎縮蛋白基因之外顯子44或50之3n+2編輯,其中「n」為任何負整數(例如,-10與-75之間的任何整數)。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA即靶向該肌肉萎縮蛋白基因之外顯子44或50且能夠切除長度為至少25、28、31、34、37、40、43、46、49、52、55、58、61、64、67、70、73、76、79、82、85、88、91、94、97、100、103、106、109、112、115、118、121、124、127、130、133、136、139、142、145、148、151、154、157、160、163、166、169、172、175、178、181、184、187、190、193、196、199、202、205、208、211、214或217個核苷酸的核酸。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA切除一部分外顯子,其中該外顯子之切除部分的尺寸為5與250個核苷酸之間的長度。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA切除一部分外顯子,其中該外顯子之切除部分的尺寸在5與250、5與200、5與150、5與100、5與75、5與50、5與25、5與10、20與250、20與200、20與150、20與100、20與75、20與50、20與25、50與250、50與200、50與150、50與100及50與75個核苷酸之間。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其包含至少兩個嚮導RNA,其中一旦在活體外或活體內與RNA引導之核酸內切酶組合表現後,該至少兩個嚮導RNA切除一部分外顯子,其中該外顯子之切除部分的尺寸在8與167個核苷酸之間。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA為sgRNA。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA經修飾。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA或核酸處於載體中。
- 如請求項25之組合物,其中該載體為病毒載體。
- 如請求項26之組合物,其中該病毒載體為AAV載體。
- 如請求項27之組合物,其中該AAV載體為AAV9載體。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA之啟動子為hU6c。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA為SaCas9之嚮導RNA,且該一或多個嚮導RNA包含含有SEQ ID NO: 504之序列的支架。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA為SluCas9之嚮導RNA,且該一或多個嚮導RNA包含含有SEQ ID NO: 901之序列的支架。
- 如前述請求項中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA處於AAV載體中,其中該載體相對於正股自5'至3'包含:第一嚮導RNA支架序列之反向互補序列;編碼第一嚮導RNA序列之核酸的反向互補序列;用於表現編碼該第一嚮導RNA序列之核酸之啟動子的反向互補序列;用於表現編碼SaCas9、SluCas9或sRGN之核酸的啟動子(例如,CK8e);編碼aSaCas9、SluCas9或sRGN (例如,sRGN3.1、sRGN3,3或sRGN4)之核酸;聚腺苷酸化序列;與SaCas9、SluCas9或sRGN之啟動子相同方向的用於表現第二嚮導RNA序列之啟動子;第二RNA嚮導序列;及第二嚮導RNA支架序列。
- 如請求項32之組合物,其中: iii)該第一嚮導RNA序列包含SEQ ID NO: 271或281之序列且該第二嚮導RNA序列包含SEQ ID NO: 275之序列;或 iv)該第一嚮導RNA序列包含SEQ ID NO: 283之序列且該第二嚮導RNA序列包含SEQ ID NO: 290之序列。
- 如請求項32或33之組合物,其中用於表現編碼SaCas9、SluCas9或sRGN之核酸的啟動子為用於表現sRGN之啟動子;其中編碼aSaCas9、SluCas9或sRGN之核酸編碼sRGN,且其中該sRGN包含與SEQ ID No: 7024、7026或7027中之任一者之序列至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的胺基酸序列。
- 如請求項34之組合物,其中該sRGN由與SEQ ID No: 917、919或920中之任一者之序列至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%一致的核酸序列編碼。
- 如請求項1至35中任一項之組合物,其中該一或多個嚮導RNA序列、或該成對嚮導RNA之該第一嚮導RNA序列及/或該第二嚮導RNA序列之長度不超過16、不超過17、不超過18、不超過19、不超過20、不超過21或不超過22個核苷酸。
- 一種治療杜興氏肌肉失養症(Duchenne Muscular Dystrophy,DMD)的方法,該方法包含將如請求項1至36中任一項之組合物遞送至細胞。
- 一種切除一部分DMD基因之方法,該方法包含將如請求項1至36中任一項之組合物遞送至細胞,其中切除部分之尺寸小於約250個核苷酸。
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