JP2009091358A - 蛍光性dnaとしてのプテリジンヌクレオチド類似体 - Google Patents

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Abstract

【課題】本発明は、生理学的条件下に高度に蛍光性であり、そして蛍光性オリゴヌクレオチドの化学的合成において使用できる新規なプテリジンヌクレオチドを提供する。
【解決手段】本発明は、1または2以上のプテリジンヌクレオチドを含んでなる蛍光性オリゴヌクレオチドをさらに提供する。さらに、本発明は、DNA 増幅法において構成モノマーとして使用できるプテリジンヌクレオチドトリホスフェートを提供する。
【選択図】なし

Description

本発明は、蛍光性DNA としてのプテリジンヌクレオチド類似体に関する。
合成オリゴヌクレオチドは、ゲノムおよび相補的DNA ライブラリーのスクリーニングのためのプローブとして、DNA 合成、配列決定、および増幅のプライマーとして、そしてDNA −タンパク質の相互作用の研究において、分子生物学において多数の用途を見出す。さらに、オリゴヌクレオチドプローブは、インサイチュ・ハイブリダイゼーションの技術を使用するin vitro遺伝子発現をアッセイするために有用であることが明らかになった。
DNA 配列決定法、蛍光性標識、および検出系における最近の改良は、これらの用途のすべてにおいて蛍光標識化オリゴヌクレオチドの使用を劇的に増加した。典型的には、オリゴヌクレオチドは蛍光性マーカーで、共有結合により直接(例えば、炭素リンカー)標識化するか、または間接的に標識化することができ、間接的標識化において、オリゴヌクレオチドを分子、例えば、ビオチンまたはジオキシゲニンに結合し、次いでこれを蛍光標識化した結合部分(例えば、ストレプチアビジンまたは標識化モノクローナル抗体)にカップリングさせる。
しかしながら、これらの蛍光標識化系は、蛍光性複合体およびそれらの結合部分が比較的大きいという欠点に悩まされる。大きい蛍光標識および関連するリンカーの存在は、配列決定におけるようにゲルを通して、または細胞の種々の区画を通して、オリゴヌクレオチドの移動度を変更することがある。
さらに、これらのマーカーの存在は、化学的相互作用または立体障害を通して、オリゴヌクレオチドと他の分子との相互作用を変更する。したがって、これらのマーカーの存在は、DNA と他の分子、例えば、タンパク質との相互作用の研究を困難とする。タンパク質−DNA の相互作用の研究は、相互作用が生物学における最も基本的メカニズムのあるものを含むので、非常に重要である。相互作用は、例えば、オリゴヌクレオチドの長さに沿ったDNA ポリメラーゼまたは逆転写酵素の進行、AP1またはステロイドホルモン経路におけるように遺伝子転写の活性、またはHIV IN酵素により仲介されるようなウイルスDNA の宿主ゲノムの中への挿入を包含する。これらの理由で、ピリミジンまたはプリンヌクレオチドに構造が類似しかつオリゴヌクレオチドの中に組込むすることができる蛍光性成分を得ることは望ましい。このような成分は、オリゴヌクレオチドの大きさまたは化学的性質を変更しないで、オリゴヌクレオチド分子を蛍光性とすることが好ましい。
ヌクレオチドの多数の類似体が知られている。それらの中にはプテリジン誘導体がある。プリンヌクレオチドに構造的に類似する、これらの産物の合成法はよく知られている。事実、新しい生物学的に活性な化合物を発見する希望をもって、多数のプテリジン由来の類似体が合成されてきている。こうして、Pfleiderer(米国特許第 3,798,210号および米国特許第 3,792,036号)は、抗菌および抗ウイルス特性を有する多数のプテリジン−グリコシドを開示した。しかしながら、Pfleidererはこれらの化合物の蛍光性を研究しなかった。
同様に、Schmidt et al., Chem. Ber. 106 : 1952-1975 (1973)は、1系列のプテリジン誘導体をリボシド化してヌクレオチドグアノシンの構造類似体を生成することを記載しているが、Harris et al., Liebigs Ann. Chem. 1457-1468 (1981)は、アデノシンに構造的に類似するプテリジン誘導体の合成を記載している。再び、いずれの参考文献もヌクレオシドの蛍光性の測定を記載していない。
ルマジン誘導体を組込んだオリゴヌクレオチドの合成は、Bannwarth et al., Helvetica Chimica Acta. 74 : 1991-1999 (1991), Bannwarth et al., Helvetica Chimica Acta. 74 : 2000-2007 (1991)およびBannwarth et al.,(欧州特許出願第 0439036A2号)に記載された。Bannwarth et al.はルマジン誘導体をバソフェナンスロリン−ルテニウム複合体と組み合わせてエネルギー転移系として利用し、ここでルマジン誘導体はエネルギードナーとして作用し、そしてルテニウム複合体はエネルギーレセプターとして作用した。2つの化合物を接近させて蛍光を発生させるとき、エネルギー転移は起こった。この系は2つの基を有する分子の相互作用を研究するのためのメカニズムを提供した。しかしながら、この参考文献はオリゴヌクレオチドにおいてルマジン誘導体を単独で使用することを記載しなかった。さらに、Bannwarth は、ルマジン誘導体の主要な欠点は「・・・ルマジン発色団の長波長の吸収についての比較的低い吸光係数(ε=8900m-1cm-1,324nm, pH6.9) 」であることを認識した。Bannwarth et al., Helv. Chim. Acta. 74 : 1991-1999 (1991) 。
本発明は、プリンヌクレオチドに構造が類似し、通常の生理学的条件下に高度に蛍光性であり、そしてオリゴヌクレオチドの化学的合成において使用するために適当である、多数のプテリジンヌクレオチドを提供することによって、これらの先行技術の制限を克服する。
本発明は、下記の形態のプテリジンヌクレオチドを提供する:
Figure 2009091358
式中、R11はR12と組合わされて二重結合により環の頂点4に結合する単一のオキソ酸素を形成するか、またはR13と結合して環の頂点3と4との間の二重結合を形成し;
12はR3 と組合わされないとき、NH2 、および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択される構成員であり;
13はR11と結合しないとき、低級アルキルまたはHであり;
14はH、低級アルキルまたはフェニルであり;
15はR16と組合わされて二重結合により環の頂点2に結合する単一のオキソ酸素を形成するか、またはR17と結合して環の頂点1と2との間の二重結合を形成し、こうして環の頂点2および4は集合的に最大1つのオキソ酸素を有し;そして
16はR15と組合わされないとき、H、フェニル、NH2 、および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択される構成員である。R15がR16と組合わされないとき、R18はR19と組合わされて二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成する。R15がR16と組合わされるとき、R18はR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そしてR19はHまたは低級アルキルである。R17はR15と結合しないとき、かつR20はR18と結合しないとき、
Figure 2009091358
の化合物であり、式中、記号R21は水素、保護基、またはトリホスフェートを表し;記号R22は水素、ヒドロキシル、または保護基で置換されたヒドロキシルを表し;そしてR23はH、ホスホルアミダイト、H−ホスホネート、メチルホスホネート、ホスホロチオエート、ホスホトリエステル、ヘミスクシネート、固体の支持体に共有結合したヘミスクシネート、ジシクロヘキシルカーボジイミド、および固体の支持体に共有結合したジシクロヘキシルカーボジイミドを表す。R13がHでありかつR23がHであるとき、R21はトリホスフェートであり、そしてR11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成でありかつR23がHであるとき、R21はトリホスフェートである。
これらの化合物は通常の生理学的条件下に高度に蛍光性であり、かつオリゴヌクレオチドの化学的合成において使用するために適当である。本発明は、さらに、これらのプテリジンヌクレオチドを組み込んだオリゴヌクレオチドを提供する。
さらに、本発明は、種々のDNA 増幅法において利用することができるプテリジンヌクレオチドトリホスフェートを提供する。DNA 増幅法において使用するとき、ヌクレオチドトリホスフェートは増幅されたDNA 配列の中に直接組込んでそれを蛍光性とする。これは増幅された生成物の存在または非存在についての急速なアッセイを提供する。
特定の態様の説明
本明細書において使用するとき、用語「低級アルキル」は直鎖状または分枝鎖状であることができる飽和炭化水素(例えば、エチル、イソプロピル、t−アミル、または2,5−ジメチルヘキシル)を意味する。好ましいアルキル基は1〜6個の炭素原子を含有するものである。この明細書および請求の範囲におけるすべての数の範囲は、それらの上限および下限を含むことを意図する。
用語「オリゴヌクレオチド」は、デオキシリボヌクレオチド、リボヌクレオチド、修飾リボヌクレオチド、修飾デオキシリボヌクレオチド、リボヌクレオチド類似体、デオキシリボヌクレオチド類似体、または本発明のプテリジン誘導体を意味する。オリゴヌクレオチドの正確な使用は、多数の因子およびオリゴヌクレオチドの究極の機能または使用に依存する。一般に、化学的に合成したオリゴヌクレオチドは長さが2〜200 塩基の範囲であるが、オリゴヌクレオチドを一緒に結合してより長い配列することができることはよく知られている。本明細書おいて使用するとき、用語「オリゴヌクレオチド」は、また、これらの長い配列を包含する。また、相補的配列とのハイブリダイゼーションによるか、または酵素的にプライマー伸長により、二本鎖ポリヌクレオチドをつくることができることは認識されている。オリゴヌクレオチドという用語は、この出願において使用するとき、一本鎖または二本鎖のオリゴヌクレオチドを包含する。
用語「固体の支持体」は、ポリヌクレオチド合成において使用するモノマーのカップリングを可能とするように官能化されている固体の物質を意味する。固体の支持体は、典型的には、フラノース上の3'−炭素への共有結合を通してヌクレオシドモノマーにカップリングされている。固体の支持体の物質は、典型的には、ポリヌクレオチドの合成の間において非反応性であり、そして成長するポリヌクレオチドを定着する下層を単に提供する。固体の支持体は、ポリアクリロイルモルホリド、シリカ、コントロールされた孔のガラス(CPG)、ポリスチレン、ポリスチレン/ラテックス、およびカルボキシル変性テフロン(登録商標)を包含するが、これらに限定されない。
固相オリゴヌクレオチド合成における用語「切断」は、固体の支持体にオリゴヌクレオチドが結合する結合の破壊を意味する。典型的には、切断は取り付けられたオリゴヌクレオチドの3'−ヒドロキシルと固体の支持体との間のスクシネートエステル結合の加水分解を包含する。
用語「脱保護」は、オリゴヌクレオチドの複素環式塩基の還外アミンからの保護基の除去を意味する。典型的には、脱保護は還外アミンと、アミノ保護基、例えば、ベンゾイル、p−ニトロフェニルオキシカルボニル、ジ−n−ブチルアミノメチリデン、およびジメチルアミノメチレンアミノとから成るアミド部分の加水分解から成る。脱保護という用語は、また、オリゴヌクレオチドのホスフェートジエステル(インタヌクレオチドホスフェート)からの保護基の除去を意味する。このような保護基がメトキシであるとき、「脱保護」は、本明細書おいて使用するとき、それらの除去を包含しないことがある。その代わり、「チオレート」オリゴヌクレオチドの生成のために、標準的チオフェノールを含有する試薬を使用する追加の処理が望ましいことがある。
用語「プテリジンヌクレオチド」または「プテリジンモノマー」は、本明細書において、3'−ホスフェート基をもつ本発明のフラノシルプテリジン誘導体を意味するために使用する。適切に述べると、プテリジンはプリンまたはピリミジンではないので、フラノシルプテリジン誘導体はヌクレオチドではないことが認識される。しかしながら、フラノシルプテリジン誘導体はプリンヌクレオチドに構造的に類似し、そして本発明のフラノシルプテリジンはヌクレオチドと同一の方法で使用されるので、双方をヌクレオチドと呼ぶ。本明細書おいて使用するとき、プテリジンヌクレオチドまたはプテリジンモノマーはポリヌクレオチド合成において使用するために完全に保護することができるか、またはトリホスフェートとしてを使用するとき、またはオリゴヌクレオチドの中に組込むとき、脱保護することができる。
用語「ヌクレオチドモノマー」は、本明細書おいて使用するとき、プテリジンヌクレオチド、「標準的」ヌクレオチド;アデノシン、グアノシン、シチジン、チミジン、およびウラシル、またはこれらのヌクレオチドの誘導体を意味する。このような誘導体は、5−ブロモデオキシシチジン、5−ブロモ−デオキシウリジン、N6−メチル−デオキシアデノシンおよび5−メチル−デオキシシチジンを包含するが、これらに限定されない。
本明細書において使用するとき、用語「保護基」は、分子上の反応性基(例えば、ヒドロキシルまたはアミン)に結合するか、またはそれと置換される基を意味する。保護基は化学反応の1または2以上の段階の間の特定の基の反応を防止するように選択される。一般に、特定の保護基は、後の時間における除去を可能として、分子の中に存在する反応性基を変更しないで反応性基を回復するように選択される。保護基の選択は、保護すべき特定の基およびその基が暴露される化合物の関数である。保護基の選択は当業者によく知られている。参照、例えば、Greene et al., Protective Groups in Organic Synthesis 、第2版、John Wiley & Sons, Inc., Somerset, N. J. (1991) 、これは引用することによって本明細書の一部とされる。
本明細書おいて使用するとき、用語「保護されたアミン」は、アミノ保護基と反応したアミンを意味する。アミノ保護基は、誘導化プテリジンヌクレオチドの合成の間またはそのヌクレオチドを使用するDNA またはRNA の化学的合成の間のアミド官能基の反応を防止する。アミノ保護基は、分子の中に存在他の基を変更しなで、後の時間において除去してアミノ基を回復することかできる。例えば、還外アミンをジメチルホルムアミド−ジエチルアセタールと反応させて、ジメチルアミノメチレンアミノ官能基を形成することができる。アミノ保護基は、一般に、カルバメート、ベンジル基、イミデート、およびこの分野において知られている他の基を包含する。好ましいアミノ保護基は、p−ニトロフェニルエトキシカルボニルまたはジメチルアミノメチレンアミノを包含するが、これらに限定されない。
用語「カップリング」は、一般に、DNA 合成において、1つのヌクレオチドモノマーを他のヌクレオチドモノマーに、またはオリゴヌクレオチドの5’末端に接合することを意味するために使用される。カップリングは、一般に、1つのヌクレオチドモノマーの3'−ホスフェートから第2モノマーまたはオリゴヌクレオチドの5'−ヒドロキシルへのホスホジエステル結合の形成により達成される。カップリングは、また、初期のヌクレオチドの固体の支持体への接合を意味する。
用語「キャッピング」は、縮合できず、次の誘導化されたヌクレオチドと首尾よくカップリングする未反応の5'−ヒドロキシル基をブロックする段階を意味する。これにより、引き続く反応が所望の配列の鎖を拡大することによってのみ進行することが保証される。典型的には、キャッピングは5'−ヒドロキシル官能基のアセチル化を包含する。通常、これは4−ジメチルアミノピリジン(DMAP)により触媒された酸無水物により達成される。当業者に知られている他の試薬は適当である。
用語「合成サイクル」は、合成されるオリゴヌクレオチドの5'末端にヌクレオチドモノマーをカップリングさせるために必要な反応の順序を意味する。典型的には、合成サイクルは、オリゴヌクレオチドの末端上の5'−ヒドロキシル基の除去、ホスホジエステル結合を形成するためのヌクレオチドモノマーのホスファイト誘導体との反応、および引き続くカップリングが不成功であった場合の分子のキャッピングを包含する。
用語「通常の生理学的条件」は、本明細書において、生きている生物または細胞の内部において典型的である条件を意味する。いくつかの器官は極端な条件を提供することが認識されているが、生物の内部および細胞の内部の環境は通常pH7付近(すなわち、 pH6.5〜pH7.5)で変化し、主要な溶媒として水を含有し、そして0℃以上かつ50℃以下の温度において存在する。
本発明は、通常の生理学的条件下に高度に蛍光性でありかつ蛍光性オリゴヌクレオチドを製造するオリゴヌクレオチドの化学的合成において利用することができる、多数のプテリジンヌクレオチドを提供する。これらの蛍光性オリゴヌクレオチドは、例えば、ゲノムおよび相補的DNA ライブラリーのスクリーニングのためのプローブ、インサイチュ・ハイブリダイゼーションのためのプローブ、DNA合成、配列決定、および増幅のためのプライマー、そして DNA−タンパク質の相互作用を研究するためのモデルの基質を包含する多数の用途を有する。
1つの態様において、本発明のプテリジンヌクレオチドはオリゴヌクレオチドの化学的合成において使用するために適当である。一般に、これは下記のステップを必要とする:プテリジン上の還外アミンのブロッキング;考える特定の合成化学に適当な反応性基をもつホスファイト部分の誘導化;および合成の間に除去できる保護基による5'−ヒドロキシル基のブロッキング、このブロッキングは成長するオリゴヌクレオチドの5'末端への誘導化ヌクレオチドの段階的カップリングを促進する。プテリジン誘導体の糖がリボースである場合、反応性2'−ヒドロキシル基をまた保護しなくてはならない。
好ましい態様において、本発明は下記の式Iのヌクレオチドモノマーを提供する:
Figure 2009091358
これらのヌクレオチドモノマーは示すように環の頂点1〜8をもつプテリジン誘導体であり、式中、R11はR12と組合わされて二重結合により環の頂点4に接合する単一のオキソ酸素を形成するか、またはR13と結合して環の頂点3と4との間の二重結合を形成し、R12はR11と組合わされないとき、NH2 、および保護基NH2 で1または2置換されたNH2 であり、R13はR11と結合しないとき、低級アルキルまたはHであり;R14はH、低級アルキルまたはフェニルであり、R15はR16と組合わされて二重結合により環の頂点2に接合する単一のオキソ酸素を形成するか、またはR17と結合して環の頂点1と2との間の二重結合を形成し、こうして環の頂点2および4は集合的に最大1つのオキソ酸素を有し、そしてR16はR15と組合わされないとき、H、フェニル、NH2 、および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択される構成員である。
15がR16と組合わされないとき、R18はR19と組合わされて二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成する。R15がR16と組合わされるとき、R18はR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そしてR19はHまたは低級アルキルである。R17はR15と結合しないとき、かつR20はR18と結合しないとき、式IIの化合物である。
Figure 2009091358
式中、記号R21は水素、保護基またはトリホスフェートを表し、記号R22は水素、ヒドロキシル、または保護基で置換されたヒドロキシルを表し、そしてR23は水素、ホスホルアミダイト、H−ホスホネート、メチルホスホネート、ホスホロチオエート、ホスホトリエステル、ヘミスクシネート、固体の支持体に共有結合したヘミスクシネート、ジシクロヘキシルカーボジイミド、および固体の支持体に共有結合したジシクロヘキシルカーボジイミドを表す。R13がHでありかつR23がHであるとき、R21はトリホスフェートであり、そしてR11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成しかつR23がHであるとき、R21はトリホスフェートである。
他の好ましい態様において、R14は水素、メチルまたはフェニル、特に水素またはメチルである。
なお他の好ましい態様において、R16は、R15と結合しないとき、水素、フェニル、アミノ基、または保護基で2置換されたNH2 である。特に、R16は水素およびフェニルである。
しかも他の好ましい態様において、R18がR20と結合するとき、R19は水素またはメチルである。
なおしかも他の好ましい態様において、R14は水素、メチルおよびフェニルであり、R16は、R15と組合わされないとき、水素、フェニルまたはアミノであり、そしてR18がR20と結合するとき、R19は水素またはメチルである。
本発明の化合物の中で、9つの態様が特に好ましい。第1好ましい態様において、R11はR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、R12はNH2 、および保護基で1または2置換されたNH2 であり、R14は水素であり、R15はR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、R16はフェニルであり、R18はR19と組合わされて二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そしてR20は式IIである。この態様は式III により例示される。この態様の特に好ましい化合物は、R12がNH2 であるとき、式III により例示される。
Figure 2009091358
第2態様において、R11はR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、R12はNH2 、および保護基で1または2置換されたNH2 であり、R14はフェニルであり、R15はR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、R16は水素であり、R18はR19と組合わされて二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そしてR20は式IIである。この態様は式IVにより例示される。この態様の特に好ましい化合物は、R12がNH2 であるとき、式IVにより例示される。
Figure 2009091358
第3の好ましい態様において、R11はR12と組合わされて二重結合により環の頂点4に接合した単一のオキソ酸素を形成し、R13はCH3 であり、R14はHであり、R15はR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、R16はNH2 であり、R18はR19と組合わされて二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そしてR20は式IIである。この態様は式Vにより例示される。この態様の1つの特に好ましい化合物は、式IIのR23がHであり、そして特に式IIのR21,R22、およびR23のすべてがHであるとき、式Vにより例示されるヌクレオシドである。
Figure 2009091358
第4の好ましい態様において、R11はR12と組合わされて二重結合により環の頂点4に接合した単一のオキソ酸素を形成し、R13は水素であり、R14は水素であり、R15はR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、R16はNH2 または保護基で1または2置換されたNH2 であり、R18はR19と組合わされて二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そしてR20は式IIである。この態様は式VIにより例示される。この態様の特に好ましい化合物は、R16がNH2 であるとき、式VIにより例示される。
Figure 2009091358
第5の好ましい態様において、R11はR12と組合わされて二重結合により環の頂点4に接合した単一のオキソ酸素を形成し、R13は水素であり、R14はCH3 であり、R15はR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、R16はNH2 または保護基で1または2置換されたNH2 であり、R18はR19と組合わされて二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そしてR20は式IIである。この態様は式VII により例示される。この態様の特に好ましい化合物は、R16がNH2 であるとき、式VII により例示される。
Figure 2009091358
第6の好ましい態様において、R11はR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、R12はNH2 または保護基で1または2置換されたNH2 であり、R14はCH3 であり、R15はR16と組合わされて二重結合により環の頂点2に接合した単一のオキソ酸素を形成し、R17は式IIであり、R18はR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そしてR19はCH3 である。この態様は式VIIIにより例示される。この態様の特に好ましい化合物は、R12がNH2 であるとき、式VIIIにより例示される。
Figure 2009091358
第7の好ましい態様において、R11はR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、R12はNH2 または保護基で1または2置換されたNH2 であり、R14は水素であり、R15はR16と組合わされて二重結合により環の頂点2に接合した単一のオキソ酸素を形成し、R17は式IIであり、R18はR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そしてR19はCH3 である。この態様は式IXにより例示される。この態様の特に好ましい化合物は、R12がNH2 であるとき、式IXにより例示される。
Figure 2009091358
第8の好ましい態様において、R11はR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、R12はNH2 であり、R14はCH3 であり、R15はR16と組合わされて二重結合により環の頂点2に接合した単一のオキソ酸素を形成し、R17は式IIであり、R18はR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そしてR19はHである。この態様は式Xにより例示される。この態様の特に好ましい化合物は、R12がNH2 であるとき、式Xにより例示される。
Figure 2009091358
第9の好ましい態様において、R11はR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、R12はNH2 または保護基で1または2置換されたNH2 であり、R14はHであり、R15はR16と組合わされて二重結合により環の頂点2に接合した単一のオキソ酸素を形成し、R17は式IIであり、R18はR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そしてR19はHである。この態様は式III により例示される。この態様の特に好ましい化合物は、R12がNH2 であるとき、式XIにより例示される。
Figure 2009091358
前述したように、プテリジンの還外アミンは一般にオリゴヌクレオチド合成の間に保護しなくてはならない。プテリジンの還外アミンのブロッキングために適当な保護基は、この分野において広く知られている。一般に、保護基はプテリジン誘導体を組込んだオリゴヌクレオチドの合成の間の還外アミンの望ましくない反応を防止するであろう。これらの基は望ましくない反応を防止するためにプテリジン誘導体の実際の合成の間に保護ことが必要であることはもちろん認識されている。保護基は、分子の他の反応性基を変更しないで、オリゴヌクレオチドの合成後除去してアミン基を回復することができるべきである。
典型的には、アミン基は、アシル化により、通常カルバメート、ベンジル基、イミデート、およびこの分野において知られている他の保護基により保護される。保護基の例は下記のものを包含するが、これらに限定されない:ベンゾイル、4−メトキシベンゾイル、フェノキシアセチル、ジフェニルアセチル、イソブチリル、フタロイル、ジ−n−ブチルアミノメチリデン、ジメチルアミノメチレンアミノ、ジメルチアミノメチリデン、p−ニトロフェニルエトキシカルボニルおよびジメチルホルムアミド−ジエチルアセタール。p−ニトロフェニルエトキシカルボニルまたはジメチルアミノメチレンアミノは特に好ましい。多数の適当な保護基の説明については、下記の参考文献を参照のこと:Reese, Tetrahedron, 34 : 3143-3179 (1978) ; Ohtsuka et al., Nucleic Acids Res., 10 : 6553-6570 (1982) 、およびNarang, Tetrahedron 39 : 3-22 (1983)これらは引用することによって本明細書の一部とされる。
こうして、好ましい態様において、本発明は、R12およびR16が独立してベンゾイル、イソブチリル、フタロイル、ジ−n−ブチルアミノメチリデン、ジメチルアミノメチリデン、p−ニトロフェニルエトキシカルボニルおよびジメチルアミノメチレンアミノから成る群より選択される保護基で1または2置換されたNH2 である、式Iのヌクレオチドモノマーを提供する。特に、R12はジ−n−ブチルアミノメチリデン、p−ニトロフェニルエトキシカルボニル、およびジメルチアミノメチレンアミノから成る群より選択される保護基で1置換されたNH2 である。
オリゴヌクレオチド合成の間に、プテリジンモノマーの5'−ヒドロキシル基をブロックして望ましくない反応を防止しなくてはならない。しかしながら、このブロッキング基は、また、合成の間に除去して、成長するオリゴヌクレオチドの5'末端への新しいモノマーの段階的カップリングを可能とすることができなくてはならない。適当な保護基はこの分野においてよく知られており、そしてトリチル、モノメトキシトリチル、ジメトキシトリチル、フタロイル、ジ−n−ブチルアミノメチリレン、およびジメチルアミノメチリデンを包含するが、これらに限定されない。ジメトキシトリチルは、5'−ヒドロキシル基のブロッキング基として一般に好ましい。
こうして、好ましい態様において、本発明は、R20が式IIであり、R21がH、トリチル、モノメトキシトリチル、ジメトキシトリチル、フタロイル、ジ−n−ブチルアミノメチリレン、またはジメチルアミノメチリデンである、式Iのヌクレオチドモノマーを提供する。さらに詳しくは、R21はジメトキシトリチル、ジ−n−ブチルアミノメチリデン、またはジメチルアミノメチリデンである。
プテリジン誘導体の糖がリボフラノースである場合、2'−ヒドロキシル基をまた保護しなくてはならない。好ましい2'−ヒドロキシル基保護基は下記のものを包含するが、これらに限定されない;トリチル、モノメトキシトリチル、ジメトキシトリチル、テトラヒドロピラン−1−イル、4−メトキシテトラヒドロピラン−4−イル、1−(2−クロロ−4−メチル)フェニル−4−メトキシピペリジン−4−イル、t−ブチルジメチルシリル、p−ニトロフェニルエチルスルホニル、テトラヒドロピラニル、4−メトキシテトラヒドロピラニル、2−ニトロベンジル、9−フェニルキサンテン−9−イルおよびp−ニトロフェニルエチルである。好ましい態様において、2'−ヒドロキシル基はt−ブチルジメチルシリル基で置換することによって保護されるであろう。
こうして、好ましい態様において、本発明は、R20が式IIであり、R22がH,OHまたは置換OHであり、前記置換OHはトリチル、モノメトキシトリチル、ジメトキシトリチル、テトラヒドロピラン−1−イル、4−メトキシテトラヒドロピラン−4−イル、1−(2−クロロ−4−メチル)フェニル−4−メトキシピペリジン−4−イル、t−ブチルジメチルシリル、p−ニトロフェニルエチルスルホニル、テトラヒドロピラニル、4−メトキシテトラヒドロピラニル、2−ニトロベンジル、9−フェニルキサンテン−9−イルまたはp−ニトロフェニルエチルで置換されている、式Iのヌクレオチドモノマーを提供する。特に、R22はHまたはジメトキシトリチル、テトラヒドロピラン−1−イル、t−ブチルジメチルシリル、2−ニトロベンジルもしくはp−ニトロフェニルエチルで置換されたOHである。
本発明のβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイト化合物は、オリゴヌクレオチド合成のモノマーとして好ましい。これらの化合物は、合成のプロトコールを変更しないで、大部分の商業的DNA 合成において一般に利用することができる。しかしながら、大規模の合成を望む場合、またはホスフェート結合の中に硫黄基または他の変更を加えたい場合、本発明のH−ホスホネート化合物は合成試薬として好ましいことがある。オリゴヌクレオチド合成に適当な他のホスファイト誘導体の合成および使用は、この分野においてよく知られている。これらはメチルホスホネート、ホスホロチオエート、およびホスホトリエステルを包含するが、これらに限定されない。
本発明の好ましい態様は、プテリジンヌクレオチドがオリゴヌクレオチド合成において試薬として使用するために誘導化および保護されている化合物である。特に反応性還外アミンを保護し、そして3'−ヒドロキシルをH−ホスホネートまたはホスホルアミダイトとして誘導化する。この方法において誘導体化された式III 〜XIにより例示される化合物は特に好ましい。
こうして、好ましい第1態様は、R12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR20が式IIであり、R23がH−ホスホネートまたはホスホルアミダイトである、式III により例示される。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHでありそしてR23はβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである。なお特に、R12はジメチルアミノメチレンアミノである。
好ましい第2態様は、R12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR20が式IIであり、R23がH−ホスホネートまたはホスホルアミダイトである、式IVにより例示される。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHでありそしてR23はβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである。なお特に、R12はジメチルアミノメチレンアミノである。
好ましい第3態様は、R20が式IIでありそしてR23がH−ホスホネートまたはホスホルアミダイトである、式IVにより例示される。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHでありそしてR23はβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである。
好ましい第4態様は、R16が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR20が式IIであり、R23がH−ホスホネートまたはホスホルアミダイトである、式VIにより例示される。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHでありそしてR23はβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである。なお特に、R16はジメチルアミノメチレンアミノである。
好ましい第5態様は、R16が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR20が式IIであり、R23がH−ホスホネートまたはホスホルアミダイトである、式VII により例示される。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHでありそしてR23はβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである。なお特に、R16はジメチルアミノメチレンアミノである。
好ましい第6態様は、R12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR17が式IIであり、R23がH−ホスホネートまたはホスホルアミダイトである、式VIIIにより例示される。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHでありそしてR23はβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである。なお特に、R12はp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである。
好ましい第7態様は、R12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR17が式IIであり、R23がH−ホスホネートまたはホスホルアミダイトである、式IXにより例示される。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHでありそしてR23はβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである。なお特に、R12はp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである。
好ましい第8態様は、R12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR17が式IIであり、R23がH−ホスホネートまたはホスホルアミダイトである、式Xにより例示される。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHでありそしてR23はβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである。なお特に、R12はp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである。
好ましい第9態様は、R12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR17が式IIであり、R23がH−ホスホネートまたはホスホルアミダイトである、式Xにより例示される。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHでありそしてR23はβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである。なお特に、R12はp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである。
本発明のオリゴヌクレオチドは、固相においてまた溶液中で合成することがきる。一般に、固相合成は好ましい。ホスファイトトリエステル、ホスホトリエステル、およびH−ホスホネートの化学によるオリゴヌクレオチドの固相合成の手法の詳細な説明は広く入手可能である。参照、例えば、Itakura 、米国特許第 4,401,796号;Caruthers et al.、米国特許第 4,458,066号および米国特許第 4,500,707号;Beaucage et al., Tetrahedron Lett., 22 : 1859-1862 (1981) ; Matteucci et al., J. Am. Chem. Soc. 103 : 3185-3191 (1981) ; Caruthers et al., Genetic Engineering, 4 : 1-17 (1982) ; Jones, chapter 2, Atkinson et al., chapter 3、およびSproar et al., chapter 4, Gait編、Oligonucleotide Synthesis: A Practical Approach, IRL Press, Washington D. C. (1984) ; Froehler et al., Tetrahedron Lett., 27 : 469-472 (1986) ; Froehler et al., Nucleic Acids Res., 14 : 5399-5407 (1986) ;Sinha et al., Tetrahedron Lett., 24 : 5843-5846 (1983);およびSinha et al., Nucl. Acids Res., 12 : 4539-4557 (1984) これらは引用することによって本明細書の一部とされる。
一般に、カップリングサイクルにおいて利用する試薬の供給のタイミングおよび濃度は、商業的DNA 合成において使用する未修飾の商用ホスホルアミダイトについて典型的なプロトコールと異なる。これらの場合において、本発明のプテリジン誘導体を含有する溶液を、商業的合成装置(例えば、380B型、Applied Biosystems、米国カリフォルニア州フォスターシティー)上に余分のホスホルアミダイトのために設けられた口上の容器に単に添加することができる。しかしながら、特定の誘導化プテリジン化合物のカップリング効率が他のホスホルアミダイトより実質的に低い場合、合成を最適化するために試薬の供給のタイミングおよび濃度を変更することが必要であることがある。
低いカップリング効率を補正するためにオリゴヌクレオチド合成のプロトコールを最適化する手段は、この分野においてよく知られている。一般に、試薬の濃度または試薬の供給量を単に増加して、より高いカップリング効率を達成する。また、カップリング効率を決定する方法はよく知られている。例えば、5'−ヒドロキシル基がジメトキシトリチル(DMT)である場合、酸ステップ(DMT基を除去する)におけるDMT カチオン濃度を測定することによって、カップリング効率を決定することができる。
DMT カチオン濃度は、通常、酸性洗浄液を分光光度計でモニターすることによって決定される。酸/DMT 溶液は鮮明なオレンジ色である。また、カップリングが起こらなかった場合、キャッピングはオリゴヌクレオチドのさらにエクステンションを防止するので、例えば、毛管電気泳動またはHPLCを使用して、切形/全長のオリゴヌクレオチドの比を比較することによって、カップリング効率を推定することができる。
固相オリゴヌクレオチド合成は、多数の固体の支持体を使用して実施することができる。適当な支持体は、合成されたオリゴヌクレオチドにおいて3'末端塩基となるであろう保護されたモノマーを取り付ける官能基を提供する支持体である。支持体は、特定の合成化学において利用される試薬に対して不活性でなくてはならない。固体の支持体物質は、ポリアクリロイルモルホリド、シリカ、コントロールされた孔のガラス(CPG)、ポリスチレン、ポリスチレン/ラテックス、およびカルボキシル変性テフロン(登録商標)を包含するが、これらに限定されない。好ましい支持体は、アミノ官能化コントロールされた孔のガラスおよびカルボキシル官能化テフロン(登録商標)である。
固相オリゴヌクレオチド合成は、出発点として、固体の支持体にカップリングされた完全に保護されたモノマー(例えば、プテリジンヌクレオシド)を必要とする。このカップリングは典型的にはリンカーに共有結合した3'−ヒドロキシル(カップリングしたときオキソ)であり、次いでこれを固体の支持体に共有結合させる。次いで、第1合成サイクルはモノマーを、その3'−ホスフェートを介して、3'−5'ホスホジエステル結合を形成する縮合反応により結合ヌクレオシドの5'−ヒドロキシルにカップリングさせる。引き続く合成サイクルは、最後の結合ヌクレオシドの5'−ヒドロキシルにヌクレオチドモノマーを付加する。この方法において、オリゴヌクレオチドは3'→5'の方向に合成されて、固体の支持体にその3'末端を結合した「成長する」オリゴヌクレオチドを生成する。
固体の支持体にヌクレオシドモノマーを結合する多数の手段は当業者に知られているが、スクシネートまたはヘミスクシネートを通してコントロールされた孔のガラスに共有結合したモノマーは一般に好ましい。ヘミスクシネートを通してコントロールされた孔のガラスにカップリングした慣用の保護されたヌクレオシドは、多数の源から商業的に入手可能である(例えば、Glen Research 、米国バーモント州スターリング、Applied Biosystems、米国カリフォルニア州フォスターシティー、Pharmacia LKB 、米国ニュージャージイ州ピスカタウェイ)。
オリゴヌクレオチドの3'末端におけるプテリジンヌクレオチドの配置は、固体の支持体に結合した完全にブロックされたフラノシルプテリジンを使用してオリゴヌクレオチド合成を開始することを必要とする。好ましい態様において、プテリジンヌクレオチドの結合はまずプテリジンヌクレオチドをヘミスクシネートとして誘導化することによって達成される。次いで、縮合剤としてメシチレン−2−スルホニルクロライド/1−メチル−1H−イミダゾールを使用する縮合反応において、ヘミスクシネートをアミノ官能化されたコントロールされた孔のガラスに取り付けることができる。
多数の異なる反応性基で官能化されたコントロールされた孔のガラスは商業的に入手可能である(例えば、Sigma Chemicals 、米国ミゾリー州セントルイス)。同様なカップリングスキームは下記の参考文献に記載されている:Atkinson et al., chapter 3, Gait編、Oligonucleotide Synthesis : A Practical Approach, IRL Press, Washington D. C. (1984)。また、トリイソプロピルベンゼンスルホニルクロライド、イミダゾリド、トリアゾリドまたはさらにテトラゾリドを縮合剤として使用することができる。ジシクロヘキシルカーボジイミド(DCC)および構造類似体はまた適当なリンカーである。他のリンカーおよび適当な縮合剤は当業者によく知られている。
好ましい態様において、したがって、本発明は、5'−ヒドロキシルがヘミスクシネートとして誘導体化され、次いで固体の支持体に、特にコントロールされた孔のガラスに共有結合させることができる、プテリジンヌクレオチドを提供する。この方法において誘導化された式III 〜XIにより例示される化合物は特に好ましい。
こうして、第1の好ましい態様において、本発明は、R12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR20が式IIであり、R23がヘミスクシネート、または固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートである、式III の化合物を提供する。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHであり、そしてR23はコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである。なお特に、R12はジメチルアミノメチレンアミノである。
第2の好ましい態様において、本発明は、R12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR20が式IIであり、R23がヘミスクシネート、または固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートである、式IVの化合物を提供する。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHであり、そしてR23はコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである。なお特に、R12はジメチルアミノメチレンアミノである。
第3の好ましい態様において、本発明は、R20が式IIであり、R23がヘミスクシネート、または固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートである、式Vの化合物を提供する。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHであり、そしてR23はコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである。
第4の好ましい態様において、本発明は、R16が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR20が式IIであり、R23がヘミスクシネート、または固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートである、式VIの化合物を提供する。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHであり、そしてR23はコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである。なお特に、R16はジメチルアミノメチレンアミノである。
第5の好ましい態様において、本発明は、R16が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR20が式IIであり、R23がヘミスクシネート、または固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートである、式VII の化合物を提供する。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHであり、そしてR23はコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである。なお特に、R16はジメチルアミノメチレンアミノである。
第6の好ましい態様において、本発明は、R12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR17が式IIであり、R23がヘミスクシネート、または固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートである、式VIIIの化合物を提供する。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHであり、そしてR23はコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである。なお特に、R12はp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである。
第7の好ましい態様において、本発明は、R12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR17が式IIであり、R23がヘミスクシネート、または固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートである、式IXの化合物を提供する。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHであり、そしてR23はコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである。なお特に、R12はp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである。
第8の好ましい態様において、本発明は、R12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR17が式IIであり、R23がヘミスクシネート、または固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートである、式Xの化合物を提供する。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHであり、そしてR23はコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである。なお特に、R12はp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである。
第9の好ましい態様において、本発明は、R12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そしてR17が式IIであり、R23がヘミスクシネート、または固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートである、式Xの化合物を提供する。特に、式IIのR21はジメトキシトリチルであり、R22はHであり、そしてR23はコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである。なお特に、R12はp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである。
還外アミンがp−ニトロフェニルエトキシカルボニルにより保護されている態様において、脱保護試薬は、また、3'末端ヌクレオシドを固体の支持体に結合するトリスクシニルスペーサーのエステル官能基を切断することができる。この場合において、Stengele et al., Tetrahedron Lett., 18 : 2549-2552 (1990)(これは引用することによって本明細書の一部とされる)に記載されているカップリングスキームは好ましい。
この方法において、固体の支持体(ジヒドロキシプロピル−CPG, 500Åおよび1400Å,Fluka AG、スイス国、カタログNo. 27754, 27764, 2770) をまずN,N'−カルボニルジイミダゾールと反応させ、次いで脂肪族第2アミンスペーサーとして1,6−ビスメチルアミノヘキサンと反応させる。次いでこの化合物を適当に保護された2'−ヌクレオシド−3'−O−スクシネートとカップリングさせ、引き続いて固体の支持体の遊離ヒドロキシル基を酢酸無水物および4−ジメチルアミノピリジン(DMAP)とカップリングさせる。このリンカーはp−ニトロフェニルエトキシカルボニルおよびp−ニトロフェニルエチレン基について使用した脱保護条件下に完全に安定であるが、マトリックスからの切断は通常濃アンモニア中の加水分解条件下に2時間より短い時間で達成することができる。
いったん全長のオリゴヌクレオチドが合成されると、保護基を除去し(オリゴヌクレオチドを脱保護し)、次いで使用する前にオリゴヌクレオチドを固体の支持体から切断する。(テフロン(登録商標)の固体の支持体を使用する場合、オリゴヌクレオチドを支持体に永久的に取り付けてアフィニティーカラムを調製することができる。)切断および脱保護は同時にまたは任意の順序で順次に実施することができる。2つの手法は介在させ、こうしていくつかの保護基をオリゴヌクレオチドから除去した後、それを固体の支持体から切断し、そして他の基を溶液中で切断したオリゴヌクレオチドから脱保護する。
事象の順序は存在する特定のブロッキング基、固体の支持体の特定の結合、および合成を実施する個人の好みに依存する。脱保護が切断に先行する場合、保護基を固体の支持体に結合したままであるオリゴヌクレオチドから洗浄除去することができる。逆に、切断に引き続いて脱保護を実施する場合、除去した特定の基はオリゴヌクレオチドとともに溶液の中に残るであろう。しばしばオリゴヌクレオチドは使用する前にこれらの保護基から単離することが必要であろう。
好ましい態様、および大部分の商業的DNA 合成において、5'−ヒドロキシル上の保護基を合成の最後の段階において除去する。次いでオリゴヌクレオチドを固体の支持体から切断し、残りの脱保護基を溶液中で実施する。5'−ヒドロキシル保護基の除去は、典型的には、次のヌクレオチドモノマーのカップリング前に末端の5’−ヒドロキシル基を除去するために、合成を通じて利用する同一試薬で処理することをちょうど必要とする。5’−ヒドロキシル保護基はジメトキシトリチル基である場合、脱保護は酢酸、ジクロロ酢酸またはトリクロロ酢酸を使用する処理により達成することができる。
典型的には、まず固相支持体に取り付けられたオリゴヌクレオチド(塩基不安定性結合)を切断剤に約1〜2時間暴露し、こうしてオリゴヌクレオチドが固体の支持体から解放されるようにし、次いで解放されたオリゴヌクレオチドを含有する切断試薬を少なくとも20〜60分間約80〜90℃に加熱し、こうして還外アミンに取り付けられた保護基を除去することによって、還外アミンの切断および脱保護の双方を実施する。また、脱保護ステップはより低い温度において実施することができるが、より大きい時間の間実施しなくてはならない。(例えば、加熱は5時間の間55℃であることができる)。
一般に、好ましい切断および脱保護は濃アンモニアである。
オリゴヌクレオチドがリボヌクレオチドでありそして2'−ヒドロキシル基がt−ブチルジメトキシトリチルシリル(TBDMS)によりブロックされている場合、後者の基はテトラブチルアンモニウムフルオライドを使用して合成の終わりにおいて除去することができる。Wu et al., J. Org. Chem. 55 : 4717-4724 (1990)参照。フェノキシアセチル基はアルコール中で無水アンモニアを使用して除去することができる(これらの条件下にTBDMS 基は安定であり、そしてオリゴヌクレオチドは切断されない)。シチジンのベンゾイル保護基は、また、アルコール中の無水アンモニアで除去される。
還外アミンをp−ニトロフェニルエトキシカルボニル基で保護しそして固体の支持体へのカップリングがスクシネートヌクレオシドと縮合した1,6−ビス−メチルアミノヘキサンを介する場合、アミノ基は好ましくは1MのDBU(1,8−ジアザ−ビシクロ〔5.4.0〕−ウンデク−7−エン)を使用する処理により脱保護される。次いで、固体の支持体からのオリゴヌクレオチドの切断は濃アンモニアを使用する処理により達成される。
脱保護に対するこの後者のアプローチを使用する場合、それぞれ、アミドおよびアミンの保護のためにp−ニトロフェニルエチルおよびp−ニトロフェニルエトキシカルボニル基を使用して保護されたプテリジン、アデニン、チミジン、グアノシン、シチジン、ウラシル、および修飾されたヌクレオチドモノマーを使用してオリゴヌクレオチドを合成することが好ましい。Barone et al., Nucleic Acids Res. 12 : 4051-4061 (1984) を引用するStengeleおよびPfleiderer, Tetrahedron Lett., 31 : 2549-2552 (1990)を参照のこと。次いで、単一の脱保護のプロトコールはオリゴヌクレオチドのすべての構成ヌクレオチドを脱保護するであろう。
切断されそして完全に脱保護されたオリゴヌクレオチドは多数の用途において直接使用することができる(凍結乾燥または蒸発させて脱保護試薬を除去した後)か、または使用前に精製することができる。脱保護工程において除去された保護基から、そして最も重要なことには、次のヌクレオチドとカップリングできなかったオリゴヌクレオチドを合成の間にキャッピングするとき形成した切形オリゴヌクレオチドから、全長のオリゴヌクレオチドを単離するために、合成オリゴヌクレオチドの精製は一般に望ましい。
オリゴヌクレオチドの精製技術は当業者によく知られている。方法は下記のものを包含するが、これらに限定されない:シリカプレート上の薄層クロマトグラフィー(TLC)、ゲル電気泳動、大きさ分画(例えば、Sephadexカラムを使用して)、逆相高性能液体クロマトグラフィー(HPLC)およびアニオン交換クロマトグラフィー(例えば、モノQカラム、Pharmacia-LKB 、米国ニュージャージイ州ピスカタウェイ、を使用する)。オリゴヌクレオチドの精製の説明については、下記の参考文献を参照のこと:McLaughlin et al., chapter 5、およびWu et al., chapter 6, Gait編、OligonucleotideSynthesis : A Practical Approach, IRL Press, Washington D. C. (1984)。
本発明のオリゴヌクレオチドは、配列に対して内部または末端における、配列の1または2以上の位置にプテリジンヌクレオチドを含有する。本発明のオリゴヌクレオチドは1または2以上の位置に単一のプテリジン誘導体を含有することができるか、または2またはそれ以上の異なるプテリジン誘導体を含有することができる。オリゴヌクレオチドは完全にプテリジンヌクレオチドから成るか、または天然に存在するおよび/または修飾されたヌクレオチドを含有することができる。
修飾されたヌクレオチドは当業者によく知られており、そして下記のものを包含するが、これらに限定されない:イノシン、5−ブロモデオキシシチジン、5−ブロモ−デオキシウリジン、N6−メチル−デオキシアデノシンおよび5−メチル−デオキシシチジン。これらのヌクレオチドのホスホルアミダイトの形態は、例えば、下記の会社を包含する多数の源から商業的に入手可能である:Applied Biosystems, Inc.、米国カリフォルニア州フォスターシティー、Clonetech 、米国カリフォルニア州パロアルト、およびGlen Research 、米国バーモント州スターリング。
好ましい態様において、本発明は、下記式XIIを有する1種または2種以上のヌクレオチドモノマーを含んでなるオリゴヌクレオチドを提供する。
Figure 2009091358
ヌクレオチドモノマーは示すように環の頂点1〜8をもつプテリジン誘導体であり、式中R16,R18、およびR19は式Iについて記載されている通りであるが、ただし保護基は排除されている。こうして、R12は、R11と組合わされないとき、NH2 であり、そしてR16はR15と組合わされないとき、H、フェニル、またはNH2 であり、R17は、R15と結合しないとき、そしてR20はR18と結合しないとき、式XIII の化合物である。
Figure 2009091358
式中、記号R22は水素またはヒドロキシルを表す。
好ましい態様において、本発明のオリゴヌクレオチドは式XIIのモノマーを含んでなり、式中R14は水素、メチルまたはフェニル、特に水素またはメチルである。
他の好ましい態様において、本発明のオリゴヌクレオチドは式XIIのモノマーを含んでなり、式中R16はR15と結合しないとき、水素、フェニル、またはアミノ基であり、特に水素およびフェニルである。
なお他の好ましい態様において、本発明のオリゴヌクレオチドは式XIIのモノマーを含んでなり、式中R18がR20と結合するとき、R19は水素またはメチルである。
さらに好ましい態様において、本発明のオリゴヌクレオチドは式XIIのモノマーを含んでなり、式中R14は水素、メチル、またはフェニルであり、R16は水素、フェニルまたはアミノであり、そして、R18がR20と結合するとき、R19は水素またはメチルである。
本発明の組成物の中で、9つのヌクレオチドモノマーの1または2以上のを含んでなるオリゴヌクレオチドは特に好ましい。第1の好ましいヌクレオチドモノマーは式XIIにより例示され、式中R11はR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、R12はアミノ基であり、R14は水素であり、R15はR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、R16はフェニルであり、R18はR19と組合わされて環の頂点7に二重結合により接合した単一のオキソ酸素を形成し、そしてR20は式XIVである。このヌクレオチドモノマーは式XIVにより例示され、式中R22はOHであり、より好ましくは、R22はHである。
Figure 2009091358
第2の好ましいヌクレオチドモノマーは式XIIにより例示され、式中R11はR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、R12はNH2 であり、R14はフェニルであり、R15はR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、R16は水素であり、R18はR19と組合わされて環の頂点7に二重結合により接合した単一のオキソ酸素を形成し、そしてR20は式XIII である。このヌクレオチドモノマーは式XVにより例示され、式中R22はHであり、より好ましくは、R22はHである。
Figure 2009091358
第3の好ましいヌクレオチドモノマーは式XIIにより例示され、式中R11はR12と結合して環の頂点4に二重結合により接合した単一のオキソ酸素を形成し、R13はCH3 であり、R14はHであり、R15はR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、R16はNH2 であり、R18はR19と組合わされて環の頂点7に二重結合により接合した単一のオキソ酸素を形成し、そしてR20は式XIII である。このヌクレオチドモノマーは式XVIにより例示され、式中R22はHまたはOHであり、より好ましくは、R22はHである。
Figure 2009091358
第4の好ましいヌクレオチドモノマーは式XIIにより例示され、式中R11はR12と結合して環の頂点4に二重結合により接合した単一のオキソ酸素を形成し、R13はHであり、R14はHであり、R15はR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、R16はNH2 であり、R18はR19と組合わされて環の頂点7に二重結合により接合した単一のオキソ酸素を形成し、そしてR20は式XIII である。このヌクレオチドモノマーは式XVIIIにより例示され、式中R22はHまたはOHであり、より好ましくは、R22はHである。
Figure 2009091358
第5の好ましいヌクレオチドモノマーは式XIIにより例示され、式中R11はR12と組合わされて環の頂点4に二重結合により接合した単一のオキソ酸素を形成し、R13は水素であり、R14はCH3 であり、R15はR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、R16はNH2 であり、R18はR19と組合わされて環の頂点7に二重結合により接合した単一のオキソ酸素を形成し、そしてR20は式XIII である。このヌクレオチドモノマーは式XVIIIにより例示され、式中R22はHまたはOHであり、より好ましくは、R22はHである。
Figure 2009091358
第6の好ましいヌクレオチドモノマーは式XIIにより例示され、式中R11はR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、R12はNH2 であり、R14はCH3 であり、R15はR16と組合わされて環の頂点2に二重結合により接合した単一のオキソ酸素を形成し、R17は式XIII であり、R18はR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そしてR19はCH3 である。このヌクレオチドモノマーは式XIXにより例示され、式中R22はHまたはOHであ、より好ましくは、R22はHである。
Figure 2009091358
第7の好ましいヌクレオチドモノマーは式XIIにより例示され、式中R11はR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、R12はNH2 であり、R14はHであり、R15はR16と組合わされて環の頂点2に二重結合により接合した単一のオキソ酸素を形成し、R17は式XIII であり、R18はR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そしてR19はCH3 である。このヌクレオチドモノマーは式XXにより例示され、式中R22はHまたはOHであり、より好ましくは、R22はHである。
Figure 2009091358
第8の好ましいヌクレオチドモノマーは式XIIにより例示され、式中R11はR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、R12はNH2 であり、R14はCH3 であり、R15はR16と組合わされて環の頂点2に二重結合により接合した単一のオキソ酸素を形成し、R17は式XIII であり、R18はR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そしてR19はHである。このヌクレオチドモノマーは式XXIにより例示され、式中R22はHまたはOHであり、より好ましくは、R22はHである。
Figure 2009091358
第9の好ましいヌクレオチドモノマーは式XIIにより例示され、式中R11はR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、R12はNH2 であり、R14はHであり、R15はR16と組合わされて環の頂点2に二重結合により接合した単一のオキソ酸素を形成し、R17は式XIII であり、R18はR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そしてR19はHである。このヌクレオチドモノマーは式XXIIにより例示され、式中R22はHまたはOHであり、より好ましくは、R22はHである。
Figure 2009091358
オリゴヌクレオチド配列中の特定のプテリジンヌクレオチドおよびそれらの位置の選択は、オリゴヌクレオチドを意図する特定の用途に依存するであろう。当業者は認識するように、プテリジン誘導体の蛍光シグナルはpHおよび付近の分子の特定の化学により影響を受けるであろう。一般に、付近のプリンは付近のピリミジンよりも多くシグナルをクエンチングする傾向があるであろう。プリンは主要な付近の物質としてシグナルを厳しくクエンチングし、そして2次付近の物質としてさえ有意な作用を有する。第3プリンはクエンチャーとして強力ではない。さらに、ヌクレオチドの末端付近においてシグナルのクエンチングは最小となる。
したがって、完全なオリゴヌクレオチドから強いシグナルを望む場合、プテリジンヌクレオチドは末端にまたはその付近に位置し、そして1または2以上のピリミジンに隣接してシグナルのクエンチングを減少することが好ましい。逆に、オリゴヌクレオチドを切断する(例えば、エンドヌクレアーゼにより)ときのみオリゴヌクレオチドがシグナルを提供することを望む場合、プテリジン誘導体をクエンチング基(プリン)に密接させるが、オリゴヌクレオチドを切断するとき、クエンチング塩基からプテリジンを含有する鎖を分離することが期待された位置に配置し、これにより蛍光シグナルを解放することが好ましい。後者のアプローチは実施例12に例示されている。
したがって、1つの態様において、プテリジンヌクレオチドは3'末端に位置するが、他の実施態様において、プテリジンヌクレオチドは本発明のオリゴヌクレオチドの5'末端に位置する。
なお他の態様において、本発明のオリゴヌクレオチドは1〜10ピリミジンモノマーにより囲まれているプテリジンヌクレオチドのモノマーを含んでなる。
本発明のオリゴヌクレオチドは短い一本鎖の配列に限定されない。当業者は認識するように、オリゴヌクレオチドの合成は典型的にはほぼ200 塩基の上限を有するが、多数のオリゴヌクレオチドを一緒に結合してより長い配列を形成することができる。さらに、相補的配列を有するオリゴヌクレオチドを一緒にハイブリダイゼーションして二本鎖の分子を形成することができる。オリゴヌクレオチドをハイブリダイゼーションおよび結合して長い二本鎖の分子を形成する方法はよく知られている。参照、例えば、Sambrook et al., Molecular Cloning : A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, 1985)。
本発明のプテリジン誘導体は、天然に存在するプリンに構造的に類似する。オリゴヌクレオチドの中に組込むとき、プテリジン誘導体は蛍光性標識として作用するが、現在入手可能な蛍光性標識と同程度に厳しくはオリゴヌクレオチドの生理的および化学的性質を変更しない。ある場合において、混乱は非常に小さいので、酵素機能にとって重要であることが知られている部位において置換を行ったときでえ、酵素を触媒とする反応を可能とする酵素基質としてオリゴヌクレオチドは作用することができる。したがって、本発明のオリゴヌクレオチドは DNA−タンパク質の相互作用の研究において特に有用である。
1つのこのような相互作用は、DNA とウイルス組込み(IN)タンパク質との間の相互作用により例示される。インテグラーゼは、ヒトゲノムの中へのHIV ウイルス遺伝子の組込みに関係づけられたウイルス組込みタンパク質である。Engleman et al., Cell, 67 : 1211-1221 (1991)。したがって、インテグラーゼは細胞のHIV 感染に対して重要であるように思われ、そしてエイズ抗ウイルスの研究にとって極めて重要な標的を提供することがある。
特定のDNA 配列(5'−GTG TGG AAA ATC TCT AGC AGT −3'、配列識別No:1)は、HIV インテグラーゼ酵素のための有効なモデルとして使用されてきている。同上。この酵素は、段階的方法で、宿主細胞のゲノムの中へのHIV ゲノムの調製および実際の挿入を達成する機能をする。このメカニズムにおける第1ステップは、配列の配列の3'末端からジヌクレオチドを切断して5'オーバーハングを残すように思われる。
本発明の多数のプテリジンヌクレオチド(例えば、式Vまたは式VIにより例示される化合物)はグアノシンに構造的に類似するので、インテグラーゼにより切断されるジヌクレオチドにおいてグアノシンの代わりに使用することができる。完全なDNA 配列において、付近のプリンはプテリジンヌクレオチドのシグナルをクエンチするであろう。インテグラーゼによる鎖からのヌクレオチドの切断はクエンチされた蛍光シグナルを解放し、そして蛍光の増加の検出により反応の実時間のモニターを可能とする。これはインテグラーゼ酵素の活性についての簡単かつ急速なアッセイを提供する。
したがって、なお他の態様において、本発明のオリゴヌクレオチドは、 HIV−1DNA のU5末端をつくり、インテグラーゼの基質として作用し、そして下記の配列から成る群より選択される:
5'−GTN TGG AAA ATC TCT AGC AGT −3’(配列識別No:2),
5'−GTG TNG AAA ATC TCT AGC AGT −3’(配列識別No:3),
5'−GTG TGN AAA ATC TCT AGC AGT −3’(配列識別No:4),
5'−GTG TGG AAA ATC TCT ANC AGT −3’(配列識別No:5),
5'−GTG TGG AAA ATC TCT AGC ANT −3’(配列識別No:6),
5'−GTG TNG AAA ATC TCT ANC AGT −3’(配列識別No:7),
5'−ACT GCT AGA NAT TTT CCA CAC −3’(配列識別No:8),
5'−ACT GCT ANA GAT TTT CCA CAC −3’(配列識別No:9),
5'−ACT NCT AGA GAT TTT CCA CAC −3’(配列識別No:10)および
5'−ACT GCT NGA GAT TTT CCA CAC −3’(配列識別No:11)。
ここでAはアデノシンヌクレオチドであり、Cはシトシンヌクレオチドであり、Gはグアノシンヌクレオチドであり、Tはチミジンヌクレオチドであり、そしてNは式XVI、式XVII 、または式XVIIIのプテリジンヌクレオチドであり、式中R22はHまたはOHであり、より好ましくは、R22はHである。
もちろん、プテリジンヌクレオチドおよびプテリジンオリゴヌクレオチドは、多数の関係においてDNA と他の分子との相互作用を研究するために利用することができる。例えば、式XIX,XX,XXI、およびXXIIのプテリジンヌクレオチドは、他の特許請求した化合物の大部分とのエネルギー転移を達成することができる。これらの化合物は宿主ゲノムの中への外来DNA の挿入をモニターするために使用することができ、ここでヌクレオチドを含有するDNA 鎖は他の特許請求した化合物の1つを含有するDNA 鎖に対して近接させる。これはエネルギー転移を発生させ、その結果新しい不連続のシグナルを放射させる。
当業者は認識するように、本発明のプテリジン誘導体は、また、ほとんど任意の生物学的分子を標識化するための蛍光標識として単に使用することかできる。未保護のプテリジン単独は、直接に、またはリンカーまたはスペーサーを通して、プテリジン1Nまたは8Nにより、標識化しようとする組成物に結合することができる。また、プテリジンヌクレオシドは蛍光標識として使用することができる。プテリジンヌクレオシドは、好ましくは5'−ヒドロキシル、3'−ホスフェート、または2'−ヒドロキシル(リボフラノースの場合において)を通して直接、またはリンカーを通して、標識化しようとする組成物に結合することができる。このような標識化組成物は、生物学的分子、例えば、抗体、リガンド、細胞表面レセプター、および酵素を包含するが、これらに限定されない。
in vitroまたはin vivo において係合標識化されたオリゴヌクレオチドを検出する方法は当業者によく知られている。これらの手段は、直接可視化、蛍光顕微鏡検査、フルオロメーター、写真的検出、画像増強を使用する検出、光電子倍増管、ビデオカメラなどを包含するが、これらに限定されない。もちろん、特定の方法は特定の実験に依存する。例えば、オリゴヌクレオチドを酵素活性について、または1対の分子の間のエネルギー転移についてのアッセイとして使用する場合、反応はフルオロメーターにより溶液中で実施することができる。オリゴヌクレオチドをインサイチュ・ハイブリダイゼーションのプローブとして使用する場合、画像獲得システム(例えば、蛍光顕微鏡と画像処理システムとの組み合わせを有するCCDビデオカメラ)を使用して検出を実施することができる。
本発明のヌクレオチドトリホスフェート化合物は、DNA 増幅技術、例えば、ポリメラーゼ連鎖反応(Innis, et al., PCR Protocols, A Guide to Methods and Application, Academic Press, Inc. San Diego, (1990)) 、リガーゼ連鎖反応(LCR)(参照、Wu et al., Genomics, 4 : 560 (1989), Landegren, et al., Science, 241 : 1077 (1988)およびBarringer, et al., Gene, 89 : 117 (1990))、転写増幅(参照、Kwoh, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (U. S. A.), 86 : 1173 (1989))および自己持続配列複製(参照、Guatelli, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (U. S. A.), 87 : 1874 (1990) においてDNA 合成のモノマーとして利用することができる。本発明のプテリジンヌクレオチドを利用する増幅は、特定のDNA 配列について急速なアッセイを提供する。特定のDNA 配列の存在または非存在が病理的症状(例えば、AIDS)の診断である場合、プテリジンヌクレオチドトリホスフェートを使用する増幅は極端に感受性の急速な診断道具を提供する。
例えば、PCR 増幅を使用する場合、問題のDNA 配列をフランキングするDNA 配列に対して相補的である1対のPCR プライマーを選択する。適切な標的配列が試料の中に存在する場合、プライマーの間のDNA 配列を増幅されるであろう。この増幅されたDNA 配列はプテリジンヌクレオチドトリホスフェートを含有するであろう。増幅された配列は、混合物の中に残留するモノマーから、簡単な大きさ分画(例えば、NAP カラム、 Pharmacia−LKB 、米国ニュージャージイ州ピスカタェイ)またはよく知られている他の技術により分離することができる。次いで、増幅された配列の存在または非存在は、残留する混合物の蛍光を測定することによって直ちに検出することができる。
また、蛍光偏光(FP)の測定を使用して、プライマーおよびヌクレオチドモノマーからのPCR 生成物の分離を必要としないで、陽性または陰性のPCR 反応を検出することができる。この技術はプテリジンヌクレオチドのモノマー、またはプテリジンヌクレオチドのモノマーを組込んだ比較的短い、各々約25塩基対のプライマーを使用する。PCR 法が完結した後、得られる混合物をFPを使用して、励起波長の偏光ビームを混合物に通過させることによって分析する。
標的配列が出発混合物の中に存在しない場合、蛍光性プライマーは溶液の中に比較的小さい一本鎖の断片として残留するか、または蛍光性ヌクレオチドモノマーは溶液の中に比較的小さい分子として残留するであろう。モノマーまたは短いプライマー断片は、比較的散乱した、非偏光の蛍光を放射するであろう。対照的に、標的配列が存在する場合、プテリジンモノマーまたは蛍光性プライマーは励起シグナルに対して応答していっそうゆっくり動く、より大きい二本鎖のセグメントの中に組込まれ、そして混合物が放射する蛍光はいっそう偏光されているであろう。参照、欧州特許(EP)第382433号、これはこの技術を詳細に記載している。
したがって、本発明は式Iのプテリジンヌクレオチドトリホスフェートを提供する。式III 〜XIのトリホスフェート化合物は特に好ましい。したがって、第1の好ましいトリホスフェートは式III であり、式中R12はNH2 であり、そしてR20は式IIであり、式中R21はトリホスフェートであり、R22はHであり、そしてR23はHである。
第2の好ましいトリホスフェートは式IVであり、式中R12はNH2 であり、そしてR20は式IIであり、式中R21はトリホスフェートであり、R22はHであり、そしてR23はHである。
第3の好ましいトリホスフェートは式Vであり、式中R20は式IIであり、式中R21はトリホスフェートであり、R22はHであり、そしてR23はHである。
第4の好ましいトリホスフェートは式VIであり、式中R16はNH2 であり、そしてR20は式IIであり、式中R21はトリホスフェートであり、R22はHであり、そしてR23はHである。
第5の好ましいトリホスフェートは式VII であり、式中R16はNH2 であり、そしてR20は式IIであり、式中R21はトリホスフェートであり、R22はHであり、そしてR23はHである。
第6の好ましいトリホスフェートは式VIIIであり、式中R12はNH2 であり、そしてR17は式IIであり、式中R21はトリホスフェートであり、R22はHであり、そしてR23はHである。
第7の好ましいトリホスフェートは式IXであり、式中R12はNH2 であり、そしてR17は式IIであり、式中R21はトリホスフェートであり、R22はHであり、そしてR23はHである。
第8の好ましいトリホスフェートは式Xであり、式中R12はNH2 であり、そしてR17は式IIであり、式中R21はトリホスフェートであり、R22はHであり、そしてR23はHである。
第9の好ましいトリホスフェートは式XIであり、式中R12はNH2 であり、そしてR17は式IIであり、式中R21はトリホスフェートであり、R22はHであり、そしてR23はHである。
本発明の追加の面は、前述のアッセイの実施において有用なキットに関する。これらのキットは種々の形態を取ることができ、そして配列の特定の増幅プライマーおよび1または2以上のプテリジンヌクレオチドトリホスフェートを含有する1または2以上の容器を含んでなる。キットの他の任意の成分は、例えば、ポリメラーゼ、モノマーを増幅された混合物から分離するために使用する手段、およびPCR または他の増幅反応のための適当な緩衝液を包含する。上記成分に加えて、キットはまた前述の方法を実施するための説明書を含有することができる。
特許請求するプテリジンヌクレオチドは、当業者によく知られている標準的方法により合成することができる。一般に、保護されたプテリジン誘導体を4−クロロベンゾイルまたはパラトルエンスルホニルエステルとして保護された3'−または5'−ヒドロキシルを有するクロロフラノースと反応させて、プテリジンヌクレオシドを生成する。参照、例えば、Kiriasis et al., p. 49-53, Chemistry and Biology of Pteridines, Kisliuk およびBrown 編、Elsevier North Holland, Inc., N. Y. (1979), Schmid et al., Chem. Ber. 106 : 1952-1975 (1973), Pfleidere 、米国特許第 3,798,210号、Pfleidere 、米国特許第 3,792,036号、Herris et al., Liebigs Ann. Chem., 1457-1468 (1981) 、これらは種々のプテリジンヌクレオシドの合成を例示し、そして引用することによって本明細書の一部とされる。参照、また、実施例1〜4、これらはプテリジンヌクレオシドの合成を記載している。カップリング後、保護基を除去し、5'−ヒドロキシルをそのジメトキシトリチルエーテルに交換する。引き続いて5'−ヒドロキシルをH−ホスホネート、ホスホアミダイト、またはヘミスクシネートに変換すると、所望の化合物が得られる。
還外アミンまたは保護されたアミンを生成物において望む場合、それはいくつかの段階の任意の段階において導入することができる。例えば、出発プテリジンは、それ以上の操作の前に保護アミン置換基を含有することができる(例えば、式III の化合物を参照のこと)。また、アミンは後の段階においてオキソ部分をチオンに変換し、次いでアンモニアでアミン化することによって導入することができる(例えば、式III のホスホアミダイトの合成を記載する実施例8を参照のこと)。アミンを導入するなお他の方法は、2位にメチルチオ置換基を有する出発プテリジンを使用する(例えば、式Vのホスホアミダイトの合成を記載する実施例7を参照のこと)。所望のクロロフラノースとのカップリング後、保護基を除去し、メチルチオ基をアンモニアと置換する。
ヌクレオシドの5'−ヒドロキシルを保護基(好ましくはジメトキシトリチル)でブロックする。保護基をカップリングする手段は当業者によく知られている。特に、ジメトキシトリチル基のカップリングは実施例6〜9において例示されている。簡単に述べると、これは乾燥ピリジン中のヌクレオシドとジメトキシトリチルクロライドとの反応により達成される。他のプロトコールは一般に当業者に知られている。参照、例えば、Atkinson et al., chapter 3, Gait編、Oligonucleotide Synthesis : A Practical Aproach (IRL Press, Washington, D. C., 1984)、これは引用することによって本明細書の一部とされる。
プテリジンヌクレオチドの3'−ヒドロキシルは、この分野においてよく知られている方法を使用して、そのそれぞれのヘミスクシネート(上に定義したCPG へのカップリングのために)、ホスホアミダイト、H−ホスホネート、またはトリホスフェートに変換することができる。例えば、ヌクレオシド3'−ヒドロキシルのヘミスクシネートへの変換は、無水コハク酸との反応により達成することができる。Atkinson et al., chapter 3, Gait編、Oligonucleotide Synthesis : A Practical Approach (IRL Press, Washington, D. C., 1984) (これは引用することによって本明細書の一部とされる)は、コントロールされた孔のガラスの官能化およびヌクレオシド−3'−Oスクシネートの合成およびカップリングを記載している。
ヌクレオシドをホスホアミダイトに変換する方法は、また、当業者によく知れている。参照、例えば、Atkinson et al., chapter 3, Gait編、Oligonucleotide Synthesis : A Practical Approach (IRL Press, Washington, D. C., 1984) (これは引用することによって本明細書の一部とされる)、これはMcBride およびCaruthers, Tetrahedron Lett., 24 : 245 (1983) 。他のアプローチは実施例7および8において例示されており、ここにおいてヌクレオシドをβ−シアノエチル−ビス−ジイソプロピルホスファンとテトラゾール中で反応させる。ホスホアミダイトの引き続く単離はそれらの実施例に記載されている。
同様に、ヌクレオシドをH−ホスホネートに変換する手段は、また、当業者によく知られている。1つアプローチにおいて、三臭化リン(III )誘導体を使用して、ヌクレオシドの3’−ヒドロキシルホスフィチレートを直接ホスフィチル化する。さらに詳しくは、リン(III )トリイミダゾリドを使用して、3'−ヒドロキシルをホスフィチル化することができる。この方法は、Garegg et al., Chemica Scripta, 25 : 280-282 (1985) およびTocik et al., NucleicAcids Res., 18 : 193 (1987)(それらの双方は引用することによって本明細書の一部とされる)に詳細に記載されている。
同様に、トリス−(1,1,1,3,3,3−ヘキサフルオロ−2−プロピル)ホスファイトを使用してリボヌクレオシド−H−ホスホネートを製造することは、Sakatsume et al., Nucleic Acids Res., 17 : 3689-3697 (1989)(これは引用することによって本明細書の一部とされる)に記載されている。ジオキシヌクレオシド−H−ホスホネートを製造する同一の試薬の使用は、Sakatsume et al., Nucleic Acids Res., 18 : 3327-3331 (1990)(これは引用することによって本明細書の一部とされる)に記載されている。H−ホスホネートを製造する3’−ヒドロキシルの誘導化の他のアプローチは、Sekine et al., J. Org. Chem., 47 : 571-573 (1982) ; Marugg et al., Tetrahedron Lett., 23 : 2661-2664 (1986) 、およびPon et al.,Tetrahedron Lett., 26 : 2525-2528 (1985)の中に見出すことができる。
3'−ヒドロキシルのトリホスフェートとしての誘導化は、当業者に知られている多数の手段により達成することができる。プテリジンヌクレオシドが酵素基質として活性するために十分な自然ヌクレオチドに対する類似体を有する場合、モノホスフェートを後述するように化学的に合成し、次いで、それぞれ適当なヌクレオチドモノホスフェートおよびジホスフェートキナーゼを使用して、酵素的にジホスフェートに、次いでトリホスフェートに変換することができる。
また、ヌクレオシドはトリホスフェートとして化学的に誘導化することができる。これはヌクレオシドをトリメチルホスフェートおよびPOCl3 と反応させ、次いでトリエチルアンモニウム重炭酸塩緩衝液を添加してヌクレオチドモノホスフェートを生成し、次いでこれをクロマトグラフィーにより精製することができる。次いでヌクレオチドモノホスフェートをカルボニルイミダゾールを使用して活性化し、トリブチルアンモニウムピロホスフェートとカップリングしてヌクレオチドトリホスフェートを生成する。次いでヌクレオチドトリホスフェートをトリエチルアンモニウム塩より安定なナトリウム塩として沈澱させ、分解なしに貯蔵することができる。ヌクレオシドのヌクレオチドトリホスフェートへの誘導化は、実施例10において詳細に説明されている。
本発明のプテリジン誘導体の合成は実施例に詳細に記載されている。特に、式III ,VI,IX,XおよびXIのプテリジンヌクレオチドの合成は、それぞれ、実施例1〜5において例示されている。式IV,V,VIIIおよびVII のプテリジンヌクレオチドホスホアミダイトの合成は、実施例6〜9において例示されている。プテリジンヌクレオシドのプテリジンヌクレオチドトリホスフェートへの変換は、実施例10において例示されている。特許請求するプテリジンヌクレオチドの1つを組込んだジオキシオリゴヌクレオチドの合成、切断および脱保護は実施例11において例示されている。最後に、インテグラーゼ活性についてのアッセイにおける特許請求するオリゴヌクレオチドの使用は実施例12において例示されている。下記の実施例により、本発明を例示するが、これらの実施例は本発明を限定しない。
実施例1. 式III のヌクレオシド:4−アミノ−2−フェニル−8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)プテリジン−7−オン(5)の合成
a)イソニトロソマロノニトリルの銀塩(1)
工程(b)において使用するイソニトロソマロノニトリルの銀塩の合成は、Longo, Gazz. Chim. Ital., 61 : 575 (1931) に記載された。酢酸およびHO(1/1)の 120mlの溶液に、20g(0.3mole)(Fluka AG、スイス国)を添加した。この混合物を、マロノニトリルが溶解するまで加熱および撹拌した。次いでこの混合物を0℃に冷却し、 100mlのH2O 中の23g(0.33mole)の亜硝酸ナトリウムの溶液を撹拌しながらゆっくり添加した。次いでこの溶液を室温において暗所で12時間撹拌した。このオレンジ色溶液に、 100mlのH2O中の52g(0.3mole)の溶液を添加した。生ずる沈殿を集め、低い真空下に濾過し、エーテルで洗浄し、次いでデシケーター中でP4O10 の存在下に真空下に乾燥すると、1が59.7g(99%の収率、融点> 350℃)。
b)2−フェニル−4,6−ジアミノ−5−ニトロソピリミジン(2)
2−フェニル−4,6−ジアミノ−5−ニトロソピリミジンの合成は、Taylor et al., J. Am. Chem. Soc., 81 : 2442-2448(1959)に記載された。小さい部分、0.11moleの微細なイソニトロソマロノニトリルの銀塩(1)を、 100mlのメタノール中の 0.1moleのベンゾアミジンハイドロハライドの撹拌溶液に添加した。添加の完結後、1時間撹拌した。この時まで、黄色銀塩は消失し、白色ハロゲン化銀の重い沈殿が分離した。反応混合物を濾過し、黄色濾液を室温において減圧下に蒸発乾固した。粗生成物の収率はほぼ定量的であった。酢酸エチルから再結晶化させると、イソニトロソマロノニトリルの純粋なベンゾアミジン塩が淡黄色結晶の形態で得られた(融点 151−150 ℃)。C10H5N5Oについての分析、計算値:C,55.8;H,4.2 ;N,32.5。実測値:C,55.7;H,4.0 ;N,32.6。
10mlの2gのα−ピコリン中のイソニトロソマロノニトリルのベンゾアミジン塩の混合物を 125〜130 ℃に 0.5時間加熱した。塩は急速に溶解し、この混合物の色は除々に緑色になった。次いで反応混合物を冷却し、H2O で希釈した。放置後濾過すると、2が2−フェニル−5,6−ジアミノ−5−ニトロソピリミジンの青色がかった結晶として得られた(融点 243−244 ℃)。C10H9N5Oについての分析、計算値:C,55.8;H,4.2 ;N,32.5。実測値:C,55.9;H,3.9 ;N,32.6。
c)4−アミノ−2−フェニル−プテリジン−7−オン(3)
4−アミノ−2−フェニル−プテリジン−7−オンは、Harris et al., Liebigs Ann. Chem. 1457-1468 (1981)に記載された。 200mlのメタノールに、2.15g(10mole)の2−フェニル−4,6−ジアミノ−5−ニトロソピリミジン(2)を添加した。反応が止むまで(ほぼ2時間)、5%炭素担持パラジウム触媒の存在下に水素を使用して混合物を撹拌機中で室温において水和した。無色の溶液を濾過し、20mlのH2O 中の1gのNaの溶液と一緒にし、加熱沸騰させ、次いで活性炭で処理し、熱時濾過した。濾液を氷酢酸でpH5にし、放置し、冷却した。沈殿をジメチルホルムアミドから再結晶化させると、3が 1.0gの褐色がかった結晶として得られた(42%の収率、融点 330−332 ℃) 。
d)4−アミノ−2−フェニル−8−〔2−デオキシ−3,5−ジ−O−(4−クロロベンゾイル)−β−D−リボフラノシル〕プテリジン−7−オン(4)
1.0g(4.2mole)の4−アミノ−2−フェニル−プテリジン−7−オン(3)および数個の結晶の硫酸アンモニウムの混合物を、 100mlのヘキサメチルジシラザン(HMDS)中で還流下に4時間加熱した。冷却後、HMDSを真空下に蒸留し、残留物をう100mの乾燥トルエン中に溶解した。この混合物に、2.17g(4.6mole)の2−デオキシ−3,5−ジ−O−(4−クロロベンゾイル)−α−D−リボフラノシルクロライド(実施例3におけるようにして製造した、トルイル誘導体について工程(a))および 0.476g(2.3mole)の銀過塩素酸塩を添加した。次いでこの溶液を無水条件下に室温において24時間撹拌し、次いで 200mlのCH2Cl2で希釈した。生ずるAgCl沈殿をシリカで濾過し、濾液を 100mlの飽和水性炭酸水素ナトリウム溶液で処理し、次いで 100mlの飽和塩化ナトリウム溶液で処理した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、次いで濾液を蒸発させた。
残留物を少量の酢酸エチル中に溶解し、シリカゲルのカラム上に置き、次いでn−ヘキサン/酢酸エチル5:1を溶離した。主要な画分を集め、蒸発させ、残留物をCHCl3 /メタノールから2回再結晶化させると、4が1.43g(54%の収率)の無色の結晶として得られた(融点 175−178 ℃)。C31H23Cl2N5O6 (632.5)についての分析:C,58.87 ;H,3.67;N,11.07 。実測値:C,58.62 ;H,3.74;N,11.10 。
e)4−アミノ−2−フェニル−8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)プテリジン−7−オン(5)
50mlの無水メタン中の10mgのナトリウムの溶液に、 0.632g(1mmol)の4−アミノ−2−フェニル−8−〔2−デオキシ−3,5−ジ−O−(4−クロロベンゾイル)−β−D−リボフラノシル〕プテリジン−7−オン(4)を添加した。この溶液を室温において1時間撹拌した。次いでこの溶液を AcOHの添加により中和し、次いで蒸発させた。残留物をメタノール/H2O から再結晶化させると、5が 0.323g(91%の収率)の無色の結晶(融点 169−172 ℃)。C17H17N5O4 (355.4)についての分析:C,57.46 ;H,4.81;N,19.71 。実測値:C,57.04 ;H,4.88;N,20.01 。
実施例2. 式IVのヌクレオシド:2’−デオキシ−β−D−リボフラノシル−イソキサントプテリン(15)の合成
2,4,5−トリアミノ−6−ベンジルオキシ−ピリミジン(9)の合成、工程(a)〜(d)は、Pfeiderer et al., Chem. Ber., 94 : 12-18(1961)に記載された。
a)6−クロロ−2,4−ジアミノ−ピリミジン(6)
500ml)新しく蒸留したPOCl3 に80〜90℃の温度において、 100gの2,4−ジアミノ−6−オキソ−ジヒドロピリミジン(Aldrich、米国ウィスコンシン州ミルウォーキー)を添加した。この混合物を、ほぼ2時間後、混合物が完全に溶解するまで、還流下に蒸留した。残留POCl3 を真空を使用して吸引し、残留するシロップ状物を氷上にゆっくり排出した。高度に酸性の溶液を濃アルミン酸ナトリウム溶液で冷却し、最後の段階において固体状炭酸ナトリウムを使用して、注意して中和した。完結したとき、溶液の合計の体積はほぼ1800mlである。冷却すると、黄色がかった沈殿が分離し、これを吸引し、真空デシケーター中で乾燥した。大部分非有機塩を含有する最終生成物を3回沸騰させ、各回1リットルのアセトン(活性炭を添加した)を使用する。抽出液を冷却し、生ずる透明な沈殿を集める。濾液を蒸発させると、追加の画分が得られる。
b)2,4−ジアミノ−6−ベンジルオキシ−ピリミジン(7)
100mlのベンジルアルコール中の 3.8gの溶液を、油浴中で、21.6gの6−クロロ−2,4−ジアミノ−ピリミジン(6)とともに 160℃において3時間加熱する。余分のアルコールを真空下に蒸留する。
a)油状残留物を温水でよく洗浄し、これによりゴム状物質が得られる。この温かい溶液を温かい30%酢酸中に溶解し、活性炭で脱色し、希薄アンモニアでpH6にする。ゆっくり冷却すると、油状塊が最初に分離し、次いで結晶質物質が分離する。結晶を撹拌、デカンテーションおよび濾過により凝固した油状物から分離する。次いで油状残留物を数回加熱および冷却して結晶化させる。プールした画分を、それらがいったん真空デシケーター中で乾燥させると、少量のクロロホルム中に溶解し、次いで活性炭および酸化アルミニウムで処理し、再び−20℃以下の温度に強く凍結することによって分離する。この方法を数回反復した後、クロマトグラフィー的に純粋な7が得られる。
b)別精製法において、アルコールを含有しない反応残留物をベンゾール中に溶解し、活性炭で処理し、濾液をよく蒸発させる。冷却したとき、分離する生成物をベンゾールから数回再結晶化させると、7が得られる。
c)5−ニトロソ−2,4−ジアミノ−6−ベンジルオキシ−ピリミジン(8)
250mlの温かい30%酢酸中の16gの2,4−ジアミノ−6−ベンジルオキシ−ピリミジン(7)の溶液に、25mlのH2O 中の7gの亜硝酸ナトリウムの溶液を添加する。亜硝酸ナトリウムの溶液を70〜80℃に保持し、連続的に撹拌しながら滴下する。ヨウ化カリウム澱粉紙が陽性の反応を示すまで、亜硝酸ナトリウム溶液を添加する。紫−赤色の沈殿を冷却し、吸引し、次いでエタノールまたはアセトンから再結晶化させると、8が得られる。
d)2,4,5−トリアミノ−6−ベンジルオキシ−ピリミジン(9)
ナトリウムジチオナイトを 300mlのH2O 中の17gの5−ニトロソ−2,4−ジアミノ−6−ベンジルオキシ−ピリミジン(8)の懸濁液に50℃において、赤色ニトロソ化合物が完全に還元されるまで、少しずつ添加する。水性アンモニアの添加により、遊離塩基を分離させる。粗生成物を冷却し、吸引し、活性炭および微量のナトリウムジチオナイトを添加した水から結晶化させると、9が得られる。
e)2,4−ジアミノ−6−ベンジルオキシ−5−エトキシカルボニルメチレンイミノ−ピリミジン(10)
2,4−ジアミノ−6−ベンジルオキシ−5−エトキシカルボニルメチレンイミノ−ピリミジンの合成は、PfleidererおよびReisser, Chem. Ber., 95 : 1621−1628 (1961) に記載されている。 250mlのH2O 中の2.39gの2,4,5−トリアミノ−6−ベンジルオキシ−ピリミジン(9)の懸濁液を、室温において3gのエチルグリオキシレート−ヘミエチルアセタール中で3時間撹拌する。生ずる鮮明な黄色沈殿を低い真空下に濾過し、洗浄し、 100℃の温度において乾燥する。沈殿をエタノールから再結晶化させると、10が得られる。
f)2−アミノ−4−ベンジルオキシプテリジン−7−オン(11)
2−アミノ−4−ベンジルオキシプテリジン−7−オンの合成は、PfleidererおよびReisser, Chem. Ber., 95 : 1621-1628 (1961)に記載されている。 190mlのエタノール中1gの2,4−ジアミノ−6−ベンジルオキシ−5−エトキシカルボニルメチレンイミノ−ピリミジン(10)の溶液に30mlの1N NaHCO3を添加する。この溶液を還流下に1時間蒸留し、この溶液を少量の残留する未溶解物質から加熱分離する。20mlの氷酢酸で濾液を酸性化することによって沈殿するプテリジンを冷却後吸引し、ベンジルアルコールから再結晶化させると、11が得られる。
g)4−ベンジルオキシ−2−(N,N−ジメチルアミノメチレンイミノ)−プテリジン−7−オン(12)
100mlの無水DMF に、2.88g(10.7mmol)の2−アミノ−4−ベンジルオキシプテリジン−7−オン(11)および1.92ml(11.2mmol)のN,N−ジメチルホルムアミドジエチルアセタールを添加する。この混合物を室温において4時間撹拌し、その時間までに混合物は透明な溶液となる。DMF を高真空下に50℃以下において蒸留する。次いでこの残留物に、1mlのメタノールおよび50mlのジエチルエーテルの溶液を添加する。10分後、沈殿を集める。濾液を再び蒸発乾固し、生ずる残留物を10mlのジエチルエーテル中で撹拌すると、第2沈殿が得られる。沈殿をプールし、高真空下に乾燥すると、12が得られる。
h)4−ベンジルオキシ−2−(N,N−ジメチルアミノメチレンイミノ)−8−(2−デオキシ−3,5−ジ−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(13)
3.24g(10mmol)の4−ベンジルオキシ−2−(N,N−ジメチルアミノメチレンイミノ)−プテリジン−7−オン(12)に、 100mlの無水アセトニトリルを添加する。次いで1.87ml(12.5mmol)のDBU を添加し、この溶液を約10分後透明になるまで撹拌する。この溶液に、 4.5g(11mmol)の1−クロロ−2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−α−D−リボフラノースを除々に添加する。次いで30分間撹拌する。生ずる沈殿を集めると、乾燥後、α,β−アノマー混合物が得られる。濾液を蒸発乾固し、残留物を 100mlのCH2Cl2 中に溶解し、H2O で2回洗浄してDBU を除去する。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、次いで蒸発させる。生ずる残留物をトルエン/酢酸エチル1/3中のシリカゲルのカラムクロマトグラフィーにより精製する。主要な画分を集め、蒸発させると、α,β−アノマー混合物が得られる。両方の収穫物をプールし、酢酸エチル/メタノール20/1から再結晶化させると、13が得られる。
i)8−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−イソキサントプテリン(14)
100mlのメタノール中に、3.38g(5mmol)の4−ベンジルオキシ−2−(N,N−ジメチルアミノメチレンイミノ)−8−(2−デオキシ−3,5−ジ−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(13)を溶解させる。次いで 0.2gの5%炭素担持パラジウムを添加し、この混合物を水素雰囲気下に1日間震盪させる。触媒を濾過し、濾液を蒸発乾固させる。残留物をメタノールから再結晶化させると、14が得られる。
j)8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−イソキサントプテリン(15)
30mlのメタノール中のアンモニアの飽和溶液に、 1.0g(2mmol)の8−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−イソキサントプテリン(14)を添加する。この混合物を室温において一夜撹拌する。次いでこの溶液を蒸発乾固し、残留物を少量のH2O から数滴の酢酸の添加により再結晶化させる。冷却すると、15が得られる。
実施例3. 式IXのヌクレオシド:4−アミノ−1−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−7−メチル−プテリジン−2−オン(23)の合成
a)2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−α−D−リボフラノシル−クロライド(16)
工程(e)において使用する2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−α−D−リボフラノシルクロライドは、Hoffer, Chem. Ber., 93 : 2777-2781 (1960) に記載されている。 243mlのメタノールに、13.6g(0.1mole)の2−デオキシ−D−リボース(Aldrich 、米国ウィスコンシン州ミルウォーキー)および27mlの1%メタノール性 HClを添加する。この混合物を12〜15分間密閉放置してメチルグルコシドを形成する。次いで、 3.5gの炭酸銀を混入してすべての炭化水素を直ちに結合させる。
透明な濾過溶液を真空下に沸騰させると、シロップ様コンシステンシーが得られ、真空下に沸騰を反復する同時に少量の乾燥ピリジンを添加して、残留するメタノールを分離する。最後に、混合物を80mlのピリジン中に溶解し、34g(0.22mole)のp−トルイルクロライドでアシル化する。次いでこの混合物を40〜50℃に2時間加熱するか、または室温において一夜放置する。水を添加し、次いで混合物 200mlのエーテルで分配する。次いでエーテル溶液をH2O 、次いで希薄硫酸、次いで炭酸水素カリウム溶液で洗浄してピリジンを除去する。次いで混合物を真空下に沸騰して、蜂蜜−黄色のシロップ状物を形成する。このシロップ状物から、結晶化した3,5−ジ−p−トルイル−メチル−2−デオキシ−D−リボフラノシドをシード添加により得ることができる。
クロライドを単離するために、シロップ状物を20〜50mlの氷酢酸中に溶解し、この溶液を80mlの塩化水素で飽和させた酢酸と一緒にビーカーに入れる。この溶液を10℃に保持し、塩化水素導入して、混合物を約10分間後濃厚な結晶質ペーストに固化させる。30分以内に、結晶質物質をフィルター上で低い真空下に無水エーテルで洗浄する。洗浄工程は好ましくは2回反復する。次いで、この物質を真空デシケーター中でソーダライムおよび五酸化リンで乾燥し、そしてこの物質は数週間この状態で安定に止まる。所望ならば、2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−α−D−リボフラノシル−クロライド(16)をトルエンまたは四塩化炭素から再結晶化させる。
b)2−ヒドロキシ−4,6−ジアミノピリミジンサルフェート(17)
4,6−ジアミノ−2−ヒドロキシ−ピリミジンサルフェートの合成は、Bendich et al., J. Amer. Chem. Soc., 70 : 3109-3113(1948)に記載されている。5.40gの4,6−ジアミノ−2−チオピリミジン(Aldrich 、米国ウィスコンシン州ミルウォーキー)および 5.5gのクロロ酢酸に、75mlの沸騰するH2O を添加する。この溶液を1.25時間還流させる。冷却しないで、 9.5mlの18N硫酸を添加し、還流をさらに1時間続ける。ノーライトを添加し、冷却すると、17が得られる。
c)4,6−ジアミノ−5−ホルミルアミノ−2−ヒドロキシ−ピリミジン(18)
4,6−ジアミノ−5−ホルミルアミノ−2−ヒドロキシ−ピリミジンの合成は、Pfleiderer, Chem. Ber. 90 : 2272-2276 (1957)に記載されている。54mlのホルムアミドに9gの4,6−ジアミノ−2−ヒドロキシ−ピリミジンサルフェート(17)および4.5 gの亜硝酸ナトリウムを添加する。この溶液を60℃に加熱し、10mlのギ酸を滴下する。これは赤色懸濁液を形成し、これを 110℃にさらに加熱する。黄色化が得られるまで、少量のナトリウムジチオナイトを添加する。この時間の間に、温度は 130℃を超えてはならない。この混合物を冷却し、沈殿を高真空下に濾過する。最後に、18を大量のH2O (動物活性炭を含む)から再結晶化させる。
d)4,5,6−トリアミノ−ピリミジン−2−オン塩酸塩(19)
4,5,6−トリアミノ−ピリミジン−2−オン塩酸塩の合成は、Pfleiderer, Chem. Ber. 90 : 2272-2276 (1957)に記載されている。3gの4,6−ジアミノ−5−ホルミルアミノ−2−ヒドロキシ−ピリミジン(18)に、50mlの10%〜15%のメタノール性 HClを添加する。この溶液を7時間還流させ、次いで放冷する。冷却すると、混合物を低い真空下に濾過し、次いでアルコール中で洗浄し、乾燥チャンバー中で乾燥する。次いでこの塩酸塩を室温においてH2O 中に溶解し、1Nアンモニアの添加により中和する。生ずる沈殿を集め、エタノールで洗浄し、乾燥チャンバー中で乾燥すると、19が得られる。
e)4−アミノ−7−メチル−プテリジン−2−オン(20)
50mlの水中に、1.77g(0.01mole)の4,5,6−トリアミノ−ピリミジン−2−オン塩酸塩(19)を溶解する。溶液のpHを5に調節し、次いで4mlの40%水性メチルグリオキサル(FLUKA AG、スイス国)を添加し、この溶液を還流下に30分間加熱する。生ずる沈殿を集め、大量のH2O から再結晶化させると、20が得られる。
f)4−ベンゾルアミノ−7−メチル−プテリジン−2−オン(21)
20mlのピリジン中に、1.63g(0.01mole)の4−アミノ−7−メチル−プテリジン−2−オン(20)を溶解する。次いで3.12g(0.02mole)の塩化ベンゾイルを、混合物を撹拌しながら滴下する。この混合物を80℃に30分間加熱し、次いで氷上に注ぐ。生ずる沈澱を集め、エタノールおよびエーテルで洗浄し、次いでDMF から再結晶化させると、21が得られる。
g)4−ベンゾイルアミノ−1(2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−7−メチル−プテリジン−2−オン(22)
60mlの無水アセトニトリルに、2.83g(0.01mmol)の4−ベンゾイルアミノ−7−メチル−プテリジン−2−オン(21)を添加する。次いで 1.5ml(11mmol)の 1.8−ジアザビシクロ〔5.4.0〕ウンデク−7−エン(DBU)を添加し、この混合物を室温において15分間撹拌する。撹拌後4.26g(11mmol)の2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−α−D−リボフラノシルクロライドを溶液に添加し、室温において1時間撹拌する。次いでこの溶液を蒸発乾固し、残留物をCHCl3 中に溶解し、重炭酸ナトリウム溶液で洗浄し、有機相を硫酸ナトリウムで乾燥する。小さい体積に濃縮した後、物質を酢酸エチル/アセトン4/1中のシリカゲルのカラムクロマトグラフィーにより精製する。主要な画分を蒸発させ、残留物をエタノールから再結晶化させると、22が得られる。
h)4−アミノ−1(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−7−メチル−プテリジン−2−オン(23)
50mlの飽和メタノール性アンモニアに、1.65g(0.005mole)の4−ベンゾイルアミノ−1−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−7−メチル−プテリジン−2−オン(22)を添加する。この混合物を室温において一夜撹拌する。次いで混合物を蒸発乾固し、残留物をエタノール/H2O 20:1から再結晶化させると、23が得られる。
実施例4. 式Xのヌクレオシド:4−アミノ−1−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−6−メチル−プテリジン−2−オン(28)の合成
a)メチルグリオキサルモノアルドキシム(24)
メチルグリオキサルアルドキシムは、G. Charrier Gazz. Chim.Italy 37 : 145 (1907) のプロトコールに従い合成することができる。30mlの酢酸/H2O 溶液(1/1)に 5.8g(0.1mole)のアセトンを添加する。次いでこの溶液を0℃に冷却する。20mlのH2O 中の 7.6g(0.11mole)の亜硝酸ナトリウムの溶液を撹拌しながら滴下する。次いでこの溶液を室温においてさらに3時間撹拌し、次いで真空下に注意して蒸発させる。残留物をベンゼンで抽出し、部分的に蒸発させると、24が無色の結晶として得られる。結晶を高真空下に昇華によりさらに精製することができる。
b)4−アミノ−6−メチル−プテリジン−2−オン(25)
50mlのH2O に、1.77g(0.01mole)の4,5,6−トリアミノ−ピリミジン−2−オン塩酸塩(19)(実施例3参照)を添加する。pHを5に調節し、混合物を撹拌しながら、1.74g(0.02mole)のメチルグリオキサルモノアルドキシム(24)を添加する。対応するシッフ塩基の生ずる沈澱を集め、次いで25mlの80%硫酸中に溶解し、30分間 100℃に加熱する。冷却した後、この混合物を氷上に注ぎ、次いでNaHCOにより注意して中和し、これにより沈澱が形成する。生成物を濾過し、次いで大量のH2O から再結晶化させると、25が得られる。
c)4−ベンゾイルアミノ−6−メチル−プテリジン−2−オン(26)
4−ベンゾイルアミノ−6−メチル−プテリジン−2−オンの合成は、実施例3、工程(d)におけるようにして、4−アミノ−6−メチル−プテリジン−2−オン(25)を4−アミノ−7−メチル−プテリジン−2−オン(20)の代わりに使用して実施する。
d)4−ベンゾイルアミノ−1−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−6−メチルプテリジン−2−オン(27)
4−ベンゾイルアミノ−1−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−6−メチルプテリジン−2−オンの合成は、実施例3 、工程(e)におけるようにして、4−ベンゾイルアミノ−6−メチル−プテリジン−2−オン(26)を4−ベンゾイルアミノ−7−メチル−プテリジン−2−オン(21)の代わりに使用して実施する。
e)4−アミノ−1−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−6−メチル−プテリジン−2−オン(28)
4−アミノ−1−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−6−メチル−プテリジン−2−オン(27)の合成は、実施例3、工程(f)におけるようにして、4−ベンゾイルアミノ−1−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−6−メチルプテリジン−2−オン(27)を4−ベンゾイルアミノ−1(2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−7−メチル−プテリジン−2−オン(22)の代わりに使用して実施する。
実施例5. 式XIのヌクレオシド:4−アミノ−1−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−2−オン(32)の合成
a)4,5,6−トリアミノ−2−ヒドロキシピリミジンサルフェート(29)
化合物17、4,6−ジアミノ−2−ヒドロキシ−ピリミジンサルフェートは、実施例3工程(e)に記載するように合成する。17の4,5,6−トリアミノ−2−ヒドロキシピリミジンサルフェート(29)への変換は、Bendich et al., J. Amer. Chem. Soc., 70 :3109-3113 (1948)に記載されている。110mlの氷酢酸および 110mlのH2O の混合物に、15.3gの非常に微細な17を添加する。
この混合物を約5℃に保持し、25mlのH2O 中の11.0gの亜硝酸ナトリウムを一定に撹拌しながら添加する。カーマイン赤色の沈澱を2時間後に集め、3つの小さい部分の冷却H2O で洗浄する。湿潤沈澱を 400mlのH2O の中に懸濁させ、この混合物を3分間沸騰させ、その期間内に物質は漂白される。この溶液に、53mlの18N硫酸を注意して添加する。この混合物を数分間沸騰させ、ノーライト処理後、濾過し、冷却すると、29が得られ、これは2N硫酸から再結晶化させることができる。
b)4−アミノ−プテリジン−2−オン(30)
4−アミノ−プテリジン−2−オンの合成は、Taylor et al., J. Amer. Chem. Soc. 71 : 2538-2541 (1949)に記載されている。冷却NaOHでpH5に調節した50mlのH2O 中の 2.0g(0.0084mole)の4,5,6−トリアミノ−2−ヒドロキシピリミジンサルフェート(29)の溶液に、 3.0g(0.0113mole)のグリオキサルビサルファイトを添加する。反応混合物を加熱沸騰させ、pHを9に調節し、15分間沸騰させる。希塩酸で中和し、冷却し、濾過した後、薄黄褐色固体状物をH2O で、次いでアセトンで洗浄し、真空下に乾燥する。この固体状物を熱 0.5N NaOH中に溶解し、次いでノーライトで処理する。次いで熱濾液を酢酸で酸性化する。最後に、 0.5N酢酸から再結晶化させると、30が得られる。
c)4−アミノ−1−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−2−オン(31)
20mlのヘキサメチルジシラザン(HMDS)に2.98g(0.02mole)の4−アミノ−プテリジン−2−オン(30)を添加する。この混合物を還流下に、湿気を排除して、24時間加熱すると、透明な溶液が得られる。過剰のHMDSを真空下に除去すると、1−トリメチルシリルアミノ−2−トリメチルシリルオキシ−プテリジンが粘性油状物として得られる。
残留物を 200mlのベンゼン中に溶解し、次いで9.37g(0.022mole)の2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−α−D−リボフラノシルクロライド、4gのHgO 、および4gのHgBr2 を添加し、この混合物を5時間還流させる。冷却後、沈澱を濾過し、濾液を蒸発乾固し、残留物を 100mlのCHCl3 中に溶解する。この溶液を2回 100mlの20%Klで抽出する。次いで有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、再び蒸発させ、残留物を少量の酢酸エチル中に溶解し、酢酸エチル/アセトン7:3を使用するシリカゲルのカラムクロマトグラフィーにかける。第1画分は過剰の糖を含有し、第2画分はα−アノマーを含有し、そして最後の溶出画分はβ−デオキシリボシドを含有する。蒸発させ、残留物をエタノールから再結晶化させると、31が得られる。
d)4−アミノ−1−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−2−オン(32)
0.51g(1mmol)の4−アミノ−1−(2−デオキシ3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−2−オン(31)に、50mlの0.0005Nナトリウムメトキシドを添加する。この混合物を室温において24時間撹拌する。次いで、この混合物をAcOHで中和し、蒸発乾固し、2回H2O と共蒸発させる。次いで残留物を50mlのエタノールから再結晶化させると、32が得られる。
実施例6. 式IVのヌクレオシドのホスホアミダイト:4−アミノ−6−フェニル−8−(5−O−ジメトキシトリチル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン−3’−O−(β−シアノエチル、N−ジイソプロピル)ホスホルアミダイト(41)の合成
4,6−ジアミノ−5−ニトロソ−ピリミジンの合成、工程(a)〜(c)は、Evans et al., J. Chem. Soc., 4106 (1956)に記載された。
a)4,6ジアミノピリミジン−2−スルフィン酸(33)
2N NaOH(200ml)中の50gの4,6−ジアミノ−2−メルカプトピリミジン(Aldrich 、米国ウィスコンシン州ミルウォーキー)の溶液に、 750mlの3%過酸化水素溶液を添加した。この溶液を20℃より低い温度に維持した。撹拌をさらに30分間続け、透明な薄黄色溶液を酢酸(約50ml)で酸性化した。沈澱をH2O で洗浄し、空気乾燥すると、33が58g(95%の収率)の灰色アモルファス酸が得られた(融点 168−170 ℃分解)。分析のために、試料を希薄水性アンモニア中に溶解し、酢酸で再沈澱させた。C4H6N4O2Sについての分析:実測値:C,27.6;H,3.5 ;N,32.2。実測値:C,27.8;H,3.8 ;N,32.2。
b)4,6−ジアミノ−ピリミジン塩酸塩(34)
2.5Nエタノール性塩化水素(150ml)を含有する 500mlの乾燥エタノールに、50gの4,6−ジアミノピリミジン−2−スルフィン酸(33)を添加した。この混合物を30分間震盪した。次いでこの混合物を0℃に冷却し、1時間後、結晶を取り出し、エーテルで洗浄し、乾燥すると、23gの薄黄色針状結晶が得られた(融点 196−198 ℃)。もとの濾液を 250mlに濃縮し、次いで 750mlのエーテルを添加すると、それ以上の収穫物の15gのほとんど白色の針状結晶が得られた(融点 203−204 ℃)。C4H6N4HClについての分析:実測値:C,32.8;H,4.8 ;N,24.2。実測値:C,33.3;H,4.8 ;N,24.1。
次いでスルフィン酸(5g)を室温において塩酸(15ml,d1.18)に少しずつ添加した。反応は激しく、二酸化硫黄が自由に発生した。塩酸を生ずるスラリーから減圧下に除去した。残留物をアセトンで、次いでエーテルで洗浄すると、4.05gの7が得られた(融点 195℃)。試料をスピリットから再結晶化させると、融点は 201−202 ℃上昇した。
c)4,6−ジアミノ−5−ニトロソ−ピリミジン(35)
250mlの2N HClに、 8.0g(55mmol)の4,6−ジアミノ−ピリミジン塩酸塩(34)を添加した。4,6−ジアミノ−ピリミジン塩酸塩を溶解させた。次いでこの溶液を0℃に冷却し、15mlのH2O中に溶解した 4.2g(61mmol)のNaNO2 の溶液を20分以内に撹拌しながら滴下した。0℃においてさらに30分間撹拌し、次いで室温において2時間撹拌した。紫色の溶液をNaHCO3で中和し、沈澱を集め、H2O およびエタノールで洗浄し、乾燥すると、35が 6.3g(82%の収率)の青−紫色の結晶質粉末状物として得られた(融点> 350℃)。
d)4−アミノ−6−フェニル−プテリジン−7−オン(36)
4−アミノ−6−フェニル−プテリジン−7−オンの合成は、Harris et al., Liebigs Ann. Chem. 1457-1468 (1981)に記載された。50mlの無水エタノール中の 0.5Naの溶液に、1.38g(10mmol)の4,6−ジアミノ−5−ニトロソ−ピリミジン(35)および 2.0gのフェニル酢酸エチルエステルを添加した。この物質を溶解させ、次いで溶液を還流下に1時間加熱した。沈降した沈澱を冷却し、集めた。次いで沈澱を100 HO中で加熱し、不溶性ニトロソ化合物から濾過し、次いで希塩酸でpH2に酸性化した。いったんゼラチン状生成物が沈澱すると、それが微結晶質の状態に到達するまで、それを加熱した。次いでゼラチン状生成物をジメチルホルムアミドから再結晶化させると、36が結晶として得られた(融点> 320℃)。C12H9N5Oについての分析:実測値:C,60.24 ;H,3.79;N,29.28 。実測値:C,60.35 ;H,3.78;N,29.53 。
e)4−N,N−ジメチルアミノメチレンイミノ−6−フェニル−プテリジン−7−オン(37)
400mlの乾燥DMF 、2.39g(10mmole)の4−アミノ−6−フェニル−プテリジン−7−オン(36)および 2.5mlのN,N−ジメチルホルムアミド−ジエチルアセタールの混合物を60℃において5時間撹拌した。この溶液を真空下に蒸発乾固し、残留物をイソプロパノールから再結晶化させると、37が2.83g(96%の収率)の無色の結晶として得られた(融点 284−286 ℃)。C15H14N6O(294.3)についての分析:C,61.21 ;H,4.79;N,28.55 。実測値:C,60.88 ;H,5.00;N,28.15 。
f)4−N,N−ジメチルアミノメチレンイミノ−6−フェニル−8−〔2−デオキシ−3,5−ジ−O−(4−クロロベンゾイル)−β−D−リボフラノシル〕プテリジン−7−オン(38)
60mlの乾燥アセトニトリルに2.94g(10mmol)の4−N,N−ジメチルアミノメチレンイミノ−6−フェニル−プテリジン−7−オン(37)および1.49ml(11mmol)の1,8−ジアザビシクロ〔5.4.0〕ウンデク−7−エン(DBU)を添加した。この溶液を透明になるまで15分間撹拌した。この溶液に、4.72g(11mmol)の2−デオキシ−3,5−ジ−O−(4−クロロベンゾイル)−α−D−リボフラノシルクロライド(トリイル誘導体についての実施例3、工程(a)におけるようにして製造した)を添加した。次いでこの溶液を室温において2時間撹拌し、その期間内に黄色がかった沈澱が形成した。この固体状沈澱を集め、CHCl3/メタノールから再結晶化させると、38が 5.3g(83%の収率)の黄色がかった結晶として得られた(融点 171−174 ℃)。C34H28Cl2N6O6 ・1/2H2O (696.6)についての分析:C,58.62 ;H,4.05;N,12.06。実測値:C,58.71 ;H,4.16;N,11.91 。
g)4−アミノ−6−フェニル−8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)プテリジン−7−オン(39)
25mlの無水メタノール中の70mgのK2CO3 から成るの溶液に、4−N,N−ジメチルアミノメチレンイミノ−6−フェニル−8−〔2−デオキシ−3,5-ジ-O-(4-クロロベンゾイル)-β−D−リボフラノシル〕プテリジン−7−オン(38)を添加した。次いで 0.7mlの濃アンモニアをこの懸濁液に添加した。この溶液を室温において2日間撹拌した後AcOHの添加により中和し、生ずる黄色沈澱(0.2g,56%の収率)を集めた。濾液を蒸発乾固し、残留物をメタノールから再結晶化させると、39が他の0.12g(34%の収率)の黄色結晶として得られた(融点 163℃分解)。C17H17N5O4・1/2H2O(364.4)についての分析:C,56.32 ;H,4.97;N,19.22 。実測値:C,56.16 ;H,4.75;N,19.14 。
h)4−アミノ−6−フェニル−8−(5−O−ジメトキシトリチル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(40)
10mlの無水ピリミジン中の 0.355g(1mmol)の4−アミノ−6−フェニル−8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)プテリジン−7−オン(39)の溶液に、多少のモレキュラーシーブおよび 0.407g(1.2mmol)のジメトキシトリチルクロライドを添加した。この溶液を室温において12時間撹拌した。残留物を30mlのCH2Cl2中に溶解し、次いでNaHCO3の飽和溶液、次いでNaClの飽和溶液で抽出した。
有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、次いで再び抽出し、残留物をシリカゲルのカラムのクロマトグラフィーかけ、トルエン/EtOAc 1:1で溶離した。生成物の画分を蒸発させ、再び少量のCH2Cl2中に溶解し、次いでn−ヘキサンに撹拌しながら滴下し、真空デシケーター中で乾燥すると、40が0.46g(70%)の黄色結晶粉末状物として得られた(融点 114℃分解)。C38H35N5O6(657.7)についての分析:C,69.39 ;H,5.36;N,10.64 。実測値:C,68.91 ;H,5.67;N,10.44 。
i)4−アミノ−6−フェニル−8−(5−O−ジメトキシトリチル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン−3'−O−(β−シアノエチル、N−ジイソプロピル)ホスホルアミダイト(41)
15mlのCH2Cl2中の 0.657g(ammol)の4−アミノ−6−フェニル−8−(5−O−ジメトキシトリチル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(40)の溶液に、 0.452g(1.5mmol)の2−シアノエチル−ビス−N,N−ジイソプロピルアミノ−ホスファンおよび35mg(0.5mmol)のテトラゾールを添加した。次いでこの混合物をアルゴン雰囲気下に室温において12時間撹拌した。
反応溶液を15mlのCH2Cl2で希釈し、次いでNaHCO3およびNaClの飽和溶液で抽出した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、蒸発させた。残留物をシリカゲルのカラムのクロマトグラフィーにかけ、少量のトリエチルアミンを含有するトルエンEtOAc 3:2で溶離した。生成物の画分を 100mlのn−ヘキサンに撹拌しながら滴下すると、0.78g(91%)の微結晶質粉末状物として得られた(融点>100 ℃分解)。C47H52N7O7P(858.0)についての分析:C,65.80 ;H,6.11;N,11.43 。実測値:C,66.13 ;H,6.20;N,11.03 。
実施例7. 式Vのホスホアミダイト:(3−メチル−8−(2−デオキシ−5−O−ジメトキシトリチル−β−D−リボフラノシル)イソキサントプテリン−3’−O−(β−シアノエチル、N−ジイソプロピル)ホスホルアミダイト)(51)の合成
a)2−メチルメルカプト−4−アミノ−6−オキソ−ピリミジン(42)
2−メチルメルカプト−4−アミノ−6−オキソピリミジンの合成は、Johns et al., J. Biol. Chem., 14 : 381-387 (1913) に記載された。NaOHの10%溶液の 100mlに、25gの4−アミノ−2−メルカプト−6−オキソピリミジン粉末(Aldrich、米国ウィスコンシン州ミルウォーキー)を添加した。この溶液に、25gの工業用ジメチルサルフェートを少しずつ添加し、各添加後よく震盪した。
ある場合において、生ずる沈澱が濃厚になり過ぎて混合が不可能となったので、溶液をH2O で希釈ことが必要であった。混合物を室温において15分間放置した後、それは酸性反応を示し、沈澱を吸引濾過した。このようにして得られたメルカプトピリミジンをまだ湿潤している間にフラスコに取り出し、 200mlのアルコールを添加し、この混合物をアルコールのベンゾイルペルオキシドに加熱した。次いで、フラスコを冷却し、室温において1時間放置した。濾過すると、20〜25gの純粋な42が得られた。これは計算重量の75〜90%であった。
b)4−アミノ−1−メチル−2−メチルチオ−6−オキソジヒドロピリミジン(43)
4−アミノ−1−メチル−2−メチルチオ−6−オキソジヒドロピリミジンの合成は、Johns et al., J. Biol. Chem., 20 : 153-160 (1915) に記載された。65mlの1N水酸化カリウムの溶液に、10gの2−メチルメルカプト−4−アミノ−6−オキソ−ピリミジン(42)を添加した。この溶液に、9gのジメチルサルフェートを添加すると同時にこの溶液を頻繁に振盪することによって撹拌した。白色の結晶質沈澱がほとんど直ちに形成し始め、これはすぐに非常に大量となった。
溶液がリトマスに対して酸性となるとすぐに、結晶を吸引濾過した。濾液をNaOHで中和し、蒸発乾固した。残留物を冷水で洗浄し、固体状物を濾過し、既に得られた結晶に添加した。次いで一緒に固体状物を希薄アンモニアで粉砕して、未変化の2−メチルメルカプト−4−アミノ−6−オキソ−ピリミジンを溶解し、その少量は存在することがわかった。アンモニア中に溶解しない残留物の部分は、融点とエーテル中の溶解度が異なる2つの化合物から成っていた。低い融点を有する化合物はエーテルに非常に可溶性であったが、高い融点を有する化合物はこの溶媒にほとんど不溶性であった。したがって、いずれもこれらの化合物を互いに分離する。手段として働いた。
エーテル中に可溶性の化合物は2−メチルメルカプト−4−アミノ−6−メトキシピリミジンであった。次いで固体状残留物をアルコールから再結晶化させると、43が細長いプリズムとして得られた(収率=60%、融点 255℃)。C6H9ON3Sについて分析:N,24.57。実測値:N,24.71 。
c)6−アミノ−3−メチル−2−メチルチオ−5−ニトロソ−ピリミジン−4−オン(44)
6−アミノ−3−メチル−2−メチルチオ−5−ニトロソ−ピリミジン−4−オン(=4−アミノ−1−メチル−2−メチルチオ−5−ニトロソ−6−オキソジヒドロピリミジン)の合成は、Schneider et al., Chem. Ber. 107 : 3377-3394 (1974) に記載された。1リットルの30%酢酸中の4−アミノ−1−メチル−2−メチルチオ−6−オキソジヒドピリミジン(43)の懸濁液に、 100mlのH2O中の50gの亜硝酸ナトリウムの溶液を滴下した。この混合物を室温においてさらに1時間撹拌し、次いで冷蔵庫中で一夜冷却した。沈澱を集め、H2O で洗浄し、次いでアセトンで洗浄し、 100℃において乾燥した。これにより、 119.5g(92%)のクロマトグラフィー的に均一な粗生成物が得られた(融点 230℃分解)。この物質の1gを 240mlのH2O から再結晶化させると、44が0.52gの青色結晶として得られた(融点 234℃分解)。
d)5,6−ジアミノ−3−メチル−2−メチルチオ−ピリミジン−4−オン(45)
4.0g(0.02mole)の6−アミノ−3−メチル−2−メチルチオ−5−ニトロソ−ピリミジン−4−オン(44)に、40mlの20%水性硫化アンモニウム溶液を添加した。この混合物を還流下に30分間加熱した。冷却後、沈澱を集め、少量のエタノールで洗浄し、デシケーター中で乾燥すると、45が2.72g(75%収率)の無色の結晶として得られた(融点 211−212 ℃)。
e)1−メチル−2−メチルメルカプト−4−アミノ−6−オキソ−ジヒドロピリミジン−アゾチメン炭酸−5エチルエステル(46)
1−メチル−2−メチルメルカプト−4,5−ジアミノ−6−オキソ−ジヒドロピリミジン(5,6−ジアミノ−3−メチル−2−メチルチオ−ピリミジン−4−オン)からの3−メチル−2−メチルチオ−プテリジン−4,7−ジオンの合成、工程cおよびdは、Pfleiderer, Chem. Ber. 91 : 1670 (1958) に記載された。この溶液を室温に冷却し、次いで6gのエチルグリオキシレート−ヘミエチルアセタールと一緒にした。直ちに生ずる濃厚な沈澱を1時間後取り出し、エタノールから再結晶化させると、46gの8gの鮮明な黄色結晶が得られた(融点 178℃)。C10H14N4O3S・H2O:C,41.66 ;H,5.59;N,19.44 。実測値:C,42.18 ; H,5.75;N,19.32 。
f)3−メチル−2−メチルチオ−プテリジン−4,7−ジオン(47)
200mlの 0.5N NaHCO3に、8gの1−メチル−2−メチルメルカプト−4−アミノ−6−オキソ−ジヒドロピリミジン−アゾメチン炭酸−5エチルエステル(46)を添加した。この溶液を30分間還流させた。この透明な溶液を動物活性炭で処理し、次いでpH1に加熱酸性化した。いったん冷却すると、沈澱を集め、H2O から再結晶化させると、47が 4.5gの3−メチル−2−メチルチオ−ピリミジン−4,7−ジオンの薄黄色結晶として得られた(融点 292−294℃)。C8H8N4O2S:C,42.86 ;H,3.60;N,24.99 。
実測値:C,42.70 ;H,3.58;N,24.73 。
g)3−メチル−2−メチルチオ−8−〔2−デオキシ−3,5−ジ−O−(4t−クロロ−β−D−リボフラノシル〕プテリジン−4,7−ジオン(48)
3−メチル−2−メチルチオ−プテリジン−4,7−ジオン(47)の結晶を、高真空下に 100℃において乾燥炉中で乾燥した。次いで 5.6g(25mmol)の乾燥した結晶を、 250mlの無水アセトニトリル中にアルゴン雰囲気下に、12.9gの2−デオキシ−3,5−ジ−O−(4−クロロベンゾイル)−D−リボフラノシルクロライド(トリイル誘導体について実施例3、工程(a)におけるようにして製造した)とともに懸濁させた。
次いで3mlのヘキサメチルジシラザンおよび2mlのトリエチルシリルクロライドを添加した。この混合物を30分間撹拌し、次いで 7.4mlのSnCl4 を2分以内に滴下した。正確に20分の反応後、この混合物を1200mlの重炭酸ナトリウムの冷却した飽和水溶液の中にゆっくり注いだ。次いで溶液を3回各 200mlの酢酸エチルで抽出した。プールした有機層をNaClで飽和溶液で洗浄し、硫酸マグネシウムで乾燥し、蒸発乾固し、3回CH2Cl2とともに共蒸発させた。
主としてα,β−アノマーヌクレオシド混合物から成る生ずる残留物を分別結晶化により分離した。第1の結晶化を 200mlのメタノール/350ml の酢酸エチルで実施した。生ずる沈澱を再び 200mlのメタノール/280ml の酢酸エチルから再結晶化させ、次いで生ずる固体状物をもう一度 200mlのメタノール/500ml の酢酸エチルから再結晶化させると、4.45gの純粋なα−ヌクレオシドから成る無色の結晶が得られた(融点 188−191 ℃,29%収率)。濾液を一緒にし、蒸発させ、残留物を 100mlのメタノール/130ml の酢酸エチルから再結晶化させると、 1.8gのα,β−混合物が得られた(12%収率)。その濾液を再び蒸発乾固し、残留物を50mlの酢酸エチル/50mlのエーテルから再結晶化させると、48が6.79g(44%の収率)のクロマトグラフィー的に純粋な結晶質β−ヌクレオシドとして得られた(融点 130−133 ℃)。C27H22Cl2O7S:C,52.52;H,3.59;N,9.07。実測値:C,52.45 ;H,3.61;N,8.90。
h)3−メチル−8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)イソキサントプテリン(2−アミノ−3−メチル−8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)プテリジン−4,7−ジオン)(49)
100mlの乾燥アセトニトリル中の 3.3g(4mmol)の3−メチル−2−メチルチオ−8−〔2−デオキシ−3,5−ジ−O−(4t−クロロ−β−D−リボフラノシル〕プテリジン−4,7−ジオン)(48)の溶液を、 100mlの飽和メタノール性アンモニアに室温において添加した。少量の不溶性物質を濾過し、濾液を蒸発乾固した。メタノールとの2回の共蒸発後、沈澱を20mlの温かいメタノール中に溶解した。次いで50mlのエチルエーテルを添加し、この混合物をアイスボックス中で3日間冷却した。沈澱を集め、60℃において真空下に乾燥すると、49が1.46g(88%収率)の無色の結晶として得られた(融点>250 ℃)。C12H15N5O5・1/2H2Oについての分析:C,45.28 ;H,5.07;N,22.00 。実測値:C,45.55 ;H,5.07;N,21.92 。
i)3−メチル−8−(2−デオキシ−5−O−ジメトキシトリチル−β−D−リボフラノシル)イソキサントプテリン(50)
3.1g(10mmol)の3−メチル−8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)イソキサントプテリン(49)に、50mlの乾燥ピリジンを添加した。次いでこの溶液を共蒸発させた。共蒸発を各50mlの乾燥ピリジンで3回反復した。次いで残留物を50mlの乾燥ピリジン中に懸濁させた。この溶液に、 5.1g(15mmol)のジメトキシトリチルクロライドを添加し、トリメチルシリル室温において撹拌した。10分後、透明溶液が得られ、10mlのメタノールの添加により反応を停止させた。この溶液を蒸発させ、残留物をCH2Cl2中に溶解し、次いで重炭酸ナトリウムの5%水溶液で2回抽出した。
有機層を硫酸マグネシウムで乾燥し、濾液を再び蒸発させた。残留物を少量のCH2Cl2/メタノール中に溶解し、フラッシュクロマトグラフィーのためにシリカゲルのカラム(3×20cm、トルエン/酢酸エチルとともにパックされた)上に置いた。溶媒混合物の勾配を適用して、精製を達成しなくてはならなかった: 500mlのトルエン/酢酸エチル1:1, 2.5リットルの酢酸エチル、1リットルの酢酸エチル/メタノール99:1および2リットルの酢酸エチル/メタノール98:2。酢酸エチル/メタノール中の物質の画分を蒸発させ、高真空下に乾燥すると、50が 3.9g(63%)の無色のアモルファス固体状物として得られた。C33H33N5O7・1/2H2Oについての分析:C,63.86 ;H,5.52;N,11.28 。実測値:C,63.90 ;H,5.82;N,10.86 。
j)3−メチル−8−(2−デオキシ−5−O−ジメトキシトリチル−β−D−リボフラノシル)イソキサントプテリン−3’−O−(β−シアノエチル,N−ジイソプロピル)ホスホルアミダイト(51)
3.06g(4.9mmol)の3−メチル−8−(2−デオキシ−5−O−ジメトキシトリチル−β−D−リボフラノシル)イソキサントプテリン(50)および0.18g(25mmol)のテトラゾールの懸濁液を、アルゴン雰囲気下に、 2.2g(7.3mmol)のβ−シアノエトキシ−ビス−ジイソプロピルホスファンとともに撹拌した。この懸濁液は30分後透明となり、反応を4時間後に停止させた。反応溶液を重炭酸ナトリウムの5%水溶液で1回抽出し、次いで有機層を硫酸マグネシウムで乾燥し、濾液を蒸発乾固させた。シリカゲルのカラム(3×20cm)上のフラッシュクロマトグラフィーにより、 200mlのヘキサン/酢酸エチル2:1、次いで2リットルのヘキサン/酢酸エチル1:1中において、精製を実施した。生成物の画分を集め、蒸発乾固し、高真空下に乾燥すると、51が2.38g(59%の収率)の無色のアモルファス固体状物として得られた。C42H50N7O8P・H2O(820.8)についての分析:C,61.45 ;H,6.26;N,11.94 。
実測値:C,61.56 ;H,6.47;N,11.51 。
実施例8. 式VIIIのホスホルアミダイト:(6,7−ジメチル−4−〔2−(4−ニトロフェニル)エトキシカルボニル)アミノ−1−(2−デオキシ−5−O−ジメトキシ−トリチル−β−D−リボフラノシル)プテリジン−2−オン−3’−O−(β−シアノエチル、N−ジイソプロピル)ホスホルアミダイト(59)の合成
a)4,5−ジアミノウラシル−塩酸塩(52)
物を水蒸気浴上で還流下に激しく撹拌しながら4時間加熱した。約2時間後、反応混合物を実際に固体状物となり、撹拌を停止しなくてはならない。反応時間の終わりにおいて、1リットルの熱(80℃)H2O を反応混合物に添加し、撹拌を再開する。完全に溶解した後、撹拌混合物を80℃に15分間加熱し、次いで氷酢酸でリトマスに対して中和する。追加の氷酢酸(75ml)を添加し、次いで70mlのH2O 中に溶解した64.8g(0.94mole)の亜硝酸ナトリウムを注意して添加した。バラ赤色のニトロソ化合物は膨張した沈澱としてほとんど直ちに分離し、これをは撹拌機をほとんど停止させた。数分後、ニトロソ化合物を濾過により除去し、少量の氷水で2回洗浄した。湿潤物質を3リットルのフラスコに戻し、 460mlの温かいH2O(50℃)を添加した。
スラリーを水蒸気浴上で加熱しながら撹拌し、ニトロソ化合物の赤色が完全に消失するまで、固体状ナトリウムヒドロサルファイトを添加した。次いで、追加の30gのナトリウムヒドロサルファイトを添加し、薄黄褐色懸濁液を加熱しながらさらに15分間撹拌し、放冷した。密なジアミノウラシル重亜硫酸塩を冷却した溶液から濾過し、H2O でよく洗浄し、部分的に乾燥した。
粗生成物はその塩酸塩への変換により容易に精製された。重亜硫酸塩を広口の1リットルのフラスコに移し、生ずる混合物のコンシステンシーが機械的撹拌を可能とするまで、濃塩酸を添加した(100〜200ml の酸)。スラリーを水蒸気浴上で撹拌しながら1時間加熱した。黄褐色のジアミノウラシル塩酸塩を焼結ガラスの漏斗上に濾過し、アセトンでよく洗浄し、五酸化リンの存在下に真空乾燥すると、 104〜124 gの52(68〜81%)が得られた。
b)6,7−ジメチルルマジン(53)
6,7−ジメチルルマジンの合成は、Pfleiderer et al., Chem. Ber., 106 : 3149-3174 (1973) に記載されている。50mlのH2O ,20mlのエタノール、および1mlの濃HCl から成るの溶液に、20mlのジアセチルを添加した。この溶液を加熱沸騰させ、 450mlのH2O 中の20gの4,5−ジアミノウラシル塩酸塩(52)の溶液の数滴をゆっくり添加した。この混合物を還流下に2時間加熱し、アイスボックス中で冷却し、生ずる沈澱(18.7g)を集めた。沈澱が溶解するまで希薄アルミン酸ナトリウム溶液を添加した 500mlのH2O 中に沈澱を溶解することによって、沈澱を精製した。溶液を活性炭を通して濾過し、次いで濾液を沸騰する希薄酢酸の中に滴下した。冷却後、混合物を 100℃の温度において減圧下に乾燥すると、53が17.0g(79%の収率)の事実上無色の結晶として得られた(融点>360 ℃)。
c)6,7−ジメチル−1−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−トルオイル−β−D−リボフラノシル)ルマジン(54)
6,7−ジメチル−1−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−トルオイル−β−D−リボフラノシル)ルマジンの合成は、Ritzmannet al., Liebigs Ann. Chem., 1217-1234 (1977)に記載されている。50mlのヘキサメチルジシラザンに、7.68gの6,7−ジメチルルマジン(53)および数個の硫酸アンモニウム結晶を添加した。この溶液が透明となるまで、これを還流下に約24加熱した。次いで過剰のヘキサメチルジシラザンを真空下に蒸留除去した。残留物を 220mlの無水ベンゾール中に溶解し、16gの3,5−ジ−O−p−トルオイル−2−デオキシ−d−エリスロ−ペントフラノシルクロライドを添加し、この溶液を室温において乾燥条件下に1週間撹拌した。
この溶液に、5mlのメタノールを添加した。この溶液を蒸発乾固し、残留物を 200mlのメタノールから再結晶化させた。ほぼDC純粋な6,7−ジメチル−1−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−4−チオルマジン(β−異性体)を沈澱させた。 300mlのメタノールからのこの第1画分の更新した再結晶化は、2.36gの純粋なβ異性体を与えた。濾液を精製し、蒸発乾固し、次いでシリカゲルのカラム(70×5cm)のクロマトグラフィーにかけ、クロロホルム/メタノール(30:1)を使用した。第1の主要な画分は、それを無色のアモルファス固体状物に蒸発させた後、 6.5gのDC純粋な6,7−ジメチル−1−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−4−チオルマジン(β−異性体)を与えるように思われる。
引き続く混合した画分をまた蒸発乾固させ、 100mlのメタノールから再結晶化させ、次いで追加の2.67gのβ異性体の無色の結晶が沈澱した(融点 154−155 ℃)。濾液を再び蒸発乾固させ、シリカゲルのカラム(900g)上に注ぎ、クロロホルム/アセトン(9:1)で展開した。追加の 2.7gのα異性体がより大きいRF 値を有する主要な画分から得られ、そして追加の0.43gのβ異性体が低いRF 値を有する画分から得られた。合計の収量は5.46g(25%)の無色の結晶(融点 154−155 ℃)の形態のβ異性体および 9.2g(43%)のアモルファス固体状物(融点 126−132 ℃)としてα異性体として得られた(融点54から成っていた。α−およびβ−D−アノマーの帰属は、Ritzman et al.の論文後に、Cao et al., Helv. Chim. Acta., 75 : 1267-1273 (1992)により逆転されたことに注意すべきである。
d)6,7−ジメチル−1−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−4−チオルマジン(55)
20mlのトルエン中の 0.871g(1.6mmol)の6,7−ジメチル−1−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−トルオイル−β−D−リボフラノシル)ルマジン(54)および 0.403g(1mmol)のラウェッソン(Lawesson) 試薬の混合物を20時間還流させた。次いでこの混合物を蒸発させ、残留物を20mlのCH2Cl2の中に取り、次いで重炭酸ナトリウムの飽和溶液で2回処理した。水性相を3回各10mlのCH2Cl2で抽出し、一緒にした抽出液を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、再び蒸発させた。残留物を 150mlのメタノールから再結晶化させると、55が0.65g(75%収率)のオレンジ色結晶として得られた(融点 166−168 ℃)。C29H28N4O6S・H2O(578.6)についての分析:C,60.20 ;H,5.22;N,9.68。実測値:C,60.43 ;H,5.06;N,9.72。
e)4−アミノ−6,7−ジメチル−1−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)プテリジン−2−オン(56)
オートクレープ中で、25mlのメタノール中のアンモニアの飽和溶液中の0.42g(0.75mmol)の6,7−ジメチル−1−(2−デオキシ−3,5−ジ−O−p−トルオイル−β−D−リボフラノシル)−4−チオルマジン(55)を 100℃に16時間加熱した。冷却後、溶液を蒸発させ、残留物をCH2Cl2で処理した。固体状物質を集め、エーテルで洗浄し、高真空下に乾燥すると、56が 0.207g(91%の収率)の無色の結晶粉末状物として得られた(融点>℃分解)。C13H17N5O4・H2Oについての分析:C,49.36 ;H,5.74;N,22.14 。実測値:C,49.17 ;H,5.47;N,21.80 。
f)6,7−ジメチル−4−〔2−(4−ニトロフェニル)エトキシカルボニル〕アミノ−1−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−2−オン(57)
80mlの無水DMF 中の1.54g(5mmol)の4−アミノ−6,7−ジメチル−1−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)プテリジン−2−オン(56)および1.87g(6mmol)の1−メチル−3−〔2(4−ニトロフェニル)エトキシカルボニル〕イミダゾリウムクロライド(参照、Himmelsbach, et al. Tetrahedron 40 : 59 (1984)これは引用することによって本明細書の一部とされる)の混合物を室温において一夜撹拌した。この溶液に、 100mlのH2O を撹拌しながらゆっくり添加した。次いでこの溶液を冷却し、沈澱を吸引により集め、メタノールおよびエーテルで洗浄し、デシケーター中で乾燥すると、57が 2.0g(80%の収率)の無色の結晶として得られた(融点 154−155 ℃)。C22H24N6O8・H2Oについての分析:C,59.96 ;H,5.01;N,16.21 。実測値:C,50.51 ;H,5.15;N,15.84 。
g)6,7−ジメチル−4−〔2−(4−ニトロフェニル)エトキシカルボニル〕アミノ−1−(2−デオキシ−5−O−ジメトキシトリチル−β−D−リボフラノシル)プテリジン−2−オン(58)
2.0g(4mmol)の6,7−ジメチル−4−〔2−(4−ニトロフェニル)エトキシカルボニル〕アミノ−1−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−2−オン(57)から、結晶を20mlの無水ピリジンとともに2回共蒸発させることによって、水を除去した。残留物を 100mlの乾燥ピリジン中に溶解し、これに1.63g(4.8mmol)のジメトキシトリチルクロライドを添加した。
次いでこの混合物を室温において18時間撹拌した。反応を10mlのメタノールの添加によりクエンチングし、次いで蒸発させ、最後に残留物をCH2Cl2中に溶解した。この溶液を重炭酸ナトリウムの飽和溶液で処理した。分離後、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、再び蒸発させた。残留物を少量のCHCl3 中に溶解し、シリカゲルのカラム上に置き、次いでトルエン/酢酸エチル4:1〜1:1の勾配で溶離した。主要な画分がトルエン/酢酸エチル2:で得られ、蒸発させると、58が2.84g(88%の収率)の無色のアモルファス固体状物として得られた。C43H42N6O10についての分析:C,64.33 ;H,5.27;N,10.47 。実測値:C,64.51 ;H,5.23;N,10.24 。
h)6,7−ジメチル−4−〔2−(4−ニトロフェニル)エトキシカルボニル〕アミノ−1−(2−デオキシ−5−O−ジメトキシ−トリチル−β−D−リボフラノシル)プテリジン−2−オン−3’−O−(β−シアノエチル、N−ジイソプロピル)ホスホルアミダイト(59)
40mlの乾燥CH2Cl2および20mlの乾燥アセトニトリルに、 1.0g(1.25mmol)の6,7−ジメチル−4−〔2−(4−ニトロフェニル)エトキシカルボニル〕アミノ−1−(2−デオキシ−5−O−ジメトキシトリチル−β−D−リボフラノシル)プテリジン−2−オン(58)、44mg(0.63mmol)のテトラゾールおよび 0.754g(2.5mmol)のβ−シアノエトキシ−ビス−ジイソプロピル−ホスファンを撹拌しながら添加した。
18時間後、この溶液を50mlのCH2Cl2で希釈し、次いで重炭酸ナトリウムの飽和溶液で抽出し、有機層硫酸ナトリウムで乾燥し、最後に蒸発させた。残留物を少量のCH2Cl2中に溶解し、次いでシリカゲルのクロマトグラフィーにより精製し、トルエン/酢酸エチル4:1〜1:1の勾配を使用した。主要な画分を蒸発させ、高真空下に乾燥すると、59が0.98g(78%の収率)のアモルファス固体状物として得られた。C52H59N8O11(1003.1)についての分析:C,52.27 ;H,5.93;N,11.17 。実測値:C,62.00 ;H,6.01;N,10.65 。
実施例9. 式VII のホスホルアミダイト:2−アミノ−6−メチル−4−p−ニトロフェニルエチル−8−(5−O−ジメトキシトリチル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン−3'−O−(β−シアノエチル、N−ジイソプロピル)ホスホルアミダイト(71)の合成
5,6−ジアミノ−2−メチルチオ−ピリミジン−4−オン(2−メチルメルカプト−4,5−ジアミノ−6−オキソピリミジン)の合成、工程(a)〜(c)は、Jons et al., J. Biol. Chem., 14 : 381-388 (1913)に記載されているように実施した。
a)2−メチルメルカプト−4−アミノ−6−オキシ−ピリミジン)(42)
2−メチルメルカプト−4−アミノ−6−オキシピリミジンの合成は、Jons et al., J. Biol. Chem., 14 : 381-388 (1913)に記載されており、そして実施例6、工程(a)に例示されている。
b)2−メチルメルカプト−4−アミノ−5−ニトロソ−6−オキソピリミジン(60)
350mlのH2O に、20gの2−メチルメルカプト−4−アミノ−6−オキソピリミジン(42)および 5.1gのNaOHを添加した。40mlの水中の亜硝酸ナトリウムの溶液を添加した。次いで、この混合物を17gの氷酢酸の徐々の添加により酸性化した。形成する沈澱は白色であったが、短時間で青色に変化した。混合物を室温において一夜放置し、次いで沈澱を濾過し、冷水で洗浄し、乾燥しないで、2−メチルメルカプト−4,5−ジアミノ−6−オキソピリミジンの製造に使用した。ニトロソ誘導体の収率はほとんど定量的であった。それはわずかに熱水またはアルコール中に可溶性であり、ベンゼン中で可溶性ではなかった。それはアルカリ中で赤色溶液を形成し、そして酸中で青色溶液を形成した。一部分を分析のためにアンモニア中に溶解し、酢酸で沈澱させることによって精製した。この物質は溶融せず、約 255℃において分解し始めた。C5HO2N4Sについての分析:N,30.10 。実測値:N,30.16 。
c)5,6−ジアミノ−2−メチルチオ−ピリミジン−4−オン(61)
1リットルのフラスコに、50mlの硫化アンモニウムの10%溶液を添加した。この溶液を水蒸気浴上で加熱した。前の実験において得られた湿潤2−メチルメルカプト−4−アミノ−5−ニトロソ−6−オキソ−ピリミジン(60)を徐々に添加した。ニトロソ化合物が過剰に存在することを示すように溶液が赤色になったとき、硫化アンモニウムをまた添加した。硫化アンモニウムは過剰に存在したとき、溶液は黄色であった。ニトロソ化合物のすべてが還元されたとき、過剰の硫化アンモニウムの添加は回避すべきであるか、または得られたジアミノ化合物は高度に着色するであろう。
d)6−エトキシカルボニルメチル−2−メチルチオ−プテリジン−4,7−ジオン(62)
17.2g(0.1mole)の5,6−ジアミノ−2−メチルチオ−ピリミジン−4−オン(61)および22.6gのナトリウムエチルオキサリルアセテートの混合物を、 200mlの氷酢酸中で80℃に30分間加熱した。冷却後、沈澱を集め、H2O で洗浄し、乾燥した。次いで粗物質を再びEtOH/H2O 1:1中で加熱することによって溶解させ、 170mlの飽和NaHCO3を添加した。熱溶液を活性炭で処理し、濾液をゆっくり 200mlの熱氷酢酸中に撹拌しながら注いだ。黄色沈澱を濾過し、H2O およびエタノールで洗浄し、 100℃において乾燥すると、62が18.9g(64%)の輝く結晶として得られた(融点 213℃)。C11H12N4O4S(296.3)についての分析:C,44.59 ;H,4.08;N,18.91 。実測値:C,44.49 ;H,4.03;N,18.88 。
e)6−メチル−2−メチルチオ−プテリジン−4,7−ジオン(63)
120mlの 2.5N NaOH中の19.7g(66.5mmol)の6−エトキシカルボニルメチル−2−メチルチオ−プテリジン−4,7−ジオン(62)の溶液を80℃において30分間撹拌した。熱溶液を活性炭で処理し、濾過し、濾液を50mlの熱氷酢酸の中にゆっくり添加した。沈澱を冷却後集め、H2O およびアセトンで洗浄し、 100℃において乾燥すると、63が14.3g(96%)の黄色結晶粉末状物として得られた(融点 275℃分解)。C8H8N4O2S(224.3)についての分析:C,42.85 ;H,3.60;N,24.99 。実測値:C,42.79 ;H,3.59;N,25.06 。
f)6−メチル−2−メチルチオ−8−(3,5−ジ−O−p−トルオイル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−4,7−ジオン(64)
240mlの無水アセトニトリル中の 4.0g(17.83mmol)の6−メチル−2−メチルチオ−プテリジン−4,7−ジオン(63)の懸濁液に、8ml(53.6mmol)のDBU を添加した。この混合物を室温において30分間撹拌した。生ずる透明な溶液に、4.62g(11.9mmol)の3,5−ジ−O−p−トルオイル−2−デオキシ−α−D−リボフラノシルクロライド(16)を添加し、次いで混合物を室温において湿気を排除して6時間撹拌した。
この溶液に、 100mlのジクロロメタン中の 2.4mlの氷酢酸を添加した。この溶液を5分間撹拌し、次いで減圧下に蒸発乾固させると、シロップ状物が得られ、これをシリカゲルのカラム(16×8.5cm)のクロマトグラフィーにかけ、まず 3.5リットルのトルエン/酢酸エチル1:1、次いで 2.5リットルのトルエン/アセトン1:2、最後に3リットルのジクロロメタン/メタノール 100:3で溶離した。生成物の画分を集め、蒸発させ、残留物をトルエンから再結晶化させると、64が2.12g(31%)の無色の結晶として得られた(融点 196−197 ℃)。C29284O7S(576.6)についての分析:C,60.41 ;H,4.89;N,9.72。実測値:C,60.26 ;H,4.96;N,9.68。
g)6−メチル−2−メチルチオ−4−p−ニトロフェニルエトキシ−8−(3,5−ジ−O−p−トルオイル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(65)
75mlのジオキサン中の2.19g(3.8mmol)の6−メチル−2−メチルチオ−8−(3,5−ジ−O−p−トルオイル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−4,7−ジオン(64),9.95g(5.69mmol)のp−ニトロ−フェニルエタノールおよび1.52g(5.69mmol)のトリフェニルホスファンの溶液に、1.16g(5.7mmol)のエチルアゾジカルボキシレートを添加した。この混合物を室温において 2.5時間撹拌した。溶媒を減圧下に除去し、残留物をシリカゲルのカラム(5.3×15cm)のフラッシュクロマトグラフィーにより精製し、 300mlのトルエン、 250mlのトルエン/酢酸エチル8:1および 650mlのトルエン酢酸エチル6:1を使用した。生成物の画分を集め、蒸発乾固し、残留物CH2Cl2/AcoEt から再結晶化させると、65が2.31g(85%の収率)の無色の結晶として得られた(融点 122−125 ℃)。C37H35N5O9S(727.8)についての分析:C,61.23 ;H,4.86;N,9.65。実測値:C,61.18 ;H,4.95;N,9.67。
h)6−メチル−2−メチルスルホニル−4−p−ニトロフェニルエトキシ−8−(3,5−ジ−O−p−トルオイル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(65)
100mlの無水CH2Cl2中の2.27g(3.13mmol)の6−メチル−2−メチルチオ−4−p−ニトロフェニルエトキシ−8−(3,5−ジ−O−p−トルオイル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(65)の溶液に、撹拌しながら1.35g(>6.25mmol)のm−クロロ過安息香酸(80〜90%の純度)を添加した。24時間撹拌した後、この溶液を減圧下に10mlに濃縮し、m−クロロ過安息香酸の沈澱を濾過し、CH2Cl2(92×5ml)で洗浄し、次いで双方の濾液を蒸発させた。残留物をシリカゲルのカラム(5.3×14cm)上に置き、生成物をトルエン/AcOEt 5:2で溶離した。生成物の画分を小さい体積に濃縮し、これにより66は溶液の中から外に結晶化して 2.4g(86%)の無色の結晶が得られた(融点 193℃)。C37H35N5O11S(757.8)についての分析:C,58.65 ;H,4.66;N,9.24。実測値:C,58.77 ;H,4.69;N,9.30。
i)2−アミノ−6−メチル−4−p−ニトロフェニルエトキシ−8−(3,5−ジ−O−p−トルオイル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(67)
撹拌しながら、1.89g(2.5mmol)の6−メチル−2−メチルスルホニル−4−p−ニトロフェニルエトキシ−8−(3,5−ジ−O−p−トルオイル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(65)に、気体NH3 を80分間泡立てて通入した。次いでこの溶液を蒸発させ、2回CH2Cl2とともに共蒸発させ、生ずる残留物をシリカゲルのカラム(5.5×8cm)上に置き、クロマトグラフィーにかけ、トルエン/AcOEt 5:2で溶離した。生成物の画分を小さい体積に濃縮し、これにより67は溶液の中から外に結晶化して1.68g(97%)の無色の結晶が得られた(融点 208−209 ℃)。C36H34N6O9(694.7)についての分析:C,62.24 ;H,4.93;N,12.10 。実測値:C,61.98 ;H,4.94;N,12.14 。
j)2−アミノ−6−メチル−4−p−ニトロフェニルエトキシ−8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(68)
30mlのCH2Cl2および60mlのMeOH中の1.17g(1.69mmol)の2−アミノ−6−メチル−4−p−ニトロフェニルエトキシ−8−(3,5−ジ−O−p−トルオイル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(67)の溶液に、0.45g(3.37mmol)のナトリウムチオフェノレートを添加した。この溶液を室温におて16時間撹拌した。次いで11gのフラッシュシリカゲルを反応混合物に添加し、減圧下に蒸発させた。生ずる混合物をCH2Cl2/MeOH混合物(500mlの 100:1, 300mlの50:1および9:1)で前もって平衡化したシリカゲルのカラム(5.3×8.5cm)上に置いた。生成物の画分をプールし、蒸発させると、68が0.63g(81%)の微結晶質粉末状物として得られた(融点>220 ℃分解)。C20H22N6O7 (458.4)についての分析:C,52.40 ;H,4.84;N,18.34 。実測値:C,52.31 ;H,4.76;N,18.22 。
k)2−アミノ−6−メチル−8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−4,7−ジオン〔6−メチル−8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−イソキサントプテリン(69)
15mlのピリジン中の 0.195g(0.425mmol)の2−アミノ−6−メチル−4−p−ニトロフェニルエトキシ−8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(68)の溶液に、1.12ml(1.14mmol)のDBU を添加した。この溶液を室温において3時間撹拌した。次いでこの溶液を減圧下に蒸発させ、残留物を25mlのH2O 中に溶解し、CH2Cl2(3×25ml)で洗浄した。水性相をHClによりpH7に中和し、次いで小さい体積(5ml)に濃縮した。この混合物をアイスボックスの中に入れ、69は0.84g(71%)の無色の結晶として得られた(融点 300℃分解)。C12H15N5O3・1/2H2O(318.3)についての分析:C,44.28 ;H,5.06;N,22.00 。実測値:C,45.42 ;H,4.91;N,21.86 。
l)2−アミノ−6−メチル−4−p−ニトロフェニルエトキシ−8−(5−O−ジメトキシトリチル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(70)
15mlの無水ピリジン中の0.57g(1.22mmol)の2−アミノ−6−メチル−8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−4,7−ジオン〔6−メチル−8−(2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−イソキサントプテリン(69)の溶液に、 0.454g(1.34mmol)のジメトキシトリチルクロライドを添加した。
この混合物を室温において 1.5時間撹拌した。次いで、5mlのMeOHを添加し、この溶液を5分間撹拌し、次いで 100mlのCH2Cl2で希釈した。生ずる溶液を 100mlの飽和NaHCO3溶液で洗浄し、H2O (100ml)で2回洗浄した。有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、蒸発させ、残留物をクロマトグラフィーのためにシリカゲルのカラム(3×15ml)上に置き、トルエン/AcOEt 1:1で溶離した。生成物の画分を蒸発させると、70が 0.5g(54%)の固体状泡状物として得られた。C40H40N6O9(760.8)についての分析:C,63.14 ;H,5.30;N,11.05 。実測値:C,63.06 ;H,5.21;N,10.91 。
m)2−アミノ−6−メチル−4−p−ニトロフェニルエトキシ−8−(5−O−ジメトキシトリチル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン−3'−O−(β−シアノエチル、N−ジイソプロピル)ホスホルアミダイト(71)
15mlの無水CH2Cl2中の0.76g(1mmol)の2−アミノ−6−メチル−4−p−ニトロフェニルエトキシ−8−(5−O−ジメトキシトリチル−2−デオキシ−β−D−リボフラノシル)−プテリジン−7−オン(70)の溶液に、アルゴン雰囲気下に、0.425g(1.5mmol)の2−シアノエチル−ビス−N,N−ジイソプロピルアミノ−−ホスファンおよび35mg(0.5mmol)のテトラゾールを添加した。この溶液を室温において12時間撹拌した。次いでこの混合物を15mlのCH2Cl2で希釈し、1回10mlの飽和NaHCO3溶液で、2回飽和NaCl溶液で抽出した。
有機層を硫酸ナトリウムで乾燥し、蒸発させ、残留物をクロマトグラフィーのためにシリカゲルのカラム上に置き、少量のトリエチルアミンを含有するトルエン/AcOEt で溶離した。生成物の画分を集め、蒸発させると、黄色がかった泡状物が得られ、これを少量のトルエン中に溶解し、 100mlのn−ヘキサンの中に撹拌しながら滴下すると、吸引濾過および乾燥後、71が 0.865g(90%)の黄色がかった粉末状物として得られた(融点>150 ℃分解)。C50H57N8O10P(960.9)についての分析:C,62.97 ;H,5.98;N,12.32 。実測値:C,62.81 ;H,5.88;N,12.20 。
実施例10. 2'−デオキシ−β−D−リボフラノシル−プテリジン−5’−トリホスフェートの一般的合成
a)トリエチルアンモニウムプテリジン−2'−デオキシリボヌクレオシド−5'−モノホスフェート(72)
15mlのトリメチルホスフェートに、 6.5mMの適当なプテリジン−β−D−2'−デオキシリボヌクレオシドを添加する。すべての湿気を排除して、この混合物を−6℃に冷却する。次いでこの混合物を撹拌し、 1.5ml(16.3mmol)のPOCl3 を5分かけて滴下し、次いで混合物を0℃において2時間撹拌して透明溶液を得る。この溶液に、 120mlの 0.5Mトリエチルアンモニウム重炭酸塩の緩衝液pH7.5 を添加する。この溶液を15分間撹拌し、次いで真空蒸発させる。メタノールとともに数回共蒸発させた後、残留物H2O 中に溶解し、DEAE−セファデックスカラム(2.5×80cm;HCO3型)上に置く。0〜0.3 Mトリエチルアンモニウム重炭酸塩の緩衝液pH7.5 の直線の勾配を使用してクロマトグラフィーを実施し、8〜10リットルの緩衝液を使用する。
主要な画分は 0.2〜0.3 Mの緩衝液濃度において溶離される。この画分を30℃において真空蒸発させ、次いで生ずる残留物をメタノールとともに数回共蒸発させる。高真空下に乾燥すると、固体状物72が得られる。
b)トリエチルアンモニウムプテリジン−2'−デオキシリボヌクレオシド−5'−トリホスフェート(73)
トリエチルアンモニウムプテリジン−2'−デオキシリボヌクレオシド−5'−モノホスフェート(58)(1mmol)を無水ピリジンとともに3回共蒸発させ、次いで10mlの無水ジメチルホルムアミド(DMF)中に溶解する。無水条件下に 0.8g(5mmol)のカルボニルジイミダゾールを添加した後、この溶液を一夜撹拌する。0.33mlの無水メタノールを溶液に添加し、1時間撹拌することによって、過剰のカルボニルジイミダゾールをクエンチングする。
この溶液に、50mlの無水DMF 中の5mMのt−ブチルアンモニウムピロホスフェートの懸濁液を添加する。次いでこの混合物を室温において連続的20時間撹拌する。生ずる沈澱を濾過し、DMF で洗浄し、濾液を高真空下に30℃において蒸発させる。残留物をメタノールおよびH2O とともに数回共蒸発させ、次いでH2O 中に溶解し、DEAE−セファデックスカラム(2.5×80cm;HCO3型)上に置き、トリエチルアンモニウム重炭酸塩の緩衝液pH7.5 の直線の勾配で溶離し、約10リットルを使用する。生成物は 0.7Mの緩衝液濃度の画分の中に溶離される。画分をポリし、次いでメタノールとともに数回共蒸発させる。次いで混合物を高真空下に乾燥すると、73がアモルファス固体状物として得られる。
c)ナトリウムプテリジン−2'−デオキシリボヌクレオシド−5'−トリホスフェート(74)
10mlの無水メタノールの中に、 0.5mMのトリエチルアンモニウムプテリジン−2'−デオキシリボヌクレオシド−5'−トリホスフェート(73)を溶解する。この溶液を撹拌し、 1.5当量のアセトン中の1N NaI溶液をゆっくり滴下してナトリウム塩の沈澱を形成する。この懸濁液を 100mlのアセトンで希釈し、30分撹拌し、次いで固体状物を磁器の漏斗を通して吸引により集める。固体状物を小さい部分のアセトンで洗浄し、高真空下に乾燥すると、74が得られ、これはトリエチルアンモニウム塩よりも安定であり、分解しないで貯蔵することができる。
実施例11. プテリジン誘導体を含有するオリゴヌクレオチドの合成
下記のオリゴヌクレオチドをABI DNA 合成装置(380B型、Applied Biosystems、カリフォルニア州フォスターシティー)により合成した:
オリゴ1: 5'−GTN TGG AAA ATC TCT AGC AGT −3’(配列識別No:2),
オリゴ2: 5'−GTG TWG AAA ATC TCT AGC AGT −3’(配列識別No:3),
オリゴ3: 5'−GTG TGN AAA ATC TCT AGC AGT −3’(配列識別No:4),
オリゴ4: 5'−GTG TGG AAA ATC TCT ANC AGT −3’(配列識別No:5),
オリゴ5: 5'−GTG TGG AAA ATC TCT ANC ANT −3’(配列識別No:6),
オリゴ6: 5'−GTG TNG AAA ATC TCT ANC AGT −3’(配列識別No:7),
オリゴ7: 5'−ACT GCT AGA NAT TTT CCA CAC −3’(配列識別No:8),
オリゴ8: 5'−ACT GCT ANA GAT TTT CCA CAC −3’(配列識別No:9),
オリゴ9: 5'−ACT NCT AGA GAT TTT CCA CAC −3’(配列識別No:10)および
オリゴ10: 5'−ACT GCT NGA GAT TTT CCA CAC −3’(配列識別No:11)。
各オリゴヌクレオチドにおいて、1または2以上のグアノシンを式XVのプテリジンデオキシリボヌクレオチド(Nと表示する)で置換した。
プテリジンヌクレオチドを含有するオリゴヌクレオチドを合成するために、ジメトキシトリチルでブロックしたプテリジンホスホルアミダイトをDNA 合成装置上のボトルの口#5の中に入れた。
濃アンモニアの処理によりオリゴヌクレオチドの固体の支持体から切断し、アンモニア溶液を55℃に5時間加熱することによって脱保護した。次いで試料をスピード・バク・コンセントレーター(Speed Vac Concentrator) (Savant 、米国ニューヨーク州ファーミングデール)中で蒸発乾固させた。19:1の20%ポリアクリルアミドゲルの電気泳動により、オリゴヌクレオチドを精製した。バンドを紫外線吸収により検出し、切除し、粉砕およびソーキング方法により 0.3Mの酢酸ナトリウムpH5.2 の中に溶離した。最後に、MgCl2 を添加して 0.1 Mの濃度を達成し、試料をエタノール中で沈降させた。
TRIS緩衝液pH7.8 中のオリゴヌクレオチドの蛍光分析は、下表1に示す相対的量子を明らかにした。 360nmの励起波長を使用して、蛍光測定を行った。硫酸キニンを標準として使用し、測定をフルオロメーター(8000型、 SLM−Aminco、米国イリノイ州アーバナ)。
Figure 2009091358
実施例12. プテリジン誘導体を含有するオリゴヌクレオチドを利用するインテグラーゼ活性の実時間検出
オリゴヌクレオチド5’−GTGTGGAAAATCTCTAGCANT −3’(配列No:6)およびその相補体5’−ACTGCTAGAGATTTTCCACAC −3’を実施例11の方法に従い合成した。次いでオリゴヌクレオチドを一緒に 100mMのNaCl溶液中で85℃に加熱し、この溶液を室温にゆっくり冷却することによってアニーリングした。これにより、モデルの基質の二本鎖DNA 分子が形成した:
5'−GTG TGG AAA ATC TCT AGC ANT −3’(配列識別No:6)
3'−CAC ACC TTT TAG AGA TCG TCA −5’(配列識別No:12)
ここでNはプテリジンヌクレオチドを表す。
HIV−1インテグラーゼp−トルオイル−(3.5pmol/反応)を大腸菌(Escherichia coli) の発現ベクターを介して、Bushmann etal., Science, 249 : 1555-1558 (1990)に記載されているように、生産した。タンパク質は−70℃において1MのNaCl/20mMのHepes, pH7.6/1mMのEDTA/1mMのジチオスレイトール/20%のグリセロール(wt/vol)中で貯蔵した。
ストックp−トルオイル−(0.44mg/ml)をまずタンパク質貯蔵緩衝液(1MのNaCl/20mMのHepes, pH7.6/1mMのEDTA/1mMのジチオスレイトール/20%(wr/vol)グリセロール)中で1:3に希釈した。引き続く酵素の希釈は反応緩衝液(25mMの Mops, pH7.2/7.5mM のMnCl2/ウシ血清アルブミン、 100μg/ml/10mMの2−メルカプトエタノール)中で1:20であった。反応体積は60μlであった。最終の反応混合物は50mMのNaCl,1mMのHepes,50μMのEDTAおよび50μMのジチオスレイトール、10%(et/vol)のグリセロール、7.5mM のMnCl2, 0.1mg/mlウシ血清アルブミン、10mMの2−メルカプトエタノール、および20mMのMOPS, pH7.2 を含有した。
反応を酵素の添加により開始し、フルオロメーター(8000型、 SLM−Aminco、米国イリノイ州アーバナ)を使用して蛍光強度の変化を観測することによって、実時間において10〜20分間モニターした。励起波長は 360nmであり、そして放射波長は 460nmであった。
インテグラーゼは上記に示すモデル基質と反応して、下記の配列を生成した:
5'−GTG TGG AAA ATC TCT AGC A −3’ +NT
3'−CAC ACC TTT TAG AGA TCG TCA −5’
プテリジンヌクレオチドをオリゴヌクレオチドの中に組込んだとき、プテリジンヌクレオチドの蛍光はかなりクェンチングした(0.14の量子収量)。切断反応はこの反応はこのクエンチを解放し、シグナルの4倍増加を生じた(モノマーについて0.88の量子収量)。したがって、蛍光の増加を測定することによって、インテグラーゼの活性はアッセイされた。

Claims (105)

  1. 下記に示すように環の頂点1〜8をもつ式;
    Figure 2009091358
    (式中、R11はR12と組合わされて二重結合により環の頂点4に結合する単一のオキソ酸素を形成するか、またはR13と結合して環の頂点3と4との間の二重結合を形成し、
    12はR11と組合わされないとき、NH2 、および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択される構成員であり、
    13はR11と結合しないとき、低級アルキルまたはHであり、
    14はH、低級アルキルまたはフェニルから成る群より選択される構成員であり、
    15はR16と組合わされて二重結合により環の頂点2に接合する単一のオキソ酸素を形成するか、またはR17と結合して環の頂点1と2との間の二重結合を形成し、こうして環の頂点2および4は集合的に最大1つのオキソ酸素を有し、
    16はR15と組合わされないとき、H、フェニル、NH2 、および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択される構成員であり、
    15がR16と組合わされないとき、R18はR19と組合わされて二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    15がR16と組合わされるとき、R18はR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そしてR19はHおよび低級アルキルから成る群より選択される構成員であり、そして
    17はR15と結合しないとき、かつR20はR18と結合しないとき、
    Figure 2009091358
    であり、式中、
    21はH、トリホスフェート、および保護基から成る群より選択される構成員であり、
    22はH、OHおよび保護基で置換されたOHから成る群より選択される構成員であり、
    23はH、ホスホルアミダイト、H−ホスホネート、メチルホスホネート、ホスホロチオエート、ホスホトリエステル、ヘミスクシネート、固体の支持体に共有結合したヘミスクシネート、ジシクロヘキシルカーボジイミド、および固体の支持体に共有結合したジシクロヘキシルカーボジイミドから成る群より選択される構成員であり、
    13がHでありかつR23がHであるとき、R21はトリホスフェートであり、そして
    11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成しかつR23がHであるとき、R21はトリホスフェートである)
    を有する化合物。
  2. 14がH,CH3 およびフェニルから成る群より選択される、請求項1に記載の化合物。
  3. 14がHおよびCH3 から成る群より選択される、請求項1に記載の化合物。
  4. 16が、R15と結合しないとき、H、フェニル、NH2 、および保護基で2置換されたNH2 から成る群より選択される、請求項1に記載の化合物。
  5. 16が、R15と結合しないとき、Hおよびフェニルから成る群より選択される、請求項1に記載の化合物。
  6. 18がR20と結合するとき、R19がHおよびCH3 から成る群より選択される、請求項1に記載の化合物。
  7. 14がH,CH3 およびフェニルから成る群より選択される構成員であり、R16が、R15と結合しないとき、H、フェニルおよびNH2 から成る群より選択される構成員であり、そして、R18がR20と結合するとき、R19がHおよびCH3 から成る群より選択される、請求項1に記載の化合物。
  8. 12がベンゾイル、イソブチリル、フタロイル、ジ−n−ブチルアミノメチリデン、ジメチルアミノメチリデン、p−ニトロフェニルエトキシカルボニルおよびジメチルアミノメチレンアミノから成る群より選択される保護基で1または2置換されたNH2 である、請求項1に記載の化合物。
  9. 12がジ−n−ブチルアミノメチリデン、p−ニトロフェニルエトキシカルボニル、およびジメルチアミノメチレンアミノから成る群より選択される保護基で1置換されたNH2 である、請求項1に記載の化合物。
  10. 16がベンゾイル、イソブチリル、フタロイル、ジ−n−ブチルアミノメチリデン、ジメチルアミノメチリデン、p−ニトロフェニルエトキシカルボニルおよびジメチルアミノメチレンアミノから成る群より選択される保護基で1または2置換されたNH2 である、請求項1に記載の化合物。
  11. 16がジ−n−ブチルアミノメチリデン、p−ニトロフェニルエトキシカルボニル、およびジメルチアミノメチレンアミノから成る群より選択される保護基で1置換されたNH2 である、請求項1に記載の化合物。
  12. 21がH、トリチル、モノメトキシトリチル、ジメトキシトリチル、フタロイル、ジ−n−ブチルアミノメチリレン、およびジメチルアミノメチリデンから成る群より選択される、請求項1に記載の化合物。
  13. 21がジメトキシトリチル、ジ−n−ブチルアミノメチリレン、およびジメチルアミノメチリデンから成る群より選択される、請求項1に記載の化合物。
  14. 22がH,OHおよび置換OHから成る群より選択される構成員であり、前記置換OHはトリチル、モノメトキシトリチル、ジメトキシトリチル、テトラヒドロピラン−1−イル、4−メトキシテトラヒドロピラン−4−イル、1−(2−クロロ−4−メチル)フェニル−4−メトキシピペリジン−4−イル、t−ブチルジメチルシリル、p−ニトロフェニルエチルスルホニル、テトラヒドロピラニル、4−メトキシテトラヒドロピラニル、2−ニトロベンジル、9−フェニルキサンテン−9−イルおよびp−ニトロフェニルエチルから成る群より選択される構成員で置換されている、請求項1に記載の化合物。
  15. 22がHおよび置換OHから成る群より選択される構成員であり、前記置換OHがジメトキシトリチル、テトラヒドロピラン−1−イル、t−ブチルジメチルシリル、2−ニトロベンジル、およびp−ニトロフェニルエチルから成る群より選択される構成員で置換されている、請求項1に記載の化合物。
  16. 式中、
    11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、
    12がNH2 、および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択され、
    14がHであり、
    15がR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、
    16がフェニルであり、
    18がR19と組合わされて二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そして
    20
    Figure 2009091358
    である、
    請求項1に記載の化合物。
  17. 式中、
    11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、
    12がNH2 、および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択され、
    14がフェニルであり、
    15がR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、
    16がHであり、
    18がR19と組合わされて二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そして
    20
    Figure 2009091358
    である、請求項1に記載の化合物。
  18. 式中、
    11がR13と組合わされて二重結合により環の頂点4に接合した単一のオキソを形成し、
    13がCH3 であり、
    14がHであり、
    15がR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、
    16がNH2 であり、
    18がR19と組合わされて二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そして
    20
    Figure 2009091358
    である、
    請求項1に記載の化合物。
  19. 式中、
    11がR12と組合わされて二重結合により環の頂点4に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    13がHであり、
    14がHであり、
    15がR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、
    16がNH2 および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択され、
    18がR19と結合して二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そして
    20
    Figure 2009091358
    である、
    請求項1に記載の化合物。
  20. 式中、
    11がR12と結合して二重結合により環の頂点4に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    13がHであり、
    14がCH3 であり、
    15がR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、
    16がNH2 および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択され、
    18がR19と組合わされて二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そして
    20
    Figure 2009091358
    である、
    請求項1に記載の化合物。
  21. 式中、
    11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、
    12がNH2 、および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択され、
    14がCH3 であり、
    15がR16と組合わされて二重結合により環の頂点2に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    17
    Figure 2009091358
    であり、
    18がR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そして
    19がCH3 である、
    請求項1に記載の化合物。
  22. 式中、
    11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、
    12がNH2 、および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択され、
    14がHであり、
    15がR16と結合して二重結合により環の頂点2に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    17
    Figure 2009091358
    であり、
    18がR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そして
    19がCH3 である、
    請求項1に記載の化合物。
  23. 式中、
    11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、
    12がNH2 、および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択され、
    14がCH3 であり、
    15がR16と組合わされて二重結合により環の頂点2に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    17
    Figure 2009091358
    であり、
    18がR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そして
    19がHである、
    請求項1に記載の化合物。
  24. 式中、
    11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、
    12がNH2 、および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択され、
    14がHであり、
    15がR16と組合わされて二重結合により環の頂点2に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    17
    Figure 2009091358
    であり、
    18がR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そして
    19がHである、
    請求項1に記載の化合物。
  25. 12がNH2 である、請求項16に記載の化合物。
  26. 式中、
    12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そして
    23がH−ホスホネート、ホスホルアミダイト、ヘミスクシネート、および固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートから成る群より選択される構成員である、
    請求項16に記載の化合物。
  27. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである、
    請求項16に記載の化合物。
  28. 12がジメチルアミノメチレンアミノである、請求項27に記載の化合物。
  29. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである、
    請求項26に記載の化合物。
  30. 12がジメチルアミノメチレンアミノである、請求項29に記載の化合物。
  31. 12がNH2 である、請求項17に記載の化合物。
  32. 式中、
    12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そして
    23がH−ホスホネート、ホスホルアミダイト、ヘミスクシネート、および固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートから成る群より選択される構成員である、
    請求項17に記載の化合物。
  33. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである、
    請求項32に記載の化合物。
  34. 12がジメチルアミノメチレンアミノである、請求項33に記載の化合物。
  35. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである、
    請求項32に記載の化合物。
  36. 12がジメチルアミノメチレンアミノである、請求項35に記載の化合物。
  37. 23がH,H−ホスホネート、ホスホルアミダイト、ヘミスクシネート、および固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートから成る群より選択される構成員である、請求項18に記載の化合物。
  38. 式中、
    21がHであり、
    22がHであり、そして
    23がHである、
    請求項37に記載の化合物。
  39. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである、
    請求項37に記載の化合物。
  40. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである、
    請求項37に記載の化合物。
  41. 16がNH2 である、請求項19に記載の化合物。
  42. 式中、
    16が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そして
    23がH−ホスホネート、ホスホルアミダイト、ヘミスクシネート、および固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートから成る群より選択される構成員である、
    請求項19に記載の化合物。
  43. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである、
    請求項42に記載の化合物。
  44. 16がジメチルアミノメチレンアミノである、請求項43に記載の化合物。
  45. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである、
    請求項42に記載の化合物。
  46. 16がジメチルアミノメチレンアミノである、請求項45に記載の化合物。
  47. 16がNH2 である、請求項20に記載の化合物。
  48. 式中、
    16が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そして
    23がH−ホスホネート、ホスホルアミダイト、ヘミスクシネート、および固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートから成る群より選択される構成員である、
    請求項21に記載の化合物。
  49. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである、
    請求項48に記載の化合物。
  50. 16がジメチルアミノメチレンアミノである、請求項49に記載の化合物。
  51. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである、
    請求項48に記載の化合物。
  52. 16がジメチルアミノメチレンアミノである、請求項51に記載の化合物。
  53. 12がNH2 である、請求項21に記載の化合物。
  54. 式中、
    12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そして
    23がH−ホスホネート、ホスホルアミダイト、ヘミスクシネート、および固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートから成る群より選択される構成員である、
    請求項21に記載の化合物。
  55. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである、
    請求項54に記載の化合物。
  56. 12がp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである、請求項55に記載の化合物。
  57. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである、
    請求項54に記載の化合物。
  58. 12がp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである、請求項57に記載の化合物。
  59. 12がNH2 である、請求項22に記載の化合物。
  60. 式中、
    12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そして
    23がH−ホスホネート、ホスホルアミダイト、ヘミスクシネート、および固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートから成る群より選択される構成員である、
    請求項22に記載の化合物。
  61. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである、
    請求項60に記載の化合物。
  62. 12がp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである、請求項61に記載の化合物。
  63. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである、
    請求項60に記載の化合物。
  64. 12がp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである、請求項63に記載の化合物。
  65. 12がNH2 である、請求項23に記載の化合物。
  66. 式中、
    12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そして
    23がH−ホスホネート、ホスホルアミダイト、ヘミスクシネート、および固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートから成る群より選択される構成員である、
    請求項23に記載の化合物。
  67. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである、
    請求項66に記載の化合物。
  68. 12がp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである、請求項67に記載の化合物。
  69. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである、
    請求項66に記載の化合物。
  70. 12がp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである、請求項69に記載の化合物。
  71. 12がNH2 である、請求項24に記載の化合物。
  72. 式中、
    12が保護基で1または2置換されたNH2 であり、そして
    23がH−ホスホネート、ホスホルアミダイト、ヘミスクシネート、および固体の支持体に共有結合したヘミスクシネートから成る群より選択される構成員である、
    請求項24に記載の化合物。
  73. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がβ−シアノエチル、N−ジイソプロピルホスホルアミダイトである、
    請求項72に記載の化合物。
  74. 12がp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである、請求項73に記載の化合物。
  75. 式中、
    21がジメトキシトリチルであり、
    22がHであり、そして
    23がコントロールされた孔のガラスに共有結合したヘミスクシネートである、
    請求項72に記載の化合物。
  76. 12がp−ニトロフェニルエトキシカルボニルである、請求項75に記載の化合物。
  77. 式中、
    21がトリホスフェートであり、
    22がHであり、そして
    23がHである、
    請求項16に記載の化合物。
  78. 式中、
    21がトリホスフェートであり、
    22がHであり、そして
    23がHである、
    請求項17に記載の化合物。
  79. 式中、
    21がトリホスフェートであり、
    22がHであり、そして
    23がHである、
    請求項18に記載の化合物。
  80. 式中、
    21がトリホスフェートであり、
    22がHであり、そして
    23がHである、
    請求項19に記載の化合物。
  81. 式中、
    21がトリホスフェートであり、
    22がHであり、そして
    23がHである、
    請求項20に記載の化合物。
  82. 式中、
    21がトリホスフェートであり、
    22がHであり、そして
    23がHである、
    請求項21に記載の化合物。
  83. 式中、
    21がトリホスフェートであり、
    22がHであり、そして
    R23がHである、
    請求項22に記載の化合物。
  84. 式中、
    21がトリホスフェートであり、
    22がHであり、そして
    23がHである、
    請求項23に記載の化合物。
  85. 式中、
    21がトリホスフェートであり、
    22がHであり、そして
    23がHである、
    請求項24に記載の化合物。
  86. 下記に示すように環の頂点1〜8をもつ式
    Figure 2009091358
    (式中、
    11はR12と組合わされて二重結合により環の頂点4に結合する単一のオキソ酸素を形成するか、またはR13と結合して環の頂点3と4との間の二重結合を形成し、
    12はR3 と組合わされないとき、NH2 であり、
    13はR11と結合しないとき、低級アルキルまたはHであり、
    14はH、低級アルキルまたはフェニルから成る群より選択される構成員であり、
    15はR16と組合わされて二重結合により環の頂点2に結合する単一のオキソ酸素を形成するか、またはR17と結合して環の頂点1と2との間の二重結合を形成し、こうして環の頂点2および4は集合的に最大1つのオキソ酸素を有し、
    16はR15と組合わされないとき、H、フェニル、およびNH2 から成る群より選択される構成員であり、
    15がR16と組合わされないとき、R18はR19と組合わされて二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    15がR16と組合わされるとき、R18はR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そしてR19はHおよび低級アルキルから成る群より選択される構成員であり、そして
    17はR15と結合しないとき、かつR20はR18と結合しないとき、
    Figure 2009091358
    であり、式中、
    22はHおよびOHから成る群より選択される構成員である)
    を有するプテリジン誘導体である1種または2種以上のヌクレオチドモノマーを含んでなるオリゴヌクレオチド。
  87. 14がH,CH3 およびフェニルから成る群より選択される、請求項86に記載の化合物。
  88. 14がHおよびCH3 から成る群より選択される、請求項86に記載の化合物。
  89. 16が、R15と結合しないとき、H、フェニル、およびNH2 から成る群より選択される、請求項86に記載の化合物。
  90. 16が、R15と結合しないとき、Hおよびフェニルから成る群より選択される、請求項86に記載の化合物。
  91. 18がR20と結合するとき、R19がHおよびCH3 から成る群より選択される、請求項86に記載の化合物。
  92. 16がH,CH3 およびフェニルから成る群より選択される構成員であり、R16が、R15と結合しないとき、H、フェニルおよびNH2 から成る群より選択される構成員であり、そして、R18がR20と結合するとき、R19がHおよびCH3 から成る群より選択される、請求項86に記載の化合物。
  93. 式中、
    11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、
    12がNH2 であり、
    14がHであり、
    15がR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、
    16がフェニルであり、
    16がR19と結合して二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そして
    20
    Figure 2009091358
    である、
    請求項86に記載の化合物。
  94. 式中、
    11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、
    12がNH2 であり、
    14がフェニルであり、
    15がR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、
    16がHであり、
    16がR19と結合して二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そして
    20
    Figure 2009091358
    である、
    請求項86に記載の化合物。
  95. 式中、
    11がR12と結合して二重結合により環の頂点4に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    13がCH3 であり、
    14がHであり、
    15がR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、
    16がNH2 であり、
    16がR19と結合して二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そして
    20
    Figure 2009091358
    である、
    請求項86に記載の化合物。
  96. 式中、
    11がR12と結合して二重結合により環の頂点4に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    13がHであり、
    14がHであり、
    15がR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、
    16がNH2 であり、
    18がR19と結合して二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そして
    20
    Figure 2009091358
    である、
    請求項86に記載の化合物。
  97. 式中、
    11がR12と結合して二重結合により環の頂点4に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    13がHであり、
    14がCH3 であり、
    15がR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、
    16がNH2 および保護基で1または2置換されたNH2 から成る群より選択され、
    18がR19と結合して二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そして
    20
    Figure 2009091358
    である、
    請求項86に記載の化合物。
  98. 式中、
    11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、
    12がNH2 であり、
    14がCH3 であり、
    15がR16と結合して二重結合により環の頂点2に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    17
    Figure 2009091358
    である、
    18がR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そして
    19がCH3 である、
    請求項86に記載の化合物。
  99. 式中、
    11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、
    12がNH2 であり、
    14がHであり、
    15がR16と結合して二重結合により環の頂点2に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    17
    Figure 2009091358
    であり、
    18がR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そして
    19がCH3 である、
    請求項86に記載の化合物。
  100. 式中、
    11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、
    12がNH2 であり、
    14がCH3 であり、
    15がR16と結合して二重結合により環の頂点2に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    17
    Figure 2009091358
    であり、
    18がR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そして
    19がHである、
    請求項86に記載の化合物。
  101. 式中、
    11がR13と結合して環の頂点3と4との間で二重結合を形成し、
    12がNH2 であり、
    14がHであり、
    15がR16と結合して二重結合により環の頂点2に接合した単一のオキソ酸素を形成し、
    17
    Figure 2009091358
    であり、
    18がR20と結合して環の頂点7と8との間で二重結合を形成し、そして
    19がHである、
    請求項86に記載の化合物。
  102. 前記ヌクレオチドモノマーが前記オリゴヌクレオチドの3'末端に存在する、請求項86に記載の化合物。
  103. 前記ヌクレオチドモノマーが前記オリゴヌクレオチドの5'末端に存在する、請求項86に記載の化合物。
  104. 前記ヌクレオチドモノマーが1〜10ピリミジンモノマーにより囲まれている、請求項86に記載の化合物。
  105. 5’−GTN TGG AAA ATC TCT AGC AGT −3’(配列識別No:2),
    5’−GTG TNG AAA ATC TCT AGC AGT −3’(配列識別No:3),
    5’−GTG TGN AAA ATC TCT AGC AGT −3’(配列識別No:4),
    5’−GTG TGG AAA ATC TCT ANC AGT −3’(配列識別No:5),
    5’−GTG TGG AAA ATC TCT AGC ANT −3’(配列識別No:6),
    5’−GTG TNG AAA ATC TCT ANC AGT −3’(配列識別No:7),
    5’−ACT GCT AGA NAT TTT CCA CAC −3’(配列識別No:8),
    5’−ACT GCT ANA GAT TTT CCA CAC −3’(配列識別No:9),
    5’−ACT NCT AGA GAT TTT CCA CAC −3’(配列識別No:10)および
    5’−ACT GCT NGA GAT TTT CCA CAC −3’(配列識別No:11)、
    から成る群より選択され、ここでAはアデノシンヌクレオチドであり、Cはシトシンヌクレオチドであり、Gはグアノシンヌクレオチドであり、Tはチミジンヌクレオチドであり、そしてNはプテリジンヌクレオチドであり、式中R11がR12と結合して二重結合により環の頂点4に接合した単一のオキソ酸素を形成し、R13がCH3 またはHであり、R14がR17と結合して環の頂点1と2との間で二重結合を形成し、R16がNH2 であり、R18がR19と結合して二重結合により環の頂点7に接合した単一のオキソ酸素を形成し、そしてR20
    Figure 2009091358
    であり、式中R22がHである、請求項86に記載の化合物。
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Families Citing this family (863)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6335434B1 (en) 1998-06-16 2002-01-01 Isis Pharmaceuticals, Inc., Nucleosidic and non-nucleosidic folate conjugates
US8153602B1 (en) 1991-11-19 2012-04-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Composition and methods for the pulmonary delivery of nucleic acids
CA2170869C (en) 1993-09-03 1999-09-14 Phillip Dan Cook Amine-derivatized nucleosides and oligonucleosides
US6787304B1 (en) 1994-12-28 2004-09-07 Georgetown University Fluorometric assay for detecting nucleic acid cleavage
US20030165908A1 (en) * 1994-12-30 2003-09-04 Georgetown University Fluorometric assay for detecting nucleic acid cleavage
US6420549B1 (en) 1995-06-06 2002-07-16 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide analogs having modified dimers
US5854033A (en) 1995-11-21 1998-12-29 Yale University Rolling circle replication reporter systems
US6379911B2 (en) * 1996-02-23 2002-04-30 Albert Einstein College Of Medicine Of Yeshiva University Enzyme detection/assay method and substrates
US9096636B2 (en) 1996-06-06 2015-08-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Chimeric oligomeric compounds and their use in gene modulation
US7875733B2 (en) * 2003-09-18 2011-01-25 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising 4′-thionucleosides for use in gene modulation
US20070275921A1 (en) * 1996-06-06 2007-11-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric Compounds That Facilitate Risc Loading
US7812149B2 (en) 1996-06-06 2010-10-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2′-Fluoro substituted oligomeric compounds and compositions for use in gene modulations
US20030044941A1 (en) 1996-06-06 2003-03-06 Crooke Stanley T. Human RNase III and compositions and uses thereof
US5898031A (en) 1996-06-06 1999-04-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligoribonucleotides for cleaving RNA
US6451530B1 (en) 1996-12-13 2002-09-17 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Fluorescent nucleotide analog hairpin formation for detection of nucleic acid hybridization
US5872011A (en) * 1997-06-13 1999-02-16 The Rockefeller University Crystal of a protein-ligand complex containing an N-terminal truncated eIF4E, and methods of use thereof
US6020162A (en) * 1997-06-13 2000-02-01 The Rockefeller University Crystal of a protein-ligand complex containing an N-terminal truncated eIF4E, and methods of use thereof
CA2242035C (en) 1997-07-01 2004-11-23 Transgene S.A. Compositions useful for transferring therapeutically active substances into a target cell, and their use in gene therapy
CA2294988C (en) 1997-07-01 2015-11-24 Isis Pharmaceuticals Inc. Compositions and methods for the delivery of oligonucleotides via the alimentary canal
US7321828B2 (en) * 1998-04-13 2008-01-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. System of components for preparing oligonucleotides
US20040186071A1 (en) 1998-04-13 2004-09-23 Bennett C. Frank Antisense modulation of CD40 expression
AU745880B2 (en) 1998-05-21 2002-04-11 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for non-parenteral delivery of oligonucleotides
JP2002515514A (ja) 1998-05-21 2002-05-28 アイシス・ファーマシューティカルス・インコーポレーテッド オリゴヌクレオチドの局所送逹のための組成物及び方法
US6867294B1 (en) 1998-07-14 2005-03-15 Isis Pharmaceuticals, Inc. Gapped oligomers having site specific chiral phosphorothioate internucleoside linkages
DE19858588B4 (de) * 1998-08-22 2016-04-07 Qiagen Gmbh Farbstoffmarkiertes Oligonukleotid zum Markieren eines Nukleinsäuremoleküls
US6225293B1 (en) 1998-09-02 2001-05-01 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods and compounds for tracking the biodistribution of macromolecule-carrier combinations
US6716971B1 (en) 1998-09-08 2004-04-06 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Pteridine nucleotide analogs
EP1112281B1 (en) * 1998-09-08 2005-11-23 THE GOVERNMENT OF THE UNITED STATES OF AMERICA as represented by the Secretary of the Department of Health and Human Services Pteridine nucleotide analogs
US6077709A (en) 1998-09-29 2000-06-20 Isis Pharmaceuticals Inc. Antisense modulation of Survivin expression
US6300320B1 (en) 1999-01-05 2001-10-09 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of c-jun using inhibitors of protein kinase C
US6127124A (en) * 1999-01-20 2000-10-03 Isis Pharmaceuticals, Inc. Fluorescence based nuclease assay
US6946465B2 (en) 1999-02-02 2005-09-20 4 Aza Bioscience Nv Immunosuppressive effects of pteridine derivatives
EP1187615A2 (en) * 1999-02-02 2002-03-20 K.U. Leuven Research & Development Immunosurpressive effects of pteridine derivatives
US6613513B1 (en) * 1999-02-23 2003-09-02 Caliper Technologies Corp. Sequencing by incorporation
US7098192B2 (en) 1999-04-08 2006-08-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotide modulation of STAT3 expression
DE69926053T2 (de) 1999-04-27 2006-04-27 Transgene S.A. Verfahren zur Herstellung von Säugetier-Zellinien
US6656730B1 (en) 1999-06-15 2003-12-02 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides conjugated to protein-binding drugs
US6147200A (en) * 1999-08-19 2000-11-14 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-O-acetamido modified monomers and oligomers
WO2001036668A1 (de) * 1999-11-16 2001-05-25 Atto-Tec Gmbh Farbstoffmarkiertes oligonukleotid zum markieren eines nukleinsäuremoleküls
WO2001038585A2 (en) * 1999-11-24 2001-05-31 The Regents Of The University Of California Polymer arrays and methods of using labeled probe molecules to identify and quantify target molecule expression
AU782912B2 (en) 1999-12-28 2005-09-08 Association Francaise Contre Les Myopathies Use of lithium (Li+) for the preparation of a composition for transfection of a polynucleotide into a cell and compositions useful in gene therapy
US20020055479A1 (en) 2000-01-18 2002-05-09 Cowsert Lex M. Antisense modulation of PTP1B expression
US6261840B1 (en) 2000-01-18 2001-07-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of PTP1B expression
US20030176385A1 (en) * 2000-02-15 2003-09-18 Jingfang Ju Antisense modulation of protein expression
US20040146918A1 (en) * 2000-02-18 2004-07-29 Weiner Michael L. Hybrid nucleic acid assembly
US6680172B1 (en) 2000-05-16 2004-01-20 Regents Of The University Of Michigan Treatments and markers for cancers of the central nervous system
US20060166227A1 (en) * 2000-06-20 2006-07-27 Stephen Kingsmore Protein expression profiling
US6323009B1 (en) * 2000-06-28 2001-11-27 Molecular Staging, Inc. Multiply-primed amplification of nucleic acid sequences
US8568766B2 (en) 2000-08-24 2013-10-29 Gattadahalli M. Anantharamaiah Peptides and peptide mimetics to treat pathologies associated with eye disease
GB0023057D0 (en) 2000-09-20 2000-11-01 Randox Lab Ltd Liquid reagent
EP1326892A2 (en) 2000-10-12 2003-07-16 University of Rochester Compositions that inhibit proliferation of cancer cells
US7767802B2 (en) 2001-01-09 2010-08-03 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of anti-apoptotic genes
ATE434936T1 (de) 2001-03-14 2009-07-15 Myriad Genetics Inc Tsg101-gag-wechselwirkung und ihre verwendung
US7803915B2 (en) 2001-06-20 2010-09-28 Genentech, Inc. Antibody compositions for the diagnosis and treatment of tumor
ES2372321T3 (es) 2001-06-20 2012-01-18 Genentech, Inc. Composiciones y métodos para el diagnóstico y tratamiento de un tumor de pulmón.
EP2270024B1 (en) 2001-06-21 2018-10-24 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of superoxide dismutase 1, soluble expression
US6964950B2 (en) 2001-07-25 2005-11-15 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of C-reactive protein expression
US7425545B2 (en) 2001-07-25 2008-09-16 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of C-reactive protein expression
US20030096772A1 (en) 2001-07-30 2003-05-22 Crooke Rosanne M. Antisense modulation of acyl CoA cholesterol acyltransferase-2 expression
US7407943B2 (en) 2001-08-01 2008-08-05 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of apolipoprotein B expression
US7227014B2 (en) 2001-08-07 2007-06-05 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of apolipoprotein (a) expression
JP4370164B2 (ja) * 2001-08-14 2009-11-25 富山化学工業株式会社 新規なウイルス増殖阻害・殺ウイルス方法および新規なピラジンヌクレオチド・ピラジンヌクレオシド類似体
EP2284195A1 (en) 2001-09-18 2011-02-16 Carnegie Institution Of Washington Fusion proteins useful for detecting analytes
KR101008758B1 (ko) 2001-09-18 2011-01-14 제넨테크, 인크. 종양의 진단 및 치료를 위한 방법 및 이를 위한 조성물
EP2270231A3 (en) 2001-10-09 2011-04-27 ISIS Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of insulin-like growth factor binding protein 5 expression
US6750019B2 (en) 2001-10-09 2004-06-15 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of insulin-like growth factor binding protein 5 expression
US6965025B2 (en) 2001-12-10 2005-11-15 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of connective tissue growth factor expression
KR100623128B1 (ko) 2002-01-02 2006-09-14 제넨테크, 인크. 종양의 진단 및 치료 방법 및 이를 위한 조성물
US7553619B2 (en) * 2002-02-08 2009-06-30 Qiagen Gmbh Detection method using dissociated rolling circle amplification
US20030180712A1 (en) 2002-03-20 2003-09-25 Biostratum Ab Inhibition of the beta3 subunit of L-type Ca2+ channels
US7169916B2 (en) * 2002-04-01 2007-01-30 Isis Pharmaceuticals, Inc. Chloral-free DCA in oligonucleotide synthesis
EP2011886A3 (en) 2002-04-16 2009-02-11 Genentech, Inc. Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor
US7199107B2 (en) 2002-05-23 2007-04-03 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of kinesin-like 1 expression
AU2003276131A1 (en) * 2002-06-18 2003-12-31 Epigenesis Pharmaceuticals, Inc. A dry powder oligonucleotide formulation, preparation and its uses
EP2116604A1 (en) 2002-08-05 2009-11-11 University of Rochester Protein transducing domain/deaminase chimeric proteins, related compounds, and uses thereof
WO2004027035A2 (en) 2002-09-20 2004-04-01 Yale University Riboswitches, methods for their use, and compositions for use with riboswitches.
EP1549767A4 (en) 2002-09-26 2006-06-07 Amgen Inc MODULATION OF FORKHEAD BOX O1A GENE EXPRESSION
US9150605B2 (en) 2002-11-05 2015-10-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions comprising alternating 2′-modified nucleosides for use in gene modulation
US9150606B2 (en) * 2002-11-05 2015-10-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions comprising alternating 2'-modified nucleosides for use in gene modulation
EP1560839A4 (en) 2002-11-05 2008-04-23 Isis Pharmaceuticals Inc CHIMERIC OLIGOMER COMPOUNDS AND THEIR USE IN GENE MODULATION
WO2004044132A2 (en) 2002-11-05 2004-05-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modified oligonucleotides for use in rna interference
EP2336319A1 (en) 2002-11-13 2011-06-22 Genzyme Corporation Antisense modulation of apolipoprotein B expression
WO2004044181A2 (en) 2002-11-13 2004-05-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of apolipoprotein b expression
AU2003295576B2 (en) * 2002-11-15 2011-03-17 Eisai, Inc. Methods of generating high-production of antibodies from hybridomas created by in vitro immunization
CA2505601C (en) 2002-11-15 2014-10-28 Musc Foundation For Research Development Complement receptor 2 targeted complement modulators
EP1624753B1 (en) 2002-11-21 2012-01-25 The University of Utah Research Foundation Purinergic modulation of smell
US7144999B2 (en) 2002-11-23 2006-12-05 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of hypoxia-inducible factor 1 alpha expression
JP4886298B2 (ja) 2002-12-20 2012-02-29 キアゲン ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテル ハフツング 核酸増幅
US9487823B2 (en) 2002-12-20 2016-11-08 Qiagen Gmbh Nucleic acid amplification
US6977153B2 (en) * 2002-12-31 2005-12-20 Qiagen Gmbh Rolling circle amplification of RNA
US7781163B2 (en) 2003-01-08 2010-08-24 Lesley Davenport G-quadruplex binding assays and compounds therefor
US7468356B2 (en) 2003-02-11 2008-12-23 Antisense Therapeutics Ltd. Modulation of insulin like growth factor I receptor expression
US7002006B2 (en) * 2003-02-12 2006-02-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Protection of nucleosides
US7803781B2 (en) 2003-02-28 2010-09-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of growth hormone receptor expression and insulin-like growth factor expression
US20040175704A1 (en) 2003-03-06 2004-09-09 Stratagene Compositions and methods for polynucleotide sequence detection
US20040185559A1 (en) 2003-03-21 2004-09-23 Isis Pharmaceuticals Inc. Modulation of diacylglycerol acyltransferase 1 expression
US8043834B2 (en) 2003-03-31 2011-10-25 Qiagen Gmbh Universal reagents for rolling circle amplification and methods of use
US7598227B2 (en) 2003-04-16 2009-10-06 Isis Pharmaceuticals Inc. Modulation of apolipoprotein C-III expression
US7399853B2 (en) 2003-04-28 2008-07-15 Isis Pharmaceuticals Modulation of glucagon receptor expression
US7276599B2 (en) 2003-06-02 2007-10-02 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide synthesis with alternative solvents
BRPI0410886A (pt) 2003-06-03 2006-07-04 Isis Pharmaceuticals Inc composto de filamento duplo, composição farmacêutica, sal farmaceuticamente aceitável, métodos de modificação do ácido nucleico que codifica a survivina humana, de inibição da expressão da suvivina em células ou tecidos, e de tratamento de uma condição associada com a expressão ou superexpressão da suvivina, e, oligonucleotìdeo de rnai de filamento único
EP1633770B1 (en) 2003-06-13 2015-04-29 Alnylam Europe AG Double-stranded ribonucleic acid with increased effectiveness in an organism
DK1648931T3 (da) 2003-07-21 2011-03-07 Transgene Sa Multifunktionelle cytokiner
US7683036B2 (en) 2003-07-31 2010-03-23 Regulus Therapeutics Inc. Oligomeric compounds and compositions for use in modulation of small non-coding RNAs
US7825235B2 (en) 2003-08-18 2010-11-02 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of diacylglycerol acyltransferase 2 expression
EP1508624A1 (en) * 2003-08-22 2005-02-23 Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale (Inserm) A quantification method for integrated viruses
NZ617083A (en) 2003-08-27 2015-04-24 Ophthotech Corp Combination therapy for the treatment of ocular neovascular disorders
US20050053981A1 (en) 2003-09-09 2005-03-10 Swayze Eric E. Gapped oligomeric compounds having linked bicyclic sugar moieties at the termini
CA2539181A1 (en) 2003-09-18 2005-03-31 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of eif4e expression
CA2541438C (en) 2003-10-10 2013-11-26 Meditech Research Limited The modulation of hyaluronan synthesis and degradation in the treatment of disease
US20050191653A1 (en) 2003-11-03 2005-09-01 Freier Susan M. Modulation of SGLT2 expression
ES2472690T3 (es) 2003-11-17 2014-07-02 Genentech, Inc. Anticuerpo contra CD22 para el tratamiento de tumores de origen hematopoy�tico
EP1711606A2 (en) 2004-01-20 2006-10-18 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of glucocorticoid receptor expression
US8778900B2 (en) * 2004-01-22 2014-07-15 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of eIF4E-BP1 expression
US7468431B2 (en) * 2004-01-22 2008-12-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of eIF4E-BP2 expression
US8569474B2 (en) 2004-03-09 2013-10-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Double stranded constructs comprising one or more short strands hybridized to a longer strand
US8790919B2 (en) 2004-03-15 2014-07-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for optimizing cleavage of RNA by RNase H
JP2007531794A (ja) 2004-04-05 2007-11-08 アルニラム ファーマスーティカルズ インコーポレイテッド オリゴヌクレオチドの合成および精製に使用する方法および反応試薬
US20050244869A1 (en) 2004-04-05 2005-11-03 Brown-Driver Vickie L Modulation of transthyretin expression
US20050260755A1 (en) * 2004-04-06 2005-11-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Sequential delivery of oligomeric compounds
JP4584987B2 (ja) 2004-04-30 2010-11-24 アルニラム ファーマスーティカルズ インコーポレイテッド C5修飾ピリミジンを含むオリゴヌクレオチド
WO2005107404A2 (en) * 2004-05-03 2005-11-17 The Penn State Research Foundation Methods and systems for nanoparticle enhancement of signals
DK1773872T3 (en) 2004-05-21 2017-05-08 Uab Res Found VARIABLE Lymphocyte Receptors, Associated Polypeptides and Nucleic Acids, and Uses thereof
US8394947B2 (en) 2004-06-03 2013-03-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Positionally modified siRNA constructs
JP2008501693A (ja) * 2004-06-03 2008-01-24 アイシス ファーマシューティカルズ、インク. 遺伝子調節で使用するための個別に調節された鎖を有する二本鎖組成物
WO2006014437A2 (en) * 2004-07-07 2006-02-09 The Penn State Research Foundation Methods and systems for nanoparticle enhancement of signals
WO2006023880A2 (en) 2004-08-23 2006-03-02 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for the characterization of oligonucleotides
US7884086B2 (en) 2004-09-08 2011-02-08 Isis Pharmaceuticals, Inc. Conjugates for use in hepatocyte free uptake assays
WO2006032436A2 (en) 2004-09-21 2006-03-30 Nascacell Technologies Ag. Use of microproteins as tryptase inhibitors
WO2006032143A1 (en) 2004-09-23 2006-03-30 Arc Pharmaceuticals, Inc. Pharmaceutical compositions and methods relating to inhibiting fibrous adhesions or inflammatory disease using low sulphate fucans
US7851152B2 (en) * 2004-09-25 2010-12-14 Yaodong Chen Fluorescent base analogues' usage in the characterization of nucleic acid molecules and their interactions
CA2590294A1 (en) * 2004-12-13 2006-06-22 Sunesis Pharmaceuticals, Inc. Pyrido pyrimidinones, dihydro pyrimido pyrimidinones and pteridinones useful as raf kinase inhibitors
EP1848815B1 (en) 2005-02-02 2010-05-19 Universität Bayreuth Esterases for monitoring protein biosynthesis in vitro
RU2007137489A (ru) 2005-03-10 2009-04-20 Дженентек, Инк. (Us) Способы и композиции для модуляции целостности сосудов
EP1863908B1 (de) 2005-04-01 2010-11-17 Qiagen GmbH Reverse transkription und amplifikation von rna bei simultaner degradierung von dna
US9505867B2 (en) 2005-05-31 2016-11-29 Ecole Polytechmique Fédérale De Lausanne Triblock copolymers for cytoplasmic delivery of gene-based drugs
WO2006138145A1 (en) 2005-06-14 2006-12-28 Northwestern University Nucleic acid functionalized nanoparticles for therapeutic applications
EP2239327B1 (en) 2005-08-11 2015-02-25 Synthetic Genomics, Inc. Method for in vitro recombination
US20100015604A1 (en) 2005-08-17 2010-01-21 Evriklia Lianidou Composition and method for determination of ck19 expression
ATE494372T1 (de) 2005-08-29 2011-01-15 Regulus Therapeutics Inc Verfahren für mir-122a-modulation
EP1762627A1 (de) 2005-09-09 2007-03-14 Qiagen GmbH Verfahren zur Aktivierung einer Nukleinsäure für eine Polymerase-Reaktion
US20070087987A1 (en) 2005-09-19 2007-04-19 Monia Brett P Modulation of glucagon receptor expression
EA200800868A1 (ru) 2005-09-19 2008-10-30 ДЖОНСОН ЭНД ДЖОНСОН ФАРМАСЬЮТИКАЛ РИСЕРЧ ЭНД ДИВЕЛОПМЕНТ, Эл. Эл. Си. Модуляция экспрессии глюкокортикоидного рецептора
EP2402435A3 (en) 2005-10-14 2012-03-28 MUSC Foundation For Research Development Targeting PAX2 for the induction of DEFB1-mediated tumor immunity and cancer therapy
US8080534B2 (en) 2005-10-14 2011-12-20 Phigenix, Inc Targeting PAX2 for the treatment of breast cancer
US7320965B2 (en) 2005-10-28 2008-01-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of Huntingtin gene
EP2363134B1 (en) 2005-11-09 2014-01-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of factor V Leiden mutant gene
JP2009516710A (ja) 2005-11-21 2009-04-23 アイシス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッド eIF4E−BP2の発現のモジュレート
EP1974052A2 (en) * 2005-12-21 2008-10-01 Yale University Methods and compositions related to the modulation of riboswitches
EP1976567B1 (en) 2005-12-28 2020-05-13 The Scripps Research Institute Natural antisense and non-coding rna transcripts as drug targets
EP2388328A1 (en) 2006-01-27 2011-11-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds and compositions for the use in modulation of micrornas
US7569686B1 (en) 2006-01-27 2009-08-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for synthesis of bicyclic nucleic acid analogs
CN102908630B (zh) 2006-01-27 2014-11-19 Isis制药公司 6-修饰的双环核酸类似物
NZ571568A (en) 2006-03-31 2010-11-26 Alnylam Pharmaceuticals Inc Double-stranded RNA molecule compositions and methods for inhibiting expression of Eg5 gene
EP2013344B1 (en) * 2006-05-03 2012-08-29 Baltic Technology Development, Ltd. Antisense agents combining strongly bound base - modified oligonucleotide and artificial nuclease
AU2007257093A1 (en) * 2006-05-05 2007-12-13 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating expression of PCSK9
EP2066684B1 (en) * 2006-05-11 2012-07-18 Isis Pharmaceuticals, Inc. 5'-modified bicyclic nucleic acid analogs
US7666854B2 (en) * 2006-05-11 2010-02-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bis-modified bicyclic nucleic acid analogs
EP2392583A1 (en) 2006-05-19 2011-12-07 Alnylam Europe AG. RNAi modulation of Aha and therapeutic uses thereof
CA2653451C (en) 2006-05-22 2015-12-29 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of ikk-b gene
EP2023938A4 (en) * 2006-05-23 2010-11-10 Isis Pharmaceuticals Inc MODULATION OF THE EXPRESSION OF ChREBP
US20090280188A1 (en) * 2006-06-23 2009-11-12 Northwestern University Asymmetric functionalizated nanoparticles and methods of use
US8198253B2 (en) 2006-07-19 2012-06-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and their uses directed to HBXIP
US10144736B2 (en) 2006-07-20 2018-12-04 Gilead Sciences, Inc. Substituted pteridines useful for the treatment and prevention of viral infections
EP2061799A4 (en) * 2006-09-11 2010-12-22 Univ Yale METHOD AND COMPOSITIONS FOR USE OF LYSIN RIBOSWITCHES
US7906484B2 (en) * 2006-09-21 2011-03-15 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Complex for transferring an anionic substance into a cell
US20100099858A1 (en) * 2006-09-28 2010-04-22 Mirkin Chad A Maximizing Oligonucleotide Loading on Gold Nanoparticle
CA2665536C (en) 2006-10-05 2016-02-16 Massachusetts Institute Of Technology Multifunctional encoded particles for high-throughput analysis
US8999317B2 (en) 2006-11-01 2015-04-07 University Of Rochester Methods and compositions related to the structure and function of APOBEC3G
WO2008073441A2 (en) 2006-12-11 2008-06-19 University Of Utah Research Foundation Compositions and methods for treating pathologic angiogenesis and vascular permeability
EP2913341A1 (en) 2006-12-22 2015-09-02 University of Utah Research Foundation Method of detecting ocular diseases and pathologic conditions and treatment of same
KR101636575B1 (ko) 2007-01-30 2016-07-05 트랜스진 에스.에이. 유두종바이러스 백신
WO2008098248A2 (en) 2007-02-09 2008-08-14 Northwestern University Particles for detecting intracellular targets
EP2471925A1 (en) 2007-03-22 2012-07-04 Yale University Methods and compositions related to riboswitches that control alternative splicing
US7759320B2 (en) 2007-03-29 2010-07-20 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of a gene from the Ebola
AU2008266684A1 (en) 2007-05-29 2008-12-24 Yale University Riboswitches and methods and compositions for use of and with riboswitches
MX2009012647A (es) * 2007-05-29 2009-12-14 Univ Yale Metodos y composiciones relacionadas con ribointerruptores que controlan la separacion alternativa y proceso de arn.
CA3055145A1 (en) 2007-05-30 2008-12-11 Northwestern University Nucleic acid functionalized nanoparticles for therapeutic applications
US8278425B2 (en) 2007-05-30 2012-10-02 Isis Pharmaceuticals, Inc. N-substituted-aminomethylene bridged bicyclic nucleic acid analogs
US7807372B2 (en) * 2007-06-04 2010-10-05 Northwestern University Screening sequence selectivity of oligonucleotide-binding molecules using nanoparticle based colorimetric assay
WO2008154401A2 (en) 2007-06-08 2008-12-18 Isis Pharmaceuticals, Inc. Carbocyclic bicyclic nucleic acid analogs
DK2176280T4 (en) * 2007-07-05 2015-07-20 Isis Pharmaceuticals Inc 6-Disubstituerede bicykliske nukleinsyreanaloge
ES2439591T3 (es) 2007-08-15 2014-01-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Análogos de ácido nucleico de tetrahidropirano
PL2197900T3 (pl) 2007-08-24 2012-12-31 Univ Wuerzburg J Maximilians Zmutowane podwójnie cyklizowane peptydy receptorowe hamujące przeciwciała przeciwko beta 1-adrenoreceptorowi
AU2008296478B9 (en) 2007-08-28 2015-03-19 The Uab Research Foundation Synthetic apolipoprotein E mimicking polypeptides and methods of use
US8557767B2 (en) 2007-08-28 2013-10-15 Uab Research Foundation Synthetic apolipoprotein E mimicking polypeptides and methods of use
WO2009039466A1 (en) 2007-09-20 2009-03-26 Vanderbilt University Free solution measurement of molecular interactions by backscattering interferometry
US7951785B2 (en) * 2007-09-21 2011-05-31 California Institute Of Technology NFIA in glial fate determination, glioma therapy and astrocytoma treatment
EP2217705A2 (en) * 2007-11-05 2010-08-18 Baltic Technology Development, Ltd. Use of oligonucleotides with modified bases in hybridization of nucleic acids
WO2009067243A2 (en) 2007-11-20 2009-05-28 Isis Pharmaceuticals Inc. Modulation of cd40 expression
JP5530933B2 (ja) 2007-12-10 2014-06-25 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド 第vii因子遺伝子発現阻害のための組成物及び方法
WO2009086558A1 (en) 2008-01-02 2009-07-09 Tekmira Pharmaceuticals Corporation Improved compositions and methods for the delivery of nucleic acids
EP2265627A2 (en) * 2008-02-07 2010-12-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic cyclohexitol nucleic acid analogs
AU2009221775B2 (en) 2008-03-05 2015-05-07 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of Eg5 and VEGF genes
US8426378B2 (en) 2008-03-21 2013-04-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising tricyclic nucelosides and methods for their use
WO2009124238A1 (en) * 2008-04-04 2009-10-08 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising neutrally linked terminal bicyclic nucleosides
US8846639B2 (en) * 2008-04-04 2014-09-30 Isis Pharmaceutical, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleosides and having reduced toxicity
AU2009237577B2 (en) 2008-04-18 2014-06-05 Baxter Healthcare Sa Microsphere-based composition for preventing and/or reversing new-onset autoimmune diabetes
JP2011523401A (ja) * 2008-04-29 2011-08-11 ワイス・エルエルシー 炎症を治療するための方法
KR101877698B1 (ko) 2008-08-25 2018-07-12 엑스칼리아드 파마슈티컬즈, 인코포레이티드 결합 조직 성장 인자에 대한 안티센스 올리고뉴클레오타이드 및 그의 용도
WO2010028054A1 (en) 2008-09-02 2010-03-11 Alnylam Europe Ag. Compositions and methods for inhibiting expression of mutant egfr gene
WO2010036698A1 (en) * 2008-09-24 2010-04-01 Isis Pharmaceuticals, Inc. Substituted alpha-l-bicyclic nucleosides
DK2361256T3 (da) * 2008-09-24 2013-07-01 Isis Pharmaceuticals Inc Cyclohexenyl-nukleinsyreanaloger
CA2739170A1 (en) 2008-09-25 2010-04-01 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Lipid formulated compositions and methods for inhibiting expression of serum amyloid a gene
EP2350043B9 (en) 2008-10-09 2014-08-20 TEKMIRA Pharmaceuticals Corporation Improved amino lipids and methods for the delivery of nucleic acids
CA2966011C (en) 2008-10-15 2021-10-19 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of factor 11 expression
ES2656516T3 (es) 2008-10-20 2018-02-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Composiciones y métodos para inhibir la expresión de transtiretina
EP2358398A2 (en) 2008-10-24 2011-08-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds and methods
US20120059045A1 (en) 2008-10-24 2012-03-08 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods of using oligomeric compounds comprising 2'-substituted nucleosides
CN106955360A (zh) 2008-11-24 2017-07-18 西北大学 多价rna纳米颗粒组合物
WO2010064146A2 (en) 2008-12-02 2010-06-10 Chiralgen, Ltd. Method for the synthesis of phosphorus atom modified nucleic acids
RU2620970C2 (ru) 2008-12-04 2017-05-30 КьюРНА,Инк., Лечение связанных с эритропоэтином (еро) заболеваний путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта к еро
KR101866152B1 (ko) 2008-12-04 2018-06-08 큐알엔에이, 인크. 종양 억제 유전자에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의해 종양 억제 유전자 관련된 질환의 치료
MX366774B (es) 2008-12-04 2019-07-24 Curna Inc Uso de oligonucleótidos antisentido en la inhibición de transcrito antisentido natural para sirtuina 1.
AU2009324534B2 (en) 2008-12-10 2015-07-30 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. GNAQ targeted dsRNA compositions and methods for inhibiting expression
WO2010070136A2 (en) 2008-12-19 2010-06-24 Centre de Recherche Public de la Santé Novel caviidae allergens and uses thereof
EP2367564A1 (en) 2008-12-22 2011-09-28 Universität Regensburg Norrin in the treatment of diseases associated with an increased tgf-beta activity
US20100184844A1 (en) * 2009-01-08 2010-07-22 Northwestern University Inhibition of Bacterial Protein Production by Polyvalent Oligonucleotide Modified Nanoparticle Conjugates
US20100233270A1 (en) 2009-01-08 2010-09-16 Northwestern University Delivery of Oligonucleotide-Functionalized Nanoparticles
KR101546673B1 (ko) * 2009-01-15 2015-08-25 삼성전자주식회사 전자 사진용 토너 및 그의 제조방법
CA2750820A1 (en) 2009-01-27 2010-08-05 Qiagen Gaithersburg Thermophilic helicase dependent amplification technology with endpoint homogenous fluorescent detection
US20120101148A1 (en) 2009-01-29 2012-04-26 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. lipid formulation
WO2010090969A1 (en) 2009-02-06 2010-08-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Tetrahydropyran nucleic acid analogs
US20120021515A1 (en) 2009-02-06 2012-01-26 Swayze Eric E Oligomeric compounds and methods
ES2658626T3 (es) 2009-02-12 2018-03-12 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con el factor neurotrófico derivado de células gliales (GDNF) por inhibición de transcrito antisentido natural a GDNF
EP2396038B1 (en) 2009-02-12 2015-10-21 CuRNA, Inc. Treatment of brain derived neurotrophic factor (bdnf) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to bdnf
WO2010092109A2 (en) 2009-02-13 2010-08-19 Novartis Ag Nucleic acid molecule of a biosynthetic cluster encoding non ribosomal peptide synthases and uses thereof
WO2010099341A1 (en) 2009-02-26 2010-09-02 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of mig-12 gene
EP2963116B1 (en) 2009-03-04 2020-11-11 CuRNA, Inc. Treatment of sirtuin 1 (sirt1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to sirt 1
CN102421900B (zh) 2009-03-12 2015-07-22 阿尔尼拉姆医药品有限公司 用于抑制Eg5和VEGF基因表达的脂质配制的组合物以及方法
ES2656290T3 (es) 2009-03-16 2018-02-26 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con el factor nuclear (derivado de eritroide 2) similar al 2 (NRF2) mediante inhibición del transcrito antisentido natural a NRF2
WO2010107740A2 (en) 2009-03-17 2010-09-23 Curna, Inc. Treatment of delta-like 1 homolog (dlk1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to dlk1
WO2010120420A1 (en) 2009-04-15 2010-10-21 Northwestern University Delivery of oligonucleotide-functionalized nanoparticles
EP3524275A1 (en) 2009-04-22 2019-08-14 Massachusetts Institute Of Technology Innate immune supression enables repeated delivery of long rna molecules
DE102010018878B4 (de) 2009-04-30 2013-09-26 Julius-Maximilians-Universität Würzburg Neue Zell-Linie zur Fluoreszenz-basierten Detektion von funktionell aktiven Antikörpern und Autoantikörpern gegen den Beta1-adrenergen Rezeptor
EP2424987B1 (en) 2009-05-01 2017-11-15 CuRNA, Inc. Treatment of hemoglobin (hbf/hbg) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to hbf/hbg
JP5889783B2 (ja) 2009-05-05 2016-03-22 テクミラ ファーマシューティカルズ コーポレイションTekmira Pharmaceuticals Corporation 免疫細胞へオリゴヌクレオチドを送達する方法
CA3042927C (en) 2009-05-05 2022-05-17 Arbutus Biopharma Corporation Lipid compositions for the delivery of therapeutic agents
US9155754B2 (en) 2009-05-06 2015-10-13 Curna, Inc. Treatment of ABCA1 gene related diseases by inhibition of a natural antisense transcript to ABCA1
US20120046236A1 (en) 2009-05-06 2012-02-23 Opko Curna Llc Treatment of tristetraproline (ttp) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to ttp
WO2010132665A1 (en) 2009-05-15 2010-11-18 Yale University Gemm riboswitches, structure-based compound design with gemm riboswitches, and methods and compositions for use of and with gemm riboswitches
KR101749356B1 (ko) 2009-05-18 2017-07-06 큐알엔에이, 인크. 재편성 인자에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의한 재편성 인자 관련된 질환의 치료
EP2432882B1 (en) 2009-05-22 2019-12-25 CuRNA, Inc. TREATMENT OF TRANSCRIPTION FACTOR E3 (TFE3) and INSULIN RECEPTOR SUBSTRATE 2 (IRS2) RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPT TO TFE3
WO2010138806A2 (en) 2009-05-28 2010-12-02 Curna, Inc. Treatment of antiviral gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to an antiviral gene
EA028860B1 (ru) 2009-06-10 2018-01-31 Арбутус Биофарма Корпорэйшн Улучшенная липидная композиция
CA2765700C (en) 2009-06-16 2021-01-05 Opko Curna, Llc Treatment of collagen gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a collagen gene
EP2443238B1 (en) 2009-06-16 2017-03-22 CuRNA, Inc. Treatment of paraoxonase 1 (pon1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to pon1
JP6073133B2 (ja) 2009-06-24 2017-02-01 クルナ・インコーポレーテッド 腫瘍壊死因子受容体2(tnfr2)に対する天然アンチセンス転写物の抑制によるtnfr2関連疾患の治療
KR101807324B1 (ko) 2009-06-26 2017-12-08 큐알엔에이, 인크. 다운 증후군 유전자에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의한 다운 증후군 유전자 관련된 질환의 치료
KR101885383B1 (ko) 2009-07-06 2018-08-03 웨이브 라이프 사이언시스 리미티드 신규한 핵산 프로드러그 및 그의 사용 방법
JP6128848B2 (ja) 2009-08-05 2017-05-17 クルナ・インコーポレーテッド インスリン遺伝子(ins)に対する天然アンチセンス転写物の抑制によるインスリン遺伝子(ins)関連疾患の治療
EP2462153B1 (en) 2009-08-06 2015-07-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic cyclohexose nucleic acid analogs
EP2461826A2 (en) 2009-08-07 2012-06-13 Transgene SA Composition for treating hbv infection
AP3574A (en) 2009-08-14 2016-02-08 Alnylam Pharmaceuticals Inc Lipid formulated compositions and methods for inhibiting expression of a gene from the ebola virus
WO2011022420A1 (en) 2009-08-17 2011-02-24 Yale University Methylation biomarkers and methods of use
WO2011031482A2 (en) 2009-08-25 2011-03-17 Curna, Inc. Treatment of 'iq motif containing gtpase activating protein' (iqgap) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to iqgap
RU2012111424A (ru) 2009-08-26 2013-10-10 Медицинише Хохшуле Ханновер Средства и способы производства искусственных капсульных полисахаридов neisseria meningitidis
JP5887270B2 (ja) 2009-09-02 2016-03-16 ジェネンテック, インコーポレイテッド 突然変異体smoothenedおよびその使用方法
ES2564207T3 (es) 2009-10-22 2016-03-18 F. Hoffmann-La Roche Ag Métodos y composiciones para modular la activación con hepsina de la proteína estimuladora de macrófagos
AU2010315399B2 (en) 2009-10-27 2016-01-28 Swift Biosciences, Inc. Bimolecular primers
JP5866119B2 (ja) 2009-10-30 2016-02-17 ノースウェスタン ユニバーシティ 鋳型ナノ複合体
WO2011056215A1 (en) 2009-11-03 2011-05-12 Landers James P Versatile, visible method for detecting polymeric analytes
EP2504450B1 (en) 2009-11-23 2016-07-06 Swift Biosciences, Inc. Devices to extend single stranded target molecules
EP3002297B1 (en) 2009-11-30 2020-04-08 F. Hoffmann-La Roche AG Antibodies for treating and diagnosing tumors expressing slc34a2 (tat211)
US9173895B2 (en) 2009-12-16 2015-11-03 Curna, Inc. Treatment of membrane bound transcription factor peptidase, site 1 (MBTPS1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to MBTPS1
WO2011079261A2 (en) 2009-12-23 2011-06-30 Curna, Inc. Treatment of hepatocyte growth factor (hgf) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to hgf
CA2782375C (en) 2009-12-23 2023-10-31 Opko Curna, Llc Treatment of uncoupling protein 2 (ucp2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to ucp2
JP5993744B2 (ja) 2009-12-29 2016-09-14 カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド 核呼吸因子1(nrf1)に対する天然アンチセンス転写物の阻害による核呼吸因子1関連疾患の治療
WO2011090741A2 (en) 2009-12-29 2011-07-28 Opko Curna, Llc TREATMENT OF TUMOR PROTEIN 63 (p63) RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPT TO p63
US8946181B2 (en) 2010-01-04 2015-02-03 Curna, Inc. Treatment of interferon regulatory factor 8 (IRF8) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to IRF8
US8912157B2 (en) 2010-01-06 2014-12-16 Curna, Inc. Treatment of pancreatic developmental gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a pancreatic developmental gene
RU2611191C2 (ru) 2010-01-11 2017-02-21 Курна, Инк. Лечение заболеваний, связанных со связывающим половые гормоны глобулином (гспг), путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта к гспг
WO2011085102A1 (en) 2010-01-11 2011-07-14 Isis Pharmaceuticals, Inc. Base modified bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
WO2011088076A2 (en) 2010-01-12 2011-07-21 Yale University Structured rna motifs and compounds and methods for their use
JP5981850B2 (ja) 2010-01-25 2016-08-31 カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド RNaseH1に対する天然アンチセンス転写物の阻害によるRNaseH1関連疾患の治療
US20130028889A1 (en) 2010-02-04 2013-01-31 Ico Therapeutics Inc. Dosing regimens for treating and preventing ocular disorders using c-raf antisense
CN102844435B (zh) 2010-02-22 2017-05-10 库尔纳公司 通过抑制吡咯啉‑5‑羧酸还原酶1(pycr1)的天然反义转录物而治疗pycr1相关疾病
WO2011105901A2 (en) 2010-02-23 2011-09-01 Academisch Ziekenhuis Bij De Universiteit Van Amsterdam Antagonists of complement component 9 (c9) and uses thereof
KR20130004579A (ko) 2010-02-23 2013-01-11 제넨테크, 인크. 종양의 진단 및 치료를 위한 조성물 및 방법
WO2011105900A2 (en) 2010-02-23 2011-09-01 Academisch Ziekenhuis Bij De Universiteit Van Amsterdam Antagonists of complement component 8-alpha (c8-alpha) and uses thereof
WO2011105902A2 (en) 2010-02-23 2011-09-01 Academisch Ziekenhuis Bij De Universiteit Van Amsterdam Antagonists of complement component 8-beta (c8-beta) and uses thereof
WO2011112516A1 (en) 2010-03-08 2011-09-15 Ico Therapeutics Inc. Treating and preventing hepatitis c virus infection using c-raf kinase antisense oligonucleotides
WO2011113054A2 (en) 2010-03-12 2011-09-15 Aurasense Llc Crosslinked polynucleotide structure
EP3210611B1 (en) 2010-03-12 2019-08-21 The Brigham and Women's Hospital, Inc. Methods of treating vascular inflammatory disorders
WO2011115817A1 (en) 2010-03-16 2011-09-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods of preparing 2'-o-substituted purine nucleosides
US9193752B2 (en) 2010-03-17 2015-11-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. 5′-substituted bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
WO2011120046A2 (en) 2010-03-26 2011-09-29 Swift Biosciences, Inc. Methods and compositions for isolating polynucleotides
CA2792291A1 (en) 2010-03-29 2011-10-06 Kumamoto University Sirna therapy for transthyretin (ttr) related ocular amyloidosis
JP2013523162A (ja) 2010-04-06 2013-06-17 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド Cd274/pd−l1遺伝子の発現を阻害するための組成物および方法
TWI644675B (zh) 2010-04-09 2018-12-21 可娜公司 藉由抑制纖維母細胞生長因子21(fgf21)之天然反義轉錄物以治療fgf21相關疾病
US20110269194A1 (en) 2010-04-20 2011-11-03 Swift Biosciences, Inc. Materials and methods for nucleic acid fractionation by solid phase entrapment and enzyme-mediated detachment
US20130260460A1 (en) 2010-04-22 2013-10-03 Isis Pharmaceuticals Inc Conformationally restricted dinucleotide monomers and oligonucleotides
US10913767B2 (en) 2010-04-22 2021-02-09 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides comprising acyclic and abasic nucleosides and analogs
KR101869570B1 (ko) 2010-04-28 2018-06-20 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 변형된 뉴클레오사이드 및 그로부터 제조된 올리고머 화합물
US9156873B2 (en) 2010-04-28 2015-10-13 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modified 5′ diphosphate nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
EP3091027B1 (en) 2010-04-28 2018-01-17 Ionis Pharmaceuticals, Inc. 5' modified nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
NZ603339A (en) 2010-04-29 2015-01-30 Isis Pharmaceuticals Inc Modulation of transthyretin expression
US20130156845A1 (en) 2010-04-29 2013-06-20 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Lipid formulated single stranded rna
RU2636461C2 (ru) 2010-05-03 2017-11-23 Дженентек, Инк. Композиции и способы для диагностики и лечения опухоли
KR101992076B1 (ko) 2010-05-03 2019-06-21 큐알엔에이, 인크. 시르투인 (sirt)에 대한 자연 안티센스 전사체의 저해에 의한 시르투인 (sirt) 관련된 질환의 치료
WO2011138457A1 (en) 2010-05-07 2011-11-10 Technische Universität Graz Ucp1 (thermogenin) - inducing agents for use in the treatment of a disorder of the energy homeostasis
TWI531370B (zh) 2010-05-14 2016-05-01 可娜公司 藉由抑制par4天然反股轉錄本治療par4相關疾病
BR112012029656A2 (pt) 2010-05-21 2016-12-13 Uni Fur Bodenkultur Wien composições para uso no tratamento ou diagnóstico de disturbios ósseos e/ou distúrbios cardiovasculares
WO2011150226A1 (en) 2010-05-26 2011-12-01 Landers James P Method for detecting nucleic acids based on aggregate formation
WO2011150227A1 (en) 2010-05-26 2011-12-01 Qiagen Gaithersburg, Inc. Quantitative helicase assay
EP3299464B1 (en) 2010-05-26 2019-10-02 CuRNA, Inc. Treatment of atonal homolog 1 (atoh1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to atoh1
WO2011153323A2 (en) 2010-06-02 2011-12-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods directed to treating liver fibrosis
US8795664B2 (en) 2010-06-04 2014-08-05 Georg-August-Universität Göttingen Stiftung Öffentlichen Rechts, Universitätsmedizin Monoclonal antibodies targeting amyloid beta oligomers
WO2011156278A1 (en) 2010-06-07 2011-12-15 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
CA2802049C (en) 2010-06-07 2018-07-10 Firefly Bioworks, Inc. Scanning multifunctional particles
US8846637B2 (en) 2010-06-08 2014-09-30 Isis Pharmaceuticals, Inc. Substituted 2′-amino and 2′-thio-bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
WO2011156713A1 (en) 2010-06-11 2011-12-15 Vanderbilt University Multiplexed interferometric detection system and method
EP2582397A4 (en) 2010-06-15 2014-10-29 Isis Pharmaceuticals Inc COMPOUNDS AND METHODS FOR MODULATING THE INTERACTION BETWEEN PROTEINS AND TARGET NUCLEIC ACIDS
RU2012157399A (ru) 2010-06-18 2014-07-27 КсайберСайенс ГмбХ Пептиды в качестве активных агентов для стабилизации биологических барьеров
US9168297B2 (en) 2010-06-23 2015-10-27 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Regulation of skin pigmentation by neuregulin-1 (NRG-1)
NO2593547T3 (ja) 2010-07-14 2018-04-14
EP3031920B1 (en) 2010-07-19 2019-08-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of dystrophia myotonica-protein kinase (dmpk) expression
WO2012021554A1 (en) 2010-08-09 2012-02-16 Yale University Cyclic di-gmp-ii riboswitches, motifs, and compounds, and methods for their use
JP2013538051A (ja) 2010-08-26 2013-10-10 エフ・ホフマン−ラ・ロシュ・アクチェンゲゼルシャフト Dccの第5フィブロネクチンタイプiiiドメインの組換えfc融合タンパク質
EP2620428B1 (en) 2010-09-24 2019-05-22 Wave Life Sciences Ltd. Asymmetric auxiliary group
DK2625197T3 (en) 2010-10-05 2016-10-03 Genentech Inc Smoothened MUTANT AND METHODS OF USING THE SAME
CA2813901C (en) 2010-10-06 2019-11-12 Curna, Inc. Treatment of sialidase 4 (neu4) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to neu4
CN103517990A (zh) 2010-10-07 2014-01-15 通用医疗公司 癌症生物标志物
US8648053B2 (en) 2010-10-20 2014-02-11 Rosalind Franklin University Of Medicine And Science Antisense oligonucleotides that target a cryptic splice site in Ush1c as a therapeutic for Usher syndrome
US9222088B2 (en) 2010-10-22 2015-12-29 Curna, Inc. Treatment of alpha-L-iduronidase (IDUA) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to IDUA
US20130210893A1 (en) 2010-10-27 2013-08-15 Curna, Inc. Treatment of interferon-related developmental regulator 1 (ifrd1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to ifrd1
CN103370054A (zh) 2010-11-09 2013-10-23 阿尔尼拉姆医药品有限公司 用于抑制Eg5和VEGF基因的表达的脂质配制的组合物和方法
EP3702460A1 (en) 2010-11-12 2020-09-02 The General Hospital Corporation Polycomb-associated non-coding rnas
CA3077910A1 (en) 2010-11-17 2012-05-24 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of alpha synuclein expression
JP6071893B2 (ja) 2010-11-23 2017-02-01 カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド Nanogへの天然アンチセンス転写物の阻害によるnanog関連疾患の治療
US9150926B2 (en) 2010-12-06 2015-10-06 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Diagnosis and treatment of adrenocortical tumors using human microRNA-483
EP2649182A4 (en) 2010-12-10 2015-05-06 Alnylam Pharmaceuticals Inc COMPOSITIONS AND METHOD FOR INCREASING AN ERYTHROPOIETIN (EPO) PREPARATION
EP2648763A4 (en) 2010-12-10 2014-05-14 Alnylam Pharmaceuticals Inc COMPOSITIONS AND METHODS FOR EXPRESSION INHIBITION OF GENES KLF-1 AND BCL11A
WO2012095841A1 (en) 2011-01-10 2012-07-19 State Of Israel, Ministry Of Agriculture And Rural Development, A.R.O. - Volcani Center Improved tomato plants
EP2663323B1 (en) 2011-01-14 2017-08-16 The General Hospital Corporation Methods targeting mir-128 for regulating cholesterol/lipid metabolism
EP2670404B1 (en) 2011-02-02 2018-08-29 The Trustees of Princeton University Sirtuin modulators as virus production modulators
MX365647B (es) 2011-02-02 2019-06-10 Excaliard Pharmaceuticals Inc El uso de compuestos antisentido dirigidos al factor de crecimiento del tejido conectivo (ctgf) para tratar queloides o cicatrices hipertroficas.
EP2673381A4 (en) 2011-02-07 2014-10-15 Univ Toronto BIOSONDES AND METHOD FOR THEIR USE
EP3067421B1 (en) 2011-02-08 2018-10-10 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof
WO2012113779A1 (en) 2011-02-21 2012-08-30 Medizinische Universität Wien Means and methods for treating a disease or disorder related to lymphangiogenesis or preventing metastasis
US9562853B2 (en) 2011-02-22 2017-02-07 Vanderbilt University Nonaqueous backscattering interferometric methods
MX343008B (es) 2011-03-29 2016-10-21 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones y metodos para inhibir la expresion del gen de proteasa transmembrana, serina 6 (tmprss6).
US10086043B2 (en) 2011-04-03 2018-10-02 The General Hospital Corporation Efficient protein expression in vivo using modified RNA (MOD-RNA)
WO2012149154A1 (en) 2011-04-26 2012-11-01 Swift Biosciences, Inc. Polynucleotide primers and probes
WO2012151268A1 (en) 2011-05-02 2012-11-08 University Of Virginia Patent Foundation Method and system for high throughput optical and label free detection of analytes
WO2012151324A1 (en) 2011-05-02 2012-11-08 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense compounds targeting genes associated with usher syndrome
WO2012151289A2 (en) 2011-05-02 2012-11-08 University Of Virginia Patent Foundation Method and system to detect aggregate formation on a substrate
EP2522689A1 (en) 2011-05-13 2012-11-14 Universität Bayreuth Non-viral transfection systems
EP2523002A1 (en) 2011-05-13 2012-11-14 Universität Bayreuth Utilization of magnetic nanoparticles as intracellular pull-down system
WO2012170347A1 (en) 2011-06-09 2012-12-13 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
US9593330B2 (en) 2011-06-09 2017-03-14 Curna, Inc. Treatment of frataxin (FXN) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to FXN
EP4092120A1 (en) 2011-06-21 2022-11-23 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Angiopoietin-like 3 (anglptl3) irna compositions and methods of use thereof
WO2012177949A2 (en) 2011-06-21 2012-12-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibition of expression of protein c (proc) genes
CA3191066A1 (en) 2011-06-21 2012-12-27 Alnylam Pharmaceuticals Inc. Compositions and methods for inhibition of expression of apolipoprotein c-iii (apoc3) genes
EP3597750B1 (en) 2011-06-23 2022-05-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Serpina1 sirnas: compositions of matter and methods of treatment
US9222093B2 (en) 2011-06-30 2015-12-29 The University Of Hong Kong Two-way, portable riboswitch mediated gene expression control device
JP6128529B2 (ja) 2011-07-19 2017-05-17 ウェイブ ライフ サイエンシズ リミテッドWave Life Sciences Ltd. 官能化核酸の合成のための方法
WO2013019857A2 (en) 2011-08-01 2013-02-07 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Method for improving the success rate of hematopoietic stem cell transplants
WO2013017656A1 (en) 2011-08-02 2013-02-07 Medizinische Universität Wien Antagonists of ribonucleases for treating obesity
EP3922722B1 (en) 2011-08-11 2023-06-28 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Selective antisense compounds and uses thereof
WO2013024173A1 (en) 2011-08-17 2013-02-21 Technische Universität München Computer implemented method for identifying regulatory regions or regulatory variations
US9976138B2 (en) 2011-08-29 2018-05-22 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods and compounds useful in conditions related to repeat expansion
EP3640332A1 (en) 2011-08-29 2020-04-22 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomer-conjugate complexes and their use
ES2856091T3 (es) 2011-09-14 2021-09-27 Univ Northwestern Nanoconjugados capaces de atravesar la barrera hematoencefálica
DK2756080T3 (da) 2011-09-14 2019-05-20 Translate Bio Ma Inc Multimeriske oligonukleotidforbindelser
WO2013040548A2 (en) 2011-09-17 2013-03-21 Yale University Fluoride-responsive riboswitchs, fluoride transporters, and methods of use
BR112014008925A2 (pt) 2011-10-11 2020-10-27 The Brigham And Women's Hospital, Inc. micro rnas em distúrbios de neurodegenerativos
ES2687951T3 (es) 2011-10-14 2018-10-30 F. Hoffmann-La Roche Ag Anticuerpos anti-HtrA1 y procedimientos de uso
US9243291B1 (en) 2011-12-01 2016-01-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods of predicting toxicity
JP2015502365A (ja) 2011-12-12 2015-01-22 オンコイミューニン,インコーポレイティド オリゴヌクレオチドのイン−ビボ送達
EP3431095B1 (en) 2011-12-22 2023-11-01 Medizinische Universität Wien Cyclotides as immunosuppressive agents
EP2802674B1 (en) 2012-01-11 2020-12-16 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for modulation of ikbkap splicing
EP2626066A1 (en) 2012-02-10 2013-08-14 Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Combination therapy comprising selective VEGFR-2 inhibitors and MEK inhibitors
EP2820037B1 (en) 2012-02-29 2020-02-19 Syngenta Participations AG Modulation of seed vigor
AU2013232131B2 (en) 2012-03-13 2018-09-20 Integrated Dna Technologies, Inc. Methods and compositions for size-controlled homopolymer tailing of substrate polynucleotides by a nucleic acid polymerase
WO2013138374A2 (en) 2012-03-15 2013-09-19 Curna, Inc. Treatment of brain derived neurotrophic factor (bdnf) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to bdnf
CA2907072A1 (en) 2012-03-16 2013-09-19 Valerion Therapeutics, Llc Antisense conjugates for decreasing expression of dmpk
JP6492003B2 (ja) 2012-03-30 2019-03-27 ワシントン・ユニバーシティWashington University 発作を減少させるためおよび神経変性症候群を改質するためにタウ発現を調節する方法
WO2013154799A1 (en) 2012-04-09 2013-10-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. Tricyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
WO2013154798A1 (en) 2012-04-09 2013-10-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. Tricyclic nucleic acid analogs
US9133461B2 (en) 2012-04-10 2015-09-15 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of the ALAS1 gene
JP2015518485A (ja) 2012-04-20 2015-07-02 アプタミアール セラピューティクス インコーポレイテッド 熱発生のmiRNA調節剤
EP3336189A1 (en) 2012-04-20 2018-06-20 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof
US9127274B2 (en) 2012-04-26 2015-09-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Serpinc1 iRNA compositions and methods of use thereof
WO2013163628A2 (en) 2012-04-27 2013-10-31 Duke University Genetic correction of mutated genes
US9273949B2 (en) 2012-05-11 2016-03-01 Vanderbilt University Backscattering interferometric methods
EP2850186B1 (en) 2012-05-16 2018-12-19 Translate Bio MA, Inc. Compositions and methods for modulating smn gene family expression
EP3511416A1 (en) 2012-05-16 2019-07-17 Translate Bio MA, Inc. Compositions and methods for modulating gene expression
US9574193B2 (en) 2012-05-17 2017-02-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for modulating apolipoprotein (a) expression
US20160002624A1 (en) 2012-05-17 2016-01-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotide compositions
US9487780B2 (en) 2012-06-01 2016-11-08 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Antisense compounds targeting genes associated with fibronectin
US9828602B2 (en) 2012-06-01 2017-11-28 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Antisense compounds targeting genes associated with fibronectin
WO2013184209A1 (en) 2012-06-04 2013-12-12 Ludwig Institute For Cancer Research Ltd. Mif for use in methods of treating subjects with a neurodegenerative disorder
WO2013185097A1 (en) 2012-06-08 2013-12-12 The Regents Of The University Of Michigan Ultrasound-triggerable agents for tissue engineering
WO2014006063A2 (en) 2012-07-02 2014-01-09 Medizinische Universität Wien Complement split product c4d for the treatment of inflammatory conditions
WO2014006088A1 (en) 2012-07-04 2014-01-09 Wintershall Holding GmbH Genetically modified microorganisms capable of producing beta-glucans and methods for producing beta-glucans
CA2879066C (en) 2012-07-13 2019-08-13 Shin Nippon Biomedical Laboratories, Ltd. Chiral nucleic acid adjuvant
DK2872485T3 (da) 2012-07-13 2021-03-08 Wave Life Sciences Ltd Asymmetrisk hjælpegruppe
JP6453212B2 (ja) 2012-07-13 2019-01-16 ウェイブ ライフ サイエンシズ リミテッドWave Life Sciences Ltd. キラル制御
US20140038182A1 (en) 2012-07-17 2014-02-06 Dna Logix, Inc. Cooperative primers, probes, and applications thereof
CA2880833A1 (en) 2012-08-03 2014-02-06 Aptamir Therapeutics, Inc. Cell-specific delivery of mirna modulators for the treatment of obesity and related disorders
EP2695950A1 (en) 2012-08-10 2014-02-12 Blackfield AG Markers for responsiveness to an inhibitor of the fibroblast growth factor receptor
KR102237882B1 (ko) 2012-08-15 2021-04-07 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 변형된 캡핑 프로토콜을 이용하는 올리고머 화합물 제조 방법
CA2884245C (en) 2012-09-06 2023-03-14 The University Of Chicago Antisense polynucleotides to induce exon skipping and methods of treating dystrophies
EP2708231A1 (en) 2012-09-12 2014-03-19 Netris Pharma Combined treatment with netrin-1 interfering drug and chemotherapeutic drug
EP2708241A1 (en) 2012-09-12 2014-03-19 Netris Pharma Recombinant Fc-fusion protein of the two Immunoglobulin domains of UNC5
EP2906699A4 (en) 2012-10-11 2016-06-08 Ionis Pharmaceuticals Inc OLIGOMER COMPOUNDS WITH BICYCLIC NUCLEOSIDES AND USES THEREOF
DK2906256T3 (en) 2012-10-12 2018-11-19 Ionis Pharmaceuticals Inc SELECTIVE ANTISENSE COMPOUNDS AND APPLICATIONS THEREOF
US20160138014A1 (en) 2012-10-12 2016-05-19 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense compounds and uses thereof
US9029335B2 (en) 2012-10-16 2015-05-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Substituted 2′-thio-bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
EP2912069B1 (en) 2012-10-23 2019-07-31 Emory University Gm-csf and il-4 conjugates, compositions, and methods related thereto
EP2912179A4 (en) 2012-10-26 2016-10-12 Geron Corp C-MYC ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDES AND METHODS OF USE FOR THE TREATMENT OF CELL PROLIFERATION DISORDERS
EP2914621B1 (en) 2012-11-05 2023-06-07 Foundation Medicine, Inc. Novel ntrk1 fusion molecules and uses thereof
US8883857B2 (en) 2012-12-07 2014-11-11 Baylor College Of Medicine Small molecule xanthine oxidase inhibitors and methods of use
WO2014093537A1 (en) 2012-12-11 2014-06-19 Isis Pharmaceuticals, Inc. Competitive modulation of micrornas
WO2014113729A2 (en) 2013-01-18 2014-07-24 Foundation Mecicine, Inc. Methods of treating cholangiocarcinoma
ES2817050T3 (es) 2013-02-04 2021-04-06 Ionis Pharmaceuticals Inc Compuestos antisentido selectivos y usos de los mismos
WO2014130922A1 (en) 2013-02-25 2014-08-28 Trustees Of Boston University Compositions and methods for treating fungal infections
MX366660B (es) 2013-03-14 2019-07-18 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones de arni contra el componente c5 del complemento y métodos para su uso.
CN105229150A (zh) 2013-03-14 2016-01-06 安第斯生物技术股份有限公司 用于治疗癌症干细胞的反义寡核苷酸
BR112015022621A2 (pt) 2013-03-14 2017-10-31 Andes Biotechnologies S A métodos para detecção e tratamento de mieloma múltiplo
CN111254145A (zh) 2013-03-14 2020-06-09 Ionis制药公司 用于调节tau表达的组合物和方法
EP2971160B1 (en) 2013-03-15 2018-05-30 Bio-Rad Laboratories, Inc. Digital assays for mutation detection
WO2014160871A2 (en) 2013-03-27 2014-10-02 The General Hospital Corporation Methods and agents for treating alzheimer's disease
JP2016522679A (ja) 2013-04-04 2016-08-04 プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ CRISPR/Cas系を用いたゲノム編集の治療的使用
WO2015012916A2 (en) 2013-04-23 2015-01-29 Northwestern University Metal-ligand coordination polymer nanoparticles and methods for making
NZ631552A (en) 2013-05-01 2017-02-24 Ionis Pharmaceuticals Inc Compositions and methods for modulating hbv expression
EP2999785B1 (en) 2013-05-22 2018-04-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Serpina1 irna compositions and methods of use thereof
IL293657A (en) 2013-05-22 2022-08-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc Preparations of tmprss6 irna and methods of using them
WO2014197835A2 (en) 2013-06-06 2014-12-11 The General Hospital Corporation Methods and compositions for the treatment of cancer
DK3007704T3 (da) 2013-06-13 2021-03-29 Antisense Therapeutics Ltd Kombinationsterapi til akromegali
AU2014284152B2 (en) 2013-06-21 2020-01-23 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for modulation of target nucleic acids
KR102285326B1 (ko) 2013-06-28 2021-08-04 에트리스 게엠베하 Rna를 세포에 도입하기 위한 조성물
EP3022176B8 (en) 2013-07-15 2019-12-25 The Regents of the University of California Azacyclic constrained analogs of fty720
TW202246503A (zh) 2013-07-19 2022-12-01 美商百健Ma公司 用於調節τ蛋白表現之組合物
US10435430B2 (en) 2013-07-31 2019-10-08 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods and compounds useful in conditions related to repeat expansion
RS59991B1 (sr) 2013-08-08 2020-04-30 Scripps Research Inst Metoda enzimskog in vitro obeležavanja specifičnog za položaj nukleinskih kiselina uvođenjem neprirodnih nukleotida
TW201536329A (zh) 2013-08-09 2015-10-01 Isis Pharmaceuticals Inc 用於調節失養性肌強直蛋白質激酶(dmpk)表現之化合物及方法
WO2015022326A1 (en) 2013-08-12 2015-02-19 Xiber Science Gmbh Peptides as active agents for treating primary graft dysfunction
US9371570B2 (en) 2013-09-16 2016-06-21 CeMM—FORSCHUNGSZENTRUM FÜR MOLEKULARE MEDIZIN GmbH Mutant calreticulin for the diagnosis of myeloid malignancies
US9943604B2 (en) 2013-09-20 2018-04-17 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Targeted therapeutic nucleosides and their use
MX2016004230A (es) 2013-10-02 2016-10-21 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones y metodos para inhibir la expresion del gen lect2.
SG10201910929QA (en) 2013-10-04 2020-01-30 Alnylam Pharmaceuticals Inc Compositions and methods for inhibiting expression of the alas1 gene
WO2015054451A1 (en) 2013-10-09 2015-04-16 The United States Of America As Represented By The Secretary Department Of Health And Human Services Detection of hepatitis delta virus (hdv) for the diagnosis and treatment of sjögren's syndrome and lymphoma
US11162096B2 (en) 2013-10-14 2021-11-02 Ionis Pharmaceuticals, Inc Methods for modulating expression of C9ORF72 antisense transcript
WO2015061091A1 (en) 2013-10-21 2015-04-30 The General Hospital Corporation Methods relating to circulating tumor cell clusters and the treatment of cancer
WO2015066708A1 (en) 2013-11-04 2015-05-07 Northwestern University Quantification and spatio-temporal tracking of a target using a spherical nucleic acid (sna)
US10752940B2 (en) 2013-11-08 2020-08-25 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for detecting oligonucleotides
ES2797679T3 (es) 2013-12-02 2020-12-03 Ionis Pharmaceuticals Inc Compuestos antisentido y usos de los mismos
JP6527516B2 (ja) 2013-12-03 2019-06-05 ノースウェスタン ユニバーシティ リポソーム粒子、前述のものを作製する方法及びその使用
CA2844640A1 (en) 2013-12-06 2015-06-06 The University Of British Columbia Method for treatment of castration-resistant prostate cancer
WO2015085183A2 (en) 2013-12-06 2015-06-11 Swift Biosciences, Inc. Cleavable competitor polynucleotides
KR102344559B1 (ko) 2013-12-12 2021-12-31 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 보체 성분 iRNA 조성물 및 이의 이용 방법
EP3082840B1 (en) 2013-12-20 2021-03-24 The General Hospital Corporation Methods and assays relating to circulating tumor cells
WO2015108046A1 (ja) 2014-01-15 2015-07-23 株式会社新日本科学 抗アレルギー作用を有するキラル核酸アジュバンド及び抗アレルギー剤
WO2015108047A1 (ja) 2014-01-15 2015-07-23 株式会社新日本科学 免疫誘導活性を有するキラル核酸アジュバンド及び免疫誘導活性剤
EP3095459A4 (en) 2014-01-15 2017-08-23 Shin Nippon Biomedical Laboratories, Ltd. Chiral nucleic acid adjuvant having antitumor effect and antitumor agent
SG10201912897UA (en) 2014-01-16 2020-02-27 Wave Life Sciences Ltd Chiral design
JP6736467B2 (ja) 2014-02-04 2020-08-05 ジェネンテック, インコーポレイテッド 平滑化変異体及びその使用方法
EP3960860A3 (en) 2014-02-11 2022-06-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Ketohexokinase (khk) irna compositions and methods of use thereof
EP3104873B1 (en) 2014-02-13 2019-09-04 Technische Universität München Fgf-8 for use in treating diseases or disorders of energy homeostasis
JP2017507946A (ja) 2014-02-26 2017-03-23 エスリス ゲーエムベーハーethris GmbH Rnaを胃腸内投与するための組成物
US10036019B2 (en) 2014-03-17 2018-07-31 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic carbocyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
WO2015143245A1 (en) 2014-03-19 2015-09-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods for modulating ataxin 2 expression
HUE055877T2 (hu) 2014-03-19 2021-12-28 Ionis Pharmaceuticals Inc Ataxin-2 expresszióját módosító készítmények
HRP20220798T1 (hr) 2014-04-01 2022-10-14 Biogen Ma Inc. Pripravci za modulaciju ekspresije sod-1
DK3129493T3 (da) 2014-04-09 2021-09-27 Scripps Research Inst Import af unaturlige eller modificerede nukleosidtriphosphater ind i celler via nukleinsyre-triphosphat-transportører
WO2015158898A2 (en) 2014-04-17 2015-10-22 Medizinische Hochschule Hannover Means and methods for producing neisseria meningitidis capsular polysaccharides of low dispersity
WO2015164693A1 (en) 2014-04-24 2015-10-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising alpha-beta-constrained nucleic acid
WO2015168172A1 (en) 2014-04-28 2015-11-05 Isis Pharmaceuticals, Inc. Linkage modified oligomeric compounds
EP3757215A3 (en) 2014-05-01 2021-03-17 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for modulating growth hormone receptor expression
CA2946003A1 (en) 2014-05-01 2015-11-05 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for modulating angiopoietin-like 3 expression
CN106232804B (zh) 2014-05-01 2019-10-25 Ionis制药公司 用于调节补体因子b表达的组合物和方法
TW201607559A (zh) 2014-05-12 2016-03-01 阿尼拉製藥公司 治療serpinc1相關疾患之方法和組成物
WO2015179693A1 (en) 2014-05-22 2015-11-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Conjugated antisense compounds and their use
JP6811094B2 (ja) 2014-05-22 2021-01-13 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッドAlnylam Pharmaceuticals, Inc. アンジオテンシノーゲン(AGT)iRNA組成物およびその使用
JP2017518307A (ja) 2014-06-02 2017-07-06 チルドレンズ メディカル センター コーポレーション 免疫調節のための方法および組成物
TR201908550T4 (tr) 2014-06-04 2019-07-22 Exicure Inc Profilaktik veya terapötik uygulamalar için lipozomal sferik nükleik asitler tarafından immün modülatörlerin çok değerlikli teslimi.
US10308940B2 (en) 2014-06-10 2019-06-04 Erasmus University Medical Center Rotterdam Antisense oligonucleotides useful in treatment of Pompe disease
WO2015200697A1 (en) 2014-06-25 2015-12-30 The General Hospital Corporation Targeting human satellite ii (hsatii)
US9951327B1 (en) 2014-07-17 2018-04-24 Integrated Dna Technologies, Inc. Efficient and rapid method for assembling and cloning double-stranded DNA fragments
US10653747B2 (en) 2014-07-31 2020-05-19 Uab Research Foundation ApoE mimetic peptides and higher potency to clear plasma cholesterol
MX2017002085A (es) 2014-08-19 2017-08-21 Univ Northwestern Tratamientos con nanopartículas núcleo-corteza de proteína/oligonucleótido.
CN107074767A (zh) 2014-08-20 2017-08-18 西北大学 用于反义基因调节的生物相容的无限配位聚合物纳米颗粒–核酸缀合物
JP6672270B2 (ja) 2014-08-29 2020-03-25 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッドAlnylam Pharmaceuticals, Inc. トランスサイレチン(ttr)媒介アミロイドーシスの治療方法
WO2016033472A1 (en) 2014-08-29 2016-03-03 Children's Medical Center Corporation Methods and compositions for the treatment of cancer
WO2016033424A1 (en) 2014-08-29 2016-03-03 Genzyme Corporation Methods for the prevention and treatment of major adverse cardiovascular events using compounds that modulate apolipoprotein b
US10436802B2 (en) 2014-09-12 2019-10-08 Biogen Ma Inc. Methods for treating spinal muscular atrophy
WO2016040589A1 (en) 2014-09-12 2016-03-17 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Polynucleotide agents targeting complement component c5 and methods of use thereof
EP3663403A1 (en) 2014-09-26 2020-06-10 University of Massachusetts Rna-modulating agents
EP3201348B2 (en) 2014-09-30 2022-06-29 Basf Se Method for preparing an aqueous acrylamide solution having a low acrylic acid concentration
WO2016050819A1 (en) 2014-09-30 2016-04-07 Basf Se Method for preparing an acrylamide solution having a low acrylic acid concentration
BR112017005847A2 (pt) 2014-09-30 2018-02-06 Basf Se métodos para produzir um composto de amida, para produzir um micro-organismo e para reduzir a formação de ácido acrílico, solução de composto de amida aquosa, composição, e, usos de uma nitrila hidratase e amidase e de um método de secagem.
JOP20200115A1 (ar) 2014-10-10 2017-06-16 Alnylam Pharmaceuticals Inc تركيبات وطرق لتثبيط التعبير الجيني عن hao1 (حمض أوكسيداز هيدروكسيلي 1 (أوكسيداز جليكولات))
WO2016061487A1 (en) 2014-10-17 2016-04-21 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Polynucleotide agents targeting aminolevulinic acid synthase-1 (alas1) and uses thereof
EP3904519A1 (en) 2014-10-30 2021-11-03 Genzyme Corporation Polynucleotide agents targeting serpinc1 (at3) and methods of use thereof
JOP20200092A1 (ar) 2014-11-10 2017-06-16 Alnylam Pharmaceuticals Inc تركيبات iRNA لفيروس الكبد B (HBV) وطرق لاستخدامها
WO2016077540A1 (en) 2014-11-12 2016-05-19 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for the modulation of comp
WO2016081444A1 (en) 2014-11-17 2016-05-26 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Apolipoprotein c3 (apoc3) irna compositions and methods of use thereof
AU2015349680A1 (en) 2014-11-21 2017-06-08 Northwestern University The sequence-specific cellular uptake of spherical nucleic acid nanoparticle conjugates
AU2015360794B2 (en) 2014-12-08 2021-07-08 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Lipocationic polymers and uses thereof
EP3230445B1 (en) 2014-12-12 2024-01-24 Tod M. Woolf Compositions and methods for editing nucleic acids in cells utilizing oligonucleotides
EP3034539A1 (en) 2014-12-19 2016-06-22 Ethris GmbH Compositions for introducing nucleic acid into cells
US9688707B2 (en) 2014-12-30 2017-06-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic morpholino compounds and oligomeric compounds prepared therefrom
WO2016112132A1 (en) 2015-01-06 2016-07-14 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions for modulating expression of c9orf72 antisense transcript
US10538763B2 (en) 2015-01-16 2020-01-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulation of DUX4
EP3247988A4 (en) 2015-01-23 2018-12-19 Vanderbilt University A robust interferometer and methods of using same
WO2016130600A2 (en) 2015-02-09 2016-08-18 Duke University Compositions and methods for epigenome editing
WO2016130806A2 (en) 2015-02-13 2016-08-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Patatin-like phospholipase domain containing 3 (pnpla3) irna compositions and methods of use thereof
EP3262173A2 (en) 2015-02-23 2018-01-03 Crispr Therapeutics AG Materials and methods for treatment of human genetic diseases including hemoglobinopathies
US11129844B2 (en) 2015-03-03 2021-09-28 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for modulating MECP2 expression
EP3722297A1 (en) 2015-03-04 2020-10-14 Gilead Sciences, Inc. Toll-like receptor modulating 4,6-diamino-pyrido[3,2-d]pyrimidine compounds
IL254734B2 (en) 2015-03-27 2023-09-01 Harvard College Modified t cells and methods for their preparation and use
WO2016164463A1 (en) 2015-04-07 2016-10-13 The General Hospital Corporation Methods for reactivating genes on the inactive x chromosome
DK3283500T3 (en) 2015-04-08 2020-11-16 Univ Chicago Compositions and methods for correcting limb girdle muscular dystrophy type 2C using exon skipping
US10745702B2 (en) 2015-04-08 2020-08-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of the LECT2 gene
WO2016167780A1 (en) 2015-04-16 2016-10-20 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions for modulating expression of c9orf72 antisense transcript
EP3307316A1 (en) 2015-06-12 2018-04-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Complement component c5 irna compositions and methods of use thereof
WO2016205323A1 (en) 2015-06-18 2016-12-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Polynucleotde agents targeting hydroxyacid oxidase (glycolate oxidase, hao1) and methods of use thereof
WO2016209862A1 (en) 2015-06-23 2016-12-29 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Glucokinase (gck) irna compositions and methods of use thereof
AU2016282986A1 (en) 2015-06-26 2018-02-01 Beth Israel Deaconess Medical Center, Inc. Cancer therapy targeting tetraspanin 33 (tspan33) in myeloid derived suppressor cells
WO2017004261A1 (en) 2015-06-29 2017-01-05 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modified crispr rna and modified single crispr rna and uses thereof
AU2016287499B2 (en) 2015-06-29 2022-08-04 Caris Science, Inc. Therapeutic oligonucleotides
US10494632B2 (en) 2015-07-10 2019-12-03 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Insulin-like growth factor binding protein, acid labile subunit (IGFALS) compositions and methods of use thereof
KR102640776B1 (ko) 2015-07-10 2024-02-23 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 디아실글리세롤 아실전이효소 2(dgat2) 조절제
MA43072A (fr) 2015-07-22 2018-05-30 Wave Life Sciences Ltd Compositions d'oligonucléotides et procédés associés
US10941176B2 (en) 2015-07-28 2021-03-09 Caris Science, Inc. Therapeutic oligonucleotides
US20180237774A1 (en) 2015-08-04 2018-08-23 Yeda Research And Development Co. Ltd. Methods of screening for riboswitches and attenuators
PE20181131A1 (es) 2015-09-02 2018-07-17 Alnylam Pharmaceuticals Inc COMPOSICIONES DE ARNi PARA LIGANDO 1 DE MUERTE CELULAR PROGRAMADA 1 (PD-L1) Y METODOS DE USO DE LAS MISMAS
KR102641298B1 (ko) 2015-09-14 2024-03-04 더 보드 오브 리젠츠 오브 더 유니버시티 오브 텍사스 시스템 지질양이온성 덴드리머 및 이의 용도
CN108366990B (zh) 2015-09-24 2021-09-03 加利福尼亚大学董事会 合成的鞘脂类分子、药物、它们的合成方法及治疗方法
AU2016339053A1 (en) 2015-09-24 2018-04-12 Crispr Therapeutics Ag Novel family of RNA-programmable endonucleases and their uses in genome editing and other applications
US20180273577A1 (en) 2015-09-24 2018-09-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulators of kras expression
WO2017053781A1 (en) 2015-09-25 2017-03-30 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for modulating ataxin 3 expression
US10709812B2 (en) 2015-09-29 2020-07-14 The Regents Of The University Of Michigan Biodegradable hydrogel for tissue expansion
EP4089175A1 (en) 2015-10-13 2022-11-16 Duke University Genome engineering with type i crispr systems in eukaryotic cells
JP2019507579A (ja) 2015-10-28 2019-03-22 クリスパー セラピューティクス アーゲー デュシェンヌ型筋ジストロフィーの処置のための材料および方法
KR102162324B1 (ko) 2015-10-30 2020-10-07 제넨테크, 인크. 항-HtrA1 항체 및 이의 사용 방법
WO2017075670A1 (en) 2015-11-05 2017-05-11 Children's Hospital Los Angeles "mobilizing leukemia cells"
EP3371201A4 (en) 2015-11-06 2019-09-18 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Conjugated antisense compounds for use in therapy
MX2018005332A (es) 2015-11-06 2018-11-09 Crispr Therapeutics Ag Materiales y metodos para tratamiento de la enfermedad de almacenamiento de glucogeno tipo 1a.
BR122023026882A2 (pt) 2015-11-06 2024-01-23 Ionis Pharmaceuticals, Inc Uso de um composto oligomérico
AU2016355178B9 (en) 2015-11-19 2019-05-30 Massachusetts Institute Of Technology Lymphocyte antigen CD5-like (CD5L)-interleukin 12B (p40) heterodimers in immunity
US11851653B2 (en) 2015-12-01 2023-12-26 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of alpha-1 antitrypsin deficiency
WO2017096395A1 (en) 2015-12-04 2017-06-08 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods of treating breast cancer
AU2015416656B2 (en) 2015-12-07 2023-02-23 Erasmus University Medical Center Rotterdam Enzymatic replacement therapy and antisense therapy for Pompe disease
US11761007B2 (en) 2015-12-18 2023-09-19 The Scripps Research Institute Production of unnatural nucleotides using a CRISPR/Cas9 system
WO2017109757A1 (en) 2015-12-23 2017-06-29 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of amyotrophic lateral sclerosis and/or frontal temporal lobular degeneration
US10907160B2 (en) 2016-01-05 2021-02-02 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods for reducing LRRK2 expression
EP3408649B1 (en) 2016-01-29 2023-06-14 Vanderbilt University Free-solution response function interferometry
US20190038771A1 (en) 2016-02-02 2019-02-07 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of severe combined immunodeficiency (scid) or omenn syndrome
CN109071625A (zh) 2016-02-04 2018-12-21 柯瑞斯公司 平滑化突变体和其使用方法
WO2017141109A1 (en) 2016-02-18 2017-08-24 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of severe combined immunodeficiency (scid) or omenn syndrome
WO2017147087A1 (en) 2016-02-25 2017-08-31 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Treatment methods for fibrosis targeting smoc2
EP3423581A4 (en) 2016-03-04 2020-03-04 Rhode Island Hospital TARGETING MIKRORNA FOR CANCER TREATMENT
US11136577B2 (en) 2016-03-09 2021-10-05 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for inhibiting PMP22 expression
WO2017161168A1 (en) 2016-03-16 2017-09-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of dyrk1b expression
EP3429632B1 (en) 2016-03-16 2023-01-04 CRISPR Therapeutics AG Materials and methods for treatment of hereditary haemochromatosis
AU2017234678A1 (en) 2016-03-16 2018-08-16 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods of modulating KEAP1
EP4339288A3 (en) 2016-03-18 2024-06-05 Caris Science, Inc. Oligonucleotide probes and uses thereof
WO2017167803A1 (en) 2016-03-29 2017-10-05 Basf Se Process for producing a polyacrylamide solution with increased viscosity
EP3225693A1 (en) 2016-03-29 2017-10-04 Basf Se Method for preparing aqueous acrylamide solutions
EP3225694A1 (en) 2016-03-29 2017-10-04 Basf Se Method for the production of acrylamide by defined addition of the biocatalyst
WO2017180835A1 (en) 2016-04-13 2017-10-19 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods for reducing c9orf72 expression
WO2017178193A1 (en) 2016-04-14 2017-10-19 MAX-PLANCK-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Method for the identification of random polynucleotide or polypeptide sequences with biological activity
SG10202010261YA (en) 2016-04-18 2020-11-27 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of hemoglobinopathies
MA45295A (fr) 2016-04-19 2019-02-27 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composition d'arni de protéine de liaison de lipoprotéines haute densité (hdlbp/vigiline) et procédés pour les utiliser
EP3448898A1 (en) 2016-04-26 2019-03-06 Basf Se Method for preparing an aqueous polyacrylamide solution
WO2017186685A1 (en) 2016-04-26 2017-11-02 Basf Se Method for preparing an aqueous polyacrylamide solution
WO2017186697A1 (en) 2016-04-26 2017-11-02 Basf Se Method for preparing an aqueous polyacrylamide solution
WO2017191503A1 (en) 2016-05-05 2017-11-09 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of hemoglobinopathies
KR20190003740A (ko) 2016-05-06 2019-01-09 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 Glp-1 수용체 리간드 모이어티 컨쥬게이트된 올리고뉴클레오티드 및 이의 용도
JP7080826B2 (ja) 2016-05-16 2022-06-06 ザ ボード オブ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティー オブ テキサス システム カチオン性スルホンアミドアミノ脂質および両親媒性両性イオンアミノ脂質
AU2017271579B2 (en) 2016-05-25 2023-10-19 Caris Science, Inc. Oligonucleotide probes and uses thereof
WO2017214518A1 (en) 2016-06-10 2017-12-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. COMPLETMENT COMPONENT C5 iRNA COMPOSTIONS AND METHODS OF USE THEREOF FOR TREATING PAROXYSMAL NOCTURNAL HEMOGLOBINURIA (PNH)
ES2929381T3 (es) 2016-06-15 2022-11-28 Streck Inc Ensayos y métodos para determinar la resistencia microbiana
WO2017219017A1 (en) 2016-06-17 2017-12-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of gys1 expression
MA45496A (fr) 2016-06-17 2019-04-24 Hoffmann La Roche Molécules d'acide nucléique pour la réduction de l'arnm de padd5 ou pad7 pour le traitement d'une infection par l'hépatite b
ES2929047T3 (es) 2016-06-24 2022-11-24 Scripps Research Inst Transportador de nucleósido trifosfato novedoso y usos del mismo
WO2018002812A1 (en) 2016-06-29 2018-01-04 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of myotonic dystrophy type 1 (dm1) and other related disorders
WO2018002783A1 (en) 2016-06-29 2018-01-04 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of friedreich ataxia and other related disorders
US11174469B2 (en) 2016-06-29 2021-11-16 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) and other related disorders
WO2018007980A1 (en) 2016-07-06 2018-01-11 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of pain related disorders
WO2018007976A1 (en) 2016-07-06 2018-01-11 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of pain related disorders
WO2018007871A1 (en) 2016-07-08 2018-01-11 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of transthyretin amyloidosis
CA3030701A1 (en) 2016-07-11 2018-01-18 Translate Bio Ma, Inc. Nucleic acid conjugates and uses thereof
EP3484524B1 (en) 2016-07-15 2022-11-09 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulation of smn2
WO2018020323A2 (en) 2016-07-25 2018-02-01 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of fatty acid disorders
NL2017295B1 (en) 2016-08-05 2018-02-14 Univ Erasmus Med Ct Rotterdam Antisense oligomeric compound for Pompe disease
NL2017294B1 (en) 2016-08-05 2018-02-14 Univ Erasmus Med Ct Rotterdam Natural cryptic exon removal by pairs of antisense oligonucleotides.
US11981703B2 (en) 2016-08-17 2024-05-14 Sirius Therapeutics, Inc. Polynucleotide constructs
US11364304B2 (en) 2016-08-25 2022-06-21 Northwestern University Crosslinked micellar spherical nucleic acids
SG10201607303YA (en) 2016-09-01 2018-04-27 Agency Science Tech & Res Antisense oligonucleotides to induce exon skipping
WO2018045150A1 (en) 2016-09-02 2018-03-08 Gilead Sciences, Inc. 4,6-diamino-pyrido[3,2-d]pyrimidine derivaties as toll like receptor modulators
AU2017318601B2 (en) 2016-09-02 2020-09-03 Gilead Sciences, Inc. Toll like receptor modulator compounds
WO2018055577A1 (en) 2016-09-23 2018-03-29 Synthena Ag Mixed tricyclo-dna, 2'-modified rna oligonucleotide compositions and uses thereof
JOP20190065A1 (ar) 2016-09-29 2019-03-28 Ionis Pharmaceuticals Inc مركبات وطرق لتقليل التعبير عن tau
CN109661233A (zh) 2016-10-06 2019-04-19 Ionis 制药公司 缀合低聚化合物的方法
SG10201609048RA (en) 2016-10-28 2018-05-30 Agency Science Tech & Res Antisense oligonucleotides
EP3532638A4 (en) 2016-10-31 2020-07-29 University of Massachusetts TARGETING MICROARN-101-3 P IN CARCINOTHERAPY
JOP20190104A1 (ar) 2016-11-10 2019-05-07 Ionis Pharmaceuticals Inc مركبات وطرق لتقليل التعبير عن atxn3
TW202313978A (zh) 2016-11-23 2023-04-01 美商阿尼拉製藥公司 絲胺酸蛋白酶抑制因子A1 iRNA組成物及其使用方法
US11033570B2 (en) 2016-12-02 2021-06-15 Cold Spring Harbor Laboratory Modulation of Lnc05 expression
AU2017378153B2 (en) 2016-12-13 2024-03-28 Seattle Children's Hospital (dba Seattle Children's Research Institute) Methods of exogenous drug activation of chemical-induced signaling complexes expressed in engineered cells in vitro and in vivo
TWI790217B (zh) 2016-12-16 2023-01-21 美商阿尼拉製藥公司 使用甲狀腺素運載蛋白(TTR)iRNA組成物於治療或預防TTR相關疾病之方法
JP7458785B2 (ja) 2017-01-23 2024-04-01 リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド ヒドロキシステロイド17-βデヒドロゲナーゼ13(HSD17B13)バリアント及びその使用
EP3585898A1 (en) 2017-02-22 2020-01-01 CRISPR Therapeutics AG Materials and methods for treatment of spinocerebellar ataxia type 1 (sca1) and other spinocerebellar ataxia type 1 protein (atxn1) gene related conditions or disorders
WO2018154459A1 (en) 2017-02-22 2018-08-30 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of primary hyperoxaluria type 1 (ph1) and other alanine-glyoxylate aminotransferase (agxt) gene related conditions or disorders
WO2018154462A2 (en) 2017-02-22 2018-08-30 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of spinocerebellar ataxia type 2 (sca2) and other spinocerebellar ataxia type 2 protein (atxn2) gene related conditions or disorders
US11920148B2 (en) 2017-02-22 2024-03-05 Crispr Therapeutics Ag Compositions and methods for gene editing
EP3585807A1 (en) 2017-02-22 2020-01-01 CRISPR Therapeutics AG Materials and methods for treatment of early onset parkinson's disease (park1) and other synuclein, alpha (snca) gene related conditions or disorders
US11180756B2 (en) 2017-03-09 2021-11-23 Ionis Pharmaceuticals Morpholino modified oligomeric compounds
JOP20190215A1 (ar) 2017-03-24 2019-09-19 Ionis Pharmaceuticals Inc مُعدّلات التعبير الوراثي عن pcsk9
US20180284123A1 (en) 2017-03-30 2018-10-04 California Institute Of Technology Barcoded rapid assay platform useful for efficient analysis of candidate molecules and methods of making and using the platform
WO2018185222A1 (en) 2017-04-05 2018-10-11 Acib Gmbh - Austrian Centre Of Industrial Biotechnology Aminoacyl trna synthetases and orthogonal trnas
IL269970B (en) 2017-04-14 2022-09-01 Tallac Therapeutics Inc Polynucleotides that modulate the immune system, their antibody binding, and methods of using them
CN110913898B (zh) 2017-04-18 2024-04-05 阿尔尼拉姆医药品有限公司 具有乙肝病毒(hbv)感染的受试者的治疗方法
CA3059321A1 (en) 2017-04-20 2018-10-25 Synthena Ag Modified oligomeric compounds comprising tricyclo-dna nucleosides and uses thereof
WO2018193428A1 (en) 2017-04-20 2018-10-25 Synthena Ag Modified oligomeric compounds comprising tricyclo-dna nucleosides and uses thereof
US20200384115A1 (en) 2017-04-21 2020-12-10 The Broad Institute , Inc. Targeted delivery to beta cells
WO2018209270A1 (en) 2017-05-11 2018-11-15 Northwestern University Adoptive cell therapy using spherical nucleic acids (snas)
IL270415B1 (en) 2017-05-12 2024-04-01 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for cell engineering and their uses in immuno-oncology
US11597744B2 (en) 2017-06-30 2023-03-07 Sirius Therapeutics, Inc. Chiral phosphoramidite auxiliaries and methods of their use
JP7325341B2 (ja) 2017-07-11 2023-08-14 シンソークス,インク. 非天然ヌクレオチドの組み込み及びその方法
MX2020000387A (es) 2017-07-13 2020-08-17 Univ Northwestern Método general y directo para preparar nanopartículas de estructura organometálica funcionalizadas con oligonucleotidos.
CA3069868A1 (en) 2017-07-13 2019-01-17 Alnylam Pharmaceuticals Inc. Lactate dehydrogenase a (ldha) irna compositions and methods of use thereof
EP3658176A1 (en) 2017-07-26 2020-06-03 Medizinische Universität Wien Superactive mutant thymidine kinase for use in cancer therapy
JP2020529976A (ja) 2017-08-03 2020-10-15 シンソークス,インク. 自己免疫疾患の処置のためのサイトカイン抱合体
AU2018318231A1 (en) 2017-08-18 2020-02-13 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of the notch signaling pathway for treatment of respiratory disorders
WO2019051173A1 (en) 2017-09-08 2019-03-14 Ionis Pharmaceuticals, Inc. MODULATORS OF SMAD7 EXPRESSION
WO2019055460A1 (en) 2017-09-13 2019-03-21 The Children's Medical Center Corporation COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE TREATMENT OF TRANSPOSON-ASSOCIATED DISEASES
US11806360B2 (en) 2017-09-19 2023-11-07 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for treating transthyretin (TTR) mediated amyloidosis
AU2018350693B2 (en) 2017-10-16 2021-03-04 F. Hoffmann-La Roche Ag Nucleic acid molecule for reduction of PAPD5 and PAPD7 mRNA for treating hepatitis B infection
MX2020004043A (es) 2017-10-17 2021-05-27 Crispr Therapeutics Ag Composiciones y métodos para la edición génica de hemofilia a.
WO2019081982A1 (en) 2017-10-26 2019-05-02 Crispr Therapeutics Ag SUBSTANCES AND METHODS FOR THE TREATMENT OF HEMOGLOBINOPATHIES
WO2019089922A1 (en) 2017-11-01 2019-05-09 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Complement component c3 irna compositions and methods of use thereof
US20210363521A1 (en) 2017-11-09 2021-11-25 Vertex Pharmaceuticals Incorporated CRISPR/CAS Systems For Treatment of DMD
TWI809004B (zh) 2017-11-09 2023-07-21 美商Ionis製藥公司 用於降低snca表現之化合物及方法
WO2019099610A1 (en) 2017-11-16 2019-05-23 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Kisspeptin 1 (kiss1) irna compositions and methods of use thereof
EP3714054A1 (en) 2017-11-20 2020-09-30 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Serum amyloid p component (apcs) irna compositions and methods of use thereof
MA50877A (fr) 2017-11-21 2020-09-30 Bayer Healthcare Llc Matériaux et méthodes pour le traitement de la rétinite pigmentaire autosomique dominante
EP3720473A1 (en) 2017-12-05 2020-10-14 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Crispr-cas9 modified cd34+ human hematopoietic stem and progenitor cells and uses thereof
JP2021506239A (ja) 2017-12-14 2021-02-22 アイオーニス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッドIonis Pharmaceuticals,Inc. 複合アンチセンス化合物及びその使用
MA51138A (fr) 2017-12-14 2020-10-21 Bayer Healthcare Llc Nouveaux systèmes d'endonucléases arn-programmables et leurs utilisations dans l'édition de génome et d'autres applications
CA3086343A1 (en) 2017-12-18 2019-06-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. High mobility group box-1 (hmgb1) irna compositions and methods of use thereof
CN111836892A (zh) 2017-12-21 2020-10-27 克里斯珀医疗股份公司 用于治疗2a型乌谢尔综合征的材料和方法
CA3084633A1 (en) 2017-12-21 2019-06-27 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of usher syndrome type 2a and/or non-syndromic autosomal recessive retinitis pigmentosa (arrp)
WO2019126641A2 (en) 2017-12-21 2019-06-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of frataxin expression
PE20201501A1 (es) 2018-01-12 2020-12-29 Bristol Myers Squibb Co Oligonucleotidos antisentido que actuan sobre alfa-sinucleina, y usos de estos
MA51637A (fr) 2018-01-12 2020-11-18 Bayer Healthcare Llc Compositions et méthodes pour l'édition génique par ciblage de la transferrine
RU2020127049A (ru) 2018-01-15 2022-02-17 Айонис Фармасьютикалс, Инк. Модуляторы экспрессии dnm2
EP3740472A1 (en) 2018-01-19 2020-11-25 Synthena AG Tricyclo-dna nucleoside precursors and processes for preparing the same
WO2019147743A1 (en) 2018-01-26 2019-08-01 Massachusetts Institute Of Technology Structure-guided chemical modification of guide rna and its applications
EP3749767A1 (en) 2018-02-05 2020-12-16 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Materials and methods for treatment of hemoglobinopathies
US11268077B2 (en) 2018-02-05 2022-03-08 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Materials and methods for treatment of hemoglobinopathies
AU2019218987A1 (en) 2018-02-12 2020-07-23 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modified compounds and uses thereof
MA51869A (fr) 2018-02-16 2020-12-23 Bayer Healthcare Llc Compositions et méthodes pour l'édition génique par ciblage du fibrinogène-alpha
SG11202007728QA (en) 2018-02-26 2020-09-29 Synthorx Inc Il-15 conjugates and uses thereof
US11241451B2 (en) 2018-03-02 2022-02-08 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulators of IRF4 expression
US11732260B2 (en) 2018-03-02 2023-08-22 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for the modulation of amyloid-β precursor protein
JP2021518139A (ja) 2018-03-19 2021-08-02 クリスパー セラピューティクス アーゲー 新規rnaプログラム可能エンドヌクレアーゼ系およびその使用
US11661601B2 (en) 2018-03-22 2023-05-30 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods for modulating FMR1 expression
CA3095545A1 (en) 2018-03-30 2019-10-03 Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universitat Bonn Aptamers for targeted activaton of t cell-mediated immunity
CN116536272A (zh) 2018-04-06 2023-08-04 儿童医疗中心有限公司 用于体细胞重新编程和调整印记的组合物和方法
AU2019252667A1 (en) 2018-04-11 2020-10-01 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulators of EZH2 expression
WO2019204668A1 (en) 2018-04-18 2019-10-24 Casebia Therapeutics Limited Liability Partnership Compositions and methods for knockdown of apo(a) by gene editing for treatment of cardiovascular disease
ES2960936T3 (es) 2018-04-25 2024-03-07 Ethris Gmbh Formulaciones a base de lípidos para el suministro de ARN
AU2019260687B2 (en) 2018-04-27 2022-09-22 Seattle Children's Hospital (dba Seattle Children's Research Institute) Rapamycin resistant cells
US20210172928A1 (en) 2018-05-03 2021-06-10 The Trustees Of Wheaton College Improved membranes for nanopore sensing applications
CU20200082A7 (es) 2018-05-09 2021-06-08 Ionis Pharmaceuticals Inc Compuestos y métodos para la reducción de la expresión de fxi
EP3799602A4 (en) 2018-05-09 2022-02-16 Ionis Pharmaceuticals, Inc. COMPOUNDS AND METHODS FOR REDUCING ATXN3 EXPRESSION
TW202016304A (zh) 2018-05-14 2020-05-01 美商阿尼拉製藥公司 血管收縮素原(AGT)iRNA組成物及其使用方法
WO2019238725A1 (en) 2018-06-13 2019-12-19 Acib Gmbh - Austrian Centre Of Industrial Biotechnology Methionine analogue synthesis
EP3807411A4 (en) 2018-06-14 2022-08-03 Ionis Pharmaceuticals, Inc. COMPOUNDS AND METHODS FOR ENHANCING STMN2 EXPRESSION
TWI833770B (zh) 2018-06-27 2024-03-01 美商Ionis製藥公司 用於減少 lrrk2 表現之化合物及方法
JP7102557B2 (ja) 2018-07-03 2022-07-19 エフ.ホフマン-ラ ロシュ アーゲー Tau発現調節用オリゴヌクレオチド
WO2020023737A1 (en) 2018-07-25 2020-01-30 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for reducing atxn2 expression
SG11202100715WA (en) 2018-08-13 2021-02-25 Alnylam Pharmaceuticals Inc HEPATITIS B VIRUS (HBV) dsRNA AGENT COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
WO2020037125A1 (en) 2018-08-16 2020-02-20 Alnylam Pharmaceuticals Inc. Compositions and methods for inhibiting expression of the lect2 gene
WO2020041348A1 (en) 2018-08-20 2020-02-27 Rogcon, Inc. Antisense oligonucleotides targeting scn2a for the treatment of scn1a encephalopathies
WO2020047229A1 (en) 2018-08-29 2020-03-05 University Of Massachusetts Inhibition of protein kinases to treat friedreich ataxia
AU2019328501A1 (en) 2018-08-31 2021-03-04 Leibniz-Institut Für Pflanzenbiochemie Calcium dependent protein kinase constructs and uses thereof
EP3620520A1 (en) 2018-09-10 2020-03-11 Universidad del Pais Vasco Novel target to treat a metabolic disease in an individual
CA3103175A1 (en) 2018-09-11 2020-03-19 Helmholtz Zentrum Muenchen - Deutsches Forschungszentrum Fur Gesundheit Und Umwelt (Gmbh) Microrna inhibitors for use in treating metabolic diseases
AU2019339509A1 (en) 2018-09-14 2021-05-13 Northwestern University Programming protein polymerization with DNA
WO2020060986A1 (en) 2018-09-18 2020-03-26 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Ketohexokinase (khk) irna compositions and methods of use thereof
TW202023573A (zh) 2018-09-19 2020-07-01 美商Ionis製藥公司 Pnpla3表現之調節劑
KR20210071003A (ko) 2018-10-05 2021-06-15 멀티플렉스디엑스, 에스.알.오. 멀티플렉스 형광 및 서열분석을 사용한 질환 진단 방법
KR20210096088A (ko) 2018-10-17 2021-08-04 크리스퍼 테라퓨틱스 아게 전이유전자 전달용 조성물 및 방법
US10913951B2 (en) 2018-10-31 2021-02-09 University of Pittsburgh—of the Commonwealth System of Higher Education Silencing of HNF4A-P2 isoforms with siRNA to improve hepatocyte function in liver failure
TW202028222A (zh) 2018-11-14 2020-08-01 美商Ionis製藥公司 Foxp3表現之調節劑
CR20210311A (es) 2018-11-15 2021-07-22 Ionis Pharmaceuticals Inc Moduladores de la expresión de irf5
CN113286886A (zh) 2018-11-21 2021-08-20 Ionis制药公司 用于减少朊病毒表达的化合物和方法
WO2020118259A1 (en) 2018-12-06 2020-06-11 Northwestern University Protein crystal engineering through dna hybridization interactions
WO2020123395A1 (en) 2018-12-10 2020-06-18 Ideaya Biosciences, Inc. 2-oxoquinazoline derivatives as methionine adenosyltransferase 2a inhibitors
EA202191736A1 (ru) 2018-12-20 2021-10-01 Вир Байотекнолоджи, Инк. Комбинированная терапия hbv
WO2020132521A1 (en) 2018-12-20 2020-06-25 Praxis Precision Medicines, Inc. Compositions and methods for the treatment of kcnt1 related disorders
WO2020132647A1 (en) 2018-12-21 2020-06-25 Northwestern University Use of annexins in preventing and treating muscle membrane injury
US20220062299A1 (en) 2018-12-26 2022-03-03 Northwestern University Use of glucocorticoid steroids in preventing and treating conditions of muscle wasting, aging and metabolic disorder
SG11202107669WA (en) 2019-01-16 2021-08-30 Genzyme Corp Serpinc1 irna compositions and methods of use thereof
CN113395971A (zh) 2019-01-31 2021-09-14 Ionis制药公司 Yap1表达的调节剂
JP2022519271A (ja) 2019-02-06 2022-03-22 シンソークス, インコーポレイテッド Il-2コンジュゲートおよびその使用方法
CA3129532A1 (en) 2019-02-15 2020-08-20 Crispr Therapeutics Ag Gene editing for hemophilia a with improved factor viii expression
TW202045724A (zh) 2019-02-27 2020-12-16 美商Ionis製藥公司 Malat1表現之調節劑
US20220175956A1 (en) 2019-03-06 2022-06-09 Northwestern University Hairpin-like oligonucleotide-conjugated spherical nucleic acid
CN113924127A (zh) 2019-03-11 2022-01-11 奥克斯纳健康系统公司 在患有自发性脑内出血的患者中作为癫痫发作的生物标志物的微rna调节网络
WO2020186059A2 (en) 2019-03-12 2020-09-17 Crispr Therapeutics Ag Novel high fidelity rna-programmable endonuclease systems and uses thereof
CA3135180A1 (en) 2019-03-29 2020-10-08 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating ube3a-ats
TW202210480A (zh) 2019-04-17 2022-03-16 美商基利科學股份有限公司 類鐸受體調節劑之固體形式
TWI751517B (zh) 2019-04-17 2022-01-01 美商基利科學股份有限公司 類鐸受體調節劑之固體形式
EP3969588A1 (en) 2019-05-13 2022-03-23 VIR Biotechnology, Inc. Compositions and methods for treating hepatitis b virus (hbv) infection
EP3976791A4 (en) 2019-05-28 2023-10-11 Ionis Pharmaceuticals, Inc. COMPOUNDS AND METHODS FOR REDUCING FOOT EXPRESSION
CA3140112A1 (en) 2019-05-31 2020-12-03 Streck, Inc. Detection of antibiotic resistance genes
EP3983543A4 (en) 2019-06-14 2023-05-03 The Scripps Research Institute REAGENTS AND METHODS FOR REPLICATION, TRANSCRIPTION AND TRANSLATION IN SEMI-SYNTHETIC ORGANISMS
TW202115056A (zh) 2019-06-28 2021-04-16 美商基利科學股份有限公司 類鐸受體調節劑化合物的製備方法
WO2021021673A1 (en) 2019-07-26 2021-02-04 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating gfap
WO2021022109A1 (en) 2019-08-01 2021-02-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. SERPIN FAMILY F MEMBER 2 (SERPINF2) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
WO2021022108A2 (en) 2019-08-01 2021-02-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. CARBOXYPEPTIDASE B2 (CPB2) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
WO2021023860A1 (en) 2019-08-07 2021-02-11 Db Biotech, As Improved horseradish peroxidase polypeptides
WO2021030522A1 (en) 2019-08-13 2021-02-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. SMALL RIBOSOMAL PROTEIN SUBUNIT 25 (RPS25) iRNA AGENT COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
KR20220047598A (ko) 2019-08-15 2022-04-18 신톡스, 인크. Il-2 콘쥬게이트를 사용한 면역 종양학 병용 요법
JP2022544587A (ja) 2019-08-15 2022-10-19 アイオーニス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッド 結合修飾オリゴマー化合物及びその使用
JP2022544817A (ja) 2019-08-23 2022-10-21 シンソークス, インコーポレイテッド Il-15コンジュゲートおよびその使用
JP2022546570A (ja) 2019-09-03 2022-11-04 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド Lect2遺伝子の発現を阻害するための組成物および方法
EP4025303A1 (en) 2019-09-04 2022-07-13 Deutsches Zentrum für Neurodegenerative Erkrankungen e.V. (DZNE) Herv inhibitors for use in treating tauopathies
WO2021050554A1 (en) 2019-09-10 2021-03-18 Synthorx, Inc. Il-2 conjugates and methods of use to treat autoimmune diseases
US20220333120A1 (en) 2019-09-11 2022-10-20 Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum Für Gesundheit Und Umwelt (Gmbh) Bactericidal phage vectors
WO2021067747A1 (en) 2019-10-04 2021-04-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for silencing ugt1a1 gene expression
WO2021074772A1 (en) 2019-10-14 2021-04-22 Astrazeneca Ab Modulators of pnpla3 expression
WO2021076828A1 (en) 2019-10-18 2021-04-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Solute carrier family member irna compositions and methods of use thereof
MX2022004726A (es) 2019-10-22 2022-05-13 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones de acido ribonucleico de interferencia (arni) de componente c3 de complemento y metodos de uso de las mismas.
EP4052035A1 (en) 2019-10-31 2022-09-07 The Trustees of Wheaton College Design and characterization of multilayered structures for support of lipid bilayers
AU2020376840A1 (en) 2019-11-01 2022-04-07 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Huntingtin (HTT) iRNA agent compositions and methods of use thereof
WO2021087325A1 (en) 2019-11-01 2021-05-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for silencing dnajb1-prkaca fusion gene expression
CN115175704A (zh) 2019-11-04 2022-10-11 新索思股份有限公司 白介素10缀合物及其用途
AR120393A1 (es) 2019-11-05 2022-02-09 Basf Se Método de almacenamiento de un biocatalizador
EP4058577A1 (en) 2019-11-13 2022-09-21 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating an angiotensinogen- (agt-) associated disorder
EP4061945A1 (en) 2019-11-22 2022-09-28 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Ataxin3 (atxn3) rnai agent compositions and methods of use thereof
CA3159501A1 (en) 2019-11-27 2021-06-03 Brian Joseph CAFFERTY Methods of synthesizing rna molecules
CN115151641A (zh) 2019-12-13 2022-10-04 阿尔尼拉姆医药品有限公司 人类染色体9开放阅读框72(C9ORF72)iRNA剂组合物及其使用方法
TW202138559A (zh) 2019-12-16 2021-10-16 美商阿尼拉製藥公司 含類PATATIN磷脂酶結構域3(PNPLA3)iRNA組成物及其使用方法
WO2021122944A1 (en) 2019-12-18 2021-06-24 Alia Therapeutics Srl Compositions and methods for treating retinitis pigmentosa
WO2021142245A1 (en) 2020-01-10 2021-07-15 Translate Bio, Inc. Compounds, pharmaceutical compositions and methods for modulating expression of muc5b in lung cells and tissues
WO2021154705A1 (en) 2020-01-27 2021-08-05 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Rab13 and net1 antisense oligonucleotides to treat metastatic cancer
WO2021154941A1 (en) 2020-01-31 2021-08-05 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Complement component c5 irna compositions for use in the treatment of amyotrophic lateral sclerosis (als)
WO2021156244A1 (en) 2020-02-03 2021-08-12 Medizinische Universität Wien Modified filamins and their uses
TW202140786A (zh) 2020-02-10 2021-11-01 美商艾爾妮蘭製藥公司 用於靜默vegf-a表現之組合物及方法
KR20220143106A (ko) 2020-02-18 2022-10-24 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 아포지질단백질 C3 (APOC3) iRNA 조성물 및 이의 사용 방법
CN115279379A (zh) 2020-02-28 2022-11-01 Ionis 制药公司 用于调节smn2的化合物和方法
IL295759A (en) 2020-02-28 2022-10-01 Tallac Therapeutics Inc Transglutaminase mediated coupling
EP4114947A1 (en) 2020-03-05 2023-01-11 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Complement component c3 irna compositions and methods of use thereof for treating or preventing complement component c3-associated diseases
WO2021178736A1 (en) 2020-03-06 2021-09-10 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. KETOHEXOKINASE (KHK) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
EP4121534A1 (en) 2020-03-18 2023-01-25 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for treating subjects having a heterozygous alanine-glyoxylate aminotransferase gene (agxt) variant
KR20220155367A (ko) 2020-03-20 2022-11-22 메디치니쉐 유니베르지테트 빈 MS 치료를 위한 카파 오피오이드 수용체(kappa opioid receptor) 리간드와 조합된 사이클로타이드(cyclotide)
JP2023519274A (ja) 2020-03-26 2023-05-10 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド コロナウイルスiRNA組成物およびその使用方法
US20230190785A1 (en) 2020-03-30 2023-06-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for silencing dnajc15 gene expression
US20230295622A1 (en) 2020-04-06 2023-09-21 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for silencing myoc expression
WO2021206917A1 (en) 2020-04-07 2021-10-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. ANGIOTENSIN-CONVERTING ENZYME 2 (ACE2) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
EP4133079A1 (en) 2020-04-07 2023-02-15 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for silencing scn9a expression
EP4133077A1 (en) 2020-04-07 2023-02-15 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Transmembrane serine protease 2 (tmprss2) irna compositions and methods of use thereof
CN111995649A (zh) * 2020-04-09 2020-11-27 瀚海新拓(杭州)生物医药有限公司 一种蝶啶酮核苷酸类似物及其药物组合物、制备方法和医药用途
CN115955972A (zh) 2020-04-27 2023-04-11 阿尔尼拉姆医药品有限公司 载脂蛋白E(APOE)iRNA剂组合物及其使用方法
BR112022021136A2 (pt) 2020-04-30 2022-11-29 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composições de irna de fator b de complemento (cfb) e métodos de uso das mesmas
JP2023524065A (ja) 2020-05-01 2023-06-08 アイオーニス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッド Atxn1を調節するための化合物及び方法
US20230175081A1 (en) 2020-05-04 2023-06-08 MultiplexDX, s.r.o. Means and methods for detecting novel coronavirus (sars-cov-2)
EP4150089A1 (en) 2020-05-15 2023-03-22 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of retinoschisin 1 (rs1)
WO2021231685A1 (en) 2020-05-15 2021-11-18 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of transmembrane channel-like protein 1 (tmc1)
WO2021231680A1 (en) 2020-05-15 2021-11-18 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of methyl-cpg binding protein 2 (mecp2)
WO2021231692A1 (en) 2020-05-15 2021-11-18 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of otoferlin (otof)
WO2021231673A1 (en) 2020-05-15 2021-11-18 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of leucine rich repeat kinase 2 (lrrk2)
EP4150078A1 (en) 2020-05-15 2023-03-22 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of argininosuccinate lyase (asl)
EP4150088A1 (en) 2020-05-15 2023-03-22 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of argininosuccinate synthetase (ass1)
WO2021231679A1 (en) 2020-05-15 2021-11-18 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for the adar-mediated editing of gap junction protein beta 2 (gjb2)
US20230183707A1 (en) 2020-05-21 2023-06-15 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for inhibiting marc1 gene expression
US11408000B2 (en) 2020-06-03 2022-08-09 Triplet Therapeutics, Inc. Oligonucleotides for the treatment of nucleotide repeat expansion disorders associated with MSH3 activity
EP4162050A1 (en) 2020-06-09 2023-04-12 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Rnai compositions and methods of use thereof for delivery by inhalation
EP4168546A1 (en) 2020-06-18 2023-04-26 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Xanthine dehydrogenase (xdh) irna compositions and methods of use thereof
AU2021296848A1 (en) 2020-06-24 2023-02-09 Humabs Biomed Sa Engineered hepatitis B virus neutralizing antibodies and uses thereof
IL299074A (en) 2020-06-25 2023-02-01 Synthorx Inc Immuno-oncology therapeutic combination with IL-2 and anti-AGFR antibody conjugates
AU2021299290A1 (en) 2020-06-29 2023-01-05 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating PLP1
WO2022003142A1 (en) 2020-07-03 2022-01-06 Engenes Biotech Gmbh PYRROLYSYL-tRNA SYNTHETASE VARIANTS AND USES THEREOF
TW202227102A (zh) 2020-09-22 2022-07-16 瑞典商阿斯特捷利康公司 治療脂肪肝病之方法
MX2023003372A (es) 2020-09-24 2023-05-04 Medigene Immunotherapies Gmbh Nuevos receptores prame y usos de los mismos.
WO2022066847A1 (en) 2020-09-24 2022-03-31 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Dipeptidyl peptidase 4 (dpp4) irna compositions and methods of use thereof
US20230392134A1 (en) 2020-09-30 2023-12-07 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of amyotrophic lateral sclerosis
JP2023544413A (ja) 2020-10-05 2023-10-23 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド Gタンパク質共役受容体75(GPR75)iRNA組成物およびその使用方法
EP3978608A1 (en) 2020-10-05 2022-04-06 SQY Therapeutics Oligomeric compound for dystrophin rescue in dmd patients throughout skipping of exon-51
MX2023004029A (es) 2020-10-09 2023-04-27 Synthorx Inc Terapia de combinacion de inmunoncologia con conjugados de il-2 y pembrolizumab.
CA3194880A1 (en) 2020-10-09 2022-04-14 Carolina E. CAFFARO Immuno oncology therapies with il-2 conjugates
CA3198823A1 (en) 2020-10-21 2022-04-28 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating primary hyperoxaluria
WO2022087329A1 (en) 2020-10-23 2022-04-28 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Mucin 5b (muc5b) irna compositions and methods of use thereof
WO2022103999A1 (en) 2020-11-13 2022-05-19 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. COAGULATION FACTOR V (F5) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
IL302817A (en) 2020-11-18 2023-07-01 Ionis Pharmaceuticals Inc Compounds and methods for modulating angiotensinogen expression
WO2022106695A1 (en) 2020-11-23 2022-05-27 Alpha Anomeric Sas Nucleic acid duplexes
US11987795B2 (en) 2020-11-24 2024-05-21 The Broad Institute, Inc. Methods of modulating SLC7A11 pre-mRNA transcripts for diseases and conditions associated with expression of SLC7A11
WO2022119873A1 (en) 2020-12-01 2022-06-09 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for inhibition of hao1 (hydroxyacid oxidase 1 (glycolate oxidase)) gene expression
EP4259795A1 (en) 2020-12-08 2023-10-18 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Coagulation factor x (f10) irna compositions and methods of use thereof
GB2603454A (en) 2020-12-09 2022-08-10 Ucl Business Ltd Novel therapeutics for the treatment of neurodegenerative disorders
EP4267732A1 (en) 2020-12-23 2023-11-01 Flagship Pioneering Innovations VI, LLC Compositions of modified trems and uses thereof
WO2022150260A1 (en) 2021-01-05 2022-07-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. COMPLEMENT COMPONENT 9 (C9) iRNA COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
IL304880A (en) 2021-02-12 2023-10-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc Superoxide dismutase 1 (SOD1) IRNA compositions and methods of using them to treat or prevent superoxide dismutase 1- (SOD1-) associated neurodegenerative diseases
EP4291243A1 (en) 2021-02-12 2023-12-20 Synthorx, Inc. Lung cancer combination therapy with il-2 conjugates and an anti-pd-1 antibody or antigen-binding fragment thereof
WO2022174101A1 (en) 2021-02-12 2022-08-18 Synthorx, Inc. Skin cancer combination therapy with il-2 conjugates and cemiplimab
CN117222739A (zh) 2021-02-25 2023-12-12 阿尔尼拉姆医药品有限公司 朊病毒蛋白(prnp)irna组合物和其使用方法
EP4298218A1 (en) 2021-02-26 2024-01-03 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Ketohexokinase (khk) irna compositions and methods of use thereof
IL305414A (en) 2021-03-04 2023-10-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc Angiopoietin-like 3 (ANGPTL3) IRNA compositions and methods of using them
EP4305169A1 (en) 2021-03-12 2024-01-17 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Glycogen synthase kinase 3 alpha (gsk3a) irna compositions and methods of use thereof
EP4304640A1 (en) 2021-03-12 2024-01-17 Northwestern University Antiviral vaccines using spherical nucleic acids
JP2024512635A (ja) 2021-03-29 2024-03-19 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド ハンチンチン(HTT)iRNA剤組成物およびその使用方法
WO2022212153A1 (en) 2021-04-01 2022-10-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Proline dehydrogenase 2 (prodh2) irna compositions and methods of use thereof
WO2022214632A1 (en) 2021-04-07 2022-10-13 Neoplants Sas Compositions and methods for indoor air remediation
EP4330392A1 (en) 2021-04-26 2024-03-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Transmembrane protease, serine 6 (tmprss6) irna compositions and methods of use thereof
EP4330396A1 (en) 2021-04-29 2024-03-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Signal transducer and activator of transcription factor 6 (stat6) irna compositions and methods of use thereof
EP4334448A1 (en) 2021-05-03 2024-03-13 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for treating transthyretin (ttr) mediated amyloidosis
WO2022245583A1 (en) 2021-05-18 2022-11-24 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Sodium-glucose cotransporter-2 (sglt2) irna compositions and methods of use thereof
EP4341405A1 (en) 2021-05-20 2024-03-27 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for adar-mediated editing
WO2022256283A2 (en) 2021-06-01 2022-12-08 Korro Bio, Inc. Methods for restoring protein function using adar
EP4347823A1 (en) 2021-06-02 2024-04-10 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Patatin-like phospholipase domain containing 3 (pnpla3) irna compositions and methods of use thereof
WO2022256538A1 (en) 2021-06-03 2022-12-08 Synthorx, Inc. Head and neck cancer combination therapy comprising an il-2 conjugate and cetuximab
JP2024521907A (ja) 2021-06-04 2024-06-04 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド ヒト9番染色体オープンリーディングフレーム72(C9ORF72)iRNA剤組成物及びその使用方法
AR126070A1 (es) 2021-06-08 2023-09-06 Alnylam Pharmaceuticals Inc Composiciones y métodos para tratar o prevenir la enfermedad de stargardt y/o trastornos asociados con la proteína transportadora de retinol 4 (rbp4)
EP4101928A1 (en) 2021-06-11 2022-12-14 Bayer AG Type v rna programmable endonuclease systems
BR112023023768A2 (pt) 2021-06-11 2024-02-27 Bayer Ag Sistemas de endonucleases programáveis por rna tipo v
CA3223192A1 (en) 2021-06-18 2022-12-22 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for reducing ifnar1 expression
US20230194709A9 (en) 2021-06-29 2023-06-22 Seagate Technology Llc Range information detection using coherent pulse sets with selected waveform characteristics
WO2023278410A1 (en) 2021-06-29 2023-01-05 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for adar-mediated editing
EP4363580A1 (en) 2021-06-30 2024-05-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating an angiotensinogen- (agt-) associated disorder
WO2023285431A1 (en) 2021-07-12 2023-01-19 Alia Therapeutics Srl Compositions and methods for allele specific treatment of retinitis pigmentosa
EP4119581A1 (en) 2021-07-14 2023-01-18 Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt GmbH Novel fab dimers
IL309905A (en) 2021-07-23 2024-03-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc IRNA compositions in β-catenin (CTNNB1) and methods of using them
WO2023009687A1 (en) 2021-07-29 2023-02-02 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coa reductase (hmgcr) irna compositions and methods of use thereof
CN117795074A (zh) 2021-08-03 2024-03-29 阿尔尼拉姆医药品有限公司 转甲状腺素蛋白(TTR)iRNA组合物和其使用方法
CA3228255A1 (en) 2021-08-04 2023-02-09 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Irna compositions and methods for silencing angiotensinogen (agt)
EP4384617A1 (en) 2021-08-13 2024-06-19 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Factor xii (f12) irna compositions and methods of use thereof
US11833221B2 (en) 2021-09-01 2023-12-05 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds for reducing DMPK expression
EP4144841A1 (en) 2021-09-07 2023-03-08 Bayer AG Novel small rna programmable endonuclease systems with impoved pam specificity and uses thereof
WO2023044370A2 (en) 2021-09-17 2023-03-23 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Irna compositions and methods for silencing complement component 3 (c3)
AU2022345881A1 (en) 2021-09-20 2024-03-21 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Inhibin subunit beta e (inhbe) modulator compositions and methods of use thereof
AU2022356427A1 (en) 2021-09-30 2024-05-09 Akouos, Inc. Compositions and methods for treating kcnq4-associated hearing loss
WO2023069603A1 (en) 2021-10-22 2023-04-27 Korro Bio, Inc. Methods and compositions for disrupting nrf2-keap1 protein interaction by adar mediated rna editing
WO2023076450A2 (en) 2021-10-29 2023-05-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. HUNTINGTIN (HTT) iRNA AGENT COMPOSITIONS AND METHODS OF USE THEREOF
AR127477A1 (es) 2021-10-29 2024-01-31 Alnylam Pharmaceuticals Inc COMPOSICIONES DE ARNi CONTRA EL FACTOR B DEL COMPLEMENTO (CFB) Y MÉTODOS DE USO DE LAS MISMAS
WO2023086292A2 (en) 2021-11-10 2023-05-19 University Of Rochester Gata4-targeted therapeutics for treatment of cardiac hypertrophy
CA3237770A1 (en) 2021-11-10 2023-05-19 University Of Rochester Antisense oligonucleotides for modifying protein expression
GB202117758D0 (en) 2021-12-09 2022-01-26 Ucl Business Ltd Therapeutics for the treatment of neurodegenerative disorders
WO2023122573A1 (en) 2021-12-20 2023-06-29 Synthorx, Inc. Head and neck cancer combination therapy comprising an il-2 conjugate and pembrolizumab
WO2023118349A1 (en) 2021-12-21 2023-06-29 Alia Therapeutics Srl Type ii cas proteins and applications thereof
WO2023122750A1 (en) 2021-12-23 2023-06-29 Synthorx, Inc. Cancer combination therapy with il-2 conjugates and cetuximab
WO2023118068A1 (en) 2021-12-23 2023-06-29 Bayer Aktiengesellschaft Novel small type v rna programmable endonuclease systems
EP4215042A1 (en) 2022-01-21 2023-07-26 Max-Delbrück-Centrum für Molekulare Medizin A non-human mammal comprising in its genome at least two human leukocyte antigen (hla) class i alleles, methods of making such mammal and uses thereof
WO2023141314A2 (en) 2022-01-24 2023-07-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Heparin sulfate biosynthesis pathway enzyme irna agent compositions and methods of use thereof
WO2023194359A1 (en) 2022-04-04 2023-10-12 Alia Therapeutics Srl Compositions and methods for treatment of usher syndrome type 2a
WO2023237587A1 (en) 2022-06-10 2023-12-14 Bayer Aktiengesellschaft Novel small type v rna programmable endonuclease systems
WO2024003799A1 (en) 2022-06-29 2024-01-04 Takeda Pharmaceutical Company Limited Method for producing extrachromosomal nucleic acids
EP4299753A1 (en) 2022-06-29 2024-01-03 enGenes Biotech GmbH Method for producing extrachromosomal nucleic acids
WO2024039776A2 (en) 2022-08-18 2024-02-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Universal non-targeting sirna compositions and methods of use thereof
WO2024050261A1 (en) 2022-08-29 2024-03-07 University Of Rochester Antisense oligonucleotide-based anti-fibrotic therapeutics
WO2024047155A1 (en) 2022-08-31 2024-03-07 Dsm Ip Assets B.V. Bifidobacterium adolescentis strains, methods and uses thereof for starch degradation and modifying gut flora in non-human mammals
WO2024059165A1 (en) 2022-09-15 2024-03-21 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. 17b-hydroxysteroid dehydrogenase type 13 (hsd17b13) irna compositions and methods of use thereof
WO2024056880A2 (en) 2022-09-16 2024-03-21 Alia Therapeutics Srl Enqp type ii cas proteins and applications thereof
WO2024089180A1 (en) 2022-10-26 2024-05-02 Eximmium Biotechnologies Gmbh Method to determine extracellular vesicle recovery
WO2024105162A1 (en) 2022-11-16 2024-05-23 Alia Therapeutics Srl Type ii cas proteins and applications thereof
WO2024115430A1 (en) 2022-11-28 2024-06-06 Helmholtz Zentrum München - Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) Acinetobacter baumannii phages

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
FR2081410B1 (ja) * 1970-01-06 1974-08-23 Ciba Geigy Ag
FR2081415A1 (en) * 1970-01-07 1971-12-03 Ciba Geigy Ag Tetrahydropteridine-glycosides as anti- - virals and antimacarials
US3792036A (en) * 1970-01-07 1974-02-12 Ciba Geigy Corp Pteridine-glycosides
GB2056459B (en) * 1979-07-04 1983-03-09 Daiichi Radioisotope Lab Pterin derivatives and an assay method for determining pterins
WO1987001373A1 (en) * 1985-09-09 1987-03-12 Teijin Limited Pyridopyrimidine nucleotide derivatives
US5270465A (en) * 1989-03-30 1993-12-14 Lipha, Lyonnaise Industrille Pharmaceutique 4(3H)-pteridinone compounds
US5034393A (en) * 1989-07-27 1991-07-23 Dowelanco Fungicidal use of pyridopyrimidine, pteridine, pyrimidopyrimidine, pyrimidopyridazine, and pyrimido-1,2,4-triazine derivatives
CA2033692A1 (en) * 1990-01-25 1991-07-26 Wilhelm Bannwarth Energy transfer systems
CA2129105A1 (en) * 1992-02-12 1993-08-19 Michael J. Conrad Applications of fluorescent n-nucleosides and fluorescent structural analogs of n-nucleosides

Also Published As

Publication number Publication date
DE69503129D1 (de) 1998-07-30
AU688036B2 (en) 1998-03-05
DE69503129T2 (de) 1999-02-18
AU2399195A (en) 1995-12-05
US5525711A (en) 1996-06-11
US5612468A (en) 1997-03-18
JPH10500949A (ja) 1998-01-27
EP0759927B1 (en) 1998-06-24
DK0759927T3 (da) 1999-04-06
ES2118593T3 (es) 1998-09-16
EP0759927A1 (en) 1997-03-05
ATE167680T1 (de) 1998-07-15
CA2190588A1 (en) 1995-11-23
CA2190588C (en) 2003-03-18
WO1995031469A1 (en) 1995-11-23

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