JP2003528883A - オリゴヌクレオチド・ハイブリダイゼーションにユニバーサル・ヌクレオシドとして使用されるｎ８−及びｃ８−連結プリン塩基、並びに構造的に関連したヘテロ環 - Google Patents

オリゴヌクレオチド・ハイブリダイゼーションにユニバーサル・ヌクレオシドとして使用されるｎ８−及びｃ８−連結プリン塩基、並びに構造的に関連したヘテロ環

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Abstract

(57)【要約】 本発明はＮ8 −又はＣ8 −連結プリン塩基又は構造的に関連したヘテロ環を含む核酸結合化合物、上記化合物の製造に有用な化合物、核酸とこの核酸結合化合物の結合産物、上記化合物を用いた核酸の測定方法、並びに８−連結プリン塩基及び構造的に関連したヘテロ環のいくつかの使用に向けられる。本発明による化合物は、ハイブリダイゼーション法に使用される場合に有利な特性を持つ。

Description

【発明の詳細な説明】
【０００１】 本発明は、Ｎ8 −又はＣ8 −連結プリン塩基及び構造的に関連したヘテロ環を
含む核酸結合化合物、上記化合物の製造に有用な化合物、この核酸結合化合物の
核酸との結合産物、上記化合物を用いた核酸の測定方法、及び８−連結プリン塩
基及び構造的に関連したヘテロ環のいくつかの使用に向けられる。
【０００２】 本発明の背景 いくつかのＣ8 −グリコシル化プリン誘導体の合成はCzech. Chem. Comm. (Vo
l 34, p. 247), Heterocycl. Chem. (Vol 12, p. 111）、及びJournal of Medic
inal Chemistry (Vol 33, p. 2750-2755）に記載されており、Ｎ8 −グリコシル
化プリン誘導体はHelv. Chim. Acta (Vol. 72, p. 1527), Zh. Org. Khim. (Vol
12, p. 1131）、及びHelv. Chim. Acta (Vol 76, p. 2184-2193）に示されてい
る。しかしならが、核酸内に組込まれた場合、４の天然塩基のそれぞれと塩基対
形成が可能なユニバーサル塩基としてのこれらの非天然塩基の使用に対する開示
は存在しない。
【０００３】 そのＮ8 位で糖部分を結合した８−アザ−７−デアザアデニンのいくつかの例
が本技術分野で知られている。Helv. Chim. Acta (Vol 72, p. 868-881）におい
て、８−アザ−７−デアザアデニンＮ8 −（β−Ｄ−２′−デオキシリボフラノ
シド）の合成が開示されている。Ｎ6 −メチル化−８−アザ−７−デアザアデニ
ンＮ8 −（β−Ｄ−２′−デオキシリボフラノシド）の合成はHelv. Chim. Acta
(Vol 71, p. 1813-1823）に示されている。しかしながら、ユニバーサル塩基と
して上述のヌクレオチドを使用する長所を示す開示は存在しない。
【０００４】 Biochemistry (Vol 15, p 1005-1015 ）において、８−アザ−７−デアザアデ
ニンＮ8 −（β−Ｄ−リボフラノシル）（Ａ* ）の合成が開示されている。ポリ
ヌクレオチド・ホスホリラーゼの存在下、ＡＤＰ及びＡ* ＤＰの酵素的重合をも
示される。しかしながら、それら２塩基以外を含む定められた配列を有するオリ
ゴヌクレオチドの合成に関する開示は存在しない。これらのポリマーのハイブリ
ダイゼーション特性は記載されていない。これらの修飾塩基がハイブリダイゼー
ション法に使用されうることをほのめかしてもいない。
【０００５】 本発明は核酸ハイブリダイゼーション法、例えば特にヘルス・ケアの分野にお
ける分析論による核酸の測定に特に有用である。それはインビトロ突然変異誘発
に使用されることもできる。それは医薬の分野、例えばアンチセンス・オリゴヌ
クレオチドとして使用されるオリゴヌクレオチドに使用されることもできる。
【０００６】 核酸は、ヒト体液、食品又は環境中の遺伝子又は微生物の存在又は不存在の判
定のための有用な検体であることが知られている。特に、ポリメラーゼ連鎖反応
（ＰＣＲ、ＵＳ−Ａ−４，６８３，２０２を参照のこと）のような核増幅技術の
導入により、それらの十分な感度のため、核酸の判定は幅広く使用される。
【０００７】 増幅された核酸は、特定の目的に依存するさまざまに異なる技術を用いて測定
される。大部分のアッセイは固定化されたか又は固定化されうるか、あるいは１
以上のリポーター基の付着により標識されたプローブの使用を必要とする。リポ
ーター基はそれ自身が測定されることを可能にする特徴を有するか又は上記リポ
ーター基を介してプローブを測定可能にする試薬と反応させうる。よって、例え
ば、プローブと測定されるべき核酸を含むハイブリッドが存在する時、リポータ
ー基により標識されたプローブが測定されうる。
【０００８】 さらなる増幅ステップ、並びにプローブ・ハイブリダイゼーション・ステップ
に関して、プライマー及びプローブとして使用されるオリゴヌクレオチドのハイ
ブリダイゼーション特性は非常に重要である。特定の目的に依存して、ハイブリ
ダイゼーション法を改良するために前述のオリゴヌクレオチド内に天然核酸塩基
の代わりに修飾又は非天然ヘテロ環式基を含むための多くの案がある。
【０００９】 前述の非天然基の例は、ｄＧＴＰに置き換えて核酸内に導入された時にシーク
エンシング・ゲル内のバンド圧縮を軽減する７−デアザ−ｄＧＴＰである（ＥＰ
−Ｂ−０ ２８６ ０２８）。
【００１０】 核酸測定は、天然の基準塩基Ａ、Ｃ、Ｇ、及びＴが４の天然塩基の１つだけと
唯一塩基対形成が可能であることに基づくところが大きい。しかしながら、ハイ
ブリッドのメルティング・ポイントがプローブ・オリゴヌクレオチドの長さだけ
でなくそのＧＣ含量にも依存するため、Ｃと塩基対形成したＧに比べＴと塩基対
形成したＡの異なる安定性が、問題となりうる。
【００１１】 核酸のスクリーニング方法において、付随的なタンパク質のアミノ酸配列だけ
が利用できる場合には他に問題はない。その場合、そのアミノ酸配列から核酸配
列が推論される。しかしながら、遺伝子コードの重複性は多数の異なる配列を導
く。この重複性を考慮するオリゴヌクレオチドの混合物を合成し、そして可能性
のあるＤＮＡ又はＲＮＡ候補のスクリーニングのために使用しなくてはならない
。
【００１２】 代替の方法は識別力を失った塩基アナログを使用する。この塩基は、対応のヌ
クレオシドがユニバーサル又は多義性ヌクレオシドと呼ばれる、普遍的又は多義
性塩基を意味する。ユニバーサル塩基は主要な識別なしに天然塩基のいくつか又
は全てと塩基対を形成する塩基である。４の天然塩基全てと水素結合を形成しう
るので、用語ユニバーサル塩基がそのために作り出されたヒポキサンチンはユニ
バーサル塩基として広く使用されている（Y. Takahashi, K. Kato, Y. Hayashiz
aki, T. Wakabayashi, E. Ohtsuka, S. Matsuki, M. Ilehara, K. Matsubara, P
roc. Natl. Acad. Sci. USA 1985, 1931-1935 ）。ヒポキサンチンによるヌクレ
オシド、２′−デオキシイノシン（図１、１参照のこと）が４の天然ヌクレオシ
ドのそれぞれと向かい合った１２ｍｅｒの二本鎖内に組み込まれる時、それらは
１５℃のＴｍ値の差により表される広い範囲にわたる熱安定性を示す（F. Seela
, K. Mittelbach, Nucleosides, Nucleotides 1999, 18, 425-441）。これはヒ
ポキサンチンが他の塩基と一様に塩基対を形成しないことを示す。さらに、ＰＣ
Ｒプライマーに使用されるヒポキサンチンはグアニンのように振る舞う。他のユ
ニバーサル・ヌクレオシドは化合物Ｐ（図１、２を参照のこと）及びＫ（図１、
３を参照のこと）である（P. Kong Thoo Lin, D.M. Brown, Nucleic Acids Res.
17, 10373-10383 ; D.M. Brown, P. Kong Thoo Lin, Carbohydrate Res., 216,
129-139）。それらの塩基のそれらのアミノ−イミノ互変異性型として選ばれた
それらは天然の塩基よりも高い結合性がある。ヌクレオシドＰはプリン・ヌクレ
オシドｄＡ及びｄＧとワトソン−クリック型塩基対を形成しうる一方で、ヌクレ
オシドＫはｄＴ及びｄＣと塩基対を形成する。
【００１３】 水素結合を形成するヌクレオシドを除いて、水素結合の能力を持たない多くの
ユニバーサル残基が存在する。前述のヘテロ環の電子電荷分布は基準部位をスタ
ッキングした塩基の良好な候補であり（図１、４を参照）（T.A. Milican, G.A.
Mock, M.A. Chaunncy, T.P. Patel, M.A.W. Eaton, J. Gunning, S.D. Cutbush
, S. Neidle, J. Mann, Nucleic Acids Res. 1984, 12, 7435-7453）、そして５
−ニトロインドール（図１、５を参照）（D. Lokes, D.M. Brown, Nucleic Acid
s Res. 1994, 22, 4039-4043）、３−ニトロピロール（図１、６を参照）による
天然塩基の置き換え（D.E. Bergstrom, P. Zhang, W. Travis Johnson, Nucleic
Acids Res. 1997, 25, 1935-1942 ）が前述の操作に使用される。
【００１４】 これまでに知られる全ての案はいくつかの不都合を有する。故に、４の天然塩
基とより良好な塩基対形成が可能なユニバーサル塩基を含むプライマー及びプロ
ーブのような核酸結合化合物を提供する必要性がなおも存在する。
【００１５】 本発明の説明 本発明の対象は、少なくとも１の、そのヘテロ環が以下の一般式（Ｉ）：
【００１６】
【化３０】
【００１７】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄは前記核酸結合化合物のこの基以外の部分へのこの基の付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
る１以上の部分により置換される。｝の基であることを特徴とし、天然核酸塩基
と塩基対形成が可能な前記ヘテロ塩基を付着したバックボーンを含む核酸結合化
合物であり、 ただし、 一般式（Ｉ）のヘテロ環基が、２′−デオキシ−β−Ｄ−エリスロペントフラ
ノシル部分に付着する８−アザ−７−デアザアデニン（Ａ* ）である場合、上記
核酸結合化合物の配列は、（Ａ* Ｔ）6 、ＣＴＧＧＡ* ＴＣＣＡＧ又はＣＴＧＧ
ＡＴＣＣＡ* Ｇから成る群からは選ばれず、 一般式（Ｉ）のヘテロ環基が２′−デオキシ−β−Ｄ−エリスロペントフラノ
シル部分に付着するＮ6 −メチル化−８−アザ−７−デアザアデニン（Ａ*m）で
ある場合、上記核酸結合化合物の配列は、（Ａ*mＴ）6 、ＣＴＧＧＡ*mＴＣＣＡ
Ｇ又はＣＴＧＧＡＴＣＣＡ*mＧから成る群からは選ばれず、 一般式（Ｉ）のヘテロ環基がβ−Ｄ−リボフラノシル部分に付着する８−アザ
−７−デアザアデニンである場合、上記化合物の配列はアデニン以外の、及び８
−アザ−７デアザアデニン以外の少なくとも１のさらなるヘテロ環を含み、そし
て 一般式（Ｉ）のヘテロ環基が２′−デオキシ−β−Ｄ−リボフラノシル部分と
Ｎ8 −付着する８−アザ−９デアザ−９−メチル−グアニンである場合、上記化
合物の配列は、チミジン以外の及び８−アザ−９−デアザ−９−メチル−グアニ
ン以外の少なくとも１のさらなるヘテロ環を含む、上記化合物である。
【００１８】 式（Ｉ）のヘテロ環式基は以下の性質により主に特徴づけられる： ・前記塩基は８位（プリン・ナンバリング）を介してバックボーンに、好まし
くは糖部位に連結される。
【００１９】 ・前記塩基は他の核酸構成要素とスタッキング相互作用の形成が可能な芳香族
又はキノイドπ電子系を含む。
【００２０】 ・前記塩基は４の天然ヌクレオシドＡ、Ｃ、Ｇ、及びＴへの水素結合のための
１以上の供与及び／又は受容部位を含む。
【００２１】 式（Ｉ）のヘテロ環式基はその８位で核酸結合化合物のバックボーンに連結す
る。他の核酸とハイブリダイズした場合、それらは普遍の９−連結プリンに比べ
二本鎖複合体において異なった配置をされる。天然の９−連結グアニン又はアデ
ニンはその相補塩基、例えばそれぞれシトシン及びチミンとだけ塩基対を形成す
る。それに対して、驚くべきことに核酸結合化合物中に含まれる本発明による８
−連結ヘテロ環式基は低い特異性を示し、そして二本鎖複合体の状態に前記核酸
結合化合物がハイブリダイズした時、核酸の向かい合わせの位置に含まれる４の
天然の塩基（Ａ、Ｃ、Ｇ、Ｔ）とのＨ−結合を介して塩基対形成をもたらす。例
として、二本鎖における８−アザ−７−デアザアデニンと４の天然塩基の全てと
の可能性のある構造を図５に示す。
【００２２】 特に好ましいものは、そのヌクレオシドの４の天然塩基全てとの塩基対形成を
もたらすだけでなく、４の天然塩基全てとのほぼ同じ安定性を持つ塩基形成をも
たらす６位（プリン・ナンバリング）で連結したＨ供与体（例えばアミノ基）を
持つ式（Ｉ）のヘテロ環式基である。これらの化合物において、Ｘ3 はＣＲ3 で
あり、好ましくはＣ−Ｒ3 はＣ−ＮＲ5 Ｒ6 であり、そして最も好ましくはＣ−
ＮＨ2 である。特定の位置にこれらの核酸塩基を含む核酸結合化合物は、イノシ
ン含有核酸結合化合物と比べて、向かい合った位置にＡ、Ｃ、Ｇ又はＴを持つ異
なるオリゴヌクレオチドにハイブリダイズした場合、同じか又はごくわずかなＴ
ｍの差を示す（実施例６を参照のこと）。好ましいものは、これらのヘテロ環式
基のＮ8 −グリコシル化をもたらすＸ5 がＮである、式（Ｉ）のヘテロ環式基で
もある。
【００２３】 故に、式（Ｉ）のヘテロ環式基を向上した性質を有する核酸結合化合物におい
て天然核酸塩基に対する代替物として使用されうる。オリゴヌクレオチドである
前述の核酸結合化合物は、例えば、標的核酸配列の配列が、可能性のあるさまざ
まな標的核酸配列を導くタンパク質のアミノ酸配列から推論される場合のハイブ
リダイゼーション法において使用されうる。それが縮退される標的核酸の位置と
ハイブリダイズするための位置で天然核酸塩基を本発明による核酸塩基により置
き換えることは、多型ハイブリダイゼーション・プローブの必要性なしにこれら
の標的核酸の測定をもたらす。有利な使用に関する他の例は特定の位置に異なる
配列を含む対立遺伝子の配列を測定しなくてはならない場合の核酸の測定である
。天然ヌクレオシドの代わりに８−アザ−７−デアザアデニンをいつもと違って
連結したような本発明によるユニバーサル塩基の使用によりたった１つのプロー
ブだけでハイブリダイゼーションには十分である。さらに、８−アザ−７−デア
ザアデニンのようなヌクレオシドは、核酸にハイブリダイズした時の得られるハ
イブリダイゼーション複合体のＴｍを変えるためにオリゴヌクレオチド内に含ま
れる４の天然塩基それぞれの代替物として使用される。元のプローブ−核酸複合
体のＴｍと比較したＴｍのこの変化は、溶液及び／又は表層で実施されるＰＣＲ
、多重ＰＣＲ、多重プローブ・ハイブリダイゼーション法又は他のハイブリダイ
ゼーション技術のような多重ハイブリダイゼーション法を行う場合のいくつかの
ハイブリダイゼーション複合体のＴｍを等しくするために使用される。ユニバー
サル塩基を含むこれらの化合物はインビトロ突然変異誘発法に、そして医薬品と
して使用されることもできる。これらの例は可能性のある使用を説明することを
意図し、本発明の範囲を制限するものでははない。
【００２４】 環系について、本発明による式（Ｉ）のヘテロ環式基を図７に示す（ヘテロ環
を図式的に示し、置換基をさらに記載しないが、式（Ｉ）から選ばれることを意
図する）。式（Ｉ）のヘテロ環式基の互変異性型及び塩も本発明の中に含まれる
。
【００２５】 式（Ｉ）によるヘテロ環式基に含まれる二重結合の配置は環系内のＣ及びＮ原
子の位置に依存する。そのため、Ｘ1 〜Ｘ6 の選択により二重結合はそれぞれに
位置して平面的な芳香族の又はキノイドのπ電子系をもたらす。二重結合の位置
をごく一般的な方法で式（Ｉ）中に示したが、それらを具体的なヘテロ環として
示すことは当業者に明白である（図７も参照のこと）。
【００２６】 ハロゲンはフルオロ、クロロ、ブロモ又はヨード基を意味する。最も好ましい
ハロゲン基は−Ｃｌ及び−Ｂｒである。
【００２７】 アルキル基は線状、分枝又は環状のいずれかに配置された１〜１０の炭素原子
を含むアルキル基から好ましくは選ばれる。アルキル基の実際の長さはそのアル
キル基が配置された個々の位置での立体構造の状況に依存する。立体的制約があ
る場合、アルキル基は一般的に小さく、メチル及びエチル基が最も好ましい。全
てのアルキル、アルケニル、及びアルキニル基は置換されないか又は置換される
かのいずれかである。先に概説したヘテロ原子による置換は水性溶液中への可溶
性を高める助けとなる。
【００２８】 アルケニル基は２〜１０の炭素原子を含むアルケニル基から好ましくは選ばれ
る。選択に関して、アルキル基に関するものと同様の検討材料を適用する。それ
らは線状、分枝、及び環状でもありうる。最も好ましいアルケニル基はエチレン
基である。
【００２９】 アルキニル基は２〜１０の炭素原子を好ましくは有する。同様に、それらの炭
素原子は線状、分枝、及び環状の様式で配置される。さらに、アルキニル基内に
２以上の三重結合が存在する。最も好ましいアルキニル基は３−プロパルギル基
である。
【００３０】 アルコキシ基は１〜６の炭素原子を好ましくは含み、そして酸素原子を介して
他の部分に付着する。アルコキシ基内に含まれるアルキル基に関して、アルキル
基に関するものの中のいくつかの検討材料を適用する。最も好ましいアルコキシ
基はメトキシ基である。
【００３１】 アリールオキシ基は６〜２０の炭素原子を好ましくは含む。それらの炭素原子
は１以上の芳香族環内、及びさらにはその芳香族部分に付着した側鎖（例えばア
ルキル鎖）内に含まれる。好ましいアリールオキシ基はフェノキシ及びベンズオ
キシ基である。
【００３２】 好ましいＯ−保護基はアロイル基、ジフェニルカルバモイル基、アシル基、及
びシリル基である。これらの中で最も好ましいものはベンゾイル基である。
【００３３】 好ましいシリル基はトリメチルシリル、トリエチルシリル、及び第３ブチル−
ジメチル−シリルのようなトリアルキルシリル基である。他の好ましいシリル基
はトリメチルシリル−オキシ−メチル基（ＴＯＭ）（スイス特許出願第０１９３
１／９７号）である。
【００３４】 本明細書中に示される式中の定義においていずれの原子も特定の同位体に制限
されない。よって、リン原子（Ｐ）は通常の31Ｐ又は放射性の32Ｐあるいはそれ
らの混合物のいずれをも意味する。水素（Ｈ／Ｄ／Ｔ）、炭素（Ｃ）、ヨウ素（
Ｃｌ、Ｂｒ、Ｉ）、及び窒素（Ｎ）についても同様に適用する。
【００３５】 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、Ｒ34、及びＲ35の定義の中の好ましい基−ＮＲ5 Ｒ6 は−ＮＨ2 基である。この場合、式（Ｉ）の前述の基を含む化合物の化学合成
の間、このアミノ基の水素原子の１つが好適なアミノ保護基により保護されるこ
とは明らかである。そのような保護基は当業者に広く知られている。
【００３６】 化学合成の間、−ＯＨ、−ＳＨ、及び−ＮＨ2 （リポーター基内のそれらの基
を含む）の全ての基は好適な保護基により保護されるべきである。さらに、化学
合成の間、前記化合物を便宜上、固相に付着させる。これらの場合において、先
に与えられた置換基の定義を適宜選択する。
【００３７】 保護基は、望まれない様式による反応から官能基を守るために官能基に付着さ
せる（例えば、ヒドロキシル基の酸素又はアミノ基の窒素と水素を置き換える）
化学基である。保護基は、それが形成される分子の生理活性、ここでは核酸結合
化合物の核酸への結合を破壊することなしに除去される事実によりさらに定義さ
れる。好適な保護基は当業者に知られている。例えば、ヌクレオチド又はオリゴ
ヌクレオチドの５′末端のヒドロキシル基のための特に好ましい保護基はトリチ
ル基、例えばジメトキシトリチルから選ばれる。
【００３８】 式（Ｉ）内の環外アミノ基での好ましい保護基はアシル基、最も好ましくはベ
ンゾイル基（Ｂｚ）、フェノキシアセチル又はアセチル又はホルミル、及びＮ，
Ｎ−ジアルキルホルムアミド基、優先的に、ジメチル−、ジイソブチル−、及び
ジ−ｎ−ブチルホルムアミド基である。
【００３９】 特定のヌクレオシドの合成に関する簡略化したプロトコールを図８及び実施例
８に記載する。一般的に、ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン含有６−アミノ基
の合成のための最初のステップにおいて６−メトキシ・ピラゾロ［３，４−ｄ］
ピリミジンを合成する。次のステップにおいて、例えば、オリゴヌクレオチド合
成のためにピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン・ホスホルアミド酸を使用する場
合、アミノ官能基を保護するための保護基を結合させたアミノ基によりメトキシ
基を交換する。驚いたことに、ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン１ａ及び２ａ
（図８）は、オリゴヌクレオチド合成の最終ステップにおいて通常使用される脱
保護の条件下でアミノ官能基へ変換される。さらに、６−メトキシ基の安定性は
、オリゴヌクレオチド合成、例えばホスホルアミド酸モノマーに使用されうるヌ
クレオシド・モノマーの合成に必要なさらなる合成ステップをもたらす。そのた
め、ヌクレオシドの合成の間に保護されたアミノ官能基の導入は必要でなく、オ
リゴヌクレオチドを合成し、そしてオリゴヌクレオチドを脱保護する時のアミノ
基によりメトキシ基を交換する場合、６−メトキシ・ピラゾロ［３，４−ｄ］ピ
リミジン・モノマーの使用が必要である。この工程を６−アミノ基を持つ関連の
ヌクレオシドの合成に使用することもできる。
【００４０】 本発明による核酸結合化合物は好ましくは１００サブユニット未満、より好ま
しくは１０〜３０サブユニットの長さを持つ。核酸結合化合物として活性である
ために、前記置換基は、結合される核酸のヘテロ環式基に対する水素結合を好ま
しくは塩基対形成、例えばワトソン−クリック型又はブーグスティーン型塩基対
形成により可能にするように選ばれるべきである。その置換基が前述の好ましい
水素結合の不可能な化合物は核酸結合化合物の製造のための中間物質として有用
である。本発明の好ましい核酸結合化合物は化学合成されるものである。
【００４１】 前記核酸結合化合物を核酸の測定のためのプローブとして使用するかあるいは
化合物又は核酸のいずれか他の同定を意図する場合、その置換基のいずれかが例
えばリポーター基を含むために選ばれる。付着されうるできるだけ多くのリポー
ター基は核酸結合化合物を十分に標識するために有用である一方で、そのプロー
ブがハイブリダイゼーション・アッセイに有用でなくなるような、核酸の認識、
核酸に対する親和性、及び可溶性への影響を受けないように１のサブユニットに
対して限られた数のリポーター基だけが付着することが好ましい。非常に好まし
い場合、各核酸結合化合物中に１〜４、最も好ましくは１又は２、あるいは最も
好ましくはただ１つのリポーター基が存在する。プローブに付着された１以上の
リポーター基を必要とする核酸測定のための形式がある。前述の形式に関する例
はＷＯ９２／０２６３８に記載されている。この場合、１のリポーター基は蛍光
エミッタであるのに対して、もう一方は蛍光クエンチャである。
【００４２】 リポーター基は一般的にその核酸結合化合物、並びにそこに結合されるあらゆ
る核酸を残り物の液体、すなわちサンプルから区別できるようにする基である（
リポーター基を付着させた核酸結合化合物は、標識核酸結合化合物、標識プロー
ブ又はただプローブとも呼ばれる）。この違いは、そのリポーター基が、直接的
又は間接的に検出されうる基の群からか、あるいは固定化された基又は固定化さ
れうる基の群から選ばれるかによりもたらされる。直接検出されうる基は、例え
ばフルオレセイン、並びにヘキサクロロフルオレセイン及びヘキサフルオロフル
オレセインのようなその誘導体、ローダミン、ソラレン、スクアライン（squara
ines）、ポルフィリン、蛍光粒子のような蛍光性化合物、アクリジニウム・エス
テル及びルミノールのような生物発光性化合物、又はＣｙ−５のようなシアニン
色素である。前述の化合物の例はＥＰ ０ ６８０ ９６９に記載されている。
さらに、ＴＥＭＰＯのようなスピン標識、電子化学的に検出可能な基、フェロセ
ン、ビオロゲン、ルテニウム、ビスピリジル複合体、及びナフトキノンのような
重金属キレート及び電子化学発光標識、並びにダブシル（dabcyl）のようなクエ
ンチャ色素、そして例えばＦｅ及びＣｕの核酸複合体が有用な検出可能な基であ
る。前述の化合物の他の例はユーロピウム化合物である。間接的に検出されうる
基は、直接的又は間接的に標識される他の部分により認識されうる基である。前
述の間接的に検出しうる基の例はジゴキシゲニン又はビオチンのようなハプテン
である。例えばジゴキシゲニンはジゴキシゲニンに対する抗体により認識される
。それらの抗体は直接標識されるか又は（抗ジゴキシゲニン）抗体に対する標識
抗体により認識されるかのいずれかである。ジゴキシゲニンの認識に基づく形式
がＥＰ−Ｂ−０ ３２４ ４７４に開示されている。ビオチンはアビジン、及び
ストレプトアビジンのような類似化合物、そして他のビオチン結合化合物により
認識される。同様にそれらの化合物も直接的又は間接的に標識される。
【００４３】 リポーター基はさらにサンプル中の他の核酸配列に干渉しないヌクレオチド配
列でありうる。従って、前記配列は特に相補配列を含むヌクレオチドにより認識
されうる。このヌクレオチド配列は直接的又は間接的に標識されるか、あるいは
固定化されうるか又は固定化されている。
【００４４】 リポーター基はさらに固相でありうる。核酸結合化合物の固相への付着は、検
出可能な基についての先の指摘のとおり直接的又は間接的である。前述の固相の
例はラテックス・ビーズ又は金粒子である。
【００４５】 直接標識は固相上の官能基への、すなわち、好ましくはリンカーを介した核酸
結合化合物の共有結合によりもたらされる。間接標識は、検出可能な基について
先に開示されたのと同様に作製される。好ましくは、間接的付着は生物固有の相
互作用、例えば、ハプテン抗体、ビタミン受容体、及び核酸に相補的な核酸の群
から選ばれるものにより非共有的である。この場合も同様に、それらの相互作用
及び核酸アッセイにおけるそれらの使用は当業者に知られている。
【００４６】 本発明によるプローブの固定に有用な固相は、ポリスチレン、ポリエチレン、
ポリプロピレン、ガラス、及びＴｉＯ2 の群から好ましくは選ばれる。前述の固
相の形態は計測の必要性及びアッセイの形態により選ばれる。例えば、固相はビ
ーズ又は容器の形をとる。
【００４７】 用語、リポーター基、そして特定の態様は、使用が意図される部分（固相その
もの又はフルオロリン部分）をリポーター基の付着部分につなぐために使用され
るリンカーを好ましくは含む。リンカーは、その核酸結合化合物が固相による障
害なしに測定すべき核酸配列を結合できるような自由度を与える。特に疎水性で
ないもの、例えばＤＥ ３９４３５２２に記載のとおり、例えば連続的なエチレ
ンオキシ単位に基づくリンカーが当業者に知られている。
【００４８】 以上の説明から、本発明は、プローブのバックボーンが厳密な意味でのオリゴ
ヌクレオチドでない場合でさえ、なおも作用するであろうことが明らかになる。
オリゴヌクレオチドのような類似の性質を有するが、しかしそれらのバックボー
ンが異なる核酸結合化合物が昨年示された。バックボーンは、同質又は異質のサ
ブユニットに結合した塩基を担う、主に線形の様式の核酸結合化合物の一部であ
ると一般的にみなされる。最もよく知られているバックボーンは（リボヌクレオ
シド・サブユニット（ＲＮＡ）、デオキシリボヌクレオシド・サブユニット（Ｄ
ＮＡ）又はペプチド核酸サブユニット（ＰＮＡ）のいずれかを含む）核酸の天然
糖リン酸バックボーンである。従って、好ましい態様において、バックボーンは
糖及びリン酸部分を含む。より好ましい態様において、糖の立体配置はα−Ｄ−
、β−Ｄ−、α−Ｌ−、及びβ−Ｌ−立体配置から成る群から選ばれ、最も好ま
しくは、前記化合物は少なくとも１の２′−デオキシ−β−Ｄ−エリスロ−ペン
トフラノシル部分又は１のβ−Ｄ−リボフラノシル部分を含む。
【００４９】 好ましいアリール基は、置換されないか、又は１以上のアミノ、−アミノアル
キル、−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−
（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、スルホニル、スルフェニル、スルフィニル、ニトロ
、及びニトロソにより置換されるフェニル又はナフチル部分である。最も好まし
いアリール基はフェニル基である。好ましいアリールアルキル基はベンジル基で
ある。好ましいアルキルアミノ基はエチルアミノ基である。好ましい−ＣＯＯ（
Ｃ1 〜Ｃ4 ）アルキル基はアルキル部分に１又は２の炭素を含む（メチル又はエ
チル・エステル）。
【００５０】 好ましくは、Ｄは本発明による化合物の糖部分であるグリコシドＣ−１である
。
【００５１】 核酸結合化合物は、測定するべき核酸に十分に相補的である核酸塩基配列、又
は塩基対形成によりそこに結合することが意図されている核酸を含むように構築
される。そのような場合、核酸は天然核酸塩基Ａｄｅ、Ｃｙｔ、Ｇｕａ、及びＴ
ｈｙ又はＵｒａのいずれかを少なくとも１度含み、本発明の核酸結合化合物もそ
れらの４の塩基のいずれかを含む。しかしながら、本発明により、少なくとも１
のヘテロ環式基が式（Ｉ）のヘテロ環式基により置き換えられる。
【００５２】 本発明による核酸結合化合物は、好ましくは逆平行の状態で核酸に結合する。
しかしながら、核酸及び／又は核酸結合化合物の核酸塩基を注意深く選ぶことに
より、プローブとしてのその機能における結合は平行の状態にさせもする。イソ
−Ｃ及びイソ−Ｇを含む核酸の平行ハイブリダイゼーションは、例えばＥＰ ０
６２４ １６１に開示されている。
【００５３】 好ましい核酸結合化合物はそのバックボーンが以下の一般式（II）：
【００５４】
【化３１】
【００５５】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、Ｎ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルから成る群から選ばれ、 Ｌはオキシ、スルファンジイル、−ＣＨ2 −、及び−ＮＲ22−から成る群から
選ばれ、 Ｔはオキソ、チオキソ、及びセレノキソから成る群から選ばれ、 Ｕは−ＯＨ、−Ｏ−リポーター基、−ＳＨ、−Ｓリポーター基、−ＳｅＨ、−
（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）
−アリール、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−ＮＲ23 Ｒ24、及び−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル
−Ｒ25から成る群から選ばれ、又はここで−ＮＲ23Ｒ24はＮと共に５〜６員ヘテ
ロ環式環であることができ、 Ｖはオキシ、スルファンジイル、−ＣＨ2 −又は−ＮＲ22−から成る群から選
ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−ア
ルケニルオキシ、−ハロゲン、−アジド、−Ｏ−アリル、−Ｏ−アルキニル、及
び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルから成る群から独立して選ばれ、 Ｒ23及びＲ24は−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ20）−アリール、
−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
アルキル−［ＮＨ（ＣＨ2 ）c ］d −ＮＲ26Ｒ27、及びリポーター基から成る群
から独立して選ばれ、 Ｒ25は−Ｈ、−ＯＨ、−ハロゲン、−アミノ、−（Ｃ1 〜Ｃ18）−アルキルア
ミノ、−ＣＯＯＨ、−ＣＯＮＨ2 、及び−ＣＯＯ（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−アルキル、並
びにリポーター基から成る群から選ばれ、 Ｒ26及びＲ27は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、及び−（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−
アルコキシ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、並びにリポーター基から成る群から独
立して選ばれ、 ｃは２〜６の整数であり、 ｄは０〜６の整数であり、そして Ｂは（先に定めた）式（Ｉ）部分であり、 ここで、いずれのアルキル、アルケニル、及びアルキニルも置換されないか、
又は−ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）
−アルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、
−ＮＨ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る
群から選ばれる１以上の部分により置換されることができ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数である。｝及びそのいずれかの塩の
１以上の部分を含むものである。
【００５６】 別段の指示がない場合、式（Ｉ）の下で定められた基の好ましい定義は式（II
）及び以下の式に適用される。
【００５７】 好ましくは、式（II）の化合物において、Ｒ14は水素である。Ｌの好ましい定
義はオキシである。Ｕの好ましい定義は−ＯＨ及び−Ｏ−リポーター基である。
Ｖの好ましい定義はオキシである。ｃの好ましい定義は２〜４の整数であり、そ
してｄの好ましい定義は０〜２の整数である。
【００５８】 式（II）の化合物は、核酸結合化合物の（好ましくは終端の１つでなく）統合
部分として本発明のヘテロ環部分を含むのに特に好適である。
【００５９】 基ＮＲ23Ｒ24は好ましくはジアルキルアミノ基から成る群から選ばれる。この
基が５又は６員ヘテロ環式環の形成と一緒の場合、好ましくはモルホリニル、ピ
ロリジニル又はピペリジニルの定義を前提とする。
【００６０】 従って、本発明の好ましい対象は先に概説した核酸結合化合物であり、ここで
そのバックボーンは以下の一般式（III ）：
【００６１】
【化３２】
【００６２】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
れ、 Ｍはオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−
又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
キル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成る群から
選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、保護基、及びリポーター基から成
る群から選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−ア
ルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジド
、−ＳＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルメルカプト、Ｏ−リポーター基、及び−
ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ15は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、
−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキル−カルボニル、−
（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルケニル−カルボニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルキニル−カ
ルボニル、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、固相、及
び以下の式（IV）：
【００６３】
【化３３】
【００６４】 ｛式中、 Ｔはオキソ、チオキソ、及びセレノキソから成る群から選ばれ、そして Ｕは−ＯＨ、−Ｏ−リポーター基、−ＳＨ、−ＳｅＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
ルコキシ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−ＮＲ23Ｒ24、及び−Ｏ−
（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｒ25から成る群か
ら選ばれ、又はここでＮＲ23Ｒ24がＮと共に５〜６員ヘテロ環式環であることが
でき、 Ｒ23及びＲ24は−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ20）−アリール、
−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
アルキル−［ＮＨ（ＣＨ2 ）c ］d −ＮＲ26Ｒ27から成る群から独立して選ばれ
、 Ｒ25は−Ｈ、−ＯＨ、−ハロゲン、−アミノ、−（Ｃ1 〜Ｃ18）−アルキルア
ミノ、−ＣＯＯＨ、−ＣＯＮＨ2 、及び−ＣＯＯ（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−アルキルから
成る群から選ばれ、 Ｒ26及びＲ27は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、及び−（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−
アルコキシ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から独立して選ばれ、 Ｒ29は−ＯＲ30及び−ＳＲ30から成る群から選ばれ、 Ｒ30は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、
−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、保護基、固相、及びリポーター基から成る群から
選ばれ、 ｃは２〜６の整数であり、 ｄは０〜６の整数である。｝の基から成る群から選ばれ、そして Ｂは（先に定めた）式（Ｉ）部分との連結である。｝及びそのいずれかの塩の
１以上の部分を含む。
【００６５】 定義及び選択について、詳細は、特に式（III ）について別段の指定がない限
り、式（Ｉ）及び（II）の下で置換基について概説されたとおり適用される。
【００６６】 核酸結合化合物において、その化合物の３′末端でサブユニット、例えばヌク
レオチドに付着する式（Ｉ）の基は、大型化合物の合成のための開始化合物とし
て又は／及び末端標識プローブとして有用である。プローブの末端の位置は一般
的に化学部分の付着の観点で最も寛容であるため、化合物のこの基は特に好まし
い。
【００６７】 本発明のより好ましい対象は以下の式（Ｖ）：
【００６８】
【化３４】
【００６９】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
れ、 Ｍ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル
−又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、並びに−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−
アルキル−Ｏ−、及び−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成る群か
ら選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ、保護基、リポーター基、及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの基か
ら選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−ア
ルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジド
、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルメルカプト、Ｏ−リポーター基、Ｏ
−固相、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ16は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ8 ）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アルケニル、
−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アルキニル、−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アルキル−カルボニル、−
（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルケニル−カルボニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルキニル−カ
ルボニル、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ8 ）−アルキル、保護基、
又は以下の式（IV）：
【００７０】
【化３５】
【００７１】 ｛式中、 Ｔはオキソ、チオキソ、及びセレノキソから成る群から選ばれ、 Ｕは−ＯＨ、−ＳＨ、−ＳｅＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ1 〜
Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール
−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−ＮＲ23Ｒ24、及び−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
キル−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｒ25から成る群から選ばれ、ここでＮＲ23 Ｒ24がＮと共に５〜６員ヘテロ環式環であることができ、 Ｒ23及びＲ24は−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ20）−アリール、
−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
アルキル−［ＮＨ（ＣＨ2 ）c ］d −ＮＲ26Ｒ27から成る群から独立して選ばれ
、 Ｒ25は−Ｈ、−ＯＨ、−ハロゲン、−アミノ、−（Ｃ1 〜Ｃ18）−アルキルア
ミノ、−ＣＯＯＨ、−ＣＯＮＨ2 、及び−ＣＯＯ（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−アルキルから
成る群から選ばれ、 Ｒ26及びＲ27は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、及び−（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−
アルコキシ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から独立して選ばれ、 Ｒ29は−ＯＲ30及び−ＳＲ30から成る群から選ばれ、 Ｒ30は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、
−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、保護基、固相、及びリポーター基から成る群から
選ばれる。｝の化合物から成る群から選ばれ、そして Ｂは（先に定めた）式（Ｉ）部分との連結である、 ここで、全てのアルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか又は
−ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−ア
ルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−Ｎ
Ｈ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群か
ら選ばれる１以上の部分により置換される。｝又はそのいずれかの塩のバックボ
ーン部分を含む先に概説した核酸結合化合物である。
【００７２】 非常に好ましい化合物は、式（Ｖ）の化合物であり、ここでＭ′はＯであり、
Ｒ16はＨであり、そしてＲ14は水素及びヒドロキシルから成る群から選ばれる。
【００７３】 これらの化合物は例えば５′末端標識プローブとして使用される。置換基の定
義に関して、別段の指示がない限り先に与えられた定義を適用する。
【００７４】 核酸結合化合物のバックボーンは、その化合物が相補配列を有する核酸に結合
しうるような塩基対形成ヘテロ環を担持するための機能を有する。好ましくは、
天然塩基における相補性の程度は、結合すべき核酸の領域内の同じ長さの一帯に
比べ、結合に影響する領域内の塩基の一帯の中の７０％〜１００％の範囲内であ
ろう。従って、各配列内のサブユニットの欠失及び挿入は、この計算により、次
の適合塩基までギャップとしてカウントされ、その結果ギャップ含有と同数の塩
基分ずつ相補性が低下する。
【００７５】 好ましいバックボーンは糖−リン酸部分を含む。これらの中で、デオキシ糖含
有バックボーンがより好ましい。
【００７６】 本発明の部分を含む、相補的配列の核酸と塩基対形成が可能な部分を担持する
バックボーンの各部分はサブユニットと呼ばれる。化合物は異なる種類のサブユ
ニットと混じり合ったバックボーンを持つことが知られている。最近、新種の非
天然核酸結合化合物が示された。それらは、少なくとも１の、サブユニット間の
ペプチド結合を含むのでペプチド核酸（ＰＮＡ）と呼ばれる（ＷＯ９２／２０７
０２）。本発明の核酸結合化合物はあらゆる長さを持ちうる。しかしながら、化
学合成の便宜のために、１００未満、より好ましくは１０〜３０サブユニットの
長さの化合物、例えばヌクレオシドが好ましい。
【００７７】 本発明の核酸結合化合物は、自動合成デバイスの適当に使用した溶液中又は好
ましくは固相上で製造される。オリゴマーはそれぞれの場合によりヌクレオチド
塩基が適当な誘導体化支持体上、又はオリゴマー鎖の伸長の先に取り付く連続的
なモノヌクレオチドの縮合により段階的に組み立てられうる。あるいは、核酸結
合化合物はジヌクレオチド又はトリヌクレオチドを同時に連結することにより組
み立てられうる（S. Beaucage et al., Tetrahedron, 48 (12), 2223-2311, (19
92) ；及びTetrahedron, 48 (28), 6123-6194, (1993））。これは、修飾された
リン酸架橋を持つオリゴヌクレオチドを合成する時に特に有利である。
【００７８】 オリゴヌクレオチドは、当業者に知られた方法、例えばトリエステル法、Ｈ−
ホスホン酸法又はホスホアミダイト法を用いて組み立てられうる（E. Sonvea ux
, (1986), Bioorganic Chemistry, 14, 274-325 ; S.L. Beaucage et al., (199
2), Tetrahedron, 48, 2223-2311）。
【００７９】 従って、本発明のさらなる対象は、少なくとも１の、式（Ｉ）の基を含むサブ
ユニットであるところの活性化サブユニットを用いた本発明の核酸結合化合物の
化学合成方法である。最も好ましい化学合成の方法はホスホアミダイト法を用い
る。特に好ましい方法は１以上の、一般式（VII ）の化合物上の活性化サブユニ
ットを用いる。この方法は非常に便利で、そして必要な試薬、例えば式（Ｉ）の
基を含むホスホアミダイトは容易に包含されうる。
【００８０】 従って、本発明のさらなる対象は、以下の一般式（VII ）：
【００８１】
【化３６】
【００８２】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
れ、 Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
ルキル−又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、並びに−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10 ）−アルキル−Ｏ−、及び−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成
る群から独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの基から選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＲ31、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−
アルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジ
ドＮＨＲ31、−ＳＲ31、Ｏ−リポーター基、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ
、 Ｒ31は保護基又はリポーター基であり、 Ｒ32及びＲ17は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アル
ケニル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリールから成る群から独立して選ばれ、又はここ
でＮＲ32Ｒ17は５〜６員ヘテロ環式環として存在するＮと一緒に形成されること
ができ、 Ｒ18は−（Ｃ2 〜Ｃ6 ）−アルケニルオキシ、置換された又は置換されない−
（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、置換されない−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、又は
−ハロゲンｐ−ニトロアリールオキシ及び−シアノから成る群から選ばれる基に
より１回以上置換された−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシから成る群から選ばれ、
そして Ｂは（先に定めた）式（Ｉ）の基であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
る１以上の部分により置換されることができ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数である。｝の化合物であって、 ただし、 上記化合物は、２−［２′−デオキシ−５′−Ｏ−（４，４′−ジメトキシト
リチル）−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル］−４−（メチルアミノ
）−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］−ピリミジン３′−［メチルＮ，Ｎ−ジイソ
プロピルホスホアミダイト］、４−（ベンゾイルアミノ）−２−［２′−デオキ
シ−５′−Ｏ−（ジメトキシトリチル）−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラ
ノシル］−２Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］−ピリミジン３′−［メチルＮ，Ｎ−
ジイソプロピルホスホアミダイト］又はＮ−［２−［５−Ｏ−［ビス（４−メト
キシフェニル）フェニルメチル］−２−デオキシ−β−Ｄ−リボフラノシル］−
３−メチル−７−オキソ−２Ｈ−ピラゾロ［４，３−ｄ］ピリミジン−５−イル
］−２−メチル−プロパンアミド−３′−［（２−シアノエチル）Ｎ，Ｎ−ジイ
ソプロピルホスホアミダイト］ではない。
【００８３】 式（VII ）の好ましいヌクレオチドモノマーの構造的要素はＸ5 がＮのもので
あり、好ましいものはＸ3 がＣＲ3 である、より好ましくはＣ−ＮＲ5 Ｒ6 であ
る、最も好ましくはＣ−ＮＨ2 である化合物でもある。
【００８４】 式（VII ）の化合物は対応の８−グリコシル化ヌクレオシドからの処理により
オリゴヌクレオチド固相合成のための構造的要素として製造される。例えば、ハ
ロゲン又はメチルにより７又は９位で置換される８−グリコシル化誘導体の調製
はSeela et al. (Helv. Chim. Acta, (1994), 77, 897-903 ）により記載される
とおり７−デアザプリン誘導体の場合に実施される。式（VII ）のアルケニル又
はアルキニル置換された８−グリコシル化ヌクレオシド誘導体を、テトラキス（
トリフェニルホスフィン）パラジウム（Ｏ）の存在下、交差結合により６〜５員
環系の７又は８位へのアルケニル又はアルキニル基の結合により製造する。求電
子置換基（例えばハロゲン）が５〜６員基の７又は９位に導入される。これらの
ハロゲン化基は８−グリコシル化及び９−又は７−グリコシル化誘導体を得るた
めにＫＯＨ及びＴＤＡ−１の存在下、α−ハロゲノースによりアセトニトリル中
グリコシル化される。前記ハロゲン化ヌクレオシドは次に前記パラジウム触媒交
差結合反応による他の置換基、例えばアルキル、アルケニル又はアルキニル基の
挿入のための開始化合物として使用される。アルコキシ誘導体又は置換されたア
ミン誘導体は求核置換により導入され、そして窒素基は求電子置換により導入さ
れる。
【００８５】 ６位のアミノ基及び糖部分遊離の５′−ヒドロキシル基のための好適な保護基
を導入した後、前記モノマーを対応のホスホン酸又はホスホアミダイトに転化さ
せる。例えばアシル保護基（例えば、イソブチリル、アセチル又はフェノキシア
セチル）の形態における好適なアミノ保護基は周知の方法を用いて挿入される（
J.C. Schulhof, D. Molko, R. Teoule, (1987), Nucleic Acids Res., 15, 397-
416 ）。糖の遊離５′−ＯＨ基に対する好適な保護基の例は、その挿入が既知の
方法（C.B. Reese (1978), Tetrahedron, 34, 3143 ; D. Flockerzi et al., (1
981), Liebigs Ann. Chem., 1568）を用いて同様にもたらされる４，４′−ジメ
トキシトリチル残基である。この方法により保護されたモノマーを、Froehler e
t al. (B.C. Froehler et al., (1986), Nucleic Acids Res., 14, 5399 ）によ
るプロトコールに従って対応のホスホン酸に転化させる。シアノエチル−ホスホ
アミダイト誘導体は、例えば前記モノマーを無水ジクロロメタン中でクロロ−β
−シアノエトキシ−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルアミノ）ホスファンと反応させる
ことにより製造される（N.D. Sinha et al., (1984), Nucleic Acids Res., 12,
4539 ）。
【００８６】 本発明のさらなる対象は以下の一般式（IX）：
【００８７】
【化３７】
【００８８】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
れ、 Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
ルキル−又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10 ）−アルキル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成
る群から独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ、及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの群から選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＲ31、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−
アルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジ
ドＮＨＲ31、−ＳＲ31、Ｏ−リポーター基、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ
、 Ｒ31は保護基又はリポーター基であり、 Ｒ32及びＲ17は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アル
ケニル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリールから成る群から独立して選ばれるか又はこ
こでＮＲ32Ｒ17はＮと共に５〜６員ヘテロ環式環であることができ、 Ｒ18は−（Ｃ2 〜Ｃ6 ）−アルケニルオキシ、置換された又は置換されない−
（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、置換されない−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、ある
いは−ハロゲン、ｐ−ニトロアリールオキシ、及び−シアノから成る群から選ば
れる基により１回以上置換された−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシから成る群から
選ばれ、そして Ｂは（先に定めた）式（Ｉ）の基である。｝の化合物である。
【００８９】 それら化合物は化学合成において式（VII ）の化合物のように使用される。
【００９０】 本発明のさらなる対象は以下の一般式（Ｘ）：
【００９１】
【化３８】
【００９２】 ｛式中、 Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
キル又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
ルキル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成る群か
ら独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの群から選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＲ31、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−
アルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジ
ドＮＨＲ31、−ＳＲ31、Ｏ−リポーター、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ31は保護基又はリポーター基であり、 Ｂは（先に定めた）式（Ｉ）の基である。｝の化合物である。
【００９３】 これらの化合物は先に触れた核酸結合化合物及びその前駆物質の化学合成に有
用である。
【００９４】 長いオリゴマー及び天然バックボーンに基づくものにより好適な他の選択肢に
おいて、そのオリゴマーは酵素的に製造される。この場合、開始オリゴマーを、
モノホスフェート又は修飾モノホスフェートをオリゴマーの末端に付着させるよ
うにポリメラーゼ及びトリホスフェート又は修飾トリホスフェートと反応させ、
それによりそのオリゴマーを伸長する。この方法についても、当業者はニック・
トランスレーション法又は単純なプライマー伸長のようないくつかの利用可能な
形式を知っているであろう（J. Sambrook. E.F. Fritsch, T. Maniatis, Molecu
lar Cloning - A laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press 1
989 ）。
【００９５】 従って、本発明のさらなる対象は、プライマー伸長のため鋳型として核酸を使
用してトリホスフェートサブユニットをプライマーと反応させることを含む本発
明による核酸結合化合物の酵素的合成方法であり、ここで上記トリホスフェート
・サブユニットは式（Ｉ）のヘテロ環式基を含む。好ましくは前記トリホスフェ
ート・サブユニットは以下の式（VI）：
【００９６】
【化３９】
【００９７】 {式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ばれ
、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、Ｏ−保護基、Ｓ−保護
基、ＮＨ−保護基、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニルオキシ、−ハロゲン、−アジ
ド、−ＳＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルメルカプト、Ｏ−リポーター基、Ｏ−
固相、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ15及びＲ16は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ8 ）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アル
ケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アルキニル、−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アルキル−カルボ
ニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルケニル−カルボニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルキ
ニル−カルボニル、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ8 ）−アルキル、
保護基、及び以下の式（IV）：
【００９８】
【化４０】
【００９９】 ｛式中、 Ｔはオキソ、チオキソ、及びセレノキソから成る群から選ばれ、そして Ｕは−ＯＨ、−ＳＨ、−ＳｅＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ1 〜
Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール
−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−ＮＲ23Ｒ24、及び−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
キル−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｒ25から成る群から選ばれ、又はここで
ＮＲ23Ｒ24がＮと共に５〜６員ヘテロ環式環であることができ、 Ｒ23及びＲ24は−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ20）−アリール、
−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
アルキル−［ＮＨ（ＣＨ2 ）c ］d −ＮＲ26Ｒ27から成る群から独立して選ばれ
、 Ｒ25は−Ｈ、−ＯＨ、−ハロゲン、−アミノ、−（Ｃ1 〜Ｃ18）−アルキルア
ミノ、−ＣＯＯＨ、−ＣＯＮＨ2 、及び−ＣＯＯ（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−アルキルから
成る群から選ばれ、 Ｒ26及びＲ27は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、及び−（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−
アルコキシ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から独立して選ばれ、 Ｒ29は−ＯＲ30及び−ＳＲ30から成る群から選ばれ、 Ｒ30は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、
−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、保護基、ホスフェート、ジホスフェート、及びリ
ポーター基から成る群から選ばれる。｝の化合物から成る群から独立して選ばれ
、 ただし、Ｒ15又はＲ16が式（IV）の化合物であり、そして Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
キル又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−
アルキル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成る群
から独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの群から選ばれ、そして Ｂは（先に定めた）式（Ｉ）の部分であり、 ここでいずれのアルキル、アルケニル、及びアルキニルも置換されないか、又
は−ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
アルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−
ＮＨ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群
から選ばれる１以上の部分により置換されることができる。｝の化合物であって
、 ただし、 上記化合物は８−アザ−７−デアザ−７−Ｈ−アデニン−Ｎ8 −β−Ｄ−リボ
フラノシル−５′−一リン酸又は８−アザ−７−デアザ−７−Ｈ−アデニン−Ｎ8 −β−Ｄ−リボフラノシル−５′−二リン酸ではない。
【０１００】 これらの化合物において最も好ましい−Ｍ′Ｒ16はトリホスフェート基であり
、そして−ＭＲ15はＯＨである。最も好ましい化合物はＲ14が−Ｈであるもので
ある。
【０１０１】 本発明による核酸結合化合物の酵素的合成に関して最も好ましい化合物は以下
の式（VIII）：
【０１０２】
【化４１】
【０１０３】 ｛式中、 ＰＰＰはトリホスフェート基であり、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−ア
ルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジド
、及びＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ36は−Ｈ及び−ＯＨの群から選ばれ、そして Ｂは（先に定めた）式（Ｉ）の基である。｝の化合物であって、 ただし、 上記化合物は、８−アザ−グアノシン−Ｎ8 −β−Ｄ−２′−３′−ジデスオ
キシ−グリセロペントフラノシルではない。
【０１０４】 他の好ましい態様において、式（VIII）の化合物における式（Ｉ）の基は、Ｘ5 がＮである式（Ｉ）の基から成る群から選ばれる。また、好ましくはＸ3 がＮ
Ｈ2 のようなＨ供与基に連結したＣである化合物である。
【０１０５】 例えば、式（VIII）による３′デオキシ−及び２′−３′−ジデスオキシ・ト
リホスフェートサブユニットは配列決定法における末端ヌクレオチドとして使用
される。
【０１０６】 より好ましくは、酵素的合成に関する前述の方法はトリホスフェート・サブユ
ニットとして先に定めた式（VIII）の化合物を使用する。
【０１０７】 先の方法により、ある核酸結合化合物中に、本発明の部分を含む１のモノマー
だけでなく、場合によっては１より多く導入することが理論上可能である。これ
は核酸結合化合物の合成のための化学的方法を用いて特に可能である。
【０１０８】 前述のトリホスフェート・サブユニットの合成に関して、いくつかの方法が本
技術分野で知られている（K. Burgess, D. Cook, Chem Rev. (2000), Vol 100,
p.2047-2059 ）。当業者は、例えばLudwig, J., Acta Biochimica Biochim et B
iophysica Acad. Sci. Hung., Vol.16, page 131-133に記載の方法を使用する。
また、ポラメラーゼによるＤＮＡ内への類似のピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジ
ンの基質依存性の組み込みの成功が証明されている。
【０１０９】 これらの核酸化合物はハイブリダイゼーション法に有効に利用される。従って
、本発明のさらなる対象は以下のステップ： − その核酸を含むことが推測されるサンプルを準備し、 − 上記核酸の一部又は全体と本質的に相補的な請求項１に記載の核酸結合化 合物を準備し、 − 上記核酸結合化合物が上記核酸に結合するための条件下、上記サンプルを その核酸結合化合物と接触させ、 − 上記核酸の存在の指標としてその核酸と上記核酸結合化合物から形成され た結合産物を測定する、 を含む核酸の測定方法である。
【０１１０】 ハイブリダイゼーションによる核酸の測定方法は、例えばSambrook et al.（
前掲）によって一般的に知られている。それらは本発明のプローブの使用を容易
に取り込まれうる。
【０１１１】 好ましくは、式（Ｉ）のヘテロ環式基は、４の天然核酸塩基のそれぞれと塩基
対形成が可能なユニバーサル塩基として使用される。これらのヘテロ環式基を含
む核酸結合化合物は、例えばプローブ及びプライマーとして使用される。他の核
酸結合化合物と同様に、それらはストリンジェントな条件下、それらの相補配列
を持つ核酸とだけハイブリダイズする。しかし本発明によるユニバーサル塩基を
含む位置では、核酸結合化合物はその配列に関係のない核酸とハイブリダイズす
る。従って、非特異的なハイブリダイゼーションが可能である。これは測定すべ
き核酸（標的核酸）の特定の位置で明確な天然塩基が知られていない場合に有用
である。通常、当業者は、標的核酸が必ず測定されるように標的核酸の不明確な
位置との塩基対形成の位置で可能性のある全ての相補ヌクレオチドを含むいくつ
かのプローブを製造する。本発明による核酸結合化合物を用いたその位置にユニ
バーサル塩基を含むたった１つのプローブで標的核酸とのハイブリダイゼーショ
ンをもたらすのに足りる。特に標的核酸のヌクレオチド配列がいくつかの位置で
知られていない場合、２以上のユニバーサル塩基を含むプローブの使用は、全て
の可能性のあるいくつかのプローブの使用よりも好ましい。従って、本発明によ
るプローブの使用は、遺伝子コードの重複が多数の可能性のある核酸配列をもた
らすので、その配列がタンパク質配列から推測される場合に核酸の測定のための
大きな助けとなりうる。
【０１１２】 本発明のプローブは、対立遺伝子又は配列が特定の位置で異なる配列を含むサ
ブタイプに属することが知られている場合における核酸の測定をももたらす。１
の例は細菌又はウイルス、例えばＨＣＶ、ＨＢＶ、及びＨＩＶのような病原体の
測定である。しばしば、それらの病原体のサブタイプは、１種類だけのプローブ
を用いた１の属に属する全てのサブタイプの測定を妨げる、それらのゲノム内の
特定の位置で異なる核酸配列を持つ。本発明によるユニバーサル塩基を含むプロ
ーブの使用はこの問題を解決する。
【０１１３】 他のユニバーサル塩基、例えばイノシンのような、本発明による塩基は全ての
天然核酸塩基と対をなす。しかしながら、全ての天然塩基と対をなす本発明によ
る前述の塩基の結合安定性は非常に類似している。従って、本発明によるユニバ
ーサル塩基を含む核酸結合化合物が、ユニバーサル塩基（Ａ，Ｃ，Ｇ，Ｔ）と対
をなす位置を除いてそれぞれが同じ配列を持つ核酸とハイブリダイズする時、そ
のＴｍは非常に近い。本発明によるユニバーサル塩基を含む核酸結合化合物にハ
イブリダイズする定義された１２−ｍｅｒ（実施例６を参照のこと）を用いた時
、そのΔＴｍは３℃であった。従って、これらのハイブリダイゼーション複合体
の結合安定性は、既知の人為的な塩基、例えばイノシンに比べ天然塩基と本発明
によるユニバーサル塩基の対に対して依存が少ない。
【０１１４】 プローブ又はプライマーに含まれる本発明によるユニバーサル塩基は対立遺伝
子性の違い又は特定の位置に知られていない配列を有する核酸の検出のために使
用される。ハイブリダイゼーション複合体のＴｍが、天然塩基と本発明によるユ
ニバーサル塩基の対に対して依存が少ないので、本発明による核酸結合化合物は
、部分的に未知の又は対立遺伝子の配列を含む核酸を測定するための多数のプロ
ーブ又はプライマーの必要を回避するだけでなく、それらはアッセイの信頼度を
向上させ、そして使用する必要がある適当なハイブリダイゼーション条件の発見
を容易にもする。
【０１１５】 本発明による核酸結合化合物は、測定すべき核酸が増幅されている場合の核酸
測定法に適用されもする。Ｑｂ−増幅、ＮＡＳＢＡ、ＬＣＲ、ＳＤＡ、ＴＭＡの
ようないくつかの方法が本技術分野で知られている。実施した方法はＰＣＲであ
る。
【０１１６】 本発明による核酸結合化合物はプライマー及びプローブとして使用される。こ
の場合、核酸結合化合物はプローブとして使用されるべきであり、好ましくは、
検出可能なリポーター基を含む。その時、核酸結合化合物と核酸から形成される
あらゆるハイブリッドはその検出可能なリポーター基により測定される。アッセ
イのこの群はさらに２つの群、１つは均一性アッセイの群であり、そしてもう１
つは不均一性アッセイに分けられる。不均一性アッセイにおいて、好ましくはハ
イブリッド（結合産物）は固相に結合した時に測定される。この態様は、あらゆ
る過剰なプローブ及び他の成分をそのハイブリッドから容易に除去できるため、
測定を容易にする利点を有する。形成されたハイブリッドは共有的又は非共有的
に、特異的又は非特異的に固相に捕捉される。当業者に知られているいくつかの
態様が存在する。
【０１１７】 いわゆる均一性アッセイにおいて、形成されたハイブリッドは固相に結合しな
いが溶液中で直接的又は間接的のいずれかで測定される。このようなアッセイの
好ましい例はＰＣＴ／ＵＳ９１／０５５７１に開示され、それを本明細書中に援
用する。
【０１１８】 従って、本発明のさらなる対象は以下のステップ： − プライマー、つまりその核酸の第１結合配列に本質的に相補的な第１プラ イマー及びこの核酸の相補鎖の結合配列に本質的に相補的な第２プライマ ー、並びに少なくとも２の異なるリポーター基により異なるサブユニット で標識されている、上記プライマーの結合配列の間の核酸又はその相補鎖 に相補的なプローブを準備し、 − 上記プライマーの伸長に好ましい条件下、そのサンプルをそのプライマー 及びプローブにさらし、そしてそのプローブの分解により互いに上記リポ ーター基を分離し、そして − 少なくとも１の上記リポーター基を介してプローブの分解の程度を測定す る、 を含む、サンプル中の核酸の存在、不存在又はその量の測定方法であり、少なく
とも１の上記プライマー又は／及びプローブが少なくとも１の式（Ｉ）のヘテロ
環式基を含む核酸結合化合物であることを特徴とする。
【０１１９】 特に、いくつかの核酸結合化合物を用いる場合、例えばＰＣＲ法、多重ＰＣＲ
法又は多重ハイブリダイゼーション法を実施する場合、低い安定性をも意味する
低いＴｍによりもたらされるいくつかの特異的なハイブリダイゼーション複合体
の遊離なしに良好な特異性を確保する適当なハイブリダイゼーション条件を見つ
け出すことは多くの場合、困難である。診断方法の場合、これは回避すべき誤っ
た陰性の結果を導きうる。さらなる困難は生物サンプル、例えば血液又は痰の複
雑さにある。このようなサンプルは多くの場合、例えば誤った陽性の結果を導く
測定法を妨げうるバックグラウンド核酸を持つ。従って、非常に特異的なアッセ
イの確立が必要であり、そしてこれらのアッセイにより形成される全てのハイブ
リダイゼーション複合体の近いＴｍが高く評価される。
【０１２０】 従って、式（Ｉ）のヘテロ環式基はアッセイにより形成される１以上のハイブ
リダイゼーション複合体のＴｍを変えるために多重ハイブリダイゼーション法に
も使用される。そのアッセイに使用される核酸結合化合物に含まれる天然塩基の
代わりに式（Ｉ）のヘテロ環式基を導入することにより、その標的核酸と形成さ
れるハイブリダイゼーション複合体のＴｍを変化させる。前述のＴｍの変化は異
なる温度でのその標的核酸と核酸化合物の特異的ハイブリダイゼーションをさら
にもたらす。この方法は、サンプル中に存在する標的核酸に関するアッセイによ
り生じうるハイブリダイゼーション複合体のＴｍを等しくするために使用される
。式（Ｉ）のヘテロ環式基の使用は、未知の又は対立遺伝子の配列を含む標的核
酸と塩基対形成する核酸結合化合物の位置に制限されず、他の位置にも適用され
うる。従って、これらのヘテロ環式基はユニバーサル塩基としてだけでなく、多
重ハイブリダイゼーション法におけるＴｍ均等化塩基としても使用される。好ま
しい応用分野は、多くの場合、１００〜数千のハイブリダイゼーション・プロー
ブを用いたチップによる多重ハイブリダイゼーション法である。
【０１２１】 本発明によるこれらのユニバーサル塩基は、例えばＰＣＲのような増幅法を用
いたインビトロにおける突然変異誘発のためにも使用される。
【０１２２】 さらに、本発明は生理的に許容される賦形剤、そして適切な場合には好適な添
加剤及び／又は慣用の補助物質と一緒に、少なくとも１の式（Ｉ）のヘテロ環式
基を含む１以上の核酸結合化合物を含む医薬組成物に関する。ごく一般的な様式
において、本発明は治療として有効な組成物への前述の核酸結合化合物の使用に
及ぶ。このような組成物は、アンチセンス・オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレ
オチドを形成する三本らせん、アプタマー又はリボザイム、特にアンチセンス・
オリゴヌクレオチドとして本発明による核酸結合化合物を含むことを意味するこ
とが理解される。
【０１２３】 記載の核酸結合化合物の化学合成のための中間物質及び前駆物質をも本発明に
含む。好ましい中間物質及び前駆物質を以下に記載する。
【０１２４】 好ましいものは、以下の一般式（VI）：
【０１２５】
【化４２】
【０１２６】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
れ、 Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
ルキル−又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10 ）−アルキル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成
る群から独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、保護基、及びリポーター基の群か
ら選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＲ31、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、Ｏ−保護基、Ｓ−保
護基、ＮＨ2 保護基、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）
−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジド、−ＳＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
キルメルカプト、−ＮＨ2 、及びＯ−固相から成る群から選ばれ、 Ｒ15及びＲ16は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アル
ケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキル−カルボ
ニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルケニル−カルボニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルキ
ニル−カルボニル、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、
保護基、及び固相から成る群から独立して選ばれ、 Ｂは以下の式（Ｉ）：
【０１２７】
【化４３】
【０１２８】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 Ｄはこの基の前記バックボーンへの付着位置である。｝の部分と連結し、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
る１以上の部分により置換され、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 ここでＲ14、Ｒ15又はＲ16のいずれか１が固相である。｝の部分を含むバック
ボーンを含む核酸結合化合物の合成のための固相に結合した前駆物質である。
【０１２９】 前述の式（VI）の化合物は前駆物質として本発明による核酸結合化合物の化学
合成に使用される。この場合、前記化合物は固相に凍結され、好ましくはＲ14が
Ｏ−固相であるか又はＲ15若しくはＲ16が固相であり、最も好ましくはＲ15が固
相である。反応基が保護基により保護されることも好ましい。
【０１３０】 そのバックボーンが以下の一般式（III ）：
【０１３１】
【化４４】
【０１３２】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
れ、 Ｍはオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−
又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
キル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成る群から
選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、保護基、及びリポーター基の群か
ら選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−ア
ルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジド
、−ＳＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルメルカプト、Ｏ−リポーター基、Ｏ−固
相、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ15は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、
−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキル−カルボニル、−
（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルケニル−カルボニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルキニル−カ
ルボニル、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、固相から
成る群から選ばれ、 Ｂは以下の式（Ｉ）：
【０１３３】
【化４５】
【０１３４】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 Ｄはこの基の前記バックボーンへの付着位置である。｝の部分と連結し、 ここで全てのアルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は
−ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−ア
ルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−Ｎ
Ｈ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群か
ら選ばれる１以上の部分により置換され、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 ここで、Ｒ14がＯ−固相であるか又はＲ15が固相である。｝の部分を含む、核
酸結合化合物の前駆物質又は中間物質も本発明中に含まれる。
【０１３５】 本発明による核酸結合化合物の化学合成のための固相は、増えた核酸結合化合
物を固定するためのリンカーをも好ましくは含む。このようなリンカーが本技術
分野で知られている。好ましくは前述のリンカーは合成後遊離の前述の核酸結合
化合物に付着し、そして例えばその核酸結合化合物内に遊離の３′−ヒドロキシ
基を生じるために使用されもする。前述のリンカーは本技術分野で知られる、例
えばエステル及びアミド結合を介して結合したコハク酸である。好ましいＲ15は
固相であるが、式（III ）による核酸結合化合物の化学合成のための前駆物質で
は、あるいはＲ14が固相でもありうる。前記化合物の反応基は好ましくは保護基
により保護される。
【０１３６】 本発明による好ましい前駆物質及び中間物質のさらなる一般式は、少なくとも
１の前述のヘテロ環式基が以下の一般式（Ｉ）：
【０１３７】
【化４６】
【０１３８】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、固相、及びリポーター基から成る群から独立して
選ばれ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄはこの基の前記バックボーンへの付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
る１以上の部分により置換され、 ここで、上記バックボーンが固相に結合されているか又はＲ5 、Ｒ6 、Ｒ12、
Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35の少なくとも１が固相である。｝の基であることを特徴と
する付着したヘテロ環式基を有するバックボーンを含む化合物である。
【０１３９】 前記前駆化合物又は中間物質をバックボーンで固相に結合させる可能性に加え
、それを上記化合物中に含まれる式（Ｉ）のヘテロ環式基で、例えば付着部位と
して−ＯＨ、−ＳＨ又は−ＮＨ2 基を用いて連結することもできる。好ましくは
、前述の化合物の他の反応基は保護基により保護される。
【０１４０】 本発明を以下の実施例によりさらに詳細に説明する： 実施例 実施例１ 合成に使用される物質は合成番号を用いて記載される。ユニバーサル塩基を含
むオリゴヌクレオチドの合成を市販のＤＮＡ／ＲＮＡ合成装置により標準的なプ
ロトコールを用いて行った。一般的に、オリゴヌクレオチドの合成はリン塩基を
持つ中間物質を通して進む。有用な中間物質のいくつかの例を、Beaucage及びCa
ruthers (1981）によるホスホルアミド、並びにFroehler及びMatteucci (1986)
によるＨ−ホスホン酸を含め図３に示す。
【０１４１】 ４−（アミノ）−２−（２−デオキシ−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラ
ノシル）−２Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン（１）を相転位グリコシル
化を用いて最初に合成した（F. Seela, H. Steker Helv. Chim. Acta 1985, 68,
563）。メチル基、例えばチオフェノールの脱保護のための特別なステップを必
要とするメチル保護ホスホルアミダイトを製造した（F. Seela, K. Kaiser Helv
. Chim. Acta 1988, 71, 1813)。この構築物の６−アミノ官能基を、脱保護のよ
り長い半減期を示すベンゾイル基により保護した（ＮＨ3 の２５％水溶液中、４
０℃で２９０分）。この構築物はＰ（III ）オリゴヌクレオチド合成又は素早い
脱保護手順の一般的なプロトコールに対応しない。
【０１４２】 現行のシアノエチル・ホスホルアミダイト・プロトコール及び素早い脱保護に
完全に対応する新しい構築物の合成について、図４に見ることができる。イソブ
チリル基の脱保護の半減期は２２分であり、そしてアセチル基のそれは８分であ
る（ともにアンモニアの２５％水溶液中、２０℃）。
【０１４３】 実施例２ ４−（アセチルアミノ）−２−（２−デオキシ−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペ
ントフラノシル）−２Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン（３ｂ、図４）。
ヌクレオシド１（図４を参照のこと）（１５０mg，０．６mol ）を無水ピリジン
との沸留去（ｃｏ−ｅｖａｐｏｒａｔｉｏｎ）により留去し、次にピリジン（４
ml）中に溶解した。Ｍｅ3 ＳｉＣｌ（０．４ml，３．１mmol）の溶液を１５分間
撹拌し、無水酢酸（０．２８ml，３．０mmol）で処理し、そして３時間室温に維
持した。前記混合物を冷却し（氷浴）、そしてＨ2 Ｏ（１ml）により希釈した。
１５分後、得られた物を水冷ＮＨ3 １０％水溶液により処理し、そしてさらに１
５分間撹拌した。次にその溶液を留去し乾固させ、そして残渣をトルエン（２×
１０ml）と共沸留去した。その残渣をＦＣ（カラム３×１０cm、溶媒（ＣＨ2 Ｃ
ｌ2 −ＭｅＯＨ ９：１））に適用した。表題の化合物３ｂを白色粉末として分
離した（１１０mg，６２％）。Ｒf （ＣＨ2 Ｃｌ2 −ＭｅＯＨ ９：１）０．２
；λmax （ＭｅＯＨ）／nm ２３９（ε／dm3 mol-1cm-1 ８４００），２７３（
９３００），３０２（６７００）；（実測：Ｃ，４８．９９；Ｈ，５．２５；Ｎ
，２３．６８．Ｃ12Ｈ15Ｎ5 Ｏ4 要求Ｃ，４９．１４；Ｈ，５．１６；Ｎ，２３
．８８％）；δH ［２５０MHz ；（ＣＤ3 ）2 ＳＯ］２．２４（３Ｈ，ｓ，Ｍｅ
），２．４１（１Ｈ，ｍ，２′−Ｈα），２．６５（１Ｈ，ｍ，２′−Ｈβ），
３．５５（２Ｈ，ｍ，５′−Ｈ2 ），３．９４（１Ｈ，ｍ，４′−Ｈ），４．４
３（１Ｈ，ｍ，３′−Ｈ），４．９１（１Ｈ，ｔ，Ｊ５．３，５′−ＯＨ），５
．３７（１Ｈ，ｄ，Ｊ４．４，３′−ＯＨ），６．４６（１Ｈ，‘ｔ’，Ｊ６．
１，１′−Ｈ），８．６０（１Ｈ，ｓ，６−Ｈ），８．９５（１Ｈ，ｓ，３−Ｈ
）、及び１１．２２（１Ｈ，ｓ，ＮＨ）。
【０１４４】 実施例３ ２−（２−デオキシ−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル）−４−（
イソブチリルアミノ）−２Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン（３ａ、図４
）。化合物１（図４を参照のこと）（１．０ｇ，４．０mmol）をピリジン（２×
２５ml）との共沸留去により乾燥させた。その残渣をピリジン（２５ml）中に懸
濁し、そして室温でＭｅ3 ＳｉＣｌ（２．５ml，１９．７mmol）を加えた。１５
分撹拌の後、その溶液を無水イソ酪酸（３．２６ml，１９．９mmol）により処理
し、そして３時間室温に維持した。それを氷浴中で冷却し、Ｈ2 Ｏ（５ml）、そ
して続けて（５分後）ＮＨ3 の２５％水溶液（５ml）を加え、そして撹拌を１５
分間続けた。その溶液を留去し乾固させ、Ｈ2 Ｏ（２５ml）中に溶解し、そして
ジエチルエーテル（２×１５ml）により洗浄した。その水相を再び留去し乾固さ
せ、最初にトルエン（２×２０ml）と、次にＭｅＯＨ（２×２０ml）と共蒸発さ
せた。その残渣をＦＣ（カラム１２×２cm、溶媒（ＣＨ2 Ｃｌ2 −ＭｅＯＨ ９
：１））に適用して表題の化合物３ａを無色フォーム（ｃｏｌｏｕｒｌｅｓｓ
ｆｏａｍ）として得た（１．０５ｇ，８２％）。Ｒf （ＣＨ2 Ｃｌ2 −ＭｅＯＨ
９：１）０．２５；λmax （ＭｅＯＨ）／nm ２３９（ε／dm3 mol-1cm-1 ８
１００），２７３（８９００），３０４（６５００）；（実測：Ｃ，５２．４８
；Ｈ，６．０５；Ｎ，２１．７０．Ｃ14Ｈ19Ｎ5 Ｏ4 要求Ｃ，５２．３３；Ｈ，
５．９６；Ｎ，２１．８０％）；δH ［２５０MHz ；（ＣＤ3 ）2 ＳＯ］１．１
５（６Ｈ，ｓ，Ｍｅ2 ），２．４０（１Ｈ，ｍ，２′−Ｈα），２．６７（１Ｈ
，ｍ，２′−Ｈβ），２．９１（１Ｈ，ｈ，Ｊ６．７，ＣＨ），３．６０（２Ｈ
，ｍ，５′−Ｈ2 ），３．９３（１Ｈ，ｍ，４′−Ｈ），４．４６（１Ｈ，ｍ，
３′−Ｈ），４．９０（１Ｈ，ｔ，Ｊ４．３，５′−ＯＨ），５．３６（１Ｈ，
ｄ，Ｊ３．１，３′−ＯＨ），６．４８（１Ｈ，‘ｔ’，Ｊ５．５，１′−Ｈ）
，８．６１（１Ｈ，ｓ，６−Ｈ），９．００（１Ｈ，ｓ，３−Ｈ）、及び１１．
２０（１Ｈ，ｓ，ＮＨ）。
【０１４５】 実施例４ ２−（２−デオキシ−５−Ｏ−（４，４′−ジメトキシトリフェニルメチル）
−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル）−４−（イソブチリルアミノ）
−２Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン（４、図４を参照のこと）。イソブ
チリル保護ヌクレオシド３（図４を参照のこと）（１．０ｇ，３．１mmol）を無
水ピリジン（２×２０ml）との共沸留去の繰り返しにより乾燥させ、そして無水
ピリジン（２５ml）中に溶解した。次に４，４′−ジメトキシトリフェニルメチ
ル・クロライド（１．２２ｇ，３．６mmol）を加え、そしてその溶液を室温でア
ルゴン雰囲気下３時間撹拌した。その混合物を室温まで冷却し、ＭｅＯＨ（５ml
）を加え、そしてその混合物をさらに３０分間撹拌した。次にその溶液を半分の
容量まで減らし、ＣＨ2 Ｃｌ2 （１００ml）中に溶解し、そしてＮａＨＣＯ3 の
５％水溶液（５０ml）、続けて飽和ＮａＣｌ溶液（５０ml）により２度抽出した
。その有機層を脱水し（Ｎａ2 ＳＯ4 ）、ろ過し、留去し、そしてトルエン（３
０ml）と２度共沸留去した。その残渣をＦＣ（シリカゲル、４×１０cm、溶媒（
ＣＨ2 Ｃｌ2 −アセトン８：２））により精製して表題の化合物４を無色フォー
ムとして得た（１．４６ｇ，７５％）。（実測：Ｃ，６７．３６；Ｈ，５．９８
；Ｎ，１１．３０．Ｃ35Ｈ37Ｎ5 Ｏ6 要求Ｃ，６７．４０；Ｈ，５．９８；Ｎ，
１１．２３％）；Ｒf （ＣＨ2 Ｃｌ2 −アセトン８：２）０．３；λmax （Ｍｅ
ＯＨ）／nm ２３６（ε／dm3 mol-1cm-1 ２８５００），２７３（１１４００）
，３０５（６７００）；δH ［２５０MHz ；（ＣＤ3 ）2 ＳＯ］１．１１（６Ｈ
，ｄｄ，Ｊ６．９，Ｊ１０．４，（ＣＨ3 ）2 ），２．４３（１Ｈ，ｍ，２′−
Ｈα），２．８１（１Ｈ，ｍ，２′−Ｈβ），２．９０（１Ｈ，ｈ，Ｊ６．８，
ＣＨ），３．１４（２Ｈ，ｍ，５′−Ｈ2 ），３．６６及び３．６９（６Ｈ，２
ｓ，ＯＭｅ），４．０４（１Ｈ，ｍ，４′−Ｈ），４．５２（１Ｈ，ｍ，３′−
Ｈ），５．４２（１Ｈ，ｄ，Ｊ５．０，３′−ＯＨ），６．５４（１Ｈ，ｄｄ，
Ｊ６．４，Ｊ２．７，１′−Ｈ），６．７４（４Ｈ，ｍ，ＡｒＨ），７．１１−
７．２９（９Ｈ，ｍ，ＡｒＨ），８．６２（１Ｈ，ｓ，６−Ｈ），９．０５（１
Ｈ，ｓ，３−Ｈ）、及び１１．２２（１Ｈ，ｓ，ＮＨ）。
【０１４６】 実施例５ ２−（２−デオキシ−５−Ｏ−（４，４′−ジメトキシトリフェニルメチル）
−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル）−４−（イソブチリルアミノ）
−２Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン−３′−［（２−シアノエチル）−
Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル−ホスホルアミダイト］（２、図４を参照のこと）。無
水ＣＨ2 Ｃｌ2 （４０ml）中、化合物４（図４を参照のこと）（８００mg，１．
２８mmol）の溶液を空気によりプレ・フラッシュした。次にアルゴン雰囲気下で
（ｉ−Ｐｒ）ＥｔＮ（０．４２ml，２．４８mmol）及び２−シアノエチル・ジイ
ソプロピルクロロホスホルアミダイト（０．４２ml，１．８８mmol）を加えた。
反応をＴＬＣにより観察した。２０分間の撹拌の後、その反応混合物をＣＨ2 Ｃ
ｌ2 （４０ml）により希釈し、そしてＮａＨＣＯ3 の５％水溶液（２×２０ml）
、続いて飽和食塩水（２０ml）により洗浄した。その有機層を脱水し（Ｎａ2 Ｓ
Ｏ4 ）、留去し、そしてＣＨ2 Ｃｌ2 （２×２０ml）と共沸留去した。そのジア
ステレオマー残渣をＦＣ（シリカゲル、４×１０cm、溶媒（ＣＨ2 Ｃｌ2 −アセ
トン９：１））により精製して表題のホスホルアミダイト５（図４）を無色フォ
ームとして得た（８４０mg，７８％）。Ｒf （ＣＨ2 Ｃｌ2 −アセトン９：１）
０．５及び０．６；δP ［１０１MHz ；ＣＤＣｌ3 ］１４９．５及び１４９．７
。
【０１４７】 実施例６ 表１に示されるオリゴヌクレオチドをホスホルアミダイト化学の一般的なプロ
トコールに従い、オリゴヌクレオチドの固相合成により合成した。そのオリゴマ
ーをＨＰＬＣにより精製し、そしてそのヌクレオシド組成を逆相ＨＰＬＣ、ヘビ
毒ホスホジエステラーゼ、続いてアルカリホスファターゼによる酵素的加水分解
により決定した。前記オリゴヌクレオチドは１又は２のユニバーサル・ヌクレオ
シド１残基を含む（図４を参照のこと）。それらをハイブリダイズさせ、そして
熱変性特性を測定した。５′−ｄ（Ｔ−Ａ−Ｇ−Ｇ−Ｔ−Ｃ−Ａ−Ａ−Ｔ−Ａ−
Ｃ−Ｔ）（Ｒ１）及び３′−ｄ（Ａ−Ｔ−Ｃ−Ｃ−Ａ−Ｇ−Ｔ−Ｔ−Ａ−Ｔ−Ｇ
−Ａ）（Ｒ２）は修飾ヌクレオシドのハイブリダイゼーション特性を詳細に詰め
るためにこれらの研究に一般的に使用される標準オリゴヌクレオチドである（F.
Seela, I. Muenster, U. Loechner, H. Rosemeyer, Helv. Chim. Acta (1998),
Vol 81, p 1139-1155）。前記配列はヘアピン又は三本鎖のような他の構造を排
除できるように設計されている。４の天然ヌクレオシドｄＡ、ｄＣ、ｄＧ、及び
ｄＴのそれぞれに向かい合った１又は２の８−アザ−７−デアザ−Ｎ8 −２′−
デオキシアデノシン（Ａ* ）残基を含むオリゴヌクレオチドについてのＴｍ値を
（F. Seela, C. Wei, Helv. Chim. Acta (1999), Vol 82, p.726-745）の記載に
従って計測した。その結果を表１に示す。
【０１４８】
【表１】
【０１４９】
【表２】
【０１５０】 表１によれば、４の天然ヌクレオシドｄＡ、ｄＣ、ｄＧ、及びｄＴのそれぞれ
に向かい合う、オリゴマーＲ１及びＲ２の中心部分への１のユニバーサル・ヌク
レオシドの挿入（図４を参照のこと）は、Ｔｍ値のごくわずかな変化しか示さな
かった。４の非修飾ヌクレオシドのそれぞれに対する第１の修飾オリゴヌクレオ
チド（８９）の間のメルティング・ポイントの違いは０℃〜３℃である。同様の
特徴が、２のユニバーサルヌクレオシド残基を４の通常ＤＮＡの構築物と向かい
合わせて組み込んだ時に観察される。このような結果は全く考えられもしなかっ
た。可能性のある二本鎖構造（図５）の最近の研究は、ｄＧ−ｄＣ対のように３
箇所ではなく、ｄＡ−ｄＴ対の２箇所であるところの２箇所の水素結合を全てが
含む塩基対が形成されるであろうことを示した。糖付着部位の間隔は、ピリミジ
ン塩基（ｄＣ又はｄＴ）が通常のグリコシル化部位を提示し、そして「プリン・
ベースの」塩基のグリコシリル化部位が８位である場合、ほぼ同一である。
【０１５１】 実施例７ ７−デアザ−グアノシン−Ｃ8 −２′−デオキシ−β−Ｄ−リボフラノシドの
ホスホルアミダイトの合成を以下に説明する（図６も参照のこと）。
【０１５２】 ２−イソブチリルアミノ−６−（β−Ｄ−リボフラノシル）−７Ｈ−ピロロ［
２，３−ｄ］ピリミジン−４（３Ｈ）−オン（５、図６）。化合物２ａ（２−ア
ミノ−６−β−Ｄ−リボフラノシル）−７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン
−４（３Ｈ）−オン、Girgis et al., J. Med. Chem., Vol.33, p.2750-2755, 1
990)（５２０mg，１．８４mmol）をピリジン（２×１０ml）との共沸留去により
乾燥させた。その残渣をピリジン（５ml）中に溶解し、そして室温でＭｅ3 Ｓｉ
Ｃｌ（３．０ml，２３．６mmol）を加えた。１５分間の撹拌の後、その溶液を無
水イソ酪酸（０．４ml，３．８２mmol）により処理し、そして６時間室温に維持
した。その溶液を氷浴中で冷却し、Ｈ2 Ｏ（３ml）、そして続けて（５分後に）
ＮＨ3 の２５％水溶液（３ml）を加え、その間１５分間撹拌を続けた。その溶液
を留去し乾固させ、Ｈ2 Ｏ（２０ml）中に溶解し、そしてエーテル（２×１０ml
）により洗浄した。その水層を再び留去し乾固させ、そして最初にトルエン（２
×１０ml）と、次にＭｅＯＨ（２×１０ml）と共沸留去した。その残渣をＦＣ（
カラム１０×２cm、ＣＨ2 Ｃｌ2 −ＭｅＯＨ ８：２，ｖ／ｖ）に適用して表題
の化合物５（図６）を黄白色粉末として得た（４７０mg，７２％）。Ｒf （ＣＨ2 Ｃｌ2 −ＭｅＯＨ ８：２，ｖ／ｖ）０．３；λmax （ＭｅＯＨ）／nm ２７
５（ε／dm3 mol-1cm-1 １６６００），２９４（１５０００sh）；（実測：Ｃ，
５１．２３；Ｈ，５．８２；Ｎ，１５．９５．Ｃ15Ｈ20Ｎ4 Ｏ6 要求Ｃ，５１．
１３；Ｈ，５．７２；Ｎ，１５．９０％）；δH ［２５０MHz ；ｄ6 −ＤＭＳＯ
］１．１１（６Ｈ，ｄ，Ｊ６．８，Ｍｅ2 ），２．７６（１Ｈ，ｈ，Ｊ６．８，
ＣＨ），３．５１（１Ｈ，ｍ，５′−Ｈ），３．５７（１Ｈ，ｍ，５″−Ｈ），
３．７８（１Ｈ，ｍ，４′−Ｈ），３．９７（２Ｈ，ｍ，２′−Ｈ，３′−Ｈ）
，４．６２（１Ｈ，ｄ，Ｊ６．３，１′−Ｈ），４．９１（１Ｈ，ｄ，Ｊ４．６
，３′−ＯＨ），４．９２（１Ｈ，ｔ，Ｊ５．８，５′−ＯＨ），５．０６（１
Ｈ，ｄ，Ｊ５．８，２′−ＯＨ），６．３９（１Ｈ，ｄ，Ｊ１．４，５−Ｈ），
１１．３４（１Ｈ，ｓ，ＮＨ），１１．６０（１Ｈ，ｓ，ＮＨ）、及び１１．７
８（１Ｈ，ｓ，ＮＨ）。
【０１５３】 ２−イソブチリルアミノ−［３，５−（１，１，３，３−テトライソプロピル
−１，３−ジシロキサン−１，３−イル）−６−β−Ｄ−リボフラノシル］−７
Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−４（３Ｈ）−オン（６）。無水ピリジン
（６ml）中、化合物２（５００mg，１．４２mmol）の溶液に、アルゴン雰囲気下
、１，３−ジクロロ−１，１，３，３−テトライソプロピルジシロキサン（０．
５５ml，１．７１mmol）を加えた。この反応混合物を室温で一晩撹拌し、そして
ＮａＨＣＯ3 ５％水溶液（２５ml）、続いて飽和ＮａＣｌ水溶液（２５ml）によ
り２度抽出した。その有機層を脱水（Ｎａ2 ＳＯ4 ）し、ろ過し、留去し、そし
てトルエン（２０ml）と２度共沸留去した。その残渣をＦＣ（シリカゲル、４×
１０cm、ＣＨ2 Ｃｌ2 −ＭｅＯＨ ９５：５，ｖ／ｖ）により精製して表題の化
合物６（図６）を無色のフォームとして得た（４８５mg，５８％）。Ｒf （ＣＨ2 Ｃｌ2 −ＭｅＯＨ ９５：５）０．５；λmax （ＭｅＯＨ）／nm ２７５（ε
／dm3 mol-1cm-1 １７２００），２９３（１５７００sh）；（実測：Ｃ，５４．
５１；Ｈ，７．８８；Ｎ，９．５１．Ｃ27Ｈ46Ｎ4 Ｏ7 Ｓｉ2 要求Ｃ，５４．５
２；Ｈ，７．７９；Ｎ，９．４２％）；δH ［２５０MHz ；ｄ6 −ＤＭＳＯ］０
．８９−１．０４（２８Ｈ，ｍ，（ＣＨＭｅ2 ）4 ），１．１２（６Ｈ，ｄ，Ｊ
６．７，Ｍｅ2 ），２．７７（１Ｈ，ｈ，Ｊ６．７，ＣＨ），３．８７（１Ｈ，
ｍ，５″−Ｈ），３．９１（１Ｈ，ｍ，５′−Ｈ），３．９４（１Ｈ，ｍ，４′
−Ｈ），４．１５（１Ｈ，ｄ‘ｔ’，Ｊ５．０，Ｊ３．５，２′−Ｈ），４．２
４（１Ｈ，ｄｄ，Ｊ６．０，Ｊ６．７，３′−Ｈ），４．７１（１Ｈ，ｄ，Ｊ３
．０，１′−Ｈ），５．０３（１Ｈ，ｄ，Ｊ５．３，２′−ＯＨ），６．３５（
１Ｈ，ｓ，５−Ｈ），１１．３４（１Ｈ，ｂｒ．ｓ，ＮＨ），１１．６７（１Ｈ
，ｓ，ＮＨ）、及び１１．７４（１Ｈ，ｂｒ．ｓ，ＮＨ）。
【０１５４】 ２−イソブチリルアミノ−［２−Ｏ−フェノキシチオカルボニル−３，５−（
１，１，３，３−テトライソプロピル−１，３−ジシロキサン−１，３−イル）
−６−β−Ｄ−リボフラノシル］−７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−４
（３Ｈ）−オン（７ａ）。無水アセトニトリル（６５ml）中、化合物６（図６）
（１．７１ｇ，２．８８mmol）及び４−ジメチルアミノピリジン（２．１ｇ；１
７．２mmol）の懸濁液にアルゴン雰囲気下、フェニルクロロチオンホルメイト（
０．４８ml，３．４８mmol）を加えた。その反応混合物を室温で一晩撹拌した後
、それを留去し乾固させ、そしてＣＨ2 Ｃｌ2 （５０ml）により溶解した。その
有機相を１Ｎ冷塩酸（２０ml）、水（２０ml）、及びＮａＨＣＯ3 の飽和水溶液
（２０ml）により２度洗浄した。その有機層を脱水し（ＮａＳＯ4 ）、そして溶
媒を留去し乾固させた。２つの主な成分の混合物であるその残渣をＦＣ（シリカ
ゲル、４×１０cm、ＣＨ2 Ｃｌ2 −アセトン ９：１，ｖ／ｖ）により精製した
。移動の遅い主要産物を無色フォームとして得、そして表題の化合物７ａ（図６
）と特徴づけた（１．０ｇ，４８％）。Ｒf （ＣＨ2 Ｃｌ2 −アセトン９：１）
０．６；λmax （ＭｅＯＨ）／nm ２７４（ε／dm3 mol-1cm-1 １８０００），
２９４（１６２００sh）；（実測：Ｃ，５６．００；Ｈ，６．８２；Ｎ，７．６
０．Ｃ34Ｈ50Ｎ4 Ｏ8 ＳＳｉ2 要求Ｃ，５５．８６；Ｈ，６．８９；Ｎ，７．６
６％）；δH ［２５０MHz ；ｄ6 −ＤＭＳＯ］０．９５−１．０３（２８Ｈ，ｍ
，（ＣＨＭｅ2 ）4 ），１．１１（６Ｈ，ｄ，Ｊ６．９，Ｍｅ2 ），２．７７（
１Ｈ，ｈ，Ｊ６．９，ＣＨ），３．９０（１Ｈ，ｍ，５″−Ｈ），４．００（２
Ｈ，ｍ，５′−Ｈ，４′−Ｈ），４．６６（１Ｈ，ｄ‘ｔ’，Ｊ６．４，３′−
Ｈ），５．１４（１Ｈ，ｄ，Ｊ２．８，１′−Ｈ），５．９０（１Ｈ，‘ｔ’，
Ｊ４．２，１′−Ｈ），７．１２（２Ｈ，ｄ，Ｊ７．９，ａｒｏｍ．Ｈ），７．
３３（１Ｈ，ｔ，Ｊ７．２，ａｒｏｍ．Ｈ），７．４８（２Ｈ，ｔ，Ｊ７．５，
ａｒｏｍ．Ｈ），１１．３６（１Ｈ，ｓ，ＮＨ），１１．８１（１Ｈ，ｓ，ＮＨ
）、及び１１．８７（１Ｈ，ｓ，ＮＨ）。
【０１５５】 ２−イソブチリルアミノ−７−フェノキシチオカルボニル［２−Ｏ−フェノキ
シチオカルボニル−３，５−（１，１，３，３−テトライソプロピル−１，３−
ジシロキサン−１，３−イル）−６−β−Ｄ−リボフラノシル］−７Ｈ−ピロロ
［２，３−ｄ］ピリミジン−４（３Ｈ）−オン（７ｂ、図６）。前記合成手順の
速く移動する副産物を黄色粉末として得（２５０mg，１０％）、そして化合物７
ｂと特徴づけした。Ｒf （ＣＨ2 Ｃｌ2 −アセトン９：１）０．８；λmax （Ｍ
ｅＯＨ）／nm ２７２（ε／dm3 mol-1cm-1 ２０９００），２９５（１５６００
sh）；（実測：Ｃ，５６．８９；Ｈ，６．１６；Ｎ，６．４１．Ｃ41Ｈ54Ｎ4 Ｏ9 Ｓ2 Ｓｉ2 要求Ｃ，５６．７９；Ｈ，６．２８；Ｎ，６．４６％）；δH ［２
５０MHz ；ｄ6 −ＤＭＳＯ］０．９７−１．０８（２８Ｈ，ｍ，（ＣＨＭｅ2 ）4 ），１．１３（６Ｈ，ｄ，Ｊ６．４，Ｍｅ2 ），２．８５（１Ｈ，ｄ，Ｊ６．
８，ＣＨ），３．９３（１Ｈ，ｄ，Ｊ８．９，４′−Ｈ），４．０１（１Ｈ，ｄ
，Ｊ１２．１，５′−Ｈ），４．２０（１Ｈ，ｄ，Ｊ１２．７，５″−Ｈ），４
．６５（１Ｈ，ｄｄ，Ｊ８．９，Ｊ４．５，３′−Ｈ），５．７８（１Ｈ，ｓ，
１′−Ｈ），６．１４（１Ｈ，ｄ，Ｊ４．５，２′−Ｈ），６．７２（２Ｈ，ｄ
，Ｊ７．６，ａｒｏｍ．Ｈ），６．８８（１Ｈ，ｓ，５−Ｈ），７．２９（１Ｈ
，ｔ，Ｊ７．３，ａｒｏｍ．Ｈ），７．３８（２Ｈ，ｄ，Ｊ８．３，ａｒｏｍ．
Ｈ），７．４１（２Ｈ，ｔ，Ｊ８．０，ａｒｏｍ．Ｈ），７．４５（１Ｈ，ｔ，
Ｊ８．３，ａｒｏｍ．Ｈ），７．５７（２Ｈ，ｔ，Ｊ７．６，ａｒｏｍ．Ｈ），
１１．４４（１Ｈ，ｂｒ．ｓ，ＮＨ）、及び１２．１８（１Ｈ，ｂｒ．ｓ，ＮＨ
）。
【０１５６】 ２−イソブチリルアミノ−［３，５−（１，１，３，３−テトライソプロピル
−１，３−ジシロキサン−１，３−イル）−６−（２−デオキシ−β−Ｄ−ｅｒ
ｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル］−７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−４
（３Ｈ）−オン（８）。無水トルエン（６０ml）中、化合物７ａ（１．０６ｇ，
１．４５mmol）の溶液にアルゴン雰囲気下、２，２′−アゾビス（２−メチルプ
ロピオニトリル）（ＡＩＢＮ，１２０mg，０．７３mmol）及び水素化トリ−ｎ−
ブチルチン（ｔｒｉ−ｎ−ｂｕｔｙｌｔｉｎ ｈｙｄｒｉｄｅ）（３．８ml，１
４．１mmol）を加えた。前記反応フラスコを予熱した油浴（７０℃）中に置いた
。２時間後、その混合物を室温まで冷却し、そして溶媒を留去した。油性残渣を
ＦＣ（シリカゲル、４×１０cm、ＣＨ2 Ｃｌ2 −ＭｅＯＨ ９５：５，ｖ／ｖ）
に適用して表題の化合物８（図６）を無色フォームとして得た（７５５mg，９０
％）。Ｒf （ＣＨ2 Ｃｌ2 −ＭｅＯＨ）０．４；λmax （ＭｅＯＨ）／nm ２７
４（ε／dm3 mol-1cm-1 １７２００），２９３（１５５００）；（実測：Ｃ，５
６．２１；Ｈ，８．１５；Ｎ，９．６３．Ｃ27Ｈ46Ｎ4 Ｏ6 Ｓｉ2 要求Ｃ，５６
．０２；Ｈ，８．０１；Ｎ，９．６３％）；δH ［２５０MHz ；ｄ6 −ＤＭＳＯ
］０．９９−１．０２（２８Ｈ，ｍ，（ＣＨＭｅ2 ）4 ），１．１１（６Ｈ，ｄ
，Ｊ６．６，Ｍｅ2 ），２．１８（１Ｈ，ｍ，２′−Ｈα），２．４１（１Ｈ，
ｍ，２′−Ｈβ），２．７６（１Ｈ，ｈ，Ｊ６．５，ＣＨ），３．７５（２Ｈ，
ｍ，５′−Ｈ2 ），３．９５（１Ｈ，ｍ，４′−Ｈ），４．５１（１Ｈ，ｍ，３
′−Ｈ），５．０２（１Ｈ，ｔ，Ｊ７．２，１′−Ｈ），６．３７（１Ｈ，ｓ，
５−Ｈ），１１．３６（１Ｈ，ｂｒ．ｓ，ＮＨ），１１．７０（１Ｈ，ｂｒ．ｓ
，ＮＨ）、及び１１．７７（１Ｈ，ｓ，ＮＨ）。
【０１５７】 ２−イソブチリルアミノ−６−（２−デオキシ−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペ
ントフラノシル）−７Ｈ−ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−４（３Ｈ）−オン
（９、図６）。ＴＨＦ（１０ml）中、化合物８（８６５ｇ，１．５０mmol）の溶
液にＴＨＦ中、フッ化テトラブチルアンモニウムの１Ｎ溶液（８ml，８mmol）を
加えた。その混合物を室温で３時間撹拌し、そして溶媒を留去した。その残渣を
ＦＣ（シリカゲル、４×１０cm、ＣＨ2 Ｃｌ2 −ＭｅＯＨ ９：１，ｖ／ｖ）に
適用して表題の化合物９を無色の粉末として得た（４１０mg，８２％）。Ｒf （
ＣＨ2 Ｃｌ2 −ＭｅＯＨ ９：１）０．２５；λmax （ＭｅＯＨ）／nm ２７２
（ε／dm3 mol-1cm-1 １５９００），２９１（１４２００）；（実測：Ｃ，５３
．５４；Ｈ，５．９４；Ｎ，１６．６３．Ｃ15Ｈ20Ｎ4 Ｏ5 要求Ｃ，５３．５７
；Ｈ，５．９９；Ｎ，１６．６６％）；δH ［２５０MHz ；ｄ6 −ＤＭＳＯ］１
．１１（６Ｈ，ｄ，Ｊ６．９，Ｍｅ2 ），２．０１（１Ｈ，ｍ，２′−Ｈα），
２．１１（１Ｈ，ｍ，２′−Ｈβ），２．７６（１Ｈ，ｈ，Ｊ７．０，ＣＨ），
３．４５（２Ｈ，ｍ，５′−Ｈ2 ），３．７４（１Ｈ，ｍ，４′−Ｈ），４．２
０（１Ｈ，ｍ，３′−Ｈ），４．７９（１Ｈ，ｔ，Ｊ４．２，５′−ＯＨ），５
．０２（１Ｈ，ｄｄ，Ｊ１０．１，Ｊ５．７，１′−Ｈ），５．０８（１Ｈ，ｄ
，Ｊ３．５，３′−ＯＨ），６．３５（１Ｈ，ｓ，５−Ｈ），１１．３３（１Ｈ
，ｂｒ．ｓ，ＮＨ），１１．６３（１Ｈ，ｂｒ．ｓ，ＮＨ）、及び１１．７６（
１Ｈ，ｓ，ＮＨ）。
【０１５８】 ２−イソブチリルアミノ−６−［２−デオキシ−５−Ｏ−（４，４′−ジメト
キシトリチル）−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル］−７Ｈ−ピロロ
［２，３−ｄ］ピリミジン−４（３Ｈ）−オン（１０、図６）。化合物９（３５
０mg，１．０４mmol）を無水ピリジン（２×１０ml）との繰り返しの共沸留去に
より乾燥し、そして無水ピリジン（１５ml）中に溶解した。次に４，４′−ジメ
トキシトリフェニルメチル・クロライド（４０７mg，１．２mmol）を加え、そし
てその溶液を室温でアルゴン雰囲気下、３時間撹拌した。その混合物を室温まで
冷却し、ＭｅＯＨ（３ml）を加え、そしてその混合物をさらに３０分間撹拌した
。次にその溶液を半分の容量まで減少させ、ＣＨ2 Ｃｌ2 （５０ml）により抽出
し、そしてＮａＨＣＯ3 の５％水溶液（２５ml，２回）により、続けて飽和Ｎａ
Ｃｌ溶液（２５ml）により洗浄した。その有機層を乾燥し（Ｎａ2 ＳＯ4 ）、ろ
過し、留去し、そしてトルエン（２０ml）と共沸留去した。その残渣をＦＣ（シ
リカゲル、４×１０cm、ＣＨ2 Ｃｌ2 −ＭｅＯＨ ９：１，ｖ／ｖ）により精製
して表題の化合物１０を無色フォームとして得た（４８０mg，７４％）。Ｒf （
ＣＨ2 Ｃｌ2 −ＭｅＯＨ ９５：５，ｖ／ｖ）０．２；λmax （ＭｅＯＨ）／nm
２７２（ε／dm3 mol-1cm-1 １５７００），２９４（１３２００）；（実測：
Ｃ，６７．７０；Ｈ，６．０４；Ｎ，８．７２．Ｃ36Ｈ28Ｎ4 Ｏ7 要求Ｃ，６７
．７０；Ｈ，６．００；Ｎ，８．７７％）；δH ［２５０MHz ；ｄ6 −ＤＭＳＯ
］１．１１（６Ｈ，ｄ，Ｊ６．６，Ｍｅ2 ），２．１０（１Ｈ，ｍ，２′−Ｈα ），２．１８（１Ｈ，ｍ，２′−Ｈβ），２．７６（１Ｈ，ｈ，Ｊ６．６，ＣＨ
），３．０２（２Ｈ，ｍ，５′−Ｈ2 ），３．７２（６Ｈ，ｓ，Ｍｅ2 ），３．
９１（１Ｈ，ｍ，４′−Ｈ），４．１６（１Ｈ，ｍ，３′−Ｈ），５．１０（１
Ｈ，ｄｄ，Ｊ９．０，Ｊ６．４，１′−Ｈ），５．１６（１Ｈ，ｄ，Ｊ３．５，
３′−ＯＨ），６．３６（１Ｈ，ｓ，５−Ｈ），６．８２−６．８７（４Ｈ，ｍ
，ａｒｏｍ．Ｈ），７．１７−７．３９（９Ｈ，ｍ，ａｒｏｍ．Ｈ），１１．３
８（１Ｈ，ｂｒ．ｓ，ＮＨ），１１．７７（１Ｈ，ｂｒ．ｓ，ＮＨ）、及び１１
．７９（１Ｈ，ｓ，ＮＨ）。
【０１５９】 ２−イソブチリルアミノ−６−［２−デオキシ−５−Ｏ−（４，４′−ジメト
キシトリチル）−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル］−７Ｈ−ピロロ
［２，３−ｄ］ピリミジン−４（３Ｈ）−オン３′−（２−シアノエチル−Ｎ，
Ｎ−ジイソプロピルホスホルアミダイト（４）。無水ＣＨ2 Ｃｌ2 （３０ml）中
、化合物１０（５３０mg，０．８３mmol）の溶液をアルゴンによりプレ・フラッ
シュした。次に（ｉ−Ｐｒ）2 ＥｔＮ（０．２７ml，１．５９mmol）及び２−シ
アノエチル・ジイソプロピルクロロホスホルアミダイト（０．２７ml，１．２１
mmol）をアルゴン下で加えた。その反応をＴＬＣにより観察した。２０分間の撹
拌の後、その反応混合物をＣＨ2 Ｃｌ2 （３０ml）により希釈し、そしてＮａＨ
ＣＯ3 の５％水溶液（２×１５ml）、続いて飽和食塩水（１５ml）により洗浄し
た。その有機層を乾燥し（Ｎａ2 ＳＯ4 ）、留去し、そしてＣＨ2 Ｃｌ2 （２×
２０ml）と共沸留去した。その残渣をＦＣ（シリカゲル、４×１０cm、ＣＨ2 Ｃ
ｌ2 −アセトン８：２，ｖ／ｖ）により精製して表題の化合物４を無色フォーム
として得た（５４０mg，７８％）。Ｒf （ＣＨ2 Ｃｌ2 −アセトン９：１，ｖ／
ｖ）０．７，０．７５；δH ［１０１MHz ；ＣＤＣｌ3 ］１４８．８及び１５０
．９。
【０１６０】
【表３】
【０１６１】 実施例８ アミノ官能基の前駆物質としてメトキシ基を伴うホスホルアミダイト（４、図
１０）の合成。
【０１６２】 結果 ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン１ａ及び２ａ（図８)（F. Seela, H. Stek
er, Helv. Chim. Acta 1985, 68, 563-570）のメトキシ基はオリゴヌクレオチド
のレベルでアミノ官能基に容易に変換される。よって、メトキシ・ホスホルアミ
ダイト４（図１０）は固相オリゴヌクレオチド合成によりＤＮＡ内に１ｂ又は２
ａ（図８）を組み込むための前駆物質として使用される。メトキシ基の変換はア
ンモニアによるオリゴヌクレオチドの脱保護の間に起こる。メトキシ−アミノ変
換の半減期値を、４０℃でアンモニアの２５％水溶液によりＵＶ分光光度法で測
定した。その半減期値については表３及び図９を参照のこと。次に４，４′−ジ
メトキシトリフェニルメチル基を５′−ＯＨの位置に導入し、そして化合物３（
図１０）を標準的なプロトコールを用いてβ−シアノエチル・ホスホルアミダイ
ト４（図１０）に変換した（図１０）。ホスホルアミダイト４（図１０）のカッ
プリング産生は少なくとも９９％になるまで見られた。
【０１６３】
【表４】
【０１６４】 試作品 ２−［２−デオキシ−５−Ｏ−（４，４′−ジメトキシトリフェニルメチル）
−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル］−４−メトキシ−２Ｈ−ピラゾ
ロ［３，４−ｄ］ピリミジン（３、図１０）。化合物１ａ（図１０，４１０mg，
１．５４mmol）を無水ピリジン（２×１０ml）との共沸留去の繰り返しにより乾
燥させ、そして無水ピリジン（１０ml）中に溶解した。次に４，４′−ジメトキ
シトリフェニルメチル・クロライド（６２０mg，１．８３mmol）を加え、そして
その溶液をアルゴン下、室温で３時間撹拌した。次に、ＭｅＯＨ（２ml）を加え
、そしてその混合物をさらに３０分間撹拌した。次に、その溶液を半分の容量ま
で減少させ、ＣＨ2 Ｃｌ2 （５０ml）中に溶解し、そしてＮａＨＣＯ3 の５％水
溶液（２０ml）、続いて飽和食塩水（２０ml）により２度抽出した。その有機層
を乾燥させ（Ｎａ2 ＳＯ4 ）、ろ過し、留去し、そしてトルエン（２０ml）と２
度共沸留去した。その残渣をＦＣ（シリカゲル、３×１０cm、溶媒ＣＨ2 Ｃｌ2
−アセトン８：２）により精製した。化合物３を無色フォームとして得た（６８
０mg，７８％）。ＴＬＣ（ＣＨ2 Ｃｌ2 −アセトン８：２，ｖ／ｖ）：０．５；
ＵＶ（ＭｅＯＨ）：２３５（２７８００），２７３（１２１００），３０４（７
３００）； 1Ｈ−ＮＭＲ（ｄ6 −ＤＭＳＯ）：２．４４（１Ｈ，ｍ，２′−Ｈα ），２．７５（１Ｈ，ｍ，２′−Ｈβ），３．１６（２Ｈ，ｍ，５′−Ｈ2 ），
３．６９（３Ｈ，ｓ，Ｍｅ），３．７０（３Ｈ，ｓ，Ｍｅ），４．０５（４Ｈ，
ｍ，Ｍｅ，４′−Ｈ），４．５２（１Ｈ，ｍ，３′−Ｈ），５．４３（１Ｈ，ｄ
，Ｊ＝５．０Ｈｚ，３′−ＯＨ），６．４２（１Ｈ，ｄｄ，Ｊ＝６．８Ｈｚ，Ｊ
＝３．３Ｈｚ，１′−Ｈ），６．７４−６．８１（４Ｈ，ｍ，ａｒｏｍ．Ｈ），
７．１７−７．３２（９Ｈ，ｍ，ａｒｏｍ．Ｈ），８．５６（１Ｈ，ｓ，３−Ｈ
），８．７９（１Ｈ，ｓ，６−Ｈ）．Ｃ32Ｈ32Ｎ4 Ｏ6 （５６８．６２）に関す
る分析計算：Ｃ，６７．５９；Ｈ，５．６７；Ｎ，９．８５．実測：Ｃ，６７．
３９；Ｈ，５．５８；Ｎ，９．７６。
【０１６５】 ２−［２−デオキシ−５−Ｏ−（４，４′−ジメトキシトリフェニルメチル）
−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル］−４−メトキシ−２Ｈ−ピラゾ
ロ［３，４−ｄ］ピリミジン−３′−［（２−シアノエチル）−Ｎ，Ｎ−ジイソ
プロピル−ホスホルアミダイト］（４、図１０）。無水ＣＨ2 Ｃｌ2 （３０ml）
中、化合物３（図１０、５１０mg，０．９０mmol）の撹拌溶液をアルゴンにより
プレ・フラッシュした。次に、（ｉ−Ｐｒ）2 ＥｔＮ（０．３０ml，１．７２mm
ol）及び２−シアノエチル・ジイソプロピルクロロホスホルアミダイト（０．３
０ml，１．３４mmol）をアルゴン下で加えた。その反応をＴＬＣにより観察した
。２０分間の撹拌の後、その反応混合物をＣＨ2 Ｃｌ2 （３０ml）により希釈し
、そしてＮａＨＣＯ3 の５％水溶液（２×２０ml）、続いて飽和食塩水（２０ml
）により洗浄した。その有機層を乾燥させ（Ｎａ2 ＳＯ4 ）、留去し、そしてＣ
Ｈ2 Ｃｌ2 （２×２０ml）と共沸留去した。その残渣をＦＣ（シリカゲル、３×
１０cm、溶媒ＣＨ2 Ｃｌ2 −アセトン９：１）により精製して表題の化合物４を
無色フォームとして得た（６００mg，８７％）。ＴＬＣ（ＣＨ2 Ｃｌ2 −アセト
ン９：１，ｖ／ｖ）：０．６，０．７；31Ｐ−ＮＭＲ（ＣＤＣｌ3 ）：１５０．
２，１５０．５．Ｃ41Ｈ49Ｎ6 Ｏ7 Ｐ（７６８．８４）に関する分析計算：Ｃ，
６４．０５；Ｈ，６．４２；Ｎ，１０．９３．実測：Ｃ，６４．１９；Ｈ，６．
４２； 実施例９ ４−（アミノ）−２−（２−デオキシ−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラ
ノシル）−２Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン５′一リン酸の合成 ４０mg（０．１６mmol）の４−（アミノ）−２−（２−デオキシ−β−Ｄ−ｅ
ｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル）−２Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン
を４mlのリン酸トリエチル中に溶解し、そして８７μｌのジイソプロピル・エチ
ル・アミンを加えた。そのフラスコを氷浴中で０〜４℃まで冷却し、１２μｌの
ホスホルオキシクロライドを加えた。０〜４℃で１０分間撹拌の後、トリエチル
アミン／酢酸バッファー０．１Ｍ，pH８．５を加えた。溶媒をロータリー・エバ
ポレーターを用いて４０℃、０．１mbarで留去した。その残渣を２０mlの水の中
に溶解し、そしてイオン交換体ＤＥＡＥセファデックスＡ２５Ｃｌ- を充填した
カラム（ｄ＝１６mm，ｌ＝１５０mm）に適用した。バッファーＡは水、バッファ
ーＢは０．５Ｍ ＬｉＣｌ、６０分で１００％Ｂまでのグラジエント、２７０nm
でＵＶ／ＶＩＳ検出器により観察。前記産物を４０％のＢで溶出した。対応の画
分を採集し、そして減圧下で１〜３mlの容量まで留去した。産物溶液を８０mlの
アセトン／エタノールの２：１混合物に加えた。その懸濁液を遠心分離し、得ら
れたペレットをアセトンにより３回洗浄してＬｉＣｌを除去し、次に高真空中で
乾燥させた。収量：３０mg。31Ｐ ＮＭＲ（Ｂｒｕｋｅｒ ＤＰＸ３００、溶媒
Ｄ2 Ｏ）（ppm ）：５．０４３（ｓ）。
【０１６６】 実施例１０ ４−（アミノ）−２−（２−デオキシ−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラ
ノシル）−２Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン５′三リン酸の合成 ３０mg（０．１１mmol）の一リン酸リチウム塩をＤｏｗｅｘ ＷＸ８カラムを
用いたイオン交換によりトリＮ−ブチルアンモニウム塩に変換した。そのトリＮ
−ブチルアンモニウム塩を３mlの無水ＤＭＦ中に溶解した。８９mg（０．５５mm
ol）カルボニルジイミダゾールを加えた混合物を室温で２時間撹拌した。０．５
mlのメタノールを加え、そしてその混合物を室温で２０分間撹拌した。メタノー
ルを減圧下の留去により除去した。次にＤＭＦ（０．５５mmol）中、ピロリン酸
ビストリブチルアンモニウムの０．８Ｍ溶液０．７mlを加えた。その混合物を室
温で一晩撹拌した。溶媒をロータリー・エバポレーターを用いることにより４０
℃、０．１mbarで留去した。脱塩のために、その混合物を酢酸を用いてpH３まで
酸性化し、Ｃａｒｂｏｒａｆｆｉｎ−Ｐを充填したカラム（ｄ＝１４mm，ｌ＝１
３０mm）に適用した。それを２００mlの水により、次に２００ml希釈アンモニア
（１０００mlの水＋６mlのｋｏｎｚアンモニア）により溶出した。前記三リン酸
塩を含むアンモニア溶液を減圧下で留去した。
【０１６７】 さらに精製するために、未処理の産物を１０．０ml中に溶解し、そしてイオン
交換体ＱＡＥセファデックスＡ２５Ｃｌ- を充填したカラム（ｄ＝１６mm，ｌ＝
１５０mm）に適用した。バッファーＡは水、バッファーＢは０．５Ｍ ＬｉＣｌ
、２０分間０％Ｂ、次に６０分で１００％Ｂまでのグラジエント、２６０nmでＵ
Ｖ／ＶＩＳ検出器により観察。産物を４９％Ｂで溶出した。対応の画分を採集し
、そして２mlの容量まで減圧下で留去した。産物溶液を８０mlのアセトン／エタ
ノールの２：１混合物に加えた。その懸濁液を遠心分離し、得られたペレットを
アセトンにより３回洗浄してＬｉＣｌを除去し、次に高真空中で乾燥した。収量
：１０mg。31Ｐ ＮＭＲ（Ｂｒｕｋｅｒ ＤＰＸ３００、溶媒Ｄ2 Ｏ［ppm ］：
−３．９１（ｄ）；−９．４７（ｄ）；−１９．２７（ｔ）。
【０１６８】 実施例１１ ２−［２−デオキシ−５−Ｏ−（４，４′−ジメトキシトリフェニルメチル）
−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル］−４−（イソブチリルアミノ）
−２Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジン３′−（３−カルボキシプロパノア
ート）（２、図１１）の合成及び固相結合 無水１，２−ジクロロエタン（１．５ml）中、化合物１（図１１）（３５０mg
，０．５６mmol）の溶液に４−（Ｎ，Ｎ−ジメチルアミノ）ピリジン（３５mg，
０．２８mmol）、無水コハク酸（４０mg，０．５３mmol）、及びＥｔ3 Ｎ（７８
μｌ，０．５６mmol）を加えた。その混合物を５０℃で３０分間撹拌した。次に
その溶液を１，２−ジクロロエタン（２０ml）により希釈し、そして氷冷クエン
酸溶液（３×１０ml）及びＨ2 Ｏ（３×１０ml）により洗浄した。有機層をＮａ2 ＳＯ4 により乾燥し、ろ過し、留去し、そしてその残渣をＦＣ（シリカゲル、
１５×３cm、アセトニトリル−Ｈ2 Ｏ ９：１）に供した。その主要な帯域を化
合物２の無色粉末として得た（３５２mg，０．４８mmol，８５％）。ＴＬＣ（ア
セトニトリル−Ｈ2 Ｏ ９：１）：０．８；ＵＶ（ＭｅＯＨ）：２３７（２８５
００），２７３（１１５００），３０５（６６００）； 1Ｈ−ＮＭＲ（ｄ6 −Ｄ
ＭＳＯ）：１．１２（６Ｈ，‘ｔ’，Ｊ＝７．４，（ＣＨ3 ）2 ），２．８８（
１Ｈ，ｍ，ＣＨ），２．９５（１Ｈ，ｍ，２′−Ｈβ），３．２１（２Ｈ，ｍ，
５′−Ｈ2 ），３．６８（６Ｈ，ｓ，ＣＨ3 ），４．２５（１Ｈ，ｍ，４′−Ｈ
），５．４０（１Ｈ，ｍ，３′−Ｈ），６．６１（１Ｈ，‘ｔ’，Ｊ＝５．４，
１′−Ｈ），６．７３（４Ｈ，ｍ，ＡｒＨ），７．１３−７．２８（９Ｈ，ｍ，
ＡｒＨ），８．６２（１Ｈ，ｓ，６−Ｈ），９．０７（１Ｈ，ｓ，３−Ｈ），１
１．２６（１Ｈ，ｂｒ．ｓ，ＮＨ），１２．３２（１Ｈ，ｂｒ．ｓ，ＣＯ2 Ｈ）
．Ｃ39Ｈ41Ｎ5 Ｏ9 （７２３．７７）に関する分析計算：Ｃ，６４．７２；Ｈ，
５．７１；Ｎ，９．６８．実測：Ｃ，６４．６９；Ｈ，５．７６；Ｎ，９．６２
。
【０１６９】 前記化合物２をF. Seela, H. Debelak, N. Usman, A. Burgin, L. Beigelman,
Nucleic Acids Res. 1998, Vol.26, page 1010-1018に記載のプロトコールを用
いて固相に結合させうる。
【図面の簡単な説明】
【図１】 従来技術においてユニバーサル塩基として提案されたさまざまな化合物を示す
。
【図２】 ２′−デオキシリボフラノシル・クロライドを伴うピラゾロ［３，４−ｄ］ピ
リミジンのＮ9 及びＮ8 グリコシル化を示す。
【図３】 オリゴヌクレオチドの化学合成に使用されうるさまざまな構築物を示す。
【図４】 ８−アザ−７−デアザアデニン−Ｎ8 −２′−デオキシ−β−Ｄ−リボフラノ
シドのホスホルアミダイトの合成を示す。
【図５】 ｄＡ* が天然核酸塩基と対を成すことにより形成される可能性のある二本鎖を
示す。
【図６】 ７−デアザ−グアニン−Ｃ8 −２′−デオキシ−β−Ｄ−リボフラノシドのホ
スホルアミダイトの合成を示す。
【図７ａ】 本発明による一般式（Ｉ）の可能性のあるヘテロ環式基の環系を示す（式（Ｉ
）に定められる置換基を図中に明記しないが、直線により示す）。
【図７ｂ】 本発明による一般式（Ｉ）の可能性のあるヘテロ環式基の環系を示す（式（Ｉ
）に定められる置換基を図中に明記しないが、直線により示す）。
【図８】 ピラゾロ［３，４−ｄ］ピリミジンのａ）メトキシ基、ｂ）アミノ基を示す。
【図９】 化合物２のメトキシ−アミノ変換の半減期値のＵＶ−分光光度的な割り当てを
示す（図８、ＮＨ3 の２５％水溶液、４０℃）。
【図１０】 アミノ官能基に対する前駆物質としてメトキシ基を伴うホスホルアミダイト、
２−［２−デオキシ−５−Ｏ−（４，４′−ジメトキシトリフェニルメチル）−
β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル］−４−メトキシ−２Ｈ−ピラゾロ
［３，４−ｄ］ピリミジン−３′−［（２−シアノエチル）−Ｎ，Ｎ−ジイソプ
ロピル−ホスホルアミダイト］の合成を示す：ｉ）ＤＭＴｒ−Ｃｌ、ピリジン、
３ｈ、室温、ii）（ｉ−Ｐｒ）2 ＮＰ（Ｃｌ）Ｏ（ＣＨ2 ）2 ＣＮ、ＣＨ2 Ｃｌ2 、２０分間、室温。
【図１１】 ３′−サクシニルエステル２の合成を示す：ｉ）無水コハク酸、４−（Ｎ，Ｎ
−ジメチルアミノ）ピリジン、Ｅｔ3 Ｎ、１，２−ジクロロエタン、３０分間、
５０℃。この化合物は固相に結合されうる。
【配列表】
【手続補正書】
【提出日】平成１４年１１月１１日（２００２．１１．１１）
【手続補正１】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【化１】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄはこの基の前記核酸結合化合物のこの基以外の部分への付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
る１以上の部分により置換される。｝の基であることを特徴とし、天然の核酸塩
基と塩基対形成が可能な前記ヘテロ環式基を付着したバックボーンを含む核酸結
合化合物であって、 ただし、 一般式（Ｉ）のヘテロ環式基が２′−デオキシ−β−Ｄ−エリスロペントフラ
ノシル部分に付着する８−アザ−７−デアザアデニン（Ａ* ）である場合、上記
核酸結合化合物の配列は、（Ａ* Ｔ）6 、ＣＴＧＧＡ* ＴＣＣＡＧ又はＣＴＧＧ
ＡＴＣＣＡ* Ｇから成る群からは選ばれず、 一般式（Ｉ）のヘテロ環式基が２′−デオキシ−β−Ｄ−エリスロペントフラ
ノシル部分に付着するＮ6 −メチル化−８−アザ−７−デアザアデニン（Ａ*m）
である場合、上記核酸結合化合物の配列は、（Ａ*mＴ）6 、ＣＴＧＧＡ*mＴＣＣ
ＡＧ、ＣＴＧＧＡＴＣＣＡ*mＧ、ＡＴＡＴＡＴＡ*mＴＡＴＡＴ、ＡＴＧＣＡＧＡ*m ＴＣＴＧＣＡ又はＣＴＧＧＡＴＣＣＡ*mＧから成る群からは選ばれず、 一般式（Ｉ）のヘテロ環式基がβ−Ｄ−リボフラノシル部分に付着する８−ア
ザ−７−デアザアデニンである場合、上記化合物の配列はアデニン以外の、及び
８−アザ−７デアザアデニン以外の少なくとも１のさらなるヘテロ環を含み、 一般式（Ｉ）のヘテロ環式基が２′−デオキシ−β−Ｄ−リボフラノシル部分
とＮ8 −付着する８−アザ−９デアザ−９−メチル−グアニンである場合、上記
化合物の配列が、チミジン以外の及び８−アザ−９−デアザ−９−メチル−グア
ニン以外の少なくとも１のさらなるヘテロ環を含み、そして 一般式（Ｉ）のヘテロ環式基のＸ4 、Ｘ5 、Ｘ6 がＮであり、かつＸ1 がＣＲ1 であり、Ｘ2 がＮであり、そしてＸ3 がＣＲ3 である場合、Ｒ1 及びＲ3 はＨ
、ＯＨ、ＮＨ2 又は保護されたＮＨ2 ではない、上記化合物。
【化２】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、Ｎ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルから成る群から選ばれ、 Ｌはオキシ、スルファンジイル、−ＣＨ2 −、及び−ＮＲ22−から成る群から
選ばれ、 Ｔはオキソ、チオキソ、及びセレノキソから成る群から選ばれ、 Ｕは−ＯＨ、−Ｏ−リポーター基、−ＳＨ、−Ｓリポーター基、−ＳｅＨ、−
（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）
−アリール、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−ＮＲ23 Ｒ24、及び−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル
−Ｒ25から成る群から選ばれ、又はここで−ＮＲ23Ｒ24はＮと共に５〜６員ヘテ
ロ環式環であることができ、 Ｖはオキシ、スルファンジイル、−ＣＨ2 −又は−ＮＲ22−から成る群から選
ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−ア
ルケニルオキシ、−ハロゲン、−アジド、−Ｏ−アリル、−Ｏ−アルキニル、及
び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルから成る群から独立して選ばれ、 Ｒ23及びＲ24は−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ20）−アリール、
−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
アルキル−［ＮＨ（ＣＨ2 ）c ］d −ＮＲ26Ｒ27、及びリポーター基から成る群
から独立して選ばれ、 Ｒ25は−Ｈ、−ＯＨ、−ハロゲン、−アミノ、−（Ｃ1 〜Ｃ18）−アルキルア
ミノ、−ＣＯＯＨ、−ＣＯＮＨ2 、及び−ＣＯＯ（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−アルキル、並
びにリポーター基から成る群から選ばれ、 Ｒ26及びＲ27は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、及び−（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−
アルコキシ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、並びにリポーター基から成る群から独
立して選ばれ、 ｃは２〜６の整数であり、 ｄは０〜６の整数であり、そして Ｂは式（Ｉ）部分であり、 ここで、いずれのアルキル、アルケニル、及びアルキニルも置換されないか、
又は−ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）
−アルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、
−ＮＨ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る
群から選ばれる１以上の部分により置換されることができ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数である。｝及びそのいずれかの塩の
１以上の部分を含む、請求項１に記載の核酸結合化合物。
【化３】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄはこの基の前記核酸結合化合物のこの基以外の部分への付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
る１以上の部分により置換される。｝の基であることを特徴とし、天然の核酸塩
基と塩基対形成が可能な前記ヘテロ環式基を付着したバックボーンを含み、そし
てここで少なくとも１のリポーター基を含む核酸結合化合物であって、 ただし、 一般式（Ｉ）のヘテロ環式基のＸ4 、Ｘ5 、Ｘ6 がＮであり、かつＸ1 がＣＲ1 であり、Ｘ2 がＮであり、そしてＸ3 がＣＲ3 である場合、Ｒ1 及びＲ3 はＨ
、ＯＨ、ＮＨ2 又は保護されたＮＨ2 ではない、上記核酸結合化合物。
【化４】 {式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ばれ
、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、Ｏ−保護基、Ｓ−保護
基、ＮＨ−保護基、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニルオキシ、−ハロゲン、−アジ
ド、−ＳＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルメルカプト、Ｏ−リポーター基、Ｏ−
固相、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ15及びＲ16は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ8 ）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アル
ケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アルキニル、−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アルキル−カルボ
ニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルケニル−カルボニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルキ
ニル−カルボニル、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ8 ）−アルキル、
保護基、及び以下の式（IV）：
【化５】 ｛式中、 Ｔはオキソ、チオキソ、及びセレノキソから成る群から選ばれ、そして Ｕは−ＯＨ、−ＳＨ、−ＳｅＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ1 〜
Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール
−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−ＮＲ23Ｒ24、及び−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
キル−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｒ25から成る群から選ばれ、又はここで
ＮＲ23Ｒ24がＮと共に５〜６員ヘテロ環式環であることができ、 Ｒ23及びＲ24は−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ20）−アリール、
−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
アルキル−［ＮＨ（ＣＨ2 ）c ］d −ＮＲ26Ｒ27から成る群から独立して選ばれ
、 Ｒ25は−Ｈ、−ＯＨ、−ハロゲン、−アミノ、−（Ｃ1 〜Ｃ18）−アルキルア
ミノ、−ＣＯＯＨ、−ＣＯＮＨ2 、及び−ＣＯＯ（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−アルキルから
成る群から選ばれ、 Ｒ26及びＲ27は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、及び−（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−
アルコキシ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から独立して選ばれ、 Ｒ29は−ＯＲ30及び−ＳＲ30から成る群から選ばれ、 Ｒ30は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、
−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、保護基、ホスフェート、ジホスフェート、及びリ
ポーター基から成る群から選ばれる。｝の化合物から成る群から独立して選ばれ
、 ただしＲ15又はＲ16が式（IV）の基であり、そして Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22、−（Ｃ1 〜Ｃ10）アルキ
ル又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
ルキル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成る群か
ら独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの群から選ばれ、 ｃは２〜６の整数であり、 ｄは０〜６の整数であり、そして Ｂは以下の式（Ｉ）：
【化６】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 Ｄはこの基の前記核酸結合化合物のこの基以外の部分への付着位置である。｝
の部分であり、 ここでいずれのアルキル、アルケニル、及びアルキニルも置換されないか、又
は−ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
アルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−
ＮＨ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群
から選ばれる１以上の部分により置換されることができ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数である。｝の化合物であって、 ただし、 上記化合物は８−アザ−７−デアザ−７−Ｈ−アデニン−Ｎ8 −β−Ｄ−リボ
フラノシル−５′−リン酸又は８−アザ−７−デアザ−７−Ｈ−アデニン−Ｎ8
−β−Ｄ−リボフラノシル−５′−二リン酸ではなく、 ＡがＯであり、かつＢがＸ4 ＝Ｘ5 ＝Ｘ6 ＝Ｎ、及びＸ1 がＣＲ1 であり、Ｘ2 がＮであり、そしてＸ3 がＣＲ3 である式（Ｉ）の基である場合、Ｒ1 及びＲ3 はＨ、ＯＨ、ＮＨ2 又は保護されたＮＨ2 ではなく、 上記化合物は、８−アザ−７−デアザ−Ｎ6 −メチル−アデニン−Ｎ8 −β−
Ｄ−リボフラノシド、及びその５′−ジメトキシトリチル−保護された誘導体、
８−アザ−７−デアザ−６−メトキシ−プリン−Ｎ8 −３′，５′−ジ−トルオ
イル−β−Ｄ−リボフラノシド、８−アザ−７−デアザ−アデニン−Ｎ8 −β−
Ｄ−リボフラノシド、及びそのＮ6 −ジメチルアセトアミド−、Ｎ6 −ベンゾイ
ル−又はＮ6 −ベンゾイル−５′−Ｏ−ジメトキシトリチル−保護された誘導体
ではなく、 上記化合物は、８−アザ−９−デアザ−９−メチル−２−メルカプト−６−ヒ
ドロキシ−グアニン−β−Ｄ−リボフラノシド、８−アザ−９−デアザ−９−メ
チル−グアニン−β−Ｄ−リボフラノシド、並びにそのＮ2 −イソブチリル−、
及びＮ2 −イソブチリル−５′−Ｏ−ジメトキシトリチル−保護された誘導体で
はない、上記化合物。
【化７】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
れ、 Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
ルキル−又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、並びに−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10 ）−アルキル−Ｏ−、及び−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成
る群から独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの群から選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＲ31、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−
アルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジ
ドＮＨＲ31、−ＳＲ31、Ｏ−リポーター基、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ
、 Ｒ31は保護基又はリポーター基であり、 Ｒ32及びＲ17は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アル
ケニル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリールから成る群から独立して選ばれ、又はここ
でＮＲ32Ｒ17はＮと共に５〜６員ヘテロ環式環であることができ、 Ｒ18は−（Ｃ2 〜Ｃ6 ）−アルケニルオキシ、置換された又は置換されない−
（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、置換されない−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、又は
−ハロゲン、ｐ−ニトロアリールオキシ及び−シアノから成る群から選ばれる基
により１回以上置換された−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシから成る群から選ばれ
、そして Ｂは以下の式（Ｉ）：
【化８】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、そして Ｄはこの基の前記核酸結合化合物のこの基以外の部分への付着位置である。｝
の基であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
る１以上の部分により置換される。｝の化合物であって ただし、 上記化合物は、２−［２′−デオキシ−５′−Ｏ−（４，４′−ジメトキシト
リチル）−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル］−４−（メチルアミノ
）−１Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］−ピリミジン３′−［メチルＮ，Ｎ−ジイソ
プロピルホスホアミダイト］、４−（ベンゾイルアミノ）−２−［２′−デオキ
シ−５′−Ｏ−（ジメトキシトリチル）−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラ
ノシル］−２Ｈ−ピラゾロ［３，４−ｄ］−ピリミジン３′−［メチルＮ，Ｎ−
ジイソプロピルホスホアミダイト］又はＮ−［２−［５−Ｏ−［ビス（４−メト
キシフェニル）フェニルメチル］−２−デオキシ−β−Ｄ−リボフラノシル］−
３−メチル−７−オキソ−２Ｈ−ピラゾロ［４，３−ｄ］ピリミジン−５−イル
］−２−メチル−プロパンアミド−３′−［（２−シアノエチル）Ｎ，Ｎ−ジイ
ソプロピルホスホアミダイト］ ではなく、 ＡがＯであり、かつＢが、Ｘ4 ＝Ｘ5 ＝Ｘ6 ＝Ｎ、並びにＸ1 がＣＲ1 であり
、Ｘ2 がＮであり、及びＸ3 がＣＲ3 である式（Ｉ）の基である場合、Ｒ1 及び
Ｒ3 はＨ、ＯＨ、ＮＨ2 又は保護されたＮＨ2 ではない、上記化合物。
【化９】 ｛式中、 ＰＰＰはトリホスフェート基であり、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−ア
ルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジド
、及びＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ36は−Ｈ及び−ＯＨの群から選ばれ、そして Ｂは以下の式（Ｉ）：
【化１０】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄはこの基の前記核酸結合化合物のこの基以外の部分への付着位置である。｝
の基であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
る１以上の部分により置換される。｝の化合物であって、 ただし、 ８−アザ−グアノシン−Ｎ8 −β−Ｄ−２′，３′−ジデオキシ−グリセロペ
ントフラノシルではない上記化合物。
【化１１】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
れ、 Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
ルキル−又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、並びに−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10 ）−アルキル−Ｏ−、及び−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成
る群から独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ、及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの群から選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＲ31、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−
アルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジ
ドＮＨＲ31、−ＳＲ31、Ｏ−リポーター基、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ
、 Ｒ31は保護基又はリポーター基であり、 Ｒ32及びＲ17は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アル
ケニル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリールから成る群から独立して選ばれるか又はこ
こでＮＲ32Ｒ17はＮと共に５〜６員ヘテロ環式環であることができ、 Ｒ18は−（Ｃ2 〜Ｃ6 ）−アルケニルオキシ、置換された又は置換されない−
（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、置換されない−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、ある
いは−ハロゲン、ｐ−ニトロアリールオキシ、及び−シアノから成る群から選ば
れる基により１回以上置換された−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシから成る群から
選ばれ、そして Ｂは以下の式（Ｉ）：
【化１２】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄはこの基の前記核酸結合化合物のこの基以外の部分への付着位置である。｝
の基であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
る１以上の部分により置換される。｝の化合物。
【化１３】 ｛式中、 Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
キル又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
ルキル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成る群か
ら独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの群から選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＲ31、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−
アルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジ
ドＮＨＲ31、−ＳＲ31、Ｏ−リポーター、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ31は保護基又はリポーター基であり、 Ｂは以下の式（Ｉ）：
【化１４】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄはこの基の前記核酸結合化合物のこの基以外の部分への付着位置である。｝
の基であり 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
る１以上の部分により置換される。｝の化合物であって、 ただし、 ＡがＯであり、かつＢがＸ4 ＝Ｘ5 ＝Ｘ6 ＝Ｎ、並びにＸ1 がＣＲ1 であり、
Ｘ2 がＮであり、及びＸ3 がＣＲ3 である式（Ｉ）の基である場合、Ｒ1 及びＲ3 はＨ、ＯＨ、ＮＨ2 又は保護されたＮＨ2 ではない、上記化合物。
【化１５】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄはこの基の前記核酸結合化合物のこの基以外の部分への付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
る１以上の部分により置換される。｝のヘテロ環式基を含む、上記方法。
【化１６】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄはこの基の前記核酸結合化合物のこの基以外の部分への付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
る１以上の部分により置換される。｝の基の少なくとも１を含む活性化サブユニ
ットを用いた、請求項１〜３のいずれか１項に記載の化合物の化学的合成方法。
【化１７】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
れ、 Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
ルキル−又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10 ）−アルキル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成
る群から独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、保護基、及びリポーター基の基か
ら選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＲ31、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、Ｏ−保護基、Ｓ−保
護基、ＮＨ2 −保護基、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジド、−ＳＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
ルキルメルカプト、−ＮＨ2 、及びＯ−固相から成る群から選ばれ、 Ｒ15及びＲ16は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アル
ケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキル−カルボ
ニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルケニル−カルボニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルキ
ニル−カルボニル、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、
保護基、及び固相から成る群から独立して選ばれ、 Ｂは以下の式（Ｉ）：
【化１８】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 Ｄはこの基の前記バックボーンへの付着位置である。｝の部分と連結し、 上記いずれのアルキル、アルケニル、及びアルキニルも置換されないか、又は
−ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−ア
ルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−Ｎ
Ｈ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群か
ら選ばれる１以上の部分により置換されることができ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 ここでＲ14、Ｒ15又はＲ16のいずれか１が固相である。｝の部分を含むバック
ボーンを含む核酸結合化合物の合成のための前駆物質として使用されうる化合物
。
【化１９】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
れ、 Ｍはオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−
又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
キル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成る群から
選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、保護基、及びリポーター基の群か
ら選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−ア
ルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジド
、−ＳＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルメルカプト、Ｏ−リポーター基、Ｏ−固
相、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ15は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、
−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキル−カルボニル、−
（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルケニル−カルボニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルキニル−カ
ルボニル、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、固相から
成る群から選ばれ、 Ｂは以下の式（Ｉ）：
【化２０】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
、 Ｄはこの基の前記バックボーンへの付着位置である。｝の部分と連結し、 上記いずれのアルキル、アルケニル、及びアルキニルも置換されないか、又は
−ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−ア
ルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−Ｎ
Ｈ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群か
ら選ばれる１以上の部分により置換されることができ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 ここで、Ｒ14がＯ−固相であるか又はＲ15が固相である。｝の部分を含む、核
酸結合化合物の合成のための前駆物質又は中間物質として使用されうる化合物。
【化２１】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
〜Ｃ22）−アリール、保護基、固相、及びリポーター基から成る群から独立して
選ばれ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄはこの基の前記バックボーンへの付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
る１以上の部分により置換され、 ここで、上記バックボーンが固相に結合されているか又はＲ5 、Ｒ6 、Ｒ12、
Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35の少なくとも１が固相である。｝の基であることを特徴と
する付着したヘテロ環式基を有するバックボーンを含む核酸結合化合物の合成の
ための前駆物質又は中間化合物として使用されうる化合物。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (81)指定国 ＥＰ(ＡＴ，ＢＥ，ＣＨ，ＣＹ， ＤＥ，ＤＫ，ＥＳ，ＦＩ，ＦＲ，ＧＢ，ＧＲ，ＩＥ，Ｉ Ｔ，ＬＵ，ＭＣ，ＮＬ，ＰＴ，ＳＥ，ＴＲ)，ＪＰ，Ｕ Ｓ (72)発明者 ベルクマン，フランク ドイツ連邦共和国，82393 イッフェルド ルフ，ファルテルガッター ５ (72)発明者 ハインドル，ディーター ドイツ連邦共和国，82327 テューツィン グ，バルトシュミットシュトラーセ １ (72)発明者 フォン デレルツ，ヘルベルト ドイツ連邦共和国，82362 バイルハイム， イン デル アウ 21 Ｆターム(参考） 4B024 AA11 CA09 HA14 4B063 QA18 QQ42 QQ52 QR55 QR62 QS25 QS34 4C057 AA03 AA21 BB02 BB05 DD02 MM01 MM04

Claims (35)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項１】 少なくとも１のそのヘテロ環式基が以下の一般式（Ｉ）： 【化１】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄは前記核酸結合化合物のこの基以外の部分へのこの基の付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
    ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
    、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
    ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
    る１以上の部分により置換される。｝の基であることを特徴とし、天然の核酸塩
    基と塩基対形成が可能な前記ヘテロ環式基を付着したバックボーンを含む核酸結
    合化合物であって、 ただし、 一般式（Ｉ）のヘテロ環式基が２′−デオキシ−β−Ｄ−エリスロペントフラ
    ノシル部分に付着する８−アザ−７−デアザアデニン（Ａ* ）である場合、上記
    核酸結合化合物の配列は、（Ａ* Ｔ）6 、ＣＴＧＧＡ* ＴＣＣＡＧ又はＣＴＧＧ
    ＡＴＣＣＡ* Ｇから成る群からは選ばれず、 一般式（Ｉ）のヘテロ環式基が２′−デオキシ−β−Ｄ−エリスロペントフラ
    ノシル部分に付着するＮ6 −メチル化−８−アザ−７−デアザアデニン（Ａ*m）
    である場合、上記核酸結合化合物の配列は、（Ａ*mＴ）6 、ＣＴＧＧＡ*mＴＣＣ
    ＡＧ又はＣＴＧＧＡＴＣＣＡ*mＧから成る群からは選ばれず、 一般式（Ｉ）のヘテロ環式基がβ−Ｄ−リボフラノシル部分に付着する８−ア
    ザ−７−デアザアデニンである場合、上記化合物の配列はアデニン以外の、及び
    ８−アザ−７デアザアデニン以外の少なくとも１のさらなるヘテロ環を含み、そ
    して 一般式（Ｉ）のヘテロ環式基が２′−デオキシ−β−Ｄ−リボフラノシル部分
    とＮ8 −付着する８−アザ−９デアザ−９−メチル−グアニンである場合、上記
    化合物の配列が、チミジン以外の及び８−アザ−９−デアザ−９−メチル−グア
    ニン以外の少なくとも１のさらなるヘテロ環を含む、上記化合物。
  2. 【請求項２】 Ｘ5 がＮである、請求項１に記載の核酸結合化合物。
  3. 【請求項３】 Ｘ3 がＣＲ3 である、請求項１又は２に記載の核酸結合化合
    物。
  4. 【請求項４】 Ｘ3 がＣＮＲ5 Ｒ6 である、請求項１〜３のいずれか１項に
    記載の核酸結合化合物。
  5. 【請求項５】 前記バックボーンが糖及びリン酸部分を含む、請求項１〜５
    のいずれか１項に記載の核酸結合化合物。
  6. 【請求項６】 前記糖の立体配置がα−Ｄ−、β−Ｄ−、α−Ｌ−、及びβ
    −Ｌ−立体配置から成る群から選ばれる、請求項５に記載の核酸結合化合物。
  7. 【請求項７】 前記糖部分が２′−デオキシ−β−Ｄ−エリスロペントフラ
    ノシル部分である、請求項６に記載の核酸結合化合物。
  8. 【請求項８】 前記核酸結合化合物が以下の一般式（II）： 【化２】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、Ｎ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルから成る群から選ばれ、 Ｌはオキシ、スルファンジイル、−ＣＨ2 −、及び−ＮＲ22−から成る群から
    選ばれ、 Ｔはオキソ、チオキソ、及びセレノキソから成る群から選ばれ、 Ｕは−ＯＨ、−Ｏ−リポーター基、−ＳＨ、−Ｓリポーター基、−ＳｅＨ、−
    （Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）
    −アリール、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−ＮＲ23 Ｒ24、及び−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル
    −Ｒ25から成る群から選ばれ、又はここで−ＮＲ23Ｒ24はＮと共に５〜６員ヘテ
    ロ環式環であることができ、 Ｖはオキシ、スルファンジイル、−ＣＨ2 −又は−ＮＲ22−から成る群から選
    ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−ア
    ルケニルオキシ、−ハロゲン、−アジド、−Ｏ−アリル、−Ｏ−アルキニル、及
    び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルから成る群から独立して選ばれ、 Ｒ23及びＲ24は−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ20）−アリール、
    −（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
    アルキル−［ＮＨ（ＣＨ2 ）c ］d −ＮＲ26Ｒ27、及びリポーター基から成る群
    から独立して選ばれ、 Ｒ25は−Ｈ、−ＯＨ、−ハロゲン、−アミノ、−（Ｃ1 〜Ｃ18）−アルキルア
    ミノ、−ＣＯＯＨ、−ＣＯＮＨ2 、及び−ＣＯＯ（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−アルキル、並
    びにリポーター基から成る群から選ばれ、 Ｒ26及びＲ27は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、及び−（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−
    アルコキシ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、並びにリポーター基から成る群から独
    立して選ばれ、 ｃは２〜６の整数であり、 ｄは０〜６の整数であり、そして Ｂは式（Ｉ）部分であり、 ここで、いずれのアルキル、アルケニル、及びアルキニルも置換されないか、
    又は−ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）
    −アルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、
    −ＮＨ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る
    群から選ばれる１以上の部分により置換されることができ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数である。｝及びそのいずれかの塩の
    １以上の部分を含む、請求項１〜７のいずれか１項に記載の核酸結合化合物。
  9. 【請求項９】 前記バックボーンが以下の一般式（III ）： 【化３】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
    れ、 Ｍはオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−
    又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
    キル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成る群から
    選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、保護基、及びリポーター基から成
    る基から選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−ア
    ルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジド
    、−ＳＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルメルカプト、Ｏ−リポーター基、Ｏ−固
    相、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ15は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、
    −（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキル−カルボニル、−
    （Ｃ3 〜Ｃ19）−アルケニル−カルボニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルキニル−カ
    ルボニル、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、固相、及
    び以下の式（IV）： 【化４】 ｛式中、 Ｔはオキソ、チオキソ、及びセレノキソから成る群から選ばれ、そして Ｕは−ＯＨ、−Ｏ−リポーター基、−ＳＨ、−ＳｅＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
    ルコキシ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−ＮＲ23Ｒ24、及び−Ｏ−
    （Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｒ25から成る群か
    ら選ばれ、又はここでＮＲ23Ｒ24がＮと共に５〜６員ヘテロ環式環であることが
    でき、 Ｒ23及びＲ24は−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ20）−アリール、
    −（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
    アルキル−［ＮＨ（ＣＨ2 ）c ］d −ＮＲ26Ｒ27から成る群から独立して選ばれ
    、 Ｒ25は−Ｈ、−ＯＨ、−ハロゲン、−アミノ、−（Ｃ1 〜Ｃ18）−アルキルア
    ミノ、−ＣＯＯＨ、−ＣＯＮＨ2 、及び−ＣＯＯ（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−アルキルから
    成る群から選ばれ、 Ｒ26及びＲ27は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、及び−（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−
    アルコキシ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から独立して選ばれ、 Ｒ29は−ＯＲ30及び−ＳＲ30から成る群から選ばれ、 Ｒ30は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、
    −（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、保護基、固相、及びリポーター基から成る群から
    選ばれ、 ｃは２〜６の整数であり、 ｄは０〜６の整数である。｝の基から成る群から選ばれ、そして Ｂは式（Ｉ）部分との連結である、 ここで、いずれのアルキル、アルケニル、及びアルキニルも置換されないか又
    は−ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
    アルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−
    ＮＨ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群
    から選ばれる１以上の部分により置換されることができ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数である。｝の部分を含む、請求項１
    又は４に記載の核酸結合化合物。
  10. 【請求項１０】 前記バックボーンが以下の一般式（Ｖ）： 【化５】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
    れ、 Ｍ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル
    −又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、並びに−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−
    アルキル−Ｏ−、及び−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成る群か
    ら選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ、保護基、リポーター基、及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの基か
    ら選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−ア
    ルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジド
    、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルメルカプト、Ｏ−リポーター基、Ｏ
    −固相、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ16は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ8 ）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アルケニル、
    −（Ｃ2 〜Ｃ18）−アルキニル、−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アルキル−カルボニル、−
    （Ｃ3 〜Ｃ19）−アルケニル−カルボニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルキニル−カ
    ルボニル、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ8 ）−アルキル、保護基、
    又は以下の式（IV）： 【化６】 ｛式中、 Ｔはオキソ、チオキソ、及びセレノキソから成る群から選ばれ、 Ｕは−ＯＨ、−ＳＨ、−ＳｅＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ1 〜
    Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール
    −（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−ＮＲ23Ｒ24、及び−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
    キル−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｒ25から成る群から選ばれ、ここでＮＲ23 Ｒ24がＮと共に５〜６員ヘテロ環式環であることができ、 Ｒ23及びＲ24は−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ20）−アリール、
    −（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
    アルキル−［ＮＨ（ＣＨ2 ）c ］d −ＮＲ26Ｒ27から成る群から独立して選ばれ
    、 Ｒ25は−Ｈ、−ＯＨ、−ハロゲン、−アミノ、−（Ｃ1 〜Ｃ18）−アルキルア
    ミノ、−ＣＯＯＨ、−ＣＯＮＨ2 、及び−ＣＯＯ（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−アルキルから
    成る群から選ばれ、 Ｒ26及びＲ27は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、及び−（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−
    アルコキシ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から独立して選ばれ、 Ｒ29は−ＯＲ30及び−ＳＲ30から成る群から選ばれ、 Ｒ30は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、
    −（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、保護基、固相、及びリポーター基から成る群から
    選ばれ、 ｃは２〜６の整数であり、 ｄは０〜６の整数である。｝の化合物から成る群から選ばれ、そして Ｂは式（Ｉ）部分との連結であり、 ここで、いずれのアルキル、アルケニル、及びアルキニルも置換されないか又
    は−ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
    アルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−
    ＮＨ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群
    から選ばれる１以上の部分により置換されることができ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数である。｝又はそれらのいずれかの
    塩の部分を含む、請求項１又は４に記載の核酸結合化合物。
  11. 【請求項１１】 Ｍ′がＯであり、Ｒ16がＨであり、そしてＲ14が−Ｈ及び
    −ＯＨから成る群から選ばれる、請求項１０に記載の化合物。
  12. 【請求項１２】 少なくとも１のそのヘテロ環式基が以下の一般式（Ｉ）： 【化７】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄは前記核酸結合化合物のこの基以外の部分へのこの基の付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
    ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
    、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
    ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
    る１以上の部分により置換される。｝の基であることを特徴とし、天然の核酸塩
    基と塩基対形成が可能な前記ヘテロ環式基を付着したバックボーンを含み、そし
    てここで少なくとも１のリポーター基を含む、核酸結合化合物。
  13. 【請求項１３】 以下の式（VI）： 【化８】 {式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ばれ
    、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、Ｏ−保護基、Ｓ−保護
    基、ＮＨ−保護基、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニルオキシ、−ハロゲン、−アジ
    ド、−ＳＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルメルカプト、Ｏ−リポーター基、Ｏ−
    固相、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ15及びＲ16は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ8 ）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アル
    ケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アルキニル、−（Ｃ2 〜Ｃ18）−アルキル−カルボ
    ニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルケニル−カルボニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルキ
    ニル−カルボニル、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ8 ）−アルキル、
    保護基、及び以下の式（IV）： 【化９】 ｛式中、 Ｔはオキソ、チオキソ、及びセレノキソから成る群から選ばれ、そして Ｕは−ＯＨ、−ＳＨ、−ＳｅＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ1 〜
    Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール
    −（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−ＮＲ23Ｒ24、及び−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
    キル−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｒ25から成る群から選ばれ、又はここで
    ＮＲ23Ｒ24がＮと共に５〜６員ヘテロ環式環であることができ、 Ｒ23及びＲ24は−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ20）−アリール、
    −（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
    アルキル−［ＮＨ（ＣＨ2 ）c ］d −ＮＲ26Ｒ27から成る群から独立して選ばれ
    、 Ｒ25は−Ｈ、−ＯＨ、−ハロゲン、−アミノ、−（Ｃ1 〜Ｃ18）−アルキルア
    ミノ、−ＣＯＯＨ、−ＣＯＮＨ2 、及び−ＣＯＯ（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−アルキルから
    成る群から選ばれ、 Ｒ26及びＲ27は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、及び−（Ｃ1 〜Ｃ4 ）−
    アルコキシ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から独立して選ばれ、 Ｒ29は−ＯＲ30及び−ＳＲ30から成る群から選ばれ、 Ｒ30は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、
    −（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール、保護基、ホスフェート、ジホスフェート、及びリ
    ポーター基から成る群から選ばれる。｝の化合物から成る群から独立して選ばれ
    、 ただしＲ15又はＲ16が式（IV）の基であり、そして Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22、−（Ｃ1 〜Ｃ10）アルキ
    ル又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
    ルキル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成る群か
    ら独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの群から選ばれ、 ｃは２〜６の整数であり、 ｄは０〜６の整数であり、そして Ｂは以下の式（Ｉ）： 【化１０】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 Ｄは前記核酸結合化合物のこの基以外の部分へのこの基の付着位置である。｝
    の部分であり、 ここでいずれのアルキル、アルケニル、及びアルキニルも置換されないか、又
    は−ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−
    アルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−
    ＮＨ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群
    から選ばれる１以上の部分により置換されることができ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数である。｝の化合物であって、 ただし、 ８−アザ−７−デアザ−７−Ｈ−アデニン−Ｎ8 −β−Ｄ−リボフラノシル−
    ５′−リン酸又は８−アザ−７−デアザ−７−Ｈ−アデニン−Ｎ8 −β−Ｄ−リ
    ボフラノシル−５′−二リン酸ではない上記化合物。
  14. 【請求項１４】 以下の式（VII ）： 【化１１】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
    れ、 Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
    ルキル−又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、並びに−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10 ）−アルキル−Ｏ−、及び−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成
    る群から独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの群から選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＲ31、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−
    アルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジ
    ドＮＨＲ31、−ＳＲ31、Ｏ−リポーター基、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ
    、 Ｒ31は保護基又はリポーター基であり、 Ｒ32及びＲ17は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アル
    ケニル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリールから成る群から独立して選ばれ、又はここ
    でＮＲ32Ｒ17はＮと共に５〜６員ヘテロ環式環であることができ、 Ｒ18は−（Ｃ2 〜Ｃ6 ）−アルケニルオキシ、置換された又は置換されない−
    （Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、置換されない−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、又は
    −ハロゲン、ｐ−ニトロアリールオキシ及び−シアノから成る群から選ばれる基
    により１回以上置換された−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシから成る群から選ばれ
    、そして Ｂは以下の式（Ｉ）： 【化１２】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、そして Ｄは前記核酸結合化合物のこの基以外の部分へのこの基の付着位置である。｝
    の基であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
    ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
    、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
    ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
    る１以上の部分により置換される。｝の化合物であって ただし、 ２−［２′−デオキシ−５′−Ｏ−（４，４′−ジメトキシトリチル）−β−
    Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル］−４−（メチルアミノ）−１Ｈ−ピラ
    ゾロ［３，４−ｄ］−ピリミジン３′−［メチルＮ，Ｎ−ジイソプロピルホスホ
    アミダイト］、４−（ベンゾイルアミノ）−２−［２′−デオキシ−５′−Ｏ−
    （ジメトキシトリチル）−β−Ｄ−ｅｒｙｔｈｒｏ−ペントフラノシル］−２Ｈ
    −ピラゾロ［３，４−ｄ］−ピリミジン３′−［メチルＮ，Ｎ−ジイソプロピル
    ホスホアミダイト］又はＮ−［２−［５−Ｏ−［ビス（４−メトキシフェニル）
    フェニルメチル］−２−デオキシ−β−Ｄ−リボフラノシル］−３−メチル−７
    −オキソ−２Ｈ−ピラゾロ［４，３−ｄ］ピリミジン−５−イル］−２−メチル
    −プロパンアミド−３′−［（２−シアノエチル）Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホス
    ホアミダイト］ ではない、上記化合物。
  15. 【請求項１５】 以下の一般式（VIII）： 【化１３】 ｛式中、 ＰＰＰはトリフォスフェート基であり、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−ア
    ルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジド
    、及びＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ36は−Ｈ及び−ＯＨの群から選ばれ、そして Ｂは以下の式（Ｉ）： 【化１４】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄは前記核酸結合化合物のこの基以外の部分へのこの基の付着位置である。｝
    の基であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
    ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
    、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
    ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
    る１以上の部分により置換される。｝の化合物であって、 ただし、 ８−アザ−グアノシン−Ｎ8 −β−Ｄ−２′，３′−ジデオキシ−グリセロペ
    ントフラノシルではない上記化合物。
  16. 【請求項１６】 Ｒ14がＨであり、Ｂが７−デアザ−８−アザ−アデニンで
    ある、請求項１５に記載の化合物。
  17. 【請求項１７】 以下の一般式（IX）： 【化１５】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
    れ、 Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
    ルキル−又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、並びに−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10 ）−アルキル−Ｏ−、及び−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成
    る群から独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ、及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの群から選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＲ31、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−
    アルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジ
    ドＮＨＲ31、−ＳＲ31、Ｏ−リポーター基、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ
    、 Ｒ31は保護基又はリポーター基であり、 Ｒ32及びＲ17は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アル
    ケニル、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリールから成る群から独立して選ばれるか又はこ
    こでＮＲ32Ｒ17はＮと共に５〜６員ヘテロ環式環であることができ、 Ｒ18は−（Ｃ2 〜Ｃ6 ）−アルケニルオキシ、置換された又は置換されない−
    （Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、置換されない−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、ある
    いは−ハロゲン、ｐ−ニトロアリールオキシ、及び−シアノから成る群から選ば
    れる基により１回以上置換された−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシから成る群から
    選ばれ、そして Ｂは以下の式（Ｉ）： 【化１６】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄは前記核酸結合化合物のこの基以外の部分へのこの基の付着位置である。｝
    の基であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
    ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
    、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
    ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
    る１以上の部分により置換される。｝の化合物。
  18. 【請求項１８】 以下の一般式（Ｘ）： 【化１７】 ｛式中、 Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
    キル又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
    ルキル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成る群か
    ら独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ及び−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルの群から選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＲ31、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−
    アルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジ
    ドＮＨＲ31、−ＳＲ31、Ｏ−リポーター、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ31は保護基又はリポーター基であり、 Ｂは以下の式（Ｉ）： 【化１８】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄは前記核酸結合化合物のこの基以外の部分へのこの基の付着位置である。｝
    の基であり 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
    ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
    、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
    ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
    る１以上の部分により置換される。｝の化合物。
  19. 【請求項１９】 請求項１〜１２のいずれか１項に記載の少なくとも１の核
    酸結合化合物と核酸の結合産物であって、上記核酸結合化合物と核酸が平行又は
    逆平行の塩基対形成により互いに結合されている上記結合産物。
  20. 【請求項２０】 以下のステップ： − その核酸を含むことが推測されるサンプルを準備し、 − 上記核酸の一部又は全体と本質的に相補的な核酸結合化合物を準備し、 − 上記核酸結合化合物が上記核酸に結合するための条件下、上記サンプルを その核酸結合化合物と接触させ、 − 上記核酸の存在の指標としてその核酸と上記核酸結合化合物から形成され た結合産物を測定する、 を含む核酸の測定方法であって、上記核酸結合化合物が少なくとも１の以下の式
    （Ｉ）： 【化１９】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄはこの基の他の核酸結合化合物への付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
    ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
    、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
    ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
    る１以上の部分により置換される。｝のヘテロ環式基を含むことを特徴とする上
    記方法。
  21. 【請求項２１】 前記核酸結合化合物中の式（Ｉ）のいずれかの基が４の天
    然塩基全てと塩基対形成が可能なユニバーサル塩基として上記化合物内に配置さ
    れる、請求項２０に記載の方法。
  22. 【請求項２２】 Ｎ８−グリコシル化８−アザ−７−デアザアデニンが４の
    天然塩基全てと塩基対形成が可能な普遍塩基として前記化合物内に配置される、
    請求項２１に記載の方法。
  23. 【請求項２３】 以下のステップ： − プライマー、つまりその核酸の第１結合配列に本質的に相補的な第１プラ イマー及びこの核酸の相補鎖の結合配列に本質的に相補的な第２プライマ ー、並びに少なくとも２の異なるリポーター基により異なるサブユニット で標識されている、上記プライマーの結合配列の間の核酸又はその相補鎖 に相補的なプローブを準備し、 − 上記プライマーの伸長に好ましい条件下、そのサンプルをそのプライマー 及びプローブにさらし、そしてそのプローブの分解によりお互いから上記 リポーター基を分離し、そして − 少なくとも１の上記リポーター基を介してプローブの分解の程度を測定す る、 を含むサンプル中の核酸の存在、不存在又は量の測定方法であって、少なくとも
    １の上記プライマー又は／及びプローブが少なくとも１の以下の式（Ｉ）： 【化２０】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄは前記核酸結合化合物のこの基以外の部分へのこの基の付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
    ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
    、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
    ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
    る１以上の部分により置換される。｝のヘテロ環式基を含む核酸であることを特
    徴とする上記方法。
  24. 【請求項２４】 そのプライマーの伸長のための鋳型として核酸を用いた三
    リン酸サブユニットのプライマーとの反応を含む、請求項１〜１２のいずれか１
    項に記載の化合物の酵素的合成方法であり、ここで上記三リン酸サブユニットが
    以下の式（Ｉ）： 【化２１】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄは前記核酸結合化合物のこの基以外の部分へのこの基の付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
    ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
    、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
    ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
    る１以上の部分により置換される。｝のヘテロ環式基を含む、上記方法。
  25. 【請求項２５】 前記三リン酸サブユニットが請求項１５に記載の化合物で
    ある、請求項２４に記載の方法。
  26. 【請求項２６】 前記三リン酸サブユニットがＮ８−グリコシル化８−アザ
    −７−デアザアデニン三リン酸である、請求項２４に記載の方法。
  27. 【請求項２７】 以下の式（Ｉ）： 【化２２】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄはこの基の前記核酸結合化合物のこの基以外の部分への付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
    ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
    、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
    ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
    る１以上の部分により置換される。｝の基の少なくとも１を含む活性化サブユニ
    ットを用いた、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の化合物の化学的合成方法
    。
  28. 【請求項２８】 少なくとも１のサブユニットが請求項１３又は１４に記載
    の化合物である、請求項２７に記載の方法。
  29. 【請求項２９】 少なくとも１の、以下の式（Ｉ）： 【化２３】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄはこの基の他の核酸結合化合物への付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
    ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
    、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
    ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
    る１以上の部分により置換される。｝のヘテロ環式基を含む核酸結合化合物のハ
    イブリダイゼーション反応への使用であって、ここで上記式（Ｉ）のヘテロ環式
    基をユニバーサル塩基として上記核酸結合化合物に導入した上記使用。
  30. 【請求項３０】 Ｎ８−グリコシル化８−アザ−７−デアザアデニンを前記
    核酸結合化合物に含む、請求項２９に記載の使用。
  31. 【請求項３１】 少なくとも１の、以下の式（１）： 【化２４】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄは前記核酸結合化合物のこの基以外の部分へのこの基の付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
    ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
    、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
    ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
    る１以上の部分により置換される。｝のヘテロ環式基を含む核酸結合化合物の多
    重ハイブリダイゼーション反応への使用であり、ここで、上記式（Ｉ）のヘテロ
    環式基を上記核酸結合化合物内に導入し、その標的核酸にハイブリダイズしたさ
    らなる核酸結合化合物により形成されたさらなるハイブリダイゼーション複合体
    の安定性と比較して標的核酸にハイブリダイズした上記核酸結合化合物の複合体
    安定性を等しくした、上記核酸結合化合物。
  32. 【請求項３２】 Ｎ8 −グリコシル化８−アザ−７−デアザアデニンを前記
    核酸結合化合物内に含む、請求項３１に記載の使用。
  33. 【請求項３３】 以下の一般式（VI）： 【化２５】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
    れ、 Ｍ及びＭ′はオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
    ルキル−又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10 ）−アルキル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成
    る群から独立して選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、保護基、及びリポーター基の基か
    ら選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＲ31、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、Ｏ−保護基、Ｓ−保
    護基、ＮＨ2 −保護基、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジド、−ＳＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−ア
    ルキルメルカプト、−ＮＨ2 、及びＯ−固相から成る群から選ばれ、 Ｒ15及びＲ16は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アル
    ケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキル−カルボ
    ニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルケニル−カルボニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルキ
    ニル−カルボニル、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、
    保護基、及び固相から成る群から独立して選ばれ、 Ｂは以下の式（Ｉ）： 【化２６】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 Ｄはこの基の前記バックボーンへの付着位置である。｝の部分と連結し、 上記いずれのアルキル、アルケニル、及びアルキニルも置換されないか、又は
    −ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−ア
    ルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−Ｎ
    Ｈ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群か
    ら選ばれる１以上の部分により置換されることができ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 ここでＲ14、Ｒ15又はＲ16のいずれか１が固相である。｝の部分を含むバック
    ボーンを含む核酸結合化合物の合成のための前駆物質。
  34. 【請求項３４】 そのバックボーンが以下の一般式（III ）： 【化２７】 ｛式中、 ＡはＯ、Ｓ、ＣＨ2 、及びＮ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキルから成る群から選ば
    れ、 Ｍはオキシ、スルファンジイル、−ＮＲ22−、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−
    又は−Ｏ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル−Ｏ−、及び−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アル
    キル−Ｏ−、並びに−ＮＲ22−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル−Ｏ−から成る群から
    選ばれ、 Ｒ22は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、保護基、及びリポーター基の群か
    ら選ばれ、 Ｒ14は−Ｈ、−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルコキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−ア
    ルケニルオキシ、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニルオキシ、−ハロゲン、−アジド
    、−ＳＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキルメルカプト、Ｏ−リポーター基、Ｏ−固
    相、及び−ＮＨ2 から成る群から選ばれ、 Ｒ15は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、
    −（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキル−カルボニル、−
    （Ｃ3 〜Ｃ19）−アルケニル−カルボニル、−（Ｃ3 〜Ｃ19）−アルキニル−カ
    ルボニル、−（Ｃ6 〜Ｃ14）−アリール−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、固相から
    成る群から選ばれ、 Ｂは以下の式（Ｉ）： 【化２８】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、及びリポーター基から成る群から独立して選ばれ
    、 Ｄはこの基の前記バックボーンへの付着位置である。｝の部分と連結し、 上記いずれのアルキル、アルケニル、及びアルキニルも置換されないか、又は
    −ハロゲン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−ア
    ルコキシ、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−Ｎ
    Ｈ−ＣＳＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群か
    ら選ばれる１以上の部分により置換されることができ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 ここで、Ｒ14がＯ−固相であるか又はＲ15が固相である。｝の部分を含む、核
    酸結合化合物の前駆物質又は中間物質。
  35. 【請求項３５】 少なくとも１のそのヘテロ環式基が以下の一般式（Ｉ）： 【化２９】 ｛式中、 Ｘ1 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ1 の群から選ばれ、そし
    てＸ2 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ1 はＣＲ1 であり、 Ｘ2 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ2 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ3 のそれぞれがＮである場合、Ｘ2 はＣＲ2 であり、 Ｘ3 はＸ4 、Ｘ5 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣＲ3 の群から選ばれ、そし
    てＸ1 及びＸ2 のそれぞれがＮである場合、Ｘ3 はＣＲ3 であり、 Ｘ4 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35、及びＣＲ4 の群から選
    ばれ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮＲ35である場合、Ｘ4 はＣＲ4 又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＮである場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ6 がＣＲ34である場合、Ｘ4 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ4 はＮ又はＣＲ4 であり、 Ｘ5 はＸ1 、Ｘ2 、Ｘ3 、Ｘ4 、及びＸ6 から独立してＮ及びＣの群から選ば
    れ、 Ｘ6 はＸ1 、Ｘ2 、及びＸ3 から独立してＮ、ＮＲ35及びＣＲ34の群から選ば
    れ、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮＲ35である場合、Ｘ6 はＣＲ34又はＮであり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＮである場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、 Ｘ5 がＣであり、そしてＸ4 がＣＲ4 である場合、Ｘ6 はＮＲ35であり、そして
    Ｘ5 がＮである場合、Ｘ6 はＮ又はＣＲ34であり、 Ｒ1 、Ｒ2 、Ｒ3 、Ｒ4 、及びＲ34は−Ｈ、−ハロゲン、−ＯＲ13、−ＳＲ19 、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10 ）−アルキニル、−ＮＯ2 、−ＮＲ5 Ｒ6 、−シアノ、及び−Ｃ（＝Ｏ）Ｒ11 から成る群から独立して選ばれ、 Ｒ11は−ＯＨ、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ、−（Ｃ6 〜Ｃ22）−アリール
    オキシ、及びＮＨＲ12から成る群から選ばれ、 Ｒ5 、Ｒ6 、Ｒ12、Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35は−Ｈ、−（Ｃ1 〜Ｃ10）−アルキ
    ル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルケニル、−（Ｃ2 〜Ｃ10）−アルキニル、−（Ｃ6
    〜Ｃ22）−アリール、保護基、固相、及びリポーター基から成る群から独立して
    選ばれ、 ｒ及びｓは互いに独立して１〜１８の整数であり、 Ｄはこの基の前記バックボーンへの付着位置であり、 上記アルキル、アルケニル、及びアルキニルは置換されないか、又は−ハロゲ
    ン、−ＳＨ、−Ｓ−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルキル、−（Ｃ1 〜Ｃ6 ）−アルコキシ
    、−ＯＨ、−ＮＲ5 Ｒ6 、−ＣＯＲ11、−ＮＨ−ＣＯＮＲ5 Ｒ6 、−ＮＨ−ＣＳ
    ＮＲ5 Ｒ6 、及び−［Ｏ−（ＣＨ2 ）r ］s −ＮＲ5 Ｒ6 から成る群から選ばれ
    る１以上の部分により置換され、 ここで、上記バックボーンが固相に結合されているか又はＲ5 、Ｒ6 、Ｒ12、
    Ｒ13、Ｒ19、及びＲ35の少なくとも１が固相である。｝の基であることを特徴と
    する付着したヘテロ環式基を有するバックボーンを含む前駆物質又は中間化合物
    。
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Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007026485A1 (ja) * 2005-08-30 2007-03-08 Inter-University Research Institute Corporation National Institutes Of Natural Sciences ユニバーサル塩基
JP5251125B2 (ja) * 2005-08-30 2013-07-31 国立大学法人高知大学 ユニバーサル塩基含有ポリマー

Families Citing this family (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7144868B2 (en) 2003-10-27 2006-12-05 Genelabs Technologies, Inc. Nucleoside compounds for treating viral infections
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US7157434B2 (en) 2003-10-27 2007-01-02 Genelabs Technologies, Inc. Nucleoside compounds for treating viral infections
WO2007116129A1 (en) * 2006-04-10 2007-10-18 Wallac Oy A universal labeling system
US7772390B1 (en) 2006-07-18 2010-08-10 The Regents Of The University Of California Lipid mediated nucleic acid synthesis
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US9597348B2 (en) 2012-09-06 2017-03-21 Epizyme, Inc. Method of treating leukemia
CA2903303A1 (en) 2013-03-15 2014-09-25 Epizyme, Inc. Methods of synthesizing substituted purine compounds
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Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5438131A (en) * 1992-09-16 1995-08-01 Bergstrom; Donald E. 3-nitropyrrole nucleoside
DE4415370A1 (de) 1994-05-02 1995-11-09 Hoechst Ag Modifizierte Oligonukleotide, deren Herstellung sowie deren Verwendung

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2007026485A1 (ja) * 2005-08-30 2007-03-08 Inter-University Research Institute Corporation National Institutes Of Natural Sciences ユニバーサル塩基
US8211899B2 (en) 2005-08-30 2012-07-03 Inter-University Research Institute Corporation National Institute Of Natural Sciences Artificial nucleic acid bases and their use in base pairing natural nucleic acid bases
JP5251125B2 (ja) * 2005-08-30 2013-07-31 国立大学法人高知大学 ユニバーサル塩基含有ポリマー

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