JP6518370B2 - Ｐｄ−１に対する抗体分子およびその使用 - Google Patents

Ｐｄ−１に対する抗体分子およびその使用 Download PDF

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Description

関連出願の相互参照
本出願は、米国仮出願６１／９３１,５１２号(２０１４年１月２４日出願)、米国仮出願６２／０５９,６７６号(２０１４年１０月３日出願)および米国仮出願６２／０９４,８３４号(２０１４年１２月１９日出願)に基づく優先権を主張し、前記出願の内容をその全体を引用により本明細書に包含させる。
配列表
本出願はASCII形式で電子的に提供している配列表を含み、ここにその全体を引用により本明細書に包含させる。該ASCIIコピーは２０１５年１月１２日に作成し、名称C2160-7000WO_SL.txtであり、サイズ１９１,５８９バイトである。
Ｔ細胞が抗原に対する免疫応答に介在する能力は、２の異なるシグナル伝達相互作用を必要とする(Viglietta, V. et al. (2007) Neurotherapeutics 4:666-675; Korman, A. J. et al. (2007) Adv. Immunol. 90:297-339)。先ず、抗原提示細胞(ＡＰＣ)の表面上に配置されている抗原を、抗原特異的ナイーブＣＤ４＋ Ｔ細胞に提示させる。このような提示は、提示された抗原に特異的な免疫応答の開始をＴ細胞に指示するＴ細胞受容体(ＴＣＲ)を経るシグナルを発送する。次いで、ＡＰＣと、別個のＴ細胞表面分子の間の相互作用を介して仲介される多様な共刺激および阻害シグナルが、Ｔ細胞の活性化および増殖を、そして最終的にその阻害を誘発する。
免疫系は共刺激リガンドおよび共阻害リガンドならびに受容体のネットワークにより緻密に制御される。これらの分子は、Ｔ細胞活性化のための第二のシグナルを提供し、感染に対する免疫応答を最大にし、同時に自己に対する免疫を制限する、正と負のシグナルのバランスのとれたネットワークを提供する(Wang, L. et al. (Epub Mar. 7, 2011) J. Exp. Med. 208(3):577-92; Lepenies, B. et al. (2008) Endocrine, Metabolic & Immune Disorders--Drug Targets 8:279-288)。共刺激シグナルの例は、ＡＰＣのＢ７.１(ＣＤ８０)およびＢ７.２(ＣＤ８６)リガンドと、ＣＤ４＋ Ｔリンパ球のＣＤ２８およびＣＴＬＡ−４受容体の結合を含む(Sharpe, A. H. et al. (2002) Nature Rev. Immunol. 2:116-126; Lindley, P. S. et al. (2009) Immunol. Rev. 229:307-321)。Ｂ７.１またはＢ７.２のＣＤ２８への結合はＴ細胞活性化を刺激し、一方Ｂ７.１またはＢ７.２のＣＴＬＡ−４への結合はこのような活性化を阻害する(Dong, C. et al. (2003) Immunolog. Res. 28(1):39-48; Greenwald, R. J. et al. (2005) Ann. Rev. Immunol. 23:515-548)。ＣＤ２８は、Ｔ細胞の表面に構成的に発現されており(Gross, J., et al. (1992) J. Immunol. 149:380-388)、一方ＣＴＬＡ−４発現はＴ細胞活性化後急速に上方制御される(Linsley, P. et al. (1996) Immunity 4:535-543)。
ＣＤ２８受容体の他のリガンドは、“Ｂ７スーパーファミリー”としても知られる関連するＢ７分子の群を含む(Coyle, A. J. et al. (2001) Nature Immunol. 2(3):203-209; Sharpe, A. H. et al. (2002) Nature Rev. Immunol. 2:116-126; Collins, M. et al. (2005) Genome Biol. 6:223.1-223.7; Korman, A. J. et al. (2007) Adv. Immunol. 90:297-339)。Ｂ７スーパーファミリーのいくつかのメンバーが知られ、Ｂ７.１(ＣＤ８０)、Ｂ７.２(ＣＤ８６)、誘導性共刺激因子リガンド(ＩＣＯＳ−Ｌ)、プログラム死−１リガンド(ＰＤ−Ｌ１；Ｂ７−Ｈ１)、プログラム死−２リガンド(ＰＤ−Ｌ２；Ｂ７−ＤＣ)、Ｂ７−Ｈ３、Ｂ７−Ｈ４およびＢ７−Ｈ６(Collins, M. et al. (2005) Genome Biol. 6:223.1-223.7)を含む。
プログラム死１(ＰＤ−１)タンパク質は、Ｔ細胞レギュレーターの拡張されたＣＤ２８／ＣＴＬＡ−４ファミリーの阻害メンバーである(Okazaki et al. (2002) Curr Opin Immunol 14: 391779-82; Bennett et al. (2003) J. Immunol. 170:711-8)。ＣＤ２８ファミリーの他のメンバーはＣＤ２８、ＣＴＬＡ−４、ＩＣＯＳおよびＢＴＬＡを含む。ＰＤ−１は、他のＣＤ２８ファミリーメンバーに特徴的な不対システイン残基を欠き、単量体として存在することが示唆されている。ＰＤ−１は活性化Ｂ細胞、Ｔ細胞および単球に発現する。
ＰＤ−１遺伝子は、５５kDaＩ型膜貫通タンパク質をコードする(Agata et al. (1996) Int Immunol. 8:765-72)。ＣＴＬＡ−４に構造的に類似するが、ＰＤ−１は、Ｂ７−１およびＢ７−２結合に重要なＭＹＰＰＹモチーフ(配列番号２３６)を欠く。ＰＤ−１に対する２のリガンド、ＰＤ−Ｌ１(Ｂ７−Ｈ１)およびＰＤ−Ｌ２(Ｂ７−ＤＣ)が同定されており、これらは、ＰＤ−１への結合によりＴ細胞活性化を阻害することが示されている(Freeman et al. (2000) J. Exp. Med. 192:1027-34; Carter et al. (2002) Eur. J. Immunol. 32:634-43)。ＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２の両者は、ＰＤ−１に結合するが、他のＣＤ２８ファミリーメンバーに結合しないＢ７ホモログである。ＰＤ−Ｌ１は多様なヒト癌で豊富である(Dong et al. (2002) Nat. Med. 8:787-9)。
ＰＤ−１は、ＴＣＲシグナルを負に制御する免疫阻害タンパク質として知られる(Ishida, Y. et al. (1992) EMBO J. 11:3887-3895; Blank, C. et al. (Epub 2006 Dec. 29) Immunol. Immunother. 56(5):739-745)。ＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１の相互作用は免疫チェックポイントとして作用し、これは、例えば、腫瘍浸潤性リンパ球減少、Ｔ細胞受容体介在増殖減少および／または癌性細胞による免疫回避に至り得る(Dong et al. (2003) J. Mol. Med. 81:281-7; Blank et al. (2005) Cancer Immunol. Immunother. 54:307-314; Konishi et al. (2004) Clin. Cancer Res. 10:5094-100)。免疫抑制は、ＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１またはＰＤ−Ｌ２の局所相互作用の阻害により逆転でき、この効果は、ＰＤ−１とＰＤ−Ｌ２の相互作用が同様に遮断されるならば相加的である(Iwai et al. (2002) Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 99:12293-7; Brown et al. (2003) J. Immunol. 170:1257-66)。
Viglietta, V. et al. (2007) Neurotherapeutics 4:666-675 Korman, A. J. et al. (2007) Adv. Immunol. 90:297-33 Wang, L. et al. (Epub Mar. 7, 2011) J. Exp. Med. 208(3):577-92 Lepenies, B. et al. (2008) Endocrine, Metabolic & Immune Disorders--Drug Targets 8:279-288 Sharpe, A. H. et al. (2002) Nature Rev. Immunol. 2:116-126 Lindley, P. S. et al. (2009) Immunol. Rev. 229:307-321 Dong, C. et al. (2003) Immunolog. Res. 28(1):39-48 Greenwald, R. J. et al. (2005) Ann. Rev. Immunol. 23:515-548 Gross, J., et al. (1992) J. Immunol. 149:380-388 Linsley, P. et al. (1996) Immunity 4:535-543 Coyle, A. J. et al. (2001) Nature Immunol. 2(3):203-209 Sharpe, A. H. et al. (2002) Nature Rev. Immunol. 2:116-126 Collins, M. et al. (2005) Genome Biol. 6:223.1-223.7 Korman, A. J. et al. (2007) Adv. Immunol. 90:297-339 Collins, M. et al. (2005) Genome Biol. 6:223.1-223.7 Okazaki et al. (2002) Curr Opin Immunol 14: 391779-82 Bennett et al. (2003) J. Immunol. 170:711-8 Agata et al. (1996) Int Immunol. 8:765-72 Freeman et al. (2000) J. Exp. Med. 192:1027-34 Carter et al. (2002) Eur. J. Immunol. 32:634-43 Dong et al. (2002) Nat. Med. 8:787-9 Ishida, Y. et al. (1992) EMBO J. 11:3887-3895 Blank, C. et al. (Epub 2006 Dec. 29) Immunol. Immunother. 56(5):739-745 Dong et al. (2003) J. Mol. Med. 81:281-7 Blank et al. (2005) Cancer Immunol. Immunother. 54:307-314 Konishi et al. (2004) Clin. Cancer Res. 10:5094-100 Iwai et al. (2002) Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 99:12293-7 Brown et al. (2003) J. Immunol. 170:1257-66
免疫応答の制御における免疫チェックポイント経路の重要性を考慮して、ＰＤ−１のような免疫阻害タンパク質の活性を制御し、そうして免疫系の活性化に至る新規薬剤を開発する必要性が存在する。このような薬剤は、例えば、癌免疫療法および慢性感染のような他の状態の処置に使用できる。
要約
ここに開示されるのは、高い親和性および特異性でプログラム死１(ＰＤ−１)と結合する抗体分子(例えば、ヒト化抗体分子)である。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子はフレームワーク領域(例えば、ＦＷ１、ＦＷ２、ＦＷ３および／またはＦＷ４)の新規組み合わせ、例えば、重鎖フレームワーク領域および／または軽鎖フレームワーク領域の新規組み合わせを含む。該抗体分子をコードする核酸分子、発現ベクター、宿主細胞および該抗体分子の製造法も提供する。免疫複合体、多または二特異性抗体分子および該抗体分子を含む医薬組成物も提供する。ここに開示する抗ＰＤ−１抗体分子は、癌性障害(例えば、固形および軟組織腫瘍)ならびに感染症(例えば、慢性感染性障害または敗血症)のような障害の処置、予防および／または診断に(単独でまたは他の薬剤もしくは治療法と組み合わせて)使用できる。それゆえに、ＰＤ−１を検出するための組成物および方法ならびに抗ＰＤ−１抗体分子を使用する癌および／または感染症を含む多様な障害の処置法をここに開示する。
したがって、一つの面において、本発明は、次の特性の１以上を有する、抗体分子(例えば、単離または組み換え抗体分子)に関する。
(ｉ)高親和性で、例えば、少なくとも約１０７Ｍ−１、概して約１０８Ｍ−１、より典型的には、約１０９Ｍ−１〜１０１０Ｍ−１またはそれより強い親和性定数でＰＤ−１、例えば、ヒトＰＤ−１と結合する；
(ii)ＣＤ２８、ＣＴＬＡ−４、ＩＣＯＳまたはＢＴＬＡに実質的に結合しない；
(iii)ＰＤ−１のＰＤ−１リガンド、例えば、ＰＤ−Ｌ１またはＰＤ−Ｌ２または両者への結合を阻害するまたは減少させる；
(iv)ＰＤ−１上のエピトープ、例えば、マウスモノクローナル抗体ＢＡＰ０４９またはキメラ抗体ＢＡＰ０４９、例えば、ＢＡＰ０４９−ｃｈｉまたはＢＡＰ０４９−ｃｈｉ−Ｙにより認識されるエピトープと同じまたは類似するエピトープと特異的に結合する；
(ｖ)ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅのいずれかと同じまたは類似する結合親和性または特異性または両者を示す；
(vi)表１に記載する抗体分子(例えば、重鎖可変領域および軽鎖可変領域)と同じまたは類似する結合親和性または特異性または両者を示す；
(vii)表１に示すアミノ酸配列を有する抗体分子(例えば、重鎖可変領域および軽鎖可変領域)と同じまたは類似する結合親和性または特異性または両者を示す；
(viii)表１に示すヌクレオチド配列によりコードされる抗体分子(例えば、重鎖可変領域および軽鎖可変領域)と同じまたは類似する結合親和性または特異性または両者を示す；
(ix)ＰＤ−１に対する第二の抗体分子の結合を阻害、例えば、競合的に阻害し、ここで、第二の抗体分子は、例えば、ここに記載する抗体分子、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅのいずれかから選択される、抗体分子である；
(ｘ)ＰＤ−１に対する第二の抗体分子と同じまたは重複するエピトープと結合し、ここで、第二の抗体分子は、例えば、ここに記載する抗体分子、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅのいずれかから選択される、抗体分子である；
(xi)ＰＤ−１に対する第二の抗体分子の結合と競合しおよび／または同じエピトープと結合し、ここで、第二の抗体分子は、例えば、ここに記載する抗体分子、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅのいずれかから選択される、抗体分子である；
(xii)ここに記載する抗体分子、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅのいずれかから選択される、例えば、抗体分子の１種以上の生物学的特性を有する；
(xiii)ここに記載する抗体分子、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅのいずれかから選択される、例えば、抗体分子の１種以上の薬物動態特性を有する；
(xiv)ＰＤ−１の１以上の活性を阻害する、例えば、腫瘍浸潤性リンパ球増加、Ｔ細胞受容体介在増殖増加または癌性細胞による免疫回避減少の１以上を生じる；
(xv)ヒトＰＤ−１と結合し、カニクイザルＰＤ−１と交差反応性である；
(xvi)ＰＤ−１のＣ鎖、ＣＣ’ループ、Ｃ’鎖またはＦＧループ内の１以上の残基またはＰＤ−１のＣ鎖、ＣＣ’ループ、Ｃ’鎖またはＦＧループの２、３または全ての組み合わせと結合し、例えば、ここで、結合はＥＬＩＳＡまたはＢｉａｃｏｒｅを使用してアッセイする；または
(xvii)ＶＨ領域よりもＰＤ−１への結合に貢献するＶＬ領域を有する。
ある態様において、抗体分子は、ＰＤ−１に高親和性で、例えば、マウスまたはキメラ抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載するマウスまたはキメラ抗ＰＤ−１抗体分子のＫＤとほぼ同じまたは少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％または９０％高いまたは低いＫＤで結合する。ある態様において、マウスまたはキメラ抗ＰＤ−１抗体分子のＫＤは、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ法で測定して、約０.４nM、０.３nM、０.２nM、０.１nMまたは０.０５nM未満である。ある態様において、マウスまたはキメラ抗ＰＤ−１抗体分子のＫＤは、約０.２nM未満、例えば、約０.１３５nMである。他の態様において、マウスまたはキメラ抗ＰＤ−１抗体分子のＫＤは、例えば、ＰＤ−１を発現する細胞(例えば、３００.１９細胞)への結合で測定して、約１０nM、５nM、３nM、２nMまたは１nM未満である。ある態様において、マウスまたはキメラ抗ＰＤ−１抗体分子のＫＤは約５nM未満、例えば、約４.６０nM(または約０.６９μg／mL)である。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＰＤ−１に１×１０−４ｓ−１、５×１０−５ｓ−１または１×１０−５ｓ−１、例えば、約１.６５×１０−５ｓ−１より遅いＫｏｆｆで結合する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＰＤ−１に１×１０４Ｍ−１ｓ−１、５×１０４Ｍ−１ｓ−１、１×１０５Ｍ−１ｓ−１または５×１０５Ｍ−１ｓ−１、例えば、約１.２３×１０５Ｍ−１ｓ−１より速いＫｏｎで結合する。
ある態様において、抗体分子の発現レベルは、マウスまたはキメラ抗体分子、例えば、ここに記載するマウスまたはキメラ抗ＰＤ−１抗体分子の発現レベルより高い、例えば、少なくとも約０.５倍、１倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍または１０倍高い。ある態様において、抗体分子はＣＨＯ細胞に発現される。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、マウスまたはキメラ抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載するマウスまたはキメラ抗ＰＤ−１抗体分子のＩＣ５０(５０％阻害濃度)とほぼ同じまたは低い、例えば、少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％または９０％ＩＣ５０でＰＤ−１関連活性の１以上を減少させる。ある態様において、マウスまたはキメラ抗ＰＤ−１抗体分子のＩＣ５０は、例えば、ＰＤ−１を発現する細胞(例えば、３００.１９細胞)への結合で測定して、約６nM、５nM、４nM、３nM、２nMまたは１nM未満である。ある態様において、マウスまたはキメラ抗ＰＤ−１抗体分子のＩＣ５０は約４nM未満、例えば、約３.４０nM(または約０.５１μg／mL)である。ある態様において、減少するＰＤ−１関連活性は、ＰＤ−Ｌ１および／またはＰＤ−Ｌ２のＰＤ−１への結合である。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ブドウ球菌エンテロトキシンＢ(ＳＥＢ)により活性化された末梢血単核細胞(ＰＢＭＣ)に結合する。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＳＥＢにより活性化された全血上のＩＬ−２の発現を増加させる。例えば、抗ＰＤ−１抗体は、ＩＬ−２の発現を、アイソタイプ対照(例えば、ＩｇＧ４)を使用したときのＩＬ−２の発現と比較して、少なくとも約２倍、３倍、４倍または５倍増加させる。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、安定性が改善され、例えば、インビボまたはインビトロで、マウスまたはキメラ抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載するマウスまたはキメラ抗ＰＤ−１抗体分子よりも、少なくとも約０.５倍、１倍、２倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍または１０倍安定である。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子はヒト化抗体分子であり、Ｔ細胞エピトープ分析に基づき３００〜７００、４００〜６５０、４５０〜６００のリスクスコアまたはここに記載するリスクスコアを有する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるもの；または前記配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列から選択される、少なくとも１の抗原結合領域、例えば、可変領域またはその抗原結合フラグメントを含む。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるもの；または前記配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列からの少なくとも１、２、３または４の可変領域を含む。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるもの；または前記配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列からの、少なくとも１または２の重鎖可変領域を含む。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるもの；または前記配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列からの、少なくとも１または２の軽鎖可変領域を含む。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＩｇＧ４、例えば、ヒトＩｇＧ４の重鎖定常領域を含む。ある態様において、ヒトＩｇＧ４は、ＥＵ番号付けに従い２２８位に置換を含む(例えば、ＳｅｒからＰｒｏ置換)。さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＩｇＧ１、例えば、ヒトＩｇＧ１の重鎖定常領域を含む。ある態様において、ヒトＩｇＧ１は、ＥＵ番号付けに従い２９７位に置換を含む(例えば、ＡｓｎからＡｌａ置換)。ある態様において、ヒトＩｇＧ１は、ＥＵ番号付けに従い２６５位に置換、ＥＵ番号付けに従い３２９位に置換を含みまたは両者を含む(例えば、２６５位でＡｓｐからＡｌａ置換および／または３２９位でＰｒｏからＡｌａ置換)。ある態様において、ヒトＩｇＧ１は、ＥＵ番号付けに従い２３４位に置換を含み、ＥＵ番号付けに従い３２５位に置換を含みまたは両者を含む(例えば、２３４位にＬｅｕからＡｌａ置換および／または２３５位にＬｅｕからＡｌａ置換)。ある態様において、重鎖定常領域は表３に示すアミノ配列またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列を含む。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、カッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパ軽鎖定常領域を含む。ある態様において、軽鎖定常領域は表３に示すアミノ配列またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列を含む。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＩｇＧ４、例えば、ヒトＩｇＧ４の重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパ軽鎖定常領域、例えば、表３に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列を含む重鎖および軽鎖定常領域を含む。ある態様において、ヒトＩｇＧ４は、ＥＵ番号付けに従い２２８位に置換を含む(例えば、ＳｅｒからＰｒｏ置換)。さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＩｇＧ１、例えば、ヒトＩｇＧ１の重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパ軽鎖定常領域、例えば、表３に示すアミノ配列またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列を含む重鎖および軽鎖定常領域を含む。ある態様において、ヒトＩｇＧ１は、ＥＵ番号付けに従い２９７位に置換を含む(例えば、ＡｓｎからＡｌａ置換)。ある態様において、ヒトＩｇＧ１は、ＥＵ番号付けに従い２６５位に置換、ＥＵ番号付けに従い３２９位に置換を含みまたは両者を含む(例えば、２６５位でＡｓｐからＡｌａ置換および／または３２９位でＰｒｏからＡｌａ置換)。ある態様において、ヒトＩｇＧ１は、ＥＵ番号付けに従い２３４位に置換を含み、ＥＵ番号付けに従い３２５位に置換を含みまたは両者を含む(例えば、２３４位にＬｅｕからＡｌａ置換および／または２３５位にＬｅｕからＡｌａ置換)。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅのアミノ酸配列；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるもの；または前記配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列を含む、重鎖可変ドメインおよび定常領域、軽鎖可変ドメインおよび定常領域または両者を含む。抗ＰＤ−１抗体分子は、所望により、表４に示す、重鎖、軽鎖、または両者からのリーダー配列；またはそれと実質的に同一の配列を含む。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるもの；または前記配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列の重鎖可変領域からの少なくとも１、２または３の相補性決定領域(ＣＤＲ)を含む。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、少なくとも１、２または３のＣＤＲ(または集合的にＣＤＲの全て)表１に示すアミノ酸配列または表１に示すヌクレオチド配列によりコードされる重鎖可変領域を含む。ある態様において、ＣＤＲの１またはそれ以上(または集合的にＣＤＲの全て)は、表１に示すまたは表１に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、１、２、３、４、５、６またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるもの；または前記配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列の軽鎖可変領域からの少なくとも１、２または３のＣＤＲを含む。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、表１に示すアミノ酸配列を含むまたは表１に示すヌクレオチド配列によりコードされる軽鎖可変領域からの、少なくとも１、２または３のＣＤＲ(または集合的にＣＤＲの全て)を含む。ある態様において、ＣＤＲの１またはそれ以上(または集合的にＣＤＲの全て)は、表１に示すまたは表１に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、１、２、３、４、５、６またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、軽鎖ＣＤＲに置換を、例えば、軽鎖のＣＤＲ１、ＣＤＲ２および／またはＣＤＲ３に１以上の置換を含む。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、軽可変領域の１０２位に軽鎖ＣＤＲ３における置換、例えば、表１の軽可変領域の１０２位にシステイン残基からチロシン残基へのまたはシステイン残基からセリン残基への置換(例えば、非修飾マウスまたはキメラについて配列番号１６または２４；または修飾配列について配列番号３４、４２、４６、５４、５８、６２、６６、７０、７４または７８のいずれか)を含む。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、重鎖および表１に示すアミノ酸配列を含むまたは表１に示すヌクレオチド配列によりコードされる軽鎖可変領域からの少なくとも１、２、３、４、５または６のＣＤＲ(または集合的にＣＤＲの全て)を含む。ある態様において、ＣＤＲの１またはそれ以上(または集合的にＣＤＲの全て)は、表１に示すまたは表１に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、１、２、３、４、５、６またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるものからの全部で６のＣＤＲまたは密接に関係するＣＤＲ、例えば、同一であるかまたは少なくとも１のアミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が２、３または４を超えないＣＤＲを含む。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子はここに記載する任意のＣＤＲを含み得る。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、軽鎖ＣＤＲに置換を、例えば、軽鎖のＣＤＲ１、ＣＤＲ２および／またはＣＤＲ３に１以上の置換を含む。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、軽可変領域の１０２位に軽鎖ＣＤＲ３における置換、例えば、表１の軽可変領域の１０２位のシステイン残基からチロシン残基へのまたはシステイン残基からセリン残基への置換を有する(例えば、非修飾マウスまたはキメラについて配列番号１６または２４；または修飾配列について配列番号３４、４２、４６、５４、５８、６２、６６、７０、７４または７８のいずれか)。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるもの；または前記配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列；または表１に示すKabat et al.による１、２または３のＣＤＲに対して、少なくとも１のアミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が２、３または４を超えないものの重鎖可変領域からのKabat et al.による少なくとも１、２または３のＣＤＲ(例えば、表に示すKabat定義による少なくとも１、２または３のＣＤＲ)を含む。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるもの；または前記配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列；または表１に示すKabat et al.による１、２または３のＣＤＲに対して、少なくとも１のアミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が２、３または４を超えないものの軽鎖可変領域からのKabat et al.による少なくとも１、２または３のＣＤＲ(例えば、表に示すKabat定義による少なくとも１、２または３のＣＤＲ)を含む。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるもの；または前記配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列；または表１に示すKabat et al.による１、２、３、４、５または６のＣＤＲに対して、少なくとも１のアミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が２、３または４を超えないものの重鎖および軽鎖可変領域からのKabat et al.による少なくとも１、２、３、４、５または６のＣＤＲ(例えば、表１に示すKabat定義による少なくとも１、２、３、４、５または６のＣＤＲ)を含む。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるもの；または前記配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列；または表１に示すKabat et al.による全部で６のＣＤＲに対して、少なくとも１のアミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が２、３または４を超えないものの重鎖および軽鎖可変領域からのKabat et al.による全部で６のＣＤＲ(例えば、表１に示すKabat定義による全部で６のＣＤＲ)を含む。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子はここに記載する任意のＣＤＲを含み得る。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるものの重鎖可変領域からの少なくとも１、２または３のChothia高度可変ループ(例えば、表１に示すChothia定義による少なくとも１、２または３の高度可変ループ)；または少なくともＰＤ−１と接触する高度可変ループからのアミノ酸；または表１に示すChothia et al.による１、２または３の高度可変ループに対して、少なくとも１のアミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が２、３または４を超えないものを含む。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体の軽鎖可変領域の、少なくとも１、２または３のChothia高度可変ループ(例えば、表１に示すChothia定義による少なくとも１、２または３の高度可変ループ)；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるもの；または少なくともＰＤ−１と接触する高度可変ループからのアミノ酸；または表１に示すChothia et al.による１、２または３の高度可変ループに対して、少なくとも１のアミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が２、３または４を超えないものを含む。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるもの；または少なくともＰＤ−１と接触する高度可変ループからのアミノ酸の重鎖および軽鎖可変領域の少なくとも１、２、３、４、５または６の高度可変ループ(例えば、表１に示すChothia定義による少なくとも１、２、３、４、５または６の高度可変ループ)；または表１に示すChothia et al.による１、２、３、４、５または６の高度可変ループに対して、少なくとも１のアミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が２、３または４を超えないものを含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体または密接に関係する高度可変ループ、例えば、同一であるかまたは少なくとも１のアミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が２、３または４を超えない高度可変ループの全部で６の高度可変ループ(例えば、表１に示すChothia定義による全部で６の高度可変ループ)；または表１に示すChothia et al.による全部で６の高度可変ループに対して、少なくとも１のアミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が２、３または４を超えないものを有する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する任意の高度可変ループを含み得る。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体の対応する高度可変ループと同じ標準構造、例えば、ここに記載する抗体の重および／または軽鎖可変ドメインの少なくともループ１および／またはループ２と同じ標準構造を有する少なくとも１、２または３の高度可変ループを含む。例えば、高度可変ループ標準構造の記載についてChothia et al., (1992) J. Mol. Biol. 227:799-817; Tomlinson et al., (1992) J. Mol. Biol. 227:776-798参照。これらの構造は、これらの参考文献に記載された表の精査により決定できる。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子Kabat et al.およびChothia et alによって定義されたＣＤＲまたは高度可変ループの組み合わせを含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、KabatおよびChothia定義によるここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択；または表１におけるヌクレオチド配列によりコードされる；または前記配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致)である配列される抗体の重鎖可変領域からの少なくとも１、２または３のＣＤＲまたは高度可変ループ(例えば、表１に示すKabatおよびChothia定義による少なくとも１、２または３のＣＤＲまたは高度可変ループ)；または表１に示すKabatおよび／またはChothiaによる１、２または３のＣＤＲまたは高度可変ループに対して、少なくとも１のアミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が２、３または４を超えないものを含む。
例えば、抗ＰＤ−１抗体分子は、例えば、表１に示すように、Kabat et al.によるＶＨ ＣＤＲ１またはChothia et al.によるＶＨ高度可変ループ１またはこれらの組み合わせを含み得る。ある態様において、ＶＨ ＣＤＲ１のKabatおよびChothia ＣＤＲの組み合わせは、アミノ酸配列ＧＹＴＦＴＴＹＷＭＨ(配列番号２２４)またはそれと実質的に同一のアミノ酸配列(例えば、少なくとも１のアミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が２、３または４を超えない)を含む。抗ＰＤ−１抗体分子は、さらに、例えば、表１に示すように、例えば、Kabat et al.によるＶＨ ＣＤＲ２〜３およびKabat et al.によるＶＬ ＣＤＲ１〜３を含み得る。したがって、ある態様において、フレームワーク領域は、Kabat et al.により定義されたＣＤＲと、Chothia et al.により定義された高度可変ループの組み合わせに基づき定義される。例えば、抗ＰＤ−１抗体分子は、例えば、表１に示すように、Chothia et al.によるＶＨ高度可変ループ１に基づき定義されたＶＨ ＦＲ１およびKabat et al.によるＶＨ ＣＤＲ１〜２に基づき定義されたＶＨ ＦＲ２を含み得る。抗ＰＤ−１抗体分子は、さらに、例えば、Kabat et al.によるＶＨ ＣＤＲ２〜３に基づき定義されたＶＨ ＦＲ３〜４およびKabat et al.によるＶＬ ＣＤＲ１〜３に基づき定義されたＶＬ ＦＲ１〜４を含み得る。
抗ＰＤ−１抗体分子は、KabatおよびChothia定義によるＣＤＲまたは高度可変ループの任意の組み合わせを含み得る。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、KabatおよびChothia定義による、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体の軽鎖可変領域からの少なくとも１、２または３のＣＤＲを含む(例えば、表１に示すKabatおよびChothia定義による少なくとも１、２または３のＣＤＲ)。
ある態様において、例えば、可変領域、ＣＤＲ(例えば、Chothia ＣＤＲまたはKabat ＣＤＲ)またはここに、例えば、表１において言及する他の配列を含む態様において、抗体分子は単一特異性抗体分子、二重特異性抗体分子であるかまたは抗体の抗原結合フラグメントを含む抗体分子、例えば、半抗体または半抗体の抗原結合フラグメントである。ある態様において、抗体分子は、ＰＤ−１に対する第一結合特異性およびＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＣＥＡＣＡＭ(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１および／またはＣＥＡＣＡＭ−５)、ＰＤ−Ｌ１またはＰＤ−Ｌ２に対する第二特異性を有する二重特異性抗体分子である。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、
(ａ)配列番号４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(ＶＨ)；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(ＶＬ)；
(ｂ)配列番号１から選択されるＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列；配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列；および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ；
(ｃ)配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ；または
(ｄ)配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列；配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列；および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ
を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、配列番号４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬを含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、配列番号１のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列；配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列；および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬを含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬを含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列；配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列；および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬを含む。
ある態様において、抗体分子はヒト化抗体分子である。他の態様において、抗体分子は単一特異性抗体分子である。さらに別の態様において、抗体分子は二重特異性抗体分子である。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、
(ｉ)配列番号１から選択されるＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号４または配列番号２２４；配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列；および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(ＶＨ)；および
(ii)配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(ＶＬ)
を含む。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、
(ｉ)配列番号１から選択されるＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号４または配列番号２２４；配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(ＶＨ)；および
(ii)配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(ＶＬ)
を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、配列番号１のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列を含む。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、配列番号４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列を含む。さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子の軽鎖または重鎖可変フレームワーク(例えば、少なくともＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３および所望によりＦＲ４を包含する領域)は、(ａ)ヒト軽鎖または重鎖可変フレームワーク、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列またはヒトコンセンサス配列の軽鎖または重鎖可変フレームワーク残基からのアミノ酸残基の少なくとも８０％、８５％、８７％、９０％、９２％、９３％、９５％、９７％、９８％または好ましくは１００％を含む軽鎖または重鎖可変フレームワーク；(ｂ)ヒト軽鎖または重鎖可変フレームワークからのアミノ酸残基の２０％〜８０％、４０％〜６０％、６０％〜９０％または７０％〜９５％を含む軽鎖または重鎖可変フレームワーク、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列またはヒトコンセンサス配列からの軽鎖または重鎖可変フレームワーク残基；(ｃ)非ヒトフレームワーク(例えば、齧歯類フレームワーク)；または(ｄ)例えば、抗原性または細胞毒性決定基を除去するために修飾されている、例えば、脱免疫化または一部ヒト化されている、非ヒトフレームワークを含む。ある態様において、軽鎖または重鎖可変フレームワーク領域(特にＦＲ１、ＦＲ２および／またはＦＲ３)は、少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、８７％、８８％、９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％同一であるか、ヒト生殖系列遺伝子のＶＬまたはＶＨセグメントのフレームワークと同一である軽鎖または重鎖可変フレームワーク配列を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ−ＨＣのアミノ酸配列、例えば、図９Ａ〜９Ｂまたは配列番号１８、２０、２２または３０に示す、例えば、可変領域全体におけるＦＲ領域のアミノ酸配列から少なくとも１、２、３、４、５、６、７、１０、１５、２０またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する重鎖可変ドメインを有する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ−ＨＣ、例えば、図９Ａ〜９Ｂまたは配列番号１８、２０、２２または３０に示す、例えば、可変領域全体におけるＦＲのアミノ酸配列のアミノ酸配列に１位にＥ、５位にＶ、９位にＡ、１１位にＶ、１２位にＫ、１３位にＫ、１６位にＥ、１８位にＬ、１９位にＲ、２０位にＩまたはＶ、２４位にＧ、３７位にＩ、４０位にＡまたはＳ、４１位にＴ、４２位にＳ、４３位にＲ、４８位にＭまたはＬ、６８位にＶまたはＦ、６９位にＴ、７０位にＩ、７１位にＳ、７２位にＡまたはＲ、７４位にＫまたはＮ、７６位にＴまたはＫ、７７位にＳまたはＮ、７９位にＬ、８１位にＬ、８２位にＥまたはＱ、８３位にＭ、８４位にＳまたはＮ、８７位にＲ、８８位にＡまたは９１位にＴの１以上を有する重鎖可変ドメインを含む。
あるいはまたはここに記載するＢＡＰ０４９−ｃｈｉ−ＨＣの重鎖置換と組み合わせて、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ−ＬＣのアミノ酸配列、例えば、図１０Ａ〜１０Ｂまたは配列番号２４または２６に示すアミノ酸配列から、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、１０、１５、２０またはそれ以上のアミノ酸変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する軽鎖可変ドメインを含む。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ−ＬＣのアミノ酸配列、例えば、図１０Ａ〜１０Ｂまたは配列番号２４または２６に示すアミノ酸配列の１位にＥ、２位にＶ、３位にＱ、４位にＬ、７位にＴ、９位にＤまたはＬまたはＡ、１０位にＦまたはＴ、１１位にＱ、１２位にＳまたはＰ、１３位にＬまたはＡ、１４位にＳ、１５位にＰまたはＬまたはＶ、１６位にＫ、１７位にＱまたはＤ、１８位にＲ、１９位にＡ、２０位にＳ、２１位にＩまたはＬ、２２位にＴ、４３位にＬ、４８位にＫ、４９位にＡまたはＳ、５１位にＲまたはＱ、５５位にＹ、６４位にＩ、６６位にＳまたはＰ、６９位にＳ、７３位にＹ、７４位にＧ、７６位にＥ、７９位にＦ、８２位にＮ、８３位にＮ、８４位にＬまたはＩ、８５位にＥ、８６位にＳまたはＰ、８７位にＤ、８９位にＡまたはＦまたはＩ、９１位にＴまたは任意のもの、９３位にＦまたは１０２位に任意のものの１以上を有する重鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、１、２、３または４の重鎖フレームワーク領域(例えば、表２に示すまたは表２に示すヌクレオチド配列によりコードされる配列)またはそれと実質的に同一の配列を含む。
さらに他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、１、２、３または４の軽鎖フレームワーク領域(例えば、表２に示すまたは表２に示すヌクレオチド配列によりコードされるＶＬＦＷアミノ酸配列)またはそれと実質的に同一の配列を含む。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、１、２、３または４の重鎖フレームワーク領域(例えば、表２に示すまたは表２に示すヌクレオチド配列によりコードされる配列)またはそれと実質的に同一の配列；および１、２、３または４の軽鎖フレームワーク領域(例えば、表２に示すまたは表２に示すヌクレオチド配列によりコードされるＶＬＦＷアミノ酸配列)またはそれと実質的に同一の配列を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの重鎖フレームワーク領域１(ＶＨＦＷ１)(例えば、配列番号１４７)を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４またはＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５の重鎖フレームワーク領域１(ＶＨＦＷ１)(例えば、配列番号１５１)を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＣまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの重鎖フレームワーク領域２(ＶＨＦＷ２)(例えば、配列番号１５３)を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｄの重鎖フレームワーク領域２(ＶＨＦＷ２)(例えば、配列番号１５７)を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６の重鎖フレームワーク領域２(ＶＨＦＷ２)(例えば、配列番号１６０)を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＣまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの重鎖フレームワーク領域３(ＶＨＦＷ３)(例えば、配列番号１６２)を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｄの重鎖フレームワーク領域３(ＶＨＦＷ３)(例えば、配列番号１６６)を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの重鎖フレームワーク領域４(ＶＨＦＷ４)(例えば、配列番号１６９)を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃの軽鎖フレームワーク領域１(ＶＬＦＷ１)(例えば、配列番号１７４)を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの軽鎖フレームワーク領域１(ＶＬＦＷ１)(例えば、配列番号１７７)を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６の軽鎖フレームワーク領域１(ＶＬＦＷ１)(例えば、配列番号１８１)を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３の軽鎖フレームワーク領域１(ＶＬＦＷ１)(例えば、配列番号１８３)を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３またはＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２の軽鎖フレームワーク領域１(ＶＬＦＷ１)(例えば、配列番号１８５)を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの軽鎖フレームワーク領域２(ＶＬＦＷ２)(例えば、配列番号１８７)を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃの軽鎖フレームワーク領域２(ＶＬＦＷ２)(例えば、配列番号１９１)を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２の軽鎖フレームワーク領域２(ＶＬＦＷ２)(例えば、配列番号１９４)を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの軽鎖フレームワーク領域３(ＶＬＦＷ３)(例えば、配列番号１９６)を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２またはＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３の軽鎖フレームワーク領域３(ＶＬＦＷ３)(例えば、配列番号２００)を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａの軽鎖フレームワーク領域３(ＶＬＦＷ３)(例えば、配列番号２０２)を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂの軽鎖フレームワーク領域３(ＶＬＦＷ３)(例えば、配列番号２０５)を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの軽鎖フレームワーク領域４(ＶＬＦＷ４)(例えば、配列番号２０８)を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＣまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５３(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６２(ＶＨＦＷ３))を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｄの重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５７(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６６(ＶＨＦＷ３))を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４またはＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１５１(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５７(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６６(ＶＨＦＷ３))を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１６０(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６６(ＶＨＦＷ３))を含む。ある態様において、抗体分子は、さらに、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの重鎖フレームワーク領域４(ＶＨＦＷ４)(例えば、配列番号１６９)を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａの軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７７(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号２０２(ＶＬＦＷ３))を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２またはＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１８５(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号２００(ＶＬＦＷ３))を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ)の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７７(ＶＬＦＷ１)、配列番号１９１(ＶＬＦＷ２)および配列番号２０５(ＶＬＦＷ３))を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１８１(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７７(ＶＬＦＷ１)、配列番号１９１(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃの軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７４(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７７(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１８５(ＶＬＦＷ１)、配列番号１９４(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。ある態様において、抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１８３(ＶＬＦＷ１)、配列番号１９１(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。ある態様において、抗体分子は、さらに、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの軽鎖フレームワーク領域４(ＶＬＦＷ４)(例えば、配列番号２０８)を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａの重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５３(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６２(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａの軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７７(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号２０２(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５３(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６２(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１８５(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号２００(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５７(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６６(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１８５(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号２００(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５７(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６６(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７７(ＶＬＦＷ１)、配列番号１９１(ＶＬＦＷ２)および配列番号２０５(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂの重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５３(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６２(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂの軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７７(ＶＬＦＷ１)、配列番号１９１(ＶＬＦＷ２)および配列番号２０５(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５３(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６２(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１８１(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５３(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６２(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７７(ＶＬＦＷ１)、配列番号１９１(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５７(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６６(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７４(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ)の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５３(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６２(ＶＨＦＷ３)およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−の軽鎖フレームワーク領域１〜３Ｃ(例えば、配列番号１７４(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｄの重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５７(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６６(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｄの軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７７(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５３(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６２(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１またはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７７(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５３(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６２(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１８５(ＶＬＦＷ１)、配列番号１９４(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５３(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６２(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１８３(ＶＬＦＷ１)、配列番号１９１(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１５１(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５７(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６６(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７７(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１５１(ＶＨＦＷ１)、配列番号１５７(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６６(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７４(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６の重鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１４７(ＶＨＦＷ１)、配列番号１６０(ＶＨＦＷ２)および配列番号１６６(ＶＨＦＷ３))およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６の軽鎖フレームワーク領域１〜３(例えば、配列番号１７４(ＶＬＦＷ１)、配列番号１８７(ＶＬＦＷ２)および配列番号１９６(ＶＬＦＷ３))を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、さらに、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの重鎖フレームワーク領域４(ＶＨＦＷ４)(例えば、配列番号１６９)およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの軽鎖フレームワーク領域４(ＶＬＦＷ４)(例えば、配列番号２０８)を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、図５または７に示すフレームワーク領域ＦＷ１、ＦＷ２およびＦＷ３の組み合わせを有する重鎖フレームワーク領域を含む。他の態様において、抗体分子は、図５または７に示すフレームワーク領域ＦＷ１、ＦＷ２およびＦＷ３の組み合わせを有する軽鎖フレームワーク領域を含む。さらに他の態様において、抗体分子は、図５または７に示すフレームワーク領域ＦＷ１、ＦＷ２およびＦＷ３の組み合わせを有する重鎖フレームワーク領域および図５または７に示すフレームワーク領域ＦＷ１、ＦＷ２およびＦＷ３の組み合わせを有する軽鎖フレームワーク領域を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子の重鎖および軽鎖可変ドメインまたは両者は、ここに開示するアミノ酸と実質的に同一であるアミノ酸配列、ここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅのいずれかから選択される抗体の可変領域；または表１に記載のとおりのまたは表１におけるヌクレオチド配列によりコードされるものと、例えば、少なくとも８０％、８５％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、９９％またはそれより高く一致するか；またはここに記載する抗体の可変領域と少なくとも１残基または５残基、しかし４０残基、３０残基、２０残基または１０残基未満が異なるものを含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子の重鎖および軽鎖可変領域または両者は、例えば、低ストリンジェンシー、中ストリンジェンシーまたは高ストリンジェンシーまたはここに記載する他のハイブリダイゼーション条件下、ここに開示する核酸配列またはここに記載する核酸配列とハイブリダイズする核酸(例えば、表１および２に示す核酸配列)またはその補体を含む。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、表１に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一の配列または表１に示す配列と１、２、５、１０または１５アミノ酸残基を超えて異ならないもの)を有する、少なくとも１、２、３または４の抗原結合領域、例えば、可変領域を含む。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、表１に示すヌクレオチド配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一の配列または表１に示す配列と３、６、１５、３０または４５ヌクレオチドを超えて異ならないもの)を有する核酸によりコードされるＶＨおよび／またはＶＬドメインを含む。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、表１に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同である配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一のおよび／または１、２、３またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する重鎖可変領域からの少なくとも１、２または３のＣＤＲを含む。さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、表１に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同である配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一のおよび／または１、２、３またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する軽鎖可変領域からの少なくとも１、２または３のＣＤＲを含む。さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、表１に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同である配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一のおよび／または１、２、３またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも１、２、３、４、５または６のＣＤＲを含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、表１に要約したここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体のアミノ酸配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一のおよび／または１、２、３またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する重鎖可変領域からの少なくとも１、２または３のＣＤＲおよび／または高度可変ループを含む。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、表１に要約したここに記載する抗体、例えば、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅから選択される抗体のアミノ酸配列またはそれにと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一のおよび／または１、２、３またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する軽鎖可変領域からの少なくとも１、２または３のＣＤＲおよび／または高度可変ループを含む。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する、例えば、表１に記載する、全部で６のＣＤＲおよび／または高度可変ループを含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、ここに記載する可変領域(例えば、ここに開示するＦＲ領域)と配列が同一であるまたは１、２、３または４のアミノ酸が異なる可変領域を有する。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、完全抗体またはそのフラグメント(例えば、Ｆａｂ、Ｆ(ａｂ’)２、Ｆｖまたは一本鎖Ｆｖフラグメント(ｓｃＦｖ))である。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、モノクローナル抗体または単一特異性を有する抗体である。抗ＰＤ−１抗体分子はまたヒト化、キメラ、ラクダ類、サメまたはインビトロ生成抗体分子であり得る。ある態様において、その抗ＰＤ−１抗体分子はヒト化抗体分子である。抗ＰＤ−１抗体分子の重鎖および軽鎖は完全長(例えば、抗体は少なくとも１、好ましくは２の完全重鎖および少なくとも１、好ましくは２の完全軽鎖を含み得る)であっても、抗原結合フラグメント(例えば、Ｆａｂ、Ｆ(ａｂ’)２、Ｆｖ、一本鎖Ｆｖフラグメント、単一ドメイン抗体、二重特異性抗体(ｄＡｂ)、二価抗体または二重特異性抗体またはそのフラグメント、その単一ドメインバリアントまたはラクダ類抗体)であってもよい。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は二重特異性または多特異性抗体分子の形である。ある態様において、二重特異性抗体分子は、ＰＤ−１に対する第一結合特異性およびＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＣＥＡＣＡＭ(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１、ＣＥＡＣＡＭ−３および／またはＣＥＡＣＡＭ−５)、ＰＤ−Ｌ１またはＰＤ−Ｌ２に対する第二結合特異性を有する。ある態様において、二重特異性抗体分子はＰＤ−１およびＴＩＭ−３に結合する。他の態様において、二重特異性抗体分子はＰＤ−１およびＬＡＧ−３に結合する。他の態様において、二重特異性抗体分子はＰＤ−１およびＣＥＡＣＡＭ(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１、ＣＥＡＣＡＭ−３および／またはＣＥＡＣＡＭ−５)に結合する。他の態様において、二重特異性抗体分子はＰＤ−１およびＣＥＡＣＡＭ−１に結合する。さらに別の態様において、二重特異性抗体分子はＰＤ−１およびＣＥＡＣＡＭ−５に結合する。他の態様において、二重特異性抗体分子はＰＤ−１およびＰＤ−Ｌ１に結合する。さらに別の態様において、二重特異性抗体分子はＰＤ−１およびＰＤ−Ｌ２に結合する。前記分子のあらゆる組み合わせを、多特異性抗体分子、例えば、ＰＤ−１に対する第一結合特異性およびＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＣＥＡＣＡＭ(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１、ＣＥＡＣＡＭ−３またはＣＥＡＣＡＭ−５)、ＰＤ−Ｌ１またはＰＤ−Ｌ２の１以上に対する第二および第三の結合特異性を含む三重特異性抗体とし得る。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、ＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＣＥＡＣＡＭ(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１、ＣＥＡＣＡＭ−３またはＣＥＡＣＡＭ−５)、ＰＤ−Ｌ１またはＰＤ−Ｌ２の１以上を含む二重特異性分子と組み合わせて使用する。ある態様において、組み合わせに使用された二重特異性抗体分子は、ＣＥＡＣＡＭ(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１、ＣＥＡＣＡＭ−３および／またはＣＥＡＣＡＭ−５)およびＬＡＧ−３と結合する。他の態様において、組み合わせに使用された二重特異性抗体分子はＣＥＡＣＡＭ(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１、ＣＥＡＣＡＭ−３および／またはＣＥＡＣＡＭ−５)およびＴＩＭ−３と結合する。他の態様において、組み合わせに使用された二重特異性抗体分子はＬＡＧ−３およびＴＩＭ−３と結合する。
さらに他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＭ、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、ＩｇＤおよびＩｇＥの重鎖定常領域から選択される、特に、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３およびＩｇＧ４の重鎖定常領域、より具体的には、ＩｇＧ１またはＩｇＧ２の重鎖定常領域(例えば、ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２またはＩｇＧ４)から選択される、重鎖定常領域(Ｆｃ)を有する。ある態様において、重鎖定常領域はヒトＩｇＧ１である。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、例えば、カッパまたはラムダの軽鎖定常領域、好ましくはカッパ(例えば、ヒトカッパ)から選択される軽鎖定常領域を有する。ある態様において、定常領域は、抗ＰＤ−１抗体分子の特性を修飾するために、改変、例えば変異させる(例えば、Ｆｃ受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基数、エフェクター細胞機能または補体機能の１以上の増加または減少のため)。例えば、定常領域は２９６位(ＭからＹ)、２９８位(ＳからＴ)、３００位(ＴからＥ)、４７７位(ＨからＫ)および４７８位(ＮからＦ)で変異させて、Ｆｃ受容体結合が改変される(例えば、変異の位置は、配列番号２１２または２１４の１３２位(ＭからＹ)、１３４位(ＳからＴ)、１３６位(ＴからＥ)、３１３位(ＨからＫ)および３１４位(ＮからＦ)；または配列番号２１５、２１６、２１７または２１８の１３５位(ＭからＹ)、１３７位(ＳからＴ)、１３９位(ＴからＥ)、３１６位(ＨからＫ)および３１７位(ＮからＦ)に対応する)。他の態様において、ＩｇＧ４、例えば、ヒトＩｇＧ４の重鎖定常領域は、例えば、表３に示すように、ＥＵ番号付けによる２２８位が変異されている(例えば、ＳからＰ)。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、例えば、表３に示すように、ＥＵ番号付けによる２２８位が変異した(例えば、ＳからＰ)ヒトＩｇＧ４；および例えば、表３に示す、カッパ軽鎖定常領域を含む。さらに別の態様において、ＩｇＧ１、例えば、ヒトＩｇＧ１の重鎖定常領域は、例えば、表３に示すように、ＥＵ番号付けによる２９７位(例えば、ＮからＡ)、ＥＵ番号付けによる２６５位(例えば、ＤからＡ)、ＥＵ番号付けによる３２９位(例えば、ＰからＡ)、ＥＵ番号付けによる２３４位(例えば、ＬからＡ)またはＥＵ番号付けによる２３５位(例えば、ＬからＡ)の１箇所以上で変異されている。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、例えば、表３に示すように、前記位置の１箇所以上が変異されたヒトＩｇＧ１；および例えば、表３に示す、カッパ軽鎖定常領域を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は単離されているかまたは組み換えである。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子はヒト化抗体分子である。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、７００、６００、５００、４００またはそれ未満のＴ細胞エピトープ分析に基づくリスクスコアを有する。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子はヒト化抗体分子であり、Ｔ細胞エピトープ分析に基づく３００〜７００、４００〜６５０、４５０〜６００のリスクスコアまたはここに記載するリスクスコアを有する。
本発明はまた、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子の重鎖および軽鎖可変領域、ＣＤＲ、高度可変ループ、フレームワーク領域をコードする一方または両方のヌクレオチド配列を含む核酸分子に関する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子をコードするヌクレオチド配列はコドン最適化される。例えば、本発明は、例えば、表１に要約するＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅのいずれかまたはそれと実質的に同一の配列から選択される、抗ＰＤ−１抗体分子の、それぞれ、重鎖および軽鎖可変領域をコードする第一および第二抗体に関する。例えば、核酸は、表１および２に示すヌクレオチド配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一の配列または表１および２に示す配列と３、６、１５、３０または４５ヌクレオチドを超えて異ならないもの)を含み得る。
他の態様において、核酸分子は、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅのアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび／または重鎖定常領域をコードするヌクレオチド配列；または表１に記載のとおり；または表１におけるヌクレオチド配列；または前記配列のいずれかと実質的に同一である配列(例えば、少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一である配列)を含む。
他の態様において、核酸分子は、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅのアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインおよび／または軽鎖定常領域をコードするヌクレオチド配列；または表１に記載のとおり；または表１におけるヌクレオチド配列；または前記配列のいずれかと実質的に同一である配列(例えば、少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一である配列)を含む。
抗ＰＤ−１重鎖および軽鎖可変ドメインおよび定常領域をコードする前記ヌクレオチド配列は別の核酸分子または同じ核酸分子に存在できる。ある態様において、核酸分子は、リーダー配列、例えば、表４に示すリーダー配列またはそれと実質的に同一である配列をコードするヌクレオチド配列を含む。
ある態様において、核酸分子は、表１に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同である配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一のおよび／または１、２、３またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する重鎖可変領域からの、少なくとも１、２または３のＣＤＲまたは高度可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む。
他の態様において、核酸分子は、表１に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同である配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一のおよび／または１、２、３またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する軽鎖可変領域からの、少なくとも１、２または３のＣＤＲまたは高度可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む。
さらに別の態様において、核酸分子は、表１に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同である配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上の同一性および／または１、２、３またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する重鎖および軽鎖可変領域からの、少なくとも１、２、３、４、５または６のＣＤＲまたは高度可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む。
ある態様において、核酸分子は、軽可変領域の１０２位に軽鎖ＣＤＲ３における置換、例えば、表１の軽可変領域の１０２位のシステイン残基からチロシン残基へのまたはシステイン残基からセリン残基への置換(例えば、非修飾マウスまたはキメラについて配列番号１６または２４；または修飾配列について配列番号３４、４２、４６、５４、５８、６２、６６、７０、７４または７８のいずれか)を含む、抗ＰＤ−１抗体分子をコードするヌクレオチド配列を含む。
他の態様において、核酸分子は、表１および２に要約するＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅのいずれかまたはそれと実質的に同一の配列のための、１以上の重鎖フレームワーク領域(例えば、ＶＨＦＷ１(タイプａ)、ＶＨＦＷ１(タイプｂ)、ＶＨＦＷ２(タイプａ)、ＶＨＦＷ２(タイプｂ)、ＶＨＦＷ２(タイプｃ)、ＶＨＦＷ３(タイプａ)、ＶＨＦＷ３(タイプｂ)またはＶＨＦＷ４のいずれかまたは任意のこれらの組み合わせ、例えば、ここに記載するフレームワーク組み合わせ)を含む。例えば、核酸分子は、表１および２に示すヌクレオチド配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一の配列または表１および２に示す配列と３、６、１５、３０または４５ヌクレオチドを超えて異ならないもの)を含み得る。
他の態様において、核酸分子は、表１および２に要約するＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０６、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０７、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１２、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１３、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１４、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｂ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｃ、ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−ＤまたはＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅのいずれかまたはそれと実質的に同一の配列のための、１以上の軽鎖フレームワーク領域(例えば、ＶＬＦＷ１(タイプａ)、ＶＬＦＷ１(タイプｂ)、ＶＬＦＷ１(タイプｃ)、ＶＬＦＷ１(タイプｄ)、ＶＬＦＷ１(タイプｅ)、ＶＬＦＷ２(タイプａ)、ＶＬＦＷ２(タイプｂ)、ＶＬＦＷ２(タイプｃ)、ＶＬＦＷ３(タイプａ)、ＶＬＦＷ３(タイプｂ)、ＶＬＦＷ３(タイプｃ)、ＶＬＦＷ３(タイプｄ)またはＶＬＦＷ４のいずれかまたは任意のこれらの組み合わせ、例えば、ここに記載するフレームワーク組み合わせ)を含む。例えば、核酸分子は、表１および２に示すヌクレオチド配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一の配列または表１および２に示す配列と３、６、１５、３０または４５ヌクレオチドを超えて異ならないもの)を含み得る。
他の態様において、核酸分子は、ここに記載する１以上の重鎖フレームワーク領域および１以上の軽鎖フレームワーク領域を含む。重鎖および軽鎖フレームワーク領域は同じベクターまたは異なるベクターに存在し得る。
他の面において、本願は、ここに記載する核酸を含む宿主細胞およびベクターに関する。核酸は、単一ベクターまたは同じ宿主細胞もしくは異なる宿主細胞に存在する異なるベクターに存在し得る。宿主細胞は、真核細胞、例えば、哺乳動物細胞、昆虫細胞、酵母細胞または原核細胞、例えば、大腸菌であり得る。例えば、哺乳動物細胞は培養細胞または細胞株であり得る。代表的哺乳動物細胞は、リンパ性細胞株(例えば、ＮＳＯ)、チャイニーズハムスター卵巣細胞(ＣＨＯ)、ＣＯＳ細胞、卵母細胞およびトランスジェニック動物由来の細胞、例えば、乳房上皮細胞を含む。
一つの面において、本発明は、ここに記載する抗体分子を提供する方法に関する。本方法は、ＰＤ−１抗原(例えば、ＰＤ−１エピトープの少なくとも一部を含む抗原)を提供し；ＰＤ−１ポリペプチドに特異的に結合する抗体分子を得て；抗体分子がＰＤ−１ポリペプチドに特異的に結合するかを評価するかまたはＰＤ−１の活性の調節、例えば阻害における抗体分子の効力を評価することを含む。本方法は、さらに、該抗体分子を対象、例えば、ヒトまたは非ヒト動物に投与することを含み得る。
他の面において、本発明は、薬学的に許容される担体、添加物または安定化剤およびここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子の少なくとも１種を含む、組成物、例えば、医薬組成物を提供する。ある態様において、組成物、例えば、医薬組成物は、ここに記載するように、抗体分子と、１種以上の薬剤、例えば、治療剤または他の抗体分子の組み合わせを含む。ある態様において、抗体分子は、標識または治療剤にコンジュゲートされる。
ここに開示する抗ＰＤ−１抗体分子はＰＤ−１の活性の１以上を阻害、低下または中和でき、免疫チェックポイントの遮断または減少に至る。ある態様において、抗体分子は、腫瘍浸潤性リンパ球増加、Ｔ細胞受容体介在増殖増加、癌性細胞による免疫回避減少、エフェクター細胞機能の回復(例えば、Ｔ細胞増殖、ＩＦＮ−γ分泌または細胞溶解性機能の１以上)、制御性Ｔ細胞機能の阻害または制御性Ｔ細胞、エフェクターＴ細胞およびＮＫ細胞のような複数の細胞型の活性に対する効果を生じる。それゆえに、このような抗体分子は、対象における免疫応答の増強が望まれる障害の処置または予防に使用できる。
抗ＰＤ−１抗体分子の使用
したがって、他の面において、対象における免疫応答を調節する方法が提供される。本方法は、対象における免疫応答が調節されるように、ここに開示する抗ＰＤ−１抗体分子(例えば、抗ＰＤ−１抗体分子の治療有効量)を、単独でまたは１種以上の薬剤または方法と組み合わせて投与することを含む。ある態様において、抗体分子は、対象における免疫応答を増強、刺激または増加する。対象は、哺乳動物、例えば、霊長類、好ましくは高等霊長類、例えば、ヒト(例えば、ここに記載する障害を有するまたは有するリスクのある患者)であり得る。ある態様において、対象は、免疫応答増強の必要性がある。ある態様において、対象は、ここに記載する障害、例えば、ここに記載する癌または感染性障害を有するかまたは有するリスクがある。ある態様において、対象は免疫無防備状態であるかまたはそのリスクがある。例えば、対象は化学療法剤処置および／または放射線療法を受けているかまたは受けた。これとは別にまたはこれと組み合わせて、対象は感染の結果として、免疫無防備状態であるかまたはそのリスクがある。
一つの面において、対象における癌または腫瘍を処置(例えば、減少、阻止または進行遅延の１以上)する方法が提供される。本方法は、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、抗ＰＤ−１抗体分子の治療有効量を、単独でまたは１種以上の薬剤または方法と組み合わせて投与することを含む。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、例えば、ここに記載するように、共刺激分子のモジュレーター(例えば、共刺激分子のアゴニスト)または阻害分子のモジュレーター(例えば、免疫チェックポイント阻害剤の阻害剤)と組み合わせて投与する。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子で処置する癌は、固形腫瘍、造血器癌(例えば、白血病、リンパ腫、骨髄腫、例えば、多発性骨髄腫)および転移病変を含むが、これらに限定されない。ある態様において、癌は固形腫瘍である。固形腫瘍の例は、悪性腫瘍、例えば、肉腫および癌、例えば、肺、乳房、卵巣、リンパ系、消化器(例えば、結腸)、肛門、生殖器および尿生殖器管(例えば、腎臓、尿路上皮性、膀胱細胞、前立腺)、咽頭、ＣＮＳ(例えば、脳、神経またはグリア細胞)、頭頸部、皮膚(例えば、黒色腫)および膵臓に影響するような多様な臓器系の腺癌、ならびに結腸癌、直腸癌、腎細胞癌、肝臓癌、非小細胞性肺癌、小腸癌および食道癌のような悪性腫瘍を含む腺癌を含む。癌は、初期段階、中期段階、後期段階または転移癌であり得る。
ある態様において、癌は、肺癌(例えば、非小細胞性肺癌(ＮＳＣＬＣ)(例えば、扁平上皮および／または非扁平上皮組織でのＮＳＣＬＣまたはＮＳＣＬＣ腺癌))、黒色腫(例えば、進行型黒色腫)、腎臓癌(例えば、腎細胞癌)、肝臓癌、骨髄腫(例えば、多発性骨髄腫)、前立腺癌、乳癌(例えば、エストロゲン受容体、プロゲステロン受容体またはＨｅｒ２／ｎｅｕの１、２または全てを発現しない乳癌、例えば、三種陰性乳癌)、結腸直腸癌、膵臓癌、頭頸部癌(例えば、頭頸部扁平上皮細胞癌(ＨＮＳＣＣ)、肛門癌、胃食道癌、甲状腺癌、子宮頸癌、リンパ増殖性疾患(例えば、移植後リンパ増殖性疾患)または造血器癌、Ｔ細胞リンパ腫、Ｂ細胞リンパ腫、非ホジキンリンパ腫または白血病(例えば、骨髄球性白血病またはリンパ系白血病)から選択される。
他の態様において、癌は細胞腫(例えば、進行型または転移癌)、黒色腫または肺癌、例えば、非小細胞肺癌から選択される。
ある態様において、癌は肺癌、例えば、非小細胞性肺癌または小細胞肺癌である。
ある態様において、癌は黒色腫、例えば、進行型黒色腫である。ある態様において、癌は、他の治療に応答しない進行型または切除不能黒色腫である。他の態様において、癌はＢＲＡＦ変異(例えば、ＢＲＡＦ Ｖ６００変異)を有する黒色腫である。さらに他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子ＢＲＡＦ阻害剤(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)と併用するまたは併用しない抗ＣＴＬＡ４抗体(例えば、イピリムマブ)での処置後に投与する。
他の態様において、癌はウイルス感染、例えば、慢性ウイルス性肝炎を伴うまたは伴わない肝癌、例えば、進行型肝癌である。
他の態様において、癌は前立腺癌、例えば、進行型前立腺癌である。
さらに別の態様において、癌は骨髄腫、例えば、多発性骨髄腫である。
さらに別の態様において、癌は腎臓癌、例えば、腎細胞癌(ＲＣＣ)(例えば、転移ＲＣＣまたは明細胞腎細胞癌(ＣＣＲＣＣ))である。
ある態様において、癌微小環境のＰＤ−Ｌ１発現レベルは増加している。これとは別にまたはこれと組み合わせて、癌微小環境はＩＦＮ−γおよび／またはＣＤ８発現増加していてよい。
ある態様において、対象は、１以上の高いＰＤ−Ｌ１レベルまたは発現または腫瘍浸潤性リンパ球(ＴＩＬ)＋である(例えば、ＴＩＬの数が増加しているとして)またはその両者である腫瘍を有するまたは有するとして同定される。ある態様において、対象は、高いＰＤ−Ｌ１レベルまたは発現かつＴＩＬ＋である腫瘍を有するまたは有するとして同定される。ある態様において、ここに記載する方法は、１以上の高いＰＤ−Ｌ１レベルまたは発現を有するまたはＴＩＬ＋であるまたは両者であることに基づき対象を同定することをさらに含む。ある態様において、ここに記載する方法は、さらに、高いＰＤ−Ｌ１レベルまたは発現を有し、かつＴＩＬ＋である腫瘍を有することに基づき対象を同定することを含む。ある態様において、ＴＩＬ＋である腫瘍は、ＣＤ８およびＩＦＮ−γ陽性である。ある態様において、対象は、ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８および／またはＩＦＮ−γの１以上が陽性である細胞のパーセンテージを有するまたは有するとして同定される。ある態様において、対象はＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８およびＩＦＮ−γの全てが陽性である細胞の高いパーセンテージを有するまたは有するとして同定される。
ある態様において、ここに記載する方法は、さらに、ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８および／またはＩＦＮ−γの１以上が陽性である細胞の高いパーセンテージに基づき対象を同定することを含む。ある態様において、ここに記載する方法は、さらに、ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８および／またはＩＦＮ−γの全てが陽性である細胞の高いパーセンテージに基づき対象を同定することを含む。ある態様において、対象は、ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８および／またはＩＦＮ−γの１、２またはそれ以上および肺癌、例えば、扁平上皮細胞肺癌または肺腺癌、頭頸部癌、扁平上皮細胞子宮頸癌、胃癌、食道癌、甲状腺癌、黒色腫および／または鼻咽頭癌(ＮＰＣ)の１以上を有するまたは有するとして同定される。ある態様において、ここに記載する方法は、さらに、ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８および／またはＩＦＮ−γの１、２またはそれ以上および肺癌、例えば、扁平上皮細胞肺癌または肺腺癌、頭頸部癌、扁平上皮細胞子宮頸癌、胃癌、甲状腺癌、黒色腫および／または鼻咽頭癌の１以上を有することに基づき対象を同定することを記載する。
ここに記載する方法および組成物は、前記癌と関連する転移病変の処置に有用である。
さらなる面において、本発明は、対象にここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子の治療有効量を、単独でまたは１種以上の薬剤または方法と組み合わせて投与することを含む、対象における感染性疾患の処置方法を提供する。ある態様において、感染疾患は肝炎(例えば、Ｃ型肝炎感染)または敗血症から選択される。
なおさらに、本発明は対象における抗原に対する免疫応答を増強する方法であって、対象に、対象における抗原に対する免疫応答が増強されるように、(ｉ)抗原；および(ii)抗ＰＤ−１抗体分子を含む方法を提供する。抗原は、例えば、腫瘍抗原、ウイルス抗原、細菌抗原または病原体からの抗原であり得る。
抗ＰＤ−１抗体分子は、対象に全身性に(例えば、経口、非経腸、皮下、静脈内、直腸、筋肉内、腹腔内、鼻腔内、経皮または吸入または腔内設置)、局所的または鼻、喉および気管支のような粘膜への適用により投与できる。
抗ＰＤ−１抗体分子の用量および治療は当業者により決定され得る。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、約１〜３０mg／kg、例えば、約５〜２５mg／kg、約１０〜２０mg／kg、約１〜５mg／kgまたは約３mg／kgの用量で注射(例えば、皮下または静脈内)により投与する。投薬スケジュールは、例えば、週１回ないし２週毎、３週毎または４週毎まで変化し得る。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を隔週、約１０〜２０mg／kgの用量で投与する。
ここに記載する抗体分子は、ここに記載する方法における使用に好ましいが、他の抗ＰＤ−１抗体を本発明の抗ＰＤ−１抗体分子の変わりにまたはそれと組み合わせて使用できる。
組み合わせ治療
ここに記載する方法および組成物を、他の薬剤または治療法と組み合わせて使用できる。ある態様において、ここに記載する方法は、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、障害の処置または予防に有効な量で、薬剤または治療法またはモダリティと組み合わせて投与することを含む。抗ＰＤ−１抗体分子と薬剤または治療法もしくはモダリティを、同時にまたは任意の順番で逐次的に投与できる。抗ＰＤ−１抗体分子および他の治療剤、方法またはモダリティ(例えば、ここに記載の)のあらゆる組み合わせおよび順番を使用できる。抗体分子および／または他の治療剤、方法またはモダリティを、活動性障害の期間または寛解または低活動性疾患の期間に投与できる。抗体分子を、他の処置の前に、処置と同時に、処置後にまたは障害の寛解中に投与できる。
ある態様において、ここに記載する方法および組成物を、他の抗体分子、化学療法剤、他の抗癌治療剤(例えば、標的抗癌治療剤、遺伝子治療、ウイルス治療、ＲＮＡ治療、骨髄移植、ナノ治療または腫瘍溶解剤)、細胞毒性剤、免疫ベースの治療(例えば、サイトカインまたは細胞ベースの免疫療法)、外科手技(例えば、乳腺腫瘍摘出術または乳房切除術)または放射線法または前記のいずれかの組み合わせの１以上と組み合わせて投与する。さらなる治療はアジュバントまたはネオアジュバント治療の形であり得る。ある態様において、さらなる治療は酵素阻害剤(例えば、小分子酵素阻害剤)または転移阻害剤である。併用投与できる代表的細胞毒性剤の例は微小管阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤、代謝拮抗剤、有糸分裂阻害剤、アルキル化剤、アントラサイクリン、ビンカアルカロイド、挿入剤、シグナル伝達経路を妨害できる薬剤、アポトーシスを促進する薬剤、プロテオソーム阻害剤および照射(例えば、局所または全身照射(例えば、ガンマ照射)を含む。他の態様において、さらなる治療は手術または照射またはこれらの組み合わせである。他の態様において、さらなる治療は、ＰＩ３Ｋ／ＡＫＴ／ｍＴＯＲ経路の１以上を標的とする治療、ＨＳＰ９０阻害剤またはチューブリン阻害剤である。
前記組み合わせとは別にまたはそれと組み合わせて、ここに記載する方法および組成物を、免疫調節剤(例えば、共刺激分子のアクティベーターまたは阻害分子の阻害剤、例えば、免疫チェックポイント分子)；ワクチン、例えば、治療的癌ワクチン；または細胞性免疫療法の他の形態の１以上と組み合わせて投与できる。
抗ＰＤ−１抗体分子の代表的非限定的組み合わせおよび使用は次のものを含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を共刺激分子のモジュレーターまたは阻害分子、例えば、共阻害リガンドまたは受容体と組み合わせて投与する。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、共刺激分子のモジュレーター、例えば、アゴニストと組み合わせて投与する。ある態様において、共刺激分子のアゴニストは、ＯＸ４０、ＣＤ２、ＣＤ２７、ＣＤＳ、ＩＣＡＭ−１、ＬＦＡ−１(ＣＤ１１ａ／ＣＤ１８)、ＩＣＯＳ(ＣＤ２７８)、４−１ＢＢ(ＣＤ１３７)、ＧＩＴＲ、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＢＡＦＦＲ、ＨＶＥＭ、ＣＤ７、ＬＩＧＨＴ、ＮＫＧ２Ｃ、ＳＬＡＭＦ７、ＮＫｐ８０、ＣＤ１６０、Ｂ７−Ｈ３またはＣＤ８３リガンドのアゴニスト(例えば、アゴニスト抗体またはその抗原結合フラグメントまたは可溶性融合物)から選択される。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、ＣＴＬＡ−４、ＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＣＥＡＣＡＭ(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１、ＣＥＡＣＡＭ−３および／またはＣＥＡＣＡＭ−５)、ＶＩＳＴＡ、ＢＴＬＡ、ＴＩＧＩＴ、ＬＡＩＲ１、ＣＤ１６０、２Ｂ４および／またはＴＧＦＲベータから選択される阻害(または免疫チェックポイント)分子の阻害剤と組み合わせて投与する。阻害分子の阻害はＤＮＡ、ＲＮＡまたはタンパク質レベルでの阻害により実施できる。複数の態様において、阻害核酸(例えば、ｄｓＲＮＡ、ｓｉＲＮＡまたはｓｈＲＮＡ)を阻害分子の発現を阻害するために使用できる。他の態様において、阻害シグナルの阻害剤は、阻害分子に結合するポリペプチド、例えば、可溶性リガンドまたは抗体またはその抗原結合フラグメントである。ある態様において、阻害剤は、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２またはＣＴＬＡ−４に結合する可溶性リガンド(例えば、ＣＴＬＡ−４−Ｉｇ)または抗体または抗体フラグメントである。例えば、抗ＰＤ−１抗体分子を抗ＣＴＬＡ−４抗体、例えば、イピリムマブと組み合わせて投与して、例えば、癌(例えば、黒色腫、例えば、転移黒色腫、肺癌、例えば、非小細胞肺癌または前立腺癌から選択される癌)を処置できる。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、ＢＲＡＦ阻害剤(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)を併用するまたは併用しない抗ＣＴＬＡ−４抗体(例えば、イピリムマブ)での処置後に投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合フラグメントと組み合わせて投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合フラグメントと組み合わせて投与する。
さらに他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を抗ＬＡＧ−３抗体および抗ＴＩＭ−３抗体(またはその抗原結合フラグメント)と組み合わせて投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子をＣＥＡＣＡＭ阻害剤(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１および／またはＣＥＡＣＡＭ−５阻害剤)、例えば、抗ＣＥＡＣＡＭ抗体分子と組み合わせて投与する。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子をＣＥＡＣＡＭ−１阻害剤、例えば、抗ＣＥＡＣＡＭ−１抗体分子と組み合わせて投与する。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子をＣＥＡＣＡＭ−５阻害剤、例えば、抗ＣＥＡＣＡＭ−５抗体分子と組み合わせて投与する。
ここに記載する抗体の組み合わせは、別々に、例えば、別々の抗体またはその抗原結合フラグメントとしてまたは、例えば、二重特異性または三重特異性抗体分子として連結して、投与できる。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子および抗ＴＩＭ−３、抗ＣＥＡＣＡＭ(例えば、抗ＣＥＡＣＡＭ−１、ＣＥＡＣＡＭ−３および／または抗ＣＥＡＣＡＭ−５)または抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合フラグメントを含む二重特異性抗体を投与する。ある態様において、ここに記載する抗体の組み合わせを、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、固形腫瘍または血液系腫瘍)の処置に使用する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子をサイトカインと組み合わせて投与する。サイトカインを抗ＰＤ−１抗体分子との融合分子としてまたは別々の組成物として投与できる。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体を、１種、２種、３種またはそれ以上のサイトカインと、例えば、融合分子としてまたは別々の組成物として投与する。ある態様において、サイトカインは、インターロイキン(ＩＬ)−１、ＩＬ−２、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５またはＩＬ−２１の１、２、３またはそれ以上から選択されるＩＬである。ある態様において、二重特異性抗体分子は第一標的に対する第一結合特異性(例えば、ＰＤ−１)、第二標的に対する第二結合特異性(例えば、ＬＡＧ−３またはＴＩＭ−３)を有し、所望によりインターロイキン(例えば、ＩＬ−１２)ドメイン、例えば完全長ＩＬ−１２またはその一部と連結している。ある態様において、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子とサイトカインの組み合わせを癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、固形腫瘍)の処置に使用する。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、ＨＬＡ Ｃに特異的な抗体、例えば、キラー細胞免疫グロブリン様受容体に特異的な抗体(ここでは“抗ＫＩＲ抗体”とも呼ぶ)と組み合わせて投与する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子と抗ＫＩＲ抗体の組み合わせを、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、固形腫瘍、例えば、進行型固形腫瘍)の処置に使用する。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、細胞性免疫療法(例えば、プロベンジ(登録商標)(例えば、シプロイセルＴ))と組み合わせて、および所望によりシクロホスファミドと組み合わせて投与する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、プロベンジ(登録商標)および／またはシクロホスファミドの組み合わせを、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、前立腺癌、例えば、進行型前立腺癌)の処置に使用する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子をワクチン、例えば、癌ワクチン(例えば、樹状細胞腎臓癌(ＤＣ−ＲＣＣ)ワクチン)と組み合わせて投与する。ある態様において、ワクチンはペプチドベース、ＤＮＡベース、ＲＮＡベースまたは抗原ベースまたはこれらの組み合わせである。複数の態様において、ワクチンは、１以上のペプチド、核酸(例えば、ＤＮＡまたはＲＮＡ)、抗原またはこれらの組み合わせを含む。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子とＤＣ−ＲＣＣワクチンの組み合わせを、例えば、ここに記載する癌(例えば、腎臓癌、例えば、転移腎細胞癌(ＲＣＣ)または明細胞腎細胞癌(ＣＣＲＣＣ))の処置に使用する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子をアジュバントと組み合わせて使用する。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を化学療法剤および／または免疫療法と組み合わせて使用する。例えば、抗ＰＤ−１抗体分子を、単特でまたは化学療法剤または他の抗癌剤(例えば、サリドマイドアナログ、例えば、レナリドマイド)、抗ＴＩＭ−３抗体、腫瘍抗原パルス樹状細胞、腫瘍細胞および樹状細胞の融合体(例えば、電気融合体)または悪性形質細胞により産生した免疫グロブリンイディオタイプでのワクチン接種と組み合わせて使用して、骨髄腫を処置できる。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、骨髄腫、例えば、多発性骨髄腫を処置するために抗ＴＩＭ−３抗体と組み合わせて使用する。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を肺癌、例えば、非小細胞性肺癌の処置のために化学療法剤と組み合わせて使用する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、肺癌を処置するために標準的な、肺、例えば、ＮＳＣＬＣの化学療法剤、例えば、プラチナダブレット療法と使用する。さらに他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子をインドールアミン−ピロール２,３−ジオキシゲナーゼ(ＩＤＯ)阻害剤(例えば、(４Ｅ)−４−[(３−クロロ−４−フルオロアニリノ)−ニトロソメチリデン]−１,２,５−オキサジアゾール−３−アミン(ＩＮＣＢ２４３６０としても既知)、インドキシモド(１−メチル−Ｄ−トリプトファン)、α−シクロヘキシル−５Ｈ−イミダゾ[５,１−ａ]イソインドール−５−エタノール(ＮＬＧ９１９としても既知)など)と組み合わせて、進行型または転移癌(例えば、転移性および再発性ＮＳＣＬ癌を有する患者)に使用する。
さらに他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、免疫ベース戦略(例えば、インターロイキン−２またはインターフェロン−α)、ターゲティング剤(例えば、ＶＥＧＦに対するモノクローナル抗体のようなＶＥＧＦ阻害剤)；スニチニブ、ソラフェニブ、アクシチニブおよびパゾパニブのようなＶＥＧＦチロシンキナーゼ阻害剤；ＲＮＡｉ阻害剤；またはＶＥＧＦシグナル伝達の下流メディエーターの阻害剤、例えば、ラパマイシンの哺乳動物標的(ｍＴＯＲ)の阻害剤、例えば、エベロリムスおよびテムシロリムスの１以上と組み合わせて使用する。あらゆるこのような組み合わせを、腎臓癌、例えば、腎細胞癌(ＲＣＣ)(例えば、明細胞腎細胞癌(ＣＣＲＣＣ))または転移ＲＣＣの処置に使用できる。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、ＭＥＫ阻害剤(例えば、ここに記載するＭＥＫ阻害剤)と組み合わせて使用する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体とＭＥＫ阻害剤の組み合わせを癌(例えば、ここに記載する癌)の処置に使用する。ある態様において、該組み合わせにより処置する癌は黒色腫、結腸直腸癌、非小細胞性肺癌、卵巣癌、乳癌、前立腺癌、膵臓癌、造血器腫瘍または腎細胞癌から選択される。ある態様において、癌はＢＲＡＦ変異(例えば、ＢＲＡＦ Ｖ６００Ｅ変異)、ＢＲＡＦ野生型、ＫＲＡＳ野生型または活性化ＫＲＡＳ変異を含む。癌は初期段階、中期段階または後期段階であり得る。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子をオキサリプラチン、ロイコボリンまたは５−ＦＵ(例えば、ＦＯＬＦＯＸ共処置)の１、２または全てと組み合わせて使用する。これとは別にまたはこれと組み合わせて、組み合わせはさらにＶＥＧＦ阻害剤(例えば、ここに開示するＶＥＧＦ阻害剤)を含む。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体、ＦＯＬＦＯＸ共処置およびＶＥＧＦ阻害剤の組み合わせを癌(例えば、ここに記載する癌)の処置に使用する。ある態様において、該組み合わせにより処置する癌は黒色腫、結腸直腸癌、非小細胞性肺癌、卵巣癌、乳癌、前立腺癌、膵臓癌、造血器腫瘍または腎細胞癌から選択される。癌は初期段階、中期段階または後期段階であり得る。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を腎細胞癌および他の固形腫瘍の処置のためにチロシンキナーゼ阻害剤(例えば、アクシチニブ)と投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、４−１ＢＢ受容体ターゲティング剤(例えば、４−１ＢＢ(ＣＤ−１３７)を経るシグナル伝達を刺激する抗体、例えば、ＰＦ−２５６６)と投与する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子をチロシンキナーゼ阻害剤(例えば、アクシチニブ)および４−１ＢＢ受容体ターゲティング剤と組み合わせて投与する。
抗ＰＤ−１抗体分子を物質、例えば、細胞毒性剤または部分(例えば、治療的薬物；放射線放射化合物；植物、真菌または細菌起源の分子；または生物学的タンパク質(例えば、タンパク質毒素)または粒子(例えば、例えば、ウイルス外被タンパク質を経る組み換えウイルス粒子)に結合できる。例えば、抗体をα−、β−またはγ−エミッターまたはβ−およびγ−エミッターのような放射性同位体とカップリングできる。
抗ＰＤ−１抗体分子および他の治療剤、方法またはモダリティ(例えば、ここに記載のような)の組み合わせおよび順番を使用できる。抗体分子および／または他の治療剤、方法またはモダリティを、活動性障害の期間または寛解または低活動性疾患の期間に投与できる。抗体分子を、他の処置の前に、処置と同時に、処置後にまたは障害の寛解中に投与できる。
さらなる組み合わせ治療
ここに記載する方法および組成物(例えば、ＰＤ−１抗体およびその使用法)を、他の薬剤または治療法、例えば、表７に挙げる１以上の薬剤から選択される第二治療剤と組み合わせて使用できる。ある態様において、ここに記載する方法は、対象にここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子(所望によりＰＤ−Ｌ１、ＬＡＧ−３、ＴＩＭ−３、ＣＥＡＣＡＭ(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１および／またはＣＥＡＣＡＭ−５の１以上の阻害剤と組み合わせて)またはＣＴＬＡ−４))を投与することを含み、さらに、障害、例えば、ここに記載する障害、例えば、癌の処置または予防に有効な量で、表７に挙げる薬剤の１以上から選択される第二治療剤を投与することを含む。組み合わせて投与するとき、抗ＰＤ−１抗体分子、さらなる薬剤(例えば、第二または第三薬剤)または全てを、個々に、例えば、単剤療法として使用する各薬剤の量または投与より高い、低いまたは同じ量または用量で投与できる。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体、さらなる薬剤(例えば、第二または第三薬剤)または全ての投与する量または用量は、個々に、例えば、単剤療法として使用する各薬剤の量または用量より低い(例えば、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％または少なくとも５０％)。他の態様において、所望の効果(例えば、癌の処置)を生じる抗ＰＤ−１抗体、さらなる薬剤(例えば、第二または第三薬剤)または全ての量または用量は低い(例えば、少なくとも２０％、少なくとも３０％、少なくとも４０％または少なくとも５０％低い)。
他の態様において、第二治療剤は、表７に挙げる薬剤の１以上から選択される。ある態様において、癌は肺癌(例えば、非小細胞性肺癌(ＮＳＣＬＣ)(例えば、扁平上皮および／または非扁平上皮組織学を伴うＮＳＣＬＣまたはＮＳＣＬＣ腺癌)から選択されるかまたは表７に挙げた刊行物に開示されている。ある態様において、第二治療剤は、例えば、ここにおよび表７に記載のように、１)タンパク質キナーゼＣ(ＰＫＣ)阻害剤；２)ヒートショックタンパク質９０(ＨＳＰ９０)阻害剤；３)ホスホイノシチド３−キナーゼ(ＰＩ３Ｋ)および／またはラパマイシンの標的(ｍＴＯＲ)の阻害剤；４)シトクロムＰ４５０阻害剤(例えば、ＣＹＰ１７阻害剤または１７アルファ−ヒドロキシラーゼ／Ｃ１７−２０リアーゼ阻害剤)；５)鉄キレート剤；６)アロマターゼ阻害剤；７)ｐ５３阻害剤、例えば、ｐ５３／Ｍｄｍ２相互作用の阻害剤；８)アポトーシスインデューサー；９)血管形成阻害剤；１０)アルドステロンシンターゼ阻害剤；１１)スムーズンド(ＳＭＯ)受容体阻害剤；１２)プロラクチン受容体(ＰＲＬＲ)阻害剤；１３)Ｗｎｔシグナル伝達阻害剤；１４)ＣＤＫ４／６阻害剤；１５)線維芽細胞増殖因子受容体２(ＦＧＦＲ２)／線維芽細胞増殖因子受容体４(ＦＧＦＲ４)阻害剤；１６)マクロファージコロニー刺激因子(Ｍ−ＣＳＦ)阻害剤；１７)ｃ−ＫＩＴ、ヒスタミン遊離、Ｆｌｔ３(例えば、ＦＬＫ２／ＳＴＫ１)またはＰＫＣの１以上の阻害剤；１８)ＶＥＧＦＲ−２(例えば、ＦＬＫ−１／ＫＤＲ)、ＰＤＧＦＲベータ、ｃ−ＫＩＴまたはＲａｆキナーゼＣの１以上の阻害剤；１９)ソマトスタチンアゴニストおよび／または成長ホルモン遊離阻害剤；２０)未分化リンパ腫キナーゼ(ＡＬＫ)阻害剤；２１)インシュリン様増殖因子１受容体(ＩＧＦ−１Ｒ)阻害剤；２２)Ｐ−糖タンパク質１阻害剤；２３)血管内皮細胞増殖因子受容体(ＶＥＧＦＲ)阻害剤；２４)ＢＣＲ−ＡＢＬキナーゼ阻害剤；２５)ＦＧＦＲ阻害剤；２６)ＣＹＰ１１Ｂ２の阻害剤；２７)ＨＤＭ２阻害剤、例えば、ＨＤＭ２−ｐ５３相互作用の阻害剤；２８)チロシンキナーゼ阻害剤；２９)ｃ−ＭＥＴ阻害剤；３０)ＪＡＫ阻害剤；３１)ＤＡＣ阻害剤；３２)１１β−ヒドロキシラーゼ阻害剤；３３)ＩＡＰ阻害剤；３４)ＰＩＭキナーゼ阻害剤；３５)Porcupine阻害剤；３６)ＢＲＡＦ、例えば、ＢＲＡＦ Ｖ６００Ｅまたは野生型ＢＲＡＦ阻害剤；３７)ＨＥＲ３阻害剤；３８)ＭＥＫ阻害剤；または３９)脂質キナーゼ阻害剤の１以上から選択される。
ある態様において、第二治療剤は化合物Ａ８、化合物Ａ１７、化合物Ａ２３、化合物Ａ２４、化合物Ａ２７、化合物Ａ２９、化合物Ａ３３および化合物Ａ１３の１以上から選択される。
他の態様において、第二治療剤は化合物Ａ５、化合物Ａ８、化合物Ａ１７、化合物Ａ２３、化合物Ａ２４、化合物Ａ２９および化合物Ａ４０の１以上から選択される。
他の態様において、第二治療剤は化合物Ａ９、化合物Ａ１６、化合物Ａ１７、化合物Ａ２１、化合物Ａ２２、化合物Ａ２５、化合物Ａ２８、化合物Ａ４８および化合物４９の１以上から選択される。
複数の態様において、第二治療剤を治療的用量または治療的より低い用量で投与する。ある態様において、阻害、例えば、増殖阻害の達成にために必要である第二治療剤の濃度は、第二治療剤を抗ＰＤ−１抗体分子と組み合わせたとき、第二治療剤を個別に投与するときよりも低い。ある態様において、阻害、例えば、増殖阻害を達成するために必要である抗ＰＤ−１抗体分子の濃度は、抗ＰＤ−１抗体分子を、第二治療剤と組み合わせて投与したとき、抗ＰＤ−１抗体分子を個別に投与するときよりも低い。ある態様において、組み合わせ治療において、阻害、例えば、増殖阻害の達成にために必要である第二治療剤の濃度は、単剤療法としての第二治療剤の治療的用量より低い、例えば、１０〜２０％、２０〜３０％、３０〜４０％、４０〜５０％、５０〜６０％、６０〜７０％、７０〜８０％または８０〜９０％低い。ある態様において、組み合わせ治療において、阻害、例えば、増殖阻害を達成するために必要である抗ＰＤ−１抗体分子の濃は、単剤療法としての抗ＰＤ−１抗体分子の治療的用量より低い、例えば、１０〜２０％、２０〜３０％、３０〜４０％、４０〜５０％、５０〜６０％、６０〜７０％、７０〜８０％または８０〜９０％低い。
検出
他の面において、本発明は、ＰＤ−１のサンプル、例えば、インビトロまたはインビボ(例えば、生物学的サンプル、例えば、血清、精液または尿または、例えば、過増殖性または癌性病変からの組織生検)における存在を検出する方法に関する。対象法を評価のために使用できる(例えば、対象におけるここに記載する障害、例えば、過増殖性または癌性障害の処置または進行、診断および／または段階のモニター)。本方法は、(ｉ)サンプル(および所望により、参照、例えば対照サンプル)とここに記載する抗体分子を、相互作用を生じさせる条件下で接触させるか、対象に投与し、(ii)抗体分子とサンプル(および所望により、基準、例えば、対照サンプル)の間の複合体の形成を検出することを含む。複合体の形成はＰＤ−１存在の指標であり、ここに記載する処置の適性または必要性を指示し得る。方法は免疫組織化学、免疫細胞化学、ＦＡＣＳ、抗体分子複合体化磁気ビーズ、ＥＬＩＳＡアッセイ、ＰＣＲ法(例えば、ＲＴ−ＰＣＲ)を含み得る。
概して、インビボおよびインビトロ診断法に使用する抗体分子を、結合したまたは結合していない結合剤の検出を容易にする検出可能物質で直接的または間接的に標識する。適当な検出可能物質は、多様な生物学的に活性な酵素、補欠分子族、蛍光物質、発光物質、常磁性(例えば、核磁気共鳴活性)物質および放射性物質を含む。
さらなる態様は、対象またはサンプル(例えば、癌細胞および所望によりＴＩＬのような免疫細胞を含む対象のサンプル)においてＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８またはＩＦＮ−γの１、２または全ての存在を同定し、それにより、ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８およびＩＦＮ−γの１、２または全ての値を提供することを含む、癌の処置法を提供する。本方法は、さらに、ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８および／またはＩＦＮ−γ値を基準値、例えば、対照値と比較することを含む。ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８および／またはＩＦＮ−γ値が基準値、例えば、対照値より高いならば、抗ＰＤ−１抗体(例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体)の治療有効量を、所望により１種以上の他の薬剤と組み合わせて対象に投与し、それにより癌を処置する。癌は、例えば、肺癌(扁平上皮)、肺癌(腺癌)、頭頸部癌、子宮頸癌(扁平上皮)、胃癌、甲状腺癌、黒色腫、鼻咽頭癌または乳癌、例えば、ＴＮ乳癌、例えば、ＩＭ−ＴＮ乳癌のような、ここに記載する癌であり得る。ある態様において、癌はＥＲ＋乳癌または膵臓癌である。
また提供されるのは、癌の処置法であって、対象またはサンプル(例えば、癌細胞を含む対象のサンプル)をＰＤ−Ｌ１の存在について試験し、それによりＰＤ−Ｌ１値を同定し、ＰＤ−Ｌ１値を対照値と比較し、ＰＤ−Ｌ１値が対照値より高いならば、抗ＰＤ−１抗体(例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体)の治療有効量を、所望により１種以上の他の薬剤と組み合わせて対象に投与し、それにより癌を処置することを含む、方法である。癌は、例えば、非小細胞肺(ＮＳＣＬＣ)腺癌(ＡＣＡ)、ＮＳＣＬＣ扁平上皮細胞癌(ＳＣＣ)または肝細胞癌(ＨＣＣ)のようなここに記載する癌であり得る。
他の面において、本発明は、ここに記載する抗体分子およびその使用指示を含む、診断用または治療用キットに関する。
ここに記載する全ての刊行物、特許出願、特許および他の文献は、引用によりその全体を本明細書に包含させる。
本発明の他の特性、目的および利点は、明細書および図面からならびに特許請求の範囲から明らかである。
図１は、マウス抗ＰＤ−１ ｍＡｂ ＢＡＰ０４９の軽鎖および重鎖可変領域のアミノ酸配列を記載する。上部および下部配列は、２回の独立した分析由来であった。Kabat番号付けに基づく軽鎖および重鎖ＣＤＲ配列は下線を引く。Chothia番号付けに基づく軽重鎖ＣＤＲ配列は太字斜体で示す。軽鎖配列の１０２位の不対Ｃｙｓ残基は四角で囲む。配列は、出現順に、それぞれ配列番号８、２２８、１６および２２９に開示する。
図２Ａは、生殖系列配列と整列されたマウス抗ＰＤ−１ ｍＡｂ ＢＡＰ０４９の軽鎖および重鎖可変領域のアミノ酸配列を示す。上部および下部配列は、それぞれ生殖系列(ＧＬ)およびＢＡＰ０４９(Ｍｕ ｍＡｂ)配列であった。Kabat番号付けに基づく軽鎖および重鎖ＣＤＲ配列は下線を引く。Chothia番号付けに基づく軽重鎖ＣＤＲ配列は太字斜体で示す。“−”は同一アミノ酸残基を意味する。配列順に、それぞれ配列番号２３０、８、２３１および１６に開示する
図２Ｂは、マウスκ Ｊ２遺伝子の配列およびマウス抗ＰＤ−１ ｍＡｂ ＢＡＰ０４９における対応する変異を示す。“−”は同一ヌクレオチド残基を意味する。配列は、出現順に、それぞれ配列番号２３３、２３２、２３４および２３５として開示する。
図３Ａ〜３Ｂは、蛍光標識したマウス抗ＰＤ−１ ｍＡｂ ＢＡＰ０４９(Ｍｕ ｍＡｂ)とＢＡＰ０４９(Ｃｈｉ ｍＡｂ)の３のキメラバージョンの競合結合を示す。実験を２回行い、結果をそれぞれ図３Ａおよび３Ｂに示す。３のキメラＢＡＰ０４９抗体(Ｃｈｉ ｍＡｂ(Ｃｙｓ)、Ｃｈｉ ｍＡｂ(Ｔｙｒ)およびＣｈｉ ｍＡｂ(Ｓｅｒ))は、それぞれ軽鎖可変領域の１０２位にＣｙｓ残基、Ｔｙｒ残基およびＳｅｒ残基を有する。Ｃｈｉ ｍＡｂ(Ｃｙｓ)、Ｃｈｉ ｍＡｂ(Ｔｙｒ)およびＣｈｉ ｍＡｂ(Ｓｅｒ)は、それぞれＢＡＰ０４９−ｃｈｉ、ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ−ＹおよびＢＡＰ０４９−ｃｈｉ−Ｓとしても知られる。 図３Ａ〜３Ｂは、蛍光標識したマウス抗ＰＤ−１ ｍＡｂ ＢＡＰ０４９(Ｍｕ ｍＡｂ)とＢＡＰ０４９(Ｃｈｉ ｍＡｂ)の３のキメラバージョンの競合結合を示す。実験を２回行い、結果をそれぞれ図３Ａおよび３Ｂに示す。３のキメラＢＡＰ０４９抗体(Ｃｈｉ ｍＡｂ(Ｃｙｓ)、Ｃｈｉ ｍＡｂ(Ｔｙｒ)およびＣｈｉ ｍＡｂ(Ｓｅｒ))は、それぞれ軽鎖可変領域の１０２位にＣｙｓ残基、Ｔｙｒ残基およびＳｅｒ残基を有する。Ｃｈｉ ｍＡｂ(Ｃｙｓ)、Ｃｈｉ ｍＡｂ(Ｔｙｒ)およびＣｈｉ ｍＡｂ(Ｓｅｒ)は、それぞれＢＡＰ０４９−ｃｈｉ、ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ−ＹおよびＢＡＰ０４９−ｃｈｉ−Ｓとしても知られる。
図４は、１６のヒト化ＢＡＰ０４９クローン(ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１〜ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６)のＦＡＣＳ結合分析の結果を示す棒グラフである。抗体濃度は、各試験したｍＡｂについて、左から右の棒で２００ng／ml、１００ng／ml、５０ng／ml、２５ng／mlおよび１２.５ng／mlである。
図５は、ヒト化ＢＡＰ０４９クローンの構造分析を示す(ａ、ｂ、ｃ、ｄおよびｅは、多様なタイプのフレームワーク領域配列を表す)。サンプル中のｍＡｂ濃度も示す。
図６Ａ〜６Ｂは、一定濃度のＡｌｅｘａ ４８８標識マウスｍＡｂ ＢＡＰ０４９、連続希釈の試験抗体およびＰＤ−１発現３００.１９細胞を使用する競合結合アッセイで測定した、ヒト化ＢＡＰ０４９ ｍＡｂの結合親和性および特異性を示す。実験を２回行い、結果をそれぞれ図６Ａおよび６Ｂに示す。
図７は、ＦＡＣＳデータ、競合結合および構造分析に基づく、ヒト化ＢＡＰ０４９クローンのランキングを示す。サンプル中のｍＡｂ濃度も示す。
図８Ａ〜８Ｂは、選択したヒト化ＢＡＰ０４９クローンによるリガンド結合からＰＤ−１の遮断を示す。ＰＤ−１へのＰＤ−Ｌ１−ＩｇおよびＰＤ−Ｌ２−Ｉｇ結合の遮断を図８Ａに示す。ＰＤ−１へのＰＤ−Ｌ２−Ｉｇ結合の遮断を図８Ｂに示す。ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０５、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０８、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０９、ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１０およびＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１１を評価した。マウスｍＡｂ ＢＡＰ０４９および軽鎖可変領域の１０２位にＴｙｒを有するキメラｍＡｂも本分析に含んだ。
図９Ａ〜９Ｂは、１６のヒト化ＢＡＰ０４９クローンおよびＢＡＰ０４９キメラ(ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ)の重鎖可変ドメイン配列のアライメントを示す。図９Ａにおいて、配列の全てを示す(出現順で、それぞれ配列番号２２、３８、３８、３８、３８、３８、３８、３８、３８、３８、５０、５０、５０、５０、８２、８２および８６)。図９Ｂにおいて、マウス配列と異なるアミノ酸配列のみ示す(出現順で、それぞれ配列番号２２、３８、３８、３８、３８、３８、３８、３８、３８、３８、５０、５０、５０、５０、８２、８２および８６)。 図９Ａ〜９Ｂは、１６のヒト化ＢＡＰ０４９クローンおよびＢＡＰ０４９キメラ(ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ)の重鎖可変ドメイン配列のアライメントを示す。図９Ａにおいて、配列の全てを示す(出現順で、それぞれ配列番号２２、３８、３８、３８、３８、３８、３８、３８、３８、３８、５０、５０、５０、５０、８２、８２および８６)。図９Ｂにおいて、マウス配列と異なるアミノ酸配列のみ示す(出現順で、それぞれ配列番号２２、３８、３８、３８、３８、３８、３８、３８、３８、３８、５０、５０、５０、５０、８２、８２および８６)。
図１０Ａ〜１０Ｂは、１６のヒト化ＢＡＰ０４９クローンおよびＢＡＰ０４９キメラ(ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ)についての軽鎖可変ドメイン配列のアライメントを示す。図１０Ａにおいて、配列の全てを示す(出現順に、それぞれ配列番号２４、６６、６６、６６、６６、７０、７０、７０、５８、６２、７８、７４、４６、４６、４２、５４および５４)。図１０Ｂにおいて、マウス配列と異なるアミノ酸配列のみ示す(出現順に、それぞれ配列番号２４、６６、６６、６６、６６、７０、７０、７０、５８、６２、７８、７４、４６、４６、４２、５４および５４)。 図１０Ａ〜１０Ｂは、１６のヒト化ＢＡＰ０４９クローンおよびＢＡＰ０４９キメラ(ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ)についての軽鎖可変ドメイン配列のアライメントを示す。図１０Ａにおいて、配列の全てを示す(出現順に、それぞれ配列番号２４、６６、６６、６６、６６、７０、７０、７０、５８、６２、７８、７４、４６、４６、４２、５４および５４)。図１０Ｂにおいて、マウス配列と異なるアミノ酸配列のみ示す(出現順に、それぞれ配列番号２４、６６、６６、６６、６６、７０、７０、７０、５８、６２、７８、７４、４６、４６、４２、５４および５４)。
図１１は、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γについて三種陽性である患者の割合が比較的高い代表的癌を示す。
図１２は、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γについて三種陽性である患者の割合が比較的低い代表的ＥＲ＋乳癌および膵臓癌を示す。
図１３は、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γについて三種陽性である代表的乳癌患者の割合を示す。
図１４は、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γについて三種陽性である代表的結腸癌患者の割合を示す。
図１５は、インビトロでの化合物Ａ１７処置をしたまたはしていないＥＢＣ−１細胞におけるＰＤ−Ｌ１表面発現のフローサイトメトリーのグラフを示す。ＥＢＣ−１細胞はｃＭＥＴ増幅を伴う非小細胞性肺癌細胞である。
図１６は、化合物Ａ１７処置をしたまたはしていない腫瘍異種移植モデルにおけるＨｓ.７４６.Ｔ細胞におけるＰＤ−Ｌ１ ｍＲＮＡ発現のグラフを示す。Ｈｓ.７４６.Ｔ細胞はｃ−ＭＥＴ増幅およびｃ−ＭＥＴ変異を伴う胃癌細胞である。
図１７は、インビトロでの化合物Ａ２３処置をしたまたはしていないＨ３１２２細胞におけるＰＤ−Ｌ１ ｍＲＮＡ発現のグラフを示す。Ｈ３１２２細胞は、ＡＬＫ転座を有する非小細胞性肺癌(ＮＳＣＬＣ)細胞である。
図１８は、化合物Ａ２９処置をしたまたはしていない腫瘍異種移植モデルにおけるＬＯＸＩＭＶ１細胞(ＢＲＡＦ変異体黒色腫細胞)におけるＰＤ−Ｌ１ ｍＲＮＡ発現のグラフを示す。
図１９は、化合物Ａ３４処置をしたまたはしていない腫瘍異種移植モデルにおけるＨＥＹＡ８細胞(ＫＲＡＳ変異体卵巣癌細胞)におけるＰＤ−Ｌ１ ｍＲＮＡ発現のグラフを示す。
図２０は、化合物Ａ１８処置をしたまたはしていない腫瘍異種移植モデルにおけるＵＫＥ−１細胞(ＪＡＫ２ Ｖ６１７Ｆ変異体骨髄増殖性新生物細胞)におけるＰＤ−Ｌ１ ｍＲＮＡ発現のグラフを示す。
表の簡単な説明
表１は、マウス、キメラおよびヒト化抗ＰＤ−１抗体分子のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列の要約である。抗体分子は、マウスｍＡｂ ＢＡＰ０４９、キメラｍＡｂ ＢＡＰ０４９−ｃｈｉおよびＢＡＰ０４９−ｃｈｉ−Ｙおよびヒト化ｍＡｂ ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１〜ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６およびＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ〜ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅを含む。重鎖および軽鎖ＣＤＲのアミノ酸配列およびヌクレオチド配列、重鎖および軽鎖可変領域のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列ならびに重鎖および軽鎖のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を本表に示す。
表２は、ヒト化ｍＡｂ ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ０１〜ＢＡＰ０４９−ｈｕｍ１６およびＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ〜ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの重鎖および軽鎖のアミノ酸配列およびヌクレオチド配列フレームワーク領域を示す。
表３はヒトＩｇＧ重鎖およびヒトカッパ軽鎖の定常領域アミノ酸配列を示す。
表４は、ヒト化ｍＡｂ ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ａ〜ＢＡＰ０４９−Ｃｌｏｎｅ−Ｅの重鎖および軽鎖リーダー配列のアミノ酸配列を示す。
表５は、ＣＨＯ細胞で発現される選択したヒト化ＢＡＰ０４９ ｍＡｂの収率、力値、単量体含量および内毒素レベルの要約である。
表６は、ＣＨＯ細胞で発現される選択したヒト化ＢＡＰ０４９ ｍＡｂのＮｏｖｅｘ ＩＥＦ分析で検出される電荷アイソフォームを示す。
表７は、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子および他の免疫調節剤(例えば、共刺激分子のアクティベーターおよび／または免疫チェックポイント分子阻害剤の１以上)と組み合わせて投与できる選択した治療剤の要約である。表７は、左から右に、第二治療剤の化合物命名、化合物構造および該化合物を開示する特許公報を提供する。
詳細な記載
プログラム死１(ＰＤ−１)は、活性化ＣＤ４＋およびＣＤ８＋ Ｔ細胞、ＴｒｅｇおよびＢ細胞に発現されるＣＤ２８／ＣＴＬＡ−４ファミリーメンバーである。これはエフェクターＴ細胞シグナル伝達および機能を負に制御する。ＰＤ−１は腫瘍浸潤性Ｔ細胞で誘発され、機能的疲弊または機能不全を生じる(Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704; Pardoll et al. (2012) Nat Rev Cancer 12(4):252-64)。
ＰＤ−１は、その２のリガンド、プログラム死リガンド１(ＰＤ−Ｌ１)またはプログラム死リガンド２(ＰＤ−Ｌ２)への結合により、共阻害シグナルを送達する。ＰＤ−Ｌ１はＴ細胞、ナチュラルキラー(ＮＫ)細胞、マクロファージ、樹状細胞(ＤＣ)、Ｂ細胞、上皮細胞、血管内皮細胞、ならびに多くのタイプの腫瘍で発現される。マウスおよびヒト腫瘍におけるＰＤ−Ｌ１の高発現は、多様な癌における臨床転帰不良と関連する(Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704; Pardoll et al. (2012) Nat Rev Cancer 12(4):252-64)。ＰＤ−Ｌ２は樹状細胞、マクロファージおよびある腫瘍で発現される。
ＰＤ−１経路遮断は、癌免疫療法のために前臨床および臨床で検証されている。前臨床および臨床試験の両者は、抗ＰＤ−１遮断がエフェクターＴ細胞の活性を回復し、頑強な抗腫瘍応答を生じることを示している。例えば、ＰＤ−１経路の遮断は、疲弊した／機能不全のエフェクターＴ細胞機能(例えば、増殖、ＩＦＮ−γ分泌または細胞溶解性機能)を回復させ、Ｔｒｅｇ細胞機能を阻害する(Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704; Pardoll et al. (2012) Nat Rev Cancer 12(4):252-64)。
したがって、本発明は、少なくとも一部、高い親和性および特異性でプログラム死１(ＰＤ−１)と結合する抗体分子(例えば、ヒト化抗体分子)を提供する。ある態様において、驚くほど低い免疫原性を示す、ＰＤ−１に対するヒト化抗体が開示される。例えば、ヒト化ＢＡＰ０４９抗体は、ここに記載するＴ細胞エピトープアッセイに従い、６５０、６００、５５０未満または５００未満のリスクスコアを有することが判明した。他の態様において、例えば、図５および７に示す、選択したフレームワーク領域の組み合わせ特徴的生産効率および結合特性を有することが示された。
本発明のさらなる面は、該抗体分子をコードする核酸分子、発現ベクター、宿主細胞および該抗体分子の製造法を含む。免疫複合体、多または二特異性分子および該抗体分子を含む医薬組成物も提供する。ここに開示する抗ＰＤ−１抗体分子を、癌性または悪性障害(例えば、固形および軟組織腫瘍；黒色腫、例えば、進行型黒色腫；肝細胞癌；膵臓癌；腎細胞癌(ＲＣＣ)、例えば、転移ＲＣＣまたは明細胞ＲＣＣ；神経膠腫または神経膠芽腫；多発性骨髄腫；結腸直腸癌；および肺癌、例えば、非小細胞癌)、ならびに感染症(例えば、肝炎、例えば、Ｃ型肝炎(例えば、慢性ウイルス性肝炎)のような感染性障害；敗血症)の処置、予防および／または診断に使用できる。それゆえに、ＰＤ−１を検出する方法、ならびに抗ＰＤ−１抗体分子を使用する癌および感染症を含む多様な障害を処置する方法をここに開示する。
用語“プログラム死１”または“ＰＤ−１”は、アイソフォーム、哺乳動物、例えば、ヒトＰＤ−１、ヒトＰＤ−１の種ホモログおよびＰＤ−１と少なくとも１の共通エピトープを含むアナログを含む。ＰＤ−１、例えば、ヒトＰＤ−１のアミノ酸配列は当分野で知られる、例えば、Shinohara T et al. (1994) Genomics 23(3):704-6; Finger LR, et al. Gene (1997) 197(1-2):177-87。
さらなる用語を、下におよび明細書をとおして定義する。
ここで使用する単数表現は、冠詞の文法的目的語が１または１を超える(例えば、少なくとも１)ことをいう
用語“または”は、文脈上明らかに他のことが示されない限り、ここでは、用語“および／または”を意味し、これと交換可能に使用する。
“約”および“およそ”は、一般に、測定の性質または精度を考慮して、測定した量の許容される誤差の程度を意味する。代表的誤差の程度は、ある値または値の範囲の２０パーセント(％)内、概して、１０％内、より典型的には５％内である。
本発明の組成物および方法は、明記した配列またはそれと実質的に同一のまたは類似する配列、例えば、明記した配列と少なくとも８５％、９０％、９５％またはそれ以上同一である配列を有するポリペプチドおよび核酸を包含する。アミノ酸配列の状況において、用語“実質的に同一”は、ここでは、ｉ)同一であるまたはii)第二アミノ酸配列における整列したアミノ酸残基が、第一および第二アミノ酸配列が共通構造ドメインおよび／または共通機能活性を有し得るように保存的置換である、十分なまたは最小数のアミノ酸残基を含む第一アミノ酸をいうために使用する。例えば、対象配列、例えば、ここに提供す配列と少なくとも約８５％、９０％。９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％同一性を有する共通構造ドメインを含むアミノ酸配列。
ヌクレオチド配列の状況において、用語“実質的に同一”は、第一および第二ヌクレオチド配列が共通機能活性を有するポリペプチドをコードするかまたは共通構造ポリペプチドドメインまたは共通機能的ポリペプチド活性をコードするように、第二核酸配列における整列したヌクレオチドと同一である十分なまたは最小数のヌクレオチドを含む第一核酸配列をいうために使用する。例えば、対象配列、例えば、ここに提供する配列と少なくとも約８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％同一性を有するヌクレオチド配列。
用語“機能的変異体”は、天然に存在する配列と実質的に同一のアミノ酸配列を有するかまたは実質的に同一のヌクレオチド配列によりコードされ、天然に存在する配列の１以上の活性を有することができるポリペプチドをいう。
配列間の相同性または配列同一性の計算(これらの用語はここでは交換可能に使用する)は次のとおり実施する。
２のアミノ酸配列または２の核酸配列の同一性パーセントを決定するために、これらの配列を最適比較目的のために整列させる(例えば、最適配列のためにギャップを第一および第二アミノ酸または核酸配列の一方または両者に挿入でき、非相同配列を比較目的で無視できる)。好ましい態様において、比較目的で整列した対象配列の長さは、対象配列の長さの少なくとも３０％、好ましくは少なくとも４０％、より好ましくは少なくとも５０％、６０％、さらに好ましくは少なくとも７０％、８０％、９０％、１００％である。対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置のアミノ酸残基またはヌクレオチドを次いで比較する。第一配列の位置が、第二配列における対応する位置と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドで占拠されているならば、該分子はその位置について同一である(ここで使用するアミノ酸または核酸“同一性”はアミノ酸または核酸“相同性”と等しい)。
２の配列間の同一性パーセントは、２の配列の最適アラインメントのために挿入が必要であったギャップの数および各ギャップの長さを考慮に入れ、配列により共有される同一位置の数の関数である。
配列の比較および２の配列間の同一性パーセントの決定は数学的アルゴリズムを使用して達成できる。好ましい態様において、２のアミノ酸配列間の同一性パーセントを、ＧＣＧソフトウェアパッケージ(http://www.gcg.comで利用可能)のＧＡＰプログラムに組み込まれているNeedlemanおよびWunsch((1970) J. Mol. Biol. 48:444-453))アルゴリズムを使用して、Ｂｌｏｓｓｕｍ ６２マトリクスまたはＰＡＭ２５０マトリクスおよびギャップ荷重１６、１４、１２、１０、８、６または４および長さ荷重１、２、３、４、５または６を使用して決定する。さらに他の好ましい態様において、２のヌクレオチド配列間の同一性パーセントを、ＧＣＧソフトウェアパッケージ(http://www.gcg.comで利用可能)のＧＡＰプログラムを使用して、ＮＷＳｇａｐｄｎａ.ＣＭＰマトリクスおよびギャップ荷重４０、５０、６０、７０または８０および長さ荷重１、２、３、４、５または６を使用して決定する。パラメータの特に好ましいセット(および特に断らない限り使用すべきもの)は、ギャップペナルティ１２、ギャップ伸長ペナルティ４およびフレームシフトギャップペナルティ５を有するＢｌｏｓｓｕｍ ６２スコアリングマトリクスである。
２のアミノ酸またはヌクレオチド配列間の同一性パーセントＡＬＩＧＮプログラム(version 2.0)に取り込まれているE. MeyersおよびW. Miller((1989) CABIOS, 4:11-17)のアルゴリズムを使用して、ＰＡＭ１２０荷重残基表、ギャップ長ペナルティ１２およびギャップペナルティ４を使用して決定できる。
ここに記載する核酸およびタンパク質配列を“クエリー配列”として使用して、例えば、他のファミリーメンバーまたは関連配列を同定するために、公的データベースに対する検索を実施できる。このような検索は、Altschul, et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-10のＮＢＬＡＳＴおよびＸＢＬＡＳＴプログラム(version 2.0)を使用して実施できる。ＢＬＡＳＴヌクレオチド検索を、ＮＢＬＡＳＴプログラムで、スコア＝１００、ワード長＝１２で実施して、本発明の核酸(配列番号１)分子と相同なヌクレオチド配列を得ることができる。ＢＬＡＳＴタンパク質検索をＸＢＬＡＳＴプログラムで、スコア＝５０、ワード長＝３で実施して、本発明のタンパク質分子と相同なアミノ酸配列を得ることができる。比較目的でギャップアラインメントを得るために、Ｇａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴを、Altschul et al., (1997) Nucleic Acids Res. 25:3389-3402に記載のように利用できる。ＢＬＡＳＴおよびＧａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴプログラムを利用するとき、各プログラムのデフォルトパラメータ(例えば、ＸＢＬＡＳＴおよびＮＢＬＡＳＴ)を使用できる。http://www.ncbi.nlm.nih.gov参照。
ここで使用する、用語“低ストリンジェンシー、中ストリンジェンシー、高ストリンジェンシーまたは超高ストリンジェンシー条件下でハイブリダイズ”は、ハイブリダイゼーションおよび洗浄条件を記載する。ハイブリダイゼーション反応を実施するための指針は、引用により本明細書に包含させるCurrent Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, N.Y. (1989), 6.3.1-6.3.6に見ることができる。水性および非水性法がその文献に記載され、いずれかを使用できる。ここにいう具体的ハイブリダイゼーション条件は次のとおりである。１)低ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件は６×塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム(ＳＳＣ)、４５℃、続く０.２×ＳＳＣ、０.１％ＳＤＳで少なくとも５０℃の２回の洗浄(洗浄温度は、低ストリンジェンシー条件のために５５℃まで上げてよい)；２)中ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件は６×ＳＳＣ、４５℃、続く０.２×ＳＳＣ、０.１％ＳＤＳで６０℃の１回以上の洗浄；３)高ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件は６×ＳＳＣ、約４５℃、続く０.２×ＳＳＣ、０.１％ＳＤＳで６５℃の１回以上の洗浄；および好ましくは４)超高ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件は、０.５Ｍ リン酸ナトリウム、７％ＳＤＳ、６５℃、続く０.２×ＳＳＣ、１％ＳＤＳ、６５℃の１回以上の洗浄。超高ストリンジェンシー条件(４)が好ましい条件であり、特に断らない限り使用すべきものである。
本発明の分子は、機能に実質的に影響しないさらなる保存的または非必須アミノ酸置換を有し得ることは理解される。
用語“アミノ酸”は、アミノ官能性と酸官能性の両者を含み、天然に存在するアミノ酸のポリマーに包含され得る、天然であれ、合成であれ、全ての分子を包含することを意図する。代表的アミノ酸は、天然に存在するアミノ酸；そのアナログ、誘導体およびコンジナー；異型側鎖を有するアミノ酸アナログ；および前記のいずれかの全立体異性体を含む。ここで使用する用語“アミノ酸”はＤ−またはＬ−光学異性体の両者およびペプチド模倣体を含む。
“保存的アミノ酸置換”は、アミノ酸残基が類似側鎖を有するアミノ酸残基に置き換えられているものである。類似側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは当分野で定義されている。これらのファミリーは、塩基性側鎖(例えば、リシン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、非電荷極性側鎖(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン)、非極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、ベータ−分枝側鎖(例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン)および芳香族側鎖(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を有するアミノ酸を含む。
用語“ポリペプチド”、“ペプチド”および“タンパク質”(一本鎖であれば)は、あらゆる長さのアミノ酸のポリマーをいうためにここで交換可能に使用する。ポリマーは直鎖でも分枝鎖でもよく、修飾アミノ酸を含んでよく、非アミノ酸で中断されていてよい。本用語はまた修飾されている、例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質付加、アセチル化、リン酸化または標識要素の接合のようなあらゆる他の操作をされているアミノ酸ポリマーを包含する。ポリペプチドは天然源から単離でき、真核または原核宿主から組み換え技術により産生でき、または合成法の産物であり得る。
用語“核酸”、“核酸配列”、“ヌクレオチド配列”または“ポリヌクレオチド配列”および“ポリヌクレオチド”は交換可能に使用する。は、デオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチドまたはそのアナログのいずれかの、あらゆる長さのヌクレオチドの重合体形態をいう。ポリヌクレオチドは一本鎖でも二本鎖でもよく、一本鎖であるならばコーディング鎖でも非コーディング(アンチセンス)鎖でもよい。ポリヌクレオチドは、メチル化ヌクレオチドおよびヌクレオチドアナログのような修飾ヌクレオチドを含み得る。ヌクレオチドの配列は、非ヌクレオチド要素で中断されていてよい。ポリヌクレオチドは、標識成分とのコンジュゲーションのような、重合化後さらに集合されてよい。核酸は、天然には存在しないかまたは非天然配置で他のポリヌクレオチドと連結している、組み換えポリヌクレオチドまたはゲノム、ｃＤＮＡ、半合成または合成起源のポリヌクレオチドであり得る。
ここで使用する用語“単離された”は、その元のまたは本来の環境(例えば、それが天然に存在するならば、天然環境)から取り出された物質をいう。例えば、生存動物に存在する天然に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドは単離されていないが、天然系では共存する物質のいくつかまたは全てからヒトの介入により分離された同じポリヌクレオチドまたはポリペプチドは単離されている。このようなポリヌクレオチドはベクターの一部でありおよび／またはこのようなポリヌクレオチドまたはポリペプチドは組成物の一部であり、このようなベクターまたは組成物がそれが本来見られる環境の一部ではない点でなお単離されている。
本発明の多様な面を下にさらに詳述する。さらなる定義は、明細書をとおして示される。
抗体分子
ある態様において、抗体分子は、哺乳動物、例えば、ヒト、ＰＤ−１に結合する。例えば、抗体分子は、ＰＤ−１上のエピトープ、例えば、直線状または立体エピトープ(例えば、ここに記載するエピトープ)に特異的に結合する。
ここで使用する、用語“抗体分子”は、少なくとも１の免疫グロブリン可変ドメイン配列を含むタンパク質、例えば、免疫グロブリン鎖またはそのフラグメントをいう用語“抗体分子”は、例えば、モノクローナル抗体(免疫グロブリンＦｃ領域を有する完全長抗体を含む)を含む。ある態様において、抗体分子は完全長抗体または完全長免疫グロブリン鎖を含む。ある態様において、抗体分子は、完全長抗体または完全長免疫グロブリン鎖の抗原結合または機能的フラグメントを含む。
ある態様において、抗体分子は単一特異性抗体分子であり、単一エピトープに結合する。例えば、各々同じエピトープに結合する多数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を有する単一特異性抗体分子。
ある態様において、抗体分子は多特異性抗体分子であり、例えば、多数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を含み、ここで、該多数の第一免疫グロブリン可変ドメイン配列が第一エピトープに結合特異性を有し、該多数の第二免疫グロブリン可変ドメイン配列が第二エピトープに結合特異性を有する。ある態様において、第一および第二エピトープは同じ抗原、例えば同じタンパク質(または多量体タンパク質のサブユニット)にある。ある態様において、第一および第二エピトープは重複する。ある態様において、第一および第二エピトープは重複しない。ある態様において、第一および第二エピトープは異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(または多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。ある態様において、多特異性抗体分子は、第三、第四または第五免疫グロブリン可変ドメインを含む。ある態様において、多特異性抗体分子は、二重特異性抗体分子、三重特異性抗体分子または四重特異性抗体分子である。
ある態様において、多特異性抗体分子は二重特異性抗体分子である。二重特異性抗体は２を超える抗原に対する特異性を有しない。二重特異性抗体分子は、第一エピトープに結合特異性を有する第一免疫グロブリン可変ドメイン配列および第二エピトープに結合特異性を有する第二免疫グロブリン可変ドメイン配列により特徴付けられる。ある態様において、第一および第二エピトープは同じ抗原、例えば同じタンパク質(または多量体タンパク質のサブユニット)にある。ある態様において、第一および第二エピトープは重複する。ある態様において、第一および第二エピトープは重複しない。ある態様において、第一および第二エピトープは異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(または多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。ある態様において、二重特異性抗体分子は、第一エピトープに結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列および第二エピトープに結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列を含む。ある態様において、二重特異性抗体分子は、第一エピトープに結合特異性を有する半抗体および第二エピトープに結合特異性を有する半抗体を含む。ある態様において、二重特異性抗体分子は、第一エピトープに結合特異性を有する半抗体またはそのフラグメントおよび第二エピトープに結合特異性を有する半抗体またはそのフラグメントを含む。ある態様において、二重特異性抗体分子は、第一エピトープに結合特異性を有するｓｃＦｖまたはそのフラグメントおよび第二エピトープに結合特異性を有するｓｃＦｖまたはそのフラグメントを含む。ある態様において、第一エピトープはＰＤ−１上に位置し、第二エピトープはＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＣＥＡＣＡＭ(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１および／またはＣＥＡＣＡＭ−５)、ＰＤ−Ｌ１またはＰＤ−Ｌ２上に位置する。
ある態様において、抗体分子は、二重特異性抗体および一本鎖分子、ならびに抗体の抗原結合フラグメント(例えば、Ｆａｂ、Ｆ(ａｂ’)２およびＦｖ)を含む。例えば、抗体分子は、重(Ｈ)鎖可変ドメイン配列(ここではＶＨと略す)および軽(Ｌ)鎖可変ドメイン配列(ここではＶＬと略す)を含み得る。ある態様において、抗体分子は、１の重鎖および１の軽鎖を含むまたはこれらからなる(ここでは半抗体と称す)。他の例において、抗体分子は２の重(Ｈ)鎖可変ドメイン配列および２の軽(Ｌ)鎖可変ドメイン配列を含み、それによりＦａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ(ａｂ’)２、Ｆｃ、Ｆｄ、Ｆｄ’、Ｆｖ、一本鎖抗体(例えばｓｃＦｖ)、単可変ドメイン抗体、二重特異性抗体(Ｄａｂ)(二価および二重特異性)およびキメラ(例えば、ヒト化)抗体のような２の抗原結合部位を形成し、これは、完全抗体の修飾により製造してよくまたは組み換えＤＮＡテクノロジーを使用してデノボ合成されたものである。これらの機能的抗体フラグメントは、その各抗原または受容体に対する選択的結合能を保持する。抗体および抗体フラグメントは、ＩｇＧ、ＩｇＡ、ＩｇＭ、ＩｇＤおよびＩｇＥを含むがこれらに限定されない抗体のあらゆるクラスおよび抗体のあらゆるサブクラス(例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３およびＩｇＧ４)由来であり得る。抗体分子の調製物はモノクローナルでもポリクローナルでもよい。抗体分子はまた、ヒト、ヒト化、ＣＤＲ移植またはインビトロで産生された抗体であり得る。抗体は、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４から選択された重鎖定常領域を有し得る。抗体はまた、例えば、カッパまたはラムダから選択された軽鎖も有し得る。用語“免疫グロブリン”(Ｉｇ)は、ここでは用語“抗体”と交換可能に使用する。
抗体分子の抗原結合フラグメントの例は、(ｉ)Ｆａｂフラグメント、ＶＬ、ＶＨ、ＣＬおよびＣＨ１ドメインからなる単価フラグメント；(ii)Ｆ(ａｂ’)２フラグメント、ヒンジ領域のジスルフィド架橋により連結された２のＦａｂフラグメントを含む二価フラグメント；(iii)ＶＨおよびＣＨ１ドメインからなるＦｄフラグメント；(iv)抗体の一アームのＶＬおよびＶＨドメインからなるＦｖフラグメント、(ｖ)ＶＨドメインからなる二重特異性抗体(ｄＡｂ)フラグメント；(vi)ラクダ類またはラクダ化可変ドメイン；(vii)一本鎖Ｆｖ(ｓｃＦｖ)(例えば、Bird et al. (1988) Science 242:423-426;およびHuston et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883参照)；(viii)単一ドメイン抗体を含む。これらのフラグメントは当業者に知られる慣用の技術を使用して得て、フラグメントを完全抗体と同じ方法でその有用性についてスクリーニングする。
用語“抗体”は、完全分子ならびにその機能的フラグメントを含む。抗体の定常領域を、抗体の特性を修飾するため(例えば、Ｆｃ受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基数、エフェクター細胞機能または補体機能の１以上の増加または減少のため)、改変、例えば、変異できる。
抗体分子はまた単一ドメイン抗体であり得る。単一ドメイン抗体は、相補性決定領域が単一ドメインポリペプチドの一部である抗体を含み得る。例は、重鎖抗体、生来軽鎖を欠く抗体、慣用の４鎖由来の単一ドメイン抗体、操作抗体および抗体由来のもの以外の単一ドメインスキャフォールドを含むが、これらに限定されない。単一ドメイン抗体は、最先端のまたは将来のあらゆる単一ドメイン抗体であり得る。単一ドメイン抗体は、マウス、ヒト、ラクダ、ラマ、魚、サメ、ヤギ、ウサギおよびウシを含むが、これらに限定されない任意の種由来であり得る。本発明の他の面によって、単一ドメイン抗体は、軽鎖を欠く重鎖抗体として知られる天然に存在する単一ドメイン抗体である。このような単一ドメイン抗体は、例えば、ＷＯ９４０４６７８号に開示されている。明確にするために、この生来軽鎖を欠く重鎖抗体由来の可変ドメインは、慣用の４鎖免疫グロブリンのＶＨと区別するために、ＶＨＨまたはナノボディとしてここで知られる。このようなＶＨＨ分子は、ラクダ科種、例えば、ラクダ、ラマ、ヒトコブラクダ、アルパカおよびグアナコで惹起させた抗体に由来し得る。ラクダ科以外の他の種は生来軽鎖を欠く重鎖抗体を産生でき、このようなＶＨＨは本発明の範囲内である。
ＶＨおよびＶＬ領域は、“フレームワーク領域”(ＦＲまたはＦＷ)と呼ばれるより保存的な領域に分散する、“相補性決定領域”(ＣＤＲ)と呼ばれる超変異性の領域に細分できる。
フレームワーク領域およびＣＤＲの程度は、多くの方法により厳密に定義されている(Kabat, E. A., et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No. 91-3242; Chothia, C. et al. (1987) J. Mol. Biol. 196:901-917；およびOxford MolecularのＡｂＭ抗体モデリングソフトウエアを使用するＡｂＭ定義参照)。一般に、例えば、Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains. In: Antibody Engineering Lab Manual (Ed.: Duebel, S. and Kontermann, R., Springer-Verlag, Heidelberg)参照。
ここで使用する用語“相補性決定領域”および“ＣＤＲ”は、抗原特異性および結合親和性を付与する抗体可変領域内のアミノ酸の配列をいう。一般に、各重鎖可変領域に３のＣＤＲ(ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３)があり、各軽鎖可変領域に３のＣＤＲ(ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、ＬＣＤＲ３)がある。
あるＣＤＲの厳密なアミノ酸配列境界は、Kabat et al.(１９９１)、“Sequences of Proteins of Immunological Interest,” 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD(“Kabat”番号付けスキーム)、Al-Lazikani et al., (1997) JMB 273,927-948(“Chothia”番号付けスキーム)。ここで使用する、“Chothia”番号付けスキームにより定義するＣＤＲは、“高度可変ループ”と呼ぶこともある。
例えば、Kabatにより、重鎖可変ドメイン(ＶＨ)におけるＣＤＲアミノ酸残基は３１〜３５(ＨＣＤＲ１)、５０〜６５(ＨＣＤＲ２)および９５〜１０２(ＨＣＤＲ３)と番号付けされ、軽鎖可変ドメイン(ＶＬ)におけるＣＤＲアミノ酸残基は２４〜３４(ＬＣＤＲ１)、５０〜５６(ＬＣＤＲ２)および８９〜９７(ＬＣＤＲ３)と番号付けされる。Chothiaにより、ＶＨにおけるＣＤＲアミノ酸は２６〜３２(ＨＣＤＲ１)、５２〜５６(ＨＣＤＲ２)および９５〜１０２(ＨＣＤＲ３)と番号付けされ、ＶＬにおけるアミノ酸残基は２６〜３２(ＬＣＤＲ１)、５０〜５２(ＬＣＤＲ２)および９１〜９６(ＬＣＤＲ３)と番号付けされる。KabatおよびChothiaのＣＤＲ定義を合わせることにより、ヒトＶＨにおけるＣＤＲはアミノ酸残基２６〜３５(ＨＣＤＲ１)、５０〜６５(ＨＣＤＲ２)および９５〜１０２(ＨＣＤＲ３)からなり、ヒトＶＬにおけるＣＤＲはアミノ酸残基２４〜３４(ＬＣＤＲ１)、５０〜５６(ＬＣＤＲ２)および８９〜９７(ＬＣＤＲ３)からなる。
一般に、具体的に示さない限り、抗ＰＤ−１抗体分子は、例えば、表１に記載の、Kabat ＣＤＲおよび／またはChothia高度可変ループの組み合わせである。ある態様において、表１に記載する抗ＰＤ−１抗体分子について、次の定義を使用する：KabatおよびChothia両者のＣＤＲ定義の組み合わせによるＨＣＤＲ１およびKabatのＣＤＲ定義によるＨＣＣＤＲ２〜３およびＬＣＣＤＲ１〜３。全ての定義において、各ＶＨおよびＶＬは、概して、アミノ末端からカルボキシ末端に次の順番で配置された６のＣＤＲと４のＦＲを含む：ＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、ＦＲ４。
ここで使用する、“免疫グロブリン可変ドメイン配列”は、免疫グロブリン可変ドメインの構造を形成できるアミノ酸配列をいう。例えば、配列は、天然に存在する可変ドメインのアミノ酸配列の全てまたは一部を含み得る。例えば、配列は、１、２またはそれ以上のＮ末端またはＣ末端アミノ酸を含んでも含まなくてもよく、または、該タンパク質構造の形成と適合する他の改変を含んでよい。
用語“抗原結合部位”は、ＰＤ−１ポリペプチドまたはそのエピトープと結合する界面を形成する決定基を含む抗体分子の一部をいう。タンパク質(またはタンパク質模倣体)に関して、抗原結合部位は、概して、ＰＤ−１ポリペプチドと結合する界面を形成する１以上の(少なくとも４のアミノ酸またはアミノ酸模倣体の)ループを含む。概して、抗体分子の抗原結合部位は、少なくとも１または２のＣＤＲおよび／または高度可変ループまたはより典型的には少なくとも３、４、５または６のＣＤＲおよび／または高度可変ループを含む。
用語“競合”または“交差競合”は、ここでは、抗体分子が、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに提供する抗ＰＤ−１抗体分子の標的、例えば、ヒトＰＤ−１との結合を妨害する能力をいうために、交換可能に使用する。結合の妨害は直接的でも間接的でもよい(例えば、抗体分子または標的のアロステリック調節を介する)。抗体分子が他の抗体分子の標的への結合を妨害できる程度、それゆえに、競合といえるか否かは、競合結合アッセイ、例えば、ＦＡＣＳアッセイ、ＥＬＩＳＡまたはＢＩＡＣＯＲＥアッセイを使用して決定できる。ある態様において、競合結合アッセイは、定量的競合アッセイである。ある態様において、第一抗ＰＤ−１抗体分子は、第二抗ＰＤ−１抗体分子と標的の結合について、第一抗体分子の標的への結合が競合結合アッセイ(例えば、ここに記載する競合アッセイ)で、１０％以上、例えば、２０％以上、３０％以上、４０％以上、５０％以上、５５％以上、６０％以上、６５％以上、７０％以上、７５％以上、８０％以上、８５％以上、９０％以上、９５％以上、９８％以上、９９％以上減少したとき競合であるという。
ここで使用する用語“モノクローナル抗体”または“モノクローナル抗体組成物”は、単分子組成物の抗体分子の調製物をいう。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに対する単一結合特異性および親和性を示す。モノクローナル抗体は、ハイブリドーマテクノロジーまたはハイブリドーマテクノロジーを使用しない方法(例えば、組み換え法)により製造できる。
“効果的ヒト”タンパク質は、中和抗体応答、例えば、ヒト抗マウス抗体(ＨＡＭＡ)応答を誘発しないタンパク質である。ＨＡＭＡは、多くの状況で、例えば、抗体分子を、例えば、慢性または再発性疾患状態の処置において繰り返し投与したとき、問題となり得る。ＨＡＭＡ応答は、血清からの抗体クリアランスの増加のため(例えば、Saleh et al., Cancer Immunol. Immunother., 32:180-190 (1990)参照)およびまたアレルギー反応の可能性のため(例えば、LoBuglio et al., Hybridoma, 5:5117-5123 (1986)参照)、反復抗体投与を無効とする可能性があり得る。
抗体分子はポリクローナル抗体でもモノクローナル抗体でもよい。他の態様において、抗体は、組み換えにより産生でき、例えば、ファージディスプレイまたはコンビナトリアル法により産生できる。
抗体産生のためのファージディスプレイおよびコンビナトリアル法は当分野で知られる(例えば、Ladner et al. 米国特許５,２２３,４０９号；Kang et al. 国際公開ＷＯ９２／１８６１９号；Dower et al. 国際公開ＷＯ９１／１７２７１号；Winter et al. 国際公開ＷＯ９２／２０７９１号；Markland et al. 国際公開ＷＯ９２／１５６７９号；Breitling et al. 国際公開ＷＯ９３／０１２８８号；McCafferty et al. 国際公開ＷＯ９２／０１０４７；Garrard et al. 国際公開ＷＯ９２／０９６９０；Ladner et al. 国際公開ＷＯ９０／０２８０９号；Fuchs et al. (1991) Bio/Technology 9:1370-1372; Hay et al. (1992) Hum Antibod Hybridomas 3:81-85; Huse et al. (1989) Science 246:1275-1281; Griffths et al. (1993) EMBO J 12:725-734; Hawkins et al. (1992) J Mol Biol 226:889-896; Clackson et al. (1991) Nature 352:624-628; Gram et al. (1992) PNAS 89:3576-3580; Garrad et al. (1991) Bio/Technology 9:1373-1377; Hoogenboom et al. (1991) Nuc Acid Res 19:4133-4137;およびBarbas et al. (1991) PNAS 88:7978-7982に開示のとおり。これらの内容は引用により本明細書に包含させる)。
ある態様において、抗体は、完全ヒト抗体(例えば、ヒト免疫グロブリン配列からの抗体を産生するように遺伝子操作したマウスで産生した抗体)または非ヒト抗体、例えば、齧歯類(マウスまたはラット)、ヤギ、霊長類(例えば、サル)、ラクダ抗体である。好ましくは、非ヒト抗体は齧歯類(マウスまたはラット抗体)である。齧歯類抗体の製造法は当分野で知られる。
ヒトモノクローナル抗体は、マウス系よりも、ヒト免疫グロブリン遺伝子を担持するトランスジェニックマウスを使用して産生できる。目的の抗原で免疫化したこれらのトランスジェニックマウス由来の脾細胞を使用して、ヒトタンパク質からのエピトープに特異的親和性を有するヒトｍＡｂを分泌するハイブリドーマを産生する(例えば、Wood et al. 国際出願ＷＯ９１／００９０６号、Kucherlapati et al. ＰＣＴ公開ＷＯ９１／１０７４１号；Lonberg et al. 国際出願ＷＯ９２／０３９１８号；Kay et al. 国際出願９２／０３９１７号；Lonberg, N. et al. 1994 Nature 368:856-859; Green, L.L. et al. 1994 Nature Genet. 7:13-21; Morrison, S.L. et al. 1994 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855; Bruggeman et al. 1993 Year Immunol 7:33-40; Tuaillon et al. 1993 PNAS 90:3720-3724; Bruggeman et al. 1991 Eur J Immunol 21:1323-1326参照)。
抗体は、可変領域またはその一部、例えば、ＣＤＲが非ヒト生物、例えば、ラットまたはマウスで産生されたものであり得る。キメラ、ＣＤＲ移植およびヒト化抗体は本発明の範囲内である。非ヒト生物、例えば、ラットまたはマウスで産生され、次いで、ヒトでの抗原性を減少させるために、例えば、可変フレームワークまたは定常領域内を修飾した抗体は本発明の範囲内である。
キメラ抗体は当分野で知られる組み換えＤＮＡ法により製造できる(Robinson et al.、国際特許出願ＰＣＴ／ＵＳ８６／０２２６９号；Akira, et al.、欧州特許出願１８４,１８７号；Taniguchi, M.、欧州特許出願１７１,４９６号；Morrison et al.、欧州特許出願１７３,４９４号；Neuberger et al.、国際出願ＷＯ８６／０１５３３号；Cabilly et al. 米国特許４,８１６,５６７号；Cabilly et al.、欧州特許出願１２５,０２３号; Better et al. (1988 Science 240:1041-1043); Liu et al. (1987) PNAS 84:3439-3443; Liu et al., 1987, J. Immunol. 139:3521-3526; Sun et al. (1987) PNAS 84:214-218; Nishimura et al., 1987, Canc. Res. 47:999-1005; Wood et al. (1985) Nature 314:446-449；およびShaw et al., 1988, J. Natl Cancer Inst. 80:1553-1559参照)。
ヒト化またはＣＤＲ移植抗体は、ドナーＣＤＲに置き換えられた、少なくとも１または２の、しかし、一般に全部で３の(重および／または軽免疫グロブリン鎖の)レシピエントＣＤＲを有する。抗体は、非ヒトＣＤＲの少なくとも一部で置き換えられていてよくまたはＣＤＲのいくつかのみが非ヒトＣＤＲで置き換えられていてよい。ヒト化抗体がＰＤ−１に結合するのに必要な数のＣＤＲに置き換えることのみが必要である。好ましくは、ドナーは齧歯類抗体、例えば、ラット抗体またはマウス抗体であり、レシピエントはヒトフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークである。概して、ＣＤＲを提供する免疫グロブリンをドナー”と呼び、フレームワークを提供する免疫グロブリンを“アクセプター”と呼ぶ。ある態様において、ドナー免疫グロブリンは非ヒト(例えば、齧歯類)である。アクセプターフレームワークは天然に存在する(例えば、ヒト)フレームワークまたはコンセンサスフレームワークまたはそれと約８５％以上、好ましくは９０％、９５％、９９％またはそれより高く一致する配列である。
ここで使用する、用語“コンセンサス配列”は、関連配列のファミリーに最も頻繁に生じるアミノ酸(またはヌクレオチド)から形成される配列をいう(例えば、Winnaker, From Genes to Clones (Verlagsgesellschaft, Weinheim, Germany 1987)参照)。タンパク質のファミリーにおいて、コンセンサス配列における各位置は、該ファミリーのその位置に最も頻繁に生じるアミノ酸で占拠される。２のアミノ酸が等しく頻繁に生じるならば、いずれもコンセンサス配列に包含できる。“コンセンサスフレームワーク”は、コンセンサス免疫グロブリン配列におけるフレームワーク領域をいう。
抗体は、当分野で知られる方法によりヒト化できる(Morrison, S. L., 1985, Science 229:1202-1207, by Oi et al., 1986, BioTechniques 4:214およびQueen et al. 米国５,５８５,０８９号、米国５,６９３,７６１号および米国５,６９３,７６２号参照)。
ヒト化またはＣＤＲ移植抗体は、免疫グロブリン鎖の１、２または全ＣＤＲを置換でき、ここで、ＣＤＲ移植またはＣＤＲ置換により産生できる。例えば、米国特許,２２５,５３９号; Jones et al. 1986 Nature 321:552-525; Verhoeyan et al. 1988 Science 239:1534; Beidler et al. 1988 J. Immunol. 141:4053-4060; Winter 米国５,２２５,５３９号を参照のこと(これら全ての内容を引用することにより明示的にここに包含させる)。Winterは、本発明のヒト化抗体の製造に使用し得るＣＤＲ移植法を記載し(米国特許出願ＧＢ２１８８６３８Ａ(１９８７年３月２６日出願)；Winter 米国５,２２５,５３９号)、この内容を引用することにより明示的にここに包含させる。
また本発明の範囲内であるのは、特異的アミノ酸が置換、欠失または付加されているヒト化抗体である。ドナーからアミノ酸を選択する基準は、例えば、米国５,５８５,０８９号のカラム１２〜１６に記載され、その内容を引用により本明細書に包含させる。抗体をヒト化する他の技術は、１９９２年１２月２３日公開のPadlan et al. ＥＰ５１９５９６Ａ１号に記載されている。
抗体分子は一本鎖抗体であり得る。一本鎖抗体(ｓｃＦＶ)を操作してよい(例えば、Colcher, D. et al. (1999) Ann N Y Acad Sci 880:263-80;およびReiter, Y. (1996) Clin Cancer Res 2:245-52参照)。一本鎖抗体は、同じ標的タンパク質の異なるエピトープに特性を有する多価抗体を産生するために二量体化または多量体化できる。
さらに他の態様において、抗体分子は、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＭ、ＩｇＡ１、ＩｇＡ２、ＩｇＤおよびＩｇＥの重鎖定常領域から選択される重鎖定常領域、特に、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３およびＩｇＧ４の、(例えば、ヒト)重鎖定常領域を有する。他の態様において、抗体分子は、例えば、カッパまたはラムダの、例えば、(例えば、ヒト)軽鎖定常領域から選択される、軽鎖定常領域を有する。定常領域は、抗体の特性を修飾(例えば、Ｆｃ受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基数、エフェクター細胞機能および／または補体機能の１以上の増加または減少)するために改変、例えば変異できる。ある態様において、抗体はエフェクター機能を有し、補体を固定できる。他の態様において、抗体はエフェクター細胞を動員せずまたは補体を固定しない。他の態様において、抗体は、Ｆｃ受容体と結合する能力が減少しているか、該能力を有しない。例えば、Ｆｃ受容体との結合を支持しないアイソタイプまたはサブタイプ、フラグメントまたは他の変異体であり、例えば、変異したまたは欠損したＦｃ受容体結合領域を有する。
抗体定常領域を改変する方法は当分野で知られる。改変された機能を有する抗体、例えば細胞上のＦｃＲまたは補体のＣ１成分のようなエフェクターリガンドに対する改変された親和性を、抗体の定常部分における少なくとも１のアミノ酸残基を、異なる残基で置き換えることにより製造できる(例えば、例えば、ＥＰ３８８,１５１Ａ１号、米国特許５,６２４,８２１号および米国特許５,６４８,２６０号参照(これら全ての内容を引用により本明細書に包含させる))。マウスまたは他の種に適用するならば、免疫グロブリンがこれらの機能を減少させるであろう、類似するタイプの改変も記載し得る。
抗体分子は、他の機能的分子(例えば、他のペプチドまたはタンパク質)に誘導体化または連結できる。ここで使用する、“誘導体化”抗体分子は、修飾されているものである。誘導体化の方法は、蛍光部分、放射性ヌクレオチド、毒素、酵素またはビオチンのような親和性リガンドの付加を含むが、これらに限定されない。したがって、本発明の抗体分子は、誘導体化および免疫接着分子を含むここに記載する抗体の他に修飾された形態を含むことを意図する。例えば、抗体分子は、他の抗体(例えば、二重特異性抗体または二重特異性抗体)、検出可能薬剤、細胞毒性剤、薬剤および／または他の分子と抗体または抗体部分の結合を仲介できるタンパク質またはペプチド(例えばストレプトアビジンコア領域またはポリヒスチジンタグ)のような１以上の他の分子に、機能的に結合(化学的カップリング、遺伝子融合、非共有結合的結合または他のものによる)できる。
誘導体化抗体分子の１タイプは、１以上の抗体(同じタイプまたは、例えば、二重特異性抗体を産生するために、異なるタイプ)の架橋により産生する。適当な架橋剤は、適切なスペーサーにより離された２の明確に反応性の基を有するヘテロ二機能性(例えば、ｍ−マレイミドベンゾイル−Ｎ−ヒドロキシスクシンイミドエステル)またはホモ二機能性(例えば、スベリン酸ジサクシンイミジル)であるものを含む。このようなリンカーは、Pierce Chemical Company, Rockford, Illから入手可能である。
本発明の抗体分子を誘導体化(または標識)し得る有用な検出可能剤は、蛍光化合物、多様な酵素、補欠分子族、発光物質、生物発光物質、蛍光放出金属原子、例えば、ユーロピウム(Ｅｕ)および他のランタニド(anthanides)および放射性物質を含む。代表的蛍光検出可能薬剤は、フルオレセイン、イソチオシアン酸フルオレセイン、ローダミン、５−ジメチルアミン−１−ナフタレンスルホニルクロライド、フィコエリトリンなどを含む。抗体を、アルカリホスファターゼ、ホースラディッシュペルオキシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、アセチルコリンエステラーゼ、グルコースオキシダーゼなどのような検出可能酵素でも誘導体化してよい。抗体を検出可能酵素で誘導体化するとき、酵素が検出可能反応産物の産生に使用するさらなる試薬の添加により検出できる。例えば、検出可能剤ホースラディッシュペルオキシダーゼが存在するとき、過酸化水素およびジアミノベンジジンの添加は、検出可能な着色された反応産物を生じる。抗体分子は補欠分子族(例えば、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチン)で誘導体化してもよい。例えば、抗体を、ビオチンで誘導体化し、アビジンまたはストレプトアビジン結合の間接的測定により検出し得る。適当な蛍光物質の例はウンベリフェロン、フルオレセイン、イソチオシアン酸フルオレセイン、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロライドまたはフィコエリトリンを含み、発光物質の例はルミノールを含み、そして生物発光物質の例はルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびエクオリンを含む。
標識抗体分子を、(ｉ)親和性クロマトグラフィーまたは免疫沈殿のような標準的技術により予定した抗体を単離するため；(ii)タンパク質の量または発現パターンを評価するために、予定した抗原を(例えば、細胞ライセートまたは細胞上清において)検出するため；(iii)例えば、ある処置レジメンの有効性を決定するための、臨床試験法の一部として組織におけるタンパク質レベルをモニターするためを含む、多くの状況において、例えば、診断的および／または実験的に使用できる。
抗体分子を、他の分子に、概して標識または治療的(例えば、細胞毒性または細胞増殖抑制)薬剤にコンジュゲートし得る。放射性同位体は診断的または治療的適用において使用できる。抗ＰＤ−１抗体と結合できる放射性同位体は、α−、β−またはγ−エミッターまたはβ−およびγ−エミッターを含むが、これらに限定されない。このような放射性同位体は、ヨウ素(１３１Ｉまたは１２５Ｉ)、イットリウム(９０Ｙ)、ルテチウム(１７７Ｌｕ)、アクチニウム(２２５Ａｃ)、プラセオジム、アスタチン(２１１Ａｔ)、レニウム(１８６Ｒｅ)、ビスマス(２１２Ｂｉまたは２１３Ｂｉ)、インジウム(１１１Ｉｎ)、テクネチウム(９９ｍＴｃ)、リン(３２Ｐ)、ロジウム(１８８Ｒｈ)、硫黄(３５Ｓ)、炭素(１４Ｃ)、トリチウム(３Ｈ)、クロム(５１Ｃｒ)、塩素(３６Ｃｌ)、コバルト(５７Ｃｏまたは５８Ｃｏ)、鉄(５９Ｆｅ)、セレン(７５Ｓｅ)またはガリウム(６７Ｇａ)を含むが、これらに限定されない。治療剤として有用な放射性同位体は、イットリウム(９０Ｙ)、ルテチウム(１７７Ｌｕ)、アクチニウム(２２５Ａｃ)、プラセオジム、アスタチン(２１１Ａｔ)、レニウム(１８６Ｒｅ)、ビスマス(２１２Ｂｉまたは２１３Ｂｉ)およびロジウム(１８８Ｒｈ)を含む。例えば、診断剤に使用するための、標識として有用な放射性同位体は、ヨウ素(１３１Ｉまたは１２５Ｉ)、インジウム(１１１Ｉｎ)、テクネチウム(９９ｍＴｃ)、リン(３２Ｐ)、炭素(１４Ｃ)およびトリチウム(３Ｈ)または上に挙げた治療的同位体の１以上を含む。
本発明は、放射性標識抗体分子およびその標識法を提供する。ある態様において、抗体分子の標識法を開示する。該方法は、抗体分子とキレート剤を接触させ、それによりコンジュゲートした抗体を産生することを含む。コンジュゲートした抗体を放射性同位体、例えば、１１１インジウム、９０イットリウムおよび１７７ルテチウムで標識し、それにより標識抗体分子を産生する。
上記のように、抗体分子を治療剤とコンジュゲートできる。治療活性放射性同位体は既に述べている。他の治療剤の例は、タキソール、サイトカラシンＢ、グラミシジンＤ、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テニポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンＤ、１−デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、ピューロマイシン、マイタンシノイド、例えば、マイタンシノール(米国特許５,２０８,０２０号参照)、ＣＣ−１０６５(米国特許５,４７５,０９２号、５,５８５,４９９号、５,８４６,５４５号参照)およびそのアナログまたはホモログを含む。治療剤は、代謝拮抗剤(例えば、メトトレキサート、６−メルカプトプリン、６−チオグアニン、シタラビン、５−フルオロウラシルデカルバジン)、アルキル化剤(例えば、メクロレタミン、チオテパ、クロラムブシル、ＣＣ−１０６５、メルファラン、カルムスチン(ＢＳＮＵ)およびロムスチン(ＣＣＮＵ)、シクロシクロホスファミドミド、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンＣおよびｃｉｓ−ジクロロジアミン白金(II)(ＤＤＰ)シスプラチン)、アントラサイクリン(例えば、ダウノルビシン(以前はダウノマイシン)およびドキソルビシン)、抗生物質(例えば、ダクチノマイシン(以前はアクチノマイシン)、ブレオマイシン、ミトラマイシンおよびアントラマイシン(ＡＭＣ))および抗有糸分裂剤(例えば、ビンクリスチン、ビンブラスチン、タキソールおよびマイタンシノイド)を含むが、これらに限定されない。
一つの面において、本発明は、ＰＤ−１受容体と特異的に結合する標的結合分子を提供する方法に関する。例えば、標的結合分子は抗体分子である。本方法は、少なくとも非ヒトタンパク質の部分を含む標的タンパク質を提供し、該部分は、ヒト標的タンパク質の対応する部分と相同であるが(少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、８７％、９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％同一)、少なくとも１のアミノ酸(例えば、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８または９のアミノ酸)が異なり；抗原と特異的に結合する抗体分子を得て；そして、結合剤が標的タンパク質の活性を調節する効果を評価することを含む。本方法は、さらに、結合剤(例えば、抗体分子)または誘導体(例えば、ヒト化抗体分子)をヒト対象に投与することを含み得る。
ある態様において、抗体分子は多特異的(例えば、二重特異性または三重特異性)抗体分子である。二重特異性またはヘテロ二量体抗体分子の製造法は当分野で知られ、例えば、ＵＳ５７３１１６８号に記載の、例えば、“ホール内のノブ”アプローチ；例えば、ＷＯ０９／０８９００４号、ＷＯ０６／１０６９０５号およびＷＯ２０１０／１２９３０４号に記載の、静電気ステアリングＦｃ対形成；例えば、ＷＯ０７／１１０２０５号に記載の、鎖交換操作ドメイン(ＳＥＥＤ)ヘテロ二量体形成；例えば、ＷＯ０８／１１９３５３号、ＷＯ２０１１／１３１７４６号およびＷＯ２０１３／０６０８６７号に記載のＦａｂアーム交換；例えば、ＵＳ４４３３０５９号に記載の、例えば、アミン反応性機およびスルフヒドリル反応性機を有するヘテロ二機能性反応材を使用する二構造的構造を産生するための、抗体架橋による、二重抗体コンジュゲート；例えば、ＵＳ４４４４８７８号に記載の、２の重鎖の間のジスルフィド結合の還元および酸化のサイクルを減る、異なる抗体からの半抗体(重−軽鎖対またはＦａｂ)の組み換えにより産生された二重特異性抗体決定基；三機能的抗体、例えば、ＵＳ５２７３７４３号に記載の、例えば、スルフヒドリル反応性基を経て架橋した３のＦａｂ’フラグメント；生合成結合タンパク質、例えば、ＵＳ５５３４２５４号に記載の、好ましくはジスルフィドまたはアミン反応性化学架橋によりＣ末端尾を経て架橋したｓｃＦｖの対；二機能性抗体、例えば、ＵＳ５５８２９９６号に記載の、例えば、定常ドメインが置換されている、ロイシンジッパー(例えば、ｃ−ｆｏｓおよびｃ−ｊｕｎ)を経て二量体化した異なる特異性を有するＦａｂフラグメント；二重特異性およびオリゴ特異的一価およびオリゴバレント受容体、例えば、ＵＳ５５９１８２８号に記載の、一方の抗体のＣＨ１領域と、他方の概して付随する軽鎖を伴う抗体のＶＨ領域の間のポリペプチドスペーサーを介して連結した２の抗体(２のＦａｂフラグメント)のＶＨ−ＣＨ１領域；二重特異性ＤＮＡ−抗体コンジュゲート、例えば、ＵＳ５６３５６０２号に記載の、ＤＮＡの二本鎖変を介する抗体またはＦａｂフラグメントの架橋；二重特異性融合タンパク質、例えば、ＵＳ５６３７４８１号に記載の、２のｓｃＦｖとその間の親水性らせん状ペプチドリンカーおよび完全定常領域を含む発現構築物；多価および多特異性結合タンパク質、例えば、ＵＳ５８３７２４２号に記載の、一般に二重特異性抗体と呼ばれる、Ｉｇ重鎖可変領域の結合領域を伴う第一ドメインと、Ｉｇ軽鎖可変領域の結合領域を伴う第二度目人の二量体(二重特異性、三重特異性または四重特異性分子を創製する、高次構造も開示されている)；例えば、ＵＳ５８３７８２１号に記載の、二重特異性／多価分子を形成するために二量体化できる、さらにペプチドスペーサーで抗体ヒンジ領域およびＣＨ３領域に連結した、連結したＶＬ鎖およびＶＨ鎖を有するミニボディ構築物；二重特異性二重特異性抗体を形成するために二量体化できる、いずれかの配向の短ペプチドリンカー(例えば、５または１０アミノ酸)を有するまたはリンカーを有しないで連結したＶＨおよびＶＬドメイン；例えば、ＵＳ５８４４０９４号に記載の三量体および四量体；例えば、ＵＳ５８６４０１９号に記載された、一連のＦＶ(またはｓｃＦｖ)を形成するために、さらにＶＬドメインと結合した、Ｃ末端で架橋可能な基とペプチド結合により結合したＶＨドメイン(またはファミリーメンバーのＶＬドメイン)の弦；および例えば、ＵＳ５８６９６２０号に記載の、ｓｃＦＶまたは二重特異性抗体タイプ形式の両者を使用して例えば、ホモ二価、ヘテロ二価、三価および四価構造を形成するために、非共有結合または化学的架橋により多価構造に合わさったペプチドリンカーにより連結したＶＨおよびＶＬドメインの両者を伴う一本鎖結合ポリペプチドを含むが、これらに限定されない。さらなる代表的多特異性および二重特異性分子およびその製造法は、例えば、ＵＳ５９１０５７３号、ＵＳ５９３２４４８号、ＵＳ５９５９０８３号、ＵＳ５９８９８３０号、ＵＳ６００５０７９号、ＵＳ６２３９２５９号、ＵＳ６２９４３５３号、ＵＳ６３３３３９６号、ＵＳ６４７６１９８号、ＵＳ６５１１６６３号、ＵＳ６６７０４５３号、ＵＳ６７４３８９６号、ＵＳ６８０９１８５号、ＵＳ６８３３４４１号、ＵＳ７１２９３３０号、ＵＳ７１８３０７６号、ＵＳ７５２１０５６号、ＵＳ７５２７７８７号、ＵＳ７５３４８６６号、ＵＳ７６１２１８１号、ＵＳ２００２００４５８７Ａ１号、ＵＳ２００２０７６４０６Ａ１号、ＵＳ２００２１０３３４５Ａ１号、ＵＳ２００３２０７３４６Ａ１号、ＵＳ２００３２１１０７８Ａ１号、ＵＳ２００４２１９６４３Ａ１号、ＵＳ２００４２２０３８８Ａ１号、ＵＳ２００４２４２８４７Ａ１号、ＵＳ２００５００３４０３Ａ１号、ＵＳ２００５００４３５２Ａ１号、ＵＳ２００５０６９５５２Ａ１号、ＵＳ２００５０７９１７０Ａ１号、ＵＳ２００５１００５４３Ａ１号、ＵＳ２００５１３６０４９Ａ１号、ＵＳ２００５１３６０５１Ａ１号、ＵＳ２００５１６３７８２Ａ１号、ＵＳ２００５２６６４２５Ａ１号、ＵＳ２００６０８３７４７Ａ１号、ＵＳ２００６１２０９６０Ａ１号、ＵＳ２００６２０４４９３Ａ１号、ＵＳ２００６２６３３６７Ａ１号、ＵＳ２００７００４９０９Ａ１号、ＵＳ２００７０８７３８１Ａ１号、ＵＳ２００７１２８１５０Ａ１号、ＵＳ２００７１４１０４９Ａ１号、ＵＳ２００７１５４９０１Ａ１号、ＵＳ２００７２７４９８５Ａ１号、ＵＳ２００８０５０３７０Ａ１号、ＵＳ２００８０６９８２０Ａ１号、ＵＳ２００８１５２６４５Ａ１号、ＵＳ２００８１７１８５５Ａ１号、ＵＳ２００８２４１８８４Ａ１号、ＵＳ２００８２５４５１２Ａ１号、ＵＳ２００８２６０７３８Ａ１号、ＵＳ２００９１３０１０６Ａ１号、ＵＳ２００９１４８９０５Ａ１号、ＵＳ２００９１５５２７５Ａ１号、ＵＳ２００９１６２３５９Ａ１号、ＵＳ２００９１６２３６０Ａ１号、ＵＳ２００９１７５８５１Ａ１号、ＵＳ２００９１７５８６７Ａ１号、ＵＳ２００９２３２８１１Ａ１号、ＵＳ２００９２３４１０５Ａ１号、ＵＳ２００９２６３３９２Ａ１号、ＵＳ２００９２７４６４９Ａ１号、ＥＰ３４６０８７Ａ２号、ＷＯ０００６６０５Ａ２号、ＷＯ０２０７２６３５Ａ２号、ＷＯ０４０８１０５１Ａ１号、ＷＯ０６０２０２５８Ａ２号、ＷＯ２００７０４４８８７Ａ２号、ＷＯ２００７０９５３３８Ａ２号、ＷＯ２００７１３７７６０Ａ２号、ＷＯ２００８１１９３５３Ａ１号、ＷＯ２００９０２１７５４Ａ２号、ＷＯ２００９０６８６３０Ａ１号、ＷＯ９１０３４９３Ａ１号、ＷＯ９３２３５３７Ａ１号、ＷＯ９４０９１３１Ａ１号、ＷＯ９４１２６２５Ａ２号、ＷＯ９５０９９１７Ａ１号、ＷＯ９６３７６２１Ａ２号、ＷＯ９９６４４６０Ａ１号に見られる。上記引用出願の内容を、その全体を引用により本明細書に包含させる。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子(例えば、単一特異性、二重特異性または多特異性抗体分子)は、他のパートナー、例えば、タンパク質、例えば、１、２またはそれ以上のサイトカインに、例えば、融合分子、例えば融合タンパク質として、共有的に連結、例えば、融合している。他の態様において、融合分子は１以上のタンパク質、例えば、１、２またはそれ以上のサイトカインを含む。ある態様において、サイトカインは、インターロイキン(ＩＬ)−１、ＩＬ−２、ＩＬ−１２、ＩＬ−１５またはＩＬ−２１の１、２、３またはそれ以上から選択されるＩＬである。ある態様において、二重特異性抗体分子は、第一標的に対する第一結合特異性(例えば、ＰＤ−１に)、第二標的に対する第二結合特異性(例えば、ＬＡＧ−３またはＴＩＭ−３)を含み、所望によりインターロイキン(例えば、ＩＬ−１２)ドメイン、例えば完全長ＩＬ−１２またはその一部と連結している。
“融合タンパク質”および“融合ポリペプチド”は、互いに共有的に連結した少なくとも２の部分を有するポリペプチドをいい、ここで、各部分は異なる特性を有するポリペプチドである。特性は、インビトロまたはインビボでの活性のような生物学的特性であり得る。特性は、標的分子への稀有号、反応の触媒などのような単純な化学的または物理的特性でもあり得る。２の部分は直接単ペプチド結合によりまたはペプチドリンカーを介して連結してよいが、互いにリーディングフレーム内である。
本発明は、上記抗体分子をコードする単離核酸分子、そのベクターおよび宿主細胞を提供する。核酸分子は、ＲＮＡ、ゲノムＤＮＡおよびｃＤＮＡを含むが、これらに限定されない。
代表的抗ＰＤ−１抗体分子
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は次のものを含む：
(ａ)配列番号４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(ＶＨ)；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(ＶＬ)；
(ｂ)配列番号１から選択されるＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列；配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列；および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ；
(ｃ)配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ；または
(ｄ)配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列；配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列；および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、次のものを含む：
(ｉ)配列番号１から選択されるＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号４または配列番号２２４；配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列；および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(ＶＨ)；および
(ii)配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(ＶＬ)。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は次のものを含む：
(ｉ)配列番号１から選択されるＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号４または配列番号２２４；配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(ＶＨ)；および
(ii)配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(ＶＬ)。
前記抗体分子の態様において、ＶＨＣＤＲ１は配列番号１のアミノ酸配列を含む。他の態様において、ＶＨＣＤＲ１は配列番号４のアミノ酸配列を含む。さらに他の態様において、ＶＨＣＤＲ１は配列番号２２４のアミノ酸配列を含む。
複数の態様において、前記抗体分子は、配列番号１４７、１５１、１５３、１５７、１６０、１６２、１６６または１６９のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９０％同一のアミノ酸配列または配列番号１４７、１５１、１５３、１５７、１６０、１６２、１６６または１６９のいずれかのアミノ酸配列と比較して、アミノ酸置換、挿入または欠失が２を超えない少なくとも１のフレームワーク(ＦＷ)領域を含む重鎖可変領域を有する。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号１４７、１５１、１５３、１５７、１６０、１６２、１６６または１６９のいずれかのアミノ酸配列を含む少なくとも１のフレームワーク領域を含む重鎖可変領域を有する。
さらに他の態様において、前記抗体分子は、配列番号１４７、１５１、１５３、１５７、１６０、１６２、１６６または１６９のいずれかのアミノ酸配列を含む少なくとも２、３または４のフレームワーク領域を含む重鎖可変領域を有する。
他の態様において、前記抗体分子は配列番号１４７または１５１のＶＨＦＷ１アミノ酸配列、配列番号１５３、１５７または１６０のＶＨＦＷ２アミノ酸配列および配列番号１６２または１６６のＶＨＦＷ３アミノ酸配列を含み、所望により、さらに配列番号１６９のＶＨＦＷ４アミノ酸配列を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号１７４、１７７、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９４、１９６、２００、２０２、２０５または２０８のアミノ酸配列またはそれと少なくとも９０％同一のアミノ酸配列または１７４、１７７、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９４、１９６、２００、２０２、２０５または２０８のいずれかのアミノ酸配列と比較して、アミノ酸置換、挿入または欠失が２を超えない少なくとも１のフレームワーク領域の軽鎖可変領域を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号１７４、１７７、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９４、１９６、２００、２０２、２０５または２０８のアミノ酸配列を含む少なくとも１のフレームワーク領域を含む軽鎖可変領域を有する。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号１７４、１７７、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９４、１９６、２００、２０２、２０５または２０８のいずれかのアミノ酸配列を含む少なくとも２、３または４のフレームワーク領域を含む軽鎖可変領域を有する。
他の態様において、前記抗体分子は配列番号１７４、１７７、１８１、１８３または１８５のＶＬＦＷ１アミノ酸配列、配列番号１８７、１９１または１９４のＶＬＦＷ２アミノ酸配列および配列番号１９６、２００、２０２または２０５のＶＬＦＷ３アミノ酸配列を含み、所望により、さらに配列番号２０８のＶＬＦＷ４アミノ酸配列を含む。
他の態様において、前記抗体は、配列番号３８、５０、８２または８６のいずれかと少なくとも８５％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号３８、５０、８２または８６のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４２、４６、５４、５８、６２、６６、７０、７４または７８のいずれかと少なくとも８５％同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４２、４６、５４、５８、６２、６６、７０、７４または７８のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号９１のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号５０のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号５２または配列番号１０２のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号８２のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号８４のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号８６のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号８８のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４２のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４４のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号５４のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号５６のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号５８のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号６０のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号６２のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体は、配列番号６４のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号６６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号６８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号７０のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号７２のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号７４のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号７６のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号７８のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号８０のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号４２のアミノ酸配列を含むを含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号６６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号７０のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号５０のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号７０のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号４６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号５０のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号４６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号５０のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号５４のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号５４のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号５８のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号６２のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号５０のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号６６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号７４のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号７８のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号８２のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号７０のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号８２のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号６６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号８６のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号６６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号９１のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号４４のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号９１のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号５６のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号９１のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号９１のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号７２のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号１０２のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号７２のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号４４のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号４８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号５２のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号４８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号５２のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号５６のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号５６のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体は、配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６０のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６４のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号５２のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号５２のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号７２のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号７２のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号７６のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号８０のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号８４のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号７２のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体は、配列番号８４のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、配列番号８８のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６８のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、Ｆａｂ、Ｆ(ａｂ’)２、Ｆｖまたは一本鎖Ｆｖフラグメント(ｓｃＦｖ)から選択される。
他の態様において、前記抗体分子は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３およびＩｇＧ４から選択される重鎖定常領域を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、カッパまたはラムダの軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、ＥＵ番号付けによる２２８位または配列番号２１２もしくは２１４の１０８位に変異を有するヒトＩｇＧ４重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、ＥＵ番号付けによる２２８位または配列番号２１２もしくは２１４の１０８位にセリンからプロリン変異を有するヒトＩｇＧ４重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、ＥＵ番号付けによる２９７位または配列番号２１６の１８０位にアスパラギンからアラニン変異を含むヒトＩｇＧ１重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、ＥＵ番号付けによる２６５位または配列番号２１７の１４８位にアスパラギン酸からアラニン変異およびＥＵ番号付けによる３２９位または配列番号２１７の２１２位にプロリンからアラニン変異を含むヒトＩｇＧ１重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、ＥＵ番号付けによる２３４位または配列番号２１８の１１７位にロイシンからアラニン変異およびＥＵ番号付けによる２３５位または配列番号２１８の１１８位にロイシンからアラニン変異を含むヒトＩｇＧ１重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域を含む。
他の態様において、前記抗体分子は、ヒトＰＤ−１に約０.２nM未満の解離定数(ＫＤ)で結合できる。
ある態様において、前記抗体分子は、ヒトＰＤ−１に、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ法で測定して、約０.２nM、０.１５nM、０.１nM、０.０５nMまたは０.０２nM、例えば、約０.１３nM〜０.０３nM、例えば、約０.０７７nM〜０.０８８nM、例えば、約０.０８３nM未満のＫＤで結合する。
他の態様において、前記抗体分子は、カニクイザルＰＤ−１に、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ法で測定して、約０.２nM、０.１５nM、０.１nM、０.０５nMまたは０.０２nM、例えば、約０.１１nM〜０.０８nM、例えば、約０.０９３nMのＫＤで結合する。
ある態様において、前記抗体分子は、ヒトＰＤ−１およびカニクイザルＰＤ−１の両者に、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ法で測定して、類似のＫＤで、例えば、nM範囲で結合する。ある態様において、前記抗体分子は、ヒトＰＤ−１−Ｉｇ融合タンパク質に、例えば、ＥＬＩＳＡで測定して、約０.１nM、０.０７５nM、０.０５nM、０.０２５nMまたは０.０１nM、例えば、約０.０４nM未満のＫＤで結合する。
ある態様において、前記抗体分子は、ヒトＰＤ−１を発現するＪｕｒｋａｔ細胞(例えば、ヒトＰＤ−１トランスフェクトＪｕｒｋａｔ細胞)に、例えば、ＦＡＣＳ分析で測定して、約０.１nM、０.０７５nM、０.０５nM、０.０２５nMまたは０.０１nM、例えば、約０.０６nM未満のＫＤで結合する。
ある態様において、前記抗体分子は、カニクイザルＴ細胞に、例えば、ＦＡＣＳ分析で測定して、約１nM、０.７５nM、０.５nM、０.２５nMまたは０.１nM、例えば、約０.４nM未満のＫＤで結合する。
ある態様において、前記抗体分子は、カニクイザルＰＤ−１を発現する細胞(例えば、カニクイザルＰＤ−１をトランスフェクトした細胞)に、例えば、ＦＡＣＳ分析で測定して、約１nM、０.７５nM、０.５nM、０.２５nMまたは０.０１nM、例えば、約０.６nM未満のＫＤで結合する。
ある態様において、前記抗体分子は、マウスまたはラットＰＤ−１と交差反応性ではない。他の態様において、前記抗体は、アカゲザルＰＤ−１と交差反応性である。例えば、交差反応性は、ＰＤ−１を発現する細胞(例えば、ヒトＰＤ−１発現３００.１９細胞)を使用するＢｉａｃｏｒｅ法または結合アッセイにより測定できる。他の態様において、前記抗体分子は、ＰＤ−１の細胞外Ｉｇ様ドメインに結合する。
他の態様において、前記抗体分子は、ＰＤ−１のＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２または両者への結合またはＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２または両者を発現する細胞を減少できる。ある態様において、前記抗体分子は、ＰＤ−１を発現する細胞(例えば、ヒトＰＤ−１発現３００.１９細胞)へのＰＤ−Ｌ１結合を、約１.５nM、１nM、０.８nM、０.６nM、０.４nM、０.２nMまたは０.１nM未満、例えば、約０.７９nM〜約１.０９nM、例えば、約０.９４nMまたは約０.７８nM以下、例えば、約０.３nMのＩＣ５０で減少(例えば、遮断)する。ある態様において、前記抗体は、ＰＤ−１を発現する細胞(例えば、ヒトＰＤ−１発現３００.１９細胞)へのＰＤ−Ｌ２結合を、約２nM、１.５nM、１nM、０.５nMまたは０.２nM未満、例えば、約１.０５nM〜約１.５５nMまたは約１.３nM以下、例えば、約０.９nMのＩＣ５０で減少(例えば、遮断)する。
他の態様において、前記抗体分子は、抗原特異的Ｔ細胞応答を増強できる。
複数の態様において、抗体分子は、単一特異性抗体分子または二重特異性抗体分子である。複数の態様において、抗体分子は、ＰＤ−１に対する第一結合特異性およびＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＣＥＡＣＡＭ(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１、ＣＥＡＣＡＭ−３および／またはＣＥＡＣＡＭ−５)、ＰＤ−Ｌ１またはＰＤ−Ｌ２に対する第二結合特異性を有する。複数の態様において、抗体分子は、抗体の抗原結合フラグメント、例えば、半抗体または半抗体の抗原結合フラグメントを含む。
ある態様において、前記抗体分子は、例えば、ＳＥＢ Ｔ細胞活性化アッセイまたはヒト全血エクスビボアッセイで測定して、アイソタイプ対照(例えば、ＩｇＧ４)を使用したときのＩＬ−２の発現と比較して、ブドウ球菌エンテロトキシンＢ(ＳＥＢ)で活性化した細胞のＩＬ−２の発現を、(例えば、２５μg／mLで)少なくとも約２倍、３倍、４倍、５倍、例えば、約２〜３倍、例えば、約２〜２.６倍、例えば、約２.３倍増加させる。
ある態様において、前記抗体分子は、例えば、ＩＦＮ−γ活性アッセイで測定して、アイソタイプ対照(例えば、ＩｇＧ４)を使用したときのＩＦＮ−γの発現と比較して、抗ＣＤ３により刺激されたＴ細胞からのＩＦＮ−γの発現を、(例えば、０.１μg／mLで)少なくとも約２倍、３倍、４倍、５倍、例えば、約１.２〜３.４倍、例えば、約２.３倍増加させる。
ある態様において、前記抗体分子は、例えば、ＩＦＮ−γ活性アッセイで測定して、アイソタイプ対照(例えば、ＩｇＧ４)を使用したときのＩＦＮ−γの発現と比較して、ＳＥＢで活性化したＴ細胞由来のＩＦＮ−γの発現を、(例えば、３pg／mLで)で少なくとも約２倍、３倍、４倍、５倍、例えば、約０.５〜４.５倍、例えば、約２.５倍増加させる。
ある態様において、前記抗体分子は、例えば、ＩＦＮ−γ活性アッセイで測定して、アイソタイプ対照(例えば、ＩｇＧ４)を使用したときのＩＦＮ−γの発現と比較して、ＣＭＶペプチドで活性化したＴ細胞によるＩＦＮ−γの発現を少なくとも約２倍、３倍、４倍、５倍、例えば、約２〜３.６倍、例えば、約２.８倍増加させる。
ある態様において、前記抗体分子は、例えば、少なくともｎ(例えば、ｎ＝２または４)細胞分裂を経たＣＤ８＋ Ｔ細胞のパーセンテージで測定して、アイソタイプ対照(例えば、ＩｇＧ４)を使用したときのＣＤ８＋ Ｔ細胞増殖と比較して、ＣＭＶペプチドで活性化したＣＤ８＋ Ｔ細胞の増殖を少なくとも約１、２倍、３倍、４倍、５倍、例えば、約１.５倍増加させる。
ある態様において、前記抗体分子は、例えば、サルにおいて測定して、約１００μg／mL〜約５００μg／mL、約１５０μg／mL〜約４５０μg／mL、約２５０μg／mL〜約３５０μg／mLまたは約２００μg／mL〜約４００μg／mL、例えば、約２９２.５μg／mLのＣｍａｘを有する。
ある態様において、前記抗体分子は、例えば、サルにおいて測定して、約２５０時間〜約６５０時間、約３００時間〜約６００時間、約３５０時間〜約５５０時間または約４００時間〜約５００時間、例えば、約４６５.５時間のＴ１／２を有する。
ある態様において、前記抗体分子は、ＰＤ−１に、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ法で測定して、５×１０−４ｓ−１、１×１０−４ｓ−１、５×１０−５ｓ−１または１×１０−５ｓ−１より遅い、例えば、約２.１３×１０−４ｓ−１のＫｄで結合する。ある態様において、前記抗体分子は、ＰＤ−１に、例えば、Ｂｉａｃｏｒｅ法で測定して、１×１０４Ｍ−１ｓ−１、５×１０４Ｍ−１ｓ−１、１×１０５Ｍ−１ｓ−１または５×１０５Ｍ−１ｓ−１より速い、例えば、約２.７８×１０５Ｍ−１ｓ−１のＫａで結合する。
ある態様において、前記抗ＰＤ−１抗体分子は、ＰＤ−１のＣ鎖、ＣＣ’ループ、Ｃ’鎖およびＦＧループ内の１以上の残基に結合する。ＰＤ−１のドメイン構造は、例えば、Cheng et al., “Structure and Interactions of the Human Programmed Cell Death 1 Receptor” J. Biol. Chem. 2013, 288:11771-11785に記載されている。Cheng et al.に記載されるように、Ｃ鎖は残基Ｆ４３〜Ｍ５０を含み、ＣＣ’ループはＳ５１〜Ｎ５４、Ｃ’鎖は残基Ｑ５５〜Ｆ６２を含み、ＦＧループは残基Ｌ１０８〜Ｉ１１４を含む(アミノ酸番号付けは上記Cheng et al.による)。したがって、ある態様において、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体は、ＰＤ−１の範囲Ｆ４３〜Ｍ５０、Ｓ５１〜Ｎ５４、Ｑ５５〜Ｆ６２およびＬ１０８〜Ｉ１１４の１以上における少なくとも１残基と結合する。ある態様において、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体は、ＰＤ−１の範囲Ｆ４３〜Ｍ５０、Ｓ５１〜Ｎ５４、Ｑ５５〜Ｆ６２およびＬ１０８〜Ｉ１１４の２、３または全部の少なくとも１残基と結合する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体は、ＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２の一方または両方の結合部位の一部でもある、ＰＤ−１における残基を提供する。
他の面において、本発明は、前記抗体分子のいずれかをコードする単離核酸分子、そのベクターおよび宿主細胞を提供する。
前記抗体分子のいずれかの抗体重鎖可変領域または軽鎖可変領域または両者をコードする単離核酸も提供する。
ある態様において、単離核酸は重鎖ＣＤＲ１〜３をコードし、ここで、該核酸は配列番号１０８〜１１２、２２３、１２２〜１２６、１３３〜１３７または１４４〜１４６のヌクレオチド配列を含む。
他の態様において、単離核酸は軽鎖ＣＤＲ１〜３をコードし、ここで、該核酸は、配列番号１１３〜１２０、１２７〜１３２または１３８〜１４３のヌクレオチド配列を含む。
他の態様において、前記核酸は、さらに重鎖可変ドメインをコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号３９、５１、８３、８７、９０、９５または１０１のいずれかと少なくとも８５％同一である。
他の態様において、前記核酸は、さらに重鎖可変ドメインをコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号３９、５１、８３、８７、９０、９５または１０１のいずれかを含む。
他の態様において、前記核酸は、さらに重鎖をコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号４１、５３、８５、８９、９２、９６または１０３のいずれかと少なくとも８５％同一である。
他の態様において、前記核酸は、さらに重鎖をコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号４１、５３、８５、８９、９２、９６または１０３のいずれかを含む。
他の態様において、前記核酸は、さらに軽鎖可変ドメインをコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号４５、４９、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、９４、９８、１００、１０５または１０７のいずれかと少なくとも８５％同一である。
他の態様において、前記核酸は、さらに軽鎖可変ドメインをコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号４５、４９、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、９４、９８、１００、１０５または１０７のいずれかを含む。
他の態様において、前記核酸は、さらに軽鎖をコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号４５、４９、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、９４、９８、１００、１０５または１０７のいずれかと少なくとも８５％同一である。
他の態様において、前記核酸は、さらに軽鎖をコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号４５、４９、５７、６１、６５、６９、７３、７７、８１、９４、９８、１００、１０５または１０７のいずれかを含む。
ある態様において、前記核酸を含む１以上の発現ベクターおよび宿主細胞が提供される。
ここに記載するような宿主細胞を、遺伝子発現に適当な条件下で培養することを含む、抗体分子またはそのフラグメントの製造法も提供する。
医薬組成物およびキット
他の面において、本発明は、薬学的に許容される担体と製剤された、ここに記載する抗体分子を含む組成物、例えば、薬学的に許容される組成物を提供する。ここで使用する、“薬学的に許容される担体”は、生理学的に適合性である、任意のかつ全ての溶媒、分散媒体、等張化剤および吸収遅延剤などを含む。担体は、静脈内、筋肉内、皮下、非経腸、直腸、脊髄または上皮投与(例えば注射または点滴による)に適当であり得る。
本発明の組成物は、多様な形態であり得る。これらは、液体溶液(例えば、注射可能および点滴可能溶液)、分散剤または懸濁液、リポソームおよび坐薬のような、例えば、液体、半固体および固体投与形態を含む。好ましい形態は、意図する投与法および治療適用による。典型的好ましい組成物は、注射可能または点滴可能溶液の形である。好ましい投与法は、非経腸(例えば、静脈内、皮下、腹腔内、筋肉内)である。好ましい態様において、抗体を静脈内点滴または注射により投与する。他の好ましい態様において、抗体を筋肉内または皮下注射により投与する。
ここで使用する用語“非経腸投与”および“非経腸的に投与”は、通常注射による、経腸および局所投与以外の投与法を意味し、静脈内、筋肉内、動脈内、髄腔内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、嚢下、くも膜下、脊髄内、硬膜外および胸骨内注射および点滴を含むが、これらに限定されない。
治療的組成物は、無菌であり、製造および保存条件下で安定でなければならない。組成物は、溶液、マイクロエマルジョン、分散剤、リポソームまたは高抗体濃度に適する他の秩序だった構造として製剤できる。無菌注射可能溶液は、必要量の活性化合物(すなわち、抗体または抗体部分)を、上に挙げた成分の１または組み合わせを含む適切な溶媒に取り込み、必要に応じて、その後濾過滅菌することにより製造できる。一般に、分散剤は、活性化合物を、基本的分散媒体および上に挙げたものからの必要な成分を含む無菌媒体に取り込むことにより製造する。無菌注射可能溶液の調製用の無菌散剤の場合、好ましい製造法は、真空乾燥および凍結乾燥であり、これは、予め濾過滅菌した養鶏からの活性成分と任意のさらなる所望の成分の粉末を生じる。溶液の適当な流度は、例えば、レシチンのようなコーティングの使用により、分散剤の場合必要な粒子径の維持によりおよび界面活性剤の使用により、維持できる。注射可能組成物の長期吸収は、組成物に吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアリン酸塩およびゼラチンを包含させることにより達成できる。
抗体分子を、当分野で知られる多様な方法で投与できるが、多くの治療的適用に関して、好ましい投与経路／方法は静脈内注射または点滴である。例えば、抗体分子を、約３５〜４４０mg／ｍ２、概して約７０〜３１０mg／ｍ２、より典型的には、約１１０〜１３０mg／ｍ２の用量に到達させるために、２０mg／分より速い、例えば、２０〜４０mg／分、概して４０mg／分以上の速度の静脈内点滴で投与できる。複数の態様において、抗体分子は、１０mg／分より遅い毒度で、好ましくは約１〜１００mg／ｍ２、好ましくは約５〜５０mg／ｍ２、約７〜２５mg／ｍ２、より好ましくは、約１０mg／ｍ２の用量に到達するために５mg／分以下の速度で静脈内点滴できる。当業者には認識されるように、投与経路／方法は所望の結果により変わる。ある態様において、活性化合物を、インプラント、経皮パッチおよびマイクロカプセル化送達系を含む、制御放出製剤のような、化合物薬剤を急速放出から保護する担体と製剤してよい。エチレン酢酸ビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステルおよびポリ乳酸のような生分解性、生体適合性ポリマーを使用できる。このような製剤の多くの製造法は特許されているか、または一般に当業者に知られる。例えば、Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems, J. R. Robinson, ed., Marcel Dekker, Inc., New York, 1978参照。
ある態様において、抗体分子を、例えば、不活性希釈剤または吸収可能可食担体と経口投与できる。化合物(および、所望であれば、他の成分)をまた硬または軟殻ゼラチンに封入し、錠剤に圧縮しまたは直接対象の食餌に包含させてもよい。経口治療的投与のために、化合物を添加物と共に包含でき、摂取可能錠剤、バッカル錠剤、トローチ剤、カプセル剤、エリキシル剤、懸濁液剤、シロップ剤、ウェーハ剤などの形で使用してよい。本発明の化合物を非経腸投与以外で投与するために、該化合物を、その不活性化を阻止する物質で被覆するか、または該化合物をそれと共投与する必要があり得る。治療的組成物はまた当分野で知られる医療機器を用いても投与できる。
投与レジメンは、最適な所望の応答(例えば、治療的応答)を提供するように調節する。例えば、治療状況の存在により示されるように、一回ボーラスを投与してよく、数回に分けた用量を経時的に投与してよくまたは用量を比例的に減少または増加させてよい。投与の容易さおよび用量の均一性のために、非経腸組成物を用量単位形態で製剤するのが特に有利である。ここで使用する用量単位形態は、処置する対象のための単位用量として適する物理的に別々の単位をいい、各単位は、必要な医薬担体とともに、所望の治療効果を生じるように計算された予定された量の活性化合物を含む。本発明の用量単位形態の明細は、(ａ)活性化合物および達成すべき特定の治療効果の独特な特徴および(ｂ)個体における処置の感受性の処置のためのこのような活性化合物の製造における分野に固有の限界により指定され、直接依存する。
抗体分子の治療的または予防有効量の代表的、非限定的範囲は、０.１〜３０mg／kg、より好ましくは１〜２５mg／kgである。抗ＰＤ−１抗体分子の用量および治療は当業者により決定され得る。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、約１〜４０mg／kg、例えば、１〜３０mg／kg、例えば、約５〜２５mg／kg、約１０〜２０mg／kg、約１〜５mg／kg、１〜１０mg／kg、５〜１５mg／kg、１０〜２０mg／kg、１５〜２５mg／kgまたは約３mg／kgの用量で注射(例えば、皮下または静脈内)により投与する。投薬スケジュールは、例えば、週１回ないし２週毎、３週毎または４週毎まで変化し得る。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を隔週、約１０〜２０mg／kgの用量で投与する。抗体分子を、約３５〜４４０mg／ｍ２、概して約７０〜３１０mg／ｍ２、より典型的には、約１１０〜１３０mg／ｍ２の用量に到達させるために、２０mg／分より速い、例えば、２０〜４０mg／分、概して４０mg／分以上の速度の静脈内点滴で投与できる。複数の態様において、約１１０〜１３０mg／ｍ２の点滴速度が、約３mg／kgのレベルを達成する。他の態様において、抗体分子を、約１〜１００mg／ｍ２、例えば、約５〜５０mg／ｍ２、約７〜２５mg／ｍ２、または、約１０mg／ｍ２の用量に到達するために、１０mg／分以下、例えば、５mg／分以下の速度で静脈内点滴により投与できる。ある態様において、抗体を、約３０分にわたり点滴する。用量値は、軽減すべき状態のタイプおよび重症度により変わることは注意すべきである。あらゆる特定の対象に対して、特定の投与レジメンは、個々の要求に応じて、かつ組成物を投与するまたは投与を監督する者の専門的判断により経時的に調節すべきであり、ここに示す用量範囲は単なる代表例であり、請求する組成物の範囲または実施を制限することを意図しないことはさらに理解すべきである。
本発明の医薬組成物は、本発明の抗体または抗体部分の“治療有効量”または“予防有効量”を含み得る。“治療有効量”は、所望の治療的結果を達成するために、用量で有効である量および必要な期間をいう。修飾抗体または抗体フラグメント治療有効量は、個体の疾患状態、年齢、性別および体重および抗体または抗体部分が個体で所望の効果を惹起する能力のような因子により変わり得る。治療有効量は、また修飾抗体または抗体フラグメントの何らかの毒性または有害作用を、治療効果が上回るものもいう。“治療有効用量”は、未処置対象に対して、好ましくは、測定可能なパラメータ、例えば、腫瘍増殖速度を、少なくとも約２０％、より好ましくは少なくとも約４０％、さらに好ましくはなくとも約６０％、なお好ましくは少なくとも約８０％阻害する。化合物が測定可能なパラメータ、例えば、癌を阻害する能力は、ヒト腫瘍における効果の予測である動物モデル系において評価できる。あるいは、この組成物の特性を、当業者に知られるアッセイによるインビトロでの阻害のような、化合物が阻害する能力を試験することにより評価できる。
“予防有効量”は、所望の予防結果を達成するために、用量で有効である量および必要な期間をいう。概して、予防用量は、疾患の前にまたは初期段階で対象に使用するため、予防有効量は治療有効量より少ない。
また本発明の範囲内であるのは、ここに記載する抗体分子を含む、キットである。キットは、使用指示；他の薬剤、例えば、標識、治療剤または抗体を標識または治療剤とキレート化もしくは他にカップリングするのに有用な薬剤または放射線防護組成物；投与のために抗体を調製するためのデバイスまたは他の物質；薬学的に許容される担体；および対象に投与するためのデバイスまたは他の物質を含む、１以上の他の要素を含み得る。
抗ＰＤ−１抗体分子の使用
ここに開示する抗ＰＤ−１抗体分子は、インビトロおよびインビボでの診断的ならびに治療的および予防有用性を有する。例えば、これらの分子を、インビトロまたはエクスビボで細胞培養にまたは対象、例えばヒト対象に投与して、癌および感染性障害のような多様な障害を処置、予防および／または診断できる。
したがって、一つの面において、本発明は、対象における免疫応答が修飾されるように、ここに記載する抗体分子を対象に投与することを含む、対象における免疫応答を修飾する方法を提供する。ある態様において、免疫応答は増強され、刺激されまたは上方制御される。ある態様において、抗体分子は、対象における免疫応答をＰＤ−１の遮断により増強する。
ここで使用する、用語“対象”は、ヒトおよび非ヒト動物を含むことを意図する。ある態様において、対象はヒト対象、例えば、ＰＤ−１機能異常により特徴付けられる障害または状態を有するヒト患者である。用語“非ヒト動物”は、非ヒト霊長類のような哺乳動物および非哺乳動物を含む。ある態様において、対象はヒトである。ある態様において、対象は、免疫応答の増強が必要であるヒト患者である。ある態様において、対象は免疫無防備状態である、例えば、対象は化学療法または放射線療法を受けているまたは受けていた。これとは別にまたはこれと組み合わせて、対象は感染の結果として、免疫無防備状態であるかまたはそのリスクがある。ここに記載する方法および組成物は、Ｔ細胞介在免疫応答の増強により処置できる障害を有するヒト患者の処置に適する。例えば、ここに記載する方法および組成物は、多くの免疫活性を増強できる。ある態様において、対象は腫瘍浸潤性Ｔリンパ球(ＴＩＬ)の数が増加しているかまたは活性が増加している。他の態様において、対象はインターフェロン−ガンマ(ＩＦＮ−γ)の発現または活性が増加している。さらに別の態様において、対象はＰＤ−Ｌ１発現または活性が低下している。
治療的使用
癌
ＰＤ−１の遮断は、対象における癌性細胞に対する免疫応答を増強できる。ＰＤ−１に対するリガンドであるＰＤ−Ｌ１は正常ヒト細胞では発現されないが、多様なヒト癌で豊富である(Dong et al. (2002) Nat Med 8:787-9)。ＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１の相互作用は、腫瘍浸潤性リンパ球の減少、癌性細胞によるＴ細胞受容体介在増殖および／または免疫回避の減少を生じ得る(Dong et al. (2003) J Mol Med 81:281-7; Blank et al. (2005) Cancer Immunol. Immunother. 54:307-314; Konishi et al. (2004) Clin. Cancer Res. 10:5094-100)。免疫抑制はＰＤ−１とＰＤ−Ｌ１の局所相互作用を阻害することにより回復でき、ＰＤ−１のＰＤ−Ｌ２への相互作用が同様に遮断されたとき、効果は相加的である(Iwai et al. (2002) PNAS 99:12293-7; Brown et al. (2003) J. Immunol. 170:1257-66)。それゆえに、ＰＤ−１の阻害は、免疫応答の増強をもたらし得る。
一つの面において、本発明は、癌性腫瘍の増殖が阻害されまたは減少されるように、抗ＰＤ−１抗体分子を使用する、インビボでの対象の処置に関する。抗ＰＤ−１抗体は、癌性腫瘍の増殖を阻害するために単独で使用し得る。あるいは、抗ＰＤ−１抗体を、下記のような標準治療(例えば、癌または感染性障害のための)、他の抗体またはその抗原結合フラグメント、免疫調節剤(例えば、共刺激分子のアクティベーターまたは阻害分子の阻害剤)；ワクチン、例えば、治療的癌ワクチン；または細胞性免疫療法の他の形態の１以上と組み合わせて使用し得る。
したがって、ある態様において、本発明は、対象にここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子の治療有効量を投与することを含む、対象における腫瘍細胞の増殖を阻害する方法を提供する。
ある態様において、本方法は、インビボでの癌処置に適する。免疫の抗原特異的増強を達成するために、抗ＰＤ−１抗体分子を目的の抗原と共に投与できる。ＰＤ−１に対する抗体を１種以上の薬剤と組み合わせて投与するとき、組み合わせは任意の順番でまたは同時に投与できる。
癌のタイプ；セラノスティック法
他の面において、対象を処置する方法、例えば、対象における過増殖性状態または障害(例えば、癌)、例えば、固形腫瘍、造血器癌、軟組織腫瘍または転移病変を減少または軽減する方法が提供される。本方法は、対象に１以上のここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の治療剤または治療法と組み合わせて投与することを含む。
ここで使用する、用語“癌”は、病理組織学的タイプまたは侵襲性の段階と無関係に、全てのタイプの癌性増殖または発癌性過程、転移組織または悪性に形質転換した細胞、組織または臓器を含むことを意味する。癌性障害の例は、固形腫瘍、造血器癌、軟組織腫瘍および転移病変を含むが、これらに限定されない。固形腫瘍の例は、肝臓、肺、乳房、リンパ系、消化器(例えば、結腸)、尿生殖器管(例えば、腎臓、尿路上皮細胞)、前立腺および咽頭を冒すもののような、多様な臓器系の悪性腫瘍、例えば、肉腫および癌(腺癌および扁平上皮細胞癌を含む)を含む。腺癌は、ほとんどの結腸癌、直腸癌、腎細胞癌、肝臓癌、肺の非小細胞癌、小腸癌および食道癌のような悪性腫瘍を含む。扁平上皮細胞癌は、例えば、肺、食道、皮膚、頭頸部領域、口腔、肛門および子宮頸における悪性腫瘍を含む。ある態様において、癌は黒色腫、例えば、進行型段階黒色腫である。前記癌の転移病変も本発明の方法および組成物を使用して処置または予防できる。
ここに開示する抗体分子を使用して増殖が阻害できる代表的癌は、概して免疫療法に応答性である癌を含む。処置のための好ましい癌の非限定的例は、黒色腫(例えば、転移悪性黒色腫)、腎臓癌(例えば、明細胞癌)、前立腺癌(例えば、ホルモン難治性前立腺腺癌)、乳癌、結腸癌および肺癌(例えば、非小細胞性肺癌)を含む。さらに、難治性または再発性悪性腫瘍をここに記載する抗体分子を使用して処置できる。
処置できる他の癌の例は、骨癌、膵臓癌、皮膚癌、頭頸部癌、皮膚または眼内悪性黒色腫、子宮癌、卵巣癌、直腸癌、肛門癌、胃食道、胃癌、精巣癌、子宮癌、ファロピウス管癌、子宮内膜、子宮頸癌、膣癌、外陰癌、メルケル細胞癌、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、食道癌、小腸癌、内分泌系の癌、甲状腺癌、副甲状腺癌、副腎癌、軟組織の肉腫、尿道癌、陰茎癌、急性骨髄球性白血病、慢性骨髄球性白血病、急性リンパ芽球性白血病、慢性リンパ性白血病を含む慢性または急性白血病、小児固形腫瘍、リンパ球性リンパ腫、膀胱癌、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群、腎臓または輸尿管癌、腎盂癌、中枢神経系(ＣＮＳ)の新生物、原発性ＣＮＳリンパ腫、腫瘍血管形成、脊髄軸腫瘍、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、カポジ肉腫、類表皮癌、扁平上皮細胞癌、Ｔ細胞リンパ腫、アスベストにより誘発されるもの(例えば、中皮腫)を含む環境により誘発される癌および該癌の組み合わせを含む。
転移癌、例えば、ＰＤ−Ｌ１を発現する転移癌(Iwai et al. (2005) Int. Immunol. 17:133-144)の処置を、ここに記載する抗体分子を使用して行い得る。ある態様において、癌は、高いレベルのＰＤ−Ｌ１、ＩＦＮ−γおよび／またはＣＤ８を発現する。
理論に縛られることを望まないが、ある態様において、患者は、患者がＰＤ−Ｌ１を高度に発現する癌を有するおよび／または癌が抗腫瘍免疫細胞、例えば、ＴＩＬにより浸潤されているならば、免疫調節剤(所望によりここに記載する１種以上の薬剤と組み合わせて)での処置に応答する可能性が高い。抗腫瘍免疫細胞はＣＤ８、ＰＤ−Ｌ１および／またはＩＦＮ−γが陽性であり得て、それゆえにＣＤ８、ＰＤ−Ｌ１および／またはＩＦＮ−γのレベルは微小環境におけるＴＩＬレベルの読み取りとして有用であり得る。ある態様において、癌微小環境は、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性という。
したがって、ある面において、本出願は、腫瘍サンプルがＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８およびＩＦＮ−γの１以上に対して陽性であるか否かを決定し、腫瘍サンプルがこのマーカーの１以上、例えば、２または全部で３に対して陽性であるならば、患者に抗ＰＤ−１抗体分子の治療有効量を、所望により１以上の他の免疫調節剤または抗癌剤と組み合わせて投与する、方法を提供する。
次の適応症において、患者の大部分はＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性である。肺癌(扁平上皮)；肺癌(腺癌)；頭頸部癌；胃癌；ＮＳＣＬＣ；ＨＮＳＣＣ；胃癌(例えば、ＭＳＩｈｉおよび／またはＥＢＶ＋)；ＣＲＣ(例えば、ＭＳＩｈｉ)；鼻咽頭癌(ＮＰＣ)；子宮頸癌(例えば、扁平上皮)；甲状腺癌、例えば、乳頭甲状腺；黒色腫；ＴＮ乳癌；およびＤＬＢＣＬ(びまん性大Ｂ細胞リンパ腫)。一般に乳癌および一般に結腸癌において、患者の中程度の割合がＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性である。次のＥＲ＋乳癌および膵臓癌の適応症について、患者の少数がＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性である。これらの知見は、実施例４にさらに検討する。患者がこれらのマーカーに対して三種陽性である割合が大きかろうが小さかろうが、これらのマーカーに対する患者のスクリーニングは、ＰＤ−１抗体での治療(例えば、ＰＤ−１抗体の遮断)、所望により１以上の他の免疫調節剤(例えば、抗ＴＩＭ−３抗体分子、抗ＬＡＧ−３抗体分子または抗ＰＤ−Ｌ１抗体分子)および／または抗癌剤、例えば、表７に挙げたものおよび表７に挙げた刊行物に開示のものと組み合わせた治療に好都合に応答する可能性が特に高い患者の部分の同定を可能にする。
ある態様において、癌サンプルは、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性として分類される。この測定は、個々の細胞が陽性と分類されるかおよびサンプルが全体として陽性と分類されるかの２の閾値に大まかに分解できる。まず、個々の細胞内で、ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８および／またはＩＦＮ−γのレベルを測定できる。ある態様において、これらのマーカーの１以上が陽性である細胞は、対照細胞または基準値と比較してマーカーのレベルが高い細胞である。例えば、ある態様において、ある細胞における高レベルのＰＤ−Ｌ１は、患者における対応する非癌性組織におけるＰＤ−Ｌ１のレベルより高いレベルである。他の例として、ある態様において、ある細胞における高レベルのＣＤ８またはＩＦＮ−γは、ＴＩＬで概して見られるこのタンパク質のレベルである。第二に、サンプル内のＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８および／またはＩＦＮ−γについて陽性である細胞のパーセンテージを測定もできる。(一細胞が全部で３のマーカーを発現している必要性はない。)ある態様において、三種陽性サンプルは、これらのマーカーが陽性である高いパーセンテージの細胞、例えば、基準値より高いまたは対照サンプルより高いものである。
他の態様において、サンプルにおけるＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８および／またはＩＦＮ−γ全体のレベルを測定できる。この場合、サンプルにおける高レベルのＣＤ８またはＩＦＮ−γは、ＴＩＬが浸潤した細胞で概して見られるこのタンパク質のレベルであり得る。同様に、高レベルのＰＤ−Ｌ１は、腫瘍サンプル、例えば、腫瘍微小環境で概して見られるこのタンパク質のレベルであり得る。
ここの実施例４に示すようなＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性である患者のサブセットの同定は、ＰＤ−１抗体治療に対して応答性である可能性がある患者のある亜集団を明らかにする。例えば、多くのＩＭ−ＴＮ(免疫調節性、三種陰性)乳癌患者は、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性である。ＩＭ−ＴＮ乳癌は、例えば、Brian D. Lehmann et al., “Identification of human triple-negative breast cancer subtypes and preclinical models for selection of targeted therapies”, J Clin Invest. Jul 1, 2011; 121(7): 2750-2767に記載されている。三種陰性乳癌はエストロゲン受容体(ＥＲ)、プロゲステロン受容体(ＰＲ)およびＨｅｒ２／ｎｅｕを発現しないものである。これらの癌は、ＥＲ、ＰＲおよびＨｅｒ２／ｎｅｕを標的とする薬剤に概して応答しないため、処置が困難である。三種陰性乳癌は、異なる群にさらに細分でき、その一つが免疫調節性である。Lehmann et al.に記載のようにＩＭ−ＴＮ乳癌は、免疫細胞過程に関与する因子、例えば、免疫細胞シグナル伝達(例えば、ＴＨ１／ＴＨ２経路、ＮＫ細胞経路、Ｂ細胞受容体シグナル伝達経路、ＤＣ経路およびＴ細胞受容体シグナル伝達)、サイトカインシグナル伝達(例えば、サイトカイン経路、ＩＬ−１２経路およびＩＬ−７経路)、抗原プロセシングおよび提示、コア免疫シグナル伝達経路(例えば、ＮＦＫＢ、ＴＮＦおよびＪＡＫ／ＳＴＡＴシグナル伝達)を介するシグナル伝達、Ｔ細胞機能、免疫転写、インターフェロン(ＩＦＮ)応答および抗原プロセシングに関与する遺伝子の１以上に富む。したがって、ある態様において、処置する癌は、ＩＭ−ＴＮ乳癌の１以上のマーカー、例えば、免疫細胞シグナル伝達(例えば、ＴＨ１／ＴＨ２経路、ＮＫ細胞経路、Ｂ細胞受容体シグナル伝達経路、ＤＣ経路およびＴ細胞受容体シグナル伝達)、サイトカインシグナル伝達(例えば、サイトカイン経路、ＩＬ−１２経路およびＩＬ−７経路)、抗原プロセシングおよび提示、コア免疫シグナル伝達経路(例えば、ＮＦＫＢ、ＴＮＦおよびＪＡＫ／ＳＴＡＴシグナル伝達)を介するシグナル伝達、Ｔ細胞機能、免疫転写、インターフェロン(ＩＦＮ)応答および抗原プロセシングに関与する遺伝子の１以上を促進する因子について陽性である、または陽性であると決定された癌である。
他の例として、高いＭＳＩ(マイクロサテライト不安定性)を有する結腸癌患者のサブセットもＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性であることがここで示される。したがって、ある態様において、ＰＤ−１抗体、例えば、ここに記載するＰＤ−１抗体(所望によりＬＡＧ−３抗体、ＴＩＭ−３抗体またはＰＤ−Ｌ１抗体のような１以上の免疫調節剤および１以上の抗癌剤、例えば、表７に記載するまたは表７における刊行物中の抗癌剤と組み合わせて)を、高ＭＳＩを有する結腸癌を有するまたは有するとして同定された患者に投与し、それにより癌を処置する。ある態様において、高ＭＳＩを有する細胞は、基準値または対照細胞、例えば、癌と同じ組織タイプの非癌性細胞より高いレベルのＭＳＩを有する細胞である。
他の例として、高ＭＳＩであるおよび／またはＥＢＶ＋である胃癌患者のサブセットもまたＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性であることがここで示される。したがって、ある態様において、ＰＤ−１抗体、例えば、ここに記載するＰＤ−１抗体、(所望によりＬＡＧ−３抗体、ＴＩＭ−３抗体またはＰＤ−Ｌ１抗体のような１以上の免疫調節剤および１以上の抗癌剤、例えば、表７に記載するまたは表７における刊行物中の抗癌剤と組み合わせて)を、高ＭＳＩおよび／またはＥＢＶ＋である胃癌を有するまたは有するとして同定された患者に投与し、それにより癌を処置する。ある態様において、高ＭＳＩを有する細胞は、基準値または対照細胞、例えば、癌と同じ組織タイプの非癌性細胞より高いレベルのＭＳＩを有する細胞である。
さらにここに開示されるのは、ＰＤ−Ｌ１について癌をアッセイし、次いで、ＰＤ−１抗体で癌を処置する方法である。ここでの実施例５に記載のように、癌サンプルを、ＰＤ−Ｌ１タンパク質レベルｍＲＮＡレベルでアッセイできる。基準値または対照細胞(例えば、非癌性細胞)より高いＰＤ−Ｌ１(タンパク質またはｍＲＮＡ)レベルを有するサンプルをＰＤ−Ｌ１陽性と分類できる。したがって、ある態様において、ＰＤ−１抗体、例えば、ここに記載するＰＤ−１抗体(所望により１以上の抗癌剤と組み合わせて)を、ＰＤ−Ｌ１陽性である癌を有するまたは有すると同定された患者に投与する。癌は、例えば、非小細胞肺(ＮＳＣＬＣ)腺癌(ＡＣＡ)、ＮＳＣＬＣ扁平上皮細胞癌(ＳＣＣ)または肝細胞癌(ＨＣＣ)であり得る。
ある態様において、ここでの方法は、ＰＤ−Ｌ１について陽性である(または陽性であるとして同定された)癌の処置のための、例えば、単剤療法として、ＰＤ−１抗体、例えば、ここに記載するＰＤ−１抗体を使用することを含む。ある態様において、癌は、結腸直腸癌(例えば、ＭＳＩ高)、胃癌(例えば、ＭＳＩ高および／またはＥＢＶ＋)、ＮＰＣ、子宮頸癌、乳癌(例えば、ＴＮ乳癌)および卵巣癌である。ある態様において、癌はＮＳＣＬＣ、黒色腫またはＨＮＳＣＣである。ある態様において、ＰＤ−１抗体を、例えば、１mg／kg、３mg／kg、１０mg／kgまたは２０mg／kgの用量で投与する。
例えば、ここでの実施例４に基づき、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性であるある種の胃癌がＰＩＫ３ＣＡにも陽性であることが判明した。したがって、ある態様において、癌を、抗ＰＤ−１抗体分子(所望により１以上の免疫調節剤、例えば、抗ＬＡＧ−３抗体分子、抗ＴＩＭ−３抗体分子または抗ＰＤ−Ｌ１抗体分子と組み合わせて)およびＰＩＫ３ＣＡを阻害する薬剤で処置できる。このカテゴリーの代表的薬剤は、Stein RC (September 2001). “Prospects for phosphoinositide 3-kinase inhibition as a cancer treatment”. Endocrine-related Cancer 8 (3): 237-48およびMarone R, Cmiljanovic V, Giese B, Wymann MP (January 2008). “Targeting phosphoinositide 3-kinase: moving towards therapy”. Biochimica et Biophysica Acta 1784 (1): 159-85に記載されている。
例えば、実施例４に基づき、ＣＲＣ、例えば、ＭＳＩ高ＣＲＣを有する(または有するとして同定された)患者は、ＰＤ−１抗体で、所望によりＬＡＧ−３、ＲＮＦ４３およびＢＲＡＦの１以上を標的とする治療剤と組み合わせて用いて処置し得る。例えば、これらの癌は、ＰＤ−１抗体で、所望によりＬＡＧ−３、ＰＤ−１、ＲＮＦ４３およびＢＲＡＦの１以上を標的とする１以上の治療剤と組み合わせて用いて処置し得る。複数の態様において、１以上の治療剤は、抗ＬＡＧ−３抗体分子のような免疫調節剤および表７にまたは表７に挙げた刊行物に記載された抗癌剤を含む。ＬＡＧ−３阻害剤、例えば、抗体を、ここに記載する。ＲＮＦ４３を、例えば、抗体、小分子(例えば、２−(２’,３−ジメチル−[２,４’−ビピリジン]−５−イル)−Ｎ−(５−(ピラジン−２−イル)ピリジン−２−イル)アセトアミド(化合物Ａ２８))、ｓｉＲＮＡまたはＲｓｐｏリガンドまたはその誘導体で阻害できる。ＢＲＡＦ阻害剤(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)をここに記載する。
例えば、ここでの実施例４に基づき、扁平上皮細胞肺癌を有する(または有するとして同定された)患者を、ＰＤ−１抗体分子で、ＬＡＧ−３を標的とする治療剤、例えば、ＬＡＧ−３抗体分子および所望により１以上の抗癌剤、例えば、表７に記載するまたは表７における刊行物中の抗癌剤と組み合わせて用いて処置し得る。
ある態様において、扁平上皮細胞肺癌を有する(または有するとして同定された)患者を、ＰＤ−１抗体で、所望によりＴＩＭ−３を標的とする治療剤、例えば、ＴＩＭ−３抗体と組み合わせて処置できる。ＴＩＭ−３阻害剤、例えば、抗体を、ここに記載する。
例えば、ここでの実施例４に基づき、甲状腺癌を有する(または有するとして同定された)患者を、ＰＤ−１抗体分子で、所望によりＢＲＡＦを標的とする治療剤および所望により１以上の免疫調節剤、例えば、抗ＬＡＧ−３抗体分子、抗ＴＩＭ−３抗体分子および抗ＰＤ−Ｌ１抗体分子と組み合わせて用いて処置し得る。ＢＲＡＦ阻害剤(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)は、ここに、例えば、表７および表７に挙げた刊行物に記載する。
ある態様において、ここでの治療を、感染、例えば、ウイルスまたは細菌感染と関係する癌有する(または有するとして同定された)患者の処置に使用できる。代表的癌は、子宮頸癌、肛門癌、ＨＰＶ関連頭頸部扁平上皮細胞癌、ＨＰＶ関連食道乳頭腫、ＨＨＶ６関連リンパ腫、ＥＢＶ関連リンパ腫(バーキットリンパ腫を含む)、胃ＭＡＬＴリンパ腫、他の感染関連ＭＡＬＴリンパ腫、ＨＣＣおよびカポジ肉腫を含む。
他の態様において、癌は、造血器腫瘍または白血病またはリンパ腫を含むが、これらに限定されない癌である。例えば、抗ＰＤ−１抗体分子は、例えば、Ｂ細胞急性リンパ系白血病(“ＢＡＬＬ”)、Ｔ細胞急性リンパ系白血病(“ＴＡＬＬ”)、急性リンパ系白血病(ＡＬＬ)を含むが、これらに限定されない急性白血病；例えば、慢性骨髄性白血病(ＣＭＬ)、慢性リンパ性白血病(ＣＬＬ)を含むが、これらに限定されない１以上の慢性白血病；例えば、Ｂ細胞前リンパ球性白血病、芽細胞性形質細胞様樹状細胞新生物、バーキットリンパ腫、びまん性大Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、小細胞または大細胞濾胞性リンパ腫、悪性リンパ増殖性状態、ＭＡＬＴリンパ腫、マントル細胞リンパ腫、周辺帯リンパ腫、多発性骨髄腫、骨髄異形成および骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、形質芽細胞性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞新生物、ワルデンストレームマクログロブリン血症および骨髄球性血液細胞などの産生無効(または異形成)によりまとめられる造血器状態の多様なコレクションである“前白血病状態”を含むが、これらに限定されないさらなる血液癌または血液学的状態を、例えば含むが、これらに限定されない癌および悪性腫瘍の処置に使用できる。
ある態様において、癌は肺癌(例えば、非小細胞性肺癌(ＮＳＣＬＣ)(例えば、扁平上皮および／または非扁平上皮組織学を伴うＮＳＣＬＣまたはＮＳＣＬＣ腺癌))、黒色腫(例えば、進行型黒色腫)、腎臓癌(例えば、腎細胞癌、例えば、明細胞腎細胞癌)、肝臓癌、骨髄腫(例えば、多発性骨髄腫)、前立腺癌、乳癌(例えば、エストロゲン受容体、プロゲステロン受容体またはＨｅｒ２／ｎｅｕの１、２または全てを発現しない乳癌、例えば、三種陰性乳癌)、結腸直腸癌、膵臓癌、頭頸部癌(例えば、頭頸部扁平上皮細胞癌(ＨＮＳＣＣ)、肛門癌、胃食道癌、甲状腺癌、子宮頸癌、リンパ増殖性疾患(例えば、移植後リンパ増殖性疾患)または造血器癌、Ｔ細胞リンパ腫、非ホジキンリンパ腫または白血病(例えば、骨髄球性白血病)から選択される。
他の態様において、癌は癌(例えば、進行型または転移癌)、黒色腫または肺癌、例えば、非小細胞肺癌から選択される。
ある態様において、癌は肺癌、例えば、非小細胞性肺癌である。
他の態様において、癌はウイルス感染、例えば、慢性ウイルス性肝炎を伴うまたは伴わない肝癌、例えば、進行型肝癌である。
他の態様において、癌は前立腺癌、例えば、進行型前立腺癌である。
さらに別の態様において、癌は骨髄腫、例えば、多発性骨髄腫である。
さらに別の態様において、癌は腎臓癌、例えば、腎細胞癌(ＲＣＣ)(例えば、転移ＲＣＣまたは明細胞腎細胞癌)である。
ある態様において、癌は黒色腫、例えば、進行型黒色腫である。ある態様において、癌は、他の治療に応答しない進行型または切除不能黒色腫である。他の態様において、癌はＢＲＡＦ変異(例えば、ＢＲＡＦ Ｖ６００変異)を有する黒色腫である。さらに他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、ＢＲＡＦ阻害剤(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)を併用するまたは併用しない抗ＣＴＬＡ−４抗体(例えば、イピリムマブ)での処置後に投与する。
ここに記載する方法および組成物は、前記癌と関連する転移病変の処置に有用である。
抗ＰＤ−１抗体と癌ワクチンの組み合わせ
ＰＤ−１に対する抗体分子を、癌性細胞、精製腫瘍抗原(組み換えタンパク質、ペプチドおよび炭水化物分子を含む)、細胞および免疫刺激性サイトカインをコードする遺伝子でトランスフェクトした細胞のような免疫原性剤と組み合わせ得る(He et al. (2004) J. Immunol. 173:4919-28)。使用できる腫瘍ワクチンの非限定的例はｇｐ１００のペプチドのような黒色腫抗原のペプチド、ＭＡＧＥ抗原、Ｔｒｐ−２、ＭＡＲＴ１および／またはチロシナーゼ、サイトカインＧＭ−ＣＳＦを発現するようにトランスフェクトした腫瘍細胞、ＤＮＡベースワクチン、ＲＮＡベースワクチンおよびウイルス形質導入ベースワクチンを含む。癌ワクチンは予防的でも治療的でもよい。
ＰＤ−１遮断を、ワクチン接種プロトコールと組み合わせ得る。腫瘍に対するワクチン接種のための多くの実験的戦略が考案されている(Rosenberg, S., 2000, Development of Cancer Vaccines, ASCO Educational Book Spring: 60-62; Logothetis, C., 2000, ASCO Educational Book Spring: 300-302; Khayat, D. 2000, ASCO Educational Book Spring: 414-428; Foon, K. 2000, ASCO Educational Book Spring: 730-738参照；またRestifo, N. and Sznol, M., Cancer Vaccines, Ch. 61, pp. 3023-3043 in DeVita, V. et al. (eds.), 1997, Cancer: Principles and Practice of Oncology. Fifth Editionも参照)。これらの戦略の一つにおいて、ワクチンを自己または同種腫瘍細胞を使用して調製する。これらの細胞ワクチンは、腫瘍細胞をＧＭ−ＣＳＦを発現するように形質導入したとき最も有効であることが示されている。ＧＭ−ＣＳＦは、腫瘍ワクチン接種のための抗原提示の強力なアクティベーターであることが示されている(Dranoff et al. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 3539-43)。
ＰＤ−１遮断を、腫瘍において発現する組み換えタンパク質および／またはペプチドのコレクションと組み合わせて、これらのタンパク質に対する免疫応答を産生するために使用できる。これらのタンパク質は通常自己抗原として免疫系により関しされ、それゆえに、これらに対して耐容性である。腫瘍抗原染色体のテロメラーゼの合成のために必要であり、８５％を超えるヒト癌で発現され、限られた数の体性組織でしか発現されない、タンパク質テロメラーゼも含み得る(Kim, N et al. (1994) Science 266: 2011-2013)。(これらの体性組織は、多様な手段により免疫攻撃から保護され得る)。腫瘍抗原は、タンパク質配列を変えるまたは２の無関係の配列の融合タンパク質を創製する(すなわちフィラデルフィア染色体におけるｂｃｒ−ａｂｌ)体性変異またはＢ細胞腫瘍からのイディオタイプのために、癌細胞において発現される“ネオ抗原”でもあり得る。
他の腫瘍ワクチンは、ヒト乳頭腫ウイルス(ＨＰＶ)、肝炎ウイルス(ＨＢＶおよびＨＣＶ)、カポジヘルペス肉腫ウイルス(ＫＨＳＶ)およびエプスタイン・バーウイルス(ＥＢＶ)のようなヒト癌に関与するウイルスからのタンパク質を含み得る。ＰＤ−１遮断と組み合わせて使用し得る腫瘍特異的抗原の他の形態は、腫瘍組織自体から単離された精製ヒートショックタンパク質(ＨＳＰ)である。これらのヒートショックタンパク質は腫瘍細胞からのタンパク質のフラグメントを含み、これらのＨＳＰは腫瘍免疫の誘発のために抗原提示細胞への送達のために高度に有効である(Suot, R & Srivastava, P (1995) Science 269:1585-1588; Tamura, Y. et al. (1997) Science 278:117-120)。
樹状細胞(ＤＣ)は、抗原特異的応答の惹起に使用できる強力な抗原提示細胞である。ＤＣはエクスビボで産生でき、多様なタンパク質およびペプチド抗原ならびに腫瘍細胞抽出物を搭載できる(Nestle, F. et al. (1998) Nature Medicine 4: 328-332)。ＤＣはこれらの腫瘍抗原を同様に発現するために遺伝的手段により形質導入もできる。ＤＣは、免疫化の目的のために、腫瘍細胞に直接融合もされている(Kugler, A. et al. (2000) Nature Medicine 6:332-336)。ワクチン接種の方法として、ＤＣ免疫化は、より強力な抗腫瘍応答を活性化するために、ＰＤ−１遮断と効果的に組み合わせ得る。
複数の態様において、組み合わせは、さらに、免疫チェックポイントモジュレーターの阻害剤またはアクティベーター(例えば、ＬＡＧ−３阻害剤(例えば、抗ＬＡＧ−３抗体分子)、ＰＤ−Ｌ１阻害剤(例えば、抗ＰＤ−Ｌ１抗体分子)、ＴＩＭ−３モジュレーター(例えば、ＴＩＭ−３アクティベーターまたは阻害剤、例えば、抗ＴＩＭ−３抗体分子)またはＣＴＬＡ−４阻害剤(例えば、抗ＣＴＬＡ−４抗体)またはこれらの任意の組み合わせを含む。
ＰＤ−１遮断はまた標準的癌処置とも組み合わせ得る。ＰＤ−１遮断は、化学療法レジメと効果的に組み合わせ得る。これらの場合、投与する化学療法剤の用量を減らすことも可能であり得る(Mokyr, M. et al. (1998) Cancer Research 58: 5301-5304)。ある態様において、ここに記載する方法および組成物を、他の抗体分子、化学療法剤、他の抗癌治療剤(例えば、標的抗癌治療剤または腫瘍溶解剤)、細胞毒性剤、免疫ベースの治療(例えば、サイトカイン)、外科的および／または放射線法の１以上と組み合わせて投与する。併用投与できる代表的細胞毒性剤は、微小管阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤、代謝拮抗剤、有糸分裂阻害剤、アルキル化剤、アントラサイクリン、ビンカアルカロイド、挿入剤、シグナル伝達経路を妨害できる薬剤、アポトーシスを促進する薬剤、プロテオソーム阻害剤および照射(例えば、局所または全身照射)を含む。
前記組み合わせとは別にまたはそれと組み合わせて、ここに記載する方法および組成物は、免疫調節剤(例えば、共刺激分子のアクティベーターまたは阻害分子の阻害剤)；ワクチン、例えば、治療的癌ワクチン；または細胞性免疫療法の他の形態の１以上と組み合わせて投与できる。
抗ＰＤ−１抗体分子の代表的非限定的組み合わせおよび使用は次のものを含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を共刺激分子のモジュレーターまたは阻害分子、例えば、共阻害リガンドまたは受容体と組み合わせて投与する。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、共刺激分子のモジュレーター、例えば、アゴニストと組み合わせて投与する。ある態様において、共刺激分子のアゴニストは、ＯＸ４０、ＣＤ２、ＣＤ２７、ＣＤＳ、ＩＣＡＭ−１、ＬＦＡ−１(ＣＤ１１ａ／ＣＤ１８)、ＩＣＯＳ(ＣＤ２７８)、４−１ＢＢ(ＣＤ１３７)、ＧＩＴＲ、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＢＡＦＦＲ、ＨＶＥＭ、ＣＤ７、ＬＩＧＨＴ、ＮＫＧ２Ｃ、ＳＬＡＭＦ７、ＮＫｐ８０、ＣＤ１６０、Ｂ７−Ｈ３またはＣＤ８３リガンドのアゴニスト(例えば、アゴニスト抗体またはその抗原結合フラグメントまたは可溶性融合物)から選択される。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、共刺激分子、例えば、ＣＤ２８、ＣＤ２７、ＩＣＯＳおよびＧＩＴＲの共刺激ドメインを含む陽性シグナルと結合したアゴニストと組み合わせて使用する。
代表的ＧＩＴＲアゴニストは、米国特許６,１１１,０９０号、欧州特許０９０５０５Ｂ１号、米国特許８,５８６,０２３号、ＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／００３１１８号および２０１１／０９０７５４号に記載のＧＩＴＲ融合タンパク質または、例えば、米国特許７,０２５,９６２号、欧州特許１９４７１８３Ｂ１号、米国特許７,８１２,１３５号、米国特許８,３８８,９６７号、米国特許８,５９１,８８６号、欧州特許ＥＰ１８６６３３９号、ＰＣＴ公開ＷＯ２０１１／０２８６８３号、ＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／０３９９５４号、ＰＣＴ公開ＷＯ２００５／００７１９０号、ＰＣＴ公開ＷＯ２００７／１３３８２２号、ＰＣＴ公開ＷＯ２００５／０５５８０８号、ＰＣＴ公開ＷＯ９９／４０１９６号、ＰＣＴ公開ＷＯ２００１／０３７２０号、ＰＣＴ公開ＷＯ９９／２０７５８号、ＰＣＴ公開ＷＯ２００６／０８３２８９号、ＰＣＴ公開ＷＯ２００５／１１５４５１号、米国特許７,６１８,６３２号およびＰＣＴ公開ＷＯ２０１１／０５１７２６号に記載の抗ＧＩＴＲ抗体のような、例えば、ＧＩＴＲ融合タンパク質および抗ＧＩＴＲ抗体(例えば、二価抗ＧＩＴＲ抗体)を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、免疫チェックポイント分子の阻害分子の阻害剤と組み合わせて投与する。用語“免疫チェックポイント”は、ＣＤ４およびＣＤ８ Ｔ細胞の細胞表面上の一群の分子を意味することは当業者には理解される。これらの分子は、抗腫瘍免疫応答を下方制御または阻止するための“ブレーキ”として効果的に作用できる。免疫チェックポイント分子は、免疫細胞を直接阻害するプログラム死１(ＰＤ−１)、細胞毒性Ｔリンパ球抗原４(ＣＴＬＡ−４)、Ｂ７Ｈ１、Ｂ７Ｈ４、ＯＸ−４０、ＣＤ１３７、ＣＤ４０、ＬＡＧ−３およびＴＩＭ−３を含むが、これらに限定されない。本発明お方法において有用な免疫チェックポイント阻害剤として作用できる免疫治療剤は、ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、ＣＴＬＡ４、ＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＶＩＳＴＡ、ＢＴＬＡ、ＴＩＧＩＴ、ＬＡＩＲ１、ＣＤ１６０、２Ｂ４、ＣＥＡＣＡＭ(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１および／またはＣＥＡＣＡＭ−５)および／またはＴＧＦＲベータの阻害剤を含むが、これらに限定されない。阻害分子の阻害はＤＮＡ、ＲＮＡまたはタンパク質レベルでの阻害により実施できる。複数の態様において、阻害核酸(例えば、ｄｓＲＮＡ、ｓｉＲＮＡまたはｓｈＲＮＡ)を阻害分子の発現を阻害するために使用できる。他の態様において、阻害シグナルの阻害剤は、阻害分子に結合するポリペプチド、例えば、可溶性リガンドまたは抗体またはその抗原結合フラグメントである。
ある態様において、阻害剤は、可溶性リガンド(例えば、ＣＴＬＡ−４−ＩｇまたはＴＩＭ−３−Ｉｇ)またはＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２またはＣＴＬＡ４と結合する抗体またはもしくは抗体フラグメントである。例えば、抗ＰＤ−１抗体分子を抗ＣＴＬＡ−４抗体、例えば、イピリムマブと組み合わせて投与して、例えば、癌を処置できる(例えば、黒色腫、例えば、転移黒色腫；肺癌、例えば、非小細胞肺癌；または前立腺癌から選択される癌)。代表的抗ＣＴＬＡ４抗体は、トレメリムマブ(Pfizerから入手可能であり、以前はチシリムマブ、CP-675,206として知られたＩｇＧ２モノクローナル抗体)；およびイピリムマブ(ＣＴＬＡ−４抗体、ＭＤＸ−０１０としても知られる、CAS No. 477202-00-9)を含む。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、処置後、例えば、ＢＲＡＦ阻害剤(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)を併用するまたは併用しない抗ＣＴＬＡ４抗体(例えば、イピリムマブ)での黒色腫の処置後投与する。使用できる代表的用量は、約１〜１０mg／kg、例えば、３mg／kgの抗ＰＤ−１抗体分子の用量および約３mg／kgの抗ＣＴＬＡ−４抗体、例えば、イピリムマブの用量を含む。
免疫阻害分子、例えば、ＰＤ−１およびＬＡＧ−３は、Ｔ細胞機能が腫瘍性免疫回避を促進することを制御、例えば、相乗的に制御できる。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合フラグメントと組み合わせて投与する。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合フラグメントと組み合わせて投与する。さらに他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、抗ＬＡＧ−３抗体および抗ＴＩＭ−３抗体またはその抗原結合フラグメントと組み合わせて投与する。ここに記載する抗体の組み合わせは、別々に、例えば、別々の抗体として、または、例えば、二重特異性または三重特異性抗体分子として連結して、投与できる。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、ＣＥＡＣＡＭ阻害剤(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１、ＣＥＡＣＡＭ−３および／またはＣＥＡＣＡＭ−５阻害剤)、例えば、抗ＣＥＡＣＡＭ抗体分子と組み合わせて投与する。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子をＣＥＡＣＡＭ−１阻害剤、例えば、抗ＣＥＡＣＡＭ−１抗体分子と組み合わせて投与する。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子をＣＥＡＣＡＭ−５阻害剤、例えば、抗ＣＥＡＣＡＭ−５抗体分子と組み合わせて投与する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子および抗ＴＩＭ−３または抗ＬＡＧ−３抗体またはその抗原結合フラグメントを含む二重特異性抗体を投与する。ある態様において、ここに記載する抗体の組み合わせを癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、固形腫瘍)の処置に使用する。前記組み合わせの効力を、当分野で知られる動物モデルで試験できる。例えば、抗ＰＤ−１および抗ＬＡＧ−３の相乗効果を試験するための動物モデルは、例えば、Woo et al. (2012) Cancer Res. 72(4):917-27に記載されている。
ある態様において、ＣＥＡＣＡＭ(例えば、ＣＥＡＣＡＭ−１および／またはＣＥＡＣＡＭ−５)の阻害剤は抗ＣＥＡＣＡＭ抗体分子である。理論に縛られることを望まないが、ＣＥＡＣＡＭ−１は、ＴＩＭ−３のリガンドおよびパートナーとして記載されている(例えば、ＷＯ２０１４／０２２３３２参照)。抗ＴＩＭ−３および抗ＣＥＡＣＡＭ−１抗体の相乗的インビボ効果は、異種移植癌モデルで検出されている(例えば、ＷＯ２０１４／０２２３３２参照)。腫瘍は、例えば、Markel et al. J Immunol. 2002 Mar 15;168(6):2803-10; Markel et al. J Immunol. 2006 Nov 1;177(9):6062-71; Markel et al. Immunology. 2009 Feb;126(2):186-200; Markel et al. Cancer Immunol Immunother. 2010 Feb;59(2):215-30; Ortenberg et al. Mol Cancer Ther. 2012 Jun;11(6):1300-10; Stern et al. J Immunol. 2005 Jun 1;174(11):6692-701; Zheng et al. PLoS One. 2010 Sep 2;5(9). pii: e12529に記載のように免疫系を阻害するためにＣＥＡＣＡＭ−１またはＣＥＡＣＡＭ−５を使用すると考えられる。それゆえに、ＣＥＡＣＡＭ阻害剤を、癌、例えば、黒色腫、肺癌(例えば、ＮＳＣＬＣ)、膀胱癌、結腸癌または卵巣癌または他のここに記載する癌に対する免疫応答を増強するために、ここに記載する他の免疫調節剤(例えば、抗ＰＤ−１または抗ＴＩＭ−３阻害剤)と使用できる。ある態様において、ＣＥＡＣＡＭの阻害剤は、ＷＯ２０１０／１２５５７１号、ＷＯ２０１３／８２３６６号およびＷＯ２０１４／０２２３３２号に記載のように抗ＣＥＡＣＡＭ−１抗であり、例えば、モノクローナル抗体３４Ｂ１、２６Ｈ７および５Ｆ４または、例えば、ＵＳ２００４／００４７８５８号、ＵＳ７,１３２,２５５号およびＷＯ９９／５２５５２号に記載のようなその組み換え形態である。他の態様において、抗ＣＥＡＣＡＭ抗体は、例えば、ＷＯ２０１０／１２５５７１号、ＷＯ２０１３／０５４３３１号およびＵＳ２０１４／０２７１６１８号に記載のような、抗ＣＥＡＣＡＭ−１および／または抗ＣＥＡＣＡＭ−５抗体分子である。
ある態様において、ＰＤ−１およびＬＡＧ−３免疫阻害分子(例えば、抗体分子)を、例えば、癌の処置のために、互いに組み合わせて投与する。ある態様において、患者は、ＰＤ−１阻害剤(例えば、ここに記載する抗体分子)および／またはＰＤ−Ｌ１阻害剤(例えば、抗体分子)での治療中、進行した(例えば、腫瘍増殖を経験した)患者である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子および／またはＰＤ−Ｌ１抗体分子での治療を続け、ＬＡＧ−３免疫阻害分子(例えば、抗体)を治療に追加する。
ある態様において、ＰＤ−１およびＴＩＭ−３免疫阻害分子(例えば、抗体分子)を、例えば、癌の処置のために、互いに組み合わせて投与する。ある態様において、患者は、ＰＤ−１阻害剤(例えば、ここに記載する抗体分子)および／またはＰＤ−Ｌ１阻害剤(例えば、抗体分子)での治療中、進行した(例えば、腫瘍増殖を経験した)患者である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子および／またはＰＤ−Ｌ１抗体分子での治療を続け、ＴＩＭ−３免疫阻害分子(例えば、抗体)を治療に追加する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、サイトカイン、例えば、インターロイキン−２１、インターロイキン−２、インターロイキン−１２またはインターロイキン−１５と組み合わせて投与する。ある態様において、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子とサイトカインの組み合わせを、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、固形腫瘍または黒色腫)の処置に使用する。
抗ＰＤ−１抗体分子と組み合わせて使用できる代表的免疫調節剤は、例えば、アフツズマブ(Roche(登録商標)から入手可能)；ペグフィルグラスチム(ニューラスタ(登録商標))；レナリドマイド(CC-5013, レブラミド(登録商標))；サリドマイド(サロミド(登録商標))、アクチミド(CC4047)；およびサイトカイン、例えば、ＩＬ−２１またはＩＲＸ−２(インターロイキン１、インターロイキン２およびインターフェロンγを含むヒトサイトカインの混合物、CAS 951209-71-5、IRX Therapeuticsから入手可能)を含むが、これらに限定されない。
さらに他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、インドールアミン−ピロール２,３−ジオキシゲナーゼ(ＩＤＯ)阻害剤(例えば、ＩＮＣＢ２４３６０)と組み合わせて、進行型または転移癌(例えば、転移性および再発性ＮＳＣＬ癌を有する患者)に使用する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、骨髄移植、フルダラビンのような化学療法剤を使用するＴ細胞除去治療、体外照射療法(ＸＲＴ)、シクロホスファミドおよび／またはＯＫＴ３またはＣＡＭＰＡＴＨのような抗体の１以上と組み合わせて(例えば、前に同時にまたは後に)対象に投与する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、ＣＤ２０と反応する薬剤、例えば、リツキサンのようなＢ細胞除去治療の後に投与する。例えば、ある態様において、対象を、高用量化学療法剤と続く末梢血幹細胞移植の標準処置に付し得る。ある態様において、移植後、対象は抗ＰＤ−１抗体分子を受ける。さらなる態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を手術の前または後に投与する。
組み合わせの他の例は、黒色腫の処置のためのデカルバジンと組み合わせた抗ＰＤ−１抗体である。理論に縛られないが、ＰＤ−１遮断と化学療法剤の組み合わせ使用は、抗原提示経路における腫瘍抗原のレベルを増加させ得る、ほとんど化学療法剤の細胞毒性の結果である細胞死を促進すると考えられる。細胞死を経てＰＤ−１遮断と相乗性をもたらし得る他の組み合わせ治療は、照射、手術およびホルモン欠乏である。これらのプロトコールの各々は、宿主における腫瘍抗原の源を作製する。血管形成阻害剤もＰＤ−１遮断と組み合わせ得る。血管形成の阻害は、腫瘍抗原を宿主抗原提示経路に供給し得る腫瘍細胞死に至る。
ＰＤ−１遮断抗体は、二重特異性抗体と組み合わせても使用できる。二重特異性抗体は、２の別々の抗原を標的とするのに使用できる。例えば抗Ｆｃ受容体／抗腫瘍抗原(例えば、Ｈｅｒ−２／ｎｅｕ)二重特異性抗体が、マクロファージを腫瘍の部位に標的化するために使用されている。このターゲティングは、腫瘍特異的応答をより効果的に活性化し得る。この応答のＴ細胞アームは、ＰＤ−１遮断の使用により増強される。あるいは、抗原を、腫瘍抗原および樹状細胞特異的細胞表面マーカーに結合する二重特異性抗体の使用により、ＤＣに直接送達し得る。
腫瘍は、多種多様な機構により宿主免疫監視を逃れる。これらの機構の多くは、腫瘍により発現され、免疫抑制性であるタンパク質の不活性化により打ち勝ち得る。これらは、とりわけＴＧＦ−ベータ(Kehrl, J. et al. (1986) J. Exp. Med. 163: 1037-1050))、ＩＬ−１０(Howard, M. & O'Garra, A. (1992) Immunology Today 13: 198-200)およびＦａｓリガンド(Hahne, M. et al. (1996) Science 274: 1363-1365)を含む。これらの各々への抗体またはその抗原結合フラグメントを、免疫抑制性剤の効果に対抗し、宿主による腫瘍免疫応答を支持するために、抗ＰＤ−１と組み合わせて使用し得る。
宿主免疫応答性の活性化に使用し得る他の抗体を、抗ＰＤ−１と組み合わせて使用できる。これらは、ＤＣ機能および抗原提示を活性化する、樹状細胞の表面上の分子を含む。抗ＣＤ４０抗体は、Ｔ細胞ヘルパー活性を効果的に置き換え(Ridge, J. et al. (1998) Nature 393: 474-478)、ＰＤ−１抗体と組み合わせて使用できる(Ito, N. et al. (2000) Immunobiology 201 (5) 527-40)。ＣＴＬＡ−４(例えば、米国特許５,８１１,０９７)、ＯＸ−４０(Weinberg, A. et al. (2000) Immunol 164: 2160-2169)、４−１ＢＢ(Melero, I. et al. (1997) Nature Medicine 3: 682-685 (1997))およびＩＣＯＳ(Hutloff, A. et al. (1999) Nature 397: 262-266)のようなＴ細胞共刺激分子に対する抗体も、Ｔ細胞活性化レベルの増加を提供し得る。
さらなる代表的標準治療は、下の“組み合わせ治療”なる表題の章に記載する。
ここに記載する方法の全てにおいて、ＰＤ−１遮断を、腫瘍抗原の提示を増強させる、サイトカイン処置(例えば、インターフェロン、ＧＭ−ＣＳＦ、Ｇ−ＣＳＦ、ＩＬ−２、ＩＬ−２１)または二重特異性抗体治療のような他の形態の免疫療法と組み合わせ得る(例えば、Holliger (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-6448; Poljak (1994) Structure 2:1121-1123参照)。
抗体分子を投与する方法は当分野で知られ、下に記載する。使用する分子の適当な用量は、対象の年齢および体重および使用する特定の薬物による。抗ＰＤ−１抗体分子の用量および治療は当業者により決定され得る。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、約１〜３０mg／kg、例えば、約５〜２５mg／kg、約１０〜２０mg／kg、約１〜５mg／kgまたは約３mg／kgの用量で注射(例えば、皮下または静脈内)により投与する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、約１mg／kg、約３mg／kgまたは１０mg／kg、約２０mg／kg、約３０mg／kgまたは約４０mg／kgの用量で投与する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、約１〜３mg／kgまたは約３〜１０mg／kgの用量で投与する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、約０.５〜２mg／kg、２〜４mg／kg、２〜５mg／kg、５〜１５mg／kgまたは５〜２０mg／kgの用量で投与する。投薬スケジュールは、例えば、週１回ないし２週毎、３週毎または４週毎まで変化し得る。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を隔週、約１０〜２０mg／kgの用量で投与する。
抗体分子は、非接合形態であっても、第二剤、例えば、細胞毒性剤、放射性同位体またはタンパク質、例えば、タンパク質毒素またはウイルスタンパク質とコンジュゲートしてもよい。この方法は、抗体分子を単特でまたは細胞毒製剤とコンジュゲートして、このような処置を必要とする対象に投与することを含む。抗体分子は、多様な治療剤、例えば、細胞毒性部分、例えば、治療的薬物、放射性同位体、植物、真菌または細菌起源の分子または生物学的タンパク質(例えば、タンパク質毒素)または粒子(例えば、組み換えウイルス粒子、例えば、ウイルス外被タンパク質を経て)またはそれらの混合物を送達するために使用できる。
さらなる組み合わせ治療
抗ＰＤ−１抗体分子を、他の治療剤と組み合わせて使用できる。例えば、組み合わせ治療は、１以上のさらなる治療剤、例えば、１以上の抗癌剤、細胞毒性または細胞増殖抑制剤、ホルモン処置、ワクチンおよび／または他の免疫治療剤と共製剤されたおよび／または共投与される、本発明の組成物を含み得る。他の態様において、抗体分子を、手術、照射、凍結手術および／または熱療法を含む、他の治療的処置法と組み合わせて投与する。このような組み合わせ治療は、投与する治療剤の低用量を有利に利用でき、それゆえに、多様な単剤療法と関係する可能性のある毒性または合併症を避ける。
“組み合わせて”は、治療または治療剤が同時に適用されなければならないおよび／または送達用に一緒に製剤されなければならないことを意図しないが、これらの送達方法はここに記載する範囲内である。抗ＰＤ−１抗体分子を、１以上の他のさらなる治療または治療剤と同時に、前にまたは後に投与できる。抗ＰＤ−１抗体分子および他の薬剤または治療的プロトコールを任意の順番で適用できる。一般に、各薬剤を、その薬剤について決定された用量および／または日程で投与する。本組み合わせで使用するさらなる治療剤を、単組成物で一緒に投与するまたは別々に異なる組成物で投与することが可能であることもさらに認められる。一般に、組み合わせで使用するさらなる治療剤は、個々に使用するレベルを超えないレベルで使用することが予測される。ある態様において、組み合わせで使用するレベルは、個々に使用するものより低い。
ある態様において、ここに記載する抗ＰＤ−１分子を、当分野で知られるＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１および／またはＰＤ−Ｌ２の１以上の他の阻害剤と共に投与する。アンタゴニストは、抗体、その抗原結合フラグメント、免疫アドヘシン、融合タンパク質またはオリゴペプチドであり得る。ある態様において、他の抗ＰＤ−１抗体は、ＭＤＸ−１１０６、Ｍｅｒｃｋ ３４７５またはＣＴ−０１１から選択される。ある態様において、ＰＤ−１阻害剤は免疫アドヘシンである(定常領域(例えば、免疫グロブリン配列のＦｃ領域)に融合したＰＤ−ＬｌまたはＰＤ−Ｌ２の細胞外またはＰＤ−１結合部分を含む、免疫アドヘシン))。ある態様において、ＰＤ−１阻害剤はＡＭＰ−２２４である。ある態様において、ＰＤ−Ｌｌ阻害剤は抗ＰＤ−Ｌｌ抗体である。ある態様において、抗ＰＤ−Ｌｌ結合アンタゴニストはＹＷ２４３.５５.Ｓ７０、ＭＰＤＬ３２８０Ａ、ＭＥＤＩ−４７３６、ＭＳＢ−００１０７１８ＣまたはＭＤＸ−１１０５から選択される。ＢＭＳ−９３６５５９としても知られるＭＤＸ−１１０５はＷＯ２００７／００５８７４号に記載の抗ＰＤ−Ｌｌ抗体である。抗体ＹＷ２４３.５５.Ｓ７０(重鎖および軽鎖可変領域配列はそれぞれ配列番号２０および２１に示す)は、ＷＯ２０１０／０７７６３４号に記載された抗ＰＤ−Ｌｌである。
ＭＤＸ−１１０６−０４、ＯＮＯ−４５３８またはＢＭＳ−９３６５５８としても知られるＭＤＸ−１１０６はＷＯ２００６／１２１１６８号に記載された抗ＰＤ−１抗体である。ＭＫ−３４７５またはＳＣＨ−９００４７５としても知られるＭｅｒｃｋ ３７４５は、ＷＯ２００９／１１４３３５号に記載された抗ＰＤ−１抗体である。ピディリズマブ(ＣＴ−０１１；Cure Tech)は、ＰＤ−１に結合するヒト化ＩｇＧ１ｋモノクローナル抗体である。ピディリズマブおよび他のヒト化抗ＰＤ−１モノクローナル抗体はＷＯ２００９／１０１６１１号に開示されている。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体はペンブロリズマブである。ペンブロリズマブ(商品名Keytruda、以前はランブロリズマブ、ＭＫ−３４７５としても既知)は、例えば、Hamid, O. et al. (2013) New England Journal of Medicine 369 (2): 134-44に開示されている。ＡＭＰ−２２４(Ｂ７−ＤＣＩｇ；Amplimmune；例えば、ＷＯ２０１０／０２７８２７号およびＷＯ２０１１／０６６３４２号に開示)は、ＰＤ−１とＢ７−Ｈ１の相互作用を遮断するＰＤ−Ｌ２ Ｆｃ融合可溶性受容体である。他の抗ＰＤ−１抗体は、とりわけ、ＡＭＰ ５１４(Amplimmune)、例えば、ＵＳ８,６０９,０８９号、ＵＳ２０１００２８３３０号および／またはＵＳ２０１２０１１４６４９号に開示の、例えば、抗ＰＤ−１抗体を含む。
ある態様において、他の抗ＰＤ−１抗体はＭＤＸ−１１０６である。ＭＤＸ−１１０６の別名はＭＤＸ−１１０６−０４、ＯＮＯ−４５３８、ＢＭＳ−９３６５５８またはニボルマブを含む。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体はニボルマブ(CAS Registry Number: 946414-94-4)である。ニボルマブ(ＢＭＳ−９３６５５８またはＭＤＸ１１０６とも呼ぶ；Bristol-Myers Squibb)は、ＰＤ−１を特異的に遮断する完全ヒトＩｇＧ４モノクローナル抗体である。ニボルマブ(クローン５Ｃ４)およびＰＤ−１に特異的に結合する他のヒトモノクローナル抗体は、ＵＳ８,００８,４４９号およびＷＯ２００６／１２１１６８号に開示されている。ランブロリズマブ(ペンブロリズマブまたはＭＫ０３４７５とも呼ぶ；Merck)は、ＰＤ−１に特異的に結合するヒト化ＩｇＧ４モノクローナル抗体である。ペンブロリズマブおよび他のヒト化抗ＰＤ−１抗体は、ＵＳ８,３５４,５０９号およびＷＯ２００９／１１４３３５号に開示される。ＭＤＰＬ３２８０Ａ(Genentech／Roche)は、ＰＤ−Ｌ１に特異的に結合するヒトＦｃ最適化ＩｇＧ１モノクローナル抗体である。ＭＤＰＬ３２８０ＡおよびＰＤ−Ｌ１に対する他のヒトモノクローナル抗体は、米国特許７,９４３,７４３号および米国公開２０１２００３９９０６号に開示されている。他の抗ＰＤ−Ｌ１結合剤は、YW243.55.S70(重鎖および軽鎖可変領域はＷＯ２０１０／０７７６３４の配列番号２０および２１に示す)およびＭＤＸ−１１０５(ＢＭＳ−９３６５５９とも呼ぶ、および、例えば、ＷＯ２００７／００５８７４号に開示された抗ＰＤ−Ｌ１結合剤を含む)を含む。
癌治療
抗ＰＤ−１抗体分子(単独でまたは他の刺激剤と組み合わせて)および癌の標準治療の代表的組み合わせは、少なくとも次のものを含む。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、アナストロゾール(Arimidex(登録商標))、ビカルタミド(Casodex(登録商標))、硫酸ブレオマイシン(Blenoxane(登録商標))、ブスルファン(Myleran(登録商標))、ブスルファン注(Busulfex(登録商標))、カペシタビン(Xeloda(登録商標))、Ｎ４−ペントキシカルボニル−５−デオキシ−５−フルオロシチジン、カルボプラチン(Paraplatin(登録商標))、カルムスチン(BiCNU(登録商標))、クロラムブシル(Leukeran(登録商標))、シスプラチン(Platinol(登録商標))、クラドリビン(Leustatin(登録商標))、シクロホスファミド(Cytoxan(登録商標)またはNeosar(登録商標))、シタラビン、シトシンアラビノシド(Cytosar-U(登録商標))、シタラビンリポソーム注(DepoCyt(登録商標))、ダカルバジン(DTIC-Dome(登録商標))、ダクチノマイシン(アクチノマイシンＤ、Cosmegan)、塩酸ダウノルビシン(Cerubidine(登録商標))、クエン酸ダウノルビシンリポソーム注(DaunoXome(登録商標))、デキサメサゾン、ドセタキセル(タキソテール(登録商標))、塩酸ドキソルビシン(アドリアマイシン(登録商標)、Rubex(登録商標))、エトポシド(Vepesid(登録商標))、リン酸フルダラビン(Fludara(登録商標))、５−フルオロウラシル(Adrucil(登録商標)、Efudex(登録商標))、フルタミド(Eulexin(登録商標))、テザシチビン、ゲムシタビン(ジフルオロデオキシシチジン)、ヒドロキシ尿素(Hydrea(登録商標))、イダルビシン(Idamycin(登録商標))、イホスファミド(IFEX(登録商標))、イリノテカン(Camptosar(登録商標))、Ｌ−アスパラギナーゼ(ELSPAR(登録商標))、ロイコボリンカルシウム、メルファラン(Alkeran(登録商標))、６−メルカプトプリン(ピュリネソール(登録商標))、メトトレキサート(Folex(登録商標))、ミトキサントロン(Novantrone(登録商標))、マイロターグ、パクリタキセル(タキソール(登録商標))、フェニックス(イットリウム９０／MX-DTPA)、ペントスタチン、ポリフェプロザン２０とカルムスチンインプラント(グリアデル(登録商標))、クエン酸タモキシフェン(Nolvadex(登録商標))、テニポシド(Vumon(登録商標))、６−チオグアニン、チオテパ、チラパザミン(Tirazone(登録商標))、注射用塩酸トポテカン(Hycamptin(登録商標))、ビンブラスチン(Velban(登録商標))、ビンクリスチン(Oncovin(登録商標))、ビノレルビン(Navelbine(登録商標))、イブルチニブ、イデラリシブおよびブレンツキシマブベドチンを含むが、これらに限定されない標準的な癌治療用化学療法剤と組み合わせて使用する。
代表的アルキル化剤は、窒素マスタード、エチレンイミン誘導体、アルキルスルホネート、ニトロソウレアおよびトリアゼン)：ウラシルマスタード(アミノウラシルマスタード(登録商標)、Chlorethaminacil(登録商標)、Demethyldopan(登録商標)、Desmethyldopan(登録商標)、Haemanthamine(登録商標)、Nordopan(登録商標)、Uracil nitrogen mustard(登録商標)、Uracillost(登録商標)、Uracilmostaza(登録商標)、Uramustin(登録商標)、ウラムスチン(登録商標))、クロルメチン(Mustargen(登録商標))、シクロホスファミド(Cytoxan(登録商標)、Neosar(登録商標)、Clafen(登録商標)、Endoxan(登録商標)、Procytox(登録商標)、RevimmuneTM)、イホスファミド(Mitoxana(登録商標))、メルファラン(Alkeran(登録商標))、クロラムブシル(Leukeran(登録商標))、ピポブロマン(Amedel(登録商標)、Vercyte(登録商標))、トリエチレンメラミン(Hemel(登録商標)、Hexalen(登録商標)、Hexastat(登録商標))、トリエチレンチオホスホロアミン、テモゾロミド(Temodar(登録商標))、チオテパ(Thioplex(登録商標))、ブスルファン(Busilvex(登録商標)、Myleran(登録商標))、カルムスチン(BiCNU(登録商標))、ロムスチン(CeeNU(登録商標))、ストレプトゾシン(Zanosar(登録商標))およびダカルバジン(DTIC-Dome(登録商標))を含むが、これらに限定されない。さらなる代表的アルキル化剤は、オキサリプラチン(Eloxatin(登録商標))；テモゾロミド(Temodar(登録商標)およびTemodal(登録商標))；ダクチノマイシン(別名アクチノマイシン−Ｄ、Cosmegen(登録商標))；メルファラン(別名L-PAM、Ｌ−サルコリシンおよびフェニルアラニンマスタード、Alkeran(登録商標))；アルトレタミン(別名ヘキサメチルメラミン(ＨＭＭ)、Hexalen(登録商標))；カルムスチン(BiCNU(登録商標))；ベンダムスチン(Treanda(登録商標))；ブスルファン(Busulfex(登録商標)およびMyleran(登録商標))；カルボプラチン(Paraplatin(登録商標))；ロムスチン(別名ＣＣＮＵ、CeeNU(登録商標))；シスプラチン(別名ＣＤＤＰ、Platinol(登録商標)およびPlatinol(登録商標)−ＡＱ)；クロラムブシル(Leukeran(登録商標))；シクロホスファミド(Cytoxan(登録商標)およびNeosar(登録商標))；ダカルバジン(別名ＤＴＩＣ、ＤＩＣおよびイミダゾールカルボキサミド、DTIC-Dome(登録商標))；アルトレタミン(別名ヘキサメチルメラミン(ＨＭＭ)、Hexalen(登録商標))；イホスファミド(IFEX(登録商標))；Prednumustine；プロカルバジン(Matulane(登録商標))；メクロレタミン(別名窒素マスタード、ムスチンおよび塩酸メクロロエタミン、Mustargen(登録商標))；ストレプトゾシン(Zanosar(登録商標))；チオテパ(別名チオホスホアミド、ＴＥＳＰＡおよびＴＳＰＡ、Thioplex(登録商標))；シクロホスファミド(Endoxan(登録商標)、Cytoxan(登録商標)、Neosar(登録商標)、Procytox(登録商標)、Revimmune(登録商標))；およびベンダムスチンＨＣｌ(Treanda(登録商標))を含むが、これらに限定されない。
代表的アントラサイクリンは、例えば、ドキソルビシン(アドリアマイシン(登録商標)およびRubex(登録商標))；ブレオマイシン(lenoxane(登録商標))；ダウノルビシン(塩酸ダウノルビシン、ダウノマイシンおよび塩酸ルビドマイシン、Cerubidine(登録商標))；ダウノルビシンリポソーム製剤(クエン酸ダウノルビシンリポソーム、DaunoXome(登録商標))；ミトキサントロン(ＤＨＡＤ、Novantrone(登録商標))；エピルビシン(EllenceTM)；イダルビシン(Idamycin(登録商標)、Idamycin PFS(登録商標))；マイトマイシンＣ(Mutamycin(登録商標))；ゲルダナマイシン；ハービマイシン；ラビドマイシン；およびデスアセチルラビドマイシンを含む。
抗ＰＤ−１抗体分子と組み合わせて、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて使用できる代表的ビンカアルカロイドは、酒石酸ビノレルビン(Navelbine(登録商標))、ビンクリスチン(Oncovin(登録商標))およびビンデシン(Eldisine(登録商標)))；ビンブラスチン(別名硫酸ビンブラスチン、ビンカロイコブラスチンおよびＶＬＢ、Alkaban-AQ(登録商標)およびVelban(登録商標))；およびビノレルビン(Navelbine(登録商標))を含むが、これらに限定されない。
抗ＰＤ−１抗体分子と組み合わせて、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて使用できる代表的プロテオソーム阻害剤は、ボルテゾミブ(ベルケイド(登録商標))；カルフィルゾミブ(PX-171-007、(Ｓ)−４−メチル−Ｎ−((Ｓ)−１−(((Ｓ)−４−メチル−１−((Ｒ)−２−メチルオキシラン−２−イル)−１−オキソペンタン−２−イル)アミノ)−１−オキソ−３−フェニルプロパン−２−イル)−２−((Ｓ)−２−(２−モルホリノアセトアミド)−４−フェニルブタンアミド)−ペンタンアミド)；マリゾミブ(ＮＰＩ−００５２)；クエン酸イキサゾミブ(ＭＬＮ−９７０８)；デランゾミブ(ＣＥＰ−１８７７０)；およびＯ−メチル−Ｎ−[(２−メチル−５−チアゾリル)カルボニル]−Ｌ−セリル−Ｏ−メチル−Ｎ−[(１Ｓ)−２−[(２Ｒ)−２−メチル−２−オキシラニル]−２−オキソ−１−(フェニルメチル)エチル]−Ｌ−セリンアミド(ＯＮＸ−０９１２)を含むが、これらに限定されない。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、受容体チロシンキナーゼ(ＲＴＫ)阻害剤)と組み合わせて使用する。代表的チロシンキナーゼ阻害剤は、上皮細胞増殖因子(ＥＧＦ)経路阻害剤(例えば、上皮細胞増殖因子受容体(ＥＧＦＲ)阻害剤)、血管内皮細胞増殖因子(ＶＥＧＦ)経路阻害剤(例えば、血管内皮細胞増殖因子受容体(ＶＥＧＦＲ)阻害剤(例えば、ＶＥＧＦＲ−１阻害剤、ＶＥＧＦＲ−２阻害剤、ＶＥＧＦＲ−３阻害剤))、血小板由来増殖因子(ＰＤＧＦ)経路阻害剤(例えば、血小板由来増殖因子受容体(ＰＤＧＦＲ)阻害剤(例えば、ＰＤＧＦＲ−β阻害剤))、ＲＡＦ−１阻害剤、ＫＩＴ阻害剤およびＲＥＴ阻害剤を含むが、これらに限定されない。ある態様において、ヘッジホッグ阻害剤と組み合わせて使用する抗癌剤を、アクシチニブ(AG013736)、ボスチニブ(ＳＫＩ−６０６)、セディラニブ(RECENTINTM、ＡＺＤ２１７１)、ダサチニブ(SPRYCEL(登録商標)、ＢＭＳ−３５４８２５)、エルロチニブ(TARCEVA(登録商標))、ゲフィチニブ(IRESSA(登録商標))、イマチニブ(Gleevec(登録商標)、CGP57148B、STI-571)、ラパチニブ(TYKERB(登録商標)、TYVERB(登録商標))、レスタウルチニブ(CEP-701)、ネラチニブ(HKI-272)、ニロチニブ(TASIGNA(登録商標))、セマキサニブ(セマキシニブ、SU5416)、スニチニブ(SUTENT(登録商標)、ＳＵ１１２４８)、トセラニブ(PALLADIA(登録商標))、バンデタニブ(ZACTIMA(登録商標)、ＺＤ６４７４)、バタラニブ(ＰＴＫ７８７、PTK/ZK)、トラスツズマブ(HERCEPTIN(登録商標))、ベバシズマブ(AVASTIN(登録商標))、リツキシマブ(リツキサン(登録商標))、セツキシマブ(ERBITUX(登録商標))、パニツムマブ(VECTIBIX(登録商標))、ラニビズマブ(Lucentis(登録商標))、ニロチニブ(TASIGNA(登録商標))、ソラフェニブ(NEXAVAR(登録商標))、アレムツズマブ(ＣＡＭＰＡＴＨ(登録商標))、ゲムツズマブオゾガマイシン(マイロターグ(登録商標))、ＥＮＭＤ−２０７６、ＰＣＩ−３２７６５、ＡＣ２２０、乳酸ドビチニブ(ＴＫＩ２５８、ＣＨＩＲ−２５８)、ＢＩＢＷ ２９９２(TOVOKTM)、ＳＧＸ５２３、ＰＦ−０４２１７９０３、ＰＦ−０２３４１０６６、ＰＦ−２９９８０４、ＢＭＳ−７７７６０７、ＡＢＴ−８６９、ＭＰ４７０、ＢＩＢＦ １１２０(VARGATEF(登録商標))、ＡＰ２４５３４、ＪＮＪ−２６４８３３２７、ＭＧＣＤ２６５、ＤＣＣ−２０３６、ＢＭＳ−６９０１５４、ＣＥＰ−１１９８１、チボザニブ(AV-951)、ＯＳＩ−９３０、ＭＭ−１２１、ＸＬ−１８４、ＸＬ−６４７、ＸＬ２２８、ＡＥＥ７８８、ＡＧ−４９０、ＡＳＴ−６、ＢＭＳ−５９９６２６、ＣＵＤＣ−１０１、ＰＤ１５３０３５、ペリチニブ(ＥＫＢ−５６９)、バンデタニブ(ZACTIMA)、ＷＺ３１４６、ＷＺ４００２、ＷＺ８０４０、ＡＢＴ−８６９(リニファニブ)、ＡＥＥ７８８、ＡＰ２４５３４(ポナチニブ)、ＡＶ−９５１(チボザニブ)、アクシチニブ、ＢＡＹ ７３−４５０６(レゴラフェニブ)、ブリバニブアラニナート(ＢＭＳ−５８２６６４)、ブリバニブ(ＢＭＳ−５４０２１５)、セディラニブ(ＡＺＤ２１７１)、ＣＨＩＲ−２５８(ドビチニブ)、ＣＰ ６７３４５１、ＣＹＣ１１６、Ｅ７０８０、Ｋｉ８７５１、マシチニブ(ＡＢ１０１０)、ＭＧＣＤ−２６５、二リン酸モテサニブ(ＡＭＧ−７０６)、MP-470、OSI-930、塩酸パゾパニブ、ＰＤ１７３０７４、トシル酸ソラフェニブ(Ｂａｙ ４３−９００６)、ＳＵ ５４０２、ＴＳＵ−６８(ＳＵ６６６８)、バタラニブ、ＸＬ８８０(ＧＳＫ１３６３０８９、ＥＸＥＬ−２８８０)からなる群から選択する。選択されるチロシンキナーゼ阻害剤は、スニチニブ、エルロチニブ、ゲフィチニブまたはソラフェニブから選択される。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単特で、または他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、ベバシズマブ(AVASTIN(登録商標))、アクシチニブ(Inlyta(登録商標))；ブリバニブアラニナート(ＢＭＳ−５８２６６４、(Ｓ)−((Ｒ)−１−(４−(４−フルオロ−２−メチル−１Ｈ−インドール−５−イルオキシ)−５−メチルピロロ[２,１−ｆ][１,２,４]トリアジン−６−イルオキシ)プロパン−２−イル)２−アミノプロパノエート)；ソラフェニブ(NEXAVAR(登録商標))；パゾパニブ(Votrient(登録商標))；スニチニブマレート(SUTENT(登録商標))；セディラニブ(AZD2171、CAS 288383-20-1)；バルガテフ(ＢＩＢＦ１１２０、CAS 928326-83-4)；フォレチニブ(GSK1363089)；テラチニブ(ＢＡＹ５７−９３５２、CAS 332012-40-5)；アパチニブ(ＹＮ９６８Ｄ１、CAS 811803-05-1)；イマチニブ(Gleevec(登録商標))；ポナチニブ(ＡＰ２４５３４、CAS 943319-70-8)；チボザニブ(ＡＶ９５１、CAS 475108-18-0)；レゴラフェニブ(ＢＡＹ７３−４５０６、CAS 755037-03-7)；二塩酸バタラニブ(ＰＴＫ７８７、CAS 212141-51-0)；ブリバニブ(ＢＭＳ−５４０２１５、CAS 649735-46-6)；バンデタニブ(Caprelsa(登録商標)またはAZD6474)；二リン酸モテサニブ(ＡＭＧ７０６、CAS 857876-30-3、ＰＣＴ公開ＷＯ０２／０６６４７０号に記載のＮ−(２,３−ジヒドロ−３,３−ジメチル−１Ｈ−インドール−６−イル)−２−[(４−ピリジニルメチル)アミノ]−３−ピリジンカルボキサミド)；二乳酸ドビチニブ(ＴＫＩ２５８、CAS 852433-84-2)；リニファニブ(ＡＢＴ８６９、CAS 796967-16-3)；カボザンチニブ(ＸＬ１８４、CAS 849217-68-1)；レスタウルチニブ(CAS 111358-88-4)；Ｎ−[５−[[[５−(１,１−ジメチルエチル)−２−オキサゾリル]メチル]チオ]−２−チアゾリル]−４−ピペリジンカルボキサミド(ＢＭＳ３８７０３、CAS 345627-80-7)；(３Ｒ,４Ｒ)−４−アミノ−１−((４−((３−メトキシフェニル)アミノ)ピロロ[２,１−ｆ][１,２,４]トリアジン−５−イル)メチル)ピペリジン−３−オール(ＢＭＳ６９０５１４)；Ｎ−(３,４−ジクロロ−２−フルオロフェニル)−６−メトキシ−７−[[(３ａα,５β,６ａα)−オクタヒドロ−２−メチルシクロペンタ[ｃ]ピロール−５−イル]メトキシ]−４−キナゾリンアミン(ＸＬ６４７、CAS 781613-23-8)；４−メチル−３−[[１−メチル−６−(３−ピリジニル)−１Ｈ−ピラゾロ[３,４−ｄ]ピリミジン−４−イル]アミノ]−Ｎ−[３−(トリフルオロメチル)フェニル]−ベンズアミド(ＢＨＧ７１２、CAS 940310-85-0)；およびアフリベルセプト(Eylea(登録商標))を含むが、これらに限定されない血管内皮細胞増殖因子(ＶＥＧＦ)受容体阻害剤と組み合わせて使用する。
代表的抗ＶＥＧＦ抗体は、Presta et al. (1997) Cancer Res. 57:4593-4599に従い製造した組み換えヒト化抗ＶＥＧＦモノクローナル抗体である、ハイブリドーマＡＴＣＣ ＨＢ １０７０９により産生されたモノクローナル抗ＶＥＧＦ抗体Ａ４.６.１と同じエピトープに結合するモノクローナル抗体を含むが、これに限定されない。ある態様において、抗ＶＥＧＦ抗体は、rhuMAb VEGFまたはAVASTIN(登録商標)としても知られるベバシズマブ(ＢＶ)である。変異ヒトＩｇＧｌフレームワーク領域と、ヒトＶＥＧＦのその受容体への結合を遮断する、マウス抗ｈＶＥＧＦモノクローナル抗体Ａ.４.６.１由来の抗原結合相補性決定領域を含む。ベバシズマブおよび他のヒト化抗ＶＥＧＦ抗体は、米国特許６,８８４,８７９号(２００５年２月２６日発行)に記載される。さらなる抗体は、ＰＣＴ公開ＷＯ２００５／０１２３５９号、ＰＣＴ公開ＷＯ２００５／０４４８５３号(これらの特許出願の内容を引用により明示的に本明細書に包含させる)に記載のような、Ｇ６またはＢ２０シリーズ抗体(例えば、G6-31、B20-4.1)を含む。さらなる抗体については、米国特許７,０６０,２６９号、６,５８２,９５９号、６,７０３,０２０号、６,０５４,２９７号、Ｗ０９８／４５３３２、ＷＯ９６／３００４６、ＷＯ９４／１０２０２、ＥＰ０６６６８６８Ｂ１、米国特許出願公開２００６００９３６０号、２００５０１８６２０８号、２００３０２０６８９９号、２００３０１９０３１７号、２００３０２０３４０９号および２００５０１１２１２６号；およびPopkov et al, Journal of Immunological Methods 288: 149-164 (2004)を参照。他の抗体は、残基Ｆ１７、Ｍｌ８、Ｄ１９、Ｙ２１、Ｙ２５、Ｑ８９、１９１、Ｋｌ０１、Ｅｌ０３およびＣ１０４を含む、あるいは残基Ｆ１７、Ｙ２１、Ｑ２２、Ｙ２５、Ｄ６３、１８３およびＱ８９を含む、ヒトＶＥＧＦ上の機能的エピトープに結合するものを含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または、他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、ＰＩ３Ｋ阻害剤と組み合わせて使用する。ある態様において、ＰＩ３Ｋ阻害剤は、ＰＩ３Ｋのデルタおよびガンマアイソフォームの阻害剤である。組み合わせで使用できる代表的ＰＩ３Ｋ阻害剤は、例えば、ＷＯ２０１０／０３６３８０号、ＷＯ２０１０／００６０８６号、ＷＯ０９／１１４８７０号、ＷＯ０５／１１３５５６号に記載のもの、ＧＳＫ ２１２６４５８、ＧＤＣ−０９８０、ＧＤＣ−０９４１、Ｓａｎｏｆｉ ＸＬ１４７、ＸＬ７５６、ＸＬ１４７、ＰＦ−４６９１５０３２、ＢＫＭ １２０、ＣＡＬ−１０１、ＣＡＬ ２６３、ＳＦ１１２６、ＰＸ−８８６およびデュアルＰＩ３Ｋ阻害剤(例えば、Novartis BEZ235)を含む。
ある態様において、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、ｍＴＯＲ阻害剤、例えば、ラパマイシン、テムシロリムス(TORISEL(登録商標))、ＡＺＤ８０５５、ＢＥＺ２３５、ＢＧＴ２２６、ＸＬ７６５、ＰＦ−４６９１５０２、ＧＤＣ０９８０、ＳＦ１１２６、ＯＳＩ−０２７、ＧＳＫ１０５９６１５、ＫＵ−００６３７９４、ＷＹＥ−３５４、Ｐａｌｏｍｉｄ ５２９(P529)、ＰＦ−０４６９１５０２またはＰＫＩ−５８７、リダフォロリムス(以前はデフェロリムスとして既知、(１Ｒ,２Ｒ,４Ｓ)−４−[(２Ｒ)−２−[(１Ｒ,９Ｓ,１２Ｓ,１５Ｒ,１６Ｅ,１８Ｒ,１９Ｒ,２１Ｒ、２３Ｓ,２４Ｅ,２６Ｅ,２８Ｚ,３０Ｓ,３２Ｓ,３５Ｒ)−１,１８−ジヒドロキシ−１９,３０−ジメトキシ−１５,１７,２１,２３、２９,３５−ヘキサメチル−２,３,１０,１４,２０−ペンタオキソ−１１,３６−ジオキサ−４−アザトリシクロ[３０.３.１.０４,９]ヘキサトリアコンタ−１６,２４,２６,２８−テトラエン−１２−イル]プロピル]−２−メトキシシクロヘキシルジメチルホスフィネート、ＡＰ２３５７３およびＭＫ８６６９としても知られ、ＰＣＴ公開ＷＯ０３／０６４３８３号に記載)；エベロリムス(Afinitor(登録商標)またはＲＡＤ００１)；ラパマイシン(ＡＹ２２９８９、シロリムス(登録商標))；セマピモド(CAS 164301-51-3)；エムシロリムス(emsirolimus)、(５−{２,４−ビス[(３Ｓ)−３−メチルモルホリン−４−イル]ピリド[２,３−ｄ]ピリミジン−７−イル}−２−メトキシフェニル)メタノール(ＡＺＤ８０５５)；２−アミノ−８−[ｔｒａｎｓ−４−(２−ヒドロキシエトキシ)シクロヘキシル]−６−(６−メトキシ−３−ピリジニル)−４−メチル−ピリド[２,３−ｄ]ピリミジン−７(８Ｈ)−オン(ＰＦ０４６９１５０２、CAS 1013101-36-4)；およびＮ２−[１,４−ジオキソ−４−[[４−(４−オキソ−８−フェニル−４Ｈ−１−ベンゾピラン−２−イル)モルホリニウム−４−イル]メトキシ]ブチル]−Ｌ−アルギニルグリシル−Ｌ−α−アスパルチルＬ−セリン−(配列番号２３７)、分子内塩(ＳＦ１１２６、CAS 936487-67-1)およびXL765の１以上から選択される１以上のｍＴＯＲ阻害剤と組み合わせて使用する。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または、他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、ＢＲＡＦ阻害剤、例えば、ＧＳＫ２１１８４３６、ＲＧ７２０４、ＰＬＸ４０３２、ＧＤＣ−０８７９、ＰＬＸ４７２０およびトシル酸ソラフェニブ(Ｂａｙ ４３−９００６)と組み合わせて使用する。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または、他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、ＭＥＫ阻害剤と組み合わせて使用する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体とＭＥＫ阻害剤の組み合わせを癌(例えば、ここに記載する癌)の処置に使用する。ある態様において、該組み合わせにより処置する癌は黒色腫、結腸直腸癌、非小細胞性肺癌、卵巣癌、乳癌、前立腺癌、膵臓癌、造血器腫瘍または腎細胞癌から選択される。ある態様において、癌はＢＲＡＦ変異(例えば、ＢＲＡＦ Ｖ６００Ｅ変異)、ＢＲＡＦ野生型、ＫＲＡＳ野生型または活性化ＫＲＡＳ変異を含む。癌は初期段階、中期段階または後期段階であり得る。ＡＲＲＹ−１４２８８６、Ｇ０２４４２１０４(別名ＧＳＫ１１２０２１２)、ＲＤＥＡ４３６、ＲＤＥＡ１１９／ＢＡＹ ８６９７６６、ＡＳ７０３０２６、Ｇ０００３９８０５(別名ＡＺＤ−６２４４またはセルメチニブ)、ＢＩＸ ０２１８８、ＢＩＸ ０２１８９、ＣＩ−１０４０(ＰＤ−１８４３５２)、ＰＤ０３２５９０１、ＰＤ９８０５９、Ｕ０１２６、ＧＤＣ−０９７３(メタノン、[３,４−ジフルオロ−２−[(２−フルオロ−４−ヨードフェニル)アミノ]フェニル][３−ヒドロキシ−３−(２５)−２−ピペリジニル−１−アゼチジニル]−)、Ｇ−３８９６３、Ｇ０２４４３７１４(別名ＡＳ７０３２０６)またはその薬学的に許容される塩または溶媒和物を含むが、これらに限定されないあらゆるＭＥＫ阻害剤を組み合わせで使用できる。ＭＥＫ阻害剤のさらなる例は、内容を引用により本明細書に包含させるＷＯ２０１３／０１９９０６号、ＷＯ０３／０７７９１４号、ＷＯ２００５／１２１１４２号、ＷＯ２００７／０４４１５号、ＷＯ２００８／０２４７２５号およびＷＯ２００９／０８５９８３号に開示される。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または、他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、ＪＡＫ２阻害剤、例えば、ＣＥＰ−７０１、ＩＮＣＢ１８４２４、ＣＰ−６９０５５０(タソシチニブ)と組み合わせて使用する。
ある態様において、ここに記載する医薬組成物を、単独で、または他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせで、パクリタキセルまたはパクリタキセル剤、例えば、タキソール(登録商標)、タンパク質結合パクリタキセル(例えば、アブラキサン(登録商標))と組み合わせで使用する。代表的パクリタキセル剤は、ナノ粒子アルブミン結合パクリタキセル(アブラキサン、Abraxis Bioscienceにより販売)、ドコサヘキサエン酸結合パクリタキセル(ＤＨＡ−パクリタキセル、Taxoprexin、Protargaにより販売)、ポリグルタメート結合パクリタキセル(ＰＧ−パクリタキセル、パクリタキセル・ポリグルメックス、ＣＴ−２１０３、ＸＹＯＴＡＸ、Cell Therapeuticにより販売)、腫瘍活性化プロドラッグ(ＴＡＰ)、ANG１０５(３分子のパクリタキセルに結合したAngiopep−2、ImmunoGenにより販売)、パクリタキセル−ＥＣ−１(ｅｒｂＢ２認識ペプチドＥＣ−１に結合したパクリタキセル；Li et al., Biopolymers (2007) 87:225-230参照)およびグルコース接合パクリタキセル(例えば、２’−パクリタキセルメチル２−グルコピラノシルスクシネート、Liu et al., Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters (2007) 17:617-620参照)を含むが、これらに限定されない。
放射線療法を、外照射療法、内部放射線療法、インプラント照射、定位放射線手術、全身放射線療法、放射線療法および永続性または一過性組織内近接照射療法を含むが、これらに限定されないいくつかのの方法の１またはいくつかの組み合わせにより投与できる。用語“組織内照射療法”は、腫瘍または他の増殖性組織疾患部位にまたはその近くに体内に入れられた空間的に限定された放射性物質により送達される放射線療法をいう。本用語は、放射性同位体(例えば、Ａｔ−２１１、Ｉ−１３１、Ｉ−１２５、Ｙ−９０、Ｒｅ−１８６、Ｒｅ−１８８、Ｓｍ−１５３、Ｂｉ−２１２、Ｐ−３２およびＬｕの放射性同位体)への暴露を含むが、これらに限定されない。本発明の細胞コンディショナーとして使用するための適当な照射源は、固形および液体の両者を含む。非限定的例として、照射源は、Ｉ−１２５、Ｉ−１３１、Ｙｂ−１６９、固形源としてのＩｒ−１９２、固形源としてのＩ−１２５または光子、ベータ粒子、ガンマ照射または他の治療的放射線を発する他の放射性核種のような放射性核種であり得る。放射性物質はまた放射性核種のあらゆる溶液、例えば、Ｉ−１２５またはＩ−１３１の溶液から製造された流体であってよくまたは放射性流体は、Ａｕ−１９８、Ｙ−９０のような固形放射性核種の小粒子を含む適当な流体のスラリーを使用して製造できる。さらに、放射性核種をゲルまたは放射性マイクロスフェアに包埋できる。
抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、手術；放射線療法(例えば、照射場が設計される三次元、原体放射線療法を含む外照射療法、局所照射(例えば、予め選択した標的または臓器に向けた照射)または焦点を合わせた照射)を含むが、これらに限定されない、癌の処置のための既存のモダリティの１以上と組み合わせて投与できる。焦点を合わせた照射は、定位放射線手術、分画定位放射線手術および強度変調放射線療法からなる群から選択できる。焦点を合わせた照射は、例えば、ＷＯ２０１２／１７７６２４号に記載のような、粒子ビーム(プロトン)、コバルト−６０(光子)および直線加速器(ｘ線)からなる群から選択される照射源を有し得る。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、キラー細胞免疫グロブリン様受容体に対する抗体(ここでは“抗ＫＩＲ抗体”とも呼ぶ)、汎ＫＩＲ抗体、抗ＮＫＧ２Ｄ抗体および抗ＭＩＣＡ抗体と組み合わせて投与する。ある態様において、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子と抗ＫＩＲ抗体、汎ＫＩＲ抗体または抗ＮＫＧ２Ｄ抗体の組み合わせを、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、固形腫瘍、例えば、進行型固形腫瘍)の処置に使用する。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、細胞性免疫療法(例えば、プロベンジ(例えば、Sipuleucel))と組み合わせておよび所望によりシクロホスファミドと共に投与する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、プロベンジおよび／またはシクロホスファミドの組み合わせを、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、前立腺癌、例えば、進行型前立腺癌)の処置に使用する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、ワクチン、例えば、樹状細胞腎臓癌(ＤＣ−ＲＣＣ)ワクチンと組み合わせて投与する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子とＤＣ−ＲＣＣワクチンの組み合わせを、例えば、ここに記載する癌(例えば、腎臓癌、例えば、転移腎細胞癌(ＲＣＣ)または明細胞腎細胞癌(ＣＣＲＣＣ))の処置に使用する。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、化学療法剤および／または免疫療法と組み合わせて使用する。例えば、抗ＰＤ−１抗体分子を、単特でまたは化学療法剤または他の抗癌剤(例えば、サリドマイドアナログ、例えば、レナリドマイド)、抗ＴＩＭ−３抗体、腫瘍抗原パルス樹状細胞、腫瘍細胞および樹状細胞の融合体(例えば、電気融合体)または悪性形質細胞により産生した免疫グロブリンイディオタイプでのワクチン接種と組み合わせて使用して、骨髄腫を処置できる。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、骨髄腫、例えば、多発性骨髄腫を処置するために抗ＴＩＭ−３抗体と組み合わせて使用する。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、肺癌、例えば、非小細胞性肺癌の処置のために化学療法剤と組み合わせて使用する。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、肺癌の処置のためのプラチナダブレット療法と使用する。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、腎臓癌、例えば、腎細胞癌(ＲＣＣ)(例えば、明細胞腎細胞癌(ＣＣＲＣＣ)または転移ＲＣＣの処置に使用する。抗ＰＤ−１抗体分子を、免疫ベース戦略(例えば、インターロイキン−２またはインターフェロン−α)、標的剤(例えば、ＶＥＧＦに対するモノクローナル抗体のようなＶＥＧＦ阻害剤)；スニチニブ、ソラフェニブ、アクシチニブおよびパゾパニブのようなＶＥＧＦチロシンキナーゼ阻害剤；ＲＮＡｉ阻害剤)またはＶＥＧＦシグナル伝達の下流メディエーターの阻害剤、例えば、ラパマイシンの哺乳動物標的(ｍＴＯＲ)の阻害剤、例えば、エベロリムスおよびテムシロリムスの１以上と組み合わせて投与できる。
膵臓癌の処置のために、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するための適当な治療的の例は、化学療法剤、例えば、パクリタキセルまたはパクリタキセル剤(例えば、タキソール、アルブミン安定化ナノ粒子パクリタキセル製剤(例えば、アブラキサン)またはリポソーム製剤パクリタキセル製剤のようなパクリタキセル製剤)；ゲムシタビン(例えば、ゲムシタビン単独またはＡＸＰ１０７−１１との組み合わせ)；オキサリプラチン、５−フルオロウラシル、カペシタビン、ルビテカン、塩酸エピルビシン、ＮＣ−６００４、シスプラチン、ドセタキセル(例えば、タキソテール)、マイトマイシンＣ、イホスファミド；インターフェロン；チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ＥＧＦＲ阻害剤(例えば、エルロチニブ、パニツムマブ、セツキシマブ、ニモツズマブ)のような他の化学療法剤；ＨＥＲ２／ｎｅｕ受容体阻害剤(例えば、トラスツズマブ)；デュアルキナーゼ阻害剤(例えば、ボスチニブ、サラカチニブ、ラパチニブ、バンデタニブ)；多キナーゼ阻害剤(例えば、ソラフェニブ、スニチニブ、ＸＬ１８４、パゾパニブ)；ＶＥＧＦ阻害剤(例えば、ベバシズマブ、AV-951、ブリバニブ)；放射性免疫療法(例えば、ＸＲ３０３)；癌ワクチン(例えば、GVAX、サバイビンペプチド)；ＣＯＸ−２阻害剤(例えば、セレコキシブ)；ＩＧＦ−１受容体阻害剤(例えば、ＡＭＧ ４７９、ＭＫ−０６４６)；ｍＴＯＲ阻害剤(例えば、エベロリムス、テムシロリムス)；ＩＬ−６阻害剤(例えば、ＣＮＴＯ ３２８)；サイクリン依存性キナーゼ阻害剤(例えば、P276-00、UCN-01)；改変されたエネルギー代謝指向(ＡＥＭＤ)化合物(例えば、CPI-613)；ＨＤＡＣ阻害剤(例えば、ボリノスタット)；ＴＲＡＩＬ受容体２(ＴＲ−２)アゴニスト(例えば、コナツムマブ)；ＭＥＫ阻害剤(例えば、ＡＳ７０３０２６、セルメチニブ、ＧＳＫ１１２０２１２)；Ｒａｆ／ＭＥＫデュアルキナーゼ阻害剤(例えば、ＲＯ５１２６７６６)；ノッチシグナル伝達阻害剤(例えば、ＭＫ０７５２)；モノクローナル抗体−抗体融合タンパク質(例えば、L19IL2)；クルクミン；ＨＳＰ９０阻害剤(例えば、タネスピマイシン、STA-9090)；ｒＩＬ−２；、デニロイキンジフチトクス；トポイソメラーゼ１阻害剤(例えば、イリノテカン、ＰＥＰ０２)；スタチン(例えば、シンバスタチン)；因子VIIａ阻害剤(例えば、ＰＣＩ−２７４８３)；ＡＫＴ阻害剤(例えば、ＲＸ−０２０１)；低酸素症活性化プロドラッグ(例えば、ＴＨ−３０２)；塩酸メトホルミン、ガンマ−セクレターゼ阻害剤(例えば、ＲＯ４９２９０９７)；リボヌクレオチドレダクターゼ阻害剤(例えば、３−ＡＰ)；免疫毒素(例えば、ＨｕＣ２４２−ＤＭ４)；ＰＡＲＰ阻害剤(例えば、ＫＵ−００５９４３６、ベリパリブ)；ＣＴＬＡ−４阻害剤(例えば、ＣＰ−６７５,２０６、イピリムマブ)；ＡｄＶ−ｔｋ治療；プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ(ベルケイド)、NPI-0052)；チアゾリジンジオン(例えば、ピオグリタゾン)；ＮＰＣ−１Ｃ；オーロラキナーゼ阻害剤(例えば、Ｒ７６３／ＡＳ７０３５６９)、ＣＴＧＦ阻害剤(例えば、ＦＧ−３０１９)；ｓｉＧ１２Ｄ ＬＯＤＥＲ；および放射線療法(例えば、トモセラピー、定位放射線、プロトン治療)、手術およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。ある態様において、パクリタキセルまたはパクリタキセル剤とゲムシタビンの組み合わせを、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子と使用できる。
小細胞肺癌の処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するのに適する治療剤の例は、化学療法剤、例えば、エトポシド、カルボプラチン、シスプラチン、オキサリプラチン、イリノテカン、トポテカン、ゲムシタビン、リポソーム製剤ＳＮ−３８、ベンダムスチン、テモゾロミド、ベロテカン、ＮＫ０１２、ＦＲ９０１２２８、フラボピリドール)；チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ＥＧＦＲ阻害剤(例えば、エルロチニブ、ゲフィチニブ、セツキシマブ、パニツムマブ)；多キナーゼ阻害剤(例えば、ソラフェニブ、スニチニブ)；ＶＥＧＦ阻害剤(例えば、ベバシズマブ、バンデタニブ)；癌ワクチン(例えば、GVAX)；Ｂｃｌ−２阻害剤(例えば、オブリメルセンナトリウム、ＡＢＴ−２６３)；プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ(ベルケイド)、ＮＰＩ−００５２)、パクリタキセルまたはパクリタキセル剤；ドセタキセル；ＩＧＦ−１受容体阻害剤(例えば、ＡＭＧ ４７９)；ＨＧＦ／ＳＦ阻害剤(例えば、ＡＭＧ １０２、ＭＫ−０６４６)；クロロキン；オーロラキナーゼ阻害剤(例えば、MLN8237)；放射性免疫療法(例えば、ＴＦ２)；ＨＳＰ９０阻害剤(例えば、タネスピマイシン、STA-9090)；ｍＴＯＲ阻害剤(例えば、エベロリムス)；Ｅｐ−ＣＡＭ−／ＣＤ３−二重特異性抗体(例えば、ＭＴ１１０)；ＣＫ−２阻害剤(例えば、ＣＸ−４９４５)；ＨＤＡＣ阻害剤(例えば、ベリノスタット)；ＳＭＯアンタゴニスト(例えば、ＢＭＳ ８３３９２３)；ペプチド癌ワクチンおよび放射線療法(例えば、強度変調放射線療法(ＩＭＲＴ)、少分割放射線療法、低酸素誘導放射線療法)、手術およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
非小細胞性肺癌の処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するための適当な治療的の例は、化学療法剤、例えば、ビノレルビン、シスプラチン、ドセタキセル、ペメトレキセドジナトリウム、エトポシド、ゲムシタビン、カルボプラチン、リポソーム製剤ＳＮ−３８、ＴＬＫ２８６、テモゾロミド、トポテカン、ペメトレキセドジナトリウム、アザシチジン、イリノテカン、テガフール−ギメラシル−オテラシルカリウム、サパシタビン)；チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ＥＧＦＲ阻害剤(例えば、エルロチニブ、ゲフィチニブ、セツキシマブ、パニツムマブ、ネシツムマブ、ＰＦ−００２９９８０４、ニモツズマブ、ＲＯ５０８３９４５)、ＭＥＴ阻害剤(例えば、ＰＦ−０２３４１０６６、ＡＲＱ １９７)、ＰＩ３Ｋキナーゼ阻害剤(例えば、ＸＬ１４７、ＧＤＣ−０９４１)、Ｒａｆ／ＭＥＫデュアルキナーゼ阻害剤(例えば、ＲＯ５１２６７６６)、ＰＩ３Ｋ／ｍＴＯＲデュアルキナーゼ阻害剤(例えば、XL765)、ＳＲＣ阻害剤(例えば、ダサチニブ)、デュアル阻害剤(例えば、ＢＩＢＷ ２９９２、ＧＳＫ１３６３０８９、ＺＤ６４７４、ＡＺＤ０５３０、ＡＧ−０１３７３６、ラパチニブ、ＭＥＨＤ７９４５Ａ、リニファニブ)、多キナーゼ阻害剤(例えば、ソラフェニブ、スニチニブ、パゾパニブ、ＡＭＧ ７０６、ＸＬ１８４、ＭＧＣＤ２６５、ＢＭＳ−６９０５１４、Ｒ９３５７８８)、ＶＥＧＦ阻害剤(例えば、エンドスター、エンドスタチン、ベバシズマブ、セディラニブ、ＢＩＢＦ １１２０、アクシチニブ、チボザニブ、ＡＺＤ２１７１)、癌ワクチン(例えば、ＢＬＰ２５リポソームワクチン、ＧＶＡＸ、組み換えＤＮＡおよびＬ５２３Ｓを発現するアデノウイルスタンパク質)、Ｂｃｌ−２阻害剤(例えば、オブリメルセンナトリウム)、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ、カーフィルゾミブ、ＮＰＩ−００５２、ＭＬＮ９７０８)、パクリタキセルまたはパクリタキセル剤、ドセタキセル、ＩＧＦ−１受容体阻害剤(例えば、シクスツムマブ、ＭＫ−０６４６、ＯＳＩ ９０６、ＣＰ−７５１，８７１、ＢＩＩＢ０２２)、ヒドロキシクロロキン、ＨＳＰ９０阻害剤(例えば、タネスピマイシン、ＳＴＡ−９０９０、ＡＵＹ９２２、ＸＬ８８８)、ｍＴＯＲ阻害剤(例えば、エベロリムス、テムシロリムス、リダフォロリムス)、Ｅｐ−ＣＡＭ−／ＣＤ３−二重特異性抗体(例えば、MT110)、ＣＫ−２阻害剤(例えば、CX-4945)、ＨＤＡＣ阻害剤(例えば、ＭＳ ２７５、ＬＢＨ５８９、ボリノスタット、バルプロ酸、ＦＲ９０１２２８)、ＤＨＦＲ阻害剤(例えば、プララトレキサート)、レチノイド(例えば、ベキサロテン、トレチノイン)、抗体−薬物コンジュゲート(例えば、ＳＧＮ−１５)、ビスホスホネート(例えば、ゾレドロン酸)、癌ワクチン(例えば、ベラゲンプマツセル−Ｌ)、低分子量ヘパリン(ＬＭＷＨ)(例えば、チンザパリン、エノキサパリン)、ＧＳＫ１５７２９３２Ａ、メラトニン、タラクトフェリン、ジメスナ、トポイソメラーゼ阻害剤(例えば、アムルビシン、エトポシド、カレニテシン)、ネルフィナビル、シレンギチド、ＥｒｂＢ３阻害剤(例えば、ＭＭ−１２１、Ｕ３−１２８７)、サバイビン阻害剤(例えば、YM155、LY2181308)、エリブリンメシレート、ＣＯＸ−２阻害剤(例えば、セレコキシブ)、ペグフィルグラスチム、Ｐｏｌｏ様キナーゼ１阻害剤(例えば、ＢＩ ６７２７)、ＴＲＡＩＬ受容体２(ＴＲ−２)アゴニスト(例えば、CS-1008)、ＣＮＧＲＣペプチド(配列番号２２５)−ＴＮＦアルファコンジュゲート、ジクロロアセテート(ＤＣＡ)、ＨＧＦ阻害剤(例えば、ＳＣＨ ９００１０５)、ＳＡＲ２４０５５０、ＰＰＡＲ−ガンマアゴニスト(例えば、ＣＳ−７０１７)、ガンマ−セクレターゼ阻害剤(例えば、ＲＯ４９２９０９７)、エピジェネティック治療(例えば、５−アザシチジン)、ニトログリセリン、ＭＥＫ阻害剤(例えば、ＡＺＤ６２４４)、サイクリン依存性キナーゼ阻害剤(例えば、UCN-01)、コレステロール−Ｆｕｓ１、抗チューブリン剤(例えば、E7389)、ファルネシル−ＯＨ−トランスフェラーゼ阻害剤(例えば、ロナファルニブ)、免疫毒素(例えば、ＢＢ−１０９０１、ＳＳ１(ｄｓＦｖ)ＰＥ３８)、フォンダパリヌクス、血管破壊剤(例えば、ＡＶＥ８０６２)、ＰＤ−Ｌ１阻害剤(例えば、ＭＤＸ−１１０５、ＭＤＸ−１１０６)、ベータ−グルカン、ＮＧＲ−ｈＴＮＦ、ＥＭＤ ５２１８７３、ＭＥＫ阻害剤(例えば、ＧＳＫ１１２０２１２)、エポチロンアナログ(例えば、イクサベピロン)、キネシン紡錘阻害剤(例えば、４ＳＣ−２０５)、テロメアターゲティング剤(例えば、ＫＭＬ−００１)、Ｐ７０経路阻害剤(例えば、ＬＹ２５８４７０２)、ＡＫＴ阻害剤(例えば、ＭＫ−２２０６)、血管形成阻害剤(例えば、レナリドマイド)、ノッチシグナル伝達阻害剤(例えば、ＯＭＰ−２１Ｍ１８)、放射線療法、手術およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
卵巣癌の処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するのに適する治療剤の例は、化学療法剤(例えば、パクリタキセルまたはパクリタキセル剤；ドセタキセル；カルボプラチン；ゲムシタビン；ドキソルビシン；トポテカン；シスプラチン；イリノテカン、ＴＬＫ２８６、イホスファミド、オラパリブ、オキサリプラチン、メルファラン、ペメトレキセドジナトリウム、ＳＪＧ−１３６、シクロホスファミド、エトポシド、デシタビン)；グレリンアンタゴニスト(例えば、ＡＥＺＳ−１３０)、免疫療法(例えば、ＡＰＣ８０２４、オレゴボマブ、ＯＰＴ−８２１)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ＥＧＦＲ阻害剤(例えば、エルロチニブ)、デュアル阻害剤(例えば、Ｅ７０８０)、多キナーゼ阻害剤(例えば、ＡＺＤ０５３０、ＪＩ−１０１、ソラフェニブ、スニチニブ、パゾパニブ)、ＯＮ ０１９１０.Ｎａ)、ＶＥＧＦ阻害剤(例えば、ベバシズマブ、ＢＩＢＦ １１２０、セディラニブ、ＡＺＤ２１７１)、ＰＤＧＦＲ阻害剤(例えば、ＩＭＣ−３Ｇ３)、パクリタキセル、トポイソメラーゼ阻害剤(例えば、カレニテシン、イリノテカン)、ＨＤＡＣ阻害剤(例えば、バロプロエート、ボリノスタット)、葉酸受容体阻害剤(例えば、ファーレツズマブ)、アンギオポエチン阻害剤(例えば、ＡＭＧ ３８６)、エポチロンアナログ(例えば、イクサベピロン)、プロテアソーム阻害剤(例えば、カーフィルゾミブ)、ＩＧＦ−１受容体阻害剤(例えば、ＯＳＩ ９０６、ＡＭＧ ４７９)、ＰＡＲＰ阻害剤(例えば、ベリパリブ、AG014699、イニパリブ、MK-4827)、オーロラキナーゼ阻害剤(例えば、ＭＬＮ８２３７、ＥＮＭＤ−２０７６)、血管形成阻害剤(例えば、レナリドマイド)、ＤＨＦＲ阻害剤(例えば、プララトレキサート)、放射性免疫治療剤(例えば、Ｈｕ３Ｓ１９３)、スタチン(例えば、ロバスタチン)、トポイソメラーゼ１阻害剤(例えば、ＮＫＴＲ−１０２)、癌ワクチン(例えば、ｐ５３合成長ペプチドワクチン、自己ＯＣ−ＤＣワクチン)、ｍＴＯＲ阻害剤(例えば、テムシロリムス、エベロリムス)、ＢＣＲ／ＡＢＬ阻害剤(例えば、イマチニブ)、ＥＴ−Ａ受容体アンタゴニスト(例えば、ＺＤ４０５４)、ＴＲＡＩＬ受容体２(ＴＲ−２)アゴニスト(例えば、CS-1008)、ＨＧＦ／ＳＦ阻害剤(例えば、ＡＭＧ １０２)、ＥＧＥＮ−００１、Ｐｏｌｏ様キナーゼ１阻害剤(例えば、ＢＩ ６７２７)、ガンマ−セクレターゼ阻害剤(例えば、ＲＯ４９２９０９７)、Ｗｅｅ−１阻害剤(例えば、ＭＫ−１７７５)、抗チューブリン剤(例えば、ビノレルビン、Ｅ７３８９)、免疫毒素(例えば、デニロイキンジフチトクス)、ＳＢ−４８５２３２、血管破壊剤(例えば、ＡＶＥ８０６２)、インテグリン阻害剤(例えば、ＥＭＤ ５２５７９７)、キネシン紡錘阻害剤(例えば、４ＳＣ−２０５)、レブラミド、ＨＥＲ２阻害剤(例えば、ＭＧＡＨ２２)、ＥｒｒＢ３阻害剤(例えば、ＭＭ−１２１)、放射線療法；およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
ある代表的態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、骨髄腫の処置のために、単独で、または化学療法剤または他の抗癌剤(例えば、サリドマイドアナログ、例えば、レナリドマイド)、ＨＳＣＴ(Cook, R. (2008) J Manag Care Pharm. 14(7 Suppl):19-25)、抗ＴＩＭ−３抗体(Hallett, WHD et al. (2011) J of American Society for Blood and Marrow Transplantation 17(8):1133-145)、腫瘍抗原パルス樹状細胞、腫瘍細胞および樹状細胞の融合体(例えば、電気融合体)または悪性形質細胞により産生された免疫グロブリンイディオタイプでのワクチン接種(Yi, Q. (2009) Cancer J. 15(6):502-10にレビュー)と組み合わせて使用する。
さらに別の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、腎臓癌、例えば、腎細胞癌(ＲＣＣ)または転移ＲＣＣの処置に使用する。抗ＰＤ−１抗体分子を、免疫ベース戦略(例えば、インターロイキン−２またはインターフェロン−α)、標的剤(例えば、ＶＥＧＦに対するモノクローナル抗体のようなＶＥＧＦ阻害剤、例えば、ベバシズマブ(Rini, B.I. et al. (2010) J. Clin. Oncol. 28(13):2137-2143))；スニチニブ、ソラフェニブ、アクシチニブおよびパゾパニブのようなＶＥＧＦチロシンキナーゼ阻害剤(Pal. S.K. et al. (2014) Clin. Advances in Hematology & Oncology 12(2):90-99)にレビュー)；ＲＮＡｉ阻害剤)またはＶＥＧＦシグナル伝達の下流メディエーターの阻害剤、例えば、ラパマイシンの哺乳動物標的(ｍＴＯＲ)の阻害剤、例えば、エベロリムスおよびテムシロリムス(Hudes, G. et al. (2007) N. Engl. J. Med. 356(22):2271-2281, Motzer, R.J. et al. (2008) Lancet 372: 449-456)の１以上と組み合わせて投与できる。
本発明によって、慢性骨髄性白血病(ＡＭＬ)の処置のために、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するための適当な治療剤の例は、化学療法剤(例えば、シタラビン、ヒドロキシ尿素、クロファラビン、メルファラン、チオテパ、フルダラビン、ブスルファン、エトポシド、コーディセピン、ペントスタチン、カペシタビン、アザシチジン、シクロホスファミド、クラドリビン、トポテカン)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ＢＣＲ／ＡＢＬ阻害剤(例えば、イマチニブ、ニロチニブ)、ＯＮ ０１９１０.Ｎａ、デュアル阻害剤(例えば、ダサチニブ、ボスチニブ)、多キナーゼ阻害剤(例えば、ＤＣＣ−２０３６、ポナチニブ、ソラフェニブ、スニチニブ、ＲＧＢ−２８６６３８))、インターフェロンアルファ、ステロイド、アポトーシス剤(例えば、マセタキシン・メペサクシネート)、免疫療法(例えば、同種ＣＤ４＋記憶Ｔｈ１様Ｔ細胞／微粒子結合抗ＣＤ３／抗ＣＤ２８、自己サイトカイン誘発キラー細胞(ＣＩＫ)、ＡＨＮ−１２)、ＣＤ５２ターゲティング剤(例えば、アレムツズマブ)、ＨＳＰ９０阻害剤(例えば、タネスピマイシン、ＳＴＡ−９０９０、ＡＵＹ９２２、ＸＬ８８８)、ｍＴＯＲ阻害剤(例えば、エベロリムス)、ＳＭＯアンタゴニスト(例えば、ＢＭＳ ８３３９２３)、リボヌクレオチドレダクターゼ阻害剤(例えば、３−ＡＰ)、ＪＡＫ−２阻害剤(例えば、ＩＮＣＢ０１８４２４)、ヒドロキシクロロキン、レチノイド(例えば、フェンレチニド)、サイクリン依存性キナーゼ阻害剤(例えば、ＵＣＮ−０１)、ＨＤＡＣ阻害剤(例えば、ベリノスタット、ボリノスタット、ＪＮＪ−２６４８１５８５)、ＰＡＲＰ阻害剤(例えば、ベリパリブ)、ＭＤＭ２アンタゴニスト(例えば、ＲＯ５０４５３３７)、オーロラＢキナーゼ阻害剤(例えば、ＴＡＫ−９０１)、放射性免疫療法(例えば、アクチニウム−２２５−標識抗ＣＤ３３抗体ＨｕＭ１９５)、ヘッジホッグ阻害剤(例えば、ＰＦ−０４４４９９１３)、ＳＴＡＴ３阻害剤(例えば、ＯＰＢ−３１１２１)、ＫＢ００４、癌ワクチン(例えば、AG858)、骨髄移植、幹細胞移植、放射線療法およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
慢性リンパ性白血病(ＣＬＬ)の処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するのに適する治療剤の例は、化学療法剤(例えば、フルダラビン、シクロホスファミド、ドキソルビシン、ビンクリスチン、クロラムブシル、ベンダムスチン、クロラムブシル、ブスルファン、ゲムシタビン、メルファラン、ペントスタチン、ミトキサントロン、５−アザシチジン、ペメトレキセドジナトリウム)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ＥＧＦＲ阻害剤(例えば、エルロチニブ)、ＢＴＫ阻害剤(例えば、ＰＣＩ−３２７６５)、多キナーゼ阻害剤(例えば、ＭＧＣＤ２６５、ＲＧＢ−２８６６３８)、ＣＤ−２０ターゲティング剤(例えば、リツキシマブ、オファツムマブ、ＲＯ５０７２７５９、ＬＦＢ−Ｒ６０３)、ＣＤ５２ターゲティング剤(例えば、アレムツズマブ)、プレドニゾロン、ダルベポエチンアルファ、レナリドマイド、Ｂｃｌ−２阻害剤(例えば、ABT-263)、免疫療法(例えば、同種ＣＤ４＋記憶Ｔｈ１様Ｔ細胞／微粒子結合抗ＣＤ３／抗ＣＤ２８、自己サイトカイン誘発キラー細胞(ＣＩＫ))、ＨＤＡＣ阻害剤(例えば、ボリノスタット、バルプロ酸、ＬＢＨ５８９、ＪＮＪ−２６４８１５８５、ＡＲ−４２)、ＸＩＡＰ阻害剤(例えば、ＡＥＧ３５１５６)、ＣＤ−７４ターゲティング剤(例えば、ミラツズマブ)、ｍＴＯＲ阻害剤(例えば、エベロリムス)、AT-101、免疫毒素(例えば、ＣＡＴ−８０１５、抗Ｔａｃ(Ｆｖ)−ＰＥ３８(LMB-2))、ＣＤ３７ターゲティング剤(例えば、ＴＲＵ−０１６)、放射性免疫療法(例えば、１３１−トシツモマブ)、ヒドロキシクロロキン、ペリホシン、ＳＲＣ阻害剤(例えば、ダサチニブ)、サリドマイド、ＰＩ３Ｋデルタ阻害剤(例えば、ＣＡＬ−１０１)、レチノイド(例えば、フェンレチニド)、ＭＤＭ２アンタゴニスト(例えば、ＲＯ５０４５３３７)、プレリキサホル、オーロラキナーゼ阻害剤(例えば、ＭＬＮ８２３７、ＴＡＫ−９０１)、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ)、ＣＤ−１９ターゲティング剤(例えば、ＭＥＤＩ−５５１、ＭＯＲ２０８)、ＭＥＫ阻害剤(例えば、ABT-348)、ＪＡＫ−２阻害剤(例えば、ＩＮＣＢ０１８４２４)、低酸素症活性化プロドラッグ(例えば、ＴＨ−３０２)、パクリタキセルまたはパクリタキセル剤、ＨＳＰ９０阻害剤、ＡＫＴ阻害剤(例えば、ＭＫ２２０６)、ＨＭＧ−ＣｏＡ阻害剤(例えば、シンバスタチン)、GNKG186、放射線療法、骨髄移植、幹細胞移植およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
急性リンパ性白血病(ＡＬＬ)の処置のために、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するための適当な治療剤の例は、化学療法剤(例えば、プレドニゾロン、デキサメサゾン、ビンクリスチン、アスパラギナーゼ、ダウノルビシン、シクロホスファミド、シタラビン、エトポシド、チオグアニン、メルカプトプリン、クロファラビン、リポソーム製剤アンナマイシン、ブスルファン、エトポシド、カペシタビン、デシタビン、アザシチジン、トポテカン、テモゾロミド)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ＢＣＲ／ＡＢＬ阻害剤(例えば、イマチニブ、ニロチニブ)、ＯＮ ０１９１０.Ｎａ、多キナーゼ阻害剤(例えば、ソラフェニブ))、ＣＤ−２０ターゲティング剤(例えば、リツキシマブ)、ＣＤ５２ターゲティング剤(例えば、アレムツズマブ)、ＨＳＰ９０阻害剤(例えば、ＳＴＡ−９０９０)、ｍＴＯＲ阻害剤(例えば、エベロリムス、ラパマイシン)、ＪＡＫ−２阻害剤(例えば、ＩＮＣＢ０１８４２４)、ＨＥＲ２／ｎｅｕ受容体阻害剤(例えば、トラスツズマブ)、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ)、メトトレキサート、アスパラギナーゼ、ＣＤ−２２ターゲティング剤(例えば、エピラツズマブ、イノツズマブ)、免疫療法(例えば、自己サイトカイン誘発キラー細胞(ＣＩＫ)、ＡＨＮ−１２)、ブリナツモマブ、サイクリン依存性キナーゼ阻害剤(例えば、ＵＣＮ−０１)、ＣＤ４５ターゲティング剤(例えば、ＢＣ８)、ＭＤＭ２アンタゴニスト(例えば、ＲＯ５０４５３３７)、免疫毒素(例えば、ＣＡＴ−８０１５、ＤＴ２２１９ＡＲＬ)、ＨＤＡＣ阻害剤(例えば、ＪＮＪ−２６４８１５８５)、ＪＶＲＳ−１００、パクリタキセルまたはパクリタキセル剤、ＳＴＡＴ３阻害剤(例えば、ＯＰＢ−３１１２１)、ＰＡＲＰ阻害剤(例えば、ベリパリブ)、ＥＺＮ−２２８５、放射線療法、ステロイド、骨髄移植、幹細胞移植またはこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
急性骨髄球性白血病(ＡＭＬ)の処置のために、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するための適当な治療剤の例は、化学療法剤(例えば、シタラビン、ダウノルビシン、イダルビシン、クロファラビン、デシタビン、ボサロキシン、アザシチジン、クロファラビン、リバビリン、ＣＰＸ−３５１、トレオスルファン、エラシタラビン、アザシチジン)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ＢＣＲ／ＡＢＬ阻害剤(例えば、イマチニブ、ニロチニブ)、ＯＮ ０１９１０.Ｎａ、多キナーゼ阻害剤(例えば、ミドスタウリン、ＳＵ １１２４８、クイザルチニブ、ソラフィニブ))、免疫毒素(例えば、ゲムツズマブオゾガマイシン)、ＤＴ３８８ＩＬ３融合タンパク質、ＨＤＡＣ阻害剤(例えば、ボリノスタット、ＬＢＨ５８９)、プレリキサホル、ｍＴＯＲ阻害剤(例えば、エベロリムス)、ＳＲＣ阻害剤(例えば、ダサチニブ)、ＨＳＰ９０阻害剤(例えば、ＳＴＡ−９０９０)、レチノイド(例えば、ベキサロテン、オーロラキナーゼ阻害剤(例えば、ＢＩ ８１１２８３)、ＪＡＫ−２阻害剤(例えば、INCB018424)、Ｐｏｌｏ様キナーゼ阻害剤(例えば、ＢＩ ６７２７)、セネルセン、ＣＤ４５ターゲティング剤(例えば、ＢＣ８)、サイクリン依存性キナーゼ阻害剤(例えば、UCN-01)、ＭＤＭ２アンタゴニスト(例えば、ＲＯ５０４５３３７)、ｍＴＯＲ阻害剤(例えば、エベロリムス)、ＬＹ５７３６３６−ナトリウム、ＺＲｘ−１０１、ＭＬＮ４９２４、レナリドマイド、免疫療法(例えば、ＡＨＮ−１２)、二塩酸ヒスタミン、放射線療法、骨髄移植、幹細胞移植およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
多発性骨髄腫(ＭＭ)の処置のために、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するための適当な治療剤の例は、化学療法剤(例えば、メルファラン、アミホスチン、シクロホスファミド、ドキソルビシン、クロファラビン、ベンダムスチン、フルダラビン、アドリアマイシン、ＳｙＢ Ｌ−０５０１)、サリドマイド、レナリドマイド、デキサメサゾン、プレドニゾン、ポマリドミド、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ、カーフィルゾミブ、ＭＬＮ９７０８)、癌ワクチン(例えば、ＧＶＡＸ)、ＣＤ−４０ターゲティング剤(例えば、ＳＧＮ−４０、ＣＨＩＲ−１２．１２)、ペリホシン、ゾレドロン酸、免疫療法(例えば、ＭＡＧＥ−Ａ３、ＮＹ−ＥＳＯ−１、ＨｕＭａｘ−ＣＤ３８)、ＨＤＡＣ阻害剤(例えば、ボリノスタット、ＬＢＨ５８９、ＡＲ−４２)、アプリジン、サイクリン依存性キナーゼ阻害剤(例えば、ＰＤ−０３３２９９１、ジナシクリブ)、三酸化ヒ素、ＣＢ３３０４、ＨＳＰ９０阻害剤(例えば、ＫＷ−２４７８)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、ＥＧＦＲ阻害剤(例えば、セツキシマブ)、多キナーゼ阻害剤(例えば、ＡＴ９２８３))、ＶＥＧＦ阻害剤(例えば、ベバシズマブ)、プレリキサホル、ＭＥＫ阻害剤(例えば、ＡＺＤ６２４４)、ＩＰＨ２１０１、アトルバスタチン、免疫毒素(例えば、ＢＢ−１０９０１)、ＮＰＩ−００５２、放射性免疫治療的(例えば、イットリウムＹ９０イブリツモマブチウキセタン)、ＳＴＡＴ３阻害剤(例えば、ＯＰＢ−３１１２１)、ＭＬＮ４９２４、オーロラキナーゼ阻害剤(例えば、ＥＮＭＤ−２０７６)、ＩＭＧＮ９０１、ＡＣＥ−０４１、ＣＫ−２阻害剤(例えば、ＣＸ−４９４５)、放射線療法、骨髄移植、幹細胞移植およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
前立腺癌の処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するのに適する治療剤の例は、化学療法剤(例えば、ドセタキセル、カルボプラチン、フルダラビン)、アビラテロン、ホルモン治療(例えば、フルタミド、ビカルタミド、ニルタミド、酢酸シプロテロン、ケトコナゾール、アミノグルテチミド、アバレリクス、デガレリクス、リュープロリド、ゴセレリン、トリプトレリン、ブセレリン)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、デュアルキナーゼ阻害剤(例えば、ラパチニブ)、多キナーゼ阻害剤(例えば、ソラフェニブ、スニチニブ))、ＶＥＧＦ阻害剤(例えば、ベバシズマブ)、ＴＡＫ−７００、癌ワクチン(例えば、ＢＰＸ−１０１、ＰＥＰ２２３)、レナリドマイド、ＴＯＫ−００１、ＩＧＦ−１受容体阻害剤(例えば、シクスツムマブ)、ＴＲＣ１０５、オーロラＡキナーゼ阻害剤(例えば、ＭＬＮ８２３７)、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ)、ＯＧＸ−０１１、放射性免疫療法(例えば、ＨｕＪ５９１−ＧＳ)、ＨＤＡＣ阻害剤(例えば、バルプロ酸、ＳＢ９３９、ＬＢＨ５８９)、ヒドロキシクロロキン、ｍＴＯＲ阻害剤(例えば、エベロリムス)、乳酸ドビチニブ、ジインドリルメタン、エファビレンツ、ＯＧＸ−４２７、ゲニステイン、ＩＭＣ−３Ｇ３、バフェチニブ、ＣＰ−６７５，２０６、放射線療法、手術またはこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
ＨＮＳＣＣの処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するのに適する治療剤の例は、ここに記載する化合物Ａ８(またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／０２９０８２号に記載の化合物)およびセツキシマブ(例えば、ERBITUX、ＢＭＳにより市販)の一方または両方を含むが、これらに限定されない。ある態様において、治療剤(例えば、化合物Ａ８またはＡ８と関係する化合物)は、ＰＩ３Ｋモジュレーター、例えば、ＰＩ３Ｋ阻害剤である。ある態様において、治療剤(例えば、セツキシマブ)は、ＥＧＦＲを調節、例えば阻害する。ある態様において、癌は、対照細胞または基準値と比較して、ＰＩ３ＫまたはＥＧＦＲのレベルまたは活性が上昇しているか、または上昇していると同定される。
胃癌、例えば、ＭＳＩ高および／またはＥＢＶ＋胃癌の処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するのに適する治療剤の例は、ここに記載する化合物Ａ８(またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／０２９０８２号に記載の化合物)を含むが、これに限定されない。ある態様において、治療剤(例えば、化合物Ａ８またはＡ８と関係する化合物)は、ＰＩ３Ｋモジュレーター、例えば、ＰＩ３Ｋ阻害剤である。ある態様において、癌は、対照細胞または基準値と比較して、ＰＩ３Ｋのレベルまたは活性が上昇しているか、または上昇していると同定される。
胃癌、例えば、ＭＳＩ高および／またはＲＮＦ４３不活性化胃癌の処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するのに適する治療剤の例は、ここに記載する化合物Ａ２８(またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／１０１８４９号に記載の化合物)を含むが、これに限定されない。ある態様において、治療剤(例えば、化合物Ａ２８またはＡ２８と関係する化合物)は、porcupineのモジュレーター、例えば、阻害剤である。ある態様において、癌は、対照細胞または基準値と比較して、porcupineのレベルまたは活性が上昇しているか、または上昇していると同定される。
ＧＩ間質腫瘍(ＧＩＳＴ)の処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するのに適する治療剤の例は、ここに記載する化合物Ａ１６(またはＰＣＴ公開ＷＯ１９９９／００３８５４号に記載の化合物)を含むが、これに限定されない。ある態様において、治療剤(例えば、化合物Ａ１６またはＡ１６と関係する化合物)は、チロシンキナーゼのモジュレーター、例えば、阻害剤である。ある態様において、癌は、対照細胞または基準値と比較して、チロシンキナーゼのレベルまたは活性が上昇しているか、または上昇していると同定される。
ＮＳＣＬＣ、例えば、扁平上皮または腺癌の処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するのに適する治療剤の例は、ここに記載する化合物Ａ１７(またはＵＳ特許番号７,７６７,６７５号および８,４２０,６４５号に記載の化合物)およびここに記載する化合物Ａ２３(またはＰＣＴ公開ＷＯ２００３／０７７９１４に記載の化合物)の一方または両方を含むが、これらに限定されない。ある態様において、化合物(例えば、化合物Ａ１７またはＡ１７と関係する化合物)は、ｃ−ＭＥＴを調節、例えば阻害する。ある態様において、化合物(例えば、化合物Ａ２３またはＡ２３と関係する化合物)は、Ａｌｋを調節、例えば阻害する。ある態様において、癌は、対照細胞または基準値と比較して、ｃ−ＭＥＴまたはＡｌｋの一方または両方のレベルまたは活性が上昇しているか、または上昇していると同定される。ある態様において、癌は、ＥＧＦＲに変異を有するまたは有すると同定される。
黒色腫(例えば、ＮＲＡＳ黒色腫)の処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するのに適する治療剤の例は、ここに記載する化合物Ａ２４(または米国特許８,４１５,３５５号および８,６８５,９８０号に記載の化合物)およびここに記載する化合物Ａ３４(またはＰＣＴ公開ＷＯ２００３／０７７９１４に記載の化合物)の一方または両方を含むが、これらに限定されない。ある態様において、化合物(例えば、化合物Ａ２４またはＡ２４と関係する化合物)は、ＪＡＫおよびＣＤＫ４／６の１以上を調節、例えば、阻害する。ある態様において、化合物(例えば、化合物Ａ３４またはＡ３４と関係する化合物)は、ＭＥＫを調節、例えば、阻害する。ある態様において、癌は、対照細胞または基準値と比較して、ＪＡＫ、ＣＤＫ４／６およびＭＥＫの１以上のレベルまたは活性が上昇しているか、または上昇していると同定される。
黒色腫(例えば、ＮＲＡＳ黒色腫)の処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するのに適する治療剤の例は、ここに記載する化合物Ａ２９(またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１１／０２５９２７に記載する化合物)およびここに記載する化合物Ａ３４(またはＰＣＴ公開ＷＯ２００３／０７７９１４に記載の化合物)の一方または両方を含むが、これらに限定されない。ある態様において、化合物(例えば、化合物Ａ２９またはＡ２９と関係する化合物)は、ＢＲＡＦを調節、例えば、阻害する。ある態様において、化合物(例えば、化合物Ａ３４またはＡ３４と関係する化合物)は、ＭＥＫを調節、例えば、阻害する。ある態様において、癌は、対照細胞または基準値と比較して、ＢＲＡＦおよびＭＥＫの一方または両方のレベルまたは活性が上昇しているか、または上昇していると同定される。
扁平上皮ＮＳＣＬＣの処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するのに適当な治療的の例は、ここに記載する化合物Ａ５(またはＵＳ特許番号８,５５２,００２号に記載の化合物)を含むが、これに限定されない。ある態様において、化合物(例えば、化合物Ａ５またはＡ５と関係する化合物)は、ＦＧＦＲを調節、例えば、阻害する。ある態様において、癌は、対照細胞または基準値と比較して、ＦＧＦＲのレベルまたは活性が上昇しているか、または上昇していると同定される。
結腸直腸癌の処置のために、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)と組み合わせて、組み合わせて使用するのに適当な治療的の例は、ここに記載する化合物Ａ２９(またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１１／０２５９２７号の化合物)およびセツキシマブ(例えば、ERBITUX、ＢＭＳにより市販)の一方または両方を含むが、これらに限定されない。ある態様において、治療剤(例えば、化合物Ａ２９またはＡ２９と関係する化合物)は、ＢＲＡＦを調節、例えば、阻害する。ある態様において、治療的(例えば、セツキシマブ)は、ＥＧＦＲを調節、例えば、阻害する。ある態様において、癌は、対照細胞または基準値と比較して、ＢＲＡＦまたはＥＧＦＲのレベルまたは活性が上昇しているか、または上昇していると同定される。
本開示はまた化合物Ａ８、セツキシマブおよびＰＤ−１抗体分子(所望によりＴＩＭ−３抗体分子またはＬＡＧ−３抗体分子と組み合わせて)で癌を処置する方法も提供する。ある態様において、患者をまず化合物Ａ８およびセツキシマブで処置する。この処置を、一定期間、例えば、予定した期間、例えば、約１ヶ月、２ヶ月、４ヶ月、６ヶ月、８ヶ月、１０ヶ月または１２ヶ月続ける。次に、ＰＤ−１抗体分子(所望によりＴＩＭ−３抗体分子またはＬＡＧ−３抗体分子と組み合わせて)を投与する。ＰＤ−１抗体を、所望により、セツキシマブと組み合わせて投与できる。
ある態様において、患者をまず化合物Ａ８、セツキシマブおよびＰＤ−１抗体分子(所望によりＴＩＭ−３抗体分子またはＬＡＧ−３抗体分子と組み合わせて)の全３種で処置する。この処置を、一定期間、例えば、予定した期間、例えば、約６ヶ月、８ヶ月、１０ヶ月または１２ヶ月続ける。次に、化合物Ａ８および／またはセツキシマブを漸減し、維持相がＰＤ−１抗体分子(例えば、単剤療法としてまたはＴＩＭ−３抗体分子またはＬＡＧ−３抗体分子と組み合わせて)での処置を含むが、化合物Ａ８またはセツキシマブを含まないようにする。
他の態様において、３化合物(化合物Ａ８、セツキシマブおよびＰＤ−１抗体分子、所望によりＴＩＭ−３抗体分子またはＬＡＧ−３抗体分子と組み合わせて)を、処置開始時から逐次的に与える。例えば、化合物Ａ８およびセツキシマブを、まず、上記のように与えてよい。次に、ＰＤ−１抗体分子(所望によりＴＩＭ−３抗体分子またはＬＡＧ−３抗体分子と組み合わせて)を本レジメンに追加する。次に、化合物Ａ８および／またはセツキシマブを上記のように漸減する。
３(またはそれ以上)剤レジメンの代表的用量は次のとおりである。ＰＤ−１抗体分子を、例えば、約１〜４０mg／kg、例えば、１〜３０mg／kg、例えば、約５〜２５mg／kg、約１０〜２０mg／kg、約１〜５mg／kgまたは約３mg／kgの用量で投与できる。ある態様において、化合物Ａ８を、約２００〜３００mg、３００〜４００mgまたは２００〜４００mgの用量で投与する。ある態様において、セツキシマブを、１２０分静脈内点滴として４００mg／ｍ２初期用量で投与し、続いて、週１回２５０mg／ｍ２を６０分かけて点滴する。複数の態様において、化合物Ａ８、セツキシマブおよびＰＤ−１抗体分子の１以上を、該薬剤が単剤療法として概して投与される用量より低用量で、例えば、を、該薬剤が単剤療法として概して投与される用量より約０〜１０％、１０〜２０％、２０〜３０％、３０〜４０％、４０〜５０％、５０〜６０％、６０〜７０％、７０〜８０％または８０〜９０％低用量で投与する。複数の態様において、化合物Ａ８、セツキシマブおよびＰＤ−１抗体分子の１以上を、本段落に記載した用量より低用量で、例えば、を、本段落に記載した用量より約０〜１０％、１０〜２０％、２０〜３０％、３０〜４０％、４０〜５０％、５０〜６０％、６０〜７０％、７０〜８０％または８０〜９０％低用量で投与する。ある態様において、化合物Ａ８を個別に投与するときよりも低い、阻害、例えば、増殖阻害を達成するために必要な化合物Ａ８の濃度を、化合物Ａ８を、セツキシマブおよびＰＤ−１抗体分子の一方または両方と組み合わせて投与する。ある態様において、阻害、例えば、セツキシマブを個別に投与するときよりも低い、増殖阻害を達成するために必要なセツキシマブの濃度は、セツキシマブを、化合物Ａ８およびＰＤ−１抗体分子の一方または両方と組み合わせて投与する。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を個別に投与するときよりも低い、阻害、例えば、増殖阻害を達成するのに必要なＰＤ−１抗体分子の濃度は、ＰＤ−１抗体分子を、セツキシマブおよび化合物Ａ８の一方または両方と組み合わせて投与する。
さらにここに開示されるのは、抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または他の免疫調節剤(例えば、抗ＬＡＧ−３、抗ＰＤ−Ｌ１または抗ＴＩＭ−３抗体分子)および標的抗癌剤、例えば、１以上のタンパク質を標的とする薬剤と組み合わせて用いて、癌を処置する方法である。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子(および所望により他の免疫調節)を、最初に投与し、標的抗癌剤を次に投与する。抗ＰＤ−１抗体分子と標的抗癌剤の投与の間の長さは、例えば、１０分、２０分または３０分、１時間、２時間、４時間、６時間または１２時間または１日、２日、３日、４日、５日、６日または７日またはこの範囲内の任意の間隔であり得る。ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子を、標的抗癌剤を投与する前に、一定期間の間(例えば、１日、２日、３日、４日、５日または６日または１週、２週、４週、８週、１２週、１６週または２０週またはこの範囲内の任意の間隔)、反復投与する。他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子および標的抗癌剤を実質的に同時に投与する。
感染症
他の本発明の方法を、特定の毒素または病原体に曝されている患者の処置に使用する。したがって、本発明の他の面は、対象における感染性疾患を処置する方法であって、該対象に抗ＰＤ−１抗体分子を、該対象が、感染性疾患が処置されるように投与することを含む、方法を提供する。
感染(例えば、急性および／または慢性)の処置において、抗ＰＤ−１抗体分子の投与を、感染に対する刺激性自然宿主免疫防御に加えて、またはその代わりに、慣用の処置と組み合わせ得る。感染に対する自然宿主免疫防御は、炎症、発熱、抗体介在宿主防御、リンホカイン分泌および細胞毒性Ｔ細胞(特にウイルス感染中)を含むＴリンパ球介在宿主防御、補体介在溶解およびオプソニン作用(促進された食作用)および食作用を含むが、これらに限定されない。抗ＰＤ−１抗体分子が機能障害性Ｔ細胞を再活性化する能力は、慢性感染、特に、細胞介在免疫が完全回復に重要であるものの処置に有用である。
上に記載した腫瘍への適応と同様、抗体介在ＰＤ−１遮断を、病原体毒素および自己抗原に対する免疫応答を刺激するために、単独で、または、ワクチンと組み合わせて、アジュバントとして、使用できる。この治療法が特に有用であり得る病原体の例は、現在有効なワクチンがない病原体または慣用のワクチンの有効性が完全に満たない病原体を含む。これらは、ＨＩＶ、肝炎(Ａ、ＢおよびＣ)、インフルエンザ、ヘルペス、ジアルジア属、マラリア、リーシュマニア、スタフィロコッカス・アウレウス、シュードモナス・エルジノーサを含むが、これらに限定されない。ＰＤ−１遮断は、感染の経過中に改変した抗体を提示する、ＨＩＶのような因子による確立された感染に対して特に有用である。これらの新規エピトープは抗ヒトＰＤ−１投与時に異物として認識され、それゆえに、ＰＤ−１を介する負のシグナルにより弱められない強いＴ細胞応答を惹起する。
ウイルス
ウイルス原因の感染に対して、抗ＰＤ−１抗体分子を、ウイルス感染の処置のための標準治療剤の適用と同時に、前にまたは後に、適用することにより組み合わせてよい。このような標準治療はウイルスのタイプにより異なるが、ほとんど全ての場合、該ウイルスに特異的な抗体(例えば、ＩｇＡ、ＩｇＧ)を含むヒト血清の投与が有効であり得る。
方法により処置可能な感染の原因となる病原性ウイルスのいくつかの例は、ＨＩＶ、肝炎(Ａ、ＢまたはＣ)、ヘルペスウイルス(例えば、ＶＺＶ、ＨＳＶ−１、ＨＡＶ−６、ＨＳＶ−ＩＩおよびＣＭＶ、エプスタイン・バーウイルス)、アデノウイルス、インフルエンザウイルス、フラビウイルス、エコーウイルス、ライノウイルス、コクサッキーウイルス、コロナウイルス、呼吸器多核体ウイルス、ムンプスウイルス、ロタウイルス、麻疹ウイルス、風疹ウイルス、パルボウイルス、ワクシニアウイルス、ＨＴＬＶウイルス、デングウイルス、パピローマウイルス、軟属腫ウイルス、ポリオウイルス、狂犬病ウイルス、ＪＣウイルスおよびアルボウイルス脳炎ウイルスを含む。
ある態様において、感染はインフルエンザ感染である。インフルエンザ感染は、発熱、咳、筋肉痛および倦怠感を起こし得て、しばしば季節性で流行する。インフルエンザは、脳炎、心筋心膜炎、グッドパスチャー症候群およびライ症候群のような多数の感染後障害とも関係する。インフルエンザ感染はまた、インフルエンザから回復した患者が、細菌性肺炎を発症するリスクが高くなるように、正常な肺抗細菌防御を抑制する。インフルエンザウイルス表面タンパク質は、変異および組換えに起因する顕著な抗原変異を示す。それゆえに、細胞溶解性Ｔリンパ球は、感染後にウイルスを除去するための、宿主の一次媒体である。インフルエンザは、主にＡ、ＣおよびＣの３タイプに分類される。インフルエンザＡは、ヒトおよび多くの他の動物(例えば、ブタ、ウマ、トリおよびアザラシ)の両者に感染することで独特であり、新型インフルエンザの主原因である。また、細胞が２種の異なるインフルエンザＡ株に感染したとき、２種の親ウイルスタイプの分割されたＲＮＡゲノムが複製中に混合されてハイブリッドレプリカントを創製し、新規エピデミック株をもたらす。インフルエンザＢは動物で複製せず、それゆえに遺伝的変異は少なく、インフルエンザＣは一血清型しか有しない。
最も慣用の治療は、宿主の免疫応答が実際に疾患を排除する間の、感染が原因の症状に対する対症療法である。しかしながら、ある株(例えば、インフルエンザＡ)は、より重篤な病気および死の原因となり得る。インフルエンザＡは、ウイルス複製を阻止する環状アミン阻害剤アマンタジンおよびリマンタジンの投与により、臨床的および予防的両者で処置し得る。しかしながら、これらの薬剤の臨床的有用性は、副作用の比較的高い発生率、狭い抗ウイルススペクトル(インフルエンザＡのみ)およびウイルスが耐性となる可能性により、限定的である主要インフルエンザ表面タンパク質、赤血球凝集素およびノイラミニダーゼに対する血清ＩｇＧ抗体の投与が肺感染を予防でき、一方粘膜ＩｇＡが上部呼吸器管および気管の感染の予防に必要である。インフルエンザに対する現在の最も有効な処置は、ホルマリンまたはβ−プロピオラクトンで不活性化したウイルスの投与を用いるワクチン接種である。
他の態様において、感染は、肝炎感染、例えば、Ｂ型またはＣ型肝炎感染である。
Ｂ型肝炎ウイルス(ＨＢ−Ｖ)は、最も感染性の既知血液媒介病原体である。急性および慢性肝炎および肝臓癌ならびに生涯の慢性感染の主原因である。感染後、ウイルスは肝細胞で複製し、これはその後表面抗原ＨＢｓＡｇを発散もさせる。血清における過剰なＨＢｓＡｇレベルの検出が、Ｂ型肝炎感染の診断の標準法として使用される。急性感染は解消する場合があり、または慢性永続性感染に発展し得る。慢性ＨＢＶに対する現在の処置はα−インターフェロンであり、これは、肝細胞表面上のクラスＩヒト白血球抗原(ＨＬＡ)の発現を増加させ、それにより、細胞毒性Ｔリンパ球による認識を容易にさせる。さらに、ヌクレオシドアナログガンシクロビル、ファムシクロビルおよびラミブジンも、臨床試験におけるＨＢＶ感染の処置に一定の効果を示している。ＨＢＶのさらなる処置は、ペグ化ａ−インターフェロン、アデフォビル、エンテカビルおよびテルビブジンを含む。受動免疫が抗ＨＢｓＡｇ血清抗体の非経口(parental)投与により寄与され得るが、不活性化または組み換えＨＢｓＡｇのワクチン接種も、感染に対する抵抗性を付与する。抗ＰＤ−１抗体分子は、治療的利益のために、Ｂ型肝炎感染に対する慣用の処置と組み合わせ得る。
Ｃ型肝炎ウイルス(ＨＣ−Ｖ)感染は、硬変を生じる慢性形態の肝炎に至り得る。Ｂ型肝炎が原因の感染と症状は類似するが、ＨＢ−Ｖとの明確な対比として、感染個体は１０〜２０年無症候であり得る。抗ＰＤ−１抗体分子を、単剤療法としてまたはＣ型肝炎感染の標準治療と組み合わせて投与できる。例えば、抗ＰＤ−１抗体分子を、ソバルディ(ソホスブビル)、Olysio(シメプレビル)の１以上に加えてリバビリンまたはペグ化インターフェロンと投与できる。インシベック(テラプレビル)またはビクトレリス(ボセプレビル)に加えてリバビリンおよびペグ化インターフェロンを含むレジメンも承認されているが、副作用の増加および処置期間の延長を伴い、それゆえに好ましいレジメンとは考えられない。
ＨＣ−Ｖ感染の慣用の処置は、α−インターフェロンおよびリバビリンの組み合わせの投与を含む。ＨＣ−Ｖ感染の有望な、可能性のある治療はプロテアーゼ阻害剤テラプレビル(ＶＸ−９６０)である。さらなる処置は、抗ＰＤ−１抗体(ＭＤＸ−１１０６、Medarex)、バビツキシマブ(Ｂ２−糖タンパク質Ｉ依存的方法でアニオン性リン脂質ホスファチジルセリンに結合する抗体、Peregrine Pharmaceuticals)、抗ＨＰＶウイルス外被タンパク質Ｅ２抗体(例えば、ＡＴＬ ６８６５Ａｂ−Ａｂ６８＋Ａｂ６５、XTL Pharmaceuticals)およびCivacir(登録商標)(ポリクローナル抗ＨＣＶヒト免疫グロブリン)を含む。本発明の抗ＰＤ−Ｌ１抗体を、治療的利益のために、Ｃ型肝炎感染のためのこれらの処置の１以上と組み合わせ得る。Ｃ型肝炎感染を特異的に処置するために抗ＰＤ−１抗体分子と組み合わせて使用し得るプロテアーゼ、ポリメラーゼおよびＮＳ５Ａ阻害剤は、引用により本明細書に包含させるＵＳ２０１３／００４５２０２号に記載のものを含む。
他の態様において、感染は麻疹ウイルスである。９〜１１日のインキュベーション後、麻疹ウイルスに感染した宿主は、発熱、咳、鼻感冒および結膜炎を生じる。１〜２日内に、紅斑性、斑状丘疹状皮疹が発症し、これは急速に全身に広がる。感染が細胞免疫を抑制もするため、宿主は、中耳炎、肺炎および感染後脳脊髄炎を含む、細菌スーパー感染を発症する大きなリスクがある。急性感染は、特に栄養不良の青年における顕著な罹病率および死亡率と関係する。
麻疹の処置は、暴露後１週間以内に投与された場合でも、非免疫対象における感染を予防できる、貯留ヒトＩｇＧの受動的投与を含む。しかしながら、予めの生存、弱毒化ウイルスでの免疫化が最も有効な処置であり、免疫化群の９５％超で疾患を予防する。このウイルスに一血清型が存在するため、単一免疫化または感染が、概してその後の感染からの障害の保護をもたらす。
感染宿主の少ない割合において、麻疹は、中枢神経系の永続性感染に起因する慢性新構成神経障害である、ＳＳＰＥに発展し得る。ＳＳＰＥは、ビリオン集合および出芽を妨害する欠損を有する麻疹ウイルスのクローン変異体により引き起こされる。患者にとって、ウイルスクリアランスを促進するための抗ＰＤ−１抗体分子でのＴ細胞再活性化が望ましい。
他の態様において、感染はＨＩＶである。ＨＩＶは、Ｔリンパ球、単球−マクロファージ、濾胞性樹状細胞およびランゲルハンス細胞を含むＣＤ４＋細胞を攻撃し、ＣＤ４＋ヘルパー／インデューサー細胞が枯渇する。その結果、宿主は、細胞介在免疫の重篤な欠損を獲得する。ＨＩＶへの感染は少なくとも５０％の個体でＡＩＤＳを起こし、性的接触、感染した血液または血液製剤の投与、感染した精液の人工授精、血液が入った針またはシリンジへの暴露および出生中の感染した母体から幼児への伝染により伝染する。
ＨＩＶに感染した宿主は無症候であるかまたは単核球症に似た急性疾患 − 発熱、頭痛、咽頭炎、倦怠感および発疹を発症し得る。永続性発熱、寝汗、体重減少、不明な下痢、湿疹、乾癬、脂漏性皮膚炎、帯状疱疹、口腔カンジダ症および口腔毛状白板症を含む症状が、免疫機能不全が進むに連れて進み得る。感染がＡＩＤＳに発展した患者において、寄生虫の宿主による日和見感染が共通する。
ＨＩＶの処置は、ヌクレオシドアナログ、ジドブジン(ＡＳＴ)の単独またはジダノシンまたはザルシタビン、ジデオキシイノシン、ジデオキシシチジン、ラミブジン、スタブジンと組み合わせた抗ウイルス治療；；デラビルジン、ネビラピン、ロビリドのような逆転写酵素阻害剤およびサキナビル、リトナビル、インジナビルおよびネルフィナビルのようなプロテイナーゼ阻害剤を含む。抗ＰＤ−１抗体分子は、治療的利益のために、ＨＩＶ感染の慣用の処置と組み合わせ得る。
他の態様において、感染はサイトメガロウイルス(ＣＭＶ)である。ＣＭＶ感染は、しばしば、永続性、不顕性および再発性感染と関係する。ＣＭＶは、単球および顆粒球−単球前駆細胞細胞に感染し、不顕性のままである。ＣＭＶの臨床的症状は、単核球症様症状(すなわち、発熱、腺肥大、倦怠感)および抗生物質に対するアレルギー性皮膚発疹を発症する傾向を含む。ウイルスは直接接触により拡散する。ウイルスは尿、唾液、精液および少ない程度で他の体液に排出される。母体から胎児または新生児におよび輸血および臓器移植によっても伝染は起こり得る。ＣＭＶ感染は、非特異的マイトジェンおよび特異的ＣＭＶ抗原に対する胚発生応答障害、細胞毒性能減少およびＣＤ４＋リンパ球のＣＤ８リンパ球の上昇により特徴付けられる細胞免疫の全般的な機能障害をもたらす。
ＣＭＶ感染の処置は、抗ウイルス剤ガンシクロビル、フォスカーネットおよびシドホビルを含むが、これらの薬物は概して免疫無防備状態患者にしか処方されない。抗ＰＤ−１抗体分子は、治療的利益のために、慣用のサイトメガロウイルス感染の処置と組み合わせ得る。
他の態様において、感染はエプスタイン・バーウイルス(ＥＢＶ)である。ＥＢＶは、永続性および不顕性感染を確立でき、主にＢ細胞を攻撃する。ＥＢＶの感染は、発熱、咽頭炎を含み、しばしば滲出液、全身性リンパ節腫脹および脾腫を伴う、感染性単核球症の臨床状態をもたらす。肝炎も存在し、これは黄疸に発展し得る。
ＥＢＶ感染の典型的処置は症状に対症的であるが、ＥＢＶはバーキットリンパ腫および鼻咽頭癌のようなある種の癌の発症と関係する。それゆえに、これらの合併症となる前のウイルス感染の排除が大きな利益となる。抗ＰＤ−１抗体分子は、治療的利益のために、エプスタイン・バーウイルス感染の慣用の処置と組み合わせ得る。
他の態様において、感染は単純ヘルペスウイルス(ＨＳＶ)である。ＨＳＶは、感染した宿主との直接接触により伝染する。直接感染は無症候であり得るが、概して感染性粒子を含む水疱を生じる。疾患は、ウイルスが不顕性に神経ガングリオンに感染し、その後激増するため、病原が出現および消失する、疾患の活動期のサイクルとして顕在化する。病変は顔面、生殖器、眼および／または手であり得る。ある症例では、感染は脳炎も起こし得る。
ヘルペス感染の処置は、主に、症候的な激増を解消するために指示され、アシクロビル(例えば、Zovirax(登録商標))、バラシクロビル、ファムシクロビル、ペンシクロビルのような全身性抗ウイルス薬およびドコサノール(Abreva(登録商標))、トロマンタジンおよびジラクチンのような局所薬を含む。ヘルペスの不顕性感染の排除は大きな臨床的利益である。抗ＰＤ−１抗体分子を、治療的利益のために、慣用のヘルペスウイルス感染の処置と組み合わせ得る。
他の態様において、感染は、ヒトＴリンパ増殖性ウイルス(ＨＴＬＶ−１、ＨＴＬＶ−２)である。ＨＴＬＶは、性的接触、授乳または汚染血への接触により伝染する。ウイルスは、Ｔｈ１細胞と呼ばれるＴＨ細胞のサブセットを活性化し、その過増殖およびＴｈ１関連サイトカイン(例えば、ＩＦＮ−γおよびＴＮＦ−α)の過産生をもたらす。これが、次にＴｈ２リンパ球抑制およびＴｈ２サイトカイン(例えば、ＩＬ−４、ＩＬ−５、ＩＬ−１０およびＩＬ−１３)産生の減少をもたらし、感染した宿主が、侵入生物排除のためにＴｈ２依存性応答(例えば、寄生虫感染、粘膜および液性抗体の産生)を必要とする適当な免疫応答を開始する能力の減少をもたらす。
ＨＴＬＶ感染は、気管支拡張症、皮膚炎および多微生物敗血症に至るスタフィロコッカス属およびストロンギロイデス属でのスーパー感染に至る日和見感染に至る。ＨＴＬＶ感染はまた成人Ｔ細胞白血病／リンパ腫およびＨＡＭ／ＴＳＰとして知られる進行性上部運動神経疾患にも直接至り得る。ＨＴＬＶ不顕性感染の排除は、大きな臨床的利益である。抗ＰＤ−１抗体分子を、治療的利益のために、ＨＴＬＶ感染の慣用の処置と組み合わせ得る。
他の態様において、感染はヒト乳頭腫ウイルス(ＨＰＶ)である。ＨＰＶは、主にケラチン生成細胞を冒し、皮膚および性器の２態様で生じる。感染は、直接接触および／または性行為を介して起こると考えられる。皮膚および性器ＨＰＶ感染の両者が疣贅および不顕性感染およびある場合、再発性感染を起こし得て、これは、症状を制御し、疣贅の発現を遮断するが、宿主が他者に伝染できるままにする、宿主免疫により制御される。
ＨＰＶでの感染はまた、子宮頸癌、肛門癌、外陰癌、陰茎癌および中咽頭癌のようなある種の癌にも至り得る。ＨＰＶ感染の治癒法は現在知られていないが、現在の処置は、感染領域を攻撃するために免疫系を刺激するイミキモドの局所適用である。ＨＰＶ不顕性感染の排除は、大きな臨床的利益である。本発明の抗ＰＤ−Ｌ１抗体を、治療的利益のために、慣用のＨＰＶ感染の処置と組み合わせ得る。
細菌感染
本発明の方法により処置可能な感染を起こす病原性細菌のいくつかの例は、梅毒、クラミジア、リケッチア性細菌、マイコバクテリア、ブドウ球菌、連鎖球菌、肺炎球菌、髄膜炎菌および淋菌、クレブシエラ、プロテウス、セラチア、シュードモナス、レジオネラ、ジフテリア、サルモネラ、桿菌、コレラ、破傷風、ボツリヌス症、炭疽、ペスト、レプトスピラ症およびライム病細菌を含む。抗ＰＤ−１抗体分子を、前記感染のための既存の処置法と組み合わせて使用できる。例えば、梅毒の処置は、ペニシリン(例えば、ペニシリンＧ)、テトラサイクリン、ドキシサイクリン、セフトリアキソンおよびアジスロマイシンを含む。
ボレリア・ブルグドルフェリが原因のライム病は、ダニ咬傷によりヒトに伝染する。疾患は、最初局所の発疹として顕在化し、倦怠感、発熱、頭痛、肩こりおよび関節痛を含むインフルエンザ様症状が続く。その後の顕在化は、遊走性および多関節型関節炎、頭側神経麻痺および神経根症を伴う神経および心臓合併症、心筋炎および不整脈を含み得る。ライム病のいくつかの症例は永続性となり、三期梅毒に類似して不可逆性損傷をもたらす。ライム病の現在の治療は、主に抗生物質投与を含む。抗生物質耐性株をヒドロキシクロロキンまたはメトトレキサートで処置し得る。神経障害性疼痛を伴う抗生物質難治性患者は、ギャバペンチンで処置できる。ミノサイクリンは、神経学または他の炎症性顕在化を伴う後期／慢性ライム病に役立ち得る。
レリア・レカレンチス、ボレリア・ヘルムシー、ボレリア・タリカテ、ボレリア・パリケリ、ボレリア・ヒスパニカ、ボレリア・ダットニイおよびボレリア・ペルシカのような他の形態のボレリア感染症ならびにレプトスピラ症(例えば、レプトスピラ・インタロガンス)は、血中力価が、肝内閉塞を起こす濃度に達しない限り、概して、自然に解消する。
真菌および寄生虫
本発明の方法により処置可能な感染の原因となる病原性真菌のいくつかの例は、カンジダ(アルビカンス、クルゼイ、グラブラタ、トロピカリスなど)、クリプトコッカス・ネオフォルマンス、アスペルギルス(フミガーツス、ニガーなど)、ケカビ目(ムコール属、アブシディア属、リゾプス属)、スポロトリックス・シェンキイ、ブラストミセス・デルマチチジス、パラコクシジオイデス・ブラジリエンシス、コクシジオイデス・イミチスおよびヒストプラズマ・カプスラーツムを含む。
ここに記載する方法により処置可能な感染の原因となる病原性寄生虫のいくつかの例は、赤痢アメーバ、大腸バランチジウム、フォーラーネグレリア、アカントアメーバ属、ランブル鞭毛虫、クリプトスポリジウム属、ニューモシスチス・カリニ、プラスモディウム・ビバックス、ネズミバベシア、トリパノソーマ・ブルセイ、トリパノソーマ・クルージ、ドノバンリーシュマニア、トキソプラズマ・ゴンディおよびブラジル鉤虫を含む。
さらなる組み合わせ治療
ＰＤ−１抗体分子と１以上の第二治療的の組み合わせをここに提供する。この章に記載する組み合わせの多くが癌の処置に有用であるが、他の適応症も記載する。この章は、抗ＰＤ−１抗体分子と、所望により１以上の免疫調節剤(例えば、抗ＴＩＭ−３抗体分子、抗ＬＡＧ−３抗体分子または抗ＰＤ−Ｌ１抗体分子)の組み合わせの、表７に記載する薬剤の１種以上との組み合わせを記載する。下記の組み合わせにおいて、ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は次のものを含む。
(ａ)配列番号４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(ＶＨ)；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(ＶＬ)；
(ｂ)配列番号１から選択されるＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列；配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列；および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ；
(ｃ)配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ；または
(ｄ)配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列；配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列；および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ。
下記の組み合わせにおいて、他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子は、(ｉ)配列番号１、配列番号４または配列番号２２４から選択されるＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列；配列番号２または配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列；および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(ＶＨ)；および(ii)配列番号１０または配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１または配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２または配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(ＶＬ)を含む。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独でまたは２以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＫＣ阻害剤、ソトラスタウリン(化合物Ａ１)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００５／０３９５４９号に開示する化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＰＫＣ阻害剤は、ソトラスタウリン(化合物Ａ１)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００５／０３９５４９号に開示する化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子をソトラスタウリン(化合物Ａ１)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００５／０３９５４９号に記載の化合物と組み合わせて使用して、癌、黒色腫、非ホジキンリンパ腫、炎症性腸疾患、移植片拒絶、眼障害または乾癬のような障害を処置する。
ある態様において、ソトラスタウリン(化合物Ａ１)を、約２０〜６００mg、例えば、約２００〜約６００mg、約５０mg〜約４５０mg、約１００mg〜４００mg、約１５０mg〜３５０mgまたは約２００mg〜３００mg、例えば、約５０mg、１００mg、１５０mg、２００mg、３００mg、４００mg、５００mgまたは６００mgの用量で投与する。投薬スケジュールは、例えば、隔日から連日、１日２回または３回まで変化し得る。
ある態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または、１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＢＣＲ−ＡＢＬ阻害剤、TASIGNA(化合物Ａ２)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００４／００５２８１に開示する化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＢＣＲ−ＡＢＬ阻害剤はTASIGNAまたはＰＣＴ公開ＷＯ２００４／００５２８１に開示する化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、TASIGNA(化合物Ａ２)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００４／００５２８１に記載の化合物と組み合わせて使用して、リンパ性白血病、パーキンソン病、神経性癌、黒色腫、消化性／消化器癌、結腸直腸癌、骨髄球性白血病、頭頸部癌または肺高血圧のような障害を処置する。
ある態様において、ＢＣＲ−ＡＢＬ阻害剤またはTASIGNAを、約３００mg(例えば、１日２回、例えば、新たに診断されたＰｈ＋ＣＭＬ−ＣＰに対して)または約４００mg、例えば、１日２回、例えば、耐性または不耐性Ｐｈ＋ＣＭＬ−ＣＰおよびＣＭＬ−ＡＰに対して)の用量で投与する。ＢＣＲ−ＡＢＬ阻害剤または化合物Ａ２を、約３００〜４００mgの用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、５−(２,４−ジヒドロキシ−５−イソプロピルフェニル)−Ｎ−エチル−４−(４−(モルホリノメチル)フェニル)イソキサゾール−３−カルボキサミド(化合物Ａ３)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／０６０９３７号またはＷＯ２００４／０７２０５１号に開示する化合物のようなＨＳＰ９０阻害剤と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＨＳＰ９０阻害剤は、５−(２,４−ジヒドロキシ−５−イソプロピルフェニル)−Ｎ−エチル−４−(４−(モルホリノメチル)フェニル)イソキサゾール−３−カルボキサミド(化合物Ａ３)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／０６０９３７号またはＷＯ２００４／０７２０５１号に開示する化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、５−(２,４−ジヒドロキシ−５−イソプロピルフェニル)−Ｎ−エチル−４−(４−(モルホリノメチル)フェニル)イソキサゾール−３−カルボキサミド(化合物Ａ３)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／０６０９３７号またはＷＯ２００４／０７２０５１号に記載の化合物と組み合わせて使用して、癌、多発性骨髄腫、非小細胞性肺癌、リンパ腫、胃癌、乳癌、消化性／消化器癌、膵臓癌、結腸直腸癌、固形腫瘍または造血発生障害のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＰＩ３Ｋおよび／またはｍＴＯＲの阻害剤、ダクトリシブ(化合物Ａ４)または８−(６−メトキシ−ピリジン−３−イル)−３−メチル−１−(４−ピペラジン−１−イル−３−トリフルオロメチル−フェニル)−１,３−ジヒドロ−イミダゾ[４,５−ｃ]キノリン−２−オン(化合物Ａ４１)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００６／１２２８０６号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＰＩ３Ｋおよび／またはｍＴＯＲ阻害剤は、ダクトリシブ(化合物Ａ４)、８−(６−メトキシ−ピリジン−３−イル)−３−メチル−１−(４−ピペラジン−１−イル−３−トリフルオロメチル−フェニル)−１,３−ジヒドロ−イミダゾ[４,５−ｃ]キノリン−２−オン(化合物Ａ４１)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００６／１２２８０６号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子をダクトリシブ(化合物Ａ４)、８−(６−メトキシ−ピリジン−３−イル)−３−メチル−１−(４−ピペラジン−１−イル−３−トリフルオロメチル−フェニル)−１,３−ジヒドロ−イミダゾ[４,５−ｃ]キノリン−２−オン(化合物Ａ４１)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００６／１２２８０６に記載の化合物と組み合わせて使用して、癌、前立腺癌、白血病(例えば、リンパ性白血病)、乳癌、脳腫瘍、膀胱癌、膵臓癌、腎臓癌、固形腫瘍または肝臓癌のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＦＧＦＲ阻害剤、３−(２,６−ジクロロ−３,５−ジメトキシフェニル)−１−(６−((４−(４−エチルピペラジン−１−イル)フェニル)アミノ)ピリミジン−４−イル)−１−メチル尿素(化合物Ａ５)またはＵＳ特許８,５５２,００２号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＦＧＦＲ阻害剤は３−(２,６−ジクロロ−３,５−ジメトキシフェニル)−１−(６−((４−(４−エチルピペラジン−１−イル)フェニル)アミノ)ピリミジン−４−イル)−１−メチル尿素(化合物Ａ５)またはＵＳ特許８,５５２,００２号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を化合物Ａ５またはＵＳ８,５５２,００２号に記載された化合物と組み合わせて使用して、消化性／消化器癌、造血器癌または固形腫瘍のような障害を処置する。
ある態様において、ＦＧＦＲ阻害剤または３−(２,６−ジクロロ−３,５−ジメトキシフェニル)−１−(６−((４−(４−エチルピペラジン−１−イル)フェニル)アミノ)ピリミジン−４−イル)−１−メチル尿素(化合物Ａ５)を、約１００〜１２５mg(例えば、１日あたり)、例えば、約１００mgまたは約１２５mgの用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＰＩ３Ｋ阻害剤、ブパルリシブ(化合物Ａ６)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０８４７８６号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＰＩ３Ｋ阻害剤はブパルリシブ(化合物Ａ６)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０８４７８６号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、ブパルリシブ(化合物Ａ６)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０８４７８６号に開示の化合物と組み合わせて使用して、前立腺癌、非小細胞性肺癌、内分泌癌、白血病、卵巣癌、黒色腫、膀胱癌、乳癌、女性生殖器系癌、消化性／消化器癌、結腸直腸癌、多形神経膠芽腫、固形腫瘍、非ホジキンリンパ腫、造血発生障害または頭頸部癌のような障害を処置する。
ある態様において、ＰＩ３Ｋ阻害剤またはブパルリシブ(化合物Ａ６)を、約１００mg(例えば、１日あたり)の用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＦＧＦＲ阻害剤、８−(２,６−ジフルオロ−３,５−ジメトキシフェニル)−Ｎ−(４−((ジメチルアミノ)メチル)−１Ｈ−イミダゾール−２−イル)キノキサリン−５−カルボキサミド(化合物Ａ７)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００９／１４１３８６号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＦＧＦＲ阻害剤は、８−(２,６−ジフルオロ−３,５−ジメトキシフェニル)−Ｎ−(４−((ジメチルアミノ)メチル)−１Ｈ−イミダゾール−２−イル)キノキサリン−５−カルボキサミド(化合物Ａ７)であるまたはＰＣＴ公開ＷＯ２００９／１４１３８６号に開示の化合物。ある態様において、ＦＧＦＲ阻害剤は、８−(２,６−ジフルオロ−３,５−ジメトキシフェニル)−Ｎ−(４−((ジメチルアミノ)メチル)−１Ｈ−イミダゾール−２−イル)キノキサリン−５−カルボキサミド(化合物Ａ７)である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を８−(２,６−ジフルオロ−３,５−ジメトキシフェニル)−Ｎ−(４−((ジメチルアミノ)メチル)−１Ｈ−イミダゾール−２−イル)キノキサリン−５−カルボキサミド(化合物Ａ７)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００９／１４１３８６号に開示の化合物と組み合わせて使用して、血管形成により特徴付けられる癌のような障害を処置する。
ある態様において、ＦＧＦＲ阻害剤または８−(２,６−ジフルオロ−３,５−ジメトキシフェニル)−Ｎ−(４−((ジメチルアミノ)メチル)−１Ｈ−イミダゾール−２−イル)キノキサリン−５−カルボキサミド(化合物Ａ７)を、例えば、約３mg〜約５ｇ、より好ましくは約１０mg〜約１.５ｇ／人／日の用量で、所望により、例えば、同じサイズである１〜３の単一用量に分けて投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＰＩ３Ｋ阻害剤、(Ｓ)−Ｎ１−(４−メチル−５−(２−(１,１,１−トリフルオロ−２−メチルプロパン−２−イル)ピリジン−４−イル)チアゾール−２−イル)ピロリジン−１,２−ジカルボキサミド(化合物Ａ８)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／０２９０８２号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＰＩ３Ｋ阻害剤は(Ｓ)−Ｎ１−(４−メチル−５−(２−(１,１,１−トリフルオロ−２−メチルプロパン−２−イル)ピリジン−４−イル)チアゾール−２−イル)ピロリジン−１,２−ジカルボキサミド(化合物Ａ８)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／０２９０８２号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子(Ｓ)−Ｎ１−(４−メチル−５−(２−(１,１,１−トリフルオロ−２−メチルプロパン−２−イル)ピリジン−４−イル)チアゾール−２−イル)ピロリジン−１,２−ジカルボキサミド(化合物Ａ８)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／０２９０８２号に開示の化合物と組み合わせて使用して、胃癌、乳癌、膵臓癌、消化性／消化器癌、固形腫瘍および頭頸部癌のような障害を処置する。
ある態様において、ＰＩ３Ｋ阻害剤または(Ｓ)−Ｎ１−(４−メチル−５−(２−(１,１,１−トリフルオロ−２−メチルプロパン−２−イル)ピリジン−４−イル)チアゾール−２−イル)ピロリジン−１,２−ジカルボキサミド(化合物Ａ８)を、約１５０〜３００mg、２００〜３００mg、２００〜４００mgまたは３００〜４００mg(例えば、１日あたり)、例えば、約２００mg、３００mgまたは４００mgの用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、シトクロムＰ４５０阻害剤(例えば、ＣＹＰ１７阻害剤)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／１４９７５５号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、シトクロムＰ４５０阻害剤(例えば、ＣＹＰ１７阻害剤)は、ＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／１４９７５５号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、ＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／１４９７５５号に開示の化合物と組み合わせて処置して、前立腺癌を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＨＤＭ２阻害剤、(Ｓ)−１−(４−クロロフェニル)−７−イソプロポキシ−６−メトキシ−２−(４−(メチル(((１ｒ,４Ｓ)−４−(４−メチル−３−オキソピペラジン−１−イル)シクロヘキシル)メチル)アミノ)フェニル)−１,２−ジヒドロイソキノリン−３(４Ｈ)−オン(化合物Ａ１０)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１１／０７６７８６に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＨＤＭ２阻害剤は、(Ｓ)−１−(４−クロロフェニル)−７−イソプロポキシ−６−メトキシ−２−(４−(メチル(((１ｒ,４Ｓ)−４−(４−メチル−３−オキソピペラジン−１−イル)シクロヘキシル)メチル)アミノ)フェニル)−１,２−ジヒドロイソキノリン−３(４Ｈ)−オン(化合物Ａ１０)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１１／０７６７８６に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を(Ｓ)−１−(４−クロロフェニル)−７−イソプロポキシ−６−メトキシ−２−(４−(メチル(((１ｒ,４Ｓ)−４−(４−メチル−３−オキソピペラジン−１−イル)シクロヘキシル)メチル)アミノ)フェニル)−１,２−ジヒドロイソキノリン−３(４Ｈ)−オン(化合物Ａ１０)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１１／０７６７８６号に開示の化合物と組み合わせて使用して、固形腫瘍のような障害を処置する。
ある態様において、ＨＤＭ２阻害剤または(Ｓ)−１−(４−クロロフェニル)−７−イソプロポキシ−６−メトキシ−２−(４−(メチル(((１ｒ,４Ｓ)−４−(４−メチル−３−オキソピペラジン−１−イル)シクロヘキシル)メチル)アミノ)フェニル)−１,２−ジヒドロイソキノリン−３(４Ｈ)−オン(化合物Ａ１０)を、約４００〜７００mgの用量で、例えば、週に２回、または、２週投与、１週休薬で投与する。ある態様において、用量は約４００mg、５００mg、６００mgまたは７００mg；約４００〜５００mg、５００〜６００mgまたは６００〜７００mgであり、例えば、週に３回投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、鉄キレート剤、デフェラシロクス(別名ＥＸＪＡＤＥ；化合物Ａ１１)または化合物ＰＣＴ公開ＷＯ１９９７／０４９３９５号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、鉄キレート剤はデフェラシロクスまたは化合物ＰＣＴ公開ＷＯ１９９７／０４９３９５号に開示の化合物である。ある態様において、鉄キレート剤はデフェラシロクス(化合物Ａ１１)である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、デフェラシロクス(化合物Ａ１１)または化合物ＰＣＴ公開ＷＯ１９９７／０４９３９５号に開示の化合物と組み合わせて使用して、鉄過負荷、ヘモクロマトーシスまたは骨髄異形成を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、アロマターゼ阻害剤、レトロゾール(別名フェマーラ；化合物Ａ１２)またはＵＳ４,９７８,６７２号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、アロマターゼ阻害剤は、レトロゾール(化合物Ａ１２)または米国特許４,９７８,６７２号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子をレトロゾール(化合物Ａ１２)または米国特許４,９７８,６７２号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌、平滑筋肉腫、子宮内膜癌、乳癌、女性生殖器系癌またはホルモン欠乏のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＰＩ３Ｋ阻害剤、例えば、汎ＰＩ３Ｋ阻害剤、(４Ｓ,５Ｒ)−３−(２’−アミノ−２−モルホリノ−４’−(トリフルオロメチル)−[４,５’−ビピリミジン]−６−イル)−４−(ヒドロキシメチル)−５−メチルオキサゾリジン−２−オン(化合物Ａ１３)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／１２４８２６号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＰＩ３Ｋ阻害剤は、(４Ｓ,５Ｒ)−３−(２’−アミノ−２−モルホリノ−４’−(トリフルオロメチル)−[４,５’−ビピリミジン]−６−イル)−４−(ヒドロキシメチル)−５−メチルオキサゾリジン−２−オン(化合物Ａ１３)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／１２４８２６号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、(４Ｓ,５Ｒ)−３−(２’−アミノ−２−モルホリノ−４’−(トリフルオロメチル)−[４,５’−ビピリミジン]−６−イル)−４−(ヒドロキシメチル)−５−メチルオキサゾリジン−２−オン(化合物Ａ１３)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／１２４８２６号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌または進行型固形腫瘍のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ｐ５３阻害剤および／またはｐ５３／Ｍｄｍ２相互作用、(Ｓ)−５−(５−クロロ−１−メチル−２−オキソ−１,２−ジヒドロピリジン−３−イル)−６−(４−クロロフェニル)−２−(２,４−ジメトキシピリミジン−５−イル)−１−イソプロピル−５,６−ジヒドロピロロ[３,４−ｄ]イミダゾール−４(１Ｈ)−オン(化合物Ａ１４)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／１１１１０５号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ｐ５３および／またはｐ５３／Ｍｄｍ２相互作用阻害剤は、(Ｓ)−５−(５−クロロ−１−メチル−２−オキソ−１,２−ジヒドロピリジン−３−イル)−６−(４−クロロフェニル)−２−(２,４−ジメトキシピリミジン−５−イル)−１−イソプロピル−５,６−ジヒドロピロロ[３,４−ｄ]イミダゾール−４(１Ｈ)−オン(化合物Ａ１４)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／１１１１０５号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、(Ｓ)−５−(５−クロロ−１−メチル−２−オキソ−１,２−ジヒドロピリジン−３−イル)−６−(４−クロロフェニル)−２−(２,４−ジメトキシピリミジン−５−イル)−１−イソプロピル−５,６−ジヒドロピロロ[３,４−ｄ]イミダゾール−４(１Ｈ)−オン(化合物Ａ１４)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／１１１１０５号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌または軟組織肉腫のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＣＳＦ−１Ｒチロシンキナーゼ阻害剤、４−((２−(((１Ｒ,２Ｒ)−２−ヒドロキシシクロヘキシル)アミノ)ベンゾ[ｄ]チアゾール−６−イル)オキシ)−Ｎ−メチルピコリンアミド(化合物Ａ１５)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００５／０７３２２４号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＣＳＦ−１Ｒチロシンキナーゼ阻害剤は、４−((２−(((１Ｒ,２Ｒ)−２−ヒドロキシシクロヘキシル)アミノ)ベンゾ[ｄ]チアゾール−６−イル)オキシ)−Ｎ−メチルピコリンアミド(化合物Ａ１５)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００５／０７３２２４号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、４−((２−(((１Ｒ,２Ｒ)−２−ヒドロキシシクロヘキシル)アミノ)ベンゾ[ｄ]チアゾール−６−イル)オキシ)−Ｎ−メチルピコリンアミド(化合物Ａ１５)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００５／０７３２２４号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、メシル酸イマチニブ(別名GLEEVEC；化合物Ａ１６)またはＰＣＴ公開ＷＯ１９９９／００３８５４号に開示の化合物のようなアポトーシスインデューサーおよび／または血管形成阻害剤と組み合わせて使用して、障害、例えば、記載した障害を処置する。ある態様において、アポトーシスインデューサーおよび／または血管形成阻害剤は、メシル酸イマチニブ(化合物Ａ１６)またはＰＣＴ公開ＷＯ１９９９／００３８５４号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子をメシル酸イマチニブ(化合物Ａ１６)またはＰＣＴ公開ＷＯ１９９９／００３８５４号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌、多発性骨髄腫、前立腺癌、非小細胞性肺癌、リンパ腫、胃癌、黒色腫、乳癌、膵臓癌、消化性／消化器癌、結腸直腸癌、多形神経膠芽腫、肝臓癌、頭頸部癌、喘息、多発性硬化症、アレルギー、アルツハイマー型認知症、筋萎縮性側索硬化症またはリウマチ性関節炎のような障害を処置する。
ある態様において、メシル酸イマチニブ(化合物Ａ１６)を、約１００〜１０００mg、例えば、約２００mg〜８００mg、約３００mg〜７００mgまたは約４００mg〜６００mg、例えば、約２００mg、３００mg、４００mg、５００mg、６００mgまたは７００mgの用量で投与する。投薬スケジュールは、例えば、隔日から連日、１日２回または３回まで変化し得る。ある態様において、メシル酸イマチニブを、１日あたり約１００mg〜６００mg、例えば、１日あたり約１００mg、２００mg、２６０mg、３００mg、４００mgまたは６００mgの用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＪＡＫ阻害剤、２−フルオロ−Ｎ−メチル−４−(７−(キノリン−６−イルメチル)イミダゾ[１,２−ｂ][１,２,４]トリアジン−２−イル)ベンズアミド(化合物Ａ１７)またはその二塩酸塩またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０７０５１４号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＪＡＫ阻害剤は２−フルオロ−Ｎ−メチル−４−(７−(キノリン−６−イルメチル)イミダゾ[１,２−ｂ][１,２,４]トリアジン−２−イル)ベンズアミド(化合物Ａ１７)またはその二塩酸塩またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０７０５１４号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を２−フルオロ−Ｎ−メチル−４−(７−(キノリン−６−イルメチル)イミダゾ[１,２−ｂ][１,２,４]トリアジン−２−イル)ベンズアミド(化合物Ａ１７)またはその二塩酸塩またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０７０５１４号に開示の化合物と組み合わせて使用して、結腸直腸癌、骨髄球性白血病、造血器癌、自己免疫性疾患、非ホジキンリンパ腫または血小板血症のような障害を処置する。
ある態様において、ＪＡＫ阻害剤または２−フルオロ−Ｎ−メチル−４−(７−(キノリン−６−イルメチル)イミダゾ[１,２−ｂ][１,２,４]トリアジン−２−イル)ベンズアミド(化合物Ａ１７)またはその二塩酸塩を、約４００〜６００mg(例えば、１日あたり)、例えば、約４００mg、５００mgまたは６００mgまたは約４００〜５００mgまたは５００〜６００mgの用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＪＡＫ阻害剤、リン酸ルキソリチニブ(別名ＪＡＫＡＦＩ；化合物Ａ１８)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０７０５１４号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＪＡＫ阻害剤はリン酸ルキソリチニブ(化合物Ａ１８)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０７０５１４号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子をリン酸ルキソリチニブ(化合物Ａ１８)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０７０５１４号に開示の化合物と組み合わせて使用して、前立腺癌、リンパ性白血病、多発性骨髄腫、リンパ腫、肺癌、白血病、カヘキシー、乳癌、膵臓癌、リウマチ性関節炎、乾癬、結腸直腸癌、骨髄球性白血病、造血器癌、自己免疫性疾患、非ホジキンリンパ腫または血小板血症のような障害を処置する。
ある態様において、ＪＡＫ阻害剤またはリン酸ルキソリチニブ(化合物Ａ１８)を、例えば１日２回、約１５〜２５mgの用量で投与する。ある態様において、用量は、約１５mg、２０mgまたは２５mgまたは約１５〜２０mgまたは２０〜２５mgである。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、デアセチラーゼ(ＤＡＣ)阻害剤、パノビノスタット(化合物Ａ１９)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１４／０７２４９３に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＤＡＣ阻害剤は、パノビノスタット(化合物Ａ１９)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１４／０７２４９３に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子をパノビノスタット(化合物Ａ１９)、ＰＣＴ公開ＷＯ２０１４／０７２４９３に開示の化合物と組み合わせて使用して、小細胞肺癌、呼吸器／胸部癌、前立腺癌、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群、骨癌、非小細胞性肺癌、内分泌癌、リンパ腫、神経性癌、白血病、ＨＩＶ／ＡＩＤＳ、免疫障害、移植片拒絶、胃癌、黒色腫、乳癌、膵臓癌、結腸直腸癌、多形神経膠芽腫、骨髄球性白血病、造血器癌、腎臓癌、非ホジキンリンパ腫、頭頸部癌、造血発生障害または肝臓癌のような障害を処置する。
ある態様において、ＤＡＣ阻害剤またはパノビノスタット(化合物Ａ１９)を、約２０mg(例えば、１日あたり)の用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、シトクロムＰ４５０(例えば、１１Ｂ２)、アルドステロンまたは血管形成の１以上の阻害剤、オシロドロスタット(化合物Ａ２０)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０２４９４５号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、シトクロムＰ４５０(例えば、１１Ｂ２)、アルドステロンまたは血管形成の１以上の阻害剤は、オシロドロスタット(化合物Ａ２０)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０２４９４５号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子をオシロドロスタット(化合物Ａ２０)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０２４９４５号に開示の化合物と組み合わせて使用して、クッシング症候群、高血圧または心不全治療のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＩＡＰ阻害剤、(Ｓ)−Ｎ−((Ｓ)−１−シクロヘキシル−２−((Ｓ)−２−(４−(４−フルオロベンゾイル)チアゾール−２−イル)ピロリジン−１−イル)−２−オキソエチル)−２−(メチルアミノ)プロパンアミド(化合物Ａ２１)またはＵＳ８,５５２,００３号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＩＡＰ阻害剤は、(Ｓ)−Ｎ−((Ｓ)−１−シクロヘキシル−２−((Ｓ)−２−(４−(４−フルオロベンゾイル)チアゾール−２−イル)ピロリジン−１−イル)−２−オキソエチル)−２−(メチルアミノ)プロパンアミド(化合物Ａ２１)またはＵＳ特許８,５５２,００３号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を(Ｓ)−Ｎ−((Ｓ)−１−シクロヘキシル−２−((Ｓ)−２−(４−(４−フルオロベンゾイル)チアゾール−２−イル)ピロリジン−１−イル)−２−オキソエチル)−２−(メチルアミノ)プロパンアミド(化合物Ａ２１)またはＵＳ特許８,５５２,００３号に開示の化合物と組み合わせて使用して、多発性骨髄腫、乳癌、卵巣癌、膵臓癌または造血発生障害のような障害を処置する。
ある態様において、ＩＡＰ阻害剤または(Ｓ)−Ｎ−((Ｓ)−１−シクロヘキシル−２−((Ｓ)−２−(４−(４−フルオロベンゾイル)チアゾール−２−イル)ピロリジン−１−イル)−２−オキソエチル)−２−(メチルアミノ)プロパンアミド(化合物Ａ２１)またはＵＳ８,５５２,００３号に開示の化合物を、例えば、週に１回、約１８００mgの用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、スムーズンド(ＳＭＯ)阻害剤、リン酸ソニデギブ(化合物Ａ２２)、(Ｒ)−２−(５−(４−(６−ベンジル−４,５−ジメチルピリダジン−３−イル)−２−メチルピペラジン−１−イル)ピラジン−２−イル)プロパン−２−オール(化合物Ａ２５)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／１３１２０１号またはＷＯ２０１０／００７１２０号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＳＭＯ阻害剤は、リン酸ソニデギブ(化合物Ａ２２)、(Ｒ)−２−(５−(４−(６−ベンジル−４,５−ジメチルピリダジン−３−イル)−２−メチルピペラジン−１−イル)ピラジン−２−イル)プロパン−２−オール(化合物Ａ２５)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／１３１２０１号またはＷＯ２０１０／００７１２０号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、リン酸ソニデギブ(化合物Ａ２２)、(Ｒ)−２−(５−(４−(６−ベンジル−４,５−ジメチルピリダジン−３−イル)−２−メチルピペラジン−１−イル)ピラジン−２−イル)プロパン−２−オール(化合物Ａ２５)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／１３１２０１号またはＷＯ２０１０／００７１２０号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌、髄芽腫、小細胞肺癌、前立腺癌、基底細胞癌、膵臓癌または炎症のような障害を処置する。
ある態様において、リン酸ソニデギブ(化合物Ａ２２)を、約２０〜５００mg、例えば、約４０mg〜４００mg、約５０mg〜３００mgまたは約１００mg〜２００mg、例えば、約５０mg、１００mg、１５０mg、２００mg、２５０mgまたは３００mgの用量で投与する。投薬スケジュールは、例えば、隔日から連日、１日２回または３回まで変化し得る。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、Ａｌｋ阻害剤、セリチニブ(別名ZYKADIA；化合物Ａ２３)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／１３１２０１に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、Ａｌｋ阻害剤は、セリチニブ(化合物Ａ２３)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／１３１２０１に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子をセリチニブ(化合物Ａ２３)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／１３１２０１に開示の化合物と組み合わせて使用して、非小細胞性肺癌または固形腫瘍のような障害を処置する。
ある態様において、Ａｌｋ阻害剤またはセリチニブ(化合物Ａ２３)を、約７５０mgの用量で、例えば、１日１回投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＪＡＫおよび／またはＣＤＫ４／６阻害剤、７−シクロペンチル−Ｎ,Ｎ−ジメチル−２−((５−(ピペラジン−１−イル)ピリジン−２−イル)アミノ)−７Ｈ−ピロロ[２,３−ｄ]ピリミジン−６−カルボキサミド(化合物Ａ２４)またはＵＳ特許８,４１５,３５５号またはＵＳ特許８,６８５,９８０号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＪＡＫおよび／またはＣＤＫ４／６阻害剤は、７−シクロペンチル−Ｎ,Ｎ−ジメチル−２−((５−(ピペラジン−１−イル)ピリジン−２−イル)アミノ)−７Ｈ−ピロロ[２,３−ｄ]ピリミジン−６−カルボキサミド(化合物Ａ２４)またはＵＳ特許８,４１５,３５５号またはＵＳ特許８,６８５,９８０号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を７−シクロペンチル−Ｎ,Ｎ−ジメチル−２−((５−(ピペラジン−１−イル)ピリジン−２−イル)アミノ)−７Ｈ−ピロロ[２,３−ｄ]ピリミジン−６−カルボキサミド(化合物Ａ２４)またはＵＳ８,４１５,３５５号またはＵＳ８,６８５,９８０号に開示の化合物と組み合わせて使用して、リンパ腫、神経性癌、黒色腫、乳癌または固形腫瘍のような障害を処置する。
ある態様において、ＪＡＫおよび／またはＣＤＫ４／６阻害剤または７−シクロペンチル−Ｎ,Ｎ−ジメチル−２−((５−(ピペラジン−１−イル)ピリジン−２−イル)アミノ)−７Ｈ−ピロロ[２,３−ｄ]ピリミジン−６−カルボキサミド(化合物Ａ２４)を、例えば、１日あたり、約２００〜６００mgの用量で投与する。ある態様において、本化合物を、約２００mg、３００mg、４００mg、５００mgまたは６００mgまたは約２００〜３００mg、３００〜４００mg、４００〜５００mgまたは５００〜６００mgの用量で投与する。
他の態様において、抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、プロラクチン受容体(ＰＲＬＲ)阻害剤、ＵＳ特許７,８６７,４９３号に開示のヒトモノクローナル抗体分子(化合物Ａ２６)と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＰＲＬＲ阻害剤は、ＵＳ７,８６７,４９３号に開示のヒトモノクローナル抗体(化合物Ａ２６)である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、ＵＳ特許７,８６７,４９３号に記載のヒトモノクローナル抗体分子(化合物Ａ２６)と組み合わせて使用して、癌、前立腺癌または乳癌のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＰＩＭキナーゼ阻害剤、Ｎ−(４−((１Ｒ,３Ｓ,５Ｓ)−３−アミノ−５−メチルシクロヘキシル)ピリジン−３−イル)−６−(２,６−ジフルオロフェニル)−５−フルオロピコリンアミド(化合物Ａ２７)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／０２６１２４号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＰＩＭキナーゼ阻害剤は、Ｎ−(４−((１Ｒ,３Ｓ,５Ｓ)−３−アミノ−５−メチルシクロヘキシル)ピリジン−３−イル)−６−(２,６−ジフルオロフェニル)−５−フルオロピコリンアミド(化合物Ａ２７)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／０２６１２４号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子をＮ−(４−((１Ｒ,３Ｓ,５Ｓ)−３−アミノ−５−メチルシクロヘキシル)ピリジン−３−イル)−６−(２,６−ジフルオロフェニル)−５−フルオロピコリンアミド(化合物Ａ２７)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／０２６１２４号に開示の化合物と組み合わせて使用して、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群、骨髄球性白血病または非ホジキンリンパ腫のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、Ｗｎｔシグナル伝達阻害剤、２−(２’,３−ジメチル−[２,４’−ビピリジン]−５−イル)−Ｎ−(５−(ピラジン−２−イル)ピリジン−２−イル)アセトアミド(化合物Ａ２８)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／１０１８４９に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、Ｗｎｔシグナル伝達阻害剤は、２−(２’,３−ジメチル−[２,４’−ビピリジン]−５−イル)−Ｎ−(５−(ピラジン−２−イル)ピリジン−２−イル)アセトアミド(化合物Ａ２８)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／１０１８４９に開示の化合物である。ある態様において、Ｗｎｔシグナル伝達阻害剤は、２−(２’,３−ジメチル−[２,４’−ビピリジン]−５−イル)−Ｎ−(５−(ピラジン−２−イル)ピリジン−２−イル)アセトアミド(化合物Ａ２８)である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を２−(２’,３−ジメチル−[２,４’−ビピリジン]−５−イル)−Ｎ−(５−(ピラジン−２−イル)ピリジン−２−イル)アセトアミド(化合物Ａ２８)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／１０１８４９に開示の化合物と組み合わせて使用して、固形腫瘍(例えば、頭頸部癌、扁平上皮細胞癌、乳癌、膵臓癌または結腸癌)のような障害を処置する。
ある態様において、２−(２’,３−ジメチル−[２,４’−ビピリジン]−５−イル)−Ｎ−(５−(ピラジン−２−イル)ピリジン−２−イル)アセトアミド(化合物Ａ２８)を、約１〜５０mg、例えば、約２mg〜４５mg、約３mg〜４０mg、約５mg〜３５mg、５mg〜１０mgまたは約１０mg〜３０mg、例えば、約２mg、５mg、１０mg、２０mg、３０mgまたは４０mgの用量で投与する。投薬スケジュールは、例えば、隔日から連日、１日２回または３回まで変化し得る。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＢＲＡＦ阻害剤、エンコラフェニブ(化合物Ａ２９)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１１／０２５９２７号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＢＲＡＦ阻害剤は、エンコラフェニブ(化合物Ａ２９)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１１／０２５９２７号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、エンコラフェニブ(化合物Ａ２９)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１１／０２５９２７号に開示の化合物と組み合わせて使用して、非小細胞性肺癌、黒色腫または結腸直腸癌のような障害を処置する。
ある態様において、ＢＲＡＦ阻害剤またはエンコラフェニブ(化合物Ａ２９)を、例えば、１日あたり、約２００〜３００mg、２００〜４００mgまたは３００〜４００mgの用量で、投与する。ある態様において、本化合物を、約２００mg、約３００mgまたは約４００mgの用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＣＤＫ４／６阻害剤、７−シクロペンチル−Ｎ,Ｎ−ジメチル−２−((５−((１Ｒ,６Ｓ)−９−メチル−４−オキソ−３,９−ジアザビシクロ[４.２.１]ノナン−３−イル)ピリジン−２−イル)アミノ)−７Ｈ−ピロロ[２,３−ｄ]ピリミジン−６−カルボキサミド(化合物Ａ３０)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１１／１０１４０９号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＣＤＫ４／６阻害剤は、７−シクロペンチル−Ｎ,Ｎ−ジメチル−２−((５−((１Ｒ,６Ｓ)−９−メチル−４−オキソ−３,９−ジアザビシクロ[４.２.１]ノナン−３−イル)ピリジン−２−イル)アミノ)−７Ｈ−ピロロ[２,３−ｄ]ピリミジン−６−カルボキサミド(化合物Ａ３０)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１１／１０１４０９号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、Ｎ,Ｎ−ジメチル−２−((５−((１Ｒ,６Ｓ)−９−メチル−４−オキソ−３,９−ジアザビシクロ[４.２.１]ノナン−３−イル)ピリジン−２−イル)アミノ)−７Ｈ−ピロロ[２,３−ｄ]ピリミジン−６−カルボキサミド(化合物Ａ３０)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１１／１０１４０９号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌、マントル細胞リンパ腫、脂肪肉腫、非小細胞性肺癌、黒色腫、扁平上皮細胞食道癌または乳癌のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＨＥＲ３阻害剤、化合物Ａ３１またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１２／０２２８１４に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＨＥＲ３阻害剤は、化合物Ａ３１またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１２／０２２８１４号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、化合物Ａ３１またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１２／０２２８１４号に開示の化合物と組み合わせて使用して、胃癌、食道癌、頭頸部癌、扁平上皮細胞癌、胃癌、乳癌(例えば、転移乳癌)または消化性／消化器癌のような障害を処置する。
ある態様において、化合物Ａ３１は、ヒトモノクローナル抗体分子である。
ある態様において、ＨＥＲ３阻害剤または化合物Ａ３１を、例えば、週に１回(ＱＷ)、約３mg／kg、１０mg／kg、２０mg／kgまたは４０mg／kgの用量で投与する。ある態様において、本化合物を、約３〜１０mg／kg、１０〜２０mg／kgまたは２０〜４０mg／kgの用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＦＧＦＲ２および／またはＦＧＦＲ４阻害剤、化合物Ａ３２または公開ＰＣＴ公開ＷＯ２０１４／１６０１６０号に開示の化合物(例えば、ＦＧＦＲ２および／またはＦＧＦＲ４に対する抗体分子薬物コンジュゲート、例えば、mAb 12425)と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＦＧＦＲ２および／またはＦＧＦＲ４阻害剤は、化合物Ａ３２または公開ＰＣＴ公開ＷＯ２０１４／１６０１６０号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、化合物Ａ３２または表７に記載の化合物と組み合わせて使用して、癌、胃癌、乳癌、横紋筋肉腫、肝臓癌、副腎癌、肺癌、食道癌、結腸癌または子宮内膜癌のような障害を処置する。
ある態様において、化合物Ａ３２は、ＦＧＦＲ２および／またはＦＧＦＲ４に対する抗体分子薬物コンジュゲート、例えば、mAb 12425である。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、Ｍ−ＣＳＦ阻害剤、化合物Ａ３３またはＰＣＴ公開ＷＯ２００４／０４５５３２号に開示の化合物(例えば、Ｍ−ＣＳＦに対する抗体分子またはＦａｂフラグメント)と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、Ｍ−ＣＳＦ阻害剤は、化合物Ａ３３またはＰＣＴ公開ＷＯ２００４／０４５５３２号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、化合物Ａ３３またはＰＣＴ公開ＷＯ２００４／０４５５３２号に記載の化合物と組み合わせて使用して、癌、前立腺癌、乳癌または色素性絨毛結節性滑膜炎(ＰＶＮＳ)のような障害を処置する。
複数の態様において、化合物Ａ３３は、Ｍ−ＣＳＦに対するモノクローナル抗体分子またはそのフラグメント(例えば、Ｆａｂフラグメント)である。複数の態様において、Ｍ−ＣＳＦ阻害剤または化合物Ａ３３を、約１０mg／kgの平均用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＭＥＫ阻害剤、ビニメチニブ(化合物Ａ３４)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００３／０７７９１４号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＭＥＫ阻害剤は、ビニメチニブ(化合物Ａ３４)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００３／０７７９１４号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、ビニメチニブ(化合物Ａ３４)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００３／０７７９１４号に開示の化合物と組み合わせて使用して、非小細胞性肺癌、多システム遺伝子障害、黒色腫、卵巣癌、消化性／消化器癌、リウマチ性関節炎または結腸直腸癌のような障害を処置する。
ある態様において、ＭＥＫ阻害剤またはビニメチニブ(化合物Ａ３４)を、例えば、１日２回、約４５mgの用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ｃ−ＫＩＴ、ヒスタミン遊離、Ｆｌｔ３(例えば、ＦＬＫ２／ＳＴＫ１)またはＰＫＣの１以上の阻害剤、ミドスタウリン(化合物Ａ３５)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００３／０３７３４７に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、阻害剤は、ミドスタウリン(化合物Ａ３５)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００３／０３７３４７に開示の化合物である。ある態様において、ｃ−ＫＩＴ、ヒスタミン遊離、Ｆｌｔ３(例えば、ＦＬＫ２／ＳＴＫ１)またはＰＫＣの１以上の阻害剤は、ミドスタウリンである。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子をミドスタウリン(化合物Ａ３５)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００３／０３７３４７に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌、結腸直腸癌、骨髄球性白血病、骨髄異形成症候群、加齢性黄斑変性症、糖尿病性合併症または皮膚科学的障害のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＴＯＲ阻害剤(例えば、ｍＴＯＲ阻害剤)、エベロリムス(別名AFINITOR；化合物Ａ３６)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１４／０８５３１８に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＴＯＲ阻害剤は、エベロリムス(化合物Ａ３６)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１４／０８５３１８に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、エベロリムス(化合物Ａ３６)と組み合わせて使用して、間質性肺疾患、小細胞肺癌、呼吸器／胸部癌、前立腺癌、多発性骨髄腫、肉腫、加齢黄斑変性症、骨癌、結節性硬化症、非小細胞性肺癌、内分泌癌、リンパ腫、神経性障害、星状細胞腫、子宮頸癌、神経性癌、白血病、免疫障害、移植片拒絶、胃癌、黒色腫、てんかん、乳癌または膀胱癌のような障害を処置する。
ある態様において、ＴＯＲ阻害剤またはエベロリムス(化合物Ａ３６)を、約２.５〜２０mg／日の用量で投与する。ある態様において、本化合物を、約２.５mg／日、５mg／日、１０mg／日または２０mg／日、例えば、約２.５〜５mg／日、５〜１０mg／日または１０〜２０mg／日の用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＶＥＧＦＲ−２、ＰＤＧＦＲベータ、ＫＩＴまたはＲａｆキナーゼＣの１以上の阻害剤、１−メチル−５−((２−(５−(トリフルオロメチル)−１Ｈ−イミダゾール−２−イル)ピリジン−４−イル)オキシ)−Ｎ−(４−(トリフルオロメチル)フェニル)−１Ｈ−ベンゾ[ｄ]イミダゾール−２−アミン(化合物Ａ３７)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０３０３７７に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＶＥＧＦＲ−２、ＰＤＧＦＲベータ、ＫＩＴまたはＲａｆキナーゼＣの１以上の阻害剤は、１−メチル−５−((２−(５−(トリフルオロメチル)−１Ｈ−イミダゾール−２−イル)ピリジン−４−イル)オキシ)−Ｎ−(４−(トリフルオロメチル)フェニル)−１Ｈ−ベンゾ[ｄ]イミダゾール−２−アミン(化合物Ａ３７)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０３０３７７に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、１−メチル−５−((２−(５−(トリフルオロメチル)−１Ｈ−イミダゾール−２−イル)ピリジン−４−イル)オキシ)−Ｎ−(４−(トリフルオロメチル)フェニル)−１Ｈ−ベンゾ[ｄ]イミダゾール−２−アミン(化合物Ａ３７)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００７／０３０３７７に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌、黒色腫または固形腫瘍のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ソマトスタチンアゴニストおよび／または成長ホルモン遊離阻害剤、二アスパラギン酸パシレオチド(別名SIGNIFOR；化合物Ａ３８)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００２／０１０１９２号またはＵＳ特許番号７,４７３,７６１号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ソマトスタチンアゴニストおよび／または成長ホルモン遊離阻害剤は、二アスパラギン酸パシレオチド(化合物Ａ３８)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００２／０１０１９２号またはＵＳ特許番号７,４７３,７６１号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、二アスパラギン酸パシレオチド(化合物Ａ３８)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００２／０１０１９２号またはＵＳ特許番号７,４７３,７６１号に開示の化合物と組み合わせて使用して、前立腺癌、内分泌癌、神経性癌、皮膚癌(例えば、黒色腫)、膵臓癌、肝臓癌、クッシング症候群、消化器障害、先端巨大症、肝臓および胆管障害または肝硬変のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、シグナル伝達モジュレーターおよび／または血管形成阻害剤、ドビチニブ(化合物Ａ３９)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００９／１１５５６２号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、シグナル伝達モジュレーターおよび／または血管形成阻害剤は、ドビチニブ(化合物Ａ３９)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００９／１１５５６２号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、ドビチニブ(化合物Ａ３９)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００９／１１５５６２号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌、呼吸器／胸部癌、多発性骨髄腫、前立腺癌、非小細胞性肺癌、内分泌癌または神経学的遺伝子障害のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＥＧＦＲ阻害剤、(Ｒ,Ｅ)−Ｎ−(７−クロロ−１−(１−(４−(ジメチルアミノ)ブト−２−エノイル)アゼパン−３−イル)−１Ｈ−ベンゾ[ｄ]イミダゾール−２−イル)−２−メチルイソニコチンアミド(化合物Ａ４０)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／１８４７５７号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＥＧＦＲ阻害剤は、(Ｒ,Ｅ)−Ｎ−(７−クロロ−１−(１−(４−(ジメチルアミノ)ブト−２−エノイル)アゼパン−３−イル)−１Ｈ−ベンゾ[ｄ]イミダゾール−２−イル)−２−メチルイソニコチンアミド(化合物Ａ４０)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／１８４７５７号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、(Ｒ,Ｅ)−Ｎ−(７−クロロ−１−(１−(４−(ジメチルアミノ)ブト−２−エノイル)アゼパン−３−イル)−１Ｈ−ベンゾ[ｄ]イミダゾール−２−イル)−２−メチルイソニコチンアミド(化合物Ａ４０)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／１８４７５７号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌、例えば、固形腫瘍のような障害を処置する。
ある態様において、ＥＧＦＲ阻害剤または(Ｒ,Ｅ)−Ｎ−(７−クロロ−１−(１−(４−(ジメチルアミノ)ブト−２−エノイル)アゼパン−３−イル)−１Ｈ−ベンゾ[ｄ]イミダゾール−２−イル)−２−メチルイソニコチンアミド(化合物Ａ４０)を、例えば、１日あたり、１５０〜２５０mgの用量で投与する。ある態様において、本化合物を、約１５０mg、２００mgまたは２５０mgまたは約１５０〜２００mgまたは２００〜２５０mgの用量で投与する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＡＬＫ阻害剤、Ｎ６−(２−イソプロポキシ−５−メチル−４−(１−メチルピペリジン−４−イル)フェニル)−Ｎ４−(２−(イソプロピルスルホニル)フェニル)−１Ｈ−ピラゾロ[３,４−ｄ]ピリミジン−４,６−ジアミン(化合物Ａ４２)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００８／０７３６８７号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＡＬＫ阻害剤は、Ｎ６−(２−イソプロポキシ−５−メチル−４−(１−メチルピペリジン−４−イル)フェニル)−Ｎ４−(２−(イソプロピルスルホニル)フェニル)−１Ｈ−ピラゾロ[３,４−ｄ]ピリミジン−４,６−ジアミン(化合物Ａ４２)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００８／０７３６８７号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、Ｎ６−(２−イソプロポキシ−５−メチル−４−(１−メチルピペリジン−４−イル)フェニル)−Ｎ４−(２−(イソプロピルスルホニル)フェニル)−１Ｈ−ピラゾロ[３,４−ｄ]ピリミジン−４,６−ジアミン(化合物Ａ４２)またはＰＣＴ公開ＷＯ２００８／０７３６８７号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌、未分化大細胞リンパ腫(ＡＬＣＬ)、非小細胞肺癌(ＮＳＣＬＣ)または神経芽腫のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＩＧＦ−１Ｒ阻害剤、３−(４−(４−((５−クロロ−４−((５−メチル−１Ｈ−ピラゾール−３−イル)アミノ)ピリミジン−２−イル)アミノ)−５−フルオロ−２−メチルフェニル)ピペリジン−１−イル)チエタン１,１−ジオキシド(化合物Ａ４３)、５−クロロ−Ｎ２−(２−フルオロ−５−メチル−４−(１−(テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−４−イル)ピペリジン−４−イル)フェニル)−Ｎ４−(５−メチル−１Ｈ−ピラゾール−３−イル)ピリミジン−２,４−ジアミン(化合物Ａ４４)または５−クロロ−Ｎ２−(４−(１−エチルピペリジン−４−イル)−２−フルオロ−５−メチルフェニル)−Ｎ４−(５−メチル−１Ｈ−ピラゾール−３−イル)ピリミジン−２,４−ジアミン(化合物Ａ４５)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／００２６５５号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、記載の障害を処置する。ある態様において、ＩＧＦ−１Ｒ阻害剤は、３−(４−(４−((５−クロロ−４−((５−メチル−１Ｈ−ピラゾール−３−イル)アミノ)ピリミジン−２−イル)アミノ)−５−フルオロ−２−メチルフェニル)ピペリジン−１−イル)チエタン１,１−ジオキシド(化合物Ａ４３)、５−クロロ−Ｎ２−(２−フルオロ−５−メチル−４−(１−(テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−４−イル)ピペリジン−４−イル)フェニル)−Ｎ４−(５−メチル−１Ｈ−ピラゾール−３−イル)ピリミジン−２,４−ジアミン(化合物Ａ４４)、５−クロロ−Ｎ２−(４−(１−エチルピペリジン−４−イル)−２−フルオロ−５−メチルフェニル)−Ｎ４−(５−メチル−１Ｈ−ピラゾール−３−イル)ピリミジン−２,４−ジアミン(化合物Ａ４５)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／００２６５５号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、３−(４−(４−((５−クロロ−４−((５−メチル−１Ｈ−ピラゾール−３−イル)アミノ)ピリミジン−２−イル)アミノ)−５−フルオロ−２−メチルフェニル)ピペリジン−１−イル)チエタン１,１−ジオキシド(化合物Ａ４３)、５−クロロ−Ｎ２−(２−フルオロ−５−メチル−４−(１−(テトラヒドロ−２Ｈ−ピラン−４−イル)ピペリジン−４−イル)フェニル)−Ｎ４−(５−メチル−１Ｈ−ピラゾール−３−イル)ピリミジン−２,４−ジアミン(化合物Ａ４４)、５−クロロ−Ｎ２−(４−(１−エチルピペリジン−４−イル)−２−フルオロ−５−メチルフェニル)−Ｎ４−(５−メチル−１Ｈ−ピラゾール−３−イル)ピリミジン−２,４−ジアミン(化合物Ａ４５)またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１０／００２６５５号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌または肉腫のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、Ｐ−糖タンパク質１阻害剤、バルスポダール(別名AMDRAY；化合物Ａ４６)またはＥＰ２９６１２２号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、Ｐ−糖タンパク質１阻害剤は、バルスポダール(化合物Ａ４６)またはＥＰ２９６１２２号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、バルスポダール(化合物Ａ４６)またはＥＰ２９６１２２号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌または薬剤耐性腫瘍のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＶＥＧＦＲ阻害剤の１以上、バタラニブスクシネート(化合物Ａ４７)またはＥＰ２９６１２２号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＶＥＧＦＲ阻害剤は、バタラニブスクシネート(化合物Ａ４７)またはＥＰ２９６１２２号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、バタラニブスクシネート(化合物Ａ４７)またはＥＰ２９６１２２号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＩＤＨ阻害剤またはＷＯ２０１４／１４１１０４号に開示の化合物障害と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＩＤＨ阻害剤は、ＰＣＴ公開ＷＯ２０１４／１４１１０４号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子ｉを、ＷＯ２０１４／１４１１０４号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＢＣＬ−ＡＢＬ阻害剤またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／１７１６３９号、ＷＯ２０１３／１７１６４０号、ＷＯ２０１３／１７１６４１号またはＷＯ２０１３／１７１６４２号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＢＣＬ−ＡＢＬ阻害剤は、ＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／１７１６３９号、ＷＯ２０１３／１７１６４０号、ＷＯ２０１３／１７１６４１号またはＷＯ２０１３／１７１６４２号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、ＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／１７１６３９号、ＷＯ２０１３／１７１６４０号、ＷＯ２０１３／１７１６４１号またはＷＯ２０１３／１７１６４２号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌のような障害を処置する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ｃ−ＲＡＦ阻害剤またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１４／１５１６１６号に開示の化合物と組み合わせて使用して、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ｃ−ＲＡＦ阻害剤は、化合物Ａ５０またはＰＣＴ公開ＷＯ２０１４／１５１６１６号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、ＣＴ公開ＷＯ２０１４／１５１６１６号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌のような障害を使用する。
他の態様において、抗ＰＤ−１抗体分子、例えば、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子を、単独で、または１以上の他の免疫調節剤と組み合わせて、ＥＲＫ１／２ ＡＴＰ競合的阻害剤または国際特許ＰＣＴ／ＵＳ２０１４／０６２９１３号に開示の化合物と組み合わせて使用して障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある態様において、ＥＲＫ１／２ ＡＴＰ競合的阻害剤は、国際特許ＰＣＴ／ＵＳ２０１４／０６２９１３号に開示の化合物である。ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、化合物Ａ５１または国際特許ＰＣＴ／ＵＳ２０１４／０６２９１３号に開示の化合物と組み合わせて使用して、癌のような障害を処置する。
ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、化合物Ａ８、化合物Ａ１７、化合物Ａ２３、化合物Ａ２４、化合物Ａ２７、化合物Ａ２９および化合物Ａ３３から選択される１種以上の薬剤と組み合わせて投与する。
ある態様において、ＰＤ−１抗体分子を、免疫細胞アッセイ、例えば、ｈｕＭＬＲアッセイ、Ｔ細胞増殖アッセイおよびＢ細胞増殖アッセイの１以上において既知活性を有する抗癌剤と組み合わせて投与する。代表的アッセイを下に記載する。アッセイに基づき、ＩＣ５０を各試験薬剤について計算できる。複数の態様において、抗癌剤は、例えば、０〜１μM、１〜４μMまたは４μMを超える、例えば、４〜１０μMまたは〜２０μMのＩＣ５０を有する。複数の態様において、第二治療剤は化合物Ａ９、化合物Ａ１６、化合物Ａ１７、化合物Ａ２１、化合物Ａ２２、化合物Ａ２５、化合物Ａ２８、化合物Ａ４８および化合物４９の１以上から選択される。
ある態様において、化合物Ａ２８(または化合物Ａ２８に関係する化合物)を、約５〜１０mgまたは１０〜３０mgの用量で投与する。ある態様において、化合物Ａ２２(または化合物Ａ２２と関係する化合物)を、約２００mgの用量で投与する。ある態様において、化合物Ａ１７(または化合物Ａ１７と関係する化合物)を、約４００〜６００mgの用量で投与する。ある態様において、化合物Ａ１６(または化合物Ａ１６と関係する化合物)を、約４００〜６００mg 経口１日１回の用量で投与する。ある態様において、化合物Ａ２９(または化合物Ａ２９と関係する化合物)を、約２００〜４００mgまたは３００〜４００mgの用量で投与する。ある態様において、化合物Ａ２４(または化合物Ａ２４と関係する化合物)を、約２００〜６００mgの用量で投与する。ある態様において、化合物Ａ２３(セリチニブ)(またはセリチニブと関係する化合物)を、約７５０mg１日１回の用量で投与する。ある態様において、化合物Ａ８(または化合物Ａ８と関係する化合物)を、約２００〜４００mgまたは３００〜４００mgの用量で投与するの用量で投与する。ある態様において、化合物Ａ５(または化合物Ａ５と関係する化合物)を、約１００〜１２５mgの用量で投与する。ある態様において、化合物Ａ６(または化合物Ａ６と関係する化合物)を、約１００mgの用量で投与する。ある態様において、化合物Ａ１(または化合物Ａ１と関係する化合物)を、約２００〜３００mgまたは２００〜６００mgの用量で投与する。ある態様において、化合物Ａ４０(または化合物Ａ４０と関係する化合物)を、約１５０〜２５０mgの用量で投与する。複数の態様において、化合物Ａ１０(または化合物Ａ１０と関係する化合物)を、約４００〜７００mgの用量で、例えば、週に２回、または、２週投与、１週休薬で投与するの用量で投与する。複数の態様において、ＢＣＲ〜ＡＢＬ阻害剤を、約２０mg ｂｉｄ〜８０mg ｂｉｄの用量で投与する。
代表的ｈｕＭＬＲアッセイおよびＢまたはＴ細胞増殖アッセイを、下に提供する。
ヒト混合リンパ球反応
混合リンパ球反応(ＭＬＲ)は、ある個体からのリンパ球(レスポンダー)の、他の個体からのリンパ球(刺激因子)に対する増殖性応答を測定する、機能的アッセイである。同種ＭＬＲを実施するために、３ドナーからの末梢血単核細胞(ＰＢＭＣ)を、未知ＨＬＡタイプのバフィーコートから単離した(Kantonspital Blutspendezentrum from Bern and Aarau, Switzerland)。細胞を、１０％胎児ウシ血清(ＦＣＳ)、１００Ｕペニシリン／１００μg ストレプトマイシン、５０μM ２−メルカプトエタノール添加RPMI 1640 GlutaMAXTMを含む、０.２mLの培養培地で２.１０５で調製した。個々の２方向反応を、２の異なるドナーからのＰＢＭＣを１：１比で混合することにより設定し、共培養を、８点濃度範囲の試験化合物の存在下または非存在下、平底９６ウェル組織培養プレートで６日、３７℃、５％ＣＯ２でトリプリケートで実施した。細胞を、培養の最後の１６時間３Ｈ−ＴｄＲ(１μCi／０.２mL)でパルスし、取り込まれた放射活性を、細胞増殖の指標として使用した。最大ｈｕＭＬＲ応答の５０％を阻害する濃度(ＩＣ５０)を、各化合物について計算した。シクロスポリンを、ｈｕＭＬＲ阻害の陽性対照として使用した。
ヒトＢ細胞増殖アッセイ
ＰＢＭＣを、ヒト血液からFicoll-Paque密度勾配により新たに単離し、陰性Ｂ細胞単離に付した。Ｂ細胞を、平底９６ウェル培養プレートのウェルあたり９.１０４の濃度で、培養培地(ＲＰＭＩ １６４０、ＨＥＰＥＳ、１０％ＦＣＳ、５０μg／mLゲンタマイシン、５０μM ２−メルカプトエタノール、１×ＩＴＳ(インスリン、トランスフェリンおよび亜セレン酸ナトリウム)、１×非必須アミノ酸)に再懸濁した。Ｂ細胞刺激を、試験化合物の７点濃度範囲の存在下または非存在下、ヒト抗ＩｇＭ抗体分子(３０μg／mL)とＩＬ−４(７５ng／mL)またはＣＤ４０リガンド(３μg／mL)とＩＬ−４(７５ng／mL)により実施した。３７℃、１０％ＣＯ２で７２時間の培養後、細胞を、培養の最後の６時間、３Ｈ−ＴｄＲ(１μCi／ウェル)でパルスした。Ｂ細胞を回収し、チミジン取り込みをシンチレーションカウンターを使用して測定した。各２回の処理で、平均を計算し、これらのデータを、XLfit 4にプロットして、各ＩＣ５０値を決定した。
ヒトＴ細胞増殖アッセイ
ＰＢＭＣを、ヒト血液からFicoll-Paque密度勾配により新たに単離し、陰性Ｔ細胞単離に付した。Ｔ細胞を、平底９６ウェル培養プレートのウェルあたり８.１０４の濃度で、培養培地(ＲＰＭＩ １６４０、ＨＥＰＥＳ、１０％ＦＣＳ、５０μg／mLゲンタマイシン、５０μM ２−メルカプトエタノール、１×ＩＴＳ(インスリン、トランスフェリンおよび亜セレン酸ナトリウム)、１×非必須アミノ酸)に調製した。Ｔ細胞刺激を、試験化合物の７点濃度範囲の存在下または非存在下、ヒト抗ＣＤ３抗体分子(１０μg／mL)またはヒト抗ＣＤ３抗体分子(５μg／mL)と抗ＣＤ２８抗体分子(１μg／mL)により実施した。３７℃、１０％ＣＯ２で７２時間の培養後、細胞を、培養の最後の６時間、３Ｈ−ＴｄＲ(１μCi／ウェル)でパルスした。細胞増殖をチミジン取り込みにより測定し、各試験化合物のＩＣ５０決定を可能とした。
免疫系のダウンモジュレーター
他の態様において、ここに開示される抗ＰＤ−１抗体分子を、Ｂ７−Ｈ１またはＰＤ−１の抗イディオタイプペプチドまたは抗体(Wallmann, J. et al. (2010) “Anti-Ids in Allergy: Timeliness of a Classic Concept,” World Allergy Organiz. J. 3(6):195-201; Nardi, M. et al. (2000) “Antiidiotype Antibody Against Platelet Anti-Gpiiia Contributes To The Regulation Of Thrombocytopenia In HIV-1-ITP Patients,” J. Exp. Med. 191(12):2093-2100)または模倣物(Zang, Y. C. et al. (2003) “Human Anti-Idiotypic T Cells Induced By TCR Peptides Corresponding To A Common CDR3Sequence Motif In Myelin Basic Protein-Reactive T Cells,” Int. Immunol. 15(9):1073-1080; Loiarro, M. et al. (Epub 2010 Apr. 8) “Targeting TLR/IL-1R Signalling In Human Diseases,” Mediators Inflamm. 2010:674363)の産生に使用する。このような分子は、ＰＤ−１の代理として役立ち、それゆえに、対象へのその投与はＢ７−Ｈ１−ＰＤ−１結合を模倣するまたは促進することにより、このような対象の免疫系を下方制御する。このような分子は、移植片対宿主病の処置に有用性がある。同様に、ｉ)このような抗体とこのような受容体／リガンドの結合を促進するまたはii)Ｂ７−Ｈ１またはＰＤ−１に直接結合したとき、シグナル伝達を誘発するアゴニスト抗体は、Ｂ７−Ｈ１−ＰＤ−１シグナル伝達のアゴニストとして有用性があり、それゆえに、受容体活性を直接的または間接的に刺激することにより、炎症および自己免疫性疾患の処置に有用性がある。
ＰＤ−１およびＢ７−Ｈ１の両者に免疫特異的結合を示す二重特異性抗体は、ＡＰＣとＴ細胞の両者に結合でき、それゆえに、ＡＰＣとＴ細胞の共局在化を促進する。このような共局在化は、このような細胞が、抗体と複合体化しないＢ７−Ｈ１およびＰＤ−１分子または共阻害分子による能力を促進する。このような結合は、レシピエントの免疫系の下方調節を提供する。
免疫系の下方調節は、炎症性および自己免疫疾患および移植片対宿主病(ＧｖＨＤ)の処置に望まれる。本発明の抗体の投与により処置され得る自己免疫性障害の例は、円形脱毛症、強直性脊椎炎、抗リン脂質抗体症候群、自己免疫性アジソン病、副腎の自己免疫性疾患、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性肝炎、自己免疫性卵巣炎および精巣炎、自己免疫性血小板減少症、ベーチェット病、類天疱瘡、心筋症、セリアックスプルー−皮膚炎、慢性疲労免疫機能不全症候群(ＣＦＩＤＳ)、慢性炎症性脱髄性ポリニューロパチー、チャーグ・ストラウス症候群、瘢痕性類天疱瘡、クレスト症候群、寒冷凝集素疾患、クローン病、円板状狼瘡、必須混合型クリオグロブリン血症、線維筋痛症−線維筋炎、糸球体腎炎、グレーブス病、ギラン・バレー、橋本甲状腺炎、特発性肺線維症、特発性血小板減少性紫斑病(ＩＴＰ)、ＩｇＡニューロパチー、若年性関節炎、扁平苔癬、エリテマトーデス、メニエール病、混合型結合組織疾患、多発性硬化症、視神経脊髄炎(ＮＭＯ)、１型または免疫介在糖尿病、重症筋無力症、尋常性天疱瘡、悪性貧血、結節性多発性動脈炎、多発性軟骨炎、多腺性症候群、リウマチ性多発筋痛症、多発性筋炎および皮膚筋炎、原発性無ガンマグロブリン血症、原発性胆汁性肝硬変、乾癬、乾癬性関節炎、レイノー現象、ライター症候群、リウマチ性関節炎、サルコイドーシス、強皮症、シェーグレン症候群、スティッフマン症候群、全身性エリテマトーデス、エリテマトーデス、高安動脈炎、側頭動脈炎／巨細胞性動脈炎、横断性脊髄炎、潰瘍性大腸炎、ブドウ膜炎、疱疹状皮膚炎脈管炎のような脈管炎、白斑症およびウェゲナー肉芽腫を含むが、これらに限定されない。
本発明の方法に従い予防、処置または管理し得る炎症性障害の例は、喘息、脳炎、炎症性腸疾患、慢性閉塞性肺疾患(ＣＯＰＤ)、アレルギー性障害、敗血症性ショック、肺線維症、未分化脊椎関節症、未分化関節症、関節炎、炎症性骨溶解および慢性ウイルスまたは細菌感染による慢性炎症を含むが、これらに限定されない。
それゆえに、本発明の抗体および抗原結合フラグメントは、炎症性および自己免疫性疾患の処置に有用である。
診断的使用
一つの面において、本発明は、ＰＤ−１タンパク質の存在をインビトロ(例えば、癌性組織からの、組織生検のような、例えば、生物学的サンプル中)またはインビボ(例えば、対象におけるインビボ造影)で検出するための診断法を提供する。本方法は次のものを含む。(ｉ)サンプルとここに記載する抗体分子を接触させるかまたは対象に抗体分子を投与し；(所望により)(ii)対象サンプル、例えば、対照サンプル(例えば、血漿、組織、生検のような対照生物学的サンプル)または対照対象))を接触させ；そして(iii)抗体分子とサンプルまたは対象もしくは対照サンプルもしくは対象の間の複合体形成を検出し、ここで、対照サンプルまたは対象と比較して、サンプルまたは対象における複合体の形成の変化、例えば、統計学的に有意な変化は、サンプルにおけるＰＤ−１の存在の指標である。抗体分子は、結合または非結合抗体の検出を容易にするために、検出可能物質で直接的または間接的に標識できる。適当な検出可能物質は、上記のようなおよび下により詳細に記載する多様な酵素、補欠分子族、蛍光物質、発光物質および放射性物質を含む。
用語“サンプル”は、ポリペプチド検出用に使用するサンプルをいうとき、細胞、細胞ライセート、細胞、体液または組織サンプルのタンパク質または膜抽出物をいうが、これらに限定されない。
抗体分子とＰＤ−１の複合体形成は、ＰＤ−１抗原に結合した結合分子または結合していない結合分子の測定または可視化により検出できる。慣用の検出アッセイ、例えば、酵素結合免疫吸着検定法(ＥＬＩＳＡ)、放射性免疫アッセイ(ＲＩＡ)または組織免疫組織化学を使用できる。抗体分子を標識する代わりに、ＰＤ−１の存在を、検出可能物質で標識した標準および非標識抗体分子を使用する競合免疫アッセイによりサンプルにおいてアッセイできる。このアッセイにおいて、生物学的サンプル、標識標準および抗体分子を合わせ、非標識結合分子に結合した標識標準の量を決定する。サンプルにおけるＰＤ−１の量は、抗体分子に結合した標識標準の量に逆比例する。
核酸
本発明はまた、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体分子の重鎖および軽鎖可変領域およびＣＤＲまたは高度可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む核酸に関する。例えば、本発明は、それぞれ、ここに開示する抗体分子の１以上から選択された抗ＰＤ−１抗体分子の重鎖および軽鎖可変領域をコードする第一および第二抗体に関する。核酸は、ここでの表に示すヌクレオチド配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一の配列またはここでの表に示す配列と、３、６、１５、３０または４５ヌクレオチドを超えて異ならないものを含み得る。
ある態様において、核酸は、ここでの表に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同である配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一のおよび／または１以上の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を有する重鎖可変領域からの少なくとも１、２または３のＣＤＲまたは高度可変ループをコードするヌクレオチド配列を含み得る。他の態様において、核酸は、ここでの表に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同である配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一のおよび／または１以上の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を有する軽鎖可変領域からの少なくとも１、２または３のＣＤＲまたは高度可変ループをコードするヌクレオチド配列を含み得る。さらに別の態様において、核酸は、ここでの表に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同である配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一のおよび／または１以上の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を有する重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも１、２、３、４、５または６のＣＤＲまたは高度可変ループをコードするヌクレオチド配列を含み得る。
ある態様において、核酸は、ここでの表に示すヌクレオチド配列、それと実質的に相同である配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一の配列および／またはここに記載するストリンジェンシー条件下でハイブリダイズできる配列)を有する重鎖可変領域からの少なくとも１、２または３のＣＤＲまたは高度可変ループをコードするヌクレオチド配列を含み得る。他の態様において、核酸は、ここでの表に示すヌクレオチド配列またはそれと実質的に相同である配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一の配列および／またはここに記載するストリンジェンシー条件下でハイブリダイズできる配列)を有する軽鎖可変領域からの少なくとも１、２または３のＣＤＲまたは高度可変ループをコードするヌクレオチド配列を含み得る。さらに別の態様において、核酸は、ここでの表に示すヌクレオチド配列またはそれと実質的に相同である配列(例えば、それと少なくとも約８５％、９０％、９５％、９９％またはそれ以上同一の配列および／またはここに記載するストリンジェンシー条件下でハイブリダイズできる配列)を有する重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも１、２、３、４、５または６のＣＤＲまたは高度可変ループをコードするヌクレオチド配列を含み得る。
他の面において、本出願は、ここに記載する核酸を含む宿主細胞およびベクターに関する。核酸は、下に詳細に記載するように、単一ベクターまたは同じ宿主細胞もしくは異なる宿主細胞に存在する異なるベクターに存在し得る。
ベクター
さらにここで提供されるのは、ここに記載する抗体分子をコードするヌクレオチド配列を含むベクターである。ある態様において、ベクターは、ここに記載する抗体分子をコードするヌクレオチドを含む。ある態様において、ベクターは、ここに記載するヌクレオチド配列を含む。ベクターは、ウイルス、プラスミド、コスミド、ラムダファージまたは酵母人工染色体(ＹＡＣ)を含むが、これらに限定されない。
多くのベクター系を用い得る。例えば、あるベクター群は、例えば、ウシ乳頭腫ウイルス、ポリオーマウイルス、アデノウイルス、ワクシニアウイルス、バキュロウイルス、レトロウイルス(ラウス肉腫ウイルス、ＭＭＴＶまたはＭＯＭＬＶ)またはＳＶ４０ウイルスのような動物ウイルス由来のＤＮＡ要素を利用する。他の群のベクターは、セムリキ森林ウイルス、東部ウマ脳炎ウイルスおよびフラビウイルスのようなＲＮＡウイルス由来のＲＮＡ要素を利用する。
さらに、ＤＮＡを染色体に安定に取り込んでいる細胞は、トランスフェクトされた宿主細胞の選択を可能にする１以上のマーカーの導入により選択し得る。マーカーは、例えば、栄養要求性宿主に対する原栄養性、殺生物剤耐性(例えば、抗生物質)または銅のような重金属に対する耐性などを提供し得る。選択可能マーカー遺伝子は、発現すべきＤＮＡ配列に直接連結するかまたは共形質転換により同じ細胞に導入し得る。さらなる要素もｍＲＮＡの最適合成のために必要であり得る。これらの要素は、スプライスシグナル、ならびに転写プロモーター、エンハンサーおよび終結シグナルを含み得る。
構築物を含む発現ベクターまたはＤＮＡ配列が発現用に調製されたら、発現ベクターを、適切な宿主細胞にトランスフェクトまたは導入し得る。例えば、プロトプラスト融合、リン酸カルシウム沈殿、エレクトロポレーション、レトロウイルス形質導入、ウイルストランスフェクション、遺伝子銃、脂質ベースのトランスフェクションまたは他の慣用法のような多様な方法をこれを達成するために用い得る。プロトプラスト融合の場合、細胞を倍地中で増殖させ、適切な活性についてスクリーニングする。
得られたトランスフェクト細胞の培養のためのならびに産生された抗体を回収するための方法および条件は当業者に既知であり、本記載に基づき、用いる特定の発現ベクターおよび哺乳動物宿主細胞により変更または最適化され得る。
細胞
本発明はまたここに記載する抗体分子をコードする核酸を含む宿主細胞も提供する。
ある態様において、宿主細胞は、抗体分子をコードする核酸を含むように遺伝子操作される。
ある態様において、宿主細胞は、発現カセットの使用により遺伝子操作される。用語“発現カセット”は、このような配列と適合性の宿主における遺伝子発現に影響を与えることができるヌクレオチド配列をいう。このようなカセットは、プロモーター、イントロンを伴うまたは伴わないオープンリーディングフレームおよび終結シグナルを含む。例えば、誘導性プロモーターのような、発現の実施に必要なまたは役立つさらなる因子も使用し得る。
本発明はまたここに記載するベクターを含む宿主細胞を提供する。
細胞は、真核細胞、細菌細胞、昆虫細胞またはヒト細胞を含むが、これらに限定されない。適当な真核細胞は、Ｖｅｒｏ細胞、ＨｅＬａ細胞、ＣＯＳ細胞、ＣＨＯ細胞、ＨＥＫ２９３細胞、ＢＨＫ細胞およびＭＤＣＫＩＩ細胞を含むが、これらに限定されない。適当な昆虫細胞は、Ｓｆ９細胞を含むが、これに限定されない。
表５. 実施例参照。
表６. 実施例参照。
下記実施例は、本発明の理解を助けるために示すが、その範囲を決して限定する意図はなく、そう解釈してはならない。
実施例１：抗ＰＤ−１抗体、ＢＡＰ０４９のヒト化
マウス抗ＰＤ−１モノクローナル抗体ＢＡＰ０４９をヒト化した。独特な可変領域配列を有する１６のヒト化ＢＡＰ０４９クローンの配列および試験サンプルを得た。これらのクローンを、その生物学的機能(例えば、抗原結合およびリガンド遮断)、構造特性およびＣＨＯ細胞における一過性発現についてさらに分析した。
実施例１.１：ヒト化テクノロジーおよび工程
ＢＡＰ０４９のヒト化を、ヒト生殖系列可変領域フレームワーク(ＦＷ)のコンビナトリアルライブラリーを使用して実施した。本テクノロジーは、ヒト生殖系列ＦＷ１、ＦＷ２およびＦＷ３配列を無作為に合わせることにより構築したヒト可変領域(ＶＲ)のライブラリーにフレーム内にマウスＣＤＲを導入することを必要とする。重鎖(ＨＣ)についてＷＧＱＧＴＴＶＴＶＳＳ(配列番号１６９)(KabatヒトＨＣサブグループＩ、２１番)および軽鎖(ＬＣ)についてＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫ(配列番号２０８)(KabatヒトκサブグループＩ、５番)である、１のＦＷ４配列のみ使用した。ＶＲ配列のライブラリーをヒト定常領域(ＣＲ)配列、ＨＣのヒトＩｇＧ４(Ｓ２２８Ｐ)およびＬＣのヒトκ ＣＲと融合し、ＩｇＧ全体の得られたライブラリーをスクリーニングのためにＣＨＯ細胞に発現させた。スクリーニングを、全細胞ＥＬＩＳＡ形式またはＦＡＣＳで抗原発現細胞に対する結合アビディティーを測定する、組織培養上清により実施した。
ヒト化工程を、ヒト化クローンのスクリーニングのためのコンパレータとして役立ち得る、適切なキメラｍＡｂ(マウスＶＲ、ＩｇＧ４(Ｓ２２８Ｐ)、ヒトκ)の構築および発現から開始する、段階的方法で実施した。ヒトＩｇＧ４(Ｓ２２８Ｐ)重鎖およびヒトカッパ軽鎖の定常領域アミノ酸配列は表３に示す。
ＬＣおよびＨＣのＶＲのヒト化を２の独立工程で実施した。ヒト化ＬＣ(ｈｕＬＣ)のライブラリーをキメラＨＣ(マウスＶＲ、ＩｇＧ４(Ｓ２２８Ｐ))と対形成し、得られた“半ヒト化”ｍＡｂを、ＥＬＩＳＡにより結合活性についてスクリーニングした。適当な結合活性(≧キメラｍＡｂの結合)を有するクローンのｈｕＬＣを選択した。同様に、ヒト化ＨＣ(ｈｕＨＣ)のライブラリーをキメラＬＣ(マウスＶＲ、ヒトκ)と対形成し、ＥＬＩＳＡにより結合活性についてスクリーニングした。適切な結合活性(≧キメラｍＡｂの結合)を有するクローンのｈｕＨＣを選択した。
選択したｈｕＬＣおよびｈｕＨＣの可変領域を、独特の配列を有するｈｕＬＣおよびｈｕＨＣを同定するために配列決定した(初期選択工程からのいくつかのクローンは同じＬＣまたはＨＣを共有し得る)。独特なｈｕＬＣおよびｈｕＨＣを無作為に合わせて、ヒト化ｍＡｂ(ｈｕｍＡｂ)の小ライブラリーを形成し、これをＣＨＯ細胞で発現させ、ＥＬＩＳＡおよびＦＡＣＳ形式で抗原発現細胞についてスクリーニングした。キメラコンパレータｍＡｂの結合と同等以上の結合活性を有するクローンは、ヒト化工程の最終産物である。
実施例１.２：マウスｍＡｂ ＢＡＰ０４９の配列
マウス抗ＰＤ−１ ｍＡｂのＬＣおよびＨＣ可変領域配列を決定した。２の別々の分析から得た配列は同一であり、図１に示す。
生殖系列分析を実施し、その結果の一部を図２Ａにアミノ酸配列アライメントとして示す。軽鎖について、Ｖ遺伝子は、ｍＩＧＫＶ８−１９＊０１Ｆ(２９３／２９７ ｎｔｓ)と９８.６５％同一であり、Ｊ遺伝子は、ｍＩＧＫＪ２＊０１Ｆ(３６／３７ ｎｔｓ)と９７.３０％同一であった。重鎖について、Ｖ遺伝子は、ｍＩＧＨＶ１Ｓ２２＊０１Ｆ(２５９／２７９ ｎｔｓ)と９２.８３％同一であり、Ｊ遺伝子は、ｍＩＧＨＪ３＊０１Ｆ(３９／４７ ｎｔｓ)と８２.９８％同一であり、Ｄ遺伝子はｍＩＧＨＤ２−１４＊０１Ｆであった。図２Ｂに示すように、マウスｍＡｂのＬＣ配列は、１０２位に不対Ｃｙｓを含み、これはＣＤＲＬ３内であり、マウスＪ２遺伝子における点変異を経て生じた(ｔａｃ→ｔｇｃ；Ｙ→Ｃ)。
実施例１.３：キメラ抗体の構築
キメラ抗体の３変異体を製造し、これは、各々ＬＣ配列の１０２位にＣｙｓ残基、Ｔｙｒ残基またはＳｅｒ残基を含んだ。３のキメラ抗体、すなわち、ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ(Ｃｙｓ)、ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ(Ｔｙｒ)およびＢＡＰ０４９−ｃｈｉ(Ｓｅｒ)(それぞれ別名ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ、ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ−ＹおよびＢＡＰ０４９−ｃｈｉ−Ｓ)をＣＨＯ細胞で発現させ、ＰＤ−１発現Ｊｕｒｋａｔ細胞への結合について標識マウス抗体と競合する能力を試験した。図３Ａ〜３Ｂに示すように、３変異体は、競合実験では区別がつかなかった。結果は、３のキメラｍＡｂ(Ｃｙｓ、Ｔｙｒ、Ｓｅｒ)が、標識マウスｍＡｂ ＢＡＰ０４９の結合と等しく良好に競合することを示す。キメラｍＡｂ曲線とマウスｍＡｂ曲線のわずかな差異は、恐らく、ｍＡｂ濃度の決定に使用した方法の違いによる。マウスｍＡｂの濃度はＯＤ２８０測定により決定し、上清中のキメラｍＡｂ濃度は、ＩｇＧ４標準を使用するＥＬＩＳＡで決定した。生殖系列残基Ｔｙｒを、ヒト化抗体のために選択した。
キメラｍＡｂ ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ(Ｃｙｓ)の重鎖および軽鎖のアミノ酸配列を表１に示す。キメラｍＡｂ ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ(Ｃｙｓ)の重鎖および軽鎖のヌクレオチド配列を表１に示す。ＢＡＰ０４９−ｃｈｉ(Ｔｙｒ)およびＢＡＰ０４９−ｃｈｉ(Ｓｅｒ)において、ＬＣの１０２位の不対Ｃｙｓ残基をＴｙｒ残基またはＳｅｒ残基と置き換えた。
実施例１.４：ヒト化抗体クローン
図４に示すように、ヒト化の工程は、キメラ抗体と同等な結合親和性を有する１６クローンを生じた。結合データに加えて、各クローンについて、ＶＲ配列を、ｍＡｂのサンプルと共に提供した。サンプルはＣＨＯ細胞の一過性トランスフェクションにより製造されており、濃縮組織培養上清であった。溶液中の抗体濃度は、ＩｇＧ４特異的ＥＬＩＳＡにより決定した。
図５に示すように、１６の独特のクローンは、４の独特なＨＣ配列と９の独特なＬＣ配列の組み合わせである。ＨＣ ＦＷ領域について、ＨＣ配列は、２の異なるＶＨＦＷ１配列の１、３の異なるＶＨＦＷ２配列の１および２の異なるＶＨＦＷ３配列の１の組み合わせである。ＬＣ ＦＷ領域について、ＬＣ配列は、５の異なるＶＬＦＷ１配列の１、３の異なるＶＬＦＷ２配列の１よび４の異なるＶＬＦＷ３配列の１の組み合わせである。ヒト化ＢＡＰ０４９クローンの重鎖および軽鎖可変ドメインのアミノ酸配列およびヌクレオチド配列を表１に示す。ヒト化ＢＡＰ０４９クローンの重鎖および軽鎖ＣＤＲのアミノ酸配列およびヌクレオチド配列も表１に示す。
図５は、サンプルが、ｍＡｂの濃度について異なり、７.９μg／mL〜６１.５μg／mLの範囲であることを示した。これらの数字は、いくつかの一過性発現実験の代表であった。
実施例１.５：ヒト化クローンの分析
実施例１.５.１：結合活性および結合特異性の分析
結合活性および特異性を、一定濃度のＡｌｅｘａ ４８８標識マウスｍＡｂ、連続希釈の試験ｍＡｂおよびＰＤ−１発現３００.１９細胞を使用する競合結合アッセイにおいて測定した。試験ｍＡｂ対標識ｍＡｂの濃度比が異なるｍＡｂ混合物とのインキュベーションは、４℃で３０分であった。結合した標識マウスｍＡｂを、ＦＡＣＳ装置を使用して定量した。実験を２回実施した。結果を図６Ａ〜６Ｂに示す。
実験の精度の範囲内で、全ヒト化クローンは、標識マウスｍＡｂの結合との競合について同等の活性を示す。活性はまた親マウスｍＡｂおよびキメラｍＡｂの活性と同等である。ＭＡｂを、互いにランク付けした。例えば、実験において、あるクローンの曲線がキメラｍＡｂ曲線の右側にあれば弱い競合因子であり得、あるクローンの曲線がキメラｍＡｂ曲線の左側にあれば、良好な競合因子であり得る。このようなランキングシステムを図７に使用した。
実施例１.５.２：配列分析
構造特性に基づき、１６のヒト化ｍＡｂを４群に分け、Ａ〜Ｅにランク付けした。結果を図７に示す。
実施例１.５.３：ヒト化クローンの選択
図７は、選りすぐりのヒト化クローンと考えられたデータを要約する。発現データ(２番目のカラム)、可変領域の組成における多様性(３番目のカラム)、結合試験における相対的ランキング(４番目および５番目のカラム)および構造分析(６番目のカラム)を考慮した。
選択したクローンを、ＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２のＰＤ−１への結合を阻止するおよびＴ細胞活性を増強する能力を、ヒトＰＢＭＣを用いるインビトロアッセイでさらに試験した。
実施例１.５.４：Ｂリガンド結合の遮断
マウス抗ＰＤ−１ ｍＡｂは、天然リガンドＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２の、低濃度で細胞に発現されるＰＤ−１への結合を遮断する。ヒト化クローンが親マウスｍＡｂのこの遮断能を保持するか否かを、マウスおよびキメラ抗体を用いる比較実験で試験した。
ｍＡｂの遮断能を、一定濃度のＰＤ−Ｌ１−ｈｕＩｇＧ１ Ｆｃ融合タンパク質またはＰＤ−Ｌ２−ｈｕＩｇＧ１ Ｆｃ融合タンパク質、試験するｍＡｂの連続希釈およびＰＤ−１発現３００.１９細胞を使用する競合結合アッセイにおいて評価した。インキュベーションは、４℃で３０分であった。結合したリガンド融合タンパク質を、ＩｇＧ４ ｍＡｂ(Southern Biotech 2043-09)を認識しないヤギ抗ヒトＩｇＧのＰＥ接合Ｆ(ａｂ’)２フラグメントおよびフローサイトメトリーで検出した。結果を図８Ａ〜８Ｂに示す。
実験の精度の範囲内で、ヒト化クローン、キメラ抗体およびマウス親ｍＡｂは、ＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２リガンドの両者に対して、同等な遮断活性を示した。
実施例１.５.５：Ｔ細胞エピトープ分析
ヒト化ｍＡｂを、EpibaseTMを使用してＴ細胞エピトープについて分析した。アルゴリズムは、ＨＬＡクラスIIへの結合に対して、各可能なペプチド(１のアミノ酸により進むタンパク質に沿った各１０量体)を分析する。これは各ペプチドについて結合の自由エネルギー(ΔＧｂｉｎｄ)を概算し、推定ＫＤ(ΔＧｂｉｎｄ＝ＲＴ ｌｎＫＤ)を計算する。次いで、ペプチドを、強、中および非結合についてＳ、ＭまたはＮと標識する。この分類に使用する閾値は、アロタイプ毎に異なる。
データをリスクスコアに対して標準化した。全体的“リスクスコア”は、各ペプチドの親和性により重み付けしたが、生殖系列配列における全ての可能性のあるエピトープを除外した、全ての試験したアレルに対する、全ての可能性のあるエピトープの合計である(それゆえ、値が小さいほど“良好”である)。
下記のように、異なる組成のｍＡｂの大きなセット由来の、ｍＡｂの大まかに３カテゴリーがある。
約５００のリスクスコア：ヒト、“ヒト化”マウスおよびファージライブラリーから産生された完全ヒトｍＡｂ(“５００未満の値は、完全ヒト抗体として考えても間違いなく良好である”)。スコアが低くなるように特異的に操作されたヒト化ｍＡｂ(ＣＤＲでさえ)は、概して５００〜７００リスクカテゴリーにある。
リスクスコア約９００：ＦＷ領域を変化させたまたは変化させていない完全マウスＣＤＲを有する典型的ＣＤＲ移植抗体；承認されるＣＤＲ移植ｍＡｂは、基本的に全てこのカテゴリー内である。
リスクスコア約１５００：キメラｍＡｂ。
選択したヒト化ＢＡＰ０４９ ｍＡｂの結果は次のとおりである。
選択したヒト化クローンは低いスコアを有する。概して、５００未満の値は、完全ヒト抗体として考えても免疫原性が低いリスクであることを示す。例えば、ヒトｍＡｂ、アダリムマブ(Humira(登録商標))は６５４のスコアを有し、これは、ヒトｍＡｂとしては比較的高いが(ガウス曲線の上限)、典型的ＣＤＲ移植ｍＡｂと比較すると低い。
要約および結論
マウス抗ＰＤ−１モノクローナル抗体、ＢＡＰ０４９をヒト化した。テクノロジーは、マウスＣＤＲのヒト生殖系列可変領域フレームワークの秩序立ったライブラリーへのインフレームのクローニング、ＣＨＯ細胞における、クローン化可変領域のライブラリーの完全ＩｇＧ４(Ｓ２２８Ｐ)ヒト化ｍＡｂとしての発現、そして親ｍＡｂと同等以上の親和性で標的と結合するクローンの選択を必要とする。それゆえに、マウスＣＤＲは、親マウスｍＡｂの高次構造、それゆえに、結合親和性および特異性を保持する適切なヒト生殖系列フレームワーク配列を選択することが要求された。ＰＤ−１トランスフェクトＣＨＯ細胞での結合試験を通過した、独特な可変領域配列を有する１６のヒト化ｍＡｂの配列および試験サンプルを得た。これらのクローンを、その生物学的機能(例えば、抗原結合およびリガンド遮断)、構造特性およびＣＨＯ細胞における一過性発現についてさらに分析した。
実施例２：ヒト化抗ＰＤ−１抗体、ＢＡＰ０４９の発現
実施例１に記載した５のヒト化クローンを、チャイニーズハムスター卵巣(ＣＨＯ)細胞における発現の評価のために選択した。
単一遺伝子ベクター(ＳＧＶ)を、Lonza's GS Xceedベクター(重鎖についてＩｇＧ４ｐｒｏΔｋおよび軽鎖についてカッパ)を使用して構築した。ＳＧＶを増幅し、２.８Ｌ体積で発現のためにＣＨＯＫ１ＳＶ ＧＳ−ＫＯ細胞に一過性に共トランスフェクトした。
発現培養物をトランスフェクション６日後に回収し、遠心分離および無菌濾過により浄化した。浄化した細胞培養上清を、一工程プロテインＡクロマトグラフィーを使用して精製した。ＳＥ−ＨＰＬＣ、ＳＤＳ−ＰＡＧＥ、ＩＥＦおよびＬＡＬの形態の製品品質分析を、対照サンプルとして抗体を含む、１mg／ml濃度で精製物質を使用して行った。
実施例２.１：ベクター構築
軽鎖および重鎖可変ドメインコード化領域の配列を、GeneArt AGにより合成した。軽鎖可変ドメインコード化領域をｐＸＣ−カッパに、重鎖可変ドメインコード化領域を、ｐＸＣ−ＩｇＧ４ｐｒｏ ΔＫベクターに、それぞれ、Ｎ末端制限部位Ｈｉｎｄ IIIおよびＣ末端制限部位ＢｓｉＷＩ(軽鎖)およびＡｐａＩ(重鎖)を使用してサブローン化した。陽性クローンを、ＰＣＲ増幅(プライマー１０５３：ＧＣＴＧＡＣＡＧＡＣＴＡＡＣＡＧＡＣＴＧＴＴＣＣ(配列番号２２６)およびプライマー１０７２：ＣＡＡＡＴＧＴＧＧＴＡＴＧＧＣＴＧＡ(配列番号２２７))によりスクリーニングし、制限消化(ＥｃｏＲＩ−ＨＦおよびＨｉｎｄIII−ＨＦの二重消化を使用)および目的の遺伝子のヌクレオチド配列決定により確認した。
実施例２.２：ＤＮＡ増幅
単一細菌コロニーを、５０μg／ml アンピシリン含有１５ml ルリア・ベルターニ(ＬＢ)培地(LB Broth, Sigma-Aldrich, L7275)に採取して入れ、３７℃で一夜、２２０rpmで振盪させながらインキュベートした。得られたスターター培養物を、５０μg／ml アンピシリン含有１Ｌルリア・ベルターニ(ＬＢ)培地への接種に使用し、３７℃で一夜、２２０rpmで振盪させながらインキュベートした。ベクターＤＮを、QIAGEN Plasmid Plus Gigaprep system(QIAGEN, 12991)を使用して単離した。全例において、ＤＮＡ濃度をNanodrop 1000分光光度計(Thermo-Scientific)を使用して測定し、ＥＢ緩衝液(１０mM Ｔｒｉｓ−Ｃｌ、ｐＨ８.５)で１mg／mlに調節した。単一遺伝子ベクターのためのＤＮＡ品質を、吸光度比Ａ２６０／Ａ２８０の測定により評価した。これは、１.８８〜１.９０であることが判明した。
実施例２.３：ＣＨＯＫ１ＳＶ ＧＳ−ＫＯ細胞の培養
ＣＨＯＫ１ＳＶ ＧＳ−ＫＯ細胞を、６mM グルタミン(Invitrogen, 25030-123)を添加したＣＤ−ＣＨＯ培地(Invitrogen, 10743-029)で培養した。細胞を、３６.５℃、５％ＣＯ２、８５％湿度、１４０rpmの振盪しているインキュベーターでインキュベートした。細胞を３〜４日毎に定期的に継代培養し、２×１０５細胞／mlを播種し、トランスフェクションに利用可能な十分な細胞を得るために増幅させた。細胞を２０継代までに廃棄した。
実施例２.４：ＣＨＯＫ１ＳＶ ＧＳ−ＫＯ細胞の一過性トランスフェクション
一過性トランスフェクションを、最小で２週間培養されていたＣＨＯＫ１ＳＶ ＧＳ−ＫＯ細胞を使用して実施した。細胞をトランスフェクション２４時間前に継代培養し、トランスフェクション時点での細胞生存能は＞９９％であった。
全てのトランスフェクションを、エレクトロポレーションのためのプレートベースのシステムであるGene Pulse MXCell(Bio-Rad)を使用するエレクトロポレーションで実施した。各トランスフェクションについて、生存可能細胞を、予め温めた培地に２.８６×１０７細胞／mlで移した。８０μg ＤＮＡ(１：１比の重鎖ＧＶおよび軽鎖ＧＶ)および７００μl細胞懸濁液を、各キュベット／ウェルに等分した。細胞を３００Ｖ、１３００μFで電気穿孔した。トランスフェクト細胞を、エレンマイヤーフラスコ中の予め温めた培地に移し、キュベット／ウェルを予め温めた培地で２回濯ぎ、これもまたフラスコに移した。トランスフェクト細胞培養を、３６.５℃、５％ＣＯ２、８５％湿度、１４０rpmの振盪しているインキュベーターで６日間インキュベートした。細胞生存能および生存可能細胞濃度を、Cedex HiRes自動化細胞カウンター(Roche)を使用して回収時に測定した。
実施例２.５：プロテインＡ親和性クロマトグラフィー
細胞培養上清ｗを回収し、２０００rpmで１０分遠心し、０.２２μm ＰＥＳ膜フィルターで濾過することにより浄化した。浄化した上清を、ＡＫＴＡピュリファー(１０ml／分)上で予充填５ml HiTrap MabSelect SuREカラム(GE Healthcare, 11-0034-94)を使用して精製した。カラムを５０mM リン酸ナトリウム、１２５mM 塩化ナトリウム、ｐＨ７.０(平衡化緩衝液)の５カラム体積(ＣＶ)で平衡化した。サンプル充填後、カラムを２ＣＶの平衡化緩衝液、続く３ＣＶの５０mM リン酸ナトリウム、１Ｍ 塩化ナトリウムｐＨ７.０で洗浄し、２ＣＶの平衡化緩衝液での洗浄を繰り返した。次いで生成物を１０mM ギ酸ナトリウム、ｐＨ３.５で５ＣＶで溶出させた。タンパク質含有溶出フラクションを直ぐにｐＨ７.２にｐＨ調節し、０.２μmフィルターで濾過した。
単一タンパク質含有ピークが、溶出相の間に観察された。このピークは、ＳＥ−ＨＰＬＣおよびＳＤＳ−ＰＡＧＥで分析したとき、ｍＡｂを含むことが観察された。回収したタンパク質収量を表５に示す。クローンは、３２.４〜４３.０mg／Ｌの範囲で一過性に発現された。
実施例２.６：ＳＥ−ＨＰＬＣ分析
プロテインＡ精製抗体のサンプルを、Zorbax GF-250 ４μm ９.４mm ＩＤ×２５０mmカラム(Agilent)を使用するAgilent 1200シリーズＨＰＬＣ系のＳＥ−ＨＰＬＣによりデュプリケートで分析した。１mg／ml濃度のサンプルの一定量を、注入前に０.２μmフィルターで濾過した。８０μl量をそれぞれ注入し、１ml／分で１５分流した。可溶性凝集体レベルを、Chemstation(Agilent)ソフトウェアを使用して分析した。
全体的に検出されたピーク面積のパーセンテージを示す保持時間を伴うクロマトグラフィープロファイルを、試験抗体および対照ＩｇＧ４抗体から得た。生成物は、単一タンパク質ピークを、ヒトＩｇＧ４抗体対照(約８.６４分)と同等であり、単量体抗体に一致する約８.６５〜８.７２分に示す。可溶性凝集体からなる少量(最大約４〜５％)の高分子量不純物が、約７.４３〜８.０８分の保持時間で検出された。
実施例２.７：ＳＤＳ−ＰＡＧＥ分析
還元サンプルを、NuPage 4x LDSサンプル緩衝液(Invitrogen, NP0007)およびNuPage 10xサンプル還元剤(Invitrogen, NP0009)と混合し、７０℃、１０分インキュベートすることにより分析用に調製した。非還元サンプルについて、還元剤および加熱インキュベーションを省いた。サンプルを、１.５mm NuPage ４〜１２％Bis-Tris Novexプレキャストゲル(Invitrogen, NP0335PK2)で、NuPageMES SDSランニング緩衝液を用いて、変性条件下電気泳動した。１０μl量のSeeBlue Plus 2着色済分子量標準(Invitrogen, LC5925)および１mg／mlの対照ＩｇＧ４抗体をゲルに入れた。１mg／mlの各サンプルの１μlをゲルに充填した。電気泳動したら、ゲルをInstantBlue(TripleRed, ISB01L)で、３０分、室温で染色した。染色ゲルの画像を、BioSpectrum Imaging System(UVP)で分析した。
本分析は抗体生成物の存在および良好な純度レベルを確認した。非還元条件下、対照ＩｇＧ４抗体と同等な、９８kDaに近い優勢なタンパク質バンドが観察された。対照ＩｇＧ４抗体および試験クローンの１は、非還元条件下、約７０kDaの重＋軽鎖半抗体に対応する、さらなる微かなバンドを示す。これは、対照抗体で期待される。２のバンドが還元条件下で観察され、重鎖(４９kDaマーカーの位置に近い)および軽鎖(２８kDaマーカーの位置に近い)に対応し、対照ＩｇＧ４抗体で見られたバンドと同等であった。
実施例２.８：等電点電気泳動(ＩＥＦ)分析
プロテインＡ精製抗体の非還元サンプルを下記のように電気泳動した。
５μgのプロテインＡ精製サンプルを、１.０mm Novex ｐＨ３〜１０勾配ゲル(Invitrogen, EC66552BOX)で、製造業者が推奨するランニング条件を使用して、電気泳動した。１０μl量のＩＥＦ ｐＨ３〜１０マーカー(Invitrogen, 39212-01)をゲルに入れた。電気泳動したら、ゲルを１０％ＴＣＡ溶液で３０分固定し、InstantBlue(TripleRed, ISB01L)で一夜、室温で染色した。染色ゲルの画像を、BioSpectrum Imaging System(UVP)で分析した。
表６に示すように、試験したクローンは、ｐＨ７.４マーカーと８.０マーカーの間で荷電アイソフォームを示した。検出した荷電アイソフォームは、これらの抗体について、６.９９〜７.５６と予測された、理論的に計算したｐＩよりわずかに塩基性であった。より塩基性の荷電アイソフォームへの全般的シフトは、分子上のグリコシル化のような翻訳後修飾の存在を示唆する。クローンＣおよびクローンＥは同等な荷電アイソフォームを示し、これはまた両者について同じである(６.９９)理論的に計算したｐＩと同等である。対照ＩｇＧ４抗体は予想通りに行動した。
実施例２.９：内毒素分析
精製タンパク質の内毒素レベルを、最終濃度(最大３.４４mg／ml)で、ＬＡＬアッセイ(Charles River)に基づくカートリッジベースの方法であるEndosafe-PTS装置で測定した。
表５に示すように、内毒素含量は、０.０４〜０.６３ＥＵ／mgの範囲であることが判明した。
結論
選択したヒト化抗ＰＤ−１ ｍＡｂのためのＧＳ単一遺伝子発現ベクターを構築し、ＣＨＯＫ１ＳＶ ＧＳ−ＫＯ細胞の一過性トランスフェクションに使用した。２.６〜２.８リットルの発現培養を、標準条件下６日間インキュベートし、得られた細胞培養上清を、プロテインＡクロマトグラフィーを使用して精製した。精製後力価を表５に示し、３２.３８〜４３.０mg／Ｌの範囲であることが判明した。回収した収は、９０.７〜１２０.４mgの範囲であった。
ＳＤＳ−ＰＡＧＥおよびＳＥ−ＨＰＬＣ分析は、ｍＡｂの二量体抗体と優勢に一致する、生成物に存在する少量(最大６.０６％)の可溶性凝集体の存在を示した。ｍＡｂはまた、三量体抗体と一致する保持時間の高分子量不純物も示した。
等電点電気泳動は、全ｍＡｂについて多数の荷電アイソフォームを検出した。ｍＡｂは、これらの分子について理論的に計算したｐＩに基づいたとき、一般に塩基性のアイソフォームを示し、一定レベルの翻訳後修飾を示した。ｍＡｂは、その理論的に計算したｐＩ値と同等であることが判明した。
全サンプルの内毒素レベルをサンプルの提供前に測定し、０.６３ＥＵ／mg以下であることが判明した。
実施例３：マウスおよびヒト化抗ＰＤ−１抗体の特徴付け
実施例３.１：マウス抗ＰＤ−１抗体の特徴付け
マウス抗ＰＤ−１抗体ＢＡＰ０４９のＰＤ−１への結合親和性を調査した。マウス抗ＰＤ−１抗体は、ヒトＰＤ−１−Ｉｇ融合タンパク質に、ＥＬＩＳＡで測定して０.０４nMのＫＤで結合した。ＦＡＣＳ分析により示されるように、マウス抗ＰＤ−１抗体は、ヒトＰＤ−１トランスフェクトＪｕｒｋａｔ細胞に０.０６nMのＫＤで、カニクイザルＴ細胞(例えば、ＣＤ３／ＣＤ２８活性化ＣＤ４ Ｔ細胞)に０.４nMのＫＤでおよびカニクイザルＰＤ−１をトランスフェクトした細胞に０.６nMのＫＤで結合した。
マウス抗ＰＤ−１抗体ＢＡＰ０４９の遮断活性を、競合結合アッセイにより試験した。マウス抗ＰＤ−１抗体は、０.３nMのＩＣ５０で、ヒトＰＤ−１発現３００.１９細胞へのＰＤ−Ｌ１結合を遮断した。０.９nMのＩＣ５０で、ヒトＰＤ−１発現３００.１９細胞へのＰＤ−Ｌ２結合を遮断した。
インターフェロンガンマ(ＩＦＮ−γ)発現に対するマウス抗ＰＤ−１抗体ＢＡＰ０４９の効果を試験した。マウス抗ＰＤ−１抗体は、ＩＦＮ−γ発現の、抗ＣＤ３(０.１μg／mL)で刺激した細胞における２.３±１.１倍増加、ブドウ球菌エンテロトキシンＢ(ＳＥＢ)(３pg／mL)で刺激した細胞における２.５±２.０倍増加およびＣＭＶペプチドで刺激した細胞における２.８±０.８倍増加をもたらした。
マウス抗ＰＤ−１抗体ＢＡＰ０４９はまた少なくとも一定数(ｎ)の細胞分裂(例えば、ｎ＝２、４、６)を経たＣＤ８＋細胞のパーセンテージにより示されるように、ＣＭＶペプチドで活性化したＣＤ８＋ Ｔ細胞の増殖を増加させることも判明した。
実施例３.２：ヒト化抗ＰＤ−１抗体の特徴付け
結合親和性および特異性
ヒトＰＤ−１タンパク質上の代表的ヒト化抗ＰＤ−１抗体の結合を、Ｂｉａｃｏｒｅ法を使用して測定した。結果は、Ｋａ＝２.７８×１０５Ｍ−１ｓ−１；Ｋｄ＝２.１３×１０−４ｓ−１；ＫＤ＝０.０８２７±０.００５５０５nMであった。
ヒトＰＤ−１発現３００.１９細胞上の同じヒト化抗ＰＤ−１抗体の結合を、ＦＡＣＳ分析を使用して測定した。結果は、ヒトＩｇＧ４アイソタイプ対照と比較して、抗ＰＤ−１抗体(ヒトＩｇＧ４)が高親和性でヒトＰＤ−１に結合することを示す。
代表的ヒト化抗ＰＤ−１抗体は、カニクイザルＰＤ−１タンパク質およびカニクイザルＰＤ−１発現３００.１９細胞に高親和性を示すことが判明した。Ｂｉａｃｏｒｅ法で測定して、抗ＰＤ−１抗体は、カニクイザルＰＤ−１に０.０９３±０.０１５nMのＫＤで結合する。カニクイザルＰＤ−１への結合親和性は、そのヒトＰＤ−１への結合親和性と同等である。
さらなる結合分析は、代表的ヒト化抗ＰＤ−１抗体がマウスＰＤ−１と交差反応性ではないまたは親細胞株と交差反応性であることを示す。
ＰＤ−１とそのリガンドの相互作用の遮断
代表的ヒト化抗ＰＤ−１抗体が、ＰＤ−１と、その既知リガンドの両者、ＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２の相互作用を遮断する能力を試験した。結果は、抗ＰＤ−１抗体が、ヒトＩｇＧ４アイソタイプ対照および無抗体対照と比較して、ヒトＰＤ−１発現３００.１９細胞上のＰＤ−Ｌ１およびＰＤ−Ｌ２の結合を遮断することを示す。抗ＰＤ−１抗体は、３００.１９細胞上のＰＤ−Ｌ１結合を０.９４±０.１５nMのＩＣ５０で遮断した。同抗体は、３００.１９細胞上のＰＤ−Ｌ２結合を１.３±０.２５nMのＩＣ５０で遮断した。
細胞活性
代表的ヒト化抗ＰＤ−１抗体が、ＩＬ−２のブドウ球菌エンテロトキシンＢ(ＳＥＢ)刺激発現を増強する能力を、ヒト全血エクスビボアッセイで試験した。希釈ヒト全血を、抗ＰＤ−１抗体と、ＳＥＢの存在下または非存在下、３７℃で４８時間インキュベートし、その後ＩＬ−２測定した。結果は、抗ＰＤ−１抗体が、ＳＥＢ刺激ＩＬ−２発現を、ヒトＩｇＧ４アイソタイプ対照と比較して、２.２８±０.３２倍増加させたことを示す(２５μg／ml ＳＥＢ；ｎ＝５ドナー)。
実施例４：ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γ状態に基づく患者選択
数タイプの癌の各々に関して、複数患者からのサンプルをＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γ状態について試験した。各サンプルを、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γについて三種陰性、これらのマーカーについて１もしくは２の陽性またはこれらのマーカーの三種陽性として分類した。図１１は、本実験において、患者の集団内で、肺癌(扁平上皮)、肺癌(腺癌)、頭頸部癌、子宮頸癌(扁平上皮)、胃癌、甲状腺癌、黒色腫および鼻咽頭癌のタイプはしばしばＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γについて三種陽性であることを示す。これらの癌のタイプを有する患者は、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体および組み合わせ療法での治療の良好な候補である。処置成功の可能性は、どの患者がＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性であるかを決定し、該三種陽性患者をここに記載する抗ＰＤ−１抗体および組み合わせ療法で処置することによりさらに押し上げ得る。
図１２は、患者の集団内で、ＥＲ＋乳癌および膵臓癌のタイプの癌がＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γについて三種陽性であることが稀であることを示す。特に、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γについて一般に陽性ではない癌においても、処置成功の可能性を、患者が、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性であるかを決定し、該三種陽性患者をここに記載する抗ＰＤ−１抗体および組み合わせ療法で処置することにより高めることができる。
図１３は、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性である乳癌患者の割合を示す。乳癌一般を考慮すると、三種陽性の割合はやや低い。しかしながら、ＩＭ−ＴＮ乳癌にのみ焦点を絞ったとき、はるかに高い割合の患者がＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γについて三種陽性であることを見ることができる。ＩＭ−ＴＮ乳癌は、慣用の治療での処置が特に困難である。ＩＭ−ＴＮ乳癌がＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γについてしばしば三種陽性であるとの発見は、ここに記載する抗ＰＤ−１抗体および組み合わせ療法でのこの癌の治療に新たな道を開く。
図１４は、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性である結腸癌患者の割合を示す。結腸癌一般を考慮すると、三種陽性の割合はやや低い。しかしながら、ＭＳＩ高(高マイクロサテライト不安定性)乳癌にのみ焦点を絞ったとき、はるかに高い割合の患者がＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γについて三種陽性であることを見ることができる。ＭＳＩレベルは、例えば、市販のＰＣＲベースの方法を使用してアッセイできる。
胃癌サンプルを、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γのレベルについて試験した(データは示していない)。ＭＳＩ高またはＥＢＶ＋胃癌において、約４９％がＰＤ−Ｌ１に陽性であり、ＰＤ−Ｌ１−陽性細胞の高い割合が、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γに対して三種陽性であることが判明した。ＰＤ−Ｌ１−陽性細胞およびＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γ陽性細胞の一定割合が、ＰＩＫ３ＣＡも陽性であることも判明した。この知見は、これらの癌が、ＰＤ−１抗体で、所望によりＰＩＫ３治療剤と組み合わせて処置し得ることを示唆する。
ＭＳＩ高ＣＲＣサンプルを、マーカーの組み合わせについて試験した(データは示していない)。ＭＳＩ高ＣＲＣサンプルにおいて、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γサンプルの大部分がまたＬＡＧ−３、ＰＤ−１(ＰＤＣＤ１とも呼ばれる)、ＲＮＦ４３およびＢＲＡＦについても陽性であることが判明した。この知見は、これらの癌が、ＰＤ−１抗体で、所望によりＬＡＧ−３、ＰＤＣＤ１、ＲＮＦ４３およびＢＲＡＦの１以上を標的とする治療剤と組み合わせて、処置し得ることを示唆する。
扁平上皮細胞肺癌をマーカーの組み合わせについて試験した(データは示していない)。扁平上皮細胞肺癌サンプルにおいて、ＰＤ−Ｌ１／ＣＤ８／ＩＦＮ−γサンプルの大部分がまたＬＡＧ−３も陽性であることが判明した。この知見は、これらの癌が、ＰＤ−１抗体で、所望によりＬＡＧ−３、例えば、ＬＡＧ−３抗体を標的とする治療剤と組み合わせて、処置し得ることを示唆する。
乳頭甲状腺癌を、ＢＲＡＦ Ｖ６００Ｅ変異を含むマーカーの組み合わせについて試験した(データは示していない)。ＰＤ−Ｌ１に陽性である甲状腺癌サンプルの大部分がＢＲＡＦ Ｖ６００Ｅも陽性であることが判明した。この知見は、これらの癌が、ＰＤ−１抗体で、所望によりＢＲＡＦを標的とする治療剤と組み合わせて、処置し得ることを示唆する。
実施例５：ＰＤ−Ｌ１状態に基づく患者選択
ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１に基づく療法の癌適応症の広い試験を可能とするために、我々は、肺および肝臓腫瘍の両者を含むヒト癌におけるＰＤ−Ｌ１発現を、タンパク質およびｍＲＮＡの両レベルで評価した。
ＰＤ−Ｌ１タンパク質発現を、免疫組織化学(ＩＨＣ)により、一連のホルマリン固定パラフィン包埋非小細胞肺(ＮＳＣＬＣ)腺癌(ＡＣＡ)、ＮＳＣＬＣ扁平上皮細胞癌(ＳＣＣ)および肝細胞癌(ＨＣＣ)腫瘍において評価した。ＰＤ−Ｌ１発現を、染色強度および陽性腫瘍細胞の割合に基づく、手動組織スコア(Ｈスコア)方法により、半定量的に採点した。我々のＩＨＣ分析において、ＰＤ−Ｌ１陽性(ＰＤ−Ｌ１＋)を、Ｈスコア≧２０として定義した。並行して、ＰＤ−Ｌ１ ｍＲＮＡ発現データを、これらの同じ適応症(５０３ ＮＳＣＬＣ ＡＣＡ、４８９ ＮＳＣＬＣ ＳＣＣおよび１９１ ＨＣＣ)についてThe Cancer Genome Atlas(TCGA)から試験した。
RNAseq分析で、ＲＳＥＭ標準化後、データをログ２(ＲＰＫＭ＋０.１)として、ＴＣＧＡ腫瘍適応症にまたがるOmicSoft RNASeqパイプラインを利用して計算した。ＰＤ−Ｌ１発現は、ＨＣＣと比較して、ＮＳＣＬＣ ＡＣＡおよびＳＣＣで上昇している。ＴＣＧＡにおける全適応症にまたがる発現レベルの分布の重層および比較により、我々はＰＤ−Ｌ１の過発現プロファイルをランク付けし、ＴＣＧＡ ＨＣＣコホートがはるかに減少したＰＤ−Ｌ１ ｍＲＮＡレベルを有し、中央レベル−０.８であり、対照的にＡＣＡは１.３およびＳＣＣは１.５であり、これは中央レベル発現の２倍を超える変化に達することを発見した。RNAseqで、我々の分析は、ＮＳＣＬＣ腺癌の５０％、ＮＳＣＬＣ扁平上皮細胞癌の５４％およびＨＣＣの６％を、ＰＤ−Ｌ１について高発現として規定した。
腫瘍細胞ＰＤ−Ｌ１タンパク質発現を、４５の肺腺癌(ＡＣＡ)サンプル、４７の肺扁平上皮細胞癌(ＳＣＣ)サンプルおよび３６の肝細胞癌(ＨＣＣ)サンプルで測定した。１６／４５(３５.６％)肺ＡＣＡ、２１／４７(４４.７％)肺ＳＣＣがＰＤ−Ｌ１陽性であった。対照的に、ＰＤ−Ｌ１陽性は、ＨＣＣサンプルの２／３６(５.６％)にしか見られなかった。
まとめると、大きなおよび独立したヒトＮＳＣＬＣおよびＨＣＣサンプルセットにおけるＩＨＣおよびRNAseq分析で、我々は、ＨＣＣよりもＮＳＣＬＣが、ＰＤ−Ｌ１発現により富んでいることを発見した。ＮＳＣＬＣ内で、腺癌と扁平上皮細胞癌は同等な所見であった。重要なことに、３適応症における多数のサンプル(ＩＨＣで１２８およびRNAseqで１１８３)の中で、タンパク質ベースの分析とｍＲＮＡベースの分析で極めて良好な一致が見られる。我々の知見は、それゆえに、ＰＤ−１／ＰＤ−Ｌ１ベースの免疫療法に対する応答を富ませ得る適応症および患者セグメントについてＴＣＧＡにおいて掘り当てた大規模ｍＲＮＡベースデータを確立する。
実施例６：ＰＤ−Ｌ１調節に対する標的剤の効果
本実施例は、ＰＤ−Ｌ１(ＣＤ２７４)調節に対する選択した治療剤(例えば、ｃＭＥＴ阻害剤、ＭＥＫ阻害剤、ｂＲＡＦ阻害剤およびＡＬＫ阻害剤)の効果を評価する。化合物Ａ１７は、ＵＳ特許番号８,４２０,６４５号に開示のように製造できる。次の化合物：化合物Ａ１８(リン酸ルキソリチニブ)、化合物Ａ２３(セリチニブ)、化合物Ａ３４(ビニメチニブ)および化合物Ａ２９(エンコラフェニブ)は、Novartis AG, Basel, Switzerlandから入手可能である。選択した治療剤を、実時間ＰＣＲおよびフローサイトメトリーでＰＤ−Ｌ１レベルについて試験した。腫瘍細胞に対する化合物Ａ１７、化合物Ａ１８、化合物Ａ３４、化合物Ａ２９および化合物Ａ２３によるＰＤ−Ｌ１の顕著な阻害が観察された。
化合物Ａ１７は、非小細胞性肺癌細胞におけるＰＤ−Ｌ１タンパク質を下方制御する
ＰＤ−Ｌ１(ＣＤ２７４)発現を、化合物Ａ１７で処置した癌細胞株で試験した。細胞をＡＴＣＣから得て、ＡＴＣＣの指示に従いインビトロで培養した。使用した細胞株は、先にCancer Cell Line Encyclopedia Project(http://www.broadinstitute.org/ccle/home)により特徴付けられていた。
６ウェル培養プレートに播種した細胞を、種々の濃度(１０nM、１００nMおよび１０００nM)の化合物Ａ１７で、２４時間、４８時間および７２時間処理した。等量の媒体(ＤＭＳＯ)を対照として使用した。細胞をＰＢＳで洗浄し、細胞スクレーパーを使用して採取した。
各反応について、０.５〜１×１０６細胞を、２０μLの抗ヒトモノクローナルＰＤ−Ｌ１−ＰＥ抗体、クローンＭ１Ｈ１(ＢＤ)で、３０〜６０分、４℃で染色した。細胞を２回洗浄し、データFACSDivaソフトウエアを備えたCanto II(BD Bioscience)を使用して得た。データ分析をFlowJoソフトウエア(Tree Star)を使用して実施した。平均蛍光強度(ＭＦＩ)を、単一セルのゲーティングにより決定した。非染色細胞をゲーティング対照として使用した。
ＥＢＣ−１細胞(ｃＭＥＴ増幅を伴う非小細胞性肺癌(ＮＳＣＬＣ))の化合物Ａ１７でのインビトロ処理は、フローサイトメトリーで観察して、ＰＤ−Ｌ１の表面発現の顕著な下方制御をもたらした(図１５)。ここに示す結果は、化合物Ａ１７がＰＤ−Ｌ１／ＰＤ−１阻害剤として機能することを示す。
化合物Ａ１７、化合物Ａ３４、化合物Ａ１８、化合物Ａ２９および化合物Ａ２３はＰＤ−Ｌ１ ｍＲＮＡを下方制御する
TaqMan RT PCRアッセイを、細胞株および異種移植腫瘍におけるＰＤ−Ｌ１(ＣＤ２７４)の発現レベルを検出するように開発した。ｍＲＮＡを、凍結細胞ペレットまたは腫瘍フラグメントから、Qiagen RNeasy Mini kitを使用して単離した。単離ＲＮＡを−８０℃で凍結した。ＲＮＡ品質を確認し、ＲＮＡを、2100 Agilent Bioanalyzerを、Agilent RNA 6000 Nano Kit用プロトコールに従い使用して定量した。ｃＤＮＡを、High Capacity RNA-to cDNA Kit(Applied Biosystems)を使用して調製した。
実時間ＰＣＲ反応を、１０μlのUniversal PCR master mix(Applied Biosystems)、１μlのヒトＰＤ−Ｌ１(ＣＤ２７４)プローブ／プライマーセット(Applied Biosystems)および８μlのｃＤＮＡを含む２０μl総体積で実施した。各サンプルを３回流した。逆転写反応で２５〜５０ngのＲＮＡから産生されたｃＤＮＡの量を各ＰＣＲ反応で使用した。ＰＤ−Ｌ１とＧＡＰＤＨのｍＲＮＡレベルの差により、２の実時間ＰＣＲ反応を、同量のｃＤＮＡを使用する別のチューブで実施した。実時間ＰＣＲ反応を、C1000 Thermal Cycle(BioRad)で次のサイクルプログラムで流した：１０分、９５℃でインキュベーション、続く４０サイクルの９５℃で１５秒および６０℃で１分。反応完了後、ＰＤ−Ｌ１平均Ｃｔを、ＧＡＰＤＨ対照反応からの各Ｃｔ値に対して標準化した。各標準化対数値を、リニア値に変換した。
化合物Ａ１７によるＰＤ−Ｌ１発現(ｍＲＮＡ)阻害が、Ｈｓ.７４６.Ｔ腫瘍(ｃＭＥＴ増幅および変異を有する胃癌細胞)異種移植で観察された(図１６)。化合物Ａ２３によるＰＤ−Ｌ１ ｍＲＮＡの阻害がＨ３１２２(ＡＬＫ転座を有する非小細胞性肺癌(ＮＳＣＬＣ))でインビトロで観察された(図１７)。化合物Ａ２９および化合物Ａ３４によるＰＤ−Ｌ１ ｍＲＮＡの下方制御が、それぞれ、ＬＯＸＩＭＶ１(ＢＲＡＦ変異体黒色腫、図１８)およびＨＥＹＡ８(ＫＲＡＦ変異体卵巣癌、図１９)腫瘍を担持する腫瘍異種移植モデルで観察された。化合物Ａ１８によるＰＤ−Ｌ１ ｍＲＮＡの下方制御が、ＵＫＥ−１(ＪＡＫ２Ｖ６１７Ｆ変異を有する骨髄増殖性新生物(ＭＰＮ)株、図２０)を担持する腫瘍異種移植モデルで観察された。
ここに示す結果は、癌に対する免疫チェックポイント分子の制御における化合物Ａ１７、化合物Ａ３４、化合物Ａ１８、化合物Ａ２９および化合物Ａ２３の役割を示す。これらの薬剤により観察されたＰＤ−Ｌ１発現阻害は、これらの標的剤が、癌シグナル伝達に対する効果に加えて、免疫調節活性を有し得ることを示唆する。それゆえに、ここに示す結果は、ＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１、ＬＡＧ−３および／またはＴＩＭ−３のような免疫チェックポイント阻害剤の阻害剤との標的剤の投与が、免疫チェックポイント介在免疫抑制のより強力な回復を達成することを示唆する。
引用による取り込み
ここに記載する全ての刊行物、特許および受託番号は、個々の文献または特許が具体的にかつ個々に引用により包含すると示されているかのように、引用によりその全体を本明細書に包含させる。
均等物
対象の発明の特異的態様が議論されているが、上記明細書は説明的であり、制限的ではない。本発明の多くの変更が、本明細書および添付する特許請求の範囲の通読により当業者には明らかとなる。本発明の完全な範囲は、特許請求の範囲とそれに付随するその均等物の全範囲および本明細書とそれに付随するこのような変異を考慮して、決定すべきである。

Claims (28)

  1. ヒトプログラム死１（ＰＤ−１）と結合できる単離抗体分子および薬学的に許容される担体、添加物または安定化剤を含む、医薬組成物であって、
    抗体分子は、
    （ａ）配列番号４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含む重鎖可変領域（ＶＨ）；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）；
    （ｂ）配列番号１のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ；
    （ｃ）配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ；または
    （ｄ）配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ
    を含み、
    医薬組成物は、化学療法剤、標的抗癌治療剤、腫瘍溶解性薬剤、細胞毒性剤、免疫ベース治療、サイトカイン、外科手技、放射線治療、共刺激分子のアクティベーター、阻害分子の阻害剤、ワクチンまたは細胞性免疫療法の１以上から選択される第二の治療剤または方法と組み合わせて使用され
    所望により、医薬組成物が：
    （ａ）ＯＸ４０、ＣＤ２、ＣＤ２７、ＣＤＳ、ＩＣＡＭ−１、ＬＦＡ−１（ＣＤ１１ａ／ＣＤ１８）、ＩＣＯＳ（ＣＤ２７８）、４−１ＢＢ（ＣＤ１３７）、ＧＩＴＲ、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＢＡＦＦＲ、ＨＶＥＭ、ＣＤ７、ＬＩＧＨＴ、ＮＫＧ２Ｃ、ＳＬＡＭＦ７、ＮＫｐ８０、ＣＤ１６０、Ｂ７−Ｈ３またはＣＤ８３リガンドの１以上から選択される共刺激分子のアゴニスト；または
    （ｂ）ＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２、ＣＴＬＡ−４、ＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＣＥＡＣＡＭ−１、ＣＥＡＣＡＭ−５、ＶＩＳＴＡ、ＢＴＬＡ、ＴＩＧＩＴ、ＬＡＩＲ１、ＣＤ１６０、２Ｂ４またはＴＧＦＲの１以上から選択される免疫チェックポイント分子の阻害剤
    と組み合わせて投与される、
    医薬組成物。
  2. ヒトプログラム死１（ＰＤ−１）と結合できる単離抗体分子および薬学的に許容される担体、添加物または安定化剤を含む、医薬組成物であって、
    抗体分子が、
    （ａ）配列番号４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含む重鎖可変領域（ＶＨ）；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）；
    （ｂ）配列番号１のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ；
    （ｃ）配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ；または
    （ｄ）配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ
    を含み、
    医薬組成物が、Ｇ０２４４２１０４（ＧＳＫ１１２０２１２）またはダブラフェニブの一方または両方と組み合わせて使用される、医薬組成物。
  3. ヒトプログラム死１（ＰＤ−１）と結合できる単離抗体分子および薬学的に許容される担体、添加物または安定化剤を含む、医薬組成物であって、
    抗体分子が、
    （ａ）配列番号４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含む重鎖可変領域（ＶＨ）；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域（ＶＬ）；
    （ｂ）配列番号１のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ；
    （ｃ）配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号５のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１３のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１４のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３３のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ；または
    （ｄ）配列番号２２４のＶＨＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号２のＶＨＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３のＶＨＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＨ；および配列番号１０のＶＬＣＤＲ１アミノ酸配列、配列番号１１のＶＬＣＤＲ２アミノ酸配列および配列番号３２のＶＬＣＤＲ３アミノ酸配列を含むＶＬ
    を含み、
    医薬組成物が、
    （ｉ）１）タンパク質キナーゼＣ（ＰＫＣ）阻害剤；２）ヒートショックタンパク質９０（ＨＳＰ９０）阻害剤；３）ホスホイノシチド３−キナーゼ（ＰＩ３Ｋ）および／またはラパマイシンの標的（ｍＴＯＲ）の阻害剤；４）シトクロムＰ４５０阻害剤（例えば、ＣＹＰ１７阻害剤または１７アルファ−ヒドロキシラーゼ／Ｃ１７−２０リアーゼ阻害剤）；５）鉄キレート剤；６）アロマターゼ阻害剤；７）ｐ５３阻害剤、例えば、ｐ５３／Ｍｄｍ２相互作用の阻害剤；８）アポトーシスインデューサー；９）血管形成阻害剤；１０）アルドステロンシンターゼ阻害剤；１１）スムーズンド（ＳＭＯ）受容体阻害剤；１２）プロラクチン受容体（ＰＲＬＲ）阻害剤；１３）Ｗｎｔシグナル伝達阻害剤；１４）ＣＤＫ４／６阻害剤；１５）線維芽細胞増殖因子受容体２（ＦＧＦＲ２）／線維芽細胞増殖因子受容体４（ＦＧＦＲ４）阻害剤；１６）マクロファージコロニー刺激因子（Ｍ−ＣＳＦ）阻害剤；１７）ｃ−ＫＩＴ、ヒスタミン遊離、Ｆｌｔ３（例えば、ＦＬＫ２／ＳＴＫ１）またはＰＫＣの１以上の阻害剤；１８）ＶＥＧＦＲ−２（例えば、ＦＬＫ−１／ＫＤＲ）、ＰＤＧＦＲベータ、ｃ−ＫＩＴまたはＲａｆキナーゼＣの１以上の阻害剤；１９）ソマトスタチンアゴニストおよび／または成長ホルモン遊離阻害剤；２０）未分化リンパ腫キナーゼ（ＡＬＫ）阻害剤；２１）インシュリン様増殖因子１受容体（ＩＧＦ−１Ｒ）阻害剤；２２）Ｐ−糖タンパク質１阻害剤；２３）血管内皮細胞増殖因子受容体（ＶＥＧＦＲ）阻害剤；２４）ＢＣＲ−ＡＢＬキナーゼ阻害剤；２５）ＦＧＦＲ阻害剤；２６）ＣＹＰ１１Ｂ２の阻害剤；２７）ＨＤＭ２阻害剤、例えば、ＨＤＭ２−ｐ５３相互作用の阻害剤；２８）チロシンキナーゼ阻害剤；２９）ｃ−ＭＥＴ阻害剤；３０）ＪＡＫ阻害剤；３１）ＤＡＣ阻害剤；３２）１１β−ヒドロキシラーゼ阻害剤；３３）ＩＡＰ阻害剤；３４）ＰＩＭキナーゼ阻害剤；３５）Ｐｏｒｃｕｐｉｎｅ阻害剤；３６）ＢＲＡＦ、例えば、ＢＲＡＦ Ｖ６００Ｅまたは野生型ＢＲＡＦ阻害剤；３７）ＨＥＲ３阻害剤；３８）ＭＥＫ阻害剤；または３９）脂質キナーゼ阻害剤の１以上
    （ｉｉ）表７に記載の化合物Ａ１〜Ａ５１の１以上
    の（ｉ）または（ｉｉ）の一方または両方と組み合わせて使用される、医薬組成物。
  4. 抗体分子が、ヒト化抗体分子および／または単一特異性抗体分子または二重特異性抗体分子である、請求項１−３のいずれかに記載の医薬組成物。
  5. 抗体分子が、配列番号１４７、１５１、１５３、１５７、１６０、１６２、１６６または１６９のいずれかのアミノ酸配列またはそれと少なくとも９０％同一のアミノ酸配列または配列番号１４７、１５１、１５３、１５７、１６０、１６２、１６６または１６９のいずれかのアミノ酸配列と比較して、アミノ酸置換、挿入または欠失が２を超えないアミノ酸配列を含む少なくとも１、２、３または４のフレームワーク（ＦＷ）領域を含む重鎖可変領域；および／または配列番号１７４、１７７、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９４、１９６、２００、２０２、２０５または２０８のいずれかのアミノ酸配列またはそれと少なくとも９０％同一のアミノ酸配列または１７４、１７７、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９４、１９６、２００、２０２、２０５または２０８のいずれかのアミノ酸配列と比較して、アミノ酸置換、挿入または欠失が２を超えないアミノ酸配列を含む少なくとも１、２、３または４のフレームワーク領域を含む軽鎖可変領域を有する、請求項１−４のいずれかに記載の医薬組成物。
  6. 抗体分子が、配列番号３８、５０、８２または８６のアミノ酸配列または配列番号３８、５０、８２または８６のいずれかと少なくとも８５％同一であるアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン；および／または配列番号４２、４６、５４、５８、６２、６６、７０、７４または７８のアミノ酸配列または配列番号４２、４６、５４、５８、６２、６６、７０、７４または７８のいずれかと少なくとも８５％同一であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、請求項１−５のいずれかに記載の医薬組成物。
  7. 抗体分子が、配列番号３８、配列番号５０、配列番号８２または配列番号８６から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメイン；および／または配列番号４２、配列番号４６、配列番号５４、配列番号５８、配列番号６２、配列番号６６、配列番号７０、配列番号７４または配列番号７８から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む、請求項１−６のいずれかに記載の医薬組成物。
  8. 抗体分子が、配列番号４０、配列番号９１、配列番号５２、配列番号１０２、配列番号８４または配列番号８８から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖；および／または配列番号４４、配列番号４８、配列番号５６、配列番号６０、配列番号６４、配列番号６８、配列番号７２、配列番号７６または配列番号８０から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、請求項１−６のいずれかに記載の医薬組成物。
  9. 抗体分子が、
    （ａ）配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号４２のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｂ）配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号６６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｃ）配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号７０のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｄ）配列番号５０のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号７０のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｅ）配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号４６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｆ）配列番号５０のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号４６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｇ）配列番号５０のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号５４のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｈ）配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号５４のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｉ）配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号５８のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｊ）配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号６２のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｋ）配列番号５０のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号６６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｌ）配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号７４のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｍ）配列番号３８のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号７８のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｎ）配列番号８２のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号７０のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；
    （ｏ）配列番号８２のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号６６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン；または
    （ｐ）配列番号８６のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号６６のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン
    を含む、請求項１−６のいずれかに記載の医薬組成物。
  10. 抗体分子が、
    （ａ）配列番号９１のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号４４のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｂ）配列番号９１のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号５６のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｃ）配列番号９１のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６８のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｄ）配列番号９１のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号７２のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｅ）配列番号１０２のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号７２のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｆ）配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号４４のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｇ）配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号４８のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｈ）配列番号５２のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号４８のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｉ）配列番号５２のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号５６のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｊ）配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号５６のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｋ）配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６０のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｌ）配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６４のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｍ）配列番号５２のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６８のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｎ）配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６８のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｏ）配列番号５２のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号７２のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｐ）配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号７２のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｑ）配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号７６のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｒ）配列番号４０のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号８０のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｓ）配列番号８４のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号７２のアミノ酸配列を含む軽鎖；
    （ｔ）配列番号８４のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６８のアミノ酸配列を含む軽鎖；または
    （ｕ）配列番号８８のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号６８のアミノ酸配列を含む軽鎖
    を含む、請求項１−９のいずれかに記載の医薬組成物。
  11. 抗体分子が、モノクローナル抗体、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖまたは一本鎖Ｆｖフラグメント（ｓｃＦｖ）であるか、または、
    ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３またはＩｇＧ４から選択された重鎖定常領域および／またはカッパまたはラムダの軽鎖定常領域から選択された軽鎖定常領域を含む、
    請求項１−１０のいずれかに記載の医薬組成物。
  12. 抗体分子が、
    （ａ）ＥＵ番号付けによる２２８位または配列番号２１２もしくは２１４の１０８位に変異を有するヒトＩｇＧ４重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域；
    （ｂ）ＥＵ番号付けによる２２８位または配列番号２１２もしくは２１４の１０８位にセリンからプロリン変異を有するヒトＩｇＧ４重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域；
    （ｃ）ＥＵ番号付けによる２９７位または配列番号２１６の１８０位にアスパラギンからアラニン変異を含むヒトＩｇＧ１重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域；
    （ｄ）ＥＵ番号付けによる２６５位または配列番号２１７の１４８位にアスパラギン酸からアラニン変異およびＥＵ番号付けによる３２９位または配列番号２１７の２１２位にプロリンからアラニン変異を含むヒトＩｇＧ１重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域；または
    （ｅ）ＥＵ番号付けによる２３４位または配列番号２１８の１１７位にロイシンからアラニン変異およびＥＵ番号付けによる２３５位または配列番号２１８の１１８位にロイシンからアラニン変異を含むヒトＩｇＧ１重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域
    を含む、請求項１１に記載の医薬組成物。
  13. 抗体分子が、
    （ａ）ヒトＰＤ−１に０．２ｎＭ未満の解離定数（ＫＤ）で結合できる；
    （ｂ）ＰＤ−１の細胞外Ｉｇ様ドメインに結合する；
    （ｃ）ＰＤ−１のＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２または両者への結合またはＰＤ−Ｌ１、ＰＤ−Ｌ２または両者を発現する細胞を減少できる；および／または
    （ｄ）抗原特異的Ｔ細胞応答を増強できる、
    請求項１−１２のいずれかに記載の医薬組成物。
  14. 抗体分子が、ＰＤ−１に対する第一結合特異性およびＴＩＭ−３、ＬＡＧ−３、ＣＥＡＣＡＭ−１、ＣＥＡＣＡＭ−５、ＰＤ−Ｌ１またはＰＤ−Ｌ２に対する第二結合特異性を有する；および／または抗体分子が、抗体の抗原結合フラグメント、半抗体または半抗体の抗原結合フラグメントを含む、請求項１−１３のいずれかに記載の医薬組成物。
  15. 対象における免疫応答の刺激または癌または感染性疾患の処置に使用するための、請求項１−１４のいずれかに記載の医薬組成物。
  16. 対象における黒色腫の処置に使用するための、請求項１−１４のいずれかに記載の医薬組成物。
  17. 請求項１５に記載の使用するための医薬組成物であって、
    癌は、固形腫瘍、肺癌、黒色腫、腎臓癌、肝臓癌、前立腺癌、乳癌、結腸直腸癌、胃癌、膵臓癌、甲状腺癌、脳腫瘍、子宮癌、鼻咽頭癌、頭頸部癌、卵巣癌、子宮内膜癌、内分泌癌、または造血器癌、または癌の転移病変から選択され、
    所望により：
    （ａ）肺癌は、非小細胞性肺癌（ＮＳＣＬＣ）、肺腺癌、扁平上皮細胞肺癌、または小細胞性肺癌から選択され、所望により、ＮＳＣＬＣはＫＲＡＳ変異を含み；
    （ｂ）黒色腫は、進行型黒色腫、切除不能黒色腫、転移黒色腫、ＢＲＡＦ変異を有する黒色腫、ＮＲＡＳ変異を有する黒色腫、皮膚黒色腫、または眼内黒色腫から選択され；
    （ｃ）腎臓癌は、腎細胞癌（ＲＣＣ）、転移腎細胞癌、または明細胞腎細胞癌（ＣＣＲＣＣ）から選択され；
    （ｄ）血液癌は、リンパ腫、骨髄腫、または白血病から選択され；
    （ｅ）脳腫瘍は、神経膠芽腫であり；
    （ｆ）乳癌は、三種陰性乳癌であり；
    （ｇ）肝臓癌は、肝細胞癌であり；または
    （ｈ）癌は、ＭＳＩ高（高マイクロサテライト不安定性）癌である、
    医薬組成物。
  18. 請求項１５−１７のいずれかに記載の使用するための医薬組成物であって、
    医薬組成物を以下の１以上と組み合わせて使用する：
    （ａ）ＬＡＧ−３阻害剤、所望により、ＬＡＧ−３阻害剤は、例えば、ＮＳＣＬＣ、黒色腫、ＲＣＣ、または血液癌を処置するための、抗ＬＡＧ−３抗体分子であり；
    （ｂ）ＴＩＭ−３阻害剤、所望により、ＴＩＭ−３阻害剤は、例えば、黒色腫またはＲＣＣを処置するための、抗ＴＩＭ−３抗体分子であり；
    （ｃ）ＰＤ−Ｌ１阻害剤、所望により、ＰＤ−Ｌ１阻害剤は、例えば、甲状腺癌、ＮＳＣＬＣ、三種陰性乳癌、子宮癌、またはリンパ腫を処置するための、抗ＰＤ−Ｌ１抗体分子、またはＹＷ２４３．５５．Ｓ７０、ＭＰＤＬ３２８０Ａ、ＭＥＤＩ−４７３６、ＭＳＢ−００１０７１８Ｃ、またはＭＤＸ−１１０５から選択され；
    （ｄ）ＧＩＴＲのアゴニスト、所望により、ＧＩＴＲのアゴニストは、例えば、ＮＳＣＬＣを処置するための、抗ＧＩＴＲ抗体分子または融合タンパク質であり；
    （ｅ）インターロイキン、所望により、インターロイキンは、例えば、固形腫瘍を処置するための、ＩＬ−１５であり；
    （ｆ）ＭＥＫ阻害剤、所望により、ＭＥＫ阻害剤は、例えば、三種陰性乳癌、ＮＳＣＬＣ、または結腸直腸癌を処置するための、ＡＲＲＹ−１４２８８６、Ｇ０２４４２１０４（ＧＳＫ１１２０２１２）、ＲＤＥＡ４３６、ＲＤＥＡ１１９／ＢＡＹ ８６９７６６、ＡＳ７０３０２６、Ｇ０００３９８０５（ＡＺＤ−６２４４またはセルメチニブ）、ＢＩＸ ０２１８８、ＢＩＸ ０２１８９、ＣＩ−１０４０（ＰＤ−１８４３５２）、ＰＤ０３２５９０１、ＰＤ９８０５９、Ｕ０１２６、ＧＤＣ−０９７３（メタノンまたは［３，４−ジフルオロ−２−［（２−フルオロ−４−ヨードフェニル）アミノ］フェニル］［３−ヒドロキシ−３−（２５）−２−ピペリジニル−１−アゼチジニル］−）、Ｇ−３８９６３、Ｇ０２４４３７１４（ＡＳ７０３２０６）またはその薬学的に許容される塩または溶媒和物から選択され；または
    （ｇ）例えば、肝細胞癌を処置するための、ＦＧＦＲ阻害剤、
    医薬組成物。
  19. 請求項１５−１８のいずれかに記載の使用するための医薬組成物であって、
    医薬組成物を以下の１以上と組み合わせて使用する：
    （ａ）肺癌を処置するための化学療法剤、所望により、化学療法剤はプラチナダブレット療法であり；
    （ｂ）肺癌を処置するためのインドールアミン−ピロール２，３−ジオキシゲナーゼ（ＩＤＯ）阻害剤、所望により、ＩＤＯ阻害剤はＩＮＣＢ２４３６０であり；
    （ｃ）肺癌または黒色腫を処置するためのＣＴＬＡ−４阻害剤、所望により、ＣＴＬＡ−４阻害剤は、抗ＣＴＬＡ−４抗体（例えば、イピリムマブ）またはＣＴＬＡ−４の可溶性リガンドであり、所望により、医薬組成物を、さらにＢＲＡＦ阻害剤、例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブと組み合わせて使用する；
    （ｄ）癌ワクチン、例えば、樹状細胞腎臓癌（ＤＣ−ＲＣＣ）ワクチン；
    （ｅ）腎臓癌を処置するための、免疫ベース戦略、ターゲティング剤、ＶＥＧＦチロシンキナーゼ阻害剤、ＲＮＡｉ阻害剤、またはＶＥＧＦシグナル伝達の下流メディエーターの阻害剤の１以上、所望により、
    （ｉ）免疫ベース戦略は、インターロイキン−２またはインターフェロン−αを含み；
    （ｉｉ）ターゲティング剤は、ＶＥＧＦ阻害剤、例えば、抗−ＶＥＧＦ抗体であり；
    （ｉｉｉ）ＶＥＧＦチロシンキナーゼ阻害剤は、スニチニブ、ソラフェニブ、アクシチニブまたはパゾパニブから選択され；
    （ｉｖ）ＶＥＧＦシグナル伝達の下流メディエーターの阻害剤は、ラパマイシンの哺乳動物標的（ｍＴＯＲ）の阻害剤、例えば、テムシロリムスであり；
    （ｆ）黒色腫、結腸直腸癌、非小細胞性肺癌、卵巣癌、乳癌、前立腺癌、膵臓癌、造血器癌、または腎細胞癌を処置するための、オキサリプラチン、ロイコボリンまたは５−ＦＵの１、２または全て；または
    （ｇ）腎臓癌を処置するための、チロシンキナーゼ阻害剤（例えば、アクシチニブ）
    と組み合わせて使用する、
    医薬組成物。
  20. 請求項１５−１９のいずれかに記載の使用するための医薬組成物であって、
    対象は、
    （ａ）ＰＤ−Ｌ１を発現する癌；
    （ｂ）ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８、ＩＦＮ−γの１、２または全てについて陽性である癌；
    （ｃ）ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８およびＩＦＮ−γについて三種陽性である癌；または
    （ｄ）腫瘍浸潤性リンパ球（ＴＩＬ）陽性である癌
    の１以上を有するまたは有するとして同定される、
    医薬組成物。
  21. 請求項１５−２０のいずれかに記載の使用するための医薬組成物であって、
    医薬組成物は、隔週、１〜３０ｍｇ／ｋｇの用量で、例えば、１〜５ｍｇ／ｋｇの用量でまたは１０〜２０ｍｇ／ｋｇの用量で投与され、所望により、医薬組成物は、週１回ないし２週毎、３週毎または４週毎に１回投与される、
    医薬組成物。
  22. 対象における免疫応答の刺激または癌または感染性疾患の処置用医薬の製造における、請求項１−１４のいずれかに記載の医薬組成物の使用。
  23. 対象における黒色腫の処置用医薬の製造における、請求項１−１４のいずれかに記載の医薬組成物の使用。
  24. 請求項２２に記載の使用であって、
    癌は、固形腫瘍、肺癌、黒色腫、腎臓癌、肝臓癌、前立腺癌、乳癌、結腸直腸癌、胃癌、膵臓癌、甲状腺癌、脳腫瘍、子宮癌、鼻咽頭癌、頭頸部癌、卵巣癌、子宮内膜癌、内分泌癌、または造血器癌、または癌の転移病変から選択され、
    所望により：
    （ａ）肺癌は、非小細胞性肺癌（ＮＳＣＬＣ）、肺腺癌、扁平上皮細胞肺癌、または小細胞性肺癌から選択され、所望により、ＮＳＣＬＣはＫＲＡＳ変異を含み；
    （ｂ）黒色腫は、進行型黒色腫、切除不能黒色腫、転移黒色腫、ＢＲＡＦ変異を有する黒色腫、ＮＲＡＳ変異を有する黒色腫、皮膚黒色腫、または眼内黒色腫から選択され；
    （ｃ）腎臓癌は、腎細胞癌（ＲＣＣ）、転移腎細胞癌、または明細胞腎細胞癌（ＣＣＲＣＣ）から選択され；
    （ｄ）血液癌は、リンパ腫、骨髄腫、または白血病から選択され；
    （ｅ）脳腫瘍は、神経膠芽腫であり；
    （ｆ）乳癌は、三種陰性乳癌であり；
    （ｇ）肝臓癌は、肝細胞癌であり；または
    （ｈ）癌は、ＭＳＩ高（高マイクロサテライト不安定性）癌である、
    使用。
  25. 請求項２２−２４のいずれかに記載の使用であって、
    医薬組成物を以下の１以上と組み合わせて使用する：
    （ａ）ＬＡＧ−３阻害剤、所望により、ＬＡＧ−３阻害剤は、例えば、ＮＳＣＬＣ、黒色腫、ＲＣＣ、または血液癌を処置するための、抗ＬＡＧ−３抗体分子であり；
    （ｂ）ＴＩＭ−３阻害剤、所望により、ＴＩＭ−３阻害剤は、例えば、黒色腫またはＲＣＣを処置するための、抗ＴＩＭ−３抗体分子であり；
    （ｃ）ＰＤ−Ｌ１阻害剤、所望により、ＰＤ−Ｌ１阻害剤は、例えば、甲状腺癌、ＮＳＣＬＣ、三種陰性乳癌、子宮癌、またはリンパ腫を処置するための、抗ＰＤ−Ｌ１抗体分子、またはＹＷ２４３．５５．Ｓ７０、ＭＰＤＬ３２８０Ａ、ＭＥＤＩ−４７３６、ＭＳＢ−００１０７１８Ｃ、またはＭＤＸ−１１０５から選択され；
    （ｄ）ＧＩＴＲのアゴニスト、所望により、ＧＩＴＲのアゴニストは、例えば、ＮＳＣＬＣを処置するための、抗ＧＩＴＲ抗体分子または融合タンパク質であり；
    （ｅ）インターロイキン、所望により、インターロイキンは、例えば、固形腫瘍を処置するための、ＩＬ−１５であり；
    （ｆ）ＭＥＫ阻害剤、所望により、ＭＥＫ阻害剤は、例えば、三種陰性乳癌、ＮＳＣＬＣ、または結腸直腸癌を処置するための、ＡＲＲＹ−１４２８８６、Ｇ０２４４２１０４（ＧＳＫ１１２０２１２）、ＲＤＥＡ４３６、ＲＤＥＡ１１９／ＢＡＹ ８６９７６６、ＡＳ７０３０２６、Ｇ０００３９８０５（ＡＺＤ−６２４４またはセルメチニブ）、ＢＩＸ ０２１８８、ＢＩＸ ０２１８９、ＣＩ−１０４０（ＰＤ−１８４３５２）、ＰＤ０３２５９０１、ＰＤ９８０５９、Ｕ０１２６、ＧＤＣ−０９７３（メタノンまたは［３，４−ジフルオロ−２−［（２−フルオロ−４−ヨードフェニル）アミノ］フェニル］［３−ヒドロキシ−３−（２５）−２−ピペリジニル−１−アゼチジニル］−）、Ｇ−３８９６３、Ｇ０２４４３７１４（ＡＳ７０３２０６）またはその薬学的に許容される塩または溶媒和物から選択され；または
    （ｇ）例えば、肝細胞癌を処置するための、ＦＧＦＲ阻害剤、
    使用。
  26. 請求項２２−２５のいずれかに記載の使用であって、
    医薬組成物を以下の１以上と組み合わせて使用する：
    （ａ）肺癌を処置するための化学療法剤、所望により、化学療法剤はプラチナダブレット療法であり；
    （ｂ）肺癌を処置するためのインドールアミン−ピロール２，３−ジオキシゲナーゼ（ＩＤＯ）阻害剤、所望により、ＩＤＯ阻害剤はＩＮＣＢ２４３６０であり；
    （ｃ）肺癌または黒色腫を処置するためのＣＴＬＡ−４阻害剤、所望により、ＣＴＬＡ−４阻害剤は、抗ＣＴＬＡ−４抗体（例えば、イピリムマブ）またはＣＴＬＡ−４の可溶性リガンドであり、所望により、医薬組成物を、さらにＢＲＡＦ阻害剤、例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブと組み合わせて使用する；
    （ｄ）癌ワクチン、例えば、樹状細胞腎臓癌（ＤＣ−ＲＣＣ）ワクチン；
    （ｅ）腎臓癌を処置するための、免疫ベース戦略、ターゲティング剤、ＶＥＧＦチロシンキナーゼ阻害剤、ＲＮＡｉ阻害剤、またはＶＥＧＦシグナル伝達の下流メディエーターの阻害剤の１以上、所望により、
    （ｉ）免疫ベース戦略は、インターロイキン−２またはインターフェロン−αを含み；
    （ｉｉ）ターゲティング剤は、ＶＥＧＦ阻害剤、例えば、抗−ＶＥＧＦ抗体であり；
    （ｉｉｉ）ＶＥＧＦチロシンキナーゼ阻害剤は、スニチニブ、ソラフェニブ、アクシチニブまたはパゾパニブから選択され；
    （ｉｖ）ＶＥＧＦシグナル伝達の下流メディエーターの阻害剤は、ラパマイシンの哺乳動物標的（ｍＴＯＲ）の阻害剤、例えば、テムシロリムスであり；
    （ｆ）黒色腫、結腸直腸癌、非小細胞性肺癌、卵巣癌、乳癌、前立腺癌、膵臓癌、造血器癌、または腎細胞癌を処置するための、オキサリプラチン、ロイコボリンまたは５−ＦＵの１、２または全て；または
    （ｇ）腎臓癌を処置するための、チロシンキナーゼ阻害剤（例えば、アクシチニブ）
    と組み合わせて使用する、
    使用。
  27. 請求項２２−２６のいずれかに記載の使用であって、
    対象は、
    （ａ）ＰＤ−Ｌ１を発現する癌；
    （ｂ）ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８、ＩＦＮ−γの１、２または全てについて陽性である癌；
    （ｃ）ＰＤ−Ｌ１、ＣＤ８およびＩＦＮ−γについて三種陽性である癌；または
    （ｄ）腫瘍浸潤性リンパ球（ＴＩＬ）陽性である癌
    の１以上を有するまたは有するとして同定される、
    使用。
  28. 請求項２２−２７のいずれかに記載の使用であって、
    医薬組成物は、隔週、１〜３０ｍｇ／ｋｇの用量で、例えば、１〜５ｍｇ／ｋｇの用量でまたは１０〜２０ｍｇ／ｋｇの用量で投与され、所望により、医薬組成物は、週１回ないし２週毎、３週毎または４週毎に１回投与される、
    使用。
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