JP6878405B2 - Pd−1に対する抗体分子を含む組み合わせ治療 - Google Patents

Pd−1に対する抗体分子を含む組み合わせ治療 Download PDF

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Description

関連出願の相互参照
本出願は、2015年7月29日出願の米国仮出願62/198,476および2016年6月2日出願の米国仮出願62/344,731号に基づく優先権を主張し、これらの出願の内容を、その全体について、引用により本明細書に包含させる。
配列表
本出願は、ASCII形式で電子的に提供し、ここにその全体を引用により包含させる配列表を含む。2016年7月25日作成の該ASCIIコピーはC2160-7009WO_SL.txtなる名称であり、256,195バイトサイズである。
背景
T細胞が抗原に対する免疫応答に介在する能力は、二つの異なるシグナル伝達相互作用を必要とする(Viglietta, V. et al. (2007) Neurotherapeutics 4:666-675; Korman, A. J. et al. (2007) Adv. Immunol. 90:297-339)。まず、抗原提示細胞(APC)表面に発現している抗原が、抗原特異的ナイーブCD4 T細胞に提示される。このような提示が、T細胞受容体(TCR)を経るシグナルを送達し、これがT細胞に提示抗原特異的免疫応答の開始を指示する。次いで、APCおよび別個のT細胞表面分子の間の相互作用により介在される種々の共刺激性および阻害性シグナルが、T細胞の活性化および増殖ならびに最終的にそれらの阻害を誘発する。
免疫系は共刺激性および共阻害性リガンドおよび受容体のネットワークにより厳しく制御される。これらの分子はT細胞活性化のための第二シグナルを提供し、感染に対する免疫応答を最大化し、同時に自己に対する免疫を制限するために、正および負のシグナルのバランスの取れたネットワークを提供する(Wang, L. et al. (Epub Mar. 7, 2011) J. Exp. Med. 208(3):577-92; Lepenies, B. et al. (2008) Endocrine, Metabolic & Immune Disorders-Drug Targets 8:279-288)。共刺激性シグナルの例は、APCのB7.1(CD80)およびB7.2(CD86)リガンドとCD28およびCD4 Tリンパ球のCTLA−4受容体の結合を含む(Sharpe, A. H. et al. (2002) Nature Rev. Immunol. 2:116-126; Lindley, P. S. et al. (2009) Immunol. Rev. 229:307-321)。B7.1またはB7.2のCD28への結合はT細胞活性化を刺激し、一方B7.1またはB7.2のCTLA−4への結合は、そのような活性化を阻害する(Dong, C. et al. (2003) Immunolog. Res. 28(1):39-48; Greenwald, R. J. et al. (2005) Ann. Rev. Immunol. 23:515-548)。CD28は、T細胞表面に構成的に発現され(Gross, J., et al. (1992) J. Immunol. 149:380-388)、一方CTLA−4発現はT細胞活性化後迅速に上方制御される(Linsley, P. et al. (1996) Immunity 4:535-543)。
CD28受容体の他のリガンドは、“B7スーパーファミリー”としても知られるB7分子の関連する一群を含む(Coyle, A. J. et al. (2001) Nature Immunol. 2(3):203-209; Sharpe, A. H. et al. (2002) Nature Rev. Immunol. 2:116-126; Collins, M. et al. (2005) Genome Biol. 6:223.1-223.7; Korman, A. J. et al. (2007) Adv. Immunol. 90:297-339)。B7スーパーファミリーの数メンバーが知られ、B7.1(CD80)、B7.2(CD86)、誘導型共刺激因子リガンド(ICOS−L)、プログラム死1リガンド(PD−L1;B7−H1)、プログラム死2リガンド(PD−L2;B7−DC)、B7−H3、B7−H4およびB7−H6を含む(Collins, M. et al. (2005) Genome Biol. 6:223.1-223.7)。
プログラム死1(PD−1)タンパク質は、T細胞制御因子の拡張CD28/CTLA−4ファミリーの阻害性メンバーである(Okazaki et al. (2002) Curr Opin Immunol 14: 391779-82; Bennett et al. (2003) J. Immunol. 170:711-8)。CD28ファミリーの他のメンバーはCD28、CTLA−4、ICOSおよびBTLAを含む。PD−1は他のCD28ファミリーメンバーの特徴である不対システイン残基を欠く、単量体として存在することが示唆される。PD−1は活性化B細胞、T細胞および単球に発現される。
PD−1遺伝子は55kDa I型膜貫通タンパク質をコードする(Agata et al. (1996) Int Immunol. 8:765-72)。構造はCTLA−4に類似するが、PD−1は、B7−1およびB7−2結合に重要なMYPPYモチーフ(配列番号236)を欠く。PD−1に対する2リガンド、PD−L1(B7−H1)およびPD−L2(B7−DC)が同定されており、PD−1への結合によりT細胞活性化を下方制御することが示されている(Freeman et al. (2000) J. Exp. Med. 192:1027-34; Carter et al. (2002) Eur. J. Immunol. 32:634-43)。PD−L1およびPD−L2の両方とも、PD−1に結合するが、他のCD28ファミリーメンバーには結合しないB7ホモログである。PD−L1は、多様なヒト癌で多い(Dong et al. (2002) Nat. Med. 8:787-9)。
PD−1は、TCRシグナルを負に制御する免疫阻害性タンパク質として知られる(Ishida, Y. et al. (1992) EMBO J. 11:3887-3895; Blank, C. et al. (Epub 2006 Dec. 29) Immunol. Immunother. 56(5):739-745)。PD−1とPD−L1の相互作用は免疫チェックポイントとして作用でき、これは、例えば、腫瘍浸潤性リンパ球減少、T細胞受容体介在増殖減少および/または癌細胞による免疫回避をもたらし得る(Dong et al. (2003) J. Mol. Med. 81:281-7; Blank et al. (2005) Cancer Immunol. Immunother. 54:307-314; Konishi et al. (2004) Clin. Cancer Res. 10:5094-100)。免疫抑制は、PD−1とPD−L1またはPD−L2の局所相互作用阻害により逆転でき、効果は、PD−1とPD−L2の相互作用を同様に遮断したとき、相加的である(Iwai et al. (2002) Proc. Nat’l. Acad. Sci. USA 99:12293-7; Brown et al. (2003) J. Immunol. 170:1257-66)。
免疫応答制御における免疫チェックポイント経路の重要性を考えると、PD−1のような免疫阻害性タンパク質の活性を修飾し、それ故に、免疫系の活性化に至る新規組み合わせ治療の開発の必要性が存在する。このような薬剤は、例えば、癌免疫療法および慢性感染のような他の状態の処置に使用できる。
要約
ここに開示するのは、少なくとも一部、次のカテゴリー(i)抗原提示(例えば、腫瘍抗原提示)を増強する薬剤、(ii)エフェクター細胞応答(例えば、B細胞および/またはT細胞活性化および/または動員)を増強する薬剤または(iii)腫瘍免疫抑制を減少させる薬剤の1、2または全てから選択される2、3またはそれ以上の治療剤の組み合わせ物を含む方法および組成物である。ある実施態様において、組み合わせ物はプログラム死1(PD−1)の阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)を含む。
理論に縛られることを望まないが、抗腫瘍免疫を増強する治療方法は、免疫応答、例えば、抗腫瘍免疫応答の1以上の段階の複数成分をターゲティングすることにより免疫応答が最適化されたとき、より効率的に働くと考えられる。例えば、腫瘍免疫抑制性シグナル伝達(例えば、マクロファージ極性化増加、Treg枯渇増加および/または骨髄系由来サプレッサー細胞(MDSC)減少による)を遮断しながら、例えば、樹状細胞の活性化および/または成熟により、抗原提示を増強させる方法と、細胞性および液性免疫応答(例えば、貪食細胞および/または腫瘍浸潤性リンパ球(例えば、NK細胞およびT細胞)の刺激、例えば、脱抑制による)を増強する方法の組み合わせは、より有効なおよび/または長期の治療応答をもたらし得る。従って、ここに開示するのは、(i)抗原提示、例えば、抗原提示増加(例えば、樹状細胞活性または成熟、抗原取り込みまたは抗原プロセシングの1以上の増強による)、(ii)エフェクター細胞応答、例えば、エフェクター細胞応答増加(例えば、リンパ節における、例えば、B細胞および/またはT細胞活性化および/または動員増強)または(iii)腫瘍免疫抑制、例えば、腫瘍免疫抑制減少(例えば、T細胞浸潤および殺腫瘍細胞増加)の1、2または全てを最適化する組み合わせ治療である。ここに記載する組み合わせ物は、例えば、障害の処置において、組み合わせ物における治療剤の単剤療法投与と比較して、抗癌作用増強、毒性減少および/または副作用減少のような優れた有益な効果を提供できる。例えば、組み合わせ物における治療剤の1以上を、同じ治療効果を達成するために必要な単剤療法投与と比較して、低用量でまたは短い投与期間で投与できる。それ故に、前記組み合わせ治療を使用する癌および他の免疫障害の処置のための組成物および方法が開示される。
従って、ある態様において、本発明は、対象における障害、例えば、過増殖性状態または障害(例えば、癌)を処置(例えば、阻止、低減、軽減または予防)する方法に関する。方法は、対象に次のカテゴリー(i)抗原(例えば、腫瘍抗原)提示を増強する薬剤、(ii)エフェクター細胞応答(例えば、B細胞および/またはT細胞活性化および/または動員)を増強する薬剤または(iii)腫瘍免疫抑制を減少させる薬剤の1、2または全てから選択される2、3またはそれ以上の治療剤の組み合わせ物を投与し、それにより障害、例えば、過増殖性状態または障害(例えば、癌)を処置することを含む。ある実施態様において、組み合わせ物はPD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)を含む。処置される癌は、例えば、肺癌(扁平上皮)、肺癌(腺癌)、頭頸部癌、子宮頸癌(扁平上皮)、胃癌、甲状腺癌、皮膚癌、黒色腫、鼻咽頭癌(例えば、分化型または未分化転移または局所再発鼻咽頭癌)、腎癌、神経内分泌腫瘍(NET)または乳癌のような、ここに記載する癌であり得る。ある実施態様において、癌は皮膚癌、例えば、メルケル細胞癌または黒色腫である。ある実施態様において、癌はメルケル細胞癌である。他の実施態様において、癌は黒色腫である。他の実施態様において、癌は乳癌、例えば、トリプルネガティブ乳癌(TNBC)である。他の実施態様において、癌は腎癌、例えば、腎細胞癌(例えば、明細胞腎細胞癌)である。他の実施態様において、癌は甲状腺癌、例えば、未分化甲状腺癌(ATC)である。他の実施態様において、癌は神経内分泌腫瘍(NET)、例えば、非定型肺カルチノイド腫瘍である。ある実施態様において、癌は肺癌、例えば、非小細胞肺癌(NSCLC)である。
他の態様において、本発明は、過増殖性(例えば、癌)細胞の活性(例えば、増殖、生存もしくは生存能または全て)を低減させる方法に関する。方法は、細胞と、次のカテゴリー(i)抗原(例えば、腫瘍抗原)提示を増強する薬剤、(ii)エフェクター細胞応答(例えば、B細胞および/またはT細胞活性化および/または動員)を増強する薬剤または(iii)腫瘍免疫抑制を減少させる薬剤の1、2または全てから選択される2、3またはそれ以上の治療剤の組み合わせ物を接触させ、それにより過増殖性細胞における活性を低減させることを含む。ある実施態様において、組み合わせ物はPD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)を含む。本方法は、対象において、例えば、治療プロトコールの一部として実施され得る。癌細胞は、例えば、肺癌(扁平上皮)、肺癌(腺癌)、頭頸部癌、子宮頸癌(扁平上皮)、胃癌、甲状腺癌、皮膚癌、黒色腫、鼻咽頭癌(例えば、分化型または未分化転移または局所再発鼻咽頭癌)、腎癌、神経内分泌腫瘍(NET)または乳癌のような、ここに記載する癌からの細胞であり得る。ある実施態様において、癌は皮膚癌、例えば、メルケル細胞癌または黒色腫である。ある実施態様において、癌はメルケル細胞癌である。他の実施態様において、癌は黒色腫である。他の実施態様において、癌は乳癌、例えば、トリプルネガティブ乳癌(TNBC)である。他の実施態様において、癌は腎癌、例えば、腎細胞癌(例えば、明細胞腎細胞癌)である。他の実施態様において、癌は甲状腺癌、例えば、未分化甲状腺癌(ATC)である。他の実施態様において、癌は神経内分泌腫瘍(NET)、例えば、非定型肺カルチノイド腫瘍である。ある実施態様において、癌は肺癌、例えば、非小細胞肺癌(NSCLC)である。
ここに開示する方法のある実施態様において、方法は、さらに対象における免疫細胞(例えば、T細胞)の浸潤レベル(例えば、腫瘍浸潤性リンパ球(TIL)のレベル)の決定を含む。ある実施態様において、免疫細胞浸潤レベルは、インビボで、例えば、非観血的に実施決定される(例えば、検出可能に標識したT細胞マーカーに対する抗体の適当な造影技術、例えば、陽電子放出断層撮影(PET)走査を使用する検出による)。他の実施態様において、免疫細胞浸潤レベルは、対象から獲得したサンプル(例えば、腫瘍生検)で決定される(例えば、免疫組織化学的手法の使用)。対象における低レベルのまたは検出不可能な腫瘍浸潤への応答性のある実施態様において、カテゴリー(i)もしくは(ii)または(i)および(ii)両方の1以上の薬剤が投与される。対象における検出可能レベルまたは高レベルの腫瘍浸潤に対する応答性の他の実施態様において、カテゴリー(iii)の1以上の薬剤が投与される。例えば、ここに記載する治療剤の有効性をモニターするために、検出過程も使用できる。例えば、検出過程を、カテゴリー(i)、(ii)および/または(iii)の治療剤の有効性のモニターに使用できる。
他の態様において、本発明は、次のカテゴリー(i)抗原(例えば、腫瘍抗原)提示を増強する薬剤、(ii)エフェクター細胞応答(例えば、B細胞および/またはT細胞の活性化および/または動員)を増強する薬剤または(iii)腫瘍免疫抑制を減少させる薬剤の1、2または全てから選択される2、3またはそれ以上の治療剤の組み合わせ物を含む、組成物(例えば、1以上の組成物または投与形態)に関する。ある実施態様において、組み合わせ物はPD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)を含む。
さらに他の態様において、本発明は、障害、例えば、癌の処置に使用するための、組成物(例えば、ここに記載する1以上の組成物または投与形態)に関する。ある実施態様において、使用するための組成物は、次のカテゴリー(i)抗原(例えば、腫瘍抗原)提示を増強する薬剤、(ii)エフェクター細胞応答(例えば、B細胞および/またはT細胞の活性化および/または動員)を増強する薬剤または(iii)腫瘍免疫抑制を減少させる薬剤の1、2または全てから選択される2、3またはそれ以上の治療剤の組み合わせ物を含む。ある実施態様において、使用される組み合わせ物はPD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)を含む。癌は、例えば、肺癌(扁平上皮)、肺癌(腺癌)、頭頸部癌、子宮頸癌(扁平上皮)、胃癌、甲状腺癌、皮膚癌、黒色腫、鼻咽頭癌(例えば、分化型または未分化転移または局所再発鼻咽頭癌)、腎癌、神経内分泌腫瘍(NET)または乳癌のような、ここに記載する癌であり得る。ある実施態様において、癌は皮膚癌、例えば、メルケル細胞癌または黒色腫である。ある実施態様において、癌はメルケル細胞癌である。他の実施態様において、癌は黒色腫である。他の実施態様において、癌は乳癌、例えば、トリプルネガティブ乳癌(TNBC)である。他の実施態様において、癌は腎癌、例えば、腎細胞癌(例えば、明細胞腎細胞癌)である。他の実施態様において、癌は甲状腺癌、例えば、未分化甲状腺癌(ATC)である。他の実施態様において、癌は神経内分泌腫瘍(NET)、例えば、非定型肺カルチノイド腫瘍である。ある実施態様において、癌は肺癌、例えば、非小細胞肺癌(NSCLC)である。
次のカテゴリー(i)抗原(例えば、腫瘍抗原)提示を増強する薬剤、(ii)エフェクター細胞応答(例えば、B細胞および/またはT細胞の活性化および/または動員)を増強する薬剤または(iii)腫瘍免疫抑制を減少させ、それにより細胞における活性を減少させる薬剤の1、2または全てから選択される2、3またはそれ以上の治療剤の組み合わせ物および(場合により)使用指示を含む製剤、例えば、投与製剤およびキット、例えば、治療キットも開示される。ある実施態様において、組み合わせ物はPD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)を含む。
ここに開示する治療剤の組み合わせ物は、2以上のここに記載する治療剤を含む。組み合わせ物における治療剤は、下記のとおり、同じカテゴリーに属しても、例えば、カテゴリー(i)の2以上の治療剤でも、2以上のカテゴリーの少なくとも1剤(例えば、カテゴリー(i)の治療剤とカテゴリー(ii)の治療剤の組み合わせ物)を含んでもよい。ある治療剤はカテゴリー(i)〜(iii)の2以上のカテゴリーに属し得る。例えば、治療剤(例えば、とりわけ、GITRアゴニスト、IDOアンタゴニスト、TGF−b阻害剤)は複数カテゴリーにおける治療剤として作用し得る。
ここに記載する方法、組成物、投与製剤およびキットのさらなる特性または実施態様は、次の1以上を含み得る。
組み合わせ物
ある実施態様において、組み合わせ物は、1、2、3、4またはそれ以上の抗原(例えば、腫瘍抗原)提示を増強する治療剤を含む(ここでは“抗原提示組み合わせ物”と称する)。ある実施態様において、抗原提示組み合わせ物は、抗原提示を増強する薬剤(例えば、ワクチン、例えば、細胞または抗原ベースのワクチン)、腫瘍細胞の溶解を増強する薬剤(例えば、腫瘍溶解性ウイルス)、貪食細胞を刺激(例えば、脱抑制)する薬剤、例えば、I型インターフェロン(IFN)アクティベーター(例えば、TLRアゴニスト、RIG−I様受容体アゴニスト(RLR))および/または樹状細胞またはマクロファージ(例えば、マクロファージI)を活性化および/または補充する薬剤、例えば、二または三特異的細胞アンガジェ(engager)の1以上を含む。
ある実施態様において、抗原提示組み合わせ物は、(i)インターフェロン遺伝子刺激因子のアゴニスト(STINGアゴニスト)、(ii)トール様受容体(TLR)のアゴニスト(例えば、TLR−3、−4、−5、−7、−8または−9のアゴニスト)、(iii)TIM−3モジュレーター(例えば、抗TIM−3抗体分子)、(iv)血管内皮細胞増殖因子受容体(VEGFR)阻害剤、(v)c−Met阻害剤、(vi)TGFb阻害剤(例えば、抗TGFb抗体)、(vii)IDO/TDO阻害剤、(viii)A2ARアンタゴニスト、(ix)腫瘍溶解性ウイルス、(x)ワクチン(例えば、足場ワクチン)または(xi)二または三特異的細胞アンガジェから選択される1、2、3、4、5またはそれ以上の治療剤を含む。前記薬剤(i)〜(xi)のあらゆる組み合わせ物を、抗原提示組み合わせ物において使用できる。ある例示的実施態様において、抗原提示組み合わせ物はSTINGアゴニストを含む。他の例示的実施態様において、抗原提示組み合わせ物はTLRアゴニスト(例えば、TLR7アゴニスト)を含む。他の例示的実施態様において、抗原提示組み合わせ物はSTINGアゴニストおよびTLRアゴニスト(例えば、TLR7アゴニスト)を含む。ある実施態様において、抗原提示組み合わせ物は、STINGアゴニスト、TLRアゴニスト、A2ARアンタゴニストまたは腫瘍溶解性ウイルスまたはこれらの組み合わせおよび場合により、(iii)〜(vii)または(x)〜(xi)の1以上から選択される。ある実施態様において、抗原提示組み合わせ物はSTINGアゴニストまたはTLRアゴニストまたは両方の組み合わせ物および場合により、(iii)〜(xi)の1以上から選択される。他の実施態様において、抗原提示組み合わせ物はSTINGアゴニスト、TLRアゴニスト(例えば、TLR7アゴニスト)およびTIM−3モジュレーター(例えば、抗TIM−3阻害剤)を含む。他の実施態様において、抗原提示組み合わせ物はSTINGアゴニスト、TLRアゴニスト(例えば、TLR7アゴニスト)およびVEGFR阻害剤を含む。他の実施態様において、抗原提示組み合わせ物はSTINGアゴニスト、TLRアゴニスト(例えば、TLR7アゴニスト)およびc−MET阻害剤を含む。さらに他の実施態様において、抗原提示組み合わせ物は腫瘍溶解性ウイルスを含む。他の実施態様において、抗原提示組み合わせ物は、腫瘍溶解性ウイルスおよびサイトカイン、例えば、GM−CSFまたはCSF(例えば、CSF1またはCSF2)の1以上を発現する腫瘍溶解性ウイルスを含む。ある実施態様において、抗原提示組み合わせ物は、Fcドメインを伴うまたは伴わない、二または三特異的細胞アンガジェ、例えば、CD47およびCD19に対する二または三特異的抗体分子を含む。ある実施態様において、抗原提示組み合わせ物は、TGFb阻害剤(例えば、抗TGFb抗体)を含む。他の実施態様において、抗原提示組み合わせ物はIDO/TDO阻害剤を含む。さらに他の実施態様において、抗原提示組み合わせ物はA2ARアンタゴニストを含む。さらに他の実施態様において、抗原提示組み合わせ物はワクチンを含む(例えば、MUC1または樹状細胞ベースのワクチン(例えば、プロベンジ(登録商標))と組み合わせたIL−2)。さらに他の実施態様において、抗原提示組み合わせ物はワクチンおよびTLRアゴニスト(例えば、ここに記載するTLRアゴニスト)を含む。ある実施態様において、抗原提示組み合わせ物はワクチンおよびSTINGアゴニストを含む。ある実施態様において、抗原提示組み合わせ物はワクチン、STINGアゴニストおよびTLRアゴニストを含む。
ある実施態様において、組み合わせ物は、1、2、3、4、5またはそれ以上のエフェクター細胞応答を増強する治療剤を含む(ここでは“エフェクター細胞組み合わせ物”と称する)。ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、リンパ球アクティベーター、例えば、NK細胞アクティベーターおよび/またはT細胞アクティベーターを含む。ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は腫瘍浸潤性リンパ球(TIL)、例えば、NK細胞またはT細胞を活性化(例えば、脱抑制)する。ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、NK受容体のモジュレーター(例えば、抗体分子)(例えば、NKG2A、KIR3DL、NKp46、MICAまたはCEACAM1の1以上のモジュレーター)、インターロイキンまたはインターロイキンバリアント(例えば、IL−2、IL−15、IL−21、IL−13RまたはIL−12サイトカインまたはそのバリアントまたはこれらの組み合わせ)、二または三特異的細胞アンガジェ(例えば、NKG2AおよびCD138の二特異的抗体分子またはCD3およびTCRの二特異的抗体分子)、NK細胞治療またはNK細胞および抗原/免疫刺激因子を含むワクチンから選択されるNK細胞モジュレーターを含む。ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、免疫調節剤(例えば、ここに記載する共刺激性分子のアクティベーターまたは免疫チェックポイント分子の阻害剤の1以上)を含む。ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、チェックポイント阻害剤の阻害剤(例えば、PD−1、PD−L1、TIM−3、LAG−3、VISTA、DKG−α、B7−H3、B7−H4、TIGIT、CTLA−4、BTLA、CD160、TIM1、IDO、LAIR1、IL−12またはこれらの組み合わせの1以上の阻害剤、例えば、PD−1およびTIM−3の阻害剤またはPD−1およびLAG−3の阻害剤)から選択されるT細胞モジュレーターである。ある実施態様において、チェックポイント阻害剤の阻害剤は、抗体分子(例えば、ここに記載する単一もしくは二特異的抗体またはそのフラグメント)である。例えば、チェックポイント阻害剤の阻害剤は、PD−1、PD−L1、TIM−3、LAG−3、VISTA、B7−H4、CTLA−4またはTIGITまたはこれらの任意の組み合わせ(例えばここに記載する組み合わせ)に対する抗体分子である。ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、共刺激性分子のアゴニストまたはアクティベーターから選択されるT細胞モジュレーターを含む。ある実施態様において、共刺激性分子のアゴニストは、GITR、OX40、ICOS、SLAM(例えば、SLAMF7)、HVEM、LIGHT、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM−1、LFA−1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、4−1BB(CD137)、CD30、CD40、BAFFR、CD7、NKG2C、NKp80、CD160、B7−H3またはCD83リガンドのアゴニスト(例えば、アゴニスト抗体またはその抗原結合フラグメントまたは可溶性融合体)から選択される。他の実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、二特異的T細胞アンガジェ(例えば、CD3および腫瘍抗原(例えば、とりわけEGFR、PSCA、PSMA、EpCAM、HER2)に結合する二特異的抗体分子)を含む。
ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、(i)GITRモジュレーター(例えば、GITRアゴニスト)、(ii)PD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)、(iii)PD−L1阻害剤、(iv)IAP(Inhibitor of Apoptosis Protein)の阻害剤、(v)EGFR(Epidermal Growth Factor Receptor)の阻害剤、(vi)ラパマイシンの標的(mTOR)阻害剤、(vii)IL−15またはそのバリアント、(viii)CTLA−4阻害剤、(ix)二特異的T細胞アンガジェ(例えば、CD3および腫瘍抗原(例えば、とりわけEGFR、PSCA、PSMA、EpCAM、HER2)に結合する二特異的抗体分子)、(x)CD40アゴニスト(例えば、抗CD40抗体分子)、(xi)OX40アゴニスト(例えば、抗OX40抗体分子)または(xii)CD27アゴニスト(例えば、抗CD27抗体分子)から選択される1、2、3、4、5またはそれ以上の治療剤を含む。前記薬剤のあらゆる組み合わせが、エフェクター細胞組み合わせ物において使用され得る。ある例示的実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、GITRアゴニストを含む。他の実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物はPD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)を含む。他の実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、PD−L1阻害剤を含む。他の実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、GITRアゴニストおよびPD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)を含む。他の実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、GITRアゴニストおよびPD−L1阻害剤を含む。他の実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、GITRアゴニスト、PD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)およびPD−L1阻害剤を含む。他の実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、PD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)およびPD−L1阻害剤を含む。ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、GITRアゴニストおよびIAPの阻害剤を含む。他の実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、GITRアゴニストおよびEGFR阻害剤の阻害剤を含む。さらに他の実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、GITRアゴニストおよびmTOR阻害剤の阻害剤を含む。ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、IL−15またはそのバリアントを含む。ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、CTLA−4阻害剤を含む。ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、二特異的T細胞アンガジェ(例えば、CD3および腫瘍抗原(例えば、とりわけEGFR、PSCA、PSMA、EpCAM、HER2)に結合する二特異的抗体分子を含む。ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、CD40アゴニスト(例えば、抗CD40抗体分子)を含む。ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、OX40アゴニスト(例えば、抗OX40抗体分子)を含む。ある実施態様において、エフェクター細胞組み合わせ物は、CD27アゴニスト(例えば、抗CD27抗体分子)を含む。
ある実施態様において、組み合わせ物は、1、2、3、4、5またはそれ以上の腫瘍免疫抑制を減少させる治療剤を含む(ここでは“抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物”と称する)。ある実施態様において、組み合わせ物は、Treg、マクロファージ2またはMDSCの1以上の活性またはレベルを調節する。ある実施態様において、組み合わせ物は、M2極性化、Treg枯渇またはT細胞動員の1以上を増加させる。ある実施態様において、抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物は、(i)免疫調節剤(例えば、ここに記載する共刺激性分子のアクティベーター(例えば、GITRアゴニスト)または免疫チェックポイント分子(例えば、PD−1、PD−L1、LAG−3、TIM−3またはCTLA−4の1以上)の阻害剤の1以上)、(ii)CSF−1/1R阻害剤(例えば、マクロファージコロニー刺激因子(M−CSF)の阻害剤)、(iii)IL−17阻害剤、(iv)IL−1β阻害剤、(v)CXCR2阻害剤、(vi)ホスホイノシチド3−キナーゼ(PI3K、例えば、PI3KγまたはPI3Kδ)の阻害剤、(vii)BAFF−R阻害剤、(viii)MALT−1/BTK阻害剤、(ix)JAK阻害剤、(x)CRTH2阻害剤、(xi)VEGFR阻害剤、(xiii)IL−15またはそのバリアント、(xiv)CTLA−4阻害剤、(xv)IDO/TDO阻害剤、(xvi)A2ARアンタゴニスト、(xvii)TGFb阻害剤または(xviii)PFKFB3阻害剤から選択される1、2、3、4、5またはそれ以上の治療剤を含む。ある実施態様において、免疫調節剤は、免疫チェックポイント分子の阻害剤(例えば、PD−1、PD−L1、LAG−3、TIM−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)またはCTLA−4またはこれらの任意の組み合わせの阻害剤)である。前記薬剤のあらゆる組み合わせが腫瘍免疫抑制組み合わせ物において使用され得る。ある例示的実施態様において、抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物は、PD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)、PD−L1阻害剤、LAG−3阻害剤、TIM−3モジュレーター(例えば、抗TIM−3阻害剤)、GITRアゴニスト、CSF−1/1R阻害剤(例えば、M−CSF阻害剤)、IL−17阻害剤、IL−1β阻害剤またはCXCR2阻害剤から選択される1、2、3、4、5またはそれ以上の治療剤を含む。ある実施態様において、抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物は、CSF−1/1R阻害剤(例えば、M−CSF阻害剤)、IL−17阻害剤、IL−1β阻害剤の1、2または全てを含む。ある実施態様において、抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物は、IL−17阻害剤、CXCR2阻害剤、CRTH2阻害剤、A2ARアンタゴニストまたはPFKFB3阻害剤またはこれらの組み合わせを含む。
ある実施態様において、組み合わせ物は、抗原提示組み合わせ物の治療剤の1以上を含む。他の実施態様において、組み合わせ物は、エフェクター細胞組み合わせ物の治療剤の1以上を含む。さらに他の実施態様において、組み合わせ物は、抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物の治療剤の1以上を含む。他の実施態様において、組み合わせ物は、抗原提示組み合わせ物の治療剤の1以上およびエフェクター細胞組み合わせ物の治療剤の1以上を含む。他の実施態様において、組み合わせ物は、抗原提示組み合わせ物の治療剤の1以上および抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物の治療剤の1以上を含む。他の実施態様において、組み合わせ物は、抗原提示組み合わせ物の治療剤の1以上、エフェクター細胞組み合わせ物の治療剤の1以上および抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物の治療剤の1以上を含む。他の実施態様において、組み合わせ物は、抗原提示組み合わせ物の治療剤の1以上、エフェクター細胞組み合わせ物の治療剤の1以上および抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物の治療剤の1以上を含む。
ある実施態様において、組み合わせ物は
(i)STINGアゴニスト、TLRアゴニスト(例えば、TLR7アゴニスト)またはTIM−3モジュレーター(例えば、TIM−3阻害剤)の1、2または全てから選択される抗原提示組み合わせ物の治療剤の1以上;
(ii)GITRモジュレーター(例えば、GITRアゴニスト)、PD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)またはPD−L1阻害剤の1、2または全てから選択されるエフェクター細胞組み合わせ物の治療剤の1以上;
(iii)CSF−1/1R阻害剤(例えば、M−CSF阻害剤)、IL−17阻害剤またはIL−1β阻害剤の1、2または全てから選択される抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物の治療剤の1以上:
(iv)(i)および(ii)の組み合わせ;
(v)(i)および(iii)の組み合わせ;
(vi)(ii)および(iii)の組み合わせ;または
(vii)(i)、(ii)および(iii)の組み合わせ
を含む。
組み合わせ物は、肺癌(扁平上皮)、肺癌(腺癌)、頭頸部癌、子宮頸癌(扁平上皮)、胃癌、甲状腺癌、皮膚癌、黒色腫(例えば、進行型黒色腫)、鼻咽頭癌、腎癌、神経内分泌腫瘍(NET)または乳癌のようなここに記載する癌の処置に使用できる。ある実施態様において、癌は皮膚癌、例えば、メルケル細胞癌または黒色腫である。ある実施態様において、癌はメルケル細胞癌である。他の実施態様において、癌は黒色腫である。他の実施態様において、癌は乳癌、例えば、トリプルネガティブ乳癌(TNBC)である。他の実施態様において、癌は腎癌、例えば、腎細胞癌(例えば、明細胞腎細胞癌)である。他の実施態様において、癌は甲状腺癌、例えば、未分化甲状腺癌(ATC)である。他の実施態様において、癌は神経内分泌腫瘍(NET)、例えば、非定型肺カルチノイド腫瘍である。ある実施態様において、癌は肺癌、例えば、非小細胞肺癌(NSCLC)である。
他の実施態様において、組み合わせ物は、抗原提示組み合わせ物からの治療剤(例えば、STINGアゴニスト、TLRアゴニスト、ワクチンまたは腫瘍溶解性ウイルスの1以上)と、エフェクター細胞および/または抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物からの治療剤(例えば、チェックポイント阻害剤の阻害剤、例えば、PD−1、PD−L1、LAG−3、TIM−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)またはCTLA−4またはこれらの任意の組み合わせの阻害剤)の組み合わせ物を含む。ある実施態様において、STINGアゴニスト、TLRアゴニスト、ワクチンまたは腫瘍溶解性ウイルスの1以上をここに記載する抗PD−1抗体分子と組み合わせて投与する。ある実施態様において、STINGアゴニストおよび/またはワクチンをここに記載する抗PD−1抗体分子と組み合わせて投与する。ある実施態様において、腫瘍溶解性ウイルスをここに記載する抗PD−1抗体分子と組み合わせて投与する。組み合わせ物を肺癌(扁平上皮)、肺癌(腺癌)、頭頸部癌、子宮頸癌(扁平上皮)、胃癌、甲状腺癌、皮膚癌、黒色腫(例えば、進行型黒色腫)、鼻咽頭癌、腎癌、神経内分泌腫瘍(NET)または乳癌のようなここに記載する癌の処置に使用できる。ある実施態様において、癌は皮膚癌、例えば、メルケル細胞癌または黒色腫である。ある実施態様において、癌はメルケル細胞癌である。他の実施態様において、癌は黒色腫である。他の実施態様において、癌は乳癌、例えば、トリプルネガティブ乳癌(TNBC)である。他の実施態様において、癌は腎癌、例えば、腎細胞癌(例えば、明細胞腎細胞癌)である。他の実施態様において、癌は甲状腺癌、例えば、未分化甲状腺癌(ATC)である。他の実施態様において、癌は神経内分泌腫瘍(NET)、例えば、非定型肺カルチノイド腫瘍である。ある実施態様において、癌は肺癌、例えば、非小細胞肺癌(NSCLC)である。
ある実施態様において、組み合わせ物は、詳細な記載において提供する“抗原提示組み合わせ物、エフェクター細胞組み合わせ物および抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物の組み合わせ物例”なる標題のセクションに提供する治療剤の組み合わせ物を含む。
ここに開示する組み合わせ物を、一緒に単一組成物で投与しても、別々に2以上の異なる組成物で、例えば、ここに記載する組成物または投与形態で投与してもよい。これら治療剤の投与は任意の順番でよい。第一剤およびさらなる薬剤(例えば、第二、第三剤)を同じ投与経路または異なる投与経路で投与し得る。例えば、第一治療剤を、さらなる薬剤と同時に、前にまたは後に投与してよい。ある実施態様において、第一剤を局所で投与し、例えば、カテゴリー(i)〜(iii)の何れかの治療剤を、第一剤の投与が所望の部位、例えば、腫瘍部位(例えば、樹状細胞富化部位)に局在化するように、腫瘍標的剤、例えば、腫瘍ターゲティング抗体(例えば、抗体−薬物コンジュゲートを形成する)または任意の他の送達剤(例えば、標的化製剤のような製剤)とカップリングできる。ある実施態様において、治療剤は抗原(例えば、ワクチン、例えば、インサイチュ癌ワクチン)であり、これは腫瘍環境に標的化され、そうして樹状細胞の活性化をもたらす。治療剤を、腫瘍部位(例えば、腫瘍内または腫瘍周囲投与)に局所投与、例えば、注射できる。治療剤の局在化送達または投与は、そうしなければ治療剤の全身投与と関連する副作用または毒性の1以上を軽減できる。ある例示的実施態様において、治療剤(例えば、STINGまたはTLR)を腫瘍結合抗体(例えば、HER2に結合する抗体)とコンジュゲートし、それにより治療剤をHER−2発現細胞に送達できる。
組み合わせ物で投与するとき、第一剤、さらなる薬剤(例えば、第二または第三剤)または全てを、個々に、例えば、単剤療法として使用される各薬剤の量または用量より高い、低いまたは同じ量または用量で投与してよい。ある実施態様において、投与される第一剤、さらなる薬剤(例えば、第二または第三剤)または全ての量または用量は、個々に、例えば、単剤療法として使用される各薬剤の量または用量より低い(例えば、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%または少なくとも50%)。他の実施態様において、所望の効果(例えば、癌の処置)をもたらす第一剤、さらなる薬剤(例えば、第二または第三剤)または全ての量または用量は低い(例えば、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%または少なくとも50%低い)。
ある実施態様において、組み合わせ物は、抗原提示組み合わせ物、エフェクター細胞組み合わせ物または抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物またはこれらの任意の組み合わせから選択される治療剤の1以上に対する抗体分子、例えば、二または三特異的分子の形態であり得る。例えば、チェックポイント阻害剤(例えば、抗PD−1および抗LAG−3抗体分子)の2以上に対する二特異的分子。他の実施態様において、組み合わせ物は、抗原提示組み合わせ物、エフェクター細胞組み合わせ物および/または抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物の2または全てから選択される治療剤の1以上に対する抗体分子、例えば、二または三特異的分子の形態であり得る。ある実施態様において、抗体分子は完全抗体またはそのフラグメント(例えば、Fab、F(ab’)、Fvまたは一本鎖Fvフラグメント(scFv))である。さらに他の実施態様において、抗体分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgDおよびIgEの重鎖定常領域から選択される、特に、例えば、IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4の重鎖定常領域、より具体的には、IgG1またはIgG4(例えば、ヒトIgG1またはIgG4)の重鎖定常領域から選択される重鎖定常領域(Fc)である。ある実施態様において、重鎖定常領域はヒトIgG1またはヒトIgG4である。ある実施態様において、定常領域は、抗体分子の性質を修飾するために改変、例えば変異される(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基数、エフェクター細胞機能または補体機能の1以上の増加または減少のため)。ある実施態様において、抗体分子は二特異的または多特異的抗体分子、例えば、ここに記載する二特異的、三特異的抗体分子の形態である。
治療剤およびこれらの組み合わせ物のいくつかの例を次に提供する。組み合わせ物において使用する治療剤のさらに詳細な記載は、詳細な記載において提供する。
免疫調節剤
ある実施態様において、ここに開示する組み合わせ物において(例えば、抗原提示組み合わせ物から選択される治療剤と組み合わせて)使用する免疫調節剤は免疫チェックポイント分子の阻害剤である。ある実施態様において、免疫調節剤はPD−1、PD−L1、PD−L2、CTLA−4、TIM−3、LAG−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4および/またはTGFベータの阻害剤である。ある実施態様において、免疫チェックポイント分子の阻害剤はPD−1、PD−L1、LAG−3、TIM−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)、CTLA−4またはこれらの任意の組み合わせを阻害する。
阻害性分子の阻害はDNA、RNAまたはタンパク質レベルで実施され得る。ある実施態様において、阻害性核酸(例えば、dsRNA、siRNAまたはshRNA)を阻害性分子の発現阻害に使用できる。他の実施態様において、阻害性シグナルの阻害剤は、阻害性分子に結合するポリペプチド、例えば、可溶性リガンド(例えば、PD−1−IgまたはCTLA−4 Ig)または抗体もしくはその抗原結合フラグメント、例えば、PD−1、PD−L1、PD−L2、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)、CTLA−4、TIM−3、LAG−3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4および/またはTGFベータまたはこれらの組み合わせに結合する抗体またはそのフラグメント(ここでは“抗体分子”とも称する)である。
ある実施態様において、抗体分子は二特異的または多特異的抗体分子の形態である。ある実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1またはPD−L1に対する第一結合特異性および第二結合特異性、例えば、TIM−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)、LAG−3またはPD−L2に対する第二結合特異性を有する。ある実施態様において、二特異的抗体分子はPD−1またはPD−L1およびTIM−3に結合する。他の実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1またはPD−L1およびLAG−3に結合する。他の実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1またはPD−L1およびCEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)に結合する。他の実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1またはPD−L1およびCEACAM−1に結合する。さらに他の実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1またはPD−L1およびCEACAM−3に結合する。さらに他の実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1またはPD−L1およびCEACAM−5に結合する。他の実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1またはPD−L1に結合する。さらに他の実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1およびPD−L2に結合する。他の実施態様において、二特異的抗体分子は、TIM−3およびLAG−3に結合する。他の実施態様において、二特異的抗体分子は、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)およびLAG−3に結合する。他の実施態様において、二特異的抗体分子は、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)およびTIM−3に結合する。前記分子のあらゆる組み合わせを、PD−1またはPD−1に対する第一結合特異性およびTIM−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)、LAG−3またはPD−L2の2以上に対する第二および第三結合特異性を含む、多特異的抗体分子、例えば、三特異的抗体にできる。
ある実施態様において、免疫調節剤は、PD−1、例えば、ヒトPD−1の阻害剤(例えば、ここに記載する抗体分子)である。他の実施態様において、免疫調節剤はPD−L1、例えば、ヒトPD−L1の阻害剤である。ある実施態様において、PD−1またはPD−L1の阻害剤はPD−1またはPD−L1に対する抗体分子である。PD−1またはPD−L1阻害剤は、単独でまたは他の免疫調節剤と組み合わせて、例えば、LAG−3、TIM−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)またはCTLA−4の阻害剤と組み合わせて投与できる。例示的実施態様において、PD−1またはPD−L1の阻害剤、例えば、抗PD−1またはPD−L1抗体分子をLAG−3阻害剤、例えば、抗LAG−3抗体分子と組み合わせて投与する。他の実施態様において、PD−1またはPD−L1の阻害剤、例えば、抗PD−1またはPD−L1抗体分子を、TIM−3阻害剤、例えば、抗TIM−3抗体分子と組み合わせて投与する。他の実施態様において、PD−1またはPD−L1の阻害剤、例えば、抗PD−1またはPD−L1抗体分子を、CEACAM阻害剤(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5阻害剤)、例えば、抗CEACAM抗体分子と組み合わせて投与する。他の実施態様において、PD−1またはPD−L1の阻害剤、例えば、抗PD−1またはPD−L1抗体分子を、CEACAM−1阻害剤、例えば、抗CEACAM−1抗体分子と組み合わせて投与する。他の実施態様において、PD−1またはPD−L1の阻害剤、例えば、抗PD−1またはPD−L1抗体分子を、CEACAM−5阻害剤、例えば、抗CEACAM−5抗体分子と組み合わせて投与する。さらに他の実施態様において、PD−1またはPD−L1の阻害剤、例えば、抗PD−1抗体分子を、LAG−3阻害剤、例えば、抗LAG−3抗体分子およびTIM−3阻害剤、例えば、抗TIM−3抗体分子と組み合わせて投与する。免疫調節剤とPD−1阻害剤(例えば、PD−L2、CTLA−4、TIM−3、LAG−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4および/またはTGFベータの1以上)の他の組み合わせ物も本発明の範囲内である。当分野で知られるまたはここに開示する抗体分子の何れもチェックポイント分子の阻害剤の前記組み合わせ物に使用できる。
他の実施態様において、免疫調節剤は、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)、例えば、ヒトCEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)の阻害剤である。ある実施態様において、免疫調節剤は、CEACAM−1、例えば、ヒトCEACAM−1の阻害剤である。他の実施態様において、免疫調節剤は、CEACAM−3、例えば、ヒトCEACAM−3の阻害剤である。他の実施態様において、免疫調節剤は、CEACAM−5、例えば、ヒトCEACAM−5の阻害剤である。ある実施態様において、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)の阻害剤は、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)に対する抗体分子である。CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)阻害剤は、単独でまたは他の免疫調節剤と組み合わせて、例えば、LAG−3、TIM−3、PD−1、PD−L1またはCTLA−4の阻害剤と組み合わせて投与できる。
他の実施態様において、免疫調節剤は、LAG−3、例えば、ヒトLAG−3の阻害剤である。ある実施態様において、LAG−3の阻害剤は、LAG−3に対する抗体分子である。LAG−3阻害剤は、単独でまたは他の免疫調節剤と組み合わせて、例えば、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)、TIM−3、PD−1、PD−L1またはCTLA−4の阻害剤と組み合わせて投与できる。
他の実施態様において、免疫調節剤は、TIM−3、例えば、ヒトTIM−3の阻害剤である。ある実施態様において、TIM−3の阻害剤は、TIM−3に対する抗体分子である。TIM−3阻害剤は、単独でまたは他の免疫調節剤と組み合わせて、例えば、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)、LAG−3、PD−1、PD−L1またはCTLA−4の阻害剤と組み合わせて投与できる。
ある実施態様において、ここに開示する組み合わせ物において(例えば、抗原提示組み合わせ物から選択される治療剤と組み合わせて)使用される免疫調節剤は、共刺激性分子のアクティベーターまたはアゴニストである。ある実施態様において、共刺激性分子のアゴニストは、OX40、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM−1、LFA−1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、4−1BB(CD137)、GITR、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7−H3またはCD83リガンドのアゴニスト(例えば、アゴニスト抗体またはその抗原結合フラグメントまたは可溶性融合体)から選択される。
他の実施態様において、免疫調節剤はGITRアゴニストである。ある実施態様において、GITRアゴニストは、GITRに対する抗体分子である。GITRアゴニストは、単独でまたは他の免疫調節剤と組み合わせて、例えば、PD−1、PD−L1、CTLA−4、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)、TIM−3またはLAG−3の阻害剤と組み合わせて投与できる。ある実施態様において、抗GITR抗体分子は、GITRおよびPD−1、PD−L1、CTLA−4、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)、TIM−3またはLAG−3に結合する二特異的抗体である。ある例示的実施態様において、抗GITR抗体分子を抗PD−1抗体分子(例えば、ここに記載する抗PD−1分子)と組み合わせて投与する。GITR抗体分子および抗PD−1抗体分子は、別々の抗体組成物の形態でも、二特異的抗体分子でもよい。他の実施態様において、GITRアゴニストを、他の共刺激性分子、例えば、OX40、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM−1、LFA−1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、4−1BB(CD137)、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7−H3またはCD83リガンドのアゴニストと組み合わせて投与し得る。
他の実施態様において、免疫調節剤は、共刺激性分子のアクティベーター(例えば、OX40アゴニスト)である。ある実施態様において、OX40アゴニストは、OX40に対する抗体分子である。OX40アゴニストは、単独でまたは他の免疫調節剤と組み合わせて、例えば、PD−1、PD−L1、CTLA−4、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)、TIM−3またはLAG−3の阻害剤と組み合わせて投与できる。ある実施態様において、抗OX40抗体分子は、GITRおよびPD−1、PD−L1、CTLA−4、CEACAM(例えば、CEACAM−1、−3および/または−5)、TIM−3またはLAG−3に結合する二特異的抗体である。ある例示的実施態様において、OX40抗体分子を抗PD−1抗体分子(例えば、ここに記載する抗PD−1分子)と組み合わせて投与する。OX40抗体分子および抗PD−1抗体分子は、別々の抗体組成物の形態でも、二特異的抗体分子でもよい。他の実施態様において、OX40アゴニストを、他の共刺激性分子、例えば、GITR、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM−1、LFA−1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、4−1BB(CD137)、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7−H3またはCD83リガンドのアゴニストと組み合わせて投与できる。
ここに提供されるのは、チェックポイント阻害剤の阻害剤または共刺激性分子のアゴニストの組み合わせ物の単なる例であることは注意すべきである。これらの薬剤のさらなる組み合わせ物は本発明の範囲内である。
PD−1に対する抗体分子
ある実施態様において、PD−1阻害剤は、引用により全体を本明細書に包含させる“PD−1に対する抗体分子およびその使用”なる名称の米国特許出願公開2015/0210769号(USSN14/604,415)に記載される抗PD−1抗体分子である。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものからの、少なくとも1つの抗原結合領域、例えば、可変領域またはその抗原結合フラグメントを含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものからの少なくとも1、2、3または4可変領域を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものからの、少なくとも1または2重鎖可変領域を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものからの、少なくとも1または2軽鎖可変領域を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、IgG4、例えば、ヒトIgG4の重鎖定常領域を含む。ある実施態様において、ヒトIgG4は、EUナンバリングによる228位に置換を含む(例えば、SerからPro置換)。さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、IgG1、例えば、ヒトIgG1の重鎖定常領域を含む。ある実施態様において、ヒトIgG1は、EUナンバリングによる297位に置換を含む(例えば、AsnからAla置換)。ある実施態様において、ヒトIgG1はEUナンバリングによる265位の置換、EUナンバリングによる329位の置換または両方を含む(例えば、265位のAspからAla置換および/または329位のProからAla置換)。ある実施態様において、ヒトIgG1はEUナンバリングによる234位の置換、EUナンバリングによる235の置換または両方を含む(例えば、234位のLeuからAla置換および/または235位のLeuからAla置換)。ある実施態様において、重鎖定常領域は、表3に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、カッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパ軽鎖定常領域を含む。ある実施態様において、軽鎖定常領域は、表3に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、IgG4、例えば、ヒトIgG4の重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパ軽鎖定常領域、例えば、表3に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む重鎖および軽鎖定常領域を含む。ある実施態様において、ヒトIgG4は、EUナンバリングによる228位に置換を含む(例えば、SerからPro置換)。さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、IgG1、例えば、ヒトIgG1の重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパ軽鎖定常領域、例えば、表3に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む重鎖および軽鎖定常領域を含む。ある実施態様において、ヒトIgG1は、EUナンバリングによる297位に置換を含む(例えば、AsnからAla置換)。ある実施態様において、ヒトIgG1はEUナンバリングによる265位の置換、EUナンバリングによる329位の置換または両方を含む(例えば、265位のAspからAla置換および/または329位のProからAla置換)。ある実施態様において、ヒトIgG1はEUナンバリングによる234位の置換、EUナンバリングによる235の置換または両方を含む(例えば、234位のLeuからAla置換および/または235位のLeuからAla置換)。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eのアミノ酸配列または表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものを含む、重鎖可変ドメインおよび定常領域、軽鎖可変ドメインおよび定常領域または両方を含む。抗PD−1抗体分子は、場合により、表4に示す重鎖、軽鎖または両方からのリーダー配列またはそれに実質的に同一の配列を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものの重鎖可変領域からの少なくとも1、2または3相補性決定領域(CDR)を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載するまたは表1におけるヌクレオチド配列または前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものの軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDRを含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、軽鎖CDRに置換、例えば、軽鎖のCDR1、CDR2および/またはCDR3に1以上の置換を含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、軽可変領域の102位の軽鎖CDR3に置換、例えば、表1による軽可変領域の102位に、システイン残基からチロシン残基またはシステイン残基からセリン残基への置換を含む(例えば、マウスまたはキメラについて配列番号16または24または修飾配列について配列番号34、42、46、54、58、62、66、70、74または78の何れか)。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1、2、3、4、5または6のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載するまたは表1におけるヌクレオチド配列によりコードされるものからの全6CDRまたは密接に関係するCDR、例えば、同一であるかまたは少なくとも1アミノ酸改変を含むが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)は2、3または4を超えない。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載するあらゆるCDRを含み得る。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、軽鎖CDRに置換、例えば、軽鎖のCDR1、CDR2および/またはCDR3に1以上の置換を含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、軽可変領域の102位の軽鎖CDR3に置換、例えば、表1による軽可変領域の102位に、システイン残基からチロシン残基またはシステイン残基からセリン残基への置換を含む(例えば、マウスまたはキメラについて配列番号16または24または修飾配列について配列番号34、42、46、54、58、62、66、70、74または78の何れか)。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の重鎖可変領域からのKabat et al.による少なくとも1、2または3のCDR(例えば、表1に示すKabat定義に従う少なくとも1、2または3のCDR)を含むまたは表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるまたは表1に示すKabat et al.による1、2または3のCDRに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)は2、3または4を超えない。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の軽鎖可変領域からのKabat et al.による少なくとも1、2または3のCDR(例えば、表1に示すKabat定義に従う少なくとも1、2または3のCDR)を含むまたは表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるまたは表1に示すKabat et al.による1、2または3のCDRに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)は2、3または4を超えない。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのKabat et al.による少なくとも1、2、3、4、5または6のCDR(例えば、表1に示すKabat定義に従う少なくとも1、2、3、4、5または6のCDR)を含むまたは表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるまたは表1に示すKabat et al.による1、2、3、4、5または6CDRに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)は2、3または4を超えない。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのKabat et al.による全6CDR(例えば、表1に示すKabat定義に従う全6CDR)を含むまたは表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるまたは表1に示すKabat et al.による全6CDRに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)は2、3または4を超えない。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載するあらゆるCDRを含み得る。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の重鎖可変領域からの少なくとも1、2または3Chothiaの超可変ループ(例えば、表1に示すChothia定義に従う少なくとも1、2または3の超可変ループ)を含むまたは表1に記載するまたは表1におけるヌクレオチド配列によりコードされるものまたは少なくともPD−1と接触する超可変ループからのアミノ酸または表1に示すChothia et al.による1、2または3の超可変ループに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)は2、3または4を超えない。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の軽鎖可変領域の少なくとも1、2または3Chothiaの超可変ループ(例えば、表1に示すChothia定義に従う少なくとも1、2または3の超可変ループ)を含むまたは表1に記載するまたは表1におけるヌクレオチド配列によりコードされるものまたは少なくともPD−1と接触する超可変ループからのアミノ酸または表1に示すChothia et al.による1、2または3の超可変ループに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)は2、3または4を超えない。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1、2、3、4、5または6の超可変ループ(例えば、表1に示すChothia定義に従う少なくとも1、2、3、4、5または6の超可変ループ)を含むまたは表1に記載するまたは表1におけるヌクレオチド配列によりコードされるものまたは少なくともPD−1と接触する超可変ループからのアミノ酸または表1に示すChothia et al.による1、2、3、4、5または6の超可変ループに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)は2、3または4を超えない。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の全6超可変ループ(例えば、表1に示すChothia定義に従う全6超可変ループ)または密接に関係する超可変ループ、例えば、表1に示すChothia et al.による全6超可変ループと同一であるかまたは少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)は2、3または4を超えないかまたは少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)は2、3または4を超えない。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はここに記載するあらゆる超可変ループを含み得る。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の対応する超可変ループと同じ標準構造例えば、ここに記載する抗体の重および/または軽鎖可変ドメインの少なくともループ1および/またはループ2と同じ標準構造を有する少なくとも1、2または3の超可変ループを含む。超可変ループ標準構造の記載について、例えば、Chothia et al., (1992) J. Mol. Biol. 227:799-817; Tomlinson et al., (1992) J. Mol. Biol. 227:776-798参照。これらの構造は、これらの参考文献に記載された表を参照して決定され得る。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、Kabat et al.およびChothia et al.により定義されたCDRまたは超可変ループの組み合わせを含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の重鎖可変領域からの、KabatおよびChothia定義に従う少なくとも1、2または3のCDRまたは超可変ループ(例えば表1に示すKabatおよびChothia定義に従う少なくとも1、2または3のCDRまたは超可変ループ)を含むまたは表1におけるヌクレオチド配列または前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるまたは表1に示すKabatおよび/またはChothiaに従う1、2または3のCDRまたは超可変ループに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)は2、3または4を超えない。
例えば、抗PD−1抗体分子は、例えば、表1に示す、Kabat et al.によるVH CDR1またはChothia et al.によるVH超可変ループ1またはこれらの組み合わせを含み得る。ある実施態様において、VH CDR1のKabatおよびChothia CDRの組み合わせはアミノ酸配列GYTFTTYWMH(配列番号224)またはそれに実質的に同一のアミノ酸配列(例えば、少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)は2、3または4を超えない)を含む。抗PD−1抗体分子は、さらに、例えば、表1に示す、例えば、Kabat et al.によるVH CDR 2〜3およびKabat et al.によるVL CDR 1〜3を含み得る。従って、ある実施態様において、フレームワーク領域は、Kabat et al.に従い定義されるCDRおよびChothia et al.に従い定義される超可変ループの組み合わせに基づき定義される。例えば、抗PD−1抗体分子は、例えば、表1に示す、Chothia et al.によるVH超可変ループ1に基づき定義されたVH FR1およびKabat et al.によるVH CDR 1〜2に基づき定義されたVH FR2を含み得る。抗PD−1抗体分子は、さらに、例えば、Kabat et al.によるVH CDR 2〜3に基づき定義されたVH FR 3〜4およびKabat et al.によるVL CDR 1〜3に基づき定義されたVL FR 1〜4を含み得る。
抗PD−1抗体分子は、KabatおよびChothia定義に従うCDRまたは超可変ループのあらゆる組み合わせを含み得る。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の軽鎖可変領域からの、KabatおよびChothia定義に従う、少なくとも1、2または3のCDR(例えば、表1に示すKabatおよびChothia定義に従う少なくとも1、2または3のCDR)を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は
(a)配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
(b)配列番号1から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;
(c)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;または
(d)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL
を含む。
ここでの組み合わせ物において、他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、(i)配列番号1、配列番号4または配列番号224から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2または配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および(ii)配列番号10または配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11または配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32または配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。
ある実施態様、例えば、可変領域、CDR(例えば、Chothia CDRまたはKabat CDR)またはここに、例えば、表1に記載する他の配列を含む実施態様において、抗体分子は、単特異的抗体分子、二特異的抗体分子であるかまたは抗体の抗原結合フラグメント、例えば、半抗体または半抗体の抗原結合フラグメントを含む抗体分子である。ある実施態様において、抗体分子は、PD−1に対する第一結合特異性およびTIM−3、LAG−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、CEACAM−3および/またはCEACAM−5)、PD−L1またはPD−L2に対する第二結合特異性を有する二特異的抗体分子である。ある実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1およびTIM−3に結合する。他の実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1およびLAG−3に結合する。他の実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1およびCEACAM(例えば、CEACAM−1、CEACAM−3および/またはCEACAM−5)に結合する。他の実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1およびCEACAM−1に結合する。さらに他の実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1およびCEACAM−5に結合する。他の実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1およびPD−L1に結合する。さらに他の実施態様において、二特異的抗体分子は、PD−1およびPD−L2に結合する。前記分子のあらゆる組み合わせは、PD−1に対する第一結合特異性およびTIM−3、LAG−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、CEACAM−3またはCEACAM−5)、PD−L1またはPD−L2の1以上に対する第二および第三結合特異性を含む、多特異的抗体分子、例えば、三特異的抗体に製造できる。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、TIM−3、LAG−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、CEACAM−3またはCEACAM−5)、PD−L1またはPD−L2の1以上を含む二特異的分子との組み合わせで使用する。ある実施態様において、組み合わせ物において使用する二特異的抗体分子は、CEACAM(例えば、CEACAM−1、CEACAM−3および/またはCEACAM−5)およびLAG−3に結合する。他の実施態様において、組み合わせ物において使用する二特異的抗体分子は、CEACAM(例えば、CEACAM−1、CEACAM−3および/またはCEACAM−5)およびTIM−3に結合する。他の実施態様において、組み合わせ物において使用する二特異的抗体分子は、LAG−3およびTIM−3に結合する。
組み合わせ治療の使用
ここに開示する組み合わせ物は、抗原提示の増加、エフェクター細胞機能(例えば、T細胞増殖、IFN−γ分泌または細胞溶解性機能の1以上)の増加、制御性T細胞機能の阻害、制御性T細胞、エフェクターT細胞およびNK細胞のような複数細胞型の活性に対する作用、腫瘍浸潤性リンパ球増加、T細胞受容体介在増殖増加および癌性細胞による免疫回避減少の1以上をもたらし得る。ある実施態様において、組み合わせ物におけるPD−1阻害剤の使用は、免疫チェックポイントの遮断または減少に至る、PD−1の1以上の活性を阻害、減少または中和する。それ故に、このような組み合わせ物を、対象における免疫応答の増強が望まれる障害の処置または予防に使用できる。
従って、他の態様において、対象における免疫応答を調節する方法が提供される。方法は、対象における免疫応答が調節されるように、対象に、ここに開示する組み合わせ物(例えば、治療有効量の抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物)を、単独でまたは1以上の薬剤または手技と組み合わせて投与することを含む。ある実施態様において、抗体分子は、対象における免疫応答を増強、刺激または増加させる。対象は、哺乳動物、例えば、霊長類、好ましくは高等霊長類、例えば、ヒト(例えば、ここに記載する障害を有するまたは有するリスクにある患者)であり得る。ある実施態様において、対象は、免疫応答の増強が必要である。ある実施態様において、対象は、ここに記載する障害、例えば、ここに記載する癌または感染性障害を有するか、それを有するリスクにある。ある実施態様において、対象は、免疫低下しているか、またはそのリスクがある。例えば、対象は、化学療法処置および/または放射線療法を受けているかまたは過去に受けた。これとは別にまたはこれと組み合わせて、対象は、感染の結果として、免疫低下しているか、またはそのリスクがある。
ある態様において、対象における癌または腫瘍を処置する方法(例えば、軽減、阻止または進行遅延の1以上)が提供される。方法は、対象にここに開示する組み合わせ物(例えば、治療有効量の抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物)を投与することを含む。
ある実施態様において、組み合わせ物で処置される癌は、固形腫瘍、血液癌(例えば、白血病、リンパ腫、骨髄腫、例えば、多発性骨髄腫)および転移病変を含むが、これらに限定されない。ある実施態様において、癌は固形腫瘍である。固形腫瘍の例は、悪性腫瘍、例えば、肉腫および癌腫、例えば、肺、乳房、卵巣、リンパ系、消化器(例えば、結腸)、肛門、生殖器および泌尿生殖器管(例えば、腎臓、尿路上皮、膀胱細胞、前立腺)、咽頭、CNS(例えば、脳、神経またはグリア細胞)、頭頸部、皮膚(例えば、黒色腫またはメルケル細胞癌)および膵臓に影響するもののような種々の臓器系の腺癌、ならびに結腸癌、直腸癌、腎細胞癌、肝臓癌、非小細胞肺癌、小腸癌および食道癌のような悪性腫瘍を含む腺癌を含む。癌は、早期、中期、後期または転移癌であり得る。
ある実施態様において、癌は肺癌(例えば、非小細胞肺癌(NSCLC)(例えば、扁平上皮および/または非扁平上皮組織型NSCLCまたはNSCLC腺癌))、皮膚癌(例えば、メルケル細胞癌または黒色腫(例えば、進行型黒色腫))、腎癌(例えば、腎癌(例えば、腎細胞癌)、肝臓癌、骨髄腫(例えば、多発性骨髄腫)、前立腺癌、乳癌(例えば、エストロゲン受容体、プロゲステロン受容体またはHer2/neuの1、2または全てを発現しない乳癌、例えば、トリプルネガティブ乳癌)、結腸直腸癌、膵臓癌、頭頸部癌(例えば、頭頸部扁平上皮細胞癌(HNSCC)、脳癌(例えば、神経膠芽腫)、子宮内膜癌、肛門癌、胃食道癌、甲状腺癌(例えば、未分化甲状腺癌)、子宮頸癌、神経内分泌腫瘍(NET)(例えば、非定型肺カルチノイド腫瘍)、リンパ増殖性疾患(例えば、移植後リンパ増殖性疾患)または血液癌、T細胞リンパ腫、B細胞リンパ腫、非ホジキンリンパ腫または白血病(例えば、骨髄性白血病またはリンパ性白血病)から選択される。
他の実施態様において、癌は、癌(例えば、進行型または転移癌)、黒色腫または肺癌、例えば、非小細胞肺癌から選択される。
ある実施態様において、癌は、肺癌、例えば、非小細胞肺癌または小細胞肺癌である。
ある実施態様において、癌は黒色腫、例えば、進行型黒色腫である。ある実施態様において、癌は、他の治療に応答しない進行型または切除不能黒色腫である。他の実施態様において、癌は、BRAF変異(例えば、BRAF V600変異)を有する黒色腫である。さらに他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物(例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物)を、BRAF阻害剤(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)を併用するまたはしない抗CTLA−4抗体(例えば、イピリムマブ)での処置後、投与する。
他の実施態様において、癌は、ウイルス感染、例えば、慢性ウイルス性肝炎を伴うまたは伴わない肝細胞癌、例えば、進行型肝細胞癌である。
他の実施態様において、癌は、前立腺癌、例えば、進行型前立腺癌である。
さらに他の実施態様において、癌は、骨髄腫、例えば、多発性骨髄腫である。
さらに他の実施態様において、癌は、腎癌、例えば、腎細胞癌(RCC)(例えば、転移RCCまたは明細胞腎細胞癌(CCRCC))である。
ある実施態様において、癌は、MSI高(高マイクロサテライト不安定性)癌(例えば、MSI高子宮内膜癌)である。他の実施態様において、癌は、EBV+癌である。ある実施態様において、癌は、FoxP3発現癌(例えば、FoxP3発現非小細胞肺癌または頭頸部扁平上皮細胞癌)である。他の実施態様において、癌は、EGFR変異またはcMET陽性(例えば、EGFR変異またはcMET陽性非小細胞肺癌)である。他の実施態様において、癌は、KRAS変異を有する(例えば、KRAS変異を有する非小細胞肺癌)。
ある態様において、対象における癌を処置する方法が提供される。方法は、対象に次のカテゴリー(i)〜(iii):
(i)STINGアゴニスト、TLRアゴニスト、A2ARアンタゴニストまたは腫瘍溶解性ウイルスから選択される腫瘍抗原提示を増強する薬剤またはこれらの組み合わせ、and、場合により、TIM−3モジュレーター、血管内皮細胞増殖因子受容体(VEGFR)阻害剤、c−Met阻害剤、TGFb阻害剤、IDO/TDO阻害剤、ワクチンまたは二または三特異的細胞アンガジェの1以上;
(ii)(場合により)GITRアゴニスト、PD−1阻害剤、PD−L1阻害剤、IAP(Inhibitor of Apoptosis Protein)の阻害剤、EGFR(Epidermal Growth Factor Receptor)の阻害剤、ラパマイシンの標的(mTOR)の阻害剤、IL−15またはそのバリアント、CTLA−4阻害剤、CD3と腫瘍抗原に結合する二特異的抗体分子、CD40アゴニスト、OX40アゴニストまたはCD27アゴニストの1以上から選択されるエフェクター細胞応答を増強する薬剤;または
(iii)抗PD−1抗体分子、および、場合により、GITRアゴニスト、PD−L1、LAG−3、TIM−3またはCTLA−4、CSF−1/1R阻害剤、IL−17阻害剤、IL−1β阻害剤、CXCR2阻害剤、PI3KγまたはPI3Kδの阻害剤)の1以上から選択される免疫チェックポイント分子の阻害剤、(vii)BAFF−R阻害剤、MALT−1/BTK阻害剤、JAK阻害剤、CRTH2阻害剤、VEGFR阻害剤、IL−15またはそのバリアント、CTLA−4阻害剤、IDO/TDO阻害剤、A2ARアンタゴニスト、TGFb阻害剤またはPFKFB3阻害剤から選択される腫瘍免疫抑制を減少させる薬剤の1以上
の2または全てから選択される2、3またはそれ以上の治療剤の組み合わせ物を投与することを含み、
ここで、抗PD−1抗体分子は
(a)配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
(b)配列番号1のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;
(c)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;または
(d)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL
を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は
(a)配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号42のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(b)配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号66のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(d)配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号70のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(d)配列番号50のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号70のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(e)配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号46のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(f)配列番号50のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号46のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(g)配列番号50のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号54のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(h)配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号54のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(i)配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(j)配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号62のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(k)配列番号50のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号66のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(l)配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号74のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(m)配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号78のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(n)配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号70のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;
(o)配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号66のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン;または
(p)配列番号86のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号66のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメイン
を含む。
ある実施態様において、癌はここに記載する癌、例えば、肺癌、扁平上皮細胞肺癌、黒色腫、腎癌、肝臓癌、骨髄腫、前立腺癌、乳癌、ER+乳癌、IM−TN乳癌、結腸直腸癌、高マイクロサテライト不安定性結腸直腸癌、EBV+胃癌、膵臓癌、甲状腺癌、血液癌、非ホジキンリンパ腫または白血病またはこれら癌の転移病変から選択される。ある実施態様において、癌は、非小細胞肺癌(NSCLC)、NSCLC腺癌、NSCLC扁平上皮細胞癌または肝細胞癌から選択される。
ある実施態様において、癌微小環境は、高レベルのPD−L1発現を有する。これとは別にまたはこれと組み合わせて、癌微小環境は、IFNγおよび/またはCD8発現が増加し得る。
ある実施態様において、対象は、PD−L1レベルもしくは発現が高いまたは腫瘍浸潤性リンパ球(TIL)+である(例えば、TIL数が増加している)の1以上または両方である腫瘍を有するまたはそれを有するとして同定される。ある実施態様において、対象は、PD−L1レベルまたは発現が高くかつTIL+である腫瘍を有するまたはそれを有するとして同定される。ある実施態様において、ここに記載する方法は、さらに、PD−L1レベルもしくは発現が高いまたはTIL+であるまたは両方である腫瘍を有することに基づき対象を同定することを含む。ある実施態様において、ここに記載する方法は、さらに、PD−L1レベルもしくは発現が高いまたはTIL+である腫瘍を有することに基づき対象を同定する。ある実施態様において、TIL+である腫瘍は、CD8およびIFNγについて陽性である。ある実施態様において、対象は、PD−L1、CD8および/またはIFNγの1、2またはそれ以上が陽性である細胞のパーセンテージが高いまたはそのように同定される。ある実施態様において、対象はPD−L1、CD8およびIFNγの全てについて陽性である細胞のパーセンテージが高いまたはそのように同定される。
ある実施態様において、ここに記載する方法は、さらに、PD−L1、CD8および/またはIFNγの1、2またはそれ以上が陽性である細胞のパーセンテージが高いことに基づき、対象を同定することを含む。ある実施態様において、ここに記載する方法は、さらに、PD−L1、CD8およびIFNγの全てについて陽性である細胞のパーセンテージが高いことに基づき、対象を同定することを含む。ある実施態様において、対象は、PD−L1、CD8および/またはIFNγの1、2またはそれ以上および肺癌、例えば、扁平上皮細胞肺癌または肺腺癌(例えば、NSCLC)、頭頸部癌、扁平上皮細胞頸部癌、胃癌、食道癌、甲状腺癌(例えば、未分化甲状腺癌)、皮膚癌(例えば、メルケル細胞癌または黒色腫)、乳癌(例えば、NTBC)および/または鼻咽頭癌(NPC)の1以上を有するまたは有するとして同定される。ある実施態様において、ここに記載する方法は、さらに、対象をPD−L1、CD8および/またはIFNγの1、2またはそれ以上および肺癌、例えば、扁平上皮細胞肺癌または肺腺癌(例えば、NSCLC)、頭頸部癌、扁平上皮細胞頸部癌、胃癌、甲状腺癌(例えば、未分化甲状腺癌)、皮膚癌(例えば、メルケル細胞癌または黒色腫)、神経内分泌腫瘍、乳癌(例えば、NTBC)および/または鼻咽頭癌の1以上を有することに基づき、同定することを含む。
ここに開示する方法および組成物は、前記癌と関連する転移病変の処置に有用である。
さらなる態様において、本発明は、対象に、ここに記載する組み合わせ物、例えば、治療有効量のここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を投与することを含む、対象における感染性疾患を処置する方法を提供する。ある実施態様において、感染疾患は肝炎(例えば、C型肝炎感染)または敗血症から選択される。
なおさらに、本発明は、対象における抗原に対する免疫応答が増強されるように、対象に(i)抗原および(ii)ここに記載する組み合わせ物、例えば、治療有効量のここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を投与することを含む、対象における抗原に対する免疫応答を増強する方法を提供する。抗原は、例えば、腫瘍抗原、ウイルス抗原、細菌抗原または病原体からの抗原であり得る。
ここに記載する組み合わせ物は、対象に全身(例えば、経口、非経腸、皮下、静脈内、直腸、筋肉内、腹腔内、鼻腔内、経皮または吸入または腔内注入)、局所または鼻、喉および気管支のような粘膜への適用により投与できる。
ここに開示する治療剤の投与量および治療レジメンは、当業者により決定され得る。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、約1〜30mg/kg、例えば、約5〜25mg/kg、約10〜20mg/kg、約1〜5mg/kgまたは約3mg/kgの用量で注射(例えば、皮下または静脈内)により投与する。投与スケジュールは例えば、週に1回から2週、3週または4週に1回までで変わり得る。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、隔週で約10〜20mg/kgの用量で投与する。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、単独でまたは組み合わせて(例えば、抗LAG−3抗体分子と組み合わせて)、隔週で、約5mg/kgまたはそれ未満、約4mg/kgまたはそれ未満、約3mg/kgまたはそれ未満、約2mg/kgまたはそれ未満、約1mg/kgまたはそれ未満の用量で投与する。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、隔週1〜5mg/kg、隔週1〜4mg/kg、隔週1〜3mg/kgまたは隔週1〜2mg/kgの用量で投与する。ある実施態様において、抗LAG−3抗体分子を、単独でまたは組み合わせて(例えば、抗PD−1抗体分子と組み合わせて)、隔週1〜5mg/kg;隔週1〜4mg/kg、隔週1〜3mg/kgまたは隔週1〜2mg/kgの用量で投与する。
ここに記載する抗体分子がここに記載する方法において使用するために好ましいが、他の抗PD−1抗体をその代わりにまたは本発明の抗PD−1抗体分子と組み合わせて使用できる。
さらなる組み合わせ治療
ここに記載する方法および組み合わせ物を、他の薬剤または治療モダリティと組み合わせて使用できる。ある実施態様において、ここに記載する方法は、対象に、障害の処置または予防に有効な量で、ここに記載する抗PD−1抗体分子を、ある薬剤または治療手技もしくはモダリティと組み合わせて含む、組み合わせ物を投与することを含む。抗PD−1抗体分子および薬剤または治療手技またはモダリティは、同時に適用しても、任意の順番で逐次適用してもよい。抗PD−1抗体分子および他の治療剤、手技またはモダリティー (例えば、ここに記載する)のあらゆる組み合わせ物および順番が使用され得る。抗体分子および/または他の治療剤、手技またはモダリティーを、障害が活動性の間または疾患が寛解もしくは低活動性の間適用できる。抗体分子を、他の処置の前、処置と同時、処置後または障害の寛解の間投与できる。
ある実施態様において、ここに記載する方法および組成物を、他の抗体分子、化学療法、他の抗癌治療(例えば、標的化抗癌治療、遺伝子治療、ウイルス治療、RNA治療、骨髄移植、ナノ治療または腫瘍溶解剤)、細胞毒性剤、免疫ベースの治療(例えば、サイトカインまたは細胞ベースの免疫治療)、外科手技(例えば、乳腺腫瘍摘出術または乳房切除術)または放射線治療または前記の何れかの組み合わせの1以上と組み合わせて投与する。付加的治療は、アジュバントまたはネオアジュバント治療の形態であり得る。ある実施態様において、付加的治療は酵素阻害剤(例えば、小分子酵素阻害剤)または転移阻害剤である。組み合わせて投与できる細胞毒性剤の例は、微小管阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤、代謝拮抗剤、有糸分裂阻害剤、アルキル化剤、アントラサイクリン、ビンカアルカロイド、挿入剤、シグナル伝達経路を妨害できる薬剤、アポトーシスを促進する薬剤、プロテオソーム阻害剤および放射線(例えば、局所または全身照射(例えば、ガンマ照射)を含む。他の実施態様において、付加的治療は手術または放射線またはこれらの組み合わせである。他の実施態様において、付加的治療はPI3K/AKT/mTOR経路、HSP90阻害剤またはチューブリン阻害剤の1以上をターゲティングする治療である。
前記組み合わせ物の代わりにまたはそれと組み合わせて、ここに記載する方法および組成物を、免疫調節剤(例えば、共刺激性分子のアクティベーターまたは阻害性分子の阻害剤、例えば、免疫チェックポイント分子)、ワクチン、例えば、治療癌ワクチンまたは他の形態の細胞免疫療法の1以上と組み合わせて投与できる。
ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物の非限定的組み合わせ物および使用の例は次のものを含む。
ある実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、共刺激性分子または阻害性分子、例えば、共阻害性リガンドまたは受容体のモジュレーターと組み合わせて投与する。
ある実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、共刺激性分子のモジュレーター、例えば、アゴニストと組み合わせて投与する。ある実施態様において、共刺激性分子のアゴニストは、OX40、CD2、CD27、CDS、ICAM−1、LFA−1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、4−1BB(CD137)、GITR、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7−H3またはCD83リガンドのアゴニスト(例えば、アゴニスト抗体またはその抗原結合フラグメントまたは可溶性融合体)から選択される。
ある実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、PD−L1、PD−L2、CTLA−4、TIM−3、LAG−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、CEACAM−3および/またはCEACAM−5)、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4および/またはTGFベータから選択される阻害性(または免疫チェックポイント)分子の阻害剤と組み合わせて投与する。ある実施態様において、阻害剤は可溶性リガンド(例えば、CTLA−4−Ig)またはPD−L1、PD−L2もしくはCTLA−4に結合する抗体もしくは抗体フラグメントである。例えば、抗PD−1抗体分子を、例えば、癌(例えば、黒色腫、例えば、転移黒色腫、肺癌、例えば、非小細胞肺癌または前立腺癌から選択される癌)の処置に、抗CTLA−4抗体、例えば、イピリムマブと組み合わせて投与できる。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、BRAF阻害剤(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)を併用するまたは併用しない抗CTLA−4抗体(例えば、イピリムマブ)での処置後投与する。
他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、抗LAG−3抗体またはその抗原結合フラグメントと組み合わせて投与する。
他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、抗TIM−3抗体またはその抗原結合フラグメントと組み合わせて投与する。
さらに他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、抗LAG−3抗体および抗TIM−3抗体(またはその抗原結合フラグメント)と組み合わせて投与する。
他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物、を、CEACAM阻害剤(例えば、CEACAM−1および/またはCEACAM−5阻害剤)、例えば、抗CEACAM抗体分子と組み合わせて投与する。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、CEACAM−1阻害剤、例えば、抗CEACAM−1抗体分子と組み合わせて投与する。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、CEACAM−5阻害剤、例えば、抗CEACAM−5抗体分子と組み合わせて投与する。
ここに記載する抗体の組み合わせは、別々に、例えば、別々の抗体またはその抗原結合フラグメントとして投与しても、例えば、二特異的または三特異的抗体分子として連結させてもよい。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子および抗TIM−3、抗CEACAM(例えば、抗CEACAM−1、CEACAM−3および/または抗CEACAM−5)または抗LAG−3抗体またはその抗原結合フラグメントを含む二特異的抗体が投与される。ある実施態様において、ここに記載する抗体の組み合わせを、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、固形腫瘍または血液系腫瘍)の処置に使用する。
他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、サイトカインと組み合わせて投与する。サイトカインは、抗PD−1抗体分子への融合分子としてまたは別々の組成物として投与され得る。ある実施態様において、抗PD−1抗体を、1、2、3またはそれ以上のサイトカインと、例えば、融合分子または別々の組成物として、組み合わせて投与する。ある実施態様において、サイトカインは、インターロイキン(IL)−1、IL−2、IL−12、IL−15またはIL−21の1、2、3またはそれ以上から選択されるILである。ある実施態様において、二特異的抗体分子は、第一標的(例えば、PD−1)に対する第一結合特異性、第二標的(例えば、LAG−3またはTIM−3)に対する第二結合特異性を有し、場合によりインターロイキン(例えば、IL−12)ドメイン、例えば、完全長IL−12またはその一部に連結している。ある実施態様において、ここに記載する抗PD−1抗体分子とサイトカインの組み合わせ物を癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、固形腫瘍の処置に使用する。
ある実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、HLA Cに特異的な抗体、例えば、キラー細胞免疫グロブリン様受容体に特異的な抗体(ここでは“抗KIR抗体”とも称する)と組み合わせて投与する。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子と抗KIR抗体の組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、固形腫瘍、例えば、進行型固形腫瘍)の処置に使用する。
ある実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、細胞免疫療法(例えば、プロベンジ(登録商標)(例えば、シプロイセルT))と組み合わせておよび場合によりシクロホスファミドと組み合わせて投与する。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子、プロベンジ(登録商標)および/またはシクロホスファミドの組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、前立腺癌、例えば、進行型前立腺癌)の処置に使用する。
他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、ワクチン、例えば、癌ワクチン、(例えば、樹状細胞腎癌(DC−RCC)ワクチン)と組み合わせて投与する。ある実施態様において、ワクチンは、ペプチドベース、DNAベース、RNAベースまたは抗原ベースまたはこれらの組み合わせである。ある実施態様において、ワクチンは、ペプチド、核酸(例えば、DNAまたはRNA)、抗原またはこれらの組み合わせの1以上を含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子とDC−RCCワクチンの組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、腎癌、例えば、転移腎細胞癌(RCC)または明細胞腎細胞癌(CCRCC))の処置に使用する。
他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、アジュバントと組み合わせて投与する。
さらに他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、化学療法および/または免疫療法と組み合わせて投与する。例えば、抗PD−1抗体分子を、単独でまたは化学療法または他の抗癌薬剤(例えば、サリドマイドアナログ、例えば、レナリドマイド)、抗TIM−3抗体、腫瘍抗原パルス樹状細胞、腫瘍細胞と樹状細胞の融合体(例えば、電気融合体)または悪性形質細胞により産生された免疫グロブリンイディオタイプでのワクチン接種の1以上と組み合わせて、骨髄腫の処置に使用できる。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、骨髄腫、例えば、多発性骨髄腫の処置に、抗TIM−3抗体と組み合わせて使用する。
ある実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、肺癌、例えば、非小細胞肺癌の処置に、化学療法と組み合わせて使用する。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、肺癌の処置に、標準的肺、例えば、NSCLC、化学療法、例えば、白金ダブレット治療と組み合わせて使用する。さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、進行型または転移癌を有する対象(例えば、転移性および再発性NSCL癌を有する患者)に、インドールアミン−ピロール2,3−ジオキシゲナーゼ(IDO)阻害剤(例えば、(4E)−4−[(3−クロロ−4−フルオロアニリノ)−ニトロソメチリデン]−1,2,5−オキサジアゾール−3−アミン(INCB24360としても知られる)、インドキシモド(1−メチル−D−トリプトファン)、α−シクロヘキシル−5H−イミダゾ[5,1−a]イソインドール−5−エタノール(NLG919としても知られる)など)と組み合わせて使用する。
さらに他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、免疫ベースのストラテジー(例えば、インターロイキン−2またはインターフェロン−α)、標的剤(例えば、VEGFに対するモノクローナル抗体のようなVEGF阻害剤)、スニチニブ、ソラフェニブ、アクシチニブおよびパゾパニブのようなVEGFチロシンキナーゼ阻害剤、RNAi阻害剤またはVEGFシグナル伝達の下流メディエーターの阻害剤、例えば、ラパマイシンの哺乳動物標的(mTOR)の阻害剤、例えば、エベロリムスおよびテムシロリムスの1以上と組み合わせて使用する。このような組み合わせ物の何れも、腎癌、例えば、腎細胞癌(RCC)(例えば、明細胞腎細胞癌(CCRCC))または転移RCCの処置に使用できる。
ある実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、MEK阻害剤(例えば、ここに記載するMEK阻害剤)と組み合わせて使用する。ある実施態様において、抗PD−1抗体とMEK阻害剤の組み合わせ物を、癌(例えば、ここに記載する癌)の処置に使用する。ある実施態様において、組み合わせ物で処置される癌は、黒色腫、結腸直腸癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、乳癌、前立腺癌、膵臓癌、造血器腫瘍または腎細胞癌から選択される。ある実施態様において、癌は、BRAF変異(例えば、BRAF V600E変異)、BRAF野生型、KRAS野生型または活性化KRAS変異を含む。癌は、早期、中期または末期であり得る。
他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、オキサリプラチン、ロイコボリンまたは5−FUの1、2または全て(例えば、FOLFOX共処置)と組み合わせて使用する。これとは別にまたはこれと組み合わせて、組み合わせ物は、さらにVEGF阻害剤(例えば、ここに記載するVEGF阻害剤)を含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体、FOLFOX共処置およびVEGF阻害剤の組み合わせ物を、癌(例えば、ここに記載する癌)の処置に使用する。ある実施態様において、組み合わせ物で処置される癌は、黒色腫、結腸直腸癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、乳癌、前立腺癌、膵臓癌、造血器腫瘍または腎細胞癌から選択される。癌は、早期、中期または末期であり得る。
他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、腎細胞癌および他の固形腫瘍の処置のために、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、アクシチニブ)と組み合わせて投与する。
他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、4−1BB受容体標的剤(例えば、4−1BB(CD−137)を通るシグナル伝達を刺激する抗体、例えば、PF−2566)と投与する。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、アクシチニブ)および4−1BB受容体標的剤と組み合わせて投与する。
抗PD−1抗体分子は、物質、例えば、細胞毒性剤または部分(例えば、治療薬物、放射線放出化合物、植物、真菌または細菌起源の分子または生物学的タンパク質(例えば、タンパク質毒素)または粒子(例えば、ウイルスコートタンパク質を介して、例えば、組み換えウイルス粒子)に結合され得る。例えば、抗体は、α−、β−またはγ−エミッターまたはβ−およびγ−エミッターのような放射性同位体に連結され得る。
抗PD−1抗体分子および他の治療剤、手技またはモダリティー(例えば、ここに記載する)のあらゆる組み合わせ物および順番が使用され得る。抗体分子および/または他の治療剤、手技またはモダリティーを、障害が活動性の間または疾患が寛解もしくは低活動性の間適用できる。抗体分子を、他の処置の前、処置と同時、処置後または障害の寛解の間投与できる。
付加的組み合わせ治療
ある実施態様において、ここに開示する組み合わせ物の何れも表7に記載のする薬剤の1以上をさらに含む。
ある実施態様において、付加的治療剤は、例えば、ここにおよび表7に記載する、1)タンパク質キナーゼC(PKC)阻害剤、2)ヒートショックタンパク質90(HSP90)阻害剤、3)ホスホイノシチド3−キナーゼ(PI3K)および/またはラパマイシンの標的(mTOR)の阻害剤、4)チトクロムP450阻害剤(例えば、CYP17阻害剤または17アルファ−ヒドロキシラーゼ/C17−20リアーゼ阻害剤)、5)鉄キレート剤、6)アロマターゼ阻害剤、7)p53阻害剤、例えば、p53/Mdm2相互作用阻害剤、8)アポトーシス誘導因子、9)血管形成阻害剤、10)アルドステロンシンターゼ阻害剤、11)スムーズンド(SMO)受容体阻害剤、12)プロラクチン受容体(PRLR)阻害剤、13)Wntシグナル伝達阻害剤、14)CDK4/6阻害剤、15)線維芽細胞増殖因子受容体2(FGFR2)/線維芽細胞増殖因子受容体4(FGFR4)阻害剤、16) マクロファージコロニー刺激因子(M−CSF)の阻害剤、17)c−KIT、ヒスタミン放出、Flt3(例えば、FLK2/STK1)またはPKCの1以上の阻害剤、18)VEGFR−2(例えば、FLK−1/KDR)、PDGFRベータ、c−KITまたはRafキナーゼCの1以上の阻害剤、19)ソマトスタチンアゴニストおよび/または成長ホルモン放出阻害剤、20)未分化リンパ腫キナーゼ(ALK)阻害剤、21)インシュリン様増殖因子1受容体(IGF−1R)阻害剤、22)P−糖タンパク質1阻害剤、23)血管内皮細胞増殖因子受容体(VEGFR)阻害剤、24)BCR−ABLキナーゼ阻害剤、25)FGFR阻害剤、26)CYP11B2阻害剤、27)HDM2阻害剤、例えば、HDM2−p53相互作用阻害剤、28)チロシンキナーゼ阻害剤、29)c−MET阻害剤、30)JAK阻害剤、31)DAC阻害剤、32)11β−ヒドロキシラーゼ阻害剤、33)IAPの阻害剤、34)PIMキナーゼ阻害剤、35)Porcupine阻害剤、36)BRAF、例えば、BRAF V600Eまたは野生型BRAFの阻害剤、37)HER3阻害剤、38)MEK阻害剤または39)脂質キナーゼ阻害剤の1以上から選択される。
ある実施態様において、付加的治療剤は、化合物A8、化合物A17、化合物A23、化合物A24、化合物A27、化合物A29、化合物A33および化合物A13の1以上から選択される。
他の実施態様において、付加的治療剤は、化合物A5、化合物A8、化合物A17、化合物A23、化合物A24、化合物A29および化合物A40の1以上から選択される。
他の実施態様において、付加的治療剤は、化合物A9、化合物A16、化合物A17、化合物A21、化合物A22、化合物A25、化合物A28、化合物A48および化合物49の1以上から選択される。
ある実施態様において、癌は、肺癌(例えば、非小細胞肺癌(NSCLC)(例えば、扁平上皮および/または非扁平上皮組織型NSCLCまたはNSCLC腺癌)から選択されるかまたは表7に挙げる刊行物に開示される。
付加的実施態様
付加的実施態様は、対象またはサンプル(例えば、癌細胞および場合によりTILのような免疫細胞を含む対象のサンプル)においてPD−L1、CD8またはIFN−γの1、2または全ての存在を同定し、それによりPD−L1、CD8またはIFN−γの1、2または全てについての値を提供することを含む、癌を処置する方法を提供する。方法は、さらに、PD−L1、CD8および/またはIFN−γ値と、参照値、例えば、対照値の比較を含み得る。PD−L1、CD8および/またはIFN−γ値が参照値、例えば、対照値より高いならば、治療有効量のここに記載する組み合わせ物(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体を含む組み合わせ物)を、対象に、場合により1以上の他の薬剤と組み合わせて投与し、それにより癌を処置する。癌は、例えば、肺癌(扁平上皮)、肺癌(腺癌)、頭頸部癌、子宮頸癌(扁平上皮)、胃癌、甲状腺癌(例えば、未分化甲状腺癌)、皮膚癌(例えば、メルケル細胞癌または黒色腫)、鼻咽頭癌、神経内分泌腫瘍(例えば、非定型肺カルチノイド腫瘍)または乳癌、例えば、TN乳癌、例えば、IM−TN乳癌のような、ここに記載する癌であり得る。ある実施態様において、癌はER+乳癌または膵臓癌である。
また提供されるのは、対象またはサンプル(例えば、癌細胞を含む対象のサンプル)をPD−L1について試験し、それによりPD−L1値を同定し、PD−L1値を対照値と比較し、PD−L1値が対照値より高いならば、治療有効量のここに記載する組み合わせ物(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体を含む組み合わせ物)を、対象に、場合により1以上の他の薬剤と組み合わせて投与し、それにより癌を処置することを含む、癌を処置する方法である。癌は、例えば、ここに記載する癌であってよく、例えば、癌は、非小細胞肺(NSCLC)腺癌(ACA)、NSCLC扁平上皮細胞癌(SCC)または肝細胞癌(HCC)である。
他の態様において、本発明は、ここに記載する抗体分子および使用指示を含む、診断または治療キットに関する。
ここに記載する全ての刊行物、特許出願、特許および他の引用は、全てのその全体を引用により本明細書に包含させる。
本発明の他の特長、目的および利点は、記載および図面ならびに特許請求の範囲から明らかである。
図1は、マウス抗PD−1 mAb BAP049の軽鎖および重鎖可変領域のアミノ酸配列を記載する。上部および下部配列は、2つの独立した分析由来であった。Kabatナンバリングに基づく軽鎖および重鎖CDR配列に下線を付す。Chothiaナンバリングに基づく軽鎖および重鎖CDR配列を斜体で示す。軽鎖配列の102位の不対Cys残基を四角で囲む。配列は、出現順で、それぞれ配列番号8、228、16および229として開示される。
図2Aは、生殖系列配列とアラインしたマウス抗PD−1 mAb BAP049の軽鎖および重鎖可変領域のアミノ酸配列を示す。上部および下部配列は、それぞれ生殖系列(GL)およびBAP049(Mu mAb)配列である。Kabatナンバリングに基づく軽鎖および重鎖CDR配列に下線を付す。Chothiaナンバリングに基づく軽鎖および重鎖CDR配列を斜体で示す。“−”は同一アミノ酸残基を意味する。配列は、出現順で、それぞれ配列番号230、8、231および16として開示した。図2Bは、マウスκ J2遺伝子の配列およびマウス抗PD−1 mAb BAP049における対応する変異を記載する。“−”は、同一ヌクレオチド残基を意味する。配列は、出現順で、それぞれ配列番号233、232、234および235として開示した。
図3A〜3Bは、蛍光標識マウス抗PD−1 mAb BAP049(Mu mAbと、BAP049(Chi mAb)の3キメラバージョンの競合結合を記載する。実験を2回実施しており、結果をそれぞれ図3Aおよび3Bに示す。3キメラBAP049抗体(Chi mAb (Cys)、Chi mAb (Tyr)およびChi mAb (Ser))は、それぞれ軽鎖可変領域の102位にCys残基、Tyr残基およびSer残基を有する。Chi mAb (Cys)、Chi mAb (Tyr)およびChi mAb (Ser)は、それぞれ、BAP049−chi、BAP049−chi−YおよびBAP049−chi−Sとしても知られる。
図4は、16ヒト化BAP049クローン(BAP049−hum01〜BAP049−hum16)のFACS結合分析の結果を示す棒グラフである。抗体濃度は、各試験mAbについて、左側から右側に200ng/ml、100ng/ml、50ng/ml、25ng/mlおよび12.5ng/mlである。
図5は、ヒト化BAP049クローンの構造分析を記載する(a、b、c、dおよびeは、種々のタイプのフレームワーク領域配列を表す)。サンプル中のmAbの濃度も示す。
図6A〜6Bは、一定濃度のAlexa 488標識マウスmAb BAP049、試験抗体の連続希釈物およびPD−1発現300.19細胞を使用する競合結合アッセイで測定した、ヒト化BAP049 mAbの結合親和性および特異性を示す。実験を2回実施しており、結果をそれぞれ図6Aおよび6Bに示す。
図7は、FACSデータ、競合結合および構造分析に基づくヒト化BAP049クローンのランキングを示す。サンプル中のmAbの濃度も示す。
図8A〜8Bは、選択ヒト化BAP049クローンによるPD−1へのリガンド結合の遮断を記載する。PD−1へのPD−L1−IgおよびPD−L2−Ig結合の遮断を図8Aに示す。PD−1へのPD−L2−Ig結合の遮断を図8Bに示す。BAP049−hum01、BAP049−hum05、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10およびBAP049−hum11を評価した。マウスmAb BAP049および軽鎖可変領域の102位にTyrを有するキメラmAbも分析に包含された。
図9A〜9Bは、16ヒト化BAP049クローンおよびBAP049キメラ(BAP049−chi)についての重鎖可変ドメイン配列のアラインメントを記載する。図9Aにおいて、配列の全てを示す(出現順に、それぞれ配列番号22、38、38、38、38、38、38、38、38、38、50、50、50、50、82、82および86)。図9Bにおいて、マウス配列と異なるアミノ酸配列のみを示す(出現順に、それぞれ配列番号22、38、38、38、38、38、38、38、38、38、50、50、50、50、82、82および86)。
図10A〜10Bは、16ヒト化BAP049クローンおよびBAP049キメラ(BAP049−chi)についての軽鎖可変ドメイン配列のアラインメントを記載する。図10Aにおいて、配列の全てを示す(出現順に、それぞれ配列番号24、66、66、66、66、70、70、70、58、62、78、74、46、46、42、54および54)。図10Bにおいて、マウス配列と異なるアミノ酸配列のみを示す(出現順に、それぞれ配列番号24、66、66、66、66、70、70、70、58、62、78、74、46、46、42、54および54)。
図11は、比較的高い割合の患者がPD−L1/CD8/IFN−γにトリプルポジティブである癌の例を示す。
図12は、比較的低い割合の患者がPD−L1/CD8/IFN−γにトリプルポジティブであるER+乳癌および膵臓癌の例を示す。
図13は、乳癌患者例のPD−L1/CD8/IFN−γにトリプルポジティブである割合を示す。
図14は、結腸癌患者例のPD−L1/CD8/IFN−γにトリプルポジティブである割合を示す。
図15は、化合物A17処置をしたまたはしていないインビトロEBC−1細胞におけるPD−L1表面発現のフローサイトメトリーのグラフ表示を示す。EBC−1細胞は、cMET増幅を伴う非小細胞肺癌細胞である。
図16は、化合物A17処置をしたまたはしていない腫瘍異種移植モデルにおけるHs.746.T細胞におけるPD−L1 mRNA発現のグラフ表示を示す。Hs.746.T細胞は、c−MET増幅およびc−MET変異を伴う胃癌細胞である。
図1は、化合物A23を伴うまたは伴わないインビトロH3122細胞におけるPD−L1 mRNA発現のグラフ表示を示す。H3122細胞は、ALK転座を伴う非小細胞肺癌(NSCLC)細胞である。
図18は、化合物A29処置をしたまたはしていない腫瘍異種移植モデルにおけるLOXIMV1細胞(BRAF変異体黒色腫細胞)におけるPD−L1 mRNA発現のグラフ表示を示す。
図19は、化合物A34処置をしたまたはしていない腫瘍異種移植モデルにおけるHEYA8細胞(KRAS変異体卵巣癌細胞)におけるPD−L1 mRNA発現のグラフ表示を示す。
図20は、化合物A18処置をしたまたはしていない腫瘍異種移植モデルにおけるUKE−1細胞(JAK2 V617F変異体骨髄増殖性新生物細胞)におけるPD−L1 mRNA発現のグラフ表示を示す。
図21は、ここに開示する組み合わせ治療により標的化される抗原プロセシングおよび提示、エフェクター細胞応答および免疫抑制経路を概説する模式図である。
図22は、進行型固形腫瘍を有する患者での例示的抗PD−1抗体分子の世界最初のヒト(first-in-human)フェーズI/II治験の治験デザインを記載する。*少なくとも21患者がMTDの規定に必要であった。腫瘍評価を、スクリーニング時、次いでサイクル3の1日目からサイクル11の1日目まで2サイクル(1サイクル=28日)±1週毎、その後irRCによる疾患進行または患者離脱まで3サイクル毎に実施した。irRC、固形腫瘍における免疫関連応答評価基準;MTD、最大耐用量;NSCLC、非小細胞肺癌;RP2D、推奨フェーズII用量;TNBC、トリプルネガティブ乳癌。
図23A〜23Bは、薬物動態分析に使用したモデルの累積、時間経過および対象内可変性を示す。影付領域は90%予測区間を表し、黒線は各時点の中央予測であり、黒点は、観察薬物動態データを示す。図23Cは、同用量の例示的抗PD−1抗体分子を受けているが、体重が異なる患者にわたる予測Cトラフ(Cmin)濃度を記載する。抗PD−1抗体分子の2レジメンの体重対均一/固定用量投与後の予測平均定常状態Cトラフの比較を示す。
図24は、フェーズI/II治験において抗PD−1抗体分子で処置したX線検査で評価可能な患者の各々についての経時的標的病変における変化パーセントを記載する。患者を、次の投与スケジュールで処置した。1mg/kg q2w、3mg/kg q2w、10mg/kg q2w、3mg/kg q4wまたは5mg/kg q4w(図において投与スケジュールの例を線と共に示す)。
図25A〜25Cは、フェーズI/II治験において抗PD−1抗体分子に臨床的応答を有する転移非定型肺カルチノイド腫瘍を有する患者における、腫瘍評価およびCD8 Tリンパ球の免疫組織化学的検出を記載する。図25Aは、患者における応答を示すCT走査画像を記載する。左パネルは、抗体処置前の肝臓転移を示す。中央パネルは、最初の再ステージ分類における肝臓の偽性増殖を示す(示していない肺病変の顕著な退縮を伴う)。右パネルは、2回目の再ステージ分類における全病変の応答を示す。図25Bは、患者における転移非定型肺カルチノイド腫瘍負荷(ベースラインからの変化%)および個々の病変(病変サイズ(nm))の減少を示す。図25Cは、サイクル2、1日目の間に患者から得た腫瘍サンプルにおける高レベルのCD8 Tリンパ球を示す免疫組織化学染色の画像を記載する。BL、ベースライン;C2D1、サイクル2、1日目。
表の簡単な説明
表1は、マウス、キメラおよびヒト化抗PD−1抗体分子のアミノ酸およびヌクレオチド配列の概要である。抗体分子は、マウスmAb BAP049、キメラmAb BAP049−chiおよびBAP049−chi−Yおよびヒト化mAb BAP049−hum01〜BAP049−hum16およびBAP049−Clone−A〜BAP049−Clone−Eを含む。重鎖および軽鎖CDRのアミノ酸およびヌクレオチド配列、重鎖および軽鎖可変領域のアミノ酸およびヌクレオチド配列および重鎖および軽鎖のアミノ酸およびヌクレオチド配列を、この表に示す。
表2は、ヒト化mAb BAP049−hum01〜BAP049−hum16およびBAP049−Clone−A〜BAP049−Clone−Eの重鎖および軽鎖フレームワーク領域のアミノ酸およびヌクレオチド配列を示す。
表3は、ヒトIgG重鎖およびヒトカッパ軽鎖の定常領域アミノ酸配列を示す。
表4は、ヒト化mAb BAP049−Clone−A〜BAP049−Clone−Eの重鎖および軽鎖リーダー配列のアミノ酸配列を示す。
表5は、CHO細胞において発現される選択ヒト化BAP049 mAbの収量、力価、単量体含量および内毒素レベルの概要である。
表6は、CHO細胞において発現される選択ヒト化BAP049 mAbについてNovex IEF分析により検出した荷電アイソフォームを示す。
表7は、ここに記載する抗PD−1抗体分子および他の免疫調節剤(例えば、共刺激性分子のアクティベーターおよび/または免疫チェックポイント分子の阻害剤の1以上)と組み合わせて投与できる選択治療剤の概要である。表7は、左から右で次のものを提供する。第二治療剤の化合物命名、化合物構造および化合物を開示する特許公報。
表8は、抗原提示組み合わせ物(カテゴリーA)、エフェクター細胞組み合わせ物(カテゴリーB)および抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物(カテゴリーC)からの治療剤の例の一覧を提供する。
表9は、フェーズI/II治験の目的およびエンドポイントの概要である。
表10は、フェーズI/II治験における患者人口統計学および特徴の概要である。
表11は、フェーズI/II治験における患者の状況を示す。
表12は、フェーズI/II治験における治験薬物関連に関わらず有害事象を示す(患者の≧20%で発生するあらゆるグレート − 安全性セット)。
表13は、最良総合効果を示す(RECIST v1.1基準を使用する治験医の疾患状態評価に基づく)。
詳細な記載
ここに開示するのは、少なくとも一部、次のカテゴリー(i)抗原提示(例えば、腫瘍抗原提示)を増強する薬剤(例えば、樹状細胞活性または成熟、抗原取り込みまたは抗原プロセシングの1以上の増強による)、(ii)エフェクター細胞応答を増強する薬剤(例えば、免疫エフェクター細胞応答、例えば、B細胞および/またはT細胞活性化および/または例えば、リンパ節における動員)または(iii)腫瘍免疫抑制を減少させる薬剤(例えば、T細胞浸潤および殺腫瘍細胞増加)の1、2または全てから選択される2、3またはそれ以上の治療剤の組み合わせ物を含む、方法および組成物である。ある実施態様において、組み合わせ物はPD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)を含む。理論に縛られることを望まないが、抗腫瘍免疫を増強する治療方法は、免疫応答、例えば、抗腫瘍免疫応答の1以上の段階の複数成分をターゲティングすることにより免疫応答が最適化されたとき、より効率的に働くと考えられる。これらの段階の各々は、図21に模式的に記載する。例えば、樹状細胞の活性化をもたらす方法と、細胞性および液性免疫を増強する方法の組み合わせは、より有効なおよび/または長期の治療応答をもたらし得る。
さらなる用語を次におよび本明細書を通して定義する。
ここで使用する単数表現は、文法的対象物の1または1超(例えば、少なくとも1)をいう。
用語“または”は、ここでは、文脈から他のことが明らかではない限り、用語“および/または”を意味し、それと相互交換可能に使用する。
“約”および“およそ”は、一般に測定の性質または厳密性を考慮して、測定された量に対して許容される程度の誤差を意味する。誤差の程度の例は、ある値または値の範囲の20パーセント(%)以内、一般に、10%以内およびより一般に5%以内である。
“組み合わせ物”または“組み合わせて”により、治療または治療剤が同時に投与されなければならないおよび/または一緒に送達されるために製剤されなければならないことを含意することは意図されないが、これらの送達方法は本記載の範囲内である。組み合わせ物における治療剤を、1以上の他の付加的治療または治療剤と同時に、前にまたは後に投与してよい。治療剤または治療プロトコールを任意の順番で適用できる。一般に、各薬剤を、その薬剤について決定された用量および/またはタイムスケジュールで投与する。この組み合わせ物において利用する付加的治療剤を一緒に単一組成物で投与しても、異なる組成物で別々に投与してもよいことはさらに認識される。一般に、組み合わせ物において利用される付加的治療剤は、それらが個々に利用されるレベルを超えないレベルで使用される。ある実施態様において、組み合わせ物において利用されるレベルは、個々に使用されるレベルより低い。
ある実施態様において、付加的治療剤を、治療用量または治療用量未満の用量で投与する。ある実施態様において、阻害、例えば、増殖阻害達成に必要な第二治療剤の濃度は、第二治療剤を第一治療剤、例えば、抗PD−1抗体分子と組み合わせて投与したとき、第二治療剤を独立して投与するときより低い。ある実施態様において、阻害、例えば、増殖阻害達成に必要な第一治療剤の濃度は、第一治療剤を第二治療剤と組み合わせて投与するとき、第一治療剤を独立して投与するときより低い。ある実施態様において、組み合わせ治療において、阻害、例えば、増殖阻害達成に必要な第二治療剤の濃度は、第二治療剤の単剤療法としての治療用量より、例えば、10〜20%、20〜30%、30〜40%、40〜50%、50〜60%、60〜70%、70〜80%または80〜90%低い。ある実施態様において、組み合わせ治療において、阻害、例えば、増殖阻害達成に必要な第一治療剤の濃度は、第一治療剤の単剤療法としての治療用量より、例えば、10〜20%、20〜30%、30〜40%、40〜50%、50〜60%、60〜70%、70〜80%または80〜90%低い。
用語“阻害”、“阻害剤”または“アンタゴニスト”は、ある分子、例えば、免疫チェックポイント阻害剤の、あるパラメーター、例えば、活性の減少を含む。例えば、活性、例えば、PD−1またはPD−L1活性の少なくとも5%、10%、20%、30%、40%またはそれ以上の阻害が、本用語により包含される。それ故に、阻害は100%である必要はない。
用語“活性化”、“アクティベーター”または“アゴニスト”は、ある分子、例えば、共刺激性分子のあるパラメーター、例えば、活性の増加を含む。例えば、活性、例えば、共刺激性活性の、少なくとも5%、10%、25%、50%、75%またはそれ以上の増加が、本用語により包含される。
用語“抗癌効果”は、例えば、腫瘍体積減少、癌細胞数減少、転移数減少、余命延長、癌細胞増殖減少、癌細胞生存減少または癌性状態と関連する種々の生理学的症状の改善を含むが、これらに限定されない、種々の手段により顕在化され得る、生物学的効果をいう。“抗癌効果”はまたまず第一に、癌の発生の予防における、ペプチド、ポリヌクレオチド、細胞および抗体の能力によっても顕在化され得る。
用語“抗腫瘍効果”は、例えば、腫瘍体積減少、腫瘍細胞数減少、腫瘍細胞増殖減少または腫瘍細胞生存減少を含むが、これらに限定されない、種々の手段により顕在化され得る生物学的効果をいう。
用語“癌”は、異常細胞の急速かつ非制御の増殖により特徴付けられる疾患をいう。癌細胞は、局所的にまたは血流およびリンパ系を介して体の他の部分に拡散し得る。種々の癌の例をここに記載し、乳癌(例えば、トリプルネガティブ乳癌)、前立腺癌、卵巣癌、子宮頸癌、皮膚癌(例えば、黒色腫)、膵臓癌、結腸直腸癌、腎癌(例えば、腎細胞癌)、肝臓癌(例えば、肝細胞癌)、脳癌(例えば、神経膠芽腫)、頭頸部癌、子宮内膜癌、鼻咽頭癌、膀胱癌、内分泌癌、リンパ腫、白血病、肺癌(例えば、非小細胞肺癌)などを含むが、これらに限定されない。用語“腫瘍”および“癌”はここで相互交換可能に使用し、例えば、両用語は固形および液性、例えば、汎発性または循環、腫瘍を包含する。ここで使用する用語“癌”または“腫瘍”は、前悪性、ならびに悪性癌および腫瘍を含む。
用語“抗原提示細胞”または“APC”は、表面で主要組織適合複合体(MHC)と複合体化した外来抗原を提示する、アクセサリー細胞(例えば、B細胞、樹状細胞など)のような免疫系細胞をいう。T細胞は、これらの複合体をT細胞受容体(TCR)を使用して認識し得る。APCは、抗原を処理し、それをT細胞に提示させる。
用語“共刺激性分子”は、共刺激性リガンドが特異的に結合し、それにより増殖のような、しかし、これに限定されないT細胞による共刺激性応答に介在する、T細胞上の同族結合パートナーをいう。共刺激性分子は、効率的免疫応答に必要な抗原受容体またはそのリガンド以外の細胞表面分子である。共刺激性分子は、MHCクラスI分子、TNF受容体タンパク質、免疫グロブリン様タンパク質、サイトカイン受容体、インテグリン、シグナル伝達リンパ性活性化分子(SLAMタンパク質)、活性化NK細胞受容体、BTLA、Tollリガンド受容体、OX40、CD2、CD7、CD27、CD28、CD30、CD40、CDS、ICAM−1、LFA−1(CD11a/CD18)、4−1BB(CD137)、B7−H3、CDS、ICAM−1、ICOS(CD278)、GITR、BAFFR、LIGHT、HVEM(LIGHTR)、KIRDS2、SLAMF7、NKp80(KLRF1)、NKp44、NKp30、NKp46、CD19、CD4、CD8アルファ、CD8ベータ、IL2Rベータ、IL2Rガンマ、IL7Rアルファ、ITGA4、VLA1、CD49a、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA−6、CD49f、ITGAD、CD11d、ITGAE、CD103、ITGAL、CD11a、LFA−1、ITGAM、CD11b、ITGAX、CD11c、ITGB1、CD29、ITGB2、CD18、LFA−1、ITGB7、NKG2D、NKG2C、TNFR2、TRANCE/RANKL、DNAM1(CD226)、SLAMF4(CD244、2B4)、CD84、CD96(Tactile)、CEACAM1、CRTAM、Ly9(CD229)、CD160(BY55)、PSGL1、CD100(SEMA4D)、CD69、SLAMF6(NTB−A、Ly108)、SLAM(SLAMF1、CD150、IPO−3)、BLAME(SLAMF8)、SELPLG(CD162)、LTBR、LAT、GADS、SLP−76、PAG/Cbp、CD19aおよびCD83と特異的に結合するリガンドを含むが、これらに限定されない。
ここで使用する用語“免疫エフェクター細胞”または“エフェクター細胞”は、免疫応答、例えば、免疫エフェクター応答の促進に関与する細胞をいう。免疫エフェクター細胞の例は、T細胞、例えば、アルファ/ベータT細胞およびガンマ/デルタT細胞、B細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、ナチュラルキラーT(NKT)細胞、肥満細胞および骨髄由来貪食細胞を含むが、これらに限定されない。
ここで使用する“免疫エフェクター”または“エフェクター”“機能”または“応答”は、標的細胞の免疫攻撃を増強または促進する、例えば、免疫エフェクター細胞の機能または応答をいう。例えば、免疫エフェクター機能または応答は、標的細胞の死滅または成長または増殖阻害を促進する、T細胞またはNK細胞の性質をいう。T細胞の場合、一次刺激および共刺激が免疫エフェクター機能または応答の例である。
用語“エフェクター機能”は、細胞の特殊化機能をいう。T細胞のエフェクター機能は、例えば、サイトカインの分泌を含む細胞溶解性活性またはヘルパー活性であり得る。
ここで使用する用語“処置”および“処置する”は、1以上の治療の適用に起因する、障害、例えば増殖性障害の進行、重症度および/または期間の軽減または改善、または障害の1以上の症状(好ましくは、1以上の認識できる症状)の改善をいう。特定の実施態様において、用語“処置”および“処置する”は、患者が必ずしも認識できない、腫瘍の増殖のような増殖性障害の少なくとも一つの測定可能な身体的パラメーターの改善をいう。他の実施態様において、用語“処置”および“処置する”は、例えば、認識できる症状の安定化による身体的な、例えば、身体的パラメーターの安定化による、生理学的な、または両方での、増殖性障害の進行の阻止をいう。他の実施態様において、用語“処置”および“処置する”は、腫瘍サイズまたは癌性細胞数の減少または安定化をいう。
本発明の組成物および方法は、特定した配列を有するポリペプチドおよび核酸またはそれと実質的に同一または類似の配列、例えば、特定した配列少なくとも85%、90%、95%またはそれ以上同一である配列を含む。アミノ酸配列の場合、用語“実質的に同一”は、ここでは、第一および第二アミノ酸配列が、共通構造ドメインおよび/または共通機能活性を有し得るように、i)同一であるまたはii)第二アミノ酸配列におけるアラインされたアミノ酸残基の保存的置換である十分なまたは最小数のアミノ酸残基を含む、第一アミノ酸をいうために使用する。例えば、参照配列、例えば、ここに提供する配列と少なくとも約85%、90%。91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%同一性を有する、共通構造ドメインを含むアミノ酸配列。
ヌクレオチド配列の場合、用語“実質的に同一”は、ここでは、第一および第二ヌクレオチド配列が、共通機能活性を有するポリペプチドをコードするまたは共通構造ポリペプチドドメインまたは共通機能的ポリペプチド活性をコードするように、第二核酸配列においてアラインされたヌクレオチドと同一である十分なまたは最小数のヌクレオチドを含む、第一核酸配列をいう。例えば、参照配列、例えば、ここに提供する配列と、少なくとも約85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%同一性を有する、ヌクレオチド配列をいう。
用語“機能的バリアント”は、天然に存在する配列と実質的に同一のアミノ酸配列を有するかまたは実質的に同一のヌクレオチド配列によりコードされ、天然に存在する配列の1以上の活性を有することができる、ポリペプチドをいう。
配列間の相同性または配列同一性(これらの用語は、ここでは相互交換可能に使用される)の計算は、次のとおり実施する。
2アミノ酸配列または2核酸配列のパーセント同一性を決定するために、これら配列を、最適比較目的でアラインする(例えば、ギャップを、最適アラインメントのために第一および第二アミノ酸または核酸配列の一方または両方に導入でき、非相同配列を比較目的で無視できる)。好ましい実施態様において、比較目的でアラインされる参照配列の長さは、その参照配列の長さの少なくとも30%、好ましくは少なくとも40%、より好ましくは少なくとも50%、60%、さらに好ましくは少なくとも70%、80%、90%、100%である。次いで、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置のアミノ酸残基またはヌクレオチドを比較する。第一配列における位置が、第二配列の対応する位置と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドで占拠されているならば、これら分子は、その位置で同一である(ここで使用するアミノ酸または核酸“同一性”は、アミノ酸または核酸“相同性”に等しい)。
2配列間のパーセント同一性は、2配列の最適アラインメントのために導入される必要がある、ギャップおよび各ギャップの長さを考慮した、これら配列により共有される同一位置の数の関数である。
2配列間の配列の比較およびパーセント同一性決定は、数学的アルゴリズムを使用して達成できる。好ましい実施態様において、2アミノ酸配列間のパーセント同一性を、GCGソフトウェアパッケージ(http://www.gcg.comで入手可能)におけるGAPプログラムに統合された、Needleman and Wunsch ((1970) J. Mol. Biol. 48:444-453)アルゴリズムを使用して、Blossum 62マトリクスまたはPAM250マトリクスおよびギャップ荷重16、14、12、10、8、6または4および長さ荷重1、2、3、4、5または6を使用して、決定する。さらに他の好ましい実施態様において、2ヌクレオチド配列間のパーセント同一性を、GCGソフトウェアパッケージ(http://www.gcg.comで入手可能)におけるGAPプログラムを使用して、NWSgapdna.CMPマトリクスおよびギャップ荷重40、50、60、70または80および長さ荷重1、2、3、4、5または6を使用して決定する。特に好ましいパラメーターセット(および特に断らない限り使用すべきもの)は、ギャップペナルティ12、ギャップ伸長ペナルティ4およびフレームシフトギャップペナルティ5を伴うBlossum 62スコアリングマトリクスである。
2アミノ酸またはヌクレオチド配列のパーセント同一性は、ALIGNプログラム(version 2.0)に統合されているE. Meyers and W. Miller ((1989) CABIOS, 4:11-17)のアルゴリズムを使用して、PAM120荷重残基表、ギャップ長ペナルティ12およびギャップペナルティ4を使用して決定できる。
ここに記載する核酸およびタンパク質配列は、例えば、他のファミリーメンバーまたは関連配列を同定するために公的データベースに対するサーチを実施するための“クエリー配列”として使用され得る。このようなサーチは、Altschul, et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403-10のNBLASTおよびXBLASTプログラム(version 2.0)を使用して実施できる。BLASTヌクレオチドサーチは、NBLASTプログラム、スコア=100、ワード長=12を使用して、本発明の核酸(配列番号1)分子と相同なヌクレオチド配列を得るために実施され得る。BLASTタンパク質サーチは、XBLASTプログラム、スコア=50、ワード長=3を使用して、本発明のタンパク質分子に相同なアミノ酸配列を得るために実施され得る。比較目的でギャップ付アラインメントを得るために、Gapped BLASTを、Altschul et al., (1997) Nucleic Acids Res. 25:3389-3402に記載のとおり利用できる。BLASTおよびGapped BLASTプログラムを使用するとき、各プログラム(例えば、XBLASTおよびNBLAST)のデフォルトパラメーターが使用され得る。http://www.ncbi.nlm.nih.gov参照。
ここで使用する用語“低ストリンジェンシー、中ストリンジェンシー、高ストリンジェンシーまたは超高ストリンジェンシー条件下でハイブリダイズ”は、ハイブリダイゼーションおよび洗浄の条件を述べる。ハイブリダイゼーション反応実施のためのガイダンスは、引用により本明細書に包含させる、Molecular Biology, John Wiley & Sons, N.Y. (1989), 6.3.1-6.3.6に見ることができる。水性および非水性方法がその文献に記載され、何れもが使用され得る。ここでいう特定のハイブリダイゼーション条件は次のとおりである。1)低ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件、6×塩化ナトリウム/クエン酸ナトリウム(SSC)中、約45℃、続く0.2×SSC、0.1%SDS中、少なくとも50℃での2回洗浄(洗浄の温度は、低ストリンジェンシー条件で55℃まで上げてよい);2)中ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件、6×SSC中、約45℃、続く0.2×SSC、0.1%SDSで60℃の1以上の洗浄;3)高ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件、6×SSC中、約45℃、続く0.2×SSC、0.1%SDSで65℃の1以上の洗浄;および好ましくは4)超高ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件は、0.5M リン酸ナトリウム、7%SDS中、65℃、続く0.2×SSC、1%SDSで65℃の1以上の洗浄。超高ストリンジェンシー条件(4)が好ましい条件であり、特に断らない限り使用すべきである。
本発明の分子は、その機能に実質的に影響しない、さらなる保存的または非必須アミノ酸置換を有し得ることは理解される。
用語“アミノ酸”は、アミノ官能基および酸官能基の両方を含み、天然に存在するアミノ酸のポリマーに包含され得る、天然であれ、合成であれ、全分子を包含することが意図される。アミノ酸の例は、天然に存在するアミノ酸、そのアナログ、誘導体およびコンジナー、バリアント側鎖を有するアミノ酸アナログならびに前記の何れかの全立体異性体を含む。ここで使用する用語“アミノ酸は、D−またはL−光学異性体およびペプチド模倣体を含む。
“保存的アミノ酸置換”は、アミノ酸残基が類似側鎖を有するアミノ酸残基に置き換えられるものである。類似側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは当分野で定義されている。これらのファミリーは、塩基性側鎖(例えば、リシン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電極性側鎖(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン)、非極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、ベータ分枝側鎖(例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン)および芳香族側鎖(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を有するアミノ酸を含む。
用語“ポリペプチド”、“ペプチド”および“タンパク質”(一本鎖であれば)はここで相互交換可能に使用し、あらゆる長さのアミノ酸のポリマーをいう。ポリマーは直鎖でも分枝でもよく、修飾アミノ酸を含んでよく、非アミノ酸で中断されていてよい。本用語はまた、修飾、例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質化、アセチル化、リン酸化または標識成分のコンジュゲーションのような任意の他の操作をされている、アミノ酸ポリマーも包含する。ポリペプチドは、天然源から単離しても、真核生物または原核生物宿主から組み換え技術により産生しても、合成法の生成物でもよい。
用語“核酸”、“核酸配列”、“ヌクレオチド配列”または“ポリヌクレオチド配列”および“ポリヌクレオチド”は、相互交換可能に使用される。これらは、デオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチドまたはそのアナログの、あらゆる長さのヌクレオチドの重合形態をいう。ポリヌクレオチドは、一本鎖でも二本鎖でもよく、一本鎖であるならば、コード鎖でも非コード(アンチセンス)鎖でもよい。ポリヌクレオチドは、メチル化ヌクレオチドおよびヌクレオチドアナログのような修飾ヌクレオチドを含み得る。ヌクレオチドの配列は非ヌクレオチド成分により中断され得る。ポリヌクレオチドを、標識成分とのコンジュゲーションによるように、重合化後さらに修飾してよい。核酸は、組み換えポリヌクレオチドまたは天然に存在しないもしくは非天然配置で他のポリヌクレオチドに連結されている、ゲノム、cDNA、半合成または合成起源のポリヌクレオチドであり得る。
ここで使用する用語“単離”は、その元のまたは天然環境(例えば、天然に存在するならば天然環境)から除かれた物質をいう。例えば、生存動物に存在する天然に存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドは単離されていないが、天然系で共存する物質の一部または全てから人為的に離された同じポリヌクレオチドまたはポリペプチドは単離されている。このようなポリヌクレオチドはベクターの一部であるおよび/またはこのようなポリヌクレオチドまたはポリペプチドは組成物の一部であり、そのようなベクターまたは組成物が、それが天然で見られる環境の一部でない点でなお単離されている。
本発明の種々の態様を下にさらに詳細に記載する。さらなる定義は本明細書をとおして示される。
抗原提示組み合わせ物、エフェクター細胞組み合わせ物および抗腫瘍免疫抑制組み合わせ物の組み合わせ物例
抗原提示カテゴリー(A)、エフェクター細胞カテゴリー(B)および抗腫瘍免疫抑制カテゴリー(C)の2以上からの治療剤の組み合わせ物の例をここに提供する。
Figure 0006878405
ある実施態様において、本発明の組み合わせ物は、次の1以上を含む。
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8C13、A9B8C14、A9B8C15、A9B8C16、A9B8C17、A9B8C18、A9B8C19、A9B8C20、A9B8C21、A9B9C1、A9B9C2、A9B9C3、A9B9C4、A9B9C5、A9B9C6、A9B9C7、A9B9C8、A9B9C9、A9B9C10、A9B9C11、A9B9C12、A9B9C13、A9B9C14、A9B9C15、A9B9C16、A9B9C17、A9B9C18、A9B9C19、A9B9C20、A9B9C21、A9B10C1、A9B10C2、A9B10C3、A9B10C4、A9B10C5、A9B10C6、A9B10C7、A9B10C8、A9B10C9、A9B10C10、A9B10C11、A9B10C12、A9B10C13、A9B10C14、A9B10C15、A9B10C16、A9B10C17、A9B10C18、A9B10C19、A9B10C20、A9B10C21、A9B11C1、A9B11C2、A9B11C3、A9B11C4、A9B11C5、A9B11C6、A9B11C7、A9B11C8、A9B11C9、A9B11C10、A9B11C11、A9B11C12、A9B11C13、A9B11C14、A9B11C15、A9B11C16、A9B11C17、A9B11C18、A9B11C19、A9B11C20、A9B11C21、A9B12C1、A9B12C2、A9B12C3、A9B12C4、A9B12C5、A9B12C6、A9B12C7、A9B12C8、A9B12C9、A9B12C10、A9B12C11、A9B12C12、A9B12C13、A9B12C14、A9B12C15、A9B12C16、A9B12C17、A9B12C18、A9B12C19、A9B12C20、A9B12C21、A10B1C1、A10B1C2、A10B1C3、A10B1C4、A10B1C5、A10B1C6、A10B1C7、A10B1C8、A10B1C9、A10B1C10、A10B1C11、A10B1C12、A10B1C13、A10B1C14、A10B1C15、A10B1C16、A10B1C17、A10B1C18、A10B1C19、A10B1C20、A10B1C21、A10B2C1、A10B2C2、A10B2C3、A10B2C4、A10B2C5、A10B2C6、A10B2C7、A10B2C8、A10B2C9、A10B2C10、A10B2C11、A10B2C12、A10B2C13、A10B2C14、A10B2C15、A10B2C16、A10B2C17、A10B2C18、A10B2C19、A10B2C20、A10B2C21、A10B3C1、A10B3C2、A10B3C3、A10B3C4、A10B3C5、A10B3C6、A10B3C7、A10B3C8、A10B3C9、A10B3C10、A10B3C11、A10B3C12、A10B3C13、A10B3C14、A10B3C15、A10B3C16、A10B3C17、A10B3C18、A10B3C19、A10B3C20、A10B3C21、A10B4C1、A10B4C2、A10B4C3、A10B4C4、A10B4C5、A10B4C6、A10B4C7、A10B4C8、A10B4C9、A10B4C10、A10B4C11、A10B4C12、A10B4C13、A10B4C14、A10B4C15、A10B4C16、A10B4C17、A10B4C18、A10B4C19、A10B4C20、A10B4C21、A10B5C1、A10B5C2、A10B5C3、A10B5C4、A10B5C5、A10B5C6、A10B5C7、A10B5C8、A10B5C9、A10B5C10、A10B5C11、A10B5C12、A10B5C13、A10B5C14、A10B5C15、A10B5C16、A10B5C17、A10B5C18、A10B5C19、A10B5C20、A10B5C21、A10B6C1、A10B6C2、A10B6C3、A10B6C4、A10B6C5、A10B6C6、A10B6C7、A10B6C8、A10B6C9、A10B6C10、A10B6C11、A10B6C12、A10B6C13、A10B6C14、A10B6C15、A10B6C16、A10B6C17、A10B6C18、A10B6C19、A10B6C20、A10B6C21、A10B7C1、A10B7C2、A10B7C3、A10B7C4、A10B7C5、A10B7C6、A10B7C7、A10B7C8、A10B7C9、A10B7C10、A10B7C11、A10B7C12、A10B7C13、A10B7C14、A10B7C15、A10B7C16、A10B7C17、A10B7C18、A10B7C19、A10B7C20、A10B7C21、A10B8C1、A10B8C2、A10B8C3、A10B8C4、A10B8C5、A10B8C6、A10B8C7、A10B8C8、A10B8C9、A10B8C10、A10B8C11、A10B8C12、A10B8C13、A10B8C14、A10B8C15、A10B8C16、A10B8C17、A10B8C18、A10B8C19、A10B8C20、A10B8C21、A10B9C1、A10B9C2、A10B9C3、A10B9C4、A10B9C5、A10B9C6、A10B9C7、A10B9C8、A10B9C9、A10B9C10、A10B9C11、A10B9C12、A10B9C13、A10B9C14、A10B9C15、A10B9C16、A10B9C17、A10B9C18、A10B9C19、A10B9C20、A10B9C21、A10B10C1、A10B10C2、A10B10C3、A10B10C4、A10B10C5、A10B10C6、A10B10C7、A10B10C8、A10B10C9、A10B10C10、A10B10C11、A10B10C12、A10B10C13、A10B10C14、A10B10C15、A10B10C16、A10B10C17、A10B10C18、A10B10C19、A10B10C20、A10B10C21、A10B11C1、A10B11C2、A10B11C3、A10B11C4、A10B11C5、A10B11C6、A10B11C7、A10B11C8、A10B11C9、A10B11C10、A10B11C11、A10B11C12、A10B11C13、A10B11C14、A10B11C15、A10B11C16、A10B11C17、A10B11C18、A10B11C19、A10B11C20、A10B11C21、A10B12C1、A10B12C2、A10B12C3、A10B12C4、A10B12C5、A10B12C6、A10B12C7、A10B12C8、A10B12C9、A10B12C10、A10B12C11、A10B12C12、A10B12C13、A10B12C14、A10B12C15、A10B12C16、A10B12C17、A10B12C18、A10B12C19、A10B12C20、A10B12C21、A11B1C1、A11B1C2、A11B1C3、A11B1C4、A11B1C5、A11B1C6、A11B1C7、A11B1C8、A11B1C9、A11B1C10、A11B1C11、A11B1C12、A11B1C13、A11B1C14、A11B1C15、A11B1C16、A11B1C17、A11B1C18、A11B1C19、A11B1C20、A11B1C21、A11B2C1、A11B2C2、A11B2C3、A11B2C4、A11B2C5、A11B2C6、A11B2C7、A11B2C8、A11B2C9、A11B2C10、A11B2C11、A11B2C12、A11B2C13、A11B2C14、A11B2C15、A11B2C16、A11B2C17、A11B2C18、A11B2C19、A11B2C20、A11B2C21、A11B3C1、A11B3C2、A11B3C3、A11B3C4、A11B3C5、A11B3C6、A11B3C7、A11B3C8、A11B3C9、A11B3C10、A11B3C11、A11B3C12、A11B3C13、A11B3C14、A11B3C15、A11B3C16、A11B3C17、A11B3C18、A11B3C19、A11B3C20、A11B3C21、A11B4C1、A11B4C2、A11B4C3、A11B4C4、A11B4C5、A11B4C6、A11B4C7、A11B4C8、A11B4C9、A11B4C10、A11B4C11、A11B4C12、A11B4C13、A11B4C14、A11B4C15、A11B4C16、A11B4C17、A11B4C18、A11B4C19、A11B4C20、A11B4C21、A11B5C1、A11B5C2、A11B5C3、A11B5C4、A11B5C5、A11B5C6、A11B5C7、A11B5C8、A11B5C9、A11B5C10、A11B5C11、A11B5C12、A11B5C13、A11B5C14、A11B5C15、A11B5C16、A11B5C17、A11B5C18、A11B5C19、A11B5C20、A11B5C21、A11B6C1、A11B6C2、A11B6C3、A11B6C4、A11B6C5、A11B6C6、A11B6C7、A11B6C8、A11B6C9、A11B6C10、A11B6C11、A11B6C12、A11B6C13、A11B6C14、A11B6C15、A11B6C16、A11B6C17、A11B6C18、A11B6C19、A11B6C20、A11B6C21、A11B7C1、A11B7C2、A11B7C3、A11B7C4、A11B7C5、A11B7C6、A11B7C7、A11B7C8、A11B7C9、A11B7C10、A11B7C11、A11B7C12、A11B7C13、A11B7C14、A11B7C15、A11B7C16、A11B7C17、A11B7C18、A11B7C19、A11B7C20、A11B7C21、A11B8C1、A11B8C2、A11B8C3、A11B8C4、A11B8C5、A11B8C6、A11B8C7、A11B8C8、A11B8C9、A11B8C10、A11B8C11、A11B8C12、A11B8C13、A11B8C14、A11B8C15、A11B8C16、A11B8C17、A11B8C18、A11B8C19、A11B8C20、A11B8C21、A11B9C1、A11B9C2、A11B9C3、A11B9C4、A11B9C5、A11B9C6、A11B9C7、A11B9C8、A11B9C9、A11B9C10、A11B9C11、A11B9C12、A11B9C13、A11B9C14、A11B9C15、A11B9C16、A11B9C17、A11B9C18、A11B9C19、A11B9C20、A11B9C21、A11B10C1、A11B10C2、A11B10C3、A11B10C4、A11B10C5、A11B10C6、A11B10C7、A11B10C8、A11B10C9、A11B10C10、A11B10C11、A11B10C12、A11B10C13、A11B10C14、A11B10C15、A11B10C16、A11B10C17、A11B10C18、A11B10C19、A11B10C20、A11B10C21、A11B11C1、A11B11C2、A11B11C3、A11B11C4、A11B11C5、A11B11C6、A11B11C7、A11B11C8、A11B11C9、A11B11C10、A11B11C11、A11B11C12、A11B11C13、A11B11C14、A11B11C15、A11B11C16、A11B11C17、A11B11C18、A11B11C19、A11B11C20、A11B11C21、A11B12C1、A11B12C2、A11B12C3、A11B12C4、A11B12C5、A11B12C6、A11B12C7、A11B12C8、A11B12C9、A11B12C10、A11B12C11、A11B12C
12、A11B12C13、A11B12C14、A11B12C15、A11B12C16、A11B12C17、A11B12C18、A11B12C19、A11B12C20またはA11B12C21。
抗体分子
ある実施態様において、抗体分子は、哺乳動物、例えば、ヒト、PD−1に結合する。例えば、抗体分子は、PD−1のエピトープ、例えば、直鎖または立体構造的エピトープ(例えば、ここに記載するエピトープ)に特異的に結合する。
ここで使用する用語“抗体分子”は、少なくとも一つの免疫グロブリン可変ドメイン配列を含む、タンパク質、例えば、免疫グロブリン鎖またはそのフラグメントをいう。用語“抗体分子”は、例えば、モノクローナル抗体(免疫グロブリンFc領域を有する完全長抗体を含む)を含む。ある実施態様において、抗体分子は完全長抗体または完全長免疫グロブリン鎖を含む。ある実施態様において、抗体分子は、完全長抗体または完全長免疫グロブリン鎖の抗原結合または機能的フラグメントを含む。ある実施態様において、抗体分子は多特異的抗体分子であり、例えば、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を有し、ここで、その複数の第一免疫グロブリン可変ドメイン配列が第一エピトープに対する結合特異性を有し、複数の第二免疫グロブリン可変ドメイン配列が第二エピトープに対する結合特異性を有する。ある実施態様において、多特異的抗体分子は二特異的抗体分子である。二特異的抗体は、2を超えない抗原に特異性を有する。二特異的抗体分子は、第一エピトープに対する結合特異性を有する第一免疫グロブリン可変ドメイン配列および第二エピトープに対する結合特異性を有する第二免疫グロブリン可変ドメイン配列により特徴付けられる。
ある実施態様において、抗体分子は単特異的抗体分子であり、単一エピトープに結合する。例えば、各々が同じエピトープに結合する複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を有する単特異的抗体分子。
ある実施態様において、抗体分子は多特異的抗体分子であり、例えば、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を含み、ここで、その複数の第一免疫グロブリン可変ドメイン配列が第一エピトープに対する結合特異性を有し、複数の第二免疫グロブリン可変ドメイン配列が第二エピトープに対する結合特異性を有する。ある実施態様において、第一および第二エピトープは同じ抗原、例えば、同じタンパク質(または多量体タンパク質のサブユニット)上にある。ある実施態様において、第一および第二エピトープは重複する。ある実施態様において、第一および第二エピトープは重複しない。ある実施態様において、第一および第二エピトープは異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(または多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。ある実施態様において、多特異的抗体分子は第三、第四または第五免疫グロブリン可変ドメインを含む。ある実施態様において、多特異的抗体分子は二特異的抗体分子、三特異的抗体分子または四特異的抗体分子である。
ある実施態様において、多特異的抗体分子は二特異的抗体分子である。二特異的抗体は、2を超えない抗原に特異性を有する。二特異的抗体分子は、第一エピトープに対する結合特異性を有する第一免疫グロブリン可変ドメイン配列および第二エピトープに対する結合特異性を有する第二免疫グロブリン可変ドメイン配列により特徴付けられる。ある実施態様において、第一および第二エピトープは同じ抗原、例えば、同じタンパク質(または多量体タンパク質のサブユニット)上にある。ある実施態様において、第一および第二エピトープは重複する。ある実施態様において、第一および第二エピトープは重複しない。ある実施態様において、第一および第二エピトープは異なる抗原、例えば、異なるタンパク質(または多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。ある実施態様において、二特異的抗体分子は、第一エピトープに対する結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列および第二エピトープに対する結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列および軽鎖可変ドメイン配列を含む。ある実施態様において、二特異的抗体分子は、第一エピトープに対する結合特異性を有する半抗体および第二エピトープに対する結合特異性を有する半抗体を含む。ある実施態様において、二特異的抗体分子は、第一エピトープに対する結合特異性を有する半抗体またはそのフラグメントおよび第二エピトープに対する結合特異性を有する半抗体またはそのフラグメントを含む。ある実施態様において、二特異的抗体分子は、第一エピトープに対する結合特異性を有するscFvまたはそのフラグメントおよび第二エピトープに対する結合特異性を有するscFvまたはそのフラグメントを含む。ある実施態様において、第一エピトープはPD−1上に位置し、第二エピトープはTIM−3、LAG−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1および/またはCEACAM−5)、PD−L1またはPD−L2上に位置する。
ある実施態様において、抗体分子は二重特異性抗体および一本鎖分子、ならびに抗体の抗原結合フラグメント(例えば、Fab、F(ab’)およびFv)を含む。例えば、抗体分子は、重(H)鎖可変ドメイン配列(ここではVHと略す)および軽(L)鎖可変ドメイン配列(ここではVLと略す)を含み得る。ある実施態様において、抗体分子は、重鎖および軽鎖を含むまたはそれから成る(ここでは半抗体と称す)。他の例において、抗体分子は2重(H)鎖可変ドメイン配列および2軽(L)鎖可変ドメイン配列を含み、それによりFab、Fab’、F(ab’)、Fc、Fd、Fd’、Fv、一本鎖抗体(例えばscFv)、単一可変ドメイン抗体、二重特異性抗体(Dab)(二価および二特異的)およびキメラ(例えば、ヒト化)抗体のような2抗原結合部位を形成し、これは、抗体全体の修飾により産生できまたは組み換えDNA技術を使用しでデノボ合成したものであり得る。これらの機能的抗体フラグメントは、その各抗原または受容体に選択的に結合する能力を維持する。抗体および抗体フラグメントは、IgG、IgA、IgM、IgDおよびIgEを含むが、これらに限定されない抗体の任意のクラスおよび抗体の任意のサブクラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4)由来であり得る。抗体分子の調製物はモノクローナルまたはポリクローナルであり得る。抗体分子はまたヒト、ヒト化、CDR移植またはインビトロ産生抗体であり得る。抗体は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3またはIgG4から選択される重鎖定常領域を有し得る。抗体はまた例えば、カッパまたはラムダから選択される軽鎖を有し得る。用語“免疫グロブリン”(Ig)は、ここでは、用語“抗体”と相互交換可能に使用する。
抗体分子の抗原結合フラグメントの例は、(i)VL、VH、CLおよびCH1ドメインからなる一価フラグメントであるFabフラグメント、(ii)ヒンジ領域でジスルフィド架橋により連結された2Fabフラグメントを含む二価フラグメントであるF(ab’)フラグメント、(iii)VHおよびCH1ドメインからなるFdフラグメント、(iv)抗体の単一アームのVLおよびVHドメインからなるFvフラグメント、(v)VHドメインからなる二重特異性抗体(dAb)フラグメント、(vi)ラクダ類またはラクダ化可変ドメイン、(vii)一本鎖Fv(scFv)(例えば、Bird et al. (1988) Science 242:423-426;およびHuston et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5879-5883参照)、(viii)単一ドメイン抗体かを含む。これらの抗体フラグメントは、当業者に知られる慣用の技術を使用して得ることができ、フラグメントを、インタクト抗体と同じ方法で有用性についてスクリーニングする。
用語“抗体”はインタクト分子ならびにその機能的フラグメントを含む。抗体の定常領域は、抗体の性質を修飾するため(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基数、エフェクター細胞機能または補体機能の1以上の増加または減少のため)、改変、例えば、変異させ得る。
抗体分子は単一ドメイン抗体でもあり得る。単一ドメイン抗体は、相補性決定領域が単一ドメインポリペプチドの一部である、抗体を含み得る。例は、重鎖抗体、天然に軽鎖を欠く抗体、慣用の4鎖抗体由来の単一ドメイン抗体、改変抗体および抗体由来のもの以外の単一ドメイン足場を含むが、これらに限定されない。単一ドメイン抗体は、当分野のまたは今後のあらゆる単一ドメイン抗体であり得る。単一ドメイン抗体はマウス、ヒト、ラクダ、ラマ、魚、サメ、ヤギ、ウサギおよびウシを含むが、これらに限定されないあらゆる種由来であり得る。本発明の他の態様によって、単一ドメイン抗体は、軽鎖を欠く重鎖抗体として知られる天然に存在する単一ドメイン抗体である。このような単一ドメイン抗体は、例えば、WO9404678号に記載される。明確化のために、天然に軽鎖を欠く重鎖抗体由来のこの可変ドメインは、ここでは、4鎖免疫グロブリンの慣用のVHと区別するために、VHHまたはナノボディとして知られる。このようなVHH分子は、ラクダ科種、例えばラクダ、ラマ、ヒトコブラクダ、アルパカおよびグアナコに生じる抗体由来であり得る。ラクダ科以外の他の種は天然に軽鎖を欠く重鎖抗体を産生でき、このようなVHHは本発明の範囲内である。
VHおよびVL領域を、“フレームワーク領域”(FRまたはFW)と称される、より保存された領域が酸剤する、“相補性決定領域”(CDR)と称される超可変性の領域に細分できる。
フレームワーク領域およびCDRの程度は、多数の方法で厳密に定義されている(Kabat, E. A., et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No. 91-3242; Chothia, C. et al. (1987) J. Mol. Biol. 196:901-917; and the AbM definition used by Oxford Molecular's AbM antibody modeling software. See, generally, e.g., Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains. In: Antibody Engineering Lab Manual (Ed.: Duebel, S. and Kontermann, R., Springer-Verlag, Heidelberg参照)。
ここで使用する用語“相補性決定領域”および“CDR”は、抗原特異性および結合親和性を付与する、抗体可変領域内のアミノ酸の配列いう。一般に、各重鎖可変領域に3CDR(HCDR1、HCDR2、HCDR3)および各軽鎖可変領域に3CDR(LCDR1、LCDR2、LCDR3)がある。
あるCDRの厳密なアミノ酸配列境界は、Kabat et al. (1991), “Sequences of Proteins of Immunological Interest,” 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD(“Kabat”ナンバリングスキーム)、Al-Lazikani et al., (1997) JMB 273,927-948(“Chothia”ナンバリングスキーム)に記載のものを含む、多数の周知のスキームの何れかを使用して決定できる。“Chothia”番号スキームに従い定義されたここで使用するCDRは、“超可変ループ”と称することもある。
例えば、Kabat下、重鎖可変ドメイン(VH)におけるCDRアミノ酸残基は31〜35(HCDR1)、50〜65(HCDR2)および95〜102(HCDR3)と番号付けされ、軽鎖可変ドメイン(VL)におけるCDRアミノ酸残基は24〜34(LCDR1)、50〜56(LCDR2)および89〜97(LCDR3)と番号付けされる。Chothia下、VHにおけるCDRアミノ酸は26〜32(HCDR1)、52〜56(HCDR2)および95〜102(HCDR3)と番号付けされ、VLにおけるアミノ酸残基は26〜32(LCDR1)、50〜52(LCDR2)および91〜96(LCDR3)と番号付けされ。KabatおよびChothia両方のCDR定義の組み合わせにより、CDRは、ヒトVHにおいてアミノ酸残基26〜35(HCDR1)、50〜65(HCDR2)および95〜102(HCDR3)からなり、ヒトVLにおいてアミノ酸残基24〜34(LCDR1)、50〜56(LCDR2)および89〜97(LCDR3)からなる。
一般に、特に断らない限り、抗PD−1抗体分子は、例えば、表1に記載の、Kabat CDRおよび/またはChothia超可変ループの1以上のあらゆる組み合わせを含み得る。ある実施態様において、次のKabatおよびChothiaの両方の組み合わせCDR定義に従うHCDR1およびKabatのCDR定義に従うHCCDR 2〜3およびLCCDR 1〜3の定義を、表1に記載する抗PD−1抗体分子の定義に使用する。全ての定義下、各VHおよびVLは一般に3CDRおよび4FR含み、アミノ末端からカルボキシ末端方向で、次の順に配置される。FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。
ここで使用する“免疫グロブリン可変ドメイン配列”は、免疫グロブリン可変ドメインの構造を形成できるアミノ酸配列をいう。例えば、配列は、天然に存在する可変ドメインのアミノ酸配列の一部または全てを含み得る。例えば、配列は1、2またはそれ以上のN末端またはC末端アミノ酸を含んでも、含まなくてもよく、またはタンパク質構造の形成と適合する他の改変を含んでよい。
用語“抗原結合部位”は、PD−1ポリペプチドまたはそのエピトープに結合する境界面を形成する決定基を含む抗体分子の部分をいう。タンパク質(またはタンパク質模倣体)に関して、抗原結合部位は、一般にPD−1ポリペプチドに結合する境界面を形成する(少なくとも4アミノ酸またはアミノ酸模倣物の)1以上のループを含む。一般に、抗体分子の抗原結合部位は、少なくとも1または2CDRおよび/または超可変ループまたはより一般に少なくとも3、4、5または6CDRおよび/または超可変ループを含む。
用語“競合”または“交差競合”はここで相互交換可能に使用し、抗PD−1抗体分子、例えば、ここに提供する抗PD−1抗体分子の標的、例えば、ヒトPD−1への結合を妨害する、抗体分子の能力をいう。結合の妨害は直接的でも間接的でもよい(例えば、抗体分子または標的のアロステリック調節を介する)。抗体分子が他の抗体分子の標的への結合を妨害する程度、それゆえに、それが競合すると言えるか否かは、競合結合アッセイ、例えば、FACSアッセイ、ELISAまたはBIAコアアッセイを使用して決定できる。ある実施態様において、競合結合アッセイは定量的競合アッセイである。ある実施態様において、第一抗PD−1抗体分子は、競合結合アッセイ(例えば、ここに記載する競合アッセイ)において、第一抗体分子の標的への結合が10%またはそれ以上、例えば、20%またはそれ以上、30%またはそれ以上、40%またはそれ以上、50%またはそれ以上、55%またはそれ以上、60%またはそれ以上、65%またはそれ以上、70%またはそれ以上、75%またはそれ以上、80%またはそれ以上、85%またはそれ以上、90%またはそれ以上、95%またはそれ以上、98%またはそれ以上、99%またはそれ以上減少したとき、第二抗PD−1抗体分子の標的への結合と競合するという。
ここで使用する用語“モノクローナル抗体”または“モノクローナル抗体組成物”は、単一分子組成の抗体分子の調製物をいう。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに単一結合特異性および親和性を示す。モノクローナル抗体は、ハイブリドーマテクノロジーまたはハイブリドーマテクノロジーを使用しない方法(例えば、組み換え方法)により製造できる。
“効果的ヒト”タンパク質は、中和抗体応答、例えば、ヒト抗マウス抗体(HAMA)応答を惹起しないタンパク質である。HAMAは多数の状況で、例えば、抗体分子を、例えば、慢性または再発疾患状態の処置において、繰り返し投与したとき、問題となることがある。HAMA応答は、反復抗体投与を、血清からの抗体クリアランス増加(例えば、Saleh et al., Cancer Immunol. Immunother., 32:180-190 (1990)参照)およびまたアレルギー反応の可能性(例えば、LoBuglio et al., Hybridoma, 5:5117-5123 (1986))のために、無効にする可能性がある。
抗体分子はポリクローナル抗体でもモノクローナル抗体でもよい。他の実施態様において、抗体は、組み換えにより産生される、例えば、ファージディスプレイまたはコンビナトリアル方法により産生され得る。
抗体産生のためのファージディスプレイおよびコンビナトリアル方法は当分野で知られる(例えば、全ての内容を引用により本明細書に包含させる、Ladner et al. 米国特許5,223,409;Kang et al. 国際公開WO92/18619号;Dower et al. 国際公開WO91/17271号;Winter et al. 国際公開WO92/20791号;Markland et al. 国際公開WO92/15679号;Breitling et al. 国際公開WO93/01288;McCafferty et al. 国際公開WO92/01047号;Garrard et al. 国際公開WO92/09690号;Ladner et al. 国際公開WO90/02809号;Fuchs et al. (1991) Bio/Technology 9:1370-1372; Hay et al. (1992) Hum Antibod Hybridomas 3:81-85; Huse et al. (1989) Science 246:1275-1281; Griffths et al. (1993) EMBO J 12:725-734; Hawkins et al. (1992) J Mol Biol 226:889-896; Clackson et al. (1991) Nature 352:624-628; Gram et al. (1992) PNAS 89:3576-3580; Garrad et al. (1991) Bio/Technology 9:1373-1377; Hoogenboom et al. (1991) Nuc Acid Res 19:4133-4137;およびBarbas et al. (1991) PNAS 88:7978-7982参照)。
ある実施態様において、抗体は、完全ヒト抗体(例えば、ヒト免疫グロブリン配列からの抗体を産生するように遺伝子改変されているマウスにおいて産生された抗体)または非ヒト抗体、例えば、齧歯類(マウスまたはラット)、ヤギ、霊長類(例えば、サル)、ラクダ抗体であり得る。好ましくは、非ヒト抗体は齧歯類(マウスまたはラット)抗体である。齧歯類抗体を産生する方法は当分野で知られる。
ヒトモノクローナル抗体は、マウス系ではなく、ヒト免疫グロブリン遺伝子を担持するトランスジェニックマウスを使用して、産生され得る。目的の抗原で免疫化したこれらのトランスジェニックマウスからの脾細胞を、ヒトタンパク質からのエピトープに特定の親和性を有するヒトmAbを分泌するハイブリドーマの産生に使用する(例えば、Wood et al. 国際出願WO91/00906号、Kucherlapati et al. PCT公開WO91/10741号;Lonberg et al. 国際出願WO92/03918号;Kay et al. 国際出願92/03917号;Lonberg, N. et al. 1994 Nature 368:856-859; Green, L.L. et al. 1994 Nature Genet. 7:13-21; Morrison, S.L. et al. 1994 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855; Bruggeman et al. 1993 Year Immunol 7:33-40; Tuaillon et al. 1993 PNAS 90:3720-3724; Bruggeman et al. 1991 Eur J Immunol 21:1323-1326参照)。
抗体は、可変領域またはその一部、例えば、CDRが非ヒト生物、例えば、ラットまたはマウスで産生させるものであり得る。キメラ、CDR移植およびヒト化抗体は本発明の範囲内である。非ヒト生物、例えば、ラットまたはマウスで産生され、次いで、例えば、可変フレームワークまたは定常領域を修飾して、ヒトにおける抗原性を低減させた抗体は本発明の範囲内である。
キメラ抗体は、当分野で知られる組み換えDNA技術により産生できる(Robinson et al.、国際特許公開PCT/US86/02269号;Akira, et al.、欧州特許出願184,187号;Taniguchi, M.、欧州特許出願171,496号;Morrison et al.、欧州特許出願173,494号;Neuberger et al.、国際出願WO86/01533号;Cabilly et al. 米国特許4,816,567号;Cabilly et al.、欧州特許出願125,023号;Better et al. (1988 Science 240:1041-1043); Liu et al. (1987) PNAS 84:3439-3443; Liu et al., 1987, J. Immunol. 139:3521-3526; Sun et al. (1987) PNAS 84:214-218; Nishimura et al., 1987, Canc. Res. 47:999-1005; Wood et al. (1985) Nature 314:446-449;およびShaw et al., 1988, J. Natl Cancer Inst. 80:1553-1559参照)。
ヒト化またはCDR移植抗体は、ドナーCDRと置き換えられた、少なくとも1または2、しかし一般に全3レシピエントCDR(重および/または軽免疫グロブリン鎖)を有する。抗体は、少なくとも非ヒトCDRの一部で置き換えられてよくまたはCDRの一部のみが非ヒトCDRで置き換えられてよい。ヒト化抗体のPD−1への結合に必要な数のCDRを置き換えることのみが必要である。好ましくは、ドナーは、齧歯類抗体、例えば、ラットまたはマウス抗体であり、レシピエントはヒトフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークである。一般に、CDRを提供する免疫グロブリンは“ドナー”と呼ばれ、フレームワークを提供する免疫グロブリンは“アクセプター”と呼ばれる。ある実施態様において、ドナー免疫グロブリンは非ヒト(例えば、齧歯類)である。アクセプターフレームワークは、天然に存在する(例えば、ヒト)フレームワークまたはコンセンサスフレームワークまたはそれと約85%以上、好ましくは90%、95%、99%またはそれ以上同一である配列である。
ここで使用する用語“コンセンサス配列”は、関連配列のファミリーにおいて最も高頻度で存在するアミノ酸(またはヌクレオチド)から形成される配列をいう(例えば、Winnaker, From Genes to Clones (Verlagsgesellschaft, Weinheim, Germany 1987参照)。タンパク質ファミリーにおいて、コンセンサス配列における各位置は、該ファミリーのその位置で最も高頻度で存在するアミノ酸により占拠される。2アミノ酸が等しい頻度で存在するならば、何れもコンセンサス配列に含んでよい。“コンセンサスフレームワーク”は、コンセンサス免疫グロブリン配列におけるフレームワーク領域をいう。
抗体は、当分野で知られる方法によりヒト化され得る(例えば、全ての内容を引用により本明細書に包含させる、Morrison, S. L., 1985, Science 229:1202-1207, by Oi et al., 1986, BioTechniques 4:214およびQueen et al. US5,585,089号、US5,693,761号およびUS5,693,762号参照)。
ヒト化またはCDR移植抗体は、CDR移植またはCDR置換により産生でき、ここで免疫グロブリン鎖のCDRの1、2または全てが置換され得る。例えば、全ての内容を引用により本明細書に包含させる米国特許5,225,539号; Jones et al. 1986 Nature 321:552-525; Verhoeyan et al. 1988 Science 239:1534; Beidler et al. 1988 J. Immunol. 141:4053-4060; Winter US5,225,539号参照。内容を明示的に引用により本明細書に包含させる、Winterは、本発明のヒト化抗体の製造に使用できるCDR移植を記載する(英国特許出願GB2188638A号、1987年6月26日出願;Winter US5,225,539号)。
また本発明の範囲内にあるのは、特定のアミノ酸が置換、欠失または付加されているヒト化抗体である。ドナーからアミノ酸を選択するための基準は、US5,585,089号、例えば、US5,585,089号のカラム12〜16に記載され、その内容は、引用により本明細書に包含させる。抗体ヒト化の他の技術は、1992年12月23日公開の、Padlan et al. EP519596A1号に記載されている。
抗体分子は一本鎖抗体であり得る。一本鎖抗体(scFV)は改変され得る(例えば、Colcher, D. et al. (1999) Ann N Y Acad Sci 880:263-80;およびReiter, Y. (1996) Clin Cancer Res 2:245-52参照)。一本鎖抗体は、同じ標的タンパク質の種々のエピトープに特異性を有する多価抗体を産生するために二量体化または多量体化され得る。
さらに他の実施態様において、抗体分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgDおよびIgEの重鎖定常領域から選択される、特に、例えば、IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4の(例えば、ヒト)重鎖定常領域から選択される重鎖定常領域を有する。他の実施態様において、抗体分子は、例えば、カッパまたはラムダの(例えば、ヒト)軽鎖定常領域から選択される、軽鎖定常領域を有する。定常領域は、抗体分子の性質を修飾するために改変、例えば変異される(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基数、エフェクター細胞機能および/または補体機能の1以上の増加または減少のため)。ある実施態様において、抗体はエフェクター機能を有し、補体を固定し得る。他の実施態様において、抗体はエフェクター細胞の補充または補体固定をしない。他の実施態様において、抗体は、Fc受容体への結合能力が減少しているか、その能力を有しない。例えば、それはFc受容体への結合を指示しないアイソタイプまたはサブタイプ、フラグメントまたは他の変異体であり、例えば、それはFc受容体結合領域が変異または欠失している。
抗体定常領域を改変する方法は当分野で知られる。機能が改変された、例えば細胞上のFcRまたは補体のC1成分のようなエフェクターリガンドへの親和性が改変された抗体は、抗体の定常部分における少なくとも1アミノ酸残基を異なる残基で置換することにより産生され得る(例えば、全ての内容を引用により本明細書に包含させる、EP388,151A1号、米国特許5,624,821号および米国特許5,648,260号参照)。類似タイプの改変が記載され、これは、マウスまたは他の種の免疫グロブリンに適用されたとき、これらの機能が低減または排除される。
抗体分子は、誘導体化または他の機能的分子(例えば、他のペプチドまたはタンパク質)と連結させ得る。ここで使用する“誘導体化”抗体分子は、修飾されているものである。誘導体化の方法は、蛍光部分、放射性ヌクレオチド、毒素、酵素またはビオチンのような親和性リガンドの付加を含むが、これらに限定されない。従って、本発明の抗体分子は、免疫接着分子を含む、ここに記載する抗体の誘導体化および他に修飾された形態を含むことが意図される。例えば、抗体分子は、他の抗体(例えば、二特異的抗体または二重特異性抗体)、検出可能薬剤、細胞毒性剤、薬剤および/または抗体または抗体部分と他の分子の結合に介在し得るタンパク質またはペプチド(例えばストレプトアビジンコア領域またはポリヒスチジンタグ)のような1以上の他の分子と機能的に連結(化学カップリング、遺伝子融合、非共有結合的結合またはその他)させ得る。
あるタイプの誘導体化抗体分子は、2以上の抗体(同じタイプまたは例えば、二特異的抗体を作製するため、異なるタイプ)の架橋により産生される。適当な架橋剤は、適切なスペーサーで分けられた2つの異なる反応性基を有するヘテロ二機能性(例えば、m−マレイミドベンゾイル−N−ヒドロキシスクシンイミドエステル)またはホモ二機能性(例えば、スベリン酸ジサクシンイミジル)であるものを含む。このようなリンカーは、Pierce Chemical Company, Rockford, Illから入手可能である。
本発明の抗体分子の誘導体化(または標識)に用い得る有用な検出可能薬剤は、蛍光化合物、種々の酵素、接合団、発光物質、生物発光物質、蛍光放出金属原子、例えば、ユウロピウム(Eu)および他のランタノイド類および放射性物質(下記)を含む。蛍光検出可能薬剤の例は、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、5ジメチルアミン−1−ナフタレンスルホニルクロライド、フィコエリトリンなどを含む。抗体はまたアルカリホスファターゼ、ホースラディッシュペルオキシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、アセチルコリンエステラーゼ、グルコースオキシダーゼなどのような検出可能酵素でも誘導体化し得る。抗体を検出可能酵素で誘導体化したとき、酵素が検出可能反応生成物の生成のために使用するさらなる薬剤の添加により検出される。例えば、検出可能薬剤ホースラディッシュペルオキシダーゼが存在するとき、過酸化水素およびジアミノベンジジンの添加により、検出可能である着色反応生成物がもたらされる。抗体分子はまた接合団(例えば、ストレプトアビジン/ビオチンおよびアビジン/ビオチン)でも誘導体化し得る。例えば、抗体をビオチンで誘導体化し、アビジンまたはストレプトアビジン結合の間接的測定により検出し得る。適当な蛍光物質の例は、ウンベリフェロン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロライドまたはフィコエリトリンを含み、発光物質の例はルミノールを含み、生物発光物質の例は、ルシフェラーゼ、ルシフェリンおよびイクオリンを含む。
標識抗体分子は、例えば、診断的におよび/または実験的に、(i)親和性クロマトグラフィーまたは免疫沈降のような標準技術により予め決定した抗原を単離するため、(ii)タンパク質の豊富さおよび発現パターンを評価するため予め決定した抗原(例えば、細胞ライセートまたは細胞上清において)を検出するため、(iii)臨床試験法の一部として、例えば、ある処置レジメンの有効性を決定するために、組織におけるタンパク質レベルをモニターするためを含む、多数の状況において使用できる。
抗体分子は、他の分子、一般に標識または治療(例えば、細胞毒性または細胞増殖抑制)薬剤または部分とコンジュゲートさせ得る。放射性同位体は、診断または治療適用において使用され得る。
本発明は、放射性標識抗体分子およびその標識方法を提供する。ある実施態様において、抗体分子を標識する方法が開示される。方法は、抗体分子とキレート剤を接触させ、それにより、コンジュゲート抗体を産生することを含む。
上記のとおり、抗体分子は治療剤とコンジュゲートされ得る。治療活性放射性同位体は既に記載されている。他の治療剤の例は、タキソール、サイトカラシンB、グラミシジンD、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テニポシド、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルヒチン、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンD、1−デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、ピューロマイシン、メイタンシノイド、例えば、マイタンシノール(米国特許5,208,020号参照)、CC−1065(米国特許5,475,092号、5,585,499号、5,846,545号参照)およびこれらのアナログまたはホモログを含む。治療剤は、代謝拮抗剤(例えば、メトトレキサート、6−メルカプトプリン、6−チオグアニン、シタラビン、5−フルオロウラシルデカルバジン)、アルキル化剤(例えば、メクロレタミン、チオテパクロラムブシル、CC−1065、メルファラン、カルムスチン(BSNU)およびロムスチン(CCNU)、シクロホスファミド、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾシン、マイトマイシンCおよびcis−ジクロロジアミン白金(II)(DDP)シスプラチン)、アントラサイクリン(例えば、ダウノルビシン(以前はダウノマイシン)およびドキソルビシン)、抗生物質(例えば、ダクチノマイシン(以前はアクチノマイシン)、ブレオマイシン、ミトラマイシンおよびアントラマイシン(AMC))および抗有糸分裂薬剤(例えば、ビンクリスチン、ビンブラスチン、タキソールおよびメイタンシノイド)を含むが、これらに限定されない。
ある態様において、本発明は、ここに開示する標的、例えば、PD−1受容体と特異的に結合する標的結合分子を提供する方法に関する。例えば、標的結合分子は抗体分子である。方法は、非ヒトタンパク質の少なくとも一部を含む標的タンパク質を提供し(当該一部はヒト標的タンパク質の対応する部分と相同(少なくとも70%、75%、80%、85%、87%、90%、92%、94%、95%、96%、97%、98%同一)であるが、少なくとも1アミノ酸(例えば、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8または9アミノ酸)異なる)、抗原に特異的に結合する抗体分子を得て、標的タンパク質の活性の調節における結合剤の有効性を評価することを含む。方法は、さらに結合剤(例えば、抗体分子)または誘導体(例えば、ヒト化抗体分子)をヒト対象に投与することを含む。
多特異的抗体分子
ある実施態様において、抗体分子は多特異的(例えば、二特異的または三特異的)抗体分子である。二特異的またはヘテロ二量体抗体分子産生のためのプロトコールは当分野で知られ、例えば、US5731168号に記載の、例えば、“ノブ・イン・ホール”手法、例えば、WO09/089004号、WO06/106905号およびWO2010/129304号に記載の、静電ステアリングFc対形成、例えば、WO07/110205号に記載の、鎖交換改変ドメイン(SEED)ヘテロ二量体形成、例えば、WO08/119353号、WO2011/131746号およびWO2013/060867号に記載の、Fabアーム交換、例えば、US4433059号に記載の、例えば、アミン官能基およびスルフヒドリル官能基を有するヘテロ二機能性薬剤を使用する二特異的構造を産生するための抗体架橋による、ダブル抗体コンジュゲート、例えば、US4444878号に記載の、2重鎖間のジスルフィド結合の還元および酸化サイクルを介する異なる抗体からの半抗体(重−軽鎖対またはFab)の再結合による二特異的抗体決定基産生、例えば、US5273743号に記載の、三機能的抗体、例えば、スルフヒドリル官能基により架橋された、3Fab’フラグメント、例えば、US5534254号に記載の、生合成結合タンパク質、例えば、好ましくはジスルフィドまたはアミン反応性化学架橋によりC末端テイルにより架橋したscFvsのペア、例えば、US5582996号に記載の、二機能性抗体、例えば、定常ドメインが置換されているロイシンジッパー(例えば、c−fosおよびc−jun)により二量体化された異なる結合特異性を有するFabフラグメント、例えば、US5591828号に記載する二特異的およびオリゴ特異的単価およびオリゴ価受容体、例えば、ある抗体のCH1領域と、一般に軽鎖を伴う他の抗体のVH領域の間のポリペプチドスペーサーにより連結された、2抗体(2Fabフラグメント)のVH−CH1領域、例えば、US5635602号に記載の、二特異的DNA−抗体コンジュゲート、例えば、DNAの二本鎖ピースを介する抗体またはFabフラグメントの架橋、例えば、US5637481号に記載の、二特異的融合体タンパク質、例えば、それらと完全定常領域の間に親水性らせん状ペプチドリンカーを伴う2scFvを含む発現構築物、例えば、US5837242号に記載の、多価および多特異的結合タンパク質、例えば、Ig重鎖可変領域の結合領域を有する第一ドメインおよびIg軽鎖可変領域の結合領域を有する第二ドメインを有するポリペプチドの二量体、一般に二重特異性抗体と称される(高次構造も、二特異的、三特異的または四特異的分子を産生することが開示されている)、例えば、US5837821号に記載の、二特異的/多価分子の形成のために二量体化され得るペプチドスペーサーで抗体ヒンジ領域およびCH3領域にさらに接続したVLおよびVH鎖に連結したミニボディ構築物、二特異的二重特異性抗体を形成するために二両体を形成できる、何れかの配向で短ペプチドリンカー(例えば、5または10アミノ酸)により連結されたまたは全くリンカーがなく連結されたVHおよびVLドメイン、例えば、US5844094号に記載の、三量体および四量体、例えば、US5864019号に記載の、一連のFVs(またはscFvs)を形成するためにさらにVLドメインと結合したC末端に架橋可能基を有するペプチド結合により接続されたVHドメイン(またはファミリーメンバーにおけるVLドメイン)のストリングおよび、例えば、US5869620号に記載の、ペプチドリンカーにより連結されたVHおよびVLドメインの両方がcFVまたは二重特異性抗体タイプ形式の両方を使用する、例えば、ホモ二価、ヘテロ二価、三価および四価構造を形成するための、非共有結合または化学架橋による多価構造に合わさった一本鎖結合ポリペプチドを含むが、これらに限定されない。多特異的および二特異的分子およびこれを製造する方法のさらなる例は、例えば、US5910573号、US5932448号、US5959083号、US5989830号、US6005079号、US6239259号、US6294353号、US6333396号、US6476198号、US6511663号、US6670453号、US6743896号、US6809185号、US6833441号、US7129330号、US7183076号、US7521056号、US7527787号、US7534866号、US7612181号、US2002004587A1号、US2002076406A1号、US2002103345A1号、US2003207346A1号、US2003211078A1号、US2004219643A1号、US2004220388A1号、US2004242847A1号、US2005003403A1号、US2005004352A1号、US2005069552A1号、US2005079170A1号、US2005100543A1号、US2005136049A1号、US2005136051A1号、US2005163782A1号、US2005266425A1号、US2006083747A1号、US2006120960A1号、US2006204493A1号、US2006263367A1号、US2007004909A1号、US2007087381A1号、US2007128150A1号、US2007141049A1号、US2007154901A1号、US2007274985A1号、US2008050370A1号、US2008069820A1号、US2008152645A1号、US2008171855A1号、US2008241884A1号、US2008254512A1号、US2008260738A1号、US2009130106A1号、US2009148905A1号、US2009155275A1号、US2009162359A1号、US2009162360A1号、US2009175851A1号、US2009175867A1号、US2009232811A1号、US2009234105A1号、US2009263392A1号、US2009274649A1号、EP346087A2号、WO0006605A2号、WO02072635A2号、WO04081051A1号、WO06020258A2号、WO2007044887A2号、WO2007095338A2号、WO2007137760A2号、WO2008119353A1号、WO2009021754A2号、WO2009068630A1号、WO9103493A1号、WO9323537A1号、WO9409131A1号、WO9412625A2号、WO9509917A1号、WO9637621A2号、WO9964460A1号に見られる。上に引用した出願の内容を、引用によりその全体を本明細書に包含させる。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子(例えば、単特異的、二特異的または多特異的抗体分子)は、例えば、融合体分子、例えば融合体タンパク質として、他のパートナー例えば、タンパク質、例えば、1、2またはそれ以上のサイトカインと共有結合により連結、例えば、融合される。他の実施態様において、融合体分子は、1以上のタンパク質、例えば、1、2またはそれ以上のサイトカインを含む。ある実施態様において、サイトカインはインターロイキン(IL)−1、IL−2、IL−12、IL−15またはIL−21の1、2、3またはそれ以上から選択されるILである。ある実施態様において、二特異的抗体分子は、第一標的(例えば、PD−1)に対する第一結合特異性、第二標的(例えば、LAG−3またはTIM−3)に対する第二結合特異性を有し、場合によりインターロイキン(例えば、IL−12)ドメイン、例えば、完全長IL−12またはその一部に連結している。
“融合体タンパク質”および“融合体ポリペプチド”は、互いに共有結合により連結した少なくとも2部分を有するポリペプチドをいい、ここで、これら部分の各々は、異なる性質を有するポリペプチドである。性質は、インビトロまたはインビボでの活性のような生物学的性質であり得る。性質は、標的分子への結合、反応の触媒などのような単純な化学的または物理的性質でもあり得る。この2部分は、直接単一ペプチド結合によりまたはペプチドリンカーにより連結され得るが、互いにリーディングフレーム内にある。
本発明は、上記抗体分子をコードする単離核酸分子、そのベクターおよび宿主細胞を提供する。核酸分子は、RNA、ゲノムDNAおよびcDNAを含むが、これらに限定されない。
組み合わせ物に使用する薬剤例
ここに記載するのは、(i)抗原(例えば、腫瘍抗原)提示を増強する薬剤;(ii)エフェクター細胞応答(例えば、B細胞および/またはT細胞活性化および/または動員)を増強する薬剤または(iii)腫瘍免疫抑制を減少させる薬剤の1以上の組み合わせ物を含み、それにより障害、例えば、過増殖性状態または障害(例えば、癌)を処置する方法および組成物である。ある実施態様において、組み合わせ物はPD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子)を含む。これらの組み合わせ物において使用できる薬剤の例をここに提供する。
STINGアゴニスト例
ある実施態様において、組み合わせ物はSTINGアゴニストを含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、乳癌、扁平上皮細胞癌、黒色腫、肺癌(例えば、非小細胞肺癌)、卵巣癌、ファロピウス管癌、腹膜癌、軟組織肉腫、食道癌、頭頸部癌、子宮内膜癌、子宮頸癌または基底細胞癌)、例えば、血液系腫瘍(例えば、白血病(例えば、慢性リンパ性白血病(CLL)またはリンパ腫(例えば、辺縁帯B細胞リンパ腫、小リンパ球性リンパ腫、濾胞性リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫))の処置に使用する。
ある実施態様において、STINGアゴニストは環状ジヌクレオチド、例えば、プリンまたはピリミジン核酸塩基(例えば、アデノシン、グアニン、ウラシル、チミンまたはシトシン核酸塩基)を含む環状ジヌクレオチドである。ある実施態様において、環状ジヌクレオチドの核酸塩基は同じ核酸塩基または異なる核酸塩基を含む。
ある実施態様において、STINGアゴニストは1アデノシンまたはグアノシン核酸塩基を含む。ある実施態様において、STINGアゴニストは1アデノシン核酸塩基および1グアノシン核酸塩基を含む。ある実施態様において、STINGアゴニストは2アデノシン核酸塩基または2グアノシン核酸塩基を含む。
ある実施態様において、STINGアゴニストは、例えば、修飾核酸塩基、修飾リボースまたは修飾リン酸結合を含む、修飾環状ジヌクレオチドを含む。ある実施態様において、修飾環状ジヌクレオチドは修飾リン酸結合、例えば、チオホスフェートを含む。
ある実施態様において、STINGアゴニストは、2’,5’または3’,5’リン酸結合を有する環状ジヌクレオチド(例えば、修飾環状ジヌクレオチド)を含む。ある実施態様において、STINGアゴニストは、リン酸結合周囲にRpまたはSp立体化学を有する環状ジヌクレオチド(例えば、修飾環状ジヌクレオチド)を含む。
ある実施態様において、STINGアゴニストは、Rp,Rpジチオ2’,3’ c−di−AMP(例えば、Rp,Rp−ジチオc−[A(2’,5’)pA(3’,5’)p])またはその環状ジヌクレオチドアナログである。ある実施態様において、STINGアゴニストは、米国特許公開US2015/0056224に記載の化合物(例えば、図2cの化合物、例えば、化合物21または化合物22)である。ある実施態様において、STINGアゴニストは、c−[G(2’,5’)pG(3’,5’)p]、そのジチオリボースO置換誘導体またはPCT公開WO2014/189805号およびWO2014/189806号の図4に記載の化合物である。ある実施態様において、STINGアゴニストは、c−[A(2’,5’)pA(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体であるかまたはPCT公開WO2014/189805号およびWO2014/189806号の図5に記載の化合物である。ある実施態様において、STINGアゴニストは、c−[G(2’,5’)pA(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体であるかまたはPCT公開WO2014/189805号およびWO2014/189806号の図5に記載の化合物である。ある実施態様において、STINGアゴニストは、2’−0−プロパルギル−環状−[A(2’,5’)pA(3’,5’)p](2’−0−プロパルギル−ML−CDA)またはPCT公開WO2014/189806号の図7に記載の化合物である。
STINGアゴニストの他の例は、例えば、PCT公開WO2014/189805号およびWO2014/189806号および米国公開2015/0056225号に開示されている。
TLRアゴニスト例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物は、トール様受容体(TLR)アゴニストを含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、乳癌、扁平上皮細胞癌、黒色腫、卵巣癌、ファロピウス管癌、腹膜癌、軟組織肉腫、食道癌、頭頸部癌、子宮内膜癌、子宮頸癌、結腸癌(例えば、転移ミスマッチ修復機構保存(MRP)結腸癌)、腎癌(例えば、腎細胞癌)または基底細胞癌)、例えば、血液系腫瘍(例えば、白血病(例えば、慢性リンパ性白血病(CLL)またはリンパ腫(例えば、辺縁帯B細胞リンパ腫、小リンパ球性リンパ腫、濾胞性リンパ腫、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫))の処置に使用する。
TLRは、微生物病原体を認識する自然免疫系のセンサーとして最初に同定された、パターン認識受容体のファミリーである。ヒトにおいて、TLRはTLR−1、TLR−2、TLR−3、TLR−4、TLR−5、TLR−6、TLR−7、TLR−8、TLR−9およびTLR−10を含む。TLR−1、−2、−4、−5および−6は細胞表面に発現され、TLR−3、−7/8および−9はERコンパートメントと共に発現される。ヒト樹状細胞サブセットを別個のTLR発現パターンに基づき同定し得る。ヒト樹状細胞の骨髄または“慣用の”サブセットはTLR 1〜8を発現し、樹状細胞の形質細胞様サブセットはTLR−7およびTLR−9のみ発現する。TLRへのリガンド結合は、炎症および免疫に関与する因子の生成を誘発する細胞内シグナル伝達経路のカスケードを惹起する。刺激により、ヒト樹状細胞の骨髄サブセットおよび形質細胞様サブセットは、抗原特異的CD4およびCD8 T細胞プライミングおよびNK細胞およびT細胞の活性化をそれぞれもたらす。
ある実施態様において、TLRアゴニストは、TLR−1アゴニスト、TLR−2アゴニスト、TLR−3アゴニスト、TLR−4アゴニスト、TLR−5アゴニスト、TLR−6アゴニスト、TLR−7アゴニスト、TLR−8アゴニスト、TLR−9アゴニスト、TLR−10アゴニスト、TLR−1/2アゴニスト、TLR−2/6アゴニストまたはTLR−7/8アゴニストの1以上から選択される。ある実施態様において、TLRアゴニストはTLR7アゴニストである。
ある実施態様において、TLRアゴニストはイミキモドまたは3−(2−メチルプロピル)−3,5,8−トリアザトリシクロ[7.4.0.02,6]トリデカ−1(9),2(6),4,7,10,12−ヘキサエン−7−アミンである。イミキモドまたは3−(2−メチルプロピル)−3,5,8−トリアザトリシクロ[7.4.0.02,6]トリデカ−1(9),2(6),4,7,10,12−ヘキサエン−7−アミンはTLR−7および/またはTLR−8に結合し、活性化できる。
ある実施態様において、TLRアゴニストは852Aである。852Aは、例えば、Inglefield et al. J Interferon Cytokine Res.2008; 28(4):253-63に岸亜される。852AはTLR−7および/またはTLR−8に結合し、活性化できる。
ある実施態様において、TLRアゴニストは、カルメット・ゲラン桿菌(BCG)である。BCGはTLR−9に結合し、活性化できる。
ある実施態様において、TLRアゴニストはEMD 120108である。EMD 120108は、ホスホロチオエートオリゴデオキシヌクレオチドを含む合成オリゴヌクレオチドである。EMD 1201081は、例えば、単球/マクロファージ、形質細胞様樹状細胞(DC)およびB細胞においてTLR−9に結合し、活性化し、免疫シグナル伝達経路を開始し、B細胞を活性化し、Tヘルパー細胞サイトカイン産生を誘発することができる。
ある実施態様において、TLRアゴニストはIMO−2055である。IMO−2055は、非メチル化CpGジヌクレオチドを含む合成オリゴヌクレオチドである。細菌DNAにおける非メチル化CpG配列の模倣により、IMO−2055は、例えば、単球/マクロファージ、形質細胞様樹状細胞(DC)およびB細胞においてTLR−9に結合し、活性化し、免疫シグナル伝達経路を開始し、B細胞およびDCsを活性化し、Tヘルパー細胞サイトカイン産生を誘発することができる。
組み合わせ物で使用できる他のTLRアゴニストの例は、例えば、TLR−1/2アゴニスト(例えば、Pam3Cys)、TLR−2アゴニスト(例えば、CFA、MALP2、Pam2Cys、FSL−1またはHib−OMPC)、TLR−3アゴニスト(例えば、ポリイノシン酸:ポリシチジル酸(ポリI:C)、ポリアデニル酸−ポリウリジル酸(ポリAU)、ポリ−L−リシンおよびカルボキシメチルセルロースで安定化したポリイノシン−ポリシチジル酸(Hiltonol(登録商標)))、TLR−4アゴニスト(例えば、モホノスホリル脂質A(MPL)、LPS、シアリル−Tn(STn))、TLR−5アゴニスト(例えば、細菌フラゲリン)、TLR−7アゴニスト(例えば、イミキモド)、TLR−7/8アゴニスト(例えば、レシキモドまたはロキソリビン)およびTLR−9アゴニスト(例えば、非メチル化CpGジヌクレオチド(CpG−ODN))を含む。
他の実施態様において、TLRアゴニストを、例えば、WO2004/060319号および国際公開WO2014/012479号に記載のとおり、GITRアゴニストと組み合わせて使用する。
VEGFR阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物は、血管内皮細胞増殖因子(VEGF)受容体阻害剤(例えば、VEGFR(例えば、VEGFR−1、VEGFR−2、VEGFR−3)またはVEGFの1以上の阻害剤)を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、黒色腫、乳癌、結腸癌、食道癌、消化器間質腫瘍(GIST)、腎癌(例えば、腎細胞癌)、肝臓癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌または胃癌)、例えば、血液系腫瘍(例えば、リンパ腫)の処置に使用する。
ある実施態様において、VEGFR阻害剤はコハク酸バタラニブ(化合物A47)またはEP296122号に開示の化合物である。
ある実施態様において、VEGFR阻害剤は、VEGFR−2、PDGFRベータ、KITまたはRafキナーゼCの1以上の阻害剤、1−メチル−5−((2−(5−(トリフルオロメチル)−1H−イミダゾール−2−イル)ピリジン−4−イル)オキシ)−N−(4−(トリフルオロメチル)フェニル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−アミン(化合物A37)またはPCT公開WO2007/030377号に開示の化合物である。
ここに開示する組み合わせ物において使用できる他のVEGFR経路阻害剤の例は、例えば、ベバシズマブ(アバスチン(登録商標))、アクシチニブ(インライタ(登録商標))、ブリバニブアラニネート(BMS-582664、(S)−((R)−1−(4−(4−フルオロ−2−メチル−1H−インドール−5−イルオキシ)−5−メチルピロロ[2,1−f][1,2,4]トリアジン−6−イルオキシ)プロパン−2−イル)2−アミノプロパノエート)、ソラフェニブ(ネクサバール(登録商標))、パゾパニブ(ヴォトリエント(登録商標))、スニチニブマレート(スーテント(登録商標))、セジラニブ(AZD2171, CAS 288383-20-1)、vargatef(BIBF1120, CAS 928326-83-4)、フォレチニブ(GSK1363089)、テラチニブ(BAY57-9352, CAS 332012-40-5)、アパチニブ(YN968D1, CAS 811803-05-1)、イマチニブ(グリベック(登録商標))、ポナチニブ(AP24534, CAS 943319-70-8)、チボザニブ(AV951, CAS 475108-18-0)、レゴラフェニブ(BAY73-4506, CAS 755037-03-7)、二塩酸バタラニブ(PTK787, CAS 212141-51-0)、ブリバニブ(BMS-540215, CAS 649735-46-6)、バンデタニブ(カプレルサ(登録商標)またはAZD6474)、モテサニブ二リン酸塩(AMG706, CAS 857876-30-3、PCT公開WO02/066470号に記載のN−(2,3−ジヒドロ−3,3−ジメチル−1H−インドール−6−イル)−2−[(4−ピリジニルメチル)アミノ]−3−ピリジンカルボキサミド)、二乳酸ドビチニブ(TKI258, CAS 852433-84-2)、リニファニブ(ABT869, CAS 796967-16-3)、カボザンチニブ(XL184, CAS 849217-68-1)、レスタウルチニブ(CAS 111358-88-4)、N−[5−[[[5−(1,1−ジメチルエチル)−2−オキサゾリル]メチル]チオ]−2−チアゾリル]−4−ピペリジンカルボキサミド(BMS38703, CAS 345627-80-7)、(3R,4R)−4−アミノ−1−((4−((3−メトキシフェニル)アミノ)ピロロ[2,1−f][1,2,4]トリアジン−5−イル)メチル)ピペリジン−3−オール(BMS690514)、N−(3,4−ジクロロ−2−フルオロフェニル)−6−メトキシ−7−[[(3aα,5β,6aα)−オクタヒドロ−2−メチルシクロペンタ[c]ピロール−5−イル]メトキシ]−4−キナゾリンアミン(XL647, CAS 781613-23-8)、4−メチル−3−[[1−メチル−6−(3−ピリジニル)−1H−ピラゾロ[3,4−d]ピリミジン−4−イル]アミノ]−N−[3−(トリフルオロメチル)フェニル]−ベンズアミド(BHG712, CAS 940310-85-0)、アフリベルセプト(アイリーア(登録商標))およびエンドスタチン(ENDOSTAR(登録商標))を含むが、これらに限定されない。
ここに開示する組み合わせ物と使用できる抗VEGF抗体の例は、例えば、Presta et al. (1997) Cancer Res. 57:4593-4599により産生された組み換えヒト化抗VEGFモノクローナル抗体であるハイブリドーマATCC HB 10709により産生されたモノクローナル抗VEGF抗体A4.6.1と同じエピトープに結合するモノクローナル抗体を含む。ある実施態様において、抗VEGF抗体は、rhuMAb VEGFまたはアバスチン(登録商標)としても知られるベバシズマブ(BV)でる。それは、ヒトVEGFのその受容体への結合を遮断する、変異ヒトIgGlフレームワーク領域およびマウス抗hVEGFモノクローナル抗体A.4.6.1からの抗原結合相補性決定領域を含む。ベバシズマブおよび他のヒト化抗VEGF抗体は、2005年2月26日公開の米国特許6,884,879号にさらに記載される。さらなる抗体は、PCT公開WO2005/012359号、PCT公開WO2005/044853号記載のG6またはB20シリーズ抗体(例えば、G6−31、B20−4.1)を含み、これらの特許出願の内容は、引用により本明細書に明示的に包含させる。さらなる抗体については、米国特許7,060,269号、6,582,959号、6,703,020号、6,054,297号、WO98/45332号、WO96/30046号、WO94/10202号、EP0666868B1号、米国特許出願公開2006/009360号、2005/0186208号、2003/0206899号、2003/0190317号、2003/0203409および2005/0112126号;およびPopkov et al, Journal of Immunological Methods 288: 149-164 (2004)参照。他の抗体は、残基F17、M18、D19、Y21、Y25、Q89、191、K101、E103およびC104を含む、あるいは、残基F17、Y21、Q22、Y25、D63、183およびQ89を含む、ヒトVEGF上の機能的エピトープに結合するものを含む。
c−MET阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はc−MET阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、非小細胞肺癌、膵臓癌、肝臓癌(例えば、肝細胞癌、例えば、c−MET過発現肝細胞癌)、甲状腺癌(例えば、未分化甲状腺癌)、脳腫瘍(例えば、神経膠芽腫)、腎癌(例えば、腎細胞癌)、頭頸部癌(例えば、頭頸部扁平上皮細胞癌)の処置に使用する。
ある実施態様において、c−MET阻害剤は、化合物A17または米国特許7,767,675号および8,420,645号に記載の化合物である)。多くの腫瘍細胞型で過発現または変異している受容体チロシンキナーゼであるc−METは、腫瘍細胞増殖、生存、侵襲、転移および腫瘍血管形成に重要な役割を有する。c−METの阻害は、c−METタンパク質を過発現するまたは構成的活性化c−METタンパク質を発現する腫瘍細胞の細胞死を誘発し得る。
ある実施態様において、c−MET阻害剤はJNJ−38877605である。JNJ−38877605は、経口利用可能、小分子c−MET阻害剤である。JNJ−38877605は選択的にc−METに結合し、それによりc−METリン酸化を阻害し、c−Metシグナル伝達経路を妨害する。
ある実施態様において、c−Met阻害剤はAMG 208である。AMG 208は選択的小分子c−MET阻害剤である。AMG 208c−METのリガンド依存性およびリガンド非依存性活性化を阻害し、そのチロシンキナーゼ活性を阻害し、これは、c−Metを過発現する腫瘍の細胞増殖阻害をもたらし得る。
ある実施態様において、c−Met阻害剤はAMG 337である。AMG 337は、経口生体利用可能c−MET阻害剤である。AMG 337はc−METに選択的に結合し、それによりc−METシグナル伝達経路を妨害する。
ある実施態様において、c−Met阻害剤はLY2801653である。LY2801653は、経口利用可能、小分子c−MET阻害剤である。LY2801653は選択的にc−METに結合し、それによりc−METリン酸化を阻害し、c−Metシグナル伝達経路を妨害する。
ある実施態様において、c−Met阻害剤はMSC2156119Jである。MSC2156119Jは、経口生体利用可能c−MET阻害剤である。MSC2156119Jはc−METに選択的に結合しこれは、c−METリン酸化を阻害し、c−Met介在シグナル伝達経路を妨害する。
ある実施態様において、c−MET阻害剤はカプマチニブである。カプマチニブはINCB028060としても知られる。カプマチニブは、経口生体利用可能c−MET阻害剤である。カプマチニブは選択的にc−METに結合し、それによりc−METリン酸化を阻害し、c−Metシグナル伝達経路を妨害する。
ある実施態様において、c−MET阻害剤はクリゾチニブである。クリゾチニブはPF−02341066としても知られる。クリゾチニブは、受容体チロシンキナーゼ未分化リンパ腫キナーゼ(ALK)およびc−Met/肝細胞増殖因子受容体(HGFR)の経口利用可能アミノピリジンベース阻害剤である。クリゾチニブは、ATP競合的方法で、ALKキナーゼおよびALK融合体タンパク質に結合し、阻害する。さらに、クリゾチニブはc−Metキナーゼを阻害し、c−Metシグナル伝達経路を妨害する。まとめると、この薬剤は腫瘍細胞増殖を阻害する。
ある実施態様において、c−MET阻害剤はゴルバチニブである。ゴルバチニブは、潜在的抗新生物活性を有する経口生体利用可能c−METおよびVEGFR−2のデュアルキナーゼ阻害剤である。ゴルバチニブはc−METおよびVEGFR−2の両方に結合ぢ、活性を阻害し、これは、これらの受容体チロシンキナーゼを過発現する腫瘍細胞増殖および腫瘍細胞生存を阻害し得る。
ある実施態様において、c−MET阻害剤はチバンチニブである。チバンチニブはARQ 197としても知られる。チバンチニブは、経口生体利用可能小分子c−MET阻害剤である。チバンチニブはc−METタンパク質に結合し、c−Metシグナル伝達経路を妨害し、これは、c−METタンパク質を過発現するまたは構成的活性化c−METタンパク質を発現する腫瘍細胞の細胞死を誘発し得る。
TGFb阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はトランスフォーミング増殖因子ベータ(TGF−β)阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、脳癌(例えば、神経膠腫)、黒色腫、腎癌(例えば、腎細胞癌)、胸膜悪性中皮腫(例えば、再発性胸膜悪性中皮腫)または乳癌(例えば、転移乳癌))の処置に使用する。
ある実施態様において、TGF−β阻害剤はフレソリムマブ(CAS Registry Number: 948564-73-6)である。フレソリムマブはGC1008としても知られる。フレソリムマブは、TGF−ベータアイソフォーム1、2および3に結合し、阻害するヒトモノクローナル抗体である。
フレソリムマブの重鎖は次のアミノ酸配列を有する。QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYTFSSNVISWVRQAPGQGLEWMGGVIPIVDIANYAQRFKGRVTITADESTSTTYMELSSLRSEDTAVYYCASTLGLVLDAMDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPSCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号238)。フレソリムマブの軽鎖は次のアミノ酸配列を有する。ETVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSLGSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYGASSRAPGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYADSPITFGQGTRLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号239)。
フレソリムマブは、例えば、WO2006/086469号、US8,383,780号およびUS8,591,901号に開示される。
ある実施態様において、TGF−β阻害剤はXOMA 089である。XOMA 089はXPA.42.089としても知られる。XOMA 089は、TGF−ベータ1および2リガンドに結合し、中和する完全ヒトモノクローナル抗体である。
XOMA 089の重鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSSYAISWVRQAPGQGLEWMGGIIPIFGTANYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARGLWEVRALPSVYWGQGTLVTVSS(配列番号240)(WO2012/167143号の配列番号6として開示)。XOMA 089の軽鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。SYELTQPPSVSVAPGQTARITCGANDIGSKSVHWYQQKAGQAPVLVVSEDIIRPSGIPERISGSNSGNTATLTISRVEAGDEADYYCQVWDRDSDQYVFGTGTKVTVLG(配列番号241)(WO2012/167143号の配列番号8として開示)。
IDO/TDO阻害剤の例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物は、インドールアミン2,3−ジオキシゲナーゼ(IDO)および/またはトリプトファン2,3−ジオキシゲナーゼ(TDO)の阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせを、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、黒色腫、非小細胞肺癌、結腸癌、扁平上皮細胞頭頸部癌、卵巣癌、腹膜癌、ファロピウス管癌、乳癌(例えば、転移またはHER2陰性乳癌))、例えば、血液系腫瘍(例えば、リンパ腫、例えば、非ホジキンリンパ腫またはホジキンリンパ腫(例えば、汎発性大B細胞リンパ腫(DLBCL)))の処置に使用する。
ある実施態様において、IDO/TDO阻害剤は(4E)−4−[(3−クロロ−4−フルオロアニリノ)−ニトロソメチリデン]−1,2,5−オキサジアゾール−3−アミン(INCB24360としても既知)、インドキシモド(1−メチル−D−トリプトファン)またはα−シクロヘキシル−5H−イミダゾ[5,1−a]イソインドール−5−エタノール(NLG919としても既知)から選択される。
ある実施態様において、IDO/TDO阻害剤はエパカドスタット(CAS Registry Number: 1204669-58-8)である。エパカドスタットはINCB24360またはINCB024360(Incyte)としても知られる。エパカドスタットは、10nMのIC50の強力かつ選択的インドールアミン2,3−ジオキシゲナーゼ(IDO1)阻害剤であり、IDO2またはトリプトファン2,3−ジオキシゲナーゼ(TDO)のような他の関連酵素より高度に選択的である。
ある実施態様において、IDO/TDO阻害剤はインドキシモド(New Link Genetics)である。1−メチル−トリプトファンのD異性体であるインドキシモドは、腫瘍が免疫介在破壊を回避する機構を妨害する、経口投与小分子インドールアミン2,3−ジオキシゲナーゼ(IDO)経路阻害剤である。
ある実施態様において、IDO/TDO阻害剤はNLG919(New Link Genetics)である。NLG919は強力なIDO(インドールアミン−(2,3)−ジオキシゲナーゼ)経路阻害剤であり、無細胞アッセイにおいて7nM/75nMのKi/EC50を有する。
ある実施態様において、IDO/TDO阻害剤は、F001287(Flexus/BMS)である。F001287は、インドールアミン2,3−ジオキシゲナーゼ1(IDO1)の小分子阻害剤である。
A2ARアンタゴニスト例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物は、アデノシンA2a受容体(A2aR)アンタゴニスト(例えば、A2aR経路の阻害剤、例えば、アデノシン阻害剤、例えば、A2aRまたはCD−73の阻害剤)を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌の処置に使用する。ある実施態様において、癌は肺癌、例えば、非小細胞肺癌である。
ある実施態様において、A2aRアンタゴニストはイストラデフィリン(CAS Registry Number: 155270-99-8)である。イストラデフィリンはKW−6002または8−[(E)−2−(3,4−ジメトキシフェニル)ビニル]−1,3−ジエチル−7−メチル−3,7−ジヒドロ−1H−プリン−2,6−ジオンとしても知られる。イストラデフィリンは、例えば、LeWitt et al. (2008) Annals of Neurology 63 (3): 295-302)に開示される。
ある実施態様において、A2aRアンタゴニストはトザデナント(Biotie)である。トザデナントはSYN115または4−ヒドロキシ−N−(4−メトキシ−7−モルホリン−4−イル−1,3−ベンゾチアゾール−2−イル)−4−メチルピペリジン−1−カルボキサミドとしても知られる。トザデナントはA2a受容体で内因性アデノシンの影響を遮断し、D2受容体でのドーパミンの効果増強およびmGluR5受容体でのグルタミン酸の効果阻害をもたらす。ある実施態様において、A2aRアンタゴニストはプレラデナント(CAS Registry Number: 377727-87-2)である。プレラデナントはSCH 420814または2−(2−フラニル)−7−[2−[4−[4−(2−メトキシエトキシ)フェニル]−1−ピペラジニル]エチル]7H−ピラゾロ[4,3−e][1,2,4]トリアゾロ[1,5−c]ピリミジン−5−アミンとしても知られる。プレラデナントは、アデノシンA2A受容体で強力かつ選択的アンタゴニストとして作用する薬物として開発された。
ある実施態様において、A2aRアンタゴニストはビパデナントである。ビパデナントはBIIB014、V2006または3−[(4−アミノ−3−メチルフェニル)メチル]−7−(フラン−2−イル)トリアゾロ[4,5−d]ピリミジン−5−アミンとしても知られる。例えば、ある実施態様において、A2aRアンタゴニストはPBF−509(Palobiofarma)である。例えば、ある実施態様において、A2aRアンタゴニスト、例えば、PBF−509は、約80mg、160mgまたは240mgの1日用量で投与される。
A2aRアンタゴニストの他の例は、例えば、ATL−444、MSX−3、SCH−58261、SCH−412,348、SCH−442,416、VER−6623、VER−6947、VER−7835、CGS−15943またはZM−241,385を含む。
ある実施態様において、A2aRアンタゴニストはA2aR経路アンタゴニスト(例えば、CD−73阻害剤、例えば、抗CD73抗体)であり、MEDI9447である。MEDI9447はCD73特異的モノクローナル抗体である。CD73によるアデノシンの細胞外産生のターゲティングは、アデノシンの免疫抑制性効果を低減させ得る。MEDI9447は、一定範囲の活性、例えば、CD73エクトヌクレオチダーゼ活性の阻害、AMP介在リンパ球抑制の軽減および同系腫瘍増殖の阻害を有することが報告された。MEDI9447は、腫瘍微小環境内で骨髄およびリンパ系両方の浸潤性白血球集団の変化を誘導できる。これらの変化は、例えば、CD8エフェクター細胞および活性化マクロファージ増加、ならびに骨髄由来サプレッサー細胞(MDSC)および制御性Tリンパ球の割合の減少を含む。
腫瘍溶解性ウイルス例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物は腫瘍溶解性ウイルスを含む。ある実施態様において、腫瘍溶解性ウイルスは、癌細胞で選択的に複製し、その死亡または増殖遅延を誘発することができる。ある場合、腫瘍溶解性ウイルスは非癌細胞に効果を有さず、または効果は最小限である。腫瘍溶解性ウイルスは、腫瘍溶解性アデノウイルス、腫瘍溶解性単純ヘルペスウイルス、腫瘍溶解性レトロウイルス、腫瘍溶解性パルボウイルス、腫瘍溶解性ワクシニアウイルス、腫瘍溶解性シンドビスウイルス、腫瘍溶解性インフルエンザウイルスまたは腫瘍溶解性RNAウイルス(例えば、腫瘍溶解性レオウイルス、腫瘍溶解性ニューカッスル病ウイルス(NDV)、腫瘍溶解性麻疹ウイルスまたは腫瘍溶解性水胞性口炎ウイルス(VSV))を含むが、これらに限定されない。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌の処置に使用する。ある実施態様において、癌は脳癌、例えば、神経膠芽腫である。
ある実施態様において、腫瘍溶解性ウイルスは、ウイルス、例えば、全体を引用により本明細書に包含させるUS2010/0178684A1号に記載の組み換え腫瘍溶解性ウイルスである。ある実施態様において、組み換え腫瘍溶解性ウイルスは、例えば、全体を引用により本明細書に包含させるUS2010/0178684A1号に記載の、免疫または炎症性応答の阻害剤を含むかまたはそれをコードする核酸配列(例えば、異種核酸配列)を含む。ある実施態様において、組み換え腫瘍溶解性ウイルス、例えば、腫瘍溶解性NDVは、アポトーシス促進性タンパク質(例えば、アポプチン)、サイトカイン(例えば、GM−CSF、CSF、インターフェロン−ガンマ、インターロイキン−2(IL−2)、腫瘍壊死因子−アルファ)、免疫グロブリン(例えば、ED−Bフィブロネクチンに対する抗体)、腫瘍関連抗原、二特異的アダプタータンパク質(例えば、二特異的抗体またはNDV HNタンパク質に対する抗体フラグメントおよびCD3またはCD28のようなT細胞共刺激性受容体またはヒトIL−2とNDV HNタンパク質に対する一本鎖抗体の融合体タンパク質)を含むかまたはそれをコードする核酸配列を含む。例えば、引用により全体を本明細書に包含させるZamarin et al. Future Microbiol. 7.3(2012):347-67参照。ある実施態様において、腫瘍溶解性ウイルスは、US8591881B2号、US2012/0122185A1号またはUS2014/0271677A1号に記載のキメラ腫瘍溶解性NDVであり、この各々をその全体を引用により本明細書に包含させる。
ある実施態様において、腫瘍溶解性ウイルスは、癌細胞で排他的に複製するように設計された制限増殖型アデノウイルス(CRAd)である。例えば、Alemany et al. Nature Biotechnol. 18(2000):723-27参照。ある実施態様において、腫瘍溶解性アデノウイルスは、全体を引用により本明細書に包含させる、Alemany et al.の725頁の表1に記載のものを含む。
腫瘍溶解性ウイルスの例は、次のものを含むが、これらに限定されない。
B群腫瘍溶解性アデノウイルス(ColoAd1)(PsiOxus Therapeutics Ltd.)(例えば、Clinical Trial Identifier: NCT02053220参照);
顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)含有アデノウイルスであるONCOS−102(以前はCGTG−102と呼ばれた)(Oncos Therapeutics)(例えば、Clinical Trial Identifier: NCT01598129参照);
ヒトPH20ヒアルロニダーゼをコードする遺伝子修飾腫瘍溶解性ヒトアデノウイルスであるVCN−01(VCN Biosciences, S.L.)(例えば、Clinical Trial Identifiers: NCT02045602およびNCT02045589参照);
脱調節網膜芽細胞腫/E2F経路を有する癌細胞で選択的に複製するよう修飾されている野生型ヒトアデノウイルス血清型5(Had5)由来ウイルスである制限増殖型アデノウイルスICOVIR−5(Institut Catala d'Oncologia)(例えば、Clinical Trial Identifier: NCT01864759参照);
腫瘍溶解性アデノウイルスICOVIR5に感染させた骨髄由来自己間葉性幹細胞(MSCs)を含むCelyvir(Hospital Infantil Universitario Nino Jesus, Madrid, Spain/ Ramon Alemany)(例えば、Clinical Trial Identifier: NCT01844661参照);
ヒトE2F−1プロモーターが必須E1aウイルス遺伝子の発現を駆動し、それによりRb経路欠損腫瘍細胞へのウイルス複製および細胞毒性を制限する、条件的に複製する腫瘍溶解性血清型5アデノウイルス(Ad5)であるCG0070(Cold Genesys, Inc.)(see、例えば、Clinical Trial Identifier: NCT02143804);または
網膜芽細胞腫(Rb)経路欠損細胞において選択的に複製し、あるRGD結合インテグリンを発現する細胞により効率的に感染するように改変されているアデノウイルスであるDNX−2401(以前の名称デルタ−24−RGD)(Clinica Universidad de Navarra, Universidad de Navarra/DNAtrix, Inc.)(例えば、Clinical Trial Identifier: NCT01956734参照)。
ある実施態様において、ここに記載する腫瘍溶解性ウイルスを注射、例えば、皮下、動脈内、静脈内、筋肉内、髄腔内または腹腔内注射により投与する。ある実施態様において、ここに記載する腫瘍溶解性ウイルスを腫瘍内、経皮、経粘膜、経口、鼻腔内または肺投与により投与する。
ワクチン、例えば、足場ワクチン例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はワクチン、例えば、足場ワクチンを含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌の処置に使用する。
癌ワクチンは、例えば、PCT公開WO2007/070660号およびWO2012/167230号、EP1960009B1号、米国特許US8,067,237号およびUS8,932,583号および米国公開US2011/0020216号に記載されている。癌ワクチン内で使用できる成分(例えば、インプラント可能足場材)は、例えば、PCT公開WO2009/102465号およびWO2013/106852号に開示されている。癌ワクチンの投与に使用できる方法は、例えば、PCT公開WO2013/158673号、WO2012/048165号およびWO2012/149358号に開示されている。
ある実施態様において、癌ワクチンは、(i)細胞または細胞動員組成物および(ii)細胞の遊走を誘発または促進することができる配置シグナルおよび(iii)足場に動員された細胞の修飾をもたらす、足場上/内に被覆または播種された生理活性組成物を含むマクロ多孔性足場を含む。修飾細胞の遊走は、開放された、相互接続マクロ孔および配置シグナルにより促進され得る。
ある実施態様において、癌ワクチンは、動員組成物および標的抗原組成物を担持する多孔性足場の投与により癌標的への内因性免疫応答を誘発し、ここで、内因性抗原提示細胞は、抗原に遭遇するために足場に動員され、そこで、該細胞は、配置シグナルが足場外のリンパ節組織への放出を誘発するまで残存し、それにより該癌標的への内因性免疫応答を刺激する。
ある実施態様において、癌ワクチンを、足場組成物を使用して哺乳動物から標的細胞を除去するのに使用する。
ある実施態様において、インサイチュ癌ワクチンを、癌細胞のインプラントした足場への動員および細胞毒性剤を使用する細胞の破壊により産生する。
ある実施態様において、シトシン−グアノシンオリゴヌクレオチド(CpG−ODN)を足場の成分として使用し、これは足場に動員された樹状細胞を効率的に再プログラムおよび配置し、有効な抗腫瘍応答を産生できる。
ある実施態様において、ポリイノシン−ポリシチジル酸(ポリI:C)および/またはCpG ODNを、腫瘍阻害に対する相乗効果を発揮させるために使用する。
ある実施態様において、免疫細胞動員化合物(例えばGM−CSF)および免疫細胞活性化化合物(例えばCpG ODN)を含み、場合により腫瘍ライセートのような抗原を含む多孔性棒を、例えば、ワクチン抗原に対する免疫応答の惹起に使用する。ある実施態様において、細胞の動員または放出を促進する孔は、ハイドロゲル注射後ハイドロゲル内でインサイチュで形成される。ある実施態様において、注射可能形状記憶多孔性ハイドロゲルポリマーを投与に使用する。
他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物は、癌または腫瘍ワクチンを含む。使用できる腫瘍ワクチンの非限定的例は、gp100のペプチドのような黒色腫抗原のペプチド、MAGE抗原、Trp−2、MART1および/またはチロシナーゼ、サイトカインGM−CSFを発現するようにトランスフェクトされた腫瘍細胞、DNAベースのワクチン、RNAベースのワクチンおよびウイルス伝達ベースのワクチンを含む。癌ワクチンは、予防的でも治療的でもよい。
腫瘍に対するワクチン接種の多くの実験的戦略が考案されている(Rosenberg, S., 2000, Development of Cancer Vaccines, ASCO Educational Book Spring: 60-62; Logothetis, C., 2000, ASCO Educational Book Spring: 300-302; Khayat, D. 2000, ASCO Educational Book Spring: 414-428; Foon, K. 2000, ASCO Educational Book Spring: 730-738; see also Restifo, N. and Sznol, M., Cancer Vaccines, Ch. 61, pp. 3023-3043 in DeVita, V. et al. (eds.), 1997, Cancer: Principles and Practice of Oncology. Fifth Edition参照)。これらの戦略の一つにおいて、ワクチンが自己または同種腫瘍細胞を使用して産生されている。これらの細胞性ワクチンは、腫瘍細胞がGM−CSFを発現するように形質導入されているとき、最も有効であることが示されている。GM−CSFは、腫瘍ワクチン接種のための抗原提示の強力なアクティベーターであることが示されている(Dranoff et al. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 3539-43)。
ここに開示する組み合わせ物、例えば、PD−1遮断を、腫瘍で発現される組み換えタンパク質および/またはペプチドのコレクションに対する免疫応答を産生するために、これらのタンパク質と共に使用できる。これらのタンパク質は、通常免疫系により自己抗原として見られ、それ故に、それらに対して寛容である。腫瘍抗原はまたタンパク質テロメラーゼも含むことがあり、これは、染色体のテロメアの合成に必要であり、85%を超えるヒト癌においておよび限られたわずかな数の体性組織において発現される(Kim, N et al. (1994) Science 266: 2011-2013)。(これらの体性組織は、種々の手段で免疫攻撃から保護され得る)。腫瘍抗原はまたタンパク質配列を変えるまたは2つの無関係な配列間の融合体タンパク質を産生する(すなわちフィラデルフィア染色体におけるbcr−abl)体性変異またはB細胞腫瘍からのイディオタイプにより、癌細胞において発現される“ネオ抗原”でもあり得る。
他の腫瘍ワクチンは、ヒト乳頭腫ウイルス(HPV)、肝炎ウイルス(HBVおよびHCV)、カポジヘルペス肉腫ウイルス(KHSV)およびエプスタイン・バーウイルス(EBV)のようなヒト癌と関連付けられているウイルス由来のタンパク質を含み得る。PD−1遮断と組み合わせて使用し得る他の形態の腫瘍特異的抗原は、腫瘍組織自体から単離された精製ヒートショックタンパク質(HSP)である。これらのヒートショックタンパク質は、腫瘍細胞からのタンパク質のフラグメントを含み、これらのHSPは、腫瘍免疫惹起のために抗原提示細胞に送達されるのが高度に効率的である(Suot, R & Srivastava, P (1995) Science 269:1585-1588; Tamura, Y. et al. (1997) Science 278:117-120)。
樹状細胞(DC)は、抗原特異的応答の誘発に使用できる強力な抗原提示細胞である。DCはエクスビボで産生され、種々のタンパク質およびペプチド抗原ならびに腫瘍細胞抽出物を積載し得る(Nestle, F. et al. (1998) Nature Medicine 4: 328-332)。DCはまた同様にこれらの腫瘍抗原を発現するために遺伝的手段によっても形質導入され得る。DCはまた免疫化の目的で腫瘍細胞に直接融合もされている(Kugler, A. et al. (2000) Nature Medicine 6:332-336)。ワクチン接種の方法として、DC免疫化を、より強力な抗腫瘍応答を活性化するために、他の薬剤、例えば、PD−1遮断と、効果的に組み合わせ得る。
二特異的T細胞アンガジェ例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物は二特異的T細胞アンガジェを含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、消化器癌、黒色腫または肺癌)または血液系腫瘍(例えば、リンパ腫(例えば、非ホジキンリンパ腫)または白血病(例えば、急性リンパ芽球性白血病)の処置に使用する。
二特異的T細胞アンガジェ(BiTE(登録商標))は、癌細胞に対する宿主免疫系、例えば、T細胞の細胞毒性活性を指示できる、人工的二特異的モノクローナル抗体のクラスである。二特異的T細胞アンガジェは、T細胞と腫瘍細胞の間に連結を形成でき、これにより、MHC Iまたは共刺激性分子の存在とは無関係に、パーフォリンおよびグランザイムのようなタンパク質を産生することにより、T細胞の腫瘍細胞に対する細胞毒性活性が発揮される。これらのタンパク質は腫瘍細胞に入り、細胞アポトーシスを開始させる。この作用は、腫瘍細胞に対するT細胞攻撃の間に見られる生理学的過程を模倣する。
ある実施態様において、二特異的T細胞アンガジェは、異なる抗体の2つの一本鎖可変フラグメント(scFvs)を含む融合体タンパク質である。ある実施態様において、scFvsの一方は、例えば、CD3受容体を介して、T細胞に結合し、他方は、例えば、腫瘍特異的分子を介して、腫瘍細胞に結合する。
ある実施態様において、二特異的T細胞アンガジェは、NKG2AおよびCD138の二特異的抗体分子またはCD3およびTCRの二特異的抗体分子である。ある実施態様において、二特異的T細胞アンガジェは、CD3および腫瘍抗原(例えば、とりわけEGFR、PSCA、PSMA、EpCAM、HER2)に結合する二特異的抗体分子である。
ある実施態様において、二特異的T細胞アンガジェは、ブリナツモマブ(CAS Registry Number: 853426-35-4)である。ブリナツモマブはMT103としても知られる。ブリナツモマブは、T細胞についてはCD3部位およびB細胞についてはCD19部位を特異的に標的とする。
ある実施態様において、二特異的T細胞アンガジェはMT110である。MT110は、EpCAMおよびCD3を標的とする一本鎖抗体である。MT110は、例えば、Amann et al. J Immunother. 2009;32(5):452-64に記載される。
ある実施態様において、二特異的T細胞アンガジェは、黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)を標的とする。ある実施態様において、二特異的T細胞アンガジェはCD33を標的とする。ある実施態様において、二特異的T細胞アンガジェはトラスツズマブ(HER2/neuターゲティング)、セツキシマブまたはパニツムマブ(両者ともEGF受容体ターゲティング)、その機能的フラグメントを含む。ある実施態様において、二特異的T細胞アンガジェはCD66eおよびEphA2を標的とする。
GITRアゴニスト例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はGITRアゴニストを含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍または血液系腫瘍の処置に使用する。ある実施態様において、癌は肺癌(例えば、非小細胞肺癌)、頭頸部癌またはFoxP3発現癌である。
GITRアゴニストの例は、米国特許6,111,090号、欧州特許0920505B1号、米国特許8,586,023号、PCT公開WO2010/003118号および2011/090754号に記載のGITR融合体タンパク質または、例えば、米国特許7,025,962号、欧州特許1947183B1号、米国特許7,812,135号、米国特許8,388,967号、米国特許8,591,886号、欧州特許EP1866339号、PCT公開WO2011/028683号、米国特許8,709,424号、PCT公開WO2013/039954号、国際公開WO2013/039954号、米国公開US2014/0072566号、国際公開WO2015/026684号、PCT公開WO2005/007190号、PCT公開WO2007/133822号、PCT公開WO2005/055808号、PCT公開WO99/40196号、PCT公開WO2001/03720号、PCT公開WO99/20758号、米国特許6,689,607号、PCT公開WO2006/083289号、PCT公開WO2005/115451号、米国特許7,618,632号、PCT公開WO2011/051726号、国際公開WO2004/060319号および国際公開WO2014/012479号に記載の抗GITR抗体のような、例えば、GITR融合体タンパク質および抗GITR抗体(例えば、二価抗GITR抗体)を含む。
ある実施態様において、GITRアゴニストを、例えば、WO2015/026684号に記載のPD−1阻害剤と組み合わせて使用する。
他の実施態様において、GITRアゴニストを、例えば、WO2004/060319号および国際公開WO2014/012479号に記載のTLRアゴニストと組み合わせて使用する。。
PD−1阻害剤の例
PD−1は、例えば、活性化CD4およびCD8 T細胞、TregおよびB細胞に発現される、CD28/CTLA−4ファミリーメンバーである。これは、エフェクターT細胞シグナル伝達および機能を負に制御する。PD−1は腫瘍浸潤性T細胞で誘発され、機能的消耗または機能不全を引き起こし得る(Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704; Pardoll et al. (2012) Nat Rev Cancer 12(4):252-64)。PD−1は、その二つのリガンド、プログラム死−リガンド1(PD−L1)またはプログラム死−リガンド2(PD−L2)の何れかへの結合により、共阻害性シグナルを送達する。PD−L1は、T細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、マクロファージ、樹状細胞(DCs)、B細胞、上皮性細胞、血管内皮細胞を含む多数の細胞型ならびに多くのタイプの腫瘍で発現される。マウスおよびヒト腫瘍におけるPD−L1の高発現は、多様な癌で悪い臨床成績と結びつけられている(Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704; Pardoll et al. (2012) Nat Rev Cancer 12(4):252-64)。PD−L2は樹状細胞、マクロファージおよび一部の腫瘍で発現される。PD−1経路の遮断が、癌免疫療法について前臨床的および臨床的に評価されている。前臨床および臨床試験の両方とも、抗PD−1遮断がエフェクターT細胞の活性を回復でき、強固な抗腫瘍応答をもたらすことが示されている。例えば、PD−1経路の遮断は、消耗/機能不全のエフェクターT細胞機能(例えば、増殖、IFN−γ分泌または細胞溶解性機能)を回復するおよび/またはTreg細胞機能を阻害することができる(Keir et al. (2008) Annu. Rev. Immunol. 26:677-704; Pardoll et al. (2012) Nat Rev Cancer 12(4):252-64)。PD−1経路の遮断は、PD−1、PD−L1および/またはPD−L2の抗体、抗原結合そのフラグメント、免疫アドヘシン、融合体タンパク質またはオリゴペプチドで実施され得る。
ここで使用する用語“プログラム死1”または“PD−1”は、アイソフォーム、哺乳動物、例えば、ヒトPD−1、ヒトPD−1の種ホモログおよびPD−1と少なくとも1共通エピトープを含むアナログを含む。PD−1、例えば、ヒトPD−1のアミノ酸配列は当分野で、例えば、Shinohara T et al. (1994) Genomics 23(3):704-6; Finger LA, et al. Gene (1997) 197(1-2):177-87で知られる。
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物は、PD−1阻害剤、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子(例えば、ヒト化抗体分子)を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子(例えば、単離または組み換え抗体分子)は、次の性質の1以上を有する。
(i)PD−1、例えば、ヒトPD−1に、高親和性で、例えば、少なくとも約10−1、一般に約10−1およびより一般に、約10−1〜1010−1またはそれより強い親和性定数で結合する;
(ii)CD28、CTLA−4、ICOSまたはBTLAに実質的に結合しない;
(iii)PD−1のPD−1リガンド、例えば、PD−L1またはPD−L2への結合または両方を阻害または減少する;
(iv)PD−1のエピトープ、例えば、マウスモノクローナル抗体BAP049またはキメラ抗体BAP049、例えば、BAP049−chiまたはBAP049−chi−Yにより認識されるエピトープと同じまたは類似のエピトープに特異的に結合する;
(v)BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかと同じまたは類似の結合親和性または特異性または両方を示す;
(vi)表1に記載する抗体分子(例えば、重鎖可変領域および軽鎖可変領域)と同じまたは類似の結合親和性または特異性または両方を示す;
(vii)表1に示すアミノ酸配列を有する抗体分子(例えば、重鎖可変領域および軽鎖可変領域)と同じまたは類似の結合親和性または特異性または両方を示す;
(viii)表1に示すヌクレオチド配列によりコードされる抗体分子(例えば、重鎖可変領域および軽鎖可変領域)と同じまたは類似の結合親和性または特異性または両方を示す;
(ix)第二抗体分子のPD−1への結合を阻害、例えば、完全に阻害し、ここで、第二抗体分子は、ここに記載する抗体分子、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される、例えば、抗体分子である;
(x)PD−1への第二抗体分子と同じまたは重複エピトープに結合し、ここで、第二抗体分子はここに記載する抗体分子、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される、例えば、抗体分子である;
(xi)PD−1への第二抗体分子と結合を競合するおよび/または同じエピトープに結合し、ここで、第二抗体分子はここに記載する抗体分子、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される、例えば、抗体分子である;
(xii)ここに記載する抗体分子、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される、例えば、抗体分子の1以上の生物学的性質を有する;
(xiii)ここに記載する抗体分子、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される、例えば、抗体分子の1以上の薬物動態性質を有する;
(xiv)PD−1の1以上の活性を阻害する、例えば、腫瘍浸潤性リンパ球増加、T細胞受容体介在増殖増加または癌性細胞による免疫回避減少の1以上をもたらす;
(xv)ヒトPD−1に結合し、カニクイザルPD−1と交差反応性である;
(xvi)PD−1のC鎖、CC’ループ、C’鎖またはFGループまたはPD−1のC鎖、CC’ループ、C’鎖またはFGループの2、3または全ての組み合わせ内の1以上の残基と結合し、例えば、ここで、結合をELISAまたはBiacoreを使用してアッセイする;または
(xvii)PD−1への結合にVH領域よりも貢献するVL領域を有する。
ある実施態様において、抗体分子は、PD−1に高親和性で、例えば、マウスまたはキメラ抗PD−1抗体分子、例えば、ここに記載するマウスまたはキメラ抗PD−1抗体分子のKとほぼ同じまたは少なくとも約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%または90%高いまたは低いKで結合する。ある実施態様において、マウスまたはキメラ抗PD−1抗体分子のKは、例えば、Biacore方法により測定して、約0.4nM、0.3nM、0.2nM、0.1nMまたは0.05nM未満である。ある実施態様において、マウスまたはキメラ抗PD−1抗体分子のKは約0.2nM未満、例えば、約0.135nMである。他の実施態様において、マウスまたはキメラ抗PD−1抗体分子のKは、例えば、PD−1発現細胞(例えば、300.19細胞)への結合により測定して、約10nM、5nM、3nM、2nMまたは1nMである。ある実施態様において、マウスまたはキメラ抗PD−1抗体分子のKは約5nM未満、例えば、約4.60nM(または約0.69μg/mL)である。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、PD−1に1×10−4−1、5×10−5−1または1×10−5−1より遅いKoff、例えば、約1.65×10−5−1で結合する。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、PD−1に、1×10−1−1、5×10−1−1、1×10−1−1または5×10−1−1、例えば、約1.23×10−1−1より速いKonで結合する。
ある実施態様において、抗体分子の発現レベルは、マウスまたはキメラ抗体分子、例えば、ここに記載するマウスまたはキメラ抗PD−1抗体分子の発現レベルより高い、例えば、少なくとも約0.5、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10倍高い。ある実施態様において、抗体分子はCHO細胞で発現される。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、1以上のPD−1関連活性を、マウスまたはキメラ抗PD−1抗体分子、例えば、ここに記載するマウスまたはキメラ抗PD−1抗体分子のIC50(50%阻害阻害濃度)とほぼ同じまたは低い、例えば、少なくとも約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%または90%低いIC50で阻害する。ある実施態様において、マウスまたはキメラ抗PD−1抗体分子のIC50は、例えば、PD−1発現細胞(例えば、300.19細胞)への結合により測定して、約6nM、5nM、4nM、3nM、2nMまたは1nM未満である。ある実施態様において、マウスまたはキメラ抗PD−1抗体分子のIC50は、約4nM未満、例えば、約3.40nM(または約0.51μg/mL)である。ある実施態様において、低減されるPD−1関連活性は、PD−L1および/またはPD−L2のPD−1への結合である。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ブドウ球菌エンテロトキシンB(SEB)により活性化された末梢血単核細胞(PBMCs)に結合する。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、SEBにより活性化された全血のIL−2の発現を増加させる。例えば、抗PD−1抗体は、アイソタイプ対照(例えば、IgG4)を使用したときのIL−2の発現と比較して、IL−2の発現を少なくとも約2倍、3倍、4倍または5倍増加させる。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、マウスまたはキメラ抗PD−1抗体分子、例えば、ここに記載するマウスまたはキメラ抗PD−1抗体分子と比較して、安定性が改善される、例えば、インビボまたはインビトロで少なくとも約0.5倍、1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍または10倍安定である。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はヒト化抗体分子であり、T細胞エピトープ分析に基づく300〜700、400〜650、450〜600のリスクスコアまたはここに記載するリスクスコアを有する。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものからの、少なくとも1つの抗原結合領域、例えば、可変領域またはその抗原結合フラグメントを含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものからの、少なくとも1、2、3または4の可変領域を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものからの、少なくとも1または2重鎖可変領域を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものからの、少なくとも1または2軽鎖可変領域を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、IgG4、例えば、ヒトIgG4の重鎖定常領域を含む。ある実施態様において、ヒトIgG4は、EUナンバリングによる228位に置換を含む(例えば、SerからPro置換)。さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、IgG1、例えば、ヒトIgG1の重鎖定常領域を含む。ある実施態様において、ヒトIgG1は、EUナンバリングによる297位に置換を含む(例えば、AsnからAla置換)。ある実施態様において、ヒトIgG1はEUナンバリングによる265位の置換、EUナンバリングによる329位の置換または両方を含む(例えば、265位のAspからAla置換および/または329位のProからAla置換)。ある実施態様において、ヒトIgG1はEUナンバリングによる234位の置換、EUナンバリングによる235の置換または両方を含む(例えば、234位のLeuからAla置換および/または235位のLeuからAla置換)。ある実施態様において、重鎖定常領域は、表3に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、カッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒトカッパ軽鎖定常領域を含む。ある実施態様において、軽鎖定常領域は、表3に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、IgG4、例えば、ヒトIgG4の重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒト例えば、表3に示す、カッパ軽鎖定常領域アミノ酸配列またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む重鎖および軽鎖定常領域を含む。ある実施態様において、ヒトIgG4は、EUナンバリングによる228位に置換を含む(例えば、SerからPro置換)。さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、IgG1、例えば、ヒトIgG1の重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域、例えば、ヒト例えば、表3に示す、カッパ軽鎖定常領域アミノ酸配列またはそれと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む重鎖および軽鎖定常領域を含む。ある実施態様において、ヒトIgG1は、EUナンバリングによる297位に置換を含む(例えば、AsnからAla置換)。ある実施態様において、ヒトIgG1はEUナンバリングによる265位の置換、EUナンバリングによる329位の置換または両方を含む(例えば、265位のAspからAla置換および/または329位のProからAla置換)。ある実施態様において、ヒトIgG1はEUナンバリングによる234位の置換、EUナンバリングによる235の置換または両方を含む(例えば、234位のLeuからAla置換および/または235位のLeuからAla置換)。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eのアミノ酸配列または表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものを含む、重鎖可変ドメインおよび定常領域、軽鎖可変ドメインおよび定常領域または両方を含む。抗PD−1抗体分子は、場合により、表4に示す重鎖、軽鎖または両方からのリーダー配列またはそれに実質的に同一の配列を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものの重鎖可変領域からの少なくとも1、2または3の相補性決定領域(CDR)を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載するまたは表1におけるヌクレオチド配列または前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるものの軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDRを含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、軽鎖CDRに置換、例えば、軽鎖のCDR1、CDR2および/またはCDR3に1以上の置換を含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、軽可変領域の102位の軽鎖CDR3に置換、例えば、表1による軽可変領域の102位に、システイン残基からチロシン残基またはシステイン残基からセリン残基への置換を含む(例えば、マウスまたはキメラについて配列番号16または24または修飾配列について配列番号34、42、46、54、58、62、66、70、74または78の何れか)。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1、2、3、4、5または6のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載するまたは表1におけるヌクレオチド配列によりコードされるものからの全6CDRまたは密接に関係するCDR、例えば、同一であるかまたは少なくとも1アミノ酸改変があるが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が2、3または4を超えないCDRを含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載するあらゆるCDRを含み得る。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、軽鎖CDRに置換、例えば、軽鎖のCDR1、CDR2および/またはCDR3に1以上の置換を含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、軽可変領域の102位の軽鎖CDR3に置換、例えば、表1による軽可変領域の102位に、システイン残基からチロシン残基またはシステイン残基からセリン残基への置換を含む(例えば、マウスまたはキメラについて配列番号16または24または修飾配列について配列番号34、42、46、54、58、62、66、70、74または78の何れか)。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の重鎖可変領域からのKabat et al.による少なくとも1、2または3のCDR(例えば、表1に示すKabat定義に従う少なくとも1、2または3のCDR)を含むまたは表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるまたは表1に示すKabat et al.による1、2または3CDRに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が2、3または4を超えないものを含む。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の軽鎖可変領域からのKabat et al.による少なくとも1、2または3のCDR(例えば、表1に示すKabat定義に従う少なくとも1、2または3のCDR)を含むまたは表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるまたは表1に示すKabat et al.による1、2または3CDRに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が2、3または4を超えないものを含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのKabat et al.による少なくとも1、2、3、4、5または6のCDR(例えば、表1に示すKabat定義に従う少なくとも1、2、3、4、5または6のCDR)を含むまたは表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるまたは表1に示すKabat et al.による1、2、3、4、5または6CDRに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が2、3または4を超えないものを含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の重鎖および軽鎖可変領域からのKabat et al.による全6CDR(例えば、表1に示すKabat定義に従う全6CDR)を含むまたは表1に記載されるまたは表1におけるヌクレオチド配列もしくは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるまたは表1に示すKabat et al.による全6CDRに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が2、3または4を超えないものを含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載するあらゆるCDRを含み得る。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の重鎖可変領域からの少なくとも1、2または3Chothia超可変ループ(例えば、表1に示すChothia定義に従う少なくとも1、2または3超可変ループ)を含むまたは表1に記載するまたは表1におけるヌクレオチド配列によりコードされるものまたは少なくともPD−1と接触する超可変ループからのアミノ酸または表1に示すChothia et al.による1、2または3超可変ループに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が2、3または4を超えないものを含む。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の軽鎖可変領域の少なくとも1、2または3Chothia超可変ループ(例えば、表1に示すChothia定義に従う少なくとも1、2または3超可変ループ)を含むまたは表1に記載するまたは表1におけるヌクレオチド配列によりコードされるものまたは少なくともPD−1と接触する超可変ループからのアミノ酸または表1に示すChothia et al.による1、2または3超可変ループに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が2、3または4を超えないものを含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1、2、3、4、5または6の超可変ループ(例えば、表1に示すChothia定義に従う少なくとも1、2、3、4、5または6の超可変ループ)を含むまたは表1に記載するまたは表1におけるヌクレオチド配列によりコードされるものまたは少なくともPD−1と接触する超可変ループからのアミノ酸または表1に示すChothia et al.による1、2、3、4、5または6超可変ループに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が2、3または4を超えないものを含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の全6超可変ループ(例えば、表1に示すChothia定義に従う全6超可変ループ)または密接に関係する超可変ループ、例えば、表1に示すChothia et al.による全6超可変ループと同一であるかまたは少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が2、3または4を超えないまたは少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が2、3または4を超えない超可変ループを含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はここに記載するあらゆる超可変ループを含み得る。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の対応する超可変ループと同じ標準構造、例えば、ここに記載する抗体の重および/または軽鎖可変ドメインの少なくともループ1および/またはループ2と同じ標準構造を含むを有する少なくとも1、2または3超可変ループ。超可変ループ標準構造の記載について、例えば、Chothia et al., (1992) J. Mol. Biol. 227:799-817; Tomlinson et al., (1992) J. Mol. Biol. 227:776-798参照。これらの構造は、これらの参考文献に記載された表の精査により決定され得る。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、Kabat et al.およびChothia et al.により定義されたCDRまたは超可変ループの組み合わせを含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の重鎖可変領域からの、KabatおよびChothia定義に従う少なくとも1、2または3のCDRまたは超可変ループ(例えば表1に示すKabatおよびChothia定義に従う少なくとも1、2または3のCDRまたは超可変ループ)または表1におけるヌクレオチド配列または前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列によりコードされるまたは表1に示すKabatおよび/またはChothiaに従う1、2または3CDRまたは超可変ループに対して少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が2、3または4を超えないものを含む。
例えば、抗PD−1抗体分子は、例えば、表1に示す、Kabat et al.によるVH CDR1またはChothia et al.によるVH超可変ループ1またはこれらの組み合わせを含み得る。ある実施態様において、VH CDR1のKabatおよびChothia CDRの組み合わせは、アミノ酸配列GYTFTTYWMH(配列番号224)またはそれに実質的に同一のアミノ酸配列(例えば、少なくとも1アミノ酸改変を有するが、改変(例えば、置換、欠失または挿入、例えば、保存的置換)が2、3または4を超えない)を含む。抗PD−1抗体分子は、さらに、例えば、表1に示す、例えば、Kabat et al.によるVH CDR 2〜3およびKabat et al.によるVL CDR 1〜3を含み得る。従って、ある実施態様において、フレームワーク領域は、Kabat et al.に従い定義されるCDRおよびChothia et al.に従い定義される超可変ループの組み合わせに基づき定義される。例えば、抗PD−1抗体分子は、例えば、表1に示す、Chothia et al.によるVH超可変ループ1に基づき定義されたVH FR1およびKabat et al.によるVH CDR 1〜2に基づき定義されたVH FR2を含み得る。抗PD−1抗体分子は、さらに、例えば、Kabat et al.によるVH CDR 2〜3に基づき定義されたVH FR 3〜4およびKabat et al.によるVL CDR 1〜3に基づき定義されたVL FR 1〜4を含み得る。
抗PD−1抗体分子は、KabatおよびChothia定義に従うCDRまたは超可変ループのあらゆる組み合わせを含み得る。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体の軽鎖可変領域からの、KabatおよびChothia定義に従う少なくとも1、2または3のCDR(例えば、表1に示すKabatおよびChothia定義に従う少なくとも1、2または3のCDR)を含む。
ある実施態様、例えば、可変領域、CDR(例えば、Chothia CDRまたはKabat CDR)またはここに、例えば、表1に記載する他の配列を含む実施態様において、抗体分子は、単特異的抗体分子、二特異的抗体分子であるかまたは抗体の抗原結合フラグメント、例えば、半抗体または半抗体の抗原結合フラグメントを含む抗体分子である。ある実施態様において、抗体分子は、PD−1に対する第一結合特異性およびTIM−3、LAG−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1および/またはCEACAM−5)、PD−L1またはPD−L2に対する第二結合特異性を有する二特異的抗体分子である。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は
(a)配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
(b)配列番号1から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;
(c)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;または
(d)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL
を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、配列番号1のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVLを含む。
ある実施態様において、抗体分子はヒト化抗体分子である。他の実施態様において、抗体分子は単特異的抗体分子である。さらに他の実施態様において、抗体分子は二特異的抗体分子である。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、
(i)配列番号1、配列番号4または配列番号224から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列;および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および
(ii)配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、
(i)配列番号1、配列番号4または配列番号224から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および
(ii)配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、配列番号1のVHCDR1アミノ酸配列を含む。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列を含む。さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子の軽鎖または重鎖可変フレームワーク(例えば、少なくともFR1、FR2、FR3および場合によりFR4を包含する領域)は、(a)ヒト軽鎖または重鎖可変フレームワーク、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列またはヒトコンセンサス配列からの軽鎖または重鎖可変フレームワーク残基からのアミノ酸の少なくとも80%、85%、87%90%、92%、93%、95%、97%、98%または好ましくは100%を含む軽鎖または重鎖可変フレームワーク、(b)ヒト軽鎖または重鎖可変フレームワーク、例えば、ヒト成熟抗体、ヒト生殖系列配列またはヒトコンセンサス配列からの軽鎖または重鎖可変フレームワーク残基からのアミノ酸残基の20%〜80%、40%〜60%、60%〜90%または70%〜95%を含む軽鎖または重鎖可変フレームワーク、(c)非ヒトフレームワーク(例えば、齧歯類フレームワーク)または(d)例えば、抗原性または細胞毒性決定基を除くため、修飾されている、例えば、脱免疫化または一部ヒト化されている、非ヒトフレームワークから選択され得る。ある実施態様において、軽鎖または重鎖可変フレームワーク領域(特にFR1、FR2および/またはFR3)は、ヒト生殖系列遺伝子のVLまたはVHセグメントのフレームワークと少なくとも70%、75%、80%、85%、87%、88%、90%、92%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一または同一である軽鎖または重鎖可変フレームワーク配列を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分は、BAP049−chi−HCのアミノ酸配列、例えば、図9A〜9Bまたは配列番号18、20、22または30に示す全可変領域におけるFR領域の、例えばアミノ酸配列から、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、10、15、20またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する重鎖可変ドメインを含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−chi−HCのアミノ酸配列、例えば、図9A〜9Bまたは配列番号18、20、22または30に示す全可変領域におけるFRの、例えばアミノ酸配列の1位のE、5位のV、9位のA、11位のV、12位のK、13位のK、16位のE、18位のL、19位のR、20位のIまたはV、24位のG、37位のI、40位のAまたはS、41位のT、42位のS、43位のR、48位のMまたはL、68位のVまたはF、69位のT、70位のI、71位のS、72位のAまたはR、74位のKまたはN、76位のTまたはK、77位のSまたはN、79位のL、81位のL、82位のEまたはQ、83位のM、84位のSまたはN、87位のR、88位のAまたは91位のTの1以上を有する重鎖可変ドメインを含む。
ここに記載するBAP049−chi−HCの重鎖置換とは別にまたはこれと組み合わせて、抗PD−1抗体分子は、BAP049−chi−LCのアミノ酸配列、例えば、図10A〜10Bまたは配列番号24または26に示すアミノ酸配列から、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、10、15、20またはそれ以上のアミノ酸変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する軽鎖可変ドメインを含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−chi−LCのアミノ酸配列、例えば、図10A〜10Bまたは配列番号24または26に示すアミノ酸配列の1位のE、2位のV、3位のQ、4位のL、7位のT、9位のDまたはLまたはA、10位のFまたはT、11位のQ、12位のSまたはP、13位のLまたはA、14位のS、15位のPまたはLまたはV、16位のK、17位のQまたはD、18位のR、19位のA、20位のS、21位のIまたはL、22位のT、43位のL、48位のK、49位のAまたはS、51位のRまたはQ、55位のY、64位のI、66位のSまたはP、69位のS、73位のY、74位のG、76位のE、79位のF、82位のN、83位のN、84位のLまたはI、85位のE、86位のSまたはP、87位のD、89位のAまたはFまたはI、91位のTまたはY、93位のFまたは102位のYの1以上を有する軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、1、2、3または4重鎖フレームワーク領域(例えば、表2に示すまたは表2に示すヌクレオチド配列によりコードされるVHFWアミノ酸配列)またはそれに実質的に同一の配列を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、1、2、3または4軽鎖フレームワーク領域(例えば、表2に示すまたは表2に示すヌクレオチド配列によりコードされるVLFWアミノ酸配列)またはそれに実質的に同一の配列を含む。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、1、2、3または4重鎖フレームワーク領域(例えば、表2に示すまたは表2に示すヌクレオチド配列によりコードされるVHFWアミノ酸配列)またはそれに実質的に同一の配列;および1、2、3または4軽鎖フレームワーク領域(例えば、表2に示すまたは表2に示すヌクレオチド配列によりコードされるVLFWアミノ酸配列)またはそれに実質的に同一の配列を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号147)の重鎖フレームワーク領域1(VHFW1)を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum14またはBAP049−hum15(例えば、配列番号151)の重鎖フレームワーク領域1(VHFW1)を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum09、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−CまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号153)の重鎖フレームワーク領域2(VHFW2)を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum08、BAP049−hum10、BAP049−hum14、BAP049−hum15またはBAP049−Clone−D(例えば、配列番号157)の重鎖フレームワーク領域2(VHFW2)を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum16(例えば、配列番号160)の重鎖フレームワーク領域2(VHFW2)を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum09、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−CまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号162)の重鎖フレームワーク領域3(VHFW3)を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum08、BAP049−hum10、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16またはBAP049−Clone−D(例えば、配列番号166)の重鎖フレームワーク領域3(VHFW3)を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号169)の重鎖フレームワーク領域4(VHFW4)を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum15、BAP049−hum16またはBAP049−Clone−C(例えば、配列番号174)の軽鎖フレームワーク領域1(VLFW1)を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum01、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum07、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum14、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号177)の軽鎖フレームワーク領域1(VLFW1)を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum06(例えば、配列番号181)の軽鎖フレームワーク領域1(VLFW1)を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum13(例えば、配列番号183)の軽鎖フレームワーク領域1(VLFW1)を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum02、BAP049−hum03またはBAP049−hum12(例えば、配列番号185)の軽鎖フレームワーク領域1(VLFW1)を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum06、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号187)の軽鎖フレームワーク領域2(VLFW2)を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum07、BAP049−hum13またはBAP049−Clone−C(例えば、配列番号191)の軽鎖フレームワーク領域2(VLFW2)を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum12(例えば、配列番号194)の軽鎖フレームワーク領域2(VLFW2)を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号196)の軽鎖フレームワーク領域3(VLFW3)を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum02またはBAP049−hum03(例えば、配列番号200)の軽鎖フレームワーク領域3(VLFW3)を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum01またはBAP049−Clone−A(例えば、配列番号202)の軽鎖フレームワーク領域3(VLFW3)を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum04、BAP049−hum05またはBAP049−Clone−B(例えば、配列番号205)の軽鎖フレームワーク領域3(VLFW3)を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号208)の軽鎖フレームワーク領域4(VLFW4)を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP−hum07、BAP049−hum09、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−CまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号153(VHFW2)および配列番号162(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum08、BAP049−hum10またはBAP049−Clone−D(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号157(VHFW2)および配列番号166(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum14またはBAP049−hum15(例えば、配列番号151(VHFW1)、配列番号157(VHFW2)および配列番号166(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum16(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号160(VHFW2)および配列番号166(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3を含む。ある実施態様において、抗体分子は、さらに、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号169)の重鎖フレームワーク領域4(VHFW4)を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、BAP049−hum01またはBAP049−Clone−A(例えば、配列番号177(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号202(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum02またはBAP049−hum03(例えば、配列番号185(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号200(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum04、BAP049−hum05またはBAP049−Clone−B(例えば、配列番号177(VLFW1)、配列番号191(VLFW2)および配列番号205(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum06(例えば、配列番号181(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum07(例えば、配列番号177(VLFW1)、配列番号191(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum15、BAP049−hum16またはBAP049−Clone−C(例えば、配列番号174(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum14、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号177(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum12(例えば、配列番号185(VLFW1)、配列番号194(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。ある実施態様において、抗体分子は、BAP049−hum13(例えば、配列番号183(VLFW1)、配列番号191(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。ある実施態様において、抗体分子は、さらに、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号208)の軽鎖フレームワーク領域4(VLFW4)を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum01またはBAP049−Clone−A(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号153(VHFW2)および配列番号162(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum01またはBAP049−Clone−A(例えば、配列番号177(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号202(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum02(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号153(VHFW2)および配列番号162(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum02(例えば、配列番号185(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号200(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum03(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号157(VHFW2)および配列番号166(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum03(例えば、配列番号185(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号200(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum04(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号157(VHFW2)および配列番号166(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum04(例えば、配列番号177(VLFW1)、配列番号191(VLFW2)および配列番号205(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum05またはBAP049−Clone−B(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号153(VHFW2)および配列番号162(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum05またはBAP049−Clone−B(例えば、配列番号177(VLFW1)、配列番号191(VLFW2)および配列番号205(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum06(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号153(VHFW2)および配列番号162(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum06(例えば、配列番号181(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum07(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号153(VHFW2)および配列番号162(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum07(例えば、配列番号177(VLFW1)、配列番号191(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum08(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号157(VHFW2)および配列番号166(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum08(例えば、配列番号174(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum09またはBAP049−Clone−C(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号153(VHFW2)および配列番号162(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum09またはBAP049−Clone−C(例えば、配列番号174(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum10またはBAP049−Clone−D(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号157(VHFW2)および配列番号166(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum10またはBAP049−Clone−D(例えば、配列番号177(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum11またはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号153(VHFW2)および配列番号162(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum11またはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号177(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum12(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号153(VHFW2)および配列番号162(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum12(例えば、配列番号185(VLFW1)、配列番号194(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum13(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号153(VHFW2)および配列番号162(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum13(例えば、配列番号183(VLFW1)、配列番号191(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum14(例えば、配列番号151(VHFW1)、配列番号157(VHFW2)および配列番号166(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum14(例えば、配列番号177(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum15(例えば、配列番号151(VHFW1)、配列番号157(VHFW2)および配列番号166(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum15(例えば、配列番号174(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はBAP049−hum16(例えば、配列番号147(VHFW1)、配列番号160(VHFW2)および配列番号166(VHFW3))の重鎖フレームワーク領域1〜3およびBAP049−hum16(例えば、配列番号174(VLFW1)、配列番号187(VLFW2)および配列番号196(VLFW3))の軽鎖フレームワーク領域1〜3を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、さらに、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号169)の重鎖フレームワーク領域4(VHFW4)およびBAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−E(例えば、配列番号208)の軽鎖フレームワーク領域4(VLFW4)を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、図5または7に示すフレームワーク領域FW1、FW2およびFW3の組み合わせを有する重鎖フレームワーク領域を含む。他の実施態様において、抗体分子は、図5または7に示すフレームワーク領域FW1、FW2およびFW3の組み合わせを有する軽鎖フレームワーク領域を含む。さらに他の実施態様において、抗体分子は、図5または7に示すフレームワーク領域FW1、FW2およびFW3の組み合わせを有する重鎖フレームワーク領域および図5または7に示すフレームワーク領域FW1、FW2およびFW3の組み合わせを有する軽鎖フレームワーク領域を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子の重鎖または軽鎖可変ドメインまたは両方は、ここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体または表1に記載するまたは表1におけるヌクレオチド配列によりコードされるものの可変領域と、ここに開示するアミノ酸と実質的に同一、例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一であるアミノ酸配列またはここに記載する抗体の可変領域と少なくとも1または5残基異なるが、40、30、20または10残基未満異なるものを含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子の重鎖または軽鎖可変領域または両方は、ここに記載する核酸配列または、例えば、ここに記載する低ストリンジェンシー、中ストリンジェンシーまたは高ストリンジェンシーまたは他のハイブリダイゼーション下で、ここに記載する核酸配列(例えば、表1および2に示す核酸配列)またはその相補体とハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含む。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、表1に示すアミノ酸配列またはそれに実質的に同一の配列(例えば、表1に示す配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一であるまたは1、2、5、10または15アミノ酸残基を超えて異ならない配列)を有する、少なくとも1、2、3または4抗原結合領域、例えば、可変領域を含む。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、表1に示すヌクレオチド配列またはそれに実質的に同一の配列(例えば、表1に示す配列と少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上またはそれ以上同一であるまたは3、6、15、30または45ヌクレオチドを超えて異ならない配列)を有する核酸によりコードされるVHおよび/またはVLドメインを含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、表1に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同な配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一であるおよび/または1、2、3またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する重鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDRを含む。さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、表1に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同な配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一であるおよび/または1、2、3またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDRを有する。さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、表1に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同な配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一であるおよび/または1、2、3またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列を有する重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1、2、3、4、5または6のCDRを含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、表1に要約するここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体のアミノ酸配列またはそれに実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一であるおよび/または1、2、3またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する重鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDRおよび/または超可変ループを含む。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、表1に要約するここに記載する抗体、例えば、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかから選択される抗体のアミノ酸配列またはそれに実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一であるおよび/または1、2、3またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDRおよび/または超可変ループを含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する、例えば、表1に記載する、全6CDRおよび/または超可変ループを含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、ここに記載する可変領域(例えば、ここに開示するFR領域)と同一であるか1、2、3または4アミノ酸異なる配列の可変領域を有する。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、完全抗体またはそのフラグメント(例えば、Fab、F(ab’)、Fvまたは一本鎖Fvフラグメント(scFv))である。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はモノクローナル抗体または単一特異性を有する抗体である。抗PD−1抗体分子はヒト化、キメラ、ラクダ類、サメまたはインビトロ産生抗体分子でもよい。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はヒト化抗体分子である。抗PD−1抗体分子の重鎖および軽鎖は完全長(例えば、抗体は少なくとも1および好ましくは2、完全重鎖および少なくとも1および好ましくは2、完全軽鎖を含み得る)でも、抗原結合フラグメント(例えば、Fab、F(ab’)、Fv、一本鎖Fvフラグメント、単一ドメイン抗体、二重特異性抗体(dAb)、二価抗体または二特異的抗体またはそのフラグメント、単一ドメインそのバリアントまたはラクダ類抗体)を含んでもよい。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgDおよびIgEの重鎖定常領域、特に、例えば、IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4の重鎖定常領域、より具体的には、IgG1またはIgG2(例えば、ヒトIgG1、IgG2またはIgG4)の重鎖定常領域から選択される、重鎖定常領域(Fc)を有する。ある実施態様において、重鎖定常領域はヒトIgG1である。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、例えば、カッパまたはラムダ、好ましくはカッパ(例えば、ヒトカッパ)の軽鎖定常領域から選択される、軽鎖定常領域を有する。ある実施態様において、定常領域は、抗PD−1抗体分子の性質を修飾するために(例えば、Fc受容体結合、抗体グリコシル化、システイン残基数、エフェクター細胞機能または補体機能の1以上の増加または減少のため)、改変、例えば、変異される。例えば、定常領域は、Fc受容体結合を改変するため、296位(MからY)、298位(SからT)、300位(TからE)、477位(HからK)および478位(NからF)で変異される(例えば、変異位置は、配列番号212または214の132位(MからY)、134位(SからT)、136位(TからE)、313位(HからK)および314位(NからF)または配列番号215、216、217または218の135位(MからY)、137位(SからT)、139位(TからE)、316位(HからK)および317位(NからF)に対応)。他の実施態様において、IgG4、例えば、ヒトIgG4の重鎖定常領域は、例えば、表3に示す、EUナンバリングによる228位(例えば、SからP)に変異を有する。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、例えば、表3に示す、EUナンバリングによる228位(例えば、SからP)に変異を有するヒトIgG4および、例えば、表3に示すカッパ軽鎖定常領域を含む。さらに他の実施態様において、IgG1、例えば、ヒトIgG1の重鎖定常領域は、例えば、表3に示す、EUナンバリングによる297位(例えば、NからA)、EUナンバリングによる265位(例えば、DからA)、EUナンバリングによる329位(例えば、PからA)、EUナンバリングによる234位(例えば、LからA)またはEUナンバリングによる235位(例えば、LからA)の1以上で変異される。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、例えば、表3に示す、前記位置の1以上で変異したヒトIgG1および例えば、表3に示す、カッパ軽鎖定常領域を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は単離または組み換えである。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はヒト化抗体分子である。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、T細胞エピトープ分析に基づく700、600、500、400またはそれより少ないリスクスコアを有する。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子はヒト化抗体分子であり、T細胞エピトープ分析に基づく300〜700、400〜650、450〜600のリスクスコアまたはここに記載するリスクスコアを有する。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、
(a)配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
(b)配列番号1から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;
(c)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;または
(d)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL
を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、
(i)配列番号1、配列番号4または配列番号224から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列;および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および
(ii)配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、
(i)配列番号1、配列番号4または配列番号224から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および
(ii)配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
前記抗体分子のある実施態様において、VHCDR1は、配列番号1のアミノ酸配列を含む。他の実施態様において、VHCDR1は、配列番号4のアミノ酸配列を含む。さらに他の実施態様において、配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列を含む。
ある実施態様において、前記抗体分子は、配列番号147、151、153、157、160、162、166または169の何れかのアミノ酸配列またはそれと少なくとも90%同一または配列番号147、151、153、157、160、162、166または169の何れかのアミノ酸配列と比較して2を超えないアミノ酸置換、挿入または欠失を有するアミノ酸配列を含む、少なくとも1フレームワーク(FW)領域を含む、重鎖可変領域を有する。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号147、151、153、157、160、162、166または169の何れかのアミノ酸配列を含む少なくとも1フレームワーク領域を含む、重鎖可変領域を有する。
さらに他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号147、151、153、157、160、162、166または169の何れかのアミノ酸配列を含む、少なくとも2、3または4フレームワーク領域を含む、重鎖可変領域を有する。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号147または151のVHFW1アミノ酸配列、配列番号153、157または160のVHFW2アミノ酸配列および配列番号162または166のVHFW3アミノ酸配列を含み、場合により、さらに配列番号169のVHFW4アミノ酸配列を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号174、177、181、183、185、187、191、194、196、200、202、205または208の何れかのアミノ酸配列またはそれと少なくとも90%同一または174、177、181、183、185、187、191、194、196、200、202、205または208の何れかのアミノ酸配列と比較して2を超えないアミノ酸置換、挿入または欠失を有するアミノ酸配列を含む、少なくとも1フレームワーク領域を含む、軽鎖可変領域を有する。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号174、177、181、183、185、187、191、194、196、200、202、205または208の何れかのアミノ酸配列を含む、少なくとも1フレームワーク領域を含む、軽鎖可変領域を有する。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号174、177、181、183、185、187、191、194、196、200、202、205または208の何れかのアミノ酸配列を含む、少なくとも2、3または4フレームワーク領域を含む、軽鎖可変領域を有する。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号174、177、181、183または185のVLFW1アミノ酸配列、配列番号187、191または194のVLFW2アミノ酸配列およびV配列番号196、200、202または205のLFW3アミノ酸配列を含み、場合により、さらに配列番号208のVLFW4アミノ酸配列を含む。
他の実施態様において、前記抗体は、配列番号38、50、82または86の何れかと少なくとも85%同一のアミノ酸配列を含む、重鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号38、50、82または86のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号42、46、54、58、62、66、70、74または78の何れかと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列を含む、軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号42、46、54、58、62、66、70、74または78のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号50のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号52または配列番号102のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号84のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号86のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号88のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号42のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号44のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号46のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号48のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号54のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号60のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号62のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体は、配列番号64のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号66のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号70のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号74のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号76のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号78のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号80のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号42のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号66のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号70のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号50のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号70のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号46のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号50のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号46のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号50のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号54のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号54のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号58のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号62のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号50のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号66のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号74のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号78のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号70のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号82のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号66のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号86のアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび配列番号66のアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号44のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号102のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号44のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号48のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号48のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体は、配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号60のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号64のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号76のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号80のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号84のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体は、配列番号84のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、配列番号88のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子はFab、F(ab’)、Fvまたは一本鎖Fvフラグメント(scFv)から選択される。
他の実施態様において、前記抗体分子は、IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4から選択される重鎖定常領域を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、カッパまたはラムダの軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、EUナンバリングによる228位または配列番号212または214の108位に変異を有するヒトIgG4重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、EUナンバリングによる228位または配列番号212または214の108位にセリンからプロリン変異を有するヒトIgG4重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、EUナンバリングによる297位または配列番号216の180位にアスパラギンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、EUナンバリングによる265位または配列番号217の148位にアスパラギン酸からアラニン変異およびEUナンバリングによる329位または配列番号217の212位にプロリンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、EUナンバリングによる234位または117位にロイシンからアラニン変異およびEUナンバリングによる235位または配列番号218の118位にロイシンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域を含む。
他の実施態様において、前記抗体分子は、約0.2nM未満の解離定数(K)でヒトPD−1に結合できる。
ある実施態様において、前記抗体分子は、例えば、Biacore方法により測定して、約0.2nM、0.15nM、0.1nM、0.05nMまたは0.02nM、例えば、約0.13nM〜0.03nM未満、例えば、約0.077nM〜0.088nM、例えば、約0.083nMのKでヒトPD−1に結合する。
他の実施態様において、前記抗体分子は、例えば、Biacore方法により測定して、約0.2nM、0.15nM、0.1nM、0.05nMまたは0.02nM未満、例えば、約0.11nM〜0.08nM、例えば、約0.093nMのKでカニクイザルPD−1に結合する。
ある実施態様において、前記抗体分子は、ヒトPD−1およびカニクイザルPD−1の両方に、例えば、Biacore方法により測定して、例えば、nM範囲で、類似のKで結合する。ある実施態様において、前記抗体分子は、ヒトPD−1−Ig融合体タンパク質に、例えば、ELISAで測定して、約0.1nM、0.075nM、0.05nM、0.025nMまたは0.01nM未満、例えば、約0.04nMのKで結合する。
ある実施態様において、前記抗体分子は、ヒトPD−1を発現するJurkat細胞(例えば、ヒトPD−1トランスフェクトJurkat細胞)に、例えば、FACS分析で測定して、約0.1nM、0.075nM、0.05nM、0.025nMまたは0.01nM未満、例えば、約0.06nMのKで結合する。
ある実施態様において、前記抗体分子は、カニクイザルT細胞に、例えば、FACS分析で測定して、約1nM、0.75nM、0.5nM、0.25nMまたは0.1nM未満、例えば、約0.4nMのKで結合する。
ある実施態様において、前記抗体分子は、カニクイザルPD−1を発現する細胞(例えば、カニクイザルPD−1でトランスフェクトした細胞)に、例えば、FACS分析で測定して、約1nM、0.75nM、0.5nM、0.25nMまたは0.01nM未満、例えば、約0.6nMのKで結合する。
ある実施態様において、前記抗体分子は、マウスまたはラットPD−1と交差反応性ではない。他の実施態様において、前記抗体は、アカゲザルPD−1と交差反応性である。例えば、交差反応性は、Biacore方法またはPD−1を発現する細胞(例えば、ヒトPD−1発現300.19細胞)を使用する結合アッセイにより測定できる。他の実施態様において、前記抗体分子は、PD−1の細胞外Ig様ドメインに結合する。
他の実施態様において、前記抗体分子は、PD−1のPD−L1、PD−L2または両方またはPD−L1、PD−L2または両方を発現する細胞への結合を減少させる。ある実施態様において、前記抗体分子は、約1.5nM、1nM、0.8nM、0.6nM、0.4nM、0.2nMまたは0.1nM未満、例えば、約0.79nM〜約1.09nM、例えば、約0.94nMまたは約0.78nM以下、例えば、約0.3nMのIC50で、PD−1を発現する細胞(例えば、ヒトPD−1発現300.19細胞)へのPD−L1結合を減少(例えば、遮断)する。ある実施態様において、前記抗体は、約2nM、1.5nM、1nM、0.5nMまたは0.2nM未満、例えば、約1.05nM〜約1.55nMまたは約1.3nM以下、例えば、約0.9nMのIC50で、PD−1を発現する細胞(例えば、ヒトPD−1発現300.19細胞)へのPD−L2結合を減少(例えば、遮断)する。
他の実施態様において、前記抗体分子は、抗原特異的T細胞応答を増強できる。
ある実施態様において、抗体分子は単特異的抗体分子または二特異的抗体分子である。ある実施態様において、抗体分子はPD−1に対する第一結合特異性およびTIM−3、LAG−3、CEACAM(例えば、CEACAM−1、CEACAM−3および/またはCEACAM−5)、PD−L1またはPD−L2に対する第二結合特異性を有する。ある実施態様において、抗体分子は、抗体の抗原結合フラグメント、例えば、半抗体または半抗体の抗原結合フラグメントを含む。
ある実施態様において、前記抗体分子は、ブドウ球菌エンテロトキシンB(SEB)(例えば、25μg/mLで)活性化された細胞からのIL−2の発現を、例えば、SEB T細胞活性化アッセイまたはヒト全血エクスビボアッセイにおいて測定して、アイソタイプ対照(例えば、IgG4)を使用したときのIL−2の発現と比較して、少なくとも約2倍、3倍、4倍、5倍、例えば、約2〜3倍、例えば、約2〜2.6倍、例えば、約2.3倍増加させる。
ある実施態様において、前記抗体分子は、抗CD3(例えば、0.1μg/mLで)により刺激されたT細胞からのIFN−γ発現を、例えば、IFN−γ活性アッセイにおいて測定して、アイソタイプ対照(例えば、IgG4)を使用したときのIFN−γ発現と比較して、少なくとも約2倍、3倍、4倍、5倍、例えば、約1.2〜3.4倍、例えば、約2.3倍増加させる。
ある実施態様において、前記抗体分子は、SEB(例えば、3pg/mL)により活性化されたT細胞からのIFN−γ発現を、例えば、IFN−γ活性アッセイにおいて測定して、アイソタイプ対照(例えば、IgG4)を使用したときのIFN−γ発現と比較して、少なくとも約2倍、3倍、4倍、5倍、例えば、約0.5〜4.5倍、例えば、約2.5倍増加させる。
ある実施態様において、前記抗体分子は、CMVペプチドで活性化されたT細胞からのIFN−γ発現を、例えば、IFN−γ活性アッセイにおいて測定して、アイソタイプ対照(例えば、IgG4)を使用したときのIFN−γ発現と比較して、少なくとも約2倍、3倍、4倍、5倍、例えば、約2〜3.6倍、例えば、約2.8倍増加させる。
ある実施態様において、前記抗体分子は、CMVペプチドで活性化されたCD8 T細胞の増殖を、例えば、少なくともn(例えば、n=2または4)細胞分裂を経るCD8 T細胞のパーセンテージにより測定して、アイソタイプ対照(例えば、IgG4)を使用したときのCD8 T細胞増殖と比較して、少なくとも約1、2倍、3倍、4倍、5倍、例えば、約1.5倍増加させる。
ある実施態様において、前記抗体分子は、例えば、サルにおいて測定して、約100μg/mL〜約500μg/mL、約150μg/mL〜約450μg/mL、約250μg/mL〜約350μg/mLまたは約200μg/mL〜約400μg/mL、例えば、約292.5μg/mLのCmaxを有する。
ある実施態様において、前記抗体分子は、例えば、サルにおいて測定して、約250時間〜約650時間、約300時間〜約600時間、約350時間〜約550時間または約400時間〜約500時間、例えば、約465.5時間のT1/2を有する。
ある実施態様において、前記抗体分子は、例えば、Biacore方法により測定して、5×10−4、1×10−4、5×10−5または1×10−5−1、例えば、約2.13×10−4−1より遅いKでPD−1に結合する。ある実施態様において、前記抗体分子は、例えば、Biacore方法により測定して、1×10、5×10、1×10または5×10−1−1、例えば、約2.78×10−1−1より速いKでPD−1に結合する。
ある実施態様において、前記抗PD−1抗体分子は、PD−1のC鎖、CC’ループ、C’鎖およびFGループ内の1以上の残基と結合する。PD−1のドメイン構造は、例えば、Cheng et al., “Structure and Interactions of the Human Programmed Cell Death 1 Receptor” J. Biol. Chem. 2013, 288:11771-11785に記載されている。Cheng et. al.に記載のとおり、C鎖は残基F43〜M50を含み、CC’ループはS51〜N54を含み、C’鎖は残基Q55〜F62を含み、FGループは残基L108〜I114を含む(Chang et al. supraによるアミノ酸ナンバリング)。従って、ある実施態様において、ここに記載する抗PD−1抗体は、PD−1のF43〜M50、S51〜N54、Q55〜F62およびL108〜I114の範囲の1以上における少なくとも1残基と結合する。ある実施態様において、ここに記載する抗PD−1抗体は、PD−1のF43〜M50、S51〜N54、Q55〜F62およびL108〜I114の範囲の2、3または全4における少なくとも1残基と結合する。ある実施態様において、抗PD−1抗体は、同様にPD−L1およびPD−L2の一方または両方の結合部位部であるPD−1における残基と結合する。
他の態様において、本発明は、前記抗体分子の何れかによりコードされる単離核酸分子、ベクターおよびその宿主細胞を提供する。
前記抗体分子の何れかの抗体重鎖可変領域または軽鎖可変領域または両方をコードする単離核酸も提供される。
ある実施態様において、単離核酸は重鎖CDR 1〜3をコードし、ここで、該核酸は配列番号108〜112、223、122〜126、133〜137または144〜146のヌクレオチド配列を含む。
他の実施態様において、単離核酸は軽鎖CDR 1〜3をコードし、ここで、該核酸は配列番号113〜120、127〜132または138〜143のヌクレオチド配列を含む。
他の実施態様において、前記核酸は、さらに重鎖可変ドメインをコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号39、51、83、87、90、95または101の何れかと少なくとも85%同一である。
他の実施態様において、前記核酸は、さらに重鎖可変ドメインをコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号39、51、83、87、90、95または101の何れかを含む。
他の実施態様において、前記核酸は、さらに重鎖をコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号41、53、85、89、92、96または103の何れかと少なくとも85%同一である。
他の実施態様において、前記核酸は、さらに重鎖をコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号41、53、85、89、92、96または103の何れかを含む。
他の実施態様において、前記核酸は、さらに軽鎖可変ドメインをコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号43、47、55、59、63、67、71、75、79、93、97、99、104または106の何れかと少なくとも85%同一である。
他の実施態様において、前記核酸は、さらに軽鎖可変ドメインをコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号43、47、55、59、63、67、71、75、79、93、97、99、104または106の何れかの配列を含む。
他の実施態様において、前記核酸は、さらに軽鎖をコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号45、49、57、61、65、69、73、77、81、94、98、100、105または107の何れかと少なくとも85%同一である。
他の実施態様において、前記核酸は、さらに軽鎖をコードするヌクレオチド配列を含み、ここで、該ヌクレオチド配列は、配列番号45、49、57、61、65、69、73、77、81、94、98、100、105または107の何れかを含む。
ある実施態様において、前記核酸を含む1以上の発現ベクターおよび宿主細胞が提供される。
ここに記載する宿主細胞を遺伝子発現に適する条件下で培養することを含む、抗体分子またはそのフラグメントを製造する方法も提供される。
ある態様において、本発明は、ここに記載する抗体分子を提供する方法に関する。方法は、PD−1抗原(例えば、PD−1エピトープの少なくとも一部を含む抗原)を提供し、obtaining PD−1ポリペプチドに特異的に結合する抗体分子を得て、抗体分子がPD−1ポリペプチドに特異的に結合するかを評価するまたは抗体分子のPD−1活性の調節、例えば阻害における有効性を評価することを含む。方法は、さらに、抗体分子を対象、例えば、ヒトまたは非ヒト動物に投与することを含み得る。
他の態様において、本発明は、薬学的に許容される担体、添加物または安定剤および治療剤、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子の少なくとも一つを含む、組成物、例えば、医薬組成物を提供する。ある実施態様において、組成物、例えば、医薬組成物は、ここに記載の抗体分子および1以上の薬剤、例えば、治療剤または他の抗体分子の組み合わせを含む。ある実施態様において、抗体分子は、標識または治療剤にコンジュゲートされる。
PD−1および他の免疫チェックポイント分子のさらなる阻害剤
ある実施態様において、PD−1阻害剤は、表1の抗PD−1抗体分子以外の阻害剤、例えば、抗PD−1抗体分子である。ある実施態様において、PD−1阻害剤は、表1の抗PD−1抗体分子および表1の抗体分子以外の抗PD−1抗体分子を含む。他の実施態様において、PD−1阻害剤は、ニボルマブ、ペンブロリズマブまたはピジリズマブから選択される抗PD−1抗体である。
ある実施態様において、抗PD−1抗体iはニボルマブである。ニボルマブの別名は、MDX−1106、MDX−1106−04、ONO−4538またはBMS−936558を含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体はニボルマブ(CAS Registry Number: 946414-94-4)である。ニボルマブは、PD1を特異的に遮断する完全ヒトIgG4モノクローナル抗体である。ニボルマブ(クローン5C4)およびPD1に特異的に結合する他のヒトモノクローナル抗体は、US8,008,449号およびWO2006/121168号に開示される。ある実施態様において、PD−1の阻害剤はニボルマブはであり、ここに開示する配列(またはそれと実質的に同一または類似する配列、例えば、特定した配列と少なくとも85%、90%、95%またはそれ以上同一である配列)を有する。
ニボルマブの重鎖および軽鎖アミノ酸配列は、次のとおりである。
重鎖
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLDCKASGITFSNSGMHWVRQAPGKGLEWVAVIWYDGSKRYYADSVKGRFTISRDNSKNTLFLQMNSLRAEDTAVYYCATNDDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号242)
軽鎖
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQSSNWPRTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号243)
ある実施態様において、抗PD−1抗体はペンブロリズマブである。ペンブロリズマブ(ランブロリズマブ、MK−3475、MK03475、SCH−900475またはキイトルー(登録商標);Merck)は、PD−1に結合するヒト化IgG4モノクローナル抗体である。ペンブロリズマブおよび他のヒト化抗PD−1抗体は、Hamid, O. et al. (2013) New England Journal of Medicine 369 (2): 134-44、US8,354,509号およびWO2009/114335号に開示される。ペンブロリズマブの重鎖および軽鎖アミノ酸配列は、次のとおりである。
重鎖(配列番号244)
Figure 0006878405
軽鎖(配列番号245)
Figure 0006878405
ある実施態様において、PD−1の阻害剤は、例えば、US8,354,509号およびWO2009/114335号に開示されるペンブロリズマブであり、ここに開示する配列(またはそれと実質的に同一または類似する配列、例えば、特定した配列と少なくとも85%、90%、95%またはそれ以上同一である配列)を有する。
ある実施態様において、抗PD−1抗体はピジリズマブである。ピジリズマブ(CT−011;Cure Tech)は、PD1に結合するヒト化IgG1kモノクローナル抗体である。ピジリズマブおよび他のヒト化抗PD−1モノクローナル抗体は、WO2009/101611号に開示される。
他の抗PD1抗体は、数あるなかで、AMP 514(Amplimmune)、例えば、US8,609,089号、US2010028330号および/またはUS20120114649号に開示の抗PD1抗体を含む。
ある実施態様において、PD−1阻害剤は、免疫アドヘシン(例えば、定常領域(例えば、免疫グロブリン配列のFc領域)に融合したPD−LlまたはPD−L2の細胞外またはPD−1結合部分を含む免疫アドヘシン)である。ある実施態様において、PD−1阻害剤は、AMP−224(B7−DCIg;Amplimmune;例えば、WO2010/027827号およびWO2011/066342号)であり、PD−1とB7−H1の相互作用を遮断するPD−L2 Fc融合体可溶性受容体である。
PD−L1またはPD−L2阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物は、PD−L1またはPD−L2阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍または血液系腫瘍の処置に使用する。ある実施態様において、癌は、甲状腺癌(例えば、未分化甲状腺癌)、肺癌(例えば、非小細胞肺癌)、乳癌(例えば、トリプルネガティブ乳癌)、子宮内膜癌、高MSI癌またはリンパ腫である。
非限定的組み合わせ物および抗PD−L1抗体分子の使用の例は、引用により全体を本明細書に包含させる“PD−L1に対する抗体分子およびその使用”なる名称の米国特許出願公開2016/0108123号(USSN14/881,888号)に開示される。
ある実施態様において、抗PD−L1抗体分子は、BAP058−hum01、BAP058−hum02、BAP058−hum03、BAP058−hum04、BAP058−hum05、BAP058−hum06、BAP058−hum07、BAP058−hum08、BAP058−hum09、BAP058−hum10、BAP058−hum11、BAP058−hum12、BAP058−hum13、BAP058−hum14、BAP058−hum15、BAP058−hum16、BAP058−hum17、BAP058−Clone−K、BAP058−Clone−L、BAP058−Clone−M、BAP058−Clone−NまたはBAP058−Clone−Oの何れかのアミノ酸配列またはUS2016/0108123号の表1に記載または表1におけるヌクレオチド配列によりコードされるものまたは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む、少なくとも1または2重鎖可変ドメイン(場合により定常領域を含む)、少なくとも1または2軽鎖可変ドメイン(場合により定常領域を含む)または両方を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−L1抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP058−hum01、BAP058−hum02、BAP058−hum03、BAP058−hum04、BAP058−hum05、BAP058−hum06、BAP058−hum07、BAP058−hum08、BAP058−hum09、BAP058−hum10、BAP058−hum11、BAP058−hum12、BAP058−hum13、BAP058−hum14、BAP058−hum15、BAP058−hum16、BAP058−hum17、BAP058−Clone−K、BAP058−Clone−L、BAP058−Clone−M、BAP058−Clone−NまたはBAP058−Clone−Oの何れかから選択される抗体の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3の相補性決定領域(CDR)またはUS2016/0108123号の表1に記載または表1におけるヌクレオチド配列によりコードされるものまたは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む。
さらに他の実施態様において、抗PD−L1抗体分子はUS2016/0108123号の表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む、重鎖可変領域からの、少なくとも1、2または3のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
さらに他の実施態様において、抗PD−L1抗体分子は、US2016/0108123号の表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。ある実施態様において、抗PD−L1抗体分子は、軽鎖CDRに置換、例えば、軽鎖のCDR1、CDR2および/またはCDR3に1以上の置換を含む。
他の実施態様において、抗PD−L1抗体分子は、US2016/0108123号の表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1、2、3、4、5または6のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
ある実施態様において、抗PD−L1抗体分子は
(i)配列番号1、配列番号4または配列番号195から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)(各々US2016/0108123号の表1に開示);および
(ii)配列番号9のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号10のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号11のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)(各々US2016/0108123号の表1に開示)
を含む。
他の実施態様において、抗PD−L1抗体分子は
(i)重鎖可変領域(VH) including配列番号1、配列番号4または配列番号195から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列(各々US2016/0108123号の表1に開示);および
(ii)配列番号12のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号13のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号14のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)(各々US2016/0108123号の表1に開示)
を含む。
ある実施態様において、抗PD−L1抗体分子は、配列番号1のVHCDR1アミノ酸配列を含む。他の実施態様において、抗PD−L1抗体分子は、配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列を含む。さらに他の実施態様において、抗PD−L1抗体分子は、配列番号195のVHCDR1アミノ酸配列(各々US2016/0108123号の表1に開示)を含む。
ある実施態様において、PD−L1阻害剤は抗体分子である。ある実施態様において、抗PD−L1阻害剤はYW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI−4736、MSB−0010718CまたはMDX−1105から選択される。
ある実施態様において、抗PD−L1抗体はMSB0010718Cである。MSB0010718C(A09−246−2とも称される;Merck Serono)は、PD−L1に結合するモノクローナル抗体である。ペンブロリズマブおよび他のヒト化抗PD−L1抗体はWO2013/079174号に開示され、ここに開示する配列(またはそれと実質的に同一または類似する配列、例えば、特定した配列と少なくとも85%、90%、95%またはそれ以上同一である配列)を有する。MSB0010718Cの重鎖および軽鎖アミノ酸配列は、少なくとも次のものを含む。
重鎖(WO2013/079174号に開示の配列番号24)
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYIMMWVRQAPGKGLEWVSSIYPSGGITFYADKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARIKLGTVTTVDYWGQGTLVTVSS(配列番号246)
軽鎖(WO2013/079174号に開示の配列番号25)
QSALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSDVGGYNYVSWYQQHPGKAPKLMIYDVSN RPSGVSNRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDEADYYCSSYTSSSTRVFGTGTKVTVL(配列番号247)
ある実施態様において、PD−L1阻害剤はYW243.55.S70である。YW243.55.S70抗体は、WO2010/077634号に開示の抗PD−L1抗体(配列番号20および21にそれぞれ示す重鎖および軽鎖可変領域配列)であり、ここに開示する配列(またはそれと実質的に同一または類似する配列、例えば、特定した配列と少なくとも85%、90%、95%またはそれ以上同一である配列)を有する。
ある実施態様において、PD−L1阻害剤はMDX−1105である。MDX−1105は、BMS−936559としても知られ、WO2007/005874号に記載され、ここに開示する配列(またはそれと実質的に同一または類似する配列、例えば、特定した配列と少なくとも85%、90%、95%またはそれ以上同一である配列)を有する抗PD−L1抗体である。
ある実施態様において、PD−L1阻害剤はMDPL3280A(Genentech/Roche)である。MDPL3280Aは、PD−L1に結合するヒトFc最適化IgG1モノクローナル抗体である。MDPL3280AおよびPD−L1に対する他のヒトモノクローナル抗体は、米国特許7,943,743号、PCT公開WO2013/019906号号および米国公開2012/0039906号に開示される。例えば、MDPL3280Aは、WO2013/019906号に開示の配列番号24のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域およびWO2013/019906号に開示する配列番号21のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(またはそれと実質的に同一または類似する配列、例えば、特定した配列と少なくとも85%、90%、95%またはそれ以上同一である配列)を含み得る。
ある実施態様において、PD−L1阻害剤はMEDI−4736(デュルバルマブとしても知られる)である。MEDI−4736は、WO2011/066389号およびWO2015/036499号に記載される。例えば、MEDI−4736は、WO2015/036499号に開示の配列番号1のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域およびWO2015/036499号に開示の配列番号2のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域(またはそれと実質的に同一または類似する配列、例えば、特定した配列と少なくとも85%、90%、95%またはそれ以上同一である配列)を含み得る。
他の実施態様において、PD−L2阻害剤はAMP−224である。AMP−224は、PD1とB7−H1の相互作用を遮断するPD−L2 Fc融合体可溶性受容体である(B7−DCIg;Amplimmune;例えば、WO2010/027827号およびWO2011/066342号に開示)。
LAG−3阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はLAG−3阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍または血液系腫瘍の処置に使用する。ある実施態様において、癌は肺癌(例えば、非小細胞肺癌)、皮膚癌(例えば、黒色腫)または腎癌(例えば、腎細胞癌)である。
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はLAG−3阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍または血液系腫瘍の処置に使用する。ある実施態様において、LAG−3阻害剤は抗LAG−3抗体またはそのフラグメントである。
ある実施態様において、抗LAG−3抗体またはそのフラグメントは、引用により全体を本明細書に包含させる“LAG3に対する抗体分子およびその使用”なる名称の米国特許出願公開2015/0259420号(USSN14/657260)に記載される抗LAG3抗体分子である。
ある実施態様において、抗LAG−3抗体分子は、BAP050−hum01、BAP050−hum02、BAP050−hum03、BAP050−hum04、BAP050−hum05、BAP050−hum06、BAP050−hum07、BAP050−hum08、BAP050−hum09、BAP050−hum10、BAP050−hum11、BAP050−hum12、BAP050−hum13、BAP050−hum14、BAP050−hum15、BAP050−hum16、BAP050−hum17、BAP050−hum18、BAP050−hum19、BAP050−hum20、huBAP050(Ser)(例えば、BAP050−hum01−Ser、BAP050−hum02−Ser、BAP050−hum03−Ser、BAP050−hum04−Ser、BAP050−hum05−Ser、BAP050−hum06−Ser、BAP050−hum07−Ser、BAP050−hum08−Ser、BAP050−hum09−Ser、BAP050−hum10−Ser、BAP050−hum11−Ser、BAP050−hum12−Ser、BAP050−hum13−Ser、BAP050−hum14−Ser、BAP050−hum15−Ser、BAP050−hum18−Ser、BAP050−hum19−SerまたはBAP050−hum20−Ser)、BAP050−Clone−F、BAP050−Clone−G、BAP050−Clone−H、BAP050−Clone−IまたはBAP050−Clone−Jの何れかのアミノ酸配列を含む、少なくとも1または2重鎖可変ドメイン(場合により定常領域を含む)、少なくとも1または2軽鎖可変ドメイン(場合により定常領域を含む)または両方またはUS2015/0259420号の表1に記載または表1におけるヌクレオチド配列によりコードされるものまたは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む。
さらに他の実施態様において、抗LAG−3抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、BAP050−hum01、BAP050−hum02、BAP050−hum03、BAP050−hum04、BAP050−hum05、BAP050−hum06、BAP050−hum07、BAP050−hum08、BAP050−hum09、BAP050−hum10、BAP050−hum11、BAP050−hum12、BAP050−hum13、BAP050−hum14、BAP050−hum15、BAP050−hum16、BAP050−hum17、BAP050−hum18、BAP050−hum19、BAP050−hum20、huBAP050(Ser)(例えば、BAP050−hum01−Ser、BAP050−hum02−Ser、BAP050−hum03−Ser、BAP050−hum04−Ser、BAP050−hum05−Ser、BAP050−hum06−Ser、BAP050−hum07−Ser、BAP050−hum08−Ser、BAP050−hum09−Ser、BAP050−hum10−Ser、BAP050−hum11−Ser、BAP050−hum12−Ser、BAP050−hum13−Ser、BAP050−hum14−Ser、BAP050−hum15−Ser、BAP050−hum18−Ser、BAP050−hum19−SerまたはBAP050−hum20−Ser)、BAP050−Clone−F、BAP050−Clone−G、BAP050−Clone−H、BAP050−Clone−IまたはBAP050−Clone−Jの何れかから選択される抗体の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3相補性決定領域(CDR)またはUS2015/0259420号の表1に記載または表1におけるヌクレオチド配列によりコードされるものまたは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む。
さらに他の実施態様において、抗LAG−3抗体分子は、US2015/0259420号の表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
さらに他の実施態様において、抗LAG−3抗体分子は、US2015/0259420号の表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。ある実施態様において、抗PD−L1抗体分子は、軽鎖CDRに置換、例えば、軽鎖のCDR1、CDR2および/またはCDR3に1以上の置換を含む。
他の実施態様において、抗LAG−3抗体分子は、US2015/0259420号の表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1、2、3、4、5または6のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1に示すまたは表1に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
ある実施態様において、抗LAG−3抗体分子は
(i)配列番号1、配列番号4または配列番号286から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)(各々US2015/0259420号の表1に開示);および
(ii)配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号12のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)(各々US2015/0259420号の表1に開示)
を含む。
他の実施態様において、抗LAG−3抗体分子は
(i)配列番号1、配列番号4または配列番号286から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)(各々US2015/0259420号の表1に開示);および
(ii)配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号15のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)(各々US2015/0259420号の表1に開示)を含む。
ある実施態様において、抗LAG−3抗体分子は、配列番号1のVHCDR1アミノ酸配列を含む。他の実施態様において、抗LAG−3抗体分子は、配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列を含む。さらに他の実施態様において、抗LAG−3抗体分子は配列番号286のVHCDR1アミノ酸配列を含む(各々US2015/0259420号の表1に開示)。ある実施態様において、抗LAG−3抗体はBMS−986016である。BMS−986016(BMS986016とも称される;Bristol-Myers Squibb)は、LAG−3に結合するモノクローナル抗体である。BMS−986016および他のヒト化抗LAG−3抗体は、US2011/0150892号、WO2010/019570号およびWO2014/008218号に開示される。
TIM−3阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はTIM−3阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍または血液系腫瘍の処置に使用する。ある実施態様において、癌は肺癌(例えば、非小細胞肺癌)、皮膚癌(例えば、黒色腫)または腎癌(例えば、腎細胞癌)である。
ある実施態様において、抗TIM3抗体またはそのフラグメントは、引用により全体を本明細書に包含させる“TIM−3に対する抗体分子およびその使用”なる名称の米国特許出願公開2015/0218274号(USSN14/610837)に記載の抗TIM3抗体分子である。
ある実施態様において、抗TIM−3抗体分子は、ABTIM3、ABTIM3−hum01、ABTIM3−hum02、ABTIM3−hum03、ABTIM3−hum04、ABTIM3−hum05、ABTIM3−hum06、ABTIM3−hum07、ABTIM3−hum08、ABTIM3−hum09、ABTIM3−hum10、ABTIM3−hum11、ABTIM3−hum12、ABTIM3−hum13、ABTIM3−hum14、ABTIM3−hum15、ABTIM3−hum16、ABTIM3−hum17、ABTIM3−hum18、ABTIM3−hum19、ABTIM3−hum20、ABTIM3−hum21、ABTIM3−hum22、ABTIM3−hum23のアミノ酸配列を含む、少なくとも1または2重鎖可変ドメイン(場合により定常領域を含む)、少なくとも1または2軽鎖可変ドメイン(場合により定常領域を含む)または両方またはUS2015/0218274号の表1〜4に記載またはUS2015/0218274号の表1〜4に記載のヌクレオチド配列によりコードされるものまたは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む。抗TIM−3抗体分子は、場合により、US2015/0218274号に示す重鎖、軽鎖または両方からのリーダー配列またはそれに実質的に同一の配列を含む。
さらに他の実施態様において、抗TIM−3抗体分子は、ここに記載する抗体、例えば、ABTIM3、ABTIM3−hum01、ABTIM3−hum02、ABTIM3−hum03、ABTIM3−hum04、ABTIM3−hum05、ABTIM3−hum06、ABTIM3−hum07、ABTIM3−hum08、ABTIM3−hum09、ABTIM3−hum10、ABTIM3−hum11、ABTIM3−hum12、ABTIM3−hum13、ABTIM3−hum14、ABTIM3−hum15、ABTIM3−hum16、ABTIM3−hum17、ABTIM3−hum18、ABTIM3−hum19、ABTIM3−hum20、ABTIM3−hum21、ABTIM3−hum22、ABTIM3−hum23の何れかから選択される抗体の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3相補性決定領域(CDR)またはUS2015/0218274号の表1〜4に記載またはUS2015/0218274号の表1〜4に記載のヌクレオチド配列によりコードされるものまたは前記配列の何れかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%またはそれ以上同一)である配列を含む。
さらに他の実施態様において、抗TIM−3抗体分子は、US2015/0218274号の表1〜4に示すまたは表1〜4に記載のヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1〜4に示すまたは表1〜4に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
さらに他の実施態様において、抗TIM−3抗体分子は、US2015/0218274号の表1〜4に示すまたは表1〜4に記載のヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1〜4に示すまたは表1〜4に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。ある実施態様において、抗TIM−3抗体分子は、軽鎖CDRに置換、例えば、軽鎖のCDR1、CDR2および/またはCDR3に1以上の置換を含む。
他の実施態様において、抗TIM−3抗体分子は、US2015/0218274号の表1〜4に示すまたは表1〜4に記載のヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1、2、3、4、5または6のCDR(または集合的にCDR全て)を含む。ある実施態様において、CDRの1以上(または集合的にCDR全て)は、表1〜4に示すまたは表1〜4に示すヌクレオチド配列によりコードされるアミノ酸配列に対して、1、2、3、4、5、6またはそれ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
ある実施態様において、抗TIM−3抗体分子は
(a)配列番号9から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号10のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および配列番号12のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号13のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号14のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)(各々US2015/0218274号の表1〜4に開示);
(b)配列番号3から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号4のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号6のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号7のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号8のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL(各々US2015/0218274号の表1〜4に開示);
(c)配列番号9から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列5および配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号12のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号13のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号14のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL(各々US2015/0218274号の表1〜4に開示);
(d)配列番号3から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列4および配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号6のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号7のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号8のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL(各々US2015/0218274号の表1〜4に開示);
(e)配列番号9から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号31のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号12のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号13のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号14のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL(各々US2015/0218274号の表1〜4に開示);または
(f)配列番号3から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号30のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号6のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号7のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号8のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL(各々US2015/0218274号の表1〜4に開示)
を含む。
抗TIM−3抗体例は、米国特許8,552,156号、WO2011/155607号、EP2581113号および米国公開2014/044728号に開示される。
CTLA−4阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はCTLA−4阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍または血液系腫瘍の処置に使用する。
抗CTLA−4抗体例は、トレメリムマブ(Pfizerから入手可能なIgG2モノクローナル抗体、以前はチシリムマブとして知られる、CP−675,206)およびイピリムマブ(CTLA−4抗体、MDX−010、CAS No. 477202-00-9としても知られる)である。
ある実施態様において、組み合わせ物は、例えば、ここに記載の抗PD−1抗体分子および抗CTLA−4抗体、例えば、イピリムマブを含む。使用できる用量の例は、約1〜10mg/kg、例えば、3mg/kg用量の抗PD−1抗体分子および約3mg/kg用量の抗CTLA−4抗体、例えば、イピリムマブである。
抗CTLA−4抗体の他の例は、例えば、米国特許5,811,097号に開示される。
IAP阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物は、アポトーシスタンパク質の阻害剤(IAP)の阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、乳癌(例えば、トリプルネガティブ乳癌)、卵巣癌、肺癌(例えば、非小細胞肺癌)、結腸直腸癌または膵臓癌)、例えば、血液系腫瘍(例えば、多発性骨髄腫)の処置に使用する。
ある実施態様において、IAP阻害剤は(S)−N−((S)−1−シクロヘキシル−2−((S)−2−(4−(4−フルオロベンゾイル)チアゾール−2−イル)ピロリジン−1−イル)−2−オキソエチル)−2−(メチルアミノ)プロパンアミド(化合物A21)または米国特許8,552,003号に開示の化合物である。
ある実施態様において、IAP阻害剤、例えば、(S)−N−((S)−1−シクロヘキシル−2−((S)−2−(4−(4−フルオロベンゾイル)チアゾール−2−イル)ピロリジン−1−イル)−2−オキソエチル)−2−(メチルアミノ)プロパンアミド(化合物A21)または米国特許8,552,003号に開示の化合物を、約1800mgの用量で、例えば、週に1回投与する。
EGFR阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物は、上皮細胞増殖因子受容体(EGFR)の阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、肺癌(例えば、非小細胞肺癌)、膵臓癌、乳癌(例えば、トリプルネガティブ乳癌)または結腸癌)の処置に使用する。
ある実施態様において、EGFR阻害剤は(R,E)−N−(7−クロロ−1−(1−(4−(ジメチルアミノ)ブト−2−エノイル)アゼパン−3−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)−2−メチルイソニコチンアミド(化合物A40)またはPCT公開WO2013/184757号に開示の化合物である。
ある実施態様において、EGFR阻害剤、例えば、(R,E)−N−(7−クロロ−1−(1−(4−(ジメチルアミノ)ブト−2−エノイル)アゼパン−3−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)−2−メチルイソニコチンアミド(化合物A40)またはPCT公開WO2013/184757号に開示の化合物を、例えば、1日あたり、150〜250mgの用量で投与する。ある実施態様において、EGFR阻害剤、例えば、(R,E)−N−(7−クロロ−1−(1−(4−(ジメチルアミノ)ブト−2−エノイル)アゼパン−3−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)−2−メチルイソニコチンアミド(化合物A40)またはPCT公開WO2013/184757号に開示の化合物を、約150mg、200mgまたは250mgまたは約150〜200mgまたは200〜250mgの用量で投与する。
ある実施態様において、EGFR阻害剤は、エルロチニブ、ゲフィチニブ、セツキシマブ、パニツムマブ、ネシツムマブ、PF−00299804、ニモツズマブまたはRO5083945の1以上から選択される5。
mTOR阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はラパマイシンの標的(mTOR)阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、前立腺癌、乳癌(例えば、トリプルネガティブ乳癌)、脳癌、膀胱癌、膵臓癌、腎癌、肝臓癌、肺癌(例えば、小細胞肺癌または非小細胞肺癌)、呼吸器/胸部癌、肉腫、骨癌、内分泌癌、星状細胞腫、子宮頸癌、神経学的癌、結腸直腸癌、胃癌または黒色腫)、例えば、血液系腫瘍(例えば、白血病(例えば、リンパ性白血病)、例えば、リンパ腫または、例えば、多発性骨髄腫)の処置に使用する。
ある実施態様において、mTOR阻害剤はダクトリシブ(化合物A4)または8−(6−メトキシ−ピリジン−3−イル)−3−メチル−1−(4−ピペラジン−1−イル−3−トリフルオロメチル−フェニル)−1,3−ジヒドロ−イミダゾ[4,5−c]キノリン−2−オン(化合物A41)またはPCT公開WO2006/122806号に開示の化合物である。
ある実施態様において、mTOR阻害剤はエベロリムス(アフィニトール(登録商標);化合物A36)またはPCT公開WO2014/085318号に開示の化合物である。
ある実施態様において、mTOR阻害剤、例えば、エベロリムス(化合物A36)またはPCT公開WO2014/085318号に開示の化合物を、約2.5〜20mg/日の用量で投与する。ある実施態様において、TOR阻害剤、例えば、エベロリムス(化合物A36)またはPCT公開WO2014/085318号に開示の化合物を、約2.5mg/日、5mg/日、10mg/日または20mg/日、例えば、約2.5〜5mg/日、5〜10mg/日または10〜20mg/日の用量で投与する。
ある実施態様において、mTOR阻害剤は、ラパマイシン、テムシロリムス(トーリセル(登録商標))、AZD8055、BEZ235、BGT226、XL765、PF−4691502、GDC0980、SF1126、OSI−027、GSK1059615、KU−0063794、WYE−354、Palomid 529(P529)、PF−04691502またはPKI−587;リダフォロリムス(以前はデフォロリムスとして知られ、(1R,2R,4S)−4−[(2R)−2−[(1R,9S,12S,15R,16E,18R,19R,21R、23S,24E,26E,28Z,30S,32S,35R)−1,18−ジヒドロキシ−19,30−ジメトキシ−15,17,21,23、29,35−ヘキサメチル−2,3,10,14,20−ペンタオキソ−11,36−ジオキサ−4−アザトリシクロ[30.3.1.04,9]ヘキサトリアコンタ−16,24,26,28−テトラエン−12−イル]プロピル]−2−メトキシシクロヘキシルジメチルホスフィネート、AP23573およびMK8669としても知られ、PCT公開WO03/064383号に記載);エベロリムス(アフィニトール(登録商標)またはRAD001);ラパマイシン(AY22989、シロリムス(登録商標));セマピモド(CAS Registry Number: 164301-51-3);(5−{2,4−ビス[(3S)−3−メチルモルホリン−4−イル]ピリド[2,3−d]ピリミジン−7−イル}−2−メトキシフェニル)メタノール(AZD8055);2−アミノ−8−[trans−4−(2−ヒドロキシエトキシ)シクロヘキシル]−6−(6−メトキシ−3−ピリジニル)−4−メチル−ピリド[2,3−d]ピリミジン−7(8H)−オン(PF04691502、CAS Registry Number: 1013101-36-4);N2−[1,4−ジオキソ−4−[[4−(4−オキソ−8−フェニル−4H−1−ベンゾピラン−2−イル)モルホリニウム−4−イル]メトキシ]ブチル]−L−アルギニルグリシル−L−α−アスパルチルL−セリン(配列番号237)分子内塩(SF1126、CAS Registry Number: 936487-67-1)またはXL765(SAR245409)の1以上から選択される。
mTOR阻害剤の他の例は、テムシロリムス;リダフォロリムス(1R,2R,4S)−4−[(2R)−2−[(1R,9S,12S,15R,16E,18R,19R,21R、23S,24E,26E,28Z,30S,32S,35R)−1,18−ジヒドロキシ−19,30−ジメトキシ−15,17,21,23、29,35−ヘキサメチル−2,3,10,14,20−ペンタオキソ−11,36−ジオキサ−4−アザトリシクロ[30.3.1.04,9]ヘキサトリアコンタ−16,24,26,28−テトラエン−12−イル]プロピル]−2−メトキシシクロヘキシルジメチルホスフィネート、AP23573およびMK8669としても既知;エベロリムス(RAD001);ラパマイシン(AY22989);セマピモド;(5−{2,4−ビス[(3S)−3−メチルモルホリン−4−イル]ピリド[2,3−d]ピリミジン−7−イル}−2−メトキシフェニル)メタノール(AZD8055);2−ミノ−8−[trans−4−(2−ヒドロキシエトキシ)シクロヘキシル]−6−(6−メトキシ−3−ピリジニル)−4−メチル−ピリド[2,3−d]ピリミジン−7(8H)−オン(PF04691502);およびN−[1,4−ジオキソ−4−[[4−(4−オキソ−8−フェニル−4H−1−ベンゾピラン−2−イル)モルホリニウム−4−イル]メトキシ]ブチル]−L−アルギニルグリシル−L−α−アスパルチルL−セリン−(配列番号237)分子内塩(SF1126);およびXL765を含むが、これらに限定されない。
IL−15アゴニスト例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はインターロイキン−15(IL−15)アゴニストを含む。ある実施態様において、組み合わせ物を癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、難治性固形腫瘍)(例えば、黒色腫(例えば、転移または進行型黒色腫)、腎癌(例えば、腎細胞癌)、非小細胞肺癌、扁平上皮細胞頭頸部癌または膀胱癌(例えば、非筋肉侵襲性膀胱癌))、例えば、血液系腫瘍(例えば、白血病、例えば、急性骨髄性白血病(例えば、難治性または再発性急性骨髄性白血病)、例えば、リンパ腫、例えば、非ホジキンリンパ腫(例えば、再発性/難治性低悪性度B細胞非ホジキンリンパ腫)、例えば、または多発性骨髄腫(例えば、再発性または難治性多発性骨髄腫))の処置に使用する。
ウイルス感染後に単核貪食細胞(およびある他の細胞型)により分泌されるIL−15は、Tおよびナチュラルキラー細胞活性化および増殖を制御する。このサイトカインは、肥満細胞、T細胞および樹状上皮T細胞におけるJAKキナーゼシグナル伝達経路により転写アクティベーターSTAT3、STAT5およびSTAT6の活性化を誘発する。IL−15およびインターロイキン−2(IL−2)は構造的に類似し、多くの生物学的活性を共有し、両者とも共通ヘマトポエチン受容体サブユニットに結合し、互いの活性を負に制御し得る。CD8 記憶T細胞数はIL−15とIL−2の間のバランスにより制御され得る。
ある実施態様において、IL−15アゴニストは組み換えヒトIL−15(rhIL−15)、例えば、CYP0150(Cytune)である。CYP0150は、ヒトアルファ鎖受容体のSushi+ドメインに連結したヒトIL−15からなる組み換えタンパク質(トランス表示)である。
CYP0150は、例えば、PCT公開WO2007/046006号に開示される。CYP0150は、MAPRRARGCRTLGLPALLLLLLLRPPATRGDYKDDDDKIEGRITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPPSGGSGGGGSGGGSGGGGSLQNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS(配列番号248)(WO2007/046006号に配列番号60として開示)またはMDSKGSSQKAGSRLLLLLVVSNLLLCQGVVSTTRDYKDDDDKIEGRNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTSSGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGSLQITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVLNKATNVAHWTTPSLKCIRDPALVHQRPAPP(配列番号249)(WO2007/046006号に配列番号62として開示)のアミノ酸配列を有する。
ある実施態様において、IL−15アゴニストはALT−803(Altor BioScience)である。ALT−803は、IL−15N72DおよびIL−15RαSu/Fc融合体タンパク質を共発現する高収量組み換え哺乳動物細胞株から産生される、IL−15N72D:IL−15RαSu/Fc可溶性複合体である。IL−15変異体(N72D)はIL−15生物学的活性が増強している(Zhu et al. 2009, J Immunol. 183:3598)。IL−15N72D変異体およびIL−15Rαの可溶性ドメインは、溶液中で安定なヘテロ二量体複合体を形成し、この複合体は、非複合体化IL−15と比較して生物学的活性が増加される(約25倍活性)。ALT−803は、例えば、PCT公開WO2012/040323号および米国特許8,507,222号に開示される。
ある実施態様において、IL−15アゴニストは、hetIL−15(Admune)である。HetIL−15はヘテロ二量体ヒトIL−15(IL−15/sIL−15Ra)である。HetIL−15は、例えば、PCT公開WO2009/002562号およびWO2014/066527号に開示される。
CD40アゴニスト例
ある実施態様において、組み合わせ物はCD40アゴニストを含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、肺癌、食道癌、黒色腫または腎細胞癌)、例えば、血液系腫瘍(例えば、白血病(例えば、慢性リンパ性白血病(CLL))、例えば、リンパ腫(例えば、非ホジキンリンパ腫)、例えば、または多発性骨髄腫)の処置に使用する。
ある実施態様において、CD40アゴニストはADC−1013(Alligator/BioInvent)である。ADC−1013は、ヒトCD40に対する完全ヒトIgGアゴニストモノクローナル抗体である。Bリンパ球表面に見られる必須の膜タンパク質であるCD40は、腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーのメンバーであり、B細胞悪性腫瘍のような多数の癌で高度に発現される。CD40アゴニスト、例えば、抗CD40抗体は、T細胞ヘルパー活性に効率的に置き換わり得る(Ridge, J. et al. (1998) Nature 393: 474-478)。
ADC−1013は、例えば、PCT公開WO2015/091853号に開示される。ADC−1013クローンは、例えば、1136/1137、1132/1133、1148/1149、1140/1135、1134/1135、1107/1108、1142/1135、1146/1147および1150/1151を含む。
1132/1133の重鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSGIGSYGGGTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARYVNFGMDYWGQGTLVTVSS(配列番号250)(WO2015/091853号に配列番号65として開示)。1132/1133の軽鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYGRNPPTFGQGTKLEIK(配列番号251)(WO2015/091853号に配列番号66として開示)。1132/1133の重鎖CDR1は次のアミノ酸配列を有する。GFTFSSYA(配列番号252)(WO2015/091853号に配列番号13として開示)。1132/1133の重鎖CDR2は次のアミノ酸配列を有する。IGSYGGGT(配列番号253)(WO2015/091853号に配列番号14として開示)。1132/1133の重鎖CDR3は次のアミノ酸配列を有する。ARYVNFGMDY(配列番号254)(WO2015/091853号に配列番号15として開示)。1132/1133の軽鎖CDR1は次のアミノ酸配列を有する。QSISSY(配列番号255)(WO2015/091853号に配列番号16として開示)。1132/1133の軽鎖CDR2は次のアミノ酸配列を有する。AAS(配列番号256)(WO2015/091853号に配列番号17として開示)。1132/1133の軽鎖CDR3は次のアミノ酸配列を有する。QQYGRNPPT(配列番号257)(WO2015/091853号に配列番号18として開示)。
1107/1108の重鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRVWGFDYWGQGTLVTVSS(配列番号258)(WO2015/091853号に配列番号79として開示)。1107/1108の軽鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGT DFTLTISSLQPEDFATYYCQQYGVYPFTFGQGTKLEIK(配列番号259)(WO2015/091853号に配列番号80として開示)。1107/1108の重鎖CDR1は次のアミノ酸配列を有する。GFTFSSYA(配列番号252)(WO2015/091853号に配列番号55として開示)。1107/1108の重鎖CDR2は次のアミノ酸配列を有する。ISGSGGST(配列番号260)(WO2015/091853号に配列番号56として開示)。1107/1108の重鎖CDR3は次のアミノ酸配列を有する。ARRVWGFDY(配列番号261)(WO2015/091853号に配列番号57として開示)。1107/1108の軽鎖CDR1は次のアミノ酸配列を有する。QSISSY(配列番号255)(WO2015/091853号に配列番号58として開示)。1107/1108の軽鎖CDR2は次のアミノ酸配列を有する。AAS(配列番号256)(WO2015/091853号に配列番号59として開示)。1107/1108の軽鎖CDR3は次のアミノ酸配列を有する。QQYGVYPFT(配列番号262)(WO2015/091853号に配列番号60として開示)。
ある実施態様において、CD40アゴニストはISF35である。ISF35は、キメラCD154である。ISFはPCT公開WO2003/099340号およびWO2008/070743に開示される。
ある実施態様において、CD40アゴニストはダセツズマブである。ダセツズマブはSGN−40またはhuS2C6としても知られる。ダセツズマブは、CD40を標的とするヒト化モノクローナル抗体である。ダセツズマブは、例えば、Advani et al. J Clin Oncol. 2009; 27(26):4371-7;およびKhubchandani et al. Curr Opin Investig Drugs. 2009; 10(6):579-87に開示される。
ある実施態様において、CD40アゴニストはルカツムマブ(CAS Registry Number: 903512-50-5)である。ルカツムマブはCHIR−12.12またはHCD−122としても知られる。ルカツムマブはCD40に結合し、阻害し、それによりCD40リガンド誘発細胞増殖を阻害し、CD40を過発現する細胞における抗体依存性細胞性細胞毒性(ADCC)により細胞溶解を誘発する。ルカツムマブは、例えば、Tai et al. Cancer Res. 2005;65(13):5898-906に開示される。
抗CD40抗体は、T細胞ヘルパー活性を効率的に置き換えることができ(Ridge, J. et al. (1998) Nature 393: 474-478)、PD−1抗体と組み合わせて使用できる(Ito, N. et al. (2000) Immunobiology 201 (5) 527-40)。
OX40アゴニスト例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はOX40アゴニストを含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、乳癌、黒色腫、頭頸部癌または前立腺癌)、例えば、血液系腫瘍(例えば、リンパ腫(例えば、B細胞リンパ腫))の処置に使用する。
CD134としても知られるOX40は、細胞表面糖タンパク質および腫瘍壊死因子(TNF)受容体スーパーファミリーのメンバーであり、Tリンパ球に発現され、活性化T細胞の増殖および生存のための共刺激性シグナルを提供する。OX40活性化は、腫瘍関連抗原(TAA)を発現する腫瘍細胞に対する免疫応答を促進する、エフェクターTリンパ球の増殖を誘発できる。
ある実施態様において、OX40アゴニストはmAb 106−222、ヒト化106−222(Hu106)、mAb 119−122またはヒト化119−122(Hu119)から選択される。
MAb 106−222、ヒト化106−222(Hu106)、mAb 119−122およびヒト化119−122(Hu119)は、例えば、PCT公開WO2012/027328号および米国特許9,006,399号に開示される。mAb 106−222のアミノ酸配列重鎖可変領域は、WO2012/027328号の配列番号4として開示される。mAb 106−222の軽鎖可変領域のアミノ酸配列は、WO2012/027328号の配列番号10として開示される。ヒト化106−222(Hu106)の重鎖可変領域のアミノ酸配列は、WO2012/027328号の配列番号5として開示される。ヒト化106−222(Hu106)の軽鎖可変領域のアミノ酸配列は、WO2012/027328号の配列番号11として開示される。mAb 119−122の重鎖可変領域のアミノ酸配列は、WO2012/027328号の配列番号16として開示される。mAb 119−122の軽鎖可変領域のアミノ酸配列は、WO2012/027328号の配列番号22として開示される。ヒト化119−122(Hu119)の重鎖可変領域のアミノ酸配列は、WO2012/027328号の配列番号17として開示される。ヒト化119−122(Hu119)の軽鎖可変領域のアミノ酸配列は、WO2012/027328号の配列番号23として開示される。
ある実施態様において、OX40アゴニストは、米国特許7,959,925号およびPCT公開WO2006/121810号に開示のヒト化モノクローナル抗体である。
ある実施態様において、OX40アゴニストは、MEDI6469、MEDI0562またはMEDI6383から選択される。MEDI6469は、OX40に対するマウスモノクローナル抗体である。MEDI0562は、OX40に対するヒト化モノクローナル抗体である。MEDI6383は、OX40に対するモノクローナル抗体である。
ある実施態様において、OX40アゴニスト、例えば、MEDI6469を、例えば、隔日で、約0.4mg/kgの用量で静脈内投与する。
抗OX−40抗体の他の例は、例えば、Weinberg, A. et al. (2000) Immunol 164: 2160-2169)に開示される。
CD27アゴニスト例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はCD27アゴニストを含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、黒色腫、腎細胞癌、ホルモン難治性前立腺腺癌、卵巣癌、乳癌、結腸直腸腺癌または非小細胞肺癌)、例えば、血液系腫瘍(例えば、リンパ腫(例えば、ホジキンリンパ腫、バーキットリンパ腫、マントル細胞リンパ腫、中枢神経系の原発リンパ腫または辺縁帯B細胞リンパ腫)または白血病(例えば、慢性リンパ性白血病(CLL))の処置に使用する。
ある実施態様において、CD27アゴニストはバルリルマブ(CAS Registry Number: 1393344-72-3)である。バルリルマブはCDX−1127(Celldex)または1F5としても知られる。バルリルマブは、リンパ球活性化経路における分子であるCD27を標的とする完全ヒトモノクローナル抗体(mAb)である。CDX−1127は、T細胞受容体刺激の状況でヒトT細胞を活性化でき、それ故に抗腫瘍効果に介在する、アゴニスト抗CD27 mAbである。CDX−1127はまたCD27発現を伴う腫瘍に対して直接治療効果も提供できる。
バルリルマブは、例えば、Vitale et al., Clin Cancer Res. 2012;18(14):3812-21、WO2008/051424号およびUS8,481,029号に開示される。
ある実施態様において、CD27アゴニストはBION−1402(BioNovion)である。BION−1402はhCD27.15としても知られる。BION−1402は、抗ヒトCD27モノクローナル抗体である。BION−1402は、CD27+細胞の増殖および/または生存を刺激できる。BION−1402は、そのリガンドCD70よりも効率的にヒトCD27を活性化でき、これは、CD8およびT細胞増殖に対する顕著に増加した効果をもたらす。
BION−1402は、例えば、WO2012/004367号にhCD27.15として記載される。この抗体は、番号PTA−11008で2010年6月2日にATCCに寄託されたハイブリドーマhCD27.15から産生される。hCD27.15の重鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。EVRLQQSGADLVKPGASVKLSCASGFIIKATYMHWVRQRPEQGLEWIGRIDPANGE KYDPKFQVKAITADTSSSTAYLQLNSLTSDDTAVYYCARYAWYFDVWGAGTTVTVSSAKTTPPXVYPXXPGS(配列番号263)(WO2012/004367号に配列番号3として開示)。hCD27.15の軽鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。DIQMTQSPASLSASVGDTVTITCRASENIYSFLAWYHQKQGRSPQLLVYHAKTLAEGVPSRFSGSGSGTQFSLKINSLQAEDFGSYYCQHYYGSPLTFGAGTKLEVKRADAAPTVSIFPPSSEELSL(配列番号264)(WO2012/004367号に配列番号4として開示)。hCD27.15の重鎖CDR1は次のアミノ酸配列を有する。GFIIKATYMH(配列番号265)(WO2012/004367号に配列番号5として開示)。hCD27.15の重鎖CDR2は次のアミノ酸配列を有する。RIDPANGETKYDPKFQV(配列番号266)(WO2012/004367号に配列番号6として開示)。hCD27.15の重鎖CDR3は次のアミノ酸配列を有する。YAWYFDV(配列番号267)(WO2012/004367号に配列番号7として開示)。hCD27.15の軽鎖CDR1は次のアミノ酸配列を有する。RASENIYSFLA(配列番号268)(WO2012/004367号に配列番号8として開示)。hCD27.15の軽鎖CDR2は次のアミノ酸配列を有する。HAKTLAE(配列番号269)(WO2012/004367号に配列番号9として開示)。hCD27.15の軽鎖CDR3は次のアミノ酸配列を有する。QHYYGSPLT(配列番号270)(WO2012/004367号に配列番号10として開示)。
CSF−1/1R結合剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はCSF−1/1R結合剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、前立腺癌、乳癌または色素性絨毛性結節性滑膜炎(PVNS))の処置に使用する。ある実施態様において、癌は脳癌(例えば、多形神経膠芽腫)、膵臓癌、卵巣癌または乳癌(例えば、トリプルネガティブ乳癌)である。
ある実施態様において、CSF−1/1R結合剤はマクロファージコロニー刺激因子(M−CSF)の阻害剤である。
他の実施態様において、CSF−1/1R結合剤はCSF−1Rチロシンキナーゼ阻害剤、4−((2−(((1R,2R)−2−ヒドロキシシクロヘキシル)アミノ)ベンゾ[d]チアゾール−6−イル)オキシ)−N−メチルピコリンアミド(化合物A15)またはPCT公開WO2005/073224号に開示の化合物である。
ある実施態様において、CSF−1/1R結合剤は、M−CSF阻害剤、化合物A33またはRX1または5H4(例えば、M−CSFに対する抗体分子またはFabフラグメント)を含むPCT公開WO2004/045532号またはPCT公開WO2005/068503号に開示のCSF−1に対する結合剤である。
ある実施態様において、CSF−1/1R結合剤、例えば、M−CSF阻害剤、化合物A33またはPCT公開WO2004/045532号に開示の化合物(例えば、M−CSFに対する抗体分子またはFabフラグメント)を、約10mg/kgの平均用量で投与する。ある実施態様において、CSF−1/1R結合剤はCSF1R阻害剤または4−(2−((1R、2R)−2−ヒドロキシシクロヘキシルアミノ)ベンゾチアゾール−6−イルオキシ)−N−メチルピコリンアミドである。4−(2−((1R、2R)−2−ヒドロキシシクロヘキシルアミノ)ベンゾチアゾール−6−イルオキシ)−N−メチルピコリンアミドは、PCT公開WO2007/121484号の117頁の実施例157として開示される。
ある実施態様において、CSF−1/1R結合剤はペキシダルチニブ(CAS Registry Number 1029044-16-3)である。ペキシダルチニブはPLX3397または5−((5−クロロ−1H−ピロロ[2,3−b]ピリジン−3−イル)メチル)−N−((6−(トリフルオロメチル)ピリジン−3−イル)メチル)ピリジン−2−アミンとしても知られる。ペキシダルチニブは、キット、CSF1RおよびFLT3の小分子受容体チロシンキナーゼ(RTK)阻害剤である。FLT3、CSF1RおよびFLT3は多くの癌細胞型で過発現または変異しており、腫瘍細胞増殖および転移に主要な役割を有する。PLX3397は、腫瘍細胞増殖阻害および溶骨性転移疾患に関与するマクロファージ、破骨細胞および肥満細胞の下方制御をもたらし得る、幹細胞因子受容体(キット)、コロニー刺激因子−1受容体(CSF1R)およびFMS様チロシンキナーゼ3(FLT3)に結合し、リン酸化を阻害できる。ある実施態様において、CSF−1/1R結合剤、例えば、ペキシダルチニブは、PD−1阻害剤、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子と組み合わせて使用される。
ある実施態様において、CSF−1/1R結合剤はエマクツズマブである。エマクツズマブはRG7155またはRO5509554としても知られる。エマクツズマブは、CSF1Rを標的とするヒト化IgG1 mAbである。ある実施態様において、CSF−1/1R結合剤、例えば、ペキシダルチニブを、PD−L1阻害剤、例えば、ここに記載する抗PD−L1抗体分子と組み合わせて使用する。
ある実施態様において、CSF−1/1R結合剤はFPA008である。FPA008は、CSF1Rを阻害するヒト化mAbである。ある実施態様において、CSF−1/1R結合剤、例えば、FPA008は、PD−1阻害剤、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子と組み合わせて使用される。
IL−17阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はインターロイキン−17(IL−17)阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍、例えば、乳癌(例えば、トリプルネガティブ乳癌)、肺癌(例えば、非小細胞肺癌)または結腸癌の処置に使用する。
ある実施態様において、IL−17阻害剤はセクキヌマブ(CAS Registry Numbers: 875356-43-7(重鎖)および875356-44-8(軽鎖))である。セクキヌマブはAIN457およびコセンティクス(登録商標)としても知られる。セクキヌマブは、IL−17Aに特異的に結合する組み換えヒトモノクローナルIgG1/κ抗体である。組み換えチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞株で発現される。
セクキヌマブは、例えば、WO2006/013107号、US7,807,155号、US8,119,131号、US8,617,552号およびEP1776142号に開示される。セクキヌマブの重鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSNYWMNWVRQAPGKGLEWVAAINQDGSEKYYVGSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRVEDTAVYYCVRDYYDILTDYYIHYWYFDLWGRGTLVTVSS(配列番号271)(WO2006/013107号に配列番号8として開示)。セクキヌマブの軽鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVSSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYGASSRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQYGSSPCTFGQGTRLEIKR(配列番号298)(WO2006/013107号に配列番号10として開示)。セクキヌマブの重鎖CDR1はアミノ酸配列NYWMN(配列番号272)(WO2006/013107号に配列番号1として開示)を有する。セクキヌマブの重鎖CDR2はアミノ酸配列AINQDGSEKYYVGSVKG(配列番号273)(WO2006/013107号に配列番号2として開示)を有する。セクキヌマブの重鎖CDR3はアミノ酸配列DYYDILTDYYIHYWYFDL(配列番号274)(WO2006/013107号に配列番号3として開示)を有する。セクキヌマブの軽鎖CDR1はアミノ酸配列RASQSVSSSYLA(配列番号275)(WO2006/013107号に配列番号4として開示)を有する。セクキヌマブの軽鎖CDR2はアミノ酸配列GASSRAT(配列番号276)(WO2006/013107号に配列番号5として開示)を有する。セクキヌマブの軽鎖CDR3はアミノ酸配列QQYGSSPCT(配列番号299)(WO2006/013107号に配列番号6として開示)を有する。
ある実施態様において、IL−17阻害剤はCJM112である。CJM112はXAB4としても知られる。CJM112は、IL−17Aを標的とする完全ヒトモノクローナル抗体である。
CJM112は、例えば、WO2014/122613号に開示される。CJM112の重鎖は次のアミノ酸配列を有する。EVQLVESGGDLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYWMSWVRQAPGKGLEWVANIKQDGSEKYYVDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRGSLYYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号277)(WO2014/122613号に配列番号14として開示)。CJM112の軽鎖は次のアミノ酸配列を有する。AIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCRPSQGINWELAWYQQKPGKAPKLLIYDASSLEQGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQFNSYPLTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号278)(WO2014/122613号の配列番号44として開示)。
ある実施態様において、IL−17阻害剤はイキセキズマブ(CAS Registry Number: 1143503-69-8)である。イキセキズマブはLY2439821としても知られる。イキセキズマブは、IL−17Aを標的とするヒト化IgG4モノクローナル抗体である。
イキセキズマブは、例えば、WO2007/070750号、US7,838,638号およびUS8,110,191号に開示される。イキセキズマブの重鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGYSFTDYHIHWVRQAPGQGLEWMGVINPMYGTTDYNQRFKGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARYDYFTGTGVYWGQGTLVTVSS(配列番号279)(WO2007/070750号に配列番号118として開示)。イキセキズマブの軽鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。DIVMTQTPLSLSVTPGQPASISCRSSRSLVHSRGNTYLHWYLQKPGQSPQLLIYKVSNRFIGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCSQSTHLPFTFGQGTKLEIK(配列番号280)(WO2007/070750号に配列番号241として開示)。
ある実施態様において、IL−17阻害剤はブロダルマブ(CAS Registry Number: 1174395-19-7)である。ブロダルマブはAMG 827またはAM−14としても知られる。ブロダルマブはインターロイキン−17受容体A(IL−17RA)に結合し、IL−17が受容体を活性化するのを阻止する。
ブロダルマブは、例えば、WO2008/054603号、US7,767,206号、US7,786,284号、US7,833,527号、US7,939,070号、US8,435,518号、US8,545,842号、US8,790,648号およびUS9,073,999号に開示される。ブロダルマブの重鎖CDR1はアミノ酸配列RYGIS(配列番号281)(WO2008/054603号に配列番号146として開示)を有する。ブロダルマブの重鎖CDR2はアミノ酸配列WISTYSGNTNYAQKLQG(配列番号282)(WO2008/054603号に配列番号147として開示)を有する。ブロダルマブの重鎖CDR3はアミノ酸配列RQLYFDY(配列番号283)(WO2008/054603に配列番号148として開示)を有する。ブロダルマブの軽鎖CDR1はアミノ酸配列RASQSVSSNLA(配列番号284)(WO2008/054603に配列番号224として開示)を有する。ブロダルマブの重鎖CDR2はアミノ酸配列DASTRAT(配列番号285)(WO2008/054603号に配列番号225として開示)を有する。ブロダルマブの重鎖CDR3はアミノ酸配列QQYDNWPLT(配列番号286)(WO2008/054603号に配列番号226として開示)を有する。
IL−1β阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はインターロイキン−1ベータ(IL−1β)阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、血液系腫瘍(例えば、リンパ腫(例えば、ホジキンリンパ腫)、白血病(例えば、急性または慢性白血病)または多発性骨髄腫)の処置に使用する。
ある実施態様において、IL−1β阻害剤はカナキヌマブである。カナキヌマブはACZ885またはイラリス(登録商標)としても知られる。カナキヌマブは、ヒトIL−1βの生理活性を中和するヒトモノクローナルIgG1/κ抗体である。
カナキヌマブは、例えば、WO2002/16436号、US7,446,175号およびEP1313769号に開示される。カナキヌマブの重鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。MEFGLSWVFLVALLRGVQCQVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSVYGMNWVRQAPGKGLEWVAIIWYDGDNQYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNGLRAEDTAVYYCARDLRTGPFDYWGQGTLVTVSS(配列番号287)(US7,446,175号に配列番号1として開示)。カナキヌマブの軽鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。MLPSQLIGFLLLWVPASRGEIVLTQSPDFQSVTPKEKVTITCRASQSIGSSLHWYQQKPDQSPKLLIKYASQSFSGVPSRFSGSGSGTDFTLTINSLEAEDAAAYYCHQSSSLPFTFGPGTKVDIK(配列番号288)(US7,446,175号に配列番号2として開示)。
CXCR2阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はケモカイン(C−X−Cモチーフ)受容体2(CXCR2)阻害剤の阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍、例えば、乳癌、転移肉腫、膵臓癌、黒色腫、腎細胞癌(RCC)、非小細胞肺癌(NSCLC)または小児科腫瘍(例えば、横紋筋肉腫)の処置に使用する。
ある実施態様において、CXCR2阻害剤はダニリキシン(CAS Registry Number: 954126-98-8)である。ダニリキシンはGSK1325756または1−(4−クロロ−2−ヒドロキシ−3−ピペリジン−3−イルスルホニルフェニル)−3−(3−フルオロ−2−メチルフェニル)尿素としても知られる。ダニリキシンは、例えば、Miller et al. Eur J Drug Metab Pharmacokinet (2014) 39:173-181;およびMiller et al. BMC Pharmacology and Toxicology (2015), 16:18に開示される。
ある実施態様において、CXCR2阻害剤はレパリキシン(CAS Registry Number: 266359-83-5)である。レパリキシンはレペルタキシンまたは(2R)−2−[4−(2−メチルプロピル)フェニル]−N−メチルスルホニルプロパンアミドとしても知られる。レパリキシンはCXCR1/2の非競合的アロステリック阻害剤である。レパリキシンは、例えば、Zarbock et al. British Journal of Pharmacology (2008), 1-8に開示される。
ある実施態様において、CXCR2阻害剤はナバリキシンである。ナバリキシンはMK−7123、SCH 527123、PS291822または2−ヒドロキシ−N,N−ジメチル−3−[[2−[[(1R)−1−(5−メチルフラン−2−イル)プロピル]アミノ]−3,4−ジオキソシクロブテン−1−イル]アミノ]ベンズアミドとしても知られる。ナバリキシンは、例えば、Ning et al. Mol Cancer Ther. 2012;11(6):1353-64に開示される。
PI3K−γ、−δ阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はホスファチジルイノシトール−4,5−ビスホスフェート3−キナーゼ(PI3K)、例えば、ホスファチジルイノシトール−4,5−ビスホスフェート3−キナーゼガンマおよび/またはデルタ(PI3K−γ,δ)の阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、前立腺癌、乳癌、脳癌、膀胱癌、膵臓癌、腎癌、固形腫瘍、肝臓癌、非小細胞肺癌、内分泌癌、卵巣癌、黒色腫、女性生殖器系癌、消化性/消化器癌、多形神経膠芽腫、頭頸部癌または結腸癌)、例えば、血液系腫瘍(例えば、白血病(例えば、リンパ性白血病、例えば、慢性リンパ性白血病(CLL)(例えば、再発性CLL))、例えば、リンパ腫(例えば、非ホジキンリンパ腫(例えば、再発性濾胞性B細胞非ホジキンリンパ腫(FL)または再発性小リンパ球性リンパ腫(SLL))または、例えば、多発性骨髄腫)の処置に使用する。
ある実施態様において、PI3K阻害剤はPI3Kのデルタおよびガンマアイソフォームの阻害剤である。組み合わせ物に使用できるPI3K阻害剤の例は、例えば、WO2010/036380号、WO2010/006086号、WO09/114870号、WO05/113556号に記載されるもの、GSK 2126458、GDC−0980、GDC−0941、Sanofi XL147、XL756、XL147、PF−46915032、BKM 120、CAL−101、CAL 263、SF1126、PX−886およびデュアルPI3K阻害剤(例えば、Novartis BEZ235)である。
ある実施態様において、PI3K−γ,δ阻害剤はイデラリシブ(CAS Registry Number: 870281-82-6)である。イデラリシブはザイデリグ(登録商標)、GS−1101、CAL−101または5−フルオロ−3−フェニル−2−[(1S)−1−(7H−プリン−6−イルアミノ)プロピル]−4(3H)−キナゾリノンとしても知られる。イデラリシブは、PI3KのデルタアイソフォームであるP110δを遮断する。イデラリシブは、例えば、Wu et al. Journal of Hematology & Oncology (2013) 6: 36に開示される。
ある実施態様において、PI3K−γ,δ阻害剤はダクトリシブ(化合物A4)または8−(6−メトキシ−ピリジン−3−イル)−3−メチル−1−(4−ピペラジン−1−イル−3−トリフルオロメチル−フェニル)−1,3−ジヒドロ−イミダゾ[4,5−c]キノリン−2−オン(化合物A41)またはPCT公開WO2006/122806号に開示の化合物である。
ある実施態様において、PI3K−γ,δ阻害剤はブパルリシブ(化合物A6)またはPCT公開WO2007/084786号に開示の化合物である。
ある実施態様において、PI3K−γ,δ阻害剤、例えば、ブパルリシブ(化合物A6)またはPCT公開WO2007/084786号に開示の化合物を、約100mg(例えば、1日あたり)の用量で投与する。
組み合わせ物において使用できるPI3K−γ,δ阻害剤の他の例は、例えば、ピクチリシブ(GDC−0941)、LY294002、ピララリシブ(XL147)、PI−3065、PI−103、VS−5584(SB2343)、CZC24832、デュベリシブ(IPI−145、INK1197)、TG100−115、CAY10505、GSK1059615、PF−04691502、AS−605240、voxtalisib(SAR245409、XL765)、IC−87114、オミパリシブ(GSK2126458、GSK458)、TG100713、ジェダトリシブ(PF−05212384、PKI−587)、PKI−402、XL147アナログ、PIK−90、PIK−293、PIK−294、3−メチルアデニン(3−MA)、AS−252424、AS−604850またはアピトリシブ(GDC−0980、RG7422)を含む。
ある実施態様において、PI3K阻害剤は化合物A8またはPCT公開WO2010/029082号に記載の化合物である。
ある実施態様において、PI3K阻害剤は汎PI3K阻害剤、(4S,5R)−3−(2’−アミノ−2−モルホリノ−4’−(トリフルオロメチル)−[4,5’−ビピリミジン]−6−イル)−4−(ヒドロキシメチル)−5−メチルオキサゾリジン−2−オン(化合物A13)またはPCT公開WO2013/124826号に開示の化合物である。
PI3K−γ、−δ阻害剤の例は、デュベリシブおよびイデラリシブを含むが、これらに限定されない。イデラリシブ(GS−1101またはCAL−101としても既知;Gilead)は、PI3Kのデルタアイソフォームを遮断する小分子である。イデラリシブ(5−フルオロ−3−フェニル−2−[(1S)−1−(7H−プリン−6−イルアミノ)プロピル]−4(3H)−キナゾリノン)の構造を下に示す。
Figure 0006878405
デュベリシブ(IPI−145とも称される;Infinity PharmaceuticalsおよびAbbvie)は、PI3K−δ,γを遮断する小分子である。デュベリシブ(8−クロロ−2−フェニル−3−[(1S)−1−(9H−プリン−6−イルアミノ)エチル]−1(2H)−イソキノリノン)の構造を下に示す。
Figure 0006878405
ある実施態様において、阻害剤は、2−アミノ−8−[trans−4−(2−ヒドロキシエトキシ)シクロヘキシル]−6−(6−メトキシ−3−ピリジニル)−4−メチル−ピリド[2,3−d]ピリミジン−7(8H)−オン(PF−04691502);N−[4−[[4−(ジメチルアミノ)−1−ピペリジニル]カルボニル]フェニル]−N’−[4−(4,6−ジ−4−モルホリニル−1,3,5−トリアジン−2−イル)フェニル]尿素(PF−05212384、PKI−587);2−メチル−2−{4−[3−メチル−2−オキソ−8−(キノリン−3−イル)−2,3−ジヒドロ−1H−イミダゾ[4,5−c]キノリン−1−イル]フェニル}プロパンニトリル(BEZ−235);アピトリシブ(GDC−0980、RG7422);2,4−ジフルオロ−N−{2−(メチルオキシ)−5−[4−(4−ピリダジニル)−6−キノリニル]−3−ピリジニル}ベンゼンスルホンアミド(GSK2126458);8−(6−メトキシピリジン−3−イル)−3−メチル−1−(4−(ピペラジン−1−イル)−3−(トリフルオロメチル)フェニル)−1H−イミダゾ[4,5−c]キノリン−2(3H)−オンマレイン酸(NVP−BGT226);3−[4−(4−モルホリニルピリド[3’,2’:4,5]フロ[3,2−d]ピリミジン−2−イル]フェノール(PI−103);5−(9−イソプロピル−8−メチル−2−モルホリノ−9H−プリン−6−イル)ピリミジン−2−アミン(VS−5584、SB2343)またはN−[2−[(3,5−ジメトキシフェニル)アミノ]キノキサリン−3−イル]−4−[(4−メチル−3−メトキシフェニル)カルボニル]アミノフェニルスルホンアミド(XL765)から選択される、デュアルホスファチジルイノシトール3−キナーゼ(PI3K)およびmTOR阻害剤である。
BAFF−R阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物は、B細胞活性化因子受容体(BAFF−R)阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、血液系腫瘍、例えば、白血病(例えば、慢性リンパ性白血病(CLL)、例えば、再発性または難治性慢性リンパ性白血病)の処置に使用する。
ある実施態様において、BAFF−R阻害剤は、VAY736である。VAY736は、BAFF−Rを標的とする、完全ヒトコンビナトリアル抗体ライブラリー(HuCAL)由来モノクローナル抗体である。BAFF−Rは、腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー13Cとしても知られ、ある腫瘍細胞型および自己免疫性疾患で過剰発現される。VAY736は抗炎症性および抗新生物活性の両方を有する。癌細胞において、BAFF−RはB細胞増殖および生存に重要な役割を有する。VAY736はBAFF−Rを標的とし、阻害し、これはBAFF/BAFF−R相互作用およびBAFF−R介在シグナル伝達の両方を阻害する。これは、BAFF−R発現腫瘍細胞の細胞増殖を減少させ得る。
VAY736は、例えば、US8,106,163号に開示される。VAY736の重鎖CDR1は、アミノ酸配列GDSVSSNSAAWG(配列番号289)(US8,106,163号に配列番号3として開示)を有する。VAY736の重鎖CDR2は、アミノ酸配列RIYYRSKWYNSYAVSVKS(配列番号290)(US8,106,163号に配列番号10として開示)を有する。VAY736の重鎖CDR3は、アミノ酸配列YDWVPKIGVFDS(配列番号300)(US8,106,163号に配列番号17として開示)を有する。VAY736の軽鎖CDR1は、アミノ酸配列RASQFISSSYLS(配列番号291)(US8,106,163号に配列番号24として開示)を有する。VAY736の軽鎖CDR2は、アミノ酸配列LLIYGSSSRAT(配列番号292)(US8,106,163号に配列番号31として開示)を有する。VAY736の軽鎖CDR3は、アミノ酸配列QQLYSSPM(配列番号293)(US8,106,163号に配列番号38として開示)を有する。VAY736の重鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。QVQLQQSGPGLVKPSQTLSLTCAISGDSVSSNSAAWGWIRQSPGRGLEWLGRIYYRSKWYNSYAVSVKSRITINPDTSKNQFSLQLNSVTPEDTAVYYCARYDWVPKIGVFDSWGQGTLVTVSS(配列番号294)(US8,106,163号に配列番号52として開示)を有する。VAY736の軽鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。DIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQFISSSYLSWYQQKPGQAPRLLIYGSSSRATGVPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQLYSSPMTFGQGTKVEIKRT(配列番号295)(US8,106,163号に配列番号45として開示)を有する。VAY736の重鎖は次のアミノ酸配列を有する。QVQLQQSGPGLVKPSQTLSLTCAISGDSVSSNSAAWGWIRQSPGRGLEWLGRIYYRSKWYNSYAVSVKSRITINPDTSKNQFSLQLNSVTPEDTAVYYCARYDWVPKIGVFDSWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号296)(US8,106,163号に配列番号75として開示)を有する。VAY736の軽鎖可変領域は次のアミノ酸配列を有する。DIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQFISSSYLSWYQQKPGQAPRLLIYGSSSRATGVPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQLYSSPMTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(配列番号297)(US8,106,163号に配列番号71として開示)を有する。
MALT−1/BTK阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物は、MALT−1および/またはBTKの阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌の処置に使用する。
MALT−1/BTK阻害剤の例は、(S)−1−(6−(2H−1,2,3−トリアゾール−2−イル)−5−(トリフルオロメチル)ピリジン−3−イル)−3−(2−クロロ−7−(1−メトキシエチル)ピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−6−イル)尿素、(S)−1−(2−クロロ−7−(1−メトキシエチル)ピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−6−イル)−3−(2−(トリフルオロメチル)ピリジン−4−イル)尿素、(S)−1−(2−クロロ−7−(1−メトキシエチル)ピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−6−イル)−3−(1−メチル−2−オキソ−5−(トリフルオロメチル)−1,2−ジヒドロピリジン−3−イル)尿素、(R)−1−(6−(2H−1,2,3−トリアゾール−2−イル)−5−(トリフルオロメチル)ピリジン−3−イル)−3−(2−クロロ−7−(1−メトキシ−2−メチルプロピル)ピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−6−イル)尿素、(R)−1−(5−クロロ−6−(2H−1,2,3−トリアゾール−2−イル)ピリジン−3−イル)−3−(2−クロロ−7−(1−メトキシ−2−メチルプロピル)ピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−6−イル)尿素、(S)−1−(7−(1−メトキシエチル)−2−メチルピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−6−イル)−3−(2−(トリフルオロメチル)ピリジン−4−イル)尿素、(S)−1−(2−フルオロ−7−(1−メトキシエチル)ピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−6−イル)−3−(2−(トリフルオロメチル)ピリジン−4−イル)尿素および(S)−1−(2−クロロ−7−(1−メトキシエチル)ピラゾロ[1,5−a]ピリミジン−6−イル)−3−(5−シアノピリジン−3−イル)尿素を含むが、これらに限定されない。
BTK阻害剤の例は、イブルチニブ(PCI−32765);GDC−0834;RN−486;CGI−560;CGI−1764;HM−71224;CC−292;ONO−4059;CNX−774またはLFM−A13を含むが、これらに限定されない。ある実施態様において、BTK阻害剤は、インターロイキン−2誘導性キナーゼ(ITK)のキナーゼ活性を低減または阻害せず、例えば、GDC−0834;RN−486;CGI−560;CGI−1764;HM−71224;CC−292;ONO−4059;CNX−774またはLFM−A13から選択される。
ある実施態様において、キナーゼ阻害剤はBTK阻害剤、例えば、イブルチニブ(PCI−32765)である。イブルチニブ(1−[(3R)−3−[4−アミノ−3−(4−フェノキシフェニル)−1H−ピラゾロ[3,4−d]ピリミジン−1−イル]ピペリジン−1−イル]プロプ−2−エン−1−オン)の構造を下に示す。
Figure 0006878405
他の実施態様において、BTK阻害剤は、引用により全体を本明細書に包含させる国際出願WO/2015/079417号に記載のBTK阻害剤である。例えば、ある実施態様において、BTK阻害剤は、式(I)の化合物またはその薬学的に許容される塩である。
Figure 0006878405
〔式中、
R1は水素、場合によりヒドロキシで置換されていてよいC−Cアルキルであり;
R2は水素またはハロゲンであり;
R3は水素またはハロゲンであり;
R4は水素であり;
R5は水素またはハロゲンであり;
またはR4およびR5は、互いに結合し、結合、−CH−、−CH−CH−、−CH=CH−、−CH=CH−CH−;−CH−CH=CH−または−CH−CH−CH−であり;
R6およびR7は、互いに独立して、H、場合によりヒドロキシで置換されていてよいC−Cアルキルル、場合によりハロゲンまたはヒドロキシで置換されていてよいC3−C6シクロアルキルまたはハロゲンであり;
R8、R9、R、R’、R10およびR11は、互いに独立して、Hまたは場合によりC−Cアルコキシで置換されていてよいC−CアルキルまたはR8、R9、R、R’、R10およびR11の任意の2個が、それらが結合している炭素原子と一体となって、3〜6員飽和炭素環式環を形成してよく;
R12は水素または場合によりハロゲンまたはC−Cアルコキシで置換されていてよいC−Cアルキルであり;
またはR12と、R8、R9、R、R’、R10またはR11の何れかが、それらが結合している原子と一体となって、4員、5員、6員または7員アザ環式環を形成してよく、この環は、場合によりハロゲン、シアノ、ヒドロキシル、C−CアルキルまたはC−Cアルコキシで置換されていてよく;
nは0または1であり;
R13は場合によりC−Cアルキル、C−CアルコキシまたはN,N−ジ−C−Cアルキルアミノで置換されていてよいC−Cアルケニル;場合によりC−CアルキルまたはC−Cアルコキシで置換されていてよいC−Cアルキニルまたは場合によりC−Cアルキルで置換されていてよいC−Cアルキレニルオキシドである。〕。
ある実施態様において、式IのBTK阻害剤は、N−(3−(5−((1−アクリロイルアゼチジン−3−イル)オキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(E)−N−(3−(6−アミノ−5−((1−(ブト−2−エノイル)アゼチジン−3−イル)オキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(6−アミノ−5−((1−プロピオロイルアゼチジン−3−イル)オキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(6−アミノ−5−((1−(ブト−2−イノイル)アゼチジン−3−イル)オキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(5−((1−アクリロイルピペリジン−4−イル)オキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(6−アミノ−5−(2−(N−メチルアクリルアミド)エトキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(E)−N−(3−(6−アミノ−5−(2−(N−メチルブト−2−エンアミド)エトキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(6−アミノ−5−(2−(N−メチルプロピオルアミド)エトキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(E)−N−(3−(6−アミノ−5−(2−(4−メトキシ−N−メチルブト−2−エンアミド)エトキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(6−アミノ−5−(2−(N−メチルブト−2−インアミド)エトキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(2−((4−アミノ−6−(3−(4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)ピリミジン−5−イル)オキシ)エチル)−N−メチルオキシラン−2−カルボキサミド;N−(2−((4−アミノ−6−(3−(6−シクロプロピル−8−フルオロ−1−オキソイソキノリン−2(1H)−イル)フェニル)ピリミジン−5−イル)オキシ)エチル)−N−メチルアクリルアミド;N−(3−(5−(2−アクリルアミドエトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(6−アミノ−5−(2−(N−エチルアクリルアミド)エトキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(6−アミノ−5−(2−(N−(2−フルオロエチル)アクリルアミド)エトキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(5−((1−アクリルアミドシクロプロピル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(S)−N−(3−(5−(2−アクリルアミドプロポキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(S)−N−(3−(6−アミノ−5−(2−(ブト−2−インアミド)プロポキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(S)−N−(3−(6−アミノ−5−(2−(N−メチルアクリルアミド)プロポキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(S)−N−(3−(6−アミノ−5−(2−(N−メチルブト−2−インアミド)プロポキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(6−アミノ−5−(3−(N−メチルアクリルアミド)プロポキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(S)−N−(3−(5−((1−アクリロイルピロリジン−2−イル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(S)−N−(3−(6−アミノ−5−((1−(ブト−2−イノイル)ピロリジン−2−イル)メトキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(S)−2−(3−(5−((1−アクリロイルピロリジン−2−イル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−(ヒドロキシメチル)フェニル)−6−シクロプロピル−3,4−ジヒドロイソキノリン−1(2H)−オン;N−(2−((4−アミノ−6−(3−(6−シクロプロピル−1−オキソ−3,4−ジヒドロイソキノリン−2(1H)−イル)−5−フルオロ−2−(ヒドロキシメチル)フェニル)ピリミジン−5−イル)オキシ)エチル)−N−メチルアクリルアミド;N−(3−(5−(((2S,4R)−1−アクリロイル−4−メトキシピロリジン−2−イル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(6−アミノ−5−(((2S,4R)−1−(ブト−2−イノイル)−4−メトキシピロリジン−2−イル)メトキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;2−(3−(5−(((2S,4R)−1−アクリロイル−4−メトキシピロリジン−2−イル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−(ヒドロキシメチル)フェニル)−6−シクロプロピル−3,4−ジヒドロイソキノリン−1(2H)−オン;N−(3−(5−(((2S,4S)−1−アクリロイル−4−メトキシピロリジン−2−イル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(6−アミノ−5−(((2S,4S)−1−(ブト−2−イノイル)−4−メトキシピロリジン−2−イル)メトキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(5−(((2S,4R)−1−アクリロイル−4−フルオロピロリジン−2−イル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(6−アミノ−5−(((2S,4R)−1−(ブト−2−イノイル)−4−フルオロピロリジン−2−イル)メトキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(S)−N−(3−(5−((1−アクリロイルアゼチジン−2−イル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(S)−N−(3−(6−アミノ−5−((1−プロピオロイルアゼチジン−2−イル)メトキシ)ピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(S)−2−(3−(5−((1−アクリロイルアゼチジン−2−イル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−(ヒドロキシメチル)フェニル)−6−シクロプロピル−3,4−ジヒドロイソキノリン−1(2H)−オン;(R)−N−(3−(5−((1−アクリロイルアゼチジン−2−イル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;(R)−N−(3−(5−((1−アクリロイルピペリジン−3−イル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(5−(((2R,3S)−1−アクリロイル−3−メトキシピロリジン−2−イル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミド;N−(3−(5−(((2S,4R)−1−アクリロイル−4−シアノピロリジン−2−イル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミドまたはN−(3−(5−(((2S,4S)−1−アクリロイル−4−シアノピロリジン−2−イル)メトキシ)−6−アミノピリミジン−4−イル)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)−4−シクロプロピル−2−フルオロベンズアミドから選択される。
特に提供しない限り、式IのBTK阻害剤の記載において上に使用する化学用語は、引用により全体を本明細書に包含させる国際出願WO2015/079417号に示す意味に従い使用する。
JAK阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はヤヌスキナーゼ(JAK)の阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、結腸癌、前立腺癌、肺癌、乳癌または膵臓癌)、例えば、血液系腫瘍(例えば、白血病(例えば、骨髄性白血病またはリンパ性白血病)、例えば、リンパ腫(例えば、非ホジキンリンパ腫)、または例えば、多発性骨髄腫の処置に使用する。
ある実施態様において、JAK阻害剤は2−フルオロ−N−メチル−4−(7−(キノリン−6−イルメチル)イミダゾ[1,2−b][1,2,4]トリアジン−2−イル)ベンズアミド(化合物A17)またはその二塩酸塩またはPCT公開WO2007/070514号に開示の化合物である。
ある実施態様において、JAK阻害剤、例えば、2−フルオロ−N−メチル−4−(7−(キノリン−6−イルメチル)イミダゾ[1,2−b][1,2,4]トリアジン−2−イル)ベンズアミド(化合物A17)またはその二塩酸塩またはPCT公開WO2007/070514号に開示の化合物を、約400〜600mg(例えば、1日あたり)、例えば、約400mg、500mgまたは600mgまたは約400〜500mgまたは500〜600mgの用量で投与する。
ある実施態様において、JAK阻害剤はリン酸ルキソリチニブ(JAKAFI;化合物A18)またはPCT公開WO2007/070514号に開示の化合物である。
ある実施態様において、JAK阻害剤、例えば、リン酸ルキソリチニブ(JAKAFIとしても既知;化合物A18)またはPCT公開WO2007/070514号に開示の化合物を、例えば、1日2回、約15〜25mgの用量で投与する。ある実施態様において、用量は約15mg、20mgまたは25mgまたは約15〜20mgまたは20〜25mgである。
CRTH2阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物はTヘルパー2細胞に発現する化学物質誘因受容体類似分子(CRTH2)の阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌の処置に使用する。
ある実施態様において、CRTH2阻害剤はQAV680(CAS Registry Number: 872365-16-7)である。QAV680はフェビピプラントおよび2−[2−メチル−1−[(4−メチルスルホニルフェニル)メチル]ピロロ[2,3−b]ピリジン−3−イル]酢酸としても知られる。QAV680は、例えば、Sandham et al. Bioorg Med Chem. 2013;21(21):6582-91に開示される。QAW039は[1−(4−メタンスルホニル−2−トリフルオロメチル−ベンジル)−2−メチル−1H−ピロロ[2,3−b]ピリジン−3−イル]−酢酸としても知られる。QAW039は、例えばSykes et al. European Respiratory Journal September 1, 2014 vol. 44 no. Suppl 58 P4074に開示される。
ある実施態様において、CRTH2阻害剤はQAW039(CAS Number: 872365-14-5)である。
組み合わせ物において使用できる他のCRTH2阻害剤は、例えば、AZD1981、ARRY−502、セチピプラント(ACT−453859)およびACT−129968を含む。
PFKFB3阻害剤例
ある実施態様において、ここに記載する組み合わせ物は、6−ホスホフルクト−2−キナーゼ/フルクトース−2,6−ビホスファターゼ3(PFKFB3)の阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌、例えば、固形腫瘍(例えば、進行型固形腫瘍)の処置に使用する。
ある実施態様において、PFKFB3阻害剤はPFK−158である。PFK−158は、ACT−PFK−158または(E)−l−(ピリジン−4−イル)−3−(7−(トリフルオロメチル)キノリン−2−イル)−プロプ−2−エン−1−オンとしても知られる。PFK−158は、3−(3−ピリジニル)−1−[4−ピリジニル]−2−プロペン−1−オン(3PO)の誘導体である。フルクトース−6−リン酸からフルクトース−2,6−ビスリン酸への変換を触媒するPFKFB3は、ヒト癌細胞で高度に発現され、活性であり、癌細胞への解糖流量および増殖の両方の増加に重要な役割を有する。PFKFB3阻害剤、例えば、PFK−158は、PFKFB3に結合し、活性を阻害でき、これは、癌細胞への解糖経路およびグルコース取り込みの両方の阻害に至り得る。これは、正常な、健常細胞と比較して、癌細胞において細胞性増殖の増強をもたらす、巨大分子およびエネルギーの生成を阻止する。癌細胞の栄養素およびエネルギー欠乏は、癌細胞増殖の阻害をもたらす。
PFK158は、例えば、WO2013/148228号の5頁に記載される。
ある実施態様において、PFKFB3阻害剤は次の構造を有する。
Figure 0006878405
医薬組成物およびキット
他の態様において、本発明は、薬学的に許容される担体と共に製剤される、ここに記載する抗体分子を含む、組成物、例えば、薬学的に許容される組成物を提供する。ここで使用する“薬学的に許容される担体”は、生理学的に適合性である任意かつ全ての溶媒、分散媒体、等張および吸収遅延薬剤などを含む。担体は、静脈内、筋肉内、皮下、非経腸、直腸、脊椎または上皮投与(例えば注射または注入による)に適するものであり得る。
本発明の組成物は、多様な形態であり得る。これらは、例えば、液体溶液(例えば、注射可能および注入可能溶液)、分散体または懸濁液、リポソームおよび坐剤のような、液体、半固体および固体投与形態を含む。好ましい形態は、意図する投与方式および治療適用による。典型的な好ましい組成物は注射可能または注入可能溶液の形態である。好ましい投与方式は非経腸(例えば、静脈内、皮下、腹腔内、筋肉内)である。好ましい実施態様において、抗体を、静脈内注入または注射により投与する。他の好ましい実施態様において、抗体を筋肉内または皮下注射により投与する。
ここで使用する用語“非経腸投与”および“非経腸的に投与する”は、通常注射により、静脈内、筋肉内、動脈内、髄腔内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、嚢下、クモ膜下、脊髄内、硬膜外および胸骨内注射および注入を含むが、これらに限定されない、経腸および局所投与以外の投与方式を意味する。
治療組成物は、一般に無菌であり、製造および保存条件下、安定でなければならない。組成物は、溶液、マイクロエマルジョン、分散体、リポソームまたは高抗体濃度に適する他の秩序構造として製剤し得る。無菌注射可能溶液は、活性化合物(すなわち、抗体または抗体部分)の必要量を、必要に応じて、上に挙げた成分の一つまたは組み合わせと共に適切な溶媒に取り込み、続いて濾過滅菌することにより製造できる。一般に、分散体は、活性化合物を、基本的分散体媒体および上に挙げたものからの必要な他の成分を含む無菌媒体に取り込むことにより製造する。無菌注射可能溶液製造のための無菌粉末の場合、好ましい製造方法は、先に無菌濾過した溶液からの活性成分と任意のさらなる所望の成分の粉末を得る、真空乾燥および凍結乾燥である。溶液の適切な流動性は、例えば、レシチンのようなコーティングの使用により、分散体の場合必要な粒子径の維持によりおよび界面活性剤の使用により、維持され得る。注射可能組成物の長期吸収は、吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアリン酸塩およびゼラチンを組成物に包含させることによりもたらし得る。
抗体分子を多様な当分野で知られる方法で投与してよいが、多くの治療適用について、好ましい経路/投与方式は静脈内注射または注入である。例えば、抗体分子を、約35〜440mg/m、一般に約70〜310mg/m、より一般に、約110〜130mg/mの用量に達するまで、20mg/分、例えば、20〜40mg/分を超える、一般に40mg/分以上の速度で、静脈内注入により投与できる。ある実施態様において、抗体分子を、約1〜100mg/m、好ましくは約5〜50mg/m、約7〜25mg/m、より好ましくは、約10mg/mの用量に達するまで、10mg/分未満、好ましくは5mg/分以下の速度で静脈内注入により投与できる。当業者には認められるとおり、投与経路および/または方式は所望の結果により変わる。ある実施態様において、活性化合物を、インプラント、経皮パッチおよびマイクロカプセル化送達系を含む、制御放出製剤のような、化合物を急速な放出から保護する担体と共に製剤できる。エチレンビニルアセテート、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステルおよびポリ乳酸のような生分解性、生体適合性ポリマーを小できる。このような製剤の製造のための多くの方法は特許であり、または一般に当業者に知られる。例えば、Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems, J. R. Robinson, ed., Marcel Dekker, Inc., New York, 1978参照。
ある実施態様において、抗体分子を、例えば、不活性希釈剤または同化性可食担体と経口投与できる。化合物(および所望であれば他の成分)を、硬または軟殻ゼラチンカプセルに封入しても、錠剤に圧縮してもまたは直接対象の食餌に包含させてもよい。経口治療投与のために、化合物は、添加物と共に取り込み、摂取可能錠剤、バッカル錠剤、トローチ剤、カプセル剤、エリキシル剤、懸濁液剤、シロップ剤、ウェーハ剤などの形態で使用され得る。本発明の化合物を非経腸投与以外で投与するために、化合物を、その不活性化を阻止する物質でコートするか、または化合物を該物質と共投与する必要があるかもしれない。治療組成物はまた当分野で知られる医療用デバイスで投与もできる。
投与レジメンは、最適な所望の応答(例えば、治療応答)を提供するように調節される。例えば、単一ボーラスを投与してよく、数分割用量を長時間にわたり投与してよくまたは用量を、治療状況の危急により示されるとおり比例的に減少させても増加させてもよい。投与の容易さおよび用量均一性から、非経腸組成物を投与単位形態で製剤するのが特に有利である。ここで使用する投与単位形態は、処置する対象のための単位投与量として適する物理的に分かれた単位をいい、各単位は、必要な医薬担体と共に所望の治療効果を産生するように計算された予め決定した量の活性化合物を含む。本発明の投与単位形態についての明細は、(a)活性化合物の独特な特徴および達成すべき特定の治療効果および(b)個体の感受性の処置における仮性化合物のような配合の分野に内在する制限により決定され、直接依存する。
治療的または予防有効量の抗体分子の例示的、非限定的範囲は0.1〜30mg/kg、より好ましくは1〜25mg/kgである。抗PD−1抗体分子の投与量および治療レジメンは、当業者により決定され得る。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、約1〜40mg/kg、例えば、1〜30mg/kg、例えば、約5〜25mg/kg、約10〜20mg/kg、約1〜5mg/kg、1〜10mg/kg、5〜15mg/kg、10〜20mg/kg、15〜25mg/kgまたは約3mg/kgの用量で注射(例えば、皮下または静脈内)により投与される。投与スケジュールは、例えば、週に1回から2週、3週または4週に1回までで変わり得る。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、隔週で約10〜20mg/kgの用量で投与する。抗体分子は、約35〜440mg/m、一般に約70〜310mg/m、より一般に、約110〜130mg/mの用量に達するために20mg/分、例えば、20〜40mg/分を超える、一般に40mg/分以上の速度で静脈内点滴により投与され得る。ある実施態様において、約110〜130mg/mの点滴率が約3mg/kgのレベルを達成する。他の実施態様において、抗体分子を、約1〜100mg/m、例えば、約5〜50mg/m、約7〜25mg/mまたは約10mg/mの用量に達するために、10mg/分未満、例えば、5mg/分以下の速度で静脈内点滴により投与し得る。ある実施態様において、抗体を、約30分の期間にわたり点滴する。投与量値は、軽減すべき状態のタイプおよび重症度により変わり得ることは注意すべきである。任意の特定の対象について、特定の投与レジメンは、個々の要求および組成物を投与するまたは投与を監督する者の専門的判断により、経時的に調節すべきであり、ここに示す投与量範囲は単なる例であり、本願組成物の範囲または実施を制限することを意図するものではないことは、さらに理解されるべきである。
本発明の医薬組成物は、“治療有効量”または“予防有効量”は、本発明の抗体または抗体部分を含み得る。“治療有効量”は、所望の治療結果の達成のために必要な、投与量および期間についての、有効量をいう。修飾抗体または抗体フラグメントの治療有効量は、疾患状態、個体の年齢、性別および体重および抗体または抗体部分が個体に所望の応答を誘発する能力のような因子により変わり得る。治療有効量はまた修飾抗体または抗体フラグメントの何らかの毒性または有害作用が、有益な治療効果に劣るものである。“治療有効投与量”は、好ましくは測定可能なパラメーター、例えば、腫瘍増殖率を、未処置対象と比較して少なくとも約20%、より好ましくは少なくとも約40%、さらに好ましくは少なくとも約60%、なおさらに好ましくは少なくとも約80%阻害するものである。化合物が測定可能なパラメーター、例えば、癌を阻害する能力は、ヒト腫瘍における有効性を予測する動物モデル系において評価できる。あるいは、組成物のこの性質を、当業者に知られるアッセイによる化合物がインビトロでの阻害のような阻害する能力を試験することにより評価できる。
“予防有効量”は、所望の予防結果の達成のために必要な、投与量および期間についての、有効量をいう。一般に、予防用量を、疾患前または初期段階の対象に使用するため、予防有効量は治療有効量より少ない。
また本発明の範囲内にあるのは、ここに記載する抗体分子を含むキットである。キットは、使用指示、他の薬剤、例えば、添付文書、治療剤または抗体を標識または治療剤にキレート化または他の方法でカップリングさせるのに有用な薬剤または放射線防護組成物、投与用抗体を調節するためのデバイスまたは他の物質;薬学的に許容される担体および対象に投与するためのデバイスまたは他の物質を含む、1以上の他の要素を含み得る。
組み合わせ治療の使用
組み合わせ物、例えば、ここに開示する抗PD−1抗体分子は、インビトロおよびインビボ診断、ならびに治療および予防有用性を有する。例えば、これらの分子を、インビトロまたはエクスビボで培養中の細胞にまたは対象、例えば、ヒト対象に、癌および感染性障害のような多様な障害を処置、予防および/または診断するために投与し得る。
従って、ある態様において、本発明は、対象にここに記載する組み合わせ物を、対象における免疫応答が修飾されるように投与することを含む、対象における免疫応答を修飾する方法を提供する。ある実施態様において、免疫応答は、増強、刺激または上方制御される。
ここで使用する用語“対象”はヒトおよび非ヒト動物を含むことを意図する。ある実施態様において、対象は、ヒト対象、例えば、異常PD−1機能により特徴付けられる障害または状態を有するヒト患者である。用語“非ヒト動物”は、非ヒト霊長類のような哺乳動物および非哺乳動物を含む。ある実施態様において、対象はヒトである。ある実施態様において、対象は、免疫応答の増強が必要なヒト患者である。ある実施態様において、対象は、免疫低下している、例えば、対象は、化学療法または放射線療法を受けているかまたは受けた。これとは別にまたはこれと組み合わせて、対象は、感染の結果として、免疫低下しているか、またはそのリスクがある。ここに記載する方法および組成物は、T細胞介在免疫応答の増強により処置できる障害を有するヒト患者の処置に適する。例えば、ここに記載する方法および組成物は、多数の免疫活性を増強できる。ある実施態様において、対象は、腫瘍浸潤性Tリンパ球(TIL)の数または活性が増強している。他の実施態様において、対象は、インターフェロン−ガンマ(IFN−γ)の発現または活性が増加している。さらに他の実施態様において、対象は、PD−L1発現または活性が低減している。
治療使用
PD−1の遮断は、対象における癌性細胞に対する免疫応答を増強できる。PD−1に対するリガンドであるPD−L1は、正常ヒト細胞で発現されないが、多様なヒト癌において豊富である(Dong et al. (2002) NatMed 8:787-9)。PD−1とPD−L1の相互作用は、腫瘍浸潤性リンパ球減少、T細胞受容体介在増殖減少および/または癌性細胞による免疫回避をもたらし得る(Dong et al. (2003) J Mol Med 81:281-7; Blank et al. (2005) Cancer Immunol. Immunother. 54:307-314; Konishi et al. (2004) Clin. Cancer Res. 10:5094-100)。免疫抑制は、PD−1とPD−L1またはPD−L2の局所相互作用阻害により逆転でき、効果は、PD−1とPD−L2の相互作用を同様に遮断したとき、相加的である(Iwai et al. (2002) PNAS 99:12293-7; Brown et al. (2003) J. Immunol. 170:1257-66)。それ故に、PD−1の阻害は免疫応答の増強をもたらし得る。
ある態様において、本発明は、癌性腫瘍の増殖が阻害または低減されるように抗PD−1抗体分子を使用してインビボで対象を処置することに関する。抗PD−1抗体は、癌性腫瘍の増殖のために単独で使用し得る。あるいは、抗PD−1抗体は、下記のとおり、標準治療処置(例えば、癌または感染性障害のため)、他の抗体またはその抗原結合フラグメント、免疫調節剤(例えば、共刺激性分子のアクティベーターまたは阻害性分子の阻害剤)、ワクチン、例えば、治療癌ワクチンまたは他の形態の細胞免疫療法の1以上と組み合わせで使用してよい。
従って、ある実施態様において、本発明は、対象に治療有効量のここに記載する抗PD−1抗体分子を投与することを含む、対象における腫瘍細胞の増殖を阻害する方法を提供する。
ある実施態様において、方法は、インビボでの癌の処置に適する。免疫の抗原特異的増強を達成するために、抗PD−1抗体分子を、目的の抗原と共に投与し得る。PD−1に対する抗体を1以上の薬剤と組み合わせて投与するとき、組み合わせ物は、何れの順番で投与しても、同時に投与してもよい。
他の態様において、対象を処置する、例えば、対象における、過増殖性状態または障害(例えば、癌)、例えば、固形腫瘍、血液癌、軟組織腫瘍または転移病変を、軽減または改善する方法が提供される。方法は、対象に、ここに開示する組み合わせ物の1以上を投与することを含む。
ここで使用する用語“癌”は、病理組織学的タイプまたは侵襲性の段階にかかわらず、全てのタイプの癌性増殖または発癌性過程、転移組織または悪性に形質転換した細胞、組織または臓器を含むことを意図する。癌性障害の例は、固形腫瘍、血液癌、軟組織腫瘍および転移病変を含むが、これらに限定されない。固形腫瘍の例は、肝臓、肺、乳房、リンパ系、消化器(例えば、結腸)、泌尿生殖器管(例えば、腎臓、尿路上皮細胞)、前立腺および咽頭に影響するものような、種々の臓器系の悪性腫瘍、例えば、肉腫および癌腫(腺癌および扁平上皮細胞癌を含む)を含む。腺癌は、大部分の結腸癌、直腸癌、腎細胞癌、肝臓癌、肺の非小細胞癌、小腸癌および食道癌のような悪性腫瘍を含む。扁平上皮細胞癌は、例えば、肺、食道、皮膚、頭頸部領域、口腔、肛門および子宮頸における悪性腫瘍を含む。ある実施態様において、癌は黒色腫である、例えば、進行期黒色腫である。前記癌の転移病変も、本発明の方法および組成物を使用して処置または予防され得る。
ここに開示する抗体分子を使用して増殖が阻害され得る癌の例は、一般に免疫療法に応答性の癌を含む。処置のための好ましい癌の非限定的例は、黒色腫(例えば、転移悪性黒色腫)、腎癌(例えば、明細胞癌)、前立腺癌(例えば、ホルモン難治性前立腺腺癌)、乳癌、結腸癌および肺癌(例えば、非小細胞肺癌)を含む。さらに、難治性または再発悪性腫瘍を、ここに記載する抗体分子を使用して処置できる。
処置され得る他の癌の例は、骨癌、膵臓癌、皮膚癌、頭頸部癌、皮膚または眼内悪性黒色腫、子宮癌、卵巣癌、直腸癌、肛門癌、胃食道、胃癌、脂肪肉腫、精巣癌、子宮癌、ファロピウス管癌、子宮内膜癌、子宮頸癌、膣癌、外陰癌、メルケル細胞癌、ホジキンリンパ腫、非ホジキンリンパ腫、食道癌、小腸癌、内分泌系癌、甲状腺癌副甲状腺癌、副腎癌、軟組織肉腫、尿道癌、陰茎癌、急性骨髄性白血病、慢性骨髄性白血病、急性リンパ芽球性白血病、慢性リンパ性白血病を含む慢性または急性白血病、小児固形腫瘍、リンパ性リンパ腫、膀胱癌、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群、腎臓または輸尿管の癌、腎盂癌、中枢神経系(CNS)の新生物、原発性CNSリンパ腫、腫瘍血管形成、脊椎軸腫瘍、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、カポジ肉腫、類表皮癌、扁平上皮細胞癌、T細胞リンパ腫、アスベストにより誘発されるもの(例えば、中皮腫)を含む環境誘発癌および該癌の組み合わせを含む。ある実施態様において、癌は皮膚癌、例えば、メルケル細胞癌または黒色腫である。ある実施態様において、癌はメルケル細胞癌である。他の実施態様において、癌は黒色腫である。他の実施態様において、癌は乳癌、例えば、トリプルネガティブ乳癌(TNBC)である。他の実施態様において、癌は腎癌、例えば、腎細胞癌(例えば、明細胞腎細胞癌)である。他の実施態様において、癌は甲状腺癌、例えば、未分化甲状腺癌(ATC)である。他の実施態様において、癌は神経内分泌腫瘍(NET)、例えば、非定型肺カルチノイド腫瘍である。ある実施態様において、癌は肺癌、例えば、非小細胞肺癌(NSCLC)である。
転移癌、例えば、PD−L1を発現する転移癌(Iwai et al. (2005) Int. Immunol. 17:133-144)の処置は、ここに記載する抗体分子を使用して実施され得る。ある実施態様において、癌は、高レベルのPD−L1、IFNγおよび/またはCD8を発現する。
理論に縛られることを望まないが、ある実施態様において、患者は、患者がPD−L1を高度に発現する癌を有するおよび/または癌が抗腫瘍免疫細胞、例えば、TILに浸潤されているならば、免疫調節剤(場合によりここに記載する1以上の薬剤との組み合わせ)での処置に応答する可能性が高い。抗腫瘍免疫細胞はCD8、PD−L1および/またはIFN−γに陽性であり得て、故に、CD8、PD−L1および/またはIFN−γのレベルは、微小環境におけるTILレベルの読み出しとして働き得る。ある実施態様において、癌微小環境は、PD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブとして称される。
従って、ある態様において、本発明は、腫瘍サンプルがPD−L1、CD8およびIFN−γの1以上について陽性であるか否かを決定し、腫瘍サンプルが該マーカーの1以上の、例えば、2または全てについて陽性であるならば、患者に治療有効量の抗PD−1抗体分子を、場合により他の免疫調節剤または抗癌剤の1以上と組み合わせて投与する、方法を提供する。
次の適応症において、患者の大部分がPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブである。肺癌(扁平上皮)、肺癌(腺癌)、頭頸部癌、胃癌、NSCLC、HNSCC、胃癌(例えば、MSIhiおよび/またはEBV+)、CRC(例えば、MSIhi)、鼻咽頭癌(NPC)、頸部癌(例えば、扁平上皮)、甲状腺癌例えば、乳頭状甲状腺、例えば、未分化甲状腺癌、皮膚癌(例えば、メルケル細胞癌または黒色腫)、乳癌(例えば、TN乳癌)およびDLBCL(汎発性大B細胞リンパ腫)。乳癌において一般におよび結腸癌において一般に、患者の中程度の割合がPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブである。次の適応症について、患者の少ない一部がPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブである。ER+乳癌および膵臓癌。これらの知見は実施例4にさらに記載する。これらのマーカーについてトリプルポジティブである患者の割合が大きいか小さいかに関わらず、これらのマーカーについての患者のスクリーニングは、PD−1抗体(例えば、遮断PD−1抗体)での、場合により他の免疫調節剤(例えば、抗TIM−3抗体分子、抗LAG−3抗体分子または抗PD−L1抗体分子)および/または抗癌剤、例えば、表7に挙げるおよび表7に挙げる文献に開示のものの1以上と組み合わせでの治療に好都合に応答する可能性が特に高い患者の部分の同定を可能とする。
ある実施態様において、癌サンプルは、PD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブとして分類される。この測定は、個々の細胞が陽性として分類されるかおよび全体として陽性として分類されるかの2閾値に、大まかに分けることができる。まず、個々の細胞において、PD−L1、CD8および/またはIFN−γのレベルを測定できる。ある実施態様において、これらのマーカーの1以上について陽性である細胞は、対照細胞または参照値と比較して、高レベルのマーカーを有する細胞である。例えば、ある実施態様において、ある細胞におけるPD−L1の高レベルは、患者における対応する非癌性組織におけるPD−L1のレベルより高いレベルである。他の例として、ある実施態様において、ある細胞におけるCD8またはIFN−γの高レベルは、一般にTILで見られるこれらタンパク質のレベルである。次に、サンプルにおけるPD−L1、CD8および/またはIFN−γについて陽性である細胞のパーセンテージも測定できる(単一細胞が全3マーカーを発現する必要はない)。ある実施態様において、トリプルポジティブサンプルは、これらのマーカーについて陽性である細胞のパーセンテージが高い、例えば、参照値より高いまたは対照サンプルより高い。
他の実施態様において、PD−L1、CD8および/またはIFN−γのレベルをサンプル中で全体として測定できる。この場合、サンプルにおけるCD8またはIFN−γの高レベルは、一般にTILで浸潤された腫瘍で見られるこのタンパク質のレベルであり得る。同様に、PD−L1の高レベルは、一般に腫瘍サンプル、例えば、腫瘍微小環境で見られる、このタンパク質のレベルであり得る。
ここでの実施例4に示す、PD−L1/CD8/IFN−γにトリプルポジティブである患者のサブセットの同定は、PD−1抗体治療に応答性である可能性がある患者のある亜集団を確認する。例えば、多くのIM−TN(免疫調節性、トリプルネガティブ)乳癌患者はPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブである。IM−TN乳癌は、例えば、Brian D. Lehmann et al., “Identification of human triple-negative breast cancer subtypes and preclinical models for selection of targeted therapies”, J Clin Invest. Jul 1, 2011; 121(7): 2750-2767に記載されている。トリプルネガティブ乳癌は、エストロゲン受容体(ER)、プロゲステロン受容体(PR)およびHer2/neuを発現しないものである。これらの癌は、一般にER、PRおよびHer2/neuを標的とする薬剤に応答性ではないため、処置が困難である。トリプルネガティブ乳癌は、さらに異なるクラスに細分でき、その一つが免疫調節性である。Lehmann et al.に記載のとおり、IM−TN乳癌は、免疫細胞過程に関与する因子、例えば、免疫細胞シグナル伝達(例えば、TH1/TH2経路、NK細胞経路、B細胞受容体シグナル伝達経路、DC経路およびT細胞受容体シグナル伝達)、サイトカインシグナル伝達(例えば、サイトカイン経路、IL−12経路およびIL−7経路)、抗原プロセシングおよび提示、コア免疫シグナル伝達経路を介するシグナル伝達(例えば、NFKB、TNFおよびJAK/STATシグナル伝達)、T細胞機能、免疫転写、インターフェロン(IFN)応答および抗原プロセシングに関与する遺伝子の1以上に富む。従って、ある実施態様において、処置される癌は、IM−TN乳癌の1以上のマーカー、例えば、免疫細胞シグナル伝達(例えば、TH1/TH2経路、NK細胞経路、B細胞受容体シグナル伝達経路、DC経路およびT細胞受容体シグナル伝達)、サイトカインシグナル伝達(例えば、サイトカイン経路、IL−12経路およびIL−7経路)、抗原プロセシングおよび提示、コア免疫シグナル伝達経路を介するシグナル伝達(例えば、NFKB、TNFおよびJAK/STATシグナル伝達)、T細胞機能、免疫転写、インターフェロン(IFN)応答および抗原プロセシングに関与する遺伝子の1以上を促進する因子に陽性である、または陽性であると決定される癌である。
他の例として、高MSI(マイクロサテライト不安定性)を有する結腸癌患者のS部セットもPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブであることがここで示される。従って、ある実施態様において、PD−1抗体、例えば、ここに記載のPD−1抗体(場合によりLAG−3抗体、TIM−3抗体またはPD−L1抗体のような1以上の免疫調節剤および1以上の抗癌剤、例えば、表7または表7における刊行物に記載の抗癌剤との組み合わせ)を、高MSIを有する結腸癌を有するまたは有するとして同定される患者に投与し、それにより癌を処置する。ある実施態様において、高MSIを有する細胞は、参照値または対照細胞、例えば、癌と同じ組織タイプの非癌性細胞より高いレベルでMSIを有する細胞である。
他の例として、高MSIを有するおよび/またはEBV+である胃癌患者のサブセットもPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブであることがここに示される。従って、ある実施態様において、PD−1抗体、例えば、ここに記載のPD−1抗体(場合によりLAG−3抗体、TIM−3抗体またはPD−L1抗体のような1以上の免疫調節剤および1以上の抗癌剤、例えば、表7または表7における刊行物に記載の抗癌剤との組み合わせ)を、高MSIおよび/またはEBV+を有する胃癌を有するまたは有するとして同定される患者に投与し、それにより癌を処置する。ある実施態様において、高MSIを有する細胞は、参照値または対照細胞、例えば、癌と同じ組織タイプの非癌性細胞より高いレベルでMSIを有する細胞である。
さらにここに開示するのは癌をPD−L1についてアッセイし、次いでPD−1抗体で癌を処置する方法である。ここでの実施例5に記載のとおり、癌サンプルを、PD−L1タンパク質レベルまたはmRNAレベルについてアッセイし得る。参照値または対照細胞(例えば、非癌性細胞)よりPD−L1(タンパク質またはmRNA)のレベルが高いサンプルをPD−L1陽性として分類できる。従って、ある実施態様において、PD−1抗体、例えば、ここに記載のPD−1抗体(場合により1以上の抗癌剤との組み合わせ)を、PD−L1陽性である癌を有するまたは有するとして同定される患者に投与する。癌は、例えば、非小細胞肺(NSCLC)腺癌(ACA)、NSCLC扁平上皮細胞癌(SCC)または肝細胞癌(HCC)であり得る。
ある実施態様において、ここでの方法は、PD−1抗体、例えば、ここに記載のPD−1抗体を、例えば、単剤療法として、PD−L1について陽性である(またはそうであると同定される)癌の処置に使用することを含む。ある実施態様において、癌は、結腸直腸癌(例えば、MSI高)、胃癌(例えば、MSI高および/またはEBV+)、NPC、子宮頸癌、乳癌(例えば、TN乳癌)および卵巣癌である。ある実施態様において、癌は、NSCLC、黒色腫またはHNSCCである。ある実施態様において、PD−1抗体を、例えば、1mg/kg、3mg/kg、10mg/kgまたは20mg/kgの用量で投与する。
例えば、ここでの実施例4に基づき、PD−L1/CD8/IFN−γにトリプルポジティブである、ある胃癌はPIK3CAも陽性であることが判明した。従って、ある実施態様において、癌を、抗PD−1抗体分子(場合により1以上の免疫調節剤、例えば、抗LAG−3抗体分子、抗TIM−3抗体分子または抗PD−L1抗体分子との組み合わせ)およびPIK3CAを阻害する薬剤で処置できる。このカテゴリーの薬剤の例は、Stein RC (September 2001). “Prospects for phosphoinositide 3-kinase inhibition as a cancer treatment”. Endocrine-related Cancer 8 (3): 237-48 and Marone R, Cmiljanovic V, Giese B, Wymann MP (January 2008). “Targeting phosphoinositide 3-kinase: moving towards therapy”. Biochimica et Biophysica Acta 1784 (1): 159-85に記載されている。
例えば、ここでの実施例4に基づき、CRC、例えば、MSI高CRCを有する(または有するとして同定される)患者を、PD−1抗体で、場合によりLAG−3、RNF43およびBRAFの1以上を標的とする治療と組み合わせて処置できる。例えば、これらの癌を、PD−1抗体で、場合によりLAG−3、PD−1、RNF43およびBRAFの1以上を標的とする1以上の治療と組み合わせて処置できる。ある実施態様において、1以上の治療は、抗LAG−3抗体分子のような免疫調節剤および表7または表7における刊行物に記載の抗癌剤を含む。LAG−3阻害剤、例えば、抗体は、ここに記載される。RNF43は、例えば、抗体、小分子(例えば、2−(2’,3−ジメチル−[2,4’−ビピリジン]−5−イル)−N−(5−(ピラジン−2−イル)ピリジン−2−イル)アセトアミド(化合物A28))、siRNAまたはRspoリガンドまたはその誘導体で阻害され得る。BRAF阻害剤(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)は、ここに記載される。
例えば、ここでの実施例4に基づき、扁平上皮細胞肺癌を有する(または有するとして同定される)患者を、PD−1抗体分子で、LAG−3を標的とする治療、例えば、LAG−3抗体分子および場合により1以上の抗癌剤、例えば、表7または表7における刊行物に記載の抗癌剤と組み合わせて処置し得る。
ある実施態様において、扁平上皮細胞肺癌を有する(またはそれを有するとして同定される)対象を、PD−1抗体で、場合によりTIM−3を標的とする治療、例えば、TIM−3抗体と組み合わせて処置し得る。TIM−3阻害剤、例えば、抗体は、ここに記載される。
例えば、ここでの実施例4に基づき、甲状腺癌(例えば、未分化甲状腺癌)を有する(またはそれを有するとして同定される)患者を、PD−1抗体分子で、場合によりBRAFを標的とする治療と組み合わせでおよび場合により1以上の免疫調節剤、例えば、抗LAG−3抗体分子、抗TIM−3抗体分子および抗PD−L1抗体分子と組み合わせて処置し得る。BRAF阻害剤(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)は、ここに、例えば、表7または表7に挙げる刊行物に記載される。
ある実施態様において、ここでの治療は、感染、例えば、ウイルスまたは細菌感染と関連する癌を有する(またはそれを有するとして同定される)患者の処置に使用できる。癌の例示は、子宮頸癌、肛門癌、HPV関連頭頸部扁平上皮細胞癌、HPV関連食道乳頭腫、HHV6関連リンパ腫、EBV関連リンパ腫(バーキットリンパ腫を含む)、胃MALTリンパ腫、他の感染関連MALTリンパ腫、HCCおよびカポジ肉腫を含む。
他の実施態様において、癌は、白血病またはリンパ腫を含むが、これらに限定されない造血器腫瘍または癌である。例えば、抗PD−1抗体分子を、例えば、B細胞急性リンパ性白血病(“BALL”)、T細胞急性リンパ性白血病(“TALL”)、急性リンパ性白血病(ALL)を含むが、これらに限定されない急性白血病、例えば、慢性骨髄性白血病(CML)、慢性リンパ性白血病(CLL)を含むが、これらに限定されない1以上の慢性白血病、例えば、B細胞前リンパ性白血病、芽細胞性形質細胞様樹状細胞新生物、バーキットリンパ腫、汎発性大B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、小細胞または大細胞濾胞性リンパ腫、悪性リンパ増殖性状態、MALTリンパ腫、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯リンパ腫、多発性骨髄腫、骨髄異形成および骨髄異形成症候群、非ホジキンリンパ腫、形質芽細胞性リンパ腫、形質細胞様樹状細胞新生物、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症および骨髄血液細胞の産生無効(または異形成)によりまとめられる血液学的状態の雑多なコレクションである“前白血病”を含むが、これらに限定されない血液癌または血液状態などを、例えば、含む、癌および悪性腫瘍の処置に使用できる。
ある実施態様において、癌は肺癌(例えば、非小細胞肺癌(NSCLC)(例えば、扁平上皮および/または非扁平上皮組織型NSCLCまたはNSCLC腺癌))、黒色腫(例えば、進行型黒色腫)、腎癌(例えば、腎細胞癌、例えば、明細胞腎細胞癌)、肝臓癌、骨髄腫(例えば、多発性骨髄腫)、前立腺癌、乳癌(例えば、エストロゲン受容体、プロゲステロン受容体またはHer2/neuの1、2または全てを発現しない乳癌、例えば、トリプルネガティブ乳癌)、結腸直腸癌、膵臓癌、頭頸部癌(例えば、頭頸部扁平上皮細胞癌(HNSCC)、肛門癌、胃食道癌、甲状腺癌(例えば、未分化甲状腺癌)、子宮頸癌、リンパ増殖性疾患(例えば、移植後リンパ増殖性疾患)または血液癌、T細胞リンパ腫、非ホジキンリンパ腫または白血病(例えば、骨髄性白血病)から選択される。
他の実施態様において、癌は、癌(例えば、進行型または転移癌)、黒色腫または肺癌、例えば、非小細胞肺癌から選択される。
ある実施態様において、癌は肺癌、例えば、非小細胞肺癌である。
他の実施態様において、癌は、ウイルス感染、例えば、慢性ウイルス性肝炎を伴うまたは伴わない肝細胞癌、例えば、進行型肝細胞癌である。
他の実施態様において、癌は、前立腺癌、例えば、進行型前立腺癌である。
さらに他の実施態様において、癌は、骨髄腫、例えば、多発性骨髄腫である。
さらに他の実施態様において、癌は腎癌、例えば、腎細胞癌(RCC)(例えば、転移RCCまたは明細胞腎細胞癌)である。
ある実施態様において、癌は黒色腫、例えば、進行型黒色腫である。ある実施態様において、癌は、他の治療に応答しない進行型または切除不能黒色腫である。他の実施態様において、癌は、BRAF変異(例えば、BRAF V600変異)を有する黒色腫である。さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、BRAF阻害剤(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)を併用するまたは併用しない抗CTLA−4抗体(例えば、イピリムマブ)での処置後投与する。
ここに開示する方法および組成物は前記癌と関連する転移病変の処置に有用である。
組み合わせ治療
抗PD−1抗体分子の非限定的組み合わせ物およびその使用の例は、引用により全体を本明細書に包含させる“PD−1に対する抗体分子およびその使用”なる名称のUS2015/0210769号(USSN14/604,415)に開示される。
ある実施態様において、組み合わせ物は、共刺激性分子または阻害性分子、例えば、共阻害性リガンドまたは受容体のモジュレーターと組み合わせた抗PD−1抗体分子を含む。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、共刺激性分子のモジュレーター、例えば、アゴニストと組み合わせて投与する。ある実施態様において、共刺激性分子のアゴニストは、OX40、CD2、CD27、CDS、ICAM−1、LFA−1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、4−1BB(CD137)、GITR、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7−H3またはCD83リガンドのアゴニスト(例えば、アゴニスト抗体またはその抗原結合フラグメントまたは可溶性融合体)から選択される。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、共刺激性分子、例えば、CD28、CD27、ICOSおよびGITRの共刺激性ドメインを含む陽性シグナルと関連するアゴニストと組み合わせて使用する。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、免疫チェックポイント分子の阻害性分子の阻害剤と組み合わせて投与する。用語“免疫チェックポイント”は、CD4およびCD8 T細胞の細胞表面上の一群の分子を意味することは当業者には理解される。これらの分子は、抗腫瘍免疫応答を下方制御または阻害するための“ブレーキ”として効率的に働き得る。免疫チェックポイント分子は、プログラム死1(PD−1)、細胞毒性Tリンパ球抗原4(CTLA−4)、B7H1、B7H4、OX−40、CD137、CD40、LAG−3およびTIM−3を含むが、これらに限定されず、これらは免疫細胞を直接阻害する。本発明の方法において有用な免疫チェックポイント阻害剤として作用し得る免疫療法剤は、PD−L1、PD−L2、CTLA−4、TIM−3、LAG−3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、CEACAM(例えば、CEACAM−1および/またはCEACAM−5)および/またはTGFベータの阻害剤を含むが、これらに限定されない。
ある実施態様において、阻害剤は、可溶性リガンド(例えば、CTLA−4−IgまたはTIM−3−Ig)またはPD−L1、PD−L2もしくはCTLA−4に結合する抗体もしくは抗体フラグメントである。例えば、抗PD−1抗体分子を、例えば、癌(例えば、黒色腫、例えば、転移黒色腫、肺癌、例えば、非小細胞肺癌または前立腺癌から選択される癌)の処置に、抗CTLA−4抗体、例えば、イピリムマブと組み合わせて投与し得る。抗CTLA−4抗体の例は、トレメリムマブ(Pfizerから入手可能なIgG2モノクローナル抗体、以前はチシリムマブ、CP−675,206として知られる)およびイピリムマブ(CTLA−4抗体、MDX−010、CAS No. 477202-00-9としても知られる)を含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、処置後、例えば、BRAF阻害剤(例えば、ベムラフェニブまたはダブラフェニブ)を併用するまたは併用しない抗CTLA−4抗体(例えば、イピリムマブ)での黒色腫処置後、投与する。使用できる用量の例は、約1〜10mg/kg、例えば、3mg/kg用量の抗PD−1抗体分子および約3mg/kg用量の抗CTLA−4抗体、例えば、イピリムマブを含む。
免疫阻害性分子、例えば、PD−1およびLAG−3は、腫瘍性免疫回避を促進するT細胞機能を制御、例えば、相乗的制御できる。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、抗LAG−3抗体またはその抗原結合フラグメントと組み合わせて投与する。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、抗TIM−3抗体またはその抗原結合フラグメントと組み合わせて投与する。さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、抗LAG−3抗体および抗TIM−3抗体または抗原結合フラグメントthereofと組み合わせて投与する。ここに記載する抗体の組み合わせを、別々に、例えば、別々の抗体としてまたは、例えば、二特異的または三特異的抗体分子として連結して、投与できる。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、CEACAM阻害剤(例えば、CEACAM−1、CEACAM−3および/またはCEACAM−5阻害剤)、例えば、抗CEACAM抗体分子と組み合わせて投与する。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、CEACAM−1阻害剤、例えば、抗CEACAM−1抗体分子と組み合わせて投与する。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、CEACAM−5阻害剤、例えば、抗CEACAM−5抗体分子と組み合わせて投与する。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子および抗TIM−3または抗LAG−3抗体またはその抗原結合フラグメントを含む二特異的抗体が投与される。ある実施態様において、ここに記載する抗体の組み合わせを癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、固形腫瘍の処置に使用する。前記組み合わせ物の有効性を、当分野で知られる動物モデルで試験できる。例えば、抗PD−1および抗LAG−3の相乗効果を試験する動物モデルは、例えば、Woo et al. (2012) Cancer Res. 72(4):917-27)に記載される。
ある実施態様において、CEACAM(例えば、CEACAM−1および/またはCEACAM−5)の阻害剤は抗CEACAM抗体分子である。理論に縛られることを望まないが、CEACAM−1は、TIM−3のリガンドおよびパートナーとして記載されている(例えば、WO2014/022332号参照)。抗TIM−3と抗CEACAM−1抗体の組み合わせのインビボでの相乗効果が異種移植癌モデルで検出されている(例えば、WO2014/022332号参照)。腫瘍は、例えば、Markel et al. J Immunol. 2002 Mar 15;168(6):2803-10; Markel et al. J Immunol. 2006 Nov 1;177(9):6062-71; Markel et al. Immunology. 2009 Feb;126(2):186-200; Markel et al. Cancer Immunol Immunother. 2010 Feb;59(2):215-30; Ortenberg et al. Mol Cancer Ther. 2012 Jun;11(6):1300-10; Stern et al. J Immunol. 2005 Jun 1;174(11):6692-701; Zheng et al. PLoS One. 2010 Sep 2;5(9). pii: e12529に記載のとおり、CEACAM−1またはCEACAM−5を使用して免疫系を阻害すると考えられる。それ故に、CEACAM阻害剤を、癌、例えば、黒色腫、肺癌(例えば、NSCLC)、膀胱、結腸または卵巣癌または他のここに記載する癌に対する免疫応答増強のために、ここに記載する他の免疫調節剤(例えば、抗PD−1または抗TIM−3阻害剤)と共に使用できる。ある実施態様において、CEACAMの阻害剤は、WO2010/125571号、WO2013/82366号およびWO2014/022332号に記載の抗CEACAM−1抗体、例えば、US2004/0047858号、US7,132,255号およびWO99/52552号に記載の、例えば、モノクローナル抗体34B1、26H7および5F4またはその組み換え形態である。他の実施態様において、抗CEACAM抗体は、例えば、WO2010/125571号、WO2013/054331号およびUS2014/0271618号に記載の、抗CEACAM−1および/または抗CEACAM−5抗体分子である。
ある実施態様において、PD−1およびLAG−3免疫阻害性分子(例えば、抗体分子)を互いに組み合わせて、例えば、癌の処置のために投与する。ある実施態様において、患者は、PD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗体分子)および/またはPD−L1阻害剤(例えば、抗体分子)での治療中に進行した(例えば、腫瘍増殖を経験した)患者である。ある実施態様において、PD−1抗体分子および/またはPD−L1抗体分子での治療を継続し、LAG−3免疫阻害性分子(例えば、抗体)をその治療に加える。
ある実施態様において、PD−1およびTIM−3免疫阻害性分子(例えば、抗体分子)を互いに組み合わせて、例えば、癌の処置のために投与する。ある実施態様において、患者は、PD−1阻害剤(例えば、ここに記載する抗体分子)および/またはPD−L1阻害剤(例えば、抗体分子)での治療中に進行した(例えば、腫瘍増殖を経験した)患者である。ある実施態様において、PD−1抗体分子および/またはPD−L1抗体分子での治療を継続し、TIM−3免疫阻害性分子(例えば、抗体)をその治療に加える。
他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、サイトカイン、例えば、インターロイキン−21、インターロイキン−2、インターロイキン−12またはインターロイキン−15と組み合わせて投与する。ある実施態様において、ここに記載する抗PD−1抗体分子とサイトカインの組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、固形腫瘍または黒色腫)の処置に使用する。
抗PD−1抗体分子と組み合わせて使用できる免疫調節剤の例は、例えば、アフツズマブ(Roche(登録商標)から入手可能)、ペグフィルグラスチム(ニューラスタ(登録商標));レナリドマイド(CC−5013、レブリミド(登録商標))、サリドマイド(サロミド(登録商標))、アクチミド(CC4047)およびサイトカイン、例えば、IL−21またはIRX−2(インターロイキン1、インターロイキン2およびインターフェロンγを含むヒトサイトカイン混合物、CAS 951209-71-5、IRX Therapeuticsから入手可能)を含むが、これらに限定されない。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、進行型または転移癌を有する患者(例えば、転移性および再発性NSCL癌を有する患者)にインドールアミン−ピロール2,3−ジオキシゲナーゼ(IDO)阻害剤(例えば、INCB24360)と組み合わせて使用する。
他の実施態様において、ここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、骨髄移植、フルダラビンのような化学療法剤を使用するT細胞除去療法、外部ビーム放射線療法(XRT)、シクロホスファミドおよび/またはOKT3またはCAMPATHのような抗体の1以上と組み合わせて(例えば、前に、同時にまたは後に)対象に投与する。ある実施態様において、組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、CD20と反応する薬剤、例えば、リツキサンのようなB細胞除去療法の後に投与する。例えば、ある実施態様において、対象は、高用量化学療法と続く末梢血幹細胞移植の標準処置下にあってよい。ある実施態様において、移植後、対象は組み合わせ物を受ける。付加的実施態様において、組み合わせ物を手術の前または後に投与する。
組み合わせ物の他の例は、黒色腫の処置のための、デカルバジンと組み合わせた抗PD−1抗体である。細胞死によりPD−1遮断と相乗性がもたらされ得る他の組み合わせ治療は、放射線、手術およびホルモン除去である。これらのプロトコールの各々は、宿主における腫瘍抗原の供給源をもたらす。血管形成阻害剤をまたPD−1遮断と組み合わせ得る。血管形成の阻害は、腫瘍抗原を宿主抗原提示経路に供給し得る腫瘍細胞死に至る。
PD−1遮断抗体を含む組み合わせ物も、二特異的抗体と組み合わせて使用できる。二特異的抗体は、2つの別々の抗原を標的とするのに使用できる。例えば抗Fc受容体/抗腫瘍抗原(例えば、Her−2/neu)二特異的抗体は、腫瘍部位にマクロファージを標的化させるために使用されている。このターゲティングは、腫瘍特異的応答をより効率的に活性化し得る。これらの応答のT細胞アームは、PD−1遮断の使用により増強される。あるいは、抗原を、腫瘍抗原および樹状細胞特異的細胞表面マーカーに結合する二特異的抗体の使用により、DCに直接送達させ得る。
腫瘍は、宿主免疫監視を、多種多様な機構により回避する。これらの機構の多くは、腫瘍により発現され、免疫抑制性であるタンパク質の不活性化により克服され得る。これらは、とりわけ、TGF−ベータ(Kehrl, J. et al. (1986) J. Exp. Med. 163: 1037-1050)、IL−10(Howard, M. & O’Garra, A. (1992) Immunology Today 13: 198-200)およびFasリガンド(Hahne, M. et al. (1996) Science 274: 1363-1365)を含む。抗PD−1抗体を含むここに開示する組成物は、免疫抑制性剤の効果を相殺し、宿主による腫瘍免疫応答を支持し得る。
宿主免疫応答性を活性化するために使用し得る他の抗体を、ここでの組み合わせ物において、さらに抗PD−1抗体分子、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子と組み合わせて使用し得る。これらは、DC機能および抗原提示を活性化する樹状細胞表面上の分子を含む。抗CD40抗体は、T細胞ヘルパー活性を効率的に置き換えることができ(Ridge, J. et al. (1998) Nature 393: 474-478)、PD−1抗体と共に使用することができる(Ito, N. et al. (2000) Immunobiology 201 (5) 527-40)。CTLA−4(例えば、米国特許5,811,097号)、OX−40(Weinberg, A. et al. (2000) Immunol 164: 2160-2169)、4−1BB(Melero, I. et al. (1997) Nature Medicine 3: 682-685(1997)およびICOS(Hutloff, A. et al. (1999) Nature 397: 262-266)のようなT細胞共刺激性分子に対する抗体も、T細胞活性化のレベル上昇のために提供し得る。
標準治療処置のさらなる例は、引用により全体を本明細書に包含させる“PD−1に対する抗体分子およびその使用”なる標題のUS2015/0210769号(USSN14/604,415)における“組み合わせ治療”のセクジョンおよび下に記載される。
ここに記載する方法の全てにおいて、PD−1遮断を、腫瘍抗原提示を増強するために提供される、サイトカイン処置(例えば、インターフェロン、GM−CSF、G−CSF、IL−2、IL−21)のような他の形態の免疫療法または二特異的抗体治療と組み合わせ得る(例えば、Holliger (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:6444-6448; Poljak (1994) Structure 2:1121-1123参照)。
抗体分子の投与方法は当分野で知られ、下に記載する。使用する分子の適当な投与量は、対象の年齢および体重ならびに使用する特定の薬物による。抗PD−1抗体分子の投与量および治療レジメンは、当業者により決定され得る。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、約1〜30mg/kg、例えば、約5〜25mg/kg、約10〜20mg/kg、約1〜5mg/kgまたは約3mg/kgの用量での注射(例えば、皮下または静脈内)により投与される。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、約1mg/kg、約3mg/kg、約5mg/kg、約10mg/kg、約20mg/kg、約30mg/kgまたは約40mg/kgの用量で投与される。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、約1〜3mg/kgまたは約3〜10mg/kgの用量で投与される。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は、約0.5〜2mg/kg、2〜4mg/kg、2〜5mg/kg、5〜15mg/kgまたは5〜20mg/kgの用量で投与される。投与スケジュールは、例えば、週に1回から2週、3週または4週に1回までで変わり得る。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、隔週で約10〜20mg/kgの用量で投与する。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、約1mg/kg2週毎、約3mg/kg2週毎、10mg/kg2週毎、3mg/kg4週毎または5mg/kg4週毎の用量で投与する。
抗体分子を、コンジュゲートされていない形態でまたは第二薬剤、例えば、細胞毒性薬物、放射性同位体またはタンパク質、例えば、タンパク質毒素またはウイルスタンパク質にコンジュゲートした形態で使用できる。この方法は、抗体分子を、単独でまたは細胞毒性薬物にコンジュゲートさせて、このような処置を必要とする対象に投与することを含む。抗体分子を、多様な治療剤、例えば、細胞毒性部分、例えば、治療薬物、放射性同位体、植物、真菌または細菌起源の分子または生物学的タンパク質(例えば、タンパク質毒素)または粒子(例えば、組み換えウイルス粒子、例えばウイルスコートタンパク質を経る)またはこれらの混合物の送達に使用できる。
付加的組み合わせ治療
ここに開示する組み合わせ物、例えば、PD−1遮断薬剤を含む組み合わせ物を、標準癌処置、例えば、化学療法レジメと組み合わせてもよい。これらの場合、投与する化学療法剤の用量を減らすことが可能であるかもしれない(Mokyr, M. et al. (1998) Cancer Research 58: 5301-5304)。ある実施態様において、ここに記載する方法および組成物を、他の抗体分子、化学療法、他の抗癌治療(例えば、標的化抗癌治療または腫瘍溶解剤)、細胞毒性剤、免疫ベースの治療(例えば、サイトカイン)、外科的および/または放射線治療の1以上と組み合わせて投与する。組み合わせて投与できる細胞毒性剤の例は、微小管阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤、代謝拮抗剤、有糸分裂阻害剤、アルキル化剤、アントラサイクリン、ビンカアルカロイド、挿入剤、シグナル伝達経路を妨害できる薬剤、アポトーシスを促進する薬剤、プロテオソーム阻害剤および放射線(例えば、局所または全身照射)を含む。
前記組み合わせ物の代わりにまたはそれと組み合わせて、ここに記載する方法および組成物を、免疫調節剤(例えば、共刺激性分子のアクティベーターまたは阻害性分子の阻害剤)、ワクチン、例えば、治療癌ワクチンまたは他の形態の細胞免疫療法の1以上と組み合わせて投与できる。
組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子および癌に対する標準治療を含む組み合わせ物の例は、引用により全体を本明細書に包含させる“PD−1に対する抗体分子およびその使用”なる名称のUS2015/0210769号(USSN14/604,415)に記載され、アルキル化剤、アントラサイクリン、ビンカアルカロイド、プロテオソーム阻害剤およびチロシンキナーゼ阻害剤(例えば、受容体チロシンキナーゼ(RTK)阻害剤)を含むが、これらに限定されない。
チロシンキナーゼ阻害剤の例は、上皮細胞増殖因子(EGF)経路阻害剤(例えば、上皮細胞増殖因子受容体(EGFR)阻害剤)、血管内皮細胞増殖因子(VEGF)経路阻害剤(例えば、血管内皮細胞増殖因子受容体(VEGFR)阻害剤(例えば、VEGFR−1阻害剤、VEGFR−2阻害剤、VEGFR−3阻害剤))、血小板由来増殖因子(PDGF)経路阻害剤(例えば、血小板由来増殖因子受容体(PDGFR)阻害剤(例えば、PDGFR−β阻害剤))、RAF−1阻害剤、キット阻害剤およびRET阻害剤を含むが、これらに限定されない。選択チロシンキナーゼ阻害剤は、スニチニブ、エルロチニブ、ゲフィチニブまたはソラフェニブから選択される。
ある実施態様において、組み合わせ物は、血管内皮細胞増殖因子(VEGF)受容体阻害剤、例えば、ここに記載するVEGFR阻害剤を含む。
ある実施態様において、組み合わせ物は、PI3K阻害剤、例えば、ここに記載するPI3K阻害剤を含む。
ある実施態様において、組み合わせ物は、mTOR阻害剤、例えば、ここに記載するmTOR阻害剤を含む。
ある実施態様において、組み合わせ物は、BRAF阻害剤、例えば、GSK2118436、RG7204、PLX4032、GDC−0879、PLX4720およびソラフェニブトシレート(Bay 43−9006)を含む。ある実施態様において、組み合わせ物は、RAF阻害剤、例えば、ダブラフェニブまたはN−{3−[5−(2−アミノピリミジン−4−イル)−2−tert−ブチル−1,3−チアゾール−4−イル]−2−フルオロフェニル}−2,6−ジフルオロベンゼンスルホンアミドを含む。
ある実施態様において、組み合わせ物は、MEK阻害剤を含む。ある実施態様において、組み合わせ物で処置される癌は、黒色腫、結腸直腸癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、乳癌、前立腺癌、膵臓癌、造血器腫瘍または腎細胞癌から選択される。ある実施態様において、癌は、BRAF変異(例えば、BRAF V600E変異)、BRAF野生型、KRAS野生型または活性化KRAS変異を含む。癌は、早期、中期または末期であり得る。ARRY−142886、G02442104(GSK1120212としても知られる)、RDEA436、RDEA119/BAY 869766、AS703026、G00039805(AZD−6244またはセルメチニブとしても知られる)、BIX 02188、BIX 02189、CI−1040(PD−184352)、PD0325901、PD98059、U0126、GDC−0973(メタノン、[3,4−ジフルオロ−2−[(2−フルオロ−4−ヨードフェニル)アミノ]フェニル][3−ヒドロキシ−3−(25)−2−ピペリジニル−1−アゼチジニル]−)、G−38963、G02443714(AS703206としても知られる)またはその薬学的に許容される塩もしくは溶媒和物を含むが、これらに限定されない、あらゆるMEK阻害剤が組み合わせ物で使用され得る。MEK阻害剤のさらなる例は、引用により内容を本明細書に包含させる、WO2013/019906号、WO03/077914号、WO2005/121142号、WO2007/04415号、WO2008/024725号およびWO2009/085983号に開示される。ある実施態様において、MEK阻害剤はトラメチニブまたはN−(3−{3−シクロプロピル−5−[(2−フルオロ−4−ヨードフェニル)アミノ]−6,8−ジメチル−2,4,7−トリオキソ−3,4,6,7−テトラヒドロピリド[4,3−d]ピリミジン−1(2H)−イル}フェニル)アセトアミドである。
ある実施態様において、組み合わせ物はJAK2阻害剤、例えば、CEP−701、INCB18424、CP−690550(タソシチニブ)を含む。
ある実施態様において、組み合わせ物は、パクリタキセルまたはパクリタキセル薬剤、例えば、タキソール(登録商標)、タンパク質結合パクリタキセル(例えば、アブラキサン(登録商標))を含む。
放射線療法を、外照射療法、内部放射線療法、インプラント放射線、定位放射線照射、全身放射線療法、放射線療法および持続性または一過性間質性密封小線源治療を含むが、これらに限定されない、いくつかの方法の一つまたは方法の組み合わせをとおして適用できる。
開示する組み合わせ物を、手術、放射線療法(例えば、放射線場が設計される3次元的原体照射療法を含む外照射療法、局所放射線(例えば、予め選択した標的または臓器に指向した照射)または焦点を絞った放射線)を含むが、これらに限定されない、癌処置の既存のモダリティの1以上と組み合わせて投与できる。焦点を絞った放射線は、定位放射線照射、分割定位放射線照射および強度変調放射線療法からなる群から選択され得る。焦点を絞った放射線は、例えば、WO2012/177624号に記載の、粒子ビーム(プロトン)、コバルト−60(フォトン)および直線加速器(x線)からなる群から選択される、放射線源を有し得る。
ある実施態様において、組み合わせ物は、キラー細胞免疫グロブリン様受容体(ここでは“抗KIR抗体”とも称する)、汎KIR抗体、抗NKG2D抗体および抗MICA抗体に対する抗体を含む。ある実施態様において、ここに記載する抗PD−1抗体分子と抗KIR抗体、汎KIR抗体または抗NKG2D抗体の組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、固形腫瘍、例えば、進行型固形腫瘍)の処置に使用する。
ある実施態様において、組み合わせ物は、細胞免疫療法(例えば、プロベンジ(例えば、シプロイセル))および場合によりシクロホスファミドとの組み合わせを含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子、プロベンジおよび/またはシクロホスファミドの組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、前立腺癌、例えば、進行型前立腺癌)の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物は、ワクチン、例えば、樹状細胞腎癌(DC−RCC)ワクチンを含む。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子とDC−RCCワクチンの組み合わせ物を、癌、例えば、ここに記載する癌(例えば、腎癌、例えば、転移腎細胞癌(RCC)または明細胞腎細胞癌(CCRCC))の処置に使用する。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせて、化学療法および/または免疫療法と組み合わせて投与される。例えば、抗PD−1抗体分子を、単独でまたは化学療法または他の抗癌剤(例えば、サリドマイドアナログ、例えば、レナリドマイド)、抗TIM−3抗体、腫瘍抗原パルス樹状細胞、腫瘍細胞と樹状細胞の融合体(例えば、電気融合体)または悪性形質細胞により産生された免疫グロブリンイディオタイプでのワクチン接種の1以上と組み合わせて、骨髄腫の処置に使用できる。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、骨髄腫、例えば、多発性骨髄腫の処置に、抗TIM−3抗体と組み合わせて使用する。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせて、肺癌、例えば、非小細胞肺癌の処置に、化学療法と組み合わせて使用する。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、肺癌の処置のために白金ダブレット治療と共に使用する。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせて、腎癌、例えば、腎細胞癌(RCC)(例えば、明細胞腎細胞癌(CCRCC)または転移RCCの処置に使用する。抗PD−1抗体分子を、免疫ベースのストラテジー(例えば、インターロイキン−2またはインターフェロン−α)、標的化薬剤(例えば、VEGFに対するモノクローナル抗体のようなVEGF阻害剤)、スニチニブ、ソラフェニブ、アクシチニブおよびパゾパニブのようなVEGFチロシンキナーゼ阻害剤、RNAi阻害剤)またはVEGFシグナル伝達の下流メディエーターの阻害剤、例えば、ラパマイシンの哺乳動物標的(mTOR)の阻害剤、例えば、エベロリムスおよびテムシロリムスの1以上と組み合わせて投与し得る。
膵臓癌の処置のために、ここに記載する抗PD−1抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)との組み合わせで、組み合わせて使用するための適当な治療の例は、化学療法剤、例えば、パクリタキセルまたはパクリタキセル薬剤(例えば、タキソール、アルブミン安定化ナノ粒子パクリタキセル製剤(例えば、アブラキサン)またはリポソームパクリタキセル製剤のようなパクリタキセル製剤)、ゲムシタビン(例えば、ゲムシタビン単独またはAXP107−11との組み合わせ)、他のオキサリプラチン、5−フルオロウラシル、カペシタビン、ルビテカン、塩酸エピルビシン、NC−6004、シスプラチン、ドセタキセル(例えば、タキソテール)、マイトマイシンC、イホスファミドのような化学療法剤、インターフェロン、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、EGFR阻害剤(例えば、エルロチニブ、パニツムマブ、セツキシマブ、ニモツズマブ)、HER2/neu受容体阻害剤(例えば、トラスツズマブ)、デュアルキナーゼ阻害剤(例えば、ボスチニブ、サラカチニブ、ラパチニブ、バンデタニブ)、多キナーゼ阻害剤(例えば、ソラフェニブ、スニチニブ、XL184、パゾパニブ)、VEGF阻害剤(例えば、ベバシズマブ、AV−951、ブリバニブ)、放射免疫療法(例えば、XR303)、癌ワクチン(例えば、GVAX、サバイビンペプチド)、COX−2阻害剤(例えば、セレコキシブ)、IGF−1受容体阻害剤(例えば、AMG 479、MK−0646)、mTOR阻害剤(例えば、エベロリムス、テムシロリムス)、IL−6阻害剤(例えば、CNTO 328)、サイクリン依存性キナーゼ阻害剤(例えば、P276−00、UCN−01)、改変エネルギー代謝指向(AEMD)化合物(例えば、CPI−613)、HDAC阻害剤(例えば、ボリノスタット)、TRAIL受容体2(TR−2)アゴニスト(例えば、コナツムマブ)、MEK阻害剤(例えば、AS703026、セルメチニブ、GSK1120212)、Raf/MEKデュアルキナーゼ阻害剤(例えば、RO5126766)、ノッチシグナル伝達阻害剤(例えば、MK0752)、モノクローナル抗体−抗体融合体タンパク質(例えば、L19IL2)、クルクミン、HSP90阻害剤(例えば、タネスピマイシン、STA−9090)、rIL−2、、デニロイキンジフチトクス、トポイソメラーゼ1阻害剤(例えば、イリノテカン、PEP02)、スタチン(例えば、シンバスタチン)、第VIIa因子阻害剤(例えば、PCI−27483)、AKT阻害剤(例えば、RX−0201)、低酸素活性化プロドラッグ(例えば、TH−302)、塩酸メトホルミン、ガンマ−セクレターゼ阻害剤(例えば、RO4929097)、リボヌクレオチドレダクターゼ阻害剤(例えば、3−AP)、免疫毒素(例えば、HuC242−DM4)、PARP阻害剤(例えば、KU−0059436、ベリパリブ)、CTLA−4阻害剤(例えば、CP−675,206、イピリムマブ)、AdV−tk治療、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ(ベルケイド)、NPI−0052)、チアゾリジンジオン(例えば、ピオグリタゾン)、NPC−1C、オーロラキナーゼ阻害剤(例えば、R763/AS703569)、CTGF阻害剤(例えば、FG−3019)、siG12D LODER、および放射線療法(例えば、トモセラピー、定位放射線、プロトン治療)、手術およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。ある実施態様において、パクリタキセルまたはパクリタキセル薬剤およびゲムシタビンの組み合わせを、ここに記載する抗PD−1抗体分子と共に使用できる。
小細胞肺癌の処置のために、ここに記載する抗PD−1抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)との組み合わせで、組み合わせて使用するための適当な治療の例は、化学療法剤、例えば、エトポシド、カルボプラチン、シスプラチン、オキサリプラチン、イリノテカン、トポテカン、ゲムシタビン、リポソームSN−38、ベンダムスチン、テモゾロミド、ベロテカン、NK012、FR901228、フラボピリドール)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、EGFR阻害剤(例えば、エルロチニブ、ゲフィチニブ、セツキシマブ、パニツムマブ)、多キナーゼ阻害剤(例えば、ソラフェニブ、スニチニブ)、VEGF阻害剤(例えば、ベバシズマブ、バンデタニブ)、癌ワクチン(例えば、GVAX)、Bcl−2阻害剤(例えば、オブリメルセンナトリウム、ABT−263)、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ(ベルケイド)、NPI−0052)、パクリタキセルまたはパクリタキセル薬剤、ドセタキセル、IGF−1受容体阻害剤(例えば、AMG 479)、HGF/SF阻害剤(例えば、AMG 102、MK−0646)、クロロキン、オーロラキナーゼ阻害剤(例えば、MLN8237)、放射免疫療法(例えば、TF2)、HSP90阻害剤(例えば、タネスピマイシン、STA−9090)、mTOR阻害剤(例えば、エベロリムス)、Ep−CAM−/CD3−二特異的抗体(例えば、MT110)、CK−2阻害剤(例えば、CX−4945)、HDAC阻害剤(例えば、ベリノスタット)、SMOアンタゴニスト(例えば、BMS 833923)、ペプチド癌ワクチンおよび放射線療法(例えば、強度変調放射線療法(IMRT)、少分割放射線療法、低酸素誘導性放射線療法)、手術およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
非小細胞肺癌の処置のために、ここに記載する抗PD−1抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)との組み合わせで、組み合わせて使用するための適当な治療の例は、化学療法剤、例えば、ビノレルビン、シスプラチン、ドセタキセル、ペメトレキセドジナトリウム、エトポシド、ゲムシタビン、カルボプラチン、リポソームSN−38、TLK286、テモゾロミド、トポテカン、ペメトレキセドジナトリウム、アザシチジン、イリノテカン、テガフール−ギメラシル−オテラシルカリウム、サパシタビン)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、EGFR阻害剤(例えば、エルロチニブ、ゲフィチニブ、セツキシマブ、パニツムマブ、ネシツムマブ、PF−00299804、ニモツズマブ、RO5083945)、MET阻害剤(例えば、PF−02341066、ARQ 197)、PI3Kキナーゼ阻害剤(例えば、XL147、GDC−0941)、Raf/MEKデュアルキナーゼ阻害剤(例えば、RO5126766)、PI3K/mTORデュアルキナーゼ阻害剤(例えば、XL765)、SRC阻害剤(例えば、ダサチニブ)、デュアル阻害剤(例えば、BIBW 2992、GSK1363089、ZD6474、AZD0530、AG−013736、ラパチニブ、MEHD7945A、リニファニブ)、多キナーゼ阻害剤(例えば、ソラフェニブ、スニチニブ、パゾパニブ、AMG 706、XL184、MGCD265、BMS−690514、R935788)、VEGF阻害剤(例えば、endostar、エンドスタチン、ベバシズマブ、セジラニブ、BIBF 1120、アクシチニブ、チボザニブ、AZD2171)、癌ワクチン(例えば、BLP25リポソームワクチン、GVAX、組み換えDNAおよびL523Sタンパク質を発現するアデノウイルス)、Bcl−2阻害剤(例えば、オブリメルセンナトリウム)、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、NPI−0052、MLN9708)、パクリタキセルまたはパクリタキセル薬剤、ドセタキセル、IGF−1受容体阻害剤(例えば、シズツムマブ、MK−0646、OSI 906、CP−751,871、BIIB022)、ヒドロキシクロロキン、HSP90阻害剤(例えば、タネスピマイシン、STA−9090、AUY922、XL888)、mTOR阻害剤(例えば、エベロリムス、テムシロリムス、リダフォロリムス)、Ep−CAM−/CD3−二特異的抗体(例えば、MT110)、CK−2阻害剤(例えば、CX−4945)、HDAC阻害剤(例えば、MS 275、LBH589、ボリノスタット、バルプロ酸、FR901228)、DHFR阻害剤(例えば、プララトレキサート)、レチノイド(例えば、ベキサロテン、トレチノイン)、抗体−薬物コンジュゲート(例えば、SGN−15)、ビスホスホネート(例えば、ゾレドロン酸)、癌ワクチン(例えば、ベラゲンプマツセル−L)、低分子量ヘパリン(LMWH)(例えば、チンザパリン、エノキサパリン)、GSK1572932A、メラトニン、タラクトフェリン、ジメスナ、トポイソメラーゼ阻害剤(例えば、アムルビシン、エトポシド、カレニテシン)、ネルフィナビル、シレンギチド、ErbB3阻害剤(例えば、MM−121、U3−1287)、サバイビン阻害剤(例えば、YM155、LY2181308)、エリブリンメシレート、COX−2阻害剤(例えば、セレコキシブ)、ペグフィルグラスチム、Polo様キナーゼ1阻害剤(例えば、BI 6727)、TRAIL受容体2(TR−2)アゴニスト(例えば、CS−1008)、CNGRCペプチド(配列番号225)−TNFアルファコンジュゲート、ジクロロアセテート(DCA)、HGF阻害剤(例えば、SCH 900105)、SAR240550、PPAR−ガンマアゴニスト(例えば、CS−7017)、ガンマ−セクレターゼ阻害剤(例えば、RO4929097)、後成的治療(例えば、5−アザシチジン)、ニトログリセリン、MEK阻害剤(例えば、AZD6244)、サイクリン依存性キナーゼ阻害剤(例えば、UCN−01)、コレステロール−Fus1、抗チューブリン薬剤(例えば、E7389)、ファルネシル−OHトランスフェラーゼ阻害剤(例えば、ロナファルニブ)、免疫毒素(例えば、BB−10901、SS1(dsFv)PE38)、フォンダパリヌクス、血管破壊薬剤(例えば、AVE8062)、PD−L1阻害剤(例えば、MDX−1105、MDX−1106)、ベータ−グルカン、NGR−hTNF、EMD 521873、MEK阻害剤(例えば、GSK1120212)、エポチロンアナログ(例えば、イクサベピロン)、キネシンスピンドル阻害剤(例えば、4SC−205)、テロメア標的剤(例えば、KML−001)、P70経路阻害剤(例えば、LY2584702)、AKT阻害剤(例えば、MK−2206)、血管形成阻害剤(例えば、レナリドマイド)、ノッチシグナル伝達阻害剤(例えば、OMP−21M18)、放射線療法、手術およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
卵巣癌の処置のために、ここに記載する抗PD−1抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)との組み合わせで、組み合わせて使用するための適当な治療の例は、化学療法剤(例えば、パクリタキセルまたはパクリタキセル薬剤、ドセタキセル、カルボプラチン、ゲムシタビン、ドキソルビシン、トポテカン、シスプラチン、イリノテカン、TLK286、イホスファミド、オラパリブ、オキサリプラチン、メルファラン、ペメトレキセドジナトリウム、SJG−136、シクロホスファミド、エトポシド、デシタビン)、グレリンアンタゴニスト(例えば、AEZS−130)、免疫療法(例えば、APC8024、オレゴボマブ、OPT−821)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、EGFR阻害剤(例えば、エルロチニブ)、デュアル阻害剤(例えば、E7080)、多キナーゼ阻害剤(例えば、AZD0530、JI−101、ソラフェニブ、スニチニブ、パゾパニブ)、ON 01910.Na)、VEGF阻害剤(例えば、ベバシズマブ、BIBF 1120、セジラニブ、AZD2171)、PDGFR阻害剤(例えば、IMC−3G3)、パクリタキセル、トポイソメラーゼ阻害剤(例えば、カレニテシン、イリノテカン)、HDAC阻害剤(例えば、バロプロエート、ボリノスタット)、葉酸受容体阻害剤(例えば、ファーレツズマブ)、アンギオポエチン阻害剤(例えば、AMG 386)、エポチロンアナログ(例えば、イクサベピロン)、プロテアソーム阻害剤(例えば、カルフィルゾミブ)、IGF−1受容体阻害剤(例えば、OSI 906、AMG 479)、PARP阻害剤(例えば、ベリパリブ、AG014699、イニパリブ、MK−4827)、オーロラキナーゼ阻害剤(例えば、MLN8237、ENMD−2076)、血管形成阻害剤(例えば、レナリドマイド)、DHFR阻害剤(例えば、プララトレキサート)、放射免疫治療剤(例えば、Hu3S193)、スタチン(例えば、ロバスタチン)、トポイソメラーゼ1阻害剤(例えば、NKTR−102)、癌ワクチン(例えば、p53合成長ペプチドワクチン、自己OC−DCワクチン)、mTOR阻害剤(例えば、テムシロリムス、エベロリムス)、BCR/ABL阻害剤(例えば、イマチニブ)、ET−A受容体アンタゴニスト(例えば、ZD4054)、TRAIL受容体2(TR−2)アゴニスト(例えば、CS−1008)、HGF/SF阻害剤(例えば、AMG 102)、EGEN−001、Polo様キナーゼ1阻害剤(例えば、BI 6727)、ガンマ−セクレターゼ阻害剤(例えば、RO4929097)、Wee−1阻害剤(例えば、MK−1775)、抗チューブリン薬剤(例えば、ビノレルビン、E7389)、免疫毒素(例えば、デニロイキンジフチトクス)、SB−485232、血管破壊薬剤(例えば、AVE8062)、インテグリン阻害剤(例えば、EMD 525797)、キネシンスピンドル阻害剤(例えば、4SC−205)、レブリミド、HER2阻害剤(例えば、MGAH22)、ErrB3阻害剤(例えば、MM−121)、放射線療法およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
ある例示的実施態様において、抗PD−1抗体分子は、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせて、骨髄腫の処置のために、化学療法または他の抗癌剤(例えば、サリドマイドアナログ、例えば、レナリドマイド)、HSCT(Cook, R. (2008) J Manag Care Pharm. 14(7 Suppl):19-25)、抗TIM−3抗体(Hallett, WHD et al. (2011) J of American Society for Blood and Marrow Transplantation 17(8):1133-145)、腫瘍抗原パルス樹状細胞、腫瘍細胞と樹状細胞の融合体(例えば、電気融合体)または悪性形質細胞により産生された免疫グロブリンイディオタイプでのワクチン接種(Yi, Q. (2009) Cancer J. 15(6):502-10に記載)の1以上と組み合わせて投与できる。
さらに他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせて、腎癌、例えば、腎細胞癌(RCC)または転移RCCの処置のために使用される。抗PD−1抗体分子を、免疫ベースのストラテジー(例えば、インターロイキン−2またはインターフェロン−α)、標的化薬剤(例えば、VEGFに対するモノクローナル抗体のようなVEGF阻害剤、例えば、ベバシズマブ(Rini, B.I. et al. (2010) J. Clin. Oncol. 28(13):2137-2143))、スニチニブ、ソラフェニブ、アクシチニブおよびパゾパニブのようなVEGFチロシンキナーゼ阻害剤(Pal. S.K. et al. (2014) Clin. Advances in Hematology & Oncology 12(2):90-99)にレビュー)、RNAi阻害剤)またはVEGFシグナル伝達の下流メディエーターの阻害剤、例えば、ラパマイシンの哺乳動物標的(mTOR)の阻害剤、例えば、エベロリムスおよびテムシロリムス(Hudes, G. et al. (2007) N. Engl. J. Med. 356(22):2271-2281, Motzer, R.J. et al. (2008) Lancet 372: 449-456)の1以上と組み合わせて投与できる。
本発明による慢性骨髄性白血病(AML)の処置のための、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、化学療法(例えば、シタラビン、ヒドロキシ尿素、クロファラビン、メルファラン、チオテパ、フルダラビン、ブスルファン、エトポシド、コーディセピン、ペントスタチン、カペシタビン、アザシチジン、シクロホスファミド、クラドリビン、トポテカン)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、BCR/ABL阻害剤(例えば、イマチニブ、ニロチニブ)、ON 01910.Na、デュアル阻害剤(例えば、ダサチニブ、ボスチニブ)、多キナーゼ阻害剤(例えば、DCC−2036、ポナチニブ、ソラフェニブ、スニチニブ、RGB−286638))、インターフェロンアルファ、ステロイド、アポトーシス剤(例えば、オマセタキシン・メペサクシネート)、免疫療法(例えば、同種記憶Th1様T細胞/微粒子結合抗CD3/抗CD28、自己サイトカイン誘発キラー細胞(CIK)、AHN−12)、CD52標的剤(例えば、アレムツズマブ)、HSP90阻害剤(例えば、タネスピマイシン、STA−9090、AUY922、XL888)、mTOR阻害剤(例えば、エベロリムス)、SMOアンタゴニスト(例えば、BMS 833923)、リボヌクレオチドレダクターゼ阻害剤(例えば、3−AP)、JAK−2阻害剤(例えば、INCB018424)、ヒドロキシクロロキン、レチノイド(例えば、フェンレチニド)、サイクリン依存性キナーゼ阻害剤(例えば、UCN−01)、HDAC阻害剤(例えば、ベリノスタット、ボリノスタット、JNJ−26481585)、PARP阻害剤(例えば、ベリパリブ)、MDM2アンタゴニスト(例えば、RO5045337)、オーロラBキナーゼ阻害剤(例えば、TAK−901)、放射免疫療法(例えば、アクチニウム225標識抗CD33抗体HuM195)、ヘッジホッグ阻害剤(例えば、PF−04449913)、STAT3阻害剤(例えば、OPB−31121)、KB004、癌ワクチン(例えば、AG858)、骨髄移植、幹細胞移植、放射線療法およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
慢性リンパ性白血病(CLL)の処置のために、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、化学療法剤(例えば、フルダラビン、シクロホスファミド、ドキソルビシン、ビンクリスチン、クロラムブシル、ベンダムスチン、クロラムブシル、ブスルファン、ゲムシタビン、メルファラン、ペントスタチン、ミトキサントロン、5−アザシチジン、ペメトレキセドジナトリウム)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、EGFR阻害剤(例えば、エルロチニブ)、BTK阻害剤(例えば、PCI−32765)、多キナーゼ阻害剤(例えば、MGCD265、RGB−286638)、CD−20標的剤(例えば、リツキシマブ、オファツムマブ、RO5072759、LFB−R603)、CD52標的剤(例えば、アレムツズマブ)、プレドニゾロン、ダルベポエチンアルファ、レナリドマイド、Bcl−2阻害剤(例えば、ABT−263)、免疫療法(例えば、同種記憶Th1様T細胞/微粒子結合抗CD3/抗CD28、自己サイトカイン誘発キラー細胞(CIK))、HDAC阻害剤(例えば、ボリノスタット、バルプロ酸、LBH589、JNJ−26481585、AR−42)、XIAP阻害剤(例えば、AEG35156)、CD−74標的剤(例えば、ミラツズマブ)、mTOR阻害剤(例えば、エベロリムス)、AT−101、免疫毒素(例えば、CAT−8015、抗Tac(Fv)−PE38(LMB−2))、CD37標的剤(例えば、TRU−016)、放射免疫療法(例えば、131−トシツモマブ)、ヒドロキシクロロキン、ペリホシン、SRC阻害剤(例えば、ダサチニブ)、サリドマイド、PI3Kデルタ阻害剤(例えば、CAL−101)、レチノイド(例えば、フェンレチニド)、MDM2アンタゴニスト(例えば、RO5045337)、プレリキサホル、オーロラキナーゼ阻害剤(例えば、MLN8237、TAK−901)、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ)、CD−19標的剤(例えば、MEDI−551、MOR208)、MEK阻害剤(例えば、ABT−348)、JAK−2阻害剤(例えば、INCB018424)、低酸素活性化プロドラッグ(例えば、TH−302)、パクリタキセルまたはパクリタキセル薬剤、HSP90阻害剤、AKT阻害剤(例えば、MK2206)、HMG−CoA阻害剤(例えば、シンバスタチン)、GNKG186、放射線療法、骨髄移植、幹細胞移植およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
急性リンパ性白血病(ALL)の処置のために、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、化学療法剤(例えば、プレドニゾロン、デキサメサゾン、ビンクリスチン、アスパラギナーゼ、ダウノルビシン、シクロホスファミド、シタラビン、エトポシド、チオグアニン、メルカプトプリン、クロファラビン、リポソームアナマイシン、ブスルファン、エトポシド、カペシタビン、デシタビン、アザシチジン、トポテカン、テモゾロミド)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、BCR/ABL阻害剤(例えば、イマチニブ、ニロチニブ)、ON 01910.Na、多キナーゼ阻害剤(例えば、ソラフェニブ))、CD−20標的剤(例えば、リツキシマブ)、CD52標的剤(例えば、アレムツズマブ)、HSP90阻害剤(例えば、STA−9090)、mTOR阻害剤(例えば、エベロリムス、ラパマイシン)、JAK−2阻害剤(例えば、INCB018424)、HER2/neu受容体阻害剤(例えば、トラスツズマブ)、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ)、メトトレキサート、アスパラギナーゼ、CD−22標的剤(例えば、エピラツズマブ、イノツズマブ)、免疫療法(例えば、自己サイトカイン誘発キラー細胞(CIK)、AHN−12)、ブリナツモマブ、サイクリン依存性キナーゼ阻害剤(例えば、UCN−01)、CD45標的剤(例えば、BC8)、MDM2アンタゴニスト(例えば、RO5045337)、免疫毒素(例えば、CAT−8015、DT2219ARL)、HDAC阻害剤(例えば、JNJ−26481585)、JVRS−100、パクリタキセルまたはパクリタキセル薬剤、STAT3阻害剤(例えば、OPB−31121)、PARP阻害剤(例えば、ベリパリブ)、EZN−2285、放射線療法、ステロイド、骨髄移植、幹細胞移植またはこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
急性骨髄性白血病(AML)の処置のために、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、化学療法剤(例えば、シタラビン、ダウノルビシン、イダルビシン、クロファラビン、デシタビン、ボサロキシン、アザシチジン、クロファラビン、リバビリン、CPX−351、トレオスルファン、エラシタラビン、アザシチジン)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、BCR/ABL阻害剤(例えば、イマチニブ、ニロチニブ)、ON 01910.Na、多キナーゼ阻害剤(例えば、ミドスタウリン、SU 11248、キザルチニブ、ソラフェニブ))、免疫毒素(例えば、ゲムツズマブオゾガマイシン)、DT388IL3融合体タンパク質、HDAC阻害剤(例えば、ボリノスタット、LBH589)、プレリキサホル、mTOR阻害剤(例えば、エベロリムス)、SRC阻害剤(例えば、ダサチニブ)、HSP90阻害剤(例えば、STA−9090)、レチノイド(例えば、ベキサロテン、オーロラキナーゼ阻害剤(例えば、BI 811283)、JAK−2阻害剤(例えば、INCB018424)、Polo様キナーゼ阻害剤(例えば、BI 6727)、セネルセン、CD45標的剤(例えば、BC8)、サイクリン依存性キナーゼ阻害剤(例えば、UCN−01)、MDM2アンタゴニスト(例えば、RO5045337)、mTOR阻害剤(例えば、エベロリムス)、LY573636−ナトリウム、ZRx−101、MLN4924、レナリドマイド、免疫療法(例えば、AHN−12)、ヒスタミンジヒドロクロライド、放射線療法、骨髄移植、幹細胞移植およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
多発性骨髄腫(MM)の処置のために、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、化学療法剤(例えば、メルファラン、アミホスチン、シクロホスファミド、ドキソルビシン、クロファラビン、ベンダムスチン、フルダラビン、アドリアマイシン、SyB L−0501)、サリドマイド、レナリドマイド、デキサメサゾン、プレドニゾン、ポマリドミド、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、MLN9708)、癌ワクチン(例えば、GVAX)、CD−40標的剤(例えば、SGN−40、CHIR−12.12)、ペリホシン、ゾレドロン酸、免疫療法(例えば、MAGE−A3、NY−ESO−1、HuMax−CD38)、HDAC阻害剤(例えば、ボリノスタット、LBH589、AR−42)、アプリジン、サイクリン依存性キナーゼ阻害剤(例えば、PD−0332991、ディナシクリブ)、三酸化ヒ素、CB3304、HSP90阻害剤(例えば、KW−2478)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、EGFR阻害剤(例えば、セツキシマブ)、多キナーゼ阻害剤(例えば、AT9283))、VEGF阻害剤(例えば、ベバシズマブ)、プレリキサホル、MEK阻害剤(例えば、AZD6244)、IPH2101、アトルバスタチン、免疫毒素(例えば、BB−10901)、NPI−0052、放射免疫治療(例えば、イットリウムY 90イブリツモマブチウキセタン)、STAT3阻害剤(例えば、OPB−31121)、MLN4924、オーロラキナーゼ阻害剤(例えば、ENMD−2076)、IMGN901、ACE−041、CK−2阻害剤(例えば、CX−4945)、放射線療法、骨髄移植、幹細胞移植およびこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
前立腺癌の処置に、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、化学療法剤(例えば、ドセタキセル、カルボプラチン、フルダラビン)、アビラテロン、ホルモン療法(例えば、フルタミド、ビカルタミド、ニルタミド、シプロテロンアセテート、ケトコナゾール、アミノグルテチミド、アバレリクス、デガレリクス、リュープロリド、ゴセレリン、トリプトレリン、ブセレリン)、チロシンキナーゼ阻害剤(例えば、デュアルキナーゼ阻害剤(例えば、ラパチニブ)、多キナーゼ阻害剤(例えば、ソラフェニブ、スニチニブ))、VEGF阻害剤(例えば、ベバシズマブ)、TAK−700、癌ワクチン(例えば、BPX−101、PEP223)、レナリドマイド、TOK−001、IGF−1受容体阻害剤(例えば、シズツムマブ)、TRC105、オーロラAキナーゼ阻害剤(例えば、MLN8237)、プロテアソーム阻害剤(例えば、ボルテゾミブ)、OGX−011、放射免疫療法(例えば、HuJ591−GS)、HDAC阻害剤(例えば、バルプロ酸、SB939、LBH589)、ヒドロキシクロロキン、mTOR阻害剤(例えば、エベロリムス)、ドビチニブ乳酸塩、ジインドリルメタン、エファビレンツ、OGX−427、ゲニステイン、IMC−3G3、バフェチニブ、CP−675,206、放射線療法、手術またはこれらの組み合わせを含むが、これらに限定されない。
HNSCCの処置のための、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、ここに記載する化合物A8(またはPCT公開WO2010/029082号に記載の化合物)およびセツキシマブ(例えば、アービタックス、BMSにより上市)の一方または両方を含むが、これらに限定されない。ある実施態様において、治療(例えば、化合物A8またはA8に関連する化合物)はPI3Kモジュレーター、例えば、PI3K阻害剤である。ある実施態様において、治療(例えば、セツキシマブ)は、EGFRを調節、例えば阻害する。ある実施態様において、癌は、対照細胞または参照値と比較して、PI3KまたはEGFRのレベルまたは活性が高い、または高いと同定される。
胃癌、例えば、MSI高および/またはEBV+胃癌の処置のための、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、ここに記載する化合物A8(またはPCT公開WO2010/029082号に記載の化合物)を含む。ある実施態様において、治療(例えば、化合物A8またはA8に関連する化合物)は、PI3Kモジュレーター、例えば、PI3K阻害剤である。ある実施態様において、癌は、対照細胞または参照値と比較して、PI3Kのレベルまたは活性が高い、または高いと同定される。
胃癌、例えば、MSI高および/またはRNF43不活性化胃癌の処置のための、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、ここに記載する化合物A28(またはPCT公開WO2010/101849号に記載の化合物)を含むが、これに限定されない。ある実施態様において、治療(例えば、化合物A28またはA28に関連する化合物)は、porcupineのモジュレーター、例えば、阻害剤である。ある実施態様において、癌は、対照細胞または参照値と比較して、porcupineのレベルまたは活性が高い、または高いと同定される。
GI間質腫瘍(GIST)の処置のための、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、ここに記載する化合物A16(またはPCT公開WO1999/003854号に記載の化合物)を含むが、これに限定されない。ある実施態様において、治療(例えば、化合物A16またはA16に関連する化合物)は、チロシンキナーゼのモジュレーター、例えば、阻害剤である。ある実施態様において、癌は、チロシンキナーゼのレベルまたは活性が高い、または高いと決定される。
NSCLC、例えば、扁平上皮または腺癌の処置のための、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、ここに記載する化合物A17(またはUS特許7,767,675号および8,420,645号に記載の化合物)およびここに記載する化合物A23(またはPCT公開WO2003/077914号に記載の化合物)の一方または両方を含むが、これらに限定されない。ある実施態様において、化合物(例えば、化合物A17またはA17に関連する化合物)は、c−METを調節、例えば阻害する。ある実施態様において、化合物(例えば、化合物A23またはA23に関連する化合物)は、Alkを調節、例えば阻害する。ある実施態様において、癌は、c−METまたはAlkの一方または両方のレベルまたは活性が高い、または高いと同定される。ある実施態様において、癌EGFRは、EGFRに変異を有するまたは有するとして同定される。
黒色腫(例えば、NRAS黒色腫)の処置のための、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、ここに記載の化合物A24(または米国特許8,415,355号および8,685,980号に記載の化合物)およびここに記載の化合物A34(またはPCT公開WO2003/077914号に記載の化合物)の一方または両方を含むが、これらに限定されない。ある実施態様において、化合物(例えば、化合物A24またはA24に関連する化合物)は、JAKおよびCDK4/6の1以上を調節、例えば阻害する。ある実施態様において、化合物(例えば、化合物A34またはA34に関連する化合物)は、MEKを調節、例えば阻害する。ある実施態様において、癌は、対照細胞または参照値と比較して、JAK、CDK4/6およびMEKの1以上のレベルまたは活性が高い、または高いと同定される。
黒色腫(例えば、NRAS黒色腫)の処置のために、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、ここに記載する化合物A29(またはPCT公開WO2011/025927号に記載の化合物)およびここに記載の化合物A34(またはPCT公開WO2003/077914号に記載の化合物)の一方または両方を含むが、これらに限定されない。ある実施態様において、化合物(例えば、化合物A29またはA29に関連する化合物)は、BRAFを調節、例えば阻害する。ある実施態様において、化合物(例えば、化合物A34またはA34に関連する化合物)は、MEKを調節、例えば阻害する。ある実施態様において、癌は、対照細胞または参照値と比較して、BRAFおよびMEKの一方または両方のレベルまたは活性が高い、または高いと同定される。
扁平上皮NSCLCの処置のために、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、ここに記載する化合物A5(またはUS特許8,552,002号に記載の化合物)を含むが、これに限定されない。ある実施態様において、化合物(例えば、化合物A5またはA5に関連する化合物)は、FGFRを調節、例えば阻害する。ある実施態様において、癌は、対照細胞または参照値と比較して、FGFRのレベルまたは活性が高い、または高いと同定される。
結腸直腸癌の処置のために、ここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子、単独または他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)と組み合わせとの組み合わせ物において使用するのに適当な治療の例は、ここに記載する化合物A29(またはa化合物PCT公開WO2011/025927)およびセツキシマブ(例えば、アービタックス、BMSにより上市)の一方または両方を含むが、これらに限定されない。ある実施態様において、治療(例えば、化合物A29またはA29に関連する化合物)は、BRAFを調節、例えば阻害する。ある実施態様において、治療(例えば、セツキシマブ)は、EGFRを調節、例えば阻害する。ある実施態様において、癌は、対照細胞または参照値と比較して、BRAFまたはEGFRのレベルまたは活性が高い、または高いと同定される。
本発明はまた、化合物A8、セツキシマブおよびここに記載する組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子(場合によりTIM−3抗体分子またはLAG−3抗体分子と組み合わせて)との組み合わせ物で癌を処置する方法も提供する。ある実施態様において、患者は、まず、化合物A8およびセツキシマブで処置される。この処置は、一定期間、例えば、予め決定した期間、例えば、約1ヶ月、2ヶ月、4ヶ月、6ヶ月、8ヶ月、10ヶ月または12ヶ月継続される。次に、PD−1抗体分子(場合によりTIM−3抗体分子またはLAG−3抗体分子と組み合わせて)が投与される。PD−1抗体を、場合により、セツキシマブと組み合わせて投与してよい。
ある実施態様において、患者を、まず化合物A8、セツキシマブおよびPD−1抗体分子(場合によりTIM−3抗体分子またはLAG−3抗体分子と組み合わせて)の全3主で処置する。この処置は、一定期間、例えば、予め決定した期間、例えば、約6ヶ月、8ヶ月、10ヶ月または12ヶ月継続される。次に、化合物A8および/またはセツキシマブを、維持期がPD−1抗体分子(例えば、単剤療法としてまたはTIM−3抗体分子またはLAG−3抗体分子と組み合わせて)での処置を含むが、化合物A8またはセツキシマブを含まないように、漸減させ得る。
他の実施態様において、3化合物(化合物A8、セツキシマブおよびPD−1抗体分子、場合によりTIM−3抗体分子またはLAG−3抗体分子と組み合わせて)を、処置の開始時に逐次的に投与する。例えば、化合物A8およびセツキシマブを、上記のとおり、まず投与してよい。次に、PD−1抗体分子(場合によりTIM−3抗体分子またはLAG−3抗体分子と組み合わせて)をレジメンに加える。次に、化合物A8および/またはセツキシマブを、上記のとおり、漸減してよい。
3(またはそれ以上の)薬剤レジメンの用量の例は次のとおりである。PD−1抗体分子を、例えば、約1〜40mg/kg、例えば、1〜30mg/kg、例えば、約5〜25mg/kg、約10〜20mg/kg、約1〜5mg/kgまたは約3mg/kgの用量で投与してよい。ある実施態様において、化合物A8を約200〜300mg、300〜400mgまたは200〜400mgの用量で投与する。ある実施態様において、セツキシマブを、120分静脈内点滴として400mg/mの初期用量で投与し、続いて、250mg/mを毎週60分にわたり点滴する。ある実施態様において、化合物A8、セツキシマブおよびPD−1抗体分子の1以上を、単剤療法としてその薬剤が一般に投与されるより低い用量で、例えば、単剤療法としてその薬剤が一般に投与されるより約0〜10%、10〜20%、20〜30%、30〜40%、40〜50%、50〜60%、60〜70%、70〜80%または80〜90%低い用量で投与する。ある実施態様において、化合物A8、セツキシマブおよびPD−1抗体分子の1以上が、本段落に記載したこれら薬剤の用量より低い用量で投与される。ある実施態様において、阻害、例えば、増殖阻害の達成に必要な化合物A8の濃度は、化合物A8をセツキシマブおよびPD−1抗体分子の一方または両方と組み合わせて投与したとき、化合物A8を個別に投与するときより低い。ある実施態様において、阻害、例えば、増殖阻害達成に必要なセツキシマブの濃度は、セツキシマブを、化合物A8およびPD−1抗体分子の一方または両方と組み合わせて投与したとき、セツキシマブを個別に投与するときより低い。ある実施態様において、阻害、例えば、増殖阻害達成に必要なPD−1抗体分子の濃度は、PD−1抗体分子を、セツキシマブおよび化合物A8の一方または両方と組み合わせて投与したとき、PD−1抗体分子を個別に投与するときより低い。
さらにここに開示されるのは、抗PD−1抗体分子を、単独でまたは他の免疫調節剤(例えば、抗LAG−3、抗PD−L1または抗TIM−3抗体分子)および標的化抗癌剤、例えば、1以上のタンパク質を標的とする薬剤と組み合わせて、癌を処置する抗体で癌を処置する方法ある。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子(および場合により他の免疫調節剤)をまず投与し、標的化抗癌剤を次に投与する。抗PD−1抗体分子および標的化抗癌剤の投与間隔の長さは、例えば、10分、20分または30分、1時間、2時間、4時間、6時間または12時間または1日、2日、3日、4日、5日、6日または7日またはこの範囲内の任意の間隔であり得る。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子を、一定期間にわたり反復投与し(例えば、1日、2日、3日、4日、5日または6日または1週、2週、4週、8週、12週、16週または20週またはこの範囲内の任意の間隔)、その後標的化抗癌剤が投与される。他の実施態様において、抗PD−1抗体分子および標的化抗癌剤は、実質的に同時に投与される。
感染症
本発明の他の方法は、特定の毒素または病原体に曝されている患者の処置に使用される。従って、本発明の他の態様は、対象が感染性疾患について処置されるように、対象にここに開示する組み合わせ物、例えば、抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を投与することを含む、対象における感染性疾患を処置する方法を提供する。
感染(例えば、急性および/または慢性)の処置において、抗PD−1抗体分子の投与を、感染に対する天然宿主免疫防衛に加えてまたはその代わりに、慣用の処置と組み合わせ得る。感染に対する天然宿主免疫防衛は、炎症、発熱、抗体介在宿主防御、リンホカイン分泌および細胞毒性T細胞(特にウイルス感染中)を含むTリンパ球介在宿主防衛、補体介在溶解およびオプソニン化(促進された食作用)および食作用を含むが、これらに限定されない。抗PD−1抗体分子が、機能不全T細胞を再活性化する能力は、慢性感染、特に細胞介在免疫が完全回復に重要であるものの処置に有用である。
上記の腫瘍への適用に類似して、抗体介在PD−1遮断を単独でまたはアジュバントとして、ワクチンと組み合わせて使用して、病原体、毒素および自己抗原に対する免疫応答を刺激し得る。この治療手法が特に有用であり得る病原体の例は、現在有効なワクチンがない病原体または慣用のワクチンが完全に有効とはいえない病原体を含む。これらは、HIV、肝炎(A、BおよびC)、インフルエンザ、ヘルペス、ジアルジア、マラリア、リーシュマニア、スタフィロコッカス・アウレウス、シュードモナス・エルジノーサを含むが、これらに限定されない。PD−1遮断は、感染の時間と共に改変された抗原を提示する、HIVのような因子による確立された感染に特に有用である。これらの新規エピトープは、抗ヒトPD−1投与時外来として認識され、それ故に、PD−1を介する負のシグナルにより弱められない強いT細胞応答を惹起する。
付加的組み合わせ治療
ここに開示する組み合わせ物、例えば、PD−1抗体分子と、1以上のさらなる治療との組み合わせ物をここに提供する。このセクションにおける組み合わせ物の多くが癌の処置に有用であるが、他の適応症も記載する。このセクションは、場合により1以上の免疫調節剤(例えば、抗TIM−3抗体分子、抗LAG−3抗体分子または抗PD−L1抗体分子)と組み合わせた、1以上の免疫調節剤(例えば、抗TIM−3抗体分子、抗LAG−3抗体分子または抗PD−L1抗体分子)と、表7に記載のする薬剤の1以上の組み合わせ物に焦点を絞る。下記組み合わせ物において、ある実施態様において、抗PD−1抗体分子は
(a)配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
(b)配列番号1から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;
(c)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;または
(d)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL
を含む。
下記組み合わせ物において、他の実施態様において、抗PD−1抗体分子は、(i)配列番号1、配列番号4または配列番号224から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2または配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および(ii)配列番号10または配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11または配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32または配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。
ある実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、PKC阻害剤、ソトラスタウリン(化合物A1)またはPCT公開WO2005/039549号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、PKC阻害剤はソトラスタウリン(化合物A1)またはPCT公開WO2005/039549号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子をソトラスタウリン(化合物A1)またはPCT公開WO2005/039549号に記載の化合物と組み合わせて、癌、黒色腫、非ホジキンリンパ腫、炎症性腸疾患、移植片拒絶、眼障害または乾癬のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、ソトラスタウリン(化合物A1)を、約20〜600mg、例えば、約200〜約600mg、約50mg〜約450mg、約100mg〜400mg、約150mg〜350mgまたは約200mg〜300mg、例えば、約50mg、100mg、150mg、200mg、300mg、400mg、500mgまたは600mgの用量で投与する。投与スケジュールは、例えば、隔日から連日、1日2回または3回まで変わり得る。
ある実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、BCR−ABL阻害剤、タシグナ(化合物A2)またはPCT公開WO2004/005281号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、BCR−ABL阻害剤はタシグナまたはPCT公開WO2004/005281号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子をタシグナ(化合物A2)またはPCT公開WO2004/005281号に記載の化合物と組み合わせて、リンパ性白血病、パーキンソン病、神経学的癌、黒色腫、消化性/消化器癌、結腸直腸癌、骨髄性白血病、頭頸部癌または肺高血圧のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、BCR−ABL阻害剤またはタシグナを、約300mg(例えば、新たに診断されたPh+ CML−CPに対して、例えば、1日2回)または例えば、耐性または不耐容Ph+ CML−CPおよびCML−APに対して、約400mg、例えば、1日2回の用量で投与する。BCR−ABL阻害剤または化合物A2を、約300〜400mgの用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、5−(2,4−ジヒドロキシ−5−イソプロピルフェニル)−N−エチル−4−(4−(モルホリノメチル)フェニル)イソキサゾール−3−カルボキサミド(化合物A3)またはPCT公開WO2010/060937号またはWO2004/072051号に開示の化合物のようなHSP90阻害剤と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、HSP90阻害剤は5−(2,4−ジヒドロキシ−5−イソプロピルフェニル)−N−エチル−4−(4−(モルホリノメチル)フェニル)イソキサゾール−3−カルボキサミド(化合物A3)またはPCT公開WO2010/060937号またはWO2004/072051号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、5−(2,4−ジヒドロキシ−5−イソプロピルフェニル)−N−エチル−4−(4−(モルホリノメチル)フェニル)イソキサゾール−3−カルボキサミド(化合物A3)またはPCT公開WO2010/060937号またはWO2004/072051号に記載の化合物と組み合わせて、癌、多発性骨髄腫、非小細胞肺癌、リンパ腫、胃癌、乳癌、消化性/消化器癌、膵臓癌、結腸直腸癌、固形腫瘍または造血障害のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、PI3Kおよび/またはmTORの阻害剤、ダクトリシブ(化合物A4)または8−(6−メトキシ−ピリジン−3−イル)−3−メチル−1−(4−ピペラジン−1−イル−3−トリフルオロメチル−フェニル)−1,3−ジヒドロ−イミダゾ[4,5−c]キノリン−2−オン(化合物A41)またはPCT公開WO2006/122806号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、PI3Kおよび/またはmTOR阻害剤は、ダクトリシブ(化合物A4)、8−(6−メトキシ−ピリジン−3−イル)−3−メチル−1−(4−ピペラジン−1−イル−3−トリフルオロメチル−フェニル)−1,3−ジヒドロ−イミダゾ[4,5−c]キノリン−2−オン(化合物A41)またはPCT公開WO2006/122806号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、ダクトリシブ(化合物A4)、8−(6−メトキシ−ピリジン−3−イル)−3−メチル−1−(4−ピペラジン−1−イル−3−トリフルオロメチル−フェニル)−1,3−ジヒドロ−イミダゾ[4,5−c]キノリン−2−オン(化合物A41)またはPCT公開WO2006/122806号に記載の化合物と組み合わせて使用して、癌、前立腺癌、白血病(例えば、リンパ性白血病)、乳癌、脳癌、膀胱癌、膵臓癌、腎癌、固形腫瘍または肝臓癌のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、FGFR阻害剤、3−(2,6−ジクロロ−3,5−ジメトキシフェニル)−1−(6−((4−(4−エチルピペラジン−1−イル)フェニル)アミノ)ピリミジン−4−イル)−1−メチル尿素(化合物A5)または米国特許8,552,002号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、FGFR阻害剤は、3−(2,6−ジクロロ−3,5−ジメトキシフェニル)−1−(6−((4−(4−エチルピペラジン−1−イル)フェニル)アミノ)ピリミジン−4−イル)−1−メチル尿素(化合物A5)または米国特許8,552,002号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、化合物A5またはUS8,552,002号に記載の化合物と組み合わせて、消化性/消化器癌、血液癌または固形腫瘍のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、FGFR阻害剤または3−(2,6−ジクロロ−3,5−ジメトキシフェニル)−1−(6−((4−(4−エチルピペラジン−1−イル)フェニル)アミノ)ピリミジン−4−イル)−1−メチル尿素(化合物A5)を、約100〜125mg(例えば、1日あたり)、例えば、約100mgまたは約125mgの用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、PI3K阻害剤、ブパルリシブ(化合物A6)またはPCT公開WO2007/084786号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、PI3K阻害剤はブパルリシブ(化合物A6)またはPCT公開WO2007/084786号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、ブパルリシブ(化合物A6)またはPCT公開WO2007/084786号に開示の化合物と組み合わせて、前立腺癌、非小細胞肺癌、内分泌癌、白血病、卵巣癌、黒色腫、膀胱癌、乳癌、女性生殖器系癌、消化性/消化器癌、結腸直腸癌、多形神経膠芽腫、固形腫瘍、非ホジキンリンパ腫、造血障害または頭頸部癌のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、PI3K阻害剤またはブパルリシブ(化合物A6)を、約100mg(例えば、1日あたり)の用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、FGFR阻害剤、8−(2,6−ジフルオロ−3,5−ジメトキシフェニル)−N−(4−((ジメチルアミノ)メチル)−1H−イミダゾール−2−イル)キノキサリン−5−カルボキサミド(化合物A7)またはPCT公開WO2009/141386号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、FGFR阻害剤は8−(2,6−ジフルオロ−3,5−ジメトキシフェニル)−N−(4−((ジメチルアミノ)メチル)−1H−イミダゾール−2−イル)キノキサリン−5−カルボキサミド(化合物A7)またはPCT公開WO2009/141386号に開示の化合物である。ある実施態様において、FGFR阻害剤は8−(2,6−ジフルオロ−3,5−ジメトキシフェニル)−N−(4−((ジメチルアミノ)メチル)−1H−イミダゾール−2−イル)キノキサリン−5−カルボキサミド(化合物A7)である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、8−(2,6−ジフルオロ−3,5−ジメトキシフェニル)−N−(4−((ジメチルアミノ)メチル)−1H−イミダゾール−2−イル)キノキサリン−5−カルボキサミド(化合物A7)またはPCT公開WO2009/141386号に開示の化合物と組み合わせて、血管形成により特徴付けられる癌のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、FGFR阻害剤または8−(2,6−ジフルオロ−3,5−ジメトキシフェニル)−N−(4−((ジメチルアミノ)メチル)−1H−イミダゾール−2−イル)キノキサリン−5−カルボキサミド(化合物A7)を、例えば、約3mg〜約5g、より好ましくは約10mg〜約1.5g/人/日の用量で、場合により、例えば、同量でよい1〜3の単一用量に分けて投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、PI3K阻害剤、(S)−N1−(4−メチル−5−(2−(1,1,1−トリフルオロ−2−メチルプロパン−2−イル)ピリジン−4−イル)チアゾール−2−イル)ピロリジン−1,2−ジカルボキサミド(化合物A8)またはPCT公開WO2010/029082号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害を処置する。ある実施態様において、PI3K阻害剤は(S)−N1−(4−メチル−5−(2−(1,1,1−トリフルオロ−2−メチルプロパン−2−イル)ピリジン−4−イル)チアゾール−2−イル)ピロリジン−1,2−ジカルボキサミド(化合物A8)またはPCT公開WO2010/029082号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、(S)−N1−(4−メチル−5−(2−(1,1,1−トリフルオロ−2−メチルプロパン−2−イル)ピリジン−4−イル)チアゾール−2−イル)ピロリジン−1,2−ジカルボキサミド(化合物A8)またはPCT公開WO2010/029082号に開示の化合物と組み合わせて、胃癌、乳癌、膵臓癌、消化性/消化器癌、固形腫瘍および頭頸部癌のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、PI3K阻害剤または(S)−N1−(4−メチル−5−(2−(1,1,1−トリフルオロ−2−メチルプロパン−2−イル)ピリジン−4−イル)チアゾール−2−イル)ピロリジン−1,2−ジカルボキサミド(化合物A8)を、約150〜300、200〜300mg、200〜400mgまたは300〜400mg(例えば、1日あたり)、例えば、約200、300または400mgの用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、チトクロムP450阻害剤(例えば、CYP17阻害剤)またはPCT公開WO2010/149755号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、チトクロムP450阻害剤(例えば、CYP17阻害剤)はPCT公開WO2010/149755号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、PCT公開WO2010/149755号に開示の化合物と組み合わせて、前立腺癌の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、HDM2阻害剤、(S)−1−(4−クロロフェニル)−7−イソプロポキシ−6−メトキシ−2−(4−(メチル(((1r,4S)−4−(4−メチル−3−オキソピペラジン−1−イル)シクロヘキシル)メチル)アミノ)フェニル)−1,2−ジヒドロイソキノリン−3(4H)−オン(化合物A10)またはPCT公開WO2011/076786号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、HDM2阻害剤は(S)−1−(4−クロロフェニル)−7−イソプロポキシ−6−メトキシ−2−(4−(メチル(((1r,4S)−4−(4−メチル−3−オキソピペラジン−1−イル)シクロヘキシル)メチル)アミノ)フェニル)−1,2−ジヒドロイソキノリン−3(4H)−オン(化合物A10)またはPCT公開WO2011/076786号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、(S)−1−(4−クロロフェニル)−7−イソプロポキシ−6−メトキシ−2−(4−(メチル(((1r,4S)−4−(4−メチル−3−オキソピペラジン−1−イル)シクロヘキシル)メチル)アミノ)フェニル)−1,2−ジヒドロイソキノリン−3(4H)−オン(化合物A10)またはPCT公開WO2011/076786号に開示の化合物と組み合わせて、固形腫瘍のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、HDM2阻害剤または(S)−1−(4−クロロフェニル)−7−イソプロポキシ−6−メトキシ−2−(4−(メチル(((1r,4S)−4−(4−メチル−3−オキソピペラジン−1−イル)シクロヘキシル)メチル)アミノ)フェニル)−1,2−ジヒドロイソキノリン−3(4H)−オン(化合物A10)を、約400〜700mgの用量で投与し、例えば、週に3回、2週間投薬、3週間休薬で投与する。ある実施態様において、用量は、約400mg、500mg、600mgまたは700mg、約400〜500mg、500〜600mgまたは600〜700mg、例えば、週3回投与である。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、鉄キレート剤、デフェラシロクス(エクジェイドとしても既知;化合物A11)またはPCT公開WO1997/049395号に記載の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、鉄キレート剤はデフェラシロクスまたはPCT公開WO1997/049395号に記載の化合物である。ある実施態様において、鉄キレート剤はデフェラシロクス(化合物A11)である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、デフェラシロクス(化合物A11)またはPCT公開WO1997/049395号に記載の化合物と組み合わせて、鉄過負荷、ヘモクロマトーシスまたは骨髄異形成の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、アロマターゼ阻害剤、レトロゾール(フェマーラとしても既知;化合物A12)またはUS4,978,672号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、アロマターゼ阻害剤はレトロゾール(化合物A12)または米国特許4,978,672号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、レトロゾール(化合物A12)または米国特許4,978,672号に開示の化合物と組み合わせて、癌、平滑筋肉腫、子宮内膜癌、乳癌、女性生殖器系癌またはホルモン欠乏のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、PI3K阻害剤、例えば、汎PI3K阻害剤、(4S,5R)−3−(2’−アミノ−2−モルホリノ−4’−(トリフルオロメチル)−[4,5’−ビピリミジン]−6−イル)−4−(ヒドロキシメチル)−5−メチルオキサゾリジン−2−オン(化合物A13)またはPCT公開WO2013/124826号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、PI3K阻害剤は(4S,5R)−3−(2’−アミノ−2−モルホリノ−4’−(トリフルオロメチル)−[4,5’−ビピリミジン]−6−イル)−4−(ヒドロキシメチル)−5−メチルオキサゾリジン−2−オン(化合物A13)またはPCT公開WO2013/124826号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、(4S,5R)−3−(2’−アミノ−2−モルホリノ−4’−(トリフルオロメチル)−[4,5’−ビピリミジン]−6−イル)−4−(ヒドロキシメチル)−5−メチルオキサゾリジン−2−オン(化合物A13)またはPCT公開WO2013/124826号に開示の化合物と組み合わせて、癌または進行型固形腫瘍のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、p53阻害剤および/またはp53/Mdm2相互作用、(S)−5−(5−クロロ−1−メチル−2−オキソ−1,2−ジヒドロピリジン−3−イル)−6−(4−クロロフェニル)−2−(2,4−ジメトキシピリミジン−5−イル)−1−イソプロピル−5,6−ジヒドロピロロ[3,4−d]イミダゾール−4(1H)−オン(化合物A14)またはPCT公開WO2013/111105号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、p53および/またはp53/Mdm2相互作用阻害剤は(S)−5−(5−クロロ−1−メチル−2−オキソ−1,2−ジヒドロピリジン−3−イル)−6−(4−クロロフェニル)−2−(2,4−ジメトキシピリミジン−5−イル)−1−イソプロピル−5,6−ジヒドロピロロ[3,4−d]イミダゾール−4(1H)−オン(化合物A14)またはPCT公開WO2013/111105号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、(S)−5−(5−クロロ−1−メチル−2−オキソ−1,2−ジヒドロピリジン−3−イル)−6−(4−クロロフェニル)−2−(2,4−ジメトキシピリミジン−5−イル)−1−イソプロピル−5,6−ジヒドロピロロ[3,4−d]イミダゾール−4(1H)−オン(化合物A14)またはPCT公開WO2013/111105号に開示の化合物と組み合わせて、癌または軟組織肉腫のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、CSF−1Rチロシンキナーゼ阻害剤、4−((2−(((1R,2R)−2−ヒドロキシシクロヘキシル)アミノ)ベンゾ[d]チアゾール−6−イル)オキシ)−N−メチルピコリンアミド(化合物A15)またはPCT公開WO2005/073224号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、CSF−1Rチロシンキナーゼ阻害剤は4−((2−(((1R,2R)−2−ヒドロキシシクロヘキシル)アミノ)ベンゾ[d]チアゾール−6−イル)オキシ)−N−メチルピコリンアミド(化合物A15)またはPCT公開WO2005/073224号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、4−((2−(((1R,2R)−2−ヒドロキシシクロヘキシル)アミノ)ベンゾ[d]チアゾール−6−イル)オキシ)−N−メチルピコリンアミド(化合物A15)またはPCT公開WO2005/073224号に開示の化合物と組み合わせて、癌のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、イマチニブメシレート(グリベックとしても既知;化合物A16)またはPCT公開WO1999/003854号に記載の化合物のようなアポトーシス誘導因子および/または血管形成阻害剤と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、アポトーシス誘導因子および/または血管形成阻害剤はイマチニブメシレート(化合物A16)またはPCT公開WO1999/003854号に記載の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、イマチニブメシレート(化合物A16)またはPCT公開WO1999/003854号に記載の化合物と組み合わせて、癌、多発性骨髄腫、前立腺癌、非小細胞肺癌、リンパ腫、胃癌、黒色腫、乳癌、膵臓癌、消化性/消化器癌、結腸直腸癌、多形神経膠芽腫、肝臓癌、頭頸部癌、喘息、多発性硬化症、アレルギー、アルツハイマー認知症、筋萎縮性側索硬化症またはリウマチ性関節炎のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、イマチニブメシレート(化合物A16)を、約100〜1000mg、例えば、約200mg〜800mg、約300mg〜700mgまたは約400mg〜600mg、例えば、約200mg、300mg、400mg、500mg、600mgまたは700mgの用量で投与する。投与スケジュールは、例えば、隔日から連日、1日2回または3回まで変わり得る。ある実施態様において、イマチニブメシレートを、1日約100mg〜600mg、例えば、1日約100mg、200mg、260mg、300mg、400mgまたは600mgの経口用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、JAK阻害剤、2−フルオロ−N−メチル−4−(7−(キノリン−6−イルメチル)イミダゾ[1,2−b][1,2,4]トリアジン−2−イル)ベンズアミド(化合物A17)またはその二塩酸塩またはPCT公開WO2007/070514号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、JAK阻害剤は2−フルオロ−N−メチル−4−(7−(キノリン−6−イルメチル)イミダゾ[1,2−b][1,2,4]トリアジン−2−イル)ベンズアミド(化合物A17)またはその二塩酸塩またはPCT公開WO2007/070514号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、2−フルオロ−N−メチル−4−(7−(キノリン−6−イルメチル)イミダゾ[1,2−b][1,2,4]トリアジン−2−イル)ベンズアミド(化合物A17)またはその二塩酸塩またはPCT公開WO2007/070514号に開示の化合物と組み合わせて、結腸直腸癌、骨髄性白血病、血液癌、自己免疫性疾患、非ホジキンリンパ腫または血小板血症のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、JAK阻害剤または2−フルオロ−N−メチル−4−(7−(キノリン−6−イルメチル)イミダゾ[1,2−b][1,2,4]トリアジン−2−イル)ベンズアミド(化合物A17)またはその二塩酸塩を、約400〜600mg(例えば、1日あたり)、例えば、約400mg、500mgまたは600mgまたは約400〜500または500〜600mgの用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、JAK阻害剤、リン酸ルキソリチニブ(JAKAFIとしても既知;化合物A18)またはPCT公開WO2007/070514号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、JAK阻害剤はリン酸ルキソリチニブ(化合物A18)またはPCT公開WO2007/070514号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、リン酸ルキソリチニブ(化合物A18)またはPCT公開WO2007/070514号に開示の化合物と組み合わせて、前立腺癌、リンパ性白血病、多発性骨髄腫、リンパ腫、肺癌、白血病、カヘキシー、乳癌、膵臓癌、リウマチ性関節炎、乾癬、結腸直腸癌、骨髄性白血病、血液癌、自己免疫性疾患、非ホジキンリンパ腫または血小板血症のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、JAK阻害剤またはリン酸ルキソリチニブ(化合物A18)を、約15〜25mg、例えば、1日2回の用量で投与する。ある実施態様において、用量は約15mg、20mgまたは25mgまたは約15〜20mgまたは20〜25mgである。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、デアセチラーゼ(DAC)阻害剤、パノビノスタット(化合物A19)またはPCT公開WO2014/072493号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、DAC阻害剤はパノビノスタット(化合物A19)またはPCT公開WO2014/072493号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、パノビノスタット(化合物A19)、PCT公開WO2014/072493号に開示の化合物と組み合わせて、小細胞肺癌、呼吸器/胸部癌、前立腺癌、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群、骨癌、非小細胞肺癌、内分泌癌、リンパ腫、神経学的癌、白血病、HIV/AIDS、免疫障害、移植片拒絶、胃癌、黒色腫、乳癌、膵臓癌、結腸直腸癌、多形神経膠芽腫、骨髄性白血病、血液癌、腎癌、非ホジキンリンパ腫、頭頸部癌、造血障害または肝臓癌のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、DAC阻害剤またはパノビノスタット(化合物A19)を、約20mg(例えば、1日あたり)の用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、チトクロムP450(例えば、11B2)、アルドステロンまたは血管形成の1以上の阻害剤、Osilodrostat(化合物A20)またはPCT公開WO2007/024945号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、チトクロムP450(例えば、11B2)、アルドステロンまたは血管形成の1以上の阻害剤はOsilodrostat(化合物A20)またはPCT公開WO2007/024945号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、Osilodrostat(化合物A20)またはPCT公開WO2007/024945号に開示の化合物と組み合わせて、クッシング症候群、高血圧または心不全治療のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、IAP阻害剤、(S)−N−((S)−1−シクロヘキシル−2−((S)−2−(4−(4−フルオロベンゾイル)チアゾール−2−イル)ピロリジン−1−イル)−2−オキソエチル)−2−(メチルアミノ)プロパンアミド(化合物A21)またはUS8,552,003号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、IAP阻害剤は(S)−N−((S)−1−シクロヘキシル−2−((S)−2−(4−(4−フルオロベンゾイル)チアゾール−2−イル)ピロリジン−1−イル)−2−オキソエチル)−2−(メチルアミノ)プロパンアミド(化合物A21)または米国特許8,552,003号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、(S)−N−((S)−1−シクロヘキシル−2−((S)−2−(4−(4−フルオロベンゾイル)チアゾール−2−イル)ピロリジン−1−イル)−2−オキソエチル)−2−(メチルアミノ)プロパンアミド(化合物A21)または米国特許8,552,003号に開示の化合物と組み合わせて、多発性骨髄腫、乳癌、卵巣癌、膵臓癌または造血障害のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、IAP阻害剤または(S)−N−((S)−1−シクロヘキシル−2−((S)−2−(4−(4−フルオロベンゾイル)チアゾール−2−イル)ピロリジン−1−イル)−2−オキソエチル)−2−(メチルアミノ)プロパンアミド(化合物A21)またはUS8,552,003号に開示の化合物を、約1800mg、例えば、週1回の用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、スムーズンド(SMO)阻害剤、リン酸ソニデジブ(化合物A22)、(R)−2−(5−(4−(6−ベンジル−4,5−ジメチルピリダジン−3−イル)−2−メチルピペラジン−1−イル)ピラジン−2−イル)プロパン−2−オール(化合物A25)またはPCT公開WO2007/131201号またはWO2010/007120号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、SMO阻害剤はリン酸ソニデジブ(化合物A22)、(R)−2−(5−(4−(6−ベンジル−4,5−ジメチルピリダジン−3−イル)−2−メチルピペラジン−1−イル)ピラジン−2−イル)プロパン−2−オール(化合物A25)またはPCT公開WO2007/131201号またはWO2010/007120号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、リン酸ソニデジブ(化合物A22)、(R)−2−(5−(4−(6−ベンジル−4,5−ジメチルピリダジン−3−イル)−2−メチルピペラジン−1−イル)ピラジン−2−イル)プロパン−2−オール(化合物A25)またはPCT公開WO2007/131201号またはWO2010/007120号に開示の化合物と組み合わせて、癌、髄芽腫、小細胞肺癌、前立腺癌、基底細胞癌、膵臓癌または炎症のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、リン酸ソニデジブ(化合物A22)を、約20〜500mg、例えば、約40mg〜400mg、約50mg〜300mgまたは約100mg〜200mg、例えば、約50mg、100mg、150mg、200mg、250mgまたは300mgの用量で投与する。投与スケジュールは、例えば、隔日から連日、1日2回または3回まで変わり得る。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、Alk阻害剤、セリチニブ(ジカディアとしても既知;化合物A23)またはPCT公開WO2007/131201号に開示する化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、Alk阻害剤はセリチニブ(化合物A23)またはPCT公開WO2007/131201号に開示する化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、セリチニブ(化合物A23)またはPCT公開WO2007/131201号に開示する化合物と組み合わせて、非小細胞肺癌または固形腫瘍のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、Alk阻害剤またはセリチニブ(化合物A23)を、約750mg、例えば、1日1回の用量で、投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、JAKおよび/またはCDK4/6阻害剤、7−シクロペンチル−N,N−ジメチル−2−((5−(ピペラジン−1−イル)ピリジン−2−イル)アミノ)−7H−ピロロ[2,3−d]ピリミジン−6−カルボキサミド(化合物A24)または米国特許8,415,355号または米国特許8,685,980号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、JAKおよび/またはCDK4/6阻害剤は7−シクロペンチル−N,N−ジメチル−2−((5−(ピペラジン−1−イル)ピリジン−2−イル)アミノ)−7H−ピロロ[2,3−d]ピリミジン−6−カルボキサミド(化合物A24)または米国特許8,415,355号または米国特許8,685,980号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、と組み合わせて7−シクロペンチル−N,N−ジメチル−2−((5−(ピペラジン−1−イル)ピリジン−2−イル)アミノ)−7H−ピロロ[2,3−d]ピリミジン−6−カルボキサミド(化合物A24)またはUS8,415,355号またはUS8,685,980号に開示の化合物、リンパ腫、神経学的癌、黒色腫、乳癌または固形腫瘍のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、JAKおよび/またはCDK4/6阻害剤または7−シクロペンチル−N,N−ジメチル−2−((5−(ピペラジン−1−イル)ピリジン−2−イル)アミノ)−7H−ピロロ[2,3−d]ピリミジン−6−カルボキサミド(化合物A24)を、例えば、1日あたり、約200〜600mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物を、約200mg、300mg、400mg、500mgまたは600mgまたは約200〜300mg、300〜400mg、400〜500mgまたは500〜600mgの用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、プロラクチン受容体(PRLR)阻害剤、米国特許7,867,493号に開示のヒトモノクローナル抗体分子(化合物A26)と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、PRLR阻害剤はUS7,867,493号に開示のヒトモノクローナル抗体(化合物A26)である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、米国特許7,867,493号に記載のヒトモノクローナル抗体分子(化合物A26)と組み合わせて、癌、前立腺癌または乳癌のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、PIMキナーゼ阻害剤、N−(4−((1R,3S,5S)−3−アミノ−5−メチルシクロヘキシル)ピリジン−3−イル)−6−(2,6−ジフルオロフェニル)−5−フルオロピコリンアミド(化合物A27)またはPCT公開WO2010/026124号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、PIMキナーゼ阻害剤はN−(4−((1R,3S,5S)−3−アミノ−5−メチルシクロヘキシル)ピリジン−3−イル)−6−(2,6−ジフルオロフェニル)−5−フルオロピコリンアミド(化合物A27)またはPCT公開WO2010/026124号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、N−(4−((1R,3S,5S)−3−アミノ−5−メチルシクロヘキシル)ピリジン−3−イル)−6−(2,6−ジフルオロフェニル)−5−フルオロピコリンアミド(化合物A27)またはPCT公開WO2010/026124号に開示の化合物と組み合わせて、多発性骨髄腫、骨髄異形成症候群、骨髄性白血病または非ホジキンリンパ腫のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、Wntシグナル伝達阻害剤、2−(2’,3−ジメチル−[2,4’−ビピリジン]−5−イル)−N−(5−(ピラジン−2−イル)ピリジン−2−イル)アセトアミド(化合物A28)またはPCT公開WO2010/101849号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、Wntシグナル伝達阻害剤は2−(2’,3−ジメチル−[2,4’−ビピリジン]−5−イル)−N−(5−(ピラジン−2−イル)ピリジン−2−イル)アセトアミド(化合物A28)またはPCT公開WO2010/101849号に開示の化合物である。ある実施態様において、Wntシグナル伝達阻害剤は2−(2’,3−ジメチル−[2,4’−ビピリジン]−5−イル)−N−(5−(ピラジン−2−イル)ピリジン−2−イル)アセトアミド(化合物A28)である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、2−(2’,3−ジメチル−[2,4’−ビピリジン]−5−イル)−N−(5−(ピラジン−2−イル)ピリジン−2−イル)アセトアミド(化合物A28)またはPCT公開WO2010/101849号に開示の化合物と組み合わせて、固形腫瘍(例えば、頭頸部癌、扁平上皮細胞癌、乳癌、膵臓癌または結腸癌)のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、2−(2’,3−ジメチル−[2,4’−ビピリジン]−5−イル)−N−(5−(ピラジン−2−イル)ピリジン−2−イル)アセトアミド(化合物A28)を、約1〜50mg、例えば、約2mg〜45mg、約3mg〜40mg、約5mg〜35mg、5mg〜10mgまたは約10mg〜30mg、例えば、約2mg、5mg、10mg、20mg、30mgまたは40mgの用量で投与する。投与スケジュールは、例えば、隔日から連日、1日2回または3回まで変わり得る。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、BRAF阻害剤、エンコラフェニブ(化合物A29)またはPCT公開WO2011/025927号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、BRAF阻害剤はエンコラフェニブ(化合物A29)またはPCT公開WO2011/025927号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、エンコラフェニブ(化合物A29)またはPCT公開WO2011/025927号に開示の化合物と組み合わせて、非小細胞肺癌、黒色腫または結腸直腸癌のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、BRAF阻害剤またはエンコラフェニブ(化合物A29)を、例えば、1日あたり、約200〜300mg、200〜400mgまたは300〜400mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物を、約200mg、約300mgまたは約400mgの用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、CDK4/6阻害剤、7−シクロペンチル−N,N−ジメチル−2−((5−((1R,6S)−9−メチル−4−オキソ−3,9−ジアザビシクロ[4.2.1]ノナン−3−イル)ピリジン−2−イル)アミノ)−7H−ピロロ[2,3−d]ピリミジン−6−カルボキサミド(化合物A30)またはPCT公開WO2011/101409号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、CDK4/6阻害剤は7−シクロペンチル−N,N−ジメチル−2−((5−((1R,6S)−9−メチル−4−オキソ−3,9−ジアザビシクロ[4.2.1]ノナン−3−イル)ピリジン−2−イル)アミノ)−7H−ピロロ[2,3−d]ピリミジン−6−カルボキサミド(化合物A30)またはPCT公開WO2011/101409号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、7−シクロペンチル−N,N−ジメチル−2−((5−((1R,6S)−9−メチル−4−オキソ−3,9−ジアザビシクロ[4.2.1]ノナン−3−イル)ピリジン−2−イル)アミノ)−7H−ピロロ[2,3−d]ピリミジン−6−カルボキサミド(化合物A30)またはPCT公開WO2011/101409号に開示の化合物と組み合わせて、癌、マントル細胞リンパ腫、脂肪肉腫、非小細胞肺癌、黒色腫、扁平上皮細胞食道癌または乳癌のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、HER3阻害剤、化合物A31またはPCT公開WO2012/022814号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、HER3阻害剤は化合物A31またはPCT公開WO2012/022814号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、化合物A31またはPCT公開WO2012/022814号に開示の化合物と組み合わせて、胃癌、食道癌、頭頸部癌、扁平上皮細胞癌、胃癌、乳癌(例えば、転移乳癌)または消化性/消化器癌のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、化合物A31はヒトモノクローナル抗体分子である。
ある実施態様において、HER3阻害剤または化合物A31を、例えば、週1回(QW)、約3mg/kg、10mg/kg、20mg/kgまたは40mg/kgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物を、約3〜10mg/kg、10〜20mg/kgまたは20〜40mg/kgの用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、FGFR2および/またはFGFR4阻害剤、化合物A32またはPCT公開WO2014/160160号に記載の化合物(例えば、FGFR2および/またはFGFR4に対する抗体分子薬物コンジュゲート、例えば、mAb 12425)と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、FGFR2および/またはFGFR4阻害剤は化合物A32またはPCT公開WO2014/160160号に記載の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、化合物A32または表7に記載の化合物と組み合わせて、癌、胃癌、乳癌、横紋筋肉腫、肝臓癌、副腎癌、肺癌、食道癌、結腸癌または子宮内膜癌のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、化合物A32はanFGFR2および/またはFGFR4に対する抗体分子薬物コンジュゲート、例えば、mAb 12425である。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、M−CSF阻害剤、化合物A33またはPCT公開WO2004/045532号に開示の化合物(例えば、M−CSFに対する抗体分子またはFabフラグメント)と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、M−CSF阻害剤は合物A33またはPCT公開WO2004/045532号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、化合物A33またはPCT公開WO2004/045532号に開示の化合物と組み合わせて、癌、前立腺癌、乳癌または色素性絨毛性結節性滑膜炎(PVNS)のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、化合物A33は、M−CSFに対するモノクローナル抗体分子またはそのフラグメント(例えば、Fabフラグメント)である。ある実施態様において、M−CSF阻害剤または化合物A33を、約10mg/kgの平均用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、MEK阻害剤、ビニメチニブ(化合物A34)またはPCT公開WO2003/077914号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、MEK阻害剤はビニメチニブ(化合物A34)またはPCT公開WO2003/077914号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、ビニメチニブ(化合物A34)またはPCT公開WO2003/077914号に開示の化合物と組み合わせて、非小細胞肺癌、多系統遺伝的障害、黒色腫、卵巣癌、消化性/消化器癌、リウマチ性関節炎または結腸直腸癌のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、MEK阻害剤またはビニメチニブ(化合物A34)を、約45mg、例えば、1日2回の用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、c−キット、ヒスタミン放出、Flt3(例えば、FLK2/STK1)またはPKCの1以上の阻害剤、ミドスタウリン(化合物A35)またはPCT公開WO2003/037347号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、阻害剤はミドスタウリン(化合物A35)またはPCT公開WO2003/037347号に開示の化合物である。ある実施態様において、c−キット、ヒスタミン放出、Flt3(例えば、FLK2/STK1)またはPKCの1以上の阻害剤はミドスタウリンである。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、ミドスタウリン(化合物A35)またはPCT公開WO2003/037347号に開示の化合物と組み合わせて、癌、結腸直腸癌、骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、黄斑変性症、糖尿病性合併症または皮膚科学的障害のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、TOR阻害剤(例えば、mTOR阻害剤)、エベロリムス(アフィニトールとしても既知;化合物A36)またはPCT公開WO2014/085318号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、TOR阻害剤はエベロリムス(化合物A36)またはPCT公開WO2014/085318号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、エベロリムス(化合物A36)と組み合わせて、間質性肺疾患、小細胞肺癌、呼吸器/胸部癌、前立腺癌、多発性骨髄腫、肉腫、加齢黄斑変性症、骨癌、結節性硬化症、非小細胞肺癌、内分泌癌、リンパ腫、神経学的障害、星状細胞腫、子宮頸癌、神経学的癌、白血病、免疫障害、移植片拒絶、胃癌、黒色腫、てんかん、乳癌または膀胱癌のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、TOR阻害剤またはエベロリムス(化合物A36)を、約2.5〜20mg/日の用量で投与する。ある実施態様において、化合物を、約2.5mg/日、5mg/日、10mg/日または20mg/日、例えば、約2.5〜5mg/日、5〜10mg/日または10〜20mg/日の用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、VEGFR−2、PDGFRベータ、キットまたはRafキナーゼCの1以上の阻害剤、1−メチル−5−((2−(5−(トリフルオロメチル)−1H−イミダゾール−2−イル)ピリジン−4−イル)オキシ)−N−(4−(トリフルオロメチル)フェニル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−アミン(化合物A37)またはPCT公開WO2007/030377号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、VEGFR−2、PDGFRベータ、キットまたはRafキナーゼCの1以上の阻害剤は1−メチル−5−((2−(5−(トリフルオロメチル)−1H−イミダゾール−2−イル)ピリジン−4−イル)オキシ)−N−(4−(トリフルオロメチル)フェニル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−アミン(化合物A37)またはPCT公開WO2007/030377号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、1−メチル−5−((2−(5−(トリフルオロメチル)−1H−イミダゾール−2−イル)ピリジン−4−イル)オキシ)−N−(4−(トリフルオロメチル)フェニル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−アミン(化合物A37)またはPCT公開WO2007/030377号に開示の化合物と組み合わせて、癌、黒色腫または固形腫瘍のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、ソマトスタチンアゴニストおよび/または成長ホルモン放出阻害剤、パシレオチドジアスパルタート(シグニフォーとしても既知;化合物A38)またはPCT公開WO2002/010192号またはUS特許7,473,761号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、ソマトスタチンアゴニストおよび/または成長ホルモン放出阻害剤はパシレオチドジアスパルタート(化合物A38)またはPCT公開WO2002/010192号またはUS特許7,473,761号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、パシレオチドジアスパルタート(化合物A38)またはPCT公開WO2002/010192号またはUS特許7,473,761号に開示の化合物と組み合わせて、前立腺癌、内分泌癌、神経性癌、神経内分泌腫瘍(NET)(例えば、非定型肺カルチノイド腫瘍)、皮膚癌(例えば、黒色腫またはメルケル細胞癌)、膵臓癌、肝臓癌、クッシング症候群、消化器障害、先端巨大症、肝臓および胆管障害または肝硬変のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、シグナル伝達モジュレーターおよび/または血管形成阻害剤、ドビチニブ(化合物A39)またはPCT公開WO2009/115562号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、シグナル伝達モジュレーターおよび/または血管形成阻害剤はドビチニブ(化合物A39)またはPCT公開WO2009/115562号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、ドビチニブ(化合物A39)またはPCT公開WO2009/115562号に開示の化合物と組み合わせて、癌、呼吸器/胸部癌、多発性骨髄腫、前立腺癌、非小細胞肺癌、内分泌癌または遺伝性神経障害のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、EGFR阻害剤、(R,E)−N−(7−クロロ−1−(1−(4−(ジメチルアミノ)ブト−2−エノイル)アゼパン−3−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)−2−メチルイソニコチンアミド(化合物A40)またはPCT公開WO2013/184757号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、EGFR阻害剤は(R,E)−N−(7−クロロ−1−(1−(4−(ジメチルアミノ)ブト−2−エノイル)アゼパン−3−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)−2−メチルイソニコチンアミド(化合物A40)またはPCT公開WO2013/184757号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、(R,E)−N−(7−クロロ−1−(1−(4−(ジメチルアミノ)ブト−2−エノイル)アゼパン−3−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)−2−メチルイソニコチンアミド(化合物A40)またはPCT公開WO2013/184757号に開示の化合物と組み合わせて、癌、例えば、固形腫瘍のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、EGFR阻害剤または(R,E)−N−(7−クロロ−1−(1−(4−(ジメチルアミノ)ブト−2−エノイル)アゼパン−3−イル)−1H−ベンゾ[d]イミダゾール−2−イル)−2−メチルイソニコチンアミド(化合物A40)を、例えば、1日あたり、150〜250mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物を、約150mg、200mgまたは250mgまたは約150〜200mgまたは200〜250mgの用量で投与する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、ALK阻害剤、N−(2−イソプロポキシ−5−メチル−4−(1−メチルピペリジン−4−イル)フェニル)−N−(2−(イソプロピルスルホニル)フェニル)−1H−ピラゾロ[3,4−d]ピリミジン−4,6−ジアミン(化合物A42)またはPCT公開WO2008/073687号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、ALK阻害剤はN−(2−イソプロポキシ−5−メチル−4−(1−メチルピペリジン−4−イル)フェニル)−N−(2−(イソプロピルスルホニル)フェニル)−1H−ピラゾロ[3,4−d]ピリミジン−4,6−ジアミン(化合物A42)またはPCT公開WO2008/073687号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、N−(2−イソプロポキシ−5−メチル−4−(1−メチルピペリジン−4−イル)フェニル)−N−(2−(イソプロピルスルホニル)フェニル)−1H−ピラゾロ[3,4−d]ピリミジン−4,6−ジアミン(化合物A42)またはPCT公開WO2008/073687号に開示の化合物と組み合わせて、癌、未分化大細胞リンパ腫(ALCL)、非小細胞肺癌(NSCLC)または神経芽腫のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、IGF−1R阻害剤、3−(4−(4−((5−クロロ−4−((5−メチル−1H−ピラゾール−3−イル)アミノ)ピリミジン−2−イル)アミノ)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)ピペリジン−1−イル)チエタン1,1−ジオキシド(化合物A43)、5−クロロ−N−(2−フルオロ−5−メチル−4−(1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)ピペリジン−4−イル)フェニル)−N−(5−メチル−1H−ピラゾール−3−イル)ピリミジン−2,4−ジアミン(化合物A44)または5−クロロ−N2−(4−(1−エチルピペリジン−4−イル)−2−フルオロ−5−メチルフェニル)−N−(5−メチル−1H−ピラゾール−3−イル)ピリミジン−2,4−ジアミン(化合物A45)またはPCT公開WO2010/002655号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、IGF−1R阻害剤は3−(4−(4−((5−クロロ−4−((5−メチル−1H−ピラゾール−3−イル)アミノ)ピリミジン−2−イル)アミノ)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)ピペリジン−1−イル)チエタン1,1−ジオキシド(化合物A43)、5−クロロ−N−(2−フルオロ−5−メチル−4−(1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)ピペリジン−4−イル)フェニル)−N−(5−メチル−1H−ピラゾール−3−イル)ピリミジン−2,4−ジアミン(化合物A44)、5−クロロ−N2−(4−(1−エチルピペリジン−4−イル)−2−フルオロ−5−メチルフェニル)−N−(5−メチル−1H−ピラゾール−3−イル)ピリミジン−2,4−ジアミン(化合物A45)またはPCT公開WO2010/002655号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、3−(4−(4−((5−クロロ−4−((5−メチル−1H−ピラゾール−3−イル)アミノ)ピリミジン−2−イル)アミノ)−5−フルオロ−2−メチルフェニル)ピペリジン−1−イル)チエタン1,1−ジオキシド(化合物A43)、5−クロロ−N−(2−フルオロ−5−メチル−4−(1−(テトラヒドロ−2H−ピラン−4−イル)ピペリジン−4−イル)フェニル)−N−(5−メチル−1H−ピラゾール−3−イル)ピリミジン−2,4−ジアミン(化合物A44)、5−クロロ−N2−(4−(1−エチルピペリジン−4−イル)−2−フルオロ−5−メチルフェニル)−N−(5−メチル−1H−ピラゾール−3−イル)ピリミジン−2,4−ジアミン(化合物A45)またはPCT公開WO2010/002655号に開示の化合物と組み合わせて、癌または肉腫のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、P−糖タンパク質1阻害剤、バルスポダール(AMDRAYとしても既知;化合物A46)またはEP296122号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、P−糖タンパク質1阻害剤はバルスポダール(化合物A46)またはEP296122号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、バルスポダール(化合物A46)またはEP296122号に開示の化合物と組み合わせて、癌または薬物耐性腫瘍のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、VEGFR阻害剤、コハク酸バタラニブ(化合物A47)またはEP296122号に開示の化合物の1以上と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、VEGFR阻害剤はコハク酸バタラニブ(化合物A47)またはEP296122号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、コハク酸バタラニブ(化合物A47)またはEP296122号に開示の化合物と組み合わせて、癌の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、IDH阻害剤またはWO2014/141104号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、IDH阻害剤はPCT公開WO2014/141104号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、WO2014/141104号に開示の化合物と組み合わせて、癌のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、BCL−ABL阻害剤またはPCT公開WO2013/171639号、WO2013/171640号、WO2013/171641号またはWO2013/171642号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、BCL−ABL阻害剤はPCT公開WO2013/171639号、WO2013/171640号、WO2013/171641号またはWO2013/171642号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、PCT公開WO2013/171639号、WO2013/171640号、WO2013/171641号またはWO2013/171642号に開示の化合物と組み合わせて、癌のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、c−RAF阻害剤またはPCT公開WO2014/151616号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、c−RAF阻害剤は化合物A50またはPCT公開WO2014/151616号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、PCT公開WO2014/151616号に開示の化合物と組み合わせて、癌のような障害の処置に使用する。
他の実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、ERK1/2 ATP競合的阻害剤またはPCT公開WO2015/066188号に開示の化合物と組み合わせて、障害、例えば、ここに記載する障害の処置に使用する。ある実施態様において、ERK1/2 ATP競合的阻害剤はPCT公開WO2015/066188号に開示の化合物である。ある実施態様において、PD−1抗体分子を、化合物A51またはPCT公開WO2015/066188号に開示の化合物と組み合わせて、癌のような障害の処置に使用する。
ある実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、化合物A8、化合物A17、化合物A23、化合物A24、化合物A27、化合物A29および化合物A33から選択される薬剤の1以上と組み合わせて投与する。
ある実施態様において、組み合わせ物、例えば、ここに記載する抗PD−1抗体分子を含む組み合わせ物を、免疫細胞アッセイ、例えば、huMLRアッセイ、T細胞増殖アッセイおよびB細胞増殖アッセイの1以上で活性を有することが知られる抗癌剤と組み合わせて投与する。アッセイの例は下に記載する。アッセイに基づき、IC50を各試験薬剤について計算できる。ある実施態様において、抗癌剤は、例えば、0〜1μM、1〜4μMまたは4μM超、例えば、4〜10μMまたは4〜20μMのIC50を有する。ある実施態様において、第二治療剤は、化合物A9、化合物A16、化合物A17、化合物A21、化合物A22、化合物A25、化合物A28、化合物A48および化合物49の1以上から選択される。
ある実施態様において、化合物A28(または化合物A28に関連する化合物)を、約5〜10mgまたは10〜30mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物A22(または化合物A22に関連する化合物)を、約200mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物A17(または化合物A17に関連する化合物)を、約400〜600mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物A16(または化合物A16に関連する化合物)を、約400〜600mg PO q日の用量で投与する。ある実施態様において、化合物A29(または化合物A29に関連する化合物)を、約200〜400mgまたは300〜400mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物A24(または化合物A24に関連する化合物)を、約200〜600mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物A23(セリチニブ)(またはセリチニブに関連する化合物)を、1日1回約750mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物A8(または化合物A8に関連する化合物)を、約200〜400mgまたは300〜400mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物A5(または化合物A5に関連する化合物)を、約100〜125mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物A6(または化合物A6に関連する化合物)を、約100mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物A1(または化合物A1に関連する化合物)を、約200〜300mgまたは200〜600mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物A40(または化合物A40に関連する化合物)を、約150〜250mgの用量で投与する。ある実施態様において、化合物A10(または化合物A10に関連する化合物)を、約400〜700mgの用量で投与し、例えば、週に3回、2週間投薬、3週間休薬で投与する。ある実施態様において、BCR−ABL阻害剤を、約20mg bid〜80mg bidの用量で投与する。
huMLRアッセイおよびBまたはT細胞増殖アッセイの例を下に提供する。
ヒト混合リンパ球反応
混合リンパ球反応(MLR)は、ある個体(レスポンダー)からのリンパ球から、他の個体(刺激因子)のリンパ球への増殖性応答を測定する機能的アッセイである。同種MLRを実施するために、3ドナーからの末梢血単核細胞(PBMC)を未知HLAタイプのバフィーコートから単離した(BernおよびAarau, SwitzerlandからのKantonspital Blutspendezentrum)。細胞を、10%ウシ胎児血清(FCS)、100Uペニシリン/100μg ストレプトマイシン、50μM 2−メルカプトエタノール添加RPMI 1640 GlutaMAXTM含有培養培地0.2mLに2.105で調製した。個々の2方向反応を、2つの異なるドナーからのPBMCを1:1比で混合することにより設定し、共培養をトリプリケートで、平底96ウェル組織培養プレート中、6日、37℃、5%COで、8点濃度範囲の試験化合物存在下または非存在下、実施した。細胞をH−TdR(1μCi/0.2mL)で培養の最後の16時間パルスし、取り込まれた放射活性を細胞増殖の指標として使用した。最大huMLR応答を50%阻害する濃度(IC50)を各化合物について計算した。シクロスポリンを、huMLR阻害の陽性対照として使用した。
ヒトB細胞増殖アッセイ
PBMCを、ヒト血液からFicoll-Paque密度勾配により新たに単離し、負のB細胞単離に付した。B細胞を培養培地(RPMI 1640、HEPES、10%FCS、50μg/mL ゲンタマイシン、50μM 2−メルカプトエタノール、1×ITS(インスリン、トランスフェリンおよび亜セレン酸ナトリウム)、1×非必須アミノ酸)に、平底96ウェル培養プレートウェルあたり9.104濃度で再懸濁した。B細胞刺激をヒト抗IgM抗体分子(30μg/mL)およびIL−4(75ng/mL)またはCD40リガンド(3μg/mL)およびIL−4(75ng/mL)で、7点濃度範囲の試験化合物の存在下または非存在下。実施した。37℃、10%COで72時間の培養後、細胞を、培養の最後の6時間、H−TdR(1μCi/ウェル)でパルスした。次いでB細胞を採取し、チミジンの取り込みをシンチレーションカウンターを使用して測定した。各2回処理で、平均を計算し、これらのデータを、XLfit 4にプロットして、各IC50値を決定した。
ヒトT細胞増殖アッセイ
PBMCを、ヒト血液からFicoll-Paque密度勾配により新たに単離し、負のT細胞単離に付した。T細胞を、培養培地(RPMI 1640、HEPES、10%FCS、50μg/mL ゲンタマイシン、50μM 2−メルカプトエタノール、1×ITS(インスリン、トランスフェリンおよび亜セレン酸ナトリウム)、1×非必須アミノ酸)中、平底96ウェル培養プレートのウェルあたり、8.104の濃度に調製した。T細胞刺激を、ヒト抗CD3抗体分子(10μg/mL)またはヒト抗CD3抗体分子(5μg/mL)および抗CD28抗体分子(1μg/mL)により、7点濃度範囲の試験化合物の存在下または非存在下実施した。37℃、10%COで72時間の培養後、細胞を、培養の最後の6時間、H−TdR(1μCi/ウェル)でパルスした。細胞増殖をチミジンの取り込みにより測定し、各試験化合物のIC50決定を可能とした。
核酸
本発明はまた、ここに記載の抗PD−1抗体分子の重鎖および軽鎖可変領域およびCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む核酸にも関する。例えば、本発明は、ここに開示する抗体分子の1以上から選択される抗PD−1抗体分子の重鎖および軽鎖可変領域それぞれをコードする第一および第二核酸に関する。核酸は、ここに記載する表に示すヌクレオチド配列またはそれに実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一またはここに記載する表に示す配列と3、6、15、30または45ヌクレオチドを超えて異ならない配列)を含み得る。
ある実施態様において、核酸は、ここでの表に示すアミノ酸配列を有する重鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列またはそれと実質的に相同な配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一および/または1以上の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を含み得る。他の実施態様において、核酸は、ここでの表に示すアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列またはそれと実質的に相同な配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一および/または1以上の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を含み得る。さらに他の実施態様において、核酸は、ここでの表に示すアミノ酸配列を有する重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも少なくとも1、2、3、4、5または6のCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列またはそれと実質的に相同な配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一および/または1以上の置換、例えば、保存的置換を有する配列)を含み得る。
ある実施態様において、核酸は、ここでの表に示すヌクレオチド配列を有する重鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列またはそれと実質的に相同な配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一および/またはここに記載するストリンジェンシー条件下でハイブリダイズできる配列)を含み得る。他の実施態様において、核酸は、ここでの表に示すヌクレオチド配列を有する軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列またはそれと実質的に相同な配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一および/またはここに記載するストリンジェンシー条件下でハイブリダイズできる配列)を含み得る。さらに他の実施態様において、核酸は、ここでの表に示すヌクレオチド配列を有する重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1、2、3、4、5または6のCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列またはそれと実質的に相同な配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一および/またはここに記載するストリンジェンシー条件下でハイブリダイズできる配列)を含み得る。
他の態様において、本発明は、ここに記載する核酸を含む宿主細胞およびベクターに関する。核酸は、下に詳述するとおり、単一ベクターまたは同じ宿主細胞もしくは別々の宿主細胞に存在する別々のベクターに存在してよい。
ある実施態様において、抗PD−1抗体分子の重鎖および軽鎖可変領域、CDR、超可変ループ、フレームワーク領域をコードする一方または両方ヌクレオチド配列を含む1以上の核酸分子が提供される。ある実施態様において、抗PD−1抗体分子をコードするヌクレオチド配列は、コドン最適化される。例えば、本発明は、例えば、表1に要約する、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかの1以上から選択される抗PD−1抗体分子の重鎖および軽鎖可変領域それぞれをコードする第一および第二核酸またはそれに実質的に同一の配列に関する。例えば、核酸は、表1および2に示すヌクレオチド配列またはそれに実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一または表1および2に示す配列と3、6、15、30または45ヌクレオチドを超えて異ならない配列)を含み得る。
他の実施態様において、核酸分子は、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eのアミノ酸配列を含む重鎖可変ドメインおよび/または重鎖定常領域をコードするヌクレオチド配列または表1に記載するまたは表1におけるヌクレオチド配列または前記配列と実質的に同一の配列(例えば、少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一の配列)を含む。
他の実施態様において、核酸分子は、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eのアミノ酸配列を含む軽鎖可変ドメインおよび/または軽鎖定常領域をコードするヌクレオチド配列または表1に記載するまたは表1におけるヌクレオチド配列または前記配列と実質的に同一の配列(例えば、少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一の配列)を含む。
抗PD−1重鎖および軽鎖可変ドメインおよび定常領域をコードする前記ヌクレオチド配列は別々の核酸分子または同じ核酸分子に存在し得る。ある実施態様において、核酸分子は、リーダー配列をコードするヌクレオチド配列、例えば、表4に示すリーダー配列またはそれと実質的に同一の配列を含む。
ある実施態様において、核酸分子は、表1に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同な配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一であるおよび/または1、2、3またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する重鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む。
他の実施態様において、核酸分子は、表1に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同な配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一であるおよび/または1、2、3またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する軽鎖可変領域からの少なくとも1、2または3のCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列を有する。
さらに他の実施態様において、核酸分子は、表1に示すアミノ酸配列またはそれと実質的に相同な配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一であるおよび/または1、2、3またはそれ以上の置換、挿入または欠失、例えば、保存的置換を有する配列)を有する重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1、2、3、4、5または6のCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む。
ある実施態様において、核酸分子は、軽可変領域の102位の軽鎖CDR3に置換、例えば、表1による軽可変領域の102位に、システイン残基からチロシン残基またはシステイン残基からセリン残基への置換を含む抗PD−1抗体分子をコードするヌクレオチド配列を含む(例えば、マウスまたはキメラについて配列番号16または24または修飾配列について配列番号34、42、46、54、58、62、66、70、74または78の何れか)。
他の実施態様において、核酸分子は、表1および2に要約する、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかについての、1以上の重鎖フレームワーク領域(例えば、VHFW1(タイプa)、VHFW1(タイプb)、VHFW2(タイプa)、VHFW2(タイプb)、VHFW2(タイプc)、VHFW3(タイプa)、VHFW3(タイプb)またはVHFW4の何れかまたはこれらの任意の組み合わせ、例えば、フレームワークここに記載する組み合わせ物)またはそれに実質的に同一の配列を含む。例えば、核酸分子は表1および2に示すヌクレオチド配列またはそれに実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一または表1および2に示す配列と3、6、15、30または45ヌクレオチドを超えて異ならない配列)を含み得る。
他の実施態様において、核酸分子は、表1および2に要約する、BAP049−hum01、BAP049−hum02、BAP049−hum03、BAP049−hum04、BAP049−hum05、BAP049−hum06、BAP049−hum07、BAP049−hum08、BAP049−hum09、BAP049−hum10、BAP049−hum11、BAP049−hum12、BAP049−hum13、BAP049−hum14、BAP049−hum15、BAP049−hum16、BAP049−Clone−A、BAP049−Clone−B、BAP049−Clone−C、BAP049−Clone−DまたはBAP049−Clone−Eの何れかの1以上の軽鎖フレームワーク領域(例えば、VLFW1(タイプa)、VLFW1(タイプb)、VLFW1(タイプc)、VLFW1(タイプd)、VLFW1(タイプe)、VLFW2(タイプa)、VLFW2(タイプb)、VLFW2(タイプc)、VLFW3(タイプa)、VLFW3(タイプb)、VLFW3(タイプc)、VLFW3(タイプd)またはVLFW4の何れかまたはこれらの任意の組み合わせ、例えば、フレームワークここに記載する組み合わせ物)またはそれに実質的に同一の配列を含み得る。例えば、核酸分子は、表1および2に示すヌクレオチド配列またはそれに実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%またはそれ以上同一または表1および2に示す配列と3、6、15、30または45ヌクレオチドを超えて異ならない配列)を含み得る。
他の実施態様において、核酸分子は、ここに記載する1以上の重鎖フレームワーク領域および1以上の軽鎖フレームワーク領域を含む。重鎖および軽鎖フレームワーク領域は、同じベクターまたは別々のベクターに存在し得る。
ベクターおよび宿主細胞
他の態様において、本発明は、ここに記載する核酸を含む宿主細胞およびベクターに関する。核酸は、単一ベクターまたは同じ宿主細胞もしくは別々の宿主細胞に存在する別々のベクターに存在し得る。
ある実施態様において、ベクターは、ここに記載する抗体分子をコードするヌクレオチドを含む。ある実施態様において、ベクターは、ここに記載するヌクレオチド配列を含む。ベクターは、ウイルス、プラスミド、コスミド、ラムダファージまたは酵母人工的染色体(YAC)を含むが、これらに限定されない。
多数のベクター系が用いられ得る。例えば、あるベクター群は、例えば、ウシ乳頭腫ウイルス、ポリオーマウイルス、アデノウイルス、ワクシニアウイルス、バキュロウイルス、レトロウイルス(ラウス肉腫ウイルス、MMTVまたはMOMLV)またはSV40ウイルスのような、動物ウイルス由来のDNA要素を利用する。他のベクター群は、セムリキ森林ウイルス、東部馬脳炎ウイルスおよびフラビウイルスのようなRNAウイルスからのRNA要素を利用する。
さらに、染色体にDNAが安定に統合されている細胞を、トランスフェクト宿主細胞の選択を可能にする1以上のマーカーの導入により選択し得る。マーカーは、例えば、栄養要求性宿主に対するプロトトロピー、殺生物剤耐性(例えば、抗生物質)または銅のような重金属に対する耐性などを提供し得る。選択可能マーカー遺伝子は、発現させるDNA配列に直接連結しても、共形質転換により同じ細胞に導入してもよい。さらなる要素が、mRNAの最適合成に必要であるかもしれない。これらの要素は、スプライスシグナル、ならびに転写プロモーター、エンハンサーおよび停止シグナルを含み得る。
構築物を含む発現ベクターまたはDNA配列が発現のために調製されたら、発現ベクターを、適切な宿主細胞にトランスフェクトまたは導入し得る。例えば、プロトプラスト融合、リン酸カルシウム沈殿、エレクトロポレーション、レトロウイルス伝達、ウイルストランスフェクション、遺伝子銃、脂質ベースのトランスフェクションまたは他の慣用の技術のような、種々の技術をこの達成のために用い得る。プロトプラスト融合の場合、細胞を培地で増殖させ、適切な活性についてスクリーニングする。得られたトランスフェクト細胞の培養および産生された抗体分子の回収のための方法および条件は当業者に知られ、本記載に基づき、用いられる特定の発現ベクターおよび哺乳動物宿主細胞により変わるまたは最適化され得る。
本発明はまた、ここに記載する抗体分子をコードする核酸を含む宿主細胞も提供する。
ある実施態様において、宿主細胞は、抗体分子をコードする核酸を含むように遺伝子改変される。
ある実施態様において、宿主細胞は、発現カセットの使用により、遺伝子改変される。用語“発現カセット”は、このような配列と適合性の宿主における遺伝子の発現に影響を与え得るヌクレオチド配列をいう。このようなカセットは、プロモーター、イントロンを伴うまたは伴わないオープンリーディングフレームおよび停止シグナルを含む。例えば、誘導可能プロモーターのような、発現の実施に必要なまたは有益なさらなる因子も使用してよい。
本発明はまた、ここに記載するベクターを含む宿主細胞も提供する。
細胞は、真核生物細胞、細菌細胞、昆虫細胞またはヒト細胞であり得るが、これらに限定されない。適当な真核生物細胞は、Vero細胞、HeLa細胞、COS細胞、CHO細胞、HEK293細胞、BHK細胞およびMDCKII細胞を含むが、これらに限定されない。適当な昆虫細胞は、Sf9細胞を含むが、これに限定されない。
ある実施態様において、宿主細胞は、真核生物細胞、例えば、哺乳動物細胞、昆虫細胞、酵母細胞または原核生物細胞、例えば、大腸菌である。例えば、哺乳動物細胞は培養細胞または細胞株であり得る。哺乳動物細胞の例は、リンパ性細胞株(例えば、NSO)、チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)、COS細胞、卵母細胞およびトランスジェニック動物からの細胞、例えば、乳房上皮性細胞を含む。
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表5. 実施例参照。
表6. 実施例参照。
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下記実施例は、本発明の理解を助けるために示すが、その範囲を限定することを決していとせず、かつそう解釈されてはならない。
実施例1:抗PD−1抗体、BAP049のヒト化
マウス抗PD−1モノクローナル抗体BAP049をヒト化した。独特の可変領域配列を有する16のヒト化BAP049クローンの配列および試験サンプルを得た。これらのクローンを、その生物学的機能(例えば、抗原結合およびリガンド遮断)、構造特長およびCHO細胞における一過性発現についてさらに分析した。
実施例1.1:ヒト化テクノロジーおよび方法
BAP049のヒト化を、ヒト生殖系列可変領域フレームワーク(FW)のコンビナトリアルライブラリーを使用して実施した。テクノロジーは、ヒト生殖系列FW1、FW2およびFW3配列の無作為組み合わせにより構築されている、ヒト可変領域(VR)のライブラリーにマウスCDRをインフレームで導入することを伴う。FW4配列は、重鎖(HC)についてWGQGTTVTVSS(配列番号169)(KabatヒトHCサブグループI、No. 21)および軽鎖(LC)についてFGQGTKVEIK(配列番号208)(KabatヒトκサブグループI、No. 5)である1個のみを使用した。VR配列のライブラリーをヒト定常領域(CR)配列、ヒトIgG4(S228P)のHCおよびヒトκ CRのLCと融合させ、得られたIgG全体のライブラリーを、スクリーニングのためにCHO細胞で発現させた。全細胞ELISA形式における抗原発現細胞またはFACSにおける結合アビディティーを測定する、スクリーニングを、組織培養上清で実施した。
ヒト化方法を、ヒト化クローンのスクリーニングのためのコンパレーターとして役立ち得る適切なキメラmAb(マウスVR、IgG4(S228P)、ヒトκ)の構築および発現から始める、段階的方法で実施した。ヒトIgG4(S228P)重鎖およびヒトカッパ軽鎖の定常領域アミノ酸配列を表3に示す。
LCおよびHCのVRのヒト化を、二つの独立した段階で実施した。ヒト化LC(huLC)のライブラリーをキメラHC(マウスVR、IgG4(S228P))と対形成させ、得られた“半ヒト化”mAbを、ELISAにより結合活性についてスクリーニングした。適切な結合活性(≧キメラmAbの結合)を有するhuLCのクローンを選択した。同様に、ヒト化HC(huHC)のライブラリーをキメラLC(マウスVR、ヒトκ)と対形成させ、ELISAにより結合活性についてスクリーニングした。適切な結合活性(≧キメラmAbの結合)を有するhuHCのクローンを選択した。
次いで、選択したhuLCおよびhuHCの可変領域を配列決定して、独特の配列を有するhuLCおよびhuHCを同定した(初期選択法由来の一部クローンは、同じLCまたはHCを共有し得る)。独特のhuLCおよびhuHCを次いで無作為に合わせて、ヒト化mAb(humAb)の小ライブラリーを形成させ、これをCHO細胞で発現させ、ELISAおよびFACS形式で抗原発現細胞をスクリーニングした。キメラコンパレーターmAbの結合と同等以上の結合活性を有するクローンが、ヒト化方法の最終産物である。
実施例1.2:マウスmAb BAP049の配列
マウス抗PD−1 mAbのLCおよびHC可変領域配列を決定した。二つの独立した分析から得られた配列は同一であり、図1に示す。
生殖系列分析を実施しており、結果の一部をアミノ酸配列アライメントとして図2Aに示す。軽鎖について、V遺伝子はmIGKV8−19*01F(293/297ヌクレオチド)と98.65%同一であり、J遺伝子はmIGKJ2*01F(36/37ヌクレオチド)と97.30%同一である。重鎖について、V遺伝子はmIGHV1S22*01F(259/279ヌクレオチド)と92.83%同一であり、J遺伝子はmIGHJ3*01F(39/47ヌクレオチド)と82.98%同一であり、D遺伝子はmIGHD2−14*01Fである。図2Bに示すとおり、マウスmAbのLC配列は、不対Cysを102位に有し、これはCDRL3にあり、マウスJ2遺伝子における点変異により生じる(tac→tgc;Y→C)。
実施例1.3:キメラ抗体の構築
キメラ抗体の3バリアントを調製し、それらは、LC配列の102位にCys残基、Tyr残基またはSer残基の何れかを有した。3キメラ抗体、すなわち、BAP049−chi(Cys)、BAP049−chi(Tyr)およびBAP049−chi(Ser)(それぞれBAP049−chi、BAP049−chi−YおよびBAP049−chi−Sとしても知られる)をCHO細胞で発現させ、PD−1発現Jurkat細胞への結合について標識マウス抗体と競合する能力について試験した。図3A〜3Bに示すとおり、3バリアントは競合実験では区別不可能であった。結果は、3キメラmAb(Cys、Tyr、Ser)が、標識マウスmAb BAP049の結合と良好に等しく競合することを示す。キメラmAb曲線とマウスmAb曲線の間のわずかな差異は、おそらく、mAb濃度決定に使用した方法が異なるためである。マウスmAbの濃度はOD280測定により決定しており、一方上清におけるキメラmAb濃度は、IgG4標準を使用するELISAで決定した。生殖系列残基Tyrをヒト化抗体のために選択した。
キメラmAb BAP049−chi(Cys)の重鎖および軽鎖のアミノ酸配列を表1に示す。キメラmAb BAP049−chi(Cys)の重鎖および軽鎖のヌクレオチド配列を表1に示す。BAP049−chi(Tyr)およびBAP049−chi(Ser)において、LCの102位の不対Cys残基をTyr残基またはSer残基に置き換えた。
実施例1.4:ヒト化抗体クローン
図4に示すとおり、ヒト化の方法は、キメラ抗体と同等な結合親和性を有する16クローンを生じた。結合データに加えて、各クローンについて、VR配列がmAbのサンプルと共に提供された。サンプルは、CHO細胞の一過性トランスフェクションにより調製され、濃縮組織培養上清であった。溶液中の抗体濃度はIgG4特異的ELISAにより決定されていた。
図5に示すとおり、16の独特のクローンは、4の独特のHC配列と9の独特のLC配列の組み合わせである。HC FW領域について、HC配列は、2つの異なるVHFW1の一つ、3つの異なるVHFW2の一つおよび2つの異なるVHFW3配列の一つの組み合わせである。LC FW領域について、LC配列は、5つの異なるVLFW1の一つ、3つの異なるVLFW2の一つおよび4つの異なるVLFW3配列の一つの組み合わせである。ヒト化BAP049クローンの重鎖および軽鎖可変ドメインのアミノ酸およびヌクレオチド配列は、表1に示される。ヒト化BAP049クローンの重鎖および軽鎖CDRのアミノ酸およびヌクレオチド配列も、表1に示される。
図5は、サンプルのmAb濃度が異なり、7.9μg/mLから61.5μg/mLの範囲であったことを示す。これらの数値は、数一過性発現実験の代表であった。
実施例1.5:ヒト化クローンの分析
実施例1.5.1:結合活性および結合特異性の分析
結合活性および特異性を、一定濃度のAlexa 488標識マウスmAb、試験mAbの連続希釈物およびPD−1発現300.19細胞を使用する競合結合アッセイにおいて測定した。試験mAb対標識mAbの種々の濃度比を有するmAb混合物と、4℃で30分インキュベートした。次いで結合した標識マウスmAbをFACS機を使用して定量した。実験を2回実施した。結果を図6A〜6Bに示す。
本実験の精度内で、全ヒト化クローンは、標識マウスmAbとの結合の競合について類似の活性を示す。活性は、親マウスmAbおよびキメラmAbの活性とも同等である。mAbを互いにランク付けした。例えば、あるクローンの曲線が、両実験でキメラmAb曲線の右側にあるならば弱いコンペティターであり得てまたはあるクローンの曲線が、キメラmAb曲線の左側にあるならば良好なコンペティターであり得る。このようなランク付けシステムを図7で使用した。
実施例1.5.2:配列分析
構造特長に基づき、16ヒト化mAbを4群に分け、AからEにランク付けした。結果を図7に示す。
実施例1.5.3:ヒト化クローンの選択
図7は、ヒト化クローンの選択のために考慮されたデータを要約する。発現データ(2番目のカラム)、可変領域組成の多様性(3番目のカラム)、結合試験における相対的ランキング(4番目および5番目のカラム)および構造分析(6番目のカラム)が考慮された。
選択クローンを、さらに、PD−L1およびPD−L2のPD−1への結合を遮断する能力およびヒトPBMCを用いるインビトロアッセイにおけるT細胞活性の増強についてさらに試験した。
実施例1.5.4:リガンド結合の遮断
マウス抗PD−1 mAbは、天然リガンドPD−L1およびPD−L2の低濃度で細胞上に発現されるPD−1への結合を遮断する。ヒト化クローンが親マウスmAbの遮断能を保持しているかを、マウスおよびキメラ抗体での比較実験で試験した。
mAbの遮断能を、一定濃度のPD−L1−huIgG1 Fc融合体タンパク質またはPD−L2−huIgG1 Fc融合体タンパク質、試験するmAbの連続希釈物およびPD−1発現300.19細胞を使用する競合結合アッセイにおいて評価した。4℃で30分インキュベートした。結合したリガンド融合体タンパク質を、IgG4 mAbを認識しないヤギ抗ヒトIgGのPEコンジュゲートF(ab’)フラグメント(Southern Biotech 2043-09)およびフローサイトメトリーで検出した。結果を図8A〜8Bに示す。
本実験の精度内で、ヒト化クローン、キメラ抗体およびマウス親mAbは、PD−L1およびPD−L2リガンドの両方について、同等の遮断活性を示した。
実施例1.5.5:T細胞エピトープ分析
ヒト化mAbを、EpibaseTMを使用してT細胞エピトープについて分析した。アルゴリズムは、HLAクラスIIへの結合について、各可能性のあるペプチド(1アミノ酸ずつ進んでいるタンパク質に沿った各々の10量体)を分析する。各ペプチドについて結合の自由エネルギー(ΔG結合)を概算し、推定K(ΔG結合=RT lnK)を計算する。ついでペプチドを、強、中および非結合剤についてS、MまたはNと標識する。この分類に使用した閾値は、各アロタイプで異なる。
データをリスクスコアに対して標準化した。全体的“リスクスコア”は、生殖系列配列における全潜在的エピトープは除き、各ペプチドの親和性により荷重した、全試験アレルに対する全潜在的エピトープの合計である(従って、値が低いほど“良好”である)。
下記のとおり異なる組成の大きなセットのmAb由来の、大まかに3カテゴリーのmAbがある。
約500のリスクスコア:ヒト、“ヒト化”マウスおよびファージライブラリーから産生された完全ヒトmAb(“500未満の値は、完全ヒト抗体としても、真に優れる”)。低スコアを有するように特異的に改変された(CDRでさえ)ヒト化mAbは、一般に500〜700リスクカテゴリーを有する。
リスクスコア約900:FW領域を変えたまたは変えていない完全マウスCDRを有する典型的CDR移植抗体であり、承認されたCDR移植mAbは基本的に全てこのカテゴリーに入る。
リスクスコア約1500:キメラmAb。
選択ヒト化BAP049 mAbの結果は次のとおりである。
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選択したヒト化クローンは低いスコアを有する。一般に、500より低い値は、完全ヒト抗体についてされ、免疫原性の低リスクを示す。例えば、ヒトmAbであるアダリムマブ(ヒュミラ(登録商標))は654のスコアを有し、これはヒトmAbとしては比較的高いが(ガウス曲線の上端)、典型的CDR移植mAbと比較すると低い。
要約および結論
マウス抗PD−1モノクローナル抗体、BAP049をヒト化した。テクノロジーは、ヒト生殖系列可変領域フレームワークの秩序ライブラリーへのマウスCDRのインフレームのクローニング、CHO細胞でのインタクトIgG4(S228P)ヒト化mAbとしてのクローン化可変領域のライブラリーの発現および親mAbと同等以上の親和性で標的に結合するクローンの選択を含む。それ故に、マウスCDRは、高次構造、故に、親マウスmAb結合親和性および特異性を保持する、適切なヒト生殖系列フレームワーク配列の選択が要求された。独特の可変領域配列を有する16のヒト化mAbの配列および試験サンプルが得られ、これは、PD−1トランスフェクトCHO細胞での結合試験に合格した。これらのクローンを、生物学的機能(例えば、抗原結合およびリガンド遮断)、構造特長およびCHO細胞における一過性発現についてさらに分析した。
実施例2:ヒト化抗PD−1抗体、BAP049の発現
実施例1に記載した5つのヒト化クローンを、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞における発現の評価のために選択した。
単一遺伝子ベクター(SGVs)を、Lonza's GS Xceedベクター(重鎖についてIgG4proΔkおよび軽鎖についてカッパ)を使用して構築した。SGVを増幅させ、2.8L体積で発現のためにCHOK1SV GS−KO細胞に一過性に共トランスフェクトした。
発現培養物を、トランスフェクション後6日目に採取し、遠心分離および無菌濾過により浄化した。浄化細胞培養上清を、一段階プロテインAクロマトグラフィーを使用して精製した。SE−HPLC、SDS−PAGE、IEFおよびLALの形式での製品品質分析を、対照サンプルとしての抗体を含み、1mg/mlの濃度で精製物質を使用して実施した。
実施例2.1:ベクター構築
軽鎖および重鎖可変ドメインコード化領域の配列はGeneArt AGにより合成された。軽鎖可変ドメインコード化領域をpXC−カッパにおよび重鎖可変ドメインコード化領域をpXC−IgG4pro ΔKベクターに、N末端制限部位Hind IIIおよびC末端制限部位BsiWI(軽鎖)およびApaI(重鎖)を使用して、それぞれ、サブクローン化した。陽性クローンをPCR増幅によりスクリーニングし(プライマー1053:GCTGACAGACTAACAGACTGTTCC(配列番号226)および1072:CAAATGTGGTATGGCTGA(配列番号227))、制限消化(EcoRI−HFおよびHindIII−HFのダブル消化を使用)および目的の遺伝子のヌクレオチド配列決定により確認した。
実施例2.2:DNA増幅
一細菌コロニーを、50μg/mlアンピシリン含有15mlルリア・ベルターニ(LB)培地(LB Broth, Sigma-Aldrich, L7275)に採り、37℃で一夜、220rpmで震盪させながらインキュベートした。得られたスターター培養物を使用して、50μg/mlアンピシリン含有1Lルリア・ベルターニ(LB)培地に摂取し、37℃で一夜、220rpmで震盪させながらインキュベートした。ベクターDNAをQIAGEN Plasmid Plus Gigaprep system(QIAGEN, 12991)を使用して単離した。全例において、DNA濃度をNanodrop 1000分光光度計(Thermo-Scientific)を使用して測定し、EB緩衝液(10mM Tris−Cl、pH8.5)で1mg/mlに調節した。単一遺伝子ベクターについてのDNA品質を吸光度比A260/A280の測定により評価した。これは、1.88〜1.90の間であることが判明した。
実施例2.3:CHOK1SV GS−KO細胞の培養
CHOK1SV GS−KO細胞を、6mMグルタミン(Invitrogen, 25030-123)添加CD−CHO培地(Invitrogen, 10743-029)で培養した。細胞を、シェーカーインキュベーターで36.5℃、5%CO、85%湿度、140rpmでインキュベートした。細胞を、3〜4日毎に定期的に継代し、2×10細胞/mlで播種し、トランスフェクションに利用可能な十分な細胞を得るために、増殖させた。細胞を20継代までに処分した。
実施例2.4:CHOK1SV GS−KO細胞の一過性トランスフェクション
一過性トランスフェクションを、最低2週培養されている、CHOK1SV GS−KO細胞を使用して実施した。細胞をトランスフェクション24時間前に継代し、細胞生存能はトランスフェクション時>99%であった。
全トランスフェクションを、プレートベースのエレクトロポレーションのシステムであるGene Pulse MXCell(Bio-Rad)を使用するエレクトロポレーションで実施した。各トランスフェクションについて、生存可能細胞を、予め温めた培地に2.86×10細胞/mlで再懸濁した。80μg DNA(重鎖および軽鎖SGV1:1比)および700μl細胞懸濁液を、各キュベット/ウェルに等分した。細胞を300V、1300μFで電気穿孔した。トランスフェクト細胞を、エレンマイヤーフラスコ中の予め温めた培地に移し、キュベット/ウェルを予め温めた培地で2回洗浄し、これもフラスコに移した。トランスフェクト細胞培養を、シェーカーインキュベーターで、36.5℃、5%CO、85%湿度、140rpmで6日インキュベートした。細胞生存能および生存可能細胞濃度を、採取時、Cedex HiRes自動セルカウンター(Roche)を使用して測定した。
実施例2.5:プロテインA親和性クロマトグラフィー
細胞培養上清を採取し、2000rpmで10分遠心分離することにより浄化し、次いで0.22μm PESメンブランフィルターで濾過した。浄化上清を、AKTA清浄器上の予め充填された5ml HiTrap MabSelect SuREカラム(GE Healthcare, 11-0034-94)を使用して精製した(10ml/分)。カラムを、5カラム体積(CV)の50mMリン酸ナトリウム、125mM塩化ナトリウム、pH7.0(平衡化緩衝液)で平衡化した。サンプル充填後、カラムを2CVの平衡化緩衝液、続いて3CVの50mMリン酸ナトリウム、1M塩化ナトリウムpH7.0および2CVの平衡化緩衝液での反復洗浄により洗浄した。次いで生成物を10mM ギ酸ナトリウム、pH3.5で5CVにわたり溶出した。タンパク質含有、溶出フラクションを即座にpH7.2にpH調節し、0.2μmフィルターで濾過した。
一タンパク質含有ピークが溶出相の間に観察された。このピークは、SE−HPLCおよびSDS−PAGEで分析したとき、mAbを含むことが示された。回収タンパク質収量を表5に示す。クローンは、32.4〜43.0mg/Lの範囲で一過性に発現された。
Figure 0006878405
実施例2.6:SE−HPLC分析
プロテインA精製抗体のサンプを、Zorbax GF-250 4μm 9.4mm ID×250mmカラム(Agilent)を使用するAgilent 1200シリーズHPLC系上のSE−HPLCでデュプリケートで分析した。1mg/ml濃度のサンプルの等量を、注入前に0.2μmフィルターで濾過した。80μl量をそれぞれ注入し、1ml/分で15分流した。可溶性凝集物レベルをChemstation(Agilent)ソフトウェアを使用して分析した。
全体的に検出されたピーク面積のパーセンテージを示す保持時間を伴うクロマトグラフィープロファイルを試験抗体および対照IgG4抗体で得た。生成物は、ヒトIgG4抗体対照(約8.64分)と同等であり、単量体抗体に一致する、約8.65〜8.72分に一タンパク質ピークを示した。可溶性凝集物と一致する小量(最大約4〜5%)の高分子量不純物が約7.43〜8.08分の保持時間で検出された。
実施例2.7:SDS−PAGE分析
還元サンプルを、NuPage 4xLDSサンプル緩衝液(Invitrogen, NP0007)およびNuPage 10xサンプル還元剤(Invitrogen, NP0009)と混合し、70℃、10分でインキュベートすることにより分析用に調製した。非還元サンプルについて、還元剤および加熱インキュベーションを省略した。サンプルを、変性条件下、NuPage MES SDS泳動用緩衝液を用いて1.5mm NuPage 4〜12%Bis-Tris Novexプレキャストゲル(Invitrogen, NP0335PK2)で電気泳動した。10μl量のSeeBlue Plus 2予染色分子量標準(Invitrogen, LC5925)および対照IgG4抗体1mg/mlをゲルに包含させた。1mg/mlでの1μlの各サンプルをゲルに載せた。電気泳動したら、ゲルをInstantBlue(TripleRed, ISB01L)で30分、室温で染色した。染色されたゲルの画像を、BioSpectrum Imaging System(UVP)で分析した。
分析は、抗体生成物の存在および良好な純度レベルを確認した。非還元条件下、98kDaに近い優勢なタンパク質バンドが、対照IgG4抗体と同等に観察された。対照IgG4抗体および一つの試験クローンは、非還元条件下、約70kDaに重鎖+軽鎖半抗体に対応するかすかなバンドを示す。これは、対照抗体について予測される。重鎖(49kDaマーカーの位置付近)および軽鎖(28kDaマーカーの位置付近)のサイズと一致し、対照IgG4抗体で見られるバンドと同等な2バンドが、還元条件下で観察された。
実施例2.8:等電点電気泳動(IEF)分析
プロテインA精製抗体の非還元サンプルを、下記のとおり電気泳動した。
5μgのプロテインA精製サンプルを、製造業者が推奨する泳動条件を使用して、1.0mm Novex pH3〜10勾配ゲル(Invitrogen, EC66552BOX)で電気泳動した。10μl分のIEF pH3〜10マーカー(Invitrogen, 39212-01)をゲルに包含させた。電気泳動したら、ゲルを10%TCA溶液で30分固定し、InstantBlue(TripleRed, ISB01L)で一夜、室温でインキュベートした。染色されたゲルの画像を、BioSpectrum Imaging System(UVP)で分析した。
表6に示すとおり、試験クローンは、pH7.4マーカーと8.0マーカーの間に、荷電アイソフォームを示す。検出された荷電アイソフォームは、6.99〜7.56と予測されたこれらの抗体の理論的に計算したpIよりもわずかに塩基性であった。より塩基性の荷電アイソフォームへの一般的シフトは、分子のグリコシル化のような翻訳後修飾の存在を示唆する。クローンCおよびクローンEは同等な荷電アイソフォームを示し、これはまた両者について同一(6.99)である理論的に計算したpIとも一致した。対照IgG4抗体は予想どおり行動した。
Figure 0006878405
実施例2.9:内毒素分析
精製タンパク質の内毒素レベルを、最終濃度(最大3.44mg/ml)で、LALアッセイ(Charles River)に基づくカートリッジベースの方法である、Endosafe-PTS装置を使用して測定した。
表5に示すとおり、内毒素含量は、0.04〜0.63EU/mgの範囲であることが判明した。
結論
選択ヒト化抗PD−1 mAbのGS一遺伝子発現ベクターを構築し、CHOK1SV GS−KO細胞の一過性トランスフェクトに使用した。2.6〜2.8リットルの発現培養物を、標準条件下、6日インキュベートし、得られた細胞培養上清を、プロテインAクロマトグラフィーを使用して精製した。精製後力価を表5に示し、32.38〜43.0mg/Lの範囲であることが判明した。回収収量は、90.7〜120.4mgの範囲であった。
SDS−PAGEおよびSE−HPLC分析は、産物に存在する小量の(最大6.06%)可溶性凝集物が、mAbの二量体抗体と主に一致することを示した。mAbはまた三量体抗体と一致する保持時間で高分子量不純物も示した。
等電点電気泳動は、全mAbについて多数の荷電アイソフォームを検出した。mAbは、これらの分子について理論的に計算したpIに基づいたとき、あるレベルの翻訳後修飾を示す、一般により塩基性のアイソフォームを示した。mAbは、理論的に計算したpI値と同等であることが判明した。
全サンプルの内毒素レベルを、サンプル提供前に測定しており、0.63EU/mg未満であることが判明した。
実施例3:マウスおよびヒト化抗PD−1抗体の特徴付け
実施例3.1:マウス抗PD−1抗体の特徴付け
マウス抗PD−1抗体BAP049のPD−1への結合親和性を調査した。マウス抗PD−1抗体は、ELISAで測定して、ヒトPD−1−Ig融合体タンパク質に0.04nMのKで結合する。FACS分析により示されるとおり、マウス抗PD−1抗体は、ヒトPD−1トランスフェクトJurkat細胞に0.06nMのK、カニクイザルT細胞(例えば、CD3/CD28活性化CD4 T細胞)に0.4nMのKおよびカニクイザルPD−1でトランスフェクトした細胞に0.6nMのKで結合する。
マウス抗PD−1抗体BAP049の遮断活性を競合結合アッセイにより試験した。マウス抗PD−1抗体は、ヒトPD−1発現300.19細胞へのPD−L1結合を、0.3nMのIC50で遮断した。ヒトPD−1発現300.19細胞へのPD−L2結合を0.9nMのIC50で遮断した。
インターフェロンガンマ(IFN−γ)発現に対するマウス抗PD−1抗体BAP049の効果を試験した。マウス抗PD−1抗体は、IFN−γ発現を、抗CD3(0.1μg/mL)で刺激した細胞で2.3±1.1倍増加、ブドウ球菌エンテロトキシンB(SEB)(3pg/mL)で刺激した細胞で2.5±2.0倍増加およびCMVペプチドで刺激した細胞で2.8±0.8倍増加させた。
マウス抗PD−1抗体BAP049は、少なくともある数(n)の細胞分裂(例えば、n=2、4、6)を経るCD8細胞のパーセンテージにより示して、CMVペプチドにより活性化されたCD8 T細胞の増殖も増加させた。
実施例3.2:ヒト化抗PD−1抗体の特徴付け
結合親和性および特異性
例示したヒト化抗PD−1抗体のヒトPD−1タンパク質に対する結合を、Biacore方法を使用して測定した。結果は、Ka=2.78×10−1−1;Kd=2.13×10〜−1;K=0.0827±0.005505nMである。
同ヒト化抗PD−1抗体のヒトPD−1発現300.19細胞に対する結合を、FACS分析を使用して測定した。結果は、抗PD−1抗体(ヒトIgG4)が、ヒトIgG4アイソタイプ対照と比較して、高親和性でヒトPD−1に結合することを示す。
該例示したヒト化抗PD−1抗体は、カニクイザルPD−1タンパク質およびカニクイザルPD−1発現300.19細胞に高親和性を示すことが判明した。Biacore方法により測定して、抗PD−1抗体は、カニクイザルPD−1に0.093±0.015nMのKで結合した。カニクイザルPD−1への結合親和性は、ヒトPD−1へのその結合親和性と同等である。
さらなる結合分析は、該例示したヒト化抗PD−1抗体がマウスPD−1と交差反応性ではなくまたは親細胞株と交差反応性であることを示す。
PD−1とそのリガンドの間の相互作用の遮断
該例示したヒト化抗PD−1抗体が、PD−1と、その既知リガンドであるPD−L1およびPD−L2の両方の間の相互作用を試験した。結果は、抗PD−1抗体がヒトIgG4アイソタイプ対照および無抗体対照と同等に、ヒトPD−1発現300.19細胞へのPD−L1およびPD−L2の結合を遮断したことを示す。抗PD−1抗体は、300.19細胞へのPD−L1結合を、0.94±0.15nMのIC50で遮断した。同抗体は、300.19細胞へのPD−L2結合を、1.3±0.25nMのIC50で遮断した。
細胞性活性
該例示したヒト化抗PD−1抗体が、IL−2のブドウ球菌エンテロトキシンB(SEB)刺激発現を増強するかを、ヒト全血エクスビボアッセイで試験した。希釈ヒト全血を、抗PD−1抗体と、SEB存在下または非存在下、37℃で48時間インキュベートし、その後IL−2測定した。結果は、抗PD−1抗体が、SEB刺激IL−2発現を、ヒトIgG4アイソタイプ対照(25μg/ml SEB;n=5ドナー)と比較して、2.28±0.32倍増加させたことを示す。
実施例4:PD−L1/CD8/IFN−γ状態に基づく患者選択
数タイプの癌の各々について、多数の患者からのサンプルを、PD−L1/CD8/IFN−γ状態について試験した。各サンプルを、PD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルネガティブ、これらのマーカーについてシングルまたはダブルポジティブまたはこれらのマーカーについてトリプルポジティブと分類した。図11は、この実験において、患者の集団間で、次のタイプの癌がしばしばPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブであることを示す。肺癌(扁平上皮)、肺癌(腺癌)、頭頸部癌、子宮頸癌(扁平上皮)、胃癌、甲状腺癌、黒色腫および鼻咽頭癌。これらのタイプの癌を有する患者は、ここに記載する抗PD−1抗体および組み合わせ治療での治療の良い候補である。処置が成功する可能性を、どの患者がPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブであるかを決定し、トリプルポジティブ患者をここに記載する抗PD−1抗体および組み合わせ治療で処置することにより、さらに上げ得る。
図12は、患者集団内で、次のタイプの癌が稀にPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブであることを示す。ER+乳癌および膵臓癌。特に、PD−L1/CD8/IFN−γについて一般にポジティブではない癌でさえ、どの患者がPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブであるかを決定し、トリプルポジティブ患者をここに記載する抗PD−1抗体および組み合わせ治療で処置することにより、処置が成功する可能性を上げることができる。
図13は、PD−L1/CD8/IFN−γにトリプルポジティブである乳癌患者の割合を示す。一般に乳癌を考えると、トリプルポジティブの割合は幾分低い。しかしながら、IM−TN乳癌にのみ焦点を絞ったとき、遙かに高いパーセンテージの患者がPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブであることを見ることができる。IM−TN乳癌は、慣用の治療の処置が特に困難である。IM−TN乳癌がしばしばPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブであるとの発見は、この癌をここに記載する抗PD−1抗体および組み合わせ治療で治療する新しい道を開く。
図14は、PD−L1/CD8/IFN−γにトリプルポジティブである結腸癌患者の割合を示す。一般に結腸癌を考えると、トリプルポジティブの割合は幾分低い。しかしながら、MSI高(高マイクロサテライト不安定性)結腸癌についてのみ焦点を絞ったとき、遙かに高いパーセンテージの患者がPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブであることを見ることができる。MSIレベルは、例えば、市販のPCRベースの方法を使用してアッセイできる。
胃癌サンプルを、PD−L1/CD8/IFN−γのレベルについて試験した(データは示していない)。MSI高またはEBV+胃癌において、約49%がPD−L1について陽性であり、PD−L1陽性細胞の高い割合がPD−L1/CD8/IFN−γについてトリプルポジティブであったことを示す。PD−L1陽性細胞およびPD−L1/CD8/IFN−γ陽性細胞の一定割合が、PIK3CAについて陽性でもあったことも判明した。この所見は、これらの癌をPD−1抗体で、場合によりPIK3治療と組み合わせて、処置し得ることを示唆する。
MSI高CRCサンプルを、マーカーの組み合わせについて試験した(データは示していない)。MSI高CRCサンプルにおいて、PD−L1/CD8/IFN−γサンプルの高い割合がLAG−3、PD−1(PDCD1とも称される)、RNF43およびBRAFについても陽性であること判明した。この所見は、これらの癌を、PD−1抗体で、場合によりLAG−3、PDCD1、RNF43およびBRAFの1以上を標的とする治療と組み合わせて、処置し得ることを示唆する。
扁平上皮細胞肺癌を、マーカーの組み合わせについて試験した(データは示していない)。扁平上皮細胞肺癌サンプルにおいて、PD−L1/CD8/IFN−γサンプルの高い割合が、LAG−3についても陽性であること判明した。この所見は、これらの癌を、PD−1抗体で、場合によりLAG−3を標的とする治療、例えば、LAG−3抗体と組み合わせて、処置し得ることを示唆する。
乳頭状甲状腺癌を、BRAF V600E変異を含むマーカーの組み合わせについて試験した(データは示していない)。PD−L1に陽性である甲状腺癌サンプルの高い割合が、BRAF V600Eについても陽性であること判明した。この所見は、これらの癌を、PD−1抗体で、場合によりBRAFを標的とする治療と組み合わせて、処置し得ることを示唆する。
実施例5:PD−L1状態に基づく患者選択
PD−1/PD−L1ベースの治療に関する癌適応症の広範な試験を可能とするために、我々は、PD−L1発現をタンパク質およびmRNAレベル両方で、肺および肝臓腫瘍の両方を含むヒト癌で評価した。
PD−L1タンパク質発現を、一連のホルマリン固定パラフィン包埋非小細胞肺(NSCLC)腺癌(ACA)、NSCLC扁平上皮細胞癌(SCC)および肝細胞癌(HCC)腫瘍において、免疫組織化学(IHC)により評価した。PD−L1発現を、染色強度および陽性腫瘍細胞のパーセンテージに基づく手動組織スコア(H−スコア)方法により、半定量的に採点した。我々のIHC分析において、PD−L1陽性度(PD−L1+)をH−スコア≧20と定義した。並行して、PD−L1 mRNA発現データを、これらの同じ適応症(503 NSCLC ACA、489 NSCLC SCCおよび191 HCC)についてThe Cancer Genome Atlas(TCGA)から試験し、TCGAからの適合正常組織における発現と比較した。
RNAseq分析で、TCGA腫瘍適応症にわたるOmicSoft RNASeqパイプラインを利用して、データをRSEM正規化後、log2(RPKM+0.1)として計算した。PD−L1の発現は、HCCと比較して、NSCLC ACAおよびSCCで上昇する。TCGAにおける全適応症にわたり分布を重ね合わせ、発現レベルを比較することにより、我々は、PD−L1についての過発現プロファイルをランク付けし、TCGA HCCコホートがはるかに低いPD−L1 mRNAレベルを有し、ACAの1.3およびSCCの1.5と比較して−0.8の中央レベルであり、これは、中央レベル発現の2倍を超える変化に達することを発見した。RNAseqで、我々の分析は、PD−L1についてNSCLC腺癌の50%、NSCLC扁平上皮細胞癌の54%およびHCCの6%が高発現体として規定した。
腫瘍細胞PD−L1タンパク質発現を45肺腺癌(ACA)サンプル、47肺扁平上皮細胞癌(SCC)サンプルおよび36肝細胞癌(HCC)サンプルで測定した。16/45(35.6%)肺ACA、21/47(44.7%)肺SCCがPD−L1陽性であった。対照的に、PD−L1陽性度は、2/36(5.6%)HCCサンプルでのみ見られた。
まとめると、大きくかつ独立したヒトNSCLCおよびHCCサンプルセットにおけるIHCおよびRNAseq分析で、我々は、PD−L1発現がHCCよりNSCLCで富化されることを発見した。NSCLC内で、腺癌と扁平上皮細胞癌で同等な所見であった。重要なことに、3適応症の多数のサンプル(IHCについて128およびRNAseqについて1183)の中で、タンパク質ベースおよびmRNAベースの分析の間の極めて良好な一致が観察される。我々の所見は、それ故に、PD−1/PD−L1ベースの免疫治療に対する応答について濃縮され得る適応症および患者セグメントについてTCGAにおける大規模mRNAベースデータ検索の基礎を確立する。
実施例6:PD−L1調節に対する標的化薬剤の効果
この実施例は、PD−L1(CD274)調節に対する選択治療剤(例えば、cMET阻害剤、MEK阻害剤、bRAF阻害剤およびALK阻害剤)の効果を評価する。化合物A17を米国特許8,420,645号の実施例21に従い製造できる。次の化合物:化合物A18(リン酸ルキソリチニブ)、化合物A23(セリチニブ)、化合物A34(ビニメチニブ)および化合物A29(エンコラフェニブ)は、Novartis AG, Basel, Switzerlandから入手可能である。選択治療剤をPD−L1レベルでリアルタイムPCRおよびフローサイトメトリーで試験した。腫瘍細胞における化合物A17、化合物A18、化合物A34、化合物A29および化合物A23によるPD−L1の顕著な阻害が観察された。
非小細胞肺癌細胞におけるPD−L1タンパク質の化合物A17下方制御
PD−L1(CD274)発現を、化合物A17処理癌細胞株において分析した。細胞をATCCから得て、ATCCの指示に従いインビトロで培養した。使用した細胞株は、Cancer Cell Line Encyclopedia Project(http://www.broadinstitute.org/ccle/home)により予め特徴付けされていた。
6ウェル培養プレートに播種した細胞を、種々の濃度(10nM、100nMおよび1000nM)の化合物A17で、24時間、48時間および72時間処理した。等量の培地(DMSO)を対照として使用した。細胞をPBSで洗浄し、次いで細胞スクレーパーを使用して採取した。
各反応について、0.5〜1×10細胞を、20μLの抗ヒトモノクローナルPD−L1−PE抗体、クローンM1H1(BD)で30〜60分、4℃で染色した。細胞を2回洗浄し、データをFACSDivaソフトウェア(BD Bioscience)と共にCanto IIを使用して獲得した。データ分析をFlowJoソフトウェア(Tree Star)を使用して実施した。平均蛍光強度(MFI)を、単一細胞上のゲーティングにより決定した。未染色細胞をゲーティング対照として使用した。
EBC−1細胞(cMET増幅を伴う非小細胞肺癌(NSCLC))の化合物A17でのインビトロ処理は、フローサイトメトリーにより観察されるとおり、PD−L1表面発現の顕著な下方制御をもたらした(図15)。ここに示す結果は、化合物A17がPD−L1/PD−1阻害剤として機能することを示す。
化合物A17、化合物A34、化合物A18、化合物A29および化合物A23はPD−L1 mRNAを下方制御する
TaqMan RT PCRアッセイを、細胞株および異種移植腫瘍におけるPD−L1(CD274)の発現レベルを検出するために開発した。mRNAを凍結細胞ペレットまたは腫瘍フラグメントから、Qiagen RNeasy Miniキットを使用して単離した。単離RNAを−80℃で凍結した。RNA品質を確認し、RNAをAgilent RNA 6000 Nanoキットのプロトコールに従い、2100 Agilent Bioanalyzerを使用して定量した。cDNAを、High Capacity RNA-to cDNA Kit(Applied Biosystems)を使用して調製した。
リアルタイムPCR反応を、10μlのUniversal PCR master mix(Applied Biosystems)、1μlのヒトPD−L1(CD274)プローブ/プライマーセット(Applied Biosystems)および8μlのcDNAを含む、20μl総体積で実施した。各サンプルをトリプリケートで流した。逆転写反応における25〜50ngのRNAから産生されたcDNAの量を、各PCR反応で使用した。PD−L1とGAPDHの間のmRNAレベルの差異により、2つのリアルタイムPCR反応を、同量のcDNAを使用して、別々のチューブで実施した。リアルタイムPCR反応をC1000 Thermal Cycle(BioRad)で、次のとおりのサイクルプログラムで実施した。95℃で10分インキュベーション、続いて95℃で15秒および60℃で1分の40サイクル。反応完了後、PD−L1平均Ctを、GAPDH参照反応からの各Ct値に対して正規化した。各正規化対数値を、次いで直線値に変換した。
化合物A17によるPD−L1発現(mRNA)の阻害が、Hs.746.T腫瘍(cMET増幅および変異を伴う胃癌細胞)異種移植において観察された(図16)。化合物A23によるPD−L1 mRNAの阻害が、インビトロでH3122(ALK転座を伴う非小細胞肺癌(NSCLC))で観察された(図17)。化合物A29および化合物A34によるPD−L1 mRNAの下方制御が、LOXIMV1(BRAF変異体黒色腫、図18)およびHEYA8(KRAF変異体卵巣癌、図19)腫瘍をそれぞれ担持する腫瘍異種移植モデル出観察された。化合物A18によるPD−L1 mRNAの下方制御が、UKE−1(JAK2V617F変異を伴う骨髄増殖性新生物(MPN)株、図20)担持腫瘍異種移植モデルで観察された。
ここに示す結果は、癌における免疫チェックポイント分子の制御における、化合物A17、化合物A34、化合物A18、化合物A29および化合物A23の役割を示す。これらの薬剤によるPD−L1発現の阻害の観察は、これらの標的化薬剤が、癌シグナル伝達に対するそれらの効果に加えて、免疫調節活性を有し得るこよえお示唆する。それ故に、ここに示す結果は、標的化薬剤と、PD−1、PD−L1、LAG−3および/またはTIM−3のような免疫チェックポイント阻害剤の阻害剤の投与は、免疫チェックポイント介在免疫抑制のより強力な逆転を達成することを示唆する。
実施例7:進行型固形腫瘍を有する患者における例示した抗PD−1抗体分子の世界最初のヒトフェーズI/II治験
抗体分子
本治験で試験した例示した抗体分子(BAP049−Clone−E)は、プログラム細胞死リガンド−1(PD−L1)およびプログラム細胞死リガンド−2(PD−L2)のPD−1への結合を遮断するヒト化抗プログラム死−1(PD−1)IgG4モノクローナル抗体(mAb)である。それは、高親和性でPD−1に結合し、その生物学的活性を阻害する。この抗体分子のアミノ酸配列は、本明細書の表1に記載される(VH:配列番号38;VL:配列番号70)。前臨床毒性研究からの結果は、有利な安全性プロファイルを有することを示している。その薬力学的活性もインビボで示されている。この実施例は、進行型固形腫瘍を有する成人におけるこの抗体分子の世界最初のヒトでのフェーズI/II治験からのデータを示す。
方法
治験デザインおよび処置
図22は、進行型固形腫瘍を有する患者に投与した該例示した抗体分子の安全性および有効性のフェーズI/II、多施設、オープンラベル用量漸増および拡大治験のための治験デザインを示す。
患者を、許容されない毒性の経験、改変固形腫瘍における免疫関連応答評価基準(irRC)に従う疾患進行(全ての測定される標的病変の直径の合計が≧20%増加として定義される。進行は、ベースライン時またはその後に記録された全標的病変の直径の最小合計を参照として取って、≧4週間後の二回目の評価において確認すべきである。合計は、≧5mmの絶対的増加も示さなければならない)および/または治験医もしくは患者の裁量での処置中断まで、該抗体分子で処置する。
治験の用量漸増期において、抗体分子を、2週毎(Q2W)または4週毎(Q4W)に静脈内投与(i.v.)した。抗体分子の、1mg/kg Q2W、3mg/kg Q2W、10mg/kg Q2W、3mg/kg Q4Wおよび5mg/kg Q4Wの5投与レジメンを評価した。患者は、最大耐用量(MTD)に達するまでまたは低推奨フェーズII用量(RP2D)が確立されるまで、抗体分子で処置した。抗体分子についての用量−曝露量相関性のベイズ線形モデルおよび過大用量制御原理を伴う漸増に従うアダプティブベイズロジスティック回帰モデルを、用量漸増の指針として使用した。
治験目的およびエンドポイント
本治験の目的およびエンドポイントを表9に示す。
Figure 0006878405
AE、有害事象;AUC、曲線下曲線;DCR、疾患制御率;DLT、用量規制毒性;DOR、応答期間;ECG、心電図;i.v. 静脈内;ORR、客観的奏効率;PK、薬物動態;PFS、無進行生存;SAE、重大有害事象。
鍵となる包含基準
標準治療に関わらず進行したまたは標準治療に不耐容であるまたは標準治療が存在しない、固形腫瘍における応答評価基準(RECIST)のversion 1.1により決定して、測定可能または測定不可能な疾患である進行型/転移固形腫瘍を有する患者を包含させた。米国東部癌治療共同研究グループ一般状態は≦2であった。腫瘍は生検可能であり、患者は、ベースラインおよび治験薬物での治療中の腫瘍生検に同意した。
鍵となる除外基準
症候性中枢神経系(CNS)転移または局所CNS指向性治療(例えば放射線療法または手術)を必要とするCNS転移を有するまたは前の2週でコルチコステロイドの用量を増加した患者を除外した。患者は、治験処置剤または先のPD−1もしくはPD−L1指向性治療の最初の投与の2週以内に全身抗癌治療を受けたならば、除外した。副腎不全の場合の補充用量ステロイド以外の全身ステロイド治療での慢性的処置を必要とするまたは他のmAbへの重篤な過敏症反応の病歴を有する患者も除外した。
評価
有害事象(AE)を、National Cancer Instituteの有害事象共通用語規準(NCI CTCAE)のversion 4.03を使用して段階分けした。多数の時点(Q2Wについて投与後336時間およびQ4Wについて投与後672時間まで)にまたがる包括的薬物動態(PK)サンプリングを、フェーズIにおける全患者から得た。予備的集団PK分析を実施して、PKパラメーターを推定し、クリアランスおよび分布の体積の共変数として、体重の影響を評価した。放射線学的応答を、RECIST version 1.1によるコンピュータ断層撮影(CT)により操作した。走査をサイクル3の1日目からサイクル11の1日目まで2サイクル毎、次いでirRCによる疾患進行または患者離脱まで3サイクル毎に行った。バイオマーカー分析について、保存腫瘍サンプルおよび新たに得た処置前腫瘍生検サンプルをスクリーニング時に集めた。さらなる腫瘍生検サンプルを処置中に得た。
結果
患者人口統計学および特徴
表10に示すとおり、58患者が、治験のフェーズI部分に参加した。患者は、多様な範囲の進行型固形腫瘍を呈した。4/58(7%)患者は、0の先の抗新生物レジメンを受けており、7/58(12%)は1つの先の抗新生物レジメンを受けており、13/58(22%)は2つの先の抗新生物レジメンを受けており、34/58(59%)は≧3の先の抗新生物レジメンを受けていた。
Figure 0006878405
ECOG、米国東部癌治療共同研究グループ;NSCLC、非小細胞肺癌;RCC、腎細胞癌;SCLC、小細胞肺癌;TNBC、トリプルネガティブ乳癌;WHO、世界保健機関。
患者の処置および曝露
表11に示すとおり、11/58(19%)患者が治験薬物を受けた。データカットオフ時の58患者について、46患者が>8週、34患者が>12週、20患者が>20週、6患者が>36週治験に参加していた。表11はまた処置修了の主理由が疾患進行で、39/58(67%)患者で生じたことも示す。フェーズI患者において、曝露の中央期間は14週(範囲2〜46)であり、フェーズII患者において、曝露の中央期間は2.86週(範囲0.6〜9.9)であった。
Figure 0006878405
用量制限的毒性(DLT)、臨床的PKおよびRP2D
用量制限的毒性は報告されなかった。用量および投与レジメンによる抗体分子について濃度−時間プロファイルを予測するモデル(利用可能であるとき、サイクル1/サイクル3;片対数図)を図23A〜23Bに示す。最高血清濃度(Cmax)は、一般に点滴修了1時間後に生じた。曝露のほぼ用量比例的増加が1〜10mg/kgで観察された。抗体分子は、3mg/kg Q2Wまたは5mg/kg Q4Wで、サイクル3に約1000μg*日/mLのAUC0〜336hを達成する。
約2.1〜3.4倍の蓄積がQ2W投与でおよび1.6〜2.2倍の蓄積がQ4W投与で観察された。PK変動は、低〜中程度、対象間変動(幾何平均CV%)はCmaxについて0.5〜39.2%AUC0〜336hについては3.6〜47.7%の範囲であった(サイクル1)。患者における予備的投与群PK分析からの推定半減期は20(95%CI:17〜23)日である。
投与群薬物動態(PK)分析に基づき、400mg Q4Wの均一用量が、約31μg/mL(90%CI:22〜42)の平均定常状態Cトラフ濃度を達成すると予測され、これは、0.42μg/mLのPD−1遮断についてのエクスビボEC50を超える(図23C)。抗体分子の推奨フェーズII用量(RP2D)は、それ故に400mg Q4Wとして選択された。300mg Q3Wの別の投与レジメンは、400mg Q4Wに類似した曝露を達成すると予測され、Q3Wスケジュールがより便利であるとき、組み合わせレジメンで使用できる。
安全性および耐容性
フェーズI患者において、治験薬物関連性と無関係に、最も一般的な(患者の≧20%で生じる)全グレード有害事象(AE)は、悪心、疲労、貧血、下痢、呼吸困難、嘔吐、腹痛、食欲不振および便秘であった(表12)。治験薬物関連性と無関係に、最も一般的な最も一般的な(患者の≧10%で生じる)グレード3/4 AEは貧血であった。治験薬物との関連性が疑われる、最も一般的な(患者の≧20%で生じる)全グレードAEは疲労であった。治験薬物との関連性が疑われる、グレード3/4 Aは稀であり、患者の3.4%しか生じていない。投与コホートにまたがる有害事象プロファイルで、傾向は観察されなかった。
Figure 0006878405
フェーズII患者において、治験薬物関連性を無視した、最も一般的な(患者の≧10%で生じる)全グレードAEは、腹痛、便秘、咳嗽、食欲不振、呼吸困難、疲労およびガンマ−グルタミルトランスフェラーゼ上昇であった。治験薬物関連性を無視した、最も一般的な(患者の≧5%で生じる)グレード3/4は、腹痛およびガンマ−グルタミルトランスフェラーゼ上昇であった。治験薬物との関連性が疑われる、最も一般的な(患者の≧5%で生じる)全グレードAEは、疲労、悪心および掻痒であった。治験薬物との関連性が疑われるグレード3/4 AEは報告されなかった。
点滴反応または用量低減は報告されなかった。1患者で、治験薬物関連との関連性は疑われない、有害事象(グレード3呼吸困難)により処置を中断した。
有効性
広範囲の腫瘍タイプにわたる全奏効率および疾患制御率は、それぞれ2%および41%であった(表13)。X線写真上評価可能な患者の各々の経時的な腫瘍負荷変化は図24に見ることができる。フェーズIからのカットオフ時点で治験継続中の患者の確定診断は、脂肪肉腫(2患者)、精巣癌、非定型肺カルチノイド、未分化甲状腺癌、メルケル細胞癌、明細胞腎細胞癌、黒色腫およびトリプルネガティブ乳癌(TNBC)を含んだ。図25A〜25Bに示すとおり、転移非定型肺カルチノイド腫瘍を有する1患者で、偽性増殖後の部分応答が観察された。図25Cに示すとおり、高レベルのCD8 Tリンパ球を、サイクル2 1日目の間に、この患者から得た腫瘍サンプルにおいて、免疫組織化学染色により検出した。
Figure 0006878405
まとめ
該例示した抗体分子は、十分耐容性であり、管理可能な安全性プロファイルを有した。RP2Dは400mg Q4Wとして選択された。300mg Q3Wの別の投与スケジュールは、同様の曝露を達成すると予測され、抗体分子を含むある組み合わせ処置レジメンの評価のための、より便利な代替法であり得る。1患者における予備的有効性データは、臨床的活性PD−1阻害剤について予想どおり、CD8 Tリンパ球の活性増強により駆動される、抗腫瘍応答を示唆する。
引用による取り込み
ここに記載する全刊行物、特許および受入番号は、各個々の刊行物および特許が明示的にかつ個別的に引用により本明細書に包含されると示されているのと同様に、引用によりその全体を本明細書に包含させる。
均等物
対象発明の特定の実施態様が記載されているが、上記明細書は説明的であり、制限的ではない。本発明の多くのバリエーションが本明細書および添付の特許請求の範囲のレビューにより、当業者には明らかとなる。本発明の完全な範囲は、特許請求の範囲をその完全な範囲の均等物と共におよび明細書をそのようなバリエーションと共に引用して、決定すべきである。
なお、本発明は次の態様を含む。
(1)抗PD−1抗体分子および腫瘍抗原提示を増強する薬剤を含む組成物であって、
抗PD−1抗体分子が
(a)配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
(b)配列番号1のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;
(c)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;または
(d)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸
配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL
を含み、
腫瘍抗原提示を増強する薬剤がSTINGアゴニスト、TLRアゴニスト、A2ARアンタゴニストまたは腫瘍溶解性ウイルスまたはこれらの組み合わせから選択される、組成物。
(2) 対象における癌の処置に使用するための抗PD−1抗体分子および腫瘍抗原提示を増強する薬剤を含む組み合わせ物であって、
抗PD−1抗体分子が
(a)配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
(b)配列番号1のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;
(c)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;または
(d)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL
を含み、
腫瘍抗原提示を増強する薬剤がSTINGアゴニスト、TLRアゴニスト、A2ARアンタゴニストまたは腫瘍溶解性ウイルスまたはこれらの組み合わせから選択される、組み合わせ物。
(3)抗PD−1抗体分子が
配列番号38、50、82または86のアミノ酸配列、または配列番号38、50、82または86の何れかと少なくとも85%同一のアミノ酸配列を含むVH;および/または
配列番号42、46、54、58、62、66、70、74または78のアミノ酸配列、または配列番号42、46、54、58、62、66、70、74または78の何れかと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列を含むVL
を含む、上記(1)に記載の組成物または上記(2)に記載の使用のための組み合わせ物。
(4)抗PD−1抗体分子が
(a)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号42のアミノ酸配列を含むVL;
(b)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL;
(c)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号70のアミノ酸配列を含むVL;
(d)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号70のアミノ酸配列を含むVL;
(e)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号46のアミノ酸配列を含むVL;
(f)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号46のアミノ酸配列を含むVL;
(g)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号54のアミノ酸配列を含むVL;
(h)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号54のアミノ酸配列を含むVL;
(i)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号58のアミノ酸配列を含むVL;
(j)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号62のアミノ酸配列を含むVL;
(k)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL;
(l)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号74のアミノ酸配列を含むVL;
(m)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号78のアミノ酸配列を含むVL;
(n)配列番号82のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号70のアミノ酸配列を含むVL;
(o)配列番号82のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL;または
(p)配列番号86のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL
を含む、上記(1)または(3)に記載の組成物または上記(2)または(3)に記載の使用のための組み合わせ物。
(5)抗PD−1抗体分子が
配列番号40、52、84、88、91または102のアミノ酸配列を含む重鎖;および/または
配列番号44、48、56、60、64、68、72、76または80のアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記(1)、(3)または(4)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(4)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(6)抗PD−1抗体分子が
(a)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号44のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(b)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(c)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(d)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(e)配列番号102のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(f)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号44のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(g)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号48のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(h)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号48のアミノ酸配列を含む
軽鎖;
(i)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(j)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(k)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号60のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(l)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号64のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(m)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(n)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(o)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(p)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(q)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号76のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(r)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号80のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(s)配列番号84のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(t)配列番号84のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;または
(u)配列番号88のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記(1)または(3)−(5)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(5)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(7)抗PD−1抗体分子が、ヒト化抗体分子、および/または単特異的抗体分子または二特異的抗体分子である、上記(1)または(3)−(6)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(6)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(8)抗PD−1抗体分子が
モノクローナル抗体、Fab、F(ab’)2、Fv、または一本鎖Fvフラグメント(scFv)であるか;または
IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4から選択される重鎖定常領域、および/またはカッパまたはラムダの軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を含む、
上記(1)または(3)−(7)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(7)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(9)抗PD−1抗体分子が
(a)配列番号212または214の108位に変異を有するヒトIgG4重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;
(b)配列番号212または214の108位にセリンからプロリン変異を有するヒトIgG4重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;
(c)配列番号216の180位にアスパラギンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;
(d)配列番号217の148位にアスパラギン酸からアラニン変異および配列番号21
7の212位にプロリンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;または
(e)配列番号218の117位にロイシンからアラニン変異および配列番号218の118位にロイシンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域
を含む、上記(1)または(3)−(8)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(8)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(10)抗PD−1抗体分子が、抗体の抗原結合フラグメント、場合により、半抗体または半抗体の抗原結合フラグメントを含む上記(1)または(3)−(9)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(9)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(11)組成物または組み合わせ物が
(a)抗PD−1抗体分子およびSTINGアゴニストまたはSTINGアゴニストの薬学的に許容される塩を含み、場合により、STINGアゴニストが環状ジヌクレオチドを含み、場合により、環状ジヌクレオチドが例えば、修飾核酸塩基、修飾リボースまたは修飾リン酸結合を含む修飾環状ジヌクレオチドであり、場合により、STINGアゴニストがRp,Rpジチオ2’,3’c−ジ−AMPまたはその環状ジヌクレオチドアナログ、c−[G(2’,5’)pG(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体、c−[A(2’,5’)pA(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体、c−[G(2’,5’)pA(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体、2’−O−プロパルギル−環状−[A(2’,5’)pA(3’,5’)p](2’−O−プロパルギル−ML−CDA)から選択され;場合により、組み合わせ物を黒色腫、頭頸部癌または肺癌から選択される癌の処置に使用し、場合により、肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)である;
(b)抗PD−1抗体分子およびTLRアゴニストを含み、場合により、TLRアゴニストがTLR−1アゴニスト、TLR−2アゴニスト、TLR−3アゴニスト、TLR−4アゴニスト、TLR−5アゴニスト、TLR−6アゴニスト、TLR−7アゴニスト、TLR−8アゴニスト、TLR−9アゴニスト、TLR−10アゴニスト、TLR−1/2アゴニスト、TLR−2/6アゴニストまたはTLR−7/8アゴニストの1以上から選択され、例えば、TLRアゴニストがイミキモド、852A、カルメット・ゲラン桿菌(BCG)、EMD 120108、IMO−2055、Pam3Cys、CFA、MALP2、Pam2Cys、FSL−1、Hib−OMPC、ポリイノシン酸:ポリシチジル酸(ポリI:C)、ポリアデニル酸−ポリウリジル酸(ポリAU)、ポリ−L−リシンおよびカルボキシメチルセルロースで安定化したポリイノシン酸−ポリシチジル酸、モノホスホリル脂質A(MPL)、LPS、シアリル−Tn(STn)、細菌フラゲリン、レシキモド、ロキソリビンまたは非メチル化CpGジヌクレオチド(CpG−ODN)から選択され、場合により、組み合わせ物が黒色腫、リンパ腫または結腸癌から選択される癌の処置に使用される;
(c)抗PD−1抗体分子およびA2aRアンタゴニストを含み、場合により、A2aRアンタゴニストがA2aRの阻害剤またはA2aR経路アンタゴニストであり、場合により、A2aR経路アンタゴニストがCD73阻害剤、例えば、抗CD73抗体であり、例えば、A2aRアンタゴニストがイストラデフィリン、トザデナント、プレラデナント、ビパデナント、PBF−509、ATL−444、MSX−3、SCH−58261、SCH−412,348、SCH−442,416、VER−6623、VER−6947、VER−7835、CGS−15943、ZM−241,385またはMEDI9447から選択され、場合により、組み合わせ物が肺癌の処置に使用され、例えば、肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)である;または
(d)抗PD−1抗体分子および腫瘍溶解性ウイルスを含み、場合により、腫瘍溶解性ウイルスが腫瘍溶解性アデノウイルス、腫瘍溶解性単純ヘルペスウイルス、腫瘍溶解性レトロウイルス、腫瘍溶解性パルボウイルス、腫瘍溶解性ワクシニアウイルス、腫瘍溶解性シンドビスウイルス、腫瘍溶解性インフルエンザウイルスまたは腫瘍溶解性RNAウイルスから選択され、例えば、腫瘍溶解性RNAウイルスが腫瘍溶解性レオウイルス、腫瘍溶解性ニューカッスル病ウイルス(NDV)、腫瘍溶解性麻疹ウイルスまたは腫瘍溶解性水胞性口炎ウイルス(VSV)であり、場合により、腫瘍溶解性アデノウイルスが制限増殖型アデノウイルス(CRAd)であり、場合により、腫瘍溶解性ウイルスが免疫または炎症性応答の阻害剤、アポトーシス促進性タンパク質、サイトカイン、免疫グロブリン、腫瘍関連抗原または二特異的アダプタータンパク質をコードする核酸配列を含み、場合により、腫瘍溶解性ウイルスがColoAd1、ONCOS−102、VCN−01、ICOVIR−5、Celyvir、CG0070またはDNX−2401から選択され、場合により、組み合わせ物が脳癌の処置に使用され、例えば、脳癌が神経膠芽腫である、
上記(1)または(3)−(10)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(10)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(12)VHが配列番号38のアミノ酸配列を含み、VLが配列番号54のアミノ酸配列を含む、上記(1)または(3)−(11)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(11)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(13)VHが配列番号38のアミノ酸配列を含み、VLが配列番号70のアミノ酸配列を含む、上記(1)または(3)−(11)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(11)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(14)抗PD−1抗体分子が、配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、上記(1)または(3)−(11)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(11)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(15)抗PD−1抗体分子が、配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、上記(1)または(3)−(11)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(11)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(16)
癌が肺癌、黒色腫、腎癌、肝臓癌、前立腺癌、乳癌、結腸直腸癌、胃癌、膵臓癌、甲状腺癌、頭頸部癌、子宮内膜癌、脳癌、鼻咽頭癌、子宮癌、卵巣癌、内分泌癌、血液癌またはこれら癌の転移病変から選択され、場合により、癌が高MSI(高マイクロサテライト不安定性)癌である、上記(2)−(15)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(17)(a)肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)、肺腺癌、扁平上皮細胞肺癌または小細胞肺癌から選択され、場合により、NSCLCがKRAS変異を含む;
(b)黒色腫が進行型黒色腫、切除不能黒色腫、転移黒色腫、BRAF変異を伴う黒色腫、NRAS変異を伴う黒色腫、皮膚黒色腫または眼内黒色腫から選択され;
(c)腎癌が腎細胞癌(RCC)、転移腎細胞癌または明細胞腎細胞癌(CCRCC)から選択され;
(d)血液癌がリンパ腫、骨髄腫または白血病から選択され、場合により、リンパ腫が非ホジキンリンパ腫である;
(e)脳癌が神経膠芽腫であり;
(f)乳癌がトリプルネガティブ乳癌またはER+乳癌から選択され;または
(g)肝臓癌が肝細胞癌である
上記(16)に記載の使用のための組み合わせ物。
(18)抗PD−1抗体分子を、腫瘍抗原提示を増強する薬剤の使用と同時に、前にまたは後に使用される、上記(2)−(17)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(19)組成物または組み合わせ物がさらにTIM−3モジュレーター、血管内皮細胞増殖因子受容体(VEGFR)阻害剤、c−Met阻害剤、TGFb阻害剤、IDO/TDO阻害剤、ワクチンまたは二または三特異的細胞アンガジェ(engager)の1以上から選択される腫瘍抗原提示を増強する薬剤を含み、場合により:
(a)組成物または組み合わせ物が、例えば、肺癌、黒色腫または腎癌から選択される癌の処置のために、TIM−3モジュレーターを含み、場合により、肺癌が非小細胞肺癌であるかまたは腎癌が腎細胞癌であり;または
(b)組成物または組み合わせ物が、例えば、肝臓癌の処置のために、c−MET阻害剤を含み、場合により、肝臓癌が肝細胞癌である、
上記(1)または(3)−(15)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(18)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(20)組成物または組み合わせ物がさらにGITRアゴニスト、PD−L1、LAG−3、TIM−3またはCTLA−4の1以上から選択される免疫チェックポイント分子の阻害剤、CSF−1/1R阻害剤、IL−17阻害剤、IL−1β阻害剤、CXCR2阻害剤、PI3KγまたはPI3Kδの阻害剤、BAFF−R阻害剤、MALT−1/BTK阻害剤、JAK阻害剤、CRTH2阻害剤、VEGFR阻害剤、IL−15またはそのバリアント、IDO/TDO阻害剤、A2aRアンタゴニスト、TGFb阻害剤またはPFKFB3阻害剤の1以上から選択される腫瘍免疫抑制を減少させる薬剤を含み、場合により、
(a)組み合わせ物が、例えば、肺癌、頭頸部癌またはFoxP3発現癌から選択される癌の処置のために、GITRアゴニストを含み、場合により、肺癌が非小細胞肺癌である;
(b)組み合わせ物が、例えば、甲状腺癌、肺癌、乳癌、子宮内膜癌またはリンパ腫から選択される癌の処置のために、PD−L1の阻害剤を含み;
(c)組み合わせ物が、例えば、肺癌、黒色腫、腎癌または血液癌から選択される癌の処置のために、LAG−3の阻害剤を含み、場合により、肺癌が非小細胞肺癌であるかまたは腎癌が腎細胞癌である;
(d)組み合わせ物が、例えば、脳癌、膵臓癌、乳癌、子宮内膜癌または黒色腫から選択される癌の処置のために、CSF−1/1R阻害剤を含み、場合により、脳癌が神経膠芽腫であるかまたは乳癌がトリプルネガティブ乳癌である;
(e)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、IL−17阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;
(f)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、IL−1β阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;
(g)組み合わせ物が、例えば、固形腫瘍の処置のために、IL−15またはそのバリアントを含み;または
(h)組み合わせ物がTGFb阻害剤を含む
上記(1)、(3)−(15)または(19)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(19)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(21)組み合わせ物が、さらに、GITRアゴニスト、表1の抗体分子以外のPD−1阻害剤、PD−L1阻害剤、IAP(Inhibitor of Apoptosis Protein)の阻害剤、EGFR(Epidermal Growth Factor Receptor)の阻害剤、ラパマイシンの標的(mTOR)の阻害剤、IL−15またはそのバリアント、CTLA−4阻害剤、CD3と腫瘍抗原に結合する二特異的抗体分子
、CD40アゴニスト、OX40アゴニストまたはCD27アゴニストの1以上から選択されるエフェクター細胞応答を増強する薬剤を含み;場合により:
(a)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、IAPの阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;
(b)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、mTORの阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;または
(c)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、EGFRの阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である、
上記(1)、(3)−(15)、(19)または(20)の何れかに記載の組成物または上記(2)−(20)の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
(22)対象における癌を処置するための医薬の製造における抗PD−1抗体分子および腫瘍抗原提示を増強する薬剤を含む組み合わせ物の使用であって、
抗PD−1抗体分子が
(a)配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
(b)配列番号1のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;
(c)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;または
(d)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL
を含み、
腫瘍抗原提示を増強する薬剤がSTINGアゴニスト、TLRアゴニスト、A2ARアンタゴニストまたは腫瘍溶解性ウイルスまたはこれらの組み合わせから選択される、使用。
(23)抗PD−1抗体分子が
配列番号38、50、82または86のアミノ酸配列、または配列番号38、50、82または86の何れかと少なくとも85%同一のアミノ酸配列を含むVH;および/または
配列番号42、46、54、58、62、66、70、74または78のアミノ酸配列、または配列番号42、46、54、58、62、66、70、74または78の何れかと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列を含むVL
を含む、上記(22)に記載の使用。
(24)抗PD−1抗体分子が
(a)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号42のアミノ酸配列を含むVL;
(b)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL;
(c)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号70のアミノ酸配列を含むVL;
(d)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号70のアミノ酸配列を含むVL;
(e)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号46のアミノ酸配列を含むVL;
(f)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号46のアミノ酸配列を含むVL;
(g)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号54のアミノ酸配列を含むVL;
(h)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号54のアミノ酸配列を含むVL;
(i)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号58のアミノ酸配列を含むVL;
(j)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号62のアミノ酸配列を含むVL;
(k)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL;
(l)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号74のアミノ酸配列を含むVL;
(m)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号78のアミノ酸配列を含むVL;
(n)配列番号82のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号70のアミノ酸配列を含むVL;
(o)配列番号82のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL;または
(p)配列番号86のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL
を含む、上記(22)または(23)に記載の使用。
(25)抗PD−1抗体分子が
配列番号40、52、84、88、91または102のアミノ酸配列を含む重鎖;および/または
配列番号44、48、56、60、64、68、72、76または80のアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記(22)−(24)の何れかに記載の使用。
(26)抗PD−1抗体分子が
(a)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号44のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(b)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(c)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(d)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(e)配列番号102のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(f)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号44のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(g)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号48のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(h)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号48のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(i)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(j)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(k)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号60のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(l)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号64のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(m)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(n)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(o)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(p)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(q)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号76のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(r)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号80のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(s)配列番号84のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
(t)配列番号84のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;または
(u)配列番号88のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖
を含む、上記(22)−(25)の何れかに記載の使用。
(27)抗PD−1抗体分子が、ヒト化抗体分子、および/または単特異的抗体分子または二特異的抗体分子である、上記(22)−(26)の何れかに記載の使用。
(28)抗PD−1抗体分子が
モノクローナル抗体、Fab、F(ab’)2、Fv、または一本鎖Fvフラグメント(scFv)であるか;または
IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4から選択される重鎖定常領域、および/またはカッパまたはラムダの軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を含む、
上記(22)−(27)の何れかに記載の使用。
(29)抗PD−1抗体分子が
(a)配列番号212または214の108位に変異を有するヒトIgG4重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;
(b)配列番号212または214の108位にセリンからプロリン変異を有するヒトIgG4重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;
(c)配列番号216の180位にアスパラギンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;
(d)配列番号217の148位にアスパラギン酸からアラニン変異および配列番号21
7の212位にプロリンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;または
(e)配列番号218の117位にロイシンからアラニン変異および配列番号218の118位にロイシンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域
を含む、上記(22)−(28)の何れかに記載の使用。
(30)抗PD−1抗体分子が、抗体の抗原結合フラグメント、場合により、半抗体または半抗体の抗原結合フラグメントを含む、上記(22)−(29)の何れかに記載の使用。
(31)組み合わせ物が
(a)抗PD−1抗体分子およびSTINGアゴニストまたはSTINGアゴニストの薬学的に許容される塩を含み、場合により、STINGアゴニストが環状ジヌクレオチドを含み、場合により、環状ジヌクレオチドが例えば、修飾核酸塩基、修飾リボースまたは修飾リン酸結合を含む修飾環状ジヌクレオチドであり、場合により、STINGアゴニストがRp,Rpジチオ2’,3’c−ジ−AMPまたはその環状ジヌクレオチドアナログ、c−[G(2’,5’)pG(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体、c−[A(2’,5’)pA(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体、c−[G(2’,5’)pA(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体、2’−O−プロパルギル−環状−[A(2’,5’)pA(3’,5’)p](2’−O−プロパルギル−ML−CDA)から選択され;場合により、組み合わせ物を黒色腫、頭頸部癌または肺癌から選択される癌の処置に使用し、場合により、肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)である;
(b)抗PD−1抗体分子およびTLRアゴニストを含み、場合により、TLRアゴニストがTLR−1アゴニスト、TLR−2アゴニスト、TLR−3アゴニスト、TLR−4アゴニスト、TLR−5アゴニスト、TLR−6アゴニスト、TLR−7アゴニスト、TLR−8アゴニスト、TLR−9アゴニスト、TLR−10アゴニスト、TLR−1/2アゴニスト、TLR−2/6アゴニストまたはTLR−7/8アゴニストの1以上から選択され、例えば、TLRアゴニストがイミキモド、852A、カルメット・ゲラン桿菌(BCG)、EMD 120108、IMO−2055、Pam3Cys、CFA、MALP2、Pam2Cys、FSL−1、Hib−OMPC、ポリイノシン酸:ポリシチジル酸(ポリI:C)、ポリアデニル酸−ポリウリジル酸(ポリAU)、ポリ−L−リシンおよびカルボキシメチルセルロースで安定化したポリイノシン酸−ポリシチジル酸、モノホスホリル脂質A(MPL)、LPS、シアリル−Tn(STn)、細菌フラゲリン、レシキモド、ロキソリビンまたは非メチル化CpGジヌクレオチド(CpG−ODN)から選択され、場合により、組み合わせ物が黒色腫、リンパ腫または結腸癌から選択される癌の処置に使用される;
(c)抗PD−1抗体分子およびA2aRアンタゴニストを含み、場合により、A2aRアンタゴニストがA2aRの阻害剤またはA2aR経路アンタゴニストであり、場合により、A2aR経路アンタゴニストがCD73阻害剤、例えば、抗CD73抗体であり、例えば、A2aRアンタゴニストがイストラデフィリン、トザデナント、プレラデナント、ビパデナント、PBF−509、ATL−444、MSX−3、SCH−58261、SCH−412,348、SCH−442,416、VER−6623、VER−6947、VER−7835、CGS−15943、ZM−241,385またはMEDI9447から選択され、場合により、組み合わせ物が肺癌の処置に使用され、例えば、肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)である;または
(d)抗PD−1抗体分子および腫瘍溶解性ウイルスを含み、場合により、腫瘍溶解性ウイルスが腫瘍溶解性アデノウイルス、腫瘍溶解性単純ヘルペスウイルス、腫瘍溶解性レト
ロウイルス、腫瘍溶解性パルボウイルス、腫瘍溶解性ワクシニアウイルス、腫瘍溶解性シンドビスウイルス、腫瘍溶解性インフルエンザウイルスまたは腫瘍溶解性RNAウイルスから選択され、例えば、腫瘍溶解性RNAウイルスが腫瘍溶解性レオウイルス、腫瘍溶解性ニューカッスル病ウイルス(NDV)、腫瘍溶解性麻疹ウイルスまたは腫瘍溶解性水胞性口炎ウイルス(VSV)であり、場合により、腫瘍溶解性アデノウイルスが制限増殖型アデノウイルス(CRAd)であり、場合により、腫瘍溶解性ウイルスが免疫または炎症性応答の阻害剤、アポトーシス促進性タンパク質、サイトカイン、免疫グロブリン、腫瘍関連抗原または二特異的アダプタータンパク質をコードする核酸配列を含み、場合により、腫瘍溶解性ウイルスがColoAd1、ONCOS−102、VCN−01、ICOVIR−5、Celyvir、CG0070またはDNX−2401から選択され、場合により、組み合わせ物が脳癌の処置に使用され、例えば、脳癌が神経膠芽腫である、
上記(22)−(30)の何れかに記載の使用。
(32)VHが配列番号38のアミノ酸配列を含み、VLが配列番号54のアミノ酸配列を含む、上記(22)−(31)の何れかに記載の使用。
(33)
VHが配列番号38のアミノ酸配列を含み、VLが配列番号70のアミノ酸配列を含む、上記(22)−(31)の何れかに記載の使用。
(34)抗PD−1抗体分子が、配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、上記(22)−(31)の何れかに記載の使用。
(35)抗PD−1抗体分子が、配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、上記(22)−(31)の何れかに記載の使用。
(36)癌が肺癌、黒色腫、腎癌、肝臓癌、前立腺癌、乳癌、結腸直腸癌、胃癌、膵臓癌、甲状腺癌、頭頸部癌、子宮内膜癌、脳癌、鼻咽頭癌、子宮癌、卵巣癌、内分泌癌、血液癌またはこれら癌の転移病変から選択され、場合により、癌が高MSI(高マイクロサテライト不安定性)癌である、上記(22)−(35)の何れかに記載の使用。
(37)(a)肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)、肺腺癌、扁平上皮細胞肺癌または小細胞肺癌から選択され、場合により、NSCLCがKRAS変異を含む;
(b)黒色腫が進行型黒色腫、切除不能黒色腫、転移黒色腫、BRAF変異を伴う黒色腫、NRAS変異を伴う黒色腫、皮膚黒色腫または眼内黒色腫から選択され;
(c)腎癌が腎細胞癌(RCC)、転移腎細胞癌または明細胞腎細胞癌(CCRCC)から選択され;
(d)血液癌がリンパ腫、骨髄腫または白血病から選択され、場合により、リンパ腫が非ホジキンリンパ腫である;
(e)脳癌が神経膠芽腫であり;
(f)乳癌がトリプルネガティブ乳癌またはER+乳癌から選択され;または
(g)肝臓癌が肝細胞癌である
上記(36)に記載の使用。
(38)抗PD−1抗体分子を、腫瘍抗原提示を増強する薬剤の使用と同時に、前にまたは後に使用される、上記(22)−(37)の何れかに記載の使用。
(39)組み合わせ物がさらにTIM−3モジュレーター、血管内皮細胞増殖因子受容体(VEGFR)阻害剤、c−Met阻害剤、TGFb阻害剤、IDO/TDO阻害剤、ワクチンまたは二または三特異的細胞アンガジェ(engager)の1以上から選択される腫瘍抗原提示を増強する薬剤を含み、場合により:
(a)組み合わせ物が、例えば、肺癌、黒色腫または腎癌から選択される癌の処置のために、TIM−3モジュレーターを含み、場合により、肺癌が非小細胞肺癌であるかまたは腎癌が腎細胞癌であり;または
(b)組み合わせ物が、例えば、肝臓癌の処置のために、c−MET阻害剤を含み、場合により、肝臓癌が肝細胞癌である、
上記(22)−(38)の何れかに記載の使用。
(40)組み合わせ物がさらにGITRアゴニスト、PD−L1、LAG−3、TIM−3またはCTLA−4の1以上から選択される免疫チェックポイント分子の阻害剤、CSF−1/1R阻害剤、IL−17阻害剤、IL−1β阻害剤、CXCR2阻害剤、PI3KγまたはPI3Kδの阻害剤、BAFF−R阻害剤、MALT−1/BTK阻害剤、JAK阻害剤、CRTH2阻害剤、VEGFR阻害剤、IL−15またはそのバリアント、IDO/TDO阻害剤、A2aRアンタゴニスト、TGFb阻害剤またはPFKFB3阻害剤の1以上から選択される腫瘍免疫抑制を減少させる薬剤を含み、場合により、
(a)組み合わせ物が、例えば、肺癌、頭頸部癌またはFoxP3発現癌から選択される癌の処置のために、GITRアゴニストを含み、場合により、肺癌が非小細胞肺癌である;
(b)組み合わせ物が、例えば、甲状腺癌、肺癌、乳癌、子宮内膜癌またはリンパ腫から選択される癌の処置のために、PD−L1の阻害剤を含み;
(c)組み合わせ物が、例えば、肺癌、黒色腫、腎癌または血液癌から選択される癌の処置のために、LAG−3の阻害剤を含み、場合により、肺癌が非小細胞肺癌であるかまたは腎癌が腎細胞癌である;
(d)組み合わせ物が、例えば、脳癌、膵臓癌、乳癌、子宮内膜癌または黒色腫から選択される癌の処置のために、CSF−1/1R阻害剤を含み、場合により、脳癌が神経膠芽腫であるかまたは乳癌がトリプルネガティブ乳癌である;
(e)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、IL−17阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;
(f)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、IL−1β阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;
(g)組み合わせ物が、例えば、固形腫瘍の処置のために、IL−15またはそのバリアントを含み;または
(h)組み合わせ物がTGFb阻害剤を含む
上記(22)−(39)の何れかに記載の使用。
(41)組み合わせ物が、さらに、GITRアゴニスト、表1の抗体分子以外のPD−1阻害剤、PD−L1阻害剤、IAP(Inhibitor of Apoptosis Protein)の阻害剤、EGFR(Epidermal Growth Factor Receptor)の阻害剤、ラパマイシンの標的(mTOR)の阻害剤、IL−15またはそのバリアント、CTLA−4阻害剤、CD3と腫瘍抗原に結合する二特異的抗体分子、CD40アゴニスト、OX40アゴニストまたはCD27アゴニストの1以上から選択されるエフェクター細胞応答を増強する薬剤を含み;場合により:
(a)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、IAPの阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;
(b)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、mTORの阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;または
(c)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のため
に、EGFRの阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である、
上記(22)−(40)の何れかに記載の使用。

Claims (41)

  1. 抗PD−1抗体分子および腫瘍抗原提示を増強する薬剤を含む組成物であって、
    抗PD−1抗体分子が
    (a)配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
    (b)配列番号1のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;
    (c)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;または
    (d)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸
    配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL
    を含み、
    腫瘍抗原提示を増強する薬剤がSTINGアゴニスト、TLRアゴニスト、A2ARアンタゴニストまたは腫瘍溶解性ウイルスまたはこれらの組み合わせから選択される、組成物。
  2. 対象における癌の処置に使用するための抗PD−1抗体分子および腫瘍抗原提示を増強する薬剤を含む組み合わせ物であって、
    抗PD−1抗体分子が
    (a)配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
    (b)配列番号1のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;
    (c)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;または
    (d)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL
    を含み、
    腫瘍抗原提示を増強する薬剤がSTINGアゴニスト、TLRアゴニスト、A2ARアンタゴニストまたは腫瘍溶解性ウイルスまたはこれらの組み合わせから選択される、組み合わせ物。
  3. 抗PD−1抗体分子が
    配列番号38、50、82または86のアミノ酸配列、または配列番号38、50、82または86の何れかと少なくとも85%同一のアミノ酸配列を含むVH;および/または
    配列番号42、46、54、58、62、66、70、74または78のアミノ酸配列、または配列番号42、46、54、58、62、66、70、74または78の何れかと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列を含むVL
    を含む、請求項1に記載の組成物または請求項2に記載の使用のための組み合わせ物。
  4. 抗PD−1抗体分子が
    (a)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号42のアミノ酸配列を含むVL;
    (b)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL;
    (c)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号70のアミノ酸配列を含むVL;
    (d)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号70のアミノ酸配列を含むVL;
    (e)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号46のアミノ酸配列を含むVL;
    (f)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号46のアミノ酸配列を含むVL;
    (g)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号54のアミノ酸配列を含むVL;
    (h)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号54のアミノ酸配列を含むVL;
    (i)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号58のアミノ酸配列を含むVL;
    (j)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号62のアミノ酸配列を含むVL;
    (k)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL;
    (l)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号74のアミノ酸配列を含むVL;
    (m)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号78のアミノ酸配列を含むVL;
    (n)配列番号82のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号70のアミノ酸配列を含むVL;
    (o)配列番号82のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL;または
    (p)配列番号86のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL
    を含む、請求項1または3に記載の組成物または請求項2または3に記載の使用のための組み合わせ物。
  5. 抗PD−1抗体分子が
    配列番号40、52、84、88、91または102のアミノ酸配列を含む重鎖;および/または
    配列番号44、48、56、60、64、68、72、76または80のアミノ酸配列を含む軽鎖
    を含む、請求項1、3または4の何れかに記載の組成物または請求項2−4の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  6. 抗PD−1抗体分子が
    (a)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号44のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (b)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (c)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (d)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (e)配列番号102のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (f)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号44のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (g)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号48のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (h)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号48のアミノ酸配列を含む
    軽鎖;
    (i)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (j)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (k)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号60のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (l)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号64のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (m)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (n)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (o)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (p)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (q)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号76のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (r)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号80のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (s)配列番号84のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (t)配列番号84のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;または
    (u)配列番号88のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖
    を含む、請求項1または3−5の何れかに記載の組成物または請求項2−5の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  7. 抗PD−1抗体分子が、ヒト化抗体分子、および/または単特異的抗体分子または二特異的抗体分子である、請求項1または3−6の何れかに記載の組成物または請求項2−6の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  8. 抗PD−1抗体分子が
    モノクローナル抗体、Fab、F(ab’)2、Fv、または一本鎖Fvフラグメント(scFv)であるか;または
    IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4から選択される重鎖定常領域、および/またはカッパまたはラムダの軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を含む、
    請求項1または3−7の何れかに記載の組成物または請求項2−7の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  9. 抗PD−1抗体分子が
    (a)配列番号212または214の108位に変異を有するヒトIgG4重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;
    (b)配列番号212または214の108位にセリンからプロリン変異を有するヒトIgG4重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;
    (c)配列番号216の180位にアスパラギンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;
    (d)配列番号217の148位にアスパラギン酸からアラニン変異および配列番号21
    7の212位にプロリンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;または
    (e)配列番号218の117位にロイシンからアラニン変異および配列番号218の118位にロイシンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域
    を含む、請求項1または3−8の何れかに記載の組成物または請求項2−8の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  10. 抗PD−1抗体分子が、抗体の抗原結合フラグメント、場合により、半抗体または半抗体の抗原結合フラグメントを含む、請求項1または3−9の何れかに記載の組成物または請求項2−9の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  11. 組成物または組み合わせ物が
    (a)抗PD−1抗体分子およびSTINGアゴニストまたはSTINGアゴニストの薬学的に許容される塩を含み、場合により、STINGアゴニストが環状ジヌクレオチドを含み、場合により、環状ジヌクレオチドが例えば、修飾核酸塩基、修飾リボースまたは修飾リン酸結合を含む修飾環状ジヌクレオチドであり、場合により、STINGアゴニストがRp,Rpジチオ2’,3’c−ジ−AMPまたはその環状ジヌクレオチドアナログ、c−[G(2’,5’)pG(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体、c−[A(2’,5’)pA(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体、c−[G(2’,5’)pA(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体、2’−O−プロパルギル−環状−[A(2’,5’)pA(3’,5’)p](2’−O−プロパルギル−ML−CDA)から選択され;場合により、組み合わせ物を黒色腫、頭頸部癌または肺癌から選択される癌の処置に使用し、場合により、肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)である;
    (b)抗PD−1抗体分子およびTLRアゴニストを含み、場合により、TLRアゴニストがTLR−1アゴニスト、TLR−2アゴニスト、TLR−3アゴニスト、TLR−4アゴニスト、TLR−5アゴニスト、TLR−6アゴニスト、TLR−7アゴニスト、TLR−8アゴニスト、TLR−9アゴニスト、TLR−10アゴニスト、TLR−1/2アゴニスト、TLR−2/6アゴニストまたはTLR−7/8アゴニストの1以上から選択され、例えば、TLRアゴニストがイミキモド、852A、カルメット・ゲラン桿菌(BCG)、EMD 120108、IMO−2055、Pam3Cys、CFA、MALP2、Pam2Cys、FSL−1、Hib−OMPC、ポリイノシン酸ポリシチジル酸(ポリI:C)、ポリアデニル酸−ポリウリジル酸(ポリAU)、ポリ−L−リシンおよびカルボキシメチルセルロースで安定化したポリイノシン−ポリシチジル酸、モノホスホリル脂質A(MPL)、LPS、シアリル−Tn(STn)、細菌フラゲリン、レシキモド、ロキソリビンまたは非メチル化CpGジヌクレオチド(CpG−ODN)から選択され、場合により、組み合わせ物が黒色腫、リンパ腫または結腸癌から選択される癌の処置に使用される;
    (c)抗PD−1抗体分子およびA2aRアンタゴニストを含み、場合により、A2aRアンタゴニストがA2aRの阻害剤またはA2aR経路アンタゴニストであり、場合により、A2aR経路アンタゴニストがCD73阻害剤、例えば、抗CD73抗体であり、例えば、A2aRアンタゴニストがイストラデフィリン、トザデナント、プレラデナント、ビパデナント、PBF−509、ATL−444、MSX−3、SCH−58261、SCH−412,348、SCH−442,416、VER−6623、VER−6947、VER−7835、CGS−15943、ZM−241,385またはMEDI9447から選択され、場合により、組み合わせ物が肺癌の処置に使用され、例えば、肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)である;または
    (d)抗PD−1抗体分子および腫瘍溶解性ウイルスを含み、場合により、腫瘍溶解性ウイルスが腫瘍溶解性アデノウイルス、腫瘍溶解性単純ヘルペスウイルス、腫瘍溶解性レトロウイルス、腫瘍溶解性パルボウイルス、腫瘍溶解性ワクシニアウイルス、腫瘍溶解性シンドビスウイルス、腫瘍溶解性インフルエンザウイルスまたは腫瘍溶解性RNAウイルスから選択され、例えば、腫瘍溶解性RNAウイルスが腫瘍溶解性レオウイルス、腫瘍溶解性ニューカッスル病ウイルス(NDV)、腫瘍溶解性麻疹ウイルスまたは腫瘍溶解性水胞性口炎ウイルス(VSV)であり、場合により、腫瘍溶解性アデノウイルスが制限増殖型アデノウイルス(CRAd)であり、場合により、腫瘍溶解性ウイルスが免疫または炎症性応答の阻害剤、アポトーシス促進性タンパク質、サイトカイン、免疫グロブリン、腫瘍関連抗原または二特異的アダプタータンパク質をコードする核酸配列を含み、場合により、腫瘍溶解性ウイルスがColoAd1、ONCOS−102、VCN−01、ICOVIR−5、Celyvir、CG0070またはDNX−2401から選択され、場合により、組み合わせ物が脳癌の処置に使用され、例えば、脳癌が神経膠芽腫である、
    請求項1または3−10の何れかに記載の組成物または請求項2−10の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  12. VHが配列番号38のアミノ酸配列を含み、VLが配列番号54のアミノ酸配列を含む、請求項1または3−11の何れかに記載の組成物または請求項2−11の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  13. VHが配列番号38のアミノ酸配列を含み、VLが配列番号70のアミノ酸配列を含む、請求項1または3−11の何れかに記載の組成物または請求項2−11の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  14. 抗PD−1抗体分子が、配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、請求項1または3−11の何れかに記載の組成物または請求項2−11の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  15. 抗PD−1抗体分子が、配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、請求項1または3−11の何れかに記載の組成物または請求項2−11の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  16. 癌が肺癌、黒色腫、腎癌、肝臓癌、前立腺癌、乳癌、結腸直腸癌、胃癌、膵臓癌、甲状腺癌、頭頸部癌、子宮内膜癌、脳癌、鼻咽頭癌、子宮癌、卵巣癌、内分泌癌、血液癌またはこれら癌の転移病変から選択され、場合により、癌が高MSI(高マイクロサテライト不安定性)癌である、請求項2−15の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  17. (a)肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)、肺腺癌、扁平上皮細胞肺癌または小細胞肺癌から選択され、場合により、NSCLCがKRAS変異を含む;
    (b)黒色腫が進行型黒色腫、切除不能黒色腫、転移黒色腫、BRAF変異を伴う黒色腫、NRAS変異を伴う黒色腫、皮膚黒色腫または眼内黒色腫から選択され;
    (c)腎癌が腎細胞癌(RCC)、転移腎細胞癌または明細胞腎細胞癌(CCRCC)から選択され;
    (d)血液癌がリンパ腫、骨髄腫または白血病から選択され、場合により、リンパ腫が非ホジキンリンパ腫である;
    (e)脳癌が神経膠芽腫であり;
    (f)乳癌がトリプルネガティブ乳癌またはER+乳癌から選択され;または
    (g)肝臓癌が肝細胞癌である
    請求項16に記載の使用のための組み合わせ物。
  18. 抗PD−1抗体分子を、腫瘍抗原提示を増強する薬剤の使用と同時に、前にまたは後に使用される、請求項2−17の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  19. 組成物または組み合わせ物がさらにTIM−3モジュレーター、血管内皮細胞増殖因子受容体(VEGFR)阻害剤、c−Met阻害剤、TGFb阻害剤、IDO/TDO阻害剤、ワクチンまたは二または三特異的細胞アンガジェ(engager)の1以上から選択される腫瘍抗原提示を増強する薬剤を含み、場合により:
    (a)組成物または組み合わせ物が、例えば、肺癌、黒色腫または腎癌から選択される癌の処置のために、TIM−3モジュレーターを含み、場合により、肺癌が非小細胞肺癌であるかまたは腎癌が腎細胞癌であり;または
    (b)組成物または組み合わせ物が、例えば、肝臓癌の処置のために、c−MET阻害剤を含み、場合により、肝臓癌が肝細胞癌である、
    請求項1または3−15の何れかに記載の組成物または請求項2−18の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  20. 組成物または組み合わせ物がさらにGITRアゴニスト、PD−L1、LAG−3、TIM−3またはCTLA−4の1以上から選択される免疫チェックポイント分子の阻害剤、CSF−1/1R阻害剤、IL−17阻害剤、IL−1β阻害剤、CXCR2阻害剤、PI3KγまたはPI3Kδの阻害剤、BAFF−R阻害剤、MALT−1/BTK阻害剤、JAK阻害剤、CRTH2阻害剤、VEGFR阻害剤、IL−15またはそのバリアント、IDO/TDO阻害剤、A2aRアンタゴニスト、TGFb阻害剤またはPFKFB3阻害剤の1以上から選択される腫瘍免疫抑制を減少させる薬剤を含み、場合により、
    (a)組み合わせ物が、例えば、肺癌、頭頸部癌またはFoxP3発現癌から選択される癌の処置のために、GITRアゴニストを含み、場合により、肺癌が非小細胞肺癌である;
    (b)組み合わせ物が、例えば、甲状腺癌、肺癌、乳癌、子宮内膜癌またはリンパ腫から選択される癌の処置のために、PD−L1の阻害剤を含み;
    (c)組み合わせ物が、例えば、肺癌、黒色腫、腎癌または血液癌から選択される癌の処置のために、LAG−3の阻害剤を含み、場合により、肺癌が非小細胞肺癌であるかまたは腎癌が腎細胞癌である;
    (d)組み合わせ物が、例えば、脳癌、膵臓癌、乳癌、子宮内膜癌または黒色腫から選択される癌の処置のために、CSF−1/1R阻害剤を含み、場合により、脳癌が神経膠芽腫であるかまたは乳癌がトリプルネガティブ乳癌である;
    (e)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、IL−17阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;
    (f)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、IL−1β阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;
    (g)組み合わせ物が、例えば、固形腫瘍の処置のために、IL−15またはそのバリアントを含み;または
    (h)組み合わせ物がTGFb阻害剤を含む
    請求項1、3−15または19の何れかに記載の組成物または請求項2−19の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  21. 組み合わせ物が、さらに、GITRアゴニスト、表1の抗体分子以外のPD−1阻害剤、PD−L1阻害剤、IAP(Inhibitor of Apoptosis Protein)の阻害剤、EGFR(Epidermal Growth Factor Receptor)の阻害剤、ラパマイシンの標的(mTOR)の阻害剤、IL−15またはそのバリアント、CTLA−4阻害剤、CD3と腫瘍抗原に結合する二特異的抗体分子
    、CD40アゴニスト、OX40アゴニストまたはCD27アゴニストの1以上から選択されるエフェクター細胞応答を増強する薬剤を含み;場合により:
    (a)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、IAPの阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;
    (b)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、mTORの阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;または
    (c)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、EGFRの阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である、
    請求項1、3−15、19または20の何れかに記載の組成物または請求項2−20の何れかに記載の使用のための組み合わせ物。
  22. 対象における癌を処置するための医薬の製造における抗PD−1抗体分子および腫瘍抗原提示を増強する薬剤を含む組み合わせ物の使用であって、
    抗PD−1抗体分子が
    (a)配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH);および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL);
    (b)配列番号1のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;
    (c)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL;または
    (d)配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH;および配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL
    を含み、
    腫瘍抗原提示を増強する薬剤がSTINGアゴニスト、TLRアゴニスト、A2ARアンタゴニストまたは腫瘍溶解性ウイルスまたはこれらの組み合わせから選択される、使用。
  23. 抗PD−1抗体分子が
    配列番号38、50、82または86のアミノ酸配列、または配列番号38、50、82または86の何れかと少なくとも85%同一のアミノ酸配列を含むVH;および/または
    配列番号42、46、54、58、62、66、70、74または78のアミノ酸配列、または配列番号42、46、54、58、62、66、70、74または78の何れかと少なくとも85%同一であるアミノ酸配列を含むVL
    を含む、請求項22に記載の使用。
  24. 抗PD−1抗体分子が
    (a)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号42のアミノ酸配列を含むVL;
    (b)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL;
    (c)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号70のアミノ酸配列を含むVL;
    (d)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号70のアミノ酸配列を含むVL;
    (e)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号46のアミノ酸配列を含むVL;
    (f)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号46のアミノ酸配列を含むVL;
    (g)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号54のアミノ酸配列を含むVL;
    (h)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号54のアミノ酸配列を含むVL;
    (i)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号58のアミノ酸配列を含むVL;
    (j)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号62のアミノ酸配列を含むVL;
    (k)配列番号50のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL;
    (l)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号74のアミノ酸配列を含むVL;
    (m)配列番号38のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号78のアミノ酸配列を含むVL;
    (n)配列番号82のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号70のアミノ酸配列を含むVL;
    (o)配列番号82のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL;または
    (p)配列番号86のアミノ酸配列を含むVHおよび配列番号66のアミノ酸配列を含むVL
    を含む、請求項22または23に記載の使用。
  25. 抗PD−1抗体分子が
    配列番号40、52、84、88、91または102のアミノ酸配列を含む重鎖;および/または
    配列番号44、48、56、60、64、68、72、76または80のアミノ酸配列を含む軽鎖
    を含む、請求項22−24の何れかに記載の使用。
  26. 抗PD−1抗体分子が
    (a)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号44のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (b)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (c)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (d)配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (e)配列番号102のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (f)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号44のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (g)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号48のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (h)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号48のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (i)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (j)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (k)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号60のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (l)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号64のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (m)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (n)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (o)配列番号52のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (p)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (q)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号76のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (r)配列番号40のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号80のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (s)配列番号84のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖;
    (t)配列番号84のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖;または
    (u)配列番号88のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号68のアミノ酸配列を含む軽鎖
    を含む、請求項22−25の何れかに記載の使用。
  27. 抗PD−1抗体分子が、ヒト化抗体分子、および/または単特異的抗体分子または二特異的抗体分子である、請求項22−26の何れかに記載の使用。
  28. 抗PD−1抗体分子が
    モノクローナル抗体、Fab、F(ab’)2、Fv、または一本鎖Fvフラグメント(scFv)であるか;または
    IgG1、IgG2、IgG3およびIgG4から選択される重鎖定常領域、および/またはカッパまたはラムダの軽鎖定常領域から選択される軽鎖定常領域を含む、
    請求項22−27の何れかに記載の使用。
  29. 抗PD−1抗体分子が
    (a)配列番号212または214の108位に変異を有するヒトIgG4重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;
    (b)配列番号212または214の108位にセリンからプロリン変異を有するヒトIgG4重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;
    (c)配列番号216の180位にアスパラギンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;
    (d)配列番号217の148位にアスパラギン酸からアラニン変異および配列番号21
    7の212位にプロリンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域;または
    (e)配列番号218の117位にロイシンからアラニン変異および配列番号218の118位にロイシンからアラニン変異を有するヒトIgG1重鎖定常領域およびカッパ軽鎖定常領域
    を含む、請求項22−28の何れかに記載の使用。
  30. 抗PD−1抗体分子が、抗体の抗原結合フラグメント、場合により、半抗体または半抗体の抗原結合フラグメントを含む、請求項22−29の何れかに記載の使用。
  31. 組み合わせ物が
    (a)抗PD−1抗体分子およびSTINGアゴニストまたはSTINGアゴニストの薬学的に許容される塩を含み、場合により、STINGアゴニストが環状ジヌクレオチドを含み、場合により、環状ジヌクレオチドが例えば、修飾核酸塩基、修飾リボースまたは修飾リン酸結合を含む修飾環状ジヌクレオチドであり、場合により、STINGアゴニストがRp,Rpジチオ2’,3’c−ジ−AMPまたはその環状ジヌクレオチドアナログ、c−[G(2’,5’)pG(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体、c−[A(2’,5’)pA(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体、c−[G(2’,5’)pA(3’,5’)p]またはそのジチオリボースO置換誘導体、2’−O−プロパルギル−環状−[A(2’,5’)pA(3’,5’)p](2’−O−プロパルギル−ML−CDA)から選択され;場合により、組み合わせ物を黒色腫、頭頸部癌または肺癌から選択される癌の処置に使用し、場合により、肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)である;
    (b)抗PD−1抗体分子およびTLRアゴニストを含み、場合により、TLRアゴニストがTLR−1アゴニスト、TLR−2アゴニスト、TLR−3アゴニスト、TLR−4アゴニスト、TLR−5アゴニスト、TLR−6アゴニスト、TLR−7アゴニスト、TLR−8アゴニスト、TLR−9アゴニスト、TLR−10アゴニスト、TLR−1/2アゴニスト、TLR−2/6アゴニストまたはTLR−7/8アゴニストの1以上から選択され、例えば、TLRアゴニストがイミキモド、852A、カルメット・ゲラン桿菌(BCG)、EMD 120108、IMO−2055、Pam3Cys、CFA、MALP2、Pam2Cys、FSL−1、Hib−OMPC、ポリイノシン酸ポリシチジル酸(ポリI:C)、ポリアデニル酸−ポリウリジル酸(ポリAU)、ポリ−L−リシンおよびカルボキシメチルセルロースで安定化したポリイノシン−ポリシチジル酸、モノホスホリル脂質A(MPL)、LPS、シアリル−Tn(STn)、細菌フラゲリン、レシキモド、ロキソリビンまたは非メチル化CpGジヌクレオチド(CpG−ODN)から選択され、場合により、組み合わせ物が黒色腫、リンパ腫または結腸癌から選択される癌の処置に使用される;
    (c)抗PD−1抗体分子およびA2aRアンタゴニストを含み、場合により、A2aRアンタゴニストがA2aRの阻害剤またはA2aR経路アンタゴニストであり、場合により、A2aR経路アンタゴニストがCD73阻害剤、例えば、抗CD73抗体であり、例えば、A2aRアンタゴニストがイストラデフィリン、トザデナント、プレラデナント、ビパデナント、PBF−509、ATL−444、MSX−3、SCH−58261、SCH−412,348、SCH−442,416、VER−6623、VER−6947、VER−7835、CGS−15943、ZM−241,385またはMEDI9447から選択され、場合により、組み合わせ物が肺癌の処置に使用され、例えば、肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)である;または
    (d)抗PD−1抗体分子および腫瘍溶解性ウイルスを含み、場合により、腫瘍溶解性ウイルスが腫瘍溶解性アデノウイルス、腫瘍溶解性単純ヘルペスウイルス、腫瘍溶解性レト
    ロウイルス、腫瘍溶解性パルボウイルス、腫瘍溶解性ワクシニアウイルス、腫瘍溶解性シンドビスウイルス、腫瘍溶解性インフルエンザウイルスまたは腫瘍溶解性RNAウイルスから選択され、例えば、腫瘍溶解性RNAウイルスが腫瘍溶解性レオウイルス、腫瘍溶解性ニューカッスル病ウイルス(NDV)、腫瘍溶解性麻疹ウイルスまたは腫瘍溶解性水胞性口炎ウイルス(VSV)であり、場合により、腫瘍溶解性アデノウイルスが制限増殖型アデノウイルス(CRAd)であり、場合により、腫瘍溶解性ウイルスが免疫または炎症性応答の阻害剤、アポトーシス促進性タンパク質、サイトカイン、免疫グロブリン、腫瘍関連抗原または二特異的アダプタータンパク質をコードする核酸配列を含み、場合により、腫瘍溶解性ウイルスがColoAd1、ONCOS−102、VCN−01、ICOVIR−5、Celyvir、CG0070またはDNX−2401から選択され、場合により、組み合わせ物が脳癌の処置に使用され、例えば、脳癌が神経膠芽腫である、
    請求項22−30の何れかに記載の使用。
  32. VHが配列番号38のアミノ酸配列を含み、VLが配列番号54のアミノ酸配列を含む、請求項22−31の何れかに記載の使用。
  33. VHが配列番号38のアミノ酸配列を含み、VLが配列番号70のアミノ酸配列を含む、請求項22−31の何れかに記載の使用。
  34. 抗PD−1抗体分子が、配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号56のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、請求項22−31の何れかに記載の使用。
  35. 抗PD−1抗体分子が、配列番号91のアミノ酸配列を含む重鎖および配列番号72のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む、請求項22−31の何れかに記載の使用。
  36. 癌が肺癌、黒色腫、腎癌、肝臓癌、前立腺癌、乳癌、結腸直腸癌、胃癌、膵臓癌、甲状腺癌、頭頸部癌、子宮内膜癌、脳癌、鼻咽頭癌、子宮癌、卵巣癌、内分泌癌、血液癌またはこれら癌の転移病変から選択され、場合により、癌が高MSI(高マイクロサテライト不安定性)癌である、請求項22−35の何れかに記載の使用。
  37. (a)肺癌が非小細胞肺癌(NSCLC)、肺腺癌、扁平上皮細胞肺癌または小細胞肺癌から選択され、場合により、NSCLCがKRAS変異を含む;
    (b)黒色腫が進行型黒色腫、切除不能黒色腫、転移黒色腫、BRAF変異を伴う黒色腫、NRAS変異を伴う黒色腫、皮膚黒色腫または眼内黒色腫から選択され;
    (c)腎癌が腎細胞癌(RCC)、転移腎細胞癌または明細胞腎細胞癌(CCRCC)から選択され;
    (d)血液癌がリンパ腫、骨髄腫または白血病から選択され、場合により、リンパ腫が非ホジキンリンパ腫である;
    (e)脳癌が神経膠芽腫であり;
    (f)乳癌がトリプルネガティブ乳癌またはER+乳癌から選択され;または
    (g)肝臓癌が肝細胞癌である
    請求項36に記載の使用。
  38. 抗PD−1抗体分子を、腫瘍抗原提示を増強する薬剤の使用と同時に、前にまたは後に使用される、請求項22−37の何れかに記載の使用。
  39. 組み合わせ物がさらにTIM−3モジュレーター、血管内皮細胞増殖因子受容体(VEGFR)阻害剤、c−Met阻害剤、TGFb阻害剤、IDO/TDO阻害剤、ワクチンまたは二または三特異的細胞アンガジェ(engager)の1以上から選択される腫瘍抗原提示を増強する薬剤を含み、場合により:
    (a)組み合わせ物が、例えば、肺癌、黒色腫または腎癌から選択される癌の処置のために、TIM−3モジュレーターを含み、場合により、肺癌が非小細胞肺癌であるかまたは腎癌が腎細胞癌であり;または
    (b)組み合わせ物が、例えば、肝臓癌の処置のために、c−MET阻害剤を含み、場合により、肝臓癌が肝細胞癌である、
    請求項22−38の何れかに記載の使用。
  40. 組み合わせ物がさらにGITRアゴニスト、PD−L1、LAG−3、TIM−3またはCTLA−4の1以上から選択される免疫チェックポイント分子の阻害剤、CSF−1/1R阻害剤、IL−17阻害剤、IL−1β阻害剤、CXCR2阻害剤、PI3KγまたはPI3Kδの阻害剤、BAFF−R阻害剤、MALT−1/BTK阻害剤、JAK阻害剤、CRTH2阻害剤、VEGFR阻害剤、IL−15またはそのバリアント、IDO/TDO阻害剤、A2aRアンタゴニスト、TGFb阻害剤またはPFKFB3阻害剤の1以上から選択される腫瘍免疫抑制を減少させる薬剤を含み、場合により、
    (a)組み合わせ物が、例えば、肺癌、頭頸部癌またはFoxP3発現癌から選択される癌の処置のために、GITRアゴニストを含み、場合により、肺癌が非小細胞肺癌である;
    (b)組み合わせ物が、例えば、甲状腺癌、肺癌、乳癌、子宮内膜癌またはリンパ腫から選択される癌の処置のために、PD−L1の阻害剤を含み;
    (c)組み合わせ物が、例えば、肺癌、黒色腫、腎癌または血液癌から選択される癌の処置のために、LAG−3の阻害剤を含み、場合により、肺癌が非小細胞肺癌であるかまたは腎癌が腎細胞癌である;
    (d)組み合わせ物が、例えば、脳癌、膵臓癌、乳癌、子宮内膜癌または黒色腫から選択される癌の処置のために、CSF−1/1R阻害剤を含み、場合により、脳癌が神経膠芽腫であるかまたは乳癌がトリプルネガティブ乳癌である;
    (e)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、IL−17阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;
    (f)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、IL−1β阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;
    (g)組み合わせ物が、例えば、固形腫瘍の処置のために、IL−15またはそのバリアントを含み;または
    (h)組み合わせ物がTGFb阻害剤を含む
    請求項22−39の何れかに記載の使用。
  41. 組み合わせ物が、さらに、GITRアゴニスト、表1の抗体分子以外のPD−1阻害剤、PD−L1阻害剤、IAP(Inhibitor of Apoptosis Protein)の阻害剤、EGFR(Epidermal Growth Factor Receptor)の阻害剤、ラパマイシンの標的(mTOR)の阻害剤、IL−15またはそのバリアント、CTLA−4阻害剤、CD3と腫瘍抗原に結合する二特異的抗体分子、CD40アゴニスト、OX40アゴニストまたはCD27アゴニストの1以上から選択されるエフェクター細胞応答を増強する薬剤を含み;場合により:
    (a)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、IAPの阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;
    (b)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のために、mTORの阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である;または
    (c)組み合わせ物が、例えば、乳癌、肺癌または結腸癌から選択される癌の処置のため
    に、EGFRの阻害剤を含み、場合により、乳癌がトリプルネガティブ乳癌であるかまたは肺癌が非小細胞肺癌である、
    請求項22−40の何れかに記載の使用。
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