JP2022503959A - Il-12ヘテロ二量体fc-融合タンパク質 - Google Patents

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Abstract

Figure 2022503959000001
【課題】IL-12ヘテロ二量体FC-融合タンパク質に関する。
【解決手段】本発明は、新規IL-12Fc融合タンパク質、それらの作製および使用方法を提供する。IL-12Fc融合タンパク質は、癌の治療に有用であり、チェックポイント遮断と組み合わせて使用することができる。
【選択図】図8

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2018年10月3日に出願された、米国仮特許出願第62/740,813号、2019年2月25日に出願された、米国仮特許出願第62/810,038号、および2019年5月15日に出願された米国仮特許出願第62/848,512号の利益を主張し、その全ては、全ての目的のためにそれらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
T細胞が効果的な抗腫瘍応答を開始するためには、3つのことが起こらなければならない。T細胞が、第1に、腫瘍環境でMHCによって提示される抗原性腫瘍ペプチドに関与しなければならない。第2に、共刺激分子がT細胞に結合しなければならない。かつ第3に、T細胞が、IL-12およびIL-2などのサイトカインによって、分化および増殖を可能にするIFNγなどの共刺激性サイトカインを産生するように誘導されなければならない。サイトカイン誘導の不在下での単独の腫瘍ペプチドの認識は、T細胞がアネルギー性になり、それによって耐性をもたらす。したがって、癌免疫療法における非常に有望なアプローチは、サイトカインベースの治療である。実際には、IL-2は、転移性腎細胞癌および悪性黒色腫を有する患者への使用について承認されている。しかしながら、現在、ヒトにおける組換えIL-12の承認された使用はない。
組換えIL-12は、免疫系の活性化におけるその幅広い効果のために、有望なサイトカインベースの治療である。しかしながら、IL-12は、これまでのところ、毒性のためにヒト臨床試験においてハードルに直面している。他のサイトカインと同様に、IL-12の短い半減期は、頻繁なボーラス注射を必要とする。
加えて、IL-12は、生物学的に活性なIL-12ヘテロ二量体を形成するように共有結合されたα鎖(p35サブユニット、IL-12p35)およびβ鎖(p40サブユニット、IL-12p40)からなる。IL-12は、T細胞上のIL-12受容体β1(IL-12Rβ1)およびIL-12受容体β2(IL-12Rβ2)からなる二量体IL-12受容体複合体に結合し、IFNγ分泌を誘導することによる結合を通してその細胞シグナル伝達機能を発揮する。しかしながら、IL-12p40サブユニットは、IL-12受容体への結合について競合することによってIL-12活性をアンタゴナイズすることが報告されているホモ二量体としても存在することができる。
本発明は、新規IL-12-Fc融合タンパク質、および低下した有効性を有する新規IL-12バリアントを提供することによって、IL-12の短い半減期に対処する。
一態様では、本発明は、a)バリアントIL-12p40サブユニットドメインおよび第1のFcドメインを含む第1の融合タンパク質であって、当該IL-12p40サブユニットドメインが、当該第1のFcドメインのN末端に共有結合している、第1の融合タンパク質と、b)IL-12p35サブユニットドメインおよび第2のFcドメインを含む第2の融合タンパク質であって、当該IL-12p35サブユニットドメインが、当該FcドメインのN末端に共有結合している、第2の融合タンパク質と、を含み、当該第1および当該第2のFcドメインが、当該第1および当該第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾を含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該バリアントIL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列と少なくとも90%の同一性を有し、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該バリアントIL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該バリアントIL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該バリアントIL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および当該第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357Q;T366S/L368A/Y407VおよびT366W;T366S/L368A/Y407V/Y349CおよびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該バリアントIL-12p40サブユニットドメインが、第1のドメインリンカーを使用して当該第1のFcドメインに結合し、かつ/または当該IL-12p35サブユニットドメインが、第2のドメインリンカーを使用して当該第2のFcドメインに結合している、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および/または当該第2のFcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421Dを含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および/または当該第2のFcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が、
a)i)配列番号47(XENP27201鎖1)、ii)配列番号85(XenD24752)、iii)配列番号86(XenD24753)、iv)配列番号87(XenD24754)、v)配列番号88(XenD24755)、vi)配列番号89(XenD24756)、vii)配列番号90(XenD24757)、viii)配列番号91(XenD24758)、ix)配列番号92(XenD24759)、x)配列番号93(XenD24760)、xi)配列番号94(XenD24761)、xii)配列番号95(XenD24762)、xiii)配列番号96(XenD24763)、xiv)配列番号97(XenD24764)、xv)配列番号98(XenD24765)、xvi)配列番号99(XenD24766)、xvii)配列番号100(XenD24767)、xviii)配列番号101(XenD24768)、xix)配列番号102(XenD24769)、xx)配列番号103(XenD24770)、xxi)配列番号104(XenD24771)、xxii)配列番号105(XenD24772)、xxiii)配列番号106(XenD24773)、xxiv)配列番号107(XenD24774)、xxv)配列番号108(XenD24775)、xxvi)配列番号109(XenD24776)、xxvii)配列番号110(XenD24777)、xxviii)配列番号111(XenD24778)、xxix)配列番号112(XenD24792)、xxx)配列番号215(XenD25922)、xxxi)配列番号216(XenD25923)、xxxii)配列番号217(XenD25924)、xxxiii)配列番号218(XenD25925)、xxxiv)配列番号219(XenD25926)、xxxv)配列番号220(XenD25927)、xxxvi)配列番号221(XenD25928)、xxxvii)配列番号222(XenD25929)、xxxviii)配列番号223(XenD25930)、xxxix)配列番号224(XenD25931)、xl)配列番号XXX(XenD26411)、xli)配列番号XXX(XenD26412)、xlii)配列番号XXX(XenD26413)、xliii)配列番号XXX(XenD26414)、xliv)配列番号XXX(XenD26415)、xlv)配列番号XXX(XenD26416)、xlvi)配列番号XXX(XenD26417)、xlvii)配列番号XXX(XenD26418)、xlviii)配列番号XXX(XenD27070)、xlix)配列番号XXX(XenD27071)、l)配列番号XXX(XenD27072)、li)配列番号XXX(XenD27073)、lii)配列番号XXX(XenD27074)、liii)配列番号XXX(XenD27075)、liv)配列番号XXX(XenD27076)、lv)配列番号XXX(XenD27077)、lvi)配列番号XXX(XenD27078)、lvii)配列番号XXX(XenD28173)、lviii)配列番号XXX(XenD24876)、lix)配列番号XXX(XenD27162)、lx)配列番号XXX(XenD27163)、lxi)配列番号XXX(XenD27164)、lxii)配列番号XXX(XenD27165)lxiii)配列番号XXX(XENP31582鎖1)、lxiv)配列番号XXX(XENP31583鎖1)、lxv)配列番号XXX(XENP31584鎖1)、lxvi)配列番号XXX(XENP32187鎖1)、lxvii)配列番号XXX(XENP32188鎖1)、lxviii)配列番号XXX(XENP32189、鎖1)、lxix)配列番号XXX(XENP32190鎖1)、lxx)配列番号XXX(XENP32191鎖1)、lxxi)配列番号XXX(XENP32991鎖1)、lxxii)配列番号XXX(XENP32992鎖1)、lxxiii)配列番号XXX(XENP32993鎖1)、lxxiv)配列番号XXX(XENP32994鎖1)、lxxv)配列番号XXX(XENP32995鎖1)、lxxvi)配列番号XXX(XENP32996鎖1)、lxxvi)配列番号XXX(XENP32997鎖1)、lxxvii)配列番号XXX(XENP32998鎖1)、lxxvii)配列番号XXX(XENP32999鎖1)、lxxviii)配列番号XXX(XENP33000鎖1)、lxxix)配列番号XXX(XENP33001鎖1)、lxxx)配列番号XXX(XENP33002鎖1)、lxxxi)配列番号XXX(XENP33003鎖1)、lxxxii)配列番号XXX(XENP33004鎖1)、lxxxiii)配列番号XXX(XENP33005鎖1)、lxxxiv)配列番号XXX(XENP33006鎖1)、lxxxv)配列番号XXX(XENP33007鎖1)、lxxxvi)配列番号XXX(XENP33008鎖1)、lxxxvii)配列番号XXX(XENP33008鎖1)、lxxxviii)配列番号XXX(XENP33009鎖1)、lxxxix)配列番号XXX(XENP33010鎖1)、およびxc)配列番号XXX(XENP33011鎖1)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する当該第1の融合タンパク質と、
b)i)配列番号48(XENP27201鎖2)、ii)配列番号126(XenD24779)、iii)配列番号127(XenD24780)、iv)配列番号128(XenD24781)、v)配列番号129(XenD24782)、vi)配列番号130(XenD24783)、vii)配列番号131(XenD24784)、viii)配列番号132(XenD24785)、ix)配列番号133(XenD24786)、x)配列番号134(XenD24787)、xi)配列番号135(XenD24788)、xii)配列番号136(XenD24789)、xiii)配列番号137(XenD24790)、xiv)配列番号138(XenD24791)、xv)配列番号236(XenD25911)、xvi)配列番号237(XenD25912)、xvii)配列番号238(XenD25913)、xviii)配列番号239(XenD25914)、xix)配列番号240(XenD25915)、xx)配列番号241(XenD25916)、xxi)配列番号242(XenD25917)、xxii)配列番号243(XenD25918)、xxiii)配列番号244(XenD25919)、xxiv)配列番号245(XenD25920)、xxv)配列番号246(XenD25921)、xxvi)配列番号XXX(XenD26427)、xxvii)配列番号XXX(XenD26428)、xxviii)配列番号XXX(XenD27089)、xxix)配列番号XXX(XenD27090)、xxx)配列番号XXX(XenD27091)、xxxi)配列番号XXX(XenD27092)、xxxii)配列番号XXX(XenD27093)、xxxiii)配列番号XXX(XenD27094)、xxxix)配列番号XXX(XenD24877)、xl)配列番号XXX(XenD27166)、xli)配列番号XXX(XENP31582鎖2)、xlii)配列番号XXX(XENP31583鎖2)、xliii)配列番号XXX(XENP31584鎖2)、xliv)配列番号XXX(XENP32187鎖2)、xlv)配列番号XXX(XENP32188鎖2)、xlvi)配列番号XXX(XENP32189、鎖2)、xlvii)配列番号XXX(XENP32190鎖2)、xlviii)配列番号XXX(XENP32191鎖2)、xlix)配列番号XXX(XENP32991鎖2)、l)配列番号XXX(XENP32992鎖2)、li)配列番号XXX(XENP32993鎖2)、lii)配列番号XXX(XENP32994鎖2)、liii)配列番号XXX(XENP32995鎖2)、liv)配列番号XXX(XENP32996鎖2)、lv)配列番号XXX(XENP32997鎖2)、lvi)配列番号XXX(XENP32998鎖2)、lvii)配列番号XXX(XENP32999鎖2)、lviii)配列番号XXX(XENP33000鎖2)、lix)配列番号XXX(XENP33001鎖2)、lx)配列番号XXX(XENP33002鎖2)、lxi)配列番号XXX(XENP33003鎖2)、lxii)配列番号XXX(XENP33004鎖2)、lxiii)配列番号XXX(XENP33005鎖2)、lxiv)配列番号XXX(XENP33006鎖2)、lxv)配列番号XXX(XENP33007鎖2)、lxvi)配列番号XXX(XENP33008鎖2)、lxvii)配列番号XXX(XENP33008鎖2)、lxviii)配列番号XXX(XENP33009鎖2)、lxix)配列番号XXX(XENP33010鎖2)、およびlxx)配列番号XXX(XENP33011鎖2)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する当該第2の融合タンパク質と、を含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供し、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、XENP27201、XENP28820、XENP28821、XENP28822、XENP28823、XENP28824、XENP28825、XENP28826、XENP28827、XENP28828、XENP28829、XENP28830、XENP28831、XENP28832、XENP28833、XENP28834、XENP28835、XENP28836、XENP28837、XENP28838、XENP28839、XENP28840、XENP28841、XENP28842、XENP28843、XENP28844、XENP28845、XENP28846、XENP28847、XENP28848、XENP28849、XENP28850、XENP28851、XENP28852、XENP29949、XENP29950、XENP29951、XENP29952、XENP30597、XENP30598、XENP30599、XENP30600、XENP30601、XENP30602、XENP30603、XENP30604、XENP30605、XENP30606、XENP30307、XENP30308、XENP30609、XENP31250、XENP31251、XENP31252、XENP31253、XENP31254、XENP31255、XENP31256、XENP31257、XENP31258、XENP31259、XENP31260、XENP31261、XENP31262、XENP31263、XENP31264、XENP31265、XENP31286、XENP31142、XENP31143、XENP31144、XENP31145、XENP31146、XENP31582、XENP31583、XENP31584、XENP32186、XENP32187、XENP32188、XENP32189、XENP32190、XENP32191、XENP32991、XENP32992、XENP32993、XENP32994、XENP32995、XENP32996、XENP32997、XENP32998、XENP32999、XENP33000、XENP33001、XENP33002、XENP33003、XENP33004、XENP33005、XENP33006、XENP33007、XENP33008、XENP33008、XENP33009、XENP33010、およびXENP33011からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が、XENP31251、XENP31254、XENP31258、XENP32186、XENP32187、XENP32188、XENP32189、XENP32190、およびXENP32191からなる群から選択される、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、N103Q、N113Q、N200Q、およびN281Qからなる群から選択されるIL-12p40サブユニットに対する1つ以上の修飾をさらに含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252、Q256、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
別の態様では、本発明は、a)第1のタンパク質ドメインおよび第1のFcドメインを含む第1の融合タンパク質であって、当該第1のタンパク質ドメインが、当該第1のFcドメインのC末端に共有結合している、第1の融合タンパク質と、b)第2のタンパク質ドメインおよび第2のFcドメインを含む第2の融合タンパク質であって、当該第2のタンパク質ドメインが、当該FcドメインのC末端に共有結合している、第2の融合タンパク質と、を含み、当該第1および当該第2のFcドメインが、当該第1および当該第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾を含み、当該第1のタンパク質ドメインが、IL-12p40サブユニットを含み、当該第2のタンパク質ドメインが、IL-12p35サブユニットを含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および当該第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357QおよびT366S/L368A/Y407V:T366W(任意に架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1のタンパク質ドメインが、第1のドメインリンカーを使用して当該第1のFcドメインに結合し、かつ/または当該第2のタンパク質ドメインが、第2のドメインリンカーを使用して当該第2のFcドメインに結合している、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および/または当該第2のFcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および/または当該第2のFcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252、Q256、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供し、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、a)配列番号49(XENP27202鎖1)のポリペプチド配列を有する当該第1の融合タンパク質、およびb)配列番号50(XENP27202鎖2)のポリペプチド配列を有する当該第2の融合タンパク質を含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供し、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、XENP27202である。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、a)第1のタンパク質ドメイン、第2のタンパク質ドメイン、および第1のFcドメインを含む融合タンパク質であって、当該第1のタンパク質ドメインが、当該第2のタンパク質ドメインに共有結合し、当該第2のタンパク質ドメインが、当該第1のFcドメインのN末端に共有結合している、融合タンパク質と、b)第2のFcドメインであって、当該第1および当該第2のFcドメインが、当該第1および当該第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾を含み、当該第1のタンパク質ドメインが、IL-12p40サブユニットを含み、当該第2のタンパク質ドメインが、IL-12p35サブユニットを含む、第2のFcドメインと、を含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および当該第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357QおよびT366S/L368A/Y407V:T366W(任意に架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1のタンパク質ドメインが、第1のドメインリンカーを使用して当該第2のタンパク質ドメインに結合し、かつ/または当該第2のタンパク質ドメインが、第2のドメインリンカーを使用して当該第1のFcドメインに結合している、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および/または当該第2のFcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および/または当該第2のFcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424S.をさらに含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、Q256、K158、C252、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供し、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、a)配列番号51(XENP27203鎖1)のポリペプチド配列を有する当該融合タンパク質、およびb)配列番号52(XENP27203鎖2)のポリペプチド配列を有する当該第2のFcドメインを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供し、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、XENP27203である。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供し、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、XENP31290である。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、a)第1のタンパク質ドメイン、第2のタンパク質ドメイン、および第1のFcドメインを含む融合タンパク質であって、当該第1のタンパク質ドメインが、当該第2のタンパク質ドメインに共有結合し、当該第2のタンパク質ドメインが、当該第1のFcドメインのN末端に共有結合している、融合タンパク質と、b)第2のFcドメインと、を含み、当該第1および当該第2のFcドメインが、当該第1および当該第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾を含み、当該第1のタンパク質ドメインが、IL-12p35サブユニットを含み、当該第2のタンパク質ドメインが、IL-12p40サブユニットを含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および当該第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357QおよびT366S/L368A/Y407V:T366W(任意に架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1のタンパク質ドメインが、第1のドメインリンカーを使用して当該第2のタンパク質ドメインに結合し、かつ/または当該第2のタンパク質ドメインが、第2のドメインリンカーを用使用して当該第1のFcドメインに結合している、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および/または当該第2のFcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および/または当該第2のFcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および/または配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252、Q256、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供し、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、a)配列番号53(XENP27204鎖1)のポリペプチド配列を有する当該融合タンパク質、およびb)配列番号54(XENP27204鎖2)のポリペプチド配列を有する当該第2のFcドメインを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供し、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、XENP27204である。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、a)第1のタンパク質ドメイン、第2のタンパク質ドメイン、および第1のFcドメインを含む融合タンパク質であって、当該第1のタンパク質ドメインが、当該第1のFcドメインのC末端に結合し、当該第2のタンパク質ドメインが、当該第1のタンパク質ドメインに共有結合している、融合タンパク質と、b)第2のFcドメインと、を含み、当該第1および当該第2のFcドメインが、当該第1および当該第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾を含み、当該第1のタンパク質ドメインが、IL-12p40サブユニットを含み、当該第2のタンパク質ドメインが、IL-12p35サブユニットを含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および当該第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357QおよびT366S/L368A/Y407V:T366W(任意に架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1のタンパク質ドメインが、第1のドメインリンカーを使用して当該第2のタンパク質ドメインに結合し、かつ/または当該第2のタンパク質ドメインが、第2のドメインリンカーを使用して当該第1のFcドメインに結合している、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および/または当該第2のFcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および/または当該第2のFcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252、Q256、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、a)第1のタンパク質ドメイン、第2のタンパク質ドメイン、および第1のFcドメインを含む融合タンパク質であって、当該第1のタンパク質ドメインが、当該第1のFcドメインのC末端に結合し、当該第2のタンパク質ドメインが、当該第1のタンパク質ドメインに共有結合している、融合タンパク質と、b)第2のFcドメインと、を含み、当該第1および当該第2のFcドメインが、当該第1および当該第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾を含み、当該第1のタンパク質ドメインが、IL-12p35サブユニットを含み、当該第2のタンパク質ドメインが、IL-12p40サブユニットを含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および当該第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357QおよびT366S/L368A/Y407V:T366W(任意に架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1のタンパク質ドメインが、第1のドメインリンカーを使用して当該第2のタンパク質ドメインに結合し、かつ/または当該第2のタンパク質ドメインが、第2のドメインリンカーを使用して当該第1のFcドメインに結合している、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および/または当該第2のFcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および/または当該第2のFcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252、Q256、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、a)IL-12p40サブユニット、およびb)IL-12p35サブユニットを含むヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、ドメインリンカーを使用して当該IL-12p35サブユニットに共有結合している、ヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252、Q256、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ヘテロ二量体複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのヘテロ二量体複合体を含む組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体複合体をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体複合体をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体複合体を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ヘテロ二量体複合体が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体複合体を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ヘテロ二量体複合体を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ヘテロ二量体複合体を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/またはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットを提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p40サブユニットを提供し、当該バリアントIL-12p40サブユニットは、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、Q256、C252、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p40サブユニットを提供し、当該バリアントIL-12p40サブユニットは、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p40サブユニットを提供し、当該バリアントIL-12p40サブユニットは、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p40サブユニットを提供し、当該バリアントIL-12p40サブユニットは、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p40サブユニットを含む組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p40サブユニットをコードする核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p40サブユニットをコードする当該核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p40サブユニットを作製する方法を提供し、当該方法は、当該バリアントIL-12p40サブユニットが産生される条件下で請求項H8に記載の宿主細胞を培養することを含む。
別の態様では、本発明は、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/またはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットを提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p35サブユニットを提供し、当該バリアントIL-12p35サブユニットは、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p35サブユニットを提供し、当該バリアントIL-12p35サブユニットは、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p35サブユニットを提供し、当該バリアントIL-12p35サブユニットは、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p35サブユニットを提供し、当該バリアントIL-12p35サブユニットは、アミノ酸置換N71D/N85D/N195Dを有する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p35サブユニットを提供し、当該バリアントIL-12p35サブユニットは、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p35サブユニットを含む組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p35サブユニットをコードする核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p35サブユニットをコードする当該核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、バリアントIL-12p35サブユニットを提供し、当該方法は、当該バリアントIL-12p35サブユニットが産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
別の態様では、本発明は、a)第1のFcドメインに共有結合したIL-12p40サブユニットドメインを含む第1の融合タンパク質と、b)第2のFcドメインに共有結合したIL-12p35サブユニットドメインを含む第2の融合タンパク質と、を含み、当該第1および第2のFcドメインが、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357Q;T366S/L368A/Y407VおよびT366W;ならびにT366S/L368A/Y407V/Y349CおよびT366W/S354C;からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットドメインが、当該第1のFcドメインのN末端に結合し、当該IL-12p35サブユニットドメインが、当該第2のFcドメインのN末端に結合している、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットドメインが、当該第1のFcドメインのC末端に結合し、当該IL-12p35サブユニットドメインが、当該第2のFcドメインのC末端に結合している、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Il-12p40サブユニットドメインが、ドメインリンカーを使用して当該第1のFcドメインに結合し、当該IL-12p35サブユニットドメインが、ドメインリンカーを使用して当該第2のFcドメインに結合している、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1および第2のFcドメインが、IgG1ヒンジ-CH2-CH3を含む、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1の融合タンパク質が、N末端からC末端へ、IL-12p40サブユニットドメイン-ドメインリンカー-ヒンジ-CH2-CH3を含み、当該第2の融合タンパク質が、N末端からC末端へ、IL-12p35サブユニットドメイン-ドメインリンカー-ヒンジ-CH2-CH3を含む、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1の融合タンパク質が、N末端からC末端へ、ヒンジ-CH2-CH3-ドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメインを含み、当該第2の融合タンパク質が、N末端からC末端へ、ヒンジ-CH2-CH3-ドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメインを含む、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択される配列を有する、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E))、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、lx)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、lxi)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、lxii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、lxiv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、lxv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびlxvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択される配列を有する、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
別の態様では、本発明は、a)第1のFcドメインと、b)i)第2のFcドメイン、ii)IL-12p40サブユニットドメイン、およびiii)IL-12p35サブユニットドメインを含む融合タンパク質と、を含む、ヘテロ二量体タンパク質を含み、当該第1および第2のFcドメインは、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357Q;T366S/L368A/Y407VおよびT366W;ならびにT366S/L368A/Y407V/Y349CおよびT366W/S354C;からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該融合タンパク質が、N末端からC末端へ、IL-12p40サブユニットドメイン-ドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメイン-ドメインリンカー-ヒンジ-CH2-CH3を含む、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該融合タンパク質が、N末端からC末端へ、IL-12p35サブユニットドメイン-ドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメイン-ドメインリンカー-ヒンジ-CH2-CH3を含む、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該融合タンパク質が、N末端からC末端へ、ヒンジ-CH2-CH3-ドメインリンカーIL-12p35サブユニットドメイン-ドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメインを含む、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該融合タンパク質が、N末端からC末端へ、ヒンジ-CH2-CH3-ドメインリンカーIL-12p40サブユニットドメイン-ドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメインを含む、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択される配列を有する、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、lx)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、lxi)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、lxii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、lxiv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、lxv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびlxvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択される配列を有する、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
別の態様では、本発明は、第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、IL-12p40サブユニットドメイン-任意の第1のドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメイン-任意の第2のドメインリンカー-Fcドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインのホモ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370S;S364K;S364K/E357L;S364K/E357Q;T411E/K360E/Q362E;D401K;T366S/L368A/Y407V;T366W;T366S/L368A/Y407V/Y349C;およびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1のドメインリンカーおよび当該第2のドメインリンカーが、同じアミノ酸配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号XX(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号XX(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、当該IL-12p35サブユニットが、配列番号XX(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号XX(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインの各々が、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252S、、Q256、K158、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31289である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31291である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのホモ二量体Fc融合タンパク質を含むホモ二量体Fc融合タンパク質組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ホモ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ホモ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ホモ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、IL-12p35サブユニットドメイン-任意の第1のドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメイン-任意の第2のドメインリンカー-Fcドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインのホモ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370S;S364K;S364K/E357L;S364K/E357Q;T411E/K360E/Q362E;D401K;T366S/L368A/Y407V;T366W;T366S/L368A/Y407V/Y349C;およびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1のドメインリンカーおよび当該第2のドメインリンカーが、同じアミノ酸配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインの各々が、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252S、、Q256、K158、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、
i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31289である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31291である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのホモ二量体Fc融合タンパク質を含むホモ二量体Fc融合タンパク質組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ホモ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ホモ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ホモ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、Fcドメイン-任意の第1のドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメイン-任意の第2のドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインのホモ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370S;S364K;S364K/E357L;S364K/E357Q;T411E/K360E/Q362E;D401K;T366S/L368A/Y407V;T366W;T366S/L368A/Y407V/Y349C;およびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1のドメインリンカーおよび当該第2のドメインリンカーが、同じアミノ酸配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインの各々が、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252S、、Q256、K158、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31289である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31291である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのホモ二量体Fc融合タンパク質を含むホモ二量体Fc融合タンパク質組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ホモ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ホモ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ホモ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、Fcドメイン-任意の第1のドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメイン-任意の第2のドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインのホモ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370S;S364K;S364K/E357L;S364K/E357Q;T411E/K360E/Q362E;D401K;T366S/L368A/Y407V;T366W;T366S/L368A/Y407V/Y349C;およびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1のドメインリンカーおよび当該第2のドメインリンカーが、同じアミノ酸配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインの各々が、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252S、、Q256、K158、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31289である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31291である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのホモ二量体Fc融合タンパク質を含むホモ二量体Fc融合タンパク質組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ホモ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ホモ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ホモ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、IL-12p40サブユニットドメイン-第1のドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメイン-第2のドメインリンカー-Fcドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインのホモ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370S;S364K;S364K/E357L;S364K/E357Q;T411E/K360E/Q362E;D401K;T366S/L368A/Y407V;T366W;T366S/L368A/Y407V/Y349C;およびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1のドメインリンカーおよび当該第2のドメインリンカーが、同じアミノ酸配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインの各々が、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252S、、Q256、K158、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、
i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31289である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31291である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのホモ二量体Fc融合タンパク質を含むホモ二量体Fc融合タンパク質組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ホモ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ホモ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ホモ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、IL-12p35サブユニットドメイン-第1のドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメイン-第2のドメインリンカー-Fcドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインのホモ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370S;S364K;S364K/E357L;S364K/E357Q;T411E/K360E/Q362E;D401K;T366S/L368A/Y407V;T366W;T366S/L368A/Y407V/Y349C;およびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1のドメインリンカーおよび当該第2のドメインリンカーが、同じアミノ酸配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインの各々が、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252S、、Q256、K158、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、
i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)(IL-12p35(E143Q))、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31289である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31291である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのホモ二量体Fc融合タンパク質を含むホモ二量体Fc融合タンパク質組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ホモ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ホモ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ホモ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、Fcドメイン-第1のドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメイン-第2のドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインのホモ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370S;S364K;S364K/E357L;S364K/E357Q;T411E/K360E/Q362E;D401K;T366S/L368A/Y407V;T366W;T366S/L368A/Y407V/Y349C;およびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1のドメインリンカーおよび当該第2のドメインリンカーが、同じアミノ酸配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインの各々が、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252S、、Q256、K158、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、
i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31289である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31291である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのホモ二量体Fc融合タンパク質を含むホモ二量体Fc融合タンパク質組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ホモ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ホモ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ホモ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、Fcドメイン-第1のドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメイン-第2のドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインのホモ二量体化を促進する当該修飾が、EU付番に従って、L368D/K370S;S364K;S364K/E357L;S364K/E357Q;T411E/K360E/Q362E;D401K;T366S/L368A/Y407V;T366W;T366S/L368A/Y407V/Y349C;およびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該第1のドメインリンカーおよび当該第2のドメインリンカーが、同じアミノ酸配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、当該IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該Fcドメインの各々が、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または当該IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252S、、Q256、K158、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p40サブユニットが、
i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、当該IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31289である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、当該第1および第2の単量体が、XENP31291である、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象における癌の治療における使用のためのホモ二量体Fc融合タンパク質を含むホモ二量体Fc融合タンパク質組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質をコードする当該1つ以上の核酸を含む宿主細胞を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法を提供し、当該方法は、当該ホモ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で宿主細胞を培養することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、ホモ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法を提供し、当該方法は、a)ホモ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、b)当該組成物をイオン交換カラムに充填することと、c)当該ホモ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む。
別の態様では、本発明は、癌を治療することを必要とする患者において癌を治療する方法を提供し、治療有効量の、先行項のいずれかによるヘテロ二量体またはホモ二量体Fc融合タンパク質を当該患者に投与することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、癌を治療することを必要とする患者において癌を治療する方法を提供し、治療有効量のチェックポイント遮断抗体を投与することをさらに含む。
いくつかのさらなる実施形態では、本発明は、癌を治療することを必要とする患者において癌を治療する方法を提供し、当該チェックポイント遮断抗体は、抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体、抗TIM3抗体、抗TIGIT抗体、抗LAG3抗体、および抗CTLA-4抗体から選択される。
いくつかのさらなる実施形態では、本発明は、癌を治療することを必要とする患者において癌を治療する方法を提供し、当該抗PD-1抗体は、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、またはピジリズマブである。
いくつかのさらなる実施形態では、本発明は、癌を治療することを必要とする患者において癌を治療する方法を提供し、当該抗PD-L1抗体は、アテゾリズマブ、アベルマブ、またはデュルバルマブである。
いくつかのさらなる実施形態では、本発明は、癌を治療することを必要とする患者において癌を治療する方法を提供し、患者は、投与後にリンパ球の増加を示す。
いくつかのさらなる実施形態では、本発明は、癌を治療することを必要とする患者において癌を治療する方法を提供し、患者は、投与後に末梢CD8+T細胞の増加を示す。
いくつかの実施形態では、本発明は、癌を治療することを必要とする患者において癌を治療する方法を提供し、IL-12Fc融合タンパク質は、治療前のチェックポイント発現を増加させるために、チェックポイント阻害剤の前に投与される。
いくつかの実施形態では、本発明は、癌を治療することを必要とする患者において癌を治療する方法を提供し、IL-12Fc融合タンパク質は、治療前のチェックポイント発現を増加させるために、チェックポイント阻害剤の前に投与される。
別の態様では、本発明は、T細胞増殖を誘導することを必要とする患者においてT細胞増殖を誘導する方法を提供し、治療有効量の先行項のいずれかによるヘテロ二量体またはホモ二量体Fc融合タンパク質を当該患者に投与することを含む。
いくつかのさらなる実施形態では、本発明は、T細胞増殖を誘導することを必要とする患者においてT細胞増殖を誘導する方法を提供し、治療有効量のチェックポイント遮断抗体を投与することをさらに含む。
いくつかのさらなる実施形態では、本発明は、T細胞増殖を誘導することを必要とする患者においてT細胞増殖を誘導する方法を提供し、当該チェックポイント遮断抗体は、抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体、抗TIM3抗体、抗TIGIT抗体、抗LAG3抗体、および抗CTLA-4抗体から選択される。
いくつかのさらなる実施形態では、本発明は、T細胞増殖を誘導することを必要とする患者においてT細胞増殖を誘導する方法を提供し、当該抗PD-1抗体は、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、またはピジリズマブである。
いくつかの他のさらなる実施形態では、本発明は、T細胞増殖を誘導することを必要とする患者においてT細胞増殖を誘導する方法を提供し、当該抗PD-L1抗体は、アテゾリズマブ、アベルマブ、またはデュルバルマブである。
いくつかのさらなる実施形態では、本発明は、T細胞増殖を誘導することを必要とする患者においてT細胞増殖を誘導する方法を提供し、T細胞増殖は、T細胞の少なくとも2倍の増加である。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞増殖を誘導することを必要とする患者においてT細胞増殖を誘導する方法を提供し、IL-12Fc融合タンパク質は、治療前のチェックポイント発現を増加させるために、チェックポイント阻害剤の前に投与される。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞増殖を誘導することを必要とする患者においてT細胞増殖を誘導する方法を提供し、IL-12Fc融合タンパク質は、治療前のチェックポイント発現を増加させるために、チェックポイント阻害剤の前に投与される。
一態様では、本発明は、IL-12p40サブユニットを提供する。別の態様では、本発明は、IL-12p35サブユニットを提供する。さらなる態様では、本発明は、a)IL-12p40サブユニットおよびb)IL-12p35サブユニットを含むヘテロ二量体複合体を提供する。
図1Aおよび1Bは、IL-12およびその受容体の配列を示す。 図2A~2Eは、(スキューおよびpIバリアントを含む)Fcヘテロ二量体化バリアントセットの有用な対を示す。対応する「単量体2」を有しないバリアントは、いずれかの単量体に対して単独で使用することができるpIバリアントである。 等比体積バリアント抗体定常領域およびそれらのそれぞれの置換の一覧を示す。pI_(-)は低pIバリアントを示し、pI_(+)は高pIバリアントを示す。これらは、任意にかつ独立して、本発明の他のヘテロ二量体化バリアント(および本明細書に概説される他のバリアント種)と組み合わせることができる。 FcγR結合をアブレートする有用なアブレーションバリアントを示す(「ノックアウト」または「KO」バリアントと称されることもある)。一般に、アブレーションバリアントは両方の単量体に見られるが、いくつかの場合では、それらは一方の単量体のみにあってもよい。 本発明の「非サイトカイン」成分の特に有用な実施形態を示す。 いくつかの例示的なドメインリンカーを示す。いくつかの実施形態では、これらのリンカーは、IL-12p35サブユニット、IL-12p40サブユニット、または単鎖IL-12複合体をFc領域のN末端に結合することに用途を見出す。いくつかの実施形態では、これらのリンカーは、単鎖IL-12複合体においてIL-12p35サブユニットをIL-12p40サブユニットに融合することに用途を見出す。scIL-12複合体は、IL-12p40にN末端結合したIL-12p35またはIL-12p35にN末端結合したIL-12p40のいずれかを含むことができることに留意することが重要である。また、本明細書に記載されるいくつかの場合では、Fcドメインのヒンジ部分は、ドメインリンカーとして機能し、これらのリンカーのいずれかと同様に組み合わせることができる。 図7A~7Eは、サイトカイン配列を含まない、ヒトIgG1に基づくいくつかの有用なIL-12-Fc融合バックボーンの配列(例えば、IL-12p35サブユニット、IL-12p40サブユニット、またはscIL-12複合体)を示す。バックボーン1は、ヒトIgG1(356E/358Mアロタイプ)に基づき、両方の鎖上のC220S、S364K/E357Q:L368D/K370Sスキューバリアント、L368D/K370Sスキューバリアントを有する鎖上のQ295E/N384D/Q418E/N421D pIバリアント、および両方の鎖上のE233P/L234V/L235A/G236del/S267Kアブレーションバリアントを含む。バックボーン2は、ヒトIgG1(356E/358Mアロタイプ)に基づき、両方の鎖上のC220S、S364K:L368D/K370Sスキューバリアント、L368D/K370Sスキューバリアントを有する鎖上のQ295E/N384D/Q418E/N421D pIバリアント、および両方の鎖上のE233P/L234V/L235A/G236del/S267Kアブレーションバリアントを含む。バックボーン3は、ヒトIgG1(356E/358Mアロタイプ)に基づき、両方の鎖上のC220S、S364K:L368E/K370Sスキューバリアント、L368E/K370Sスキューバリアントを有する鎖上のQ295E/N384D/Q418E/N421D pIバリアント、および両方の鎖上のE233P/L234V/L235A/G236del/S267Kアブレーションバリアントを含む。バックボーン4は、ヒトIgG1(356E/358Mアロタイプ)に基づき、両方の鎖上のC220S、D401K:K360E/Q362E/T411Eスキューバリアント、K360E/Q362E/T411Eスキューバリアントを有する鎖上のQ295E/N384D/Q418E/N421D pIバリアント、および両方の鎖上のE233P/L234V/L235A/G236del/S267Kアブレーションバリアントを含む。バックボーン5は、ヒトIgG1(356D/358Lアロタイプ)に基づき、両方の鎖上のC220S、S364K/E357Q:L368D/K370Sスキューバリアント、L368D/K370Sスキューバリアントを有する鎖上のQ295E/N384D/Q418E/N421D pIバリアント、および両方の鎖上のE233P/L234V/L235A/G236del/S267Kアブレーションバリアントを含む。バックボーン6は、ヒトIgG1(356E/358Mアロタイプ)に基づき、両方の鎖上のC220S、S364K/E357Q:L368D/K370Sスキューバリアント、L368D/K370Sスキューバリアントを有する鎖上のQ295E/N384D/Q418E/N421D pIバリアント、および両方の鎖上のE233P/L234V/L235A/G236del/S267Kアブレーションバリアント、ならびに両方の鎖上のN297Aバリアントを含む。バックボーン7は、変異がN297Sであることを除いて、6と同一である。バックボーン6および7についての代替フォーマットは、両方の鎖においてアブレーションバリアントE233P/L234V/L235A/G236del/S267Kを除外することができる。バックボーン8は、ヒトIgG4に基づき、S364K/E357Q:L368D/K370Sスキューバリアント、L368D/K370Sスキューバリアントを有する鎖上のQ295E/N384D/Q418E/N421D pIバリアント、および当該技術分野で知られるようにFabアーム交換をアブレートする両方の鎖上のS228P(EU付番、すなわちKabatのS241P)バリアントを含む。バックボーン9は、ヒトIgG2に基づき、S364K/E357Q:L368D/K370S スキューバリアント、L368D/K370Sスキューバリアントを有する鎖上のQ295E/N384D/Q418E/N421D pIバリアントを含む。バックボーン10は、ヒトIgG2に基づき、S364K/E357Q:L368D/K370Sスキューバリアント、L368D/K370Sスキューバリアントを有する鎖上のQ295E/N384D/Q418E/N421D pIバリアント、および両方の鎖上のS267Kバリアントを含む。バックボーン11は、M428L/N434S Xtend変異を含むことを除いて、バックボーン1と同一である。バックボーン12は、ヒトIgG1(356E/358Mアロタイプ)に基づき、両方の同一の鎖上のC220S、および両方の同一の鎖上のE233P/L234V/L235A/G236del/S267Kアブレーションバリアントを含む。バックボーン13は、ヒトIgG1(356E/358Mアロタイプ)に基づき、両方の鎖上のC220S、S364K/E357Q:L368D/K370Sスキューバリアント、S364K/E357Qスキューバリアントを有する鎖上のP217R/P229R/N276K pIバリアント、および両方の鎖上のE233P/L234V/L235A/G236del/S267Kアブレーションバリアントを含む。 当業者によって理解され、以下に概説されるように、これらの配列は、これらに限定されないが、図8に概略的に示される、IL-12-ヘテロFc、ヘテロFc-IL-12、およびscIL-12-Fcフォーマットを含む、本明細書に概説される任意のIL-12-Fc融合フォーマットで使用することができる。ヘテロFc-IL-12融合体について、バックボーンはK447の欠失をさらに含み得ることが留意されるべきである。加えて、任意のIL-12p35および/またはIL-12p40バリアントは、これらの図7バックボーンに任意の組み合わせで組み込むことができる。 これらのバックボーンの各々の内に含まれるものは、列挙された配列に対して(本明細書で定義されるように)90、95、98、および99%同一である配列であり、かつ/または(当業者によって理解されるように、親ヒトIgG1(またはバックボーンに応じた、IgG2もしくはIgG4)と比べて、いくつかのアミノ酸修飾をすでに含有する、図の「親」と比べて)1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個からの追加のアミノ酸置換を含有する。すなわち、列挙されたバックボーンは、この図のバックボーン内に含まれるスキューバリアント、pIバリアント、およびアブレーションバリアントに加えて、追加のアミノ酸修飾(一般にアミノ酸置換)を含み得る。 図8A~8Fは、本発明のIL-12-Fc融合タンパク質についての例示的なフォーマットを示す。N末端IL-12ヘテロ二量体Fc融合体または「IL-12-ヘテロFc」(図8A)フォーマットは、ヘテロ二量体Fcの一方の側のN末端に組換え融合したIL-12p40サブユニット、およびヘテロ二量体Fcの他方の側のN末端に組換え融合したIL-12p35サブユニットを含む。IL-12p35およびIL-12p40サブユニットは、ドメインリンカーによってそれらのそれぞれのFc鎖に結合され得る。C末端IL-12ヘテロ二量体Fc融合体または「ヘテロFc-IL-12」(図8B)フォーマットは、ヘテロ二量体Fcの一方の側のC末端に組換え融合したIL-12p40サブユニット、およびヘテロ二量体Fcの他方の側のC末端に組換え融合したIL-12p35サブユニットを含む。IL-12p35およびIL-12p40サブユニットは、ドメインリンカーによってそれらのそれぞれのFc鎖に結合され得る。N末端単鎖IL-12-Fc融合体または「scIL-12-Fc」(図8C~D)フォーマットは、(任意にドメインリンカーを介して)ヘテロ二量体Fcの一方の側のN末端に組換え融合した単鎖IL-12複合体(または「scIL-12複合体」)を含み、分子の他方の側は、「Fcのみ」または「空Fc」ヘテロ二量体Fcである。C末端単鎖IL-12-Fc融合体または「Fc-scIL-12」(図8E~F)フォーマットは、(任意にドメインリンカーを介して)ヘテロ二量体Fcの一方の側のC末端に組換え融合したscIL-12複合体を含み、分子の他方の側は、「Fcのみ」または「空Fc」ヘテロ二量体Fcである。scIL-12複合体は、一般的であるが任意にドメインリンカーで、IL-12p40にN末端結合したIL-12p35またはIL-12p35にN末端結合したIL-12p40のいずれかを含むことができる。scIL-12複合体における2つのサブユニットの順序は、以下のように指定され得る:IL-12p40サブユニットがIL-12p35サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p40/p35)」、またはIL-12p35がIL-12p40サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p35/p40)」。 野生型IL-12p40および野生型IL-12p35配列を含有する、XENP27201、「IL-12-ヘテロFc」フォーマットの例示的なIL-12-Fc融合タンパク質の配列を示す。リンカーは、二重下線が付され(当業者によって理解されるように、リンカーは、そのいくつかが図6に示される、他のリンカーによって置き換えることができるが)、スラッシュ(/)は、IL-12p35、IL-12p40、リンカー、およびFc領域の間の境界(複数可)を示す。 野生型IL-12p40および野生型IL-12p35配列を含有する、XENP27202、「ヘテロFc-IL-12」フォーマットの例示的なIL-12-Fc融合タンパク質の配列を示す。リンカーは、二重下線が付され(当業者によって理解されるように、リンカーは、そのいくつかが図6に示される、他のリンカーによって置き換えることができるが)、スラッシュ(/)は、IL-12p35、IL-12p40、リンカー、およびFc領域の間の境界(複数可)を示す。 野生型IL-12p40および野生型IL-12p35配列を含有する、XENP27203およびXENP27204、「scIL-12-Fc」フォーマットの例示的なIL-12-Fc融合タンパク質の配列を示す。リンカーは、二重下線が付され(当業者によって理解されるように、リンカーは、そのいくつかが図6に示される、他のリンカーによって置き換えることができるが)、スラッシュ(/)は、IL-12p35、IL-12p40、リンカー、およびFc領域の間の境界(複数可)を示す。 図12A~12Bは、A)XENP27201の精製パート2を示すクロマトグラム(タンパク質Aクロマトグラフィー後のアニオン交換クロマトグラフィー)、ならびにB)多角度光散乱での分析サイズ排除クロマトグラフィー(aSEC-MALS)およびC)分析アニオン交換クロマトグラフィー(分析AIEX)によって決定されるピークAと比較した図12Aに示されるアニオン交換分離から単離されたピークBの純度および均一性を示す。図12Bは、多角度光散乱によって決定されるピークのタンパク質種の分子量も示す。 図13A~13Cは、A)XENP27203の精製パート2を示すクロマトグラム(タンパク質Aクロマトグラフィー後のアニオン交換クロマトグラフィー)、ならびにB)多角度光散乱での分析サイズ排除クロマトグラフィー(SEC-MALS)およびC)分析アニオン交換クロマトグラフィーによって決定されるピークAと比較した図13Aに示されるアニオン交換分離から単離されたピークBの純度および均一性を示す。図13Bは、多角度光散乱によって決定されるピークのタンパク質種の分子量も示す。 図A~14Bは、A)二価IL-12p40-Fc融合体およびB)二価IL-12p35-Fc融合体の漫画概略図を示す。各融合体は、ホモ二量体FcのN末端に組換え融合したIL-12p40またはIL-12p35サブユニットのいずれかを含む。サブユニットは、Fc領域のそれぞれのC末端およびN末端の間にドメインリンカーを有し得る。 野生型IL-12p40および野生型IL-12p35配列を含有する、XENP27560、二価IL-12p40-Fc融合体、およびXENP27561、二価IL-12p35-Fc融合体(図14に示される漫画概略図)の配列を示す。リンカーは、二重下線が付され(当業者によって理解されるように、リンカーは、そのいくつかが図6に示される、他のリンカーによって置き換えることができるが)、スラッシュ(/)は、IL-12p35、IL-12p40、リンカー、およびFc領域の間の境界(複数可)を示す。 図16A~16Dは、示された試験品との活性化PBMCのインキュベーション後のA)CD4CD45RACD25hiT細胞、B)CD8CD45RACD25hiT細胞、C)γδT細胞、およびD)NK細胞に対するSTAT4リン酸化を示す。 IL-12受容体でのIL-12p40の結合に寄与すると予測される(IL-12p40成熟形態配列に基づく)IL-12p40上の残基を示す。 MOEにおけるQuaSARパッケージを使用して少なくとも19のASAスコア(水分子の1.4Åの半径および各原子の多面体表示を使用して計算される水接触可能表面積)を有すると特定される(IL-12p40成熟形態配列に基づく)IL-12p40上のアスパラギン酸、グルタミン酸、アスパラギン、およびグルタミン残基を示す。 (アクセッション番号5MZVでPDBに登録される結晶構造に基づいて)IL-23受容体と接触すると予測される(IL-12p40成熟形態配列に基づく)IL-12p40上の残基および予測される接触タイプ(複数可)を示す。「D」は、近接性に基づいて予測される接触を示す。「H」は、潜在的な水素結合に基づいて予測される接触を示す。「I」は、潜在的な塩橋に基づいて予測される接触を示す。「A」は、潜在的なアレーン結合に基づいて予測される接触を示す。 図20A~20Iは、IL-12受容体についてのIL-12ヘテロ二量体複合体の親和性を低減および/または推定グリコシル化部位を除去する目的で設計された例示的なIL-12p40バリアントについての配列を示す。修飾されたアミノ酸は、下線が引かれ、太字である。 図21A~21Jは、Fc融合パートナーを有する例示的なIL-12p40バリアントについてのアミノ酸配列を示す。ドメインリンカーは二重下線が引かれ、IL-12p40バリアントはイタリック体である。 MOEにおけるQuaSARパッケージを使用して少なくとも103のASAスコア(水分子の1.4Åの半径および各原子の多面体表示を使用して計算される水接触可能表面積)を有すると特定される(IL-12p35成熟形態配列に基づく)IL-12p35上のアスパラギン酸、グルタミン酸、アスパラギン、およびグルタミン残基を示す。 図23A~23Cは、IL-12受容体についてのIL-12ヘテロ二量体複合体の親和性を低減および/または推定グリコシル化部位を除去する目的で設計された例示的なIL-12p35バリアントについての配列を示す。修飾されたアミノ酸は、下線が引かれ、太字である。 図24A~24Dは、Fc融合パートナーを有する例示的なIL-12p35バリアントについてのアミノ酸配列を示す。ドメインリンカーは二重下線が引かれ、IL-12p35バリアントはイタリック体である。 図25A~25Qは、IL-12受容体についてのIL-12-Fc複合体の親和性を低減または推定グリコシル化部位を除去する目的で設計された例示的なバリアントIL-12-Fc融合体についての配列を示す。リンカーは、二重下線が付され(当業者によって理解されるように、リンカーは、そのいくつかが図6に示される、他のリンカーによって置き換えることができるが)、スラッシュ(/)は、IL-12p35、IL-12p40、リンカー、およびFc領域の間の境界(複数可)を示す。 図26A~26Bは、親和性および有効性を低減する目的で操作されたIL-12p40バリアントを含むIL-12-Fc融合体との活性化PBMCのインキュベーション後のA)CD4CD45RACD25T細胞およびB)CD8CD45RACD25T細胞に対するSTAT4リン酸化を示す。 図27A~27Bは、親和性および有効性を低減する目的で操作されたIL-12p35バリアントを含むIL-12-Fc融合体との活性化PBMCのインキュベーション後のA)CD4CD45RACD25T細胞およびB)CD8CD45RACD25T細胞に対するSTAT4リン酸化を示す。 IL-12p40またはIL-12p35バリアントを含むIL-12-Fc融合体としての(STAT4リン酸化についての)EC50およびWTIL-12-FcXENP27201と比較したEC50の減少倍率を示す。27201-1および27201-2は、XENP27201の2つの別々に生成されたバッチを表す。 図29A~29Bは、IL-12受容体についてのIL-12ヘテロ二量体複合体の親和性を低減する目的で設計された例示的なIL-12p40バリアントについての配列を示す。修飾されたアミノ酸は、下線が引かれ、太字である。 図30A~30Dは、Fc融合パートナーを有する例示的なIL-12p40バリアントについてのアミノ酸配列を示す。ドメインリンカーは二重下線が引かれ、IL-12p40バリアントはイタリック体である。 図31A~31Bは、IL-12受容体についてのIL-12ヘテロ二量体複合体の親和性を低減する目的で設計された例示的なIL-12p35バリアントについての配列を示す。修飾されたアミノ酸は、下線が引かれ、太字である。 図32A~32Cは、Fc融合パートナーを有する例示的なIL-12p35バリアントについてのアミノ酸配列を示す。ドメインリンカーは二重下線が引かれ、IL-12p35バリアントはイタリック体である。 図33A~33Pは、IL-12受容体についてのIL-12-Fc複合体の親和性を低減する目的で設計された例示的なバリアントIL-12-Fc融合体についての配列を示す。リンカーは、二重下線が付され(当業者によって理解されるように、リンカーは、そのいくつかが図6に示される、他のリンカーによって置き換えることができるが)、スラッシュ(/)は、IL-12p35、IL-12p40、リンカー、およびFc領域の間の境界(複数可)を示す。 図34Aおよび34Bは、親和性および有効性を低減する目的で操作されたIL-12p40バリアントを含むIL-12-Fc融合体との活性化PBMCのインキュベーション後のA)CD4CD45RACD25T細胞およびB)CD8CD45RACD25T細胞に対するSTAT4リン酸化を示す。 図35Aおよび35Bは、親和性および有効性を低減する目的で操作されたIL-12p40および/またはIL-12p35バリアントを含むIL-12-Fc融合体との活性化PBMCのインキュベーション後のA)CD4CD45RACD25T細胞およびB)CD8CD45RACD25T細胞に対するSTAT4リン酸化を示す。 IL-12p40および/またはIL-12p35バリアントを含むIL-12-Fc融合体の(STAT4リン酸化についての)EC50ならびにWTIL-12-FcXENP27201と比較したEC50の減少倍率を示す。データは、有効性がIL-12p40サブユニットにおけるE59K置換のみを含むIL-12-Fc融合体によって最大12倍低減したことを示す。 図37A~37Bは、IL-12受容体についてのIL-12ヘテロ二量体複合体の親和性を低減する目的で設計された例示的なIL-12p40バリアントについての配列を示す。修飾されたアミノ酸は、下線が引かれ、太字である。 IL-12受容体についてのIL-12ヘテロ二量体複合体の親和性を低減する目的で設計された例示的なIL-12p35バリアントについての配列を示す。修飾されたアミノ酸は、下線が引かれ、太字である。 図39A~39Iは、IL-12受容体についてのIL-12-Fc複合体の親和性を低減する目的で設計された例示的なバリアントIL-12-Fc融合体についての配列を示す。リンカーは、二重下線が付され(当業者によって理解されるように、リンカーは、そのいくつかが図6に示される、他のリンカーによって置き換えることができるが)、スラッシュ(/)は、IL-12p35、IL-12p40、リンカー、およびFc領域の間の境界(複数可)を示す。 図40A~40Bは、親和性および有効性を低減する目的で操作されたIl-12p40および/またはIL-12p35バリアントを含むIL-12-Fc融合体との活性化PBMCのインキュベーション後のA)CD4CD45RACD25T細胞およびB)CD8CD45RACD25T細胞に対するSTAT4リン酸化を示す。 IL-12p40および/またはIL-12p35バリアントを含むIL-12-Fc融合体の(STAT4リン酸化についての)EC50ならびにWTIL-12-FcXENP27201と比較したEC50の減少倍率を示す。データは、有効性が最大100倍低減したことを示す。 図42A~42Bは、IL-12受容体についてのIL-12ヘテロ二量体複合体の親和性を低減する目的で設計された例示的なIL-12p40バリアントについての配列を示す。修飾されたアミノ酸は、下線が引かれ、太字である。 IL-12受容体についてのIL-12ヘテロ二量体複合体の親和性を低減する目的で設計された例示的なIL-12p35バリアントについての配列を示す。修飾されたアミノ酸は、下線が引かれ、太字である。 図44A~44Kは、IL-12受容体についてのIL-12-Fc複合体の親和性を低減する目的で設計された例示的なバリアントIL-12-Fc融合体についての配列を示す。リンカーは、二重下線が付され(当業者によって理解されるように、リンカーは、そのいくつかが図6に示される、他のリンカーによって置き換えることができるが)、スラッシュ(/)は、IL-12p35、IL-12p40、リンカー、およびFc領域の間の境界(複数可)を示す。 図45A~45Cは、IL-12受容体についてのIL-12-Fc融合体の親和性を低減する目的で設計され、半減期を延長するためにXtendFc(M428L/N434S)でさらに操作された例示的なバリアントIL-12-Fc融合体についての配列を示す。リンカーは、二重下線が付され(当業者によって理解されるように、リンカーは、そのいくつかが図6に示される、他のリンカーによって置き換えることができるが)、スラッシュ(/)は、IL-12p35、IL-12p40、リンカー、およびFc領域の間の境界(複数可)を示す。これらの配列が例示的な目的で提供され、半減期を延長するために他の図に示される配列のいずれもXtendFc(M428L/N434S)を含み得ることが留意されるべきである。 図46A~46Dは、親和性および有効性を低減する目的で操作されたIL-12p40および/またはIL-12p35バリアントを含むIL-12-Fc融合体との活性化PBMCのインキュベーション後のA)CD4CD45RACD25T細胞、B)CD4CD45RACD25T細胞、C)CD8CD45RACD25T細胞、およびD)CD8CD45RACD25T細胞に対するSTAT4リン酸化を示す。 IL-12p40および/またはIL-12p35バリアントを含むIL-12-Fc融合体の(STAT4リン酸化についての)EC50ならびにWTIL-12-FcXENP27201と比較したEC50の減少倍率を示す。 図48A~48Dは、本発明の二価IL-12-Fc融合タンパク質についての例示的なフォーマットを示す。二価N末端単鎖(図48A~B)フォーマットは、各々が、(任意にドメインリンカーを介して)ホモ二量体Fc鎖のN末端に融合したscIL-12複合体組換え体を含む、2つの同一の単量体を含む。二価C末端単鎖(図48C~D)フォーマットは、各々が、(任意にドメインリンカーを介して)ホモ二量体Fc鎖のC末端に融合したscIL-12複合体組換え体を含む、2つの同一の単量体を含む。scIL-12複合体は、任意にドメインリンカーで、IL-12p40にN末端結合したIL-12p35またはIL-12p35にN末端結合したIL-12p40のいずれかを含むことができる。scIL-12複合体における2つのサブユニットの順序は、以下のように指定され得る:IL-12p40サブユニットがIL-12p35サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p40/p35)」、またはIL-12p35がIL-12p40サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p35/p40)」。 XENP31289およびXENP31291、(scIL-12(p40/p35))-Fcフォーマットの例示的なIL-12-Fc融合タンパク質についての配列を示す。XENP31289は、野生型IL-12p40および野生型IL-12p35サブユニットを含有する。XENP31291は、IL-12p40(E59K/K99E)バリアントおよび野生型IL-12p35サブユニットを含有する。リンカーは、二重下線が付され(当業者によって理解されるように、リンカーは、そのいくつかが図6に示される、他のリンカーによって置き換えることができるが)、スラッシュ(/)は、IL-12p35、IL-12p40、リンカー、およびFc領域の間の境界(複数可)を示す。 IL-12p40(E59K/K99E)バリアントおよび野生型IL-12p35サブユニットを含有する、XENP31290、scIL-12(p40/p35)-Fcフォーマットの例示的なIL-12-Fc融合タンパク質についての配列を示す。リンカーは、二重下線が付され(当業者によって理解されるように、リンカーは、そのいくつかが図6に示される、他のリンカーによって置き換えることができるが)、スラッシュ(/)は、IL-12p35、IL-12p40、リンカー、およびFc領域の間の境界(複数可)を示す。 図51A~51Dは、WTIL-12p40サブユニットまたはバリアントIL-12p40(E59K/K99E)サブユニットのいずれかを有するscIL-12(p40/p35)-Fcおよび(scIL-12(p40/p35))-FcフォーマットのIL-12-Fc融合体との活性化PBMCのインキュベーション後のA)CD4CD45RACD25T細胞、B)CD4CD45RACD25T細胞、C)CD8CD45RACD25T細胞、およびD)CD8CD45RACD25T細胞に対するSTAT4リン酸化を示す。データは、バリアントIL-12p40(E59K/K99E)サブユニットを含むscIL-12(p40/p35)-Fcおよび(scIL-12(p40/p35))-Fc融合体におけるIL-12-Fc融合体が、WTIL-12p40サブユニットを含むIL-12-Fc融合体と比較して低減した有効性を示したことを示す。 WTIL-12p40サブユニットまたはバリアントIL-12p40(E59K/K99E)サブユニットのいずれかを有するscIL-12(p40/p35)-Fcおよび(scIL-12(p40/p35))-FcフォーマットでのIL-12-Fc融合体の(STAT4リン酸化についての)EC50を示す。 XENP16432、ニボルマブおよびE233P/L234V/L235A/G236del/S267Kアブレーションバリアントを有するIgG1バックボーンに基づく抗PD-1 mAbについての配列を示す。 図54A~54Dは、PBS、XENP16432(二価抗PD-1 mAb)、またはXENP29952(バリアントIL-12p40(E59K))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)が投与されたpp65-MCF7およびhuPBMC生着NSGマウスにおけるA)11日目、B)13日目、およびC)15日目、ならびにD)時間経過での腫瘍体積(キャリパー測定によって決定される)の変化を示す。XENP29952は、腫瘍体積の変化によって示されるように11日目までに抗腫瘍活性を有意に増強した(対応のないt検定を使用してベースライン補正データに対して実施された統計)。 図55A~55Fは、PBMC生着ならびにPBS、XENP16432(二価抗PD-1 mAb)、またはXENP29952(バリアントIL-12p40(E59K))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)の第1の用量後14日目のpp65-MCF7およびhuPBMC生着NSGマウスにおけるA)CD45細胞、B)CD3T細胞、C)CD4T細胞、D)CD8T細胞、E)NK細胞数、およびF)CD4T細胞対CD8T細胞比を示す。XENP29952は、PBS対照およびXENP16432によるチェックポイント遮断の両方と比較して、14日目までにCD45、CD3T細胞、CD4T細胞、CD8T細胞、およびNK細胞の増殖を有意に増強した(対応のないt検定を使用して対数変換データに対して実施された統計)。 図56A~56Dは、PBMC生着ならびにPBS、XENP16432(二価抗PD-1 mAb)、またはXENP29952(バリアントIL-12p40(E59K))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)の第1の用量後のpp65-MCF7およびhuPBMC生着NSGマウスにおけるA)7日目およびB)14日目の血清IFNγ濃度、ならびにC)7日目およびD)14日目の血清CD25濃度を示す。XENP29952は、XENP16432によるチェックポイント遮断と比較して、7日目までにIFNγおよびCD25の分泌を有意に増強した(対応のないt検定を使用して対数変換データに対して実施された統計)。 図57A~57Iは、PBSまたはXENP29952(バリアントIL-12p40(E59K))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP30597(バリアントIL-12p40(E59K/K99E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP31254(バリアントIL-12p40(D18K/E59K/K99E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP31251(バリアントIL-12p40(E59K/K99Y))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、もしくはXENP31258(バリアントIL-12p40(E59K/K99E/K264E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)が0.3または0.03mg/kgで投与されたhuPBMC生着NSGマウスにおけるA)3日目、B)6日目、C)10日目、D)13日目、E)17日目、F)20日目、G)24日目、およびH)27日目まで、ならびにI)時間経過での体重の変化(GVHDの指標として)を示す。特に、IL-12-Fc融合試験品は、それらのインビトロ有効性と相関する変動する程度のGVHDを誘導した。加えて、データは、試験品についての用量応答(すなわち、0.3mg/kg対0.03mg/kgによって増強されたGVHD)を示す。 図58A~58Cは、PBMC生着およびPBSまたはXENP29952(バリアントIL-12p40(E59K))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP30597(バリアントIL-12p40(E59K/K99E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP31254(バリアントIL-12p40(D18K/E59K/K99E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP31251(バリアントIL-12p40(E59K/K99Y))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、もしくはXENP31258(バリアントIL-12p40(E59K/K99E/K264E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)の0.3または0.03mg/kgでの第1の用量後のA)7日目、B)10日目、およびC)14日目のhuPBMC生着NSGマウスにおけるCD8T細胞上でのPD-1発現を(活性化の指標として)示す。特に、IL-12-Fc融合試験品は、それらのインビトロ有効性と相関する変動する程度のCD8T細胞活性化を誘導した。加えて、データは、試験品についての用量応答(すなわち、0.3mg/kg対0.03mg/kgによって増強されたCD8T細胞活性化)を示す。 図59A~59Cは、PBMC生着およびPBSまたはXENP29952(バリアントIL-12p40(E59K))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP30597(バリアントIL-12p40(E59K/K99E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP31254(バリアントIL-12p40(D18K/E59K/K99E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP31251(バリアントIL-12p40(E59K/K99Y))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、もしくはXENP31258(バリアントIL-12p40(E59K/K99E/K264E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)の0.3または0.03mg/kgでの第1の用量後のA)7日目、B)10日目、およびC)14日目のhuPBMC生着NSGマウスにおけるCD4T細胞上でのPD-1発現を(活性化の指標として)示す。特に、IL-12-Fc融合試験品は、それらのインビトロ有効性と相関する変動する程度のCD4T細胞活性化を誘導した。加えて、データは、試験品についての用量応答(すなわち、0.3mg/kg対0.03mg/kgによって増強されたCD4T細胞活性化)を示す。 図60A~60Dは、PBMC生着およびPBSまたはXENP29952(バリアントIL-12p40(E59K))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP30597(バリアントIL-12p40(E59K/K99E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP31254(バリアントIL-12p40(D18K/E59K/K99E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP31251(バリアントIL-12p40(E59K/K99Y))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、もしくはXENP31258(バリアントIL-12p40(E59K/K99E/K264E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)の0.3または0.03mg/kgでの第1の用量後のA)7、B)10、C)14、およびD)31日目のhuPBMC生着NSGマウスにおけるIFNγの血清濃度を示す。特に、IL-12-Fc融合試験品は、それらのインビトロ有効性と相関する変動するレベルのIFNγ分泌を誘導した。加えて、データは、試験品についての用量応答(すなわち、0.3mg/kg対0.03mg/kgによって誘導される増強されたIFNγ分泌)を示す。 図61A~61Kは、組換えヒトIL-12、XENP29952(バリアントIL-12p40(E59K))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP30597(バリアントIL-12p40(E59K/K99E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP31254(バリアントIL-12p40(D18K/E59K/K99E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP31251(バリアントIL-12p40(E59K/K99Y))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、またはXENP31258(バリアントIL-12p40(E59K/K99E/K264E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)との、活性化PBMC(第1のドナー、ドナー1由来)のインキュベーション後のA)CD4CD45RACD25T細胞、B)CD4CD45RACD25T細胞、C)CD4CD45RACD25-T細胞、D)CD4CD45RACD25T細胞、E)CD8CD45RACD25T細胞、F)CD8CD45RACD25T細胞、G)CD8CD45RACD25T細胞、H)CD8CD45RACD25T細胞、I)Treg、J)γδT細胞、およびK)CD56NK細胞に対するSTAT4リン酸化を示す。データは有効性ラダーを示し、XENP29952は最も有効なバリアントであり、XENP31254およびXENP31258は最も有効でないバリアントであり、XENP30597およびXENP31251はその間に入る。特に、低減有効性IL-12-Fc融合バリアントによってインビボで誘導されるGVHDおよびT細胞活性化の程度は、インビトロ有効性と相関した。 図62A~62Dは、PBS、XENP16432(二価抗PD-1 mAb)、XENP31258、XENP31251、またはXENP31251およびXENP16432の組み合わせが投与されたpp65-MCF7およびhuPBMC生着NSGマウスにおけるA)14日目、B)16日目、およびC)21日目、ならびにD)時間経過での腫瘍体積(キャリパー測定によって決定される)の変化を示す。XENP31258は、14日目までに抗腫瘍活性を有意に増強した。XENP31251(単独またはXENP16432との組み合わせ)は、PBSでの処理と比較して、16日目までに抗腫瘍活性を有意に増強し、XENP16432と組み合わせたXENP31251は、XENP16432単独での処理と比較して、21日目までに抗腫瘍活性を有意に増強した(マン-ホイットニー検定を使用してベースライン補正データに対して実施された統計)。 図63A~63Fは、PBMC生着ならびにPBS、XENP16432(二価抗PD-1 mAb)、XENP31258、XENP31251、またはXENP31251およびXENP16432の組み合わせの第1の用量後14日目のpp65-MCF7およびhuPBMC生着NSGマウスにおけるA)CD45細胞、B)CD3T細胞、C)CD4T細胞、D)CD8T細胞、E)NK細胞数、およびF)CD8T細胞対CD4T細胞比を示す。特に、データは、XENP16432と組み合わせたXENP31251での治療が、XENP31251またはXENP16432のいずれか単独と比較してリンパ球増殖を有意に増強し、IL-12-Fc融合体が、チェックポイント遮断と生産的に組み合わせることを示した。 図64A~64Cは、IL-12受容体についてのIL-12-Fc融合体の親和性を低減する目的で設計され、半減期を延長するためにXtendFc(M428L/N434S)でさらに操作された例示的なバリアントIL-12-Fc融合体についての配列を示す。リンカーは、二重下線が付され(当業者によって理解されるように、リンカーは、そのいくつかが図6に示される、他のリンカーによって置き換えることができるが)、スラッシュ(/)は、Il-12p35、IL-12p40、リンカー、およびFc領域の間の境界(複数可)を示す。これらの配列が例示的な目的で提供され、半減期を延長するために他の図に示される配列のいずれもXtendFc(M428L/N434S)を含み得ることが留意されるべきである。 図65A~65Cは、(発現および親和性/有効性バリアントに加えて)遊離システインを除去する目的でC252Sで操作された例示的なIL-12p40バリアントについての配列を示す。 図66A~66Qは、(発現および親和性/有効性バリアントに加えて)遊離システインを除去する目的でIL-12p40サブユニットにおいてC252Sで操作された例示的なバリアントIL-12-Fc融合体についての配列を示す。リンカーは、二重下線が付され(当業者によって理解されるように、リンカーは、そのいくつかが図6に示される、他のリンカーによって置き換えることができるが)、スラッシュ(/)は、IL-12p35、IL-12p40、リンカー、およびFc領域の間の境界(複数可)を示す。 図67A~67Dは、遊離システインを除去する追加の操作ありまたはなしでのIL-12p40バリアントを含むIL-12-Fcとの活性化PBMCのインキュベーション後のA)CD8CD45RACD25T細胞、B)CD8CD45RACD25T、C)CD4CD45RACD25T、D)CD4CD45RACD25T、およびE)NK細胞に対するSTAT4リン酸化を示す。データは、IL-12p40サブユニットにおけるC252Sを含むバリアントのほとんどが、C252S修飾を含まないバリアントと比較して、わずかに改善されたが、類似の有効性を示したことを示す。
I.概要
本発明は、IL-12サブユニットおよびFcドメインを含有する新規ヘテロ二量体融合タンパク質構築物に関する。上記のように、IL-12は、生物学的に活性なIL-12ヘテロ二量体を形成するように共有結合されたα鎖(p35サブユニット、IL-12p35)およびβ鎖(p40サブユニット、IL-12p40)からなる。IL-12は、T細胞上のIL-12受容体β1(IL-12Rβ1)およびIL-12受容体β2(IL-12Rβ2)からなる二量体IL-12受容体複合体に結合し、IFNγ分泌を誘導することによる結合を通してその細胞シグナル伝達機能を発揮する。しかしながら、IL-12p40サブユニットは、IL-12受容体への結合について競合することによってIL-12活性をアンタゴナイズすることが報告されているホモ二量体としても存在することができる。したがって、本発明は、IL-12-Fc融合タンパク質、および低下した有効性を有する新規IL-12バリアントを提供することによってIL-12の短い半減期、および拮抗的なIL12p40ホモ二量体の潜在的な形成に対処する。図8に一般的に示されるように、本発明のヘテロ二量体融合タンパク質は、様々な構造をとることができる。
本出願は、参照により、2018年10月3日に出願された62/740、813および2019年5月15日に出願された62/828、512、より具体的には62/740、813の図17ならびに62/828、512の図62A~62Kおよび図63A~63D、ならびに図凡例、および対応する明細書におけるこれらの図の言及を組みこむ。
II.定義
本出願をより完全に理解できるようにするため、いくつかの定義を以下に示す。そのような定義は、文法的同等物を包含することを意図する。
本明細書において「アブレーション」とは、結合および/または活性の低下または除去を意味する。したがって、例えば、「FcγR結合をアブレートする」とは、Fc領域アミノ酸バリアントが、その特定のバリアントを含まないFc領域と比較して50%未満の開始結合を有することを意味し、70~80~90~95~98%未満の結合喪失が好ましく、一般に、結合はBiacoreアッセイにおいて検出可能な結合のレベル未満である。FcγR結合のアブレーションにおいて特に有用なものは、図4に示すものである。しかしながら、他の記載がない限り、本発明のFc単量体はFcRnへの結合を保持する。
本明細書で使用される「ADCC」または「抗体依存性細胞媒介性細胞傷害」とは、FcγRを発現する非特異的細胞傷害性細胞が標的細胞上の結合抗体を認識し、続いて標的細胞の溶解を引き起こす細胞媒介反応を意味する。ADCCは、FcγRIIIaへの結合と相関し、FcγRIIIaへの結合の増加はADCC活性の増加をもたらす。本明細書で議論されるように、本発明の多くの実施形態はADCC活性を完全にアブレートする。
本明細書における「修飾」とは、ポリペプチド配列におけるアミノ酸の置換、挿入、および/もしくは欠失、またはタンパク質に化学的に結合された部分への変更を意味する。例えば、修飾は、タンパク質に結合した変更された炭水化物またはPEG構造であってもよい。本明細書における「アミノ酸修飾」は、ポリペプチド配列中のアミノ酸の置換、挿入、および/または欠失を意味する。明確にするために、別段の記載がない限り、アミノ酸修飾は常に、DNAによってコードされるアミノ酸、例えば、DNAおよびRNA中にコドンを有する20個のアミノ酸に対するものである。
本明細書における「アミノ酸置換」または「置換」は、親ポリペプチド配列中の特定の位置のアミノ酸を異なるアミノ酸で置き換えることを意味する。特に、いくつかの実施形態では、置換は、特定の位置で天然に存在しない(生物内で天然に存在しないか、またはいずれの生物中にも存在しないかのいずれか)アミノ酸に対するものである。例えば、置換E272Yまたは272Yは、位置272のグルタミン酸がチロシンで置き換えられている、バリアントポリペプチド、この場合ではFcバリアントを指す。明確にするために、核酸コード配列を変化させるが、出発アミノ酸を変化させない(例えば、宿主生物発現レベルを上昇させるためにCGG(アルギニンをコードする)をCGA(アルギニンをなおコードする)に交換する)ように操作されたタンパク質は、「アミノ酸置換」ではない。すなわち、同じタンパク質をコードする新たな遺伝子の創出にもかかわらず、タンパク質は、それが開始する特定の位置に同じアミノ酸を有する場合、それはアミノ酸置換ではない。
本明細書で使用される「アミノ酸挿入」または「挿入」は、親ポリペプチド配列中の特定の位置にアミノ酸残基またはアミノ酸配列を付加することを意味する。例えば、-233Eは、位置233の後、かつ位置234の前のグルタミン酸の挿入を示す。加えて、-233ADEまたはA233ADEは、位置233の後、かつ位置234の前のAlaAspGluの挿入を示す。
本明細書で使用される「アミノ酸欠失」または「欠失」は、親ポリペプチド配列中の特定の位置でアミノ酸残基またはアミノ酸配列を除去することを意味する。例えば、E233-、またはE233#、E233()、またはE233delは、位置233のグルタミン酸の欠失を示す。加えて、EDA233-またはEDA233#は、位置233で始まる配列GluAspAlaの欠失を示す。
本明細書で使用される「バリアントタンパク質」、「タンパク質バリアント」、または「バリアント」とは、少なくとも1つの修飾によって親タンパク質のそれとは異なるタンパク質を意味する。タンパク質バリアントは、タンパク質自体、タンパク質を含む組成物、それをコードするアミノ配列、またはそれをコードするDNA配列を指し得る。好ましくは、タンパク質バリアントは、親タンパク質と比較して少なくとも1個のアミノ酸修飾、例えば、親と比較して約1~約70個のアミノ酸修飾、好ましくは約1~約5個のアミノ酸修飾を有する。修飾は、付加、欠失、または置換であり得る。以下に記載されるように、いくつかの実施形態では、親ポリペプチド、例えば、Fc親ポリペプチドは、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4由来のFc領域などのヒト野生型配列である。本明細書のタンパク質バリアント配列は、好ましくは、親タンパク質配列と少なくとも約80%の同一性、最も好ましくは少なくとも約90%の同一性、より好ましくは少なくとも約95~98~99%の同一性を有する。
本明細書で使用される場合、「タンパク質」は、タンパク質、ポリペプチド、オリゴペプチド、およびペプチドを含む、少なくとも2つの共有結合したアミノ酸を意味する。生物学的に機能的なユニットが2つ以上のタンパク質を含む場合、各タンパク質は、「単量体」または「サブユニット」または「ドメイン」と称されてもよく、生物学的に機能的な分子は、「複合体」と称されてもよい。
本明細書で使用される場合、「タンパク質」は、タンパク質、ポリペプチド、オリゴペプチド、およびペプチドを含む、少なくとも2つの共有結合したアミノ酸を意味する。生物学的に機能的な分子または複合体が2つ以上のタンパク質を含む場合、各タンパク質は、「単量体」または「サブユニット」または「ドメイン」と称されてもよく、生物学的に機能的な分子は、「複合体」と称されてもよい。いくつかの実施形態では、機能的な複合体の2つ以上のタンパク質は、非共有結合される。いくつかの実施形態では、「単量体」という用語は、タンパク質(複数可)の1つ以上の成分、断片、またはサブユニットを含むポリペプチドまたはタンパク質を指し、成分、断片、またはサブユニットは、共有結合される。
「残基」とは、本明細書で使用されるとき、タンパク質における位置およびその関連するアミノ酸同一性を意味する。例えば、アスパラギン297(Asn297またはN297とも称される)は、ヒト抗体IgG1中の位置297の残基である。
本明細書で使用される「IgGサブクラス修飾」または「アイソタイプ修飾」とは、1つのIgGアイソタイプの1つのアミノ酸を、異なる、整合したIgGアイソタイプの対応するアミノ酸に変換するアミノ酸修飾を意味する。例えば、IgG1はチロシンおよびIgG2を含むので、EU位置296のフェニルアラニン、IgG2におけるF296Y置換は、IgGサブクラス修飾とみなされる。
各IgG鎖のカルボキシ末端部分は、エフェクター機能に主に関与する定常領域を定義する。Kabatらは、重鎖および軽鎖の可変領域の多数の一次配列を収集した。配列の保存の程度に基づき、Kabatらは、個々の一次配列をCDRおよびフレームワークに分類し、そのリストを作成した(参照により全体が組み込まれる、SEQUENCES OF IMMUNOLOGICAL INTEREST、5th edition、NIH publication、No.91-3242,E.A.Kabat et al.を参照されたい)。本明細書全体を通して、Kabat付番系は、一般に、可変ドメインにおける残基(およそ、軽鎖可変領域の残基1~107および重鎖可変領域の残基1~113)、EU付番系は、Fc領域(例えば、Kabat et al.、前掲(1991))を参照するときに使用される。
免疫グロブリンのIgGサブクラスには、重鎖においていくつかの免疫グロブリンドメインがある。本明細書の「免疫グロブリン(Ig)ドメイン」とは、明確に異なる三次構造を有する免疫グロブリンの領域を意味する。定常重(CH)ドメインおよびヒンジドメインを含む重鎖ドメインが本発明における関心対象である。IgG抗体の関連において、IgGアイソタイプは、それぞれ3つのCH領域を有する。したがって、IgGとの関連における「CH」ドメインは以下のとおりである。「CH1」は、KabatにあるようなEU指数による位置118~215を指す。「ヒンジ」とは、Kabatにあるような、EU指数による位置216~230を指す。「CH2」は、KabatにあるようなEU指数による位置231~340を指し、「CH3」は、KabatにあるようなEU指数による位置341~447を指す。表1に示すように、重鎖ドメインの正確な付番および配置は、異なる付番システムで異なり得る。本明細書に示され、以下に記載されるように、pIバリアントは、以下に考察されるヒンジ領域と同様に1つまたは複数のCH領域にあり得る。
重鎖のIgドメインの別の種類は、ヒンジ領域である。本明細書において「ヒンジ」または「ヒンジ領域」または「抗体ヒンジ領域」または「免疫グロブリンヒンジ領域」とは、抗体の第1のおよび第2の定常ドメイン間のアミノ酸を含む可動性ポリペプチドを意味する。構造的に、IgGCH1ドメインは、EU位置215で終わり、IgGCH2ドメインは、残基EU位置231で始まる。したがって、IgGについて、抗体ヒンジは、位置216(IgG1における(E216)~230(IgG1におけるP230)を含むように本明細書で定義され、付番は、Kabatと同様にEU指数によるものである。いくつかの実施形態では、例えば、Fc領域の文脈で、ヒンジが含まれ、一般に位置216~230を指す。本明細書に記載のとおり、pIバリアントはヒンジ領域にも同様に作製することができる。
本明細書で使用される「天然に存在しない修飾」とは、アイソタイプ性ではないアミノ酸修飾を意味する。例えば、IgGのうちのいずれも位置434にセリンを含まないので、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4(またはそれらのハイブリッド)における置換434Sは、非自然発生修飾とみなされる。
本明細書で使用される「アミノ酸」および「アミノ酸同一性」は、DNAおよびRNAによってコードされている20種の天然に存在するアミノ酸のうちの1つを意味する。
本明細書で使用される「エフェクター機能」とは、抗体Fc領域とFc受容体またはリガンドとの相互作用から生じる生化学的事象を意味する。エフェクター機能には、ADCC、ADCP、およびCDCが含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される「IgG Fcリガンド」または「Fcリガンド」とは、IgG抗体のFc領域に結合してFc/Fcリガンド複合体を形成する任意の生物由来の分子、好ましくはポリペプチドを意味する。Fcリガンドには、FcγRI、FcγRII、FcγRIII、FcRn、C1q、C3、マンナン結合レクチン、マンノース受容体、staphylococcalタンパク質A、streptococcalタンパク質G、およびウイルスFcγRが含まれるが、これらに限定されない。Fcリガンドにはまた、FcγRと相同なFc受容体のファミリーである、Fc受容体相同体(FcRH)が含まれる(Davis et al.、2002、Immunological Reviews 190:123-136(参照により全体が組み込まれる))。Fcリガンドは、Fcに結合する未発見の分子を含み得る。特定のIgG Fcリガンドは、FcRnおよびFcガンマ受容体である。
本明細書で使用される「Fcガンマ受容体」、「FcγR」、または「FcガンマR」とは、IgG抗体Fc領域に結合し、かつFcγR遺伝子によってコードされるタンパク質ファミリーの任意のメンバーを意味する。ヒトでは、このファミリーには、アイソフォームFcγRIa、FcγRIb、およびFcγRIcを含む、FcγRI(CD64)、アイソフォームFcγRIIa(アロタイプH131およびR131を含む)、FcγRIIb(FcγRIIb-1およびFcγRIIb-2を含む)、およびFcγRIIcを含む、FcγRII(CD32)、ならびにアイソフォームFcγRIIIa(アロタイプV158およびF158を含む)およびFcγRIIIb(アロタイプFcγRIIb-NA1およびFcγRIIb-NA2を含む)を含む、FcγRIII(CD16)(参照により全体が組み込まれる、Jefferis et al.、2002、Immunol Lett 82:57-65)、ならびに任意の発見されていないヒトFcγRまたはFcγRアイソフォームまたはアロタイプが含まれるが、これらに限定されない。FcγRは、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、およびサルを含むが、これらに限定されない任意の生物由来であり得る。マウスFcγRには、FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)、FcγRIII-(CD16)、およびFcγRIII-2(CD16-2)、ならびに任意の発見されていないマウスFcγRまたはFcγRアイソフォームまたはアロタイプが含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される「FcRn」または「新生児Fc受容体」とは、IgG抗体のFc領域に結合し、少なくとも部分的にFcRn遺伝子によってコードされるタンパク質を意味する。FcRnは、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、およびサルを含むが、これらに限定されない任意の生物由来であり得る。当技術分野で既知のとおり、機能性FcRnタンパク質は、しばしば重鎖および軽鎖と称される2つのポリペプチドを含む。軽鎖はβ-2-ミクログロブリン(β2-ミクログロブリン)であり、重鎖はFcRn遺伝子によってコードされる。本明細書において別段の記載がない限り、FcRnまたはFcRnタンパク質は、FcRn重鎖とβ2-ミクログロブリンとの複合体を指す。様々なFcバリアントを使用して、FcRnへの結合を増加させ、いくつかの場合では、血清半減期を増加させることができる。一般に、別段の記載がない限り、本発明のFc単量体は、FcRnへの結合を保持する(および下記のように、FcRnへの結合を増加させるためのアミノ酸バリアントを含み得る)。
本明細書で使用される「親ポリペプチド」とは、バリアントを生成するようにその後修飾される出発ポリペプチドを意味する。親ポリペプチドは、天然に存在するポリペプチド、または天然に存在するポリペプチドのバリアントもしくは操作されたバージョンであってもよい。親ポリペプチドとは、ポリペプチド自体、親ポリペプチドを含む組成物、またはそれをコードするアミノ酸配列を指し得る。
本明細書で使用される「Fc」または「Fc領域」または「Fcドメイン」とは、いくつかの場合では、第1の定常領域免疫グロブリンドメイン(例えば、CH1)の全部またはその一部を除き、いくつかの例では、任意にヒンジの全部または一部を含む、ポリペプチドを意味する。IgGについて、Fcドメインは、免疫グロブリンドメインCH2およびCH3(Cγ2およびCγ3)、ならびに任意にCH1(Cγ1)とCH2(Cγ2)との間のヒンジ領域の全部または一部を含む。したがって、いくつかの場合では、Fcドメインは、N末端からC末端へ、CH2-CH3およびヒンジ-CH2-CH3を含む。いくつかの実施形態では、Fcドメインは、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4に由来するものであり、IgG1ヒンジ-CH2-CH3およびIgG4ヒンジ-CH2-CH3は、多くの実施形態で特定の用途を見出す。加えて、ヒトIgG1Fcドメインの場合では、頻繁にヒンジはC220Sアミノ酸置換を含む。さらに、ヒトIgG4Fcドメインの場合では、頻繁にヒンジはS228Pアミノ酸置換を含む。Fc領域の境界は異なり得るが、ヒトIgG重鎖Fc領域は、通常、そのカルボキシ末端に残基E216、C226、またはA231を含むと定義され、付番は、KabatにあるようなEU指数によるものである。いくつかの実施形態では、以下でより詳細に説明されるように、例えば、1つ以上のFcγRまたはFcRnへの結合を変更させるために、Fc領域に対してアミノ酸修飾が行われる。
当業者には理解されるように、重定常領域ドメインの正確な付番および配置は、異なる付番システムで異なり得る。EUおよびKabatによる重定常領域の付番の有用な比較は以下のとおり、Edelman et al.、1969、Proc Natl Acad Sci USA 63:78-85、およびKabat et al.、1991、Sequences of Proteins of Immunological Interest、5th Ed.、United States Public Health Service、National Institutes of Health、Bethesda(参照によりその全体が組み込まれる)を参照されたい。
Figure 2022503959000002
本明細書で使用される「Fcバリアント」または「バリアントFc」とは、Fcドメインにアミノ酸修飾を含むタンパク質を意味する。修飾は、付加、欠失、または置換であり得る。本発明のFcバリアントは、それらを構成するアミノ酸修飾に従って定義される。したがって、例えば、N434Sまたは434Sは、親Fcポリペプチドに対して位置434でセリンの置換を有するFcバリアントであり、付番は、EU指数によるものである。同様に、M428L/N434Sは、親Fcポリペプチドに対して置換M428LおよびN434Sを有するFcバリアントを定義する。WTアミノ酸の同一性は特定されていなくてもよく、その場合、前述のバリアントは428L/434Sと称される。置換が提供される順序は任意であり、すなわち、例えば、428L/434Sは434S/428Lと同じFcバリアントなどであることが留意される。抗体に関連する本発明において議論される全ての位置について、特に明記しない限り、アミノ酸位置の付番はEU指数によるものである。EU指数、またはKabatもしくはEU付番スキームと同様のEU指数は、EU抗体の付番を指す(Edelman et al.、1969、Proc Natl Acad Sci USA 63:78-85、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。修飾は、付加、欠失、または置換であり得る。
本明細書で使用される「融合タンパク質」とは、少なくとも2つのタンパク質またはタンパク質ドメインの共有結合を意味する。融合タンパク質は、人工配列、例えば、本明細書に記載されるドメインリンカー、バリアントFcドメイン、バリアントIL-12p40サブユニットドメイン、バリアントIL-12p35サブユニットドメインなどを含み得る。本明細書における「Fc融合タンパク質」または「イムノアドヘシン」とは、(任意に本明細書に記載されるようにドメインリンカーを通して)一般に1つ以上の異なるタンパク質に結合した、Fc領域を含むタンパク質を意味する。したがって、「IL-12Fc融合体」は、本明細書に記載されるように、(任意であるが通常はドメインリンカーを通して)IL-12p40サブユニット、IL12p35サブユニット、および/または単鎖IL-12複合体(scIL-12)に結合したFc領域を含む。いくつかの例では、2つのFc融合タンパク質は、ホモ二量体Fc融合タンパク質またはヘテロ二量体Fc融合タンパク質を形成することができ、いくつかの場合では後者が好ましい。いくつかの場合では、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質の一方の単量体は、Fcドメイン単独(例えば、「空Fcドメイン」)を含み、他方の単量体は、本明細書に概説されるように、バリアントFcドメインおよび1つまたは2つのIL-12サブユニットドメインを含むFc融合体である。
本明細書で使用される「位置」は、タンパク質の配列中の場所を意味する。位置は、順番に付番されるか、または確立されたフォーマット、例えば、抗体付番のためのEU指数によって付番されてもよい。
本明細書における本発明のヘテロ二量体タンパク質の単量体の文脈における「鎖性(strandedness)」は、「整合」する二本鎖DNAと同様に、「整合」してヘテロ二量体を形成する能力を保持、創出、および/または増強するようにヘテロ二量体化バリアントを各単量体に組み込むことを意味する。例えば、いくつかのpIバリアントが単量体Aへと操作される(例えば、pIをより高くする)場合、同様に利用され得る「電荷対」である立体バリアントは、pIバリアントに干渉せず、例えば、pIを高くした電荷バリアントは、同じ「鎖」または「単量体」上に置かれ、両方の機能を保持する。同様に、以下により詳細に概説されるように、対のセットになる「スキュー」バリアントについて、当業者は、対の1つのセットを組み入れる鎖または単量体がどちらに入るかを決定する際にpIを考慮し、同様にスキューのpIを使用してpI分離を最大化するようにする。
本明細書における「野生型またはWT」とは、対立遺伝子変異を含む、天然に見出されるアミノ酸配列またはヌクレオチド配列を意味する。WTタンパク質は、意図的に修飾されていないアミノ酸配列またはヌクレオチド配列を有する。
本発明のヘテロ二量体タンパク質は一般に、単離されているか、または組換え体である。本明細書に開示される様々なポリペプチドを説明するために使用される場合、「単離された」とは、それが発現された細胞または細胞培養物から特定および分離および/または回収されたポリペプチドを意味する。通常、単離されたポリペプチドは、少なくとも1つの精製ステップによって調製される。「単離されたタンパク質」とは、宿主細胞タンパク質などの細胞培養由来の他のタンパク質を実質的に含まないタンパク質を指す。「組換え体」は、外来性宿主細胞において組換え核酸技法を使用してタンパク質が生成されることを意味する。
タンパク質配列に関する「アミノ酸配列同一性パーセント(%)」は、最大の配列同一性パーセントを達成するために配列を整合し、必要ならギャップを導入した後の、特定の(親)配列中のアミノ酸残基と同一である候補配列中のアミノ酸残基のパーセンテージとして定義され、そして配列同一性の一部としていかなる保存的置換も考慮しない。アミノ酸配列同一性パーセントを決定するためのアラインメントは、例えば、BLAST、BLAST-2、ALIGN、またはMegalign(DNASTAR)ソフトウェアなどの公的に利用可能なコンピューターソフトウェアを使用して、当技術分野の範囲内である様々な方法で達成できる。当業者は、比較される配列の全長にわたって最大の整合を達成するために必要とされる任意のアルゴリズムを含む、整合を測定するための適切なパラメータを決定することができる。1つの特定のプログラムは、参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願公開第2016/0244525号の段落[0279]~[0280]に概説されているALIGN-2プログラムである。
本発明のアミノ酸配列(「本発明の配列」)と親アミノ酸配列との間の同一性の程度は、「本発明の配列」の長さまたは親配列の長さのうちの短い方で割った、2つの配列の整合における正確な一致の数として計算される。結果は同一性パーセントで表される。
いくつかの実施形態では、2つ以上のアミノ酸配列は少なくとも50%、60%、70%、80%、または90%同一である。いくつかの実施形態では、2つ以上のアミノ酸配列は少なくとも95%、97%、98%、99%、さらには100%まで同一である。
本明細書における「IL-12p40サブユニットドメイン」とは、β鎖(p40サブユニット、IL-12p40)を意味する。本明細書で議論されるように、IL-12p40サブユニットドメインは、以下でより完全に議論されるように、野生型ヒト配列(例えば、図1からの配列番号XX)またはそのバリアントであり得る(例えば、図20、23、および29を参照されたい)。
本明細書における「IL-12p35サブユニットドメイン」とは、α鎖(p35サブユニット、IL-12p35)を意味する。本明細書で議論されるように、IL-12p35サブユニットドメインは、以下でより完全に議論されるように、野生型ヒト配列(例えば、図1からの配列番号XX)またはそのバリアントであり得る(例えば、図20、23、および29を参照されたい)。
本発明のIL-12サブユニットドメインは、一緒に会合されると、IL-12受容体β1およびIL-12受容体β2を含む二量体IL-12受容体複合体に特異的に結合する。特異的結合の強度または親和性は、相互作用の解離定数(K)として表すことができ、Kが小さいほどより大きな親和性を表し、Kが大きいほどより低い親和性を表す。結合特性は、BiacoreおよびOctet方法論を含む、生体層干渉法および表面プラズモン共鳴に基づく方法などの当該技術分野で周知の方法によって決定することができる。そのような方法の1つは、抗原結合部位/抗原または受容体/リガンド複合体の会合速度および解離速度を測定することを伴い、速度は、複合パートナーの濃度、相互作用の親和性、および両方向の速度に等しく影響を与える幾何学的パラメータに依存する。したがって、会合速度(k)および解離速度(k)の両方を決定することができ、k/kの比は、解離定数Kに等しく(Nature 361:186-187((1993)およびDavies et al.(1990)Annual Rev Biochem 59:439-473を参照されたい)、その両方は、その中の方法について参照によりそれらの全体が組み込まれる。
特定の分子に特異的な結合は、例えば、少なくとも約10-4M、少なくとも約10-5M、少なくとも約10-6M、少なくとも約10-7M、少なくとも約108M、少なくとも約10-9M、あるいは少なくとも約10-10M、少なくとも約10-11M、少なくとも約10-12M、またはそれ以上のリガンド(この場合では、一般的には受容体)についてのKを有する分子によって示すことができる。典型的には、その受容体に特異的に結合する分子は、受容体と比べて、対照分子について20倍、50倍、100倍、500倍、1000倍、5、000倍、10、000倍以上大きいKを有するであろう。
また、特定の分子への特異的結合は、例えば、対照と比べて受容体について少なくとも20倍、50倍、100倍、500倍、1000倍、5、000倍、10、000倍以上大きいリガンドまたは受容体についてのkまたは会合速度を有する分子によって示すことができる。
「融合」または「共有結合」とは、成分(例えば、IL-12サブユニットおよびFcドメイン)が、直接または、本明細書で概説される、ドメインリンカーを介して間接のいずれかで、ペプチド結合によって結合されることを意味する。
本明細書で使用される場合、「単鎖」という用語は、ペプチド結合によって線形に結合したアミノ酸ドメインを含む分子を指す。特定の実施形態では、生物学的に機能的なIL-12は、単鎖IL-12複合体または「scIL-12」であり、すなわち、IL-12p35サブユニットおよびIL-12p40サブユニットは、融合して単一ペプチド鎖を形成する。特定のそのような実施形態では、IL-12p35サブユニットのC末端は、IL-12p40サブユニット、指定された「scIL-12(p35/p40)」のN末端に接続される。別の特定のそのような実施形態では、IL-12p40サブユニットのC末端は、IL-12p35サブユニット、指定された「scIL-12(p40/p35)」のN末端に接続される。加えて、これらの複合体がFcドメインにさらに融合される場合、それらは依然として「単鎖」である。p35およびp40サブユニットが同じアミノ酸鎖上にある、これらの単鎖構築物は、依然として2つのアミノ酸鎖(例えば、図8Cおよび8Dに示されるように、scIL-12(p35/p40)成分および「空アーム」Fc成分)を含有するヘテロ二量体複合体の一部であることが留意されるべきである。すなわち、ヘテロ二量体複合体を構成する2つの単鎖がある。
本発明の融合タンパク質は、図8に示されるものなどのヘテロ二量体フォーマット、ならびに図14および図48に示されるものなどのホモ二量体フォーマットを含む、様々なフォーマットをとることができる。
III.ヘテロ二量体Fc融合タンパク質
いくつかの態様では、本発明は、一般に(任意にドメインリンカーを通して)1つ以上の異なるIL-12タンパク質ドメインに結合した、Fc領域を含むヘテロ二量体Fc融合タンパク質に関する。これらのヘテロ二量体融合タンパク質は、図8に一般的に示されるように、多数の異なるフォーマットをとることができる。一態様では、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、IL-12Rβ1/β2のIL-12受容体複合体に結合するように一緒に示すIL-12p40およびIL-12p35サブユニットを異なる配向で含むIL-12ヘテロ二量体Fc融合タンパク質である。Fcドメインは、IgG Fcドメイン、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4Fcドメインに由来することができ、IgG1およびIgG4Fcドメインは、本発明において特定の用途を見出す。本明細書に記載されるように、IgG1Fcドメインは、エフェクター機能をアブレートするために、常にではないが、多くの場合、アブレーションバリアントと組み合わせて使用され得る。同様に、低いエフェクター機能が望ましい場合、IgG4Fcドメインが使用され得る。
本明細書中に記載され、当技術分野において既知のとおり、本発明のヘテロ二量体タンパク質は異なるドメインを含み、これもまた重複し得る。これらのドメインは、これらに限定されないが、Fcドメイン、CH2ドメイン、CH3ドメインおよびヒンジドメイン、IL-12p40サブユニットドメインおよびIl-12p35サブユニットドメインを含む。本明細書に記載されるように、これらのドメインは、図8に一般的に概説されるように、異なるフォーマットで一緒に結合される。
本明細書の実施形態のいくつかでは、タンパク質断片、例えば、IL-12p40またはIL-12p35が、Fcドメインに結合される場合、それはFcドメインのヒンジの全部または一部に結合しているタンパク質断片のC末端であり、例えば、それは一般にIgG1ヒンジの始まりである配列EPKSに結合している。本明細書の実施形態の他では、タンパク質断片、例えば、IL-12p40またはIL-12p35が、Fcドメインに結合される場合、それはCH3ドメインのC末端に結合しているタンパク質断片のN末端である。
Fcドメインタンパク質の本明細書に概説される構築物および配列のいくつかでは、IL-12p40またはIL-12p35タンパク質断片のC末端は、ドメインリンカーのN末端に結合し、そのC末端は、定常FcドメインのN末端に結合している(N-IL-12p40またはIL-12p35タンパク質断片-リンカー-Fcドメイン-C)が、それは切替えることができる(N-Fcドメイン-リンカー-IL-12p40またはIL-12p35タンパク質断片-C)。本明細書に概説される他の構築物および配列では、第1のタンパク質断片のC末端は、任意にドメインリンカーを介して、第2のタンパク質断片のN末端に結合し、第2のタンパク質断片のC末端は、任意にドメインリンカーを介して、定常FcドメインのN末端に結合している。さらに別の構築物では、第1のタンパク質断片のN末端は、任意にドメインリンカーを介して、第2のタンパク質断片のC末端に結合し、第2のタンパク質断片のN末端は、任意にドメインリンカーを介して定常FcドメインのC末端に結合する。本明細書に概説されるさらに他の構築物および配列において、第1のタンパク質断片または第2のタンパク質断片に結合していない定常Fcドメインが提供される。ヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、本明細書に記載の2つ以上の例示的な単量体Fcドメインタンパク質を含有し得る。
したがって、いくつかの実施形態では、本発明は、自己組織化してヘテロ二量体Fcドメイン融合ポリペプチドを形成する、2つの異なる重鎖バリアントFc配列の使用に依存するヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。一実施形態では、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、それがpI操作などのヘテロ二量体を産生するように操作することができる少なくとも2つの定常ドメインを含有する。使用することができる他のFcドメインは、pI操作された本発明のCH1、CH2、CH3、およびヒンジドメインのうちの1つ以上を含有する断片を含む。特に、図8A~Fに示されるフォーマットは、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質であり、タンパク質が、ヘテロ二量体Fcドメインに自己組織化した2つの会合されたFc配列および少なくとも1つのタンパク質断片(例えば、1つ、2つ以上のタンパク質断片)を有することを意味する。いくつかの場合では、第1のタンパク質断片は第1のFc配列に結合し、そして第2のタンパク質断片は第2のFc配列に結合する。いくつかの場合では、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、第1のFc配列に結合している第2のタンパク質断片に結合した第1のタンパク質断片、および第1のまたは第2のタンパク質断片のいずれにも結合していない第2のFc配列を含有する。
本発明は、1つ以上の結合パートナー、リガンド、または受容体への結合を可能にするヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供するための新規構築物に関する。ヘテロ二量体Fc構築物は、抗体の重鎖の2つのFcドメイン、例えば、「二量体」に組み立てられる2つの「単量体」の自己組織化の性質に基づく。ヘテロ二量体Fc融合体は、以下でさらに詳しく説明するとおり、各単量体のアミノ酸配列を変更することによって作製される。したがって、本発明は一般に、いくつかの方法で結合相手(複数可)またはリガンド(複数可)または受容体(複数可)と共係合することができるヘテロ二量体Fc融合タンパク質の創出に関し、ヘテロ二量体形成を促進するために、および/またはホモ二量体よりもヘテロ二量体の精製を容易にするために、各鎖上で異なる定常領域におけるアミノ酸バリアントに依存する。本発明のヘテロ二量体を生成するために使用することができる多くの機構がある。加えて、当業者には理解されるように、これらの機序を組み合わせて高いヘテロ二量体化を確実にすることができる。したがって、ヘテロ二量体の産生をもたらすアミノ酸バリアントは、「ヘテロ二量体化バリアント」と称される。後述するように、ヘテロ二量体化バリアントは、ヘテロ二量体からのホモ二量体の精製を可能にする立体バリアント(例えば、後述の「ノブアンドホール」または「スキュー」バリアントおよび「電荷対」バリアント)ならびに「pIバリアント」を含み得る。その全体が参照により本明細書に組み込まれ、具体的に以下で「ヘテロ二量体化バリアント」の議論について、WO2014/145806に一般に記載されるように、ヘテロ二量体化に有用な機構は、「ノブアンドホール」(「KIH」、時に「スキュー」バリアントとして本明細書に記載される(WO2014/145806中の議論を参照されたい)、WO2014/145806に記載される「静電ステアリング」または「電荷対」、WO2014/145806に記載されるpIバリアント、ならびにWO2014/145806および以下に概説される一般的な追加のFcバリアントを含む。
本発明において、ヘテロ二量体タンパク質および抗体の精製を容易することができるいくつかの基本的な機構が存在し、その1つは、各単量体、続いて各二量体種が異なるpIを有することによって、A-A、A-B、およびB-B二量体タンパク質の等電点精製が可能になるように、pIバリアントの使用に依存する。代替的に、いくつかのフォーマットはまた、サイズに基づいて分離することも可能にする。以下にさらに概説するように、ホモ二量体よりもヘテロ二量体の形成を「スキューさせる」ことも可能である。したがって、立体的ヘテロ二量体化バリアントおよびpIバリアントまたは電荷対バリアントの組み合わせは、本発明において特に使用される。
一般に、本発明において特に使用される実施形態は、2つの単量体間および各二量体種間のpI差を増加させる、pIバリアントと組み合わせた、ホモ二量体形成に対するヘテロ二量体形成を促進するスキューバリアントを含むバリアントのセットに依存する。
加えて、以下により完全に概説されるように、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質のフォーマットに応じて、pIバリアントは単量体の定常ドメインおよび/またはFcドメイン内に含まれるか、またはドメインリンカーが使用されるかのいずれかであり得る。すなわち、本発明は、一方または両方の単量体上にあるpIバリアント、および/または荷電ドメインリンカーも提供する。加えて、代替の機能性のためのさらなるアミノ酸操作もまた、Fc、FcRn、およびKOバリアントなどのpI変化を付与し得る。
ヘテロ二量体タンパク質の精製を可能にするための分離機構としてpIを利用する本発明においては、アミノ酸変異を一方または両方の単量体のポリペプチドに導入することができ、すなわち、単量体の一方(本明細書では簡単のために「単量体A」と呼ぶ)のpIを単量体Bと異なるように操作でき、または、単量体AおよびBの両方を、単量体AのpIを増加させ、単量体BのpIを減少させるように変えることができる。議論されるように、いずれかまたは両方の単量体のpI変化は、荷電残基を除去または付加することによって(例えば中性アミノ酸を正または負に荷電したアミノ酸残基によって置き換える、例えばグルタミンからグルタミン酸)、正または負から反対の電荷への荷電残基の変更によって(例えばアスパラギン酸からリジンへ)、または荷電残基の中性残基への変更によって(例えば電荷の消失、リジンからセリン)、実施することができる。いくつかのこれらのバリアントを図に示す。
したがって、本発明のこの実施形態は、ヘテロ二量体をホモ二量体から分離することができるように、少なくとも1つの単量体に十分なpIの変化を生じさせることを提供する。当業者には理解され、かつ以下でさらに議論されるように、これは「野生型」重鎖定常領域、およびそのpIを増加または減少させる(wtA:B+またはwtA:B-)ように操作されたバリアント領域を使用することによって、または一方の領域を増加して他方の領域を減少させることによって(A+:B-またはA-:B+)、実施できる。
したがって、一般に、本発明のいくつかの実施形態の構成要素は、二量体タンパク質の単量体の両方ではないにしても少なくとも1つの等電点(pI)を、アミノ酸置換(「pIバリアント」または「pI置換」)を単量体の一方または両方に組み込むことによって変化させることを目的とする定常領域におけるアミノ酸バリアントである。本明細書中の2つのホモ二量体からのヘテロ二量体の分離は、2つの単量体のpIが0.1pH単位とわずかに異なる場合に達成でき、0.2、0.3、0.4、および0.5以上異なるものが全て本発明において使用される。
当業者には理解されるように、良好な分離を得るために各単量体または両方の単量体(複数可)に含まれるべきpIバリアントの数は、構成要素の出発pIに部分的に依存するであろう。すなわち、どの単量体を操作するか、またはどの「方向」(例えば、より陽性またはより陰性)かを決定するために、Fcドメインの配列、いくつかの場合では、Fcドメインに結合するタンパク質ドメイン(複数可)が計算され、そこから決定がなされる。当技術分野において既知のとおり、異なるFcドメインおよび/またはタンパク質ドメインは、本発明において利用される異なる出発pIを有するであろう。一般に、本明細書に概説されるように、pIは、少なくとも約0.1logの各単量体の総pI差をもたらすように操作され、本明細書に概説されるように0.2~0.5が好ましい。
さらに、当業者には理解され、本明細書に概説されるように、いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体はサイズに基づいてホモ二量体から分離することができる。図に示されるように、例えば、フォーマットのいくつかは、サイズに基づいてヘテロ二量体およびホモ二量体の分離を可能にする。
pIバリアントを使用してヘテロ二量体化を達成する場合、Fcドメイン(複数可)の定常領域(複数可)を使用することによって、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を設計および精製するためのよりモジュール方式のアプローチが提供される。したがって、いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体化バリアント(スキューバリアントおよび精製ヘテロ二量体化バリアントを含む)を操作しなければならない。加えて、いくつかの実施形態では、pIバリアントから生じる免疫原性の可能性は、顕著な免疫原性を導入することなくpIが変化するように、異なるIgGアイソタイプからのpIバリアントを移入することによって顕著に低減する。したがって、解決されるべきさらなる問題は、高いヒト配列含有量を有する低pIの定常ドメインの解明、例えば、任意の特定の位置における非ヒト残基の最小化または回避である。
このpI操作で起こり得る副次的な利益はまた、血清半減期の延長およびFcRn結合の増加である。すなわち、USSN13/194、904(その全体が参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、抗体定常ドメイン(抗体およびFc融合体に見られるものを含む)のpIを低下させるとインビボでより長い血清保持をもたらし得る。血清半減期を延長するためのこれらのpIバリアントはまた、精製のためのpI変化を促進する。
加えて、ヘテロ二量体化バリアントのpIバリアントは、ホモ二量体が存在するとき、排除、最小化、および区別する能力が顕著であるので、Fc融合タンパク質の分析および品質管理プロセスにさらなる利益を与える。同様に、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質の製造の再現性を確実に試験する能力は重要である。
A.ヘテロ二量体化バリアント
本発明は、ヘテロ二量体形成および/またはホモ二量体からの精製を可能にするためにヘテロ二量体バリアントを利用する、様々なフォーマットのヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。ヘテロ二量体融合構築物は、2つのFcドメイン、例えば、「二量体」に組み立てられる2つの「単量体」の自己組織化の性質に基づく。
ヘテロ二量体化スキューバリアントのセットのいくつかの好適な対がある。これらのバリアントは、「セット」の「対」になる。すなわち、一方のセットの対が第1の単量体に組み込まれ、他のセットの対が第2の単量体に組み込まれる。注目すべきは、これらのセットは、一方の単量体上の残基と他方の単量体上の残基との間で一対一の対応関係を有する「ノブインホール」バリアントとして必ずしも振舞わないことであり、すなわち、これらのセットの対は、ヘテロ二量体形成を促進し、ホモ二量体形成を妨げる2つの単量体間の境界面を形成し、生物学的条件下で自発的に形成するヘテロ二量体の割合を予想の50%(25%ホモ二量体A/A:50%ヘテロ二量体A/B:25%ホモ二量体B/B)ではなく90%以上にする。
B.立体バリアント
いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体の形成は、立体バリアントの付加によって促進され得る。すなわち、各重鎖中のアミノ酸を変えることによって、異なる重鎖が会合して同じFcアミノ酸配列を有するホモ二量体を形成するよりもヘテロ二量体構造を形成する可能性が高い。好適な立体バリアントは、その全てがその全体において参照により本明細書に組み込まれる、USSN15/141、350の図29、同様に図2に含まれる。
1つの機構は、その全てがそれらの全体において参照により本明細書に組み込まれる、USSN61/596、846、Ridgway et al.、Protein Engineering 9(7):617(1996)、Atwell et al.、J.Mol.Biol.1997 270:26、米国特許第8、216、805号に記載されるように、当該技術分野において一般的に「ノブアンドホール」と称され、ヘテロ二量体形成を有利にし、ホモ二量体形成を不利にする立体効果を創出するアミノ酸操作を指す。これらの図は、「ノブアンドホール」に依存するいくつかの「単量体A-単量体B」対を特定する。加えて、Merchant et al、Nature Biotech16:677(1998)に記載されるように、これらの「ノブアンドホール」変異は、ヘテロ二量体化へのスキュー形成へジスルフィド結合と組み合わせることができる。
ヘテロ二量体の生成に使用を見出す追加の機構は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Gunasekaran et al.、J.Biol.Chem.285(25):19637(2010)に記載されるように、時に「静電ステアリング」と称される。これは、本明細書において、時折「電荷対」と称される。この実施形態では、静電学を使用して、ヘテロ二量体化に向けて形成をスキューさせる。当業者には理解されるように、これらは、pI、すなわち精製にも影響を及ぼす可能性があり、したがっていくつかの場合ではpIバリアントとみなすこともできる。しかしながら、これらはヘテロ二量体化を強制するために生成され、精製手段として使用されなかったので、それらは「立体バリアント」として分類される。これらには、D221R/P228R/K409Rと対になった D221E/P228E/L368E(例えば、これらは「単量体」対応セットである)、およびC220R/E224R/P228R/K409Rと対になったC220E/P228E/368Eが含まれるが、これらに限定されない。
さらなる単量体Aおよび単量体Bのバリアントは、本明細書に概説されるpIバリアントまたは参照によりその全てが本明細書に明示的に組み込まれるUS2012/0149876の図37に示される他の立体バリアントなどの他のバリアントと、任意選択的に独立して任意の量で組み合わせることができる。
いくつかの実施形態では、本明細書に概説される立体バリアントは、任意のpIバリアント(またはFcバリアント、FcRnバリアントなどの他のバリアント)を一方または両方の単量体に任意にかつ独立して組み込むことができ、本発明のタンパク質に独立してかつ任意に含むかまたは除外することができる。
好適なスキューバリアントの一覧は、図2に見られる。多くの実施形態における特定の使用のうち、これらに限定されないが、S364K/E357Q:L368D/K370S;L368D/K370S:S364K;L368E/K370S:S364K;T411T/E360E/Q362E:D401K;L368D/K370S:S364K/E357L;K370S:S364K/E357Q;およびT366S/L368A/Y407V:T366W(任意に、架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)を含む、セットの対がある。命名法に関して、対「S364K/E357Q:L368D/K370S」は、上記のように単量体の一方が二重バリアントセットS364K/E357Qを有し、他方が二重バリアントセットL368D/K370S;を有することを意味し、これらの対の「鎖性」は、出発pIに依存する。
C.ヘテロ二量体のpI(等電点)バリアント
一般に、当業者には理解されるように、pIバリアントには2つの一般的なカテゴリー:タンパク質のpIを増加させるもの(塩基性変化)とタンパク質のpIを減少させるもの(酸性変化)がある。本明細書に記載されるように、これらのバリアントの全ての組み合わせを使用することができる。一方の単量体は野生型、または野生型と顕著に異なるpIを示さないバリアントであってもよく、他方がより塩基性またはより酸性のいずれかであり得る。あるいは、各単量体は、1つはより塩基性に、1つはより酸性へと変化し得る。
pIバリアントの好ましい組み合わせはUSSN15/141、350の図30に示されており、その全てはその全体が参照により本明細書に組み込まれる。本明細書に概説され、図に示されるように、これらの変化は、IgG1と比較して示されるが、全てのアイソタイプは、このように変更することができ、アイソタイプハイブリッドも同様である。重鎖定常ドメインがIgG2~4に由来する場合、R133EおよびR133Qも使用され得る。
一実施形態では、pIバリアントの好ましい組み合わせは、Fc単量体のうちの1つがCH1ドメインを含む場合、208D/295E/384D/418E/421Dバリアント(ヒトIgG1と比較するときN208D/Q295E/N384D/Q418E/N421D)を含む1つの単量体を有する。いくつかの例では、第2の単量体は、(GKPGS)を含む、正荷電ドメインリンカーを含む。いくつかの場合では、第1の単量体は、位置208を含む、CH1ドメインを含む。したがって、CH1ドメインを含まない構築物(例えば、ドメインの1つにCH1ドメインを利用しないヘテロ二量体Fc融合タンパク質について)では、好ましい負のpIバリアントFcセットは、295E/384D/418E/421Dバリアント(ヒトIgG1と比較するときQ295E/N384D/Q418E/N421D)を含む。
いくつかの実施形態では、変異は、位置216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、および230を含む、Fcドメインのヒンジにおいて生じる。したがって、pI変異、特に置換は、本発明で使用されている1、2、3、4または5個の変異によって位置216~230のうちの1つ以上で行うことができる。同様に、全ての可能な組み合わせが、単独で、または他のドメイン中の他のpIバリアントとともに企図されている。
ヒンジドメインのpIを低下させるのに使用される具体的な置換としては、位置221の欠失、位置222の非天然バリンまたはトレオニン、位置223の欠失、位置224の非天然グルタミン酸、位置225の欠失、位置235の欠失、および位置236の欠失または非天然アラニンが含まれるがこれらに限定されない。いくつかの場合では、ヒンジドメインにおいてはpI置換のみが行われ、他の例では、これらの置換(複数可)は他のドメイン内の他のpIバリアントに任意の組み合わせで加えられる。
いくつかの実施形態では、変異は、位置233、234、235、236、274、296、300、309、320、322、326、327、334、および339を含む、CH2領域において生じることができる。233~236における変化は、IgG2バックボーンにおける(327Aとともに)エフェクター機能を増加させるために行うことができることが留意されるべきである。同様に、これらの14個の位置の全ての可能な組み合わせを作製することができ、例えば、pI抗体は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のCH2pI置換を有し得る。
CH2ドメインのpIを低下させることに使用を見出す具体的な置換には、位置274の非天然グルタミンまたはグルタミン酸、位置296の非天然フェニルアラニン、位置300の非天然フェニルアラニン、位置309の非天然バリン、位置320の非天然グルタミン酸、位置322の非天然グルタミン酸、位置326の非天然グルタミン酸、位置327の非天然グリシン、位置334の非天然グルタミン酸、位置339の非天然トレオニン、およびCH2内および他のドメインとの全ての可能な組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
この実施形態では、変異は位置355、359、362、384、389、392、397、418、419、444および447から独立してかつ任意に選択され得る。CH3ドメインのpIを低下させることに使用を見出す具体的な置換には、位置355の非天然グルタミンまたはグルタミン酸、位置384の非天然セリン、位置392の非天然アスパラギンまたはグルタミン酸、位置397の非天然メチオニン、位置419の非天然グルタミン酸、位置359の非天然グルタミン酸、位置362の非天然グルタミン酸、位置389の非天然グルタミン酸、位置418の非天然グルタミン酸、位置444の非天然グルタミン酸、および位置447の欠失または非天然アスパラギン酸が含まれるが、これらに限定されない。
D.アイソタイプバリアント
加えて、本発明の多くの実施形態は、あるIgGアイソタイプから別のIgGアイソタイプへの特定の位置でのpIアミノ酸の「移入」に依存し、したがって、バリアントに望ましくない免疫原性が導入される可能性を低減または排除する。これらのいくつかは、参照により本明細書に組み込まれている、米国特許出願公開第2014/0370013号の図21に示されている。すなわち、IgG1は、高いエフェクター機能を含む、様々な理由で治療用抗体の一般的なアイソタイプである。しかしながら、IgG1の重定常領域は、IgG2のそれよりも高いpIを有する(8.10対7.31)。特定の位置のIgG2残基をIgG1バックボーンに導入することによって、得られる単量体のpIは、低下(または上昇)し、より長い血清半減期をさらに示す。例えば、IgG1は、位置137にグリシン(pI5.97)を有し、IgG2は、グルタミン酸(pI3.22)を有し、グルタミン酸を移入することは、得られるタンパク質のpIに影響を与えるであろう。以下に記載されるように、バリアントFc融合タンパク質のpIに顕著な影響を与えるためには、一般にいくつかのアミノ酸置換が必要とされる。しかしながら、IgG2分子中の変化でさえも増加した血清半減期を可能にすることが以下で議論されることが留意されるべきである。
他の実施形態では、非アイソタイプのアミノ酸変化を行って、(例えば、高pIのアミノ酸から低pIのアミノ酸へと変化させることによって)得られるタンパク質の全体的な荷電状態を低減させるか、または以下でさらに詳細に説明する安定性などのための構造の調整を可能にする。
加えて、重定常ドメインおよび軽定常ドメインの両方をpI操作することによって、ヘテロ二量体の各単量体における顕著な変化を見ることができる。本明細書で議論されるように、2つの単量体のpIが少なくとも0.5だけ異なることは、イオン交換クロマトグラフィーもしくは等電点電気泳動、または等電点に感受性の他の方法による分離を可能にし得る。
EpIの計算
各単量体のpIは、バリアント重鎖定常ドメインのpIおよび全単量体のpIに依存し、バリアント重鎖定常ドメインおよび融合パートナーを含み得る。したがって、いくつかの実施形態では、pIの変化は、米国特許出願公開第2014/0370013号の図19のチャートを使用して、バリアント重鎖定常ドメインに基づいて計算される。本明細書で議論されるように、どの単量体を操作するかは一般に、各単量体の固有のpIによって決定される。
Fインビボ結合により良好なFcRnも付与するpIバリアント
pIバリアントが単量体のpIを減少させる場合、それらはインビボでの血清保持を改善するというさらなる利点を有することができる。
まだ検討中ではあるが、エンドソーム内のpH6でFcRnに結合するとFcが隔離されるため、Fc領域はインビボでより長い半減期を有すると考えられている(Ghetie and Ward、1997 Immunol Today18(12):592-598、全体が参照により組み込まれる)。次いでエンドソーム区画はFcを細胞表面にリサイクルする。区画が細胞外空間に開くと、約7.4のより高いpHが、血中へのFcの放出を誘導する。マウスでは、Dall’Acquaらは、pH6およびpH7.4での増加したFcRn結合を有するFcバリアントは、実際に低減した血清濃度および野生型Fcと同じ半減期を有することを示した(Dall’Acqua et al.2002、J.Immunol.169:5171-5180、参照によりその全体が組み込まれる)。pH7.4でのFcRnに対するFcの親和性の増加は、血中へのFcの放出を妨げると考えられる。したがって、インビボでのFcの半減期を増加させるFc変異は、理想的には、より高いpHでのFcの放出をなお可能にしながら、より低いpHでのFcRn結合を増加させる。アミノ酸ヒスチジンは、6.0~7.4のpH範囲でその荷電状態を変化させる。したがって、Fc/FcRn複合体中の重要な位置にHis残基を見出すことは驚くべきことではない。
その全体が参照により本明細書に組み込まれる、USSN12/341、769に具体的に開示されるように、FcRnへの増加された結合および増加された血清半減期における用途を見出す多数のFc置換があり、これらに限定されないが、434A、428L、308F、259I、428L/434S、259I/308F、436I/428L、436I、434S、252Y/428L、252Y/434S、428L/434S、436V/428L、および259I/308F/428Lを含む。
G.追加機能のための追加のFcバリアント
pIアミノ酸バリアントに加えて、1つ以上のFcγR受容体への結合を変更すること、FcRn受容体への結合の変更などを含むがこれらに限定されない、様々な理由で行うことができるいくつかの有用なFcアミノ酸修飾が存在する。
したがって、本発明のタンパク質は、pIバリアントおよび立体バリアントを含む、本明細書に概説したヘテロ二量体化バリアントを含むアミノ酸修飾を含むことができる。バリアントの各セットは独立してかつ任意に特定のヘテロ二量体タンパク質に含み得るかまたはそれから除外し得る。
H.FcγRバリアント
したがって、Fcγ受容体のうちの1つ以上への結合を変更するために行われ得るいくつかの有用なFc置換が存在する。結合の増加ならびに結合の減少をもたらす置換が有用であり得る。例えば、FcγRIIIaへの結合の増加は、一般に、ADCC(抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性、すなわち、FcγRを発現する非特異的細胞傷害性細胞が標的細胞上の結合抗体を認識し、その後、標的細胞の溶解を引き起こす細胞媒介性反応)の増加をもたらすことが知られている。同様に、いくつかの状況下では、FcγRIIb(抑制性受容体)への結合の減少も有益であり得る。本発明で使用されるアミノ酸置換には、USSN11/124、620(特に図41)、USSN11/174、287、USSN11/396、495、USSN11/538、406に列挙されるものが含まれ、それらの全てはその全体が、具体的にはそこで開示されるバリアントが参照により、明示的に本明細書に組み込まれる。使用される特定のバリアントには、236A、239D、239E、332E、332D、239D/332E、267D、267E、328F、267E/328F、236A/332E、239D/332E/330Y、239D、332E/330L、243A、243L、264A、264V、および299Tが含まれるがこれらに限定されない。
加えて、FcγRIIcに対する親和性を増加させるアミノ酸置換もまた、本明細書に概説されるFcドメインバリアントに含まれ得る。例えば、USSN11/124、620およびUSSN14/578、305に記載される置換は有用である。
I.アブレーションバリアント
同様に、機能性バリアントの別のカテゴリーは「FcγRアブレーションバリアント」または「Fcノックアウト(FcKOまたはKO)」バリアントである。これらの実施形態では、いくつかの治療用途について、追加の作用機序を回避するために、Fcγ受容体(例えば、FcγR1、FcγRIIa、FcγRIIb、FcγRIIIaなど)のうちの1つ以上または全てのへのFcドメインの正常な結合を低減または除去することが望ましい。すなわち、例えば、多くの実施形態では、特に、免疫調節タンパク質の使用において、Fcドメインのうちの1つが、1つ以上のFcγ受容体アブレーションバリアントを含むように、FCγRIIIa結合をアブレートしてADCC活性を排除または著しく低減することが望ましい。これらのアブレーションバリアントは、その全てが参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、USSN15/141、350の図31に示されており、各々は、独立してかつ任意に含まれても除外されてもよく、好ましい態様は、EU指数に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236del/S239K、E233P/L234V/L235A/G236del/S267K、E233P/L234V/L235A/G236del/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236del/S267K/A327G、およびE233P/L234V/L235A/G236delからなる群から選択されるアブレーションバリアントを利用する。本明細書で言及されるアブレーションバリアントは、FcγR結合をアブレートするが、FcRn結合をアブレートしないことに留意されたい。
J.ヘテロ二量体およびFcバリアントの組み合わせ
当業者には理解されるように、列挙されたヘテロ二量体化バリアント(スキューバリアントおよび/またはpIバリアントを含む)は全て、それらの「鎖性(strandedness)」または「単量体分割」を保持する限り、任意の方法で任意にかつ独立して組み合わせることができる。加えて、これらのバリアントは全て、ヘテロ二量体化フォーマットのいずれにも組み合わせることができる。
pIバリアントの場合、特に使用される実施形態が図面に示されているが、精製を促進するために2つの単量体間のpIの差異を変更するという基本的な規則に従って、他の組み合わせを生成できる。
加えて、ヘテロ二量体化バリアント、スキュー、およびpIのいずれも、本明細書で概説されるように、独立してかつ任意にFcアブレーションバリアント、Fcバリアント、FcRnバリアントと組み合わせることができる。
加えて、単量体Fcドメインは、C220S/S267K/L368D/K370SまたはC220S/S267K/S364K/E357Qを含むアミノ酸置換のセットを含むことができる。
加えて、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、スキューバリアント(例えば、それらの全てが参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、USSN15/141、350の図1A~1Cに示されるアミノ酸置換のセット)(特に有用なスキューバリアントは、S364K/E357Q:L368D/K370S;L368D/K370S:S364K;L368E/K370S:S364K;T411T/E360E/Q362E:D401K;L368D/K370S:S364K/E357L;K370S:S364K/E357Q;T366S/L368A/Y407V:T366W;およびT366S/L368A/Y407V:T366W(任意に架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)からなる群から選択される)、任意にアブレーションバリアント、任意に荷電されたドメインリンカー、および任意にpIバリアントを含むことができる。
いくつかの実施形態では、Fcドメインは、EU指数に従って、236R、S239D、S239E、F243L、M252Y、V259I、S267D、S267E、S67K、S298A、V308F、L328F、L328R、330L、I332D、I332E、M428L、N434A、N434S、236R/L328R、S239D/I332E、236R/L328F、V259I/V308F、S267E/L328F、M428L/N43S、Y436I/M428L、N436V/M428L、V436I/N434S、Y436V/N434S、S239D/I332E/330L、M252Y/S54T/T256E、V259I/V308F/M428L、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を含む。
一実施形態では、本発明における使用を見出すスキューおよびpIバリアントの特定の組み合わせは、T366S/L368A/Y407V:T366W(任意に、架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)であり、一方の単量体がQ295E/N384D/Q418E/N481Dを含み、他方が正に荷電されたドメインリンカーを含む。当技術分野において理解されるように、「ノブインホール」バリアントはpIを変化させず、したがってどちらの単量体にも使用することができる。
IV.ホモ二量体Fc融合タンパク質
いくつかの態様では、本発明は、一般に(任意にドメインリンカーを通して)1つ以上の異なるタンパク質ドメインに結合した、Fc領域を含むホモ二量体Fc融合タンパク質に関する。これらのフォーマットは、一般的に図14および図48に示される。一態様では、ホモ二量体Fc融合タンパク質は、IL-12Rβ1/β2のIL-12受容体複合体に結合することを一緒に示すように、IL-12p40およびIL-12p35サブユニットを異なる配向で含むIL-12ホモ二量体Fc融合タンパク質である。Fcドメインは、IgG Fcドメイン、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4Fcドメインに由来することができ、IgG1およびIgG4Fcドメインは、本発明において特定の用途を見出す。本明細書に記載されるように、IgG1Fcドメインは、エフェクター機能をアブレートするために、常にではないが、多くの場合、アブレーションバリアントと組み合わせて使用され得る。同様に、低いエフェクター機能が望ましい場合、IgG4Fcドメインが使用され得る。
一態様では、ホモ二量体Fc融合タンパク質は、第1の単量体および第2の単量体を含み、N末端からC末端へ、IL-12p40サブユニット-任意のリンカー-IL-12p35サブユニット-任意のリンカー-Fcドメインを含む。いくつかの実施形態では、ホモ二量体Fc融合タンパク質は、第1の単量体および第2の単量体を含み、N末端からC末端へ、IL-12p40サブユニット-リンカー-IL-12p35サブユニット-リンカー-Fcドメインを含む。一実施形態の例は、図48Aに提供されている。
別の態様では、ホモ二量体Fc融合タンパク質は、第1の単量体および第2の単量体を含み、N末端からC末端へ、IL-12p35サブユニット-任意のリンカー-IL-12p40サブユニット-任意のリンカー-Fcドメインを含む。いくつかの実施形態では、ホモ二量体Fc融合タンパク質は、第1の単量体および第2の単量体を含み、N末端からC末端へ、IL-12p35サブユニット-リンカー-IL-12p40サブユニット-リンカー-Fcドメインを含む。一実施形態の例は、図48Bに提供されている。
別の態様では、ホモ二量体Fc融合タンパク質は、第1の単量体および第2の単量体を含み、N末端からC末端へ、Fcドメイン-任意のリンカー-IL-12p40サブユニット-任意のリンカー-IL-12p35サブユニットを含む。いくつかの実施形態では、ホモ二量体Fc融合タンパク質は、第1の単量体および第2の単量体を含み、N末端からC末端へ、Fcドメイン-リンカー-IL-12p40サブユニット-リンカー-IL-12p35サブユニットを含む。一実施形態の例は、図48Cに提供されている。
別の態様では、ホモ二量体Fc融合タンパク質は、第1の単量体および第2の単量体を含み、N末端からC末端へ、Fcドメイン-任意のリンカー-IL-12p35サブユニット-任意のリンカー-IL-12p40サブユニットを含む。いくつかの実施形態では、ホモ二量体Fc融合タンパク質は、第1の単量体および第2の単量体を含み、N末端からC末端へ、Fcドメイン-リンカー-IL-12p35サブユニット-リンカー-IL-12p40サブユニットを含む。一実施形態の例は、図48Dに提供されている。
いくつかの実施形態では、二価IL-12p40-Fcフォーマットは、a)N末端からC末端へ、i)IL-12p40ドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)第1のバリアントFcドメインタンパク質を含む第1の単量体と、b)N末端からC末端へ、i)IL-12p40ドメインタンパク質、ii)任意に第2のドメインリンカー、iii)第2のバリアントFcドメインタンパク質を含む第2の単量体と、を含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、二価IL-12p35-Fcフォーマットは、a)N末端からC末端へ、i)IL-12p35ドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)第1のバリアントFcドメインタンパク質を含む第1の単量体と、b)N末端からC末端へ、i)IL-12p35ドメインタンパク質、ii)任意に第2のドメインリンカー、iii)第2のバリアントFcドメインタンパク質を含む第2の単量体と、を含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、(scIL-12(p40/p35))-Fcフォーマットは、a)N末端からC末端へ、i)IL-12p40ドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)IL-12p35ドメインタンパク質、iv)任意の第2のドメインリンカー、v)第1のバリアントFcドメインタンパク質を含む第1の単量体と、b)N末端からC末端へ、i)IL-12p40ドメインタンパク質、ii)任意に第3のドメインリンカー、iii)IL-12p35ドメインタンパク質、iv)任意に第4のドメインリンカー、v)第2のバリアントFcドメインタンパク質を含む第2の単量体と、を含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、(scIL-12(p35/p40))-Fcフォーマットは、a)N末端からC末端へ、i)IL-12p35ドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)IL-12p40ドメインタンパク質、iv)任意の第2のドメインリンカー、v)第1のバリアントFcドメインタンパク質を含む第1の単量体と、b)N末端からC末端へ、i)IL-12p35ドメインタンパク質、ii)任意に第3のドメインリンカー、iii)IL-12p40ドメインタンパク質、iv)任意に第4のドメインリンカー、v)第2のバリアントFcドメインタンパク質を含む第2の単量体と、を含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、Fc-(scIL-12(p40/p35))フォーマットは、a)N末端からC末端へ、i)第1のバリアントFcドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)IL-12p40ドメインタンパク質、iv)任意の第2のドメインリンカー、v)IL-12p35ドメインタンパク質を含む第1の単量体と、b)N末端からC末端へ、i)第2のバリアントFcドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)IL-12p40ドメインタンパク質、iv)任意の第2のドメインリンカー、v)IL-12p35ドメインタンパク質を含む第2の単量体と、を含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、Fc-(scIL-12(p35/p40))フォーマットは、a)N末端からC末端へ、i)第1のバリアントFcドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)IL-12p35ドメインタンパク質、iv)任意の第2のドメインリンカー、v)IL-12p40ドメインタンパク質を含む第1の単量体と、b)N末端からC末端へ、i)第2のバリアントFcドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)IL-12p35ドメインタンパク質、iv)任意の第2のドメインリンカー、v)IL-12p40ドメインタンパク質を含む第2の単量体と、を含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、第1のドメインリンカーおよび当該第2のドメインリンカーは、同じアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、第1のドメインリンカーおよび第2のドメインリンカーは、異なるアミノ酸配列を有する。
いくつかの実施形態では、Fcバリアントは、本明細書で提供されるような1つ以上のスキュー、pI、およびアブレーションバリアントを含む。一実施形態では、Fcバリアントは、特定のスキュー、pI、およびアブレーションバリアントを含む。いくつかの実施形態では、第1および第2のFcドメインのホモ二量体化を促進する修飾は、EU付番に従って、L368D/K370S;S364K;S364K/E357L;S364K/E357Q;T411E/K360E/Q362E;D401K;T366S/L368A/Y407V;T366W;T366S/L368A/Y407V/Y349C;およびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する。いくつかの実施形態では、第1および第2のFcドメインは、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む。
このフォーマットでは、有用なIL-12p40タンパク質ドメインは、これに限定されないが、配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)を含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p40バリアントは、これらに限定されないが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qを含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p40バリアントは、これらに限定されないが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eを含む。
このフォーマットでは、IL-12p35タンパク質ドメインは、配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)を含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p35バリアントは、これらに限定されないが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qを含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p35バリアントは、これらに限定されないが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dを含む。
このフォーマットでは、有用な実施形態には、図14A~14Bおよび図15に見られるものが含まれるが、これらに限定されない。
ホモ二量体Fc融合タンパク質の潜在的な実施形態は、ヘテロ二量体ではなくホモ二量体を産生する目的で、必要に応じて、「ヘテロ二量体Fc融合タンパク質」と題する上記セクションに記載される方法および組成物を使用し得る。ホモ二量体Fc融合タンパク質の潜在的な実施形態は、本明細書に記載される方法および組成物の任意の組み合わせを使用し得る。
V.インターロイキン12
本発明は、インターロイキン12の生物学的に機能的な形態に関する。IL-12p40バリアントおよび/またはIL-12p35バリアントを含むIL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質は、p40/p35ヘテロ二量体およびp40ホモ二量体を含む、野生型IL-12と比較したIL-12受容体への低減または低下した結合親和性を有する。本発明のIL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質は、野生型IL-12と比較して低減または低下した有効性を有する。IL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質は、延長または増加した血清半減期を有する。IL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質は、毒性の低減または低下した潜在性を有する。本発明のIL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質は、これらに限定されないが、T細胞およびNK細胞などの免疫細胞におけるSTAT4リン酸化を誘導することにおける低減または低下した有効性を有する。IL-12p40バリアントは、潜在的なN-グリコシル化部位を除去するアミノ酸修飾(例えば、置換、付加、および欠失)を含む。IL-12p35バリアントは、潜在的なN-グリコシル化部位を除去するアミノ酸修飾(例えば、置換、付加、および欠失)を含む。いくつかの実施形態では、本発明のIL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質は、野生型IL-12と比較して、低減/減少したグリコシル化を有する。いくつかの実施形態では、本発明のIL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質のグリコシル化状態は、野生型IL-12タンパク質とは異なる。本発明のIL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質は、野生型IL-12と比較して改善された薬物動態を提供する。また、そのようなIL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質は、治療に効果的であり、野生型IL-12と比較して改善された治療指数を有する。本発明のIL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質は、T細胞活性化を促進/誘導することができる。いくつかの実施形態では、患者へのIL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質のいずれか1つの投与は、患者におけるT細胞活性化を誘導する。いくつかの例では、投与は、患者におけるIFN-ガンマ分泌を誘導する。いくつかの場合では、IL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質の投与は、患者におけるリンパ球の増殖を誘導する。IL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質は、固形腫瘍癌または液体腫瘍癌などの癌の治療に有用である。いくつかの実施形態では、IL-12ヘテロ二量体Fcタンパク質のうちのいずれか1つの患者への投与は、いくつかの場合では、チェックポイント遮断剤と組み合わせて、腫瘍サイズを低減する。
上記のように、インターロイキン12の生物学的に機能的な形態または「IL-12」は、ヘテロ二量体であり、IL-12p35サブユニット(IL-12サブユニットアルファ)およびIL-12p40サブユニット(IL-12サブユニットベータ)からなり、以降「IL-12ヘテロ二量体複合体」と表される。この複合体は、2つの異なるフォーマットで使用することができる。図8A~Bに示されるように、IL-12p40サブユニットおよびIL-12p35サブユニットは、互いに共有結合されないが、むしろヘテロ二量体として組み立てられる第1および第2のFcドメインにそれぞれ共有結合される。あるいは、IL-12p35およびIL-12p40サブユニットは、図8C~Fに一般的に示されるように、任意にドメインリンカー(本明細書に記載される)を使用して、共有結合させることができ、以降、単鎖IL-12複合体または「scIL-12」と表される。scIL-12における2つのサブユニットの順序は、以下のように指定され得る:IL-12p40サブユニットが(ドメインリンカーありまたはなしで)IL-12p35サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p40/p35)」、またはIL-12p35が(ドメインリンカーありまたはなしで)IL-12p40サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p35/p40)」。
いくつかの実施形態では、ヒトIL-12p35タンパク質は、NCBI参照配列番号NP_000873.2または配列番号1(図1に示されるヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)に示されるアミノ酸配列を有する。いくつかの場合では、ヒトIL-12p35のコード配列は、NCBI参照配列番号NM_000882.3に示される。本明細書に概説されるFc融合ヘテロ二量体タンパク質の例示的なIL-12p35タンパク質は、配列番号2のアミノ酸配列(図1に示されるヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)または配列番号1のアミノ酸23~219を有することができる。いくつかの実施形態では、IL-12p35タンパク質は、配列番号2に対して少なくとも90%、例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれ以上の配列同一性を有する。Fc融合タンパク質のIL-12p35タンパク質は、1、2、3、4、5、6、7、8、または9個のアミノ酸変異を有することができる。
いくつかの実施形態では、ヒトIL-12p40タンパク質は、NCBI参照配列番号NP_002178.3または配列番号3(図1に示されるヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)に示されるアミノ酸配列を有する。いくつかの場合では、ヒトIL-12p40のコード配列は、NCBI参照配列番号NM_002187.3に示される。本明細書に概説されるFc融合タンパク質の例示的なIL-12p40タンパク質は、配列番号4のアミノ酸配列(図1に示されるヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)または配列番号3のアミノ酸23~328を有することができる。いくつかの実施形態では、IL-12p40タンパク質は、配列番号4に対して少なくとも90%、例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれ以上の配列同一性を有する。Fc融合タンパク質のIL-12p40タンパク質は、1、2、3、4、5、6、7、8、または9個のアミノ酸変異を有することができる。
本発明はまた、バリアントIL-12p40サブユニットおよびバリアントIL-12p35サブユニットを提供する。これらのバリアントは、生物学的に機能的なIL-12複合体の一部、および本明細書に記載されるIL-12-Fc融合体のいずれかとして用途を見出す。
A.発現バリアント
予備的な問題として、本発明のIL-12p40およびIL-12p35サブユニットはまた、不均一性を低減するように設計された潜在的なN-グリコシル化部位を除去するバリアントを含む。
アミノ酸修飾を導入することができるIL-12p40上のそのような潜在的なN-グリコシル化部位は、N103、N113、N200、およびN281(図1に示されるヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40成熟形態配列に従って付番される)を含む。これらの部位のうちの1つ以上での例示的な修飾は、N103D、N103Q、N113D、N113Q、N200D、N200Q、N281D、およびN281Qからなる群から選択され得る。IL-12p40発現バリアントは、これらの部位での1つ以上の修飾を含むことができる。したがって、一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103D/N113D/N200D/N281Dである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103D/N113Dである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103D/N200Dである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103D/N281Dである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N113D/N200Dである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N113D/N281Dである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N200D/N281Dである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103D/N113D/N200Dである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103D/N113D/N281Dである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N/103D/N200D/N281Dを含む。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N113D/N200D/N281Dである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103Q/N113Qである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103Q/N200Qである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103Q/N281Qである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N113Q/N200Qである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N113Q/N281Qである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103Q/N113Q/N200Qである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103Q/N113Q/N281Qである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103Q/N200Q/N281Qである。一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N113Q/N200Q/N281Qを含む。これらの修飾は、単独で、または任意の他のIL-12p40バリアント、例えば、親和性バリアントと組み合わせて使用することができる。
部位のうちの1つ以上でアミノ酸修飾を導入することができるIL-12p35上のそのような潜在的なN-グリコシル化部位は、N71、N85、およびN195(図1に示されるヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列に従って付番される)からなる群から選択される。これらの部位での例示的な修飾は、N71D、N71Q、N85D、N85Q、N195D、およびN195Qを含む。IL-12p35バリアントは、これらの部位で1つ以上の修飾を含むことができる。したがって、一実施形態では、IL-12p35バリアントは、N71D/N85D/N195Dを含む。これらの修飾は、単独で、または任意の他のIL-12p35バリアント、例えば、親和性バリアントと組み合わせて使用することができる。
IL-12p40サブユニットは、位置252に遊離システイン(図1に示されるヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列に従って付番される)を有し、これは他の遊離システインと結合し、少なくとも不均一性、さらに悪い場合では免疫原性をもたらし得る。したがって、IL-12p40バリアントは、例えば、C252S修飾を導入することによって(他の置換も使用され得るが)、遊離システインを除去するように操作された。C252(例えば、C252S)の修飾は、単独で、または任意の他のIL-12p40バリアント、例えば、親和性もしくは発現バリアントと組み合わせて使用することができる。遊離システインを除去するC252での修飾を含む例示的なIL-12p40バリアントは、図65に示される。例示的なIL-12-Fc融合タンパク質は、追加のバリアントIL-12p40サブユニットで生成され、その配列は、図66に示され、実施例1Bに一般的に記載されるように生成される。これらの修飾は、単独で、または任意の他のIL-12p40バリアント、例えば、親和性バリアントと組み合わせて使用することができる。
B.親和性および有効性バリアント
本発明は、IL-12受容体についての変更された、すなわち、低減または増加された、結合親和性を有する生物学的に機能的なIL-12を形成するIL-12p40バリアントおよびIL-12p35バリアントを提供する。いくつかの場合では、バリアントIL-12p40サブユニットは、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/またはIL-12受容体複合体についての変更された、すなわち、低減または増加された、結合親和性を有する。いくつかの場合では、バリアントIL-12p35は、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/またはIL-12受容体複合体についての変更された、すなわち、低減または増加された、結合親和性を有する。本発明は、野生型IL-12p40およびIL-12p35と比較して変更された、すなわち、低減または増加した、有効性を有する生物学的に機能的なIL-12を形成するIL-12p40バリアントおよびIL-12p35バリアントも提供する。
アミノ酸修飾を導入することができるIL-12p40上の好適な部位は、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252、Q256、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299(図1に示されるヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40成熟形態配列に従って付番される)からなる群から選択される。これらの部位での例示的な修飾は、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択することができ、IL-12p40親和性バリアントは、これらの部位の1つ以上での修飾を含むことができる。したがって、一実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103D/N113D/N200D/N281Dを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、Q42E/E45Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E45Q/Q56Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、Q42E/E59Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、Q56E/E59Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、Q42E/E45Q/Q56Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E45Q/Q56E/E59Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E32Q/E59Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、D34N/E59Kを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、D34N/E59K/K99Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、D34K/E59K/K99Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E32Q/D34N/E59K/K99Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E32K/D34N/E59K/K99Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、D34N/E59Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59Q/E187Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、S43E/E59Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、S43K/E49Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59Q/K163Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59Q/K99Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59Q/K258Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59Q/K260Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、D18K/E59K/K99Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99Yを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59Y/K99Yを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59Y/K99Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E45K/E59K/K99Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/Q144Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/Q144Kを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/R159Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、D18K/E59K/K99E/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、DI8K/E59K/K99E/C252Sである。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、D18K/E59K/K99E/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99Y/C252Sを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/C252Sを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103D/N113Dを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103D/N200Dを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103D/N281Dを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N113D/N200Dを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N113D/N281Dを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N200D/N281Dを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103D/N113D/N200Dを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103D/N113D/N281Dを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103D/N200D/N281Dを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N113D/N200D/N281Dを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103Q/N113Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103Q/N200Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103Q/N281Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N113Q/N200Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N113Q/N281Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N200Q/N281Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103Q/N113Q/N200Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103Q/N113Q/N281Q、を含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103Q/N200Q/N281Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N113Q/N200Q/N281Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、N103Q/N113Q/N200Q/N281Qを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eを含む。別の実施形態では、IL-12p40バリアントは、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eを含む。
加えて、これらの修飾は、単独で、または任意の他のIL-12p40バリアント、例えば、発現バリアントと組み合わせて使用することができる。
IL-12p40サブユニットは、位置252に遊離システイン(図1に示されるヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列に従って付番される)を有し、これは他の遊離システインと結合し、少なくとも不均一性、さらに悪い場合では免疫原性をもたらし得る。したがって、IL-12p40バリアントは、例えば、C252S修飾を導入することによって(他の置換も使用され得るが)、遊離システインを除去するように操作された。C252(例えば、C252S)の修飾は、単独で、または任意の他のIL-12p40バリアント、例えば、親和性もしくは発現バリアントと組み合わせて使用することができる。遊離システインを除去するC252での修飾を含む例示的なIL-12p40バリアントは、図65に示される。例示的なIL-12-Fc融合タンパク質は、追加のバリアントIL-12p40サブユニットで生成され(generate)、その配列は、図66に示され、実施例1Bに一般的に記載されるように生成(produce)される。加えて、これらの修飾は、単独で、または任意の他のIL-12p40バリアント、例えば、発現バリアントと組み合わせて使用することができる。
アミノ酸修飾を導入することができるIL-12p35上の好適な部位は、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、F96、M97、L89、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、およびA196(図1に示されるヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列に従って付番される)からなる群から選択される。例示的な修飾は、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択され、IL-12p35親和性バリアントは、これらの部位の1つ以上での修飾を含むことができる。したがって、一実施形態では、IL-12p35バリアントは、N71D/N85D/N195Dを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、N151D/E153Qを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、N151D/D165Nを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、Q130E/N151Dを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、N151D/K158Eを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、E79Q/N151Dを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、D55Q/N151Dを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、N136D/N151Dを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、N21D/N151Dを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、E143Q/N151Dを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、N71Q/N85Qを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、N71Q/N195Qを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、N85Q/N195Qを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、N71Q/N85Q/N195Qを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、N71D/N85Dを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、N71D/N195Dを含む。別の実施形態では、IL-12p35バリアントは、N85D/N195Dを含む。
加えて、これらの修飾は、単独で、または任意の他のIL-12p35バリアント、例えば、発現バリアントと組み合わせて使用することができる。
生物学的に機能的なIL-12ヘテロ二量体複合体は、野生型IL-12p40サブユニットおよび野生型IL-12p35サブユニット、バリアントIL-12p40サブユニットおよび野生型IL-12p35サブユニット、野生型IL-12p40サブユニットおよびバリアントIL-12p35サブユニット、またはバリアントIL-12p40サブユニットおよびバリアントIL-12p35サブユニットを含むことができる。
生物学的に機能的なIL-12二価ホモ二量体複合体は、野生型IL-12p40サブユニットおよび野生型IL-12p35サブユニット、バリアントIL-12p40サブユニットおよび野生型IL-12p35サブユニット、野生型IL-12p40サブユニットおよびバリアントIL-12p35サブユニット、またはバリアントIL-12p40サブユニットおよびバリアントIL-12p35サブユニットを含むことができる。
VI.ドメインリンカー
いくつかの実施形態では、IL-12p35およびIL-12p40サブユニットは、リンカーを介して一緒に結合される。任意に、サブユニットは、リンカーを介して結合されない。他の実施形態では、IL-12p35およびIL-12p40サブユニットは、非共有結合される。いくつかの実施形態では、IL-12p35サブユニットは、リンカーを介してFcドメインに結合される。特定の実施形態では、IL-12p35サブユニットは、直接、例えば、リンカーなしで、Fcドメインに結合される。他の実施形態では、IL-12p40サブユニットは、リンカーを介してFcドメインに結合される。他の実施形態では、IL-12p40サブユニットは、直接Fcドメインに結合される。いくつかの場合では、リンカーは、IL-12p35サブユニットまたはIL-12p40サブユニットをFcドメインに結合するために使用されない。
いくつかの実施形態では、リンカーは、本明細書に概説される任意の2つのドメインをともに結合するために使用される「ドメインリンカー」である。任意の好適なリンカーを使用することができるが、多くの実施形態は、例えば、nが少なくとも0(および一般に0~1~2~3~4~5)である、(GS)、(GSGGS)、(GGGGS)、および(GGGS)を含む、グリシン-セリンポリマー、ならびに各ドメインがその生物学的機能を保持することを可能するために十分な長さおよび柔軟性を有する2つのドメインの組換え結合を可能にする任意のペプチド配列を利用する。特定の場合では、有用なリンカーは、(GGGGS)または(GGGGS)または(GGGGS)を含む。例示的なドメインリンカーを図6に示す。いくつかの場合では、以下に概説されるように、「鎖性」に注意を払って、荷電ドメインリンカーを本明細書に議論されるように使用することができる。
加えて、Fc融合体におけるGly-SerリンカーのセリンがO-グリコシル化に供され得ることが以前に報告されている。したがって、(Fc融合体の文脈で)不均一性を減少させる最終的なアプローチは、これまで使用されたGly-SerリンカーをGly-Alaリンカーで置き換えることである。
VII.本発明の有用なフォーマット
図8A~Fに示されるように、本発明のヘテロ二量体融合タンパク質のいくつかの有用なフォーマットがある。一般に、本発明のヘテロ二量体融合タンパク質は、2つの機能的成分:IL-12ヘテロ二量体成分およびFc成分を有し、その両方は、本明細書で概説されるように異なる形態をとることができ、その両方は、任意の構成で他の成分と組み合わせることができる。
いくつかの実施形態では、IL-12p35およびIL-12p40サブユニットは、任意にドメインリンカーと共有結合され、本明細書では単鎖IL-12複合体または「scIL-12」と称される。scIL-12は、任意にドメインリンカーで、IL-12p40にN末端結合したIL-12p35またはIL-12p35にN末端結合したIL-12p40のいずれかを含むことができる。scIL-12における2つのサブユニットの順序は、以下のように指定され得る:IL-12p40サブユニットが(ドメインリンカーありまたはなしで)IL-12p35サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p40/p35)」、またはIL-12p35が(ドメインリンカーありまたはなしで)IL-12p340サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p35/p40)」。
いくつかの実施形態では、IL-12p35およびIL-12p40サブユニットは、共有結合されないが、むしろヘテロ二量体として組み立てられる第1および第2のFcドメインにそれぞれ共有結合される。
第1および第2のFcドメインは、EU付番に従って、a)L368D/K370SおよびS364K;b)L368D/K370SおよびS364K/E357L;c)L368D/K370SおよびS364K/E357Q;d)S267K/L368D/K370S;e)T411E/K360E/Q362EおよびD401K;f)L368E/K370SおよびS364K;g)K370SおよびS364K/E357Q;ならびにh)T366S/L368A/Y407VおよびT366W(任意に架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349CおよびT366W/S354Cを含む)からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットを有することができる。
いくつかの実施形態では、第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する。
任意に、第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する。
任意に、第1および/または第2のFcドメインは、半減期延長のために428L/434Sバリアントを有する。
A.IL-12-ヘテロFcフォーマット
一実施形態では、本発明は、N末端IL-12ヘテロ二量体Fc融合体または「IL-12-ヘテロFc」フォーマットを提供する。この実施形態では、図8Aに示されるように、ヘテロ二量体融合タンパク質は、2つの単量体を含む。第1の単量体は、(N末端からC末端へ)IL-12p40-任意のドメインリンカー-Fcを含む。第2の単量体は、(N末端からC末端へ)IL-12p35-任意のドメインリンカー-Fcを含む。
IL-12-ヘテロFcフォーマットでは、好ましい実施形態は、スキューバリアント対S364K/E357Q:L368D/K370Sを利用する。
IL-12-ヘテロFcフォーマットでは、好ましい実施形態は、図9(鎖1鎖2を含むXENP27201)に示される。
いくつかの実施形態では、IL-12-ヘテロFcフォーマットは、a)N末端からC末端へ、i)IL-12p40ドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)第1のバリアントFcドメインタンパク質を含む第1の単量体と、b)N末端からC末端へ、i)IL-12p35ドメインタンパク質、ii)任意に第2のドメインリンカー、iii)第2のバリアントFcドメインタンパク質を含む第2の単量体と、を含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、Fcバリアントは、本明細書で提供されるような1つ以上のスキュー、pI、およびアブレーションバリアントを含む。一実施形態では、Fcバリアントは、特定のスキュー、pI、およびアブレーションバリアントを含む。いくつかの実施形態では、第1および第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾は、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357Q;T366S/L368A/Y407VおよびT366W;T366S/L368A/Y407V/Y349CおよびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する。いくつかの実施形態では、第1および第2のFcドメインは、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む。
このフォーマットでは、有用なIL-12p40タンパク質ドメインは、これに限定されないが、配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)を含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p40バリアントは、これらに限定されないが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qを含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p40バリアントは、これらに限定されないが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eを含む。
このフォーマットでは、IL-12p35タンパク質ドメインは、配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)を含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p35バリアントは、これらに限定されないが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qを含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p35バリアントは、これらに限定されないが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dを含む。
このフォーマットでは、バリアントIL-12p40サブユニットおよびIL-12p35サブユニットの有用な組み合わせは、これらに限定されないが、IL-12p40(E59K/K99Y)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(E59K/K99E/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(E59K/K99Y/C252S)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、ならびにIL-12p40(E59K/K99E/C252S)およびIL-12p35(配列番号2)を含む。
このフォーマットでは、バリアントIL-12p40サブユニットおよびIL-12p35サブユニットの有用な組み合わせは、これに限定されないが、配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)を含むIL-12p35と、これらに限定されないが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、E299Q、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eを含む、1つ以上の置換を含むバリアントIL-12p40との組み合わせを含む。
このフォーマットでは、IL-12p40およびIL-12p35バリアントの有用な組み合わせは、これに限定されないが、配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)を含むIL-12p40と、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、N195Q、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dを含むIL-12p35との組み合わせを含む。
このフォーマットでは、IL-12p40バリアントおよびIL-12p35バリアントの有用な組み合わせは、これに限定されないが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、E299Q、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E;からなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を含むIL-12p40バリアントと、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、N195Q、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択される1つ以上の置換を含むIL-12p35バリアントとの組み合わせを含む。
このフォーマットでは、有用な実施形態は、これらに限定されないが、バリアントIL-12p40サブユニットドメインが、第1のドメインリンカーを使用して当該第1のFcドメインに結合し、かつ/または当該IL-12p35サブユニットドメインが、第2のドメインリンカーを使用して当該第2のFcドメインに結合しているものを含む。
このフォーマットでは、有用な実施形態には、これらに限定されないが、XENP31251、XENP31254、XENP31258、XENP32186、XENP32187、XENP32188、XENP32189、XENP32190、およびXENP32191が含まれる。さらなる実施形態では、XENP31251、XENP31254、XENP31258、XENP32186、XENP32187、XENP32188、XENP32189、XENP32190、およびXENP32191は、さらなる糖鎖工学を含む。
このフォーマットでは、有用な実施形態には、図44A~44Kおよび図66A~66Qに見られるものが含まれるが、これらに限定されない。
B.ヘテロFc-IL-12フォーマット
別の実施形態では、本発明は、C末端IL-12ヘテロ二量体Fc融合体または「ヘテロFc-IL-12」フォーマットを提供する。この実施形態では、図8Bに示されるように、ヘテロ二量体融合タンパク質は、2つの単量体を含む。第1の単量体は、(N末端からC末端へ)Fc-任意のドメインリンカー-IL-12p40を含む。第2の単量体は、(N末端からC末端へ)Fc-任意のドメインリンカー-IL-12p35を含む。
ヘテロFc-IL-12フォーマットでは、好ましい実施形態は、スキューバリアント対S364K/E357Q:L368D/K370Sを利用する。
IL-12-ヘテロFcフォーマットでは、好ましい実施形態は、図10(鎖1鎖2を含むXENP27202)に示される。
いくつかの実施形態では、ヘテロFc-IL-12フォーマットは、a)N末端からC末端へ、i)第1のバリアントFcドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)IL-12p40ドメインタンパク質を含む第1の単量体と、b)N末端からC末端へ、i)第2のバリアントFcドメインタンパク質、ii)任意に第2のドメインリンカー、iii)IL-12p35ドメインタンパク質を含む第2の単量体と、を含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、Fcバリアントは、本明細書で提供されるような1つ以上のスキュー、pI、およびアブレーションバリアントを含む。一実施形態では、Fcバリアントは、特定のスキュー、pI、およびアブレーションバリアントを含む。いくつかの実施形態では、第1および第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾は、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357Q;T366S/L368A/Y407VおよびT366W;T366S/L368A/Y407V/Y349CおよびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する。いくつかの実施形態では、第1および第2のFcドメインは、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む。
このフォーマットでは、有用なIL-12p40タンパク質ドメインは、これに限定されないが、配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)を含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p40バリアントは、これらに限定されないが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qを含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p40バリアントは、これらに限定されないが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eを含む。
このフォーマットでは、IL-12p35タンパク質ドメインは、配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)を含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p35バリアントは、これらに限定されないが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qを含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p35バリアントは、これらに限定されないが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dを含む。
このフォーマットでは、バリアントIL-12p40サブユニットおよびIL-12p35サブユニットの有用な組み合わせは、これらに限定されないが、IL-12p40(E59K/K99Y)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(E59K/K99E/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(E59K/K99Y/C252S)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、ならびにIL-12p40(E59K/K99E/C252S)およびIL-12p35(配列番号2)を含む。
このフォーマットでは、バリアントIL-12p40サブユニットおよびIL-12p35サブユニットの有用な組み合わせは、これに限定されないが、配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)を含むIL-12p35と、これらに限定されないが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、E299Q、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eを含む、1つ以上の置換を含むバリアントIL-12p40との組み合わせを含む。
このフォーマットでは、IL-12p40およびIL-12p35バリアントの有用な組み合わせは、これに限定されないが、配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)を含むIL-12p40と、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、N195Q、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dを含むIL-12p35との組み合わせを含む。
このフォーマットでは、IL-12p40バリアントおよびIL-12p35バリアントの有用な組み合わせは、これに限定されないが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、E299Q、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E;からなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を含むIL-12p40バリアントと、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、N195Q、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択される1つ以上の置換を含むIL-12p35バリアントとの組み合わせを含む。
このフォーマットでは、有用な実施形態には、図10に見られるものが含まれるが、これらに限定されない。
C.scIL-12-Fcフォーマット
さらなる実施形態では、本発明は、N末端単鎖IL-12-Fc融合体または「scIL-12-Fc」フォーマットを提供する。この実施形態では、図8C~Dに示されるように、ヘテロ二量体融合タンパク質は、2つの単量体を含む。第1の単量体は、(N末端からC末端へ)scIL-12-任意のドメインリンカー-Fcを含む。第2の単量体は、ヒンジ-CH2-CH3の全部または一部を含む、「空」Fcを含む。scIL-12は、IL-12p40サブユニットが(ドメインリンカーありまたはなしで)IL-12p35サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p40/p35)」、またはIL-12p35が(ドメインリンカーありまたはなしで)IL-12p40サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p35/p40)」であり得る。
scIL-12-Fcフォーマットでは、好ましい実施形態は、スキューバリアント対S364K/E357Q:L368D/K370Sを利用する。
scIL-12-Fcフォーマットでは、好ましい実施形態は、図11にXENP24203(鎖1および鎖2を含む)およびXENP24204(鎖1および鎖2を含む)として示される。
scIL-12-Fcフォーマットでは、好ましい実施形態は、図50にXENP31290(鎖1および鎖2を含む)として示される。
いくつかの実施形態では、scIL-12-Fcフォーマットは、二価IL-12-Fc融合体である。いくつかの実施形態では、二価IL-12-Fc融合フォーマット(図48A~B)は、各々が、(任意にドメインリンカーを介して)ホモ二量体Fc鎖のN末端に融合したscIL-12複合体組換え体を含む、2つの同一の単量体を含む。
いくつかの実施形態では、scIL-12-Fcフォーマットは、a)N末端からC末端へ、i)IL-12p40ドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)IL-12p35ドメインタンパク質、iv)任意の第2のリンカー、v)第1のバリアントFcドメインタンパク質を含む第1の単量体と、b)第2のバリアントFcドメインタンパク質を含む第2の単量体と、を含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質である。
いくつかの実施形態では、scIL-12-Fcフォーマットは、a)N末端からC末端へ、i)IL-12p35ドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)IL-12p40ドメインタンパク質、iv)任意の第2のリンカー、v)第1のバリアントFcドメインタンパク質を含む第1の単量体と、b)第2のバリアントFcドメインタンパク質を含む第2の単量体と、を含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質である。
いくつかの実施形態では、Fcバリアントは、本明細書で提供されるような1つ以上のスキュー、pI、およびアブレーションバリアントを含む。一実施形態では、Fcバリアントは、特定のスキュー、pI、およびアブレーションバリアントを含む。いくつかの実施形態では、第1および第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾は、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357Q;T366S/L368A/Y407VおよびT366W;T366S/L368A/Y407V/Y349CおよびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する。いくつかの実施形態では、第1および第2のFcドメインは、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む。
このフォーマットでは、有用なIL-12p40タンパク質ドメインは、これに限定されないが、配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)を含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p40バリアントは、これらに限定されないが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qを含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p40バリアントは、これらに限定されないが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eを含む。
このフォーマットでは、IL-12p35タンパク質ドメインは、配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)を含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p35バリアントは、これらに限定されないが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qを含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p35バリアントは、これらに限定されないが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dを含む。
このフォーマットでは、バリアントIL-12p40サブユニットおよびIL-12p35サブユニットの有用な組み合わせは、これらに限定されないが、IL-12p40(E59K/K99Y)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(E59K/K99E/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(E59K/K99Y/C252S)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、ならびにIL-12p40(E59K/K99E/C252S)およびIL-12p35(配列番号2)を含む。
このフォーマットでは、バリアントIL-12p40サブユニットおよびIL-12p35サブユニットの有用な組み合わせは、これに限定されないが、配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)を含むIL-12p35と、これらに限定されないが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、E299Q、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eを含む、1つ以上の置換を含むバリアントIL-12p40との組み合わせを含む。
このフォーマットでは、IL-12p40およびIL-12p35バリアントの有用な組み合わせは、これに限定されないが、配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)を含むIL-12p40と、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、N195Q、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dを含むIL-12p35との組み合わせを含む。
このフォーマットでは、IL-12p40バリアントおよびIL-12p35バリアントの有用な組み合わせは、これに限定されないが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、E299Q、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E;からなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を含むIL-12p40バリアントと、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、N195Q、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択される1つ以上の置換を含むIL-12p35バリアントとの組み合わせを含む。
このフォーマットでは、有用な実施形態には、図11に見られるものが含まれるが、これらに限定されない。
D.Fc-scIL-12フォーマット
追加の実施形態では、本発明は、C末端単鎖IL-12-Fc融合体または「Fc-scIL-12」フォーマットを提供する。この実施形態では、図8E~Fに示されるように、ヘテロ二量体融合タンパク質は、2つの単量体を含む。第1の単量体は、(N末端からC末端へ)Fc-任意のリンカー-scIL-12を含む。第2の単量体は、ヒンジ-CH2-CH3の全部または一部を含む、「空」Fcを含む。上記のように、scIL-12は、IL-12p40サブユニットが(ドメインリンカーありまたはなしで)IL-12p35サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p40/p35)」、またはIL-12p35が(ドメインリンカーありまたはなしで)IL-12p40サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p35/p40)」であり得る。
Fc-scIL-12フォーマットでは、好ましい実施形態は、スキューバリアント対S364K/E357Q:L368D/K370Sを利用する。
いくつかの実施形態では、scIL-12-Fcフォーマットは、二価IL-12-Fc融合体である。いくつかの実施形態では、二価IL-12-Fc融合フォーマット(図48C~D)は、各々が、(任意にドメインリンカーを介して)ホモ二量体Fc鎖のC末端に融合したscIL-12複合体組換え体を含む、2つの同一の単量体を含む。
いくつかの実施形態では、scIL-12-Fcフォーマットは、a)N末端からC末端へ、i)第1のバリアントFcドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)IL-12p40ドメインタンパク質、iv)任意の第2のドメインリンカー、v)IL-12p35ドメインタンパク質を含む第1の単量体と、b)第2のバリアントFcドメインタンパク質を含む第2の単量体と、を含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、scIL-12-Fcフォーマットは、a)N末端からC末端へ、i)第1のバリアントFcドメインタンパク質、ii)任意の第1のドメインリンカー、iii)IL-12p35ドメインタンパク質、iv)任意の第2のドメインリンカー、v)IL-12p40ドメインタンパク質を含む第1の単量体と、b)第2のバリアントFcドメインタンパク質を含む第2の単量体と、を含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を提供する。
いくつかの実施形態では、Fcバリアントは、本明細書で提供されるような1つ以上のスキュー、pI、およびアブレーションバリアントを含む。一実施形態では、Fcバリアントは、特定のスキュー、pI、およびアブレーションバリアントを含む。いくつかの実施形態では、第1および第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾は、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357Q;T366S/L368A/Y407VおよびT366W;T366S/L368A/Y407V/Y349CおよびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する。いくつかの実施形態では、第1および第2のFcドメインは、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む。
このフォーマットでは、有用なIL-12p40タンパク質ドメインは、これに限定されないが、配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)を含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p40バリアントは、これらに限定されないが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qを含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p40バリアントは、これらに限定されないが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eを含む。
このフォーマットでは、IL-12p35タンパク質ドメインは、配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)を含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p35バリアントは、これらに限定されないが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qを含む。このフォーマットでは、有用なIL-12p35バリアントは、これらに限定されないが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dを含む。
このフォーマットでは、バリアントIL-12p40サブユニットおよびIL-12p35サブユニットの有用な組み合わせは、これらに限定されないが、IL-12p40(E59K/K99Y)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(E59K/K99E/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(E59K/K99Y/C252S)およびIL-12p35(配列番号2)、IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E)およびIL-12p35(配列番号2)、ならびにIL-12p40(E59K/K99E/C252S)およびIL-12p35(配列番号2)を含む。
このフォーマットでは、バリアントIL-12p40サブユニットおよびIL-12p35サブユニットの有用な組み合わせは、これに限定されないが、配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)を含むIL-12p35と、これらに限定されないが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、E299Q、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eを含む、1つ以上の置換を含むバリアントIL-12p40との組み合わせを含む。
このフォーマットでは、IL-12p40およびIL-12p35バリアントの有用な組み合わせは、これに限定されないが、配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)を含むIL-12p40と、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、N195Q、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dを含むIL-12p35との組み合わせを含む。
このフォーマットでは、IL-12p40バリアントおよびIL-12p35バリアントの有用な組み合わせは、これに限定されないが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、E299Q、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E;からなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を含むIL-12p40バリアントと、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、N195Q、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択される1つ以上の置換を含むIL-12p35バリアントとの組み合わせを含む。
VIII.本発明の有用な実施形態
当業者によって理解され、以下でより完全に議論されるように、本発明のヘテロ二量体融合タンパク質は、一般に図8A~Fに示されるように、多種多様な立体配置をとることができる。例示的な融合タンパク質のアミノ酸配列は、図9~11に提供される。
本明細書に概説される実施形態の多くは、一般に、第1のFcドメインのN末端に(任意にドメインリンカーを介して)共有結合したIL-12p35サブユニットドメインを含む第1の単量体(第1の融合タンパク質)、および第2のFcドメインのN末端に(任意にドメインリンカーを介して)共有結合したIL-12p40サブユニットドメインを含む第2の単量体(第2の融合タンパク質)を含むフォーマットに依存する。このフォーマットの例示的な実施形態は、これに限定されないが、XENP27201を含む。追加の実施形態では、第1の単量体は、i)配列番号XX(XENP27201鎖1)、ii)配列番号XX(XenD24752)、iii)配列番号XX(XenD24753)、iv)配列番号XX(XenD24754)、v)配列番号XX(XenD24755)、vi)配列番号XX(XenD24756)、vii)配列番号XX(XenD24757)、viii)配列番号XX(XenD24758)、ix)配列番号XX(XenD24759)、x)配列番号XX(XenD24760)、xi)配列番号XX(XenD24761)、xii)配列番号XX(XenD24762)、xiii)配列番号XX(XenD24763)、xiv)配列番号XX(XenD24764)、xv)配列番号XX(XenD24765)、xvi)配列番号XX(XenD24766)、xvii)配列番号XX(XenD24767)、xviii)配列番号XX(XenD24768)、xix)配列番号XX(XenD24769)、xx)配列番号XX(XenD24770)、xxi)配列番号XX(XenD24771)、xxii)配列番号XX(XenD24772)、xxiii)配列番号XX(XenD24773)、xxiv)配列番号XX(XenD24774)、xxv)配列番号XX(XenD24775)、xxvi)配列番号XX(XenD24776)、xxvii)配列番号XX(XenD24777)、xxviii)配列番号XX(XenD24778)、xxix)配列番号XX(XenD24792)、xxx)配列番号XX(XenD25922)、xxxi)配列番号XX(XenD25923)、xxxii)配列番号XX(XenD25924)、xxxiii)配列番号XX(XenD25925)、xxxiv)配列番号XX(XenD25926)、xxxv)配列番号XX(XenD25927)、xxxvi)配列番号XX(XenD25928)、xxxvii)配列番号XX(XenD25929)、xxxviii)配列番号XX(XenD25930)、およびxxxix)配列番号XX(XenD25931)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、第2の単量体は、i)配列番号XX(XENP27201鎖2)、ii)配列番号XX(XenD24779)、iii)配列番号XX(XenD24780)、iv)配列番号XX(XenD24781)、v)配列番号XX(XenD24782)、vi)配列番号XX(XenD24783)、vii)配列番号XX(XenD24784)、viii)配列番号XX(XenD24785)、ix)配列番号XX(XenD24786)、x)配列番号XX(XenD24787)、xi)配列番号XX(XenD24788)、xii)配列番号XX(XenD24789)、xiii)配列番号XX(XenD24790)、xiv)配列番号XX(XenD24791)、xv)配列番号XX(XenD25911)、xvi)配列番号XX(XenD25912)、xvii)配列番号XX(XenD25913)、xviii)配列番号XX(XenD25914)、xix)配列番号XX(XenD25915)、xx)配列番号XX(XenD25916)、xxi)配列番号XX(XenD25917)、xxii)配列番号XX(XenD25918)、xxiii)配列番号XX(XenD25919)、xxiv)配列番号XX(XenD25920)、およびxxv)配列番号XX(XenD25921)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する。特定のそのような実施形態は、これらに限定されないが、XENP27201、XENP28820、XENP28821、XENP28822、XENP28823、XENP28824、XENP28825、XENP28826、XENP28827、XENP28828、XENP28829、XENP28830、XENP28831、XENP28832、XENP28833、XENP28834、XENP28835、XENP28836、XENP28837、XENP28838、XENP28839、XENP28840、XENP28841、XENP28842、XENP28843、XENP28844、XENP28845、XENP28846、XENP28847、XENP28848、XENP28849、XENP28850、XENP28851、XENP28852、XENP29949、XENP29950、XENP29951、XENP29952、XENP30597、XENP30598、XENP30599、XENP30600、XENP30601、XENP30602、XENP30603、XENP30604、XENP30605、XENP30606、XENP30307、XENP30308、XENP30609、XENP31250、XENP31251、XENP31252、XENP31253、XENP31254、XENP31255、XENP31256、XENP31257、XENP31258、XENP31259、XENP31260、XENP31261、XENP31262、XENP31263、XENP31264、XENP31265、XENP31286、XENP31142、XENP31143、XENP31144、XENP31145、XENP31146、XENP31582、XENP31583、XENP31584、XENP32187、XENP32188、XENP32189、XENP32190、XENP32191、XENP32991、XENP32992、XENP32993、XENP32994、XENP32995、XENP32996、XENP32997、XENP32998、XENP32999、XENP33000、XENP33001、XENP33002、XENP33003、XENP33004、XENP33005、XENP33006、XENP33007、XENP33008、XENP33008、XENP33009、XENP33010、およびXENP33011を含む。ヘテロ二量体Fc融合タンパク質の有用な実施形態は、第1のFcドメインのC末端に(任意にドメインリンカーを介して)共有結合したIL-12p35サブユニットドメインを含む第1の単量体(第1の融合タンパク質)、および第2のFcドメインのC末端に(任意にドメインリンカーを介して)共有結合したIL-12p40サブユニットドメインを含む第2の単量体(第2の融合タンパク質)を含む。このフォーマットの例示的な実施形態は、これに限定されないが、XENP27202を含む。
ヘテロ二量体Fc融合タンパク質の別の有用な実施形態は、第1のFcドメイン、および第2のFcドメイン(例えば、空のFcドメイン)のN末端に(任意にドメインリンカーを介して)共有結合した単鎖IL-12複合体(「scIL-12」)を含む第1の単量体(第1の融合タンパク質)を含む。scIL-12は、IL-12p40サブユニットが(ドメインリンカーありまたはなしで)IL-12p35サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p40/p35)」、またはIL-12p35が(ドメインリンカーありまたはなしで)IL-12p40サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p35/p40)」であり得る。このフォーマットの例示的な実施形態は、これらに限定されないが、XENP27203およびXENP27204を含む。
ヘテロ二量体Fc融合タンパク質のさらに有用な実施形態は、第1のFcドメイン、および第2のFcドメイン(例えば、空のFcドメイン)のC末端に(任意にドメインリンカーを介して)共有結合した単鎖IL-12複合体(「scIL-12」)を含む第1の単量体(第1の融合タンパク質)を含む。scIL-12は、IL-12p40サブユニットが(ドメインリンカーありまたはなしで)IL-12p35サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p40/p35)」、またはIL-12p35が(ドメインリンカーありまたはなしで)IL-12p40サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p35/p40)」であり得る。
本明細書に概説されるヘテロ二量体Fc融合タンパク質のいずれかについて、第1の単量体、第2の単量体、および/またはscIL-12において使用される任意のドメインリンカーは、同じでも異なってもよい。加えて、ヘテロ二量体タンパク質の第1のFcドメインおよび第2のFcドメインは、異なるアミノ酸配列を有し得る。
本発明のFcドメインは、IgG Fcドメイン、例えば、IgG1Fcドメインを含む。いくつかの実施形態では、第1および第2のFcドメインは、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357QおよびT366S/L368A/Y407V:T366W(任意に架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットを含む。いくつかの例では、本明細書に概説されるヘテロ二量体Fc融合フォーマットのうちのいずれかの第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有することができる。いくつかの実施形態では、第1および/または第2のFcドメインは、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する。
追加のヘテロ二量体化またはホモ二量体化バリアントは、独立してかつ任意に含み、図に概説されるバリアントから選択することができる。これらの組成物は、アブレーションバリアント、pIバリアント、荷電バリアント、アイソタイプバリアントなどをさらに含み得る。
A.IL-12p40バリアント
いくつかの実施形態では、IL-12p40サブユニットは、バリアントIL-12p40サブユニットである。いくつかの特定のそのような実施形態では、IL-12p40サブユニットは、低減された不均一性を有するバリアントIL-12p40サブユニットである。他の特定のそのような実施形態では、IL-12p40サブユニットは、変更された、すなわち、低減または増加された、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/またはIL-12受容体複合体についての親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットである。いくつかの実施形態では、バリアントIL-12p40サブユニットは、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252、Q256、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する。(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列に従って付番される)。
いくつかの実施形態では、バリアントIL-12p40サブユニットは、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する。いくつかの実施形態では、バリアントIL-12p40サブユニットは、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する。
いくつかの実施形態では、IL-12p40バリアントは、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する。
B.IL-12p35バリアント
いくつかの実施形態では、IL-12p35サブユニットは、バリアントIL-12p35サブユニットである。いくつかの特定のそのような実施形態では、IL-12p35サブユニットは、低減された不均一性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである。他の特定のそのような実施形態では、IL-12p35サブユニットは、変更された、すなわち、低減または増加された、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/またはIL-12受容体複合体についての親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである。いくつかの実施形態では、バリアントIL-12p35サブユニットは、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する。(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列に従って付番される)。いくつかの実施形態では、バリアントIL-12p35サブユニットは、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する。いくつかの実施形態では、バリアントIL-12p35サブユニットは、アミノ酸置換N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dを有する。いくつかの実施形態では、バリアントIL-12p35サブユニットは、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q)、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、lx)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、lxi)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、lxii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、lxiv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、lxv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびlxvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する。
C.追加の選択肢
いくつかの実施形態では、scIL-12-Fcフォーマットは、二価IL-12-Fc融合体である。いくつかの実施形態では、二価IL-12-Fc融合フォーマット(図48A~B)は、各々が、(任意にドメインリンカーを介して)ホモ二量体Fc鎖のN末端に融合したscIL-12複合体組換え体を含む、2つの同一の単量体を含む。いくつかの実施形態では、二価IL-12-Fc融合フォーマット(図48C~D)は、各々が、(任意にドメインリンカーを介して)ホモ二量体Fc鎖のC末端に融合したscIL-12複合体組換え体を含む、2つの同一の単量体を含む。例としては、これらに限定されないが、XENP31289およびXENP31291(図49)が挙げられる。
いくつかの実施形態では、IL-12Fc融合タンパク質は、M428LおよびN434Sを含む置換によって半減期を延長するためにさらに操作される。いくつかの実施形態では、IL-12Fc融合タンパク質は、M428L/N434Sを含む置換によって半減期を延長するためにさらに操作される。本明細書に列挙されるIL-12Fc融合体のいずれかは、半減期を延長するために操作され得る。例としては、これらに限定されないが、XENP31582、XENP31583、およびXENP31584(図65)が挙げられる。
いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質の例は、XENP27201、XENP28820、XENP28821、XENP28822、XENP28823、XENP28824、XENP28825、XENP28826、XENP28827、XENP28828、XENP28829、XENP28830、XENP28831、XENP28832、XENP28833、XENP28834、XENP28835、XENP28836、XENP28837、XENP28838、XENP28839、XENP28840、XENP28841、XENP28842、XENP28843、XENP28844、XENP28845、XENP28846、XENP28847、XENP28848、XENP28849、XENP28850、XENP28851、XENP28852、XENP29949、XENP29950、XENP29951、XENP29952、XENP30597、XENP30598、XENP30599、XENP30600、XENP30601、XENP30602、XENP30603、XENP30604、XENP30605、XENP30606、XENP30307、XENP30308、XENP30609、XENP31250、XENP31251、XENP31252、XENP31253、XENP31254、XENP31255、XENP31256、XENP31257、XENP31258、XENP31259、XENP31260、XENP31261、XENP31262、XENP31263、XENP31264、XENP31265、XENP31286、XENP31142、XENP31143、XENP31144、XENP31145、XENP31146、XENP31582、XENP31583、XENP31584、XENP32186、XENP32187、XENP32188、XENP32189、XENP32190、XENP32191、XENP32991、XENP32992、XENP32993、XENP32994、XENP32995、XENP32996、XENP32997、XENP32998、XENP32999、XENP33000、XENP33001、XENP33002、XENP33003、XENP33004、XENP33005、XENP33006、XENP33007、XENP33008、XENP33008、XENP33009、XENP33010、およびXENP33011を含む。
いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質の例は、i)配列番号47(XENP27201鎖1)、ii)配列番号85(XenD24752)、iii)配列番号86(XenD24753)、iv)配列番号87(XenD24754)、v)配列番号88(XenD24755)、vi)配列番号89(XenD24756)、vii)配列番号90(XenD24757)、viii)配列番号91(XenD24758)、ix)配列番号92(XenD24759)、x)配列番号93(XenD24760)、xi)配列番号94(XenD24761)、xii)配列番号95(XenD24762)、xiii)配列番号96(XenD24763)、xiv)配列番号97(XenD24764)、xv)配列番号98(XenD24765)、xvi)配列番号99(XenD24766)、xvii)配列番号100(XenD24767)、xviii)配列番号101(XenD24768)、xix)配列番号102(XenD24769)、xx)配列番号103(XenD24770)、xxi)配列番号104(XenD24771)、xxii)配列番号105(XenD24772)、xxiii)配列番号106(XenD24773)、xxiv)配列番号107(XenD24774)、xxv)配列番号108(XenD24775)、xxvi)配列番号109(XenD24776)、xxvii)配列番号110(XenD24777)、xxviii)配列番号111(XenD24778)、xxix)配列番号112(XenD24792)、xxx)配列番号215(XenD25922)、xxxi)配列番号216(XenD25923)、xxxii)配列番号217(XenD25924)、xxxiii)配列番号218(XenD25925)、xxxiv)配列番号219(XenD25926)、xxxv)配列番号220(XenD25927)、xxxvi)配列番号221(XenD25928)、xxxvii)配列番号222(XenD25929)、xxxviii)配列番号223(XenD25930)、xxxix)配列番号224(XenD25931)、xl)配列番号XXX(XenD26411)、xli)配列番号XXX(XenD26412)、xlii)配列番号XXX(XenD26413)、xliii)配列番号XXX(XenD26414)、xliv)配列番号XXX(XenD26415)、xlv)配列番号XXX(XenD26416)、xlvi)配列番号XXX(XenD26417)、xlvii)配列番号XXX(XenD26418)、xlviii)配列番号XXX(XenD27070)、xlix)配列番号XXX(XenD27071)、l)配列番号XXX(XenD27072)、li)配列番号XXX(XenD27073)、lii)配列番号XXX(XenD27074)、liii)配列番号XXX(XenD27075)、liv)配列番号XXX(XenD27076)、lv)配列番号XXX(XenD27077)配列番号XXX(XenD27078)、lvii)配列番号XXX(XenD28173)、lviii)配列番号XXX(XenD24876)、lix)配列番号XXX(XenD27162)、lx)配列番号XXX(XenD27163)、lxi)配列番号XXX(XenD27164)、lxii)配列番号XXX(XenD27165)lxiii)配列番号XXX(XENP31582鎖1)、lxiv)配列番号XXX(XENP31583鎖1)、lxv)配列番号XXX(XENP31584鎖1)、lxvi)配列番号XXX(XENP32187鎖1)、lxvii)配列番号XXX(XENP32188鎖1)、lxviii)配列番号XXX(XENP32189、鎖1)、lxix)配列番号XXX(XENP32190鎖1)、lxx)配列番号XXX(XENP32191鎖1)、lxxi)配列番号XXX(XENP32991鎖1)、lxxii)配列番号XXX(XENP32992鎖1)、lxxiii)配列番号XXX(XENP32993鎖1)、lxxiv)配列番号XXX(XENP32994鎖1)、lxxv)配列番号XXX(XENP32995鎖1)、lxxvi)配列番号XXX(XENP32996鎖1)、lxxvi)配列番号XXX(XENP32997鎖1)、lxxvii)配列番号XXX(XENP32998鎖1)、lxxvii)配列番号XXX(XENP32999鎖1)、lxxviii)配列番号XXX(XENP33000鎖1)、lxxix)配列番号XXX(XENP33001鎖1)、lxxx)配列番号XXX(XENP33002鎖1)、lxxxi)配列番号XXX(XENP33003鎖1)、lxxxii)配列番号XXX(XENP33004鎖1)、lxxxiii)配列番号XXX(XENP33005鎖1)、lxxxiv)配列番号XXX(XENP33006鎖1)、lxxxv)配列番号XXX(XENP33007鎖1)、lxxxvi)配列番号XXX(XENP33008鎖1)、lxxxvii)配列番号XXX(XENP33008鎖1)、lxxxviii)配列番号XXX(XENP33009鎖1)、lxxxix)配列番号XXX(XENP33010鎖1)、およびxc)配列番号XXX(XENP33011鎖1)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する第1の融合タンパク質と、i)配列番号48(XENP27201鎖2)、ii)配列番号126(XenD24779)、iii)配列番号127(XenD24780)、iv)配列番号128(XenD24781)、v)配列番号129(XenD24782)、vi)配列番号130(XenD24783)、vii)配列番号131(XenD24784)、viii)配列番号132(XenD24785)、ix)配列番号133(XenD24786)、x)配列番号134(XenD24787)、xi)配列番号135(XenD24788)、xii)配列番号136(XenD24789)、xiii)配列番号137(XenD24790)、xiv)配列番号138(XenD24791)、xv)配列番号236(XenD25911)、xvi)配列番号237(XenD25912)、xvii)配列番号238(XenD25913)、xviii)配列番号239(XenD25914)、xix)配列番号240(XenD25915)、xx)配列番号241(XenD25916)、xxi)配列番号242(XenD25917)、xxii)配列番号243(XenD25918)、xxiii)配列番号244(XenD25919)、xxiv)配列番号245(XenD25920)、xxv)配列番号246(XenD25921)、xxvi)配列番号XXX(XenD26427)、xxvii)配列番号XXX(XenD26428)、xxviii)配列番号XXX(XenD27089)、xxix)配列番号XXX(XenD27090)、xxx)配列番号XXX(XenD27091)、xxxi)配列番号XXX(XenD27092)、xxxii)配列番号XXX(XenD27093)、xxxiii)配列番号XXX(XenD27094)、xxxix)配列番号XXX(XenD24877)、xl)配列番号XXX(XenD27166)、xli)配列番号XXX(XENP31582鎖2)、xlii)配列番号XXX(XENP31583鎖2)、xliii)配列番号XXX(XENP31584鎖2)、xliv)配列番号XXX(XENP32187鎖2)、xlv)配列番号XXX(XENP32188鎖2)、xlvi)配列番号XXX(XENP32189、鎖2)、xlvii)配列番号XXX(XENP32190鎖2)、xlviii)配列番号XXX(XENP32191鎖2)、xlix)配列番号XXX(XENP32991鎖2)、l)配列番号XXX(XENP32992鎖2)、li)配列番号XXX(XENP32993鎖2)、lii)配列番号XXX(XENP32994鎖2)、liii)配列番号XXX(XENP32995鎖2)、liv)配列番号XXX(XENP32996鎖2)、lv)配列番号XXX(XENP32997鎖2)、lvi)配列番号XXX(XENP32998鎖2)、lvii)配列番号XXX(XENP32999鎖2)、lviii)配列番号XXX(XENP33000鎖2)、lix)配列番号XXX(XENP33001鎖2)、lx)配列番号XXX(XENP33002鎖2)、lxi)配列番号XXX(XENP33003鎖2)、lxii)配列番号XXX(XENP33004鎖2)、lxiii)配列番号XXX(XENP33005鎖2)、lxiv)配列番号XXX(XENP33006鎖2)、lxv)配列番号XXX(XENP33007鎖2)、lxvi)配列番号XXX(XENP33008鎖2)、lxvii)配列番号XXX(XENP33008鎖2)、lxviii)配列番号XXX(XENP33009鎖2)、lxix)配列番号XXX(XENP33010鎖2)、およびlxx)配列番号XXX(XENP33011鎖2)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する当該第2の融合タンパク質と、を含む。
好ましい実施形態は、XENP31251、XENP31254、XENP31258、XENP32186、XENP32187、XENP32188、XENP32189、XENP32190、およびXENP32191を含む。さらなる実施形態では、XENP31251、XENP31254、XENP31258、XENP32186、XENP32187、XENP32188、XENP32189、XENP32190、およびXENP32191は、さらなる糖鎖工学を含む。
IX.本発明の核酸
本発明は、本発明のヘテロ二量体Fc融合タンパク質、IL-12サブユニット、およびIL-12ヘテロ二量体複合体をコードする核酸組成物(または、単量体Fcドメインタンパク質の場合、同様にそれらをコードする核酸)をさらに提供する。
当業者には理解されるように、核酸組成物はヘテロ二量体タンパク質のフォーマットに依存するであろう。したがって、例えば、フォーマットが3つのアミノ酸配列を必要とするとき、3つの核酸配列を発現のために1つ以上の発現ベクターに組み込むことができる。同様に、いくつかのフォーマットは2つの核酸のみを必要とし、同様に、それらを1つまたは2つの発現ベクターに入れることができる。
当該技術分野において既知であるように、本発明の構成要素をコードする核酸は、当該技術分野において既知であるように、そして本発明のヘテロ二量体Fc融合タンパク質を産生するために使用される宿主細胞に依存した発現ベクターに組み込まれ得る。一般に、核酸は任意の数の調節エレメント(プロモーター、複製起点、選択可能マーカー、リボソーム結合部位、インデューサーなど)に作動可能に結合されている。発現ベクターは、染色体外ベクターまたは組み込みベクターであり得る。
次いで、本発明の核酸および/または発現ベクターを、哺乳動物細胞、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞および/または真菌細胞を含む当該技術分野で周知の任意の数の異なる種類の宿主細胞に形質転換するが、哺乳動物細胞(例えばCHO細胞)が、多くの実施形態において使用される。
いくつかの実施形態では、各単量体をコードする核酸は、フォーマットに応じて適用可能なように、それぞれ一般に異なるまたは同じプロモーター制御下で単一の発現ベクター内に含有される。本発明において特に使用される実施形態では、これら2つまたは3つの核酸の各々は異なる発現ベクターに含有される。
本発明のヘテロ二量体Fc融合タンパク質は、当該技術分野において周知のように、発現ベクター(複数可)を含む宿主細胞を培養することによって作製される。一旦産生されると、イオン交換クロマトグラフィーステップを含む従来の融合タンパク質または抗体精製ステップが実施される。本明細書で議論されるように、2つの単量体のpIが少なくとも0.5異なることは、イオン交換クロマトグラフィーもしくは等電点電気泳動、または等電点に感受性の他の方法による分離を可能にし得る。すなわち、各単量体が異なる等電点(pI)を有し、ヘテロ二量体も異なるpIを有するように、各単量体のpIを変更させるpI置換を含むことによって、ヘテロ二量体の等電点精製(例えば、アニオン交換クロマトグラフィー、カチオン交換クロマトグラフィー)を促進する。これらの置換はまた、精製後の任意の混入したホモ二量体の特定および監視にも役立つ(例えば、IEFゲル、cIEF、および分析用IEXカラム)。
X.IL-12ヘテロ二量体免疫調節Fc融合タンパク質の生物学的および生化学的機能性
一般に、本発明のFc融合タンパク質は、癌を有する患者に投与され、有効性は、本明細書に記載されるようないくつかの方法で評価される。したがって、癌量、腫瘍のサイズ、転移の存在または程度の評価などの、有効性の標準的なアッセイを実行し得るが、免疫腫瘍学的治療もまた免疫状態評価に基づいて評価され得る。これは、インビトロアッセイおよびインビボアッセイの両方を含むいくつかの方法で行うことができる。例えば、腫瘍量、サイズ、侵襲性、LN関与、転移などといった「古典的な」測定と併せて、免疫状態(例えば、ipi治療後のICOS+CD4+T細胞の存在)の変化の評価を実施することができる。したがって、以下のいずれかまたは全てを評価することができる:CD4T細胞活性化もしくは増殖、CD8T(CTL)細胞活性化もしくは増殖、CD8T細胞媒介性細胞傷害性活性および/もしくはCTL媒介性細胞枯渇、NK細胞活性およびNK媒介性細胞枯渇に対するPVRIGの阻害効果、Treg細胞分化および増殖ならびにTregもしくは骨髄由来抑制細胞(MDSC)媒介性免疫抑制もしくは免疫耐性に対するPVRIGの増強効果、ならびに/または免疫細胞による炎症促進性サイトカイン産生、例えば、Tもしくは他の免疫細胞によるIL-2、IFN-γ、もしくはTNF-α産生に対するPVRIGの効果。
いくつかの実施形態では、治療の評価は、例えば、CFSE希釈法、免疫エフェクター細胞のKi67細胞内染色、およびH-チミジン組み込み法を使用して、免疫細胞増殖を評価することによって実施される。
いくつかの実施形態では、治療の評価は、遺伝子発現の増加、またはCD25、CD69、CD137、ICOS、PD1、GITR、OX40、およびCD107Aの表面発現によって測定される細胞脱顆粒のうちの1つ以上を含む、活性化関連マーカーの増加したタンパク質レベルを評価することによって行われる。
一般に、遺伝子発現アッセイは、当該技術分野で既知であるように行われる。
一般に、タンパク質発現測定も同様に、当該技術分野で知られているように実施される。
いくつかの実施形態では、治療の評価は、酵素活性(プロテアーゼ活性を含む)、細胞膜透過性、細胞接着、ATP産生、補酵素産生、およびヌクレオチド取り込み活性などの多数の細胞パラメータを推測することを通した標的細胞生存検出によって測定される細胞傷害性活性を評価することによって行われる。これらのアッセイの具体的な例としては、トリパンブルーまたはPI染色、51Crまたは35S放出法、LDH活性、MTTおよび/またはWSTアッセイ、カルセイン-AMアッセイ、発光系アッセイ、ならびに他のものが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、治療の評価は、サイトカイン産生によって測定されるT細胞活性を評価することによって行われ、周知の技法を使用して、IFNγ、TNFα、GM-CSF、IL2、IL6、IL4、IL5、IL10、IL13を含むが、これらに限定されない、サイトカインを使用して、培養上清中で細胞内のいずれかで測定する。
したがって、治療の評価は、以下のうちの1つ以上を評価するアッセイを使用して行うことができる:(i)免疫応答の増加、(ii)αβおよび/またはγδT細胞の活性化の増加、(iii)細胞傷害性T細胞活性の増加、(iv)NKおよび/またはNKT細胞活性の増加、(v)αβおよび/またはγδT細胞抑制の軽減、(vi)炎症促進性サイトカイン分泌の増加、(vii)IL-2分泌の増加、(viii)インターフェロン-γ産生の増加、(ix)Th1応答の増加、(x)Th2応答の減少、(xi)調節性T細胞(Treg)のうちの少なくとも1つの細胞数および/または活性の減少または除外。
A.有効性(Efficacy)および有効性(Potency)を測定するアッセイ
いくつかの実施形態では、T細胞活性化は、当技術分野において既知の混合リンパ球反応(MLR)アッセイを使用して評価される。活性の増加は免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、異なる因子のリン酸化もしくは脱リン酸化によって、または他の翻訳後修飾を測定することによって測定される免疫応答の増加または減少を測定する。IL-12は、STAT4のリン酸化を通してIFNγ発現および分泌を媒介する(Morinobu et al.、2002)。したがって、好ましい実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、STAT4のリン酸化によって示されるように、免疫応答の増加または減少を測定する。活性の増加は免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、サイトカイン分泌によって、または増殖によって、または例えば、CD137、CD107a、PD1などのような活性化マーカーの発現の変化によって測定される、αβおよび/またはγδT細胞の活性化の増加または減少を測定する。活性の増加は、免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、例えば、癌細胞のような標的細胞の直接的な殺傷によって、またはサイトカイン分泌によって、または増殖によって、または例えば、CD137、CD107a、PD1などのような活性化マーカーの発現の変化によって測定される、細胞傷害性T細胞活性の増加または減少を測定する。活性の増加は、免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、例えば、癌細胞のような標的細胞の直接的な殺傷によって、またはサイトカイン分泌によって、または例えば、CD107aなどの例のような活性化マーカーの発現の変化によって測定される、NKおよび/またはNKT細胞活性の増加または減少を測定する。活性の増加は免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、サイトカイン分泌によって、または増殖によって、または例えば、CD137、CD107a、PD1などのような活性化マーカーの発現の変化によって測定される、αβおよび/またはγδT細胞抑制の増加または減少を測定する。活性の増加は、免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、ELISAによって、またはLuminexによって、またはマルチプレックスビーズ系方法によって、または細胞内染色およびFACS分析によって、またはAlispotなどによって測定される、炎症促進性サイトカイン分泌の増加または減少を測定する。活性の増加は免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、ELISAによって、またはLuminexによって、またはマルチプレックスビーズ系方法によって、または細胞内染色およびFACS分析によって、またはAlispotなどによって測定される、IL-2分泌の増加または減少を測定する。活性の増加は、免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、ELISAによって、またはLuminexによって、またはマルチプレックスビーズ系方法によって、または細胞内染色およびFACS解析によって、またはAlispot等によって測定される、インターフェロン-γ産生の増加または減少を測定する。活性の増加は免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、サイトカイン分泌によって、または活性化マーカーの発現の変化によって測定される、Th1応答の増加または減少を測定する。活性の増加は免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、サイトカイン分泌によって、または活性化マーカーの発現の変化によって測定される、Th2応答の増加または減少を測定する。活性の増加は免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、フローサイトメトリーによって、またはIHCによって測定される調節性T細胞(Treg)のうちの少なくとも1つの細胞数および/または活性の増加または減少を測定する。応答の減少は免疫刺激活性を示す。適切な減少は、以下に概説する増加の場合と同じである。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、フローサイトメトリーによって、またはIHCによって測定される、M2マクロファージ細胞数の増加または減少を測定する。応答の減少は免疫刺激活性を示す。適切な減少は、以下に概説する増加の場合と同じである。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、サイトカイン分泌によって、または活性化マーカーの発現の変化によって測定される、M2マクロファージ腫瘍形成促進活性の増加または減少を測定する。応答の減少は免疫刺激活性を示す。適切な減少は、以下に概説する増加の場合と同じである。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、フローサイトメトリーによって、またはIHCによって測定される、N2好中球増加の増加または減少を測定する。応答の減少は免疫刺激活性を示す。適切な減少は、以下に概説する増加の場合と同じである。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、サイトカイン分泌によって、または活性化マーカーの発現の変化によって測定される、N2好中球腫瘍形成促進活性の増加または減少を測定する。応答の減少は免疫刺激活性を示す。適切な減少は、以下に概説する増加の場合と同じである。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、サイトカイン分泌によって、または増殖によって、または例えば、CD137、CD107a、PD1などのような活性化マーカーの発現の変化によって測定される、T細胞活性化の阻害の増加または減少を測定する。活性の増加は、免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、例えば、癌細胞のような標的細胞の直接的な殺傷によって、またはサイトカイン分泌によって、または増殖によって、または例えば、CD137、CD107a、PD1などのような活性化マーカーの発現の変化によって測定される、CTL活性化の阻害の増加または減少を測定する。活性の増加は、免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、活性化マーカーの発現の変化によって測定される、αβおよび/またはγδT細胞枯渇(exhaustion)の増加または減少を測定する。応答の減少は免疫刺激活性を示す。適切な減少は、以下に概説する増加の場合と同じである。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、サイトカイン分泌によって、または増殖によって、または例えば、CD137、CD107a、PD1などのような活性化マーカーの発現の変化によって測定される、αβおよび/またはγδT細胞応答の増加または減少を測定する。活性の増加は、免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、サイトカイン分泌によって、または増殖によって、または例えば、CD45RA、CCR7などのような活性化マーカーの発現の変化によって測定される、抗原特異的メモリー応答の刺激の増加または減少を測定する。活性の増加は、免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、例えばMTT、Cr放出、カルサインAMなどの細胞傷害性アッセイによって、または例えばCFSE希釈もしくはヨウ化プロピジウム染色などのようなフローサイトメトリー系アッセイによって測定される、癌細胞のアポトーシスまたは溶解の増加または減少を測定する。活性の増加は免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、例えばMTT、Cr放出、カルサインAMなどの細胞傷害性アッセイによって、または例えば、CFSE希釈もしくはヨウ化プロピジウム染色などのようなフローサイトメトリー系アッセイによって測定される、癌細胞への細胞傷害性または細胞増殖抑制性の効果の刺激の増加または減少を測定する。活性の増加は免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、例えばMTT、Cr放出、カルサインAMなどの細胞傷害性アッセイによって、または例えばCFSE希釈もしくはヨウ化プロピジウム染色などのようなフローサイトメトリー系アッセイによって測定される、癌細胞の直接的な殺傷の増加または減少を測定する。活性の増加は免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイ測定は、例えば、サイトカイン分泌によって、または増殖によって、または活性化マーカーの発現の変化によって測定される、Th17活性の増加または減少を測定する。活性の増加は免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、シグナル伝達経路アッセイは、例えば、例えばMTT、Cr放出、カルサインAMなどの細胞傷害性アッセイによって、または例えばCFSE希釈もしくはヨウ化プロピジウム染色などのようなフローサイトメトリー系アッセイによって測定される、補体依存性細胞傷害性および/または抗体依存性細胞媒介性細胞傷害性の誘導の増加または減少を測定する。活性の増加は免疫刺激活性を示す。活性の適切な増加を以下に概説する。
一実施形態では、T細胞活性化は、例えば、例えば癌細胞のような標的細胞の直接的な殺傷によって、またはサイトカイン分泌によって、または増殖によって、または例えば、CD137、CD107a、PD1などのような活性化マーカーの発現の変化によって測定される。T細胞について、増殖、活性化の細胞表面マーカー(例えば、CD25、CD69、CD137、PD1)、細胞傷害性(標的細胞を殺傷する能力)、サイトカイン産生(例えば、IL-2、IL-4、IL-6、IFNγ、TNF-a、IL-10、IL-17A)の増加は、癌細胞の増強された殺傷と一貫する免疫調節の指標となるであろう。
一実施形態では、NK細胞活性化は、例えば、例えば癌細胞のような標的細胞の直接的な殺傷によって、またはサイトカイン分泌によって、または例えば、CD107aなどのような活性化マーカーの発現の変化によって測定される。NK細胞については、増殖、細胞傷害性(標的細胞を殺傷し、CD107a、グランザイム、およびパーフォリン発現を増加させる能力)、サイトカイン産生(例えば、IFNγおよびTNF)、および細胞表面受容体発現(例えば、CD25)の増加が、癌細胞の増強された殺傷と一貫する免疫調節の指標となるであろう。
一実施形態では、γδT細胞活性化は、例えば、サイトカイン分泌によって、または増殖によって、または活性化マーカーの発現の変化によって測定される。
一実施形態では、Th1細胞活性化は、例えば、サイトカイン分泌によって、または活性化マーカーの発現の変化によって測定される。
活性または応答の適切な増加(または適切な場合上記で概説されるような減少)とは、参照試料または対照試料のいずれか、例えば、本発明のIL-12ヘテロ二量体融合タンパク質を含有しない試験試料におけるシグナルに対して、少なくとも10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または98~99%パーセントの増加である。同様に、参照対象または対照試料と比較して、少なくとも1倍、2倍、3倍、4倍または5倍の増加が有効性を示す。
XI.併用療法
いくつかの態様では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質は、別の治療剤と組み合わせて投与される。本明細書で使用される「組み合わせて」投与されるとは、対象が障害に苦しんでいる過程で2つ(またはそれ以上)の異なる治療が対象に提供されることを意味し、例えば、対象が障害があると診断された後に、障害が治癒もしくは解消される前、または他の理由で治療が中止される前に、2つ以上の治療が提供される。いくつかの実施形態では、1つの治療の送達は、第2の治療の送達が開始されたときにまだ起こっているので、投与に関して重複がある。これは、本明細書では「同時」または「同時送達」と称されることもある。他の実施形態では、一方の治療の送達は、他方の治療の送達が始まる前に終了する。いずれかの場合のいくつかの実施形態では、治療は、併用投与のためにより効果的である。例えば、第2の治療はより効果的であり、例えば、第2の治療がより少なくて同等の効果が見られるか、または第2の治療は、第2の治療が第1の治療の非存在下で投与された場合に見られるよりも症状を大幅に軽減するか、または同様の状況が第1の治療で見られる。いくつかの実施形態では、送達は、症状の減少、または障害に関連する他のパラメータが、他方の非存在下で送達された一方の治療で観察されるものよりも大きいようなものである。2つの治療の効果は、部分的に相加的、完全に相加的、または相加的より大きくあり得る。送達は、送達された第1の治療の効果が、第2の治療が送達されたときに依然として検出可能であるようなものであり得る。
本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質(例えば、本明細書に記載される任意のXENP配列)および少なくとも1つの追加の治療剤は、同時に、同じもしくは別々の組成物で、または連続して投与することができる。連続投与について、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質(例えば、本明細書に記載される任意のXENP配列)を第1に投与することができ、追加の薬剤を第2に投与するか、または投与の順序を逆にすることができる。
本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質(例えば、本明細書に記載される任意のXENP配列)および/または他の治療剤、手順または様式は、活動性障害の期間中、または寛解期間または低活動性疾患の期間中に投与することができる。IL-12-Fc融合タンパク質(例えば、本明細書に記載される任意のXENP配列)は、他の治療の前、治療と同時に、治療後、または障害の寛解中に投与することができる。
A.チェックポイント遮断抗体
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質は、これらに限定されないが、PD-1阻害剤、TIM3阻害剤、CTLA4阻害剤、PD-L1阻害剤、TIGIT阻害剤、LAG3阻害剤、またはそれらの組み合わせなどのチェックポイント遮断抗体を含む他の治療剤と組み合わされる。
1.抗PD-1抗体
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質は、抗PD-1抗体と組み合わせて、癌を有する対象に投与することができる。いくつかの場合では、抗PD-1抗体は、XENP16432(二価抗PD-1 mAb、生着ヒトT細胞を抑制解除することによって抗腫瘍活性を増強するチェックポイント阻害剤、図53に示される配列)を含む。
いくつかの実施形態では、本発明のIl-12-Fc融合タンパク質は、Keytruda(登録商標)またはOptivo(登録商標)と組み合わせて投与される。
例示的な非限定的な抗PD-1抗体分子は、参照によりその全体が組み込まれる、「Antibody Molecules to PD-1 and Uses Thereof」という名称の、2015年7月30日に公開されたUS2015/0210769に開示されている。
一実施形態では、抗PD-1抗体分子は、BAP049-Clone-A、BAP049-Clone-B、BAP049-Clone-C、BAP049-Clone-D、もしくはBAP049-Clone-Eのアミノ酸配列、またはUS2015/0210769の表1に記載されているか、もしくは表1のヌクレオチド配列によってコードされているようなもの、または前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、もしくはそれ以上同一)の配列を含む、少なくとも1つもしくは2つの重鎖可変ドメイン(任意に定常領域を含む)、少なくとも1つもしくは2つの軽鎖可変ドメイン(任意に定常領域を含む)、またはその両方を含む。抗PD-1抗体分子は、任意に、US2015/0210769の表4に示されているように、重鎖、軽鎖、またはその両方からのリーダー配列、またはそれと実質的に同一の配列を含む。
さらに別の実施形態では、抗PD-1抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、BAP049-hum01、BAP049-hum02、BAP049-hum03、BAP049-hum04、BAP049-hum05、BAP049-hum06、BAP049-hum07、BAP049-hum08、BAP049-hum09、BAP049-hum10、BAP049-hum11、BAP049-hum12、BAP049-hum13、BAP049-hum14、BAP049-hum15、BAP049-hum16、BAP049-Clone-A、BAP049-Clone-B、BAP049-Clone-C、BAP049-Clone-D、もしくはBAP049-Clone-Eのいずれかから選択される抗体、または表1に記載されているか、もしくは表1のヌクレオチド配列によってコードされているもの、または前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、もしくはそれ以上同一)の配列の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つの相補性決定領域(CDR)を含む。
さらに別の実施形態では、抗PD-1抗体分子は、US2015/0210769の表1に示されるか、または表1に示すヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(または集合的に全てのCDR)を含む。一実施形態では、1つ以上のCDR(または集合的に全てのCDR)は、表1に示されるかまたは表1に示すヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
さらに別の実施形態では、抗PD-1抗体分子は、US2015/0210769の表1に示されるか、または表1に示すヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(または集合的に全てのCDR)を含む。一実施形態では、1つ以上のCDR(または集合的に全てのCDR)は、表1に示されるかまたは表1に示すヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。特定の実施形態では、抗PD-1抗体分子は、軽鎖CDRにおける置換、例えば、軽鎖のCDR1、CDR2、および/またはCDR3における1つ以上の置換を含む。一実施形態では、抗PD-1抗体分子は、軽鎖可変領域の位置102での軽鎖CDR3における置換、例えば、または表1による軽鎖可変領域(例えば、マウスまたはキメラ、非修飾について配列番号16もしくは24、または修飾された配列について配列番号34、42、46、54、58、62、66、70、74、もしくは78のいずれか)の位置102でのシステインからチロシン、またはシステインからセリン残基への置換を含む。
別の態様では、抗PD-1抗体分子は、US2015/0210769の表1に示されるか、または表1に示されるヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのCDR(または集合的に全てのCDR)を含む。一実施形態では、1つ以上のCDR(または集合的に全てのCDR)は、表1に示されるかまたは表1に示すヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
一実施形態では、抗PD-1抗体分子は以下を含む:
(a)各々が、US2015/0210769の表1に開示されている、配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、
(b)各々が、US2015/0210769の表1に開示されている、配列番号1から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL、
(c)各々が、US2015/0210769の表1に開示されている、配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL、または
(d)各々が、US2015/0210769の表1に開示されている、配列番号224のVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号32のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL。
別の実施形態では、抗PD-1抗体分子は、各々がUS2015/0210769の表1に開示されている、(i)配列番号1、配列番号4、または配列番号224から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2または配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに(ii)配列番号10または配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11または配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号32または配列番号33のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含む。
他の実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、またはピジリズマブから選択される抗PD-1抗体である。
いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体はニボルマブである。ニボルマブの別名には、MDX-1106、MDX-1106-04、ONO-4538、またはBMS-936558が含まれる。いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、ニボルマブ(CAS登録番号:946414-94-4)である。ニボルマブは、PD1を特異的に遮断する完全ヒトIgG4モノクローナル抗体である。ニボルマブ(クローン5C4)およびPD1に特異的に結合する他のヒトモノクローナル抗体は、US8、008、449およびWO2006/121168に開示されている。一実施形態では、PD-1の阻害剤はニボルマブであり、本明細書に開示される配列(またはそれと実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、指定された配列と少なくとも85%、90%、95%、もしくはそれ以上同一の配列)を有する。いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、ペンブロリズマブである。ペンブロリズマブ(ランブロリズマブ、MK-3475、MK03475、SCH-900475、またはKEYTRUDA(登録商標)Merckとも称される)は、PD-1に結合するヒト化IgG4モノクローナル抗体である。ペンブロリズマブおよび他のヒト化抗PD-1抗体は、Hamid,Oet al(2013)New England Journal of Medicine 369(2):134-44、US8、354、509、およびWO2009/114335に開示されている。
一実施形態では、PD-1の阻害剤は、例えば、US8、354、509およびWO2009/114335に開示され、本明細書に開示される配列(またはそれと実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、指定された配列と少なくとも85%、90%、95%、もしくはそれ以上同一の配列)を有する。
いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、ピジリズマブである。ピジリズマブ(CT-011、Cure Tech)は、PD1に結合するヒト化IgG1kモノクローナル抗体である。ピジリズマブおよび他のヒト化抗PD-1モノクローナル抗体は、US8、747、847およびWO2009/101611に開示されている。
他の抗PD1抗体は、とりわけ、AMP 514(Amplimmune)、例えば、US8、609、089、US2010/028330、および/またはUS2012/0114649に開示されている抗PD1抗体を含む。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、イムノアドヘシン(例えば、定常領域(例えば、免疫グロブリン配列のFc領域)に融合したPD-L1またはPD-L2の細胞外またはPD-1結合部分を含むイムノアドヘシン)である。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、AMP-224(B7-DCIg、Amplimmune、例えば、WO2010/027827およびWO2011/066342に開示されるもの)であり、PD-1とB7-H1との間の相互作用を遮断するPD-L2Fc融合可溶性受容体である。
いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、本発明のIL-12Fc融合タンパク質と組み合わせて使用され得る。これらに限定されないが、現在FDAが承認している2つの抗体、ペンブロリズマブおよびニボリズマブ、ならびにこれらに限定されないが、チスレリズマブ、Sym021、REGN2810(Rengeneronにより開発)、JNJ-63723283(J and Jにより開発)、SHR-1210、ピジリズマブ、AMP-224、MEDIo680、PDR001、およびCT-001を含む、現在臨床試験中のもの、ならびにその中の抗体が参照により明示的に組み込まれる、Liu et al.、J.Hemat.&Oncol.(2017)10:136に概説される他のものを含む、いくつかの抗PD-1抗体がある。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質は、PD-1阻害剤(例えば、抗PD-1抗体)と組み合わせて使用され得る。特定の実施形態では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質(例えば、本明細書に記載される任意のXENP配列)は、抗PD-1抗体と組み合わせて投与される。
2.抗TIM3抗体
いくつかの実施形態では、本発明のIL-12-Fc融合タンパク質は、抗TIM3抗体と組み合わせて投与される。
いくつかの実施形態では、本発明のIl-12-Fc融合タンパク質は、LY3321367(Eli Lilly and Company)、MBG453(Novartis Pharmaceuticals)、およびTSR-022(Tesaro、Inc.)と組み合わせて投与される。
例示的な非限定的な抗TIM-3抗体分子は、参照によりその全体が組み込まれる、「Antibody Molecules to TIM-3 and Uses Thereof」という名称の、2015年8月6日に公開されたUS2015/0218274に開示されている。
一実施形態では、抗TIM-3抗体分子は、ABTIM3、ABTIM3-hum01、ABTIM3-hum02、ABTIM3-hum03、ABTIM3-hum04、ABTIM3-hum05、ABTIM3-hum06、ABTIM3-hum07、ABTIM3-hum08、ABTIM3-hum09、ABTIM3-hum10、ABTIM3-hum11、ABTIM3-hum12、ABTIM3-hum13、ABTIM3-hum14、ABTIM3-hum15、ABTIM3-hum16、ABTIM3-hum17、ABTIM3-hum18、ABTIM3-hum19、ABTIM3-hum20、ABTIM3-hum21、ABTIM3-hum22、ABTIM3-hum23のアミノ酸配列、またはUS2015/0218274の表1~4に記載されているか、もしくは表1~4のヌクレオチド配列によってコードされているようなもの、または前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、またはそれ以上同一)の配列を含む、少なくとも1つもしくは2つの重鎖可変ドメイン(任意に定常領域を含む)、少なくとも1つもしくは2つの軽鎖可変ドメイン(任意に定常領域を含む)、またはその両方を含む。抗TIM-3抗体分子は、任意に、US2015/0218274に示されているように、重鎖、軽鎖、またはその両方からのリーダー配列、またはそれと実質的に同一の配列を含む。
さらに別の実施形態では、抗TIM-3抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、ABTIM3、ABTIM3-hum01、ABTIM3-hum02、ABTIM3-hum03、ABTIM3-hum04、ABTIM3-hum05、ABTIM3-hum06、ABTIM3-hum07、ABTIM3-hum08、ABTIM3-hum09、ABTIM3-hum10、ABTIM3-hum11、ABTIM3-hum12、ABTIM3-hum13、ABTIM3-hum14、ABTIM3-hum15、ABTIM3-hum16、ABTIM3-hum17、ABTIM3-hum18、ABTIM3-hum19、ABTIM3-hum20、ABTIM3-hum21、ABTIM3-hum23のいずれかから選択される抗体、またはUS2015/0218274の表1~4に記載されているか、もしくは表1~4のヌクレオチド配列によってコードされているもの、または前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、もしくはそれ以上同一)の配列の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つの相補性決定領域(CDR)を含む。
さらに別の実施形態では、抗TIM-3抗体分子は、US2015/0218274の表1~4に示されるか、または表1~4に示すヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(または集合的に全てのCDR)を含む。一実施形態では、1つ以上のCDR(または集合的に全てのCDR)は、表1~4に示されるかまたは表1~4に示すヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
さらに別の実施形態では、抗TIM-3抗体分子は、US2015/0218274の表1~4に示されるか、または表1~4に示すヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(または集合的に全てのCDR)を含む。一実施形態では、1つ以上のCDR(または集合的に全てのCDR)は、表1~4に示されるかまたは表1~4に示すヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。特定の実施形態では、抗TIM-3抗体分子は、軽鎖CDRにおける置換、例えば、軽鎖のCDR1、CDR2、および/またはCDR3における1つ以上の置換を含む。
別の実施形態では、抗TIM-3抗体分子は、US2015/0218274の表1~4に示されるか、または表1~4に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つまたは6つのCDR(または集合的に全てのCDR)を含む。一実施形態では、1つ以上のCDR(または集合的に全てのCDR)は、表1~4に示されるかまたは表1~4に示すヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
一実施形態では、抗TIM-3抗体分子は以下を含む:
(a)各々が、US2015/0218274の表1~4に開示されている、配列番号9から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号10のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに配列番号12のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号13のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号14のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)、
(b)各々が、US2015/0218274の表1~4に開示されている、配列番号3から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号4のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号7のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号8のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL、
(c)各々が、US2015/0218274の表1~4に開示されている、配列番号9から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号25のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号12のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号13のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号14のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL、
(d)各々が、US2015/0218274の表1~4に開示されている、配列番号3から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号24のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号7のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号8のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL、
(e)各々が、US2015/0218274の表1~4に開示されている、配列番号9から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号31のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号12のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号13のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号14のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL、または
(f)各々が、US2015/0218274の表1~4に開示されている、配列番号3から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号30のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号5のVHCDR3アミノ酸配列を含むVH、ならびに配列番号6のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号7のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号8のVLCDR3アミノ酸配列を含むVL。
例示的な抗TIM-3抗体は、米国特許出願第8、552、156号、WO2011/155607、EP2581113、および米国特許出願公開第2014/044728号に開示されている。
いくつかの実施形態では、抗TIM-3抗体は、本発明のIL-12Fc融合タンパク質と組み合わせて使用され得る。MBG453およびTSR-022を含むが、これらに限定されない、臨床開発中のいくつかのTIM-3抗体がある。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質は、TIM-3阻害剤(例えば、抗TIM3抗体)と組み合わせて使用され得る。特定の実施形態では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質(例えば、本明細書に記載される任意のXENP配列)は、抗TIM3抗体と組み合わせて投与される。
3.抗CTLA4抗体
例示的な抗CTLA4抗体は、トレメリムマブ(以前はチシリムマブ、CP-675、206)として知られている、Pfizerから入手可能なIgG2モノクローナル抗体)、およびイピリムマブ(MDX-010、CAS番号477202-00-9としても知られている、CTLA-4抗体)を含む。他の例示的な抗CTLA-4抗体は、例えば、米国特許第5、811、097号に開示されている。
一実施形態では、抗CTLA4抗体は、例えば、US5、811、097、US7、605、238、WO00/32231、およびWO97/20574に開示されるイピリムマブであり、本明細書に開示される配列(またはそれと実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、指定された配列と少なくとも85%、90%、95%、もしくはそれ以上同一の配列)を有する。
一実施形態では、抗CTLA4抗体は、例えば、US6、682、736およびWO00/37504に開示されている、トレメリムマブであり、本明細書に開示される配列(またはそれと実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、指定された配列と少なくとも85%、90%、95%、もしくはそれ以上同一の配列)を有する。
いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、本発明のIL-12-Fc融合タンパク質と組み合わせて使用され得る。したがって、本明細書に概説されるような併用療法で使用するのに適した抗CTLA-4抗体には、現在FDAが承認した抗体イピリムマブが、およびCP-675、206およびAGEN-1884を含むさらにいくつかのものが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質は、CTLA-4阻害剤(例えば、抗CTLA-4抗体)と組み合わせて使用され得る。特定の実施形態では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質(例えば、本明細書に記載される任意のXENP配列)は、抗CTLA-4抗体と組み合わせて投与される。
4.抗PD-L1抗体
例示的な非限定的な抗PD-L1抗体分子は、参照によりその全体が組み込まれる、「Antibody Molecules to PD-L1 and Uses Thereof」という名称の、2016年4月21日に公開されたUS2016/0108123に開示されている。
一実施形態では、抗PD-L1抗体分子は、BAP058-hum01、BAP058-hum02、BAP058-hum03、BAP058-hum04、BAP058-hum05、BAP058-hum06、BAP058-hum07、BAP058-hum08、BAP058-hum09、BAP058-hum10、BAP058-hum11、BAP058-hum12、BAP058-hum13、BAP058-hum14、BAP058-hum15、BAP058-hum16、BAP058-hum17、BAP058-Clone-K、BAP058-Clone-L、BAP058-Clone-M、BAP058-Clone-N、BAP058-Clone-Oのいずれかのアミノ酸配列、またはUS2016/0108123の表1に記載されているか、もしくは表1のヌクレオチド配列によってコードされているようなもの、または前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、もしくはそれ以上同一)の配列を含む、少なくとも1つもしくは2つの重鎖可変ドメイン(任意に定常領域を含む)、少なくとも1つもしくは2つの軽鎖可変ドメイン(任意に定常領域を含む)、またはその両方を含む。
さらに別の実施形態では、抗PD-L1抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、BAP058-hum01、BAP058-hum02、BAP058-hum03、BAP058-hum04、BAP058-hum05、BAP058-hum06、BAP058-hum07、BAP058-hum08、BAP058-hum09、BAP058-hum10、BAP058-hum11、BAP058-hum12、BAP058-hum13、BAP058-hum14、BAP058-hum15、BAP058-hum16、BAP058-hum17、BAP058-Clone-K、BAP058-Clone-L、BAP058-Clone-M、BAP058-Clone-N、もしくはBAP058-Clone-Oのいずれかから選択される抗体、またはUS2016/0108123の表1に記載されているか、もしくは表1のヌクレオチド配列によってコードされているもの、または前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、もしくはそれ以上同一)の配列の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つの相補性決定領域(CDR)を含む。
さらに別の実施形態では、抗PD-L1抗体分子は、US2016/0108123の表1に示されるか、または表1に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(または集合的に全てのCDR)を含む。一実施形態では、1つ以上のCDR(または集合的に全てのCDR)は、表1に示されるかまたは表1に示すヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
さらに別の実施形態では、抗PD-L1抗体分子は、US2016/0108123の表1に示されるか、または表1に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(または集合的に全てのCDR)を含む。一実施形態では、1つ以上のCDR(または集合的に全てのCDR)は、表1に示されるかまたは表1に示すヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。特定の実施形態では、抗PD-L1抗体分子は、軽鎖CDRにおける置換、例えば、軽鎖のCDR1、CDR2、および/またはCDR3における1つ以上の置換を含む。
別の実施形態では、抗PD-L1抗体分子は、表1に示されるか、またはUS2016/0108123の表1に示されるヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのCDR(または集合的に全てのCDR)を含む。一実施形態では、1つ以上のCDR(または集合的に全てのCDR)は、表1に示されるかまたは表1に示すヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
一実施形態では、抗PD-L1抗体分子は以下を含む:
(i)各々が、US2016/0108123の表1に開示されている、配列番号1、配列番号4、または配列番号195から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)各々が、US2016/0108123の表1に開示されている、配列番号9のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号10のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号11のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)。
別の実施形態では、抗PD-L1抗体分子は以下を含む:
(i)各々が、US2016/0108123の表1に開示されている、配列番号1、配列番号4、または配列番号195から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)各々が、US2016/0108123の表1に開示されている、配列番号12のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号13のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号14のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)。
一実施形態では、抗PD-L1抗体分子は、配列番号1のVHCDR1アミノ酸配列を含む。別の実施形態では、抗PD-L1抗体分子は、配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列を含む。さらに別の実施形態では、抗PD-L1抗体分子は、配列番号195のVHCDR1アミノ酸配列を含み、各々は、US2016/0108123の表1に開示されている。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、抗体分子である。いくつかの実施形態では、抗PD-L1阻害剤は、YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C、MDX-1105、アテゾリズマブ、デュルバルマブ、アベルマブ、またはBMS936559から選択される。
いくつかの実施形態では、抗PD-L1抗体は、アテゾリズマブである。アテゾリズマブ(MPDL3280AおよびAtezo(登録商標)、Rocheとも称される)は、PD-L1に結合するモノクローナル抗体である。アテゾリズマブおよび他のヒト化抗PD-L1抗体は、US8、217、149に開示されており、本明細書に開示される配列(またはそれと実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、指定された配列と少なくとも85%、90%、95%、もしくはそれ以上同一の配列)を有する。
いくつかの実施形態では、抗PD-L1抗体は、アベルマブである。アベルマブ(A09-246-2、Merck Seronoとも称される)は、PD-L1に結合するモノクローナル抗体である。アベルマブおよび他のヒト化抗PD-L1抗体は、US9、324、298およびWO2013/079174に開示され、本明細書に開示される配列(またはそれと実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、指定された配列と少なくとも85%、90%、95%、もしくはそれ以上同一の配列)を有する。
いくつかの実施形態では、抗PD-L1抗体は、デュルバルマブである。デュルバルマブ(MEDI4736、AstraZenecaとも称される)は、PD-L1に結合するモノクローナル抗体である。デュルバルマブおよび他のヒト化抗PD-L1抗体は、US8、779、108に開示されており、本明細書に開示される配列(またはそれと実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、指定された配列と少なくとも85%、90%、95%、もしくはそれ以上同一の配列)を有する。
いくつかの実施形態では、抗PD-L1抗体は、BMS-936559である。BMS-936559(MDX-1105、BMSとも称される)は、PD-L1に結合するモノクローナル抗体である。BMS-936559および他のヒト化抗PD-L1抗体は、US7、943、743およびWO2007005874に開示されており、本明細書に開示される配列(またはそれと実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、指定された配列と少なくとも85%、90%、95%、もしくはそれ以上同一の配列)を有する。
いくつかの実施形態では、抗PD-L1抗体は、本発明のIL-12-Fc融合タンパク質と組み合わせて使用され得る。現在FDAが承認している3つの抗体、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、ならびにこれらに限定されないが、LY33000054およびCS1001を含む、現在臨床試験中のもの、ならびにその中の抗体が参照により明示的に組み込まれる、Liu et al、J.Hemat.&Oncol.(2017)10:136に概説される他のものを含む、いくつかの抗PD-L1抗体がある。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質は、PD-L1またはPD-L2阻害剤(例えば、抗PD-L1抗体)と組み合わせて使用され得る。
5.抗TIGIT抗体
いくつかの実施形態では、抗TIGIT抗体は、OMP-313M32である。OMP-313M32(OncoMed Pharmaceuticals)は、TIGITに結合するモノクローナル抗体である。OMP-313M32および他のヒト化抗TIGIT抗体は、US20160376365およびWO2016191643に開示されており、本明細書に開示される配列(またはそれと実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、指定された配列と少なくとも85%、90%、95%、もしくはそれ以上同一の配列)を有する。
いくつかの実施形態では、抗TIGIT抗体は、BMS-986207である。BMS-986207(ONO-4686;Bristol-Myers Squibbとも称される)は、TIGITに結合するモノクローナル抗体である。BMS-986207および他のヒト化抗TIGIT抗体は、US20160176963およびWO2016106302に開示されており、本明細書に開示される配列(またはそれと実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、指定された配列と少なくとも85%、90%、95%、もしくはそれ以上同一の配列)を有する。
いくつかの実施形態では、抗TIGIT抗体は、MTIG7192である。MTIG7192(Genentech)は、TIGITに結合するモノクローナル抗体である。MTIG7192および他のヒト化抗TIGIT抗体は、US2017088613、WO2017053748、およびWO2016011264に開示されており、本明細書に開示される配列(またはそれと実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、指定された配列と少なくとも85%、90%、95%、もしくはそれ以上同一の配列)を有する。
いくつかの実施形態では、抗TIGIT抗体は、本発明のIL-12-Fc融合タンパク質と組み合わせて使用され得る。臨床開発中のいくつかのTIGIT抗体、BMS-986207、OMP-313M32、およびMTIG7192Aがある。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質は、TIGIT阻害剤(例えば、抗TIGIT抗体)と組み合わせて使用され得る。特定の実施形態では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質(例えば、本明細書に記載される任意のXENP配列)は、抗TIGIT抗体と組み合わせて投与される。
6.抗LAG3抗体
例示的な非限定的な抗LAG-3抗体分子は、参照によりその全体が組み込まれる、「Antibody Molecules to LAG-3 and Uses Thereof」という名称の、2015年9月17日に公開されたUS2015/0259420に開示されている。
一実施形態では、抗LAG-3抗体分子は、BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例えば、BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser、もしくはBAP050-hum20-Ser)、BAP050-Clone-F、BAP050-Clone-G、BAP050-Clone-H、BAP050-Clone-I、もしくはBAP050-Clone-Jのいずれかのアミノ酸配列、またはUS2015/0259420の表1に記載されているか、もしくは表1のヌクレオチド配列によってコードされているようなもの、または前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、もしくはそれ以上同一)の配列を含む、少なくとも1つもしくは2つの重鎖可変ドメイン(任意に定常領域を含む)、少なくとも1つもしくは2つの軽鎖可変ドメイン(任意に定常領域を含む)、またはその両方を含む。
さらに別の実施形態では、抗LAG-3抗体分子は、本明細書に記載される抗体、例えば、BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例えば、BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser、もしくはBAP050-hum20-Ser)、BAP050-Clone-F、BAP050-Clone-G、BAP050-Clone-H、BAP050-Clone-I、もしくはBAP050-Clone-Jのいずれかから選択される抗体、またはUS2015/0259420の表1に記載されているか、もしくは表1のヌクレオチド配列によってコードされているもの、または前述の配列のいずれかと実質的に同一(例えば、少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%、もしくはそれ以上同一)の配列の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つの相補性決定領域(CDR)を含む。
さらに別の実施形態では、抗LAG-3抗体分子は、US 2015/0259420の表1に示されるか、または表1に示すヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(または集合的に全てのCDR)を含む。一実施形態では、1つ以上のCDR(または集合的に全てのCDR)は、表1に示されるかまたは表1に示すヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
さらに別の実施形態では、抗LAG-3抗体分子は、US2015/0259420の表1に示されるか、または表1に示すヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、または3つのCDR(または集合的に全てのCDR)を含む。一実施形態では、1つ以上のCDR(または集合的に全てのCDR)は、表1に示されるかまたは表1に示すヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。特定の実施形態では、抗PD-L1抗体分子は、軽鎖CDRにおける置換、例えば、軽鎖のCDR1、CDR2、および/またはCDR3における1つ以上の置換を含む。
別の実施形態では、抗LAG-3抗体分子は、表1に示されるか、またはUS2015/0259420の表1に示されるヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、重鎖および軽鎖可変領域からの少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つまたは6つのCDR(または集合的に全てのCDR)を含む。一実施形態では、1つ以上のCDR(または集合的に全てのCDR)は、表1に示されるかまたは表1に示すヌクレオチド配列によってコードされているアミノ酸配列に対して、1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ以上の変化、例えば、アミノ酸置換または欠失を有する。
一実施形態では、抗LAG-3抗体分子は以下を含む:
(i)各々が、US2015/0259420の表1に開示されている、配列番号1、配列番号4、または配列番号286から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号2のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)各々が、US2015/0259420の表1に開示されている、配列番号10のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号11のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号12のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)。
別の実施形態では、抗LAG-3抗体分子は以下を含む:
(i)各々が、US2015/0259420の表1に開示されている、配列番号1、配列番号4、または配列番号286から選択されるVHCDR1アミノ酸配列、配列番号5のVHCDR2アミノ酸配列、および配列番号3のVHCDR3アミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに
(ii)各々が、US2015/0259420の表1に開示されている、配列番号13のVLCDR1アミノ酸配列、配列番号14のVLCDR2アミノ酸配列、および配列番号15のVLCDR3アミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)。
一実施形態では、抗LAG-3抗体分子は、配列番号1のVHCDR1アミノ酸配列を含む。別の実施形態では、抗LAG-3抗体分子は、配列番号4のVHCDR1アミノ酸配列を含む。さらに別の実施形態では、抗LAG-3抗体分子は、配列番号286のVHCDR1アミノ酸配列を含み、各々は、US2015/0259420の表1に開示されている。
いくつかの実施形態では、抗LAG-3抗体は、BMS-986016である。BMS-986016(BMS986016;Bristol-Myers Squibbとも称される)は、LAG-3に結合するモノクローナル抗体である。BMS-986016および他のヒト化抗LAG-3抗体は、US2011/0150892、WO2010/019570、およびWO2014/008218に開示されている。
いくつかの実施形態では、抗LAG3抗体は、LAG525である。LAG525(IMP701、Novartisとも称される)は、LAG3に結合するモノクローナル抗体である。LAG525および他のヒト化抗LAG3抗体は、US9、244、059およびWO2008132601に開示されており、本明細書に開示される配列(またはそれと実質的に同一もしくは類似の配列、例えば、指定された配列と少なくとも85%、90%、95%、もしくはそれ以上同一の配列)を有する。
他の例示的な抗LAG3抗体は、例えば、US2011150892およびUS2018066054に開示される。
いくつかの実施形態では、抗LAG-3抗体は、本発明のIL-12-Fc融合タンパク質と組み合わせて使用され得る。REGN3767、Regeneronによるもの、BMS-986016(Bristol-Myers Squibb)、MK-4280(Merck)、LAG525(Novartis)、TSR-033(Tesaro)を含む、臨床開発中のいくつかの抗LAG-3抗体がある。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質は、LAG3阻害剤(例えば、抗LAG3抗体)と組み合わせて使用され得る。特定の実施形態では、本明細書に記載されるIL-12-Fc融合タンパク質(例えば、本明細書に記載される任意のXENP配列)は、抗LAG3抗体と組み合わせて投与される。
XII.治療
一旦作製されると、本発明の組成物は、一般に、本発明のヘテロ二量体Fc融合タンパク質の結合を用いてT細胞活性化を促進すること(例えば、T細胞はもはや抑制されない)による、癌治療によって、いくつかの腫瘍学適用に使用される。
したがって、本発明のヘテロ二量体組成物はこれらの癌の治療に使用される。
A.インビボ投与のための融合タンパク質組成物
本発明に従って使用される融合タンパク質の製剤は、所望の純度を有する融合タンパク質を任意の薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定化剤(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition、Osol、A.Ed.[1980]に一般に概説される)と、凍結乾燥製剤または水性溶液の形態で混合することによって、保存のために調製される。
B.投与様式
本発明の融合タンパク質および化学療法剤は、ボーラスとしての静脈内投与またはある期間にわたる連続注入による、既知の方法に従って、対象に投与される。
B.治療様式
本発明の方法において、治療は、疾患または病状に関して肯定的な治療応答を提供するために使用される。「肯定的な治療応答」は、疾患もしくは病状の改善、および/または疾患または病状に関連する症状の改善を意図する。例えば、肯定的な治療応答は、疾患における以下の改善のうちの1つ以上を指し得る:(1)腫瘍細胞の数の減少、(2)腫瘍細胞死の増加、(3)腫瘍細胞の生存の阻害、(5)腫瘍増殖の阻害(すなわち、ある程度の減速、好ましくは停止)、(6)患者生存率の増加、および(7)疾患または病状に関連する1つ以上の症状からのいくらかの解放。
任意の所与の疾患または病状における肯定的な治療応答は、その疾患または病状に特有の標準化された応答基準によって決定され得る。腫瘍応答は、磁気共鳴画像(MRI)スキャン、X線撮影、コンピュータ断層撮影(CT)スキャン、骨スキャン撮影、内視鏡検査、ならびに骨髄穿刺(BMA)および循環中の腫瘍細胞の計数を含む腫瘍生検サンプリングなどのスクリーニング技法を使用して、腫瘍形態(すなわち、全身腫瘍組織量、腫瘍サイズなど)の変化について評価され得る。
これらの肯定的な治療応答に加えて、治療を受けている対象は、疾患に関連する症状の改善の有益な効果を経験し得る。
本発明に従う治療には、使用される医薬品の「治療有効量」が含まれる。「治療有効量」は、所望の治療結果を達成するために、必要な投薬量および期間で有効な量をいう。
治療有効量は、個体の疾患状態、年齢、性別、および体重、ならびに個体において所望の応答を誘発する薬剤の能力などの因子によって異なり得る。治療有効量はまた、タンパク質またはタンパク質部分のいずれの毒性または有害な効果よりも治療上有益な効果が勝る量である。
腫瘍療法のための「治療有効量」は、疾患の進行を安定化する能力によっても測定することができる。癌を阻害する化合物の能力は、ヒト腫瘍における有効性を予測する動物モデル系において評価してもよい。
あるいは、組成物のこの特性は、当業者に知られているインビトロアッセイによって、化合物が細胞増殖を阻害するか、またはアポトーシスを誘導する能力を検査することによって評価してもよい。治療有効量の治療用化合物は、腫瘍サイズを減少させるか、さもなければ対象の症状を軽減し得る。当業者であれば、対象のサイズ、対象の症状の重症度、および選択される特定の組成物または投与経路などの因子に基づいて、そのような量を決定することができるであろう。
投薬レジメンは、最適な所望の応答(例えば、治療応答)を提供するように調節される。例えば、単回のボーラスを投与してもよく、いくつかの分割用量を経時的に投与してもよく、または治療状況の緊急性によって示されるように用量を比例して減少または増加させてもよい。非経口組成物は、投与の容易性および投薬量の均一性のために、単位剤形で処方され得る。本明細書で使用される単位剤形は、治療される対象のための単一投薬量として好適な物理的に別個の単位を指し、各単位は、必要とされる薬学的担体に関連して所望の治療効果を生じるように計算された所定量の活性化合物を含有する。
本発明の単位剤形形態の仕様は、(a)活性化合物の固有の特徴および達成すべき特定の治療効果、ならびに(b)個体における感受性の治療に対してそのような活性化合物を調合する分野に付いて回る制限に影響され、またそれらに直接的に依存する。
本発明で使用されるヘテロ二量体タンパク質の効率的な投薬量および投薬レジメンは、治療される疾患または状態に依存し、当業者によって決定され得る。
本発明で使用される治療有効量のヘテロ二量体タンパク質の例示的な非限定的な範囲は、約0.1~100mg/kgである。
全ての引用文献は、本明細書にそれらの全体が参照により明示的に組み込まれる。
本発明の特定の実施形態を例示の目的で上述のように説明してきたが、添付の特許請求の範囲に記載の本発明から逸脱することなく詳細の多数の変形をなし得ることが当業者には理解されよう。
本発明を説明するために実施例を以下に提供する。これらの実施例は、本発明を任意の特定の用途または動作理論に限定することを意味するものではない。本発明で議論される全ての定常領域位置について、付番は、Kabat(Kabat et al.、1991、Sequences of Proteins of Immunological Interest、5th Ed.、United States Public Health Service、National Institutes of Health、Bethesda、参照により全体が組み込まれる)と同様のEU指数に従う。抗体の技術分野の当業者は、この規則が免疫グロブリン配列の特定の領域における非連続的な付番からなり、免疫グロブリンファミリーにおける保存された位置への標準的な基準を可能にすることを理解するであろう。したがって、EU指数によって定義されるような任意の所与の免疫グロブリンの位置は必ずしもその連続配列に対応しない。
一般的および具体的な科学技法は、米国特許出願公開第2015/0307629号、同第2014/0288275号、およびWO2014/145806に概説されており、それらは全て、特にその中に概説されている技術に関して、参照によりそれらの全体が明示的に組み込まれる。
実施例1:IL-12-Fc融合タンパク質
他のサイトカインと同様に、IL-12は短い半減期を有し、短い半減期を克服する高用量治療は全身毒性をもたらす。加えて、抗腫瘍効果は、IL-12によるIFNγ産生の持続的な誘導を必要とすることが報告されている(Gollob,JA et al.、2000)。さらに、IL-12p40サブユニットは、単量体またはホモ二量体のいずれかとして、IL-12受容体への結合について競合することによってIL-12活性をアンタゴナイズすることが報告され(Gillessen,S et al.、1995)、したがって、IL-12p40およびIL-12p35サブユニットを前複合体化することが有利である。これらの2つの警告に対処するために、我々は、FcRn媒介性リサイクルを通した循環の増強、ならびにIL-12p40およびIL-12p35サブユニットの前複合体化の両方のために、IL-12ヘテロ二量体をFc融合タンパク質(集合的に以降IL-12-Fc融合体と呼ばれる)として操作した。
1A:様々なフォーマットのIL-12-Fc融合体の操作
我々は、N末端IL-12ヘテロ二量体Fc融合体または「IL-12-ヘテロFc」フォーマットを生成し、これはヘテロ二量体Fcの一方の側のN末端に組換え融合したIL-12p40サブユニット、およびヘテロ二量体Fcの他方の側のN末端に組換え融合したIL-12p35サブユニットを含む(図8A)。IL-12p40およびIL-12p35サブユニットは、ドメインリンカーによってそれらのそれぞれのFc鎖に結合され得る。このフォーマットの例示的なタンパク質は、XENP27201であり、その配列は、図9に示される。
我々はまた、C末端IL-12ヘテロ二量体Fc融合体または「ヘテロFc-IL-12」フォーマットを生成し、これはヘテロ二量体Fcの一方の側のC末端に組換え融合したIL-12p40サブユニット、およびヘテロ二量体Fcの他方の側のC末端に組換え融合したIL-12p35サブユニットを含む(図8B)。IL-12p30およびIL-12p35サブユニットは、ドメインリンカーによってそれらのそれぞれのFc鎖に結合され得る。このフォーマットの例示的なタンパク質は、XENP27202であり、その配列は、図10に示される。
我々は、N末端単鎖IL-12-Fc融合体または「scIL-12-Fc」フォーマットをさらに生成し、これは(任意にドメインリンカーを介して)ヘテロ二量体Fcの一方の側のN末端に組換え融合した単鎖IL-12複合体(または「scIL-12複合体」)を含み、分子の他方の側は、「Fcのみ」または「空Fc」ヘテロ二量体Fcである(図8C~D)。scIL-12複合体は、任意にドメインリンカーで、IL-12p40にN末端結合したIL-12p35またはIL-12p35にN末端結合したIL-12p40のいずれかを含むことができる。scIL-12複合体における2つのサブユニットの順序は、本明細書では以下のように指定される:IL-12p40サブユニットがIL-12p35サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p40/p35)」、またはIL-12p35がIL-12p35サブユニットにN末端結合している「scIL-12(p35/p40)」。scIL-12-Fcフォーマットの例示的なタンパク質は、XENP27203およびXENP27204を含み、その配列は、図11に示される。
使用に企図される追加のIL-12-Fcフォーマットの漫画概略図は、図8に示される。
1B:例示的なIL-12-Fc融合体の産生および物理的特徴分析
1B(a):IL-12-ヘテロFc
IL-12p35およびIL-12p40サブユニットをコードするプラスミドを、標準的な遺伝子合成、続いてFc融合パートナー(例えば、図7に示される定常領域)を含有するpTT5発現ベクターへのサブクローニングによって構築した。タンパク質をHEK293E細胞における一過性トランスフェクションによって産生し、タンパク質Aクロマトグラフィー(精製パート1)、続いてアニオン交換クロマトグラフィー(精製パート2)を含む2段階精製プロセスによって精製した。例示的なIL-12-ヘテロFcXENP27201のための精製パート2を示すクロマトグラムは、図12Aに示される。クロマトグラムは、2つのピーク(ピークAおよびピークB)の単離を示し、これは、以下に一般的に記載される同一性、純度、および均一性について多角度光散乱での分析サイズ排除クロマトグラフィー(aSEC-MALS)および分析アニオン交換クロマトグラフィー(分析AIEX)によってさらに特徴分析された。
XENP27201のための精製パート2から単離されたピークAおよびBを、aSEC-MALSを使用して分析し、それらの成分タンパク質種を推定した。分析は、Agilent 1200高速液体クロマトグラフィー(HPLC)システムで実施した。試料を、Superdex(商標)200 10/300GLカラム(GE Healthcare Life Sciences)に1.0mL/分で、1×PBS、pH7.4を移動相として4℃で25分間、280nMのUV検出波長で用いて注入した。MALSは、Optilab(登録商標)T-rEX屈折率検出器(Wyatt Technology、Santa Barbara、Cali)を備えたminiDAWN(登録商標)TREOS(登録商標)で実施した。分析を、Agilent OpenLabクロマトグラフィーデータシステム(CDS)ChemStation Edition AICバージョンC0107およびASTRAバージョン6.1.7.15を使用して実施した。ピークAおよびBのaSEC分離プロファイルを示すクロマトグラムは、MALSによって決定される成分種のMWとともに図12Bに示される。プロファイルは、ピークAが、約299kDおよび約140kDの分子量を有する種を含み、ピークBが、約118kDの分子量を有する種を主に含むことを示し、これはグリカンによって寄与される追加の質量を考慮して、110.4kDaの(アミノ酸配列に基づく)XENP27201の計算された分子量と一致している。
精製パート2からのピークも分析AIEXを使用して分析して、ピークBの純度および均一性をさらに評価した。分析は、Agilent 1200高速液体クロマトグラフィー(HPLC)システムで実施した。試料を、Proteomix SAX-NP55μM非多孔質カラム(Sepax Technologies、Inc、Newark、Del)に、1.0mL/分で、20mMのTris、pH8.5バッファー中の0~40%NaCl勾配を使用して、280nMのUV検出波長で注入した。分析を、Agilent OpenLAB CDS ChemStation Edition AICバージョンC.01.07を使用して実施した。ピークAおよびBの分析AIEX分離を示すクロマトグラムは、図12Cに示される。ピークBのaSEC分離プロファイルと一致して、ピークBの分析AIEX分離プロファイルは、ピークBにおける種の純度および均一性を示す。以降、XENP27201は、図12Aに示されるように、精製パート2から単離されるピークBを指す。
1B(b):scIL-12(p40/p35)-Fc
リンカーを介してIL-12p35に組換え融合したIL-12p40をコードするプラスミドを、標準的な遺伝子合成、続いてFc融合パートナー(例えば、図7に示される定常領域)を含有するpTT5発現ベクターへのサブクローニングによって構築した。タンパク質をHEK293E細胞における一過性トランスフェクションによって産生し、タンパク質Aクロマトグラフィー(精製パート1)、およびアニオン交換クロマトグラフィー(精製パート2)を含む2段階精製プロセスによって精製した。
例示的なscIL-12(p40/p35)-Fc融合体XENP27203のための精製パート2を示すクロマトグラムは、図13Aに示される。上記のように、クロマトグラムは、2つのピークの単離を示し、これらは、実施例1B(a)に記載されるように、同一性、純度、および均一性についてaSEC-MALSおよび分析AIEXによってさらに特徴付けられ、そのクロマトグラムは、図13B~Cに示される。
XENP27203の精製パート2から単離されたピークAおよびBのaSEC分離プロファイルは、ピークAが、約396kD、約188kD、および約118kDの分子量を有する種を含み、ピークBが、約118kDの分子量を有する種を主に含むことを示し、これはグリカンによって寄与される追加の質量を考慮して、111.3kDaの(アミノ酸配列に基づく)XENP27203の計算された分子量と一致している。ピークはまた、ピークBの純度および均一性をさらに調査するために、実施例1B(a)に記載される分析AIEXを使用して分析された。ピークBのaSEC分離プロファイルと一致して、ピークBの分析AIEX分離プロファイル(図13C)は、ピークBにおける種の純度および均一性を示す。以降、XENP27203は、図13Aに示されるようにアニオン交換から単離されるピークBを指す。
1C:STAT4リン酸化の誘導におけるIL-12-Fc融合体のインビトロ活性
サイトカインのそれらの受容体への結合後、サイトカイン受容体と会合したヤヌスキナーゼ(JAK)は、STATタンパク質をリン酸化し、これは次いで核に移行して、さらなる下流プロセスを制御する。特に、IL-12は、STAT4のリン酸化を通してIFNγ発現および分泌を媒介する(Morinobu et al.、2002)。したがって、上記IL-12-ヘテロFc(XENP27201)およびscIL-12(p40/p35)-Fc(XENP27203)の能力は、様々なリンパ球集団におけるSTAT4リン酸化を誘導するために調査された。二価IL-12p35-Fc融合体およびIL-12p40-Fc融合体(図14~15に示される漫画概略図および配列)ならびに組換えIL-12を対照として使用した。
新鮮なPBMCを、プレートに結合した抗CD3(100ng/ml)との3日間のインキュベーションによって活性化した。活性化後、PBMCを次いで、示される試験品と示される濃度で15分間37℃でインキュベートした。インキュベーション後、PBMCを第1に抗CD3-BUV395(UCHT1)、抗CD4-BV605(RPA-T4)、抗CD8-AF700(SK1)、抗CD14-APC/Fire750(M5E2)、抗CD20-PerCP/5.5(2H7)、抗CD25-BV421(M-A251)、および抗CD56-PE抗体で染色した。最初の染色後、PerFix EXPOSE(Beckman Coulter、Indianapolis、Ind)を使用して細胞を透過処理した。透過処理後、細胞を抗CD45RA-BV510(HI100)、抗FoxP3-AF488(259D)、および抗pSTAT4-AF647(38/p-Stat4)抗体で染色した。第2の染色後、細胞をフローサイトメトリーによって分析して、様々なリンパ球集団に対するSTAT4リン酸化を調査した。IL-12受容体を介してIL-12-Fc融合体によってシグナル伝達を示す、様々なリンパ球集団に対するpSTAT4MFIを示すデータは、図16に示される。
データは、XENP27201およびXENP27203の両方が、様々なリンパ球集団におけるSTAT4リン酸化を、組換えIL-12によって誘導されるものと類似のレベルに誘導することにおいて活性であり、二価IL-12p40-Fc(XENP27560)および二価IL-12p35-Fc(XENP27561)融合体は、不活性であったことを示す。特に、2つのIL-12-Fc融合フォーマットは、類似の有効性を示した。加えて、XENP27560およびXENP27561と比較してSTAT4リン酸化を誘導する精製IL-12-Fc融合タンパク質の能力は、(実施例1Bに記載されるように)XENP27201およびXENP27203の両方の精製パート2から単離されたピークBが、完全なIL-12ヘテロ二量体を含む活性種からなることを確認する。
実施例2:低減有効性について操作されたIL-12バリアント
半減期をさらに延長し、毒性の潜在性を低減するために、我々が、これが抗原シンクを低下させるだけでなく、有効性を低減すると推論したように、我々は、IL-12受容体についての低下した結合親和性を有するIL-12バリアントを操作した。
2A(a):IL-12p40バリアントの操作
我々は、第1に、W15、P17、D18、A19、P20、G21、M23、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Y66、およびK84を、親和性調節置換を導入するためのIL-12p40上の潜在的な部位として特定した(残基は図17に示される)。
第2の戦略として、MOEソフトウェアにおけるQuaSARパッケージを使用することによって、我々は、IL-12p40結晶構造(PDBコード3HMX)における高度に露出したアスパラギン酸、グルタミン酸、アスパラギン、およびグルタミン残基を(水分子の1.4Åの半径および各原子の多面体表示を使用して計算される水接触可能表面積に従って)特定し、これらの残基がIL-12p40とIL-12受容体との間の結合に寄与し得ると推論した。特に、我々は、免疫原性の潜在性を最小限に抑えることを目的として、我々が等比体積置換を組み込むことができる残基(すなわち、AsnおよびAsp、ならびにGlnおよびGlu)に我々の検索を集中し、したがって、我々は、少なくとも19のASAスコアを有するE3、D7、E12、D14、D18、E22、D29、E32、E33、D41、Q42、E45、Q56、E59、D62、Q65、E73、E86、D93、D97、E100、N103、E110、D129、D142、Q144、E156、D161、N162、E166、E170、Q172、D174、E187、N200、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、Q256、E262、D265、D270、N281、Q289、およびE299を特定した(残基およびASAスコアは図18に示される)。
上記のように、p40サブユニットは、IL-12およびIL-23によって共有される。Blochら(2018)は、IL-23RおよびNb22E11を有する複合体におけるIL-23の結晶構造を報告した。第3の戦略として、我々は、IL-23Rと接触しているIL-12p40サブユニット上の残基が、IL-12受容体複合体における類似受容体IL-12Rβ2を結合することにも関与し得ると推論した。したがって、Blochら(PDBコード5MZV)によって報告された結晶構造およびMOEソフトウェアでのモデリングを使用して、我々は、D87、G88、I89、W90、K104、およびF106を、潜在的にIL-12Rβ2と接触しているIL-12p40上の残基として特定した(残基および予測される接触タイプは図19に示される)。
最後に、我々がIL-12p40およびIL-12p35サブユニット間の自然な相互作用を混乱させないことを保証するために、我々は、Luoら(2010)によって報告される結晶構造に基づいてIL-12p35と潜在的に接触したIL-12p40上の以下の残基を特定した:K102、Y114、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、S204、F206、R208、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、D290、R291、Y292、およびY293。
上記を考慮して、我々は、IL-12受容体に対するIL-12ヘテロ二量体の親和性を低減する目的で、等比体積置換を導入することができる残基で、特に上記のような、いくつかのIL-12p40バリアントを設計した。P40における潜在的なN-グリコシル化部位を除去する置換も、タンパク質不均一性に対するグリコシル化の影響を調査するために設計された。例示的なバリアントの配列は、図20に示される。IL-12p40バリアントをコードするプラスミドを、標準的な遺伝子合成、続いてFc融合パートナー(例えば、図7に示される定常領域)を含有するpTT5発現ベクターへのサブクローニングによって構築し、その対応するアミノ酸配列は、図21に示される。
2A(b):IL-12p35バリアントの操作
上に記載される第2の戦略と同様に、我々は、MOEソフトウェアにおけるQuaSARパッケージを使用して、IL-12p35結晶構造(PDBコード3HMX)における高度に露出したアスパラギン酸、グルタミン酸、アスパラギン、およびグルタミン残基を特定し、これらの残基がIL-12ヘテロ二量体複合体とIL-12受容体との間の結合に寄与し得ると推論する。同様に、我々は、免疫原性の潜在性を最小限に抑えるために、特に、我々が等比体積置換を組み込むことができる残基に、ここで焦点を当てた。我々は、少なくとも103のASAスコアを有するQ35、E38、E46、D55、E67、N71、N76、N85、Q135、Q146、N151、E153、E162、およびE163を特定した(図22に示される残基およびASAスコア)。
上記のように、我々がIL-12p40およびIL-12p354サブユニット間の自然な相互作用を混乱させないことを保証するために、我々は、Luoら(2010)によって報告される結晶構造に基づいてIL-12p40と潜在的に接触したIL-12p35上の以下の残基を特定した:Q20、S44、E45、E46、H49、K54、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、S73、C74、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、およびA196。
上記を考慮して、我々は、IL-12受容体に対するIL-12ヘテロ二量体の親和性を低減する目的で等比体積置換を有するいくつかのIL-12p35バリアントを設計した。p35における潜在的なN-グリコシル化部位を除去する置換も、タンパク質不均一性に対するグリコシル化の影響を調査するために設計された。例示的なバリアントの配列は、図23に示される。IL-12p35バリアントをコードするプラスミドを、標準的な遺伝子合成、続いてFc融合パートナー(例えば、図7に示される定常領域)を含有するpTT5発現ベクターへのサブクローニングによって構築し、その対応するアミノ酸配列は、図24に示される。
2A(c):低減した有効性を有するIL-12-Fc融合体のスクリーニング
上記のバリアントIL-12サブユニットを有する例示的なバリアントIL-12-Fc融合タンパク質は、有効性を低減するためにIL-12受容体についての低減した親和性を有するIL-12-Fc融合体を生成する目的で設計され、その配列は図25に示される。我々は、実施例1Bに一般的に記載されるようにIL-12-Fc融合体を産生および精製し、pSTAT4アッセイにおいてそれらの活性を調査した。
ヒトPBMCを100ng/mlの抗CD3(OKT3)で2日間活性化した。次いで活性化PBMCを15分間37℃で示される試験品とインキュベートした。次いで、細胞を抗CD3-BUV395(UCHT1)、抗CD4-BV605(RPAT4)、抗CD8-AF700(SK1)、抗CD25-BV510(M-A251)、抗CD45RA-BV421(HI100)、抗CD56-PE(N901)、抗FoxP3-AF488(259D)、および抗pSTAT4-AF647(38/p-Stat4)でPerFix EXPOSEキット(Beckman Coulter、Indianapolis、Ind.)を使用して染色し、フローサイトメトリーにより分析した。
IL-12p35またはIL-12p40バリアントを有するIL-12-Fc融合体によるCD4CD45RACD25およびCD8CD45RACD25T細胞に対するSTAT4リン酸化の誘導を示すデータは、それぞれ図26および27に示される。図28は、様々なバリアントIL-12-Fc融合体のEC50およびWTIL-12-FcXENP27201と比較したEC50の減少倍率を示す。データは、バリアントIL-12p40サブユニットまたはIL-12p30サブユニットを含むIL-12-Fc融合体のほとんどが、STAT4リン酸化を誘導することにおいて低下した有効性を示すことを示す。特に、IL-12p40サブユニットにおけるE59QおよびE235Q置換、ならびにIL-12p35置換におけるE153QおよびN151D置換は、バリアントIL-12-Fc融合体について有効性の2倍を超える低減を個別に提供することができた。加えて、E59Qを含むIL-12p40二重および三重変異体は、有効性の最大6.5倍低減を提供した。
驚くべきことに、IL-12p40(D87N)またはIL-12p40(E262Q)を含む2つのバリアントIL-12-Fc融合体は、有効性の増加を示した。我々は、抗原シンクを減少させ、それによってIL-12-Fc融合体の半減期を増加させることを目的として、有効性を減少させることに関心があるが、増加した有効性を有するIL-12-Fc融合体は、他の文脈で使用を見出し得る。
2B:IL-12p40およびIL-12p35バリアントの操作(ラウンド2)
IL-12受容体についてのそれらの親和性を低減することを目的としてIL-12p40およびIL-12p35バリアントをさらに操作し、生物学的に活性なIL-12複合体の有効性を低減するために、我々は、拡大された基準で実施例2Aに記載される戦略を再適用した。例えば、我々は、置換を導入するIL-12p40およびIL-12p35残基を特定するために実施例2Aで定義されたものよりも低いASAスコア閾値を使用した。我々はまた、我々の基準を、その置換の導入がIL-12p35、IL-12p40、および/またはIL-12受容体とのIL-12複合体の相互作用を混乱させる可能性が高い、リジンなどのより大きな残基に特に焦点を合わせて、追加のアミノ酸残基を含むように拡大した。
同様に、我々は、IL-12p35、IL-12p40、および/またはIL-12受容体とのIL-12複合体の相互作用を混乱させるために、リジンなどのより大きな残基に特に焦点を合わせて、非等比体積置換を導入した。これらのアプローチを使用して、我々は、IL-12p40サブユニットにおけるD34、K99、K163、K258、およびK260、ならびにIL-12p35サブユニットにおけるN21、E79、Q130、N136、E143、K158、およびD165を、置換を操作するために適した残基としてさらに特定した。加えて、我々は、実施例2において特定された置換を組み込む追加の組み合わせバリアントを生成し、これは有効性の最大の低減に寄与した。
上記を踏まえ、我々は、さらなるIL-12p40およびIL-12p35バリアントを指定し、その例示的な配列は、それぞれ図29および31に示される。上記のように、IL-12p40およびIL-12p35バリアントをコードするプラスミドを、標準的な遺伝子合成、続いてFc融合パートナー、それぞれ図30および32に示される対応するアミノ酸配列を含有するpTT5発現ベクターへのサブクローニングによって構築した。IL-12-Fc融合タンパク質は、追加のバリアントIL-12サブユニットで生成され、その配列は、図33に示され、実施例1Bに一般的に記載されるように生成される。
追加のバリアントIL-12-Fc融合体の活性を上記で一般的に記載されるpSTAT4アッセイにおいて調査した。特に、ヒトPBMCを100ng/mlの抗CD3(OKT3)で2日間活性化した。次いで活性化PBMCを15分間37℃で示される試験品とインキュベートした。次いで、細胞を抗CD3-BUV395(UCHT1)、抗CD4-BV605(RPAT4)、抗CD8-AF700(SK1)、抗CD25-BV510(M-A251)、抗CD45RA-BV421(HI100)、および抗CD56-PE(N901)で染色した。次に、PerFix EXPOSE(Beckman Coulter、Indianopolis、Ind.)を使用して細胞を透過処理した。透過処理後、細胞を抗FoxP3-AF488(259D)および抗-pSTAT4-AF647(38/p-Stat4)で染色し、フローサイトメトリーによって分析した。CD4CD45RACD25およびCD8CD45RACD25T細胞に対するpSTAT4MFIを示すデータは、図34~35に示され、EC50(およびWTIL-12-Fc XENP27201と比較した減少倍率)を表すデータは、図36に示される。データは、バリアントIL-12p40および/またはIL-12p30サブユニットを含むIL-12-Fc融合体のほとんどが、STAT4リン酸化を誘導することにおいて低下した有効性を示したことを示す。
2C:IL-12p40およびIL-12p35バリアントの操作(ラウンド3)
実施例2Bでは、我々は、有効性の約2倍のみの低減を有したIL-12p40(E59Q)を含むIL-12-Fc融合体XENP28825とは対照的に、IL-12p40(E59K)を含むIL-12-Fc融合体XENP29952は、約12倍低減を可能にしたことを見出した。加えて、我々は、IL-12p40サブユニットにおけるE59Qを含むいくつかの二重変異体が、有効性の>3.5倍低減を示したことに留意した(例えば、XENP29953、XENP29954、およびXENP29959)。さらに、我々は、IL-12p35(N151D)を含むXENP28846が増加した有効性を可能にするが、IL-12p35(D55Q/N151D)が実際に有効性の約2倍低減を可能にすることに留意し、これは我々に、IL-12p35サブユニットにおけるD55の修飾が有効性の低減に大きく寄与することを示した。したがって、IL-12-Fc融合体の有効性をさらに低減するために、我々は、実施例2Bにおける置換を組み込む追加の組み合わせバリアントを生成し、これは有効性の最大の低減に寄与した。加えて、実施例2Bのように、我々は、リジンなどのより大きな残基に特に焦点を合わせて、非等比体積置換をさらに含めた。
上記を踏まえ、我々は、さらなるIL-12p40およびIL-12p35バリアントを指定し、その例示的な配列は、それぞれ図37および38に示される。IL-12-Fc融合タンパク質は、追加のバリアントIL-12サブユニットで生成され、その配列は、図39に示され、実施例1Bに一般的に記載されるように生成される。追加のバリアントIL-12-Fc融合体の活性を上記で一般的に記載されるpSTAT4アッセイにおいて調査した。CD4CD45RACD25およびCD8CD45RACD25T細胞に対するpSTAT4MFIを示すデータは、図40に示され、EC50(およびWTIL-12-Fc XENP27201と比較した減少倍率)を表すデータは、図41に示される。データは、バリアントIL-12p40および/またはIL-12p30サブユニットを含む新しいIL-12-Fc融合体の全てが、STAT4リン酸化を誘導することにおいて実質的に低下した有効性を示したことを示す。特に、XENP30607およびXENP30608は、XENP27201と比較して有効性の約100倍減少を示した。
2D:IL-12p40およびIL-12p35バリアントの操作(ラウンド4)
我々は、有効性のシフトに寄与する実施例2に見られる追加のバリアントを組み込むこと、ならびにリジンおよびチロシンなどのより大きな残基に特に焦点を合わせて、非等比体積置換をさらに使用することの両方によって、IL-12p35、IL-12p40、および/またはIL-12受容体とのIL-12複合体の相互作用を混乱させるように、IL-12p40およびIL-12p35サブユニットをさらに操作した。
加えて、我々は、表面露出に基づいてMOEソフトウェアでさらなる構造分析を実施し、修飾を導入するIL-12p40およびIL-12p35サブユニットにおける追加の残基を特定した。我々は、IL-12p40サブユニットにおける残基R159およびK264、ならびにIL-12p35サブユニットにおける残基L75、L89、F96、M97、L124、M125、およびI171をさらに特定した。我々は、これらの追加で特定された残基での修飾の効果を予備的に調査するために、前述のアプローチ、および(アラニンスキャニング変異誘発技法に沿った)アラニン置換を使用した。
上記を踏まえ、我々は、さらなるIL-12p40およびIL-12p35バリアントを設計し、その例示的な配列は、それぞれ図42および43に示される。IL-12-Fc融合タンパク質は、追加のバリアントIL-12サブユニットで生成され、その配列は、図44に示され、実施例1Bに一般的に記載されるように生成される。
追加のバリアントIL-12-Fc融合体の活性を上記で一般的に記載されるpSTAT4アッセイにおいて調査した。CD4CD45RACD25、CD4CD45RACD25、CD8CD45RACD25、およびCD8CD45RACD25T細胞に対するpSTAT4MFIを示すデータは、図46に示され、EC50(およびWTIL-12-Fc XENP27201と比較した減少倍率)を表すデータは、図47に示される。データは、バリアントIL-12p40および/またはIL-12p35サブユニットを含む新しいIL-12-Fc融合体の全てが、STAT4リン酸化を誘導することにおいて実質的に低下した有効性を示したことを示す。
実施例3:二価IL-12-Fc融合体
我々はまた、二価IL-12-Fc融合体を考えた。1つのそのようなフォーマットは、各々が、(任意にドメインリンカーを介して)ホモ二量体Fc鎖のN末端に融合したscIL-12複合体組換え体を含む、2つの同一の単量体を含む二価N末端IL-12-Fc融合フォーマット(図48A~B)である。別のそのようなフォーマットは、各々が、(任意にドメインリンカーを介して)ホモ二量体Fc鎖のC末端に融合したscIL-12複合体組換え体を含む、2つの同一の単量体を含む二価C末端IL-12-Fc融合フォーマット(図48C~D)である。
実施例4:代替IL-12-Fc融合フォーマットの低減有効性IL-12バリアント
我々はまた、追加のIL-12-Fc融合フォーマットの文脈でIL-12バリアントを調査した。scIL-12(p40/p35)-Fcおよび(scIL-12(p40/p35))-Fcフォーマットの融合体は、WTIL-12p40サブユニットまたはバリアントIL-12p40(E59K/K99E)サブユニットのいずれかで生成され、実施例1Bに一般的に記載されるように生成された(その配列は図49~50に示される)。
IL-12-Fc融合体の活性を上記で一般的に記載されるpSTAT4アッセイにおいて調査した。特に、ヒトPBMCを100ng/mlの抗CD3(OKT3)で2日間37℃で活性化した。次いで活性化PBMCを15分間37℃で示される試験品とインキュベートした。次いで、細胞を抗CD3-BUV395(UCHT1)、抗CD4-BV605(RPAT4)、抗CD8-AF700(SK1)、抗CD25-BV711(M-A251)、抗CD45RA-BV421(HI100)、および抗CD56-PE(N901)で染色した。次に、PerFix EXPOSE(Beckman Coulter、Indianopolis、Ind.)を使用して細胞を透過処理した。透過処理後、細胞を抗FoxP3-V450(259D)および抗-pSTAT4-AF647(38/p-Stat4)で染色し、フローサイトメトリーによって分析した。CD4CD45RACD25、CD4CD45RACD25、CD8CD45RACD25、およびCD8CD45RACD25T細胞に対するpSTAT4MFIを示すデータは、図51に示され、EC50(およびWTIL-12-Fc XENP27201と比較した減少倍率)を表すデータは、図52に示される。データは、様々なフォーマットのIL-12-Fc融合体が、非常に類似した有効性を示し、バリアントIL-12p40(E59K/K99E)サブユニットを含むscIL-12(p40/p35)-Fcおよび(scIL-12(p40/p35))-Fc融合体におけるIL-12-Fc融合体が、バリアントIL-12p40(E59K/K99E)サブユニットを含むIL-12-ヘテロFcフォーマットのIL-12-Fc融合体と非常に類似した有効性を示したことを示す。
実施例5:IL-12-Fc融合体はインビボでT細胞の同種異系抗腫瘍効果を増強する
次に、我々は、本発明のIL-12-Fc融合体のインビボ抗腫瘍効果を調査した。-15日目に、NOD SCIDガンマ(NSG)マウスの右脇腹に、3×10個のpp-65発現MCF-7細胞を皮内生着させた。0日目に、マウスに1.5×10個のヒトPBMCを腹腔内生着させた。次に、マウス(n=15)を0、7、14、および21日目に0.03mg/kgのXENP29952、バリアントIL-12p40(E59K)を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体で処理した。使用される対照(n=10)は、PBSおよびXENP16432(二価抗PD-1 mAb、生着ヒトT細胞を抑制解除することによって抗腫瘍活性を増強するチェックポイント阻害剤、図53に示される配列)であった。腫瘍体積は、キャリパー測定により監視し、そのデータは、図54に示される(第1の用量後の日数)。血液および血清を、7、14、および21日目に採取し、フローサイトメトリーにより分析して、ヒトリンパ球の増殖を調査し、そのデータは、図55に示され、同様にU-PLEX Biomarker Group 1 Human Assay(Meso Scale、Rockville、Md.)によって血清サイトカイン濃度について調査し、そのデータは、図56に示される。
データは、IL-12ヘテロFc融合体XENP29952が、PBS対照およびXENP16432によるチェックポイント遮断の両方と比較して、14日目までにCD45、CD3T細胞、CD4T細胞、CD8T細胞、およびNK細胞の増殖を有意に増強したことを示す(対応のないt検定を使用して対数変換データに対して実施された統計)。特に、XENP29952は、腫瘍体積の変化によって示されるように、11日目までに抗腫瘍活性を有意に増強した(対応のないt検定を使用してベースライン補正データに対して実施された統計)。さらに、XENP29952は、XENP16432によるチェックポイント遮断と比較して7日目までにIFNγおよびCD25の分泌を有意に増強した(対応のないt検定を使用して対数変換データに対して実施された統計)。
抗腫瘍活性に加えて、生着ヒトPBMCは、マウス細胞に対する自己免疫応答を発現し、その後、移植片対宿主病(GVHD)を発症する。したがって、XENP29952で処理された全ての動物が19日目までに死亡したが、これはおそらく、ヒトリンパ球の有意に増強された増殖によって悪化したGVHDに屈したためであった。これは、薬物動態を改善するためだけでなく、治療指数を改善するためにも、低減有効性IL-12バリアントの重要性を強調する。
実施例6:IL-12-Fc融合体はインビトロ有効性にインビボ相関する調節された活性を示す
実施例5においてXENP29952で処理された全ての動物がGVHDの結果として死亡したため、我々は、GVHD研究において低減有効性IL-12バリアントで操作されたIL-12-Fc融合体のインビボ活性を調査した。
NSGマウスに、-1日目にIV-OSPを介して10x10個のヒトPBMCを生着させ、0、7、14、および21日目に以下の試験品:XENP29952(バリアントIL-12p40(E59K))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP30597(バリアントIL-12p40(E59K/K99E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP31254(バリアントIL-12p40(D18K/E59K/K99E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、XENP31251(バリアントIL-12p40(E59K/K99Y))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)、またはXENP31258(バリアントIL-12p40(E59K/K99E/K264E))を含むIL-12-ヘテロFcフォーマットの低減有効性IL-12-Fc融合体)を0.3または0.03mg/kgで腹腔内投与した。体重は、GVHDの指標として週に2回評価し、そのデータは、(初期体重と比較した)体重の変化として図57に示される。加えて、7、10、14、および31日目に採血して、PD-1発現レベルによって示される様々なT細胞集団の活性化を調査し(そのデータは図58および59に示される)、血清を採取して、サイトカイン分泌を調査した(そのデータは図60に示される)。特に、データは、試験品についての用量応答(すなわち、0.03mg/kg用量と比較して0.3mg/kg用量によって増強されたGVHD、T細胞活性化、およびIFNγ分泌)を示す。
インビトロでのCD4T細胞に対するSTAT4リン酸化を誘導することにおいて最も弱いバリアントの1つであると思われる(図46A~46Bを参照されたい)XENP31251が、GVHDのより強力な誘導因子の1つであったことは意外であった。したがって、我々は、2つの別々のPBMCドナーを使用して上記で一般的に記載されるSTAT4リン酸化アッセイにおいて同じ例示的な低減有効性IL-12-Fcのインビトロ活性を再調査した。ヒトPBMCを1μg/mlの抗CD3(OKT3)で2日間37℃で活性化した。次いで活性化PBMCを15分間37℃で示される試験品とインキュベートした。
次いで、細胞を抗CD3-BUV395(UCHT1)、抗CD4-BV605(RPAT4)、抗CD8-AF700(SK1)、抗CD25-BV510(M-A251)、抗CD45-BV785、抗CD45RA-BV421(HI100)、抗CD16-PE(B73)、および抗CD56-PE(N901)で染色した。次に、PerFix EXPOSE(Beckman Coulter、Indianapolis、Ind.)を使用して細胞を透過処理した。透過処理後、細胞を抗FoxP3-AF488(259D)および抗-pSTAT4-AF647(38/p-Stat4)で染色し、フローサイトメトリーによって分析した。2ドナーからのPBMCにおける様々なリンパ球集団に対するSTAT4リン酸化の誘導は、図61に示される(第2のドナーについてのデータは示されないが、62/848、512)における図62から参照により組み込まれる)。両ドナーからの様々なリンパ球集団にわたるデータは、有効性ラダーを示し、XENP29952は最も有効なバリアントであり、XENP31254およびXENP31258は最も有効でないバリアントであり、XENP30597およびXENP31251はその間に入る。特に、低減有効性IL-12-Fc融合バリアントによって誘導されるGVHD、T細胞活性化、およびIFNγ分泌の程度は、インビトロ有効性とインビボ相関した。例えば、0.03mg/kg用量では、XENP29952は、全ての低減有効性IL-12-Fc融合体よりも大きなGVHD、T細胞活性化、およびIFNγ分泌を誘導し、XENP31254およびXENP31258は、最小GVHD、T細胞活性化、およびIFNγ分泌を誘導した。
実施例7:IL-12-Fc融合体は抗腫瘍活性を有し、チェックポイント遮断と生産的に組み合わせる
次に、我々は、IL-12-Fc融合体をチェックポイント遮断と組み合わせる効果とともに追加のIL-12-Fc融合体を組み合わせるインビボ抗腫瘍効果を調査した。-15日目に、NSGマウスの右脇腹に、3×10個のpp-65発現MCF-7細胞を皮内生着させた。0日目に、マウスに5×10個のヒトPBMCを腹腔内生着させた。次いで、マウスを0、7、14、および21日目に0.1mg/kgのXENP31251単独で、または3.0mg/kgの抗PD-1 mAbXENP16432と組み合わせて治療した。使用された対照は、PBS、3.0mg/kgのXENP16432単独、およびXENP31258であった。腫瘍体積は、キャリパー測定により監視し、そのデータは、図62に示される(第1の用量後の日数)。7、14、および21日目に採血し、フローサイトメトリーにより分析して、ヒトリンパ球の増殖を調査し、そのデータは、14日目について図63に示される。
データは、PBSでの処理と比較して、XENP31258が14日目までに抗腫瘍活性を有意に増強し、XENP31251(単独またはXENP16432との組み合わせ)が、16日目までに抗腫瘍活性(腫瘍体積の変化によって示される)を有意に増強したことを示す(マンホイットニー検定を使用してベースライン補正データで実施された統計)。特に、データは、XENP16432と組み合わせたXENP31251がXENP16432単独での処理と比較して21日目までに抗腫瘍活性を有意に増強し、XENP16432と組み合わせたXENP31251での処理が、XENP31251またはXENP16432単独のいずれかと比較してリンパ球増殖を有意に増強し、IL-12-Fc融合体をチェックポイント遮断と生産的に組み合わせることを示した。
実施例8:IL-12p40サブユニットにおける遊離システインの除去
IL-12p40サブユニットは、位置252に遊離システイン(図1に示されるヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列に従って付番される)を有し、これは他の遊離システインと結合し、少なくとも不均一性、さらに悪い場合では免疫原性をもたらし得る。したがって、IL-12p40バリアントは、例えば、C252S修飾を導入することによって(他の置換も使用され得るが)、遊離システインを除去するように操作された。C252(例えば、C252S)の修飾は、単独で、または任意の他のIL-12p40バリアント、例えば、親和性もしくは発現バリアントと組み合わせて使用することができる。遊離システインを除去するC252での修飾を含む例示的なIL-12p40バリアントは、図65に示される。例示的なIL-12-Fc融合タンパク質は、追加のバリアントIL-12p40サブユニットで生成され、その配列は、図66に示され、実施例1Bに一般的に記載されるように生成される。
遊離システインを除去するように操作されたIL-12p40バリアントの活性を、遊離システインの除去が活性のいずれの変化も引き起こさなかったことを確認するために、上記で一般的に記載されるpSTAT4アッセイにおいて調査した。活性化PBMCを、示された試験品とインキュベートし、様々な集団に対するpSTAT4MFIを評価し、そのデータは図67に示される。データは、C252S修飾を含むバリアントが、C252S修飾を含まない対応するバリアントと類似の活性を示したことを示す。特に、試験された4つのバリアントのうちの3つについて、我々はバージョンをC252S 変異ありおよびなしで操作し(すなわちD18K/E59K/K99E;D18K/E59K/K99E/K264E;およびE59K/K99E)、C252S変異は、IL-12-Fc融合体の有効性をわずかに増加させるように見えた。
上記の実施例は、当業者に本発明の組成物、システム、および方法の実施形態をどのように作製および使用するかについての完全な開示および説明を与えるために提供されており、本発明者らがそれらの発明とみなすものの範囲を限定することは意図されていない。当業者に明らかである本発明を実施するための上に記載される様式の修正は、以下の特許請求の範囲内にあることが意図される。本明細書中で言及されている全ての特許および刊行物は、本発明が関係する当業者の技術水準を示している。本開示において引用された全ての参考文献は、あたかも各参考文献が参照によりその全体が個別に組み込まれているのと同程度に参照により組み込まれる。
全ての見出しおよびセクションの指定は、明確さおよび参照目的のためだけに使用されているにすぎず、決して限定的であると見なされるべきではない。例えば、当業者は、本明細書に記載される本発明の趣旨および範囲に従って、必要に応じて異なる見出しおよびセクションからの様々な態様を組み合わせることの有用性を認識するであろう。
本明細書に引用された全ての参考文献は、あたかも各個々の刊行物または特許または特許出願が全ての目的のためにその全体が参照により組み込まれるように具体的かつ個別に示されるのと同程度にそれらの全体が全ての目的のために本明細書に参照により組み込まれる。
当業者には明らかなように、本出願の趣旨および範囲から逸脱することなく、本出願の多くの修正および変形をなすことができる。本明細書に記載された特定の実施形態および実施例は例としてのみ提供され、特許請求の範囲が権利を与えられる同等物の全範囲と共に、添付の特許請求の範囲の用語によってのみ限定されるべきである。

Claims (239)

  1. ヘテロ二量体Fc融合タンパク質であって、
    a)バリアントIL-12p40サブユニットドメインおよび第1のFcドメインを含む第1の融合タンパク質であって、前記IL-12p40サブユニットドメインが、前記第1のFcドメインのN末端に共有結合している、第1の融合タンパク質と、
    b)IL-12p35サブユニットドメインおよび第2のFcドメインを含む第2の融合タンパク質であって、前記IL-12p35サブユニットドメインが、前記FcドメインのN末端に共有結合している、第2の融合タンパク質と、を含み、
    前記第1および前記第2のFcドメインが、前記第1および前記第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾を含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  2. 前記IL-12p40サブユニットが、E59K、E59Q、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項1に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  3. 前記IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項1または2に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  4. 前記IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項1~3のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  5. 前記バリアントIL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列と少なくとも90%の同一性を有し、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項1~4のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  6. 前記IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、請求項1~4のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  7. 前記IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、請求項1~4および6のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  8. 前記バリアントIL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項6~7のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  9. 前記バリアントIL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項6~8のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  10. 前記バリアントIL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項6~9のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  11. 前記第1および前記第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する前記修飾が、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357Q;T366S/L368A/Y407VおよびT366W;T366S/L368A/Y407V/Y349CおよびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、請求項1~10のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  12. 前記バリアントIL-12p40サブユニットドメインが、第1のドメインリンカーを使用して前記第1のFcドメインに結合し、かつ/または前記IL-12p35サブユニットドメインが、第2のドメインリンカーを使用して前記第2のFcドメインに結合している、請求項1~11のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  13. 前記第1および/または前記第2のFcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項1~12のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  14. 前記第1および/または前記第2のFcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項1~13のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  15. 前記第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、請求項1~14のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  16. 前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が、
    a)i)配列番号47(XENP27201鎖1)、ii)配列番号85(XenD24752)、iii)配列番号86(XenD24753)、iv)配列番号87(XenD24754)、v)配列番号88(XenD24755)、vi)配列番号89(XenD24756)、vii)配列番号90(XenD24757)、viii)配列番号91(XenD24758)、ix)配列番号92(XenD24759)、x)配列番号93(XenD24760)、xi)配列番号94(XenD24761)、xii)配列番号95(XenD24762)、xiii)配列番号96(XenD24763)、xiv)配列番号97(XenD24764)、xv)配列番号98(XenD24765)、xvi)配列番号99(XenD24766)、xvii)配列番号100(XenD24767)、xviii)配列番号101(XenD24768)、xix)配列番号102(XenD24769)、xx)配列番号103(XenD24770)、xxi)配列番号104(XenD24771)、xxii)配列番号105(XenD24772)、xxiii)配列番号106(XenD24773)、xxiv)配列番号107(XenD24774)、xxv)配列番号108(XenD24775)、xxvi)配列番号109(XenD24776)、xxvii)配列番号110(XenD24777)、xxviii)配列番号111(XenD24778)、xxix)配列番号112(XenD24792)、xxx)配列番号215(XenD25922)、xxxi)配列番号216(XenD25923)、xxxii)配列番号217(XenD25924)、xxxiii)配列番号218(XenD25925)、xxxiv)配列番号219(XenD25926)、xxxv)配列番号220(XenD25927)、xxxvi)配列番号221(XenD25928)、xxxvii)配列番号222(XenD25929)、xxxviii)配列番号223(XenD25930)、xxxix)配列番号224(XenD25931)、xl)配列番号XXX(XenD26411)、xli)配列番号XXX(XenD26412)、xlii)配列番号XXX(XenD26413)、xliii)配列番号XXX(XenD26414)、xliv)配列番号XXX(XenD26415)、xlv)配列番号XXX(XenD26416)、xlvi)配列番号XXX(XenD26417)、xlvii)配列番号XXX(XenD26418)、xlviii)配列番号XXX(XenD27070)、xlix)配列番号XXX(XenD27071)、l)配列番号XXX(XenD27072)、li)配列番号XXX(XenD27073)、lii)配列番号XXX(XenD27074)、liii)配列番号XXX(XenD27075)、liv)配列番号XXX(XenD27076)、lv)配列番号XXX(XenD27077)、lvi)配列番号XXX(XenD27078)、lvii)配列番号XXX(XenD28173)、lviii)配列番号XXX(XenD24876)、lix)配列番号XXX(XenD27162)、lx)配列番号XXX(XenD27163)、lxi)配列番号XXX(XenD27164)、lxii)配列番号XXX(XenD27165)lxiii)配列番号XXX(XENP31582鎖1)、lxiv)配列番号XXX(XENP31583鎖1)、lxv)配列番号XXX(XENP31584鎖1)、lxvi)配列番号XXX(XENP32187鎖1)、lxvii)配列番号XXX(XENP32188鎖1)、lxviii)配列番号XXX(XENP32189、鎖1)、lxix)配列番号XXX(XENP32190鎖1)、lxx)配列番号XXX(XENP32191鎖1)、lxxi)配列番号XXX(XENP32991鎖1)、lxxii)配列番号XXX(XENP32992鎖1)、lxxiii)配列番号XXX(XENP32993鎖1)、lxxiv)配列番号XXX(XENP32994鎖1)、lxxv)配列番号XXX(XENP32995鎖1)、lxxvi)配列番号XXX(XENP32996鎖1)、lxxvi)配列番号XXX(XENP32997鎖1)、lxxvii)配列番号XXX(XENP32998鎖1)、lxxvii)配列番号XXX(XENP32999鎖1)、lxxviii)配列番号XXX(XENP33000鎖1)、lxxix)配列番号XXX(XENP33001鎖1)、lxxx)配列番号XXX(XENP33002鎖1)、lxxxi)配列番号XXX(XENP33003鎖1)、lxxxii)配列番号XXX(XENP33004鎖1)、lxxxiii)配列番号XXX(XENP33005鎖1)、lxxxiv)配列番号XXX(XENP33006鎖1)、lxxxv)配列番号XXX(XENP33007鎖1)、lxxxvi)配列番号XXX(XENP33008鎖1)、lxxxvii)配列番号XXX(XENP33008鎖1)、lxxxviii)配列番号XXX(XENP33009鎖1)、lxxxix)配列番号XXX(XENP33010鎖1)、およびxc)配列番号XXX(XENP33011鎖1)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する前記第1の融合タンパク質と、
    b)i)配列番号48(XENP27201鎖2)、ii)配列番号126(XenD24779)、iii)配列番号127(XenD24780)、iv)配列番号128(XenD24781)、v)配列番号129(XenD24782)、vi)配列番号130(XenD24783)、vii)配列番号131(XenD24784)、viii)配列番号132(XenD24785)、ix)配列番号133(XenD24786)、x)配列番号134(XenD24787)、xi)配列番号135(XenD24788)、xii)配列番号136(XenD24789)、xiii)配列番号137(XenD24790)、xiv)配列番号138(XenD24791)、xv)配列番号236(XenD25911)、xvi)配列番号237(XenD25912)、xvii)配列番号238(XenD25913)、xviii)配列番号239(XenD25914)、xix)配列番号240(XenD25915)、xx)配列番号241(XenD25916)、xxi)配列番号242(XenD25917)、xxii)配列番号243(XenD25918)、xxiii)配列番号244(XenD25919)、xxiv)配列番号245(XenD25920)、xxv)配列番号246(XenD25921)、xxvi)配列番号XXX(XenD26427)、xxvii)配列番号XXX(XenD26428)、xxviii)配列番号XXX(XenD27089)、xxix)配列番号XXX(XenD27090)、xxx)配列番号XXX(XenD27091)、xxxi)配列番号XXX(XenD27092)、xxxii)配列番号XXX(XenD27093)、xxxiii)配列番号XXX(XenD27094)、xxxix)配列番号XXX(XenD24877)、xl)配列番号XXX(XenD27166)、xli)配列番号XXX(XENP31582鎖2)、xlii)配列番号XXX(XENP31583鎖2)、xliii)配列番号XXX(XENP31584鎖2)、xliv)配列番号XXX(XENP32187鎖2)、xlv)配列番号XXX(XENP32188鎖2)、xlvi)配列番号XXX(XENP32189、鎖2)、xlvii)配列番号XXX(XENP32190鎖2)、xlviii)配列番号XXX(XENP32191鎖2)、xlix)配列番号XXX(XENP32991鎖2)、l)配列番号XXX(XENP32992鎖2)、li)配列番号XXX(XENP32993鎖2)、lii)配列番号XXX(XENP32994鎖2)、liii)配列番号XXX(XENP32995鎖2)、liv)配列番号XXX(XENP32996鎖2)、lv)配列番号XXX(XENP32997鎖2)、lvi)配列番号XXX(XENP32998鎖2)、lvii)配列番号XXX(XENP32999鎖2)、lviii)配列番号XXX(XENP33000鎖2)、lix)配列番号XXX(XENP33001鎖2)、lx)配列番号XXX(XENP33002鎖2)、lxi)配列番号XXX(XENP33003鎖2)、lxii)配列番号XXX(XENP33004鎖2)、lxiii)配列番号XXX(XENP33005鎖2)、lxiv)配列番号XXX(XENP33006鎖2)、lxv)配列番号XXX(XENP33007鎖2)、lxvi)配列番号XXX(XENP33008鎖2)、lxvii)配列番号XXX(XENP33008鎖2)、lxviii)配列番号XXX(XENP33009鎖2)、lxix)配列番号XXX(XENP33010鎖2)、およびlxx)配列番号XXX(XENP33011鎖2)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する前記第2の融合タンパク質と、を含む、請求項1~15のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  17. 前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が、XENP27201、XENP28820、XENP28821、XENP28822、XENP28823、XENP28824、XENP28825、XENP28826、XENP28827、XENP28828、XENP28829、XENP28830、XENP28831、XENP28832、XENP28833、XENP28834、XENP28835、XENP28836、XENP28837、XENP28838、XENP28839、XENP28840、XENP28841、XENP28842、XENP28843、XENP28844、XENP28845、XENP28846、XENP28847、XENP28848、XENP28849、XENP28850、XENP28851、XENP28852、XENP29949、XENP29950、XENP29951、XENP29952、XENP30597、XENP30598、XENP30599、XENP30600、XENP30601、XENP30602、XENP30603、XENP30604、XENP30605、XENP30606、XENP30307、XENP30308、XENP30609、XENP31250、XENP31251、XENP31252、XENP31253、XENP31254、XENP31255、XENP31256、XENP31257、XENP31258、XENP31259、XENP31260、XENP31261、XENP31262、XENP31263、XENP31264、XENP31265、XENP31286、XENP31142、XENP31143、XENP31144、XENP31145、XENP31146、XENP31582、XENP31583、XENP31584、XENP32186、XENP32187、XENP32188、XENP32189、XENP32190、XENP32191、XENP32991、XENP32992、XENP32993、XENP32994、XENP32995、XENP32996、XENP32997、XENP32998、XENP32999、XENP33000、XENP33001、XENP33002、XENP33003、XENP33004、XENP33005、XENP33006、XENP33007、XENP33008、XENP33008、XENP33009、XENP33010、およびXENP33011からなる群から選択される、請求項1~16のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  18. 前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が、XENP31251、XENP31254、XENP31258、XENP32186、XENP32187、XENP32188、XENP32189、XENP32190、およびXENP32191からなる群から選択される、請求項1~17のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合。
  19. N103Q、N113Q、N200Q、およびN281Qからなる群から選択される前記IL-12p40サブユニットに対する1つ以上の修飾をさらに含む、請求項17~18のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  20. 対象における癌の治療における使用のための請求項1~19のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物。
  21. 請求項1~19のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸。
  22. 請求項21に記載の1つ以上の核酸を含む宿主細胞。
  23. ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法であって、前記方法が、前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で請求項22に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
  24. 請求項1~19のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法であって、前記方法が、
    a)前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、
    b)前記組成物をイオン交換カラム上に充填することと、
    c)前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む、方法。
  25. ヘテロ二量体Fc融合タンパク質であって、
    a)第1のタンパク質ドメインおよび第1のFcドメインを含む第1の融合タンパク質であって、前記第1のタンパク質ドメインが、前記第1のFcドメインのC末端に共有結合している、第1の融合タンパク質と、
    b)第2のタンパク質ドメインおよび第2のFcドメインを含む第2の融合タンパク質であって、前記第2のタンパク質ドメインが、前記FcドメインのC末端に共有結合している、第2の融合タンパク質と、を含み、
    前記第1および前記第2のFcドメインが、前記第1および前記第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾を含み、前記第1のタンパク質ドメインが、IL-12p40サブユニットを含み、前記第2のタンパク質ドメインが、IL-12p35サブユニットを含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  26. 前記第1および前記第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する前記修飾が、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357QおよびT366S/L368A/Y407V:T366W(任意に架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、請求項25に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  27. 前記第1のタンパク質ドメインが、第1のドメインリンカーを使用して前記第1のFcドメインに結合し、かつ/または前記第2のタンパク質ドメインが、第2のドメインリンカーを使用して前記第2のFcドメインに結合している、請求項25または26に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  28. 前記第1および/または前記第2のFcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421D、を含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項25~27のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  29. 前記第1および/または前記第2のFcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項25~28のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  30. 前記IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項25~29のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  31. 前記第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、請求項25~30のいずれかに記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  32. 前記IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、請求項25~31のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  33. 前記IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、請求項25~32のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  34. 前記IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252、Q256、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項25~33のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  35. 前記IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項25~34のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  36. 前記IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項25~35のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  37. 前記IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項25~36のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  38. 前記IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項25~37のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  39. 前記IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項25~38のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  40. 前記IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、N85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項25~39のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  41. 前記IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項25~40のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  42. 前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が、
    a)配列番号49(XENP27202鎖1)のポリペプチド配列を有する前記第1の融合タンパク質と、
    b)配列番号50(XENP27202鎖2)のポリペプチド配列を有する前記第2の融合タンパク質と、を含む、請求項25~40のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  43. 前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が、XENP27202である、請求項25~41のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  44. 対象における癌の治療における使用のための請求項25~42のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物。
  45. 請求項25~42のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸。
  46. 請求項44に記載の1つ以上の核酸を含む宿主細胞。
  47. ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法であって、前記方法が、前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で請求項45に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
  48. 請求項25~42のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法であって、前記方法が、
    a)前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、
    b)前記組成物をイオン交換カラム上に充填することと、
    c)前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む、方法。
  49. ヘテロ二量体Fc融合タンパク質であって、
    a)第1のタンパク質ドメイン、第2のタンパク質ドメイン、および第1のFcドメインを含む融合タンパク質であって、前記第1のタンパク質ドメインが、前記第2のタンパク質ドメインに共有結合し、前記第2のタンパク質ドメインが、前記第1のFcドメインのN末端に共有結合している、融合タンパク質と、
    b)第2のFcドメインと、を含み、
    前記第1および前記第2のFcドメインが、前記第1および前記第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾を含み、前記第1のタンパク質ドメインが、IL-12p40サブユニットを含み、前記第2のタンパク質ドメインが、IL-12p35サブユニットを含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  50. 前記第1および前記第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する前記修飾が、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357QおよびT366S/L368A/Y407V:T366W(任意に架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、請求項48に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  51. 前記第1のタンパク質ドメインが、第1のドメインリンカーを使用して前記第2のタンパク質ドメインに結合し、かつ/または前記第2のタンパク質ドメインが、第2のドメインリンカーを使用して前記第1のFcドメインに結合している、請求項48または49に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  52. 前記第1および/または前記第2のFcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421Dを含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項48~50のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  53. 前記第1および/または前記第2のFcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項48~51のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  54. 前記IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項48~52のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  55. 前記第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、請求項48~53のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  56. 前記IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、請求項48~53のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  57. 前記IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、請求項48~55のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  58. 前記IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、Q256、K158、C252、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項48~56のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  59. 前記IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項48~57のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  60. 前記IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項48~58のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  61. 前記IL-12p40サブユニットが、
    i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項48~59のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  62. 前記IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項48~60のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  63. 前記IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項48~61のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  64. 前記IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、N85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項48~62のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  65. 前記IL-12p35サブユニットが、
    i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項48~63のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  66. 前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が、
    a)配列番号51(XENP27203鎖1)のポリペプチド配列を有する前記融合タンパク質と、
    b)配列番号52(XENP27203鎖2)のポリペプチド配列を有する前記第2のFcドメインと、を含む、請求項48~64のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  67. 前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が、XENP27203である、請求項48~65のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  68. 前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が、XENP31290である、請求項48~65のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  69. 対象における癌の治療における使用のための請求項48~66のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物。
  70. 請求項48~67のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸。
  71. 請求項69に記載の1つ以上の核酸を含む宿主細胞。
  72. ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法であって、前記方法が、前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で請求項70に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
  73. 請求項48~67のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法であって、前記方法が、
    a)前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、
    b)前記組成物をイオン交換カラム上に充填することと、
    c)前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む、方法。
  74. ヘテロ二量体Fc融合タンパク質であって、
    a)第1のタンパク質ドメイン、第2のタンパク質ドメイン、および第1のFcドメインを含む融合タンパク質であって、前記第1のタンパク質ドメインが、前記第2のタンパク質ドメインに共有結合し、前記第2のタンパク質ドメインが、前記第1のFcドメインのN末端に共有結合している、融合タンパク質と、
    b)第2のFcドメインと、を含み、
    前記第1および前記第2のFcドメインが、前記第1および前記第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾を含み、前記第1のタンパク質ドメインが、IL-12p35サブユニットを含み、前記第2のタンパク質ドメインが、IL-12p40サブユニットを含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  75. 前記第1および前記第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する前記修飾が、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357QおよびT366S/L368A/Y407V:T366W(任意に架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、請求項73に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  76. 前記第1のタンパク質ドメインが、第1のドメインリンカーを使用して前記第2のタンパク質ドメインに結合し、かつ/または前記第2のタンパク質ドメインが、第2のドメインリンカーを使用して前記第1のFcドメインに結合している、請求項73または74に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  77. 前記第1および/または前記第2のFcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421Dを含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項73~75のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  78. 前記第1および/または前記第2のFcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項73~76のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  79. 前記IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および/または配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、前記IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項73~77のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  80. 前記第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、請求項73~78のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  81. 前記IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、請求項73~79のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  82. 前記IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、請求項73~80のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  83. 前記IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252、Q256、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項73~81のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  84. 前記IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項73~82のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  85. 前記IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項73~83のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  86. 前記IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項73~84のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  87. 前記IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項73~85のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  88. 前記IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項73~86のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  89. 前記IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項73~87のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  90. 前記IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項73~88のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  91. 前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が、
    a)配列番号53(XENP27204鎖1)のポリペプチド配列を有する前記融合タンパク質と、
    b)配列番号54(XENP27204鎖2)のポリペプチド配列を有する前記第2のFcドメインと、を含む、請求項73~89のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  92. 前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が、XENP27204である、請求項73~90のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  93. 対象における癌の治療における使用のための請求項73~91のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物。
  94. 請求項73~91のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸。
  95. 請求項93に記載の1つ以上の核酸を含む宿主細胞。
  96. ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法であって、前記方法が、前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で請求項94に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
  97. 請求項73~91のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法であって、前記方法が、
    a)前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、
    b)前記組成物をイオン交換カラム上に充填することと、
    c)前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む、方法。
  98. ヘテロ二量体Fc融合タンパク質であって、
    a)第1のタンパク質ドメイン、第2のタンパク質ドメイン、および第1のFcドメインを含む融合タンパク質であって、前記第1のタンパク質ドメインが、前記第1のFcドメインのC末端に結合し、前記第2のタンパク質ドメインが、前記第1のタンパク質ドメインに共有結合している、融合タンパク質と、
    b)第2のFcドメインと、を含み、
    前記第1および前記第2のFcドメインが、前記第1および前記第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾を含み、前記第1のタンパク質ドメインが、IL-12p40サブユニットを含み、前記第2のタンパク質ドメインが、IL-12p35サブユニットを含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  99. 前記第1および前記第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する前記修飾が、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357QおよびT366S/L368A/Y407V:T366W(任意に架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、請求項97に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  100. 前記第1のタンパク質ドメインが、第1のドメインリンカーを使用して前記第2のタンパク質ドメインに結合し、かつ/または前記第2のタンパク質ドメインが、第2のドメインリンカーを使用して前記第1のFcドメインに結合している、請求項97または98に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  101. 前記第1および/または前記第2のFcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421Dを含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項97~99のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  102. 前記第1および/または前記第2のFcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項97~100のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  103. 前記IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項97~101のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  104. 前記第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、請求項97~102のうちの一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  105. 前記IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、請求項97~103のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  106. 前記IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、請求項97~104のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  107. 前記IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252、Q256、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項97~105のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  108. 前記IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項97~106のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  109. 前記IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項97~107のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  110. 前記IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項97~1081のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  111. 前記IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項97~109のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  112. 前記IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項97~110のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  113. 前記IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項97~111のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  114. 前記IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項97~112のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  115. 対象における癌の治療における使用のための請求項97~113のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物。
  116. 請求項97~113のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸。
  117. 請求項115に記載の1つ以上の核酸を含む宿主細胞。
  118. ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法であって、前記方法が、前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で請求項116に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
  119. 請求項97~113のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法であって、前記方法が、
    a)前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、
    b)前記組成物をイオン交換カラム上に充填することと、
    c)前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む、方法。
  120. ヘテロ二量体Fc融合タンパク質であって、
    a)第1のタンパク質ドメイン、第2のタンパク質ドメイン、および第1のFcドメインを含む融合タンパク質であって、前記第1のタンパク質ドメインが、前記第1のFcドメインのC末端に結合し、前記第2のタンパク質ドメインが、前記第1のタンパク質ドメインに共有結合している、融合タンパク質と、
    b)第2のFcドメインと、を含み、
    前記第1および前記第2のFcドメインが、前記第1および前記第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する修飾を含み、前記第1のタンパク質ドメインが、IL-12p35サブユニットを含み、前記第2のタンパク質ドメインが、IL-12p40サブユニットを含む、ヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  121. 前記第1および前記第2のFcドメインのヘテロ二量体化を促進する前記修飾が、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357QおよびT366S/L368A/Y407V:T366W(任意に架橋ジスルフィド、T366S/L368A/Y407V/Y349C:T366W/S354Cを含む)からなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、請求項119に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  122. 前記第1のタンパク質ドメインが、第1のドメインリンカーを使用して前記第2のタンパク質ドメインに結合し、かつ/または前記第2のタンパク質ドメインが、第2のドメインリンカーを使用して前記第1のFcドメインに結合している、請求項119または120に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  123. 前記第1および/または前記第2のFcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421Dを含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項119~121のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  124. 前記第1および/または前記第2のFcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項119~122のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  125. 前記IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項119~123のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  126. 前記IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、請求項119~124のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  127. 前記IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、請求項119~125のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  128. 前記IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252、Q256、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項119~126のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  129. 前記IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項119~127のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  130. 前記IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項119~128のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  131. 前記IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項119~129のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  132. 前記IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項119~130のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  133. 前記IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項119~131のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  134. 前記IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項119~132のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  135. 前記IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項119~133のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  136. 対象における癌の治療における使用のための請求項119~134のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物。
  137. 請求項119~134のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸。
  138. 請求項136に記載の1つ以上の核酸を含む宿主細胞。
  139. ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法であって、前記方法が、前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で請求項137に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
  140. 請求項119~134のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法であって、前記方法が、
    a)前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、
    b)前記組成物をイオン交換カラム上に充填することと、
    c)前記ヘテロ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む、方法。
  141. a)IL-12p40サブユニットと、
    b)IL-12p35サブユニットと、を含む、ヘテロ二量体複合体。
  142. 前記IL-12p40サブユニットが、ドメインリンカーを使用して前記IL-12p35サブユニットに共有結合している、請求項140に記載のヘテロ二量体複合体。
  143. 前記IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項140または141に記載のヘテロ二量体複合体。
  144. 前記第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、請求項140~142のいずれか一項に記載のヘテロ二量体複合体。
  145. 前記IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、請求項140~143のいずれか一項に記載のヘテロ二量体複合体。
  146. 前記IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、請求項140~144のいずれか一項に記載のヘテロ二量体複合体。
  147. 前記IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252、Q256、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項140~145のいずれか一項に記載のヘテロ二量体複合体。
  148. 前記IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項140~146のいずれか一項に記載のヘテロ二量体複合体。
  149. 前記IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項140~147のいずれか一項に記載のヘテロ二量体複合体。
  150. 前記IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項140~148のいずれか一項に記載のヘテロ二量体複合体。
  151. 前記IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項140~149のいずれか一項に記載のヘテロ二量体複合体。
  152. 前記IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項140~150のいずれか一項に記載のヘテロ二量体複合体。
  153. 前記IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項140~151のいずれか一項に記載のヘテロ二量体複合体。
  154. 前記IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項140~152のいずれか一項に記載のヘテロ二量体複合体。
  155. 対象における癌の治療における使用のための請求項140~153のいずれか一項に記載のヘテロ二量体複合体を含む組成物。
  156. 請求項140~153のいずれか一項に記載のヘテロ二量体複合体をコードする1つ以上の核酸。
  157. 請求項155に記載の1つ以上の核酸を含む宿主細胞。
  158. ヘテロ二量体複合体を作製する方法であって、前記方法が、前記ヘテロ二量体複合体が産生される条件下で請求項156に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
  159. IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/またはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニット。
  160. 前記バリアントIL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、Q256、C252、K258、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項1に記載のバリアントIL-12p40サブユニット。
  161. 前記バリアントIL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項158または159に記載のバリアントIl-12p40サブユニット。
  162. 前記バリアントIL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項158~160のいずれか一項に記載のバリアントIL-12p40サブユニット。
  163. 前記バリアントIL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項158~161のいずれか一項に記載のバリアントIL-12p40。
  164. 請求項158~162のいずれか一項に記載のバリアントIL-12p40サブユニットを含む組成物。
  165. 請求項158~162のいずれか一項に記載のバリアントIL-12p40サブユニットをコードする核酸。
  166. 請求項164に記載の前記核酸を含む宿主細胞。
  167. バリアントIL-12p40サブユニットを作製する方法であって、前記方法が、前記バリアントIL-12p40サブユニットが産生される条件下で請求項165に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
  168. IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/またはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニット。
  169. 前記バリアントIL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項167に記載のバリアントIL-12p35サブユニット。
  170. 前記バリアントIL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項167または168に記載のバリアントIL-12p35サブユニット。
  171. 前記バリアントIL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項167~169のいずれか一項に記載のバリアントIL-12p35サブユニット。
  172. 前記バリアントIL-12p35サブユニットが、アミノ酸置換N71D/N85D/N195Dを有する、請求項167~170のいずれか一項に記載のバリアントIL-12p35サブユニット。
  173. 前記バリアントIL-12p35サブユニットが、
    i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項167~171のいずれか一項に記載のバリアントIL-12p35サブユニット。
  174. 請求項167~172のいずれか一項に記載のバリアントIL-12p35サブユニットを含む組成物。
  175. 請求項167~172のいずれか一項に記載のバリアントIL-12p35サブユニットをコードする核酸。
  176. 請求項174に記載の前記核酸を含む宿主細胞。
  177. バリアントIL-12p35サブユニットを作製する方法であって、前記方法が、前記バリアントIL-12p35サブユニットが産生される条件下で請求項175に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
  178. ヘテロ二量体タンパク質であって、
    a)第1のFcドメインに共有結合したIL-12p40サブユニットドメインを含む第1の融合タンパク質と、
    b)第2のFcドメインに共有結合したIL-12p35サブユニットドメインを含む第2の融合タンパク質と、を含み、
    前記第1および第2のFcドメインが、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357Q;T366S/L368A/Y407VおよびT366W;ならびにT366S/L368A/Y407V/Y349CおよびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ヘテロ二量体タンパク質。
  179. 前記IL-12p40サブユニットドメインが、前記第1のFcドメインのN末端に結合し、前記IL-12p35サブユニットドメインが、前記第2のFcドメインのN末端に結合している、請求項177に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  180. 前記IL-12p40サブユニットドメインが、前記第1のFcドメインのC末端に結合し、前記IL-12p35サブユニットドメインが、前記第2のFcドメインのC末端に結合している、請求項177に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  181. 前記Il-12p40サブユニットドメインが、ドメインリンカーを使用して前記第1のFcドメインに結合し、前記IL-12p35サブユニットドメインが、ドメインリンカーを使用して前記第2のFcドメインに結合している、請求項177~179のいずれかに記載のヘテロ二量体タンパク質。
  182. 前記第1および第2のFcドメインが、IgG1ヒンジ-CH2-CH3を含む、請求項177~180のいずれかに記載のヘテロ二量体タンパク質。
  183. 前記第1の融合タンパク質が、N末端からC末端へ、IL-12p40サブユニットドメイン-ドメインリンカー-ヒンジ-CH2-CH3を含み、前記第2の融合タンパク質が、N末端からC末端へ、IL-12p35サブユニットドメイン-ドメインリンカー-ヒンジ-CH2-CH3を含む、請求項177に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  184. 前記第1の融合タンパク質が、N末端からC末端へ、ヒンジ-CH2-CH3-ドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメインを含み、前記第2の融合タンパク質が、N末端からC末端へ、ヒンジ-CH2-CH3ドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメインを含む、請求項177に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  185. ヘテロ二量体タンパク質であって、
    a)第1のFcドメインと、
    b)融合タンパク質であって、
    i)第2のFcドメインと、
    ii)IL-12p40サブユニットドメインと、
    iii)IL-12p35サブユニットドメインと、を含む、融合タンパク質と、を含み、
    前記第1および第2のFcドメインが、EU付番に従って、L368D/K370SおよびS364K;L368D/K370SおよびS364K/E357L;L368D/K370SおよびS364K/E357Q;T411E/K360E/Q362EおよびD401K;L368E/K370SおよびS364K;K370SおよびS364K/E357Q;T366S/L368A/Y407VおよびT366W;ならびにT366S/L368A/Y407V/Y349CおよびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、ヘテロ二量体タンパク質。
  186. 前記融合タンパク質が、N末端からC末端へ、IL-12p40サブユニットドメイン-ドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメイン-ドメインリンカー-ヒンジ-CH2-CH3を含む、請求項184に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  187. 前記融合タンパク質が、N末端からC末端へ、IL-12p35サブユニットドメイン-ドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメイン-ドメインリンカー-ヒンジ-CH2-CH3を含む、請求項184に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  188. 前記融合タンパク質が、N末端からC末端へ、ヒンジ-CH2-CH3ドメインリンカーIL-12p35サブユニットドメイン-ドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメインを含む、請求項184に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  189. 前記融合タンパク質が、N末端からC末端へ、ヒンジ-CH2-CH3ドメインリンカーIL-12p40サブユニットドメイン-ドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメインを含む、請求項184に記載のヘテロ二量体タンパク質。
  190. 前記IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択される配列を有する、請求項177~188のいずれかに記載のヘテロ二量体タンパク質。
  191. 前記IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、lx)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、lxi)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、lxii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、lxiv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、lxv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびlxvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択される配列を有する、請求項177~188のいずれかに記載のヘテロ二量体タンパク質。
  192. 前記第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、請求項177~190のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
  193. 第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、IL-12p40サブユニットドメイン-任意の第1のドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメイン-任意の第2のドメインリンカー-Fcドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質。
  194. 第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、IL-12p35サブユニットドメイン-任意の第1のドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメイン-任意の第2のドメインリンカー-Fcドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質。
  195. 第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、Fcドメイン-任意の第1のドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメイン-任意の第2のドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質。
  196. 第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、Fcドメイン-任意の第1のドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメイン-任意の第2のドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質。
  197. 第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、IL-12p40サブユニットドメイン-第1のドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメイン-第2のドメインリンカー-Fcドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質。
  198. 第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、IL-12p35サブユニットドメイン-第1のドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメイン-第2のドメインリンカー-Fcドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質。
  199. 第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、Fcドメイン-第1のドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメイン-第2のドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質。
  200. 第1の単量体および第2の単量体を含むホモ二量体Fc融合タンパク質であって、各々が、N末端からC末端へ、Fcドメイン-第1のドメインリンカー-IL-12p35サブユニットドメイン-第2のドメインリンカー-IL-12p40サブユニットドメインを含む、ホモ二量体Fc融合タンパク質。
  201. 前記Fcドメインのホモ二量体化を促進する前記修飾が、EU付番に従って、L368D/K370S;S364K;S364K/E357L;S364K/E357Q;T411E/K360E/Q362E;D401K;T366S/L368A/Y407V;T366W;T366S/L368A/Y407V/Y349C;およびT366W/S354Cからなる群から選択されるアミノ酸置換のセットである、請求項192~199に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  202. 前記第1のドメインリンカーおよび前記第2のドメインリンカーが、同じアミノ酸配列を有する、請求項192~200に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  203. 前記Fcドメインが、EU付番に従って、Q295E/N384D/Q418E/N421Dを含むアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項192~201のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  204. 前記Fcドメインが、EU付番に従って、G236R/L328R、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K、E233P/L234V/L235A/G236_/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_/S267K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236_、およびE233P/L234V/L235A/G236_/S267Kからなる群から選択されるアミノ酸置換の追加のセットを有する、請求項192~202のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  205. 前記IL-12p40サブユニットが、配列番号3(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)前駆体配列)および配列番号4(ヒトIL-12サブユニットベータ(IL-12p40)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有し、前記IL-12p35サブユニットが、配列番号1(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)前駆体配列)および配列番号2(ヒトIL-12サブユニットアルファ(IL-12p35)成熟形態配列)からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項192~203のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  206. 前記Fcドメインの各々が、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、請求項192~204のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  207. 前記IL-12p40サブユニットが、バリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、バリアントIL-12p35サブユニットである、請求項192~205のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  208. 前記IL-12p40サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p40サブユニットであり、かつ/または前記IL-12p35サブユニットが、IL-12受容体サブユニットベータ-1(IL-12Rβ1)、IL-12受容体サブユニットベータ-2(IL-12Rβ2)、および/もしくはIL-12受容体複合体についての変更された親和性を有するバリアントIL-12p35サブユニットである、請求項192~206のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  209. 前記IL-12p40サブユニットが、E3、D7、E12、D14、W15、P17、D18、A19、P20、G21、E22、M23、D29、E32、E33、D34、L40、D41、Q42、S43、E45、L47、T54、I55、Q56、K58、E59、F60、G61、D62、Q65、Y66、E73、K84、E86、D87、G88、I89、W90、D93、D97、K99、E100、K102、N103、K104、F106、E110、N113、Y114、D129、D142、Q144、E156、R159、D161、N162、K163、D166、D170、Q172、D174、A176、C177、P178、A179、A180、E181、S183、P185、E187、N200、S204、F206、R208、D209、D214、N218、Q220、N226、Q229、E231、E235、T242、P243、S245、Y246、F247、S248、C252S、Q256、K158、K260、E262、K264、D265、D270、N281、Q289、D290、R291、Y292、Y293、およびE299からなる群から選択されるアミノ酸残基で1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項192~207のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  210. 前記IL-12p40サブユニットが、D18N、D18K、E32Q、E33Q、D34N、D34K、Q42E、S43E、S43K、E45Q、Q56E、E59Q、E59K、D62N、E73Q、D87N、K99E、K99Y、E100Q、N103D、N103Q、N113D、N113Q、Q144E、D161N、R159E、K163E、E187Q、N200D、N200Q、N218Q、Q229E、E235Q、C252S、Q256N、K258E、K260E、E262Q、K264E、N281D、N281Q、およびE299Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項192~208のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  211. 前記IL-12p40サブユニットが、N103D/N113D/N200D/N281D、Q42E/E45Q、E45Q/Q56E、Q42E/E59Q、Q56E/E59Q、Q42E/E45Q/Q56E、E45Q/Q56E/E59Q、E32Q/E59Q、D34N/E59K、D34N/E59K/K99E、D34K/E59K/K99E、E32Q/D34N/E59K/K99E、E32K/D34N/E59K/K99E、D34N/E59Q、E59Q/E187Q、S43E/E59Q、S43K/E49Q、E59Q/K163E、E59Q/K99E、E59Q/K258E、E59Q/K260E、E59K/K99E、D18K/E59K/K99E、E59K/K99E/K264E、E59K/K99Y、E59Y/K99Y、E59Y/K99E、E45K/E59K/K99E、E59K/K99E/Q144E、E59K/K99E/Q144K、E59K/K99E/R159E、E59K/K99E/K264E、D18K/E59K/K99E/K264E、DI8K/E59K/K99E/C252S、D18K/E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99Y/C252S、E59K/K99E/C252S/K264E、E59K/K99E/C252S、N103D/N113D、N103D/N200D、N103D/N281D、N113D/N200D、N113D/N281D、N200D/N281D、N103D/N113D/N200D、N103D/N113D/N281D、N103D/N200D/N281D、N113D/N200D/N281D、N103Q/N113Q、N103Q/N200Q、N103Q/N281Q、N113Q/N200Q、N113Q/N281Q、N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q、N103Q/N113Q/N281Q、N103Q/N200Q/N281Q、N113Q/N200Q/N281Q、N103Q/N113Q/N200Q/N281Q、E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E、およびE59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264Eからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項192~209のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  212. 前記IL-12p40サブユニットが、i)配列番号57(IL-12p40(N103D))、ii)配列番号58(IL-12p40(N113D))、iii)配列番号59(IL-12p40(N200D))、iv)配列番号60(IL-12p40(N281D))、v)配列番号61(IL-12p40(N103D/N113D/N200D/N281D))、vi)配列番号62(IL-12p40(Q42E))、vii)配列番号63(IL-12p40(E45Q))、viii)配列番号64(IL-12p40(Q56E))、ix)配列番号65(IL-12p40(E59Q))、x)配列番号66(IL-12p40(D62N))、xi)配列番号67(IL-12p40(Q42E/E45Q))、xii)配列番号68(IL-12p40(E45Q/Q56E))、xiii)配列番号69(IL-12p40(Q42E/E59Q))、xiv)配列番号70(IL-12p40(Q56E/E59Q))、xv)配列番号71(IL-12p40(Q42E/E45Q/Q56E))、xvi)配列番号72(IL-12p40(E45Q/Q56E/E59Q))、xvii)配列番号73(IL-12p40(D161N))、xviii)配列番号74(IL-12p40(E73Q))、xix)配列番号75(IL-12p40(Q144E))、xx)配列番号76(IL-12p40(E262Q))、xxi)配列番号77(IL-12p40(E100Q))、xxii)配列番号78(IL-12p40(D18N))、xxiii)配列番号79(IL-12p40(E33Q))、xxiv)配列番号80(IL-12p40(Q229E))、xxv)配列番号81(IL-12p40(E235Q))、xxvi)配列番号82(IL-12p40(Q256N))、xxvii)配列番号83(IL-12p40(E299Q))、xxviii)配列番号84(IL-12p40(D87N))、xxix)IL-12p40(E32Q)、xxx)IL-12p40(D34N)、xxxi)IL-12p40(S43E)、xxxii)IL-12p40(S43K)、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、xxxiv)配列番号205(IL-12p40(E59K))、xxxv)IL-12p40(K99E)、xxxvi)IL-12p40(K163E)、xxxvii)IL-12p40(E187Q)、xxxviii)IL-12p40(K258E)、xxxix)IL-12p40(K260E)、xl)配列番号206(IL-12p40(E32Q/E59Q))、xli)配列番号207(IL-12p40(D34N/E59Q))、xlii)配列番号208(IL-12p40(E59Q/E187Q))、xliii)配列番号209(IL-12p40(S43E/E59Q))、xliv)配列番号210(IL-12p40(S43K/E49Q))、xlv)配列番号211(IL-12p40(E59Q/K163E))、xlvi)配列番号212(IL-12p40(E59Q/K99E))、xlvii)配列番号213(IL-12p40(E59Q/K258E))、xlviii)配列番号214(IL-12p40(E59Q/K260E))、xlix)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K))、l)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E))、li)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E))、lii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、liii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y))、liv)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99E))、lv)配列番号XXX(IL-12p40(E45K/E59K/K99E))、lvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144E))、lvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/Q144K))、lviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/R159E))、lix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/K264E))、lx)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/K264E))、lxi)配列番号XXX(IL-12p40(C252S))、lxii)配列番号XXX(IL-12p40(DI8K/E59K/K99E/C252S))、lxiii)配列番号XXX(IL-12p40(D18K/E59K/K99E/C252S/K264E))、lxiv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99Y/C252S))、lxv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S/K264E))、lxvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/C252S))、lxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D))、lxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D))、lxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N281D))、lxx)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D))、lxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N281D))、lxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N200D/N281D))、lxxiii)配列番号XXX(IL-12p50(N103D/N113D/N200D))、lxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N113D/N281D))、lxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N103D/N200D/N281D))、lxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N113D/N200D/N281D))、lxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q))、lxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q))、lxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q))、lxxx)配列番号XXX(IL-12p40(N281Q))、lxxxi)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q))、lxxxii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q))、lxxxiii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N281Q))、lxxxiv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q))、lxxxv)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N281Q))、lxxxvi)配列番号XXX(IL-12p40(N200Q/N281Q))、lxxxvii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q))、lxxxviii)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N281Q))、lxxxix)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N200Q/N281Q))、xc)配列番号XXX(IL-12p40(N113Q/N200Q/N281Q))、xci)配列番号XXX(IL-12p40(N103Q/N113Q/N200Q/N281Q))、xcii)配列番号XXX(IL-12p40(D34N/E59K/K99E))、xciii)配列番号XXX(IL-12p40(D34K/E59K/K99E))、xciv)配列番号XXX(IL-12p40(E32Q/D34N/E59K/K99E))、xcv)配列番号XXX(IL-12p40(E32K/D34N/E59K/K99E))、xcvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59Y/K99Y))、xcvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/C252S/K264E))、xcviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/C252S/K264E))、xcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/C252S/K264E))、c)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N281Q/C252S/K264E))、ci)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/C252S/K264E))、cii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/C252S/K264E))、ciii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N281Q/C252S/K264E))、civ)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cv)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N281Q/C252S/K264E))、cvi)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、cvii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N113Q/N200Q/C252S/K264E))、cviii)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N103Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))、およびcix)配列番号XXX(IL-12p40(E59K/K99E/N113Q/N200Q/N281Q/C252S/K264E))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項192~210のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  213. 前記IL-12p35サブユニットが、Q20、N21、Q35、E38、S44、E45、E46、H49、K54、D55、T59、V60、E61、C63、L64、P65、E67、L68、N71、S73、C74、L75、N76、E79、N85、L89、F96、M97、L124、M125、Q130、Q135、N136、E143、Q146、N151、E153、K158、E162、E163、D165、I171、R181、I182、R183、V185、T186、D188、R189、V190、S192、Y193、N195、およびA196からなる群から選択されるアミノ酸残基として1つ以上のアミノ酸修飾を有する、請求項192~211のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  214. 前記IL-12p35サブユニットが、N21D、Q35D、E38Q、D55Q、D55K、N71D、N71Q、L75A、N76D、E79Q、N85D、N85Q、L89A、F96A、M97A、L124A、M125A、Q130E、Q135E、N136D、E143Q、Q146E、N151D、N151K、E153K、E153Q、K158E、E162Q、E163Q、D165N、I171A、N195D、およびN195Qからなる群から選択される1つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項192~212のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  215. 前記IL-12p35サブユニットが、N71D/N85D/N195D、N151D/E153Q、N151D/D165N、Q130E/N151D、N151D/K158E、E79Q/N151D、D55Q/N151D、N136D/N151D、N21D/N151D、E143Q/N151D、N71Q/N85Q、N71Q/N195Q、N85Q/N195Q、N71Q/N85Q/N195Q、N71D/N85D、N71D/N195D、およびN85D/N195Dからなる群から選択されるアミノ酸置換を有する、請求項192~213のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  216. 前記IL-12p35サブユニットが、i)配列番号113(IL-12p35(N71D))、ii)配列番号114(IL-12p35(N85D))、iii)配列番号115(IL-12p35(N195D))、iv)配列番号116(IL-12p35(N71D/N85D/N195D))、v)配列番号117(IL-12p35(E153Q))、vi)配列番号118(IL-12p35(E38Q))、vii)配列番号119(IL-12p35(N151D))、viii)配列番号120(IL-12p35(Q135E))、ix)配列番号121(IL-12p35(Q35D))、x)配列番号122(IL-12p35(Q146E))、xi)配列番号123(IL-12p35(N76D))、xii)配列番号124(IL-12p35(E162Q))、xiii)配列番号125(IL-12p35(E163Q))、xiv)IL-12p35(N21D)、xv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、xvi)IL-12p35(E79Q)、xvii)IL-12p35(Q130E)、xviii)IL-12p35(N136D)、xix)IL-12p35(E143Q)、xx)配列番号227(IL-12p35(N151K))、xxi)配列番号226(IL-12p35(E153K))、xxii)IL-12p35(K158E)、xxiii)IL-12p35(D165N)、xxiv)配列番号225(IL-12p35(N151D/E153Q))、xxv)配列番号228(IL-12p35(N151D/D165N))、xxvi)配列番号229(IL-12p35(Q130E/N151D))、xxvii)配列番号230(IL-12p35(N151D/K158E))、xxviii)配列番号231(IL-12p35(E79Q/N151D))、xxix)配列番号232(IL-12p35(D55Q/N151D))、xxx)配列番号233(IL-12p35(N136D/N151D))、xxxi)配列番号234(IL-12p35(N21D/N151D))、xxxii)配列番号235(IL-12p35(E143Q/N151D))、xxxiii)配列番号XXX(IL-12p35(F96A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(M97A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(L89A))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(L124A))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(M125A))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(L75A))、xxxiv)配列番号XXX(IL-12p35(I171A))、xxxv)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q))、xxxvi)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q))、xxxvii)配列番号XXX(IL-12p35(N195Q))、xxxviii)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q))、xxxix)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N195Q))、xl)配列番号XXX(IL-12p35(N85Q/N195Q)、xli)配列番号XXX(IL-12p35(N71Q/N85Q/N195Q))、xlii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N85D))、xliii)配列番号XXX(IL-12p35(N71D/N195D)、xliv)配列番号XXX(IL-12p35(N85D/N195D))、xlv)配列番号XXX(IL-12p35(D55Q))、およびxlvi)配列番号XXX(IL-12p35(D55K))からなる群から選択されるポリペプチド配列を有する、請求項192~214のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  217. 前記第1および第2の単量体が、XENP31289である、請求項192または196に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  218. 前記第1および第2の単量体が、XENP31291である、請求項192または196のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質。
  219. 対象における癌の治療における使用のための請求項192~217のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物。
  220. 請求項192~217のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質をコードする1つ以上の核酸。
  221. 請求項219に記載の1つ以上の核酸を含む宿主細胞。
  222. ホモ二量体Fc融合タンパク質を作製する方法であって、前記方法が、前記ホモ二量体Fc融合タンパク質が産生される条件下で請求項220に記載の宿主細胞を培養することを含む、方法。
  223. 請求項192~217のいずれか一項に記載のホモ二量体Fc融合タンパク質を精製する方法であって、前記方法が、
    a)前記ホモ二量体Fc融合タンパク質を含む組成物を提供することと、
    b)前記組成物をイオン交換カラム上に充填することと、
    c)前記ホモ二量体Fc融合タンパク質を含有する画分を収集することと、を含む、方法。
  224. 癌を治療することを必要とする患者において癌を治療する方法であって、治療有効量の、先行請求項のいずれかに記載のヘテロ二量体またはホモ二量体Fc融合タンパク質を前記患者に投与することを含む、方法。
  225. 治療有効量のチェックポイント遮断抗体を投与することをさらに含む、請求項223に記載の方法。
  226. 前記チェックポイント遮断抗体が、抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体、抗TIM3抗体、抗TIGIT抗体、抗LAG3抗体、および抗CTLA-4抗体から選択される、請求項224に記載の方法。
  227. 前記抗PD-1抗体が、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、またはピジリズマブである、請求項225に記載の方法。
  228. 前記抗PD-L1抗体が、アテゾリズマブ、アベルマブ、またはデュルバルマブである、請求項225に記載の方法。
  229. 前記患者が、投与後にリンパ球の増加を示す、請求項223~227のいずれか一項に記載の方法。
  230. 前記患者が、投与後に末梢CD8+T細胞の増加を示す、請求項223~228のいずれか一項に記載の方法。
  231. T細胞増殖を誘導することを必要とする患者においてT細胞増殖を誘導する方法であって、治療有効量の、先行請求項のいずれかに記載のヘテロ二量体またはホモ二量体Fc融合タンパク質を前記患者に投与することを含む、方法。
  232. 治療有効量のチェックポイント遮断抗体を投与することをさらに含む、請求項230に記載の方法。
  233. 前記チェックポイント遮断抗体が、抗PD-1抗体、抗PD-L1抗体、抗TIM3抗体、抗TIGIT抗体、抗LAG3抗体、および抗CTLA-4抗体から選択される、請求項231に記載の方法。
  234. 前記抗PD-1抗体が、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、またはピジリズマブである、請求項232に記載の方法。
  235. 前記抗PD-L1抗体が、アテゾリズマブ、アベルマブ、またはデュルバルマブである、請求項232に記載の方法。
  236. 前記T細胞増殖が、T細胞の少なくとも2倍増加である、請求項230~234のいずれか一項に記載の方法。
  237. 前記IL-12Fc融合タンパク質が、治療の前にチェックポイント発現を増加させるために前記チェックポイント阻害剤の前に投与される、請求項224~229および230~235のいずれか一項に記載の方法。
  238. 前記IL-12Fc融合タンパク質が、治療の前にチェックポイント発現を増加させるために前記チェックポイント阻害剤の前に投与される、請求項226、228、229、233、および235のいずれか一項に記載の方法。
  239. 前記第1および第2のFcドメインが、アミノ酸置換M428L/N424Sをさらに含む、請求項119~124のいずれか一項に記載のヘテロ二量体Fc融合タンパク質。
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TWI797097B (zh) 2016-11-28 2023-04-01 日商中外製藥股份有限公司 包含抗原結合域與運送部分的多胜肽
JP7479383B2 (ja) 2018-09-27 2024-05-08 エクシリオ デベロップメント, インコーポレイテッド マスクされたサイトカインポリペプチド
AU2019355971A1 (en) 2018-10-03 2021-05-06 Xencor, Inc. IL-12 heterodimeric Fc-fusion proteins
WO2020086758A1 (en) * 2018-10-23 2020-04-30 Dragonfly Therapeutics, Inc. Heterodimeric fc-fused proteins
AU2020358979A1 (en) 2019-10-03 2022-04-21 Xencor, Inc. Targeted IL-12 heterodimeric Fc-fusion proteins
WO2022094046A1 (en) * 2020-10-29 2022-05-05 Proviva Therapeutics (Hong Kong) Limited Il-12 compositions and methods of use thereof
CA3232071A1 (en) * 2021-09-29 2023-04-06 Ryan BLACKLER Modified interleukin p40 subunit proteins and methods of use thereof
WO2023070056A2 (en) * 2021-10-20 2023-04-27 Synthekine, Inc. Heterodimeric fc cytokines and uses thereof
WO2023133540A1 (en) * 2022-01-07 2023-07-13 Lyell Immunopharma, Inc. Il-12 affinity variants
WO2023242769A1 (en) * 2022-06-17 2023-12-21 Pfizer Inc. Il-12 variants, anti-pd1 antibodies, fusion proteins, and uses thereof
WO2023246840A1 (en) * 2022-06-22 2023-12-28 Wuhan Houxian Biopharmaceutical Co. Ltd. Combination of il-12 and ox40l for cancer immunotherapy
WO2024006563A1 (en) 2022-07-01 2024-01-04 Sutro Biopharma, Inc. Il-12 mutants with reduced toxicity, compositions thereof and methods of using the same
CN116162171A (zh) * 2022-10-13 2023-05-26 深圳市百士通科技开发有限公司 抗体突变方法在治疗性抗体药物中的应用
WO2024086739A1 (en) 2022-10-20 2024-04-25 Synthekine, Inc. Methods and compositions of il12 muteins and il2 muteins

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2001525423A (ja) * 1997-12-08 2001-12-11 レキシジェン ファーマシューティカルズ コーポレイション 標的化免疫治療および一般の免疫刺激に対して有用であるヘテロ二量体融合タンパク質

Family Cites Families (399)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3773919A (en) 1969-10-23 1973-11-20 Du Pont Polylactide-drug mixtures
CU22545A1 (es) 1994-11-18 1999-03-31 Centro Inmunologia Molecular Obtención de un anticuerpo quimérico y humanizado contra el receptor del factor de crecimiento epidérmico para uso diagnóstico y terapéutico
US4179337A (en) 1973-07-20 1979-12-18 Davis Frank F Non-immunogenic polypeptides
US4169888A (en) 1977-10-17 1979-10-02 The Upjohn Company Composition of matter and process
US4307016A (en) 1978-03-24 1981-12-22 Takeda Chemical Industries, Ltd. Demethyl maytansinoids
US4256746A (en) 1978-11-14 1981-03-17 Takeda Chemical Industries Dechloromaytansinoids, their pharmaceutical compositions and method of use
JPS55102583A (en) 1979-01-31 1980-08-05 Takeda Chem Ind Ltd 20-acyloxy-20-demethylmaytansinoid compound
JPS55162791A (en) 1979-06-05 1980-12-18 Takeda Chem Ind Ltd Antibiotic c-15003pnd and its preparation
JPS6023084B2 (ja) 1979-07-11 1985-06-05 味の素株式会社 代用血液
JPS5645483A (en) 1979-09-19 1981-04-25 Takeda Chem Ind Ltd C-15003phm and its preparation
JPS5645485A (en) 1979-09-21 1981-04-25 Takeda Chem Ind Ltd Production of c-15003pnd
EP0028683A1 (en) 1979-09-21 1981-05-20 Takeda Chemical Industries, Ltd. Antibiotic C-15003 PHO and production thereof
US4364935A (en) 1979-12-04 1982-12-21 Ortho Pharmaceutical Corporation Monoclonal antibody to a human prothymocyte antigen and methods of preparing same
WO1982001188A1 (en) 1980-10-08 1982-04-15 Takeda Chemical Industries Ltd 4,5-deoxymaytansinoide compounds and process for preparing same
US4450254A (en) 1980-11-03 1984-05-22 Standard Oil Company Impact improvement of high nitrile resins
US4313946A (en) 1981-01-27 1982-02-02 The United States Of America As Represented By The Secretary Of Agriculture Chemotherapeutically active maytansinoids from Trewia nudiflora
US4315929A (en) 1981-01-27 1982-02-16 The United States Of America As Represented By The Secretary Of Agriculture Method of controlling the European corn borer with trewiasine
JPS57192389A (en) 1981-05-20 1982-11-26 Takeda Chem Ind Ltd Novel maytansinoid
US4640835A (en) 1981-10-30 1987-02-03 Nippon Chemiphar Company, Ltd. Plasminogen activator derivatives
US4496689A (en) 1983-12-27 1985-01-29 Miles Laboratories, Inc. Covalently attached complex of alpha-1-proteinase inhibitor with a water soluble polymer
US4943533A (en) 1984-03-01 1990-07-24 The Regents Of The University Of California Hybrid cell lines that produce monoclonal antibodies to epidermal growth factor receptor
US4970198A (en) 1985-10-17 1990-11-13 American Cyanamid Company Antitumor antibiotics (LL-E33288 complex)
EP0206448B1 (en) 1985-06-19 1990-11-14 Ajinomoto Co., Inc. Hemoglobin combined with a poly(alkylene oxide)
JPS63502716A (ja) 1986-03-07 1988-10-13 マサチューセッツ・インステチュート・オブ・テクノロジー 糖タンパク安定性の強化方法
DE3783588T2 (de) 1986-04-17 1993-06-09 Kyowa Hakko Kogyo Kk Neue verbindungen dc-88a und dc-89a1 und deren herstellungsverfahren.
US4791192A (en) 1986-06-26 1988-12-13 Takeda Chemical Industries, Ltd. Chemically modified protein with polyethyleneglycol
US4880935A (en) 1986-07-11 1989-11-14 Icrf (Patents) Limited Heterobifunctional linking agents derived from N-succinimido-dithio-alpha methyl-methylene-benzoates
IL85035A0 (en) 1987-01-08 1988-06-30 Int Genetic Eng Polynucleotide molecule,a chimeric antibody with specificity for human b cell surface antigen,a process for the preparation and methods utilizing the same
US5606040A (en) 1987-10-30 1997-02-25 American Cyanamid Company Antitumor and antibacterial substituted disulfide derivatives prepared from compounds possessing a methyl-trithio group
US5770701A (en) 1987-10-30 1998-06-23 American Cyanamid Company Process for preparing targeted forms of methyltrithio antitumor agents
US5053394A (en) 1988-09-21 1991-10-01 American Cyanamid Company Targeted forms of methyltrithio antitumor agents
JP3040121B2 (ja) 1988-01-12 2000-05-08 ジェネンテク,インコーポレイテッド 増殖因子レセプターの機能を阻害することにより腫瘍細胞を処置する方法
IL106992A (en) 1988-02-11 1994-06-24 Bristol Myers Squibb Co Noble hydrazonic history of anthracycline and methods for their preparation
US5084468A (en) 1988-08-11 1992-01-28 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. Dc-88a derivatives
US5530101A (en) 1988-12-28 1996-06-25 Protein Design Labs, Inc. Humanized immunoglobulins
JP2598116B2 (ja) 1988-12-28 1997-04-09 協和醗酵工業株式会社 新規物質dc113
US5187186A (en) 1989-07-03 1993-02-16 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. Pyrroloindole derivatives
JP2510335B2 (ja) 1989-07-03 1996-06-26 協和醗酵工業株式会社 Dc―88a誘導体
US5208020A (en) 1989-10-25 1993-05-04 Immunogen Inc. Cytotoxic agents comprising maytansinoids and their therapeutic use
CA2026147C (en) 1989-10-25 2006-02-07 Ravi J. Chari Cytotoxic agents comprising maytansinoids and their therapeutic use
US5859205A (en) 1989-12-21 1999-01-12 Celltech Limited Humanised antibodies
AU652936B2 (en) 1990-05-07 1994-09-15 Scripps Clinic And Research Foundation Intermediates in the formation of the calicheamicin and esperamicin oligosaccharides
US5968509A (en) 1990-10-05 1999-10-19 Btp International Limited Antibodies with binding affinity for the CD3 antigen
CZ282603B6 (cs) 1991-03-06 1997-08-13 Merck Patent Gesellschaft Mit Beschränkter Haftun G Humanizované a chimerické monoklonální protilátky
CA2103059C (en) 1991-06-14 2005-03-22 Paul J. Carter Method for making humanized antibodies
WO1994004679A1 (en) 1991-06-14 1994-03-03 Genentech, Inc. Method for making humanized antibodies
US5264586A (en) 1991-07-17 1993-11-23 The Scripps Research Institute Analogs of calicheamicin gamma1I, method of making and using the same
US5622929A (en) 1992-01-23 1997-04-22 Bristol-Myers Squibb Company Thioether conjugates
GB9206422D0 (en) 1992-03-24 1992-05-06 Bolt Sarah L Antibody preparation
EP0563475B1 (en) 1992-03-25 2000-05-31 Immunogen Inc Cell binding agent conjugates of derivatives of CC-1065
ZA932522B (en) 1992-04-10 1993-12-20 Res Dev Foundation Immunotoxins directed against c-erbB-2(HER/neu) related surface antigens
US6329507B1 (en) 1992-08-21 2001-12-11 The Dow Chemical Company Dimer and multimer forms of single chain polypeptides
US5736137A (en) 1992-11-13 1998-04-07 Idec Pharmaceuticals Corporation Therapeutic application of chimeric and radiolabeled antibodies to human B lymphocyte restricted differentiation antigen for treatment of B cell lymphoma
US5635483A (en) 1992-12-03 1997-06-03 Arizona Board Of Regents Acting On Behalf Of Arizona State University Tumor inhibiting tetrapeptide bearing modified phenethyl amides
ATE199392T1 (de) 1992-12-04 2001-03-15 Medical Res Council Multivalente und multispezifische bindungsproteine, deren herstellung und verwendung
SG55079A1 (en) 1992-12-11 1998-12-21 Dow Chemical Co Multivalent single chain antibodies
US5780588A (en) 1993-01-26 1998-07-14 Arizona Board Of Regents Elucidation and synthesis of selected pentapeptides
US6214345B1 (en) 1993-05-14 2001-04-10 Bristol-Myers Squibb Co. Lysosomal enzyme-cleavable antitumor drug conjugates
CA2125763C (en) 1993-07-02 2007-08-28 Maurice Kent Gately P40 homodimer of interleukin-12
EP0731106B1 (en) 1993-10-01 2004-11-17 Teikoku Hormone Mfg. Co., Ltd. Dolastatin derivatives
GB9401182D0 (en) 1994-01-21 1994-03-16 Inst Of Cancer The Research Antibodies to EGF receptor and their antitumour effect
ES2220927T3 (es) 1994-04-22 2004-12-16 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. Derivados de dc-89.
JPH07309761A (ja) 1994-05-20 1995-11-28 Kyowa Hakko Kogyo Co Ltd デュオカルマイシン誘導体の安定化法
US5773001A (en) 1994-06-03 1998-06-30 American Cyanamid Company Conjugates of methyltrithio antitumor agents and intermediates for their synthesis
US5945311A (en) 1994-06-03 1999-08-31 GSF--Forschungszentrumfur Umweltund Gesundheit Method for producing heterologous bi-specific antibodies
US5550246A (en) 1994-09-07 1996-08-27 The Scripps Research Institute Calicheamicin mimics
US5541087A (en) 1994-09-14 1996-07-30 Fuji Immunopharmaceuticals Corporation Expression and export technology of proteins as immunofusins
US5663149A (en) 1994-12-13 1997-09-02 Arizona Board Of Regents Acting On Behalf Of Arizona State University Human cancer inhibitory pentapeptide heterocyclic and halophenyl amides
EP0820299B1 (en) * 1995-02-06 2002-04-24 Genetics Institute, Inc. Formulations for il-12
US5731168A (en) 1995-03-01 1998-03-24 Genentech, Inc. Method for making heteromultimeric polypeptides
US5714586A (en) 1995-06-07 1998-02-03 American Cyanamid Company Methods for the preparation of monomeric calicheamicin derivative/carrier conjugates
US5712374A (en) 1995-06-07 1998-01-27 American Cyanamid Company Method for the preparation of substantiallly monomeric calicheamicin derivative/carrier conjugates
EP0831880A4 (en) 1995-06-07 2004-12-01 Imclone Systems Inc ANTIBODIES AND FRAGMENTS OF ANTIBODIES INHIBITING TUMOR GROWTH
US5811097A (en) 1995-07-25 1998-09-22 The Regents Of The University Of California Blockade of T lymphocyte down-regulation associated with CTLA-4 signaling
US7696338B2 (en) 1995-10-30 2010-04-13 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Immunotoxin fusion proteins and means for expression thereof
WO1997023243A1 (en) 1995-12-22 1997-07-03 Bristol-Myers Squibb Company Branched hydrazone linkers
DE69830901T2 (de) 1997-05-02 2006-05-24 Genentech Inc., San Francisco ein verfahren zur herstellung multispezifischer antikörper die heteromultimere und gemeinsame komponenten besitzen
US6235883B1 (en) 1997-05-05 2001-05-22 Abgenix, Inc. Human monoclonal antibodies to epidermal growth factor receptor
DE69922159T2 (de) 1998-01-23 2005-12-01 Vlaams Interuniversitair Instituut Voor Biotechnologie Mehrzweck-antikörperderivate
ATE458007T1 (de) 1998-04-20 2010-03-15 Glycart Biotechnology Ag Glykosylierungs-engineering von antikörpern zur verbesserung der antikörperabhängigen zellvermittelten zytotoxizität
IL138857A0 (en) 1998-04-21 2001-10-31 Micromet Ges For Biomedizinisc Cd19xcd3 specific polypeptides and uses thereof
US6455677B1 (en) 1998-04-30 2002-09-24 Boehringer Ingelheim International Gmbh FAPα-specific antibody with improved producibility
AU760854B2 (en) 1998-06-22 2003-05-22 Immunomedics Inc. Use of bi-specific antibodies for pre-targeting diagnosis and therapy
GB9815909D0 (en) 1998-07-21 1998-09-16 Btg Int Ltd Antibody preparation
ES2308857T3 (es) 1998-12-03 2008-12-01 The Regents Of The University Of California Estimulacion de celulas t contra autoantigenos mediante el uso de agentes bloqueadores de ctla-4.
US6682736B1 (en) 1998-12-23 2004-01-27 Abgenix, Inc. Human monoclonal antibodies to CTLA-4
EA006972B1 (ru) 1998-12-23 2006-06-30 Пфайзер Инк. Моноклональное антитело человека к ctla-4 и способы его применения
US6723538B2 (en) 1999-03-11 2004-04-20 Micromet Ag Bispecific antibody and chemokine receptor constructs
CA2704600C (en) 1999-04-09 2016-10-25 Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd. A method for producing antibodies with increased adcc activity
US6939545B2 (en) 1999-04-28 2005-09-06 Genetics Institute, Llc Composition and method for treating inflammatory disorders
SK782002A3 (en) 1999-07-21 2003-08-05 Lexigen Pharm Corp FC fusion proteins for enhancing the immunogenicity of protein and peptide antigens
MXPA02001417A (es) 1999-08-09 2002-08-12 Lexigen Pharm Corp Complejos multiples de citosina-anticuerpo.
US7605238B2 (en) 1999-08-24 2009-10-20 Medarex, Inc. Human CTLA-4 antibodies and their uses
AU775373B2 (en) 1999-10-01 2004-07-29 Immunogen, Inc. Compositions and methods for treating cancer using immunoconjugates and chemotherapeutic agents
US7303749B1 (en) 1999-10-01 2007-12-04 Immunogen Inc. Compositions and methods for treating cancer using immunoconjugates and chemotherapeutic agents
JP4668498B2 (ja) 1999-10-19 2011-04-13 協和発酵キリン株式会社 ポリペプチドの製造方法
US6716410B1 (en) 1999-10-26 2004-04-06 The Regents Of The University Of California Reagents and methods for diagnosing, imaging and treating atherosclerotic disease
ES2269366T3 (es) 2000-02-11 2007-04-01 Merck Patent Gmbh Mejoramiento de la vida media en circulacion de proteinas de fusion basadas en anticuerpos.
JP2003523771A (ja) 2000-02-25 2003-08-12 ザ ガバメント オブ ザ ユナイテッド ステイツ, アズ レプレゼンテッド バイ ザ セクレタリー オブ ザ デパートメント オブ ヘルス アンド ヒューマン サービシーズ 改善された細胞傷害性および収率を有する抗EGFRvIIIscFv、それに基づく免疫毒素、ならびにその使用方法
CA2402213C (en) 2000-03-15 2012-08-07 Pohang University Of Science And Technology Genes of il-12p40 subunit mutated for improving the activity of il-12 and use thereof for dna vaccine adjuvant
US20010035606A1 (en) 2000-03-28 2001-11-01 Schoen Alan H. Set of blocks for packing a cube
WO2001083525A2 (en) 2000-05-03 2001-11-08 Amgen Inc. Modified peptides, comprising an fc domain, as therapeutic agents
KR100480985B1 (ko) 2000-05-19 2005-04-07 이수화학 주식회사 표피 성장 인자 수용체에 대한 사람화된 항체
EP1299419A2 (en) 2000-05-24 2003-04-09 Imclone Systems, Inc. Bispecific immunoglobulin-like antigen binding proteins and method of production
DE60129695T2 (de) 2000-06-29 2008-06-05 Merck Patent Gmbh Steigerung von durch antikörper-zytokin-fusionsproteine mediierten immunantworten durch eine kombinierte behandlung mit mitteln zur erhöhung der immunzytokinaufnahme
JP2004523205A (ja) 2000-07-25 2004-08-05 イムノメディクス, インコーポレイテッド 多価標的結合タンパク質
US6333410B1 (en) 2000-08-18 2001-12-25 Immunogen, Inc. Process for the preparation and purification of thiol-containing maytansinoids
DE10043437A1 (de) 2000-09-04 2002-03-28 Horst Lindhofer Verwendung von trifunktionellen bispezifischen und trispezifischen Antikörpern zur Behandlung von malignem Aszites
HU231090B1 (hu) 2000-10-06 2020-07-28 Kyowa Kirin Co., Ltd. Antitest-kompozíciót termelő sejt
CA2424977C (en) 2000-10-06 2008-03-18 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. Process for purifying antibody
US20030133939A1 (en) 2001-01-17 2003-07-17 Genecraft, Inc. Binding domain-immunoglobulin fusion proteins
US20020147312A1 (en) 2001-02-02 2002-10-10 O'keefe Theresa Hybrid antibodies and uses thereof
US7189830B2 (en) 2001-02-19 2007-03-13 Merck Patent Gmbh Anti-KSA/IL-2 fusion proteins with reduced immunogenicity
CN1330664C (zh) 2001-03-07 2007-08-08 默克专利有限公司 用于含杂合同种型抗体部分的蛋白质的表达技术
EP1243276A1 (en) 2001-03-23 2002-09-25 Franciscus Marinus Hendrikus De Groot Elongated and multiple spacers containing activatible prodrugs
EP1383800A4 (en) 2001-04-02 2004-09-22 Idec Pharma Corp RECOMBINANT ANTIBODIES CO-EXPRESSED WITH GNTIII
US6884869B2 (en) 2001-04-30 2005-04-26 Seattle Genetics, Inc. Pentapeptide compounds and uses related thereto
MXPA03011094A (es) 2001-05-31 2004-12-06 Medarex Inc Citotoxinas, profarmacos, ligadores, y estabilizadores utiles para ello.
US6441163B1 (en) 2001-05-31 2002-08-27 Immunogen, Inc. Methods for preparation of cytotoxic conjugates of maytansinoids and cell binding agents
CN100497389C (zh) 2001-06-13 2009-06-10 根马布股份公司 表皮生长因子受体(egfr)的人单克隆抗体
EP1411983A4 (en) 2001-06-26 2006-06-21 Imclone Systems Inc BISPECIFIC ANTIBODIES BINDING TO VEGF RECEPTORS
HUP0600342A3 (en) 2001-10-25 2011-03-28 Genentech Inc Glycoprotein compositions
US8188231B2 (en) 2002-09-27 2012-05-29 Xencor, Inc. Optimized FC variants
US20080219974A1 (en) 2002-03-01 2008-09-11 Bernett Matthew J Optimized antibodies that target hm1.24
US7332580B2 (en) 2002-04-05 2008-02-19 The Regents Of The University Of California Bispecific single chain Fv antibody molecules and methods of use thereof
KR101086533B1 (ko) 2002-05-24 2011-11-23 쉐링 코포레이션 중화 사람 항-igfr 항체, 이를 제조하는 방법 및 이를 포함하는 조성물
AU2003263964C1 (en) 2002-07-31 2010-08-19 Seagen Inc. Drug conjugates and their use for treating cancer, an autoimmune disease or an infectious disease
US8946387B2 (en) 2002-08-14 2015-02-03 Macrogenics, Inc. FcγRIIB specific antibodies and methods of use thereof
US20060235208A1 (en) 2002-09-27 2006-10-19 Xencor, Inc. Fc variants with optimized properties
US7820166B2 (en) 2002-10-11 2010-10-26 Micromet Ag Potent T cell modulating molecules
EP1418184A1 (en) 2002-11-08 2004-05-12 Cell Center Cologne GmbH Recombinant fusion protein consisting of the p40 and p35 subunits of IL-12 and a ScFv and use thereof
AU2003282624A1 (en) 2002-11-14 2004-06-03 Syntarga B.V. Prodrugs built as multiple self-elimination-release spacers
EP1578397B1 (en) 2002-11-15 2012-12-26 Genmab A/S Human monoclonal antibodies against cd25
ES2367430T3 (es) 2002-12-23 2011-11-03 Wyeth Llc Anticuerpos contra pd-1 y sus usos.
US8084582B2 (en) 2003-03-03 2011-12-27 Xencor, Inc. Optimized anti-CD20 monoclonal antibodies having Fc variants
US7610156B2 (en) 2003-03-31 2009-10-27 Xencor, Inc. Methods for rational pegylation of proteins
PT3524611T (pt) 2003-05-20 2021-04-01 Immunogen Inc Agentes citotóxicos melhorados compreendendo novos maitansinóides
US7276497B2 (en) 2003-05-20 2007-10-02 Immunogen Inc. Cytotoxic agents comprising new maytansinoids
RU2005137325A (ru) 2003-05-31 2006-09-10 Микромет Аг (De) Фармацевтическая композиция, содержащая конструкт, специфичный к ерсам
WO2004106381A1 (en) 2003-05-31 2004-12-09 Micromet Ag Pharmaceutical compositions comprising bispecific anti-cd3, anti-cd19 antibody constructs for the treatment of b-cell related disorders
US7888134B2 (en) 2003-06-05 2011-02-15 Oakland University Immunosensors: scFv-linker design for surface immobilization
US20150071948A1 (en) 2003-09-26 2015-03-12 Gregory Alan Lazar Novel immunoglobulin variants
US20060134105A1 (en) 2004-10-21 2006-06-22 Xencor, Inc. IgG immunoglobulin variants with optimized effector function
US20050176028A1 (en) 2003-10-16 2005-08-11 Robert Hofmeister Deimmunized binding molecules to CD3
SI1725249T1 (sl) 2003-11-06 2014-04-30 Seattle Genetics, Inc. Spojine monometilvalina, sposobne konjugacije na ligande
US20050142133A1 (en) 2003-12-03 2005-06-30 Xencor, Inc. Optimized proteins that target the epidermal growth factor receptor
WO2005056759A2 (en) 2003-12-04 2005-06-23 Xencor, Inc. Methods of generating variant proteins with increased host string content and compositions thereof
PL1718677T3 (pl) 2003-12-19 2012-09-28 Genentech Inc Jednowartościowe fragmenty przeciwciała stosowane jako środki lecznicze
US7235641B2 (en) 2003-12-22 2007-06-26 Micromet Ag Bispecific antibodies
AU2005244980B2 (en) 2004-05-19 2011-09-15 E. R. Squibb & Sons, L.L.C. Chemical linkers and conjugates thereof
RU2402548C2 (ru) 2004-05-19 2010-10-27 Медарекс, Инк. Химические линкеры и их конъюгаты
BRPI0511782B8 (pt) 2004-06-03 2021-05-25 Novimmune Sa anticorpos anti-cd3, uso e método de produção dos mesmos, composição farmacêutica, molécula de ácido nucleico isolada e vetor
US20060018897A1 (en) 2004-06-28 2006-01-26 Transtarget Inc. Bispecific antibodies
JP2008512352A (ja) 2004-07-17 2008-04-24 イムクローン システムズ インコーポレイティド 新規な四価の二重特異性抗体
AU2005282720B2 (en) 2004-09-02 2011-08-04 Genentech, Inc. Anti-FC-gamma RIIB receptor antibody and uses therefor
WO2006034488A2 (en) 2004-09-23 2006-03-30 Genentech, Inc. Cysteine engineered antibodies and conjugates
CA2580796C (en) 2004-09-24 2013-03-26 Amgen Inc. Modified fc molecules having peptides inserted in internal loop regions
US8546543B2 (en) 2004-11-12 2013-10-01 Xencor, Inc. Fc variants that extend antibody half-life
US8367805B2 (en) 2004-11-12 2013-02-05 Xencor, Inc. Fc variants with altered binding to FcRn
US8066989B2 (en) 2004-11-30 2011-11-29 Trion Pharma Gmbh Method of treating tumor growth and metastasis by using trifunctional antibodies to reduce the risk for GvHD in allogeneic antitumor cell therapy
DE602006003695D1 (de) 2005-01-05 2009-01-02 F Star Biotech Forsch & Entw Synthetische Immunoglobulindomänen mit in Regionen des Moleküls, die sich von den die Komplementarität bestimmenden Bereichen unterscheiden, modifizierten Bindeeigenschaften
JP4986633B2 (ja) 2005-01-12 2012-07-25 協和発酵キリン株式会社 安定化されたヒトIgG2およびIgG3抗体
EP3623473A1 (en) 2005-03-31 2020-03-18 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Process for production of polypeptide by regulation of assembly
US7714016B2 (en) 2005-04-08 2010-05-11 Medarex, Inc. Cytotoxic compounds and conjugates with cleavable substrates
US9284375B2 (en) 2005-04-15 2016-03-15 Macrogenics, Inc. Covalent diabodies and uses thereof
CN101213297B (zh) 2005-05-09 2013-02-13 小野药品工业株式会社 程序性死亡-1(pd-1)的人单克隆抗体及单独使用或与其它免疫治疗剂联合使用抗pd-1抗体来治疗癌症的方法
US8309690B2 (en) 2005-07-01 2012-11-13 Medimmune, Llc Integrated approach for generating multidomain protein therapeutics
KR101411165B1 (ko) 2005-07-01 2014-06-25 메다렉스, 엘.엘.시. 예정 사멸 리간드 1 (피디-엘1)에 대한 인간 모노클로날항체
US9017992B2 (en) 2005-07-01 2015-04-28 Dako Denmark A/S In situ hybridization detection method
RU2421242C2 (ru) 2005-07-25 2011-06-20 Трабьон Фармасьютикалз, Инк. Применение однократной дозы cd20-специфических связывающих молекул
PT2298815E (pt) 2005-07-25 2015-07-16 Emergent Product Dev Seattle Moléculas de ligaçao especificas para cd37 e especificas para cd20
CA2617907A1 (en) 2005-08-05 2007-02-15 Syntarga B.V. Triazole-containing releasable linkers and conjugates comprising the same
US7612181B2 (en) 2005-08-19 2009-11-03 Abbott Laboratories Dual variable domain immunoglobulin and uses thereof
UA92505C2 (ru) 2005-09-12 2010-11-10 Новиммюн С.А. Композиции на основе антитела против cd3
DK1931709T3 (en) 2005-10-03 2017-03-13 Xencor Inc FC VARIETIES WITH OPTIMIZED FC RECEPTOR BINDING PROPERTIES
AU2006301492B2 (en) 2005-10-11 2011-06-09 Amgen Research (Munich) Gmbh Compositions comprising cross-species-specific antibodies and uses thereof
JP2009511067A (ja) 2005-10-14 2009-03-19 メディミューン,エルエルシー 抗体ライブラリーの細胞提示
WO2007047829A2 (en) 2005-10-19 2007-04-26 Laboratoires Serono S.A. Novel heterodimeric proteins and uses thereof
EP1777294A1 (en) 2005-10-20 2007-04-25 Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale (Inserm) IL-15Ralpha sushi domain as a selective and potent enhancer of IL-15 action through IL-15Rbeta/gamma, and hyperagonist (IL15Ralpha sushi -IL15) fusion proteins
TW200732350A (en) 2005-10-21 2007-09-01 Amgen Inc Methods for generating monovalent IgG
WO2007059404A2 (en) 2005-11-10 2007-05-24 Medarex, Inc. Duocarmycin derivatives as novel cytotoxic compounds and conjugates
WO2007062037A2 (en) 2005-11-21 2007-05-31 Laboratoires Serono Sa Compositions and methods of producing hybrid antigen binding molecules and uses thereof
CA2633713A1 (en) 2005-12-21 2007-06-28 Micromet Ag Epha2 bite molecules and uses thereof
ES2384055T3 (es) 2005-12-30 2012-06-28 Merck Patent Gmbh Variantes de la interleucina-12p40 con estabilidad mejorada
US7833754B2 (en) 2006-01-13 2010-11-16 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services IL-12 for expression in mammalian cell
NZ596494A (en) 2006-01-13 2013-07-26 Us Gov Nat Inst Health Codon optimized il-15 and il-15r-alpha genes for expression in mammalian cells
US8940784B2 (en) 2006-02-02 2015-01-27 Syntarga B.V. Water-soluble CC-1065 analogs and their conjugates
EP1820513A1 (en) 2006-02-15 2007-08-22 Trion Pharma Gmbh Destruction of tumor cells expressing low to medium levels of tumor associated target antigens by trifunctional bispecific antibodies
EP1829895A1 (en) 2006-03-03 2007-09-05 f-star Biotechnologische Forschungs- und Entwicklungsges.m.b.H. Bispecific molecule binding TLR9 and CD32 and comprising a T cell epitope for treatment of allergies
NZ591252A (en) 2006-03-17 2012-06-29 Biogen Idec Inc Methods of designing antibody or antigen binding fragments thereof with substituted non-covarying amino acids
PT1999154E (pt) 2006-03-24 2013-01-24 Merck Patent Gmbh Domínios proteicos heterodiméricos modificados
US9670269B2 (en) 2006-03-31 2017-06-06 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Methods of modifying antibodies for purification of bispecific antibodies
JP5624276B2 (ja) 2006-03-31 2014-11-12 中外製薬株式会社 抗体の血中動態を制御する方法
EP2007423A2 (en) 2006-04-05 2008-12-31 Pfizer Products Incorporated Ctla4 antibody combination therapy
WO2007147901A1 (en) 2006-06-22 2007-12-27 Novo Nordisk A/S Production of bispecific antibodies
AT503861B1 (de) 2006-07-05 2008-06-15 F Star Biotech Forsch & Entw Verfahren zur manipulation von t-zell-rezeptoren
AT503889B1 (de) 2006-07-05 2011-12-15 Star Biotechnologische Forschungs Und Entwicklungsges M B H F Multivalente immunglobuline
AT503902B1 (de) 2006-07-05 2008-06-15 F Star Biotech Forsch & Entw Verfahren zur manipulation von immunglobulinen
JP5473603B2 (ja) 2006-10-02 2014-04-16 シー レーン バイオテクノロジーズ, エルエルシー 多様な合成ペプチドおよびポリペプチドライブラリーの設計および構築
MX2009009912A (es) 2007-03-27 2010-01-18 Sea Lane Biotechnologies Llc Constructos y colecciones que comprenden secuencias de cadena ligera sustitutas de anticuerpos.
EP1975178A1 (en) 2007-03-30 2008-10-01 f-star Biotechnologische Forschungs- und Entwicklungsges.m.b.H. Transcytotic modular antibody
MX2009010611A (es) 2007-04-03 2010-03-26 Micromet Ag Enlazadores biespecificos, especificos para especies.
PT2520590T (pt) 2007-04-03 2018-11-14 Amgen Res Munich Gmbh Domínio de ligação específico de espécies cruzadas
WO2008124858A2 (en) 2007-04-11 2008-10-23 F-Star Biotechnologische Forschungs- Und Entwicklungsges. M.B.H. Targeted receptor
US9244059B2 (en) 2007-04-30 2016-01-26 Immutep Parc Club Orsay Cytotoxic anti-LAG-3 monoclonal antibody and its use in the treatment or prevention of organ transplant rejection and autoimmune disease
EP1987839A1 (en) 2007-04-30 2008-11-05 I.N.S.E.R.M. Institut National de la Sante et de la Recherche Medicale Cytotoxic anti-LAG-3 monoclonal antibody and its use in the treatment or prevention of organ transplant rejection and autoimmune disease
ES2654303T3 (es) 2007-05-04 2018-02-13 University Health Network Inmunoterapia de IL-12 contra el cáncer
BRPI0811857A2 (pt) 2007-05-14 2014-10-21 Biogen Idec Inc Regiões fc (scfc) de cadeia simples, polipeptídeos de aglutinação que as compreendem e métodos relacionados.
ES2659517T3 (es) 2007-05-30 2018-03-16 Xencor, Inc. Métodos y composiciones para inhibir células que expresan CD32B
CA2688275A1 (en) 2007-05-31 2008-12-04 Genmab A/S Stable igg4 antibodies
BRPI0812562A2 (pt) 2007-06-12 2019-09-24 Trubion Pharmaceuticals Inc composições terapêuticas anti-cd20 e métodos
KR101586617B1 (ko) 2007-06-18 2016-01-20 머크 샤프 앤 도메 비.브이. 사람 프로그램된 사멸 수용체 pd-1에 대한 항체
ES2627223T3 (es) 2007-06-26 2017-07-27 F-Star Biotechnologische Forschungs- Und Entwicklungsges.M.B.H Presentación de agentes de unión
US8680293B2 (en) 2007-08-01 2014-03-25 Syntarga B.V. Substituted CC-1065 analogs and their conjugates
AU2008282729B2 (en) 2007-08-01 2015-07-16 Scott & White Healthcare A fold-back diabody diphtheria toxin immunotoxin and methods of use
AU2008296386A1 (en) 2007-08-28 2009-03-12 Biogen Idec Ma Inc. Compositions that bind multiple epitopes of IGF-1R
EP2033657A1 (de) 2007-09-04 2009-03-11 Trion Pharma Gmbh Intraoperative trifunktionale Antikörper-Applikation zur Prophylaxe intraperitonealer Tumorzelldissemination
EP2197911A2 (en) 2007-09-14 2010-06-23 Amgen Inc. Homogeneous antibody populations
ES2622460T3 (es) 2007-09-26 2017-07-06 Ucb Biopharma Sprl Fusiones de anticuerpos con doble especificidad
EP3689912A1 (en) 2007-09-26 2020-08-05 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Method of modifying isoelectric point of antibody via amino acid substitution in cdr
ES2566957T3 (es) 2007-09-26 2016-04-18 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Región constante de anticuerpo modificado
EP3575317A1 (en) 2007-12-26 2019-12-04 Xencor, Inc. Fc variants with altered binding to fcrn
DK2235064T3 (en) 2008-01-07 2016-01-11 Amgen Inc A process for the preparation of heterodimeric Fc molecules using electrostatic control effects
HUE034465T2 (en) 2008-02-11 2018-02-28 Cure Tech Ltd Monoclonal antibodies for tumor treatment
WO2009106096A1 (en) 2008-02-27 2009-09-03 Fresenius Biotech Gmbh Treatment of resistant tumors with trifunctional antibodies
EP2262837A4 (en) 2008-03-12 2011-04-06 Merck Sharp & Dohme PD-1 BINDING PROTEINS
WO2009126944A1 (en) 2008-04-11 2009-10-15 Trubion Pharmaceuticals, Inc. Cd37 immunotherapeutic and combination with bifunctional chemotherapeutic thereof
US8314213B2 (en) 2008-04-18 2012-11-20 Xencor, Inc. Human equivalent monoclonal antibodies engineered from nonhuman variable regions
CN102076865B (zh) 2008-05-02 2016-03-16 西雅图基因公司 用于制造核心岩藻糖基化降低的抗体和抗体衍生物的方法和组合物
PE20100092A1 (es) 2008-06-03 2010-03-12 Abbott Lab Inmunoglobulina con dominio variable dual y usos de la misma
AR072999A1 (es) 2008-08-11 2010-10-06 Medarex Inc Anticuerpos humanos que se unen al gen 3 de activacion linfocitaria (lag-3) y los usos de estos
CN102203125A (zh) 2008-08-25 2011-09-28 安普利穆尼股份有限公司 Pd-1拮抗剂及其使用方法
NZ591130A (en) 2008-08-25 2012-09-28 Amplimmune Inc Compositions comprising a PD-1 antagonists and cyclophosphamide and methods of use thereof
WO2010028796A1 (en) 2008-09-10 2010-03-18 F. Hoffmann-La Roche Ag Trispecific hexavalent antibodies
US20170247470A9 (en) 2008-09-17 2017-08-31 Xencor, Inc. Rapid clearance of antigen complexes using novel antibodies
EP2703415B1 (en) 2008-09-17 2019-03-06 Xencor, Inc. Compositions and methods for treating IgE-mediated disorders
KR20110047255A (ko) 2008-09-26 2011-05-06 로슈 글리카트 아게 이중특이적 항-egfr/항-igf-1r 항체
CA2738565C (en) 2008-10-01 2023-10-10 Micromet Ag Cross-species-specific psmaxcd3 bispecific single chain antibody
EP2370467B1 (en) 2008-10-01 2016-09-07 Amgen Research (Munich) GmbH Cross-species-specific pscaxcd3, cd19xcd3, c-metxcd3, endosialinxcd3, epcamxc d3, igf-1rxcd3 or fapalpha xcd3 bispecific single chain antibody
EP2352763B2 (en) 2008-10-01 2022-09-21 Amgen Research (Munich) GmbH Bispecific single chain antibodies with specificity for high molecular weight target antigens
EP2352765B1 (en) 2008-10-01 2018-01-03 Amgen Research (Munich) GmbH Cross-species-specific single domain bispecific single chain antibody
SG172754A1 (en) 2008-10-10 2011-08-29 Trubion Pharmaceuticals Inc Tcr complex immunotherapeutics
HUE035798T2 (en) 2008-11-03 2018-05-28 Syntarga Bv CC-1065 analogues and conjugates
PE20120341A1 (es) 2008-12-09 2012-04-24 Genentech Inc Anticuerpos anti-pd-l1 y su uso para mejorar la funcion de celulas t
JP2012515556A (ja) 2009-01-23 2012-07-12 バイオジェン・アイデック・エムエイ・インコーポレイテッド 低下したエフェクタ機能を有する安定化Fcポリペプチドおよび使用方法
MX2011009306A (es) 2009-03-06 2011-10-13 Genentech Inc Formulacion con anticuerpo.
EP2233500A1 (en) 2009-03-20 2010-09-29 LFB Biotechnologies Optimized Fc variants
MX2011010159A (es) 2009-04-02 2011-10-17 Roche Glycart Ag Anticuerpos multiespecificos que comprenden anticuerpos de longitud completa y fragmentos fab de cadena sencilla.
JP5616428B2 (ja) 2009-04-07 2014-10-29 ロシュ グリクアート アクチェンゲゼルシャフト 三価の二重特異性抗体
EP2417159A1 (en) 2009-04-07 2012-02-15 Roche Glycart AG Bispecific anti-erbb-3/anti-c-met antibodies
CN102361883A (zh) 2009-04-07 2012-02-22 罗氏格黎卡特股份公司 双特异性抗-ErbB-1/抗-c-Met抗体
EP2241576A1 (en) 2009-04-17 2010-10-20 Trion Pharma Gmbh Use of trifunctional bispecific antibodies for the treatment of tumors associated with CD133+/EpCAM+ cancer stem cells
EP2435473B1 (en) 2009-05-27 2013-10-02 F.Hoffmann-La Roche Ag Tri- or tetraspecific antibodies
EP2445936A1 (en) 2009-06-26 2012-05-02 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Readily isolated bispecific antibodies with native immunoglobulin format
CA2764729C (en) 2009-06-26 2019-04-02 Sea Lane Biotechnologies, Llc Expression of surrogate light chains
US9308258B2 (en) 2009-07-08 2016-04-12 Amgen Inc. Stable and aggregation free antibody FC molecules through CH3 domain interface engineering
US9493578B2 (en) 2009-09-02 2016-11-15 Xencor, Inc. Compositions and methods for simultaneous bivalent and monovalent co-engagement of antigens
DE102009045006A1 (de) 2009-09-25 2011-04-14 Technische Universität Dresden Anti-CD33 Antikörper und ihre Anwendung zum Immunotargeting bei der Behandlung von CD33-assoziierten Erkrankungen
RU2548746C2 (ru) 2009-10-27 2015-04-20 Эмджен Рисерч (Мьюник), ГмбХ Режим дозирования для введения биспецифичного антитела cd19×cd3
ES2688978T3 (es) 2009-11-23 2018-11-07 Amgen Inc. Anticuerpo monomérico Fc
WO2011066342A2 (en) 2009-11-24 2011-06-03 Amplimmune, Inc. Simultaneous inhibition of pd-l1/pd-l2
MX343747B (es) 2009-11-24 2016-11-22 Medimmune Ltd Agentes de union diana contra b7-h1.
CN102711810B (zh) 2009-11-30 2015-04-22 詹森生物科技公司 效应子功能已消除的抗体Fc区突变体
MX2012007497A (es) 2009-12-25 2012-08-01 Chugai Pharmaceutical Co Ltd Metodo para modificacion de polipeptidos para purificar multimeros de polipeptido.
US20130129723A1 (en) 2009-12-29 2013-05-23 Emergent Product Development Seattle, Llc Heterodimer Binding Proteins and Uses Thereof
ME02505B (me) 2009-12-29 2017-02-20 Aptevo Res & Development Llc Heterodimerni vezujući proteini i njihove upotrebe
WO2011082301A2 (en) 2009-12-30 2011-07-07 Vitag Holdings, Llc Bioorganically-augmented high value fertilizer
US20110189178A1 (en) 2010-02-04 2011-08-04 Xencor, Inc. Immunoprotection of Therapeutic Moieties Using Enhanced Fc Regions
WO2011120134A1 (en) 2010-03-29 2011-10-06 Zymeworks, Inc. Antibodies with enhanced or suppressed effector function
TWI653333B (zh) 2010-04-01 2019-03-11 安進研究(慕尼黑)有限責任公司 跨物種專一性之PSMAxCD3雙專一性單鏈抗體
US9150663B2 (en) 2010-04-20 2015-10-06 Genmab A/S Heterodimeric antibody Fc-containing proteins and methods for production thereof
WO2011133886A2 (en) 2010-04-23 2011-10-27 Genentech, Inc. Production of heteromultimeric proteins
EP2569337A1 (en) 2010-05-14 2013-03-20 Rinat Neuroscience Corp. Heterodimeric proteins and methods for producing and purifying them
WO2011154453A1 (en) 2010-06-09 2011-12-15 Genmab A/S Antibodies against human cd38
TWI629483B (zh) 2010-06-11 2018-07-11 協和醱酵麒麟有限公司 anti-TIM-3 antibody
CA2802344C (en) 2010-06-18 2023-06-13 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Bi-specific antibodies against tim-3 and pd-1 for immunotherapy in chronic immune conditions
CN103052649B (zh) 2010-07-29 2015-12-16 Xencor公司 具有修改的等电点的抗体
MX339622B (es) 2010-08-02 2016-06-02 Macrogenics Inc Diacuerpos covalentes y sus usos.
CN103068846B9 (zh) 2010-08-24 2016-09-28 弗·哈夫曼-拉罗切有限公司 包含二硫键稳定性Fv片段的双特异性抗体
WO2012032080A1 (en) 2010-09-07 2012-03-15 F-Star Biotechnologische Forschungs- Und Entwicklungsges.M.B.H Stabilised human fc
RS59589B1 (sr) 2010-11-05 2019-12-31 Zymeworks Inc Dizajniranje stabilnog heterodimernog antitela sa mutacijama u fc domenu
CN103533943B (zh) 2010-11-10 2018-02-13 安进研发(慕尼黑)股份有限公司 由cd3特异性结合结构域导致的不良作用的预防
CN103282385A (zh) 2010-11-12 2013-09-04 美国洛克菲勒大学 用于hiv治疗的融合蛋白
EP3075745B1 (en) 2011-02-10 2018-09-05 Roche Glycart AG Mutant interleukin-2 polypeptides
ES2676878T3 (es) 2011-03-03 2018-07-25 Zymeworks Inc. Diseño de armazón de heteromultímero multivalente y constructos
MX2013010172A (es) 2011-03-11 2013-10-25 Amgen Inc Metodo de analisis mutacional correlacionado para mejorar anticuerpos terapeuticos.
CA2830254C (en) 2011-03-16 2019-09-10 Amgen Inc. Fc variants
BR112013023918A2 (pt) 2011-03-25 2016-12-13 Glenmark Pharmaceuticals Sa imunoglobulina hetero-dimérica ou fragmento hetero-dimérico da mesma, método para produzir uma imunoglobulina hetero-dimérica ou fragmento hetero-dimérico da mesma, método para construir uma interface proteína-proteína de um domínio de uma proteína de múltiplos domínios e uso de um domínio doador de um primeiro e de um segundo membro de uma super-família de imunoglobulina de ocorrência natural
TWI588156B (zh) 2011-03-28 2017-06-21 賽諾菲公司 具有交叉結合區定向之雙重可變區類抗體結合蛋白
KR20160044598A (ko) 2011-03-29 2016-04-25 로슈 글리카트 아게 항체 Fc 변이체
AU2012247762B2 (en) 2011-04-28 2017-07-06 Amgen Research (Munich) Gmbh Dosage regimen for administering a CD19xCD3 bispecific antibody to patients at risk for potential adverse effects
EA201892619A1 (ru) 2011-04-29 2019-04-30 Роше Гликарт Аг Иммуноконъюгаты, содержащие мутантные полипептиды интерлейкина-2
ME03440B (me) 2011-05-21 2020-01-20 Macrogenics Inc Cd3-vezujući molekuli sposobni za vezivanje za humani i nehumani cd3
AU2012258907A1 (en) 2011-05-25 2013-11-07 Merck Sharp & Dohme Corp. Method for preparing Fc-containing polypeptides having improved properties
US20140155581A1 (en) 2011-07-06 2014-06-05 Medimmune, Llc Methods For Making Multimeric Polypeptides
EP2736928B1 (en) 2011-07-28 2019-01-09 i2 Pharmaceuticals, Inc. Sur-binding proteins against erbb3
WO2013022855A1 (en) 2011-08-05 2013-02-14 Xencor, Inc. Antibodies with modified isoelectric points and immunofiltering
CA2837975C (en) 2011-08-23 2022-04-05 Roche Glycart Ag Bispecific t cell activating antigen binding molecules
MX2014002289A (es) 2011-08-26 2015-03-20 Merrimack Pharmaceuticals Inc Anticuerpos fc especificos en tandem.
US20150050269A1 (en) 2011-09-30 2015-02-19 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Antigen-binding molecule promoting disappearance of antigens having plurality of biological activities
EP2766392B1 (en) 2011-10-10 2019-07-17 Xencor, Inc. A method for purifying antibodies
US10851178B2 (en) 2011-10-10 2020-12-01 Xencor, Inc. Heterodimeric human IgG1 polypeptides with isoelectric point modifications
PL3351261T3 (pl) 2011-10-11 2021-12-06 Universität Zürich Lek złożony zawierający IL-12 i środek do blokowania cząsteczek hamujących komórki T w terapii nowotworów
CA2850572A1 (en) 2011-10-20 2013-04-25 Esbatech, A Novartis Company Llc Stable multiple antigen-binding antibody
US11851476B2 (en) 2011-10-31 2023-12-26 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Antigen-binding molecule having regulated conjugation between heavy-chain and light-chain
CN104080811B (zh) 2011-11-04 2019-09-27 酵活有限公司 在Fc结构域中具有突变的稳定异源二聚的抗体设计
RS61033B1 (sr) 2011-11-28 2020-12-31 Merck Patent Gmbh Antitela na pd-l1 i njihova upotreba
KR102277469B1 (ko) 2011-12-12 2021-07-15 더 트러스티스 오브 더 유니버시티 오브 펜실바니아 개선된 il-12 유전적 컨스트럭트 및 백신을 포함하는 조성물, 면역치료제 및 이를 이용하는 방법
US9975956B2 (en) 2011-12-22 2018-05-22 I2 Pharmaceuticals, Inc. Surrogate binding proteins which bind DR4 and/or DR5
TW202015731A (zh) 2012-02-24 2020-05-01 日商中外製藥股份有限公司 經FcγRIIB促進抗原消失之抗原結合分子
NZ772318A (en) 2012-04-20 2023-06-30 Merus Nv Methods and means for the production of ig-like molecules
CA3004695C (en) 2012-04-30 2020-08-04 Biocon Limited Targeted/immunomodulatory fusion proteins and methods for making same
DK2857419T3 (da) 2012-05-30 2021-03-29 Chugai Pharmaceutical Co Ltd Antigen-bindende molekyle til eliminering af aggregerede antigener
US9499634B2 (en) 2012-06-25 2016-11-22 Zymeworks Inc. Process and methods for efficient manufacturing of highly pure asymmetric antibodies in mammalian cells
AR091649A1 (es) 2012-07-02 2015-02-18 Bristol Myers Squibb Co Optimizacion de anticuerpos que se fijan al gen de activacion de linfocitos 3 (lag-3) y sus usos
WO2014012085A2 (en) 2012-07-13 2014-01-16 Zymeworks Inc. Bispecific asymmetric heterodimers comprising anti-cd3 constructs
US20140072581A1 (en) 2012-07-23 2014-03-13 Zymeworks Inc. Immunoglobulin Constructs Comprising Selective Pairing of the Light and Heavy Chains
JOP20200236A1 (ar) 2012-09-21 2017-06-16 Regeneron Pharma الأجسام المضادة لمضاد cd3 وجزيئات ربط الأنتيجين ثنائية التحديد التي تربط cd3 وcd20 واستخداماتها
KR20150064068A (ko) 2012-10-08 2015-06-10 로슈 글리카트 아게 2개의 Fab 단편을 포함하는 FC-부재 항체 및 이용 방법
US9562110B2 (en) 2012-11-21 2017-02-07 Wuhan Yzy Biopharma Co., Ltd. Bispecific antibody
US20140377269A1 (en) 2012-12-19 2014-12-25 Adimab, Llc Multivalent antibody analogs, and methods of their preparation and use
US10131710B2 (en) 2013-01-14 2018-11-20 Xencor, Inc. Optimized antibody variable regions
US10968276B2 (en) 2013-03-12 2021-04-06 Xencor, Inc. Optimized anti-CD3 variable regions
WO2014110601A1 (en) 2013-01-14 2014-07-17 Xencor, Inc. Novel heterodimeric proteins
US9605084B2 (en) 2013-03-15 2017-03-28 Xencor, Inc. Heterodimeric proteins
US9701759B2 (en) 2013-01-14 2017-07-11 Xencor, Inc. Heterodimeric proteins
US10487155B2 (en) 2013-01-14 2019-11-26 Xencor, Inc. Heterodimeric proteins
WO2014113510A1 (en) 2013-01-15 2014-07-24 Xencor, Inc. Rapid clearance of antigen complexes using novel antibodies
KR20150131208A (ko) 2013-03-13 2015-11-24 이미지냅 인코포레이티드 Cd8에의 항원 결합 구조체들
US10519242B2 (en) 2013-03-15 2019-12-31 Xencor, Inc. Targeting regulatory T cells with heterodimeric proteins
US10106624B2 (en) 2013-03-15 2018-10-23 Xencor, Inc. Heterodimeric proteins
US10858417B2 (en) 2013-03-15 2020-12-08 Xencor, Inc. Heterodimeric proteins
PL3587448T3 (pl) 2013-03-15 2021-11-29 Xencor, Inc. Białka heterodimeryczne
DK2970486T3 (en) 2013-03-15 2018-08-06 Xencor Inc MODULATION OF T-CELLS WITH BISPECIFIC ANTIBODIES AND FC-FUSIONS
JP6329343B2 (ja) 2013-06-13 2018-05-23 任天堂株式会社 画像処理システム、画像処理装置、画像処理プログラム、および画像処理方法
WO2014209804A1 (en) 2013-06-24 2014-12-31 Biomed Valley Discoveries, Inc. Bispecific antibodies
GB201311487D0 (en) 2013-06-27 2013-08-14 Alligator Bioscience Ab Bispecific molecules
EP4269441A3 (en) 2013-08-08 2024-01-24 Cytune Pharma Il-15 and il-15ralpha sushi domain based on modulokines
EP2839842A1 (en) 2013-08-23 2015-02-25 MacroGenics, Inc. Bi-specific monovalent diabodies that are capable of binding CD123 and CD3 and uses thereof
SG11201603244VA (en) 2013-11-04 2016-05-30 Glenmark Pharmaceuticals Sa Production of t cell retargeting hetero-dimeric immunoglobulins
ES2811923T3 (es) 2013-12-17 2021-03-15 Genentech Inc Anticuerpos anti-CD3 y métodos de uso
EP3527587A1 (en) 2013-12-17 2019-08-21 F. Hoffmann-La Roche AG Combination therapy comprising ox40 binding agonists and pd-l1 binding antagonists
CN105899535A (zh) 2013-12-17 2016-08-24 豪夫迈·罗氏有限公司 用pd-1轴结合拮抗剂和抗cd20抗体治疗癌症的方法
TW201609794A (zh) 2013-12-18 2016-03-16 英翠克頌公司 編碼單鏈il-12之核酸、多肽及彼等之用途
CN106459182B (zh) 2013-12-30 2021-09-03 岸迈生物科技有限公司 串联fab免疫球蛋白及其用途
CA2935599A1 (en) 2014-01-08 2015-07-16 Shanghai Hengrui Pharmaceutical Co., Ltd. Il-15 heterodimeric protein and uses thereof
JOP20200094A1 (ar) 2014-01-24 2017-06-16 Dana Farber Cancer Inst Inc جزيئات جسم مضاد لـ pd-1 واستخداماتها
JOP20200096A1 (ar) 2014-01-31 2017-06-16 Children’S Medical Center Corp جزيئات جسم مضاد لـ tim-3 واستخداماتها
US20150259420A1 (en) 2014-03-14 2015-09-17 Novartis Ag Antibody molecules to lag-3 and uses thereof
TWI701042B (zh) 2014-03-19 2020-08-11 美商再生元醫藥公司 用於腫瘤治療之方法及抗體組成物
ME03666B (me) 2014-03-28 2020-10-20 Xencor Inc Bispecifična antitela koja se vezuju za cd38 i cd3
JP7348708B2 (ja) 2014-04-30 2023-09-21 プレジデント・アンド・フェロウズ・オブ・ハーバード・カレッジ 組み合わせワクチン装置および癌細胞を殺滅する方法
RU2718692C2 (ru) 2014-05-29 2020-04-13 Мэкроудженикс, Инк. Триспецифичные связывающие молекулы, которые специфически связывают антигены множества злокачественных опухолей, и способы их применения
BR112017000703A2 (pt) 2014-07-16 2017-11-14 Genentech Inc métodos para tratar ou retardar a progressão do câncer, para reduzir ou inibir a reincidência do câncer, para tratar ou retardar a progressão da imunidade tumoral e para aumentar, intensificar ou estimular uma resposta ou função imune e kit
US20160060360A1 (en) 2014-07-24 2016-03-03 Xencor, Inc. Rapid clearance of antigen complexes using novel antibodies
PL3183268T3 (pl) 2014-08-19 2020-09-07 Novartis Ag Chimeryczny receptor antygenowy (CAR) anty-CD123 do zastosowania w leczeniu nowotworu złośliwego
JO3663B1 (ar) 2014-08-19 2020-08-27 Merck Sharp & Dohme الأجسام المضادة لمضاد lag3 وأجزاء ربط الأنتيجين
US20170291934A1 (en) 2014-09-22 2017-10-12 Charles C. Reed Improved therapeutic control of heterodimeric and single chain forms of interleukin-12
BR112017007379A2 (pt) 2014-10-14 2017-12-19 Dana Farber Cancer Inst Inc moléculas de anticorpo para pd-l1 e usos das mesmas
MX2017003478A (es) 2014-11-05 2018-02-01 Genentech Inc Anticuerpos anti-fgfr2/3 y metodos para su uso.
PL3221355T3 (pl) 2014-11-20 2021-03-08 F. Hoffmann-La Roche Ag Terapia skojarzona składająca się z dwuswoistych aktywujących limfocyty T cząsteczek wiążących antygen CD3 i receptor folianowy 1 (FolR1) oraz antagonistów wiązania osi PD-1
US10259887B2 (en) 2014-11-26 2019-04-16 Xencor, Inc. Heterodimeric antibodies that bind CD3 and tumor antigens
WO2016086186A2 (en) 2014-11-26 2016-06-02 Xencor, Inc. Heterodimeric antibodies including binding to cd8
EP3223907A2 (en) 2014-11-26 2017-10-04 Xencor, Inc. Heterodimeric antibodies that bind cd3 and cd38
KR20170084326A (ko) 2014-11-26 2017-07-19 젠코어 인코포레이티드 Cd3 및 종양 항원과 결합하는 이종이량체 항체
US10428155B2 (en) 2014-12-22 2019-10-01 Xencor, Inc. Trispecific antibodies
AU2015369683C1 (en) 2014-12-23 2024-06-20 Bristol-Myers Squibb Company Antibodies to TIGIT
RS63384B1 (sr) 2015-01-08 2022-08-31 BioNTech SE Agonistička sredstva za vezivanje tnf receptora
EP3245227A4 (en) 2015-01-14 2018-07-25 Compass Therapeutics LLC Multispecific immunomodulatory antigen-binding constructs
MA41414A (fr) 2015-01-28 2017-12-05 Centre Nat Rech Scient Protéines de liaison agonistes d' icos
WO2016141387A1 (en) 2015-03-05 2016-09-09 Xencor, Inc. Modulation of t cells with bispecific antibodies and fc fusions
EP4059514A1 (en) 2015-05-08 2022-09-21 Xencor, Inc. Heterodimeric antibodies that bind cd3 and tumor antigens
TWI715587B (zh) 2015-05-28 2021-01-11 美商安可美德藥物股份有限公司 Tigit結合劑和彼之用途
GEP20227419B (en) 2015-07-30 2022-10-10 Macrogenics Inc Pd-1-binding molecules and methods of use thereof
CN106520778A (zh) 2015-09-09 2017-03-22 北京锤特生物科技有限公司 改造的白介素12及其在制备治疗肿瘤的药物中的用途
CA2994858C (en) 2015-09-25 2024-01-23 Genentech, Inc. Anti-tigit antibodies and methods of use
AU2016334401A1 (en) 2015-10-10 2018-04-26 Intrexon Corporation Improved therapeutic control of proteolytically sensitive, destabilized forms of interleukin-12
CN108699136B (zh) 2015-12-07 2022-03-18 Xencor股份有限公司 结合cd3和psma的异二聚抗体
CN108473578A (zh) 2015-12-22 2018-08-31 瑞泽恩制药公司 治疗癌症的抗pd-1抗体和双特异性抗cd20/抗cd3抗体组合
US10344067B2 (en) 2016-02-25 2019-07-09 Deutsches Krebsforschungszentrum RNA viruses expressing IL-12 for immunovirotherapy
EP3464370A1 (en) 2016-06-01 2019-04-10 Xencor, Inc. Bispecific antibodies that bind cd20 and cd3 for use in the treatment of lymphoma
US20170349660A1 (en) 2016-06-01 2017-12-07 Xencor. Inc. Bispecific antibodies that bind cd123 and cd3
EP3252078A1 (en) 2016-06-02 2017-12-06 F. Hoffmann-La Roche AG Type ii anti-cd20 antibody and anti-cd20/cd3 bispecific antibody for treatment of cancer
JP2019517539A (ja) 2016-06-07 2019-06-24 マクロジェニクス,インコーポレーテッド 併用療法
EP4257613A3 (en) 2016-06-14 2023-12-13 Xencor, Inc. Bispecific checkpoint inhibitor antibodies
US10696722B2 (en) * 2016-08-10 2020-06-30 Ajou University Industry-Academic Cooperation Foundation Heterodimeric Fc-fused cytokine and pharmaceutical composition comprising the same
WO2018030806A1 (ko) 2016-08-10 2018-02-15 아주대학교산학협력단 항체 중쇄불변부위 이종이중체에 융합된 사이토카인 및 이를 포함하는 약제학적 조성물
EP4273252A3 (en) 2016-08-29 2024-04-17 Akamis Bio Limited Adenovirus armed with bispecific t cell engager (bite)
US10793632B2 (en) 2016-08-30 2020-10-06 Xencor, Inc. Bispecific immunomodulatory antibodies that bind costimulatory and checkpoint receptors
CN110267978A (zh) 2016-10-07 2019-09-20 得克萨斯大学体系董事会 用于治疗癌症的表达膜锚定的il-12的t细胞
PE20191034A1 (es) 2016-10-14 2019-08-05 Xencor Inc Proteinas de fusion heterodimericas biespecificas que contienen proteinas de fusion fc il-15/il-15r y fragmentos de anticuerpo pd-1
WO2018213731A1 (en) 2017-05-18 2018-11-22 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding tethered interleukin-12 (il12) polypeptides and uses thereof
EP3645122A1 (en) 2017-06-30 2020-05-06 Xencor, Inc. Targeted heterodimeric fc fusion proteins containing il-15/il-15ra and antigen binding domains
US20210061911A1 (en) 2017-09-07 2021-03-04 Macrogenics, Inc. Dosing Regiments of Bi-Specific CD123 x CD3 Diabodies in the Treatment of Hematologic Malignancies
JP2021502100A (ja) 2017-11-08 2021-01-28 ゼンコア インコーポレイテッド 新規抗pd−1配列を用いた二重特異性および単一特異性抗体
US10981992B2 (en) 2017-11-08 2021-04-20 Xencor, Inc. Bispecific immunomodulatory antibodies that bind costimulatory and checkpoint receptors
WO2019129053A1 (zh) 2017-12-26 2019-07-04 南京金斯瑞生物科技有限公司 以抗体Fc区为骨架的融合蛋白二聚体及其应用
AU2019355971A1 (en) 2018-10-03 2021-05-06 Xencor, Inc. IL-12 heterodimeric Fc-fusion proteins
WO2020086758A1 (en) 2018-10-23 2020-04-30 Dragonfly Therapeutics, Inc. Heterodimeric fc-fused proteins

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2001525423A (ja) * 1997-12-08 2001-12-11 レキシジェン ファーマシューティカルズ コーポレイション 標的化免疫治療および一般の免疫刺激に対して有用であるヘテロ二量体融合タンパク質

Also Published As

Publication number Publication date
WO2020072821A9 (en) 2020-05-22
CA3115096A1 (en) 2020-04-09
KR20210069641A (ko) 2021-06-11
MA53822A (fr) 2021-08-11
CN113195523A (zh) 2021-07-30
US11358999B2 (en) 2022-06-14
US11655277B2 (en) 2023-05-23
EP3861016A2 (en) 2021-08-11
MX2021003765A (es) 2021-07-15
AU2019355971A1 (en) 2021-05-06
SG11202103192RA (en) 2021-04-29
IL281962A (en) 2021-05-31
US20200216509A1 (en) 2020-07-09
US20230027540A1 (en) 2023-01-26
US20220396605A1 (en) 2022-12-15
WO2020072821A3 (en) 2020-06-18
WO2020072821A2 (en) 2020-04-09

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