ES2258817T3 - Metodo para la produccion de proteinas no inmunogenas. - Google Patents
Metodo para la produccion de proteinas no inmunogenas.Info
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Abstract
Método para hacer que la estreptoquinasa sea no inmunógena o menos inmunógena cuando se expone al sistema inmunológico de una especie humana determinada, cuyo método comprende: (a) determinar al menos parte de la secuencia de aminoácidos de estreptoquinasa; (b) identificar un primer conjunto de uno o más epitopos potenciales de células T dentro de la secuencia de aminoácidos de estreptoquinasa a través de (i) análisis respecto a las secuencias de péptidos de solapamiento dentro de dicha secuencia de aminoácidos, que o bien se unen a moléculas de MHC de clase II o bien muestran la capacidad para estimular células T por vía de la presentación sobre MHC de clase II, respecto a la presencia de motivos de unión a MHC de clase II, y (ii) comparación de dichas secuencias con motivos humanos de unión a MHC de clase II disponibles a partir de bases de datos de MHC, (c) identificar un segundo conjunto de uno o más epitopos potenciales de células T que comprenden un número reducido de motivos de células T mediante substracción de dicho primer conjunto de los epitopos potenciales de células T, que también están presentes en secuencias de la línea germinal de región variable de inmunoglobulina humana obtenidas a partir de bases de datos de líneas germinales humanas y (d) eliminar de la secuencia de aminoácidos de estreptoquinasa al menos uno de dichos epitopos de células T identificados de acuerdo con la etapa c) mediante la alteración de uno o más residuos de aminoácidos dentro de o adyacentes a dicha secuencia en posiciones correspondientes a aquellos dentro del epitopo o epitopos de células T identificados.
Description
Método para la producción de proteínas no
inmunógenas.
La presente invención se refiere a la producción
de proteínas sustancialmente no inmunógenas para la generación de
nuevos agentes terapéuticos y de diagnóstico in vivo para su
uso particular en seres humanos. La invención se refiere
concretamente a una nueva versión desinmunizada de la proteína
bacteriana estreptoquinasa.
La presente invención detalla un procedimiento
por medio del cual se pueden identificar epitopos potencialmente
inmunógenos dentro de una proteína no autóloga y ofrece metodología
a través de la cual se pueden eliminar dichos epitopos. Existe un
número de proteínas terapéuticas probadas cuyo uso terapéutico está
restringido teniendo en cuenta su inmunogenicidad en el ser humano.
En el presente ejemplo, se analiza la proteína terapéutica
estreptoquinasa con respecto a la presencia de motivos potenciales
de unión a MHC y se describe un método para separar de la molécula
un número de tales motivos.
La estreptoquinasa (SK) es un proteína de una
sola cadena con un peso molecular aproximado de 47 kDa que es
producida por ciertas cepas de estreptococos
\beta-hemolíticos (Huang T.T. et al., Mol.
Biol. 2 197-205 (1989)). La proteína no presenta
actividad enzimática inherente pero es de una importancia clínica
considerable debido a su capacidad para unirse eficientemente a
plasminógeno humano, para potenciar su activación a plasmina y para
promover con ello la disolución de filamentos de fibrina en coágulos
de sangre. Varios estudios han demostrados que la SK es un agente
trombolítico eficaz en el tratamiento de trombosis coronaria,
mejorando la supervivencia (ISIS-2 Collaborative
Group, Lancet 2 349-360 (1988)) y preservando la
función ventricular izquierda después de un infarto de miocardio
(ISAM Study Group, N. Ergl. J. Med. 314 1465-1471
(1986); Kennedy J. W. et al., Circulation 77
345-352 (1988)). A pesar del indudable valor
terapéutico de la SK, el origen no autólogo de la proteína
constituye una desventaja debido a su inmunogenicidad en seres
humanos. La producción de anticuerpos neutralizantes en el paciente
limita la proteína generalmente a un solo uso.
La presente invención proporciona, por primera
vez, un método general para crear proteínas sustancialmente no
inmunógenas tal como la proteína bacteriana estreptoquinasa.
De acuerdo con un primer aspecto de la
invención, se proporciona un método para hacer que la
estreptoquinasa, o parte de la proteína, sea no inmunógena o menos
inmunógena a una determinada especie, cuyo método comprende:
(a) determinar al menos parte de la secuencia de
aminoácidos de estreptoquinasa;
(b) identificar un primer conjunto de uno o más
epitopos potenciales de células T dentro de la secuencia de
aminoácidos de estreptoquinasa a través de (i) análisis
respecto a las secuencias de péptidos de solapamiento dentro de
dicha secuencia de aminoácidos, que o bien se unen a moléculas de
MHC de clase II o bien muestran la capacidad para estimular células
T por vía de la presentación sobre MHC de clase II, respecto a la
presencia de motivos de unión a MHC de clase II, y (ii) comparación
de dichas secuencias con motivos humanos de unión a MHC de clase II
disponibles a partir de bases de datos de MHC,
(c) identificar un segundo conjunto de uno o más
epitopos potenciales de células T que comprenden un número reducido
de motivos de células T mediante substracción de dicho primer
conjunto de los epitopos potenciales de células T, que también
están presentes en secuencias de la línea germinal de región
variable de inmunoglobulina humana obtenidas a partir de bases de
datos de líneas germinales humanas y
(d) eliminar de la secuencia de aminoácidos de
estreptoquinasa al menos uno de dichos epitopos de células T
identificados de acuerdo con la etapa c) mediante la alteración de
uno o más residuos de aminoácidos dentro de o adyacentes a dicha
secuencia en posiciones correspondientes a aquellos dentro del
epitopo o epitopos de células T identificados.
El término "epitopos de células T" se
refiere a secuencias de péptidos específicas que se unen con una
eficacia razonable a moléculas de MHC de clase II o que, a partir de
estudios previos u otros estudios, muestran la capacidad de
estimular células T por vía de la presentación sobre MHC de clase
II. Sin embargo, ha de entenderse que no todas esas secuencias de
péptidos se suministrarán dentro del compartimiento celular correcto
de MHC de clase II para la unión a MHC de clase II o se liberarán
adecuadamente a partir de una proteína celular más grande para su
posterior a MHC de clase II. Igualmente, ha de entenderse que
incluso tales péptidos que son presentados por MHC de clase II sobre
la superficie de células presentadoras de antígenos ejercerán una
respuesta de las células T por razones que incluyen la ausencia de
la especificidad adecuada de las células T y la tolerancia por el
sistema inmunológico a la secuencia de péptidos en particular.
Los expertos en la materia podrán entender que
la presente invención podría aplicarse también a la producción de
proteínas terapéuticas distintas de la estreptoquinasa. Las
proteínas que de otro modo serían inmunógenas en el ser humano
podrían ser desinmunizadas por separación de epitopos de células T.
Además, en el caso de que pueda disponerse de una proteína humana de
referencia con una estructura secundaria similar y con aminoácidos
en la superficie identificables, los epitopos de células T podrían
ser también separados de la proteína sustituyendo el amino de la
superficie de la proteína humana de referencia en lugar de los
correspondientes aminoácidos en la proteína no humana o
potencialmente inmunógena. Por ejemplo, el uso clínico del agente
trombolítico, estreptoquinasa bacteriana, está limitado por las
respuestas inmunológicas humanas contra la molécula. Dichas
moléculas podrían ser construidas para separar epitopos potenciales
de células T con el fin de eliminar la inmunogenicidad.
En general, la invención se utilizará para
reducir la inmunogenicidad de una proteína o parte de la misma de
una primera especie en relación al sistema inmunológico de una
segunda especie. La primera especie puede no ser humana y la
segunda especie puede ser humana. Ejemplos de especies típicas no
humanas útiles en relación a modalidades de la invención que se
refieren a inmunoglobulinas, incluyen mamíferos, especialmente
roedores tales como ratas y, en particular, ratones, y animales de
granja tales como ovejas y vacas. Sin embargo, y como anteriormente
se ha aclarado en relación a la estreptoquinasa bacteriana, la
primera especie puede estar taxonómicamente muy separada de la
segunda especie; cuando la primera especie no es humana, la misma
puede ser una especie no mamífera e incluso no eucaríotica. Ha de
entenderse que la invención se refiere también a especies distintas
del ser humano y a proteínas, en particular proteínas terapéuticas,
incluyendo en general moléculas de unión específicas distintas de
los anticuerpos enteros.
El método de la invención está basado en la
consideración de cómo se crea normalmente una respuesta inmunológica
contra una proteína en seres humanos como base para evitar o
eliminar secuencias dentro de la proteína que están implicadas en
esta respuesta inmunológica. Cuando se administra una proteína
terapéutica a un paciente humano, la proteína queda sujeta a
vigilancia por ambos brazos humoral y celular del sistema
inmunológico el cual responderá a la proteína en el caso de que esta
sea reconocida como foránea y en el caso de que el sistema
inmunológico ya no sea tolerante a la secuencia inmunógena dentro de
la proteína. Para la respuesta inmunológica humoral, las
inmunoglobulinas de superficie que exhiben células B inmaduras (sIg)
pueden unirse a una o más secuencias dentro de la proteína
terapéutica ("epitopos de células B") en el caso de que exista
un ajuste de afinidad entre la sIg individual y el epitopo de la
célula B y en el caso de que el epitopo de la célula B quede
expuesto de manera que la sIg puede tener acceso al epitopo de la
célula B. El proceso de unión de sIg a la proteína terapéutica
puede, en presencia de citoquinas adecuadas, estimular la célula B
para diferenciarse y dividirse y proporcionar así formas solubles de
la sIg original que pueden complejarse con la proteína terapéutica
para limitar su eficacia y facilitar su eliminación del paciente.
Sin embargo, para una respuesta eficaz de las células B, se requiere
una respuesta paralela de las células T con el fin de proporcionar
las citoquinas y otras señales necesarias para dar lugar a
anticuerpos solubles. Una respuesta eficaz de las células T requiere
la absorción de la proteína terapéutica por células presentadoras de
antígenos (APCs) que pueden incluir las propias células B u otras
APCs profesionales tales como macrófagos, células dendríticas y
otros monocitos. Además, las APCs no profesionales, tales como las
células a las cuales se une la proteína, pueden absorber la proteína
terapéutica y proporcionar el procesado intermedio de la proteína,
de manera que las APCs profesionales pueden absorber entonces los
componentes de la proteína. Una ves absorbida la proteína
terapéutica, las APCs pueden presentar entonces péptidos adecuados
procedentes de la proteína terapéutica ("epitopos de células
T") complejados con moléculas de MHC de clase II en la superficie
de la célula. Dichos compuestos de péptido-MHC de
clase II pueden ser reconocidos por células T colaboradoras por vía
del receptor de células T, dando esto como resultado la estimulación
de las células T y la secreción de citoquinas lo cual aporta
"ayuda" a las células B en su diferenciación a células de
producción plena de anticuerpos. Además, la respuesta de células T
puede dar lugar también a efectos perjudiciales en el paciente, por
ejemplo a través de reacciones inflamatorias y alérgicas.
Por tanto, una respuesta inmunógena primaria
eficaz a una proteína terapéutica requiere normalmente una
combinación de respuestas de células B y T a epitopos de células B y
T. En consecuencia, la evitación de una respuesta inmunógena
primaria requiere la evitación o eliminación de ambos epitopos de
células B y T dentro de la proteína terapéutica. Sin cualquiera de
las respuestas de células B o T, la respuesta inmunógena primaria a
una proteína terapéutica es probable que sufra una mutación o esté
ausente. Por tanto, la presente invención proporciona métodos para
evitar o eliminar epitopos de células T, o una combinación de
epitopos tanto de células B como de células T, de proteínas
terapéuticas con el fin crear proteínas sustancialmente no
inmunógenas, con énfasis particular en la evitación de tales
epitopos en la proteína terapéutica. Para epitopos de células B, el
método saca provecho del hecho de que la sIg sólo puede unirse a
regiones accesibles de la proteína terapéutica, es decir, secuencias
de aminoácidos expuestos en la superficie. Para epitopos de células
T, se analizan las secuencias de péptidos de solapamiento dentro de
la proteína terapéutica con el fin de identificar péptidos putativos
adecuados para la presentación por moléculas de MHC de clase II.
Mediante el escaneado de la proteína terapéutica y, cuando se
identifican epitopos de células T, mediante el cambio de uno o más
aminoácidos individuales para eliminar el epitopo de la célula T, se
puede crear entonces una proteína desprovista de epitopos de células
T.
Un método preferido de la presente invención
combina por tanto la separación de epitopos de ambas células B y T
de una proteína terapéutica, un procedimiento que recibe la
denominación de "desinmunización".
La presente invención proporciona la separación
de epitopos de células T humanas (o de otra segunda especie) de la
proteína terapéutica, en donde la secuencia de la proteína puede ser
analizada respecto a la presencia de motivos de unión a MHC de
clase II por cualquier medio adecuado. Por ejemplo, se puede
efectuar una comparación con bases de datos de motivos de unión a
MHC tal como, por ejemplo, realizando una búsqueda en la base de
datos de "motivos" en la página www.wehil.wehi.edu.au.
Alternativamente, se pueden identificar péptidos de unión a MHC de
clase II empleando métodos de enhebrado por ordenador tales como
aquellos creados por Altuvia et al. (J. Mol. Biol. 249
244-250 (1995)) en donde se ensayan péptidos de
solapamiento consecutivos de la secuencias de la proteína respecto a
sus energías de unión a proteínas de MHC de clase II. Con el fin de
facilitar la identificación de péptidos de unión a MHC de clase II,
se pueden investigar características asociadas de la secuencia que
se relacionan con péptidos presentados con total éxito, tales como
anfipaticidad y motivos Rothbard, y sitios de escisión para
catepsina B y otras enzimas de procesado.
Una vez identificados los epitopos potenciales
de células T de la segunda especie (por ejemplo humana), estos
epitopos son eliminados entonces por alteración de uno o más
aminoácidos, tal como se requiera para eliminar el epitopo de célula
T. Normalmente, esto implicará la alteración de uno o más
aminoácidos dentro del propio epitopo de célula T. Esto podría
implicar la alteración de una aminoácido adyacente al epitopo en
términos de la estructura primaria de la proteína o de uno que no es
adyacente en la estructura primaria sino que es adyacente en la
estructura secundaria de la molécula. La alteración usual
contemplada será la sustitución del aminoácido, pero es posible que
en ciertas circunstancias resulte adecuada la adición deleción del
aminoácido. Todas las alteraciones pueden ser realizadas con
preferencia mediante la tecnología del ADN recombinante, de manera
que la molécula final se puede preparar mediante expresión a partir
de un hospedante recombinante, por ejemplo por métodos ya bien
establecidos, pero en la práctica de la invención no se deshecha el
uso de química de proteínas o de cualquier otro medio de alteración
molecular.
En la práctica, se ha reconocido que los
epitopos potenciales de células T humanas pueden ser identificados
incluso en secuencias estructurales de la región V de la línea
germinal humana cuando se efectúa una comparación con bases de datos
de motivos de unión a MHC. Dado que los seres humanos no ejercen
generalmente una respuesta inmunológica progresiva contra sus
propias proteínas, entonces o bien los humanos son tolerantes a
estos epitopos o bien estos epitopos potenciales no pueden ser
presentados por APCs humanas debido a que no son procesados de forma
adecuada. Por tanto, dichos epitopos potenciales de células T que
están representados en secuencias de la región V de la línea
germinal pueden, en la práctica, quedar retenidos en el anticuerpo
desinmunizado. Con el fin de reducir al mínimo la creación de más
epitopos de células T durante la eliminación de epitopos potenciales
de células T de la secuencia de la proteína terapéutica, la
eliminación de epitopos de células T se consigue preferentemente
(pero no necesariamente) por conversión a aminoácidos de la línea
germinal de la segunda especie (normalmente humana) en posiciones
correspondientes a aquellas de los aminoácidos de la primera especie
(normalmente ratón) dentro de epitopos de células T. Una vez
separados los epitopos de células T inicialmente identificados, la
secuencia desinmunizada puede ser analizada de nuevo para asegurar
que no se han creado nuevos epitopos de células T y, en el caso de
que existan, el epitopo o los epitopos pueden ser suprimidos, como
se ha descrito anteriormente; o la conversión previa a un aminoácido
correspondiente de la línea germinal humana se altera por conversión
del aminoácido murínico (o de otra primera especie) a un aminoácido
no humano similar (o no de una segunda especie) (es decir, que tiene
un tamaño y/o carga similares, por ejemplo) hasta que se eliminan
todos los epitopos de células T.
Los expertos en la materia entenderán que son
posibles diversas variaciones del método de la presente invención
que estarán incluidas dentro del alcance de la misma. Si bien la
presente invención se refiere principalmente a proteínas
terapéuticas de las cuales se han suprimido los epitopos de células
B y T humanas, se reconocerá que la separación de epitopos de
células T únicamente podría, en algunos casos, ser también eficaz a
la hora de evitar una respuesta inmunógena en pacientes. Además, se
considerará dentro del alcance de la presente invención el rediseño
de una proteína terapéutica ya existente a la cual se ha detectado y
caracterizado una respuesta inmunológica humana, para suprimir los
epitopos relacionados con la respuesta inmunológica observada en
humanos.
De acuerdo con la invención, se proporciona una
molécula de estreptoquinasa desinmunizada que ha sido preparada
mediante un método según la invención, para utilizarse en medicina o
diagnosis. Como una modalidad preferida, se proporciona una molécula
de estreptoquinasa que tiene la secuencia de proteínas de la figura
2.
La invención se extiende también a un método de
tratamiento o prevención de una enfermedad o estado, cuyo método
comprende administrar a un sujeto una cantidad eficaz de dicha
molécula preparada por un método según la invención.
La invención será ahora ilustrada, pero no de
forma limitativa, por el siguiente ejemplo. El ejemplo se refiere a
los dibujos, en donde:
La figura 1 muestra la secuencia de proteínas de
estreptoquinasa de Streptococcus equisimilis.
La figura 2 muestra la secuencia de proteínas de
una molécula de estreptoquinasa desinmunizada.
Se utilizó el siguiente ejemplo para identificar
motivos potenciales de unión a MHC de clase II en estreptoquinasa.
La secuencia de la estreptoquinasa fue identificada a partir de la
base de datos de GenBank. En todo momento se utilizó la secuencia
con el número de acceso S46536 (figura 1). La secuencia fue
analizada respecto a la presencia de motivos potenciales de unión a
MHC de clase II por comparación, auxiliada por ordenador, con una
base de datos de motivos de unión a MHC como aparece en la página
www.wehil.wehi.edu.au.
Los resultados del proceso de "búsqueda"
indican la presencia de 395 motivos potenciales de unión a MHC de
clase II. Entre éstos, 283 coinciden con la secuencias identificadas
en una base de datos de secuencias de proteínas de la región
variable de inmunoglobulina de la línea germinal humana. Estos
epitopos dejaron de ser considerados en base a que en general no
están montadas respuestas inmunológicas a proteínas autólogas en
circulación, tales como inmunoglobulinas. Esto implica una
tolerancia inmunológica a los epitopos potenciales de células T
presentes en la estructura de la inmunoglobulinas (y en realidad en
la mayoría de las proteínas humanas). Los epitopos presentados por
proteínas no autólogas, tal como SK, que son idénticos o similares a
los motivos presentes en las proteínas de inmunoglobulina, es
probable que también sean tolerados y, en la práctica, pueden quedar
retenidos a través del proceso de desinmunización.
Después de la sustracción de los motivos de la
línea germinal de proteína de inmunoglobulina humana, los restantes
112 epitopos potenciales fueron analizados individualmente respecto
a la similitud con secuencias de proteínas de no inmunoglobulinas.
En la práctica, los residuos de anclaje pronosticados para cada
epitopo potencial fueron utilizados en la búsqueda de la secuencia
de consenso de proteínas expresadas humanas. Las bases de datos de
secuencias traducidas de SwissProt y GenBank fueron interrogadas
empleando software comercialmente disponible (DNAstar Madison, WI,
USA). Los epitopos identificados en proteínas humanas en circulación
conocidas dejaron de ser considerados y, por tanto, se permitió que
permanecieran inalterados dentro de la molécula de SK. Un ejemplo de
uno de tales epitopos potenciales rechazados viene dado por la
secuencia LLKAIQEQL en las posiciones
79-87 de la proteína SK. Esta secuencia representa
un motivo de unión de consenso pronosticado para
HLA-DR1*0101 con los residuos de anclaje subrayados.
La búsqueda en la base de datos empleando la secuencia de consenso
LxxxAxxxxL identifica >4000 entradas en un
sub-conjunto de proteínas humanas de la base de
datos SwissProt, incluyendo la proteína de albúmina de suero
(SwissProt número de acceso P02768). Un ejemplo de un epitopo en
donde no se encontró coincidencia con una proteína humana
considerada como estando en la circulación general, viene dado por
la secuencia YVDVNTN en las posiciones
299-305 de la proteína SK. Esta secuencia representa
una epitopo potencial para la presentación por
HLA-DR4*0401. La búsqueda de la secuencia de
consenso identifica <50 proteínas humanas que contienen este
motivo, muchas de las cuales son proteínas intracelulares de tejidos
diferenciados tal como cerebro. Estas pueden ser consideradas como
no asequibles generalmente al sistema inmunológico para conseguir
tolerancia y, por tanto, identificar esto como un epitopo potencial
a eliminar de acuerdo con el método de la presente invención. De
manera similar, otro motivo de unión potencial a
HLA-DR1*0101 fue identificado en la secuencia
KADLLKAI del péptido SK en las posiciones 76-83 de
la proteína SK. Este motivo identifica <150 proteínas humanas en
el mismo conjunto de datos y también fue identificado para su
modificación por el método de la presente invención.
El resultado neto de estos procesos fue el de
identificar aquellos residuos dentro de la molécula de SK que
deberán ser alterados para eliminar motivos potenciales de unión a
MHC de clase II. Para la alteración se seleccionaron aminoácidos
individuales dentro de los motivos de unión pronosticados. Con el
fin de maximizar la posibilidad de mantener la actividad funcional
de la proteína, se eligieron en todos los casos, en cualquier sitio
dado, sustituciones conservadoras de aminoácidos. Se recopiló una
nueva una nueva secuencia de SK (desinmunizada) (figura 2) y se
analizó adicionalmente por comparación con la base de datos, como
anteriormente, para confirmar la eliminación con éxito de motivos
potenciales de unión a MHC de clase II.
Se utilizó el siguiente método para la
construcción de moléculas de SK desinmunizadas. Se emplearon
cebadores PCR SK1
(5'-ggaattcatgattgctggacctgagtggctg) y SK2
(5'-tggatccttatttgtcgttagggtatc) para amplificar el
gen de SK de tipo salvaje a partir de una cepa del grupo
Streptococcus equisimililis C (ATCC número acceso 9542). El
fragmento de 1233 pb resultante fue clonado en pUC19 con un
fragmento de restricción BamHI-EcoRI empleando
técnicas convencionales [Sambrook J., Fritisch E. F. & Maniatis
T. (eds) en: "Molecular Cloning: A Laboratory Manual", Cold
Spring Harbor Laboratory Press, NY, USA (1989)]. Se confirmó que la
secuencia del gen era idéntica a las entradas de la base de datos
empleando sistemas reactivos comercialmente disponibles e
instrucciones aportadas por el proveedor (Amersham, Little Chalfont,
UK). Se llevó a cabo una mutagénesis dirigida al sitio empleando
oligonucleótidos sintéticos y el procedimiento de "cambio
rápido" y reactivos de Stratagene UK Ltd. Por secuenciación se
confirmaron versiones mutadas (desinmunizadas) del gen. Los genes
mutados de SK fueron sub-clonados como fragmentos
EcoRI-BamHI en el vector de expresión bacteriana
pEKG-3 (Estrada M. P. et al., Bio/Technology
10 1138-1142 (1992)) para la expresión de SK
desinmunizada. La proteína recombinante fue purificada empleando un
columna de afinidad por plasminógeno de acuerdo con el método de
Rodriguez et al., [Rodriguez P. et al., Biotechniques
7 638-641 (1992)]. La actividad fibrinolítica fue
evaluada empleando la técnica de la placa de caseína/plasminógeno y
el ensayo de lisis de coágulos in vitro descrito por Estrada
et al., (Estrada et al., ibid).
Claims (7)
1. Método para hacer que la estreptoquinasa sea
no inmunógena o menos inmunógena cuando se expone al sistema
inmunológico de una especie humana determinada, cuyo método
comprende:
(a) determinar al menos parte de la secuencia de
aminoácidos de estreptoquinasa;
(b) identificar un primer conjunto de uno o más
epitopos potenciales de células T dentro de la secuencia de
aminoácidos de estreptoquinasa a través de (i) análisis respecto a
las secuencias de péptidos de solapamiento dentro de dicha secuencia
de aminoácidos, que o bien se unen a moléculas de MHC de clase II o
bien muestran la capacidad para estimular células T por vía de la
presentación sobre MHC de clase II, respecto a la presencia de
motivos de unión a MHC de clase II, y (ii) comparación de dichas
secuencias con motivos humanos de unión a MHC de clase II
disponibles a partir de bases de datos de MHC,
(c) identificar un segundo conjunto de uno o más
epitopos potenciales de células T que comprenden un número reducido
de motivos de células T mediante substracción de dicho primer
conjunto de los epitopos potenciales de células T, que también
están presentes en secuencias de la línea germinal de región
variable de inmunoglobulina humana obtenidas a partir de bases de
datos de líneas germinales humanas y
(d) eliminar de la secuencia de aminoácidos de
estreptoquinasa al menos uno de dichos epitopos de células T
identificados de acuerdo con la etapa c) mediante la alteración de
uno o más residuos de aminoácidos dentro de o adyacentes a dicha
secuencia en posiciones correspondientes a aquellos dentro del
epitopo o epitopos de células T identificados.
2. Método según la reivindicación 1, que
comprende una etapa de sustracción adicional que elimina de dicho
segundo conjunto de motivos de células T aquellos epitopos de
células T que están presentes en secuencias de proteínas de no
inmunoglobulinas humanas mediante el análisis de la secuencia
respecto a la similitud con dichas secuencias de proteínas de no
inmunoglobulinas.
3. Método según la reivindicación 1 o 2, en
donde la eliminación de los epitopos potenciales de células T
identificados por alteración de uno o más aminoácidos se consigue
mediante sustitución.
4. Método según la reivindicación 3, en donde
los residuos de aminoácidos originales son sustituidos por
aminoácidos de la línea germinal de la especie humana
determinada.
5. Método según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 4, en donde la secuencia alterada se analiza
para identificar cualesquiera epitopos de células T que surjan de
dicha alteración o de la alteración propuesta y se modifica para
eliminar cualesquiera de tales epitopos de células T, en donde la
identificación y alteración se efectúa de acuerdo con cualquiera de
las reivindicaciones anteriores.
6. Método según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 5, en donde la molécula de estreptoquinasa
desinmunizada tiene la secuencia de proteínas mostrada en la figura
2.
7. Una estreptoquinasa modificada que es no
inmunógena o menos inmunógena cuando se expone al sistema
inmunológico de una especie humana determinada, que tiene la
secuencia de proteínas mostrada en la figura 2.
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