JP2012505900A - 全身性強皮症に伴う肺線維症の治療および予防のためのｉｇｆ−ｉｉ／ｉｇｆ−ｉｉｅ結合タンパク質の使用 - Google Patents

全身性強皮症に伴う肺線維症の治療および予防のためのｉｇｆ−ｉｉ／ｉｇｆ−ｉｉｅ結合タンパク質の使用 Download PDF

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Abstract

全身性強皮症に伴う肺線維症の治療または予防のための、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと結合するタンパク質の使用方法を開示する。
【選択図】なし

Description

関連出願への相互参照
本出願は、２００８年１０月１４日に出願された米国仮出願第６１／１０５，２２９号の優先権を主張する。先の出願の開示は本出願の開示の一部である（および参照することにより本出願の開示に組み込まれる）とみなされる。
ポリペプチドのインスリン様増殖因子（ＩＧＦ）ファミリーは、正常な増殖および発達において主な役割を果たす。ＩＧＦシステムの成分（ＩＧＦ−ＩＩなど）の変化した発現は多くの腫瘍タイプにおける悪性表現型の発現および維持に関与しており、このシステムを標的とする薬剤は抗癌治療薬としての可能性を有し得ることが示唆される。腫瘍により増大したＩＧＦ−ＩＩ分泌に関わり得るいくつかの経路が同定されている；これらとしては、母系ＩＧＦ−ＩＩ対立遺伝子のゲノムインプリンティングの消失、父系対立遺伝子複製とのヘテロ結合性の消失、および／または転写性制御の消失が挙げられる。かかる増大した分泌により、特にＩＧＦ−ＩＩに特異的に結合する受容体、ＩＧＦ−Ｉ受容体（ＩＧＦ−１ＲまたはＩＧＦ−ＩＲ）およびインスリン受容体のアイソフォーム（ＩＲ−Ａ）は、腫瘍細胞内で典型的には、上方制御されるため、より大きな増殖、アポトーシスからの保護、および癌の転移能が可能となる。増大したＩＧＦ−ＩＩ産生は、循環由来ＩＧＦ−ＩＩクリアランスの中心の役割を担うと思われるＩＧＦ−ＩＩ受容体の第三の種類であるマンノース−６−リン酸受容体の下方制御によりさらに悪化する。ＩＧＦ−ＩＩの局所レベルは、腫瘍により分泌される特異的なＩＧＦ−ＩＩ結合タンパク質の発現変化によっても、または腫瘍により産生された増大したプロテアーゼ活性の結果としても上昇し得る。
ＩＧＦシグナル伝達軸は癌の５０％の病因に関係があるとされているが、ＩＧＦシグナル伝達軸を特異的に標的とする利用可能な治療薬は限られている（改善するための多くの研究努力が進行中ではある）。乳癌治療モデルにおけるＥＧＦ受容体アンタゴニストの有効性が、ＩＧＦシステムを介した耐性の急速な出現により限定されることが最近示されている。ＩＧＦシステムに干渉する治療薬の発見または開発は、ほとんどのＩＧＦ−Ｉ受容体が、ＩＧＦ−ＩＩとインスリンの両方と高親和性で結合するインスリン受容体のアイソフォームであるＩＲ−Ａとハイブリッド受容体を形成するように見える所見により複雑となっている。したがって、チロシンキナーゼ阻害剤または抗体によるＩＧＦ−ＩＲの治療標的化はインスリンシグナル伝達も遮断して糖尿病を引き起こし得るものであり、最近の報告においてこれが実際に起こることが示されている。霊長類試験におけるＩＧＦ−ＩＲ低分子キナーゼアンタゴニストの毒性問題も報告されている。
正常な循環において、９５％のＩＧＦ−ＩおよびＩＩが６つの高親和性ＩＧＦ結合タンパク質（ＩＧＦＢＰ）と結合している。主な血清結合タンパク質は、ＩＧＦＢＰ−３であり、これは酸不安定（ａｃｉｄ ｌａｂｉｌｅ）タンパク質（ＡＬＳ）と三量体複合体を形成する。通常は、ＩＧＦ−ＩＩは、ｐｒｏ−ＩＧＦ−ＩＩとして知られる１５６個のアミノ酸（ａａ）の前駆体タンパク質として合成される。タンパク質はＥドメインとして知られる８７個のａａのＣ末端領域を含み、したがって「ＩＧＦ−ＩＩＥ」と呼ばれる。本明細書において、アミノ酸１〜１０４を含む構築物は、Ｅドメインを包含し、「ＩＧＦ−ＩＩＥ」と呼ばれる。タンパク質分解過程は６７個のａａの成熟ＩＧＦ−ＩＩポリペプチドを放出する。文献において、ＩＧＦ−ＩＩの「長い」または「大きい」形態とは、時折、Ｅドメインの一部のみが切断されている形態を指す。時折、この長いまたは大きい形態は、完全なＥドメインではなくＥドメインの一部のみを含み得るものであってもまた、ＩＧＦ−ＩＩＥと呼ばれる。
多くの腫瘍において、主にゲノムレベルのインプリンティングの消失に起因する、増大したＩＧＦ−ＩＩ産生、または遊離ＩＧＦ−ＩＩの増大した生物学的利用能を可能とする腫瘍により産生される増大したプロテアーゼ活性に起因する、低減レベルの結合タンパク質が存在する。最近のＩＧＦ ＩＩマウスモデルにおいて、Ａｐｃ＋／Ｍｉｎマウスと交配したインプリンティング特性を消失した仔マウスでは非常に高まった腫瘍形成が示されている。多くの腫瘍はＩＧＦ−ＩＩＥを成熟７．５ＫＤａタンパク質にプロセシングするための酵素的機構を欠き、主にＩＧＦ−ＩＩＥを分泌する。この長いＩＧＦ−ＩＩリガンド（アミノ酸１〜１０４）は、カルボキシ末端での２１個のアミノ酸の伸長およびトレオニン７５位での不完全なグリコシル化を有すためにＡＬＳと結合できず、より多くの「遊離ＩＧＦ−ＩＩ」がＩＲまたはＩＧＦ−ＩＲを活性化して腫瘍性増殖を増強し、一部の癌において低血糖症を引き起こす。
肺線維芽細胞はＩＧＦ−ＩＩの主要源であるように見え、正常な肺線維芽細胞と比較して、全身性強皮症（ＳＳｃ）肺由来の一次肺線維芽細胞におけるＩＧＦ−ＩＩ ＲＮＡおよびタンパク質の発現は有意に増大する。さらに、一次ＳＳｃ肺線維芽細胞は正常な肺線維芽細胞と比較して約４倍増大したＩＧＦ−ＩＩ ｍＲＮＡおよび２倍増大したＩＧＦ−ＩＩタンパク質を有する。ＳＳｃ肺線維芽細胞中のＩＧＦ−ＩＩ ｍＲＮＡは主にＩＧＦ−ＩＩ遺伝子のＰ３プロモーターから発現し、ＩＧＦ−ＩＩはコラーゲンＩ型およびフィブロネクチン産生の用量依存的かつ時間依存的な増大を誘発する。ＩＧＦ−ＩＩは、ホスファチジルイノシトール−３（ＰＩ３）キナーゼおよびＪｕｎ Ｎ末端キナーゼ（ＪＮＫ）シグナル伝達カスケードの両方の活性化、および肺線維芽細胞中のＡｋｔリン酸化を引き起こし得る。ＰＩ３キナーゼおよびＪＮＫの阻害剤はＩＧＦ−ＩＩ誘発性のコラーゲンおよびフィブロネクチン産生を阻止し得る。ＳＳｃ肺線維芽細胞へのＩＧＦ−ＩＩの添加は、コラーゲン（例えば、コラーゲンＩ）およびフィブロネクチン産生を（例えば、用量依存的に）有意に増大できる一方、正常な肺線維芽細胞においては細胞外マトリックス（ＥＣＭ）産生をごく僅かに改変するのみである。正常な肺線維芽細胞と比較して、ＳＳｃ肺線維芽細胞は、１０ｎｇ／ｍｌ以上のＩＧＦ−ＩＩを外因的に添加した時にコラーゲンＩ型を、１００ｎｇ／ｍｌ以上のＩＧＦ−ＩＩを外因的に添加した時にフィブロネクチンを、統計的により多く産生し得る。
全身性強皮症に伴う肺線維症の特質である、増大したコラーゲンおよび／またはフィブロネクチンの産生は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはあるいはＩＧＦ−ＩＩＥ（長いＩＧＦ−ＩＩ）と、ＩＧＦ受容体、例えば、ＩＧＦ−Ｉ受容体との相互作用を阻止することにより阻害され得る。
全身性強皮症（ＳＳｃ）に伴う肺線維症の治療上の処置（例えば、免疫治療上の処置）は、治療薬（例えば、サイトカイン、抗体または抗体様部分）が肺線維芽細胞、例えば、ＳＳｃ肺における肺線維芽細胞、または線維芽細胞巣に対して高度に特異的であり得るため、免疫抑制剤および／または外科手術などの従来療法に勝る利点を提供できる。ＩＧＦ−ＩＩを標的とする治療薬は、このリガンドの作用を、ＩＲの下方制御ならびに低血糖症および／もしくは糖尿病の潜在的リスクを引き起こさずにＩＧＦ−Ｉ受容体およびＩＲ−Ａの両方に対する結合を阻害することにより、阻止し得る。ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥに特異的に結合する結合タンパク質、例えば、抗体の出現は、キナーゼアンタゴニストにより示される毒性の問題も緩和する。さらに、ＩＧＦ−ＩＩＥのみを標的とし、ＩＧＦ−ＩＩは標的としない治療薬も価値がある。
したがって、本開示は、とりわけ、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法に関し、この方法はＩＧＦ ＩＩおよび／またはＩＧＦ ＩＩＥと結合する単離タンパク質（例えば、抗体、例えば、ヒト抗体）を対象に投与することを含み、前記抗体はＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体と同一のエピトープと結合するか、またはＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体と結合について競合する。
いくつかの実施形態では、抗体はＤＸ−２６４７と競合するか、またはＤＸ−２６４７と同一のエピトープと結合する。
いくつかの実施形態では、抗体はＭ００６４−Ｆ０２と競合するか、またはＭ００６４−Ｆ０２と同一のエピトープと結合する。
いくつかの態様では、本開示は、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法を提供し、この方法は免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列および免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列を含む単離タンパク質（例えば、抗体、例えば、ヒト抗体）を対象に投与することを含み、ここで
前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列は、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の重鎖可変ドメイン由来の１つ、２つ、もしくは３つ（例えば、３つ）のＣＤＲ領域を含み、ならびに／または
前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列は、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の軽鎖可変ドメイン由来の１つ、２つ、もしくは３つ（例えば、３つ）のＣＤＲ領域を含み（それぞれ）、ならびに
前記タンパク質がＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合する（例えば、およびそれらを阻害する）。
いくつかの実施形態では、重鎖可変ドメイン由来の１つ、２つ、もしくは３つ（例えば、３つ）のＣＤＲ領域はＤＸ−２６４７由来であり、および／または軽鎖可変ドメイン由来の１つ、２つ、もしくは３つ（例えば、３つ）のＣＤＲ領域はＤＸ−２６４７由来である。
いくつかの実施形態では、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列は、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の重鎖可変ドメインを含み、および／または免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列はＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の軽鎖可変ドメインを含む（それぞれ）。
いくつかの実施形態では、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列はＤＸ−２６４７の重鎖可変ドメインを含み、および／または免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列はＤＸ−２６４７の軽鎖可変ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の重鎖、および／またはＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の軽鎖を含む（それぞれ）。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖、および／またはＤＸ−２６４７の軽鎖を含む。
いくつかの態様では、本開示は、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法を提供し、この方法は免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列および免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列を含む単離タンパク質（例えば、抗体、例えば、ヒト抗体）を対象に投与することを含み、ここで
前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列は、Ｍ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖可変ドメイン由来の１つ、２つ、もしくは３つ（例えば、３つ）のＣＤＲ領域を含み、ならびに／または
前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列は、Ｍ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖可変ドメイン由来の１つ、２つ、もしくは３つ（例えば、３つ）のＣＤＲ領域を含み（それぞれ）、ならびに
前記タンパク質はＩＧＦ−ＩＩＥとは結合する（例えば、およびそれを阻害する）がＩＧＦ−ＩＩとは結合しない。
いくつかの実施形態では、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列はＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖可変ドメインを含み、および／または免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列はＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の軽鎖可変ドメインを含む（それぞれ）。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、Ｍ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖、および／またはＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の軽鎖を含む（それぞれ）。
いくつかの態様では、本開示は、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法を提供し、この方法は以下のコンセンサス配列またはその機能的断片と特異的に結合することができる単離タンパク質（例えば、抗体、例えば、ヒト抗体）を対象に投与することを含む：
Figure 2012505900
Ｘは任意のアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、以下のコンセンサス配列またはその機能的断片と特異的に結合することができる。
Figure 2012505900
いくつかの実施形態では、タンパク質は、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列および免疫グロブリン軽鎖可変ドメインを含み、ここで
前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列は、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の重鎖可変ドメイン由来の１つ、２つ、もしくは３つ（例えば、３つ）のＣＤＲ領域を含み、ならびに／または
前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列は、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の軽鎖可変ドメインの由来の１つ、２つ、または３つ（例えば、３つ）のＣＤＲ領域を含み（それぞれ）、ならびに
前記タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合する（例えば、およびそれらを阻害する）。
いくつかの実施形態では、重鎖可変ドメイン由来の１つ、２つ、もしくは３つ（例えば、３つ）のＣＤＲ領域はＤＸ−２６４７由来でありおよび／または軽鎖可変ドメイン由来の１つ、２つ、もしくは３つ（例えば、３つ）のＣＤＲ領域はＤＸ−２６４７由来である。
いくつかの実施形態では、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列は、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の重鎖可変ドメインを含み、および／または免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列はＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の軽鎖可変ドメインを含む（それぞれ）。
いくつかの実施形態では、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列はＤＸ−２６４７の重鎖可変ドメインを含み、および／または免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列はＤＸ−２６４７の軽鎖可変ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の重鎖、および／またはＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の軽鎖を含む（それぞれ）。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖、および／またはＤＸ−２６４７の軽鎖を含む。
本開示は、とりわけ、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法に関し、この方法はＩＧＦ ＩＩおよび／またはＩＧＦ ＩＩＥと結合する単離タンパク質（例えば、本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質）を対象に投与することを含み、例えば、ここでタンパク質のＩＧＦ ＩＩおよび／またはＩＧＦ ＩＩＥへの結合は少なくとも１０９Ｍ−１の親和性を特徴とする。
いくつかの実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を第二治療薬と併用して使用する。いくつかの実施形態では、第二治療薬は、別のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質、例えば、本明細書に記載の別のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、第二治療薬は、抗炎症剤（例えば、ステロイド）、細胞傷害性薬物、免疫抑制剤、コラーゲン合成阻害剤、またはエンドセリン受容体アンタゴニストである。例えば、高用量の経口コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン、４０〜８０ｍｇ／日）などの経口コルチコステロイドを使用できる。シクロホスファミドなどの細胞傷害性薬物およびアザチオプリンなどの免疫抑制剤（シクロホスファミドは、免疫抑制剤でもある）；またはピルフェニドンなどのコラーゲン合成阻害剤もしくはボセンタンなどのエンドセリン受容体アンタゴニストを第二薬として使用できる。好ましい実施形態では、第二薬は、シクロホスファミドまたはアザチオプリンである。好ましい実施形態では、第二薬は、低用量ステロイド；エポプロステノール；ボセンタン；またはイロプロスト（例えばエーロゾル化イロプロスト）と併用したシクロホスファミドである。いくつかの実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を外科手術、例えば、肺移植と併用して使用する。いくつかの実施形態では、第二薬は、抗炎症剤、例えば、ステロイド（例えば、コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン））、細胞傷害性薬物（例えば、シクロホスファミド）、免疫抑制剤（例えば、シクロホスファミドまたはアザチオプリン）、コラーゲン合成阻害剤（例えば、ピルフェニドン）、またはエンドセリン受容体アンタゴニスト（例えば、ボセンタン）などのＳＳｃに伴う肺線維症のための別の治療である。
いくつかの実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、コラーゲンおよび／またはフィブロネクチン産生を基準値、例えば、治療前の対象のコラーゲンおよび／またはフィブロネクチン産生と比較して約５％、約１０％、約１５％、約２０％、約２５％、約３０％、約３５％、約４０％、約４５％、約５０％、約５５％、約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、または約９５％超低減する。
タンパク質は、１つ以上の以下の特徴を含み得る：（ａ）ヒトＣＤＲまたはヒトフレームワーク領域；（ｂ）免疫グロブリンＨＣ可変ドメイン配列が、本明細書に記載のＨＣ可変ドメインのＣＤＲと少なくとも８５、８８、９０、９２、９４、９５、９６、９７、９８、９９、もしくは１００％同一であるＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）含むこと；（ｃ）免疫グロブリンＬＣ可変ドメイン配列が、本明細書に記載のＬＣ可変ドメインのＣＤＲと少なくとも８５、８８、９０、９２、９４、９５、９６、９７、９８、９９、もしくは１００％同一であるＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）含むこと；（ｄ）免疫グロブリンＬＣ可変ドメイン配列が、本明細書に記載のＬＣ可変ドメインと少なくとも８５、８８、９０、９２、９４、９５、９６、９７、９８、９９、もしくは１００％同一であること；（ｅ）免疫グロブリンＨＣ可変ドメイン配列が、本明細書に記載のＨＣ可変ドメインと少なくとも８５、８８、９０、９２、９４、９５、９６、９７、９８、９９、もしくは１００％同一であること；（ｆ）前記タンパク質が、本明細書に記載のタンパク質によって結合されるエピトープ、もしくはかかるエピトープと重複するエピトープと結合すること；ならびに（ｇ）霊長類ＣＤＲもしくは霊長類フレームワーク領域。
タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ（例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ）と、少なくとも１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０および１０１１Ｍ−１の結合親和性で結合できる。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０−３、５×１０−４ｓ−１、または１×１０−４ｓ−１より遅いＫｏｆｆで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０２、１×１０３、または５×１０３Ｍ−１ｓ−１より速いＫｏｎで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩ活性とヒトＩＧＦ−ＩＩＥ活性の両方を、例えば、１０−５、１０−６、１０−７、１０−８、１０−９、および１０−１０Ｍ未満のＫｉで阻害する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩ活性またはヒトＩＧＦ−ＩＩＥ活性のいずれかを、例えば、１０−５、１０−６、１０−７、１０−８、１０−９、および１０−１０Ｍ未満のＫｉで阻害する。タンパク質は、例えば、１００ｎＭ、１０ｎＭまたは１ｎＭ未満のＩＣ５０を有し得る。例えば、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／もしくはＩＧＦ−ＩＩＥのみならず、ＩＧＦ−Ｉ受容体（ＩＧＦ−１Ｒ）活性および／もしくはインスリン受容体のアイソフォーム（ＩＲ−Ａ）活性を調節し得る。タンパク質はＩＧＦ−１Ｒ、ＩＲ−Ａ、ならびにＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ活性を阻害し得る。ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥに対するタンパク質の親和性は１００ｎｍ未満、１０ｎＭ未満、または１ｎＭ未満のＫＤを特徴とし得る。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖および重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖および重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる重鎖の群の対応するＣＤＲから選択される重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる軽鎖の群の対応するＣＤＲから選択される軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる重鎖の群の対応するＣＤＲから選択される重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）ならびにＭ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる軽鎖の群の対応するＣＤＲから選択される軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）（それぞれ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖および重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７から選択される抗体の軽鎖および重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖の対応するＣＤＲ由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）ならびにＤＸ−２６４７の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖および重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５から選択される抗体の軽鎖および重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖の対応するＣＤＲ由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）およびＤＸ−２６５５の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は同一ポリペプチド鎖の成分である。別の実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は異なるポリペプチド鎖の成分である。例えば、タンパク質は、ＩｇＧ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４）である。タンパク質は、可溶性Ｆａｂ（ｓＦａｂ）であり得る。他の実施形態では、タンパク質は、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ミニボディ、ｓｃＦｖ：：Ｆｃ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ融合物、ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、または本明細書の結合タンパク質の１つの抗原結合部位を含む他の分子を含む。これらＦａｂのＶＨおよびＶＬ領域は、ＩｇＧ、Ｆａｂ、Ｆａｂ２、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ、ＰＥＧ化ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ２、ＶＨ：：ＣＨ１：：ＨＳＡ＋ＬＣ、ＨＳＡ：：ＶＨ：：ＣＨ１＋ＬＣ、ＬＣ：：ＨＳＡ＋ＶＨ：：ＣＨ１、ＨＳＡ：：ＬＣ＋ＶＨ：：ＣＨ１、または他の適切な構築物として提供できる。
１つの実施形態では、タンパク質は、ヒト抗体またはヒト化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上のヒト抗体フレームワーク領域（例えば、すべてのヒトフレームワーク領域）を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＦｃドメインを含むか、またはヒトＦｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、もしくは９９％同一であるＦｃドメインを含む。
１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類抗体または霊長類化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上の霊長類抗体フレームワーク領域、例えば、すべての霊長類フレームワーク領域を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類Ｆｃドメインを含むか、または霊長類Ｆｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、または９９％同一であるＦｃドメインを含む。「霊長類」は、ヒト（Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ）、チンパンジー（Ｐａｎ ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓおよびＰａｎ ｐａｎｉｓｃｕｓ（ボノボ）)、ゴリラ（Ｇｏｒｉｌｌａ ｇｏｒｉｌｌａ）、テナガザル、サル、キツネザル、アイアイ（Ｄａｕｂｅｎｔｏｎｉａ ｍａｄａｇａｓｃａｒｉｅｎｓｉｓ）、およびメガネザルを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥに対する霊長類抗体の親和性は１ｎＭ未満のＫＤを特徴とする。
ある実施形態では、タンパク質は、マウスまたはウサギ由来の配列を含まない（例えば、マウスまたはウサギ抗体ではない）。
ある実施形態では、タンパク質は、（例えば、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥを発現する）肺線維芽細胞、または線維芽細胞巣と結合できる。
１つの実施形態では、タンパク質は、ナノ粒子と物理的に結合しており、細胞表面上にＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥを発現する細胞へとナノ粒子を誘導するために使用することができる。
他の態様では、本開示は、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法に関し、この方法は免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列および免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列を含む単離タンパク質を対象に投与することを含み、ここで
前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、もしくはＤＸ−２６５５の重鎖由来のＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）含み、ならびに／または
前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、もしくはＤＸ−２６５５の軽鎖由来のＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）含み（それぞれ）、ならびに
前記タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合し、かつＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方を阻害する。
いくつかの実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を第二治療薬と併用して使用する。いくつかの実施形態では、第二治療薬は、別のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質、例えば、本明細書に記載の別のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、第二治療薬は、抗炎症剤（例えば、ステロイド）、細胞傷害性薬物、免疫抑制剤、コラーゲン合成阻害剤、またはエンドセリン受容体アンタゴニストである。例えば、高用量の経口コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン、４０〜８０ｍｇ／日）を使用できる。シクロホスファミドなどの細胞傷害性薬物およびアザチオプリンなどの免疫抑制剤（シクロホスファミドは、免疫抑制剤でもある）；ピルフェニドンなどのコラーゲン合成阻害剤もしくはボセンタンなどのエンドセリン受容体アンタゴニストを第二薬として使用できる。好ましい実施形態では、第二薬は、シクロホスファミドまたはアザチオプリンである。好ましい実施形態では、第二薬は、低用量ステロイド；エポプロステノール；ボセンタン；またはイロプロスト（例えばエーロゾル化イロプロスト）と併用したシクロホスファミドである。いくつかの実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を外科手術、例えば、肺移植と併用して使用する。いくつかの実施形態では、第二薬は、抗炎症剤、例えば、ステロイド（例えば、コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン））、細胞傷害性薬物（例えば、シクロホスファミド）、免疫抑制剤（例えば、シクロホスファミドまたはアザチオプリン）、コラーゲン合成阻害剤（例えば、ピルフェニドン）、またはエンドセリン受容体アンタゴニスト（例えば、ボセンタン）などのＳＳｃに伴う肺線維症のための別の治療である。
いくつかの実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質はコラーゲンおよび／またはフィブロネクチン産生を基準値、例えば、対象の治療前のコラーゲンおよび／またはフィブロネクチン産生と比較して約５％、約１０％、約１５％、約２０％、約２５％、約３０％、約３５％、約４０％、約４５％、約５０％、約５５％、約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、または約９５％超低減する。
タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ（例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ）と、少なくとも１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０および１０１１Ｍ−１の結合親和性で結合できる。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０−３、５×１０−４ｓ−１、または１×１０−４ｓ−１より遅いＫｏｆｆで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０２、１×１０３、または５×１０３Ｍ−１ｓ−１より速いＫｏｎで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩ活性とヒトＩＧＦ−ＩＩＥ活性の両方を、例えば、１０−５、１０−６、１０−７、１０−８、１０−９、および１０−１０Ｍ未満のＫｉで阻害する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩ活性またはヒトＩＧＦ−ＩＩＥ活性のいずれかを、例えば、１０−５、１０−６、１０−７、１０−８、１０−９、および１０−１０Ｍ未満のＫｉで阻害する。タンパク質は、例えば、１００ｎＭ、１０ｎＭまたは１ｎＭ未満のＩＣ５０を有し得る。例えば、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／もしくはＩＧＦ−ＩＩＥのみならず、ＩＧＦ−Ｉ受容体（ＩＧＦ−１Ｒ）活性および／もしくはインスリン受容体のアイソフォーム（ＩＲ−Ａ）活性を調節し得る。タンパク質はＩＧＦ−１Ｒ、ＩＲ−Ａ、ならびにＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ活性を阻害し得る。ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥに対するタンパク質の親和性は１００ｎｍ未満、１０ｎＭ未満、または１ｎＭ未満のＫＤを特徴とし得る。
タンパク質は、１つ以上の以下の特徴を含み得る：（ａ）ヒトＣＤＲまたはヒトフレームワーク領域；（ｂ）前記タンパク質が、本明細書に記載のタンパク質によって結合されるエピトープ、もしくはかかるエピトープと重複するエピトープと結合すること；ならびに（ｃ）霊長類ＣＤＲもしくは霊長類フレームワーク領域。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖および重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖および重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる重鎖の群の対応するＣＤＲから選択される重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる軽鎖の群の対応するＣＤＲから選択される軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる軽鎖の群の対応するＣＤＲから選択される軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）ならびに重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖および重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７から選択される抗体の軽鎖および重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖の対応するＣＤＲ由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）およびＤＸ−２６４７の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖および重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５から選択される抗体の軽鎖および重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖の対応するＣＤＲ由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）およびＤＸ−２６５５の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は同一ポリペプチド鎖の成分である。別の実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は異なるポリペプチド鎖の成分である。例えば、タンパク質は、ＩｇＧ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４）である。タンパク質は、可溶性Ｆａｂ（ｓＦａｂ）であり得る。他の実施形態では、タンパク質は、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ミニボディ、ｓｃＦｖ：：Ｆｃ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ融合物、ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、または本明細書の結合タンパク質の１つの抗原結合部位を含む他の分子を含む。これらＦａｂのＶＨおよびＶＬ領域は、ＩｇＧ、Ｆａｂ、Ｆａｂ２、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ、ＰＥＧ化ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ２、ＶＨ：：ＣＨ１：：ＨＳＡ＋ＬＣ、ＨＳＡ：：ＶＨ：：ＣＨ１＋ＬＣ、ＬＣ：：ＨＳＡ＋ＶＨ：：ＣＨ１、ＨＳＡ：：ＬＣ＋ＶＨ：：ＣＨ１、または他の適切な構築物として提供できる。
１つの実施形態では、タンパク質は、ヒト抗体またはヒト化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上のヒト抗体フレームワーク領域（例えば、すべてのヒトフレームワーク領域）を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＦｃドメインを含むか、またはヒトＦｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、もしくは９９％同一であるＦｃドメインを含む。
１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類抗体または霊長類化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上の霊長類抗体フレームワーク領域、例えば、すべての霊長類フレームワーク領域を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類Ｆｃドメインを含むか、または霊長類Ｆｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、または９９％同一であるＦｃドメインを含む。「霊長類」は、ヒト（Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ）、チンパンジー（Ｐａｎ ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓおよびＰａｎ ｐａｎｉｓｃｕｓ（ボノボ）)、ゴリラ（Ｇｏｒｉｌｌａ ｇｏｒｉｌｌａ）、テナガザル、サル、キツネザル、アイアイ（Ｄａｕｂｅｎｔｏｎｉａ ｍａｄａｇａｓｃａｒｉｅｎｓｉｓ）、およびメガネザルを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥに対する霊長類抗体の親和性は１ｎＭ未満のＫＤを特徴とする。
ある実施形態では、タンパク質は、マウスまたはウサギ由来の配列を含まない（例えば、マウスまたはウサギ抗体ではない）。
ある実施形態では、タンパク質は、（例えば、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥを発現する）肺線維芽細胞、または線維芽細胞巣と結合できる。
１つの実施形態では、タンパク質は、ナノ粒子と物理的に結合しており、細胞表面上にＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥを発現する細胞へとナノ粒子を誘導するために使用することができる。
別の態様では、本開示は、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法に関し、この方法は以下を含む単離タンパク質（例えば、抗体、例えば、ヒト抗体）を対象に投与することを含む：
（ｉ）重鎖配列がＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖のアミノ酸配列を含み、および／または軽鎖配列がＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の軽鎖のアミノ酸配列を含む（それぞれ）、重鎖配列および／または軽鎖配列、
（ｉｉ）重鎖可変ドメイン配列がＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖可変ドメインのアミノ酸配列を含み、および／または軽鎖可変ドメイン配列がＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の軽鎖可変ドメインのアミノ酸配列を含む（それぞれ）、重鎖可変ドメイン配列および／または軽鎖可変ドメイン配列、または
（ｉｉｉ）抗体Ｍ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖ＣＤＲの１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）、および／または抗体Ｍ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の対応するＣＤＲから選択される軽鎖ＣＤＲの１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）（それぞれ）、
ならびに前記タンパク質はＩＧＦ−ＩＩＥと結合し、かつＩＧＦ−ＩＩＥを阻害するが、ＩＧＦ−ＩＩとは結合せず、阻害しない。
いくつかの実施形態では、タンパク質を第二治療薬と併用して使用する。いくつかの実施形態では、第二治療薬は、別のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質、例えば、本明細書に記載の別のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、第二治療薬は、抗炎症剤（例えば、ステロイド）、細胞傷害性薬物、免疫抑制剤、コラーゲン合成阻害剤、またはエンドセリン受容体アンタゴニストである。例えば、高用量の経口コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン、４０〜８０ｍｇ／日）を使用できる。シクロホスファミドなどの細胞傷害性薬物およびアザチオプリンなどの免疫抑制剤（シクロホスファミドは、免疫抑制剤でもある）；ピルフェニドンなどのコラーゲン合成阻害剤またはボセンタンなどのエンドセリン受容体アンタゴニストを第二薬として使用できる。好ましい実施形態では、第二薬はシクロホスファミドまたはアザチオプリンである。好ましい実施形態では、第二薬は、低用量ステロイド；エポプロステノール；ボセンタン；またはイロプロスト（例えばエーロゾル化イロプロスト）と併用したシクロホスファミドである。いくつかの実施形態では、タンパク質を外科手術、例えば、肺移植と併用して使用する。いくつかの実施形態では、第二薬は、抗炎症剤、例えば、ステロイド（例えば、コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン））、細胞傷害性薬物（例えば、シクロホスファミド）、免疫抑制剤（例えば、シクロホスファミドまたはアザチオプリン）、コラーゲン合成阻害剤（例えば、ピルフェニドン）、またはエンドセリン受容体アンタゴニスト（例えば、ボセンタン）などのＳＳｃに伴う肺線維症のための別の治療である。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、コラーゲンおよび／またはフィブロネクチン産生を、基準値、例えば、治療前の対象のコラーゲンおよび／またはフィブロネクチン産生と比較して約５％、約１０％、約１５％、約２０％、約２５％、約３０％、約３５％、約４０％、約４５％、約５０％、約５５％、約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、または約９５％超低減する。
タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩＥ、例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩＥと、少なくとも１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０および１０１１Ｍ−１の結合親和性で結合できる。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０−３、５×１０−４ｓ−１、または１×１０−４ｓ−１より遅いＫｏｆｆで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０２、１×１０３、または５×１０３Ｍ−１ｓ−１より速いＫｏｎで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩＥ活性を、例えば、１０−５、１０−６、１０−７、１０−８、１０−９、および１０−１０Ｍ未満のＫｉで阻害する。タンパク質は、例えば、１００ｎＭ、１０ｎＭまたは１ｎＭ未満のＩＣ５０を有し得る。例えば、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩＥのみならず、ＩＧＦ−Ｉ受容体（ＩＧＦ−１Ｒ）活性および／またはインスリン受容体のアイソフォーム（ＩＲ−Ａ）活性を調節し得る。タンパク質はＩＧＦ−１Ｒ、ＩＲ−Ａ、およびＩＧＦ−ＩＩＥ活性を阻害し得る。ヒトＩＧＦ−ＩＩＥに対するタンパク質の親和性は１００ｎｍ未満、１０ｎＭ未満、または１ｎＭ未満のＫＤを特徴とし得る。
タンパク質は、１つ以上の以下の特徴を含み得る：（ａ）ヒトＣＤＲまたはヒトフレームワーク領域；（ｂ）前記タンパク質が、本明細書に記載のタンパク質によって結合されるエピトープ、もしくはかかるエピトープと重複するエピトープと結合すること；ならびに（ｃ）霊長類ＣＤＲもしくは霊長類フレームワーク領域。
１つの実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は同一ポリペプチド鎖の成分である。別の実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は異なるポリペプチド鎖の成分である。例えば、タンパク質は、ＩｇＧ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４）である。タンパク質は、可溶性Ｆａｂ（ｓＦａｂ）であり得る。他の実施形態では、タンパク質は、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ミニボディ、ｓｃＦｖ：：Ｆｃ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ融合物、ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、または本明細書の結合タンパク質の１つの抗原結合部位を含む他の分子を含む。これらＦａｂのＶＨおよびＶＬ領域は、ＩｇＧ、Ｆａｂ、Ｆａｂ２、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ、ＰＥＧ化ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ２、ＶＨ：：ＣＨ１：：ＨＳＡ＋ＬＣ、ＨＳＡ：：ＶＨ：：ＣＨ１＋ＬＣ、ＬＣ：：ＨＳＡ＋ＶＨ：：ＣＨ１、ＨＳＡ：：ＬＣ＋ＶＨ：：ＣＨ１、または他の適切な構築物として提供できる。
１つの実施形態では、タンパク質は、ヒト抗体またはヒト化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上のヒト抗体フレームワーク領域（例えば、すべてのヒトフレームワーク領域）を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＦｃドメインを含むか、またはヒトＦｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、もしくは９９％同一であるＦｃドメインを含む。
１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類抗体または霊長類化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上の霊長類抗体フレームワーク領域、例えば、すべての霊長類フレームワーク領域を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類Ｆｃドメインを含むか、または霊長類Ｆｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、または９９％同一であるＦｃドメインを含む。「霊長類」は、ヒト（Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ）、チンパンジー（Ｐａｎ ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓおよびＰａｎ ｐａｎｉｓｃｕｓ（ボノボ）)、ゴリラ（Ｇｏｒｉｌｌａ ｇｏｒｉｌｌａ）、テナガザル、サル、キツネザル、アイアイ（Ｄａｕｂｅｎｔｏｎｉａ ｍａｄａｇａｓｃａｒｉｅｎｓｉｓ）、およびメガネザルを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＩＧＦ−ＩＩＥに対する霊長類抗体の親和性は１ｎＭ未満のＫＤを特徴とする。
ある実施形態では、タンパク質は、マウスまたはウサギ由来の配列を含まない（例えば、マウスまたはウサギ抗体ではない）。
ある実施形態では、タンパク質は、（例えば、ＩＧＦ−ＩＩＥを発現する）肺線維芽細胞、または線維芽細胞巣と結合できる。
１つの実施形態では、タンパク質は、ナノ粒子と物理的に結合しており、細胞表面上にＩＧＦ−ＩＩＥを発現する細胞へとナノ粒子を誘導するために使用することができる。
いくつかの態様では、本開示は、以下を含む単離タンパク質（例えば、抗体、例えば、ヒト抗体）を特徴とする：
（ｉ）重鎖配列がＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖アミノ酸配列を含み、および／または軽鎖配列がＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の軽鎖アミノ酸配列を含む（それぞれ）、重鎖配列および／または軽鎖配列、
（ｉｉ）重鎖可変ドメイン配列がＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖可変ドメインのアミノ酸配列を含み、および／または軽鎖可変ドメイン配列がＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の軽鎖可変ドメインのアミノ酸配列を含む（それぞれ）、重鎖可変ドメイン配列および／または軽鎖可変ドメイン配列、または
（ｉｉｉ）抗体Ｍ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖ＣＤＲの１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）、および／または抗体Ｍ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の対応するＣＤＲから選択される軽鎖ＣＤＲの１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）（それぞれ）。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩＥと結合し、かつＩＧＦ−ＩＩＥを阻害するが、ＩＧＦ−ＩＩとは結合せず、阻害しない。
タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩＥ、例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩＥと、少なくとも１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０および１０１１Ｍ−１の結合親和性で結合できる。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０−３、５×１０−４ｓ−１、または１×１０−４ｓ−１より遅いＫｏｆｆで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０２、１×１０３、または５×１０３Ｍ−１ｓ−１より速いＫｏｎで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、例えば、１０−５、１０−６、１０−７、１０−８、１０−９、および１０−１０Ｍ未満のＫｉでヒトＩＧＦ−ＩＩＥ活性を阻害する。タンパク質は、例えば、１００ｎＭ、１０ｎＭまたは１ｎＭ未満のＩＣ５０を有し得る。例えば、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩＥのみならず、ＩＧＦ−Ｉ受容体（ＩＧＦ−１Ｒ）活性および／またはインスリン受容体のアイソフォーム（ＩＲ−Ａ）活性を調節し得る。タンパク質はＩＧＦ−１Ｒ、ＩＲ−Ａ、およびＩＧＦ−ＩＩＥ活性を阻害し得る。ヒトＩＧＦ−ＩＩＥに対するタンパク質の親和性は１００ｎｍ未満、１０ｎＭ未満、または１ｎＭ未満のＫＤを特徴とし得る。
タンパク質は、１つ以上の以下の特徴を含み得る：（ａ）ヒトＣＤＲまたはヒトフレームワーク領域；（ｂ）前記タンパク質が、本明細書に記載のタンパク質によって結合されるエピトープ、もしくはかかるエピトープと重複するエピトープと結合すること；ならびに（ｃ）霊長類ＣＤＲもしくは霊長類フレームワーク領域。
１つの実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は同一ポリペプチド鎖の成分である。別の実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は異なるポリペプチド鎖の成分である。例えば、タンパク質は、ＩｇＧ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４）である。タンパク質は、可溶性Ｆａｂ（ｓＦａｂ）であり得る。他の実施形態では、タンパク質は、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ミニボディ、ｓｃＦｖ：：Ｆｃ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ融合物、ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、または本明細書の結合タンパク質の１つの抗原結合部位を含む他の分子を含む。これらＦａｂのＶＨおよびＶＬ領域は、ＩｇＧ、Ｆａｂ、Ｆａｂ２、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ、ＰＥＧ化ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ２、ＶＨ：：ＣＨ１：：ＨＳＡ＋ＬＣ、ＨＳＡ：：ＶＨ：：ＣＨ１＋ＬＣ、ＬＣ：：ＨＳＡ＋ＶＨ：：ＣＨ１、ＨＳＡ：：ＬＣ＋ＶＨ：：ＣＨ１、または他の適切な構築物として提供できる。
１つの実施形態では、タンパク質は、ヒト抗体またはヒト化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上のヒト抗体フレームワーク領域（例えば、すべてのヒトフレームワーク領域）を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＦｃドメインを含むか、またはヒトＦｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、もしくは９９％同一であるＦｃドメインを含む。
１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類抗体または霊長類化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上の霊長類抗体フレームワーク領域、例えば、すべての霊長類フレームワーク領域を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類Ｆｃドメインを含むか、または霊長類Ｆｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、または９９％同一であるＦｃドメインを含む。「霊長類」は、ヒト（Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ）、チンパンジー（Ｐａｎ ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓおよびＰａｎ ｐａｎｉｓｃｕｓ（ボノボ）)、ゴリラ（Ｇｏｒｉｌｌａ ｇｏｒｉｌｌａ）、テナガザル、サル、キツネザル、アイアイ（Ｄａｕｂｅｎｔｏｎｉａ ｍａｄａｇａｓｃａｒｉｅｎｓｉｓ）、およびメガネザルを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＩＧＦ−ＩＩＥに対する霊長類抗体の親和性は１ｎＭ未満のＫＤを特徴とする。
ある実施形態では、タンパク質は、マウスまたはウサギ由来の配列を含まない（例えば、マウスまたはウサギ抗体ではない）。
ある実施形態では、タンパク質は、（例えば、ＩＧＦ−ＩＩＥを発現する）肺線維芽細胞、または線維芽細胞巣と結合できる。
１つの実施形態では、タンパク質は、ナノ粒子と物理的に結合しており、細胞表面上にＩＧＦ−ＩＩＥを発現する細胞へとナノ粒子を誘導するために使用することができる。
他の態様では、本開示は、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法に関し、この方法は以下のコンセンサス配列またはその機能的断片と特異的に結合することができる単離タンパク質を対象に投与することを含む：
Figure 2012505900
Ｘは任意のアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、以下のコンセンサス配列またはその機能的断片と特異的に結合することができる。
Figure 2012505900
いくつかの実施形態では、タンパク質を第二治療薬と併用して使用する。いくつかの実施形態では、第二治療薬は、別のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質、例えば、本明細書に記載の別のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、第二治療薬は、抗炎症剤（例えば、ステロイド）、細胞傷害性薬物、免疫抑制剤、コラーゲン合成阻害剤、またはエンドセリン受容体アンタゴニストである。例えば、高用量の経口コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン、４０〜８０ｍｇ／日）を使用できる。シクロホスファミドなどの細胞傷害性薬物およびアザチオプリンなどの免疫抑制剤（シクロホスファミドは、免疫抑制剤でもある）；ピルフェニドンなどのコラーゲン合成阻害剤またはボセンタンなどのエンドセリン受容体アンタゴニストを第二薬として使用できる。好ましい実施形態では、第二薬は、シクロホスファミドまたはアザチオプリンである。好ましい実施形態では、第二薬は、低用量ステロイド；エポプロステノール；ボセンタン；またはイロプロスト（例えばエーロゾル化イロプロスト）と併用したシクロホスファミドである。いくつかの実施形態では、タンパク質を外科手術、例えば、肺移植と併用して使用する。いくつかの実施形態では、第二薬は、抗炎症剤、例えば、ステロイド（例えば、コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン））、細胞傷害性薬物（例えば、シクロホスファミド）、免疫抑制剤（例えば、シクロホスファミドまたはアザチオプリン）、コラーゲン合成阻害剤（例えば、ピルフェニドン）、またはエンドセリン受容体アンタゴニスト（例えば、ボセンタン）などのＳＳｃに伴う肺線維症のための別の治療である。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、コラーゲンおよび／またはフィブロネクチン産生を基準値、例えば、対象の治療前のコラーゲンおよび／またはフィブロネクチン産生と比較して約５％、約１０％、約１５％、約２０％、約２５％、約３０％、約３５％、約４０％、約４５％、約５０％、約５５％、約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、または約９５％超低減する。
タンパク質は、１つ以上の以下の特徴を含み得る：（ａ）ヒトＣＤＲまたはヒトフレームワーク領域；（ｂ）前記タンパク質が、本明細書に記載のタンパク質によって結合されるエピトープ、もしくはかかるエピトープと重複するエピトープと結合すること；ならびに（ｃ）霊長類ＣＤＲもしくは霊長類フレームワーク領域。
タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ（例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ）と、少なくとも１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０および１０１１Ｍ−１の結合親和性で結合できる。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０−３、５×１０−４ｓ−１、または１×１０−４ｓ−１より遅いＫｏｆｆで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０２、１×１０３、または５×１０３Ｍ−１ｓ−１より速いＫｏｎで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩ活性とヒトＩＧＦ−ＩＩＥ活性の両方を、例えば、１０−５、１０−６、１０−７、１０−８、１０−９、および１０−１０Ｍ未満のＫｉで阻害する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩ活性またはヒトＩＧＦ−ＩＩＥ活性のいずれかを、例えば、１０−５、１０−６、１０−７、１０−８、１０−９、および１０−１０Ｍ未満のＫｉで阻害する。タンパク質は、例えば、１００ｎＭ、１０ｎＭまたは１ｎＭ未満のＩＣ５０を有し得る。例えば、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／もしくはＩＧＦ−ＩＩＥのみならず、ＩＧＦ−Ｉ受容体（ＩＧＦ−１Ｒ）活性および／もしくはインスリン受容体のアイソフォーム（ＩＲ−Ａ）活性を調節し得る。タンパク質はＩＧＦ−１Ｒ、ＩＲ−Ａ、ならびにＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ活性を阻害し得る。ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥに対するタンパク質の親和性は１００ｎｍ未満、１０ｎＭ未満、または１ｎＭ未満のＫＤを特徴とし得る。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖および重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、および生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２からなる群から選択される抗体の重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖および重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる重鎖の群の対応するＣＤＲから選択される重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる軽鎖の群の対応するＣＤＲから選択される軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる軽鎖の群の対応するＣＤＲから選択される軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）ならびに重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖および重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７から選択される抗体の軽鎖および重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖の対応するＣＤＲ由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）ならびにＤＸ−２６４７の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖および重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５から選択される抗体の軽鎖および重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖の対応するＣＤＲ由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）およびＤＸ−２６５５の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの実施形態では、タンパク質は、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列を有する。いくつかの実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は同一ポリペプチド鎖の成分である。別の実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は異なるポリペプチド鎖の成分である。例えば、タンパク質は、ＩｇＧ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４）である。タンパク質は、可溶性Ｆａｂ（ｓＦａｂ）であり得る。他の実施形態では、タンパク質は、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ミニボディ、ｓｃＦｖ：：Ｆｃ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ融合物、ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、または本明細書の結合タンパク質の１つの抗原結合部位を含む他の分子を含む。これらＦａｂのＶＨおよびＶＬ領域は、ＩｇＧ、Ｆａｂ、Ｆａｂ２、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ、ＰＥＧ化ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ２、ＶＨ：：ＣＨ１：：ＨＳＡ＋ＬＣ、ＨＳＡ：：ＶＨ：：ＣＨ１＋ＬＣ、ＬＣ：：ＨＳＡ＋ＶＨ：：ＣＨ１、ＨＳＡ：：ＬＣ＋ＶＨ：：ＣＨ１、または他の適切な構築物として提供できる。
１つの実施形態では、タンパク質は、ヒト抗体またはヒト化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上のヒト抗体フレームワーク領域（例えば、すべてのヒトフレームワーク領域）を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＦｃドメインを含むか、またはヒトＦｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、もしくは９９％同一であるＦｃドメインを含む。
１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類抗体または霊長類化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上の霊長類抗体フレームワーク領域、例えば、すべての霊長類フレームワーク領域を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類Ｆｃドメインを含むか、または霊長類Ｆｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、または９９％同一であるＦｃドメインを含む。「霊長類」は、ヒト（Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ）、チンパンジー（Ｐａｎ ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓおよびＰａｎ ｐａｎｉｓｃｕｓ（ボノボ）)、ゴリラ（Ｇｏｒｉｌｌａ ｇｏｒｉｌｌａ）、テナガザル、サル、キツネザル、アイアイ（Ｄａｕｂｅｎｔｏｎｉａ ｍａｄａｇａｓｃａｒｉｅｎｓｉｓ）、およびメガネザルを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥに対する霊長類抗体の親和性は１ｎＭ未満のＫＤを特徴とする。
ある実施形態では、タンパク質は、マウスまたはウサギ由来の配列を含まない（例えば、マウスまたはウサギ抗体ではない）。
ある実施形態では、タンパク質は、（例えば、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥを発現する）肺線維芽細胞、または線維芽細胞巣と結合できる。
１つの実施形態では、タンパク質は、ナノ粒子と物理的に結合しており、細胞表面上にＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥを発現する細胞へとナノ粒子を誘導するために使用することができる。
いくつかの態様では、本開示は、全身性強皮症に伴う肺線維症の治療および／または予防のために、本明細書において「ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質」と呼ばれるＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方またはいずれかと結合するタンパク質を使用する方法を提供する。これらのタンパク質は、結果的に例えば、ＩＧＦ−１Ｒおよび／もしくはインスリン受容体のアイソフォーム（ＩＲ−Ａ）と結合するＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合するならびに／またはＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方を阻害する抗体および抗体断片（例えば、霊長類抗体およびＦａｂ、特にヒト抗体およびＦａｂ）を含む。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥの過剰なまたは不適切な活性を特徴とする疾患、特にヒト疾患（全身性強皮症に伴う肺線維症など）の治療に使用できる。多くの場合において、タンパク質の毒性はないか許容できるほど低い。
１つの態様では、本開示は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ（例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ）と結合し、少なくとも１つの免疫グロブリン可変領域を含むタンパク質（例えば、単離タンパク質）を使用する全身性強皮症に伴う肺線維症の治療および／または予防方法を特徴とする。例えば、タンパク質は、免疫グロブリン重鎖（ＨＣ）可変ドメイン配列および免疫グロブリン軽鎖（ＬＣ）可変ドメイン配列を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、結果的に例えば、ＩＧＦ−１Ｒおよび／もしくはインスリン受容体のアイソフォーム（ＩＲ−Ａ）と結合するＩＧＦ−ＩＩおよび／もしくはＩＧＦ−ＩＩＥ（例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ）と結合し、かつＩＧＦ−ＩＩおよび／もしくはＩＧＦ−ＩＩＥを阻害する。別の実施形態では、タンパク質は、ＩＧＦ ＩＩＥのみと結合するおよび／またはＩＧＦ ＩＩＥのみを阻害するが、ＩＧＦ−ＩＩとは結果的に結合しない。
タンパク質は、１つ以上の以下の特徴を含み得る：（ａ）ヒトＣＤＲまたはヒトフレームワーク領域；（ｂ）免疫グロブリンＨＣ可変ドメイン配列が、本明細書に記載のＨＣ可変ドメインのＣＤＲと少なくとも８５、８８、９０、９２、９４、９５、９６、９７、９８、９９、もしくは１００％同一であるＣＤＲを１つ以上含むこと；（ｃ）免疫グロブリンＬＣ可変ドメイン配列が、本明細書に記載のＬＣ可変ドメインのＣＤＲと少なくとも８５、８８、９０、９２、９４、９５、９６、９７、９８、９９、もしくは１００％同一であるＣＤＲを１つ以上含むこと；（ｄ）免疫グロブリンＬＣ可変ドメイン配列が、本明細書に記載のＬＣ可変ドメインと少なくとも８５、８８、９０、９２、９４、９５、９６、９７、９８、９９、もしくは１００％同一であること；（ｅ）免疫グロブリンＨＣ可変ドメイン配列が、本明細書に記載のＨＣ可変ドメインと少なくとも８５、８８、９０、９２、９４、９５、９６、９７、９８、９９、もしくは１００％同一であること；（ｆ）前記タンパク質が、本明細書に記載のタンパク質によって結合されるエピトープ、もしくはかかるエピトープと重複するエピトープと結合すること；ならびに（ｇ）霊長類ＣＤＲもしくは霊長類フレームワーク領域。
タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ（例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ）と、少なくとも１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０および１０１１Ｍ−１の結合親和性で結合できる。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０−３、５×１０−４ｓ−１、または１×１０−４ｓ−１より遅いＫｏｆｆで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０２、１×１０３、または５×１０３Ｍ−１ｓ−１より速いＫｏｎで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩ活性とヒトＩＧＦ−ＩＩＥ活性の両方を、例えば、１０−５、１０−６、１０−７、１０−８、１０−９、および１０−１０Ｍ未満のＫｉで阻害する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩ活性またはヒトＩＧＦ−ＩＩＥ活性のいずれかを、例えば、１０−５、１０−６、１０−７、１０−８、１０−９、および１０−１０Ｍ未満のＫｉで阻害する。タンパク質は、例えば、１００ｎＭ、１０ｎＭまたは１ｎＭ未満のＩＣ５０を有し得る。例えば、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／もしくはＩＧＦ−ＩＩＥのみならず、ＩＧＦ−Ｉ受容体（ＩＧＦ−１Ｒ）活性および／もしくはインスリン受容体のアイソフォーム（ＩＲ−Ａ）活性を調節し得る。タンパク質はＩＧＦ−１Ｒ、ＩＲ−Ａ、ならびにＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ活性を阻害し得る。ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥに対するタンパク質の親和性は１００ｎｍ未満、１０ｎＭ未満、または１ｎＭ未満のＫＤを特徴とし得る。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖および重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖および重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる重鎖の群の対応するＣＤＲから選択される重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる軽鎖の群の対応するＣＤＲから選択される軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる軽鎖の群の対応するＣＤＲから選択される軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）ならびに重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖および重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７から選択される抗体の軽鎖および重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖の対応するＣＤＲ由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６４７の重鎖由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）およびＤＸ−２６４７の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖および重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５から選択される抗体の軽鎖および重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖の対応するＣＤＲ由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、ＤＸ−２６５５の重鎖由来の重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）およびＤＸ−２６５５の軽鎖の対応するＣＤＲ由来の軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は同一ポリペプチド鎖の成分である。別の実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は異なるポリペプチド鎖の成分である。例えば、タンパク質は、ＩｇＧ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４）である。タンパク質は、可溶性Ｆａｂ（ｓＦａｂ）であり得る。他の実施形態では、タンパク質は、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ミニボディ、ｓｃＦｖ：：Ｆｃ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ融合物、ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、または本明細書の結合タンパク質の１つの抗原結合部位を含む他の分子を含む。これらＦａｂのＶＨおよびＶＬ領域は、ＩｇＧ、Ｆａｂ、Ｆａｂ２、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ、ＰＥＧ化ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ２、ＶＨ：：ＣＨ１：：ＨＳＡ＋ＬＣ、ＨＳＡ：：ＶＨ：：ＣＨ１＋ＬＣ、ＬＣ：：ＨＳＡ＋ＶＨ：：ＣＨ１、ＨＳＡ：：ＬＣ＋ＶＨ：：ＣＨ１、または他の適切な構築物として提供できる。
１つの実施形態では、タンパク質は、ヒト抗体またはヒト化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上のヒト抗体フレームワーク領域（例えば、すべてのヒトフレームワーク領域）を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＦｃドメインを含むか、またはヒトＦｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、もしくは９９％同一であるＦｃドメインを含む。
１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類抗体または霊長類化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上の霊長類抗体フレームワーク領域（例えば、すべての霊長類フレームワーク領域）を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類Ｆｃドメインを含むか、または霊長類Ｆｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、または９９％同一であるＦｃドメインを含む。「霊長類」は、ヒト（Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ）、チンパンジー（Ｐａｎ ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓおよびＰａｎ ｐａｎｉｓｃｕｓ（ボノボ）)、ゴリラ（Ｇｏｒｉｌｌａ ｇｏｒｉｌｌａ）、テナガザル、サル、キツネザル、アイアイ（Ｄａｕｂｅｎｔｏｎｉａ ｍａｄａｇａｓｃａｒｉｅｎｓｉｓ）、およびメガネザルを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥに対する霊長類抗体の親和性は１ｎＭ未満のＫＤを特徴とする。
ある実施形態では、タンパク質は、マウスまたはウサギ由来の配列を含まない（例えば、マウスまたはウサギ抗体ではない）。
ある実施形態では、タンパク質は、（例えば、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥを発現する）肺線維芽細胞、または線維芽細胞巣と結合し得る。
１つの実施形態では、タンパク質は、ナノ粒子と物理的に結合しており、細胞表面上にＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥを発現する細胞へとナノ粒子を誘導するために使用することができる。
本明細書に記載の結合タンパク質は、（例えば、医薬上許容可能な担体を含む）医薬組成物として提供できる。組成物は、他のタンパク質種を少なくとも１０、２０、３０、５０、７５、８５、９０、９５、９８、９９、または９９．９％含まないことができる。いくつかの実施形態では、結合タンパク質は、ＧＭＰ（医薬品および医薬部外品の製造管理および品質管理規則）下で産生できる。いくつかの実施形態では、結合タンパク質は、医薬上許容可能な担体中、例えば、適切な緩衝液または賦形剤中に提供される。
別の態様では、本開示は、試料中のＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥを検出する方法を特徴とする。この方法は、試料をＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質（例えば、本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質）と接触させること；ならびに、タンパク質とＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥとの間の相互作用が存在する場合、それを検出することを含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、検出可能な標識を含む。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、対象におけるＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥを検出するために使用することができる。この方法は、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質（例えば、本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質）を対象に投与すること；ならびに、対象においてタンパク質とＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥとの間の相互作用が存在する場合、それを検出することを含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、検出可能な標識をさらに含む。例えば、検出は対象の画像化を含む。
別の態様では、本開示は、（例えば、全身性強皮症に伴う肺線維症の治療または予防方法において）ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ活性を調節する方法を特徴とする。この方法は、（例えば、ヒト対象において）ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥをＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質と接触させ、それによりＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ活性を調節することを含む。
別の態様では、本開示は、ＳＳｃに伴う肺線維症を治療する方法を特徴とする。この方法は、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を、対象におけるＳＳｃに伴う肺線維症を治療するのに十分な量で対象に投与することを含む。この方法は、ＳＳｃに伴う肺線維症に対する療法、例えば、抗炎症剤、例えば、ステロイド、例えば、コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン））、細胞傷害性薬物（例えば、シクロホスファミド）、免疫抑制剤（例えば、シクロホスファミドまたはアザチオプリン）、コラーゲン合成阻害剤（例えば、ピルフェニドン）、エンドセリン受容体アンタゴニスト（例えば、ボセンタン（例えば、ＴＲＡＣＬＥＥＲ（登録商標）））または外科手術（例えば、肺移植）である第二療法を対象に提供することをさらに含むことができる。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、対象（例えば、腫瘍を有するかまたは有することが疑われる対象）への薬剤の標的送達にとって、例えば、薬剤を対象の肺（例えば、肺線維芽細胞または線維芽細胞巣）へと指向させるのに有用である。例えば、作用因子（毒素、薬剤、または放射性核種（例えば、１３１Ｉ、９０Ｙ、１７７Ｌｕ）など）と結合したＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質（例えば、本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質）を、ＳＳｃに伴う肺線維症を有するかまたは有することが疑われる対象に投与できる。
別の態様では、本開示は、対象を画像化する方法を特徴とする。この方法はＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質（例えば、本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質）を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥ活性を実質的に阻害しないものである。いくつかの実施形態では、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥ活性を実質的に阻害するものである。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、検出可能な標識（例えば、放射性核種またはＭＲＩ検出可能な標識）を含み得る。１つの実施形態では、対象はＳＳｃに伴う肺線維症を有するか、または有することが疑われる。この方法は、ＳＳｃに伴う肺線維症の診断に有用である。
１つの態様では、本開示は、本明細書に記載の障害、例えば、ＳＳｃに伴う肺線維症の治療のための薬剤の製造のための、本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質の使用を特徴とする。
本発明の１つ以上の実施形態の詳細について、添付の図面および本明細書の下記において説明する。本発明の他の特徴、目的、および利点は、本明細書の説明および図面から、ならびに特許請求の範囲から明らかであろう。
図１（Ａ）および１（Ｂ）は、（下記の実施例８記載のように）Ｍ００６４−Ｆ０２ ＦａｂとＩＧＦ−ＩＩとの複合体の結晶分析により決定されるポリペプチドフォールドを示す。らせんは巻き上がったリボン状の帯により、βシートは太い矢印により示す。 図２（Ａ）および２（Ｂ）は、結合タンパク質ＢＰ２およびＢＰ４と相互作用する抗体の１つのＳＰＲ親和性測定から得られた典型的プロファイルを示す。（Ａ）はＭ００６３−Ｆ０２候補抗体データ、（Ｂ）はＭ００６４−Ｅ０４候補抗体データである。
定義
便宜上、本発明をさらに詳述する前に、本明細書、実施例および添付の特許請求の範囲で使用する特定の用語をここに定義する。他の用語は本明細書の初出時に定義する。
本明細書において、Ｅドメインを包含するＩＧＦ−ＩＩ前駆体タンパク質のアミノ酸１〜１０４を含む構築物は、「ＩＧＦ−ＩＩＥ」と呼ばれる。
単数形「一つの（ａ）」、「一つの（ａｎ）」、および「その（ｔｈｅ）」は、文脈において明確に別段の指摘がされない限り、複数形の指示対象を含む。
本明細書で使用する「アゴニスト」という用語は、タンパク質の生物活性を模倣するかまたは上方制御する（例えば、増強するかまたは補充する）薬剤を指すことを意味する。アゴニストは、野生型タンパク質であり得るか、または野生型タンパク質の少なくとも１つの生物活性を有するその誘導体であり得る。アゴニストは、遺伝子の発現を上方制御するかまたはタンパク質の少なくとも１つの生物活性を増大する化合物でもあり得る。アゴニストは、ポリペプチドと別の分子、例えば、標的ペプチドもしくは核酸との相互作用を増大する化合物でもあり得る。
本明細書で使用する「アンタゴニスト」は、タンパク質の少なくとも１つの生物活性を下方制御する（例えば、抑制するかまたは阻害する）薬剤を指すことを意味する。アンタゴニストは、タンパク質と別の分子（例えば、標的ペプチドまたは酵素基質）との間の相互作用を阻害するかまたは低減する化合物であり得る。アンタゴニストは、遺伝子発現を下方制御するかまたは発現タンパク質の存在量を低減する化合物でもあり得る。
「抗体」という用語は、少なくとも１つの免疫グロブリン可変ドメイン（可変領域）または免疫グロブリン可変ドメイン（可変領域）配列を含むタンパク質を指す。例えば、抗体は、重（Ｈ）鎖可変領域（本明細書でＶＨと略す）、および軽（Ｌ）鎖可変領域（本明細書でＶＬと略す）を含むことができる。別の例では、抗体は２本の重（Ｈ）鎖可変領域および２本の軽（Ｌ）鎖可変領域を含む。「抗体」という用語は、抗体の抗原結合断片（例えば、単鎖抗体、ＦａｂおよびｓＦａｂ断片、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｄ断片、Ｆｖ断片、ｓｃＦｖ、およびドメイン抗体（ｄＡｂ）断片（ｄｅ Ｗｉｌｄｔ ｅｔ ａｌ．， Ｅｕｒ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ． １９９６； ２６（３）：６２９−３９．））ならびに完全抗体を包含する。抗体は、ＩｇＡ、ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＤ、ＩｇＭ（ならびにこれらのサブタイプ）の構造特性を有し得る。抗体は任意の供給源に由来し得るが、霊長類（ヒトおよび非ヒト霊長類）抗体および霊長類化抗体が好ましい。
ＶＨおよびＶＬ領域は、「フレームワーク領域」（「ＦＲ」）と呼ばれるより保存的な領域と共に散在する「相補性決定領域」（「ＣＤＲ」）と呼ばれる超可変領域にさらに細分できる。フレームワーク領域およびＣＤＲの範囲は定義されている（Ｋａｂａｔ， Ｅ．Ａ．， ｅｔ ａｌ． （１９９１） Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ， Ｆｉｆｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ， Ｕ．Ｓ． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ ａｎｄ Ｈｕｍａｎ Ｓｅｒｖｉｃｅｓ， ＮＩＨ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ Ｎｏ． ９１−３２４２、およびＣｈｏｔｈｉａ， Ｃ． ｅｔ ａｌ． （１９８７） Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． １９６：９０１−９１７を参照されたい）。本明細書ではＫａｂａｔ（カバット）の定義を使用する。各ＶＨおよびＶＬは、典型的には、３つのＣＤＲおよび４つのＦＲから構成され、これらはアミノ末端からカルボキシ末端へと、ＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、ＦＲ４の順で配置している。
本明細書で使用する「免疫グロブリン可変ドメイン配列」とは、１つ以上のＣＤＲ領域が抗原結合部位に適した高次構造で配置されるように免疫グロブリン可変ドメインの構造を形成できるアミノ酸配列を指す。例えば、配列は、天然可変ドメインのアミノ酸配列のすべてまたは一部を含み得る。例えば、配列は、１つ、２つ、または３つ以上のＮ末端またはＣ末端アミノ酸、内部アミノ酸を省き得るか、１つ以上の挿入または追加末端アミノ酸を含み得るか、他の改変を含み得る。１つの実施形態では、免疫グロブリン可変ドメイン配列を含むポリペプチドは、別の免疫グロブリン可変ドメイン配列と結合して、抗原結合部位（例えば、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと選択的に相互作用する構造）を形成できる。
抗体のＶＨまたはＶＬ鎖は、重鎖または軽鎖定常領域のすべてまたは一部をさらに含み、それにより、免疫グロブリン重鎖または軽鎖をそれぞれ形成できる。１つの実施形態では、抗体は、２本の免疫グロブリン重鎖および２本の免疫グロブリン軽鎖の四量体であり、ここで、免疫グロブリン重鎖および軽鎖は、例えば、ジスルフィド結合によって相互に連結している。ＩｇＧの場合、重鎖定常領域は、３つの免疫グロブリンドメイン（ＣＨ１、ＣＨ２およびＣＨ３）を含む。軽鎖定常領域は、ＣＬドメインを含む。重鎖および軽鎖の可変領域は、抗原と相互作用する結合ドメインを含む。抗体の定常領域は、典型的には、宿主組織または因子（免疫系の様々な細胞（例えば、エフェクター細胞）および従来の補体系の第一成分（Ｃｌｑ）を含む）への抗体の結合を媒介する。免疫グロブリン軽鎖は、κ型またはλ型であり得る。１つの実施形態では、抗体は、グリコシル化されている。抗体は、抗体依存性細胞傷害性および／または補体媒介細胞傷害性にとって機能的であり得る。
抗体の１つ以上の領域はヒトであり得るか、事実上ヒトであり得る。例えば、１つ以上の可変領域はヒトであり得るか、事実上ヒトであり得る。例えば、１つ以上のＣＤＲは、ヒトであり得る（例えば、ＨＣ ＣＤＲ１、ＨＣ ＣＤＲ２、ＨＣ ＣＤＲ３、ＬＣ ＣＤＲ１、ＬＣ ＣＤＲ２、およびＬＣ ＣＤＲ３）。各軽鎖ＣＤＲはヒトであり得る。ＨＣ ＣＤＲ３はヒトであり得る。１つ以上のフレームワーク領域は、ヒトであり得る（例えば、ＨＣまたはＬＣのＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３、およびＦＲ４）。例えば、Ｆｃ領域はヒトであり得る。１つの実施形態では、すべてのフレームワーク領域はヒトであり、例えば、ヒト体細胞（例えば、免疫グロブリンを産生する造血細胞または非造血細胞）由来である。１つの実施形態では、ヒト配列は（例えば、生殖系列核酸によってコードされる）生殖系列配列である。１つの実施形態では、選択されたＦａｂのフレームワーク（ＦＲ）残基を、最も類似した霊長類生殖系列遺伝子（特に、ヒト生殖系列遺伝子）中の対応する残基のアミノ酸タイプに変換できる。１つ以上の定常領域はヒトであり得るか、事実上ヒトであり得る。例えば、少なくとも７０、７５、８０、８５、９０、９２、９５、９８、または１００％の免疫グロブリン可変ドメイン、定常領域、定常ドメイン（ＣＨ１、ＣＨ２、ＣＨ３、ＣＬ１）、または完全抗体はヒトであり得るか、事実上ヒトであり得る。
抗体のすべてまたは一部は、免疫グロブリン遺伝子またはそのセグメントによってコードされ得る。例示的なヒト免疫グロブリン遺伝子としては、κ、λ、α（ＩｇＡ１およびＩｇＡ２）、γ（ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４）、δ、εおよびμ定常領域遺伝子、ならびに多数の免疫グロブリン可変領域遺伝子が挙げられる。完全長の免疫グロブリン「軽鎖」（約２５ＫＤａまたは約２１４個のアミノ酸）はＮＨ２末端において可変領域遺伝子によってコードされ（約１１０個のアミノ酸）、かつＣＯＯＨ末端においてκまたはλ定常領域遺伝子によってコードされる。完全長の免疫グロブリン「重鎖」（約５０ＫＤａまたは約４４６個のアミノ酸）は、同様に、可変領域遺伝子によってコードされ（約１１６個のアミノ酸）、かつ他の上記の定常領域遺伝子の１つ、例えば、γ（約３３０個のアミノ酸をコードする）によってコードされる。ＨＣ ＣＤＲ３が約３個のアミノ酸残基から３５個超のアミノ酸残基まで異なるので、ヒトＨＣの長さは大きく変動する。
完全長抗体の「抗原結合断片」という用語は、目的の標的に特異的に結合する能力を保持した完全長抗体の１つ以上の断片を指す。完全長抗体の「抗原結合断片」という用語に包含される結合断片の例としては、（ｉ）Ｆａｂ断片（ＶＬ、ＶＨ、ＣＬおよびＣＨ１ドメインからなる一価断片）；（ｉｉ）ヒンジ領域でジスルフィド結合により結合した２個のＦａｂ断片を含む二価断片であるＦ（ａｂ’）２断片；（ｉｉｉ）ＶＨおよびＣＨ１ドメインからなるＦｄ断片；（ｉｖ）抗体の単一アームのＶＬおよびＶＨドメインからなるＦｖ断片、（ｖ）ＶＨドメインからなるｄＡｂ断片（Ｗａｒｄ ｅｔ ａｌ．， （１９８９） Ｎａｔｕｒｅ ３４１：５４４−５４６）；ならびに（ｖｉ）機能性を保持する単離相補性決定領域（ＣＤＲ）が挙げられる。さらに、Ｆｖ断片の２つのドメインであるＶＬおよびＶＨは、別々の遺伝子によりコードされるが、それらは、ＶＬおよびＶＨ領域が対合して単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）として知られる一価分子を形成する単一タンパク質鎖としてそれらを作製することを可能にする合成リンカーにより、組換え方法を用いて結合できる。例えば、米国特許第５，２６０，２０３号、同第４，９４６，７７８号、および同第４，８８１，１７５号；Ｂｉｒｄ ｅｔ ａｌ． （１９８８） Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４２：４２３−４２６；ならびにＨｕｓｔｏｎ ｅｔ ａｌ． （１９８８） Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ８５：５８７９−５８８３を参照されたい。
抗体断片は、当業者に既知である従来技術を含む任意の適切な技術を用いて得ることができる。「単一特異性抗体」という用語は、特定の標的（例えば、エピトープ）に対して単一の結合特異性および親和性を示す抗体を指す。この用語は「モノクローナル抗体」または「モノクローナル抗体組成物」を含み、本明細書で使用する場合、抗体がどのように生成されたかを問わず、単一の分子組成物の抗体またはその断片の調製物を指す。
本明細書で使用する「結合親和性」とは、見かけ上の結合定数つまりＫＡを指す。ＫＡは、解離定数（ＫＤ）の逆数である。結合タンパク質は、例えば、特定の標的分子（例えば、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ）に対する結合親和性が少なくとも１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０および１０１１Ｍ−１であり得る。第二の標的と比較して第一の標的への結合タンパク質のより高い親和性の結合は、第二の標的への結合に対するＫＡ（またはＫＤ値）より高い第一の標的への結合に対するＫＡ（またはより小さいＫＤ値）によって示すことができる。かかる場合、結合タンパク質は、第二の標的（例えば、第二の高次構造のタンパク質もしくはその模倣物；または第二のタンパク質）と比較して第一の標的（例えば、第一の高次構造のタンパク質またはその模倣物）に対して特異性を有する。（例えば、特異性または他の比較における）結合親和性の相違は、少なくとも１．５、２、３、４、５、１０、１５、２０、３７．５、５０、７０、８０、９１、１００、５００、１０００、１０，０００または１０５倍であり得る。
結合親和性は、平衡透析、平衡結合、ゲルろ過、ＥＬＩＳＡ、表面プラズモン共鳴、または分光法（例えば、蛍光アッセイを使用する）を含む様々な方法により決定できる。結合親和性の例示的評価条件は、ＨＢＳ−Ｐ緩衝液（１０ｍＭのＨＥＰＥＳ ｐＨ７．４、１５０ｍＭのＮａＣｌ、０．００５％（ｖ／ｖ）界面活性剤Ｐ２０）である。これらの技術を使用して、結合タンパク質（または標的）濃度の関数として、結合している結合タンパク質および遊離している結合タンパク質の濃度を測定できる。結合している結合タンパク質の濃度（［結合］）は、以下の式によって、遊離している結合タンパク質の濃度（［遊離］）および標的上の結合タンパク質の結合部位の濃度と関連付けられる：
［結合］＝Ｎ・［遊離］／（（１／ＫＡ）＋［遊離］）
式中、（Ｎ）は標的分子当たりの結合部位数である。
しかしながら、ＫＡは常に正確に決定する必要はない。なぜなら、時によっては、ＫＡに比例する親和性の定量的測定値（例えば、ＥＬＩＳＡまたはＦＡＣＳ分析などの方法を用いて決定する）を得れば十分であり、したがって、比較のため（より高い親和性が、例えば、２倍高いかどうかの決定など）に使用して、例えば、機能アッセイ（例えば、インビトロ（ｉｎ ｖｉｔｒｏ）またはインビボ（ｉｎ ｖｉｖｏ）アッセイ）における活性によって親和性の定性的測定値を得るか親和性の推定値を得ることができるからである。
「結合タンパク質」という用語は、標的分子と相互作用し得るタンパク質を指す。この用語を「リガンド」と互換可能に使用する。「ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質」とは、ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と相互作用し得るタンパク質を指し、特にＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と選択的に相互作用するおよび／またはＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方を選択的に阻害するタンパク質を含む。例えば、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は抗体である。同様に、「ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質」とは、ＩＧＦ−ＩＩＥのみと相互作用し得るタンパク質を指し、特に、ＩＧＦ−ＩＩＥのみと選択的に相互作用するおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥのみを選択的に阻害するタンパク質を含む。
「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が類似の側鎖を有するアミノ酸残基に置換されたものである。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当該技術分野で定義されている。これらのファミリーとしては、塩基性側鎖を有するアミノ酸（例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、無電荷極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン）、非極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、β分岐側鎖を有するアミノ酸（例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン）、および芳香族側鎖を有するアミノ酸（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）が挙げられる。多数のフレームワークおよびＣＤＲのアミノ酸残基が１つ以上の保存的置換を含むことが可能である。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、本明細書に記載の結合タンパク質と比較して、タンパク質機能に対する実質的な効果を有さない変異（例えば、少なくとも１、２、もしくは４個、ならびに／または１５、１０、５、もしくは３個未満）を有し得る（例えば、保存的または非必須アミノ酸置換）。特定の置換が容認できるかどうか、すなわち、結合活性などの生物学的特性に悪影響を及ぼさないかどうかについては、例えば、変異が保存的であるかどうかを評価することによって、またはＢｏｗｉｅ， ｅｔ ａｌ． （１９９０） Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４７：１３０６−１３１０の方法によって予想できる。
生体ポリマーのモチーフ配列は、アミノ酸が異なり得る位置を含み得る。例えば、かかる文脈中の記号「Ｘ」は、一般に、任意のアミノ酸（例えば、２０種の天然アミノ酸のいずれかまたは１９種の非システインアミノ酸のいずれか）を指す。他の許容されるアミノ酸を、例えば、丸括弧および斜線を用いて示すこともできる。例えば、「（Ａ／Ｗ／Ｆ／Ｎ／Ｑ）」とは、アラニン、トリプトファン、フェニルアラニン、アスパラギン、およびグルタミン酸が、その特定の位置で許容されることを意味する。
「事実上ヒトの」免疫グロブリン可変領域とは、免疫グロブリン可変領域が正常なヒトで免疫原性応答を誘発しないように十分な数のヒトフレームワークアミノ酸位置を含む免疫グロブリン可変領域である。「事実上ヒト」抗体とは、抗体が正常なヒトで免疫原性応答を誘発しないように十分な数のヒトアミノ酸位置を含む抗体である。
「エピトープ」とは、結合タンパク質（例えば、Ｆａｂまたは完全長抗体などの抗体）によって結合される標的化合物上の部位を指す。標的化合物がタンパク質である場合、この部位は、完全にアミノ酸成分から構成されるか、完全にタンパク質のアミノ酸の化学修飾（例えば、グリコシル部分）から構成されるか、その組み合わせから構成され得る。重複エピトープは、少なくとも１つの共通のアミノ酸残基、グリコシル基、リン酸基、硫酸基、または他の分子の特徴を含む。
ある（第一）抗体は、別の（第二）抗体が結合する標的化合物上の同一部位と結合する場合、または例えば、第二抗体が結合する部位と重複する（例えばアミノ酸配列または他の分子の特性（例えば、グリコシル基、リン酸基、または硫酸基）に関して、例えば５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、または１００％重複する）部位と結合する場合、第二抗体と「同一のエピトープと結合する」。
ある（第一）抗体は、第一抗体のエピトープに対する結合が別の（第二）抗体の該エピトープに対する結合量を（例えば、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、または１００％超）低減する場合、第二抗体と「結合について競合する」。競合は、直接的（例えば、第一抗体が、第二抗体により結合されるエピトープと同一であるかまたは重複するエピトープと結合する）でもあり得、間接的（例えば、第一抗体のエピトープへの結合が、第二抗体の該エピトープへの結合能を低減する立体的な変化を標的化合物において引き起こす）でもあり得る。
２配列間の「相同性」または「配列同一性」（これらの用語は本明細書において互換可能に使用する）の計算を、以下のように行う。至適に比較できるように配列を整列させる（例えば、至適に整列するために第一および第二のアミノ酸配列または核酸配列の一方または両方にギャップを導入し、比較するために非相同配列を無視することができる）。ギャップペナルティ１２、ギャップ伸長ペナルティ４、およびフレームシフトギャップペナルティ５を使用したＢｌｏｓｓｕｍ６２スコアリング行列を有するＧＣＧソフトウェアパッケージのＧＡＰプログラムを使用して、至適なスコアとして至適な整列を決定する。次いで、対応するアミノ酸の位置またはヌクレオチドの位置のアミノ酸残基またはヌクレオチドを比較する。第一の配列中の位置が第二の配列中の対応する位置と同一のアミノ酸残基またはヌクレオチドで占められている場合、その位置で分子は同一である（本明細書で使用する、アミノ酸または核酸の「同一性」は、アミノ酸または核酸の「相同性」と互換可能である）。２配列間の同一率（％）は、配列が共有する同一の位置の数の関数である。
１つの好ましい実施形態では、比較のために整列させた基準配列の長さは、基準配列の長さの少なくとも３０％、好ましくは少なくとも４０％、さらに好ましくは少なくとも５０％、よりさらに好ましくは少なくとも６０％、よりさらに好ましくは少なくとも７０％、８０％、９０％、９２％、９５％、９７％、９８％、または１００％である。例えば、基準配列は、免疫グロブリン可変ドメイン配列の長さであり得る。
「ヒト化」免疫グロブリン可変領域は、免疫グロブリン可変領域が正常なヒトで免疫原性応答を誘発しないように十分な数のヒトフレームワークアミノ酸位置を含むように修飾された免疫グロブリン可変領域である。「ヒト化」免疫グロブリンの説明としては、例えば、米国特許第６，４０７，２１３号および米国特許第５，６９３，７６２号が挙げられる。
本明細書で使用する「低ストリンジェンシー、中ストリンジェンシー、高ストリンジェンシー、または超高ストリンジェンシー条件下のハイブリッド形成」という用語は、ハイブリッド形成および洗浄の条件を説明する。ハイブリッド形成反応を実施するためのガイダンスは、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｎ．Ｙ． （１９８９）， ６．３．１−６．３．６に見出すことができる。水性方法および非水性方法は、この参考文献に記載されており、いずれをも使用することができる。本明細書で参照する特異的ハイブリッド形成条件は以下のとおりである：（１）約４５℃での６×塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム（ＳＳＣ）、続いて少なくとも５０℃の０．２×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ中で２回洗浄する低ストリンジェンシーハイブリッド形成条件（洗浄温度は、低ストリンジェンシー条件では５５℃に上昇させることができる）、（２）約４５℃での６×ＳＳＣ、続いて６０℃の０．２×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳで１回以上洗浄する中ストリンジェンシーハイブリッド形成条件、（３）約４５℃での６×ＳＳＣ、続いて６５℃の０．２×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳで１回以上洗浄する高ストリンジェンシーハイブリッド形成条件、および（４）６５℃での０．５Ｍリン酸ナトリウム、７％ＳＤＳ、続いて６５℃の０．２×ＳＳＣ、１％ＳＤＳで１回以上洗浄する超高ストリンジェンシーハイブリッド形成条件。超高ストリンジェンシー条件（４）が好ましい条件であり、他で明記しない限り、これを使用すべきである。本開示には、低、中、高、または超高ストリンジェンシーで本明細書に記載の核酸またはその相補物（例えば、本明細書に記載の結合タンパク質をコードする核酸）とハイブリッド形成する核酸が含まれる。核酸は、基準核酸と同一の長さであり得るか、基準核酸の長さの３０、２０、または１０％以内であり得る。核酸は、本明細書に記載の免疫グロブリン可変ドメイン配列をコードする領域に対応し得る。
「単離組成物」とは、単離組成物を得ることができる天然試料の少なくとも１つの成分の少なくとも９０％から取り出された組成物を指す。人工的または天然に産生された組成物は、目的の種または種の集団が重量−重量ベースで少なくとも５、１０、２５、５０、７５、８０、９０、９２、９５、９８、または９９％の純度である場合、「少なくとも一定の純度の組成物」であり得る。
「調節因子」という用語は、調節をもたらす能力を有し得る、ポリペプチド、核酸、ポリマー、複合体、分子、低分子、化合物、種など（天然または非天然）、または細菌、植物、真菌、もしくは動物細胞もしくは動物組織などの生体物質からの抽出物を指す。調節因子を、機能特性、生物活性もしくは過程またはこれらの組み合わせについての（直接的または間接的な）阻害剤または活性化因子（例えば、アゴニスト、部分的アンタゴニスト、部分的アゴニスト、逆アゴニスト、アンタゴニスト、抗菌剤、微生物感染または増殖の阻害剤など）としての潜在的活性をアッセイにおいて評価し得る。かかるアッセイでは、多数の調節因子を同時にスクリーニングし得る。調節因子の活性は既知、未知、または部分的に既知であり得る。
「必須」アミノ酸残基の変化が実質的な活性の消失に至るのに対して、「非必須」アミノ酸残基は、生物活性を消滅させずにまたはさらに好ましくは実質的に改変せずに、結合剤（例えば、抗体）の野生型配列から改変され得る残基である。
主題の方法により治療されるべき「患者」、「対象」または「宿主」とは、ヒトまたは非ヒト動物のいずれかを意味し得る。
対象における疾患の「予防」または対象における疾患を「予防する」という用語は、対象に薬物治療を供すること（例えば、薬剤投与）を指し、疾患の少なくとも１つの症状が予防されるように、すなわち、望ましくない容態（例えば、宿主動物の疾患または他の望ましくない容態）の発現から宿主を保護するように望ましくない容態の臨床的顕在化の前に投与することである。疾患の「予防」は「予防法」または「予防治療」とも呼び得る。
本明細書で使用する「実質的に同一」（または「実質的に相同」）という用語は、第一および第二のアミノ酸または核酸配列が類似の活性（例えば、結合活性、結合優先性、または生物活性）を有する（またはこれらを有するタンパク質をコードする）ように第二のアミノ酸または核酸配列と同一または等価な（例えば、類似の側鎖、例えば、保存的アミノ酸置換を有する）アミノ酸残基またはヌクレオチドを十分な数で含む第一のアミノ酸または核酸配列を指すために本明細書で使用する。抗体の場合、第二の抗体は、同一の抗原に対して同一の特異性を有し、少なくとも５０％、少なくとも２５％、または少なくとも１０％の親和性を有する。
本明細書に開示の配列と類似または相同な（例えば、少なくとも約８５％の配列同一性）配列も本出願の一部である。いくつかの実施形態では、配列同一性は、約８５％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、またはそれを超え得る。さらに、核酸セグメントが選択的ハイブリッド形成条件下（例えば、高ストリンジェントなハイブリッド形成条件下）で鎖の相補物とハイブリッド形成する場合、実質的な同一性が存在する。核酸は、完全細胞、細胞溶解物、部分精製形態、または実質的に純粋な形態で存在し得る。
統計的有意性は当該技術分野で既知の任意の方法により決定できる。例示的な統計的検定としては、スチューデントＴ検定、マンホイットニーＵのノンパラメトリック検定、およびウィルコクソンのノンパラメトリック統計検定が挙げられる。いくつかの統計的に有意な関係は０．０５または０．０２未満のＰ値を有する。特定の結合タンパク質は、（例えば、特異性または結合において）統計的有意差（例えば、Ｐ値＜０．０５または０．０２）を示し得る。例えば、２つの状態間の識別可能な定性的または定量的差異を示す、「誘発する」、「阻害する」、「増強する」、「上昇する」、「増大する」、「低減する」などの用語は、２つの条件間の差異（例えば、統計的有意差）を指し得る。
「治療する」または「治療」という用語は、対象、例えば、患者、例えば、障害（例えば、本明細書に記載の障害）、障害症状または障害素因を有する患者に対する、障害、障害症状または障害素因を例えば、治癒する（ｃｕｒｅ）、治癒する（ｈｅａｌ）、緩和する、軽減する、改変する、修復する、寛解する、改善する、または影響を及ぼすための、単独または１つ以上の他剤（例えば、第二薬）と併用した薬剤の適用または投与を指す。細胞の処置とは、細胞活性、例えば、内皮細胞が管または血管を形成する能力の低減を指す。低減とは活性の総除去を必ずしも要さないが、細胞活性または細胞数の低減、例えば、統計的に有意な低減である。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質
本開示は、ＳＳｃに伴う肺線維症の治療（または予防）方法における、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ（例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ）の両方またはいずれかと結合しかつ少なくとも１つの免疫グロブリン可変領域を含むタンパク質（例えば、結合タンパク質）の使用を提供する。例えば、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、免疫グロブリン重鎖（ＨＣ）可変ドメイン配列および免疫グロブリン軽鎖（ＬＣ）可変ドメイン配列を含む。いくつかの例示的ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥおよびＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質について本明細書に記載する。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、単離タンパク質であり得る（例えば、他のタンパク質を少なくとも７０、８０、９０、９５、または９９％含まない）。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ（例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ）の両方をさらに阻害し得る。
１つの態様では、本開示は、ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ（例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ）と結合しかつ少なくとも１つの免疫グロブリン可変領域を含むタンパク質（例えば、単離タンパク質）を特徴とする。例えば、タンパク質は、免疫グロブリン重鎖（ＨＣ）可変ドメイン配列および／または免疫グロブリン軽鎖（ＬＣ）可変ドメイン配列を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ、例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと結合し、かつそれらを阻害する。
タンパク質は、１つ以上の以下の特徴を含み得る：（ａ）ヒトＣＤＲもしくはヒトフレームワーク領域；（ｂ）免疫グロブリンＨＣ可変ドメイン配列が、本明細書に記載のＨＣ可変ドメインのＣＤＲと少なくとも８５、８８、９０、９２、９４、９５、９６、９７、９８、９９、もしくは１００％同一であるＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）含むこと；（ｃ）免疫グロブリンＬＣ可変ドメイン配列が、本明細書に記載のＬＣ可変ドメインのＣＤＲと少なくとも８５、８８、９０、９２、９４、９５、９６、９７、９８、９９、もしくは１００％同一であるＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）含むこと；（ｄ）免疫グロブリンＬＣ可変ドメイン配列が、本明細書に記載のＬＣ可変ドメインと少なくとも８５、８８、９０、９２、９４、９５、９６、９７、９８、９９、もしくは１００％同一であること；（ｅ）免疫グロブリンＨＣ可変ドメイン配列が、本明細書に記載のＨＣ可変ドメインと少なくとも８５、８８、９０、９２、９４、９５、９６、９７、９８、９９、もしくは１００％同一であること；（ｆ）前記タンパク質が、本明細書に記載のタンパク質によって結合されるエピトープ、もしくはかかるエピトープと重複するエピトープと結合すること；ならびに（ｇ）霊長類ＣＤＲもしくは霊長類フレームワーク領域。
ある実施形態では、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩの以下のエピトープまたはその断片と結合する：
Figure 2012505900
Ｘは任意のアミノ酸である。エピトープ断片は、本明細書に記載のタンパク質が特異的に結合するものである。
さらに特に、タンパク質はＩＧＦ−ＩＩの以下の配列またはその断片と結合し得る：
Figure 2012505900
ここで太字ではない残基は保存的変異により置換されてもよい。
タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ（例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ）と、少なくとも１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１０１０および１０１１Ｍ−１の結合親和性で結合できる。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０−３、５×１０−４ｓ−１、または１×１０−４ｓ−１より遅いＫｏｆｆで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと１×１０２、１×１０３、または５×１０３Ｍ−１ｓ−１より速いＫｏｎで結合する。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ活性を、例えば、１０−５、１０−６、１０−７、１０−８、１０−９、および１０−１０Ｍ未満のＫｉで阻害する。タンパク質は、例えば、１００ｎＭ、１０ｎＭまたは１ｎＭ未満のＩＣ５０を有し得る。例えば、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥのみならず、ＩＧＦ−Ｉ受容体（ＩＧＦ−１Ｒ）活性および／またはインスリン受容体のアイソフォーム（ＩＲ−Ａ）活性を調節し得る。タンパク質はＩＧＦ−１Ｒ、ＩＲ−Ａ、ならびにＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ活性を阻害し得る。ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥに対するタンパク質の親和性は１００ｎｍ未満、１０ｎＭ未満、または１ｎＭ未満のＫＤを特徴とし得る。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は抗体であり得る。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合抗体は、単一ポリペプチド（例えば、ｓｃＦｖ）、または別個のポリペプチド（例えば、ＩｇＧまたはＦａｂ）上に含まれるＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列を有し得る。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖および重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の重鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖および重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の重鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体の軽鎖抗体可変領域を有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる重鎖の群の対応するＣＤＲから選択される重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる軽鎖の群の対応するＣＤＲから選択される軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの好ましい実施形態では、タンパク質は、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、ＤＸ−２６４７、およびＤＸ−２６５５からなる軽鎖の群の対応するＣＤＲから選択される軽鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）ならびに重鎖ＣＤＲを１つ以上（例えば、１つ、２つ、または３つ）有する抗体（例えば、ヒト抗体）である。
１つの実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は同一ポリペプチド鎖の成分である。別の実施形態では、ＨＣおよびＬＣ可変ドメイン配列は異なるポリペプチド鎖の成分である。例えば、タンパク質は、ＩｇＧ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４）である。タンパク質は、可溶性Ｆａｂであり得る。他の実施形態では、タンパク質は、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ミニボディ、ｓｃＦｖ：：Ｆｃ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ融合物、ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、Ｆａｂ：：ＨＳＡ：：Ｆａｂ融合物、または本明細書の結合タンパク質の１つの抗原結合部位を含む他の分子を含む。これらＦａｂのＶＨおよびＶＬ領域は、ＩｇＧ、Ｆａｂ、Ｆａｂ２、Ｆａｂ２’、ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ、ＰＥＧ化ｓｃＦｖ、ＰＥＧ化Ｆａｂ２、ＶＨ：：ＣＨ１：：ＨＳＡ＋ＬＣ、ＨＳＡ：：ＶＨ：：ＣＨ１＋ＬＣ、ＬＣ：：ＨＳＡ＋ＶＨ：：ＣＨ１、ＨＳＡ：：ＬＣ＋ＶＨ：：ＣＨ１、または他の適切な構築物として提供できる。
１つの実施形態では、タンパク質は、ヒト抗体またはヒト化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上のヒト抗体フレームワーク領域（例えば、すべてのヒトフレームワーク領域）を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、ヒトＦｃドメインを含むか、またはヒトＦｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、もしくは９９％同一であるＦｃドメインを含む。
１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類抗体または霊長類化抗体であるか、ヒトにおいて非免疫原性である。例えば、タンパク質は、１つ以上の霊長類抗体フレームワーク領域、例えば、すべての霊長類フレームワーク領域を含む。１つの実施形態では、タンパク質は、霊長類Ｆｃドメインを含むか、または霊長類Ｆｃドメインと少なくとも９５、９６、９７、９８、または９９％同一であるＦｃドメインを含む。「霊長類」は、ヒト（Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ）、チンパンジー（Ｐａｎ ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓおよびＰａｎ ｐａｎｉｓｃｕｓ（ボノボ）)、ゴリラ（Ｇｏｒｉｌｌａ ｇｏｒｉｌｌａ）、テナガザル、サル、キツネザル、アイアイ（Ｄａｕｂｅｎｔｏｎｉａ ｍａｄａｇａｓｃａｒｉｅｎｓｉｓ）、およびメガネザルを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥに対する霊長類抗体の親和性は１ｎＭ未満のＫＤを特徴とする。
ある実施形態では、タンパク質は、マウスまたはウサギ由来の配列を含まない（例えば、マウスまたはウサギ抗体ではない）。
ある実施形態では、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥを発現する腫瘍細胞、例えば、結腸直腸細胞株ＳＷ１１１６（グレードＡ）、ＳＷ４８０（グレードＢ）、ＨＴ２９＊、ＨＴ２９、ＳＷ４８０、ＣａＣＯ２、ＨＣＴ１１６、ＳＷ６２０（すべてグレードＣ）、およびＣＯＬＯ２０５（グレードＤ）；乳癌細胞株ＭＣＦ−７＊および４Ｔ１；子宮癌細胞株ＳＫＵＴ−１（中胚葉腫瘍）、横紋筋肉腫細胞株、ならびに肝細胞癌腫細胞株ＨｅｐＧ２、ＨｕＨ７およびＨｅｐ３Ｂに対する結合能があり得る。いくつかの実施形態では、タンパク質は、肺線維芽細胞または線維芽細胞巣と結合できる。
ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質が開発され得る例示的なＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ配列としては、ヒトまたはマウスＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥアミノ酸配列、これらの配列の１つと８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である配列、またはそれらの断片、例えば、シグナル配列またはプロドメインを有さない断片を含むことができる。ヒトおよびマウスＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥアミノ酸配列、ならびにこれらをコードするｍＲＮＡ配列を下に示す。
ＩＧＦ−ＩＩ
＞インスリン様増殖因子ＩＩ［ヒト、小細胞肺癌細胞株Ｔ３Ｍ−１１、ｍＲＮＡ、１３２２ｎｔ］（アクセッション番号Ｓ７７０３５の一部）
Figure 2012505900
＞インスリン様増殖因子ＩＩ；ＩＧＦ−ＩＩ［Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ］。（アクセッション番号ＡＡＢ３４１５５の一部）
Figure 2012505900
＞ハツカネズミ（Ｍｕｓ Ｍｕｓｃｕｌｕｓ）インスリン様増殖因子２、ｍＲＮＡ（ｃＤＮＡクローンＭＧＣ：６０５９８ 画像：３００１３２９５）、完全ｃｄｓ．（アクセッション番号ＢＣ０５３４８９の一部）
Figure 2012505900
＞Ｉｇｆ２タンパク質［ハツカネズミ（Ｍｕｓ Ｍｕｓｃｕｌｕｓ）］。（アクセッション番号ＡＡＨ５３４８９の一部）
Figure 2012505900
ＩＧＦ−ＩＩＥ
＞インスリン様増殖因子ＩＩ［ヒト、小細胞肺癌細胞株Ｔ３Ｍ−１１、ｍＲＮＡ、１３２２ｎｔ］（アクセッション番号Ｓ７７０３５の一部）
Figure 2012505900
＞インスリン様増殖因子ＩＩ；ＩＧＦ−ＩＩ［Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ］。（アクセッション番号ＡＡＢ３４１５５）
Figure 2012505900
＞ハツカネズミ（Ｍｕｓ Ｍｕｓｃｕｌｕｓ）インスリン様増殖因子２、ｍＲＮＡ（ｃＤＮＡクローンＭＧＣ：６０５９８ 画像：３００１３２９５）、完全ｃｄｓ．（アクセッション番号ＢＣ０５３４８９の一部）
Figure 2012505900
＞Ｉｇｆ２タンパク質［ハツカネズミ（Ｍｕｓ Ｍｕｓｃｕｌｕｓ）］。（アクセッション番号ＡＡＨ５３４８９）
Figure 2012505900
ディスプレイライブラリー
ディスプレイライブラリーは、実体のコレクションであり、各実体は、利用可能なポリペプチド成分ならびにポリペプチド成分をコードもしくは同定する回収可能な成分を含む。ポリペプチド成分は変化し、その結果、異なるアミノ酸配列が表現される。ポリペプチド成分は、任意の長さ（例えば、３個のアミノ酸〜３００個超のアミノ酸）であり得る。ディスプレイライブラリーの実体は、複数のポリペプチド成分（例えば、ｓＦａｂの２本のポリペプチド鎖）を含むことができる。１つの例示的な実施形態では、ディスプレイライブラリーを使用して、ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合するタンパク質を同定できる。選択では、ライブラリーの各メンバーのポリペプチド成分を、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ（またはそれらの断片）を用いて探索し、ポリペプチド成分がＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥと結合する場合、ディスプレイライブラリーメンバーを、典型的には、支持体上に保持することによって同定する。
保持されたディスプレイライブラリーメンバーを支持体から回収し、分析する。分析は、増幅およびその後の類似したまたは類似しない条件下での選択を含むことができる。例えば、ポジティブ選択とネガティブ選択を交互に行うことができる。分析は、詳細な特性決定のためのポリペプチド成分のアミノ酸配列決定およびポリペプチド成分の精製も含むことができる。
ディスプレイライブラリー用に様々な形式を使用できる。例としては、下記のものが挙げられる。
ファージディスプレイ：タンパク質成分は、典型的には、バクテリオファージ被覆タンパク質と共有結合している。結合は、被覆タンパク質に融合したタンパク質成分をコードする核酸の翻訳に由来する。結合には、可動性ペプチドリンカー、プロテアーゼ部位、または終止コドンの抑制の結果として組み込まれたアミノ酸が含まれ得る。ファージディスプレイは、例えば、米国特許第５，２２３，４０９号；Ｓｍｉｔｈ （１９８５） Ｓｃｉｅｎｃｅ ２２８：１３１５−１３１７；ＷＯ９２／１８６１９号；ＷＯ９１／１７２７１号；ＷＯ９２／２０７９１号；ＷＯ９２／１５６７９号；ＷＯ９３／０１２８８号；ＷＯ９２／０１０４７号；ＷＯ９２／０９６９０号；ＷＯ９０／０２８０９号；ｄｅ Ｈａａｒｄ ｅｔ ａｌ． （１９９９） Ｊ．Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ ２７４：１８２１８−３０； Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ｅｔ ａｌ． （１９９８） Ｉｍｍｕｎｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ４：１−２０； Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ｅｔ ａｌ． （２０００） Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｔｏｄａｙ ２：３７１−８ ａｎｄ Ｈｏｅｔ ｅｔ ａｌ． （２００５） Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ． ２３（３）３４４−８に記載されている。タンパク質成分を提示するバクテリオファージは、増殖させ、標準的なファージ調製方法（例えば増殖培地からのＰＥＧ沈殿法）を用いて採集することができる。各ディスプレイファージの選択後、選択したタンパク質成分をコードする核酸を、選択したファージを感染させた細胞またはファージ自体から増幅後に単離できる。各コロニーまたはプラークを選別し、核酸を単離し、配列決定することができる。
他のディスプレイ形式。他のディスプレイ形式としては、細胞ベースのディスプレイ（例えば、ＷＯ０３／０２９４５６号を参照されたい）、タンパク質−核酸融合（例えば、米国特許第６，２０７，４４６号を参照されたい）、リボゾームディスプレイ（例えば、Ｍａｔｔｈｅａｋｉｓ ｅｔ ａｌ． （１９９４） Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ９１：９０２２およびＨａｎｅｓ ｅｔ ａｌ． （２０００） Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ． １８：１２８７−９２； Ｈａｎｅｓ ｅｔ ａｌ． （２０００） Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ． ３２８：４０４−３０；およびＳｃｈａｆｆｉｔｚｅｌ ｅｔ ａｌ． （１９９９） Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ． ２３１（１−２）：１１９−３５を参照されたい）、および大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）周辺質ディスプレイ（Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ． ２００５ Ｎｏｖ ２２；ＰＭＩＤ： １６３３７９５８）が挙げられる。
足場。ディスプレイに有用な足場には、以下が含まれる：抗体（例えば、Ｆａｂ断片、単鎖Ｆｖ分子（ｓｃＦＶ）、単一ドメイン抗体、ラクダ抗体、およびラクダ化抗体）；Ｔ細胞受容体；ＭＨＣタンパク質；細胞外ドメイン（例えば、フィブロネクチンＩＩＩ型受容体、ＥＧＦ反復）；プロテアーゼ阻害剤（例えば、Ｋｕｎｉｔｚドメイン、エコチン、ＢＰＴＩなど）；ＴＰＲ反復；三葉構造；亜鉛フィンガードメイン；ＤＮＡ結合タンパク質；特に、単量体ＤＮＡ結合タンパク質；ＲＮＡ結合タンパク質；酵素、例えば、プロテアーゼ（特に、不活化プロテアーゼ）、ＲＮアーゼ；シャペロン（例えば、チオレドキシンおよび熱ショックタンパク質）；細胞内シグナル伝達ドメイン（ＳＨ２およびＳＨ３ドメインなど）；直鎖および拘束ペプチド；ならびに直鎖ペプチド基質。ディスプレイライブラリーは、合成および／または天然の多様性を含み得る。例えば、米国特許第２００４−０００５７０９号を参照されたい。
ディスプレイ技術を使用して、標的の特定のエピトープと結合する結合タンパク質（例えば、抗体）を得ることもできる。これは、例えば、特定のエピトープを欠くかエピトープ内で例えばアラニンにて変異された競合非標的分子を用いることにより行うことができる。かかる非標的分子は、ディスプレイライブラリーを標的と結合させる時の競合分子として、または、例えば、標的特異的ではないディスプレイライブラリーメンバーを分離する洗浄液中で捕捉するための前溶出剤として、下記のネガティブ選択手順で使用できる。
反復選択。１つの好ましい実施形態では、ディスプレイライブラリー技術を反復様式で使用する。第一のディスプレイライブラリーを使用して、標的に対する結合タンパク質を１つ以上同定する。次いで、変異誘発法を用いてこれらの同定された結合タンパク質を変化させ、第二のディスプレイライブラリーを形成する。次いで、例えば、より高いストリンジェンシー、またはより高い競合性の結合および洗浄条件を用いることにより、親和性のより高い結合タンパク質を第二のライブラリーから選択する。
いくつかの実施形態では、変異誘発は、結合面の領域を標的とする。例えば、同定された結合タンパク質が抗体である場合、変異誘発は、本明細書に記載の重鎖または軽鎖のＣＤＲ領域に向けることができる。さらに、変異誘発は、ＣＤＲ付近またはＣＤＲに隣接したフレームワーク領域に向けることができる。抗体の場合、変異誘発は、例えば、正確な段階的改善を行うために１つまたは数個のＣＤＲに限定することもできる。例示的な変異誘発技術としては、エラープローンＰＣＲ、組換え、ＤＮＡシャフリング、部位特異的変異誘発およびカセット変異誘発が挙げられる。
反復選択の１つの例では、本明細書に記載の方法を使用して、標的に対して少なくとも最小限の結合特異性または最小限の活性（例えば、１ｎＭ、１０ｎＭ、または１００ｎＭ未満の結合についての平衡解離定数）でＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合するタンパク質をディスプレイライブラリーから最初に同定する。最初に同定したタンパク質をコードする核酸配列を、変異の導入のための核酸鋳型として使用して、例えば、第一タンパク質と比較して増強された特性（例えば、結合親和性、反応速度、または安定性）を有する第二タンパク質を同定する。
オフレート選択。遅い解離速度は、特にポリペプチドとその標的との間の相互作用に関して高親和性と予想することができるため、本明細書に記載の方法を使用して、標的への結合相互作用のための所望の（例えば、低減した）速度論的解離速度を有する結合タンパク質を単離することができる。
ディスプレイライブラリーから解離の遅い結合タンパク質を選択するために、ライブラリーを、固定した標的と接触させる。次いで、固定した標的を、非特異的にまたは弱く結合した生体分子を除去する第一の溶液で洗浄する。次いで、結合した結合タンパク質を、飽和量の遊離標的または標的特異的高親和性競合モノクローナル抗体（すなわち、粒子に付着していない標的の複製物）を含む第二の溶液で溶離する。遊離標的は、標的から解離した生体分子と結合する。再結合は、より低い濃度の固定した標的と比較して、飽和量の遊離標的により効果的に阻止される。
第二の溶液は、実質的に生理的であるかストリンジェントである溶液条件を有し得る。典型的には、第二の溶液の溶液条件は、第一の溶液の溶液条件と同一である。第二の溶液の画分を、初期画分と後期画分とを区別するために、時間順序で採集する。後期画分は、初期画分中の生体分子よりも遅い速度で標的から解離する生体分子を含む。
さらに、長期間のインキュベーション後でさえも標的と結合し続けるディスプレイライブラリーメンバーを採集することも可能である。これらを、カオトロピック条件を用いて解離させるか、標的に付着させながら増幅させるかのいずれかを行うことができる。例えば、標的に結合したファージを、細菌細胞に接触させることができる。
特異性の選択またはスクリーニング。本明細書に記載のディスプレイライブラリースクリーニング方法は、非標的分子と結合するディスプレイライブラリーメンバーを廃棄する選択またはスクリーニング過程を含み得る。非標的分子の例としては、磁性ビーズ上のストレプトアビジン、ウシ血清アルブミンなどのブロッキング剤、脱脂牛乳、大豆タンパク質、任意の捕捉もしくは標的固定モノクローナル抗体、または標的を発現しない非形質移入細胞が挙げられる。
１つの実施形態では、いわゆる「ネガティブ選択」工程を使用して、標的分子と、関連する非標的分子と、関連するが別個の非標的分子とを識別する。ディスプレイライブラリーまたはそのプールを、非標的分子と接触させる。非標的と結合しない試料メンバーを採集して、標的分子への結合についての選択、またはその後のネガティブ選択に使用する。ネガティブ選択工程は、標的分子と結合するライブラリーメンバーの選択前に行うことも後に行うこともできる。
別の実施形態では、スクリーニング工程を使用する。ディスプレイライブラリーメンバーを標的分子との結合のために単離後、単離した各ライブラリーメンバーの非標的分子（例えば、上に挙げた非標的）に結合する能力について試験する。例えば、高処理ＥＬＩＳＡスクリーニングを用いて、このデータを得ることができる。ＥＬＩＳＡスクリーニングを用いて、各ライブラリーメンバーの標的への結合ならびに関連標的または標的のサブユニット（例えば、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ）に対する異種間の反応性についての定量的データを得ることもでき、異なる条件下（ｐＨ６またはｐＨ７．５など）でも用いることができる。（例えば、コンピュータおよびソフトウェアを用いて）非標的結合データと標的結合データを比較して、標的に特異的に結合するライブラリーメンバーを同定する。
他の例示的発現ライブラリー
他のタイプのタンパク質のコレクション（例えば、発現ライブラリー）を用いて、特定の特性（例えば、ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥとの結合能）を有するタンパク質（例えば、抗体のタンパク質アレイ、例えば、Ｄｅ Ｗｉｌｄｔ ｅｔ ａｌ． （２０００） Ｎａｔ． Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ． １８：９８９−９９４を参照されたい）、λｇｔ１１ライブラリー、２ハイブリッドライブラリーなどを含む）を同定できる。
例示的ライブラリー
非ヒト霊長類を免疫化し、ファージ上にディスプレイできる霊長類抗体遺伝子を採集することが可能である（以下を参照されたい）。かかるライブラリーから、免疫化で使用した抗原と結合する抗体を選択できる。例えば、Ｖａｃｃｉｎｅ． （２００３） ２２（２）：２５７−６７またはＩｍｍｕｎｏｇｅｎｅｔｉｃｓ． （２００５） ５７（１０）：７３０−８を参照されたい。したがって、チンパンジーもしくはマカクを免疫化し、ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥと結合するならびにＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥを阻害する霊長類抗体を選択もしくはスクリーニングする様々な手段を用いることにより、ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥと結合するならびにＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥを阻害する霊長類抗体を得ることができる。ヒト定常領域を有する霊長類化Ｆａｂのキメラを作製することもできる（Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｍｏｌ Ｔｈｅｒ． （２００４） ６（６）：６７５−８３を参照されたい）。カニクイマカクザルおよびヒトの成分由来の遺伝子操作した霊長類化抗体は、ヒト抗体と構造的に識別不能である。したがって、霊長類化抗体は、ヒトにおいて有害反応を引き起こす可能性が低く、長期の常習的な治療に潜在的に適切となる。Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｉｎｖｅｓｔｉｇ Ｄｒｕｇｓ． （２００１） ２（５）：６３５−８。
１つの例示的なライブラリーのタイプは、それぞれが免疫グロブリンドメイン（例えば、免疫グロブリン可変ドメイン）を含む多様なポリペプチドプールを提示する。目的のものは、ライブラリーメンバーが、霊長類または「霊長類化」（例えば、ヒト、非ヒト霊長類または「ヒト化」など）免疫グロブリンドメイン（例えば、免疫グロブリン可変ドメイン）を含むか、またはヒト定常領域を有するキメラ霊長類化Ｆａｂを含む、ディスプレイライブラリーである。ヒトまたはヒト化免疫グロブリンドメインライブラリーを使用して、例えば、ヒト抗原を認識するヒトまたは「ヒト化」抗体を同定し得る。抗体の定常領域およびフレームワーク領域がヒトであるため、これらの抗体は、ヒトに投与された時、それら抗体自体が抗原として認識され標的とされることを回避し得る。定常領域は、ヒト免疫系のエフェクター機能を動員するために至適化もされ得る。インビトロディスプレイ選択過程は、正常なヒト免疫系が自己抗原に対する抗体を生成できないという課題を克服する。
典型的な抗体ディスプレイライブラリーは、ＶＨドメインおよびＶＬドメインを含むポリペプチドを提示する。「免疫グロブリンドメイン」とは、免疫グロブリン分子の可変または定常ドメイン由来のドメインを指す。免疫グロブリンドメインは、典型的には、約７つのβ鎖および保存されたジスルフィド結合から形成される２つのβ−シートを含む（例えば、Ａ． Ｆ． Ｗｉｌｌｉａｍｓ ａｎｄ Ａ． Ｎ． Ｂａｒｃｌａｙ， １９８８， Ａｎｎ． Ｒｅｖ． Ｉｍｍｕｎｏｌ． ６：３８１−４０５を参照されたい）。ディスプレイライブラリーは、抗体をＦａｂ断片として（例えば、２本のポリペプチド鎖を用いて）または単鎖Ｆｖとして（例えば、単ポリペプチド鎖を用いて）提示できる。他の形式も使用できる。
Ｆａｂおよび他の形式の場合、提示された抗体は、軽鎖および／または重鎖の一部として定常領域を１つ以上含むことができる。１つの実施形態では、例えば、Ｆａｂの場合、各鎖は１つの定常領域を含む。他の実施形態では、さらなる定常領域を提示する。
抗体ライブラリーは、いくつかの過程により構築できる（例えば、ｄｅ Ｈａａｒｄ ｅｔ ａｌ．， １９９９， Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２７４：１８２１８−３０； Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ｅｔ ａｌ．， １９９８， Ｉｍｍｕｎｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ４：１−２０； Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ｅｔ ａｌ．， ２０００， Ｉｍｍｕｎｏｌ． Ｔｏｄａｙ ２１：３７１−３７８、およびＨｏｅｔ ｅｔ ａｌ． （２００５） Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ． ２３（３）３４４−８を参照されたい）。さらに、各過程の要素を他の過程の要素と組み合わせることができる。これらの過程は、単一の免疫グロブリンドメイン（例えば、ＶＨまたはＶＬ）または複数の免疫グロブリンドメイン（例えば、ＶＨおよびＶＬ）に変異が導入されるように使用できる。変異は、例えば、１つ以上のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、ＣＤＲ３、ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３、およびＦＲ４の領域（重鎖および軽鎖可変ドメインのいずれかおよび両方のかかる領域を指す）中の免疫グロブリン可変ドメインに導入できる。この変異（１つまたは複数）は、所与の可変ドメインの全３つのＣＤＲ、または（例えば、重鎖可変ドメインの）ＣＤＲ１およびＣＤＲ２に導入し得る。いかなる組み合わせも実行可能である。１つの過程では、ＣＤＲをコードする多様なオリゴヌクレオチドの核酸の対応する領域への挿入により抗体ライブラリーを構築する。オリゴヌクレオチドは、単量体ヌクレオチドまたはトリヌクレオチドを用いて合成できる。例えば、Ｋｎａｐｐｉｋ ｅｔ ａｌ．， ２０００， Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． ２９６：５７−８６は、オリゴヌクレオチドの許容のために操作した制限部位を有する鋳型とトリヌクレオチド合成とを用いてオリゴヌクレオチドをコードするＣＤＲを構築する方法について記載している。
別の過程では、動物（例えば、齧歯類）をＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥで免疫化する。この動物を任意に抗原で追加免疫してさらに応答を刺激する。次いで、この動物から脾臓細胞を単離し、ＶＨおよび／またはＶＬドメインをコードする核酸を増幅し、ディスプレイライブラリー中の発現についてクローニングする。
さらに別の過程では、ナイーブ生殖系列免疫グロブリン遺伝子から増幅した核酸から抗体ライブラリーを構築する。増幅した核酸は、ＶＨおよび／またはＶＬドメインをコードする核酸を含む。免疫グロブリンコード核酸の供給源を以下に記載する。増幅は、ＰＣＲ（例えば、保存された定常領域にアニーリングするプライマーを使用）、または別の増幅方法を含むことができる。
免疫グロブリンドメインをコードする核酸は、例えば、霊長類（例えば、ヒト）、マウス、ウサギ、ラクダ、または齧歯類の免疫細胞から得ることができる。１つの例では、細胞を特定の特性について選択する。様々な成熟期のＢ細胞を選択できる。別の例では、Ｂ細胞はナイーブである。
１つの実施形態では、蛍光活性化細胞選別器（ＦＡＣＳ）を用いて、表面結合性ＩｇＭ、ＩｇＤ、またはＩｇＧ分子を発現するＢ細胞を選別する。さらに、ＩｇＧの異なるアイソタイプを発現するＢ細胞を単離できる。別の好ましい実施形態では、Ｂ細胞またはＴ細胞をインビトロで培養する。細胞は、例えば、支持細胞との培養により、またはマイトジェンもしくは他の調節試薬（ＣＤ４０抗体、ＣＤ４０リガンドもしくはＣＤ２０、酢酸ミリスチン酸ホルボール、細菌リポ多糖、コンカナバリンＡ、植物性血球凝集素、またはヤマゴボウマイトジェンなど）の添加によりインビトロで刺激できる。
別の実施形態では、細胞は、本明細書に記載の病態、例えば、全身性強皮症に伴う肺線維症を有する対象から単離される。
１つの好ましい実施形態では、細胞は、体細胞超変異プログラムを活性化している。例えば、抗免疫グロブリン、抗ＣＤ４０、および抗ＣＤ３８抗体での処置により細胞を刺激して免疫グロブリン遺伝子の体細胞変異誘発を行うことができる、（例えば、Ｂｅｒｇｔｈｏｒｓｄｏｔｔｉｒ ｅｔ ａｌ．， ２００１， Ｊ． Ｉｍｍｕｎｏｌ． １６６：２２２８を参照されたい）。別の実施形態では、細胞はナイーブである。
免疫グロブリン可変ドメインをコードする核酸は、以下の例示的方法により天然のレパートリーから単離できる。まず、ＲＮＡを免疫細胞から単離する。完全長（すなわち、キャッピングされた）ｍＲＮＡを解離する（例えば子牛腸ホスファターゼでキャッピングされていないＲＮＡの分解による）。次いで、タバコ酸ピロホスファターゼを用いてキャップを除去し、逆転写を用いてｃＤＮＡを産生する。
第一（アンチセンス）鎖の逆転写は、任意の適切なプライマーと任意の方法で行うことができる。例えば、ｄｅ Ｈａａｒｄ ｅｔ ａｌ．， １９９９， Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２７４：１８２１８−３０を参照されたい。プライマー結合領域は、例えば、免疫グロブリンの異なるアイソタイプを逆転写するために異なる免疫グロブリン間で一定であり得る。プライマー結合領域は、免疫グロブリンの特定のアイソタイプに特異的でもあり得る。典型的には、プライマーは、少なくとも１つのＣＤＲをコードする配列の３末端側である領域に特異的である。別の実施形態では、ポリｄＴプライマーを使用し得る（重鎖遺伝子にとって好ましいかもしれない）。
合成配列は、逆転写した鎖の３末端に連結できる。合成配列は、逆転写後のＰＣＲ増幅中の順方向プライマーの結合のためのプライマー結合部位として使用できる。合成配列の使用により、利用可能な多様性を完全に捕捉するために異なる順方向プライマーのプールを使用する必要性を回避できる。
次いで、可変ドメインコード遺伝子を、例えば、１回以上のラウンドを用いて増幅する。複数ラウンドを使用する場合、信頼性を高めるためにネスト化プライマーを使用できる。次いで、増幅した核酸を、ディスプレイライブラリーベクターにクローニングする。
二次スクリーニング方法
標的と結合する候補ライブラリーメンバーを選択後、各候補ライブラリーメンバーをさらに分析して、例えば、標的（例えば、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ）の結合特性、または別のタンパク質、例えば、別のＩＧＦタンパク質（ＩＧＦ−Ｉなど）との結合をさらに特徴付けることができる。各候補ライブラリーメンバーは、１つ以上の二次スクリーニングアッセイに供することができる。アッセイは、結合特性、触媒特性、阻害特性、生理特性（例えば、細胞傷害性、腎臓クリアランス、免疫原性）、構造特性（例えば、安定性、高次構造、オリゴマー形成状態）または別の機能特性について行い得る。同一アッセイを異なる条件下で反復使用して、例えば、ｐＨ、イオン感受性、または温度感受性を決定することができる。
適切な場合、アッセイは、ディスプレイライブラリーメンバーを直接使用することもでき、選択されたポリペプチドをコードする核酸から産生された組換えポリペプチドを使用することもでき、選択されたポリペプチド配列に基づき合成された合成ペプチドを使用することもできる。選択されたＦａｂの場合、Ｆａｂを評価することもでき、インタクトなＩｇＧタンパク質として修飾および産生することもできる。結合特性のための例示的アッセイとしては、以下が挙げられる。
ＥＬＩＳＡ。結合タンパク質は、ＥＬＩＳＡアッセイを用いて評価できる。例えば、各タンパク質を、底面が標的（例えば、限られた量の標的）で被覆されているマイクロタイタープレートに接触させる。プレートを緩衝液で洗浄して非特異的に結合したポリペプチドを除去する。次いで、プレート上の標的と結合した結合タンパク質の量を、結合タンパク質（例えば、結合タンパク質のタグまたは一定の部分）を認識できる抗体を用いてプレートを探索することにより決定する。抗体は、検出システム（例えば、適切な基質を与えた場合に比色産物を産生するアルカリホスファターゼまたは西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）などの酵素）に連結する。
均一結合アッセイ。本明細書に記載の結合タンパク質の標的結合能は、均一アッセイを用いて分析できる（すなわち、アッセイの全成分を添加後、さらなる流体の操作を必要としない）。例えば、均一アッセイとして蛍光共鳴エネルギー転移（ＦＲＥＴ）を使用できる（例えば、Ｌａｋｏｗｉｃｚ ｅｔ ａｌ．の米国特許第５，６３１，１６９号；Ｓｔａｖｒｉａｎｏｐｏｕｌｏｓ， ｅｔ ａｌ．の米国特許第４，８６８，１０３号を参照されたい）。第二の分子（例えば、標的）が第一の分子（例えば、画分中で同定された分子）に近接して存在する場合、その放出された蛍光エネルギーが第二の分子上の蛍光標識により吸収されることができるように第一の分子上のフルオロフォア標識を選択する。第二の分子上の蛍光標識は転移エネルギーに吸収時に蛍光を発する。標識間のエネルギー転移の効率は分子間距離に比例するため、分子間の空間的関係を評価できる。分子間で結合が生じる状況では、アッセイにおける「アクセプター」分子標識の蛍光放出は最大であるはずである。ＦＲＥＴによるモニタリングのために構成された結合事象は、標準的な蛍光定量検出法により、例えば、蛍光光度計を用いて、都合よく測定できる。第一または第二の結合分子の量を滴定することにより結合曲線を作成して平衡結合定数を推定できる。
均一アッセイの別の例は、ＡＬＰＨＡＳＣＲＥＥＮ（商標）（Ｐａｃｋａｒｄ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ， Ｍｅｒｉｄｅｎ ＣＴ）である。ＡＬＰＨＡＳＣＲＥＥＮ（商標）は２つの標識されたビーズを使用する。一方のビーズは、レーザーによって励起時に一重項酸素を生成する。他方のビーズは、一重項酸素が第一のビーズから拡散されてそれと衝突した場合に光シグナルを生成する。シグナルは、２つのビーズが近接している場合にのみ生成される。一方のビーズをディスプレイライブラリーメンバーに付着し、他方を標的に付着することができる。シグナルを測定して、結合の程度を決定する。
表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）。結合タンパク質と標的との間の相互作用は、ＳＰＲを用いて分析できる。ＳＰＲつまり生体分子相互作用分析（ＢＩＡ）は、いかなる反応体も標識せずに、生体特異的相互作用をリアルタイムで検出する。ＢＩＡチップの結合表面の質量（結合事象を示す）の変化により、表面付近の光の屈折率が変化する（表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）の光学現象）。屈折度の変化により、検出可能なシグナルが生成され、これを生体分子間のリアルタイム反応の指標として測定する。ＳＰＲの使用方法については、例えば、米国特許第５，６４１，６４０号；Ｒａｅｔｈｅｒ， １９８８， Ｓｕｒｆａｃｅ Ｐｌａｓｍｏｎｓ Ｓｐｒｉｎｇｅｒ Ｖｅｒｌａｇ； Ｓｊｏｌａｎｄｅｒ ａｎｄ Ｕｒｂａｎｉｃｚｋｙ， １９９１， Ａｎａｌ． Ｃｈｅｍ． ６３：２３３８−２３４５； Ｓｚａｂｏ ｅｔ ａｌ．， １９９５， Ｃｕｒｒ． Ｏｐｉｎ． Ｓｔｒｕｃｔ． Ｂｉｏｌ． ５：６９９−７０５およびＢＩＡｃｏｒｅ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＡＢ （Ｕｐｐｓａｌａ， Ｓｗｅｄｅｎに提供されているオンライン情報源に記載されている。
ＳＰＲ由来の情報を使用して、標的への結合タンパク質の結合についての平衡解離定数（ＫＤ）、および速度変数（ＫｏｎおよびＫｏｆｆを含む）の正確かつ定量的な測定値を得ることができる。かかるデータを使用して、異なる生体分子を比較することができる。例えば、発現ライブラリーから選択されたタンパク質を比較して、標的に対する親和性が高いまたはＫｏｆｆが遅いタンパク質を同定できる。この情報は、構造活性関係（ＳＡＲ）を展開するために使用することもできる。例えば、親タンパク質の成熟版の速度および平衡結合変数を、親タンパク質の変数と比較できる。特定の結合変数（例えば、高親和性および遅いＫｏｆｆ）と相関する所与の位置の変異型アミノ酸を同定できる。この情報は、構造モデリングと（例えば、相同モデリング、エネルギー最小化、またはＸ線結晶学またはＮＭＲによる構造決定を用いて）組み合わせることができる。結果として、タンパク質とその標的との間の物理的相互作用を定式化することができ、これを使用して、他の設計過程を誘導することができる。
細胞アッセイ。細胞表面上に目的の標的を一過性または安定して発現し提示する細胞に対して結合する能力について、結合タンパク質をスクリーニングできる。例えば、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を蛍光標識し、アンタゴニスト抗体の存在下または非存在下でのＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥへの結合を、フローサイトメトリー（例えば、ＦＡＣＳ装置）を用いた蛍光強度の変化により検出できる。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を得るための他の例示的方法
ディスプレイライブラリーの使用の他に、他の方法を用いてＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質（例えば、抗体）を得ることができる。例えば、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥタンパク質またはそれらの領域を、非ヒト動物（例えば、齧歯類）における抗原として使用できる。
１つの実施形態では、非ヒト動物は、少なくとも一部のヒト免疫グロブリン遺伝子を含む。例えば、ヒトＩｇ遺伝子座の巨大断片を用いて、マウス抗体産生を欠損したマウス株を操作することが可能である。ハイブリドーマ技術を用いて、所望の特異性を有する遺伝子由来の抗原特異的モノクローナル抗体（Ｍａｂ）を産生および選択し得る。例えば、ＸＥＮＯＭＯＵＳＥ（商標）、Ｇｒｅｅｎ ｅｔ ａｌ．， １９９４， Ｎａｔ． Ｇｅｎ． ７：１３−２１；米国特許第２００３−００７０１８５号、ＷＯ９６／３４０９６号（１９９６年１０月３１日公開）、およびＰＣＴ出願番号ＰＣＴ／ＵＳ９６／０５９２８号（１９９６年４月２９日出願）を参照されたい。
別の実施形態では、非ヒト動物からモノクローナル抗体を得、次いで、修飾、例えば、ヒト化または脱免疫化する。Ｗｉｎｔｅｒは、ヒト化抗体を調製するために使用し得るＣＤＲグラフティング法について記載している（英国特許第２１８８６３８Ａ号（１９８７年３月２６日出願）；米国特許第５，２２５，５３９号）。特定のヒト抗体のすべてのＣＤＲを少なくとも一部の非ヒトＣＤＲと置換してもよいし、ＣＤＲの一部のみを非ヒトＣＤＲと置換してもよい。要されるのは、所定の抗原へのヒト化抗体の結合に要される数のＣＤＲを置換することのみである。
ヒト化抗体は、ヒトＦｖ可変領域由来の等価な配列と結合する抗原に直接関与しないＦｖ可変領域配列を置換することにより生成できる。ヒト化抗体の一般的な生成方法については、Ｍｏｒｒｉｓｏｎ， Ｓ． Ｌ．， １９８５， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２２９：１２０２−１２０７により、Ｏｉ ｅｔ ａｌ．， １９８６， ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ４：２１４により、およびＱｕｅｅｎ ｅｔ ａｌ．、米国特許第５，５８５，０８９号、米国特許第５，６９３，７６１号および米国特許第５，６９３，７６２号により提供されている。それらの方法は、少なくとも１本の重鎖または軽鎖由来の免疫グロブリンＦｖ可変領域のすべてまたは一部をコードする核酸配列の単離、操作、および発現を含む。かかる核酸の供給源は多く利用可能である。例えば、上記のように、所定の標的に対する抗体を産生するハイブリドーマから核酸を得ることができる。次いで、ヒト化抗体をコードする組換えＤＮＡまたはその断片を、適切な発現ベクターにクローニングできる。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質の免疫原性の減少
免疫グロブリン ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質（例えば、ＩｇＧまたはＦａｂ ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質）を、免疫原性を減少するように修飾し得る。対象が治療分子に対する免疫応答を生じる可能性が減少するので、免疫原性の減少は、治療薬としての使用を意図するＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質で望ましい。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質の免疫原性の減少に有用な技術としては、潜在的なヒトＴ細胞エピトープの欠失／修飾およびＣＤＲの外側の配列（例えば、フレームワークおよびＦｃ）の「生殖系列化」が挙げられる。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合抗体は、ヒトＴ細胞エピトープの特異的欠失またはＷＯ９８／５２９７６号およびＷＯ００／３４３１７号に開示の方法による「脱免疫化」により修飾し得る。簡単に述べると、抗体の重鎖および軽鎖可変領域をＭＨＣクラスＩＩと結合するペプチドについて分析し、これらのペプチドが、潜在的Ｔ細胞エピトープを提示する（ＷＯ９８／５２９７６号およびＷＯ００／３４３１７号に定義）。潜在的なＴ細胞エピトープの検出のために、「ペプチドトレッディング（ｐｅｐｔｉｄｅ ｔｈｒｅａｄｉｎｇ）」と呼ばれるコンピュータモデリングアプローチを適用し、および加えてヒトＭＨＣクラスＩＩ結合ペプチドのデータベースを、ＷＯ９８／５２９７６号およびＷＯ００／３４３１７号に記載のように、ＶＨおよびＶＬ配列中に存在するモチーフについて検索できる。これらのモチーフは、１８個の主要ＭＨＣクラスＩＩ ＤＲアロタイプのいずれかと結合することにより、潜在的なＴ細胞エピトープを構成する。検出された潜在的なＴ細胞エピトープは、可変領域中の少数のアミノ酸残基を置換することにより、または好ましくは単一アミノ酸の置換により排除が行われ得る。可能な保存的置換を行う限り、ヒト生殖系列抗体配列の位置に共通のアミノ酸を頻繁に使用し得るが、これに限らない。ヒト生殖系列配列については、Ｔｏｍｌｉｎｓｏｎ， Ｉ．Ａ． ｅｔ ａｌ．， １９９２， Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． ２２７：７７６−７９８； Ｃｏｏｋ， Ｇ． Ｐ． ｅｔ ａｌ．， １９９５， Ｉｍｍｕｎｏｌ． Ｔｏｄａｙ Ｖｏｌ． １６ （５）： ２３７−２４２； Ｃｈｏｔｈｉａ， Ｄ． ｅｔ ａｌ．， １９９２， Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏ． ２２７：７９９−８１７に開示されている。Ｖ ＢＡＳＥディレクトリは、ヒト免疫グロブリン可変領域配列の包括的ディレクトリを提供している（Ｔｏｍｌｉｎｓｏｎ， Ｉ．Ａ． ｅｔ ａｌ． ＭＲＣ Ｃｅｎｔｒｅ ｆｏｒ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ， Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ， ＵＫによって編纂されている）。脱免疫化の変化を同定後、ＶＨおよびＶＬをコードする核酸を、変異誘発または他の合成方法（例えば、ｄｅ ｎｏｖｏ合成、カセット置換など）により構築できる。変異誘発した可変配列は、任意に、ヒト定常領域（例えば、ヒトＩｇＧ１）またはκ定常領域と融合できる。
一部の場合、潜在的Ｔ細胞エピトープは、抗体機能にとって重要であることが知られているまたは予想される残基を含む。例えば、潜在的Ｔ細胞エピトープは、通常、ＣＤＲに偏っている。さらに、潜在的Ｔ細胞エピトープは、抗体の構造および結合に重要なフレームワーク残基で生じ得る。これらの潜在的エピトープの排除を行うための変更には、一部の場合、例えば、変化した鎖および変化していない鎖の作製および試験によるさらなる精査が必要となる。可能な場合、ＣＤＲと重複する潜在的Ｔ細胞エピトープを、ＣＤＲの外側の置換により排除した。一部の場合、ＣＤＲ内の改変は唯一の選択肢であるので、置換を含む変異型および含まない変異型を試験すべきである。他の場合、潜在的Ｔ細胞エピトープの排除に必要な置換は、抗体結合にとって重要であり得るフレームワーク内の残基位置で行う。これらの場合、置換を含む変異型および含まない変異型を試験すべきである。したがって、一部の場合、重鎖および軽鎖可変領域を脱免疫化したいくつかの変異型を設計し、様々な重／軽鎖の組み合わせを試験して至適な脱免疫化抗体を同定した。次いで、脱免疫化の範囲（すなわち、可変領域に残る潜在的Ｔ細胞エピトープ数）と併せて異なる変異型の結合親和性を考慮することにより最終的な脱免疫化抗体を選択することができる。脱免疫化を用いて、任意の抗体、例えば、非ヒト配列を含む抗体（例えば、合成抗体）、マウス抗体、他の非ヒトモノクローナル抗体、またはディスプレイライブラリーから単離した抗体を修飾できる。
結合特性が実質的に保持される限り、フレームワーク領域の１つ以上の非生殖系列アミノ酸を、抗体の対応する生殖系列アミノ酸に戻すことによりＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合抗体を「生殖系列化」する。類似の方法を、定常領域（例えば、定常免疫グロブリンドメイン）中で使用することもできる。
ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合する抗体（例えば、本明細書に記載の抗体）は、１つ以上の生殖系列配列にさらに類似する抗体の可変領域を作製するために修飾し得る。例えば、抗体は、基準生殖系列配列にさらに類似させるために、１、２、３、または４個以上のアミノ酸置換を、例えば、フレームワーク、ＣＤＲ、または定常領域中に含むことができる。１つの例示的な生殖系列化方法は、単離抗体の配列に類似する（例えば、特定のデータベースで最も類似する）生殖系列配列を１つ以上同定することを含み得る。次いで、単離抗体を、漸進的に、または他の変異との組み合わせのいずれかにより（アミノ酸レベルで）変異させる。例えば、一部のまたはすべての可能な生殖系列変異をコードする配列を含む核酸ライブラリーを作製する。次いで、変異抗体を評価し、例えば、単離抗体と比較して１つ以上のさらなる生殖系列残基を有し、かつ依然として有用な（例えば、機能活性を有する）抗体を同定する。１つの実施形態では、単離抗体に、可能な限り多くの生殖系列残基を導入する。
１つの実施形態では、変異誘発を用いて、フレームワークおよび／または定常領域に１つ以上の生殖系列残基を置換または挿入する。例えば、生殖系列フレームワークおよび／または定常領域の残基は、修飾される非可変領域と類似する（例えば、最も類似する）生殖系列配列に由来し得る。変異誘発後、抗体の活性（例えば、結合または他の機能活性）を評価して、１つ以上の生殖系列残基が容認される（すなわち、活性を無効にしない）かどうかを決定できる。類似の変異誘発をフレームワーク領域中で実施できる。
生殖系列配列の選択は、異なる方法で実施できる。例えば、生殖系列配列が選択性または類似性について所定の基準（例えば、少なくとも一定の同一率、例えば、少なくとも７５、８０、８５、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、または９９．５％同一）を満たす場合に生殖系列配列を選択できる。この選択は、少なくとも２、３、５、または１０個の生殖系列配列を用いて実施できる。ＣＤＲ１およびＣＤＲ２の場合、類似の生殖系列配列の同定は、１つのかかる配列の選択を含むことができる。ＣＤＲ３の場合、類似の生殖系列配列の同定は、１つのかかる配列の選択を含むことができるが、アミノ末端部分およびカルボキシ末端部分に別々に関わる２つの生殖系列配列の使用を含み得る。他の実施形態では、１つまたは２つを超える生殖系列配列を使用して、例えば、コンセンサス配列を形成する。
１つの実施形態では、特定の基準可変ドメイン配列（例えば、本明細書に記載の配列）に関して、関連可変ドメイン配列は、基準ＣＤＲ配列中の残基（ヒト生殖系列配列（すなわち、ヒト生殖系列核酸によってコードされるアミノ酸配列）中の対応する位置の残基と同一の残基）と同一ではないＣＤＲアミノ酸位置の少なくとも３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、９５または１００％を有する。
１つの実施形態では、特定の基準可変ドメイン配列（例えば、本明細書に記載の配列）に関して、関連可変ドメイン配列は、ヒト生殖系列配列（例えば、基準可変ドメイン配列と関連する生殖系列配列）由来のＦＲ配列と同一のＦＲ領域の少なくとも３０、５０、６０、７０、８０、９０または１００％を有する。
したがって、所与の目的の抗体に対して類似の活性を有するが、１つ以上の生殖系列配列、特に１つ以上のヒト生殖系列配列により類似した抗体を単離することが可能である。例えば、抗体は、ＣＤＲの外側領域（例えば、フレームワーク領域）中の生殖系列配列と少なくとも９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、または９９．５％同一であり得る。さらに、抗体は、修飾される可変領域に類似する（例えば、最も類似する）生殖系列配列由来の生殖系列残基をＣＤＲ領域中に少なくとも１、２、３、４、または５個含むことができる。主な目的の生殖系列配列は、ヒト生殖系列配列である。抗体の活性（例えば、ＫＡにより測定した結合活性）は、元の抗体の係数内、すなわち１００、１０、５、２、０．５、０．１、および０．００１であり得る。
ヒト免疫グロブリン遺伝子の生殖系列配列は決定されており、いくつかの供給源（ワールドワイドウェブのｉｍｇｔ．ｃｉｎｅｓ．ｆｒで利用可能なｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＩｍＭｕｎｏＧｅｎｅＴｉｃｓ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｓｙｓｔｅｍ（登録商標）（ＩＭＧＴ）およびＶ ＢＡＳＥディレクトリ（Ｔｏｍｌｉｎｓｏｎ， Ｉ．Ａ． ｅｔ ａｌ． ＭＲＣ Ｃｅｎｔｒｅ ｆｏｒ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ， Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ， ＵＫによって編纂され、ワールドワイドウェブのｖｂａｓｅ．ｍｒｃ−ｃｐｅ．ｃａｍ．ａｃ．ｕｋで利用可能）を含む）から利用可能である。
Ｖκについての例示的な生殖系列基準配列は、Ｏ１２／Ｏ２、Ｏ１８／Ｏ８、Ａ２０、Ａ３０、Ｌ１４、Ｌ１、Ｌ１５、Ｌ４／１８ａ、Ｌ５／Ｌ１９、Ｌ８、Ｌ２３、Ｌ９、Ｌ２４、Ｌ１１、Ｌ１２、Ｏ１１／Ｏ１、Ａ１７、Ａ１、Ａ１８、Ａ２、Ａ１９／Ａ３、Ａ２３、Ａ２７、Ａ１１、Ｌ２／Ｌ１６、Ｌ６、Ｌ２０、Ｌ２５、Ｂ３、Ｂ２、Ａ２６／Ａ１０、およびＡ１４を含む。例えば、Ｔｏｍｌｉｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ．， １９９５， ＥＭＢＯ Ｊ． １４（１８）：４６２８−３を参照されたい。
ＨＣ可変ドメインの生殖系列基準配列は、特定の標準構造（例えば、Ｈ１およびＨ２超可変ループ中の１〜３つの構造）を有する配列に基づくことができる。Ｃｈｏｔｈｉａ ｅｔ ａｌ．， １９９２， Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． ２２７：７９９−８１７； Ｔｏｍｌｉｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ．， １９９２， Ｊ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． ２２７：７７６−７９８）；およびＴｏｍｌｉｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ．， １９９５， ＥＭＢＯ Ｊ． １４（１８）：４６２８−３８に記載のように、免疫グロブリン可変ドメインの超可変ループの標準構造は、その配列から推測できる。１〜３つの構造を有する例示的配列は、ＤＰ−１、ＤＰ−８、ＤＰ−１２、ＤＰ−２、ＤＰ−２５、ＤＰ−１５、ＤＰ−７、ＤＰ−４、ＤＰ−３１、ＤＰ−３２、ＤＰ−３３、ＤＰ−３５、ＤＰ−４０、７−２、ｈｖ３００５、ｈｖ３００５ｆ３、ＤＰ−４６、ＤＰ−４７、ＤＰ−５８、ＤＰ−４９、ＤＰ−５０、ＤＰ−５１、ＤＰ−５３、およびＤＰ−５４を含む。
タンパク質産生
標準的な組換え核酸法を使用して、ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合するタンパク質を発現させることができる。一般に、タンパク質をコードする核酸配列を核酸発現ベクターにクローニングする。勿論、タンパク質が複数のポリペプチド鎖を含む場合、各鎖を、同一または異なる細胞中で発現する発現ベクター（例えば、同一または異なるベクター）にクローニングし得る。
抗体産生。いくつかの抗体（例えば、Ｆａｂ）は、細菌細胞（例えば、大腸菌細胞）中で産生できる。例えば、Ｆａｂが、ディスプレイ実体とバクテリオファージタンパク質（またはその断片）との間の抑制可能な終止コドンを含むファージディスプレイベクター中の配列によりコードされる場合、ベクター核酸を、終止コドンを抑制できない細菌細胞に移入できる。この場合、Ｆａｂは遺伝子ＩＩＩタンパク質に融合せず、周辺質および／または培地に分泌される。
抗体は真核細胞中で産生することもできる。１つの実施形態では、抗体（例えば、ｓｃＦｖ）を、ピキア属（Ｐｉｃｈｉａ）（例えば、Ｐｏｗｅｒｓ ｅｔ ａｌ．， ２００１， Ｊ． Ｉｍｍｕｎｏｌ． Ｍｅｔｈｏｄｓ． ２５１：１２３−３５を参照されたい）、ハンセウラ属（Ｈａｎｓｅｕｌａ）、またはサッカロミセス属（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）などの酵母菌細胞中で発現させる。
１つの好ましい実施形態では、抗体を哺乳動物細胞中で産生する。クローン抗体またはその抗原結合断片を発現するために好ましい哺乳動物宿主細胞としては、チャイニーズハムスター卵巣細胞（ＣＨＯ細胞）（例えば、Ｋａｕｆｍａｎ ａｎｄ Ｓｈａｒｐ， １９８２， Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ． １５９：６０１ ６２１に記載のＤＨＦＲ選択マーカーを使用したＵｒｌａｕｂ ａｎｄ Ｃｈａｓｉｎ， １９８０， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ７７：４２１６−４２２０に記載のｄｈｆｒ−ＣＨＯ細胞が挙げられる）、リンパ球細胞株、例えば、ＮＳ０骨髄腫細胞およびＳＰ２細胞、ＣＯＳ細胞、ＨＥＫ２９３Ｔ細胞（Ｊ． Ｉｍｍｕｎｏｌ． Ｍｅｔｈｏｄｓ （２００４） ２８９（１−２）：６５−８０．）、およびトランスジェニック動物（例えば、トランスジェニック哺乳動物）由来の細胞が挙げられる。例えば、細胞は、哺乳動物上皮細胞である。
組換え発現ベクターは、多様な免疫グロブリンドメインをコードする核酸配列の他に、宿主細胞中でベクターの複製を調節する配列（例えば、複製起点）および選択マーカー遺伝子などの追加配列を保有し得る。選択マーカー遺伝子は、ベクターが導入された宿主細胞の選択を容易にする（例えば、米国特許第４，３９９，２１６号、同第４，６３４，６６５号および同第５，１７９，０１７号を参照されたい）。例えば、典型的には、選択マーカー遺伝子は、ベクターが導入された宿主細胞にＧ４１８、ハイグロマイシンまたはメトトレキサートなどの薬剤耐性を付与する。好ましい選択マーカー遺伝子としては、ジヒドロ葉酸還元酵素（ＤＨＦＲ）遺伝子（メトトレキサート選択／増幅を有するｄｈｆｒ−宿主細胞用）およびｎｅｏ遺伝子（Ｇ４１８選択用）が挙げられる。
抗体またはその抗原結合部分の組換え発現のための例示的なシステムでは、抗体重鎖および抗体軽鎖の両方をコードする組換え発現ベクターを、リン酸カルシウム媒介形質移入によりｄｈｆｒ−ＣＨＯ細胞中に導入する。組換え発現ベクター内で、抗体の重鎖および軽鎖遺伝子を、エンハンサー／プロモーター調節因子（例えば、ＳＶ４０、ＣＭＶ、およびアデノウイルスなどに由来する、ＣＭＶエンハンサー／ＡｄＭＬＰプロモーター調節因子またはＳＶ４０エンハンサー／ＡｄＭＬＰプロモーター調節因子など）にそれぞれ作動可能に連結して、遺伝子の高レベルの転写を駆動する。組換え発現ベクターはまた、メトトレキサート選択／増幅を用いることによりベクターを形質移入したＣＨＯ細胞の選択を可能とするＤＨＦＲ遺伝子も保有する。選択された形質転換宿主細胞を培養して、抗体の重鎖および軽鎖を発現させ、培養培地からインタクトな抗体を回収する。標準的な分子生物学的技術を用いて、組換え発現ベクターを調製し、宿主細胞に形質移入を行い、形質転換体を選択し、宿主細胞を培養し、培養培地から抗体を採集する。例えば、一部の抗体は、プロテインＡまたはプロテインＧ結合マトリックスを用いた親和性クロマトグラフィーにより単離できる。
Ｆｃドメインを含む抗体のために、抗体産生システムは、Ｆｃ領域がグリコシル化された抗体を産生し得る。例えば、ＩｇＧ分子のＦｃドメインを、ＣＨ２ドメイン中のアスパラギン２９７位でグリコシル化する。アスパラギンは、二分岐型オリゴ糖による修飾のための部位である。グリコシル化は、Ｆｃｇ受容体および補体Ｃ１ｑによって媒介されるエフェクター機能に必要であることが示されている（Ｂｕｒｔｏｎ ａｎｄ Ｗｏｏｆ， １９９２， Ａｄｖ． Ｉｍｍｕｎｏｌ． ５１：１−８４； Ｊｅｆｆｅｒｉｓ ｅｔ ａｌ．， １９９８， Ｉｍｍｕｎｏｌ． Ｒｅｖ． １６３：５９−７６）。１つの実施形態では、Ｆｃドメインは、アスパラギン２９７位に対応する残基を適切にグリコシル化する哺乳動物発現システムで産生される。Ｆｃドメインはまた、他の真核生物翻訳後修飾も含み得る。
抗体は、トランスジェニック動物によって産生することもできる。例えば、米国特許第５，８４９，９９２号には、トランスジェニック哺乳動物の乳腺中の抗体の発現方法について記載されている。乳汁特異的プロモーター、目的の抗体をコードする核酸、および分泌のためのシグナル配列を含む導入遺伝子を構築する。かかるトランスジェニック哺乳動物の雌により産生された乳汁は、そこで分泌される目的の抗体を含む。抗体は、乳汁から精製することもでき、一部の適用のために直接使用することもできる。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質の特性決定
結合タンパク質のＥＣ５０（有効濃度５０％）値。一連の結合タンパク質または結合タンパク質群内で、より低いＩＣ５０値またはＥＣ５０値を有する結合タンパク質は、より高いＩＣ５０値またはＥＣ５０値を有する結合タンパク質よりもＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥのさらに強力な阻害剤であるとみなされる。例示的な結合タンパク質は、例えば、ＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥ活性阻害に関するインビトロアッセイで測定して、ＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥが２ｐＭ時に８００ｎＭ、４００ｎＭ、１００ｎＭ、２５ｎＭ、５ｎＭ、または１ｎＭ未満のＩＣ５０値を有する。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質はまた、ＩＧＦ受容体Ｉ型（ＩＧＦ−１ＲまたはＩＧＦ−ＩＲ）およびＩＲ−Ａ（インスリン受容体アイソフォームＡ）シグナル伝達事象上のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ活性と関連させて特性決定することができる。
結合タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥに対する選択性について評価することもできる。例えば、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／もしくはＩＧＦ−ＩＩＥに対する効力についてアッセイして、ＩＧＦ−ＩＩパネルならびに各ＩＧＦについてのＩＣ５０値もしくはＥＣ５０値を決定することができる。１つの実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥに対して低いＩＣ５０値またはＥＣ５０値を示し、試験パネル内の別のＩＧＦに対してより高いＩＣ５０値またはＥＣ５０値を示す、例えば、少なくとも２倍、５倍、または１０倍高い化合物は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥに対して選択的であるとみなされる。
細胞ベースのアッセイにおいて、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質のＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ阻害能を評価できる。三次元コラーゲンマトリックス内部の腫瘍細胞の拡大を、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ過剰発現に応答して著しく増強することができる（Ｈｏｔａｒｙ ｅｔ ａｌ．， ２００３ Ｃｅｌｌ １１４：３３−４５）。このアッセイへのＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質の添加を用いて、タンパク質の阻害特性および／または他の特性を決定できる。
ラット、マウス、またはサルにおける薬物動態学的研究を、血清中のＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥの半減期を決定するためにＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を使用して実施できる。同様に、結合タンパク質の治療薬としての使用、例えば、本明細書に記載の疾患または容態（例えば、全身性強皮症に伴う肺線維症）を治療するための効果を、例えば、動物疾患モデルにてインビボで評価できる。
医薬組成物
ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ（例えば、ヒトＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ）の両方またはいずれかと結合し、例えば、少なくとも１つの免疫グロブリン可変領域を含むタンパク質（例えば、結合タンパク質）を、ＳＳｃに伴う肺線維症の治療（または予防）方法に使用できる。結合タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質（例えば、本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥへの結合が同定された抗体分子、他のポリペプチドまたはペプチド）を含む組成物（例えば、医薬上許容可能な組成物または医薬組成物）中に存在できる。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、医薬上許容可能な担体と共に処方できる。医薬組成物としては、治療組成物および診断組成物（例えば、インビボ画像化のための標識ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を含む組成物）、ならびにＳＳｃに伴う肺線維症の治療（または予防）のための標識ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を含む組成物が挙げられる。
医薬上許容可能な担体は、生理的に適合する任意およびすべての溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤、抗真菌剤、等張剤および吸収遅延剤などを含む。吸入および鼻腔内投与に適した担体も意図されるが、好ましくは、担体は、静脈内、筋肉内、皮下、非経口、脊髄、または表皮投与（例えば、注射または注入）に適している。投与経路に応じて、酸の作用および化合物を不活化し得る他の天然条件から化合物を保護するための材料でＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を被覆し得る。
医薬上許容可能な塩とは、親化合物の所望の生物活性を保持し、いかなる望ましくない毒性作用も与えない塩である（例えば、Ｂｅｒｇｅ， Ｓ．Ｍ．， ｅｔ ａｌ．， １９７７， Ｊ． Ｐｈａｒｍ． Ｓｃｉ． ６６：１−１９を参照されたい）。かかる塩の例としては、酸付加塩および塩基付加塩が挙げられる。酸付加塩としては、非毒性無機酸（塩酸、硝酸、リン酸、硫酸、臭化水素酸、ヨウ化水素酸、亜リン酸など）、ならびに非毒性有機酸（脂肪族モノカルボン酸、脂肪族ジカルボン酸、フェニル置換アルカン酸、ヒドロキシアルカン酸、芳香族酸、脂肪族スルホン酸、および芳香族スルホン酸など）に由来する酸付加塩が挙げられる。塩基付加塩としては、アルカリ土類金属（ナトリウム、カリウム、マグネシウム、カルシウムなど）、ならびに非毒性有機アミン（Ｎ，Ｎ’−ジベンジルエチレンジアミン、Ｎ−メチルグルカミン、クロロプロカイン、コリン、ジエタノールアミン、エチレンジアミン、プロカインなど）由来の塩基付加塩が挙げられる。
組成物は様々な形態であってよい。これらは、例えば、液体、半固体および固体投与形態（溶液（例えば、注射液および注入液）、分散液もしくは懸濁液、錠剤、丸剤、粉末剤、リポソームおよび坐剤など）を含む。形態は、意図する投与方法および治療への適用に応じ得る。ヒトへの抗体の投与のために使用される組成物に類似した組成物など、多数の組成物が注射液または注入液の形態である。例示的な投与方法は、非経口（例えば、静脈内、皮下、腹腔内、筋肉内）である。１つの実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を静脈内注入または静脈内注射により投与する。別の好ましい実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を筋肉内注射または皮下注射により投与する。
本明細書で使用する「非経口投与」および「非経口的に投与される」という語句は、経腸および局所投与以外の投与方法を意味し、通常、静脈内、筋肉内、動脈内、髄腔内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、くも膜下、髄腔内、硬膜外および胸骨内への注射および注入が挙げられるが、これらに限定されない注射による。
組成物は、高濃度の薬剤に適した溶液、マイクロエマルジョン、分散液、リポソーム、または他の規則正しい構造として処方できる。滅菌注射液は、上に列挙した成分の単独または組み合わせを含む適切な溶媒中に必要量の結合タンパク質を組み込んだ後、必要に応じてろ過滅菌することにより調製できる。一般に、基剤としての分散媒および上に列挙した必要な他の成分を含む滅菌ビヒクルへ活性化合物を組み込むことにより分散液を調製する。滅菌注射液の調製用の滅菌粉末剤の場合、好ましい調製方法は、有効成分および事前にろ過滅菌したその溶液由来の任意のさらなる所望の成分の粉末が得られる真空乾燥および凍結乾燥である。溶液の適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティングの使用により、分散液の場合は必要な粒径の維持により、および界面活性剤の使用により維持できる。吸収を遅延化させる薬剤（例えば、モノステアリン酸塩およびゼラチン）を組成物中に含めることにより、注射用組成物を長期吸収させることができる。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、様々な方法により投与できるが、多数の適用において好ましい投与経路／投与方法は静脈内注射または静脈内注入である。例えば、治療的適用のため、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、約１〜１００ｍｇ／ｍ２または７〜２５ｍｇ／ｍ２の用量に到達させるために、３０、２０、１０、５、または１ｍｇ／分未満の速度の静脈内注入により投与できる。投与経路および／または投与方法は、所望の結果に応じて異なる。ある実施形態では、活性化合物は、化合物を急速な放出から保護する担体を用いて調製し得る（徐放剤（インプラントを含む）およびマイクロカプセル化送達システムなど）。エチレン酢酸ビニル、ポリ酸無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、およびポリ乳酸などの生分解性生体適合性ポリマーを使用できる。かかる製剤の多数の調製方法が利用可能である。例えば、Ｓｕｓｔａｉｎｅｄ ａｎｄ Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ Ｒｅｌｅａｓｅ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ， Ｊ．Ｒ． Ｒｏｂｉｎｓｏｎ， ｅｄ．， １９７８， Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ， Ｉｎｃ．， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋを参照されたい。
医薬組成物は、医療機器を使用して投与できる。例えば、１つの実施形態では、本明細書に開示の医薬組成物は、機器（例えば、針無し皮下注射機器、ポンプ、またはインプラント）を使用して投与できる。
ある実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、インビボで確実に適切に分布されるように処方できる。例えば、血液脳関門（ＢＢＢ）は、多数の高親水性化合物を排除する。本明細書に開示の治療化合物は、（所望の場合）ＢＢＢを確実に通過するように、例えば、リポソーム中に処方できる。リポソームの製造方法については、例えば、米国特許第４，５２２，８１１号；同第５，３７４，５４８号；ならびに同第５，３９９，３３１号を参照されたい。リポソームは、特定の細胞または臓器に選択的に輸送されて標的とした薬剤送達を増強する１つ以上の部分を含み得る（例えば、Ｖ．Ｖ． Ｒａｎａｄｅ， １９８９， Ｊ． Ｃｌｉｎ． Ｐｈａｒｍａｃｏｌ． ２９：６８５を参照されたい）。
投与計画は、至適な所望の応答（例えば、治療反応）が得られるように調節できる。例えば、治療状況の要件によって示されるように、単回ボーラスを投与してもよく、複数回に分割した用量を長期間投与してもよく、用量を比例的に減量もしくは増量してもよい。投与を容易にし、投与量を均一にするために、投与量単位形態で非経口組成物を処方することが特に有利である。本明細書で使用する場合、投与量単位形態とは、治療すべき対象への単回投与に適した物理的に分離した単位を指し、各単位は、必要な医薬担体と組み合わせて所望の治療効果が得られるように計算された所定量の活性化合物を含む。投与量単位形態の仕様は、（ａ）活性化合物の固有の特徴および達成すべき特定の治療効果、ならびに（ｂ）個体の感受性の処置のためのかかる活性化合物の配合技術に固有の制限、によって影響を受け、これらに直接依存し得る。
本明細書に開示の結合タンパク質（例えば、抗体）の治療有効量または予防有効量の例示的範囲は０．１〜２０ｍｇ／ｋｇ、さらに好ましくは１〜１０ｍｇ／ｋｇであるが、これらに限定されない。抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ抗体は、例えば、静脈内注入により、例えば、約１〜１００ｍｇ／ｍ２または約５〜３０ｍｇ／ｍ２の用量に到達するために、３０、２０、１０、５、または１ｍｇ／分未満の速度で投与できる。抗体よりも小さな分子量の結合タンパク質では、適量は比例的に低値であり得る。投与量値は、緩和すべき容態の型および重症度に応じて変わり得る。特定の対象のための具体的な投与計画は、個体の必要性ならびに組成物の投与者もしくは投与監視者の専門的な判断により経時的に調整できる。
本明細書に開示の医薬組成物は、「治療有効量」または「予防有効量」の本明細書に開示のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を含み得る。「治療有効量」とは、所望の治療成果を達成するために必要な投与量および期間で有効な量を指す。組成物の治療有効量は、個体の病態、年齢、性別、および体重、ならびに個体の所望の応答を誘発するタンパク質の能力などの要因に応じて変わり得る。治療有効量はまた、組成物のいずれの毒性作用または有害作用よりも治療に有利な効果が勝る量である。
「治療有効投与量」は、好ましくは、測定可能な変数を（例えば、未治療対象と比較して、ＩｇＧ抗体の循環レベルを統計的に有意な程度または少なくとも約２０％、さらに好ましくは少なくとも約４０％、よりさらに好ましくは少なくとも約６０％、それよりさらに好ましくは少なくとも約８０％）調節する。測定可能な変数（例えば、疾患関連変数）を調節する化合物の能力は、ヒトの障害および容態（例えば、全身性強皮症に伴う肺線維症）における有効性を予想する動物モデルシステムで評価できる。あるいは、組成物の特性は、化合物のインビトロでの変数調節能力を検討することにより評価できる。
「予防有効量」とは、所望の予防成果を達成するために必要な投与量および期間で有効な量を指す。典型的には、予防用量は疾患の前または初期段階の対象に使用されるため、予防有効量は治療有効量より少ない。
安定化および保持
１つの実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を、循環、例えば、血液、血清、リンパ液、または他の組織でのその安定化および／または保持を、例えば、少なくとも１．５、２、５、１０、または５０倍改善する部分と物理的に結合する。例えば、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を、ポリマー、例えば、実質的に非抗原性のポリマー（ポリアルキレンオキシドまたはポリエチレンオキシドなど）と結合し得る。適切なポリマーの重量は大幅に変化する。約２００〜約３５，０００（または約１，０００〜約１５，０００、および２，０００〜約１２，５００）の範囲の数平均分子量を有するポリマーを使用できる。例えば、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、水溶性ポリマー、例えば、親水性ポリビニルポリマー、例えばポリビニルアルコールおよびポリビニルピロリドンと結合できる。かかるポリマーの一覧としては、ポリアルキレンオキシドホモポリマー（ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）またはポリプロピレングリコールなど）、ポリオキシエチレン化ポリオール、それらのコポリマーおよびそれらのブロックコポリマー（ブロックコポリマーの水溶性が維持される場合）が挙げられるが、これらに限定されない。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、担体タンパク質、例えば、血清アルブミン（ヒト血清アルブミンなど）と結合することもできる。例えば、翻訳融合を使用して、担体タンパク質とＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質とを結合させることができる。
キット
本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、キット中に（例えば、キットの成分として）提供できる。例えば、キットは（ａ）ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質、例えば、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を含む組成物（例えば、医薬組成物）、および、任意に（ｂ）情報資料を含む。情報資料は、本明細書に記載の方法および／または本明細書に記載の方法のためのＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質の使用に関する説明資料、指示資料、販売資料または他の資料であり得る。
キットの情報資料は、その形態が限定されない。１つの実施形態では、情報資料は、化合物の産生、化合物の分子量、濃度、有効期限、バッチまたは産生部位情報などの情報を含むことができる。１つの実施形態では、情報資料は、障害および容態（例えば、全身性強皮症に伴う肺線維症）を治療、予防、または診断するための結合タンパク質の使用に関する。
１つの実施形態では、情報資料は、本明細書に記載の方法を実施するために適切な方法、例えば、適切な用量、投与形態、または投与方法（例えば、本明細書に記載の用量、投与形態、または投与方法）でＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を投与するための使用説明書を含むことができる。別の実施形態では、情報資料は、適切な対象、例えば、ヒト、例えば、本明細書に記載の障害または容態（例えば、全身性強皮症に伴う肺線維症）を有するかまたはそのリスクのあるヒトにＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を投与するための使用説明書を含むことができる。例えば、資料は、本明細書に記載の障害または容態（例えば、全身性強皮症に伴う肺線維症）を有する患者にＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を投与するための使用説明書を含むことができる。キットの情報資料は、その形態が限定されない。多くの場合、情報資料（例えば、使用説明書）は印刷物として提供されるが、他の形式（コンピュータ媒体資料など）でも提供され得る。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、任意の形態（例えば、液体、乾燥形態または凍結乾燥形態）で提供できる。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は実質的に純粋および／または無菌であることが好ましい。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質が溶液で提供される場合、溶液は好ましくは水溶液であり、滅菌水溶液が好ましい。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質が乾燥形態として提供される場合、一般に、適切な溶媒の添加によって再構成する。溶媒（例えば、滅菌水または滅菌緩衝液）は任意にキット中に提供できる。
キットは、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を含む組成物用の容器を１つ以上含むことができる。いくつかの実施形態では、キットは、組成物および情報資料用に別々の容器、仕切りまたは区画を含む。例えば、組成物を、瓶、バイアル、またはシリンジに含めることができ、情報資料を容器と関連させて含めることができる。他の実施形態では、キットの個別の要素を単一の非分割容器内に含める。例えば、組成物を、ラベルの形態で情報資料を添付した瓶、バイアルまたはシリンジ中に含める。いくつかの実施形態では、キットは、個別の容器を複数（例えば、パックで）含み、各容器は１つ以上の単位投与形態（例えば、本明細書に記載の投与形態）のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を含む。例えば、キットは、複数のシリンジ、アンプル、ホイルパッケージ、またはブリスターパックを含み、それぞれが単一の単位用量のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を含む。キットの容器は、気密性、防水性（例えば、湿気または蒸発の変化を防止する）、および／または遮光性であり得る。
キットは、組成物の投与に適した機器、例えば、シリンジ、吸入器、点滴器（例えば、点眼器）、スワブ（例えば、綿棒または木製スワブ）、またはかかる送達機器のいずれかを任意に含む。１つの実施形態では、機器は、結合タンパク質を一定量投与するインプラント機器である。本開示は、例えば、本明細書に記載の成分の組み合わせによるキットの提供方法も特徴とする。
治療
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合し、本明細書に記載および／または詳述の方法によって同定されるタンパク質は、特にヒト対象での治療および予防において有用である。これらの結合タンパク質は、様々な障害（例えば、全身性強皮症に伴う肺線維症）を治療、予防、および／もしくは診断するために、対象に投与されるか、培養細胞（例えば、インビトロまたはエクスビボ（ｅｘ ｖｉｖｏ））にさえも投与される。治療は、障害、障害症状または障害素因を緩和する、軽減する、改変する、修復する、寛解する、改善する、または影響を及ぼすために有効な量を投与することを含む。治療は、疾患または容態の発現の遅延化、例えば、発現の予防または悪化の予防も行い得る。
本明細書で使用する場合、障害の予防に有効な標的結合剤の量、つまり結合剤の予防有効量とは、単回または複数回用量を対象に投与した時、障害、例えば、本明細書に記載の障害（例えば、全身性強皮症に伴う肺線維症）の発現または再発を予防または遅延化するのに有効な標的結合剤、例えば、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質（例えば、本明細書に記載の抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ抗体）の量を指す。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質および他剤の投与方法は、「医薬組成物（Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｓ）」にも記載されている。使用する分子の適切な投与量は、対象の年齢および体重ならびに使用する特定の薬剤に応じ得る。結合タンパク質は、例えば、天然または病理学的な作用因子とＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥとの間の望ましくない相互作用を阻害、低減するために競合薬として使用できる。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質の用量は、患者におけるＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥの活性を特に疾患部位で９０％、９５％、９９％、または９９．９％阻止する上で十分な量であり得る。これは、疾患に応じて、０．１、１．０、３．０、６．０、または１０．０ｍｇ／Ｋｇを要し得る。これらの用量は、分子質量が１５０，０００ｇ／モル（２つの結合部位）であるＩｇＧについては、５Ｌ血液量に対して、約１８ｎＭ、１８０ｎＭ、５４０ｎＭ、１．０８μＭ、および１．８μＭの結合部位に相当する。
１つの実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を、細胞の活性、例えば、インビボ肺線維芽細胞の活性を阻害する（例えば、コラーゲンおよび／またはフィブロネクチン産生の少なくとも１つの活性を阻害するかまたは低減する）ために使用する。結合タンパク質は、これら自体でまたは薬物（例えば、細胞傷害性薬物、細胞傷害性酵素、または放射性同位体）と結合させることにより使用できる。この方法は、結合タンパク質単独または薬物（例えば、細胞傷害性薬物）と結合させた結合タンパク質を、かかる治療を必要とする対象に投与することを含む。例えば、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥを実質的には阻害しないＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、毒素などの作用因子を含むナノ粒子をＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ関連細胞または組織、例えば、肺線維芽細胞またはＳＳｃ肺由来線維芽細胞巣に送達するために使用し得る。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ発現細胞を認識し、肺に関連した（例えば、肺の近傍または肺と混じった）細胞、例えば、肺線維芽細胞、例えば、ＳＳｃ肺由来線維芽細胞、または線維芽細胞巣と結合できるため、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、任意のかかる細胞を阻害する（例えば、少なくとも１つの活性を阻害するか、またはコラーゲンおよび／またはフィブロネクチン産生を低減する）ために用いて、線維症を阻害または低減できる。肺線維芽細胞の近傍または肺の線維芽細胞巣（例えば、ＳＳｃ肺由来）のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ活性の低減は、ＳＳｃに伴う肺線維症の発現および／または進行、増殖因子の活性化などにおけるＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ活性に依存し得る細胞を間接的に阻害できる。
結合タンパク質は、薬物（例えば、任意の様々な細胞傷害性薬物および治療薬）をＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥが存在する細胞および組織に送達するために使用し得る。例示的な薬物としては、放射線放出化合物、植物、真菌、もしくは細菌起源の分子、生体タンパク質、ならびにそれらの混合物が挙げられる。細胞傷害性薬物は、細胞中で作用する細胞傷害性薬物（短距離放射体、例えば、短距離高エネルギーα放射体の毒素など）であり得る。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ発現細胞（特に、肺線維芽細胞またはＳＳｃ肺由来線維芽細胞巣）を標的にするために、プロドラッグシステムを使用できる。例えば、第一の結合タンパク質を、プロドラッグ活性化因子と近接した場合のみに活性化されるプロドラッグとコンジュゲートさせる。プロドラッグ活性化因子を、第二の結合タンパク質、好ましくは標的分子上の非競合部位と結合する第二の結合タンパク質にコンジュゲートさせる。２つの結合タンパク質が競合結合部位または非競合結合部位に結合するかどうかを、従来の競合結合アッセイにより決定できる。例示的薬剤プロドラッグ対については、Ｂｌａｋｅｌｙ ｅｔ ａｌ．， （１９９６） Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ， ５６：３２８７ ３２９２に記載されている。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質はインビボで直接使用して、天然の補体依存性細胞傷害性（ＣＤＣ）または抗体依存性細胞傷害性（ＡＤＣＣ）を介して、抗原発現細胞を排除することができる。本明細書に記載の結合タンパク質は、ＩｇＧ１、−２、もしくは−３由来のＦｃ部分、または補体と結合するＩｇＭの対応部分などの補体結合エフェクタードメインを含むことができる。１つの実施形態では、標的細胞集団は、本明細書に記載の結合剤および適切なエフェクター細胞にてエクスビボ処置する。この処置は、補体または補体を含む血清の添加によって補足できる。さらに、本明細書に記載の結合タンパク質で被覆した標的細胞の食作用を、補体タンパク質の結合により改善できる。別の実施形態では、標的（補体結合エフェクタードメインを含む結合タンパク質で被覆した細胞）を補体により溶解する。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質の投与方法は、「医薬組成物（Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｓ）」に記載されている。使用する分子の適切な投与量は、対象の年齢および体重ならびに使用する特定の薬物に応じる。結合タンパク質は、例えば、天然または病理学的な作用因子とＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ間の望ましくない相互作用を阻害または低減するために競合薬として使用できる。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、高分子および低分子、例えば、遺伝子を遺伝子療法目的で内皮または上皮内細胞に送達して、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ発現組織のみを標的とするために使用できる。結合タンパク質は、様々な細胞傷害性薬物（治療薬、放射線放出化合物、植物、真菌、もしくは細菌起源の分子、生体タンパク質、およびこれらの混合物を含む）を送達するために使用し得る。細胞傷害性薬物は、本明細書に記載のように、細胞内作用細胞傷害性薬物（短距離放射体、例えば、短距離高エネルギーα放射体など）であり得る。
ポリペプチド毒素の場合、組換え核酸技術を使用して、翻訳様式として結合タンパク質（例えば、抗体またはその抗原結合断片）および細胞毒素（またはそのポリペプチド成分）をコードする核酸を構築することができる。次いで、例えば、細胞中で組換え核酸を発現し、コードされた融合ポリペプチドを単離する。
あるいは、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、高エネルギー放射体（例えば、ある部位に局在した場合にいくつかの細胞が死滅する放射性同位体（１３１Ｉなど）、γ放射体）に結合体化できる。例えば、Ｓ．Ｅ． Ｏｒｄｅｒ， “Ａｎａｌｙｓｉｓ， Ｒｅｓｕｌｔｓ， ａｎｄ Ｆｕｔｕｒｅ Ｐｒｏｓｐｅｃｔｉｖｅ ｏｆ ｔｈｅ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ Ｕｓｅ ｏｆ Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ Ａｎｔｉｂｏｄｙ ｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ”， Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｆｏｒ Ｃａｎｃｅｒ Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ ａｎｄ Ｔｈｅｒａｐｙ， Ｒ．Ｗ． Ｂａｌｄｗｉｎ ｅｔ ａｌ． （ｅｄｓ．）， ｐｐ ３０３ ３１６ （Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ １９８５）を参照されたい。他の適切な放射性同位体としては、２１２Ｂｉ、２１３Ｂｉ、および２１１Ａｔなどのａ放射体、ならびに１８６Ｒｅおよび９０Ｙなどのｂ放射体が挙げられる。さらに、１７７Ｌｕも造影剤および細胞傷害性薬物の両方として使用し得る。
１３１Ｉ、９０Ｙ、および１７７Ｌｕで標識した抗体を用いる放射免疫療法（ＲＩＴ）が熱心に臨床的に調査されている。これら３つの核種の物理的特性は著しく異なるため、放射性核種の選択は、目的の組織に最大の線量を送達するために非常に重要である。９０Ｙのより高いβエネルギー粒子は、嵩高い腫瘍に効果的であり得る。１３１Ｉの比較的低いエネルギーのβ粒子が理想的であるが、放射性ヨウ化分子のインビボ脱ハロゲン化は、主に抗体の内部移行に不利である。対照的に、１７７Ｌｕは０．２〜０．３ｍｍ範囲のみの低エネルギーβ粒子を有し、９０Ｙと比較してはるかに低い線量を骨髄に送達する。さらに、（９０Ｙと比較して）より長い物理的半減期のため、体滞留時間がより長い。結果として、比較的低い線量で、１７７Ｌｕ標識作用因子のより高い活性（より高いｍＣｉ量）を骨髄に投与できる。様々な癌の治療における１７７Ｌｕ標識抗体の使用を調査したいくつかの臨床研究が行われている。（Ｍｕｌｌｉｇａｎ Ｔ ｅｔ ａｌ．， １９９５， Ｃｌｉｎ． Ｃａｎｃ． Ｒｅｓ． １： １４４７−１４５４； Ｍｅｒｅｄｉｔｈ ＲＦ， ｅｔ ａｌ．， １９９６， Ｊ． Ｎｕｃｌ． Ｍｅｄ． ３７：１４９１−１４９６； Ａｌｖａｒｅｚ ＲＤ， ｅｔ ａｌ．， １９９７， Ｇｙｎｅｃｏｌ． Ｏｎｃｏｌ． ６５： ９４−１０１）。
例示的疾患および容態
本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／もしくはＩＧＦ−ＩＩＥ活性が関与する疾患もしくは容態（例えば、本明細書に記載の疾患もしくは容態）の治療、またはそれらに関連する１つ以上の症状の治療に有用である。いくつかの実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質（例えば、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合ＩｇＧまたはＦａｂ）は、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ活性を阻害する。
かかる疾患および容態の例としては、全身性強皮症に伴う肺線維症が挙げられる。治療有効量のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ活性が関与する障害を有するかまたは有することが疑われる対象へ投与し、それにより、その障害を治療する（例えば、障害の症状もしくは特徴を寛解もしくは改善する、または疾患進行を遅延化させる、安定化させるおよび／もしくは停止する）。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、治療有効量で投与する。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質の治療有効量は、単回または複数回用量で対象へ投与した時、対象を治療する（例えば、対象の障害症状の少なくとも１つを、かかる治療を行わない場合に予期される程度を超えて治癒、緩和、軽減または改善する）のに有効な量である。組成物の治療有効量は、個体の病態、年齢、性別、および体重、ならびに個体の所望の応答を誘発する化合物の能力などの要因に応じて変わり得る。治療有効量はまた、組成物のいずれの毒性作用または有害作用よりも治療に有利な効果が勝る。
治療有効量は、典型的には、対象へ単回または複数回用量で投与した時、対象を治療する（例えば、対象の障害症状の少なくとも１つを、かかる治療を行わない場合に予期される程度を超えて治癒、緩和、軽減または改善する）のに有効な化合物量で投与され得る。組成物の治療有効量は、個体の病態、年齢、性別、および体重、ならびに個体の所望の応答を誘発する化合物の能力などの要因に応じて変わり得る。治療有効量ではまた、組成物のいずれの毒性または有害作用よりも治療に有利な効果が勝る。治療有効投与量は好ましくは、未治療対象と比較して測定可能なパラメータを好ましく調節する。測定可能なパラメータを阻害する化合物の能力は、ヒト障害における有効性を予想する動物モデルシステムで評価できる。
投与計画は、至適な所望の応答（例えば、治療反応）が得られるように調節できる。例えば、治療状況の要件によって示されるように、単回ボーラスを投与してもよく、複数回に分割した用量を長期間投与してもよく、用量を比例的に減量もしくは増量してもよい。投与を容易にし、投与量を均一にするために、投与量単位形態で非経口組成物を処方することが特に有利である。本明細書で使用する場合、投与量単位形態とは、治療すべき対象への単回投与に適した物理的に分離した単位を指し、各単位は、必要な医薬担体と組み合わせて所望の治療効果が得られるように計算された所定量の活性化合物を含む。
全身性強皮症に伴う肺線維症
線維症は、臓器または組織の正常な構成要素としての線維組織の形成ではなく、修復または反応過程としての、臓器または組織中の過剰な線維結合組織の形成または発現である。肺線維症は肺の瘢痕に関与する。徐々に、肺の気嚢が線維化組織に置き換えられる。瘢痕が形成される時、この組織はより厚くなり、血流中へ酸素を輸送する組織の能力の不可逆的な喪失を引き起こす。
強皮症は、皮膚または他の臓器の硬化または強皮を特徴とする慢性自己免疫疾患である。この疾患の全身性型である全身性強皮症（ＳＳｃ）は、心臓、腎臓、肺、または腸管障害の結果、致死的となり得る。全身性強皮症における肺線維症は、高い罹患率および死亡率を伴う。少なくとも１／３のＳＳｃ患者が臨床的に有意な肺線維症を有し、最大７０％のＳＳｃ患者において肺機能欠陥が明らかである。ＳＳｃにおける肺線維症発現時からの１０年生存率は約７０％であり、多数の患者が進行性息切れ障害を経験する。慢性炎症は進行性肺損傷および増加性線維症を続発すると考えられる。
肺線維症の症状としては、例えば、息切れ（特に労作時）、慢性乾性咳および／もしくは短い空咳、疲労および脱力、胸部不快感、食欲喪失、ならびに急速な体重低下が挙げられる。未治療の個人は、気腫、肺感染、および心疾患を含む合併症を発症する。
世界中で約５百万人が肺線維症に罹患している。米国では、かかる患者は２００，０００人を超えている。典型的には、患者は診断時、４０歳代および５０歳代である。しかしながら、診断時年齢は７歳から８０歳代の範囲に及んでいる。
肺線維症の原因およびリスク因子は、例えば、自己免疫障害、ウイルス感染、遺伝子的素因（例えば、ＳＰ−Ｃタンパク質の変異）、肺の微視的損傷、吸入環境および／もしくは職業汚染、喫煙、疾患（強皮症、関節リウマチ、狼瘡およびサルコイドーシスなど）、特定の薬剤、ならびに治療放射線と関連付けられている。
コラーゲンおよび／またはフィブロネクチン産生の増大は、全身性強皮症に伴う肺線維症の特徴である。活性コラーゲンおよび／またはフィブロネクチン合成部位である線維芽細胞巣（ＦＦ）は、肺線維症の病理学的特徴であり、重度の疾患において線維化反応が開始するおよび／または永続化する場所である。
コラーゲンは、動物における結合組織の主要タンパク質であり、哺乳動物において最も豊富なタンパク質であり、身体全体のタンパク質の含有量の約５０％を成す。２８種を超すコラーゲンが文献に記載されている。体内のコラーゲンの９０％超はＩ、ＩＩ、ＩＩＩ、およびＩＶ型である。
フィブロネクチンは、インテグリンと呼ばれる膜スパニング受容体タンパク質および細胞外マトリックス成分（コラーゲン、フィブリンおよび硫酸ヘパランなど）と結合する炭水化物を約５％含む高分子量細胞外マトリックスの糖タンパク質である。フィブロネクチンにはいくつかのアイソフォームがあり、すべて単一遺伝子の産物である。これらのアイソフォーム構造は、Ｉ、ＩＩおよびＩＩＩと呼ばれる、異なる長さおよびジスルフィド結合の有無を示す３つの種類の反復内領域から構成される。ｍＲＮＡ前駆体の代替的なスプライシングは、これら３種類の領域の組み合わせをもたらすが、可変領域ももたらす。
現在の治療としては、例えば、ある抗炎症剤（例えば、ステロイド）、細胞傷害性薬物、免疫抑制剤、コラーゲン合成阻害剤、エンドセリン受容体アンタゴニストおよび外科手術が挙げられる。例えば、高用量の経口コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン、４０〜８０ｍｇ／日）は通常の治療法である。シクロホスファミドなどの細胞傷害性薬物およびアザチオプリンなどの免疫抑制剤（シクロホスファミドは、免疫抑制剤でもある）も使用されている。これらの薬剤を用いた臨床経験は約２０％の患者が改善することを示唆する。コルチコステロイドに対する応答は、肺生検で炎症が多くかつ線維症が少なく認められた患者においてより優れている。ピルフェニドンなどのコラーゲン合成阻害剤およびボセンタンなどのエンドセリン受容体アンタゴニストも有効であり得る。高選択的な末期肺線維症患者のための肺移植が報告されている。特に、シクロホスファミドまたはアザチオプリンは、ＳＳｃに伴う肺線維症の治療に使用できる。さらなる例として、シクロホスファミドのパルスを、しばしば低用量のステロイド；エポプロステノール、ボセンタンまたはイロプロスト（例えばエーロゾル化イロプロスト）と共に使用できる。
様々な肺（ｌｕｎｇ）機能検査（肺（ｐｕｌｍｏｎａｒｙ）機能検査とも呼ばれる）を用いて、肺障害の原因を決定し、人の肺機能を評価し、肺疾患治療の有効性をモニタリングできる。例えば、スパイロメトリーは、空気がどの程度およびどれだけ迅速に肺から移動し得るかを測定する。スパイロメトリーにより測定される一般的な肺機能値は、対象が可能な限り深く吸息した後に力を込めて呼息できる空気量を測定する努力肺活量（ＦＶＣ）；対象が１回の呼吸で力を込めて呼息できる空気量を測定する努力呼気肺活量（ＦＥＶ）である。対象が呼息する空気量は１秒量（ＦＥＶ１）、２秒量（ＦＥＶ２）、または３秒量（ＦＥＶ３）として測定し得る。ＦＥＶ１をＦＶＣで除したものも決定できる；呼息半ばの空気流（ＦＶＣ）を測定する努力呼気流量２５％〜７５％；対象がどれだけ迅速に呼息できるかを測定するピーク呼気流量（ＰＥＦ）；対象が１分間に吸息および呼息できる空気の最大量を測定する最大換気量（ＭＶＶ）；対象が可能な限り深く吸息した後に対象がゆっくりと呼息できる空気量を測定する静的肺活量（ＳＶＣ）；対象が可能な限り深く吸息した後の対象の肺の空気量を測定する全肺気量（ＴＬＣ）；正常な呼息終了時の対象の肺の空気量を測定する機能的残気量（ＦＲＣ）；正常な呼息後の対象の肺の空気量（ＦＲＣ）と対象が力を込めて呼息した後の量（ＲＶ）との間の相違を測定する呼気予備量（ＥＲＶ）。気体拡散検査は、肺の気嚢（肺胞）を通過する一分間当たりの酸素および他の気体の量：対象の血流中酸素および二酸化炭素の量を決定する動脈血気体；ならびに、対象の肺が少量の一酸化炭素（ＣＯ）を血液中へどれだけよく移動させるかを測定する一酸化炭素拡散能（トランスファー因子、またはＴＦとも呼ばれる）を測定する。体幹プレチスモグラフィーは、対象の肺が保持できる空気の総量である全肺能力（ＴＬＣ）、対象が可能な限り完全に呼息した後に対象の肺に残る空気量である残気量（ＲＶ）を測定するために使用し得る。喘息または喘鳴を引き起こし得る物質（アレルゲン）に対する対象の気道の応答を測定するために吸入投与試験を使用する。運動負荷試験は肺機能検査で発揮する効果を評価する。
本開示は、有効量のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質（例えば、抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ ＩｇＧまたはＦａｂ）、例えば、本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を投与することにより、全身性強皮症に伴う肺線維症の症状の治療（例えば、線維芽細胞巣、息切れ、慢性咳嗽、疲労および脱力、胸部不快感、食欲喪失、ならびに／または急速な体重減少の低減または除去）方法、または全身性強皮症に伴う肺線維症の治療方法、または全身性強皮症に伴う肺線維症であると既に診断されている対象の無病生存期間の延長方法を提供する。いくつかの実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ活性を阻害する。
ある実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、単剤治療として投与される。他の実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、ＳＳｃに伴う肺線維症を治療するための追加薬剤と併用投与される。
また、全身性強皮症に伴う肺線維症の発現リスクを有する対象へ有効量のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を投与することにより全身性強皮症に伴う肺線維症の発現リスクを予防または低減し、それにより対象の全身性強皮症に伴う肺線維症の発現リスクも低減する方法も提供する。例えば、方法は、例えば、ＳＳｃに伴う肺線維症の症状を１つ以上示すまたはＳＳｃに伴う肺線維症の発現リスクのある対象（例えば、対象はＳＳｃと診断されているまたはその症状もしくはリスク因子を有している、または対象はＳＳｃに伴う肺線維症のリスク因子、例えば、自己免疫障害、ウイルス感染、遺伝子的素因（例えば、ＳＰ−Ｃタンパク質における変異）、肺の微視的損傷、吸入環境および／もしくは職業汚染、喫煙、疾患（強皮症、関節リウマチ、狼瘡およびサルコイドーシスなど）、特定の薬剤、ならびに治療的放射線を１つ以上有している）において、ＳＳｃに伴う肺線維症またはその症状（例えば、線維芽細胞巣、息切れ、慢性咳嗽、疲労および脱力、胸部不快感、食欲喪失、急速な体重減少）の発現の遅延化および／または進行の緩慢化に使用できる。ＳＳｃ素因は、自己免疫疾患の家族性素因を含む；ＣＯＬ１Ａ２およびＴＧＦ−β１多型はＳＳＣの重症度および発現に影響し得る；免疫応答の元のエピトープとしてサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）を示唆する限定的な証拠がある；ならびに有機溶媒および他の化学的薬剤が強皮症と関係している。
全身性強皮症に伴う肺線維症の治療の治療有効量の決定のためのガイダンスは、治療すべき全身性強皮症に伴う肺線維症のインビボモデルを参照することによって得ることができる。例えば、齧歯類の肺線維症モデルにおける治療有効量であるＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質の量を使用して、治療有効量の用量の選択を導き得る。いくつかの齧歯類の肺線維症モデルが利用可能である（例えば、Ｍｏｏｒｅ ａｎｄ Ｈｏｇａｂｏａｍ ｅｔ ａｌ． Ａｍ Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ Ｌｕｎｇ Ｃｅｌｌ Ｍｏｌ Ｐｈｙｓｉｏｌ． ２９４：Ｌ１５２−６０ （２００８）を参照されたい）。
併用療法
本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質（例えば、抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ ＦａｂまたはＩｇＧ）は、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ活性に関連する疾患または容態（例えば、本明細書に記載の疾患または容態）を治療するための１つ以上の他の療法と併用して投与できる。例えば、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、外科手術、ＩＧＦ−ＩＩ阻害剤、例えば、低分子阻害剤、別の抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ ＦａｂまたはＩｇＧ（例えば、本明細書に記載の別のＦａｂまたはＩｇＧ）、別のＩＧＦ−ＩＩ阻害剤、ペプチド阻害剤、または小分子阻害剤と共に治療的または予防的に使用できる。本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質との併用療法に使用できるＩＧＦ−ＩＩ阻害剤の例としては、ＩＧＦ−ＩおよびＩＧＦ−ＩＩと交差反応する抗ＩＧＦ−ＩＩ抗体（例えば、ＷＯ２００７１１８２１４号、ＷＯ２００７０７０４３２号、欧州特許第１５０５０７５号、米国特許第２００６０１６５６９５号、ＷＯ２００５０２８５１５号、ＷＯ２００５０２７９７０号、ＷＯ２００５０１８６７１号を参照されたい）、ならびにＩＧＦ−ＩＩのみと反応する抗ＩＧＦ−ＩＩ抗体（例えば、ＷＯ２００７１１８２１４号を参照されたい）が挙げられる。
１つ以上の低分子ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ阻害剤を、１つ以上の本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質と併用して使用できる。例えば、併用により、副作用が軽減するように低分子阻害剤の必要量をより少なくすることができる。
本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、全身性強皮症に伴う肺線維症を治療するための１つ以上の現在の療法（外科手術が挙げられるが、これに限定されない）と併用して投与できる。例えば、ＩＧＦ−ＩＩを阻害するかまたはＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ活性の下流事象を阻害するタンパク質は、ＳＳｃに伴う肺線維症のための別の治療（外科手術または第二薬の投与など）と併用して使用することもできる。例えば、第二薬は、ある抗炎症剤（例えば、ステロイド）、細胞傷害性薬物、免疫抑制剤、コラーゲン合成阻害剤、エンドセリン受容体アンタゴニストまたは外科手術を含むことができる。例えば、高用量の経口コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン、４０〜８０ｍｇ／日）は通常の治療である。シクロホスファミドなどの細胞傷害性薬物およびアザチオプリンなどの免疫抑制剤（シクロホスファミドは、免疫抑制剤でもある）も使用されている。ピルフェニドンなどのコラーゲン合成阻害剤およびボセンタンなどのエンドセリン受容体アンタゴニストも有効であり得る。高選択的な末期肺線維症患者のための肺移植が報告されている。特に、シクロホスファミドまたはアザチオプリンをＳＳｃに伴う肺線維症の治療に使用できる。さらなる例として、シクロホスファミドのパルスを、しばしば、低用量ステロイド；エポプロステノール、ボセンタンまたはイロプロスト（例えばエーロゾル化イロプロスト）と共に使用できる。
「併用」という用語は、同一患者を治療するための２つ以上の薬剤または療法の使用を指し、これらの薬剤または療法の使用または作用は時間的に重複する。これらの薬剤または療法は（例えば、患者に投与する単一製剤としてまたは同時投与する２つの別々の製剤として）同時投与することも、任意の順序で順次投与することもできる。順次投与は異なる時点で行われる投与である。１つの薬剤と別の薬剤との投与間隔は、数分、数時間、数日、または数週間であり得る。本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を使用して、別の療法の投与量を低減する、例えば、投与される別の薬剤関連の副作用を軽減する、例えば、抗ＶＥＧＦ抗体（ベバシズマブなど）の副作用を低減することもできる。あるいは、併用は、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質の非存在下で使用するより少なくとも１０、２０、３０、または５０％低い投与量での第二薬の投与を含むことができる。
第二薬または療法は、ＳＳｃに伴う肺線維症療法のための別の薬剤であることもできる。ＳＳｃに伴う肺線維症のための別の治療の例としては、例えば、抗炎症剤、例えば、ステロイド（例えば、コルチコステロイド（例えば、プレドニゾン））、細胞傷害性薬物（例えば、シクロホスファミド）、免疫抑制剤（例えば、シクロホスファミドまたはアザチオプリン）、コラーゲン合成阻害剤（例えば、ピルフェニドン）、エンドセリン受容体アンタゴニスト（例えば、ボセンタン）および外科手術（例えば、肺移植）、ならびに本明細書に記載の他の薬剤が挙げられるが、これらに限定されない。
併用療法は、他の療法の副作用を低減する薬剤を投与することを含み得る。薬剤はＳＳｃに伴う肺線維症治療の副作用を低減する薬剤であり得る。例えば、薬剤は、コルチコステロイドまたはシクロホスファミドであり得る。
診断での使用
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥと結合し、本明細書に記載の方法により同定されたおよび／または本明細書で詳述したタンパク質は、インビトロおよびインビボ診断に有用である。本明細書に記載のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質（例えば、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥと結合しＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥを阻害するタンパク質、またはＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥと結合するがＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥを阻害しないタンパク質）を、例えば、ＩＧＦ−ＩＩおよび／もしくはＩＧＦ−ＩＩＥが活性な疾患または容態（例えば、本明細書に記載の疾患もしくは容態）の治療過程中、または本明細書に記載の疾患もしくは容態の診断において、例えば、インビボ画像化で使用できる。
１つの態様では、本開示は、インビトロまたはインビボで（例えば、対象のインビボ画像化で）ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥの存在を検出するための診断方法を提供する。この方法は、対象中または対象由来の試料中のＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥの局在化を含み得る。試料評価に関して、この方法は、例えば、（ｉ）試料をＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質と接触させること；ならびに（ｉｉ）試料中のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質の位置を検出すること、を含み得る。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を使用して、試料中のＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ発現の定性的または定量的レベルを決定することもできる。この方法は、基準試料（例えば、対照試料）を結合タンパク質と接触させ、基準試料の対応する評価を確定することも含み得る。対照試料または対照対象と比較した試料または対象における複合体形成の変化（例えば、統計的に有意な変化）は、試料中のＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥの存在を示し得る。１つの実施形態では、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、別のＩＧＦタンパク質（ＩＧＦ−Ｉなど）と交差反応しない。例えば、結合タンパク質はＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥと結合するよりも別のＩＧＦタンパク質と５分の１〜１０分の１で（またはさらに低く）結合する。例えば、結合タンパク質はＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥとは約１０〜５０ｐＭのＫＤで結合できる一方、ＩＧＦ−Ｉとは約１０ｎＭで結合する。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を検出可能な物質で直接または間接的に標識して、結合または非結合抗体の検出を容易にし得る。適切な検出可能な物質としては、様々な酵素、配合団、蛍光物質、発光物質および放射性物質が挙げられる。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質とＩＧＦ−ＩＩおよび／もしくはＩＧＦ−ＩＩＥとの間の複合体形成を、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥと結合する結合タンパク質または結合しない結合タンパク質を評価することにより検出し得る。従来の検出アッセイ（例えば、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、放射免疫アッセイ（ＲＩＡ）または組織の免疫組織化学）を使用できる。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質をさらに標識することに加えて、検出可能な物質で標識した標準と非標識のＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質とを用いた競合免疫アッセイにより試料中のＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥの存在をアッセイできる。このアッセイの１つの例では、生体試料、標識標準、およびＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を組み合わせて、非標識結合タンパク質と結合する標識標準の量を決定する。試料中のＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥの量は、ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質と結合する標識標準の量に反比例する。
フルオロフォア発色団で標識したタンパク質を調製することができる。抗体および他のタンパク質が最大約３１０ｎｍの波長の光を吸収するため、３１０ｎｍ超、好ましくは４００ｎｍ超の波長を実質的に吸収する蛍光部分を選択すべきである。様々な適切な蛍光剤および発色団について、Ｓｔｒｙｅｒ，１９６８， Ｓｃｉｅｎｃｅ １６２：５２６ ａｎｄ Ｂｒａｎｄ， Ｌ． ｅｔ ａｌ．，１９７２， Ａｎｎｕ． Ｒｅｖ． Ｂｉｏｃｈｅｍ． ４１：８４３ ８６８により記載されている。米国特許第３，９４０，４７５号、同第４，２８９，７４７号、および同第４，３７６，１１０号に開示の手順などの従来の手順によって、タンパク質を蛍光発色団で標識できる。いくつかの上記の所望の特性を有する１つの蛍光剤群は、フルオレセインおよびローダミンを含むキサンチン系色素である。別の蛍光化合物群はナフチルアミンである。いったんフルオロフォアまたは発色団で標識されると、タンパク質を使用して、例えば、蛍光顕微鏡法（共焦点または逆重畳顕微鏡法など）を用いて、試料中のＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥの存在または位置を検出できる。
組織学的分析。本明細書に記載のタンパク質を使用して、免疫組織化学を実施できる。例えば、抗体の場合、標識（精製またはエピトープタグなど）を使用して抗体を合成することもできるし、例えば、標識または標識結合基とコンジュゲートさせることによって検出可能に標識することもできる。例えば、キレーターを抗体に付着させることができる。次いで、抗体を、組織学的調製物（例えば、顕微鏡スライド上に存在する組織の固定切片）と接触させる。結合のためのインキュベーション後、調製物を洗浄して、非結合抗体を除去する。次いで、調製物を、例えば、顕微鏡法を用いて分析し、抗体が調製物と結合したかどうかを同定する。
勿論、抗体（または他のポリペプチドまたはペプチド）は結合時に非標識であってもよい。結合および洗浄後、検出できるように抗体を標識する。
タンパク質アレイ。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、タンパク質アレイ上に固定することもできる。タンパク質アレイは、例えば、医学試料（単離細胞、血液、血清、生検など）をスクリーニングするために診断手段として使用できる。勿論、タンパク質アレイは、例えば、ＩＧＦ−ＩＩおよび／もしくはＩＧＦ−ＩＩＥまたは他の標的分子と結合する他の結合タンパク質を含むこともできる。
ポリペプチドアレイの産生方法については、例えば、Ｄｅ Ｗｉｌｄｔ ｅｔ ａｌ．， ２０００， Ｎａｔ． Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ． １８：９８９−９９４； Ｌｕｅｋｉｎｇ ｅｔ ａｌ．， １９９９， Ａｎａｌ． Ｂｉｏｃｈｅｍ． ２７０：１０３−１１１； Ｇｅ， ２０００， Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． ２８， ｅ３， Ｉ−ＶＩＩ； ＭａｃＢｅａｔｈ ａｎｄ Ｓｃｈｒｅｉｂｅｒ， ２０００， Ｓｃｉｅｎｃｅ ２８９：１７６０−１７６３；ＷＯ０１／４０８０３号およびＷＯ９９／５１７７３Ａ１号に記載されている。アレイのためのポリペプチドは、例えば、市販のロボット装置（例えば、Ｇｅｎｅｔｉｃ ＭｉｃｒｏＳｙｓｔｅｍｓまたはＢｉｏＲｏｂｏｔｉｃｓから）を用いて、高速でスポットできる。アレイ基板は、例えば、ニトロセルロース、プラスチック、ガラス（例えば、表面改質ガラス）であり得る。アレイはまた、多孔質マトリックス（例えば、アクリルアミド、アガロース、または別のポリマー）を含むこともできる。
例えば、アレイは、例えば、上記Ｄｅ Ｗｉｌｄｔに記載のように抗体のアレイであり得る。タンパク質を産生する細胞を、整列させた形式でフィルター上で増殖させることができる。ポリペプチド産生を誘発し、発現したポリペプチドを、前記細胞の位置でフィルターに固定する。タンパク質アレイを標識標的と接触させて、標的の各固定化ポリペプチドへの結合の程度を決定できる。アレイの各アドレスでの結合の程度に関する情報は、プロファイルとして、例えば、コンピュータデータベースに保存できる。タンパク質アレイを複製物中で産生して、（例えば、標的および非標的の）結合プロファイルを比較するために使用することができる。
ＦＡＣＳ（蛍光活性化細胞選別器）。ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質は、細胞、例えば、試料（例えば、患者試料）中の細胞を標識するために使用できる。結合タンパク質を、蛍光化合物に付着させる（または付着可能である）。次いで、蛍光活性化細胞選別器を用いて（例えば、Ｂｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ Ｉｍｍｕｎｏｃｙｔｏｍｅｔｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ， Ｓａｎ Ｊｏｓｅ ＣＡから販売されている選別器を用いて；米国特許第５，６２７，０３７号；同第５，０３０，００２号；ならびに同第５，１３７，８０９号も参照されたい）細胞を選別できる。細胞が選別器を通過する時、レーザービームが蛍光化合物を励起して、その間検出器が通過した細胞を計数し、蛍光化合物が細胞に付着しているかどうかを蛍光の検出により決定する。各細胞に結合した標識の量を定量および分析して、試料を特性決定できる。
選別器は、細胞を偏向させ、結合タンパク質の結合した細胞を結合タンパク質の結合しなかった細胞から分離することもできる。分離した細胞は、培養および／または特性決定できる。
インビボ画像化。インビボでＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ発現組織の存在を検出する方法も特徴とする。この方法は、（ｉ）対象（例えば、全身性強皮症に伴う肺線維症を例えば有する患者）に、検出可能なマーカーとコンジュゲートさせた抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ抗体を投与すること；（ｉｉ）対象を、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ発現組織または細胞に対する前記検出可能なマーカーを検出する手段に曝露すること、を含む。例えば、対象を、例えば、ＮＭＲまたは他の断層撮影方法により画像化する。
画像診断に有用な標識の例としては、放射標識（１３１Ｉ、１１１Ｉｎ、１２３Ｉ、９９ｍＴｃ、３２Ｐ、１２５Ｉ、３Ｈ、１４Ｃ、および１８８Ｒｈなど）、蛍光標識（フルオレセインおよびローダミンなど）、核磁気共鳴活性標識、陽電子放出断層撮影（「ＰＥＴ」）スキャナにより検出可能な陽電子放出同位体、化学発光体（ルシフェリンなど）、および酵素マーカー（ペルオキシダーゼまたはホスファターゼなど）が挙げられる。短距離放射体（短距離検出プローブにより検出可能な同位体など）も使用できる。タンパク質は、かかる試薬で標識できる；例えば、Ｗｅｎｓｅｌ ａｎｄ Ｍｅａｒｅｓ， １９８３， Ｒａｄｉｏｉｍｍｕｎｏｉｍａｇｉｎｇ ａｎｄ Ｒａｄｉｏｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒａｐｙ， Ｅｌｓｅｖｉｅｒ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ ｆｏｒ ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ｒｅｌａｔｉｎｇ ｔｏ ｔｈｅ ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｉｎｇ ｏｆ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ａｎｄ Ｄ． Ｃｏｌｃｈｅｒ ｅｔ ａｌ．， １９８６， Ｍｅｔｈ． Ｅｎｚｙｍｏｌ． １２１： ８０２ ８１６を参照されたい。
結合タンパク質は、放射性同位体（１４Ｃ、３Ｈ、３５Ｓ、１２５Ｉ、３２Ｐ、１３１Ｉなど）で標識できる。放射性標識した結合タンパク質は、診断的検査（例えば、インビトロアッセイ）に使用できる。同位体標識した結合タンパク質の比活性は、放射性標識の半減期、同位体純度、および標識がどのように抗体に組み込まれたかに応じて異なる。
放射性標識された結合タンパク質の場合、結合タンパク質を患者に投与し、それを、結合タンパク質が応答する抗原を保有する細胞に局在化させ、例えば、γ線カメラまたは放出断層撮影を用いた放射性核種スキャニングなどの既知の技術を用いて、インビボで検出または「画像化」する。例えば、Ａ．Ｒ． Ｂｒａｄｗｅｌｌ ｅｔ ａｌ．， “Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｓ ｉｎ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｉｍａｇｉｎｇ”， Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｆｏｒ Ｃａｎｃｅｒ Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ ａｎｄ Ｔｈｅｒａｐｙ， Ｒ．Ｗ． Ｂａｌｄｗｉｎ ｅｔ ａｌ．， （ｅｄｓ．）， ｐｐ ６５ ８５ （Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ １９８５）を参照されたい。あるいは、放射標識が陽電子（例えば、１１Ｃ、１８Ｆ、１５Ｏ、および１３Ｎ）を放出する場合、Ｂｒｏｏｋｈａｖｅｎ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙに存在する指定されたＰｅｔ ＶＩなどの陽電子放出横断断層撮影スキャナを使用できる。
ＭＲＩ造影剤。核磁気共鳴（ＭＲＩ）は、ＮＭＲを用いて生きている対象の内部特性を視覚化するものであり、予後診断、診断、治療、および外科手術に有用である。ＭＲＩは、明らかな便益のため、放射性トレーサー化合物なしで使用できる。一部のＭＲＩ技術について、ＥＰ−Ａ−０ ５０２ ８１４にまとめられている。一般に、異なる環境における水プロトンの緩和時間定数Ｔ１およびＴ２に関する相違が造影に用いられる。しかしながら、これらの相違は、鮮明な高解像度の画像を得るには不十分であり得る。
これらの緩和時間定数の相違は、造影剤によって強調し得る。かかる造影剤の例としては、いくつかの磁性造影剤、常磁性造影剤（主にＴ１を改変する）および強磁性造影剤または超常磁性造影剤（主にＴ２応答を改変する）が挙げられる。キレート（例えば、ＥＤＴＡ、ＤＴＰＡおよびＮＴＡキレート）を使用して、一部の常磁性物質（例えば、Ｆｅ＋３、Ｍｎ＋２、Ｇｄ＋３）を付着させる（そして毒性を減らす）ことができる。他の造影剤は、粒子（例えば、直径１０ｍｍ未満〜約１０ｎＭ）の形態であり得る。粒子は、強磁性、反強磁性、または超常磁性であり得る。粒子は、例えば、磁鉄鉱（Ｆｅ３Ｏ４）、γ−Ｆｅ２Ｏ３、フェライト、および遷移元素の他の磁性無機化合物を含み得る。磁性粒子は、非磁性造影剤を含むおよび非磁性造影剤を含まない１つ以上の磁性結晶を含み得る。非磁性物質は、合成または天然ポリマー（セファロース、デキストラン、デキストリン、デンプンなど）などを含み得る。
ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を、ＮＭＲ活性１９Ｆ原子を含む指示基または複数のかかる原子で標識でき、これは、（ｉ）実質的にすべての天然に豊富なフッ素原子が１９Ｆ同位体であり、したがって、実質的にすべてのフッ素含有化合物がＮＭＲ活性である；（ｉｉ）多数の化学的に活性なポリフッ素化化合物（トリフルオロ酢酸無水物など）が比較的安価で市販されている；ならびに（ｉｉｉ）ヘモグロビン代替物として酸素を運搬するために使用されるペルフルオロポリエーテルなど、多数のフッ素化化合物がヒトにおける使用において医学的に承認されているからである。かかるインキュベーション時間後、Ｐｙｋｅｔｔ， １９８２， Ｓｃｉ． Ａｍ． ２４６：７８ ８８に記載の装置などの装置を用いて全身ＭＲＩを実行し、ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ発現組織を局在化させて、画像化する。
例証
本発明を下記の実施例によりさらに例証するが、下記の実施例は決して本発明を制限するものと解釈すべきではない。本出願を通して引用されたすべての文献、係属特許出願および公開特許の内容は参照により本明細書に明示的に組み込まれる。
ライブラリーからの抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ抗体の選択およびスクリーニング
Ｆａｂディスプレイファージをまず磁性ストレプトアビジンビーズと接触させるように配置し、ストレプトアビジンビーズと結合し得るものを枯渇させた。次いで、非結合ファージを、ストレプトアビジン磁性ビーズ上に固定されたビオチン化ＩＧＦ−ＩＩＥ（アミノ酸１〜１０４）と接触させるように配置した。非結合ファージを洗い流し、ファージを増殖させるために、結合ファージを大腸菌細胞とともに配置した。増殖したファージを、磁性ストレプトアビジンビーズと接触させるように配置し、さらに枯渇させるためにストレプトアビジンビーズ上に固定したビオチン化ＩＧＦ−Ｉと接触させるように配置した。先のように、非結合ファージを、ストレプトアビジン磁性ビーズ上に固定されたビオチン化ＩＧＦ−ＩＩＥ（アミノ酸１〜１０４）と接触させるように配置した。非結合ファージを洗い流し、この全体過程をさらにもう１サイクル反復した。次いで、増殖したアウトプットファージ上で遺伝子ＩＩＩ除去を実施した。次いで、ＩＧＦ−ＩＩＥ（アミノ酸１〜１０４）、ＩＧＦ−ＩＩ（アミノ酸１〜６７）、ＩＧＦ−Ｉおよびストレプトアビジンを標的として用いてｓＦａｂ ＥＬＩＳＡを実施した。次いで、ＩＧＦ−ＩＩＥおよびＩＧＦ−ＩＩとは結合するが、ＩＧＦ−Ｉもしくはストレプトアビジンとは結合しないｓＦａｂを追求した。以下の材料および方法を用いて、ＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥにより刺激されるＢＡ／Ｆ３細胞増殖に対する阻害についてｓＦａｂをスクリーニングした。
細胞培養および材料：
ＢＡ／Ｆ３細胞を完全培地（９０％ＲＰＭＩ１６４０＋１０％ＦＢＳ＋１０ｎｇ／ｍｌ ＩＬ−３＋２ｍＭのＬ−アラニル−グルタミン＋１×Ｐｅｎ／Ｓｔｒｅｐ）中で培養した。６〜１５継代の細胞を高処理細胞増殖アッセイ用に使用した。ＩＧＦ−ＩＩ（６７ａａ）、ＩＧＦ−ＩＩＥ（１０４ａａ）をＰＢＳ中１０μｇ／ｍｌで−７０℃に保った。ＩＬ−４をＲ＆Ｄ ＳＹＳＴＥＭ、Ｃａｔ番号４０４−ＭＬから購入し、抗ＩＧＦ−ＩＩ抗体をＲ＆Ｄ ＳＹＳＴＥＭ、Ｃａｔ番号ＭＡＢ２９２から購入した。中央値スケールの精製においてバッチ１およびバッチ２由来の３４個のｓＦａｂ（すべてＰＢＳ中）をスクリーニングした。
スクリーニング手順：
ＰＢＳ中、ＩＧＦ−ＩＩを４００ｎｇ／ｍｌの濃度で；ＩＧＦ−ＩＩＥを８００ｎｇ／ｍｌの濃度で；ｓＦａｂを２００μｇ／ｍｌの濃度で調製した。２５μｌのＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥを、９６ウェルプレート中の２５μｌのｓＦａｂとともに、各ｓＦａｂにつき三つずつ、総量５０μｌ／ウェルで室温で３０分間プレインキュベーションした。細胞を以下のとおり調製した。
○ １１００ｒｐｍで５分間遠心分離してＢＡ／Ｆ３細胞を回収する。
○ 上清を除去し、細胞を２０ｍｌのＰＢＳ中に再懸濁する。
○ １０μｌの細胞懸濁液を１０μｌのトリパンブルー溶液と混合して、１０μｌを血球計算器に乗せることにより細胞密度を計算し、細胞密度および生存率を計算する。
○ 細胞をＰＢＳ溶液から１１００ｒｐｍで５分間遠心沈殿する。
○ 上清を除去し、ＩＬ−３を含まない培養培地に２×１０６細胞／ｍｌで細胞を再懸濁する。
○ 細胞懸濁液を、調製した９６ウェルプレートの各ウェルに２５μｌ添加して、最終細胞密度を５×１０４細胞／ウェルとする。
○ ＩＬ−３を含まない培地中の２００ｎｇ／ｍｌのＩＬ−４を各ウェルに２５μｌ添加して、最終濃度を５０ｎｇ／ｍｌとする。
○ 総量は１００μｌ／ウェルである。Ｒ＆Ｄ由来の中和抗体５０μｇ／ｍｌを陽性対照として；非処理を陰性対照とした。ｓＦａｂの最終濃度：５０μｇ／ｍｌ（１μＭ）
○ プレートを３７℃、５％ＣＯ２で７２時間インキュベーションする。
ＭＴＳアッセイを以下のとおり実施した。
・ ２０μｌのＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６Ａｑｕｅｏｕｓ Ｏｎｅ Ｓｏｌｕｔｉｏｎ Ｒｅａｇｅｎｔを各ウェルに添加する。
・ ３７℃、５％ＣＯ２でさらに４時間インキュベーションする。
・ マイクロプレート分光光度計で波長４９０ｎｍの吸収についてプレートを読み取る。
第一バッチ由来の２個のＦａｂおよび第二バッチ由来の６個のＦａｂがＩＧＦ−ＩＩ刺激ＢＡ／Ｆ３細胞増殖およびＩＧＦ−ＩＩＥ刺激ＢＡ／Ｆ３細胞増殖の両方に対して有意な阻害効果を示した。これら８個のＦａｂ、すなわちＭ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００７２−Ｇ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７０ Ｈ０８、Ｍ００６４−Ｅ０４およびＭ００６３−Ｆ０２について、ＩＣ５０決定のためにさらに評価した。
抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ ＦａｂのＩＣ５０決定
ＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥにより刺激されるＢＡ／Ｆ３細胞増殖に対する阻害についての８個のｓＦａｂのＩＣ５０値を以下のとおり決定した。
細胞培養および材料：
ＢＡ／Ｆ３細胞を完全培地（９０％ＲＰＭＩ１６４０＋１０％ＦＢＳ＋１０ｎｇ／ｍｌ ＩＬ−３＋２ｍＭのＬ−アラニル−グルタミン＋１×Ｐｅｎ／Ｓｔｒｅｐ）中で培養した。２４継代の細胞を細胞増殖アッセイ用に使用した。ＩＧＦ−ＩＩ（６７ａａ）、ＩＧＦ−ＩＩＥ（１０４ａａ）をＰＢＳ中、１０μｇ／ｍｌで−７０℃に保った。ＩＬ−４をＲ＆Ｄ ＳＹＳＴＥＭ、Ｃａｔ番号４０４−ＭＬから購入し、抗ＩＧＦ−ＩＩ抗体をＲ＆Ｄ ＳＹＳＴＥＭ、Ｃａｔ番号ＭＡＢ２９２から購入した。実施例１の８個のｓＦａｂをＰＢＳ中で中規模の精製に供した。
手順：
・ ＰＢＳ中、ＩＧＦ−ＩＩを４００ｎｇ／ｍｌの濃度で；ＩＧＦ−ＩＩＥを８００ｎｇ／ｍｌの濃度で；ｓＦａｂを２００μｇ／ｍｌの濃度で調製する。
・ ２５μｌのＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥを、９６ウェルプレート中の２５μｌの１：２連続希釈ｓＦａｂ（５０μｇ／ｍｌから０まで）とともに、各ｓＦａｂの各用量につき三つずつプレインキュベーションし、総量５０μｌ／ウェル中、室温で３０分間インキュベーションする。
・ 細胞を調製する：
○ １１００ｒｐｍで５分間遠心分離してＢＡ／Ｆ３細胞を回収する。
○ 上清を除去し、細胞を２０ｍｌのＰＢＳ中に再懸濁する。
○ １０μｌの細胞懸濁液を１０μｌのトリパンブルー溶液と混合して、１０μｌを血球計算器に乗せることにより細胞密度を計算し、細胞密度および生存率を計算する。
○ 細胞をＰＢＳ溶液から１１００ｒｐｍで５分間遠心沈殿する。
○ 上清を除去し、ＩＬ−３を含まない培養培地に２×１０６細胞／ｍｌで細胞を再懸濁する。
○ 細胞懸濁液を、調製した９６ウェルプレートの各ウェルに２５μｌ添加して、最終細胞密度を５×１０４細胞／ウェルとする。
○ ＩＬ−３を含まない培地中の２００ｎｇ／ｍｌのＩＬ−４を各ウェルに２５μｌ添加して、最終濃度を５０ｎｇ／ｍｌとする。
○ 総量は１００μｌ／ウェルである。
○ プレートを３７℃、５％ＣＯ２で７２時間インキュベーションする。
ＭＴＳアッセイ：
・ ２０μｌのＣｅｌｌＴｉｔｅｒ９６Ａｑｕｅｏｕｓ Ｏｎｅ Ｓｏｌｕｔｉｏｎ Ｒｅａｇｅｎｔを各ウェルに添加する。
・ ３７℃、５％ＣＯ２でさらに４時間インキュベーションする。
・ マイクロプレート分光光度計で波長４９０ｎｍの吸収についてプレートを読み取る。
８個中６個のＦａｂにおいて、表２に示すＩＣ５０値で、細胞増殖に対する用量依存的な抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＩＥ ｓＦａｂの阻害効果が観察された。ＩＧＦ−ＩＩＥ刺激細胞増殖について、Ｆａｂ ７２Ｅ０３はいくらか阻害を示したが、他のものによる阻害ほど有意ではなかった。７２Ｅ０３のＩＣ５０値は低効力のため計算しなかった。Ｆａｂ ７０Ｈ０８は有意な阻害を示さなかった。
（表２）ＩＧＦ−ＩＩ刺激細胞増殖およびＩＧＦ−ＩＩＥ刺激細胞増殖の両方に対して阻害効果を示した６個のＦａｂのＩＣ５０値
Figure 2012505900
５０μｇ／ｍｌでのほとんどのｓＦａｂにおいて、ＩＧＦ−Ｉ刺激細胞増殖に対する阻害効果が観察された。Ｎｅｕ−ＩＧＦ−Ｉ抗体は強力な阻害を示した；Ｎｅｕ−ＩＧＦ−ＩＩ抗体および他のすべてのｓＦａｂ（７０Ｈ０８を除く）も約３０％の阻害を示した。
結論として、６個のｓＦａｂ（Ｍ００７２−Ｇ０６、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０、Ｍ００６８−Ｅ０３およびＭ００７２−Ｃ０６）は、ＩＧＦ−ＩＩ刺激ＢａＦ３細胞増殖およびＩＧＦ−ＩＩＥ刺激ＢａＦ３細胞増殖の両方に対して有意な阻害効果を示した。さらに、５０μｇ／ｍｌのＭ００７０−Ｈ０８を除いたすべての可溶性Ｆａｂが、ＩＧＦ−Ｉ刺激細胞増殖に対して多かれ少かれ阻害（約３０％）を示した。
抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ ＦａｂのＤＮＡおよびアミノ酸配列
ヒトＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合する例示的なＦａｂを上記のように同定し、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、およびＭ００７２−Ｇ０６と命名した。これらＦａｂ軽鎖可変領域（ＬＶ）、軽鎖定常領域（ＬＣ）、重鎖可変領域（ＨＶ）および重鎖定常領域（ＨＣ）のＤＮＡ配列を表３に示す。ＣＤＲ領域をコードするＤＮＡ配列は太字で示す。
（表３）抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ ＦａｂのＤＮＡ配列
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
ヒトＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥと結合し、かつヒトＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥを阻害する例示的なＦａｂ ＬＶ、ＬＣ、ＨＶおよびＨＣ領域のアミノ酸配列（これらのＤＮＡ配列は表３に提示している）を表４に示す。ＣＤＲ領域は太字で示す。
（表４）抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ Ｆａｂのアミノ酸配列
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ ＩｇＧの生殖系列化および産生
２つのＩｇＧを生殖系列化した。両方ともＶＫ１＿０２ ＤＰＫ９／０２由来であった。Ｍ００６４−Ｅ０４は軽鎖固有で３つ、ＪＫ５内で１つ、全体で４つの変異を必要とし、Ｍ００６４−Ｆ０２は軽鎖固有で３つの変異を必要とし、ＪＫ１内では変異を必要としなかった。
生殖系列化において生成されたアミノ酸変異を下に示す。これらの変異はフレームワーク領域において行われた。
Ｍ００６４−Ｅ０４）：
＞ＶＫ１＿Ｏ２ ＤＰＫ９／Ｏ２
長さ＝９５；スコア＝１７４ビット（４４２）、期待値＝７ｅ−４８
同一性＝８６／９５（９０％）、陽性＝８９／９５（９３％）
Figure 2012505900
＞ＪＫ５
長さ＝１２；スコア＝２４．３ビット（５１）、期待値＝４ｅ−０５
同一性＝１０／１１（９０％）、陽性＝１０／１１（９０％）
Figure 2012505900
Ｍ００６４−Ｆ０２−ＬＶ
＞ＶＫ１＿Ｏ２ ＤＰＫ９／Ｏ２
長さ＝９５；スコア＝１７８ビット（４５１）、期待値＝６ｅ−４９
同一性＝８７／９５（９１％）、陽性＝９２／９５（９６％）
Figure 2012505900
＞ＪＫ１
長さ＝１２；スコア＝３０．４ビット（６７）、期待値＝６ｅ−０７
同一性＝１２／１２（１００％）、陽性＝１２／１２（１００％）
Figure 2012505900
選択された抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ ＦａｂおよびＩｇＧの親和性測定
（表５）ＳＰＲ（Ｆｌｅｘｃｈｉｐ）によるＦａｂの親和性測定（二回ずつ）
Figure 2012505900
- - - ＝２回目の親和性測定値を得ていない
（表６）ＳＰＲ（Ｂｉａｃｏｒｅ）により測定されたＩｇＧの親和性測定
Figure 2012505900
ｎＭ＝Ｅ−０９
ｐＭ＝Ｅ−１２
選択された抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ ＩｇＧのＩＣ５０決定
Ｍ００６３−Ｆ０２
本試験の目的は、ＩＧＦ−ＩＩもしくはＩＧＦ−ＩＩＥ刺激ＢａＦ３細胞増殖に対する阻害のためのＭ００６３−Ｆ０２ ＩｇＧの大量産生およびＩＣ５０決定を試験することであった。
細胞培養および材料：
ＢＡＦ３細胞を完全培地（９０％ＲＰＭＩ１６４０＋１０％ＦＢＳ＋１０ｎｇ／ｍｌ ＩＬ−３＋２ｍＭのＬ−アラニル−グルタミン＋１×Ｐｅｎ／Ｓｔｒｅｐ）中で培養した。増殖アッセイ用に４１継代の細胞を使用した。ＩＧＦ−ＩＩ（６７ａａ）、ＩＧＦ−ＩＩＥ（１０４ａａ）をＰＢＳ中１０μｇ／ｍｌで−７０℃に保った。ＩＬ−４をＲ＆Ｄ ＳＹＳＴＥＭ、Ｃａｔ番号４０４−ＭＬから購入し、抗ＩＧＦ−ＩＩ抗体をＲ＆Ｄ ＳＹＳＴＥＭ、Ｃａｔ番号ＭＡＢ２９２から購入した。抗ＩＧＦ−ＩＩＭ００６３−Ｆ０２は６．１ｍｇ／ｍｌであった。Ｇｕａｖａ ＶｉａＣｏｕｎｔ試薬、Ｃａｔ＃４０００−００４１を購入した。
手順：
・ ＰＢＳ中、ＩＧＦ−ＩＩを４００ｎｇ／ｍｌの濃度で；ＩＧＦ−ＩＩＥを８００ｎｇ／ｍｌの濃度で；ＩｇＧを１２０μｇ／ｍｌの濃度で調製する。
・ ２５μｌのＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥを、９６ウェルプレート中の２５μｌの連続希釈ＩｇＧ（最終濃度３０μｇ／ｍｌから０まで）とともに、各用量につき三つずつ、総量５０μｌ／ウェルで室温で３０分間プレインキュベーションする。
・ 細胞を調製する：
○ １１００ｒｐｍで５分間遠心分離してＢＡ／Ｆ３細胞を回収する。
○ 上清を除去し、細胞を２０ｍｌのＰＢＳ中に再懸濁する。
○ １０μｌの細胞懸濁液を１０μｌのトリパンブルー溶液と混合して、１０μｌを血球計算器に乗せることにより細胞密度を計算し、細胞密度および生存率を計算する。
○ 細胞をＰＢＳ溶液から１１００ｒｐｍで５分間遠心沈殿する。
○ 上清を除去し、ＩＬ−３を含まない培養培地に４×１０５細胞／ｍｌで細胞を再懸濁する。
○ 細胞懸濁液を、調製した９６ウェルプレートの各ウェルに２５μｌ添加して、最終細胞密度１×１０４細胞／ウェルとする。
○ ＩＬ−３を含まない培地中の２００ｎｇ／ｍｌのＩＬ−４を各ウェルに２５μｌ添加して、最終濃度を５０ｎｇ／ｍｌとする。
○ 総量は１００μｌ／ウェルである。
○ プレートを３７℃、５％ＣＯ２で４８時間インキュベーションする。
Ｇｕａｖａ ＶｉａＣｏｕｎｔアッセイ：
・ ９６ウェルプレートを遠心分離し、細胞を２００μｌのＧｕａｖａ ＶｉａＣｏｕｎｔ試薬に再懸濁し、５分間混合およびインキュベーションする。丸底９６ウェルプレートに移す。
・ Ｇｕａｖａ ＶｉａＣｏｕｎｔ分析。
・ ＩＣ５０をＳｉｇｍａプロットにおいて下記の方程式を用いて計算する：
ｆ＝ｙ０−（（ａ＊ｘ）／（ＩＣ５０＋ｘ））。
Ｍ００６３−Ｆ０２ ＩｇＧはＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ刺激ＢａＦ３増殖に対して用量依存的な阻害を示した。Ｍ００６３−Ｆ０２ ＩｇＧは、ＩＧＦ−ＩＩ刺激細胞増殖およびＩＧＦ−ＩＩＥ刺激細胞増殖の両方をそれぞれ２および０．８５ｎＭのＩＣ５０値で阻害した。
Ｍ００６４−Ｅ０４ ＩｇＧおよびＭ００６３−Ｆ０２ ＩｇＧ：
本試験の目的は、２つのＩｇＧ候補をＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥ刺激ＢａＦ３細胞増殖に対する阻害について試験し、ＩＣ５０値を比較することであった。
細胞培養および材料：
ＢａＦ３細胞を完全培地（９０％ＲＰＭＩ１６４０＋１０％ＦＢＳ＋１０ｎｇ／ｍｌ ＩＬ−３＋２ｍＭのＬ−アラニル−グルタミン＋１×Ｐｅｎ／Ｓｔｒｅｐ）中で培養した。２２継代の細胞を増殖アッセイ用に使用した。
ＩＧＦ−ＩＩ（６７ａａ）、ＩＧＦ−ＩＩＥ（１０４ａａ）をＰＢＳ中、１０μｇ／ｍｌで−７０℃に保った。ＩＬ−４をＲ＆Ｄ ＳＹＳＴＥＭ、Ｃａｔ番号４０４−ＭＬから購入し、抗ＩＧＦ−ＩＩ抗体をＲ＆Ｄ ＳＹＳＴＥＭ、Ｃａｔ番号ＭＡＢ２９２から購入した。抗ＩＧＦ−ＩＩ抗体：Ｒ＆Ｄ ＳＹＳＴＥＭ、Ｃａｔ番号ＭＡＢ２９２。
手順：
・ ＰＢＳ中、ＩＧＦ−ＩＩを４００ｎｇ／ｍｌの濃度で；ＩＧＦ−ＩＩＥを８００ｎｇ／ｍｌの濃度で；ＩｇＧを２００μｇ／ｍｌの濃度で調製する。
・ ２５μｌのＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥを、９６ウェルプレート中の２５μｌの１：２連続希釈ＩｇＧ（５０μｇ／ｍｌから０まで）とともに、各用量につき三つずつプレインキュベーションし、総量５０μｌ／ウェル中、室温で３０分間インキュベーションする。
・ 細胞を調製する：
○ １１００ｒｐｍで５分間遠心分離してＢＡ／Ｆ３細胞を回収する。
○ 上清を除去し、細胞を２０ｍｌのＰＢＳ中に再懸濁する。
○ １０μｌの細胞懸濁液を１０μｌのトリパンブルー溶液と混合して、１０μｌを血球計算器に乗せることにより細胞密度を計算し、細胞密度および生存率を計算する。
○ 細胞をＰＢＳ溶液から１１００ｒｐｍで５分間遠心沈殿する。
○ 上清を除去し、ＩＬ−３を含まない培養培地に２×１０６細胞／ｍｌで細胞を再懸濁する。
○ 細胞懸濁液を、調製した９６ウェルプレートの各ウェルに２５μｌ添加して、最終細胞密度を５×１０４細胞／ウェルとする。
○ ＩＬ−３を含まない培地中の２００ｎｇ／ｍｌのＩＬ−４を各ウェルに２５μｌ添加して、最終濃度を５０ｎｇ／ｍｌとする。
○ 総量は１００μｌ／ウェルである。
○ プレートを３７℃、５％ＣＯ２で４８時間インキュベーションする。
Ｇｕａｖａ ＶｉａＣｏｕｎｔアッセイ
・ ９６ウェルプレートの各ウェルを混合し、各ウェルから新しい９６ウェルプレートに２０μｌの細胞試料を移し、１８０μｌのＧｕａｖａ ＶｉａＣｏｕｎｔ試薬を各ウェルに添加し、５分間混合およびインキュベーションする。
・ Ｇｕａｖａ ＶｉａＣｏｕｎｔ分析。
両ＩｇＧが、ＩＧＦ−ＩＩ；ＩＧＦ−ＩＩＥ刺激ＢａＦ３増殖に対して用量依存的な阻害を示した。いずれのＩｇＧもＩＧＦ−Ｉ刺激細胞増殖に対して有意な効果を示さなかった。Ｍ００６３−Ｆ０２ ＩｇＧはＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ刺激細胞増殖の両方をそれぞれ約７ｎＭおよび１０ｎＭのＩＣ５０値で阻害し、Ｍ００６４−Ｅ０４ ＩｇＧはＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ刺激細胞増殖の両方をそれぞれ約１９ｎＭおよび１３０ｎＭのＩＣ５０値で阻害した。
抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ結合タンパク質を用いたインビトロ試験
ＭＣＦ−７細胞におけるＩＧＦ−１Ｒリン酸−アッセイ
本発明者らはＭＣＦ−７細胞株におけるＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ誘発性ＩＧＦ−１Ｒリン酸化に対するＭ００６３−Ｆ０２ ＩｇＧの阻害効果を試験した。
ＭＣＦ−７：乳癌細胞株細胞を、１０％ＦＢＳ、０．１ｍＭのＮＥＡＡ、１ｍＭのピルビン酸Ｎａ、０．０１ｍｇ／ｍｌウシインスリンおよび１×Ｐｅｎ／Ｓｔｒｅｐを有するＭＥＭ培地中で培養した。抗ＩＧＦ−１Ｒ抗体をＵｐｓｔａｔｅ、Ｃａｔ番号０５−６５６から購入し、抗リン酸化ＩＧＦ−ＩＲ抗体をＣｅｌｌ Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ、Ｃａｔ＃３０２４から購入した。ＭＣＦ−７（Ｐ１５）を６ウェルプレートにおける完全培地中、１×１０６細胞／ウェルで、３７℃、５％ＣＯ２インキュベーターにて一晩培養した。次いで、この細胞を基礎ＭＥＭ培地で６時間飢餓状態にさせ、バッチ内で以下のとおり処理した。
１． 処理なし。
２． 細胞を１０ｎＭ ＩＧＦ−ＩＩで２０分間処理した。
３． 細胞を１０ｎＭ ＩＧＦ−ＩＩＥで２０分間処理した。
４． 細胞を４０ｎＭ Ｍ００６３−Ｆ０２ ＩｇＧで３０分間前処理後、ＩＧＦ−ＩＩ １０ｎＭを２０分間添加した。
５． 細胞を４０ｎＭ Ｍ００６３−Ｆ０２ ＩｇＧで３０分間前処理後、ＩＧＦ−ＩＩＥ １０ｎＭを２０分間添加した。
６． Ｍ００６３−Ｆ０２ ４０ｎＭをＩＧＦ−ＩＩ １０ｎＭと３０分間事前混合後、細胞に添加した。
７． Ｍ００６３−Ｆ０２ ４０ｎＭをＩＧＦ−ＩＩＥ １０ｎＭと３０分間事前混合後、細胞に添加した。
８． Ｆ０２ ４０ｎＭ、ＩＧＦ−ＩＩ １０ｎＭを細胞に同時添加し、２０分間処理した。
９． Ｍ００６３−Ｆ０２ ４０ｎＭ、ＩＧＦ−ＩＩＥ １０ｎＭを細胞に同時添加し、２０分間処理した。
１０． 細胞を４０ｎＭのＡ０２ ＩｇＧで３０分間前処理後、ＩＧＦ−ＩＩ １０ｎＭを２０分間添加した。
１１． 細胞を４０ｎＭのＡ０２ ＩｇＧで３０分間前処理後、ＩＧＦ−ＩＩＥ １０ｎＭを２０分間添加した。
細胞を、１ｍＭオルトバナジン酸ナトリウムを含む氷冷ＰＢＳで１回洗浄した。細胞をプロテアーゼ阻害剤カクテルと１ｍｌのＲＩＰＡ緩衝液で溶解し、氷上で１０分間インキュベーションした。可溶化物を１４，０００ｒｐｍで１０分間回転させて細胞残骸を取り除いた。細胞可溶化物を２μｇ／ｍｌの抗ＩＧＦ−１Ｒ抗体、２０μｌのアガロースビーズで４℃、一晩免疫沈殿し、免疫沈澱物を回収し、１ｍｌのＲＩＰＡ緩衝液で３回洗浄した。１２μｌの２×電気泳動試料緩衝液を添加した。
ウエスタンブロッティング：試料を７０℃の湯浴で１０分間熱した後、１５ウェル４〜１２％ビス−トリスゲルに乗せた。分解タンパク質を０．４５μｍのＰＶＤＦ膜に移した。膜を５％ＢＳＡ−ＰＢＳＴ（０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０）で室温で１時間ブロッキングし、３％ＢＳＡ−ＰＢＳ−Ｔ溶液で１：１０００希釈した抗リン酸化ＩＧＦ−１Ｒ Ａｂを用いて一晩４０℃でプロービングした。膜をＰＢＳで３回洗浄した。続いて、ブロットを３％ＢＳＡ−ＰＢＳＴ溶液で１：５０００希釈した抗ウサギ−ＩｇＧ−ＨＲＰを用いて室温で１時間プロービングし、ＰＢＳで３回洗浄した。ブロットをＳｕｐｅｒｓｉｇｎａｌ ｗｅｓｔ Ｆｅｍｔｏ Ｍａｘｉｍｕｍ Ｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ Ｓｕｂｓｔｒａｔｅ（Ｐｉｅｒｃｅ １８５９０２２＆２３）で展開させた。膜を５％ＢＳＡ−ＰＢＳＴ（０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０）で室温で１時間ストリッピングおよびブロッキングした。３％ＢＳＡ−ＰＢＳ−Ｔ溶液で１：３０００希釈した抗ＩＧＦ−１Ｒ Ａｂを用いて一晩４０℃でプロービングした。膜をＰＢＳで３回洗浄した。続いて、ブロットを３％ＢＳＡ−ＰＢＳＴ溶液で１：５０００希釈した抗マウスＩｇＧ−ＨＲＰを用いて室温で１時間プロービングし、ＰＢＳで３回洗浄した。ブロットをＳｕｐｅｒｓｉｇｎａｌ ｗｅｓｔ Ｆｅｍｔｏ Ｍａｘｉｍｕｍ Ｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ Ｓｕｂｓｔｒａｔｅ（Ｐｉｅｒｃｅ １８５９０２２＆２３）で展開させた。
予備結果により、無血清条件下におけるＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥによるＭＣＦ−７細胞の刺激はＩＧＦ−１Ｒリン酸化を誘発したことが示された。４０ｎＭのＭ００６３−Ｆ０２ ＩｇＧは、ＭＣＦ−７細胞においてＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥ誘発性ＩＧＦ−１Ｒリン酸化の両方に対して阻害効果を示した。類似の阻害活性が３つの異なるプロトコールにおいて観察された：抗体との細胞とのプレインキュベーション；抗体とＩＧＦ−ＩＩもしくはＩＧＦ−ＩＩＥとの事前混合、ならびにＩＧＦ−ＩＩ／ＩＩＥと抗体との細胞への同時添加。ＩｇＧ対照としてのＡ０２は、ＩＧＦ−ＩＩまたはＩＧＦ−ＩＩＥ誘発性ＩＧＦ−１Ｒリン酸化に対して無効であることが示された。
ＩＧＦ−１Ｒリン酸化アッセイにおけるＭ００６４−Ｅ０４とＭ００６４−Ｆ０２ ＩｇＧの比較
本発明者らはＭＣＦ−７細胞株におけるＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＩＧＦ−ＩＩＥ誘発性ＩＧＦ−１Ｒリン酸化に対するＭ００６４−Ｆ０２およびＭ００６４−Ｅ０４ ＩｇＧの相対的な阻害効果を試験した。
ＭＣＦ−７：乳癌細胞株細胞を、１０％ＦＢＳ、０．１ｍＭのＮＥＡＡ、１ｍＭのピルビン酸Ｎａ、０．０１ｍｇ／ｍｌウシインスリンおよび１×Ｐｅｎ／Ｓｔｒｅｐを有するＭＥＭ培地中で培養した。抗ＩＧＦ−１Ｒ抗体をＵｐｓｔａｔｅ、Ｃａｔ番号０５−６５６から購入し、抗リン酸化ＩＧＦ−ＩＲ抗体をＣｅｌｌ Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ、Ｃａｔ＃３０２４から購入した。ＭＣＦ−７（Ｐ２０）細胞を回収して６ウェルプレートにおける完全培地中に１×１０６細胞／ウェルで播種し、３７℃、５％ＣＯ２インキュベーターに一晩置いた。次いで、この細胞を基礎ＭＥＭ培地で６時間飢餓状態にさせた。細胞をバッチ内で以下のとおり処理した。
・ 処理なし。
・ 細胞を１０ｎＭ ＩＧＦ−ＩＩで２０分間処理した。
・ 細胞をＩＧＦ−ＩＩ １０ｎＭ＋異なる用量のＭ００６４−Ｅ０４（４０ｎＭから０．１６ｎＭまで）で２０分間処理した。
・ 細胞をＩＧＦ−ＩＩ １０ｎＭ＋異なる用量のＭ００６４−Ｆ０２（４０ｎＭから０．１６ｎＭまで）で２０分間処理した。
・ 細胞をＩＧＦ−ＩＩ １０ｎＭ＋対照ＩｇＧ Ａ２ ４０ｎＭ（陰性対照として）で２０分間処理した。
細胞を、１ｍＭオルトバナジン酸ナトリウムを含む氷冷ＰＢＳで１回洗浄した。細胞をプロテアーゼ阻害剤カクテルと１ｍｌのＲＩＰＡ緩衝液で溶解し、氷上で１０分間インキュベーションした。可溶化物を１４，０００ｒｐｍで１０分間回転させて細胞残骸を取り除いた。細胞可溶化物を２μｇ／ｍｌの抗ＩＧＦ−１Ｒ抗体、２０μｌのアガロースビーズで４℃、一晩免疫沈殿し、免疫沈澱物を回収し、１ｍｌのＲＩＰＡ緩衝液で３回洗浄した。１２μｌの２×電気泳動試料緩衝液を添加した。
ウエスタンブロッティング：試料を７０℃の湯浴で１０分間熱した後、１５ウェル４〜１２％ビス−トリスゲルに乗せた。分解タンパク質を０．４５μｍのＰＶＤＦ膜に移した。膜を５％ＢＳＡ−ＰＢＳＴ（０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０）で室温で１時間ブロッキングし、３％ＢＳＡ−ＰＢＳ−Ｔ溶液で１：１０００希釈した抗リン酸化ＩＧＦ−１Ｒ Ａｂを用いて一晩４０℃でプロービングした。膜をＰＢＳで３回洗浄した。続いて、ブロットを３％ＢＳＡ−ＰＢＳＴ溶液で１：５０００希釈した抗ウサギ−ＩｇＧ−ＨＲＰを用いて室温で１時間プロービングし、ＰＢＳで３回洗浄した。ブロットをＳｕｐｅｒｓｉｇｎａｌ ｗｅｓｔ Ｆｅｍｔｏ Ｍａｘｉｍｕｍ Ｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ Ｓｕｂｓｔｒａｔｅ（Ｐｉｅｒｃｅ １８５９０２２＆２３）で展開させた。膜を５％ＢＳＡ−ＰＢＳＴ（０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０）で室温で１時間ストリッピングおよびブロッキングし、３％ＢＳＡ−ＰＢＳ−Ｔ溶液で１：３０００希釈した抗ＩＧＦ−１Ｒ Ａｂを用いて一晩４０℃でプロービングした。膜をＰＢＳで３回洗浄した。続いて、ブロットを３％ＢＳＡ−ＰＢＳＴ溶液で１：５０００希釈した抗マウスＩｇＧ−ＨＲＰを用いて室温で１時間プロービングし、ＰＢＳで３回洗浄した。ブロットをＳｕｐｅｒｓｉｇｎａｌ ｗｅｓｔ Ｆｅｍｔｏ Ｍａｘｉｍｕｍ Ｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ Ｓｕｂｓｔｒａｔｅ（Ｐｉｅｒｃｅ １８５９０２２＆２３）で展開させた。
予備結果により、無血清条件下におけるＩＧＦ−ＩＩによるＭＣＦ−７細胞の刺激はＩＧＦ−１Ｒリン酸化を誘発したことが示された。Ｍ００６４−Ｅ０４およびＭ００６４−Ｆ０２ ＩｇＧは、ＭＣＦ−７細胞中のＩＧＦ−ＩＩ誘発性ＩＧＦ−１Ｒリン酸化に対する用量依存的な阻害効果を示した。それら２つの抗体間で類似の阻害効力が観察された。ＩｇＧ陰性対照としてのＡ０２は、ＩＧＦ−ＩＩ誘発性ＩＧＦ−１Ｒリン酸化に対して無効であることが示された。
結晶学およびエピトープマッピング
Ｍ００６４−Ｆ０２を伴うＩＧＦ−ＩＩの結晶構造を決定して、抗体が結合するＩＧＦ２のエピトープ領域を特性決定した。Ｃａ＋＋またはＬｉ＋＋のいずれかを添加剤として、１〜１０ｍｇ／ｍｌのＩＧＦ−ＩＩとＭ００６４−Ｆ０２ Ｆａｂをモル比２：１の中重量ＰＥＧ条件（ｐＨ約５）下で用いて結晶を得た。
結晶化統計値は以下のとおりであった。
細胞：５０．２２ １０６．６７ １１０．８９ ９０．００ ９０．００ ９０．００
空間群：Ｐ２１２１２１
原子数：４０５０（２３３個の水分子）
溶媒％：５２．６７
＜Ｂ＞原子モデル用：３３．８５
Ｓｉｇｍａ（Ｂ）：９．２１
解像度：４９．２１〜２．４０
報告されたＲ因子：０．１８５
Ｒｆｒｅｅ因子：０．２６１
可能なｒｅｆｌｓ最大数値：２４０１０ 実測値：２２７７５
完成度：９４．９％
相関因子：０．９２５４
ｐｄｂ＃１ｉｇｆとの分子置換を用いてＦａｂ構造を分解し、ｐｄｂ ２ｖ５ｐを用いてＩＧＦ−ＩＩ構造を分解した。
構造図を図１に描写する。Ｆａｂ表面の１つ目の谷はＩＧＦ−ＩＩへの結合にとって重要であると思われる。１つは残基Ｃｙｓ９からＧｌｙ１１を囲い込み、Ｃｙｓ９〜Ｃｙｓ４７ジスルフィド結合を埋め込み、一隆起中に残基Ｐｈｅ４８も埋め込む。２つ目の谷は、Ｔｙｒ１０３Ｈバルジの反対側にあり、ここの残基は谷の上部に沿って並ぶが内部深くには見られない。谷は負電位であるが、この範囲に入って電荷を相殺する正電荷残基はない。２つのＡｒｇ残基（３７および３８）があり、その側鎖は、Ａｓｐ１０２Ｈならびにさらに埋め込まれたＧｌｕ１０６ＨおよびＡｓｐ９９Ｈ残基に対して水素（Ｈ）結合もイオン性相互作用も生成しない空間内へと向いている。最も近接した接触は、Ａｒｇ３４のＮイプシロンからＶａｌ３５主鎖窒素までの４．４ＡおよびＡｓｐ１０２のカルボン酸基までの４．７Ａと思われる。
Ｍｅｔ５７Ｈ残基は、ほぼ帯電した残基（Ｇｌｕ４４、Ｇｌｕ４５、Ａｒｇ４９）により３側面を覆われるように見えるが、これらの電荷はすべてＭｅｔからそれる方向に向いており、脂肪族炭素のみが結合表面に関わるように見え、これは無電荷のＰｈｅ４８も含む。
Ｆａｂ上の最も突出した特徴は、Ｔｙｒ１０３Ｈにより生成されたフィンガーバルジである。スティックはＩＧＦ−ＩＩ中に入った指のようにやや見えるが、２分子の表面間には依然として、より大きな残基（Ｔｒｐなど）によりある程度埋め得る隙間または孔が残る。それはＴｙｒ５９、Ｐｈｅ２６、Ｌｅｕ１７、Ｌｅｕ１３、Ｖａｌ４３、Ｖａｌ１４でできたＩＧＦ−ＩＩ表面上の疎水性ポケットである。
下表７はＩＧＦ−ＩＩ配列の一部を示し、太字のアミノ酸は結晶学的試験を通して、Ｆａｂ結合に関与すると示されたものである。
（表７）
Figure 2012505900
この一部配列を読むと、ＩＧＦ−ＩＩ由来の残基が結合表面に関わるということを理解することができ、これらの残基をＴ７、Ｃ９、Ｇ１０、Ｇ１１、Ｌ１３、Ｖ１４、Ｌ１７、Ｆ２６、Ｐ３１、Ｒ３４、Ｖ３５、Ｒ３７、Ｓ３９、Ｒ４０、Ｇ４１、Ｖ４３、Ｅ４４、Ｅ４５、Ｃ４７、Ｆ４８、Ｒ４９、Ｙ５９と命名する。
重鎖（Ｈ）とＩＧＦ−ＩＩ（Ｄ）との間に見られた水素結合（オングストローム距離２．６０Å〜３．８４Å）は以下のとおりである：
Ｈ：Ｓ５３−Ｄ：Ｅ４４
Ｈ：Ｒ５９−Ｄ：Ｃ９
Ｈ：Ｒ５９−Ｄ：Ｃ４７
Ｈ：Ｒ５９−Ｄ：Ｔ７
Ｈ：Ｙ１０３−Ｄ：Ｙ５９
Ｈ：Ｎ３１−Ｄ：Ｒ４０
Ｈ：Ｇ５６−Ｄ：Ｒ４９
Ｈ：Ｙ１０３−Ｄ：Ｇ１０。
重鎖由来の結合表面に関わる残基は以下のとおりである：
Ｓ３０、Ｎ３１、Ｉ３３、Ｖ５０、Ｉ５１、Ｓ５２、Ｓ５３、Ｓ５４、Ｇ５６、Ｍ５７、Ｔ５８、Ｒ５９、Ｄ１０２、Ｙ１０３、Ｖ１０４、Ｇ１０５、Ｅ１０６。
軽鎖（Ｌ）とＩＧＦ−ＩＩ（Ｄ）との間に見られた水素結合（距離２．８８Å〜３．５２Å）は以下のとおりである：
Ｌ：Ｙ３３−Ｄ：Ｄ１５
Ｌ：Ｓ９２−Ｄ：Ｇ１１
Ｌ：Ｙ９３−Ｄ：Ｇ１１
Ｌ：Ｙ９３−Ｄ：Ｅ１２。
軽鎖由来の結合表面に関わる残基：
Ｓ３１、Ｎ３２、Ｙ３３、Ｓ９２、Ｙ９３、Ｎ９４、Ｓ９５、Ｗ９７。
ＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥへのＦａｂの結合についての、溶液中での親和性の測定値
競合ＳＰＲ（ＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標））分析を使用して、
１）ファージディスプレイライブラリーから単離されたＦａｂ断片が、固定化完全長ヒトインスリン受容体Ａ外部ドメイン（ｈｕＩＲ−Ａ ＥＣＤ）に対するＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥリガンドの結合を特異的に阻害したことを示し、かつ
２）これらＦａｂについての溶液中での親和性を推定する。
方法
記載されている方法（Ｊ Ｓｔｒｕｃｔ Ｂｉｏｌ． １９９９ Ｍａｒ；１２５（１）：１１−８）のように、Ｃ末端ｍｙｃエピトープタグと共に成熟タンパク質の残基１〜９１４を含むヒトＩＲ−Ａ ＥＣＤを、安定的に形質移入したＬｅｃ８細胞（ＣＨＯ−Ｋ１細胞由来のグリコシル化変異体）のバイオリアクター培養物から単離して精製した。
競合ＳＰＲ（ＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標））を既に記載されている方法（Ｎｉｅｂａ ｅｔ ａｌ．， １９９６）により部分的に大量輸送が制限された状態の条件下で実施した。ｈｕＩＲ−Ａ（−エクソン１１）外部ドメインの約１６，７００の相対反応単位（ＲＵ）を、標準アミン化学によりＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標）ＣＭ５チップセンサーと結合させた。被覆していないフローセル表面を参照として使用した。ＩＧＦ−ＩＩリガンドと固定化ｈｕＩＲ−Ａ ＥＣＤとの間の各結合／再生サイクルを３０μｌ／分の一定流速のＨＢＳ−ＥＰ＋ランニング緩衝液（１０ｍＭのＨＥＰＥＳ、ｐＨ７．４、１５０ｍＭのＮａＣｌ、３．４ｍＭのＥＤＴＡ、０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０）中、２５℃で実施した。表面の再生を３０μｌのクエン酸Ｎａ／ＮａＣｌ（ｐＨ４．５）注入により達成した。はじめに、漸増量のＩＧＦ−ＩＩ（またはＩＧＦ−ＩＩＥ）リガンド（典型的には、０．５から８ｎＭまで２倍増量）のＨＢＳ−ＥＰ＋緩衝液を含む試料６０μｌを、固定化ｈｕＩＲ−Ａ ＥＣＤ上に注入し、それら全体の結合反応（注入停止後５秒）を用いて標準結合曲線を確立した。Ｆａｂ断片によるＩＧＦ−ＩＩ結合の阻害を示して溶液中での親和性値（ＫＤ）を得るため、ＩＧＦ−ＩＩ（またはＩＧＦ−ＩＩＥ）リガンドを、一定の最終容量１２０μｌ中の異なる濃度のＦａｂ断片とともに、注入前少なくとも１時間、２５℃でプレインキュベーションした。これら平衡混合物の試料６０μｌを、固定化ｈｕＩＲ−Ａ ＥＣＤ上に注入し、ｈｕＩＲ−Ａ ＥＣＤへの遊離ＩＧＦ−ＩＩリガンドの結合により生じた全体の結合反応を、注入停止後５秒間記録した。Ｂｉａｃｏｒｅ Ｔ１００ Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎソフトウェア（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を用いて結合データを評価し、それによってこれら全体の結合反応を上記の標準曲線と共に用いて平衡（Ｒｅｑ）溶液中の遊離ＩＧＦ−ＩＩリガンド濃度を得た。続いて、使用したＦａｂの総濃度に対してこれらＲｅｑ推定値をプロットし、得られた阻害曲線を使用して解離定数（ＫＤ）を計算した。
結果：
（表８）Ｆａｂについての溶液中での親和性（ＫＤ）推定値（ＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標）Ｔ１００）
Figure 2012505900
結果により、これらＦａｂのほとんどが、ｈｕＩＲ−Ａ ＥＣＤ受容体に対するＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの結合を阻害したことが示された。本明細書に示す２個のＦａｂ（Ｍ００８０−Ｇ０３およびＭ００７３−Ｃ１１）はＩＧＦ−ＩＩＥ結合のみ阻害し、ＩＧＦ−ＩＩ結合は阻害しなかったことが観察され、これら２個のＦａｂの結合はＩＧＦ−ＩＩＥ特異的であることが示された。
結合タンパク質（ＢＰ２およびＢＰ４）に対する抗ＩＧＦＩＩ（およびＩＧＦ−ＩＩＥ）抗体競合アッセイ
ＩＧＦ結合タンパク質（ＢＰ）は細胞上のＩＧＦ−ＩおよびＩＧＦ−ＩＩ（およびＩＧＦ−ＩＩＥ）作用を調節する上で主な役割を果たす。それらは、細胞上のＩＧＦ作用の向上または阻害のいずれかをもたらすことができる。ＩＧＦ ＢＰ２はＩＧＦ−ＩよりもＩＧＦ−ＩＩと優先的に結合し、多様な細胞により分泌される。同様に、ＩＧＦ ＢＰ４はＩＧＦのスカベンジャーとして作用し、ＩＧＦ作用の阻害剤である。
この例において、ＢＰ２およびＢＰ４と候補ＩｇＧとの相互作用、ならびにＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥに対するそれら候補ＩｇＧの競合結合を調査した。
方法：
ＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標）Ｔ１００およびプロテインＧで被覆したＣＭ５チップを使用して以下のアッセイを設定した。約１０００ＲＵのプロテインＧを標準アミン化学不動化方法を用いてＣＭ５チップ上に固定した。
全アッセイは以下の４つの試薬の３回の順次注入から構成された。
１）候補ＩｇＧをプロテインＧ上に１０μｇ／ｍｌ、５μｌ／分で１８０秒間注入した。これにより典型的には、約３０００ＲＵのＩｇＧが捕捉された。
２）次いで、ＩＧＦ−ＩＩリガンド（５０ｎＭ）を５μｌ／分で９０秒間注入した。これによりＩＧＦ−ＩＩを捕捉抗体に結合させた。
３）次いで、ＢＰ２またはＢＰ４（同様に５０ｎＭで）を３０μｌ／分で９０秒間注入した。ＢＰ注入時の有意な結合反応により、ＩＧＦ−ＩＩに対する候補抗体およびＢＰの非競合的な結合が示唆された。
４）プロテインＧの表面は最終的に、３０μｌ／分で６０秒間注入した１０ｍＭグリシン（ｐＨ１．５）の注入により再生させた。
図２Ａは候補抗体の１つについて得られた典型的な結合プロファイルを示す。Ｍ００６３−Ｆ０２はＢＰ４に関して非競合的にＩＧＦＩＩと結合するように見えた。
図２ＢはＭ００６４−Ｅ０４候補抗体についての競合結合データを示す。これらの結合結果を確認するために以下の対照を含んだ（図左下の説明文参照）。
１）ＩＧＦ−ＩＩ注入なし（ＢＩＡＣＯＲＥ（登録商標）ランニング緩衝液のみを代わりに注入）。ＢＰ２／ＢＰ４が捕捉抗体と結合しないことを確認した。
２）ＩＧＦ−ＩＩを捕捉後、ＢＰ２またはＢＰ４を注入しなかった。抗体から解離するＩＧＦ−ＩＩのベースラインを確立した。
３）ＩＧＦ−ＩＩおよび／またはＢＰ２／ＢＰ４がプロテインＧまたはチップの表面のいずれとも有意に相互作用しないことを確認するための、ＩＧＦ−ＩＩと結合しない対照抗体（ｗ０２マウス抗体）。
下表は、ＢＰ２、ＢＰ４に関して、ＩＧＦ−ＩＩリガンドに対する候補抗体のこれらの競合結合結果の概要を示す。
（表９）スコアシステムスケール：
５＝候補ＩｇＧはＩＧＦ−ＩＩリガンドとの結合においてＢＰと強く競合する
０＝候補ＩｇＧはＩＧＦ−ＩＩリガンドとの結合においてＢＰと有意には競合しない
Figure 2012505900
要約：
ＩＧＦＩＩリガンド競合：
Ｍ００６４−Ｅ０４ ＩｇＧは、ＩＧＦＩＩリガンドとの結合においてＢＰ２およびＢＰ４と良好に競合する抗体であるように見える。Ｍ００６４−Ｆ０２およびＭ００７２−Ｅ０３は次に良好な２つの抗体である。
抗ＩＧＦ−ＩＩＥ ＦａｂのＤＮＡおよびアミノ酸配列
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
例示的ＩＧＦ ＩＩ／ＩＧＦ ＩＩＥ阻害性結合タンパク質
ＤＸ−２６４７
ＤＸ−２６４７は、例示的なＩＧＦ ＩＩ／ＩＧＦ ＩＩＥ阻害抗体である。ＤＸ−２６４７は、５６６Ａ−Ｍ００６４−Ｆ０２親クローン由来の生殖系列である。ＤＸ−２６４７のＤＮＡおよびアミノ酸配列は以下のとおりである。
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
軽鎖および重鎖のフレームワーク、ＣＤＲならびに定常領域配列は以下のとおりである。ＤＸ−２６４７由来の６つのＣＤＲを含むタンパク質を、本明細書に記載の組成物および方法に使用できる。
Figure 2012505900
生殖系列ＬＶ−ＦＲ３領域と非生殖系列ＬＶ−ＦＲ３領域との間の相違を以下に示す。
Figure 2012505900
太字は、親５６６Ａ−Ｍ００６４−Ｆ０２ Ｆａｂに見られた非生殖系列アミノ酸である。
ＤＸ−２６５５
ＤＸ−２６５５は、例示的なＩＧＦ ＩＩ／ＩＧＦ ＩＩＥ阻害抗体である。ＤＸ−２６５５は、５６６Ａ−Ｍ００６４−Ｅ０４親クローン由来の生殖系列である。ＤＸ−２６５５のＤＮＡおよびアミノ酸配列は以下のとおりである。
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
生殖系列ＬＶ−ＦＲ３領域と非生殖系列ＬＶ−ＦＲ３領域との間の相違を以下に示す。
Figure 2012505900
太字は、親５６６Ａ−Ｍ００６４−Ｅ０４ Ｆａｂに見られた非生殖系列アミノ酸である。
生殖系列ＬＶ−ＦＲ４領域と非生殖系列ＬＶ−ＦＲ４領域との間の相違を以下に示す。
Figure 2012505900
太字＝Ｍ０６４−Ｅ０４に見られた非生殖系列アミノ酸
参考文献
本出願を通して引用した文献参照、出願特許、公開または非公開特許出願ならびに以下の列挙を含むすべての引用した参考文献の内容は、それらの全体が参照により本明細書に明示的に組み込まれる。矛盾する場合、本明細書における任意の定義を含む本出願を優先する。
均等物
本発明のいくつかの実施形態が記載されている。それにも関わらず、本発明の真意および範囲から逸脱することなく様々な修正を行い得ることが理解される。したがって、他の実施形態は、添付の特許請求の範囲の範囲内である。
配列表
本出願は、ＥＦＳ−Ｗｅｂによって提出された配列表を含み、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。２００９年１１月２０日に作成された当該ＡＳＣＩＩコピーの名称はＤ２０３３７１２．ｔｘｔであり、サイズが８７，６０６バイトである。
関連出願への相互参照
本出願は、２００８年１０月１４日に出願された米国仮出願第６１／１０５，２２９号の優先権を主張する。先の出願の開示は本出願の開示の一部である（および参照することにより本出願の開示に組み込まれる）とみなされる。
いくつかの態様では、本開示は、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法を提供し、この方法は以下のコンセンサス配列またはその機能的断片と特異的に結合することができる単離タンパク質（例えば、抗体、例えば、ヒト抗体）を対象に投与することを含む：
Figure 2012505900
Ｘは任意のアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、以下のコンセンサス配列またはその機能的断片と特異的に結合することができる。
Figure 2012505900
他の態様では、本開示は、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法に関し、この方法は以下のコンセンサス配列またはその機能的断片と特異的に結合することができる単離タンパク質を対象に投与することを含む：
Figure 2012505900
Ｘは任意のアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、タンパク質は、以下のコンセンサス配列またはその機能的断片と特異的に結合することができる。
Figure 2012505900
本発明の１つ以上の実施形態の詳細について、添付の図面および本明細書の下記において説明する。本発明の他の特徴、目的、および利点は、本明細書の説明および図面から、ならびに特許請求の範囲から明らかであろう。
[請求項1001]
ＩＧＦ ＩＩおよび／またはＩＧＦ ＩＩＥと結合する単離抗体を対象に投与することを含む、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法であって、
ここで、前記抗体が、ＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、およびＤＸ−2655からなる群から選択される抗体と同一のエピトープと結合するか、またはＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、およびＤＸ−2655からなる群から選択される抗体と結合について競合する、
前記方法。
[請求項1002]
前記抗体がＤＸ−2647と競合するか、またはＤＸ−2647と同一のエピトープと結合する、請求項1001記載の方法。
[請求項1003]
前記抗体がＭ0064−Ｆ02と競合するか、またはＭ0064−Ｆ02と同一のエピトープと結合する、請求項1001記載の方法。
[請求項1004]
免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列および免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列を含む単離タンパク質を対象に投与することを含む、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法であって、
ここで、
前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列が、ＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、もしくはＤＸ−2655の重鎖可変ドメイン由来の3つのＣＤＲ領域を含み、ならびに／または
前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列が、ＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、もしくはＤＸ−2655の軽鎖可変ドメイン由来の3つのＣＤＲ領域を含み（それぞれ）、ならびに
前記タンパク質がＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合し、かつＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方を阻害する、
前記方法。
[請求項1005]
前記重鎖可変ドメイン由来の3つのＣＤＲ領域がＤＸ−2647由来であり、および／または前記軽鎖可変ドメイン由来の3つのＣＤＲ領域がＤＸ−2647由来である、請求項1004記載の方法。
[請求項1006]
前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列がＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、もしくはＤＸ−2655の重鎖可変ドメインを含み、および／または前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列がＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、もしくはＤＸ−2655の軽鎖可変ドメインを含む（それぞれ）、請求項1004記載の方法。
[請求項1007]
前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列がＤＸ−2647の重鎖可変ドメインを含み、および／または前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列がＤＸ−2647の軽鎖可変ドメインを含む、請求項1004記載の方法。
[請求項1008]
前記タンパク質が、ＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、もしくはＤＸ−2655の重鎖、ならびに／またはＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、もしくはＤＸ−2655の軽鎖を含む（それぞれ）、請求項1004記載の方法。
[請求項1009]
前記タンパク質がＤＸ−2647の重鎖および／またはＤＸ−2647の軽鎖を含む、請求項1004記載の方法。
[請求項1010]
免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列および免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列を含む単離タンパク質を対象に投与することを含む、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法であって、
ここで、
前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列が、Ｍ0080−Ｇ03もしくはＭ0073−Ｃ11の重鎖可変ドメイン由来の3つのＣＤＲ領域を含み、ならびに／または
前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列が、Ｍ0080−Ｇ03もしくはＭ0073−Ｃ11の重鎖可変ドメイン由来の3つのＣＤＲ領域を含み（それぞれ）、ならびに
前記タンパク質がＩＧＦ−ＩＩＥと結合し、かつＩＧＦ−ＩＩＥを阻害するが、ＩＧＦ−ＩＩとは結合せず、阻害しない、
前記方法。
[請求項1011]
前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列がＭ0080−Ｇ03もしくはＭ0073−Ｃ11の重鎖可変ドメインを含み、および／または前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列がＭ0080−Ｇ03もしくはＭ0073−Ｃ11の軽鎖可変ドメインを含む（それぞれ）、請求項1010記載の方法。
[請求項1012]
前記タンパク質が、Ｍ0080−Ｇ03もしくはＭ0073−Ｃ11の重鎖、および／またはＭ0080−Ｇ03もしくはＭ0073−Ｃ11の軽鎖を含む（それぞれ）、請求項1010記載の方法。
[請求項1013]
以下のコンセンサス配列またはその機能的断片と特異的に結合することができる単離タンパク質を対象に投与することを含む、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法：
Figure 2012505900
Ｘは任意のアミノ酸である。
[請求項1014]
前記タンパク質が、以下のコンセンサス配列またはその機能的断片と特異的に結合することができる、請求項1013記載の方法：
Figure 2012505900
。
[請求項1015]
前記タンパク質が、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列および免疫グロブリン軽鎖可変ドメインを含み、
ここで、
前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列が、ＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、もしくはＤＸ−2655の重鎖可変ドメイン由来の3つのＣＤＲ領域を含み、ならびに／または
前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列が、ＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、もしくはＤＸ−2655の軽鎖可変ドメイン由来の3つのＣＤＲ領域を含み（それぞれ）、ならびに
前記タンパク質がＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合し、かつＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方を阻害する、
請求項1013記載の方法。
[請求項1016]
前記重鎖可変ドメイン由来の3つのＣＤＲ領域がＤＸ−2647由来であり、および／または前記軽鎖可変ドメイン由来の3つのＣＤＲ領域がＤＸ−2647由来である、請求項1013記載の方法。
[請求項1017]
前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列がＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、もしくはＤＸ−2655の重鎖可変ドメインを含み、および／または前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列がＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、もしくはＤＸ−2655の軽鎖可変ドメインを含む（それぞれ）、請求項1013記載の方法。
[請求項1018]
前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列がＤＸ−2647の重鎖可変ドメインを含み、および／または前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列がＤＸ−2647の軽鎖可変ドメインを含む、請求項1013記載の方法。
[請求項1019]
前記タンパク質が、ＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、もしくはＤＸ−2655の重鎖、および／またはＤＸ−2647、Ｍ0033−Ｅ05、Ｍ0063−Ｆ02、Ｍ0064−Ｅ04、Ｍ0064−Ｆ02、Ｍ0068−Ｅ03、Ｍ0070−Ｈ08、Ｍ0072−Ｃ06、Ｍ0072−Ｅ03、Ｍ0072−Ｇ06、生殖系列Ｍ0064−Ｅ04、生殖系列Ｍ0064−Ｆ02、もしくはＤＸ−2655の軽鎖を含む（それぞれ）、請求項1013記載の方法。
[請求項1020]
前記タンパク質がＤＸ−2647の重鎖および／またはＤＸ−2647の軽鎖を含む、請求項1013記載の方法。
ある実施形態では、タンパク質は、ＩＧＦ−ＩＩの以下のエピトープまたはその断片と結合する：
Figure 2012505900
Ｘは任意のアミノ酸である。エピトープ断片は、本明細書に記載のタンパク質が特異的に結合するものである。
さらに特に、タンパク質はＩＧＦ−ＩＩの以下の配列またはその断片と結合し得る：
Figure 2012505900
ここで太字ではない残基は保存的変異により置換されてもよい。
ＩＧＦ−ＩＩ
＞インスリン様増殖因子ＩＩ［ヒト、小細胞肺癌細胞株Ｔ３Ｍ−１１、ｍＲＮＡ、１３２２ｎｔ］（アクセッション番号Ｓ７７０３５の一部）
Figure 2012505900
＞インスリン様増殖因子ＩＩ；ＩＧＦ−ＩＩ［Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ］。（アクセッション番号ＡＡＢ３４１５５の一部）
Figure 2012505900
＞ハツカネズミ（Ｍｕｓ Ｍｕｓｃｕｌｕｓ）インスリン様増殖因子２、ｍＲＮＡ（ｃＤＮＡクローンＭＧＣ：６０５９８ 画像：３００１３２９５）、完全ｃｄｓ．（アクセッション番号ＢＣ０５３４８９の一部）
Figure 2012505900
＞Ｉｇｆ２タンパク質［ハツカネズミ（Ｍｕｓ Ｍｕｓｃｕｌｕｓ）］。（アクセッション番号ＡＡＨ５３４８９の一部）
Figure 2012505900
ＩＧＦ−ＩＩＥ
＞インスリン様増殖因子ＩＩ［ヒト、小細胞肺癌細胞株Ｔ３Ｍ−１１、ｍＲＮＡ、１３２２ｎｔ］（アクセッション番号Ｓ７７０３５の一部）
Figure 2012505900
＞インスリン様増殖因子ＩＩ；ＩＧＦ−ＩＩ［Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ］。（アクセッション番号ＡＡＢ３４１５５）
Figure 2012505900
＞ハツカネズミ（Ｍｕｓ Ｍｕｓｃｕｌｕｓ）インスリン様増殖因子２、ｍＲＮＡ（ｃＤＮＡクローンＭＧＣ：６０５９８ 画像：３００１３２９５）、完全ｃｄｓ．（アクセッション番号ＢＣ０５３４８９の一部）
Figure 2012505900
＞Ｉｇｆ２タンパク質［ハツカネズミ（Ｍｕｓ Ｍｕｓｃｕｌｕｓ）］。（アクセッション番号ＡＡＨ５３４８９）
Figure 2012505900
（表３）抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ ＦａｂのＤＮＡ配列
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
（表４）抗ＩＧＦ−ＩＩ／ＩＧＦ−ＩＩＥ Ｆａｂのアミノ酸配列
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
生殖系列化において生成されたアミノ酸変異を下に示す。これらの変異はフレームワーク領域において行われた。
Ｍ００６４−Ｅ０４）：
＞ＶＫ１＿Ｏ２ ＤＰＫ９／Ｏ２
長さ＝９５；スコア＝１７４ビット（４４２）、期待値＝７ｅ−４８
同一性＝８６／９５（９０％）、陽性＝８９／９５（９３％）
Figure 2012505900
＞ＪＫ５
長さ＝１２；スコア＝２４．３ビット（５１）、期待値＝４ｅ−０５
同一性＝１０／１１（９０％）、陽性＝１０／１１（９０％）
Figure 2012505900
Ｍ００６４−Ｆ０２−ＬＶ
＞ＶＫ１＿Ｏ２ ＤＰＫ９／Ｏ２
長さ＝９５；スコア＝１７８ビット（４５１）、期待値＝６ｅ−４９
同一性＝８７／９５（９１％）、陽性＝９２／９５（９６％）
Figure 2012505900
＞ＪＫ１
長さ＝１２；スコア＝３０．４ビット（６７）、期待値＝６ｅ−０７
同一性＝１２／１２（１００％）、陽性＝１２／１２（１００％）
Figure 2012505900
（表７）
Figure 2012505900
抗ＩＧＦ−ＩＩＥ ＦａｂのＤＮＡおよびアミノ酸配列
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
例示的ＩＧＦ ＩＩ／ＩＧＦ ＩＩＥ阻害性結合タンパク質
ＤＸ−２６４７
ＤＸ−２６４７は、例示的なＩＧＦ ＩＩ／ＩＧＦ ＩＩＥ阻害抗体である。ＤＸ−２６４７は、５６６Ａ−Ｍ００６４−Ｆ０２親クローン由来の生殖系列である。ＤＸ−２６４７のＤＮＡおよびアミノ酸配列は以下のとおりである。
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
軽鎖および重鎖のフレームワーク、ＣＤＲならびに定常領域配列は以下のとおりである。ＤＸ−２６４７由来の６つのＣＤＲを含むタンパク質を、本明細書に記載の組成物および方法に使用できる。
Figure 2012505900
生殖系列ＬＶ−ＦＲ３領域と非生殖系列ＬＶ−ＦＲ３領域との間の相違を以下に示す。
Figure 2012505900
太字は、親５６６Ａ−Ｍ００６４−Ｆ０２ Ｆａｂに見られた非生殖系列アミノ酸である。
ＤＸ−２６５５
ＤＸ−２６５５は、例示的なＩＧＦ ＩＩ／ＩＧＦ ＩＩＥ阻害抗体である。ＤＸ−２６５５は、５６６Ａ−Ｍ００６４−Ｅ０４親クローン由来の生殖系列である。ＤＸ−２６５５のＤＮＡおよびアミノ酸配列は以下のとおりである。
Figure 2012505900
Figure 2012505900
Figure 2012505900
生殖系列ＬＶ−ＦＲ３領域と非生殖系列ＬＶ−ＦＲ３領域との間の相違を以下に示す。
Figure 2012505900
太字は、親５６６Ａ−Ｍ００６４−Ｅ０４ Ｆａｂに見られた非生殖系列アミノ酸である。
生殖系列ＬＶ−ＦＲ４領域と非生殖系列ＬＶ−ＦＲ４領域との間の相違を以下に示す。
Figure 2012505900
太字＝Ｍ０６４−Ｅ０４に見られた非生殖系列アミノ酸

Claims (20)

  1. ＩＧＦ ＩＩおよび／またはＩＧＦ ＩＩＥと結合する単離抗体を対象に投与することを含む、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法であって、
    ここで、前記抗体が、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体と同一のエピトープと結合するか、またはＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、およびＤＸ−２６５５からなる群から選択される抗体と結合について競合する、
    前記方法。
  2. 前記抗体がＤＸ−２６４７と競合するか、またはＤＸ−２６４７と同一のエピトープと結合する、請求項１記載の方法。
  3. 前記抗体がＭ００６４−Ｆ０２と競合するか、またはＭ００６４−Ｆ０２と同一のエピトープと結合する、請求項１記載の方法。
  4. 免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列および免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列を含む単離タンパク質を対象に投与することを含む、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法であって、
    ここで、
    前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列が、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の重鎖可変ドメイン由来の３つのＣＤＲ領域を含み、ならびに／または
    前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列が、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の軽鎖可変ドメイン由来の３つのＣＤＲ領域を含み（それぞれ）、ならびに
    前記タンパク質がＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合し、かつＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方を阻害する、
    前記方法。
  5. 前記重鎖可変ドメイン由来の３つのＣＤＲ領域がＤＸ−２６４７由来であり、および／または前記軽鎖可変ドメイン由来の３つのＣＤＲ領域がＤＸ−２６４７由来である、請求項４記載の方法。
  6. 前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列がＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の重鎖可変ドメインを含み、および／または前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列がＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の軽鎖可変ドメインを含む（それぞれ）、請求項４記載の方法。
  7. 前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列がＤＸ−２６４７の重鎖可変ドメインを含み、および／または前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列がＤＸ−２６４７の軽鎖可変ドメインを含む、請求項４記載の方法。
  8. 前記タンパク質が、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の重鎖、ならびに／またはＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の軽鎖を含む（それぞれ）、請求項４記載の方法。
  9. 前記タンパク質がＤＸ−２６４７の重鎖および／またはＤＸ−２６４７の軽鎖を含む、請求項４記載の方法。
  10. 免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列および免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列を含む単離タンパク質を対象に投与することを含む、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法であって、
    ここで、
    前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列が、Ｍ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖可変ドメイン由来の３つのＣＤＲ領域を含み、ならびに／または
    前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列が、Ｍ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖可変ドメイン由来の３つのＣＤＲ領域を含み（それぞれ）、ならびに
    前記タンパク質がＩＧＦ−ＩＩＥと結合し、かつＩＧＦ−ＩＩＥを阻害するが、ＩＧＦ−ＩＩとは結合せず、阻害しない、
    前記方法。
  11. 前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列がＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖可変ドメインを含み、および／または前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列がＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の軽鎖可変ドメインを含む（それぞれ）、請求項１０記載の方法。
  12. 前記タンパク質が、Ｍ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の重鎖、および／またはＭ００８０−Ｇ０３もしくはＭ００７３−Ｃ１１の軽鎖を含む（それぞれ）、請求項１０記載の方法。
  13. 以下のコンセンサス配列またはその機能的断片と特異的に結合することができる単離タンパク質を対象に投与することを含む、対象における全身性強皮症に伴う肺線維症を治療または予防する方法：
    Figure 2012505900
    Ｘは任意のアミノ酸である。
  14. 前記タンパク質が、以下のコンセンサス配列またはその機能的断片と特異的に結合することができる、請求項１３記載の方法：
    Figure 2012505900
    。
  15. 前記タンパク質が、免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列および免疫グロブリン軽鎖可変ドメインを含み、
    ここで、
    前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列が、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の重鎖可変ドメイン由来の３つのＣＤＲ領域を含み、ならびに／または
    前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列が、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の軽鎖可変ドメイン由来の３つのＣＤＲ領域を含み（それぞれ）、ならびに
    前記タンパク質がＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方と結合し、かつＩＧＦ−ＩＩおよびＩＧＦ−ＩＩＥの両方を阻害する、
    請求項１３記載の方法。
  16. 前記重鎖可変ドメイン由来の３つのＣＤＲ領域がＤＸ−２６４７由来であり、および／または前記軽鎖可変ドメイン由来の３つのＣＤＲ領域がＤＸ−２６４７由来である、請求項１３記載の方法。
  17. 前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列がＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の重鎖可変ドメインを含み、および／または前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列がＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の軽鎖可変ドメインを含む（それぞれ）、請求項１３記載の方法。
  18. 前記免疫グロブリン重鎖可変ドメイン配列がＤＸ−２６４７の重鎖可変ドメインを含み、および／または前記免疫グロブリン軽鎖可変ドメイン配列がＤＸ−２６４７の軽鎖可変ドメインを含む、請求項１３記載の方法。
  19. 前記タンパク質が、ＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の重鎖、および／またはＤＸ−２６４７、Ｍ００３３−Ｅ０５、Ｍ００６３−Ｆ０２、Ｍ００６４−Ｅ０４、Ｍ００６４−Ｆ０２、Ｍ００６８−Ｅ０３、Ｍ００７０−Ｈ０８、Ｍ００７２−Ｃ０６、Ｍ００７２−Ｅ０３、Ｍ００７２−Ｇ０６、生殖系列Ｍ００６４−Ｅ０４、生殖系列Ｍ００６４−Ｆ０２、もしくはＤＸ−２６５５の軽鎖を含む（それぞれ）、請求項１３記載の方法。
  20. 前記タンパク質がＤＸ−２６４７の重鎖および／またはＤＸ−２６４７の軽鎖を含む、請求項１３記載の方法。
JP2011532204A 2008-10-14 2009-10-14 全身性強皮症に伴う肺線維症の治療および予防のためのｉｇｆ−ｉｉ／ｉｇｆ−ｉｉｅ結合タンパク質の使用 Ceased JP2012505900A (ja)

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