ES2263984T3 - Ligandos doble-especificos con una vida media serica aumentada. - Google Patents
Ligandos doble-especificos con una vida media serica aumentada.Info
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Abstract
Ligando doble-específico que comprende un primer dominio variable simple de inmunoglobulina con cadena pesada que presenta una especificidad de fijación a un primer epítopo o antígeno y un segundo dominio variable simple de inmunoglobulina con cadena ligera que presenta una actividad de fijación a un segundo epítopo o antígeno, en el que la fijación a uno o ambos de dichos antígenos o epítopos actúa para prolongar la vida media del ligando in vivo y en el que dichos primer y segundo dominios no son un dominio variable con cadena pesada y un dominio variable con cadena ligera que comparte la misma especificidad, con la condición de que dicho ligando doble-específico no esté constituido por un dominio VH de anti-HSA y por un dominio Vk de anti-beta galactosidasa.
Description
Ligandos doble-específicos con
una vida media sérica aumentada.
La presente invención se refiere a ligandos
doble-específicos que comprenden un primer dominio
variable simple de inmunoglobulina que se une a un primer antígeno
o epítopo, y un segundo dominio variable simple de inmunoglobulina
que se une a un segundo antígeno o epítopo, en los que la unión a
por lo menos uno de los primer y segundo antígenos o epítopos actúa
para prolongar la vida media del ligando in vivo. Se
describen ligandos con conformación abierta y cerrada que
comprenden más de una especificidad de unión.
El dominio de fijación al antígeno de un
anticuerpo comprende dos regiones independientes: un dominio
variable con cadena pesada (V_{H}) y un dominio variable con
cadena ligera (V_{L}) que pueden ser V_{\kappa} o
V_{\lambda}. El propio sitio de fijación al antígeno está formado
por seis bucles polipeptídicos: tres del dominio V_{H} (H1, H2 y
H3) y tres del dominio V_{L} (L1, L2 y L3). Un repertorio primario
variado de genes V que codifica los dominios V_{H} y V_{L} es
producido por la reconfiguración de segmentos del gen. El gen
V_{H} es producido por la recombinación de tres segmentos del gen,
V_{H}, D y J_{H}. En los seres humanos, existen aproximadamente
51 segmentos V_{H} operativos (Cook y Tomlison, (1995) Immunol.
Today, 16: 237), 25 segmentos B operativos B (Corbett
et al., (1997) J. Mol. Biol., 268: 69) y 6
segmentos J_{H} operativos (Ravetch et al., (1981)
Cell 27: 583), dependiendo del haplotipo. El segmento
V_{H} codifica la región de la cadena polipeptídica que forma los
primer y segundo bucles de fijación al antígeno del dominio V_{H}
(H1 y H2), mientras que los segmentos V_{H}, D y J_{H} se
combinan para formar el tercer bucle de fijación al antígeno del
dominio V_{H} (H3). El gen V_{L} es producido por la
recombinación de sólo dos segmentos del gen, V_{L} y J_{L}. En
los seres humanos, existen aproximadamente 40 segmentos V_{\kappa}
operativos (Schäble y Zachau (1993) Biol. Chem.
Hoppe-Seyler, 374: 1001), 31 segmentos
V_{\lambda} operativos (Williams et al., (1996) J. Mol.
Biol., 264: 220; Kawasaki et al., (1997) Genome
Res. 7: 250), 5 segmentos J_{\kappa} operativos (Hieter et
al., (1982) J. Biol. Chem., 257: 1516) y 4
segmentos J_{\lambda} operativos (Vasicek y Leder (1990) J.
Exp. Med., 172: 609), dependiendo del haplotipo. El
segmento V_{L} codifica la región de la cadena polipeptídica que
forma los primer y segundo bucles de fijación al antígeno del
dominio V_{L} (L1 y L2), mientras que los segmentos V_{L} y
J_{L} se combinan para formar el tercer bucle de fijación al
antígeno del dominio V_{L} (L3). Los anticuerpos seleccionados de
este repertorio primario se considera que son suficientemente
variados para unirse casi a todos los antígenos por lo menos con
afinidad moderada. Los anticuerpos con gran afinidad son producidos
por "maduración de afinidad" de los genes reordenados, en los
que se generan mutaciones puntuales y son seleccionados por el
sistema inmunitario basándose en el aumento de la fijación.
El análisis de las estructuras y las secuencias
de anticuerpos ha demostrado que cinco de los seis bucles de
fijación al antígeno (H1, H2, L1, L2 y L3) poseen un número limitado
de conformaciones de la cadena principal o estructuras canónicas
(Chothia y Lesk (1987) J. Mol. Biol., 196: 901; Chothia et
al. (1989) Nature, 342: 877). Las conformaciones de la
cadena principal se determinan mediante (i) la longitud del bucle de
fijación al antígeno, (ii) restos de partículas, o tipos de resto,
en determina posición clave en el bucle de fijación al antígeno y
en el armazón del anticuerpo. El análisis de las longitudes del
bucle y de los restos clave ha permitido a los solicitantes la
predicción de las conformaciones de la cadena principal de H1, H2,
L1, L2 y L3 codificadas por la mayoría de secuencias del anticuerpo
humano (Chothia et al. (1992) J. Mol. Biol., 227: 799;
Tomlinson et al. (1995) EMBO J., 14: 4628; Williams
et al. (1996) J. Mol. Biol, 264: 220). Aunque la
región H3 es mucho más variada desde el punto de vista de la
secuencia, longitud y estructura (debido a la utilización de
segmentos D), forma asimismo un número limitado de conformaciones de
la cadena principal para longitudes de bucle cortas que dependen de
la longitud y la presencia de determinados restos, o tipos de
resto, en posiciones clave en el bucle y en el armazón del
anticuerpo (Martin et al. (1996) J. Mol. Biol., 263:
800; Shirai et al. (1996) FEBS Letters, 399:1.
Los anticuerpos biespecíficos que comprenden
pares complementarios de regiones V_{H} y V_{L} son conocidos en
la materia. Los anticuerpos biespecíficos deben comprender dos pares
de V_{H} y V_{L}, fijándose cada par V_{H}/V_{L} a un único
antígeno o epítopo. Los métodos descritos implican hibridomas
híbridos (Milstein y Cuello A.C., Nature
305:537-40), minibodies (Hu et al., (1996)
Cancer Res. 56:3055-3061); diacuerpos
(Holliger et al., (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA
90, 6444-6448; WO 94/13804), anticuerpos
recombinantes quelantes (CRAbs; (Neri et al., (1995) J.
Mol. Biol. 246, 367-373), biscFv (p. ej. Atwell
et al., (1996) Mol. Immunol. 33,
1301-1312), anticuerpos estabilizados por
"protuberancias en orificios" (Carter et al., (1997)
Protein Sci. 6, 781-788). En cada caso cada
especie de anticuerpo comprende dos sitios de fijación al antígeno,
modelado cada uno por un par complementario de dominios V_{H} y
V_{L}. Cada anticuerpo por esta razón es capaz de unirse a dos
antígenos o epítopos diferentes al mismo tiempo, con la fijación a
cada antígeno o epítopo mediada por un dominio V_{H} y su V_{L}
complementario. Cada una de estas técnicas adolece de sus
inconvenientes particulares; por ejemplo en el caso de hibridomas
híbridos, los pares V_{H}/V_{L} inactivos pueden reducir en gran
medida la fracción de IgG biespecífica. Además, los métodos más
biespecíficos se basan en la asociación de los pares
V_{H}/V_{L} diferentes o en la asociación de las cadenas V_{H}
y V_{L} para recrear los dos sitios de fijación V_{H}/V_{L}
diferentes. Por lo tanto es imposible controlar la relación de
sitios de fijación a cada antígeno o epítopo en la molécula montada
y por lo tanto muchas de las moléculas montadas se unirán a un
antígeno o epítopo pero no al otro. En algunos casos ha sido posible
modificar genéticamente las cadenas pesada o ligera en las
interfases de la subunidad (Carter et al., (1997) a fin de
aumentar el número de moléculas que tienen sitios de fijación a
ambos antígenos o epítopos pero esto nunca produce todas las
moléculas que presentan fijación a ambos antígenos o
epítopos.
epítopos.
Existen algunas pruebas de que dos
especificidades diferentes de fijación al antígeno pueden
incorporarse en el mismo sitio de fijación, pero éstas representan
generalmente dos o más especificidades que corresponden a antígenos
o epítopos o a anticuerpos relacionados estructuralmente que son
ampliamente interreactivos. Por ejemplo, se han descrito
frecuentemente anticuerpos interreactivos, donde los dos antígenos
están relacionados en la secuencia y en la estructura, tal como la
lisozima de la clara de huevo de gallina y la lisozima del pavo
(McCafferty et al., WO 92/01047) o para el hapteno libre y
para el conjugado del hapteno con vehículo (Griffiths AD et
al. EMBO J. 1994 13:14 3245-60). En un
ejemplo adicional, el documento WO 02/02773 (Abbott Laboratories)
describe moléculas de anticuerpo con "doble especificidad". Las
moléculas de anticuerpo citadas por ser anticuerpos producidos o
seleccionados contra antígenos múltiples, de modo que su
especificidad abarca más de un solo antígeno. Cada par
V_{H}/V_{L} complementario en los anticuerpos del documento WO
02/02773 especifica una sola especificidad de fijación para dos o
más antígenos estructuralmente relacionados; los dominios V_{H} y
V_{L} en dichos pares complementarios no poseen cada uno una
especificidad independiente. Los anticuerpos por lo tanto presentan
una especificidad amplia única que comprende dos antígenos, que
están relacionados estructuralmente. Además se han descrito
anticuerpos naturales que son polirreactivos (Casali & Notkins,
Ann. Rev. Immunol. 7, 515-531), que
reaccionan con por lo menos dos (normalmente más) antígenos o
epítopos diferentes que no están relacionados estructuralmente. Se
ha demostrado también que las selecciones de repertorios de
péptidos al azar que utilizan tecnología de presentación del fago en
un anticuerpo monoclonal identificarán una gama de secuencias
peptídicas que se fija al sitio de fijación al antígeno. Algunas de
las secuencias están muy relacionadas, fijando una secuencia de
consenso, mientras que otras son muy diferentes y han sido
denominadas mimotopos (Lane y Stephen, Current Opinion in
Immunology, 1993, 5, 268-271). Por lo tanto es
evidente que un anticuerpo con cuatro cadenas naturales, que
comprende los dominios V_{H} y V_{L} asociados y
complementarios, presenta el potencial para unir muchos antígenos
diferentes de una gran cantidad de antígenos conocidos. Es menos
evidente cómo crear un sitio de fijación a dos antígenos dados en el
mismo anticuerpo, particularmente los que no están necesariamente
relacionados estructuralmente.
Se ha sugerido que los métodos de modificación
genética de proteínas pueden tener relación con esto. Por ejemplo,
se ha propuesto asimismo que podría crearse un anticuerpo catalítico
con una actividad de fijación a un ión metálico mediante una
variable de dominio, y a un hapteno (sustrato) mediante contactos
con el ión metálico y un dominio variable complementario (Barbas
et al., 1993 Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90,
6385-6389). Sin embargo en este caso, se propone
que la fijación y la catálisis del sustrato (primer antígeno)
requiera la fijación del ión metálico (segundo antígeno). Por lo
tanto la fijación del par V_{H}/V_{L} se refiere a un antígeno
único pero multicomponente.
Se han descrito métodos para la creación de
anticuerpos biespecíficos a partir de los dominios individuales con
cadena pesada de anticuerpo camélido en los que se crean contactos
de fijación para un antígeno en un dominio variable, y para un
segundo antígeno en un segundo dominio variable. Sin embargo los
dominios variables no fueron complementarios. Por lo tanto se
selecciona un primer dominio variable con cadena pesada contra un
primer antígeno, y un segundo dominio variable con cadena pesada
contra un segundo antígeno, y a continuación ambos dominios se unen
en la misma cadena para proporcionar un fragmento de anticuerpo
biespecífico (Conrath et al., J. Biol. Chem. 276,
7346-7350). Sin embargo los dominios simples con
cadena pesada bifásica no son frecuentes porque proceden de
anticuerpos naturales camélidos que no tienen cadenas ligeras, y de
hecho los dominios simples con cadena pesada son incapaces de
asociarse con las cadenas ligeras bifásicas para formar pares
V_{H} y V_{L} complementarios.
Asimismo se han descrito dominios individuales
variables con cadena pesada procedentes de anticuerpos naturales
que están normalmente asociados a cadenas ligeras (de anticuerpos
monoclonales o de repertorios de dominios; véase el documento
EP-A-0368684). Se ha
demostrado que estos dominios variables con cadena pesada
interactúan específicamente con uno o más antígenos relacionados
pero no se han combinado con otros dominios variables con cadena
pesada o ligera para crear un ligando con una especificidad para dos
o más antígenos diferentes. Además, se ha demostrado que estos
dominios individuales presentan una vida media muy corta in
vivo. Por consiguiente dichos dominios son de valor terapéutico
limitado.
Se ha sugerido para preparar fragmentos de
anticuerpo biespecíficos mediante fijación de los dominios variables
con cadena pesada de diferente especificidad (como se describió
anteriormente). El inconveniente de este método es que los dominios
variables aislados del anticuerpo pueden presentar una interfase
hidrófoba que produce normalmente interacciones con la cadena
ligera y está expuesto al disolvente y puede ser "pegajoso"
permitiendo que el dominio individual se una a superficies
hidrófobas. Además, en ausencia de una cadena ligera asociada, la
combinación de dos o más dominios variables con cadena pesada
diferentes y su asociación, posiblemente por sus interfases
hidrófobas, puede impedirles que se unan a uno en ninguno de los
ligandos que son capaces de unirse en aislamiento. Además, en este
caso los dominios variables con cadena pesada no estarían asociados
a los dominios variables con cadena ligera complementarios y por lo
tanto puede ser menos estable y fácilmente despleglable (Worn y
Pluckthun, 1998 Biochemistry 37, 13120-7). El
documento WO 03/002609 que fue publicado el 9 de enero de 2003
describe ligandos multiespecíficos.
Los inventores han descrito, en su solicitud de
patente internacional WO 03/002609 en trámite ligandos de
inmunoglobina específicos dobles que comprenden dominios variables
independientes de inmunoglobulina que presentan cada uno
especificidades diferentes. Los dominios pueden actuar en
competencia entre sí o independientemente unirse a antígenos o
epítopos en moléculas diana.
En una primera configuración, la presente
invención proporciona una mejora adicional en los ligandos
doble-específicos desarrollados por los presentes
inventores, en la que una especificidad del ligando se refiere a una
proteína o polipéptido presente in vivo en un organismo que
puede actuar para prolongar la vida media del ligando uniéndose a
éste.
Por consiguiente, en un primer aspecto, se
proporciona un ligando doble-específico que
comprende un primer dominio variable simple de inmunoglobulina que
presenta una especificidad de fijación a un primer antígeno o
epítopo y un segundo dominio variable simple de inmunoglobulina
complementario que presenta una actividad de fijación a un segundo
antígeno o epítopo, en el que uno o ambos de dichos antígenos o
epítopos actúa para prolongar la vida media del ligando in
vivo y en el que dichos primer y segundo dominios no son un
dominio variable con cadena pesada y un dominio variable con cadena
ligera que comparte la misma especificidad, con la condición de que
dicho ligando doble-específico no esté constituido
por un dominio V_{H} de anti-HSA y un dominio
V_{\kappa} de anti-\beta galactosidasa.
Preferentemente, ni el primer ni el segundo dominio variable se unen
a la albúmina de suero humano (HSA).
Los antígenos o epítopos que prolongan la vida
media de un ligando descritos en la presente memoria están presentes
con ventaja en las proteínas o polipéptidos localizados en un
organismo in vivo. Los ejemplos incluyen proteínas de la
matriz extracelular, proteínas de la sangre y las proteínas
presentes en varios tejidos en el organismo. Las proteínas actúan
reduciendo el ritmo de eliminación del ligando en la sangre, por
ejemplo actuando como agentes de esponjamiento o anclando el ligando
a un punto deseado de actuación. Ejemplos de antígenos/epítopos que
prolongan la vida media in vivo se proporcionan a
continuación en el Anexo 1.
La prolongación de la vida media es útil en
aplicaciones in vivo de inmunoglobulinas, especialmente
anticuerpos y más especialmente fragmentos de anticuerpo de tamaño
pequeño. Dichos fragmentos (Fvs, Fvs unido a disulfuro, Fabs,
scFvs, dAbs) adolecen de eliminación rápida en el cuerpo; por lo
tanto, aunque son capaces de alcanzar la mayoría de las partes del
cuerpo rápidamente y son rápidos para producir y facilitar su
manipulación, sus aplicaciones in vivo han estado limitadas
por su persistencia sólo breve in vivo. La invención resuelve
este problema proporcionando una vida media prolongada de los
ligandos in vivo y por consiguiente tiempos de persistencia
mayores en el cuerpo de la actividad operativa del ligando.
Los métodos para el análisis farmacocinético y
la determinación de la vida media del ligando son conocidos por los
expertos en la materia. Los detalles pueden encontrarse en Kenneth,
A. et al.: Chemical Stability of Pharmaceuticals: A
Handbook for Pharmacists y en Peters et al.,
Pharmacokinetic analysis: A Practical Approach (1996). Se
hace referencia también a "Pharmacokinetics", M. Gibaldi y D.
Perron, publicada por Marcel Dekker, 2ª rev. ex edición (1982) que
describe los parámetros farmacocinéticos tales como las vidas medias
t alfa y t beta y el área bajo la curva (AUC).
Las vidas medias (t1/2 alfa y t1/2 beta) y AUC
pueden determinarse a partir de una curva de concentración del
suero del ligando frente al tiempo. El paquete de análisis WinNonlin
(disponible en Pharsight Corp., Mountain View, CA94040, USA) puede
utilizarse, por ejemplo, para modelar la curva. En una primera fase
(fase alfa) el ligando está experimentando principalmente la
distribución en el paciente, con alguna eliminación. Una segunda
fase (fase beta) es la fase terminal cuando el ligando se ha
distribuido y la concentración de suero está disminuyendo a medida
que el ligando se elimina en el paciente. La vida media t alfa es la
vida media de la primera fase y la vida media t beta es la vida
media de la segunda fase. Por lo tanto, la presente invención
proporciona, con ventaja, un ligando o una composición que
comprende un ligando según la invención con una vida media
t\alpha comprendida en el intervalo de 15 minutos o más. En una
forma de realización, el extremo inferior del intervalo es de 30
minutos, 45 minutos, 1 hora, 2 horas, 3 horas, 4 horas, 5 horas, 6
horas, 7 horas, 10 horas, 11 horas o 12 horas. Además, o
alternativamente, un ligando o composición según la invención
tendrá una vida media t \alpha comprendida en el intervalo de
hasta 12 horas inclusive. En una forma de realización, el extremo
superior del intervalo es de 11, 10, 9, 8, 7, 6 ó 5 horas. Un
ejemplo de intervalo adecuado es de 1 a 6 horas, 2 a 5 horas o 3 a
4 horas.
La presente invención proporciona, con ventaja,
un ligando o una composición que comprende un ligando según la
invención con una vida media t\beta comprendida en el intervalo de
2,5 horas o más. En una forma de realización, el extremo inferior
del intervalo es de 3 horas, 4 horas, 5 horas, 6 horas, 7 horas, 10
horas, 11 horas o 12 horas. Además, o alternativamente, un ligando
o composición según la invención tiene una vida media t\beta
comprendida en el intervalo de hasta 21 días inclusive. En una forma
de realización, el extremo superior del intervalo es de 12 horas,
24 horas, 2 días, 3 días, 5 días, 10 días, 15 días o 20 días.
Ventajosamente, un ligando o composición según la invención tendrá
una vida media t\beta comprendida en el intervalo entre 12 a 60
horas En una forma de realización adicional estará comprendido en el
intervalo entre 12 y 48 horas. En una forma de realización adicional
estará comprendido en el intervalo entre 12 y 26 horas.
Además, o alternativamente a los criterios
anteriores, la presente invención proporciona un ligando o una
composición que comprende un ligando según la invención con un valor
de AUC (área bajo la curva) comprendido en el intervalo de 1
mg.min/ml o más. En una forma de realización el extremo inferior del
intervalo es 5, 10, 15, 20, 30, 100, 200 ó 300 mg.min/ml. Además, o
alternativamente, un ligando o composición según la invención
presenta un AUC comprendido en el intervalo de hasta 600 mg.min/ml.
En una forma de realización, el extremo superior del intervalo es
500, 400, 300, 200, 150, 100, 75 ó 50 mg.min/ml. Un ligando según la
invención presentará ventajosamente una AUC comprendido en el
intervalo seleccionado de entre el grupo constituido por los
siguientes: 15 a 150 mg.min/ml, 15 a 100 mg.min/ml, 15 a 75
mg.min/ml y 15 a 50 mg.min/ml.
En una primera forma de realización, el ligando
doble-específico comprende dos dominios variables
complementarios, es decir, dos dominios variables que, en su medio
natural, son capaces de operar conjuntamente como un par o grupo
análogo aun si en el contexto de la presente invención se unen por
separado a sus epítopos análogos. Por ejemplo, los dominios
variables complementarios pueden ser dominios con cadena pesada de
inmunoglobulina y con cadena ligera (V_{H} y V_{L}). Los
dominios V_{H} y V_{L} son proporcionados ventajosamente por
los fragmentos de anticuerpos scFv o Fab. Los dominios variables
pueden unirse para formar ligandos polivalentes, por ejemplo: por
provisión de una región bisagra del terminal C de cada dominio V y
el enlace disulfuro entre las cisteínas en las regiones bisagra; o
el suministro de los dAb cada uno con una cisteína en el terminal C
del dominio, estando las cisteínas unidas por disulfuro; o la
producción de V-CH y V-CL para
producir un formado Fab; o la utilización de enlazadores peptídicos
(por ejemplo los enlazadores Gly_{4}Ser expuestos más adelante)
para producir dímeros, trímeros y polímeros adicionales.
Los inventores han descubierto que la
utilización de dominios variables complementarios permite que las
dos superficies del dominio se empaqueten y estén secuestradas en
el disolvente. Además los dominios complementarios son capaces de
estabilizarse entre sí. Además, permite la creación de anticuerpos
específicos dobles de IgG sin los inconvenientes de los hibridomas
híbridos utilizados en la técnica anterior, o la necesidad de
modificar genéticamente cadenas pesadas o ligeras en las interfases
de la subunidad. Los ligandos doble-específicos del
primer aspecto de la presente invención presentan por lo menos un
par V_{H}/V_{L}. Una IgG biespecífica según la presente
invención comprenderá por consiguiente dos de dichos pares, un par
en cada brazo de la molécula en forma de Y. A diferencia de los
anticuerpos o diacuerpos biespecíficos convencionales, por
consiguiente, en los que la relación con cadenas utilizada es
determinante del éxito de la preparación de las mismas y conduce a
dificultades prácticas, los ligandos
doble-específicos de la invención están exentos de
los resultados del equilibrio de la cadena. El desequilibrio de la
cadena en los anticuerpos biespecíficos convencionales procede de
la asociación de dos cadenas V_{L} diferentes con dos cadenas
V_{H} diferentes, en la que la cadena 1 V_{L} junto con la
cadena 1 V_{H} es capaz de unirse al antígeno o epítopo 1 y la
cadena 2 V_{L} junto con la cadena 2 V_{H} es capaz de unirse
al antígeno o epítopo 2 y los dos pares correctos están de alguna
manera unidos entre sí. Por lo tanto, solamente cuando la cadena 1
V_{L} esté emparejada con la cadena 1 V_{H} y la cadena 2
V_{L} esté emparejada con la cadena 2 V_{H} en una sola molécula
se crea biespecificidad. Dichas moléculas biespecíficas pueden
crearse de dos formas diferentes. En primer lugar, pueden crearse
por asociación de dos pares V_{H}/V_{L} existentes que se une
cada uno a un antígeno o epítopo diferente (por ejemplo, en una IgG
biespecífica). En este caso todos los emparejamientos
V_{H}/V_{L} deben venir juntos en una relación 1:1 a fin de
crear una población de moléculas todas las cuales son biespecíficas.
Esto nunca tiene lugar (aun cuando el dominio CH complementario esté
potenciado por la modificación genética "protuberancias en
orificios" conduciendo a una mezcla de moléculas biespecíficas y
moléculas que solamente son capaces de unirse a un antígeno o
epítopo pero no al otro. La segunda forma de crear un anticuerpo
biespecífico es mediante la asociación simultánea de dos cadenas
V_{H} diferentes con dos cadenas V_{L} diferentes (por ejemplo
en un diacuerpo biespecífico). En este caso, aunque tiende a ser una
preferencia de la cadena 1 V_{L} para emparejarse con la cadena 1
V_{H} y de la cadena 2 V_{L} para emparejarse con la cadena 2
V_{H} (que puede estar potenciada por modificación genética
"protuberancias en orificios" de los dominios V_{L} y
V_{H}), este emparejamiento no se consigue nunca en todas las
moléculas, lo que conduce a una formulación mezclada por lo que
tienen lugar emparejamientos incorrectos que son incapaces de unirse
al antígeno o epítopo.
Los anticuerpos biespecíficos construidos de
acuerdo con el método del ligando doble-específico
según el primer aspecto de la presente invención resuelven todos
estos problemas porque la unión al antígeno o epítopo 1 radica en
el dominio V_{H} o V_{L} y la unión al antígeno o epítopo 2
radica en el dominio V_{L} o V_{H} complementario,
respectivamente. Dado que los dominios V_{H} y V_{L} se
emparejan en una base 1:1 todos los pares V_{H}/V_{L} serán
biespecíficos y por lo tanto todos los formatos construidos
utilizando estos pares V_{H}/V_{L} (Fv, scFvs, Fabs,
minicuerpos, IgG, etc.) presentarán el 100% de actividad
biespecífica.
En cuanto a la presente invención, se entiende
que el primer y segundo "epítopos" son epítopos que no son
iguales y no están unidos por un ligando monoespecífico simple. En
la primera configuración de la invención, están ventajosamente en
diferentes antígenos, uno de los cuales actúa para prolongar la vida
media del ligando in vivo. Asimismo, el primer y segundo
antígenos no son ventajosamente los mismos.
Los ligandos doble-específicos
de la invención no incluyen los ligandos descritos en el documento
WO 02/02773. Por lo tanto, los ligandos de la presente invención no
comprenden los pares V_{H}/V_{L} complementarios que unen
alguno o más antígenos o epítopos de forma operativa conjunta. En
lugar de esto, los ligandos según el primer aspecto de la invención
comprenden un par V_{H}/V_{L} complementario, en el que los
dominios V presentan especificidades
diferentes.
diferentes.
Además, los ligandos según el primer aspecto de
la invención comprenden los pares complementarios V_{H}/V_{L}
que presentan especificidades diferentes para los epítopos o
antígenos no estructuralmente relacionados. Los epítopos o
antígenos relacionados estructuralmente son epítopos o antígenos que
poseen similitud estructural suficiente para estar unidos mediante
un par complementario V_{H}/V_{L} convencional que actúa de
manera operativa conjunta para unirse a un antígeno o epítopo; en
el caso de los epítopos relacionados estructuralmente, los epítopos
son lo suficientemente similares en estructura para que "se
fijen" en la misma bolsa de fijación formada en el sitio de
fijación al antígeno del dímero V_{H}/V_{L}.
En un segundo aspecto, la presente invención
proporciona un ligando que comprende un primer dominio variable de
inmunoglobulina que presenta una primera especificidad de fijación
al antígeno o epítopo y un segundo dominio variable de
inmunoglobulina que presenta una segunda especificidad de fijación
del antígeno o epítopo en el que uno o ambos de dichos primer y
segundo dominios variables se unen a un antígeno que prolonga la
vida media del ligando in vivo, y
- (i)
- el primer y el segundo dominios variables de inmunoglobulina son dominios variables con cadena pesada; o
- (ii)
- el primer y el segundo dominios variables de inmunoglobulina son dominios variables con cadena ligera;
con la condición de que cuando el primer y el
segundo dominios variables de inmunoglobulina sean dominios VHH de
camélidos, el dominio VHH que es específico para un antígeno que
prolonga la vida media del ligando in vivo no se una a la
lisozima de la clara de huevo de gallina (HEL), a la
alfa-amilasa pancreática porcina; a
NmC-A, a hcg, al colorante azo RR6 unido a BSA o a
las células HG982 de S. mutans.
En una forma de realización, la fijación a un
dominio variable modula la fijación del ligando al segundo domino
variable.
En esta forma de realización, los dominios
variables pueden ser, por ejemplo, pares de dominios V_{H} o
pares de dominios V_{L}. La fijación del antígeno al primer punto
puede modular, tal como aumentar o inhibir, la fijación de un
antígeno al segundo punto. Por ejemplo, la fijación al primer punto
inhibe por lo menos parcialmente la fijación de un antígeno a un
segundo punto. En dicha forma de realización, el ligando puede
mantenerse, por ejemplo, en el cuerpo de un organismo de un sujeto
in vivo mediante la fijación a una proteína que prolonga la
vida media del ligando hasta un momento tal que se una al segundo
antígeno diana y se disocie de la proteína que prolonga la vida
media.
La modulación de la fijación en el contexto
anterior se consigue como consecuencia de la proximidad estructural
del antígeno que une puntos próximos uno del otro. Dicha proximidad
estructural puede conseguirse por la naturaleza de los componentes
estructurales que se unen a dos o más sitios de fijación del
antígeno, p. ej. mediante el suministro de un ligando con una
estructura relativamente rígida que mantiene los sitios de fijación
del antígeno en estrecha proximidad. De manera ventajosa, los dos o
más sitios de fijación del antígeno están en proximidad físicamente
estrecha entre sí de manera que un punto modula la fijación del
antígeno en otro punto mediante un proceso que implica impedimento
estérico y/o cambios de conformación en la molécula de
inmunoglobulina.
El primer y el segundo dominios de fijación del
antígeno pueden estar asociados por enlace covalente o no
covalente. En el caso en que los dominios estén asociados por enlace
covalente, entonces la asociación puede estar mediada por ejemplo
por enlaces disulfuro o por un enlazador polipéptido tal como
(Gly_{4}Ser)_{n}, en el que n = de 1 a 8, p. ej., 2, 3,
4, 5 ó 7.
Los ligandos según la invención pueden
combinarse en estructuras poliligando distintas de la
inmunoglobulina para formar complejos polivalentes, que fijan
moléculas diana con el mismo antígeno, proporcionando de este modo
avidez superior, mientras que por lo menos un dominio variable se
fija a un antígeno para prolongar la vida media del polímero. Por
ejemplo, receptores bacterianos naturales tal como SpA se han
utilizado como armazones para el trasplante de los CDR para generar
ligandos que se fijan específicamente a uno o más epítopos.
Detalles de este procedimiento se describen en el documento US
nº 5.831.012. Otros armazones adecuados comprenden las
basadas en fibronectina y cuerpos afines. Los detalles de los
procedimientos adecuados se describen en el documento WO 98/58965.
Otros armazones adecuados incluyen lipocaína y CTLA4, como se
describe en van den Beuken et al., J. Mol. Biol.
(2001) 310, 591-601, y armazones tales como los
descritos en el documento WO 0069907 (Medical Research Council),
que están basadas por ejemplo en la estructura anular de GroEL
bacteriano u otros polipéptidos de chaperona.
Los soportes de proteínas pueden combinarse; por
ejemplo, las CDR pueden injertarse en un soporte CTLA4 y utilizarse
junto con los dominios V_{H} o V_{L} de inmunoglobulina para
formar un ligando. Asimismo, pueden combinarse fibronectina,
lipocallina y otros soportes.
En el caso en que los dominios variables se
seleccionen de los repertorios del gen V utilizando por ejemplo la
tecnología de presentación del fago como se describe en la presente
memoria, entonces estos dominios variables pueden comprender una
región con armazón universal, de modo que puedan ser reconocidos por
un ligando genérico específico como se define en la presente
memoria. La utilización de armazones universales, ligandos genéricos
y similares está descrita en el documento WO 99/20749. En la
presente invención, la referencia a la presentación del fago
incluye la utilización tanto de fagos como de fagómidos.
Cuando se utilicen repertorios del gen V la
variación en la secuencia de polipéptidos está situada
preferentemente en los bucles estructurales de los dominios
variables. Las secuencias de polipéptidos de los dominios variables
pueden alterarse desordenado el ADN o por mutación a fin de aumentar
la interacción de cada dominio variable con su par
complementario.
En una forma de realización preferida de la
invención, el "ligando doble-específico" es un
fragmento Fv de una sola cadena. En una forma de realización
alternativa de la invención, el "ligando
doble-específico" está constituido por una
región Fab de un anticuerpo. La expresión "región Fab" incluye
una región similar a Fab en la que se utilizan dos dominios VH o dos
VL.
Las regiones variables pueden proceder de
anticuerpos dirigidos contra antígenos o epítopos diana.
Alternativamente pueden proceder de un repertorio de dominios con
un solo anticuerpo tales como los expresados en la superficie de
bacteriófagos filamentosos. La selección puede realizarse como se
describe más adelante.
En un tercer aspecto, la invención proporciona
un método para producir un ligando que comprende un primer dominio
variable simple de inmunoglobulina con una primera especificidad de
fijación y un segundo dominio variable simple de inmunoglobulina
con una segunda especificidad de fijación (diferente), siendo una o
ambas especificidades de fijación específicas para un antígeno que
prolonga la vida media del ligando in vivo, comprendiendo el
método las etapas siguientes:
- (a)
- seleccionar un primer dominio variable por su capacidad para unirse a un primer epítopo,
- (b)
- seleccionar una segunda región variable por su capacidad para unirse a un segundo epítopo,
- (c)
- combinar los dominios variables; y
- (d)
- seleccionar el ligando por su capacidad para unirse a dicho primer epítopo y a dicho segundo epítopo; en el que dichos dominios variables son un dominio variable con cadena pesada y cadena ligera; el dominio variable con cadena pesada no es un dominio V_{H} específico para HSA.
El ligando puede unirse al primer y segundo
epítopos simultáneamente o, cuando existe competencia entre los
dominios de fijación para la fijación del epítopo, la fijación de un
dominio puede excluir la fijación de otro dominio a su epítopo
análogo. En una forma de realización, por consiguiente, la etapa (d)
requiere simultáneamente tanto al primer como al segundo (y
posiblemente más) epítopos; en otra forma de realización, la
fijación al primer y segundo epítopos no es simultánea.
Los epítopos están preferentemente en antígenos
separados.
Los ligandos de forma ventajosa comprenden
combinaciones V_{H}/V_{L}, o combinaciones V_{H}/V_{H} o
V_{L}/V_{L} de dominios variables de inmunoglobulina, como se
describió anteriormente. Los ligandos pueden comprender además
dominios V_{HH} camélidos, con la condición de que el dominio
V_{HH} que es específico para un antígeno que prolonga la vida
media del ligando in vivo no se una a la lisozima de la clara
de huevo de gallina (HEL), a la alfa-amilasa
pancreática porcina o a NmC-A; a hcg, al colorante
azo RR6 unido a BSA o a células HG982 de S. mutans, tal como
se describe en Conrath et al., (2001) JBC 276:
7346-7350 y el documento WO 99/23221, ninguno de
los cuales describe la utilización de una especificidad para un
antígeno que prolonga la vida media al prolongar la vida media del
ligando
in vivo.
in vivo.
En una forma de realización, se selecciona dicho
primer dominio variable para fijarse a dicho primer epítopo en
ausencia de un dominio variable complementario. En una forma de
realización adicional, se selecciona dicho primer dominio variable
para fijar dicho primer epítopo/antígeno en presencia de un tercer
dominio variable en el que dicho tercer dominio variable es
diferente de dicho segundo dominio variable y es complementario con
el primer dominio. Asimismo, el segundo dominio puede seleccionarse
en ausencia o presencia de un dominio variable
complementario.
complementario.
Los antígenos o epítopos dirigidos por los
ligandos de la invención, además de la proteína que prolonga la
vida media, puede ser cualquier antígeno o epítopo pero de forma
ventajosa es un antígeno o epítopo que está dirigido con utilidad
terapéutica. La invención proporciona ligandos, incluyendo la
conformación abierta, la conformación cerrada y ligandos aislados
del monómero dAb, específicos para cualquiera de dichas dianas,
particularmente aquellas dianas más identificadas en la presente
memoria. Dichas dianas pueden ser, o formar parte de, polipéptidos,
proteínas o ácidos nucleicos, que pueden ser naturales o sintéticos.
A este respecto, el ligando de la invención puede fijar el epítopo
o antígeno y actúa como antagonista o agonista (p. ej., el agonista
del receptor EPO). Un experto en la materia apreciará que la
selección sea extensa y variada. Pueden ser por ejemplo proteínas,
citocinas, receptores de citocina, cofactores enzimáticos para
enzimas o proteínas de fijación del ADN humanas o animales. Las
citocinas y factores de crecimiento adecuados incluyen pero no se
limitan a: ApoE, Apo-SAA, BDNF,
cardiotrofina-1, EGF, receptor de EGF,
ENA-78, Eotaxina, Eotaxina-2,
Exodus-2, EpoR, FGF-ácido,
FGF-básico, factor 10 de crecimiento de
fibroblastos, ligando FLT3, fractalquina (CX3C), GDNF,
G-CSF, GM-CSF,
GF-\beta1, insulina, IFN-\gamma,
IGF-I, IGF-II,
IL-1\alpha, IL-1\beta,
IL-3, IL-4, IL-5,
IL-6, IL-7, IL-8 (72
a.a.), IL-8 (77 a.a.), IL-9,
IL-10, IL-11, IL-12,
IL-13, IL-15, IL-16,
IL-17, IL-18 (IGIF), inhibina
\alpha, inhibina \beta, IP-10, factor 2 de
crecimiento de queratinocitos (KGF-2), KGF,
leptina, LIF, linfotactina, sustancia inhibidora mulleriana, factor
inhibidor de colonias de monocitos, proteína atrayente de monocitos,
M-CSF, MDC (67 a.a.), MDC (69 a.a.),
MCP-1 (MCAF), MCP-2,
MCP-3, MCP-4, MDC (67 a.a.), MDC
(69 a.a.), MIG, MIP-1\alpha,
MIP-1\beta, MIP-3\alpha,
MIP-3\beta, MIP-4,
factor-1 inhibidor precursor mieloide
(MPIF-1), NAP-2, neurturina, factor
de crecimiento de nervios, \beta-NGF,
NT-3, NT-4, oncostatina M,
PDGF-AA, PDGF-AB,
PDGF-BB, PF-4, RANTES, SDF1\alpha,
SDF1\beta, SCF, SCGF, factor de células madre (SCF), TARC,
TGF-\alpha, TGF-\beta,
TGF-\beta2, TGF-\beta3, factor
de necrosis tumoral (TNF), TNF-\alpha,
TNF-\beta, el receptor I de TNF, el receptor II de
TNF, TNIL-1, TPO, VEGF, el receptor 1 de VEGF, el
receptor 2 de VEGF, el receptor 3 de VEGF, GCP-2,
GRO/MGSA, GRO-\beta, GRO-\gamma,
HCC1, 1-309, HER 1, HER 2, HER 3 y HER 4. Los
receptores de citocina incluyen los receptores para las citocinas
anteriores. Se apreciará que esta lista no sea de ningún modo
exhaustiva.
En una forma de realización de la invención, los
dominios variables proceden del anticuerpo respectivo dirigido
contra el antígeno o epítopo. En una forma de realización preferida
los dominios variables proceden de un repertorio de dominios de
anticuerpo variables individuales.
En un aspecto adicional, la presente invención
proporciona una o más moléculas de ácido nucleico que codifican por
lo menos un ligando doble-específico definido en la
presente memoria. El ligando doble-específico puede
estar codificado en una sola molécula de ácido nucleico;
alternativamente, cada dominio puede estar codificado por una
molécula de ácido nucleico independiente. Cuando el ligando está
codificado por una sola molécula de ácido nucleico, los dominios
pueden expresarse como un polipéptido de fusión, en forma de
molécula scFv, o pueden expresarse por separado y sucesivamente
ligados, por ejemplo utilizando agentes de enlace químico. Los
ligandos expresados procedentes de ácidos nucleicos independientes
estarán ligados por medios apropiados.
El ácido nucleico puede codificar además una
secuencia señal para exportación de los polipéptidos procedentes de
una célula huésped en la expresión y pueden estar fusionados con un
componente de superficie de una partícula filamentosa de
bacteriófago (u otro componente de un sistema de presentación de la
selección) en el momento de la expresión.
En un aspecto adicional la presente invención
proporciona un vector que comprende ácido nucleico que codifica un
ligando doble-específico según la presente
invención.
En un aspecto adicional todavía, la presente
invención proporciona una célula huésped transfectada con un vector
que codifica un ligando doble-específico según la
presente invención.
La expresión de dicho vector puede configurarse
para producir, por ejemplo en la superficie de una partícula de
bacteriófago, dominios variables para la selección. Esto permite la
selección de regiones variables desplegadas y de este modo la
selección de "ligandos doble-específicos"
utilizando el método de la presente invención.
Los ligandos doble-específicos
según la presente invención comprenden preferentemente combinaciones
de dominios con cadena pesada y ligera. Por ejemplo, el ligando
doble-específico puede comprender un dominio V_{H}
y un dominio V_{L}, que puede estar unido en forma de un scFv.
Además, los ligandos pueden comprender uno o más dominios C_{H} o
C_{L}. Por ejemplo, los ligandos pueden comprender un dominio
C_{H}1, C_{H}2 o C_{H}3 y/o un dominio C_{L} o dominios
C\mu1, C\mu2, C\mu3, C\mu4 o cualquier combinación de los
mismos. Puede incluirse también un dominio con región de bisagra.
Dicha combinación de dominios puede, por ejemplo, simular
anticuerpos naturales, tal como IgG o IgM, o fragmentos de los
mismos, tales como moléculas Fv, scFv, Fab o F(ab')_{2}. Se
contemplan otras estructuras, tal como un solo brazo de una molécula
de IgG que comprende los dominios V_{H}, V_{L}, C_{H}1 y
C_{L}.
En una forma de realización preferida de la
invención, las regiones variables se seleccionan de entre los
repertorios del gen V con un solo dominio. Generalmente el
repertorio de dominios de anticuerpo simples se despliega sobre la
superficie del bacteriófago filamentoso. En una forma de realización
preferida cada dominio un solo anticuerpo se selecciona mediante la
fijación de un repertorio de fago al antígeno.
En una forma de realización preferida de la
invención cada dominio variable simple puede seleccionarse para
fijarse a su antígeno o epítopo diana en ausencia de una región
variable complementaria. En una forma de realización alternativa,
los dominios variables simples pueden seleccionarse para fijarse a
su antígeno o epítopo diana en presencia de una región variable
complementaria. Por lo tanto el primer dominio variable simple puede
seleccionarse en presencia de un tercer dominio variable
complementario y el segundo dominio variable puede seleccionarse en
presencia de un cuarto dominio variable complementario. El tercer o
cuarto dominio variable complementario puede ser el dominio
variable análogo que presente la misma especificidad que el dominio
simple que se está probando, o un dominio complementario no
homólogo, tal como un dominio variable "ficticio".
Preferentemente el ligando
doble-específico de la invención comprende solamente
dos dominios variables aunque varios de dichos ligandos pueden
incorporarse a la misma proteína, por ejemplo dos de dichos ligandos
pueden incorporarse a una IgG o una inmunoglobulina polimérica, tal
como IgM. Alternativamente, en otra forma de realización se
combinan diversos ligandos doble-específicos para
formar un polímero. Por ejemplo, se combinan dos ligandos
doble-específicos diferentes para crear una molécula
tetraespecífica.
Un experto en la materia apreciará que las
regiones variables ligeras y pesadas de un ligando
doble-específico producidas según el método de la
presente invención puedan estar en la misma cadena polipeptídica, o
alternativamente, en diferentes cadenas polipeptídicas. En el caso
en que las regiones variables estén en diferentes cadenas
polipeptídicas, entonces pueden estar unidas por un enlazador,
generalmente un enlazador flexible (tal como una cadena
polipeptídica), un grupo de enlace químico o por cualquier otro
método conocido en la materia.
En un aspecto adicional, la presente invención
proporciona una composición que comprende un ligando
doble-específico, que puede obtenerse por un método
de la presente invención, y un vehículo, diluyente o excipiente
farmacéuticamente aceptable.
Además, la presente invención proporciona un
"ligando doble-específico" o una composición
del mismo según la presente invención, para su utilización en
terapia.
Los inventores han descubierto cuenta de que en
determinadas condiciones estructurales, los dominios variables no
complementarios (por ejemplo, dos dominios variables con cadena
ligera o dos dominios variables con cadena pesada) pueden estar
presentes en un ligando de modo que la fijación de un primer epítopo
a un primer dominio variable inhibe la fijación de un segundo
epítopo a un segundo dominio variable, aun cuando dichos dominios
no complementarios no operen conjuntamente como par homólogo.
El ligando comprende de manera ventajosa dos o
más pares de dominios variables; esto es, comprende por lo menos
cuatro dominios variables. De manera ventajosa, los cuatro dominios
variables comprenden armazones de origen humano.
En una forma de realización preferida, los
armazones humanos son idénticos a los de las secuencias de la línea
germinal humana.
Los presentes inventores consideran que dichos
anticuerpos serán de particular utilización en los ensayos de
fijación del ligando para terapia y otras utilizaciones.
Según la presente invención la expresión
"ligando multiespecífico" se refiere a un ligando que posee más
de una especificidad para su fijación al epítopo como se define en
la presente memoria.
Tal como se define en la presente memoria la
expresión "conformación cerrada" (ligando multiespecífico)
significa que los dominios del ligando de fijación al epítopo están
unidos o asociados entre sí, opcionalmente mediante un armazón
proteico, de modo que la fijación al epítopo mediante un dominio de
fijación al epítopo compite con la fijación al epítopo por otro
dominio de fijación al epítopo. Esto es, los epítopos análogos
pueden estar unidos por cada dominio de fijación al epítopo
individualmente pero no simultáneamente. La conformación cerrada
del ligando puede conseguirse utilizando los métodos descritos en la
presente memoria.
"Conformación abierta" significa que los
dominios de fijación al epítopo del ligando están unidos o asociados
entre sí, opcionalmente mediante una estructura proteica, tal como
la fijación al epítopo por un dominio de fijación al epítopo, de
modo que la fijación al epítopo por un epítopo que se fija al
dominio no compite con la fijación al epítopo por otro dominio de
fijación al epítopo.
Tal como se denomina en la presente memoria, el
término "compite" significa que la fijación de un primer
epítopo a su dominio de fijación del epítopo análogo se inhibe
cuando se fija un segundo epítopo a su dominio de fijación del
epítopo análogo. Por ejemplo, la fijación puede inhibirse
estéricamente, por ejemplo mediante bloqueo físico de un dominio de
fijación o por alteración de la estructura o del medio de un dominio
de fijación de modo que su actividad o afinidad es reducida por un
epítopo.
En cuanto a la presente invención, se entiende
que el primer y segundo "epítopos" son epítopos que no son
iguales y no están unidos por un solo ligando monoespecífico. Pueden
estar en diferentes antígenos o en el mismo antígeno, pero
separados por una distancia suficiente que hace que no formen una
sola entidad que podría estar unida mediante un solo par de
fijación V_{H}/V_{L} monoespecífico de un anticuerpo
convencional. Experimentalmente, si ambos dominios variables
individuales en la forma de anticuerpo con una sola cadena
(anticuerpos con dominio o dAb) compiten por separado mediante un
ligando V_{H}/V_{L} monoespecífico frente a dos epítopos a
continuación estos dos epítopos no están lo suficientemente
apartados para que se consideren epítopos independientes según la
presente
invención.
invención.
Los ligandos multiespecíficos de conformación
cerrada de la invención no incluyen ligandos tales como los
descritos en el documento WO 02/02773. Por lo tanto, los ligandos de
la presente invención no comprenden pares V_{H}/V_{L}
complementarios que se unan a uno o cualquiera o más antígenos o
epítopos de forma cooperante. En su lugar, los ligandos según la
invención comprenden preferentemente pares
V_{H}-V_{H} o V_{L}-V_{L}
no complementarios. Cada dominio V_{H} o V_{L} ventajosamente en
cada par V_{H}-V_{H} o
V_{L}-V_{L} presenta una especificidad
diferente de fijación al epítopo y los sitios de fijación al epítopo
están tan ordenados que la fijación de un epítopo a una región
compite con la fijación de un epítopo en otro punto.
Según la presente invención, ventajosamente,
cada dominio de fijación del epítopo comprende un dominio variable
de inmunoglobulina. De forma más ventajosa, cada dominio variable de
inmunoglobulina será un dominio variable con cadena ligera
(V_{L}) o un dominio variable con cadena pesada V_{H}. En la
segunda configuración de la presente invención, los dominios de
inmunoglobulina cuando están presentes en un ligando según la
presente invención son no complementarios, esto es no se asocian
para formar un sitio de fijación del antígeno V_{H}/V_{L}. Por
lo tanto, los ligandos multiespecíficos definidos en la segunda
configuración de la invención comprenden dominios de
inmunoglobulina del mismo subtipo, esto es dominios variable con
cadena ligera (V_{L}) o dominios variables con cadena pesada
(V_{H}). Además, cuando el ligando según la invención está en la
conformación cerrada, los dominios de inmunoglobulina pueden ser
del tipo V_{HH} camélidos.
En una forma de realización alternativa el o los
ligando(s) según la invención no comprende(n) un
dominio V_{HH} camélido. Más particularmente, el o los
ligando(s) de la invención no comprende(n) uno o más
restos de aminoácido que sean específicos para los dominios
V_{HH} camélidos en comparación con los dominios V_{H}
humanos.
De manera ventajosa, los dominios variables
individuales proceden de los anticuerpos seleccionados para la
actividad de fijación contra diferentes antígenos o epítopos. Por
ejemplo, los dominios variables pueden aislarse por lo menos en
parte por inmunización humana. Los métodos alternativos son
conocidos en la técnica, incluyendo el aislamiento de bancos de
anticuerpos humanos y la síntesis de genes de anticuerpos
artificiales.
Los dominios variables de manera ventajosa se
fijan a superantígenos, tales como la proteína A o la proteína L.
La fijación a superantígenos es una propiedad de los dominios
variables de anticuerpo plegado correctamente y permiten que dichos
dominios sean aislados, por ejemplo de bancos de dominios
recombinantes o mutantes.
Los dominios de fijación al epítopo según la
presente invención comprenden un armazón proteico y puntos de
interacción del epítopo (que están ventajosamente en la superficie
del armazón proteico).
Los dominios de fijación al epítopo pueden
basarse también en soportes o armazones proteicos distintos de los
dominios de inmunoglobulina. Por ejemplo, se han utilizado
receptores bacterianos naturales tales como SpA como soportes para
el trasplante de los CDR destinados a generar ligandos que se unen
específicamente a uno o más epítopos. Los detalles de este
procedimiento se describen en el documento US nº 5.831.012. Otros
soportes adecuados comprenden los basados en fibronectina y cuerpos
afines. Los detalles de los procedimientos adecuados se describen
en el documento WO 98/58965. Otros soportes adecuados incluyen
lipocaína y CTLA4, como se describe en van den Beuken et
al., J. Mol. Biol. (2001) 310, 591-601, y
soportes tales como los descritos en el documento WO 0069907
(Medical Research Council), que están basadas por ejemplo en la
estructura anular de GroEL bacteriano u otros polipéptidos de
chaperona.
Los soportes de proteínas pueden combinarse; por
ejemplo, los CDR pueden injertarse en un soporte CTLA4 y utilizarse
junto con los dominios V_{H} o V_{L} de inmunoglobulina para
formar un ligando polivalente. Asimismo, pueden combinarse
fibronectina, lipocallina y otros soportes.
Un experto en la materia apreciará que los
dominios que fijan el epítopo de un ligando multiespecífico con
conformación cerrada producido según el método de la presente
invención pueda estar en la misma cadena polipeptídica, o
alternativamente, en diferentes cadenas polipeptídicas. En el caso
en que las regiones variables estén en diferentes cadenas
polipeptídicas, entonces pueden estar unidas por un enlazador,
ventajosamente un enlazador flexible (tal como una cadena
polipeptídica), un grupo de enlace químico o por cualquier otro
método conocido en la materia.
El primer y el segundo dominios de fijación del
epítopo pueden estar asociados por enlace covalente o no covalente.
En el caso en que los dominios estén asociados por enlace covalente,
entonces la asociación puede estar mediada por ejemplo por enlaces
disulfuro.
Los epítopos pueden ser, o formar parte de,
polipéptidos, proteínas o ácidos nucleicos, que pueden ser naturales
o sintéticos. A este respecto, el ligando de la invención puede
fijar el epítopo o antígeno y actúa como antagonista o agonista (p.
ej., el agonista del receptor de EPO). El epítopo que fija dominios
del ligando en una forma de realización presenta la misma
especificidad del epítopo y puede por ejemplo fijar simultáneamente
su epítopo cuando están presentes múltiples copias del epítopo en
el mismo antígeno. En otra forma de realización se proporcionan
estos epítopos en diferentes antígenos, de modo que el ligando pueda
unir los epítopos y forman un puente con los antígenos. Un experto
en la materia apreciará que la selección sea extensa y variada.
Pueden ser por ejemplo proteínas, citocinas, receptores de
citocina, cofactores enzimáticos para enzimas o proteínas de
fijación del ADN humanas o animales. Las citocinas y factores de
crecimiento adecuados incluyen pero no se limitan a: ApoE,
Apo-SAA, BDNF, cardiotrofina-1, EGF,
receptor de EGF, ENA-78, Eotaxina,
Eotaxina-2, Exodus-2, EpoR,
FGF-ácido, FGF-básico, factor 10 de crecimiento de
fibroblastos, ligando FLT3, fractalquina (CX3C), GDNF,
G-CSF, GM-CSF,
GF-\beta1, insulina, IFN-\gamma,
IGF-I, IGF-II,
IL-1\alpha, IL-1\beta,
IL-3, IL-4, IL-5,
IL-6, IL-7, IL-8 (72
a.a.), IL-8 (77 a.a.), IL-9,
IL-10, IL-11, IL-12,
IL-13, IL-15,
IL-16, IL-17, IL-18
(IGIF), inhibina \alpha, inhibina \beta, IP-10,
factor 2 de crecimiento de queratinocitos (KGF-2),
KGF, leptina, LIF, linfotactina, sustancia inhibidora mulleriana,
factor inhibidor de colonias de monocitos, proteína atrayente de
monocitos, M-CSF, MDC (67 a.a.), MDC (69 a.a.),
MCP-1 (MCAF), MCP-2,
MCP-3, MCP-4, MDC (67 a.a.), MDC
(69 a.a.), MIG, MIP-1\alpha,
MIP-1\beta, MIP-3\alpha,
MIP-3\beta, MIP-4,
factor-1 inhibidor precursor mieloide
(MPIF-1), NAP-2, neurturina,
factor de crecimiento de nervios, \beta-NGF,
NT-3, NT-4, oncostatina M,
PDGF-AA, PDGF-AB,
PDGF-BB, PF-4, RANTES, SDF1\alpha,
SFF1\beta, SCF, SCGF, factor de células madre (SCF), TARC,
TGF-\alpha, TGF-\beta,
TGF-\beta2, TGF-\beta3, factor
de necrosis tumoral (TNF), TNF-\alpha,
TNF-\beta, receptor I de TNF, receptor II de TNF,
TNIL-1, TPO, VEGF, receptor I de VEGF, receptor 2
de VEGF, receptor 3 de VEGF, GCP-2, GRO/MGSA,
GRO-\beta, GRO-\gamma, HCC1,
1-309, HER 1, HER 2, HER 3 y HER 4, centro de
reconocimiento de TACE, BP-I de TNF y
BP-II de TNF, así como cualquier diana expuesta en
el Anexo 2 o en el Anexo 3 de esta memoria, si está en la
combinación indicada en los Anexos, en una combinación diferente o
individualmente.
Los receptores de citocina incluyen los
receptores para las citocinas anteriores, por ejemplo
IL-1 R1; IL-6R;
IL-10R; IL-18R, así como los
receptores para citocinas indicados en el Anexo 2 o en el Anexo 3 y
también los receptores expuestos en los Anexos 2 y 3. Se apreciará
que esta lista no sea de ningún modo exhaustiva. Cuando el ligando
multiespecífico se une a dos epítopos (en el mismo o diferentes
antígenos), el o los antígeno(s) puede(n)
seleccionarse de esta lista.
De forma ventajosa, pueden utilizarse ligandos
doble-específicos para citocinas diana y otras
moléculas que cooperan sinérgicamente en situaciones terapéuticas
en el cuerpo de un organismo. La invención proporciona por
consiguiente un método para sinergizar la actividad de dos o más
citocinas, que comprende la administración de un ligando
doble-específico capaz de unirse a dichas dos o más
citocinas. En este aspecto de la invención, el ligando
doble-específico puede ser cualquier ligando
doble-específico, incluyendo un ligando compuesto
de dominios complementarios y/o no complementarios, un ligando en
una conformación abierta y un ligando en una conformación cerrada.
Por ejemplo, este aspecto de la invención se refiere a combinaciones
de dominios V_{H} y de dominios V_{L}, de dominios V_{H}
solamente y de dominios V_{L} solamente.
La sinergia en un contexto terapéutico puede
conseguirse de numerosas maneras. Por ejemplo, las combinaciones
diana pueden ser terapéuticamente activas solamente si ambas dianas
están dirigidas por el ligando, mientras que dirigir una diana sola
puede proporcionar algún efecto terapéutico bajo o mínimo, pero
junto con una segunda diana la combinación proporciona un aumento
sinérgico en el efecto terapéutico.
Preferentemente, las citocinas unidas por
ligandos doble-específicos de este aspecto de la
invención se seleccionan de la lista presentada en el Anexo 2.
Además, pueden utilizarse ligandos
doble-específicos en aplicaciones oncológicas, en
las que una especificidad dirige CD89, que es expresado por células
citotóxicas, y la otra es específica para el tumor. Ejemplos de
antígenos tumorales que pueden dirigirse se proporcionan en el Anexo
3.
En una forma de realización de la segunda
configuración de la invención, los dominios variables proceden de
un anticuerpo dirigido contra el primer y/o segundo antígeno o
epítopo. En una forma de realización preferida los dominios de la
variable proceden de un repertorio de dominios de anticuerpo
variables individuales. En un ejemplo, el repertorio es un
repertorio que no se crea en un animal o un repertorio sintético. En
otro ejemplo, los dominios variables individuales no se aislan (al
menos en parte) por inmunización animal. Por lo tanto, los dominios
variables individuales pueden aislarse de un banco natural.
En un aspecto adicional, la presente invención
proporciona un ligando multiespecífico de conformación cerrada que
comprende un primer dominio de fijación del epítopo que presenta una
primera especificidad de fijación del epítopo y un dominio de
fijación del segundo epítopo no complementario que presenta una
segunda especificidad de fijación del epítopo en el que las primera
y segunda especificidades de fijación son capaces de competir para
la fijación del epítopo de modo que el ligando multiespecífico de
conformación cerrada no puede unirse a ambos epítopos
simultáneamente.
simultáneamente.
Los ligandos de conformación abierta comprenden
dominios de fijación no complementarios, en los que los dominios
son específicos para un epítopo diferente en la misma diana. Dichos
ligandos se unen a dianas con avidez aumentada. Asimismo, la
invención proporciona ligandos polivalentes que comprenden dominios
de fijación no complementarios específicos para el mismo epítopo y
dirigidos a dianas que comprenden copias múltiples de dicho epítopo
tales como IL-5, PDGF-AA,
PDGF-BB, TGF beta, TGF beta2, TGF beta3 y
TNF\alpha, por ejemplo el receptor 1 del TNF humano y del
TNF\alpha humano.
Los ligandos pueden configurarse para unir
epítopos individuales con baja afinidad, de modo que la fijación a
epítopos individuales no sea terapéuticamente significativa; pero el
aumento de avidez resultante de la fijación a dos epítopos
proporciona una utilidad terapéutica. En un ejemplo concreto, los
epítopos que están presentes individualmente en tipos de células
normales pueden estar dirigidos, pero están presentes conjuntamente
solamente en las células anormales o enfermas, tal como las células
tumorales. En dicha situación, únicamente las células anormales o
enfermas son dirigidas eficazmente por los ligandos biespecíficos
según la invención.
Los ligandos específicos para múltiples copias
del mismo epítopo, o de epítopos adyacentes, en la misma diana
(conocidos como dAb quelantes) pueden ser también ligandos
triméricos o poliméricos (tertraméricos o más) que comprenden tres,
cuatro o más dominios de fijación no complementarios. Por ejemplo,
pueden construirse ligandos que comprenden tres o cuatro dominios
V_{H} o dominios V_{L}.
Además, se proporcionan ligandos que se unen a
dianas multisubunidad, en los que cada dominio de fijación es
específico para una unidad de dicha diana. El ligando puede ser
dimérico, trimérico o polimérico.
Preferentemente, los ligandos multiespecíficos
según los aspectos anteriores de la invención pueden obtenerse por
el método del primer aspecto de la invención.
Según el aspecto anterior de la segunda
configuración de la invención, de manera ventajosa el primer epítopo
que fija el dominio y el segundo epítopo que fija los dominios son
dominios variables de inmunoglobulina no complementarios, como los
definidos en la presente memoria. Esto es, dominios variables
V_{H}-V_{H} o
V_{L}-V_{L}.
Los dAb quelantes en particular pueden
prepararse según un aspecto preferido de la invención, a saber, la
utilización de los dAb de anclaje, en los que se construye un banco
de dAb diméricos, triméricos o poliméricos utilizando un vector que
comprende un dAb constante corriente arriba o corriente abajo de una
secuencia enlazadora, estando insertado un repertorio del segundo,
tercero y más dAb en la otra cara del enlazador. Por ejemplo, el
anclaje o vía dAb puede ser TAR1-5 (V_{\kappa}),
TAR1-27 (V_{\kappa}),
TAR2h-5(VH) o
TAR2h-6(V_{\kappa}).
En las metodologías alternativas, puede evitarse
la utilización de enlazadores, por ejemplo mediante la utilización
de afinidad de enlace no covalente o natural entre los dominios de
fijación tales como V_{H} y V_{\kappa}.
Según la presente invención, la expresión
"armazón de inmunoglobulina" se refiere a una proteína que
comprende por lo menos un pliegue de inmunoglobulina y que actúa
como núcleo para uno o más dominios de fijación del epítopo,
definidos en la presente memoria.
Los armazones de inmunoglobulina preferidos
definidos en la presente memoria incluyen uno cualquiera o más de
los seleccionados de entre los siguientes: una molécula de
inmunoglobulina que comprende por lo menos (i) el dominio CL
(subclase kappa o lambda) de un anticuerpo; o (ii) el dominio CH1 de
un anticuerpo con cadena pesada; una molécula de inmunoglobulina
que comprende los dominios CH1 y CH2 de una cadena pesada de
anticuerpo; una molécula de inmunoglobulina que comprende los
dominios CH1, CH2 y CH3 de una cadena pesada de anticuerpo; o
cualquiera del subconjunto (ii) juntamente con el dominio CL
(subclase kappa o lambda) de un anticuerpo. También puede estar
incluido un dominio de la región bisagra. Dichas combinaciones de
dominios pueden, por ejemplo, simular anticuerpos naturales, tales
como IgG o IgM, o fragmentos de los mismos tales como las moléculas
Fv, scFv, Fab o F(ab')_{2}. Los expertos en la materia
están al corriente de que esta lista no pretende ser exhaustiva.
El enlace del armazón a los dominios de fijación
del epítopo, como se define en la presente memoria puede
conseguirse en el contexto del polipéptido, que está después de la
expresión del ácido nucleico que codifica la estructura y/o los
dominios de fijación del epítopo. Alternativamente, la etapa de
fijación puede realizarse en el contexto del ácido nucleico. Los
métodos de fijación de un armazón de proteína según la presente
invención, a uno o más dominios de fijación del epítopo incluyen la
utilización de la química de las proteínas y/o las técnicas de
biológica molecular que son habituales para los expertos en la
materia y se describen en la presente memoria.
De manera ventajosa el ligando multiespecífico
de conformación cerrada comprende un primer dominio capaz de fijar
una molécula diana, y un segundo dominio capaz de fijar una molécula
o grupo que prolonga la vida media del ligando. Por ejemplo, la
molécula o grupo puede ser un agente de esponjamiento, tal como HSA
o una proteína de la matriz celular. Tal como se utiliza en la
presente memoria la frase "molécula o grupo que prolonga la vida
media de un ligando" se refiere a una molécula o grupo químico
que, cuando se fija a un ligando doble-específico
como el descrito en la presente memoria prolonga la vida media in
vivo de dicho ligando doble-específico cuando
se administra a un animal, en comparación con un ligando que no se
fija a esta molécula o grupo. Se describen a continuación ejemplos
de moléculas o grupos que prolongan la vida media de un ligando. En
una forma de realización preferida, el ligando multiespecífico de
conformación cerrada puede ser capaz de fijar la molécula diana
solamente en el desplazamiento de la molécula o grupo que prolonga
la vida media. Por lo tanto, por ejemplo, un ligando
multiespecífico de conformación cerrada se mantiene en circulación
en el torrente sanguíneo de un sujeto mediante una molécula
esponjosa tal como HSA. Cuando se encuentra una molécula diana, la
competencia entre los dominios de fijación del ligando
multiespecífico de conformación cerrada produce el desplazamiento de
la HSA y la fijación de la diana.
Los ligandos según algún aspecto de la presente
invención, así como los monómeros dAb útiles para construir dichos
ligandos pueden disociarse de manera ventajosa de su(s)
diana(s) homóloga(s) con una K_{d} de 300 nM a 5 pM
(es decir, 3 \times 10^{-7} a 5 x 10^{-12} M), preferentemente
de 50 nM a 20 pM, o 5 nM a 200 pM o 1 nM a 100 pM, 1 \times
10^{-7} M o menos, 1 \times 10^{-8} M o menos, 1 \times
10^{-9} M o menos, 1 \times 10^{-10} M o menos, 1 \times
10^{-11} M o menos; y/o una K_{off} de
5 \times 10^{-1} a 1 \times 10^{-7} S^{-1}, preferentemente 1 \times 10^{-2} a 1 \times 10^{-6} S^{-1}, o 5 \times 10^{-3} a 1 \times 10^{-5} S^{-1}, o 5 \times 10^{-1} S^{-1} o menos, o 1 \times 10^{-2} S^{-1} o menos, o 1 \times 10^{-3} S^{-1} o menos, o 1 \times 10^{-4} S^{-1} o menos, o 1 \times 10^{-5} S^{-1} o menos, o 1 \times 10^{-6} S^{-1} o menos, determinadas por resonancia de plasmón superficial. La constante de velocidad K_{d} se define como K_{off}/K_{on}.
5 \times 10^{-1} a 1 \times 10^{-7} S^{-1}, preferentemente 1 \times 10^{-2} a 1 \times 10^{-6} S^{-1}, o 5 \times 10^{-3} a 1 \times 10^{-5} S^{-1}, o 5 \times 10^{-1} S^{-1} o menos, o 1 \times 10^{-2} S^{-1} o menos, o 1 \times 10^{-3} S^{-1} o menos, o 1 \times 10^{-4} S^{-1} o menos, o 1 \times 10^{-5} S^{-1} o menos, o 1 \times 10^{-6} S^{-1} o menos, determinadas por resonancia de plasmón superficial. La constante de velocidad K_{d} se define como K_{off}/K_{on}.
Un ligando puede comprender un monómero dAb
anti-TNF\alpha (o un ligando
doble-específico que comprenda dicho dAb), un
ligando homodímero, heterodímero u homotrímero en el que cada dAb se
une a TNF\alpha. El ligando se fija a TNF\alpha con una K_{d}
de 300 nM a 5 pM (es decir, 3 \times 10^{-7} a 5 x 10^{-12}
M), preferentemente de 50 nM a 20 pM, más preferentemente de 5
nM a 200 pM y aún más preferentemente de 1 nM a 100 pM, expresado
de manera alternativa, la K_{d} es 1 \times 10^{-7} M o menos,
preferentemente 1 \times 10^{-8} M o menos, más preferentemente
1 \times 10^{-9} M o menos, ventajosamente 1 \times
10^{-10} M o menos, y más preferentemente 1 \times 10^{-11} M
o menos; y/o una constante de velocidad K_{off} de 5 \times
10^{-1} a 1 \times 10^{-7} S^{-1}, preferentemente
1 \times 10^{-2} a 1 \times 10^{-6} S^{-1}, más
preferentemente 5 \times 10^{-3} a 1 \times
10^{-5} S^{-1}, por ejemplo 5 \times 10^{-1} S^{-1} o
menos, preferentemente 1 \times 10^{-2} S^{-1} o menos, más
preferentemente 1 \times 10^{-3} S^{-1} o menos,
ventajosamente 1 \times 10^{-4} S^{-1} o menos, más
ventajosamente 1 \times 10^{-5} S^{-1} o menos, y aún más
preferentemente 1 \times 10^{-6} S^{-1} o menos, determinadas
por resonancia de plasmón superficial.
Preferentemente, el ligando neutraliza a
TNF\alpha en un ensayo L929 normalizado con un ND50 de 500 nM a
50 pM, preferentemente o 100 nM a 50 pM, ventajosamente de 10 nM a
100 pM, más preferentemente de 1 nM a 100 pM; por ejemplo 50 nM o
menos, preferentemente 5 nM o menos, ventajosamente 500 pM o menos,
más preferentemente 200 pM o menos y aún más preferentemente 100 pM
o menos.
Preferentemente, el ligando inhibe la fijación
de TNF alfa al receptor I de TNF alfa (receptor p55) con una IC50 de
500 nM a 50 pM, preferentemente 100 nM a 50 pM, más preferentemente
de 10 nM a 100 pM, ventajosamente de 1 nM a 100 pM; por ejemplo 50
nM o menos, preferentemente 5 nM o menos, más preferentemente 500 pM
o menos, ventajosamente 200 pM o menos y aún más preferentemente 100
pM o menos. Preferentemente, el TNF alfa es TNF alfa humano.
Un ligando puede comprender un monómero dAb del
receptor I anti-TNF\alpha o un ligando
doble-específico que comprende dicho dAb, que se
fija a al receptor I de TNF con una K_{d} de 300 nM a 5 pM (es
decir, 3 \times 10^{-7} a 5 x 10^{-12} M), preferentemente de
50 nM a 20 pM, más preferentemente de 5 nM a 200 pM y aún más
preferentemente de 1 nM a 100 pM, por ejemplo 1 \times 10^{-7} M
o menos, preferentemente 1 \times 10^{-8} M o menos, más
preferentemente 1 \times 10^{-9} M o menos, ventajosamente
1 \times 10^{-10} M o menos, y más preferentemente 1 \times
10^{-11} M o menos; y/o una constante de velocidad K_{off} de 5
\times 10^{-1} a 1 \times 10^{-7} S^{-1}, preferentemente
1 \times 10^{-2} a 1 \times 10^{-6} S^{-1}, más
preferentemente 5 \times 10^{-3} a 1 \times 10^{-5}
S^{-1}, por ejemplo 5 \times 10^{-1} S^{-1} o menos,
preferentemente 1 \times 10^{-2} S^{-1} o menos,
ventajosamente 1 \times 10^{-3} S^{-1} o menos, más
preferentemente 1 \times 10^{-4} S^{-1} o menos, aún más
preferentemente 1 \times 10^{-5} S^{-1} o menos, y lo más
preferentemente 1 \times 10^{-6} S^{-1} o menos, determinadas
por resonancia de plasmón superficial.
Preferentemente, el ligando del monómero dAb
neutraliza a TNF\alpha en un ensayo normalizado (p. ej. L929 o en
los ensayos con HeLa descritos en la presente memoria) con un ND50
de 500 nM a 50 pM, preferentemente de 100 nM a 50 pM, más
preferentemente de 10 nM a 100 pM, ventajosamente de 1 nM a 100 pM;
por ejemplo 50 nM o menos, preferentemente 5 nM o menos,
ventajosamente 500 pM o menos, ventajosamente 200 pM o menos y lo
más preferentemente 100 pM o menos.
Preferentemente, el monómero o el ligando dAb
inhibe la fijación de TNF alfa al receptor I de TNF alfa (receptor
p55) con una IC50 de 500 nM a 50 pM, preferentemente 100 nM a 50 pM,
más preferentemente de 10 nM a 100 pM, ventajosamente de 1 nM a
100 pM; por ejemplo 50 nM o menos, preferentemente 5 nM o
menos, más preferentemente 500 pM o menos, ventajosamente 200 pM o
menos y aún más preferentemente 100 pM o menos. Preferentemente, la
diana del receptor I de TNF es TNF\alpha humano.
Un ligando puede comprender un monómero dAb (o
un ligando doble-específico que comprende dicho dAb)
que se une a la albúmina del suero (SA) con una K_{d} de 1 nM a
500 \muM (es decir, de 1 \times 10^{-9} a 5 \times
10^{-4}), preferentemente de 100 nM a 10 \muM. Preferentemente,
para un ligando doble-específico que comprende un
primer dAb anti-SA y un segundo dAb en otra diana,
la afinidad (p. ej. K_{d} y/o K_{off} medida por resonancia de
plasmón superficial, p. ej. utilizando BiaCore) del segundo dAb para
su diana está comprendida entre 1 y 100.000 veces (preferentemente
entre 100 y 100.000, más preferentemente entre 1.000 y 100.000 o
entre 10.000 y 100.000 veces) la afinidad del primer dAb para SA.
Por ejemplo, el primer dAb se une a SA con una afinidad de
aproximadamente 10 \muM, mientras que el segundo dAb se une a su
diana con una afinidad de 100 pM. Preferentemente la albúmina del
suero es albúmina de suero humano (HSA).
En una forma de realización, el primer dAb (o un
monómero de dAb) se une a SA (p. ej., HSA) con una K_{d} de
aproximadamente 50, preferentemente 70 y más preferentemente 100,
150 ó 200 nM.
La invención proporciona además dímeros,
trímeros y polímeros de los monómeros de dAb, mencionados
anteriormente, según el siguiente aspecto de la presente
invención.
Los ligandos según la invención que incluyen
monómeros, dímeros y trímeros de dAb, pueden estar ligados a una
región Fc del anticuerpo, que comprende uno o ambos de los dominios
C_{H}2 y C_{H}3, y opcionalmente una región bisagra. Por
ejemplo, los vectores que codifican ligandos unidos como una sola
secuencia de nucleótidos a una región Fc pueden utilizarse para
preparar dichos polipéptidos.
En otro aspecto de la invención, la presente
invención proporciona un vector que comprende un ácido nucleico
según la presente invención.
Todavía en otro aspecto, la presente invención
proporciona una célula huésped transfectada con un vector según la
presente invención.
La expresión de dicho vector puede configurarse
para producir, por ejemplo en la superficie de una partícula de
bacteriófago, un epítopo que se une a los dominios para la
selección. Esto permite la selección de dominios desplegados y por
lo tanto la selección de "ligandos multiespecíficos" utilizando
el método de la presente invención.
Todavía en otro aspecto de la invención, la
presente invención proporciona una composición que comprende un
ligando, que puede obtenerse por un método de la presente invención
y un vehículo, diluyente o excipiente farmacéuticamente
aceptable.
Además, la presente invención proporciona un
método para el tratamiento de enfermedades que utiliza un "ligando
multiespecífico de conformación cerrada" o una composición según
la presente invención.
En una forma de realización preferida de la
invención, la enfermedad es el cáncer o una enfermedad inflamatoria,
p. ej., artritis reumatoide, asma o enfermedad de Crohn.
Las secuencias similares u homólogas (p. ej.,
por lo menos con aproximadamente el 70% de identidad de la
secuencia) a las secuencias expuestas en la presente memoria forman
asimismo parte de la invención. En algunas formas de realización,
la identidad de la secuencia en cuanto a los aminoácidos puede ser
80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o
superior. En cuanto a los ácidos nucleicos, la identidad de
secuencia puede ser aproximadamente del 70%, 75%, 80%, 85%, 90%,
91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o superior.
Alternativamente, existe identidad sustancial cuando los segmentos
de ácido nucleico se hibridan en condiciones de hibridación
selectiva (p. ej., condiciones de hibridación con severidad muy
alta), con el complemento de la cadena. Los ácidos nucleicos pueden
estar presentes en todas las células, en un lisado celular o en una
forma parcialmente purificada o sustancialmente pura.
Los cálculos de "homología" o de
"identidad de secuencia" o de "similitud" entre dos
secuencias (en la presente memoria los términos se utilizan
indistintamente) se realizan de la forma siguiente. Se alinean las
secuencias en aras de la comparación óptima (p. ej., pueden
introducirse huecos en una o ambas de una primera y una segunda
secuencia de aminoácidos o ácidos nucleicos para la alineación
óptima y las secuencias no homólogas pueden despreciarse en aras de
la comparación). En una forma de realización preferida, la longitud
de una secuencia de referencia alineada a título de comparación es
por lo menos del 30%, preferentemente por lo menos del 40%, más
preferentemente por lo menos del 50%, aun más preferentemente por lo
menos del 60% y aun más preferentemente por lo menos del 70%, 80%,
90%, 100% de la longitud de la secuencia de referencia. A
continuación se comparan los restos de aminoácidos o los nucleótidos
en las posiciones de los aminoácidos correspondientes o en las
posiciones de los nucleótidos. Cuando una posición en la primera
secuencia está ocupada por el mismo resto de aminoácido o nucleótido
como la posición correspondiente en la segunda secuencia, entonces
las moléculas son idénticas en esta posición (tal como se utiliza
en la presente memoria "homología" de aminoácido o ácido
nucleico es equivalente a "identidad" de aminoácido o de ácido
nucleico). El porcentaje de identidad entre las dos secuencias es
función del número de posiciones idénticas compartidas por las
secuencias, teniendo en cuenta el número de huecos, y la longitud de
cada hueco, que se necesita introducir para la alineación óptima de
las dos secuencias.
De forma ventajosa se emplea el algoritmo BLAST
(versión 2.0) para la alineación de la secuencia, con parámetros
fijados en valores por defecto. El algoritmo BLAST se describe con
detalle en la world wide web ("www") del National Center for
Biotechnology Information (".ncbi") de los National Institutes
of Health ("nih") del gobierno de los Estados Unidos
(".gov"), en el directorio "/Blast/", en el archivo
"blast_help.html". Los parámetros de búsqueda se definen como
se indica a continuación y se ajustan ventajosamente a los
parámetros definidos por defecto.
BLAST (herramienta básica de búsqueda de la
alineación local) es el algoritmo de búsqueda heurístico empleado
por los programas blastp, blasm, blastx, tblastn y tblastx; estos
programas asignan significación a sus resultados utilizando los
métodos estadísticos de Karlin y Altschul, 1990, Proc. Natl.
Acad. Sci. USA 87(6):2264-8 (véase el
archivo "blast_help.html", descrito anteriormente) con unas
pocas mejoras. Los programas BLAST se ajustaron para la búsqueda de
similitud de la secuencia, por ejemplo para identificar homólogos en
una secuencia de búsqueda. Los programas generalmente no son útiles
para la búsqueda de estilo del motivo. Para una exposición de
resultados básicos en la búsqueda de similitud de las bases de datos
de la secuencia, véase Altschul et al. (1994).
Los cinco programas BLAST disponibles en la
página web del National Center for Biotechnology Information
realizan las siguientes tareas:
"blastp" compara una secuencia de búsqueda
de aminoácidos frente a una base de datos de la secuencia de
proteínas;
"blastn" compara una secuencia de búsqueda
de nucleótidos frente a una base de datos de las secuencias de
nucleótidos;
"blastx" compara los productos de la
traducción conceptual de seis marcos de una secuencia de búsqueda de
nucleótidos (ambas cadenas) frente a una base de datos de las
secuencias de proteína;
"tblastn" compara una secuencia de búsqueda
de proteínas frente a una base de datos de la secuencia de
nucleótidos traducida de forma dinámica en los seis marcos de
lectura (ambas cadenas).
"tblastx" compara las producciones de los
seis marcos de una secuencia de búsqueda de nucleótidos frente a
las traducciones de seis marcos de una base de datos de la secuencia
de nucleótidos.
BLAST utiliza los parámetros de búsqueda
siguientes:
HISTOGRAM presenta un histograma de puntuaciones
para cada búsqueda; por defecto es sí. (Véase el parámetro H en el
manual BLAST).
DESCRIPTIONS limita el número de descripciones
cortas de secuencias compatibles descritas para el número
especificado; el límite por defecto es de 100 descripciones. (Véase
el parámetro V en la página del manual). Véase también EXPECT y
CUTOFF.
ALIGNMENTS limita las secuencias de la base de
datos al número especificado para el que se describen los pares de
segmentos de puntuación alta (HSP); el límite por defecto es 50. Si
aparecen más secuencias que éstas de la base de datos para
satisfacer el umbral de significación estadística durante el informe
(véase EXPECT y CUTOFF a continuación), solamente se adscriben las
compatibilidades asignadas a la significación estadística mayor.
Véase el parámetro B en el manual BLAST).
EXPECT Umbral de significación mayor para
describir las equivalencias frente a las secuencias de la base de
datos; el valor por defecto es 10, de modo que es de esperar que se
encuentren 10 equivalencias meramente por probabilidad, según el
modelo estocástico de Karlin y Altschul (1990). Si la significación
estadística asignada a una equivalencia es mayor que el umbral
EXPECT, la equivalencia no se comunicará. Los umbrales EXPECT
inferiores son más severos, lo que conduce a que se comuniquen
equivalencias con menor probabilidad. Los valores fraccionarios son
aceptables. Véase el parámetro E en el manual BLAST).
CUTOFF Puntuación Cutoff para comunicar pares de
segmentos con puntuación elevada. El valor por defecto se calcula a
partir del valor EXPECT (véase anteriormente). Solamente se
describen los HSP para una secuencia de la base de datos si la
significación estadística asignada a ellos es por lo menos tan
elevada como se asignaría a HSP solo, teniendo una puntuación igual
al valor CUTOFF. Los valores CUTOFF elevados son más severos, lo
que conduce a que se comuniquen equivalencias con menor
probabilidad. (Véase el parámetro S en el manual BLAST).
Típicamente, los umbrales de significación pueden prepararse de
manera más intuitiva utilización EXPECT.
MATRIX especifica una matriz de puntuación
alternativa para BLASTP, BLASTX, TBLASTN y TBLASTX. La matriz por
defecto es BLOSUM62 (Henikoff y Henikoff, 1992, Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 89(22):10915-9). Las opciones
alternativas válidas incluyen: PAM40, PAM120, PAM250 e IDENTITY.
Ninguna matriz de puntuación alternativa está disponible para
BLASTN; lo que especifica que la directiva MATRIX en la petición
BLASTN devuelve una respuesta errónea.
STRAND limita una búsqueda de TBLASTN a sólo la
cadena superior o inferior de las secuencias de la base de datos; o
limita una búsqueda de BLASTN, BLASTX o TBLASTX a sólo los
armazones de lectura de la cadena superior o inferior de la
secuencia de búsqueda.
FILTER enmascara los segmentos de la secuencia
de búsqueda que presentan complejidad de composición baja,
determinados mediante el programa SEG de Wootton & Federhen
(1993) Computers and Chemistry 17:149-163, o
los segmentos que constan de repeticiones internas con periodicidad
corta, determinados por el programa XNU de Claverie & Status,
1993, Computers and Chemistry 17:191-201, o,
para BLASTN, mediante el programa DUST de Tatusov y Lipman (véase la
pág world wide web de la NCBI). El filtrado puede eliminar los
informes estadísticamente significativos pero biológicamente no
interesantes de los resultados de blast (p. ej., aciertos frente a
las regiones comunes ácidas, básicas o ricas en prolina), dejando
las regiones más biológicamente interesantes de la secuencia de
búsqueda disponibles para la equivalencia específica frente a las
secuencias de la base de datos.
La secuencia de baja complejidad hallada
mediante un programa de filtración se sustituye utilizando la letra
"N" en la secuencia de nucleótidos (p. ej., "N", se
repitió 13 veces) y la letra "X" en las secuencias de proteínas
(p. ej., "X" se repitió 9 veces).
El filtrado se aplica solamente a la secuencia
de búsqueda (o a sus productos de traducción), no a las secuencias
de la base de datos. El filtrado por defecto es DUST para BLASTN,
SEG para otros programas. No es raro en absoluto que esté
enmascarado por SEG, XNU, o ambos, cuando se aplica a las secuencias
en SWISS-PROT, por eso no debería esperarse que la
filtración produzca siempre un efecto. Además, en algunos casos, se
enmascaran las secuencias en su totalidad, lo que indica que la
significación estadística de algunas equivalencias descritas frente
a la secuencia de búsqueda sin filtrar sería sospechosa.
NCBI-gi da lugar a que los
identificadores de NCBI gi se presenten en los resultados, además de
la denominación del acceso y/o del locus.
Más preferentemente, se realizan comparaciones
de la secuencia utilizando el algoritmo de búsqueda BLAST sencillo
proporcionado en la página world wide bed de NCBI descrita
anteriormente en el directorio "/BLAST".
- Figura 1
- presenta la diversificación de V_{H}/HSA en las posiciones H50, H52, H53, H55, H56, H58, H95, H96, H97, H98 (DVT o NNK codificadas respectivamente) que están en el sitio de fijación del antígeno de HSA de V_{H}. La secuencia de V_{\kappa} está diversificada en las posiciones L50 y L53.
- Figura 2
- presenta el Banco 1: línea germinal V_{\kappa} /V_{H} de DVT,
- \quad
- {}\hskip1,2cm el Banco 2: línea germinal V_{\kappa} /V_{H} de NNK,
- \quad
- {}\hskip1,2cm el Banco 3: línea germinal V_{H}/V_{\kappa} de DVT,
- \quad
- {}\hskip1,2cm el Banco 4: línea germinal V_{H}/V_{\kappa} de NNK.
- \quad
- En formato de presentación de fago/ScFv. Se preseleccionaron estos bancos para fijar la proteína A y la proteína L a ligandos genéricos de modo que la mayoría de los clones y de los bancos seleccionados sean operativos. Se seleccionaron los bancos en HSA (primera ronda) y \beta-gal (segunda ronda) o en la selección \beta-gal de HSA o en \beta-gal (primera ronda) y HSA (segunda ronda) selección HSA de \beta-gal. El scFv soluble de estos clones de PCR se amplía en la secuencia. Un clon que codifica un anticuerpo K8 específico doble se seleccionó para el trabajo adicional.
- Figura 3
- presenta una alineación de las cadenas V_{H} y de las cadenas V_{\kappa}.
- Figura 4
- presenta la caracterización de la propiedades de fijación del anticuerpo K8, las propiedades de fijación del anticuerpo K8 se caracterizan mediante ELISA del fago monoclonal, se descubrió que el anticuerpo K8 específico doble se fija a HSA y a \beta-gal y se presenta en la superficie del fago sin señales absorbentes mayores de 1,0. No se detectó reactividad cruzada con otras proteínas.
- Figura 5
- presenta el ELISA de scFv soluble utilizando concentraciones conocidas del fragmento de anticuerpo K8. Se recubrió una placa de 96 pocillos con 100 \mug de HSA, BSA y \beta-gal a 10 \mug/ml y 100 \mug/ml de Proteína A a una concentración de 1 \mug/ml. Se aplicaron 50 \mug de las diluciones en serie del scFv de K8 y se detectaron los fragmentos de anticuerpo fijados con Proteína L-HRP. Los resultados del ELISA confirman la naturaleza específica doble del anticuerpo K8.
- Figura 6
- presenta las características de fijación del clon K8 V_{\kappa}, V_{H} ficticio analizadas utilizando el ELISA de scFv soluble. La producción de los fragmentos de scFv solubles se produjo por IPTG como describe Harrison et al., Methods Enzymol. 1996; 267:83-109 y el sobrenadante que contiene scFv se analizó directamente. Se realizó el ELISA de scFv soluble como se describe en el ejemplo 1 se detectaron los scFv unidos con la Proteína L-HRP. Los resultados del ELISA pusieron de manifiesto que este clon era capaz todavía de unirse a \beta-gal, mientras que se anuló la fijación de BSA.
- Figura 7
- presenta la secuencia de los vectores 1 y 2 con dominio variable.
- Figura 8
- es una cartografía del vector C_{H} utilizado para construir un ligando multiespecífico de V_{H}1/V_{H}2.
- Figura 9
- es una cartografía del vector V_{\kappa} utilizado para construir un ligando multiespecífico de V_{\kappa}1/V_{\kappa}2.
- Figura 10
- análisis del receptor TNF que compara el dímero 4, TAR1-5, el dímero 4 TAR1-5-19 y el monómero TAR-5-19.
- Figura 11
- análisis del receptor TNF que compara los dímeros 1 a 6 de TAR1-5. Todos los dímeros se han purificado por HPLC y se presentan los resultados para las especies diméricas óptimas.
- Figura 12
- análisis del receptor de TNF de 19 homodímeros de TAR1-5 en diferentes formatos: formato dAb-enlazador-dAb con el enlazador 3U, 5U o 7U, formato Fab y formato del enlazador bisagra de cisteína.
- Figura 13
- Secuencia V_{H} ficticia para el banco 1. Secuencia del armazón de VH basada en la secuencia DP47-JH4b de la línea germinal. Las posiciones en las que NNK (N= nucleótidos A, T, C o G; K = nucleótidos G o T) se han incorporado al azar al banco 1 se indican el texto subrayados en negrita.
- Figura 14
- Secuencia V_{H} ficticia para el banco 2. Secuencia del armazón de VH basada en la secuencia DP47-JH4b de la línea germinal. Las posiciones en las que NNK (N= nucleótidos A, T, C o G; K = nucleótidos G o T) se han incorporado al azar en el banco 2 se indican el texto subrayados en negrita.
- Figura 15
- Secuencia V_{\kappa} ficticia para el banco 3. Secuencia del armazón de V_{\kappa} basada en la secuencia DP_{\kappa}9-J_{\kappa}1 de la línea germinal. Las posiciones en las que NNK (N= nucleótidos A, T, C o G; K = nucleótidos G o T) se ha incorporado al azar en el banco 3 se indican el texto subrayados en negrita.
- Figura 16
- Secuencia de nucleótidos de aminoácidos de los anti MSA dAb MSA 16 y MSA 26.
- Figura 17
- Inhibición biacore MSA 16 y 26. Se analizaron los dAb MSA16 y MSA26 purificados mediante inhibición biacore para determinar K_{d}. En resumen, se analizaron los dAb para determinar la concentración de dAb requerida para conseguir 200 UR de respuesta en un kit CM5 biacore recubierto con una densidad elevada de MSA. Una vez se determinaron las concentraciones requeridas de dAb, se premezcló el antígeno MSA en un intervalo de concentraciones alrededor de la K_{d} esperada con el dAb y se incubó durante la noche. La fijación al chip de dAb de biacore recubierto con MSA en cada una de las premezclas se midió a continuación a un caudal elevado de 30 \mul/minuto.
- Figura 18
- Concentraciones de MSA16 en el suero después de la inyección. Se determinó la vida media en el suero del MSA16 de dAb en ratones. Se administró MSA16 en inyecciones i.v. individuales a aprox. 1,5 mg/kg en ratones CD1. El modelado con un modelo de comportamiento 2 demostró que MSA16 tenía una t1/2\alpha de 0,98 h, una t1/2\beta de 36,5 h y una AUC de 913 h.mg/ml. MSA16 presentó una vida media considerablemente disminuida en comparación con HEL4 (dAb de lisozima de la clara de huevo antigallina) que presentó una t1/2\alpha de 0,06 h y una t1/2\beta de 0,34 h.
- Figura 19
- ELISA (a) y análisis del receptor TNF (c) que presenta la inhibición de la fijación de TNF con un fragmento de tipo Fab que comprende MSA26Ck y TAR1-5-19CH. La adición de MSA con el fragmento de tipo Fba reduce el nivel de inhibición. Se sondó una placa ELISA recubierta con 1 \mug/ml de TNF\alpha con C_{H} de V_{\kappa} específico doble y un fragmento similar a Fab de C_{\kappa} _{} de V_{\kappa} y asimismo con TFN\alpha de referencia que se une a dAb a una concentración calculada para proporcionar una señal similar en el ELISA. Se utilizaron tanto el dAb específico doble como de referencia para sondar la placa ELISA en presencia y en ausencia de 2 mg/ml de MSA. La señal en el pocillo específico doble se redujo en más del 50% pero la señal en el pocillo dAb no se redujo en absoluto (véase la figura 19a). La misma proteína específica doble se colocó también en el análisis del receptor con y sin MSA y se demostró también la competencia por MSA (véase la figura 19c). Esto demuestra que la fijación de MSA al específico doble es competitiva con la fijación a TNF\alpha.
- Figura 20
- Análisis del receptor TNF que presenta la inhibición de la fijación de TNF con un heterodímero con puente disulfuro de dAb de TAR1-5-19 y de dAb de MSA16. La adición de MSA con el dímero reduce el nivel de inhibición en función de la dosis. El análisis del receptor TNF (figura 19 (b)) se realizó en presencia de una concentración constante de heterodímero (18 nM) y una dilución en serie de MSA y HSA. La presencia de HSA en un intervalo de concentraciones (hasta 2 mg/ml) no produjo una reducción de la capacidad del dímero para inhibir TNF\alpha. Sin embargo, la adición de MSA produjo una reducción de la capacidad del dímero en función de la dosis para inhibir TNF\alpha (figura 19a). Esto demuestra que MSA y TNF\alpha compiten para la fijación al dímero MSA16, TAR1-5-19fijado en cys. MSA y HSA solos no presentan un efecto sobre el nivel de fijación de TNF en el ensayo.
Complementario Dos dominios de
inmunoglobulina son "complementarios" cuando pertenecen a
familias de estructuras que forman pares o grupos homólogos o
proceden de dichas familias y mantienen esta propiedad. Por ejemplo,
un dominio V_{H} y un dominio V_{L} de un anticuerpo son
complementarios; dos dominios V_{H} no son complementarios y dos
dominios V_{L} no son complementarios. Los dominios
complementarios pueden encontrarse en otros miembros de la
superfamilia de la inmunoglobulina, tales como los dominios
V_{\alpha} y V_{\beta} (o \gamma y \delta) del receptor de
linfocitos T. En cuanto a la segunda configuración de la presente
invención, los dominios no complementarios no se fijan a una
molécula diana de manera cooperativa, pero actúan independientemente
sobre diferentes epítopos diana que pueden ser moléculas iguales o
diferentes. Los dominios que son artificiales, tales como los
dominios a base de armazones de proteínas que no fijan epítopos a
menos que se modifiquen genéticamente para hacerlo, son no
complementarios. Asimismo, dos dominios a base de (por ejemplo) un
dominio de inmunoglobulina y un dominio de fibronectina no son
complementarios.
Inmunoglobulina Ésta se refiere a una
familia de polipéptidos que conservan la característica de plegado
de la inmunoglobulina de moléculas de anticuerpo, que contiene dos
hojas \beta y, normalmente, un enlace disulfuro conservado. Los
miembros de la superfamilia de la inmunoglobulina están implicados
en muchos aspectos de las interacciones celulares y no celulares
in vivo, incluyendo las funciones extendidas en el sistema
inmunitario (por ejemplo, anticuerpos, moléculas del receptor de
linfocitos T y similares), implicación en la adhesión celular (por
ejemplo las moléculas ICAM) y en la señalización intracelular (por
ejemplo, moléculas receptoras, tal como el receptor de PDGF). La
presente invención se aplica a todas las moléculas de la
superfamilia de la inmunoglobulina que poseen dominios de fijación.
Preferentemente, la presente invención se refiere a anticuerpos.
Combinación Los dominios variables según
la invención se combinan para formar un grupo de dominios; por
ejemplo, pueden combinarse los dominios complementarios, tales como
los dominios V_{L} que se combinan con los dominios V_{H}. Los
dominios no complementarios también pueden combinarse. Los dominios
pueden combinarse de numerosas maneras, lo que implica el enlace de
los dominios por medios covalentes o no covalentes.
Dominio Un dominio es una estructura
proteica plegada que conserva su estructura terciaria
independientemente del resto de la proteína. Generalmente, los
dominios son responsables de las propiedades operativas discretas
de las proteínas, y en muchos casos pueden añadirse, eliminarse o
transferirse a otras proteínas sin pérdida de la función del resto
de la proteína y/o del dominio. Dominio simple de la variable del
anticuerpo significa un dominio del polipéptido plegado que
comprende secuencias características de los dominios variables del
anticuerpo. Esto incluye por consiguiente los dominios variables
completos de anticuerpo y los dominios variables modificados, por
ejemplo en los que uno o más bucles han sido sustituidos por
secuencias que no son características de los dominios variables de
anticuerpo, o de los dominios variables de anticuerpo que han sido
truncados o que comprenden extensiones con terminal N o C, así como
fragmentos plegados de dominios variables que conservan por lo
menos en parte la actividad de fijación y la especificidad del
dominio completo.
Repertorio Colección de diversas
variantes, por ejemplo variantes de polipéptido que se diferencian
en su secuencia primaria. Un banco utilizado en la presente
invención comprenderá un repertorio de polipéptido que comprende
por lo menos 1.000 elementos.
Banco El término banco se refiere a una
mezcla de polipéptidos o ácidos nucleicos heterogéneos. El banco se
compone de elementos, cada uno de los cuales presenta una secuencia
individual de polipéptidos o de ácidos nucleicos. Hasta cierto
punto, banco es sinónimo de repertorio. Las
diferencias de secuencia entre los elementos del banco son
responsables de la presente diversidad en el banco. El banco puede
tener la forma de una mezcla sencilla de polipéptidos o de ácidos
nucleicos, o puede tener la forma de organismos o células, por
ejemplo bacterias, virus, células animales o vegetales y similares,
transformados con un banco de ácidos nucleicos. Preferentemente
cada organismo o célula individual contiene solamente uno o un
número limitado de elementos del banco. De forma ventajosa, los
ácidos nucleicos se incorporan a los vectores de expresión, a fin de
permitir la expresión de los polipéptidos codificados por los
ácidos nucleicos. En un aspecto preferido, por consiguiente, un
banco puede tener la forma de una población de organismos
anfitriones, conteniendo cada organismo una o más copias de un
vector de expresión que contiene un solo elemento del banco en forma
de ácido nucleico que puede expresarse para producir su elemento de
polipéptido correspondiente. Por lo tanto, la población de
organismos anfitriones tiene potencial para codificar un gran
repertorio de variantes de polipéptido genéticamente variadas.
"Ligando multiespecífico con conformación
cerrada" describe un ligando multiespecífico como el definido
en la presente memoria que comprende por lo menos dos dominios de
fijación al epítopo como los definidos en la presente memoria. La
expresión "conformación cerrada" (ligando multiespecífico)
significa que los dominios de fijación al epítopo del ligando están
ordenados de modo que la fijación al epítopo por un dominio de
fijación al epítopo compite con la fijación al epítopo por otro
dominio de fijación al epítopo. Esto es, los epítopos homólogos
pueden fijarse por cada dominio de fijación al epítopo
individualmente pero no simultáneamente. La conformación cerrada
del ligando puede conseguirse utilizando los métodos descritos en la
presente memoria.
Anticuerpo Un anticuerpo (por ejemplo
IgG, IgM, IgA, IgD o IgE) o fragmento (tales como un Fab,
F(ab')_{2}, Fv, Fv ligado por disulfuro, scFv, anticuerpo
multiespecífico con conformación cerrada, scFv ligado por disulfuro,
diacuerpo) si proceden de alguna especie que produce de forma
natural un anticuerpo o se crea por tecnología de ADN recombinante;
si se aísla del suero, de linfocitos B, de hibridomas,
transfectomas, levadura o bacterias).
Ligando doble-específico
Ligando que comprende un primer dominio variable simple de
inmunoglobulina y un segundo dominio variable simple de
inmunoglobulina como el definido en la presente memoria, en el que
las regiones variables son capaces de fijarse a dos antígenos
diferentes o a dos epítopos en el mismo antígeno al que no están
normalmente unidos por una inmunoglobulina monoespecífica. Por
ejemplo, los dos epítopos pueden estar en el mismo hapteno, pero no
están en el mismo epítopo o lo suficientemente adyacentes para estar
unidos por un ligando monoespecífico. Los ligandos
doble-específicos según la invención se componen de
dominios variables que presentan diferentes especificidades y no
contienen pares de dominio variable mutuamente complementarios que
presentan la misma especificidad.
Antígeno Molécula que está unida por un
ligando según la presente invención. Típicamente, los antígenos son
fijados por los ligandos del anticuerpo y son capaces de producir
una respuesta al anticuerpo in vivo. Puede ser un
polipéptido, proteína, ácido nucleico u otra molécula. Generalmente,
los ligandos doble-específicos según la invención
se seleccionan para la especificidad de la diana contra un
determinado antígeno. En el caso de los anticuerpos convencionales
y de los fragmentos de los mismos, el sitio de fijación al
anticuerpo definido por los bucles variables (L1, L2, L3 y H1, H2,
H3) es capaz de unirse al antígeno.
Epítopo Unidad de estructura
convencionalmente unida por un par V_{H}/V_{L} de
inmunoglobulina. Los epítopos definen el sitio de fijación mínimo a
un anticuerpo, y por lo tanto representan la diana de especificidad
de un anticuerpo. En el caso de un anticuerpo con un solo dominio,
un epítopo representa la unidad de estructura unida mediante un
dominio variable en aislamiento.
Ligando genérico Ligando que se une a
todos los elementos de un repertorio. Generalmente, no está unido
por el sitio de fijación al antígeno definido anteriormente. Los
ejemplos no limitativos incluyen la proteína A, la proteína L y la
proteína G.
Selección Procedente por cribado o
procedente por un proceso de selección darwiniano, en el que las
interacciones para la fijación se realizan entre un dominio y el
antígeno o epítopo o entre un anticuerpo y un antígeno o epítopo.
Por lo tanto, puede seleccionarse un primer dominio variable para la
fijación a un antígeno o epítopo en presencia o en ausencia de su
dominio variable complementario.
Soporte universal Secuencia individual
del armazón del anticuerpo correspondiente a las regiones de un
anticuerpo conservado en la secuencia definida por Kabat
("Sequences of Proteins of Immunological Interest", US
Department of Health and Human Services) o correspondiente al
repertorio de inmunoglobulina de la línea germinal humana o a la
estructura definida por Chothia y Lesk, (1987) J. Mol. Biol.
196:910-917. La invención proporciona la
utilización de un solo armazón, o de un conjunto de dichos
armazones, que se ha descubierto que permite la derivación de
prácticamente cualquier especificidad de fijación mediante la
variación en las regiones hipervariables solas.
Vida media Tiempo transcurrido para que
la concentración en el suero del ligando se reduzca al 50%, in
vivo, por ejemplo debido a la degradación del ligando y/o la
eliminación o secuestro del ligando por mecanismos naturales. Los
ligandos de la invención se estabilizan in vivo y su
prolongación de la vida media por fijación a moléculas que resisten
la degradación y/o la eliminación o secuestro. Típicamente, dichas
moléculas son proteínas naturales que presentan ellas mismas una
vida media prolongada in vivo. La vida media de un ligando
se prolonga si su actividad operativa persiste, in vivo,
durante un periodo más largo que un ligando similar que no es
específico para la molécula que prolonga la vida media. Por lo
tanto, un ligando específico para HSA y una molécula diana se
comparan con el mismo ligando en el que la especificidad para HSA no
está presente, lo que hace que no se una a HSA pero que se una a
otra molécula. Por ejemplo, puede unirse un segundo epítopo en la
molécula diana. Típicamente, la vida media se prolonga en el 10%,
20%, 30%, 40%, 50% o más. Son posibles las prolongaciones
comprendidas en el intervalo de 2\times, 3\times, 4\times,
5\times, 10\times, 20\times, 30\times, 40\times,
50\times o más de la vida media. Alternativamente, o además, son
posibles las prolongaciones comprendidas en el intervalo de hasta
30\times, 40\times, 50\times, 60\times, 70\times,
80\times, 90\times, 100\times, 150\times de la vida
media.
Inmunoanálisis homogéneo Inmunoanálisis
en el cual se detecta el analito sin necesidad de una etapa de
separación de los reactivos ligados y no ligados.
Sustancialmente idéntico (o
"sustancialmente homólogo") Una primera secuencia de
aminoácidos o nucleótidos que contiene un número suficiente de
restos de aminoácidos idénticos o equivalentes (por ejemplo, con una
cadena lateral similar, p. ej., sustituciones de aminoácidos
conservados) o de nucleótidos con una segunda secuencia de
aminoácidos o nucleótidos de modo que la primera y segunda
secuencias de aminoácidos o nucleótidos presentan actividades
similares. En el caso de los anticuerpos, el segundo anticuerpo
presenta la misma especificidad de fijación y presenta al menos el
50% de la afinidad de la misma.
Tal como se utiliza en la presente memoria, las
expresiones "baja severidad", "media severidad",
"alta severidad" o "condiciones a muy alta
severidad" describen las condiciones para la hibridación y
lavado de los ácidos nucleicos. Las directrices para realizar las
reacciones de hibridación pueden encontrarse en Current Protocols
in Molecular Biology, John Wiley & Sons, N.Y. (198),
6.3.1-6.3.6, que se incorpora a la presente memoria
como referencia en su totalidad. Los métodos acuoso y no acuoso se
describen en esta referencia y ambos pueden utilizarse. Las
condiciones de hibridación específicas citadas en la presente
memoria son las siguientes: (1) condiciones de hibridación a baja
severidad en 6\times cloruro sódico/citrato sódico (SSC) a
aproximadamente 45ºC, seguidas de dos lavados en 0,2\timesSSC,
SDS al 0,1% por lo menos a 50ºC (la temperatura de los lavados
puede aumentarse hasta 55ºC para las condiciones de baja severidad);
(2) condiciones de hibridación a baja severidad en 6\times SSC a
aproximadamente 45ºC, seguidas de uno o más lavados en
0,2\timesSSC, SDS al 0,1% a 60ºC; (3) condiciones de hibridación
a alta severidad en 6\times SSC a aproximadamente 45ºC, seguidas
de uno o más lavados en 0,2\timesSSC, SDS al 0,1% a 65ºC; y
preferentemente (4) las condiciones de hibridación a muy alta
severidad son fosfato sódico 0,5 M, SDS al 7% a 65ºC, seguidas de
uno o más lavados en 0,2\timesSSC, SDS al 1% a 65ºC. Las
condiciones (4) a muy alta severidad son las condiciones preferidas
y las que deberían utilizarse a menos que se especifique de otra
manera.
A menos que se defina de otra manera, todos los
términos técnicos y científicos utilizados en la presente memoria
tienen el mismo significado que el entendido normalmente por un
experto en la materia (p. ej., en cultivo celular, genética
molecular, química de los ácidos nucleicos, técnicas de hibridación
y bioquímica). Para los métodos moleculares, genéticos y
bioquímicos se utilizan técnicas normalizadas (véase generalmente,
Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory
Manual, 2ª ed. (1989) Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold
Spring Harbor, N.Y. y Ausubel et al., Short Protocols in
Molecular Biology (1999) 4ª ed., John Wiley & Sons, Inc. y
métodos químicos.
Los ligandos doble-específicos
según la invención, si son de conformación abierta o cerrada según
la configuración deseada de la invención, pueden prepararse según
las técnicas creadas anteriormente, utilizadas en el campo de la
modificación genética de anticuerpos, para la preparación de scFv,
anticuerpos de "fago" y otras moléculas de anticuerpos
modificadas genéticamente. Las técnicas para la preparación de
anticuerpos, y en particular de anticuerpos biespecíficos, son las
descritas por ejemplo en los estudios y en las referencias
siguientes citadas en la presente memoria: Winter & Milstein,
(1991) Nature 349:293-299; Plueckthun (1992)
Immunological Reviews 130:151-188; Wright
et al., (1992) Crti. Rev. Immunol.
12:125-168; Holliger, P. y Winter, G. (1993)
Curr. Op. Biotechn. 4, 446-449; Carter, et
al. (1995) J. Hematother. 4, 463-470;
Chester, K. A. y Hawkins, R. E. (1995) Trends Biotechn. 13,
294-300; Hoogenboom, H. R. (1997) Nature
Biotechnol. 15, 125-126; Fearon, D. (1997)
Nature Biotechnol. 15, 618-619; Plückthun, A.
y Pack, P. (1997) Immunotechnology 3, 83-105;
Carter, P. y Merchant, A. M. (1997) Curr. Op. Biotechnol. 8,
449-454; Holliger, P. y Winter, G. (1997) Cancer
Immunol. Immunother. 45, 128-130.
La invención proporciona la selección de
dominios variables contra dos antígenos o epítopos diferentes y la
combinación posterior de los dominios variables.
Las técnicas empleadas para la selección de los
dominios variables emplean bancos y procedimientos de selección que
son conocidos en la materia. Los bancos naturales (Marks et
al. (1991) J. Mol. Biol., 222: 581; Vaughan et
al. (1996) Nature Biotech., 14: 309) que utilizan genes V
reordenados recogidos de linfocitos B humanos son bien conocidos
por los expertos en la materia. Los bancos de síntesis (Hoogenboom
& Winter (1992) J. Mol. Biol., 227: 381; Barbas et al.
(1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89: 4457; Nissim et
al. (1994) EMBO J., 13: 692; Griffiths et al.
(1994) EMBO J., 13: 3245; De Kruif et al. (1995) J.
Mol. Biol., 248: 97) se preparan mediante clonación de genes V
de inmunoglobulina, utilizando habitualmente PCR. Los errores en el
procedimiento PCR pueden conducir a un grado elevado de mezcla al
azar. Los bancos de V_{H} y V_{L} pueden seleccionarse contra
antígenos o epítopos diana por separado, en cuyo caso la fijación
del dominio simple se selecciona directamente por o conjuntamente
con éstos.
Un método preferido para preparar un ligando
doble-específico según la presente invención
comprende la utilización de un sistema de selección en el que se
selecciona un repertorio de dominios variables para fijarse a un
primer antígeno o epítopo y se selecciona un repertorio de dominios
variables para fijarse a un segundo antígeno o epítopo. Los
dominios de la primera variable y de la segunda variable
seleccionados se combinan a continuación y el ligando
doble-específico se selecciona para unirse tanto al
primer antígeno o epítopo como al segundo. Los ligandos de
conformación cerrada se seleccionan para unirse tanto al primer
antígeno o epítopo como al segundo en aislamiento pero no
simultáneamente.
Una variedad de sistemas de selección es sabido
en la materia que son adecuados para su utilización en la presente
invención. Ejemplos de dichos sistemas se describen a
continuación.
Los sistemas de expresión lambda de
bacteriófagos pueden cribarse directamente como placas de
bacteriófagos o como colonias de lisogenes, ambas descritas
anteriormente (Huse et al. (1989) Science, 246: 1275;
Caton y Koprowski (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87;
Mullinax et al. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87;
8095; Persson et al. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci.
USA, 88: 2432) y son de utilización de la invención. Aunque
dichos sistemas de expresión pueden utilizarse para cribar hasta
10^{6} elementos diferentes de un banco, no son adecuados
realmente para cribar grandes cantidades (más de 10^{6}
elementos).
De utilización particular en la construcción de
bancos son los sistemas de presentación de la selección, que
permiten que un ácido nucleico que debe unirse al polipéptido lo
exprese. Tal como se utiliza en la presente memoria, un sistema de
presentación de la selección es un sistema que permite la selección,
mediante los medios de presentación adecuados, de los elementos
individuales del banco uniendo los ligandos genéricos y/o diana.
Los protocolos de selección para aislar
elementos deseados de grandes bancos son conocidos en la técnica,
tipificados mediante técnicas de presentación de fagos. Dichos
sistemas, en los que diversas secuencias peptídicas se presentan en
la superficie del bacteriófago filamentoso (Scott y Smith (1990)
Science, 249: 386), han demostrado ser útiles para la
creación de bancos de fragmentos de anticuerpos (y las secuencias de
nucleótidos que los codifican) para la selección in vitro y
la ampliación de fragmentos de anticuerpo específicos que se unen a
un antígeno diana (McCafferty et al., documento WO 92/01047).
Las secuencias de nucleótidos que codifican las regiones V_{H} y
V_{L} están unidas a fragmentos de genes que codifican las señales
principales que les dirigen al espacio periplásmico de E.
coli y como resultado los fragmentos de anticuerpo resultantes
se presentan en la superficie del bacteriófago, normalmente como
fusiones a las proteínas del recubrimiento del bacteriófago (p.
ej., pIII o pVIII). Alternativamente, los fragmentos de anticuerpo
se presentan externamente sobre los cápsidos de fago lambda
(fagocuerpos). Una ventaja de los sistemas de presentación a base de
fagos es que, debido a que son sistemas biológicos, los elementos
del banco seleccionados pueden ampliarse simplemente cultivando el
fago que contiene el elemento del banco seleccionado en células
bacterianas. Además, ya que la secuencia de nucleótidos que
codifica el elemento del banco de polipéptidos está contenida en un
fago o vector fagómido, el secuenciado, la expresión y subsiguiente
manipulación genética son relativamente sencillos.
Los métodos para la construcción de bancos de
presentación del anticuerpo bacteriófago y de bancos de expresión
del fago lambda son bien conocidos en la técnica (McCafferty et
al. (1990) Nature, 348: 552; Kang et al.
(1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88: 4363; Clackson
et al. (1991) Nature, 352: 624; Lowman et
al. (1991) Biochemistry, 30: 10832; Burton et
al. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 88: 10134;
Hoogenboom et al. (1991) Nucleic Acids Res.,
19: 4133; Chang et al. (1991) J. Immunol.,
147: 3610; Breiling et al. (1991) Gene,
104: 147; Marks et al. (1991) supra; Barbas
et al. (1992) supra; Hawkins y Winter (1992) J.
Immunol., 22: 867; Marks et al., 1992, J.
Biol. Chem., 267: 16007; Lerner et al. (1992)
Science, 258: 1313.
Un método particularmente ventajoso ha
consistido en la utilización de bancos de fago scFv (Huston et
al., 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 85: 5879-
5883; Chaudhary et al. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci.
USA, 87: 1066-1070; McCafferty et
al. (1990) supra; Clackson et al. (1991)
Nature, 352: 624; Marks et al. (1991) J.
Mol. Biol., 222: 581; Chiswell et al. (1992)
Trends Biotech., 10: 80; Marks et al. (1992)
J. Biol. Chem., 267). Se han descrito varias formas de
realización de bancos de scFv presentados en las proteínas del
recubrimiento de bacteriófago. Son conocidos también los
perfeccionamientos de los métodos de presentación del fago, por
ejemplo como se describe en los documentos WO
96/06213 y WO 92/01047 (Medical Research Council et al.) y en
el documento WO 97/08320 (Morphosys).
Otros sistemas para la generación de bancos de
polipéptidos implican la utilización de sistemas enzimáticos
exentos de células para la síntesis in vitro de los elementos
del banco. En un método, se seleccionan moléculas de ARN por rondas
alternativas de selección frente a un ligando diana y ampliación por
PCR (Tuerk y Gold (1990) Science, 249: 505; Ellington
y Szostak (1990) Nature, 346: 818). Puede utilizarse
una técnica similar para identificar las secuencias de ADN que se
unen a un factor de transcripción humano predeterminado (Thiesen y
Bach (1990) Nucleic Acids Res., 18: 3203; Beudry y
Joyce (1992) Science, 257: 635; documentos WO 92/05258
y WO 92/14843). De manera similar, puede utilizarse la traducción
in vitro para sintetizar polipéptidos como método de
generación de grandes bancos. Estos métodos que comprenden
generalmente complejos estabilizados de polisomas, se describen
además en los documentos WO 88/08453, WO 90/05785,
WO 90/07003, WO 91/02076, WO 91/05058 y WO 92/02536. Los sistemas
de presentación alternativos que no están basados en fagos, tales
como los descritos en los documentos WO 95/22625 y WO 95/11922
(Affymax) utilizan los polisomas para presentar polipéptidos para
la selección.
Todavía otra categoría adicional de técnicas
implica la selección de repertorios en compartimentos artificiales,
que permiten la unión de un gen con su producto génico. Por ejemplo,
un sistema de selección en el que pueden seleccionarse ácidos
núcleicos que codifican productos génicos deseables en microcápsulas
formadas por emulsiones de agua en aceite está descrito en los
documentos WO 99/02671, WO 00/40712 y Tawfik y Griffiths (1998)
Nature Biotechnol. 16(7), 652-6. Los
elementos genéticos que codifican un producto génico que presenta
una actividad deseada están compartimentados en microcápsulas y a
continuación transcritos y/o traducidos para producir sus
respectivos productos génicos (ARN o proteína) en las microcápsulas.
Los elementos genéticos que producen el producto génico con la
actividad deseada se clasifican posteriormente. Este método
selecciona productos génicos de interés detectando la actividad
deseada por una variedad de medios.
Los bancos propuestos para la selección, pueden
construirse utilizando técnicas conocidas en la materia, por
ejemplo las indicadas anteriormente o pueden adquirirse en
proveedores comerciales. Los bancos que son útiles en la presente
invención se describen, por ejemplo en el documento WO 99/20749. Una
vez se selecciona el sistema de vector y se clonan una o más
secuencias de ácidos nucleicos que codifican los polipéptidos de
interés en el vector del banco, se pueden generar una diversidad en
el interior de las moléculas clonadas acometiendo la mutagénesis
antes de la expresión; alternativamente, pueden expresarse las
proteínas codificadas y seleccionarse, como se describió
anteriormente, antes de realizar la mutagénesis y las rondas de
selección adicionales. La mutagénesis de las secuencias de ácido
nucleico que codifican polipéptidos estructuralmente optimizados se
realiza por métodos moleculares normalizados. De particular
utilización en la reacción en cadena de polimerasa, o PCR, (Mullis y
Faloona (1987) Methods Enzymol., 155: 335, incorporada
a la presente memoria como referencia). La PCR, que utiliza
múltiples ciclos de replicación de ADN catalizados por una ADN
polimerasa dependiente del ADN, termoestable para ampliar la
secuencia diana de interés, es bien conocida en la materia. La
construcción de varios bancos de anticuerpos se ha expuesto en
Winter et al. (1994) Ann. Rev. Immunology 12,
433-55, y referencias citadas en la presente
memoria.
La PCR se realiza utilizando la plantilla de ADN
(por lo menos 1 fg; más útilmente, 1 a 1.000 ng) y por lo menos 25
pmoles de cebadores de oligonucleótido; puede ser ventajosa la
utilización de una cantidad mayor de cebador cuando el grupo
cebador sea heterogéneo en exceso, ya que cada secuencia está
representada solamente por una pequeña fracción de las moléculas
del grupo, y las cantidades se vuelven limitativas en los ciclos de
ampliación posteriores. Una mezcla de reacción típica incluye: 2
\mul de ADN, 25 pmoles de cebador oligonucleotídico, 2,5 \mul
de 10\times tampón 1 de PCR (Perkin-Elmer, Foster
City, CA), 0,4 \mul de dNTP 1,25 \muM, 0,15 \mul (o 2,5
unidades) de Taq ADN polimerasa (Perkin Elmer, Foster City, CA) y
agua desionizada hasta un volumen total de 25 \mul. Se cubre con
una capa de aceite mineral y se realiza la PCR utilizando un
ciclador térmico programable. La longitud y temperatura de cada
etapa de un ciclo PCR, así como el número de ciclos, se ajusta de
acuerdo con los requisitos de severidad en el efecto. La
temperatura y el programa de hibridación se determinan ambos por la
eficacia con la que es de esperar que se hibride el cebador a una
plantilla y el grado de compatibilidad que debe tolerarse;
obviamente, cuando las moléculas de ácido nucleico se amplían
simultáneamente y se mutagenizan, se requiere compatibilidad, por
lo menos en la primera ronda de la síntesis. La capacidad para
optimizar la severidad de las condiciones de hibridación del
cebador está dentro de los conocimientos de un experto moderado en
la materia. Se utiliza una temperatura de hibridación comprendida
entre 30ºC y 72ºC. La desnaturalización inicial de las moléculas de
la plantilla normalmente tiene lugar a una temperatura comprendida
entre 92ºC y 99ºC durante 4 minutos, seguida de 20 a
40 ciclos consistentes en la desnaturalización (94 a 99ºC durante
15 segundos a 1 minuto), hibridación (temperatura determinada como
se expuso anteriormente; 1 a 2 minutos) y ampliación (72ºC durante 1
a 5 minutos, dependiendo de la longitud del producto ampliado). La
ampliación final es generalmente de 4 minutos a 72ºC y puede ser
seguida por una etapa indefinida (0 a 24 horas) a 4ºC.
Los dominios útiles en la invención, una vez
seleccionados, pueden combinarse mediante una variedad de métodos
conocidos en la materia, incluyendo métodos covalentes y no
covalentes.
Los métodos preferidos comprenden la utilización
de enlazadores polipeptídicos, como los descritos, por ejemplo, en
relación con las moléculas scFV (Bird et al., (1988)
Science 242: 423-426). La exposición de los
enlazadores adecuados se proporciona en Bird et al., Science
242, 423-426; Hudson et al., Journal
Immunol. Methods 231 (1999) 177-189; Hudson
et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85,
5879-5883. Los enlazadores son preferentemente
flexibles, permitiendo que interactúen los dos dominios
individuales. Un ejemplo de enlazador es un enlazador (Gly_{4}
Ser)_{n}, en el que n=1 a 8, p. ej., 2, 3, 4, 5 ó 7. Pueden
emplearse también los enlazadores utilizados en diacuerpos, que son
menos flexibles, (Holliger et al. (1993) PNAS (USA) 90:
6444-6448).
En una forma de realización, el enlazador
empleado no es una región bisagra de inmunoglobulina.
Pueden combinarse dominios variables utilizando
otros métodos aparte de los enlazadores. Por ejemplo, la utilización
de puentes disulfuro, provistos de restos de cisteína naturales o
modificados genéticamente, puede aprovecharse para estabilizar
dímeros V_{H}-V_{H},
V_{L}-V_{L} o V_{H}-V_{L}
(Reiter et al., (1994) Protein Eng.
7:697-704) o remodelando la interfase entre los
dominios variables para aprovechar el "ataque" y por lo tanto
la estabilidad de la interacción (Ridgeway et al., (1996)
Protein Eng. 7:617-621; Zhu et al.
(1997) Protein Science 6:781-788).
Pueden emplearse de forma apropiada otras
técnicas para unir o estabilizar dominios variables de
inmunoglobulinas, y en particular dominios V_{H} de
anticuerpos.
Según la presente invención, los ligandos
doble-específicos pueden estar en conformaciones
"cerradas" en solución. Una configuración "cerrada" es
aquella en la que los dos dominios (por ejemplo V_{H} y V_{L})
están presentes en forma asociada, tal como la de un par
V_{H}-V_{L} asociado que forma un sitio de
fijación al anticuerpo. Por ejemplo, scFv puede estar en una
conformación cerrada, dependiendo del ordenamiento del enlazador
utilizado para unir los dominios V_{H} y V_{L}. Si éste es
suficientemente flexible para permitir que se asocien los dominios,
o mantenerlos rígidamente en la posición asociada, es probable que
los dominios adopten una conformación cerrada.
Asimismo, los pares del dominio V_{H} y los
pares del dominio V_{L} pueden existir en una conformación
cerrada. Generalmente ésta será una función de la asociación cerrada
de los dominios, tal como mediante un enlazador rígido, en la
molécula de ligando. Los ligandos en una conformación cerrada serán
incapaces de unirse a la molécula que prolonga la vida media del
ligando y a una segunda molécula diana. Por lo tanto, el ligando
típicamente se unirá solamente a la segunda molécula diana en la
disociación de la molécula que aumenta la vida media del
ligando.
Además, la construcción de dímeros
V_{H}/V_{H}, V_{L}/V_{L} o V_{H}/V_{L} sin enlazadores
proporciona competencia entre los dominios.
Los ligandos según la invención pueden además
estar en una conformación abierta, en dicha conformación, los
ligandos serán capaces de unirse simultáneamente a la molécula que
prolonga la vida media del ligando y a la segunda molécula diana.
Típicamente, los dominios variables en una configuración abierta se
mantienen (en el caso de los pares
V_{H}-V_{L}) lo suficientemente aparte para que
los dominios no interactúen y formen un sitio de fijación del
anticuerpo y no compitan para unirse a sus respectivos epítopos. En
el caso de los dimeros V_{H}/V_{H} o V_{L}/V_{L}, los
dominios no están forzados conjuntamente por enlazadores rígidos.
Naturalmente, dichos emparejamientos de dominios no competirán para
la fijación del antígeno o para formar un sitio de fijación al
anticuerpo.
Los fragmentos Fab y los anticuerpos completos
existirán principalmente en conformación cerrada, aunque se
apreciará que los ligandos doble-específicos
abiertos y cerrados es probable que existan en una variedad de
equilibrios en diferentes circunstancias. La fijación del ligando a
una diana es probable que desplace el equilibrio hacia la
configuración abierta. Por lo tanto, determinados ligandos según la
invención pueden existir en dos conformaciones en solución, una de
las cuales (la forma abierta) puede unir dos antígenos o epítopos
independientemente, mientras que la conformación alternativa (forma
cerrada) puede unir solamente un antígeno o epítopo; los antígenos o
epítopos por lo tanto compiten para unirse al ligando en esta
conformación.
Aunque la forma abierta del ligando
doble-específico puede pues existir en equilibrio
con la forma cerrada en solución, se contempla que el equilibrio
favorezca la forma cerrada; además, la forma abierta puede ser
secuestrada por la diana que se une en una conformación cerrada.
Preferentemente, por consiguiente, determinados ligandos
doble-específicos de la invención están presentes en
un equilibrio entre dos conformaciones (abierta y cerrada).
Los ligandos doble-específicos
según la invención pueden modificarse para favorecer una
conformación abierta o cerrada. Por ejemplo, la estabilización de
las interacciones V_{H}-V_{L} con
enlaces disulfuro estabiliza la conformación cerrada. Además,
pueden construirse los enlazadores utilizados para unir los
dominios, incluyendo los pares del dominio V_{H} y del dominio
V_{L}, de modo que la forma abierta esté favorecida; por ejemplo,
los enlazadores pueden impedir estéricamente la asociación de los
dominios, como por ejemplo por incorporación de restos de
aminoácidos grandes en posiciones oportunas o el diseño de una
estructura rígida adecuada que mantenga los dominios
físicamente
espaciados.
espaciados.
La fijación del ligando
doble-específico a sus antígenos o epítopos
específicos puede probarse por métodos que serán habituales para
los expertos en la materia e incluyen ELISA. En una forma de
realización preferida de la invención la fijación se prueba
utilizando ELISA del fago monoclonal.
El ELISA del fago puede realizarse según
cualquier procedimiento adecuado: a continuación se indica un
protocolo a título de ejemplo.
Las poblaciones de fago producidas en cada ronda
de selección pueden identificarse por ELISA por fijación al
antígeno o epítopo seleccionado, para identificar anticuerpos de
fago "policlonales". El fago de colonias bacterianas
individuales infectadas de estas poblaciones puede cribarse por
ELISA para identificar anticuerpos de fago "monoclonales". Es
también deseable identificar fragmentos de anticuerpo solubles para
la fijación al antígeno o epítopo, y esto puede acometerse también
por ELISA utilizando reactivos, por ejemplo, contra una etiqueta con
terminal C o N (véase por ejemplo Winter et al. (1994)
Ann. Rev. Immunology 12, 433-55 y referencias
citadas en la presente
memoria).
memoria).
La variedad de anticuerpos monoclonales del fago
seleccionados puede evaluarse también por electroforesis en gel de
los productos de la PCR (Marks et al. 1991, supra;
Nissim et al. 1994 supra), sondado (Tomlinson et
al., 1992) J. Mol. Biol. 227, 776) o por secuenciado del
ADN del vector.
Como se describió anteriormente, un anticuerpo
se define en la presente memoria como un anticuerpo (por ejemplo
IgG, IgM, IgA, IgA, IgE) o fragmento (Fab, Fv, Fv ligado a
disulfuro, scFv, diacuerpo) que comprende por lo menos un dominio
variable con cadena pesada y ligera, por lo menos dos dominios
variables con cadena pesada o por lo menos dos dominios variables
con cadena ligera. Puede derivarse por lo menos parcialmente de
cualquier especie natural que produzca un anticuerpo o crearse
mediante tecnología de ADN recombinante; tanto si se aísla del
suero, linfocitos B, hibridomas, transfectomas, levaduras o
bacterias.
En una forma de realización preferida de la
invención el ligando doble-específico comprende por
lo menos un dominio variable con cadena pesada individual de un
anticuerpo y un dominio variable con cadena ligera individual de un
anticuerpo, o dos dominios variables con cadena pesada y ligera
individuales. Por ejemplo, el ligando puede comprender un par
V_{H}/V_{L}, un par de dominios V_{H} o un par de dominios
V_{L}.
El primer y el segundo dominios variables de
dicho ligando pueden estar en la misma cadena polipeptídica.
Alternativamente pueden estar en cadenas polipeptídicas separadas.
En el caso en que estén en la misma cadena polipeptídica pueden
estar ligados por un enlazador, que es preferentemente una secuencia
peptídica, descrita anterior-
mente.
mente.
El primer y segundo dominios variables pueden
estar asociados por enlace covalente o no covalente. En caso de que
estén asociados por enlace covalente, los enlaces covalentes pueden
ser enlaces disulfuro.
En caso de que los dominios variables se
seleccionen de los repertorios del gen V, por ejemplo utilizando
una tecnología de presentación del fago como se describió en la
presente memoria, entonces estos dominios variables comprenden una
región de armazón universal, de modo que pueden ser reconocidos por
un ligando genérico específico como se define en la presente
memoria. La utilización de armazones universales, ligandos genéricos
y similares se describe en el documento WO 99/20749.
Cuando se utilizan repertorios del gen V la
variación en la secuencia polipeptídica se sitúa preferentemente en
los núcleos estructurales de los dominios variables. Las secuencias
polipeptídicas de dominio variable pueden alterarse por desorden
del ADN o por mutación a fin de aumentar la interacción de cada
dominio variable con su par complementario. El desorden del ADN es
conocido en la materia y dado a conocer, por ejemplo, por Stemmer,
1994, Nature 370: 389-391 y en la patente
U.S. nº 6.297.053, ambas de las cuales se incorporan a la presente
memoria como referencia. Otros métodos de mutagénesis son bien
conocidos por los expertos en la materia.
En una forma de realización preferida de la
invención, el "ligando doble-específico" es un
fragmento Fv con cadena individual. En una forma de realización
alternativa de la invención, el "ligando
doble-específico" consiste en un formato Fab.
En un aspecto adicional, la presente invención
proporciona un ácido nucleico que codifica por lo menos a un
"ligando doble-específico" como se define en la
presente memoria.
Un experto en la materia apreciará que,
dependiendo del aspecto de la invención, tanto los antígenos como
los epítopos pueden unirse simultáneamente a la misma molécula de
anticuerpo. Alternativamente, pueden competir para la fijación de
la misma molécula de anticuerpo. Por ejemplo, cuando ambos epítopos
se unen simultáneamente, ambos dominios variables de un ligando
doble-específico son capaces de unirse
independientemente a sus epítopos diana. Cuando los dominios
compiten, el dominio variable es capaz de unirse a su diana, pero no
al mismo tiempo que el otro dominio variable se une a su diana
homóloga; o el primer dominio variable es capaz de unirse a su
diana, pero no al mismo tiempo que el segundo dominio variable se
une a su diana homóloga.
Las regiones variables pueden proceder de
anticuerpos dirigidos contra antígenos o epítopos diana.
Alternativamente pueden proceder de un repertorio de dominios de
anticuerpo individuales tales como los expresados sobre la
superficie del bacteriófago filamentoso. La selección puede
realizarse como se describe a continuación.
En general, las moléculas de ácido nucleico y
los montajes del vector requeridos para la realización de la
presente invención pueden montarse y manipularse como se indica en
los manuales de laboratorio ordinarios, tal como Sambrook et
al. (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold
Spring Harbor, USA.
La manipulación de los ácidos nucleicos útiles
en la presente invención se realiza normalmente en vectores
recombinantes.
Por lo tanto en un aspecto adicional, la
presente invención proporciona un vector que comprende ácido
nucleico que codifica por lo menos un "ligando
doble-específico" como se define en la presente
memoria.
Tal como se utiliza en la presente memoria,
vector se refiere a un elemento discreto que se utiliza para
introducir ADN heterólogo en las células para la expresión y/o
replicación del mismo. Los métodos mediante los cuales se
selecciona o se construye y, posteriormente, se utilizan dichos
vectores son bien conocidos por los expertos en la materia.
Numerosos vectores están disponibles públicamente, incluyendo
plásmidos bacterianos, bacteriófagos, cromosomas artificiales y
vectores episómicos. Dichos vectores pueden utilizarse para la
clonación simple y la mutagénesis. Alternativamente se emplea el
vector de expresión génica. Un vector de utilización según la
invención puede seleccionarse para acomodar una secuencia de
codificación del polipéptido de un tamaño deseado, típicamente de
0,25 kilobases (kb) a 40 kb o más de longitud. Una célula huésped
adecuada se transforma con el vector tras las manipulaciones de
clonación in vitro. Cada vector contiene varios componentes
operativos, que generalmente comprenden un punto de clonación (o
"polienlazador"), un origen de replicación y por lo menos un
gen marcador seleccionable. Si el vector dado es un vector de
expresión, posee además uno o más de los siguientes elementos:
elemento potenciador, activador, terminación de la transcripción y
secuencias señal, cada uno colocado en la proximidad del centro de
clonación, de modo que están operativamente ligados al gen que
codifica un ligando según la
invención.
invención.
Los vectores tanto de clonación como de
expresión contienen secuencias de ácido nucleico que permiten al
vector replicarse en una o más células huésped seleccionadas.
Típicamente, en los vectores de clonación, esta secuencia es la que
permite al vector replicarse independientemente del ADN cromosómico
del huésped e incluye los orígenes de replicación o las secuencias
de replicación de manera autónoma. Dichas secuencias son bien
conocidas para una variedad de bacterias, levaduras y virus.
El origen de la replicación del plásmido pBR322
es adecuado para la mayoría de las bacterias Gram negativas, el
origen del plásmido de 2 micras es adecuado para las levaduras y
varios orígenes víricos (p. ej. SV 40, adenovirus) son útiles para
clonar vectores en células de mamíferos. Generalmente, el origen de
la replicación no es necesario para los vectores de expresión de
mamíferos a menos que se utilicen en células de mamífero capaces de
replicar concentraciones elevadas de ADN, tales como las células
COS.
Un vector de clonación o de expresión puede
contener de manera ventajosa un gen de selección denominado también
marcador seleccionable. Este gen codifica una proteína necesaria
para la supervivencia o el cultivo de células huésped transformadas
en un medio de cultivo selectivo. Las células huésped no
transformadas con el vector que contiene el gen de selección no
sobrevivirán por consiguiente en el medio de cultivo. Los genes de
selección típicos codifican proteínas que confieren resistencia a
los antibióticos a otras toxinas, por ejemplo ampicilina,
neomicina, metotrexato o tetraciclina, complementan insuficiencias
auxótrofas o suministran nutrientes críticos no disponibles en el
medio de cultivo.
Ya que la replicación de los vectores que
codifican un ligando según la presente invención se realiza más
convenientemente en E. coli, se utiliza un marcador
seleccionable de E. coli, por ejemplo, el gen de
\beta-lactamasa que confiere resistencia al
antibiótico ampicilina. Éstos pueden obtenerse de los plásmidos de
E. coli, tal como el pBR322 o un plásmido pUC tal como el
pUC18 o pUC19.
Los vectores de expresión contienen
habitualmente un activador que es reconocido por el organismo
anfitrión y se une operativamente a la secuencia de codificación de
interés. Dicho activador puede ser inducible o constitutivo. La
expresión "operativamente ligado" se refiere a una
yuxtaposición en la que los componentes descritos están en una
relación que les permite funcionar de la manera deseada. Una
secuencia de referencia "operativamente ligada" a una
secuencia de codificación está ligada de tal manera que la expresión
de la secuencia de codificación se consigue en condiciones
compatibles con las secuencias de referencia.
Para su utilización con anfitriones
procarióticos los activadores adecuados incluyen, por ejemplo, los
sistemas activadores de \beta-lactamasa y
lactosa, fosfatasa alcalina, el sistema activador de triptófano
(trp) y activadores híbridos tales como el activador tac. Para su
utilización en sistemas bacterianos los activadores generalmente
contendrán también una secuencia Shine-Delgarno
operativamente ligada a la secuencia de codificación.
Los vectores preferidos son vectores de
expresión que permiten la expresión de una secuencia de nucleótidos
que corresponde a un elemento del banco de polipéptidos. Por lo
tanto, la selección con el primer y/o segundo antígeno o epítopo
puede realizarse por propagación y expresión independientes de un
único clon que expresa el elemento del banco de polipéptidos o
mediante la utilización de cualquier sistema de presentación de la
selección. Como se describió anteriormente, el sistema de
presentación de la selección preferido es la presentación del
bacteriófago. Por lo tanto, pueden utilizarse vectores de fago o
fagómidos, p. ej. pIT1 o pIT2. Las secuencia principales útiles en
la invención incluyen peIB, stII, ompA, phoA, bla y pelA. Un ejemplo
son los vectores de fagómido que presentan un origen de replicación
del E. coli (para la replicación de la doble cadena) y
también un origen de replicación del fago (para la producción del
ADN de una sola cadena). La manipulación y la expresión de dichos
vectores es bien conocida en la materia (Hoogenboom y Winter (1992)
supra; Nissim et al. (1994) supra). En resumen,
el vector contiene un gen de \beta-lactamasa que
confiere selectividad al fagómido y un activador lac corriente
arriba de una casete de expresión que consta (terminal N a C) de una
secuencia principal pelB (que dirige el polipéptido expresado al
espacio periplásmico), un punto de clonación múltiple (para clonar
la versión nucleotídica del elemento del banco), opcionalmente, una
o más etiquetas peptídicas (para detección), opcionalmente, uno más
codones de terminación TAG y la proteína pIII del fago. Por lo
tanto, utilizando varias cepas supresoras y no supresoras de E.
coli y con la adición de glucosa, isopropil
tio-\beta-D-galactósido
(IPTG) o un fago auxiliar, tal como VCS M13, el vector es capaz de
replicar como un plásmido sin expresión, producir grandes cantidades
del elemento del banco de polipéptidos únicamente o producir fagos,
algunos de los cuales contienen por lo menos una copia de la fusión
polipéptido-pIII en su superficie.
La construcción de vectores que codifican
ligandos según la invención emplean técnicas de ligadura
convencionales. Los vectores aislados o los fragmentos de ADN se
escinden, se adaptan y se vuelven a ligar en la forma deseada para
generar el vector requerido. Si se desea, el análisis para confirmar
que las secuencias correctas están presentes en el vector
construido pueden realizarse de un modo conocido. Los métodos
adecuados para construir los vectores de expresión, preparando
transcritos in vitro, introduciendo ADN en las células
huésped y realizando análisis para evaluar la expresión y la
función son conocidos por los expertos en la materia. La presencia
de una secuencia génica en una muestra es detectada, o su ampliación
y/o expresión cuantificada por métodos convencionales, tales como
los análisis de Southern o Northern, transferencia Western,
transferencia de manchas de ADN, ARN o proteína, hibridación in
situ, inmunocitoquímica o análisis de secuencias de moléculas de
ácido nucleico o de proteína. Resultará fácilmente evidente para
los expertos en la materia cómo pueden modificarse estos métodos, si
se desea.
Según un aspecto de la presente invención, los
dos o más dominios de fijación del epítopo no complementarios se
unen de modo que están en una conformación cerrada como se definió
en la presente memoria. Pueden estar unidos además, de manera
ventajosa, a una estructura que puede facilitar, como alternativa o
además de un enlazador descrito en la presente memoria, la
formación y/o mantenimiento de la conformación cerrada de los
sitios de fijación al epítopo con respecto uno al otro.
Los armazones pueden basarse en moléculas de
inmunoglobulina o pueden ser distintas de inmunoglobulina en origen
como se indicó anteriormente. Los armazones de inmunoglobulinas
preferidas tal como se define en la presente memoria incluyen
alguno o más de los seleccionados de entre los siguientes: una
molécula de inmunoglobulina que comprende por lo menos (i) el
dominio CL (subclase kappa o lambda) de un anticuerpo; o (ii) el
dominio CH1 de una cadena pesada de anticuerpo; una molécula de
inmunoglobulina que comprende los dominios CH1 y CH2 de una cadena
pesada de anticuerpo; una molécula de inmunoglobulina que comprende
los dominios CH1, CH2 y CH3 de una cadena pesada de anticuerpo; o
cualquiera de los subconjuntos (ii) juntamente con el dominio CL
(subclase kappa o lambda) de un anticuerpo. El dominio de la región
bisagra puede estar también incluido. Dichas combinaciones de
dominios pueden, por ejemplo, simular anticuerpos naturales, tales
como IgG o IgM, o fragmentos de los mismos, tales como las
moléculas de Fv, scFv, Fab o F(ab')_{2}. Los expertos en la
materia podrán apreciar que no se pretende que esta lista sea
exhaustiva.
Cada dominio de fijación al epítopo comprende un
soporte de proteínas y uno o más CDR que están implicados en la
interacción específica del dominio con uno o más epítopos. De manera
ventajosa, un dominio de fijación al epítopo según la presente
invención comprende tres CDR. Los soportes de proteínas adecuados
incluyen cualquiera de los seleccionados de entre el grupo
constituido por los siguientes: los basados en dominios de
inmunoglobulina, los basados en fibronectina, los basados en
afficuerpos, los basados en CTLA4, los basados en chaperonas tales
como GroEL, los basados en lipocallina y los basados en los
receptores bacterianos SpA y SpD de Fc. Los expertos en la materia
apreciarán que no se pretende que esta lista sea exhaustiva.
Todos los miembros de la superfamilia de las
inmunoglobulinas comparten un plegamiento similar para su cadena
polipeptídica. Por ejemplo, aunque los anticuerpos son muy
diferentes desde el punto de vista de su secuencia primaria, la
comparación de las secuencias y estructuras cristalográficas ha
puesto de manifiesto que al contrario de lo esperado, cinco de los
seis bucles de fijación al antígeno de anticuerpos (H1, H2, L1, L2 y
L3) adoptan un número limitado de conformaciones de la cadena
principal o de estructuras canónicas (Chothia y Lesk (1987) J.
Mol. Biol., 196: 901; Chothia et al. (1989)
Nature, 342: 877). El análisis de las longitudes del
bucle y de los restos clave ha permitido por consiguiente la
predicción de las conformaciones de la cadena principal de H1, H2,
L1, L2 y L3 localizadas en la mayoría de los anticuerpos humanos
(Chothia et al. (1992) J. Mol. Biol., 227: 799;
Tomlinson et al. (1995) EMBO J., 14: 4628;
Williams et al. (1996) J. Mol. Biol., 264:
220). Aunque la región H3 es mucho más diversa desde el punto de
vista de la secuencia, longitud y estructura (debido a la
utilización de segmentos D), también forma un número limitado de
conformaciones de la cadena principal para las longitudes de bucle
corto que dependen de la longitud y la presencia de restos
determinados, o tipos de resto, en posiciones clave en el bucle y
el armazón del anticuerpo (Martin et al. (1996) J. Mol.
Biol., 263: 800; Shirai et al. (1996) FEBS
Letters, 399: 1).
Los ligandos doble-específicos
de la presente invención se montan de manera ventajosa en bancos de
dominios, como por ejemplo bancos de dominios V_{H} y/o bancos de
dominios V_{L}. Además, los ligandos
doble-específicos de la invención pueden
proporcionarse en forma de bancos. En un aspecto de la presente
invención, se diseñan bancos de ligandos y/o dominios específicos
dobles en los que determinadas longitudes de bucle y restos clave
se han seleccionado para asegurar que se conoce la conformación de
la cadena principal de los elementos. Estas conformaciones reales
de moléculas de la superfamilia de la inmunoglobulina encontradas en
la naturaleza, de manera ventajosa, minimizan las probabilidades de
que sean no operativas, como se expuso anteriormente. Los segmentos
del gen V de la línea germinal sirven de armazón básico adecuado
para construir bancos de anticuerpos o de receptor de linfocitos T;
también son útiles otras secuencias. Pueden producirse variaciones
con baja frecuencia, de modo que un pequeño número de elementos
operativos pueden poseer una conformación con cadena principal
alterada, que no afecte su función.
La teoría de la estructura canónica se utiliza
también para evaluar las numerosas conformaciones diferentes de la
cadena principal codificadas por ligandos, para predecir la
conformación de la cadena principal basada en secuencias de ligando
y para seleccionar restos para la diversificación que no afectan la
estructura canónica. Es sabido que, en el dominio V_{\kappa}
humano, el bucle L1 puede adoptar una de las cuatro estructuras
canónicas, el bucle L2 presenta una única estructura canónica y el
90% de los dominios V_{\kappa} humanos adoptan una de las cuatro
o cinco estructuras canónicas del bucle L3 (Tomlinson et al.
(1995) supra); por lo tanto, en el dominio V_{\kappa}
solo, pueden combinarse las estructuras canónicas diferentes para
crear un intervalo de conformaciones diferentes de la cadena
principal. Dado que el dominio V_{\lambda} codifica un intervalo
diferente de estructuras canónicas para los bucles L1, L2 y L3 y que
los dominios V_{\kappa} y V_{\lambda} pueden emparejarse con
cualquier dominio V_{H} que puede codificar varias estructuras
canónicas para los bucles H1 y H2, el número de combinaciones de la
estructura canónica observados para estos cinco bucles es muy
grande. Esto implica que la generación de diversidad en la
conformación de la cadena principal puede ser esencial para la
producción de un amplio intervalo de especificidades de unión. Sin
embargo, al construir un banco de anticuerpos basado en una
conformación única con cadena principal conocida se ha observado, al
contrario de lo esperado, que no se necesita la diversidad en la
conformación de la cadena principal para generar diversidad
suficiente para dirigir sustancialmente todos los antígenos. Aun más
sorprendentemente, la conformación de la cadena principal única no
necesita ser una estructura de consenso, puede utilizarse una
conformación natural única como base para un banco completo. Por lo
tanto, en un aspecto preferido, los ligandos
doble-específicos de la invención poseen una
conformación única con cadena principal conocida.
La conformación única con cadena principal que
se selecciona es preferentemente común entre las moléculas del tipo
de la superfamilia de la inmunoglobulina en cuestión. Una
conformación es común cuando se observan que un número
significativo de moléculas naturales la adoptan. Por consiguiente,
en un aspecto preferido de la invención, la aparición natural de
las diferentes conformaciones de la cadena principal para cada bucle
de fijación de un dominio de inmunoglobulina se considera
independientemente y cuando se selecciona un dominio variable
natural que posee la combinación deseada de las
conformaciones de la cadena principal para los diferentes bucles.
Si ninguna está disponible, puede seleccionarse la equivalente más
próxima. Es preferible que la combinación deseada de las
conformaciones de la cadena principal para los bucles diferentes se
cree seleccionando los segmentos del gen de la línea germinal que
codifican las conformaciones de la cadena principal deseadas. Es
más preferible que los segmentos génicos de la línea germinal
seleccionados se expresen frecuentemente en la naturaleza, y lo más
preferible es que sean los más frecuentemente expresados de todos
los segmentos génicos naturales de la línea germinal.
En el diseño de sus ligandos o bancos
específicos dobles puede considerarse independientemente la
frecuencia de las diferentes conformaciones de la cadena principal
para cada uno de los seis bucles de fijación al antígeno. Para H1,
H2, L1, L2 y L3, se selecciona una conformación dada que se adopta
entre el 20 y el 30% de los bucles de fijación al antígeno de las
moléculas naturales. Típicamente, su frecuencia observada es
superior al 35% (es decir, entre el 35% y el 100%) y, teóricamente,
superior al 50% o incluso superior al 65%. Ya que la inmensa
mayoría de bucles H3 no presentan estructuras canónicas, es
preferible seleccionar una conformación con cadena principal que
sea común entre los bucles que no presentan estructuras canónicas.
Para cada uno de los bucles, se selecciona por consiguiente la
conformación que se observa más a menudo en el repertorio natural.
En los anticuerpos humanos, las estructuras canónicas (CS) más
populares para cada bucle son las siguientes: H1 - CS 1 (79% del
repertorio expresado), H2 - CS 3 (46%), L1 - CS 2 de V_{\kappa}
(39%), L2 - CS 1 (100%), L3 - CS 1 de V_{\kappa} (36%) (el
cálculo supone una relación \kappa:\lambda de 70:30, Hood et
al. (1967) Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol., 48:
133). Para los bucles H3 que presentan estructuras canónicas, una
longitud CDR3 (Kabat et al. (1991) Sequences of proteins
of immunological interest, U.S. Department of Health and Human
Services) de siete restos con un puente salino desde el resto 94 al
resto 101 parece ser la más frecuente. Existen por lo menos 16
secuencias de anticuerpos humanas en el banco de datos EMBL con la
longitud de H3 requerida y restos clave que forman esta conformación
y por lo menos dos estructuras cristalográficas en el banco de
datos de la proteína que pueden utilizarse como bases para el
modelado del anticuerpo (2cgr y 1tet). Los segmentos génicos de la
línea germinal expresados más frecuentemente que esta combinación de
estructuras canónicas son el segmento 3-23 de
V_{H} (DP-47), el segmento JH4b de J_{H}, el
segmento O2/O12 de V_{\kappa} (DPK9) y el segmento J_{\kappa}1
de J_{\kappa}. Los segmentos de DP45 y DP38 de V_{H} son también
adecuados. Estos segmentos pueden utilizarse por consiguiente en
combinación como base para construir un banco con la conformación
con cadena principal única deseada.
Alternativamente, en lugar de seleccionar la
conformación con cadena principal única basada en la aparición
natural de las diferentes conformaciones con cadena principal para
cada uno de los bucles de fijación en aislamiento, la aparición
natural de combinaciones de las conformaciones de la cadena
principal se utiliza como base para seleccionar la única
conformación de la cadena principal. En el caso de los anticuerpos,
por ejemplo, puede determinarse la aparición natural de
combinaciones de la estructura canónica para cualquiera de los dos,
tres, cuatro, cinco o para los seis bucles de fijación al antígeno.
Aquí, es preferible que la conformación seleccionada sea común en
los anticuerpos naturales y lo más preferible que se observe más
frecuentemente en el repertorio natural. Por lo tanto, en los
anticuerpos humanos, por ejemplo, cuando se consideran las
combinaciones naturales de los cinco bucles de fijación al
antígeno, H1, H2, L1, L2 y L3, se determina la combinación más
frecuente de estructuras canónicas y a continuación se combina con
la conformación más popular para el bucle H3, como base para
seleccionar la conformación única con cadena principal.
Una vez seleccionadas varias conformaciones de
la cadena principal conocidas o, preferentemente una sola
conformación de la cadena principal conocida, los ligandos
doble-específicos según la invención o los bancos
para su utilización en la invención pueden construirse variando el
sitio de fijación de la molécula a fin de generar un repertorio con
diversidad estructural y/u operativa. Esto significa que las
variantes se generan de modo que poseen suficiente diversidad en su
estructura y/o en su función de modo que son capaces de proporcionar
una gama de actividades.
La diversidad deseada se genera de manera típica
variando la molécula seleccionada en una o más posiciones. Las
posiciones que deben cambiarse pueden seleccionarse al azar o se
seleccionan preferentemente. La variación puede conseguirse
entonces por mezcla al azar, durante la cual el aminoácido residente
se sustituye por cualquier aminoácido o análogo del mismo, natural
o sintético, produciendo un gran número de variantes o sustituyendo
el aminoácido residente por uno o más de entre un subconjunto
definido de aminoácidos, produciendo un número más limitado de
variantes.
Se han descrito varios métodos para introducir
dicha diversidad. PCR propensa al error (Hawkins et al.
(1992) J. Mol. Biol., 226: 889), mutagénesis química (Deng
et al. (1994) J. Biol. Chem., 269: 9533) o cepas
mutadoras bacterianas (Low et al. (1996) J. Mol.
Biol., 260: 359) pueden utilizarse para introducir mutaciones al
azar en los genes que codifican la molécula. Los métodos para mutar
posiciones seleccionadas son asimismo bien conocidos en la materia
e incluyen la utilización de oligonucleótidos incompatibles y
oligonucleótidos degenerados, con o sin la utilización de PCR. Por
ejemplo, se han creado varios bancos de anticuerpos sintéticos
dirigiendo mutaciones a los bucles de fijación al antígeno. La
región H3 del Fab que se fija a la vacuna contra el tétanos humano
se ha mezclado al azar para crear una gama de nuevas especificidades
de fijación (Barbas et al. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci.
USA, 89: 4457). Se han agregado las regiones H3 y L3
aleatorias o semialeatorias a los segmentos génicos V de la línea
germinal para producir grandes bancos con regiones de armazón no
mutadas (Hoogenboom & Winter (1992) J. Mol. Biol.,
227: 381; Barbas et al. (1992) Proc. Natl. Acad.
Sci. USA, 89: 4457; Nissim et al. (1994) EMBO
J., 13: 692; Griffiths et al. (1994) EMBO
J., 13: 3245; De Kruif et al. (1995) J. Mol.
Biol., 248: 97). Dicha diversificación se ha ampliado
para incluir algunos o todos los demás bucles de fijación al
antígeno (Crameri et al. (1996) Nature Med., 2:
100; Riechmann et al. (1995) Bio/Technology,
13: 475; Morphosys, documento WO 97/08320, supra).
Dado que el mezclado al azar del bucle presenta
potencial para crear aproximadamente más de 10^{15} estructuras
para H3 solo y un número igualmente grande de variantes para los
otros cinco bucles, no es factible utilizar la tecnología de
transformación actual o incluso utilizar sistemas exentos de células
para producir un banco que representa todas las combinaciones
posibles. Por ejemplo, en uno de los bancos mayores construidos
hasta la fecha, se generaron 6 \times 10^{10} anticuerpos
diferentes, que es solamente una fracción de la diversidad
potencial para un banco de este diseño (Griffiths et al.,
(1994) supra).
En una forma de realización preferida, solamente
aquellos restos que están implicados directamente en la creación o
modificación de la función deseada de la molécula están
diversificados. Para muchas moléculas, la función consistirá en
fijar una diana y por lo tanto la diversidad debería concentrarse en
el centro de fijación a la diana, si bien impidiendo que cambien
los restos que son cruciales para el empaquetamiento total de la
molécula o para mantener la conformación de la cadena principal
seleccionada.
En el caso de los ligandos
doble-específicos de anticuerpos, el sitio de
fijación para la diana es lo más a menudo el sitio de fijación del
antígeno. Por lo tanto, en un aspecto muy preferido, la invención
proporciona bancos de o para el montaje de ligandos
doble-específicos de anticuerpos en los que
solamente se varían los restos en el sitio de fijación al antígeno.
Estos restos son extremadamente heterogéneos en el repertorio de
anticuerpos humanos y son conocidos al entrar en contacto en
complejos anticuerpo/antígeno de alta resolución. Por ejemplo, en
L2 es conocido que las posiciones 50 y 53 son heterogéneas en los
anticuerpos naturales y se observan al entrar en contacto con el
antígeno. En cambio, el método convencional habría consistido en
diversificar todos los restos en la región determinante de
complementariedad (CDR1) correspondiente definida por Kabat et
al. (1991, supra), algunos de los siete restos comparados
con los dos diversificados en el banco para su utilización según la
invención. Esto representa una mejora significativa desde el punto
de vista de su diversidad operativa requerida para crear una gama
de especificidades de fijación al antígeno.
En la naturaleza, la diversidad de anticuerpos
es el resultado de dos procesos: recombinación somática de los
segmentos génicos V, D y J de la línea germinal para crear un
repertorio principal natural (denominado diversidad de la línea
germinal y de la unión) e hipermutación somática de los genes V
reordenados resultantes. El análisis de las secuencias de
anticuerpos humanos ha demostrado que la diversidad en el repertorio
principal está centrada al centro del sitio de fijación al antígeno
mientras que la hipermutación somática extiende la diversidad a
regiones en la periferia del sitio de fijación al antígeno que están
muy conservadas en el repertorio principal (véase Tomlinson et
al. (1996) J. Mol. Biol., 256: 813). Esta
complementariedad se ha desarrollado probablemente como una
estrategia eficaz para el espacio de la secuencia de búsqueda y,
aunque aparentemente exclusiva para los anticuerpos, puede
fácilmente aplicarse a otros repertorios de polipéptido. Los restos
que se varían son un subconjunto de los que forman el sitio de
fijación para la diana. Si se desea, subconjuntos diferentes
(incluyendo la superposición) de restos en el sitio de fijación a la
diana se diversifican en diferentes etapas durante la selección.
En el caso de un repertorio de anticuerpos, se
crea un repertorio "natural" inicial en el que, algunos pero
no todos, los restos en el sitio de fijación al antígeno se
diversifican. Tal como se utiliza en la presente memoria, en este
contexto, el término "natural" se refiere a moléculas de
anticuerpo que presentan diana no predeterminada. Estas moléculas
se parecen a las que son codificadas por los genes de
inmunoglobulina de un individuo que no ha experimentado
diversificación inmunitaria, como es el caso de los fetos y de
individuos recién nacidos, cuyos sistemas inmunitarios no han sido
todavía sometidos a una prueba de provocación mediante una amplia
variedad de estímulos antigénicos. Este repertorio se selecciona a
continuación frente a una gama de antígenos o epítopos. Si se
requiere, puede introducirse a continuación más diversidad fuera de
la región diversificada en el repertorio inicial. Este repertorio
madurado puede seleccionarse para la función, especificidad o
afinidad modificadas.
La invención proporciona dos repertorios
naturales diferentes de dominios de fijación para la construcción
de ligandos doble-específicos, o un banco natural de
ligandos doble-específicos, en el que se varían
alguno o todos los restos en el sitio de fijación al antígeno. El
banco "primario" simula el repertorio primario natural, con
diversidad restringida a los restos en el centro del sitio de
fijación al antígeno que son variados en los segmentos génicos V de
la línea germinal (diversidad de la línea germinal) o se
diversifican durante el proceso de recombinación (diversidad de
unión). Estos restos que están diversificados comprenden, pero no
se limitan a, H50, H52, H52a, H53, H55, H56, H58, H95, H96, H97,
H98, L50, L53, L91, L92, L93, L94 y L96. En el banco
"somático", la diversidad está restringida a los restos que se
diversifican durante el proceso de recombinación (diversidad de
unión) o están muy somáticamente mutados. Los restos que están
diversificados comprenden, pero no se limitan a: H31, H33, H35,
H95, H96, H97, H98, L30, L31, L32, L34 y L96. Todos los restos
enumerados anteriormente como adecuados para la diversificación de
estos bancos son conocidos por entrar en contactos con uno o más
complejos anticuerpo-antígeno. Dado que en ambos
bancos, no todos los restos en el sitio de fijación del antígeno se
varían, se incorpora una diversidad adicional durante la selección
variando los restos que quedan, si se desea hacerlo así. Es
evidente para un experto en la materia que cualquier subconjunto de
cualquiera de estos restos (o de los restos adicionales que
comprenden el sitio de fijación al antígeno) puede utilizarse para
la diversificación inicial y/o posterior del sitio de fijación al
antígeno.
En la construcción de bancos para su utilización
en la invención, la diversificación de posiciones seleccionada se
consigue típicamente en cuanto al ácido nucleico, alterando la
secuencia de codificación que especifica la secuencia del
polipéptido de modo que en esta posición puede incorporarse un
número de posibles aminoácidos (los 20 o un subconjunto de los
mismos). Utilizando la nomenclatura de la IUPAC, el codón más
versátil es NNK, que codifica todos los aminoácidos así como el
codón de terminación TAG. El codón NNK se utiliza preferentemente
para introducir la diversidad requerida. Se utilizan también otros
codones que consiguen los mismos fines, incluyendo el codón NNN,
que conduce a la producción de los codones de terminación TGA y TAA
adicionales.
Una característica de la diversidad con cadenas
laterales en el sitio de fijación al antígeno de anticuerpos
humanos es un sesgo pronunciado que favorece determinados restos de
aminoácidos. Si se suma la composición de los aminoácidos de las
diez posiciones más diversas en cada una de las regiones V_{H},
V_{\kappa} y V_{\lambda}, más del 76% de la diversidad de la
cadena lateral procede solamente de siete restos diferentes, siendo
éstos, serina (24%), tirosina (14%), asparagina (11%), glicina (9%),
alanina (7%), aspartato (6%) y treonina (6%). Este sesgo hacia los
restos hidrófilos y pequeños restos que pueden proporcionar
flexibilidad a la cadena principal refleja probablemente la
evolución de las superficies que están predispuestas a unirse a una
gama amplia de antígenos o epítopos y puede ayudar a explicar la
promiscuidad de anticuerpos requerida en el repertorio
principal.
Dado que es preferible simular esta distribución
de aminoácidos, la distribución de aminoácidos en las posiciones
que deben variarse preferentemente simula que se observan en el
sitio de fijación al antígeno de los anticuerpos. Dicho sesgo en la
sustitución de los aminoácidos que permite la selección de
determinados polipéptidos (no sólo polipéptidos de anticuerpo)
frente a una gama de antígenos diana se aplica fácilmente a
cualquier repertorio de polipéptidos. Existen varios métodos para
sesgar la distribución de aminoácidos en la posición que debe
variarse (incluyendo la utilización de mutagénesis de
trinucleótidos, véase el documento WO 97/08320), de los cuales el
método preferido, debido a la facilidad de la síntesis, es la
utilización de codones degenerados convencionales. Comparando el
perfil de aminoácido codificado por todas las combinaciones de
codones degenerados (con simple, doble, triple y cuádruple
degeneración en relaciones iguales en cada posición) con la
utilización de aminoácidos naturales es posible calcular el codón
más representativo. Los codones (AGT)(AGC)T,
(AGT)(AGC)C y (AGT)(AGC)(CT), esto es, DVT, DVC y DVY,
utilizando respectivamente la nomenclatura de la IUPAC, son los más
próximos al perfil de aminoácido deseado: codifican el 22% de serina
y 11% de tirosina, asparagina, glicina, alanina, aspartato,
treonina y cisteína. Preferentemente, por consi-
guiente, los bancos se construyen utilizando el codón DVT, DVC o DVY en cada una de las posiciones diversificadas.
guiente, los bancos se construyen utilizando el codón DVT, DVC o DVY en cada una de las posiciones diversificadas.
Los antígenos específicos dobles según la
invención, son capaces de unirse a una o más moléculas que pueden
prolongar la vida media del ligando in vivo. Típicamente,
dichas moléculas son polipéptidos que existen en la naturaleza
in vivo y que resisten la degradación o eliminación por
mecanismos endógenos que eliminan el material indeseable para el
organismo. Por ejemplo, la molécula que prolonga la vida media del
organismo puede seleccionarse de entre las siguientes:
Proteínas de la matriz extracelular: por ejemplo
colágeno, lamininas, integrinas y fibronectina. Los colágenos son
las proteínas principales de la matriz extracelular. Se conocen
actualmente aproximadamente 15 tipos de moléculas de colágeno,
localizadas en diferentes partes del cuerpo, p. ej. colágeno de
tipo I (totalizando el 90% del colágeno corporal) localizado en
los huesos, piel, tendones, ligamentos, córnea, órganos internos o
colágeno de tipo II localizado en los cartílagos, disco
intervertebral, notocordio y humor vítreo del ojo.
Las proteínas localizadas en la sangre,
incluyen:
Proteínas del plasma tales como la fibrina,
\alpha-2 macroglobulina, albúmina del suero,
fibrinógeno A, fibrinógeno B, proteína A amiloide del suero,
heptaglobina, profilina, ubiquitina, uteroglobulina y
\beta-2-microglobulina;
Enzimas e inhibidores tales como plasminógeno,
lisozima, cistatina C,
alfa-1-antitripsina e inhibidor de
la tripsina pancreática. El plasminógeno es el precursor inactivo
de la serina proteasa plasmina de tipo tripsina. Se encuentra
normalmente circulando en todo el torrente circulatorio. Cuando el
plasminógeno se activa y se convierte en plasmina, despliega un
potente dominio enzimático que disuelve las fibras de fibrinógenos
que retienen las células sanguíneas en un coágulo sanguíneo. Esto
se denomina fibrinólisis.
Proteínas del sistema inmunitario, tales como
IgE, IgG e IgM.
Proteínas de transporte tales como la proteína
de fijación al retinol, \alpha-1
microglobulina.
Defensinas tales como
beta-defensina 1, defensinas 1, 2 y 3
neutrófilas.
Proteínas localizadas en la barrera
sangre-cerebro o en los tejidos nerviosos, tales
como el receptor de melanocortina, la mielina y el transportador de
ascorbato.
Proteínas de fusión
ligando-agente neurofarmacéutico específicas para el
receptor de transferrina (véase el documento U.S. nº 5.977.307);
receptor de células endoteliales capilares del cerebro,
transferrina, receptor de transferrina, insulina, receptor del
factor 1 de crecimiento similar a la insulina (IGF 1), receptor del
factor 2 de crecimiento similar a la insulina (IGF 2), receptor de
insulina.
Proteínas localizadas en el riñón, tales como
policistina, colágeno de tipo IV, transportador K1 de aniones
orgánicos y antígeno de Heymann.
Proteínas localizadas en el hígado, por ejemplo
la alcohol deshidrogenasa, G250.
- Factor X de coagulación de la sangre
- \alpha1 antitripsina
- HNF 1\alpha
Proteínas localizadas en los pulmones, tal como
el componente secretor (que se une a IgA).
Proteínas localizadas en el corazón, por ejemplo
HSP 27. Ésta está asociada a la miocardiopatía dilatada.
Proteínas localizadas en la piel, por ejemplo
queratina.
Proteínas óseas específicas, tales como las
proteínas óseas morfógenas (BMP) que son un subconjunto de la
superfamilia del factor \beta de crecimiento transformante que
presenta actividad osteógena. Los ejemplos comprenden
BMP-2, -4, -5, -6, -7 (denominada también proteína
osteógena (OP-1) y -8 (OP-2).
Proteínas tumorales específicas, incluyendo el
antígeno del trofoblasto humano, el receptor de herceptina, el
receptor del estrógeno, catepsinas, p. ej., catepsina B (localizada
en el hígado y en el bazo).
Proteínas específicas de enfermedades, tales
como los antígenos expresados solamente en los linfocitos T
activados: incluyendo LAG-3 (gen de activación de
linfocitos), ligando de osteoprotegerina (OPGL) véase Nature
402, 304-309; 1999, OX40 (miembro de la familia del
receptor de TNF, expresado en linfocitos T activados y la única
molécula del linfocito T coestimulante conocida por ser regulada
por incremento específicamente en las células que producen el virus
tipo-I de la leucemia de linfocitos T humanos
(HTLV-I)). Véase J. Immunol. 1 jul. 2000;
165(1):263-70; metaloproteasas (asociadas a
artritis/cánceres), incluyendo la Drosophila CG6512,
paraplegina humana, FtsH humana, AFG3L2 humana, ftsH murina;
factores de crecimiento angiógenos, incluyendo el factor de
crecimiento de fibroblastos ácido (FGF-1), factor de
crecimiento de fibroblastos básico (FGF-2), factor
de crecimiento endotelial vascular/factor de permeabilidad vascular
(VEGF/VPF), factor-a de crecimiento transformante
(TGF a), factor alfa de la necrosis tumoral
(TNF-\alpha), angiogenina,
interleucina-3 (IL-3),
interleucina-8 (IL-8), factor de
crecimiento endotelial derivado de plaquetas
(PD-ECGF), factor de crecimiento de la placenta
(PIGF), midcina, factor-BB de crecimiento derivado
de plaquetas de tipo medio (PDGF), fractalquina.
Proteínas del estrés (proteínas del choque
térmico)
Las HSP se encuentran normalmente en el interior
de las células. Cuando se encuentran en el exterior de las células,
es un indicador de que una célula ha muerto y se esparce su
contenido. Esta muerte celular no programada (necrosis) solo ocurre
cuando como resultado del traumatismo, enfermedad o lesión y por lo
tanto in vivo las HSP extracelulares desencadenan una
respuesta del sistema inmunitario que combate la infección y la
enfermedad. Un ligando doble-específico que se une
a la HSP extracelular puede localizarse en un punto de la
enfermedad.
Proteínas implicadas en el transporte de Fc
Receptor de Brambell (conocido también como
FcRB)
Este receptor de Fc presenta dos funciones, las
cuales son potencialmente útiles para su administración.
Las funciones son
- (1)
- El transporte de IgG de la madre al niño a través de la placenta
- (2)
- La protección de IgG de la degradación prolongando por esta razón su vida media en el suero de la IgG. Se cree que el receptor recicla la IgG del endosoma.
Véase Holliger et al., Nat.
Biotechnol. Jul. de 1997;
15(7):632-6.
Los ligandos según la invención pueden diseñarse
para que sean específicos para las dianas anteriores. Los ligandos
según la invención pueden ser específicos para las dianas
seleccionadas de entre las anteriores que son específicas para el
tejido, permitiendo de este modo el direccionamiento específico al
tejido del ligando doble-específico. Además, cuando
el ligando o el monómero dAb se dirige al riñón o al hígado, este
puede redireccionar el ligando o el monómero dAb a una serie de
reacciones de eliminación alternativa in vivo (por ejemplo,
el ligando puede ser dirigido lejos de la eliminación en el hígado
a la eliminación en el riñón).
Las utilizaciones terapéuticas y profilácticas
de los ligandos multiespecíficos preparados según la invención
implican la administración de ligandos según la invención a un
mamífero receptor, tal como un ser humano. La multiespecificidad
puede permitir que los anticuerpos se unan a un antígeno polimérico
con gran avidez. Los ligandos multiespecíficos pueden permitir la
reticulación de dos antígenos, por ejemplo incorporando linfocitos
T citotóxicos para mediar la destrucción de las líneas celulares del
tumor.
En la presente solicitud, el término
"prevención" implica la administración de la composición
protectora antes de la inducción de la enfermedad.
"Supresión" se refiere a la administración de la composición
después de un caso inductivo, pero antes de la aparición clínica
de la enfermedad. "Tratamiento" implica la administración
de la composición protectora una vez se han manifestado los síntomas
de la enfermedad.
Están disponibles sistemas de modelo animal que
pueden utilizarse para identificar la eficacia de los anticuerpos o
de sus proteínas de fijación en la protección contra la enfermedad o
en el tratamiento de ésta. Los métodos para la experimentación del
lupus eritematoso diseminado (SLE) en ratones sensibles son
conocidos en la materia (Knight et al. (1978) J. Exp.
Med., 147: 1653; Reinersten et al. (1978) New.
Eng. J. Med., 299: 515). La miastemia grave (MG) se
experimenta en ratones hembra SJL/J provocando la enfermedad con la
proteína AchR soluble procedente de otra especie (Lindstrom et
al. (1988) Adv. Immunol., 42: 233). La artritis es
provocada en una cepa sensible de ratones mediante la inyección de
colágeno de tipo II (Stuart et al. (1984) Ann. Rev.
Immunol., 42: 233). Se ha descrito un modelo mediante
cuyo adyuvante se provoca la artritis en ratas sensibles mediante la
inyección de proteína microbacteriana del choque térmico (Van Eden
et al. (1988) Nature, 331: 171). La tiroiditis
se provoca en los ratones mediante la administración de
tiroglobulina según describe (Maron et al. (1980) J. Exp.
Med., 152: 1115). La diabetes mellitus dependiente de
insulina (IDDM) se produce de forma natural o puede provocarse en
determinas cepas de ratones tales como los descritos por Kanasawa
et al. (1984) Diabetologia, 27: 113. EAE en
ratón y rata sirve como modelo para MS en el hombre. En este modelo,
se provoca la enfermedad de desemielinación mediante la
administración de la proteína básica mielina (véase Paterson (1986)
Textbook of Immunopathology, Mischer et al., eds.,
Grune y Stratton, Nueva York, págs. 179-213;
McFarlin et al. (1973) Science, 179: 478; y
Satoh et al. (1987) J. Immunol., 138: 179).
Generalmente, los presentes ligandos se
utilizarán en forma purificada junto con vehículos
farmacológicamente apropiados. Típicamente, estos vehículos
incluyen soluciones acuosas o alcohólico/acuosas, emulsiones o
suspensiones, incluyendo alguna solución salina y/o medios
tamponados. Los vehículos parenterales incluyen la solución de
cloruro sódico, dextrosa de Ringer, dextrosa y cloruro sódico y
solución de Ringer lacteada. Adyuvantes adecuados fisiológicamente
aceptables, si son necesarios para mantener un complejo
polipeptídico en suspensión, pueden seleccionarse de entre
espesantes tales como carboximetilcelulosa, polivinilpirrolidona,
gelatina y alginatos.
Los vehículos intravenosos comprenden
reabastecedores de fluido y nutrientes y reabastecedores de
electrolitos, tales como los basados en dextrosa de Ringer. Pueden
estar también presentes conservantes y otros aditivos, tales como
antimicrobianos, antioxidantes, agentes quelantes y gases inertes,
(Mack (1982) Remington's Pharmaceutical Sciences, 16ª
edición).
Los ligandos de la presente invención pueden
utilizarse como composiciones administradas independientemente o
junto con otros agentes. Estos pueden comprender varios fármacos
inmunoterapéuticos, tales como ciclosporina, metotrexato,
adriamicina o cisplatino, e inmunotoxinas. Las composiciones
farmacéuticas pueden comprender "mezclas" de varios agentes
citotóxicos u otros juntamente con los ligandos de la presente
invención, o incluso combinaciones de ligandos según la presente
invención con diferentes especificidades, tal como los ligandos
seleccionados que utilizan diferentes antígenos o epítopos diana,
estén o no agrupados antes de la administración.
La vía de administración de las composiciones
farmacéuticas según la invención puede ser cualquiera de las
conocidas frecuentemente por los expertos en la materia. Para la
terapia, incluyendo sin limitación la inmunoterapia, sus ligandos
seleccionados de la invención pueden administrarse a cualquier
paciente según las técnicas habituales. La administración puede ser
por cualquier medio apropiado, incluyendo por vía parenteral,
intravenosa, intramuscular, intraperitoneal, transdérmica,
pulmonar, o también, de manera apropiada, mediante infusión directa
con un catéter. La dosis y frecuencia de administración dependerá
de la edad, sexo y estado del paciente, de la administración
simultánea de otros fármacos, de las contraindicaciones y de otros
parámetros que deben ser considerados por el médico.
Los ligandos de la presente invención pueden
liofilizarse durante el almacenamiento y redisolverse en un vehículo
adecuado antes de su uso. Esta técnica ha demostrado ser eficaz con
las inmunoglobulinas convencionales y pueden emplearse técnicas de
liofilización y redisolución conocidas en la materia. Los expertos
en la materia apreciarán que la liofilización y la redisolución
pueden conducir a grados variables de pérdida de actividad del
anticuerpo (p. ej., con inmunoglobulinas convencionales, los
anticuerpos IgM tienden a presentar mayor pérdida de actividad que
los anticuerpos de IgG) y estos niveles de utilización pueden tener
que ajustarse hacia arriba para compensar.
Las composiciones que contienen los presentes
ligandos o una mezcla de las mismas pueden administrarse para
tratamientos profilácticos y/o terapéuticos. En determinadas
aplicaciones terapéuticas, una cantidad adecuada para realizar por
lo menos la inhibición, supresión, modulación, destrucción parcial,
o algunos otros parámetros mensurables, de una población de células
seleccionadas se define como "dosis terapéuticamente eficaz".
Las cantidades necesarias para conseguir esta dosis dependerán de
la gravedad de la enfermedad y del estado general del sistema
inmunitario del propio paciente, pero generalmente oscilan entre
0,005 y 5,0 mg de ligando, p. ej., anticuerpo, receptor (p. ej., un
receptor de linfocitos T) o de su proteína de fijación por kilogramo
de peso corporal, utilizándose más frecuentemente dosis de 0,05 a
2,0 mg/kg/dosis. Para las aplicaciones profilácticas, las
composiciones que contienen los presentes ligandos o sus mezclas
pueden administrarse también en dosis similares o ligeramente
inferiores.
El tratamiento realizado utilizando las
composiciones descritas en la presente memoria se considera
"eficaz" si se reducen uno o más síntomas (p. ej., en por lo
menos el 10% o por lo menos un punto en una escala de evaluación
clínica), en comparación con dichos síntomas presentes antes del
tratamiento, o en comparación con dichos síntomas en un individuo
(humano o modelo animal) no tratado con dicha composición. Los
síntomas variarán obviamente dependiendo de la enfermedad o
trastorno al que se refieren, pero pueden ser medidos por un médico
o especialista experto. Dichos síntomas pueden medirse, por ejemplo,
controlando la concentración de uno o más indicadores bioquímicos
de la enfermedad o trastorno (concentraciones de una enzima o
metabolito correlacionados con la enfermedad, número de células
afectadas, etc.), controlando las manifestaciones físicas (p. ej.,
inflamación, tamaño del tumor, etc.) o mediante una escala de
evaluación clínica aceptada, por ejemplo, la escala de estado de
discapacidad ampliada (para la esclerosis múltiple), el cuestionario
para la enfermedad inflamatoria de los intestinos de Irvine (la
valoración de 32 puntos evalúa la calidad de vida con respecto a la
función intestinal, síntomas generales, función social y estado
emocional, intervalos de puntuación de 32 a 224, indicando las
puntuaciones mayores una mejor calidad de vida), escala de calidad
de vida para la artritis reumatoide u otras escalas de evaluación
clínica aceptadas conocidas en este campo. Una reducción mantenida
(p. ej., un día o más, preferentemente más) de los síntomas de la
enfermedad o del trastorno en por lo menos el 10% o en uno o más
puntos en una escala clínica dada es indicadora de tratamiento
"eficaz". Asimismo, la profilaxis realizada que utiliza una
composición descrita en la presente memoria es "eficaz" si el
comienzo o gravedad de uno o más síntomas se retarda, reduce o
elimina en comparación con dichos síntomas en un individuo similar
(modelo humano o animal) no tratado con la composición.
Una composición que contiene un ligando o una
mezcla de la misma según la presente invención puede utilizarse en
instalaciones profilácticas y terapéuticas para ayudar a la
alteración, inactivación, destrucción o eliminación de una
población de células diana seleccionada en un mamífero. Además, los
repertorios de polipéptidos seleccionados descritos en la presente
memoria pueden utilizarse extracorporalmente o selectivamente in
vitro para destruir, eliminar o eliminar de manera eficaz una
población celular diana de una colección heterogénea de células. La
sangre de un mamífero puede combinarse extracorporalmente con los
ligandos, p. ej. anticuerpos, receptores de la superficie celular o
proteínas de fijación de los mismos por lo cual las células
indeseables se destruyen o se eliminan de la sangre para
reintegrarla al mamífero según técnicas normalizadas.
Los ligandos doble-específicos
según el método de la presente invención pueden emplearse en
aplicaciones terapéuticas y profilácticas in vivo,
aplicaciones para diagnóstico in vivo y similares.
Las utilizaciones terapéuticas y profilácticas
de los ligandos doble-específicos preparados según
la invención implican la administración de ligandos según la
invención a un mamífero receptor, tal como el hombre. Los
anticuerpos específicos dobles según la invención comprenden por lo
menos una especificidad para una molécula que prolonga la vida
media; una o más especificidades adicionales pueden dirigirse contra
moléculas diana. Por ejemplo, una IgG específica doble puede ser
específica para cuatro epítopos, uno de los cuales está en una
molécula que prolonga la vida media. La especificidad doble puede
permitir que los anticuerpos se unan al antígeno polimérico con
gran avidez. Los anticuerpos específicos dobles pueden permitir la
reticulación de dos antígenos, por ejemplo incorporando linfocitos
T citotóxicos para mediar en la descripción de líneas celulares
tumorales.
Sustancialmente los ligandos puros o sus
proteínas de fijación, tales como los monómeros dAb, de por lo menos
el 90 al 95% de homogeneidad se prefieren para la administración a
un mamífero, y el 98 al 99% o más de homogeneidad es más preferida
para las utilizaciones farmacéuticas especialmente cuando el
mamífero es un ser humano. Una vez purificados, parcialmente o
hasta su homogeneidad según se desee, los ligandos pueden ser
utilizados para diagnóstico o terapia (incluyendo
extracorporalmente) o en el desarrollo y ejecución de los
procedimientos de análisis, tinciones inmunofluorescentes y
similares (Lefkovite y Pernis, (1979 y 1981) Immunological
Methods, volúmenes I y II, Academic Press, NY).
Los ligandos de la presente invención hallarán
utilización normalmente en la prevención, supresión o tratamiento
de estados inflamatorios, hipersensibilidad alérgica, cáncer,
infección bacteriana o vírica y trastornos autoinmunitarios (que
incluyen, pero no se limitan a, diabetes de tipo I, esclerosis
múltiple, artritis reumatoide, lupus eritematoso diseminado,
enfermedad de Crohn y miastenia grave).
En la presente solicitud, el término
"prevención" implica la administración de la composición
protectora antes de la inducción de la enfermedad. "Supresión"
se refiere a la administración de la composición después de un caso
inductivo, pero antes de la aparición clínica de la enfermedad.
"Tratamiento" implica la administración de la composición
protectora una vez se han manifestado los síntomas de la
enfermedad.
Están disponibles sistemas de modelo animal que
pueden utilizarse para identificar la eficacia de los ligandos
doble-específicos en la protección contra la
enfermedad o en el tratamiento de ésta. Los métodos para la
experimentación del lupus eritematoso diseminado (SLE) en ratones
sensibles son conocidos en la materia (Knight et al. (1978)
J. Exp. Med., 147: 1653; Reinersten et al.
(1978) New. Eng. J. Med., 299: 515). La miastemia
grave (MG) se experimenta en ratones hembra SJL/J provocando la
enfermedad con la proteína AchR soluble procedente de otra especie
(Lindstrom et al. (1988) Adv. Immunol., 42:
233). La artritis se provoca en una cepa sensible de ratones
mediante la inyección de colágeno de tipo II (Stuart et al.
(1984) Ann. Rev. Immunol., 42: 233). Se ha descrito
un modelo mediante cuyo adyuvante se provoca la artritis en ratas
sensibles mediante la inyección de proteína microbacteriana del
choque térmico (Van Eden et al. (1988) Nature,
331: 171). La tiroiditis se provoca en los ratones mediante
la administración de tiroglobulina según describe (Maron et
al. (1980) J. Exp. Med., 152: 1115). La diabetes
mellitus dependiente de insulina (IDDM) se produce de forma natural
o puede provocarse en determinas cepas de ratones tales como los
descritos por Kanasawa et al. (1984) Diabetologia,
27: 113. EAE en ratón y rata sirve como modelo para MS en el
hombre. En este modelo, se provoca la enfermedad de desmielinación
mediante la administración de la proteína básica mielina (véase
Paterson (1986) Textbook of Immunopathology, Mischer et
al., eds., Grune y Stratton, Nueva York, págs.
179-213; McFarlin et al. (1973)
Science, 179: 478; y Satoh et al. (1987) J.
Immunol., 138: 179).
Los ligandos doble-específicos
según la invención y los monómeros dAb capaces de fijarse a dianas
extracelulares implicadas en la endocitosis (p. ej. Clatrina)
permiten a los ligandos doble-específicos ser
endocitosados, lo que permite otra especificidad capaz de unirse a
una diana intracelular para ser liberada en un medio intracelular.
Esta estrategia requiere un ligando doble-específico
con propiedades físicas que permitan mantenerlo operativo en el
interior de la célula. Alternativamente, si el destino final del
compartimento intracelular es la oxidación, puede que no se
necesite que un ligando bien plegado esté exento de disulfuro.
Generalmente, los presentes ligandos se
utilizarán en forma purificada junto con vehículos
farmacológicamente apropiados. Típicamente, estos vehículos
incluyen soluciones acuosas o alcohólico/acuosas, emulsiones o
suspensiones, incluyendo alguna solución salina y/o medios
tamponados. Los vehículos parenterales incluyen la solución de
cloruro sódico, dextrosa de Ringer, dextrosa y cloruro sódico y
solución de Ringer lacteada. Si son necesarios adyuvantes adecuados
fisiológicamente aceptables, para mantener un complejo polipeptídico
en suspensión, pueden seleccionarse de entre espesantes tales como
carboximetilcelulosa, polivinilpirrolidona, gelatina y
alginatos.
Los vehículos intravenosos comprenden
reabastecedores de fluido y nutrientes y reabastecedores de
electrolitos, tales como los basados en dextrosa de Ringer. Pueden
estar también presentes conservantes y otros aditivos, tales como
antimicrobianos, antioxidantes, agentes quelantes y gases inertes,
(Mack (1982) Remington's Pharmaceutical Sciences, 16ª
edición).
Los ligandos de la presente invención pueden
utilizarse como composiciones administradas independientemente o
junto con otros agentes. Estos pueden comprender varios fármacos
inmunoterapéuticos, tales como ciclosporina, metotrexato,
adriamicina o cisplatino, e inmunotoxinas. Las composiciones
farmacéuticas pueden comprender "mezclas" de varios agentes
citotóxicos u otros juntamente con los ligandos de la presente
invención.
La vía de administración de las composiciones
farmacéuticas según la invención puede ser cualquiera de las
conocidas habitualmente por los expertos en la materia. Para la
terapia, incluyendo sin limitación la inmunoterapia, sus ligandos
seleccionados de la invención pueden administrarse a cualquier
paciente según las técnicas habituales. La administración puede ser
por cualquier medio apropiado, incluyendo por vía parenteral,
intravenosa, intramuscular, intraperitoneal, transdérmica,
pulmonar, o también, de manera apropiada, mediante infusión directa
con un catéter. La dosis y frecuencia de administración dependerá
de la edad, sexo y estado del paciente, de la administración
simultánea de otros fármacos, de las contraindicaciones y de otros
parámetros que deben ser tenidos en cuenta por el médico.
Los ligandos de la presente invención pueden
liofilizarse durante el almacenamiento y redisolverse en un vehículo
adecuado antes de su uso. Esta técnica ha demostrado ser eficaz con
las inmunoglobulinas convencionales y pueden emplearse técnicas de
liofilización y redisolución conocidas en la materia. Los expertos
en la materia apreciarán que la liofilización y la redisolución
puedan conducir a grados variables de pérdida de actividad del
anticuerpo (p. ej., con inmunoglobulinas convencionales, los
anticuerpos IgM tienden a presentar mayor pérdida de actividad que
los anticuerpos de IgG) y estos niveles de utilización pueden tener
que ajustarse hacia arriba para compensar.
Las composiciones que contienen los presentes
ligandos o una mezcla de las mismas pueden administrarse para
tratamientos profilácticos y/o terapéuticos. En determinadas
aplicaciones terapéuticas, una cantidad adecuada para realizar por
lo menos la inhibición, supresión, modulación, destrucción parcial,
o algunos otros parámetros mensurables, de una población de células
seleccionadas se define como "dosis terapéuticamente eficaz".
Las cantidades necesarias para conseguir esta dosis dependerán de
la gravedad de la enfermedad y del estado general del sistema
inmunitario del propio paciente, pero generalmente oscilan entre
0,005 y 5,0 mg de ligando por kilogramo de peso corporal,
utilizándose más frecuentemente dosis de 0,05 a 2,0 mg/kg/dosis.
Para las aplicaciones profilácticas, las composiciones que
contie-
nen los presentes ligandos o sus mezclas pueden administrarse también en dosis similares o ligeramente inferiores.
nen los presentes ligandos o sus mezclas pueden administrarse también en dosis similares o ligeramente inferiores.
Una composición que contiene un ligando o una
mezcla de la misma según la presente invención puede utilizarse en
instalaciones profilácticas y terapéuticas para ayudar a la
alteración, inactivación, destrucción o eliminación de una
población de células diana seleccionada en un mamífero.
Además, los repertorios de polipéptidos
seleccionados descritos en la presente memoria pueden utilizarse
extracorporalmente o selectivamente in vitro para destruir,
eliminar o eliminar de manera eficaz una población celular diana de
una colección heterogénea de células. La sangre de un mamífero puede
combinarse extracorporalmente con los ligandos, p. ej. anticuerpos,
receptores de la superficie celular o proteínas de fijación de los
mismos por lo cual las células indeseables se destruyen o se
eliminan de la sangre para reintegrarla al mamífero según técnicas
normalizadas.
La invención se describe además, a título de
ilustración únicamente, en los ejemplos siguientes. Como se utiliza
en la presente memoria, en aras de la nomenclatura de dAb, el
TNF\alpha humano se denomina TAR1 y el receptor de TNF\alpha
humano (receptor p55) se denomina TAR2.
Este ejemplo explica un método para preparar un
anticuerpo específico doble dirigido contra
\beta-gal y HSA en el que se selecciona un
repertorio de dominios variables V_{\kappa} ligados a un dominio
V_{H} de la línea germinal (ficticia) para fijarse a
\beta-gal y se selecciona un repertorio de
dominios variables V_{H} unidos a un dominio V_{\kappa} de la
línea germinal (ficticia) para fijarse a HSA. Los dominios HSA de
V_{H} y \beta-gal de V_{\kappa} variables
seleccionados se combinan a continuación y se seleccionan los
anticuerpos para fijarse a \beta-gal y HSA. HSA es
una proteína que prolonga la vida media localizada en la sangre
humana.
En este experimento se utilizaron cuatro bancos
de anticuerpos de fago humano.
Banco 1 | Línea germinal V_{\kappa} /DVT V_{H} | 8,46 \times 10^{7} |
Banco 2 | Línea germinal V_{\kappa} /NNK V_{H} | 9,64 \times 10^{7} |
Banco 3 | Línea germinal V_{H}/DVT V_{\kappa} | 1,47 \times 10^{8} |
Banco 4 | Línea germinal V_{H}/NNK V_{\kappa} | 1,45 \times 10^{8} |
Todos los bancos se basan en un armazón humano
individual para V_{H} (V3-23/DP47 y J_{H}4b) y
V_{\kappa} (O12/O2/DP49 y J_{\kappa}1) con la diversidad de la
cadena lateral incorporada a regiones determinantes de
complementariedad (CDR2 y CDR3).
El banco 1 y el banco 2 contienen una secuencia
V_{\kappa} ficticia, mientras que la secuencia de V_{H} se
diversifica en las posiciones H50, H52, H52a, H53, H56, H58, H95,
H96, H97 y H98 (DVT o NNK codificados, respectivamente) (Figura 1).
El banco 3 y el banco 4 contienen una secuencia V_{H} ficticia,
mientras que la secuencia de V_{\kappa} se diversifica en las
posiciones L50, L52, L91, L92, L93, L94 y L96 (DVT o NNK
codificados, respectivamente) (Figura 1). Los bancos están en
formato de fagómido pIT2/ScFv (Figura 2) y se han preseleccionado
para fijarse a ligandos genéricos, proteína A y proteína L, de modo
que la mayoría de los clones en los bancos no seleccionados son
operativos. Las dimensiones de los bancos presentados anteriormente
corresponden a las dimensiones tras la preselección. El banco 1 y el
banco 2 se mezclaron antes que las selecciones en el antígeno
proporcionen un banco de V_{H} simple/V_{\kappa} ficticio y el
banco 3 y el banco 4 se mezclaron para formar un banco V_{\kappa}
simple /V_{H} ficticio.
Se realizaron tres rondas de selecciones en
\beta-gal utilizando el banco V_{\kappa}
/V_{H} ficticio y se realizaron tres rondas de selecciones en HSA
utilizando el banco V_{H}/V_{\kappa} ficticio. En el caso de
\beta-gal los títulos del fago estaban
comprendidos entre 1,1 \times 10^{6} en la primera ronda y 2,0
\times 10^{8} en la tercera ronda. En el caso de HSA los títulos
del fago estaban comprendidos entre 2 \times 10^{4} en la
primera ronda y 1,4 \times 10^{9} en la tercera ronda. Las
selecciones se realizaron como describe Griffith et al.,
(1993), excepto que se utilizó el fago auxiliar KM13 (que contiene
una proteína pIII con una secuencia de escisión de proteasa entre
los dominios D2 y D3) y el fago se eluyó con 1 mg/ml de tripsina en
PBS. La adición de tripsina escinde las proteínas pIII procedentes
del fago auxiliar (pero no las del fagómido) y eluye las fusiones
scFv-fago unidas mediante la escisión en la etiqueta
c-myc (Figura 2), proporcionando de este modo un
enriquecimiento adicional para los fagos que expresan los scFv
operativos y una reducción correspondiente del fondo (Kristensen y
Winter, Folding & Design 3: 321-328, 9
jul., 1998). Se realizaron selecciones utilizando inmunotubos
recubiertos con HSA o \beta-gal a una
concentración de 100 \mug/ml.
Para comprobar el enlace, se cribaron 24
colonias de la tercera ronda de cada selección mediante ELISA del
fago monoclonal. Se produjeron partículas de fago tal como describe
Harrison et al., Methods Enzymol.
1996;267:83-109. Se recubrieron las placas de ELISA
de 96 pocillos con 100 \mul de HSA o \beta-gal a
una concentración de 10 \mug/ml en PBS durante la noche a 4ºC. Se
siguió un protocolo ELISA estándar (Hoogenboom et al., 1991)
utilizando la detección del fago unido con conjugado
anti-M13-HRP. Una selección de
clones proporcionó señales de ELISA mayores de 1,0 con 50 \mul de
sobrenadante.
A continuación, se elaboraron preparaciones de
ADN a partir del banco V_{H}/V_{\kappa} ficticio seleccionado
en HSA y del banco V_{\kappa} /V_{H} ficticio en
\beta-gal utilizando el kit QIAprep Spin Miniprep
(Qiagen). Para acceder a la mayor parte de la diversidad, se
elaboraron preparaciones de ADN de cada una de las tres rondas de
selecciones y a continuación se extrajeron de cada uno de los
antígenos. Las preparaciones de ADN se digirieron a continuación
con SalI/NotI durante la noche a 37ºC. Tras la purificación en gel
de los fragmentos, las cadenas V_{\kappa} del banco V_{\kappa}
/V_{H} ficticio seleccionadas en \beta-gal se
ligaron en lugar de una cadena V_{\kappa} ficticia del banco
V_{H}/V_{\kappa} ficticio seleccionado en HSA creando un banco
de 3,3 \times 10^{9} clones.
Este banco se seleccionó a continuación en HSA
(primera ronda) y \beta-gal (segunda ronda), las
selecciones se realizaron como se describió anteriormente. En cada
caso, después de la segunda ronda se probó la fijación de 48 clones
a HSA y a \beta-gal por ELISA del fago monoclonal
(como se describió anteriormente) y por ELISA de fragmentos de scFv
solubles. Se produjeron fragmentos de anticuerpo solubles y se
siguió el protocolo ELISA estándar, Hoogenboom et al. (1991)
Nucleic Acids Res., 19: 4133, excepto que se utilizó
Tween al 2%/PBS como tampón de bloqueo y se detectaron los scFv
unidos con proteína L-HRP. Estos clones (E4, E5 y
E8) procedentes de la selección HSA/\beta-gal y
dos clones (K8 y K10) procedentes de la seleccion
\beta-gal/HSA eran capaces de fijar ambos
antígenos. Los scFv de estos clones se ampliaron por PCR y se
secuenciaron tal como describe Ignatovich et al., (1999)
J. Mol. Biol. 26 nov. 1999;
294(2):457-65, utilizando los cebadores LMB3
y pHENseq. El análisis de la secuencia puso de manifiesto que todos
los clones eran idénticos. Por consiguiente, solamente se
seleccionó un clon que codifica un anticuerpo específico doble (K8)
para la investigación posterior (Figura 3).
En primer lugar, las propiedades de fijación del
anticuerpo K8 se caracterizaron mediante ELISA de fago monoclonal.
Se recubrieron placas de 96 pocillos con 100 \mul de HSA y
\beta-gal junto con fosfatasa alcalina (APS),
albúmina de suero bovino (BSA), aglutinina de cacahuete, lisozima y
citocromo c (para comprobar la reactividad cruzada) a una
concentración de 10 \mug/ml en PBS toda la noche a 4ºC. El
fagómido del clon K8 se recuperó con KM13 tal como describe
Harrison et al., (1996) y el sobrenadante (50 \mul) que
contiene el fago se analizó directamente. Se siguió un protocolo
del ELISA estándar (Hoogenboom et al., 1991) utilizando la
detección del fago unido con conjugado
anti-M13-HRP. Se observó que el
anticuerpo K8 específico doble se une a HSA y a
\beta-gal cuando se presenta en la superficie del
fago con señales de absorbancia mayores de 1,0 (Figura 4). La
fijación firme a BSA se observó también (Figura 4). Ya que HSA y
BSA son 76% homólogas en cuanto a aminoácidos, no es sorprendente
que el anticuerpo K8 reconozca estas proteínas estructuralmente
relacionadas. Se detectó reactividad cruzada con otras
proteínas
(Figura 4).
(Figura 4).
En segundo lugar, las propiedades de fijación
del anticuerpo K8 se determinaron en un ELISA de scFv soluble. La
producción del fragmento scFv soluble fue provocada por IPTG como
describe Harrison et al., (1996). Para determinar los
niveles de expresión de scFv de K8, se purificaron los fragmentos de
anticuerpo solubles del sobrenadante de 50 \mul de inducciones
que utilizan columnas con proteína A-sefarosa como
describe Harlow y Lane, Antibodies: a Laboratory Manual,
(1988) Cold Spring Harbor. Se determinó a continuación la DO_{280}
y se calculó la concentración de proteínas como describe Sambrook
et al., (1989). Se produjo scFv de K8 en el sobrenadante a
razón de 19 mg/l.
Se realizó a continuación ELISA de scFv soluble
utilizando concentraciones conocidas del fragmento de anticuerpo
K8. Se recubrió una placa de 96 pocillos con 100 \mul de HSA, BSA
y \beta-gal a 10 \mug/ml y 100 \mul de
proteína A a una concentración de 1 \mug/ml. Se aplicaron 50
\mul de diluciones en serie de scFv de K8 y se detectaron los
fragmentos de anticuerpo ligados con proteína L-HRP.
Los resultados del ELISA confirmaron la naturaleza específica doble
del anticuerpo K8 (Figura 5).
Para confirmar que la fijación a
\beta-gal es determinada mediante el dominio
V_{\kappa} y la fijación a HSA/BSA mediante el dominio V_{H}
del anticuerpo scFv de K8, se cortó el dominio V_{\kappa}
procedente del ADN con scFv de K8 mediante digestión con
SalI/NotI y se ligó en un vector pIT2 digerido con
SalI/NotI que contiene la cadena V_{H} ficticia
(Figuras 1 y 2). Las características de fijación del clon K8
V_{\kappa} /V_{H} ficticio resultante se analizaron por ELISA
de scFv soluble. La producción de fragmentos scFv fue inducida por
IPTG tal como describe Harrison et al., (1996) y el
sobrenadante (50 \mu) que contiene los scFv analizados
directamente. Se realizó el ELISA de scFv soluble como se describe
en el Ejemplo 1 y se detectaron los scFv ligados con proteína
L-HRP. Los resultados del ELISA pusieron de
manifiesto que este clon era capaz de unirse todavía a
\beta-gal, mientras que la fijación aBSA se
eliminó (Figura 6).
Este ejemplo describe un método de preparación
de anticuerpos con dominio V_{H} individual dirigido contra los
antígenos A y B y anticuerpos con dominio V_{\kappa} dirigidos
contra los antígenos C y D seleccionando repertorios de dominios
variables con anticuerpo individual virgen para fijarse a estos
antígenos en ausencia de dominios variables complementarios.
Las selecciones y la caracterización de los
clones de fijación se realiza como se describió anteriormente
(véase Ejemplo 5, documento PCT/GB 02/003014). Se seleccionan cuatro
clones para la investigación adicional:
- VH1 - Anti A V_{H}
- VH2 - Anti B V_{H}
- VK1 - Anti C V_{\kappa}
- VK2 - Anti D V_{\kappa}.
Los procedimientos descritos anteriormente en
los Ejemplos 1 a 3 pueden utilizarse, de manera similar a la
descrita, para producir moléculas de dímero que comprenden
combinaciones de dominios V_{H} (es decir ligandos
V_{H}-V_{H}) y combinaciones de dominios V_{L}
(ligandos V_{L}-V_{L}).
Este ejemplo demuestra que los anticuerpos ScFv
específicos dobles (VH1/VH2 dirigidos contra los antígenos A y B y
VK1/VK2 dirigidos contra los antígenos C y D) pudieron crearse
combinando los dominios individuales V_{\kappa} y V_{H}
seleccionados contra los antígenos respectivos en un vector
ScFv.
Para crear el anticuerpo VH1/VH2 específico
doble, el dominio VH1 individual se escinde del vector 1 con dominio
variable (Figura 7) por digestión con NcoI/XhoI y se
liga en el vector 2 con dominio variable digerido con
NcoI/XhoI (Figura 7) para crear VH1/vector 2 con
dominio variable. El dominio individual VH2 se amplía por PCR a
partir del vector 1 con dominio variable utilizando cebadores para
introducir las secuencias de restricción SalI en el extremo
5' y la secuencia de restricción NotI en el extremo 3'. El
producto de PCR se digiere a continuación con
SalI/NotI y se liga en VH1/vector 2 con dominio
variable digerido con SalI/NotI para crear
VH1/VH2/vector 2 con dominio variable.
El vector 2 con dominio variable VK1/VK2 se crea
de manera similar. La natural específica doble del ScFv de VH1/VH2
producido y de ScFv de VK1/VK2 se determina en un ELISA de ScFv
soluble tal como se describió anteriormente (véase el Ejemplo 6,
documento PCT/GB02/003014). Se realiza el ELISA de competición como
se describió anteriormente (véase el Ejemplo 8, documento
PCT/GB02/003014).
Resultados posibles:
- -
- ScFv de VH1/VH2 es capaz de unirse a los antígenos A y B simultáneamente
- -
- ScFv de VK1/VK2 es capaz de unirse a los antígenos C y D simultáneamente
- -
- La fijación de ScFv de VH1/VH2 es competitiva (cuando se fija al antígeno A, ScFv de VH1/VH2 no puede fijarse al antígeno B)
- -
- La fijación de ScFv de VK1/VK2 es competitiva (cuando se fija al antígeno C, ScFv de VK1/VK2 no puede fijarse al antígeno D)
Para crear Fab de VH1/VH2, el dominio individual
VH1 se liga en el vector CH digerido con NcoI/XhoI
(Figura 8) para crear VH1/CH y el dominio individual VH2 se liga en
el vector CK digerido en SalI/NotI (Figura 9) para
crear VH2/CK. El ADN del plásmido procedente de VH1/CH y de VH2/CK
se utiliza para transformar conjuntamente las células competentes de
E. coli descritas anteriormente (véase Ejemplo 8, documento
PCT/GB02/003014).
El clon que contiene los plásmidos VH1/CH y
VH2/CK es introducido a continuación por IPTG para producir Fab de
VH1/VH2 soluble como se describió anteriormente (véase Ejemplo 8,
documento PCT/GB02/003014).
Fab de VK1/VK2 se produce de manera similar.
Las propiedades de fijación de los Fab
producidos se analizan por ELISA de competencia descrito
anteriormente (véase Ejemplo 8, documento PCT/GB 02/003014).
Resultados posibles:
- -
- Fab de VH1/VH2 es capaz de unirse a los antígenos A y B simultáneamente
- -
- Fab de VK1/VK2 es capaz de unirse a los antígenos C y D simultáneamente
- -
- La fijación de Fab de VH1/VH2 es competitiva (cuando se fija al antígeno A, Fab de VH1/VH2 no puede fijarse al antígeno B)
- -
- La fijación de Fab de VK1/VK2 es competitiva (cuando se fija al antígeno C, Fab de VK1/VK2 no puede fijarse al antígeno D)
Los homodímeros VH y VK se crean en formato
dAb-enlazador-dAb utilizando
enlazadores polipeptídicos flexibles. Los vectores se crean en el
formato dAb-enlazador-dAb que
contiene los enlazadores glicina-serina de
diferentes longitudes 3U:(Gly_{4}Ser)_{3},
5U:(Gly_{4}Ser)_{5}, 7U:(Gly_{4},Ser)_{7}. Se
crearon bancos de dímero utilizando de guía dAb corriente arriba
del enlazador: TAR1-5(VK),
TAR1-27(VK),
TAR2-5(VH) o
TAR2-6(VK) y un banco de segundos dAb
correspondientes tras el enlazador. Utilizando este método, se
seleccionaron nuevos dAb diméricos. El efecto de la dimerización
sobre la fijación del antígeno se determinó por ELISA y por estudios
de BIAcore y en la neutralización celular y ensayos de fijación del
receptor. La dimerización tanto de TAR1-5 como de
TAR1-27 produjo una mejora significativa de la
afinidad de fijación y de los niveles de neutralización.
Se diseñaron los vectores pEDA3U, pEDA5U y
pEDA7U para introducir diferentes longitudes de enlazador
compatibles con el formato
dAb-enlazador-dAb. Para pEDA3U, se
hibridaron oligoenlazadores de 73 pares de bases transcritos y
complementarios utilizando un programa de hibridación lenta
(95ºC-5 min., 80ºC-10 min.,
70ºC-15 min., 56ºC-15 min., 42ºC
hasta su utilización) en tampón que contiene NaCl 0,1 M,
Tris-HCl 10 mM pH 7,4 y se clonaron utilizando las
secuencias de restricción XhoI y NotI. Los enlazadores
comprendían 3 unidades (Gly_{4}Ser) y una región de relleno
ubicada entre las secuencias de clonación SalI y NotI
(esquema 1). Para reducir la posibilidad de los dAb monoméricos que
se seleccionan para la presentación del fago, se diseñó la región de
relleno que incluye 3 codones de terminación, una secuencia de
restricción SacI y una mutación de desplazamiento del marco
para colocar la región fuera del marco cuando no estaba presente el
segundo dAb. Para pEDA5U y 7U debido a la longitud de los
enlazadores requeridos, se diseñaron oligoenlazadores de
superposición para cada vector, se hibridaron y se alargaron
utilizando Klenow. Se purificó a continuación el fragmento y se
digirió utilizando las enzimas apropiadas antes de la clonación
utilizando las secuencias de restricción XhoI y
NotI.
\newpage
Esquema
1
\vskip1.000000\baselineskip
El gen V con terminal N correspondiente al dAb
de guía se clonó corriente arriba del enlazador utilizando las
secuencias de restricción NcoI y XhoI. Los genes VH
presentan secuencias existentes compatibles, sin embargo la
clonación de los genes VK requería la introducción de secuencias de
restricción adecuadas. Esto se consiguió utilizando los cebadores de
PCR con modificación (VK-DLIBF: 5'
cggccatggcgtcaacggacat; VKXhoIR: 5' atgtgcgctcgagcgttt
gattt 3') en 30 ciclos de ampliación por PCR utilizando una mezcla 2:1 de SuperTaq (HTBiotechnology Ltd) y pfu turbo (Stratagene). Esto mantuvo las secuencias NcoI en el extremo 5' mientras que se destruía la secuencia SalI adyacente y se introdujo la secuencia XhoI en el extremo 3'. Los 5 dAb de guía se clonaron en cada uno de los 3 vectores del dímero: TAR1-5 (VK), TAR1-27(VK), TAR2-5(VH), TAR2-6(VK) y TAR2-7(VK). Todos los montajes se verificaron por análisis de secuencias.
gattt 3') en 30 ciclos de ampliación por PCR utilizando una mezcla 2:1 de SuperTaq (HTBiotechnology Ltd) y pfu turbo (Stratagene). Esto mantuvo las secuencias NcoI en el extremo 5' mientras que se destruía la secuencia SalI adyacente y se introdujo la secuencia XhoI en el extremo 3'. Los 5 dAb de guía se clonaron en cada uno de los 3 vectores del dímero: TAR1-5 (VK), TAR1-27(VK), TAR2-5(VH), TAR2-6(VK) y TAR2-7(VK). Todos los montajes se verificaron por análisis de secuencias.
Una vez clonados los dAb de guía corriente
arriba del enlazador en cada uno de los vectores (pEDA3U, 5U y 7U):
TAR1-5 (VK), TAR1-27(VK),
TAR2-5(VH) o
TAR2-6(VK) un banco de los segundos dAb
correspondientes se clonó después del enlazador. Para conseguir
esto, los bancos de dAb complementarios se ampliaron por PCR
procedente del fago recuperado de las selecciones de la ronda 1 de
un banco de VK contra TNF\alpha humano (a una densidad aproximada
de 1 \times 10^{6} después de la ronda 1) cuando
TAR1-5 o TAR1-27 son los dAb de
guía, o un banco VH o VK contra el receptor de TNF p55 humano
(ambos a aproximadamente una diversidad de 1 \times 10^{5}
después de la ronda 1) cuando TAR2-5 o
TAR2-6 respectivamente son los dAb de guía. Para los
bancos de VK se realizó la ampliación por PCR utilizando cebadores
en 30 ciclos de ampliación por PCR utilizando una mezcla 2:1 de
SuperTaq y pfu turbo. Los bancos de VH se ampliaron por PCR
utilizando cebadores para introducir una secuencia de restricción
SalI y el extremo 5' del gen. Las PCR del banco de dAb se
digirieron con las enzimas de restricción apropiadas, se ligaron en
los correspondientes vectores corriente abajo de enlazador,
utilizando las enzimas de restricción SalI/NotI y se
electroporaron en células TG1 competentes recién preparadas.
Los títulos conseguidos para cada banco son los
siguientes:
- TAR1-5: pEDA3U = 4\times10^{8}, pEDA5U = 8\times10^{7}, pEDA7U = 1\times10^{8}
- TAR1-27: pEDA3U = 6,2\times10^{8}, pEDA5U = 1\times10^{8}, pEDA7U = 1\times10^{9}
- TAR2h-5: pEDA3U = 4\times10^{7}, pEDA5U = 2\times10^{8}, pEDA7U = 8\times10^{7}
- TAR2h-6: pEDA3U = 7,4\times10^{8}, pEDA5U = 1,2\times10^{8}, pEDA7U = 2,2\times10^{8}.
Se realizaron selecciones utilizando TNF\alpha
recubiertos de forma pasiva en inmunotubos. En resumen, se
revistieron inmunotubos toda la noche con 1 a 4 ml de antígeno
requerido. Los inmunotubos se lavaron a continuación 3 veces con
PBS y se bloquearon con leche en polvo al 2% en PBS durante 1 a 2 h.
y se lavaron 3 veces más con PBS. La solución del fago se diluye en
leche en polvo al 2% en PBS y se incuba a temperatura ambiente
durante 2 h. Los tubos se lavan a continuación con PBS y el fago se
eluye con 1 mg/ml de tripsina-PBS. Se investigaron
tres estrategias de selección para los bancos del dímero
TAR1-5. Las selecciones de la primera ronda se
realizaron en inmunotubos TNF\alpha humano recubierto con 1
\mug/ml o 20 \mug/ml con 20 lavados en Tween al 0,1%
en PBS. Las células TG1 se infectan con el fago eluido y se
determinan los títulos (p. ej., Marks et al. J. Mol.
Biol. 5 dic. 1991; 222(3):581-97,
Richmann et al. Biochemistry, 31 ag. 1993;
32(34):8848-55).
\newpage
Los títulos recuperados fueron:
- pEDA3U = 2,8\times10^{7} (1 \mug/ml TNF) 1,5\times10^{8} (20 \mug/ml TNF),
- pEDA5U = 1,8\times10^{7} (1 \mug/ml TNF), 1,6\times10^{8} (20 \mug/ml TNF)
- pEDA7U = 8\times10^{6} (1 \mug/ml TNF), 7\times10^{7} (20 \mug/ml TNF).
Las selecciones de la segunda ronda se
realizaron utilizando 3 métodos diferentes.
- 1.
- En inmunotubos, 20 lavados con incubación durante la noche seguida de 10 lavados más.
- 2.
- En inmunotubos, 20 lavados seguidos de 1 h de incubación a t.a. en tampón de lavado con (1 \mug/ml de TNF\alpha) y 10 lavados más.
- 3.
- Selección en perlas de estreptavidina utilizando 33 pmoles de TNF\alpha humano biotinilado (Henderikx et al., 2002, Selection of antibodies against biotinylated antigens. Antibody Phage Display: Methods and protocols, ed. O'Brien and Atkin, Humana Press). Los clones individuales de las selecciones de la ronda 2 se seleccionaron en placas de 96 pocillos y se elaboraron preparaciones de sobrenadante en bruto en un formato de placa de 96 pocillos de 2 ml.
\vskip1.000000\baselineskip
Ronda 1 | Ronda 2 | Ronda 2 | Ronda 2 | |
Concentración de recubrimiento del | Selección del | Selección del | Selección del | |
inmunotubo con TNF\alpha humano | método 1 | método 2 | método 3 | |
pEDA3U | 1 \mug/ml | 1 \times 10^{9} | 1,8 \times 10^{9} | 2,4 \times 10^{10} |
pEDA3U | 20 \mug/ml | 6 \times 10^{9} | 1,8 \times 10^{10} | 8,5 \times 10^{10} |
pEDA5U | 1 \mug/ml | 9 \times 10^{8} | 1,4 \times 10^{9} | 2,8 \times 10^{10} |
pEDA5U | 20 \mug/ml | 9,5 \times 10^{9} | 8,5 \times 10^{9} | 2,8 \times 10^{10} |
pEDA7U | 1 \mug/ml | 7,8 \times 10^{8} | 1,6 \times 10^{8} | 4 \times 10^{10} |
pEDA7U | 20 \mug/ml | 1 x 10^{10} | 8 \times 10^{9} | 1,5 \times 10^{10} |
Las selecciones para TAR1-27 se
realizaron como se describió anteriormente con las modificaciones
siguientes: Las selecciones de la primera ronda se realizaron en
inmunotubos utilizando TNF\alpha humano recubierto con 1
\mug/ml o 20 \mug/ml con 20 lavados en Tween al 0,1% en PBS. Las
selecciones de la segunda ronda se realizaron en inmunotubos
utilizando 20 lavados con incubación durante la noche seguida de 20
lavados más. Los clones individuales de las selecciones de la ronda
2 se seleccionaron en placas de 96 pocillos y se elaboraron
preparaciones de sobrenadante en bruto en un formato de placa de 96
pocillos de 2 ml.
Los títulos de TAR1-27 son los
siguientes:
\vskip1.000000\baselineskip
Conc. de recubrimiento inmunotubo con TNF\alpha humano | Ronda 1 | Ronda 2 | |
pEDA3U | 1 \mug/ml | 4 \times 10^{9} | 6 \times 10^{9} |
pEDA3U | 20 \mug/ml | 5 \times 10^{9} | 4,4 \times 10^{10} |
pEDA5U | 1 \mug/ml | 1,5 \times 10^{9} | 1,9 \times 10^{10} |
pEDA5U | 20 \mug/ml | 3,4 \times 10^{9} | 3,5 \times 10^{10} |
pEDA7U | 1 \mug/ml | 2,6 \times 10^{9} | 5 \times 10^{9} |
pEDA7U | 20 \mug/ml | 7 \times 10^{9} | 1,4 \times 10^{10} |
Las selecciones se realizaron como se describió
anteriormente para los bancos TARh-5 solamente. Las
rondas de selecciones se realizaron en inmunotubos utilizando 1
\mug/ml del receptor TNF humano o 10 \mug/ml del receptor TNF
p55 humano con 20 lavados en PBS en incubación durante la noche
seguida de 20 lavados más. Los clones individuales de las
selecciones de la ronda 2 y 3 se seleccionaron en placas de 96
pocillos y se elaboraron preparaciones de sobrenadante en bruto en
un formato de placa de 96 pocillos de 2 ml.
Los títulos de TAR2h-5 son los
siguientes:
Ronda 1 | Ronda 1 | Ronda 2 | Ronda 3 | |
Concentración de recubrimiento del | ||||
inmunotubo con TNF p55 humano | ||||
pEDA3U | 1 \mug/ml | 2,4 \times 10^{6} | 1,2 \times 10^{7} | 1,9 \times 10^{9} |
pEDA3U | 10 \mug/ml | 3,1 \times 10^{7} | 7 \times 10^{7} | 1 \times 10^{9} |
pEDA5U | 1 \mug/ml | 2,5 \times 10^{6} | 1,1 \times 10^{7} | 5,7 \times 10^{8} |
pEDA5U | 10 \mug/ml | 3,7 \times 10^{7} | 2,3 \times 10^{8} | 2,9 \times 10^{9} |
pEDA7U | 1 \mug/ml | 1,3 \times 10^{6} | 1,3 \times 10^{7} | 1,4 \times 10^{9} |
pEDA7U | 10 \mug/ml | 1,6 x 10^{7} | 1,9 \times 10^{7} | 3 \times 10^{10} |
\vskip1.000000\baselineskip
Se seleccionaron clones individuales de las
selecciones de la ronda 2 ó 3 de cada uno de los bancos 3U, 5U y 7U
de los diferentes métodos de selecciones, cuando procedía. Se
cultivaron los clones en 2\timesTY con 100 \mug/ml de
ampicilina y glucosa al 1% a 37ºC. Se inoculó una dilución al 1/100
de este cultivo en 2 ml de 2\timesTY con 100 \mug/ml de
ampicilina y glucosa al 0,1% en formato de placa de 96 pocillos de 2
ml y se cultivó a 37ºC agitando hasta que la DO600 fue
aproximadamente 0,9. Se produjo a continuación el cultivo con IPTG
1 mM toda la noche a 30ºC. Se clarificaron los sobrenadantes por
centrifugación a 4.000 rpm durante 15 min. en una centrifugadora de
placa sorval. Las preparaciones del sobrenadante se utilizaron para
el cribado inicial.
La actividad de fijación de las proteínas
recombinantes diméricas se comparó a la del monómero por ELISA de
la proteína A/L o por ELISA del antígeno. En resumen, se recubre una
placa de 96 pocillos con antígeno o proteína A/L durante la noche a
4ºC. Se lava la placa con Tween al 0,05%-PBS, se bloquea durante 2 h
con Tween al 2%-PBS. Se añade la muestra a la placa incubada
durante 1 h. a temperatura ambiente. Se lava la placa y se incuba
con el reactivo secundario durante 1 h a temperatura ambiente. Se
lava la placa y se revela con sustrato TMB. Se utilizó proteína
A/L-HRP o India-HRP como reactivo
secundario. Para los ELISA del antígeno, las concentraciones de
antígeno utilizadas fueron 1 \mug/ml en PBS para TNF\alpha
humano y el receptor 1 del THF humano. Debido a la presencia del
dAb de guía en la mayoría de los casos, los dímeros proporcionaron
una señal positiva de ELISA, por consiguiente la determinación del
índice off se examinó por BIAcore.
El análisis BIAcore se realizó para los clones
TAR1-5 y TAR2h-5. Para el cribado,
se acopló TNF\alpha humano a un chip de CM5 a alta densidad
(aproximadamente 10.000 UR). Se acoplaron 50 \mul de TNF\alpha
humano (50 \mug/ml) al chip a 5 \mul/min. en tampón de acetato,
pH 5,5. La regeneración del chip después del análisis utilizando
métodos normalizados no es posible debido a la inestabilidad del
TNF\alpha humano, por lo tanto después de analizar cada muestra,
se lavó el chip durante 10 min. con tampón.
Para TAR1-5, los sobrenadantes
de los clones de la selección de la ronda 2 se identificaron por
BIAcore.
Se cribaron 48 clones de cada uno de los bancos
3U, 5U y 7U adquiridos, utilizando los métodos de selección
siguientes:
- R1:
- 1 \mug/ml de inmunotubo de TNF\alpha humano, R2 1 \mug/ml de inmunotubo de TNF\alpha humano, lavado durante la noche.
- R1:
- 20 \mug/ml de inmunotubo de TNF\alpha humano, R2 20 \mug/ml de inmunotubo de TNF\alpha humano, lavado durante la noche.
- R1:
- 1 \mug/ml de inmunotubo de TNF\alpha humano, R2 33 pmoles de TNF\alpha humano en perlas biotinilado.
- R1:
- 20 \mug/ml de inmunotubo de TNF\alpha humano, R2 33 pmoles de TNF\alpha humano en perlas biotinilado.
Para el cribado, se acopló el receptor de TNF de
p55 humano a un chip de CM5 a alta densidad (aproximadamente 4.000
UR). Se acoplaron 100 \mul del receptor TNF de p55 humano al chip
en 5 \mul/ml en tampón de acetato, pH 5,5. Se examinaron las
condiciones de regeneración habituales (glicina a pH 2 o pH 3) pero
en cada caso se eliminó el antígeno de la superficie del chip, por
consiguiente como con TNF\alpha, por lo tanto después de analizar
cada muestra, se lavó el chip durante 10 min. con tampón.
Para TAR2-5, se identificaron
los sobrenadantes de los clones de la selección de la ronda 2.
Se cribaron 48 clones de cada uno de los bancos
3U, 5U y 7U, utilizando los métodos de selección siguientes:
- R1:
- 1 \mug/ml de inmunotubo del receptor de TNF\alpha p55 humano, R2 1 \mug/ml del receptor de inmunotubo TNF\alpha p55 humano, lavado durante la noche.
- R1:
- 10 \mug/ml de inmunotubo del receptor de TNF\alpha p55 humano, R2 10 \mug/ml de inmunotubo del receptor de TNF\alpha p55 humano, lavado durante la noche.
La capacidad de los dímeros para neutralizar en
el análisis del receptor se realizó de la forma siguiente:
Se determinó la capacidad de los dAb
anti-TNF para inhibir la fijación de TNF al receptor
1 del TNF recombinante (p55). En resumen, se incubaron toda la
noche placas Maxisorp con 30 mg/ml de anticuerpo monoclonal de ratón
Fc antihumano (Zymed, San Francisco, USA). Se lavaron los pocillos
con solución salina tamponada con fosfato (PBS) que contenía
Tween-20 al 0,05% y a continuación se bloquearon con
BSA al 1% en PBS antes de ser incubados con 100 ng/ml de proteína
de fusión Fc con receptor 1 de TNF (R&D Systems, Minneapolis,
USA). La fijación del TNF se detectó con 0,2 mg/ml de anticuerpo
anti-TNF biotinilado (HyCult biotechnology, Uben,
Holanda) seguido de una dilución 1 en 500 de estreptavidina marcada
con peroxidasa de rábano picante (Amersham Biosciences, UK) y a
continuación la incubación con sustrato TMB (KPL, Gaithersburg,
USA). La reacción se interrumpió mediante la adición de HCl y se
leyó la absorbancia a 450 nm. La actividad de dAb
anti-TNF condujo a una disminución en la
fijación
de TNF y por lo tanto a una disminución de la absorbancia en comparación con el TNF de referencia solamente.
de TNF y por lo tanto a una disminución de la absorbancia en comparación con el TNF de referencia solamente.
Se determinó también la capacidad de los dAb
anti-TNF para neutralizar la actividad citotóxica de
TNF en fibroblastos L929 de ratón (Evans, T. (2000) Molecular
Biotechnology 15, 243-248). En resumen, se
incubaron toda la noche células L929 en placas de microvaloración
con dAb anti-TNF, 100 pg/ml de TNF y 1 mg/ml de
actinomicina D (Sigma, Poole, UK). Se midió la viabilidad celular
leyendo la absorbancia a 490 nm después de una incubación con
[3-(4,5-dimetiltiazol-2-il)-5-(3-carboximetoxifenil)-2-(4-sulfofenil)-2H-tetrazolio
(Promega, Madison, USA). La actividad de dAb
anti-TNF condujo a una disminución de la
citotoxicidad de TNF y por consiguiente a un aumento de la
absorbancia en comparación con la referencia TNF solamente.
En el cribado inicial, se utilizaron los
sobrenadantes preparados para el análisis BIAcore, descritos
anteriormente, también en el análisis del receptor. Se realizaron
más análisis de dímeros seleccionados en el análisis del receptor y
de células utilizando proteínas purificadas.
Se determinó la capacidad de los dAb
anti-TNF o anti-TNF R1 para
neutralizar la producción de secreción de IL-8 por
TNF en células HeLa (método adaptado del de Akeson, L. et al.
(1996) Journal of Biological Chemistry 271,
30517-30523, que describe la producción de
IL-8 por IL-1 en HUVEC; aquí los
investigadores estudian la producción por TNF alfa humano y los
investigadores utilizan células HeLa en lugar de la línea celular
HUVEC). En resumen, se incubaron toda la noche células colocadas en
placas de microvaloración con dAb y 300 pg/ml de TNF. Tras la
incubación se aspiró el sobrenadante de las células y se midió la
concentración de IL-8 mediante un ELISA en sandwich
(R&D Systems). La actividad de dAb anti-TNFR1
condujo a una disminución de IL-8 en el sobrenadante
en comparación con la referencia TNF solamente.
El análisis de L929 se utiliza en todos los
experimentos siguientes; sin embargo, se prefiere la utilización del
análisis de HeLa IL-8 para medir los ligandos del
receptor 1 anti-TNF (p55); la presencia de p55 de
ratón en el análisis de L929 posee determinadas limitaciones en su
utilización.
Se secuenciaron los dímeros que demostraron
poseer propiedades interesantes en el BIAcore y los cribados del
análisis del receptor. Las secuencias de detallan en el listado de
secuencias.
Los dímeros TAR1-5 que se
demostró que presentaban buenas propiedades de neutralización se
volvieron a formatear y se analizaron en los análisis de células y
de receptores. El dAb de guía de TAR1-5 se sustituyó
por el clon TAR1-5-19. Para
conseguir esto se clonó TAR1-5 del par del dímero
individual y se sustituyó con
TAR1-5-19 que había sido ampliado
por PCR. Además, se construyeron también los homodímeros de
TAR1-5-19 en los vectores 3U, 5U y
7U. La copia con terminal N del gen se amplió por PCR y se clonó
como se describió anteriormente y el fragmento del gen con terminal
C se clonó utilizando las secuencias de restricción SalI y
NotI.
El codón de terminación ámbar presente en dAb2,
uno de los dAb con terminal C en los pares del dímero
TAR1-5 se mutó a una glutamina por mutagénesis
dirigida al punto.
Los dímeros que contenían TAR1-5
o TAR1-5-19 se volvieron a formatear
en vectores de expresión Fab. Los dAb se clonaron en vectores de
expresión que contenían los genes CK o CH utilizando las secuencias
de restricción SfiI y NotI y se comprobaron por
análisis de la secuencia. El vector CK procede del vector resistente
a la ampicilina a base de pUC y el vector CH procede de un vector
pACYC resistente al cloranfenicol. Para la expresión de Fab los
montajes dAb-CH y dAb-CK se
transformaron conjuntamente en células HB2151 y se cultivaron en
2\timesTY que contenía glucosa al 0,1%, 100 \mug/ml de
ampicilina y 10 \mug/ml de cloranfenicol.
Se examinó la dimerización de los dAb mediante
la formación del enlace con cistina. Una secuencia corta de
aminoácidos EPKSGDKTHTCPPCP, forma modificada de la bisagra IgGC1
humana se modificó genéticamente en la región del terminal C del
dAb. Un oligo enlazador que codifica esta secuencia se sintetizó y
se hibridó, como se describió anteriormente. El enlazador se clonó
en el vector pEDA que contenía
TAR1-5-19 utilizando las secuencias
de restricción XhoI y NotI. La dimerización tiene
lugar in situ en el periplasma.
Se prepararon sobrenadantes en el formato de
placa de 96 pocillos de 2 ml para el cribado inicial como se
describió anteriormente. Después del proceso de cribado inicial los
dímeros seleccionados se continuaron analizando. Los montajes de
dímero se expresaron en células TOP10F' o HB2151 como sobrenadantes.
En resumen, una colonia individual de una placa recién estriada se
cultivó toda la noche a 37ºC en 2\timesTY con 100 \mug/ml de
ampicilina y glucosa al 1%. Se inoculó una dilución al 1/100 de
este cultivo en 2\timesTY con 100 \mug/ml de ampicilina y
glucosa al 0,1% y se cultivó a 37ºC agitando hasta que la DO600 fue
aproximadamente 0,9. Se produjo a continuación el cultivo con IPTG 1
mM toda la noche a 30ºC. Se eliminaron las células por
centrifugación y se purificó el sobrenadante con proteína A o
agarosa L.
Fab y los dímeros bisagra de cisteína se
expresaron como proteínas periplásmicas en células HB2152. Una
dilución al 1/100 de un cultivo de toda la noche se inoculó en
2\timesTY con glucosa al 0,1% y los antibióticos apropiados y se
cultivó a 30ºC agitando hasta que la DO600 fue aproximadamente 0,9.
Se produjo a continuación el cultivo con IPTG 1 mM durante 3 a 4
horas a 25ºC. Se recogieron las células por centrifugación y se
volvió a poner en suspensión el sedimento en tampón de preparación
periplásmico (Tris-HCl 30 mM, pH 8,0, EDTA 1 mM,
sacarosa al 20%). Después de la centrifugación se conservó el
sobrenadante y se volvió a poner en suspensión el sedimento en
MgSO_{4} 5 mM. Se recogió de nuevo el sobrenadante por
centrifugación, se agrupó y se purificó.
Se examinó la optimización de la purificación de
proteínas dímeras a partir de la agarosa con proteína L (Affitech,
Noruega) o proteína A agarosa (Sigma, UK). Se eluyó la proteína por
lotes o por elución en columna utilizando una bomba peristáltica.
Se examinaron tres tampones tampón de
fosfato-citrato 0,1 M, pH 2,6, glicina 0,2 M pH 2,5
y glicina 0,1 M pH 2,5. Se determinó la condición óptima que eran
condiciones con bomba peristáltica utilizando más de 10 volúmenes
de columna de glicina 0,1 M pH 2,5. Se realizó la purificación de la
proteína A en las condiciones con bomba peristáltica utilizando
glicina 0,1 M pH 2,5.
La purificación adicional se realizó mediante
análisis FPLC en el Explorer 100 system de AKTA (Amersham
Biosciences Ltd.). Los dímeros TAR1-5 y
TAR1-5-19 se fraccionaron por
cromatografía de intercambio catiónico (1 ml de Resource S -
Amersham Biosciences Ltd.) eluido con gradiente de NaCl 0 a 1 M en
tampón de acetato 50 mM, pH 4. Se purificaron los dímeros bisagra
por intercambio iónico (1 ml de Resource K - Amersham Biosciences
Ltd.) eluido con un gradiente de NaCl 0 a 1 M en
Tris-HCl 25 mM, pH 8,0. Se purificaron los Fab por
cromatografía por exclusión de tamaño utilizando una columna
Superose 12 (Amersham Biosciences Ltd.) a un caudal de 0,5 ml/min.
en PBS con Tween al 0,05%. Tras la purificación se concentraron las
muestras utilizando concentradores del corte 5K de vivaspina
(Vivascience Ltd.).
Se seleccionaron 6 \times 96 clones de la
selección de la ronda 2 que comprende todos los bancos y las
condiciones de selección. Se elaboraron preparaciones del
sobrenadante y se analizaron mediante ELISA, con antígeno y
proteína L, BIAcore y en los análisis del receptor. En los ELISA, se
identificaron clones con fijación positiva en cada método de
selección y se distribuyeron entre los bancos 3U, 5U y 7U. Sin
embargo, como el dAb de guía está siempre presente no fue posible
discriminar entre los aglutinantes de alta y baja afinidad por este
método por lo tanto se realizó el análisis BIAcore.
Se realizó el análisis BIAcore utilizando 2 ml
de sobrenadantes. El análisis BIAcore puso de manifiesto que los
índices K_{off} del dímero estaban ampliamente mejorados en
comparación con los de TAR1-5 monomérico. El índice
K_{off} del monómero estaba comprendido en el intervalo de
10^{-1} M en comparación con los índices K_{off} del dímero que
estaban comprendidos en el intervalo entre 10^{-3} y 10^{-4} M.
Se seleccionaron 16 clones que parecía que presentaban índices
K_{off} muy bajos, todos procedían de los bancos 3U, 5U y 7U y se
secuenciaron. Además se analizó la capacidad de los sobrenadantes
para neutralizar TNF\alpha humano en el análisis del
receptor.
6 clones principales (d1-d6 a
continuación) que se neutralizaron en estos análisis y se habían
secuenciado. Los resultados demuestran que fuera de los 6 clones
obtenidos existen solamente 3 segundos dAb diferentes (dAb1, dAb2 y
dAb3) sin embargo cuando se encuentra el segundo dAb más de una vez
están ligados con enlazadores de diferentes longitudes.
TAR1-5d1: enlazador 3U 2º
dAb=dAb1 - 1 \mug/ml de inmunotubo Ag lavado toda la noche
TAR1-5d2: enlazador 3U 2º
dAb=dAb2 - 1 \mug/ml de inmunotubo Ag lavado toda la noche
TAR1-5d3: enlazador 5U 2º
dAb=dAb2 - 1 \mug/ml de inmunotubo Ag lavado toda la noche
TAR1-5d4: enlazador 5U 2º
dAb=dAb3 - 20 \mug/ml de inmunotubo Ag lavado toda la noche
TAR1-5d5: enlazador 5U 2º
dAb=dAb1 - 20 \mug/ml de inmunotubo Ag lavado toda la noche
TAR1-5d6: enlazador 7U 2º
dAb=dAb1 - R1: 1 \mug/ml de inmunotubo Ag lavado toda la noche,
R2: perlas
Se continuaron examinando los 6 clones
principales. La proteína se produjo del periplasma y el
sobrenadante, se purificó con proteína L agarosa y se examinó en
los análisis de células y receptores. Los niveles de neutralización
fueron variables (Tabla 1). Se determinaron las condiciones óptimas
para la preparación de proteínas. La proteína producida a partir de
células HB2151 como sobrenadantes proporcionó el rendimiento mayor
(aproximadamente 10 mg/l de cultivo). Los sobrenadantes se
incubaron con proteína L agarosa durante 2 h a temperatura ambiente
o toda la noche a 4ºC. Se lavaron las perlas con PBS/NaCl y se
rellenaron en una columna FPLC utilizando una bomba peristáltica.
Se lavaron las perlas con 10 volúmenes de columna de PBS/NaCl y se
eluyeron con glicina 0,1 M pH 2,5. En general, la proteína dimérica
se eluye después del monómero.
Los dímeros
TAR1-5d1-6 fueron purificados por
FPLC. Se obtuvieron tres especies, por purificación por FPLC y
fueron identificados por SDS PAGE. Una especie corresponde al
monómero y las otras dos especies corresponden a los dímeros de
dimensiones diferentes. La mayor de las dos especies es posiblemente
debida a la presencia de etiquetas con terminal C. Estas proteínas
se examinaron en el análisis del receptor. Los datos presentados en
la Tabla 1 representan los resultados óptimos obtenidos a partir de
dos especies diméricas (Figura 11).
Los tres segundos dAb de los pares del dímero
(es decir, dAb1, dAb2 y dAb3) se clonaron como monómeros y se
examinaron por ELISA y en el análisis de células y receptores. Los
tres dAb se unen específicamente a TNF mediante el ELISA del
antígeno y no interreaccionan con plástico o BSA. Como los
monómeros, ninguno de los dAb se neutraliza en los análisis de
células o receptores.
TAR1-5-19 se
sustituyó por TAR1-5 en los 6 clones principales. El
análisis de todos los dímeros
TAR1-5-19 en el análisis de células
y receptores se realizó utilizando la proteína completa (proteína L
purificada solamente) a menos que se indique de otra manera (Tabla
2). TAR1-5-19d4 y
TAR1-5-19d3 presentan la mejor
ND_{50} (\sim5 nM) en el análisis de células, lo que es
coherente con los resultados del análisis del receptor y es una
mejora sobre el monómero TAR1-5-19
(ND_{50}\sim30 nM). Aunque los dímeros TAR1-5
purificados proporcionaron resultados variables en los análisis del
receptor y de la célula, los dímeros
TAR1-5-19 fueron más coherentes. La
variabilidad se demostró al utilizar diferentes tampones de elución
durante la purificación de la proteína. La elución que utiliza
tampón fosfato-citrato 0,1 M pH 2,6 o glicina 0,2 M
pH 2,5 si bien eliminando toda la proteína de la proteína L agarosa
en la mayoría de los casos le hizo menos operativo.
TAR1-5-19d4 se
expresó en el fermentador y se purificó por FPLC de intercambio
catiónico para dar un dímero completamente puro. Como con
TAR1-5d4 se obtuvieron tres especies, mediante
purificación por FPLC que corresponden al monómero y dos especies
de dímero. Este dímero era aminoácido secuenciado. El monómero
TAR1-5-19 y
TAR1-5-19b4 se examinaron a
continuación en el análisis del receptor y el IC50 resultante para
el monómero fue 30 nM y para el dímero fue 8 nM. Los resultados del
ensayo del receptor en comparación con el monómero
TAR1-5-19,
TAR1-5-19d4 y
TAR1-5d4 se presentan en la figura 10.
Se prepararon homodímeros de
TAR1-5-19 en los vectores 3U, 5U y
7U, se expresaron y se purificaron en la proteína L. Se examinaron
las proteínas en los análisis de células y receptores y se
determinaron los IC_{50} resultantes (para el análisis del
receptor) y de ND_{50} (para el análisis de células) (tabla 3,
figura 12).
Se clonaron asimismo los dímeros
TAR1-5 y TAR1-5-19
en formato Fab, se expresaron y se purificaron en proteína L
agarosa. Se evaluaron los Fab en los análisis del receptor (Tabla
4). Los resultados demostraron que para ambos dímeros
TAR1-5-19 y TAR1-5
los niveles de neutralización fueron similares a los de los dímeros
del enlazador Gly_{4}Ser original de los que proceden. Un Fab de
TAR1-5-19 en el que se desplegó
TAR1-5-19 se expresó en ambos CH y
CK, la proteína L se purificó y se evaluó en el análisis del
receptor. La IC50 resultante fue aproximadamente de 1 nM.
Se seleccionaron 3 \times 96 clones de la
selección de la ronda 2 que comprende todos los bancos y las
condiciones de selección. Se realizaron preparaciones de 2 ml de
sobrenadante para el análisis en ELISA y bioanálisis. El ELISA del
antígeno proporcionó 71 clones positivos. El análisis del receptor
de sobrenadantes en bruto proporcionó 42 clones con propiedades
inhibidoras (fijación de TNF 0 al 60%). En la mayoría de los casos
las propiedades inhibidoras se correlacionaron con la señal potente
del ELISA. Se secuenciaron 42 clones, 39 de éstos presentan
secuencias únicas del dAb segundo. Los 12 dímeros que proporcionaron
las mejores propiedades inhibidoras se continuaron
analizando.
analizando.
Los 12 clones neutralizantes se expresaron como
200 ml de preparaciones del sobrenadante y se purificaron en la
proteína L. Éstos fueron evaluados mediante la proteína L y el ELISA
con antígeno, BIAcore y en el análisis del receptor. Se obtuvieron
en todos los casos señales positivas potentes de ELISA. El análisis
BIAcore puso de manifiesto que todos los clones presentan índices
rápidos on y off. Los índices off mejoraron en comparación con el
TAR1-27 monomérico, sin embargo los índices off de
los dímeros TAR1-27 fueron más rápidos (K_{off}
está comprendido aproximadamente en el intervalo de 10^{-1} y
10^{-2} M) que los dímeros TAR1-5 examinados
anteriormente (K_{off} está comprendido aproximadamente en el
intervalo de 10^{-3} y 10^{-4} M). La estabilidad de los
dímeros purificados se cuestionó y por consiguiente para mejorar la
estabilidad, se incluyó la adición en glicerol al 5%, Triton X100
al 0,5% o NP40 al 0,5% (Sigma) en la purificación de los 2 dímeros
TAR1-27 (d2 y d16). La adición de NP40 o Triton
X100^{TM} mejoró el rendimiento del producto purificado
aproximadamente 2 veces. Ambos dímeros se evaluaron en el análisis
del receptor. TAR1-27d2 dio un IC_{50} de
\sim30 nM en todas las condiciones de purificación.
TAR1-27d16 no presentó ningún efecto de
neutralización cuando se purificó sin la utilización de agentes
estabilizantes pero dio un IC_{50}
de \sim50 nM cuando se purificó en las condiciones de estabilización. No se realizó ningún análisis más.
de \sim50 nM cuando se purificó en las condiciones de estabilización. No se realizó ningún análisis más.
Se seleccionaron 3 \times 96 clones de las
selecciones de la segunda ronda que comprenden todos los bancos y
las condiciones de selección. Se elaboran preparaciones de 2 ml
de sobrenadante para análisis. Se realizaron los ELISA de la
proteína A y del antígeno para cada placa. Se identificaron 30
clones interesantes que presentaban buenos índices de K_{orr} por
BIAcore (intervalos de K_{off} entre 10^{-2} y 10^{-3} M). Se
secuenciaron los clones y se identificaron 13 dímeros únicos por
análisis de secuencias.
Dímero | Tipo de célula | Purificación | Fracción proteica | Condiciones de | Análisis de |
elución | receptor/célula | ||||
TAR1-5d1 | HB2151 | Proteína L + FPLC | Especies diméricas | Glicina 0,1 M pH 2,5 | RA\sim30 nM |
pequeñas | |||||
TAR1-5d2 | HB2151 | Proteína L + FPLC | Especies diméricas | Glicina 0,1 M pH 2,5 | RA\sim50 nM |
pequeñas | |||||
TAR1-5d3 | HB2151 | Proteína L + FPLC | Especies diméricas | Glicina 0,1 M pH 2,5 | RA\sim300 nM |
grandes | |||||
TAR1-5d4 | HB2151 | Proteína L + FPLC | Especies diméricas | Glicina 0,1 M pH 2,5 | RA\sim3 nM |
grandes | |||||
TAR1-5d5 | HB2151 | Proteína L + FPLC | Especies diméricas | Glicina 0,1 M pH 2,5 | RA\sim200 nM |
grandes | |||||
TAR1-5d6 | HB2151 | Proteína L + FPLC | Especies diméricas | Glicina 0,1 M pH 2,5 | RA\sim100 nM |
grandes | |||||
\begin{minipage}[t]{160mm} *obsérvese que el dímero 2 y el dímero 3 presentan el mismo dAb segundo (denominado dAb2), sin embargo presentan diferentes longitudes de enlazador (d2 = (Gly_{4}Ser)_{3}, d3 = (Gly_{4}Ser)_{3}). dAb1 es el dAb asociado a los dímeros 1, 5 y 6. dAb3 es el dAb asociado al dímero 4. Ninguno de los dAb asociados se neutraliza solo. La purificación por FPLC es por intercambio catiónico a menos que se indique de otro modo. Las especies diméricas óptimas para cada dímero obtenidas por FPLC se determinaron en estos análisis.\end{minipage} |
\vskip1.000000\baselineskip
Dímero | Tipo de célula | Purificación | Fracción proteica | Condiciones | Análisis de |
de elución | receptor/célula | ||||
TAR1-5-19d1 | TOP10F' | Proteína L | Proteína total | Glicina 0,1 M | RA\sim15 nM |
pH 2,0 | |||||
TAR1-5-19d2 | TOP10F' | Proteína L | Proteína total | Glicina 0,1 M pH | RA\sim2 nM |
(sin codón de | 2,0 + NP40 | ||||
terminación) | al 0,05% | ||||
TAR1-5-19d3 | TOP10F' | Proteína L | Proteína total | Glicina 0,1 M pH | RA\sim8 nM |
(sin codón de | 2,5 + NP40 | ||||
terminación) | al 0,05% | ||||
TAR1-5-19d4 | TOP10F' | Proteína L + | Fracción purificada | Glicina 0,1 M | RA\sim2-5 nM |
FPLC | por FPLC | pH 2,0 | CA\sim12 nM | ||
TAR1-5-19d5 | TOP10F' | Proteína L | Proteína total | Glicina 0,1 M pH | RA\sim8 nM |
2,0 + NP40 | CA\sim10 nM | ||||
TAR1-5-19d6 | TOP10F' | Proteína L | Proteína total | Glicina 0,1 M | RA\sim10 nM |
pH 2,0 |
Dímero | Tipo de | Purificación | Fracción proteica | Condiciones | Análisis de |
célula | de elución | receptor/célula | |||
TAR1-5-19 | HB2151 | Proteína L | Proteína total | Glicina 0,1 M | RA\sim20 nM |
homodímero 3U | pH 2,5 | CA\sim30 nM | |||
TAR1-5-19 | HB2151 | Proteína L | Proteína total | Glicina 0,1 M | RA\sim2 nM |
homodímero 5U | pH 2,5 | CA\sim3 nM | |||
TAR1-5-19 | HB2151 | Proteína L | Proteína total | Glicina 0,1 M | RA\sim10 nM |
homodímero 7U | pH 2,5 | CA\sim15 nM | |||
TAR1-5-19 | HB2151 | Proteína L + FPLC | Fracción de dímero | Glicina 0,1 M | RA\sim2 nM |
bisagra cys | purificada por FPLC | pH 2,5 | |||
TAR1-5-19CH/ | HB2151 | Proteína | Proteína total | Glicina 0,1 M | RA\sim1 nM |
TAR1-5-19 CK | pH 2,5 |
\vskip1.000000\baselineskip
Dímero | Tipo de | Purificación | Fracción proteica | Condiciones de | Análisis de |
célula | elución | receptor/célula | |||
TAR1-5-CH/dAb1 CK | HB2151 | Proteína L | Proteína total | Citrato 0,1 M pH 2,6 | RA\sim90 nM |
TAR1-5-CH/dAb2 CK | HB2151 | Proteína L | Proteína total | Glicina 0,1 M pH 2,5 | RA\sim30 nM |
CA\sim60 nM | |||||
DAb3CH/TAR1-5CK | HB2151 | Proteína L | Proteína total | Citrato 0,1 M pH 2,5 | RA\sim30 nM |
CA\sim60 nM | |||||
TAR1-5-19CH/dAb1 CK | HB2151 | Proteína L | Proteína total | Glicina 0,1 M pH 2,0 | RA\sim100 nM |
dab1CH/TAR 1-5-19CK | HB2151 | Proteína L | Glicina 0,1 M, | Myc/flag | RA\sim30 nM |
pH 2,0 | |||||
TAR1-5-19CH/dab2 CK | HB2151 | Proteína | Proteína total | Glicina 0,1 M pH 2,0 | RA\sim8 nM |
CA\sim12 nM | |||||
TAR1-5-19CH/dab3 CK | HB2151 | Proteína L | Proteína total | Glicina 0,1 M pH 2,0 | RA\sim3 nM |
Para la dimerización de dAb, se ha modificado
genéticamente una cisteína libre en el terminal C de la proteína.
Cuando se expresa la proteína forma un dímero que puede purificarse
por un método de purificación en dos etapas.
Véase el ejemplo 8 que describe el trímero de
dAb. El protocolo del trímero da lugar a una mezcla de monómero,
dímero y trímero.
El dímero se purificó a partir del sobrenadante
del cultivo por captura en proteína L agarosa como se esboza en el
ejemplo 8.
Antes de la separación por intercambio
catiónico, la muestra de monómero/dímero mezclada era tampón
intercambiado en tampón de acetato sódico 50 mM pH 4,0 utilizando
una columna PD-10 (Amersham Pharmacia), siguiendo
las instrucciones del fabricante. La muestra se aplicó a
continuación a una columna de intercambio catiónico Resource S de 1
ml (Amersham Pharmacia), que había sido equilibrada previamente con
acetato sódico 50 mM pH 4,0. Se separaron el monómero y el dímero
utilizando el siguiente gradiente salino en acetato sódico 50 mM, pH
4,0:
- Cloruro sódico 150 a 200 mM sobre 15 volúmenes de columna
- Cloruro sódico 250 a 450 mM sobre 10 volúmenes de columna
- Cloruro sódico 450 a 1000 mM sobre 15 volúmenes de columna.
Se identificaron las fracciones que contienen
solamente dímero utilizando SDS-PAGE y a
continuación se agruparon y el pH se aumentó hasta 8 mediante la
adición de 1/5 volumen de Tris 1 M, pH 8,0.
Se determinó la afinidad del dímero para
TNF\alpha humano utilizando el receptor TNF y el análisis de
células. El IC50 en el análisis del receptor fue aproximadamente de
0,3 a 0,8 nM; el ND50 en el análisis de células fue aproximadamente
de 3 a 8 nM.
Nektar (Shearwater) ofrece una gama de PEG con
bi-maleimida [mPEG2-(MAL)_{2} o
mPEG-(MAL)_{2}] que permitiría al monómero ser formateado
como dímero, con un enlazador pequeño que separa los dAb y estando
ambos ligados a un PEG de tamaño comprendido entre 5 y 40 kDa. Se ha
demostrado que el mPEG-(MAL)_{2} de 5 kDa (es decir,
[TAR1-5-19]-Cys-maleimida-PEG
\times 2, en el que las maleimidas están ligadas en el dímero)
presenta una afinidad en el análisis del receptor de TNF de \sim1
a 3 nM. Asimismo puede también producirse el dímero utilizando TMEA
(Tris[2-maleimidoetil]amina) (Pierce
Biotechnology) u otros enlazadores bifuncionales.
También es posible producir el dímero del
disulfuro utilizando un procedimiento de acoplamiento químico que
utiliza 2,2'-ditiodipiridina (Sigma Aldrich) y el
monómero reducido.
Un enlazador pequeño,
(Gly_{4}Ser)_{n} donde n=1 a 10, p. ej., 1, 2, 3, 4, 5, 6
ó 7, una inmunoglobulina (por ejemplo, la región bisagra de IgG o
la secuencia peptídica al azar (p. ej., seleccionada de entre un
banco de secuencias peptídicas al azar) puede modificarse
genéticamente entre el dAb y el resto de cisteína terminal. Esto
puede utilizarse a continuación para preparar dímeros como se esbozó
anteriormente.
Para la trimerización de dAb, se requiere una
cisteína libre en el terminal C de la proteína. El resto de
cisteína, una vez reducido para dar el tiol libre, puede utilizarse
a continuación para acoplar específicamente la proteína a una
molécula de maleimida trimérica, por ejemplo TMEA
(Tris[2-maleimidoetil]amina).
Se utilizaron los oligonucleótidos siguientes
para TAR1-5-19 por PCR
específicamente con unas secuencias SalI y BamHI para clonación y
también para introducir un resto de cisteína con terminal C:
(*comienzo de la secuencia
TAR1-5-19CYS)
Cebador transcrito
- 5'-TGGAGCGCGTCGACGGACATCCAGATGACCCAGTCTCCA-3'
Cebador complementario
- 5'-TTAGCAGCCGGATCCTTATTAGCACCGTTTGATTTCCAC-3'.
La reacción PCR (50 \mul de volumen) se
planteó de la forma siguiente: dNTP 200 \muM, cada cebador 0,4
\muM, 5 \mul de 10\times tampón PfuTurbo (Stratagene),
100 ng de plásmido plantilla (que codifica a
TAR1-5-19), 1 \mul de enzima
PfuTurbo (Stratagene) y se ajustó el volumen a 50 \mul
utilizando agua esterilizada. Se utilizaron las siguientes
condiciones de PCR: etapa de desnaturalización inicial a 94ºC
durante 2 min., a continuación 25 ciclos de 94ºC durante 30 s., 64ºC
durante 30 s. y 72ºC durante 30 s. Una etapa de ampliación final se
incluyó también de 72ºC durante 5 min. El producto de la PCR se
purificó y se digirió con SalI y BamHI y se ligó en el
vector que también se había cortado con las mismas enzimas de
restricción. Se verificaron los clones correctos por secuenciado de
ADN.
El vector
TAR1-5-19CYS se transformó en
células químicamente competitivas BL21 (DE3) pLysS (Novagen)
siguiendo el protocolo del fabricante. Se seleccionaron las células
que llevan el plásmido dAb para utilizar 100 \mug/ml de
carbenicilina y 37 \mug/ml de cloranfenicol. Los cultivos se
colocaron en matraces con tabiques de 2 l que contenían 500 ml de
caldo de cultivo fabuloso (Sigma-Aldrich), 100
\mug/ml de carbenicilina y 37 \mug/ml de cloranfenicol. Los
cultivos se cultivaron a 30ºC a 200 rpm hasta una D.O.600 de 1 a 1,5
y a continuación se indujeron con IPTG 1 mM
(isopropil-beta-D-tiogalactopiranosido,
de Melford Laboratories). Se dejó continuar la expresión del dAb
durante 12 a 16 h. a 30ºC. Se observó que la mayoría de los dAb
estaba presente en el medio de cultivo. Por consiguiente, se
separaron las células del medio por centrifugación (8.000\timesg
durante 30 min.) y se utilizó el sobrenadante para purificar el dAb.
Se añadieron 30 ml de proteína L agarosa (Affitech) por litro de
sobrenadante y se dejó que el dAb aglutinase el lote en agitación
durante 2 horas. Se dejó sedimentar la resina a continuación por
gravedad durante una hora más antes de sifonar el sobrenadante. La
agarosa se empaquetó a continuación en una columna XK 50 (Amersham
Pharmacia) y se lavó con 10 volúmenes de columna de PBS. El dAb
ligado se eluyó con glicina 100 mM pH 2,0 y las fracciones que
contienen la proteína se neutralizaron a continuación mediante la
adición de 1,5 volúmenes de Tris 1 M pH 8,0. Se aislaron
20 mg de proteína pura por litro de sobrenadante del cultivo, que contenía una relación 50:50 de monómero a dímero.
20 mg de proteína pura por litro de sobrenadante del cultivo, que contenía una relación 50:50 de monómero a dímero.
Se redujeron 2,5 ml de
TAR1-5-19CYS 100 \muM con
ditiotreitol 5 mM y se dejaron a temperatura ambiente durante 20
minutos. La muestra se intercambió a continuación con tampón
utilizando una columna PD-10 (Amersham Pharmacia).
La columna se había equilibrado previamente con EDTA 5 mM, fosfato
sódico 50 mM, pH 6,5 y la muestra se aplicó y se eluyó siguiendo
las orientaciones de los fabricantes. Se colocó la muestra en hielo
hasta que se necesitó. TMEA
(Tris[2-maleimidoetil]amina) se
adquirió en Pierce Biotechnology. Se preparó una solución madre 20
mM de TMEA en DMSO (sulfóxido de dimetilo) al 100%. Se observó que
una concentración de TMEA mayor del 3:1 (relación molar de
dAb:TMEA) producía la precipitación rápida y la reticulación de la
proteína. Asimismo la velocidad de la precipitación y reticulación
era mayor a medida que aumentaba el pH. Por consiguiente utilizando
TAR1-5-19CYS 100 \muM reducida,
se añadió TMEA 25 \muM para trimerizar la proteína y se dejó que
prosiguiera la reacción a temperatura ambiente durante dos horas.
Se observó que la adición de aditivos tales como glicerol o
etilenglicol hasta el 20% (v/v), reducía de manera significativa la
precipitación del trímero a medida que proseguía la reacción de
acoplamiento. Tras el acoplamiento, el análisis por
SDS-PAGE demostró la presencia de monómero, dímero y
trímero en solución.
Se añadió 40 \mul de ácido acético glacial al
40% por ml de la reacción
TMEA-TAR1-5-19cys
para reducir el pH hasta \sim4. La muestra se aplicó a
continuación a una columna de intercambio catiónico Resource S de 1
ml (Amersham Pharmacia), que había sido equilibrada previamente con
acetato sódico 50 mM pH 4,0. El dímero y el trímero se separaron
parcialmente utilizando un gradiente salino de cloruro sódico 340 a
450 mM, acetato sódico 50 mM pH 4,0 sobre 30 volúmenes de columna.
Las fracciones que contenían el trímero solamente se identificaron
utilizando SDS-PAGE y a continuación se agruparon y
se aumentó el pH a 8 mediante la adición de 1/5 volúmenes de Tris 1
M pH 8,0. Para evitar la precipitación del trímero durante las
etapas de concentración (utilizando concentradores de Vivaspina de
del corte5K; Vivascience), se añadió glicerol al 10% a la
muestra.
Se determinó la afinidad del trímero para
TNF\alpha humano utilizando el receptor de TNF y el análisis de
células. El IC50 en el análisis del receptor fue 0,3 nM; ND50 en el
análisis de células estaba comprendido en el intervalo entre 3 y 10
nM (p. ej. 3 nM).
TAR1-5-19CYS
puede formatearse también en un trímero utilizando los reactivos
siguientes:
Nektar (Shearwater) ofrece una gama de PEG
multibrazo, que puede modificarse químicamente en el extremo
terminal del PEG. Por consiguiente utilizando un trímero de PEG con
un grupo funcional maleimida en el extremo de cada brazo permitiría
la trimerización del dAb de manera similar a la esbozada
anteriormente utilizando TMEA. El PEG puede también adolecer del
inconveniente de aumentar la solubilidad del trímero impidiendo de
este modo el problema de acumulación. Por lo tanto, se pudo
producir un trímero de dAb en el que cada dAb tiene una cisteína
terminal C que está ligada a un grupo funcional de maleimida,
estando ligados los grupos funcionales de maleimida a un trímero de
PEG.
Un enlazador pequeño,
(Gly_{4}Ser)_{n} donde n=1 a 10, p. ej., 1, 2, 3, 4, 5, 6
ó 7, una inmunoglobulina (por ejemplo, la región bisagra de IgG o
la secuencia peptídica al azar (p. ej., seleccionada de entre un
banco de secuencias peptídicas al azar) puede modificarse
genéticamente entre el dAb y el resto de cisteína terminal. Cuando
se utiliza para preparar polímeros (p. ej., dímeros o trímeros),
esto introduciría otra vez un grado mayor de flexibilidad y
distancia entre los monómeros individuales, que pueden mejorar las
características de fijación a la diana, p. ej. una multisubunidad
diana tal como el TNF\alpha humano.
Este ejemplo explica un método para preparar un
anticuerpo con dominio individual (dAb) dirigido contra la albúmina
de suero. Se describe la selección de los dAb tanto contra la
albúmina de suero de ratón (MSA) como contra la albúmina de suero
humano (HSA). En este experimento se utilizaron tres bancos de
anticuerpos para la presentación de fago humano, basado cada uno en
un solo armazón humano para V_{H} (véase la Figura 13: secuencia
del V_{H} ficticio basada en V3-23/DP47 y JH4b) o
V_{\kappa} (véase la Figura 15: secuencia de V_{\kappa}
ficticia basada en o12/o2/DPK9 y Jk1) con diversidad con cadena
lateral codificada por los codones NNK incorporados a las regiones
de determinación de complementariedad (CDR1, CDR2 y CDR3).
Banco 1 (V_{H}):
- Diversidad en las posiciones: H30, H31, H33, H35, H50, H52, H52a, H53, H55, H56, H58, H95, H97 y H98.
- Tamaño del banco: 6,2 \times 10^{9}
Banco 2 (V_{H}):
- Diversidad en las posiciones: H30, H31, H33, H35, H50, H52, H52a, H53, H55, H56, H58, H95, H97, H98, H99, H100, H100a y H100b.
- Tamaño del banco: 4,3 \times 10^{9}
Banco 3 (V_{\kappa}):
- Diversidad en las posiciones: L30, L31, L32, L34, L50, L53, L91, L92, L93, L94 Y L96.
- Tamaño del banco: 2 \times 10^{9}.
Los bancos de V_{H} y V_{\kappa} se han
preseleccionado para fijarse a LA proteína A y proteína L
respectivamente de ligandos genéricos de modo que la mayoría de los
clones en los bancos no seleccionados son operativos. Las
dimensiones de los bancos presentados anteriormente corresponden a
las dimensiones después de la preselección.
Se realizaron dos rondas de selección en
albúmina de suero que utiliza cada uno de los bancos por separado.
Para cada selección, se recubrió el antígeno en inmunotubo (nunc) en
4 ml de PBS a una concentración de 100 \mug/ml. En la primera
ronda de selección, cada uno de los tres bancos se apelmazó por
separado contra HSA (Sigma) y MSA (Sigma). En la segunda ronda de
selección, el fago de cada una de las seis selecciones de la primera
ronda se apelmazó contra (i) el mismo antígeno otra vez (p. ej. MSA
de la 1ª ronda, HSA de la 2ª ronda) e (ii) contra el antígeno
recíproco (p. ej. MSA de la 1ª ronda, HSA de la 2ª ronda)
produciendo un total de doce selecciones de la 2ª ronda. En este
caso, después de la segunda ronda de selección se analizó la
fijación a HSA y MSA en 48 clones. Se produjeron fragmentos solubles
de dAb como describió para los fragmentos scFv Harrison et
al., Methods Enzymol. 1996;267:83-109 y
se siguió el protocolo ELISA estándar (Hoogenboom et al.
(1991) Nucleic Acids Res., 19: 4133) excepto que se utilizó
PBS en Tween al 2% como tampón de bloqueo y los dAb unidos se
detectaron con proteína L-HRP (Sigma) (para los
V_{\kappa}) y proteína A-HRP (Amersham Pharmacia
Biotech) (para los V_{H}).
Los dAb que proporcionan una señal por encima
del fondo que indica que se unen a MSA, HSA o a ambos se analizaron
en la forma insoluble de ELISA para la fijación a plástico solo pero
también eran específicos para la albúmina del suero. Se
secuenciaron a continuación los clones (véase la tabla a
continuación) poniendo de manifiesto que se habían identificado 21
secuencias únicas de dAb. La similitud mínima (en cuanto a
aminoácidos) entre los clones dAb de V_{\kappa} seleccionados
fue del 86,25% ((69/80)\times100; resultado cuando todos
los restos diversificados son diferentes, p. ej. los clones 24 y
34). La similitud mínima entre los clones de dAb de los V_{H}
seleccionados fue del 94% ((127/136)\times100).
A continuación se determinó la capacidad de la
albúmina de suero para unirse a los dAb para capturar el antígeno
biotinilado procedente de la solución. Se siguió el protocolo ELISA
(como anteriormente) excepto que la placa de ELISA se recubrió con
1 \mug/ml de proteína L (para los clones de V_{\kappa}) y 1
\mug/ml de proteína A (para los clones de V_{H}). Se capturó el
dAb soluble de la solución como en el protocolo y la detección se
hizo con MSA o HSA biotinilados y estreptavidina HRP. El MSA y el
HSA biotinilados se han preparado según las instrucciones del
fabricante, con objeto de conseguir un promedio de 2 biotinas por
molécula de albúmina de suero. Se identificaron veinticuatro clones
que capturaron MSA biotinilado de la solución en el ELISA. Dos de
éstos (los clones 2 y 38 a continuación) capturaron también HSA
biotinilado. A continuación, se determinó la capacidad de los dAb
para unirse a MSA recubierto en un chip biacore CM5. Se observó que
ocho clones se unen a MSA en el biacore.
En todos los casos los armazones eran idénticos
a los armazones en la secuencia ficticia correspondiente, con
diversidad en las CDR como se indica en la tabla anterior.
De los ocho clones que se unen a MSA en el
biacore, dos clones que están muy expresados en E. coli
(clones MSA16 y MSA26) se seleccionaron para el estudio ulterior
(véase el ejemplo 10). En la figura 16 se proporcionan todas las
secuencias de nucleótidos y aminoácidos para MSA16 y 26.
Los MSA16 y MSA26 de los dAb se expresaron en el
periplasma de E. coli y se purificaron utilizando la
absorción en lotes en la resina con afinidad a la proteína
L-agarosa (Affitech, Noruega) seguido de elución con
glicina a pH 2,2. Los dAb purificados se analizaron a continuación
por biacore de inhibición para determinar K_{d}. En resumen se
analizaron MSA16 y MSA26 purificados para determinar la
concentración del dAb requerido para conseguir 200 UR de
respuesta en un chip CM5 de biacore recubierto con una densidad
elevada de MSA. Una vez determinadas las concentraciones requeridas
de dAb, se premezcló el antígeno MSA, en un intervalo de
concentraciones en torno a la K_{d} esperada, con el dAb y se
incubó durante la noche. Se midió a continuación la fijación al chip
de biacore recubierto con MSA de dAb en cada una de las premezclas a
un caudal elevado de 30 \mul/minuto. Se utilizaron las curvas
resultantes para crear diagramas de Klotz, que proporcionaron una
K_{d} estimada de 200 nM para MSA16 y de 70 nM para MSA26
(Figura 17 A & B).
A continuación, se clonaron los clones MSA16 y
MSA26 en un vector de expresión con la etiqueta HA (secuencia de
ácidos nucleicos: TATCCTTATGATGTTCCTGATTATGCA y la secuencia de
aminoácidos: YPYDVPDYA) y cantidades de 2 a 10 mg se expresaron en
E. coli y se purificaron en el sobrenadante con resina de
afinidad a la proteína L-agarosa (Affitech,
Noruega) y se eluyeron con glicina a pH 2,2. Se determinó la vida
media en el suero de los dAb en ratones. Se dosificaron MSA26 y
MSA16 en inyecciones i.v. individuales a aproximadamente 1,5 mg/kg
en ratones CD1. El análisis de las concentraciones en el suero fue
por captura de anti-HA de cabra (Abcam, UK) y
detección por ELISA de la proteína L-HRP
(Invitrogen) que se bloqueó con Marvel al 4%. El lavado se hizo con
PBS en Tween al 0,05%. Se crearon curvas patrón de concentraciones
conocidas de dAb en presencia de 1\timessuero de ratón para
asegurar la comparación con las muestras de ensayo. El modelado con
un modelo de 2 compartimentos demostró que MSA-26
presentaba una t1/2\alpha de 0,16 h., una t1/2\beta de 14,5 h. y
un área bajo la curva (AUC) de 465 h.mg/ml (datos no representados)
y MSA-16 presentó una t1/2\alpha de 0,98 h., una
t1/2\beta de 36,5 h. y un AUC de 913 h.mg/ml (figura 18). Ambos
clones anti-MSA habían prolongado considerablemente
la vida media en comparación con HEL4 (dAb de la lisozima de la
clara de huevo anti-gallina) que presentó una
t1/2\alpha de 0,06 h. y una t1/2\beta de 0,34 h.
Este ejemplo describe un método para preparar
fragmentos similares a Fab específicos dobles de
V_{H}-V_{H} y de
V_{\kappa}-V_{\kappa}. Antes de construir cada
uno de los fragmentos similares a Fab descritos, los dAb que se
unen a las dianas de selección se seleccionaron en primer lugar de
bancos de dAb similares a los descritos en el ejemplo 9. Se aisló
un dAb de V_{H}, HEL4, que se une a la lisozima del huevo de
gallina (Sigma) y se aisló también un segundo dAb de V_{H}
(TAR2h-5) que se fija al receptor de TNF\alpha
(sistemas R y D). Las secuencias de éstos se proporcionan en el
listado de secuencias. El dAb de V_{\kappa} que se une a
TNF\alpha (TAR1-5-19) se aisló por
selección y maduración de afinidad y la secuencia se indica también
en el listado de secuencias. Un segundo dAb de V_{\kappa} (MSA
26) descrito en el ejemplo 9 cuya secuencia está en la figura 17B
se utilizó también en estos experimentos.
El ADN procedente de los vectores de expresión
que contienen los cuatro dAb descritos anteriormente se digirió con
las enzimas SalI y NotI para escindir el ADN que codifica el dAb. Se
purificó una banda del tamaño esperado (300 a 400 bp) realizando la
digestión en un gel de agarosa y escindiendo la banda, seguido de
purificación en gel que utiliza el kit de purificación en gel de
Qiagen (Qiagen, UK). La codificación del ADN para los dAb se
insertó a continuación en los vectores C_{H} o C_{\kappa}
(Figuras 8 y 9) como se indica en la tabla a continuación.
\vskip1.000000\baselineskip
dAb | Antígeno diana | V_{H} de dAb o | Insertado en | Etiqueta | Resistencia al |
V_{\kappa} de dAb | el vector | (terminal C) | antibiótico | ||
HEL4 | Lisozima de huevo de gallina | V_{H} | C_{H} | myc | Cloranfenicol |
TAR2-5 | Receptor de TNF | V_{H} | C_{K} | flag | Ampicilina |
TAR1-5-19 | TNF \alpha | V_{\kappa} | C_{H} | myc | Cloranfenicol |
MSA 26 | Albúmina de suero de ratón | V_{\kappa} | C_{K} | flag | Ampicilina |
Se transformaron conjuntamente los montajes
V_{H} C_{H} y V_{H} C_{\kappa} _{} en células HB2151.
Independientemente, los montajes V_{\kappa} C_{H} y
V_{\kappa} C_{\kappa} se transformaron conjuntamente en
células HB2151. Los cultivos de cada una de las líneas celulares
cotransfectadas se cultivaron toda la noche (en 2xTy que contenían
glucosa al 5%, 10 \mug/ml de cloranfenicol y 100 \mug/ml de
ampicilina para mantener la selección del antibiótico para ambos
plásmidos C_{H} y C_{\kappa}). Los cultivos de toda la noche se
utilizaron para inocular medio reciente (2xTy, 10 \mug/ml de
cloranfenicol y 100 \mug/ml de ampicilina) y se cultivaron hasta
una D.O. de 0,7 a 0,9 antes de la inducción por adición de IPTG para
expresar sus montajes C_{H} y C_{\kappa}. El fragmento expresado
similar a Fab se purificó a continuación en el periplasma mediante
purificación de la proteína A (para los V_{H} C_{H} y V_{H}
C_{\kappa} cotransformados) y purificación mediante la resina
de afinidad para MSA (para los V_{\kappa} C_{H} y V_{\kappa}
C_{\kappa} cotransformados).
Se determinó la expresión del V_{H} C_{H} y
del V_{H} C_{\kappa} específicos dobles introduciendo la
proteína en un gel. El gel se transfirió y se pudo detectar una
banda del tamaño esperado para el fragmento Fab en la transferencia
Western mediante la etiqueta myc y la etiqueta flag, indicando que
ambas partes V_{H} C_{H} y V_{H} C_{\kappa} del fragmento
similar a Fab estaban presentes. A continuación, para determinar si
las dos mitades del específico doble estaban presentes en el mismo
fragmento similar a Fab, se recubrió una placa de ELISA durante la
noche a 4ºC con 100 \mul por pocillo de lisozima de huevo de
gallina (HEL) a razón de 3 mg/ml en tampón de bicarbonato sódico. Se
bloqueó a continuación la placa (como se describe en el ejemplo 1)
con PBS en Tween al 2% seguido de incubación con el fragmento
similar a Fab V_{H} C_{H}/V_{H} C_{\kappa} específico
doble. La detección del enlace del específico doble al HEL fue
mediante la cadena no afín que utiliza 9e10 (anticuerpo monoclonal
que se une a la etiqueta myc, Roche) e IgG-HRP
antirratón (Amersham Pharmacia Biotech). La señal para el fragmento
similar a Fab de V_{H} C_{H}/V_{H} C_{\kappa} específico
doble fue 0,154 comparada con una señal de fondo de 0,069 para la
cadena V_{H} C_{\kappa} expresada sola. Esto demuestra que el
fragmento similar a Fab presenta especificidad de enlace para el
antígeno diana.
Después de purificar el fragmento similar a Fab
de V_{\kappa} C_{H} y V_{\kappa} C_{\kappa} específico
doble cotransformado en una resina de afinidad a MSA, se utilizó la
proteína resultante para sondar una placa de ELISA recubierta con 1
\mug/ml de TNF\alpha y una placa de ELISA recubierta con 10
\mug/ml de MSA. Como estaba previsto, era la señal por encima del
fondo cuando se detectaba con proteína L-HRP en
placas de ELISA (datos no representados). Esto indicaba que la
fracción de proteína capaz de unirse a MSA (y por consiguiente
purificadas en la columna de afinidad a MSA) era también capaz de
unirse a TNF\alpha en un ELISA posterior, confirmando la
especificidad doble del fragmento de anticuerpo. Esta fracción de
proteína se utilizó a continuación para dos experimentos
posteriores. En primer lugar, una placa de ELISA recubierta con 1
\mug/ml de TNF\alpha se sondó con un fragmento similar a Fab de
V_{\kappa} C_{H} y V_{\kappa} C_{\kappa} específico
doble y también con un TNF\alpha de referencia que se une a dAb a
una concentración calculada para proporcionar una señal similar en
el ELISA. Se utilizaron tanto el específico doble como el dAb de
referencia para sondar la placa ELISA en presencia y en ausencia de
2 mg/ml de MSA. La señal en el pocillo específico doble se redujo
en más del 50% pero la señal en el pocillo de dAb no se redujo
completamente (véase la figura 19a). La misma proteína se colocó
también en el análisis del receptor con y sin MSA y la competición
por MSA se demostró también (véase la figura 19c). Esto demuestra
que la fijación de MSA al específico doble es competitiva con la
fijación al TNF\alpha.
Este ejemplo describe un método para preparar un
fragmento específico de anticuerpo específico doble para albúmina
de suero de ratón y TNF\alpha por acoplamiento químico mediante un
enlace disulfuro. Tanto MSA16 (del ejemplo 1) como los dAb de
TAR1-5-19 se volvieron a clonar en
un vector pET basado en un vector con una cisteína con terminal C y
sin etiquetas. Los dos dAb se expresaron a concentraciones de 4 a 10
mg y se purificaron en el sobrenadante utilizando resina de
afinidad a la proteína L-agarosa (Affitech,
Noruega). Los dAb marcados con cisteína se redujeron a continuación
con ditiotreitol. dAb de TAR1-5-19
se acopló a continuación con ditiodipiridina para la reforma del
bloque de enlace disulfuro que producen la formación homodímeros PEP
1-5-19. Los dos dAb diferentes se
mezclaron a continuación a pH 6,5 para favorecer la formación del
enlace disulfuro y la generación de los heterodímeros
TAR1-5-19, enlazados en cis por
MSA16. Este método para la producción de conjugados de dos proteínas
diferentes fue descrito originalmente por King et al. (King
TP, Li Y., Kochoumian L. Biochemistry. 1978 vol.
17:1499-506. Preparation of protein conjugates via
intermolecular disulfide bond formation). Se separaron los
heterodímeros de las especies monoméricas por intercambio catiónico.
La separación se confirmó por la presencia de una banda del tamaño
esperado en un gel de SDS. Se probaron las especies heterodiméricas
resultantes en el análisis del receptor de TNF y se observó que
presentaban un IC50 para neutralizar el TNF de aproximadamente 18
nM. A continuación, se repitió el análisis del receptor con una
concentración constante de heterodímero (18 nM) y una dilución en
serie de MSA y HSA. La presencia de HSA en un intervalo de
concentraciones (hasta 2 mg/ml) no produjo una reducción de la
capacidad del dímero para inhibir TNF\alpha. Sin embargo, la
adición de MSA produjo una reducción dependiente de la dosis en la
capacidad del dímero para inhibir TNF\alpha (figura 20). Esto
demuestra que MSA y TNF\alpha compiten para unirse al
TAR1-5-19 unido en cys, dímero
MSA16.
En el Anexo 4 se indica un resumen de datos
obtenido en los experimentos indicados en los ejemplos
anteriores.
Todas las publicaciones mencionadas en la
presente memoria y las referencias citadas en dichas publicaciones,
se incorporan a la presente memoria como referencia. Varias
modificaciones y variaciones de los métodos y del sistema descritos
de la invención serán evidentes para los expertos en la materia sin
apartarse del alcance ni del espíritu de la invención. Aunque la
invención se ha descrito en relación con las formas de realización
específicas preferidas, debe entenderse que la invención tal como se
reivindica no debería estar limitada indudablemente a dichas formas
de realización específicas. De hecho, varias modificaciones de los
modos de poner en práctica la invención descritos que son obvios
para los expertos en biología molecular o en los campos
relacionados se pretende que estén dentro del alcance de las
reivindicaciones siguientes.
\newpage
Anexo
1
Polipéptidos que prolongan la
vida media in
vivo
\vskip1.000000\baselineskip
- Glucoproteína alfa-1 (orosomucoide) (AAG)
- Antiquiromotripsina alfa-1 (ACT)
- Antitripsina alfa-1 (AAT)
- Microglobulina alfa-1 (proteína HC) (AIM)
- Macroglobulina alfa-2 (A2M)
- Antitrombina III (AT III)
- Apoliproteína A-1 (Apo A-1)
- Apoliproteína B (Apo B)
- Beta-2-Microglobulina (B2M)
- Ceruloplasmina (Cp)
- Componente complementario (C3)
- Componente complementario (C4)
- Inhibidor de C1 esterasa (C1 INH)
- Proteína C-reactiva (CRP)
- Cistacina C (Cys C)
- Ferritina (FER)
- Fibrinógeno (FIB)
- Fibronectina (FN)
- Haptoglobina (Hp)
- Hemopexina (HPX)
- Inmunoglobulina A (IgA)
- Inmunoglobulina D (IgD)
- Inmunoglobulina E (IgE)
- Inmunoglobulina G (IgG)
- Inmunoglobulina M (IgM)
- Cadenas ligeras de inmunoglobulina (kappa/lambda)
- Lipoproteína(a) [Lp(a)]
- Proteína de unión a la manosa (MBP)
- Mioglobina (Myo)
- Plasminógeno (PSM)
- Prealbúmina (transtirretina) (PAL)
\newpage
Anexo 1
(continuación)
\vskip1.000000\baselineskip
- Proteína que se une al retinol (RBP)
- Factor reumatoide (RF)
- Amiloide A del suero (SAA)
- Receptor soluble de transferrina (sTfR)
- Transferrina (Tf)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Anexo
2
Anexo
3
Combinaciones
oncológicas
\newpage
\dotable{\tabskip\tabcolsep#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{ \cr}
\newpage
\dotable{\tabskip\tabcolsep#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{ \cr}
\newpage
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\newpage
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\newpage
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\newpage
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\newpage
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\newpage
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\newpage
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\newpage
\dotable{\tabskip\tabcolsep#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{ \cr}
\newpage
\dotable{\tabskip\tabcolsep#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{ \cr}
<110> Domantis Limited
\hskip1cmWinter, Greg
\hskip1cmTomlinson, Ian
\hskip1cmIgnatovich, Olga
\hskip1cmHolt, Lucy
\hskip1cmDe Angelis, Elena
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Ligando
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130> P014435WO ATM
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<140> PCT/GB 03/02804
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
2003-06-30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> PCT/GB2002/003014
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
2002-06-28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> GB 0230202.4
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
2002-12-27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 240
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn versión 3.1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 360
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> HEL4
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<221> CDS
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<222> (1)..(360)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
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<210> 2
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<211> 120
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> HEL4
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
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<210> 3
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<211> 348
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> TAR2-5
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<220>
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<221> CDS
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<222> (1)..(348)
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<223>
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
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\vskip1.000000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TAR2-5
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223>
TAR1-5-19
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
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<222> (1)..(324)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 108
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
TAR1-5-19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 362
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TAR2-10
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 360
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TAR2-10
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(360)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 120
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TAR2-10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip0.800000\baselineskip
-
41
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
TAR1-5-19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(324)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 108
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
TAR1-5-19
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
TAR1-5-19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TAR1-5
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(324)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 108
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TAR1-5
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TAR1-5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero - dAb1: Pareja de dAB en
TAR1-5d1 (3U linker), d5 (5U ligador), d6 (7U
ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(324)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 108
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero - dAb1: Pareja de dAB en
TAR1-5d1 (3U ligador), d5 (5U ligador), d6 (7U
ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero - dAb1: Pareja de dAB en
TAR1-5d1 (3U ligador), d5 (5U ligador), d6 (7U
ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero - dAb2: Pareja de dAB en
TAR1-5d2 (3U ligador), d3 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero - dAb2: Pareja de dAB en
TAR1-5d2 (3U ligador), d3 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu
Ser Ala Ser Val Gly}
\sac{Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser
Gln Ser Ile Tyr Asp Ala}
\sac{Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 74
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero - dAb2: Pareja de dAB en
TAR1-5d2 (3U ligador), d3 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero - dAb2: Pareja de dAB en
TAR1-5d2 (3U ligador), d3 (5U ligador)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero - dAb3: Pareja de dAB en
TAR1-5d4 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
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<222> (1)..(324)
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<223>
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 108
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero - dAb3: Pareja de dAB en
TAR1-5d4 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
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<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero - dAb3: Pareja de dAB en
TAR1-5d4 (5U ligador)
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
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<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> TAR1-27
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
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<222> (1)..(324)
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<223>
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\vskip0.400000\baselineskip
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<211> 108
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> TAR1-27
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<212> ADN
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TAR1-27
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<210> 29
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<211> 324
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d1 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
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<222> (1)..(324)
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<223>
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d1 (3U ligador)
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
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\sa{Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu
Ser Ala Ser Val Gly}
\sac{Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser
Gln Ser Ile}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 78
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d1 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 32
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<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d1 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d2 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(324)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d2 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu
Ser Ala Ser Val Gly}
\sac{Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser
Gln Ser Ile Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 77
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d2 (3U ligador)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d2 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 36
\vskip1.000000\baselineskip
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<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d7 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(324)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d7 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 38
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 58
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d7 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d7 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 40
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d8 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
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<222> (1)..(324)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d8 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 42
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu
Ser Ala Ser Val Gly}
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Gln Ser Ile}
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 78
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d8 (3U ligador)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d8 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 44
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<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d12 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(324)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\newpage
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<400> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d12 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 46
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu
Ser Ala Ser Val Gly}
\sac{Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser
Gln Ser Ile}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 78
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d12 (3U ligador)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d12 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 48
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 49
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d16 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(324)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
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<210> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 108
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d16 (3U ligador)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 51
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d16 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 51
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 52
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d23 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(324)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 52
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 53
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d23 (5U ligador)
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 53
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu
Ser Ala Ser Val Gly}
\sac{Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser
Gln Ser Ile Lys His}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 54
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 76
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d23 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 54
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 55
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d23 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 55
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 56
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d30 (7U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
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<222> (1)..(324)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\newpage
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<400> 56
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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<211> 31
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d30 (7U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 57
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu
Ser Ala Ser Val Gly}
\sac{Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser
Gln Ser Val Lys Ala}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 58
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 76
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d30 (7U ligador)
\newpage
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d30 (7U ligador)
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 59
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<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d31 (7U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
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<222> (1)..(324)
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<223>
\newpage
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d31 (7U ligador)
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
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<211> 58
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d31 (7U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
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<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d31 (7U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 63
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 64
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<211> 324
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d36 (7U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(324)
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<223>
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 64
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 65
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 49
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d36 (7U ligador)
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\vskip0.400000\baselineskip
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d36 (7U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 66
\vskip0.400000\baselineskip
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<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d36 (7U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 67
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<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d37 (7U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(324)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\newpage
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\vskip1.000000\baselineskip
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d37 (7U ligador)
\newpage
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<400> 69
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\vskip1.000000\baselineskip
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d37 (7U ligador)
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 70
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\vskip1.000000\baselineskip
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<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d39 (7U ligador)
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
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<222> (1)..(324)
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<223>
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\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 72
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<211> 108
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d39 (7U ligador)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 72
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 73
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<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR1-27d39 (7U ligador)
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 73
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TAR2h-5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
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<222> (1)..(345)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
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\vskip1.000000\baselineskip
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TAR2h-5
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> TAR2h-5
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<211> 357
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d1 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(357)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 119
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d1 (3U ligador)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 78
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 79
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 357
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d1 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 79
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 80
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 345
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d2 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(345)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 80
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 81
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 56
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d2 (3U ligador)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 81
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 82
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 58
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d2 (3U ligador)
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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TAR2h-5d3 (3U ligador)
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<220>
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<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d3 (3U ligador)
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Phe Thr Phe}
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TAR2h-5d3 (3U ligador)
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<220>
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<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d3 (3U ligador)
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TAR2h-5d4 (3U ligador)
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Val Gln Pro Gly Gly}
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Phe Thr Phe Arg Lys Tyr}
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<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d4 (3U ligador)
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<220>
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<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d5 (3U ligador)
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d5 (3U ligador)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
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<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d6 (3U ligador)
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<220>
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d6 (3U ligador)
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<400> 96
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Val Gln Pro Gly Gly}
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Phe Thr Phe}
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d6 (3U ligador)
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d6 (3U ligador)
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<212> ADN
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\vskip0.400000\baselineskip
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TAR2h-5d7 (3U ligador)
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\vskip0.400000\baselineskip
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<220>
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d7 (3U ligador)
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<400> 101
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d8 (3U ligador)
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
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<222> (1)..(357)
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<220>
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<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d8 (3U ligador)
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\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d8 (3U ligador)
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\vskip0.400000\baselineskip
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<212> ADN
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TAR2h-5d9 (3U ligador)
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\sa{Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu
Val Gln Pro Gly Gly}
\sac{Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly
Phe Thr Phe Lys Lys Tyr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d9 (3U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d9 (3U ligador)
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\vskip0.400000\baselineskip
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TAR2h-5d10 (5U ligador)
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\vskip0.400000\baselineskip
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<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d10 (5U ligador)
\newpage
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d10 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 111
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 112
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 357
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d11 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(357)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 112
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d11 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 113
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu
Val Gln Pro Gly Gly}
\sac{Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly
Phe Thr Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 114
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 89
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d11 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 114
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 115
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 357
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d11 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 115
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 116
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 357
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d12 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(357)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 116
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 117
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 119
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d12 (5U ligador)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 117
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 118
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 357
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d12 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 118
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 119
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 357
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d13 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(357)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 119
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 120
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d13 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 120
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu
Val Gln Pro Gly Gly}
\sac{Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly
Phe Thr Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 121
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 89
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d13 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 121
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 122
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 357
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Monómero de pareja de dAB en
TAR2h-5d13 (5U ligador)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 122
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 123
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 720
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Anticuerpo específico dual
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(720)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 123
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 124
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 240
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Anticuerpo específico dual
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 124
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 125
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 332
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vectores 1 y 2 de dominio
variables
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (69)..(332)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 125
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 126
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 77
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vectores 1 y 2 de dominio
variables
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 126
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 127
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vectores 1 y 2 de dominio
variables
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 127
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Thr Val Glu Ser Cys Leu Ala Lys Pro
His}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 128
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Inserción en el dominio V
únicamente del vector 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(27)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 128
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 129
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Inserción en el dominio V
únicamente del vector 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 129
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His His His His His His Gly Ala Ala}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 130
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 116
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de VH K8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 130
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 131
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 116
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de VH VH2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 131
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 132
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 55
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de VH VH4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 132
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 133
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 60
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de VH VH4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 133
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 134
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 116
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de VH VHC11
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 134
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 135
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 56
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de VH VHA10sd
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 135
\vskip0.800000\baselineskip
-
201
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 136
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 59
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de VH VHA10sd
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 136
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 137
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 116
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de VH VHA1sd
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 137
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 138
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 55
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de VH VHa5sd
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 138
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 139
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 60
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de VH VHA5sd
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 139
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 140
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 116
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de VH VHC5sd
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 140
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 141
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 116
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de VH VHC11sd
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 141
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 142
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 108
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de Vkappa K8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 142
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 143
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 108
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de Vkappa E5sd
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 143
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 144
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 49
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de Vkappa C3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 144
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 145
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 58
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cadena de Vkappa C3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 145
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\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 146
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<211> 348
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia ficticia de VH para la
biblioteca 1
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<220>
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<221> CDS
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<222> (1)..(348)
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<223>
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<400> 146
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<211> 116
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia ficticia de VH para la
biblioteca 1
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<400> 147
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<210> 148
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<211> 348
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Secuencia ficticia de VH para la
biblioteca 1
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<400> 148
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<210> 149
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Secuencia ficticia de VH para la
biblioteca 2
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<220>
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<221> CDS
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<221> misc_feature
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<222> (307)..(308)
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<221> misc_feature
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<222> (313)..(314)
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<220>
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<221> misc_feature
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<222> (316)..(317)
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<223> n = a ó t ó c ó g
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<212> PRT
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<220>
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<221> misc_feature
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<222> (103)..(103)
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<223> "Xaa" en la situación 103 se
codifica mediante nnk, que codifica todos los aminoácidos así como
el codón TAG
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (104)..(104)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> "Xaa" en la situación 104 se
codifica mediante nnk, que codifica todos los aminoácidos así como
el codón TAG
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (105)..(105)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> "Xaa" en la situación 105 se
codifica mediante nnk, que codifica todos los aminoácidos así como
el codón TAG
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
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<222> (106)..(106)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> "Xaa" en la situación 106 se
codifica mediante nnk, que codifica todos los aminoácidos así como
el codón TAG
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia ficticia de VH para la
biblioteca 2
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 150
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 151
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 360
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia ficticia de VH para la
biblioteca 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
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<222> (44)..(45)
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<223> n = a ó t ó c ó g
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<220>
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<221> misc_feature
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<222> (47)..(48)
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<223> n = a ó t ó c ó g
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<220>
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<221> misc_feature
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<222> (50)..(51)
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<223> n = a ó t ó c ó g
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
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<222> (53)..(54)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n = a ó t ó c ó g
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 151
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 152
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia ficticia de Vkappa para
la biblioteca 3
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
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<223>
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 152
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia ficticia de Vkappa para
la biblioteca 3
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 153
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 324
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia ficticia de Vkappa para
la biblioteca 3
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 154
\vskip1.000000\baselineskip
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<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> anti MSA dAb MSA 16
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<220>
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<221> CDS
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<222> (1)..(324)
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<223>
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<400> 155
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\vskip0.400000\baselineskip
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<211> 108
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> anti MSA dAb MSA 16
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 157
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<211> 324
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> anti MSA dAb MSA 26
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
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<222> (1)..(324)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 108
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> anti MSA dAb MSA 26
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 158
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 159
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<211> 5
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Ligador de polipéptido
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<211> 10
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ligador de polipéptido
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 160
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\sa{Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
Ser}
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<210> 161
\vskip0.400000\baselineskip
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ligador de polipéptido
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<400> 161
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\sa{Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
Gly Gly Gly Ser}
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<210> 162
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<211> 20
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<212> PRT
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<220>
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<223> Ligador de polipéptido
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<400> 162
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\sa{Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
Gly Gly Gly Ser Gly}
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Ligador de polipéptido
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<400> 163
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\sa{Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
Gly Gly Gly Ser Gly}
\sac{Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser}
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 164
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ligador de polipéptido
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 164
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\sa{Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
Gly Gly Gly Ser Gly}
\sac{Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
Gly Gly Gly Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 165
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ligador de polipéptido
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<400> 165
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\sa{Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
Gly Gly Gly Ser Gly}
\sac{Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
Gly Gly Gly Ser Gly Gly}
\sac{Gly Gly Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 166
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 40
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ligador de polipéptido
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 166
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
Gly Gly Gly Ser Gly}
\sac{Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
Gly Gly Gly Ser Gly Gly}
\sac{Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 167
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 45
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<223> Ligador de polipéptido
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<400> 167
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\sa{Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
Gly Gly Gly Ser Gly}
\sac{Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
Gly Gly Gly Ser Gly Gly}
\sac{Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
Gly Gly Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 168
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 50
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Ligador de polipéptido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 168
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 169
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 169
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcggccatggc gtcaacggac at
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 170
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 170
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatgtgcgctc gagcgtttga ttt
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 171
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Forma modificada de la articulación
humana IgGC1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 171
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Glu Pro Lys Ser Gly Asp Lys Thr His Thr Cys
Pro Pro Cys Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 172
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 357
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
TAR1-5-19CYS
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(357)
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 172
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 173
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 114
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
TAR1-5-19CYS
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 173
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 174
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 357
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223>
TAR1-5-19CYS
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 174
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 175
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 175
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptggagcgcgt cgacggacat ccagatgacc cagtctcca
\hfill39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 176
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 176
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipttagcagccg gatccttatt agcaccgttt gatttccac
\hfill39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 177
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 177
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Ser Tyr Leu Asn}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 178
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 178
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Lys Ser Leu Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 179
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 179
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Tyr Tyr His Leu Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 180
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 180
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Arg Tyr Leu Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 181
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 181
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Tyr Asn Trp Leu Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 182
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 182
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Trp His Leu Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 183
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 183
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Arg Tyr Leu Ala}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 184
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 184
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Tyr His Leu Ala}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 185
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 185
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile Trp His Leu Asn}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 186
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 186
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Tyr Arg Tyr Leu Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 187
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 187
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Lys Tyr Leu Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 188
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 188
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Arg Tyr Leu Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 189
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 189
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Arg Ser Leu Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 190
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 190
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Arg His Leu Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 191
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 191
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Lys Tyr Leu Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 192
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 192
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Arg Tyr Leu Asn}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 193
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 193
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile Lys His Leu Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 194
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR1
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 194
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Tyr Lys His Leu Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 195
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> VH CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 195
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Trp Val Tyr Gln Met Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 196
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> VH CDR1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 196
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Trp Ser Tyr Gln Met Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 197
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa ficticia CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MISC_FEATURE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa se codifica mediante nkk, que
codifica todos los aminoácidos así como el codón TAG.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MISC_FEATURE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (4)..(4)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa se codifica mediante nkk, que
codifica todos los aminoácidos así como el codón TAG.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 197
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Ala Ser Xaa Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 198
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 198
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Ala Ser Pro Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 199
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 199
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asn Ala Ser Tyr Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 200
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 200
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Ala Ser Thr Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 201
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 201
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Ala Ser Val Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 202
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 202
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Ala Ser Ser Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 203
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 203
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Ala Ser Leu Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 204
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 204
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Ala Ser His Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 205
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 205
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Pro Ala Ser Lys Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 206
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 206
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Ala Ser Arg Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 207
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 207
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Ala Ser Ser Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 208
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 208
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asn Ala Ser His Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 209
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 209
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Ala Ser Trp Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 210
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 210
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Ala Ser Arg Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 211
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 211
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Thr Ala Ser Ser Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 212
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 212
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 213
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 213
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Ala Ser Arg Leu Gln Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 214
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> VH dummy CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MISC_FEATURE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa se codifica mediante nkk, que
codifica todos los aminoácidos así como el codón TAG.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MISC_FEATURE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3)..(5)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa se codifica mediante nkk, que
codifica todos los aminoácidos así como el codón TAG.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MISC_FEATURE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (7)..(8)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa se codifica mediante nkk, que
codifica todos los aminoácidos así como el codón TAG.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MISC_FEATURE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (10)..(10)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa se codifica mediante nkk, que
codifica todos los aminoácidos así como el codón TAG.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 214
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Ile Xaa Xaa Xaa Gly Xaa Xaa Thr Xaa Tyr
Ala Asp Ser Val Lys}
\sac{Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 215
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> VH CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 215
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Ile Ser Ala Phe Gly Ala Lys Thr Leu Tyr
Ala Asp Ser Val Lys}
\sac{Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 216
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> VH CDR2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 216
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Ile Ser Ser Phe Gly Ser Ser Thr Leu Tyr
Ala Asp Ser Val Lys}
\sac{Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 217
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa ficticia CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MISC_FEATURE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3)..(6)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa se codifica mediante nkk, que
codifica todos los aminoácidos así como el codón TAG.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> MISC_FEATURE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (8)..(8)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa se codifica mediante nkk, que
codifica todos los aminoácidos así como el codón TAG.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 217
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Xaa Xaa Xaa Xaa Pro Xaa Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 218
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 218
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Thr Tyr Ser Val Pro Pro Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 219
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 219
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Thr Tyr Arg Ile Pro Pro Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 220
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 220
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Val Val Tyr Trp Pro Val Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 221
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 221
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Val Arg Lys Val Pro Arg Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 222
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 222
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Gly Leu Tyr Pro Pro Ile Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 223
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 223
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Asn Val Val Ile Pro Arg Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 224
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 224
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Ser Ala Val Tyr Pro Lys Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 225
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 225
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Arg Leu Leu Tyr Pro Lys Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 226
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 226
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Arg Ala Arg Trp Pro Arg Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 227
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 227
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Val Ala Arg Val Pro Arg Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 228
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 228
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Tyr Val Gly Tyr Pro Arg Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 229
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 229
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Thr Thr Tyr Tyr Pro Ile Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 230
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 230
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Val Leu Tyr Tyr Pro Gln Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 231
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 231
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Val Val Tyr Trp Pro Ala Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 232
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 232
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Val Ala Leu Tyr Pro Lys Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 233
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 233
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Asn Leu Phe Trp Pro Arg Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 234
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 234
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Met Leu Phe Tyr Pro Lys Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 235
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 235
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Gly Ala Arg Trp Pro Gln Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 236
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Vkappa CDR3
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 236
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Gln Val Gly Arg Tyr Pro Lys Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 237
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> VH CDR3
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 237
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Ser Gly Lys Phe Asp Tyr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 238
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> VH CDR3
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 238
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Arg Asp His Asn Tyr Ser Leu Phe Asp
Tyr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 239
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> HA tag
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 239
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptatccttatg atgttcctga ttatgca
\hfill27
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 240
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> HA tag
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 240
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala}
Claims (77)
1. Ligando doble-específico
que comprende un primer dominio variable simple de inmunoglobulina
con cadena pesada que presenta una especificidad de fijación a un
primer epítopo o antígeno y un segundo dominio variable simple de
inmunoglobulina con cadena ligera que presenta una actividad de
fijación a un segundo epítopo o antígeno, en el que la fijación a
uno o ambos de dichos antígenos o epítopos actúa para prolongar la
vida media del ligando in vivo y en el que dichos primer y
segundo dominios no son un dominio variable con cadena pesada y un
dominio variable con cadena ligera que comparte la misma
especificidad, con la condición de que dicho ligando
doble-específico no esté constituido por un dominio
V_{H} de anti-HSA y por un dominio V_{\kappa}
de anti-\beta galactosidasa.
2. Ligando doble-específico
según la reivindicación 1, en el que se proporcionan dominios
variables como un fragmento de anticuerpo scFv.
3. Ligando doble-específico
según la reivindicación 1, en el que se proporcionan dominios
variables como una región Fab del anticuerpo.
4. Inmunoglobulina IgG con cuatro cadenas que
comprende un ligando doble-específico según
cualquiera de las reivindicaciones anteriores.
5. Inmunoglobulina IgG con cuatro cadenas
según la reivindicación 4, en la que dicha IgG comprende dos
ligandos doble-específicos siendo dichos ligandos
doble-específicos idénticos en sus dominios
variables.
6. Inmunoglobulina IgG con cuatro cadenas
según la reivindicación 4, en la que dicha IgG comprende dos
ligandos doble-específicos, siendo dichos ligandos
doble-específicos diferentes en sus dominios
variables.
7. Ligando que comprende un primer dominio
variable simple de inmunoglobulina que presenta una primera
especificidad de fijación al antígeno o epítopo y un segundo dominio
variable simple de inmunoglobulina que presenta una segunda
especificidad de fijación del antígeno o epítopo en el que uno o
ambos de dichos primer y segundo dominios variables se unen a un
antígeno que prolonga la vida media del ligando in vivo,
y
- (i)
- el primer y el segundo dominios variables de inmunoglobulina son dominios variables con cadena pesada; o
- (ii)
- el primer y el segundo dominios variables de inmunoglobulina son dominios variables con cadena ligera.
con la condición de que cuando los
primer y segundo dominios variables de inmunoglobulina sean dominios
VHH camélidos, el dominio VHH que es específico para un antígeno
que prolonga la vida media del ligando in vivo no se una a
la lisozyma de la clara de huevo de gallina (HEL), a la
alfa-amilasa pancreática porcina; a
NmC-A, a hcg, al colorante azo RR6 unido a BSA o a
las células HG982 de S.
mutans.
8. Ligando según la reivindicación 7, en el
que el ligando comprende los primer y segundo dominios VHH
camélidos.
9. Ligando según la reivindicación 7, en el
que el primer y/o el segundo dominio variable es humano.
10. Ligando doble-específico
según la reivindicación 8 ó 9, en el que los dominios variables
simples son idénticos.
11. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, en el que los primer y segundo dominios
se unen independientemente, de manera que el ligando
doble-específico puede unirse simultáneamente tanto
a los primeros como a los segundos epítopos o antígenos.
12. Ligando según la reivindicación 11, en el
que el ligando doble-específico comprende una
primera forma y una segunda forma en equilibrio en solución, en el
que ambos epítopos o antígenos se unen a la primera forma
independientemente pero compiten para unirse a la segunda forma.
13. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, en el que dichos primer y segundo
epítopos están presentes en antígenos separados.
14. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 12, en el que dichos primer y segundo epítopos
están presentes en el mismo antígeno.
15. Ligando doble-específico
según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en el que los
dominios variables están asociados de manera no covalente.
16. Ligando doble-específico
según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 14, en el que las
regiones variables están asociadas de manera covalente.
17. Ligando doble-específico
según la reivindicación 16, en el que la asociación covalente está
mediada por enlaces disulfuros.
18. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, que comprende un dominio variable
simple específico para TNF\alpha, que presenta una constante de
disociación (K_{d}) de 1x10^{-8} M o menos para TNF\alpha
humano, y una constante de velocidad K_{off} de 1x10^{-3}
s^{-1} o menos, determinadas por resonancia de plasmón
superficial.
19. Ligando según la reivindicación 18, en el
que el dominio específico para TNF\alpha es V_{\kappa}.
20. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 17, que comprende un dominio variable simple
específico para el receptor 1 de TNF (p55), que presenta una
constante de disociación (K_{d}) de 1x10^{-8} M o menos para el
receptor 1 de TNF, y una constante de velocidad K_{off} de
1x10^{-3} s^{-1} o menos, determinadas por resonancia de
plasmón superficial.
21. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 18 a 20, en el que un dominio específico para
TNF\alpha o p55 neutraliza TNF\alpha o el receptor 1 de
TNF\alpha humanos en un análisis de células estándar con una ND50
de 50 nM o menos.
22. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 17, que comprende un dominio variable simple
específico para el receptor 1 de TNF (p55), en el que el dAb
antagoniza la actividad del receptor 1 de TNF en un análisis de
células estándar con una ND50 \leq 100 nM y a una concentración
\leq 10 \muM el dAb agoniza la actividad del receptor 1 de TNF
por \leq 5% en el análisis.
23. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, que comprende un dominio variable
simple específico para la albúmina del suero (SA) que presenta una
constante de disociación (K_{d}) comprendida entre 1 nM y 500
\muM para SA, como es determinada por resonancia de plasmón
superficial.
24. Ligando según la reivindicación 23, en el
que el dominio específico para SA se une a SA en un ensayo estándar
de fijación del ligando con un IC50 comprendido entre 1 nM y 500
\muM.
25. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 17, que comprende un dominio variable simple
específico para TNF\alpha, y que comprende la secuencia de
aminoácidos de TAR1-5-19
identificada por su secuencia en las páginas 2 y 3 del listado de
secuencias o una secuencia que es por lo menos 80% homóloga a
ésta.
26. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 17, que comprende un dominio variable simple
específico para TNF\alpha, y que comprende la secuencia de
aminoácidos de TAR1-5 identificada por su secuencia
en las páginas 2 y 3 del listado de secuencias o una secuencia que
es por lo menos 80% homóloga a ésta.
27. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 17, que comprende un dominio variable simple
específico para TNF\alpha, y que comprende la secuencia de
aminoácidos de TAR1-27 identificada por su secuencia
en la página 4 del listado de secuencias o una secuencia que es por
lo menos 80% homóloga a ésta.
28. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 17, que comprende un dominio variable simple
específico para el receptor 1 de TNF, y que comprende la secuencia
de aminoácidos de TAR2-10 identificada por su
secuencia en la página 2 del listado de secuencias o una secuencia
que es por lo menos 80% homóloga a ésta.
29. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 17, que comprende un dominio variable simple
específico para el receptor 1 de TNF, y que comprende la secuencia
de aminoácidos de TAR2-10 identificada por su
secuencia en la página 2 del listado de secuencias o una secuencia
que es por lo menos 90% homóloga a ésta.
30. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 17, que comprende un dominio variable simple
específico para el receptor 1 de TNF, y que comprende la secuencia
de aminoácidos de TAR2-5 identificada por su
secuencia en la página 1 del listado de secuencias o una secuencia
que es por lo menos 80% homóloga a ésta.
31. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 17, que comprende un dominio variable simple
específico para el receptor 1 de TNF, y que comprende la secuencia
de aminoácidos de TAR2-5 identificada por su
secuencia en la página 1 del listado de secuencias o una secuencia
que es por lo menos 90% homóloga a ésta.
32. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 17, que comprende un dominio variable simple
específico para SA, y que comprende la secuencia de aminoácidos de
MSA-16 identificada por su secuencia en la figura
16 o una secuencia que es por lo menos 80% homóloga a ésta.
33. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 17, que comprende un dominio variable simple
específico para SA, y que comprende la secuencia de aminoácidos de
MSA-26 identificada por su secuencia en la figura
16 o una secuencia que es por lo menos 80% homóloga a ésta.
34. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 25 a 31, que comprende un dominio variable simple
específico para SA como se ha definido en la reivindicación 23 ó
24.
35. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 18 a 34, en el que TNF\alpha, el receptor 1 de
TNF o SA es una forma humana.
36. Ligando doble-específico
que comprende un dAb de TNF alfa anti-humano y un
dAb anti-SA.
37. Ligando según la reivindicación 36, en el
que los dAb son dominios V_{HH} camélidos.
38. Ligando según la reivindicación 37, en el
que el dAb anti-TNF alfa es un dominio específico
para TNF\alpha como se ha definido en cualquiera de las
reivindicaciones 18, 19, 21 y 25 a 27.
39. Ligando según la reivindicación 37, en el
que el dAb anti-SA es un dominio específico para SA
como se ha definido en cualquiera de las reivindicaciones 23, 24,
32 y 33.
40. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, que comprende un armazón universal.
41. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, que comprende un armazón V_{H}
seleccionado de entre el grupo constituido por DP47, DP45 y DP38;
y/o un armazón V_{L} que es DPK9.
42. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, que comprende un sitio de fijación para
un ligando genérico.
43. Ligando según la reivindicación 42, en el
que el sitio de fijación a un ligando genérico se selecciona de
entre el grupo constituido por proteína A, proteína L y proteína
G.
44. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones anteriores, en el que el ligando comprende un
dominio variable que presenta una o más regiones con armazón que
comprenden una secuencia de aminoácidos que es la misma que la
secuencia de aminoácidos de una región con armazón correspondiente
codificada por un segmento génico del anticuerpo de la línea
germinal humana o las secuencias de aminoácidos de una o más de
dichas regiones con armazón que comprende en conjunto hasta 5
diferencias de aminoácidos en comparación con la secuencia de
aminoácidos de dicha
región con armazón correspondiente codificada por un segmento génico del anticuerpo de la línea germinal humana.
región con armazón correspondiente codificada por un segmento génico del anticuerpo de la línea germinal humana.
45. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 43, en el que el ligando comprende un dominio
variable, en el que las secuencias de aminoácidos de FW1, FW2, FW3
y FW4 son las mismas que las secuencia de aminoácidos de las
regiones con armazón correspondientes codificadas por un segmento
génico del anticuerpo de la línea germinal humana o las secuencias
de aminoácidos de FW1, FW2, FW3 y FW4 contienen en conjunto hasta 10
diferencias de aminoácidos en comparación con las secuencias de
aminoácidos de las regiones con armazón correspondientes
codificadas por dicho segmento génico del anticuerpo de la línea
germinal humana.
46. Ligando según las reivindicaciones 44 ó 45,
que comprende un dominio variable de anticuerpo que comprende las
regiones de FW1, FW2 y FW3, y las secuencias de aminoácidos de
dichos FW1, FW2 y FW3 son las mismas que las secuencias de
aminoácidos de las regiones con armazón correspondientes codificadas
por los segmentos génicos del anticuerpo de la línea germinal
humana.
47. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 44 a 46, en el que dicho segmento génico del
anticuerpo de la línea germinal humana se selecciona de entre el
grupo constituido por DP47, DP45 y DP48 y DPK9.
48. Ligando según la reivindicación 1 ó 7, en
el que cada dominio variable con cadena pesada no es un dominio
variable de camélidos de inmunoglobulina.
49. Ligando según la reivindicación 1 ó 7, que
comprende por lo menos un dominio variable con cadena pesada que no
contiene uno o más aminoácidos que son específicos para los dominios
variables de camélidos de inmunoglobulina en comparación con los
dominios V_{H} humanos.
50. Método para la producción de un ligando
según cualquiera de las reivindicaciones anteriores, que comprende
un primer dominio variable simple de inmunoglobulina que presenta
una primera especificidad de fijación y un segundo dominio variable
simple de inmunoglobulina simple que presenta una segunda
especificidad de fijación, siendo una o ambas especificidades de
fijación específicas para un antígeno que prolonga la vida media del
ligando in vivo, comprendiendo el método las etapas
siguientes:
- (a)
- seleccionar un primer dominio variable por su capacidad para unirse a un primer epítopo,
- (b)
- seleccionar una segunda región variable por su capacidad para unirse a un segundo epítopo,
- (c)
- combinar las regiones variables; y
- (d)
- seleccionar el ligando por su capacidad para unirse a dichos primer y segundo epítopos; en el que, cuando dichos dominios variables son un dominio variable con cadena pesada y cadena ligera; el dominio variable con cadena pesada no es un dominio V_{H} específico para HSA.
51. Método según la reivindicación 50, en el
que dicho primer dominio variable se selecciona para unirse a dicho
primer epítopo en ausencia de un dominio variable
complementario.
52. Método según la reivindicación 51, en el
que dicho primer dominio variable se selecciona para unirse a dicho
primer epítopo en presencia de un tercer dominio variable
complementario en el que dicho tercer dominio variable es diferente
de dicho segundo dominio variable.
53. Ácido nucleico que codifica por lo menos un
ligando doble-específico según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 49.
54. Ácido nucleico según la reivindicación 53,
que comprende la secuencia de ácido nucleico de
TAR1-5-19 identificada por su
secuencia en las páginas 2 y 3 del listado de secuencias o una
secuencia que es por lo menos 70% homóloga a ésta.
55. Ácido nucleico según la reivindicación 53,
que comprende la secuencia de ácido nucleico de
TAR1-5 identificada por su secuencia en la página 3
del listado de secuencias o una secuencia que es por lo menos 70%
homóloga a ésta.
56. Ácido nucleico según la reivindicación 53,
que comprende la secuencia de ácido nucleico de
TAR1-27 identificada por su secuencia en la página
4 del listado de secuencias o una secuencia que es por lo menos 70%
homóloga a ésta.
57. Ácido nucleico según la reivindicación 53,
que comprende la secuencia de ácido nucleico de
TAR2-10 identificada por su secuencia en la página
2 del listado de secuencias o una secuencia que es por lo menos 70%
homóloga a ésta.
58. Ácido nucleico según la reivindicación 53,
que comprende la secuencia de ácido nucleico de
TAR2-10 identificada por su secuencia en la página
2 del listado de secuencias o una secuencia que es por lo menos 80%
homóloga a ésta.
59. Ácido nucleico según la reivindicación 53,
que comprende la secuencia de ácido nucleico de
TAR2-5 identificada por su secuencia en la página 1
del listado de secuencias o una secuencia que es por lo menos 70%
homóloga a ésta.
60. Ácido nucleico según la reivindicación 53,
que comprende la secuencia de ácido nucleico de
TAR2-5 identificada por su secuencia en la página 1
del listado de secuencias o una secuencia que es por lo menos 80%
homóloga a ésta.
61. Ácido nucleico según la reivindicación 53,
que comprende la secuencia de ácido nucleico de
MSA-16 identificada por su secuencia en la figura
16 o una secuencia que es por lo menos 70% homóloga a ésta.
62. Ácido nucleico según la reivindicación 53,
que comprende la secuencia de ácido nucleico de
MSA-26 identificada por su secuencia en la figura
16 o una secuencia que es por lo menos 70% homóloga a ésta.
63. Vector que comprende un ácido nucleico
según cualquiera de las reivindicaciones 53 a 62.
64. Vector según la reivindicación 63, que
comprende además componentes necesarios para la expresión de un
ligando doble-específico.
65. Célula huésped que comprende un vector
según la reivindicación 64.
66. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 49 para su utilización en terapia.
67. Composición farmacéutica que comprende un
ligando según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 49, y un
excipiente, vehículo o diluyente farmacéuticamente aceptable.
68. Ligando doble-específico
que comprende un primer dominio variable simple de inmunoglogulina
que presenta especificidad de fijación para la albúmina de suero
(SA) y un segundo dominio variable simple de inmunoglogulina que
presenta especificidad de fijación para un antígeno seleccionado de
entre el grupo constituido por el receptor de EPO, ApoE,
Apo-SAA, BDNF, cardiotrofina-1, EGF,
receptor de EGF, ENA-78, Eotaxina,
Eotaxina-2, Exodus-2, EpoR,
FGF-ácido, FGF-básico, factor 10 de crecimiento de
fibroblastos, ligando FLT3, fractalquina (CX3C), GDNF,
G-CSF, GM-CSF,
GF-\beta1, insulina, IFN-\gamma,
IGF-I, IGF-II,
IL-1\alpha, IL-1\beta,
IL-2, IL-3, IL-4,
IL-5, IL-6, IL-7,
IL-8 (72 a.a.), IL-8 (77 a.a.),
IL-9, IL-10, IL-11,
IL-12, IL-13, IL-15,
IL-16, IL-17, IL-18
(IGIF), inhibina \alpha, inhibina \beta, IP-10,
factor 2 de crecimiento de queratinocitos (KGF-2),
KGF, leptina, LIF, linfotactina, sustancia inhibidora mulleriana,
factor inhibidor de colonias de monocitos, proteína atrayente de
monocitos, M-CSF, MDC (67 a.a.), MDC (69 a.a.),
MCP-1 (MCAF), MCP-2,
MCP-3, MCP-4, MDC (67 a.a.), MDC
(69 a.a.), MIG, MIP-1\alpha,
MIP-1\beta, MIP-3\alpha,
MIP-3\beta, MIP-4,
factor-1 inhibidor precursor mieloide
(MPIF-1), NAP-2, neurturina, factor
de crecimiento de nervios, \beta-NGF,
NT-3, NT-4, oncostatina M,
PDGF-AA, PDGF-AB,
PDGF-BB, PF-4, RANTES, SDF1\alpha,
SDF1\beta, SCF, SCGF, factor de células madre (SCF), TARC,
TGF-\alpha, TGF-\beta,
TGF-\beta2, TGF-\beta3, factor
de necrosis tumoral (TNF), TNF-\alpha,
TNF-\beta, receptor I de TNF, receptor II de TNF,
TNIL-1, TPO, VEGF, receptor 1 de VEGF, receptor 2 de
VEGF, receptor 3 de VEGF, GCP-2, GRO/MGSA,
GRO-\beta, GRO-\gamma, HCC1,
1-309, HER 1, HER 2, HER 3 y HER 4.
69. Ligando doble-específico
que comprende un primer dominio variable simple de inmunoglogulina
que presenta especificidad de fijación para la albúmina de suero
(SA) y un segundo dominio variable simple de inmunoglogulina que
presenta especificidad de fijación para un antígeno seleccionado de
entre el grupo constituido por proteínas humanas o animales,
citocinas, receptores de citocina, enzimas, cofactores enzimáticos y
proteínas de fijación al ADN.
70. Ligando doble-específico
que comprende un primer dominio variable simple de inmunoglogulina
que presenta especificidad de fijación para la albúmina de suero
(SA) y un segundo dominio variable simple de inmunoglogulina que
presenta especificidad de fijación para un receptor de una citosina
indicada en la reivindicación 68.
71. Ligando según la reivindicación 68, 69 ó
70, en el que cada uno de entre los primer y segundo dominios
es
- (i)
- un dominio variable con cadena pesada o
- (ii)
- un dominio variable con cadena ligera.
72. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 68 a 71, en el que el dominio
anti-SA es como se ha definido según cualquiera de
las reivindicaciones 23, 24, 32 y 33.
73. Ácido nucleico que comprende dichas
secuencias de ácidos nucleicos como se han definido en cualquiera
de las reivindicaciones 53 a 62.
74. Vector que comprende ácido nucleico según
la reivindicación 73.
75. Célula huésped que comprende un vector
según la reivindicación 74.
76. Ligando según cualquiera de las
reivindicaciones 68 a 72 para su utilización en terapia.
77. Composición farmacéutica que comprende un
ligando según cualquiera de las reivindicaciones 68 a 72 y un
excipiente, vehículo o diluyente farmacéuticamente aceptable.
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