DD159435A5 - Verfahren zum herstellen eines polypeptidproduktes durch expression in bakterien eines dafuer codierenden gens - Google Patents

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DD159435A5 DD81228534A DD22853481A DD159435A5 DD 159435 A5 DD159435 A5 DD 159435A5 DD 81228534 A DD81228534 A DD 81228534A DD 22853481 A DD22853481 A DD 22853481A DD 159435 A5 DD159435 A5 DD 159435A5
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Herbert L Heyneker
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Abstract

Die Erfindung betrifft ein Verfahren zum Herstellen eines Polypeptid-Produkts durch Expression in Bakterien eines fuer dieses codierenden Gens. Weiterhin betrifft die Erfindung einen von einem Plasmid abgeleiteten Expressionsvektor zur Herstellung eines heterologen Polypeptid-Produkts in E. coli- Bakterien und ein Verfahren zum Schneiden von DNA. Ziel der Erfindung ist eine gute Ausbeute an Polypeptid- Produkt. Erfindungsgemaess wird a) eine bakterielle Kultur mit einem sich replizierenden, von einem Plasmid abgeleiteten Expressionsvektor transformiert, welcher eine Sequenz doppelstraengiger DNA enthaelt, die in Phase von einem ersten 5' -Ende bis zu einem zweiten 3' -Ende ihres codierenden Strangs folgende Elemente aufweist: (i) ein bakterielles trp-Promoter-Operator-System; (ii) Nukleotide fuer eine Ribosomen-Bindestelle betr. Element (iv); (iii) Nukleotide fuer ein Translations-Startsignal betr. Element (iv); (iv) Strukturen fuer die Aminosaeuresequenz betr. heterologes Polypeptid; b) die transformierte Bakterienkultur in einem zusaetzliches Tryptophan enthaltenden Naehrmittel gezuechtet; c) das zusaetzliche Tryptophan entzogen und die Expression des gewuenschten Polypeptid-Produkts anlaufen gelassen.

Description

25.8*1981
AP C 12 D/228 543/2
59 004/18
Anwendungsgebiet der Erfindung
t—imHn1.1 iTiiiiiil'· mrriL"w1rTiTr r"i t.β» mi "ιιιμιι 'ίΐ'ιιιι .. Ii ι.« — |ii> ' ι m'j >.rmr -i-iri
Die Erfindung betrifft ein Verfahren zum Herstellen eines Polypeptid-Produkts durch die Expression in Bakterien eines für dieses codierenden Gens«
Insbesondere befaßt sich die vorliegende Erfindung mit Problemen im Zusammenhang mit Tryptophan-Repression und Attenuierung auf eine neue VVsise und stellt Verfahren bereit, um
1» einen Expressionsvektor zu erhalten* der für eine direkte Expression heterologer Gene, ausgehend vom trp-Promoter-Operator* bestimmt ist;
2* Vektoren zu erhalten, bestimmt für die Expression von spezifisch schneidbaren Polypeptiden, die durch homolog-»heterologe Genfusionen codiert werden, ebenfalls ausgehend vom trp-Operator-Promoter; und
3» heterologe Polypeptide kontrolliert« wirkungsvoll und in großen Mengen zu exprimieren«
Weiterhin bezieht sich die Erfindung auf die zur Durchführung dieser Verfahren nützlichen Mittel,,
Charakteristik der bekannten technischen Lösunqen
filif ι»»« i'l iii ι' ι ι JiIIiIf ι ιι'Ίΐ ι;» ι 1I ι!," ιί " ι ill Ί nni|-|» Γ ι; J, aHr «ιι "nil ι Ii - Ii ι ι' .Ί *iiiiwi i ! ιΊιγ ι ι Ί '1IHj ι ι Fin-» i^tmt Im I T'nir Ί iWiiiii Ii-ι ;ι Γ Ii ι>Ίτιι Tim mn - ,'
Mit dem Aufkommen der DNA-Rekombinations~Technologie ist die kontrollierte bakterielle Produktion einer enormen Vielfalt nützlicher Polypeptide möglich gewordene Man hat bereits Bakterien in der Handf die durch diese Technologie
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verändert wurden^ um die Produktion derartiger Polypeptid-Produkte zu ermöglichen,, wie z* B0 Somatostatin (K;" Itakura, et al.t Science 198, 1056 (1977)), die jeweils einzelnen A- und B-Ketten des menschlichen Insulins (D.. V, GoeddelV et al.V Proc„ Nat 8I Acad, Sei,V USA 76y 106 (1979)) und menschliches Wachstumshormon (D0 V0 Goeddel* et alyi" Nature 281V 544 (1979J)0. Kürzlich wurde die DNA-Rekornbinations·"Technik dazu verwendet, um die bakterielle Herstellung von Thymosin o41 zu ermöglichen,}· einer immun- -verstärkenden Substanz^ die in der Thymusdrüse gebildet wird (US^Patentanmeldung.von Roberto Crea und Ronald Wetzel vom 28^ Februar 198O4 übertragen auf die Anmelderin der vorliegenden Anmeldung)e Die Möglichkeiten dieser Technologie sind derartig durchschlagend, daß so gut wie jedes nützliche Polypeptid bakteriell hergestellt werden kann und die kontrollierte Herstellung von Hormonen, Enzymen, Antikörpern und Impfstoffen gegen eine große Vielfalt von Krankheiten in Reichweite gebracht wird* Die zitierten Veröffentlichungen, die im Detail die oben genannten repräsentativen Beispiele beschreiben* sowie weitere* im folgenden genannte Veröffentlichungen, welche den Hintergrund der Erfindung bilden, sind durch Verweis in die Offenbarung mit einbezogen©
Das Arbeitspferd der DNA-Rekombinations-Technologie ist das Plasmid^ ein nichtchromoso.maler Ring doppelst rängiger DNAf der. in.Bakterien gefunden wird und oft in.vielfacher' .
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Kopie pro Bakterienzelle vorliegt. Die DNA des Plasmids enthalt eine Information, die benötigt wird, um das Plasmid in Tochterzellen zu reproduzieren (d.h. ein'Replikon") und normalerweise ein oder mehr Selektions-Charakteristika, wie z.B. Resistenz gegen Antibiotika, die es erlauben, diejenigen Clone der Wirtszelle, die das interessierende Plasmic enthalten, zu erkennen und bevorzugt in selektivem Medium wachsen zu lassen. Der Nutzen der bakteriellen Plasmide liegt in der Tatsache, daß sie durch die eine oder andere Restriktionsendonuklease oder "Restriktionsenzym" spezifisch geschnitten werden können, von denen jedes eine andere Stelle auf der Plasmid-DNA erkennt. Danach können heterologe Gene oder Genfragmente in das Plasmid eingefügt werden, wobei entweder die Enden der Schnittstellen oder unmittelbar an die Schnittstellen angefügte Enden miteinander verbunden werden. Im folgenden wird der Terminus "heterolog" für ein Gen verwendet, das normalerweise nicht in E.coli gefunden wird oder eine Polypeptidsequenz, die normalerweise nicht durch E.coli hergestellt wird. Der Terminus "homolog" wird für ein Gen oder Polypeptid verwendet, das in Wildtyp E.coli hergestellt wird. Die DNA-Rekombination wird außerhalb der Bakterie durchgeführt. Das resultierende "rekombinante" Plasmid kann durch ein Verfahren, das als Transformation bekannt ist, in Bakterien eingeführt werden, und man erhält große Mengen des rekombinanten Plasmids, das das heterologe Gen enthält, indem man die Transformanten wachsen läßt. Wenn das Gen im Hinblick auf Bereiche des Plasmids, die die Transkription und Translation der codierten DNA-Information regeln, richtig eingefügt ist,: kann der resultierende Expressionsvektor . dazu verwendet werden, tatsächlich die Polypeptidsequenz zu produzieren, für die das inserierte Gen codiert, ein Prozeß, der Expression genannt wird.
Die Expression wird in einer Gegend initiiert, die als Promoter bekannt ist, der von der RNA-Polymerase erkannt wird und an den diese bindet. In einigen Fällen, wie z.B. beim trp-Operon, das im nachfolgenden noch ausführlich diskutiert werden wird, werden Promoterregionen von "Operator"· Regionen überlappt, wodurch ein kombinierter Promoter-Operator gebildet wird. Operatoren sind DNA-Sequenzen, die von sogenannten Repressorproteinen erkannt werden, die dazu dienen,, die Häufigkeit der Initiation der Transkription an einem speziellen Promoter zu regulieren.» Die Polymerase arbeitet sich an der DNA entlang, wobei sie die in dem codierenden Strang enthaltene Information vom 5'~ zum 3'-Ende in Messenger-RNA (mRNA) transkribiert, die ihrerseits wieder in ein Polypeptid translatiert wird, das die Aminosäuresequenz aufweist, für die die DNA codiert. Jede ,Aminosäure wird durch ein einziges Nukleotidtriplet oder "Codon" codiert, das innerhalb eines "Strukturgens" liegt, wie man es für die vorliegenden Zwecke nennen mag, d.h. in dem Teil, der für die Aminosäuresequenz des exprimierten Produkts codiert. Nach dem Binden an den Promoter transkribiert die RNA-Polymerase vorerst Nukleotide, die für eine Ribosomen-Bindestelle codieren, sodann ein Initiations- oder "Start"-signal (normalerweise ATG, das in der resultierenden mRNA zu AUG wird) und schließlich die Nukleotidcodons innerhalb des Strukturgens selbst. Sogenannte Stop-Codons werden am Ende des Strukturgens transkribiert, wonach'.die. Polymerase eine zusätzliche Sequenz von mRNA bilden kann, die, auf- . 'gr.und 'der-.Anwesenheit des St-opsignals, .von den Rib.osomen nicht mehr translatiert wird. Ribosomen binden an die auf der mRNA zur Verfugung gestellten Bindestelle, bei Bakterien normalerweise wenn die mRNA gebildet wird, und stellen selbst das codierte Polypeptid her, wobei sie am Translations-Startsignal beginnen und an dem oben erwähnten Stopsignal enden. Das gewünschte Produkt wird hergestellt,
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wenn die Sequenzen, die für die Ribosomen-Bindestelle codieren, im Hinblick auf das AUG-Initiatorcodon richtig liegen und wenn alle übrigen Codons dem Initiatorcodon in Phase folgen. Das resultierende Produkt kann erhalten werden, indem man die Wirtszelle lysiert und das Produkt durch geeignete Reinigungsschritte von anderen bakteriellen Proteinen trennt.
Die durch die Anwendung der DNA-Rekombinations-Technik exprimierten Polypeptide können vollkommen heterolog sein, wie im Falle der direktion Expression des menschlichen Wachstumshormons, können aber auch andererseits ein heterologes Polypeptid enthalten, das zumindest mit einem Teil der Aminosäuresequenz eines homologen Peptids verbunden ist, wie im Fall der Herstellung von Zwischenprodukten für Somatostatin und die Bestandteile des menschlichen Insulins. Im letzteren Fall enthält beispielsweise das angefügte homologe Polypeptid einen Teil der Aminosäuresequenz für ß-Galactosidase. In diesen Fällen ist das angestrebte bioaktive Produkt durch das angefügte homologe Polypeptid so lange bioinaktiv, bis dieses durch extrazelluläre Maßnahmen abgeschnitten wird«, Die ebengenannten "Fusionsproteine" können so hergestellt werden, daß ein hochspezifisches Schneiden des Vorläuferproteins von dem angestrebten Produkt ermöglicht ist, beispielsweise durch die Einwirkung von Bromcyan auf Methionin oder aber durch enzymatisches Schneiden; siehe auch GB-PS Nr. 2 007 676 A.
Wenn die DNA-Rekombinations-Technologie ihr Versprechen voll halten soll, müssen Systeme erdacht v/erden, die die Expression der Geninsertionen optimieren, so daß das angestrebte Polypeptid-Produkt in großen Mengen erhalten werden kann. Die ß-Lactamase- und Lactose-Promoter-Operator-Systeme, die in der Vergangenheit üblicherweise verwendet
wurden, haben, obwohl sie gut zu verwenden sind, vom Standpunkt der Menge her die Kapazität der Technologie nicht voll ausgenutzt. Es besteht ein Bedürfnis für einen bakteriellen Expressionsvektor,der fähig ist, das gewünschte Polypeptid-Produkt in größerer Menge kontrolliert zu exprimleren.
Tryptophan ist eine Aminosäure, die von Bakterien als Bestandteil eines homologen Polypeptids verwendet wird und in einem Biosyntheseweg hergestellt wird, der folgende Schritte enthält: Chorisminsäure —> Anthranilsäure —> Phosphoribοsylanthranilsäure —> CHRP (Enol-1-(o-Carboxyphenylamino)-i-desoxy-D-Eibulose-5-Phosphat) —> Indol-3-Glycerinphosphat und letztlich Tryptophan selbst. Die enzymatischen Reaktionen dieses Synthesewegs v/erden durch Produkte des Tryptophan- oder "trp"-Operons katalysiert, einem polycistronischen DNA-Segment, das unter der Kontrolle des trp-Promoter-Operator-Systems transkribiert wird. Die resultierende polycistronische HiRFA codiert die sogenannte trp-Führer- (im folgenden "Leader"- genannte) Sequenz und dann, der Reihe nach, die Polypeptide, genannt trpE, trpD, trpC, trpB und trpA. Diese Polypeptide katalysieren und kontrollieren auf verschiedene Weise einzelne Schritte des Synthesewegs ausgehend von der Chorisminsäure bis zum Tryptophan.
..Im Uildtyp E.coli ist das Tryptophan-Operon unter der .Kontrolle mindestens dreier, deutlich zu unterscheidender-' Arten«, Im ersten Fall, einer Promoter-Operator-Repression, handelt das Tryptophan als Corepressor und bindet an seinen Aporepressor, um einen aktiven Repressorkomplex zu bilden, der seinerseits an den Operator bindet, wodurch das Tryptophan seinen eigenen Syntheseweg vollkommen verschließt. Zweitens bindet Tryptophan in einem Prozeß von Rückkopp-
lungsheminung an einen Komplex der trpE- und trpD-Polypeptide und verhindert dadurch deren Beteiligung an dem Syntheseweg. Letztlich v;ird eine Kontrolle ausgeübt durch einen Prozeß, der als "Attenuierung" bekannt ist. Dieser Vorgang läuft unter der Kontrolle einer "Attenuator-Region" des Gens ab, einer Region, die innerhalb der trp-Leader-Sequenz liegt. Die Attenuierung ist ein Vorgang, der phänotypisch als eine Art Verdünnung des Tryptophans in der Zelle in Erscheinung tritt (siehe dazu allgemein G.F. Miozzari et al., J. Bacteriology 133, 1^57 (1978); The Operon 263-302, Cold Spring Harbor Laboratory (1978), Miller und Reznikoff, eds.; F. Lee et al., Proc Natfl Acad Sei, USA 74, 4365 (1977) und K. Bertrand et al., J. Mol. Biol. 103, 319 (1976)). Das Ausmaß der Attenuierung scheint durch die intrazelluläre Konzentration des Tryptophans geregelt zu werden, und in Wildtyp E.coli beendet der Attenuator die Expression in ungefähr neun von zehn Fällen, möglicherweise durch die Bildung einer Sekundärstruktur, eines "Terminationsrings" in der mRNA, welcher die RNA-Polymerase dazu veranlaßt, sich verfrüht von der DNA zu lösen.
Andere Autoren haben das trp-Operon dazu verwendet, um bis zu einem gewissen Grad heterologe Polypeptide zu exprimieren. Mit diesen Arbeiten hat man sich versuchsweise mit Problemen der Repression und Attenuierung befaßt, wobei Indolacrylsäure zugegeben wird, ein Induktor und . Änalogon, das mit Tryptophan um das trp-Repressor-Molekül-' konkurriert, wobei durch .!competitive Hemmung auf Derepressior abgezielt wurde. Gleichzeitig verringert der Induktor durch Hemmung der enzymatischen Umwandlung von Indol zu Tryptophan die Attenuierung und bewirkt dadurch, daß der Zelle Tryptophan entzogen wird. Als Ergebnis davon lesen mehr Polymerasei erfolgreich über den Attenuator hinweg. Vom Standpunkt der
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vollständig durchgehenden Translation und der angestrebten großen Mengen erscheint dieser Versuch jedoch problematisch* da die Tryptophan-enthaltenden Proteinsequenzen während der Synthese infolge des Mangels von nutzbarem Tryptophan vorzeitig beendet werden,? Tatsächlich ist bei diesem Versuch eine wirkungsvolle Unterstützung der Attenuierung vollständig von einer strengen Tryptophan-Aushungerung abhängig«
Ziel der
Ziel der Erfindung ist die Bereitstellung eines neuen Verfahrens zum Herstellen eines Polypeptid-Produkts durch die Expression in Bakterien eines für dieses codierenden Gensf mit welchem, das Polypeptid-Produkt in guter Ausbeute hergestellt werden kann»
Darlegung des Wesens der Erfindung
Der Erfindung liegt die Aufgabe zugrunde, neue Systeme aufzufinden* die die Expression der Geninsertionen optimiereiij so daß das gewünschte Polypeptid-Produkt in großen Mengen erhalten werden l<ant\ und insbesondere einen bakteriellen Expressionsvektor aufzufinden^ der fähig ist, das gewünschte Polypeptid-Produkt in größerer Menge · kontrolliert zu exprimieren«
Erfindungsgeraäß. wird ein Polypeptid-Produkt durch die Expression in Bakterien eines für dieses codierenden Gens in der Weise hergestellt, daß
a) eine bakterielle Kultur geschaffen wird,, die mit einem sich replizierenden-, von einem Plasmid abgeleiteten
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- t&a* - 59 004/18
Expressionsvektor transformiert wurde,, welcher eine Sequenz doppelst rängiger DNA enthält t die in Phase von einem ersten 5'~Ende bis zu einem zweiten 3*~Ende ihres codierenden Strangs die folgenden Elemente aufweist:
(ϊ) ein bakterielles trp-Promoter-Operator-System,'
(ii) Nukleotide, die für eine Ribosomen-Bindestelle für die Translation des Elements (iv) codieren,
(iii) Nukleotidee die für ein Translations-Startsignal für die Translation des Elements (iv) codieren* und
(iv) ein Strukturgen^ das für die Aminosäuresequenz eines heterologen Polypeptide codiert*
wobei die genannte Sequenz weder irgendeine trp-Attenuierungs~Fähigkeit noch Nukleotide aufweist,, die für die trpE-Ribosomen-Bindestelle codieren;
b) die transformierte Bakterienkultur in ein Fermentationsgefäß überführt und diese Kultur bis zu einer vorgegebenen Dichte in einem geeigneten Nährmediuin gezüchtet wirdp welches zusätzliches Tryptophan enthält*' und zwar in ausreichender Menge, um das genannte Promoter-'
· Operaΐρr-*~System zu reprimieren; und - ; . ·
c) den genannten B kterien das zusätzliche Tryptophan entzogen wird, um das genannte System zu dereprimieren und die Expression des Produkts* für welches das genannte Strukturgen codiert* anlaufen zu lassen,,
'S 25β8β1981
f ^0 AP C 12 D/228 543/2
- ±eb - 59 004/18
Das erfindungsgemäße Verfahren kann dabei in der Weise durchgeführt werden., daß das durch das genannte Strukturgen exprimierte Polypeptid vollständig heterolog ist; das exprimierte Polypeptid ein Fusionsprotein ist, das ein heterologes Polypoptid und mindestens einen Teil der Aminosäuresequenz eines homologen Polypeptids aufweist; 6er genannte Teil ein Teil der Aminosäuresequenz eines.
Enzyms iste das am Biosyntheseweg von der Chorisminsäure zum Tryptophan beteiligt ist;
das heterologe Polypeptid ein bioaktives Polypeptid und das angefügte homologe Polypeptid ein spezifisch spaltbares bioinaktivierendes Polypeptid ist; das homologe Polypeptid das trpE*»Polypeptid ist und die genannte Ribosomen-Bindestelle diejenige für das trp~Leader» Polypeptid ist oder daß
das homologe Polypeptid das trpD«~Polypeptid ist β
Es ist besonders vorteilhaft* wenn das Fusionsprotein ein heterologes und ein homologes Polypeptid enthält p wobei das homologe Polypeptid selbst eine Fusion darstellt, und zwar aus etwa den ersten sechs Aminosäuren des trp-Leader-» Polypeptids und der Aminosäuresequenz,» die durch mindestens etwa dem distalen Drittel des trpE-Polypeptidgons codiert wird«,
Erfindungsgemäß wird der Tryptophan-Entzug dadurch bewirkt, daß die Zugabe des zusätzlichen Tryptophans beendet und das Fermentätionsm'edium, in dem die Bakterienkultur zuerst gewachsen ist, verdünnt wird«
In dem erfindungsgemäßen Verfahren wird als VVirtsbakteriutn E0, coli angewendet«
Γ *"> / 7 25,8,1981
*·* ^ S ηη AP C 12 D/228 543/2
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Die Erfindung betrifft weiterhin einen von einem Plasmid abgeleiteten Expressionsvektor zum Herstellen eines heterologen Polypeptid-Produkts in Ee coli-Bakterien, Erfindungsgemäß enthält der Vektor eine Sequenz doppelsträngiger DNA, die in Phase von einem ersten 5'~Ende bis zu einem zweiten S'-Ende ihres codierenden Strangs die folgenden Elemente aufweist:
a) ein bakterielles trp-Promoter-Operator~System;
b) Nukleotide, die für eine Ribosomen~»Bindestelle für die Translation des Elements (iv) codieren;
c) Nukleotide, die für ein Translations-Startsignal für die Translation des Elements (iv) codieren; und
d) ein Strukturgen^ das für die Aminosäuresequenz eines heterologen Polypeptide codiert,
wobei die genannte Sequenz vieder irgendeine trp~Attenuie~ rungs-Fähigkeit noch Nukleotide aufweist, die für die trpE«Ribosomen-Bindestelle codieren* Dabei ist das durch das genannte Strukturgen exprimierte Polypeptid vollständig heterolog oder das exprimierte Polypeptid ist ein Fusionsprotein, das ein heterologes Polypeptid und mindestens einen Teil der Aminosäuresequenz eines homologen Polypeptids aufweist s wobei der genannte Teil ein Teil der Aminosäuresequenz eines Enzyms ist, das am Biosyntheseweg von der Chorisminsäure zum Tryptophan beteiligt ist*
Weiterhin ist es möglich, daß das heterologe Polypeptid ein bioaktives Polypeptid und das angefügte homologe Poly-
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peptid ein spezifisch spaltbares bioinaktivierendes Polypeptid ist.
Insbesondere ist der erfindungsgemäße Vektor derart zusammengesetzt g daß'-das homologe Polypeptid das trpE-Polypeptid ist und die genannte Ribosomen^Bindestelle diejenige für das trp-»Leader~Polypeptid ist; das homologe Polypeptid das trpD-Polypeptid ist; das Fusionsprotein ein heterologes und ein homologes Polypeptid enthält> wobei das homologe Polypeptid selbst eine Fusion darstellt* und zwar aus etwa den ersten sechs Aminosäuren des trp«Leac!er~Polypeptids und der Aminosäuresequenz, die. durch mindestens etwa dem distalen Drittel des trpE-Polypeptidgens codiert wird*
Weiterhin betrifft die Erfindung ein Verfahren zur Schaffung eines Expressionoplasmids für die Expression eines heterologen Gensy welches dadurch gekennzeichnet ist, daß in Phase die folgenden Elemente gleichzeitig verknüpft werden;
a) ein erstes lineares doppelströngiges DNA-Fragment, das ein Replikon enthält und ein Gen^, das eine selektierbare Eigenschaft exprimiert8 wenn es unter die Steuerung eines bakteriellen Promoters gestellt wird, wobei das Fragment keinen derartigen Promotor aufweist;
bX ein'· zweit·©s lineares/ -doppelst rängiges DNA~Fragmentydas das genannte heterologe Gen aufweist; und
c) ein drittes doppelst rängiges DNA-Fragment, das einen bakteriellen Promoter aufweist.
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wobei die verknüpfbaren Enden der genannten Fragmente so gestaltet sindfi daß nach dem Verknüpfen zum Bilden eines sich replizierenden Plasmids sowohl das Gen für die selektierbare Eigenschaft als auch das heterologe Gen unter die Steuerung des Promoters kommen, wodurch die Verwendung der selektierbaren Eigenschaft bei der Selektion von transformierten Bakterienkolonien möglich ist, welche zur Expression der heterologen Gene fähig sind*
Die selektierbare Eigenschaft kann eine Antibiotikumresistenz seine
Die selektierbare Eigenschaft kann eine Tetracyclin-Resistenz sein und der bakterielle Promoter der trp-Promoter«,
Das Verfahren wird in vorteilhafter Weise so ausgeführt, daß die Verknüpfung ebenso ein Operon für die Expression von Ampicillin-Resistenz wiederherstellt.
Die Erfindung umfaßt weiterhin ein Verfahren zum Schneiden doppelsträngiger DNA, Es ist dadurch gekennzeichnet, daß zum Schneiden an jeder beliebigen Stelle
a) die doppelst rängige DNA in einem die zu schneidende Stelle umgebenden Bereich in einzelsträngige DNA umgewandelt wird; . ' · ' . ".
b) an die in Schritt a) gebildete Einzelstrangregion ein komplementäres Primerstück von einzelsträngiger DNA hybridisiert wird, wobei das 5'-Ende des Primers gegen« über demjenigen Nukleotid liegt, das an die beabsichtigte Schnittstelle angrenzt;
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c) derjenige Teil des zweiten, in Schritt a) eliminierten Strangs wiederhergestellt wird* der in 3'-Richtung des Primers liegt» und zwar durch eine Reaktion mit DNA-Polymerase in Anwesenheit von Adenin«β Thymin-, Guanin« und Cytosin-enthaltenden Desoxynukleotidtriphosphatenj und ·
d) das verbleibende DNA-Einzelstrangstück, das über die beabsichtigte Schnittstelle vorstehtj verdaut wird«
Erfindungsgemäß werden die Schritte c) und d) gleichzeitig durchgeführt durch Reaktion mit einer DNA~Polymerasef die in 5*.-——v-Z '-Richtung polymerisiert "g die Exonukleasewirkung in 3"——.>5.*.-Richtung aufweist1, jedoch keine Nuklease«* wirkung in 5'·———»3VRichtung zeigt„
Vorteilhaft ist die Polyrnerasef die Klenow-Polymerase I iet»
Das erfindungsgemäße Verfahren ist besonders vorteilhaft, wenn das heterologe Polypeptid ein wiedergewinnbares Polypeptid ist, das aus einer Gruppe von Polypeptiden ausgewählt wird, die menschliches Wachstumshormon, menschliches Proinsulin, Somatostatine Thymosin oil', die A-Ket-te des menschlichen Insulins sowie die B-Kette des menschlichen Insulins enthält*
Ebenso ist der'erfindungsgemäße Vektor besonders vorteilhafte wenn er ein heterogenes Polypeptid der oben beschriebenen Art enthält ο
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Mit der vorliegenden Erfindung werden für das Herstellen von heterologen Polypeptid-Produkten in Bakterien nsue, von Plasmiden abgeleitete Expressionsvektoren zur Verfügung gestellt. Die Vektoren haben eine Sequenz von doppelsträngiger DNA# die in Phase von einem ersten 5*~ zu einem zweiten 3*-Ende des codierenden Strangs folgende
Ab
Bestandteile enthält: einen trp-Promoter-Operator, TTukleotide, die für die trp-Leader-Ribosoraen-Bindestelle codieren und Hukleotide, die für die Translationsinitiation zur Expression eines Strukturgens codieren, welches für die Aminosäuresequenz eines heterologen Polypeptids codiert. Diese "beschriebene DNA-Sequenz enthält weder eine trp-Attenuator-Region noch Nukleotide, die für die trpE-Ribosomen-Bindestelle codieren. Stattdessen wird die trp-Leader-Ribosomen-Bindestelle wirkungsvoll dazu verwendet, die Expression von Information zu bewirken, die durch inserierte Gene codiert wird. ;
Mit einem, einen trp-Promoter-Operator enthaltenden, erfindungsgemäßen Plasmid, das keinen Attenuator aufweist, werden Zellen transformiert und in Gegenwart von zugegebenem Tryptophan kultiviert. Mit der Verwendung von Tryptophan-reichem Medium steht ausreichend Tryptophan zur Verfugung, um im wesentlichen vollständig den trp-Promoter-Operator durch trp/Repressorinteraktionen zu reprimieren, so daß das Zellwachstum, ungehemmt durch vorzeitige Expression großer Mengen von heterologen Polypeptiden, fortschreiten kann, wobei dieses Polypeptid durch eine Insertion codiert wird, die ansonsten unter der Kontrolle des trp-Promoter-Operator-Systems steht. Sobald einerseits die Kultur der Rekombinanten zu einer Dichte angewachsen ist, die für eine industrielle Herstellung des Polypeptids geeignet ist und andererseits das von außen zugeführte Tryptophan 'entfernt wurde, läßt man die Zellen lediglich mit dem Tryptophan wachsen, das sie selbst produzieren. Das Ergebnis ist eine schwache Tryptophanlimitierung, wodurch folglich der Syntheseweg dereprimiert wird und eine überaus wirksame Expression der heterologen Insertion auf~ tritt, unbehindert durch Attenuierung, da die Attenuator-Region aus dem System entfernt wurde. Auf diese Weise wird
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den Zellen niemals ernstlich Tryptophan entzogen, und alle Proteine* ob sie Tryptophan enthalten oder nicht, können in einem ausreichenden Umfang produziert werden*
Die Erfindung stellt weiter Mittel zur.Verfugung, um doppelsträngige DNA an jeder beliebigen, gewünschten Stelle zu schneiden, auch wenn eine Erkennungsstelle für ein. Restrilctionsenzym fehlt, eine Techniks die unter anderem für das Herstellen eines trp-Operons brauchbar ist,welches Attenuator-Deletionen aufweist, die sich von denjenigen unterscheiden, die man früher durch Selektion von Mutanten erhalten hat«,
Schließlich stellt die Erfindung eine Vielzahl von brauchbaren Zwischenprodukten und Endprodukten zur Verfugung, einschließlich spezifisch spaltbarer, heterolog-homologer Fusionsproteine, die unter Expressionsbedingungen gegen Abbau stabil sind,}
Ausführunqsbeispiel
Die Erfindung wird nachstehend an einigen Beispielen näher erläutert« In der beiliegenden Zeichnung zeigen:
Fige 1 das Schema einer bevorzugten Ausführung der Bildung und eines Plasmids, das fähig ist, heterologe Gene als F-ig,, 2: Fusionen m.it einem Teil des trpD-Pqlypeptids zu
exprimieren, von dem sie später abgespalten werden können;
Fig β 3,: das Ergebnis einer Polyacrylamid-Gel-Trennung von Zellprotein, das homolog( trpD* )«-heterologe (Somatostatin oder Thymosin 5>cl) Fusionsproteine enthält;
Fig. 4, aufeinanderfolgende Stufen in einem bevorzugten Fig. 5 Schema für die Herstellung eines Plasmids, das und fähig ist, direkt unter der Kontrolle eines trp-Fig« 6 Promoter-Operator-Systems ein heterologes Gen (menschliches Wachstumshormon) zu exprimieren;
Fig» 7 das Ergebnis einer Polyacrylamid-Gel-Trennung von Zellprotein, das menschliches Wachstumshormon enthält, welches direkt unter der Kontrolle des trp-Promoter-Operator-Systems exprimiert wurde;
Fig. 8, aufeinanderfolgende Stufen in einem bevorzugten Fig. 9a, Schema für die Herstellung eines Plasmids, das Fig. 9b fähig ist, heterologe Gene (in dem dargestellten und Fall für Somatostatin) fusioniert mit einem Teil Fig. 10 des trpE-Polypeptids zu exprimieren, wobei die Fusion später gespalten werden kann;
Fig. 11 das Ergebnis einer Polyacrylamid-Gel-Trennung von Zellprotein, das homolog(trpE)-heterologe Fusionsproteine zum Herstellen von Somatostatin bzw. Thymosinoci, menschlichem Proinsulin und der A- und B-Ketten des menschlichen Insulins enthält;
Fig. 12 aufeinanderfolgende Stufen der Art und Weise, und auf welche das Plasmid, das durch die Schemata Fig. 13 , <äer Figuren 8 bis einschließlich 10 konstruiert wurde, manipuliert wird, um ein System zu bilden, in dem andere heterologe Gene als Fusion mit trpE-Polypeptidsequenzen austauschbar exprimiert werden können.
9 9 R 5
L L. O «J
In den Figuren werden aus Gründen der Klarheit der Darstellung in den meisten Fällen nur der codierende Strang des doppelsträngigen Plasmids und lineare DNA-Stränge gezeichnet. Gene, die für die Eesistenz gegen ein Antibiotikum codieren, werden als ap (Ampicillin-Eesistenz)
R und te (Tetracyclin-Eesistenz) bezeichnet« Die Bezeichnung
te bedeutet ein Gen für Tetracyclin-Eesistenz, das nicht unter der Kontrolle eines Promoter-Operator-Systems steht, so daß Plasmide, die dieses Gen enthalten, dennoch Tetracyclin-sensitiv sind. Die Bezeichnung ap bezeichnet eine Ampicillin-Sensitivität, die durch die Deletion eines Teils des Gens entstanden ist, das für Ampicillin-Sensitivität codiert. Promotoren und Operatoren des Plasmids werden mit ρ und ο bezeichnet. Die Buchstaben A, T, G bzw. C bezeichnen die Nukleotide, die die Basen Adenin, Thymin, Guanin und Cytosin enthalten. V/eitere Legenden der Figuren werden aus dem Text ersichtlich.
Eine im folgenden beschriebene, bevorzugte Ausführungsform der Erfindung schließt die Verwendung einer Anzahl allgemein erhältlicher Eestriktionsendonukleasen ein, die im folgenden bezeichnet und mit ihrer zugehörigen Erkennungssequenz sowie dem Schneidemuster (angezeigt durch Pfeile) beschrieben sind.
IO
Xbal: TCTAGA Taql: TCGA
AGATCT T AGCJ
ί EcoRI: GAATTC HindIII : AAGCTT
. CTTAAG. t AGATCT TTCGAA t
BgIII: TCTAGA f Hpai": GTTAAC
GAGCTG CAATTG t I
PvuII GTCGAC t I GGATCC Pstl: CTGCAG
BamHI: CCTAGG r GACGTC t
Wo die Schnittpunkte auf den entsprechenden Strängen voneinander entfernt sind, werden die geschnittenen Enden "sticky", d.h. überstehend, und insofern in der Lage sein, sich wieder neu zu verbinden, bzw. diese "sticky-ends" können mit einer anderen, komplementären "sticky-end"-DNA durch Watson-Crick-Basenpaarung (A mit T und G mit C) korrekt miteinander verzapft werden. Einige Restriktionsenzyme, beispielsweise die oben beschriebenen Hpai und PvuII, hinterlassen nach dem Schnitt stumpfe Enden. Die "oben gezeigten Nukleotidsequenzen sind gemäß einer diesbezüglichen 'Übereinkunft in der, folgenden Weise darge- . ·. stellt: Der obere Strang ist der Protein-codierende Strang, und man bewegt sich fortschreitend von links nach rechts vom 5'- zum 3'-Ende dieses Strangs, d.h. in Richtung der Transkription von einem proximalen zu einem distalen Punkt.
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Schließlich "bezeichnet, im Hinblick auf die Übereinkunft, das Symbol "Δ" eine Deletion. Daher bezeichnet eine Benennung eines Plasmids, wie beispielsweise "AEcoRI-Xbal", dasjenige Plasmid, aus welchem die Nukleotidsequenz zwischen den EcoRI- und Xbal-Erkennungsstellen der entsprechenden Restriktionsenzyme durch Verdauung durch diese Enzyme entfernt wurde» Der Einfachheit halb er.wurden verschiedene Deletionen durch Zahlen bezeichnet. Die Bezeichnung "Δ1" bedeutet daher, beginnend vom ersten Basenpaar (Bp) der EcoRI-Erkennungsstelle, die auf das Gen für Tetracyclin-Resistenz in dem Elternplasmid pBRj522 folgt, eine Deletion vom Bp 1-30 (d.h. AEcoRI-Hindlll) und daraus folgend ein Ausschalten des Tetracyclin-Promoter-Operator-Systeins. Als "A2" wird eine Deletion der Bp 1-375 verstanden (d.h. ÄEcoRI-BamHl) und infolgedessen ein Entfernen sowohl des Tetracyclin-Promoter-Operators und der Strukturgene, die für Tetracyclin-Resistenz codieren. Die Bezeichnung "A3" bedeutet eine Deletion der Bp 3611-4359 (d.h. APstl-EcoRI) und die Eliminierung der Ampicillin-Resistenz. "ΛΛ" wird verwendet, um das Entfernen der Bp ~9OO-~15OO vom trp-Operon-Pragment 5 (Fig. 1) zu bezeichnen, in dem die Strukturgene für das trpD-Polypeptid eliminiert sind.
Die trp-Leader-Sequenz ist aus den Basenpaaren (Bp) 1-162 aufgebaut, angefangen vom Startpunkt für die trpmRNA..Ein auf 14 Aminosäuren'geschätzes trp-Leader-Polypeptid wird durch die Bp 27-71 codiert, die den ATG-Nükleotiden folgen, die für das Translations-Startsignal codieren. Die trp-Attenuator-Region enthält aufeinanderfolgend GC-reiche und AT-reiche Sequenzen, die zwischen den Bp 114 und 156 liegen. Die Attenuierung wird offensichtlich durch rnRNA-Nukleotide bewirkt, die durch die
Bp '--134—141 der Leader-Sequenz codiert werden. Um heterologe Polypeptide unter dem Einfluß der trp-Leader-Ribosomen-Bindestelle zu exprimieren und gleichzeitig die Attenuierung zu verhindern, müssen die folgenden Kriterien "beachtet werden:
1. Die Basenpaare 134-141 oder noch mehr über das Bp 141 hinaus müssen deletiert werden;'
2. das ATG-Codon des inserierten Gens muß,wie bekannt, in der richtigen Lage zu einer Ribosomen-Bindestelle ausgerichtet sein (siehe z.B. J.A. Steitz "Genetic signals and nucleotide sequences in messenger RITA" in Biological Regulation and Control (ed. R. Goldberger) Plenum Press, N.Y. (1978));
3. wo ein homolog-heterologes Fusionsprotein produziert werden soll, sollte das Translations-Startsignal einer homologen Polypeptidsequenz verfügbar bleiben, und die Codons für den homologen Teil des Fusionsproteine müssen in Phase ohne dazwischenliegende Translations-Stopsignale inseriert werden.
Wenn beispielsweise alle Basenpaare innerhalb der Leader-Sequenz distal vom Bp 70 deletiert werden, wird die Attenuator-Region entfernt, die ATG-Sequenz,- die für das Translations-Startsignal codiert, verbleibt und der dazwischenliegende Translations-Stop, codiert durch TCA (Bp 69-71), wird, entfernt durch Eliminieren von A und die darauffolgenden Nucleotide. Eine derartige Deletion hätte als Ergebnis die Expression eines Fusionsproteins, das mit dem Leader-Polypeptid beginnt und mit demjenigen Polypeptid endet, das durch irgendeine heterologe Insertion codiert wird. Von diesen Polypeptiden wird eine distale Region
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eines an die Leader-Sequenz anschließenden trp-Operon-Polypeptids eingeschlossen, die durch das Ausmaß der Deletion in der 3'-Richtung bestimmt wird. Eine in das Gen E hineinreichende Deletion würde daher zur Expression eines homologen Vorläufers führen, der die L-Sequenz und die distale Region des Gens E (jenseits des Endpunkts der. Deletion) enthält, verbunden mit der Sequenz, die durch irgendeine folgende Insertion codiert wird, usw.
J Zwei besonders brauchbare Plasmide, aus denen die Attenuator· . Region entfernt wurde, sind die Plasmide pGM1 und pGM3 (G.F. Miozzari et al., J. Bacteriology 133, Ή57 (1978)). Diese Plasmide tragen die Deletionen trp ΔΙΜ 1413 und trp Δ LE 14-17 und exprimieren (unter der Kontrolle des trp-Promoter-Operators) ein Polypeptid, das ungefähr die ersten sechs Aminosäuren des trp-Leaders und distale Regionen des E-Polypeptids enthält. In dem besonders bevorzugten Pail des Plasmids pGM1 wird lediglich etwa das letzte Drittel des E-Polypeptids exprimiert, wohingegen pGM3 nahezu die gesamte distale Hälfte des E-Polypeptid-Codons exprimiert. Der Stamm E.coli K-12 V/3110 tna ff trp_~A102, äer pGM1 ent-
-, hält, ist bei der American Type Culture Collection (ATCC) unter der Kummer 31622 hinterlegt. Das Plasmid pGM1 kann auf herkömmliche Weise aus dem genannten Stamm zur Verwendung in den unten beschriebenen Verfahren entfernt werden.
..Eine Möglichkeit, um mit den durch die Erfindung bereitgestellten Mitteln Deletionen einzuführen, ist das spez-i--' fische Schneiden von doppelsträngiger DHA an jeder gewünschten Stelle. Ein Beispiel dieser Schneidetechnik ist unten im Teil IV der Beschreibung der Experimente dargelegt. Dabei wird doppelsträngige DNA in einem den beabsichtigten Schneidepunkt umgebenden Bereich durch Reaktion mit X-Exonuklease in einzelsträngige DNA umge-
-abDaraufhin wird ein synthetischer oder anderer Einzelstrang-DNA-Primer an das vorher gebildete Einzelstrangstück durch Watson-Crick-Basenpaarung hybridisiert. Dabei muß sichergestellt sein, daß das 5'-Ende der Primer-Sequenz exakt gegenüber demjenigen Nukleotid auf dem ersten Strang endet, das genau vor dem beabsichtigten Schneidepunkt liegt. Als nächstes wird der Primer durch Reaktion mit DNA-Polymerase in 3'-Richtung verlängert, wodurch derjenige Teil der ursprünglich doppelsträngigen DNA, der vor dem beabsichtigten Schnittpunkt liegt,.wieder hergestellt wird, der im ersten Schritt verlorengegangen war. Gleichzeitig oder danach wird derjenige Teil des ersten Stranges, der jenseits des beabsichtigten Schnittpunkts liegt, wegverdaut. Das nachfolgende Schema veranschaulicht diesen Vorgang noch einmal, wobei "v" den beabsichtigten Schnittpunkt kennzeichnet:
a) I .- beabsichtigter Schnittpunkt
»ν»
c) .d)
Bilden eines Einzelstranges im Bereich von "v"
Primer-Hybridi sierung Verlängerung des Primers
e) j.··.·« ——— ____ Einzelstrangverdauung
I- L Ö 3 ä *k
In einer besonders bevorzugten Ausführungsform werden die Schritte (d) und (e) gleichzeitig ausgeführt, wobei eine Polymerase verwendet wird, die gleichzeitig die vor stehenden Einzelstrangenden in der 3' -} 5'-Richtung verdaut und den Primer (in Anwesenheit von dATP, dGTP, dTTP und dCTP) in der 5' -> 3'-Richtung verlängert. Besonders geeignet für diese Zwecke ist die Klenow-Polymerase I, d.h. dasjenige Fragment, das durch proteolytisches Spalten . der DNA-Polymer ase I erhalten wird und die 51 -* 3'-Polymerisierungsaktivität sowie die 3' -> 5'-Exonukleaseaktivität des Elternenzyms aufweist, dagegen seine 51 "4 3'-Exonukleaseaktivität verloren hat (A. Korn berg, DNA Synthesis, 98, V/.H. Freeman und Co., SFO
Bei Verwendung des eben beschriebenen Verfahrens können Attenuator-Deletionen in einem ein trp-Operon enthaltenden Plasraid auf jede nur gewünschte Weise eingeführt werden. Das Plasmid wurde vorher in die lineare Form überführt, beispielsweise durch einen Schnitt an einer Restriktionserkennungsstelle stromabwärts von dem beabsichtigten Schnittpunkt, an dem das Molekül stumpfendig sein soll (siehe Bereich "v" im oben gezeigten Schema). Nach dem Deletier.en der Attenuator-Region wird das Plasmid wieder in die Ringform gebracht. Dies.kann beispielsweise durch Verbinden der stumpfen Enden oder auch durch andere Methoden geschehen, die dem Fachmann bekannt sind.
Obwohl die Erfindung die direkte Expression heterologer Polypeptide· unter der Kontrolle des trp-Prpmoter-Operators umfaßt, ist der bevorzugte Fall die Expression von fusionierten Proteinen, die sowohl homologe als auch heterologe Sequenzen enthalten, wobei letztere vorzugsweise durch extrazelluläre Maßnahmen spezifisch von den homologen Proteinen abspaltbar sind. Ganz besonders bevorzugt sind
Fusionen, in denen der homologe Teil eine oder mehrere Aminosäuren des trp-Leader-Polypeptids enthält und etwa ein Drittel oder mehr der trpE-Aminosäuresequenz (distales Ende). So erhaltene Fusionsproteine scheinen unter Expressionsbedingungen bemerkenswert stabil gegen Abbau zu sein.
Das Bakterium E.coli K-12, Stamm V/3110 tna 2~trp~AiO2 (pGMi), ATCC Nummer 31622, kann dazu verwendet werden, den Vorrat des Plasmids pGM1 zu vervielfachen, das bevorzugt für die Konstruktion des Attenuator-freien trp-Promoter-Operator-Systems der Erfindung verwendet wird. Dieser Stamm ist in Gegenwart von Anthranilat phänotypsich trp+ und kann in Minimalmedium, beispielsweise LB, das mit 50 /ug/ml Anthranilat supplementiert wurde, wachsen.
Alle Bakterienstämme, die im Zusammenhang mit der Erfindung für die trp-Promoter-Operator dirigierte Expression verwendet werden, sind trp Repressor* (trp R+) wie im Fall des Wildtyp E.coli, so daß die Repression sichergestellt ist, bis die heterologe Expression angestrebt wird.
In einer bevorzugten Ausführungsform wird die DMA-Rekombination in EeColi K-12, Stamm 294- (end A, thi~, hsr~, hsmi), ATCC Hummer 31446, durchgeführt, einem Bakterienstamm, dessen Membraneigenschaften die Transfor- «mation erleichtern.« Plasmide·, die heterologe Polypeptide produzieren und im Stamm 294 gewachsen sind, werden'auf die übliche Weise .extrahiert und in Lösung gehalten (beispielsweise 10 mM Tris, 1 mM EDTA, pH 8,0) bei Temperatüren von etwa -200C bis 40C. Für die Expression unter industriellen Bedingungen wird andererseits jedoch bevorzugt ein widerstandsfähigerer Stamm verwendet, nämlich E.coli K-12
A~F~RV 508 strr, gal J08", ATCC Nummer 31608. RV 308 ist ernährungsmäßig Wildtyp und wächst gut in Minimalmedium, in dem alle nötigen Macromoleküle aus einer üblichen Mischung von Ammonium-, Phosphat- und Magnesiumsalzen, Spurenelementen und Glukose synthetisiert werden. Nach der Transformation einer RV 308-Kultur mit dem aus dem Stamm 294 abgeleiteten Plasmid wird die Kultur auf einem Medium plattiert, das für einen Marker selektiv ist (beispielsweise Resistenz gegen ein Antibiotikum), den das Plasmid trägt ·. Eine Transformantenkolonie wird abgeimpft und in einer Piaschenkultur gezüchtet. Aliquots dieser Flasehenkultur werden in 10 % DMSO oder Glycerinlösung (in sterilen Wheaton-Fläschchen) in einem Äthanol-Trockeneisbad schockgefroren und auf -800C tiefgefroren. Um das codierte heterologe Polypeptid zu produzieren, werden Proben der Kultur in einem Medium gezüchtet, das Tryptophan enthält, um den trp-Promoter-Operator zu reprimieren. Anschließend wird dem System das zugegebene Tryptophan entzogen, um die Expression zu ermöglichen.
Für die erste Wachstumsstufe kann beispielsweise LB-Medium verwendet werden (J.H. Miller, Experiments in Molecular Genetics, 433, Cold Spring Harbor Laboratory (1972)), das pro Liter wäßriger Lösung 10 g Bacto Trypton, 5 g Bacto Hefeextrakt und 10 g NaCl enthält. Vorzugsweise läßt man die beimpfte Kultur bis zu einer optischen Dichte (o.D.) von 10 oder mehr (bei 550 nm), insbesondere zu einer o.D. von 20 oder mehr-, besonders bevorzugt jedoch zu einer o.D'. von 30 oder mehr wachsen·, jedoch nicht bis zur stationären Phase.
Für die Derepression und Expression wird die beimpfte Kultur als nächstes unter Bedingungen gezüchtet, unter · denen der Zelle das zugegebene Tryptophan entzogen wird.
Ein geeignetes Medium für ein derartiges Wachstum ist M9 (J.H. Miller, Seite 431, a.a.O.), das wie folgt hergestellt wird (pro Liter):
: KH2PO4 3g
Na__frpOi f\ σ
Λ.Λ CJ /*} ± J,) \,/ J t V^l ^j
NaCl 0,5 g
NH4Cl 1g
Nach dem Autoklavieren wird dieser Mischung zugegeben:
10 ml 0,01 M CaCl2
1 ml 1 M MgSO4
10 ml 20 % Glukose
Vitamin B1 1 yug/ral
"Humko Hycase Amino"
oder DIFCO Käsein-Aminosäuren 40 /ig/ml.
Das Aminosäuresupplement ist ein Hydrolysat von Kasein, dem Tryptophan fehlt.
Um die Expression des heterologen Polypeptids zu starten, kann man "beispielsweise die in einem Tryptophan-reichen Medium gewachsene Impfkultur in einem größeren Volumen eines .Mediums verdünnen, das kein zusätzliches Tryptophan enthält -("Beispielsweise'in einer -2--his 10-fachen V-erdünr- ' nung). Man läßt die Kultur dann "bis zu einer gewünschten Dichte wachsen (vorzugsweise bis kurz vor die stationäre Wachstumsphase) und erhält das angestrebte Produkt auf übliche Weise durch Lyse, Zentrifugieren und Reinigen. In dem Wachstumsstadium des Tryptophanentzugs läßt man die Zellen vorzugsweise bis zu einer o.D. von mehr als 10,
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insbesondere von mehr als 20 und besonders bevorzugt bis zu oder über eine o.D. von 30 (jeweils bei 550 mn) wachsen, ehe das angestrebte Produkt isoliert, wird.
Alle DNA-Rekombinations-Experimente, die in dem folgenden experimentiellen Teil beschrieben werden, wurden bei Genentech Inc. in Übereinstimmung mit den Richtlinien des National Institutes of Health (NIH) bezüglich der Forschung mit rekombinanter DNA durchgeführt.
I. Expression des D-Polypeptid-Fusionsproteins
Mit Bezug auf die Figuren 1 bis 3 wird ein bevorzugtes Verfahren zur Expression von Fusionsproteinen beschrieben, die das gewünschte Polypeptid enthalten und, daran angebunden, einen Teil der Aminosäuresequenz des trpD-Polypeptids, das in vitro mittels einer Aminosäure Methionin, die spezifisch für ein CNBr-Spalten sensitiv ist, abgetrennt werden kann.
A) Konstruktion von pBRHtrp
Das Plasmid pGM1 (1, Fig. 1) trägt das E.coli-Tryptophan-Operon, das die Deletion AIiE 1413 : enthält (G.F. Miozzari et al., (1978), J. Bacteriology 1457-1466) und exprimiert somit ein Fusionsprotein,· das die ersten sechs Aminosäuren des trp-Leaders und annähernd'das letzte Drittel .des trpE-Polypeptids (im nachfolgenden als die Verbindung LE1 bezeichnet), ebenso wie das vollständige trpD-Polypeptid, enthält, alle unter der Eontrolle des trp-Promoter-Operator-Systems. 20 /ig des Plasmids werden mit dem Restriktionsenzym PvuII verdaut, das das Plasmid
^ Oi C% V O / 1 25β8βΐ981
L Z ϋ J i 4 ^ 30 AP C 12 D/228 54.3/2
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an fünf Stellen schneidet. Das Genfragroent 2 (Fig. 1) wird als nächstes mit einer EcoRI-Verbindungsstelle, einem sogenannten Linker (bestehend aus einem in sich selbst komplementären Oligonukleotid 3 (Fige 1) der Sequenz: ρCATGAATTCATG) kombiniert„ wodurch eine EcoRI-Schnittstelle für ein späteres Clonen in ein Plasrn.id 20 (Fige 6), das eine EcoRI-Erkennungsstelle enthält» zur Verfügung gestellt wird* Die durch das Plasmid pGMl erhaltenen 20 ^g des DNA-Fragments 2 (FigV. .1) werden mit 10 Einheiten T>~DNA~ Ligase in Anwesenheit von 200 Picomolen des 5*~phosphoryliertens synthetischen Oligonukleotids 3 (Fig„ 1) mit der Sequenz ρCATGAATTCATG und in 20 ^l T4~DNA~Ligase~Puffer (20 mM Trisf pH 7,6; 0^5 mM ATP, 10 mM MgCl2, 5 mM Dithio-' threit) bei 4 C über Nacht behandelt« Die Lösung wird daraufhin 10 Minuten lang bei einer Temperatur von 70 0C erhitzt, um die Ligasebindung zu stoppen« Die Linker werden durch EcoRl-Verdauung geschnitten,und die Fragmente, die nun EcoRI-=Enden enthalten,, werden mittels 5%±ger Polyacrylamid~Gel-*Elektrophorese (im folgenden PAGE genannt) voneinander getrennte Die drei größten Fragmente v/erden sodann aus dem Gel isoliert, indem sie zuerst mit Athidiumbromid markiert ε danach die Fragmente mit Ultraviolett~Lxtit lokalisiert und schließlich die interessierenden Teile aus dem Gel herausgeschnitten wordene Dedes Gelfragment wird mit 300 Mikrolitern 0^1 χ TBE in einen Dialyseschlauch überführt und in einem 0sl χ TBE«Puffer bei 100 V eine Stunde lang einer Elektrophorese unterworfen (der TBE« Puffer enthält·: ior8' g Tris, g Borsäure, 0,09 g Na2EDTA in 1 1 H9O)9 Die wäßrige Lösung
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wird aus dem Dialyseschlauch gesammelt, mit Phenol extrahiert, mit Chloroform extrahiert, und 0,2 Natriumchlorid-molar gemacht und die DNA in Wasser überführt, nachdem sie mit Äthanol gefällt wurde. (Sämtliche DNA~Fragment-Isolie~ rungen, die im folgenden "beschrieben werden, wurden unter Vervrendung von PAGE, gefolgt von der eben beschriebenen Methode des Elektroeluierens durchgeführt.) Das Gen 5 (Fig. 1), das den trp-Promoter-Operator enthält sowie überstehende EcoRI-Enden aufweist, wird in einem Verfahren identifiziert, das als nächstes beschrieben werden wird, welches das Einfügen von Fragmenten in ein Tetracyclin-sensitives Plasmid (Fig. 1) zur Folge hat, das, infolge der Promoter-Operator-Insertion, Tetracyclin-resistent wird.
B) Herstellen des Plasmids pBRHtrp, das unter der Kontrolle des trp-Promoter-Operators Tetracyclin-Resistenz exprimiert sowie Identifizieren und Vervielfältigen des im obigen Abschnitt A) isolierten DNA-Fragments 5 (Fig. 1), das den trp-Promoter-Operator enthält.
Das Plasmid 6 (Fig. 1) mit der Bezeichnung pBRH1 (R.I. Rodriguez, et al., Nucleic Acids Research 6, J267-3287 (1979)) exprimiert Ampicillin-Resistenz ' . und enthält das· Gen für Tetracyclin-Resiste.nz, welches allerdings, da kein dazugehöriger Promoter vorhanden ist, diese Resistenz nicht exprimiert. Dementsprechend ist das Plasmid Tetracyclin-sensitiv. Durch Einführen eines Promoter-Operator-Systems in die EcoRI-Erkennungsstelle kann das Plasmid Tetracyclin-resistent gemacht werden.
Das Plasmid pBRH1 wird mit EcoEI verdaut, worauf das Enzym durch. Phenol-Extraktion entfernt wird, gefolgt durch eine Chloroform-Extraktion und
. Wiederaufnahme in Wasser nach einer Äthanolfällung. Das entstandene DNA-Molekül 7 (Jig. 1) wird, in getrennten Reaktionsmischungen, mit jedem der drei DNA-Fragmente, die im oben geschilderten Teil A) erhalten wurden, kombiniert und mit IV-DNA-Ligase, wie vorstehend beschrieben, verbunden. Die in der Reak.tionsmischung vorhandene DNA wird durch Standardtechniken (V. Hershfield et al., Proc Nat 1I Acad Sei USA 71, 3455-3459 (1974-)) dazu verwendet, um einen kompetenten E.coli K-12, Stamm (Kc Backman et al., Proc Nat 1I Acad Sei USA 73, 4174-4198 (1976)) (ATCC Nummer 3W8) zu transformieren, worauf die Bakterien auf LB-Platten, die 20 /ig/ml Ampicillin und 5 /ig/ml Tetracyclin
. enthalten, plattiert werden.-Es v/erden einige Tetracyclin-resistente Kolonien selektiert, die Plasmid-DNA isoliert und die Anwesenheit des gewünschten ."Fragments durch eine Restriktionsenzym-Analyse sichergestellt. Das resultierende Plasmid (Fig. 1), mit der Bezeichnung pBRHtrp, expriiaiert ß~Lactamase, verleiht Ampicillin-Resistenz, und es enthält ein DNA-Fragment, das den trp-Promoter-Operator einschließt und für ein erstes Protein codiert, das aus einer Fusion der ersten, sechs Aminosäuren des. trp-Leaders: und annähernd des letzten Drittels des trpE-Polypeptids (dieses Polypeptid wird EE1 genannt) besteht, sowie für ein zweites Protein, entsprechend der ungefähr · ersten Hälfte des trpD-Polypeptids. (dieses Polypeptid wird D' genannt) und weiterhin für ein drittes Protein, für das das Gen für Tetracyclin-Resistenz codiert.
C) Cionierende Gene für verschiedene Endprodukt-Polypeptide und die Expression dieser Gene als Fusionsproteine, die das Endprodukt und einen spezifisch spaltbaren trpD-Polypeptid-Vorläufer · enthalten (Fig. 2). .
Aus dem Plasmid pBRHtrp erhält, man ein, den trp-Promoter-Operator und Codons für die IE1- und D'-Polypeptide aufweisendes DNA-Fragment, das in Plasmide inseriert wird, die Strukturgene für verschiedene gewünschte Polypeptide enthalten, im folgenden beispielhaft dargestellt für den Fall des Somatοstatin (Fig. 2).
Das Plasmid pBRHtrp wird mit dem Ee strikti ons enzym EcoEI verdaut und das so entstandene Fragment 5 (Fig. 2) durch PAGE und Elektroeluierung isoliert. Das EcoRI-verdaute Plasmid pSom11 (K. Itakura et al., Science 198, 1056 (1977)); GB-PS 2 007 676 A) wird mit Fragment 5 (Fig. 2) vereint. Die Mischung wird, wie oben beschrieben, mit T^-DRA-Ligase verbunden, und mit der resultierenden DHA wird E.coli K-12, Stamm 294, wie bereits geschildert, transformiert. Transformierte Bakterien werden auf Ampicilli enthaltenden Platten selektiert. So erhaltene Ampicillin-resistente Kolonien werden durch Hybridisieren der Kolonien geprüft (M. Gruenstein ' et al., .Proc Hat 1I Acad Sei USA 72, 3951-3965 wobe.i als Vergleich das aus dem Plasmid pBRHtrp ' isolierte, den trp-Promoter.-Operator enthaltende Fragment 5 (Fig. 2) verwendet wird, das mit Έ radioaktiv markiert wurde. Verschiedene Kolonien, die sich bei der Hybridosierung der Kolonien als positiv herausgestellt haben, werden selektiert,
die Plasmid-DNA wird isoliert und die Orientierung des inserierten Fragments durch Restriktionsanalyse bestimmt, wobei die Restriktionsenzyme BgIII und BamHI in einer Doppelverdauung verwendet werden. Der Stamm E.coli 294-, der das Plasmid 11 (Fig. 2), mit der Bezeichnung pSom7fi2T enthält, welches das trp-Promoter-Operator-Fragment in der gewünschten Orientierung aufweist, wird in LB-Medium gezüchtet, das 10/ig/ml Ampicillin enthält. Man läßt die Zellen bis zu einer optischen Dichte von 1 wachsen (bei 550 nm)? sammelt sie durch Zentrifugieren und resuspendiert sie in M9-Medium in zehnfacher Verdünnung. Man läßt die Zellen daraufhin zwei bis drei Stunden lang wachsen, bis sie wieder eine optische Dichte von 1 aufweisen, lysiert sie und analysiert das vollständige zelluläre Protein mit SDS (Natriumdodecylsulfat), Harnstoff (15 %) und Polyacrylamid-Gel-Elektrophorese (J.V. Maizel Jr. et al., Meth Viral 5, 180-246 (1971))-
In Fig. 3 ist eine Protein-Gel-Analyse dargestellt, bei der sämtliches Protein von verschiedenen Kulturen der Größe nach getrennt wurde. Die Dichte der einzelnen Banden gibt die Menge wieder, in der die entsprechenden Proteine vorliegen, in der Abbildung der Fig. 3 sind die Spalten 1 und 7 ' Kontrollen, die eine Vielzahl von Proteinen ent- : halten, deren Größe· vorher bestimmt wurde und die als Referenz dienen. In den Spalten 2 und 3 ist' zelluläres Protein von Kolonien des Stammes E.coli 29^ gewandert, der mit dem Plasmid pSom7Ä2 trans- " formiert wurde und entweder in LB-Medium (Spalte 2) oder in M9-Medium (Spalte 3) gezüchtet wurde. Die Spalten 4· und 5 enthalten zelluläres Protein, das
aus ähnlichen Zellen erhalten wurde, die mit dem Plasmid pTha742 transformiert wurden. Hierbei handelt es sich um ein Thymosin-exprimierendes Plasmid, das durch ein im wesentlichen mit dem bereits beschriebenen identischen Verfahren erhalten wird, wobei von dem Plasmid pThid ausgegangen wird (siehe die gemeinsam von Roberto Crea und Ronald B. Wetzel auf die Anmelderin übergegangene. US-Patentanmeldung, eingereicht am 28. Februar 1980 bezüglich der Thymosin 0C1-Produktion; durch dieses Zitat ist die Patentanmeldung in die Offenbarung mit einbezogen). Die Spalte 4 enthält zelluläres Protein von E.coli 29VpThcc7A2, das in LB-Medium gewachsen ist, wohingegen die Spalte 5 Zellprotein aus derselben Transformanten enthält, die jedoch in M9-Medium gewachsen ist. Spalte 6, eine weitere Kontrolle, ist das Proteinmuster von E.coli 294/ pBR322, gewachsen in LB-Medium.
Ein Vergleich mit den Kontrollen zeigt, daß die oberste der beiden am stärksten hervortretenden Banden in den Spalten 3 und 5 Proteine derjenigen Größe enthalten, die im Fall der Expression eines Fusionsproteins erwartet wird, das das D'-PoIypeptid und Somatostatin bzw. Thymosin enthält (die andere ausgeprägte Bande enthält das LE'-Polypeptid als Ergebnis der Deletion des Attenuators Fig. 3 bestätigt, daß die Expression in Tryptophanreichem Medium reprimiert ist, jedoch unter Tryptophan-Mangelbedingungen dereprimiert ist.
D) Bromcyan-Spaltung und Radioimmunoassay des Hormonprodukts
Sowohl im Fall des Thymosins als auch des Somatostatins wird das vollständige, zelluläre Protein mit Bromcyan gespalten, das Spaltprodukt wiedergewonnen und, nach dem Trocknen, in Puffer resuspendiert und durch Radioimmunoassay analysiert, wodurch sichergestellt wird, daß das Expressionsprodukt immunologisch identisch ist mit Somatostatin bzw. Thymosin. Das Spalten mit Bromcyan ist "beschrieben bei D.V. Goeddel et al., Proc Nat 1I Acad Sei USA 76, 106-110 (1979).
II. Konstruktion von Plasmiden für die direkte Expression heterologer Gene unter der Kontrolle des trp-Promoter-Operator-Systems
Die Strategie für eine direkte Expression hat die Schaffung eines Plasmids zur Folge, das distal von allen Kontrollelementen des trp-Operons eine einzige . Restriktionserkennungsstelle aufweist, in welche heterologe Gene.anstelle der trp-Leader-Sequenz und in richtigem, räumlichem Verhältnis zu der trp-Leader-• ' Ribosomen-Bindestelle des Polypeptids geclont werden können.· Die Durchführung der direkten Expression wird im folgenden für den Fall der Expression des menschlichen Wachstumshormons beispielhaft beschrieben.
10yug des Plasmids pSom7A2 werden mit EcoRI geschnitten und das DNA-Fragment 5 (Fig. 4), das die genetischen Bestand-
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teile für Tryptophan enthält, wird durch PAGE und Elektroeluierung isoliert. 2 ug dieses Fragments werden mit zwei Einheiten der Restriktionsendonuklease Taql verdaut, und zwar 10 Minuten bei 37°C, so daß im Durchschnitt nur eine der vermutlich fünf Taql-Erkennungsstellen in jedem Molekül geschnitten wird. Diese teilweise verdaute Fragmentmischung wird durch PAGE getrennt und ein annähernd 300 Basenpaare langes Fragment 12 (Fig. 4·), das ein EcoRI-Ende und ein Taql-Ende enthält, wird durch Elektroeluierung isoliert. Die korrespondierende Taql-Erkennungsstelle ist zwischen den Startstellen für die Transkription und die Translation angeordnet und liegt 5 Nukleotide stromaufwärts vom ATG-Codon des trp-Leader-Peptids. Die DNA-Sequenz dieses Bereichs ist in Fig. 4 gezeigt. Wenn man wie "beschrieben verfährt, kann ein Fragment isoliert werden, das alle Kontrollelemente des trp-Operons enthält, d.h. das Promoter-Operator-System, das Transkriptions-Initiationssignal und die trp-Leader-Ribosomen-Bindestelle.
Als nächstes wird der, dem Translations-Startsignal für die trp-Leader-Sequenz benachbarte Taql-Rest am 3'-Ende des erhaltenen Fragments in eine Xbal-Erkennungsstelle umgewandelt, wie Fig. 5 zeigt. Dies erfolgt durch Anknüpfen des oben erhaltenen Fragments an ein Plasmid, das nur eine einzige EcoRI- und eine einzige Xbal-Erkennungs-stelle enthält. Für diese ' . Zwecke kann man im wesentlichen jedes Plasmid verwenden, das aufeinanderfolgend ein Eeplikon, einen selektierbaren Marker, beispielsweise eine Antibiotikum-Resistenz, und EcoRI-, Xbal- und BamHI-Erkennungsstellen enthält. Hierzu kann beispielsweise eine Xbal-Erkennungsstelle zwischen die EcoRI- und BamHI-Erken-
AP C 12 I) /228 543/2 59 004/18
nungsstelle auf dem Plasraid pBR322 eingefügt werden (Pe Bolivar et al., Gene 2, 95 - 119 (1977)), und zwar beispielsweise in der Weise, daß an der einzigen Hindlll-Erkennungsstelle des Plasmids mit dem Restriktionsenzym Hindill geschnitten wird, gefolgt von einer Einzelstrangspezifischen Nukleaseverdauung der so entstandenen überstehenden Enden und Verknüpfen der stumpfen Enden eines sich selbst fest verbindenden doppelsträngigeny synthetischen Nukleotids, das beispielsweise eine Erkennungsstelle CCTGTAGAGG enthält«, Andererseits können auf natürliche Weise erhaltene DNA-Pragmente verwendet v/erden, wie im vorliegenden fall, die eine einzelne Xbal-Erkennungsstelle zwischen BcoRI» und BamHI-Schneideresten enthalten. Mit üblichen Mitteln wurde somit ein EcoRI- und Bamlll-Verdauungsprodukt des Genoms des Hepatitis-B-Virus hergestellt und zwischen die EcoRI- und BamHI-Erkennungsstellen des Plasmids pGH6 eingefügt (DcV. Goeddel et al., Nature 281, 544 (1979)), wodurch das Plasmid pHS32 gebildet wird. Bas Plasmid pHS32 wird mit Xbal geschnitten und aufeinanderfolgend mit Phenol und Chloroform extrahiert und mit Äthanol gefällt. Es wird dann mit 1 yul E. coli-Polyrnerase I, Klenow-Fragment in 30 μΐ Polymerase-Puffer (50 mM Calciumphosphat pH 7,4, 7 ml MgCl2, 1 mM ß-Mercaptöäthanol), enthaltend 0,1 mM dTTP und 0,1 mM dCTP, vorerst 30 Minuten lang bei 0° C und dann 2 Stunden bei 37° C behandelt. Diese Behandlung hat zur Folge, daß zwei der-vier,.zu der am 5'-Ende überstehenden Xbal-Schneidestelle komplementären Nucleotiden aufgefüllt werden?. .' , , . .. ';.
CTAGA- 51 CTAGA
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Zwei Nukleotide, dC und dT, werden auf diese \7eise eingebaut, wodurch ein Ende mit zwei 5'-überstehenden Nukleotiden entsteht. Dieser lineare Rest des Plasmids pHS32 wird (nach Phenol- und Chloroformextraktion und Wie der auf nähme in. Wasser nach Äthanol fällung) mit EcoRI geschnitten. Das große Plasmidfragment 13 (Fig. 5) wird von dem kleineren EcoRI-Xbal-Fragment durch PAGE getrennt und nach Elektroeluierung isoliert, Dieses DNA-Fragment von pHS32 (~0,2 ng) wird, unter ähnlichen Bedingungen wie oben beschrieben, an das EcoRI-Taql-Fragment des Tryptophan-Operons (0,01 yag) angeknüpft, wie in Fig. 5 dargestellt. Bei diesem Verfahren wird das überstehende' Taql-Ende mit dem verbleibenden überstehenden Xbal-Ende verknüpft, wobei sogar vermutet wird, daß nicht überall Watson-Crick-Basenpaarung vorliegt:
0? CTAGA TCTAGA-
AGC TCT AGCTCTi
Ein Teil dieser Verknüpfungs-Reaktionsmischung wird in E.coli 294-Zellen transformiert, wie oben in Abschnitt I beschrieben, hitzebehandelt und auf LB-Platten, die Ampicillin enthalten, plattiert
24- Kolonien werden selektiert, in 3 ml LB-Medium gezüchtet und das'Plasmid isoliert. Sechs- dieser Plasmide zeigten via E.coli katalysierter DNA-Reparatur und -Replikation eine- völlig . wiederhergestellte. Xbal-Erkennungsstelle:
^TCTAGA TCTAGA-^—
^AGCTCT —AGATCT
- 44 -
Diese Plasmide wurden auch sowohl durch EcoRI als auch Hpal geschnitten und ergaben die erwarteten Restriktionsfragmente. Ein Plasmid 14· (Fig. 5), genannt pTrp 14-, wurde für die Expression heterologer Polypeptide verwendet, wie im folgenden diskutiert werden wird.
Das Plasmid pHGH107, mit dem Bezugszeichen 18 in Pig. 6 (D.V. Goeddel et al., Nature, 281, 544 (1979)) enthält ein Gen für menschliches Wachstumshormon, be-1 stehend aus 23 Aminosäurecodons, hergestellt aus synthetischen DNA-Fragmenten und weiteren 163 Aminosäurecodons, erhalten aus komplementärer DNA, die mittels reverser Transkription der m-RNÄ des menschlichen Wachstumshormons erhalten wurde. Dieses Gen 21 (Fig. 6) enthält, obwohl ihm die "pre"-Sequenz des menschlichen Wachstumshormons fehlt, ein ATG-Translations-Initiationscodon. Das Gen wird aus 1Oyug pHGH107 nach Behandlung mit EcoRI und nachfolgend mit E.coli-Polymerase~I~ Klenow-Fragment und dTTP und dATP, wie beschrieben, isoliert» Nach einer Phenol- und Chloroformextraktion und A'thanolfällung wird das Plasmid mit BamHI behandelt, siehe dazu Fig* 6. Das Fragment 21, welches das Gen für menschliches Wachstumshormon (HGH) enthält, wird durch PAGE, gefolgt durch Elektroeluierung, isoliert. Das erhaltene DNA-Fragment enthält weiterhin die ersten 350 Nukleotide des Strukturgens für Tetracyclin-Resistenz, nicht· dagegen das Tetracyclin-Fromoter-Operator-System, so daß;,· wenn es anschließend'in einem' Expressionsplasmid.geclont wird, Plasmide, die die Insertion tragen, dadurch gefunden werden können, daß die Tetracyclin-Resistenz wieder hergestellt ist,, Da das EcoRI-Ende des Fragments 21 (Fig. 6) durch die Behandlung mit der Klenow-Polymerase-I aufgefüllt wurde,
-bedas Fragment ein stumpfes und ein überstehendes Ende auf, wodurch beim späteren Einfügen in ein Expressionsplasmid die korrekte Orientierung sichergestellt ist, siehe dazu Fig. 6.
Als nächstes wird das Expressionsplasmid pTrpi4- vorbereitet, um das vorstehend hergestellte, das HGH-Gen enthaltende Fragment aufzunehmen. Dazu wird das Plasmid pTrpi4 Xbal-verdaut,und die erhaltenen überstehenden Enden v/erden mit dem Klenow-Polymerase-I-Verfahren unter Verwendung von dATP, dTTP, dGTP und dCTP aufgefüllt. Nach Phenol- und Chloroformextraktion und Äthanolfällung wird die resultierende DNA 16 (Fig. 6) mit BamHI behandelt und das so erhaltene große Plasmidfragment (Fig. 6) durch PAGE und Elektroeluierung isoliert. Das von pTrp14 abgeleitete Fragment 17 (Fig. 6) hat ein stumpfes und ein überstehendes Ende, wodurch Rekombination mit dem das HGH-Gen enthaltenden Fragment, das oben beschrieben wurde, in korrekter Orientierung sicher gestellt ist.
Das HGH-Genfragment 21 (Fig. 6) und das pTrp14- Xba-BamHI-Fragment 17 (Fig. 6) werden unter ähnlichen Bedingungen wie oben beschrieben zusammengefügt und miteinander verknüpft. Die aufgefüllten Xbal- und EcoRI-Enden werden durch stumpfendige Verknüpfung miteinander verbunden, wodurch sowohl die Xbal- als auch die EcoRI-Erkennungsstellen wieder hergestellt vjerden:
Xbal, . EcoRI, HGH-Gen- ·
aufgefüllt aufgefüllt Initiation
-TCTAG AATTCTATG -—!(GTAGJAATTCTATC
-AGATC TTAAGATAC AGATc[tTA/}gATA(
Xbal EcoRI
Diese Konstruktion stellt auch das Gen für Tetracyclin-Resistenz wieder her. Da das Plasmid pHGH1O7 die Tetracyclin-Resistenz von einem Promoter aus exprimiert, der stromaufwärts vom HGH-Gen liegt (dem lac-Promoter), erlaubt diese Konstruktion 22 (Fig. 6), genannt pHGH2O7, die Expression des Gens für Tetracyclin-Resistenz unter der Kontrolle des Tryptophan-Promoter-Operators. Dazu wird E.coli 29^ mit der Verknüpfungsmischung transformiert und die Kolonien auf LB-Platten, die 5 /-igAtl Tetracyclin enthalten, selektiert.
Um die direkte Expression des menschlichen Wachstumshormons vom Plasmid pHGH2O7 nachzuweisen, wird das gesamte zelluläre Protein aus der Kultur E.coli 29V pHGH2O7 gewonnen, nachdem die Kultur bis zu einer optischen Dichte von 1 in LB-Medium mit 10 /ig/ml Ampicillin gezüchtet, danach in M9-Medium 1:10 verdünnt und wieder bis zu einer optischen Dichte von 1 gezüchtet wurde. Das gesamte zelluläre Protein wird einer SDS-GeI-Elektrophorese, wie im obigen Abschnitt I geschildert, unterworfen und mit ähnlichen Elektrophoresedaten für menschliches Wachstumshormon verglichen, die früher von anderen gefunden wurden (D.V. Goeddel et al., Nature, 281, 544 (1979)). Fig. 7 ist eine Fotografie des so erhaltenen, gefärbten Gels. Die Spalten 1 und 7 enthalten Vergleichsproteine verschiedener bekannter Größen; die Spalte 2 ist eine Kontrolle mit dem gesamten zellulären Protein des Stammes E.coli 29VpBR322; •die Spalte 5 enthält. Protein von. E.coli 29VpHGHfI Ö?, . . -gewachsen in LB-Medium; die Spalte 4 enthält Protein von E.coli 29VpHGHI07; gewachsen in M9-Medium; die Spalte 5 enthält Protein von E.coli 29VpHGH2O7, gewachsen in LB-Medium; und Spalte 6 enthält Protein E.coli 29VpHGH2O?, gewachsen in M9~Medium. Die dichte
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Bande in Spalte 6 ist menschliches Wachstumshormon, wie durch den Vergleich zu den ähnlichen Banden in den Spalten 2 Ms 4 gezeigt ist. Wie durch die Erfindung vorausgesagt, produziert der Organismus E.coli 2°A/pHGH2O7, wenn er in Tryptophan-reichem LB-Medium wächst, weniger V/achstumshormon aufgrund der Tryptophan-Repressor-Operator-Interaktion, und, gezogen in M9-Medium, beträchtlich mehr HGH als E.coli 29VpHGHIO?, bedingt durch die Induktion des im Gegensatz zum lac-Promoter-Operator-Systems in pHGH107 stärkeren Tryptopha Promoter-Operator-Systems.
III. Herstellen eines allgemeinen Expressionsplasmids für die direkte Expression heterologer Gene unter der Kontrolle des Tryptophan-Promoter-Operators
Das im vorstehenden Abschnitt hergestellte Plasmid pHGH2O7 wird als nächstes dazu verwendet, um ein DNA-Fragment zu erhalten, das die Kontrollelemente des Tryptophan-Operons enthält (mit Ausnahme des Attenuators) und einen Plasmid-Expressions-Vektor herzustellen, der für die direkte Expression ver- schiedener, inserierter Strukturgene geeignet ist. Zur Strategie des Herstellens des allgemeinen Expressionsplasmids gehört das Entfernen der Trypto- ·' phän-Kontrollregion von pHGH20'7 durch-EcoRI-Ver.dau-,.. ung und Inserieren in das EcoPLl-verdaute Plasmid pBRH1, das oben in Abschnitt I verwendet wurde. pBRH1 ist, wie bereits erwähnt, ein Ampicillinresistentes Plasmid, das die Gene für Tetracyclin-Resistenz enthält, jedoch Tetracyclin-sensitiv ist, da ein geeignetes Promoter-Operator-System fehlt.
Das so erhaltene Plasmid, pHKY1, dessen Konstruktion unten detailliert beschrieben wird und in Fig. 8 dargestellt ist, ist sowohl Ampicillin- als auch Tetracyclin-resistent, enthält das Tryptophan-PrοmoterOper ator-System, enthält nicht den Tryptophan-Attenuator und enthält eine einzige Xbal-Erkennungsstelle, die distal vom Tryptophan-Promoter-Operator liegt. Der Tryptophan-Promoter-Operator und die einzige Xbal~ Erkennungsstelle sind von EcoRI-Erkennungssteilen eingefaßt, so daß das Fragment, das den Tryptophan-PromoterOperator und die Xbal-Erkennungsstelle enthält, zum Zwecke des Einfügens in andere Strukturgene enthaltende Plasmide entfernt werden kann.
Andererseits können heterologe Strukturgene entweder in die Xbal-Erkennungsstelle oder (nach teilweiser EcoE!-Verdauung) in die EcoRI-Erkennungsstelle distal von der Tryptophan-Kontrollregion eingefügt werden, in jedem Fall mit dem Ziel, die Strukturgene der Kontrolle des Tryptophan-Promoter-Operator-Systems zu unterwerfen.
Das Plasmid pHGH2O7 wird EcoRI-verdaut und das den trp-Promoter enthaltende EcoRI-Fragment.23 (Fig. 8) wird durch PAGE, gefolgt von Elektroeluierung wiedergewonnen . _
Das, Plasmid pBRHI wird EcoRI-verdaut und die ge- \ schnittenen Enden mit bakterieller alkalischer Phospha-•tase (BAP) behandelt (1 yug, in 50 mH Tris pH8 und 10 mM MgGl2, 30 Minuten lang bei 65°G), um die Phosphatgruppen an den überstehenden EcoRI-Enden zu entfernen. Der Überschuß an bakterieller alkalischer Phosphatase wird durch Phenolextraktion, Chloroformextraktion und Äthanolfällung entfernt. Die resultierende lineare
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DNA 7a (I1IS* 8) wird, da an ihren überstehenden Enden Phosphate fehlen, bei einer Verknüpfung nur Insertionen annehmen, deren komplementäre überstehende Enden phosphoryliert sind und wird nicht in sich selbst rezirkularisieren, wodurch das Aussieben nach Plasmiden, die die Insertion tragen, erleichtert wird. Das von pHGH207 abgeleitete EcoRI-Fragment und die vom Plasmid pBRH1 erhaltene lineare DNA werden in Anwesenheit von T^,-Ligase, wie bereits beschrieben, vermischt und verknüpft. Mit einem Teil der so erhaltenen Mischung wird der Stamm E.coli 29^-, wie bereits beschrieben, transformiert, auf LB-Medium, enthaltend 5 /ig/ml Tetracyclin, plattiert, und es werden zwölf Tetracyclin-resistente Kolonien selektiert. Aus jeder Kolonie wird das Plasmid isoliert und auf die Anwesenheit einer DNA-Insertion durch Restriktionsendonuklease-Analyse unter Verwendung von EcoRI und Xbal überprüft. Ein Plasmid, das die Insertion enthielt, wurde pHKY1 genannt.
IV. Herstellen eines Plasmids, das das Tryptophan-Operon enthält, fähig zur Expression eines spezifisch spaltbaren Fusionsproteine, das aus sechs Aminosäuren des trp-Leader-Peptids, dem letzten Drittel des trpE-Poly-'peptids (genannt IiE1) sowie einem heterologen Strukturgen-Produkt besteht.
Die Strategie für das Herstellen eines 'Plasmids',' das ' ein IE'-Fusionsprotein exprimiert, beinhaltet folgende Schritte:
a) Bereitstellen eines Genfragments, das aus Codons für die distale Region des IE'-Polypeptids be-
steht und überstehende Enden einer BgIII-Erkennungsstelle am 5'-Ende und einer EcoRI-Erkennungsstelle am 3'-Ende des codierenden Strangs aufweist;
b) Eliminieren der Codons von der distalen Region des IE'-Genfragments und derjenigen für die trpD-Gene aus dem Plasmid Som7A2 und Inserieren des in Stufe 1 gebildeten Fragments, wodurch die LE'-Codonsequenz unmittelbar stromaufwärts von der für das heterologe Gen für:Somatostatin codierenden Codonsequenz wiederhergestellt wird.
e 9a zeigt die Hindlll-Verdauung des Plasmids
, gefolgt von einer X-Exonuklease-Verdauung (einer 5' —> 3'-Exonuklease) unter Bedingungen, die so gewählt werden, daß jenseits der BgIII-Restriktionserkennungsstelle innerhalb der LE1 codierenden Region verdaut wird» 20 yug des Hindlll-verdauten pSom7Ä2 werden in Puffer gelöst (20 mM Glycinpuffer pH 9,6, 1 mM MgCl2, 1 mM ß-Mercaptoäthanol). Das erhaltene Gemisch wird mit 5 Einheiten A.-Exonuklease 60 Minuten lang bei Raumtemperatur behandelt» Die so erhaltene Reaktionsmischung wird dann Phenol-extrahiert, Chloroform-extrahiert und mit Äthanol gefällt.
Um letztlich einen EcoRI-Rest am distalen Ende des LE'Gehfragments herzustellen, wird mittels' der bewährten Phosphotriester-Methode (R. Crea et al., Proc Nat 1I Acad Sei USA 75, 5765 (1978)) ein Primer ^2pCCTGTGCATGAT synthetisiert und an ein Einzelstrangende des IE'-Genfragments hybridisiert, das durch A-Exonuklease-Verdarning erhalten wurde. Die Hybridisierung wird im folgenden beschrieben.
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20 /ig des λ,-Exonuklease behandelten Hindlll-Verdauungsprodukts des Plasmids pSom7A2 wird in 20 yul H2O gelöst und mit 6/ll einer Lösung vereint, die etwa 80 Picomole der 5'-phosphorylierten Oligonukleotide, wie oben beschrieben, enthält. Das synthetische Fragment wird an das 3'-Ende der LE1 codierenden Sequenz hybridisiert, und der verbleibende Einzelstrangteil des IE1-Fragments wird durch das Klenow-Polymerase-I-Yerfahren, wie oben beschrieben, aufgefüllt, wobei dATP, dTTP, dGTP und ). dCTP verwendet werden.
Die Reaktionsmischung wird auf 50°C erhitzt und langsam auf 100C abgekühlt, wonach 4 yul Klenow-Enzym zugegeben werden. Nach 15 minütiger Inkubation bei Raumtemperatur, gefolgt von 30 minütiger Inkubation bei 37°C, wird die Reaktion durch Zugabe von 5/il 0,25 molarem EDTA gestoppt. Die Reaktionsmischung wird Phenol-extrahiert, Chloroform-extrahiert und mit Äthanol gefällt. Anschließend wird die DNA mit dem Restriktionsenzym BgIII geschnitten. Die Fragmente werden durch PAGE getrennt. Ein aus dem Gel erhaltenes
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Autoradiogramm zeigt ein J P-markiertes Fragment der erwarteten Länge von annähernd 470 Bp , das durch Elektro eluierung rückgewonnen wird. Wie bereits hervorgehoben, . hat das Fragment LE'(d) ein BgIII- und ein stumpfes Ende, das.mit dem Anfang des Primers übereinstimmt.
' Das. Plasraid pTh pc.1, das'oben im Abschnitt I. (C) beschrieben wurde, enthält ein Strukturgen für Thymosin C>61, das an seinem 5'-Ende des codierenden Strangs in eine EcoRI-Erkennungsstelle und an seinem 3'-Ende in eine BamHI-Erkennungsstelle geclont ist. Wie in Fig. 9b gezeigt, enthält das Gen für Thymosin eine zusätzliche Bglll-Erkennungsstelle.
Das Plasmid pThcci enthält weiterhin ein Gen für Ampicillin-Resistenz. Um ein Plasmid herzustellen, das in der Lage ist, das, wie oben geschildert, hergestellte LE1(d)-Fragment aufzunehmen, wird das Plasmid pThool mit EcoRI verdaut, gefolgt von einer Klenow-Polymerase-I-Eeaktion mit dTTP und dATP, um die EcoRI-Eeste stumpfendig zumachen. Durch.Bglll-Verdauung des so erhaltenen Produkts wird ein lineares DNA-Fragment 33 (Fig. 9*0 hergestellt, das die Gene für Ampicillin-Resistenz und, jeweils an den entgegengesetzten Enden, einen überstehenden BgIII-Rest und ein stumpfes Ende enthält. Das so erhaltene Produkt kann durch Reaktion mit dem LE'(d)-Fragment, das ein überstehendes Bglll-Ende und ein stumpfes Ende enthält, in der Gegenwart von T2,-Ligase rezirkularisiert v/erden, um das Plasmid pTrp24 (Fig. 9b) zu bilden. Während dieses Vorgangs wird eine EcoRI-Erkennungsstelle an der Position wiederhergestellt, wo die Verknüpfung der stumpfen Enden erfolgte«,
Im weiteren Verlauf wird, wie in Fig. 10 gezeigt, nacheinander das Plasmid pTrp24· mit BgIII und EcoRI verdaut, danach PAGE behandelt und elektroeluiert, wodurch ein Fragment entsteht, das die Codons für das LE'(d)-Polypeptid mit einem überstehenden Bglll-Ende und einem überstehenden EcoRI-Ende, angrenzend .an seinen 3'Terminus des codierenden Strangs aufweist. Das LE' (d)-Fragment 38 (Fig. 10.) kann in die BgIII- . Erkennungsstelle des. Plasmids pSom7a2 g'eclont werden,' um ein LE'-Polypeptid/Somatostatin-Fusionsprotein zu bilden, das unter der Kontrolle des Tryptophan-Promoter-Operators exprimiert wird, wie in. Fig. 10 gezeigt. Ein solches Verfahren erfordert'erstens eine partielle EcoRI-Verdauung des Plasmids pSöm7<d25 um die EcoRI-Erkennungsstelle distal vom Tryptophan-Promoter-
ty?
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Operator zu schneiden, wie in Fig. 10.gezeigt, und zweitens eine korrekte Wahl der Primer-Sequenz (Fig. 9)5 um den korrekten Codon-Leseraster zu erhalten und eine EcoRI-Schneidestelle wiederherzustellen.
Dazu werden 16 yug des Plasmids pSom74 2 in 200 pl Puffer, bestehend aus 20 mM Tris, pH 7,5, 5 mM HgCl2, 0,02 % NP4-0 Detergens, 100 mM HaCl verdünnt und mit 0,5 Einheiten EcoRI behandelt. Nach 15 minütiger Behandlungszeit bei 37°C wird die Eeaktionsmxschung Phenol-extrahiert, Chloroform-extrahiert und mit Äthanol gefällt und anschließend mit BIgII verdaut. das größere, so erhaltene Fragment 36 (Fig. 10) wird durch die PAGE-Behandlung isoliert, gefolgt von Elektroeluierung. Dieses Fragment enthält die Codons IS1(p) für das proximale Ende des LE'-Polypeptids, d.h., diejenigen Codons, die stromaufwärts von der BgIII-Erkennungsstelle liegen. Das Fragment 36 (Fig. 10) wird als nächstes an das Fragment 38 (Fig. 10) in Anwesenheit von T2,-Liga se verknüpft, um das Plasmid pSom7A244 zu bilden, das, nach Transformation in den Stamm E.coli 294·» wie bereits beschrieben, wirksam' unter die Kontrolle des Tryptophan-Promoter-Operators ein Fusionsprotein produziert., das aus dem vollständig r konstituierten IiE'-Polypeptid und Somatostatin besteht. Das Fusionsprotein, von dem das Somatostatin dank der Anweaenheit .eines Hethionins am; 5'-Ende der Somatostatir sequenz spezifisch gespalten werden kann, wird durch SDS-Polyacrylamid-Gel-Elektrophorese, wie bereits beschrieben, segregiert. Das Fusionsprotein-Produkt stellt die am deutlichsten sichtbare Bande.in der Spalte 6 der Fig. 11 dar, wie im Detail im noch folgenden Abschnitt VI beschrieben x^erden wird.
V. Herstellen eines Expressionssystems für trp-LE1-Polypeptid-Fusionsprodukte, wobei die Tetracyclin-Resistenz unter der Kontrolle des Tryptophan-Promoter-Operators steht.
Die Strategie für das Herstellen eines Expressionsvektors, der in der Lage ist, eine große Anzahl verschiedener heterologer Gene für Polypeptide als trp-LE1-Fusionsproteine unter der Kontrolle des Tryptophan-Operons zu exprimieren, erfordert die Konstruktion eines Plasmids, das die folgenden Charakteristika aufweist:
1. eine Tetracyclin-Resistenz, die im Falle des Herausschneidens des Promoter-Operator-Systems, das die Gene für diese Resistenz kontrolliert, verlorengehen würde.
2. Durch Wiedereinfügen des Promoter-Operator-Systems, das die Tetracyclin-Resistenz kontrolliert5 und Rezirkularisieren durch dessen Verknüpfen mit einem heterologen Gen sowie einem Tryptophan-PromoterOperator-System in richtiger Lesephase wird Tetracyclin-Resistenz wieder hergestellt und entsprechend die Identifizierung von Plasmiden, die den heterologen Geneinschluß enthalten, ermöglicht.
. ·' In Kürze gesagt und in Übereinstimmung mit der ITatür der beabsichtigten Insertionen, soll ein lineares Stück DlTA' hergestellt werden, das einen Pst-Rest an seinem 3'-Ende und einen BIgII-Rest an seinem 5'-Ende aufweist, die an ein Gen angrenzen, das fähig ist, Tetracyclin-Resistenz zu spezifizieren, wenn es unter die Kontrolle eines Promoter-Operator-Systems gebracht wird.
53 4 2 -S
Dazu wird, wie in Fig. 12 dargestellt, das Plasmid pER322 mit Hindlll verdaut und das überstehende Hindlll-Ende daraufhin mit S1-Nuklease verdaut. Die S1-Nuklease-Verdauung besteht aus der Behandlung von 10 yug eines HindiII-geschnittenen Plasmids pBR322 in 30/11 S1-Puffer. (0,3 M NaCl, 1 mM ZnCl2, 25 mM ITatriumacetat, pH 4,5) mit 300 Einheiten S1-Nuklease 30 Minuten lang bei 15°C. Die Reaktion wird durch
Zugeben von 1 /al von 30 X S1-Nuklease-Stoplösun (0,8 M Tris,·. . · 50 mM EDTA) gestoppt. Die Mischung wird Phenol-extrahiert, Chloroform-extrahiert und mit Äthanol gefällt, dann EcoRI-verdaut, wie bereits beschrieben, und das große Fragment 46 (Fig. 12) durch PAGE-Behandlung erhalten, worauf eine Elektroeluierung folgt. Das erhaltene Fragment hat ein erstes überstehendes EcoRI-Ende und ein zweites stumpfes Ende, dessen codierender Strang mit dem Nukleotid Thymidin beginnt. Wie im folgenden gezeigt wird, kann der S1-verdaute Hindlll-Rest, der mit Thymidin beginnt, mit einem Klenow-Polymerase-I-behandelten Bglll-Rest verbunden v/erden, so daß nach der Verknüpfung die Bglll-Restriktionserkennungsstelle wieder hergestellt ist. . .
Das Plasmid pSom742, das im obigen Abschnitt I vorbereitet wurde, wird Bglll-verdaut und die so entstandenen überstehenden Bglll-Enden mit dem" Kienow-Polymerase-I-Verfahren doppelsträngig gemacht, wobei alle vier De.soxynukleotidtriphosphäte verwendet werden. '· · ·. Das EcoRI-Schneiden des resultierenden Produkts, gefolgt durch PAGE und Elektroeluierung des kleinen Fragments 42 (Fig. 13),stellt ein lineares Stück DNA zur Verfugung, das den Tryptophan-Promoter-Operator
- si
und Codons der proximalen Sequenz des LE'-Proteins stromaufwärts der Bglll-Erkennungsstelle (IE'(p)) enthält. Das DNA-Stück hat ein EcoRI-Ende und ein stumpfes Ende als Ergebnis des Auffüllens der Bglll-Erkennungsstelle. Die Bglll-Erkennungsstelle kann jedoch durch Anknüpfen des stumpfen Endes des Fragments 42 (Fig. 13) an das stumpfe Ende des Fragments 46 (Fig. 13) wieder hergestellt werden. Dazu werden die beiden Fragmente in Anwesenheit von T^-DNA-Ligase verknüpft, um das rezirkularisierte Plasmid pHKXIO (siehe Fig. 12) zu bilden, das durch Transformation in kompetente Zellen des Stammes E.coli 294 vermehrt wird. Tetracyclinresistente Zellen, die das rekombinante Plasmid pHKYIO tragen, werden gezüchtet, die Plasmid-DNA extrahiert und nacheinander mit BgIII und Pst verdaut, daraufhin durch das PAGE-Verfahren isoliert und das große Fragment elektroeluiert, das als lineares Stück DNA vorliegt und überstehende Pst- und Bglll-Enden aufweist. Dieses DNA-Fragment 49 (Fig. 13) enthält den Origin (die Anfangsstelle) der Replikation und hat sich infolgedessen als erster Bestandteil bei der Konstruktion eines Plasmids als nützlich erwiesen, bei dem sowohl die Gene, die für das trp-LE'Polypeptid-Fusionsprotein codieren, als auch die Tetracyclin-Resistenz-Gene durch den trp-Promoter-Operator kontrolliert werden.
Das Plasmid pSom7£2Ä4, das auf die in Abschnitt IV beschriebene Weise hergestellt.werden kann, kann so manipuliert werden, daß es als zweite Komponente · ·.· des Systems dient, das in der Lage sein soll, eine große Anzahl verschiedener heterologer Strukturgene aufzunehmen. Vie in Fig. 13 gezeigt, wird das Plasmid einer Teil-EcoRI-Verdauung unterworfen (siehe Abschnitt IY), gefolgt von einer Pst-Verdauung. Das so erhaltene
Fragment 51 (Pig. 12) enthält den trp-Promoter-Operator und wird durch das PAGE-Verfahren isoliert, gefolgt von Elektroeluierung. Die Teil-EcoRI-Verdauung ist nötig, um ein Fragment zu erhalten, das unmittelbar anschließend an das 5'-Ende des Somatostatingens geschnitten wird, Jedoch nicht an der EcoRI-Erkennungsstelle geschnitten wird, die zwischen dem Gen für Ampicillin-Resistenz und dem trp-PromoterOperator liegt. Die durch den Pstl-Schnitt im Gen für Ampicillin-Resistenz verlorengegangene Ampicillin-Eesistenz kann durch Verknüpfung mit Fragment 51 (Fig. wieder hergestellt werden.
In einer ersten Ausführungsform kann der dritte Bestandteil, ein Strukturgen für ThymosinOc.1 durch EcoRI- und BamHI-Verdauung des Plasmids pThod erhalten werden. Das so hergestellte Fragment 52 (Fig. 12) wird durch PAGE gereinigt und elektroeluiert.
Die drei Genfragmente 49, 51 und 52 können nun, wie in Fig. i2 dargestellt, in richtiger Orientierung miteinander verknüpft werden, um das Plasmid pThct7Aii& zu bilden, das aufgrund der Wiederherstellung der Ampicillin- und Tetracyclin-Resistenz selektiert werden kann«. Wenn mit diesem Plasmid der Stamm E.coli 29^ transformiert wird und der Stamm unter Bedingungen gezüchtet wird, wie sie im Abschnitt I beschrieben wurden, wird ein trp-LE'-Polypeptid-Fusionsprotein. ." exprimiert, von dem Thymos'incd durch Bromcyan~Behandlung spezifisch gespalten werden kann. Wenn andere heterologe Strukturgene, die EcoRI- und BamHI-Enden aufweisen, auf ähnliche V/eise mit von pHKYIO und pSom7Ä2A4- abgeleiteten Bestandteilen verknüpft werden, können ähnlich wirksame trp-IE'-Polypeptid-
5?
Fusionsproteine erhalten werden, die jeweils diejenigen Polypeptide enthalten, für welche die heterologen Gene codieren. Fig. 11 zeigt eine SDS-* Polyacrylamid-Gel-Elektrophorese-Trennung des totalen zellulären Proteins von E.coli 294-Transformanten, wobei die dunkelsten Banden in jedem Fall das Fusionsprotein repräsentieren, das unter der Kontrolle des Tryptophan-Promoter-Operator-Systems produziert wurde. Die Spalte 1 in Fig. 11 ist eine Kontrolle, die das vollständige zelluläre Protein des Stammes E.coli 29VpBR322 enthält. Die Spalte 2 enthält das Somatostatin-Fusionsprodukt des Plasmids pSom7A2/14, dessen Herstellung in Abschnitt IV "beschrieben wurde«, Spalte 3 ist das Somatostatin-enthaltende Expressionsprodukt des Plasmids pSom7a1^4. Spalte 4-enthält das Expressionsprodukt des Plasmids pThct7A1A4-, wohingegen Spalte 5 das Produkt enthält, das durch ein Plasmid exprimiert wird, das erhalten wird, wenn die pHKYIO-ahgeleiteten und p3om7&2£A-abgeleiteten Fragmente, wie oben erörtert, mit einem EcoRI/BamHI-terminierten Struturgen verknüpft werden, das für menschliches Proinsulin codiert, das teilweise bei der Anmelderin hergestellt wurde. Die Spalten 6 bzw. enthalten, als dunkelste Banden, ein trp-IIE'-Polypeptid-Fusionsprotein, von dem in dem einen Fall die B-Kette und in dem anderen Fall die A~Kette des menschlichen Insulins gespalten werden kann. Die B- und A-Strukturgene des Insulins werden durch EcoHI- und BainHI-Ver--' dauung des Plasmids pIB1 bzw. pIA11 erhalten, deren Herstellung bei D.V. Goeddel et al., Proc Nat 1I Acad Sei USA 76, 106 (1979), beschrieben ist. Die Spalte enthält Größenmarker, wie bereits beschrieben.
2285
Eine besonders bevorzugte Ausführungsform der Erfindung ist unter Verwendung von E.coli beschrieben. Es können jedoch wahlv/eise andere Enterobacteriaceen als Wirtszellen für die Expression und als Quelle für die trp-Operons dienen, von denen beispielsweise Salmonella typhimuriura und Serratia marcesans zu erwähnen sind. Somit ist die Erfindung nicht auf die geschilderten Ausführungsbeispiele beschränkt.
Die nach dem erfindungsgemäßen Verfahren herstellbaren neu zu konstruierenden Plasmide sind neue, in ihrer Struktur eindeutig definierbare chemische Substanzen.

Claims (11)

  1. Berlin» den 25«8β1981
    AP C 12 D/228 543/2 59 004/18
    Verfahren zum Herstellen eines Polypeptid-Produkts durch die Expression in Bakterien eines für dieses codierenden Gense gekennzeichnet dadurch, daß
    a) eine bakterielle Kultur geschaffen wird^; die mit einem sich replizierenden* von einem Plasmid abgeleiteten Expressionsvektor transformiert wurde; welcher eine Sequenz doppelst rängiger DNA enthält« die in Phase von einem ersten 5'>Ende bis zu einem zweiten 3*~>Ende ihres codierenden Strangs di© folgenden Elemente aufweist:
    (i) ein bakterielles trp-Promoter-Operator-Systera*
    (ii) Nukleotide^ die für eine Ribosomen-Bindestelle für die Translation des Elements (iv) codieren;
    (iii) Nukleotidev die für ein Translations-Startsignal für die Translation des Elements (iv) codieren> und
    (iv) ein Strukturgen^ das für die Aminosäuresequenz eines heterologen Polypeptids codiert#
    wobei die genannte Sequenz weder irgendeine trp-Attenuierungs-Fähigkeit noch Nukleotide aufweist^, die für die trpE-Ribosomen~Bindestelle codieren;
    b) die transformierte Bakterienkultur in ein Fermentationsgefäß überführt und diese Kultur bis zu einer
    25β8#1981
    m 5> AP C 12 D/228 543/2
    - % - 59 004/18
    vorgegebenen Dichte in einem geeigneten Nährmedium gezüchtet wird, welches zusätzliches Tryptophan enthält, und zwar in ausreichender Menge, um das genannte Promoter-Operator-System zu reprimieren; und
    c) den genannten Bakterien das zusätzliche Tryptophan entzogen wird, um das genannte System zu dereprimieren und die Expression des Produkts,, für welches das genannte Strukturgen codiert, anlaufen zu lassen*.
  2. 2. Verfahren nach Punkt 1, gekennzeichnet dadurch, daß das durch das genannte Strukturgen exprimierte Polypeptid vollständig heterolog ist«
  3. 3· Verfahren nach Punkt 1, gekennzeichnet dadurch, daß das exprimierte Polypeptid ein Fusionsprotein ist, das ein heterologes Polypeptid und mindestens einen Teil der Aminosäuresequenz eines homologen Polypeptide aufweist«
  4. 4» Verfahren nach Punkt 3, gekennzeichnet dadurch, daß aer genannte Teil ein Teil der Aminosäuresequenz eines Enzyms ist, das am Biosyntheseweg von der Chorisminsäure zum Tryptophan beteiligt iste
  5. 5* Verfahren nach Punkt-4, gekennzeichnet dadurch, daß' das heterologe Polypeptid ein bioaktives Polypeptid und das angefügte homologe Polypeptid ein spezifisch spaltbares bioinaktivierendes Polypeptid ist«
  6. 6« Verfahren nach Punkt 3, gekennzeichnet dadurch, daß das homologe Polypeptid das trpE~Polypeptid ist und die genannte Ribosomen-Bindestelle diejenige für das trp» Leader-Polypeptid ist*
    AP C 12 D /228 543/2 5$ 59 004 18
    £w SaS *is>
  7. 7. Verfahren nach Punkt 3j gekennzeichnet dadurch, daß das homologe Polypeptid das trpD-Polypeptid ist.
  8. 8. Verfahren nach Punkt 5, gekennzeichnet dadurch, daß das Fusionsprotein ein heterologes und ein homologes Polypeptid enthält, wobei das homologe Polypeptid selbst eine Fusion darstellt, und zwar aus etwa den ersten sechs Aminosäuren des trp-Leader-Polypeptide und der Aminosäuresequenz, die durch mindestens etwa dem distalen Drittel des trpE-Polypeptidgens codiert wird.
  9. 9. Verfahren nach Punkt 1, gekennzeichnet dadurch, daß der Tryptophan-Entzug dadurch bewirkt wird, daß die Zugabe des zusätzlichen Tryptophans beendet und das Fermenta-t'ionsmedium, in dem die Bakterienkultur zib rst gewachsen ist, verdünnt wird.
  10. 10. Verfahren nach Punkt 9, gekennzeichnet dadurch, daß das Wirtsbakterium E. coli ist,
  11. 11-sr Verfahren nach Punkt 1, gekennzeichnet dadurch, daß das heterologe Polypeptid ein wiedergewinnbares Polypeptid ist, das aus einer Gruppe von Polypeptiden ausgewählt wird, die menschliches Wachstumshormon, menschliches Proinsulin». Somatostatin, Thymosin·^ 1, die A-Kette des menschlichen Insulins sowie die B-Kette des « menschlichen Insulins enthält. .
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