CZ20012574A3 - Sloučenina, oligonukleotidový analog a jeho pouľití, farmaceutický prostředek, sonda a primer - Google Patents

Sloučenina, oligonukleotidový analog a jeho pouľití, farmaceutický prostředek, sonda a primer Download PDF

Info

Publication number
CZ20012574A3
CZ20012574A3 CZ20012574A CZ20012574A CZ20012574A3 CZ 20012574 A3 CZ20012574 A3 CZ 20012574A3 CZ 20012574 A CZ20012574 A CZ 20012574A CZ 20012574 A CZ20012574 A CZ 20012574A CZ 20012574 A3 CZ20012574 A3 CZ 20012574A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
group
amino
protected
oxo
ethylene
Prior art date
Application number
CZ20012574A
Other languages
English (en)
Other versions
CZ296576B6 (cs
Inventor
Masakatsu Kaneko
Koji Morita
Takeshi Imanishi
Original Assignee
Sankyo Company, Limited
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=12398349&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=CZ20012574(A3) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Sankyo Company, Limited filed Critical Sankyo Company, Limited
Publication of CZ20012574A3 publication Critical patent/CZ20012574A3/cs
Publication of CZ296576B6 publication Critical patent/CZ296576B6/cs

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/06—Pyrimidine radicals
    • C07H19/10—Pyrimidine radicals with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7042—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
    • A61K31/7052—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
    • A61K31/706—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
    • A61P17/06—Antipsoriatics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00—Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/16—Antivirals for RNA viruses for influenza or rhinoviruses
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/18—Antivirals for RNA viruses for HIV
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A61P31/20—Antivirals for DNA viruses
    • A61P31/22—Antivirals for DNA viruses for herpes viruses
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/06—Pyrimidine radicals
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/16—Purine radicals
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/16—Purine radicals
    • C07H19/20—Purine radicals with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
    • Y10T—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER US CLASSIFICATION
    • Y10T436/00—Chemistry: analytical and immunological testing
    • Y10T436/14—Heterocyclic carbon compound [i.e., O, S, N, Se, Te, as only ring hetero atom]
    • Y10T436/142222—Hetero-O [e.g., ascorbic acid, etc.]
    • Y10T436/143333—Saccharide [e.g., DNA, etc.]

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • AIDS & HIV (AREA)
  • Dermatology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Pain & Pain Management (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Description

Sloučenina, oligonukleotidový analog a jeho použití, farmaceutický prostředek, sonda a primer.
Oblast techniky
Popisují se nové oligonukleotidové analogy, které vykazují ^nesmyslnou nebo antigenní aktivity^ výbornou stabilitu nebo vykazují výbornou aktivitu jako detekční činidlo (sonda) pro specifický gen nebo jako primer pro počátek amplifikace, a nové nukleosidové analogy, které mohou zprostředkovat jejich produkci.
Dosavadní stav techniky
Očekává se, že oligonukleotidové analogy, které vykazují výbornou nesmyslnou nebo antigenní aktivitu a ktere jsou v těle stabilní, se budou moci použití jako farmaceutické prostředky. Navíc oligonukleotidové analogy, které vykazují vysoký stupeň schopnosti tvořit stabilní komplementární řetězec s DNA nebo mRNA se mohou použít jako detekční činidla vhodná pro specifický gen nebo jako primery pro začátek amplifikace.
Naopak je známo, že přirozeně se vyskytující oligonukleotidy se rychle rozkládají pomocí různých nukleáz, které jsou přítomny v krvi a v buňkách. V některých případech přirozeně se vyskytující oligonukleotidy nevykazují dostatek citlivosti při použití jako detekční činidlo pro specifické geny nebo jako primery pro začátek amplifikace, což je způsobeno jejich afinitou vůči sekvencím komplementárních bází.
Za účelem překonat nedostatky, se připravily různé nepřirozeně se vyskytující oligonukleotidové analogy, které jsou určeny pro použití jako farmaceutické prostředky nebo detekční činidla pro specifické geny. Jmenovitě známé příklady takových nepřirozeně se vyskytujících oligonukleotidových analogů zahrnují ty, kde atom kyslíku zachycený na atomu fosforu ve fosfordiesterové vazbě oligonukleotidu je nahrazen atomem síry, • ·· ·· ·· ·· · • · · · · ·· · · ♦·· • · · ···· · · · ·· ··· ······ · · • · · · · · ··· ··· ·· ·· · · · · · · dále ty, kde uvedený atom kyslíku je nahrazen atomem bóru a ty, ve kterých cukerná část a báze oligonukleotidu je upravena chemickou cestou. Například společnost ISIS Corp. vyvinula thioátový typ oligonukleotidu ISIS2922 (Vitravene) jako terapeutický prostředek vhodný pro lidský zánět sítnice způsobený cytomegalovirem a tento prostředek se uvedl na trh v USA.
Když se vsak zvazuje potenciál aesmyslne a antigenní aktivity shora popsaných nepřirozeně se vyskytujících oligonukleotidových analogů, jmenovitě pak schopnost tvořit stabilní komplementární řetězec s DNA nebo mRNA, stabilita s ohledem na různé nukleázy a zobrazení nežádoucích vedlejších účinků způsobených nespecifickým navázáním na různé proteiny v těle, je nutné připravit nepřirozeně se vyskytující oligonukleotidový analog, který má dokonce lepší stabilitu v těle a malý výskyt vedlejších účinků a vysoký stupeň schopnosti tvpřit komplementární řetězce.
Podstata vynálezu
Vynález popisuje nepřirozeně se vyskytující oligonukleoti, , ptačit dové analogy, ktere vykazuji výbornou 'i*esmyslnou nebo antigenní aktivitu, výbornou stabilitu v těle a nízký výskyt nežádoucích vedlejších účinků. Zjistilo se, že oligonukleotidové analogy nebo nukleosidové analogy vykazující etherovou vazbu , _ pp&W v uvedených molekulách je mozne použit jako 's=esmyslne nebo antigenní prostředky mající výbornou stabilitu, jako detekční činidla (sondy) vhodné pro specifický gen, jako primer pro začátek amplifikace nebo jako meziprodukt pro jejich přípravu.
Nové nukleosidové analogy podle vynálezu jsou sloučeniny obecného vzorce 1:
• 9 • ·· ·· ·· ·· ··· · · * · · ♦ • · · · · ····· · ····· ·· ·· ·· ·
kde symboly R1 a R2 jsou stejné a reprezentují atom vodíku, hydroxylovou ochranou skupinu, skupinu kyseliny fosforečné, chráněnou skupinu kyseliny fosforečné nebo -P(R3)R4, kde symboly R3 a R4 jsou stejné nebo různé a reprezentují hydroxylovou skupinu, chráněnou hydroxylovou skupinu, merkaptoskupinu, chráněnou merkaptoskupinu, aminoskupinu, alkoxyskupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, alkylthioskupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, kyanalkoxyskupinu, která obsahuje 1 až 5 atomů uhlíku, nebo aminoskupinu substituovanou alkylovou skupinou, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, symbol A reprezentuje alkylenovou skupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku a symbol B reprezentuje skupinu purin-9-yl, 2-oxopyrimidin-l-yl nebo substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, která má substituent vybraný z následující skupiny a, nebo jejich sole.
Oligonukleotidové analogy podle vynálezu jsou oligonukleotidové analogy, které mají jednu nebo dvě nebo více struktur obecného vzorce 2:
(2) kde [symbol A reprezentuje alkylenovou skupinu, která má 1 až 4 atomy uhlíku a symbol B reprezentuje skupinu purin-9-yl, 2-oxopyrimidin-l-yl a substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, kde se substituent vybral z následující skupiny a], nebo jejich farmaceuticky přijatelné sole.
Skupina a je:
hydroxylová skupina chráněná hydroxylová skupina alkoxyskupina s 1 až 4 atomy uhlíku, merkaptoskupina chráněná merkaptoskupina alkylthioskupina s 1 až 4 atomy uhlíku aminoskupina chráněná aminoskupina aminoskupina substituovaná alkylovou skupinou s 1 až 4 atomy uhlíku alkylová skupina s 1 až 4 atomy uhlíku alkylová skupina s 1 až 4 atomy uhlíku a halogenový atom.
Termín „alkylenová skupina, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku symbolu A ve shora uvedeném vzorci 1 nebo 2 může zahrnovat methylenovou, ethylenovou, trimethylenovou a tetramethylenovou skupinu, přičemž je výhodnější methylenová skupina.
Termín „hydroxylová chránící skupina symbolu R1 a R2 „chráněná hydroxylová skupina symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 nebo 2 znamená chránící skupinu, kterou je možné štěpit chemickou metodou jako je hydrogenolýza, rozklad, hydrolýza, elXetrolýza a fotolýza nebo biologickou metodou, jako je hydrolýza v těle člověka. Takové chránící skupiny mohou zahrnovat „alifatickou acylovou skupinu jako je alkylkarbonylová skupina, což je například formyl, acetyl, propionyl, butyryl, isobutyryl, pentanoyl, pivaloyl, valeryl, isovaleryl, oktanoyl, nonanoyl, dekanoyl, 3-methylnonanoyl, • ··· · ····· · • · · · · · · • · « · · ·· · · ·· ·
8-methylnonanoyl, 3-ethyloktanoyl, 3,7-di-methyloktanoyl, undekanoyl, dodecanoyl, tridekanoyl, tetradekanoyl, pentadekanoyl, hexadekanoyl, 1-methylpenta-dekanoyl, 14-methylpentadekanoyl, 13,13-dimethyltetradekanoyl, heptadekanoyl, 15-methylhexadekanoyl, oktadekanoyl, 1-methyl-heptadekanoyl, nonadekanoyl, eikosanoyl a heneikosanoyl, karboxylovaná alkylkarbonylová skupina, je to například sukcinoylová, glutaroylová a adipoylová skupina, halogen nižší alkylkarbonylová skupina, například chloracetylová, dichloracetylová, trichloracetylová a trifluoracetylová, nižší alkoxyalkyl karbonylová skupina, což je například methoxyacetyl, a nesaturovaná alkoxykarbonylová skupina, což je například (E)-2-methyl-2-butenoyl,
Termín „aromatická acylová skupina, jako například arylkarbonylová skupina je například 2-brombenzoylová a 4-chlorbenzoylová, nižší alkylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 2,4,6-trimethylbenzoyl a 4-toluoyl, nižší alkoxylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 4-ani-soyl, karboxylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 2-karboxybenzoylová, 3-karboxybenzoyl a 4-karboxybenzoyl, nitrovaná arylkarbonylová skupina, což je například 4-nitro-benzoyl a 2-nitrobenzoyl, nižší alkoxykarbonylovaná arylkarbonylová skupina , což je například 2-(methoxykar-bonyl)benzoyloová a arylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 4-fenylbenzoyl.
Termín „tetrahydropyranylová skupina nebo tetrahydrothiopyranylová skupina je například tetrahydropyran-2-yl, 3-bromotetrahydropyran-2-yl, 4-methoxytetrahydropyran-4-yl, tetrahydropyran-2-yl a 4-methoxytetrahydrothiopyran-4-yl.
Termín „tetrahydrofuranylová skupina nebo tetrahydrothiofuranylová skupina je například tetrahydrofuran-2-yl a tetrahydrothiofuran-2-yl.
Termín „silylová skupina zahrnuje například silylovou skupinu obsahující tři nižší alkyly, což je například trimethylsilyl, triethylsilyl, isopropyldimethylsilyl, t-butyldimebutyldimethylsilyl, methyldiisopropylsilyl, methyldi-t-butylsilyl a triisopropylsilyl a silylová skupina obsahující tři alkyly substituovaná jednou nebo dvěmi arylovými skupinami, což je například difenylmethylsilyl, difenylbutylsilyl, difenylisopropylsilyl a fenyladiisopropylsilyl.
Termín „nižší alkoxymethylová skupina je například metho xymethyl, 1,1-dimethyl-l-methoxymethyl, ethoxymethyl, propoxymethyl, isopropoxymethyl, butoxymethyl a t-butoxy/methyl.
Termín „nižší alkoxylovaná nižší alkoxymethylová skupina je například 2-methoxyethoxxymethyl.
Termín „halogenovaná nižší alkoxymethylová skupina znamená například 2,2,2-trichlorethoxymethyl a bis(2-chlorethoxy)methyl.
Termín „nižší alkoxylovaná ethylová skupina znamená například 1-ethoxyathyl a 1-(isopropoxy)ethyl.
Termín „halogenovaná ethylová skupina znamená například
2,2,2-trichlorethyl.
Termín „methylovaná skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami znamená například benzyl, α-naftylmethyl, β-naftylmethyl, difenylmethyl, trifenylmethyl, α-naftyl-difenylmethyl a 9-antrylmethyl.
Termín „methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, kde uvedený arylový kruh je substituován nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou zahrnuje například 4-methylbenzyl, 2,4,6-tri-methylbenzyl, 3,4,5-trimethylbenzyl, 4-methoxybenzyl, 4-methoxyfenyldifenylmethyl, 4,4'-dimethoxytrifenylmethyl, 2-nitrobenzyl, 4-nitrobenzyl, 4-chlorbenzyl, 4-brombenzyl a
4-kyanbenzyl.
Termín „nižší alkoxykarbonylová skupina zahrnuje například methoxykarbonyl, ethoxykarbonyl, t-butoxykarbonyl a isobutoxykarbonyl.
Termín „nižší alkoxykarbonylová skupina substituovaná halogenem nebo „silylová skupina obsahující tři nizžší alkyly • ·· · · ·· ·· •99 9 · · 9 · · *9 zahrnuje 2, 2,2-trichlorethoxykarbonyl a 2-trimethylsilylethoxykarbonyl.
Termín „alkenoyloxykarbonylová skupina zahrnuje vinyloxykarbonyl a alyloxykarbonyl.
Termín „aralkyloxykarbonylová skupina, kde uvedený arylový kruh se může substituovat jednou nebo dvěmi alkoxy nebo nitroskupinami zahrnuje například benzyloxykarbonyl, 4-methoxybenzyloxykarbonyl, 3,4-dimethoxybenzyloxykarbonyl, 2-nitrobenzyloxykarbonyl a 4-nitrobenzylkarbonyl.
„Hydroxylová chránící skupina symbolu R1 a R2 přednostně zahrnuje „alyfatickou acylovou skupinu, „aromatickou acylovou skupinu, „methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, „methylovou skupinu substituovanou 1 až třemi arylovými skupinami, kde arylový kruh se substituoval nižší alkylovou, nižší alkoxy, kyanoskupinou nebo halogenem nebo „sulylovou skupinu. Výhodnější je acetylová skupina, benzoylová skupina, benzylová skupina, p-methoxybenzoylová skupina, dimethoxytritylová skupina, monomethoxytritylová skupina nebo terc-butyldifenylsilylová skupina.
Chránící skupina „chráněné hydroxylové skupiny symbolu R3 a R4 nebo skupina a může s výhodou zahrnovat „alifatickou acylovou skupinu nebo „aromatickou acylovou skupinu, výhodnější je benzoylová skupina.
Chránící skupina „chráněné skupiny kyseliny fosforečné symbolu R1 a R2 ve shora uvedeném vzorci 1 reprezentuje chránící skupinu, která se může štěpit chemickou metodou, jako je hydrogenolýza, hydrolýza, elektrolýza a fosfolýza a biologickou metodou, jako je hydrolýza v lidském těle. Takové chránící skupiny mohou zahrnovat „nižší alkylovou skupinu jako je methyl, ethyl, n-propyl, isopropyl, a-butyl, isobutyl, s-butyl, terc-butyl, n-pentyl, isopentyl, 2-methylbutyl, neopentyl, 1-ethylpropyl, n-hexyl, isohexyl, 4-methylpentyl, 3-methylpentyl, 2-methylpentyl, 1-methylpentyl, 3,3-dimethylbutyl,
2.2- dimethylbutyl, 1,1-dimethylbutyl, 1,2-dimethylbutyl, 1,3-dimethylbutyl, 2,3-dimethylbutyl a 2-ethylbutyl.
„Nižší alkylová skupina substituovaná kyanoskupinou zahrnuje například 2-kyanoethyl a 2-kyano-l,1-dimethylethyl.
„Ethylová skupina substituovaná silylovou šupinou zahrnuje například 2-methyldifenylsilylethyl, 2-trimethylsilylethyl a 2-trifenylsilylethyl.
„Halogenovaná nižší alkylová skupina zahrnuje například
2.2.2- trichlorethyl, 2,2,2-tribromethyl, 2,2,2-trifluorethyl a
2.2.2- trichlor-l,1-dimethylethyl.
„Nižší alkenylová skupina zahrnuje například ethenyl, 1-propenyl, 2-propenyl, l-methyl-2-propenyl, 1-methyl-l-propenyl, 2-methyl-l-propenyl, 2-methyl-2-propenyl, 2-ethyl-2-propenyl, 1-butenyl, 2-butenyl, l-methyl-2-butenyl, 1-methyl-2-butenyl, 1-methyl-l-butenyl, 3-methyl-2-butenyl, l-ethyl-2-butenyl, 3-butenyl, l-methyl-3-butenyl, 2-methyl-3-butenyl, l-ethyl-3-butenyl, 1-pentenyl, 2-pentenyl, l-methyl-2-pentenyl, l-methyl-2-pentenyl, 3-pentenyl, l-methyl-3-pentenyl, 2-methyl-3-pentenyl, 4-pentenyl, l-methyl-4-pentenyl, 2-methyl-4-pentenyl, 1-hexenyl, 2-hexenyl, 3-hexenyl, 4-hexenyl a 5-hexenyl.
„Cykloalkylová skupina zahrnuje například cyklopropyl, cyklobutyl, cyklopentyl, cyklohexyl, cykloheptyl, norbornyl a adamantyl.
„Kyanátovaná nižší alkenylová skupina je například 2-kyanobutenyl.
„Arylalkylová skupina zahrnuje například benzyl, a-naftylmethyl, indenylmethyl, fenantrenylmethyl, antracenylmethyl, difenylmethyl, trifenylmethyl, 1-fenethyl, 2-fenethyl, 1-naftylethyl, 2-naftylethyl, 1-fenylpropyl, 2-fenylpropyl, 3-fenylpropyl, 1-naftylpropyl, 2-naftylpropyl, 3-naftylpropyl, 1-fenylbutyl, 2-fenylbutyl, 3-fenylbutyl, 4-fenylbutyl, 1-naftylbutyl, 2-naftylbutyl, 3-naftylbutyl, 4-naftylbutyl, 1-fenylpentyl, 2-fenylpentyl, 3-fenylpentyl, 4-fenylpentyl, 4-fe9 • ·· *· ·· ·· · • · · · · ♦ · ♦ ♦ ? · · • · · · · · · ·« · • · ··· ····«· · · ··· · · · · · · ··· ·· ·· ·· ·* ··· nylpentyl, 5-fenylpentyl, 1-naftylpentyl, 2-naftylpentyl, 3-naftylpentyl, 4-naftylpentyl, 5-naftylpentyl, 1-fenylhexyl, 3-fenylhexyl, 4-fenylhexyl, 5-fenylhexyl, 6-fenylhexyl, 1-naftylhexyl, 2-naftylhexyl, 3-naftylhexyl, 4-naftylhexyl, 5-naftylhexyl a 6-naftylhexyl.
„Aralkylová skupina, kde uvedený arylový kruh se substituoval nitroskupinou nebo halogenovým atomem zahrnuje 4-chlorbenzyl, 2-(4-nitrofenyl)ethyl, o-nitrobenzyl, 4-nitrobenzyl,
2.4- dinitrobenzyl a 4-chlor-2-nitrobenzyl.
„Arylová skupina zahrnuje fenyl, indenyl, naftyl, fenantrenyl a antracenyl a „arylová skupina substituovaná nižší alkylovou skupinou, atomem halogenu nebo nitroskupinou zahrnuje 2-methylfenyl, 2,6-dimethylfenyl, 2-chlorfenyl, 4-chlorfenyl,
2.4- dichlorfenyl, 2,5-dichlorfenyl, 2-bro-mofenyl, 4-nitrofenyl a 4-chlor-2-nitrofenyl.
Výhodné jsou „nižší alkylová skupina, „nižší alkylová skupina substituovaná cyanoskupinou, „aralkylová skupina nebo „aralkylová skupina, kde uvedený arylový kruh se substituuje nitroskupinou nebo halogenovým atomem. Výhodnější je 2-kyanoethylová skupina, 2,2,2-trichlorethylová skupina nebo benzylová skupina.
„Alkoxyskupina zahrnující 1 až 4 atomy uhlíku symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 a 2 může zahrnovat methoxy, ethoxy, n-propoxy, isopropoxy, a-butoxy, isobutoxy, s-butoxy nebo terc-butoxyskupinu. Výhodná je methoxyskupina nebo ethoxyskupina.
Chránící skupina „chráněné merkaptoskupiny symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 a 2 může zahrnovat mimo hydroxylovách chránících skupin uvedených shora v textu „skupinu, která tvoří disulfid jako je alkylthioskupina, což je například methylthioskupina, ethylthioskupina, terc-butylthioskupina a aralkylthioskupina jako je benzylthioskupina. Výhodná je „alifatická acylová skupina nebo „aromatická acylová skupina, výhodnější je benzoylová skupina. Termín „alky10 « ·· ♦· ·· ·· ΦΦΦΦ ···· 9 9 • · · » · · ·*♦ · 9 · ····· · 4 9
999 99 ·· *· ·♦
Ithioskupina, která vykazuje 1 až 4 atomy uhlíku symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 nebo 2 může zahrnovat methylthioskupinu, ethylthioskupinu, propylthioskupinu, isopropylthioskupinu, butylthioskupinu, s-butylthioskupinu a terc-butylthioskupinu. Výhodná je methylthioskupina nebo ethylthioskupina.
Chránící skupina „chráněné aminoskupiny skupiny a ve sho ra uvedeném vzorci 1 a 2 zahrnuje „alifatickou acylovou skupinu jako je alkylkarbonylová skupina a to například formyl, acetyl, propionyl, butyryl, isobutyryl, pentanoyl, pivaloyl, valeryl, isovaleryl, aktanoyl, nonanoyl, dekanoyl, 3-methylnonanoyl, 8-methyl-nonanoyl, 3-ethyloctanoyl, 3,7-dimethyloktanoyl, undekanoyl, dodekanoyl, tridekanoyl, tetradekanoyl, pentadekanoyl, hexadekanoyl, 1-methyl-pantadekanoyl, 14-methylpentadekanoyl, 13,13-dimethyltetra-dekanoyl, heptadekanoyl, 15-methylhexa-dekanoyl, oktadekanoyl, 1-methylheptadekanoyl, nonadekanoyl, eikosanoyl a heneikosanoyl a karboxylovaná akylkarbonylová skupina, jako je například sukcinoyl, glutaroyl a adipoyl, halogen nižší alkylkarbonylová skupina, což je například chloracetyl, dichloracetyl, trichloracetyl a trifluoracetyl, nižší alkoxy nižší alkylkarbonylová skupina, jako je například methoxyacetyl, a nesaturovaná alkylkarbonylová skupina, což je například (E)-2-methyl-2-butenoyl.
„Aromatická acylová skupina je například arylkarbonylová skupina, což je například benzoyl, α-naftoyl a β-naftoyl, halogenoarylkarbonylová skupina, jako je například benzoyl, a-naftoyl a β-naftoyl, halogenarylkarbonylová skupina, což je například 2-brombenzoyl a 4-chlorbenzoyl, nižší alkylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 2,4,6-trimethylbenzoyl a 4-toluoyl, nižší alkoxylovaná arylkarbonylovaná skupina, jako je například 4-anisoyl, karboxylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 2-karboxybenzoyl, 3-karboxybenzoyl a 4-karboxybenzoyl, nitrovaná arylkarbonylová skupina, což je například 4-nitrobenoyl a 2-nitrobenzoyl, nižší alkoxykarbonylovaná
9 9 Μ 99 9· 9
909 9 9 99 9 * 999
999 99#9 99 9
999 999999 9 9
999 99 9 999
999 99 99 99 99 99 ,aryl karbonylovaná skupina, což je například 2-(methoxykarbonyl)benzoyl a arylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 4-fenylbenzoyl.
„Nižší alkoxykarbonylová skupina, což je například methoxykarbonyl, ethoxykarbonyl, t-butoxykarbonyl a isobutoxykarbonyl.
„Nižší alkoxykarbonylová skupina substituovaná halogenem nebo silylová skupina s třeminižšími alkyly zahrnuje například 2,2,2-trichlorethoxykarbonyl a 2-trimethylsilylethoxykarbonyl.
„Alkenyloxykarbonylová skupina zahrnuje například vinyloxykarbonyl a alyloxykarbonyl.
Termín „aralkyloxykarbonylová skupina, kde uvedený arylový kruh se může substituovat nižší alkoxyskupinou nebo nitroskupinou zahrnuje benzyloxykarbonyl, 4-methoxybenzyloxykarbonyl, 3,4-dimethoxybenzyloxykarbonyl, 2-nitrobenzyloxykarbonyl a 4-nitrobenzoyloxykarbonyl, přičemž je výhodná „alifatická acylová skupina nebo „aromatická acylová skupina. Více se upřednostňuje benzoylová skupina.
„Aminoskupina substituovaná alkylovou skupinou zahrnující 1 až 4 atomy uhlíku symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora popsaném vzorci 1 a 2 může zahrnovat methylamino, ethylamino, propylamino, isopropylamino, butylamino, isobutylamino, s-butylamino, terc-butylamino, dimethylamino, díethylamino, dípropylamino, diisopropylamino, dibutylamino, diisobutyl-amino, di(s-butyl)amino a di(terc-butyl)amino, přičemž je výhodné použít skupinu methylamino, ethylamino, dimethylamino, diethylamino nebo diisopropylamino.
Termín „kyanoalkoxyskupina vykazující 1 až 5 atomů uhlíku symbolu R3 a R4 ve shora uvedeném vzorci 1 reprezentuje skupinu, ve které shora popsaná „alkoxyskupina vykazující 1 až 4 atomy uhlíku se substituovala kyanoskupinou. Taková skupina může zahrnovat kyanomethoxy, 2-kyanoethoxy, 3-kyanopropoxy, 412
4 4 · · · · 4
4 4 4 4 4 4 · • · 4 · 4 4 444 * · • 4 4 4 4 4 4
4·· 44 44 44
-kyanobutoxy, 3-kyano-2-methylpropoxy nebo 1-kyanomethyl-l, 1-dimethylmethoxy. Výhodná je 2-kyanoethoxyskupina.
Termín „alkylová skupina zahrnující 1 až 4 atomy uhlíku skupiny a ve shora uvedeném vzorci 1 nebo 2 může zahrnovat methyl, ethyl, propyl, isopropyl, butyl, isobutyl, s-butyl a terc-butyl. Upřednostňuje se methylová a ethylová skupina.
Termín „atom halogenu skupiny a ve shora uvedeném vzorci nebo 2 může zahrnovat atom fluóru, chlóru a brómu nebo jódu. Výhodný je atom jódu nebo chlóru.
Preferované skupiny „purin-9-yl a „substituovaná skupina purin-9-yl symbolu B ve shora v textu uvedeném vzorci 1 nebo může zahrnovat jako celek 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl), aminoskupinu chráněnou skupinou 6-aminopurin-9-yl, 2,6-diaminoputin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, aminoskupinu chráněnou skupinou 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, aminoskupinu chráněnou skupinou 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2--amino-6-brompurin-9-yl, aminoskupinu chráněnou skupinou 2-amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl chráněný aminoskupinou a hydroxylovou skupinou, 6-amino-2-methoxypurin-9-yl, 6-amino-2-chlorpurin-9-yl, 6-amino-2-fluorpurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl nebo 6-merkaptopurin. Výhodnější je 6-benzylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-isobutyrylamino-6-hydroxypurin-9-yl nebo guaninylová skupina.
Výhodné skupiny „skupiny 2-oxopyrimidin-l-yl a „substituovaná skupina 2-oxopyrimidin-l-yl symbolu B ve shora v textu uvedením vzorci 1 a 2 mohou zahrnovat jako celek 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl (to je cytosinyl), aminoskupinu chráněnou skupinou 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, aminoskupinu chráněnou skupinou 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-merkaptopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-hydroxypyremidin-l-yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5-methylpyrimidin-l-yl (to je thyminyl) nebo 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je 5-methylcytosinyl). Výhodnější • *· ·· ·* ·· 9 · · · · · « 9 · f ♦ · · • · · · ♦ ······ · · • · · · · · · · · ··» ·· ·· ·· ·» ♦·· je skupina 2-oxo-4-benzoylaminopyrimidin-l-yl, cytosinyl, thyminyl, uracinyl, 2-oxo-4-benzoylamino-5-methyl-pyrimidin-l-yl nebo 5-methylcytosinylová skupina.
Termín „nukleosidový analog znamená nepřirozený typ nukleosidu, ve kterém purinová nebo pyrimidinová skupina je zachycena na cukru.
Termín „oligonukleotidový analog zahrnuje nepřirozený typ derivátu „oligonukleotidu, který zahrnuje 2 až 50 „nukleosidů a mohou být stejné nebo odlišné a váží se pomocí diesterové vazby kyseliny fosforečné a takové analogy mohou přednostně zahrnovat cukerné deriváty, ve kterých se upravuje cukerná složka. Dále zahrnuje deriváty thiotátu, ve kterých část vázaná diesterovou vazbou kyseliny fosforečné je thioátována. Dále zahrnuje esterové produkty, kde je esterifikována terminální část kyseliny fosforečné a amidové produkty, kde aminoskupina na purinové bázi je amidována. Výhodné jsou cukerné deriváty, ve kterých se cukerná složka upravuje a deriváty thioátu, kde část diesteru kyseliny fosforečné je thioátována.
Termín „jejich sůl znamená sole sloučeniny obecného vzorce 1 podle vynálezu, poněvadž se mohou převést na sole a takové sole mohou s výhodou zahrnovat anorganické sole například sole kovů, jako jsou sole alkalických kovů, například sodné sole, draselné sole a litné sole, sole kovů alkalických zemin, například vápenaté sole a sole hořečnaté, sole hlinité, sole železité, sole zinku, mědi, niklu a kobaltu. Dále může zahrnovat sole aminů, jako jsou anorganické sole, například sole amonné, organické sole, například sole t-oktylaminu, sole dibenzylaminu, sole morfolinu, sole glukozaminu, sole fenylglycinalkylesteru, sole ethylendiaminu, sole N-methylglukaminu, sole guanidinu, sole diethylaminu, sole triethylaminu, sole dicyklohexylaminu, N,N'-dibenzylethylendiaminu, sole chlorprokainu, sole prokainu, sole diethanolaminu, sole N-benzylfenethylaminu, sole piperazinu, tetramethylamonné sole a sole tris(hydroxymethyl)aminomethanu. Dále zahrnuje sole anorganic14 ·· · · ·· • · · · · · · · · · ft · · · · · · · · • · · · ······ · · • · ·· · · · »
9· ·· ·· · * · *' „kých kyselin, jako jsou sole halogenovodíkových kyselin, například sole kyseliny fluorovodíkové, sole kyseliny chlorovodíkové, sole kyseliny bromovodíkové a sole kyseliny jodovodíkové, sole kyseliny dusičné, sole kyseliny chloristé, sole kyseliny sírové a sole kyseliny fosforečné. Dále zahrnuje sole organických kyselin, jako jsou sole kyseliny nižší alkensulfonové, například sole kyseliny methansulonové, sole kyseliny trifluormethansulfonové a sole kyseliny ethansulfonové, sole kyseliny arylsulfonové, například sole kyseliny benzensulfonové a sole kyseliny p-toluensulfonové, sole kyseliny octové, sole kyseliny máselné, sole kyseliny mravenčí, sole kyseliny jantarové, sole kyseliny citrónové, sole kyseliny vinné, sole kyseliny šťavelové a sole kyseliny máselné a sole aminokyselin, jako jsou například sole glycinu, sole lyzinu, sole argininu, sole ornitinu a sole kyseliny glutamové a sole kyseliny asparagové.
Poněvadž upravené oligonukleotidy nebo poloynukleotidové analogy podle vynálezu se mohou převést na sůl, termín „jejich farmaceuticky přijatelné sole může s výhodou zahrnovat anorganické sole, jako jsou například sole kovů, což jsou například sole alkalických kovů, například sodné sole, draselné sole a litné sole, sole kovů alkalických zemin, například vápenaté sole a sole hořečnaté, sole hlinité, sole železité, sole zinku, mědi, niklu a kobaltu. Dále může zahrnovat sole aminů, jako jsou anorganické sole, například sole amonné, organické sole, například sole t-oktylaminu, sole dibenzylaminu, sole morfolinu, sole glukozaminu, sole fenylglycinalkylesteru, sole ethylendiaminu, sole N-methylglukaminu, sole guanidinu, sole diethylaminu, sole triethylaminu, sole dicyklohexylaminu, N,N'-dibenzyl-ethylendiaminu, sole chlorprokainu, sole prokainu, sole diethanolaminu, sole N-benzylfenethylaminu, sole piperazinu, tetramethylamonné sole a sole tris(hydroxymethyl)aminomethanu. Dále zahrnuje sole anorganických kyselin, jako jsou sole halogenovodíkových kyselin, například sole ky»9 J-'-' »>· ······ v ··· 99 99 »· ·· ·♦' .seliny fluorovodíkové, sole kyseliny chlorovodíkové, sole kyseliny bromovodíkové a sole kyseliny jodovodíkové, sole kyseliny dusičné, sole kyseliny chloristé, sole kyseliny sírové a sole kyseliny fosforečné. Dále zahrnuje sole organických kyselin, jako jsou sole kyseliny nižší alkensulfonové, například sole kyseliny methansulonové, sole kyseliny trifluormethansulfonové a sole kyseliny ethansulfonové, sole kyseliny arylsulfonové, například sole kyseliny benzensulfonové a sole kyseliny p-toluensulfonové, sole kyseliny octové, sole kyseliny máselné, sole kyseliny mravenčí, sole kyseliny jantarové, sole kyseliny citrónové, sole kyseliny vinné, sole kyseliny šťavelové a sole kyseliny máselné a sole aminokyselin, jako jsou například sole glycinu, sole lyzinu, sole argininu, sole ornitinu a sole kyseliny glutamové a sole kyseliny asparagové.
Ze sloučenin podle obecného vzorce 1 a jejich solí podle vynálezu výhodné sloučeniny mohou zahrnovat (1) sloučeniny, ve kterých symbol R1 představuje atom vodíku, alifatickou acylovou skupinu, aromatickou acylovou skupinu, methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, přičemž arylový kruh je substituovaný nižším alkylem, nižší alkoxyskupinu, halogenem nebo kyanoskupinou nebo silylovou skupinu, a její sole, (2) sloučeniny, kde symbol R1 představuje atom vodíku, acetylovou skupinu, benzoylovou skupinu, benzylovou skupinu, p-methoxybenzylovou skupinu, dimethoxytritylovou skupinu, monomethoxytritylovou skupinu nebo terc-butyldifenylsilylovou skupinu, a její sole, (3) sloučeniny, ve kterých symbol R2 představuje atom vodíku, alifatickou acylovou skupinu, aromatickou acylovou skupinu, methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, přičemž arylový kruh je substituovaný nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem ♦· 99 ·· • 9 9 9 9 · a ♦ • 9 9 9 * 9 9
9 9 9 9*9 99 9
9 9 9 9 9
99 9*9 • 99 nebo kyanoskupinou nebo silylovou skupinou, skupinou fos foramiditu, fosfonylovou skupinou, skupinou kyseliny fos forečné nebo chráněnou skupinou kyseliny fosforečné, a je jí sole, (4) sloučeniny, kde symbol R2 představuje atom vodíku, acetylovou skupinu, benzoylovou skupinu, benzylovou skupinu, p-methoxybenzylovou skupinu, terc-butyldifenylsilylovou skupinu, -P (OCH2H4CN) (NCH (CH3) 2) , -P (OCH3) (NCH (CH3) 2) , fosfonylovou skupinu nebo 2-chlorfenyl nebo skupinu kyseliny 4-chlorfenylfosforečné a jejich sole, (5) sloučeniny, kde symbol A představuje methylenovou skupinu a jejich sole, (6) sloučeniny, kde symbol B představuje 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl), aminoskupinu chráněnou skupinou 6-aminopurin-9-yl, 2,6-diaminopurin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2-amino-6-brompurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl (to je guaninyl), aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, hydroxylová skupina chráněná skupinou 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, 6-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl, 6-merkaptopurin-9-yl, 2-oxo-4-amino-pyrimidin-1-yl (to je cytosinyl), aminoskupina chráněná skupinou 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-oxo-4-amino-5fluorpyrimidin-l-yl, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrímidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-merkaptopyrimidin-1-yl, 2-oxo-4-hydroxypyrimidin-l--yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5-methylpyrimidin-l—yl (to je thyminyl), 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je 5-methylcyto« · • * φ» « · · · · · »··· ··· · · « t 9 9 9
-1-7 «···«· ··♦ · · · 9
X / 999 99 9 999
999 99 99 99 9 9. ··!
sinyl) nebo aminoskupina chráněná skupinou 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl, a jejich sole a (7) sloučeniny, kde symbol B představuje 6-benzoylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-isobutyrylamino-6~hydroxypurin-9-yl, guaninyl, 2-oxo-4-benzoylaminopyrimidin-l-yl, cytosinyl, 2-oxo-5-methyl-4-benzoylaminopyrimidin-l-yl, 5-methylcytosinyl, uracinyl nebo thyminyl, a jejich sole.
Shora uvedené sloučeniny v odstavcích (1) a (2), (3) a (4) nebo (6) a (7) označují výhodné sloučeniny, jejichž počet se stává ve vzorci 1 vyšší. Sloučenina získaná výběrem symbolu R1 ze skupin popsaných v odstavcích (1) a (2), výběrem symbolu R2 ze skupin popsaných v odstavcích (3) a (4), výběrem symbolu A ze skupin popsaných v odstavci (5) a výběrem symbolu B ze skupin popsaných v odstavci (6) a (7) nebo jejich kombinací, a její sole je výhodná. Zvláště výhodné jsou sloučeniny a jejich sole vybrané z následujících skupin.
(Skupina sloučenin)
2'-0,4'-C-ethylenguanosin 2'-0,4'-C-ethylenadenosin ', 5 '-di-0-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin
3', 5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin 5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin 5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin 2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin
2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit 2'-0,4'-C-ethylenuridin
2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin
2'-0, 4'-C-ethylencytidin
2'-0,4'-C-ethylen-5-methylcytidin
3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylenuridin ·♦ μ ·♦ ·» · · · · · ♦ · · • · · » * « » * « · · · ♦ ··* · · · « · e » ·♦·· • ·* *· ·« ·* ·* .5 ' -O-dimethoxytrityl-2 '-0,4' -C-ethylenuridin 3',5'-di-0-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin 3',5'-di-0-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin 3',5'-di-0-benzýl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methyluridin 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin
2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin
2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin
5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylenuridin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit
5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit
5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit a 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit
Výhodné sloučeniny zahrnující oligonukleotidové analogy obsahující jednu nebo dvě nebo více struktur obecného vzorce 2 a jejich farmaceuticky přijatelné sole podle vynálezu mohou zahrnovat (8) oligonukleotidové analogy, kde symbol A představuje methylenovou skupinu, a jejich farmaceuticky přijatelné sole, (9) oligonukleotidové analogy, kde symbol B představuje 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl), aminoskupinu chráněnou skupinou 6-ami-nopurin-9-yl, 2,6-diaminopurin-9-yl, 2-amino-6-chlor-purin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2ami-no-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2-amino-6-brompurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl (to je guaninyl), aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6« »« »· *· »· ·· « » »«»* «·· • « ♦ »»♦· »»
-1Γ, ··»»»··«»··· i y «···«··· · ·«··♦<··«···· hydroxypurin-9-yl, hydroxylová skupina chráněná skupinou 2-amino~6-hydroxypurin-9-yl, 6-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2 -amino-6-fluorpurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl, 6-merkaptopurin-9-yl, 2-oxo-4-amino-pyrimidin-l-yl (to je cytosinyl), aminoskupina chráněná skupinou 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-merkaptopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-hydroxypyrimidin-l—yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5-methylpyrimidin-l-yl (to je thyminyl), 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je 5-methylcytosinyl) nebo aminoskupina chráněná skupinou 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl, a jejich sole a (10) oligonukleotidové analogy, kde symbol B představuje 6-benzoylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-isobutyrylamino-6-hydroxypurin-9-yl, guaninyl, 2-oxo-4-benzoylaminopyrimidin-1-yl, cytosinyl, 2-oxo-5-methyl-4-benzoylaminopyrimidin-1-yl, 5-methylcytosinyl, uracinyl nebo thyminyl, a jejich farmaceuticky přijatelné sole.
Odstavce (9) a (10) shora v textu označují nejvýhodnější oligonukleotidové analogy, jejichž počet se zvyšuje, a preferují se oligonukleotidové analogy získané výběrem symbolu A z odstavce (8) a výběrem symbolu B z odstavce (9) a (10) nebo jejich kombinace a jejich farmaceuticky přijatelné sole.
Specifické sloučeniny zahrnuté ve sloučenině shora uvedeného obecného vzorce 1 podle vynálezu jsou uvedeny v tabulce č. 1 a 2. Avšak sloučeniny podle vynálezu se neomezují na zde uvedené sloučeniny.
V tabulce č. 1 a 2 zkratka Př.č. slouč. reprezentuje příklad sloučeniny číslo, Me představuje methylovou skupinu, Bn představuje benzylovou skupinu, Bz představuje benzoylovou skupinu, PMB reprezentuje p-methoxybenzylovou skupinu, Tr reprezentuje trifenylmethylovou skupinu, MMTr reprezentuje ·· 4»· ·· • 9 9 · 4 9 999 < · 9 <9 4 · • 999 9 999 99 9
9 9 9 9 9 9 <99 9« 49 44 4
4-methoxytrifenylmethylovou (monomethoxytritylovou) skupinu, DMTr reprezentuje 4,4'-dimethoxytrifenylmethylovou (dimethoxytritylovo) skupinu, zkratka .TMTr reprezentuje 4,4',4''-trimethoxytrifenylmethylovou (trimethoxytritylovou) skupinu, TMS reprezentuje trimethylsilylovou skupinu, TBDMS reprezentuje terc-butyldimethylsilylovou skupinu, TBDPS reprezentuje tercbutyldifenylsilylovou skupinu a TIPS reprezentuje triisopropylsilylovou skupinu.
(1·)
• v •9 «· 99
• · • • · · 9 • 9 9
• · • · • i ··· · • •
• · • • · 9 • •
• 9 ·» 99 99 *9 9
Tabulka č. 1:
Př. slouč. č. A R1 R2 R3a R4a
1-1 ch2 H H H H
1-2 ch2 H H H nh2
1-3 ch2 H H H OH
1-4 ch2 H H OH H
1-5 ch2 H H OH nh2
1-6 ch2 H H OH OH
1-7 ch2 H H nh2 H
1-8 ch2 H H nh2 nh2
1-9 ch2 H H nh2 Cl
1-10 ch2 H H nh2 F
1-11 ch2 H H nh2 Br
1-12 ch2 H H nh2 OH
1-13 ch2 H H OMe H
1-14 ch2 H H OMe OMe
1-15 ch2 H H OMe nh2
1-16 ch2 H H Cl H
1-17 ch2 H H Br H
1-18 ch2 H H F H
1-19 ch2 H H Cl Cl
1-20 ch2 H H SH H
• · • ·
1-21 ch2 Bn H NHBz H
1-22 ch2 Bn H OH NHCOCH(CH3)2
1-23 ch2 Bn Bn NHBz H
1-24 ch2 Bn Bn OH NHCOCH(CH3)2
1-25 ch2 PMB H NHBz H
1-26 ch2 PMB H OH NHCOCH(CH3)2
1-27 ch2 PMB PMB NHBz H
1-28 ch2 PMB PMB OH NHCOCH(CH3)2
1-29 ch2 Tr H NHBz H
1-30 ch2 MMTr H NHBz H
1-31 ch2 DMTr H NHBz H
1-32 ch2 TMTr H NHBz H
1-33 ch2 Tr H OH NHCOCH(CH3)2
1-34 ch2 MMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-35 ch2 DMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-36 ch2 TMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-37 ch2 TMS H NHBz H
1-38 ch2 TBDMS H NHBz H
1-39 ch2 TBDPS H NHBz H
1-40 ch2 TIPS H NHBz H
1-41 ch2 TMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-42 ch2 TBDMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-43 ch2 TBDPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-44 ch2 TIPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-45 (CH2)2 H H H H
1-46 (CH2)2 H H H nh2
1-47 (CH2)2 H H H OH
1-48 (CH2)2 H H OH H
1-49 (CH2)2 H H OH nh2
1-50 (CH2)2 H H OH OH
1-51 (CH2)2 H H nh2 H
1-52 (ch2)2 H H nh2 nh2
1-53 (CH2)2 H H nh2 Cl
1-54 (CH2)2 H H nh2 F
1-55 (CH2)2 H H nh2 Br
1-56 (CH2)2 H H nh2 OH
1-57 (CH2)2 H H OMe H
1-58 (CH2)2 H H OMe OMe
1-59 (CH2)2 H H OMe nh2
1-60 (CH2)2 H H Cl H
1-61 (CH2)2 H H Br H
1-62 (CH2)2 H H F H
1-63 (CH2)2 H H Cl Cl
1-64 (CH2)2 H H SH H
1-65 (CH2)2 Bn H NHBz H
1-66 (CH2)2 Bn H OH NHCOCH(CH3)2
1-67 (CH2)2 Bn Bn NHBz H
1-68 (CH2)2 Bn Bn OH NHCOCH(CH3)2
1-69 (CH2)2 PMB H NHBz H
1-70 (CH2)2 PMB H OH NHCOCH(CH3)2
1-71 (CH2)2 PMB PMB NHBz H
1-72 (CH2)2 PMB PMB OH NHCOCH(CH3)2
1-73 (CH2)2 Tr H NHBz H
1-74 (CH2)2 MMTr H NHBz H
1-75 (CH2)2 DMTr H NHBz H
1-76 (CH2)2 TMTr H NHBz H
1-77 (CH2)2 Tr H OH NHCOCH(CH3)2
1-78 (CH2)2 MMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-79 (CH2)2 DMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-80 (CH2)2 TMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-81 (CH2)2 TMS H NHBz H
1-82 (CH2)2 TBDMS H NHBz H
1-83 (CH2)2 TBDPS H NHBz H
1-84 (CH2)2 TIPS H NHBz H
• · · 99 99 99 9 • 99 9 · ·· · · *99
999 9 9 9 9 99 9
999 999999 9 ·
999 99 9 ··· •99 99 99 99 99 999
1-85 (CH2)2 TMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-86 (CH2)2 TBDMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-87 (CH2)2 TBDPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-88 (CH2)2 TIPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-89 (CH2)3 H H H H
1-90 (CH2)3 H H H NH2
1-91 (CH2)3 H H H OH
1-92 (CH2)3 H H OH H
1-93 (CH2)3 H H OH nh2
1-94 (CH2)3 H H OH OH
1-95 (CH2)3 H H NH2 Η
1-96 (CH2)3 H H nh2 nh2
1-97 (CH2)3 H H nh2 Cl
1-98 (CH2)3 H H nh2 F
1-99 (CH2)3 H H nh2 Br
1-100 (CH2)3 H H nh2 OH
1-101 (CH2)3 H H OMe H
1-102 (CH2)3 H H OMe OMe
1-103 (CH2)3 H H OMe nh2
1-104 (CH2)3 H H Cl H
1-105 (CH2)3 H H Br H
1-106 (CH2)3 H H F H
1-107 (CH2)3 H H Cl Cl
1-108 (CH2)3 H H SH H
1-109 (CH2)3 Bn H NHBz H
1-110 (CH2)3 Bn H OH NHCOCH(CH3)2
1-111 (CH2)3 3n Bn NHBz H
1-112 (CH2)3 3n Bn OH NHCOCH(CH3)2
1-113 (CH2)3 PMB H NHBz H
1-114 (CH2)3 PMB H OH NHCOCH(CH3)2
1-115 (CH2)3 PMB PMB NHBz H
1-116 (CH2)3 PMB PMB OH NHCOCH(CH3)2
1-117 (CH2)3 Tr H NHBz H
1-118 (CH2)3 MMTr H NHBz H
1-119 (CH2)3 DMTr H NHBz H
1-120 (CH2)3 TMTr H NHBz H
1-121 (CH2)3 Tr H OH NHCOCH(CH3)2
1-122 (CH2)3 MMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-123 (CH2)3 DMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-124 (CH2)3 TMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-125 (CH2)3 TMS H NHBz H
1-126 (CH2)3 TBDMS H NHBz H
1-127 (CH2)3 TBDPS H NHBz H
1-128 (CH2)3 TIPS H NHBz H
1-129 (CH2)3 TMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-130 (CH2)3 TBDMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-131 (CH2)3 TBDPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-132 (CH2)3 TIPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-133 (CH2)4 H H H H
1-134 (CH2)4 H H H NH2
1-135 (CH2)4 H H H OH
1-136 (CH2)4 H H OH H
1-137 (CH2)4 H H OH nh2
1-138 (CH2)4 H H OH OH
1-139 (CH2)4 H H NH2 H
1-140 (CH2)4 H H nh2 nh2
1-141 (CH2)4 H H nh2 Cl
1-142 (CH2)4 H H nh2 F
1-143 (CH2)4 H H nh2 Br
1-144 (CH2)4 H H nh2 OH
1-145 (CH2)4 H H OMe H
1-146 (CH2)4 H H OMe OMe
1-147 (CH2)4 H H OMe nh2
1-148 (CH2)4 H H Cl H
1-149 (CH2)4 H H Br H
1-150 (CH2)4 H H F H
1-151 (CH2)4 H H Cl Cl
1-152 (CH2)4 H H SH H
1-153 (CH2)4 Bn H NHBz H
1-154 (CH2)4 Bn H OH NHCOCH(CH3)2
1-155 (CH2)4 Bn Bn NHBz H
1-156 (CH2)4 Bn Bn OH NHCOCH(CH3)2
1-157 (CH2)4 PMB H NHBz H
1-158 (CH2)4 PMB H OH NHCOCH(CH3)2
1-159 (CH2)4 PMB PMB NHBz H
1-160 (CH2)4 PMB PMB OH NHCOCH(CH3)2
1-161 (CH2)4 Tr H NHBz H
1-162 (CH2)4 MMTr H NHBz H
1-163 (CH2)4 DMTr H NHBz H
1-164 (CH2)4 TMTr H NHBz H
1-165 (CH2)4 Tr H OH NHCOCH(CH3)2
1-166 (CH2)4 MMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-167 (CH2)4 DMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-168 (CH2)4 TMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-169 (CH2)4 TMS H NHBz H
1-170 (CH2)4 TBDMS H NHBz H
1-171 (CH2)4 TBDPS H NHBz H
1-172 (CH2)4 TIPS H NHBz H
1-173 (CH2)4 TMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-174 (CH2)4 TBDMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-175 (CH2)4 TBDPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-176 (CH2)4 TIPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-177 ch2 H H OH NHCOCH(CH3)2
1-178 ch2 H H NHBz H
1-179 (CH2)2 H H OH NHCOCH(CH3)2
1-180 (CH2)2 H H NHBz H
1-181 (CH2)3 H H ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-182 (CH2)3 H H ΝΗΒζ Η
1-183 (CH2)4 H H ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-184 (CH2)4 H H ΝΗΒζ Η
1-185 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-186 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) ΝΗΒζ Η
1-187 (CH2)2 DMTr PÍNfiPrhXOCNELfCN) ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-188 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) ΝΗΒζ Η
1-189 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-190 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) ΝΗΒζ Η
1-191 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2XOC2H4CN) ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-192 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) ΝΗΒζ Η
1-193 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-194 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) ΝΗΒζ Η
1-195 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-196 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) ΝΗΒζ Η
1-197 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-198 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) ΝΗΒζ Η
1-199 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-200 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) ΝΗΒζ Η
1-201 ch2 DMTr P(O)(OH)H ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-202 ch2 DMTr P(O)(OH)H ΝΗΒζ Η
1-203 (CH2)2 DMTr P(OXOH)H ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-204 (CH2)2 DMTr P(O)(OH)H ΝΗΒζ Η
1-205 (CH2)3 DMTr Ρ(Ο)(ΟΗ)Η ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-206 (CH2)3 DMTr Ρ(ΟΧΟΗ)Η ΝΗΒζ Η
1-207 (CH2)4 DMTr Ρ(ΟΧΟΗ)Η ΟΗ NHCOCH(CH3)2
1-208 (CH2)4 DMTr Ρ(Ο)(ΟΗ)Η ΝΗΒζ Η
Π)
Tabulka č. 2
Př. slouč. č. A R1 R2 R5 R6
2-1 ch2 H H OH H
2-2 ch2 H H OH ch3
2-3 ch2 H H nh2 H
2-4 ch2 H H nh2 ch3
2-5 ch2 H H nh2 F
2-6 ch2 H H Cl H
2-7 ch2 H H OMe H
2-8 ch2 H H SH H
2-9 ch2 Bn H OH H
2-10 ch2 Bn Bn OH H
2-11 ch2 PMB H OH H
2-12 ch2 PMB PMB OH H
2-13 ch2 Tr H OH H
2-14 ch2 MMTr H OH H
2-15 ch2 DMTr H OH H
2-16 ch2 TMTr H OH H
2-17 ch2 TMS H OH H
2-18 ch2 TBDMS H OH H
2-19 ch2 TBDPS H OH H
* 4»
• * · · • · · · • · · « « · • · · ·· · *
2-20 ch2 TIPS H OH H
2-21 ch2 Bn H OH ch3
2-22 ch2 Bn Bn OH ch3
2-23 ch2 PMB H OH ch3
2-24 ch2 PMB PMB OH ch3
2-25 ch2 Tr H OH ch3
2-26 ch2 MMTr H OH ch3
2-27 ch2 DMTr H OH ch3
2-28 ch2 TMTr H OH ch3
2-29 ch2 TMS H OH ch3
2-30 ch2 TBDMS H OH ch3
2-31 ch2 TBDPS H OH ch3
2-32 ch2 TIPS H OH ch3
2-33 ch2 Bn H NHBz H
2-34 ch2 Bn Bn NHBz H
2-35 ch2 PMB H NHBz H
2-36 ch2 PMB PMB NHBz H
2-37 ch2 Tr H NHBz H
2-38 ch2 MMTr H NHBz H
2-39 ch2 DMTr H NHBz H
2-40 ch2 TMTr H NHBz H
2-41 ch2 TMS H NHBz H
2-42 ch2 TBDMS H NHBz H
2-43 ch2 TBDPS H NHBz H
2-44 ch2 TIPS H NHBz H
2-45 ch2 3n H NHBz CH3
2-46 ch2 Bn Bn NHBz ch3
2-47 ch2 PMB H NHBz ch3
2-48 ch2 PMB PMB NHBz ch3
2-49 ch2 Tr H NHBz ch3
2-50 ch2 MMTr H NHBz ch3
2-51 ch2 DMTr H NHBz ch3
* ♦ · * * · · 9 •*·» 9 · · · «9« • · · 9 9*9 « « • 9 9 » · * ··« · « » • · · 9 9 · «3
9·*·· »9 * * 9 9 3
2-52 ch2 TMTr H NHBz CH3
2-53 ch2 TMS H NHBz ch3
2-54 ch2 TBDMS H NHBz ch3
2-55 ch2 TBDPS H NHBz ch3
2-56 ch2 TIPS H NHBz ch3
2-57 (CH2)2 H H OH H
2-58 (CH2)2 H H OH čh3
2-59 (CH2)2 H H NH2 Η
2-60 (CH2)2 H H nh2 ch3
2-61 (CH2)2 H H nh2 F
2-62 (CH2)2 H H Cl H
2-63 (CH2)2 H H OMe H
2-64 (CH2)2 H H SH H
2-65 (CH2)2 Bn H OH H
2-66 (CH2)2 Bn Bn OH H
2-67 (CH2)2 PMB H OH H
2-68 (CH2)2 PMB PMB OH H
2-69 (CH2)2 Tr H OH H
2-70 (CH2)2 MMTr H OH H
2-71 (ch2)2 DMTr H OH H
2-72 (CH2)2 TMTr H OH H
2-73 (CH2)2 TMS H OH H
2-74 (CH2)2 TBDMS H OH H
2-75 (CH2)2 TBDPS H OH H
2-76 (CH2)2 TIPS H OH H
2-77 (CH2)2 Bn H OH CH3
2-78 (CH2)2 3n Bn OH ch3
2-79 (CH2)2 PMB H OH ch3
2-80 (CH2)2 PMB PMB OH ch3
2-81 (CH2)2 Tr H OH ch3
2-82 (CH2)2 MMTr H OH ch3
2-83 (CH2)2 DMTr H OH ch3
*· • · * *
2-84 (CH2)2 TMTr H OH ch3
2-85 (CH2)2 TMS H OH ch3
2-86 (CH2)2 TBDMS H OH ch3
2-87 (CH2)2 TBDPS H OH ch3
2-88 (CH2)2 TIPS H OH ch3
2-89 (CH2)2 Bn H NHBz H
2-90 (CH2)2 Bn Bn NHBz H
2-91 (CH2)2 PMB H NHBz H
2-92 (CH2)2 PMB PMB NHBz H
2-93 (CH2)2 Tr H NHBz H
2-94 (CH2)2 MMTr H NHBz H
2-95 (CH2)2 DMTr H NHBz H
2-96 (CH2)2 TMTr H NHBz H
2-97 (CH2)2 TMS H NHBz H
2-98 (CH2)2 TBDMS H NHBz H
2-99 (CH2)2 TBDPS H NHBz H
2-100 (CH2)2 TIPS H NHBz H
2-101 (CH2)2 Bn H NHBz ch3
2-102 (CH2)2 Bn Bn NHBz ch3
2-103 (CH2)2 PMB H NHBz ch3
2-104 (CH2)2 PMB PMB NHBz ch3
2-105 (CH2)2 Tr H NHBz ch3
2-106 (CH2)2 MMTr H NHBz ch3
2-107 (CH2)2 DMTr H NHBz ch3
2-108 (CH2)2 TMTr H NHBz ch3
2-109 (CH2)2 TMS H NHBz ch3
2-110 (CH2)2 TBDMS H NHBz ch3
2-111 (CH2)2 TBDPS H NHBz ch3
2-112 (CH2)2 TIPS H NHBz ch3
2-113 (CH2)3 H H OH H
2-114 (CH2)3 H H OH ch3
2-115 (CH2)3 H H nh2 H
2-116 (CH2)3 H H nh2 CH3
2-117 (CH2)3 H H nh2 F
2-118 (CH2)3 H H Cl H
2-119 (CH2)3 H H OMe H
2-120 (CH2)3 H H SH H
2-121 (CH2)3 Bn H OH H
2-122 (CH2)3 Bn Bn OH H
2-123 (CH2)3 PMB H OH H
2-124 (CH2)3 PMB PMB OH H
2-125 (CH2)3 Tr H OH H
2-126 (CH2)3 MMTr H OH H
2-127 (CH2)3 DMTr H OH H
2-128 (CH2)3 TMTr H OH H
2-129 (CH2)3 TMS H OH H
2-130 (CH2)3 TBDMS H OH H
2-131 (CH2)3 TBDPS H OH H
2-132 (CH2)3 TIPS H OH H
2-133 (CH2)3 Bn H OH ch3
2-134 (CH2)3 Bn Bn OH ch3
2-135 (CH2)3 PMB H OH ch3
2-136 (CH2)3 PMB PMB OH ch3
2-137 (CH2)j Tr H OH ch3
2-138 (CH2)3 MMTr H OH ch3
2-139 (CH2)3 DMTr H OH ch3
2-140 (CH2)3 TMTr H OH ch3
2-141 (CH2)3 TMS H OH ch3
2-142 (CH2)3 TBDMS H OH ch3
2-143 (CH2)3 TBDPS H OH ch3
2-144 (CH2)3 TIPS H OH ch3
2-145 (CH2)3 Bn H NHBz H
2-146 (CH2)3 Bn Bn NHBz H
2-147 (CH2)3 PMB H NHBz H
• · ·· ·
2-148 (CH2)3 PMB PMB NHBz H
2-149 (CH2)3 Tr H NHBz H
2-150 (CH2)3 MMTr H NHBz H
2-151 (CH2)3 DMTr H NHBz H
2-152 (CH2)3 TMTr H NHBz H
2-153 (CH2)3 TMS H NHBz H
2-154 (CH2)3 TBDMS H NHBz H
2-155 (CH2)3 TBDPS H NHBz H
2-156 (CH2)3 TIPS H NHBz H
2-157 (CH2)3 Bn H NHBz ch3
2-158 (CH2)3 Bn Bn NHBz ch3
2-159 (CH2)3 PMB H NHBz ch3
2-160 (CH2)3 PMB PMB NHBz ch3
2-161 (CH2)3 Tr H NHBz ch3
2-162 (CH2)3 MMTr H NHBz ch3
2-163 (CH2)3 DMTr H NHBz ch3
2-164 (CH2)3 TMTr H NHBz ch3
2-165 (CH2)3 TMS H NHBz ch3
2-166 (CH2)3 TBDMS H NHBz ch3
2-167 (CH2)3 TBDPS H NHBz ch3
2-168 (CH2)3 TIPS H NHBz ch3
2-169 (CH2)4 H H OH Η
2-170 (CH2)4 H H OH ch3
2-171 (CH2)4 H H NH2 H
2-172 (CH2)4 H H nh2 ch3
2-173 (CH2)4 H H nh2 F
2-174 (CH2)4 H H Cl H
2-175 (CH2)4 H H OMe H
2-176 (CH2)4 H H SH H
2-177 (CH2)4 Bn H OH H
2-178 (CH2)4 Bn Bn OH H
2-179 (CH2)4 PMB H OH H
• ·
2-180 (CH2)4 PMB PMB OH H
2-181 (CH2)4 Tr H OH H
2-182 (CH2)4 MMTr H OH H
2-183 (CH2)4 DMTr H OH H
2-184 (CH2)4 TMTr H OH H
2-185 (CH2)4 TMS H OH H
2-186 (CH2)4 TBDMS H OH H
2-187 (CH2)4 TBDPS H OH H
2-188 (CH2)4 TIPS H OH H
2-189 (CH2)4 Bn H OH ch3
2-190 (CH2)4 Bn Bn OH ch3
2-191 (CH2)4 PMB H OH ch3
2-192 (CH2)4 PMB PMB OH ch3
2-193 (CH2)4 Tr H OH ch3
2-194 (CH2)4 MMTr H OH ch3
2-195 (CH2)4 DMTr H OH ch3
2-196 (CH2)4 TMTr H OH ch3
2-197 (CH2)4 TMS H OH ch3
2-198 (CH2)4 TBDMS H OH ch3
2-199 (CH2)4 TBDPS H OH ch3
2-200 (CH2)4 TIPS H OH ch3
2-201 (CH2)4 Bn H NHBz H
2-202 (CH2)4 Bn Bn NHBz H
2-203 (CH2)4 PMB H NHBz H
2-204 (CH2)4 PMB PMB NHBz H
2-205 (CH2)4 Tr H NHBz H
2-206 (CH2)4 MMTr H NHBz H
2-207 (CH2)4 DMTr H NHBz H
2-208 (CH2)4 TMTr H NHBz H
2-209 (CH2)4 TMS H NHBz H
2-210 (CH2)4 TBDMS H NHBz H
2-211 (CH2)4 TBDPS H NHBz H
' 2-212 (CH2)4 TIPS H NHBz H
2-213 (CH2)4 Bn H NHBz CH3
2-214 (CH2)4 Bn Bn NHBz ch3
2-215 (CH2)4 PMB H NHBz ch3
2-216 (CH2)4 PMB PMB NHBz ch3
2-217 (CH2)4 Tr H NHBz ch3
2-218 (CH2)4 MMTr H NHBz ch3
2-219 (CH2)4 DMTr H NHBz ch3
2-220 (CH2)4 TMTr H NHBz ch3
2-221 (CH2)4 TMS H NHBz ch3
2-222 (CH2)4 TBDMS H NHBz ch3
2-223 (CH2)4 TBDPS H NHBz ch3
2-224 (CH2)4 TIPS H NHBz ch3
2-225 ch2 H H NHBz H
2-226 ch2 H H NHBz ch3
2-227 (CH2)2 H H NHBz H
2-228 (CH2)2 H H NHBz ch3
2-229 (ch2)3 H H NHBz H
2-230 (CH2)3 H H NHBz ch3
2-231 (CH2)4 H H NHBz H
2-232 (CH2)4 H H NHBz ch3
2-233 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH Η
2-234 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH ch3
2-235 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz H
2-236 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz ch3
2-237 (CH2)2 DMTr PÍNCiPrhXOCzILCN) OH H
2-238 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH ch3
2-239 (CH2)2 DMTr PCNCiPrhXOQJLCN) NHBz H
2-240 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz ch3
2-241 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH H
2-242 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) - OH ch3
2-243 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz H
2-244 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz ch3
2-245 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH H
2-246 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH ch3
2-247 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz H
2-248 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz ch3
2-249 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH H
2-250 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH CH3
2-251 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz H
2-252 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz ch3
2-253 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH H
2-254 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH ch3
2-255 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz H
2-256 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz ch3
2-257 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH Η
2-258 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH ch3
2-259 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz H
2-260 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz CH3
2-261 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH H
2-262 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH ch3
2-263 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz H
2-264 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz CH3
« ·
V tabulce č. 1 a 2 uvedené shora v textu výhodné sloučeniny zahrnuj í (i_5)? (μγχ (1-23), (1-24), (1-31), (1-35), (1-39), (1-43), (1-49), (1-51), (1-67), (1-68), (1-75), (1-79), (1-83), (1-87), (1-93), (1-95), (1-111), (1-112), (1-119), (1-123), (1-127), (1-131), (1-137), (1-139), (1-155), (1-156), (1-163), (1-167), (1-171), (1-175), (1-177), (1-178), (1-185), (1-186), (1-193), (1-194), (1-201), (1-202), (2-1), (2-2), (2-3), (2-4), (2-10), (2-15), (2-19), (2-22), (2-27), (2-31), (2-34), (2-39), (2-43), (2-46), (2-51), (2-55), (2-57), (2-58), (2-59), (2-60), (2-66), (2-71), (2-75), (2-78), (2-83), (2-87), (2-90), (2-95), (2-99), (2-102), (2-107), (2-111), (2-113), (2-114), (2-115), (2-116), (2-122), (2-127), (2-131), (2-134), (2-139), (2-143), (2-146), (2-151), (2-155), (2-158), (2-163), (2-167), (2-169), (2-170), (2-171), (2-172), (2-178), (2-183), (2-187), (2-190), (2-195), (2-199), (2-202), (2-207), (2-211), (2-214), (2-219), (2-223), (2-225), (2-226), (2-233), (2-234), (2-235) (2-236), výhodnější sloučeniny mohou zahrnovat 2 ' -O,4'-C-ethylenguanosin (1-5)
2'-O,4'-C-ethylenadenosin (1-7)
3',5'-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin (1-23)
3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin (124)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin (131)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin (1-35) '-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin (1-177)
2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin (1-178) '-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (1-185)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (1-186) '-0,4'-C-ethylenuridin (2-1)
2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin (2-2) ' -0,4'-C-ethylencytidin (2-3)
2'-O,4'-C-ethylen-5-methylcytidin (2-4) ',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylenuridin (2-10) • ·
5-O-dimethoxytrityl-2-0,4-C-ethylenuridin (2-15) ',5'-di-0-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin (2-22)
5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin (2-27)
3',5'-di-0-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin (2-34)
5'-0-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin (239)
3',5'-dí-0-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methyluridin (2-46)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin (2-51)
2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin (2-225)
2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin (2-226)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylenuridin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (2-233)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (2-234)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (2-235) a 5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (2-36).
Postup A
(6)
Při postupu A, symbol X reprezentuje chránící skupinu, symbol Y reprezentuje chránící skupinu, symbol A reprezentuje to samé, jak se uvádí shora v textu, zatímco symbol B1 reprezentuje skupinu purin-9-yl, substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, uvedené substituenty se vybraly ze shora uvedených substituentů a, ale s výjimkou nechráněné aminoskupiny „aminoskupiny, která se může chránit, zatímco symbol B2 reprezentuje skupinu purin-9-yl, substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, uvedené substituenty se vybraly ze shora uvedených substituentů a, ale s výjimkou chráněných aminoskupin „aminoskupiny, která se může chránit. Symbol R7 reprezentuje skupinu, která tvoří odstupující skupinu a symbol R8 reprezentuje alifatickou acylovou skupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku.
Chránící skupina vyjádřená symbolem X je stejná skupina jako je „hydroxylová chránící skupina ve shora v textu uvedeném symbolu R1.
Chránící skupina Y je stejná skupina jako „hydroxylová chránící skupina ve shora uvedeném symbolu R2.
„Skupina, která tvoří odstupující skupinu, symbolu R7 může zahrnovat nižší alkylsulfonylovou skupinu, jako je methansulfonyl a ethansulfonyl, nižší alkylsulfonylovou skupinu substituovanou halogenem, jako je trifluormethansulfonyl a arylsulfonylová skupina, jako je p-toluensulfonyl, přičemž je výhodná methansulfonylová skupina nebo p-toluensulfonylová skupina.
„Alifatická acylová skupina zahrnující 2 až 4 atomy uhlíku symbolu R8 může zahrnovat acetylovou, propionylovou, butyrylovou skupinu a podobně. Výhodná je acetylová skupina.
Dále v textu se každý krok postupu A popisuje detailně.
Krok A-l
Účelem je připravit sloučeninu obecného vzorce 4 reakcí sloučeniny obecného vzorce 3, která se může připravit způsobem B až D popsaným dále v textu s činidlem vhodným pro zavedení odstupující skupiny v přítomnosti bazického katalyzátoru v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroín a petroleter. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylisobutylketon, isoforon a cyklohexanon, nitrosloučeniny, jako je nitroethan a nitrobenzen, nitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, amidy, jako je formamid, N,N-dimethylformamid, N,N-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrolidon, N-methylpyrolidinon a hexamethylfosforečný triamid, sulfoxidy, jako je sulfolan a pyridinové deriváty, přičemž výhodný je pyridin.
Zde použitý bazický katalyzátor může přednostně zahrnovat bázi, jako je triethylamin, pyridin a dimethylaminopyridin.
Činidlo pro zavedení odstupující skupiny může zahrnovat alkylsulfonylové halidy, jako je methansulfonylchlorid a ethansulfonylbromid a arylsulfonylové halidy, jako je p-toluensulfonylchlorid, přičemž výhodný je methansulfonylchlorid a p-toluensulfonylchlorid.
• * ·
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, na rozpouštědle, na činidle pro zavedení odstupující skupiny a bazického katalyzátoru, ale je použitelný při teplotě 0°C až 50°C. Výhodná je teplota 10°C až 40°C.
Reakční čas kolísá v závislosti na počátečním materiálu, na rozpouštědle, na činidle pro zavedení odstupující skupiny a na bazickém katalyzátoru a reakční teplotě, ale je obvykle 10 minut až 24 hodin. Výhodný čas je 1 až 10 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 4 získala například neutralizací reakčního roztoku, koncentrací reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promýváním vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením nevodným síranem hořečnatým a rozpouštědlo se odstranilo destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistil, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem.
Krok A-2
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce 5 reakcí sloučeniny obecného vzorce 4 v kroku A-l s kyselým anhydridem v přítomnosti kyselého katalyzátoru v rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo může zahrnovat ethery, jako je diethylether, dioxan a tetrahydrofuran, nitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, amidy, jako je formamid, N,N-dimethylformamid, N,N-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrrolidin, N-methylpyrrolidin a triamid kyseliny hexamethylfosforečné a organická kyselina, jako je kyselina octová. Výhodné je použití kyseliny octové.
Zde použitelný kyselý katalyzátor může zahrnovat anorganické kyseliny, jako je kyselina chlorovodíková, kyselina sírová a kyselina dusičná. Výhodná je kyselina sírová (zvláště koncentrovaná kyselina sírová).
• · · ♦ · ♦·
Zde použitelný kyselý anhydrid může zahrnovat anhydrid nižší alifatické karboxylové kyseliny, jako je kyselý anhydrid a anhydrid kyseliny propionové, upřednostňuje se kyselý anhydrid .
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru a kyselém anhydridu a je obvykle 0°C až 50°C. Výhodné je 10°C až 40 °C.
Reakční směs kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru, kyselém anhydridu a reakční teplotě, ale je obvykle 10 minuť až 12 hodin. Výhodný čas reakce je 30 minut až 3 hodiny.
Po reakci požadovaná sloučenina obecného vzorce 5 se získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je etylacetát, promytím vodou, separací organické vrstvy, která obsahuje požadovanou sloučeninu, sušením na síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstranilo destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistil, je-li to nutné, běžnou metodou, například rekrystalizací, chromatografií na koloně se silkagelem a podobně.
Krok A-3
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce 6 reakcí sloučeniny obecného vzorce 5 v kroku A-2 s trimethylsilylovanou sloučeninou odpovídající purinu nebo pyrimidinu, který může zahrnovat požadovaný substituent připravený podle publikace H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981) v přítomnosti katalyzátoru v inertním rozpouštědle.
Použitelný rozpouštědlo může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen, xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, 1,2-dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, nitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, amidy, jako je formamid, N,N43 dímethylformamid, N, N-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrrolidin, N-methylpyrrolidinon a triamid kyseliny hexamethylfosforečné, sulfid uhličitý. Výhodný je 1,2-di-chlorethan.
Zde použitelný kyselý katalyzátor může zahrnovat Lewisovy kyselé katalyzátory, jako je A1C13, SnCl4, TiCl4, ZnCl2, BF3, trimethylsilyltrifluormethansulfonát. Výhodný je trimethylsilyltrifluormethansulfonát.
Reakčni teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a kyselém katalyzátoru, ale obvykle se pohybuje od 0°C do 100 °C. Výhodná je teplota 50 °C až 80 °C.
Reakčni čas kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru a reakčni teplotě, ale obvykle se pohybuje od 1 hodiny do 24 hodin. Výhodná je doba reakce 1 až 8 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 6 získala například zakoncentrováním reakčni směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušení nevodným síranem hořečnatým a rozpouštědlo se odstranilo destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistil, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok Ά-4
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce la podle vynálezu cyklizací sloučeniny obecného vzorce 6 připravenév kroku A-3 v přítomnosti bazického katalyzátoru v inertním rozpouštědle.
Použitelný rozpouštědlo může zahrnovat vodu, pyridinové deriváty, acetonitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, amidy, jako je formamid, N,N-dimethylformamid, N,N-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrrolidin, N-methylpyrrolidinon a ♦
« ♦
triamid kyseliny hexamethylfosforečné a jejich směsi. Výhodná je směs vody a pyridinu.
Zde použitelný bazický katalyzátor může zahrnovat hydroxidy alkalických kovů, jako je hydroxid sodný a hydroxid draselný, uhličitany alkalických kovů, jako je uhličitan sodný a uhličitan draselný, alkoxidy alkalických kovů, jako je methoxid sodný a ethoxid sodný a vodný amoniak. Výhodné jsou hydroxidy alkalických kovů (zvláště pak hydroxid sodný).
Teplota reakce kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a bazickém katalyzátoru, ale obvykle její hodnota je od 0°C do 50°C. Výhodná je teplota od 10°C do 30°C.
Reakční čas kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru a reakční teplotě, ale je obvykle od 1 minuty do 5 hodin. Výhodný je čas reakce 1 minuta až 30 minut.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 6 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok A-5
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce lb reakcí sloučeniny obecného vzorce la připravené v kroku A-4 v přítomnosti činidla odstraňujícího ochranou skupinu v inertním rozpouštědle.
Metoda odstranění ochranné skupiny závisí na druhu ochranné skupiny a není omezena. Způsobuje vedlejší reakce a může se například provést způsobem popsaným v publikaci „Protective • ·
Groups in Organic Synthesis, Theodora W. Greene and Peter G. M. Wuts, 1999, Published A. Wiley-Interscience Publication).
Odstranění ochranné skupiny je možné zvláště provést následujícím způsobem, kde ochranná skupina je (1) alifatická acylová skupina nebo aromatická acylová skupina, (2) methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami nebo methylovou skupinou substituovanou jednou až třemi arylovými kruhy, které jsou substituovanými nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou nebo (3) silylovou skupinou.
(1) V případě, že ochranná skupina je alifatická acylová skupina nebo aromatická acylová skupina, reakce odstraňující ochrannou skupinu je obvykle provedena ošetřením alkalickým činidlem v inertním rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo není omezeno, pokud je jednoduše mísitelné s vodou, neinhibuje reakci a rozpouští počáteční materiál a může zahrnovat vodné a nevodné amidy, jako je dimethylformamid a dimethylacetamid, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, 1,2-dichlorethan nebo tetrachlorid uhlíku a ethery, jako je tetrahydrofuran, diethylether a dioxan. Výhodné jsou ethery. Výhodnější je tetrafuran.
Zde použitelné alkalické činidlo může zahrnovat hydroxidy alkalických kovů, jako je hydroxid litný, hydroxid draselný a hydroxid sodný, uhličitany alkalického kovu, jako je uhličitan sodný a uhličitan draselný, alkoxidy alkalických kovů, jako je methoxid sodný a ethoxid sodný a roztok amoniaku, jako je roztok amoniaku ve vodě a roztok amoniaku v methanolu.
Reakční teplota je od 0°C do 60 °C. Výhodná je teplota 20°C až 40°C. Reakční čas je od 10 minut do 24 hodin. Výhodná je doba reakce 1 až 3 hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lb získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující po46 • *· žadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu horečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
(2) V případě, že ochranná skupina je methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami nebo methylovou skupinou substituovanou jednou až třemi arylovými kruhy, které jsou substituovanými nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou, reakce se provádí v inertním rozpouštědle za použití redukčního činidla.
Zde použitelné rozpouštědlo zahrnuje přednostně alkoholy, jako je methanol, ethanol aisopropanol, ethery, jako je diethylether, tetrahydrofuran a dioxan, aromatické uhlovodíky, jako je toluen, benzen a xylen, alifatické uhlovodíky, jako je hexan a cyklohexan, estery, jako je ethylacetát a propylacetát, organické kyseliny, jako je kyselina octová nebo směsi těchto organických rozpouštědel a vody.
Zde použitelné redukční činidlo není zvláště omezeno, pokud se může použít pro katalytickou redukci a je výhodné, aby zahrnovalo paládium na uhlíku, Raneyoův nikl, oxid platiny, platinovou čerň, oxid rhodičito-hlinitý, chlorid trifenylfosfinrhodíčitý a síran paladičito-barnatý.
Tlak není nijak omezen, ale je obvykle od 1 do 10 atmosfér .
Reakční teplota je od 0°C do 60°C. Výhodná je teplota od 20°C do 40°C.
Reakční čas je od 10 minut do 24 hodin. Výhodná je jedna hodina až tři hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lb získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promytím vodou, separací organické vrstvy obsahující po47
9 > »9 • · 9 • · 9 • 999 • 9 » 99 žadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu horečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čisti, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
V případě, že ochranná skupina je methylová skupina substituovaná třemi arylovými skupinami, to znamená tritylová skupina, reakce odstraňující tritylovou skupinu může také proběhnout za použití kyseliny.
V případě, že zde použitelné rozpouštědlo zahrnuje aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, 1,2-dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, alkoholy, jako je methanol, ethanol, isopropanol a terc-butanol, nitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, amidy, jako je formamid, N,N-dimethylformamid, N,N-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrrolidon, N-methylpyrolidon a triamid kyseliny hexamethylfosforečné a organické kyseliny, jako je kyselina octová. Výhodné jsou organické kyseliny (zvláště kyselina octová) nebo alkoholy (zvláště terc-butanol).
Zde použitelná kyselina může s výhodou zahrnovat kyselinu octovou nebo kyselinu trifluoicctovou.
Reakční teplota je od 0°C do 60°C. Výhodná je reakční teplota od 20°C do 40°C.
Reakční čas je od 10 minut do 24 hodin. Výhodná je doba reakce 1 až 3 hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lb získala například zakončenírováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu horečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
·· Φ· > φ φ φ Φ Φ 9 Φ ΦΦΦ ► ♦ Φ ·· ΦΦ
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
(3) V případě, že ochranná skupina je silylová skupina, může se obvykle odstranit ošetřením se sloučeninou produkující fluorid, jako je tetrabutylamoniumfluorid, kyselina fluorovodíková, kyselina fluorovodíková-pyridin a fluorid draselný nebo organické kyseliny, jako je kyselina octová, kyselina methansulfonová, kyselina paratoluensulfonová, kyselina trifluorctová a kyselina trifluormethansulfonová nebo organické kyseliny, jako je kyselina chlorovodíková.
V případě, že se ochranná skupina odstraní fluoridem, reakce se někdy podpoří přidáním organických kyselin, jako je kyselina mravenčí, kyselina octová a kyselina propionová.
Zde použitelné rozpouštědlo není omezeno, pokud neinhibuje reakci a rozpouští počáteční materiál a může s výhodou použít ether, jako je tetrahydrofuran, diethylether, diisopropylether a dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, nitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, voda, organické kyseliny, jako je kyselina octová a jejich směsi.
Reakční teplota je od 0°C do 100°C. Výhodná je reakční teplota od 20°C do 70°C.
Reakční čas je od 5 minut do 48 hodin. Výhodná je doba reakce 1 až 24 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lb získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
. Krok A-6
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce lc reakcí sloučeniny obecného vzorce lb připravené v kroku A-5 v přítomnosti činidla odstraňujícího ochranou skupinu v inertním rozpouštědle.
Metoda odstranění ochranné skupiny závisí na druhu ochranné skupiny a není omezena. Způsobuje vedlejší reakce a může se například provést způsobem popsaným v publikaci „Protective Groups in Organic Synthesis, Theodora W. Greene and Peter G. M. Wuts, 1999, Published A. Wiley-Interscience Publication).
Odstranění ochranné skupiny je možné zvláště provést následujícím způsobem, když ochranná skupina je alifatická acylová skupina nebo aromatická acylová skupina, reakce odstraňující ochrannou skupinu je obvykle provedena ošetřením alkalickým činidlem v inertním rozpouštědle.
Zde použití rozpouštědla není omezeno, pokud je jednoduše mísitelné s vodou, neinhibuje reakci a rozpouští počáteční materiál a může zahrnovat vodné a nevodné alkoholy jako je methanol a ethanol, amidy, jako je dimethylformamid a dimethylacetamid, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, 1,2-dichlorethan nebo chlorid uhličitý a ethery, jako je tetrahydrofuran, diethylether a dioxan. Výhodné jsou alkoholy. Výhodnější je methanol.
Zde použitelné alkalické činidlo může zahrnovat hydroxidy alkalických kovů, jako je hydroxid litjyiý, hydroxid draselný a hydroxid sodný, uhličitany alkalického kovu, jako je uhličitan sodný a uhličitan draselný, alkoxidy alkalických kovů, jako je methoxid sodný a ethoxid sodný a roztok amoniaku. Výhodný je amoniak.
Reakční teplota je od 0°C do 50 °C. Výhodné je teplota od 10°C do 40°C.
Reakční čas je od 10 minut do 24 hodin. Výhodná je doba reakce 10 minut až 15 hodin.
• 9 • ·
Ml • 4 • 4 « 4 4 • » • 4 *4 «
·*· • 4 4
4
4 ·
*
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lc získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Meziprodukt obecného vzorce 3 popsaný shora v textu se může připravit způsobem B až D, jak se popisuje dále v textu.
Způsob B
B-3 xo
OHC0.
B-4
OY (10)
HO
(7) (11) (12)
Při způsobu B až D symboly X a Y mají stejný význam jako se definuje shora v textu. Symbol R9 reprezentuje skupinu, která tvoří odstupující skupinu, symbol E reprezentuje ethylen, trimethylen nebo tetramethylen a symbol Z reprezentuje jednoduchou vazbu, methylenovou nebo ethylenovou skupinu.
Skupina, která tvoří odstupující skupinu symbolu R9 může zahrnovat skupinu popsanou shora v textu pro symbol R7. Výhodná je trifluormethansulfonylová skupina.
Symboly R11 a R12 jsou stejné a reprezentují vodíkový atom a dohromady tvoří atom kyslíku.
V případě, kde symbol R11 a R12 dohromady tvoří atom kyslíku, symbol R10 reprezentuje alkylovou skupinu, která má 1 až 4 • · · · · ·· · · ··· · · · · · · ·· atomy uhlíku, jako je metyl, ethyl, propyl, isopropyl, butyl, isobutyl, s-butyl a terc-butyl. Výhodná je methylová skupina.
V případe, že symboly R a R jsou stejne a reprezentuji atom vodíku, symbol R10 může zahrnovat aralkylovou skupinu, jako je benzylová skupina, alkoxyalkylová skupina, jako je methoxymethylová skupina, arylkarbonyloxymethylovou skupinu, jako je benzoyloxymethylová skupina, aralkyloxymethylová skupina, jako je benzyloxymethylová skupina, alkoxyalkoxyalkylová skupina, jako je methoxyethoxymethylová skupina, silylová skupina, jako je trimethylsilyl, t-butyldimethylsilyl, difenylmethylsilyl, difenylbutylsilyl, difenyl-isopropylsilyl a fenyldiisopropylsilyl.
Sloučenina obecného vzorce 7, to znamená počáteční materiál používaný v postupu B nebo v postupu C, se může připravit následujícím způsobem.
Sloučenina odpovídající sloučenině obecného vzorce 6, jejíž část „X je atom vodíku, se připravila z 1,1,5,6-diisopropyliden-D-glukosy podle způsobu uvedeného v publikaci R.D. Youssefyeh, J. P. H. Verheyden, J.G. Moffatt. J. Organ. Chem., 44, 1301-1309 (1979) a následně sloučenina obecného vzorce 6 se může připravit podle metody popsané v publikaci T. Waga, T. Nishizaki, I. Miyakawa, H. Ohrui, H. Meguro, Biosci. Biotechnol. Biochem., 57, 1433-1438 (1993) (v případě, že symbol X je Bn).
Způsob B
Krok B-l
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 8 reakcí sloučeniny obecného vzorce 7 připravené shora v textu popsanou metodou s činidlem vhodným pro zavedení odstupující skupiny v přítomnosti alkalického katalyzátoru v inertním rozpouštědle .
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat amidy, jako je dimethylformamid a dimethylacetamid, halogenované uhlovodíky, • · · · · ·· ·· • · · · · ·· · · · · • · · ···· ·· ·· ··· ······ · ····· · · · ····· ·· ·· · · · . jako je methylenchlorid, chloroform, 1,2-dichlorethan nebo chlorid uhličitý a ethery, jako je hydrofuran, diethylether a dioxan. Výhodný je methylenchlorid.
Použitelný alkalický katalizátor s výhodou může zahrnovat alkalické činidlo, jako je triethylamin, pyridin a dimethylaminopyridin.
Činidlo pro zavedení odstupující skupiny může zahrnovat s výhodou chlorid trifluormethansulfonové kyseliny nebo anhydrid kyseliny trifluormethansulfonové.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a kyselém katalyzátoru, ale je obvykle -100°C až -50 °C. Výhodná je teplota od -100°C do -70°C. Obvyklá teplota je od -100°C do -50°C. Výhodná je teplota -100°C až -70°C.
Reakční čas kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a kyselém katalyzátoru, ale obvykle je od 30 minut do 12 hodin. Výhodná je doba reakce 30 minut až 3 hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 8 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok B-2
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 9 reakcí sloučeniny obecného vzorce 8, která se připravila v kroku B-l s činidlem pro zavedení kyanoskupiny v inertním rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo může zahrnovat amidy, jako jsou methylenchlorid, chloroform, 1,2-dichlorethan, chlorid uhličitý, ethery, jako je tetrahydrofuran, diethylether a dioxan, acetonitril, dimethoxysulfoxid a podobně. Výhodné jsou amidy (dimethylformamid).
Použitelné činidlo pro zavedení kyanoskupiny může zahrnovat KCN, NaCN a kyanid trimethylsilanu. Významný je NaCN.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědlu a činidlu vhodném pro zavedení kyanoskupiny, ale obvykle je od 0°C do 100°C . Výhodná je teplota 30°C až 70°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, činidlu pro zavedení kyanoskupiny a teplotě reakce, ale je obvykle 30 minut až 12 hodin. Výhodná je reakční doba od 1 do 3 hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 9 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok B-3
V tomto kroku se připraví sloučenina obecného vzorce 10 reakcí sloučeniny obecného vzorce 9 v kroku B-2 s redukčním činidlem v inertním rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo může zahrnovat halogenované uhlovodíky, jako je methylchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, 1,2-dichlorethan, alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, ethery, jako je diethylether, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je • · · · ·· ·· ·· · · · ♦ · * · • · ···· ·· • ··· · ····· · • · ·· · · 9· 9 aceton, methylethylketon, methylisobutylketon, isoforon acyklohexanon. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid).
Zde použitá redukční činidla mohou zahrnovat diisobutylhydrid hlinitý a triethoxyhydrid hlinitý. Výhodný je diisobutylhydrid hlinitý.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a redukčním činidlu, ale je obvykle -100°C a -50°C. Výhodná je teplota -90°C až -70°C.
Reakčni doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 30 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 1 hodina až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 9 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok B-4
V tomto kroku se připraví sloučenina obecného vzorce (3a), která je počátečním materiálem v postupu A s reakční sloučeninou obecného vzorce 10 připravené v kroku B-3 s redukčním činidlem v inertním rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alkoholy, jako je methanol, ethanol, n-propanol, isopropanol, n-butanol, isObutanol, isoamylalkohol, diethylglykol, terc-butanol, diethylglykol, glycerin, oktanol, cyklohexanol a methylcelosolv a kyselina octová. Výhodné jsou alkoholy (zvláště ethanol).
• ··· · ····· · • · · · ·· · ·
Použitelné redukční činidlo může zahrnovat borovodík alkalického kovu, jako je borovodík sodný a borovodík lítný, sloučeniny hydridu litného jako je hydrid litno-hlinitý a triethoxid litný-hydrid hlinitý a boran. Výhodný je hydrid sodnoboritý.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a redukčním činidle, ale je obvykle 0°C až 50°C. Upřednostňuje se teplota od 10°C do 40°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 10 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 3a získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Postup C
Krok C-l
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 11 reakcí sloučeniny obecného vzorce 7 připravené v postupu s oxidačním činidlem v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethyle57 • 9 · « · · · · • ··· · ····· · ·· ·· ·· ·· , ther, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylisobutylketon, ísoforon a cyklohexanon. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid.
Zde použitelná oxidační činidla zahrnují Swernovo činidlo pro oxidaci, Dess-Martinovo činidlo pro oxidaci, komplex oxidu chromového, jako je komplex pyridinhydrochlorid/oxid chromový (pyridinium chlorchromát a pyrídiníum dichromát). Výhodné je Swernovo činidlo pro oxidaci (jmenovitě dimethylsulfoxidoxalylchlorid).
Reakční teplota kolísí v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a oxidačním činidle, ale je obvykle od -100°C do -50°C. Výhodná je teplota -100°C až -70°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 10 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 11 získala například rozložením oxidačního činidla, zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok C-2
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 12 reakcí sloučeniny obecného vzorce 11 připravené v kroku C-l s činidle zvyšujícím počet uhlíků v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může ·· ·· ·· ·· ♦ · ♦♦·♦ « « · • ··· · * · · · · · • · · · · · · · ··· ·· ·· »· ·· · „ zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichloroethan, chlorobenzen a dichlorobenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylisobutylketon, isoforon a cyklohexanon. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid) .
Zde použitelná oxidační činidla zahrnují Wittingovo činidlo, Horner-Emmonsovo činidlo, Petersonovo reakční činidlo, reakční činidlo systému TiCl4-CH2Cl2-Zn a Tebbeho činidlo. Výhodné je Wittingovo činidlo, Horner-Emmosovo činidlo a Tebbeho činidlo.
Reakční teplota kolísí v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a oxidačním činidle, ale je obvykle od -20°C do 20°C. Výhodná je teplota 0°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 30 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je jedna až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 12 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok C-3 ♦ · • · • · · ·· · ·· • · * · · ·· · · · · φ
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 3a selektivně zavádějící hydroxylovou skupinu na koncový uhlík olefinu sloučeniny obecného vzorce 12 připravené v kroku C-2 v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylisobutylketon, isoforon a cyklohexanon. Výhodné jsou ethery (zvláště tetrahydrofuran).
Zde použitelná oxidační činidla zahrnují boranovodík, disiamylboran, thexylboran, 9-BBN (9-borabicyklo[3,3, l]nonan) . Výhodný je 9-BBN.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a oxidačním činidle, ale je obvykle od 0°C do 50°C. Výhodná je teplota 10°C až 40°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidle a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 6 hodin do 48 hodin. Výhodná doba reakce je 12 až 24 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 3a získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu horečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
• · · · · 9 · · • · · · · ····« 9
9 9 9 9 9 9
999 99 99 99 99 9
Postup D Krok D-l
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 13 reakcí sloučeniny obecného vzorce 11 připravené v kroku C-l s činidlem zvyšujícím počet uhlíků v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylisobutylketon, isoforon a cyklohexanon. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid) .
Zde použitelná činidla ke zvyšování počtu uhlíků zahrnují Wittingovo činidlo, Horner-Emmonsovo činidlo.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a činidle, ale je obvykle od -20°C do 40°C. Výhodná je teplota 0°C až 20°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 30 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je jedna až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 13 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
• · *· · · ·· • · · ♦ · · · • · · · · ♦ · · • · · · · ··· · · φ * ····«·♦« ·· · · · ·· ·« · φ φ
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok D-2
V tomto kroku se připravila sloučenina obecného vzorce 14 reakcí sloučeniny obecného vzorce 13 připravené v kroku D-l s redukčním činidlem v inertním rozpouštědle.
Tento krok se provedl podle odstavce (2) v kroku A-5.
V případě, kde symbol R10 je substituován benzylovou skupinou a symboly R11 a R12 jsou atomy vodíku, se sloučenina 3b může přímo připravit v tomto kroku.
Krok D-3
V tomto kroku se připravila sloučenina obecného vzorce 3b, který je jeden z počátečních materiálů postupu A reakcí sloučeniny obecného vzorce 14 připravené v kroku D-2 s redukčním činidlem.
(a) Případ, kde symbol R11 a R12 dohromady tvoří atom kyslíku. Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alkoholy, jako je methanol, ethanol, n-propanol, isopropanol, n-propanol, isopropanol, n-butanol, isobutanol, isoamylalkohol, terc-butanol, diethylenglykol, glycerin, oktanol, cyklohexanol a methylcelosolv a kyselina octová. Výhodné jsou alkoholy (zvláště ethanol).
Použitelné redukční činidlo může zahrnovat borovodík alkalického kovu, jako je borovodík sodný a borovodík litný, sloučeniny hydridu litného jako je hydrid litno-hlinitý a triethoxid litný-hydrid hlinitý a boran. Výhodný je hydrid sodnoboritý.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a redukčním činidle, ale je obvykle 0°C až 50 °C. Upřednostňuje se teplota od 10°C do 40°C.
• 9 • 99
99 99 • 9 9 9 9 9 • · 9 · «9 • 9 999 99 9 • 9 9 9 9 ·· 99 99
Reakčni doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakčni teplotě. Doba reakce je obvykle od 10 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 3b získala například zakoncentrováním reakčni směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
(b) Případ, kde symboly R11 a R12 jsou vodíkové atomy a symbol
R10 je skupina jiná než benzylová skupina.
V případě, kdy symbol R10 je silylová skupina, se tento krok provede podle metody popsané v odstavci (3) krok A-5.
V případě, že symbol R10 je aralkylová skupina, jako je benzylová skupina, alkoxyalkylová skupina, jako je methoxymethylová skupina, arylkarbonyloxymethylová skupina, jako je benzoyloxymethylová skupina nebo aralkyloxymethylenová skupina, jako je benzyloxymethylová skupina a alkoxyalkoxyalkylová skupina, jako je methoxyethoxymethylová skupina, se použije kyselý katalyzátor a ten může zahrnovat v tomto případě organickou kyselina, jako je p-toluensulfonovou kyselinu, trifluoroctovou kyselinu a dichloroctovou kyselinu a Lewisovou kyselinu, jako je BF3 a A1C13.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, 1,2-dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, nitrily, jako je acetonitril a isobutyrinitril, amidy, jako je formamid, N,N-dimethylformamid, N,N-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrrolidon,
99 99
9 9 9 9 9
9 9 9 9
999 99 9
9 9 9 9
99 99 9
N-methylpyrrolidinon a triamid kyseliny hexamethylfosforečné a sulfid uhličitý.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a kyselém katalyzátoru, ale je obvykle 0°C až 50 °C. Upřednostňuje se teplota od 10°C do 40°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 10 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 3b získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Oligonukleotidy obsahující upravený nukleosid nebo jeho thioátový derivát se mohou připravit podle postupu E, jak se popisuje dále v textu za použití sloučeniny obecného vzorce 1 podle vynálezu.
• 99 ·· 9 · 9 9 · *·9 9 9 · • 9 9 9 9 9 • 9 9 9 9 9
999 99 99 99
Postup E
E-3
->- oligonucleotid
V postupu E symbol A a B mají stejný význam jak se definuje shora v textu, symbol R13 reprezentuje hydroxylovou ochrannou skupinu (zvláště tritylovou skupinu, která se může substituovat methoxyskupinou),symbol R14 reprezentuje fosfonylovou skupinu a skupinu tvořenou reakcí monosubstituovaných chlor(alkoxy)fosfinů nebo dvakrát substituovaných alkoxyfosfinů popsaných dále v textu.
Postup E
Krok E-l
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 15 reakcí sloučeniny obecného vzorce 1 připravené postupem A s ochranným činidlem v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, * »4 ·* 44 4» • 4 » · · · · · « · » • 4 · · ♦ · f · 4 «4 4 · 4 ««···· ·
4 ♦ · · 4 · 4 •«4 4« ·« »» fc ketony, jako je aceton, methyl-ethylketon, methylisobutylketon, isoforon a cyklohexanon, nitrátované sloučeniny, jako je nitroethan a nitrobenze, nitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, amidy, jako je formamid, dimethylformamid (DMF), dimethylacet-amid a triamid kyseliny hexamethylfosforečné, sulfoxid, jako je dimethylsulfoxid a sulfolan, alifatické terciální aminy, jako je trimethylamin, triethylamin a N-methylmorfolin a aromatické aminy, jako je pyridin a pikolin. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid) a aromatické aminy (zvláště pyridin).
Použitelné chránící činidlo není nijak omezeno pokud se může selektivně chránit pouze 5-poloha a může se odstranit za kyselých nebo neutrálních podmínek. Může s výhodou zahrnovat triarylmethylhalidy, jako je tritylchlorid, monomethoxytritylchlorid a dimethoxytritylchlorid.
V případě triarylmethylhalidů se používá ochranné činidlo, obvykle používané alkalické činidlo.
V takovém případě zde použitelné alkalické činidlo může zahrnovat heterocyklické aminy, jako je pyridin, dimethylaminopyridin a pyrrolidinpyridin a alifatické terciální aminy, jako je trimethylamin a triethylamin. Výhodný je pyridin, dimethylaminopyridin a pyrrolidinpyridin.
V případě, že se jako rozpouštědlo použije kapalné alkalické činidlo, protože samotné alkalické činidlo funguje jako kyselé zachycovací činidlo, není potřeba přidat jiné alkalické činidlo.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a činidle, ale je obvykle od 0°C do 150°C. Výhodná je teplota 20°C až 100°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidle a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 1 do 100 hodin. Výhodná doba reakce je 2 až 5 hodin.
• · · · · · · t 9 · « * · 9··«· 9 9*9« 9 · · ·*« ·· 9* ·· *9 9
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 15 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením za použití nevodného síranu hořečnatého a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok E-2
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 16 reakcí sloučeniny obecného vzorce 15 připravené v kroku E-l s chlor(alkoxy)fosfiny s jednou substitucí nebo alkoxyfosfiny s dvěmi substitucemi, které se obvykle používají při amidaci v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo není omezeno pokud neovlivňuje reakcí a může přednostně zahrnovat ethery, jako je tetrahydrofuran, diethylether a dioxan a halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen.
Chlor(alkoxy)fosfiny s jednou substitucí mohou zahrnovat fosfinové deriváty, jako je chlor(morfolin)methoxyfosfin, chlor(morfolin)kyanoethoxyfosfin, chlor(dimethylamino)methoxyfosfin, chlor(diisopropylamino)methoxyfosfin a chlor(diisopropylamino)kyanoethoxyfosfin. Výhodný je chlor(morfolin)methoxyfosfin, chlor(morfolin)kyanoethoxyfosfin, chlor(diisopropylamino) kyanoethoxyfosfin.
V případě chlor(alkoxy)fosfinů s jednou substitucí se používá kyselé zachytávací činidlo a toto činidlo může zahrnovat heterocyklické aminy, jako je pyridin a dimethylaminopyridin a alifatické aminy, jako je trimethylamin, triethylamin a diisopropylamin. Výhodné jsou alifatické aminy (zvláště diisopropylamin).
·· • » • t *φ ·φ • · » · · · • · · · · ·
Φ » Φ · Φ ··· · · · • · · φ · · · ·· ·· «· 4«
Zde použitelné alkoxyfosfiny se dvěmi substitucemi mohou zahrnovat deriváty fosfinů, jako je bis(diisopropylamino)kyanoethoxyfosfin, bis(diethylamino)methansulfonylethoxyfosfin, bis(diisopropylamino)2,2,2-trichlorethoxy)fosfin a bis(diisopropylamino)(4-chlorfenylmethoxy)fosfin. Výhodný je bis (diisopropylamino)kyanoethoxyfosfín.
V případě kde se používají alkoxyfosfiny s dvojitou substitucí se použije kyselina. V takovém případě používaná kyselina může s výhodou zahrnovat tetrazol, kyselinu octovou nebo kyselinu p-toluensulfonovou.
Reakční teplota není nijak omezena, ale obvykle je v rozmezí 0°C až 80 °C. Výhodná je teplota místnosti.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 5 minut až 30 hodin. Výhodná doba reakce je od 30 minut do 10 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 16 získala například neutralizací reakční směsi, odstraněním nerozpustných částic filtrací, jestliže existují, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
V jiném případě se v tomto kroku připraví sloučenina obecného vzorce 16 reakcí sloučeniny obecného vzorce 15 připravené v kroku E-l s tris-(1,2,4-triazolyl)fosfitem v inertním rozpouštědle (s výhodou jde o halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid). Následuje adice vody za účelem dosažení Hfosfonace.
Reakční teplota není nijak omezena, ale obvykle je v rozmezí -20°C až 100 °C. Výhodná je teplota 10°C až 40°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle 5 minut až 30 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut v případě, že reakce se provedla při teplotě místnosti.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 16 získala například neutralizací reakční směsi, odstraněním nerozpustných částic filtrací, jestliže existují, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok E-3
V tomto kroku se připravuje oligonukleotidový analog pomocí DNA syntetizéru za použití alespoň jedné sloučeniny obecného vzorce 16 připravené v kroku E-2 a obecně dostupného fosforamiditového činidla nutného při produkci oligonukleotidového analogu požadované nukleotidové sekvence v souladu s běžnými metodami.
Oligonukleotidový analog vykazující požadovanou nukleotidovou sekvenci se může syntetizovat DNA syntetizérem, jako je Perkin-Elmer model 392 za použití fosforamiditové metody v souladu s metodou popsanou v publikaci (Nucleic Acids Research, 12, 4539 (1984)).
Navíc v případě převedení thioátu derivát thioátu se může získat v souladu s metodou popsanou v publikaci Tetrahedron Letters, 32, 3005 (1991, J. Am. Chem. Soc. , 112, 1253 (1990) za použití činidla, které tvoří thioát reakcí s trivalentní kyselinou fosforečnou, jako je tetraethylthiuramdisulfid (TETD, Applied Biosystems lne.) nebo Beaucageovo činidlo (Millipore Corp.).
Výsledný surový oligonukleotidový analog se může čistit chromatograficky na koloně s reverzní fází OligoPak a čistota produktu se může potvrdit analýzou HPLC.
Délka řetězce výsledného oligonukleotidového analogu je v normálním případě 2 až 50 jednotek a s výhodou 10 až 30 jednotek v jednotkách nukleosidů.
Schopnost tvořit komplementární řetězec a odolnost vůči nukleázám výsledného oligonukleotidového analogu se může stanovit způsoby popsanými shora v textu.
Testovací metoda 1
Schopnost tvořit hybrid oligonukleotidového analogu podle vynálezu s ohledem na komplementární DNA a RNA se může stanovit teplotní hybridizací různých výsledných oligonukleotidových analogů s oligonukleotidovým analogem, který zahrnuje přirozeně se vyskytující DNA nebo RNA, která má komplementární sekvenci a měřitelnou teplotu denaturace (hodnota Tm).
Vzorek roztoku obsahující stejné množství oligonukleotidového analogu a přirozeně se vyskytujícího komplementárního oligonukleotidu v pufru fosforečnanu sodného se vložil do lázně s vroucí vodou a pak se pomalu ochlazoval při teplotě místnosti (teplotní hybridizace) . Teplota roztoku v cele spektrofotometru (například Shimadzu UV-2100PC) pak postupně trochu vzrostla z 20°C na 90 °C. Pak následuje měření absorbce ultrafialového světla při vlnové délce 260 nm.
Testovací metoda 2: Meření rezistence na nukleázy
K oligonukleotidu v pufru se přidala nukleáza a směs se zahřála. Příklady použitých nukleáz zahrnují fosfodiesterázu hadího jedu, endonukleázu Pl a Sl. Ačkoli neexistuje žádné zvláštní omezení v použitém pufru, doporučuje se pufr vhodný pro enzymy, v případě fosfodiesterázy hadího jedu se použil Tris-HCl, zatímco v případě endonukleázy Pl se použil pufr acetát sodný. Navíc je-li to nezbytné k roztoku pufru se přiΊΟ daly ionty kovů. Příklady iontů kovů zahrnujív případě fosfodiesterázu hadího jedu ionty horečnaté a v případě endonukleázy ionty zinečnaté. Reakční teplota je s výhodou 0 až 100°C. Výhodná je teplota v rozmezí 30°C až 50°C.
Po předem stanovené době se přidá kyselina ethylendiamintetraoctová (EDTA) a pak se směs zahřívá na teplotu 100 °C po dobu 2 minuty za účelem ukončit reakci.
Příklady metod používané k testování množství zbývajícího oligonukleotidu zahrnují metodu, při které se oligonukleotid značí radioizotopem, přičemž pak následuje testování štěpící reakce produktu analyzátorem obrazu, což je metoda, při které se produkt štěpící reakce testuje HPLC s reverzní fází a způsobem, při kterém se produkt štěpící reakce testuje barvivém (jako je ethidiumbromid) a obraz se zpracovávý na počítači.
Formy dávek oligonukleotidového analogu mající jednu nebo dvě nebo více struktur obecného vzorce 2 podle vynálezu mohou být tablety, kapsule, granule, prášek nebo syrup, které se používají pro orální aplikaci, nebo to mohou být injekce nebo čípky pro parenterální aplikaci. Tyto dávkové formy se připravují dobře známými metodami za použití přídavných činidel, jako jsou ekcipienti) například organické ekcipienti, jako jsou cukerné deriváty, například laktóza, sacharóza, glukóza, manitol a sorbitol, deriváty škrobu, jako je například kukuřičný škrob, bramborový škrob, α-škrob a dextrin, deriváty celulózy, jako je například krystalická celulóza, arabská guma, dextran a pululan a anorganické ekcipienti, jako jsou silikátové deriváty, například anhydrid křemičitý, syntetizovaný křemičitan hlinitý, křemičitan vápenatý a metakřemičitan hořečnatohlinitý, fosforečnany, jako je například hydrogenfosforečnan vápenatý, uhličitany, jako je například uhličitan vápenatý a sírany, jako je například síran vápenatý, lubrikační prostředek (například kyselina stearová, kovové sole kyseliny stearové, jako je stearát vápenatý a stearát hořečnatý, talek, koloidní silika, vosky, jako je včelí vosk a spermacet, kyselina bori71 tá, kyselina adipová, sulfáty, jako je například síran sodný, glykol, kyselina mravenčí, benzoát sodný, DL-leucin, sodná sůl mastné kyseliny, laurylsulfáty, jako je laurylsulfát sodný a laurylsulfát hořečnatý, kyselina orthokřemičitá, jako je anhydrid křemičitý a kyselý hydrát křemičitý a shora uvedené deriváty škrobu), pojidlo (například hydroxypropylcelulóza, hydroxypropylmethylcelulóza, polyvinylpyrrolidon, Macrogol a sloučeniny podobné shora uvedeným ekcipientům), disintegrační činidla (například deriváty celulózy, jako je málo substituovaná hydroxypropylcelulóza, karboxymethylcelulóza, karboxymethylacelulóza vápníku a karboxymethylacelulóza sodíku s vnitřními můstky a chemicky upravené škrob-celulózy, jako je karboxymethylový škrob, karboxymethylový škrob sodíku a polyvinylpyrrolidon s můstky), stabilizátory (paraoxybenzoáty, jako je methylparaben a propylparaben, alkoholy, jako je chlorbutanol, benzylalkohol a fenylethylalkohol, benzalkoniumchlorid, deriváty fenolu, jako je fenol a kresol, thimerosal, kyselina dehydrooctová a kyselina sorbová) , látky korigující smyslově nepříjemné vlastnosti léku (například sladidla, kyselící činidla), ředidla atd.
Zatímco dávka bude kolísat v závislosti na stavu onemocnění, věku pacienta, metodách aplikace atd., například v případě orální aplikace je nutné aplikovat aktivní látku v množství v rozmezí 0,01 kg/kg tělesné hmotnosti (upřednostňuje se 0,1 mg/kg tělesné hmotnosti) až 1 000 mg/kg tělesné hmotnosti (s výhodou jde o dávku 100 mg/kg tělesné hmotnosti) a v případě intravenózní aplikace je nutné aplikovat aktivní složku v množství od 0,001 mg/kg tělesné hmotnosti (s výhodou 0,01 mg/kg tělesné hmotnosti) až 100 mg/kg tělesné hmotnosti (výhodná je dávka 10 mg/kg tělesné hmotnosti) ve formě jediné dávky za den nebo se dávka rozdělí do několika dávek za den.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1: 3',5'-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin (příklad sloučeniny číslo 2-34)
Vodný roztok 2N hydroxidu sodného (68 ml) se přidal k roztoku sloučeniny získané v příkladu 11 (6,80 g, 8,86 mmol) v pyridinu (136 ml) při teplotě 0°C a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu jedné hodiny. Reakční směs se neutralizovala přidáváním po kapkách 20% vodného roztoku kyseliny octové a extrahovala se chloroformem. Vrstva chloroformu se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan:methanol = 100:3), aby se získala sloučenina uvedená v názvu (3,3 g, 6,02 mmol, výtěžek je 68 %).
fo-NMRMOO MHz, CDC13) : 8,64(2H, brs), 7,89(2H, d, 7,6 Hz),
7, 64-7,60 (1H, m) , 7,54-7,51(2H, m) , 7,48-7,37(3H, m) , 7,367,26(8H, m) , 6,18(1H, s), 4,7O(1H, d, 11Hz), 4,6O(1H, d,
11Hz), 4,46(1H, d, 2,9Hz), 4,42(1H, d, 11Hz), 4,10-4,02(2H,
m) , 3,89(1H, d, 2,9 Hz), 3,75(1H, d, 11Hz) , 3,62(1H, d, 11Hz) , 2,34-2,26(1H, m), 1,39-1,36 (1H, m) .
FAB-MAS(mNBA): 554(M+H)+
Příklad 2: 2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benoylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-225)
Roztok (31,7 ml) 1,0 M trichlorboranu v dichlormethanu se přidal po kapkách do roztoku sloučeniny získané v příkladu 1 (2,06 gm 3,72 mmol) v nevodném methylenchloridu (317 ml) při teplotě -78°C a směs se míchala při teplotě -78°C po dobu jedné hodiny. Reakční směs se pomalu zahřívala na teplotu -20°C a reakční nádoba se umístila do ledové lázně s chloridem sodným a směs se míchala při teplotě mezi -20°C a -10°C po dobu 2 hodin. Do směsi se pomalu přidával methanol (12 ml) a směs se míchala po dobu 10 minut. Hodnota pH reakční směsi se upravila na hodnotu 7 až 8 tak, že se po kapkách přidával saturovaný • · · · ····»· · · • · · · · · · · • · · · · ·· · · ··· vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného. Směs se zahřála na teplotu místnosti a koncentrovala se vakuu. Zbytek se čistil chromatografií na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan:methanol=100:5), aby se získala sloučenina uvedená v názvu (1,21 g, 3,24 mmol, výtěžek je 87 %) ve formě bílé pevné látky.
xH-NMR(500 MHz, DMSO-d6) : 11,23(1H, brs), 8,7O(1H, d, 7,2 Hz), 8,00(2H, d, 7,5 Hz), 7,3-6(4H, m), 5,97(1H, s), 5,35(1H, dd, 5 a 10 Hz), 4,1O(1H, dd, 5 a 10 Hz), 4,O3(1H, d, 3,2 Hz), 3,953,85(2H, m) , 3,83(1H, d, 3,2Hz), 3,65-3,51(2H, m), 2,061,98(1H, m), 1,26(1).
FAB-MAS(mNBA): 374(M+H)+
Příklad 3
2'-O,4 '-C-ethylencytidin (příklad sloučeniny č. 2-3)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 2 (0,1 g, 0,268 mmol) v methanolu saturovaném v amoniaku (12 ml) se nechal stát přes noc. Směs se zakoncentrovala do sucha, přičemž vzniká sloučenina uvedená v názvu (0,054 g, výtěžek je 75 %) ve formě bílé pevné látky.
^-NMRUOO MHz, DMSO-d6) : 8,18(1H, d, 7,4 Hz), 7,10(2H, br) ,
5,84(1H, s), 5,69(1H, d, 7,6 Hz), 5,27-5,24(2H, m) , 3,86(1H, d, 3,2 Hz), 3,90-3, 78 (2H, m) , 3,76(1H, d, 3,2 Hz), 3,56(1H, dd, 5,5 a 12 Hz), 3,49(1H, dd, 5,5 a 12 Hz), 2,01-1,93(1H, dt,
7,5 a 12 Hz), 1,22(1H, dd, 3,6 a 13 Hz).
FAB-MAS(mNBA): 270(M+H)+
Příklad 4: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcitidin (příklad sloučeniny č. 2-39)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 2 (1,29 g, 3,46 mmol) v nevodném pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem od74 stranit vodu. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (26 ml) v atmosféře dusíku a do roztoku se přidal 4,4'-dimethoxytritylchlorid (1,76 g, 5,18 mmol). Směs se míchala při teplotě mlsnosti přes noc. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a z reakční směsi se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethanol:methanol = 100:5), přičemž se získala sloučenina uvedená v názvu (2,10 g, 3,11 mmol, výtěžek je 90 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
1H-NMR(270 MHz, DMSO-dg) : 11,27(lH,brs), 8,59(1H, m), 6,928,01(19H, m) , 6,O3(1H, s) , 5,56(1H, m) , 4,17(1H, m) , 4,O8(1H,
m) , 3,86(2H, m), 3,77(6H, s), 3,24(2H,m), 1,98(1H, m) .
FAB-MAS(mNBA): 676 (M+H)+
Příklad 5: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4x-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 2-235)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 4 (6,53 g, 9,66 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxovalo za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil za podmínek atmosféry dusíku v nevodném dichlormethanu (142 ml). Do roztoku se přidal N, N-diisopropylamin (2,80 ml, 16,1 mmol) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-N,N-diisopropylchlorfosforamidit (2,16 ml, 9,66 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 6 hodin. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan:triethylamin = 50:1 - dichlormethan:ethylacetát:triethylamin = 60: 30:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (7,10 g , 8,11 mmol, výtěžek je 84 %), ve formě bílé látky.
xH-NMR(270 MHz, CDCl3) : 1,1-1,2(12H, m) , 1,35(1H, m) , 2,11(1H,
m) , 2,3(2H, m) , 3,35-3,7(6H, m) , 3,8(6H, m) , 3,9-4,l(2H, m) ,
4,33(1H, m) , 6,23(1H, m) , 6,23(1H, s) , 6,9(4H, s) , 7,37,9(15H, m), 8,7-8,8(lH, m).
Příklad 6: 3', 5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin (příklad sloučeniny č. 2-22)
Do sloučeniny získané v příkladu 10 (418 mg, 0,62 mmol) ve směsi pyridin:methanol:voda = 65:30:5 (5 ml) při teplotě 0°C se přidal 2N roztok hydroxidu sodného a roztok směsi (5 ml), která obsahuje pyridin:methanol:voda = 65:30:5 a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 15 minut. Reakčni směs se neutralizovala 1N kyselinou chlorovodíkovou a extrahovala se ethylacetátem (přibližně 30 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 30 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 30 ml) , sušila se na bezvodém síranu hořečnatém a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čitil chromatografřeky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs hexan : ethylacetát = 1:1), aby se získala bezbarvá amorfní pevná látka (228 mg, 0,49 mmol, výtěžek je 79 %).
xH-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,35(1H, d, 13 Hz), 1,41(3H, s),
2,28(1H, dt, 9,4 a 13 Hz), 3,6O(1H, d, 11Hz) , 3,76(1H, d, 11Hz), 3,94(1H, d, 3,0 Hz), 4,1O(1H, d, 7,0 Hz), 4,14(1H, d, 7,0 Hz), 4,31(1H, d, 3,0 Hz), 4,51(1H, d, 12 Hz), 4,54(1H, d, 12 Hz), 4,58(1H, d, 12 Hz), 4,75(1H, d, 12 Hz), 6,O6(1H, s), 7,3(10H, m), 7,91(lH,s), 8,42(1H, brs).
FAB-MAS(mNBA): 465 (M+H)+ • · ·»· »····· * · ··· ·» ·· ·· ·· ···
Příklad 7: 2'-Ο,4'-C-ethylen-5-methyluridin (příklad sloučeniny č. 2-2)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 6 (195 mg, 0,42 mmol) v methanolu (10 ml) se míchal v atmosféře vodíku za atmosferického tlaku v přítomnosti hydrogenačního katalyzátoru po dobu 5 hodin. Reakční směs se filtrovala za účelem odstranit katalyzátor a filtrát se koncentroval ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografií na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan/methanol = 10:1) za účelem získat bezbarví prášek (v množství 76 mg, 0,268 mmol a výtěžek je 64 %).
A-NMR^OO MHz, CD3OD) : 1,33(1H, dd, 3,8 a 13 Hz), 1,86(3H, D,
0,9 Hz), 1,94(1H, ddd, 7,5, 11,7 a 13 Hz), 3,86(1H, d, 12 Hz), 3,75(1H, d, 12 Hz), 3,9-4,0(2H, m), 4,O5(1H, d, 3,2 Hz),
4,O9(1H, d, 3,2 Hz), 6,00(lH, s), 8,28(1H, d, 1,1 Hz).
FAB-MAS(mNBA): 285 (M+H)+
Příklad 8: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-5-methyluridin (příklad sloučeniny č. 2-27)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 7 (1,45 g, 5,10 mmol) v nevodném pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranění vody. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (44 ml) za atmosféry dusíku a 4,4'-dimethoxytritylchloridu (2,59 g, 7,65 mmol) a přidal se k roztoku. Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a pak se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografíčky na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan:methanol = 100 : 10) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu »» · * · · · · • * · · » ····· · « » · · · · ·· (2,42 g, 4,13 mmol, výtěžek je 81 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
M-NMR^O MHz, DMSO-dg) : ll,36(lH,s), 7,68(1H, s) , 6,907,44(13H, m) , 5,89(1H, s), 5,55(1H, d), 4,O9(1H, m) , 4,O4(1H, d) , 4,O4(1H, d) , 3,82(2H, m) , 3,74(6H,s), 3,19(2H, m) ,
1,99(1H, m), 1,36(1H, m) , 1,17(3H, s).
FAB-MAS(mNBA): 578 (M+H)+
Příklad 9: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 2-234)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 8 (4,72 g, 8,05 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil v atmosféře dusíku v nevodném dichlormethanu (142 ml). K roztoku se přidal N,N-diisopropylamin (2,80 ml, 16,1 mmol) a pak 2-kyanoethyl-N,N-diisopropylchorfosforamidit (2,16 ml, 9,66 mmol) přidal po kapkách do ledové lázně. Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 6 hodin. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitannu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chormatograficky na koloně se silikagelem (jako eluát se použila směs hexan:ethylacetát:triethylamin = 50:50:1 - hexan : ethylacetát : triethylamin = 30:60:1) za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (5,64 g, 7,17 mmol, výtěžek je 89 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,1-1,2(15H, m) , 1,4(1H, m) , 2,08(lH,
m) , 2,4(2H, m) , 3,2-4,0(14H, m) , 4,38(2H, m) , 4,47(1H, m) ,
6,O6(1H, s), 6,8-6,9(4H, m), 7,2-7,5(9H, m), 7,91(1H, m).
FAB-MAS(mNBA): 787 (M+H)+
Příklad 10: 3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin (příklad sloučeniny č. 1-23)
K sloučenině získané v příkladu 12 (238 mg, 0,30 mmol) ve směsi pyridin:methanol:voda = 65:30.5 (5 ml) při teplotě 0°C se přidal vodný 2N roztok hydroxidu sodného a roztok směsi (5 ml) obsahující pyridin:methanol:voda = 65:30:5. Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 15 minut. Reakční směs se neutralizovala 1N kyselinou chlorovodíkovou a extrahovala se ethylacetátem (přibližně 30 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem uhličitanu sodného (přibližně 30 ml) a saturovaným vodným roztok chloridu sodného (přibližně 30 ml), sušila se na bezvodém síranu hořečnatém a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky a na koloně se silikagelem (jako eluát se použila směs dichlormethan:methanol = 50:1) za účelem získat bezbarvou amorfní pevnou látku (133 mg, 0,23 mmol, výtěžek je 78 %) .
to-NMRÍÍOO MHz, CDC13) : 1,44(1H, d, 13 Hz), 2,31(1H, dd, 13 a 19 Hz), 3,56(1H, d, 11Hz), 3,70(lH, d, 11Hz), 4,10(2H,m), 4,24(lH,s), 4,45(1H, d, 12 Hz), 4,53-4,67(4H, m), 6,52(1H, s), 7,3(10H, m) , 7,53(2H, m) , 7,62(1H, m) , 8,03(2H, d, 7,6 Hz), 8,66 (1H, s), 8,78(1H, s), 9,OO(1H, brs).
FAB-MAS(mNBA): 578 (M+H)+
Příklad 11: 2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin (příklad sloučeniny č. 1-178)
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 10 (116 mg, 0,20 mmol) v bezvodém methylenchloridu (5 ml) při teplotě -78 °C se přidal pomalu po kapkách 1M roztok chloridu boritého (1,5 ml, 1,5 mmol) v dichlormethanu a směs se míchala při teplotě -78°C po dobu 3 hodiny. K reakční směsi se přidal 1M roztok chloridu boritého (1,5 ml, 1,5 mmol) v dichlormethanu a směs se míchala po dobu 2 hodin. Směs se pomalu zahřívala na teplotu místnosti a rychle se ochladila na teplotu -78°C a pak se přidal do směsi methanol (5 ml). Reakční směs se pomalu zahřívala na teplotu místnosti a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil
♦ · ·· · · ·· chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan:methanol = 9:1). Vzniká bílý prášek (49 mg, 0,17 mmol, výtěžek je 84 %).
1H-NMR(400 MHz, CD3OD): 1,45(1H, dd, 4,3 a 13 Hz), 2,12(1H, m), 3,72(1H, d, 12Hz), 3,79(1H, d, 12Hz) , 4,O4(1H, dd, 7,3 a 12
Hz), 4,15(1H, dt, 4,3 a9,4 Hz), 4,36(1H, d, 3,2Hz), 4,43(1H, d, 3,2 Hz), 6,57(1H, s), 7,57(2H, m), 7,66(1H, m), 8,09(2H, d, 8,0 Hz), 8,72(1H, s), 8,85(1H, s).
FAB-MAS(mNBA): 398 (M+H)+
Příklad 12: 2'-0,4'-ethylenadenosin (příklad sloučeniny č. 1-7)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 11 (14 mg, 0,035 mmol) v methanolu saturovaném amoniakem (1 ml) se nechal stát přes noc. Směs se zakoncentrovala a zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan:methanol) za vzniku bílého prášku (10 mg, 0,034 mmol, výtěžek je 98 %) .
1H-NMR(400 MHz, CD3OD) : 1,32(1H, dd, 4 a 13 Hz), 2,04(lH, dt, 7,4 a 12 Hz), 3,53(1H, dd, 5 a 12 Hz), 3,61(1H, dd, 5,2 a 12 Hz), 3,90(lH, dd, 7,4 a 12 Hz), 3,97(1H, dt, 4 a 12 Hz), 4,15(1H, d, 3,1 Hz), 5,27(1H, t, 5,2 Hz), 5,39(1H, d, 3,1 Hz), 6,33(1H, s), 7,29(2H, s) , 7,66(1H, m) , 8,14(1H, s) , 8,42(1H,
s) .
FAB-MAS(mNBA): 294 (M+H)+
UV(Xmax):260(pH7), 260(pHl), 258(pHl3)
Příklad 13: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin (příklad sloučeniny číslo 1-31)
Roztok sloučeniny získaný v příkladu 11 (14 mg, 0,035 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil v nevodném pyridinu (1
• ♦ • « • ♦ • a ♦· • · • « • · • •
• · * ♦ • · • •
• · ♦ * · * « · · ♦ · •
* · a · • · < »
ml) za atmosféry dusíku a k roztoku se přidal 4,4'dimethoxytritylchlorid (2,59 g, 7,65 mmol). Směs se míchala při teplotě 40°C po dobu 5 hodin. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a pak se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentroval se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan:methanol = 100 : 5) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu (18 mg, 0,026 mmol, výtěžek je 73 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : l,63(lH,m), 2,14(1H, 7,5, 12 a 13 Hz),
3,37(1H, d, 11Hz), 3,41(1H, d, 11 Hz), 3,79(6H, s),
4,10(2H,m), 4,48(1H, d, 3,3 Hz), 4,59(1H, d, 3,3 Hz), 6,54(1H, s), 6,58(4H, m) , 7,2-7,6(12H, m) , 8,02(2H, m) , 8,45(1H, s),
8,82(1H, s) , 9,02(1H, brs) .
FAB-MAS(mNBA): 700 (M+H)+
Příklad 14: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 1-186)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 13 (16 mg, 0,023 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxovalo za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil za podmínek atmosféry dusíku v bezvodém dichlormethanu (0,5 ml). K roztoku se přidal tetrazol-N, N-diisopropylaminová sůl (10 mg) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-N, N, Ν', N'-tetraisopropylchlorfosforamidit (přibližně 20 μΐ) . Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve va81 • « ·· ** ·· · * * · ♦ ♦ 9 ·· * · · · » I * * · «·« 9 · · <
·····♦···
999 99 99 ·· 99 + 9 9 kuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan:ethylacetát =
2:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (20 mg ,
0,022 mmol, výtěžek je 97 %), ve formě bílé pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : l,0-l,2(12H, m) , 1,54(1H, m) , 2,15(1H, m), 2,33(2H, m), 3,3-3,6(6H, m), 3,8(6H, s), 4,08(2H, m),
4,65(1H, m), 4,75(1H, m), 6,53(1H, s), 6,84(4H, m), 7,27,6(12H, m) , 8,01(2H, m) , 8,53(1H, s), 8,83(1H, s) , 9,O1(1H, brs) .
FAB-MAS(mNBA):900(M+H)+
Příklad 15: 3',5'-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylenuridin (příklad sloučeniny č. 2-10)
Vodný roztok IN hydroxidu sodného (2 ml) se přidal k roztoku sloučeniny získané v příkladu 13 (194 mg, 0,292 mmol) v pyridinu (3 ml) při teplotě 0°C a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 30 minut. Reakční směs se neutralizovala IN kyselinou chlorovodíkovou a extrahovala se ethylacetátem (10 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného, sušil se na bezvodém síranu hořečnatém a pak se koncentroval ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluát se použila směs dichlormethan:methanol = 100:3) za vzniku bezbarvého oleje (105 mg, 0,233 mmol, výtěžek je 80 %).
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,36(1H, m) , 2,29(1H, m) , 3,63(1H, d,
Hz), 3,74(1H, d, 11 Hz), 3,87(1H, d, 2,9 Hz), 4,03(2H, m), 4,29(1H, d, 2,9 Hz), 4,49(1H, d, 12 Hz), 4,5O(1H, d, 11Hz), 4,53(1H, d, 12 Hz), 5,2O(1H, dd, 2 a 8 Hz), 6,O4(1H, s) , 7,27,4(10H, m),, 8,13(1H, d, 8,2 Hz), 8,57(1H, brs).
FAB-MAS(mNBA):451(M+H)+
Příklad 16: 2'-0,4'-ethylenuridin • 9 9 9 9 4·9 · « · • · 9 · 9 9 9
999 49 99 ·· 99 9 (příklad sloučeniny č. 2-1)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 15 (100 mg, 0,222 mmol) v methanolu (4 ml) se míchal v atmosféře vodíku za atmosferického tlaku v přítomnosti hydrogenačního katalyzátoru po dobu 5 hodin. Reakční směs se filtrovala za účelem odstranění katalyzátoru a filtrát se koncentroval ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografií na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan:methanol = 10:1) za účelem získat bezbarvý olej (v množství 45 mg, 0, 167 mmol a výtěžek je 75 %) .
1H-NMR(400 MHz, CD3OD) : 1,35(1H, dd, 4 a 13 Hz), 2,13(1H, ddd,
7,11 a 13 Hz), 3,66(1H, d, 12 Hz), 3,73(1H, d, 12 Hz), 3,914,08(2H,m), 4,01(lH, d, 3,2 Hz), 4,12(lH, d, 3,2 Hz), 5,66(1H, d, 8,2 Hz), 6,OO(1H, s), 8,37(1H, d, 8,2 Hz).
FAB-MAS(mNBA): 271 (M+H)+
Příklad 17: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylenuridin (příklad sloučeniny č. 2-15)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 16 (28 mg, 0,104 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (3 ml) v atmosféře dusíku a do roztoku se přidal 4,4'-dimethoxytritylchlorid (50 mg, 0,15 mmol). Směs se míchala při teplotě mísnosti přes noc. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a z reakční směsi se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan:methanol=100:3), přičemž se získala sloučenina uvedená v názvu (25 mg, 0,044 mmol, výtěžek je 42 %) ve formě bezbarvého oleje.
· · *· >· ·· • · · « • · ♦ · · • ··· « · » * 9 9 · «
999 99 99 99 ·· ·
A-NMRHOO MHz, CD3OD) : 1,35(1H, dd, 3 a 14 Hz), 2,03(lH, ddd,
8, 11 a 14 Hz), 2,46(1H, d, 8Hz), 3,36(1H, d, 11 Hz), 3,41(1H, d, 11 Hz), 3,80(3H, s) , 3,81(3H, s), 3,97(2H, m) , 4,21(1), 4,33(1H, brm), 5,31(1H, m) , 6,1O(1H, s), 6,86(4H, m) , 7,27,5(9H, m) , 8,27(1H, d, 8,2 Hz), 8,43(1H, brs) .
FAB-MAS(mNBA): 573 (M+H)+
Příklad 18: 5'-O-dimethoxy trityl-2'-O,4'-C-ethylenuridin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 2-233)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 17 (6 mg, 0,0105 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu v atmosféře dusíku a do roztoku se přidal dichlormethan (0,5 ml). K roztoku se přidal tetrazol-N,N-diisopropylaminová sůl (3 mg) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-Ν,Ν, Ν', N'-tetraisopropylchlorfosforamidit (přibližně 5 μΐ) . Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan : ethylacetát = 2:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (8mg) ve formě bílé pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,1-1,2(13H, m) , 2,O9(1H, m) , 2,4(2H,
m) , 3,3-3,6(6H, m) , 3,81(6H, s), 3,94(2H, m) , 4,47(1H, m) ,
5,18(1H, d, 8,2 Hz), 6,O8(1H, s), 6,86(4H, m), 7,2-7,4(9H, m) ,
8,31(1H, d, 8,2 Hz).
FAB-MAS(mNBA):773(M+H)+
Příklad 19: 3',5'-di-O-benyl-2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5methylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-46)
Φ · · • · φ • · · φφ· · φ φ * · «
Κ roztoku sloučeniny získané v příkladu 14 (310 mg, 0,396 mmol) v pyridinu (5 ml) při teplotě 0°C se přidal IN vodný roztok hydroxidu sodného (5 ml) a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 20 minut. Reakční směs se neutralizovala přidáváním po kapkách 20% kyseliny octové a extrahovala se dichlormethanem. Dichlormethanová vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se se použila směs dichlormethan : methanol = 100:2) a získala se sloučenina uvedená v názvu (190 mg, 0,334 mmol, výtěžek je 84 %).
8,29(2H, m)
FAB-MAS(mNBA):568(M+H)+
Příklad 20: 2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-226)
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 19 (120 mg, 0,211 mmol) v bezvodém dichlormethanu (5 ml) při teplotě -78 °C se přidal po kapkách 1 M roztok chloridu boritého (1,6 ml) a směs se míchala při teplotě -78 °C po dobu 4 hodin. Ke směsi se po kapkách pomalu přidával methanol (1 ml) a směs se míchala po dobu 10 minut. pH reakce se upravilo na hodnotu 7 až 8 přidáváním saturovaného vodného roztoku hydrogenuhličitanu sodného. Reakční směs se zahřívala na teplotu místnosti a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použije směs dichlormetan : methanol = 100 : 6) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu (29 mg,
0,075 mmol, výtěžek je 36 %) ve formě pevné látky.
• · · 9 9 999 99 9 • 9 9 9 9 9 9 ·9 99 99 99 1H-NMR(400 MHz, d-DMSO: 1,24(1H, m), 2,01(3H, m) , 2,0(lH, m) ,
3,54(1H, dd, 5,4 a 12 Hz), 3,64(1H, dd, 5,4 a 12 Hz), 3,88(3H, m) , 4,1O(1H, m) , 5,36(1H, d, 5,4 Hz), 5,49(1H, t, 5,0 Hz),
5,95(1H, s), 7,4-7,6(3H,
13,17(1H, brs).
FAB-MAS(mNBA):388(M+H)+ !,21(2H, m) , 8,49(1H,
Příklad 21: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-51)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 20 (44 mg, 0,114 mmol) v nevodném pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranění vody. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (1 ml) za atmosféry dusíku a k roztoku se přidal 4,4'-dimethoxytritylchlorid (60 mg, 0,177 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a pak se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan:methanol = 100 : 4) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu (73 mg, 0,106 mmol, výtěžek je 93 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,46(1H, m) , 1,49(3H, s) , 2,O6(1H, m) , 2,59(lh, d, 8,6 Hz), 3,36(1H, d, 11 Hz), 3,39(1H, d, 11Hz) , 3,80(3H, s), 3,81(3H, s), 3,99(2H, m) , 4,3O(1H, d, 3,3 Hz),
4,39(1H, m) , 6,12(1H, s) , 6,85(4H, m) , 7,2 - 7,5 (12H, m) ,
8,03(1H, s), 8,28(2H, s).
FAB-MAS(mNBA): 573 (M+H) «*«
• ·
Příklad 22: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 2-236)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 21 (35 mg, 0,0507 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxovalo za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil za podmínek atmosféry dusíku v bezvodém dichlormethanu (1 ml) . K roztoku se přidala tetrazol-N,N-diisopropylaminová sůl (17 mg) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-N, N, Ν', N'-tetraisopropylchlorfosforamidit (přibližně 32 μΐ, 0,1 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan:ethylacetát = 2:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (40 mg , 0,0445 mmol, výtěžek je 89 %), ve formě bílé pevné látky.
ta-NMRÍÍOO MHz, CDC13) : 1,1-1,2(12H, m) , 1,36(3H, m), 2,1O(1H, m) , 2,36(2H, m) , 3,3-3,6(6H, m) ,
3,98(2H, m) , 4,42(1H, m) , 4,49(1H, m) , 6,11(1H,
m), 7,2-7,5(12H, m), 8,14(1H, s), 8,28(2H, m). FAB-MAS(mNBA):890(M+H)+
s), 1,37(1H, 3,81(6H, m), s) , 6,88(4H,
Příklad 23: 2'-O,4'-C-ethylen-5-methylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-226)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 20 (11,6 mg, 0,030 mmol) v methanolu saturovaném amoniakem (2 ml) se nechal stát přes noc. Směs se zakoncentrovala a získalo se pevná bílá látka (8,5 mg, 0,030 mmol).
1H-NMR(400 MHz, d-DMSO): 1,2O(1H, m), 1,82(3H, s), 1,97(1H, m), 3,49(1H, dd, 5 a 12 Hz), 3,58(1H, dd, 5 a 12 Hz), 3,85(2H, m), • ·
5,23(1H, d, 5 Hz), 5,32(1H, t, 5 Hz), 5,84{lH, s), 6,7 (1H, brs), 7,2(1H, brs), 8,O8(1H, s).
FAB-MAS(mNBA):284(M+H)+
UV(lmax): 279(pH7), 289(pHl), 279(pH13)
Příklad 24: 3',5'-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin (příklad sloučeniny č. 1-24)
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 15 (přibližně 200 mg) v pyridinu (2 ml) se přidal 1 N vodný roztok hydroxidu sodného (2 ml) a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 15 minut. Reakční směs se neutralizovala 1 N kyselinou chlorovodíkovou a extrahovala se ethylacetátem. Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného, sušila se na bezvodém síranu hořečnatém a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se se použila směs dichlormethan : methanol = 50:1) a získala se bezbarvá amorfní pevná látka (20 mg, 0,36 mmol, výtěžek je 6 %, dva kroky).
fo-NMRKOO MHz, CDC13) : 1,27(3H, s) , 1,29(3H, s) , 1,43(1H, dd, a 13 Hz), 2,28(1H, m) , 2,59(1H, kvi, 6,9 Hz), 3,54(1H, d, 11 Hz), 3,68(1H, d, 11 Hz), 4,03(2H, m) , 4,15(1H, d, 3,0 Hz),
4,31(1H, d, 3,0 Hz), 4,45(1H, d, 12) , 4,56(1H, d, 12 Hz) ,
4,61(1H, d, 12 Hz), 4,63(1H, d, 12 Hz) , 6,18(1H, s), 7,2-
7,4(10H, m) , 8, 19(1H, s), 11,93(1H, brs) .
FAB-MAS(mNBA):560(M+H)
Příklad 25: 2'-O,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin (příklad sloučeniny č. 1-177)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 24 (10 mg, 0,018 mmol) v methanolu (2 ml) se míchal v atmosféře vodíku za atmosferického tlaku v přítomnosti hydrogenačního katalyzátoru * φφ »φ ·φ ··
Φ·Φ« » φ · φ · « φ φ φ φ φ · · · « · • · Φ · · « ΦΦΦ * φ « φ φ · ·· φ φφ ··· φφ < φ φφ φφ « po dobu 5 hodin. Reakční směs se filtrovala za účelem odstranění katalyzátoru a filtrát se koncentroval ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografií na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan/methanol = 10:2) za účelem získání bezbarvého oleje (v množství 5 mg, 0,013 mmol a výtěžek je 72 %).
1H-NMR(400 MHz, CD3OD): 1,21(3H, s), 1,22(3H, s), 1,41(1H, dd, 4 a 13 Hz), 2,18 (1H, m) , 2,69(1H, kvi, 6,9 Hz), 3,69(1H, d,
Hz), 3,76(1H, d, 12 Hz), 4,0(2H, m) , 4,26(1H, d, 3,2 Hz),
4,3O(1H, d, 3,2 Hz), 6,30(lH, s), 8,4O(1H, s).
FAB-MAS(mNBA): 380 (M+H)+
Příklad 26: 5'-O-dimethoxytrityl-2-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin (příklad sloučeniny č. 1-35)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 25 (5 mg, 0,13 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranění vody. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (1 ml) za atmosféry dusíku a 4,4'-dimethoxytritylchloridu (14 mg, 0,04 mmol) a přidal se k roztoku. Směs se míchala při teplotě 40 °C po dobu 3 hodiny. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a pak se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan:methanol = 100 : 6) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu (4 mg, 0,0059 mmol, výtěžek je 45 %) ve formě bezbarvé pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,26(3H, d, 1,4 Hz), 1,28(3H, d, 1,4
Hz), 1,66(1H, m) , 2,15(1H, m) , 2,59(1H, kvi, 6,9 Hz), 3,65(1H, m) , 3,78(1H, m) , 4,06(2H, m) , 4,35(1H, m) , 4,38(1H, d, 3,2 Hz), 6,23(1H, s) , 6,8(4H, m) , 7,2-7,5(9H, m) , 8,01(lH, s) , 8,19(1H, brs).
FAB-MAS(mNBA): 682(M+H)+ • 94 99 *4 99 • 9 · 9 9 · 4 9 9 « 9 ο η ·«···«··· ο y ···♦·· ««· · · 9
994 99 3 99 • 9« 99 99 9« 99 9
Příklad 27: 5 '-0-c!imethoxytrityl-2 '-0, 4 '-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 1-185)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 26 (4 mg, 0,0058 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil za podmínek atmosféry dusíku v bezvodém dichlormethanu (0,5 ml). K roztoku se přidala tetrazol-N,N-diisopropylaminová sůl (5 mg) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-N,N, Ν', N'-tetraisopropylchlorf osf oramidit (9 μΐ, 0,03 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu jedné hodiny. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan:ethylacetát = 2:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (4 mg ) ve formě bílé pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,1-1,4(19H, m) , 2,1(1H, m) , 2,4(2H,
m) , 2,6(1H, m) , 3,3-3,6(6H, m) , 3,8(6H, s) , 4,0-4,6(4H, m) ,
6,2(1H, s), 6,8(4H, m) , 7,2-7,5(9H, m) , 8,1(1H, s) .
Příklad 28: 2'-0,4'-ethylenguanosin (příklad sloučeniny č. 1-5)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 25 (0,5 mg) v methanolu saturovaném v amoniaku (0,5 ml) se nechal stát při teplotě 60 °C po dobu 5 hodin. Směs se zakoncentrovala a vytvořil se bílý prášek (0,4 mg).
FAB-MAS(mNBA): 310(M+H)+ UV(Xmax): 255(pH7), 256(pHl), 258266(pH13)
Příklad 29: Syntéza oligonukleotidového derivátu • · «··· * · • · · · · «·· * · · • · · · · · · ··» ·· ·· *« »· ·
Syntéza oligonukleotidového derivátu se provádí za použití mechanického syntetizéru nukleových kyselin (ABI model392 DNA/RNA syntetizér: produkt firmy Perkin-Elmer Corp.) v rozmezí 1,0 mikromolů. Rozpouštědla, činidla a koncentrace fosforamiditu v každém cyklu syntézy je stejná, jako při syntéze přirozených oligonukleotidů. Rozpouštědla, činidla a fosforamídity přirozeného typu nukleotidů jsou produkty firmy PE Biosystems. Každá sekvence upraveného oligonukleotidového derivátu se syntetizovala opakováním kondenzace sloučeniny získané v příkladu 9 nebo amidity obsahující čtyři druhy bází nukleové kyseliny vhodné pro syntézu nukleotidů s 5'-hydroxythymidinem produkovaným deprotekcí skupiny DMTr 5'-O-DMTr-thymidinu (1,0 mikromolů) za použití kyseliny trichlorctové, 3'-hydroxyskupiny thymidinu, která je zachycena na nosiči CGP. Cyklus syntézy je následující:
1) detritylace směsí kyselina trichlorctová/dichlormethan, 35 vteřin
2) spojování fosforamiditu (přibližně 20 ekv.), tetrazol/acetonitril, 25 vteřin nebo 10 minut
3) vyplňování mezer za použití směsi 1-methylimidazol/tetrahydrofuran, anhydrid kyseliny octové/pyridin/tetrahydrofuran, 15 vteřin
4) oxidace za použití směsi jód/voda/pyridin/tetrahydrofuran, vteřin
Když se použije ve shora uvedeném kroku 2) cyklusloučenina získaná v příkladu 9, reakční čas je 10 minut, a když se použijí fosforamidity, reakční čas je 25 vteřin.
Po syntéze požadované sekvence oligonukleotiového derivátu se odstranila skupina 5'-DTMr. Nosič obsahující požadovaný produkt se odstranil koncentrovaným vodným roztokem amoniaku za účelem odstranit oligomér z nosiče a tak se odstranila ochrana z kyanoethylové skupiny, která je chráněna fosforovou skupinou. Z oligoméru se odstranila ochranná aminoskupina v adeninu, guaninu a v cytosinu. Oligonukleotidový derivát se se Čistil HPLC s reverzní fází (HPLC: LC-PV: produkt firmy Shimazu Corp., kolona: Wakopak WS-DNA: produkt Wako Pure Chemical Industry, Ltd.) za účelem získání požadovaného oligonukleotidu.
Na základě této syntetické metody se získala následující oligonukleotidová sekvence (oligonukleotid je zde označen jako „oligonukleotid 1) (koncentrace je 0,23 μπιοί, výtěžek je 23 %)
Příkladem sekvence č. 2 uvedené v seznamu sekvencí je sekvence 5'-gcgttttttgct-3', kde cukerná část thymidinů v bázích č. 4 až 8 je 2'-O,4'-C-ethylen.
Připomínky k příkladu 1
3,5-di-O-benzyl-4-trifluormethansulfonyloxymethyl-1,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku 3,5-di-O-benzyl-4-trifluormethansulfonyloxymethyl-1,2-O-iso-propyliden-a-D-erythropentofuranosy (2 000 mg, 5,0 mmol) v bezvodém dichlormethanu (50 ml) a trifluorsulfonovém anhydridu (1 010 mg, 6,0 mmol) v atmosféře dusíku při teplotě -78°C se přidal bezvodý pyridin (0,60 ml, 7,5 mmol) a směs se míchala po dobu 40 minut. Reakční směs se částečně rozdělila mezi methylenchlorid a saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 100 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 100 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 100 ml) , sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a pak se koncentrovala ve vakuu za vzniku bílého prášku (2 520 mg, 4,73 mmol, výtěžek je 95 %) , který se použije v další reakci, aniž dojde k dalšímu čištění.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,34(3H, s) , 1,63(3H, s) , 3,48(1H, d, 10 Hz), 3,53(1H, d, 10 Hz), 4,21(1H, d, 5,0 Hz), 4,5(4H, m) , 4,74(1H, d, 12 Hz), 4,80(lH, d, 12 Hz), 5,01(lH, d, 12 Hz), 5,73(1H, d, 4,6 Hz), 7,3(10H, m) .
• ·· · · ·· ·· ··· · · · · · · · · ' Odkaz k příkladu 2
3.5- di-0-benzyl-4-kyanomethyl-l,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
Sloučenina získaná v příkladu 1 (2 520 mg, 4,73 mmol) se rozpustila v dimethylsulfoxidu (50 ml) při teplotě 90 °C.
K roztoku se přidal kyanid sodný (463 mg, 9,46 mmol) při teplotě místnosti a směs se míchala při teplotě 50°C po dobu 3 hodin. Reakční směs se rozdělila mezi vodu (přibližně 100 ml) a ethylacetát (přibližně 100 ml) . Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 100 ml), sušila se pomocí bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát =4:1) za vzniku bezbarvého oleje (1 590 mg, 3,89 mmol, výtěžek je 82 %). 1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,34(3H, s), 1,62(3H, s), 2,88(1H, d, 17 Hz), 3,15(1H, d, 17 Hz), 3,5O(1H, d, 10 Hz), 3,58(1H, d, 10 Hz), 4,O8(1H, d, 5,1 Hz), 4,52(1H, d, 12 Hz), 4,56(1H, d, 12Hz), 4,57(1H, m) , 4,58(1H, d, 12 Hz), 4,76(1H, d, 12 Hz),
5,73(1H, d, 3,7 Hz), 7,3(10H, m).
Odkaz k příkladu 3
3.5- di-0-benzyl-4-formylmethyl-l,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 2 (610 mg, 1,49 mmol) v dichlormethanu (10 ml) v atmosféře dusíku při teplotě -78°C se přidal po kapkách 1,5 M toluenový roztok hydridu isobutylhlinítého a směs se míchala po dobu 1 hodiny při teplotě -78°C a pak se zahřála na teplotu místnosti. K reakční směsi se přidal methanol (5 ml) a saturovaný vodný roztok chloridu amonného (přibližně 20 ml) a tato směs se míchala po dobu 30 minut. Reakční směs se extrahovala ethylacetátem (přibližně 30 ml) . Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 30 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 30 ml), sušila se • · · · · ·· ·· · • · · · · ·· · · »·· • · · ···· ·· · • · · · · ······ · · ··· ·· · ··· ··· · · ·· ·· ·· ··· pomocí bezvodého síranu horečnatého a pak se koncentrovala ve vakuu za vzniku produktu, který se použil v další reakci bez dalšího čištění.
Odkaz k příkladu 4
3.5- di-0-benzyl-4-hydroxyethyl-l,2-0-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 3 (154 mg, 0,377 mmol) v ethanolu (5 ml) se přidal NaBH4 (7,6 mg, 0,2 mmol) a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu jedné hodiny. Reakční směs se rozdělila mezi ethylacetát (přibližně 10 ml) a vodu (přibližně 10 ml) a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 10 ml) , sušila se za použití vodného síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát =2:1) za vzniku bezbarvého oleje (117 mg, 0,284 mmol, 75 %).
Odkaz k příkladu 5
3.5- di-O-benzyl-4-formyl-1,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K methylenchloridu (200 ml) chlazenému při teplotě -78°C se přidal oxalylchlorid (6,02 ml, 69,0 mmol). K tomuto roztoku se po kapkách přidal roztok dimethylsulfoxidu (7,87 ml, 110 mmol) v bezvodém methylenchloridu (100 ml) . Po zamíchání po dobu 20 minut se k této směsi přidal roztok 3,5-di-O-benzyl-1,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosy (9 210 mg, 23,02 mmol) v bezvodém dichlormethanu (100 ml) a směs se míchala po dobu 30 minut. K reakční směsi se přidal triethylamin (28 ml, 200 mmol) a pomalu se zahříval na teplotu místnosti. Reakční směs se rozdělila mezi dichlormethan a vodu (přibližně 300 ml) . Organická vrstva se promyla vodou (přibližně 300 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 300 ml), sušila se pomocí bezvodého síranu hořečnatého a pak se • · · · · · · ·· ··· · · ·· · · »· koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na slikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 5:1) za vzniku bezbarvého oleje (8 310 mg, 20,88 mmol, výtěžek je 91 %) · 1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,35(3H, s), l,60(3H, s) , 3,68(1H, d,
Hz), 4,37(1H, d, 4,4 Hz), 4,46(1H, d, 12Hz), 4,52(1H, d, 12 Hz), 4,59(1H, d, 12 Hz), 4,59(1H, dd, 3,4, 4,4 Hz), 4,71(1H, d, 12 Hz), 5,84(1H, d, 3,4 Hz), 7,3(10H, m), 9,91(1H, s).
FABMS(mNBA): 397(M-H)+, 421(M+Na)+ [a]D+27,4° (0,51, methanol).
Odkaz k příkladu 6
3,5-di-O-benzyl-4-vinyl-l,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku sloučeniny získané v odkazech k příkladu 5 (8
310 mg, 20,88 mmol) v bezvodém tetrahydrofuranu (300 ml) v atmosféře dusíku při teplotě 0°C se přidal 0,5 M toluenový roztok činidla Tebbe (44 ml, 22 mmol) a směs se míchala. Pak se pomalu přidával 0,1 N vodný roztok hydroxidu sodného (20 ml) . Směs se filtrovala přes celit za účelem odstranit sraženinu a sraženina se promyla diethyletherem (přibližně 100 ml) . Organická vrstva se sušila za použití bezvodého síranu horečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 8 : 1 až 5:1) za vzniku bezbarvého oleje (5 600 mg, 14,14 mmol, výtěžek je 68 %) .
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,28(3H, s) , 1,52(3H, s), 3,31(1H, d,
Hz), 3,34(1H, d, 11 Hz), 4,25(1H, d, 4,9 Hz), 4,4O(1H, d,
Hz), 4,52(1H, d, 12 Hz), 4,57(1H, dd, 3,9, 4,9 Hz),
4,59(1H, d, 12 Hz), 4,76(1H, d, 12 Hz), 5,25(1H, dd, 1,8, 11
Hz), 5,52(1H, dd, 1,8, 18 Hz), 5,76(1H, d, 3,9 Hz), 6,20(lH, dd, 11, 8 Hz) , 7,3 (10H, m) .
FABMS(mNBA): 419(M+Na)+.
* Odkaz k příkladu 7
3,5-di-0-benzyl-4-hydroxyethyl-l,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku sloučeniny získané v odkazech k příkladu 6 (5
500 mg, 13,89 mmol) v bezvodém tetrahydrofuranu (200 ml) v atmosféře dusíku se přidal po kapkách 0,5 M roztok tetrahydrofuranu 9-BBN (9-borabicyklo[3,3, ljnonan) (80 ml, 40 mmol) a směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Do reakční směsi se přidávala voda do té doby než se zastavil vývoj plynu. Pak se přidal 3N vodný roztok hydroxidu sodného (30 ml) a pak se pomalu přidával 30 % vodný roztok hydrogenperoxidu při teplotě, která se udržovala mezi hodnotou 30 a 50 °C. Směs se míchala při teplotě 30 minut a dělila mezi saturovaný vodný roztok chloridu sodného (přibližně 200 ml) a ethylacetát (200 ml) . Organická vrstva se promyla neutrálním pufrovaným roztokem kyseliny fosforečné (přibližně 200 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 200 ml) a sušila se pomocí bezvodého síranu horečnatého a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 2 : 1 až 1 : 1) za vzniku bezbarvého oleje (5 370 mg, 12,97 mmol, výtěžek je 93 %). 1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,33(3H, s) , 1,66(3H, s) , 1,78(1H, ddd, 4,0, 8,5, 15 Hz), 2,51(1H, ddd, 3,4, 6,4, 15 Hz), 3,54(1H, d, 10 Hz), 3,80(2H, m), 4,13(1H, d, 5,3 Hz), 4,43(1H, d, 12 Hz), 4,52(1H, d, 12 Hz), 4,55(1H, d, 12 Hz), 4,65(1H, dd, 4,0, 5,3 Hz), 4,77(1H, d, 12 Hz), 5,77(1H, d, 4,0 Hz), 7,3(10H, m).
FABMS (mNBA) : 415(M+Na)+, [oc]D+57,4° (0,91, methanol).
Odkaz k příkladu 8
3,5-di-O-benzyl-4-(p-toluensulfonyloxyethyl)-1,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku sloučeniny získané v odkazu k příkladu 4, který se azeotropicky refluxoval s toluenem (1 035 mg, 2,5 mmol) v bezvodém dichlormethanu (35 ml) v atmosféře dusíku při tep96 lote 0 °C se přidal triethylamin (1,8 ml, 13 mmol), dimethylaminopyridin (30 mg, 0,25 mmol) a p-toluensulfonylchlorid (858 mg, 4,5 mmol) a směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Reakční směs se dělila mezi dichlormethan a saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 100 ml) . Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 100 ml) a saturovaného vodného roztoku chloridu sodného (přibližně 100 ml) a sušila se za pomoci bezvodého síranu hořečnatého a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát =3:1) za vzniku bezbarvého oleje (1 340 mg, 2,6 mmol, výtěžek je 94 %).
XH -NMR(400 MHz, CDC13) : 1 ,33 ( :3h, s), 1,49(3H, s), 1,99(1H, dt,
7, 6 a 15 Hz) , 2,47(3H, s) , 2,60 (1H ddd, 5, 7, 7,6, 15 Hz) ,
3, 28 (1H, d, 10 Hz), 3,45 (1H, . d, 10 Hz), 4,11 (1H, d, 5,3 Hz) ,
4, 32(2H, m) , 4,42(1H, d, 12 Hz), 4, 5O(1H, d, 12 Hz), 4,54 ‘ (1H,
d, 12 Hz) , 4, 62(1H, dd, 4, 0, 5,2 Hz), 4,76 (1H, d, 12 Hz) ,
5,74(1H, d, 4,0 Hz), 7,3(12H, m), 7,78(2H, d, 8,3 Hz).
FABMS(mNBA): 569(M+H)+.
Odkaz k příkladu 9
1,2-di-O-acetyl-3,5-di-O-benzyl-4-(p-toluensulfonyloxyethyl)-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku sloučeniny získané v odkazu k příkladu 8 (1 340 mg, 2,36 mmol) v kyselině octové (15 ml) se přidal kyselý anhydrid (1,88 ml, 20 mmol) a koncentrovaná kyselina sírová (0,01 ml). Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu jedné hodiny. Reakční směs nalila do vody (60 ml) v ledové lázni a míchala se po dobu 30 minut a pak se dělila mezi saturovaný vodný roztok chloridu sodného (přibližně 100 ml) a ethylacetát (přibližně 100 ml). Organická vrstva se promyla neutrálním pufrovacím roztokem kyseliny fosforečné, saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a a sušila se za použití bezvodého sí• 9 ♦ 9 ránu horečnatého a pak se koncentrovala. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 2:1) za vzniku bezbarvého oleje (1 290 mg, 2,11 mmol, výtěžek je 89 %, poměr α : β je 1 : 5) .
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : (derivát β) 1,86(3H, s) , 2,05(3H, s),
2,08(lH, m), 2,18(1H, m) , 2,42(3H s) , 3,30(lH, d, 10 Hz), 3,33(1H, d, 10 Hz), 4,23(1H, d, 5,1 Hz), 4,24(2H, m) , 4,42(2H, s), 4,45(1H, d, 12Hz), 4,55(1H, d, 12 Hz), 5,28(1H, d, 5,1
Hz), 6,01(lH, s), 7,3 (12 H, m), 7,73(2H, d, 8,3 Hz).
FAB-MAS(mNBA): 613(M+H)+.
Odkaz k příkladu 10
2'-O-acetyl-3', 5'-di-O-benzyl-4-p-toluensulfonyloxyethyl-5-methyluridin
Trimethylsilyllovaný thymin (500 mg, přibližně 2 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolíkiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (650 mg, 1,06 mmol) v bezvodém 1,2-dichlorethanu (15 ml) při teplotě místnosti v atmosféře dusíku. Ke směsi se po kapkách přidal trimethylasilyltrifluormethansulfonát (0,36 ml, 2 mmol) a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 1 hodiny. Saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného se filtroval před celit. K filtrátu se přidal dichlormethan (50 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 50 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 50 ml) a sušila se za použití síranu horečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (použila se směs hexan : ethylacetát =1 : 2) za vzniku bezbarvé amorfní pevné látky (432 mg, 0,64 mmol, výtěžek je 60 %).
xH-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,52(3H, d, 0,9 Hz), 1,94(1H, dt, 7,5 a 15 Hz), 2,06(3H, s), 2,23(1H, dt, 6,0 a 15 Hz), 2,42(3H, s) , 3,38(1H, d, 10 Hz), 3,67(1H, d, 10 Hz), 4,17(2H, m) , 4,36(1H, *9 99 99
9999 9 *9
999 9 999*9 9
9 9 9 9 9 9
999 9* *9 99 9* 9 d, 6,0 Hz), 4,41(1H, d, 12 Hz), 4,44(1H, d, 12 Hz), 4,48(1H, d, 12 Hz), 4,58(1H, d, 12 Hz), 5,39(1H, dd, 5,1 a 6,0 Hz), 6,O4(1H, d, 5,1 Hz), 7,3 (12 H, m) , 7,73(2H, dt, 1?8 a 8,3
Hz), 8,18 (1H, s).
FAB-MAS(mNBA): 679(M+H)+.
Odkaz k příkladu 11
2'-O-acetyl-3',5'-di-O-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyl-4-N-benzoylcytidin
Trimethylsilylovaný benzoylcytosin (300 mg, přibližně 1,0 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981) se přidal k roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (383 mg, 0,626 mmol) v bezvodém 1,2-dichlorethanu (4 ml). Trimethylsilyltrifluormethansulfonát (0,18 ml, 0,995 mmol) při teplotě 0 °C se přidal do směsi a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 1 hodiny. Do směsí se přidal saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 10 ml) a methylenchlorid (přibližně 20 ml) a směs se míchala. Výsledná bílá sraženina se odfiltrovala za použití celitu. Organická vrstva filtrátu se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 20 ml) a sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu za vzniku bezbarvé amorfní pevné látky (397 mg, výtěžek je 83 %). 1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 8,70(lH, br) , 8,18(1H, d, 7,4 Hz), 7,87(2H, d, 7,5 Hz), 7,72(2H, d, 8,3 Hz), 7,61-7,57 (1H, m) , 7,51-7,48(2H, m) , 7,43-7,21(13 H, m) , 6,02(lH, d, 2,9 Hz), 5,4O(1H, dd, 5,8, 2,9 Hz), 4,57(1H, d, 11 Hz), 4,39(1H, d, 11 Hz), 4,32-4,28(3H, m) , 4,19-4,16(2H, m) , 3,69(1H, d 11 Hz),
3,31(1H, d, 11 Hz), 2,40(3H, s) , 2,30-2,23(1H, m) , 2,06(3H,
s), 1,95-1,89(1H, m).
FAB-MAS(mNBA): 768(M+H)+.
Odkaz k příkladu 12 • ·· ·· ·· ·· · y y *········· ····«···♦♦··· • · · · · · · · · ··· ·· ·· ·· ·♦ ··· • 2'-O-acetyl-3',5'-di-O-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyl-6-N—
-benzoyladenosin
Trimethylsilylovaný benzoyladenosin (500 mg, přibližně 2 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (600 mg, 0,98 mmol) v bezvodém 1,2-dichlorethanu (15 ml) při teplotě místnosti v atmosféře dusíku.
Ke směsi se po kapkách přidal trimethylasílyltrífluormethansulfonát (0,36 ml, 2 mmol) a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 4 hodiny. Do reakční směsi se přidal saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného a dichlormethan (50 ml). Reakční směs se rozdělila do těchto dvou vrstev. Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 50 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 50 ml) a sušila se za použití síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (použila se směs dichlormethan : methanol =50 : 1) za vzniku bezbarvé amorfní pevné látky (405 mg, 0,51 mmol, výtěžek je 52 %).
xH-NMR(400 MHz, CDC13) : 2,O(1H, m) , 2,06(3H, s), 2,32(1H, dt,
6,0 a 15 Hz), 2,40(3H, s) , 3,36(1H, d, 10 Hz), 3,58(1H, d, 10
Hz) , 4, 22(2H, m), 4,39(1H, d, 12 Hz) , 4,45(1H, d, 12 Hz),
4,47 (1H, d, 12 Hz), 4,59(1H, d, 12 Hz), 4, 62(1H, d, 5,6 Hz) ,
5, 94 (1H, dd, 4,5 a 5.6 Hz), 5,94 (1H, dd, 4,5 a 5,6 Hz),
6,21 (1H, d, 4,5 Hz), 7,2-7,3(12H, m) , 7,54(2H, m) , 7,62(1H,
dt, 1,2 a 6,2 Hz), 7,72(2H, d, 8,3 Hz) , 8,02(2H, m) , 8,21(1H,
s) , 8,75(1H, s), 8,97(1H, brs) .
FAB-MAS(mNBA): 7 92 (M+H)+.
Odkaz k příkladu 13
2'-O-acetyl-3',5'-di-O-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyluridin • «
100 φ φ · φ φ » φ φ φ ·· · · · · · · • · φ φ φ φ φφ φ φ φ • · φ φ φ φ φ φ φ φ φ φ φφ φ φ φφ φ
Trimethylsilylovaný uráčil (200 mg, přibližně 0,8 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolíkíewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (200 mg, 0,327 mmol) v bezvodém 1,2-dichlorethanu (8 ml) při teplotě místnosti v atmosféře dusíku. Ke směsi se po kapkách přidal trimethylasilyltrífluormethansulfonát (0,145 ml, 0,8 mmol) a směs se míchala při teplotě 70 °C po dobu 1 hodiny. Do reakční směsi se přidal saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (10 ml) a směs se filtrovala za použití celitu. K filtrátu se přidal dichlormethan (přibližně 10 ml) . Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na silikagelu (použila se směs dichlormethan : methanol = 100 : 2) za vzniku bezbarvého oleje (199 mg, 0,299 mmol, výtěžek je 92 %) .
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,94(1H, dt, 7,4 a 15 Hz), 2,07(3H, s), 2,23(1H, dt, 5,9 a 15 Hz), 2,43(3H, s), 3,36(1H, d, 10 Hz),
3,65(1H, d, 10 Hz), 4,17 (2H, dd, 6 a 7 Hz), 4,31(1H, d, 5,9
Hz), 4,38(1H, d, 11Hz), 4,39(1H, d, 11 Hz), 4,40(lH, d, 11
Hz), 4,58(1H, d, 11 Hz), 5,29(1H, dd, 2,4 a 8,2 Hz), 5,33(1H,
dd, 4,5 a 6 Hz), 6,00(lH, d, 4,5 Hz), 7,2-7,4(12H, m),
7,61(1H, d, 8,2 Hz), 7,74(1H, d, 8, 3 Hz ), 8,14(1H, brs).
FAB-MAS(mNBA): 665(M+H)+.
Odkaz k příkladu 14
2'-O-acetyl-3',5'-di-O-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyl-4-N-benzoyl-5-methylcytidin
Trimethylsilylovaný uráčil (200 mg, přibližně 0,8 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu pří• *
101 kladu 9 (400 mg, 0,653 mmol) v bezvodém 1,2-dichlorethanu (6 ml) . Ke směsi se po kapkách přidal trimethylasilyltrifluormethansulfonát (0,180 μΐ, 1,0 mmol) při teplotě 0°C a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 1 hodiny. Reakční směs se zahřála na teplotu místnosti. Do reakční směsi se přidal saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 5 ml) a methylenchlorid (přiližně 10 ml) a směs se zamíchala. Dále se směs filtrovala za použití celitu, aby se odstranila bílá sraženina. Organická vrstva filtrátu se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu za vzniku bezbarvé amorfní pevné látky (320 mg, 0,409 mmol, výtěžek je 63 %) .
xH-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,68(3H, s), 1,95(1H, dt, 7,3 a 15 Hz), 2,07(3H, s), 2,25(1H, dt, 6 a 15 Hz), 2,43(3H, s), 3,4O(1H, d, 10 Hz), 3,71(1H, d, 10 Hz), 4,18(2H, m), 4,37(1H, d, 5,8 Hz), 4,42(1H, d, 12 Hz), 4,46(1H, d, 12 Hz), 4,51(1H, d, 12 Hz), 4,61(lH,d, 12 Hz), 5,42(1H, dd, 4,9 a 5,8 Hz), 6,07(lH, d, 4,9 Hz), 7,2-7,6(17H, m) , 7,74(2H, d, 8,3 Hz), 8,28(2H, d, 7,0 Hz) .
FAB-MAS(mNBA): 782(M+H)+.
Odkaz k příkladu 15
2'-0-acetyl-3',5'-di-O-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyl-2-N-isobutyrylguanosin
Trimethylsilylovaný isobutyrylguanosin (650 mg, přibližně 1,5 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (400 mg, 0,65 mmol) v bezvodém 1,2-dichlorethanu (10 ml) při teplotě místnosti v atmosféře dusíku. Ke směsi se po kapkách přidal trimethylasilyltrifluormethansulfonát (0,2 ml, 1,2 mmol) a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 4 hodin. Do reakční směsi se přidal saturovaný vod102
99 9999 9 • 99 9999 9 · ·
9 9 · 9 999 999 9
999 99 9 999 • 99 99 99 99 99 9 9 9 ný roztok hydrogenuhličitanu sodného (5 ml) a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu za vzniku produktu, který se použil v další reakci bez dalšího čištění.
Příklad testu 1
Test měření Tm
Roztok vzorku (1 ml), jehož konečná koncentrace NaCl je 100 mM, pufrovací roztok fosforečnanu sodného (pH7,2) s koncentrací 10 mM, oligonukleotid (1) s koncentrací 4 μΜ a komplementární DNA (zde uvedená jako oligonukleotid (2)), která vykazuje sekvenci indikovanou svým komplementárním řetězcem (sekvence 5'-agcaaaaaacgc-3'(sekvence č. 1 na seznamu sekvencí) nebo komplementární RNA (zde uvedená jako oligonukleotid (3)), která má sekvenci indikovanou sekvencí 5'-agcaaaaaacgc3' (sekvence č. 1 uvedenou na seznamu sekvencí) s koncentrací 4 μΜ, se zahřál v lázni s vroucí vodou a pomalu se chladil na teplotu místnosti, což trvalo přibližně dvě hodiny. Vzorek se pak zahřál a měřilo se za použití spektrofotometru (UV-3100PC: produkt firmy Shimadzu Corp.). Vzorek se zahřál v cele (tloušťka cely je 1,0 cm, cylindrický plášťový typ) cirkulující vodou zahřívanou v inkubátoru (Haake FE2: produkt firmy EKO Corp.) a monitorovala se teplota za použití teploměru (SÁTO SK1250MC) . Teplota se zvýšila z 20 °C na 95 °C a při každém zvýšení teploty o jeden °C se měřila absorbance ultrafialového záření při maximální absorpční vlnové délce 260 nm. Přirozeně se vyskytující DNA (zde uvedená jako oligonukleotid (4)), která má sekvenci indikovanou sekvencí 5'-gcgttttttgct3' (sekvence č. 2 uvedená v seznamu sekvencí), jenž má stejnou sekvenci jako oligonukleotid (1) (sloučenina příkladu 29) se použila jsko kontrola a provedl se stejný postup.
103 * · 4 4 4 *4 ♦» • •44 4444 444
444 4444 « «
444 4 44« 4 4 4
444 4 4 4 44
4444« 44 44 44 4
Teplota, při které změna na 1°C dosáhne maxima, je teplota Tm (teplota denaturace) a při této teplotě se hodnotila schopnost olígonukleotidového analogu tvořit komplementární řetězec .
Výsledky měření hodnot Tm oligonukleotidu (4) (přirozeně se vyskytující DNA) a oligonukleotidu (1) (sloučenina z příkladu 29) je vztažena k oligonukleotidu (2) (komplementární DNA) a oligonukleotidu (3) (komplementární RNA).
Tabulka č. 3
Tm (°C)
sloučenina oligonukleotid (2) oligonukleotid (3)
oligonukleotid (4) 48 44
oligonukleotid (1) 61 75
S tabulky plyne, že oligonukleotidový analog podle vynálezu vykazuje překvapivě vyšší hodnotu Tm a překvapivě vyšší schopnost tvořit komplementární řetězec ve srovnání s přirozeně se vyskytující DNA.
Příklad testu 2
Měření rezistence vůči nukleázám
Exonukleáza a endonukleáza se smíchaly s pufrem s oligonukleotidem a směs se udržovala při teplotě 37 °C po dobu 15 minut. Roztok směsi se pak udržoval při teplotě 37 °C po předem určenou dobu. K části směsi se přidala kyselina ethylendiaminotetraoctová (EDTA) a směs se zahřála na teplotu 100 °C po dobu 2 minuty, přičemž se zastavila reakce. Množství zbývajícího oligonukleotidu se stanovilo HPLC s reverními fázemi, měřily se změny množství oligonukleotidu závislé na čase v přítomnosti nukleázy.
Oligonukleotidové analogy podle vynálezu demonstrují překvapivou rezistenci vůči nukleázám.
104
9» 4» *» 9»
4·»· 9 4 4· · 9 9
499 «994 · · · · · · ··· 4 4 ·
49· 49 4 44
494 44 «4 4» 44 4
Průmyslová využitelnost
Nový oligonukleotidový a nukleosidový analog podle vynálezu se může použít jako antigenní farmaceutický prostředek, který vykazují skvělou stabilitu. Dále se mohou použít jako detekční činidla (sondy) specifického genu, jako primery pro začátek amplifikace nebo jako meziprodukty při jejich přípravě .
105 • ·· »* e* ·· * »· » » · O « · f ·· • · · * · · · · · 9 • 9 · » · · ··· · ♦ · « • « · ·· · · · 9 ··· ·· «· et ·« *··
Seznam sekvencí <210> 1 <211> 12 <212> DNA <213> umělá sekvence <220>
<223> Popis umělé sekvence: Syntetizovaný oligonukleotid určený pro testování hodnoty Tm <400> 1 agcaaaaaac gc 12 <210> 2 <211> 12 <212> DNA <213> umělá sekvence <220>
<223> Popis umělé sekvence: Syntetizovaný oligonukleotid určený pro testování hodnoty Tm

Claims (19)

  1. PATENTOVÉ NÁROKY
    1. Sloučenina obecného vzorce 1:
    kde symboly R1 a R2 jsou stejné nebo různé a reprezentují atom vodíku, hydroxylovou ochranou skupinu, skupinu kyseliny fosforečné, chráněnou skupinu kyseliny fosforečné nebo -P(R3)R4, [kde symboly R3 a R4 jsou stejné nebo různé a reprezentují hydroxylovou skupinu, chráněnou hydroxylovou skupinu, merkaptoskupinu, chráněnou merkaptoskupinu, aminoskupinu, alkoxyskupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, alkylthioskupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, kyanoalkoxyskupinu, která obsahuje 1 až 5 atomů uhlíku, nebo aminoskupinu substituovanou alkylovou skupinou, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku], symbol A reprezentuje alkylenovou skupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku a symbol B reprezentuje skupinu purin-9-yl, 2-oxopyrimidin-l-yl nebo substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, která má alespoň jeden substituent vybraný z následující skupiny a, nebo její sole, přičemž skupina a je hydroxylová skupina, chráněná hydroxylová skupina, alkoxyskupina, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, merkaptoskupina,
    107 chráněná merkaptoskupina, alkylthioskup.ina s 1 až 4 atomy uhlíku, aminoskupina, chráněná aminoskupina, aminoskupina substituovaná alkylovou skupinou s 1 až 4 atomy uhlíku, alkylová skupina s 1 až 4 atomy uhlíku a halogenový atom.
  2. 2. Sloučenina podle nároku 1 nebo její sůl, kde symbol R1 je atom vodíku, alifatická acylová skupina, aromatická acylová skupina, methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, jejichž arylový kruh je substituován nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou nebo silylovou skupinou.
  3. 3. Sloučenina podle nároku 1 nebo její sůl, kde symbol R1 je atom vodíku, acetylová skupina, benzoylová skupina, benzylová skupina, p-methoxybenzylová skupina, dimethoxytritylová skupina, monomethoxytritylová skupina nebo terc-butyldifenylsilylová skupina.
  4. 4. Sloučenina podle libovolného z nároků 1 až 3 nebo její sůl, kde symbol R2 je atom vodíku, alifatická acylová skupina, aromatická acylová skupina, methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, jejichž arylový kruh je substituován nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou, silylovou skupinou, fosforamiditovou skupinou, fosfonylovou skupinou, skupinou kyseliny fosforečné nebo chráněnou skupinou kyseliny fosforečné.
  5. 5. Sloučenina podle libovolného z nároků 1 až 3 nebo její sůl, kde symbol R2 je atom vodíku, acetylová skupina, benzoylová skupina, benzylová skupina, p-methoxybenzylová skupina, terc-butyldifenylsilylová skupina, -P(OC2H4CN)NCH(CH3) 2) r
    108
    -P(OCH3) NCH(CH3) 2) , fosfonylová skupina nebo skupina kyseliny
    2-chlorfenylfosforečné nebo 4-chlorfenylfosforečné.
  6. 6. Sloučenina podle libovolného z nároků 1 až 5 nebo její sůl, kde symbol A je methylenová skupina.
  7. 7. Sloučenina podle libovolného z nároků 1 až 6 nebo její sůl, kde symbol B je 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl),
    6-aminopurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2,6-diaminopurin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6«chlorpurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6•fluorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6-brompurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl (to je guaninyl), 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, jehož aminoskupina a hydroxylová skupina jsou chráněné, 6-amino-2-methoxypurin-9-yl, 6-amino-2-chlorpurin-9-yl, 6-amino-2-fluorpurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl, 6-merkaptopurin-9-yl, 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl (to je cytosinyl), 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino5-fluorpyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-merkaptopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-hydroxypyrimidin-l-yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5-methylpyrimidin-l-yl (to je thyminyl) nebo 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je methylcytosinyl) nebo 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná.
  8. 8. Sloučenina podle libovolného z nároků 1 až 6 nebo její sůl, kde symbol B je 6-benzoylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-isobutyrylamino-6-hydroxypurin-9-yl, guaninyl, 2-oxo-4~benzoylaminopyrimidin-l-yl, cytosinyl, 2-oxo-5-methyl-4-benzoylaminopyridin-l-yl, 5-methylcytosinyl, uracinyl nebo thyminyl.
  9. 9. Sloučenina nebo její sůl vybraná z následující skupiny:
    2'-O,4'-C-ethylenguanosin
    109 • ·
    2'-O,4'-C-ethylenadenosin
    3', 5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin 3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin 5'-0-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin 2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin
    2'-O,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin
    5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit
    5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit 2'-0, 4'-C-ethylenuridin
    2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin
    2'-0, 4'-C-ethylencytidin
    2'-0,4'-C-ethylen-5-methylcytidin
    3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylenuridin
    5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylenuridin
    3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin
    5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin
    3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin
    5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin 3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin
    5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin
    2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin
    2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin
    5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylenuridin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit
    5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit
    5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit a
    110 • ·
    5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit.
  10. 10. Oligonukleotidový analog, který vykazuje jednu nebo dvě nebo více struktur obecného vzorce 2:
    kde symbol A reprezentuje alkylenovou skupinu, která má 1 až 4 atomy uhlíku a symbol B reprezentuje skupinu purin-9-yl, 2-oxopyrimidin-l-yl a substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, kde se alespoň jeden substituent vybral z následující skupiny a, nebo jeho farmaceuticky přijatelná sůl, přičemž skupina a je: hydroxylová skupina, chráněná hydroxylová skupina, alkoxyskupina s 1 až 4 atomy uhlíku, merkaptoskupina, chráněná merkaptoskupina, alkylthioskupina s 1 až 4 atomy uhlíku, aminoskupina, chráněná aminoskupina, aminoskupina substituovaná alkylovou skupinou s 1 až 4 atomy uhlíku, alkylová skupina s 1 až 4 atomy uhlíku a halogenový atom.
  11. 11. Oligonukleotidový analog podle nároku 10 nebo jeho farmaceuticky přijatelná sůl, kde symbol A je methylenová skupina.
    111 • · · ·· ·· ·· β ···· ···· « · · ·· ··· ······ · ····· ·· ·· ** *
  12. 12. Oligonukleotidový analog podle libovolného z nároků 10 a 11 nebo jeho farmakologicky přijatelná sůl, kde symbol B je 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl), 6-aminopurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2,6-diaminopurin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6-brompurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl (to je guaninyl), 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, jehož aminoskupina a hydroxylová skupina jsou chráněné, 6-amino-2-methoxypurin-9-yl, 6-amino-2-chlorpurin-9-yl, 6-amino-2-fluorpurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl, 6-merkaptopurin-9-yl, 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl (to je cytosinyl), 2-oxo-4-aminopyrimídin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-merkaptopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-hydroxypyrimidin-l-yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5-methylpyrimidin-l-yl (to je thyminyl) nebo 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je methylcytosinyl) nebo 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná.
  13. 13. Oligonukleotidový analog podle libovolného z nároků 10 a 11 nebo jeho farmaceuticky přijatelná sůl, kde symbol B je 6-benzoylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-isobutyrylamino-6-hydroxy-purin-9-yl, guaninyl, 2-oxo-4-benzoylaminopyrimidin-l-yl, cytosinyl, 2-oxo-5-methyl-4-benzoylaminopyridin-l-yl, 5-methylcytosinyl, uracinyl nebo thyminyl.
  14. 14. Farmaceutický prostředek, vyznačuj ící se tím, že obsahuje účinné množství farmaceuticky aktivní sloučeniny spolu s nosičem nebo ředidlem, kde uvedená farmakologicky aktivní sloučenina je oligonukleotidový analog
    112 • 9 • 9 9
    9 9 9
    9 9 • · • · podle libovolného z nároků 10 až 13 nebo jeho farmaceuticky přijatelná sůl.
  15. 15. Sonda vhodná pro gen obsahující oligonukleotidový analog podle libovolného z nároků 10 až 13.
  16. 16. Primer vhodný pro začátek amplifikace obsahující oligonukleotidový analog podle libovolného z nároků 10 až 13.
  17. 17. Použití oligonukleotidového analogu podle libovolného z nároků 10 až 13 nebo jeho farmakologicky přijatelné sole při výrobě léčiva vhodného pro prevenci nebo léčbu onemocnění, kterému je možné předcházet nebo ho léčit schopností uvedeného oligonukleotidového analogu vykazovat farmakologicky použitelnou aktivitu v těle pacienta po jeho aplikaci.
  18. 18. Použití oligonukleotidového analogu podle libovolného z nároků 10 až 13 nebo jeho farmakologicky přijatelné sole při výrobě léčiva vhodného pro prevenci nebo léčbu onemocnění, kterému je možné předcházet nebo ho léčit schopností uvedeného oligonukleotidového analogu vykazovat farmakologicky použitelnou antigenní aktivitu v těle pacienta po jeho aplikaci.
  19. 19. Oligonukleotidový analog podle libovolného z nároků 10 až 13 nebo jeho farmakologicky přijatelná sůl vhodná pro použití jako léčiva.
CZ20012574A 1999-02-12 2000-02-10 Nukleosidový analog a oligonukleotidový analog a farmaceutický prostredek, sonda a primer s jeho obsahem CZ296576B6 (cs)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP3386399 1999-02-12

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CZ20012574A3 true CZ20012574A3 (cs) 2002-02-13
CZ296576B6 CZ296576B6 (cs) 2006-04-12

Family

ID=12398349

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20012574A CZ296576B6 (cs) 1999-02-12 2000-02-10 Nukleosidový analog a oligonukleotidový analog a farmaceutický prostredek, sonda a primer s jeho obsahem

Country Status (26)

Country Link
US (4) US7335765B2 (cs)
EP (1) EP1152009B2 (cs)
JP (1) JP3420984B2 (cs)
KR (1) KR100573231B1 (cs)
CN (1) CN1273478C (cs)
AT (1) ATE287897T2 (cs)
AU (1) AU758956B2 (cs)
BR (1) BRPI0008131B8 (cs)
CA (1) CA2361318C (cs)
CZ (1) CZ296576B6 (cs)
DE (1) DE60017711T3 (cs)
DK (1) DK1152009T4 (cs)
ES (1) ES2234563T5 (cs)
HK (1) HK1040084B (cs)
HU (1) HU228398B1 (cs)
ID (1) ID30093A (cs)
IL (2) IL144338A0 (cs)
NO (1) NO320441B1 (cs)
NZ (1) NZ513402A (cs)
PL (1) PL208245B1 (cs)
PT (1) PT1152009E (cs)
RU (1) RU2233844C2 (cs)
TR (2) TR200102328T2 (cs)
TW (1) TW513438B (cs)
WO (1) WO2000047599A1 (cs)
ZA (1) ZA200106544B (cs)

Families Citing this family (440)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7119184B2 (en) * 1991-08-12 2006-10-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides having A-DNA form and B-DNA form conformational geometry
US9096636B2 (en) 1996-06-06 2015-08-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Chimeric oligomeric compounds and their use in gene modulation
US5898031A (en) 1996-06-06 1999-04-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligoribonucleotides for cleaving RNA
US7812149B2 (en) 1996-06-06 2010-10-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2′-Fluoro substituted oligomeric compounds and compositions for use in gene modulations
JP4148662B2 (ja) * 2000-08-10 2008-09-10 第一三共株式会社 ヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体を含有する核酸試薬及び医薬
JP4151751B2 (ja) * 1999-07-22 2008-09-17 第一三共株式会社 新規ビシクロヌクレオシド類縁体
WO2002028875A2 (en) * 2000-10-04 2002-04-11 Cureon A/S Improved synthesis of purine locked nucleic acid analogues
GB0114719D0 (en) * 2001-06-15 2001-08-08 Glaxo Group Ltd Compound
WO2003033696A1 (fr) * 2001-10-18 2003-04-24 Sankyo Company, Limited Compose antisens vegf
US7615619B2 (en) * 2002-02-13 2009-11-10 Takeshi Imanishi Nucleoside analogues and oligonucleotide derivative comprising nucleotide analogue thereof
US20040219565A1 (en) 2002-10-21 2004-11-04 Sakari Kauppinen Oligonucleotides useful for detecting and analyzing nucleic acids of interest
WO2004041889A2 (en) 2002-11-05 2004-05-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Polycyclic sugar surrogate-containing oligomeric compounds and compositions for use in gene modulation
WO2004044136A2 (en) 2002-11-05 2004-05-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions comprising alternating 2’-modified nucleosides for use in gene modulation
DK2284269T3 (en) 2002-11-18 2017-10-23 Roche Innovation Ct Copenhagen As Antisense design
AU2013201786B2 (en) * 2002-11-18 2015-04-02 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Amino-LNA, thio-LNA and alpha-L-oxy-LN
JP5132025B2 (ja) * 2002-11-19 2013-01-30 第一三共株式会社 新規２’，５’−オリゴアデニル酸類縁体
TWI347948B (en) 2002-11-19 2011-09-01 Sankyo Co Novel 2',5'-oligoadenylic acid compositions
CA2796924C (en) 2002-11-25 2016-12-13 Nonprofit Organization Translational Research Organization Of Duchenne Muscular Dystrophy Ena nucleic acid pharmaceuticals capable of modifying splicing of mrna precursors
DK1639130T3 (da) 2003-06-20 2012-07-09 Exiqon As Prober, biblioteker og kits til analyse af blandinger af nukleinsyrer og metoder til opbygning af disse
US7683036B2 (en) 2003-07-31 2010-03-23 Regulus Therapeutics Inc. Oligomeric compounds and compositions for use in modulation of small non-coding RNAs
ATE555118T1 (de) * 2003-08-28 2012-05-15 Takeshi Imanishi Neue synthetische nukleidsäuren vom typ mit quervernetzter n-o-bindung
US20050053981A1 (en) 2003-09-09 2005-03-10 Swayze Eric E. Gapped oligomeric compounds having linked bicyclic sugar moieties at the termini
US7480382B2 (en) * 2003-09-30 2009-01-20 Microsoft Corporation Image file container
GB0324854D0 (en) * 2003-10-24 2003-11-26 Expresson Biosystems Ltd App/ena antisense
US7906639B2 (en) 2003-11-07 2011-03-15 Sankyo Company, Limited Oligonucleotides having a 2′-O,4′-C-ethylene nucleotide in the third position of the 3′-end
US8569474B2 (en) 2004-03-09 2013-10-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Double stranded constructs comprising one or more short strands hybridized to a longer strand
EP1783216A1 (en) * 2004-05-28 2007-05-09 Sankyo Company, Limited Telomerase-inhibitory ena oligonucleotide
US8394947B2 (en) 2004-06-03 2013-03-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Positionally modified siRNA constructs
US7884086B2 (en) 2004-09-08 2011-02-08 Isis Pharmaceuticals, Inc. Conjugates for use in hepatocyte free uptake assays
WO2006059507A1 (ja) * 2004-11-30 2006-06-08 Sankyo Company, Limited 11β-HSD1アンチセンス化合物
US20090264635A1 (en) 2005-03-25 2009-10-22 Applera Corporation Methods and compositions for depleting abundant rna transcripts
DK1931780T3 (en) 2005-08-29 2016-01-25 Regulus Therapeutics Inc Antisense-forbindelser med forøget anti-microrna-aktivitet
US9862770B2 (en) 2005-10-19 2018-01-09 Ibc Pharmaceuticals, Inc. Multivalent antibody complexes targeting IGF-1R show potent toxicity against solid tumors
US20100226884A1 (en) 2009-01-20 2010-09-09 Immunomedics, Inc. Novel Class of Monospecific and Bispecific Humanized Antibodies that Target the Insulin-like Growth Factor Type I Receptor (IGF-1R)
US8883162B2 (en) * 2005-10-19 2014-11-11 Ibc Pharmaceuticals, Inc. Multivalent antibody complexes targeting IGF-1R show potent toxicity against solid tumors
EP3000480A1 (en) 2005-12-01 2016-03-30 ProNAi Therapeutics, Inc. Cancer therapies and pharmaceutical compositions used therein
CN101365791B (zh) * 2005-12-09 2012-07-25 独立行政法人理化学研究所 核酸的复制方法及新型人工碱基对
CN101437933B (zh) 2005-12-28 2013-11-06 斯克里普斯研究所 作为药物靶标的天然反义和非编码的rna转录物
JP5342881B2 (ja) 2006-01-27 2013-11-13 アイシス ファーマシューティカルズ， インコーポレーテッド ６−修飾された二環式核酸類似体
JP5213723B2 (ja) 2006-01-27 2013-06-19 アイシス ファーマシューティカルズ， インコーポレーテッド マイクロｒｎａの調節に使用するためのオリゴマー化合物及び組成物
CN103554205A (zh) 2006-05-05 2014-02-05 Isis制药公司 调节gccr的表达的化合物和方法
EP2505649A1 (en) 2006-05-05 2012-10-03 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating expression of GCGR
AU2007249349B2 (en) 2006-05-11 2012-03-08 Isis Pharmaceuticals, Inc. 5'-Modified bicyclic nucleic acid analogs
US7666854B2 (en) 2006-05-11 2010-02-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bis-modified bicyclic nucleic acid analogs
DK2410054T4 (da) 2006-10-18 2020-02-10 Ionis Pharmaceuticals Inc Antisenseforbindelser
MX2009005527A (es) * 2006-11-27 2009-06-08 Isis Pharmaceuticals Inc Metodos para el tratamiento de hipercolesterolemia.
US8093222B2 (en) 2006-11-27 2012-01-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods for treating hypercholesterolemia
US20100292301A1 (en) * 2007-02-28 2010-11-18 Elena Feinstein Novel sirna structures
US8278425B2 (en) 2007-05-30 2012-10-02 Isis Pharmaceuticals, Inc. N-substituted-aminomethylene bridged bicyclic nucleic acid analogs
EP2173760B2 (en) 2007-06-08 2015-11-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Carbocyclic bicyclic nucleic acid analogs
US20110046206A1 (en) * 2007-06-22 2011-02-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Double strand compositions comprising differentially modified strands for use in gene modulation
CN101796062B (zh) 2007-07-05 2014-07-30 Isis制药公司 6-双取代双环核酸类似物
AU2008307482B2 (en) 2007-10-02 2012-07-12 Amgen Inc. Increasing erythropoietin using nucleic acids hybridizable to micro-RNA and precursors thereof
EP2231168A4 (en) * 2007-10-03 2012-01-04 Quark Pharmaceuticals Inc NEW STRUCTURES OF ARNSI
WO2009067647A1 (en) * 2007-11-21 2009-05-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Carbocyclic alpha-l-bicyclic nucleic acid analogs
US8614311B2 (en) 2007-12-12 2013-12-24 Quark Pharmaceuticals, Inc. RTP801L siRNA compounds and methods of use thereof
WO2009074990A2 (en) * 2007-12-12 2009-06-18 Quark Pharmaceuticals, Inc. Rtp801l sirna compounds and methods of use thereof
EP2242854A4 (en) * 2008-01-15 2012-08-15 Quark Pharmaceuticals Inc COMPOUNDS AND USES THEREOF
US8530640B2 (en) 2008-02-07 2013-09-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic cyclohexitol nucleic acid analogs
CN104975020B (zh) 2008-02-11 2020-01-17 菲奥医药公司 经修饰的RNAi多核苷酸及其用途
CA2718765A1 (en) * 2008-03-20 2009-09-24 Quark Pharmaceuticals, Inc. Novel sirna compounds for inhibiting rtp801
EP2285819B1 (en) 2008-04-04 2013-10-16 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising neutrally linked terminal bicyclic nucleosides
EP2285385A4 (en) * 2008-04-15 2013-01-16 Quark Pharmaceuticals Inc COMPOUNDS BASED ON RNSI TO INHIBIT NRF2
AU2009256243A1 (en) 2008-06-04 2009-12-10 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Modulation of gene expression through endogenous small RNA targeting of gene promoters
WO2009147684A2 (en) 2008-06-06 2009-12-10 Quark Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for treatment of ear disorders
TWI455944B (zh) 2008-07-01 2014-10-11 Daiichi Sankyo Co Ltd 雙股多核苷酸
WO2010008582A2 (en) 2008-07-18 2010-01-21 Rxi Pharmaceuticals Corporation Phagocytic cell drug delivery system
US8901095B2 (en) 2008-07-29 2014-12-02 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Selective inhibition of polyglutamine protein expression
NZ591416A (en) * 2008-08-25 2012-11-30 Excaliard Pharmaceuticals Inc Antisense oligonucleotides directed against connective tissue growth factor and uses thereof
EP2949752B1 (en) 2008-09-22 2017-12-20 RXi Pharmaceuticals Corporation Reduced size self-delivering rnai compounds
DK2356129T3 (da) 2008-09-24 2013-05-13 Isis Pharmaceuticals Inc Substituerede alpha-L-bicykliske nukleosider
RU2604489C2 (ru) * 2008-10-03 2016-12-10 КьюРНА,Инк.,US Лечение заболеваний, связанных с аполипопротеином-а1, путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта аполипопротеина-а1
US9074211B2 (en) 2008-11-19 2015-07-07 Rxi Pharmaceuticals Corporation Inhibition of MAP4K4 through RNAI
ES2629630T3 (es) 2008-12-04 2017-08-11 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con eritropoyetina (EPO) mediante inhibición del transcrito antisentido natural a EPO
MX2011005918A (es) 2008-12-04 2011-06-17 Opko Curna Llc Tratamiento de enfermedades relacionadas con un gen supresor de tumor mediante inhibicion del transcrito antisentido natural para el gen.
US8927511B2 (en) * 2008-12-04 2015-01-06 Curna, Inc. Treatment of vascular endothelial growth factor (VEGF) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to VEGF
US8592386B2 (en) 2008-12-17 2013-11-26 Sarepta Therapeutics, Inc. Antisense compositions and methods for modulating contact hypersensitivity or contact dermatitis
WO2010080452A2 (en) 2008-12-18 2010-07-15 Quark Pharmaceuticals, Inc. siRNA COMPOUNDS AND METHODS OF USE THEREOF
WO2010078536A1 (en) 2009-01-05 2010-07-08 Rxi Pharmaceuticals Corporation Inhibition of pcsk9 through rnai
WO2010090762A1 (en) 2009-02-04 2010-08-12 Rxi Pharmaceuticals Corporation Rna duplexes with single stranded phosphorothioate nucleotide regions for additional functionality
CA2752237C (en) 2009-02-12 2020-03-24 Opko Curna, Llc Treatment of brain derived neurotrophic factor (bdnf) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to bdnf
CA2755409C (en) 2009-03-16 2019-04-30 Joseph Collard Treatment of nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 2 (nrf2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to nrf2
CA2755404C (en) 2009-03-17 2020-03-24 Joseph Collard Treatment of delta-like 1 homolog (dlk1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to dlk1
US8815586B2 (en) 2009-04-24 2014-08-26 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Modulation of gene expression using oligomers that target gene regions downstream of 3′ untranslated regions
DE102009019476A1 (de) * 2009-05-04 2010-11-11 Biametrics Marken Und Rechte Gmbh Wiedererkennbarer Träger für optische Meßverfahren
CN103223177B (zh) 2009-05-06 2016-08-10 库尔纳公司 通过针对脂质转运和代谢基因的天然反义转录物的抑制治疗脂质转运和代谢基因相关疾病
CA2761142C (en) 2009-05-06 2021-06-08 Opko Curna, Llc Treatment of tristetraproline (ttp) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to ttp
US9012139B2 (en) 2009-05-08 2015-04-21 Curna, Inc. Treatment of dystrophin family related diseases by inhibition of natural antisense transcript to DMD family
CN102575251B (zh) 2009-05-18 2018-12-04 库尔纳公司 通过抑制针对重编程因子的天然反义转录物来治疗重编程因子相关的疾病
US8895527B2 (en) 2009-05-22 2014-11-25 Curna, Inc. Treatment of transcription factor E3 (TFE3) and insulin receptor substrate 2(IRS2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to TFE3
CA2764683A1 (en) 2009-05-28 2010-12-02 Joseph Collard Treatment of antiviral gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to an antiviral gene
EP3276004B1 (en) 2009-06-08 2020-03-18 Quark Pharmaceuticals, Inc. Methods for treating chronic kidney disease
JP6128846B2 (ja) 2009-06-16 2017-05-17 クルナ・インコーポレーテッド パラオキソナーゼ（ｐｏｎ１）に対する天然アンチセンス転写物の抑制によるｐｏｎ１遺伝子関連疾患の治療
ES2620960T3 (es) 2009-06-16 2017-06-30 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con un gen de colágeno mediante la inhibición de un transcrito antisentido natural a un gen de colágeno
JP6073133B2 (ja) 2009-06-24 2017-02-01 クルナ・インコーポレーテッド 腫瘍壊死因子受容体２（ｔｎｆｒ２）に対する天然アンチセンス転写物の抑制によるｔｎｆｒ２関連疾患の治療
WO2010151674A2 (en) 2009-06-26 2010-12-29 Curna, Inc. Treatment of down syndrome gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a down syndrome gene
KR101801407B1 (ko) 2009-07-24 2017-11-24 큐알엔에이, 인크. 시르투인 (ｓｉｒｔ)에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의한 시르투인 관련된 질환의 치료
KR101802536B1 (ko) 2009-08-05 2017-11-28 큐알엔에이, 인크. 인슐린 유전자 (ｉｎｓ)에 대한 자연 안티센스 전사체의 저해에 의한 인슐린 유전자 (ｉｎｓ) 관련된 질환의 치료
EP2462153B1 (en) 2009-08-06 2015-07-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic cyclohexose nucleic acid analogs
WO2011019815A2 (en) 2009-08-11 2011-02-17 Curna, Inc. Treatment of adiponectin (adipoq) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to an adiponectin (adipoq)
JP5943836B2 (ja) 2009-08-21 2016-07-05 カッパーアールエヌエー，インコーポレイテッド ‘ｈｓｐ７０相互作用タンパク質ｃ末端’（ｃｈｉｐ）に対する天然アンチセンス転写産物の阻害によるｃｈｉｐ関連疾患の治療
JP5964232B2 (ja) 2009-08-25 2016-08-03 カッパーアールエヌエー，インコーポレイテッド ‘ｉｑモチーフ含有ｇｔｐアーゼ活性化タンパク質’（ｉｑｇａｐ）に対する天然アンチセンス転写産物の阻害によるｉｑｇａｐ関連疾患の治療
JP6175236B2 (ja) 2009-09-25 2017-08-09 カッパーアールエヌエー，インコーポレイテッド フィラグリン（ｆｌｇ）の発現および活性の調整によるｆｌｇ関連疾患の処置
JPWO2011052715A1 (ja) 2009-10-30 2013-03-21 第一三共株式会社 修飾２本鎖ポリヌクレオチド
US20110110860A1 (en) 2009-11-02 2011-05-12 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Modulation of ldl receptor gene expression with double-stranded rnas targeting the ldl receptor gene promoter
US8710209B2 (en) 2009-12-09 2014-04-29 Nitto Denko Corporation Modulation of HSP47 expression
WO2011072091A1 (en) 2009-12-09 2011-06-16 Quark Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating diseases, disorders or injury of the cns
DK2513310T3 (en) 2009-12-16 2018-02-05 Curna Inc TREATMENT OF DISEASES CONNECTED WITH MEMBRANE-BONDED TRANSCRIPTION FACTOR Peptidase, site 1 (MBTPS1), BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENCE TRANSCRIPTION TO MBTPS1
DK2516648T3 (en) 2009-12-23 2018-02-12 Curna Inc TREATMENT OF HEPATOCYTE GROWTH FACTOR (HGF) RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPT AGAINST HGF
EP2515947B1 (en) 2009-12-23 2021-10-06 CuRNA, Inc. Treatment of uncoupling protein 2 (ucp2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to ucp2
JP5993744B2 (ja) 2009-12-29 2016-09-14 カッパーアールエヌエー，インコーポレイテッド 核呼吸因子１（ｎｒｆ１）に対する天然アンチセンス転写物の阻害による核呼吸因子１関連疾患の治療
EP2519634B1 (en) 2009-12-29 2016-06-01 CuRNA, Inc. TREATMENT OF TUMOR PROTEIN 63 (p63) RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPT TO p63
US20120289583A1 (en) 2009-12-31 2012-11-15 Curna, Inc. Treatment of insulin receptor substrate 2 (irs2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to irs2 and transcription factor e3 (tfe3)
EP2521784B1 (en) 2010-01-04 2017-12-06 CuRNA, Inc. Treatment of interferon regulatory factor 8 (irf8) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to irf8
EP2521785B1 (en) 2010-01-06 2022-03-09 CuRNA, Inc. Inhibition of natural antisense transcript to a pancreatic developmental gene for use in a treatment of pancreatic developmental gene related diseases
WO2011084193A1 (en) 2010-01-07 2011-07-14 Quark Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide compounds comprising non-nucleotide overhangs
WO2011085102A1 (en) 2010-01-11 2011-07-14 Isis Pharmaceuticals, Inc. Base modified bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
ES2664866T3 (es) 2010-01-11 2018-04-23 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con la globulina fijadora de hormonas sexuales (shbg) mediante inhibición del transcrito antisentido natural a shbg
DK2529015T3 (en) 2010-01-25 2018-02-26 Curna Inc TREATMENT OF RNASE H1-RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPT TO RNASE H1
US9574191B2 (en) 2010-02-03 2017-02-21 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Selective inhibition of polyglutamine protein expression
CA2790506A1 (en) 2010-02-22 2011-08-25 Curna, Inc. Treatment of pyrroline-5-carboxylate reductase 1 (pycr1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to pycr1
BR112012022946A2 (pt) 2010-03-12 2017-02-07 Daiichi Sankyo Co Ltd método para proliferar cardiomiócitos usando micro-rna
US9193752B2 (en) 2010-03-17 2015-11-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. 5′-substituted bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
EP3578183B1 (en) 2010-03-24 2021-09-08 Phio Pharmaceuticals Corp. Rna interference in ocular indications
WO2011119887A1 (en) 2010-03-24 2011-09-29 Rxi Pharmaceuticals Corporation Rna interference in dermal and fibrotic indications
RU2615143C2 (ru) 2010-03-24 2017-04-04 Адвирна Самодоставляющие PHKi соединения уменьшенного размера
CA2795145C (en) 2010-04-02 2019-01-22 Curna, Inc. Treatment of colony-stimulating factor 3 (csf3) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to csf3
TWI644675B (zh) 2010-04-09 2018-12-21 可娜公司 藉由抑制纖維母細胞生長因子２１（ｆｇｆ２１）之天然反義轉錄物以治療ｆｇｆ２１相關疾病
EP2601204B1 (en) 2010-04-28 2016-09-07 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modified nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
KR20130101442A (ko) 2010-05-03 2013-09-13 큐알엔에이, 인크. 시르투인 (sirt)에 대한 자연 안티센스 전사체의 저해에 의한 시르투인 (sirt) 관련된 질환의 치료
TWI531370B (zh) 2010-05-14 2016-05-01 可娜公司 藉由抑制ｐａｒ４天然反股轉錄本治療ｐａｒ４相關疾病
JP5973996B2 (ja) 2010-05-26 2016-08-23 カッパーアールエヌエー，インコーポレイテッド Ａｔｏｈ１に対する天然アンチセンス転写物の阻害による無調ホモログ１（ａｔｏｈ１）関連疾患の治療
RU2620978C2 (ru) 2010-05-26 2017-05-30 Курна, Инк. Лечение заболеваний, связанных с метионинсульфоксидредуктазой а (msra), путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта гена msra
US8957200B2 (en) 2010-06-07 2015-02-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
RU2016118528A (ru) 2010-06-23 2018-10-31 Курна, Инк. Лечение заболеваний, связанных с альфа-субъединицей потенциалзависимого натриевого канала (scna), путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта гена scna
RU2611190C2 (ru) 2010-07-14 2017-02-21 Курна, Инк. Лечение заболеваний, связанных с геном dlg, путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта гена dlg
EP2412724A1 (en) 2010-07-29 2012-02-01 Centre National de la Recherche Scientifique (C.N.R.S) Regulation of Glypican 4 activity to modulate the fate of stem cells and uses thereof
US8993533B2 (en) 2010-10-06 2015-03-31 Curna, Inc. Treatment of sialidase 4 (NEU4) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to NEU4
US9222088B2 (en) 2010-10-22 2015-12-29 Curna, Inc. Treatment of alpha-L-iduronidase (IDUA) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to IDUA
US10000752B2 (en) 2010-11-18 2018-06-19 Curna, Inc. Antagonat compositions and methods of use
KR102010598B1 (ko) 2010-11-23 2019-08-13 큐알엔에이, 인크. Nanog에 대한 자연 안티센스 전사체의 저해에 의한 nanog 관련된 질환의 치료
WO2012074038A1 (ja) 2010-12-02 2012-06-07 第一三共株式会社 修飾１本鎖ポリヌクレオチド
US10017764B2 (en) 2011-02-08 2018-07-10 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof
US9796979B2 (en) 2011-03-03 2017-10-24 Quark Pharmaceuticals Inc. Oligonucleotide modulators of the toll-like receptor pathway
US9487778B2 (en) 2011-03-03 2016-11-08 Quark Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide modulators of the toll-like receptor pathway
JP6000287B2 (ja) 2011-03-03 2016-09-28 クォーク ファーマシューティカルズ インコーポレーティッドＱｕａｒｋ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ． 肺疾患および損傷を治療するための組成物および方法
TWI658830B (zh) 2011-06-08 2019-05-11 日東電工股份有限公司 Ｈｓｐ47表現調控強化用類視色素脂質體
US10196637B2 (en) 2011-06-08 2019-02-05 Nitto Denko Corporation Retinoid-lipid drug carrier
CN103620036B (zh) 2011-06-09 2016-12-21 库尔纳公司 通过抑制共济蛋白(fxn)的天然反义转录物而治疗fxn 相关疾病
EP2643460B1 (en) * 2011-06-15 2017-07-26 Grifols Therapeutics Inc. Methods, compositions, and kits for determining human immunodeficiency virus (hiv)
EP2742136B1 (en) 2011-08-11 2017-09-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Gapped oligomeric compounds comprising 5'-modified deoxyribonucleosides in the gap and uses thereof
EA029151B1 (ru) 2011-09-06 2018-02-28 Курна, Инк. ЛЕЧЕНИЕ ЗАБОЛЕВАНИЙ, СВЯЗАННЫХ С АЛЬФА-СУБЪЕДИНИЦАМИ ПОТЕНЦИАЛЗАВИСИМЫХ НАТРИЕВЫХ КАНАЛОВ (SCNxA), С ПОМОЩЬЮ МАЛЫХ МОЛЕКУЛ
DK2756080T3 (da) 2011-09-14 2019-05-20 Translate Bio Ma Inc Multimeriske oligonukleotidforbindelser
JP6118331B2 (ja) 2011-11-03 2017-04-19 クォーク ファーマシューティカルズ インコーポレーティッドＱｕａｒｋ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ． 神経保護のための方法および組成物
US10557136B2 (en) 2011-12-12 2020-02-11 Oncolmmunin Inc. In vivo delivery of oligonucleotides
WO2013119602A1 (en) 2012-02-06 2013-08-15 President And Fellows Of Harvard College Arrdc1-mediated microvesicles (armms) and uses thereof
HUE040179T2 (hu) 2012-03-15 2019-02-28 Curna Inc Agyi eredetû neutrotróf faktorral (Brain-derived neurotrophic factor, BDNF) összefüggõ betegségek kezelése a BDNF-fel kapcsolatos természetes antiszensz transzkriptumok gátlása révén
WO2013148260A1 (en) 2012-03-30 2013-10-03 Washington University Methods for modulating tau expression for reducing seizure and modifying a neurodegenerative syndrome
EP2850092B1 (en) 2012-04-09 2017-03-01 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Tricyclic nucleic acid analogs
WO2013154799A1 (en) 2012-04-09 2013-10-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. Tricyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
EP2839006B1 (en) 2012-04-20 2018-01-03 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof
US10837014B2 (en) 2012-05-16 2020-11-17 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for modulating SMN gene family expression
CA2873779A1 (en) 2012-05-16 2013-11-21 Rana Therapeutics Inc. Compositions and methods for modulating mecp2 expression
EA201492123A1 (ru) 2012-05-16 2015-10-30 Рана Терапьютикс, Инк. Композиции и способы для модулирования экспрессии семейства генов smn
JP2015518714A (ja) 2012-05-16 2015-07-06 ラナ セラピューティクス インコーポレイテッド 遺伝子発現を調節するための組成物及び方法
JP2013256452A (ja) * 2012-06-11 2013-12-26 Kawaken Fine Chem Co Ltd メラニン産生抑制剤とその組成物
TW201402594A (zh) * 2012-06-18 2014-01-16 Daiichi Sankyo Co Ltd 核苷類似物的製造中間體及其製造方法
EP2897633B1 (en) 2012-09-18 2020-01-01 UTI Limited Partnership Treatment of pain by inhibition of usp5 de-ubiquitinase
WO2014059353A2 (en) 2012-10-11 2014-04-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleosides and uses thereof
US9029335B2 (en) 2012-10-16 2015-05-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Substituted 2′-thio-bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
US20150299803A1 (en) 2012-11-05 2015-10-22 Pronai Therapeutics, Inc. Methods of Using Biomarkers for the Treatment of Cancer by Modulation of BCL2 Expression
US10398661B2 (en) 2013-02-28 2019-09-03 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Methods for classifying a cancer as susceptible to TMEPAI-directed therapies and treating such cancers
WO2014143158A1 (en) 2013-03-13 2014-09-18 The Broad Institute, Inc. Compositions and methods for labeling of agents
ES2807379T3 (es) 2013-03-14 2021-02-22 Ionis Pharmaceuticals Inc Composiciones y métodos para regular la expresión de Tau
US9273349B2 (en) 2013-03-14 2016-03-01 Affymetrix, Inc. Detection of nucleic acids
US9822418B2 (en) 2013-04-22 2017-11-21 Icahn School Of Medicine At Mount Sinai Mutations in PDGFRB and NOTCH3 as causes of autosomal dominant infantile myofibromatosis
EP2992009B1 (en) 2013-05-01 2020-06-24 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for modulating apolipoprotein (a) expression
TWI657819B (zh) * 2013-07-19 2019-05-01 美商Ionis製藥公司 用於調節τ蛋白表現之組合物
JP2016534035A (ja) 2013-10-04 2016-11-04 ラナ セラピューティクス インコーポレイテッド 筋萎縮性側索硬化症を治療するための組成物及び方法
US11162096B2 (en) 2013-10-14 2021-11-02 Ionis Pharmaceuticals, Inc Methods for modulating expression of C9ORF72 antisense transcript
WO2015075166A1 (en) 2013-11-22 2015-05-28 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and pharmaceutical compositions for treatment of a bacterial infection
EP3079707A4 (en) 2013-12-02 2017-10-18 RXi Pharmaceuticals Corporation Immunotherapy of cancer
EP3099798B1 (en) 2014-01-29 2018-06-27 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Oligonucleotides and methods for inhibiting or reducing bacterial biofilms
WO2015153800A2 (en) 2014-04-01 2015-10-08 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions for modulating sod-1 expression
WO2015168172A1 (en) 2014-04-28 2015-11-05 Isis Pharmaceuticals, Inc. Linkage modified oligomeric compounds
CA2947270A1 (en) 2014-04-28 2015-11-05 Rxi Pharmaceuticals Corporation Methods for treating cancer using nucleic acids targeting mdm2 or mycn
ES2745825T3 (es) 2014-05-01 2020-03-03 Ionis Pharmaceuticals Inc Composiciones y métodos para modular la expresión del factor B del complemento
GB201410693D0 (en) 2014-06-16 2014-07-30 Univ Southampton Splicing modulation
TW201620526A (zh) 2014-06-17 2016-06-16 愛羅海德研究公司 用於抑制α－１抗胰蛋白酶基因表現之組合物及方法
WO2016017422A1 (ja) * 2014-07-31 2016-02-04 国立大学法人大阪大学 架橋型ヌクレオシドおよびヌクレオチド
IL234246A0 (en) 2014-08-21 2014-11-30 Omrix Biopharmaceuticals Ltd Stabilized thrombin
US10900039B2 (en) 2014-09-05 2021-01-26 Phio Pharmaceuticals Corp. Methods for treating aging and skin disorders using nucleic acids targeting Tyr or MMP1
JP6867945B2 (ja) 2014-10-03 2021-05-12 コールド スプリング ハーバー ラボラトリー 核内遺伝子出力の標的とされた増強
US9816080B2 (en) 2014-10-31 2017-11-14 President And Fellows Of Harvard College Delivery of CAS9 via ARRDC1-mediated microvesicles (ARMMs)
EP3234141A4 (en) 2014-12-18 2018-06-20 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Reversir tm compounds
US9688707B2 (en) 2014-12-30 2017-06-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic morpholino compounds and oligomeric compounds prepared therefrom
US10793855B2 (en) 2015-01-06 2020-10-06 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions for modulating expression of C9ORF72 antisense transcript
US10407678B2 (en) 2015-04-16 2019-09-10 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions for modulating expression of C9ORF72 antisense transcript
US10808247B2 (en) 2015-07-06 2020-10-20 Phio Pharmaceuticals Corp. Methods for treating neurological disorders using a synergistic small molecule and nucleic acids therapeutic approach
JP6983752B2 (ja) 2015-07-06 2021-12-17 フィオ ファーマシューティカルズ コーポレーションPhio Pharmaceuticals Corp. スーパーオキシドディスムターゼ１（ｓｏｄ１）を標的とする核酸分子
US11053495B2 (en) 2015-07-17 2021-07-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Multi-targeted single entity conjugates
CN107922945A (zh) 2015-08-24 2018-04-17 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 Lna‑g 方法
WO2017060731A1 (en) 2015-10-09 2017-04-13 University Of Southampton Modulation of gene expression and screening for deregulated protein expression
WO2017070151A1 (en) 2015-10-19 2017-04-27 Rxi Pharmaceuticals Corporation Reduced size self-delivering nucleic acid compounds targeting long non-coding rna
WO2017068087A1 (en) 2015-10-22 2017-04-27 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotide detection method
EP3371211A4 (en) 2015-11-04 2019-08-21 Icahn School of Medicine at Mount Sinai METHOD FOR THE TREATMENT OF TUMORS AND CANCER AND IDENTIFICATION OF CANDIDATE PATIENTS FOR SUCH TREATMENT
CA3004799C (en) 2015-11-12 2024-05-14 F. Hoffmann-La Roche Ag Oligonucleotides for inducing paternal ube3a expression
WO2017096395A1 (en) 2015-12-04 2017-06-08 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods of treating breast cancer
EP3933041B1 (en) 2015-12-14 2024-01-31 Cold Spring Harbor Laboratory Antisense oligomers for treatment of autosomal dominant retardation
US11096956B2 (en) 2015-12-14 2021-08-24 Stoke Therapeutics, Inc. Antisense oligomers and uses thereof
AU2017235278C1 (en) 2016-03-14 2022-03-10 F. Hoffmann-La Roche Ag Oligonucleotides for reduction of PD-L1 expression
AU2017234678A1 (en) 2016-03-16 2018-08-16 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods of modulating KEAP1
US10577607B2 (en) 2016-03-16 2020-03-03 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of DYRK1B expression
WO2017178656A1 (en) 2016-04-14 2017-10-19 Roche Innovation Center Copenhagen A/S TRITYL-MONO-GalNAc COMPOUNDS AND THEIR USE
WO2017189730A1 (en) 2016-04-26 2017-11-02 Icahn School Of Medicine At Mount Sinai Treatment of hippo pathway mutant tumors and methods of identifying subjects as candidates for treatment
AU2017286811A1 (en) 2016-06-17 2018-11-22 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of gys1 expression
MA45496A (fr) 2016-06-17 2019-04-24 Hoffmann La Roche Molécules d'acide nucléique pour la réduction de l'arnm de padd5 ou pad7 pour le traitement d'une infection par l'hépatite b
EP3478839A1 (en) 2016-07-01 2019-05-08 H. Hoffnabb-La Roche Ag Antisense oligonucleotides for modulating htra1 expression
EP3507367A4 (en) 2016-07-05 2020-03-25 Aduro BioTech, Inc. CYCLIC DINUCLEOTID COMPOUNDS WITH INCLUDED NUCLEIC ACIDS AND USES THEREOF
US11253601B2 (en) 2016-07-11 2022-02-22 Translate Bio Ma, Inc. Nucleic acid conjugates and uses thereof
CA3037042A1 (en) 2016-09-14 2018-03-22 Janssen Biopharma, Inc. Modified oligonucleotides and methods of use
JOP20190065A1 (ar) 2016-09-29 2019-03-28 Ionis Pharmaceuticals Inc مركبات وطرق لتقليل التعبير عن tau
US11730823B2 (en) 2016-10-03 2023-08-22 President And Fellows Of Harvard College Delivery of therapeutic RNAs via ARRDC1-mediated microvesicles
US20190284621A1 (en) 2016-11-11 2019-09-19 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Therapeutic oligonucleotides capture and detection
US11033570B2 (en) 2016-12-02 2021-06-15 Cold Spring Harbor Laboratory Modulation of Lnc05 expression
CA3047894A1 (en) 2016-12-28 2018-07-05 Daiichi Sankyo Company, Limited Therapeutic drug for alport's syndrome
JOP20180003B1 (ar) 2017-01-10 2022-09-15 Arrowhead Pharmaceuticals Inc عوامل RNAi ألفا-1 مضادة للتريبسين (AAT)، وتركيبات تتضمن عوامل AAT RNAi، وطرق الاستخدام
US20190338286A1 (en) 2017-01-13 2019-11-07 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating rel expression
US20200216845A1 (en) 2017-01-13 2020-07-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating rela expression
EP3568481A1 (en) 2017-01-13 2019-11-20 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating relb expression
EP3568479A1 (en) 2017-01-13 2019-11-20 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating nfkb1 expression
EP3568480A1 (en) 2017-01-13 2019-11-20 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating nfkb2 expression
US11180756B2 (en) 2017-03-09 2021-11-23 Ionis Pharmaceuticals Morpholino modified oligomeric compounds
EP3594346A4 (en) 2017-03-10 2020-12-16 National Center For Child Health And Development ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDE AND COMPOSITION FOR THE PREVENTION OR TREATMENT OF GLYCOGEN STORAGE DISEASE TYPE IA
US11795192B2 (en) 2017-03-10 2023-10-24 Lakewood Amedex, Inc. Antimicrobial compounds, compositions, and uses thereof
US11377468B2 (en) 2017-03-10 2022-07-05 Lakewood Amedex, Inc. Antimicrobial compounds, compositions, and uses thereof
BR112019018615B1 (pt) * 2017-03-10 2021-11-16 Lakewood Amedex, Inc. Composto antimicrobiano e sua composiqao farmaceutica
WO2018169063A1 (ja) 2017-03-17 2018-09-20 国立大学法人千葉大学 構造強化されたＳ－ＴｕＤを用いた新規がん治療法
JP7246729B2 (ja) 2017-05-18 2023-03-28 国立大学法人京都大学 脊髄小脳変性症３６型の予防又は治療用組成物
US20190055564A1 (en) 2017-06-01 2019-02-21 F. Hoffmann-La Roche Ag Antisense oligonucleotides for modulating htra1 expression
JPWO2019009299A1 (ja) 2017-07-05 2020-05-07 国立大学法人大阪大学 α−シヌクレイン発現抑制するＥＮＡアンチセンスオリゴヌクレオチド
EP3653711A4 (en) 2017-07-10 2021-07-14 Osaka University ANTI-SENSE OLIGONUCLEOTIDE REGULATING THE LEVEL OF TDP-43 EXPRESSION AND ITS USE
WO2019030313A2 (en) 2017-08-11 2019-02-14 Roche Innovation Center Copenhagen A/S OLIGONUCLEOTIDES FOR MODULATION OF UBE3C EXPRESSION
EP3668984A4 (en) 2017-08-18 2021-09-08 Ionis Pharmaceuticals, Inc. MODULATION OF THE NOTCH SIGNALING PATH FOR THE TREATMENT OF RESPIRATORY DISORDERS
WO2019038228A1 (en) 2017-08-22 2019-02-28 Roche Innovation Center Copenhagen A/S OLIGONUCLEOTIDES FOR MODULATION OF TOM1 EXPRESSION
PL3673080T3 (pl) 2017-08-25 2024-03-11 Stoke Therapeutics, Inc. Oligomery antysensowne do leczenia stanów i chorób
WO2019051173A1 (en) 2017-09-08 2019-03-14 Ionis Pharmaceuticals, Inc. MODULATORS OF SMAD7 EXPRESSION
AU2018332216B2 (en) 2017-09-14 2024-05-02 Janssen Biopharma, Inc. Galnac derivatives
WO2019073018A1 (en) 2017-10-13 2019-04-18 Roche Innovation Center Copenhagen A/S METHODS OF IDENTIFYING ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDE IMPROVED OLIGONUCLEOTIDE PHOSPHOROTHIOATE STEREODEFINIS VARIANTS USING PARTIALLY STEREODEFINIS OLIGONUCLEOTIDE SUB LIBRARIES
US10953034B2 (en) 2017-10-16 2021-03-23 Hoffmann-La Roche Inc. Nucleic acid molecule for reduction of PAPD5 and PAPD7 mRNA for treating hepatitis B infection
US11261445B2 (en) 2017-10-17 2022-03-01 Inserm (Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale) Combination treatment for cystic fibrosis
WO2019111791A1 (ja) * 2017-12-07 2019-06-13 第一三共株式会社 ジストロフィン遺伝子のイントロンリテンションを解消するアンチセンスオリゴヌクレオチド
JP2021505175A (ja) 2017-12-11 2021-02-18 ロシュ イノベーション センター コペンハーゲン エーエス Ｆｎｄｃ３ｂの発現を調節するためのオリゴヌクレオチド
WO2019115417A2 (en) 2017-12-12 2019-06-20 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating rb1 expression
CA3085211A1 (en) 2017-12-21 2019-06-27 F. Hoffmann-La Roche Ag Companion diagnostic for htra1 rna antagonists
JP2021508327A (ja) 2017-12-22 2021-03-04 ロシュ イノベーション センター コペンハーゲン エーエス 新規のチオホスホラミダイト
JP7476101B2 (ja) 2017-12-22 2024-04-30 ロシュ イノベーション センター コペンハーゲン エーエス ホスホロジチオアートヌクレオシド間結合を含むギャップマーオリゴヌクレオチド
TW201929870A (zh) 2017-12-22 2019-08-01 丹麥商羅氏創新中心哥本哈根有限公司 包含二硫代磷酸酯核苷間連結之寡核苷酸
EP3737758A1 (en) 2018-01-10 2020-11-18 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating pias4 expression
MX2020006973A (es) 2018-01-12 2020-09-09 Roche Innovation Ct Copenhagen As Oligonucleotidos antisentido para alfa-sinucleina y usos de los mismos.
US20210095275A1 (en) 2018-01-12 2021-04-01 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating gsk3b expression
CA3088112A1 (en) 2018-01-12 2019-07-18 Bristol-Myers Squibb Company Antisense oligonucleotides targeting alpha-synuclein and uses thereof
AU2019208011A1 (en) 2018-01-12 2020-07-23 Bristol-Myers Squibb Company Antisense oligonucleotides targeting alpha-synuclein and uses thereof
EP3740574A1 (en) 2018-01-17 2020-11-25 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating erc1 expression
US20210095277A1 (en) 2018-01-18 2021-04-01 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting srebp1
WO2019145386A1 (en) 2018-01-26 2019-08-01 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating csnk1d expression
RU2020125769A (ru) 2018-02-09 2022-03-10 Дженентек, Инк. Олигонуклеотиды для модуляции экспрессии tmem106b
SG11202007652UA (en) 2018-02-21 2020-09-29 Bristol Myers Squibb Co Camk2d antisense oligonucleotides and uses thereof
CN111511915A (zh) 2018-03-09 2020-08-07 第一三共株式会社 糖原病Ia型治疗药
BR112020018365A2 (pt) 2018-03-13 2020-12-29 Janssen Pharmaceutica Nv Oligonucleotídeos modificados e métodos para uso em tauopatias
PE20211912A1 (es) 2018-04-05 2021-09-28 Centre Nat Rech Scient Uso de inhibidores de fubp1 para el tratamiento de infeccion de virus de hepatitis b
WO2019215067A1 (en) 2018-05-07 2019-11-14 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Massively parallel discovery methods for oligonucleotide therapeutics
KR20210018267A (ko) 2018-05-07 2021-02-17 알닐람 파마슈티칼스 인코포레이티드 간외 전달
WO2019215175A1 (en) 2018-05-08 2019-11-14 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating myh7 expression
EP3793685A1 (en) 2018-05-18 2021-03-24 F. Hoffmann-La Roche AG Pharmaceutical compositions for treatment of microrna related diseases
WO2019224172A1 (en) 2018-05-25 2019-11-28 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Novel process for making allofuranose from glucofuranose
WO2019233921A1 (en) 2018-06-05 2019-12-12 F. Hoffmann-La Roche Ag Oligonucleotides for modulating atxn2 expression
EP3816286A4 (en) 2018-06-13 2022-04-20 Daiichi Sankyo Company, Limited THERAPEUTIC AGENT FOR MYOCARDIC DYSFUNCTION
US20210260002A1 (en) 2018-06-18 2021-08-26 University Of Rochester Methods of treating schizophrenia and other neuropsychiatric disorders
CN112654366A (zh) 2018-06-21 2021-04-13 罗切斯特大学 治疗或抑制亨廷顿病发作的方法
WO2020007772A1 (en) 2018-07-02 2020-01-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting gbp-1
WO2020007702A1 (en) 2018-07-02 2020-01-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting bcl2l11
WO2020007700A1 (en) 2018-07-02 2020-01-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting spi1
CR20210179A (es) 2018-07-03 2022-05-23 Hoffmann La Roche OLIGONUCLEÓTIDOS PARA MODULAR LA EXPRESIÓN DE TAU (Divisional 2021-0058)
EP3819378A4 (en) 2018-07-04 2022-09-14 Aichi Medical University OLIGONUCLEOTIDES FOR CONTROL OF TAU SPLICING AND THEIR USES
WO2020007826A1 (en) 2018-07-05 2020-01-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting mbtps1
WO2020007889A1 (en) 2018-07-05 2020-01-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting stat1
WO2020011653A1 (en) 2018-07-09 2020-01-16 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting kynu
WO2020011743A1 (en) 2018-07-09 2020-01-16 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting mafb
WO2020011869A2 (en) 2018-07-11 2020-01-16 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting tlr2
WO2020011744A2 (en) 2018-07-11 2020-01-16 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting cers5
WO2020011745A2 (en) 2018-07-11 2020-01-16 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting cers6
MX2021000404A (es) 2018-07-13 2021-03-25 Hoffmann La Roche Oligonucleotidos para modular la expresion de rtel1.
ES2924362T3 (es) 2018-07-31 2022-10-06 Roche Innovation Ct Copenhagen As Oligonucleótidos que comprenden un enlace internucleosídico fosforotritioato
EP3830101A1 (en) 2018-07-31 2021-06-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides comprising a phosphorotrithioate internucleoside linkage
US12018087B2 (en) 2018-08-02 2024-06-25 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle-targeting complexes comprising an anti-transferrin receptor antibody linked to an oligonucleotide and methods of delivering oligonucleotide to a subject
US11911484B2 (en) 2018-08-02 2024-02-27 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and uses thereof for treating myotonic dystrophy
WO2020038976A1 (en) 2018-08-23 2020-02-27 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting usp8
WO2020038973A1 (en) 2018-08-23 2020-02-27 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting sptlc1
JP7499754B2 (ja) 2018-08-23 2024-06-14 ロシュ・イノベーション・センター・コペンハーゲン・アクティーゼルスカブ Ｍｉｃｒｏｒｎａ－１３４バイオマーカー
WO2020038971A1 (en) 2018-08-23 2020-02-27 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting vcan
WO2020043750A1 (en) 2018-08-28 2020-03-05 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Neoantigen engineering using splice modulating compounds
EP3620519A1 (en) 2018-09-04 2020-03-11 F. Hoffmann-La Roche AG Use of isolated milk extracellular vesicles for delivering oligonucleotides orally
JP7470107B2 (ja) 2018-09-28 2024-04-17 アルナイラム ファーマシューティカルズ， インコーポレイテッド トランスサイレチン（ＴＴＲ）ｉＲＮＡ組成物及びＴＴＲ関連眼疾患を治療又は予防するためのその使用方法
AU2019361999A1 (en) 2018-10-17 2021-02-25 Lakewood Amedex, Inc. Methods and compositions for treating oral mucositis
WO2020089260A1 (en) 2018-11-01 2020-05-07 F. Hoffmann-La Roche Ag Antisense oligonucleotides targeting tia1
TW202028222A (zh) 2018-11-14 2020-08-01 美商Ionis製藥公司 Foxp3表現之調節劑
EP3880821A4 (en) 2018-11-15 2023-01-25 Ionis Pharmaceuticals, Inc. IRF5 EXPRESSION MODULATORS
EP3883941A1 (en) 2018-11-22 2021-09-29 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Pyridinium salts as activators in the synthesis of stereodefined oligonucleotides
WO2020109343A1 (en) 2018-11-29 2020-06-04 F. Hoffmann-La Roche Ag Combination therapy for treatment of macular degeneration
WO2020109344A1 (en) 2018-11-29 2020-06-04 F. Hoffmann-La Roche Ag Occular administration device for antisense oligonucleotides
CN113728103A (zh) 2018-12-11 2021-11-30 罗切斯特大学 治疗精神分裂症和其他神经精神病症的方法
EP3898975A2 (en) 2018-12-21 2021-10-27 Boehringer Ingelheim International GmbH Antisense oligonucleotides targeting card9
EP3914232A1 (en) 2019-01-25 2021-12-01 F. Hoffmann-La Roche AG Lipid vesicle for oral drug delivery
CA3128093A1 (en) 2019-01-31 2020-08-06 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulators of yap1 expression
US20230057355A1 (en) 2019-02-13 2023-02-23 University Of Rochester Gene networks that mediate remyelination of the human brain
CA3129646A1 (en) 2019-02-20 2020-08-27 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Novel phosphoramidites
TW202102516A (zh) 2019-02-20 2021-01-16 丹麥商羅氏創新中心哥本哈根有限公司 膦醯基乙酸酯間隙子寡核苷酸
JP7503072B2 (ja) 2019-02-26 2024-06-19 ロシュ イノベーション センター コペンハーゲン エーエス オリゴヌクレオチドの製剤化方法
MX2021010152A (es) 2019-02-27 2021-09-14 Ionis Pharmaceuticals Inc Moduladores de la expresion de malat1.
CN113507942A (zh) 2019-03-05 2021-10-15 豪夫迈·罗氏有限公司 分子的细胞内靶向
CA3133314A1 (en) 2019-03-21 2020-09-24 Codiak Biosciences, Inc. Extracellular vesicle conjugates and uses thereof
EP3967328A4 (en) 2019-03-29 2022-12-28 Sysmex Corporation NEW ARTIFICIAL NUCLEIC ACID, PROCESS FOR THEIR PRODUCTION AND ITS USE
EA202192733A1 (ru) 2019-04-03 2022-03-14 Бристол-Маерс Сквибб Компани Антисмысловые олигонуклеотиды angptl2 и их применения
US11286485B2 (en) 2019-04-04 2022-03-29 Hoffmann-La Roche Inc. Oligonucleotides for modulating ATXN2 expression
EP3947677A1 (en) 2019-04-04 2022-02-09 F. Hoffmann-La Roche AG Oligonucleotides for modulating atxn2 expression
CN113661168A (zh) 2019-04-16 2021-11-16 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 用于制备核苷酸p(v)单体的新方法
JP2022530537A (ja) 2019-04-30 2022-06-29 ロシュ イノベーション センター コペンハーゲン エーエス レニウムキレート化ｍａｇ３オリゴヌクレオチドを調製するための新規の方法
JP2022530678A (ja) 2019-05-03 2022-06-30 ディセルナ ファーマシューティカルズ インコーポレイテッド 短縮センス鎖を有する二本鎖核酸阻害剤分子
WO2020236600A1 (en) 2019-05-17 2020-11-26 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Oral delivery of oligonucleotides
CN113950529A (zh) 2019-06-06 2022-01-18 豪夫迈·罗氏有限公司 靶向atxn3的反义寡核苷酸
WO2020256084A1 (ja) * 2019-06-19 2020-12-24 ヤマサ醤油株式会社 架橋型ヌクレオシド中間体の結晶及びその製造方法、並びに架橋型ヌクレオシドアミダイトの製造方法
US20220220478A1 (en) 2019-06-26 2022-07-14 Knc Laboratories Co., Ltd. Nucleic acid drug suppressing production of myostatin gene mrna
US20220251567A1 (en) 2019-07-10 2022-08-11 Inserm (Institut National De La Santè Et De La Recherche Médicale) Methods for the treatment of epilepsy
EP3998108A1 (en) 2019-07-12 2022-05-18 Daiichi Sankyo Company, Limited Antisense oligonucleotide capable of altering splicing of dux4 pre-mrna
WO2021011936A2 (en) 2019-07-18 2021-01-21 University Of Rochester Cell-type selective immunoprotection of cells
EP3956450A4 (en) 2019-07-26 2022-11-16 Ionis Pharmaceuticals, Inc. COMPOUNDS AND METHODS FOR MODULATION OF GFAP
US20230193274A1 (en) 2019-08-14 2023-06-22 Codiak Biosciences, Inc. Extracellular vesicles with stat3-antisense oligonucleotides
CN114728078A (zh) 2019-08-14 2022-07-08 科迪亚克生物科学公司 与分子连接的细胞外囊泡及其用途
US20230132093A1 (en) 2019-08-14 2023-04-27 Codiak Biosciences, Inc. Extracellular vesicle-nlrp3 antagonist
WO2021030776A1 (en) 2019-08-14 2021-02-18 Codiak Biosciences, Inc. Extracellular vesicle-aso constructs targeting stat6
JP2022544290A (ja) 2019-08-14 2022-10-17 コディアック バイオサイエンシーズ， インコーポレイテッド Ｋｒａｓを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを有する細胞外小胞
AU2020330133A1 (en) 2019-08-14 2022-03-17 Lonza Sales Ag Extracellular vesicle-ASO constructs targeting CEBP/beta
WO2021030778A1 (en) 2019-08-15 2021-02-18 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Linkage modified oligomeric compounds and uses thereof
AU2020345317A1 (en) 2019-09-10 2022-04-21 Daiichi Sankyo Company, Limited CONJUGATE OF GalNAc-OLIGONUCLEOTIDE FOR DELIVERY TO LIVER AND MANUFACTURING METHOD THEREOF
US20230241089A1 (en) 2019-09-25 2023-08-03 Codiak Biosciences, Inc. Sting agonist comprising exosomes for treating neuroimmunological disorders
WO2021074657A1 (en) 2019-10-17 2021-04-22 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Combination treatment for cystic fibrosis
EP4047005A4 (en) * 2019-10-18 2024-03-06 Daiichi Sankyo Company, Limited PROCESS FOR MANUFACTURING BICYCLIC PHOSPHORAMIDITE
CN111109591A (zh) 2019-10-25 2020-05-08 新疆红旗坡农业发展集团有限公司 肠道微生态高效重建型苹果酵素及加工技术
AU2020378414A1 (en) 2019-11-06 2022-05-26 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Extrahepatic delivery
EP4055165A1 (en) 2019-11-06 2022-09-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Transthyretin (ttr) irna compositions and methods of use thereof for treating or preventing ttr-associated ocular diseases
WO2021099394A1 (en) 2019-11-19 2021-05-27 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Antisense oligonucleotides and their use for the treatment of cancer
JP2023506954A (ja) 2019-12-19 2023-02-20 エフ． ホフマン－ラ ロシュ エージー． Ｂ型肝炎ウイルス感染を処置するためのｓａｒａｆ阻害剤の使用
WO2021122735A1 (en) 2019-12-19 2021-06-24 F. Hoffmann-La Roche Ag Use of sept9 inhibitors for treating hepatitis b virus infection
JP2023506540A (ja) 2019-12-19 2023-02-16 エフ． ホフマン－ラ ロシュ エージー． Ｂ型肝炎ウイルス感染を処置するためのｓｃａｍｐ３阻害剤の使用
EP4077669A1 (en) 2019-12-19 2022-10-26 F. Hoffmann-La Roche AG Use of sbds inhibitors for treating hepatitis b virus infection
JP2023506547A (ja) 2019-12-19 2023-02-16 エフ． ホフマン－ラ ロシュ エージー． Ｂ型肝炎ウイルス感染を処置するためのｃｏｐｓ３阻害剤の使用
CN114829603A (zh) 2019-12-20 2022-07-29 豪夫迈·罗氏有限公司 用于抑制scn9a表达的增强寡核苷酸
MX2022007909A (es) 2019-12-24 2022-07-21 Hoffmann La Roche Combinacion farmaceutica de agentes antivirales que actuan sobre hbv y/o un inmunomodulador para el tratamiento de hbv.
EP4081639A1 (en) 2019-12-24 2022-11-02 F. Hoffmann-La Roche AG Pharmaceutical combination of a therapeutic oligonucleotide targeting hbv and a tlr7 agonist for treatment of hbv
WO2021158810A1 (en) 2020-02-05 2021-08-12 Bristol-Myers Squibb Company Oligonucleotides for splice modulation of camk2d
EP4110916A1 (en) 2020-02-28 2023-01-04 F. Hoffmann-La Roche AG Oligonucleotides for modulating cd73 exon 7 splicing
CA3175125A1 (en) 2020-03-11 2021-09-16 Biocomber Co., Ltd. Single-stranded nucleic acid molecule for inducing -1 frameshift and composition
WO2021184020A1 (en) 2020-03-13 2021-09-16 Codiak Biosciences, Inc. Methods of treating neuroinflammation
WO2021184021A1 (en) 2020-03-13 2021-09-16 Codiak Biosciences, Inc. Extracellular vesicle-aso constructs targeting pmp22
AU2021247043A1 (en) 2020-03-31 2022-10-27 Janssen Biopharma, Inc. Synthesis of oligonucleotides and related compounds
EP4150085A1 (en) 2020-05-11 2023-03-22 Genentech, Inc. Complement component c1r inhibitors for treating a neurological disease, and related compositions, systems and methods of using same
WO2021231211A1 (en) 2020-05-11 2021-11-18 Genentech, Inc. Complement component c1s inhibitors for treating a neurological disease, and related compositions, systems and methods of using same
JP2023525770A (ja) 2020-05-11 2023-06-19 ジェネンテック， インコーポレイテッド 神経学的疾患を処置するための補体ｃ４阻害剤および関連する組成物、ならびにそれを使用するシステムおよび方法
KR20230022409A (ko) 2020-05-11 2023-02-15 스톡 테라퓨틱스, 인크. 병태 및 질환의 치료를 위한 opa1 안티센스 올리고머
JP2023526267A (ja) 2020-05-13 2023-06-21 エフ． ホフマン－ラ ロシュ アーゲー プログラニュリン標的オリゴヌクレオチドアゴニスト
CN115884777A (zh) 2020-05-22 2023-03-31 豪夫迈·罗氏有限公司 用于card9的剪接调节的寡核苷酸
EP4162047A1 (en) 2020-06-09 2023-04-12 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Guanosine analogues for use in therapeutic polynucleotides
AR122731A1 (es) 2020-06-26 2022-10-05 Hoffmann La Roche Oligonucleótidos mejorados para modular la expresión de fubp1
WO2022011262A1 (en) 2020-07-10 2022-01-13 Inserm (Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale) Methods and compositions for treating epilepsy
WO2022018155A1 (en) 2020-07-23 2022-01-27 F. Hoffmann-La Roche Ag Lna oligonucleotides for splice modulation of stmn2
CN116209761A (zh) 2020-07-23 2023-06-02 豪夫迈·罗氏有限公司 靶向rna结合蛋白位点的寡核苷酸
CN115916976A (zh) 2020-07-28 2023-04-04 神户天然物化学株式会社 诱导血管紧张素转换酶2基因外显子跳跃的反义核酸
WO2022038211A2 (en) 2020-08-21 2022-02-24 F. Hoffmann-La Roche Ag Use of a1cf inhibitors for treating hepatitis b virus infection
WO2022043531A1 (en) * 2020-08-28 2022-03-03 Janssen Sciences Ireland Unlimited Company 7'-substituted 2'-o-4'-c-ethylene-bridged nucleic acid (ena) monomers and uses thereof
WO2022065413A1 (ja) 2020-09-25 2022-03-31 株式会社理研ジェネシス 新規人工核酸、その製造方法及び用途
US20230364127A1 (en) 2020-10-06 2023-11-16 Codiak Biosciences, Inc. Extracellular vesicle-aso constructs targeting stat6
TW202237843A (zh) 2020-12-03 2022-10-01 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 靶向ａｔｘｎ３之反義寡核苷酸
WO2022117745A1 (en) 2020-12-03 2022-06-09 F. Hoffmann-La Roche Ag Antisense oligonucleotides targeting atxn3
JP2023553069A (ja) 2020-12-08 2023-12-20 エフ． ホフマン－ラ ロシュ アーゲー ホスホロジチオエートオリゴヌクレオチドの新規合成
AR124378A1 (es) 2020-12-18 2023-03-22 Hoffmann La Roche Oligonucleótidos antisentido dirigida a progranulina
CN116670282A (zh) 2020-12-22 2023-08-29 豪夫迈·罗氏有限公司 靶向xbp1的寡核苷酸
WO2022147223A2 (en) 2020-12-31 2022-07-07 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. 2'-modified nucleoside based oligonucleotide prodrugs
JP2024501857A (ja) 2020-12-31 2024-01-16 アルナイラム ファーマシューティカルズ， インコーポレイテッド 環状ジスルフィド修飾リン酸ベースのオリゴヌクレオチドプロドラッグ
CA3202832A1 (en) * 2020-12-31 2022-07-07 Romesh R. Subramanian Muscle targeting complexes and uses thereof for treating myotonic dystrophy
TW202246500A (zh) 2021-02-02 2022-12-01 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 用於抑制 ｒｔｅｌ１ 表現之增強型寡核苷酸
WO2022178180A1 (en) 2021-02-17 2022-08-25 Codiak Biosciences, Inc. Extracellular vesicle linked to a biologically active molecule via an optimized linker and an anchoring moiety
US20240167036A1 (en) 2021-02-17 2024-05-23 Lonza Sales Ag Extracellular vesicle-nlrp3 antagonist
JPWO2022181532A1 (cs) 2021-02-26 2022-09-01
CA3212944A1 (en) 2021-03-31 2022-10-06 Patrick Dougherty Cyclic cell penetrating peptides
CN117120041A (zh) 2021-04-01 2023-11-24 隆萨销售股份有限公司 胞外囊泡组合物
WO2022241408A1 (en) 2021-05-10 2022-11-17 Entrada Therapeutics, Inc. Compositions and methods for modulating tissue distribution of intracellular therapeutics
JP2024518476A (ja) 2021-05-10 2024-05-01 エントラーダ セラピューティクス，インコーポレイティド ｍＲＮＡスプライシングを調節するための組成物及び方法
WO2022240721A1 (en) 2021-05-10 2022-11-17 Entrada Therapeutics, Inc. Compositions and methods for modulating interferon regulatory factor-5 (irf-5) activity
US20220403388A1 (en) 2021-06-08 2022-12-22 Hoffmann-La Roche Inc. Oligonucleotide Progranulin Agonists
KR20240038967A (ko) 2021-06-23 2024-03-26 엔트라다 테라퓨틱스, 인크. Cug 반복을 표적화하기 위한 안티센스 화합물 및 방법
US11633498B2 (en) 2021-07-09 2023-04-25 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and uses thereof for treating myotonic dystrophy
EP4367237A2 (en) 2021-07-09 2024-05-15 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Bis-rnai compounds for cns delivery
IL309897A (en) 2021-07-21 2024-03-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc Target gene IRNA compositions associated with a metabolic disorder and methods of using them
WO2023021046A1 (en) 2021-08-16 2023-02-23 Vib Vzw Oligonucleotides for modulating synaptogyrin-3 expression
EP4389893A1 (en) 2021-08-21 2024-06-26 Takeda Pharmaceutical Company Limited Human transferrin receptor binding peptide-drug conjugate
CA3229661A1 (en) 2021-09-01 2023-03-09 Xiang Li Compounds and methods for skipping exon 44 in duchenne muscular dystrophy
CN118019848A (zh) 2021-09-29 2024-05-10 豪夫迈·罗氏有限公司 Rna编辑
IL311864A (en) 2021-10-15 2024-06-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc IRNA compositions for extrahepatic administration and methods of using them
WO2023078883A1 (en) 2021-11-03 2023-05-11 F. Hoffmann-La Roche Ag Oligonucleotides for modulating apolipoprotein e4 expression
CA3234478A1 (en) 2021-11-11 2023-05-19 Souphalone LUANGSAY Pharmaceutical combinations for treatment of hbv
WO2023104693A1 (en) 2021-12-07 2023-06-15 F. Hoffmann-La Roche Ag Antisense oligonucleotides targeting actl6b
WO2023111210A1 (en) 2021-12-17 2023-06-22 F. Hoffmann-La Roche Ag Combination of oligonucleotides for modulating rtel1 and fubp1
WO2023111336A1 (en) 2021-12-17 2023-06-22 F. Hoffmann-La Roche Ag Oligonucleotide gba agonists
WO2023117738A1 (en) 2021-12-20 2023-06-29 F. Hoffmann-La Roche Ag Threose nucleic acid antisense oligonucleotides and methods thereof
WO2023122762A1 (en) 2021-12-22 2023-06-29 Camp4 Therapeutics Corporation Modulation of gene transcription using antisense oligonucleotides targeting regulatory rnas
WO2023141507A1 (en) 2022-01-20 2023-07-27 Genentech, Inc. Antisense oligonucleotides for modulating tmem106b expression
WO2023150553A1 (en) 2022-02-01 2023-08-10 University Of Rochester Gpr17 promoter-based targeting and transduction of glial progenitor cells
WO2023152369A1 (en) 2022-02-14 2023-08-17 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Nucleic acid mir-9 inhibitor for the treatment of cystic fibrosis
US20240167040A1 (en) 2022-02-21 2024-05-23 Hoffmann-La Roche Inc. Antisense oligonucleotide
US11931421B2 (en) 2022-04-15 2024-03-19 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and formulations for treating myotonic dystrophy
WO2023217890A1 (en) 2022-05-10 2023-11-16 F. Hoffmann-La Roche Ag Antisense oligonucleotides targeting cfp-elk1 intergene region
WO2023220744A2 (en) 2022-05-13 2023-11-16 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Single-stranded loop oligonucleotides
WO2023222858A1 (en) 2022-05-18 2023-11-23 F. Hoffmann-La Roche Ag Improved oligonucleotides targeting rna binding protein sites
WO2023240277A2 (en) 2022-06-10 2023-12-14 Camp4 Therapeutics Corporation Methods of modulating progranulin expression using antisense oligonucleotides targeting regulatory rnas
WO2023242324A1 (en) 2022-06-17 2023-12-21 F. Hoffmann-La Roche Ag Antisense oligonucleotides for targeting progranulin
WO2024006999A2 (en) 2022-06-30 2024-01-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Cyclic-disulfide modified phosphate based oligonucleotide prodrugs
WO2024017990A1 (en) 2022-07-21 2024-01-25 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Methods and compositions for treating chronic pain disorders
WO2024026474A1 (en) 2022-07-29 2024-02-01 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for transferrin receptor (tfr)-mediated delivery to the brain and muscle
WO2024040041A1 (en) 2022-08-15 2024-02-22 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Regulation of activity of rnai molecules
WO2024039776A2 (en) 2022-08-18 2024-02-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Universal non-targeting sirna compositions and methods of use thereof
EP4332221A1 (en) 2022-08-29 2024-03-06 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Threose nucleic acid antisense oligonucleotides and methods thereof
WO2024052403A1 (en) 2022-09-06 2024-03-14 F. Hoffmann-La Roche Ag Double-stranded rna molecule for administration to the eye
WO2024073732A1 (en) 2022-09-30 2024-04-04 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Modified double-stranded rna agents
US20240182561A1 (en) 2022-11-04 2024-06-06 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 (cacng1) binding proteins and cacng1-mediated delivery to skeletal muscle
WO2024098061A2 (en) 2022-11-04 2024-05-10 Genkardia Inc. Oligonucleotide-based therapeutics targeting cyclin d2 for the treatment of heart failure
WO2024107765A2 (en) 2022-11-14 2024-05-23 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for fibroblast growth factor receptor 3-mediated delivery to astrocytes
WO2024119145A1 (en) 2022-12-01 2024-06-06 Camp4 Therapeutics Corporation Modulation of syngap1 gene transcription using antisense oligonucleotides targeting regulatory rnas
WO2024126654A1 (en) 2022-12-14 2024-06-20 F. Hoffmann-La Roche Ag Antisense oligonucleotides targeting actl6b
CN117510564B (zh) * 2024-01-08 2024-03-08 苏州诺维康生物科技有限公司 一种医药中间体N2-Ac-5'-O-DMT-2'-O-炔丙基鸟苷的合成方法

Family Cites Families (41)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3687808A (en) 1969-08-14 1972-08-29 Univ Leland Stanford Junior Synthetic polynucleotides
NZ209840A (en) 1983-10-17 1988-11-29 Kaji Akira A method of inhibiting viral propagation by hybridising dna with the viral rna thus blocking its action
US4806463A (en) 1986-05-23 1989-02-21 Worcester Foundation For Experimental Biology Inhibition of HTLV-III by exogenous oligonucleotides
US5194428A (en) 1986-05-23 1993-03-16 Worcester Foundation For Experimental Biology Inhibition of influenza virus replication by oligonucleotide phosphorothioates
US5004810A (en) 1988-09-30 1991-04-02 Schering Corporation Antiviral oligomers
US5457189A (en) 1989-12-04 1995-10-10 Isis Pharmaceuticals Antisense oligonucleotide inhibition of papillomavirus
US5620963A (en) 1991-10-15 1997-04-15 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides for modulating protein kinase C having phosphorothioate linkages of high chiral purity
US5514788A (en) 1993-05-17 1996-05-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide modulation of cell adhesion
US5591623A (en) 1990-08-14 1997-01-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide modulation of cell adhesion
US5514577A (en) 1990-02-26 1996-05-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide therapies for modulating the effects of herpes viruses
US5248670A (en) 1990-02-26 1993-09-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotides for inhibiting herpesviruses
US5166195A (en) 1990-05-11 1992-11-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense inhibitors of the human immunodeficiency virus phosphorothioate oligonucleotides
BR9106747A (pt) 1990-08-14 1993-07-20 Isis Pharmaceuticals Inc Oligonucleotideo ou analogo de oligonucleotideo e processo para tratamento de um animal suspeito de estar infectado por virus da influenza
US6111094A (en) 1990-08-14 2000-08-29 Isis Pharmaceuticals Inc. Enhanced antisense modulation of ICAM-1
US5691461A (en) 1990-08-16 1997-11-25 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides inhibiting candida germ tube formation
ATE154947T1 (de) 1990-08-16 1997-07-15 Isis Pharmaceuticals Inc Oligonukleotide zur modulation der effekte von cytomegalovirusinfektionen
US5442049A (en) 1992-11-19 1995-08-15 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides for modulating the effects of cytomegalovirus infections
JP2515230Y2 (ja) * 1990-08-31 1996-10-30 徹 松井 道糸通し糸付き浮子
US5242906A (en) 1991-04-22 1993-09-07 University Of North Carolina At Chapel Hill Antisense oligonucleotides against Epstein-Barr virus
WO1994008003A1 (en) 1991-06-14 1994-04-14 Isis Pharmaceuticals, Inc. ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDE INHIBITION OF THE ras GENE
US5582986A (en) 1991-06-14 1996-12-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotide inhibition of the ras gene
AU672175B2 (en) 1991-06-14 1996-09-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotide inhibition of the ras gene
US5661134A (en) 1991-10-15 1997-08-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides for modulating Ha-ras or Ki-ras having phosphorothioate linkages of high chiral purity
US5607923A (en) 1991-10-15 1997-03-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides for modulating cytomegalovirus having phosphorothioate linkages of high chiral purity
US5681747A (en) 1992-03-16 1997-10-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Nucleic acid sequences encoding protein kinase C and antisense inhibition of expression thereof
US5523389A (en) 1992-09-29 1996-06-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Inhibitors of human immunodeficiency virus
US5985558A (en) 1997-04-14 1999-11-16 Isis Pharmaceuticals Inc. Antisense oligonucleotide compositions and methods for the inibition of c-Jun and c-Fos
ATE198079T1 (de) 1995-04-07 2000-12-15 Mogens Havsteen Jakobsen Verfahren zur photochemischen immobilisierung von liganden unter verwendung von chinonen
US6127533A (en) 1997-02-14 2000-10-03 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-O-aminooxy-modified oligonucleotides
GB2337541B (en) * 1997-03-07 2001-04-25 Kvaerner Oilfield Prod As Termination of a tension member for use as a tendon for a tension leg platform
JP3756313B2 (ja) * 1997-03-07 2006-03-15 武 今西 新規ビシクロヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体
US5877309A (en) 1997-08-13 1999-03-02 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotides against JNK
US7572582B2 (en) * 1997-09-12 2009-08-11 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
EP2341058A3 (en) * 1997-09-12 2011-11-23 Exiqon A/S Oligonucleotide Analogues
US6794499B2 (en) 1997-09-12 2004-09-21 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
US5955443A (en) 1998-03-19 1999-09-21 Isis Pharmaceuticals Inc. Antisense modulation of PECAM-1
US7084125B2 (en) 1999-03-18 2006-08-01 Exiqon A/S Xylo-LNA analogues
PT1178999E (pt) 1999-05-04 2007-06-26 Santaris Pharma As Análogos de l-ribo-lna
JP4151751B2 (ja) 1999-07-22 2008-09-17 第一三共株式会社 新規ビシクロヌクレオシド類縁体
ES2302701T3 (es) 1999-09-10 2008-08-01 Geron Corporation N3'-p5' tiofosforamidatos oligonucleotidicos: su sintesis y uso.
EP1783216A1 (en) * 2004-05-28 2007-05-09 Sankyo Company, Limited Telomerase-inhibitory ena oligonucleotide

Also Published As

Publication number Publication date
AU2459800A (en) 2000-08-29
CN1273478C (zh) 2006-09-06
ATE287897T2 (de) 2005-02-15
ES2234563T3 (es) 2005-07-01
US7314923B2 (en) 2008-01-01
DE60017711T2 (de) 2005-11-17
KR100573231B1 (ko) 2006-04-24
ID30093A (id) 2001-11-01
ES2234563T5 (es) 2018-01-17
CA2361318A1 (en) 2000-08-17
BRPI0008131B8 (pt) 2021-05-25
CZ296576B6 (cs) 2006-04-12
IL144338A0 (en) 2002-05-23
US7335765B2 (en) 2008-02-26
EP1152009B2 (en) 2017-09-06
DK1152009T3 (da) 2005-03-07
US20110009471A1 (en) 2011-01-13
PT1152009E (pt) 2005-03-31
US20020147332A1 (en) 2002-10-10
ZA200106544B (en) 2002-11-08
US20090149404A1 (en) 2009-06-11
KR20020013498A (ko) 2002-02-20
NO320441B1 (no) 2005-12-05
US8957201B2 (en) 2015-02-17
NO20013899D0 (no) 2001-08-10
CN1347418A (zh) 2002-05-01
RU2233844C2 (ru) 2004-08-10
TW513438B (en) 2002-12-11
DE60017711D1 (de) 2005-03-03
EP1152009B1 (en) 2005-01-26
HU228398B1 (en) 2013-03-28
BRPI0008131B1 (pt) 2016-12-27
CA2361318C (en) 2008-11-25
TR200604211T1 (tr) 2007-02-21
BR0008131A (pt) 2002-04-09
HK1040084B (zh) 2005-04-22
TR200102328T2 (tr) 2002-01-21
PL208245B1 (pl) 2011-04-29
EP1152009A4 (en) 2002-06-05
HK1040084A1 (en) 2002-05-24
HUP0105367A2 (hu) 2002-05-29
EP1152009A1 (en) 2001-11-07
JP3420984B2 (ja) 2003-06-30
AU758956B2 (en) 2003-04-03
US7816333B2 (en) 2010-10-19
DK1152009T4 (en) 2017-12-11
WO2000047599A1 (fr) 2000-08-17
DE60017711T3 (de) 2018-01-11
NO20013899L (no) 2001-10-10
IL144338A (en) 2013-11-28
NZ513402A (en) 2003-06-30
US20030207841A1 (en) 2003-11-06
HUP0105367A3 (en) 2005-10-28
JP2000297097A (ja) 2000-10-24

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CA2361318C (en) Novel nucleosides and oligonucleotide analogues
US7994145B2 (en) Bicyclonucleoside analogues
TW200817514A (en) ENA antisense oligonucleotides exhibiting sequence-specification
JP4148662B2 (ja) ヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体を含有する核酸試薬及び医薬
JP4245837B2 (ja) ２’，５’−オリゴアデニル酸類縁体
WO2000078775A1 (fr) Nouveaux nucleosides pontes en 3&#39;-4&#39; et analogues d&#39;oligonucleotides
JP2002265489A (ja) 新規３’‐４’架橋ヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体を含有する核酸試薬
JP2001064296A (ja) 新規３’‐４’架橋ヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体
JP2002255990A (ja) Ｎ３’−ｐ５’結合を有する２’，４’−ｂｎａオリゴヌクレオチド
JP2001064297A (ja) 新規ビシクロヌクレオシド誘導体
MXPA01008145A (en) Novel nucleosides and oligonucleotide analogues
JP2002249496A (ja) 新規ビシクロヌクレオシド誘導体を含有する核酸試薬

Legal Events

Date Code Title Description
MK4A Patent expired

Effective date: 20200210