ES2134481T5 - Método y aparato para producir microconjuntos de muestras biológicas - Google Patents
Método y aparato para producir microconjuntos de muestras biológicas Download PDFInfo
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Abstract
SE PRESENTAN UN METODO Y UN APARATO PARA LA FORMACION DE MICROMATRICES DE MUESTRAS BIOLOGICAS SOBRE UN SOPORTE. EL METODO CONSISTE EN DISTRIBUIR UN VOLUMEN CONOCIDO DE UN REACTIVO EN CADA POSICION SELECCIONADA DE UNA MATRIZ, MEDIANTE LA PUNCION DE UN DISTRIBUIDOR CAPILAR SOBRE EL SOPORTE BAJO CONDICIONES EFECTIVAS COMO PARA EXTRAER UN VOLUMEN DE LIQUIDO DETERMINADO DEL SOPORTE. EL APARATO ESTA DISEÑADO PARA PRODUCIR UNA MICROMATRIZ DE TALES REGIONES DE FORMA AUTOMATIZADA.
Description
Método y aparato para producir microconjuntos de muestras biológicas
Campo del invento
Este invento se refiere a un método y a un aparato para producir microconjuntos de muestras biológicas para análisis de exploración a gran escala, tales como conjuntos de muestras de ADN que se han de utilizar en análisis de hibridación de ADN para aplicaciones de investigación genética y de diagnóstico.
Abouzied y colaboradores, Journal of AOAC International 77(2):495-500 (1994).
Bohlander y colaboradores, Genomics 13:1.322-1.324 (1992).
Drmanac y colaboradores, Science 260:1.649-1.652 (1993).
Fodor y colaboradores, Science 251:767-773 (1991).
Khrapko y colaboradores, DNA Sequence 1:375-388 (1991).
Kuriyama y colaboradores, AN ISFET BIOSENSOR, APPLIED BIOSENSORS (Donald Wise, coordinador de edición), Butterworths, páginas 93-114 (1989).
Lehrach y colaboradores, HYBRIDIZATION FINGERPRINTING IN GENOME MAPPING AND SEQUENCING, GENOME ANALYSIS, VOLUMEN 1 (Davies y Tilgham, coordinadores de edición), Cold Spring Harbor Press, páginas 39-81 (1990).
Maniatis y colaboradores, MOLECULAR CLONING, A LABORATORY MANUAL, Cold Spring Harbor Press (1989).
Nelson y colaboradores, Nature Genetics 4:11-18 (1993).
Pirrung y colaboradores, Patente de los EE.UU. 5.143.854 (1992).
Riles y colaboradores, Genetics 134:81-150 (1993).
Schena M. y colaboradores, Proc. Nat. Acad. Sci. USA 89:3.894-3.898 (1992).
Southern y colaboradores, Genomics 13:1.008-1.017 (1992).
Actualmente se encuentran disponibles una diversidad de métodos para producir conjuntos de macromoléculas biológicas, tales como conjuntos de moléculas de ácidos nucleicos o proteínas. Un método para producir conjuntos ordenados de ADN sobre una membrana porosa es un enfoque de "borrones de puntos = dot blot". En este método, un múltiple distribuidor en vacío transfiere una pluralidad, p. ej. de 96 muestras acuosas de ADN desde pocillos con un diámetro de 3 milímetros a una membrana porosa. Una variante corriente de este procedimiento es un método de "borrones de rendijas = slot-blot", en el que los pocillos tienen unas formas ovaladas muy alargadas.
El ADN es inmovilizado sobre la membrana porosa cociendo la membrana o exponiéndola a radiación de UV. Éste es un procedimiento manual que resulta práctico para producir una agrupación de una sola vez y está usualmente limitado a 96 muestras por conjunto. Por lo tanto, los procedimientos de "borrones de puntos" son inadecuados para aplicaciones en las cuales han de determinarse muchos millares de muestras.
Una técnica más eficaz, empleada para producir conjuntos ordenados de fragmentos genómicos, utiliza un conjunto de alfileres sumergidos en los pocillos, p. ej. en los 96 pocillos de una placa de microtitulación, para transferir un conjunto muestras a un substrato, tal como una membrana porosa. Un conjunto incluye alfileres que están diseñadas para motear una membrana de una manera escalonada, para crear un conjunto de 9.216 motas en una zona de 22 x 22 cm (Lehrach, y colaboradores, 1990). Una limitación que se presenta con este enfoque consiste en que el volumen de ADN moteado en cada pixel (elemento de imagen) de cada conjunto es muy variable. Además, el número de conjuntos que se pueden producir con cada inmersión es usualmente bastante pequeño.
Un método alternativo para crear conjuntos ordenados de secuencias de ácidos nucleicos ha sido descrito por Pirrung y colaboradores (1992), y también por Fodor y colaboradores (1991). El método implica sintetizar diferentes secuencias de ácidos nucleicos en diferentes regiones discretas de un soporte. Este método emplea complicados esquemas de síntesis, y está limitado generalmente a una muestra de un ácido nucleico relativamente corto, p. ej. menor que 20 bases. Un método relacionado ha sido descrito por Southern y colaboradores (1992).
Khrapko y colaboradores (1991) describen un método para producir una matriz de oligonucleótido moteando (aplicando en motas) un ADN sobre una delgada capa de poliacrilamida. El moteado (la aplicación de motas) se hace manualmente con una micropipeta.
Ninguno de los métodos o dispositivos descritos en la técnica anterior está diseñado para la producción a gran escala de microconjuntos, caracterizados por (i) un gran número de regiones de análisis dimensionadas en micrómetros, separadas por una distancia de 50-200 micrómetros o menos, y (ii) una cantidad bien definida, típicamente en el margen de los picomoles, de un analito asociado con cada región del conjunto.
Además, la tecnología actual se dirige a la realización de tales análisis de una sola vez para un único conjunto de moléculas de ADN. Por ejemplo, el método más corriente de realizar hibridaciones de ADN en conjuntos moteados sobre una membrana porosa implica cerrar herméticamente la membrana en una bolsa de material plástico (Maniatis y colaboradores, 1989) o un cilindro de vidrio giratorio (Robbins Scientific) estando la sonda de hibridación marcada dentro de la cámara herméticamente cerrada. Para conjuntos producidos sobre superficies no porosas, tal como un portaobjetos de microscopio, cada conjunto es incubado con la sonda de hibridación marcada cerrada herméticamente bajo un cubreobjetos. Estas técnicas requieren una cámara herméticamente cerrada por separado para cada conjunto, lo cual hace que la exploración y la manipulación de muchos de estos conjuntos resulten inconvenientes y consuman mucho tiempo.
Abouzied y colaboradores (1994) describen un método para imprimir líneas horizontales de anticuerpos sobre una membrana de nitrocelulosa y separar regiones de la membrana con franjas verticales de un material hidrófobo. Luego, cada franja vertical se hace reaccionar con un antígeno diferente y se detecta la reacción entre el anticuerpo inmovilizado y un antígeno utilizando una técnica colorimétrica ELISA normalizada. La técnica de Abouzied hace posible explorar muchos conjuntos unidimensionales de modo simultáneo sobre una única lámina de nitrocelulosa. Abouzied hace a la nitrocelulosa algo hidrófoba utilizando una línea trazada con el estilete PAP Pen (Research Products International). Sin embargo, Abouzied no describe ninguna tecnología que sea capaz de obturar por completo los poros de la nitrocelulosa. Los poros de la nitrocelulosa están todavía físicamente abiertos y de este modo los reactivos para el análisis se pueden derramar a través de la barrera hidrófoba durante prolongadas incubaciones a altas temperaturas o en presencia de detergentes, lo cual hace que la técnica de Abouzied sea inaceptable para análisis de hibridación de ADN.
Existen membranas porosas con diseños impresos de regiones hidrófilas/hidrófobas para aplicaciones tales como conjuntos ordenados de colonias de bacterias. La entidad QA Life Sciences (San Diego CA) produce tal membrana con un diseño de rejilla impreso sobre ella. Sin embargo, esta membrana tiene la misma desventaja que la técnica de Abouzied, puesto los que los reactivos pueden todavía circular entre los conjuntos enrejillados haciéndolos inútiles para análisis de hibridación de ADN por separado.
La entidad Pall Corporation produce una placa de 96 pocillos con un filtro poroso termosellado al fondo de la placa. Estas placas son capaces de contener diferentes reactivos en cada pocillo sin contaminación cruzada entre ellos. Sin embargo, cada pocillo está destinado a contener solamente un elemento diana mientras que el invento aquí descrito produce un microconjunto de muchas biomoléculas en cada región subdividida del soporte sólido. Además, las placas de 96 pocillos tienen un espesor de al menos 1 cm e impiden el uso del dispositivo para muchos formatos de detección colorimétricos, fluorescentes y radiactivos, que requieren que la membrana se coloque de modo plano contra la superficie de detección. El invento aquí descrito no requiere ningún tratamiento adicional después de la operación de análisis, puesto que los elementos de barreras son poco profundos y no interfieren con la operación de detección, aumentando con ello en gran manera la utilidad.
La entidad Hyseq Corporation ha descrito un método producir un "conjunto de conjuntos" sobre un soporte sólido no poroso para utilizarlo en su secuenciación por la técnica de hibridación. El método descrito por Hyseq implica modificar las condiciones químicas del material de soporte sólido para formar un diseño de rejilla hidrófoba en el que cada región subdividida contiene un microconjunto de biomoléculas. El diseño hidrófobo plano de Hyseq no utiliza el bloqueo físico como un medio adicional de impedir la contaminación cruzada.
El invento incluye, en un aspecto, un método de formar un microconjunto de regiones para análisis de analitos sobre un soporte sólido, en que cada región en el conjunto tiene una cantidad conocida de un reactivo seleccionado, que es específico para un analito. El método implica primeramente cargar una solución de un reactivo seleccionado, específico para un analito, en un dispositivo distribuidor de reactivos, que tiene un canal capilar alargado (i) formado por miembros alargados, de la misma extensión, distanciados entre sí, (ii) destinado a retener una cierta cantidad de la solución de reactivo y (iii) que tiene una región de punta en la que una solución acuosa existente en el canal forma un menisco. El canal está formado preferiblemente por un par de elementos estrechados cónicamente, separados entre sí.
La punta del dispositivo distribuidor es golpeada ligeramente contra un soporte sólido en una posición definida sobre la superficie del soporte con un impulso que es eficaz para romper el menisco en el canal capilar y depositar un volumen seleccionado de solución sobre la superficie, preferiblemente un volumen seleccionado en el margen de 0,01 a 100 nl. Las dos operaciones se repiten hasta que se forme el conjunto deseado.
El método se puede llevar a la práctica para formar una pluralidad de tales conjuntos, en el que la operación de deposición de soluciones es aplicada a una posición seleccionada sobre cada uno de una pluralidad de soportes sólidos en cada ciclo de repetición.
El dispositivo distribuidor puede ser cargado con una nueva solución, por las operaciones de (i) sumergir el canal capilar del dispositivo en una solución de lavado, (ii) eliminar la solución de lavado arrastrada dentro del canal capilar, y (iii) sumergir el canal capilar en la nueva solución de reactivo.
También se incluye en el invento un aparato automático para formar un microconjunto de regiones para análisis de analitos sobre una pluralidad de soportes sólidos, en el que cada región en el conjunto tiene una cantidad conocida de un reactivo seleccionado, específico para un analito. El aparato tiene una montura para retener, en posiciones conocidas, una pluralidad de soportes planos y un dispositivo distribuidor de reactivos del tipo antes descrito, siendo el canal capilar de costados abiertos.
El aparato incluye además una estructura de colocación para colocar el dispositivo distribuidor en una posición seleccionada del conjunto con respecto a un soporte en dicha montura, y una estructura distribuidora para mover el dispositivo distribuidor a aplicación de golpeo ligero contra un soporte con un impulso seleccionado que es eficaz para depositar un volumen seleccionado sobre el soporte, p. ej. un volumen seleccionado en el margen de volúmenes de 0,01 a 100 nl.
Las estructuras de colocación y distribución son controladas por una unidad de control existente en el aparato. La unidad funciona para (i) colocar el dispositivo distribuidor en un puesto de carga, (ii) mover el canal capilar existente en el dispositivo dentro de un reactivo seleccionado en el puesto de carga, para cargar el dispositivo distribuidor con el reactivo, y (iii) distribuir el reactivo en una posición definida del conjunto sobre cada uno de los soportes de dicha montura. La unidad puede trabajar adicionalmente, al final de un ciclo de distribución, para lavar el dispositivo de distribución (i) colocando el dispositivo distribuidor en un puesto de lavado, (ii) moviendo el canal capilar existente en el dispositivo dentro de un fluido de lavado, para cargar el dispositivo distribuidor con el fluido, y (iii) eliminando el fluido de lavado antes de cargar el dispositivo distribuidor con un reactivo seleccionado de nueva aportación.
El dispositivo distribuidor existente en el aparato puede ser uno cualquiera entre una pluralidad de tales dispositivos que están soportados sobre el brazo para distribuir diferentes reactivos de análisis de analitos en posiciones separadas seleccionadas del conjunto.
En otro aspecto, el invento incluye un substrato con una superficie que tiene un microconjunto de al menos 103
biopolímeros polinucleotídicos distintos en un área de superficie menor que aproximadamente 1 cm2. Cada biopolímero distinto (i) está dispuesto en una posición definida, por separado, en dicho conjunto, (ii) tiene una longitud de al menos 50 subunidades, y (iii) está presente en una cantidad definida entre aproximadamente 0,1 femtomoles y 100 nanomoles.
En una realización, la superficie es una superficie de portaobjetos de vidrio revestida con un polímero policatiónico, tal como polilisina, y los biopolímeros son polinucleótidos con una longitud de al menos 50 subunidades. En otra realización, este substrato tiene un respaldo impermeable al agua, una película permeable al agua formada sobre el respaldo, y una rejilla formada sobre la película. La rejilla se compone de elementos de rejilla intersecantes, impermeables al agua, que se extienden desde dicho respaldo hasta posiciones resaltadas sobre la superficie de dicha película, y que subdividen a la película en una pluralidad de celdillas impermeables al agua. Un conjunto de biopolímeros es formado dentro de cada pocillo.
Este substrato está previsto para utilizarse en detectar la unión de polinucleótidos marcados a uno o más de una pluralidad de polinucleótidos inmovilizados de diferentes secuencias. Este substrato incluye, en un aspecto, un soporte de vidrio, un revestimiento de un polímero policatiónico, tal como polilisina, sobre dicha superficie de soporte, y un conjunto de polinucleótidos distintos unidos electrostáticamente por enlaces no covalentes a dicho revestimiento, en que cada uno de los biopolímeros distintos está dispuesto en una posición definida separada en un conjunto superficial de polinucleótidos.
En otro aspecto, este substrato incluye un respaldo impermeable al agua, una película permeable al agua formada sobre el respaldo, y una rejilla formada sobre la película, en que la rejilla se compone de elementos de rejilla intersecantes, impermeables al agua, que se extienden desde el respaldo a posiciones resaltadas sobre la superficie de la película, formando una pluralidad de celdillas. Un conjunto de biopolímeros es formado dentro de cada celdilla.
Los objetivos de la invención se consiguen mediante las características de las reivindicaciones. Además, los objetivos y características del invento resultarán evidentes de un modo más completo cuando la siguiente descripción detallada del invento se lea en conjunción con las figuras anejas.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1 es una vista lateral de un dispositivo distribuidor de reactivos que tiene una cabeza distribuidora de capilar abierto, estructurada para utilizarse en una realización del invento;
las Figuras 2A-2C ilustran operaciones en el suministro de un glóbulo de volumen preestablecido sobre una superficie hidrófoba empleando la cabeza distribuidora de la Figura 1, de acuerdo con una realización del método del invento;
la Figura 3 muestra una porción de un conjunto bidimensional de regiones para análisis de analitos, estructuradas de acuerdo con el método del invento;
la Figura 4 es una vista plana que muestra componentes de un aparato automático para formar conjuntos de acuerdo con el invento;
la Figura 5 muestra una imagen fluorescente de un conjunto real de 20 x 20 de 400 muestras de ADN marcadas fluorescentemente, que están inmovilizadas sobre un portaobjetos revestido con poli-l-lisina, en que el área total cubierta por el conjunto de 400 elementos es de 16 milímetros cuadrados;
la Figura 6 es una imagen fluorescente de un microconjunto de 1,8 cm x 1,8 cm que contiene clones lambda con insertos de levadura, surgiendo la señal fluorescente de la hibridación con el conjunto con aproximadamente la mitad del genoma de levadura marcada con un fluoróforo verde y con la otra mitad marcada con un fluoróforo rojo;
la Figura 7 muestra la traducción de la imagen de hibridación de la Figura 6 en un cariotipo del genoma de levadura, en el que los elementos del microconjunto de la Figura 6 contienen secuencias de ADN de levadura que previamente han sido cartografiadas físicamente en el genoma de levadura;
la Figura 8 muestra una imagen fluorescente de un microconjunto de 0,5 cm x 0,5 cm de 24 clones de ADNc, en el que el microconjunto se había hibridado simultáneamente con el ADNc total procedente de la planta Arabidopsis de tipo salvaje, marcada con un fluoróforo verde, y el ADNc total procedente de una planta Arabidopsis transgénica, marcada con un fluoróforo rojo, y la flecha apunta hacia el clon de ADNc que representa al gen introducido en la planta Arabidopsis transgénica;
la Figura 9 muestra una vista en planta de un substrato que tiene un conjunto de celdillas formadas por elementos de barrera en la forma de una rejilla;
la Figura 10 muestra una vista en planta ampliada de una de las celdillas en el substrato de la Figura 9, que muestra un conjunto de regiones de polinucleótidos en la celdilla;
la Figura 11 es una vista en sección ampliada del substrato en la Figura 9, tomada a lo largo de una línea de sección en esa Figura; y
la Figura 12 es una imagen explorada de un soporte sólido de nitrocelulosa de 3 cm x 3 cm que contiene cuatro conjuntos idénticos de clones de M13 en cada uno de los cuatro cuadrantes, en que cada cuadrante se había hibridado simultáneamente con un diferente oligonucleótido utilizando un método de hibridación de caras abiertas.
Descripción detallada del invento
A menos que se indique otra cosa distinta, los términos seguidamente definidos tienen los siguientes significados:
"Ligando" se refiere a un miembro de un par de unión entre un ligando y un anti-ligando. El ligando puede ser, por ejemplo, una de las cadenas de ácido nucleico en un par de unión duplex de ácido nucleico hibridado, complementario; una molécula efectora en un par de unión entre una efectora y una receptor; o un antígeno en un par de unión entre un antígeno y un anticuerpo o entre un antígeno y un fragmento de anticuerpo.
"Anti-ligando" se refiere al miembro opuesto de un par de unión entre un ligando y un anti-ligando. El anti-ligando puede ser la otra de las cadenas de ácido nucleico en un par de unión duplex de ácido nucleico hibridado, complementario; la molécula receptora en un par de unión entre una efectora y una receptora; o una molécula de anticuerpo o fragmento de anticuerpo en un par de unión entre un antígeno y un anticuerpo o entre un antígeno y un fragmento de anticuerpo, respectivamente.
"Analito" o "molécula de analito" se refiere a una molécula, típicamente una macromolécula, tal como un polinucleótido o polipéptido, cuya presencia, cantidad y/o identidad se tengan que determinar. El analito es un miembro de un par de unión entre un ligando y un anti-ligando.
"Reactivo de análisis específico para un analito" se refiere a una molécula eficaz para unirse específicamente a una molécula de un analito. El reactivo es el miembro opuesto de un par de unión entre un ligando y un anti-ligando.
Un "conjunto de regiones sobre un soporte sólido" es un conjunto lineal o bidimensional de regiones, preferiblemente discretas, cada una de las cuales tiene un área finita, formadas sobre la superficie de un soporte sólido.
Un "microconjunto" es un conjunto de regiones que tiene una densidad de regiones discretas de al menos
aproximadamente 100/cm2 y preferiblemente de al menos aproximadamente 1.000/cm2. Las regiones existentes en un microconjunto tienen unas dimensiones típicas, p. ej. unos diámetros, en el margen comprendido entre aproximadamente 10 y 250 !m, y están separadas de otras regiones en el conjunto por aproximadamente la misma distancia.
Una superficie de soporte es "hidrófoba" si una gotita de un medio acuoso, aplicada a la superficie, no se desparrama sustancialmente más allá del tamaño del área de la gotita aplicada. Esto quiere decir que la superficie actúa para evitar el desparramamiento de la gotita aplicada a la superficie por interacción hidrófoba con la gotita.
Un "menisco" significa una superficie cóncava o convexa que se forma sobre el fondo de un líquido en un canal como resultado de la tensión superficial del líquido.
"Biopolímeros distintos", tal como se aplican a los biopolímeros que forman un microconjunto, significan un miembro del conjunto que es distinto de otros miembros del conjunto sobre la base de una diferente secuencia de biopolímero, y/o de diferentes concentraciones de los mismos o distintos biopolímeros y/o diferentes mezclas de biopolímeros distintos o en diferente concentración. Por lo tanto, un conjunto de "polinucleótidos distintos" significa un conjunto que contiene, como sus miembros, (i) distintos polinucleótidos, que pueden tener una cantidad definida de cada miembro, (ii) diferentes concentraciones graduadas de polinucleótidos de secuencia establecida y/o (iii) mezclas de diferentes composiciones de dos o más polinucleótidos distintos.
"Tipo de células" significa una célula procedente de una fuente dada, p. ej. un tejido, un órgano, una célula en un estado dado de diferenciación, o una célula asociada con una patología o constitución genética establecida.
Esta sección describe un método para formar un microconjunto de regiones para análisis de analitos sobre un soporte o substrato sólido, en que cada región en el conjunto tiene una cantidad conocida de un reactivo seleccionado, específico para un analito.
La Figura 1 ilustra, en una vista parcialmente esquemática, un dispositivo 10 distribuidor de reactivos, útil para poner en práctica el método. El dispositivo incluye generalmente un distribuidor 12 de reactivos, que tiene un canal capilar abierto alargado 14 destinado a retener una cantidad de la solución de reactivo, como se indica por 16, tal como se describirá más adelante. El canal capilar es formado por un par de miembros alargados 12a, 12b de la misma extensión, separados entre sí, que se estrechan cónicamente uno hacia otro y convergen en una punta o región de punta 18 junto al extremo inferior del canal. De un modo más general, el canal abierto está formado por al menos dos miembros alargados, separados entre sí, destinados a retener una cierta cantidad de soluciones de reactivos y que tienen una región de punta junto a la que la solución acuosa existente en el canal forma un menisco, tal como el menisco cóncavo ilustrado por 20 en la Figura 2A. Las ventajas de la estructura de canal abierto del distribuidor se discuten seguidamente.
Continuando la referencia a la Figura 1, el dispositivo distribuidor incluye también una estructura para mover el distribuidor rápidamente acercándolo a, y alejándolo de, una superficie de soporte, para efectuar la deposición de una cantidad conocida de una solución existente en el distribuidor sobre un soporte, como se describirá más adelante al hacer referencia a las Figuras 2A-2C. En la realización que se muestra, esta estructura incluye un solenoide 22 que puede ser activado para impulsar rápidamente hacia abajo a un pistón 24 de solenoide, luego liberar el pistón, p. ej. bajo la influencia de un resorte, a una posición resaltada normal, como se muestra. El distribuidor está soportado sobre el pistón por un miembro de conexión 26, como se muestra. La estructura en movimiento que se acaba de describir es citada aquí también como "medios distribuidores para mover el distribuidor a aplicación con un soporte sólido, a fin de distribuir un volumen conocido de fluido sobre el soporte".
El dispositivo distribuidor que se acaba de describir está soportado por un brazo 28 que puede ser movido o bien linealmente o en un plano x-y para colocar el distribuidor en una posición seleccionada de deposición, como se describirá.
Las Figuras 2A-2C ilustran el método de depositar una cantidad conocida de una solución de reactivo en el distribuidor que se acaba de describir sobre la superficie de un soporte sólido, tal como el soporte indicado por 30. El soporte es un soporte de material polímero, vidrio u otro material sólido que tiene una superficie indicada por 31.
En una realización general, la superficie es una superficie relativamente hidrófila, es decir humectable, tal como una superficie que tiene grupos cargados nativos, combinados o enlazados covalentemente. Una de tales superficies que se describe seguidamente es una superficie de vidrio que tiene una capa absorbida de un polímero policatiónico, tal como poli-l-lisina.
En otra realización, la superficie tiene, o está formada para tener, un carácter relativamente hidrófobo, es decir una que haga que un medio acuoso depositado sobre la superficie se conglomere en forma de un glóbulo. Una diversidad de conocidos polímeros hidrófobos, tales como poliestireno, polipropileno, o polietileno, tienen deseadas propiedades hidrófobas, como las tienen el vidrio y una diversidad de películas lubricantes o hidrófobas de otro tipo, que se pueden aplicar a la superficie de soporte.
Inicialmente, el distribuidor es cargado con una solución seleccionada de un reactivo específico para un analito, por ejemplo sumergiendo la punta del distribuidor, después de haberla lavado, en una solución del reactivo, y dejándola que llene por flujo capilar el interior del canal del distribuidor. Luego el distribuidor es movido hasta una posición seleccionada con respecto a una superficie del soporte, colocando la punta del distribuidor directamente por encima de la posición de la superficie del soporte, junto a la que se ha de depositar el reactivo. Este movimiento tiene lugar con la punta del distribuidor en su posición alzada, como se observa en la Figura 1, en que la punta está típicamente al menos en alrededor de 1-5 mm por encima de la superficie del substrato.
Estando el distribuidor así colocado, seguidamente se activa el solenoide 22 para dar lugar a que la punta del distribuidor se mueva rápidamente acercándose a, y alejándose de, la superficie del substrato, haciendo un contacto provisional con la superficie, en realidad, golpeando ligeramente con la punta del distribuidor contra la superficie de soporte. El
5 movimiento de golpeo ligero de la punta contra la superficie actúa rompiendo el menisco de líquido en el canal de la punta, poniendo al líquido existente en la punta en contacto con la superficie de soporte. Esto, a su vez, produce una circulación del líquido dentro del espacio capilar entre la punta y la superficie, actuando para arrastrar líquido fuera del canal del distribuidor, como se ve en la Figura 2B.
La Figura 2C muestra la circulación del fluido desde la punta sobre la superficie del soporte, que en este caso es una
10 superficie hidrófoba. La figura ilustra que el líquido continua circulando desde el distribuidor hacia sobre la superficie del soporte hasta que se forme un glóbulo 32 de líquido. Con un tamaño dado, es decir con un volumen dado, del glóbulo, la tendencia del líquido a fluir sobre la superficie será equilibrada por la interacción superficial hidrófoba del glóbulo con la superficie del soporte, que actúa limitando el área total del glóbulo sobre la superficie, y por la tensión superficial de la gotita, que tiende a producir una curvatura dada del glóbulo. En este punto, se habrá formado un volumen dado de
15 glóbulo, y la continuación del contacto de la punta del distribuidor con el glóbulo, cuando está siendo retirada la punta del distribuidor, tendrá poco o ningún efecto sobre el volumen del glóbulo.
Al distribuir un líquido sobre una superficie más hidrófila, el líquido tendrá menos tendencia a formar glóbulos y el volumen distribuido será más sensible al tiempo de permanencia total de la punta del distribuidor en la inmediata vecindad de la superficie del soporte, p. ej. las posiciones ilustradas en las Figuras 2B y 2C.
20 El deseado volumen de deposición, es decir, el volumen de un glóbulo, formado por este método, está preferiblemente en el margen desde 2 pl (picolitros) hasta 2 nl (nanolitros), aunque se pueden distribuir unos volúmenes tan altos como de 100 nl o más. Se apreciará que el volumen distribuido seleccionado dependerá (i) de la "huella" de la punta del distribuidor, es decir del tamaño del área abarcada por la punta, (ii) de la hidrofobia de la superficie del soporte, y (iii) del tiempo de contacto con esta superficie del soporte y la velocidad de retirada de la punta desde dicha superficie del
25 soporte. Además, el tamaño de un glóbulo puede ser reducido aumentando la viscosidad del medio, reduciendo con ello de manera eficaz el tiempo de circulación del líquido desde el distribuidor hasta sobre la superficie del soporte. El tamaño de una gota puede ser restringido adicionalmente depositando la gota en una región hidrófila rodeada por un diseño de rejilla hidrófoba sobre la superficie del soporte.
En una realización típica, la punta del distribuidor es golpeada ligera y rápidamente contra la superficie de soporte, con
30 un tiempo de permanencia total en contacto con el soporte de menos que aproximadamente 1 milisegundo (ms) y con una velocidad de desplazamiento hacia arriba desde la superficie de aproximadamente 10 cm/s.
Suponiendo que el glóbulo que se forma al entrar en contacto con la superficie sea un glóbulo semiesférico, con un diámetro aproximadamente igual a la anchura de la punta del distribuidor, como se muestra en la Figura 2C, en la Tabla 1 siguiente se da el volumen del glóbulo formado en relación con la anchura (d) de la punta del distribuidor. Como se
35 observa, el volumen del glóbulo fluctúa entre 2 pl y 2 nl según se va aumentando la magnitud de la anchura desde aproximadamente 20 hasta 200 !m (micrómetros).
Tabla 1
- d
- Volumen (nl)
- 20 !m
- 2 x 10-3
- 50 !m
- 3,1 x 10-2
- 100 !m
- 2,5 x 10-1
- 200 !m
- 2
Con un tamaño dado de la punta, el volumen de un glóbulo puede ser reducido de una manera controlada aumentando la hidrofobia de la superficie, reduciendo el tiempo de contacto de la punta con la superficie, aumentando la velocidad del
40 movimiento de la punta alejándose desde la superficie, y/o aumentando la viscosidad del medio. Una vez que se hayan fijado estos parámetros, se puede conseguir de una manera repetible un volumen seleccionado de deposición en el margen deseado desde los pl hasta los nl.
Después de haber depositado un glóbulo en un sitio seleccionado sobre un soporte, se mueve la punta típicamente hasta una posición correspondiente sobre un segundo soporte, se deposita una gotita en esa posición, y se repite este proceso
45 hasta que una gotita líquida del reactivo haya sido depositada en una posición seleccionada sobre cada soporte de una pluralidad de ellos.
Luego, la punta se lava para eliminar el líquido de reactivo, se carga con otro líquido de reactivo y este reactivo se deposita seguidamente en cada subsiguiente posición del conjunto sobre cada uno de los soportes. En una realización, la punta se lava y vuelve a cargar mediante las operaciones de (i) sumergir el canal capilar del dispositivo en una 50 solución de lavado, (ii) eliminar la solución de lavado arrastrada dentro del canal capilar, y (iii) sumergir el canal capilar en
la nueva solución de reactivo.
A partir de lo que antecede, se apreciará que la punta del distribuidor de capilar abierto, similar a unas tenacillas, proporciona las ventajas de que (i) el canal abierto de la punta facilita un lavado eficiente y rápido y el secado antes de volver a cargar la punta con un nuevo reactivo, (ii) una acción capilar pasiva puede cargar la muestra directamente desde una placa clásica de micropocillos, al mismo tiempo que se retenga suficiente cantidad de muestra en el depósito capilar abierto para la impresión de numerosos conjuntos, (iii) los capilares abiertos son menos propensos a obstruirse que los capilares cerrados, y (iv) los capilares abiertos no requieren una superficie de fondo perfectamente acabada para suministrar fluidos.
Una porción de un microconjunto 36 formado sobre la superficie 38 de un soporte sólido 40 de acuerdo con el método que se acaba de describir, se muestra en la Figura 3. El conjunto está formado por una pluralidad de regiones de reactivos específicos para analitos, tales como regiones 42, en que cada región puede incluir un diferente reactivo específico para un analito. Como antes se indica, el diámetro de cada región está preferiblemente entre alrededor de 20 y 200 !m. La distancia entre cada región y su región vecina más próxima (no en sentido diagonal), medida de centro a centro (indicada por 44) está preferiblemente en el margen de aproximadamente 20-400 !m. Así, por ejemplo, un conjunto que tiene una separación de centro a centro de aproximadamente 250 !m contiene aproximadamente 40
regiones/cm o 1.600 regiones/cm2. Después de la formación del conjunto, el soporte es tratado para evaporar el líquido de la gotita que forma cada región, para dejar un conjunto deseado de regiones secas, relativamente planas. Esta desecación puede hacerse por calentamiento o en vacío.
En algunos casos, se desea primeramente volver a hidratar las gotitas que contienen los reactivos para analitos con el fin de dejar más tiempo para la adsorción al soporte sólido. También es posible extender en motas los reactivos para analitos en un entorno húmedo de manera tal que las gotitas no se sequen hasta que esté completa la operación de formación de los conjuntos.
En otro aspecto, el invento incluye un aparato automático para formar un conjunto de regiones de análisis de analitos sobre un soporte sólido, en que cada región en el conjunto tiene una cantidad conocida de un reactivo seleccionado, específico para un analito.
El aparato se muestra en vista plana y parcialmente esquemática en la Figura 4. Un dispositivo distribuidor 72 existente en el aparato tiene la estructura básica descrita antes con respecto a la Figura 1, e incluye un distribuidor 74 que tiene un canal capilar abierto que termina en una punta, sustancialmente tal como se muestra en las Figuras 1 y 2A-2C.
El distribuidor está montado en el dispositivo para moverse acercándose a, y alejándose de, una posición de distribución en la que la punta del distribuidor golpea ligeramente una superficie del soporte para suministrar un volumen seleccionado de una solución de reactivo, tal como antes se describe. Este movimiento es efectuado por un solenoide 76 tal como antes se describe. El solenoide 76 se encuentra bajo el control de una unidad de control 77 cuyo funcionamiento se describirá más adelante. El solenoide es citado también en el presente contexto como "unos medios distribuidores para mover el dispositivo a aplicación de golpeo ligero con un soporte, cuando el dispositivo está colocado en una posición definida del conjunto con respecto a ese soporte".
El dispositivo distribuidor está soportado por un brazo 74 que está montado de manera roscable sobre un tornillo sinfín 80 propulsado (hecho girar) en una dirección deseada por un motor 82 de accionamiento gradual, también bajo el control de la unidad 77. En su extremo izquierdo en la figura, el tornillo 80 está soportado por un manguito 84 para girar en torno al eje de tornillo. En su otro extremo, el tornillo está montado en el árbol de accionamiento del motor de accionamiento gradual, que a su vez está soportado por un manguito 86. El dispositivo distribuidor, el tornillo sinfín, los dos manguitos que montan al tornillo sinfín, y el motor de accionamiento gradual, utilizado para mover el dispositivo en la dirección "x" (horizontal) en la figura, forman lo que se cita aquí colectivamente como un "conjunto para desplazamiento" 86.
El conjunto para desplazamiento está estructurado para producir un movimiento preciso en el margen de los micrómetros en la dirección del tornillo, es decir a lo largo de un eje "x" en la figura. En una modalidad, el conjunto funciona para mover el distribuidor por incrementos en el eje "x" que tienen una distancia seleccionada en el margen de 5-25 !m. En otra modalidad, la unidad distribuidora puede ser movida en incrementos exactos en el eje "x", de varios micrómetros o más, para colocar el distribuidor en posiciones asociadas sobre soportes adyacentes, como se describirá seguidamente.
El conjunto para desplazamiento, a su vez, está montado para movimiento en el eje "y" (vertical) de la figura, para colocar el distribuidor en una posición seleccionada en el eje "y". La estructura que monta el conjunto incluye una varilla fija 88 montada rígidamente entre un par de barras 90, 92 del bastidor, y un tornillo sinfín 94 montado para girar entre un par de barras 96, 98 del bastidor. El tornillo sinfín es propulsado (hecho girar) por un motor de accionamiento gradual 100 que funciona bajo el control de la unidad 77. El motor está montado sobre la barra 96, como se muestra.
La estructura que se acaba de describir, inclusive el tornillo sinfín 94 y el motor 100, está construida para producir un movimiento preciso en el margen de los micrómetros en la dirección del tornillo, es decir a lo largo de un eje "y" en la figura. Igual que anteriormente, la estructura funciona en una modalidad para mover el distribuidor por incrementos en el eje "y" que tienen una distancia seleccionada en el margen de 5-250 !m, y en una segunda modalidad, para mover el distribuidor por incrementos exactos en el eje "y" de varios micrómetros (
!m) o más, para colocar el distribuidor en posiciones asociadas sobre soportes adyacentes.
El conjunto de desplazamiento y la estructura para mover este conjunto en el eje "y" se citan en este contexto colectivamente como "medios de colocación" para colocar el dispositivo distribuidor en una posición seleccionada del grupo con respecto a un soporte.
Una montura de sostén 102 existente en el aparato funciona para sostener una pluralidad de soportes, tal como los soportes 104 sobre los cuales han de ser formados por el aparato los microconjuntos de regiones de reactivos. La montura de sostén proporciona un cierto número de ranuras rebajadas, tales como la ranura 106, que reciben a los soportes, y las coloca en posiciones seleccionadas exactas con respecto a las barras del bastidor en las que están montados los medios para movimiento del distribuidor.
Como antes se señala, la unidad de control en el dispositivo funciona para accionar a los dos motores de accionamiento gradual y al solenoide del distribuidor en una secuencia diseñada para un funcionamiento automático del aparato a fin de formar un microconjunto seleccionado de regiones de reactivos sobre cada soporte de una pluralidad de ellos.
La unidad de control está construida, de acuerdo con principios convencionales de control por microprocesadores, para proporcionar señales apropiadas a cada uno de los solenoides y a cada uno de los motores de accionamiento gradual, en una secuencia temporizada establecida y por un tiempo de señalización apropiado. La estructura de la unidad, y los ajustes que se seleccionan por el usuario para conseguir un diseño deseado de un conjunto, se entenderán a partir de la siguiente descripción de un funcionamiento típico del aparato.
Inicialmente, uno o más soportes se colocan dentro de una o más ranuras en la montura. El distribuidor es luego movido a una posición situada directamente por encima de un pocillo (no mostrado), que contiene una solución del primer reactivo que se ha de distribuir sobre el o los soporte(s). El solenoide del distribuidor es accionado ahora para hacer descender la punta del distribuidor dentro de este pocillo, dando lugar a que se llene el canal capilar del distribuidor. Ahora, los motores 82 y 100 son accionados para colocar el distribuidor en una posición seleccionada del conjunto en el primero de los soportes. El accionamiento del solenoide del distribuidor es entonces eficaz para distribuir una gotita de volumen seleccionado de este reactivo en este lugar. Como antes se señala, este funcionamiento es eficaz para distribuir un volumen seleccionado, preferiblemente entre 2 pl y 2 nl de la solución de reactivo.
Seguidamente, el distribuidor es movido a la posición correspondiente junto a un soporte adyacente y se suministra un volumen similar de la solución en esta posición. El proceso se repite hasta que el reactivo haya sido distribuido en esta posición correspondiente preseleccionada sobre cada uno de los soportes.
Cuando se desea distribuir un único reactivo en más de dos posiciones de un conjunto sobre un soporte, el distribuidor puede ser movido hasta diferentes posiciones en el conjunto junto a cada soporte, antes de mover el distribuidor hasta un nuevo soporte, o se puede suministrar una solución en posiciones individuales sobre cada soporte, en una posición seleccionada, y luego se repite el ciclo para cada nuevas posición en el conjunto.
Para suministrar el siguiente reactivo, el distribuidor se coloca sobre una solución de lavado (no mostrada), y la punta del distribuidor se sumerge en, y se saca de, esta solución hasta que la solución de reactivo haya sido sustancialmente separada por lavado con respecto de la punta. La solución se puede eliminar desde la punta, después de cada inmersión, por vacío, por proyección de aire comprimido, con una esponja o de un modo similar.
La punta del distribuidor es sumergida seguidamente en un segundo pocillo de reactivo, y la punta llena es movida hasta una segunda posición seleccionada del conjunto en el primer soporte. El proceso de suministrar un reactivo en cada una de las correspondientes posiciones del segundo conjunto se lleva a cabo como anteriormente. Este proceso se repite hasta que se haya formado un microconjunto completo de soluciones de reactivos sobre cada uno de los soportes.
Esta sección describe realizaciones de un substrato que tiene un microconjunto de polímeros biológicos soportados sobre la superficie del substrato. La subsección A describe un substrato de celdillas múltiples, conteniendo cada una de las celdillas de éste un microconjunto, y preferiblemente un microconjunto idéntico, de polímeros distintos, tales como polinucleótidos distintos, formado sobre una superficie porosa. La subsección B describe un microconjunto de polinucleótidos distintos unidos sobre un portaobjetos de vidrio que está revestido con un polímero policatiónico.
La Figura 9 ilustra, en una vista en planta, un substrato 110 construido de acuerdo con el invento. El substrato tiene un conjunto rectangular 112 de 8 x 12 celdillas, tales como las celdillas 114, 116, formadas sobre la superficie del substrato. Con referencia a la Figura 10, cada celdilla, tal como la celdilla 114, soporta a su vez a un microconjunto 118 de biopolímeros distintos, tales como polipéptidos o polinucleótidos en regiones conocidas a las que se puede acceder del microconjunto. Dos de tales regiones que forman el microconjunto se indican en 120 y corresponden a regiones, tales como las regiones 42, que forman el microconjunto de biopolímeros distintos mostrados en la Figura 3.
El conjunto de 96 celdillas, mostrado en la Figura 9, tiene típicamente unas dimensiones de conjunto comprendidas aproximadamente entre 12 y 244 mm en cuanto a la anchura y entre 8 y 400 mm en cuanto a la longitud, teniendo las celdillas en el conjunto unas dimensiones de anchura y longitud de 1/12 y 1/8 de las dimensiones de anchura y longitud del conjunto, respectivamente, es decir, entre aproximadamente 1 y 20 mm en cuanto a la anchura y de 1 a 50 mm en cuando a la longitud.
La estructura del substrato se muestra en sección transversal en la Figura 11, que es una vista en sección ampliada tomada a lo largo de la línea de observación 124 en la Figura 9. El substrato incluye un respaldo 126 impermeable al agua, tal como un portaobjetos de vidrio o una lámina de polímero rígido. Se ha formado sobre la superficie del respaldo una película 128 permeable al agua. La película se forma a base de un material de membrana porosa, tal como una membrana de nitrocelulosa, o un material de banda continua porosa, tal como un material polímero poroso de Nylon, polipropileno o PVDF. El espesor de la película está comprendido preferiblemente entre alrededor de 10 y 1.000 !m. La película puede ser aplicada al respaldo proyectando o aplicando como revestimiento un material sin curar sobre el respaldo, o aplicando una membrana previamente conformada al respaldo. El respaldo y la película se pueden obtener como una unidad previamente formada a partir de una fuente comercial, p. ej. una película de nitrocelulosa respaldada por un material plástico, que está disponible de la entidad Schleicher and Schuell Corporation.
Continuando la referencia a la Figura 11, la superficie cubierta por la película en el substrato es subdividida en un conjunto deseado de celdillas por líneas de rejilla impermeables al agua, tales como las líneas 130, 132, que se han infiltrado en la película hacia abajo hasta el nivel del respaldo, y se extienden por encima de la superficie de la película como se muestra, típicamente por una distancia de 100 a 2.000 !m por encima de la superficie de la película.
Las líneas de rejilla son formadas sobre el substrato extendiendo una solución de resina o elastómero, por lo demás capaz de fluir, dentro de una rejilla del conjunto, permitiendo que el material se infiltre en la película porosa hasta llegar al respaldo, y luego curando o endureciendo de otro modo las líneas de rejilla para formar el substrato de para el conjunto de celdillas.
Un material preferido para la rejilla es una silicona capaz de fluir disponible de Loctite Corporation. El material de barrera se puede extruir a través de una estrecha jeringa (p. ej., de calibre 22) utilizando presión neumática o presión mecánica. La jeringa es movida con relación al soporte sólido para imprimir los elementos de barrera como un diseño de rejilla. El glóbulo extruido de silicona se difunde por efecto de mecha dentro de los poros del soporte sólido y se cura para formar una barrera poco profunda impermeable al agua, que separa las regiones del soporte sólido.
En realizaciones alternativas, el elemento de barrera puede ser un material basado en cera o un material termoestable, tal como una resina epoxídica. El material de barrera puede ser también un polímero de curado por ultravioletas (UV), que es expuesto a una luz UV después de haber sido impreso sobre el soporte sólido. El material de barrera puede también ser aplicado al soporte sólido utilizando técnicas de impresión tales como la de impresión por serigrafía. El material de barrera puede ser también una estampación para obturación térmica del soporte sólido poroso que obtura sus poros y forma un elemento de barrera impermeable al agua. El material de barrera puede ser también una rejilla poco profunda, que es estratificada o adherida de otro modo al soporte sólido.
Además de la nitrocelulosa respaldada por un material plástico, el soporte sólido puede ser virtualmente cualquier membrana porosa con o sin un respaldo no poroso. Tales membranas están fácilmente disponibles de numerosos vendedores y se producen a base de Nylon, PVDF, polisulfona y polímeros similares. En una realización alternativa, el elemento de barrera se puede utilizar también para adherir la membrana porosa a un respaldo no poroso, además de funcionar como una barrera para evitar una contaminación cruzada de los reactivos para análisis.
En una realización alternativa, el soporte sólido puede ser de un material no poroso. La barrera puede ser impresa o bien antes o después de que el microconjunto de biomoléculas haya sido impreso sobre el soporte sólido.
Como se puede apreciar, las celdillas formadas por las líneas de rejilla y el respaldo subyacente son impermeables al agua, teniendo barreras laterales que sobresalen por encima de la película porosa en las celdillas. De este modo, muestras con volúmenes definidos pueden ser colocadas dentro de cada pocillo sin riesgo de contaminación cruzada con el material de muestra existente en celdillas adyacentes. En la Figura 11, se presentan dentro de las celdillas muestras de volúmenes definidos tales como la muestra 134.
Tal como antes se señala, cada pocillo contiene un microconjunto de biopolímeros distintos. En una realización general, los microconjuntos presentes en el pocillo son conjuntos idénticos de biopolímeros distintos, p. ej. polinucleótidos de secuencias diferentes. Dichos conjuntos se pueden formar de acuerdo con los métodos descritos en la Sección II, depositando un primer polinucleótido seleccionado en la misma posición seleccionada de microconjunto dentro de cada una de las celdillas, luego depositando un segundo polinucleótido en una diferente posición de microconjunto dentro de cada pocillo, y así sucesivamente hasta que se forme en cada celdilla un microconjunto idéntico completo.
En una realización preferida, cada microconjunto contiene aproximadamente 103 biopolímeros polinucleótidos o
polipéptidos distintos por unidad de área de superficie de menos de aproximadamente 1 cm2. También en una realización preferida, los biopolímeros existentes en cada región del microconjunto están presentes en una cantidad definida comprendida entre alrededor de 0,1 femtomoles y 100 nanomoles. La capacidad para formar conjuntos de alta densidad de biopolímeros, en los que cada región está formada por una cantidad bien definida de material depositado, se puede conseguir de acuerdo con el método de formación de microconjuntos que se describe en la Sección II.
También en una realización preferida, los biopolímeros son polinucleótidos que tienen unas longitudes de al menos aproximadamente 50 pares de bases (pb), es decir sustancialmente más largos que los oligonucleótidos que se pueden formar en conjuntos de alta densidad por esquemas que implican una síntesis paralela y escalonada del polímero sobre la superficie de los conjuntos.
En el caso de un conjunto de polinucleótidos, en un proceso de análisis, un pequeño volumen de la mezcla de sonda de ADN marcado en una solución de hibridación normalizada, se carga sobre cada celdilla. La solución se desparramará para cubrir todo el microconjunto y se detendrá junto a los elementos de barrera. Luego el soporte sólido se incuba en una cámara húmeda a la temperatura apropiada, como se requiera por el análisis.
Cada análisis se puede realizar en un formato de "cara abierta" en el que no se requiere ninguna operación adicional de obturación, puesto que la solución de hibridación será mantenida apropiadamente hidratada por el vapor de agua en la cámara húmeda. A la conclusión de la operación de incubación, la totalidad del soporte sólido, que contiene los numerosos microconjuntos, se enjuaga con suficiente rapidez para diluir los reactivos para análisis de manera tal que no se produzca ninguna importante contaminación cruzada. Todo el soporte sólido se hace reaccionar luego con reactivos para detección, si se necesitan, y se analizan utilizando medios de detección colorimétricos, radiactivos o fluorescentes normalizados. Todas las operaciones de tratamiento y detección se realizan simultáneamente para todos los microconjuntos situados sobre el soporte sólido, asegurando unas condiciones uniformes del análisis para todos los microconjuntos situados sobre el soporte sólido.
La Figura 5 muestra un substrato 136 formado de acuerdo con otro aspecto del invento y destinado a utilizarse en la detección de la unión de polinucleótidos marcados a uno o más entre una pluralidad de distintos polinucleótidos. El substrato incluye un substrato de vidrio 138 que tiene formado sobre su superficie un revestimiento de un polímero policatiónico, preferiblemente un polipéptido catiónico, tal como una polilisina o una poliarginina. Se ha formado sobre el revestimiento policatiónico un microconjunto 140 de polinucleótidos distintos, cada uno de ellos situado en regiones seleccionadas conocidas del conjunto, tales como las regiones 142.
El portaobjetos es revestido colocando una película de espesor uniforme de un polímero policatiónico, p. ej. de poli-llisina, sobre la superficie de un portaobjetos y secando la película para formar un revestimiento seco. La cantidad de polímero policatiónico que se añade es suficiente para formar por lo menos una monocapa de polímero sobre la superficie de vidrio. La película del polímero es unida a la superficie a través de una unión electrostática entre grupos silil-OH negativos sobre la superficie y grupos amino cargados eléctricamente en los polímeros. Los portaobjetos revestidos con poli-l-lisina se pueden obtener comercialmente, p. ej. de la entidad Sigma Chemical Co. (St. Louis, MO).
Para formar el microconjunto, se depositan volúmenes definidos de polinucleótidos distintos sobre el portaobjetos revestido con polímero, como se describe en la Sección II. De acuerdo con una característica importante del substrato, los polinucleótidos depositados permanecen unidos no covalentemente a la superficie revestida del portaobjetos cuando una muestra acuosa de ADN es aplicada al substrato en condiciones que permiten la hibridación de polinucleótidos marcados con reporteros en la muestra a polinucleótidos de secuencia complementaria (monocatenarios) en el conjunto del substrato. El método es ilustrado en los Ejemplos 1 y 2.
Para ilustrar esta característica, un substrato del tipo que se acaba de describir, pero que tenía un conjunto de polinucleótidos con la misma secuencia, se mezcló con ADN complementario marcado fluorescentemente en condiciones de hibridación. Después de haber lavado para eliminar el material no hibridado, el substrato se examinó mediante microscopía con fluorescencia de baja potencia. El conjunto puede ser visualizado por el reactivo de marcación relativamente uniforme de la regiones del conjunto.
En una realización preferida, cada microconjunto contiene por lo menos 103 biopolímeros polinucleótidos o polipéptidos
distintos por unidad de área de superficie menor que aproximadamente 1 cm2. En la realización mostrada en la Figura 5,
el microconjunto contiene 400 regiones en un área de aproximadamente 16 mm2, o 2,5 x 103 regiones/cm2. También en una realización preferida, los biopolímeros existentes en cada región del microconjunto están presentes en una cantidad definida entre aproximadamente 0,1 femtomoles y 100 nanomoles en el caso de los polinucleótidos. Igual que anteriormente, la capacidad para formar conjuntos de alta densidad de este tipo, en que cada región está formada por una cantidad bien definida de material depositado, se puede conseguir de acuerdo con el método para formar microconjuntos que se describe en la Sección II.
Los polinucleótidos tienen una longitud de por lo menos aproximadamente 50 pb, es decir son sustancialmente más largos que los oligonucléotidos que pueden ser formados en conjuntos de alta densidad por diversos esquemas de síntesis in situ.
Los microconjuntos de secuencias de ácidos nucleicos inmovilizados que se han preparado de acuerdo con el invento, pueden utilizarse para análisis de hibridación a gran escala en numerosas aplicaciones genéticas, inclusive el cartografiado genético y físico de los genomas, la vigilancia de la expresión de genes, la secuenciación de ADN, el diagnóstico genético, la genotipación de organismos y la distribución de reactivos de ADN a los investigadores.
Para el cartografiado de genes, un gen o un fragmento de ADN clonado es hibridado con un conjunto ordenado de fragmentos de ADN, y la identidad de los elementos de ADN aplicados a este conjunto se demuestra sin ambigüedad por el pixel o la pauta de pixeles del conjunto, que se detectan. Una aplicación de tales conjuntos para crear un mapa genético es descrito por Nelson y colaboradores (1993). Para construir mapas físicos del genoma, se hibridan conjuntos de fragmentos de ADN clonados e inmovilizados con otros fragmentos clonados de ADN para determinar si los fragmentos clonados en la mezcla de sonda se solapan y por lo tanto son contiguos a los clones inmovilizados existentes en el conjunto. Por ejemplo Lehrach y colaboradores describen tal procedimiento.
Los conjuntos de fragmentos de ADN inmovilizados pueden ser utilizados también para diagnósticos genéticos. Como ilustración, un conjunto que contiene formas múltiples de un gen o varios genes mutado(s) se puede sondear con una mezcla marcada del ADN de un paciente, que preferentemente interactuará con solamente una de las versiones inmovilizadas del gen.
La detección de esta interacción puede conducir a un diagnóstico médico. Los conjuntos de fragmentos de ADN inmovilizados se pueden utilizar también en diagnósticos con sondas de ADN. Por ejemplo, la identidad de un microorganismo patógeno se puede demostrar sin ambigüedad hibridando una muestra del ADN de patógeno desconocido con un conjunto que contiene muchos tipos de ADN patogénicos conocidos. Una técnica similar se puede utilizar también para genotipar sin ambigüedad cualquier organismo. Otras moléculas de interés genético, tales como ADNc's y ARN's se pueden inmovilizar sobre el conjunto o alternativamente se pueden utilizar como la mezcla de sonda marcada que es aplicada al conjunto.
En una aplicación, un conjunto de clones de ADNc que representan a genes es hibridado con el ADNc total procedente de un organismo para vigilar la expresión de genes con finalidades de investigación o diagnóstico. La marcación del ADNc total procedente de una célula normal con un fluoróforo coloreado y del ADNc total procedente de una célula enferma con un fluoróforo de otro color distinto, y la hibridación simultánea de las dos muestras de ADNc con el mismo conjunto de clones de ADNc permite que la expresión diferencial de genes sea medida como la relación de las dos intensidades de fluoróforos. Este experimento en dos colores se puede utilizar para vigilar la expresión de genes en diferentes tipos de tejidos, estados de enfermedad, la respuesta a fármacos, o la respuesta a factores ambientales. Un ejemplo de este enfoque es ilustrado en el Ejemplo 2, que se describe con respecto a la Figura 8.
Por vía de ejemplo y sin implicar ninguna limitación del alcance, tal procedimiento se podría usar para explorar simultáneamente a muchos pacientes contra todas las mutaciones conocidas en un gen de una enfermedad. Este invento se podría utilizar en la forma de, por ejemplo, 96 microconjuntos idénticos de 0,9 cm x 2,2 cm producidos sobre una única lámina de 12 cm x 18 cm de nitrocelulosa respaldada con material plástico, en que cada microconjunto podría contener por ejemplo 100 fragmentos de ADN que representen todas las mutaciones conocidas de un gen dado. La región que interesa de cada una de las muestras de ADN de 96 pacientes se podría amplificar, marcar e hibridar con los 96 conjuntos individuales, realizándose cada análisis en 100 microlitros de una solución para hibridación. Los elementos de barrera de caucho de silicona, con un espesor de aproximadamente 1 !m, situados entre conjuntos individuales impiden la contaminación cruzada de las muestras de un paciente, obturando los poros de la nitrocelulosa y actuando como una barrera física entre cada microconjunto. El soporte sólido que contiene la totalidad de los 96 microconjuntos analizados con las 96 muestras de pacientes, es incubado, enjuagado, detectado y analizado como una única lámina de material utilizando medios clásicos de detección radiactiva, fluorescente o colorimétrica (Maniatis y colaboradores, 1989). Con anterioridad, dicho proceso hubiera implicado la manipulación, la elaboración y el seguimiento de 96 membranas separadas en 96 membranas cerradas herméticamente y separadas. Tratando la totalidad de los 96 conjuntos como una única lámina de material, son posibles importantes ahorros de tiempo y costos.
El formato de análisis puede ser invertido cuando el ADN del paciente o del organismo es inmovilizado como los elementos de conjuntos y cada conjunto es hibridado con un diferente alelo mutado o marcador genético. El soporte sólido enrejillado se puede utilizar también para análisis ELISA paralelos que no se refieran a ADN. Además, el invento permite el uso de todos los métodos clásicos de detección sin la necesidad de retirar los elementos de barrera poco profundos a fin de llevar a cabo la operación de detección.
Además de las aplicaciones genéticas antes enumeradas, conjuntos de células enteras, péptidos, enzimas, anticuerpos, antígenos, receptores, ligandos, fosfolípidos, polímeros, preparaciones cogenéricas de fármacos o sustancias químicas, se pueden producir por los medios descritos en este invento para análisis de exploración a gran escala en diagnósticos médicos, descubrimiento de fármacos, biología molecular, inmunología y toxicología.
El aspecto de substrato de celdillas múltiples del invento permite la exploración rápida y conveniente de muchas sondas de ADN frente a muchos conjuntos ordenados de fragmentos de ADN. Esto elimina la necesidad de manipular y detectar muchos conjuntos individuales a fin de realizar exploraciones a gran escala para aplicaciones de investigación genética y diagnóstico. Numerosos microconjuntos pueden ser producidos sobre el mismo soporte sólido y cada microconjunto se puede hacer reaccionar con una diferente sonda de ADN mientras que el soporte sólido está siendo tratado como una única lámina de material.
Los siguientes ejemplos ilustran el presente invento, pero de ninguna manera están destinados a limitarlo.
Ejemplo 1
Hibridación de complejidad genómica con micro-conjuntos de ADN que representan el genoma de la levadura Saccharomyces cerevisiae con detección fluorescente en dos colores
Los elementos de conjuntos eran productos de PCR amplificados aleatoriamente (Bohlander y colaboradores, 1992) utilizando clones lambda cartografiados físicamente de moldes de ADN genómico de S. cerevisiae (Riles y colaboradores, 1993). La PCR fue realizada directamente en los materiales lisados de fagos lambda dando como resultado una amplificación tanto del vector lambda de 35 kb como de las secuencias del inserto de levadura de 5-15 kb en la forma de una distribución uniforme del producto de PCR que tiene una longitud comprendida entre 250 y 1.500 pares de bases. El producto de PCR se purificó utilizando una filtración a través de gel de Sephadex G50 (Pharmacia, Piscataway, NJ) y se concentró por evaporación hasta sequedad a la temperatura ambiente durante una noche. Cada uno de los 864 clones lambda amplificados fue rehidratado en15 !l de 3 x SSC como preparaci ón para laaplicación en motas (moteado) sobre el vidrio.
Los microconjuntos fueron producidos sobre portaobjetos de microscopio, que fueron revestidos con una capa de poli-llisina (Sigma). El aparato automático descrito en la Sección IV cargaba 1!l del producto de PCR de un clon lambda concentrado en 3 x SSC directamente a partir de placas de almacenamiento de 96 pocillos dentro del elemento impresor capilar abierto y depositaba 5 nl de muestra por cada portaobjetos a una distancia de 380 micrometros entre motas, sobre cada uno de 40 portaobjetos. El proceso se repitió para la totalidad de las 864 muestras y 8 motas de control. Después de que se hubiera completado la operación de moteado, los portaobjetos fueron vueltos a hidratar en una cámara húmeda durante 2 horas, cocidos en una estufa a vacío seca a 801C durante 3 horas, enjuagados para eliminar el ADN sin absorber y luego tratados con anhídrido succínico para reducir la adsorción inespecífica de la sonda de hibridación marcada a la superficie de vidrio revestida con poli-l-lisina. Inmediatamente antes del uso, el ADN inmovilizado situado sobre el conjunto fue desnaturalizado en agua destilada a 901C durante 2 minutos.
Para el experimento de cromosomas agrupados, los 16 cromosomas de Saccharomyces cerevisiae fueron separados en un aparato con gel de agarosa CHEF (Biorad, Richmond, CA). Los seis cromosomas de mayor tamaño fueron aislados en una rodaja de gel y los 10 cromosomas de menor tamaño lo fueron en una segunda rodaja de gel. El ADN fue recuperado utilizando un estuche de ensayo para extracción con gel (Qiagen, Chatsworth, CA). Las dos agrupaciones de cromosomas fueron amplificadas aleatoriamente de una manera similar a la utilizada para los clones lambda dianas. Después de la amplificación, 5 microgramos de cada una de las agrupaciones de cromosomas amplificados fueron marcados con un cebador aleatoriamente por separado utilizando la polimerasa de Klenow (Amersham, Arlington Heights IL) con un compuesto análogo a un nucleótido conjugado con lissamina (Dupont NEN, Boston, MA) para la agrupación que contenía los seis cromosomas de mayor tamaño, y con un compuesto análogo a nucleótido conjugado con fluoresceína (BMB) para la agrupación que contenía los diez cromosomas de menor tamaño. Las dos agrupaciones fueron mezcladas y concentradas utilizando un dispositivo de ultrafiltración (Amicon, Danvers, MA).
Cinco microgramos de la sonda de hibridación que constaba de ambas agrupaciones de cromosomas en 7,5 !l de TE se desnaturalizaron en un baño de agua hirviendo y luego se enfriaron bruscamente sobre hielo. Se añadieron 2,5 !l de solución de hibridación concentrada (5 x SSC y SDS al 0,1%) y la totalidad de los 10 !l se transfirió a la superficie de los conjuntos, se cubrió con un cubreobjetos, se colocó dentro de una cámara húmeda con un único portaobjetos estructurado según las necesidades, y se incubó a 601C durante 12 horas. Los portaobjetos fueron luego enjuagados a la temperatura ambiente en 0,1 x SSC y SDS al 0,1% durante 5 minutos, cubiertos con cubreobjetos y explorados.
Un explorador fluorescente de láser construido según las necesidades se utilizó para detectar las señales de hibridación en dos colores procedentes del conjunto de 1,8 x 1,8 cm con una resolución de 20 micrómetros. La imagen explorada fue subdividida por enrejillado y analizada utilizando un sistema lógico acostumbrado para análisis de imágenes. Después de haber corregido en cuanto a la diafotía óptica entre los fluoróforos debido a sus espectros de emisión solapados, los valores de hibridación de rojo y verde para cada clon en el conjunto fueron correlacionados con la conocida posición en el mapa físico del clon dando como resultado un cariotipo en colores generado por ordenador del genoma de la levadura.
La Figura 6 muestra el diseño de hibridación de las dos agrupaciones de cromosomas. Una señal roja indica que el clon lambda situado sobre la superficie del conjunto contiene un segmento de ADN genómico clonado procedente de uno de los seis cromosomas de mayor tamaño de la levadura. Una señal verde indica que el inserto de clon lambda procede de uno de los diez cromosomas de menor tamaño de la levadura. Las señales anaranjadas indican secuencias periódicamente repetidas que se hibridan de modo cruzado con ambas agrupaciones de cromosomas. Unas motas testigos sobre el conjunto confirman que la hibridación es específica y reproducible.
Las situaciones en un mapa físico de los fragmentos de ADN genómicos contenidos en cada uno de los clones utilizados como elementos de conjuntos han sido previamente determinadas por Olsson y colaboradores (Riles y colaboradores) permitiendo la generación automática del cariotipo en colores que se muestra en la Figura 7. El color de una sección de cromosoma en el cariotipo corresponde al color del elemento de conjunto que contiene el clon procedente de esa sección. Las regiones en negro del cariotipo representan motas oscuras falsamente negativas en el conjunto (10%) o regiones del genoma que no están cubiertas por la genoteca de clones de Olsson (90%). Obsérvese que los seis cromosomas de mayor tamaño son principalmente rojos mientras que los diez cromosomas de menor tamaño son principalmente verdes equiparándose al aislamiento en gel CHEF original de la sonda de hibridación. Las zonas de los cromosomas en rojo que contienen motas verdes, y viceversa, son probablemente debidas a errores de seguimiento de muestras espurias en la formación de la genoteca original y en los procesos de amplificación y moteado.
Los conjuntos de genomas de levadura han sido también sondeados con clones individuales o agrupaciones de clones que se han marcados fluorescentemente para finalidades de cartografiado físico. Las señales de hibridación de estos clones con el conjunto fueron traducidas a una posición sobre el mapa físico de la levadura.
Ejemplo 2
ADNc total hibridado a microconjuntos de clones de ADNc con detección fluorescente en dos colores
24 Clones que contenían insertos de ADNc procedentes de la planta Arabidopsis fueron amplificados utilizando una PCR. Se añadió una sal a los productos purificados de la PCR hasta una concentración final de 3 x SSC. Los clones de ADNc fueron moteados sobre portaobjetos de microscopio revestidos con poli-l-lisina, de una manera similar a la del Ejemplo 1. Entre los clones de ADNc había un clon que representaba a un factor de transcripción HAT 4, que se había utilizado previamente para crear una línea transgénica de la planta Arabidopsis, en que este gen está presente en un nivel diez veces mayor que el encontrado en Arabidopsis de tipo salvaje (Schena y colaboradores, 1992).
El ARNm de poli-A total procedente de Arabidopsis de tipo salvaje se aisló utilizando métodos clásicos (Maniatis y colaboradores, 1989) y fue transcrito inversamente en el ADNc total utilizando un compuesto análogo a nucleótido con fluoresceína para marcar el producto de ADNc (fluorescencia verde). Se realizó un proceso similar con la línea transgénica de Arabidopsis en la que el factor de transcripción HAT 4 había sido insertado en el genoma utilizando protocolos clásicos de transferencia de genes. Las copias de ADNc de un ARNm procedente de la planta transgénica son marcadas con un compuesto análogo a nucleótido con lissamina (fluorescencia roja). Dos microgramos de los productos de ADNc procedentes de cada tipo de planta fueron agrupados conjuntamente e hibridados con el conjunto de clones de ADNc en una reacción de hibridación de 10 microlitros, de una manera similar al Ejemplo 1. El enjuague y la detección de la hibridación se realizaron también de una manera similar a la del Ejemplo 1. La Figura 8 muestra el modelo de hibridación resultante del conjunto.
Genes expresados de igual manera en una Arabidopsis de tipo salvaje y en la Arabidopsis transgénica aparecieron coloreados de amarillo debido a las iguales contribuciones de las fluorescencias verde y roja a la señal final. Las motas son de diferentes intensidades de amarillo, indicando diversos niveles de expresión de genes. El clon de ADNc que representa al factor de transcripción HAT 4, expresado en la línea transgénica de Arabidopsis pero no expresado detectablemente en Arabidopsis de tipo salvaje, aparece como una mota roja (apuntando la flecha hacia ella), indicando la expresión preferente del factor de transcripción en la Arabidopsis transgénica marcada de rojo y la falta relativa de expresión del factor de transcripción en la Arabidopsis de tipo salvaje marcada de verde.
Una ventaja del formato de hibridación de microconjuntos para estudios de expresión de genes, es la alta concentración parcial de cada especie de ADNc que se puede conseguir en la reacción de hibridación de 10 microlitros. Esta alta concentración parcial permite la detección de transcritos raros sin la necesidad de una amplificación por PCR de la sonda de hibridación, que puede influir sobre la verdadera representación genética de cada especie de ADNc discreto.
Estudios de expresión de genes, tales como éstos, se pueden utilizar para una investigación genómica con el fin de descubrir cuáles genes son expresados en qué tipos de células, estados de enfermedad, estados de desarrollo o condiciones ambientales. Se pueden utilizar también estudios de expresión de genes para el diagnóstico de una enfermedad correlacionando empíricamente los modelos de expresión de genes con estados de enfermedad.
Ejemplo 3
Hibridación colorimétrica multiplexada sobre un soporte sólido enrejillado
Una lámina de nitrocelulosa respaldada por un material plástico fue enrejillada con elementos de barrera hechos de un caucho de silicona, de acuerdo con la descripción dada en la Sección IV-A. La lámina fue empapada en 10 x SSC y dejada secarse. Como se muestra en la Figura 12, 192 clones de M13, cada uno con un diferente inserto de levadura, fueron agrupados en conjuntos a una distancia de 400 micrómetros en cuatro cuadrantes del soporte sólido, utilizando el dispositivo automático descrito en la Sección III. El cuadrante izquierdo inferior sirvió como testigo negativo para hibridación mientras que cada uno de los otros tres cuadrantes fue hibridado simultáneamente con un diferente oligonucleótido utilizando la tecnología de hibridación de cara abierta que se describe en la Sección IV-A. Los primeros dos elementos y los últimos cuatro elementos de cada agrupación son testigos positivos para la operación de detección colorimétrica.
Los oligonucleótidos fueron marcados con la fluoresceína que había sido detectada utilizando un anticuerpo antifluoresceína conjugado con fosfatasa alcalina, que había precipitado un colorante NBT/BCIP sobre el soporte sólido (Amersham). Las perfectas conjugaciones entre los oligómeros marcados y los clones de M13 dieron como resultado motas oscuras visibles a simple vista y detectadas utilizando un rastreador óptico (HP ScanJet II) acoplado a un ordenador personal. Los diseños de hibridación son diferentes en cada uno de los cuadrantes, indicando que cada oligo encontró varios clones de M13 singulares entre los 192, con una perfecta conjugación de secuencias. Obsérvese que la punta de impresión de capilar abierto deja hoyuelos detectables sobre la nitrocelulosa, que se pueden utilizar para alinear y analizar las imágenes automáticamente.
Claims (11)
- REIVINDICACIONES1.- Un método para formar un microconjunto de regiones de análisis específicas para un analito sobre un soporte sólido o una pluralidad de soportes sólidos, que comprende:
- (a)
- cargar una solución de un reactivo de análisis específico para un analito en un dispositivo distribuidor de reactivos, que tiene un canal capilar alargado (i) formado por miembros alargados de la misma extensión y separados entre sí, (ii) adaptado para retener una cantidad seleccionada de la solución de reactivo, y (iii) que tiene una región de punta en la que la solución de reactivo existente en el canal forma un menisco,
- (b)
- golpear ligeramente la punta del dispositivo distribuidor contra el soporte sólido en una posición definida del soporte sólido, con un impulso eficaz para romper el menisco en el canal capilar y depositar un volumen seleccionado de la solución de reactivo sobre el o los soporte(s) sólido(s), y
- (c)
- repetir las operaciones (a) y (b) con diferentes reactivos de análisis específicos para analitos, depositados en diferentes posiciones definidas sobre el (los) soporte(s) sólido(s), hasta que se formen el (los) microconjunto(s).
- 2.- El método según la reivindicación 1, en el que el microconjunto tiene regiones discretas de análisis, específicas para analitos, y cada región discreta en el microconjunto tiene un reactivo de análisis seleccionado, específico para un analito.
- 3.- El método según la reivindicación 2, en el que el volumen seleccionado se encuentra entre 0,002 y 2 nl.
- 4.-El método de la reivindicación 1, 2 ó 3, en el que los reactivos de análisis específicos para un analito son cadenas deácidos nucleicos y en que el microconjunto tiene al menos aproximadamente 1.000 regiones discretas por cm2 del soporte sólido.
- 5.- El método de la reivindicación 4, en el que las cadenas de ácido nucleico son polinucleótidos distintos y en el que cada polinucleótido distinto está colocado en una región separada del microconjunto.
- 6.- El método de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, que comprende, después de haber realizado las operaciones (a) y (b), la operación de volver a cargar el dispositivo distribuidor de reactivos con una nueva solución de reactivo de análisis específico para un analito mediante las operaciones de (i) sumergir el canal capilar del dispositivo en una solución de lavado, (ii) eliminar la solución de lavado arrastrada dentro del canal capilar, y (iii) sumergir el canal capilar en la nueva solución de reactivo.
- 7.- El método de las reivindicaciones 5 ó 6, que comprende la operación de inmovilizar los polinucleótidos distintos en las regiones separadas del microconjunto.
- 8.- Un aparato útil para formar un microconjunto de regiones de análisis de analitos sobre una pluralidad de soportes sólidos, en el que cada región tiene un reactivo seleccionado, específico para un analito, que comprende
- (a)
- una montura para sostener, en posiciones conocidas, una pluralidad de soportes planos,
- (b)
- un dispositivo distribuidor de reactivos que tiene un canal capilar alargado abierto formado por miembros alargados de la misma extensión y separados entre sí, adaptados para sostener una cantidad de la solución de reactivo y que tiene una región de punta en la que la solución de reactivo existente en el canal forma un menisco,
- (c)
- medios de colocación para colocar el dispositivo distribuidor en una posición seleccionada del conjunto con respecto a un soporte en dicha montura,
- (d)
- medios distribuidores para mover el dispositivo a aplicación de golpeo ligero contra un soporte con un impulso seleccionado, cuando el dispositivo distribuidor está colocado en una posición definida del microconjunto con respecto a ese soporte, con un impulso eficaz para romper el menisco de líquido en el canal capilar y depositar un volumen seleccionado de solución sobre la superficie, y
- (e)
- medios de control para controlar y posicionar los medios distribuidores.
- 9.- El aparato de la reivindicación 8, en el que el dispositivo distribuidor de reactivos deposita entre aproximadamente 0,002 y 100 nl del reactivo para análisis específico para un analito en cada región del microconjunto.
- 10.- Un substrato con una superficie que comprende un microconjunto de distintos polinucleótidos, en el que (i) elmicroconjunto tiene al menos aproximadamente 1.000 regiones discretas de polinucleótidos por cm2 de superficie del substrato, (ii) cada polinucleótido distinto está colocado en una región separada del microconjunto, y (iii) cada polinucleótido distinto tiene una longitud de al menos 50 subunidades.
- 11.- Un substrato con una superficie que comprende un microconjunto de polinucleótidos distintos que tienen una longitud de al menos 50 subunidades, obtenible por el método de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, en el queel microconjunto tiene al menos aproximadamente 1.000 regiones discretas de polinucleótidos distintos por cm2 desuperficie del substrato. 12.- El substrato de la reivindicación 10 ó 11, en el que la superficie del substrato es hidrófoba. 13.- El substrato de la reivindicación 10 ó 11, en que este substrato es vidrio. 14.- El substrato de una cualquiera de las reivindicaciones 10 a 13, en el que los polinucleótidos son secuenciasderivadas de ARNm, secuencias de ADN genómico o fragmentos de ellas.
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Families Citing this family (1382)
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---|---|---|---|---|
US6054270A (en) * | 1988-05-03 | 2000-04-25 | Oxford Gene Technology Limited | Analying polynucleotide sequences |
US6379895B1 (en) | 1989-06-07 | 2002-04-30 | Affymetrix, Inc. | Photolithographic and other means for manufacturing arrays |
US6309822B1 (en) * | 1989-06-07 | 2001-10-30 | Affymetrix, Inc. | Method for comparing copy number of nucleic acid sequences |
US6040138A (en) * | 1995-09-15 | 2000-03-21 | Affymetrix, Inc. | Expression monitoring by hybridization to high density oligonucleotide arrays |
US6551784B2 (en) | 1989-06-07 | 2003-04-22 | Affymetrix Inc | Method of comparing nucleic acid sequences |
US6406844B1 (en) | 1989-06-07 | 2002-06-18 | Affymetrix, Inc. | Very large scale immobilized polymer synthesis |
US5143854A (en) | 1989-06-07 | 1992-09-01 | Affymax Technologies N.V. | Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof |
US5800992A (en) | 1989-06-07 | 1998-09-01 | Fodor; Stephen P.A. | Method of detecting nucleic acids |
US6346413B1 (en) | 1989-06-07 | 2002-02-12 | Affymetrix, Inc. | Polymer arrays |
US5547839A (en) * | 1989-06-07 | 1996-08-20 | Affymax Technologies N.V. | Sequencing of surface immobilized polymers utilizing microflourescence detection |
US5744101A (en) | 1989-06-07 | 1998-04-28 | Affymax Technologies N.V. | Photolabile nucleoside protecting groups |
US6506558B1 (en) | 1990-03-07 | 2003-01-14 | Affymetrix Inc. | Very large scale immobilized polymer synthesis |
EP1231282A3 (en) | 1990-12-06 | 2005-05-18 | Affymetrix, Inc. | Methods and compositions for identification of polymers |
US6468740B1 (en) | 1992-11-05 | 2002-10-22 | Affymetrix, Inc. | Cyclic and substituted immobilized molecular synthesis |
US6943034B1 (en) | 1991-11-22 | 2005-09-13 | Affymetrix, Inc. | Combinatorial strategies for polymer synthesis |
DE69233087T2 (de) * | 1991-11-22 | 2003-12-24 | Affymetrix Inc N D Ges D Staat | Verfahren zur Herstellung von Polymerarrays |
US5795714A (en) * | 1992-11-06 | 1998-08-18 | Trustees Of Boston University | Method for replicating an array of nucleic acid probes |
US5605798A (en) | 1993-01-07 | 1997-02-25 | Sequenom, Inc. | DNA diagnostic based on mass spectrometry |
DE4344726C2 (de) * | 1993-12-27 | 1997-09-25 | Deutsches Krebsforsch | Verfahren zum Nachweis von nicht balanciertem genetischen Material einer Spezies oder zum Nachweis der Genexpression in Zellen einer Spezies |
US6287850B1 (en) * | 1995-06-07 | 2001-09-11 | Affymetrix, Inc. | Bioarray chip reaction apparatus and its manufacture |
US7615368B1 (en) | 1994-06-17 | 2009-11-10 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Microarrays of polypeptides |
US5807522A (en) * | 1994-06-17 | 1998-09-15 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods for fabricating microarrays of biological samples |
US7323298B1 (en) * | 1994-06-17 | 2008-01-29 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Microarray for determining the relative abundances of polynuceotide sequences |
GB9418981D0 (en) * | 1994-09-21 | 1994-11-09 | Univ Glasgow | Apparatus and method for carrying out analysis of samples |
USRE43097E1 (en) | 1994-10-13 | 2012-01-10 | Illumina, Inc. | Massively parallel signature sequencing by ligation of encoded adaptors |
US6121048A (en) * | 1994-10-18 | 2000-09-19 | Zaffaroni; Alejandro C. | Method of conducting a plurality of reactions |
US5795716A (en) | 1994-10-21 | 1998-08-18 | Chee; Mark S. | Computer-aided visualization and analysis system for sequence evaluation |
US8236493B2 (en) | 1994-10-21 | 2012-08-07 | Affymetrix, Inc. | Methods of enzymatic discrimination enhancement and surface-bound double-stranded DNA |
SE9404166D0 (sv) * | 1994-11-30 | 1994-11-30 | Pharmacia Biotech Ab | Multifunctional surfaces |
US5830645A (en) * | 1994-12-09 | 1998-11-03 | The Regents Of The University Of California | Comparative fluorescence hybridization to nucleic acid arrays |
US6428955B1 (en) | 1995-03-17 | 2002-08-06 | Sequenom, Inc. | DNA diagnostics based on mass spectrometry |
US7803529B1 (en) | 1995-04-11 | 2010-09-28 | Sequenom, Inc. | Solid phase sequencing of biopolymers |
US5830655A (en) | 1995-05-22 | 1998-11-03 | Sri International | Oligonucleotide sizing using cleavable primers |
US5690894A (en) * | 1995-05-23 | 1997-11-25 | The Regents Of The University Of California | High density array fabrication and readout method for a fiber optic biosensor |
US6720149B1 (en) * | 1995-06-07 | 2004-04-13 | Affymetrix, Inc. | Methods for concurrently processing multiple biological chip assays |
US6660233B1 (en) * | 1996-01-16 | 2003-12-09 | Beckman Coulter, Inc. | Analytical biochemistry system with robotically carried bioarray |
EP0880598A4 (en) | 1996-01-23 | 2005-02-23 | Affymetrix Inc | RAPID EVALUATION OF NUCLEIC ACID ABUNDANCE DIFFERENCE, WITH A HIGH-DENSITY OLIGONUCLEOTIDE SYSTEM |
US6965020B2 (en) | 1996-01-23 | 2005-11-15 | Affymetrix, Inc. | Nucleic acid labeling compounds |
US6864059B2 (en) | 1996-01-23 | 2005-03-08 | Affymetrix, Inc. | Biotin containing C-glycoside nucleic acid labeling compounds |
US7423143B2 (en) | 1996-01-23 | 2008-09-09 | Affymetrix. Inc. | Nucleic acid labeling compounds |
US7291463B2 (en) | 1996-01-23 | 2007-11-06 | Affymetrix, Inc. | Nucleic acid labeling compounds |
US7282327B2 (en) | 1996-01-23 | 2007-10-16 | Affymetrix, Inc. | Nucleic acid labeling compounds |
US20010018514A1 (en) | 1998-07-31 | 2001-08-30 | Mcgall Glenn H. | Nucleic acid labeling compounds |
US5837196A (en) * | 1996-01-26 | 1998-11-17 | The Regents Of The University Of California | High density array fabrication and readout method for a fiber optic biosensor |
US6051378A (en) * | 1996-03-04 | 2000-04-18 | Genetrace Systems Inc. | Methods of screening nucleic acids using mass spectrometry |
US6881571B1 (en) * | 1998-03-11 | 2005-04-19 | Exonhit Therapeutics S.A. | Qualitative differential screening |
US6361937B1 (en) | 1996-03-19 | 2002-03-26 | Affymetrix, Incorporated | Computer-aided nucleic acid sequencing |
US7244622B2 (en) * | 1996-04-03 | 2007-07-17 | Applera Corporation | Device and method for multiple analyte detection |
US6586193B2 (en) * | 1996-04-25 | 2003-07-01 | Genicon Sciences Corporation | Analyte assay using particulate labels |
US5958342A (en) * | 1996-05-17 | 1999-09-28 | Incyte Pharmaceuticals, Inc. | Jet droplet device |
US5770151A (en) * | 1996-06-05 | 1998-06-23 | Molecular Dynamics, Inc. | High-speed liquid deposition device for biological molecule array formation |
DE19628928A1 (de) | 1996-07-18 | 1998-01-22 | Basf Ag | Feste Träger für analytische Meßverfahren, ein Verfahren zu ihrer Herstellung sowie ihre Verwendung |
US6582921B2 (en) * | 1996-07-29 | 2003-06-24 | Nanosphere, Inc. | Nanoparticles having oligonucleotides attached thereto and uses thereof |
US5777324A (en) * | 1996-09-19 | 1998-07-07 | Sequenom, Inc. | Method and apparatus for maldi analysis |
US6391550B1 (en) * | 1996-09-19 | 2002-05-21 | Affymetrix, Inc. | Identification of molecular sequence signatures and methods involving the same |
AU4495497A (en) * | 1996-09-19 | 1998-04-14 | Affymetrix, Inc. | Identification of molecular sequence signatures and methods involving the same |
US5965363A (en) | 1996-09-19 | 1999-10-12 | Genetrace Systems Inc. | Methods of preparing nucleic acids for mass spectrometric analysis |
US6124092A (en) * | 1996-10-04 | 2000-09-26 | The Perkin-Elmer Corporation | Multiplex polynucleotide capture methods and compositions |
GB9622665D0 (en) * | 1996-10-31 | 1997-01-08 | Zeneca Ltd | Methods |
AU745624B2 (en) * | 1996-11-06 | 2002-03-28 | Sequenom, Inc. | High density immobilization of nucleic acids |
AU761161B2 (en) * | 1996-11-06 | 2003-05-29 | Sequenom, Inc. | High density immobilization of nucleic acids |
US7285422B1 (en) | 1997-01-23 | 2007-10-23 | Sequenom, Inc. | Systems and methods for preparing and analyzing low volume analyte array elements |
US6024925A (en) * | 1997-01-23 | 2000-02-15 | Sequenom, Inc. | Systems and methods for preparing low volume analyte array elements |
EP1460083B1 (en) | 1996-11-06 | 2006-01-18 | Sequenom, Inc. | Analysing method and apparatus |
US6503452B1 (en) * | 1996-11-29 | 2003-01-07 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Biosensor arrays and methods |
US6699719B2 (en) * | 1996-11-29 | 2004-03-02 | Proteomic Systems, Inc. | Biosensor arrays and methods |
US6083761A (en) * | 1996-12-02 | 2000-07-04 | Glaxo Wellcome Inc. | Method and apparatus for transferring and combining reagents |
US6054325A (en) * | 1996-12-02 | 2000-04-25 | Glaxo Wellcom Inc. | Method and apparatus for transferring and combining distinct chemical compositions with reagents |
AU5794498A (en) | 1996-12-10 | 1998-07-03 | Genetrace Systems, Inc. | Releasable nonvolatile mass-label molecules |
US6060240A (en) * | 1996-12-13 | 2000-05-09 | Arcaris, Inc. | Methods for measuring relative amounts of nucleic acids in a complex mixture and retrieval of specific sequences therefrom |
JP4663824B2 (ja) | 1996-12-31 | 2011-04-06 | ハイ スループット ジェノミクス インコーポレイテッド | 多重化分子分析装置および方法 |
US6303301B1 (en) * | 1997-01-13 | 2001-10-16 | Affymetrix, Inc. | Expression monitoring for gene function identification |
US6309824B1 (en) * | 1997-01-16 | 2001-10-30 | Hyseq, Inc. | Methods for analyzing a target nucleic acid using immobilized heterogeneous mixtures of oligonucleotide probes |
DE19707204A1 (de) | 1997-02-24 | 1998-08-27 | Boehringer Mannheim Gmbh | System zur Herstellung diagnostischer Vielfach-Testelemente |
US6553317B1 (en) * | 1997-03-05 | 2003-04-22 | Incyte Pharmaceuticals, Inc. | Relational database and system for storing information relating to biomolecular sequences and reagents |
US6419883B1 (en) | 1998-01-16 | 2002-07-16 | University Of Washington | Chemical synthesis using solvent microdroplets |
IL131978A0 (en) * | 1997-03-20 | 2001-03-19 | Univ Washington | Solvent for biopolymer synthesis solvent microdots and methods of use |
US6028189A (en) * | 1997-03-20 | 2000-02-22 | University Of Washington | Solvent for oligonucleotide synthesis and methods of use |
AU736321B2 (en) | 1997-05-23 | 2001-07-26 | Lynx Therapeutics, Inc. | System and apparatus for sequential processing of analytes |
EP0921857B1 (en) * | 1997-06-02 | 2007-07-18 | Aurora Discovery Inc. | Low background multi-well plates for fluorescence measurements of biological and biochemical samples |
US6664044B1 (en) * | 1997-06-19 | 2003-12-16 | Toyota Jidosha Kabushiki Kaisha | Method for conducting PCR protected from evaporation |
NZ516848A (en) | 1997-06-20 | 2004-03-26 | Ciphergen Biosystems Inc | Retentate chromatography apparatus with applications in biology and medicine |
AU8177398A (en) * | 1997-06-30 | 1999-01-19 | Government of the United States of America, as represented by The Secretary of the Department of Health and Human Services and His Successors, The | Spectral cloning-a new technical approach to the cloning and characterization ofevery chromosomal aberration in cancer samples |
CN1265156A (zh) | 1997-07-22 | 2000-08-30 | 拉普吉恩公司 | 核酸阵列上进行的扩增及其它酶反应 |
AU736776B2 (en) | 1997-07-22 | 2001-08-02 | Qiagen Genomics, Inc. | Apparatus and methods for arraying solution onto a solid support |
US6444422B2 (en) | 1997-07-22 | 2002-09-03 | Qiagen Genomics, Inc. | Computer method and system for correlating data |
JP4313861B2 (ja) * | 1997-08-01 | 2009-08-12 | キヤノン株式会社 | プローブアレイの製造方法 |
CA2244414A1 (en) * | 1997-08-01 | 1999-02-01 | Canon Kabushiki Kaisha | Reaction site array, preparation process of it, reaction process using it and quantitative determination method of substance in sample solution using it |
US6432639B1 (en) | 1997-09-10 | 2002-08-13 | Dna Sciences Laboratories, Inc. | Isolated CYP3A4 nucleic acid molecules and detection methods |
US7745142B2 (en) | 1997-09-15 | 2010-06-29 | Molecular Devices Corporation | Molecular modification assays |
US6013486A (en) * | 1997-09-17 | 2000-01-11 | Yale University | Method for selection of insertion mutants |
US7214298B2 (en) * | 1997-09-23 | 2007-05-08 | California Institute Of Technology | Microfabricated cell sorter |
DE19742246A1 (de) * | 1997-09-25 | 1999-04-01 | Basf Ag | Analytisches Meßverfahren und seine Verwendung |
US6762019B2 (en) * | 1997-09-30 | 2004-07-13 | Surmodics, Inc. | Epoxide polymer surfaces |
US6465178B2 (en) * | 1997-09-30 | 2002-10-15 | Surmodics, Inc. | Target molecule attachment to surfaces |
US7351578B2 (en) | 1999-12-10 | 2008-04-01 | Invitrogen Corp. | Use of multiple recombination sites with unique specificity in recombinational cloning |
US7157234B2 (en) * | 1997-10-24 | 2007-01-02 | Beckman Coulter, Inc. | Detection of very low quantities of analyte bound to a solid phase |
JP4564165B2 (ja) | 1997-10-31 | 2010-10-20 | アプライド バイオシステムズ, エルエルシー | アレイ(群)を作製するための方法および装置 |
US7321023B2 (en) * | 1997-11-07 | 2008-01-22 | Incyte Corporation | SP16 protein |
US5922617A (en) * | 1997-11-12 | 1999-07-13 | Functional Genetics, Inc. | Rapid screening assay methods and devices |
US6177558B1 (en) | 1997-11-13 | 2001-01-23 | Protogene Laboratories, Inc. | Method and composition for chemical synthesis using high boiling point organic solvents to control evaporation |
US6101946A (en) * | 1997-11-21 | 2000-08-15 | Telechem International Inc. | Microarray printing device including printing pins with flat tips and exterior channel and method of manufacture |
US6268131B1 (en) | 1997-12-15 | 2001-07-31 | Sequenom, Inc. | Mass spectrometric methods for sequencing nucleic acids |
US5957167A (en) * | 1997-12-18 | 1999-09-28 | Pharmacopeia, Inc. | Article for dispensing small volumes of liquid |
US20030039967A1 (en) * | 1997-12-19 | 2003-02-27 | Kris Richard M. | High throughput assay system using mass spectrometry |
US6232066B1 (en) * | 1997-12-19 | 2001-05-15 | Neogen, Inc. | High throughput assay system |
US20100105572A1 (en) * | 1997-12-19 | 2010-04-29 | Kris Richard M | High throughput assay system |
US20030096232A1 (en) * | 1997-12-19 | 2003-05-22 | Kris Richard M. | High throughput assay system |
US6087102A (en) | 1998-01-07 | 2000-07-11 | Clontech Laboratories, Inc. | Polymeric arrays and methods for their use in binding assays |
US20020159919A1 (en) * | 1998-01-09 | 2002-10-31 | Carl Churchill | Method and apparatus for high-speed microfluidic dispensing using text file control |
US6265163B1 (en) | 1998-01-09 | 2001-07-24 | Lynx Therapeutics, Inc. | Solid phase selection of differentially expressed genes |
US6063339A (en) * | 1998-01-09 | 2000-05-16 | Cartesian Technologies, Inc. | Method and apparatus for high-speed dot array dispensing |
US7470547B2 (en) * | 2003-07-31 | 2008-12-30 | Biodot, Inc. | Methods and systems for dispensing sub-microfluidic drops |
WO1999034920A1 (en) * | 1998-01-12 | 1999-07-15 | Massachusetts Institute Of Technology | Method and apparatus for performing microassays |
US6893877B2 (en) | 1998-01-12 | 2005-05-17 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods for screening substances in a microwell array |
US6428752B1 (en) | 1998-05-14 | 2002-08-06 | Affymetrix, Inc. | Cleaning deposit devices that form microarrays and the like |
US6722395B2 (en) | 1998-01-13 | 2004-04-20 | James W. Overbeck | Depositing fluid specimens on substrates, resulting ordered arrays, techniques for analysis of deposited arrays |
US6269846B1 (en) | 1998-01-13 | 2001-08-07 | Genetic Microsystems, Inc. | Depositing fluid specimens on substrates, resulting ordered arrays, techniques for deposition of arrays |
US6407858B1 (en) | 1998-05-14 | 2002-06-18 | Genetic Microsystems, Inc | Focusing of microscopes and reading of microarrays |
JP2002500896A (ja) * | 1998-01-26 | 2002-01-15 | ジェンザイム・コーポレーション | 治療標的の同定法 |
US6297010B1 (en) | 1998-01-30 | 2001-10-02 | Genzyme Corporation | Method for detecting and identifying mutations |
JP2002502977A (ja) | 1998-02-04 | 2002-01-29 | インビトロジェン コーポレイション | マイクロアレイとその使用 |
US6537505B1 (en) | 1998-02-20 | 2003-03-25 | Bio Dot, Inc. | Reagent dispensing valve |
GB9803684D0 (en) * | 1998-02-24 | 1998-04-15 | Genevac Ltd | Method and apparatus for controlling temperature during evaporation of samples |
US20020090639A1 (en) * | 1998-02-26 | 2002-07-11 | Mcginnis Ralph Evan | Two dimensional linkage study methods and related inventions |
US6610526B2 (en) * | 1998-03-13 | 2003-08-26 | Inctye Corporation | Human E1-like protein |
FR2776389B1 (fr) * | 1998-03-20 | 2000-06-16 | Fondation Jean Dausset Ceph | Dispositif automatique de realisation d'echantillons en vue de la mise en oeuvre de reactions chimiques ou biologiques en milieu liquide |
US7095032B2 (en) * | 1998-03-20 | 2006-08-22 | Montagu Jean I | Focusing of microscopes and reading of microarrays |
US6218114B1 (en) * | 1998-03-27 | 2001-04-17 | Academia Sinica | Methods for detecting differentially expressed genes |
US6077673A (en) * | 1998-03-31 | 2000-06-20 | Clontech Laboratories, Inc. | Mouse arrays and kits comprising the same |
DE69835342T2 (de) * | 1998-04-27 | 2007-08-23 | Corning Inc. | Verfahren zur Ablage von biologischen Proben mit Hilfe eines nachgezogenen Kapillarspeichers |
US6350618B1 (en) | 1998-04-27 | 2002-02-26 | Corning Incorporated | Redrawn capillary imaging reservoir |
US6884626B1 (en) | 1998-04-27 | 2005-04-26 | Corning Incorporated | Redrawn capillary imaging reservoir |
US6048695A (en) * | 1998-05-04 | 2000-04-11 | Baylor College Of Medicine | Chemically modified nucleic acids and methods for coupling nucleic acids to solid support |
US6723564B2 (en) | 1998-05-07 | 2004-04-20 | Sequenom, Inc. | IR MALDI mass spectrometry of nucleic acids using liquid matrices |
DE19823660C1 (de) * | 1998-05-20 | 1999-10-07 | Nanomont Ges Fuer Nanotechnolo | Verfahren und Vorrichtung zur Fixierung fester Mikro- und/oder Nanoobjekte |
US6268210B1 (en) * | 1998-05-27 | 2001-07-31 | Hyseq, Inc. | Sandwich arrays of biological compounds |
EP1090293B2 (en) | 1998-06-24 | 2019-01-23 | Illumina, Inc. | Decoding of array sensors with microspheres |
EP1090118A2 (en) | 1998-06-26 | 2001-04-11 | Incyte Pharmaceuticals, Inc. | Human signal peptide-containing proteins |
US6762061B1 (en) | 1998-07-03 | 2004-07-13 | Corning Incorporated | Redrawn capillary imaging reservoir |
US6551557B1 (en) | 1998-07-07 | 2003-04-22 | Cartesian Technologies, Inc. | Tip design and random access array for microfluidic transfer |
CN1315913A (zh) * | 1998-07-07 | 2001-10-03 | 笛卡尔技术公司 | 用于微量液体移液的管尖设计和随机存取系统 |
US6406921B1 (en) | 1998-07-14 | 2002-06-18 | Zyomyx, Incorporated | Protein arrays for high-throughput screening |
US6576478B1 (en) | 1998-07-14 | 2003-06-10 | Zyomyx, Inc. | Microdevices for high-throughput screening of biomolecules |
AU2003262452B2 (en) * | 1998-07-14 | 2007-02-08 | Zyomyx, Inc. | Arrays of proteins and methods of use thereof I |
US6682942B1 (en) | 1998-07-14 | 2004-01-27 | Zyomyx, Inc. | Microdevices for screening biomolecules |
US6897073B2 (en) | 1998-07-14 | 2005-05-24 | Zyomyx, Inc. | Non-specific binding resistant protein arrays and methods for making the same |
US6291190B1 (en) | 1998-08-25 | 2001-09-18 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Molecular differences between species of the M. tuberculosis complex |
US6929912B2 (en) | 1998-08-31 | 2005-08-16 | Genaissance Pharmaceuticals, Inc. | Methods for evaluating the ability to metabolize pharmaceuticals |
US6309891B1 (en) | 1998-09-09 | 2001-10-30 | Incyte Genomics, Inc. | Capillary printing systems |
US6461812B2 (en) | 1998-09-09 | 2002-10-08 | Agilent Technologies, Inc. | Method and multiple reservoir apparatus for fabrication of biomolecular arrays |
US20020012913A1 (en) * | 1998-09-15 | 2002-01-31 | Kevin L. Gunderson | Nucleic acid analysis using complete n-mer arrays |
US6475440B1 (en) | 1998-09-16 | 2002-11-05 | Clontech Laboratories, Inc. | Applicator for use in deposition of fluid samples onto a substrate surface |
US7079241B2 (en) * | 2000-04-06 | 2006-07-18 | Invitrogen Corp. | Spatial positioning of spectrally labeled beads |
US6703228B1 (en) * | 1998-09-25 | 2004-03-09 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods and products related to genotyping and DNA analysis |
US6277628B1 (en) | 1998-10-02 | 2001-08-21 | Incyte Genomics, Inc. | Linear microarrays |
US6545264B1 (en) | 1998-10-30 | 2003-04-08 | Affymetrix, Inc. | Systems and methods for high performance scanning |
US7014815B1 (en) | 1998-10-30 | 2006-03-21 | Burstein Technologies, Inc. | Trackable optical discs with concurrently readable nonoperational features |
US6689323B2 (en) | 1998-10-30 | 2004-02-10 | Agilent Technologies | Method and apparatus for liquid transfer |
JP2002532066A (ja) | 1998-11-16 | 2002-10-02 | ジェンウェイ バイオテック, インコーポレイテッド | 鳥類におけるポリヌクレオチドワクチンを用いる抗体の産生 |
US6309828B1 (en) | 1998-11-18 | 2001-10-30 | Agilent Technologies, Inc. | Method and apparatus for fabricating replicate arrays of nucleic acid molecules |
US6184347B1 (en) * | 1998-11-19 | 2001-02-06 | Agilent Technologies Inc. | Minimization of blooming in high-density arrays by using reactive wash reagents |
WO2000034521A1 (en) * | 1998-12-08 | 2000-06-15 | Boston Probes, Inc. | Methods, kits and compositions for the identification of nucleic acids electrostatically bound to matrices |
US6881570B1 (en) * | 1998-12-15 | 2005-04-19 | Fuji Photo Film Co., Ltd. | Test piece and quantitative method and apparatus for an organism-oriented substance |
US6429027B1 (en) | 1998-12-28 | 2002-08-06 | Illumina, Inc. | Composite arrays utilizing microspheres |
US7612020B2 (en) | 1998-12-28 | 2009-11-03 | Illumina, Inc. | Composite arrays utilizing microspheres with a hybridization chamber |
US6351712B1 (en) * | 1998-12-28 | 2002-02-26 | Rosetta Inpharmatics, Inc. | Statistical combining of cell expression profiles |
US6087112A (en) * | 1998-12-30 | 2000-07-11 | Oligos Etc. Inc. | Arrays with modified oligonucleotide and polynucleotide compositions |
US20030180789A1 (en) * | 1998-12-30 | 2003-09-25 | Dale Roderic M.K. | Arrays with modified oligonucleotide and polynucleotide compositions |
ATE277065T1 (de) | 1999-01-05 | 2004-10-15 | Bio Merieux | Funktionalisierte verbindung, gegebenenfalls markierte polynukleotide und verfahren zur detektion einer ziel-nukleinsäure |
US7595189B2 (en) * | 1999-01-08 | 2009-09-29 | Applied Biosystems, Llc | Integrated optics fiber array |
US20050026209A1 (en) * | 1999-01-08 | 2005-02-03 | Vann Charles S. | Optical fiber bundle for detecting binding of chemical species |
US6635470B1 (en) * | 1999-01-08 | 2003-10-21 | Applera Corporation | Fiber array and methods for using and making same |
US6720139B1 (en) | 1999-01-27 | 2004-04-13 | Elitra Pharmaceuticals, Inc. | Genes identified as required for proliferation in Escherichia coli |
US6429302B1 (en) | 1999-02-02 | 2002-08-06 | Chiron Corporation | Polynucleotides related to pancreatic disease |
US6251601B1 (en) * | 1999-02-02 | 2001-06-26 | Vysis, Inc. | Simultaneous measurement of gene expression and genomic abnormalities using nucleic acid microarrays |
US9534254B1 (en) | 1999-02-02 | 2017-01-03 | Abbott Molecular Inc. | Patient stratification for cancer therapy based on genomic DNA microarray analysis |
US6232129B1 (en) | 1999-02-03 | 2001-05-15 | Peter Wiktor | Piezoelectric pipetting device |
DE60000836T2 (de) * | 1999-02-08 | 2003-09-04 | Fuji Photo Film Co Ltd | Verfahren zur herstellung eines dns chip |
US7101510B2 (en) | 1999-02-16 | 2006-09-05 | Applera Corporation | Matrix storage and dispensing system |
US6432719B1 (en) | 1999-02-16 | 2002-08-13 | Pe Corporation (Ny) | Matrix storage and dispensing system |
US8710201B2 (en) | 1999-12-08 | 2014-04-29 | Ceres, Inc. | Nucleic acid sequences encoding strictosidine synthase proteins |
US7659386B2 (en) | 2000-08-03 | 2010-02-09 | Ceres, Inc. | Nucleic acid sequences encoding transcription factor proteins |
US7365183B2 (en) | 2001-01-03 | 2008-04-29 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding SRF-type transcription factor proteins |
US8299231B2 (en) | 1999-03-09 | 2012-10-30 | Ceres, Inc. | Nucleic acid sequences encoding AN1-like zinc finger proteins |
US8710204B2 (en) | 1999-02-25 | 2014-04-29 | Ceres, Inc. | Nucleic acid sequences encoding secE/sec61-gamma subunits of protein translocation complexes |
EP1586645A3 (en) | 1999-02-25 | 2006-02-22 | Ceres Incorporated | Sequence-determined DNA fragments and corresponding polypeptides encoded thereby |
US6627157B1 (en) | 1999-03-04 | 2003-09-30 | Ut-Battelle, Llc | Dual manifold system and method for fluid transfer |
US9000140B2 (en) | 1999-03-05 | 2015-04-07 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding AN1-like zinc finger proteins |
FR2790766B1 (fr) * | 1999-03-08 | 2002-12-20 | Commissariat Energie Atomique | Procede de realisation d'une matrice de sequences de molecules chimiques ou biologiques pour dispositif d'analyse chimique ou biologique |
US6296702B1 (en) | 1999-03-15 | 2001-10-02 | Pe Corporation (Ny) | Apparatus and method for spotting a substrate |
CA2367912A1 (en) | 1999-03-19 | 2000-09-28 | Genencor International, Inc. | Multi-through hole testing plate for high throughput screening |
WO2000056762A2 (en) * | 1999-03-22 | 2000-09-28 | Novozymes Biotech, Inc. | Methods for monitoring multiple gene expression |
AU4025300A (en) * | 1999-03-24 | 2000-10-09 | Packard Bioscience Company | Continuous porous matrix arrays |
US6347259B1 (en) | 1999-04-01 | 2002-02-12 | Virtek Vision International Inc. | High precision positioning device and method of operating same |
US6235479B1 (en) | 1999-04-13 | 2001-05-22 | Bio Merieux, Inc. | Methods and devices for performing analysis of a nucleic acid sample |
AU777469B2 (en) * | 1999-04-15 | 2004-10-21 | Cambridge University Technical Services Limited | A novel family of beta sub-unit proteins from a voltage-gated sodium channel, nucleic acids encoding them and therapeutic or diagnostic uses thereof |
EP1169649A2 (en) * | 1999-04-15 | 2002-01-09 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Microarrays of polypeptides |
US6245297B1 (en) | 1999-04-16 | 2001-06-12 | Pe Corporation (Ny) | Apparatus and method for transferring small volumes of substances |
US20060275782A1 (en) | 1999-04-20 | 2006-12-07 | Illumina, Inc. | Detection of nucleic acid reactions on bead arrays |
US20030207295A1 (en) * | 1999-04-20 | 2003-11-06 | Kevin Gunderson | Detection of nucleic acid reactions on bead arrays |
CN1204592C (zh) * | 1999-04-27 | 2005-06-01 | 赛弗根生物系统股份有限公司 | 气相离子谱仪的探头 |
US20040203138A1 (en) * | 1999-04-30 | 2004-10-14 | Caren Michael P. | Polynucleotide array fabrication |
JP2001021558A (ja) * | 1999-04-30 | 2001-01-26 | Agilent Technol Inc | ポリヌクレオチドアレイの製作法 |
US7276336B1 (en) | 1999-07-22 | 2007-10-02 | Agilent Technologies, Inc. | Methods of fabricating an addressable array of biopolymer probes |
US6395559B1 (en) * | 1999-05-04 | 2002-05-28 | Orchid Biosciences, Inc. | Multiple fluid sample processor with single well addressability |
US20020182749A1 (en) * | 1999-05-11 | 2002-12-05 | Aclara Biosciences, Inc. | Sample evaporative control |
US6824987B1 (en) | 1999-05-11 | 2004-11-30 | President And Fellows Of Harvard College | Small molecule printing |
US7932213B2 (en) * | 1999-05-11 | 2011-04-26 | President And Fellows Of Harvard College | Small molecule printing |
US6852493B2 (en) * | 1999-05-14 | 2005-02-08 | Iris Biotechnologies, Inc. | Magnetic field enhanced hybridization of target molecules to immobilized probes |
JP3957118B2 (ja) * | 1999-05-18 | 2007-08-15 | 富士フイルム株式会社 | 試験片およびこの試験片からの画像情報読取装置 |
US6365410B1 (en) * | 1999-05-19 | 2002-04-02 | Genencor International, Inc. | Directed evolution of microorganisms |
US20030096321A1 (en) * | 1999-05-19 | 2003-05-22 | Jose Remacle | Method for the identification and/or the quantification of a target compound obtained from a biological sample upon chips |
ATE225940T1 (de) * | 1999-05-19 | 2002-10-15 | Advanced Array Technologies S | Verfahren zur identifizierung und/oder quantifizierung einer zielverbindung |
US20030073250A1 (en) * | 1999-05-21 | 2003-04-17 | Eric Henderson | Method and apparatus for solid state molecular analysis |
CA2374515A1 (en) * | 1999-05-21 | 2000-11-30 | Christian E. Gruber | Compositions and methods for labeling of nucleic acid molecules |
US20030186311A1 (en) * | 1999-05-21 | 2003-10-02 | Bioforce Nanosciences, Inc. | Parallel analysis of molecular interactions |
US20020042081A1 (en) * | 2000-10-10 | 2002-04-11 | Eric Henderson | Evaluating binding affinities by force stratification and force panning |
US6573369B2 (en) * | 1999-05-21 | 2003-06-03 | Bioforce Nanosciences, Inc. | Method and apparatus for solid state molecular analysis |
US6225109B1 (en) * | 1999-05-27 | 2001-05-01 | Orchid Biosciences, Inc. | Genetic analysis device |
JP2003500673A (ja) | 1999-05-27 | 2003-01-07 | ピーイー コーポレイション (エヌワイ) | 反応プレートの正確な位置決めのための装置および方法 |
AU5870200A (en) * | 1999-06-03 | 2000-12-28 | Jonathan Hibbs | Non-cognate hybridization system (nchs) |
US6716579B1 (en) | 1999-06-11 | 2004-04-06 | Narayan Baidya | Gene specific arrays, preparation and use |
WO2000079006A1 (en) * | 1999-06-17 | 2000-12-28 | Fred Hutchinson Cancer Research Center | Oligonucleotide arrays for high resolution hla typing |
US6296673B1 (en) * | 1999-06-18 | 2001-10-02 | The Regents Of The University Of California | Methods and apparatus for performing array microcrystallizations |
US7420049B2 (en) | 1999-06-18 | 2008-09-02 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding AP2 domain proteins |
US6630006B2 (en) * | 1999-06-18 | 2003-10-07 | The Regents Of The University Of California | Method for screening microcrystallizations for crystal formation |
US7399850B2 (en) | 1999-06-18 | 2008-07-15 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding AP2 domain proteins |
US7485715B2 (en) | 1999-06-18 | 2009-02-03 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA encoding AP2 domain polypeptides |
US6656682B1 (en) | 1999-06-21 | 2003-12-02 | Nisshinbo Industries, Inc. | Nucleic acid-immobilized substrate |
US6399394B1 (en) | 1999-06-30 | 2002-06-04 | Agilent Technologies, Inc. | Testing multiple fluid samples with multiple biopolymer arrays |
ATE323113T1 (de) * | 1999-07-02 | 2006-04-15 | Symyx Technologies Inc | Polymerverzweigungen zur immobilisierung von molekülen auf oberflächen oder substraten, wobei die polymere wasserlösliche oder wasserdispergierbare segmente und sonden aufweisen |
GB9916406D0 (en) * | 1999-07-13 | 1999-09-15 | Biorobotics Ltd | Liquid transfer pin |
US7371516B1 (en) * | 1999-07-16 | 2008-05-13 | Rosetta Inpharmatics Llc | Methods for determining the specificity and sensitivity of oligonucleo tides for hybridization |
US7209836B1 (en) * | 1999-07-16 | 2007-04-24 | Perkinelmer Las, Inc. | Method and system for automatically creating crosstalk-corrected data of a microarray |
US6306599B1 (en) * | 1999-07-16 | 2001-10-23 | Agilent Technologies Inc. | Biopolymer arrays and their fabrication |
US6346423B1 (en) | 1999-07-16 | 2002-02-12 | Agilent Technologies, Inc. | Methods and compositions for producing biopolymeric arrays |
DE19933838A1 (de) * | 1999-07-20 | 2001-02-01 | Max Planck Gesellschaft | Nadel und Verfahren zum Transfer von Liquiden sowie Verfahren zum Herstellen der Nadel |
GB2348002B (en) * | 1999-07-20 | 2001-02-07 | Genpak Ltd | Microarrayer |
US7479555B2 (en) | 1999-07-21 | 2009-01-20 | Ceres, Inc. | Polynucleotides having a nucleotide sequence that encodes a polypeptide having MOV34 family activity |
US20090011945A1 (en) * | 1999-07-28 | 2009-01-08 | Bright Frank V | Method For Making Microsensor Arrays For Detecting Analytes |
US20030170908A1 (en) * | 2000-07-28 | 2003-09-11 | Bright Frank V. | Method for making microsensor arrays for detecting analytes |
WO2001013105A1 (en) * | 1999-07-30 | 2001-02-22 | Agy Therapeutics, Inc. | Techniques for facilitating identification of candidate genes |
KR100320752B1 (ko) * | 1999-08-06 | 2002-01-17 | 박한오 | 자동 시료 미세배열 장치 |
CA2374745A1 (en) * | 1999-08-09 | 2001-02-15 | Incyte Genomics, Inc. | Proteases and protease inhibitors |
DE60045451D1 (de) * | 1999-08-09 | 2011-02-10 | Riken | Vorrichtung zur Herstellung von Mikroarrays |
US6498032B1 (en) * | 1999-08-11 | 2002-12-24 | Corning Incorporated | Use of ceramic labels for identifying biomolecule immobilizing subtrates |
JP2003507715A (ja) * | 1999-08-13 | 2003-02-25 | カーティージャン テクノロジーズ、 インコーポレイテッド | 液体試料取扱い装置 |
ATE414171T1 (de) * | 1999-08-27 | 2008-11-15 | Matrix Technologies Corp | Verfahren zur immobilisierung von oligonukleotiden auf festem trägermaterial |
AU7090600A (en) * | 1999-09-02 | 2001-03-26 | Corning Incorporated | Porous substrates for dna arrays |
US6528319B1 (en) | 1999-09-02 | 2003-03-04 | Amersham Biosciences Corp | Method for anchoring oligonucleotides to a substrate |
US6750023B2 (en) * | 1999-09-02 | 2004-06-15 | Corning Incorporated | Porous inorganic substrate for high-density arrays |
US6994972B2 (en) * | 1999-09-02 | 2006-02-07 | Corning Incorporated | Porous substrates for DNA arrays |
AU7353500A (en) * | 1999-09-10 | 2001-04-10 | Incyte Genomics, Inc. | Apoptosis proteins |
FR2798673B1 (fr) * | 1999-09-16 | 2004-05-28 | Exonhit Therapeutics Sa | Methodes et compositions pour la detection d'evenements pathologiques |
ATE346156T1 (de) * | 1999-09-17 | 2006-12-15 | Whitehead Biomedical Inst | Umkehrtransfektionsverfahren |
US20020006664A1 (en) * | 1999-09-17 | 2002-01-17 | Sabatini David M. | Arrayed transfection method and uses related thereto |
US7078167B2 (en) * | 1999-09-17 | 2006-07-18 | Agilent Technologies, Inc. | Arrays having background features and methods for using the same |
US7122303B2 (en) * | 1999-09-17 | 2006-10-17 | Agilent Technologies, Inc. | Arrays comprising background features that provide for a measure of a non-specific binding and methods for using the same |
CA2384186C (en) * | 1999-09-17 | 2010-06-01 | Bioarray Solutions, Llc | System and method for programmable illumination pattern generation |
US6623936B1 (en) | 1999-09-24 | 2003-09-23 | Imgenex | Compositions and methods for improved detection and classification of neoplasms |
DE19946525A1 (de) * | 1999-09-28 | 2001-05-03 | Fraunhofer Ges Forschung | Vorrichtung zur Aufnahme und Abgabe kleinster Flüssigkeitsmengen |
US6844151B1 (en) * | 1999-09-29 | 2005-01-18 | Oligos Etc. Inc. | Methods for production of arrays with modified oligonucleotide and polynucleotide compositions |
US6558623B1 (en) * | 2000-07-06 | 2003-05-06 | Robodesign International, Inc. | Microarray dispensing with real-time verification and inspection |
US20030190644A1 (en) * | 1999-10-13 | 2003-10-09 | Andreas Braun | Methods for generating databases and databases for identifying polymorphic genetic markers |
US6607885B1 (en) | 1999-10-15 | 2003-08-19 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Method for high-density microarray medicated gene expression profiling |
US6709816B1 (en) * | 1999-10-18 | 2004-03-23 | Affymetrix, Inc. | Identification of alleles |
US6171797B1 (en) | 1999-10-20 | 2001-01-09 | Agilent Technologies Inc. | Methods of making polymeric arrays |
US20030036070A1 (en) * | 1999-10-21 | 2003-02-20 | Shukti Chakravarti | Gene expression profiling of inflammatory bowel disease |
JP2001186880A (ja) * | 1999-10-22 | 2001-07-10 | Ngk Insulators Ltd | Dnaチップの製造方法 |
US6656432B1 (en) * | 1999-10-22 | 2003-12-02 | Ngk Insulators, Ltd. | Micropipette and dividedly injectable apparatus |
JP2001186881A (ja) * | 1999-10-22 | 2001-07-10 | Ngk Insulators Ltd | Dnaチップの製造方法 |
US6958225B2 (en) * | 1999-10-27 | 2005-10-25 | Affymetrix, Inc. | Complexity management of genomic DNA |
US6689319B1 (en) | 1999-10-29 | 2004-02-10 | Agilent Technologies, Ind. | Apparatus for deposition and inspection of chemical and biological fluids |
EP1230397A2 (en) * | 1999-11-02 | 2002-08-14 | Celine Hu | Molecular microarrays and methods for production and use thereof |
AU2041901A (en) | 1999-11-09 | 2001-06-06 | Elitra Pharmaceuticals, Inc. | Genes essential for microbial proliferation and antisense thereto |
US6362004B1 (en) * | 1999-11-09 | 2002-03-26 | Packard Biochip Technologies, Llc | Apparatus and method for using fiducial marks on a microarray substrate |
US7420046B2 (en) | 1999-11-10 | 2008-09-02 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding RNA polymerase proteins |
US7041445B2 (en) | 1999-11-15 | 2006-05-09 | Clontech Laboratories, Inc. | Long oligonucleotide arrays |
US7109024B2 (en) * | 1999-11-15 | 2006-09-19 | Dr. Chip Biotechnology Inc. | Biomolecule-bound substrates |
GB2356063B (en) | 1999-11-22 | 2001-10-24 | Genpak Ltd | Adhesive label with grid for microscope slide |
US6446642B1 (en) | 1999-11-22 | 2002-09-10 | Agilent Technologies, Inc. | Method and apparatus to clean an inkjet reagent deposition device |
US6423535B1 (en) | 1999-11-24 | 2002-07-23 | Incyte Genomics, Inc. | Normalization control for hybridization reactions |
US6448013B1 (en) * | 1999-11-24 | 2002-09-10 | Incyte Genomics, Inc. | Duplex probes for hybridization reactions |
JP2001149060A (ja) | 1999-11-29 | 2001-06-05 | Nisshinbo Ind Inc | 核酸固定化基板 |
AU1807201A (en) * | 1999-12-01 | 2001-06-12 | Trustees Of Princeton University, The | Complexes of form L2MX as phosphorescent dopants for organic leds |
AU783996B2 (en) * | 1999-12-16 | 2006-01-12 | University Of Louisville Research Foundation, Inc. | Compositions and methods for caspase-induced apoptosis |
US6489114B2 (en) | 1999-12-17 | 2002-12-03 | Bio Merieux | Process for labeling a ribonucleic acid, and labeled RNA fragments which are obtained thereby |
US6902891B2 (en) | 1999-12-17 | 2005-06-07 | Bio Merieux | Process for labeling a nucleic acid |
US20020022718A1 (en) * | 1999-12-23 | 2002-02-21 | Forsyth R. Allyn | Genes identified as required for proliferation of E. coli |
WO2001048242A2 (en) | 1999-12-29 | 2001-07-05 | Mergen Ltd. | Methods for amplifying and detecting multiple polynucleotides on a solid phase support |
ATE340025T1 (de) * | 2000-01-06 | 2006-10-15 | Caliper Life Sciences Inc | Vorrichtungen und verfahren für hochdurchsatz- probenentnahme und analyse |
US20050089923A9 (en) * | 2000-01-07 | 2005-04-28 | Levinson Douglas A. | Method and system for planning, performing, and assessing high-throughput screening of multicomponent chemical compositions and solid forms of compounds |
US20050095696A9 (en) * | 2000-01-07 | 2005-05-05 | Lemmo Anthony V. | Apparatus and method for high-throughput preparation and characterization of compositions |
US6977723B2 (en) * | 2000-01-07 | 2005-12-20 | Transform Pharmaceuticals, Inc. | Apparatus and method for high-throughput preparation and spectroscopic classification and characterization of compositions |
US20050118637A9 (en) * | 2000-01-07 | 2005-06-02 | Levinson Douglas A. | Method and system for planning, performing, and assessing high-throughput screening of multicomponent chemical compositions and solid forms of compounds |
US20020048610A1 (en) * | 2000-01-07 | 2002-04-25 | Cima Michael J. | High-throughput formation, identification, and analysis of diverse solid-forms |
US7108970B2 (en) * | 2000-01-07 | 2006-09-19 | Transform Pharmaceuticals, Inc. | Rapid identification of conditions, compounds, or compositions that inhibit, prevent, induce, modify, or reverse transitions of physical state |
US20070020662A1 (en) * | 2000-01-07 | 2007-01-25 | Transform Pharmaceuticals, Inc. | Computerized control of high-throughput experimental processing and digital analysis of comparative samples for a compound of interest |
US20070021929A1 (en) * | 2000-01-07 | 2007-01-25 | Transform Pharmaceuticals, Inc. | Computing methods for control of high-throughput experimental processing, digital analysis, and re-arraying comparative samples in computer-designed arrays |
JP4731781B2 (ja) | 2000-01-11 | 2011-07-27 | ナノゲン・レコグノミクス・ゲゼルシャフト・ミット・ベシュレンクテル・ハフツング | 基体表面に結合させるための複数の結合部分を有する生体分子 |
US6635423B2 (en) | 2000-01-14 | 2003-10-21 | Integriderm, Inc. | Informative nucleic acid arrays and methods for making same |
US8143195B2 (en) * | 2000-01-24 | 2012-03-27 | Yingjian Wang | Arrays for bringing two or more reagents in contact with one or more biological targets and methods for making and using the arrays |
US7429466B2 (en) * | 2000-01-24 | 2008-09-30 | Hypromatrix, Inc | Methods and arrays for detecting biological molecules |
US20030097222A1 (en) * | 2000-01-25 | 2003-05-22 | Craford David M. | Method, system, and computer software for providing a genomic web portal |
US6587579B1 (en) * | 2000-01-26 | 2003-07-01 | Agilent Technologies Inc. | Feature quality in array fabrication |
US7355026B2 (en) | 2000-01-27 | 2008-04-08 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding SRF-type transcription factor proteins |
US6399396B1 (en) * | 2000-01-28 | 2002-06-04 | Agilent Technologies, Inc. | Compressed loading apparatus and method for liquid transfer |
US6618679B2 (en) | 2000-01-28 | 2003-09-09 | Althea Technologies, Inc. | Methods for analysis of gene expression |
US7955794B2 (en) | 2000-09-21 | 2011-06-07 | Illumina, Inc. | Multiplex nucleic acid reactions |
US8076063B2 (en) | 2000-02-07 | 2011-12-13 | Illumina, Inc. | Multiplexed methylation detection methods |
US7582420B2 (en) | 2001-07-12 | 2009-09-01 | Illumina, Inc. | Multiplex nucleic acid reactions |
EP1990428B1 (en) * | 2000-02-07 | 2010-12-22 | Illumina, Inc. | Nucleic acid detection methods using universal priming |
US20020039728A1 (en) * | 2000-02-10 | 2002-04-04 | Robert Kain | Alternative substrates and formats for bead-based array of arrays |
US6770441B2 (en) * | 2000-02-10 | 2004-08-03 | Illumina, Inc. | Array compositions and methods of making same |
US20020151040A1 (en) | 2000-02-18 | 2002-10-17 | Matthew O' Keefe | Apparatus and methods for parallel processing of microvolume liquid reactions |
WO2001061054A2 (en) | 2000-02-18 | 2001-08-23 | Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Apparatus and methods for parallel processing of micro-volume liquid reactions |
US7160511B2 (en) | 2000-02-18 | 2007-01-09 | Olympus Corporation | Liquid pipetting apparatus and micro array manufacturing apparatus |
US6783985B1 (en) | 2000-02-18 | 2004-08-31 | Elitra Pharmaceuticals Inc. | Gene disruption methodologies for drug target discovery |
US6594432B2 (en) | 2000-02-22 | 2003-07-15 | Genospectra, Inc. | Microarray fabrication techniques and apparatus |
US20040014102A1 (en) * | 2000-02-22 | 2004-01-22 | Shiping Chen | High density parallel printing of microarrays |
CA2399189A1 (en) | 2000-02-22 | 2001-08-30 | Genospectra, Inc. | Microarray fabrication techniques and apparatus |
US20030162232A1 (en) * | 2000-02-28 | 2003-08-28 | Derya Ozkan | Component comprising a plurality of fiber elements and sample molecules that are immobilized on said fiber elements |
EP1305605A2 (de) * | 2000-02-28 | 2003-05-02 | Variom Biotechnology AG | Bauteil zur interaktionsanalyse mit kooperationseffekte ausbildenden probenmolekülspezies |
WO2001066733A1 (fr) * | 2000-03-07 | 2001-09-13 | Chiba-Prefecture | Sequences d'acides nucleiques presentant une expression accrue dans le neuroblastome benin par rapport au neuroblastome humain acritique |
ITCA20000004A1 (it) * | 2000-03-07 | 2001-09-07 | Mario Raimondo Caria | Metodo e sistema per la rivelazione simultanea e multipla con quantificazione della ibridizzazione di composti molecolari quali acidi nuclei |
US6897015B2 (en) * | 2000-03-07 | 2005-05-24 | Bioforce Nanosciences, Inc. | Device and method of use for detection and characterization of pathogens and biological materials |
US6537433B1 (en) | 2000-03-10 | 2003-03-25 | Applera Corporation | Methods and apparatus for the location and concentration of polar analytes using an alternating electric field |
US6447723B1 (en) | 2000-03-13 | 2002-09-10 | Packard Instrument Company, Inc. | Microarray spotting instruments incorporating sensors and methods of using sensors for improving performance of microarray spotting instruments |
US20060252920A1 (en) | 2001-08-10 | 2006-11-09 | Nickolai Alexandrov | Sequence-determined DNA fragments encoding cyclopropyl isomerase proteins |
US6756232B1 (en) * | 2000-03-20 | 2004-06-29 | Perkinelmer Las, Inc. | Method and apparatus for producing compact microarrays |
US6878554B1 (en) * | 2000-03-20 | 2005-04-12 | Perkinelmer Las, Inc. | Method and apparatus for automatic pin detection in microarray spotting instruments |
US6376191B1 (en) | 2000-03-22 | 2002-04-23 | Mergen, Ltd. | Microarray-based analysis of polynucleotide sequence variations |
US6413722B1 (en) | 2000-03-22 | 2002-07-02 | Incyte Genomics, Inc. | Polymer coated surfaces for microarray applications |
JP4152054B2 (ja) * | 2000-03-23 | 2008-09-17 | 富士フイルム株式会社 | 画像読み取り装置 |
US7829313B2 (en) * | 2000-03-24 | 2010-11-09 | Eppendorf Array Technologies | Identification and quantification of a plurality of biological (micro)organisms or their components |
US20080085515A1 (en) * | 2000-03-24 | 2008-04-10 | Eppendorf Array Technologies Sa (Eat) | Identification of multiple biological (micro) organisms by detection of their nucleotide sequences on arrays |
US7205104B2 (en) * | 2000-03-24 | 2007-04-17 | Eppendorf Array Technologies Sa (Eat) | Identification of biological (micro) organisms by detection of their homologous nucleotide sequences on arrays |
KR100340126B1 (ko) * | 2000-03-24 | 2002-06-10 | 박한오 | 자동 생물학적 시료 미세배열 장치 |
US7875442B2 (en) * | 2000-03-24 | 2011-01-25 | Eppendorf Array Technologies | Identification and quantification of a plurality of biological (micro)organisms or their components |
US7202026B2 (en) * | 2000-03-24 | 2007-04-10 | Eppendorf Array Technologies Sa (Eat) | Identification of a large number of biological (micro)organisms groups at different levels by their detection on a same array |
US6800455B2 (en) * | 2000-03-31 | 2004-10-05 | Scios Inc. | Secreted factors |
AU2001249727A1 (en) * | 2000-03-31 | 2001-10-15 | Genentech, Inc. | Compositions and methods for detecting and quantifying gene expression |
US20050003364A1 (en) * | 2000-03-31 | 2005-01-06 | Stanton Lawrence W. | Secreted factors |
US7157227B2 (en) * | 2000-03-31 | 2007-01-02 | University Of Louisville Research Foundation | Microarrays to screen regulatory genes |
JP4425420B2 (ja) * | 2000-04-03 | 2010-03-03 | 独立行政法人理化学研究所 | マイクロアレイ作製装置 |
DE10017105A1 (de) * | 2000-04-06 | 2001-10-11 | Basf Ag | Verfahren und Vorrichtung zur Herstellung von Biopolymer-Feldern |
GB0008563D0 (en) * | 2000-04-07 | 2000-05-24 | Cambridge Discovery Chemistry | Investigating different physical and/or chemical forms of materials |
US7691991B2 (en) | 2000-04-17 | 2010-04-06 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding cytochrome P450 proteins |
DE10020704B4 (de) * | 2000-04-27 | 2006-09-28 | Bioref Gmbh | Biochip zur Archivierung und labormedizinischen Analyse von biologischem Probenmaterial, Verfahren zu dessen Herstellung sowie dessen Verwendung in diagnostischen Verfahren |
JP2004511753A (ja) | 2000-05-04 | 2004-04-15 | イエール ユニバーシティー | タンパク質活性のスクリーニング用タンパク質チップ |
ATE418733T1 (de) * | 2000-05-04 | 2009-01-15 | Blood Res Center | Kolloidzusammensetzungen für festphasen- biomolekulare analytische systeme |
US6709840B1 (en) | 2000-05-11 | 2004-03-23 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Anergy associated genes |
US6902882B2 (en) | 2000-05-23 | 2005-06-07 | Kerong Gu | Methods of monitoring production of gene products and uses thereof |
EP1313880A2 (en) * | 2000-05-30 | 2003-05-28 | PE Corporation (NY) | Methods for detecting target nucleic acids using coupled ligation and amplification |
US7700359B2 (en) * | 2000-06-02 | 2010-04-20 | Novartis Vaccines And Diagnostics, Inc. | Gene products differentially expressed in cancerous cells |
WO2005000087A2 (en) * | 2003-06-03 | 2005-01-06 | Chiron Corporation | Gene products differentially expressed in cancerous colon cells and their methods of use ii |
US7521245B1 (en) | 2000-06-05 | 2009-04-21 | Perkinelmer Las, Inc. | Method for washing and drying pins in microarray spotting instruments |
WO2001096607A2 (en) | 2000-06-13 | 2001-12-20 | The Trustees Of Boston University | Use of nucleotide analogs in the analysis of oligonucleotide mixtures and in highly multiplexed nucleic acid sequencing |
US6455007B1 (en) * | 2000-06-13 | 2002-09-24 | Symyx Technologies, Inc. | Apparatus and method for testing compositions in contact with a porous medium |
EP1164201A1 (en) * | 2000-06-14 | 2001-12-19 | Facultés Universitaires Notre-Dame de la Paix | Reverse detection for identification and/or quantification of nucleotide target sequences on biochips |
DE60134275D1 (de) | 2000-06-15 | 2008-07-10 | Novartis Vaccines & Diagnostic | Polynukleotide zur bestimmung von kolonkrebs |
US20040086877A1 (en) | 2000-06-16 | 2004-05-06 | Lal Preeti G. | Multi-mode directi memory access controller and method |
US20020049152A1 (en) * | 2000-06-19 | 2002-04-25 | Zyomyx, Inc. | Methods for immobilizing polypeptides |
US7062418B2 (en) | 2000-06-27 | 2006-06-13 | Fluidigm Corporation | Computer aided design method and system for developing a microfluidic system |
US7584761B1 (en) | 2000-06-30 | 2009-09-08 | Lam Research Corporation | Wafer edge surface treatment with liquid meniscus |
US7234477B2 (en) * | 2000-06-30 | 2007-06-26 | Lam Research Corporation | Method and apparatus for drying semiconductor wafer surfaces using a plurality of inlets and outlets held in close proximity to the wafer surfaces |
US7000622B2 (en) * | 2002-09-30 | 2006-02-21 | Lam Research Corporation | Methods and systems for processing a bevel edge of a substrate using a dynamic liquid meniscus |
US20030219816A1 (en) * | 2001-07-02 | 2003-11-27 | Keith Solomon | Composite microarray slides |
US7025933B2 (en) * | 2000-07-06 | 2006-04-11 | Robodesign International, Inc. | Microarray dispensing with real-time verification and inspection |
US6913879B1 (en) * | 2000-07-10 | 2005-07-05 | Telechem International Inc. | Microarray method of genotyping multiple samples at multiple LOCI |
US6890760B1 (en) * | 2000-07-31 | 2005-05-10 | Agilent Technologies, Inc. | Array fabrication |
US7205400B2 (en) * | 2000-07-31 | 2007-04-17 | Agilent Technologies, Inc. | Array fabrication |
US6613893B1 (en) | 2000-07-31 | 2003-09-02 | Agilent Technologies Inc. | Array fabrication |
US6599693B1 (en) | 2000-07-31 | 2003-07-29 | Agilent Technologies Inc. | Array fabrication |
US20020102617A1 (en) * | 2000-08-03 | 2002-08-01 | Macbeath Gavin | Protein microarrays |
US6984522B2 (en) | 2000-08-03 | 2006-01-10 | Regents Of The University Of Michigan | Isolation and use of solid tumor stem cells |
JP2004506201A (ja) * | 2000-08-03 | 2004-02-26 | マサチューセッツ・インスティチュート・オブ・テクノロジー | 機能性生体分子のマイクロアレイおよびその使用 |
US9085771B2 (en) | 2001-01-03 | 2015-07-21 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments with regulatory functions |
US7390893B2 (en) | 2000-08-07 | 2008-06-24 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding peptide transport proteins |
US10106586B2 (en) | 2000-08-07 | 2018-10-23 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding peptide transport proteins |
JP3398366B2 (ja) * | 2000-08-09 | 2003-04-21 | 富士写真フイルム株式会社 | Dna分析用マイクロアレイの製造方法 |
US7129229B2 (en) * | 2000-08-11 | 2006-10-31 | Nanogen Recognomics Gmbh | Hydrazide building blocks and hydrazide modified biomolecules |
AU2002245009B2 (en) * | 2000-08-15 | 2007-05-17 | Bioforce Nanoscience, Inc. | Nanoscale molecular arrayer |
US7198924B2 (en) | 2000-12-11 | 2007-04-03 | Invitrogen Corporation | Methods and compositions for synthesis of nucleic acid molecules using multiple recognition sites |
US7062092B2 (en) | 2000-08-22 | 2006-06-13 | Affymetrix, Inc. | System, method, and computer software product for gain adjustment in biological microarray scanner |
US6965704B2 (en) * | 2000-08-22 | 2005-11-15 | Affymetrix, Inc. | System, method, and computer software product for grid alignment of multiple scanned images |
US20040161789A1 (en) * | 2000-08-30 | 2004-08-19 | Tanner Cameron W. | Porous inorganic substrate for high-density arrays |
US9024004B2 (en) | 2000-08-31 | 2015-05-05 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding acetohydroxyacid synthase proteins |
US20030190612A1 (en) * | 2000-08-31 | 2003-10-09 | Nobuko Yamamoto | Detecting method and detection substrate for use therein |
US7608441B2 (en) | 2000-08-31 | 2009-10-27 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding sterol desaturase proteins |
US20040185464A1 (en) * | 2000-09-15 | 2004-09-23 | Kris Richard M. | High throughput assay system |
WO2002025288A2 (en) * | 2000-09-22 | 2002-03-28 | Clontech Laboratories Inc. | Highly sensitive proteomic analysis methods and kits and systems for practicing the same |
AU2001293086B2 (en) * | 2000-09-25 | 2006-04-13 | Picoliter Inc. | Focused acoustic energy method and device for generating droplets of immiscible fluids |
US20020037359A1 (en) | 2000-09-25 | 2002-03-28 | Mutz Mitchell W. | Focused acoustic energy in the preparation of peptide arrays |
US7900505B2 (en) | 2000-09-25 | 2011-03-08 | Labcyte Inc. | Acoustic assessment of fluids in a plurality of reservoirs |
US6642061B2 (en) | 2000-09-25 | 2003-11-04 | Picoliter Inc. | Use of immiscible fluids in droplet ejection through application of focused acoustic energy |
US20020061258A1 (en) * | 2000-09-25 | 2002-05-23 | Mutz Mitchell W. | Focused acoustic energy in the preparation and screening of combinatorial libraries |
JP4990476B2 (ja) * | 2000-09-25 | 2012-08-01 | ピコリター インコーポレイテッド | コンビナトリアルライブラリの調製およびスクリーニングにおける集束された音響エネルギー |
DE60116794T2 (de) * | 2000-09-25 | 2006-08-31 | Picoliter, Inc., Sunnyvale | Schallausstoss von fluiden aus mehreren behältern |
US6548308B2 (en) | 2000-09-25 | 2003-04-15 | Picoliter Inc. | Focused acoustic energy method and device for generating droplets of immiscible fluids |
US20030082604A1 (en) * | 2000-09-27 | 2003-05-01 | Swanson Melvin J. | High density arrays |
US20060141507A1 (en) * | 2000-09-27 | 2006-06-29 | Kronick Mel N | Manufacture and use of non-standard size microarray slides |
US6658324B2 (en) | 2000-09-29 | 2003-12-02 | Gpc Biotech Ag | Pick and place robot system |
US8168773B2 (en) * | 2000-10-06 | 2012-05-01 | Novozymes, Inc. | Methods for monitoring multiple gene expression |
EP1355931A2 (en) * | 2000-10-06 | 2003-10-29 | Novozymes Biotech, Inc. | Methods for monitoring multiple gene expression |
EP1336097A4 (en) | 2000-10-13 | 2006-02-01 | Fluidigm Corp | SAMPLE INJECTION SYSTEM USING A MICROFLUIDIC DEVICE, FOR ANALYSIS DEVICES |
US6849409B2 (en) * | 2000-10-16 | 2005-02-01 | Axxima Pharmaceuticals Ag | Cellular kinases involved in Cytomegalovirus infection and their inhibition |
US7604971B2 (en) | 2000-10-19 | 2009-10-20 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding UBIE/COQ5 methyltransferase family proteins |
AU2001210599A1 (en) * | 2000-10-23 | 2002-05-06 | Diachip Limited | High precision and intellectual biochip arrayer having function of respotting |
US20020061538A1 (en) * | 2000-10-26 | 2002-05-23 | Rajan Kumar | Fluidic arrays |
EP1332000B1 (en) | 2000-10-30 | 2012-06-20 | Sequenom, Inc. | Method for delivery of submicroliter volumes onto a substrate |
US20020051995A1 (en) * | 2000-10-30 | 2002-05-02 | Rajan Kumar | Stacked arrays |
US7608704B2 (en) | 2000-11-08 | 2009-10-27 | Incyte Corporation | Secreted proteins |
US20020150887A1 (en) * | 2000-11-09 | 2002-10-17 | National Institute Of Advanced Industrial Science And Technology | Methods and nucleic acid probes for molecular genetic analysis of polluted environments and environmental samples |
AU2002235128A1 (en) | 2000-11-14 | 2002-05-27 | Genetag Technology, Inc. | Expression miniarrays and uses thereof |
US20020177138A1 (en) * | 2000-11-15 | 2002-11-28 | The United States Of America , Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Methods for the indentification of textual and physical structured query fragments for the analysis of textual and biopolymer information |
US20050202470A1 (en) * | 2000-11-16 | 2005-09-15 | Caliper Life Sciences, Inc. | Binding assays using molecular melt curves |
US20030092009A1 (en) * | 2000-11-16 | 2003-05-15 | Kaia Palm | Profiling tumor specific markers for the diagnosis and treatment of neoplastic disease |
AU2002241602A1 (en) * | 2000-11-16 | 2002-06-11 | Burstein Technologies, Inc. | Methods and apparatus for detecting and quantifying lymphocytes with optical biodiscs |
US7087203B2 (en) * | 2000-11-17 | 2006-08-08 | Nagaoka & Co., Ltd. | Methods and apparatus for blood typing with optical bio-disc |
US7026131B2 (en) * | 2000-11-17 | 2006-04-11 | Nagaoka & Co., Ltd. | Methods and apparatus for blood typing with optical bio-discs |
US6740530B1 (en) * | 2000-11-22 | 2004-05-25 | Xerox Corporation | Testing method and configurations for multi-ejector system |
JP2002153272A (ja) * | 2000-11-24 | 2002-05-28 | Inst Of Physical & Chemical Res | 生体分子マイクロアレイ |
DE60141171D1 (de) | 2000-11-27 | 2010-03-11 | Intelligent Medical Devices Ll | Klinische intelligente diagnostische vorrichtungen und verfahren |
US6905816B2 (en) | 2000-11-27 | 2005-06-14 | Intelligent Medical Devices, Inc. | Clinically intelligent diagnostic devices and methods |
CA2430379A1 (en) | 2000-12-07 | 2002-06-13 | Chiron Corporation | Endogenous retroviruses up-regulated in prostate cancer |
US20040262318A1 (en) * | 2000-12-08 | 2004-12-30 | Ardais Corporation | Container, method and system for cryptopreserved material |
AU2002227255A1 (en) * | 2000-12-08 | 2002-06-18 | Ardais Corporation | Container for cryopreserved material |
AU2002245107A1 (en) * | 2000-12-12 | 2002-07-30 | Autogenomics, Inc. | Improved biochip |
JP4437171B2 (ja) * | 2000-12-12 | 2010-03-24 | 独立行政法人放射線医学総合研究所 | 遺伝子の発現を解析する方法 |
US6448387B1 (en) * | 2000-12-18 | 2002-09-10 | Monsanto Technology, Llc | Polymeric arrays adapted for high expressing polynucleotides |
US20030232334A1 (en) | 2000-12-22 | 2003-12-18 | Morris David W. | Novel compositions and methods for cancer |
US7820447B2 (en) | 2000-12-22 | 2010-10-26 | Sagres Discovery Inc. | Compositions and methods for cancer |
US20020155473A1 (en) * | 2000-12-22 | 2002-10-24 | Zaoyuan Peng | Methods for identifying G-protein coupled receptors associated with diseases |
US7700274B2 (en) | 2000-12-22 | 2010-04-20 | Sagres Discovery, Inc. | Compositions and methods in cancer associated with altered expression of KCNJ9 |
US20020094304A1 (en) * | 2000-12-22 | 2002-07-18 | Tom Yang | High speed liquid deposition apparatus for microarray fabrication |
US7892730B2 (en) | 2000-12-22 | 2011-02-22 | Sagres Discovery, Inc. | Compositions and methods for cancer |
US7645441B2 (en) | 2000-12-22 | 2010-01-12 | Sagres Discovery Inc. | Compositions and methods in cancer associated with altered expression of PRLR |
US20030180953A1 (en) * | 2000-12-29 | 2003-09-25 | Elitra Pharmaceuticals, Inc. | Gene disruption methodologies for drug target discovery |
US7368555B2 (en) | 2001-01-03 | 2008-05-06 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding EF-hand calcium-binding proteins |
US7385046B2 (en) | 2001-01-03 | 2008-06-10 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding ethylene responsive element binding proteins |
JP3605039B2 (ja) * | 2001-01-09 | 2004-12-22 | 株式会社日立製作所 | 核酸マイクロアレイ、その製造方法及びそれを用いた核酸検出方法 |
AU2002246978A1 (en) * | 2001-01-10 | 2002-07-24 | Symyx Technologies, Inc. | Polymer brushes for immobilizing molecules to a surface |
FR2819524B1 (fr) * | 2001-01-18 | 2003-07-04 | Antonios Vekris | Hybridation differentielle par competition |
JP2005500008A (ja) * | 2001-01-19 | 2005-01-06 | インサイト・ゲノミックス・インコーポレイテッド | 受容体および膜結合タンパク質 |
JPWO2002062993A1 (ja) * | 2001-02-06 | 2004-06-10 | タカラバイオ株式会社 | 増幅核酸及びその固定化物 |
US7087389B2 (en) * | 2001-02-09 | 2006-08-08 | Council Of Scientific & Industrial Research | Highly cost-effective analytical device for performing immunoassays with ultra high sensitivity |
AU2002250078A1 (en) | 2001-02-13 | 2002-08-28 | Children`S Hospital Research Foundation | Quantitative epstein barr virus pcr rapid assay |
WO2002066984A2 (en) * | 2001-02-16 | 2002-08-29 | Pepscan Systems B.V. | Arrays for determining binding of biomolecules |
US7361472B2 (en) | 2001-02-23 | 2008-04-22 | Invitrogen Corporation | Methods for providing extended dynamic range in analyte assays |
US20050196785A1 (en) * | 2001-03-05 | 2005-09-08 | California Institute Of Technology | Combinational array for nucleic acid analysis |
JP2002262876A (ja) * | 2001-03-07 | 2002-09-17 | Ngk Insulators Ltd | 高感度な核酸のハイブリダイゼーション方法、及びその方法を用いた遺伝子解析方法 |
CA2440615A1 (en) | 2001-03-12 | 2002-09-19 | Affymetrix, Inc. | Nucleic acid labeling compounds |
US6605438B1 (en) * | 2001-03-26 | 2003-08-12 | Louis Dischler | Lyophilizing of liquid drops having arbitrary edges and application thereof to microarrays of biological reagents |
EP1372668B1 (en) | 2001-03-26 | 2011-12-07 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Method of attenuating reactions to skin irritants |
JP2002286735A (ja) | 2001-03-28 | 2002-10-03 | Canon Inc | プローブ担体製造用の液体吐出装置、プローブ担体の製造装置及びプローブ担体の製造方法 |
US20020142341A1 (en) * | 2001-03-28 | 2002-10-03 | Makoto Kameyama | Method and apparatus for producing probe carrier |
JP3937742B2 (ja) | 2001-03-28 | 2007-06-27 | キヤノン株式会社 | プローブ担体及びその製造方法 |
US6869551B2 (en) * | 2001-03-30 | 2005-03-22 | Picoliter Inc. | Precipitation of solid particles from droplets formed using focused acoustic energy |
US7604976B2 (en) | 2001-04-02 | 2009-10-20 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding glutamine amidotransferase proteins |
US20020150944A1 (en) * | 2001-04-06 | 2002-10-17 | Fuji Photo Film Co., Ltd. | Biochemical analysis unit and method for exposing stimulable phosphor sheet using the same |
AU2002307152A1 (en) | 2001-04-06 | 2002-10-21 | California Institute Of Technology | Nucleic acid amplification utilizing microfluidic devices |
US20060129329A1 (en) * | 2001-04-09 | 2006-06-15 | Kobylecki Ryszard J | Investigating different physical and/or chemical forms of materials |
CA2443777A1 (en) | 2001-04-10 | 2002-10-24 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Therapeutic and diagnostic uses of antibody specificity profiles |
US7033747B2 (en) | 2001-04-11 | 2006-04-25 | Nagaoka & Co., Ltd | Multi-parameter assays including analysis discs and methods relating thereto |
US20020155587A1 (en) | 2001-04-20 | 2002-10-24 | Sequenom, Inc. | System and method for testing a biological sample |
KR100777362B1 (ko) * | 2001-05-08 | 2007-11-19 | (주)바이오니아 | 생물학적 시료의 미세 배열을 위한 스팟팅 핀 |
US20030119013A1 (en) * | 2001-04-23 | 2003-06-26 | Bo Jiang | Identification of essential genes of Aspergillus fumigatus and methods of use |
US6852524B2 (en) | 2001-04-27 | 2005-02-08 | Canon Kabushiki Kaisha | Probe carrier, probe fixing carrier and method of manufacturing the same |
US6943036B2 (en) * | 2001-04-30 | 2005-09-13 | Agilent Technologies, Inc. | Error detection in chemical array fabrication |
AU2002340641A1 (en) * | 2001-05-03 | 2002-11-18 | Sigma-Genosys, Ltd. | Methods for assembling protein microarrays |
US7338805B2 (en) | 2001-05-04 | 2008-03-04 | Bio Merieux | Labeling reagents, methods for synthesizing such reagents and methods for detecting biological molecules |
KR100419002B1 (ko) * | 2001-05-11 | 2004-02-14 | (주)로봇앤드디자인 | 글래스 칩 자세조정 장치 |
US6558907B2 (en) | 2001-05-16 | 2003-05-06 | Corning Incorporated | Methods and compositions for arraying nucleic acids onto a solid support |
EP1445613B1 (en) | 2001-05-21 | 2010-07-07 | FUJIFILM Corporation | Biochemical analysis unit and method for its production |
WO2002094846A2 (en) * | 2001-05-22 | 2002-11-28 | Parallel Synthesis Technologies, Inc. | Method for in situ, on-chip chemical synthesis |
WO2002097111A2 (en) * | 2001-05-29 | 2002-12-05 | Genomic Solutions, Inc. | Method and apparatus for facilitating the creation and analysis of microarrays |
US20030059807A1 (en) * | 2001-06-07 | 2003-03-27 | Proligo Llc | Microcalorimetric detection of analytes and binding events |
US6905827B2 (en) | 2001-06-08 | 2005-06-14 | Expression Diagnostics, Inc. | Methods and compositions for diagnosing or monitoring auto immune and chronic inflammatory diseases |
US7026121B1 (en) | 2001-06-08 | 2006-04-11 | Expression Diagnostics, Inc. | Methods and compositions for diagnosing and monitoring transplant rejection |
US7235358B2 (en) | 2001-06-08 | 2007-06-26 | Expression Diagnostics, Inc. | Methods and compositions for diagnosing and monitoring transplant rejection |
US20020192657A1 (en) * | 2001-06-19 | 2002-12-19 | Erwin Robert L. | Bio-tolerant substrata having analyte binding microarray |
US7041257B2 (en) * | 2001-09-25 | 2006-05-09 | Cytonome, Inc. | Microfabricated two-pin liquid sample dispensing system |
ATE371018T1 (de) | 2001-06-22 | 2007-09-15 | Stemcells Inc | Le-zellen (liver engrafting cells), assays und verwendungen davon |
US7402286B2 (en) * | 2001-06-27 | 2008-07-22 | The Regents Of The University Of California | Capillary pins for high-efficiency microarray printing device |
US6855538B2 (en) * | 2001-06-27 | 2005-02-15 | The Regents Of The University Of California | High-efficiency microarray printing device |
US7297480B2 (en) * | 2001-06-28 | 2007-11-20 | Dermtech International | Method for detection of melanoma |
US20030003493A1 (en) * | 2001-07-02 | 2003-01-02 | Fuji Photo Film Co., Ltd. | Biochemical analysis unit and biochemical analysis kit |
US6989267B2 (en) * | 2001-07-02 | 2006-01-24 | Agilent Technologies, Inc. | Methods of making microarrays with substrate surfaces having covalently bound polyelectrolyte films |
US6485918B1 (en) | 2001-07-02 | 2002-11-26 | Packard Bioscience Corporation | Method and apparatus for incubation of a liquid reagent and target spots on a microarray substrate |
US6753145B2 (en) * | 2001-07-05 | 2004-06-22 | Agilent Technologies, Inc. | Buffer composition and method for hybridization of microarrays on adsorbed polymer siliceous surfaces |
JP4312595B2 (ja) * | 2001-07-11 | 2009-08-12 | ベイラー カレッジ オブ メディシン | 表面上の核酸二重鎖の新規形態に基づく方法および装置 |
US10272409B2 (en) | 2001-07-11 | 2019-04-30 | Michael E. Hogan | Methods and devices based upon a novel form of nucleic acid duplex on a surface |
US20030013208A1 (en) * | 2001-07-13 | 2003-01-16 | Milagen, Inc. | Information enhanced antibody arrays |
AU2002329606A1 (en) * | 2001-07-17 | 2003-03-03 | Bioforce Nanosciences, Inc. | Combined molecular blinding detection through force microscopy and mass spectrometry |
US7402282B2 (en) | 2001-07-20 | 2008-07-22 | Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. | Auxiliary sample supply for a clinical analyzer |
US20040006033A1 (en) * | 2001-08-06 | 2004-01-08 | Zhu York Yuan-Yuan | Methods for identifying low-abundance polynucleotides and related compositions |
US6787312B2 (en) * | 2001-08-09 | 2004-09-07 | Corning Incorporated | Treatment of substrates for immobilizing biomolecules |
EP1453600A1 (en) * | 2001-08-10 | 2004-09-08 | Oxford Genome Sciences (UK) Limited | Liquid delivery apparatus and method |
US20050019223A1 (en) * | 2001-08-10 | 2005-01-27 | Platt Albert Edward | Liquid delivery apparatus and method |
US20030040129A1 (en) * | 2001-08-20 | 2003-02-27 | Shah Haresh P. | Binding assays using magnetically immobilized arrays |
JP2005501237A (ja) * | 2001-08-21 | 2005-01-13 | エムシーダブリユー リサーチ フオンデーシヨン インコーポレーテツド | 3標識マイクロアレイのための方法および装置 |
JP4723133B2 (ja) * | 2001-08-24 | 2011-07-13 | 千葉県 | 新規ヒトbmcc1遺伝子 |
US7014744B2 (en) | 2001-08-24 | 2006-03-21 | Applera Corporation | Method of purification and concentration using AC fields with a transfer tip |
JP2003135063A (ja) * | 2001-08-24 | 2003-05-13 | Chiba Prefecture | 新規な遺伝子nedl−1 |
US6969489B2 (en) | 2001-08-24 | 2005-11-29 | Cytoplex Biosciences | Micro array for high throughout screening |
US20030087309A1 (en) * | 2001-08-27 | 2003-05-08 | Shiping Chen | Desktop drug screening system |
US20030129665A1 (en) * | 2001-08-30 | 2003-07-10 | Selvan Gowri Pyapali | Methods for qualitative and quantitative analysis of cells and related optical bio-disc systems |
US20040151627A1 (en) * | 2001-08-30 | 2004-08-05 | Nelson Mary Anne | Methods for covalently attaching nucleic acids to substrates |
US20050123913A1 (en) * | 2001-08-30 | 2005-06-09 | Emory University | Human mitochondrial dna polymorphisms, haplogroups, associations with physiological conditions, and genotyping arrays |
WO2003020898A2 (en) * | 2001-08-30 | 2003-03-13 | Spectral Genomics, Inc. | Arrays comprising pre-labeled biological molecules and methods for making and using these arrays |
CA2356540A1 (en) * | 2001-08-30 | 2003-02-28 | Emory University | Expressed dna sequences involved in mitochondrial functions |
US20050147984A1 (en) * | 2001-08-31 | 2005-07-07 | Clondiag Chip Technologies Gmbh | Interaction detection on several probe arrays |
WO2003021222A2 (en) * | 2001-08-31 | 2003-03-13 | Burstein Technologies, Inc. | Capture layer assemblies for cellular assays including related optical analysis discs and methods |
US6955788B2 (en) * | 2001-09-07 | 2005-10-18 | Affymetrix, Inc. | Apparatus and method for aligning microarray printing head |
AU2002336457A1 (en) * | 2001-09-07 | 2003-03-24 | Transform Pharmaceuticals, Inc. | Apparatus and method for high-throughput preparation and characterization of compositions |
EP1423699A4 (en) * | 2001-09-07 | 2006-01-18 | Burstein Technologies Inc | CELLULAR MORPHOLOGY BASED IDENTIFICATION AND QUANTIFICATION OF WHITE BLOOD CELL TYPES USING OPTICAL BIO-DISC SYSTEMS |
JP4768224B2 (ja) * | 2001-09-10 | 2011-09-07 | メソ スケイル テクノロジーズ,エルエルシー | 1つの試料について複数の測定を実施する方法及び装置 |
US6974671B1 (en) | 2001-09-12 | 2005-12-13 | Salk Institute For Biological Studies | Methods for indentifying compounds that modulate gluconeogenesis through the binding of CREB to the PGC-1 promoter |
US20030113816A1 (en) | 2001-09-18 | 2003-06-19 | Weitz Stephen L. | Methods of assaying connective tissue growth factor |
US6670129B2 (en) | 2001-09-24 | 2003-12-30 | Corning Incorporated | Cell transfection apparatus and methods for making and using the cell transfection apparatus |
KR100443641B1 (ko) * | 2001-09-25 | 2004-08-09 | 김흥기 | 디엔에이 함침 핀의 제조방법 |
US7153699B2 (en) * | 2001-12-21 | 2006-12-26 | Cytonome, Inc. | Microfabricated two-pin system for biomolecule crystallization |
US20070054408A1 (en) * | 2001-09-25 | 2007-03-08 | Cytonome, Inc. | Microfabricated two-pin system for biomolecule crystallization |
US7042488B2 (en) | 2001-09-27 | 2006-05-09 | Fujinon Corporation | Electronic endoscope for highlighting blood vessel |
AU2002334887A1 (en) * | 2001-10-05 | 2003-04-22 | Vanderbilt University | Capillary tube printing tips for microarray printing |
WO2003091426A1 (en) | 2001-10-12 | 2003-11-06 | Spectral Genomics, Inc. | Compilations of nucleic acids and arrays and methods of using them |
US7439346B2 (en) | 2001-10-12 | 2008-10-21 | Perkinelmer Las Inc. | Nucleic acids arrays and methods of use therefor |
US20040029129A1 (en) * | 2001-10-25 | 2004-02-12 | Liangsu Wang | Identification of essential genes in microorganisms |
US8440093B1 (en) | 2001-10-26 | 2013-05-14 | Fuidigm Corporation | Methods and devices for electronic and magnetic sensing of the contents of microfluidic flow channels |
US20030082560A1 (en) * | 2001-10-29 | 2003-05-01 | Yingjian Wang | Method of making interactive protein arrays |
US20030082294A1 (en) * | 2001-10-31 | 2003-05-01 | Laurakay Bruhn | Surface treatment method for bio-arrays |
US6866825B2 (en) | 2001-11-05 | 2005-03-15 | Industrial Technology Research Institute | Micro-dispenser for biochemical analysis |
AU2002360361A1 (en) * | 2001-11-09 | 2003-06-10 | Biomicroarrays, Inc. | High surface area substrates for microarrays and methods to make same |
RU2316591C2 (ru) * | 2001-11-09 | 2008-02-10 | Джорджтаун Юниверсити | Новые изоформы ингибитора роста васкулярных эндотелиальных клеток |
US20030124599A1 (en) * | 2001-11-14 | 2003-07-03 | Shiping Chen | Biochemical analysis system with combinatorial chemistry applications |
AU2002352778A1 (en) * | 2001-11-16 | 2003-06-10 | Sloan-Kettering Institute For Cancer Research | High-density cell microarrays for parallel functional determinations |
EP1448992A4 (en) * | 2001-11-20 | 2005-11-02 | Burstein Technologies Inc | OPTICAL BIODISTICS AND FLUIDIC CIRCUITS FOR CELL ANALYSIS AND CORRESPONDING METHODS |
EP1451358A2 (en) * | 2001-11-20 | 2004-09-01 | Genentech, Inc. | Cell and tissue arrays and microarrays and methods of use |
CA2467587A1 (en) | 2001-11-30 | 2003-06-12 | Fluidigm Corporation | Microfluidic device and methods of using same |
US7691333B2 (en) | 2001-11-30 | 2010-04-06 | Fluidigm Corporation | Microfluidic device and methods of using same |
WO2003048727A2 (en) * | 2001-12-03 | 2003-06-12 | Invitrogen Corporation | Identification of rearrangements in nucleic acid molecules |
EP2295060B1 (en) | 2001-12-06 | 2018-10-31 | Fibrogen, Inc. | Treatment or prevention of ischemic or hypoxic conditions |
US20030176317A1 (en) | 2001-12-06 | 2003-09-18 | Volkmar Guenzler-Pukall | Stabilization of hypoxia inducible factor (HIF) alpha |
US20070037147A1 (en) * | 2001-12-07 | 2007-02-15 | Pablo Garcia | Endogenous retrovirus polypeptides linked to oncogenic transformation |
EP1463531B1 (en) | 2001-12-11 | 2011-09-28 | Fibrogen, Inc. | Methods for inhibiting ocular processes |
US7258839B2 (en) * | 2001-12-21 | 2007-08-21 | Cytonome, Inc. | Temperature controlled microfabricated two-pin liquid sample dispensing system |
US20030170694A1 (en) * | 2001-12-21 | 2003-09-11 | Daniel Wall | Stabilized nucleic acids in gene and drug discovery and methods of use |
US6846454B2 (en) * | 2001-12-24 | 2005-01-25 | Agilent Technologies, Inc. | Fluid exit in reaction chambers |
US20030124542A1 (en) * | 2001-12-28 | 2003-07-03 | Spectral Genomics, Inc. | Methods for mapping the chromosomal loci of genes expressed by a cell |
DE60326931D1 (de) | 2002-01-08 | 2009-05-14 | Novartis Vaccines & Diagnostic | In kanzerösen mammazellen differentiell exprimierte genprodukte und ihre verwendungsverfahren |
FR2834521B1 (fr) * | 2002-01-10 | 2004-12-17 | Bio Merieux | Procede de detection et/ou d'identification de l'espece animale d'origine de la matiere animale contenue dans un echantillon |
US20030148391A1 (en) * | 2002-01-24 | 2003-08-07 | Salafsky Joshua S. | Method using a nonlinear optical technique for detection of interactions involving a conformational change |
US20030143329A1 (en) * | 2002-01-30 | 2003-07-31 | Shchegrova Svetlana V. | Error correction in array fabrication |
DE60300424T2 (de) | 2002-01-31 | 2006-03-09 | Fuji Photo Film Co., Ltd., Minami-Ashigara | Vorrichtung zur Durchführung biochemischer Analysen und Verfahren zu ihrer Herstellung |
KR100969209B1 (ko) * | 2002-01-31 | 2010-07-09 | 후지필름 가부시키가이샤 | 생화학분석용 유니트의 제조방법 |
WO2003070902A2 (en) * | 2002-02-20 | 2003-08-28 | Incyte Corporation | Receptors and membrane-associated proteins |
EP1520037A4 (en) * | 2002-02-27 | 2006-06-07 | Miragene Inc | CHEMICAL COMPOSITION WITH IMPROVED SUBSTRATE FOR IMMOBILIZATION OF PROTEIN ON RIGID SUPPORT |
US20030161761A1 (en) * | 2002-02-28 | 2003-08-28 | Williams Roger O. | Apparatus and method for composing high density materials onto target substrates by a rapid sequence |
DE10229253A1 (de) * | 2002-06-28 | 2004-01-29 | Axaron Bioscience Ag | Aufbringen eines Stoffs auf ein Substrat |
AU2003218727A1 (en) * | 2002-03-11 | 2003-09-22 | Axaron Bioscience Ag | Method for applying a substance to a substrate |
AU2003209886A1 (en) * | 2002-03-14 | 2003-09-22 | Qlt Inc. | Cancer associated araf1 protein kinase and its uses |
US20040241723A1 (en) * | 2002-03-18 | 2004-12-02 | Marquess Foley Leigh Shaw | Systems and methods for improving protein and milk production of dairy herds |
EP2093233A1 (en) | 2002-03-21 | 2009-08-26 | Sagres Discovery, Inc. | Novel compositions and methods in cancer |
US6919531B2 (en) * | 2002-03-25 | 2005-07-19 | Agilent Technologies, Inc. | Methods for producing glass substrates for use in biopolymeric microarrays |
US6916621B2 (en) * | 2002-03-27 | 2005-07-12 | Spectral Genomics, Inc. | Methods for array-based comparitive binding assays |
CA2480728A1 (en) | 2002-04-01 | 2003-10-16 | Fluidigm Corporation | Microfluidic particle-analysis systems |
US20040029151A1 (en) * | 2002-04-09 | 2004-02-12 | Affymetrix, Inc. | Molecular genetic profiling of gleason grades 3 and 4/5 prostate cancer |
US7687256B2 (en) * | 2002-04-11 | 2010-03-30 | Spire Corporation | Surface activated biochip |
US7226771B2 (en) | 2002-04-19 | 2007-06-05 | Diversa Corporation | Phospholipases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
EP1497418B1 (en) | 2002-04-19 | 2012-10-17 | Verenium Corporation | Phospholipases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
KR100456213B1 (ko) * | 2002-05-02 | 2004-11-09 | 주식회사 가이아모 | 시료배열장치용 초미세 인쇄용 펜 |
US20040072274A1 (en) * | 2002-05-09 | 2004-04-15 | Lebrun Stewart J. | System and method for visualization and digital analysis of protein and other macromolecule microarrays |
US6841379B2 (en) | 2002-05-15 | 2005-01-11 | Beckman Coulter, Inc. | Conductive microplate |
JP3732457B2 (ja) * | 2002-05-20 | 2006-01-05 | 日立ソフトウエアエンジニアリング株式会社 | スポットピン |
TWI221523B (en) * | 2002-05-21 | 2004-10-01 | Sony Corp | Bioassay method, bioassay device, and bioassay substrate |
US6980677B2 (en) * | 2002-05-24 | 2005-12-27 | Niles Scientific, Inc. | Method, system, and computer code for finding spots defined in biological microarrays |
WO2003100421A1 (fr) * | 2002-05-28 | 2003-12-04 | Bio Strand, Inc. | Dispositif distributeur d'echantillons, procede de fabrication d'elements de revetement, procede de distribution d'echantillons, et dispositif d'activation de substrat |
AU2003238178A1 (en) | 2002-05-29 | 2003-12-12 | Develogen Aktiengesellschaft Fur Entwicklungsbiologische Forschung | Pancreas-specific proteins |
US20050239193A1 (en) * | 2002-05-30 | 2005-10-27 | Bioforce Nanosciences, Inc. | Device and method of use for detection and characterization of microorganisms and microparticles |
US7537936B2 (en) * | 2002-05-31 | 2009-05-26 | Agilent Technologies, Inc. | Method of testing multiple fluid samples with multiple biopolymer arrays |
AU2003276679A1 (en) * | 2002-06-13 | 2003-12-31 | Chiron Corporation | Vectors for expression of hml-2 polypeptides |
US20040031167A1 (en) * | 2002-06-13 | 2004-02-19 | Stein Nathan D. | Single wafer method and apparatus for drying semiconductor substrates using an inert gas air-knife |
US20030232379A1 (en) * | 2002-06-14 | 2003-12-18 | Amorese Douglas A. | Methods of performing array based assays and compositions for practicing the same |
US7919308B2 (en) * | 2002-06-14 | 2011-04-05 | Agilent Technologies, Inc. | Form in place gaskets for assays |
US9068173B2 (en) | 2002-06-17 | 2015-06-30 | Ceres, Inc. | Sequence-determined DNA fragments encoding trehalose-6P phosphatase proteins |
US20030231986A1 (en) * | 2002-06-18 | 2003-12-18 | Eastman Kodak Company | Micro-array identification means |
USH2223H1 (en) | 2002-07-11 | 2008-09-02 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy | Patterned, micrometer-sized antibody features |
DE10329928A1 (de) * | 2002-07-12 | 2004-02-05 | Benq Corp., Kweishan | Verfahren zur Aufbereitung von Biochips und Biochip |
JP2004045346A (ja) * | 2002-07-16 | 2004-02-12 | Nisshinbo Ind Inc | マイクロアレイの作製方法 |
WO2004009765A2 (en) * | 2002-07-19 | 2004-01-29 | Althea Technologies, Inc. | Strategies for gene expression analysis |
US20040018497A1 (en) * | 2002-07-26 | 2004-01-29 | Warden Craig H | Human obesity LIPIN3 polynucleotide and polypeptide sequences and methods of use thereof |
US7105347B2 (en) * | 2002-07-30 | 2006-09-12 | Corning Incorporated | Method and device for protein delivery into cells |
WO2004015393A2 (en) * | 2002-08-13 | 2004-02-19 | Discovery Partners International | Spotting pattern for placement of compounds in an array |
US20070276126A1 (en) * | 2002-08-13 | 2007-11-29 | Incyte Corporation | Cell adhesion and extracellular matrix proteins |
US20040063124A1 (en) * | 2002-08-15 | 2004-04-01 | Proteoplex, Inc. | Methods and apparatus for preparing and assaying biological samples to determine protein concentration |
US7384742B2 (en) * | 2002-08-16 | 2008-06-10 | Decision Biomarkers, Inc. | Substrates for isolating reacting and microscopically analyzing materials |
US20030036085A1 (en) * | 2002-08-19 | 2003-02-20 | Salinaro Richard F | Membranes |
US8277753B2 (en) | 2002-08-23 | 2012-10-02 | Life Technologies Corporation | Microfluidic transfer pin |
EP1548105A4 (en) * | 2002-08-30 | 2006-03-01 | Japan Science & Tech Agency | TARGETED GENE DISRUPTION METHOD, HYPERTHERMOSTABLE BACTERIUM GENOME AND GENOMIC CHIP USING SUCH A METHOD |
US20070219353A1 (en) * | 2002-09-03 | 2007-09-20 | Incyte Corporation | Immune Response Associated Proteins |
US20040054160A1 (en) * | 2002-09-16 | 2004-03-18 | Santona Pal | Nucleic-acid ink compositions for arraying onto a solid support |
US7595883B1 (en) * | 2002-09-16 | 2009-09-29 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Biological analysis arrangement and approach therefor |
US20040142864A1 (en) * | 2002-09-16 | 2004-07-22 | Plexxikon, Inc. | Crystal structure of PIM-1 kinase |
US6989234B2 (en) * | 2002-09-24 | 2006-01-24 | Duke University | Method and apparatus for non-contact electrostatic actuation of droplets |
US8349276B2 (en) | 2002-09-24 | 2013-01-08 | Duke University | Apparatuses and methods for manipulating droplets on a printed circuit board |
US6911132B2 (en) | 2002-09-24 | 2005-06-28 | Duke University | Apparatus for manipulating droplets by electrowetting-based techniques |
US7329545B2 (en) * | 2002-09-24 | 2008-02-12 | Duke University | Methods for sampling a liquid flow |
EP2298448A3 (en) | 2002-09-25 | 2012-05-30 | California Institute of Technology | Microfluidic large scale integration |
US7997288B2 (en) * | 2002-09-30 | 2011-08-16 | Lam Research Corporation | Single phase proximity head having a controlled meniscus for treating a substrate |
US7153400B2 (en) * | 2002-09-30 | 2006-12-26 | Lam Research Corporation | Apparatus and method for depositing and planarizing thin films of semiconductor wafers |
US6988327B2 (en) * | 2002-09-30 | 2006-01-24 | Lam Research Corporation | Methods and systems for processing a substrate using a dynamic liquid meniscus |
US7632376B1 (en) | 2002-09-30 | 2009-12-15 | Lam Research Corporation | Method and apparatus for atomic layer deposition (ALD) in a proximity system |
US7093375B2 (en) * | 2002-09-30 | 2006-08-22 | Lam Research Corporation | Apparatus and method for utilizing a meniscus in substrate processing |
US7389783B2 (en) * | 2002-09-30 | 2008-06-24 | Lam Research Corporation | Proximity meniscus manifold |
US7069937B2 (en) * | 2002-09-30 | 2006-07-04 | Lam Research Corporation | Vertical proximity processor |
US7383843B2 (en) * | 2002-09-30 | 2008-06-10 | Lam Research Corporation | Method and apparatus for processing wafer surfaces using thin, high velocity fluid layer |
US7240679B2 (en) * | 2002-09-30 | 2007-07-10 | Lam Research Corporation | System for substrate processing with meniscus, vacuum, IPA vapor, drying manifold |
US7513262B2 (en) * | 2002-09-30 | 2009-04-07 | Lam Research Corporation | Substrate meniscus interface and methods for operation |
US7367345B1 (en) | 2002-09-30 | 2008-05-06 | Lam Research Corporation | Apparatus and method for providing a confined liquid for immersion lithography |
US7045018B2 (en) * | 2002-09-30 | 2006-05-16 | Lam Research Corporation | Substrate brush scrubbing and proximity cleaning-drying sequence using compatible chemistries, and method, apparatus, and system for implementing the same |
US7293571B2 (en) * | 2002-09-30 | 2007-11-13 | Lam Research Corporation | Substrate proximity processing housing and insert for generating a fluid meniscus |
US6988326B2 (en) * | 2002-09-30 | 2006-01-24 | Lam Research Corporation | Phobic barrier meniscus separation and containment |
US6954993B1 (en) | 2002-09-30 | 2005-10-18 | Lam Research Corporation | Concentric proximity processing head |
US7614411B2 (en) * | 2002-09-30 | 2009-11-10 | Lam Research Corporation | Controls of ambient environment during wafer drying using proximity head |
US8236382B2 (en) * | 2002-09-30 | 2012-08-07 | Lam Research Corporation | Proximity substrate preparation sequence, and method, apparatus, and system for implementing the same |
DE10393431T5 (de) * | 2002-10-01 | 2005-11-17 | Nimblegen Systems, Inc., Madison | Mikroarrays mit mehreren Oligonukleotiden in einzelnen Array Features |
US8871446B2 (en) | 2002-10-02 | 2014-10-28 | California Institute Of Technology | Microfluidic nucleic acid analysis |
US20040067492A1 (en) * | 2002-10-04 | 2004-04-08 | Allan Peng | Reverse transcription on microarrays |
WO2004033636A2 (en) * | 2002-10-04 | 2004-04-22 | Incyte Corporation | Protein modification and maintenance molecules |
US20040235005A1 (en) * | 2002-10-23 | 2004-11-25 | Ernest Friedlander | Methods and composition for detecting targets |
US20040089750A1 (en) * | 2002-10-23 | 2004-05-13 | Muniswamappa Anjanappa | Micro-array fluid dispensing apparatus and method |
US20040082058A1 (en) * | 2002-10-29 | 2004-04-29 | Arthur Schleifer | Array hybridization apparatus and method for making uniform sample volumes |
US20040086868A1 (en) * | 2002-10-30 | 2004-05-06 | Parker Russell A. | Enclosed arrays and their reading |
US20030153013A1 (en) * | 2002-11-07 | 2003-08-14 | Ruo-Pan Huang | Antibody-based protein array system |
AU2002952696A0 (en) | 2002-11-14 | 2002-11-28 | Genomics Research Partners Pty Ltd | Status determination |
WO2004046387A1 (en) * | 2002-11-15 | 2004-06-03 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for analysis of regulatory sequences |
WO2004048550A2 (en) * | 2002-11-26 | 2004-06-10 | Incyte Corporation | Immune response associated proteins |
AU2003298733B2 (en) | 2002-11-27 | 2009-06-18 | Agena Bioscience, Inc. | Fragmentation-based methods and systems for sequence variation detection and discovery |
US20040109045A1 (en) * | 2002-12-06 | 2004-06-10 | Eastman Kodak Company | Print head for micro-deposition of bio-molecules |
US7247337B1 (en) | 2002-12-16 | 2007-07-24 | Agilent Technologies, Inc. | Method and apparatus for microarray fabrication |
ATE545428T1 (de) | 2002-12-16 | 2012-03-15 | Develogen Ag | Pik4cb involviert in der regulierung des energiestoffwechsels |
US20040121339A1 (en) * | 2002-12-19 | 2004-06-24 | Jizhong Zhou | Special film-coated substrate for bio-microarray fabrication and use thereof |
CA2521999A1 (en) | 2002-12-20 | 2004-09-02 | Biotrove, Inc. | Assay apparatus and method using microfluidic arrays |
US20040120859A1 (en) * | 2002-12-20 | 2004-06-24 | Kocher Thomas E. | Biomolecular micro-deposition system |
EP2474632B1 (en) | 2002-12-20 | 2015-08-12 | Celera Corporation | Genetic polymorphisms associated with myocardial infarction, methods of detection and uses thereof |
US7323555B2 (en) | 2002-12-26 | 2008-01-29 | Isao Saito | Nucleotide derivative and DNA microarray |
US7414117B2 (en) | 2002-12-26 | 2008-08-19 | Ngk Insulators, Ltd. | Nucleotide derivative and DNA microarray |
US20030166263A1 (en) * | 2002-12-30 | 2003-09-04 | Haushalter Robert C. | Microfabricated spotting apparatus for producing low cost microarrays |
US7344832B2 (en) * | 2003-01-02 | 2008-03-18 | Bioforce Nanosciences, Inc. | Method and apparatus for molecular analysis in small sample volumes |
US7029855B1 (en) * | 2003-01-28 | 2006-04-18 | Proteomyx Inc. | Radioactive multiplexing analytical methods for biomarkers discovery |
US7691580B2 (en) * | 2003-01-29 | 2010-04-06 | Corning Incorporated | Reverse protein delivery into cells on coded microparticles |
US20040152081A1 (en) * | 2003-01-31 | 2004-08-05 | Leproust Eric M. | Viscosity control during polynucleotide synthesis |
US20040151635A1 (en) * | 2003-01-31 | 2004-08-05 | Leproust Eric M. | Array fabrication using deposited drop splat size |
US20040152083A1 (en) * | 2003-01-31 | 2004-08-05 | Leproust Eric M. | Multiple arrays with surface energy transition to maintain separation of samples on the arrays |
US20050048573A1 (en) * | 2003-02-03 | 2005-03-03 | Plexxikon, Inc. | PDE5A crystal structure and uses |
US7767387B2 (en) | 2003-06-13 | 2010-08-03 | Sagres Discovery, Inc. | Therapeutic targets in cancer |
WO2004074321A2 (en) | 2003-02-14 | 2004-09-02 | Sagres Discovery, Inc. | Therapeutic gpcr targets in cancer |
US6861251B2 (en) * | 2003-02-24 | 2005-03-01 | Pritest, Inc. | Translucent solid matrix assay device for microarray analysis |
US20050170431A1 (en) * | 2003-02-28 | 2005-08-04 | Plexxikon, Inc. | PYK2 crystal structure and uses |
US20040233250A1 (en) * | 2003-03-05 | 2004-11-25 | Haushalter Robert C. | Microcontact printhead device |
CN104388449A (zh) | 2003-03-06 | 2015-03-04 | 维莱尼姆公司 | 淀粉酶、编码它们的核酸及其制备和应用方法 |
CA2889013C (en) | 2003-03-07 | 2018-07-17 | Dsm Ip Assets B.V. | Hydrolases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
EP2390352A1 (en) | 2003-03-18 | 2011-11-30 | Quantum Genetics Ireland Limited | Systems and methods for improving protein and milk production of dairy herds |
DE10312628A1 (de) * | 2003-03-21 | 2004-10-07 | Friz Biochem Gmbh | Verfahren und Vorrichtung zum Benetzen eines Substrats mit einer Flüssigkeit |
US20040248287A1 (en) * | 2003-03-28 | 2004-12-09 | Qianjin Hu | Multi-array systems and methods of use thereof |
US20050145496A1 (en) | 2003-04-03 | 2005-07-07 | Federico Goodsaid | Thermal reaction device and method for using the same |
US8828663B2 (en) | 2005-03-18 | 2014-09-09 | Fluidigm Corporation | Thermal reaction device and method for using the same |
US7666361B2 (en) | 2003-04-03 | 2010-02-23 | Fluidigm Corporation | Microfluidic devices and methods of using same |
US7476363B2 (en) | 2003-04-03 | 2009-01-13 | Fluidigm Corporation | Microfluidic devices and methods of using same |
US7604965B2 (en) | 2003-04-03 | 2009-10-20 | Fluidigm Corporation | Thermal reaction device and method for using the same |
US7592434B2 (en) | 2003-04-04 | 2009-09-22 | Verenium Corporation | Pectate lyases, nucleic encoding them and methods for making and using them |
US7025935B2 (en) * | 2003-04-11 | 2006-04-11 | Illumina, Inc. | Apparatus and methods for reformatting liquid samples |
US8652774B2 (en) * | 2003-04-16 | 2014-02-18 | Affymetrix, Inc. | Automated method of manufacturing polyer arrays |
US7892745B2 (en) | 2003-04-24 | 2011-02-22 | Xdx, Inc. | Methods and compositions for diagnosing and monitoring transplant rejection |
US20040214310A1 (en) * | 2003-04-25 | 2004-10-28 | Parker Russell A. | Apparatus and method for array alignment |
US7056673B2 (en) * | 2003-04-25 | 2006-06-06 | Janssen Pharmaceutica N.V. | Preservation of RNA in a biological sample |
US7829682B1 (en) | 2003-04-30 | 2010-11-09 | Incyte Corporation | Human β-adrenergic receptor kinase nucleic acid molecule |
US20050025763A1 (en) | 2003-05-08 | 2005-02-03 | Protein Design Laboratories, Inc. | Therapeutic use of anti-CS1 antibodies |
US7709610B2 (en) | 2003-05-08 | 2010-05-04 | Facet Biotech Corporation | Therapeutic use of anti-CS1 antibodies |
US20040223890A1 (en) * | 2003-05-09 | 2004-11-11 | Summers Douglas G. | Clamshell slide holder |
WO2004101808A2 (en) * | 2003-05-09 | 2004-11-25 | Sigma-Aldrich Co. | Genomic and proteomic approaches for the development of cell culture medium |
US8150626B2 (en) * | 2003-05-15 | 2012-04-03 | Illumina, Inc. | Methods and compositions for diagnosing lung cancer with specific DNA methylation patterns |
US8150627B2 (en) | 2003-05-15 | 2012-04-03 | Illumina, Inc. | Methods and compositions for diagnosing lung cancer with specific DNA methylation patterns |
US7795006B2 (en) | 2003-05-19 | 2010-09-14 | Toray Industries, Inc. | Support having selectively bonding substance fixed thereto |
US20040241659A1 (en) * | 2003-05-30 | 2004-12-02 | Applera Corporation | Apparatus and method for hybridization and SPR detection |
FR2855832B1 (fr) * | 2003-06-03 | 2007-09-14 | Biomerieux Sa | Procede de diagnostic et/ou de pronostic d'un syndrome septique |
US20050239089A1 (en) * | 2003-06-06 | 2005-10-27 | Johnson Martin D | Mobility cassettes |
US20040248323A1 (en) | 2003-06-09 | 2004-12-09 | Protometrix, Inc. | Methods for conducting assays for enzyme activity on protein microarrays |
CA2533087A1 (fr) * | 2003-06-17 | 2005-01-27 | Moussa Hoummady | Dispositif de prelevement et de depot de gouttelettes d'au moins un liquide, procede de mise en oeuvre de ce dispositif, ainsi que systeme d'asservissement pour ce procede |
US20040259100A1 (en) | 2003-06-20 | 2004-12-23 | Illumina, Inc. | Methods and compositions for whole genome amplification and genotyping |
WO2004113918A1 (ja) | 2003-06-20 | 2004-12-29 | Universal Bio Research Co., Ltd. | 試料配列・集積化装置、その方法、および試料集積体使用装置 |
US20040259261A1 (en) * | 2003-06-20 | 2004-12-23 | Phalanx Biotech Group, Inc. | Method for manufacturing a microarray and verifying the same |
US7675000B2 (en) * | 2003-06-24 | 2010-03-09 | Lam Research Corporation | System method and apparatus for dry-in, dry-out, low defect laser dicing using proximity technology |
BRPI0412279A (pt) | 2003-07-02 | 2006-09-19 | Diversa Corp | glucanases, ácidos nucléicos codificando as mesmas e métodos para preparar e aplicar os mesmos |
WO2005003769A1 (ja) * | 2003-07-04 | 2005-01-13 | Kubota Corporation | バイオチップ |
US20050079548A1 (en) * | 2003-07-07 | 2005-04-14 | Plexxikon, Inc. | Ligand development using PDE4B crystal structures |
JP2005030869A (ja) * | 2003-07-10 | 2005-02-03 | Fuji Photo Film Co Ltd | プローブ溶液の点着方法 |
FR2857375B1 (fr) * | 2003-07-10 | 2007-11-09 | Biomerieux Sa | Procede de detection et/ou d'identification de bacteries de genre staphylococcus |
ES2392430T3 (es) | 2003-07-11 | 2012-12-10 | Develogen Aktiengesellschaft | Uso de productos de proteínas segregadas DG153 para prevenir y tratar enfermedades pancreáticas y/u obesidad y/o síndrome metabólico |
AP2006003513A0 (en) | 2003-07-14 | 2006-02-28 | Internat Levestock Res Inst Il | East coast fever vaccine based on ctl-specific schizont antigens. |
US20050048571A1 (en) * | 2003-07-29 | 2005-03-03 | Danielson Paul S. | Porous glass substrates with reduced auto-fluorescence |
US20050026304A1 (en) * | 2003-07-30 | 2005-02-03 | Laurakay Bruhn | Microarray based affinity purification and analysis device coupled with secondary analysis technologies |
DE602004019941D1 (de) | 2003-07-31 | 2009-04-23 | Sequenom Inc | Verfahren für multiplex-polymerasekettenreaktionen auf hohem niveau und homogenen massenverlängerungsreaktionen zur genotypisierung von polymorphismen |
US20050031488A1 (en) * | 2003-08-06 | 2005-02-10 | Hui Ge | Sample array test slide with suspended membrane |
AU2004263896A1 (en) | 2003-08-08 | 2005-02-17 | Genenews Inc. | Osteoarthritis biomarkers and uses thereof |
CA2535526C (en) | 2003-08-11 | 2015-09-29 | Diversa Corporation | Laccases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
US7413712B2 (en) | 2003-08-11 | 2008-08-19 | California Institute Of Technology | Microfluidic rotary flow reactor matrix |
WO2005017807A2 (en) * | 2003-08-13 | 2005-02-24 | Iconix Pharmaceuticals, Inc. | Apparatus and method for classifying multi-dimensional biological data |
US20050046848A1 (en) * | 2003-08-26 | 2005-03-03 | Blueshift Biotechnologies, Inc. | Time dependent fluorescence measurements |
JP2005077284A (ja) * | 2003-09-01 | 2005-03-24 | Seiko Epson Corp | 粒子アレイの製造装置及び製造方法と標的物質の検出方法 |
WO2005024068A2 (en) | 2003-09-05 | 2005-03-17 | Sequenom, Inc. | Allele-specific sequence variation analysis |
ATE461292T1 (de) * | 2003-09-10 | 2010-04-15 | Althea Technologies Inc | Erstellung von expressionsprofilen unter verwendung von mikroarrays |
US20050164300A1 (en) * | 2003-09-15 | 2005-07-28 | Plexxikon, Inc. | Molecular scaffolds for kinase ligand development |
US20050060100A1 (en) * | 2003-09-15 | 2005-03-17 | Becton Dickinson And Company | Computer software and algorithms for systems biologically linked to cellular phenotype |
US20050059083A1 (en) * | 2003-09-15 | 2005-03-17 | Becton Dickinson And Company | High throughput method to identify ligands for cell attachment |
US20050282177A1 (en) * | 2003-09-22 | 2005-12-22 | Aichi Prefecture | Types of lymphoma and method for prognosis thereof |
US7601532B2 (en) * | 2003-09-25 | 2009-10-13 | Hisamitsu Pharmaceutical Co., Inc. | Microarray for predicting the prognosis of neuroblastoma and method for predicting the prognosis of neuroblastoma |
FR2860518B1 (fr) * | 2003-10-01 | 2006-02-17 | Biomerieux Sa | Procede pour le diagnostic/pronostic du neuroblastome |
JP2005114427A (ja) * | 2003-10-03 | 2005-04-28 | Sony Corp | 二枚の基板を重ね合わせてバイオアッセイ用基板を製造する方法及びバイオアッセイ用基板 |
EP1689882B1 (en) * | 2003-10-07 | 2014-11-26 | TRAN, Nathaniel Tue | Radioactive multiplexing analytical methods |
ES2627048T3 (es) | 2003-10-24 | 2017-07-26 | Aushon Biosystems, Inc. | Aparato y procedimiento para la dispensación de muestras fluidas, semisólidas y sólidas |
JP2007515947A (ja) * | 2003-10-30 | 2007-06-21 | タフツ−ニュー イングランド メディカル センター | 羊水中の無細胞胎児dnaを使用する出生前診断 |
WO2005049848A2 (en) * | 2003-11-12 | 2005-06-02 | Geneohm Sciences, Inc. | Nucleic acid hybridization methods |
FR2862239B1 (fr) * | 2003-11-14 | 2007-11-23 | Commissariat Energie Atomique | Dispositif de reception d'un echantillon de fluide, et ses applications |
CA2546171A1 (en) | 2003-11-17 | 2005-05-26 | Tm Bioscience Corporation | Method of detecting mutations associated with thrombosis |
US20070107073A1 (en) | 2003-11-19 | 2007-05-10 | Develogen Aktiengesellschaft | Use of secreted protein products for preventing and treating pancreatic diseases and/or obesity and/or metabolic syndrome |
EP1711622A2 (en) | 2003-11-26 | 2006-10-18 | Applera Corporation | Genetic polymorphisms associated with cardiovascular disorders and drug response, methods of detection and uses thereof |
EP1697534B1 (en) | 2003-12-01 | 2010-06-02 | Life Technologies Corporation | Nucleic acid molecules containing recombination sites and methods of using the same |
JP2005173484A (ja) * | 2003-12-15 | 2005-06-30 | Canon Inc | 画像形成装置及びプロセスカートリッジ |
PL1696920T3 (pl) * | 2003-12-19 | 2015-03-31 | Plexxikon Inc | Związki i sposoby opracowywania modulatorów Ret |
US20070066641A1 (en) * | 2003-12-19 | 2007-03-22 | Prabha Ibrahim | Compounds and methods for development of RET modulators |
AU2004303448A1 (en) | 2003-12-23 | 2005-07-07 | Mount Sinai Hospital | Methods for detecting markers associated with endometrial disease or phase |
EP2284185A3 (en) | 2004-01-09 | 2011-05-18 | Novozymes A/S | Bacillus protein inactivation |
US7670771B2 (en) | 2004-01-21 | 2010-03-02 | University Of Utah Research Foundation | Mutant sodium channel Nav1.7 nucleic acid methods |
WO2005070020A2 (en) | 2004-01-23 | 2005-08-04 | The Regents Of The University Of Colorado | Gefitinib sensitivity-related gene expression and products and methods related thereto |
WO2005081801A2 (en) * | 2004-02-09 | 2005-09-09 | Blueshift Biotechnologies, Inc. | Methods and apparatus for scanning small sample volumes |
EP1718770B1 (en) | 2004-02-19 | 2011-05-25 | The Governors of the University of Alberta | Leptin promoter polymorphisms and uses thereof |
DK2096120T3 (da) | 2004-02-20 | 2012-07-09 | Develogen Ag | Anvendelse af sekreterede proteinprodukter til at forebygge og behandle pankreatiske sygdomme og/eller obesitet og/eller metabolsk syndrom |
US20050196761A1 (en) * | 2004-03-08 | 2005-09-08 | Thompson Allen C. | Array hybridization apparatus and method |
EP1735097B1 (en) | 2004-03-12 | 2016-11-30 | Life Technologies Corporation | Nanoliter array loading |
KR100590550B1 (ko) * | 2004-03-12 | 2006-06-19 | 삼성전자주식회사 | 동일한 표적핵산에 결합하는 프로브 폴리뉴클레오티드사이의 거리가 최대가 되도록 배열되어 있는마이크로어레이 및 그를 제조하는 방법 |
US20080254997A1 (en) * | 2004-03-18 | 2008-10-16 | Nissui Pharmaceutical Co., Ltd. | Kit, Device and Method For Analyzing Biological Substance |
JP4420020B2 (ja) * | 2004-03-23 | 2010-02-24 | 東レ株式会社 | 溶液を攪拌する方法 |
WO2005098050A2 (en) | 2004-03-26 | 2005-10-20 | Sequenom, Inc. | Base specific cleavage of methylation-specific amplification products in combination with mass analysis |
US20050214930A1 (en) * | 2004-03-26 | 2005-09-29 | Bynum Magdalena A | Apparatus and method for preventing cross contamination when dissassembling an array |
US7608394B2 (en) | 2004-03-26 | 2009-10-27 | Sequenom, Inc. | Methods and compositions for phenotype identification based on nucleic acid methylation |
FR2868071B1 (fr) * | 2004-03-26 | 2006-06-09 | Biomerieux Sa | Reactifs de marquage, procedes de synthese de tels reactifs et procedes de detection de molecules biologiques |
JP2005283306A (ja) * | 2004-03-29 | 2005-10-13 | Lintec Corp | プローブアレイ製造用部材及びプローブアレイの製造方法 |
US7183057B2 (en) * | 2004-03-31 | 2007-02-27 | Dermtech International | Tape stripping methods for analysis of skin disease and pathological skin state |
US8062471B2 (en) * | 2004-03-31 | 2011-11-22 | Lam Research Corporation | Proximity head heating method and apparatus |
ES2741574T3 (es) | 2004-03-31 | 2020-02-11 | Massachusetts Gen Hospital | Método para determinar la respuesta del cáncer a tratamientos dirigidos al receptor del factor de crecimiento epidérmico |
US20050227239A1 (en) * | 2004-04-08 | 2005-10-13 | Joyce Timothy H | Microarray based affinity purification and analysis device coupled with solid state nanopore electrodes |
US7384779B2 (en) * | 2004-04-12 | 2008-06-10 | Corning Incorporated | Porous substrate plates and the use thereof |
CA2564769C (en) | 2004-04-23 | 2013-12-17 | Pharmacia & Upjohn Company Llc | Cellular permissivity factor for viruses, and uses thereof |
US20070021918A1 (en) * | 2004-04-26 | 2007-01-25 | Georges Natsoulis | Universal gene chip for high throughput chemogenomic analysis |
WO2005115630A2 (en) * | 2004-04-30 | 2005-12-08 | Bioforce Nanosciences, Inc. | Method and apparatus for depositing material onto a surface |
DE102004021904B4 (de) * | 2004-05-04 | 2011-08-18 | Carl Zeiss Microlmaging GmbH, 07745 | Verfahren und Vorrichtung zur Erzeugung einer Analyseanordnung mit diskreten, separaten Messbereichen zur biologischen, biochemischen oder chemischen Analyse |
US7585859B2 (en) * | 2004-05-06 | 2009-09-08 | Plexxikon, Inc. | PDE4B inhibitors and uses therefor |
JP5236286B2 (ja) | 2004-05-07 | 2013-07-17 | セレラ コーポレーション | 肝線維症に関連する遺伝的多型、その検出方法および使用 |
EP1766061B1 (en) * | 2004-05-20 | 2013-07-17 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Single label comparative hybridization |
AU2005249492B2 (en) | 2004-05-27 | 2011-09-22 | The Regents Of The University Of Colorado | Methods for prediction of clinical outcome to epidermal growth factor receptor inhibitors by cancer patients |
EP2471922A1 (en) | 2004-05-28 | 2012-07-04 | Asuragen, Inc. | Methods and compositions involving microRNA |
US7338763B2 (en) * | 2004-06-02 | 2008-03-04 | Eppendorf Array Technologies S.A. | Method and kit for the detection and/or quantification of homologous nucleotide sequences on arrays |
EP2270034A3 (en) | 2004-06-03 | 2011-06-01 | Athlomics Pty Ltd | Agents and methods for diagnosing stress |
US20060035250A1 (en) * | 2004-06-10 | 2006-02-16 | Georges Natsoulis | Necessary and sufficient reagent sets for chemogenomic analysis |
CN103173282A (zh) | 2004-06-16 | 2013-06-26 | 帝斯曼知识产权资产管理有限公司 | 对叶绿素进行酶促脱色的组合物和方法 |
CA2570817A1 (en) * | 2004-06-17 | 2006-01-26 | Plexxikon, Inc. | Azaindoles modulating c-kit activity and uses therefor |
US7498342B2 (en) | 2004-06-17 | 2009-03-03 | Plexxikon, Inc. | Compounds modulating c-kit activity |
US7702466B1 (en) | 2004-06-29 | 2010-04-20 | Illumina, Inc. | Systems and methods for selection of nucleic acid sequence probes |
DE102004031177A1 (de) * | 2004-06-29 | 2006-01-19 | Henkel Kgaa | Neue Geruchsstoffe bildende Genprodukte von Bacillus licheniformis und darauf aufbauende verbesserte biotechnologische Produktionsverfahren |
DE102004044179B4 (de) * | 2004-06-30 | 2010-04-22 | Osram Opto Semiconductors Gmbh | Verfahren zur Montage von Halbleiterchips |
WO2006002526A1 (en) | 2004-06-30 | 2006-01-12 | Tm Bioscience Pgx, Inc. | Method of detecting mutations in the gene encoding cytochrome p450-2d6 |
US20060003345A1 (en) | 2004-06-30 | 2006-01-05 | Pfizer Inc | RNA bioassay |
JP2008505321A (ja) * | 2004-07-02 | 2008-02-21 | ブルーシフト・バイオテクノロジーズ・インコーポレーテッド | 蛍光体微小環境の探索 |
JP2008506114A (ja) * | 2004-07-06 | 2008-02-28 | ユニバーシティー オブ ユタ リサーチ ファンデーション | マイクロアレイおよび他のマイクロスケール装置上に高濃度スポットを沈着させるためのスポッティング装置および方法 |
US7588892B2 (en) * | 2004-07-19 | 2009-09-15 | Entelos, Inc. | Reagent sets and gene signatures for renal tubule injury |
US20060024677A1 (en) | 2004-07-20 | 2006-02-02 | Morris David W | Novel therapeutic targets in cancer |
EP2484780A1 (en) * | 2004-07-23 | 2012-08-08 | The University of North Carolina At Chapel Hill | Methods and materials for determining pain sensibility and predicting and treating related disorders |
US20060105453A1 (en) | 2004-09-09 | 2006-05-18 | Brenan Colin J | Coating process for microfluidic sample arrays |
EP1623996A1 (en) * | 2004-08-06 | 2006-02-08 | Deutsches Krebsforschungszentrum Stiftung des öffentlichen Rechts | Improved method of selecting a desired protein from a library |
WO2006017859A2 (en) | 2004-08-06 | 2006-02-16 | Genentech, Inc. | Assays and methods using biomarkers |
ATE508205T1 (de) | 2004-08-06 | 2011-05-15 | Genentech Inc | Tests und verfahren unter verwendung von biomarkern |
EP1786813A2 (en) * | 2004-09-03 | 2007-05-23 | Plexxikon, Inc. | Bicyclic heteroaryl pde4b inhibitors |
US7645575B2 (en) | 2004-09-08 | 2010-01-12 | Xdx, Inc. | Genes useful for diagnosing and monitoring inflammation related disorders |
JP2006078356A (ja) * | 2004-09-10 | 2006-03-23 | Yokogawa Electric Corp | バイオチップ作成装置 |
US20060059585A1 (en) | 2004-09-14 | 2006-03-16 | Boris Jankowski | Modulating plant sugar levels |
US20060108287A1 (en) * | 2004-09-21 | 2006-05-25 | Arnold Todd E | Discrete zoned microporous nylon coated glass platform for use in microwell plates and methods of making and using same |
US20060063274A1 (en) * | 2004-09-23 | 2006-03-23 | Schremp Donald J | Methods for manufacturing and using chemical array calibration devices |
US20080268437A1 (en) * | 2004-09-27 | 2008-10-30 | Wan Ji | Method of Targeted and Comprehensive Sequencing Using High-Density Oligonucleotide Array |
FR2876116B1 (fr) * | 2004-10-01 | 2007-04-06 | Biomerieux Sa | Methode pour generer des transcrits |
US20060078896A1 (en) * | 2004-10-12 | 2006-04-13 | Peck Bill J | Method, system, and computer program product to assess properties of a chemical array |
FR2876705B1 (fr) * | 2004-10-19 | 2008-12-12 | Biomerieux Sa | Procede pour le diagnostic d'une intolerance a l'aspirine |
US20090118132A1 (en) * | 2004-11-04 | 2009-05-07 | Roche Molecular Systems, Inc. | Classification of Acute Myeloid Leukemia |
US8173611B2 (en) | 2004-11-12 | 2012-05-08 | Asuragen Inc. | Methods and compositions involving miRNA and miRNA inhibitor molecules |
KR100624458B1 (ko) * | 2005-01-17 | 2006-09-19 | 삼성전자주식회사 | 휴대용 원심분리기 |
US8021888B2 (en) * | 2005-01-27 | 2011-09-20 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Rapid comparative genomic hybridization using acoustic surface waves |
FR2881437B1 (fr) | 2005-01-31 | 2010-11-19 | Biomerieux Sa | Procede pour le diagnostic/pronostic d'un syndrome septique |
JP5265923B2 (ja) | 2005-02-07 | 2013-08-14 | ジーンニュース インコーポレーテッド | 軽度の変形性関節症のバイオマーカーおよびその使用 |
US20060199207A1 (en) * | 2005-02-24 | 2006-09-07 | Matysiak Stefan M | Self-assembly of molecules using combinatorial hybridization |
US20080279727A1 (en) * | 2005-03-01 | 2008-11-13 | Haushalter Robert C | Polymeric Fluid Transfer and Printing Devices |
CA2614769A1 (en) | 2005-03-10 | 2006-09-21 | Verenium Corporation | Lyase enzymes, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
EP2113572B1 (en) | 2005-03-11 | 2012-12-05 | Celera Corporation | Genetic polymorphisms associated with coronary heart disease, methods of detection and uses thereof |
CA2861310A1 (en) | 2005-03-15 | 2006-09-28 | Bp Corporation North America Inc. | Cellulases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
US20070092886A1 (en) * | 2005-03-22 | 2007-04-26 | Raymond Tabibiazar | Methods and compositions for diagnosis, monitoring and development of therapeutics for treatment of atherosclerotic disease |
US20080020941A1 (en) | 2005-03-24 | 2008-01-24 | Jimpei Tabata | Biomolecule-immobilized plate and method for fabricating biomolecule-immobilized plate |
JP4921458B2 (ja) * | 2005-04-04 | 2012-04-25 | ブルーシフト・バイオテクノロジーズ・インコーポレーテッド | Fret発光における偏光異方性を使用したスクリーニングの方法 |
EP2631652A1 (en) | 2005-04-05 | 2013-08-28 | Corning Incorporated | Label free biosensor |
US20060246576A1 (en) | 2005-04-06 | 2006-11-02 | Affymetrix, Inc. | Fluidic system and method for processing biological microarrays in personal instrumentation |
WO2006110581A2 (en) | 2005-04-07 | 2006-10-19 | Novartis Vaccines And Diagnostics Inc. | Cancer-related genes |
EP1865981A2 (en) | 2005-04-07 | 2007-12-19 | Chiron Corporation | Cacna1e in cancer diagnosis, detection and treatment |
CN103789405B (zh) | 2005-04-18 | 2018-03-30 | Mdna生命科学有限公司 | 作为检测日光照射、前列腺癌和其它癌症的诊断工具的线粒体突变及重排 |
BRPI0610066A2 (pt) * | 2005-05-17 | 2010-05-25 | Plexxikon Inc | compostos que modulam atividade de c-kit e c-fms e usos para estes |
US8263414B2 (en) * | 2005-05-23 | 2012-09-11 | Siemens Healthcare Diagnostics Inc. | Dispensing of a diagnostic liquid onto a diagnostic reagent |
EP3492602A1 (en) | 2005-06-15 | 2019-06-05 | Complete Genomics, Inc. | Single molecule arrays for genetic and chemical analysis |
US20060286548A1 (en) * | 2005-06-16 | 2006-12-21 | Gregory Liposky | Method of making recombinant human antibodies for use in biosensor technology |
BRPI0611863B1 (pt) * | 2005-06-22 | 2021-11-23 | Plexxikon, Inc | Composto, bem como composição e kit compreendendo o mesmo, composto intermediário na preparação do mesmo, método para tratamento e uso do mesmo |
US20060292559A1 (en) * | 2005-06-23 | 2006-12-28 | Beckman Coulter, Inc. | Cell-based microarrays, and methods for their preparation and use |
EP1910565A4 (en) | 2005-07-07 | 2009-10-28 | Athlomics Pty Ltd | POLYNUCLEOTIDE MARKER GENES AND THEIR EXPRESSION IN THE DIAGNOSIS OF ENDOTOXEMIA |
CN1908189A (zh) * | 2005-08-02 | 2007-02-07 | 博奥生物有限公司 | 体外辅助鉴定肠型胃癌及其分化程度的方法与专用试剂盒 |
ATE549416T1 (de) | 2005-08-05 | 2012-03-15 | Genentech Inc | Verfahren und zusammensetzungen zum nachweis von autoimmunkrankheiten |
ATE540318T1 (de) | 2005-08-16 | 2012-01-15 | Genentech Inc | Apoptosesensitivität gegenüber apo2l/trail mittels testen auf galnac-t14-expression in zellen/gewebe |
ATE526398T1 (de) * | 2005-08-19 | 2011-10-15 | Commw Scient Ind Res Org | Arachnocampa-luciferasen |
US20070047388A1 (en) * | 2005-08-25 | 2007-03-01 | Rockwell Scientific Licensing, Llc | Fluidic mixing structure, method for fabricating same, and mixing method |
US7799530B2 (en) | 2005-09-23 | 2010-09-21 | Celera Corporation | Genetic polymorphisms associated with cardiovascular disorders and drug response, methods of detection and uses thereof |
US8383059B2 (en) | 2005-09-30 | 2013-02-26 | University Of Utah Research Foundation | Microfluidic interface for highly parallel addressing of sensing arrays |
WO2007047408A2 (en) * | 2005-10-12 | 2007-04-26 | Pathologica, Llc. | Promac signature application |
US7749704B2 (en) | 2005-11-01 | 2010-07-06 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Promoter polymorphisms of the BLyS gene and use in diagnostic methods |
US20070105125A1 (en) * | 2005-11-08 | 2007-05-10 | Tsai George P | Chemical array housing having a gas delivery element and methods of using the same |
US7329860B2 (en) | 2005-11-23 | 2008-02-12 | Illumina, Inc. | Confocal imaging methods and apparatus |
US8076074B2 (en) | 2005-11-29 | 2011-12-13 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Balanced translocation in comparative hybridization |
CA2631675A1 (en) * | 2005-11-30 | 2007-06-21 | The University Of North Carolina At Chapel Hill | Identification of genetic polymorphic variants associated with somatosensory disorders and methods of using the same |
US7875274B2 (en) | 2005-12-16 | 2011-01-25 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Protein modulators of resistance to alkylating agents |
US20070161031A1 (en) * | 2005-12-16 | 2007-07-12 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Functional arrays for high throughput characterization of gene expression regulatory elements |
CN101437933B (zh) | 2005-12-28 | 2013-11-06 | 斯克里普斯研究所 | 作为药物靶标的天然反义和非编码的rna转录物 |
US20070198653A1 (en) * | 2005-12-30 | 2007-08-23 | Kurt Jarnagin | Systems and methods for remote computer-based analysis of user-provided chemogenomic data |
CN101384757A (zh) * | 2006-01-03 | 2009-03-11 | 哈佛大学校长及研究员协会 | 小分子印渍 |
WO2007082352A1 (en) | 2006-01-20 | 2007-07-26 | Child Health Research Institute Inc | Method of treatment, prophylaxis and diagnosis of pathologies of the bone |
US20070172840A1 (en) * | 2006-01-26 | 2007-07-26 | Lin Liu | Parallel microarray hybridization |
US8138123B2 (en) | 2006-01-27 | 2012-03-20 | Takeda Pharmaceutical Company Limited | Gene expressing analysis tool |
WO2007092314A2 (en) | 2006-02-02 | 2007-08-16 | Verenium Corporation | Esterases and related nucleic acids and methods |
DK2444487T3 (en) | 2006-02-10 | 2018-05-28 | Bp Corp North America Inc | CELLULOLYTIC ENZYMES, NUCLEIC ACIDS, CODING THEM, AND PROCEDURES FOR THEIR PREPARATION AND USE |
EP3406621A1 (en) | 2006-02-14 | 2018-11-28 | BP Corporation North America Inc. | Xylanases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
US11237171B2 (en) | 2006-02-21 | 2022-02-01 | Trustees Of Tufts College | Methods and arrays for target analyte detection and determination of target analyte concentration in solution |
US8492098B2 (en) | 2006-02-21 | 2013-07-23 | The Trustees Of Tufts College | Methods and arrays for target analyte detection and determination of reaction components that affect a reaction |
EA029538B1 (ru) | 2006-03-07 | 2018-04-30 | Басф Энзаймс Ллк | Полипептид, обладающий активностью альдолазы, полинуклеотид, кодирующий этот полипептид, и способы получения и применения полинуклеотида и полипептида |
BRPI0708673A2 (pt) | 2006-03-07 | 2011-06-07 | Cargill Inc | método para fabricação de polipeptìdeos com atividade de aldolase e polinucleotìdeos que codificam estes polipeptìdeos |
US7914988B1 (en) | 2006-03-31 | 2011-03-29 | Illumina, Inc. | Gene expression profiles to predict relapse of prostate cancer |
US20070232556A1 (en) * | 2006-03-31 | 2007-10-04 | Montine Thomas J | Methods and compositions for the treatment of neurological diseases and disorders |
EP2537943B1 (en) | 2006-04-24 | 2014-03-12 | Genentech, Inc. | Methods and compositions for detecting autoimmune disorders |
US8592149B2 (en) | 2006-04-27 | 2013-11-26 | Pikamab, Inc. | Methods and compositions for antibody therapy |
EP2767595B1 (en) | 2006-05-22 | 2018-09-19 | Clinical Genomics Pty Ltd | Detection method for characterising the anatomical origin of a cell |
US11001881B2 (en) | 2006-08-24 | 2021-05-11 | California Institute Of Technology | Methods for detecting analytes |
EP2489745B1 (en) | 2006-06-05 | 2017-01-11 | California Institute Of Technology | Real time micro arrays |
US8637436B2 (en) | 2006-08-24 | 2014-01-28 | California Institute Of Technology | Integrated semiconductor bioarray |
WO2007142202A1 (ja) | 2006-06-06 | 2007-12-13 | Panasonic Corporation | ヌクレオチド鎖修飾方法 |
US7928366B2 (en) * | 2006-10-06 | 2011-04-19 | Lam Research Corporation | Methods of and apparatus for accessing a process chamber using a dual zone gas injector with improved optical access |
US8663577B2 (en) | 2006-07-12 | 2014-03-04 | National Institute Of Advanced Industrial Science And Technology | Variable pitch array spotter |
JP2009543862A (ja) | 2006-07-14 | 2009-12-10 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | ガンのバイオマーカーおよびその使用方法 |
US11525156B2 (en) | 2006-07-28 | 2022-12-13 | California Institute Of Technology | Multiplex Q-PCR arrays |
WO2008014485A2 (en) | 2006-07-28 | 2008-01-31 | California Institute Of Technology | Multiplex q-pcr arrays |
AU2007356171B8 (en) | 2006-08-04 | 2014-01-16 | Bp Corporation North America Inc. | Glucanases, nucleic acids encoding them, and methods for making and using them |
TWI316873B (en) * | 2006-08-08 | 2009-11-11 | Ind Tech Res Inst | Apparatus of manufacturing biochip and manufacture method of biochip tip array |
EP2057465A4 (en) | 2006-08-09 | 2010-04-21 | Homestead Clinical Corp | SPECIFIC ORGAN PROTEINS AND METHODS OF USE |
US7993832B2 (en) | 2006-08-14 | 2011-08-09 | Xdx, Inc. | Methods and compositions for diagnosing and monitoring the status of transplant rejection and immune disorders |
US11560588B2 (en) | 2006-08-24 | 2023-01-24 | California Institute Of Technology | Multiplex Q-PCR arrays |
US8813764B2 (en) | 2009-05-29 | 2014-08-26 | Lam Research Corporation | Method and apparatus for physical confinement of a liquid meniscus over a semiconductor wafer |
US20100021885A1 (en) * | 2006-09-18 | 2010-01-28 | Mark Fielden | Reagent sets and gene signatures for non-genotoxic hepatocarcinogenicity |
CA2663962A1 (en) | 2006-09-19 | 2008-03-27 | Asuragen, Inc. | Mir-15, mir-26, mir-31,mir-145, mir-147, mir-188, mir-215, mir-216, mir-331, mmu-mir-292-3p regulated genes and pathways as targets for therapeutic intervention |
EP2115138A2 (en) | 2006-09-19 | 2009-11-11 | Asuragen, Inc. | Micrornas differentially expressed in pancreatic diseases and uses thereof |
JP4692454B2 (ja) * | 2006-09-20 | 2011-06-01 | パナソニック株式会社 | 塗布部材及び塗布方法 |
WO2008036863A2 (en) | 2006-09-21 | 2008-03-27 | Verenium Corporation | Phospholipases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
US20080076139A1 (en) | 2006-09-21 | 2008-03-27 | Sharat Singh | Methods and compositions for detecting the activation states of multiple signal transducers in rare circulating cells |
PL2617823T3 (pl) | 2006-09-21 | 2015-12-31 | Basf Enzymes Llc | Fitazy, kodujące je kwasy nukleinowe oraz sposoby ich wytwarzania i stosowania |
US10753927B2 (en) | 2006-09-22 | 2020-08-25 | ALERE TECHNOLOGIES GmbH | Methods for detecting an analyte |
US20100092683A1 (en) * | 2006-09-22 | 2010-04-15 | Clondiag Gmbh | Dispenser device for and a method of dispensing a substance onto a substrate |
FR2906537A1 (fr) | 2006-09-28 | 2008-04-04 | Biomerieux Sa | Procede de diagnostic in vitro du cancer broncho-pulmonaire par detection des transcrits majoritaires alternatifs du gene klk8 codant la kallicreine 8 et son utilisation pour le pronostic de survie |
WO2008051511A2 (en) | 2006-10-20 | 2008-05-02 | Applera Corporation | Genetic polymorphisms associated with venous thrombosis, methods of detection and uses thereof |
EP1914317A1 (en) * | 2006-10-21 | 2008-04-23 | Biolytix AG | A method for qualitative and quantitative detection of short nucleic acid sequences of about 8 to 50 nucleotides in length |
US8618248B2 (en) | 2006-10-31 | 2013-12-31 | President And Fellows Of Harvard College | Phosphopeptide compositions and anti-phosphopeptide antibody compositions and methods of detecting phosphorylated peptides |
WO2008140484A2 (en) | 2006-11-09 | 2008-11-20 | Xdx, Inc. | Methods for diagnosing and monitoring the status of systemic lupus erythematosus |
US9201063B2 (en) | 2006-11-16 | 2015-12-01 | General Electric Company | Sequential analysis of biological samples |
US7741045B2 (en) * | 2006-11-16 | 2010-06-22 | General Electric Company | Sequential analysis of biological samples |
US8305579B2 (en) | 2006-11-16 | 2012-11-06 | Thomas Pirrie Treynor | Sequential analysis of biological samples |
US7629125B2 (en) | 2006-11-16 | 2009-12-08 | General Electric Company | Sequential analysis of biological samples |
WO2008063888A2 (en) | 2006-11-22 | 2008-05-29 | Plexxikon, Inc. | Compounds modulating c-fms and/or c-kit activity and uses therefor |
EP2210898A1 (en) | 2006-11-29 | 2010-07-28 | Novozymes Inc. | Bacillus Licheniformis chromosome |
JP4307478B2 (ja) * | 2006-12-05 | 2009-08-05 | キヤノン株式会社 | 生化学反応用カートリッジ |
AU2007336811A1 (en) | 2006-12-21 | 2008-07-03 | Plexxikon, Inc. | Compounds and methods for kinase modulation, and indications therefor |
PE20121126A1 (es) * | 2006-12-21 | 2012-08-24 | Plexxikon Inc | Compuestos pirrolo [2,3-b] piridinas como moduladores de quinasa |
WO2008079909A1 (en) * | 2006-12-21 | 2008-07-03 | Plexxikon, Inc. | Pyrrolo [2,3-b] pyridines as kinase modulators |
US8146902B2 (en) * | 2006-12-21 | 2012-04-03 | Lam Research Corporation | Hybrid composite wafer carrier for wet clean equipment |
CA2982640A1 (en) | 2006-12-21 | 2008-07-03 | Basf Enzymes Llc | Amylases and glucoamylases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
US20080227663A1 (en) | 2007-01-19 | 2008-09-18 | Biodot, Inc. | Systems and methods for high speed array printing and hybridization |
EP2106439B1 (en) | 2007-01-24 | 2014-11-12 | The Regents of the University of Michigan | Compositions and methods for treating and diagnosing pancreatic cancer |
DK2115477T3 (en) * | 2007-01-25 | 2015-08-10 | Hoffmann La Roche | USE OF IGFBP-7 IN THE EVIDENCE OF HEART FAILURE |
CN101652381B (zh) | 2007-01-30 | 2014-04-09 | 维莱尼姆公司 | 用于处理木质纤维素的酶、编码它们的核酸及其制备和应用方法 |
EP2520668B1 (en) | 2007-01-31 | 2014-12-24 | Celera Corporation | A molecular prognostic signature for predicting breast cancer distant metastasis, and uses thereof |
US20080220983A1 (en) * | 2007-03-08 | 2008-09-11 | Switchgear Genomics A California Corporation | Functional arrays for high throughput characterization of regulatory elements in untranslated regions of genes |
CA2680339C (en) * | 2007-03-08 | 2017-02-28 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Use of slim-1 in the assessment of heart failure |
US20080243865A1 (en) * | 2007-03-28 | 2008-10-02 | Oracle International Corporation | Maintaining global state of distributed transaction managed by an external transaction manager for clustered database systems |
US7975708B2 (en) * | 2007-03-30 | 2011-07-12 | Lam Research Corporation | Proximity head with angled vacuum conduit system, apparatus and method |
US8464736B1 (en) | 2007-03-30 | 2013-06-18 | Lam Research Corporation | Reclaim chemistry |
CA2684801C (en) | 2007-04-04 | 2017-10-10 | The Regents Of The University Of California | Compositions, devices, systems, and methods for using a nanopore |
US20100255004A1 (en) * | 2007-04-13 | 2010-10-07 | Dana Farber Cancer Institute | Receptor tyrosine kinase profiling |
ES2529790T3 (es) | 2007-04-13 | 2015-02-25 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Métodos de tratamiento de cáncer resistente a agentes terapéuticos de ERBB |
EA019514B1 (ru) | 2007-04-27 | 2014-04-30 | Те Риджентс Оф Те Юниверсити Оф Калифорния | Сенсоры coрастений, нуклеиновые кислоты, кодирующие их, способы их получения и применение |
AU2008247649A1 (en) * | 2007-05-01 | 2008-11-13 | University Of Miami | Transcriptomic biomarkers for individual risk assessment in new onset heart failure |
AU2008247502A1 (en) * | 2007-05-04 | 2008-11-13 | Dermtech International | Diagnosis of melanoma by nucleic acid analysis |
AU2008255641B2 (en) | 2007-05-31 | 2014-03-13 | Board Of Regents Of The University Of Texas System | Diagnostic markers for ankylosing spondylitis and uses thereof |
US20120115131A1 (en) | 2007-05-31 | 2012-05-10 | Yale University | Genetic lesion associated with cancer |
PE20090321A1 (es) | 2007-06-04 | 2009-04-20 | Genentech Inc | Anticuerpos anti-notch1 nrr, metodo de preparacion y composicion farmaceutica |
FR2917090B1 (fr) | 2007-06-11 | 2012-06-15 | Biomerieux Sa | Reactifs de marquage portant des fonctions diazo et nitro, procedes de synthese de tels reactifs et procedes de detection de molecules biologiques |
EP2716656B1 (en) | 2007-06-15 | 2016-10-12 | Xiamen University | Monoclonal antibodies binding to avian influenza virus subtype H5 haemagglutinin and uses thereof |
US8141566B2 (en) * | 2007-06-19 | 2012-03-27 | Lam Research Corporation | System, method and apparatus for maintaining separation of liquids in a controlled meniscus |
US8158757B2 (en) | 2007-07-02 | 2012-04-17 | Oncomed Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for treating and diagnosing cancer |
EP2666874B1 (en) | 2007-07-12 | 2015-05-27 | The Brigham and Women's Hospital, Inc. | Compositions and methods for diagnosing and assessing inflammatory myopathies |
WO2009012357A2 (en) | 2007-07-17 | 2009-01-22 | The General Hospital Corporation | Methods to identify and enrich for populations of ovarian cancer stem cells and somatic ovarian stem cells and uses thereof |
BRPI0814423B1 (pt) | 2007-07-17 | 2022-04-19 | Plexxikon, Inc | Compostos que modulam quinase e composição farmacêutica compreendendo os mesmos |
EP2613149B1 (en) | 2007-07-25 | 2014-09-17 | University Of Louisville Research Foundation, Inc. | Exosome-associated microRNA as a diagnostic marker |
US7507539B2 (en) * | 2007-07-30 | 2009-03-24 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Substractive single label comparative hybridization |
US8268246B2 (en) * | 2007-08-09 | 2012-09-18 | Advanced Liquid Logic Inc | PCB droplet actuator fabrication |
EP2201374B1 (en) * | 2007-08-30 | 2015-10-07 | Trustees Of Tufts College | Methods for determining the concentration of an analyte in solution. |
US9388457B2 (en) | 2007-09-14 | 2016-07-12 | Affymetrix, Inc. | Locus specific amplification using array probes |
US8053198B2 (en) * | 2007-09-14 | 2011-11-08 | Meso Scale Technologies, Llc | Diagnostic methods |
US20090180931A1 (en) | 2007-09-17 | 2009-07-16 | Sequenom, Inc. | Integrated robotic sample transfer device |
CN103757036B (zh) | 2007-10-03 | 2019-10-01 | 维莱尼姆公司 | 木聚糖酶、编码它们的核酸以及其制备和应用方法 |
WO2009052567A1 (en) | 2007-10-23 | 2009-04-30 | Clinical Genomics Pty. Ltd. | A method of diagnosing neoplasms - ii |
US20100292094A1 (en) | 2007-10-23 | 2010-11-18 | Clinical Genomics Pty. Ltd. | Method of diagnosing neoplasms |
US8039212B2 (en) | 2007-11-05 | 2011-10-18 | Celera Corporation | Genetic polymorphisms associated with liver fibrosis, methods of detection and uses thereof |
US8481263B2 (en) * | 2007-11-06 | 2013-07-09 | Ambergen | Bead-ligand-nascent protein complexes |
US8906700B2 (en) | 2007-11-06 | 2014-12-09 | Ambergen, Inc. | Methods and compositions for phototransfer |
US8932879B2 (en) * | 2007-11-06 | 2015-01-13 | Ambergen, Inc. | Methods and compounds for phototransfer |
US20090264298A1 (en) * | 2007-11-06 | 2009-10-22 | Ambergen, Inc. | Methods for enriching subpopulations |
US8486634B2 (en) | 2007-11-06 | 2013-07-16 | Ambergen, Inc. | Amplifying bisulfite-treated template |
US20090286286A1 (en) * | 2007-11-06 | 2009-11-19 | Ambergen , Inc. | Methods for controlling amplification |
US20090270278A1 (en) * | 2007-11-06 | 2009-10-29 | Ambergen, Inc. | Methods and compounds for making arrays |
CA2704499C (en) | 2007-11-07 | 2020-03-10 | Genentech, Inc. | Methods and compositions for assessing responsiveness of b-cell lymphoma to treatment with anti-cd40 antibodies |
US20100075374A1 (en) * | 2007-11-08 | 2010-03-25 | Ambergen, Inc. | Methods for capturing nascent proteins |
EP2227556B1 (en) | 2007-11-19 | 2014-08-27 | Celera Corporation | Lung cancer markers and uses thereof |
US20090131263A1 (en) * | 2007-11-19 | 2009-05-21 | Longying Dong | Normalization methods for G-protein coupled receptor membrane array |
US8003325B2 (en) | 2007-11-30 | 2011-08-23 | Mayo Foundation For Medical Education And Research | Polymorphisms of the BLyS gene and use in diagnostic methods |
US8440425B2 (en) * | 2007-12-18 | 2013-05-14 | Abbott Laboratories | Method of preparing a biological specimen slide |
US20110003708A1 (en) * | 2007-12-27 | 2011-01-06 | Compugen Ltd. | Biomarkers for the prediction of renal injury |
PL2238242T3 (pl) | 2008-01-03 | 2015-06-30 | Basf Enzymes Llc | Transferazy i oksydoreduktazy, kwasy nukleinowe kodujące je oraz sposoby ich wytwarzania i zastosowania |
EP3574909A1 (en) | 2008-01-30 | 2019-12-04 | Imbed Biosciences, Inc. | Methods and compositions for wound healing |
CA2618163A1 (en) | 2008-02-07 | 2009-08-07 | K. W. Michael Siu | Head and neck cancer biomarkers |
US20090221620A1 (en) | 2008-02-20 | 2009-09-03 | Celera Corporation | Gentic polymorphisms associated with stroke, methods of detection and uses thereof |
DK2250498T3 (da) | 2008-02-25 | 2013-02-04 | Nestec Sa | Lægemiddelvalg til brystcancerterapi under anvendelse af antistof-baserede arrays |
US9074244B2 (en) | 2008-03-11 | 2015-07-07 | Affymetrix, Inc. | Array-based translocation and rearrangement assays |
CN107011428B (zh) | 2008-03-28 | 2022-02-25 | Mdna生命科学有限公司 | 异常线粒体dna、相关的融合转录物及其杂交探针 |
DE102008018982A1 (de) * | 2008-04-14 | 2009-11-05 | Merz, Hartmut, Prof. Dr. med. | Automatische Vorrichtung zur Durchführung von Nachweisreaktionen und Verfahren zur Dosierung von Reagenzien auf Objektträgern |
US20090260458A1 (en) * | 2008-04-17 | 2009-10-22 | Victor Joseph | High throughput dispenser |
US9017610B2 (en) * | 2008-04-25 | 2015-04-28 | Roche Diagnostics Hematology, Inc. | Method of determining a complete blood count and a white blood cell differential count |
US9602777B2 (en) | 2008-04-25 | 2017-03-21 | Roche Diagnostics Hematology, Inc. | Systems and methods for analyzing body fluids |
EP2274622B1 (en) * | 2008-04-30 | 2014-10-08 | The Governing Council of the University of Toronto | Use of sfrp-3 in the assessment of heart failure |
US20110118125A1 (en) * | 2008-05-03 | 2011-05-19 | Tufts Medical Center, Inc. | Neonatal salivary genomics |
WO2009137807A2 (en) | 2008-05-08 | 2009-11-12 | Asuragen, Inc. | Compositions and methods related to mirna modulation of neovascularization or angiogenesis |
CN102089444A (zh) | 2008-05-14 | 2011-06-08 | 德玛泰克国际公司 | 利用核酸分析方法来诊断黑素瘤和太阳能雀斑 |
EP2878680B1 (en) | 2008-07-09 | 2016-06-08 | Celera Corporation | Genetic polymorphisms associated with cardiovascular diseases, methods of detection and uses thereof |
FR2934595B1 (fr) * | 2008-07-29 | 2013-04-05 | Biomerieux Sa | Reactifs de marquage ayant un noyau pyridine portant une fonction diazomethyle, procedes de synthese de tels reactifs et procedes de detection de molecules biologiques |
WO2010017248A2 (en) | 2008-08-04 | 2010-02-11 | University Of Miami | Sting (stimulator of interferon genes), a regulator of innate immune responses |
US9182406B2 (en) * | 2008-08-04 | 2015-11-10 | Biodesy, Inc. | Nonlinear optical detection of molecules comprising an unnatural amino acid possessing a hyperpolarizability |
EP2977469A1 (en) * | 2008-08-28 | 2016-01-27 | Dermtech International | Determining age ranges of skin samples |
US8198062B2 (en) | 2008-08-29 | 2012-06-12 | Dsm Ip Assets B.V. | Hydrolases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
US8357503B2 (en) | 2008-08-29 | 2013-01-22 | Bunge Oils, Inc. | Hydrolases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
US8153391B2 (en) | 2008-08-29 | 2012-04-10 | Bunge Oils, Inc. | Hydrolases, nucleic acids encoding them and methods for making and using them |
WO2010034010A2 (en) | 2008-09-22 | 2010-03-25 | Wasatch Microfluidics | Microassay with internal referencing |
US20100075439A1 (en) * | 2008-09-23 | 2010-03-25 | Quanterix Corporation | Ultra-sensitive detection of molecules by capture-and-release using reducing agents followed by quantification |
US20100075862A1 (en) * | 2008-09-23 | 2010-03-25 | Quanterix Corporation | High sensitivity determination of the concentration of analyte molecules or particles in a fluid sample |
US8222047B2 (en) * | 2008-09-23 | 2012-07-17 | Quanterix Corporation | Ultra-sensitive detection of molecules on single molecule arrays |
CA2738417A1 (en) * | 2008-10-17 | 2010-04-22 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Use of biglycan in the assessment of heart failure |
CA2742324A1 (en) | 2008-10-30 | 2010-06-03 | Caris Life Sciences Luxembourg Holdings, S.A.R.L. | Methods for assessing rna patterns |
US8539905B2 (en) * | 2008-11-07 | 2013-09-24 | The Research Foundation For The State University Of New York | Polymeric micro-cantilevers for ultra-low volume fluid and living cell deposition |
CN102272599B (zh) | 2008-11-11 | 2015-01-14 | 密执安大学评议会 | 抗cxcr1组合物和方法 |
GB0820822D0 (en) | 2008-11-13 | 2008-12-24 | Inst Catala D Oncologia | Novel product and processes |
US8927511B2 (en) | 2008-12-04 | 2015-01-06 | Curna, Inc. | Treatment of vascular endothelial growth factor (VEGF) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to VEGF |
ES2629630T3 (es) | 2008-12-04 | 2017-08-11 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con eritropoyetina (EPO) mediante inhibición del transcrito antisentido natural a EPO |
MX2011005918A (es) | 2008-12-04 | 2011-06-17 | Opko Curna Llc | Tratamiento de enfermedades relacionadas con un gen supresor de tumor mediante inhibicion del transcrito antisentido natural para el gen. |
WO2010075249A2 (en) | 2008-12-22 | 2010-07-01 | Genentech, Inc. | A method for treating rheumatoid arthritis with b-cell antagonists |
SG172355A1 (en) | 2008-12-23 | 2011-07-28 | Genentech Inc | Methods and compositions for diagnostic use in cancer patients |
CA2752237C (en) | 2009-02-12 | 2020-03-24 | Opko Curna, Llc | Treatment of brain derived neurotrophic factor (bdnf) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to bdnf |
GB0903168D0 (en) | 2009-02-25 | 2009-04-08 | Fusion Antibodies Ltd | Diagnostic method and kit |
CN106008707A (zh) | 2009-03-09 | 2016-10-12 | 生物蛋白有限公司 | Mirac蛋白 |
CA2755409C (en) | 2009-03-16 | 2019-04-30 | Joseph Collard | Treatment of nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 2 (nrf2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to nrf2 |
CA2755404C (en) | 2009-03-17 | 2020-03-24 | Joseph Collard | Treatment of delta-like 1 homolog (dlk1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to dlk1 |
JP5734947B2 (ja) | 2009-03-27 | 2015-06-17 | ミトミクス インコーポレイテッドGenesis Genomics Inc. | 異常型ミトコンドリアdna、関連融合転写物および翻訳産物、並びにそのハイブリダイゼーションプローブ |
AR078033A1 (es) | 2009-04-03 | 2011-10-12 | Plexxikon Inc | Una dispersion solida, que contiene al compuesto {3-[5-(4-(cloro-fenil)-1h-pirrolo[2,3-b]piridina-3-carbonil]-2,4-difluor-fenil}-amida del acido propano-1-sulfonico, composiciones y formulaciones que comprenden a dicha dispersion solida; metodos para fabricar dicha dispersion solida, formas 1 y 2 de |
WO2010118243A2 (en) | 2009-04-08 | 2010-10-14 | Genentech, Inc. | Use of il-27 antagonists to treat lupus |
JP5836929B2 (ja) | 2009-04-18 | 2015-12-24 | ジェネンテック, インコーポレイテッド | 抗cd40抗体を用いる治療に対するb細胞性リンパ腫の応答性を評価するための方法 |
WO2010127186A1 (en) | 2009-04-30 | 2010-11-04 | Prognosys Biosciences, Inc. | Nucleic acid constructs and methods of use |
US20120046197A1 (en) | 2009-05-01 | 2012-02-23 | Meso Scale Technologies, Llc | Biomarkers of therapeutic responsiveness |
CA2761142C (en) | 2009-05-06 | 2021-06-08 | Opko Curna, Llc | Treatment of tristetraproline (ttp) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to ttp |
CN103223177B (zh) | 2009-05-06 | 2016-08-10 | 库尔纳公司 | 通过针对脂质转运和代谢基因的天然反义转录物的抑制治疗脂质转运和代谢基因相关疾病 |
US9012139B2 (en) | 2009-05-08 | 2015-04-21 | Curna, Inc. | Treatment of dystrophin family related diseases by inhibition of natural antisense transcript to DMD family |
US20120058916A1 (en) | 2009-05-13 | 2012-03-08 | Meso Scale Technologies, Llc. | Diagnostic methods for liver disorders |
CN102575251B (zh) | 2009-05-18 | 2018-12-04 | 库尔纳公司 | 通过抑制针对重编程因子的天然反义转录物来治疗重编程因子相关的疾病 |
ES2607688T3 (es) | 2009-05-21 | 2017-04-03 | Basf Enzymes Llc | Fitasas, ácidos nucleicos que las codifican y métodos para su producción y uso |
US8895527B2 (en) | 2009-05-22 | 2014-11-25 | Curna, Inc. | Treatment of transcription factor E3 (TFE3) and insulin receptor substrate 2(IRS2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to TFE3 |
CA2764683A1 (en) | 2009-05-28 | 2010-12-02 | Joseph Collard | Treatment of antiviral gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to an antiviral gene |
CA2763199A1 (en) | 2009-05-29 | 2010-12-02 | The Regents Of The Univeristy Of California | B cell signature associated with tolerance in transplant recipients |
WO2010141546A1 (en) | 2009-06-02 | 2010-12-09 | University Of Miami | Diagnostic transcriptomic biomakers in inflammatory cardiomyopathies |
EP2264183B1 (en) | 2009-06-09 | 2016-12-07 | Gendiag.exe, S.L. | Risk markers for cardiovascular disease |
JP6128846B2 (ja) | 2009-06-16 | 2017-05-17 | クルナ・インコーポレーテッド | パラオキソナーゼ(pon1)に対する天然アンチセンス転写物の抑制によるpon1遺伝子関連疾患の治療 |
ES2620960T3 (es) | 2009-06-16 | 2017-06-30 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con un gen de colágeno mediante la inhibición de un transcrito antisentido natural a un gen de colágeno |
US8367334B2 (en) * | 2009-06-18 | 2013-02-05 | The Penn State Research Foundation | Methods, systems and kits for detecting protein-nucleic acid interactions |
JP6073133B2 (ja) | 2009-06-24 | 2017-02-01 | クルナ・インコーポレーテッド | 腫瘍壊死因子受容体2(tnfr2)に対する天然アンチセンス転写物の抑制によるtnfr2関連疾患の治療 |
JP2012531210A (ja) | 2009-06-25 | 2012-12-10 | イェール ユニバ−シティ− | Brca1における一塩基多型および癌のリスク |
WO2010151674A2 (en) | 2009-06-26 | 2010-12-29 | Curna, Inc. | Treatment of down syndrome gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a down syndrome gene |
AU2010273585B2 (en) | 2009-07-13 | 2015-04-23 | Genentech, Inc. | Diagnostic methods and compositions for treatment of cancer |
EP2454598B1 (en) | 2009-07-15 | 2017-03-22 | DiaTech Holdings, Inc. | Drug selection for gastric cancer therapy using antibody-based arrays |
KR101801407B1 (ko) | 2009-07-24 | 2017-11-24 | 큐알엔에이, 인크. | 시르투인 (sirt)에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의한 시르투인 관련된 질환의 치료 |
ES2512018T3 (es) | 2009-07-27 | 2014-10-23 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Utilización de mimecán en la evaluación de la insuficiencia cardiaca |
US8329724B2 (en) | 2009-08-03 | 2012-12-11 | Hoffmann-La Roche Inc. | Process for the manufacture of pharmaceutically active compounds |
KR101802536B1 (ko) | 2009-08-05 | 2017-11-28 | 큐알엔에이, 인크. | 인슐린 유전자 (ins)에 대한 자연 안티센스 전사체의 저해에 의한 인슐린 유전자 (ins) 관련된 질환의 치료 |
US9689025B2 (en) | 2009-08-07 | 2017-06-27 | Nec Solution Innovators, Ltd. | Nucleic acid element for use in analysis, and analytical method, analytical reagent, and analytical instrument using same |
WO2011019815A2 (en) | 2009-08-11 | 2011-02-17 | Curna, Inc. | Treatment of adiponectin (adipoq) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to an adiponectin (adipoq) |
MX2012001716A (es) | 2009-08-14 | 2012-04-02 | Genentech Inc | Marcadores biologicos para monitorizar la respuesta del paciente a los antagonistas vegf. |
JP5943836B2 (ja) | 2009-08-21 | 2016-07-05 | カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド | ‘hsp70相互作用タンパク質c末端’(chip)に対する天然アンチセンス転写産物の阻害によるchip関連疾患の治療 |
JP5964232B2 (ja) | 2009-08-25 | 2016-08-03 | カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド | ‘iqモチーフ含有gtpアーゼ活性化タンパク質’(iqgap)に対する天然アンチセンス転写産物の阻害によるiqgap関連疾患の治療 |
US8815779B2 (en) * | 2009-09-16 | 2014-08-26 | SwitchGear Genomics, Inc. | Transcription biomarkers of biological responses and methods |
WO2011033006A1 (en) | 2009-09-17 | 2011-03-24 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Methods and compositions for diagnostics use in cancer patients |
US20120252022A1 (en) | 2009-09-21 | 2012-10-04 | Paul Walfish | Methods and compositions for the diagnosis and treatment of thyroid cancer |
US20110086772A1 (en) * | 2009-09-25 | 2011-04-14 | Signature Genomics Laboratories Llc | Multiplex (+/-) stranded arrays and assays for detecting chromosomal abnormalities associated with cancer and other diseases |
JP6175236B2 (ja) | 2009-09-25 | 2017-08-09 | カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド | フィラグリン(flg)の発現および活性の調整によるflg関連疾患の処置 |
US9927435B2 (en) | 2009-10-15 | 2018-03-27 | Robert Bosch Gmbh | Multisite biosensor and associated method |
UA109884C2 (uk) | 2009-10-16 | 2015-10-26 | Поліпептид, що має активність ферменту фосфатидилінозитол-специфічної фосфоліпази с, нуклеїнова кислота, що його кодує, та спосіб його виробництва і застосування | |
UA111708C2 (uk) | 2009-10-16 | 2016-06-10 | Бандж Ойлз, Інк. | Спосіб рафінування олії |
EP2491141A2 (en) | 2009-10-19 | 2012-08-29 | Stichting Het Nederlands Kanker Instituut | Differentiation between brca2-associated tumours and sporadic tumours via array comparative genomic hybridization |
EP2491139A1 (en) | 2009-10-19 | 2012-08-29 | Stichting Het Nederlands Kanker Instituut | Predicting benefit of anti-cancer therapy via array comparative genomic hybridization |
WO2011049964A1 (en) | 2009-10-19 | 2011-04-28 | Lab Scientific Group | Rna detection and quantitation |
EP2491140A1 (en) | 2009-10-19 | 2012-08-29 | Stichting Het Nederlands Kanker Instituut | Predicting response to anti-cancer therapy via array comparative genomic hybridization |
CA2777934A1 (en) | 2009-10-20 | 2011-04-28 | Prometheus Laboratories Inc. | Proximity-mediated assays for detecting oncogenic fusion proteins |
US9677125B2 (en) * | 2009-10-21 | 2017-06-13 | General Electric Company | Detection of plurality of targets in biological samples |
ES2633317T3 (es) | 2009-11-06 | 2017-09-20 | Plexxikon, Inc. | Compuestos y métodos para la modulación de quinasas, e indicaciones para ello |
JP2013510564A (ja) | 2009-11-13 | 2013-03-28 | パンガエア ビオテック、ソシエダッド、リミターダ | 肺癌におけるチロシンキナーゼ阻害剤に対する応答を予測するための分子バイオマーカー |
DK2513310T3 (en) | 2009-12-16 | 2018-02-05 | Curna Inc | TREATMENT OF DISEASES CONNECTED WITH MEMBRANE-BONDED TRANSCRIPTION FACTOR Peptidase, site 1 (MBTPS1), BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENCE TRANSCRIPTION TO MBTPS1 |
DK2516648T3 (en) | 2009-12-23 | 2018-02-12 | Curna Inc | TREATMENT OF HEPATOCYTE GROWTH FACTOR (HGF) RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPT AGAINST HGF |
EP2515947B1 (en) | 2009-12-23 | 2021-10-06 | CuRNA, Inc. | Treatment of uncoupling protein 2 (ucp2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to ucp2 |
PL2516465T3 (pl) | 2009-12-23 | 2016-11-30 | Przeciwciała anty-bv8 i ich zastosowania | |
EP2519634B1 (en) | 2009-12-29 | 2016-06-01 | CuRNA, Inc. | TREATMENT OF TUMOR PROTEIN 63 (p63) RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPT TO p63 |
JP5993744B2 (ja) | 2009-12-29 | 2016-09-14 | カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド | 核呼吸因子1(nrf1)に対する天然アンチセンス転写物の阻害による核呼吸因子1関連疾患の治療 |
US20120289583A1 (en) | 2009-12-31 | 2012-11-15 | Curna, Inc. | Treatment of insulin receptor substrate 2 (irs2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to irs2 and transcription factor e3 (tfe3) |
EP2519260A2 (en) | 2009-12-31 | 2012-11-07 | Deutsches Krebsforschungszentrum | Novel modulators of trail signalling |
EP2521784B1 (en) | 2010-01-04 | 2017-12-06 | CuRNA, Inc. | Treatment of interferon regulatory factor 8 (irf8) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to irf8 |
EP2521785B1 (en) | 2010-01-06 | 2022-03-09 | CuRNA, Inc. | Inhibition of natural antisense transcript to a pancreatic developmental gene for use in a treatment of pancreatic developmental gene related diseases |
ES2664866T3 (es) | 2010-01-11 | 2018-04-23 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con la globulina fijadora de hormonas sexuales (shbg) mediante inhibición del transcrito antisentido natural a shbg |
WO2011088149A2 (en) | 2010-01-12 | 2011-07-21 | Prometheus Laboratories Inc. | Methods for predicting response of triple-negative breast cancer to therapy |
US11275084B2 (en) | 2010-01-15 | 2022-03-15 | Stanford University | Successive sampling device and associated method |
JP5691178B2 (ja) * | 2010-01-22 | 2015-04-01 | 凸版印刷株式会社 | 分注方法及び分注装置 |
DK2529015T3 (en) | 2010-01-25 | 2018-02-26 | Curna Inc | TREATMENT OF RNASE H1-RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPT TO RNASE H1 |
US8648016B2 (en) | 2010-02-08 | 2014-02-11 | Robert Bosch Gmbh | Array with extended dynamic range and associated method |
US8324914B2 (en) | 2010-02-08 | 2012-12-04 | Genia Technologies, Inc. | Systems and methods for characterizing a molecule |
CA2790506A1 (en) | 2010-02-22 | 2011-08-25 | Curna, Inc. | Treatment of pyrroline-5-carboxylate reductase 1 (pycr1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to pycr1 |
US9678068B2 (en) | 2010-03-01 | 2017-06-13 | Quanterix Corporation | Ultra-sensitive detection of molecules using dual detection methods |
US8236574B2 (en) | 2010-03-01 | 2012-08-07 | Quanterix Corporation | Ultra-sensitive detection of molecules or particles using beads or other capture objects |
US8415171B2 (en) | 2010-03-01 | 2013-04-09 | Quanterix Corporation | Methods and systems for extending dynamic range in assays for the detection of molecules or particles |
ES2544635T3 (es) | 2010-03-01 | 2015-09-02 | Quanterix Corporation | Métodos para extender el rango dinámico en ensayos para la detección de moléculas o partículas |
WO2011108930A1 (en) | 2010-03-04 | 2011-09-09 | Interna Technologies Bv | A MiRNA MOLECULE DEFINED BY ITS SOURCE AND ITS DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC USES IN DISEASES OR CONDITIONS ASSOCIATED WITH EMT |
CA2795145C (en) | 2010-04-02 | 2019-01-22 | Curna, Inc. | Treatment of colony-stimulating factor 3 (csf3) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to csf3 |
US10787701B2 (en) | 2010-04-05 | 2020-09-29 | Prognosys Biosciences, Inc. | Spatially encoded biological assays |
US20190300945A1 (en) | 2010-04-05 | 2019-10-03 | Prognosys Biosciences, Inc. | Spatially Encoded Biological Assays |
PL2556171T3 (pl) | 2010-04-05 | 2016-04-29 | Prognosys Biosciences Inc | Oznaczenia biologiczne kodowane przestrzennie |
TWI644675B (zh) | 2010-04-09 | 2018-12-21 | 可娜公司 | 藉由抑制纖維母細胞生長因子21(fgf21)之天然反義轉錄物以治療fgf21相關疾病 |
WO2011128096A1 (en) | 2010-04-16 | 2011-10-20 | Roche Diagnostics Gmbh | Polymorphism markers for predicting response to interleukin-6 receptor-inhibiting monoclonal antibody drug treatment |
WO2011133450A2 (en) | 2010-04-19 | 2011-10-27 | Meso Scale Technologies, Llc. | Serology assays |
US20110269735A1 (en) | 2010-04-19 | 2011-11-03 | Celera Corporation | Genetic polymorphisms associated with statin response and cardiovascular diseases, methods of detection and uses thereof |
US20120003639A1 (en) | 2010-04-27 | 2012-01-05 | Prelude, Inc. | Cancer biomarkers and methods of use thereof |
KR20130101442A (ko) | 2010-05-03 | 2013-09-13 | 큐알엔에이, 인크. | 시르투인 (sirt)에 대한 자연 안티센스 전사체의 저해에 의한 시르투인 (sirt) 관련된 질환의 치료 |
SG185100A1 (en) | 2010-05-04 | 2012-11-29 | Paul Walfish | Method for the diagnosis of epithelial cancers by the detection of epicd polypeptide |
US9188585B2 (en) | 2010-05-13 | 2015-11-17 | Robert Bosch Gmbh | Device and method for indirect modulation of detection environment |
TWI531370B (zh) | 2010-05-14 | 2016-05-01 | 可娜公司 | 藉由抑制par4天然反股轉錄本治療par4相關疾病 |
JP5973996B2 (ja) | 2010-05-26 | 2016-08-23 | カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド | Atoh1に対する天然アンチセンス転写物の阻害による無調ホモログ1(atoh1)関連疾患の治療 |
RU2620978C2 (ru) | 2010-05-26 | 2017-05-30 | Курна, Инк. | Лечение заболеваний, связанных с метионинсульфоксидредуктазой а (msra), путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта гена msra |
WO2011153224A2 (en) | 2010-06-02 | 2011-12-08 | Genentech, Inc. | Diagnostic methods and compositions for treatment of cancer |
ES2647612T3 (es) | 2010-06-04 | 2017-12-22 | Chronix Biomedical | Biomarcadores de ácidos nucleicos en circulación asociados al cáncer de próstata |
JP5916718B2 (ja) | 2010-06-04 | 2016-05-11 | ビオメリューBiomerieux | 結腸直腸癌の予後判定のための方法及びキット |
EP2576824A2 (en) | 2010-06-07 | 2013-04-10 | Roche Diagnostics GmbH | Gene expression markers for predicting response to interleukin-6 receptor-inhibiting monoclonal antibody drug treatment |
BR112012032240A2 (pt) | 2010-06-16 | 2019-09-24 | Dynavax Technologies Corporation | método de tratamento utilizando inibidores tlr7 e/ou tlr9 |
WO2011159942A1 (en) | 2010-06-18 | 2011-12-22 | Illumina, Inc. | Conformational probes and methods for sequencing nucleic acids |
EP2400304A1 (en) | 2010-06-22 | 2011-12-28 | Centro de Investigación Cooperativa En Biomateriales ( CIC biomaGUNE) | Method for the characterization of intermolecular interactions |
RU2016118528A (ru) | 2010-06-23 | 2018-10-31 | Курна, Инк. | Лечение заболеваний, связанных с альфа-субъединицей потенциалзависимого натриевого канала (scna), путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта гена scna |
NZ605420A (en) | 2010-07-06 | 2015-02-27 | Interna Technologies Bv | Mirna and its diagnostic and therapeutic uses in diseases or conditions associated with melanoma, or in diseases or conditions associated with activated braf pathway |
RU2611190C2 (ru) | 2010-07-14 | 2017-02-21 | Курна, Инк. | Лечение заболеваний, связанных с геном dlg, путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта гена dlg |
US9040464B2 (en) | 2010-08-16 | 2015-05-26 | Mount Sinai Hosptial | Markers of the male urogenital tract |
WO2012037456A1 (en) | 2010-09-17 | 2012-03-22 | President And Fellows Of Harvard College | Functional genomics assay for characterizing pluripotent stem cell utility and safety |
WO2012038837A2 (en) | 2010-09-20 | 2012-03-29 | Stichting Het Nederlands Kanker Instituut | Methods for predicting response to anti-cancer therapy in cancer patients |
US9110079B2 (en) | 2010-09-29 | 2015-08-18 | Biomerieux | Method and kit for establishing an in vitro prognosis on a patient exhibiting SIRS |
US8993533B2 (en) | 2010-10-06 | 2015-03-31 | Curna, Inc. | Treatment of sialidase 4 (NEU4) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to NEU4 |
BR112013008048A2 (pt) | 2010-10-06 | 2016-06-14 | Bp Corp North America Inc | polipeptídeos, composição, caldo de fermentação, métodos para sacrificar biomassa e para produzir etanol, ácido nucleico, vetor, células recombinante e hospedeira e métodos para produzir polipeptídeo e para gerar polipeptídeo de cbh i variante tolerante a produto e ácido nucleíco |
US9222088B2 (en) | 2010-10-22 | 2015-12-29 | Curna, Inc. | Treatment of alpha-L-iduronidase (IDUA) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to IDUA |
US20120108651A1 (en) | 2010-11-02 | 2012-05-03 | Leiden University Medical Center (LUMC) Acting on Behalf of Academic Hospital Leiden (AZL) | Genetic polymorphisms associated with venous thrombosis and statin response, methods of detection and uses thereof |
US10150999B2 (en) | 2010-11-17 | 2018-12-11 | Interpace Diagnostics, Llc | miRNAs as biomarkers for distinguishing benign from malignant thyroid neoplasms |
US10000752B2 (en) | 2010-11-18 | 2018-06-19 | Curna, Inc. | Antagonat compositions and methods of use |
KR102010598B1 (ko) | 2010-11-23 | 2019-08-13 | 큐알엔에이, 인크. | Nanog에 대한 자연 안티센스 전사체의 저해에 의한 nanog 관련된 질환의 치료 |
US20120302456A1 (en) * | 2010-11-23 | 2012-11-29 | President And Fellows Of Harvard College | Vertical flow-through devices for multiplexed elisa driven by wicking |
CA2817183A1 (en) | 2010-11-24 | 2012-05-31 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Methods for detecting low grade inflammation |
KR20140002711A (ko) | 2010-12-23 | 2014-01-08 | 네스텍 소시에테아노님 | 항체-기반 어레이를 사용한 악성 암 치료를 위한 약물 선별법 |
WO2012086772A1 (ja) | 2010-12-24 | 2012-06-28 | Necソフト株式会社 | 分析用デバイスおよび分析方法 |
EP2474617A1 (en) | 2011-01-11 | 2012-07-11 | InteRNA Technologies BV | Mir for treating neo-angiogenesis |
WO2012100205A2 (en) | 2011-01-21 | 2012-07-26 | Biodot, Inc. | Piezoelectric dispenser with a longitudinal transducer and replaceable capillary tube |
US9952237B2 (en) | 2011-01-28 | 2018-04-24 | Quanterix Corporation | Systems, devices, and methods for ultra-sensitive detection of molecules or particles |
JP5804395B2 (ja) | 2011-02-03 | 2015-11-04 | ポップ テスト オンコロジー エルエルシー | 診断と治療のためのシステムおよび方法 |
MA34948B1 (fr) | 2011-02-07 | 2014-03-01 | Plexxikon Inc | Composes et procedes de modulation de kinase, et leurs indications |
EP2673728B1 (en) | 2011-02-08 | 2018-09-12 | dacadoo ag | System, method and apparatus for the remote analysis of chemical compound microarrays |
TWI558702B (zh) | 2011-02-21 | 2016-11-21 | 普雷辛肯公司 | 醫藥活性物質的固態形式 |
EP2492688A1 (en) | 2011-02-23 | 2012-08-29 | Pangaea Biotech, S.A. | Molecular biomarkers for predicting response to antitumor treatment in lung cancer |
US20140057295A1 (en) | 2011-02-28 | 2014-02-27 | Barbara J. Stegmann | Anti-mullerian hormone changes in pregnancy and prediction of adverse pregnancy outcomes and gender |
ES2578477T3 (es) | 2011-03-11 | 2016-07-27 | Roche Diagniostics Gmbh | ASC como marcador de la enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC) |
CN103415772A (zh) | 2011-03-11 | 2013-11-27 | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 | 表面表达蛋白酶作为慢性阻塞性肺病(copd)的标志物 |
WO2012123297A1 (en) | 2011-03-11 | 2012-09-20 | Roche Diagnostics Gmbh | Nnmt as marker for chronic obstructive pulmonary disease (copd) |
EP2684050B1 (en) | 2011-03-11 | 2016-05-11 | Roche Diagnostics GmbH | Armet as marker for chronic obstructive pulmonary disease (copd) |
CN103415771B (zh) | 2011-03-11 | 2015-04-22 | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 | Fen1作为慢性阻塞性肺病(copd)的标志物 |
WO2012123294A1 (en) | 2011-03-11 | 2012-09-20 | Roche Diagnostics Gmbh | Apex1 as marker for chronic obstructive pulmonary disease (copd) |
WO2012129347A1 (en) | 2011-03-21 | 2012-09-27 | Biodesy, Llc | Classification of kinase inhibitors using nonlinear optical techniques |
WO2012130731A1 (en) | 2011-03-25 | 2012-10-04 | Roche Diagnostics Gmbh | MEASUREMENT OF C-TERMINAL proSP-B |
WO2012129758A1 (en) | 2011-03-25 | 2012-10-04 | Biomerieux | Method and kit for determining in vitro probability for individual to suffer from colorectal cancer |
WO2012139110A2 (en) | 2011-04-08 | 2012-10-11 | Prognosys Biosciences, Inc. | Peptide constructs and assay systems |
US20140302532A1 (en) | 2011-04-12 | 2014-10-09 | Quanterix Corporation | Methods of determining a treatment protocol for and/or a prognosis of a patient's recovery from a brain injury |
GB201106254D0 (en) | 2011-04-13 | 2011-05-25 | Frisen Jonas | Method and product |
US9700579B2 (en) | 2011-04-27 | 2017-07-11 | Yale University | Drug therapy to inhibit chemotherapy-induced adverse effects and related pharmaceutical compositions, diagnostics, screening techniques and kits |
RU2631487C2 (ru) | 2011-05-17 | 2017-09-22 | Плексксикон Инк. | Модуляция киназ и показания к её применению |
EP2718465B1 (en) | 2011-06-09 | 2022-04-13 | Illumina, Inc. | Method of making an analyte array |
CN103620036B (zh) | 2011-06-09 | 2016-12-21 | 库尔纳公司 | 通过抑制共济蛋白(fxn)的天然反义转录物而治疗fxn 相关疾病 |
JP2014518069A (ja) | 2011-06-17 | 2014-07-28 | デイナ ファーバー キャンサー インスティチュート,インコーポレイテッド | 骨髄異形成症候群対象の生存率を予測するための変異シグネチャー |
EP2730915A4 (en) | 2011-07-04 | 2015-06-17 | Nec Solution Innovators Ltd | METHOD FOR EVALUATING THE REDOX EFFECT OF A NUCLEIC ACID MOLECULE AND NUCLEIC ACID MOLECULE WITH REDOX EFFECT |
KR101851425B1 (ko) | 2011-09-02 | 2018-04-23 | 네스텍 소시에테아노님 | 치료 효능 결정을 위한 신호 경로 단백질의 프로파일링 |
EA029151B1 (ru) | 2011-09-06 | 2018-02-28 | Курна, Инк. | ЛЕЧЕНИЕ ЗАБОЛЕВАНИЙ, СВЯЗАННЫХ С АЛЬФА-СУБЪЕДИНИЦАМИ ПОТЕНЦИАЛЗАВИСИМЫХ НАТРИЕВЫХ КАНАЛОВ (SCNxA), С ПОМОЩЬЮ МАЛЫХ МОЛЕКУЛ |
WO2013040251A2 (en) | 2011-09-13 | 2013-03-21 | Asurgen, Inc. | Methods and compositions involving mir-135b for distinguishing pancreatic cancer from benign pancreatic disease |
US9920371B2 (en) | 2011-09-22 | 2018-03-20 | Medvet Sciences Pty. Ltd. | Screening method |
CN107058059B (zh) | 2011-09-26 | 2020-08-07 | 基因技术股份公司 | 高效的小体积核酸合成 |
WO2014153188A2 (en) | 2013-03-14 | 2014-09-25 | Life Technologies Corporation | High efficiency, small volume nucleic acid synthesis |
DE102011083555B4 (de) | 2011-09-27 | 2013-10-10 | Aspre Ag | Analyseverfahren und Analysevorrichtung |
EP3511717A3 (en) | 2011-09-29 | 2019-09-25 | Meso Scale Technologies, LLC. | Biodosimetry panels and methods |
PL2768985T3 (pl) | 2011-10-21 | 2019-10-31 | Chronix Biomedical | Biomarkery będące krążącymi kwasami nukleinowymi związane z rakiem jelita grubego |
US20130157884A1 (en) | 2011-10-26 | 2013-06-20 | Asuragen, Inc. | Methods and compositions involving mirna expression levels for distinguishing pancreatic cysts |
EP2771487A1 (en) | 2011-10-27 | 2014-09-03 | Asuragen, INC. | Mirnas as diagnostic biomarkers to distinguish benign from malignant thyroid tumors |
WO2013063382A2 (en) | 2011-10-28 | 2013-05-02 | Illumina, Inc. | Microarray fabrication system and method |
US10100092B2 (en) | 2011-11-03 | 2018-10-16 | Vca, Inc. | Compositions and methods to detect various infectious organisms |
US11262362B2 (en) | 2011-11-18 | 2022-03-01 | Memorial Sloan-Kettering Cancer Center | 2-hydroxyglutarate as a biomarker for chronic hypoxia |
EP2783215B1 (en) | 2011-11-22 | 2018-04-25 | Robert Bosch GmbH | Method for self-referenced confidence test |
US8748097B1 (en) | 2011-12-02 | 2014-06-10 | President And Fellows Of Harvard College | Identification of agents for treating calcium disorders and uses thereof |
WO2013087789A1 (en) | 2011-12-13 | 2013-06-20 | Glykos Finland Ltd. | Antibody isoform arrays and methods thereof |
CA2859021A1 (en) | 2011-12-19 | 2013-06-27 | Valley Health System | Methods and kits for detecting subjects at risk of having cancer |
WO2013096528A1 (en) | 2011-12-20 | 2013-06-27 | Siemens Healthcare Diagnostics Inc. | Coated substrates for high energy capture phase binding and methods of production and use thereof |
US20130164217A1 (en) | 2011-12-21 | 2013-06-27 | Meso Scale Technologies, Llc | Method of diagnosing, preventing and/or treating dementia & related disorders |
WO2013096661A1 (en) | 2011-12-22 | 2013-06-27 | Illumina, Inc. | Methylation biomarkers for ovarian cancer |
WO2013101771A2 (en) | 2011-12-30 | 2013-07-04 | Genentech, Inc. | Compositions and method for treating autoimmune diseases |
WO2013106790A1 (en) | 2012-01-12 | 2013-07-18 | Robert Bosch Gmbh | Device and method for indirect electronic condition control in biomolecule detection platforms |
CA2862835A1 (en) | 2012-01-13 | 2013-07-18 | Genentech, Inc. | Biological markers for identifying patients for treatment with vegf antagonists |
JP6253596B2 (ja) | 2012-02-16 | 2017-12-27 | ザ ペン ステイト リサーチ ファンデーション | アシル補酵素a:リゾカルジオリピン・アシル基転移酵素1(alcat1)の発現、機能または活性の阻害物質を同定する方法 |
GB2503131B (en) | 2012-02-21 | 2015-11-18 | Cytonics Corp | Systems, compositions and methods for transplantation |
US20150045249A1 (en) | 2012-02-27 | 2015-02-12 | Toray Industries, Inc. | Nucleic acid detection method |
HUE040179T2 (hu) | 2012-03-15 | 2019-02-28 | Curna Inc | Agyi eredetû neutrotróf faktorral (Brain-derived neurotrophic factor, BDNF) összefüggõ betegségek kezelése a BDNF-fel kapcsolatos természetes antiszensz transzkriptumok gátlása révén |
WO2013140629A1 (ja) | 2012-03-23 | 2013-09-26 | Necソフト株式会社 | Atpまたはampの分析用デバイスおよび分析方法 |
WO2013141291A1 (ja) | 2012-03-23 | 2013-09-26 | Necソフト株式会社 | ストレプトアビジンの分析用デバイスおよび分析方法 |
SG11201406184XA (en) | 2012-03-30 | 2014-10-30 | Genentech Inc | Diagnostic methods and compositions for treatment of cancer |
EP2834371B1 (en) | 2012-04-05 | 2019-01-09 | The Regents of The University of California | Gene expression panel for breast cancer prognosis |
US9150570B2 (en) | 2012-05-31 | 2015-10-06 | Plexxikon Inc. | Synthesis of heterocyclic compounds |
US9347948B2 (en) | 2012-06-04 | 2016-05-24 | The Scripps Research Institute | Phenyl glyoxal probes |
US9012022B2 (en) | 2012-06-08 | 2015-04-21 | Illumina, Inc. | Polymer coatings |
EP2861989A4 (en) | 2012-06-15 | 2016-03-02 | Univ Wayne State | BIOMARK TEST FOR PREDICTING OR EARLY IDENTIFICATION OF PRE-LAMPSY AND / OR HELLP SYNDROME |
EP3339861B8 (en) | 2012-06-15 | 2023-11-01 | Genesis Theranostix Korlatolt Felelossegu Tarsasag | Biomarker test for prediction or early detection of preeclampsia |
BR112014032072A2 (pt) | 2012-06-20 | 2017-06-27 | Toray Industries | método para detectar ácido nucleico e kit de detecção de ácido nucleico. |
WO2014007623A1 (en) | 2012-07-03 | 2014-01-09 | Interna Technologies B.V. | Diagnostic portfolio and its uses |
JP2015524397A (ja) | 2012-07-20 | 2015-08-24 | ラトローブ ユニヴァーシティ | 診断及び処置の方法 |
US20160169875A1 (en) | 2012-07-27 | 2016-06-16 | Nec Solution Innovators, Ltd. | Nucleic acid sensor for melamine analysis, device for melamine analysis, and method for melamine analysis |
WO2014028461A2 (en) | 2012-08-13 | 2014-02-20 | The Rockefeller University | Treatment and diagnosis of melanoma |
CN104428424A (zh) | 2012-08-31 | 2015-03-18 | 东丽株式会社 | 目标核酸的检测方法 |
US10300450B2 (en) | 2012-09-14 | 2019-05-28 | Carterra, Inc. | Method and device for depositing a substance on a submerged surface |
US20140100124A1 (en) | 2012-10-04 | 2014-04-10 | Asuragen, Inc. | Diagnostic mirnas for differential diagnosis of incidental pancreatic cystic lesions |
DE102012020496A1 (de) | 2012-10-18 | 2014-04-24 | Charité - Universitätsmedizin Berlin | Biomarker zur Diagnostik und Behandlung von Neurofibromatose Typ 1 |
CA2890045C (en) | 2012-10-31 | 2016-11-15 | The Rockefeller University | Treatment and diagnosis of colon cancer |
EP3995158A1 (en) | 2012-11-06 | 2022-05-11 | Imbed Biosciences, Inc. | Methods and compositions for wound healing |
ME02925B (me) | 2012-11-28 | 2018-04-20 | Merck Sharp & Dohme | Kompozicije i postupci za liječenje kancera |
WO2014113502A1 (en) | 2013-01-15 | 2014-07-24 | Quanterix Corporation | Detection of dna or rna using single molecule arrays and other techniques |
EP2759602A1 (en) | 2013-01-25 | 2014-07-30 | Charité - Universitätsmedizin Berlin | Non-invasive prenatal genetic diagnostic methods |
US20140309263A1 (en) | 2013-02-01 | 2014-10-16 | Meso Scale Technologies, Llc | Biomarkers of therapeutic responsiveness |
US20140221368A1 (en) | 2013-02-01 | 2014-08-07 | Meso Scale Technologies, Llc | Biomarkers of therapeutic responsiveness |
US20140221325A1 (en) | 2013-02-01 | 2014-08-07 | Meso Scale Technologies, Llc | Glomerulonephritis biomarkers |
CA2901126C (en) | 2013-02-25 | 2022-01-25 | Genentech, Inc. | Methods and compositions for detecting and treating drug resistant akt mutant |
US9267171B2 (en) | 2013-02-28 | 2016-02-23 | New York University | DNA photolithography with cinnamate crosslinkers |
WO2014136560A1 (ja) | 2013-03-08 | 2014-09-12 | Necソリューションイノベータ株式会社 | 核酸素子候補分子、および、これを用いたターゲット分析用核酸素子のスクリーニング方法 |
EP3366785A3 (en) | 2013-03-15 | 2018-09-19 | Baylor Research Institute | Ulcerative colitis (uc)-associated colorectal neoplasia markers |
BR112015022448B1 (pt) | 2013-03-15 | 2020-12-08 | Illumina Cambridge Limited | molécula de nucleotídeo ou nucleosídeo modificado, métodos para preparar o crescimento de polinucleotídeo complementar a polinucleotídeo alvo de fita simples em reação de sequenciação e para determinar a sequência de polinucleotídeo alvo de fita simples e kit |
CA2907377A1 (en) | 2013-03-15 | 2014-09-18 | Baylor Research Institute | Tissue and blood-based mirna biomarkers for the diagnosis, prognosis and metastasis-predictive potential in colorectal cancer |
US20140274749A1 (en) | 2013-03-15 | 2014-09-18 | Affymetrix, Inc. | Systems and Methods for SNP Characterization and Identifying off Target Variants |
WO2014144666A2 (en) | 2013-03-15 | 2014-09-18 | The University Of Chicago | Methods and compositions related to t-cell activity |
SG11201508878WA (en) | 2013-05-01 | 2015-11-27 | Five Prime Therapeutics Inc | Methods of treating cancer |
CN104178562B (zh) | 2013-05-21 | 2018-11-09 | 生物梅里埃股份公司 | 一种大肠癌预后试剂盒 |
US9775881B2 (en) | 2013-05-23 | 2017-10-03 | Five Prime Therapeutics, Inc. | Methods of treating mesothelioma by administration of compounds comprising FGFR1 ECD |
JP6697380B2 (ja) | 2013-06-10 | 2020-05-20 | プレジデント・アンド・フェロウズ・オブ・ハーバード・カレッジ | 多能性幹細胞の有用性および安全性を特徴付けるための初期発生ゲノムアッセイ |
EP3011061B1 (en) | 2013-06-21 | 2021-12-29 | The Johns Hopkins University | Virion display array for profiling functions and interactions of human membrane proteins |
US9868979B2 (en) | 2013-06-25 | 2018-01-16 | Prognosys Biosciences, Inc. | Spatially encoded biological assays using a microfluidic device |
ES2899618T3 (es) | 2013-07-01 | 2022-03-14 | Illumina Inc | Funcionalización de superficie exenta de catalizador e injerto de polímero |
JP5503062B1 (ja) | 2013-07-23 | 2014-05-28 | Necソフト株式会社 | ターゲット分析用蛍光センサ、ターゲット分析用キット、およびこれを用いたターゲットの分析方法 |
US20150038365A1 (en) | 2013-08-01 | 2015-02-05 | Meso Scale Technologies, Llc | Lung cancer biomarkers |
US9352021B2 (en) | 2013-08-28 | 2016-05-31 | Cytonics Corporation | Systems, compositions, and methods for transplantation and treating conditions |
EP3039424B1 (en) | 2013-08-28 | 2020-07-29 | Crown Bioscience, Inc. (Taicang) | Gene expression signatures predictive of subject response to a multi-kinase inhibitor and methods of using the same |
US10456470B2 (en) | 2013-08-30 | 2019-10-29 | Genentech, Inc. | Diagnostic methods and compositions for treatment of glioblastoma |
JP6683615B2 (ja) | 2013-09-19 | 2020-04-22 | ザ ボード オブ トラスティーズ オブ ザ レランド スタンフォード ジュニア ユニバーシティー | 肝細胞様細胞を産生するための方法および組成物 |
EP3060685B1 (en) | 2013-10-23 | 2019-05-01 | F. Hoffmann-La Roche AG | Method of predicting the response of an asthma patient to therapy |
CN105874385B (zh) | 2013-12-19 | 2021-08-20 | Illumina公司 | 包括纳米图案化表面的基底及其制备方法 |
CN105917008B (zh) | 2014-01-16 | 2020-11-27 | 启迪公司 | 用于前列腺癌复发的预后的基因表达面板 |
US10850278B2 (en) | 2014-01-29 | 2020-12-01 | Arizona Board Of Regents On Behalf Of Arizona State University | Microreactor array platform |
ES2838804T3 (es) | 2014-01-31 | 2021-07-02 | Univ Temple | BAG3 como diana para el tratamiento de la insuficiencia cardíaca |
US10261084B1 (en) | 2014-02-19 | 2019-04-16 | Stc.Unm | Activated GTPase-based assays and kits for the diagnosis of sepsis and other infections |
JP2017508457A (ja) | 2014-02-27 | 2017-03-30 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド | T細胞バランス遺伝子発現、組成物およびその使用方法 |
WO2015161148A1 (en) * | 2014-04-18 | 2015-10-22 | Ibis Biosciences, Inc. | Uniform deposition of material |
US10329556B2 (en) | 2014-05-13 | 2019-06-25 | Bioatla, Llc | Conditionally active biological proteins |
US10745761B2 (en) | 2014-06-02 | 2020-08-18 | Valley Health System | Method and systems for lung cancer diagnosis |
EP3169801A1 (en) | 2014-07-14 | 2017-05-24 | F. Hoffmann-La Roche AG | Diagnostic methods and compositions for treatment of glioblastoma |
GB201414098D0 (en) | 2014-08-08 | 2014-09-24 | Illumina Cambridge Ltd | Modified nucleotide linkers |
US9982250B2 (en) | 2014-08-21 | 2018-05-29 | Illumina Cambridge Limited | Reversible surface functionalization |
US11111288B2 (en) | 2014-08-28 | 2021-09-07 | Bioatla, Inc. | Conditionally active chimeric antigen receptors for modified t-cells |
EP3186284B1 (en) | 2014-08-28 | 2022-04-06 | BioAtla, Inc. | Conditionally active chimeric antigen receptors for modified t-cells |
WO2016036916A1 (en) | 2014-09-03 | 2016-03-10 | Bioatla, Llc | Discovering and producing conditionally active biologic proteins in the same eukaryotic cell production hosts |
WO2016046640A2 (en) | 2014-09-26 | 2016-03-31 | Medical Prognosis Institute A/S | Methods for predicting drug responsiveness |
PL3212684T3 (pl) | 2014-10-31 | 2020-10-19 | Illumina Cambridge Limited | Polimery i powłoki z kopolimeru DNA |
CN107109494B (zh) | 2014-11-10 | 2023-10-27 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | Il-33介导型疾病的治疗方法和诊断方法 |
US11168369B2 (en) | 2014-11-25 | 2021-11-09 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Method of identifying and treating a person having a predisposition to or afflicted with a cardiometabolic disease |
US10683552B2 (en) | 2014-11-25 | 2020-06-16 | Presidents And Fellows Of Harvard College | Clonal haematopoiesis |
US11543411B2 (en) | 2014-12-05 | 2023-01-03 | Prelude Corporation | DCIS recurrence and invasive breast cancer |
SG10202012249YA (en) | 2014-12-08 | 2021-01-28 | Berg Llc | Use of markers including filamin a in the diagnosis and treatment of prostate cancer |
EP3557262B1 (en) | 2014-12-09 | 2022-08-10 | Life Technologies Corporation | High efficiency, small volume nucleic acid synthesis |
EP3237906B8 (en) | 2014-12-23 | 2020-10-28 | Bluelight Therapeutics, Inc. | Attachment of proteins to interfaces for use in nonlinear optical detection |
CA2969830A1 (en) | 2014-12-24 | 2016-06-30 | Genentech, Inc. | Therapeutic, diagnostic and prognostic methods for cancer of the bladder |
JP2018506720A (ja) | 2015-02-13 | 2018-03-08 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲーF. Hoffmann−La Roche Aktiengesellschaft | 抗ccpおよび抗pik3cdを測定することによる関節リウマの査定方法 |
EP3056904A1 (en) | 2015-02-13 | 2016-08-17 | F. Hoffmann-La Roche AG | Method of assessing rheumatoid arthritis by measuring anti-CCP and anti-MCM3 |
EP3056903A1 (en) | 2015-02-13 | 2016-08-17 | F. Hoffmann-La Roche AG | Method of assessing rheumatoid arthritis by measuring anti-CCP and anti-Casp8 |
US11434264B2 (en) | 2015-02-13 | 2022-09-06 | Quanterix Corporation | Immunoassays for differential detection of clostridium difficile |
EP4276059A3 (en) | 2015-02-24 | 2024-05-01 | City of Hope | Chemically encoded spatially addressed library screening platforms |
KR102286801B1 (ko) | 2015-02-24 | 2021-08-09 | 바이오아트라, 인코퍼레이티드 | 조건부 활성 생체 단백질 |
WO2016138488A2 (en) | 2015-02-26 | 2016-09-01 | The Broad Institute Inc. | T cell balance gene expression, compositions of matters and methods of use thereof |
CN104826673B (zh) * | 2015-03-16 | 2017-06-23 | 中国科学院微生物研究所 | 写入式二维微流控液滴阵列化装置、用途及其使用方法 |
US9708647B2 (en) | 2015-03-23 | 2017-07-18 | Insilixa, Inc. | Multiplexed analysis of nucleic acid hybridization thermodynamics using integrated arrays |
WO2016164641A1 (en) | 2015-04-08 | 2016-10-13 | Plexxikon Inc. | Compounds and methods for kinase modulation, and indications therefor |
ES2955916T3 (es) | 2015-04-10 | 2023-12-11 | Spatial Transcriptomics Ab | Análisis múltiplex de especímenes biológicos de ácidos nucleicos espacialmente distinguidos |
AU2016257772B2 (en) | 2015-05-01 | 2022-06-02 | Griffith University | Diagnostic methods |
WO2016196065A1 (en) | 2015-05-29 | 2016-12-08 | Genentech, Inc. | Methods and compositions for assessing responsiveness of cancers to bet inhibitors |
US10196701B2 (en) | 2015-06-01 | 2019-02-05 | The Penn State Research Foundation | Hepatitis B virus capsid assembly |
US20180207920A1 (en) | 2015-07-17 | 2018-07-26 | Illumina, Inc. | Polymer sheets for sequencing applications |
WO2017019804A2 (en) | 2015-07-28 | 2017-02-02 | Plexxikon Inc. | Compounds and methods for kinase modulation, and indications therefor |
US9499861B1 (en) | 2015-09-10 | 2016-11-22 | Insilixa, Inc. | Methods and systems for multiplex quantitative nucleic acid amplification |
EP3347714B1 (en) | 2015-09-10 | 2021-03-10 | InSilixa Inc. | Methods for multiplex quantitative nucleic acid amplification |
EP3141613A1 (en) | 2015-09-11 | 2017-03-15 | Nederlandse Organisatie voor toegepast- natuurwetenschappelijk onderzoek TNO | Detection of quality of surface water |
WO2017053838A1 (en) | 2015-09-23 | 2017-03-30 | Oklahoma Medical Research Foundation | Biomarkers for assessing subjects with multiple sclerosis |
CA2998208A1 (en) | 2015-10-22 | 2017-04-27 | Jounce Therapeutics, Inc. | Gene signatures for determining icos expression |
SG11201804711RA (en) | 2015-12-07 | 2018-07-30 | Plexxikon Inc | Compounds and methods for kinase modulation, and indications therefor |
WO2017155858A1 (en) | 2016-03-07 | 2017-09-14 | Insilixa, Inc. | Nucleic acid sequence identification using solid-phase cyclic single base extension |
US11285478B2 (en) | 2016-04-04 | 2022-03-29 | Combinati Incorporated | Microfluidic siphoning array for nucleic acid quantification |
US9845499B2 (en) * | 2016-04-04 | 2017-12-19 | Combinati Incorporated | Microfluidic siphoning array for nucleic acid quantification |
US11254742B2 (en) | 2016-05-13 | 2022-02-22 | Bioatla, Inc. | Anti-Ror2 antibodies, antibody fragments, their immunoconjugates and uses thereof |
KR102171865B1 (ko) | 2016-05-18 | 2020-10-29 | 일루미나, 인코포레이티드 | 패턴화된 소수성 표면을 사용한 자가 조립된 패터닝 |
WO2018053039A1 (en) | 2016-09-14 | 2018-03-22 | The Usa, As Represented By The Secretary, Department Of Health & Human Services | Methods of diagnosing and treating cd55 deficiency, hyperactivation of complement, angiopathic thrombosis and protein losing enteropathy (chaple), a newly identified orphan disease |
TW201815766A (zh) | 2016-09-22 | 2018-05-01 | 美商普雷辛肯公司 | 用於ido及tdo調節之化合物及方法以及其適應症 |
EP3535297B1 (en) | 2016-11-02 | 2022-08-10 | Debiopharm International, S.A. | Methods for improving anti-cd37 immunoconjugate therapy |
WO2018094091A1 (en) | 2016-11-17 | 2018-05-24 | Combinati Incorporated | Methods and systems for nucleic acid analysis and quantification |
EP3558991A2 (en) | 2016-12-23 | 2019-10-30 | Plexxikon Inc. | Compounds and methods for cdk8 modulation and indications therefor |
WO2018170464A1 (en) | 2017-03-17 | 2018-09-20 | The Johns Hopkins University | Targeted epigenetic therapy against distal regulatory element of tgfb2 expression |
EP3601602B1 (en) | 2017-03-29 | 2024-04-10 | Crown Bioscience, Inc. (Taicang) | System and method for determining cetuximab sensitivity on gastric cancer |
US20200024351A1 (en) | 2017-04-03 | 2020-01-23 | Jounce Therapeutics, Inc. | Compositions and Methods for the Treatment of Cancer |
EP3615694B1 (en) | 2017-04-25 | 2022-03-30 | The Brigham and Women's Hospital, Inc. | Il-8, il-6, il-1b and tet2 and dnmt3a in atherosclerosis |
EP3625358A4 (en) | 2017-05-17 | 2021-02-24 | Microbio Pty Ltd | BIOMARKERS AND USES THEREOF |
US11766249B2 (en) * | 2017-05-19 | 2023-09-26 | Envivo Bio Inc. | Devices and methods for collecting gastrointestinal samples |
US10428067B2 (en) | 2017-06-07 | 2019-10-01 | Plexxikon Inc. | Compounds and methods for kinase modulation |
AU2017424318B2 (en) * | 2017-07-21 | 2023-06-08 | Germitec | Bioassay carrier and preparation thereof |
WO2019046791A1 (en) | 2017-09-01 | 2019-03-07 | The Johns Hopkins University | TARGETED EPIGENETIC THERAPY FOR AERIAL CONDITION OF AERTICAL HERITATION |
WO2019060607A1 (en) | 2017-09-20 | 2019-03-28 | Quanterix Corporation | METHODS AND SYSTEMS FOR DETECTING MOLECULES OF ANALYTES |
WO2019086603A1 (en) | 2017-11-03 | 2019-05-09 | Interna Technologies B.V. | Mirna molecule, equivalent, antagomir, or source thereof for treating and/or diagnosing a condition and/or a disease associated with neuronal deficiency or for neuronal (re)generation |
WO2019104062A1 (en) | 2017-11-21 | 2019-05-31 | Rgenix, Inc. | Polymorphs and uses thereof |
WO2019151972A1 (en) * | 2018-01-30 | 2019-08-08 | Hewlett-Packard Development Company, L.P. | Fluid ejections in nanowells |
KR102417088B1 (ko) | 2018-02-09 | 2022-07-07 | 제넨테크, 인크. | 비만 세포 매개 염증성 질환에 대한 치료 및 진단 방법 |
EP3752645A4 (en) | 2018-02-14 | 2022-04-13 | Dermtech, Inc. | NEW GENE CLASSIFIERS AND THEIR USES IN NON-MELANOMA SKIN CANCERS |
EP3762729A1 (en) | 2018-03-08 | 2021-01-13 | Meso Scale Technologies, LLC | Genetic marker and/or biomarkers for traumatic brain injury, and ultrasensitive assays for biomarkers of traumatic brain injury |
CN113366117A (zh) | 2018-08-28 | 2021-09-07 | 10X基因组学股份有限公司 | 用于生物样品中转座酶介导的空间标记和分析基因组dna的方法 |
US11519033B2 (en) | 2018-08-28 | 2022-12-06 | 10X Genomics, Inc. | Method for transposase-mediated spatial tagging and analyzing genomic DNA in a biological sample |
US20210317524A1 (en) | 2018-08-28 | 2021-10-14 | 10X Genomics, Inc. | Resolving spatial arrays |
WO2020056338A1 (en) | 2018-09-14 | 2020-03-19 | Prelude Corporation | Method of selection for treatment of subjects at risk of invasive breast cancer |
WO2020067122A1 (ja) | 2018-09-25 | 2020-04-02 | 東レ株式会社 | アルカリホスファターゼ組成物並びに脱リン酸化核酸及び標識化核酸の製造方法 |
US20220033874A1 (en) | 2018-09-25 | 2022-02-03 | Toray Industries, Inc. | Method of evaluating quality of dephosphorylation reagent and method of detecting target nucleic acid |
CN112771158A (zh) | 2018-09-25 | 2021-05-07 | 东丽株式会社 | 碱性磷酸酶组合物以及去磷酸化核酸和标记化核酸的制造方法 |
EP3660172A1 (en) | 2018-11-28 | 2020-06-03 | Bioscreening and Diagnostics LLC | Method for detection of traumatic brain injury (tbi) |
CN112368077B (zh) | 2018-12-07 | 2023-11-24 | 元素生物科学公司 | 流动池装置及其用途 |
EP3894592A2 (en) | 2018-12-10 | 2021-10-20 | 10X Genomics, Inc. | Generating spatial arrays with gradients |
US11293061B2 (en) | 2018-12-26 | 2022-04-05 | Illumina Cambridge Limited | Sequencing methods using nucleotides with 3′ AOM blocking group |
US11926867B2 (en) | 2019-01-06 | 2024-03-12 | 10X Genomics, Inc. | Generating capture probes for spatial analysis |
US11649485B2 (en) | 2019-01-06 | 2023-05-16 | 10X Genomics, Inc. | Generating capture probes for spatial analysis |
WO2020176788A1 (en) | 2019-02-28 | 2020-09-03 | 10X Genomics, Inc. | Profiling of biological analytes with spatially barcoded oligonucleotide arrays |
CN113924041A (zh) | 2019-03-14 | 2022-01-11 | 因斯利克萨公司 | 基于时间门控的荧光检测的方法和系统 |
WO2020190509A1 (en) | 2019-03-15 | 2020-09-24 | 10X Genomics, Inc. | Methods for using spatial arrays for single cell sequencing |
WO2020198071A1 (en) | 2019-03-22 | 2020-10-01 | 10X Genomics, Inc. | Three-dimensional spatial analysis |
US11578373B2 (en) | 2019-03-26 | 2023-02-14 | Dermtech, Inc. | Gene classifiers and uses thereof in skin cancers |
US11421271B2 (en) | 2019-03-28 | 2022-08-23 | Illumina Cambridge Limited | Methods and compositions for nucleic acid sequencing using photoswitchable labels |
EP3952849A4 (en) | 2019-04-12 | 2023-03-01 | The Regents Of The University Of California | COMPOSITIONS AND METHODS FOR INCREASING MUSCLE MASS AND OXIDATIVE METABOLISM |
EP3963099A1 (en) | 2019-04-30 | 2022-03-09 | Larimar Therapeutics, Inc. | Frataxin-sensitive markers for determining effectiveness of frataxin replacement therapy |
EP3976820A1 (en) | 2019-05-30 | 2022-04-06 | 10X Genomics, Inc. | Methods of detecting spatial heterogeneity of a biological sample |
US11514575B2 (en) | 2019-10-01 | 2022-11-29 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for identifying morphological patterns in tissue samples |
CA3160211A1 (en) | 2019-11-05 | 2021-05-14 | Meso Scale Technologies, Llc. | Methods and kits for quantitating radiation exposure |
EP4025711A2 (en) | 2019-11-08 | 2022-07-13 | 10X Genomics, Inc. | Enhancing specificity of analyte binding |
WO2021091611A1 (en) | 2019-11-08 | 2021-05-14 | 10X Genomics, Inc. | Spatially-tagged analyte capture agents for analyte multiplexing |
US20230002812A1 (en) | 2019-11-13 | 2023-01-05 | 10X Genomics, Inc. | Generating capture probes for spatial analysis |
WO2021102003A1 (en) | 2019-11-18 | 2021-05-27 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for tissue classification |
US20210155982A1 (en) | 2019-11-21 | 2021-05-27 | 10X Genomics, Inc. | Pipeline for spatial analysis of analytes |
US11501440B2 (en) | 2019-11-22 | 2022-11-15 | 10X Genomics, Inc. | Systems and methods for spatial analysis of analytes using fiducial alignment |
WO2021108666A2 (en) | 2019-11-26 | 2021-06-03 | Meso Scale Technologies, Llc. | Methods and kits for detecting autoimmune diseases |
JP2023509845A (ja) | 2019-12-13 | 2023-03-10 | インスピルナ,インコーポレーテッド | 金属塩及びその使用 |
EP3891300B1 (en) | 2019-12-23 | 2023-03-29 | 10X Genomics, Inc. | Methods for spatial analysis using rna-templated ligation |
JP2023510847A (ja) | 2020-01-13 | 2023-03-15 | ジャウンス セラピューティックス, インク. | 癌の治療方法 |
US11702693B2 (en) | 2020-01-21 | 2023-07-18 | 10X Genomics, Inc. | Methods for printing cells and generating arrays of barcoded cells |
US11732299B2 (en) | 2020-01-21 | 2023-08-22 | 10X Genomics, Inc. | Spatial assays with perturbed cells |
US11821035B1 (en) | 2020-01-29 | 2023-11-21 | 10X Genomics, Inc. | Compositions and methods of making gene expression libraries |
US11898205B2 (en) | 2020-02-03 | 2024-02-13 | 10X Genomics, Inc. | Increasing capture efficiency of spatial assays |
US11732300B2 (en) | 2020-02-05 | 2023-08-22 | 10X Genomics, Inc. | Increasing efficiency of spatial analysis in a biological sample |
US11835462B2 (en) | 2020-02-11 | 2023-12-05 | 10X Genomics, Inc. | Methods and compositions for partitioning a biological sample |
JP2023514749A (ja) | 2020-02-21 | 2023-04-07 | 10エックス ジェノミクス インコーポレイテッド | 統合型インサイチュ空間的アッセイのための方法および組成物 |
US11891654B2 (en) | 2020-02-24 | 2024-02-06 | 10X Genomics, Inc. | Methods of making gene expression libraries |
US11926863B1 (en) | 2020-02-27 | 2024-03-12 | 10X Genomics, Inc. | Solid state single cell method for analyzing fixed biological cells |
US11768175B1 (en) | 2020-03-04 | 2023-09-26 | 10X Genomics, Inc. | Electrophoretic methods for spatial analysis |
WO2021211754A2 (en) | 2020-04-15 | 2021-10-21 | Quanterix Corporation | Methods and systems related to highly sensitive assays and delivering capture objects |
ES2965354T3 (es) | 2020-04-22 | 2024-04-12 | 10X Genomics Inc | Métodos para análisis espacial que usan eliminación de ARN elegido como diana |
EP4143576A1 (en) | 2020-05-01 | 2023-03-08 | Meso Scale Technologies, LLC | Viral serology assays |
AU2021275906A1 (en) | 2020-05-22 | 2022-12-22 | 10X Genomics, Inc. | Spatial analysis to detect sequence variants |
WO2021236929A1 (en) | 2020-05-22 | 2021-11-25 | 10X Genomics, Inc. | Simultaneous spatio-temporal measurement of gene expression and cellular activity |
WO2021242834A1 (en) | 2020-05-26 | 2021-12-02 | 10X Genomics, Inc. | Method for resetting an array |
WO2021247543A2 (en) | 2020-06-02 | 2021-12-09 | 10X Genomics, Inc. | Nucleic acid library methods |
EP4158054A1 (en) | 2020-06-02 | 2023-04-05 | 10X Genomics, Inc. | Spatial transcriptomics for antigen-receptors |
EP4162074B1 (en) | 2020-06-08 | 2024-04-24 | 10X Genomics, Inc. | Methods of determining a surgical margin and methods of use thereof |
EP4165207A1 (en) | 2020-06-10 | 2023-04-19 | 10X Genomics, Inc. | Methods for determining a location of an analyte in a biological sample |
BR112022026056A2 (pt) | 2020-06-22 | 2023-03-07 | Illumina Cambridge Ltd | Nucleosídeos e nucleotídeos com grupo bloqueador 3? acetal |
CN116034166A (zh) | 2020-06-25 | 2023-04-28 | 10X基因组学有限公司 | Dna甲基化的空间分析 |
US11761038B1 (en) | 2020-07-06 | 2023-09-19 | 10X Genomics, Inc. | Methods for identifying a location of an RNA in a biological sample |
US11981960B1 (en) | 2020-07-06 | 2024-05-14 | 10X Genomics, Inc. | Spatial analysis utilizing degradable hydrogels |
US11981964B2 (en) | 2020-07-28 | 2024-05-14 | Illumina Cambridge Limited | Substituted coumarin dyes and uses as fluorescent labels |
US11981958B1 (en) | 2020-08-20 | 2024-05-14 | 10X Genomics, Inc. | Methods for spatial analysis using DNA capture |
WO2022047359A1 (en) | 2020-08-31 | 2022-03-03 | Berg Llc | Protein biomarkers for pancreatic cancer |
US11926822B1 (en) | 2020-09-23 | 2024-03-12 | 10X Genomics, Inc. | Three-dimensional spatial analysis |
US11827935B1 (en) | 2020-11-19 | 2023-11-28 | 10X Genomics, Inc. | Methods for spatial analysis using rolling circle amplification and detection probes |
US20220195196A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Illumina Cambridge Limited | Alkylpyridinium coumarin dyes and uses in sequencing applications |
US20220195517A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Illumina Cambridge Limited | Long stokes shift chromenoquinoline dyes and uses in sequencing applications |
US20220195516A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Illumina Cambridge Limited | Methods, systems and compositions for nucleic acid sequencing |
AU2021409136A1 (en) | 2020-12-21 | 2023-06-29 | 10X Genomics, Inc. | Methods, compositions, and systems for capturing probes and/or barcodes |
US20220195518A1 (en) | 2020-12-22 | 2022-06-23 | Illumina Cambridge Limited | Methods and compositions for nucleic acid sequencing |
US20220228210A1 (en) | 2020-12-30 | 2022-07-21 | 10X Genomics, Inc. | Molecular array generation using photoresist |
EP4271509A1 (en) | 2020-12-30 | 2023-11-08 | 10X Genomics, Inc. | Molecular arrays and methods for generating and using the arrays |
EP4271510A1 (en) | 2020-12-30 | 2023-11-08 | 10X Genomics, Inc. | Methods and compositions for light-controlled surface patterning using a polymer |
EP4301870A1 (en) | 2021-03-18 | 2024-01-10 | 10X Genomics, Inc. | Multiplex capture of gene and protein expression from a biological sample |
CA3214833A1 (en) | 2021-04-06 | 2022-10-13 | Bpgbio, Inc. | Protein markers for the prognosis of breast cancer progression |
EP4320441A1 (en) | 2021-04-06 | 2024-02-14 | BPGbio, Inc. | Protein markers for estrogen receptor (er)-positive-like and estrogen receptor (er)-negative-like breast cancer |
EP4320440A1 (en) | 2021-04-06 | 2024-02-14 | BPGbio, Inc. | Protein markers for estrogen receptor (er)-positive luminal a(la)-like and luminal b1 (lb1)-like breast cancer |
EP4334327A1 (en) | 2021-05-05 | 2024-03-13 | Illumina Cambridge Limited | Fluorescent dyes containing bis-boron fused heterocycles and uses in sequencing |
CA3216735A1 (en) | 2021-05-20 | 2022-11-24 | Patrizia IAVICOLI | Compositions and methods for sequencing by synthesis |
WO2022246215A1 (en) | 2021-05-21 | 2022-11-24 | Meso Scale Technologies, Llc. | Viral strain serology assays |
US20230016633A1 (en) | 2021-06-15 | 2023-01-19 | Illumina, Inc. | Hydrogel-free surface functionalization for sequencing |
CN117813391A (zh) | 2021-07-23 | 2024-04-02 | 因美纳有限公司 | 制备用于dna测序的基底表面的方法 |
WO2023034489A1 (en) | 2021-09-01 | 2023-03-09 | 10X Genomics, Inc. | Methods, compositions, and kits for blocking a capture probe on a spatial array |
AU2022371198A1 (en) | 2021-10-20 | 2024-05-02 | Illumina, Inc. | Methods for capturing library dna for sequencing |
US11820140B2 (en) | 2022-03-21 | 2023-11-21 | Funai Electric Co., Ltd | Dispense modes for multi-mode capable device |
US20230330659A1 (en) | 2022-03-22 | 2023-10-19 | Illumina Cambridge Limited | Substrate with orthogonally functional nanodomains |
CA3223115A1 (en) | 2022-03-28 | 2023-10-05 | Xiaolin Wu | Labeled avidin and methods for sequencing |
WO2023186819A1 (en) | 2022-03-29 | 2023-10-05 | Illumina Cambridge Limited | Chromenoquinoline dyes and uses in sequencing |
WO2023196937A1 (en) | 2022-04-06 | 2023-10-12 | Larimar Therapeutics, Inc. | Frataxin-sensitive markers for monitoring frataxin replacement therapy |
WO2023194369A1 (en) | 2022-04-08 | 2023-10-12 | Fundació Institut Mar D'investigacions Mèdiques (Imim) | Genetic markers for severe covid-19 |
WO2023232829A1 (en) | 2022-05-31 | 2023-12-07 | Illumina, Inc | Compositions and methods for nucleic acid sequencing |
WO2023240201A1 (en) | 2022-06-08 | 2023-12-14 | Larimar Therapeutics, Inc. | Frataxin-sensitive markers for monitoring progression and treatment of leigh syndrome |
WO2023245184A1 (en) | 2022-06-17 | 2023-12-21 | Meso Scale Technologies, Llc. | Viral strain serology assays |
WO2024003087A1 (en) | 2022-06-28 | 2024-01-04 | Illumina, Inc. | Fluorescent dyes containing fused tetracyclic bis-boron heterocycle and uses in sequencing |
WO2024006830A1 (en) | 2022-06-29 | 2024-01-04 | 10X Genomics, Inc. | Methods and compositions for patterned molecular array generation by directed bead delivery |
WO2024006797A1 (en) | 2022-06-29 | 2024-01-04 | 10X Genomics, Inc. | Methods and compositions for refining feature boundaries in molecular arrays |
EP4370242A1 (en) | 2022-06-29 | 2024-05-22 | 10X Genomics, Inc. | Compositions and methods for generating molecular arrays using oligonucleotide printing and photolithography |
US20240060127A1 (en) | 2022-06-29 | 2024-02-22 | 10X Genomics, Inc. | Methods and systems for light-controlled surface patterning using photomasks |
WO2024006814A1 (en) | 2022-06-29 | 2024-01-04 | 10X Genomics, Inc. | Method of generating arrays using microfluidics and photolithography |
WO2024006832A1 (en) | 2022-06-29 | 2024-01-04 | 10X Genomics, Inc. | Click chemistry-based dna photo-ligation for manufacturing of high-resolution dna arrays |
WO2024006816A1 (en) | 2022-06-29 | 2024-01-04 | 10X Genomics, Inc. | Compositions and methods for oligonucleotide inversion on arrays |
US20240167077A1 (en) | 2022-06-29 | 2024-05-23 | 10X Genomics, Inc. | Covalent attachment of splint oligonucleotides for molecular array generation using ligation |
WO2024006798A1 (en) | 2022-06-29 | 2024-01-04 | 10X Genomics, Inc. | High definition molecular array feature generation using photoresist |
WO2024028794A1 (en) | 2022-08-02 | 2024-02-08 | Temple Therapeutics BV | Methods for treating endometrial and ovarian hyperproliferative disorders |
WO2024039516A1 (en) | 2022-08-19 | 2024-02-22 | Illumina, Inc. | Third dna base pair site-specific dna detection |
US20240103002A1 (en) | 2022-09-23 | 2024-03-28 | Meso Scale Technologies, Llc. | Orthopoxvirus serology assays |
WO2024068889A2 (en) | 2022-09-30 | 2024-04-04 | Illumina, Inc. | Compositions and methods for reducing photo damage during sequencing |
WO2024123748A1 (en) | 2022-12-07 | 2024-06-13 | Illumina, Inc. | Etch-free photoresist patterning in multi-depth nanowells |
Family Cites Families (69)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US3730844A (en) * | 1971-08-27 | 1973-05-01 | Purdue Research Foundation | Polynucleotide analysis |
FR2353856A1 (fr) * | 1976-06-02 | 1977-12-30 | Chateau Guy | Ruban destine a servir de support a une reaction par exemple chimique ou biochimique, et procede d'analyse le mettant en oeuvre |
US4711955A (en) * | 1981-04-17 | 1987-12-08 | Yale University | Modified nucleotides and methods of preparing and using same |
FI63596C (fi) * | 1981-10-16 | 1983-07-11 | Orion Yhtymae Oy | Mikrobdiagnostiskt foerfarande som grundar sig pao skiktshybridisering av nukleinsyror och vid foerfarandet anvaenda kombinationer av reagenser |
US4556643A (en) * | 1982-07-26 | 1985-12-03 | Agracetus | Assay method and probe for polynucleotide sequences |
US4591570A (en) * | 1983-02-02 | 1986-05-27 | Centocor, Inc. | Matrix of antibody-coated spots for determination of antigens |
US4677054A (en) * | 1983-08-08 | 1987-06-30 | Sloan-Kettering Institute For Cancer Research | Method for simple analysis of relative nucleic acid levels in multiple small samples by cytoplasmic dot hybridization |
FI71768C (fi) * | 1984-02-17 | 1987-02-09 | Orion Yhtymae Oy | Foerbaettrade nykleinsyrareagenser och foerfarande foer deras framstaellning. |
GB8405437D0 (en) * | 1984-03-01 | 1984-04-04 | Amersham Int Plc | Detecting polynucleotide sequences |
US4670380A (en) * | 1984-05-23 | 1987-06-02 | Molecular Diagnostics, Inc. | Assays utilizing labeled nucleic acid probes |
US4755458A (en) * | 1984-08-30 | 1988-07-05 | Enzo Biochem, Inc. | Composition and method for the detection of the presence of a polynucleotide sequence of interest |
US5064754A (en) * | 1984-12-14 | 1991-11-12 | Mills Randell L | Genomic sequencing method |
US4767700A (en) * | 1985-02-15 | 1988-08-30 | Beckman Research Institute Of The City Of Hope | Detection of particular nucleotide sequences |
US4683202A (en) * | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
US4683195A (en) * | 1986-01-30 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or-cloning nucleic acid sequences |
US4868104A (en) * | 1985-09-06 | 1989-09-19 | Syntex (U.S.A.) Inc. | Homogeneous assay for specific polynucleotides |
US4868105A (en) * | 1985-12-11 | 1989-09-19 | Chiron Corporation | Solution phase nucleic acid sandwich assay |
US5348855A (en) * | 1986-03-05 | 1994-09-20 | Miles Inc. | Assay for nucleic acid sequences in an unpurified sample |
US4981783A (en) * | 1986-04-16 | 1991-01-01 | Montefiore Medical Center | Method for detecting pathological conditions |
US5202231A (en) * | 1987-04-01 | 1993-04-13 | Drmanac Radoje T | Method of sequencing of genomes by hybridization of oligonucleotide probes |
US5100777A (en) * | 1987-04-27 | 1992-03-31 | Tanox Biosystems, Inc. | Antibody matrix device and method for evaluating immune status |
SE458968B (sv) * | 1987-06-16 | 1989-05-22 | Wallac Oy | Biospecifikt analysfoerfarande foer flera analyter i vilket ingaar partikelraekning och maerkning med fluorescerande maerksubstanser |
US4921805A (en) * | 1987-07-29 | 1990-05-01 | Life Technologies, Inc. | Nucleic acid capture method |
GB8810400D0 (en) * | 1988-05-03 | 1988-06-08 | Southern E | Analysing polynucleotide sequences |
US5013669A (en) * | 1988-06-01 | 1991-05-07 | Smithkline Diagnostics, Inc. | Mass producible biologically active solid phase devices |
US5204268A (en) * | 1988-06-02 | 1993-04-20 | Fuji Photo Film Co., Ltd. | Method and apparatus for applying liquid samples |
US5188963A (en) * | 1989-11-17 | 1993-02-23 | Gene Tec Corporation | Device for processing biological specimens for analysis of nucleic acids |
US5185243A (en) * | 1988-08-25 | 1993-02-09 | Syntex (U.S.A.) Inc. | Method for detection of specific nucleic acid sequences |
GB8822228D0 (en) * | 1988-09-21 | 1988-10-26 | Southern E M | Support-bound oligonucleotides |
US5389512A (en) * | 1988-10-07 | 1995-02-14 | Hoffman-La Roche Inc. | Method for determining the relative amount of a viral nucleic acid segment in a sample by the polymerase chain reaction |
US5200051A (en) * | 1988-11-14 | 1993-04-06 | I-Stat Corporation | Wholly microfabricated biosensors and process for the manufacture and use thereof |
US5200312A (en) * | 1989-01-30 | 1993-04-06 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy | Membrane based dot immunoassay and method of use |
US5800992A (en) * | 1989-06-07 | 1998-09-01 | Fodor; Stephen P.A. | Method of detecting nucleic acids |
US5242974A (en) * | 1991-11-22 | 1993-09-07 | Affymax Technologies N.V. | Polymer reversal on solid surfaces |
US6040138A (en) * | 1995-09-15 | 2000-03-21 | Affymetrix, Inc. | Expression monitoring by hybridization to high density oligonucleotide arrays |
US5143854A (en) * | 1989-06-07 | 1992-09-01 | Affymax Technologies N.V. | Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof |
US5744101A (en) * | 1989-06-07 | 1998-04-28 | Affymax Technologies N.V. | Photolabile nucleoside protecting groups |
US5252743A (en) * | 1989-11-13 | 1993-10-12 | Affymax Technologies N.V. | Spatially-addressable immobilization of anti-ligands on surfaces |
US5091652A (en) * | 1990-01-12 | 1992-02-25 | The Regents Of The University Of California | Laser excited confocal microscope fluorescence scanner and method |
DE69032425T2 (de) * | 1990-05-11 | 1998-11-26 | Microprobe Corp., Bothell, Wash. | Teststreifen zum Eintauchen für Nukleinsäure-Hybridisierungsassays und Verfahren zur kovalenten Immobilisierung von Oligonucleotiden |
US5252296A (en) * | 1990-05-15 | 1993-10-12 | Chiron Corporation | Method and apparatus for biopolymer synthesis |
DE4024545A1 (de) * | 1990-08-02 | 1992-02-06 | Boehringer Mannheim Gmbh | Verfahren und vorrichtung zum dosierten zufuehren einer biochemischen analysefluessigkeit auf ein target |
EP0557456A4 (en) * | 1990-11-14 | 1995-11-15 | Siska Diagnostics Inc | Non-isotopic detection of nucleic acids using a polystyrene support-based sandwich hybridization assay and compositions useful therefor |
EP1231282A3 (en) * | 1990-12-06 | 2005-05-18 | Affymetrix, Inc. | Methods and compositions for identification of polymers |
WO1992022680A1 (en) * | 1991-06-17 | 1992-12-23 | Stauffer John E | Improved process for removal of sulfur dioxide from waste gases |
US5556748A (en) * | 1991-07-30 | 1996-09-17 | Xenopore Corporation | Methods of sandwich hybridization for the quantitative analysis of oligonucleotides |
US5474796A (en) * | 1991-09-04 | 1995-12-12 | Protogene Laboratories, Inc. | Method and apparatus for conducting an array of chemical reactions on a support surface |
US5605662A (en) * | 1993-11-01 | 1997-02-25 | Nanogen, Inc. | Active programmable electronic devices for molecular biological analysis and diagnostics |
US5326691A (en) * | 1991-11-21 | 1994-07-05 | John Hozier | Micro-libraries and methods of making and manipulating them methods for generating and analyzing micro-libraries |
US5412087A (en) * | 1992-04-24 | 1995-05-02 | Affymax Technologies N.V. | Spatially-addressable immobilization of oligonucleotides and other biological polymers on surfaces |
DE69233087T2 (de) * | 1991-11-22 | 2003-12-24 | Affymetrix Inc N D Ges D Staat | Verfahren zur Herstellung von Polymerarrays |
JPH05236997A (ja) * | 1992-02-28 | 1993-09-17 | Hitachi Ltd | ポリヌクレオチド捕捉用チップ |
ATE205542T1 (de) * | 1992-03-04 | 2001-09-15 | Univ California | Vergleichende genomhybridisierung |
DE69322266T2 (de) * | 1992-04-03 | 1999-06-02 | Perkin Elmer Corp | Proben zusammensetzung und verfahren |
DE69313611T2 (de) * | 1992-07-02 | 1998-01-08 | Erkki Soini | Biospezifisches multiparameter-analyseverfahren |
WO1995000530A1 (en) * | 1993-06-25 | 1995-01-05 | Affymax Technologies N.V. | Hybridization and sequencing of nucleic acids |
US5512430A (en) * | 1993-07-13 | 1996-04-30 | Hri Research, Inc. | Diagnostic array for virus infection |
US5472842A (en) * | 1993-10-06 | 1995-12-05 | The Regents Of The University Of California | Detection of amplified or deleted chromosomal regions |
AU8126694A (en) * | 1993-10-26 | 1995-05-22 | Affymax Technologies N.V. | Arrays of nucleic acid probes on biological chips |
US5610287A (en) * | 1993-12-06 | 1997-03-11 | Molecular Tool, Inc. | Method for immobilizing nucleic acid molecules |
US5578832A (en) * | 1994-09-02 | 1996-11-26 | Affymetrix, Inc. | Method and apparatus for imaging a sample on a device |
EP0743989B1 (en) * | 1994-02-14 | 2007-03-21 | Smithkline Beecham Corporation | Methed of identifying differentially expressed genes |
US6015880A (en) * | 1994-03-16 | 2000-01-18 | California Institute Of Technology | Method and substrate for performing multiple sequential reactions on a matrix |
US5807522A (en) * | 1994-06-17 | 1998-09-15 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods for fabricating microarrays of biological samples |
US5556752A (en) * | 1994-10-24 | 1996-09-17 | Affymetrix, Inc. | Surface-bound, unimolecular, double-stranded DNA |
US5795716A (en) * | 1994-10-21 | 1998-08-18 | Chee; Mark S. | Computer-aided visualization and analysis system for sequence evaluation |
US6974666B1 (en) * | 1994-10-21 | 2005-12-13 | Appymetric, Inc. | Methods of enzymatic discrimination enhancement and surface-bound double-stranded DNA |
US5830645A (en) * | 1994-12-09 | 1998-11-03 | The Regents Of The University Of California | Comparative fluorescence hybridization to nucleic acid arrays |
US5545531A (en) * | 1995-06-07 | 1996-08-13 | Affymax Technologies N.V. | Methods for making a device for concurrently processing multiple biological chip assays |
-
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