TWI697500B - 針對lag-3之抗體分子及其用途 - Google Patents
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Abstract
本發明揭示特異性結合至LAG-3之抗體分子。該等抗LAG-3抗體分子可用於治療、預防及/或診斷癌性或傳染性病症。
Description
本申請案主張於2014年3月14日提出申請之美國臨時申請案第61/953,536號、於2014年10月3日提出申請之美國臨時申請案第62/059,690號及於2014年12月19日提出申請之美國臨時申請案第62/094,889號的權益,上文所提及申請案之內容之全文皆以引用方式併入本文中。
本申請案含有以ASCII格式以電子方式提交之序列表且其全文以引用方式併入本文中。該ASCII拷貝在2015年3月10日創建,命名為C2160-7001WO_SL.txt且大小為258,890個位元組。
淋巴球活化基因-3或LAG-3(亦稱為CD223)係免疫球蛋白超基因家族之成員,且在以下細胞上表現:經活化T細胞(Huard等人(1994)Immunogenetics 39:213)、NK細胞(Triebel等人(1990)J.Exp.Med.171:1393-1405)、調控T細胞(Huang等人(2004)Immunity 21:503-513;Camisaschi等人(2010)J Immunol.184:6545-6551;Gagliani等人(2013)Nat Med 19:739-746)及漿細胞樣樹突狀細胞(DC)(Workman等人(2009)J Immunol 182:1885-1891)。LAG-3係由位於染色體12上之基因編碼之膜蛋白,且在結構上及遺傳上與CD4相關。
與CD4相似,LAG-3可與細胞表面上之II類MHC分子相互作用
(Baixeras等人(1992)J.Exp.Med.176:327-337;Huard等人(1996)Eur.J.Immunol.26:1180-1186)。已表明,LAG-3與II類MHC之直接結合在下調CD4+ T淋巴球之抗原依賴性刺激中起作用(Huard等人(1994)Eur.J.Immunol.24:3216-3221),且亦已顯示在腫瘤或自身抗原(Gross等人(2007)J Clin Invest.117:3383-3392)及病毒模型(Blackburn等人(2009)Nat.Immunol.10:29-37)二者中阻斷LAG-3會使CD8+淋巴球複生。此外,LAG-3之細胞質內區域可與LAP(LAG-3相關蛋白)相互作用,LAP係參與下調CD3/TCR活化路徑之信號轉導分子(Iouzalen等人(2001)Eur.J.Immunol.31:2885-2891)。此外已顯示,CD4+CD25+調控T細胞(T調控)在活化後表現LAG-3,此有助於T調控細胞之阻抑活性(Huang,C.等人(2004)Immunity 21:503-513)。在T細胞依賴性及非依賴性機制二者中,LAG-3亦可藉助T調控細胞負調控T細胞穩態(Workman,C.J.及Vignali,D.A.(2005)J.Immunol.174:688-695)。
鑒於LAG-3在下調免疫反應中之重要性,業內需要研發出調節其活性以活化免疫系統之新穎藥劑。該等藥劑可用於例如癌症免疫療法及治療其他病況,例如慢性感染。
本文揭示以高親和力及特異性結合至淋巴球活化基因-3(LAG-3)之抗體分子(例如,人類化抗體分子)。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括框架區(例如,FW1、FW2、FW3及/或FW4)之新穎組合,例如重鏈框架區及/或輕鏈框架區之新穎組合。亦提供編碼抗體分子之核酸分子、表現載體、宿主細胞及製備該等抗體分子之方法。亦提供免疫偶聯物、多特異性或雙特異性抗體分子及包含該等抗體分子之醫藥組合物。本文所揭示之抗LAG-3抗體分子可用於(單獨或與其他藥劑或治療模式組合)治療、預防及/或診斷癌性病症(例如,實體及軟組織腫瘤)以及傳染病。因此,本文揭示使用抗LAG-3抗體分子檢測
LAG-3之組合物及方法以及治療各種病症(包括癌症及/或傳染病)之方法。
因此,在一個態樣中,本發明之特徵在於抗體分子(例如,經分離或重組抗體分子),其具有以下性質中之一或多者:(i)以高親和力、例如以至少約107M-1、通常約108M-1、且更通常約109M-1至1010M-1或更強之親和力常數結合至LAG-3,例如人類LAG-3;(ii)以小於以下之KD結合至LAG-3、例如LAG-3-CHO轉染子:5nM、4nM、3nM、2nM、1nM,例如1nM至3nM(例如,約1.92nM或約2.3nM);(iii)實質上不與CD4結合;(iv)抑制LAG-3與II類主要組織相容性(MHC)分子之結合,例如顯示約1nM至20nM、5nM至15nM、例如5.5nM之IC50;(v)結合至LAG-3(例如,人類LAG-3)之D1結構域,例如結合至D1結構域,但不與D1結構域之外環區域結合;(vi)調節(例如,刺激、增強或恢復)免疫反應,例如抗原特異性T細胞反應或抗腫瘤反應;(vii)特異性結合至LAG-3上之表位,例如與鼠類單株抗體BAP050或嵌合抗體BAP050-chi所識別之表位相同或相似之表位;(viii)結合至LAG-3上與抗體BMS-986016所識別之表位不同之表位;(ix)顯示與以下各項中之任一者相同或相似之結合親和力或特異性或二者皆有:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-
hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;(x)顯示與表1中所述之抗體分子(例如,重鏈可變區及輕鏈可變區)相同或相似之結合親和力或特異性或二者皆有;(xi)顯示與具有表1中所顯示胺基酸序列之抗體分子(例如,重鏈可變區及輕鏈可變區)相同或相似之結合親和力或特異性或二者皆有;(xii)顯示與由表1中所顯示之核苷酸序列編碼之抗體分子(例如,重鏈可變區及輕鏈可變區)相同或相似之結合親和力或特異性或二者皆有;(xiii)抑制、例如競爭性抑制第二抗體分子與LAG-3之結合,其中第二抗體分子係本文所述之抗體分子,例如選自以下各項中之任一者之抗體分子:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、
BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;(xiv)與針對LAG-3之第二抗體分子結合相同或重疊之表位,其中第二抗體分子係本文所述之抗體分子,例如選自以下各項中之任一者之抗體分子:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;(xv)與針對LAG-3之第二抗體分子競爭結合及/或與針對LAG-3之第二抗體分子結合相同表位,例如如藉由Biacore方法、FACS方法
或二者所量測,其中第二抗體分子係本文所述之抗體分子,例如選自以下各項中之任一者之抗體分子:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;(xvi)具有本文所述抗體分子、例如選自以下各項中之任一者之抗體分子的一或多種生物性質:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-
hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;(xvii)具有本文所述抗體分子、例如選自以下各項中之任一者之抗體分子的一或多種藥物動力學性質:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或(xviii)抑制LAG-3之一或多種活性,例如引起以下中之一或多者:增加CD4+ T淋巴球之抗原依賴性刺激;增加T細胞增殖;增加活化抗原(例如CD25)之表現;增加細胞介素(例如干擾素-γ(IFN-γ)、介白素-2(IL-2)或介白素-4(IL-4))之表現;增加趨化介素(例如CCL3、CCL4或CCL5)之表現;降低T調控細胞之阻抑活性;增加T細胞穩態;增加腫瘤浸潤淋巴球;或減少癌細胞之免疫逃避。
如本文所用之「huBAP050(Ser)」係指在重鏈框架區3(VHFW3)
之位置84處具有Cys至Ser取代之人類化BAP050抗體分子,例如本文所述之任一人類化BAP050抗體分子,例如如表1中所述。在一些實施例中,huBAP050(Ser)抗體分子選自BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子以高親和力、例如以約等於鼠類或嵌合抗LAG-3抗體分子、例如本文所述鼠類或嵌合抗LAG-3抗體分子之KD或比其高或低至少約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%或90%的解離平衡常數(KD)結合至LAG-3。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子以小於以下之KD結合至LAG-3、例如LAG-3-CHO轉染子:5nM、4nM、3nM、2nM,例如1nM至3nM(例如,約1.92nM或約2.3nM)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子之表現量約等於、高於或低於鼠類或嵌合抗體分子、例如本文所述鼠類或嵌合抗LAG-3抗體分子之表現量,例如係該表現量之至少約0.5倍、1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍或10倍,或係其至少約1/0.5、1、1/2、1/3、1/4、1/5、1/6、1/7、1/8、1/9或1/10。在一些實施例中,抗體分子係在CHO細胞中表現。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子降低一或多種LAG-3相關活性,且IC50(50%抑制時之濃度)約等於、高於或低於鼠類或嵌合抗LAG-3抗體分子、例如本文所述鼠類或嵌合抗LAG-3抗體分子之IC50,例如比該IC50高或低至少約10%、20%、30%、40%、50%、
60%、70%、80%或90%。在一些實施例中,LAG-3相關活性係II類MHC分子與LAG-3之結合。在一些實施例中,LAG-3相關活性係L-SECtin與LAG-3之結合。在一個實施例中,抗LAG-3抗體之IC50為約1nM至20nM、5nM至15nM、5.5nM(例如,藉由抑制II類MHC或L-SECtin結合所檢測)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子具有與鼠類或嵌合抗LAG-3抗體分子、例如本文所述之鼠類或嵌合抗LAG-3抗體分子大致相同或改良之活體內或活體外穩定性,例如至少約0.5倍、1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍或10倍更穩定。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係人類化抗體分子,且基於T細胞表位分析具有800至1200、850至1150、900至1100、950至1050之風險評分或如本文所述之風險評分。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含至少一個來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的抗原結合區域,例如可變區或其抗原結合片段:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、
BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或如表1中所述,或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含至少一個、兩個、三個或四個來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的可變區:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或如表1中所述,或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列。在一個實施例中,抗體分子包括重鏈框架區3(VHFW3)(例如,如表1及2中所顯示)中之取代(例如,位置84處之Cys至Ser取代)。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含至少一個或兩個來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的重鏈可變區:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、
BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或如表1中所述,或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含至少一個或兩個來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的輕鏈可變區:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、
BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或如表1中所述,或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括IgG4、例如人類IgG4之重鏈恆定區。在一個實施例中,人類IgG4包括根據EU編號位置228處之取代(例如,Ser至Pro取代)。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括IgG1、例如人類IgG1之重鏈恆定區。在一個實施例中,人類IgG1包括根據EU編號位置297處之取代(例如,Asn至Ala取代)。在一個實施例中,人類IgG1包括根據EU編號位置265處之取代、根據EU編號位置329處之取代或二者(例如,根據EU編號位置265處之Asp至Ala取代及/或根據EU編號位置329處之Pro至Ala取代)。在一個實施例中,人類IgG1包括根據EU編號位置234處之取代、根據EU編號位置235處之取代或二者(例如,根據EU編號位置234處之Leu至Ala取代及/或根據EU編號位置235處之Leu至Ala取代)。在一個實施例中,重鏈恆定區包含表3中所陳述之胺基序列或與其實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)之序列。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括κ輕鏈恆定區,例如人類κ輕鏈恆定區。在一個實施例中,輕鏈恆定區包含表3中所陳述之胺基序列或與其實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)之序列。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括IgG4、例如人類IgG4
之重鏈恆定區及κ輕鏈恆定區(例如人類κ輕鏈恆定區),例如包含表3中所陳述之胺基序列或與其實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)之序列的重鏈及輕鏈恆定區。在一個實施例中,恆定區係突變的IgG4,例如突變的人類IgG4(例如,具有根據EU編號之位置228處之突變(例如,S228P突變)。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括IgG1、例如人類IgG1之重鏈恆定區及κ輕鏈恆定區(例如人類κ輕鏈恆定區),例如包含表3中所陳述之胺基序列或與其實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)之序列的重鏈及輕鏈恆定區。在一個實施例中,人類IgG1包括根據EU編號位置297處之取代(例如,Asn至Ala取代)。在一個實施例中,人類IgG1包括根據EU編號位置265處之取代、根據EU編號位置329處之取代或二者(例如,根據EU編號位置265處之Asp至Ala取代及/或根據EU編號位置329處之Pro至Ala取代)。在一個實施例中,人類IgG1包括根據EU編號位置234處之取代、根據EU編號位置235處之取代或二者(例如,根據EU編號位置234處之Leu至Ala取代及/或根據EU編號位置235處之Leu至Ala取代)。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括包含以下各項之胺基酸序列之重鏈可變結構域及恆定區、輕鏈可變結構域及恆定區或二者:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、
BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或如表1中所述,或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列。抗LAG-3抗體分子視情況包含來自重鏈、輕鏈或二者之前導序列,如表4中所顯示;或與其實質上一致之序列。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括至少一個、兩個或三個來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體之重鏈可變區的互補決定區(CDR):BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或如表1中所述;或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序
列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列;或相對於表1中所顯示之一個、兩個或三個CDR,具有至少一個胺基酸變化、但不超過兩個、三個或四個變化(例如,取代、缺失或插入,例如保守取代)者。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括來自包含表1中所顯示之胺基酸序列或由表1中所顯示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列的重鏈可變區之至少一個、兩個或三個CDR(或全部所有CDR)。在一個實施例中,相對於表1中所顯示之胺基酸序列或由表1中所顯示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列,一或多個CDR(或全部所有CDR)具有一個、兩個、三個、四個、五個、六個或更多個變化,例如胺基酸取代或缺失。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括至少一個、兩個或三個來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體之輕鏈可變區的互補決定區(CDR):BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-
J;或如表1中所述;或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列;或相對於表1中所顯示之一個、兩個或三個CDR,具有至少一個胺基酸變化、但不超過兩個、三個或四個變化(例如,取代、缺失或插入,例如保守取代)者。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括來自包含表1中所顯示之胺基酸序列或由表1中所顯示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列的輕鏈可變區之至少一個、兩個或三個CDR(或全部所有CDR)。在一個實施例中,相對於表1中所顯示之胺基酸或由表1中所顯示之核苷酸序列編碼之胺基酸,一或多個CDR(或全部所有CDR)具有一個、兩個、三個、四個、五個、六個或更多個變化,例如胺基酸取代或缺失。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括來自包含表1中所顯示之胺基酸或由表1中所顯示之核苷酸序列編碼之胺基酸的重鏈及輕鏈可變區之至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個CDR(或全部所有CDR)。在一個實施例中,相對於表1中所顯示之胺基酸或由表1中所顯示之核苷酸序列編碼之胺基酸,一或多個CDR(或全部所有CDR)具有一個、兩個、三個、四個、五個、六個或更多個變化,例如胺基酸取代或缺失;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列;或相對於表1中所顯示之一個、兩個、三個、四個、五個或六個CDR,具有至少一個胺基酸變化、但不超過兩個、三個或四個變化(例如,取代、缺失或插入,例如保守取代)者。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括來自包含表1中所顯示之胺基酸序列或由表1中所顯示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列的重鏈及輕鏈可變區之至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個CDR(或全部所有CDR)。在一個實施例中,相對於表1中所顯示之胺基酸
序列或由表1中所顯示之核苷酸序列編碼之胺基酸序列,一或多個CDR(或全部所有CDR)具有一個、兩個、三個、四個、五個、六個或更多個變化,例如胺基酸取代或缺失。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的所有六個CDR:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或如表1中所述,或由表1中之核苷酸序列編碼,或密切相關之CDR,例如相對於表1中所顯示之一個、兩個、三個、四個、五個或六個CDR一致或具有至少一個胺基酸變化、但不超過兩個、三個或四個變化(例如,取代、缺失或插入,例如保守取代)之CDR。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子可包括本文所述之任一CDR。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括至少一個、兩個或三個根據Kabat之CDR(例如,至少一個、兩個或三個根據Kabat定義之CDR,如表1中所述),該等CDR來自本文所述抗體、例如選自以下中
之任一者之抗體的重鏈可變區:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J,或如表1中所述;或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列;或相對於表1中所顯示之一個、兩個或三個根據Kabat之CDR,具有至少一個胺基酸變化、但不超過兩個、三個或四個變化(例如,取代、缺失或插入,例如保守取代)者。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括至少一個、兩個或三個根據Kabat之CDR(例如,至少一個、兩個或三個根據Kabat定義之CDR,如表1中所述),該等CDR來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的輕鏈可變區:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、
BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或如表1中所述;或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列;或相對於表1中所顯示之一個、兩個或三個根據Kabat之CDR,具有至少一個胺基酸變化、但不超過兩個、三個或四個變化(例如,取代、缺失或插入,例如保守取代)者。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個根據Kabat之CDR(例如,至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個根據Kabat定義之CDR,如表1中所述),該等CDR來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的重鏈及輕鏈可變區:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、
BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或如表1中所述;或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列;或相對於表1中所顯示之至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個根據Kabat等人之CDR,具有至少一個胺基酸變化、但不超過兩個、三個或四個變化(例如,取代、缺失或插入,例如保守取代)者。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子可包括本文所述之任一CDR。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括所有六個根據Kabat之CDR(例如,所有六個根據Kabat定義之CDR,如表1中所述),該等CDR來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的重鏈及輕鏈可變區:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、
BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或如表1中所述;或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列;或相對於表1中所顯示之所有六個根據Kabat等人之CDR,具有至少一個胺基酸變化、但不超過兩個、三個或四個變化(例如,取代、缺失或插入,例如保守取代)者。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子可包括本文所述之任一CDR。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括至少一個、兩個或三個根據Chothia之超變環(例如,至少一個、兩個或三個根據Chothia定義之超變環,如表1中所述),該等超變環來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的重鏈可變區:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J(例如,至少一個、兩個或三個根據Chothia定義之超變環,如表1中所述);或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、
98%、99%或更高一致)的序列;或相對於表1中所顯示之一個、兩個或三個根據Chothia之超變環,具有至少一個胺基酸變化、但不超過兩個、三個或四個變化(例如,取代、缺失或插入,例如保守取代)者。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括至少一個、兩個或三個根據Chothia之超變環(例如,至少一個、兩個或三個根據Chothia定義之CDR,如表1中所述),該等超變環來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的輕鏈可變區:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列;或相對於表1中所顯示之一個、兩個或三個根據Chothia之超變環,具有至少一個胺基酸變化、但不超過兩個、三個或四個變化(例如,取代、缺失或插入,例如保守取代)者。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括至少一個、兩個、三
個、四個、五個或六個超變環(例如,至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個根據Chothia定義之超變環,如表1中所述),該等超變環來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的重鏈及輕鏈可變區:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或如表1中所述;或由表1中之核苷酸序列編碼;或至少來自接觸LAG-3之彼等超變環之胺基酸。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括表1之至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個Chothia超變環。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體之所有六個超變環(例如,所有六個根據Chothia定義之超變環,如表1中所述):BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-
hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J,或密切相關之超變環,例如相對於表1中所顯示之所有六個超變環一致或具有至少一個胺基酸變化、但不超過兩個、三個或四個變化(例如,取代、缺失或插入,例如保守取代)的超變環。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子可包括本文所述之任一超變環。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括至少一個、兩個或三個超變環,該等超變環具有與本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體之相應超變環相同的規範結構:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、
BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J,例如與本文所述抗體之重鏈及/或輕鏈可變結構域之至少環1及/或環2相同的規範結構。關於超變環規範結構之描述參見例如Chothia等人,(1992)J.Mol.Biol.227:799-817;Tomlinson等人,(1992)J.Mol.Biol.227:776-798。該等結構可藉由檢查該等參考文獻中所述之表來確定。
在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子包括根據Kabat等人及Chothia等人定義之CDR或超變環之組合。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括至少一個、兩個或三個根據Kabat及Chothia定義之CDR或超變環,該等CDR或超變環來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的重鏈可變區:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J(例如,至少一個、兩個或三個根據Kabat及Chothia定義之CDR或超變環,如表1中所述);或由表1
中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列;或相對於表1中所顯示之一個、兩個或三個根據Kabat及/或Chothia之CDR或超變環,具有至少一個胺基酸變化、但不超過兩個、三個或四個變化(例如,取代、缺失或插入,例如保守取代)者。
舉例而言,抗LAG-3抗體分子可包括根據Kabat等人之VH CDR1或根據Chothia等人之VH超變環1或其組合,例如如表1中所顯示。在一個實施例中,VH CDR1之Kabat及Chothia CDR之組合包含胺基酸序列GFTLTNYGMN(SEQ ID NO:286)或與其實質上一致之胺基酸序列(例如,具有至少一個胺基酸變化、但不超過兩個、三個或四個變化(例如,取代、缺失或插入,例如保守取代))。抗LAG-3抗體分子可進一步包括例如根據Kabat等人之VH CDR 2-3及根據Kabat等人之VL CDR 1-3,例如如表1中所顯示。因此,在一些實施例中,框架區係基於根據Kabat等人定義之CDR及根據Chothia等人定義之超變環的組合來定義。舉例而言,抗LAG-3抗體分子可包括基於根據Chothia等人之VH超變環1定義之VH FR1及基於根據Kabat等人之VH CDR 1-2定義的VH FR2,例如如表1中所顯示。抗LAG-3抗體分子可進一步包括例如基於根據至Kabat等人之VH CDR 2-3定義之VH FR 3-4及基於根據Kabat等人之VL CDR 1-3定義的VL FR 1-4。
抗LAG-3抗體分子可含有根據Kabat及Chothia定義之CDR或超變環之任一組合。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括至少一個、兩個或三個根據Kabat及Chothia定義之CDR,該等CDR來自本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的輕鏈可變區:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-
hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J(例如,至少一個、兩個或三個根據Kabat及Chothia定義之CDR,如表1中所述)。
在實施例、例如包含可變區、CDR(例如,CDR或Kabat CDR)或本文例如在表1中提及之其他序列的實施例中,抗體分子係單特異性抗體分子、雙特異性抗體分子,或係包含抗體之抗原結合片段(例如半抗體或半抗體之抗原結合片段)之抗體分子。在某些實施例中,抗體分子係具有針對LAG-3之第一結合特異性及針對PD-1、TIM-3、CEACAM(例如,CEACAM-1及/或CEACAM-5)、PD-L1或PD-L2之第二結合特異性的雙特異性抗體分子。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體包括:(i)重鏈可變區(VH),其包括選自SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:286之VHCDR1胺基酸序列;SEQ ID NO:2之VHCDR2胺基酸序列;及SEQ ID NO:3之VHCDR3胺基酸序列;及(ii)輕鏈可變區(VL),其包括SEQ ID NO:10之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO:11之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO:12之VLCDR3胺基酸序列。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括:
(i)重鏈可變區(VH),其包括選自SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:286之VHCDR1胺基酸序列;SEQ ID NO:5之VHCDR2胺基酸序列,及SEQ ID NO:3之VHCDR3胺基酸序列;及(ii)輕鏈可變區(VL),其包括SEQ ID NO:13之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO:14之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO:15之VLCDR3胺基酸序列。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含SEQ ID NO:1之VHCDR1胺基酸序列。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含SEQ ID NO:4之VHCDR1胺基酸序列。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含SEQ ID NO:286之VHCDR1胺基酸序列。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子之輕鏈或重鏈可變框架(例如,涵蓋至少FR1、FR2、FR3及視情況FR4之區域)可選自:(a)輕鏈或重鏈可變框架,其包括至少80%、85%、87%、90%、92%、93%、95%、97%、98%或較佳100%的來自人類輕鏈或重鏈可變框架之胺基酸殘基,例如來自人類成熟抗體、人類種系序列或人類共有序列之輕鏈或重鏈可變框架殘基;(b)輕鏈或重鏈可變框架,其包括20%至80%、40%至60%、60%至90%或70%至95%之來自人類輕鏈或重鏈可變框架之胺基酸殘基,例如來自人類成熟抗體、人類種系序列或人類共有序列之輕鏈或重鏈可變框架殘基;(c)非人類框架(例如,齧齒類動物框架);或(d)非人類框架,其已經修飾以例如移除抗原或細胞毒性決定子,例如去免疫化或部分人類化。在一個實施例中,輕鏈或重鏈可變框架區(具體而言FR1、FR2及/或FR3)包括與人類種系基因之VL或VH區段之框架至少70%、75%、80%、85%、87%、88%、90%、92%、94%、95%、96%、97%、98%、99%一致或一致的輕鏈或重鏈可變框架序列。
在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含具有BAP050-chi-HC之
胺基酸序列(例如整個可變區中FR區之胺基酸序列,例如圖9A-9B中所顯示)或SEQ ID NO:20或22的至少一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、十個、十五個、二十個或更多個變化(例如胺基酸取代或缺失)之重鏈可變結構域。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含具有BAP050-chi-HC之胺基酸序列(例如整個可變區中FR之胺基酸序列,例如圖9A-9B中所顯示)或SEQ ID NO:20或22的以下中之一或多者之重鏈可變結構域:位置1處之E、位置2處之V、位置9處之A、位置11處之V、位置16處之A、位置17處之S、位置18處之L、位置19處之R、位置20處之V、位置24處之V或G、位置37處之I、位置40處之A或S、位置41處之R或T、位置42處之S、位置43處之Q或R、位置44處之R、位置46處之E、位置48處之I或L、位置68處之V、位置69處之V或T、位置70處之I、位置72處之A、位置73處之D、位置74處之K、位置76處之V或I、位置80處之Y、位置83處之W、位置84處之C或S、位置85處之S或T、位置88處之A、位置89處之E或S、位置93處之V或M或位置95處之Y。在一個實施例中,抗體分子包括重鏈框架區3(VHFW3)(例如,如表2中所顯示)中之取代(例如,位置84處之Cys至Ser取代)。
或者,或在與本文所述BAP050-chi-HC之重鏈取代之組合中,抗LAG-3抗體分子包含具有BAP050-chi-LC之胺基酸序列(例如圖10A-10B中所顯示之胺基酸序列)或SEQ ID NO:24或26的至少一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、十個、十五個、二十個或更多個胺基酸變化(例如胺基酸取代或缺失)之輕鏈可變結構域。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含具有BAP050-chi-LC之胺基酸序列(例如圖10A-10B中所顯示之胺基酸序列)或SEQ ID NO:24或26的以下中之一或多者之重鏈可變結構域:位置1處之E或A、位置3處之V、位置4處之L、位置7處之S、位置8處之P、位置9處之A或L或D、位置10處
之T或F、位置11處之Q、位置12處之P、位置13處之V或L、位置14處之T、位置15處之V或P、位置16處之K、位置17處之Q或E、位置18處之T或P或K、位置19處之A、位置20處之S、位置21處之L、位置22處之T、位置37處之L、位置41處之G、位置42處之K或Q、位置43處之A或S、位置44處之P、位置45處之R或Q、位置46處之L、位置58處之I、位置60處之P或D、位置67處之Y、位置70處之E、位置71處之F、位置72處之T、位置73處之F、位置76處之N、位置77處之S或R、位置78處之I、位置79處之Q、位置80處之A或S或P、位置81處之D、位置83處之A或F、位置85處之Y或V或位置87處之F。
在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子包括一個、兩個、三個或四個重鏈框架區(例如,表2中所顯示之VHFW胺基酸或核苷酸序列,或由表2中所顯示之核苷酸序列編碼之VHFW胺基酸序列)或與其實質上一致之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失、例如保守取代之序列)。在一個實施例中,抗體分子包括重鏈框架區3(VHFW3)(例如,如表2中所顯示)中之取代(例如,位置84處之Cys至Ser取代)。
在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子包括一個、兩個、三個或四個輕鏈框架區(例如,表2中所顯示之VLFW胺基酸序列,或由表2中所顯示之核苷酸序列編碼之VLFW胺基酸序列)或與其實質上一致之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失、例如保守取代之序列)。
在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子包括一個、兩個、三個或四個重鏈框架區(例如,表2中所顯示之VHFW胺基酸序列,或由表2中所顯示之核苷酸序列編碼之VHFW胺基酸序列)或與其實質上一致之序列;及一個、兩個、三個或四個輕鏈框架區(例如,表2中所顯示之
VLFW胺基酸序列顯示,或由表2中所顯示之核苷酸序列編碼之VLFW胺基酸序列)或與其實質上一致之序列。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含以下各項之重鏈框架區1(VHFW1):BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser、BAP050-純系-F或BAP050-純系-G(例如,SEQ ID NO:187)。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之重鏈框架區1(VHFW1):BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、或BAP050-hum20、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系J(例如,SEQ ID NO:190)。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum16之重鏈框架區1(VHFW1)(例如,SEQ ID NO:194)。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum17之重鏈框架區1(VHFW1)(例如,SEQ ID NO:196)。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈框架區1(VHFW1),其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含以下各項之重鏈框架區2(VHFW2):BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、
BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum13、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G或BAP050-純系-J(例如,SEQ ID NO:198)。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之重鏈框架區2(VHFW2):BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum20、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum20-Ser或BAP050-純系-I(例如,SEQ ID NO:202)。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之重鏈框架區2(VHFW2):BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum14-Ser或BAP050-hum15-Ser(例如,SEQ ID NO:206)。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum16之重鏈框架區2(VHFW2)(例如,SEQ ID NO:208)。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈框架區2(VHFW2),其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含以下各項之重鏈框架區3(VHFW3):BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum18、BAP050-hum19或BAP050-hum20(例如,SEQ ID
NO:210)。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之重鏈框架區3(VHFW3):BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser、BAP050-hum20-Ser、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J(例如,SEQ ID NO:212)。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum16之重鏈框架區3(VHFW3)(例如,SEQ ID NO:217)。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum17之重鏈框架區3(VHFW3)(例如,SEQ ID NO:219)。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈框架區3(VHFW3),其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含以下各項之重鏈框架區4(VHFW4):BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19或BAP050-hum20、BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-
hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser、BAP050-hum20-Ser、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J(例如,SEQ ID NO:221)。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈框架區4(VHFW4),其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區1(VLFW1):BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum04、BAP050-hum07、BAP050-hum09、BAP050-hum11、BAP050-hum13、BAP050-hum17、BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J(例如,SEQ ID NO:226)。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區1(VLFW1):BAP050-hum03、BAP050-hum10、BAP050-hum14、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum10-Ser或BAP050-hum14-Ser(例如,SEQ ID NO:230)。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum05或BAP050-hum05-Ser之輕鏈框架區1(VLFW1)(例如,SEQ ID NO:232)。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區1(VLFW1):BAP050-hum06、BAP050-hum20、BAP050-hum06-Ser或BAP050-hum20-Ser(例如,SEQ ID NO:234)。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區1(VLFW1):BAP050-hum08、BAP050-hum12、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum19、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum15-Ser或
BAP050-hum19-Ser(例如,SEQ ID NO:236)。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum18或BAP050-hum18-Ser之輕鏈框架區1(VLFW1)(例如,SEQ ID NO:238)。在其他實施例中,抗體分子包含輕鏈框架區1(VLFW1),其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區2(VLFW2):BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum05、BAP050-hum09、BAP050-hum13、BAP050-hum17、BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum17-Ser、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J(例如,SEQ ID NO:240)。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區2(VLFW2):BAP050-hum03、BAP050-hum06、BAP050-hum08、BAP050-hum10、BAP050-hum12、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser(例如,SEQ ID NO:244)。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum04或BAP050-hum04-Ser之輕鏈框架區2(VLFW2)(例如,SEQ ID NO:246)。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區2(VLFW2):BAP050-hum07、BAP050-hum11、BAP050-hum07-Ser或BAP050-hum11-Ser(例如,SEQ ID NO:248)。在其他實施例中,抗體分子包含輕鏈框架區2(VLFW2),其具
有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區3(VLFW3):BAP050-hum01、BAP050-hum03、BAP050-hum05、BAP050-hum10、BAP050-hum14、BAP050-hum19、BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-純系-F(例如,SEQ ID NO:252)。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區3(VLFW3):BAP050-hum02、BAP050-hum09、BAP050-hum13、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H或BAP050-純系-J(例如,SEQ ID NO:255)。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum04或BAP050-hum04-Ser之輕鏈框架區3(VLFW3)(例如,SEQ ID NO:259)。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區3(VLFW3):BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum11、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum11-Ser或BAP050-純系-I(例如,SEQ ID NO:261)。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區3(VLFW3):BAP050-hum08、BAP050-hum12、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum18、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum15-Ser或BAP050-hum18-Ser(例如,SEQ ID NO:265)。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum17之輕鏈框架區3(VLFW3)(例如,SEQ ID NO:267)。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum20或BAP050-hum20-Ser之輕鏈框架區3(VLFW3)(例如,SEQ ID NO:269)。在其他實施例中,抗體分子包含輕鏈框架區3(VHLW3),其具有如下序列或
由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區4(VLFW4):BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser、BAP050-hum20-Ser、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J(例如,SEQ ID NO:271)。在其他實施例中,抗體分子包含輕鏈框架區4(VLFW4),其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含以下各項之重鏈框架區1-3:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum18、BAP050-hum19(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3))。
在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum20之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:202(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum13之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum14或BAP050-hum15之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:206(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum16之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:194(VHFW1)、SEQ ID NO:208(VHFW2)及SEQ ID NO:217(VHFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum17之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:196(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:219(VHFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之重鏈框架區1-3:BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser、BAP050-純系-F或BAP050-純系-G(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之重鏈框架區1-3:BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum20-Ser、BAP050-純系-H或BAP050-純系I(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:202(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum13-Ser或BAP050-純系-J之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:212
(VHFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum14-Ser或BAP050-hum15-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:206(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3))。在一些實施例中,抗體分子進一步包含以下各項之重鏈框架區4:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J(例如,SEQ ID NO:221)。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum01、BAP050-hum01-Ser或BAP050-純系-F之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:226(VLFW1)、SEQ ID NO:240(VLFW2)及SEQ ID NO:252(VLFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區1-3:BAP050-hum02、BAP050-hum09、BAP050-hum13、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H或BAP050-純系-J(例如,SEQ ID NO:226(VLFW1)、SEQ ID NO:240(VLFW2)及SEQ ID NO:255(VLFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區1-3:BAP050-
hum03、BAP050-hum10、BAP050-hum14、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum10-Ser或BAP050-hum14-Ser(例如,SEQ ID NO:230(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:252(VLFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum04或BAP050-hum04-Ser之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:226(VLFW1)、SEQ ID NO:246(VLFW2)及SEQ ID NO:259(VLFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum05或BAP050-hum05-Ser之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:232(VLFW1)、SEQ ID NO:240(VLFW2)及SEQ ID NO:252(VLFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum06或BAP050-hum06-Ser之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:234(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:261(VLFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum07、BAP050-hum11、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum11-Ser或BAP050-純系-I之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:226(VLFW1)、SEQ ID NO:248(VLFW2)及SEQ ID NO:261(VLFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含以下各項之輕鏈框架區1-3:BAP050-hum08、BAP050-hum12、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum12-Ser或BAP050-hum15-Ser(例如,SEQ ID NO:236(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:265(VLFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum17之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:226(VLFW1)、SEQ ID NO:240(VLFW2)及SEQ ID NO:267(VLFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum18或BAP050-hum18-Ser之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:238(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:265(VLFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum19或BAP050-hum19-Ser之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:236(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:
252(VLFW3))。在一些實施例中,抗體分子包含BAP050-hum20或BAP050-hum20-Ser之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:234(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:269(VLFW3))。在一些實施例中,抗體分子進一步包含以下各項之重鏈框架區4:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser、BAP050-hum20-Ser、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J(例如,SEQ ID NO:271)。在其他實施例中,抗體分子包含輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum01之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum01-Ser或BAP050-純系-F之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-
hum01、BAP050-hum01-Ser或BAP050-純系-F之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:226(VLFW1)、SEQ ID NO:240(VLFW2)及SEQ ID NO:252(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum02之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum02-Ser或BAP050-純系-G之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum02、BAP050-hum02-Ser或BAP050-純系-G之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:226(VLFW1)、SEQ ID NO:240(VLFW2)及SEQ ID NO:255(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum03之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum03-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum03之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:230(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:252(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)
及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum04之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum04-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum04之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:226(VLFW1)、SEQ ID NO:246(VLFW2)及SEQ ID NO:259(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum05之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3))或BAP050-hum05-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum05或BAP050-hum05-Ser之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:232(VLFW1)、SEQ ID NO:240(VLFW2)及SEQ ID NO:252(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum06之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198
(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum06-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum06之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:234(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:261(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum07之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum07-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum07之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:226(VLFW1)、SEQ ID NO:248(VLFW2)及SEQ ID NO:261(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum08之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum08-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum08之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:236(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)
及SEQ ID NO:265(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum09之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:202(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum09-Ser或BAP050-純系-H之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:202(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum09、BAP050-hum09-Ser或BAP050-純系-H之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:226(VLFW1)、SEQ ID NO:240(VLFW2)及SEQ ID NO:255(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum10之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:202(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum10-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:202(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum10之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:230(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:252(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取
代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum11之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:202(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum11-Ser或BAP050-純系-I之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:202(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum11、BAP050-hum11-Ser或BAP050-純系-I之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:226(VLFW1)、SEQ ID NO:248(VLFW2)及SEQ ID NO:261(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum12之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:202(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3))或BAP050-hum12-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:202(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum12或BAP050-hum12-Ser之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:236(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:265(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum13之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum13-Ser或
BAP050-純系-J之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum13、BAP050-hum13-Ser或BAP050-純系-J之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:226(VLFW1)、SEQ ID NO:240(VLFW2)及SEQ ID NO:255(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum14之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:206(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum14-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:206(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3));及BAP050-hum14之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:230(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:252(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum15之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:206(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum15-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:206(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3));及BAP050-hum15之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:236(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:265(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈
及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum16之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:194(VHFW1)、SEQ ID NO:208(VHFW2)及SEQ ID NO:217(VHFW3));及BAP050-hum16之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:236(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:265(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum17之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:196(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:219(VHFW3));及BAP050-hum17之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:226(VLFW1)、SEQ ID NO:240(VLFW2)及SEQ ID NO:267(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum18之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum18-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198
(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum18之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:238(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:265(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum19之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum18-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:187(VHFW1)、SEQ ID NO:198(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum19之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:236(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:252(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含BAP050-hum20之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:202(VHFW2)及SEQ ID NO:210(VHFW3)),或BAP050-hum20-Ser之重鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:190(VHFW1)、SEQ ID NO:202(VHFW2)及SEQ ID NO:212(VHFW3));及BAP050-hum20之輕鏈框架區1-3(例如,SEQ ID NO:234(VLFW1)、SEQ ID NO:244(VLFW2)及SEQ ID NO:269(VLFW3))。在其他實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈框架區,其具有如下序列或由如下序列編碼:與任一上述序列
實質上一致(例如,至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列)及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失(例如保守取代)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含具有如圖4或6中所顯示之框架區FW1、FW2及FW3之組合之重鏈框架區。在其他實施例中,抗體分子包含具有如圖4或6中所顯示之框架區FW1、FW2及FW3之組合之輕鏈框架區。在其他實施例中,抗體分子包含具有如圖4或6中所顯示之框架區FW1、FW2及FW3之組合的重鏈框架區,及具有如圖4或6中所顯示之框架區FW1、FW2及FW3之組合的輕鏈框架區。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子之重鏈或輕鏈可變結構域或二者包括以下胺基酸序列:其與本文所揭示之胺基酸實質上一致,例如與本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體之可變區至少70%、75%、80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J;或如表1中所述,或由表1中之核苷酸序列編碼;或與本文所述抗體之可變區相差至少1或5個殘基、但少於40個、30個、20個或10個殘基者。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子之重鏈或輕鏈可變區或二者
包括由本文所述之核酸序列或例如在低嚴格度、中嚴格度或高嚴格度或本文所述之其他雜交條件下與本文所述之核酸序列(例如,特定核酸序列或編碼本文所述胺基酸序列之核酸序列,例如如表1及2中所顯示)雜交之核酸或其補體編碼的胺基酸序列。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含至少一個、兩個、三個或四個抗原結合區域,例如可變區,其具有如表1中所陳述之胺基酸序列或與其實質上一致之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列,或與表1中所顯示之序列相差不超過1個、2個、5個、10個或15個胺基酸殘基者)。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包括由核酸編碼之VH及/或VL結構域,該核酸具有如表1中所陳述之核苷酸序列或與其實質上一致之序列(例如,與其至少約70%、75%、85%、90%、95%、99%或更高一致之序列,或與表1中所顯示之序列相差不超過3個、6個、15個、30個或45個核苷酸者)。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含至少一個、兩個或三個來自重鏈可變區之CDR,該重鏈可變區具有如表1中所陳述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失、例如保守取代之序列)。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含至少一個、兩個或三個來自輕鏈可變區之CDR,該輕鏈可變區具有如表1中所陳述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失、例如保守取代之序列)。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個來自重鏈及輕鏈可變區之CDR,該等重鏈及輕鏈可變區具有如表1中所陳述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如,
與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失、例如保守取代之序列)。在一個實施例中,至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個CDR係根據Kabat來定義,例如如表1中所顯示。在另一個實施例中,至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個CDR係根據Chothia來定義,例如如表1中所顯示。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含至少一個、兩個或三個來自重鏈可變區之CDR及/或超變環,該重鏈可變區具有本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的胺基酸序列:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J,如表1中所概述,或與其實質上一致之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失、例如保守取代之序列)。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含至少一個、兩個或三個來自輕鏈可變區之CDR,該輕鏈可變區具有本文所述抗體、例如選自以下中之任一者之抗體的胺基酸序列:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-
hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J,如表1中所概述,或與其實質上一致之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失、例如保守取代之序列)。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含本文所述、例如表1中所述之所有六個CDR及/或超變環。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子之可變區與本文所述之可變區(例如,本文所揭示之FR區)的序列一致,或相差1個、2個、3個或4個胺基酸。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係全抗體或其片段(例如,Fab、F(ab')2、Fv或單鏈Fv片段(scFv))。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係單株抗體或具有單一特異性之抗體。抗LAG-3抗體分子亦可係人類化、嵌合、駱駝、鯊魚或活體外產生之抗體分子。在一個實施例中,其抗LAG-3抗體分子係人類化抗體分子。抗LAG-3抗體分子之重鏈及輕鏈可為全長(例如,抗體可包括至少一條、且較佳兩條完整重鏈及至少一條、且較佳兩條完整輕鏈),或可包括抗原結合片段(例如,Fab、F(ab')2、Fv、單鏈Fv片段、單一結構域抗體、雙價抗體(dAb)、二價或雙特異性抗體或其片段、其單一結構域變體或駱駝科抗體)。
在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子呈雙特異性或多特異性抗體分子形式。在一個實施例中,雙特異性抗體分子具有針對LAG-3之第
一結合特異性及針對PD-1、TIM-3、CEACAM(例如,CEACAM-1及/或CEACAM-5)、PD-L1或PD-L2之第二結合特異性。在一個實施例中,雙特異性抗體分子結合至LAG-3及PD-1。在另一個實施例中,雙特異性抗體分子結合至LAG-3及TIM-3。在另一個實施例中,雙特異性抗體分子結合至LAG-3及CEACAM(例如,CEACAM-1及/或CEACAM-5)。在另一個實施例中,雙特異性抗體分子結合至LAG-3及CEACAM-1。在另一個實施例中,雙特異性抗體分子結合至LAG-3及CEACAM-5。在另一個實施例中,雙特異性抗體分子結合至LAG-3及PD-L1。在另一個實施例中,雙特異性抗體分子結合至LAG-3及PD-L2。可在多特異性抗體分子中製備上述分子之任一組合,例如包括針對LAG-3之第一結合特異性以及針對以下中之一或多者之第二及第三結合特異性的三特異性抗體:PD-1、TIM-3、CEACAM(例如,CEACAM-1或CEACAM-5)、PD-L1或PD-L2。
在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子係與包含以下中之一或多者之雙特異性分子組合使用:PD-1、TIM-3、CEACAM(例如,CEACAM-1或CEACAM-5)、PD-L1或PD-L2。在一個實施例中,以組合使用之雙特異性抗體分子結合至CEACAM(例如,CEACAM-1及/或CEACAM-5)及PD-1。在另一個實施例中,以組合使用之雙特異性抗體分子結合至CEACAM(例如,CEACAM-1及/或CEACAM-5)及TIM-3。在另一個實施例中,以組合使用之雙特異性抗體分子結合至PD-1及TIM-3。
在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子具有選自以下之重鏈恆定區(Fc):例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD及IgE之重鏈恆定區;具體而言例如IgG1、IgG2、IgG3及IgG4之重鏈恆定區,更具體而言IgG1、IgG2或IgG4(例如,人類IgG1、IgG2或IgG4)之重鏈恆定區。在一個實施例中,重鏈恆定區係人類IgG1或人類
IgG4。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子具有選自例如κ或λ、較佳κ(例如,人類κ)之輕鏈恆定區的輕鏈恆定區。在一個實施例中,恆定區經改變、例如經突變以改變抗LAG-3抗體分子之性質(例如,增加或減少以下中之一或多者:Fc受體結合、抗體糖基化、半胱胺酸殘基數、效應細胞功能或補體功能)。舉例而言,使恆定區之位置296(M至Y)、298(S至T)、300(T至E)、477(H至K)及478(N至F)突變以改變Fc受體結合(例如,突變位置對應於SEQ ID NO:212或214之位置132(M至Y)、134(S至T)、136(T至E)、313(H至K)及314(N至F);或SEQ ID NO:215、216、217或218之位置135(M至Y)、137(S至T)、139(T至E)、316(H至K)及317(N至F))。在另一個實施例中,使IgG4(例如人類IgG4)之重鏈恆定區之根據EU編號之位置228突變(例如,S至P),例如如表3中所顯示。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含根據EU編號之位置228突變(例如,S至P)之人類IgG4,例如如表3中所顯示;及κ輕鏈恆定區,例如如表3中所顯示。在另一個實施例中,使IgG1(例如人類IgG1)之重鏈恆定區之一或多個位置突變:根據EU編號之位置297(例如,N至A)、根據EU編號之位置265(例如,D至A)、根據EU編號之位置329(例如,P至A)、根據EU編號之位置234(例如,L至A)或根據EU編號之位置235(例如,L至A),例如如表3中所顯示。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含一或多個上述位置突變之人類IgG1,例如如表3中所顯示;及κ輕鏈恆定區,例如如表3中所顯示。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係經分離或重組抗體分子。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係人類化抗體分子。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子基於T細胞表位分析具有小於1200、1150、1100、1050、1000、950、900、850或800之風險評分。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係人類化抗體分子,且基於T細胞表位分析具有800至1200、850至1150、900至1100、950至1050之風險評分或如本文所述之風險評分。
本發明之特徵亦在於核酸分子,其包含一或多條編碼抗LAG-3抗體分子之重鏈及輕鏈可變區、CDR、超變環及/或框架區之核苷酸序列,如本文所述。在某些實施例中,編碼抗LAG-3抗體分子之核苷酸序列經密碼子最佳化。舉例而言,本發明之特徵在於分別編碼抗LAG-3抗體分子之重鏈及輕鏈可變區之第一及第二核酸,該抗體分子選自以下中之一或多者、例如任一者:BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J,如表1中所概述,或與其實質上一致之序列。舉例而言,核酸可包含如表1及2中所陳述之核苷酸序列或與其實質上一致之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列,或與表1及2中所顯示之序列相差不超過3個、6個、15個、30個或45個核苷酸者)。
在其他實施例中,核酸分子包含編碼包含BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J之胺基酸序列之重鏈可變結構域及重鏈恆定區的核苷酸序列;或如表1中所述,或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列。
在其他實施例中,核酸包含編碼包含BAP050-純系-F、BAP050-純系-G、BAP050-純系-H、BAP050-純系-I或BAP050-純系-J之胺基酸序列之輕鏈可變結構域及/或輕鏈恆定區的核苷酸序列;或如表1中所述,或由表1中之核苷酸序列編碼;或與任一上述序列實質上一致(例如,至少80%、85%、90%、92%、95%、97%、98%、99%或更高一致)的序列。
編碼抗LAG-3重鏈及輕鏈可變結構域及恆定區之上述核苷酸序列可存在於單獨核酸分子中或同一核酸分子中。在某些實施例中,核酸分子包含編碼前導序列、例如如表4中所顯示之前導序列之核苷酸序列或與其實質上一致之序列。
在某些實施例中,核酸分子包含編碼至少一個、兩個或三個來自重鏈可變區之CDR或超變環之核苷酸序列,該重鏈可變區具有如表1中所陳述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失、例如保守取代之序列)。
在另一個實施例中,核酸分子包含編碼至少一個、兩個或三個來自輕鏈可變區之CDR或超變環之核苷酸序列,該輕鏈可變區具有如表1中所陳述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失、例如保守取代之序列)。
在另一個實施例中,核酸分子可包含編碼至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個來自重鏈及輕鏈可變區之CDR或超變環之核苷酸序列,該等重鏈及輕鏈可變區具有如表1中所陳述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或具有一個、兩個、三個或更多個取代、插入或缺失、例如保守取代之序列)。
在一個實施例中,核酸分子包括編碼抗LAG-3抗體分子之核苷酸序列,該抗體分子包括重鏈框架區3(VHFW3)(例如,如表1及2中所顯示)中之取代(例如,位置84處之Cys至Ser取代)。
在另一個實施例中,核酸分子包括以下各項中之任一者之一或多個重鏈框架區(例如,以下中之任一者:VHFW1(a型)、VHFW1(b型)、VHFW1(c型)、VHFW1(d型)、VHFW2(a型)、VHFW2(b型)、VHFW2(c型)、VHFW2(d型)、VHFW3(a型)、VHFW3(a’型)、VHFW3(b型)、VHFW3(c型)或VHFW4或其任一組合,例如如本文所述之框架組合):BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP049-純系-F、
BAP049-純系-G、BAP049-純系-H、BAP049-純系-I或BAP049-純系-J,如表1及2中所概述,或與其實質上一致之序列。舉例而言,核酸分子可包含如表1及2中所陳述之核苷酸序列或與其實質上一致之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列,或與表1及2中所顯示之序列相差不超過3個、6個、15個、30個或45個核苷酸者)。
在另一個實施例中,核酸分子包括以下各項中之任一者之一或多個輕鏈框架區(例如,以下中之任一者:VLFW1(a型)、VLFW1(b型)、VLFW1(c型)、VLFW1(d型)、VLFW1(e型)、VLFW1(f型)、VLFW2(a型)、VLFW2(b型)、VLFW2(c型)、VLFW2(d型)、VLFW3(a型)、VLFW3(b型)、VLFW3(c型)、VLFW3(d型)、VLFW3(e型)、VLFW3(f型)、VLFW3(g型)或VLFW4或其任一組合,例如框架組合如本文所述):BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum03、BAP050-hum04、BAP050-hum05、BAP050-hum06、BAP050-hum07、BAP050-hum08、BAP050-hum09、BAP050-hum10、BAP050-hum11、BAP050-hum12、BAP050-hum13、BAP050-hum14、BAP050-hum15、BAP050-hum16、BAP050-hum17、BAP050-hum18、BAP050-hum19、BAP050-hum20、huBAP050(Ser)(例如,BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum03-Ser、BAP050-hum04-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum06-Ser、BAP050-hum07-Ser、BAP050-hum08-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum10-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser、BAP050-hum13-Ser、BAP050-hum14-Ser、BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser、BAP050-hum19-Ser或BAP050-hum20-Ser)、BAP049-純系-F、BAP049-純系-G、BAP049-純系-H、BAP049-純系-I或BAP049-純系-J,如表1及2中所概述,或與其實質上一致之序列。舉例而言,核酸
分子可包含如表1及2中所陳述之核苷酸序列或與其實質上一致之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列,或與表1及2中所顯示之序列相差不超過3個、6個、15個、30個或45個核苷酸者)。
在另一個實施例中,核酸分子包括一或多個重鏈框架區及一或多個輕鏈框架區,如本文所述。重鏈及輕鏈框架區可存在於同一載體或單獨載體中。
在另一個態樣中,本申請案之特徵在於含有本文所述核酸之宿主細胞及載體。該等核酸可存在於同一宿主細胞或單獨宿主細胞中所存在之單一載體或單獨載體中。宿主細胞可係真核細胞(例如哺乳動物細胞、昆蟲細胞、酵母細胞)或原核細胞(例如大腸桿菌(E.coli))。舉例而言,哺乳動物細胞可係經培養細胞或細胞系。實例性哺乳動物細胞包括淋巴球性細胞系(例如,NSO)、中國倉鼠卵巢細胞(CHO)、人類Per C6細胞系(例如,來自Crucell之PER C6細胞)、COS細胞、卵母細胞及來自轉基因動物之細胞(例如乳腺上皮細胞)。
在一個態樣中,本發明之特徵在於提供本文所述抗體分子之方法。該方法包括:提供LAG-3抗原(例如,包含LAG-3表位之至少一部分之抗原);獲得特異性結合至LAG-3多肽之抗體分子;及評估抗體分子是否特異性結合至LAG-3多肽,或評估抗體分子在調節、例如抑制LAG-3之活性方面的效能。該方法可進一步包括向個體(例如人類或非人類動物)投與該抗體分子。
在另一個態樣中,本發明提供組合物(例如醫藥組合物),其包括醫藥上可接受之載劑、賦形劑或穩定劑及至少一種本文所述之抗LAG3抗體分子。在一個實施例中,組合物(例如醫藥組合物)包括抗LAG-3抗體分子及一或多種藥劑(例如治療劑或其他抗體分子)之組合,如本文所述。在一個實施例中,抗體分子偶聯至標記或治療劑。
本文所揭示之抗體分子可抑制、降低或中和LAG-3之一或多種活性。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子引起以下各項中之一或多者:增加CD4+ T淋巴球或CD8+ T淋巴球之抗原依賴性刺激、增加T細胞增殖;增加活化抗原(例如CD25)之表現;增加細胞介素(例如干擾素-γ(IFN-γ)、介白素-2(IL-2)、介白素-4(IL-4)、趨化介素(C-C基序)配體3(CCL3)、趨化介素(C-C基序)配體4(CCL4)或趨化介素(C-C基序)配體5(CCL5))之表現;降低T調控細胞之阻抑活性、增加T細胞穩態、增加腫瘤浸潤淋巴球或減少癌細胞之免疫逃避。因此,該等抗體分子可單獨或組合用於治療或預防其中期望增強個體之免疫反應之病症。
因此,在另一個態樣中,提供調節個體之免疫反應之方法。該方法包含向個體單獨或與一或多種藥劑或程序組合投與本文所揭示之抗體分子(例如,治療有效量之抗LAG-3抗體分子),使得調節個體之免疫反應。在一個實施例中,抗體分子恢復、增強、刺激或增加個體之免疫反應。
個體可為哺乳動物、例如靈長類動物,較佳高等靈長類動物、例如人類(例如,患有或具有罹患本文所述病症之風險的患者)。在一個實施例中,個體需要增強免疫反應。在一些實施例中,在個體中,抗LAG-3抗體分子會恢復、增強或刺激抗原特異性T細胞反應,例如抗原特異性T細胞反應中之介白素-2(IL-2)或干擾素-γ(IFN-γ)產生。在一些實施例中,免疫反應係抗腫瘤反應。在一個實施例中,個體患有或具有罹患本文所述病症、例如如本文所述癌症或傳染性病症之風險。在某些實施例中,個體為免疫受損或具有免疫受損之風險。舉例而言,個體正經歷或已經歷化學治療性治療及/或輻射療法。或者或組合地,個體因感染而免疫受損或具有因感染而免疫受損之風險。
在一個態樣中,提供治療(例如,減輕、抑制或延遲進展中之一或多者)個體之癌症或腫瘤之方法。該方法包含向個體單獨(例如作為單一療法)或與例如一或多種藥劑或程序組合投與本文所述之抗LAG-3抗體分子,例如治療有效量之抗LAG-3抗體分子。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係與共刺激分子之調節劑(例如,共刺激分子之激動劑)或抑制分子之調節劑(例如,免疫檢查點抑制劑之抑制劑)組合投與,例如如本文所述。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與免疫檢查點調節劑之抑制劑或活化劑(例如,PD-1抑制劑(例如,抗PD-1抗體分子)、PD-L1抑制劑(例如,抗PD-L1抗體分子)、TIM-3調節劑(例如,TIM-3活化劑或抑制劑,例如抗TIM-3抗體分子)或CTLA-4抑制劑(例如,抗CTLA4抗體))組合投與。
在某些實施例中,使用抗LAG-3抗體分子單獨或組合治療之癌症包括(但不限於)實體腫瘤、血液癌症(例如,白血病、淋巴瘤、骨髓瘤)及其轉移性病灶。在一個實施例中,癌症係實體腫瘤。實體腫瘤之實例包括各個器官系統之惡性病,例如肉瘤及癌(例如,腺癌),例如侵襲肺、乳房、淋巴、胃腸或結腸直腸、生殖器及生殖泌尿道(例如,腎細胞、尿道上皮細胞、膀胱細胞)、咽、CNS(例如,腦、神經或膠質細胞)、皮膚(例如,黑色素瘤)、頭及頸(例如,頭及頸鱗狀細胞癌(HNCC))及胰臟之彼等。舉例而言,黑色素瘤、結腸癌、胃癌、直腸癌、腎細胞癌、乳癌(例如,不表現雌激素受體、孕甾酮受體或Her2/neu中之一者、兩者或所有之乳癌,例如三陰性乳癌)、肝癌、肺癌(例如,非小細胞肺癌(NSCLC)(例如,具有鱗狀及/或非鱗狀組織學之NSCLC)或小細胞肺癌)、前列腺癌、頭頸癌(例如,HPV+鱗狀細胞癌)、小腸癌及食道癌。血液癌症之實例包括(但不限於)白血病(例如,類骨髓性白血病、淋巴樣白血病或慢性淋巴球性白血病(CLL))、淋巴瘤(例如,霍奇金氏淋巴瘤(Hogdkin lymphoma,HL)、非霍奇金
氏淋巴瘤(NHL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、T細胞淋巴瘤或外套細胞淋巴瘤(MCL))及骨髓瘤(例如多發性骨髓瘤)。癌症可為早期、中期晚期或轉移性癌症。
在一些實施例中,癌症選自結腸直腸癌(例如,CRC)、黑色素瘤(例如晚期黑色素瘤(例如,II-IV期黑色素瘤)或HLA-A2陽性黑色素瘤);胰臟癌,例如晚期胰臟癌;乳癌,例如轉移性乳癌或三陰性乳癌;頭頸癌(例如,HNSCC);食道癌;腎細胞癌(RCC),例如透明腎細胞癌(ccRCC)或轉移性腎細胞癌(MRCC);肺癌(例如,NSCLC);子宮頸癌;膀胱癌;或血液惡性病,例如白血病(例如,淋巴球性白血病)或淋巴瘤(例如,霍奇金氏淋巴瘤(HL)、非霍奇金氏淋巴瘤(NHL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、外套細胞淋巴瘤(MCL)或CLL(例如復發性或難治性慢性淋巴球性白血病))。
在一個實施例中,癌症係不因應其他療法之晚期或不可切除性黑色素瘤。在其他實施例中,癌症係具有BRAF突變(例如,BRAF V600突變)之黑色素瘤。在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子呈單獨(例如,作為單一療法)或與一或多種第二藥劑(例如,BRAF抑制劑)組合之形式。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係在具或不具BRAF抑制劑(例如,威羅菲尼(vemurafenib)或達拉菲尼(dabrafenib))的情況下與免疫檢查點調節劑之抑制劑(例如,PD-1抑制劑、PD-L1抑制劑、TIM-3抑制劑、CEACAM(例如,CEACAM1及/或CEACAM5)抑制劑或CTLA4抑制劑(例如,抗CLA4抗體,例如伊匹單抗(ipilimumab)))組合投與(例如,在治療之前或之後或同時)來治療黑色素瘤。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與PD-1或PD-L1抑制劑(例如抗PD-1或抗PD-L1抗體分子)組合投與來治療黑色素瘤,如本文所述。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係單獨(例如作為單一療法)
或與免疫檢查點調節劑之抑制劑(例如,PD-1抑制劑(例如,抗PD-1抗體分子)、PD-L1抑制劑(例如,抗PD-L1抗體分子)、TIM-3抑制劑(例如,抗TIM-3抗體分子)、CEACAM(例如,CEACAM1及/或CEACAM5)抑制劑(例如,抗CEACAM抗體分子)或CTLA-4抑制劑(例如,抗CTLA4抗體)組合投與,來治療頭頸癌(例如,HNSCC)。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與PD-1或PD-L1抑制劑(例如抗PD-1或抗PD-L1抗體分子)組合投與來治療頭頸癌,如本文所述。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係單獨(例如作為單一療法)或與免疫檢查點調節劑之抑制劑或活化劑(例如,PD-1抑制劑(例如,抗PD-1抗體分子)、PD-L1抑制劑(例如,抗PD-L1抗體分子)、TIM-3調節劑(例如,TIM-3活化劑或抑制劑,例如抗TIM-3抗體分子)、CEACAM(例如,CEACAM1及/或CEACAM5)抑制劑(例如,抗CEACAM抗體分子)或CTLA-4抑制劑(例如,抗CTLA4抗體)組合投與,來治療肺癌(例如,NSCLC)。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與PD-1或PD-L1抑制劑(例如抗PD-1或抗PD-L1抗體分子)組合投與來治療肺癌(例如,NSCLC),如本文所述。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係單獨(例如作為單一療法)或與免疫檢查點調節劑之抑制劑(例如,PD-1抑制劑(例如,抗PD-1抗體分子)、PD-L1抑制劑(例如,抗PD-L1抗體分子)、TIM-3抑制劑(例如,抗TIM-3抗體分子)、CEACAM(例如,CEACAM1及/或CEACAM5)抑制劑(例如,抗CEACAM抗體分子)或CTLA-4抑制劑(例如,抗CTLA4抗體)組合投與,來治療胃癌。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與PD-1或PD-L1抑制劑(例如抗PD-1或抗PD-L1抗體分子)組合投與來治療胃癌,如本文所述。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係單獨(例如作為單一療法)或與免疫檢查點調節劑之抑制劑(例如,PD-1抑制劑(例如,抗PD-1抗
體分子)、PD-L1抑制劑(例如,抗PD-L1抗體分子)、TIM-3抑制劑(例如,抗TIM-3抗體分子)、CEACAM(例如,CEACAM1及/或CEACAM5)抑制劑(例如,抗CEACAM抗體分子)或CTLA-4抑制劑(例如,抗CTLA4抗體)組合投與,來治療淋巴瘤(例如,霍奇金氏淋巴瘤(HL)、非霍奇金氏淋巴瘤(NHL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、外套細胞淋巴瘤(MCL)或CLL(例如復發性或難治性慢性淋巴球性白血病))。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與PD-1或PD-L1抑制劑(例如抗PD-1或抗PD-L1抗體分子)組合投與來治療淋巴瘤,如本文所述。
在一個實施例中,癌症微環境具有升高的PD-L1表現量。或者或組合地,癌症微環境可具有增加的IFNγ及/或CD8表現。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子係單獨或與PD-1抑制劑(例如,抗PD-1抗體分子)或PD-L1抑制劑(例如,抗PD-L1抗體分子)組合投與,來治療患有或經鑒定患有具有高PD-L1含量或表現中之一或多者、或為腫瘤浸潤淋巴球(TIL)+(例如,具有增加的TIL數)或二者的腫瘤之個體。在某些實施例中,個體患有或經鑒定患有具有高PD-L1含量或表現且為TIL+之腫瘤。在一些實施例中,本文所述方法進一步包括基於患有具有高PD-L1含量或表現中之一或多者或為TIL+或二者之腫瘤鑒定個體。在某些實施例中,本文所述方法進一步包括基於患有具有高PD-L1含量或表現且為TIL+之腫瘤鑒定個體。在一些實施例中,為TIL+之腫瘤對CD8及IFNγ呈陽性。在一些實施例中,個體具有或經鑒定具有高百分比之對PD-L1、CD8及/或IFNγ中之一者、兩者或更多者呈陽性之細胞。在某些實施例中,個體具有或經鑒定具有高百分比之對PD-L1、CD8及IFNγ中之所有呈陽性之細胞。
在一些實施例中,本文所述方法進一步包括基於具有高百分比之對PD-L1、CD8及/或IFNγ中之一者、兩者或更多者呈陽性之細胞鑒
定個體。在某些實施例中,本文所述方法進一步包括基於具有高百分比之對PD-L1、CD8及IFNγ中之所有呈陽性之細胞鑒定個體。在一些實施例中,個體具有或經鑒定具有PD-L1、CD8及/或IFNγ中之一者、兩者或更多者及以下癌症中之一或多者:肺癌,例如鱗狀細胞肺癌或肺腺癌;頭頸癌;鱗狀細胞子宮頸癌;胃癌;食道癌;甲狀腺癌;黑色素瘤及/或鼻咽癌(NPC)。在某些實施例中,本文所述方法進一步闡述基於具有PD-L1、CD8及/或IFNγ中之一者、兩者或更多者及以下癌症中之一或多者來鑒定個體:肺癌,例如鱗狀細胞肺癌或肺腺癌;頭頸癌;鱗狀細胞子宮頸癌;胃癌;甲狀腺癌;黑色素瘤及或鼻咽癌。
本文所揭示之方法及組合物可用於治療與上文所提及之癌症相關之轉移性病灶。
在另一個態樣中,本發明提供治療個體之傳染病之方法,其包含向個體單獨或與一或多種藥劑或程序組合投與治療有效量之本文所述之抗LAG-3抗體分子。在該方法中較佳使用本發明抗體,但亦可使用其他抗LAG-3抗體或其抗原結合片段(或與本文所述之抗LAG-3抗體分子組合)。
在一個實施例中,傳染病係肝炎(例如,B型肝炎感染)。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係與B型肝炎抗原或疫苗組合及視情況與含鋁佐劑組合投與。
在另一個實施例中,傳染病係流行性感冒。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係與流行性感冒抗原或疫苗組合投與。
此外,本發明提供增強個體對抗原之免疫反應之方法,其包含向個體投與:(i)抗原;及(ii)抗LAG-3抗體分子,使得增強個體對抗原之免疫反應。抗原可為例如腫瘤抗原、病毒抗原、細菌抗原或來自病原體之抗原。
抗LAG-3抗體分子可以下列方式單獨或組合投與個體:以全身性
方式(例如,經口、非經腸、皮下、靜脈內、經直腸、肌內、腹膜內、鼻內、經皮或藉由吸入或腔內安裝)、經局部或藉由施加至黏膜,例如鼻、喉及支氣管。
抗LAG-3抗體分子之劑量及治療方案可由熟習此項技術者來確定。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係以下列劑量藉由注射(例如,皮下或靜脈內)來投與:約1mg/kg至30mg/kg,例如約5mg/kg至25mg/kg、約10mg/kg至20mg/kg、約1mg/kg至10mg/kg或約1mg/kg、3mg/kg或10mg/kg。投藥時間表可自例如每週一次至每2週、3週或4週一次變化。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係以約10mg/kg至20mg/kg之劑量每隔一週投與。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係以約3mg至800mg、例如約3mg、20mg、80mg、240mg或800mg之劑量投與(例如,靜脈內)。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係以約20mg至800mg、例如約3mg、20mg、80mg、240mg或800mg之劑量單獨投與。在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子在與第二藥劑或治療模式、例如本文所述之第二藥劑或治療模式組合時,係以約3mg至240mg、例如約3mg、20mg、80mg或240mg之劑量投與。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係在每一8週週期期間、例如至多96週每2週(例如,在第1、3、5、7週期間)投與。
在本文所述方法中較佳使用本文所述之抗體分子,但亦可使用其他抗LAG-3抗體或與本發明抗LAG-3抗體分子之組合。
本文所述之方法及組合物可與其他藥劑或治療模式組合使用。在一個實施例中,本文所述方法包括向個體投與可有效地治療或預防病症之量的如本文所述之抗LAG-3抗體分子與藥劑或治療程序或模式之組合。抗LAG-3抗體分子及藥劑或治療程序或模式可同時或以任何順序依序投與。可使用抗LAG-3抗體分子及其他治療劑、程序或模式
(例如,如本文所述)之任一組合及序列。抗體分子及/或其他治療劑、程序或模式可在活性病症時段期間或在緩解或活性較低之疾病時段期間投與。抗體分子可在另一治療之前、與該治療同時、在治療後或在病症緩解期間投與。
在某些實施例中,本文所述之方法及組合物係與以下中之一或多者組合投與:其他抗體分子、化學療法、其他抗癌療法(例如,靶向抗癌療法、基因療法、病毒療法、RNA療法、骨髓移植、奈米療法或溶瘤藥物)、細胞毒性劑、基於免疫之療法(例如,基於細胞介素或細胞之免疫療法)、手術程序(例如,乳房瘤切除術或乳房切除術)及/或輻射程序或前述任一者之組合。其他療法可呈輔助或新輔助療法形式。在一些實施例中,另一療法係酶促抑制劑(例如,小分子酶促抑制劑)或轉移性抑制劑。
可組合投與之實例性細胞毒性劑包括抗微管劑、拓撲異構酶抑制劑、抗代謝物、有絲分裂抑制劑、烷基化劑、蒽環類、長春花生物鹼、嵌入劑、能夠干擾信號轉導路徑之藥劑、促進細胞凋亡之藥劑、蛋白體抑制劑及輻射(例如,局部或全身照射(例如,γ照射))。在其他實施例中,另一療法係手術或輻射或其組合。在其他實施例中,另一療法係靶向PI3K/AKT/mTOR路徑、HSP90抑制劑或微管蛋白抑制劑中之一或多者之療法。可組合投與之其他實例性抗體分子尤其包括(但不限於)檢查點抑制劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1);刺激免疫細胞之抗體(例如,激動性GITR或CD137抗體);抗癌抗體(例如,利妥昔單抗(rituximab,Rituxan®或MabThera®)、曲妥珠單抗(trastuzumab,Herceptin®)、西妥昔單抗(cetuximab,Erbitux®)。
或者或在與上述組合之組合中,本文所述之方法及組合物可與以下中之一或多者組合投與:免疫調節劑(例如,共刺激分子之活化劑或免疫抑制分子(例如免疫檢查點分子)之抑制劑);疫苗,例如治療
性癌症疫苗;或細胞免疫療法之其他形式。
抗LAG-3抗體分子之實例性非限制性組合及用途包括以下各項。
在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係與共刺激分子之調節劑(例如,共刺激分子之激動劑)或抑制分子之調節劑(例如,免疫檢查點抑制劑之抑制劑)組合投與。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與共刺激分子之調節劑(例如激動劑)組合投與。在一個實施例中,共刺激分子之激動劑選自以下之激動劑(例如,激動性抗體或可溶性融合物):OX40、CD2、CD27、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、4-1BB(CD137)、GITR、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3或CD83配體。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與選自以下之抑制(或免疫檢查點)分子之抑制劑組合投與:PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA-4、TIM-3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、CEACAM(例如,CEACAM-1及/或CEACAM-5)及/或TGFR β。可藉由在DNA、RNA或蛋白質層級上抑制來實施抑制分子之抑制。在實施例中,可使用抑制核酸(例如,dsRNA、siRNA或shRNA)來抑制抑制分子之表現。在其他實施例中,抑制信號之抑制劑係結合至抑制分子之多肽,例如可溶性配體或抗體或抗體片段。在一個實施例中,抑制劑係可溶性配體(例如,CTLA-4-Ig)或結合至PD-1、PD-L1、PD-L2或CTLA-4之抗體或抗體片段。
舉例而言,抗LAG-3抗體分子可與例如結合至PD-1、PD-L1、PD-L2或CTLA-4之抗體或抗體片段之抑制劑組合投與來治療癌症(例如,選自以下之癌症:結腸直腸癌(例如,CRC);黑色素瘤,例如晚期黑色素瘤(例如,II-IV期黑色素瘤)或HLA-A2陽性黑色素瘤;胰臟癌,例如晚期胰臟癌;乳癌,例如轉移性乳癌或三陰性乳癌;頭頸癌
(例如,HNSCC);食道癌;腎細胞癌(RCC),例如透明腎細胞癌(ccRCC)或轉移性腎細胞癌(MRCC);肺癌(例如,NSCLC);子宮頸癌;膀胱癌;或血液惡性病,例如白血病(例如,淋巴球性白血病)或淋巴瘤(例如,霍奇金氏淋巴瘤(HL)、非霍奇金氏淋巴瘤(NHL)、瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)、外套細胞淋巴瘤(MCL)或CLL(例如復發性或難治性慢性淋巴球性白血病))。
在一個實施例中,抗LAG-3-1抗體分子係在具或不具BRAF抑制劑(例如,威羅菲尼或達拉菲尼)的情況下與使用抗CTLA4抗體(例如,伊匹單抗)之治療(例如,在其之前、同時或之後)組合投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與組合投與抗PD-1抗體(例如,尼沃魯單抗(Nivolumab)或匹姆泊單抗(Pembrolizumab))或其抗原結合片段。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗TIM-3抗體或其抗原結合片段組合投與。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗PD-L1抗體或其抗原結合片段組合投與。在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗PD-1抗體及抗TIM-3抗體(或其抗原結合片段)組合投與。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗PD-1抗體及抗PD-L1抗體(或其抗原結合片段)組合投與。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗TIM-3抗體及抗PD-L1抗體(或其抗原結合片段)組合投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與CEACAM抑制劑(例如,CEACAM-1及/或CEACAM-5抑制劑)、例如抗CEACAM抗體分子組合投與。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與CEACAM-1抑制劑、例如抗CEACAM-1抗體分子組合投與。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與CEACAM-5抑制劑、例如抗CEACAM-5抗體分子組合投與。
在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗CEACAM(例如,抗
CEACAM-1及/或抗CEACAM-5)抗體分子及抗PD-1抗體分子組合投與。在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗CEACAM(例如,抗CEACAM-1及/或抗CEACAM-5)抗體分子及抗TIM-3抗體分子組合投與。在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗CEACAM(例如,抗CEACAM-1及/或抗CEACAM-5)抗體分子及抗PD-L1抗體分子組合投與。本文所述抗體之組合可單獨(例如作為單獨抗體或其抗原結合片段)或聯合(例如作為雙特異性或三特異性抗體分子)投與。在一個實施例中,投與包括抗LAG-3抗體分子及以下中之一者之雙特異性抗體:抗TIM-3抗體、抗CEACAM(例如,抗CEACAM-1及/或抗CEACAM-5)抗體、抗PD-L1抗體或抗PD-1抗體或其抗原結合片段。在某些實施例中,使用本文所述抗體之組合來治療癌症,例如如本文所述之癌症(例如,實體腫瘤或血液惡性病)。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗PD-1或抗PD-L1抗體組合投與來治療實體腫瘤。
在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子係與細胞介素組合投與。細胞介素可作為與抗LAG-3抗體分子之融合分子或作為單獨組合物投與。在一個實施例中,抗LAG-3抗體係與一種、兩種、三種或更多種例如作為融合分子或作為單獨組合物之細胞介素組合投與。在一個實施例中,細胞介素係選自IL-1、IL-2、IL-12、IL-12、IL-15或IL-21中之一者、兩者、三者或更多者的介白素(IL)。在一個實施例中,雙特異性抗體分子具有針對第一靶(例如,針對LAG-3)之第一結合特異性、針對第二靶(例如,PD-1、TIM-3或PD-L1)之第二結合特異性,且視情況連接至介白素(例如,IL-12)結構域(例如全長IL-12或其部分)。在某些實施例中,使用本文所述之抗LAG-3抗體分子及細胞介素之組合來治療癌症,例如如本文所述之癌症(例如,實體腫瘤)。
在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子係與疫苗(例如治療性癌症疫苗)或細胞免疫療法之其他形式組合投與。在一個實施例中,疫苗
係基於肽、基於DNA、基於RNA或基於抗原之疫苗或其組合。在實施例中,疫苗包含一或多種肽、核酸(例如,DNA或RNA)、抗原或其組合。在某些實施例中,癌症疫苗包含佐劑(例如,磷酸鋁或氫氧化鋁)。在一些實施例中,本文所述方法係與手術移除組織、化學療法或其他抗癌療法中之一或多者組合投與,且主要或唯一靶將為轉移性病灶,例如骨髓或淋巴結中之轉移。
在一個實施例中,癌症係黑色素瘤,例如晚期黑色素瘤(例如,II-IV期黑色素瘤)或HLA-A2陽性黑色素瘤。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係與腫瘤抗原肽(例如一或多種HLA-A2肽)組合及視情況與佐劑(例如MontanideTM)組合投與。可與抗LAG-3抗體分子組合投與之實例性腫瘤肽包括以下中之一或多者:酪胺酸酶.A2、MAGE-C2.A2、NY-ESO-1b.A2、MAGE-4.A2、MAGE-3.A2、MAGE-1.A2、NA17.A2(GnTV)及MAGE-10.A2。
在另一個實施例中,癌症係胰臟癌,例如晚期胰臟癌。在某些實施例中,抗體分子可與化學治療劑(例如吉西他濱(gemcitabine))組合投與。
在另一個實施例中,癌症係乳癌,例如轉移性乳癌或三陰性乳癌。在某些實施例中,抗體分子可與化學治療劑(例如太平洋紫杉醇(paclitaxel))組合投與。
在另一個實施例中,癌症係腎細胞癌,例如透明細胞癌、晚期(例如,IV期)或轉移性腎細胞癌(MRCC)。
在另一個實施例中,癌症係頭頸癌,例如HPV+鱗狀細胞癌。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗原組合投與。舉例而言,抗LAG-3抗體分子可與B型肝炎抗原(例如,安在時(Engerix)B)組合。在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子係與流感抗原組合投與。
抗LAG-3抗體分子可以未偶聯形式單獨使用,或可結合至物質,
例如細胞毒性劑或部分(例如,治療性藥物;發射輻射之化合物;植物、真菌或細菌來源之分子;或生物蛋白質(例如,蛋白質毒素)或粒子(例如,經由例如病毒外殼蛋白之重組病毒粒子)。舉例而言,抗體可偶合至放射性同位素,例如α-、β-或γ-發射體或β-及γ-發射體。
本文所述之方法及組合物(例如,LAG-3抗體及其使用方法)可與其他藥劑或治療模式(例如選自表7中所列示之一或多種藥劑之第二治療劑)組合使用。在一個實施例中,本文所述方法包括向個體投與如本文所述之抗LAG-3抗體分子(視情況與PD-1、PD-L1、TIM-3、CEACAM(例如,CEACAM-1及/或CEACAM-5)或CTLA-4)之一或多種抑制劑組合),其進一步包括投與可有效地治療或預防病症(例如如本文所述之病症,例如癌症)之量的選自表7中所列示之一或多種藥劑之第二治療劑。在組合投與時,抗LAG-3抗體分子、另一藥劑(例如,第二或第三藥劑)或所有皆可以高於、低於或等於每一藥劑個別使用(例如作為單一療法)之量或劑量的量或劑量來投與。在某些實施例中,抗LAG-3抗體、另一藥劑(例如,第二或第三藥劑)或所有之投與量或劑量低於每一藥劑個別使用(例如作為單一療法)之量或劑量(例如,低至少20%、至少30%、至少40%或至少50%)。在其他實施例中,抗LAG-3抗體、另一藥劑(例如,第二或第三藥劑)或所有之引起期望效應(例如,治療癌症)之量或劑量較低(例如,低至少20%、至少30%、至少40%或至少50%)。
在其他實施例中,第二治療劑選自表7中所列示之一或多種藥劑。在一個實施例中,癌症選自肺癌(例如,非小細胞肺癌(NSCLC)(例如,具有鱗狀及/或非鱗狀組織學之NSCLC或NSCLC腺癌),或揭示於表7中所列示之公開案中。在一些實施例中,第二治療劑選自以下中之一或多者:1)蛋白激酶C(PKC)抑制劑;2)熱休克蛋白90
(HSP90)抑制劑;3)磷酸肌醇3激酶(PI3K)及/或雷帕黴素靶(mTOR)之抑制劑;4)細胞色素P450抑制劑(例如,CYP17抑制劑或17α羥化酶/C17-20溶解酶抑制劑);5)鐵螯合劑;6)芳香酶抑制劑;7)p53抑制劑,例如p53/Mdm2相互作用之抑制劑;8)細胞凋亡誘導物;9)血管生成抑制劑;10)醛固酮合酶抑制劑;11)平滑(SMO)受體抑制劑;12)泌乳素受體(PRLR)抑制劑;13)Wnt信號傳導抑制劑;14)CDK4/6抑制劑;15)纖維母細胞生長因子受體2(FGFR2)/纖維母細胞生長因子受體4(FGFR4)抑制劑;16)巨噬細胞群落刺激因子(M-CSF)抑制劑;17)c-KIT、組胺釋放、Flt3(例如,FLK2/STK1)或PKC中之一或多者之抑制劑;18)VEGFR-2(例如,FLK-1/KDR)、PDGFRβ、c-KIT或Raf激酶C中之一或多者之抑制劑;19)生長抑制素激動劑及/或生長激素釋放抑制劑;20)退行性淋巴瘤激酶(ALK)抑制劑;21)胰島素樣生長因子1受體(IGF-1R)抑制劑;22)P-糖蛋白1抑制劑;23)血管內皮生長因子受體(VEGFR)抑制劑;24)BCR-ABL激酶抑制劑;25)FGFR抑制劑;26)CYP11B2抑制劑;27)HDM2抑制劑,例如HDM2-p53相互作用之抑制劑;28)酪胺酸激酶抑制劑;29)c-MET抑制劑;30)JAK抑制劑;31)DAC抑制劑;32)11β-羥化酶抑制劑;33)IAP抑制劑;34)PIM激酶抑制劑;35)Porcupine抑制劑;36)BRAF(例如BRAF V600E或野生型BRAF)抑制劑;37)HER3抑制劑;38)MEK抑制劑;或39)例如如本文所述及表7中之脂質激酶抑制劑。
在一個實施例中,第二治療劑選自以下中之一或多者:化合物A8、化合物A17、化合物A23、化合物A24、化合物A27、化合物A29、化合物A33及化合物A13。
在其他實施例中,第二治療劑選自以下中之一或多者:化合物A5、化合物A8、化合物A17、化合物A23、化合物A24、化合物A29及化合物A40。
在其他實施例中,第二治療劑選自以下中之一或多者:化合物A9、化合物A16、化合物A17、化合物A21、化合物A22、化合物A25、化合物A28、化合物A48及化合物49。
在實施例中,第二治療劑係以治療或低於治療之劑量投與。在某些實施例中,在組合投與第二治療劑與抗LAG-3抗體分子時達成抑制(例如生長抑制)所需之第二治療劑之濃度低於個別投與第二治療劑時達成抑制(例如生長抑制)所需之第二治療劑之濃度。在某些實施例中,在組合投與抗LAG-3抗體分子與第二治療劑時達成抑制(例如生長抑制)所需之抗LAG-3抗體分子之濃度低於在個別投與抗LAG-3抗體分子時達成抑制(例如生長抑制)所需之抗LAG-3抗體分子之濃度。在某些實施例中,在組合療法中,達成抑制(例如生長抑制)所需之第二治療劑之濃度低於第二治療劑作為單一療法之治療劑量,例如低10%-20%、20%-30%、30%-40%、40%-50%、50%-60%、60%-70%、70%-80%或80%-90%。在某些實施例中,在組合療法中,達成抑制(例如生長抑制)所需之抗LAG-3抗體分子之濃度低於抗PD-1抗體分子作為單一療法之治療劑量,例如低10%-20%、20%-30%、30%-40%、40%-50%、50%-60%、60%-70%、70%-80%或80%-90%。
在另一個態樣中,本發明之特徵在於例如在活體外或活體內檢測樣品(例如,生物樣品(例如血清、精液或尿液),或例如來自過度增殖或癌性病灶之組織生檢)中LAG-3之存在之方法。標的方法可用於評估(例如監測)個體之本文所述病症(例如過度增殖或癌性病症)之治療或進展、診斷及/或對其進行分期。該方法包括:(i)在容許發生相互作用之條件下,使樣品與如本文所述之抗LAG-3抗體分子(及視情況參考物,例如對照樣品)接觸,或向個體投與該抗體分子,及(ii)檢測抗體分子與樣品(及視情況參考物,例如對照樣品)之間之複合物
的形成。形成複合物指示存在LAG-3,且可指示本文所述治療之適宜性或對其之需要。該方法可涉及免疫組織化學、免疫細胞化學、流式細胞術(例如,FACS)、抗體分子複合磁珠、ELISA分析、PCR技術(例如,RT-PCR)。
通常,用於活體內及活體外診斷方法中之抗LAG-3抗體分子直接或間接標記有可檢測物質以幫助檢測所結合或未結合之結合劑。適宜可檢測物質包括多種生物活性酶、輔基、螢光材料、發光材料、順磁(例如,核磁共振活性)材料及放射性材料。
其他實施例提供治療癌症之方法,其包含:鑒定樣品(例如,包含癌細胞及視情況免疫細胞(例如TIL)之個體樣品)中PD-L1、CD8或IFN-γ中之一者、兩者或所有之存在,由此提供PD-L1、CD8及IFN-γ中之一者、兩者或所有之值。該方法可進一步包括比較PD-L1、CD8及/或IFN-γ值與參考值(例如對照值)。若PD-L1、CD8及/或IFN-γ值大於參考值(例如對照值),則向個體單獨或與抗PD-1抗體分子、抗PD-L1抗體分子或二者組合、視情況與一或多種其他藥劑組合投與治療有效量之抗LAG-3抗體(例如,本文所述之抗LAG-3抗體),由此治療癌症。癌症可係例如本文所述之癌症,例如肺癌(鱗狀)、肺癌(腺癌)、頭頸癌、子宮頸癌(鱗狀)、胃癌、甲狀腺癌、黑色素瘤、鼻咽癌或乳癌(例如TN乳癌,例如IM-TN乳癌)。在一些實施例中,癌症係ER+乳癌或胰臟癌。
亦提供治療癌症之方法,其包含:測試樣品(例如,包含癌細胞之個體樣品)之PD-L1之存在,由此鑒定PD-L1值,比較PD-L1值與對照值,且若PD-L1值大於對照值,則向個體單獨或與抗PD-1抗體分子、抗PD-L1抗體分子或二者組合、視情況與一或多種其他藥劑組合投與治療有效量之抗LAG-3抗體(例如,本文所述之抗LAG-3抗體),由此治療癌症。癌症可係例如如本文所述之癌症,例如癌症係非小細
胞肺(NSCLC)腺癌(ACA)、NSCLC鱗狀細胞癌(SCC)或肝細胞癌(HCC)。
在另一個態樣中,本發明之特徵在於包括本文所述之抗LAG-3抗體分子及使用說明書之診斷或治療套組。
本文所提及之所有公開案、專利申請案、專利及其他參考文獻之全部內容皆以引用方式併入本文中。
根據描述及圖式以及申請專利範圍,將明瞭本發明之其他特徵、目標及優點。
圖1繪示鼠類抗LAG-3 mAb BAP050之輕鏈(SEQ ID NO:16)及重鏈(SEQ ID NO:6)可變區之胺基酸序列。加下劃線處為基於Kabat編號之輕鏈及重鏈CDR序列。基於Chothia編號之輕鏈及重鏈CDR序列係以粗斜體顯示。
圖2繪示與種系序列(按出現順序分別為SEQ ID NO:290-291)比對之鼠類抗LAG-3 mAb BAP050之輕鏈(SEQ ID NO:16)及重鏈(SEQ ID NO:6)可變區的胺基酸序列。上方及下方序列分別係種系(GL)及BAP050(Mu mAb)序列。加下劃線處為基於Kabat編號之輕鏈及重鏈CDR序列。基於Chothia編號之輕鏈及重鏈CDR序列係以粗斜體顯示。「-」意指一致的胺基酸殘基。
圖3繪示顯示20個人類化BAP050純系(BAP050-hum01至BAP050-hum20)及嵌合mAb(BAP050-chi)之FACS結合分析之結果的條形圖。每一所測試mAb之抗體濃度自最左側條至最右側條為200ng/ml、100ng/ml、50ng/ml、25ng/ml及12.5ng/ml。
圖4繪示人類化BAP049純系(a、b、c、d、e、f、g代表框架區序列之不同類型)之結構分析。亦顯示樣品中mAb之濃度。
圖5A-5B繪示在使用恆定濃度之經FITC標記之鼠類mAb、測試抗
體之連續稀釋物及表現LAG-3的CHO細胞之競爭結合分析中量測之人類化mAb的結合親和力及特異性。實施兩次實驗,且結果分別顯示於圖5A及5B中。
圖6繪示基於FACS數據、競爭結合及結構分析對人類化BAP050純系之分級。亦顯示樣品中mAb之濃度。
圖7繪示在使用恆定濃度之經FITC標記之鼠類mAb、測試抗體之連續稀釋物及表現LAG-3的CHO細胞之競爭結合分析中量測之huBAP050(Ser)純系的結合親和力及特異性。評估HuBAP050(Ser)純系,例如BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser及BAP050-hum13-Ser。鼠類mAb BAP050、嵌合mAb BAP050-chi及人類化BAP050-hum01、BAP050-hum02、BAP050-hum05、BAP050-hum09、BAP050-hum11、BAP050-hum12及BAP050-hum13亦納入分析中。
圖8繪示huBAP050(Ser)純系對LAG-3-Ig與Daudi細胞之結合之阻斷。評估HuBAP050(Ser)純系,例如BAP050-hum01-Ser、BAP050-hum02-Ser、BAP050-hum05-Ser、BAP050-hum09-Ser、BAP050-hum11-Ser、BAP050-hum12-Ser及BAP050-hum13-Ser。鼠類mAb BAP050及嵌合mAb BAP050-chi亦納入分析中。
圖9A-9B繪示20個人類化BAP050純系與BAP050嵌合體(BAP050-chi)之重鏈可變結構域序列之比對。在圖9A中,顯示所有序列(按出現順序分別為SEQ ID NO:20、28、28、28、28、28、28、28、28、28、28、64、64、64、64、64、68、72、72、76及80)。在圖9B中,僅顯示與小鼠序列不同之胺基酸序列(按出現順序分別為SEQ ID NO:20、28、28、28、28、28、28、28、28、28、28、64、64、64、64、64、68、72、72、76及80)。
圖10A-10B繪示20個人類化BAP050純系與BAP050嵌合體(BAP050-chi)之輕鏈可變結構域序列之比對。在圖10A中,顯示所有序列(按出現順序分別為SEQ ID NO:24、32、36、36、36、292、292、292、44、48、52、56、56、60、60、60、60、84、88、92及96)。在圖10B中,僅顯示與小鼠序列不同之胺基酸序列(按出現順序分別為SEQ ID NO:24、32、36、36、36、292、292、292、44、48、52、56、56、60、60、60、60、84、88、92及96)。
圖11顯示具有相對較高之對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性之患者比例的實例性癌症。
圖12顯示具有相對較低之對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性之患者比例的實例性ER+乳癌及胰臟癌。
圖13顯示對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性之實例性乳癌患者之比例。
圖14顯示對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性之實例性結腸癌患者之比例。
表1係鼠類、嵌合及人類化抗LAG-3抗體分子之胺基酸及核苷酸序列之概述。抗體分子包括鼠類mAb BAP050及嵌合mAb BAP050-chi、人類化mAb BAP050-hum01至BAP050-hum20、BAP050-hum01-Ser至BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser至BAP050-hum20-Ser及BAP050-純系-F至BAP050-純系-J。重鏈及輕鏈CDR之胺基酸及核苷酸序列、重鏈及輕鏈可變區之胺基酸及核苷酸序列以及重鏈及輕鏈之胺基酸及核苷酸序列顯示於此表中。
表2繪示人類化mAb BAP050-hum01至BAP049-hum20、BAP050-hum01-Ser至BAP050-hum15-Ser、BAP050-hum18-Ser至BAP050-hum20-Ser及BAP049-純系-F至BAP049-純系-J之重鏈及輕鏈框架區之
胺基酸及核苷酸序列。
表3繪示人類IgG重鏈及人類κ輕鏈之恆定區胺基酸序列。
表4顯示人類化mAb BAP050-純系-F至BAP050-純系-J之重鏈及輕鏈前導序列之胺基酸序列。
表5係在CHO細胞中表現之實例性人類化BAP050 mAb之產率、效價、單體含量及內毒素含量的概述。
表6顯示在CHO細胞中表現之實例性人類化BAP050 mAb之如藉由Novex IEF分析檢測之電荷同種型。
表7係可與本文所述之抗LAG-3抗體分子及其他免疫調節劑(例如,以下中之一或多者:共刺激分子之活化劑及/或免疫檢查點分子之抑制劑)組合投與之所選治療劑的概述。表7自左至右提供以下各項:第二治療劑之化合物名稱、化合物結構及揭示該化合物之專利公開案。
免疫系統能夠識別且消除腫瘤細胞;然而,腫瘤可利用多條策略來避開免疫性。阻斷免疫檢查點係一種活化或再活化治療性抗腫瘤免疫性之方式。淋巴球活化基因-3(LAG-3)已闡述為免疫突觸中之抑制受體(Chen及Flies(2013)Nat Rev Immunol.13(4):227-42)。因此,阻斷LAG-3可增強抗腫瘤免疫性。
若干細胞類型會表現LAG-3。舉例而言,LAG-3在經活化CD4+及CD8+ T細胞、T調控細胞、天然殺手(NK)細胞及漿細胞樣樹突狀細胞(DC)上表現。LAG-3在腫瘤浸潤淋巴球(例如頭及頸鱗狀細胞癌(HNSCC)中之浸潤淋巴球)中表現。LAG-3僅在高度阻抑性誘導之T調控及天然T調控上表現。舉例而言,高度阻抑性FoxP3+ nT調控及FoxP3- iT調控在黑色素瘤及結腸直腸癌中為LAG-3陽性(Camisaschi等人(2010)J.Immunol.184(11):6545-6551;Scurr等人(2014)Mucosal. Immunol.7(2):428-439)。
LAG-3負調控T細胞信號傳導及功能。LAG-3之配體包括例如II類MHC及L-SECtin。已顯示抗LSECtin會抑制B16黑色素瘤細胞生長(Xu等人(2014)Cancer Res.74(13):3418-3428)。阻斷LAG-3可恢復效應細胞之活性,降低T調控之阻抑活性及/或增強抗PD-1抗腫瘤活性。
LAG-3通常但並非排他性地在PD-1+細胞上共表現且單一阻斷可恢復活細胞之體外活性。例如如藉由雙重IFN-γ/TNF-α產生劑之百分比所顯示之CD8+ T細胞耗竭度與所表現之抑制受體數相關(Blackburn等人(2009)Nat.Immunol.10(1):29-37)。在黑色素瘤中,高PD-1/LAG-3表現與T細胞浸潤相關。在臨床前模型中,共阻斷LAG-3與抗PD-1或PD-L1可導致腫瘤阻抑活性。舉例而言,抗LAG-3及抗PD-1阻斷在Sa1N纖維肉瘤及MC38結腸癌模型中顯示效能(Woo等人(2012)Cancer Res.72(4):917-27)。
LAG-3阻斷亦在淋巴球性脈絡叢腦膜炎病毒(LCMV)模型中有效。舉例而言,慢性LCMV感染期間之PD-L1加LAG-3阻斷會增強抗病毒CD8+ T細胞反應(Blackburn等人(2009)Nat.Immunol.10(1):29-37)。
因此,本發明至少部分地提供具有高親和力及特異性之結合至淋巴球活化基因-3(LAG-3)之抗體分子(例如,人類化抗體分子)。在一個實施例中,揭示顯示低免疫原性之針對LAG-3之人類化抗體。舉例而言,發現根據本文所述之T細胞表位分析,人類化BAP050抗體具有小於1200、1150、1100、1050、1000、950、900、850或800之風險評分。在其他實施例中,顯示例如如圖4及6中所顯示之框架區之所選組合具有不同的產生效率及結合性質。
本發明之其他態樣包括編碼抗體分子之核酸分子、表現載體、宿主細胞及用於製備該等抗體分子之方法。亦提供包含該等抗體分子
之免疫偶聯物、多特異性或雙特異性分子及醫藥組合物。本文所揭示之抗LAG-3抗體分子可用於治療、預防及/或診斷癌性或惡性病症(例如癌症,例如黑色素瘤,例如晚期黑色素瘤;胰臟癌,例如晚期胰臟癌;實體腫瘤;乳癌,例如轉移性乳癌;腎細胞癌,例如晚期或轉移性腎細胞癌(MRCC)或透明細胞腎細胞癌),以及傳染病(例如肝炎,例如B型肝炎;流行性感冒)。因此,本文揭示使用單獨或組合之抗LAG-3抗體分子檢測LAG-3之方法,以及治療多種病症(包括癌症及傳染病)之方法。
術語「淋巴球活化基因-3」或「LAG-3」包括所有同種型、哺乳動物(例如人類)LAG-3、人類LAG-3之物種同系物及包含至少一個與LAG-3共同之表位的類似物。LAG-3(例如人類LAG-3)之胺基酸及核苷酸序列為業內已知,例如Triebel等人(1990)J.Exp.Med.171:1393-1405。
其他術語定義於下文及整個申請案中。
如本文所用之冠詞「一(a及an)」係指一個或一個以上(例如指至少一個)的該冠詞之文法受詞。
除非上下文另外明確指示,否則術語「或」在本文中用於意指術語「及/或」,且可與該術語互換使用。
「約」及「大約」通常應意指在給出量測之性質或精確度下所量測量之可接受之誤差度。實例性誤差度係在給定值或值之範圍之百分之20(%)內,通常在10%內,且更通常在5%內。
本發明之組合物及方法涵蓋具有所指定序列或與其實質上一致或類似之序列、例如與所指定序列至少70%、75%、80%、85%、90%、95%一致或更高之序列的多肽及核酸。在胺基酸序列之背景下,術語「實質上一致」在本文中用於指第一胺基酸含有足夠或最少數量之i)與第二胺基酸序列中之所比對胺基酸殘基一致之胺基酸殘
基,或ii)第二胺基酸序列中之所比對胺基酸殘基之保守取代,使得第一及第二胺基酸序列可具有共同結構結構域及/或共同功能活性。舉例而言,與參考序列(例如本文所提供之序列)具有至少約85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性之含有共同結構結構域之胺基酸序列。
在核苷酸序列之背景下,術語「實質上一致」在本文中用於指第一核酸序列含有足夠或最少數量之與第二核酸序列中之所比對核苷酸一致之核苷酸,使得第一及第二核苷酸序列編碼具有共同功能活性之多肽或編碼共同結構多肽結構域或共同功能多肽活性。舉例而言,與參考序列(例如本文所提供之序列)具有至少約85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%一致性之核苷酸序列。
術語「功能變體」係指與天然序列具有實質上一致之胺基酸序列、或由實質上一致之核苷酸序列編碼、且能夠具有天然序列之一或多種活性之多肽。
如下計算序列之間之同源性或序列一致性(該等術語在本文中可互換使用)。
為確定兩條胺基酸序列或兩條核酸序列之一致性%,出於最佳比較之目的比對該等序列(例如,可將空位引入第一及第二胺基酸或核酸序列中之一或兩者中用於最佳比對,且可出於比較目的忽視非同源序列)。在較佳實施例中,出於比較目的比對之參考序列之長度佔參考序列長度的至少30%,較佳至少40%,更佳至少50%、60%,且甚至更佳至少70%、80%、90%、100%。然後比較相應胺基酸位置或核苷酸位置處的胺基酸殘基或核苷酸。當佔據第一序列中之位置的胺基酸殘基或核苷酸與佔據第二序列中的相應位置之胺基酸殘基或核苷酸相同時,該等分子在此位置一致(乳本文所用之胺基酸或核酸「一致
性」等效於胺基酸或核酸「同源性」)。
兩條序列之間之一致性%隨序列共有的一致位置數變化,其中考慮到為達成兩條序列的最佳比對而需要引入之空位數及每一空位的長度。
兩條序列之間之序列比較及同源性%之測定可使用數學算法來完成。在較佳實施例中,兩條胺基酸序列之間之同源性%係使用已納入GCG軟體包(在http://www.gcg.com上獲得)中之GAP程式中之Needleman及Wunsch((1970)J.Mol.Biol.48:444-453)算法、使用Blossum 62矩陣或PAM250矩陣,以及16、14、12、10、8、6或4之空位權重及1、2、3、4、5或6之長度權重來測定。在另一較佳實施例中,兩條核苷酸序列之間之同源性%係使用GCG軟體包(在http://www.gcg.com上獲得)中之GAP程式、使用NWSgapdna.CMP矩陣以及40、50、60、70或80之空位權重及1、2、3、4、5或6之長度權重來測定。尤佳參數集合(及除非另有規定否則應使用者)係Blossum 62評分矩陣與空位罰分12、空位延伸罰分4及移碼空位罰分5來測定。
兩條胺基酸或核苷酸序列之間之一致性%可使用已納入ALIGN程式(2.0版)中之E.Meyers及W.Miller((1989)CABIOS,4:11-17)算法、使用PAM120權重殘基表、空位長度罰分12及空位罰分4來測定。
可使用本文所述之核酸及蛋白質序列作為「詢問序列」來實施針對公共數據庫之檢索,以例如鑒定其他家族成員或相關序列。該等檢索可使用Altschul等人(1990)J.Mol.Biol.215:403-10之NBLAST及XBLAST程式(2.0版)來實施。BLAST核苷酸檢索可使用NBLAST程式、評分=100、字長=12來實施,以獲得與本發明之核酸(SEQ ID NO:1)分子同源之核苷酸序列。BLAST蛋白質檢索可使用XBLAST程式、評分=50、字長=3來實施,以獲得與本發明之蛋白質分子同源之胺基酸序列。為出於比較之目的獲得空位比對,可如Altschul等人
(1997)Nucleic Acids Res.25:3389-3402中所述來利用空位BLAST。在利用BLAST及空位BLAST程式時,可使用各別程式(例如,XBLAST及NBLAST)之預設參數。參見http://www.ncbi.nlm.nih.gov。
如本文所用之術語「在低嚴格度、中嚴格度、高嚴格度或極高嚴格度條件下雜交」闡述用於雜交及洗滌之條件。用於實施雜交反應之指導可參見Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley及Sons,N.Y.(1989),6.3.1-6.3.6,其以引用方式併入本文中。水性及非水性方法闡述於此參考文獻中且可使用任一者。本文所提及之特定雜交條件如下:1)低嚴格度雜交條件係在6×氯化鈉/檸檬酸鈉(SSC)中,在約45℃下,之後在0.2×SSC、0.1% SDS中至少在50℃(對於低嚴格度條件,可將洗滌溫度提高至55℃)下洗滌兩次;2)中嚴格度雜交條件係在6×SSC中,在約45℃下,之後在0.2×SSC、0.1% SDS中在60℃下洗滌一或多次;3)高嚴格度雜交條件係在6×SSC中,在約45℃下,之後在0.2×SSC、0.1% SDS中在65℃下洗滌一或多次;及較佳地4)極高嚴格度雜交條件為0.5M磷酸鈉、7% SDS,在65℃下,之後在0.2×SSC、1% SDS中在65℃下洗滌一或多次。極高嚴格度條件(4)通常係較佳條件且係除非另有規定否則應使用之條件。
應理解,本發明分子可具有對其功能不具實質效應之其他保守或非必需胺基酸取代。
術語「胺基酸」意欲涵蓋所有分子,無論天然抑或合成,其包括胺基官能基及酸官能基二者且能夠納入天然胺基酸之聚合物中。實例性胺基酸包括天然胺基酸;其類似物、衍生物及同源物;具有變體側鏈之胺基酸類似物;及前述任一者之所有立體異構物。如本文所用之術語「胺基酸」包括D-或L-光學異構物及擬肽二者。
「保守胺基酸取代」係其中胺基酸殘基經具有類似側鏈之胺基酸殘基替代之取代。業內已定義具有類似側鏈之胺基酸殘基家族。該
等家族包括具有以下側鏈之胺基酸:鹼性側鏈(例如,離胺酸、精胺酸、組胺酸)、酸性側鏈(例如,天冬胺酸、麩胺酸)、不帶電荷之極性側鏈(例如,甘胺酸、天冬醯胺、麩醯胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸)、非極性側鏈(例如,丙胺酸、纈胺酸、白胺酸、異白胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸、色胺酸)、β-具支鏈側鏈(例如,蘇胺酸、纈胺酸、異白胺酸)及芳香族側鏈(例如,酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸)。
術語「多肽」、「肽」及「蛋白質」(若為單鏈)在本文中可互換使用且指任何長度之胺基酸聚合物。聚合物可為直鏈或具支鏈,其可包含經修飾胺基酸,且其可雜有非胺基酸。該等術語亦涵蓋經修飾之胺基酸聚合物;例如,二硫鍵形成、糖基化、脂化、乙醯化、磷酸化或任何其他操縱,例如與標記組份偶聯。多肽可自天然來源分離,可藉由重組技術自真核或原核宿主產生,或可係合成程序之產物。
術語「核酸」、「核酸序列」、「核苷酸序列」或「多核苷酸序列」及「多核苷酸」可互換使用。其係指任何長度核苷酸之聚合形式(去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸)或其類似物。多核苷酸可為單鏈或雙鏈,且若為單鏈,則可為編碼鏈或非編碼(反義)鏈。多核苷酸可包含經修飾核苷酸,例如甲基化核苷酸及核苷酸類似物。核苷酸之序列可雜有非核苷酸組份。多核苷酸可在聚合後藉由(例如)與標記組份偶聯來進一步修飾。核酸可為在自然界中不存在或以非天然排列連接至另一多核苷酸之重組多核苷酸或基因組、cDNA、半合成或合成來源之多核苷酸。
如本文所用之術語「經分離」係指自其原始或天然環境(例如,若其為天然的則為天然環境)移除之材料。例如,存在於活動物中之天然多核苷酸或多肽未經分離,但藉由人類干預與天然系統中之一些或所有共存材料分離之相同多核苷酸或多肽經分離。該等多核苷酸可
係載體之一部分及/或該等多核苷酸或多肽可係組合物之一部分,且仍經分離以使該載體或組合物不為在自然界中發現其之環境的一部分。
本發明之多個態樣進一步詳細闡述於下文中。其他定義闡述於說明書通篇中。
在一個實施例中,抗體分子結合至哺乳動物(例如人類)LAG-3。舉例而言,抗體分子特異性結合至LAG-3上之表位,例如直鏈或構象表位(例如,如本文所述之表位)。在一些實施例中,抗體分子結合至LAG-3之一或多個細胞外Ig樣結構域,例如LAG-3之第一、第二、第三或第四細胞外Ig樣結構域。
如本文所用之術語「抗體分子」係指包含至少一條免疫球蛋白可變結構域序列之蛋白質,例如免疫球蛋白鏈或其片段。術語「抗體分子」包括例如單株抗體(包括具有免疫球蛋白Fc區之全長抗體)。在實施例中,抗體分子包含全長抗體或全長免疫球蛋白鏈。在實施例中,抗體分子包含全長抗體或全長免疫球蛋白鏈之抗原結合或功能片段。
在實施例中,抗體分子係單特異性抗體分子且結合單一表位。例如,具有複數個各自結合相同表位之免疫球蛋白可變結構域序列之單特異性抗體分子。
在實施例中,抗體分子係多特異性抗體分子,例如其包含複數個免疫球蛋白可變結構域序列,其中複數個中之第一免疫球蛋白可變結構域序列具有針對第一表位之結合特異性,且複數個中之第二免疫球蛋白可變結構域序列具有針對第二表位之結合特異性。在實施例中,第一及第二表位在同一抗原上,例如同一蛋白質(或多聚蛋白之亞單位)。在實施例中,第一及第二表位重疊。在實施例中,第一及
第二表位不重疊。在實施例中,第一及第二表位在不同抗原上,例如不同蛋白質(或多聚蛋白之不同亞單位)。在實施例中,多特異性抗體分子包含第三、第四或第五免疫球蛋白可變結構域。在實施例中,多特異性抗體分子係雙特異性抗體分子、三特異性抗體分子或四特異性抗體分子。
在實施例中,多特異性抗體分子係雙特異性抗體分子。雙特異性抗體具有針對不超過兩種抗原之特異性。雙特異性抗體分子之特徵在於具有針對第一表位之結合特異性之第一免疫球蛋白可變結構域序列及具有針對第二表位之結合特異性的第二免疫球蛋白可變結構域序列。在實施例中,第一及第二表位在同一抗原上,例如同一蛋白質(或多聚蛋白之亞單位)。在實施例中,第一及第二表位重疊。在實施例中,第一及第二表位不重疊。在實施例中,第一及第二表位在不同抗原上,例如不同蛋白質(或多聚蛋白之不同亞單位)。在實施例中,雙特異性抗體分子包含具有針對第一表位之結合特異性之重鏈可變結構域序列及輕鏈可變結構域序列及具有針對第二表位之結合特異性的重鏈可變結構域序列及輕鏈可變結構域序列。在實施例中,雙特異性抗體分子包含具有針對第一表位之結合特異性之半抗體及具有針對第二表位之結合特異性的半抗體。在實施例中,雙特異性抗體分子包含具有針對第一表位之結合特異性之半抗體或其片段,及具有針對第二表位之結合特異性的半抗體或其片段。在實施例中,雙特異性抗體分子包含具有針對第一表位之結合特異性之scFv或其片段,及具有針對第二表位之結合特異性的scFv或其片段。在實施例中,第一表位位於LAG-3上,且第二表位位於PD-1、TIM-3、CEACAM(例如,CEACAM-1及/或CEACAM-5)、PD-L1或PD-L2上。
在實施例中,抗體分子包含雙價抗體及單鏈分子以及抗體之抗原結合片段(例如,Fab、F(ab')2及Fv)。舉例而言,抗體分子可包括重
鏈(H)可變結構域序列(在本文中縮寫為VH)及輕鏈(L)可變結構域序列(在本文中縮寫為VL)。在實施例中,抗體分子包含重鏈及輕鏈(在本文中稱為半抗體)或由其組成。在另一實例中,抗體分子包括兩條重鏈(H)可變結構域序列及兩條輕鏈(L)可變結構域序列,由此形成兩個抗原結合位點,例如Fab、Fab’、F(ab’)2、Fc、Fd、Fd’、Fv、單鏈抗體(例如scFv)、單一可變結構域抗體、雙價抗體(Dab)(二價及雙特異性)及嵌合(例如,人類化)抗體,其可藉由修飾完整抗體或使用重組DNA技術從頭合成之彼等來產生。該等功能抗體片段保留與其各別抗原或受體選擇性結合之能力。抗體及抗體片段可來自抗體之任一類別,包括(但不限於)IgG、IgA、IgM、IgD及IgE,及來自抗體之任何子類(例如,IgG1、IgG2、IgG3及IgG4)。抗體分子之製劑可為單株或多株。抗體分子亦可係人類、人類化、CDR移植或活體外產生之抗體。抗體可具有選自例如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4之重鏈恆定區。抗體亦可具有選自例如κ或λ之輕鏈。術語「免疫球蛋白」(Ig)在本文中可與術語「抗體」互換使用。
抗體分子之抗原結合片段之實例包括:(i)Fab片段,即由VL、VH、CL及CH1結構域組成之單價片段;(ii)F(ab')2片段,即包含兩個由鉸鏈區之二硫橋連接之Fab片段的二價片段;(iii)由VH及CH1結構域組成之Fd片段;(iv)由抗體單臂之VL及VH結構域組成之Fv片段;(v)雙價抗體(dAb)片段,其係由VH結構域組成;(vi)駱駝科或駱駝化可變結構域;(vii)單鏈Fv(scFv),參見例如Bird等人(1988)Science 242:423-426;及Huston等人(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883);(viii)單一結構域抗體。該等抗體片段係使用彼等熟習此項技術者已知之習用技術獲得,且以與完整抗體相同之方式針對效用篩選該等片段。
術語「抗體」包括完整分子以及其功能片段。可改變(例如突變)
抗體之恆定區,以改變抗體之性質(例如,增加或減少以下中之一或多者:Fc受體結合、抗體糖基化、半胱胺酸殘基數、效應細胞功能或補體功能)。
本發明抗體亦可係單一結構域抗體。單一結構域抗體可包括互補決定區為單一結構域多肽之一部分之抗體。實例包括(但不限於)重鏈抗體、通常不含輕鏈之抗體、源自習用4鏈抗體之單一結構域抗體、經改造抗體及除源自抗體之彼等外之單一結構域支架。單一結構域抗體可係現有技術中之任一者或任一將來的單一結構域抗體。單一結構域抗體可源自任何物種,包括(但不限於)小鼠、人類、駱駝、美洲駝、魚、鯊魚、山羊、兔及牛。根據本發明之另一態樣,單一結構域抗體係天然單一結構域抗體,稱為不含輕鏈之重鏈抗體。該等單一結構域抗體揭示於例如WO 94/04678中。為簡潔起見,源自通常不含輕鏈之重鏈抗體之此可變結構域在本文中稱為VHH或奈米抗體,以區分其與四鏈免疫球蛋白之習用VH。此一VHH分子可源自在駱駝科物種中、例如在駱駝、美洲駝、單峰駱駝、羊駝及原駝中產生之抗體。除駱駝科外之其他物種可產生通常不含輕鏈之重鏈抗體;該等VHH在本發明之範疇內。
VH及VL區可細分成超變區(稱為「互補決定區」(CDR))及更保守之區域(稱為「框架區」(FR或FW)),二者間雜排列。框架區及CDR之範圍已由多種方法精確定義(參見Kabat,E.A.等人(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,U.S.Department of Health and Human Services,NIH公開案第91-3242號;Chothia,C.等人(1987)J.Mol.Biol.196:901-917;及Oxford Molecular之AbM抗體建模軟體所使用之AbM定義。通常參見例如Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains.Antibody Engineering Lab Manual(編輯:Duebel,S.及Kontermann,R.,Springer-Verlag,
Heidelberg)。
如本文所用之術語「互補決定區」及「CDR」係指抗體可變區內賦予抗原特異性及結合親和力之胺基酸序列。一般而言,在每一重鏈可變區中存在三個CDR(HCDR1、HCDR2、HCDR3),且在每一輕鏈可變區中存在三個CDR(LCDR1、LCDR2、LCDR3)。
給定CDR之精確胺基酸序列邊界可使用多種熟知方案中之任一者來確定,該等方案包括Kabat等人(1991),「Sequences of Proteins of Immunological Interest」,第5版,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD(「Kabat」編號方案);Al-Lazikani等人,(1997)JMB 273,927-948(「Chothia」編號方案)所述之彼等。如本文所用之根據「Chothia」編號方案定義之CDR有時亦稱為「超變環」。
舉例而言,在Kabat下,重鏈可變結構域(VH)中之CDR胺基酸殘基編號為31-35(HCDR1)、50-65(HCDR2)及95-102(HCDR3);且輕鏈可變結構域(VL)中之CDR胺基酸殘基編號為24-34(LCDR1)、50-56(LCDR2)及89-97(LCDR3)。在Chothia下,VH中之CDR胺基酸編號為26-32(HCDR1)、52-56(HCDR2)及95-102(HCDR3);且VL中之胺基酸殘基編號為26-32(LCDR1)、50-52(LCDR2)及91-96(LCDR3)。藉由組合Kabat及Chothia二者之CDR定義,CDR係由人類VH中之胺基酸殘基26-35(HCDR1)、50-65(HCDR2)及95-102(HCDR3)以及人類VL中之胺基酸殘基24-34(LCDR1)、50-56(LCDR2)及89-97(LCDR3)組成。
通常,除非明確指示,否則抗LAG-3抗體分子可包括例如表1中所述之一或多個Kabat CDR及/或Chothia超變環之任一組合。在一個實施例中,對表1中所述之抗LAG-3抗體分子使用以下定義:HCDR1係根據Kabat及Chothia二者之組合CDR定義,且HCCDR 2-3及LCCDR
1-3係根據Kabat之CDR定義。在所有定義下,每一VH及VL通常包括三個CDR及四個FR,其自胺基末端至羧基末端按下列順序排列:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。
如本文所用之「免疫球蛋白可變結構域序列」係指可形成免疫球蛋白可變結構域之結構之胺基酸序列。舉例而言,序列可包括天然可變結構域之胺基酸序列之所有或一部分。舉例而言,該序列可或可不包括一個、兩個或更多個N或C末端胺基酸,或可包括與形成蛋白質結構相容之其他變化。
術語「抗原結合位點」係指抗體分子之包含形成結合至LAG-3多肽或其表位之界面之決定子的部分。關於蛋白質(或蛋白質模擬物),抗原結合位點通常包括(至少四個胺基酸或胺基酸模擬物之)一或多個形成結合至LAG-3多肽之界面的環。通常,抗體分子之抗原結合位點包括至少一個或兩個CDR及/或超變環,或更通常至少三個、四個、五個或六個CDR及/或超變環。
術語「競爭」或「交叉競爭」在本文中可互換使用且係指抗體分子干擾抗LAG-3抗體分子(例如本文所提供之抗LAG-3抗體分子)與靶(例如人類LAG-3)結合之能力。對結合之干擾可為直接或間接的(例如,經由別位調節抗體分子或靶)。抗體分子能夠干擾另一抗體分子與靶結合之程度及因此是否可認為其具有競爭性可使用競爭結合分析(例如FACS分析、ELISA或BIACORE分析)來確定。在一些實施例中,競爭結合分析係定量競爭分析。在一些實施例中,在競爭結合分析(例如,本文所述之競爭分析)中,當第一抗體分子與靶之結合降低10%或更高、例如20%或更高、30%或更高、40%或更高、50%或更高、55%或更高、60%或更高、65%或更高、70%或更高、75%或更高、80%或更高、85%或更高、90%或更高、95%或更高、98%或更高、99%或更高時,認為第一抗LAG-3抗體分子與第二抗LAG-3抗體
分子競爭結合至靶。
如本文所用之術語「表位」係指抗原(例如,人類LAG-3)之與抗體分子特異性相互作用之部分。該等部分(在本文中稱為表位決定子)通常包含諸如胺基酸側鏈或糖側鏈等元件或係其一部分。表位決定子可藉由業內已知或本文所揭示之方法(例如藉由結晶學或藉由氫-氘交換)來定義。抗體分子上與表位決定子特異性相互作用之至少一個或一些部分通常位於CDR中。通常,表位具有特定三維結構特徵。通常,表位具有特定電荷特徵。一些表位係直鏈表位,而其他表位為構象表位。
如本文所使用之術語「單株抗體」或「單株抗體組合物」係指具有單一分子組成之抗體分子製劑。單株抗體組合物展示針對具體表位之單一結合特異性及親和力。單株抗體可藉由雜交瘤技術或藉由不使用雜交瘤技術之方法(例如,重組方法)來製備。
「有效人類」蛋白係不會誘發中和抗體反應(例如人類抗鼠類抗體(HAMA)反應)之蛋白質。HAMA可能在多種情況下有問題,例如若重複投與抗體分子,例如在治療慢性或復發性疾病病況中。HAMA反應可使重複抗體投與可能無效,此乃因增加抗體自血清之清除率(例如,參見Saleh等人,Cancer Immunol.Immunother.,32:180-190(1990))亦及潛在過敏反應(例如,參見LoBuglio等人,Hybridoma,5:5117-5123(1986))。
抗體分子可為多株或單株抗體。在其他實施例中,抗體可以重組方式產生,例如藉由噬菌體展示或藉由組合方法產生。
用於產生抗體之噬菌體展示及組合方法為業內已知(如例如以下文獻中所述:Ladner等人,美國專利第5,223,409號;Kang等人,國際公開案第WO 92/18619號;Dower等人,國際公開案第WO 91/17271號;Winter等人,國際公開案WO 92/20791;Markland等人,國際公
開案第WO 92/15679號;Breitling等人,國際公開案WO 93/01288;McCafferty等人,國際公開案第WO 92/01047號;Garrard等人,國際公開案第WO 92/09690號;Ladner等人,國際公開案第WO 90/02809號;Fuchs等人(1991)Bio/Technology 9:1370-1372;Hay等人(1992)Hum Antibod Hybridomas 3:81-85;Huse等人(1989)Science 246:1275-1281;Griffths等人(1993)EMBO J 12:725-734;Hawkins等人(1992)J Mol Biol 226:889-896;Clackson等人(1991)Nature 352:624-628;Gram等人(1992)PNAS 89:3576-3580;Garrad等人(1991)Bio/Technology 9:1373-1377;Hoogenboom等人(1991)Nuc Acid Res 19:4133-4137;及Barbas等人(1991)PNAS 88:7978-7982,該等所有文獻之內容皆以引用方式併入本文中)。
在一個實施例中,抗體係完整人類抗體(例如,在已經遺傳改造以產生來自人類免疫球蛋白序列之抗體的小鼠中製備之抗體);或非人類抗體,例如齧齒類動物(小鼠或大鼠)抗體、山羊抗體、靈長類動物(例如,猴)抗體、駱駝抗體。較佳地,非人類抗體係齧齒類動物(小鼠或大鼠)抗體。產生齧齒類動物抗體之方法為業內已知。
人類單株抗體可使用攜載人類免疫球蛋白基因之轉基因小鼠而非小鼠系統產生。使用來自該等經所關注抗原免疫之轉基因小鼠之脾細胞來產生分泌對來自人類蛋白質之表位具有特異性親和力之人類mAb的雜交瘤(例如,參見Wood等人國際申請案WO 91/00906、Kucherlapati等人PCT公開案WO 91/10741;Lonberg等人國際申請案WO 92/03918;Kay等人國際申請案92/03917;Lonberg,N.等人1994Nature 368:856-859;Green,L.L.等人1994 Nature Genet.7:13-21;Morrison,S.L.等人1994 Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:6851-6855;Bruggeman等人1993 Year Immunol 7:33-40;Tuaillon等人1993 PNAS 90:3720-3724;Bruggeman等人1991 Eur J Immunol 21:1323-1326)。
抗體可係其中可變區或其部分(例如CDR)係在非人類生物體(例如大鼠或小鼠)中產生者。嵌合、CDR移植及人類化抗體在本發明內。在非人類生物體(例如大鼠或小鼠)中產生且然後修飾例如可變框架或恆定區以降低人類中之抗原性之抗體在本發明內。
嵌合抗體可藉由業內已知之重組DNA技術來產生(參見Robinson等人,國際專利公開案PCT/US86/02269;Akira等人,歐洲專利申請案184,187;Taniguchi,M.,歐洲專利申請案171,496;Morrison等人,歐洲專利申請案173,494;Neuberger等人,國際申請案WO 86/01533;Cabilly等人,美國專利第4,816,567號;Cabilly等人,歐洲專利申請案125,023;Better等人(1988 Science 240:1041-1043);Liu等人(1987)PNAS 84:3439-3443;Liu等人,1987,J.Immunol.139:3521-3526;Sun等人(1987)PNAS 84:214-218;Nishimura等人,1987,Canc.Res.47:999-1005;Wood等人(1985)Nature 314:446-449;及Shaw等人,1988,J.Natl Cancer Inst.80:1553-1559)。
人類化或CDR移植抗體將具有(免疫球蛋白重鏈及或輕鏈之)至少一個或兩個、但通常所有三個經供體CDR替代之接受者CDR。抗體可經非人類CDR之至少一部分替代或僅一些CDR可經非人類CDR替代。僅需要替代人類化抗體與LAG-3結合所需之CDR數。較佳地,供體將係齧齒類動物抗體,例如大鼠或小鼠抗體,且接受者將係人類框架或人類共有框架。通常,提供CDR之免疫球蛋白稱為「供體」,且提供框架之免疫球蛋白稱為「受體」。在一個實施例中,供體免疫球蛋白為非人類(例如,齧齒類動物)免疫球蛋白。受體框架為天然(例如,人類)框架或共有框架,或與其約85%或更高、較佳90%、95%、99%或更高一致之序列。
如本文所用之術語「共有序列」係指自相關序列家族中之最常見胺基酸(或核苷酸)形成之序列(例如,參見Winnaker,From Genes to
Clones(Verlagsgesellschaft,Weinheim,Germany 1987)。在蛋白質家族中,該家族中該位置處最常見之胺基酸佔據共有序列中之每一位置。若兩個胺基酸同等頻繁出現,則共有序列中可包括任一者。術語「共有框架」係指共有免疫球蛋白序列中之框架區。
抗體可藉由業內已知之方法人類化(例如,參見Morrison,S.L.,1985,Science 229:1202-1207;Oi等人,1986,BioTechniques 4:214;及Queen等人,US 5,585,089、US 5,693,761及US 5,693,762,該等所有文獻之內容皆以引用方式併入本文中)。
人類化或CDR移植抗體可藉由CDR移植或CDR取代來產生,其中免疫球蛋白鏈之一個、兩個或所有CDR皆可經替代。例如,參見美國專利5,225,539;Jones等人1986 Nature 321:552-525;Verhoeyan等人1988 Science 239:1534;Beidler等人1988J.Immunol.141:4053-4060;Winter US 5,225,539,該等所有文獻之內容皆以引用方式併入本文中。Winter闡述可用於製備本發明之人類化抗體之CDR移植方法(於1987年3月26日提出申請之UK專利申請案GB 2188638A;Winter US 5,225,539),該申請案之內容以引用方式併入本文中。
已取代、缺失或添加特定胺基酸之人類化抗體亦在本發明範疇內。用於自供體選擇胺基酸之準則闡述於US 5,585,089(例如US 5,585,089之第12-16行)中,該等文獻之內容以引用方式併入本文中。用於人類化抗體之其他技術闡述於1992年12月23日公開之Padlan等人,EP 519596 A1中。
抗體分子可為單鏈抗體。單鏈抗體(scFV)可經改造(例如,參見Colcher,D.等人(1999)Ann N Y Acad Sci 880:263-80;及Reiter,Y.(1996)Clin Cancer Res 2:245-52)。單鏈抗體可經二聚化或多聚化以產生具有針對同一靶蛋白之不同表位之特異性的多價抗體。
在其他實施例中,抗體分子具有選自例如以下各項之重鏈恆定
區:IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD及IgE之重鏈恆定區;尤其IgG1、IgG2、IgG3及IgG4之(例如,人類)重鏈恆定區。在另一個實施例中,抗體分子具有選自例如κ或λ之(例如,人類)輕鏈恆定區之輕鏈恆定區。可改變(例如突變)恆定區以改變抗體之性質(例如,增加或減少以下中之一或多者:Fc受體結合、抗體糖基化、半胱胺酸殘基數、效應細胞功能及/或補體功能)。在一個實施例中,抗體具有:效應物功能;且可固定補體。在其他實施例中,抗體並不招募效應細胞;或固定補體。在另一個實施例中,抗體具有降低的或不具結合Fc受體之能力。舉例而言,其為同型或亞型、片段或其他突變體,此並不支持與Fc受體之結合,例如其具有誘變或缺失的Fc受體結合區域。
用於改變抗體恆定區之方法為業內已知。功能改變、例如對效應物配體(例如細胞上之FcR或補體之C1組份)之親和力改變之抗體可藉由用不同殘基替代抗體恆定部分中之至少一個胺基酸殘基來產生(例如,參見EP 388,151 A1、美國專利第5,624,821號及美國專利第5,648,260號,該等所有專利之內容皆以引用方式併入本文中)。若施用於施加至鼠類或其他物種免疫球蛋白,則可闡述將降低或消除該等功能之類似變化類型。
抗體分子可衍生或連接至另一功能分子(例如,另一肽或蛋白質)。如本文所用之「衍生」抗體分子係已經修飾者。衍生之方法包括(但不限於)添加螢光部分、放射性核苷酸、毒素、酶或親和力配體(例如生物素)。因此,本發明之抗體分子意欲包括本文所述抗體之衍生及其他修飾形式,包括免疫黏附分子。舉例而言,可將抗體分子以官能基方式連接(藉由化學偶合、基因融合、非共價締合或其他方式)至一或多個其他分子實體,例如另一抗體(例如,雙特異性抗體或雙價抗體)、可檢測劑、細胞毒性劑、醫藥劑及/或可調介該抗體或抗體
部分與另一分子之締合的蛋白質或肽(例如鏈黴抗生物素蛋白核心區或聚組胺酸標籤)。
一種類型之衍生抗體分子係藉由交聯兩種或更多種抗體(相同類型或不同類型,例如以產生雙特異性抗體)來產生。適宜交聯劑包括彼等具有兩個藉由適當間隔體分開之不同反應性基團之異雙官能交聯劑(例如,間-馬來醯亞胺基苯甲醯基-N-羥基琥珀醯亞胺酯)或同雙官能交聯劑(例如,辛二酸二琥珀醯亞胺酯)。該等連接體可自Pierce Chemical公司,Rockford,Ill獲得。
可衍生出(或標記)本發明之抗體分子之有用可檢測劑包括螢光化合物、各種酶、輔基、發光材料、生物發光材料、螢光發射金屬原子(例如銪(Eu)及其他鑭系)及放射性材料(下文所述)。實例性螢光可檢測劑包括螢光素、異硫氰酸螢光素、羅丹明(rhodamine)、5-二甲基胺-1-萘磺醯氯、藻紅素及諸如此類。亦可使用諸如鹼性磷酸酶、辣根過氧化物酶、β-半乳糖苷酶、乙醯膽鹼脂酶、葡萄糖氧化酶及諸如此類等可檢測酶來衍生抗體。當用可檢測酶衍生抗體時,其係藉由添加可供該酶利用以產生可檢測反應產物之額外試劑來檢測。舉例而言,當存在可檢測劑辣根過氧化物酶時,添加過氧化氫及二胺基聯苯胺可產生可檢測之有色反應產物。亦可使用輔基(例如,鏈黴抗生物素蛋白/生物素及抗生物素蛋白/生物素)來衍生抗體分子。舉例而言,可使用生物素來衍生抗體,並經由間接量測抗生物素蛋白或鏈黴抗生物素蛋白結合來檢測。適宜螢光材料之實例包括傘形酮、螢光黃、螢光黃異硫氰酸鹽、玫瑰紅、二氯三嗪基胺螢光黃、丹磺醯氯或藻紅素;發光材料之實例包括流明諾(luminol);且生物發光材料之實例包括螢光素酶、螢光素及水母素。
經標記抗體分子可以(例如)診斷及/或實驗方式用於多種情況下,包括(i)藉由諸如親和層析或免疫沈澱等標準技術來分離預定抗
原;(ii)檢測預定抗原(例如,在細胞溶解物或細胞上清液中),以評估蛋白質表現之豐度及模式;(iii)作為臨床測試程序之一部分,監測組織中之蛋白質含量,以(例如)確定給定治療方案之效能。
抗體分子可偶聯至另一分子實體,通常為標記或治療劑(例如,細胞毒性劑或細胞生長抑制劑)或部分。放射性同位素可用於診斷或治療應用中。可偶合至抗PSMA抗體之放射性同位素包括(但不限於)α-、β-或γ-發射體或β-及γ-發射體。該等放射性同位素包括(但不限於)碘(131I或125I)、釔(90Y)、鑥(177Lu)、錒(225Ac)、鐠、砈(211At)、錸(186Re)、鉍(212Bi或213Bi)、銦(111In)、鍀(99mTc)、磷(32P)、銠(188Rh)、硫(35S)、碳(14C)、氚(3H)、鉻(51Cr)、氯(36Cl)、鈷(57Co或58Co)、鐵(59Fe)、硒(75Se)或鎵(67Ga)。可用作治療劑之放射性同位素包括釔(90Y)、鑥(177Lu)、錒(225Ac)、鐠、砈(211At)、錸(186Re)、鉍(212Bi或213Bi)及銠(188Rh)。可用作例如診斷用標記之放射性同位素包括碘(131I或125I)、銦(111In)、鍀(99mTc)、磷(32P)、碳(14C)及氚(3H)或上文所列示之一或多種治療性同位素。
本發明提供經放射性標記之抗體分子及其標記方法。在一個實施例中,揭示標記抗體分子之方法。該方法包括使抗體分子與螯合劑接觸,由此產生偶聯抗體。使用放射性同位素(例如111銦、90釔及177鑥)對偶聯抗體進行放射性標記,由此產生經標記之抗體分子。
如上文所論述,抗體分子可偶聯至治療劑。已提及治療活性放射性同位素。其他治療劑之實例包括汰癌勝(taxol)、細胞鬆弛素B、短桿菌素D、溴乙錠、依米丁(emetine)、絲裂黴素、依託泊苷(etoposide)、替尼泊苷(tenoposide)、長春新鹼(vincristine)、長春鹼(vinblastine)、秋水仙鹼(colchicine)、多柔比星(doxorubicin)、道諾黴素(daunorubicin)、二羥基炭疽菌素二酮(dihydroxy anthracin dione)、米托蒽醌(mitoxantrone)、光輝黴素(mithramycin)、放線菌素D、1-去
氫睪甾酮(1-dehydrotestosterone)、糖皮質激素、普魯卡因(procaine)、四卡因(tetracaine)、利多卡因(lidocaine)、普萘洛爾(propranolol)、嘌呤黴素(puromycin)、類美登素(maytansinoid,例如美登木醇(maytansinol))(參見美國專利第5,208,020號)、CC-1065(參見美國專利第5,475,092號、第5,585,499號、第5,846,545號)及其類似物或同系物。治療劑包括(但不限於)抗代謝物(例如,胺甲喋呤、6-巰基嘌呤、6-硫鳥嘌呤、阿糖胞苷、5-氟尿嘧啶達卡巴嗪(5-fluorouracil decarbazine))、烷基化劑(例如,甲基二氯乙胺、塞替派(thiotepa)、氮芥苯丁酸、CC-1065、美法侖(melphalan)、卡莫司汀(carmustine,BSNU)及洛莫司汀(lomustine,CCNU)、環磷醯胺、白消安(busulfan)、二溴甘露醇、鏈佐黴素(streptozotocin)、絲裂黴素C及順式-二氯二胺鉑(II)(DDP)順鉑)、蒽環類(anthracyclines)(例如,道諾黴素(舊稱柔紅黴素(daunomycin))及多柔比星)、抗生素(例如,放線菌素(dactinomycin)(舊稱放線菌素(actinomycin))、博來黴素(bleomycin)、光輝黴素及安麯黴素(anthramycin,AMC))以及抗有絲分裂劑(例如,長春新鹼、長春鹼、汰癌勝及類美登素)。
在一個態樣中,本發明之特徵在於提供特異性結合至LAG-3受體之靶結合分子之方法。舉例而言,靶結合分子係抗體分子。該方法包括:提供包含非人類蛋白質之至少一部分之靶蛋白,該部分與人類靶蛋白之相應部分同源(至少70%、75%、80%、85%、87%、90%、92%、94%、95%、96%、97%、98%一致),但相差至少一個胺基酸(例如,至少一個、兩個、三個、四個、五個、六個、七個、八個或九個胺基酸);獲得特異性結合至抗原之抗體分子;及評估結合劑在調節靶蛋白活性方面之效能。該方法可進一步包括向人類個體投與結合劑(例如,抗體分子)或衍生物(例如,人類化抗體分子)。
本發明提供編碼上述抗體分子之經分離核酸分子、載體及其宿
主細胞。核酸分子包括(但不限於)RNA、基因組DNA及cDNA。
在某些實施例中,抗體分子係多特異性(例如,雙特異性或三特異性)抗體分子。用於產生雙特異性或異二聚體抗體分子之方案為業內已知;包括(但不限於)例如「隆凸於孔洞中」方式,例如US 5731168中所述;靜電牽引Fc配對,如例如WO 09/089004、WO 06/106905及WO 2010/129304中所述;鏈交換改造之結構域(SEED)異二聚體形成,如例如WO 07/110205中所述;Fab臂交換,如例如WO 08/119353、WO 2011/131746及WO 2013/060867中所述;雙抗體偶聯,其係使用具有胺反應性基團及硫氫基反應性基團之異雙官能試劑例如藉由抗體交聯來實施以產生二特異性結構,如例如US 4433059中所述;雙特異性抗體決定子,其係藉由還原及氧化兩條重鏈之間之二硫鍵的循環重組來自不同抗體之半抗體(重鏈-輕鏈對或Fab)產生,如例如US 4444878中所述;三功能抗體,例如經由硫氫基反應性基團交聯之三個Fab'片段,如例如US5273743中所述;生物合成結合蛋白,例如經由C末端尾、較佳經由二硫鍵或胺反應性化學交聯交聯之scFvs對,如例如US5534254中所述;雙功能抗體,例如經由已替代恆定結構域之白胺酸拉鍊(例如,c-fos及c-jun)二聚化且具有不同結合特異性之Fab片段,如例如US5582996中所述;雙特異性及低特異性單價及低價受體,例如兩種抗體(兩個Fab片段)之經由一種抗體之CH1區與通常締合有輕鏈之另一抗體之VH區之間的多肽間隔體連接之VH-CH1區,如例如US5591828中所述;雙特異性DNA-抗體偶聯物,例如經由雙鏈DNA片段交聯抗體或Fab片段,如例如US5635602中所述;雙特異性融合蛋白,例如含有兩個scFv(在其與完整恆定區之間具有親水螺旋肽連接體)之表現構築體,如例如US5637481中所述;多價及多特異性結合蛋白,例如多肽之二聚體,其具有具Ig重鏈可變區之結合區域之第一結構域及具Ig輕鏈可變區之結合區域的第二結構域,通常
稱為雙價抗體(亦涵蓋高次結構以產生雙特異性、三特異性或四特異性分子,如例如US5837242中所述;微小抗體構築體,其連接的VL與VH鏈藉助肽間隔體進一步連結至抗體鉸鏈區及CH3區,其可二聚化形成雙特異性/多價分子,如例如US5837821中所述;使用短肽連接體(例如,5個或10個胺基酸)或根本不使用連接體以任一取向連接之VH及VL結構域,此可形成二聚體以形成雙特異性雙價抗體;三聚體及四聚體,如例如US5844094中所述;藉由肽鍵與C末端之可交聯基團連結之VH結構域(或家族成員之VL結構域)串進一步與VL結構域締合以形成一系列FV(或scFv),如例如US5864019中所述;及經由肽連接體連接之具有VH及VL結構域二者之單鏈結合多肽經由非共價或化學交聯組合成多價結構,以形成例如使用scFV或雙價抗體型格式二者的同二價、異二價、三價及四價結構,如例如US5869620中所述。其他實例性多特異性及雙特異性分子及其製備方法參見例如US5910573、US5932448、US5959083、US5989830、US6005079、US6239259、US6294353、US6333396、US6476198、US6511663、US6670453、US6743896、US6809185、US6833441、US7129330、US7183076、US7521056、US7527787、US7534866、US7612181、US2002004587A1、US2002076406A1、US2002103345A1、US2003207346A1、US2003211078A1、US2004219643A1、US2004220388A1、US2004242847A1、US2005003403A1、US2005004352A1、US2005069552A1、US2005079170A1、US2005100543A1、US2005136049A1、US2005136051A1、US2005163782A1、US2005266425A1、US2006083747A1、US2006120960A1、US2006204493A1、US2006263367A1、US2007004909A1、US2007087381A1、US2007128150A1、US2007141049A1、US2007154901A1、US2007274985A1、
US2008050370A1、US2008069820A1、US2008152645A1、US2008171855A1、US2008241884A1、US2008254512A1、US2008260738A1、US2009130106A1、US2009148905A1、US2009155275A1、US2009162359A1、US2009162360A1、US2009175851A1、US2009175867A1、US2009232811A1、US2009234105A1、US2009263392A1、US2009274649A1、EP346087A2、WO0006605A2、WO02072635A2、WO04081051A1、WO06020258A2、WO2007044887A2、WO2007095338A2、WO2007137760A2、WO2008119353A1、WO2009021754A2、WO2009068630A1、WO9103493A1、WO9323537A1、WO9409131A1、WO9412625A2、WO9509917A1、WO9637621A2、WO9964460A1。上文所提及申請案之內容之全文皆以引用方式併入本文中。
在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子(例如,單特異性、雙特異性或多特異性抗體分子)共價連接(例如融合)至另一伴侶(例如蛋白質,例如一種、兩種或更多種細胞介素)例如作為融合分子(例如融合蛋白)。在其他實施例中,融合分子包含一或多種蛋白質,例如一種、兩種或更多種細胞介素。在一個實施例中,細胞介素係選自IL-1、IL-2、IL-12、IL-15或IL-21中之一者、兩者、三者或更多者之介白素(IL)。在一個實施例中,雙特異性抗體分子具有針對第一靶(例如,針對LAG-3)之第一結合特異性、針對第二靶(例如,PD-1、TIM-3或PD-L1)之第二結合特異性,且視情況連接至介白素(例如,IL-12)結構域,例如全長IL-12或其部分。
「融合蛋白」及「融合多肽」係指至少兩個部分共價連接在一起之多肽,其中該等部分中之每一者係具有不同性質之多肽。該性質可係生物性質,例如活體外或活體內活性。該性質亦可係簡單化學或
物理性質,例如結合至靶分子、催化反應等。該兩個部分可藉由單一肽鍵或經由肽連接體直接連接,但彼此處於閱讀框中。
本發明提供編碼上述抗體分子之經分離核酸分子、載體及其宿主細胞。該核酸分子包括(但不限於)RNA、基因組DNA及cDNA。
在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子包含:(i)重鏈可變區(VH),其包含選自SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:286之VHCDR1胺基酸序列;SEQ ID NO:2之VHCDR2胺基酸序列;及SEQ ID NO:3之VHCDR3胺基酸序列;及(ii)輕鏈可變區(VL),其包含SEQ ID NO:10之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO:11之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO:12之VLCDR3胺基酸序列。
在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子包含:(i)重鏈可變區(VH),其包含選自SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:286之VHCDR1胺基酸序列;SEQ ID NO:5之VHCDR2胺基酸序列,及SEQ ID NO:3之VHCDR3胺基酸序列;及(ii)輕鏈可變區(VL),其包含SEQ ID NO:13之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO:14之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO:15之VLCDR3胺基酸序列。
在上述抗體分子之實施例中,VHCDR1包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列。在其他實施例中,VHCDR1包含SEQ ID NO:4之胺基酸序列。在其他實施例中,VHCDR1包含SEQ ID NO:286之胺基酸序列。
在實施例中,上述抗體分子具有包含至少一個框架(FW)區之重鏈可變區,該至少一個框架(FW)區包含SEQ ID NO:187、190、194、196、198、202、206、208、210、212、217、219或221中任一者之胺基酸序列,或與其至少90%一致之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:
187、190、194、196、198、202、206、208、210、212、217、219或221中任一者之胺基酸序列相比具有不超過兩個的胺基酸取代、插入或缺失。
在其他實施例中,上述抗體分子具有包含至少一個框架區之重鏈可變區,該至少一個框架區包含SEQ ID NO:187、190、194、196、198、202、206、208、210、212、217、219或221中任一者之胺基酸序列。
在其他實施例中,上述抗體分子具有包含至少兩個、三個或四個框架區之重鏈可變區,該等框架區包含SEQ ID NO:187、190、194、196、198、202、206、208、210、212、217、219或221中任一者之胺基酸序列。
在其他實施例中,上述抗體分子包含SEQ ID NO:187、190、194或196之VHFW1胺基酸序列、SEQ ID NO:198、202、206或208之VHFW2胺基酸序列及SEQ ID NO:210、212、217或219之VHFW3胺基酸序列,且視情況進一步包含SEQ ID NO:221之VHFW4胺基酸序列。
在其他實施例中,上述抗體分子具有包含至少一個框架區之輕鏈可變區,該至少一個框架區包含SEQ ID NO:226、230、232、234、236、238、240、244、246、248、252、255、259、261、265、267、269或271中任一者之胺基酸序列,或與其至少90%一致之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:226、230、232、234、236、238、240、244、246、248、252、255、259、261、265、267、269或271中任一者之胺基酸序列相比具有不超過兩個的胺基酸取代、插入或缺失。
在其他實施例中,上述抗體分子具有包含至少一個框架區之輕鏈可變區,該至少一個框架區包含SEQ ID NO:226、230、232、234、236、238、240、244、246、248、252、255、259、261、265、
267、269或271中任一者之胺基酸序列。
在其他實施例中,上述抗體分子具有包含至少兩個、三個或四個框架區之輕鏈可變區,該等框架區包含SEQ ID NO:226、230、232、234、236、238、240、244、246、248、252、255、259、261、265、267、269或271中任一者之胺基酸序列。
在其他實施例中,上述抗體分子包含SEQ ID NO:226、230、232、234、236或238之VLFW1胺基酸序列、SEQ ID NO:240、244、246或248之VLFW2胺基酸序列及SEQ ID NO:252、255、259、261、265、267或269之VLFW3胺基酸序列,且視情況進一步包含SEQ ID NO:271之VLFW4胺基酸序列。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括與SEQ ID NO:8、28、64、68、72、76、80、100、104或108中之任一者至少85%一致之胺基酸序列的重鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:8、28、64、68、72、76、80、100、104或108之胺基酸序列的重鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括與SEQ ID NO:32、36、40、44、48、52、56、60、84、88、92或96中之任一者至少85%一致之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:32、36、40、44、48、52、56、60、84、88、92或96之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:8之胺基酸序列的重鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:18之胺基酸序列的重鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:28之胺基酸序列的重鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:30之胺基酸序列的重鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:64之胺基酸序列的重鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:66之胺基酸序列的重鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:68之胺基酸序列的重鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:70之胺基酸序列的重鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:72之胺基酸序列的重鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:74之胺基酸序列的重鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:76之胺基酸序列的重鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:78之胺基酸序列的重鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:80之胺基酸序列的重鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:82之胺基酸序列的重鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:100之胺基酸序列的重鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:102或SEQ ID NO:113之胺基酸序列的重鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:104之胺基酸序列的重鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:106之胺基酸序列的重鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:122之胺基酸序列的重鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:108之胺基酸序列的重鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:110之胺基酸序列的重鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:134之胺基酸序列的重鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:34之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:36之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:40之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:42之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:44之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:46之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:48之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:50之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:52之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:54之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:56之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:58之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:60之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:62之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:84之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:86之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:88之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:90之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:92之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:94之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:96之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:98之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:32之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:36之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:40之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:44之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:48之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:28或SEQ
ID NO:100之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:52之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:56之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:60之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:64或SEQ ID NO:104之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:36之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:64或SEQ ID NO:104之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:40之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:64或SEQ ID NO:104之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:56之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:64或SEQ ID NO:104之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:60之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:68或SEQ ID NO:108之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:36之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:72或SEQ ID NO:8之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:40之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:72或SEQ ID NO:8之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:60之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:76之胺基酸序列的重鏈可變結構域及包括SEQ ID NO:60之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:80之胺基酸序列的重鏈可變結構域及包括SEQ ID NO:84之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:88之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:92之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:64或SEQ ID NO:104之胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:96之胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:34之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:42之胺基酸序
列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:46之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:50之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:54之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:58之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:62之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:66或SEQ ID NO:106之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:66或SEQ ID NO:106之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:42之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:66或SEQ ID NO:106之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:58之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:66或SEQ
ID NO:106之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:62之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:70或SEQ ID NO:110之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:74或SEQ ID NO:18之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:42之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:74或SEQ ID NO:18之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:62之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:78之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:62之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:82之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:86之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:94之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:66或SEQ ID NO:106之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:98之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:113之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:34之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:113之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:122之胺基
酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:122之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:58之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子包含包括SEQ ID NO:134之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈。
在其他實施例中,上述抗體分子選自Fab、F(ab')2、Fv或單鏈Fv片段(scFv)。
在其他實施例中,上述抗體分子包含選自IgG1、IgG2、IgG3及IgG4之重鏈恆定區。
在其他實施例中,上述抗體分子包含選自κ或λ之輕鏈恆定區之輕鏈恆定區。
在其他實施例中,上述抗體分子包含具有根據EU編號之位置228處或SEQ ID NO:275或277之位置108處的突變之人類IgG4重鏈恆定區,及κ輕鏈恆定區。
在其他實施例中,上述抗體分子包含具有根據EU編號之位置228處或SEQ ID NO:275或277之位置108處的絲胺酸至脯胺酸突變之人類IgG4重鏈恆定區,及κ輕鏈恆定區。
在其他實施例中,上述抗體分子包含具有根據EU編號之位置297處或SEQ ID NO:279之位置180處的天冬醯胺至丙胺酸突變之人類IgG1重鏈恆定區,及κ輕鏈恆定區。
在其他實施例中,上述抗體分子包含具有根據EU編號之位置265處或SEQ ID NO:280之位置148處的天冬胺酸至丙胺酸突變及根據EU編號之位置329處或SEQ ID NO:280之位置212處的脯胺酸至丙胺酸突變之人類IgG1重鏈恆定區,及κ輕鏈恆定區。
在其他實施例中,上述抗體分子包含具有根據EU編號之位置234處或SEQ ID NO:281之位置117處的白胺酸至丙胺酸突變及根據EU編
號之位置235處或SEQ ID NO:281之位置118處的白胺酸至丙胺酸突變之人類IgG1重鏈恆定區,及κ輕鏈恆定區。
在其他實施例中,上述抗體分子能夠以小於約0.2nM之解離常數(KD)結合至人類LAG-3。
在一些實施例中,上述抗體分子以下列KD結合至人類LAG-3:小於約0.2nM、0.15nM、0.1nM、0.05nM或0.02nM,例如約0.05nM至0.15nM,例如約0.11nM,如例如藉由Biacore方法所量測。
在其他實施例中,上述抗體分子以下列KD結合至食蟹猴LAG-3:小於約0.2nM、0.15nM、0.1nM、0.05nM或0.02nM,例如約0.05nM至0.15nM,如例如藉由Biacore方法所量測。
在某些實施例中,上述抗體分子以例如介於nM範圍內之類似KD結合至人類LAG-3及食蟹猴LAG-3二者,如例如藉由Biacore方法所量測。在一些實施例中,上述抗體分子以下列KD結合至人類LAG-3-Ig融合蛋白:小於約0.5nM、0.2nM、0.1nM、0.05nM、0.025nM或0.01nM,如例如藉由ELISA所量測。
在一些實施例中,上述抗體分子以下列KD結合至表現人類LAG-3之CHO細胞(例如,人類LAG-3轉染之CHO細胞):小於約4nM、2.5nM、2nM、1.5nM、1nM、0.75nM、0.5nM、0.4nM、0.3nM、0.2nM、0.1nM或0.05nM,例如約2.3nM、1.92nM或約0.2nM,如例如藉由FACS分析所量測。
在一些實施例中,上述抗體分子以下列KD結合至人類T細胞:小於約0.5nM、0.4nM、0.3nM、0.2nM、0.1nM或0.05nM,例如約0.26nM,如例如藉由FACS分析所量測。
在一些實施例中,上述抗體分子以下列KD結合至表現LAG-3之細胞(例如,表現人類LAG-3之300.19細胞):小於約20nM、15nM、10nM、5nM、2nM或1nM,例如約13.6nM,如例如藉由FACS分析
所量測。
在一些實施例中,上述抗體分子以下列KD結合至表現恒河猴LAG-3之細胞(例如,經恒河猴LAG-3轉染之細胞):小於約15nM、10nM、9nM、8nM、6nM、5nM、2nM或1nM,例如約8.03nM,如例如藉由FACS分析所量測。
在某些實施例中,上述抗體分子不與小鼠LAG-3交叉反應。在一些實施例中,上述抗體不與大鼠LAG-3交叉反應。在其他實施例中,上述抗體與恒河猴LAG-3交叉反應。在一些實施例中,上述抗體與大鼠LAG-3交叉反應。舉例而言,可藉由Biacore方法或結合分析使用表現LAG-3之細胞(例如,表現人類LAG-3之300.19細胞)來量測交叉反應性。
在其他實施例中,上述抗體分子結合LAG-3(例如,人類LAG-3)之細胞外Ig樣結構域,例如結構域1(D1)、結構域2(D2)、結構域3(D3)或結構域4(D4)中之任一者。在一些實施例中,上述抗體分子結合D1中之一或多個胺基酸殘基。在一些實施例中,上述抗體分子不結合D1之額外環或其片段(例如,如藉由Biacore方法或FACS方法所量測)。在一些實施例中,上述抗體不結合D2。在一些實施例中,上述抗體分子結合D1及D2二者。在一些實施例中,上述抗體分子結合D1及/或D2中之一或多個結合II類MHC分子之胺基酸殘基。在其他實施例中,上述抗體分子能夠減少LAG-3與II類主要組織相容性(MHC)分子或表現II類MHC分子之細胞的結合。在一些實施例中,上述抗體分子會減少(例如,阻斷)LAG-3-Ig與例如Raji細胞或Daudi細胞上II類MHC分子之結合,且IC50小於約10nM、8nM、5nM、4nM、3nM、2nM、1nM或0.5nM,例如介於約8nM與約10nM之間或介於約2nM與約3nM之間,例如約5.5nM或約2.3nM。
在其他實施例中,上述抗體分子能夠增強抗原特異性T細胞反
應。
在實施例中,抗體分子係單特異性抗體分子或雙特異性抗體分子。在實施例中,抗體分子具有針對LAG-3之第一結合特異性及針對PD-1、TIM-3、CEACAM(例如,CEACAM-1及/或CEACAM-5)、PD-L1或PD-L2之第二結合特異性。在實施例中,抗體分子包含抗體之抗原結合片段,例如半抗體或半抗體之抗原結合片段。
在一些實施例中,與使用同型對照(例如,IgG4)時IL-2之表現相比,上述抗體分子使來自經葡萄球菌腸毒素B(SEB)(例如,在25μg/mL下)活化之細胞之IL-2的表現增加至少約2倍、3倍、4倍、5倍,例如約2倍至3倍,例如如在SEB T細胞活化分析或人類全血離體分析中所量測。
在一些實施例中,與使用同型對照(例如,IgG4)時IFN-γ之表現相比,上述抗體分子使來自經抗CD3(例如,在0.1μg/mL下)刺激之T細胞之IFN-γ的表現增加至少約0.5倍、1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍或8倍,例如約0.9倍至5.1倍,例如約3倍,例如如在IFN-γ活性分析中所量測。
在一些實施例中,與使用同型對照(例如,IgG4)時IFN-γ之表現相比,上述抗體分子使經SEB(例如,在3pg/mL下)活化之T細胞之IFN-γ的表現增加至少約2倍、3倍、4倍、5倍,例如約1.2倍至2倍,例如約1.6倍,例如如在IFN-γ活性分析中所量測。
在一些實施例中,在T細胞受體不活化的情況下(例如不存在SEB下),上述抗體分子不會增加IL-2或IFN-γ之表現。
在一些實施例中,與使用同型對照(例如,IgG4)時IFN-γ之表現相比,上述抗體分子使來自經CMV肽活化之T細胞之IFN-γ的表現增加至少約2倍、3倍、4倍、5倍,例如約1.1倍至1.7倍,例如約1.4倍,例如如在IFN-γ活性分析中所量測。在一些實施例中,與使用同型對
照(例如,IgG4)時CD8+ T細胞之增殖相比,上述抗體分子使經CMV肽活化之CD8+ T細胞之增殖增加至少約1倍、2倍、3倍、4倍、5倍,例如約1.5倍,例如如藉由通過至少n次(例如,n=2或4)細胞分裂之CD8+ T細胞之百分比所量測。
在某些實施例中,上述抗體分子之Cmax介於約50μg/mL與約400μg/mL之間、介於約100μg/mL與約350μg/mL之間、介於約150μg/mL與約300μg/mL之間或介於約200μg/mL與約250μg/mL之間,例如約166μg/mL,例如如在動物中所量測。
在某些實施例中,上述抗體分子之T1/2介於約50小時與約400小時之間、介於約100小時與約350小時之間、介於約150小時與約300小時之間或介於約200小時與約250小時之間,例如約231.9小時,例如如在動物中所量測。
在一些實施例中,上述抗體分子以小於5×10-4s-1、1×10-4s-1、5×10-5s-1或1×10-5s-1、例如約7×10-5s-1之Kd結合至LAG-3,如例如藉由Biacore方法所量測。在一些實施例中,上述抗體以大於1×104M-1s-1、5×104M-1s-1、1×105M-1s-1、5×105M-1s-1或1×106M-1s-1、例如約6.41×105M-1s-1之Ka結合至LAG-3,如例如藉由Biacore方法所量測。
在另一個態樣中,本發明提供編碼任一上述抗體分子之經分離核酸分子、載體及其宿主細胞。
在一個實施例中,經分離核酸編碼任一上述抗體分子之抗體重鏈可變區或輕鏈可變區或二者。
在一個實施例中,經分離核酸編碼重鏈CDR 1-3,其中該核酸包含SEQ ID NO:140-144、151-155、162-166、173-177、184-186或287之核苷酸序列。
在另一個實施例中,經分離核酸編碼輕鏈CDR 1-3,其中該核酸包含SEQ ID NO:145-150、156-161、167-172或178-183之核苷酸序
列。
在其他實施例中,上述核酸進一步包含編碼重鏈可變結構域之核苷酸序列,其中該核苷酸序列與SEQ ID NO:9、29、65、69、73、77、81、101、105、109、112、121、124、125、132或133中之任一者至少85%一致。
在其他實施例中,上述核酸進一步包含編碼重鏈可變結構域之核苷酸序列,其中該核苷酸序列包含SEQ ID NO:9、29、65、69、73、77、81、101、105、109、112、121、124、125、132或133中之任一者。
在其他實施例中,上述核酸進一步包含編碼重鏈之核苷酸序列,其中該核苷酸序列與SEQ ID NO:19、31、67、71、75、79、83、103、107、111、114、123、126、127、135或136中之任一者至少85%一致。
在其他實施例中,上述核酸進一步包含編碼重鏈之核苷酸序列,其中該核苷酸序列包含SEQ ID NO:19、31、67、71、75、79、83、103、107、111、114、123、126、127、135或136中之任一者。
在其他實施例中,上述核酸進一步包含編碼輕鏈可變結構域之核苷酸序列,其中該核苷酸序列與SEQ ID NO:33、37、41、45、49、53、57、61、85、89、93、97、115、118、128、129或137中之任一者至少85%一致。
在其他實施例中,上述核酸進一步包含編碼輕鏈可變結構域之核苷酸序列,其中該核苷酸序列包含SEQ ID NO:33、37、41、45、49、53、57、61、85、89、93、97、115、118、128、129或137中之任一者。
在其他實施例中,上述核酸進一步包含編碼輕鏈之核苷酸序列,其中該核苷酸序列與SEQ ID NO:35、39、43、47、51、55、
59、63、87、91、95、99、117、120、130、131、138或139中之任一者至少85%一致。
在其他實施例中,上述核酸進一步包含編碼輕鏈之核苷酸序列,其中該核苷酸序列包含SEQ ID NO:35、39、43、47、51、55、59、63、87、91、95、99、117、120、130、131、138或139中之任一者。
在某些實施例中,提供一或多個包含上述核酸之表現載體及宿主細胞。
亦提供產生抗體分子或其片段之方法,其包含在適於基因表現之條件下培養如本文所述之宿主細胞。
在另一個態樣中,本發明提供組合物、例如醫藥上可接受之組合物,其包括與醫藥上可接受之載劑調配在一起之本文所述之抗體分子。如本文所用之「醫藥上可接受之載劑」包括在生理上相容之任何及所有溶劑、分散介質、等滲劑及吸收延遲劑及諸如此類。載劑可適於靜脈內、肌內、皮下、非經腸、直腸、脊柱或表皮投與(例如,藉由注射或輸注)。
本發明組合物可呈眾多種形式。該等形式包括(例如)液體、半固體及固體劑型,例如液體溶液(例如,可注射及可輸注溶液)、分散液或懸浮液、脂質體及栓劑。較佳形式端視預期投與模式及治療應用而定。典型較佳組合物呈可注射或可輸注溶液形式。較佳投與模式係非經腸(例如,靜脈內、皮下、腹膜內、肌內)。在較佳實施例中,抗體係藉由靜脈內輸注或注射來投與。在另一較佳實施例中,抗體係藉由肌內或皮下注射來投與。
如本文所用之片語「非經腸投與」及「以非經腸方式投與」意指除經腸及局部投與外之投與模式,通常係藉由注射且包括(但不限
於)靜脈內、肌內、動脈內、鞘內、莢膜內、眼窩內、心臟內、皮內、腹膜內、經氣管、皮下、表皮下、關節內、囊下、蛛網膜下、經脊柱內胸骨內注射及輸注。
治療組合物通常應無菌且在製造及儲存條件下穩定。該組合物可調配成溶液、微乳液、分散液、脂質體或其他適於高抗體濃度之有序結構。無菌可注射溶液可藉由以下步驟來製備:將所需量之活性化合物(即抗體或抗體部分)納入具有上文所列舉成份中之一者或組合(視需要)的適宜溶劑中,隨後進行過濾滅菌。通常,藉由將活性化合物納入含有基本分散介質及來自彼等上文所列舉者之所需其他成份的無菌媒劑中來製備分散液。在使用無菌粉末來製備無菌可注射溶液之情形下,較佳製備方法係真空乾燥及冷凍乾燥,此自預先經無菌過濾之溶液產生具有活性成份加上任一其他期望成份之粉末。可藉由(例如)利用諸如卵磷脂等包衣、藉由維持所需粒徑(就分散液而言)以及藉由利用表面活性劑維持恰當的流動性。可藉由向組合物中納入延遲吸收之藥劑(例如,單硬脂酸鹽及明膠)來延長可注射組合物之吸收。
抗體分子可藉由眾多種業內已知方法來投與,但對於許多治療應用,較佳投與途徑/模式係靜脈內注射或輸注。在一個實施例中,抗體分子係藉由靜脈內輸注以大於20mg/min、例如20-40mg/min、且較佳大於或等於40mg/min之速率投與,以達到約35mg/m2至440mg/m2、較佳約70mg/m2至310mg/m2、且更佳約110mg/m2至130mg/m2之劑量。在另一個實施例中,抗體分子係藉由靜脈內輸注以小於10mg/min、較佳小於或等於5mg/min之速率投與,以達到約1mg/m2至100mg/m2、較佳約5mg/m2至50mg/m2、約7mg/m2至25mg/m2、且更佳約10mg/m2之劑量。如熟習此項技術者將瞭解,投與途徑及/或模式將端視期望結果而變化。在某些實施例中,活性化合物可使用可防止該化合物快速釋放之載劑(例如受控釋放調配物,包
括植入物、經皮貼劑及微囊化遞送系統)來製備。可使用生物可降解之生物相容性聚合物,例如乙烯基乙酸乙烯酯、聚酸酐、聚乙醇酸、膠原、聚原酸酯及聚乳酸。用於製備該等調配物之許多方法已獲得專利權或通常為彼等熟習此項技術者已知。例如,參見Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems,J.R.Robinson編輯,Marcel Dekker公司,New York,1978。
在某些實施例中,抗體分子可(例如)與惰性稀釋劑或可同化之食用載劑一起經口投與。亦可將該化合物(及其他成份,若需要)封裝入硬殼或軟殼明膠膠囊中、壓縮成錠劑或直接納入個體飲食中。就經口治療投與而言,可將化合物與賦形劑一起納入並以可吸收錠劑、口含錠、喉錠、膠囊、酏劑、懸浮液、糖漿、糯米紙囊劑及諸如此類等形式利用。為藉由除非經腸投與外之途徑投與本發明化合物,可能需要用材料包覆該化合物或與該化合物共投與以防止其失活。治療性組合物亦可與業內已知之醫學裝置一起投與。
可對劑量方案進行調整以提供最佳期望反應(例如治療反應)。例如,可投與單次濃注,可隨時間投與若干個分開劑量或可根據治療狀況之緊急程度所指示按比例減少或增加劑量。尤其有利的係將非經腸組合物調配成劑量單元形式以便於投與及劑量均勻性。如本文所用之劑量單元形式係指適於作為單位劑量供欲治療個體使用之物理離散單元;各單元含有經計算與所需醫藥載劑一起產生期望治療效應之預定量之活性化合物。本發明之劑量單元形式之規格取決於且直接依賴於下列因素:(a)活性化合物之獨特特徵及欲達成之具體治療效應,及(b)複合此一活性化合物以治療個體敏感性之技術中的固有限制條件。
治療或預防有效量之抗體分子之實例性、非限制性範圍為0.1-30mg/kg,更佳1-25mg/kg。抗LAG-3抗體分子之劑量及治療方案可由熟
習此項技術者來確定。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係藉由注射(例如,皮下或靜脈內)以下列劑量來投與:約1mg/kg至40mg/kg,例如1mg/kg至30mg/kg,例如約5mg/kg至25mg/kg、約10mg/kg至20mg/kg、約1mg/kg至5mg/kg、1mg/kg至10mg/kg、5mg/kg至15mg/kg、10mg/kg至20mg/kg、15mg/kg至25mg/kg或約3mg/kg。投藥時間表可自例如每週一次至每2週、3週或4週一次變化。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係以約10至20mg/kg之劑量每隔一週投與。抗體分子可藉由靜脈內輸注以大於20mg/min、例如20-40mg/min、且較佳大於或等於40mg/min之速率投與,以達到約35mg/m2至440mg/m2、較佳約70mg/m2至310mg/m2、且更佳約110mg/m2至130mg/m2之劑量。在實施例中,約110mg/m2至130mg/m2之輸注速率達成約3mg/kg之含量。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係以約3mg至800mg、例如約3mg、20mg、80mg、240mg或800mg之劑量投與(例如,靜脈內)。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係以約20mg至800mg、例如約3mg、20mg、80mg、240mg或800mg之劑量單獨投與。在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子係以約3至240mg、例如約3mg、20mg、80mg或240mg之劑量與第二藥劑或治療模式(例如本文所述之第二藥劑或治療模式)組合投與。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係在每一8週週期期間、例如至多96週每2週(例如,在第1、3、5、7週期間)投與。
抗體分子可藉由靜脈內輸注以大於20mg/min、例如20-40mg/min、且較佳大於或等於40mg/min之速率投與,以達到約35mg/m2至440mg/m2、較佳約70mg/m2至310mg/m2、且更佳約110mg/m2至130mg/m2之劑量。在實施例中,約110至130mg/m2之輸注速率達成約3mg/kg之含量。在其他實施例中,抗體分子係藉由靜脈內輸注以小於10mg/min、例如小於或等於5mg/min之速率投與,以達
到約1至100mg/m2、例如約5mg/m2至50mg/m2、約7mg/m2至25mg/m2、且更佳約10mg/m2之劑量。在一些實施例中,抗體係在約30min之時段內輸注。
應注意,劑量值可隨欲緩解病況之類型及嚴重程度而變化。應進一步理解,就任一具體個體而言,應根據個體需要及投與組合物或監督組合物投與之個人的專業判斷隨時間調整特定劑量方案,且本文所述劑量範圍僅具有實例性且並不意欲限制所主張組合物之範疇或實踐。
本發明之醫藥組合物可包括「治療有效量」或「預防有效量」之本發明抗體或抗體部分。「治療有效量」係指可在所需時間段內以所需劑量有效地達成期望治療結果之量。經修飾抗體或抗體片段之治療有效量可根據諸如以下等因素而變化:疾病狀態、年齡、性別及個體體重以及抗體或抗體部分於該個體內引發期望反應之能力。治療有效量亦為經修飾抗體或抗體片段之治療有益效應勝過其任何毒性或有害效應的量。「治療有效劑量」較佳抑制可量測參數,例如相對於未經治療之個體將腫瘤生長速率抑制至少約20%、更佳至少約40%、甚至更佳至少約60%、且仍更佳至少約80%。可在用以預測在人類腫瘤中之效能的動物模型系統中評估化合物抑制可量測參數(例如癌症)之能力。或者,可藉由檢查化合物抑制之能力來評估組合物之此性質,該活體外抑制係藉由熟習此項技術者已知之分析來實施。
「預防有效量」係指在所需時間段內以所需劑量有效地達成期望預防結果之量。通常,由於預防劑量係在患病之前或患病早期用於個體中,故預防有效量將小於治療有效量。
包含本文所述抗體分子之套組亦在本發明範疇內。該套組可包括一或多個其他元件,包括:使用說明書;其他試劑,例如標記、治療劑或可用於螯合或以其他方式偶合之試劑、結合至標記或治療劑之
抗體或放射性保護組合物;用於製備投與用抗體之裝置或其他材料;醫藥上可接受之載劑;及用於投與個體之裝置或其他材料。
本文所揭示之抗LAG-3抗體分子具有活體外及活體內診斷以及治療及預防效用。舉例而言,可將該等分子在活體外或離體投與培養物中之細胞,或例如在活體內投與個體(例如人類個體),以增強免疫性。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子例如藉由阻斷LAG-3(例如,藉由阻斷LAG-3與MHC分子或其他配體之結合)來增強個體之免疫反應。
因此,在一個態樣中,本發明提供改良個體之免疫反應之方法,其包含向個體投與本文所述之抗體分子,使得改良個體之免疫反應。在一個實施例中,增強、刺激或上調免疫反應。在一些實施例中,在個體中,抗LAG-3抗體分子恢復、增強或刺激抗原特異性T細胞反應,例如抗原特異性T細胞反應中之介白素-2(IL-2)或干擾素-γ(IFN-γ)產生。在一些實施例中,免疫反應係抗腫瘤反應。本文所述之方法及組合物適於治療患有可藉由加強T細胞介導之免疫反應治療之病症的人類患者。舉例而言,可向個體單獨或組合投與抗LAG-3抗體分子來治療、預防及/或診斷眾多種病症,例如癌症(黑色素瘤或肝癌)或傳染性病症。
如本文所用之術語「個體」意欲包括人類及非人類動物。在一個實施例中,個體係人類個體,例如患有特徵在於異常LAG-3功能之病症或病況的人類患者。術語本發明之「非人類動物」包括哺乳動物及非哺乳動物,例如非人類靈長類動物。在一個實施例中,個體係人類。在一個實施例中,個體係需要增強免疫反應之人類患者。在一個實施例中,個體患有或具有罹患本文所述病症、例如如本文所述之癌症或傳染性病症之風險。在某些實施例中,個體為免疫受損或具有免
疫受損之風險。舉例而言,個體正經歷或已經歷化學治療性治療及/或輻射療法。或者或組合地,個體因感染而免疫受損或具有因感染而免疫受損之風險。舉例而言,本文所述之方法及組合物可增強多種免疫活性。在一個實施例中,個體具有增加的腫瘤浸潤T淋巴球(TIL)數量或活性。在另一個實施例中,個體具有增加的干擾素-γ(IFN-γ)表現或活性。在另一個實施例中,個體具有減少的PD-L1表現或活性。因此,在某些實施例中,可使用TIL、IFN-γ、CD8或PD-L1中之任一者(例如,一者、兩者、三者或所有)作為生物標記用於本文所述之抗LAG-3免疫療法。
抗體對LAG-3之阻斷可增強個體對癌細胞之免疫反應。與CD4類似,LAG-3與II類MHC分子相互作用,但與CD4不同,LAG-3並不與人類免疫缺陷病毒gp120蛋白相互作用(Baixeras等人(1992)J.Exp.Med.176:327-337)。研究已展示LAG-3與細胞表面上之II類MHC之直接及特異性結合(Huard等人(1996)Eur.J.Immunol.26:1180-1186)。LAG-3/II類MHC相互作用在下調CD4+及CD8+ T淋巴球之抗原依賴性刺激方面起作用。添加抗LAG-3抗體可增加T細胞增殖、提高活化抗原(例如CD25)之表現且提高細胞介素(例如干擾素-γ及介白素-4)之濃度(Huard等人(1994)Eur.J.Immunol.24:3216-3221)。LAG-3之細胞質內區域亦可與參與下調CD3/TCR活化路徑之信號轉導分子LAP相互作用(Iouzalen等人(2001)Eur.J.Immunol.31:2885-2891)。此外,LAG-3有助於CD4+CD25+調控T細胞(T調控)之阻抑活性。T調控細胞在活化後表現LAG-3,且針對LAG-3之抗體抑制由T調控細胞誘導之阻抑(Huang,C.等人(2004)Immunity 21:503-513)。在T細胞依賴性及非依賴性機制二者中,LAG-3亦可藉由調控T細胞負調控T細胞穩態(Workman,C.J.及
Vignali,D.A.(2005)J.Immunol.174:688-695)。因此,抑制LAG-3可加強免疫反應。
因此,在一個態樣中,提供治療(例如,減輕或抑制)個體之癌症或腫瘤之方法。該方法包含向個體單獨或與例如一或多種藥劑或程序組合投與本文所述之抗LAG-3抗體分子,例如治療有效量之抗LAG-3抗體分子。在一個實施例中,可單獨使用抗LAG-3抗體分子來抑制癌性腫瘤之生長。或者,抗LAG-3抗體可與以下中之一或多者組合使用:標準護理治療(例如,用於癌症或傳染性病症)、另一抗體、免疫調節劑(例如,共刺激分子之活化劑或抑制分子之抑制劑);疫苗,例如治療性癌症疫苗;或其他形式之細胞免疫療法,如下文所述。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係與共刺激分子之調節劑(例如,共刺激分子之激動劑)或抑制分子之調節劑(例如,免疫檢查點抑制劑之抑制劑)組合投與,例如如本文所述。
在一個實施例中,該等方法適於治療活體內癌症。為達成免疫性之抗原特異性增強,抗LAG-3抗體分子可與所關注抗原一起投與。當針對LAG-3之抗體與一或多種藥劑組合投與時,該組合可按任一順序或同時投與。
在某些實施例中,提供個體之治療個體、例如減輕或改善過度增殖性病況或病症(例如,癌症)、例如實體腫瘤、血液癌症、軟組織腫瘤或轉移性病灶的方法。該方法包括向個體單獨或與其他藥劑或治療模式組合投與一或多種本文所述之抗LAG-3抗體分子。
不論侵襲之組織病理類型或時期如何,如本文所用之術語「癌症」意欲包括所有類型之癌性生長或致癌過程、轉移性組織或惡性轉化細胞、組織或器官。癌性病症之實例包括(但不限於)實體腫瘤、血液癌症、軟組織腫瘤及轉移性病灶。實體腫瘤之實例包括惡性病,例
如各種器官系統之肉瘤及癌(包括腺癌及鱗狀細胞癌),例如侵襲肝、肺、乳房、淋巴、胃腸(例如,結腸)、生殖泌尿道(例如,腎、尿道上皮細胞)、前列腺及咽之彼等。腺癌包括惡性病,例如大部分結腸癌、直腸癌、腎細胞癌、肝癌、肺非小細胞癌、小腸癌及食道癌。鱗狀細胞癌包括惡性病,例如侵襲肺、食道、皮膚、頭及頸區、口腔、肛門及子宮頸之彼等。亦可使用本發明之方法及組合物來治療或預防上文所提及癌症之轉移性病灶。
可使用本文所揭示之抗體分子抑制生長之實例性癌症包括通常對免疫療法有反應之癌症。用於治療之較佳癌症之非限制性實例包括黑色素瘤(例如,晚期(例如,II-IV期)黑色素瘤或HLA-A2陽性黑色素瘤)、胰臟癌(例如,晚期胰臟癌)、實體腫瘤、乳癌(例如,轉移性乳癌、不表現雌激素受體、孕甾酮受體或Her2/neu中之一者、兩者或所有之乳癌,例如三陰性乳癌)及腎細胞癌(例如,晚期(例如,IV期)或轉移性腎細胞癌(MRCC))。另外,可使用本文所述之抗體分子治療難治性或復發性惡性病。
可治療之其他癌症之實例包括例如實體腫瘤,例如前列腺癌(例如,激素難治性前列腺腺癌)、結腸癌、肺癌(例如,非小細胞肺癌)、骨癌、皮膚癌、頭頸癌(例如,HPV+鱗狀細胞癌)、皮膚或眼內惡性黑色素瘤、子宮癌、卵巢癌、直腸癌、肛區癌、胃癌、睪丸癌、子宮癌、輸卵管癌、子宮內膜癌、子宮頸癌、陰道癌、陰戶癌、默克細胞癌(Merkel cell cancer)、兒童實體腫瘤、膀胱癌、腎或輸尿管癌、腎骨盆癌、中樞神經系統(CNS)贅瘤、腫瘤血管生成、脊椎腫瘤、腦幹膠質瘤、垂體腺瘤、卡波氏肉瘤(Kaposi's sarcoma)、表皮樣癌或鱗狀細胞癌或血液惡性病(例如霍奇金氏淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤)、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌症、甲狀腺癌、甲狀旁腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、慢性或急性白血病(包括急性類
骨髓性白血病、慢性類骨髓性白血病、急性淋巴母細胞性白血病、慢性淋巴球性白血病(例如,復發性或難治性慢性淋巴球性白血病))、兒童實體腫瘤、淋巴球性淋巴瘤、多發性骨髓瘤、骨髓發育不良症候群、膀胱癌、腎或輸尿管癌、腎骨盆癌、中樞神經系統(CNS)贅瘤、原發性CNS淋巴瘤、腫瘤血管生成、脊椎腫瘤、腦幹膠質瘤、垂體腺瘤、卡波氏肉瘤、表皮樣癌、鱗狀細胞癌、T細胞淋巴瘤、環境誘導之癌症(包括由石棉誘導之彼等(例如,間皮瘤))及該等癌症之組合。轉移性癌症(例如表現II類MHC分子或LAG-3之轉移性癌症)之治療可使用本文所述抗體分子來實現。
儘管不希望受限於理論,但在一些實施例中,若患者患有高度表現PD-L1之癌症及/或經抗腫瘤免疫細胞(例如TIL)浸潤之癌症,則該患者更可能因應使用抗LAG-3單獨或與抗PD-1或PD-L1抗體分子之組合(視情況與一或多種如本文所述藥劑組合)的治療。抗腫瘤免疫細胞可對CD8、PD-L1及/或IFN-γ呈陽性;因此,CD8、PD-L1及/或IFN-γ之含量可用作微環境中TIL含量之讀數。在某些實施例中,癌症微環境稱為對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性。
因此,在某些態樣中,本申請案提供以下方法:確定腫瘤樣品是否對PD-L1、CD8及IFN-γ中之一或多者呈陽性以及腫瘤樣品是否對該等標記物中之一或多者、例如兩者或所有三者呈陽性,然後向患者投與治療有效量之抗PD-1抗體分子視情況與一或多種其他免疫調節劑或抗癌劑之組合。
在以下適應症中,大部分患者對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性:肺癌(鱗狀);肺癌(腺癌);頭頸癌;胃癌;NSCLC;HNSCC;胃癌(例如,MSIhi及/或EBV+);CRC(例如,MSIhi);鼻咽癌(NPC);子宮頸癌(例如,鱗狀);甲狀腺癌,例如乳頭狀甲狀腺;黑色素瘤;TN乳癌;及DLBCL(瀰漫性大B細胞淋巴瘤)。通常在乳癌中且通常在結腸
癌中,中等部分之患者對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性。在以下適應症中,小部分患者對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性:ER+乳癌及胰臟癌。該等發現進一步論述於實例4中。無論大部分或小部分患者是否對該等標記物呈三陽性,針對該等標記物篩選患者容許鑒定一部分具有尤其高的有利地因應以下療法之可能性之患者:使用LAG-3抗體單獨或與PD-1抗體組合(例如,阻斷PD-1抗體)、視情況與一或多種其他免疫調節劑(例如,抗TIM-3抗體分子或抗PD-L1抗體分子)及/或抗癌劑(例如表7中所列示及表7中所列示公開案中所揭示之彼等)組合的療法。
在一些實施例中,癌症樣品歸類為對PDL1/CD8/IFN-γ呈三陽性。此量度大致可分解為兩個臨限值:個別細胞是否歸類為陽性,及樣品整體是否歸類為陽性。第一,可量測個別細胞內PD-L1、CD8及/或IFN-γ之含量。在一些實施例中,對該等標記物中之一或多者呈陽性之細胞係與對照細胞或參考值相比具有較高標記物含量之細胞。舉例而言,在一些實施例中,給定細胞中之高PD-L1含量係高於患者中相應非癌性組織中之PD-L1含量的含量。作為另一實例,在一些實施例中,給定細胞中之高CD8或IFN-γ含量係通常可見於TIL中之該蛋白質之含量。第二,亦可量測樣品中對PD-L1、CD8及/或IFN-γ呈陽性之細胞之百分比。(單一細胞不必表現所有三種標記物。)在一些實施例中,三陽性樣品係具有高百分比、例如高於參考值或高於對照樣品的對該等標記物呈陽性之細胞者。
在其他實施例中,可量測樣品中PD-L1、CD8及/或IFN-γ整體之含量。在此情形中,樣品中之高CD8或IFN-γ含量可係通常可見於經TIL浸潤之腫瘤中之該蛋白質的含量。類似地,高PD-L1含量可係通常可見於腫瘤樣品(例如腫瘤微環境)中之該蛋白質之含量。
如本文實例4中所顯示,對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性之患者亞組之鑒定揭露可能對PD-1抗體療法尤其有反應之某些患者亞群。例
如,許多IM-TN(免疫調節性、三陰性)乳癌患者對PDL1/CD8/IFN-γ呈三陽性。IM-TN乳癌闡述於例如Brian D.Lehmann等人,「Identification of human triple-negative breast cancer subtypes and preclinical models for selection of targeted therapies」,J Clin Invest.2011年7月1日;121(7):2750-2767中。三陰性乳癌係不表現雌激素受體(ER)、孕甾酮受體(PR)及Her2/neu之彼等。該等癌症難以治療之原因在於其通常不對靶向ER、PR及Her2/neu之藥劑有反應。三陰性乳癌可進一步細分成不同的類別,其中之一者係免疫調節性乳癌。如Lehmann等人所述,IM-TN乳癌富含參與免疫細胞過程(例如免疫細胞信號傳導(例如,TH1/TH2路徑、NK細胞路徑、B細胞受體信號傳導路徑、DC路徑及T細胞受體信號傳導)、細胞介素信號傳導(例如,細胞介素路徑、IL-12路徑及IL-7路徑)、抗原處理及呈遞、經由核心免疫信號轉導路徑之信號傳導(例如,NFKB、TNF及JAK/STAT信號傳導)中之一或多者)之因子;參與T細胞功能、免疫轉錄、干擾素(IFN)反應及抗原處理之基因。因此,在一些實施例中,所治療之癌症係為或經確定為對IM-TN乳癌之一或多種標記物呈陽性的癌症,該等標記物係例如促進免疫細胞信號傳導(例如,TH1/TH2路徑、NK細胞路徑、B細胞受體信號傳導路徑、DC路徑及T細胞受體信號傳導)、細胞介素信號傳導(例如,細胞介素路徑、IL-12路徑及IL-7路徑)、抗原處理及呈遞、信號傳導經由核心免疫信號轉導路徑(例如,NFKB、TNF及JAK/STAT信號傳導)中之一或多者之因子;參與T細胞功能、免疫轉錄、干擾素(IFN)反應及抗原處理之基因。
作為另一實例,本文顯示具有高MSI(微衛星不穩定性)之結腸癌患者之亞組亦對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性。因此,在一些實施例中,LAG-3抗體(例如如本文所述之LAG-3抗體)係單獨或與PD-1抗體組合(視情況與一或多種免疫調節劑(例如TIM-3抗體或PD-L1抗體)及
一或多種抗癌劑(例如表7或表7中之公開案所述之抗癌劑)組合)投與患有或經鑒定患有高MSI結腸癌之患者,由此治療該癌症。在一些實施例中,具有高MSI之細胞係MSI之含量高於參考值或對照細胞(例如組織類型與癌症相同之非癌細胞)的細胞。
作為另一實例,本文顯示具有高MSI及/或為EBV+之胃癌患者亞組亦對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性。因此,在一些實施例中,LAG-3抗體(例如如本文所述之LAG-3抗體)係單獨或與PD-1抗體組合(視情況與一或多種免疫調節劑(例如TIM-3抗體或PD-L1抗體)及一或多種抗癌劑(例如表7或表7中之公開案中所述之抗癌劑)組合)投與患有或經鑒定患有高MSI及/或EBV+胃癌之患者,由此治療該癌症。在一些實施例中,具有高MSI之細胞係MSI之含量高於參考值或對照細胞(例如組織類型與癌症相同之非癌細胞)的細胞。
另外,本文揭示分析針對PD-L1之癌症、且然後使用LAG-3抗體單獨或與PD-1抗體組合治療該癌症之方法。如本文實例5中所述,可針對PD-L1蛋白質含量或mRNA含量分析癌症樣品。PD-L1(蛋白質或mRNA)含量高於參考值或對照細胞(例如,非癌細胞)之樣品可歸類為PD-L1陽性。因此,在一些實施例中,LAG-3抗體(例如如本文所述之LAG-3抗體)係單獨或與PD-1抗體組合(視情況與一或多種抗癌劑組合)投與患有或經鑒定患有PD-L1陽性癌症之患者。癌症可係例如非小細胞肺(NSCLC)腺癌(ACA)、NSCLC鱗狀細胞癌(SCC)或肝細胞癌(HCC)。
在一些實施例中,本文之方法涉及使用LAG-3抗體、例如如本文所述之LAG-3抗體、例如與PD-1抗體組合治療對PD-L1呈陽性(或經鑒定對PD-L1呈陽性)之癌症。在一些實施例中,癌症係結腸直腸癌(例如,高MSI)、胃癌(例如,高MSI及/或EBV+)、NPC、子宮頸癌、乳癌(例如,TN乳癌)及卵巢癌。在一些實施例中,癌症係NSCLC、黑
色素瘤或HNSCC。在一些實施例中,LAG-3抗體係以例如1mg/kg、3mg/kg、10mg/kg或20mg/kg之劑量來投與。
基於例如本文之實例4發現,某些對PDL1/CD8/IFN-γ呈三陽性之胃癌亦對PIK3CA呈陽性。因此,在一些實施例中,癌症可使用LAG-3抗體單獨或與抗PD1抗體分子(視情況與一或多種免疫調節劑(例如抗TIM-3抗體分子或抗PD-L1抗體分子)之組合)及抑制PIK3CA之藥劑之組合治療。此類實例性藥劑闡述於Stein RC(2001年9月).「Prospects for phosphoinositide 3-kinase inhibition as a cancer treatment」.Endocrine-related Cancer 8(3):237-48,及Marone R、Cmiljanovic V、Giese B、Wymann MP(2008年1月).「Targeting phosphoinositide 3-kinase:moving towards therapy」.Biochimica et Biophysica Acta 1784(1):159-85中。
基於例如本文之實例4,可使用LAG-3抗體單獨或與PD-1抗體組合、視情況與靶向RNF43及BRAF中之一或兩者之治療劑組合治療CRC,例如患有(或經鑒定患有)高MSI CRC之患者。例如,該等癌症可使用LAG-3抗體及PD-1抗體、視情況與一或多種靶向RNF43及BRAF中之一或多者之治療劑組合治療。在實施例中,一或多種治療劑包括表7或表7中所列示公開案中所述之抗癌劑。PD-1抑制劑(例如抗體)闡述於本文中。RNF43可使用例如抗體、小分子(例如,2-(2',3-二甲基-[2,4'-聯吡啶]-5-基)-N-(5-(吡嗪-2-基)吡啶-2-基)乙醯胺(化合物A28))、siRNA或Rspo配體或其衍生物來抑制。BRAF抑制劑(例如,威羅菲尼或達拉菲尼)闡述於本文中。
基於例如本文之實例4,可使用LAG-3抗體分子與靶向PD-1之治療劑(例如PD-1抗體分子)及視情況與一或多種抗癌劑(例如表7或表7中之公開案中所述之抗癌劑)或靶向TIM-3之治療劑(例如TIM-3抗體)組合治療患有(或經鑒定患有)鱗狀細胞肺癌之患者。
基於例如本文之實例4,可使用LAG-3抗體分子單獨或與PD-1抗體分子組合、視情況與靶向BRAF之治療劑組合、及視情況與一或多種免疫調節劑(例如抗TIM-3抗體分子及抗PD-L1抗體分子)組合治療患有(或經鑒定患有)甲狀腺癌之患者。BRAF抑制劑(例如,威羅菲尼或達拉菲尼)闡述於本文中,例如闡述於表7及表7中所列示之公開案中。
在一些實施例中,可使用本文療法來治療患有(或經鑒定患有)與感染(例如病毒或細菌感染)相關之癌症之患者。實例性癌症包括子宮頸癌、肛門癌、HPV相關之頭及頸鱗狀細胞癌、HPV相關之食道乳頭狀瘤、HHV6相關之淋巴瘤、EBV相關之淋巴瘤(包括伯基特氏淋巴瘤(Burkitt lymphoma))、胃MALT淋巴瘤、其他感染相關之MALT淋巴瘤、HCC、卡波氏肉瘤。在其他實施例中,癌症係血液癌症,包括(但不限於)白血病或淋巴瘤。舉例而言,抗LAG-3抗體分子可用於治療癌症及惡性病,包括(但不限於)例如急性白血病,包括(但不限於)例如B細胞急性淋巴樣白血病(「BALL」)、T細胞急性淋巴樣白血病(「TALL」)、急性淋巴樣白血病(ALL);一或多種慢性白血病,包括(但不限於)例如慢性骨髓性白血病(CML)、慢性淋巴球性白血病(CLL);其他血液癌症或血液病況,包括(但不限於)例如B細胞前淋巴球性白血病、母細胞性漿細胞樣樹突狀細胞贅瘤、伯基特氏淋巴瘤、瀰漫性大B細胞淋巴瘤、濾泡性淋巴瘤、多毛細胞白血病、小細胞或大細胞濾泡性淋巴瘤、惡性淋巴組織增殖病況、MALT淋巴瘤、外套細胞淋巴瘤、邊緣帶淋巴瘤、多發性骨髓瘤、骨髓發育不良及骨髓發育不良症候群、非霍奇金氏淋巴瘤、漿母細胞性淋巴瘤、漿細胞樣樹突狀細胞贅瘤、瓦登斯特隆巨球蛋白血症(Waldenstrom macroglobulinemia)及「白血病前期」(其係因骨髓樣血球之無效產生(或發育不良)集合在一起之血液病況之不同集合)及諸如此類。
在一個實施例中,癌症係黑色素瘤,例如晚期黑色素瘤。在一個實施例中,癌症係不因應其他療法之晚期或不可切除性黑色素瘤。在其他實施例中,癌症係具有BRAF突變(例如,BRAF V600突變)之黑色素瘤。在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子係在具或不具BRAF抑制劑(例如,威羅菲尼或達拉菲尼)的情況下使用抗CTLA4抗體(例如,伊匹單抗)治療後投與。
本文所揭示之方法及組合物可用於治療與上文所提及之癌症相關之轉移性病灶。
針對LAG-3之抗體分子可與免疫原性劑組合,該免疫原性劑係例如癌細胞、經純化腫瘤抗原(包括重組蛋白、肽(例如,HLA-A2肽)及碳水化合物分子)、細胞及經編碼免疫刺激細胞介素之基因轉染之細胞(He等人(2004)J.Immunol.173:4919-28)。可用腫瘤疫苗之非限制性實例包括例如黑色素瘤抗原之肽(例如gp100、MAGE抗原、Trp-2、MART1及/或酪胺酸酶之肽)或經轉染以表現細胞介素GM-CSF之腫瘤細胞、基於DNA之疫苗、基於RNA之疫苗及基於病毒轉導之疫苗。癌症疫苗可具有預防性或治療性。
LAG-3阻斷可與疫苗接種方案組合。已設計出針對腫瘤之疫苗接種之許多實驗策略(參見Rosenberg,S.,2000,Development of Cancer Vaccines,ASCO Educational Book Spring:60-62;Logothetis,C.,2000,ASCO Educational Book Spring:300-302;Khayat,D.2000,ASCO Educational Book Spring:414-428;Foon,K.2000,ASCO Educational Book Spring:730-738;亦參見Restifo,N.及Sznol,M.,Cancer Vaccines,第61章,第3023-3043頁,DeVita,V.等人(編輯),1997,Cancer:Principles and Practice of Oncology.第5版)。在該等策略中之一者中,疫苗係使用自體或同種異體腫瘤細胞來製備。已顯示該等
細胞疫苗在腫瘤細胞經轉導以表現GM-CSF時最有效。已顯示GM-CSF係用於腫瘤疫苗接種之抗原呈遞之強效活化劑(Dranoff等人(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.90:3539-43)。
LAG-3阻斷可與在腫瘤中表現之重組蛋白及/或肽之集合結合使用以產生針對該等蛋白質之免疫反應。免疫系統通常將該等蛋白質視為自身抗原,且因此對其耐受。腫瘤抗原亦可包括蛋白質端粒酶,其為合成染色體之端粒所必需且在大於85%之人類癌症及僅有限數量之體細胞組織中表現(Kim,N.等人(1994)Science 266:2011-2013)。(可藉由多種方式保護該等體細胞組織免於免疫攻擊)。由於改變蛋白質序列或在兩條不相關序列(例如,費城染色體(Philadelphia chromosome)中之bcr-abl)之間產生融合蛋白或來自B細胞腫瘤之個體基因型的體細胞突變,腫瘤抗原亦可為在癌細胞中表現之「新抗原」。
其他腫瘤疫苗可包括來自參與人類癌症之病毒(例如人類乳頭瘤病毒(HPV)、肝炎病毒(HBV及HCV)、愛潑斯坦-巴爾病毒(Epstein-Barr virus,EBV)及卡波氏皰疹肉瘤病毒(Kaposi's Herpes Sarcoma Virus,KHSV))的蛋白質。可與LAG-3阻斷結合使用之另一形式之腫瘤特異性抗原係自腫瘤組織自身分離之經純化熱休克蛋白(HSP)。該等熱休克蛋白含有來自腫瘤細胞之蛋白質之片段,且該等HSP在遞送至抗原呈遞細胞以引發腫瘤免疫性時高度有效(Suot,R及Srivastava,P(1995)Science 269:1585-1588;Tamura,Y.等人(1997)Science 278:117-120)。
樹突狀細胞(DC)係可用於引發抗原特異性反應之強效抗原呈遞細胞。DC可離體產生且負載有多種蛋白質及肽抗原以及腫瘤細胞提取物(Nestle,F.等人(1998)Nature Medicine 4:328-332)。DC亦可藉由遺傳方式來轉導以亦表現該等腫瘤抗原。DC亦已出於免疫之目的直
接融合至腫瘤細胞(Kugler,A.等人(2000)Nature Medicine 6:332-336)。作為疫苗接種之方法,DC免疫可有效地與LAG-3阻斷組合來活化更強效的抗腫瘤反應。
在一些實施例中,該組合進一步包括免疫檢查點調節劑之抑制劑或活化劑(例如,PD-1抑制劑(例如,抗PD-1抗體分子)、PD-L1抑制劑(例如,抗PD-L1抗體分子)、TIM-3調節劑(例如,TIM-3活化劑或抑制劑,例如抗TIM-3抗體分子)或CTLA-4抑制劑(例如,抗CTLA4抗體)或其任一組合。
LAG-3阻斷亦可與標準癌症治療組合。LAG-3阻斷可有效地與化學治療方案組合。在該等情況下,可降低化學治療試劑投與之劑量(Mokyr,M.等人(1998)Cancer Research 58:5301-5304)。在某些實施例中,本文所述之方法及組合物係與以下中之一或多者組合投與:其他抗體分子、化學療法、其他抗癌療法(例如,靶向抗癌療法或溶瘤藥物)、細胞毒性劑、基於免疫之療法(例如,細胞介素)、手術及/或輻射程序。可組合投與之實例性細胞毒性劑包括抗微管劑、拓撲異構酶抑制劑、抗代謝物、有絲分裂抑制劑、烷基化劑、蒽環類、長春花生物鹼、嵌入劑、能夠干擾信號轉導路徑之藥劑、促進細胞凋亡之藥劑、蛋白體抑制劑及輻射(例如,局部或全身照射)。
或者或在與上述組合之組合中,本文所述之方法及組合物可與以下中之一或多者組合投與:免疫調節劑(例如,共刺激分子之活化劑或抑制分子之抑制劑);疫苗,例如治療性癌症疫苗;或細胞免疫療法之其他形式。
抗LAG-3抗體分子之實例性非限制性組合及用途包括以下各項。
在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係與共刺激分子或抑制分子(例如共抑制配體或受體)之調節劑組合投與。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與共刺激分子之調節劑
(例如激動劑)組合投與。在一個實施例中,共刺激分子之激動劑選自以下各項之激動劑(例如,激動性抗體或可溶性融合物):OX40、CD2、CD27、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、4-1BB(CD137)、GITR、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3或CD83配體。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與共刺激分子(例如與包括CD28、CD27、ICOS及GITR之共刺激結構域之正信號相關之激動劑)組合使用。
實例性GITR激動劑包括例如GITR融合蛋白及抗GITR抗體(例如,二價抗GITR抗體),例如以下專利中所述之GITR融合蛋白:美國專利第6,111,090號、歐洲專利第090505B1號、美國專利第8,586,023號、PCT公開案第WO 2010/003118號及第2011/090754號;或例如以下專利中所述之抗GITR抗體:美國專利第7,025,962號、歐洲專利第1947183B1號、美國專利第7,812,135號、美國專利第8,388,967號、美國專利第8,591,886號、歐洲專利第EP 1866339號、PCT公開案第WO 2011/028683號、PCT公開案第WO 2013/039954號、PCT公開案第WO2005/007190號、PCT公開案第WO 2007/133822號、PCT公開案第WO2005/055808號、PCT公開案第WO 99/40196號、PCT公開案第WO 2001/03720號、PCT公開案第WO99/20758號、PCT公開案第WO2006/083289號、PCT公開案第WO 2005/115451號、美國專利第7,618,632號及PCT公開案第WO 2011/051726號。一種實例性抗GITR抗體係TRX518。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抑制分子之抑制劑(例如,免疫檢查點分子之抑制劑)組合投與。彼等熟習此項技術者應理解,術語「免疫檢查點」意指CD4及CD8 T細胞之細胞表面上之分子
群。該等分子可有效地用作下調或抑制抗腫瘤免疫反應之「制動器」。免疫檢查點分子包括(但不限於)直接抑制免疫細胞之程式化死亡1(PD-1)、細胞毒性T淋巴球抗原4(CTLA-4)、B7H1、B7H4、OX-40、CD137、CD40及TIM-3,可用作可用於本發明方法中之免疫檢查點抑制劑之免疫治療劑,該等抑制劑包括(但不限於)PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA-4、TIM-3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、CEACAM(例如,CEACAM-1及/或CEACAM-5)及/或TGFR β之抑制劑。可藉由在DNA、RNA或蛋白質層級上抑制來實施抑制分子之抑制。在實施例中,可使用抑制核酸(例如,dsRNA、siRNA或shRNA)來抑制抑制分子之表現。在其他實施例中,抑制信號之抑制劑係結合至抑制分子之多肽,例如可溶性配體或抗體或抗體片段。實例性TIM-3抗體分子包括(但不限於)MBG220、MBG227及MBG219。實例性TIGIT抑制劑包括(但不限於)10A7及1F4(Roche)。
調節劑之其他實例包括(但不限於)B7-H5、ENTPD1、ENTPD2、SIGGIR、B7-1、B7-2、VSIG4、TIM-1、CD200、RANKL及P2X7。
在一個實施例中,抑制劑係可溶性配體(例如,CTLA-4-Ig或TIM-3-Ig)或結合至PD-L1、PD-L2或CTLA4之抗體或抗體片段。舉例而言,抗LAG-3抗體分子可與抗CTLA-4抗體(例如伊匹單抗)組合投與。實例性抗CTLA4抗體包括曲美木單抗(Tremelimumab,可自Pfizer購得之IgG2單株抗體,先前稱為替西莫單抗(ticilimumab,CP-675,206))及伊匹單抗(Ipilimumab,CTLA-4抗體,亦稱為MDX-010,CAS編號477202-00-9)。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係在治療後、例如在具或不具BRAF抑制劑(例如,威羅菲尼或達拉菲尼)的情況下使用抗CTLA4抗體(例如,伊匹單抗)治療黑色素瘤後投與。在一個實施例中,抗CTLA-4抗體(例如伊匹單抗)係以約3mg/kg之劑量投與。抗LAG-3抗體分子可以約20mg至800mg、例如約20mg、80
mg、240mg或800mg之劑量組合投與。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係在每一8週週期期間、例如至多96週每2週(例如,在第1、3、5、7週期間)投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗PD-1抗體分子組合投與。可使用之實例性劑量包括約1mg/kg至10mg/kg、例如3mg/kg之抗PD-1抗體分子之劑量。抗LAG-3抗體分子可以約20mg至800mg、例如約20mg、80mg、240mg或800mg之劑量組合投與。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係在每一8週週期期間、例如至多96週每2週(例如,在第1、3、5、7週期間)投與。
免疫抑制分子(例如PD-1及LAG-3)可調控、例如協同地調控T細胞功能以促進腫瘤免疫逃脫。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗TIM-3抗體分子組合投與。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗PD-L1抗體分子組合投與。在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗PD-1抗體及抗TIM-3抗體組合投與。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗PD-1抗體及抗PD-L1抗體組合投與。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係與抗TIM-3抗體及抗PD-L1抗體組合投與。本文所述抗體之組合可例如作為單獨抗體單獨投與,或例如作為雙特異性或三特異性抗體分子聯合投與。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與CEACAM抑制劑(例如,CEACAM-1及/或CEACAM-5抑制劑)、例如抗CEACAM抗體分子組合投與。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與CEACAM-1抑制劑、例如抗CEACAM-1抗體分子組合投與。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與CEACAM-5抑制劑、例如抗CEACAM-5抗體分子組合投與。在一個實施例中,投與包括抗LAG-3抗體分子及抗PD-1或抗LAG-3抗體之雙特異性抗體。在某些實施例中,使用本文所述抗體之組合來治療癌症,例如如本文所述之癌症(例如,實體腫瘤)。可在業內已知之動
物模型中測試上述組合之效能。舉例而言,測試抗LAG-3及抗PD-1之協同效應之動物模型闡述於例如Woo等人(2012)Cancer Res.72(4):917-27)中。在一個實施例中,CEACAM(例如,CEACAM-1及/或CEACAM-5)之抑制劑係抗CEACAM抗體分子。在不希望受限於理論的情況下,CEACAM-1已闡述為TIM-3之配體及伴侶(例如,參見WO 2014/022332)。已在異種移植物癌症模型中檢測抗TIM-3及抗CEACAM-1抗體之組合之活體內協同效應(例如,參見WO 2014/022332)。人們認為腫瘤會利用CEACAM-1或CEACAM-5來抑制免疫系統,如例如以下文獻中所述:Markel等人J Immunol.2002年3月15日;168(6):2803-10;Markel等人J Immunol.2006年11月1日;177(9):6062-71;Markel等人Immunology.2009年2月;126(2):186-200;Markel等人Cancer Immunol Immunother.2010年2月;59(2):215-30;Ortenberg等人Mol Cancer Ther.2012年6月;11(6):1300-10;Stern等人J Immunol.2005年6月1日;174(11):6692-701;Zheng等人PLoS One.2010年9月2日;5(9).pii:e12529。因此,CEACAM抑制劑可與本文所述之其他免疫調節劑(例如,抗LAG-3、抗PD-1或抗TIM-3抑制劑)一起使用來增強針對癌症(例如黑色素瘤、肺癌(例如,NSCLC)、膀胱癌、結腸癌或卵巢癌或如本文所述之其他癌症)之免疫反應。在一個實施例中,CEACAM之抑制劑係如WO 2010/125571、WO 2013/82366及WO 2014/022332中所述之抗CEACAM-1抗體,例如單株抗體34B1、26H7及5F4或其重組形式,如例如US 2004/0047858、US 7,132,255及WO 99/52552中所述。在其他實施例中,抗CEACAM抗體係如例如WO 2010/125571、WO 2013/054331及US 2014/0271618中所述之抗CEACAM-1及/或抗CEACAM-5抗體分子。
在一些實施例中,LAG-3及PD-1免疫抑制分子(例如,抗體分子)係彼此組合投與來例如治療癌症。在一些實施例中,患者係在使用
PD-1抑制劑(例如,如本文所述之抗體分子)及/或PD-L1抑制劑(例如,抗體分子)治療期間有進展(例如,經歷腫瘤生長)之患者。在一些實施例中,持續使用PD-1抗體分子及/或PDL1抗體分子之療法,且將LAG-3免疫抑制分子(例如,抗體)添加至療法中。在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子係與細胞介素(例如介白素-21、介白素-2或介白素15)組合投與。在某些實施例中,使用本文所述抗LAG-3抗體分子及細胞介素之組合來治療癌症,例如如本文所述之癌症(例如,實體腫瘤或黑色素瘤)。
可與抗LAG-3抗體分子組合使用之實例性免疫調節劑包括(但不限於)例如阿托珠單抗(afutuzumab,可自Roche®購得);非格司亭(pegfilgrastim,Neulasta®);雷利竇邁(lenalidomide,CC-5013,Revlimid®);沙利竇邁(thalidomide,Thalomid®)、actimid(CC4047);及細胞介素,例如IL-21或IRX-2(人類細胞介素之混合物,包括介白素1、介白素2及干擾素γ,CAS 951209-71-5,可自IRX Therapeutics購得)。
此一組合之另一實例係抗LAG-3抗體與達卡巴嗪組合治療黑色素瘤。此一組合之另一實例係抗LAG-3抗體分子與介白素-2(IL-2)組合治療黑色素瘤。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子可與IL-21組合。在不受限於理論的情況下,LAG-3阻斷及化學療法之組合使用在於細胞死亡,人們認為細胞死亡會促進此組合使用,細胞死亡係大部分化學治療性化合物之細胞毒性作用的結果,此可增加抗原呈遞路徑中之腫瘤抗原含量。可藉助細胞死亡與LAG-3阻斷協同作用之其他組合療法係輻射、手術及激素剝奪。該等方案中之每一者在宿主中產生腫瘤抗原來源。血管生成抑制劑亦可與LAG-3阻斷組合。抑制血管生成會導致腫瘤細胞死亡,此可將腫瘤抗原進給至宿主抗原呈遞路徑中。
LAG-3阻斷抗體亦可與雙特異性抗體組合使用。雙特異性抗體可用於靶向兩種單獨抗原。例如,抗Fc受體/抗腫瘤抗原(例如,Her-2/neu)雙特異性抗體已用於使巨噬細胞靶向腫瘤之位點。此靶向可更有效地活化腫瘤特異性反應。該等反應之T細胞臂將因使用LAG-3阻斷而加強。或者,可藉由使用結合至腫瘤抗原及樹突狀細胞特異性細胞表面標記物之雙特異性抗體將抗原直接遞送至DC。
腫瘤藉助眾多種機制避開宿主免疫監督。該等機制中之許多可藉由使由腫瘤表現且具有免疫阻抑性之蛋白質失活來克服。該等蛋白質尤其包括TGF-β(Kehrl,J.等人(1986)J.Exp.Med.163:1037-1050)、IL-10(Howard,M.及O'Garra,A.(1992)Immunology Today 13:198-200)及Fas配體(Hahne,M.等人(1996)Science 274:1363-1365)。針對該等實體中之每一者之抗體可與抗LAG-3組合使用以抵消免疫阻抑劑之效應且有利於宿主之腫瘤免疫反應。
可用於活化宿主免疫反應性之其他抗體可與抗LAG-3組合使用。該等抗體包括樹突狀細胞表面上之活化DC功能及抗原呈遞之分子。抗CD40抗體能夠有效地取代T細胞輔助物活性(Ridge,J.等人(1998)Nature 393:474-478),且可與LAG-3抗體結合使用(Ito,N.等人(2000)Immunobiology 201(5)527-40)。活化針對T細胞共刺激分子(例如CTLA-4(例如,美國專利第5,811,097)、OX-40(Weinberg,A.等人(2000)Immunol 164:2160-2169)、4-1BB(Melero,I.等人(1997)Nature Medicine 3:682-685(1997)及ICOS(Hutloff,A.等人(1999)Nature 397:262-266))之抗體亦可提供增加的T細胞活化程度。
可與抗LAG-3抗體分子組合使用之其他實例性治療闡述於下文標題為「組合療法」之部分中。
在所有上述方法中,LAG-3阻斷可與其他形式之免疫療法(例如細胞介素治療(例如,干擾素、GM-CSF、G-CSF、IL-2、IL-21))或雙
特異性抗體療法(其提供增強的腫瘤抗原呈遞)組合(例如,參見Holliger(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444-6448;Poljak(1994)Structure 2:1121-1123)。
投與抗LAG-3抗體分子之方法為業內已知且闡述於下文中。所用分子之適宜劑量將端視個體之年齡及體重以及所使用之具體藥物而定。抗LAG-3抗體分子之劑量及治療方案可由熟習此項技術者來確定。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子係以下列劑量藉由注射(例如,皮下或靜脈內)來投與:約1mg/kg至30mg/kg,例如約5mg/kg至25mg/kg、約10mg/kg至20mg/kg、約1mg/kg至5mg/kg或約3mg/kg或約10mg/kg、約20mg/kg、約30mg/kg或約40mg/kg。在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子係以約1-3mg/kg或約3-10mg/kg之劑量來投與。在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子係以約0.5-2mg/kg、2-4mg/kg、2-5mg/kg、5-15mg/kg或5-20mg/kg之劑量來投與。投藥時間表可自例如每週一次至每2週、3週或4週一次變化。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係以約10mg/kg至20mg/kg之劑量每隔一週投與。
抗體分子可以未偶聯形式或偶聯至第二藥劑(例如細胞毒性藥物、放射性同位素或蛋白質,例如蛋白質毒素或病毒蛋白)來使用。此方法包括:向需要該治療之個體投與單獨或偶聯至細胞毒性藥物之抗體分子。抗體分子可用於遞送眾多種治療劑,例如細胞毒性部分,例如治療性藥物、放射性同位素、植物、真菌或細菌來源之分子或生物蛋白質(例如,蛋白質毒素)或粒子(例如,例如經由病毒外殼蛋白之重組病毒粒子)或其混合物。
抗LAG-3抗體分子可與其他療法組合使用。例如,組合療法可包括與一或多種其他治療劑(例如一或多種抗癌劑、細胞毒性劑或細胞
生長抑制劑、激素治療、疫苗及/或其他免疫療法)共調配及/或共投與之本發明組合物。在其他實施例中,抗體分子係與其他治療性治療模式(包括手術、輻射、冷凍手術及/或溫熱療法)組合投與。該等組合療法可有利地利用較低劑量之所投與治療劑,由此避免與各種單一療法相關之可能毒性或併發症。在一個實施例中,抗LAG-3抗體係以約20mg至800mg、例如約20mg、80mg、240mg或800mg之劑量與本文所揭示之療法組合投與。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係每週、在每一8週週期期間、例如至多96週每2週(例如,在第1、3、5、7週期間)投與。
在一個實施例中,本文所述組合物係與其他抗體分子、例如以下中之一或多者組合投與:本文所述之抗體、化學治療劑、細胞毒性劑、手術及/或輻射程序。可組合投與之實例性化學治療及/或細胞毒性劑包括抗微管劑、拓撲異構酶抑制劑、抗代謝物、有絲分裂抑制劑、烷基化劑、嵌入劑、能夠干擾信號轉導路徑之藥劑、促進細胞凋亡之藥劑及輻射。可組合投與之其他實例性抗體分子尤其包括(但不限於)檢查點抑制劑(例如,PD-1、PD-L1);刺激免疫細胞之抗體(例如,激動性GITR或CD137抗體);抗癌抗體(例如,利妥昔單抗(Rituxan®或MabThera®)、曲妥珠單抗(Herceptin®)、西妥昔單抗(Erbitux®)。
「與......組合」並不意欲暗示療法或治療劑必須同時投與及/或經調配以一起遞送,但該等遞送方法在本文所述之範疇內。抗LAG-3抗體分子可與一或多種其他額外療法或治療劑同步、在其之前或同時投與。抗LAG-3抗體分子及另一藥劑或治療方案可以任一順序投與。一般而言,每一藥劑將以對該藥劑確定之劑量及/或時間表投與。應進一步瞭解,用於此組合中之另一治療劑可以單一組合物一起投與或以不同組合物單獨投與。一般而言,預期用於組合中之其他治療劑係
以不超過個別利用其時之量的量來使用。在一些實施例中,用於組合中之量低於個別利用之彼等。兩次治療之效應可為部分加和、完全加和或大於加和。遞送可使得在遞送第二治療時仍可檢測到所遞送之第一次治療之效應。
抗體分子可與用於治療癌症之一或多種現有模式組合投與,該等現有模式包括(但不限於):手術;輻射療法(例如外部光束療法,其涉及其中輻射場經設計之三維順形輻射療法)。
在某些實施例中,本文所述之抗LAG-3分子係與業內已知之PD-1、PD-L1及/或PD-L2之一或多種抑制劑組合投與。拮抗劑可係抗體、其抗原結合片段、免疫黏附素、融合蛋白或寡肽。
在一些實施例中,另一抗PD-1抗體選自MDX-1106、Merck 3475或CT-011。
在一些實施例中,PD-1抑制劑係免疫黏附素(例如,包含融合至恆定區(例如,免疫球蛋白序列之Fc區)之PD-L1或PD-L2之細胞外或PD-1結合部分的免疫黏附素)。
在一些實施例中,PD-L1抑制劑係抗PD-L1抗體。在一些實施例中,抗PD-L1結合拮抗劑選自YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C或MDX-1105。MDX-1105(亦稱為BMS-936559係闡述於WO2007/005874中之抗PD-L1抗體。抗體YW243.55.S70(重鏈及輕鏈可變區序列分別顯示於SEQ ID No.20及21中)係闡述於WO 2010/077634中之抗PD-L1。
在一些實施例中,抗PD-1抗體係尼沃魯單抗。尼沃魯單抗之替代性名稱包括MDX-1106、MDX-1106-04、ONO-4538或BMS-936558。在一些實施例中,抗PD-1抗體係尼沃魯單抗(CAS登記號:946414-94-4)。尼沃魯單抗(亦稱為BMS-936558或MDX1106;Bristol-Myers Squibb)係特異性阻斷PD-1之完整人類IgG4單株抗體。尼沃魯
單抗(純系5C4)及特異性結合至PD-1之其他人類單株抗體揭示於US 8,008,449、EP2161336及WO2006/121168中。
易普利姆瑪(Pidilizumab,CT-011;Cure Tech)係結合至PD-1之人類化IgG1k單株抗體。易普利姆瑪及其他人類化抗PD-1單株抗體揭示於WO2009/101611中。
在其他實施例中,抗PD-1抗體係派姆單抗(pembrolizumab)。派姆單抗(商標名Keytruda,舊稱拉波裡單抗(lambrolizumab),亦稱為MK-3475)揭示於例如Hamid,O.等人(2013)New England Journal of Medicine 369(2):134-44中。
其他抗PD-1抗體尤其包括AMP 514(Amplimmune)、LZV178及LZV181,例如揭示於US 8,609,089、US 2010028330及/或US 20120114649中之抗PD1抗體。
在一些實施例中,抗PD-L1抗體係MSB0010718C。MSB0010718C(亦稱為A09-246-2;Merck Serono)係結合至PD-L1之單株抗體。派姆單抗及其他人類化抗PD-L1抗體揭示於WO2013/079174中。
MDPL3280A(Genentech/Roche)係結合至PD-L1之人類Fc最佳化IgG1單株抗體。針對PD-L1之MDPL3280A及其他人類單株抗體揭示於美國專利第7,943,743號及U.S公開案第20120039906號中。其他抗PD-L1結合劑包括YW243.55.S70(重鏈及輕鏈可變區顯示於WO2010/077634中之SEQ ID NO 20及21中)及MDX-1105(亦稱為BMS-936559,及例如揭示於WO2007/005874中之抗PD-L1結合劑)。
在一些實施例中,PD-1抑制劑係AMP-224。AMP-224(B7-DCIg;Amplimmune;例如WO2010/027827及WO2011/066342中所揭示)係阻斷PD1與B7-H1之間之相互作用的PD-L2 Fc融合可溶性受體。
在一些實施例中,PD-1抑制劑係MEDI4736。
抗LAG-3抗體分子(單獨或與其他刺激劑組合)及標準癌症護理之實例性組合包括至少以下各項。在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如本文所述之抗LAG-3抗體分子係與標準癌症護理化學治療劑組合使用,該化學治療劑包括(但不限於)阿那曲唑(anastrozole,Arimidex®)、比卡魯胺(bicalutamide,Casodex®)、硫酸博來黴素(Blenoxane®)、白消安(Myleran®)、白消安注射劑(Busulfex®)、卡培他濱(capecitabine,Xeloda®)、N4-戊氧基羰基-5-去氧-5-氟胞苷、卡鉑(carboplatin,Paraplatin®)、卡莫司汀(BiCNU®)、氮芥苯丁酸(Leukeran®)、順鉑(Platinol®)、克拉屈濱(cladribine,Leustatin®)、環磷醯胺(Cytoxan®或Neosar®)、阿糖胞苷、胞嘧啶阿拉伯糖苷(Cytosar-U®)、阿糖胞苷脂質體注射劑(DepoCyt®)、達卡巴嗪(DTIC-Dome®)、放線菌素(放線菌素D,Cosmegan)、鹽酸道諾黴素(Cerubidine®)、檸檬酸道諾黴素脂質體注射劑(DaunoXome®)、地塞米松(dexamethasone)、多西他賽(docetaxel,Taxotere®)、鹽酸多柔比星(Adriamycin®、Rubex®)、依託泊苷(Vepesid®)、磷酸氟達拉濱(fludarabine phosphate,Fludara®)、5-氟尿嘧啶(Adrucil®、Efudex®)、氟他胺(flutamide,Eulexin®)、替紮他濱(tezacitibine)、吉西他濱(二氟去氧胞苷)、羥基脲(Hydrea®)、伊達比星(Idarubicin,Idamycin®)、異環磷醯胺(IFEX®)、伊立替康(irinotecan,Camptosar®)、L-門冬醯胺酶(ELSPAR®)、甲醯四氫葉酸鈣、美法侖(Alkeran®)、6-巰基嘌呤(Purinethol®)、胺甲喋呤(Folex®)、米托蒽醌(Novantrone®)、麥羅塔(mylotarg)、太平洋紫杉醇(汰癌勝®)、菲尼克斯(phoenix,釔90/MX-DTPA)、噴司他汀(pentostatin)、聚苯丙生(polifeprosan)20與卡莫司汀植入物(Gliadel®)、檸檬酸他莫昔芬(tamoxifen citrate,Nolvadex®)、替尼泊苷(Vumon®)、6-硫鳥嘌呤、
噻替派、替拉紮明(tirapazamine,Tirazone®)、注射用鹽酸托泊替康(topotecan hydrochloride for injection,Hycamptin®)、長春鹼(Velban®)、長春新鹼(Oncovin®)、長春瑞濱(vinorelbine,Navelbine®)、依魯替尼(ibrutinib)、艾代拉裡(idelalisib)及貝倫妥單抗維多汀(brentuximab vedotin)。
實例性烷基化劑包括(但不限於)氮芥、乙烯亞胺衍生物、磺酸烷基酯、亞硝基脲及三氮烯):尿嘧啶氮芥(Aminouracil Mustard®、Chlorethaminacil®、Demethyldopan®、Desmethyldopan®、Haemanthamine®、Nordopan®、Uracil nitrogen mustard®、Uracillost®、Uracilmostaza®、Uramustin®、Uramustine®)、甲川氯(chlormethine,Mustargen®)、環磷醯胺(Cytoxan®、Neosar®、Clafen®、Endoxan®、Procytox®、RevimmuneTM)、異環磷醯胺(Mitoxana®)、美法侖(Alkeran®)、氮芥苯丁酸(Leukeran®)、哌血生(pipobroman,Amedel®、Vercyte®)、三乙烯三聚氰胺(Hemel®、Hexalen®、Hexastat®)、三乙烯磷醯胺、替莫唑胺(Temozolomide,Temodar®)、噻替派(Thioplex®)、白消安(Busilvex®、Myleran®)、卡莫司汀(BiCNU®)、洛莫司汀(CeeNU®)、鏈脲菌素(streptozocin,Zanosar®)及達卡巴嗪(DTIC-Dome®)。其他實例性烷基化劑包括(但不限於)奧利沙鉑(Oxaliplatin,Eloxatin®);替莫唑胺(Temodar®及Temodal®);放線菌素(亦稱為放線菌素-D,Cosmegen®);美法侖(亦稱為L-PAM、L-沙可來新(sarcolysin)及苯丙胺酸氮芥,Alkeran®);六甲蜜胺(亦稱為六甲基三聚氰胺(HMM),Hexalen®);卡莫司汀(BiCNU®);苯達莫斯汀(Bendamustine,Treanda®);白消安(Busulfex®及Myleran®);卡鉑(Paraplatin®);洛莫司汀(亦稱為CCNU、CeeNU®);順鉑(亦稱為CDDP、Platinol®及Platinol®-AQ);氮芥苯丁酸(Leukeran®);環磷醯胺(Cytoxan®及Neosar®);達卡巴嗪
(亦稱為DTIC、DIC及咪唑甲醯胺,DTIC-Dome®);六甲蜜胺(亦稱為六甲基三聚氰胺(HMM)、Hexalen®);異環磷醯胺(Ifex®);普瑞斯汀(Prednumustine);丙卡巴肼(Procarbazine,Matulane®);甲基二氯乙胺(亦稱為氮芥、莫斯汀(mustine)及甲基二氯乙胺鹽酸鹽,Mustargen®);鏈脲菌素(Zanosar®);噻替派(亦稱為硫代磷醯胺、TESPA及TSPA,Thioplex®);環磷醯胺(Endoxan®、Cytoxan®、Neosar®、Procytox®、Revimmune®);及苯達莫斯汀HCl(Treanda®)。
實例性蒽環類包括例如多柔比星(Adriamycin®及Rubex®);博來黴素(lenoxane®);道諾黴素(鹽酸道諾黴素、柔紅黴素及鹽酸紅比黴素(rubidomycin hydrochloride),Cerubidine®);道諾黴素脂質體(檸檬酸道諾黴素脂質體,DaunoXome®);米托蒽醌(DHAD,Novantrone®);表柔比星(EllenceTM);伊達比星(Idamycin®、Idamycin PFS®);絲裂黴素C(Mutamycin®);格爾德黴素(geldanamycin);除莠黴素;灰暗黴素(ravidomycin);及去乙醯基灰暗黴素。
可與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用之實例性長春花生物鹼包括(但不限於)酒石酸長春瑞濱(Navelbine®)、長春新鹼(Oncovin®)及長春地辛(Vindesine,Eldisine®));長春鹼(亦稱為硫酸長春鹼、長春花鹼(vincaleukoblastine)及VLB,Alkaban-AQ®及Velban®);及長春瑞濱(Navelbine®)。
可與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用之實例性蛋白體抑制劑包括(但不限於)硼替佐米(bortezomib,Velcade®);卡非左米(carfilzomib,PX-171-007、(S)-4-甲基-N-((S)-1-(((S)-4-甲基-1-((R)-2-
甲基環氧乙烷-2-基)-1-側氧基戊-2-基)胺基)-1-側氧基-3-苯基丙-2-基)-2-((S)-2-(2-嗎啉基乙醯胺基)-4-苯基丁醯胺基)-戊醯胺);馬瑞佐米(marizomib,NPI-0052);檸檬酸易賽佐米(ixazomib citrate,MLN-9708);德蘭佐米(delanzomib,CEP-18770);及O-甲基-N-[(2-甲基-5-噻唑基)羰基]-L-絲胺醯基-O-甲基-N-[(1S)-2-[(2R)-2-甲基-2-環氧乙烷基]-2-側氧基-1-(苯基甲基)乙基]-L-絲胺醯胺(ONX-0912)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)組合用於與酪胺酸激酶抑制劑(例如,受體酪胺酸激酶(RTK)抑制劑)之組合中。實例性酪胺酸激酶抑制劑包括(但不限於)表皮生長因子(EGF)路徑抑制劑(例如,表皮生長因子受體(EGFR)抑制劑)、血管內皮生長因子(VEGF)路徑抑制劑(例如,血管內皮生長因子受體(VEGFR)抑制劑(例如,VEGFR-1抑制劑、VEGFR-2抑制劑、VEGFR-3抑制劑))、血小板源性生長因子(PDGF)路徑抑制劑(例如,血小板源性生長因子受體(PDGFR)抑制劑(例如,PDGFR-β抑制劑))、RAF-1抑制劑、KIT抑制劑及RET抑制劑。在一些實施例中,與hedgehog抑制劑組合使用之抗癌劑選自由以下組成之群:阿西替尼(axitinib,AG013736)、博舒替尼(bosutinib,SKI-606)、西地尼布(cediranib,RECENTINTM、AZD2171)、達沙替尼(dasatinib,SPRYCEL®、BMS-354825)、埃羅替尼(erlotinib,TARCEVA®)、吉非替尼(gefitinib,IRESSA®)、伊馬替尼(imatinib,Gleevec®、CGP57148B、STI-571)、拉帕替尼(lapatinib,TYKERB®、TYVERB®)、來他替尼(lestaurtinib,CEP-701)、來那替尼(neratinib,HKI-272)、尼羅替尼(nilotinib,TASIGNA®)、司馬沙尼(semaxanib,司馬西尼(semaxinib)、SU5416)、舒尼替尼(sunitinib,SUTENT®、SU11248)、托西尼布(toceranib,PALLADIA®)、凡德他尼
(vandetanib,ZACTIMA®、ZD6474)、瓦他拉尼(vatalanib,PTK787、PTK/ZK)、曲妥珠單抗(HERCEPTIN®)、貝伐珠單抗(bevacizumab,AVASTIN®)、利妥昔單抗(RITUXAN®)、西妥昔單抗(ERBITUX®)、帕尼單抗(panitumumab,VECTIBIX®)、蘭尼單抗(ranibizumab,Lucentis®)、尼羅替尼(TASIGNA®)、索拉菲尼(sorafenib,NEXAVAR®)、阿倫珠單抗(alemtuzumab,CAMPATH®)、吉妥單抗奧佐米星(gemtuzumab ozogamicin,麥羅塔®)、ENMD-2076、PCI-32765、AC220、乳酸多維替尼(dovitinib lactate,TKI258、CHIR-258)、BIBW 2992(TOVOKTM)、SGX523、PF-04217903、PF-02341066、PF-299804、BMS-777607、ABT-869、MP470、BIBF 1120(VARGATEF®)、AP24534、JNJ-26483327、MGCD265、DCC-2036、BMS-690154、CEP-11981、替沃尼布(tivozanib,AV-951)、OSI-930、MM-121、XL-184、XL-647、XL228、AEE788、AG-490、AST-6、BMS-599626、CUDC-101、PD153035、培利替尼(pelitinib,EKB-569)、凡德他尼(zactima)、WZ3146、WZ4002、WZ8040、ABT-869(利尼伐尼(linifanib)、AEE788、AP24534(帕納替尼(ponatinib))、AV-951(替沃尼布)、阿西替尼、BAY 73-4506(瑞格菲尼(regorafenib))、丙胺酸布立尼布(brivanib alaninate,BMS-582664)、布立尼布(BMS-540215)、西地尼布(AZD2171)、CHIR-258(多維替尼)、CP 673451、CYC116、E7080、Ki8751、馬賽替尼(masitinib,AB1010)、MGCD-265、二磷酸莫替沙尼(motesanib diphosphate,AMG-706)、MP-470、OSI-930、鹽酸帕唑帕尼(Pazopanib Hydrochloride)、PD173074、甲苯磺酸索拉菲尼(Bay 43-9006)、SU 5402、TSU-68(SU6668)、瓦他拉尼、XL880(GSK1363089、EXEL-2880)。所選酪胺酸激酶抑制劑選自舒尼替尼、埃羅替尼、吉非替尼或索拉菲尼。
在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如本文所述之抗LAG-3
抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)組合係與血管內皮生長因子(VEGF)受體抑制劑組合使用,該等受體抑制劑包括(但不限於)貝伐珠單抗(Avastin®)、阿西替尼(Inlyta®);丙胺酸布立尼布(BMS-582664、(S)-((R)-1-(4-(4-氟-2-甲基-1H-吲哚-5-基氧基)-5-甲基吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-6-基氧基)丙-2-基)2-胺基丙酸酯);索拉菲尼(Nexavar®);帕唑帕尼(Votrient®);蘋果酸舒尼替尼(Sutent®);西地尼布(AZD2171,CAS 288383-20-1);Vargatef(BIBF1120,CAS 928326-83-4);福瑞替尼(Foretinib,GSK1363089);替拉替尼(Telatinib,BAY57-9352,CAS 332012-40-5);阿法替尼(Apatinib,YN968D1,CAS 811803-05-1);伊馬替尼(Gleevec®);帕納替尼(AP24534,CAS 943319-70-8);替沃尼布(AV951,CAS 475108-18-0);瑞格菲尼(BAY73-4506,CAS 755037-03-7);二鹽酸瓦他拉尼(PTK787,CAS 212141-51-0);布立尼布(BMS-540215,CAS 649735-46-6);凡德他尼(Caprelsa®或AZD6474);二磷酸莫替沙尼(AMG706,CAS 857876-30-3、N-(2,3-二氫-3,3-二甲基-1H-吲哚-6-基)-2-[(4-吡啶基甲基)胺基]-3-吡啶甲醯胺,闡述於PCT公開案第WO 02/066470號中);多維替尼二乳酸(TKI258,CAS 852433-84-2);利尼伐尼(ABT869,CAS 796967-16-3);卡博替尼(Cabozantinib,XL184,CAS 849217-68-1);來他替尼(CAS 111358-88-4);N-[5-[[[5-(1,1-二甲基乙基)-2-噁唑基]甲基]硫基]-2-噻唑基]-4-六氫吡啶甲醯胺(BMS38703,CAS 345627-80-7);(3R,4R)-4-胺基-1-((4-((3-甲氧基苯基)胺基)吡咯并[2,1-f][1,2,4]三嗪-5-基)甲基)六氫吡啶-3-醇(BMS690514);N-(3,4-二氯-2-氟苯基)-6-甲氧基-7-[[(3aα,5β,6aα)-八氫-2-甲基環戊[c]吡咯-5-基]甲氧基]-4-喹唑啉胺(XL647,CAS 781613-23-8);4-甲基-3-[[1-甲基-6-(3-吡啶基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-基]胺基]-N-[3-(三氟甲基)苯基]-苯甲醯胺
(BHG712,CAS 940310-85-0);及阿柏西普(Aflibercept,Eylea®)。
實例性抗VEGF抗體包括(但不限於)與由雜交瘤ATCC HB 10709產生之單株抗VEGF抗體A4.6.1結合至相同表位之單株抗體;根據Presta等人(1997)Cancer Res.57:4593-4599產生之重組人類化抗VEGF單株抗體。在一個實施例中,抗VEGF抗體係貝伐珠單抗(BV),亦稱為rhuMAb VEGF或AVASTIN®。貝伐珠單抗包含來自鼠類抗hVEGF單株抗體A.4.6.1之突變人類IgG1框架區及抗原結合互補決定區,該單株抗體阻斷VEGF與其受體之結合。貝伐珠單抗及其他人類化抗VEGF抗體進一步闡述於2005年2月26日頒佈之美國專利第6,884,879號中。其他抗體包括G6或B20系列抗體(例如,G6-31、B20-4.1),如PCT公開案第WO2005/012359號、PCT公開案第WO2005/044853號中所述,該等專利申請案之內容以引用方式明確併入本文中。關於其他抗體參見美國專利第7,060,269號、第6,582,959號、第6,703,020號、第6,054,297號;W098/45332;WO 96/30046;WO94/10202;EP 0666868B1;美國專利申請公開案第2006009360號、第20050186208號、第20030206899號、第20030190317號、第20030203409號及第20050112126號;以及Popkov等人,Journal of Immunological Methods 288:149-164(2004)。其他抗體包括結合至人類VEGF上之包含殘基F17、Ml 8、D19、Y21、Y25、Q89、191、Kl 01、El 03及C104或者包含殘基F17、Y21、Q22、Y25、D63、183及Q89的功能表位之彼等。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合係與PI3K抑制劑組合使用。在一個實施例中,PI3K抑制劑係PI3K之δ及γ同種型之抑制劑。可組合使用之實例性PI3K抑制劑闡述於例如WO 2010/036380、WO 2010/006086、WO
09/114870、WO 05/113556中。可組合使用之實例性PI3K抑制劑包括例如GSK 2126458、GDC-0980、GDC-0941、Sanofi XL147、XL756、XL147、PF-46915032、BKM 120、CAL-101、CAL 263、SF1126、PX-886及雙重PI3K抑制劑(例如,Novartis BEZ235)。
在一些實施例中,本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合係與mTOR抑制劑、例如一或多種選自以下中之一或多者之mTOR抑制劑組合使用:雷帕黴素、替西羅莫司(temsirolimus,TORISEL®)、AZD8055、BEZ235、BGT226、XL765、PF-4691502、GDC0980、SF1126、OSI-027、GSK1059615、KU-0063794、WYE-354、Palomid 529(P529)、PF-04691502或PKI-587。瑞達弗莫司(ridaforolimus,之前稱為迪弗莫司(deferolimus)、(1R,2R,4S)-二甲基亞磷酸4-[(2R)-2[(1R,9S,12S,15R,16E,18R,19R,21R,23S,24E,26E,28Z,30S,32S,35R)-1,18-二羥基-19,30-二甲氧基-15,17,21,23,29,35-六甲基-2,3,10,14,20-五側氧基-11,36-二氧雜-4-氮雜三環[30.3.1.04,9]三十六碳-16,24,26,28-四烯-12-基]丙基]-2-甲氧基環己基酯,亦稱為AP23573及MK8669,且闡述於PCT公開案第WO 03/064383號中);依維莫司(everolimus,Afinitor®或RAD001);雷帕黴素(AY22989、西羅莫司®);塞馬莫德(semapimod,CAS 164301-51-3);替西羅莫司,(5-{2,4-雙[(3S)-3-甲基嗎啉-4-基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-基}-2-甲氧基苯基)甲醇(AZD8055);2-胺基-8-[反式-4-(2-羥基乙氧基)環己基]-6-(6-甲氧基-3-吡啶基)-4-甲基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮(PF04691502,CAS 1013101-36-4);及N 2-[1,4-二側氧基-4-[[4-(4-側氧基-8-苯基-4H-1-苯并吡喃-2-基)嗎啉鎓-4-基]甲氧基]丁基]-L-精胺醯基甘胺醯基-L-α-天冬胺醯基L-絲胺酸-內鹽(SF1126,CAS 936487-67-1)及XL765。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如本文所述之抗LAG-3
抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合係與BRAF抑制劑組合使用,該BRAF抑制劑係例如GSK2118436、RG7204、PLX4032、GDC-0879、PLX4720及甲苯磺酸索拉菲尼(Bay 43-9006)。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合係與MEK抑制劑組合使用。在一些實施例中,使用抗LAG-3抗體及MEK抑制劑之組合來治療癌症(例如,本文所述之癌症)。在一些實施例中,使用該組合治療之癌症選自黑色素瘤、結腸直腸癌、非小細胞肺癌、卵巢癌、乳癌、前列腺癌、胰臟癌、血液惡性病或腎細胞癌。在某些實施例中,癌症包括BRAF突變(例如,BRAF V600E突變)、BRAF野生型突變、KRAS野生型突變或活化KRAS突變。癌症可處於早期、中期或晚期。可組合使用之任一MEK抑制劑包括(但不限於)ARRY-142886、G02442104(亦稱為GSK1120212)、RDEA436、RDEA119/BAY 869766、AS703026、G00039805(亦稱為AZD6244或司美替尼(selumetinib))、BIX 02188、BIX 02189、CI-1040(PD-184352)、PD0325901、PD98059、U0126、GDC-0973(甲酮、[3,4-二氟-2-[(2-氟-4-碘苯基)胺基]苯基][3-羥基-3-(25)-2-六氫吡啶基-1-氮雜環丁基]-)、G-38963、G02443714(亦稱為AS703206)或其醫藥上可接受之鹽或溶劑合物。MEK抑制劑之其他實例揭示於WO 2013/019906、WO 03/077914、WO 2005/121142、WO 2007/04415、WO 2008/024725及WO 2009/085983中,該等文獻之內容皆以引用方式併入本文中。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合係與奧利沙鉑、甲醯四氫葉酸或5-FU(例如,FOLFOX共治療)中之一者、兩者或
所有組合使用。或者或組合地,該組合進一步包括VEGF抑制劑(例如,如本文所揭示之VEGF抑制劑)。在一些實施例中,使用抗LAG-3抗體、FOLFOX共治療及VEGF抑制劑之組合來治療癌症(例如,本文所述之癌症)。在一些實施例中,使用該組合治療之癌症選自黑色素瘤、結腸直腸癌、非小細胞肺癌、卵巢癌、乳癌、前列腺癌、胰臟癌、血液惡性病或腎細胞癌。癌症可處於早期、中期或晚期。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合係與JAK2抑制劑、例如CEP-701、INCB18424、CP-690550(托法替尼(tasocitinib))組合使用。
在一些實施例中,本文所述之醫藥組合物單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合係與太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇藥劑、例如汰癌勝®、蛋白質結合之太平洋紫杉醇(例如,ABRAXANE®)組合使用。實例性太平洋紫杉醇藥劑包括(但不限於)奈米粒子白蛋白結合之太平洋紫杉醇(ABRAXANE,由Abraxis Bioscience出售)、二十二碳六烯酸結合之太平洋紫杉醇(DHA-太平洋紫杉醇,Taxoprexin,由Protarga出售)、聚麩胺酸鹽結合之太平洋紫杉醇(PG-太平洋紫杉醇(paclitaxel)、太平洋紫杉醇(paclitaxel poliglumex)、CT-2103、XYOTAX,由Cell Therapeutic出售)、腫瘤活化之前藥(TAP)、ANG105(結合至三個太平洋紫杉醇分子之血管肽-2,由ImmunoGen出售)、太平洋紫杉醇-EC-1(結合至erbB2識別肽EC-1之太平洋紫杉醇;參見Li等人,Biopolymers(2007)87:225-230)及葡萄糖偶聯之太平洋紫杉醇(例如,2'-太平洋紫杉醇甲基2-吡喃葡萄糖基琥珀酸酯,參見Liu等人,Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters(2007)17:617-620)。
輻射療法可經由若干方法中之一者或方法之組合來投與,包括
(但不限於)外部光束療法、內部輻射療法、植入物輻射、立體定位放射性手術、全身性輻射療法、放射性療法及永久或暫時性間質近程療法。術語「近程療法」係指藉由在腫瘤或其他增殖組織疾病位點處或附近將在空間上受限之放射性材料插入體內遞送之輻射療法。該術語意欲包括(但不限於)暴露於放射性同位素(例如At-211、I-131、I-125、Y-90、Re-186、Re-188、Sm-153、Bi-212、P-32及Lu之放射性同位素)下。適宜用作本發明之細胞調理器之輻射源包括固體及液體二者。藉助非限制性實例,輻射源可係放射性核種,例如I-125、I-131、Yb-169、呈固體源形式之Ir-192、呈固體源形式之I-125或發射光子、β粒子、γ輻射或其他治療射線之其他放射性核種。放射性材料亦可係自放射性核種之任何溶液(例如I-125或I-131之溶液)製造之流體,或放射性流體可使用含有固體放射性核種(例如Au-198、Y-90)之小粒子之適宜流體之漿液來產生。此外,放射性核種可於凝膠或放射性微球體中體現。
抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合可與一或多種現有模式組合投與來治療癌症,該等現有模式包括(但不限於):手術;輻射療法(例如,外部光束療法,其涉及其中輻射場經設計之三維順形輻射療法)、局部輻射(例如,針對預選靶或器官之輻射)或聚焦輻射)。聚焦輻射可選自由立體定位放射性手術、分次立體定位放射性手術及調節強度之輻射療法組成之群。聚焦輻射可具有選自由粒子束(質子)、鈷-60(光子)及線性加速器(x射線)組成之群之輻射源,例如如WO 2012/177624中所述。
在某些實施例中,抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合係與針對殺手細胞免疫球蛋白樣受體之抗體(在本文中亦稱為「抗KIR抗體」)、
pan-KIR抗體、抗NKG2D抗體及抗MICA抗體一起使用。在某些實施例中,使用本文所述之抗LAG-3抗體分子、抗PD-1抗體分子及抗KIR抗體、pan-KIR抗體、抗MICA抗體或抗NKG2D抗體之組合來治療癌症,例如如本文所述之癌症(例如實體腫瘤,例如晚期實體腫瘤)。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合係與細胞免疫療法(例如,Provenge(例如,Sipuleucel))及視情況與環磷醯胺組合使用。在某些實施例中,使用抗LAG-3抗體分子、抗PD-1抗體分子、Provenge及/或環磷醯胺之組合來治療癌症,例如如本文所述之癌症(例如前列腺癌,例如晚期前列腺癌)。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合係與疫苗、例如樹突狀細胞腎癌(DC-RCC)疫苗一起使用。在某些實施例中,使用抗LAG-3抗體分子、抗PD-1抗體分子及/或DC-RCC疫苗之組合來治療癌症,例如如本文所述之癌症(例如腎癌,例如轉移性腎細胞癌(RCC))。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合係與化學療法組合使用來治療肺癌,例如非小細胞肺癌。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與鉑雙聯療法一起使用來治療肺癌。
在另一個實施例中,使用抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合來治療腎癌,例如腎細胞癌(RCC)或轉移性RCC。抗LAG-3抗體分子可與以下中之一或多者組合投與:基於免疫之策略(例如,介白素-2或干擾素-α)、靶向劑(例如VEGF抑制劑,例如針對VEGF之單株抗體);VEGF酪胺酸激酶抑制劑,例如舒尼替尼、索拉菲尼、阿西替尼及帕唑帕
尼;RNAi抑制劑)或VEGF信號傳導之下游調介劑之抑制劑,例如雷帕黴素(mTOR)之哺乳動物靶之抑制劑,例如依維莫司及替西羅莫司。
本文所述與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療胰臟癌之適宜治療劑的實例包括(但不限於)化學治療劑,例如太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇藥劑(例如太平洋紫杉醇調配物,例如汰癌勝、白蛋白穩定之奈米粒子太平洋紫杉醇調配物(例如,ABRAXANE)或脂質體太平洋紫杉醇調配物);吉西他濱(例如,吉西他濱單獨或與AXP107-11組合);其他化學治療劑,例如奧利沙鉑、5-氟尿嘧啶、卡培他濱、盧比替康(rubitecan)、鹽酸表柔比星、NC-6004、順鉑、多西他賽(例如,TAXOTERE)、絲裂黴素C、異環磷醯胺;干擾素;酪胺酸激酶抑制劑(例如,EGFR抑制劑(例如,埃羅替尼、帕尼單抗、西妥昔單抗、尼妥珠單抗(nimotuzumab));HER2/neu受體抑制劑(例如,曲妥珠單抗);雙重激酶抑制劑(例如,博舒替尼、塞卡替尼(saracatinib)、拉帕替尼、凡德他尼);多激酶抑制劑(例如,索拉菲尼、舒尼替尼、XL184、帕唑帕尼);VEGF抑制劑(例如,貝伐珠單抗、AV-951、布立尼布);放射性免疫療法(例如,XR303);癌症疫苗(例如,GVAX、存活蛋白肽);COX-2抑制劑(例如,塞來昔布(celecoxib));IGF-1受體抑制劑(例如,AMG 479、MK-0646);mTOR抑制劑(例如,依維莫司、替西羅莫司);IL-6抑制劑(例如,CNTO 328);週期蛋白依賴性激酶抑制劑(例如,P276-00、UCN-01);改變的能量代謝定向(AEMD)化合物(例如,CPI-613);HDAC抑制劑(例如,伏立諾他(vorinostat));TRAIL受體2(TR-2)激動劑(例如,可那木單抗(conatumumab));MEK抑制劑(例如,AS703026、司美替尼、GSK1120212);Raf/MEK雙重激酶抑制劑(例如,RO5126766);Notch
信號傳導抑制劑(例如,MK0752);單株抗體-抗體融合蛋白(例如,L19IL2);薑黃素;HSP90抑制劑(例如,坦螺旋黴素(tanespimycin)、STA-9090);rIL-2;地尼白介素(denileukin diftitox);拓撲異構酶1抑制劑(例如,伊立替康、PEP02);史他汀(statin,例如斯伐他汀(simvastatin));因子VIIa抑制劑(例如,PCI-27483);AKT抑制劑(例如,RX-0201);低氧活化之前藥(例如,TH-302);鹽酸二甲雙胍、γ-分泌酶抑制劑(例如,RO4929097);核糖核苷酸還原酶抑制劑(例如,3-AP);免疫毒素(例如,HuC242-DM4);PARP抑制劑(例如,KU-0059436、維利帕尼(veliparib));CTLA-4抑制劑(例如,CP-675,206、伊匹單抗);AdV-tk療法;蛋白酶體抑制劑(例如,硼替佐米(萬珂(Velcade))、NPI-0052);噻唑啶二酮(例如,吡格列酮(pioglitazone));NPC-1C;極光激酶抑制劑(例如,R763/AS703569)、CTGF抑制劑(例如,FG-3019);siG12D LODER;及輻射療法(例如,螺旋刀療法、立體定位輻射、質子療法)、手術及其組合。在某些實施例中,太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇藥劑及吉西他濱之組合可與本文所述之抗PD-1抗體分子一起使用。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療小細胞肺癌之適宜治療劑的實例包括(但不限於)化學治療劑,例如依託泊苷、卡鉑、順鉑、奧利沙鉑、伊立替康、托泊替康、吉西他濱、脂質體SN-38、苯達莫斯汀、替莫唑胺、貝洛替康(belotecan)、NK012、FR901228、夫拉平度(flavopiridol));酪胺酸激酶抑制劑(例如,EGFR抑制劑(例如,埃羅替尼、吉非替尼、西妥昔單抗、帕尼單抗);多激酶抑制劑(例如,索拉菲尼、舒尼替尼);VEGF抑制劑(例如,貝伐珠單抗、凡德他尼);癌症疫苗(例如,GVAX);Bcl-2抑制劑(例如,奧利莫森鈉(oblimersen sodium)、ABT-263);蛋白酶體抑制劑(例如,硼替佐米
(萬珂)、NPI-0052)、太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇藥劑;多西他賽;IGF-1受體抑制劑(例如,AMG 479);HGF/SF抑制劑(例如,AMG102、MK-0646);氯喹(chloroquine);極光激酶抑制劑(例如,MLN8237);放射性免疫療法(例如,TF2);HSP90抑制劑(例如,坦螺旋黴素、STA-9090);mTOR抑制劑(例如,依維莫司);Ep-CAM-/CD3-雙特異性抗體(例如,MT110);CK-2抑制劑(例如,CX-4945);HDAC抑制劑(例如,比利諾他(belinostat));SMO拮抗劑(例如,BMS 833923);肽癌症疫苗及輻射療法(例如,調節強度之輻射療法(IMRT)、低分次放射性療法、低氧引導之放射性療法)、手術及其組合。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療非小細胞肺癌之適宜治療劑的實例包括(但不限於)化學治療劑,例如長春瑞濱、順鉑、多西他賽、培美曲塞二鈉(pemetrexed disodium)、依託泊苷、吉西他濱、卡鉑、脂質體SN-38、TLK286、替莫唑胺、托泊替康、培美曲塞二鈉、阿紮胞苷(azacitidine)、伊立替康、替吉奧鉀(tegafur-gimeracil-oteracil potassium)、沙帕他濱(sapacitabine));酪胺酸激酶抑制劑(例如,EGFR抑制劑(例如,埃羅替尼、吉非替尼、西妥昔單抗、帕尼單抗、尼西單抗(necitumumab)、PF-00299804、尼妥珠單抗、RO5083945)、MET抑制劑(例如,PF-02341066、ARQ 197)、PI3K激酶抑制劑(例如,XL147、GDC-0941)、Raf/MEK雙重激酶抑制劑(例如,RO5126766)、PI3K/mTOR雙重激酶抑制劑(例如,XL765)、SRC抑制劑(例如,達沙替尼)、雙重抑制劑(例如,BIBW 2992、GSK1363089、ZD6474、AZD0530、AG-013736、拉帕替尼、MEHD7945A、利尼伐尼)、多激酶抑制劑(例如,索拉菲尼、舒尼替尼、帕唑帕尼、AMG 706、XL184、MGCD265、BMS-690514、
R935788)、VEGF抑制劑(例如,恩度(endostar)、內皮他丁(endostatin)、貝伐珠單抗、西地尼布、BIBF 1120、阿西替尼、替沃尼布、AZD2171)、癌症疫苗(例如,BLP25脂質體疫苗、GVAX、重組DNA及表現L523S蛋白之腺病毒)、Bcl-2抑制劑(例如,奧利莫森鈉)、蛋白酶體抑制劑(例如,硼替佐米、卡非左米、NPI-0052、MLN9708)、太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇藥劑、多西他賽、IGF-1受體抑制劑(例如,西妥木單抗(cixutumumab)、MK-0646、OSI 906、CP-751,871、BIIB022)、羥基氯喹、HSP90抑制劑(例如,坦螺旋黴素、STA-9090、AUY922、XL888)、mTOR抑制劑(例如,依維莫司、替西羅莫司、瑞達弗莫司)、Ep-CAM-/CD3-雙特異性抗體(例如,MT110)、CK-2抑制劑(例如,CX-4945)、HDAC抑制劑(例如,MS 275、LBH589、伏立諾他、丙戊酸、FR901228)、DHFR抑制劑(例如,普拉曲沙(pralatrexate))、類視色素(例如,貝沙羅汀(bexarotene)、維A酸(tretinoin))、抗體-藥物偶聯物(例如,SGN-15)、雙磷酸鹽(例如,唑來膦酸(zoledronic acid))、癌症疫苗(例如,貝拉根-L(belagenpumatucel-L))、低分子量肝素(LMWH)(例如,亭紮肝素(tinzaparin)、依諾肝素(enoxaparin))、GSK1572932A、褪黑激素、塔乳鐵蛋白(talactoferrin)、地美司鈉(dimesna)、拓撲異構酶抑制劑(例如,胺柔比星(amrubicin)、依託泊苷、卡侖尼替星(karenitecin))、奈非那韋(nelfinavir)、西侖吉肽(cilengitide)、ErbB3抑制劑(例如,MM-121、U3-1287)、存活蛋白抑制劑(例如,YM155、LY2181308)、甲磺酸埃雷布林(eribulin mesylate)、COX-2抑制劑(例如,塞來昔布)、非格司亭、保羅樣激酶(Polo-like kinase)1抑制劑(例如,BI 6727)、TRAIL受體2(TR-2)激動劑(例如,CS-1008)、CNGRC肽(SEQ ID NO:293)-TNF α偶聯物、二氯乙酸酯(DCA)、HGF抑制劑(例如,SCH 900105)、SAR240550、PPAR-γ激動劑(例如,CS-7017)、γ-分泌酶抑
制劑(例如,RO4929097)、後生療法(例如,5-阿紮胞苷)、硝基甘油、MEK抑制劑(例如,AZD6244)、週期蛋白依賴性激酶抑制劑(例如,UCN-01)、膽固醇-Fus1、抗微管蛋白劑(例如,E7389)、法尼基-OH-轉移酶抑制劑(例如,洛那法尼(lonafarnib))、免疫毒素(例如,BB-10901、SS1(dsFv)PE38)、達肝癸鈉(fondaparinux)、血管破壞劑(例如,AVE8062)、PD-L1抑制劑(例如,MDX-1105、MDX-1106)、β-葡聚糖、NGR-hTNF、EMD 521873、MEK抑制劑(例如,GSK1120212)、埃博黴素(epothilone)類似物(例如,伊沙匹隆(ixabepilone))、紡錘體驅動蛋白抑制劑(例如,4SC-205)、端粒靶向劑(例如,KML-001)、P70路徑抑制劑(例如,LY2584702)、AKT抑制劑(例如,MK-2206)、血管生成抑制劑(例如,雷利竇邁)、Notch信號傳導抑制劑(例如,OMP-21M18)、輻射療法、手術及其組合。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療卵巢癌之適宜治療劑的實例包括(但不限於)化學治療劑(例如,太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇藥劑;多西他賽;卡鉑;吉西他濱;多柔比星;托泊替康;順鉑;伊立替康、TLK286、異環磷醯胺、奧拉帕尼(olaparib)、奧利沙鉑、美法侖、培美曲塞二鈉、SJG-136、環磷醯胺、依託泊苷、地西他濱(decitabine));格那啉(ghrelin)拮抗劑(例如,AEZS-130)、免疫療法(例如,APC8024、奧伐伏單抗(oregovomab)、OPT-821)、酪胺酸激酶抑制劑(例如,EGFR抑制劑(例如,埃羅替尼)、雙重抑制劑(例如,E7080)、多激酶抑制劑(例如,AZD0530、JI-101、索拉菲尼、舒尼替尼、帕唑帕尼)、ON 01910.Na)、VEGF抑制劑(例如,貝伐珠單抗、BIBF 1120、西地尼布、AZD2171)、PDGFR抑制劑(例如,IMC-3G3)、太平洋紫杉醇、拓撲異構酶抑制劑(例如,卡侖尼替星、伊立替康)、HDAC抑制劑(例如,丙戊酸鹽、伏立諾他)、葉酸受體抑制劑
(例如,法樂珠單抗(farletuzumab))、血管生成素抑制劑(例如,AMG 386)、埃博黴素類似物(例如,伊沙匹隆)、蛋白酶體抑制劑(例如,卡非左米)、IGF-1受體抑制劑(例如,OSI 906、AMG 479)、PARP抑制劑(例如,維利帕尼、AG014699、依尼帕尼(iniparib)、MK-4827)、極光激酶抑制劑(例如,MLN8237、ENMD-2076)、血管生成抑制劑(例如,雷利竇邁)、DHFR抑制劑(例如,普拉曲沙)、放射性免疫治療劑(例如,Hu3S193)、史他汀(例如,洛伐他汀)、拓撲異構酶1抑制劑(例如,NKTR-102)、癌症疫苗(例如,p53合成長肽疫苗、自體OC-DC疫苗)、mTOR抑制劑(例如,替西羅莫司、依維莫司)、BCR/ABL抑制劑(例如,伊馬替尼)、ET-A受體拮抗劑(例如,ZD4054)、TRAIL受體2(TR-2)激動劑(例如,CS-1008)、HGF/SF抑制劑(例如,AMG 102)、EGEN-001、保羅樣激酶1抑制劑(例如,BI 6727)、γ-分泌酶抑制劑(例如,RO4929097)、Wee-1抑制劑(例如,MK-1775)、抗微管蛋白劑(例如,長春瑞濱、E7389)、免疫毒素(例如,地尼白介素)、SB-485232、血管破壞劑(例如,AVE8062)、整聯蛋白抑制劑(例如,EMD 525797)、紡錘體驅動蛋白抑制劑(例如,4SC-205)、雷利米得(revlimid)、HER2抑制劑(例如,MGAH22)、ErrB3抑制劑(例如,MM-121)、輻射療法;及其組合。
在一個實例性實施例中,使用抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合單獨或與以下中之一或多者組合來治療骨髓瘤:化學療法或其他抗癌劑(例如,沙利竇邁類似物,例如雷利竇邁)、HSCT(Cook,R.(2008)J Manag Care Pharm.14(7增刊):19-25)、抗TIM3抗體(Hallett,WHD等人(2011)J of American Society for Blood and Marrow Transplantation 17(8):1133-145)、腫瘤抗原致敏樹突狀細胞、腫瘤細胞及樹突狀細胞之融合物(例如,電融合物)或使用由惡性漿細胞產生之免疫球蛋白個
體基因型進行疫苗接種(綜述於Yi,Q.(2009)Cancer J.15(6):502-10中)。
在另一個實施例中,使用抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合來治療腎癌,例如腎細胞癌(RCC)或轉移性RCC。抗PD-1抗體分子可與以下中之一或多者組合投與:基於免疫之策略(例如,介白素-2或干擾素-α)、靶向劑(例如,VEGF抑制劑,例如針對VEGF之單株抗體,例如貝伐珠單抗(Rini,B.I.等人(2010)J.Clin.Oncol.28(13):2137-2143));VEGF酪胺酸激酶抑制劑,例如舒尼替尼、索拉菲尼、阿西替尼及帕唑帕尼(綜述於Pal.S.K.等人(2014)Clin.Advances in Hematology & Oncology 12(2):90-99));RNAi抑制劑),或VEGF信號傳導之下游調介劑之抑制劑,例如雷帕黴素(mTOR)之哺乳動物靶之抑制劑,例如依維莫司及替西羅莫司(Hudes,G.等人(2007)N.Engl.J.Med.356(22):2271-2281;Motzer,R.J.等人(2008)Lancet 372:449-456)。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療本發明慢性骨髓性白血病(AML)之適宜治療劑的實例包括(但不限於)化學治療(例如,阿糖胞苷、羥基脲、氯法拉濱(clofarabine)、美法侖、噻替派、氟達拉濱、白消安、依託泊苷、蛹蟲草菌素、噴司他汀、卡培他濱、阿紮胞苷、環磷醯胺、克拉屈濱、托泊替康)、酪胺酸激酶抑制劑(例如,BCR/ABL抑制劑(例如,伊馬替尼、尼羅替尼)、ON 01910.Na雙重抑制劑(例如,達沙替尼、博舒替尼)、多激酶抑制劑(例如,DCC-2036、帕納替尼、索拉菲尼、舒尼替尼、RGB-286638))、干擾素α、類固醇、細胞凋亡劑(例如,高三尖杉酯鹼(omacetaxine mepesuccinat))、免疫療法(例如,同種異體CD4+記憶體Th1樣T細胞/微粒子結合之抗CD3/抗CD28、自體細胞介素誘導之殺手細胞(CIK)、
AHN-12)、CD52靶向劑(例如,阿倫珠單抗)、HSP90抑制劑(例如,坦螺旋黴素、STA-9090、AUY922、XL888)、mTOR抑制劑(例如,依維莫司)、SMO拮抗劑(例如,BMS 833923)、核糖核苷酸還原酶抑制劑(例如,3-AP)、JAK-2抑制劑(例如,INCB018424)、羥基氯喹、類視色素(例如,芬維A銨(fenretinide))、週期蛋白依賴性激酶抑制劑(例如,UCN-01)、HDAC抑制劑(例如,比利諾他、伏立諾他、JNJ-26481585)、PARP抑制劑(例如,維利帕尼)、MDM2拮抗劑(例如,RO5045337)、極光B激酶抑制劑(例如,TAK-901)、放射性免疫療法(例如,經錒-225標記之抗CD33抗體HuM195)、Hedgehog抑制劑(例如,PF-04449913)、STAT3抑制劑(例如,OPB-31121)、KB004、癌症疫苗(例如,AG858)、骨髓移植、幹細胞移植、輻射療法及其組合。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療慢性淋巴球性白血病(CLL)之適宜治療劑的實例包括(但不限於)化學治療劑(例如,氟達拉濱、環磷醯胺、多柔比星、長春新鹼、氮芥苯丁酸、苯達莫斯汀、氮芥苯丁酸、白消安、吉西他濱、美法侖、噴司他汀、米托蒽醌、5-阿紮胞苷、培美曲塞二鈉)、酪胺酸激酶抑制劑(例如,EGFR抑制劑(例如,埃羅替尼)、BTK抑制劑(例如,PCI-32765)、多激酶抑制劑(例如,MGCD265、RGB-286638)、CD-20靶向劑(例如,利妥昔單抗、歐法單抗(ofatumumab)、RO5072759、LFB-R603)、CD52靶向劑(例如,阿倫珠單抗)、潑尼松龍(prednisolone)、阿法達貝泊汀(darbepoetin alfa)、雷利竇邁、Bcl-2抑制劑(例如,ABT-263)、免疫療法(例如,同種異體CD4+記憶體Th1樣T細胞/微粒子結合之抗CD3/抗CD28、自體細胞介素誘導之殺手細胞(CIK))、HDAC抑制劑(例如,伏立諾他、丙戊酸、LBH589、JNJ-26481585、AR-42)、XIAP抑制劑(例如,AEG35156)、CD-74靶向劑(例如,米拉珠單抗
(milatuzumab))、mTOR抑制劑(例如,依維莫司)、AT-101、免疫毒素(例如,CAT-8015、抗Tac(Fv)-PE38(LMB-2))、CD37靶向劑(例如,TRU-016)、放射性免疫療法(例如,131-托西莫單抗(tositumomab))、羥基氯喹、哌立福新(perifosine)、SRC抑制劑(例如,達沙替尼)、沙利竇邁、PI3K δ抑制劑(例如,CAL-101)、類視色素(例如,芬維A銨)、MDM2拮抗劑(例如,RO5045337)、普樂沙福(plerixafor)、極光激酶抑制劑(例如,MLN8237、TAK-901)、蛋白酶體抑制劑(例如,硼替佐米)、CD-19靶向劑(例如,MEDI-551、MOR208)、MEK抑制劑(例如,ABT-348)、JAK-2抑制劑(例如,INCB018424)、低氧活化之前藥(例如,TH-302)、太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇藥劑、HSP90抑制劑、AKT抑制劑(例如,MK2206)、HMG-CoA抑制劑(例如,斯伐他汀)、GNKG186、輻射療法、骨髓移植、幹細胞移植及其組合。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療急性淋巴球性白血病(ALL)之適宜治療劑的實例包括(但不限於)化學治療劑(例如,潑尼松龍、地塞米松、長春新鹼、門冬醯胺酶、道諾黴素、環磷醯胺、阿糖胞苷、依託泊苷、硫鳥嘌呤、巰基嘌呤、氯法拉濱、脂質體環黴素、白消安、依託泊苷、卡培他濱、地西他濱、阿紮胞苷、托泊替康、替莫唑胺)、酪胺酸激酶抑制劑(例如,BCR/ABL抑制劑(例如,伊馬替尼、尼羅替尼)、ON 01910.Na多激酶抑制劑(例如,索拉菲尼))、CD-20靶向劑(例如,利妥昔單抗)、CD52靶向劑(例如,阿倫珠單抗)、HSP90抑制劑(例如,STA-9090)、mTOR抑制劑(例如,依維莫司、雷帕黴素)、JAK-2抑制劑(例如,INCB018424)、HER2/neu受體抑制劑(例如,曲妥珠單抗)、蛋白酶體抑制劑(例如,硼替佐米)、胺甲喋呤、門冬醯胺酶、CD-22靶向劑(例如,依帕珠單抗(epratuzumab)、英妥珠單抗(inotuzumab))、免疫療法(例如,自體細胞
介素誘導之殺手細胞(CIK)、AHN-12)、布林莫單抗(blinatumomab)、週期蛋白依賴性激酶抑制劑(例如,UCN-01)、CD45靶向劑(例如,BC8)、MDM2拮抗劑(例如,RO5045337)、免疫毒素(例如,CAT-8015、DT2219ARL)、HDAC抑制劑(例如,JNJ-26481585)、JVRS-100、太平洋紫杉醇或太平洋紫杉醇藥劑、STAT3抑制劑(例如,OPB-31121)、PARP抑制劑(例如,維利帕尼)、EZN-2285、輻射療法、類固醇、骨髓移植、幹細胞移植或其組合。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療急性類骨髓性白血病(AML)之適宜治療劑的實例包括(但不限於)化學治療劑(例如,阿糖胞苷、道諾黴素、伊達比星、氯法拉濱、地西他濱、沃紮若辛(vosaroxin)、阿紮胞苷、氯法拉濱、利巴韋林、CPX-351、曲奧舒凡(treosulfan)、艾西拉濱(elacytarabine)、阿紮胞苷)、酪胺酸激酶抑制劑(例如,BCR/ABL抑制劑(例如,伊馬替尼、尼羅替尼)、ON 01910.Na多激酶抑制劑(例如,米哚妥林(midostaurin)、SU 11248、奎紮替尼(quizartinib)、索拉菲尼))、免疫毒素(例如,吉妥單抗奧佐米星)、DT388IL3融合蛋白、HDAC抑制劑(例如,伏立諾他、LBH589)、普樂沙福、mTOR抑制劑(例如,依維莫司)、SRC抑制劑(例如,達沙替尼)、HSP90抑制劑(例如,STA-9090)、類視色素(例如,貝沙羅汀、極光激酶抑制劑(例如,BI 811283)、JAK-2抑制劑(例如,INCB018424)、保羅樣激酶抑制劑(例如,BI 6727)、塞那生(cenersen)、CD45靶向劑(例如,BC8)、週期蛋白依賴性激酶抑制劑(例如,UCN-01)、MDM2拮抗劑(例如,RO5045337)、mTOR抑制劑(例如,依維莫司)、LY573636-鈉、ZRx-101、MLN4924、雷利竇邁、免疫療法(例如,AHN-12)、組胺二鹽酸鹽、輻射療法、骨髓移植、幹細胞移植及其組合。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療多發性骨髓瘤(MM)之適宜治療劑的實例包括(但不限於)化學治療劑(例如,美法侖、胺磷汀(amifostine)、環磷醯胺、多柔比星、氯法拉濱、苯達莫斯汀、氟達拉濱、阿黴素(adriamycin)、SyB L-0501)、沙利竇邁、雷利竇邁、地塞米松、潑尼松(prednisone)、泊馬度胺(pomalidomide)、蛋白酶體抑制劑(例如,硼替佐米、卡非左米、MLN9708)、癌症疫苗(例如,GVAX)、CD-40靶向劑(例如,SGN-40、CHIR-12.12)、哌立福新、唑來膦酸、免疫療法(例如,MAGE-A3、NY-ESO-1、HuMax-CD38)、HDAC抑制劑(例如,伏立諾他、LBH589、AR-42)、阿匹利定(aplidin)、環化素依賴性激酶抑制劑(例如,PD-0332991、地那西布(dinaciclib))、三氧化砷、CB3304、HSP90抑制劑(例如,KW-2478)、酪胺酸激酶抑制劑(例如,EGFR抑制劑(例如,西妥昔單抗)、多激酶抑制劑(例如,AT9283))、VEGF抑制劑(例如,貝伐珠單抗)、普樂沙福、MEK抑制劑(例如,AZD6244)、IPH2101、阿托伐他汀、免疫毒素(例如,BB-10901)、NPI-0052、放射性免疫治療(例如,釔Y 90替伊莫單抗(ibritumomab tiuxetan))、STAT3抑制劑(例如,OPB-31121)、MLN4924、極光激酶抑制劑(例如,ENMD-2076)、IMGN901、ACE-041、CK-2抑制劑(例如,CX-4945)、輻射療法、骨髓移植、幹細胞移植及其組合。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療前列腺癌之適宜治療劑的實例包括(但不限於)化學治療劑(例如,多西他賽、卡鉑、氟達拉濱)、阿比特龍(abiraterone)、激素療法(例如,氟他胺、比卡魯胺、尼魯米特、乙酸環丙孕酮、酮康唑(ketoconazole)、胺魯米特(aminoglutethimide)、阿巴瑞克(abarelix)、地加瑞克(degarelix)、柳培
林(leuprolide)、戈舍瑞林(goserelin)、曲普瑞林(triptorelin)、布舍瑞林(buserelin))、酪胺酸激酶抑制劑(例如,雙重激酶抑制劑(例如,拉帕替尼(lapatanib))、多激酶抑制劑(例如,索拉菲尼、舒尼替尼))、VEGF抑制劑(例如,貝伐珠單抗)、TAK-700、癌症疫苗(例如,BPX-101、PEP223)、雷利竇邁、TOK-001、IGF-1受體抑制劑(例如,西妥木單抗)、TRC105、極光A激酶抑制劑(例如,MLN8237)、蛋白酶體抑制劑(例如,硼替佐米)、OGX-011、放射性免疫療法(例如,HuJ591-GS)、HDAC抑制劑(例如,丙戊酸、SB939、LBH589)、羥基氯喹、mTOR抑制劑(例如,依維莫司)、乳酸多維替尼、二吲哚基甲烷、依非韋倫(efavirenz)、OGX-427、金雀異黃酮、IMC-3G3、巴氟替尼(bafetinib)、CP-675,206、輻射療法、手術或其組合。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療HNSCC之適宜治療劑的實例包括(但不限於)如本文所述之化合物A8(或PCT公開案第WO2010/029082號中所述之化合物)及西妥昔單抗(例如,Erbitux,由BMS出售)中之一或兩者。在一些實施例中,治療劑(例如,化合物A8或與A8相關之化合物)係PI3K調節劑,例如PI3K抑制劑。在一些實施例中,治療劑(例如,西妥昔單抗)調節(例如抑制)EGFR。在一些實施例中,癌症具有或經鑒定具有與對照細胞或參考值相比升高的PI3K或EGFR含量或活性。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療胃癌(例如高MSI及/或EBV+胃癌)之適宜治療劑的實例包括(但不限於)如本文所述之化合物A8(或PCT公開案第WO2010/029082號中所述之化合物)。在一些實施例中,治療劑(例如,化合物A8或與A8相關之化合物)係PI3K調節劑,例如PI3K抑制劑。在一些實施例中,癌症具有或經鑒定具有與
對照細胞或參考值相比升高的PI3K含量或活性。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療胃癌(例如高MSI及/或RNF43失活之胃癌)之適宜治療劑的實例包括(但不限於)如本文所述之化合物A28(或PCT公開案第WO2010/101849號中所述之化合物)。在一些實施例中,治療劑(例如,化合物A28或與A28相關之化合物)係porcupine之調節劑,例如抑制劑。在一些實施例中,癌症具有或經鑒定具有與對照細胞或參考值相比升高的porcupine含量或活性。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療GI基質腫瘤(GIST)之適宜治療劑的實例包括(但不限於)如本文所述之化合物A16(或PCT公開案第WO1999/003854號中所述之化合物)。在一些實施例中,治療劑(例如,化合物A16或與A16相關之化合物)係酪胺酸激酶之調節劑,例如抑制劑。在一些實施例中,癌症具有或經測定具有與對照細胞或參考值相比升高的酪胺酸激酶含量或活性。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療NSCLC(例如鱗狀或腺癌)之適宜治療劑的實例包括(但不限於)如本文所述之化合物A17(或美國專利第7,767,675號及第8,420,645號中所述之化合物)及如本文所述之化合物A23(或PCT公開案第WO2003/077914號中所述之化合物)中的一或兩者。在一些實施例中,化合物(例如,化合物A17或與A17相關之化合物)調節(例如抑制)c-MET。在一些實施例中,化合物(例如,化合物A23或與A23相關之化合物)調節(例如抑制)Alk。在一些實施例中,癌症具有或經測定具有與對照細胞或參考值相比升高的c-MET或Alk中一或兩者之含量或活性。在一些實施例中,癌症具有或經鑒定具有EGFR中之突變。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療黑色素瘤(例如,NRAS黑色素瘤)之適宜治療劑的實例包括(但不限於)如本文所述之化合物A24(或美國專利第8,415,355號及第8,685,980號中所述之化合物)及如本文所述之化合物A34(或PCT公開案第WO2003/077914號中所述之化合物)中的一或兩者。在一些實施例中,化合物(例如,化合物A24或與A24相關之化合物)調節(例如抑制)JAK及CDK4/6中之一或多者。在一些實施例中,化合物(例如,化合物A34或與A34相關之化合物)調節(例如抑制)MEK。在一些實施例中,癌症具有或經鑒定具有與對照細胞或參考值相比升高的JAK、CDK4/6及MEK中一或多者之含量或活性。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療黑色素瘤(例如,NRAS黑色素瘤)之適宜治療劑的實例包括(但不限於)如本文所述之化合物A29(或PCT公開案第WO2011/025927號中所述之化合物)及如本文所述之化合物A34(或PCT公開案第WO2003/077914號中所述之化合物)中的一或兩者。在一些實施例中,化合物(例如,化合物A29或與A29相關之化合物)調節(例如抑制)BRAF。在一些實施例中,化合物(例如,化合物A34或與A34相關之化合物)調節(例如抑制)MEK。在一些實施例中,癌症具有或經鑒定具有與對照細胞或參考值相比升高的BRAF及MEK中一或兩者之含量或活性。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療鱗狀NSCLC之適宜治療劑的實例包括(但不限於)如本文所述之化合物A5(或美國專利第8,552,002號中所述之化合物)。在一些實施例中,化合物(例如,化合物A5或與A5相關之化合物)調節(例如抑制)FGFR。在一些實施例
中,癌症具有或經鑒定具有與對照細胞或參考值相比升高的FGFR含量或活性。
與抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合組合使用來治療結腸直腸癌之適宜治療劑的實例包括(但不限於)如本文所述之化合物A29(或PCT公開案第WO2011/025927號中之化合物)及西妥昔單抗(例如,Erbitux,由BMS出售)中的一或兩者。在一些實施例中,治療劑(例如,化合物A29或與相關之化合物A29)調節(例如抑制)BRAF。在一些實施例中,治療(例如,西妥昔單抗)調節(例如抑制)EGFR。在一些實施例中,癌症具有或經鑒定具有與對照細胞或參考值相比升高的BRAF或EGFR含量或活性。
本發明亦提供使用化合物A8、西妥昔單抗及LAG-3抗體分子(視情況與PD-1抗體分子或TIM-3抗體分子組合)治療癌症之方法。在一些實施例中,首先使用化合物A8及西妥昔單抗治療患者。此治療持續一定時間量,例如預定時間量,例如約1個月、2個月、4個月、6個月、8個月、10個月或12個月。然後,投與LAG-3抗體分子(視情況與PD-1抗體分子或TIM-3抗體分子組合)。LAG-3抗體可視情況與西妥昔單抗組合投與。
在一些實施例中,首先使用化合物A8、西妥昔單抗及LAG-3抗體分子(視情況與PD-1抗體分子或TIM-3抗體分子組合)中之所有三者治療患者。此治療持續一定時間量,例如預定時間量,例如約6個月、8個月、10個月或12個月。然後,可逐漸減少化合物A8及/或西妥昔單抗,以使得維持期涉及使用LAG-3抗體分子(例如,作為單一療法或與PD-1抗體分子或TIM-3抗體分子組合)而非化合物A8或西妥昔單抗之治療。
在其他實施例中,在開始治療時依序給予三種化合物(化合物
A8、西妥昔單抗及LAG-3抗體分子,視情況與PD-1抗體分子或TIM-3抗體分子組合)。例如,可首先給予化合物A8及西妥昔單抗,如上文所述。然後,將LAG-3抗體分子(視情況與PD-1抗體分子或TIM-3抗體分子組合)添加至方案中。然後,可如上文所述逐漸減少化合物A8及/或西妥昔單抗。
三種(或更多種)藥劑方案之實例性劑量如下。LAG-3抗體分子可以例如約1mg/kg至40mg/kg、例如1mg/kg至30mg/kg、例如約5mg/kg至25mg/kg、約10mg/kg至20mg/kg、約1mg/kg至5mg/kg或約3mg/kg之劑量投與。在一些實施例中,化合物A8係以約200-300mg、300-400mg或200-400mg之劑量來投與。在一些實施例中,西妥昔單抗係以400mg/m2初始劑量以120分鐘靜脈內輸注、然後250mg/m2每週輸注經60分鐘投與。在實施例中,化合物A8、西妥昔單抗及LAG-3抗體分子中之一或多者係以低於該藥劑通常作為單一療法投與時之劑量、例如比該藥劑通常作為單一療法投與時之劑量低約0-10%、10%-20%、20%-30%、30%-40%、40%-50%、50%-60%、60%-70%、70%-80%或80%-90%的劑量來投與。在實施例中,化合物A8、西妥昔單抗及LAG-3抗體分子中之一或多者係以低於此段落中所述之該藥劑之劑量、例如比此段落中所述之該藥劑之劑量低約0-10%、10%-20%、20%-30%、30%-40%、40%-50%、50%-60%、60%-70%、70%-80%或80%-90%的劑量來投與。在某些實施例中,在組合投與化合物A8與西妥昔單抗及LAG-3抗體分子中之一或兩者時達成抑制(例如生長抑制)所需之化合物A8濃度低於個別投與化合物A8時達成抑制(例如生長抑制)所需之化合物A8濃度。在某些實施例中,在組合投與西妥昔單抗與化合物A8及LAG-3抗體分子中之一或兩者時達成抑制(例如生長抑制)所需之西妥昔單抗濃度低於個別投與西妥昔單抗時達成抑制(例如生長抑制)所需之西妥昔單抗濃度。在某些實施例中,在
組合投與LAG-3抗體分子與西妥昔單抗及化合物A8中之一或兩者時達成抑制(例如生長抑制)所需之LAG-3抗體分子濃度低於個別投與LAG-3抗體分子時達成抑制(例如生長抑制)所需之LAG-3抗體分子濃度。
另外,本文揭示使用抗LAG-3抗體分子單獨或與另一免疫調節劑(例如,抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子)之組合及靶向抗癌劑(例如靶向一或多種蛋白質之藥劑)治療癌症之方法。在一些實施例中,首先投與抗LAG-3抗體分子(及視情況其他免疫調節劑),且其次投與靶向抗癌劑。投與抗LAG-3抗體分子與靶向抗癌劑之間之時間長度可係例如10分鐘、20分鐘或30分鐘、1小時、2小時、4小時、6小時或12小時、或1天、2天、3天、4天、5天、6天或7天、或此範圍內之任一時間段。在某些實施例中,在一定時間段(例如,1天、2天、3天、4天、5天或6天、或1週、2週、4週、8週、12週、16週或20週、或此範圍內之任一時間段)內重複投與抗LAG-3抗體分子,然後投與靶向抗癌劑。在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子與靶向抗癌劑係實質上同時投與。
使用本發明之其他方法來治療已暴露於具體毒素或病原體下之患者。因此,本發明之另一態樣提供治療個體之傳染病之方法,其包含向個體投與抗LAG-3抗體分子,使得治療個體之傳染病。
在治療感染(例如,急性及/或慢性)時,除刺激針對感染之天然宿主免疫防禦外或作為其代替,可組合投與抗LAG-3抗體分子(單獨或與抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子組合)與習用治療。針對感染之天然宿主免疫防禦包括(但不限於)發炎、發熱、抗體介導之宿主防禦、T淋巴球介導之宿主防禦、包括淋巴介質分泌及細胞毒性T細胞(尤其在病毒感染期間)、補體介導之溶解及調理作用(促進性吞噬作用)及吞噬作用。抗LAG-3抗體分子再活化功能障礙性T細胞之能力可
用於治療慢性感染,具體而言其中細胞介導之免疫性對完全恢復至關重要之彼等。
與其應用於如上文所論述之腫瘤類似,抗體介導之LAG-3阻斷可單獨或作為佐劑與疫苗組合使用來刺激針對病原體、毒素及自身抗原之免疫反應。此治療方式可尤其有用之病原體之實例包括當前無有效疫苗之病原體或習用疫苗並不完全有效之病原體。該等病原體包括(但不限於)肝炎(A型、B型及C型)、流行性感冒、HIV、皰疹、梨形鞭毛蟲屬(Giardia)、瘧疾、利什曼原蟲屬(Leishmania)、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、綠膿桿菌(Pseudomonas Aeruginosa)。在感染進程內呈遞經改變之抗原的藥劑(例如HIV)對LAG-3之阻斷尤其可用於針對已建立之感染。該等新穎表位在投與抗人類LAG-3時經識別為外源,因此引起不能由通過LAG-3之負信號減弱之強T細胞反應。
對於源自病毒原因之感染,可藉由與施加標準療法同時、在其之前或之後組合施加抗LAG-3抗體分子(單獨或與抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子組合)來治療病毒感染。該等標準療法端視病毒之類型而變化,但在幾乎所有的情形下,投與含有特異性針對該病毒之抗體(例如,IgA、IgG)之人類血清可有效。
引起可藉由多種方法治療之感染之病原性病毒的一些實例包括肝炎(A型、B型或C型)、流行性感冒病毒(A型、B型或C型)、HIV、皰疹病毒(例如,VZV、HSV-1、HAV-6、HSV-II、CMV、艾伯斯坦-巴爾病毒)、腺病毒、黃病毒、埃柯病毒(echovirus)、鼻病毒、柯薩奇病毒(coxsackie virus)、冠狀病毒、呼吸道融合病毒、流行性腮腺炎病毒、輪狀病毒、麻疹病毒、德國麻疹病毒、小病毒、痘瘡病毒、HTLV病毒、登革熱病毒、乳頭狀瘤病毒、軟疣病毒、脊髓灰白質炎
病毒、狂犬病毒、JC病毒及蟲媒病毒性腦炎病毒。
在一個實施例中,感染係流行性感冒感染。流行性感冒感染可導致發熱、咳嗽、肌痛、頭痛及全身乏力,此通常出現在季節性流行病中。流行性感冒亦與多種感染後病症相關,例如腦炎、心肌心包炎、古德巴斯德症候群(Goodpasture's syndrome)及雷伊氏症候群(Reye's syndrome)。流行性感冒感染亦阻抑正常肺部抗細菌防禦,使得自流行性感冒恢復之患者具有增加的罹患細菌性肺炎的風險。流行性感冒病毒表面蛋白顯示顯著抗原變異,從而導致突變及重組。因此,細胞溶解性T淋巴球係宿主在感染後用於消除病毒之主要媒劑。流行性感冒分成三種主要類型:A、B及C。A型流行性感冒之獨特之處在於其感染人類及許多其他動物(例如,豬、馬、鳥及海豹)二者且係大流行性感冒之主要原因。同樣,當用兩種不同的A型流行性感冒株感染細胞時,兩種親代病毒類型之分段RNA基因組在複製期間混合以產生雜合複製子,從而產生新穎流行株。B型流行性感冒不在動物中複製且因此具有較少遺傳變異,且C型流行性感冒僅具有單一血清型。
大部分習用療法對源自感染之症狀具有姑息性,而宿主之免疫反應實際上會清除該疾病。然而,某些株(例如,A型流行性感冒)可導致更嚴重的疾病及死亡。A型流行性感冒可以臨床及預防方式二者藉由投與抑制病毒複製之環狀胺抑制劑金剛烷胺及龜剛烷來治療。然而,該等藥物之臨床效用因相對較高之不利反應發生率、其較窄抗病毒譜(僅A型流行性感冒)及病毒變成抗性之傾向而受限。投與針對主要流行性感冒表面蛋白、血球凝集素及神經胺糖糖苷酶之血清IgG抗體可預防肺部感染,而黏膜IgA為預防上呼吸道及氣管感染所必需。流行性感冒之最有效之當前治療係藉由投與經福馬林或β-丙內酯失活之病毒進行疫苗接種。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與流行
性感冒抗原或疫苗組合投與。
在另一個實施例中,感染係肝炎感染,例如B型肝炎或C型感染。
B型肝炎病毒(HB-V)係已知最具感染性之血源性病原體。其係急性及慢性肝炎及肝癌以及終身慢性感染之主要原因。感染後,該病毒在肝細胞中複製,其然後亦使表面抗原HBsAg脫落。使用檢測血清中之過量HBsAg作為診斷B型肝炎感染之標準方法。急性感染可消退或其可發展成慢性持久性感染。對慢性HBV之當前治療包括α-干擾素,其增加肝細胞表面上I類人類白血球抗原(HLA)之表現,由此促進細胞毒性T淋巴球對該等肝細胞之識別。另外,在臨床試驗中,核苷類似物更昔洛韋(ganciclovir)、泛昔洛韋(famciclovir)及拉夫米定(lamivudine)亦已顯示在治療HBV感染中之一定效能。對HBV之其他治療包括聚乙二醇化a-干擾素、阿德福韋(adenfovir)、恩替卡韋(entecavir)及替比夫定(telbivudine)。儘管經由非經腸投與抗HBsAg血清抗體可賦予被動免疫性,但使用失活或重組HBsAg進行疫苗接種亦會賦予抗感染性。抗LAG-3抗體分子(單獨或與抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子組合)可與用於B型肝炎感染之習用治療組合用於治療優點。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與B型肝炎抗原或疫苗組合、及視情況與含鋁佐劑組合投與。
C型肝炎病毒(HC-V)感染可導致慢性形式之肝炎,從而引起硬化。儘管症狀類似於源自B型肝炎之感染,但與HB-V恰恰相反,經感染宿主可無症狀達10-20年。抗LAG-3抗體分子可作為單一療法(或與抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子組合)來投與,或前述各項中之所有可與C型肝炎感染之標準護理組合。舉例而言,抗LAG-3抗體分子可與Sovaldi(索非不韋(sofosbuvir))、Olysio(西咪匹韋(simeprevir))加利巴韋林或聚乙二醇化干擾素中之一或多者一起投與。儘管亦批準
包括Incivek(特拉匹韋(telaprevir))或Victrelis(波普瑞韋(boceprevir))加利巴韋林及聚乙二醇化干擾素之方案,但其與增加的副作用及較長治療持續時間相關,且因此不視為較佳方案。
用於HC-V感染之習用治療包括投與α-干擾素及利巴韋林之組合。用於HC-V感染之有希望的潛在療法係蛋白酶抑制劑特拉匹韋(VX-960)。其他治療包括:抗PD-1抗體(例如,MDX-1106,Medarex)、巴維昔單抗(bavituximab,以B2-糖蛋白I依賴性方式結合陰離子型磷脂磷脂醯基絲胺酸之抗體,Peregrine Pharmaceuticals)、抗HPV病毒外殼蛋白E2抗體(例如,ATL 6865-Ab68+Ab65,XTL Pharmaceuticals)及Civacir®(多株抗HCV人類免疫球蛋白)。抗LAG-3抗體分子可與用於C型肝炎感染之該等治療中之一或多者組合用於治療優點。可與抗LAG-3抗體分子組合使用來特異性治療C型肝炎感染之蛋白酶、聚合酶及NS5A抑制劑包括US 2013/0045202中所述之彼等,該文獻以引用方式併入本文中。
在另一個實施例中,感染係麻疹病毒。在培育9-11天後,感染麻疹病毒之宿主發生發熱、咳嗽、鼻炎及結膜炎。在1-2天內,發生紅斑丘疹,其快速擴散至整個身體。由於感染亦會阻抑細胞免疫性,故宿主具有較大的罹患細菌重複感染、包括中耳炎、肺炎及感染後腦脊髓炎之風險。急性感染與尤其營養失調之青少年中之較大發病率及死亡率相關。
對麻疹之治療包括被動投與所彙集之人類IgG,即使在暴露後高達一週給予,其仍可預防非免疫個體之感染。然而,在免疫之前使用減弱活病毒係最有效的治療,且預防大於95%之經免疫彼等之疾病。由於此病毒存在一種血清型,故單次免疫或感染通常可保護生命免於後續感染。
在較小比例之經感染宿主中,麻疹可發展成SSPE,其係源自中
樞神經系統之持久性感染之慢性進行性神經病症。SSPE係由麻疹病毒之具有干擾病毒體組裝及出芽缺陷之純系變體引起。對於該等患者,將期望使用抗LAG-3抗體分子再活化T細胞以促進病毒清除率。
在另一個實施例中,感染係HIV。HIV會攻擊CD4+細胞,包括T淋巴球、單核球-巨噬細胞、濾泡性樹突狀細胞及蘭格漢細胞(Langerhan's cell),且缺失CD4+輔助/誘導細胞。因此,宿主獲得細胞介導之免疫性之嚴重缺陷。HIV感染在至少50%之個體中導致AIDS,且係經由以下途徑來傳播:性接觸、投與受感染之血液或血液產品、使用受感染之精液人工授精、暴露於含有血液之針或注射器下及在分娩期間自受感染母親傳播至嬰兒。
感染HIV之宿主可無症狀,或可罹患類似於單核白血球增多症-發熱、頭痛、咽喉炎、全身乏力及疹之急性疾病。症狀可進展至進行性免疫功能障礙,包括持久性發熱、盜汗、體重損失、難以解釋的腹瀉、濕疹、牛皮癬、脂溢性皮炎、帶狀皰疹、口腔念珠菌病及口腔毛狀白斑。寄生蟲宿主之機會性感染在感染發展成AIDS之患者中較為常見。
對HIV之治療包括抗病毒療法,包括核苷類似物、齊多夫定(zidovudine,AST)單獨或與地達諾新(didanosine)或紮西他濱(zalcitabine)之組合、二去氧肌苷、二去氧胞苷、拉米夫定(lamivudine)、司他夫定(stavudine);逆轉錄抑制劑,例如地拉韋定(delavirdine)、奈韋拉平(nevirapine)、洛韋胺(loviride);及蛋白酶抑制劑,例如沙奎那韋(saquinavir)、利托那韋(ritonavir)、茚地那韋(indinavir)及奈非那韋。抗LAG-3抗體分子(單獨或與抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子組合)可與用於HIV感染之習用治療組合用於治療優點。
在另一個實施例中,感染係巨細胞病毒(CMV)。CMV感染通常
與持久性、潛伏性及復發性感染相關。CMV感染單核球及顆粒球-單核球祖細胞且在其中保持潛伏。CMV之臨床症狀包括單核白血球增多症樣症狀(即,發熱、腺腫脹、全身乏力),且往往發生針對抗生素之過敏性皮膚疹。該病毒係藉由直接接觸來擴散。該病毒在尿液、唾液、精液及在較小程度上其他體液中脫落。傳播亦可自受感染母親至其胎或新生兒及藉由血液轉輸及器官移植進行。CMV感染導致細胞免疫性之一般損害,其特徵在於損害針對非特異性促分裂原及特異性CMV抗原之胚性反應,降低細胞毒性能力及增多CD4+淋巴球之CD8淋巴球數。
CMV感染之治療包括抗病毒性更昔洛韋、膦甲酸及西多福韋(cidovir),但該等藥物通常僅規定用於免疫受損患者中。抗LAG-3抗體分子(單獨或與抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子組合)可與用於巨細胞病毒感染之習用治療組合用於治療優點。
在另一個實施例中,感染係愛潑斯坦-巴爾病毒(EBV)。EBV可建立持久且潛伏的感染且主要攻擊B細胞。感染EBV導致傳染性單核白血球增多症之臨床病況,其包括發熱、咽喉炎、通常伴有滲出物、全身性淋巴腺病及脾增大。亦存在肝炎,其可發展成腹瀉。
儘管對EBV感染之典型治療對症狀具有姑息性,但EBV與罹患某些癌症(例如伯基特氏淋巴瘤及鼻咽癌)相關。因此,在該等併發症發生之前清除病毒感染將具有較大益處。抗LAG-3抗體分子(單獨或與抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子組合)可與用於愛潑斯坦-巴爾病毒之習用治療組合感染用於治療優點。
在另一個實施例中,感染係單純皰疹病毒(HSV)。HSV係藉由與受感染之宿主直接接觸來傳播。直接感染可能無症狀,但通常產生含有感染性粒子之水泡。該疾病表現為疾病活躍時段之循環,其中病灶隨病毒潛伏地感染神經節以供後續爆發而出現及消失。病灶可處於面
部、生殖器、眼睛及/或手上。在某一情形下,感染亦可導致腦炎。
對皰疹感染之治療主要係關於消退症狀性爆發,且包括全身性抗病毒藥劑,例如:阿昔洛韋(例如,Zovirax®)、伐昔洛韋(valaciclovir)、泛昔洛韋、噴昔洛韋(penciclovir),及局部藥劑,例如二十二烷醇(Abreva®)、醋胺金剛烷及茲拉可汀(zilactin)。清除皰疹之潛伏感染將具有較大臨床益處。抗LAG-3抗體分子(單獨或與抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子組合)可與用於皰疹病毒感染之習用治療組合用於治療優點。
在另一個實施例中,感染係人類T親淋巴性病毒(HTLV-1、HTLV-2)。HTLV係經由性接觸、哺乳或暴露於受污染血液下來傳播。該病毒會活化TH細胞之亞組(稱為Th1細胞),從而導致其過度增殖並過度產生Th1相關之細胞介素(例如,IFN-γ及TNF-α)。此進而可阻抑Th2淋巴球且減少Th2細胞介素產生(例如,IL-4、IL-5、IL-10及IL-13),從而降低受感染宿主引起針對需要Th2依賴性反應來清除之侵襲生物體(例如,寄生蟲感染、產生黏膜及體液抗體)的充分免疫反應。
HTLV感染導致機會性感染,引起支氣管擴張症、皮膚炎以及重複感染葡萄球菌屬(Staphylococcus spp.)及類原蟲屬(Strongyloides spp.),從而導致因多微生物性敗血症而死亡。HTLV感染亦可直接引起成人T細胞白血病/淋巴瘤及進行性脫髓鞘上運動神經元疾病(稱為HAM/TSP)。清除HTLV潛伏感染將具有較大臨床益處。抗LAG-3抗體分子(單獨或與抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子組合)可與用於HTLV感染之習用治療組合用於治療優點。
在另一個實施例中,感染係人類乳頭瘤病毒(HPV)。HPV主要侵襲角質細胞且以兩種形式出現:皮膚及生殖器。人們認為傳播係經由直接接觸及/或性活動來進行。皮膚及生殖器HPV感染二者可導致疣
及潛伏感染且有時復發感染,其受控於控制症狀且阻斷疣之出現、但使宿主能夠將感染傳播至他人之宿主免疫性。
HPV感染亦可導致某些癌症,例如子宮頸癌、肛門癌、外陰癌、陰莖癌及口咽癌。業內尚無HPV感染之已知治癒,但當前治療係局部施加咪喹莫特(Imiquimod),其刺激免疫系統攻擊受侵襲區域。清除HPV潛伏感染將具有較大臨床益處。抗LAG-3抗體分子(單獨或與抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子組合)可與用於HPV感染之習用治療組合用於治療優點。
引起可藉由本發明方法治療之感染之病原性細菌的一些實例包括梅毒、披衣菌、立克次體菌(rickettsial bacteria)、分枝桿菌(mycobacteria)、葡萄球菌(staphylococci)、鏈球菌(streptococci)、肺炎球菌(pneumonococci)、腦膜炎球菌(meningococci)及淋球菌(conococci)、克留氏菌屬(klebsiella)、變形桿菌屬(proteus)、鋸桿菌屬(serratia)、假單胞菌屬(pseudomonas)、退伍軍人菌(legionella)、白喉、沙門桿菌屬(salmonella)、桿菌、霍亂、破傷風、肉毒桿菌毒素、炭疽、瘟疫、鉤端螺旋體病及萊姆病(Lymes disease)細菌。抗LAG-3抗體分子(單獨或與抗PD-1、抗PD-L1或抗TIM-3抗體分子組合)可與現有治療模式組合用於上述感染。舉例而言,對梅毒之治療包括青黴素(penicillin,例如青黴素G.)、四環素、去氧羥四環素、頭孢曲松(ceftriaxone)及阿奇黴素(azithromycin)。
由伯氏疏螺旋體(Borrelia burgdorferi)引起之萊姆病經由蜱叮咬傳播至人類中。該疾病最初表現為局部發疹,隨後為感冒樣症狀,包括全身乏力、發熱、頭痛、脖子發僵及關節痛。後期表現可包括移動性及多發性關節炎、伴有腦神經麻痺及神經根病變之神經及心臟參與、心肌炎及心律不整。萊姆病之一些病例變得持久,從而導致類似
於三級梅毒之不可逆損傷。萊姆病之當前療法主要包括投與抗生素。可使用羥基氯喹或胺甲喋呤來治療抗生素抗性株。可使用加巴噴丁來治療具有神經病性疼痛之抗生素難治性患者。米諾四環素可能有助於具有神經或其他發炎表現之後期/慢性萊姆病。
除非血液效價達到引起肝內阻塞之濃度,否則其他形式之螺旋體病(例如源自回歸熱疏螺旋體(B.recurentis)、赫姆斯疏螺旋體(B.hermsii)、特氏疏螺旋體(B.turicatae)、帕克疏螺旋體(B.parikeri.)、伯氏疏螺旋體、杜通螺旋體(B.duttonii)及波斯螺旋體(B.persica)之彼等)以及鉤端螺旋體病(例如問號狀鉤端螺旋體(L.interrogans))通常會自發消退。
引起可藉由本發明方法治療之感染之病原性真菌的一些實例包括念珠菌屬(Candida)(白色念珠菌(Candida albicans)、克魯斯念珠菌(Candida krusei)、光滑念珠菌(Candida glabrata)、熱帶念珠菌(Candida tropicalis)等)、新型隱球菌(Cryptococcus neoformans)、麴菌屬(Aspergillus)(熏煙色麴菌(Aspergillus fumigatus)、黑麴菌(Aspergillus niger)等)、毛黴目屬(Genus Mucorales)(毛黴屬(mucor)、犁頭黴屬(absidia)、根黴(rhizophus))、申克孢子絲菌(Sporothrix schenkii)、皮炎芽生菌(Blastomyces dermatitidis)、巴西副球孢子菌(Paracoccidioides brasiliensis)、粗球孢子菌(Coccidioides immitis)及莢膜組織漿菌(Histoplasma capsulatum)。
引起可藉由本發明方法治療之感染之病原性寄生蟲的一些實例包括溶組織阿米巴(Entamoeba histolytica)、大腸絨毛蟲(Balantidium coli)、福氏內格裡阿米巴原蟲(Naegleriafowleri)、棘狀變形蟲屬(Acanthamoeba sp.)、蘭氏賈第鞭毛蟲(Giardia lambia)、隱孢子蟲屬(Cryptosporidium sp.)、肺胞囊蟲(Pneumocystis carinii)、間日瘧原蟲 (Plasmodium vivax)、小鼠焦蟲(Babesia microti)、布魯氏錐蟲(Trypanosoma brucei)、克魯氏錐蟲(Trypanosoma cruzi)、黑熱病原蟲(Leishmania donovani)、弓漿蟲(Toxoplasma gondi)及巴西鼠鉤蟲(Nippostrongylus brasiliensis)。
本文提供抗LAG-3抗體分子與一或多種第二治療劑之組合。此部分中之許多組合可用於治療癌症,但亦闡述其他適應症。此部分關注抗LAG-3抗體分子之組合,視情況與一或多種免疫調節劑(例如,抗PD-1抗體分子、抗TIM-3抗體分子或抗PD-L1抗體分子)、與表7中所述之一或多種藥劑之組合。在下文之組合中,在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子包含(i)重鏈可變區(VH),其包含選自SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:286之VHCDR1胺基酸序列;SEQ ID NO:2之VHCDR2胺基酸序列;及SEQ ID NO:3之VHCDR3胺基酸序列;及(ii)輕鏈可變區(VL),其包含SEQ ID NO:10之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO:11之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO:12之VLCDR3胺基酸序列。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與PKC抑制劑索曲妥林(Sotrastaurin,化合物A1)或PCT公開案第WO 2005/039549號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,PKC抑制劑係索曲妥林(化合物A1)或PCT公開案第WO 2005/039549號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與索曲妥林(化合物A1)或如PCT公開案第WO 2005/039549號中所述之化合物組合使用來治療病症,例如癌症、黑色素瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、發炎性腸病、移植排斥、眼部病症或牛皮癬。
在某些實施例中,索曲妥林(化合物A1)係以下列劑量來投與:約20mg至600mg,例如約200mg至約600mg、約50mg至約450mg、約100mg至400mg、約150mg至350mg、或約200mg至300mg,例如約50mg、100mg、150mg、200mg、300mg、400mg、500mg或600mg。投藥時間表可自例如每隔一天至每天、每天兩次或三次變化。
在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與BCR-ABL抑制劑TASIGNA(化合物A2)或PCT公開案第WO 2004/005281號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,BCR-ABL抑制劑係TASIGNA或PCT公開案第WO 2004/005281號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與TASIGNA(化合物A2)或PCT公開案第WO 2004/005281號中所述之化合物組合使用來治療病症,例如淋巴球性白血病、帕金森氏病(Parkinson’s Disease)、神經癌、黑色素瘤、消化/胃腸癌、結腸直腸癌、類骨髓性白血病、頭頸癌或肺部高血壓。
在一個實施例中,BCR-ABL抑制劑或TASIGNA係以下列劑量來投與:約300mg(例如每天兩次,例如用於新診斷之Ph+ CML-CP),或約400mg(例如每天兩次,例如用於抗性或不耐受性Ph+ CML-CP及CML-AP)。BCR-ABL抑制劑或化合物A2係以約300-400mg之劑量來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與HSP90抑制劑、例如5-(2,4-二羥基-5-異丙基苯基)-N-乙基-4-(4-(嗎啉基甲基)苯基)異噁唑-3-甲醯胺(化合物A3)或PCT公開案第WO 2010/060937號或第WO 2004/072051號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例
如本文所述之病症。在一個實施例中,HSP90抑制劑係5-(2,4-二羥基-5-異丙基苯基)-N-乙基-4-(4-(嗎啉基甲基)苯基)異噁唑-3-甲醯胺(化合物A3)或PCT公開案第WO 2010/060937號或第WO 2004/072051號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與5-(2,4-二羥基-5-異丙基苯基)-N-乙基-4-(4-(嗎啉基甲基)苯基)異噁唑-3-甲醯胺(化合物A3)或如PCT公開案第WO 2010/060937號或第WO 2004/072051號中所述之化合物組合使用來治療病症,例如癌症、多發性骨髓瘤、非小細胞肺癌、淋巴瘤、胃癌、乳癌、消化/胃腸癌、胰臟癌、結腸直腸癌、實體腫瘤或造血病症。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與PI3K及/或mTOR之抑制劑達托西布(Dactolisib,化合物A4)或8-(6-甲氧基-吡啶-3-基)-3-甲基-1-(4-六氫吡嗪-1-基-3-三氟甲基-苯基)-1,3-二氫-咪唑并[4,5-c]喹啉-2-酮(化合物A41)或PCT公開案第WO 2006/122806號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,PI3K及/或mTOR抑制劑係達托西布(化合物A4)8-(6-甲氧基-吡啶-3-基)-3-甲基-1-(4-六氫吡嗪-1-基-3-三氟甲基-苯基)-1,3-二氫-咪唑并[4,5-c]喹啉-2-酮(化合物A41)或PCT公開案第WO 2006/122806號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與達托西布(化合物A4)8-(6-甲氧基-吡啶-3-基)-3-甲基-1-(4-六氫吡嗪-1-基-3-三氟甲基-苯基)-1,3-二氫-咪唑并[4,5-c]喹啉-2-酮(化合物A41)或PCT公開案第WO 2006/122806號中所述之化合物組合使用來治療病症,例如癌症、前列腺癌、白血病(例如,淋巴球性白血病)、乳癌、腦癌、膀胱癌、胰臟癌、腎癌、實體腫瘤或肝癌。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與FGFR
抑制劑3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基苯基)-1-(6-((4-(4-乙基六氫吡嗪-1-基)苯基)胺基)嘧啶-4-基)-1-甲基脲(化合物A5)或美國專利8,552,002中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,FGFR抑制劑係3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基苯基)-1-(6-((4-(4-乙基六氫吡嗪-1-基)苯基)胺基)嘧啶-4-基)-1-甲基脲(化合物A5)或美國專利8,552,002中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與化合物A5或如US 8,552,002中所述之化合物組合使用來治療病症,例如消化/胃腸癌、血液癌症或實體腫瘤。
在一個實施例中,FGFR抑制劑或3-(2,6-二氯-3,5-二甲氧基苯基)-1-(6-((4-(4-乙基六氫吡嗪-1-基)苯基)胺基)嘧啶-4-基)-1-甲基脲(化合物A5)係以約100-125mg(例如,每天)、例如約100mg或約125mg之劑量來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與PI3K抑制劑布帕西布(Buparlisib,化合物A6)或PCT公開案第WO 2007/084786號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,PI3K抑制劑係布帕西布(化合物A6)或PCT公開案第WO 2007/084786號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與布帕西布(化合物A6)或PCT公開案第WO 2007/084786號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如前列腺癌、非小細胞肺癌、內分泌癌、白血病、卵巢癌、黑色素瘤、膀胱癌、乳癌、女性生殖系統癌症、消化/胃腸癌、結腸直腸癌、多形性神經膠母細胞瘤、實體腫瘤、非霍奇金氏淋巴瘤、造血病症或頭頸癌。
在一個實施例中,PI3K抑制劑或布帕西布(化合物A6)係以約100mg(例如,每天)之劑量來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與FGFR抑制劑8-(2,6-二氟-3,5-二甲氧基苯基)-N-(4-((二甲基胺基)甲基)-1H-咪唑-2-基)喹喏啉-5-甲醯胺(化合物A7)或PCT公開案第WO 2009/141386號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,FGFR抑制劑係8-(2,6-二氟-3,5-二甲氧基苯基)-N-(4-((二甲基胺基)甲基)-1H-咪唑-2-基)喹喏啉-5-甲醯胺(化合物A7)或PCT公開案第WO 2009/141386號中所揭示之化合物。在一個實施例中,FGFR抑制劑係8-(2,6-二氟-3,5-二甲氧基苯基)-N-(4-((二甲基胺基)甲基)-1H-咪唑-2-基)喹喏啉-5-甲醯胺(化合物A7)。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與8-(2,6-二氟-3,5-二甲氧基苯基)-N-(4-((二甲基胺基)甲基)-1H-咪唑-2-基)喹喏啉-5-甲醯胺(化合物A7)或PCT公開案第WO 2009/141386號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如特徵在於血管生成之癌症。
在一個實施例中,FGFR抑制劑或8-(2,6-二氟-3,5-二甲氧基苯基)-N-(4-((二甲基胺基)甲基)-1H-咪唑-2-基)喹喏啉-5-甲醯胺(化合物A7)係以例如每人每天約3mg至約5g、更佳約10mg至約1.5g之劑量、視情況分成1至3個可具有例如相同大小之單一劑量來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與PI3K抑制劑(S)-N1-(4-甲基-5-(2-(1,1,1-三氟-2-甲基丙-2-基)吡啶-4-基)噻唑-2-基)吡咯啶-1,2-二甲醯胺(化合物A8)或PCT公開案第WO 2010/029082號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,PI3K抑制劑係(S)-N1-(4-甲基-5-(2-(1,1,1-三氟-2-甲基丙-2-基)吡啶-4-基)噻唑-2-基)吡咯啶-1,2-二甲醯胺(化合物A8)或PCT公開案第WO 2010/029082號中所揭示之化合物。在一個實施例中,
抗LAG-3抗體分子係與(S)-N1-(4-甲基-5-(2-(1,1,1-三氟-2-甲基丙-2-基)吡啶-4-基)噻唑-2-基)吡咯啶-1,2-二甲醯胺(化合物A8)或PCT公開案第WO 2010/029082號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如胃癌、乳癌、胰臟癌、消化/胃腸癌、實體腫瘤及頭頸癌。
在一個實施例中,PI3K抑制劑或(S)-N1-(4-甲基-5-(2-(1,1,1-三氟-2-甲基丙-2-基)吡啶-4-基)噻唑-2-基)吡咯啶-1,2-二甲醯胺(化合物A8)係以約150-300mg、200-300mg、200-400mg或300-400mg(例如,每天)、例如約200mg、300mg或400mg之劑量來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與細胞色素P450之抑制劑(例如,CYP17抑制劑)或PCT公開案第WO 2010/149755號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,細胞色素P450抑制劑(例如,CYP17抑制劑)係PCT公開案第WO 2010/149755號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與PCT公開案第WO 2010/149755號中所揭示之化合物組合使用來治療前列腺癌。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與HDM2抑制劑(S)-1-(4-氯苯基)-7-異丙氧基-6-甲氧基-2-(4-(甲基(((1r,4S)-4-(4-甲基-3-側氧基六氫吡嗪-1-基)環己基)甲基)胺基)苯基)-1,2-二氫異喹啉-3(4H)-酮(化合物A10)或PCT公開案第WO 2011/076786號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,HDM2抑制劑係(S)-1-(4-氯苯基)-7-異丙氧基-6-甲氧基-2-(4-(甲基(((1r,4S)-4-(4-甲基-3-側氧基六氫吡嗪-1-基)環己基)甲基)胺基)苯基)-1,2-二氫異喹啉-3(4H)-酮(化合物A10)或PCT公開案第WO 2011/076786號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分
子係與(S)-1-(4-氯苯基)-7-異丙氧基-6-甲氧基-2-(4-(甲基(((1r,4S)-4-(4-甲基-3-側氧基六氫吡嗪-1-基)環己基)甲基)胺基)苯基)-1,2-二氫異喹啉-3(4H)-酮(化合物A10)或PCT公開案第WO 2011/076786號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如實體腫瘤。
在一個實施例中,HDM2抑制劑或(S)-1-(4-氯苯基)-7-異丙氧基-6-甲氧基-2-(4-(甲基(((1r,4S)-4-(4-甲基-3-側氧基六氫吡嗪-1-基)環己基)甲基)胺基)苯基)-1,2-二氫異喹啉-3(4H)-酮(化合物A10)係以約400mg至700mg之劑量來投與,例如每週投與三次、2週投與且一週不投與。在一些實施例中,劑量為約400mg、500mg、600mg或700mg;約400-500mg、500-600mg或600-700mg,例如每週投與三次。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與鐵螯合劑去鐵斯若(Deferasirox,亦稱為EXJADE;化合物A11)或PCT公開案第WO 1997/049395號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,鐵螯合劑係去鐵斯若或PCT公開案第WO 1997/049395號中所揭示之化合物。在一個實施例中,鐵螯合劑係去鐵斯若(化合物A11)。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與去鐵斯若(化合物A11)或PCT公開案第WO 1997/049395號中所揭示之化合物組合使用來治療鐵過載、血色素沉著症或骨髓發育不良。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與芳香酶抑制劑來曲唑(Letrozole,亦稱為FEMARA;化合物A12)或US 4,978,672中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,芳香酶抑制劑係來曲唑(化合物A12)或美國專利4,978,672中所揭示之化合物。在一個實施例中,LAG-3抗體分子係與來曲唑(化合物A12)或美國專利4,978,672中所揭示之化合物組合使
用來治療病症,例如癌症、平滑肌肉瘤、子宮內膜癌、乳癌、女性生殖系統癌症或激素缺乏。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與PI3K抑制劑、例如pan-PI3K抑制劑(4S,5R)-3-(2'-胺基-2-嗎啉基-4'-(三氟甲基)-[4,5'-聯嘧啶]-6-基)-4-(羥基甲基)-5-甲基噁唑啶-2-酮(化合物A13)或PCT公開案第WO2013/124826號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,PI3K抑制劑係(4S,5R)-3-(2'-胺基-2-嗎啉基-4'-(三氟甲基)-[4,5'-聯嘧啶]-6-基)-4-(羥基甲基)-5-甲基噁唑啶-2-酮(化合物A13)或PCT公開案第WO2013/124826號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與(4S,5R)-3-(2'-胺基-2-嗎啉基-4'-(三氟甲基)-[4,5'-聯嘧啶]-6-基)-4-(羥基甲基)-5-甲基噁唑啶-2-酮(化合物A13)或PCT公開案第WO2013/124826號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症或晚期實體腫瘤。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與p53及/或p53/Mdm2相互作用之抑制劑(S)-5-(5-氯-1-甲基-2-側氧基-1,2-二氫吡啶-3-基)-6-(4-氯苯基)-2-(2,4-二甲氧基嘧啶-5-基)-1-異丙基-5,6-二氫吡咯并[3,4-d]咪唑-4(1H)-酮(化合物A14)或PCT公開案第WO2013/111105號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,p53及/或p53/Mdm2相互作用抑制劑係(S)-5-(5-氯-1-甲基-2-側氧基-1,2-二氫吡啶-3-基)-6-(4-氯苯基)-2-(2,4-二甲氧基嘧啶-5-基)-1-異丙基-5,6-二氫吡咯并[3,4-d]咪唑-4(1H)-酮(化合物A14)或PCT公開案第WO2013/111105號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與(S)-5-(5-氯-1-甲基-2-側氧基
-1,2-二氫吡啶-3-基)-6-(4-氯苯基)-2-(2,4-二甲氧基嘧啶-5-基)-1-異丙基-5,6-二氫吡咯并[3,4-d]咪唑-4(1H)-酮(化合物A14)或PCT公開案第WO2013/111105號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症或軟組織肉瘤。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與CSF-1R酪胺酸激酶抑制劑4-((2-(((1R,2R)-2-羥基環己基)胺基)苯并[d]噻唑-6-基)氧基)-N-甲基吡啶醯胺(化合物A15)或PCT公開案第WO 2005/073224號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,CSF-1R酪胺酸激酶抑制劑係4-((2-(((1R,2R)-2-羥基環己基)胺基)苯并[d]噻唑-6-基)氧基)-N-甲基吡啶醯胺(化合物A15)或PCT公開案第WO 2005/073224號中所揭示之化合物。在一個實施例中,LAG-3抗體分子係與4-((2-(((1R,2R)-2-羥基環己基)胺基)苯并[d]噻唑-6-基)氧基)-N-甲基吡啶醯胺(化合物A15)或PCT公開案第WO 2005/073224號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與細胞凋亡誘導物及/或血管生成抑制劑、例如甲磺酸伊馬替尼(亦稱為GLEEVEC;化合物A16)或PCT公開案第WO1999/003854號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如所述病症。在一個實施例中,細胞凋亡誘導物及/或血管生成抑制劑係甲磺酸伊馬替尼(化合物A16)或PCT公開案第WO1999/003854號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與甲磺酸伊馬替尼(化合物A16)或PCT公開案第WO1999/003854號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症、多發性骨髓瘤、前列腺癌、非小細胞肺癌、淋巴瘤、胃癌、黑色
素瘤、乳癌、胰臟癌、消化/胃腸癌、結腸直腸癌、多形性神經膠母細胞瘤、肝癌、頭頸癌、氣喘、多發性硬化、過敏、阿茲海默氏失智症、肌肉萎縮性脊髓側索硬化症或類風濕性關節炎。
在某些實施例中,甲磺酸伊馬替尼(化合物A16)係以系列劑量來投與:約100mg至1000mg,例如約200mg至800mg、約300mg至700mg或約400mg至600mg,例如約200mg、300mg、400mg、500mg、600mg或700mg。投藥時間表可自例如每隔一天至每天、每天兩次或三次變化。在一個實施例中,甲磺酸伊馬替尼係以下列口服劑量來投與:每天約100mg至600mg,例如每天約100mg、200mg、260mg、300mg、400mg或600mg。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與JAK抑制劑2-氟-N-甲基-4-(7-(喹啉-6-基甲基)咪唑并[1,2-b][1,2,4]三嗪-2-基)苯甲醯胺(化合物A17)或其二鹽酸鹽或PCT公開案第WO 2007/070514號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,JAK抑制劑係2-氟-N-甲基-4-(7-(喹啉-6-基甲基)咪唑并[1,2-b][1,2,4]三嗪-2-基)苯甲醯胺(化合物A17)或其二鹽酸鹽或PCT公開案第WO 2007/070514號中所揭示之化合物。在一個實施例中,LAG-3抗體分子係與2-氟-N-甲基-4-(7-(喹啉-6-基甲基)咪唑并[1,2-b][1,2,4]三嗪-2-基)苯甲醯胺(化合物A17)或其二鹽酸鹽或PCT公開案第WO 2007/070514號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如結腸直腸癌、類骨髓性白血病、血液癌症、自體免疫疾病、非霍奇金氏淋巴瘤或血小板增多症。
在一個實施例中,JAK抑制劑或2-氟-N-甲基-4-(7-(喹啉-6-基甲基)咪唑并[1,2-b][1,2,4]三嗪-2-基)苯甲醯胺(化合物A17)或其二鹽酸鹽係以約400-600mg(例如,每天)、例如約400mg、500mg或600mg或
約400-500mg或500-600mg之劑量來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與JAK抑制劑磷酸魯索替尼(Ruxolitinib Phosphate,亦稱為JAKAFI;化合物A18)或PCT公開案第WO 2007/070514號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,JAK抑制劑係磷酸魯索替尼(化合物A18)或PCT公開案第WO 2007/070514號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與磷酸魯索替尼(化合物A18)或PCT公開案第WO 2007/070514號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如前列腺癌、淋巴球性白血病、多發性骨髓瘤、淋巴瘤、肺癌、白血病、惡病質、乳癌、胰臟癌、類風濕性關節炎、牛皮癬、結腸直腸癌、類骨髓性白血病、血液癌症、自體免疫疾病、非霍奇金氏淋巴瘤或血小板增多症。
在一個實施例中,JAK抑制劑或磷酸魯索替尼(化合物A18)係以約15-25mg之劑量、例如每天兩次來投與。在一些實施例中,劑量為約15mg、20mg或25mg或約15-20mg或20-25mg。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與去乙醯酶(DAC)抑制劑帕比司他(Panobinostat,化合物A19)或PCT公開案第WO 2014/072493號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,DAC抑制劑係帕比司他(化合物A19)或PCT公開案第WO 2014/072493號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與帕比司他(化合物A19)、PCT公開案第WO 2014/072493號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如小細胞肺癌、呼吸道/胸腔癌、前列腺癌、多發性骨髓瘤、骨髓發育不良症候群、骨癌、非小細胞肺癌、內分泌癌、淋巴瘤、神經癌、白血
病、HIV/AIDS、免疫病症、移植排斥、胃癌、黑色素瘤、乳癌、胰臟癌、結腸直腸癌、多形性神經膠母細胞瘤、類骨髓性白血病、血液癌症、腎癌、非霍奇金氏淋巴瘤、頭頸癌、造血病症或肝癌。
在一個實施例中,DAC抑制劑或帕比司他(化合物A19)係以約20mg(例如,每天)之劑量來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與組合使用細胞色素P450(例如,11B2)、醛固酮或血管生成中之一或多者之抑制劑歐司朗特(Osilodrostat,化合物A20)或PCT公開案第WO2007/024945號中所揭示之化合物來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,細胞色素P450(例如,11B2)、醛固酮或血管生成中之一或多者之抑制劑係歐司朗特(化合物A20)或PCT公開案第WO2007/024945號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與歐司朗特(化合物A20)或PCT公開案第WO2007/024945號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如庫興氏症候群(Cushing’s syndrome)、高血壓或心臟衰竭療法。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與IAP抑制劑(S)-N-((S)-1-環己基-2-((S)-2-(4-(4-氟苯甲醯基)噻唑-2-基)吡咯啶-1-基)-2-側氧基乙基)-2-(甲基胺基)丙醯胺(化合物A21)或US 8,552,003中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,IAP抑制劑係(S)-N-((S)-1-環己基-2-((S)-2-(4-(4-氟苯甲醯基)噻唑-2-基)吡咯啶-1-基)-2-側氧基乙基)-2-(甲基胺基)丙醯胺(化合物A21)或美國專利8,552,003中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與(S)-N-((S)-1-環己基-2-((S)-2-(4-(4-氟苯甲醯基)噻唑-2-基)吡咯啶-1-基)-2-側氧基乙基)-2-(甲基胺基)丙醯胺(化合物
A21)或美國專利8,552,003中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如多發性骨髓瘤、乳癌、卵巢癌、胰臟癌或造血病症。
在一個實施例中,IAP抑制劑或(S)-N-((S)-1-環己基-2-((S)-2-(4-(4-氟苯甲醯基)噻唑-2-基)吡咯啶-1-基)-2-側氧基乙基)-2-(甲基胺基)丙醯胺(化合物A21)或US 8,552,003中所揭示之化合物係以約1800mg之劑量、例如每週一次來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與平滑(SMO)抑制劑磷酸索尼得吉(Sonidegib phosphate,化合物A22)(R)-2-(5-(4-(6-苄基-4,5-二甲基嗒嗪-3-基)-2-甲基六氫吡嗪-1-基)吡嗪-2-基)丙-2-醇(化合物A25)或PCT公開案第WO 2007/131201號或第WO 2010/007120號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,SMO抑制劑係磷酸索尼得吉(化合物A22)(R)-2-(5-(4-(6-苄基-4,5-二甲基嗒嗪-3-基)-2-甲基六氫吡嗪-1-基)吡嗪-2-基)丙-2-醇(化合物A25)或PCT公開案第WO 2007/131201號或第WO 2010/007120號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與磷酸索尼得吉(化合物A22)(R)-2-(5-(4-(6-苄基-4,5-二甲基嗒嗪-3-基)-2-甲基六氫吡嗪-1-基)吡嗪-2-基)丙-2-醇(化合物A25)或PCT公開案第WO 2007/131201號或第WO 2010/007120號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症、髓母細胞瘤、小細胞肺癌、前列腺癌、基底細胞癌、胰臟癌或發炎。
在某些實施例中,磷酸索尼得吉(化合物A22)係以下列劑量來投與:約20mg至500mg,例如約40mg至400mg、約50mg至300mg或約100mg至200mg,例如約50mg、100mg、150mg、200mg、250mg或300mg。投藥時間表可自例如每隔一天至每天、每天兩次或三次變化。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與Alk抑制劑塞瑞替尼(ceritinib,亦稱為ZYKADIA;化合物A23)或PCT公開案第WO 2007/131201號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,Alk抑制劑係塞瑞替尼(化合物A23)或PCT公開案第WO 2007/131201號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與塞瑞替尼(化合物A23)或PCT公開案第WO 2007/131201號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如非小細胞肺癌或實體腫瘤。
在一個實施例中,Alk抑制劑或塞瑞替尼(化合物A23)係以約750mg之劑量、例如每天一次來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與JAK及/或CDK4/6抑制劑7-環戊基-N,N-二甲基-2-((5-(六氫吡嗪-1-基)吡啶-2-基)胺基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-甲醯胺(化合物A24)或美國專利8,415,355或美國專利8,685,980中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,JAK及/或CDK4/6抑制劑係7-環戊基-N,N-二甲基-2-((5-(六氫吡嗪-1-基)吡啶-2-基)胺基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-甲醯胺(化合物A24)或美國專利8,415,355或美國專利8,685,980中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與7-環戊基-N,N-二甲基-2-((5-(六氫吡嗪-1-基)吡啶-2-基)胺基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-甲醯胺(化合物A24)或US 8,415,355或US 8,685,980中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如淋巴瘤、神經癌、黑色素瘤、乳癌或實體腫瘤。
在一個實施例中,JAK及/或CDK4/6抑制劑或7-環戊基-N,N-二甲基-2-((5-(六氫吡嗪-1-基)吡啶-2-基)胺基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-甲
醯胺(化合物A24)係以約200-600mg之劑量、例如每天來投與。在一個實施例中,化合物係以約200mg、300mg、400mg、500mg或600mg、或約200-300mg、300-400mg、400-500mg或500-600mg之劑量來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與泌乳素受體(PRLR)抑制劑如美國專利7,867,493中所揭示之人類單株抗體分子(化合物A26)組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,PRLR抑制劑係US 7,867,493中所揭示之人類單株抗體(化合物A26)。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與美國專利7,867,493中所述之人類單株抗體分子(化合物A26)組合使用來治療病症,例如癌症、前列腺癌或乳癌。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與PIM激酶抑制劑N-(4-((1R,3S,5S)-3-胺基-5-甲基環己基)吡啶-3-基)-6-(2,6-二氟苯基)-5-氟吡啶醯胺(化合物A27)或PCT公開案第WO 2010/026124號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,PIM激酶抑制劑係N-(4-((1R,3S,5S)-3-胺基-5-甲基環己基)吡啶-3-基)-6-(2,6-二氟苯基)-5-氟吡啶醯胺(化合物A27)或PCT公開案第WO 2010/026124號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與N-(4-((1R,3S,5S)-3-胺基-5-甲基環己基)吡啶-3-基)-6-(2,6-二氟苯基)-5-氟吡啶醯胺(化合物A27)或PCT公開案第WO 2010/026124號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如多發性骨髓瘤、骨髓發育不良症候群、類骨髓性白血病或非霍奇金氏淋巴瘤。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗
LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與Wnt信號傳導抑制劑2-(2',3-二甲基-[2,4'-聯吡啶]-5-基)-N-(5-(吡嗪-2-基)吡啶-2-基)乙醯胺(化合物A28)或PCT公開案第WO 2010/101849號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,Wnt信號傳導抑制劑係2-(2',3-二甲基-[2,4'-聯吡啶]-5-基)-N-(5-(吡嗪-2-基)吡啶-2-基)乙醯胺(化合物A28)或PCT公開案第WO 2010/101849號中所揭示之化合物。在一個實施例中,Wnt信號傳導抑制劑係2-(2',3-二甲基-[2,4'-聯吡啶]-5-基)-N-(5-(吡嗪-2-基)吡啶-2-基)乙醯胺(化合物A28)。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與2-(2',3-二甲基-[2,4'-聯吡啶]-5-基)-N-(5-(吡嗪-2-基)吡啶-2-基)乙醯胺(化合物A28)或PCT公開案第WO 2010/101849號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如實體腫瘤(例如,頭頸癌、鱗狀細胞癌、乳癌、胰臟癌或結腸癌)。
在某些實施例中,2-(2',3-二甲基-[2,4'-聯吡啶]-5-基)-N-(5-(吡嗪-2-基)吡啶-2-基)乙醯胺(化合物A28)係以下列劑量來投與:約1mg至50mg,例如約2mg至45mg、約3mg至40mg、約5mg至35mg、5mg至10mg或約10mg至30mg,例如約2mg、5mg、10mg、20mg、30mg或40mg。投藥時間表可自例如每隔一天至每天、每天兩次或三次變化。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與BRAF抑制劑恩科菲尼(Encorafenib,化合物A29)或PCT公開案第WO 2011/025927號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,BRAF抑制劑係恩科菲尼(化合物A29)或PCT公開案第WO 2011/025927號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與恩科菲尼(化合物A29)或PCT公開案第WO
2011/025927號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如非小細胞肺癌、黑色素瘤或結腸直腸癌。
在一個實施例中,BRAF抑制劑或恩科菲尼(化合物A29)係以約200-300mg、200-400mg或300-400mg之劑量、例如每天來投與。在一個實施例中,化合物係以約200mg、約300mg或約400mg之劑量來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與CDK4/6抑制劑7-環戊基-N,N-二甲基-2-((5-((1R,6S)-9-甲基-4-側氧基-3,9-二氮雜二環[4.2.1]壬-3-基)吡啶-2-基)胺基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-甲醯胺(化合物A30)或PCT公開案第WO 2011/101409號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,CDK4/6抑制劑係7-環戊基-N,N-二甲基-2-((5-((1R,6S)-9-甲基-4-側氧基-3,9-二氮雜二環[4.2.1]壬-3-基)吡啶-2-基)胺基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-甲醯胺(化合物A30)或PCT公開案第WO 2011/101409號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與組合使用7-環戊基-N,N-二甲基-2-((5-((1R,6S)-9-甲基-4-側氧基-3,9-二氮雜二環[4.2.1]壬-3-基)吡啶-2-基)胺基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-6-甲醯胺(化合物A30)或PCT公開案第WO 2011/101409號中所揭示之化合物來治療病症,例如癌症、外套細胞淋巴瘤、脂肪肉瘤、非小細胞肺癌、黑色素瘤、鱗狀細胞食道癌或乳癌。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與HER3抑制劑化合物A31或PCT公開案第WO 2012/022814號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,HER3抑制劑係化合物A31或PCT公開案WO 2012/022814中所揭示之化
合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與化合物A31或PCT公開案WO 2012/022814中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如胃癌、食道癌、頭頸癌、鱗狀細胞癌、胃癌、乳癌(例如,轉移性乳癌)或消化/胃腸癌。
在一些實施例中,化合物A31係人類單株抗體分子。
在一個實施例中,HER3抑制劑或化合物A31係以約3mg/kg、10mg/kg、20mg/kg或40mg/kg之劑量、例如每週一次(QW)來投與。在一個實施例中,化合物係以約3-10mg/kg、10-20mg/kg或20-40mg/kg之劑量來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與FGFR2及/或FGFR4抑制劑化合物A32或公開案PCT公開案第WO 2014/160160號中所揭示之化合物(例如,針對FGFR2及/或FGFR4之抗體分子藥物偶聯物,例如mAb 12425)組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,FGFR2及/或FGFR4抑制劑係化合物A32或公開案PCT公開案第WO 2014/160160號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與化合物A32或如表7中所述之化合物組合使用來治療病症,例如癌症、胃癌、乳癌、橫紋肌肉瘤、肝癌、腎上腺癌、肺癌、食道癌、結腸癌或子宮內膜癌。
在一些實施例中,化合物A32係針對FGFR2及/或FGFR4之抗體分子藥物偶聯物,例如mAb 12425。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與M-CSF抑制劑化合物A33或PCT公開案第WO 2004/045532號中所揭示之化合物(例如,針對M-CSF之抗體分子或Fab片段)組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,M-CSF抑制劑係化合物A33
或PCT公開案第WO 2004/045532號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與化合物A33或如PCT公開案第WO 2004/045532號中所述之化合物組合使用來治療病症,例如癌症、前列腺癌、乳癌或色素絨毛結節性滑膜炎(PVNS)。
在實施例中,化合物A33係針對M-CSF之單株抗體分子或其片段(例如,Fab片段)。在實施例中,M-CSF抑制劑或化合物A33係以約10mg/kg之平均劑量來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與MEK抑制劑比尼替尼(Binimetinib,化合物A34)或PCT公開案第WO 2003/077914號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,MEK抑制劑係比尼替尼(化合物A34)或PCT公開案第WO 2003/077914號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與比尼替尼(化合物A34)或PCT公開案第WO 2003/077914號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如非小細胞肺癌、多系統遺傳病症、黑色素瘤、卵巢癌、消化/胃腸癌、類風濕性關節炎或結腸直腸癌。
在一個實施例中,MEK抑制劑或比尼替尼(化合物A34)係以約45mg之劑量、例如每天兩次來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與c-KIT、組胺釋放、Flt3(例如,FLK2/STK1)或PKC中之一或多者之抑制劑米哚妥林(化合物A35)或PCT公開案第WO 2003/037347號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,抑制劑係米哚妥林(化合物A35)或PCT公開案第WO 2003/037347號中所揭示之化合物。在一個實施例中,c-KIT、組胺釋
放、Flt3(例如,FLK2/STK1)或PKC中之一或多者之抑制劑係米哚妥林。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與米哚妥林(化合物A35)或PCT公開案第WO 2003/037347號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症、結腸直腸癌、類骨髓性白血病、骨髓發育不良症候群、年齡相關之黃斑退化、糖尿病併發症或皮膚病。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與TOR抑制劑(例如,mTOR抑制劑)、依維莫司(亦稱為AFINITOR;化合物A36)或PCT公開案第WO 2014/085318號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,TOR抑制劑係依維莫司(化合物A36)或PCT公開案第WO 2014/085318號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與依維莫司(化合物A36)組合使用來治療病症,例如間質性肺疾病、小細胞肺癌、呼吸道/胸腔癌、前列腺癌、多發性骨髓瘤、肉瘤、年齡相關之黃斑退化、骨癌、結節性硬化症、非小細胞肺癌、內分泌癌、淋巴瘤、神經病症、星細胞瘤、子宮頸癌、神經癌、白血病、免疫病症、移植排斥、胃癌、黑色素瘤、癲癇、乳癌或膀胱癌。
在一個實施例中,TOR抑制劑或依維莫司(化合物A36)係以約2.5-20mg/天之劑量來投與。在一個實施例中,化合物係以約2.5mg/天、5mg/天、10mg/天或20mg/天、例如約2.5-5mg/天、5-10mg/天或10-20mg/天之劑量來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與VEGFR-2、PDGFRβ、KIT或Raf激酶C中之一或多者之抑制劑1-甲基-5-((2-(5-(三氟甲基)-1H-咪唑-2-基)吡啶-4-基)氧基)-N-(4-(三氟甲基)苯基)-1H-苯并[d]咪唑-2-胺(化合物A37)或PCT公開案第WO 2007/030377
號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,VEGFR-2、PDGFRβ、KIT或Raf激酶C中之一或多者之抑制劑係1-甲基-5-((2-(5-(三氟甲基)-1H-咪唑-2-基)吡啶-4-基)氧基)-N-(4-(三氟甲基)苯基)-1H-苯并[d]咪唑-2-胺(化合物A37)或PCT公開案第WO 2007/030377號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與1-甲基-5-((2-(5-(三氟甲基)-1H-咪唑-2-基)吡啶-4-基)氧基)-N-(4-(三氟甲基)苯基)-1H-苯并[d]咪唑-2-胺(化合物A37)或PCT公開案第WO 2007/030377號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症、黑色素瘤或實體腫瘤。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與生長抑制素激動劑及/或生長激素釋放抑制劑二天冬胺酸帕瑞肽(Pasireotide diaspartate,亦稱為SIGNIFOR;化合物A38)或PCT公開案第WO2002/010192號或美國專利第7,473,761號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,生長抑制素激動劑及/或生長激素釋放抑制劑係二天冬胺酸帕瑞肽(化合物A38)或PCT公開案第WO2002/010192號或美國專利第7,473,761號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與二天冬胺酸帕瑞肽(化合物A38)或PCT公開案第WO2002/010192號或美國專利第7,473,761號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如前列腺癌、內分泌癌、尿道癌、皮膚癌(例如,黑色素瘤)、胰臟癌、肝癌、庫興氏症候群、胃腸道病症、肢端肥大症、肝及膽道病症或肝硬化。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與信號轉導調節劑及/或血管生成抑制劑多維替尼(化合物A39)或PCT公開案第WO 2009/115562號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本
文所述之病症。在一個實施例中,信號轉導調節劑及/或血管生成抑制劑係多維替尼(化合物A39)或PCT公開案第WO 2009/115562號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與多維替尼(化合物A39)或PCT公開案第WO 2009/115562號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症、呼吸道/胸腔癌、多發性骨髓瘤、前列腺癌、非小細胞肺癌、內分泌癌或神經遺傳病症。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與EGFR抑制劑(R,E)-N-(7-氯-1-(1-(4-(二甲基胺基)丁-2-烯醯基)氮雜環庚烷-3-基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)-2-甲基異菸鹼醯胺(化合物A40)或PCT公開案第WO 2013/184757號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,EGFR抑制劑係(R,E)-N-(7-氯-1-(1-(4-(二甲基胺基)丁-2-烯醯基)氮雜環庚烷-3-基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)-2-甲基異菸鹼醯胺(化合物A40)或PCT公開案第WO 2013/184757號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與(R,E)-N-(7-氯-1-(1-(4-(二甲基胺基)丁-2-烯醯基)氮雜環庚烷-3-基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)-2-甲基異菸鹼醯胺(化合物A40)或PCT公開案第WO 2013/184757號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症,例如實體腫瘤。
在一個實施例中,EGFR抑制劑或(R,E)-N-(7-氯-1-(1-(4-(二甲基胺基)丁-2-烯醯基)氮雜環庚烷-3-基)-1H-苯并[d]咪唑-2-基)-2-甲基異菸鹼醯胺(化合物A40)係以150-250mg之劑量、例如每天來投與。在一個實施例中,化合物係以約150mg、200mg或250mg、或約150-200mg或200-250mg之劑量來投與。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與ALK抑
制劑N6-(2-異丙氧基-5-甲基-4-(1-甲基六氫吡啶-4-基)苯基)-N4-(2-(異丙基磺醯基)苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4,6-二胺(化合物A42)或PCT公開案第WO 2008/073687號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,ALK抑制劑係N6-(2-異丙氧基-5-甲基-4-(1-甲基六氫吡啶-4-基)苯基)-N4-(2-(異丙基磺醯基)苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4,6-二胺(化合物A42)或PCT公開案第WO 2008/073687號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與N6-(2-異丙氧基-5-甲基-4-(1-甲基六氫吡啶-4-基)苯基)-N4-(2-(異丙基磺醯基)苯基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4,6-二胺(化合物A42)或PCT公開案第WO 2008/073687號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症、退行性大細胞淋巴瘤(ALCL)、非小細胞肺癌(NSCLC)或神經胚細胞瘤。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與IGF-1R抑制劑3-(4-(4-((5-氯-4-((5-甲基-1H-吡唑-3-基)胺基)嘧啶-2-基)胺基)-5-氟-2-甲基苯基)六氫吡啶-1-基)硫雜環丁烷1,1-二氧化物(化合物A43)、5-氯-N2-(2-氟-5-甲基-4-(1-(四氫-2H-吡喃-4-基)六氫吡啶-4-基)苯基)-N4-(5-甲基-1H-吡唑-3-基)嘧啶-2,4-二胺(化合物A44)或5-氯-N2-(4-(1-乙基六氫吡啶-4-基)-2-氟-5-甲基苯基)-N4-(5-甲基-1H-吡唑-3-基)嘧啶-2,4-二胺(化合物A45)或PCT公開案第WO 2010/002655號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如所述病症。在一個實施例中,IGF-1R抑制劑係3-(4-(4-((5-氯-4-((5-甲基-1H-吡唑-3-基)胺基)嘧啶-2-基)胺基)-5-氟-2-甲基苯基)六氫吡啶-1-基)硫雜環丁烷1,1-二氧化物(化合物A43)、5-氯-N2-(2-氟-5-甲基-4-(1-(四氫-2H-吡喃-4-基)六氫吡啶-4-基)苯基)-N4-(5-甲基-1H-吡唑-3-基)嘧啶-2,4-二胺(化合物A44)、5-氯-N2-(4-(1-乙基六氫吡啶-4-基)-2-氟-5-甲基苯基)-N4-(5-甲
基-1H-吡唑-3-基)嘧啶-2,4-二胺(化合物A45)或PCT公開案第WO 2010/002655號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與3-(4-(4-((5-氯-4-((5-甲基-1H-吡唑-3-基)胺基)嘧啶-2-基)胺基)-5-氟-2-甲基苯基)六氫吡啶-1-基)硫雜環丁烷1,1-二氧化物(化合物A43)、5-氯-N2-(2-氟-5-甲基-4-(1-(四氫-2H-吡喃-4-基)六氫吡啶-4-基)苯基)-N4-(5-甲基-1H-吡唑-3-基)嘧啶-2,4-二胺(化合物A44)、5-氯-N2-(4-(1-乙基六氫吡啶-4-基)-2-氟-5-甲基苯基)-N4-(5-甲基-1H-吡唑-3-基)嘧啶-2,4-二胺(化合物A45)或PCT公開案第WO 2010/002655號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症或肉瘤。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與P-糖蛋白1抑制劑伐司撲達(Valspodar,亦稱為AMDRAY;化合物A46)或EP 296122中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,P-糖蛋白1抑制劑係伐司撲達(化合物A46)或EP 296122中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與伐司撲達(化合物A46)或EP 296122中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症或抗藥性腫瘤。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與VEGFR抑制劑琥珀酸瓦他拉尼(化合物A47)或EP 296122中所揭示之化合物中之一或多者組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,VEGFR抑制劑係琥珀酸瓦他拉尼(化合物A47)或EP 296122中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與琥珀酸瓦他拉尼(化合物A47)或EP 296122中所揭示之化合物組合使用來治療癌症。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗
LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與IDH抑制劑或WO2014/141104中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,IDH抑制劑係PCT公開案第WO2014/141104號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與WO2014/141104中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與BCL-ABL抑制劑或PCT公開案第WO2013/171639號、第WO2013/171640號、第WO2013/171641號或第WO2013/171642號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,BCL-ABL抑制劑係PCT公開案第WO2013/171639號、第WO2013/171640號、第WO2013/171641號或第WO2013/171642號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與PCT公開案第WO2013/171639號、第WO2013/171640號、第WO2013/171641號或第WO2013/171642號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與c-RAF抑制劑或PCT公開案第WO2014/151616號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,c-RAF抑制劑係化合物A50或PCT公開案第WO2014/151616號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與PCT公開案第WO2014/151616號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗
LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與ERK1/2 ATP競爭性抑制劑或國際專利申請案第PCT/US2014/062913號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,ERK1/2 ATP競爭性抑制劑係國際專利申請案第PCT/US2014/062913號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與化合物A51或國際專利申請案第PCT/US2014/062913號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症。
在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子、例如如本文所述之抗LAG-3抗體分子單獨或與一或多種其他免疫調節劑之組合係與酪胺酸激酶抑制劑(化合物A52)或PCT公開案第WO2005/073224號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如本文所述之病症。在一個實施例中,酪胺酸激酶抑制劑係4-((2-(((1R,2R)-2-羥基環己基)胺基)苯并[d]噻唑-6-基)氧基)-N-甲基吡啶醯胺(化合物A52)或PCT公開案第WO2005/073224號中所揭示之化合物。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係與4-((2-(((1R,2R)-2-羥基環己基)胺基)苯并[d]噻唑-6-基)氧基)-N-甲基吡啶醯胺(化合物A52)或PCT公開案第WO2005/073224號中所揭示之化合物組合使用來治療病症,例如癌症。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子係與一或多種選自以下之藥劑組合投與:化合物A8、化合物A17、化合物A23、化合物A24、化合物A27、化合物A29及化合物A33。
在一些實施例中,抗LAG-3抗體分子係與在免疫細胞分析中、例如在huMLR分析、T細胞增殖分析及B細胞增殖分析中之一或多者中具有已知活性之抗癌劑組合投與。實例性分析闡述於下文中。基於該分析,可計算每一測試藥劑之IC50。在實施例中,抗癌劑之IC50為例如0-1μM、1-4μM或大於4μM,例如4-10μM或4-20μM。在實施例中,第二治療劑選自以下中之一或多者:化合物A9、化合物A16、化
合物A17、化合物A21、化合物A22、化合物A25、化合物A28、化合物A48及化合物49。
在一些實施例中,化合物A28(或與化合物A28相關之化合物)係以約5-10或10-30mg之劑量來投與。在一些實施例中,化合物A22(或與化合物A22相關之化合物)係以約200mg之劑量來投與。在一些實施例中,化合物A17(或與化合物A17相關之化合物)係以約400-600mg之劑量來投與。在一些實施例中,化合物A16(或與化合物A16相關之化合物)係以約400-600mg PO qDay之劑量來投與。在一些實施例中,化合物A29(或與化合物A29相關之化合物)係以約200-400或300-400mg之劑量來投與。在一些實施例中,化合物A24(或與化合物A24相關之化合物)係以約200-600mg之劑量來投與。在一些實施例中,化合物A23(塞瑞替尼)(或與塞瑞替尼相關之化合物)係以約750mg之劑量每天一次來投與。在一些實施例中,化合物A8(或與化合物A8相關之化合物)係以約200-400或300-400mg之劑量來投與。在一些實施例中,化合物A5(或與化合物A5相關之化合物)係以約100-125mg之劑量來投與。在一些實施例中,化合物A6(或與化合物A6相關之化合物)係以約100mg之劑量來投與。在一些實施例中,化合物A1(或與化合物A1相關之化合物)係以約200-300或200-600mg之劑量來投與。在一些實施例中,化合物A40(或與化合物A40相關之化合物)係以約150-250mg之劑量來投與。在一些實施例中,化合物A10(或與化合物A10相關之化合物)係以約400至700mg之劑量來投與,例如每週投與三次、2週投與且一週不投與。在一些實施例中,BCR-ABL抑制劑係以約20mg bid-80mg bid之劑量來投與。
實例性huMLR分析及B或T細胞增殖分析提供於下文中。
混合淋巴球反應(MLR)係量測一個體(反應者)之淋巴球對另一個
體(刺激物)之淋巴球的增殖反應之功能分析。為實施同種異體MLR,自未知HLA類型之血沉棕黃層(來自Bern及Aarau,Switzerland之Kantonspital Blutspendezentrum)分離三個供體之末梢血單核細胞(PBMC)。於0.2mL含有RPMI 1640 GlutaMAXTM與10%胎牛血清(FCS)、100U青黴素/100μg鏈黴素(streptomycin)、50μM 2-巰基乙醇之培養基中以2.105製備細胞。藉由以1:1比率混合兩個不同供體之PBMC來設定個別2因子反應,且在37℃、5% CO2下、在測試化合物之8點濃度範圍存在或不存在下,將共培養物以一式三份於平底96孔組織培養板中培育6天。在培養之最後16h使用3H-TdR(1μCi/0.2mL)對細胞實施脈衝處理,且使用所納入之放射性作為細胞增殖之量度。計算每一化合物之抑制50%最大huMLR反應之濃度(IC50)。使用環孢素作為huMLR抑制之陽性對照。
藉由Ficoll-Paque密度梯度自人類血液新鮮分離PBMC,且使其經受陰性B細胞分離。將B細胞以9.104個/孔之濃度重懸浮於平底96孔培養板中之培養基(RPMI 1640、HEPES、10% FCS、50μg/mL慶大黴素(gentamicine)、50μM 2-巰基乙醇、1×ITS(胰島素、運鐵蛋白及亞硒酸鈉)、1×非必需胺基酸)中。在測試化合物之7點濃度範圍存在或不存在下,藉由人類抗IgM抗體分子(30μg/mL)及IL-4(75ng/mL)或藉由CD40配體(3μg/mL)及IL-4(75ng/mL)實施B細胞刺激。在37℃、10% CO2下培養72h後,在培養之最後6h使用3H-TdR(1μCi/孔)對細胞實施脈衝處理。然後收穫B細胞且使用閃爍記數器量測胸苷之納入。在每一一式兩份治療中,計算平均值,且將該等數據繪製於XLfit 4中以確定各別IC50值。
藉由Ficoll-Paque密度梯度自人類血液新鮮分離PBMC,且使其經
受陰性T細胞分離。將T細胞以8.104個/孔之濃度重懸浮於平底96孔培養板中之培養基(RPMI 1640、HEPES、10% FCS、50μg/mL慶大黴素、50μM 2-巰基乙醇、1×ITS(胰島素、運鐵蛋白及亞硒酸鈉)、1×非必需胺基酸)中。在測試化合物之7點濃度範圍存在或不存在下,藉由人類抗CD3抗體分子(10μg/mL)或藉由人類抗CD3抗體分子(5μg/mL)及抗CD28抗體分子(1μg/mL)實施T細胞刺激。在37℃、10% CO2下培養72h後,在培養之最後6h使用3H-TdR(1μCi/孔)對細胞實施脈衝處理。藉由胸苷之納入量測細胞增殖,從而容許確定每一經測試化合物之IC50。
可使用抗LAG-3抗體來調節、例如引起及擴大免疫反應,例如自體免疫反應。舉例而言,抗LAG-3阻斷可與多種自身蛋白結合使用來設計疫苗接種方案,以有效地產生針對該等自身蛋白之免疫反應用於疾病治療。實際上,許多抗腫瘤反應涉及抗自身反應性(van Elsas等人(2001)J.Exp.Med.194:481-489;Overwijk等人(1999)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.96:2982-2987;Rosenberg及White(1996)J.Immunother Emphasis Tumor Immunol 19(1):81-4)。此外,阿茲海默氏病涉及類澱粉沈積物中之Aβ肽在腦中之不適當累積;針對類澱粉之抗體反應能夠清除該等類澱粉沈積物(Schenk等人,(1999)Nature 400:173-177)。
亦可使用其他自身蛋白作為靶,例如治療過敏及氣喘之IgE及治療類風濕性關節炎之TNFc。可藉由使用抗LAG-3抗體來誘導針對多種激素之抗體反應。可使用針對生殖激素之中和抗體反應來避孕。針對為具體腫瘤之生長所必需之激素及其他可溶性因子的中和抗體反應亦可視為候選疫苗接種靶。
可使用與上文所述使用抗LAG-3抗體類似之方法來誘導治療性自
體免疫反應,以治療具有其他自身抗原、例如類澱粉沈積物(包括阿茲海默氏病中之Aβ)、細胞介素(例如TNFa)及IgE之不適當累積的患者。
在其他實施例中,抗LAG-3抗體分子係與以下中之一或多者(例如,在其之前、同時或之後)結合投與個體:骨髓移植、使用化學治療劑(例如氟達拉濱)之T細胞剝除療法、外部光束輻射療法(XRT)、環磷醯胺及/或抗體(例如OKT3或CAMPATH)。在一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係在B細胞剝除療法(例如與CD20反應之藥劑,例如瑞圖宣(Rituxan))後來投與。舉例而言,在一個實施例中,個體可經歷使用高劑量化學療法、然後進行末梢血幹細胞移植之標準治療。在某些實施例中,在移植後,使個體接受抗LAG-3抗體分子。在另一個實施例中,抗LAG-3抗體分子係在手術之前或之後投與。
在一個態樣中,本發明提供用於檢測活體外(例如,在生物樣品中,例如組織生檢,例如來自癌性組織)或活體內(例如,個體中之活體內成像)LAG-3蛋白之存在之診斷方法。該方法包括:(i)使樣品與本文所述之抗體分子接觸,或向個體投與該抗體分子;(視情況)(ii)接觸參考樣品,例如對照樣品(例如對照生物樣品,例如血漿、組織、生檢)或對照個體));及(iii)檢測抗體分子與樣品或個體、或對照樣品或個體之間複合物之形成,其中樣品或個體相對於對照樣品或個體中複合物形成之變化、例如統計學上顯著之變化指示在樣品中存在LAG-3。抗體分子可直接或間接地經可檢測物質標記以幫助檢測結合或未結合的抗體。適宜可檢測物質包括各種酶、輔基、螢光材料、發光材料及放射性材料,如上文所闡述及下文更詳細闡述。
術語「樣品」在其係指用於檢測多肽之樣品時包括(但不限於)細胞、細胞溶解物、細胞之蛋白質或膜提取物、體液或組織樣品。
可藉由量測或視覺分析結合至LAG-3抗原之結合分子或未結合之結合分子來檢測抗體分子與LAG-3之間的複合物形成。可使用習用檢測分析,例如酶聯免疫吸附分析(ELISA)、放射免疫分析(RIA)或組織免疫組織化學。作為標記抗體分子之替代方式,可利用經可檢測物質標記之標準物及未經標記之抗體分子藉由競爭免疫分析來分析樣品中LAG-3之存在。在此分析中,將生物樣品、經標記標準物及抗體分子組合並測定結合至未經標記之結合分子之經標記標準物的量。樣品中LAG-3之量與結合至抗體分子之經標記標準物之量成反比。
本發明之特徵亦在於包含編碼抗LAG-3抗體分子之重鏈及輕鏈可變區以及CDR之核苷酸序列的核酸,如本文所述。舉例而言,本發明之特徵在於分別編碼選自一或多種本文所揭示抗體分子之抗LAG-3抗體分子之重鏈及輕鏈可變區的第一及第二核酸。核酸可包含如本文表中所陳述之核苷酸序列或與其實質上一致之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致之序列,或與本文表中所顯示之序列相差不超過3個、6個、15個、30個或45個核苷酸者)。
在某些實施例中,核酸可包含編碼至少一個、兩個或三個來自重鏈可變區之CDR之核苷酸序列,該重鏈可變區具有如本文表中所陳述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或具有一或多個取代、例如保守取代之序列)。在其他實施例中,核酸可包含編碼至少一個、兩個或三個來自輕鏈可變區之CDR之核苷酸序列,該輕鏈可變區具有如本文表中所陳述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或具有一或多個取代、例如保守取代之序列)。在另一個實施例中,核酸可包含編碼至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個來自重鏈及輕鏈可變區之CDR之核苷酸
序列,該等重鏈及輕鏈可變區具有如本文表中所陳述之胺基酸序列或與其實質上同源之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或具有一或多個取代、例如保守取代之序列)。
在某些實施例中,核酸可包含編碼至少一個、兩個或三個來自重鏈可變區之CDR之核苷酸序列,該重鏈可變區具有如本文表中所陳述之核苷酸序列、與其實質上同源之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或能夠在本文所述之嚴格度條件下雜交之序列)。在另一個實施例中,核酸可包含編碼至少一個、兩個或三個來自輕鏈可變區之CDR之核苷酸序列,該輕鏈可變區具有如本文表中所陳述之核苷酸序列或與其實質上同源之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或能夠在本文所述之嚴格度條件下雜交之序列)。在另一個實施例中,核酸可包含核苷酸序列編碼至少一個、兩個、三個、四個、五個或六個來自重鏈及輕鏈可變區之CDR,該等重鏈及輕鏈可變區具有如本文表中所陳述之核苷酸序列或與其實質上同源之序列(例如,與其至少約85%、90%、95%、99%或更高一致及/或能夠在本文所述之嚴格度條件下雜交之序列)。
在另一個態樣中,本申請案之特徵在於含有本文所述核酸之宿主細胞及載體。核酸存在於同一宿主細胞或單獨宿主細胞中所存在之單一載體或單獨載體中,如下文更詳細闡述。
本文進一步提供載體包含編碼本文所述抗體分子之核苷酸序列。在一個實施例中,載體包含編碼本文所述抗體分子之核苷酸。在一個實施例中,載體包含本文所述之核苷酸序列。載體包括(但不限於)病毒、質體、黏粒、λ噬菌體或酵母人工染色體(YAC)。
可採用多種載體系統。舉例而言,一類載體利用源自諸如以下等動物病毒之DNA元件:牛乳頭瘤病毒、多瘤病毒、腺病毒、痘瘡病
毒、桿狀病毒、反轉錄病毒(勞斯肉瘤病毒、MMTV或MOMLV)或SV40病毒。另一類載體利用源自諸如以下等RNA病毒之RNA元件:塞姆利基森林病毒(Semliki Forest virus)、東方馬腦炎病毒(Eastern Equine Encephalitis virus)及黃病毒。
另外,可藉由引入一或多種容許選擇經轉染宿主細胞之標記物來選擇已將DNA穩定整合至其染色體中之細胞。標記物可提供例如營養缺陷型宿主之原養型、殺生物劑抗性(例如抗生素)或諸如銅等重金屬之抗性或諸如此類。可選標記物基因可直接連接至欲表現之DNA序列,或藉由共轉化引入相同細胞中。亦可需要其他元件用於mRNA之最佳合成。該等元件可包括剪接信號以及轉錄啟動子、增強子及終止信號。
含有構築體之表現載體或DNA序列經製備用於表現後,可立即將表現載體轉染或引入適宜宿主細胞中。可採用多種技術來達成此結果,例如原生質體融合、磷酸鈣沈澱、電穿孔、逆轉錄病毒轉導、病毒轉染、基因槍、基於脂質之轉染或其他習用技術。在原生質體融合之情形下,使細胞生長於培養基中且篩選適宜活性。
基於本發明描述,用於培養所得經轉染細胞及回收所產生抗體分子之方法及條件為熟習此項技術者已知,且可端視所採用之特定表現載體及哺乳動物宿主細胞而變化或最佳化。
本發明亦提供包含編碼如本文所述之抗體分子之核酸的宿主細胞。
在一個實施例中,宿主細胞經遺傳改造以包含編碼抗體分子之核酸。
在一個實施例中,藉由使用表現盒對宿主細胞進行遺傳改造。片語「表現盒」係指核苷酸序列,係能夠影響基因在與該等序列相容
之宿主中之表現。該等盒可包括啟動子、具或不具內含子之開放閱讀框及終止信號。亦可使用為實現表現所需或有幫助之其他因素,例如誘導型啟動子。
本發明亦提供包含本文所述載體之宿主細胞。
該細胞可係(但不限於)真核細胞、細菌細胞、昆蟲細胞或人類細胞。適宜真核細胞包括(但不限於)Vero細胞、HeLa細胞、COS細胞、CHO細胞、HEK293細胞、BHK細胞、MDCKII細胞及Per C6細胞系(例如,來自Crucell之PER C6細胞)。適宜昆蟲細胞包括(但不限於)Sf9細胞。
表5. 參見實例.
表6. 參見實例.
陳述下文實例以幫助理解本發明,但並不意欲且不應理解為以任何方式限制其範疇。
將鼠類抗LAG-3單株抗體BAP050人類化。獲得20個具有獨特可變區序列之人類化BAP050純系之序列及測試樣品。進一步分析該等純系之生物功能(例如,抗原結合及配體阻斷)、結構特徵及在CHO細胞中之瞬時表現。
使用人類種系可變區框架(FW)之組合文庫來實施BAP050之人類化。該技術需要將框架中之鼠類CDR轉移至已藉由隨機組合人類種系FW1、FW2及FW3序列構築之人類可變區(VR)文庫。僅使用一條FW4序列,其為重鏈(HC)之WGQGTTVTVSS(SEQ ID NO:221)(Kabat人類HC亞組I,No.21)及輕鏈(LC)之FGQGTKVEIK(SEQ ID NO:271)(Kabat人類κ亞組I,No.5)。將VR序列之文庫融合至人類恆定區(CR)序列、HC之人類IgG4(S228P)及LC之人類κ CR,且使整個IgG之所得文庫在CHO細胞中表現用於篩選。使用組織培養物上清液實施篩選,以全細胞ELISA格式或在FACS上量測抗原表現細胞上之結合親合力。
自構築及表現可用作篩選人類化純系之比較劑之適宜嵌合mAb(鼠類VR、IgG4(S228P)、人類κ)開始以逐步方式實施人類化方法。人類IgG4(S228P)重鏈及人類κ輕鏈之恆定區胺基酸序列顯示於表6中。
以兩個獨立步驟實施LC及HC之VR之人類化。使人類化LC(huLC)之文庫與嵌合HC(鼠類VR、IgG4(S228P))配對,且藉由ELISA針對結合活性篩選所得「半人類化」mAb。選擇具有適宜結合活性(嵌合mAb之結合)之純系之huLC。以類似方式,使人類化HC
(huHC)之文庫與嵌合LC(鼠類VR、人類κ)配對且藉由ELISA針對結合活性進行篩選。選擇具有適宜結合活性(嵌合mAb之結合)之純系之huHC。
然後對所選huLC及huHC之可變區進行測序以鑒定具有獨特序列之huLC及huHC(一些來自初始選擇方法之純系可共享相同的LC或HC)。然後將獨特的huLC及huHC隨機組合以形成小humAb文庫,其係在CHO細胞中表現且以ELISA及FACS格式在抗原表現細胞上進行篩選。具有等於或優於嵌合比較劑mAb之結合之結合活性的純系係人類化方法之最終產物。
確定鼠類抗LAG-3 mAb之LC及HC可變區序列。自兩種獨立分析獲得之序列一致且顯示於圖1中。
實施種系分析且結果之一部分於圖2中顯示為胺基酸序列比對。對於輕鏈,V-基因與mIGkV10-94*01F(279/288 nt)為96.88%一致,且J-基因與mIGkJ1*01F(36/37 nt)為97.30%一致。對於重鏈,V-基因與mIGHV9-3-1*01F(279/288 nt)為96.88%一致,J-基因與mIGHJ4*01F為86.79%一致,且D-基因係mIGHD1-1*01F。
如圖3中所顯示,人類化方法產生20個具有與嵌合抗體相當之結合親和力之人類化純系。除結合數據外,對於每一純系,提供VR序列以及mAb樣品。已藉由瞬時轉染CHO細胞製備樣品且濃縮組織培養物上清液。已藉由IgG4特異性ELISA測定溶液中之mAb濃度。
如圖4中所顯示,20個獨特純系係6個獨特HC及12個獨特LC之組合。人類化BAP050純系之重鏈及輕鏈可變結構域之胺基酸及核苷酸序列顯示於表1中。人類化BAP050純系之重鏈及輕鏈CDR之胺基酸及核苷酸序列顯示於表1中。
使用18個具有相同FWH3之純系獲得HC FW3區之有限多樣性,該FWH3係來自人類種系IGHV7-4且在人類化純系之位置84處具有暴露的Cys殘基。密切相關之VHFW3序列通常在此位置中具有Ser或Ala殘基。因此,在所選人類化純系中Cys84經Ser替代。
圖4指示樣品之mAb濃度之變化,介於3.2μg/mL至35.8μg/mL範圍內。該等數值代表若干個瞬時表現實驗。
在使用恆定濃度之經FITC標記之鼠類mAb、測試mAb之系列稀釋物及表現LAG-3的CHO細胞之競爭結合分析中量測結合活性及特異性。在4℃下將具有不同濃度比之測試mAb對經標記mAb之mAb混合物培育30min。然後使用FACS機器量化結合的經標記鼠類mAb。實施兩次實驗。結果顯示於表5A-5B中。
在實驗之精確度內,所有人類化純系均顯示與經標記鼠類mAb之結合競爭之相似活性。該活性亦與親代鼠類mAb及嵌合mAb之活性相當。將MAb相對於彼此進行分級。舉例而言,若在兩次實驗中,某一純系之曲線在嵌合mAb曲線之右側,則其可為較弱競爭者,或若某一純系之曲線在嵌合mAb曲線之左側,則其可為較佳競爭者。此一分級系統用於圖6中。
基於結構特徵,將20個人類化mAb分成6組且將其自A至F分級。結果顯示於圖6中。
圖6概述經考慮用於選擇人類化純系之數據。考慮表現數據(第2行)、可變區組成之多樣性(第3行)、結合研究中之相對分級(第4行及第5行)及結構分析(第6行)。可選擇個別純系之某些特徵使用灰色區域
標記出。
將某些純系之VHFW3之位置84處自Cys突變成Ser(參見上述實例1.3)。新形式稱為純系編號1S、2S、5S、9S、11S、12S及13S以及huBAP050(Ser)純系。
使具有VHFW3中之C84S突變之所選純系的新形式經受與實例1.4.1下所闡述類似之競爭結合分析。該實驗包括具有Cys84殘基之原始人類化純系、具有Ser84殘基、嵌合mAb及親代鼠類mAb之新人類化純系。結果顯示於圖7中。
所有經測試變體在阻斷經標記鼠類mAb與表現LAG-3之CHO細胞之結合方面與鼠類親代mAb相當。因而斷定,具有Ser84殘基之新人類化純系之性能與具有Cys84殘基之原始人類化純系並無不同。
LAG-3結合至II類MHC,因此測試所選huBAP050(Ser)純系之阻斷可溶性LAG-3-Ig與表現II類MHC之Daudi細胞(伯基特氏淋巴瘤細胞系)之結合的能力。在使用恆定濃度之LAG-3-huIgG1 Fc融合蛋白(2μg/mL)、欲測試mAb之系列稀釋物及Daudi細胞的競爭結合分析中評估mAb之阻斷能力。在4℃下培育30min。使用並不識別IgG4 mAb(Southern Biotech 2043-09)之山羊抗人類IgG之PE偶聯F(ab’)2片段及流式細胞術檢測結合的配體融合蛋白。結果顯示於圖8中。
在實驗之精確度內,7個huBAP050(Ser)純系、嵌合mAb及鼠類親代mAb展示相當的針對LAG-3-Ig之阻斷活性。
使用EpibaseTM分析人類化mAb之T細胞表位。該算法分析每一可能肽(沿該蛋白質前進一個胺基酸之每一10聚體)與II類HLA之結合。其估計每一肽之結合自由能(△G結合)且計算推定的KD(△G結合=RT
lnKD)。然後將肽標記為S、M或N用於指示強、中等及非結合劑。每一異型之用於此分類之臨限值有所不同。
將數據正規化至風險評分。總體「風險評分」係藉由各別肽之親和力加權之針對所有經測試等位基因之所有潛在表位之總和,但省略種系序列中之所有潛在表位(值越低「越佳」)
業內大致存在三種mAb,其源自一系列如下文所述具有不同組成之mAb。
風險評分為約500:自人類、「人類化」小鼠及噬菌體文庫產生之完整人類mAb(「即使對於完整人類抗體,值低於500實際上仍良好」)。經特異性改造(甚至CDR)以具有較低評分之人類化mAb通常在500-700風險類別中。
風險評分為約900:典型CDR移植抗體,其具有具或不具FW區變化之完整鼠類CDR(「Gary Queen技術」);經批準之CDR移植mAb基本上皆在此類別中。
風險評分為約1500:嵌合mAb。
7個所選人類化純系之風險評分在典型CDR移植mAb類別中。舉例而言,人類mAb阿達木單抗(adalimumab,Humira®)之評分為654,其對於人類mAb而言相對較高(處於Gaussian曲線之上端),但與典型CDR移植mAb相比較低。
評分來自鼠類CDR,特定而言Y殘基。該等評分係為用於癌症治療之抗體可接受之評分。改變該評分將意味著改造鼠類CDR,特定而言移除Y殘基。
將鼠類抗LAG-3單株抗體BAP050人類化。該技術需要將框架中之鼠類CDR選殖至人類種系可變區框架之有序文庫中,使所選殖可變區之文庫在CHO細胞中表現為完整IgG4(S228P)人類化mAb,及選擇以與親代mAb相當或更高之親和力結合至靶之純系。因此,要求鼠類CDR選擇保留其構象、且因此保留親代鼠類mAb之結合親和力及特異性之最佳人類種系框架序列。獲得具有獨特可變區序列之20個人類化形式之序列及測試樣品,該等序列及樣品亦已通過與經LAG-3轉染之CHO細胞之結合測試。18個純系含有相同的HC FW3種系序列,其具有位置84處之罕見Cys。在7個所選純系中,Cys經Ser替代,從而產生新的mAb經標記之huBAP050(Ser)純系。進一步分析該等純系之生物功能(例如,抗原結合及配體阻斷)、結構特徵及在CHO細胞中之瞬時表現。
選擇實例1中所述之5個人類化純系來評估在中國倉鼠卵巢(CHO)細胞中之表現。
使用Lonza之GS Xceed載體(IgG4pro△k用於重鏈及κ用於輕鏈)構築單一基因載體(SGV)。將SGV擴增且瞬時共轉染至CHOK1SV GS-KO細胞中以2.8L之體積表現。
在轉染後第6天收穫表現培養物且藉由離心澄清並無菌過濾。使用一步蛋白質A層析純化澄清的細胞培養物上清液。以SE-HPLC、SDS-PAGE、IEF及LAL之形式使用濃度為1mg/ml之經純化材料(包括作為對照樣品之抗體)實施產物品質分析。
藉由GeneArt AG合成輕鏈及重鏈可變結構域編碼區之序列。分別使用N末端限制位點Hind III及C末端限制位點BsiWI(輕鏈)及ApaI(重鏈),將輕鏈可變結構域編碼區亞選殖至pXC-κ中,且將重鏈可變結構域編碼區亞選殖至pXC-IgG4pro △K載體中。藉由PCR擴增(引子1053:GCTGACAGACTAACAGACTGTTCC(SEQ ID NO:288)及1072:CAAATGTGGTATGGCTGA(SEQ ID NO:289))篩選陽性純系,且藉由所關注基因之限制消化(使用EcoRI-HF及HindIII-HF之雙消化)及核苷酸測序來驗證。
將單一細菌群落挑選至15ml含有50μg/ml胺苄青黴素(ampicillin)之Luria Bertani(LB)培養基(LB培養液,Sigma-Aldrich,L7275)中,且在220rpm下振盪的同時在37℃下培育過夜。使用所得起始培養物接種1L含有50μg/ml胺苄青黴素之Luria Bertani(LB)培養基,且在220rpm下振盪的同時在37℃下培育過夜。使用QIAGEN質體Plus Gigaprep系統(QIAGEN,12991)分離載體DNA。在所有情況下,使用Nanodrop 1000分光光度計(Thermo-Scientific)量測DNA濃度,且用EB緩衝液(10mM Tris-Cl,pH 8.5)將其調節至1mg/ml。藉由量測吸光度比率A260/A280評價單一基因載體之DNA品質。發現此值介於1.88與1.90之間。
將CHOK1SV GS-KO細胞培養於補充有6mM麩醯胺酸(Invitrogen,25030-123)之CD-CHO培養基(Invitrogen,10743-029)中。將細胞培育於振盪培育器中於36.5℃、5% CO2、85%濕度、140rpm下。每3-4天以常規方式將細胞繼代培養,以2×105個細胞/ml接種,且使其繁殖以具有可用於轉染之足夠細胞。直至第20代丟棄細胞。
使用已培養最少兩週之CHOK1SV GS-KO細胞實施瞬時轉染。將細胞繼代培養24h,然後轉染,且在轉染時細胞活力為>99%。
使用基因脈衝MXCell(Bio-Rad)(用於電穿孔之基於板之系統)經由電穿孔實施所有轉染。對於每一轉染,將活細胞於預熱培養基中重懸浮至2.86×107個細胞/ml。將80μg DNA(1:1比率之重鏈與輕鏈SGV)及700μl細胞懸浮液等分至每一比色杯/孔中。在300V、1300μF下對細胞實施電穿孔。將經轉染之細胞轉移至錐形燒瓶中之預熱培養基,且用亦轉移至燒瓶之預熱培養基將比色杯/孔沖洗兩次。將經轉染之細胞培養物於振盪培育器中於36.5℃、5% CO2、85%濕度、140rpm下培育6天。在收穫時使用Cedex HiRes自動化細胞計數器(Roche)量測細胞活力及活細胞濃度。
將細胞培養物上清液收穫且藉由在2000rpm下離心10min澄清,然後經由0.22μm PES膜過濾器過濾。在AKTA純化器(10ml/min)上使用預填充之5ml HiTrap MabSelect SuRE管柱(GE Healthcare,11-0034-94)純化澄清的上清液。用5管柱體積(CV)之50mM磷酸鈉、125mM氯化鈉(pH 7.0)(平衡緩衝液)平衡管柱。在樣品裝載後,用2 CV之平衡緩衝液洗滌管柱,然後用3 CV之50mM磷酸鈉、1M氯化鈉(pH 7.0)洗滌,且用2 CV之平衡緩衝液重複洗滌。然後用5 CV之10mM甲酸鈉(pH 3.5)溶析產物。立即將含有蛋白質之所溶析部分之pH調節至pH 7.2,且經由0.2μm過濾器過濾。
在溶析期期間觀察到含有單一蛋白質之峰。當藉由SE-HPLC及SDS-PAGE分析時,顯示此峰含有mAb。所回收蛋白質產量顯示於表5中。該等純系在21.9mg/L至29.4mg/L之範圍內瞬時表現。
藉由Agilent 1200系列HPLC系統上之SE-HPLC、使用Zorbax GF-250 4μm 9.4mm ID×250mm管柱(Agilent)分析一式兩份經蛋白質A純化之抗體之樣品。經由0.2μm過濾器過濾濃度為1mg/ml之樣品等份,然後注射。分別注射80μl等份且以1ml/min運行15分鐘。使用Chemstation(Agilent)軟體分析可溶性聚集物含量。
獲得經測試抗體及對照IgG4抗體之層析概況,其中滯留時間顯示佔總體經檢測峰面積之百分比。產物在約8.59min至8.61min時顯示單一蛋白質峰,此與人類IgG4抗體對照(約8.64min)相當且與單體抗體一致。在約7.90min之滯留時間處檢測到少量(至多約3%-4%)與可溶性聚集物一致之較高分子量雜質。
藉由與NuPage 4×LDS樣品緩衝液(Invitrogen,NP0007)及NuPage 10×樣品還原劑(Invitrogen,NP0009)混合來製備還原樣品用於分析,且在70℃下培育10min。對於非還原樣品,省略還原劑及熱培育。在1.5mm NuPage 4%-12% Bis-Tris Novex預澆注凝膠(Invitrogen,NP0335PK2)上使用NuPage MES SDS運行緩衝液在變性條件下對樣品實施電泳。在凝膠上納入SeeBlue Plus 2預染色分子量標準(Invitrogen,
LC5925)之10μl等份及1mg/ml之對照IgG4抗體。以1mg/ml將每一樣品之1μl裝載至凝膠中。電泳後,立即在室溫下用InstantBlue(TripleRed,ISB01L)將凝膠染色30min。在BioSpectrum成像系統(UVP)上分析經染色凝膠之影像。
該分析確認抗體產物之存在及良好純度。在非還原條件下,觀察到接近98kDa之主要蛋白質條帶,此與對照IgG4抗體相當。在非還原條件下,對照IgG4抗體及一個經測試純系展示對應於約70kDa之重鏈加輕鏈半抗體之另一模糊條帶。預期此條帶針對對照抗體。在還原條件下觀察到兩個條帶與重鏈(接近49kDa標記物之位置)及輕鏈(接近28kDa標記物之位置)之大小一致且與對對照IgG4抗體發現之條帶相當。
如下文所述對經蛋白質A純化之抗體之非還原樣品實施電泳。
在1.0mm Novex pH 3-10梯度凝膠(Invitrogen,EC66552BOX)上使用製造商推薦之運行條件對5μg經蛋白質A純化之樣品實施電泳。在凝膠上納入IEF(pH 3-10)標記物(Invitrogen,39212-01)之10μl等份。電泳後,在室溫下立即用10% TCA溶液將凝膠固定30min,且然後用InstantBlue(TripleRed,ISB01L)染色過夜。在BioSpectrum成像系統(UVP)上分析經染色凝膠之影像。
如表6中所顯示,經測試純系在pH 6.0與7.45之間展示電荷同種型。該等抗體之經檢測之電荷同種型與理論計算之pI相當,其預測介於6.35與6.82之間。純系F及G二者之經預測pI為6.35且顯示相當的電荷同種型,此亦與理論計算之pI一致且二者之pI相同(6.35)。對照IgG4抗體之性能與所預期一致。
使用Endosafe-PTS儀器、基於柱之方法基於LAL分析(Charles River)來量測在最終濃度(至多3.44mg/ml)下經純化蛋白質之內毒素含量。
如表8中所顯示,發現內毒素含量介於0.05EU/mg至0.27EU/mg範圍內。
構築所選人類化抗LAG-3 mAb之GS單一基因表現載體且將其用於瞬時轉染CHOK1SV GS-KO細胞。在標準條件下將2.6至2.8升表現培養物培育6天,且使用蛋白質A層析純化所得細胞培養物上清液。純化後效價指示於表8中且發現介於21.88mg/L至29.38mg/L範圍內。所回收產量介於61.3mg至82.3mg範圍內。
SDS-PAGE及SE-HPLC分析指示在產物中存在少量(至多4.69%)可溶性聚集物,此與mAb之二聚體抗體基本一致。mAb亦在與三聚體抗體一致之滯留時間下顯示較高分子量雜質。
等電聚焦檢測所有mAb之多種電荷同種型。mAb顯示同種型通常在基於該等分子之理論計算之pI時更具鹼性,此指示一定程度之翻譯後修飾。發現mAb與其理論計算之pI值相當。
在提供樣品前量測所有樣品之內毒素含量,且發現低於0.63EU/mg。
研究鼠類抗LAG-3抗體BAP050與LAG-3之結合親和力。如藉由FACS分析所顯示,鼠類抗LAG-3抗體以0.2nM之KD結合至人類LAG-3轉染之CHO細胞,以0.26nM之KD結合至人類T細胞,且以13.6nM之KD結合至人類LAG-3轉染之300.19細胞。
藉由競爭結合分析檢查鼠類抗LAG-3抗體BAP050之阻斷活性。鼠類抗LAG-3抗體以2.3nM之IC50阻斷LAG-3-Ig與Raji細胞上II類MHC分子之結合。
測試鼠類抗LAG-3抗體BAP050對干擾素γ(IFN-γ)表現之效應。鼠類抗LAG-3抗體使經抗CD3(0.1μg/mL)刺激之細胞上之IFN-γ表現增加3.0±2.1倍,使經葡萄球菌腸毒素B(SEB)(3pg/mL)刺激之細胞上的IFN-γ表現增加1.6±0.4倍,且使經CMV肽刺激之細胞上之IFN-γ表現增加1.4±0.3倍。
檢查LAG-3中之可結合鼠類抗LAG-3抗體BAP050之區域。如藉由ELISA所顯示,鼠類抗LAG-3抗體結合含有所有四個細胞外Ig樣結構域(D1-D4)之LAG-3 Ig融合蛋白(sLAG-3 D1-D4Ig),以及僅含有結構域1(D1)至結構域2(D2)之LAG-3 Ig融合蛋白(sLAG-3 D1-D2Ig)。進一步分析顯示,抗LAG-3抗體結合表現全長LAG-3、具有D2缺失之LAG-3(CHO-LAG-3△D2)及具有D1額外環部分缺失之LAG-3(CHO-LAG-3△P48A60)的CHO細胞。因此,抗LAG-3抗體結合LAG-3之D1。
亦發現與小鼠IgG1對照及無抗體對照相比,鼠類抗LAG-3抗體BAP050增加CD3刺激之PBMC中之IFN-γ分泌。在四個供體中,增加倍數介於1.4倍至2.9倍之間。
使用Biacore方法量測人類LAG-3蛋白上實例性人類化抗LAG-3抗體之結合。結果為:Ka=6.41×105M-1s-1;Kd=7.00×10-5s-1;KD=0.109±0.008nM。抗LAG-3抗體亦結合食蟹猴LAG-3,如藉由Biacore方法所量測。
使用FACS分析量測表現人類LAG-3之CHO細胞及表現食蟹猴LAG-3之HEK 209細胞上相同人類化抗LAG-3抗體之結合。結果顯示與人類IgG4同型對照相比,抗LAG-3抗體(人類IgG4)以高親和力結合至人類LAG-3。抗LAG-3抗體以1.92nM之KD結合表現人類LAG-3之細胞,且以2.3nM之KD結合表現食蟹猴LAG-3之細胞。
亦量測表現恒河猴LAG-3之300.19細胞上抗LAG-3抗體之結合。結果顯示抗LAG-3抗體以8.03nM之KD結合恒河猴LAG-3。
其他結合分析顯示實例性人類化抗LAG-3抗體不與小鼠LAG-3交叉反應或與親代細胞系交叉反應。
檢查實例性人類化抗LAG-3抗體阻斷LAG-3與其已知配體、II類MHC分子二者之間之相互作用的能力。結果顯示與人類IgG4同型對照相比,抗LAG-3抗體以5.5nM之IC50阻斷LAG-3與Daudi細胞上II類MHC分子之間之相互作用。
預期在不具T細胞受體之特異性刺激下抗LAG-3抗體不會刺激可檢測到之細胞介素反應。藉由風乾將抗LAG-3抗體固定並高度交聯於組織培養板上,且使用源自Stebbings R.等人之方法測試其刺激細胞介素產生之能力(J Immunol.2007 179(5):3325-3331)。在全血之葡萄球菌腸毒素B(SEB)刺激不存在下,抗LAG-3抗體或對照IgG無法誘導
IL-2或IFN-γ產生。
對於若干癌症類型中之每一者,測試來自多個患者之樣品之PD-L1/CD8/IFN-γ狀態。每一樣品歸類為:對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陰性,對該等標記物呈單或雙陽性,或對該等標記物呈三陽性。圖11顯示在此實驗中,在患者群體內,以下癌症類型通常對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性:肺癌(鱗狀)、肺癌(腺癌)、頭頸癌、子宮頸癌(鱗狀)、胃癌、甲狀腺癌、黑色素瘤及鼻咽癌。患有該等類型之癌症之患者係在如本文所述之組合療法(例如抗LAG-3抗體)中使用抗PD-1抗體之療法的良好候選者。成功治療之可能性可藉由確定哪個患者對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性、並使用抗PD-1或抗PD-L1抗體及如本文所述之組合療法(例如抗LAG-3抗體)治療三陽性患者來進一步強化。
圖12顯示在患者群體內,以下癌症類型極少對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性:ER+乳癌及胰臟癌。應注意,即使在通常不對PD-L1/CD8/IFN-γ呈陽性之癌症中,仍可藉由確定哪個患者對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性、並使用抗PD-1或抗PD-L1抗體及如本文所述之組合療法(例如抗LAG-3抗體)治療三陽性患者來增加成功治療之可能性。
圖13顯示對PDL1/CD8/IFN-γ呈三陽性之乳癌患者之比例。考慮到乳癌,三陽性之比例通常略低。然而,在僅關注IM-TN乳癌時,可觀察到顯著較大之患者百分比對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性。IM-TN乳癌尤其難以使用習用療法來治療。發現IM-TN乳癌通常對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性開創了使用抗PD-1或抗PD-L1抗體及如本文所述之組合療法(例如抗LAG-3抗體)治療之此癌症的新治療途徑。
圖14顯示對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性之結腸癌患者之比例。考慮到結腸癌,三陽性之比例通常略低。然而,在僅關注高MSI(高微
衛星不穩定性)乳癌時,可觀察到顯著較高之患者百分比對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性。可使用例如市售基於PCR之方法來分析MSI含量。
測試胃癌樣品之PD-L1/CD8/IFN-γ含量(數據未顯示)。發現在高MSI或EBV+胃癌中,約49%對PD-L1呈陽性,且高比例之PD-L1陽性細胞對PD-L1/CD8/IFN-γ呈三陽性。亦發現一定比例之PD-L1陽性細胞及PD-L1/CD8/IFN-γ陽性細胞亦對PIK3CA呈陽性。此發現表明,該等癌症可使用PD-1或抗PD-L1抗體、例如與抗LAG-3抗體組合、視情況與PIK3治療組合來治療。
測試高MSICRC樣品之標記物組合(數據未顯示)。發現在高MSICRC樣品中,高比例之PD-L1/CD8/IFN-γ樣品亦對LAG-3、PD-1(亦稱為PDCD1)、RNF43及BRAF呈陽性。此發現表明該等癌症可使用LAG-3抗體、視情況與靶向PD-1、PD-L1、PDCD1、RNF43及BRAF中之一或多者的治療劑組合來治療。
測試鱗狀細胞肺癌之標記物組合(數據未顯示)。發現在鱗狀細胞肺癌樣品中,高比例之PD-L1/CD8/IFN-γ樣品亦對LAG-3呈陽性。此發現表明該等癌症可使用LAG-3抗體、視情況與靶向PD-1或PD-L1之治療劑、例如抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體組合來治療。
測試乳頭狀甲狀腺癌之包括BRAF V600E突變在內之標記物組合(數據未顯示)。發現高比例之對PD-L1呈陽性之甲狀腺癌樣品亦對BRAF V600E呈陽性。此發現表明該等癌症可使用抗PD-1抗體或抗PD-L1抗體、例如與抗LAG-3抗體組合、視情況與靶向BRAF之治療劑組合來治療。
為使得能夠廣泛地檢查基於免疫調節劑(例如,LAG-3單獨或與PD1/PD-L1組合)之療法之癌症適應症,在蛋白質及mRNA層級二者上
評估人類癌症(包括肺腫瘤及肝腫瘤二者)中之PD-L1表現。
藉由免疫組織化學(IHC)評估一系列福馬林固定之石蠟包埋之非小細胞肺(NSCLC)腺癌(ACA)、NSCLC鱗狀細胞癌(SCC)及肝細胞癌(HCC)腫瘤中的PD-L1蛋白表現。以半定量方式、藉由人工組織學評分(H-評分)方法、基於陽性腫瘤細胞之染色強度及百分比對PD-L1表現進行評分。在IHC分析中,PD-L1陽性(PD-L1+)定義為H-評分20。同時,在該等相同適應症(503個NSCLC ACA、489個NSCLC SCC及191個HCC)中根據癌症基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)檢查PD-L1 mRNA表現數據,且藉由比較匹配正常組織中之表現與TCGA來分析。
在RNAseq分析內,跨越TCGA腫瘤適應症利用OmicSoft RNASeq管線在RSEM正規化後將數據計算為log2(RPKM+0.1)。PD-L1在NSCLC ACA及SCC中之表現相對於在HCC中之表現升高。藉由對TCGA中之所有適應症疊加分佈並比較表現量,對PD-L1之過表現概況分級且發現TCGA HCC隊列具有顯著降低的PD-L1 mRNA含量,且與ACA之1.3及SCC之1.5相比中值含量為-0.8,該等量係中值表現量變化的2倍以上。使用RNAseq,分析將50%之NSCLC腺癌、54%之NSCLC鱗狀細胞癌及6%之HCC定義為PD-L1之高表現者。
在45個肺腺癌(ACA)樣品、47個肺鱗狀細胞癌(SCC)樣品及36個肝細胞癌(HCC)樣品中量測腫瘤細胞PD-L1蛋白表現。16/45(35.6%)之肺ACA、21/47(44.7%)之肺SCC為PD-L1陽性。相比之下,僅在2/36(5.6%)之HCC樣品中觀察到PD-L1陽性。
總之,使用大且獨立的人類NSCLC及HCC樣品集合中之IHC及RNAseq分析,發現在NSCLC中比在HCC中更富含PD-L1表現。在NSCLC內,在腺癌與鱗狀細胞癌之間存在相當的發現。重要的係,在3種適應症之大量樣品(128個用於IHC且1183個用於RNAseq)中,在
基於蛋白質與基於mRNA之分析之間觀察到極佳一致性。因此,此發現建立了針對可能富含對基於免疫調節劑(例如PD1/PD-L1,例如與LAG-3組合)之免疫療法之反應的適應症及患者區段在TCGA中大規模的基於mRNA之數據探勘的基礎。
本文所提及之所有公開案、專利及登錄號之全部內容皆以引用方式併入本文中,如同將每一個別公開案或專利特定且個別地指示以引用方式併入本文中一般。
儘管已論述本發明之特定實施例,但上文之說明具有闡釋性而非限制性。閱讀此說明書及下文申請專利範圍後,彼等熟習此項技術者將明瞭本發明之許多變化形式。應參考申請專利範圍以及其等效內容之完整範疇及說明書以及該等變化形式來確定本發明之完整範疇。
Claims (39)
- 一種經分離抗體分子,其能夠結合至人類淋巴球活化基因-3(LAG-3),該抗體分子包含:(a)重鏈可變區(VH),其包含SEQ ID NO:4之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO:5之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO:3之VHCDR3胺基酸序列;及輕鏈可變區(VL),其包含SEQ ID NO:13之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO:14之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO:15之VLCDR3胺基酸序列;(b)VH,其包含SEQ ID NO:1之VHCDR1胺基酸序列;SEQ ID NO:2之VHCDR2胺基酸序列;及SEQ ID NO:3之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO:10之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO:11之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO:12之VLCDR3胺基酸序列;(c)VH,其包含SEQ ID NO:286之VHCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO:5之VHCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO:3之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO:13之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO:14之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO:15之VLCDR3胺基酸序列;或(d)VH,其包含SEQ ID NO:286之VHCDR1胺基酸序列;SEQ ID NO:2之VHCDR2胺基酸序列;及SEQ ID NO:3之VHCDR3胺基酸序列;及VL,其包含SEQ ID NO:10之VLCDR1胺基酸序列、SEQ ID NO:11之VLCDR2胺基酸序列及SEQ ID NO:12之VLCDR3胺基酸序列。
- 如請求項1之抗體分子,其中該抗體分子係人類化抗體分子、及/或單特異性抗體分子、或雙特異性抗體分子。
- 如請求項1或2之抗體分子,其包含:包括至少一個、兩個、三個或四個框架(FW)區之VH,該框架區包含SEQ ID NO:187、190、194、196、198、202、206、208、210、212、217、219或221中任一者之胺基酸序列,或與其至少90%一致之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:187、190、194、196、198、202、206、208、210、212、217、219或221中任一者之該胺基酸序列相比具有不超過兩個的胺基酸取代、插入或缺失;及/或包含至少一個、兩個、三個或四個框架區之VL,該框架區包含SEQ ID NO:226、230、232、234、236、238、240、244、246、248、252、255、259、261、265、267、269或271中任一者之胺基酸序列,或與其至少90%一致之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:226、230、232、234、236、238、240、244、246、248、252、255、259、261、265、267、269或271中任一者之該胺基酸序列相比具有不超過兩個的胺基酸取代、插入或缺失。
- 如請求項1或2之抗體分子,其包含:重鏈可變結構域,其包括SEQ ID NO:8、28、64、68、72、76、80、100、104或108中任一者之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:8、28、64、68、72、76、80、100、104或108中之任一者至少85%一致之胺基酸序列;及/或輕鏈可變結構域,其包括SEQ ID NO:32、36、40、44、48、52、56、60、84、88、92或96中之任一者之胺基酸序列,或與 SEQ ID NO:32、36、40、44、48、52、56、60、84、88、92或96中之任一者至少85%一致之胺基酸序列。
- 如請求項1或2之抗體分子,其包含:重鏈可變結構域,其包括選自SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:104或SEQ ID NO:108之胺基酸序列;及/或輕鏈可變結構域,其包括SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:56、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:92或SEQ ID NO:96之胺基酸序列。
- 如請求項1或2之抗體分子,其包含:包括SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:78、SEQ ID NO:82、SEQ ID NO:102、SEQ ID NO:106、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:122或SEQ ID NO:134之胺基酸序列的重鏈;及/或包括SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:58、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:94或SEQ ID NO:98之胺基酸序列的輕鏈。
- 如請求項1或2之抗體分子,其包含:(a)包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之該胺基酸序列的重 鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:32之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(b)包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:36之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(c)包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:40之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(d)包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:44之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(e)包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:48之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(f)包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:52之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(g)包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:56之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(h)包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:60之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(i)包括SEQ ID NO:64或SEQ ID NO:104之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:36之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域; (j)包括SEQ ID NO:64或SEQ ID NO:104之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:40之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(k)包括SEQ ID NO:64或SEQ ID NO:104之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:56之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(l)包括SEQ ID NO:64或SEQ ID NO:104之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:60之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(m)包括SEQ ID NO:68或SEQ ID NO:108之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:36之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(n)包括SEQ ID NO:72或SEQ ID NO:8之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:40之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(o)包括SEQ ID NO:72或SEQ ID NO:8之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:60之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(p)包括SEQ ID NO:76之該胺基酸序列的重鏈可變結構域及包括SEQ ID NO:60之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(q)包括SEQ ID NO:80之該胺基酸序列的重鏈可變結構域及包括SEQ ID NO:84之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(r)包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:88之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;(s)包括SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:100之該胺基酸序列的重 鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:92之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域;或(t)包括SEQ ID NO:64或SEQ ID NO:104之該胺基酸序列的重鏈可變結構域;及包括SEQ ID NO:96之該胺基酸序列的輕鏈可變結構域。
- 如請求項1或2之抗體分子,其包含:(a)包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:34之胺基酸序列的輕鏈;(b)包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈;(c)包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:42之胺基酸序列的輕鏈;(d)包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:46之胺基酸序列的輕鏈;(e)包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:50之胺基酸序列的輕鏈;(f)包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:54之胺基酸序列的輕鏈;(g)包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:58之胺基酸序列的輕鏈;(h)包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:62之胺基酸序列的輕鏈;(i)包括SEQ ID NO:66或SEQ ID NO:106之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈;(j)包括SEQ ID NO:66或SEQ ID NO:106之胺基酸序列的重 鏈;及包括SEQ ID NO:42之胺基酸序列的輕鏈;(k)包括SEQ ID NO:66或SEQ ID NO:106之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:58之胺基酸序列的輕鏈;(l)包括SEQ ID NO:66或SEQ ID NO:106之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:62之胺基酸序列的輕鏈;(m)包括SEQ ID NO:70或SEQ ID NO:110之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈;(n)包括SEQ ID NO:74或SEQ ID NO:18之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:42之胺基酸序列的輕鏈;(o)包括SEQ ID NO:74或SEQ ID NO:18之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:62之胺基酸序列的輕鏈;(p)包括SEQ ID NO:78之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:62之胺基酸序列的輕鏈;(q)包括SEQ ID NO:82之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:86之胺基酸序列的輕鏈;(r)包括SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:102之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:94之胺基酸序列的輕鏈;(s)包括SEQ ID NO:66或SEQ ID NO:106之胺基酸序列的重鏈;及包括SEQ ID NO:98之胺基酸序列的輕鏈;(t)包括SEQ ID NO:113之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:34之胺基酸序列的輕鏈;(u)包括SEQ ID NO:113之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈;(v)包括SEQ ID NO:122之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈;(w)包括SEQ ID NO:122之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:58之胺基酸序列的輕鏈;或(x)包括SEQ ID NO:134之胺基酸序列的重鏈及包括SEQ ID NO:38之胺基酸序列的輕鏈。
- 如請求項1或2之抗體分子,其係單株抗體、Fab、F(ab')2、Fv或單鏈Fv片段(scFv);或包含:選自IgG1、IgG2、IgG3及IgG4之重鏈恆定區,及/或選自κ或λ之輕鏈恆定區。
- 如請求項9之抗體分子,其包含:(a)具有SEQ ID NO:275或277之位置108處之突變的人類IgG4重鏈恆定區,及κ輕鏈恆定區;(b)具有SEQ ID NO:275或277之位置108處之絲胺酸至脯胺酸突變的人類IgG4重鏈恆定區,及κ輕鏈恆定區;(c)具有SEQ ID NO:279之位置180處之天冬醯胺至丙胺酸突變的人類IgG1重鏈恆定區,及κ輕鏈恆定區;(d)具有SEQ ID NO:280之位置148處之天冬胺酸至丙胺酸突變及位置212處之脯胺酸至丙胺酸突變的人類IgG1重鏈恆定區,及κ輕鏈恆定區;或(e)具有SEQ ID NO:281之位置117處之白胺酸至丙胺酸突變及位置118處之白胺酸至丙胺酸突變的人類IgG1重鏈恆定區,及κ輕鏈恆定區。
- 如請求項1或2之抗體分子,其(a)能夠以小於約0.2nM之解離常數(KD)結合至人類LAG-3;(b)結合LAG-3之細胞外Ig樣結構域; (c)能夠減少LAG-3與II類主要組織相容性(MHC)分子或表現II類MHC分子之細胞的結合;及/或(d)能夠增強抗原特異性T細胞反應。
- 如請求項1或2之抗體分子,其中該抗體分子具有針對LAG-3之第一結合特異性及針對PD-1、TIM-3、CEACAM、PD-L1或PD-L2之第二結合特異性;及/或其中該抗體分子包含抗體之抗原結合片段。
- 一種醫藥組合物,其包含如請求項1至12中任一項之經分離抗體分子及醫藥上可接受之載劑、賦形劑或穩定劑。
- 一種編碼重鏈CDR 1-3、輕鏈CDR 1-3或二者之經分離核酸,其中該核酸包含SEQ ID NO:140-186或287中任一者之核苷酸序列。
- 如請求項14之核酸,其進一步包含:編碼重鏈可變結構域之核苷酸序列,其中該核苷酸序列包含SEQ ID NO:9、29、65、69、73、77、81、101、105、109、112、121、124、125、132或133中任一者,或與SEQ ID NO:9、29、65、69、73、77、81、101、105、109、112、121、124、125、132或133中之任一者至少85%一致;及/或編碼輕鏈可變結構域之核苷酸序列,其中該核苷酸序列包含SEQ ID NO:33、37、41、45、49、53、57、61、85、89、93、97、115、118、128、129或137中之任一者,或與SEQ ID NO:33、37、41、45、49、53、57、61、85、89、93、97、115、118、128、129或137中之任一者至少85%一致。
- 如請求項15之核酸,其進一步包含:編碼重鏈之核苷酸序列,其中該核苷酸序列包含SEQ ID NO:19、31、67、71、75、79、83、103、107、111、114、123、126、127、135或136中之任一者,或與SEQ ID NO:19、31、67、71、75、79、83、103、107、111、114、123、126、127、135或136中之任一者至少85%一致;及/或編碼輕鏈之核苷酸序列,其中該核苷酸序列包含SEQ ID NO:35、39、43、47、51、55、59、63、87、91、95、99、117、120、130、131、138或139中之任一者,或與SEQ ID NO:35、39、43、47、51、55、59、63、87、91、95、99、117、120、130、131、138或139中之任一者至少85%一致。
- 一種經分離核酸,其編碼如請求項1至12中任一項之抗體分子之抗體重鏈可變區、輕鏈可變區或二者。
- 一種表現載體,其包含如請求項14至17中任一項之核酸。
- 一種宿主細胞,其包含如請求項14至17中任一項之核酸。
- 一種產生抗體分子或其片段之方法,其包含在適於基因表現之條件下培養如請求項19之宿主細胞。
- 一種檢測生物樣品中之LAG-3之方法,其包含(i)使該樣品(及視情況參考樣品)與如請求項1至12中任一項之經分離抗體分子在容許發生該抗體分子與多肽相互作用之條件下接觸,及(ii)檢測該抗體分子 與該樣品(及視情況該參考樣品)之間複合物之形成。
- 如請求項1至12中任一項之抗體分子或如請求項13之醫藥組合物,其用於在個體中刺激免疫反應或治療癌症或傳染病。
- 如請求項22之供使用的抗體分子或醫藥組合物,其中該癌症選自肺癌、黑色素瘤、腎癌、肝癌、前列腺癌、乳癌、頭頸癌、結腸直腸癌、胰臟癌、腦癌、血液癌症或該癌症之轉移性病灶,視情況,其中:(a)該肺癌選自非小細胞肺癌(NSCLC),視情況,其中該NSCLC包含KRAS突變;肺腺癌;鱗狀細胞肺癌或小細胞肺癌;(b)該黑色素瘤選自晚期黑色素瘤、不可切除性黑色素瘤、轉移性黑色素瘤、HLA-A2陽性黑色素瘤、具有BRAF突變之黑色素瘤、具有NRAS突變之黑色素瘤、皮膚黑色素瘤或眼內黑色素瘤;(c)該腎癌選自腎細胞癌(RCC)、轉移性腎細胞癌或透明腎細胞癌(CCRCC);或(d)該血液癌症選自淋巴瘤、骨髓瘤或白血病。
- 如請求項22或23之供使用的抗體分子或醫藥組合物,其中該抗體分子或醫藥組合物係與第二治療劑或程序組合使用,視情況,其中該第二治療劑或程序選自以下中之一或多者:化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、基於免疫之療法、細胞介素、手術程序、輻射程序、共刺激分子之活化劑、抑制分子之抑制劑、疫苗或細胞免疫療法,視情況,其中該抗體分子或醫藥組合物係與下列組合投與: (a)選自以下中之一或多者之共刺激分子的激動劑:OX40、CD2、CD27、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、4-1BB(CD137)、GITR、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3或CD83配體;或(b)選自以下中之一或多者之免疫檢查點的抑制劑:PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4或TGFR。
- 如請求項22或23之供使用的抗體分子或醫藥組合物,其中該抗體分子或醫藥組合物係與下列之一或多者組合使用:(a)PD-1抑制劑,視情況,其中該PD-1抑制劑係抗PD-1抗體分子,或該PD-1抑制劑係選自尼沃魯單抗(Nivolumab)、匹姆泊單抗(Pembrolizumab)、易普利姆瑪(Pidilizumab)、AMP-224或AMP514;(b)TIM-3抑制劑,視情況,其中該TIM-3抑制劑係抗TIM-3抗體分子;(c)GITR激動劑,視情況,其中該GITR激動劑係抗GITR抗體分子或GITR融合蛋白;或(d)PD-L1抑制劑,視情況,其中該PD-L1抑制劑係選自YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C或MDX-1105之抗體分子。
- 如請求項22或23之供使用的抗體分子或醫藥組合物,其中該抗體分子或醫藥組合物係與下列之一或多者組合使用:(a)腫瘤抗原肽,用以治療黑色素瘤,視情況,其中該腫瘤抗原肽包含HLA-A2肽; (b)化學治療劑,用以治療胰臟癌,視情況,其中該化學治療劑包含吉西他濱;或(c)化學治療劑,用以治療乳癌,視情況,其中該化學治療劑包含太平洋紫杉醇。
- 如請求項22或23之供使用的抗體分子或醫藥組合物,其中該個體患有或經鑒定患有下列之一或多者:(a)表現PD-L1之癌症;(b)對PD-L1、CD8或IFN-γ中之一者、兩者或所有呈陽性之癌症;(c)對PD-L1、CD8及IFN-γ呈三陽性之癌症;或(d)腫瘤浸潤淋巴球(TIL)陽性之癌症。
- 如請求項22或23之供使用的抗體分子或醫藥組合物,其中該抗體分子或醫藥組合物係以約0.1至30mg/kg之劑量投與,視情況,其中該抗體分子或醫藥組合物係以一週一次至每2、3或4週一次投與,或以自約10至20mg/kg之劑量隔週投與。
- 如請求項22或23之供使用的抗體分子或醫藥組合物,其中該抗體分子或醫藥組合物係與下列之一或多者組合使用:1)蛋白激酶C(PKC)抑制劑;2)熱休克蛋白90(HSP90)抑制劑;3)磷酸肌醇3激酶(PI3K)及/或雷帕黴素靶(mTOR)之抑制劑;4)細胞色素P450抑制劑;5)鐵螯合劑;6)芳香酶抑制劑;7)p53抑制劑;8)細胞凋亡誘導物;9)血管生成抑制劑;10)醛固酮合酶抑制劑;11)平滑(SMO)受體抑制劑;12)泌乳素受體(PRLR)抑制劑;13)Wnt信號傳導抑制劑;14)CDK4/6抑制劑;15)纖維母細胞生長因子受體2(FGFR2)/纖 維母細胞生長因子受體4(FGFR4)抑制劑;16)巨噬細胞群落刺激因子(M-CSF)抑制劑;17)c-KIT、組胺釋放、Flt3或PKC中之一或多者之抑制劑;18)VEGFR-2、PDGFRβ、c-KIT或Raf激酶C中之一或多者之抑制劑;19)生長抑制素激動劑及/或生長激素釋放抑制劑;20)退行性淋巴瘤激酶(ALK)抑制劑;21)胰島素樣生長因子1受體(IGF-1R)抑制劑;22)P-糖蛋白1抑制劑;23)血管內皮生長因子受體(VEGFR)抑制劑;24)BCR-ABL激酶抑制劑;25)FGFR抑制劑;26)CYP11B2抑制劑;27)HDM2抑制劑;28)酪胺酸激酶抑制劑;29)c-MET抑制劑;30)JAK抑制劑;31)DAC抑制劑;32)11β-羥化酶抑制劑;33)IAP抑制劑;34)PIM激酶抑制劑;35)Porcupine抑制劑;36)BRAF抑制劑;37)HER3抑制劑;38)MEK抑制劑;或39)脂質激酶抑制劑。
- 如請求項22或23之供使用的抗體分子或醫藥組合物,其中該抗體分子或醫藥組合物係與表7中所述之化合物A1至A51中的一或多者組合使用。
- 一種如請求項1至12中任一項之抗體分子或如請求項13之醫藥組合物的用途,其用於製造用來在個體中刺激免疫反應或治療癌症或傳染病之藥劑。
- 如請求項31之用途,其中該該癌症選自肺癌、黑色素瘤、腎癌、肝癌、前列腺癌、乳癌、頭頸癌、結腸直腸癌、胰臟癌、腦癌、血液癌症或該癌症之轉移性病灶,視情況,其中:(a)該肺癌選自非小細胞肺癌(NSCLC),視情況其中該NSCLC 包含KRAS突變;肺腺癌;鱗狀細胞肺癌或小細胞肺癌;(b)該黑色素瘤選自晚期黑色素瘤、不可切除性黑色素瘤、轉移性黑色素瘤、HLA-A2陽性黑色素瘤、具有BRAF突變之黑色素瘤、具有NRAS突變之黑色素瘤、皮膚黑色素瘤或眼內黑色素瘤;(c)該腎癌選自腎細胞癌(RCC)、轉移性腎細胞癌或透明腎細胞癌(CCRCC);或(d)該血液癌症選自淋巴瘤、骨髓瘤或白血病。
- 如請求項31或32之用途,其中該抗體分子或醫藥組合物係與第二治療劑或程序組合使用,視情況,其中該第二治療劑或程序選自以下中之一或多者:化學療法、靶向抗癌療法、溶瘤藥物、細胞毒性劑、基於免疫之療法、細胞介素、手術程序、輻射程序、共刺激分子之活化劑、抑制分子之抑制劑、疫苗或細胞免疫療法,視情況,其中該抗體分子或醫藥組合物係與下列組合投與:(a)選自以下中之一或多者之共刺激分子的激動劑:OX40、CD2、CD27、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、4-1BB(CD137)、GITR、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3或CD83配體;或(b)選自以下中之一或多者之免疫檢查點的抑制劑:PD-1、PD-L1、PD-L2、CTLA4、TIM3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4或TGFR。
- 如請求項31或32之用途,其中該抗體分子或醫藥組合物係與下 列之一或多者組合使用:(a)PD-1抑制劑,視情況,其中該PD-1抑制劑係抗PD-1抗體分子,或該PD-1抑制劑係選自尼沃魯單抗、匹姆泊單抗、易普利姆瑪、AMP-224或AMP514;(b)TIM-3抑制劑,視情況,其中該TIM-3抑制劑係抗TIM-3抗體分子;(c)GITR激動劑,視情況,其中該GITR激動劑係抗GITR抗體分子或GITR融合蛋白;或(d)PD-L1抑制劑,視情況,其中該PD-L1抑制劑係選自YW243.55.S70、MPDL3280A、MEDI-4736、MSB-0010718C或MDX-1105之抗體分子。
- 如請求項31或32之用途,其中該抗體分子或醫藥組合物係與下列之一或多者組合使用:(a)腫瘤抗原肽,用以治療黑色素瘤,視情況,其中該腫瘤抗原肽包含HLA-A2肽;(b)化學治療劑,用以治療胰臟癌,視情況,其中該化學治療劑包含吉西他濱;或(c)化學治療劑,用以治療乳癌,視情況,其中該化學治療劑包含太平洋紫杉醇。
- 如請求項31或32之用途,其中該個體患有或經鑒定患有下列之一或多者:(a)表現PD-L1之癌症;(b)對PD-L1、CD8或IFN-γ中之一者、兩者或所有呈陽性之癌症; (c)對PD-L1、CD8及IFN-γ呈三陽性之癌症;或(d)腫瘤浸潤淋巴球(TIL)陽性之癌症。
- 如請求項31或32之用途,其中該抗體分子或醫藥組合物係以約0.1至30mg/kg之劑量投與,視情況,其中該抗體分子或醫藥組合物係以一週一次至每2、3或4週一次投與,或以自約10至20mg/kg之劑量隔週投與。
- 如請求項31或32之用途,其中該抗體分子或醫藥組合物係與下列之一或多者組合使用:1)蛋白激酶C(PKC)抑制劑;2)熱休克蛋白90(HSP90)抑制劑;3)磷酸肌醇3激酶(PI3K)及/或雷帕黴素靶(mTOR)之抑制劑;4)細胞色素P450抑制劑;5)鐵螯合劑;6)芳香酶抑制劑;7)p53抑制劑;8)細胞凋亡誘導物;9)血管生成抑制劑;10)醛固酮合酶抑制劑;11)平滑(SMO)受體抑制劑;12)泌乳素受體(PRLR)抑制劑;13)Wnt信號傳導抑制劑;14)CDK4/6抑制劑;15)纖維母細胞生長因子受體2(FGFR2)/纖維母細胞生長因子受體4(FGFR4)抑制劑;16)巨噬細胞群落刺激因子(M-CSF)抑制劑;17)c-KIT、組胺釋放、Flt3;18)VEGFR-2、PDGFRβ、c-KIT或Raf激酶C中之一或多者之抑制劑;19)生長抑制素激動劑及/或生長激素釋放抑制劑;20)退行性淋巴瘤激酶(ALK)抑制劑;21)胰島素樣生長因子1受體(IGF-1R)抑制劑;22)P-糖蛋白1抑制劑;23)血管內皮生長因子受體(VEGFR)抑制劑;24)BCR-ABL激酶抑制劑;25)FGFR抑制劑;26)CYP11B2抑制劑;27)HDM2抑制劑;28)酪胺酸激酶抑制劑;29)c-MET抑制劑;30)JAK抑制劑;31)DAC抑制劑;32)11β-羥化酶抑制劑;33)IAP抑制劑;34)PIM激酶抑制劑;35)Porcupine抑制劑;36)BRAF抑制劑;37)HER3抑制劑;38)MEK抑制劑;或39) 脂質激酶抑制劑。
- 如請求項31或32之用途,其中該抗體分子或醫藥組合物係與表7中所述之化合物A1至A51中的一或多者組合使用。
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