JP6781740B2 - ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法、ヘテロ二量体のIgG様分子、ヘテロ二量体の抗体、組み換え宿主細胞、医薬組成物、宿主細胞を作成する方法、および培養物 - Google Patents
ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法、ヘテロ二量体のIgG様分子、ヘテロ二量体の抗体、組み換え宿主細胞、医薬組成物、宿主細胞を作成する方法、および培養物 Download PDFInfo
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Description
a. 第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸分子,
b. 第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸分子,
c. 第3のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第3の核酸分子,および、
d. 第4のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第4の核酸分子,
を与えることを含み、少なくとも2つの前記核酸分子で、前記第1および第2のCH3ドメインを備えるポリペプチドと前記第3および第4のCH3ドメインを備えるポリペプチドの選択的ペアリングのための手段を備え、前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記少なくとも4つの核酸分子を発現させ、前記少なくとも2つの異なるIg様分子を培養物から回収する工程をさらに備える。
a. 第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸分子
b. 第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸分子
を与える工程を備え、前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、中立的なアミノ酸残基から正に荷電したアミノ酸残基への少なくとも1つの置換を備え、前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、中立的なアミノ酸残基から負に荷電したアミノ酸残基への少なくとも1つの置換を備え、前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記2つの核酸分子を発現させ、前記ヘテロ二量体Ig様分子を培養から回収する工程をさらに備える。
好ましくは、前記方法は、前記宿主細胞に共通の軽鎖をコードする核酸分子を与える工程をさらに備えるが、それによる有利な点の概要は上述した。
−第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸分子、および
−第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸分子
を与えることを備え、前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖はアミノ酸置換T366Kを備え、前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖はアミノ酸置換L351Dを備え、前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記核酸分子を発現させ、前記ヘテロ二量体Ig様分子を培養から回収する工程をさらに備える。
−第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸分子、および
−第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸分子
を与える工程を備え、前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、アミノ酸置換T366Kを備え、前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、アミノ酸置換L351Dを備え、前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記2つの核酸分子を発現させ、前記ヘテロ二量体のIg様分子を培養から回収する工程をさらに備える。
−第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸分子、および
−第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸分子
を与えることを含み、前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖はアミノ酸置換T366Kを備え、前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖はアミノ酸置換L351DおよびL368Eを備え、前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記2つの核酸分子を発現させ、前記ヘテロ二量体Ig様分子を培養から回収する工程をさらに備える。
−第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸分子、および
−第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸分子
を与えることを備え、前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖はアミノ酸置換T366Kを備え、前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖はアミノ酸置換L351DおよびY349Eを備え、前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記2つの核酸分子を発現させ、前記ヘテロ二量体のIg様分子を培養から回収する工程をさらに備える。
−第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸分子、および
−第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸分子
を与える工程を備え、前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖はアミノ酸置換T366Kを備え、前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖はアミノ酸置換L351D、Y349EおよびL368Eを備え、前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記2つの核酸分子を発現させ、前記ヘテロ二量体のIg様分子を培養から回収する工程をさらに備える。
−第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸分子、および
−第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸分子
を与える工程を備え、前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、アミノ酸置換T366KおよびL351Kを備え、前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、アミノ酸置換L351DおよびL368Eを備え、前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記2つの核酸分子を発現させ、前記ヘテロ二量体のIg様分子を培養から回収する工程をさらに備える。
−第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸分子、および
−第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸分子
を与える工程を備え、前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、アミノ酸置換T366KおよびL351Kを備え、前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、アミノ酸置換L351D、Y349DおよびR355Dを備え、前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記2つの核酸分子を発現させ、前記ヘテロ二量体のIg様分子を培養から回収する工程をさらに備える。
−A特異性を有する第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸分子、および
−B特異性を有する第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸分子
を与える工程を備え、前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、K392D,D399KおよびK409Dの変異を備え、前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、野生型のCH3ドメインを備えるか、またはE356K,E357K,K439DおよびK370D変異を備え、前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記核酸分子を発現させ、前記少なくとも2つの異なるIg様分子を培養から回収する工程をさらに備える。
−A特異性を有する第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸分子、および
−B特異性を有する第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸分子
を与える工程を備え、前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、野生型のCH3ドメインを備えるか、K392D,D399K,K409Dの変異を備え、前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、E356K,E357K,K439D,K370D変異を備え、前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記核酸分子を発現させ、前記少なくとも2つの異なるIg様分子を培養から回収する工程をさらに備える。
CH3ドメインを備えるIg様分子のペアリングを選択的に促進するかまたは阻害し、CH3ドメインの異なる多種多様なIg様分子を得るため、ヘテロ二量体の形成を促進すると知られている多くのアミノ酸置換および、これまで報告のない、または試されていないがホモ二量体の形成を促進するように選ばれた多くの別のアミノ酸置換を、コンストラクトベクターに導入した(コンストラクトベクターMV1057;図1A)。
これらのコンストラクトへのクローニングに、既知の特異性をもち、また既知のヒトIGKV1-39軽鎖との結合能をもついくつかの抗体VH領域が用いられた。
上述のように、すべてのCH3変異体は、他の抗体ドメインと共に用いられることで、二重特異性または単一特異性の抗体全長となりうる。VH/VLの組み合わせにより定められる抗体の特異性は、CH3ドメインにより誘導される重鎖の二量化の挙動には影響しない。モデルとなるVH/VLの組み合わせ、つまり、全ての軽鎖はヒト生殖細胞系列IGKV1-39に基づき、VHは様々である組み合わせが、本研究を通じて用いられる。
再クローンされたVH変異体、さらに共通の軽鎖であるヒトIGKV1-39をコードする様々なプラスミドの、HEK293T細胞へのトランスフェクションは、IgGが発現できるような標準的な手順(de Kruif et al Biotech Bioeng. 2010)で行われる。トランスフェクションの後、上清のIgGの発現レベルはForteBIO Octet-QKシステムで測定される。該システムはバイオレイヤー干渉法(Bio-Layer Interferometry (BLI))に基づき、リアルタイムの定量化と生体分子の相互作用の動的特性評価を可能にする。詳細はwww.fortebio.com参照。5μg/mlを超える発現量が測定された場合、IgGはプロテインA親和性精製を用いて精製される。
プロテインAカラム(GE Healthcare/ cat# 11-0034-95/ 製造業者の指示に従う)を用いて培養の上清を精製した後、pH3.0の0.1Mクエン酸バッファに溶出し、直ちに同体積の、pH8.0の1.0MのTris-HCLにより中和させるか、直接的に脱塩カラムを用いてPBSに再バッファーする。別の方法では、プロテインAビーズ(セファロースビーズCL-4B,GE healthcare cat#170780-01)を用いてIgGを精製してもよい。
抗原特異的ELISAは、抗原に対する結合活性を評価するために行われる。抗原補足ELISAは、二重特異性抗体の結合活性を立証するために行われる。ビオチン化された2番目の抗原が複合体の検出に用いられる(de Kruif et al Biotech Bioeng. 2010)。
精製されたIgG混合物は標準的な手順により、還元条件下および非還元条件下でSDS−PAGE(NuPAGE(登録商標) 4-12% bis-tris gel/Invitrogen/ cat# NP0323BOX)により解析された。また、ゲルの蛋白質はコロイド状の青色試薬(PageBlue(商標)protein staining solution/Fermentas/ cat# RO571)により染色された。
IgGのグリコシル化は不均一なので、質量スペクトル分析に好適に用いられるよう、1つの生産物がはっきりとした一の質量ををもつために脱グリコシル化をが行われた。10μgのIgG1に対し一単位のN−グリコシダーゼF(PNGase F;Roche Diagnostics, Mannheim, Germany)を投与し、37℃で一晩培養した。元々の精製バッファ(0.1Mクエン酸バッファpH3.0/1.0M Tris-HCL pH 8.0)を除去するため、10kDa・MWCO遠心分離フィルターカラム(Millipore)を用いたバッファ交換が行われ、PBSに再バッファした。分離されたグリカン鎖を除去するために、同様のバッファ交換の手順が行われ、pH7.5の150mM酢酸アンモニウムに交換された。フィルターはpH7.5の150mM酢酸アンモニウム200μlで12分、11000rpm、4℃の条件で洗い流された。洗い流された後、50μlの脱グリコシル化したIgGがフィルターに投与され、pH7.5の150mM酢酸アンモニウム450μlが加えられた。その後、もう一度、12分、11000rpm、4℃の条件で遠心分離をした。毎回150mMの新しいpH7.5酢酸アンモニウムバッファーを、総体積が500μlになるよう加え、全部で5回遠心分離を繰り返した。最後の遠心分離のステップの後、バッファ交換された、おおよそ25μlの残りの脱グリコシル化されたIgG1、が回収され、エッペンドルフチューブに移され、質量スペクトル解析に用意された。
精製されたIgGの混合物の異なるIgGの種を同定し、どういった比率でこれらのIgGの種が存在するかを決定するために、質量分析法が用いられる。簡潔に述べると、1μM濃度のIgGを含むpH7.5の150mM酢酸アンモニウム2−3μlを自社製の金メッキしたボロシリケート毛細管(Sutter P-97 プラー [Sutter Instruments Co., Novato, CA, USA] および Edwards Scancoat six スパッタ装置 [Edwards Laboratories, Milpitas, CA, USA]を用いて)に投入し、高質量検出(Tahallah et al., RCM 2001)に最適化するように調整されたLCT1質量分析器(Waters Corp., Milford, MA, USA)で解析した。1300Vのキャピラリ電圧および200Vのサンプリングコーン電圧を用いた。しかし、これらの設定はより高い解像度の「信号対雑音」(signal-to-noise)比が必要な場合は調節された。衝突冷却を促進するために、ソース支持圧(source backing pressure)を約7.5mbarに上昇させた。変性状態のIgG1を測定するためには、その蛋白質を、5%ギ酸中で1μMの濃度で噴霧した。
MassLynx 4.1 ソフトウェアを用いて取得したスペクトルの処理が行われた(Waters Corp., Milford, MA, USA)。最小のスムージングが用いられ、スペクトルが中心に置かれた。一連の各電荷状態(charge state)を用いて、その種の質量が計算された。各電荷状態について、対応する強度がMassLynxにより割り当てられ、加算された。このアプローチは、試料のすべての種に対し相対的な定量化を可能にする。または、公知の、曲線下の面積(area-under-the-curve:AUC)による方法を用いてピークの定量化を行うこともできる。全ての解析は、IgGの質量とその相対量の標準偏差を算出するために3度繰り返された。
既知の特異性および既知のヒトIGKV1−39軽鎖結合能を有する、いくつかの抗体のVH領域(図3)が、野生型のコンストラクトベクターMV1057、または表1のコンストラクト4若しくはコンストラクト5に再クローンするのに用いられ、結果としてベクターI−III(表2)を得た。結果として得た、異なるCH3領域および異なるVH特異性をもつIg重鎖と、共通のヒト軽鎖をコードする核酸配列をそれぞれ含む、ベクターI,II,およびIIIが、そのあと細胞にトランスフェクションされた。該トランスフェクションは、インタクトな単一特異性抗体の形成をみるために1つだけされるか、または、2若しくは3の単一特異性抗体の混合物を得るために、他の一若しくは二のコンストラクトベクターと組み合わせてされた。表3はトランスフェクションの一覧表と結果である。
興味深いことは、トランスフェクションMおよびNにより示されるように、野生型とCH3が操作されたIg重鎖を、単一細胞に共通の軽鎖と共に共発現させると、望ましくない二重特異性抗体の存在が無く、わずか4−5%程、混入した「他の分子」が混合物に存在するだけで、二種の単一特異性抗体の混合物が得られた。「他の分子」は、インタクトなIgGの質量を有しないすべての分子として定義され、単一の重鎖および軽鎖のペアからなる半分子を含む。重要な点は、「他」区分は二重特異性生産物を含まないということである。
CH3が操作された重鎖を用いた単一の二重特異性抗体の生産は他で報告されている。ここで、この実験は、単一細胞からの2つの異なる二重特異性抗体の混合物の生産が実行可能かどうかについて調査することを目的として設計された。
既知の特異性および既知のヒトIGKV1−39軽鎖との結合能を有する抗体のVH領域(図3)を、表1のコンストラクト1−3または6−7を含むベクターに再クローンし、ベクターIV−X(表4)を結果として得た。異なるCH3領域および異なるVH特異性をもつIg重鎖と、共通のヒト軽鎖をコードする核酸配列をそれぞれ含む、ベクターIV−Xが、そのあと細胞にトランスフェクションされた。該トランスフェクションは、インタクトな単一特異性抗体の形成の妨害を示すために1つだけされるか、または、二重特異性抗体若しくは2つの二重特異性抗体の混合物を得るために、他のコンストラクトベクターと組み合わせてされた。表5はトランスフェクションの一覧表と結果である。
単一細胞から、3つのエピトープを認識する2つの二重特異性抗体の混合物の生産、または単一細胞からの2または3の単一特異性抗体の混合物の生産が技術的に実行可能なことが示された。そこで次に、我々は、様々なその他の混合物の、制御された生産の実行可能性を探索した。
この研究の目的は、単一細胞において、異なるIgG重鎖を混ぜて発現させた場合に、ヘテロ二量体のみまたはホモ二量体のみが結果として生産されるようにIgGのCH3領域を操作することである。ここで、新規の操作されたCH3ドメインは既知の操作されたCH3ドメインまたは野生型CH3ドメインとホモ二量化またはヘテロ二量化しないようにする。従って、この基準を満たす新規に操作されたCH3ドメインを同定するための最初の工程として、IgGのCH3ドメインの接触面にある多くの接触残基を1つずつあるいは群として、静電的相互作用による同一の重鎖間の反発−すなわち、ホモ二量体の形成の減少−が起こるように置換し調べた。その目的は、これらの変異が、異なるIgG重鎖を混合して発現させたときに、ホモおよび/またはヘテロ二量体の形成を誘導するのに使えるよう、荷電残基に置換したときに同一鎖同士の反発がおきるような残基のリストを得ることである。これにより、得られた全長IgGは安定になり、高い割合で生産される。
実施例13で説明したように、新しく見出した荷電ペアT366K/L351’Dは、混合物におけるヘテロ二量体の割合を増加させる(69%)とともに、少しの割合の望ましくないCCホモ二量体(7%)(L351D/L351’D)および相当な割合の半分子A(24%)を混合物に「コンタミネーションする」。本例では、in silicoのアプローチを用いて、CH3の接触面での相互作用に関わるアミノ酸残基についてさらなる知見を得、CH3領域で対向する相補的な置換を試験し、2つの重鎖のホモ二量体の効率的な形成を阻害する一方、効率的なヘテロ二量化をさらに増加させる相補的な置換を含む新規のCH3ペアを見出す。
実施例13において、T366K/L351’Dの変異電荷のペアとは別の方法によっても、混合物中の二重特異性抗体の割合について同様の結果を得られうるように設計できるとの仮説が立てられる。該別の方法は、T366R,T366D,T366E,L351E,L351K,およびL351Rの置換を含みうる。L351D/L351’DのCCホモ二量体の割合は366/351ペアの変異体を生成することにより減少しうる。全ての可能な変異のペアはHADDOCKで実行され、結果のスコアは表12に示され、図11に視覚化した。
この実施例における一連のHADDOCK解析では、T366K/L351’DまたはT366K/L351’Eのペアを起点の構造とした。これらのAおよびB鎖の二重特異性の割合の予測値をさらに高めうる追加の変異を同定するため、B鎖に変異を追加しHADDOCKスコアおよびエネルギーを算出した。CH3ドメイン構造を、分子レベルでの蛋白質構造の視覚化のためのビューアー(YASARA, www.yasara.org)を用いて検討すると、個々の残基の間の距離を算出することができる。その検討の間に、2つの残基Y349およびL368が、二量体の相互作用に正または負の寄与をしうる、隣り合う残基であることが観察された。本実施例では、これらの変異により―L351変異に追加して―ホモおよびヘテロ二量体の二量体形成への効果を検討した(図13を参照)。両方の残基はヘテロ二量体の安定性を増し(より低いHADDOCKスコア)、BB二量体を不安定にする(より高いHADDOCKスコア)。位置349および368のグルタミン酸(E)はアスパラギン酸(D)より好適と示唆された。従って、すでに位置351にアミノ酸置換を有するB鎖での第2のアミノ酸変異の導入は、ヘテロ二量化が好まれるようになると示唆された。
実施例16での解析から示唆されるように、T366K/L351’Dペアの周りに追加した変異をもついくつかのCH3変異体は、より高い二重特異性成分の割合とより低いホモ二量体成分の割合をもつ混合物を産生しうる。これらの最適な成績を収めたペアは生産のために選択され、さらなる解析が行われた。さらに、コンストラクトT366RおよびL351Eも生成された。作成されたコンストラクト、および既知の特異性と既知のヒトIGKV1−39軽鎖との結合能をもつ抗体VH領域の再クローンに用いられたコンストラクトのリストを表14に示した。
全ての二重特異性の試料に対し、ネイティブMSを実行した。得られたグラフを解析し、目的の種の相対的な比を2通りの方法(ピークの高さとピークの面積)で導出した。ピークの面積による方法が科学的にはより正しい解析方法だが、これまでの他の研究におけるすべての解析がピークの高さで行われているため、比較の面から両方の方法を解析に含めた。2つの方法における差は、測定の誤差の範囲内であったため、以降の測定についてはピークの面積の値のみを用いた。
この研究では、インタクトのIgG分画に高い割合の二重特異性ヘテロ二量体と、非常に少ない量(<5%)の親のIgGが得られた場合の一連のCH3変異のペアについて、さらにIgG分子のFc部の安定性を解析する。重鎖のヘテロ二量化を促進するために用いられた変異したCH3ドメインは、IgGのFc領域に、予期しない不安定化の効果を及ぼしうる。これにより、in vivoの半減期の減少,エフェクター機能の減少および/または免疫原性の増加のような望ましくない特性を生む結果となりうる。
以前の実験では、CH3変異を備える2つの異なる重鎖と、共通の軽鎖との共発現により、高い割合の二重特異性抗体が得られた(例17)。
温度の上昇または下降のようなストレスを与えると、蛋白質のコンフォメーションの変化(例えばアンフォールディング)および/または凝集を引き起こす。CH3が操作されたIgGの熱安定性を調べるため、組み合わせ3−6および9−12(表15)と、野生型二重特異性分子並びにコンストラクト1および2(E356K:D399K/ K392D’:K409D’の組み合わせ。「電荷反転」ペアとも呼ばれる)を用いて得られた二重特異性分子とを、PCR装置を用い、4,60,62.5,65,67.5,70および72.5℃で1時間、100μg/ml(PBSを溶媒)の濃度でインキュベートした。こののち、試料はゆっくりと冷却され、15分をかけて25℃とし、この温度で2時間保った後、4℃で翌日まで保管した。沈降された抗体は遠心分離(18000rpm;4℃,20分)により除去し、水溶性抗体の総IgG濃度を、Octetにより、プロテインAバイオセンサー(1/10PBS希釈)を用いて導出した。
CH3が操作されたIgGの、凍結融解を反復した際の安定性を調べるため、組み合わせ3−6および9−12(表15)からの二重特異性分子と、野生型二重特異性分子並びにコンストラクト1および2(E356K:D399K/ K392D’:K409D’の組み合わせ(電荷反転ペア))を用いて得た二重特異性分子とを10回の凍結融解サイクルにかけた。各サイクルにおいて、試料を完全に凍結するまで−80℃に少なくとも15分置き、その後室温で融解させた。完全に融解したら、再びこの凍結融解サイクルを繰り返した。10回の凍結融解サイクルの後、沈降された抗体は遠心分離(18000rpm;4℃,20分)により除去し、水溶性抗体の総IgG濃度を、Octetにより、プロテインAバイオセンサー(1/10PBS希釈)を用いて導出した。凍結融解安定性テストは3回繰り返された。
CH3が操作されたIgGの、37℃に保持された血清での安定性を調べるため、組み合わせ3−6および9−12(表15)からの二重特異性分子と、野生型二重特異性分子並びに電荷反転した二重特異性分子を37℃の10%ヒト血清下でインキュベートした。コントロールの試料は4℃に保たれた。1,2,または5日後、沈降された抗体を遠心分離により除去した。その後、試料はフィブリノーゲン特異的ELISAで添加され、機能的なIgGの相対量を導出した。精製されたコントロールの抗体はヒト血清に急激に投与され、参照群として用いられた。
変異IgGの安定性を評価するため、さらなる一連の分析方法が用いられた。組み合わせ3−6および9−12(表15)からの二重特異性分子,野生型の二重特異性分子(AA,AB,BB),個々の親の抗体(AAおよびBB)並びにコンストラクト1および2(E356K:D399K / K392D’:K409D’の組み合わせ(電荷反転ペア))を用いて得た二重特異性分子がこれらの安定性のアッセイに試料として用いられた。
−ナイルレッドによる蛍光顕微鏡法(表16の「ナイルレッド粒子」);ナイルレッド色素を加えた後、0.5μmより大きい粒子の量を観察するため。
−350nmでのUV分光分析(「UV350nm」);320nmより長い波長における吸収の変化は、蛋白質の集合状態に関する情報をもたらす。
−400nmでの90°光散乱(「LS400nm」);蛋白質の凝集の変化、例えばIgGの単量体と二量体の違い、を観察する感度のよい技術である。
−自家蛍光;蛋白質の芳香族残基の蛍光波長の最大値と強度は、環境によって(例えば、アンフォールディング)変化する。
−1,8-ANS蛍光分光分析;1,8-ANSはイオンペア形成を介し、静電的相互作用を通して陽イオンの群と結合する。蛋白質構造および/またはコンフォメーションの変化が検出される。
UV−Vis吸収スペクトルは、Varian社の異なるクォーツキュベット(例えば光路長1.0cmの黒色低用量Hellmaキュベットおよび0.2cm x 1.0cm透明Hellmaキュベット)を用い、25℃で、ダブルビームと2つのモノクロメータのCary 300 Bio 分光光度計で測定した。1.0cmの光路長を用いて、220から450nmの間のスペクトルをモニターした。280nm付近の吸収が蛋白質の濃度の情報を提供する。320nmから450nmの間の領域は試料の集合状態についての情報を提供する。
90°光散乱スペクトル法は、蛋白質の凝集を研究するために開発された。該方法はCapelle 2005やDemeule 2007aの記載と同様に行われた。90°光散乱スペクトルは、FluoroMax蛍光光度計(Spex, Instruments S.A., Inc. U.K.)を用い、積算時間(integration time)を0.01秒として400nmから750nmの同期スキャン(λem=λex)を実行して25℃でモニターされる。最適な条件を得るため、異なるスリットの設定が試された。最適化した後は、そのスリット設定を用いてすべての測定を行った。
トリプトファン,チロシン,およびフェニルアラニン残基の蛍光放射は、これらのフルオロフォアの局所環境に関する状況を与えてくれる。親水性および/または剛直性の、変化または違いが測定される。一般的には、より疎水性と剛直性の高い環境は、蛍光強度の増加と、放射最大となる値の青方偏移へと導く。自家蛍光分光分析により、蛋白質のその時の状態の情報が提供され、物理的および化学的特性の変化がモニターされる。チロシンおよびトリプトファンのより詳細な情報は、Lakowiczの本(Lakowicz, 2006)に記載されている。
ナイルレッド染色法は、蛋白質の凝集を視覚化するために開発された。該染色法は、Demeule et al., 2007bに記載されたように行われた。
8‐アニリノ‐1‐ナフタレンスルホン酸(1-anilinonaphthalene-8-sulfonic acid: 1,8-ANS)は荷電していない疎水性の蛍光小分子(分子量299.34Da)であり、膜表面と蛋白質の両方を研究するために用いられる。
偏った比でトランスフェクションした場合の混合物中のCH3変異したIgGの挙動についての知識を深めるため、特にT366K:L351K/L351D’:L368E’ の組み合わせ(以下では KK/DE または DEKKと呼ぶ)について、より詳細に比率に関する実験を行った。
DEKK組み合わせの変異は、高い純度の二重特異性IgG分子(「AB」)の形成を誘導することが示された。次に我々は、1つの細胞から、「ABとAA」または「ABとAC」混合物のような、より複雑な抗体混合物の制御された生産の実行可能性を模索した。これまでに用いられたFabの型が、「DEコンストラクト」または「KKコンストラクト」のいずれかを含むベクターに組み込まれた。そして、技術の多用性を示すため、これらのベクターの様々な組み合わせが共発現され混合物が生成された。Fabの型MF1337(破傷風毒素),MF1122(フィブリノーゲン)およびMF1025(チログロブリン)が、これらの全体的に安定な挙動、良好な発現量およびこれらのFabを含むIgGの間の質量の差から、選択された(表19参照)。
実施例12では、トランスフェクションZAまたはZBからの混合物は、大量生産に移ったときに問題になるのではないかという予測の仮説があった。その理由は、ノブ・イントゥ・ホール変異体は不安定と報告され、「ノブ」または「ホール」を備えるCH3ドメインが電荷を操作されたCH3ドメインと二量化することは除外できないからである。上述の例で示されたように、選択的にヘテロ二量化を誘導し、ホモ二量体の形成は実質的に無い新規の電荷ペアの変異体が見出された。これらの新規の電荷ペアの変異体を備えるCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、これまでに知られている電荷を操作されたCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖あるいはSEED bodiesと共に細胞に発現され、2つの二重特異性分子のみを選択的に形成する結果となりうる。
CH3領域にDEKK変異の組み合わせを保持する二重特異性抗体の、薬物動態(pK)の挙動を研究するため、この研究では、3つの異なるIgGバッチのpKパラメタを測定し比較した。3つのバッチに含まれるのは以下である;1)野生型抗破傷風毒素の親の抗体1337:1337(野生型Fc主鎖に2つのMF1337Fab)、2)野生型抗破傷風毒素の親の抗体1516:1516(野生型Fc主鎖に2つのMF1516Fab)、3)Fc領域にDEKK組み合わせ変異を保持するCH3操作された二重特異性抗破傷風毒素抗体1516:1337(DE側にMF1516Fab、KK側にMF1337Fab)。
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Claims (48)
- 単一宿主細胞からヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法であって、
前記IgG様分子は、接触面を形成することができる2つのCH3ドメインを備え、
前記方法は、前記細胞に、
a.第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸、
b.第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸
を与えることを含み、
前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の366番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基またはアスパラギン酸(D)残基、および、アミノ酸の351番目の位置にあるロイシン(L)残基を備え、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の351番目の位置にあるアルギニン(R)残基またはリシン(K)残基、および、アミノ酸の366番目の位置にあるスレオニン(T)残基を備え、
前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記2つの核酸を発現させ、前記ヘテロ二量体のIgG様分子を培養物から回収する工程をさらに備える、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 単一宿主細胞からヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法であって、
前記IgG様分子は、接触面を形成することができる2つのCH3ドメインを備え、
前記方法は、前記細胞に、
a.第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸、
b.第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸
を与えることを含み、
前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の366番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基またはアスパラギン酸(D)残基を備え、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の351番目の位置にあるアルギニン(R)残基を備え、
前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記2つの核酸を発現させ、前記ヘテロ二量体のIgG様分子を培養物から回収する工程をさらに備える、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 単一宿主細胞からヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法であって、
前記IgG様分子は、接触面を形成することができる2つのCH3ドメインを備え、
前記方法は、前記細胞に、
a.第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第1の核酸、
b.第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする第2の核酸
を与えることを含み、
前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の366番目の位置にあるリシン(K)残基、および、アミノ酸の351番目の位置にあるロイシン(L)残基を備え、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の351番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基、および、アミノ酸の366番目の位置にあるスレオニン(T)残基を備え、
前記方法は、前記宿主細胞を培養し、前記2つの核酸を発現させ、前記ヘテロ二量体のIgG様分子を培養物から回収する工程をさらに備える、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項1から3までのいずれか一項に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記宿主細胞に、共通の軽鎖をコードする核酸を与えることをさらに含む、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項1、2、および4のいずれか一項に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の368番目の位置にあるリシン(K)残基をさらに備える、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項3または4に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の349番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基をさらに備える、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項1から6までのいずれか一項に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
それぞれのコードされた前記CH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、エピトープを認識する可変領域をさらに備える、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項7に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記コードされたCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖の、それぞれの2つの前記可変領域は異なるエピトープを認識する、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項8に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記異なるエピトープは同一の標的に位置する、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項9に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記標的は水溶性である、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項9に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記標的は膜結合性である、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項8に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記異なるエピトープは異なる標的に位置する、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項12に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記異なる標的は同一の細胞に発現する、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項12に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記異なる標的は異なる細胞に発現する、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項12に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記異なる標的は水溶性である、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項12に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
1つの標的は水溶性であり、2番目の標的は膜結合性である、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項7から9、11から14、または16のいずれか一項に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記エピトープの少なくとも1つは腫瘍細胞に位置する、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項7から9、11から14、または16のいずれか一項に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記エピトープの少なくとも1つはエフェクター細胞に位置する、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項18に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記エフェクター細胞は、NK細胞,T細胞,B細胞,単球,マクロファージ,樹状細胞,または好中性顆粒球である、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項18または19に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記エピトープは、CD3,CD16,CD25,CD28,CD64,CD89,NKG2DまたはNKp46分子に位置する、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項1から20までのいずれか一項に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記ヘテロ二量体のIgG様分子は、抗体、好ましくはヒトIgG、最も好ましくはヒトIgG1である、ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項4から21までのいずれか一項に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法において、
前記共通の軽鎖は生殖細胞系列由来の軽鎖であり、好ましくは再編成された生殖細胞系列ヒトκ軽鎖IgVκ1−39*01/IGJκ1*01であるヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法。 - 請求項1から22までのいずれか一項に記載のヘテロ二量体のIgG様分子を生産する方法により得られるヘテロ二量体のIgG様分子。
- 請求項23に記載のヘテロ二量体のIgG様分子において、
前記ヘテロ二量体のIgG様分子は、同一の抗原にある異なるエピトープおよび/または異なる抗原にある異なるエピトープに結合する、ヘテロ二量体のIgG様分子。 - 請求項23または24に記載のヘテロ二量体のIgG様分子において、
前記IgG様分子は抗体である、ヘテロ二量体のIgG様分子。 - 2つのIgGのCH3ドメインを備えるヘテロ二量体の抗体であって、
前記2つのCH3ドメインの1つは、
EUの番号方式に従って、アミノ酸の366番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基またはアスパラギン酸(D)残基、および、アミノ酸の351番目の位置にあるロイシン(L)残基を備え、
前記2つのCH3ドメインの他の1つは、
EUの番号方式に従って、アミノ酸の351番目の位置にあるアルギニン(R)残基またはリシン(K)残基、および、アミノ酸の366番目の位置にあるスレオニン残基(T)を備える、ヘテロ二量体の抗体。 - 2つのIgGのCH3ドメインを備えるヘテロ二量体の抗体であって、
前記2つのCH3ドメインの1つは、
EUの番号方式に従って、アミノ酸の366番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基またはアスパラギン酸(D)残基を備え、
前記2つのCH3ドメインの他の1つは、
EUの番号方式に従って、アミノ酸の351番目の位置にあるアルギニン(R)残基を備える、ヘテロ二量体の抗体。 - 2つのIgGのCH3ドメインを備えるヘテロ二量体の抗体であって、
前記2つのCH3ドメインの1つは、EUの番号方式に従って、アミノ酸の366番目の位置にあるリシン(K)残基、および、アミノ酸の351番目の位置にあるロイシン残基(L)を備え、
前記2つのCH3ドメインの他の1つは、EUの番号方式に従って、アミノ酸の351番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基、および、アミノ酸の366番目の位置にあるスレオニン(T)残基を備える、ヘテロ二量体の抗体。 - 請求項26または27に記載のヘテロ二量体の抗体であって、
前記2つのCH3ドメインの他の1つは、EUの番号方式に従って、アミノ酸の368番目の位置にあるリシン(K)残基をさらに備えるヘテロ二量体の抗体。 - 請求項28に記載のヘテロ二量体の抗体であって、
前記2つのCH3ドメインの他の1つは、EUの番号方式に従って、アミノ酸の349番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基をさらに備えるヘテロ二量体の抗体。 - 少なくとも第1および第2のIgGのCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする1以上の核酸を備える組み換え宿主細胞であって、
前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の366番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基またはアスパラギン酸(D)残基、および、アミノ酸の351番目の位置にあるロイシン(L)残基を備え、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の351番目の位置にあるアルギニン(R)残基またはリシン(K)残基、および、アミノ酸の366番目の位置にあるスレオニン(T)残基を備える、組み換え宿主細胞。 - 少なくとも第1および第2のIgGのCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする1以上の核酸を備える組み換え宿主細胞であって、
前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の366番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基またはアスパラギン酸(D)残基を備え、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の351番目の位置にあるアルギニン(R)残基を備える、組み換え宿主細胞。 - 少なくとも第1および第2のIgGのCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする1以上の核酸を備える組み換え宿主細胞であって、
前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の366番目の位置にあるリシン(K)残基、および、アミノ酸の351番目の位置にあるロイシン(L)残基を備え、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の351番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基、および、アミノ酸の366番目の位置にあるスレオニン(T)残基を備える、組み換え宿主細胞。 - 請求項31または32に記載の組み換え宿主細胞において、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の368番目の位置にあるリシン(K)残基をさらに備える、組み換え宿主細胞。 - 請求項33に記載の組み換え宿主細胞において、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の349番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基をさらに備える、組み換え宿主細胞。 - 請求項31から35までのいずれか一項に記載の組み換え宿主細胞において、
前記宿主細胞は、共通の軽鎖をコードする核酸をさらに備える、組み換え宿主細胞。 - 請求項23から25までのいずれか一項に記載のヘテロ二量体のIgG様分子または請求項26から30までのいずれか一項に記載のヘテロ二量体の抗体と、薬学的に容認可能な担体とを備える医薬組成物。
- 請求項37に記載の医薬組成物において、
前記ヘテロ二量体のIgG様分子または前記ヘテロ二量体の抗体は請求項31から36までのいずれか一項に記載の組み換え宿主細胞で生産された、医薬組成物。 - ヘテロ二量体IgG様分子を生産するための宿主細胞を作成する方法であって、
前記方法は、
前記宿主細胞に、少なくとも第1および第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする1以上の核酸を導入する工程を備え、
前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の366番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基またはアスパラギン酸(D)残基、および、アミノ酸の351番目の位置にロイシン(L)残基を備え、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の351番目の位置にあるアルギニン(R)残基またはリシン(K)残基、および、
アミノ酸の366番目の位置にあるスレオニン(T)残基を備える、宿主細胞を作成する方法。 - ヘテロ二量体IgG様分子を生産するための宿主細胞を作成する方法であって、
前記方法は、
前記宿主細胞に、少なくとも第1および第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする1以上の核酸を導入する工程を備え、
前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の366番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基またはアスパラギン酸(D)残基を備え、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の351番目の位置にあるアルギニン(R)残基を備える、宿主細胞を作成する方法。 - ヘテロ二量体IgG様分子を生産するための宿主細胞を作成する方法であって、
前記方法は、
前記宿主細胞に、少なくとも第1および第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖をコードする1以上の核酸を導入する工程を備え、
前記第1のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の366番目の位置にあるリシン(K)残基、および、アミノ酸の351番目の位置にあるロイシン(L)残基を備え、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の351番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基、および、アミノ酸の366番目の位置にあるスレオニン(T)残基を備える、宿主細胞を作成する方法。 - 請求項39または40に記載の宿主細胞を作成する方法において、
前記第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の368番目の位置にあるリシン(K)残基をさらに備える、宿主細胞を作成する方法。 - 請求項41に記載の宿主細胞を作成する方法において、
前記第第2のCH3ドメインを備えるポリペプチド鎖は、EUの番号方式に従って、アミノ酸の349番目の位置にあるグルタミン酸(E)残基をさらに備える、宿主細胞を作成する方法。 - 請求項39から43までのいずれか一項に記載の宿主細胞を作成する方法において、
前記宿主細胞に共通の軽鎖をコードする核酸を導入する工程をさらに備える、宿主細胞を作成する方法。 - ヘテロ二量体のIgG様分子を生産する、請求項31から36までのいずれか一項に記載の組み換え宿主細胞の、または請求項39から44までのいずれか一項に記載の宿主細胞を作成する方法により得られる組み換え宿主細胞の、培養物。
- 請求項37または38に記載の医薬組成物であって、前記IgG様分子は抗体である、医薬組成物。
- 請求項39から44までのいずれか一項に記載の宿主細胞を作成する方法であって、
前記IgG様分子は抗体である、宿主細胞を作成する方法。 - 請求項45に記載の培養物であって、前記IgG様分子は抗体である、培養物。
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