JP6737744B2 - サンプル収集のためのデバイス、溶液及び方法 - Google Patents

Description

関連出願
本出願は、２０１１年６月１９日に出願された米国特許仮出願第６１／４９８，５８４号、２０１２年２月１４日に出願された米国特許仮出願第６１／５９８，６０１号、及び２０１２年２月１４日に出願された米国特許仮出願第６１／５９８，６１８号に対し、３５ ＵＳＣ §１１９（ｅ）における優先権を主張する。それぞれの開示は、参照によりその全内容が本明細書に組み込まれる。

開示の技術分野
本開示は、体液、或いは有害及び／または毒性物質を含む他の物質、そして特に天然で発現した体液（例えば唾液、尿）のサンプルを収集するためのデバイス、溶液及び方法に関する。さらに本開示は、一般に機能的ゲノム、そして任意の：機能的ゲノム及びエピジェネティック研究、並びに（例えば）バイオマーカー発見における研究のためのかかる体液からの細胞の単離及び保存に関する。

オーダーメイド医療（Ｐｅｒｓｏｎａｌｉｚｅｄ ｍｅｄｉｃｉｎｅ）とは、全てのモデルのための１つの治療とは対照的に、個人に対する特注治療である。オーダーメイド医療は、彼または彼女の健康状態に基づき患者を分類し、そしてその分類にのみ最適な健康管理解決法を設計することを伴う。オーダーメイド医療の発展は、バイオマーカーの発見、検証、及び商業化により決まり、治療のため、並びにスクリーニング及びより早期の検出のための診断の開発のために個体群を階層化する。

エピジェネティック調査は、医療調査の最前線にならなければならず、且つ癌、肥満、糖尿病、統合失調症、及びアルツハイマー病を含む多くの身体的及び精神的疾患の病因に関わる（Ａｌｉｋａ等、２０１０；Ｇｒａｎｔ等、２０１０；ＭｃＧｏｗｅｎ等、２００９；ＭｃＧｏｗｅｎ及びＳｚｙｆ、２０１０；Ｐｌａｚａｓ-Ｍａｙｏｒｃａ及びＶｒａｎａ、２０１１；並びにＰｏｒｔｅｌａ及びＥｓｔｅｌｌｅｒ、２０１０）。さらにエピジェネティックは、これらに限定されないが、癌、糖尿病、薬物統合（drug integrations）、薬物有効性、子どもの攻撃性、自殺行動、加齢、炎症、疼痛、肥満、統合失調症、及び他の精神疾患を含む多くの科学及び医療分野において特定の裏付けを抱え得る（Ａｂｄｏｌｍａｌｅｋｙ等、２００５；Ｃｏｓｔａ等、２００３；Ｉｗａｍｏｔｏ＆Ｋａｔｏ、２００９；Ｋｕｒａｔｏｍｉ等、２００７；ＭｃＧｏｗａｎ＆Ｋａｔｏ、２００７；ＭｃＧｏｗｅｎ及びＳｚｙｆ、２０１０；Ｐｅｅｄｉｃａｙｉｌ、２００７；Ｐｅｔｒｏｎｉｓ等、１９９９；ＭｃＧｏｗｅｎ及びＳｚｙｆ、２０１０；Ｐｌａｚａｓ-Ｍａｙｏｒｃａ及びＶｒａｎａ、２０１１；並びにＺａｗｉａ等、２００９）。

本分野における主な挑戦は、全ゲノム解析研究を含む大規模エピジェネティック調査に十分である、在宅でのサンプル収集のための適切な原料物質の同定を含む。エピジェネティックは、エピジェネティック機構が環境経験の分子記憶を提供し得ることを示唆する証拠が増えるにつれて、遺伝子−環境の相互作用機構を理解するための鍵となり得る（Ｈｏ、２０１０；Ｋａｐｐｅｌｅｒ及びＭｅａｎｅｙ、２０１０；ＭｃＧｏｗｅｎ等、２００９、ＭｃＧｏｗｅｎ及びＳｚｙｆ、２０１０；Ｐｏｒｔｅｌａ及びＥｓｔｅｌｌｅｒ、２０１０；Ｒｉｃｈａｒｄｓ、２００８；Ｒｕｓｓｏ等、２０１０；Ｔｓａｉ等、２０１０；並びにＶｌａａｎｄｅｒｅｎ等、２０１０）。いくつかのヒトからの予備データは、末梢血液細胞中の明確なメチル化パターンが、子どもの攻撃性、自殺行動、及び加齢を含む社会的行動に関連することを示唆する（Ｋａｐｐｅｌｅｒ及びＭｅａｎｅｙ、２０１０;ＭｃＧｏｗｅｎ等、２００９；ＭｃＧｏｗｅｎ及びＳｚｙｆ、２０１０；Ｐｏｒｔｅｌａ及びＥｓｔｅｌｌｅｒ、２０１０；Ｒｕｓｓｏ等、２０１０、Ｔｉｅｒｌｉｎｇ等、２０１０；Ｔｓａｉ等、２０１０；並びにＺｈａｎｇ等、２０１１）。

少なくともある程度ヒト疾病、特に精神疾患の異質な性質、及び寄与する病因因子の複雑な相互作用のせいで、研究は、信頼でき、且つ意義ある効果を提供するために、大きなサンプルサイズを要求する。しかしながらエピジェネティック研究用のサンプル収集のための現行の調査オプションは、「大きなサンプルサイズ」の本要求に合致しない。研究のための大きなサンプルサイズの必要性は、ヒト−環境相互作用の研究に関し、これらの相互作用が多くの寄与因子による非常に複雑な性質でもあるので、有意な効果を生み出すためにも当てはまる。大規模「個体群サイズ」（少なくとも数百〜数千の対象サンプル番号）エピジェネティック調査の実行能は、ヒト−環境相互作用の新たな理解を導入し、そして現代の医療の進歩に不可欠なエピジェネティックに基づくスクリーニング診断の発展を促進する長期的な研究の完成を促進し得る。このエピジェネティック調査は、どのように環境が我々のエピゲノムに影響を及ぼすか、及びどのようにこれが人間の健康転帰に関連するかという新たな理解を導き得るし、それは高リスクであると見なされる個人への予防的介入、及びこれに限定されないが、診断を含むこれらの健康格差についての診断の発展をさらに導き得る。

ヒト個体群における環境及び他の複雑な相互作用を数値化することを試みるいくつかのエピジェネティック研究は、実験用の原料物質として血液を使用する。血液は：
１．一般に医療管理を要求し、
２．収集に侵襲的な手順を伴い、
３．参加を制限する兆候を持ち、そして
４．収集及び船積みが高価であるので、大きな個体群サイズの研究を行う研究者の能力を制限し得る：

天然で発現した体液（naturally expressed fluid）、例えば唾液及び尿は：
１．侵襲的な技術を要求せず、
２．血液と同一の兆候を有さず、
３．専門的な管理を要求せず、そして
４．安価に収集できるので、在宅でのサンプル収集に適した付加的な、または代替的な原料物質であり得る。

さらに少なくとも唾液は、白血球を含むことが示されている（Ｄｏｓ−Ｓａｎｔｏｓ等、２００９）。体液、例えば唾液、尿の使用は、大規模「個体群サイズ」のエピジェネティック調査を可能にし得る。さらに唾液、または尿の在宅でのサンプル収集は、世界中からの対象により参加数をかなり増加させることができ、且つサンプルをより簡単に船積みできることから、より広範囲な利用可能な調査オプションを可能にし得る。例えばより簡単に世界中からのサンプルを船積みできることは、サンプルが研究室インフラを有しない国からのものである場合に特に有用であり得る。

有機体のゲノムは、その遺伝的な情報を含む固定配列であり、且つ有機体の全ての細胞において同一である。それに反して有機体のエピゲノムは、細胞タイプ間で変わり、且つ有機体の生存期間を変化させる。したがってエピジェネティック研究は、これらの差異を制御するサンプル材料の起源として、単一の細胞タイプを含み得る（Ｊｏｈｎｓｏｎ及びＴｒｉｃｋｅｒ、２０１０；Ｌｉｓｔｅｒ等、２００９；並びにＲａｎｇｗａｌａ等、２００６）。例えばヒトの唾液は、上皮細胞、血液中で正常に見出される細胞（すなわちＴ細胞及びＢ細胞）、細菌及び破片を含む多数の細胞タイプを含む（Ｄｏｓ−Ｓａｎｔｏｓ等、２００９、並びにＶｉｅｔ及びＳｃｈｍｉｄｔ、２００８）。エピジェネティック的にプロファイルすることが最重要となる唾液中の細胞は、これらの細胞が全身からエピジェネティック情報を運ぶように、血流から由来するものである（Ｋａｐｐｅｌｅｒ及びＭｅａｎｅｙ、２０１０;ＭｃＧｏｗｅｎ及びＳｚｙｆ、２０１０；ＭｃＧｏｗｅｎ及びＳｚｙｆ、２０１０；Ｒｉｇｈｉｎｉ等、２００７；Ｒｏｓａｓ等、２０１１、Ｖｌａａｎｄｅｒｅｎ等、２０１０、並びにＺｈａｎｇ等、２０１１）。

さらに唾液中の大部分の細胞を作り出す、上皮細胞等の血液中において見出されない唾液中の細胞（Ｄｏｓ−Ｓａｎｔｏｓ等、２００９）が、少数の細胞の効果を削ぐことにより、Ｔ細胞（血液中で生じる細胞）において見られるエピジェネティック効果を「隠す」能力を有する（Ｄｏｓ Ｓａｎｔｏｓ等、２００９、Ｌｉｓｔｅｒ等、２００９;及びＴｉｅｒｌｉｎｇ等、２０１０）ので、全唾液ＤＮＡを使用することは、実用に成り得ない。これらを追跡することは、細胞特異的マーカー及び単離技術（例えば磁気的なもの）をうまく利用することにより唾液等の体液中で見出される多様な細胞タイプを分離及び抽出する、ＡｂｏＧｅｎが開発した方法に関連する。本方法は、大規模機能的ゲノム研究（例えばエピゲノム研究）を含む下流の生物学的適用に使用され得る富んだ細胞を産するために、実用的な量の唾液等の体液を使用する。例えば唾液サンプル処理技術は、収集サンプルを単一の細胞タイプに処理することを可能にし、そしてそれらのエピゲノムがプロファイルされる。

さらに唾液（及び他の体液）は、以下のような理由のために、下流の実験に関する血液細胞のための原料物質として、細胞単離の挑戦を提示し得る。
１．血液は輸送流体であるが、唾液はプロテアーゼ、酵素、及び分泌物質に富み得る消化液であり、そして尿は不要な老廃物から成る排泄液である。
２．いくつかの流体は、広いｐＨ範囲を有することができ、また報告されている唾液等のいくつかのｐＨ値は、血液がそのｐＨに達したら死に至るだろう（唾液は６．２〜７．４であり；尿は４．５〜８であり；血液は７．３５〜７．４５である）。
３．いくつかの流体は、血液よりも細菌を多く含む。
４．いくつかの流体は、個体間で変化し、且つ細胞単離を妨げる非細胞性材料を含む。
５．いくつかの流体は、血液中で豊富であり得るが、血液中とは異なり唾液または尿等の他の天然で発現した体液中ではまれにしか存在し得ず、且つ上皮細胞等の他の細胞タイプよりもはるかに少ないＴ細胞等の血液細胞を含む。
６．唾液等のいくつかの体液中のリンパ球細胞のサブセットは、血液中のそれらの細胞タイプの個体群とは大きく異なる。例えばＣＤ４＋ＣＤ８-Ｔ細胞だけが唾液中で見出されると報告されている。
７．唾液等のいくつかの流体は、約０．５〜１．５リットル／日／人の比率で毎日生産される。

したがって希少な細胞（すなわちＴ細胞）を、唾液及び他の天然で発現した体液から単離するための新規の方法が必要とされている。

広く地理的に分散した人々の大きな個体群から唾液サンプルを収集するためには（例えば、機能的ゲノム研究）、最適なサンプル収集デバイスに合致するべきいくつかの要件が必要とされ得る。例えば閉じたチャンバー中の毒性保存溶液を安全に在宅でサンプル収集するデバイスを有することは、有益であり得る。さらにサンプル収集デバイスは、安全に封入された毒性溶液と共にドナーに送られることを可能にし得る。さらにサンプル収集デバイスは、ドナーの毒性溶液への曝露のリスクを伴わずにヒト唾液または尿等のドナー試料の容易且つ安全な収集を可能にし得る。さらにサンプル収集デバイスは、ドナーの毒性溶液または任意の他の危険への曝露のリスクを伴わずに、（試料の保存のために）ドナーが毒性溶液及び試料を安全に混合できるようにし得る。さらにサンプル収集デバイスは、一般にサンプル収集デバイスをしっかりと閉じた後に「現状のままで」処理するために、ドナーが研究室にサンプル収集デバイスを送ることができるようにし得る。最終的にサンプル収集デバイスは、研究室技術者が、サンプル収集デバイスを受け取り、且つ一般に任意の危険への曝露のリスクを伴わずに処理するために安全にそれを開くことができるようにし得る。

いくつかの現在利用可能なサンプル収集デバイスは、例えばドナーサンプルを保持している空洞と溶液の間での流体連絡を可能にするためにバリアを解くことを利用するデバイスを発表する、米国特許第７，４８２，１１６号を含むが、当該特許において含められる態様は、鋭い押し出し物、及び薄い突き抜け可能な膜の使用に限定される。薄い突き抜け可能な膜は、任意の誤った操作（指爪による等）が膜の貫通及び溶液の放出を導き得るような、サンプルドナーへの安全上の問題を示し得る。米国特許公開第２００９／０２１６２１３ Ａｌ号は、突き抜け可能な膜を利用し、溶液を含む空洞とドナーサンプルの間での流体連絡を確立するデバイスの特許を請求する。これは、任意の誤った操作が膜を貫き、そして溶液の曝露を導き得るような、サンプルドナーへの安全上の問題を示し得る。さらにデバイスは、サンプルを最終利用者に送る前に、蓋の交換を要求する。これは、サンプルドナーを潜在的に毒性のある溶液に曝露し得るような、安全上の問題を示し得る。したがってサンプル収集デバイスを使用するにあたり、より安全で、且つより容易であることが必要とされる。

さらに精製工程は、細胞がそれらの抗原プロファイルを維持することを要求し、そしてエピゲノムプロファイリングは、それらのエピゲノムを維持することを要求する。この目的を達成するために、一般にこれらの特徴を維持することができるような方法において細胞を取り扱うことが必要とされる。現在利用可能な処置は、一般にこの必要性に合致していない。例えば米国特許第７，２６７，９８０号及び第７，７４９，７５７号は、血液由来の細胞を安定させるためのリシン、グリシン及びホルムアルデヒドを含む溶液を開示する。しかしながらこれらの溶液は、唾液等のいくつかの体液中に見出されるプロテアーゼから細胞を保護しないだろう。

したがって、唾液等の他の体液中の細胞の抗原性及びエピゲノムを保存するであろう新規の溶液及び方法が必要とされる。

本開示の態様は、（例えば）天然で発現した体液のためのサンプル収集デバイスのより安全な使用、及び使用のし易さ、並びに収集したサンプルの細胞を保存するための溶液及び方法、そしてさらに収集した及び／または保存した特異的な細胞を単離するための方法を提供する。かかる単離細胞は（及び非単離の収集された細胞でさえ）、その後に機能的ゲノム及びエピジェネティック研究、並びに（例えば）バイオマーカーの発見のいずれかにおいて、研究のために分析され得る。

本開示にかかるサンプル収集デバイスは、現在利用可能なサンプル収集デバイスを凌ぐいくつかの利点を提供する。例えばいくつかの態様では、サンプル収集デバイスは、最小量の部品を使用し、且つその一片または物体の除去または交換を必要としない。いくつかの態様では、サンプル収集デバイスは、サンプル収集デバイスにおいてサンプルを提供すること、及びサンプル収集デバイスを閉じることとは別に、サンプルドナーによる任意の追加の操作を要求しない。いくつかの態様では、例えば鋭い物体は含められず、且つ毒性のある溶液（例えばサンプル保存溶液）に曝されるリスクがないことが限定されていることから、サンプル収集デバイスの使用は、サンプルドナー及び最終利用者の両者にとって改良された安全性を提供する。

サンプル収集デバイスのいくつかの態様では、サンプル収集デバイスは、２つの主要なはめ合わせ体(mating body)、蓋（cap）及び管（tube）を有し得る。蓋は、管と結合し、閉じたサンプル収集デバイスを構成し得る、保存溶液を保持している閉じた空洞を含み得る。管は、ドナー試料を受け取るように設定され得る。蓋及び管は、ドナーが試料を提供し、そして蓋で管を閉じる時に保存溶液を保持している空洞が開き、保存溶液を放出し、それがドナー試料と混合し得るように設定される。

いくつかの態様では、天然で発現した体液を収集するための体液サンプル収集デバイスが提供され、それは、かみ合わせ部材（engagement member）を有する外壁、及び流体を保持するための内部チャンバー、を有する蓋を含む。チャンバーは、開口部が取り外し可能な遮断部材（blocking member）により密閉されるように設定される場合に、内部空間及び開口部を定義する内壁を含んで成り得る。遮断部材は、管中で対応する第二の連結部材（coupling member）をかみ合わせるための第一の連結部材を含み得るので、蓋が管と連結する時に遮断部材の除去及び開口部の開口をもたらす。デバイスはさらに、体液サンプル収集のための容器を定義付ける封じ込め壁（containment wall）、蓋のかみ合わせ部材に相補的なかみ合わせ部材、及び第二の連結部材、を含む管も含める。

いくつかの態様では、１つ及び／またはもう１つの以下の特徴が、サンプル収集デバイスに提供され得る：
−取り外し可能な遮断部材は、開口部を筋に沿って（threadably）かみ合わせる円盤型の部材であり；
−第一の連結部材は、遮断部材の底の中心に配置された刻み目（indentation）を含んで成り、且つ第二の連結部材は、管内部の中心に配置され；
−第一の連結部材は、遮断部材の底に偏心して（eccentrically）配置された凹部（recess）を含んで成り、且つ第二の連結部材は、管内部に偏心して配置され；
−取り外し可能な遮断部材は、環状遮断部材が実質的に開口部を覆う場合に、その上に配列された筋（thread）を有する環状部材を含んで成り、且つ蓋の内壁は、環状部材が内部空間中にねじ留めされ、開口部を覆わないようにし得るように、相補的な筋を含み；
−管に蓋をロックする（または任意の２つの部品を一緒にロックする）ためのロック機構、それは、くさび及び相補的なフランジを含んで成ってよく；
−密閉物質を含んで成り得る密閉機構は、蓋のかみ合わせ部材と関連し、管に蓋を連結させる場合、密閉物質は、少なくとも蓋のかみ合わせ部材中に流れ；
−蓋が開いたか否かを判断するための不正開封明示手段（tamper-evident means）、それは、蓋の開口端と一体になってその第一の部分を有する環を含んで成ってよく、管に蓋を連結させる場合、環は、管に隣接して位置し；したがって、いくつかの態様では、蓋が管から脱連結した際に、第一の部分は壊れ、そして環は実質的に管に隣接したままであり；及び／または
−蓋チャンバー中の流体は、細胞を保存するための溶液を含んで成る。

いくつかの態様では、天然で発現した体液を収集するための体液サンプル収集デバイスが提供され、且つ流体、及び第一のかみ合わせ部材を保持するための内部チャンバーを有する蓋、並びに、サンプル収集のための容器を定義する封じ込め壁、及び第一のかみ合わせ部材にかみ合わすための第二のかみ合わせ部材、を含んで成る管を含む。いくつかのかかる態様では、蓋は、第一のかみ合わせ部材を有する外壁を含んで成り、チャンバーは、流体を保持する内部空間及び開口部を定義する内壁を含んで成り、開口部は、取り外し可能な遮断部材により密閉するために設定されている。さらにいくつかの態様では、遮断部材は、対応する管の第二の連結部材をかみ合わせるための第一の連結部材を含み、管へ蓋が連結する際に、遮断部材は移動し、そして開口部が開く。

いくつかの態様では、天然で発現した体液（または毒性のある、もしくは危険な流体）のサンプルを収集するための方法が提供され、且つ体液中に含まれる細胞が分析のために保存されるように、遮断部材が移動し、そして保存液が体液を含む容器中に流れる場合に、任意の開示されたサンプル収集デバイス態様にかかる体液収集サンプルデバイスを提供すること、チャンバー中に体液を置くこと、及び対応するかみ合わせ部材がかみ合わされるように、蓋と管を一緒にはめ合わせることを含む。いくつかのかかる態様では、少なくとも１つの（体液に関連した）さらなるステップ：体液中の複数の細胞タイプについて、１つ以上の細胞タイプを単離すること、及び収集した細胞を分析すること、を含み得る。

当業者が理解するように、いくつかの態様では、少なくとも１つのＤＮＡ、ＲＮＡ及びタンパク質が、細胞が単離されているか否かに関わらず、収集／保存された細胞から抽出され得る。

いくつかの態様では、天然で発現した体液（または毒性のある、及び／もしくは危険な流体）を収集するためのキットが提供され、且つ本開示サンプル収集デバイスにかかる複数のサンプル収集デバイスを含んで成る。

さらに、本開示は、エピジェネティック研究を含む機能的ゲノム研究に関する。より詳細には、本開示は、さらにこれらの研究のための唾液及び尿等の体液からの細胞の単離に関する。したがって、本開示のいくつかの態様は、細胞の抗原性及びエピゲノムを保存するための方法を含み、且つ制限なく唾液及び尿等の体液からＴ細胞を含む稀な細胞を単離することが本明細書において開示される。

本明細書において、「体液（bodily fluid）」の収集は、（いくつかの態様では、静脈内収集方法−例えば血液の収集のために使用され得るが）一般に、天然で発現した体液の収集のことである。したがって本開示態様に関して、「体液」は、例えば唾液及び尿を含む天然に発現した体液のことである。

例えばいくつかの態様では、唾液及び尿等の体液中の細胞を保存するための溶液は、唾液中の細胞が貯蔵の間にそれらの抗原性及び細胞構造を保持させることを可能とする、細胞タイプへのさらなる分離、及び下流分析のために提供される。溶液は、これに限定されないが、パラホルムアルデヒド等の少なくとも１つの化学的固定剤、及び少なくとも１つのプロテアーゼ阻害剤を含み得る。いくつかの態様では、溶液は、例えば１つ以上の：少なくとも１つの抗微生物剤、ヒト及び／または他の動物種由来の血清タンパク質をさらに含み得る。溶液は、約６．４〜約８．４、及びいくつかの態様では約７．２〜約７．６のｐＨで緩衝され得る。

いくつかの態様では、１つ以上の体液中で細胞を保存するための方法は、収集した細胞を、細胞が例えばそれらの抗原性及びエピゲノムを保持できるようにする本開示の１つ及び／または他の態様にかかる溶液に接触させることを含む。

いくつかの態様では、例えば唾液または尿の体液から収集された化学的に固定された細胞から細胞を単離するための方法は、細胞を遠心分離し、細胞のペレット、細菌、及びペレットの他の含有物から由来する白血球に富む破片から例えばＤＮＡ及び／または他の溶解性材料を分離し、そして細胞特異的マーカーを標的とする磁気ビーズに結合した抗体を用いて特定の細胞（例えば白血球）を単離することを含む。

いくつかの態様では、１つ以上の体液（例えば唾液及び／または尿）から特定の細胞のタイプ、例えば白血球のタイプ（例えばリンパ球）を単離するための方法は、１つ以上の以下のステップ（及び態様に応じていくつかの、または全ての以下のステップ）：化学的に固定された細胞を含んで成る体液のサンプルを提供すること、任意に体液を遠心分離にかけ、細胞を含んで成るペレットを得ること、任意に懸濁物中のペレットを再懸濁させること、再懸濁したペレットを密度勾配分離にかけ、白血球タイプ（リンパ球を含む）の混合物の層を得ること、細胞タイプの混合物を、特定の白血球のタイプにおいて見出されるエピトープに特異的な結合剤を含む溶液に接触させること、及び白血球のタイプの混合物から特定の白血球のタイプ（リンパ球を含む）を分離すること、を含む。

いくつかの態様では、特異的な結合剤は、白血球の特定のタイプにおいて見出されるエピトープに特異的な抗体と連結した磁気ビーズであってよく、且つ（他の細胞分離技術は、本開示の範囲内にあるが）その後の分離ステップでは、例えば特定の白血球のタイプ（リンパ球を含む）を、白血球タイプの混合物から磁気的に分離することを含んで成り得る。

いくつかの態様では、体液（例えば唾液、尿）は、化学固定液と混合され得るし、且つ混合物は、ペレットから除去され得る。その後にペレットは、緩衝剤中で再懸濁され得る。再懸濁されたペレットは、任意に遠心分離にかけられ、そして１回以上、緩衝剤中で洗浄され得る。その後に洗浄されたペレットは、親水性の多糖混合物に適用され、勾配を形成し得る。この密度勾配を通して時間、温度、及び／または処理される細胞の密度勾配の変化を要求する保存された細胞の多様な密度のせいで、保存のための化学固定後の血液以外の体液（例えば唾液、尿）中の細胞の密度が相違し得るために、この勾配は、血液のために使用されるものとは異なり得る。

さらにいくつかの態様では、白血球は、勾配において層を形成し得る。白血球層は、勾配から抽出され、そしてそれが緩衝剤中で洗浄され、そして再度ペレット化され、残りの勾配混合物が除去される場合に、もう一つの遠心分離管中に設置され得る。その後にペレットは、再懸濁され、そして磁気ビーズに結合し、且つ単離される細胞タイプに特異的である抗原に特異的な抗体を含む緩衝剤中で培養され得る。いくつかの態様では、単離される細胞タイプはＴ細胞であり、且つ抗原はＴ細胞特異的抗原である。いくつかの態様では、抗原はＣＤ４である。緩衝剤中で再懸濁した細胞は、抗体により結合され、そして抗体に結合した磁気ビーズに結合した細胞を、管の側面に磁気的に引き付ける磁場にかけられ得る。その後に残りの液体は管から除去され、そして管は緩衝剤中で洗浄される。その後に単離されたＴ細胞は、管の側面に引き付けられたままの状態にあり、そして（例えば）後の下流の実験のために凍結等のさらなる処理にかけられる状態にある。

いくつかの態様では、天然で発現した体液中の細胞を保存するための方法は、体液を、任意の開示された態様にかかる保存溶液に接触させることを含んで成る。

サンプル収集、保存、単離及び分析のためのデバイス、溶液及び方法は、以下の図面、詳細な説明及び特許請求の範囲を踏まえて、より深く理解されるだろう。多様な図面中の参照記号のようなものは、要素のようなものを示す。

注目されるのは、本明細書において開示されたサンプル収集デバイスのいくつかの態様は、体液の収集に伴い使用するために発表されることであり、危険な流体及び／または毒性の流体を含む任意の他の物質の収集に伴う特定の使用にも同じことが言える。

図１は、本開示のいくつかの態様にかかる蓋及び管を含んで成るサンプル収集デバイスを示す。 図１Ａは、図１の線１Ａ−１Ａに沿った断面図であり、且つ本開示のいくつかの態様にかかる内部空間及び開口部を定義する内壁を含んで成る蓋の内部チャンバーを示す。 図１Ｂは、図１Ａの線１Ｂ−１Ｂに沿った断面図であり、且つ本開示のいくつかの態様にかかる管内部の中心に位置した連結部材を示す。 図２Ａは、サンプル収集デバイスの縦断面図を示し、ここでの蓋は、本開示のいくつかの態様にかかる管中に偏心して設置された連結部材とはめ合され得る、偏心して設置された連結特徴を有する取り外し可能な遮断部材を有する内部チャンバーを含む。 図２Ｂは、図２Ａの線２Ｂ−２Ｂに沿った断面図であり、且つ本開示のいくつかの態様にかかる管内部に偏心して位置した連結部材を示す。 図３Ａは、サンプル収集デバイスの蓋の態様を示し、ここでの蓋は、本開示のいくつかの態様にかかる内壁中の開口部を覆うことができる移動式環状部材を有する内部チャンバーを含む。 図３Ｂは、サンプル収集デバイスの態様を示し、ここでの蓋は、管と連結し、且つ移動式環状部材は、それが本開示のいくつかの態様にかかる内壁中の開口部を覆わない位置に移動する。 図３Ｃは、図２Ｂ中に示された管の上面図であり、且つ本開示のいくつかの態様にかかる管内部に位置した連結部材を示す。 図４Ａは、蓋が本開示のいくつかの態様にかかる管に連結された後に、少なくともドナーにより蓋が取り除かれることを防ぐ、蓋及び管の内側内部に配置されたロック機構を含んで成るサンプル収集デバイスの態様を示す。 図４Ｂは、本開示のいくつかの態様にかかるロック設定及び非ロック設定を示す図４Ａにおいて示される、サンプル収集デバイスにおけるロック機構を示す。 図５Ａは、蓋が本開示のいくつかの態様にかかる管に連結された後に、少なくともドナーにより蓋が取り除かれることを防ぐ、蓋及び管の外面上に配置されたロック機構を含んで成るサンプル収集デバイスを示す。 図５Ｂは、本開示のいくつかの態様にかかるロック設定及び非ロック設定を示す図５Ａにおいて示される、サンプル収集デバイスにおけるロック機構を示す。 図６は、蓋が管に連結された時に、蓋及び管のかみ合わせ特徴中に放出される密閉溶液を含む密閉された空洞をさらに含むサンプル収集デバイスを示し、本サンプル収集デバイスは、蓋が本開示のいくつかの態様にかかる管に連結された後に、少なくともドナーにより蓋が取り除かれることを防ぐ。 図７Ａは、「不正開封明示」蓋を示し、図中の蓋の底での環状部材は、本開示のいくつかの態様にかかる管上で回転し／ねじ留めされた後に蓋が取り除かれたら、蓋から壊れて外れ得る。 図７Ｂは、本開示のいくつかの態様にかかる蓋から壊れて外れた環状部材を示す図７Ａにおいて示された「不正開封明示」蓋を示す。 図８は、室温で化学固定溶液中に貯蔵されたサンプルにおける、０、１、２及び７日後の経時的なＤＮＡ収量、並びに本開示のいくつかの態様にかかるそれぞれのサンプル由来のＴ細胞から抽出されたＤＮＡを示す。 図９は、１ｍＬの出発材料（例えば体液のサンプル）につき抽出されたＴ細胞の、血液から由来するＴ細胞の収率と比較した相対収率を説明するチャートである。 図１０は、本開示のいくつかの態様にかかる１ｍＬの唾液につき単離されたＴ細胞のマイクログラムの唾液用量曲線を示す。

態様の詳細な説明
本開示の態様は、体液等のサンプルを収集するためのデバイス、溶液及び方法、並びに１つ以上の細胞タイプを収集した細胞から（化学的に固定し、または別の方法で）単離するための方法を含む。例えばいくつかの態様では、サンプル収集デバイスは、現在利用可能なサンプル収集デバイスを凌ぐいくつかの利点を提供し、そしてさらにいくつかの態様にかかるサンプル収集デバイスは、最小量の部分を使用し、且つデバイスは、一片または物体の除去または交換を必要としない。さらにいくつかの態様では、サンプル収集デバイスは、サンプルを置くこと、及び収集デバイスを閉じることとは別に、一般にサンプルドナーによる追加の操作を要求し得ない。いくつかの態様にかかるサンプル収集デバイスは、より詳細に後述されるように、少なくとも一部分において鋭い物体を排除し、且つ毒性溶液への曝露のリスクを制限することから、サンプルドナー及び最終利用者の両者にとって改良された使用の安全性を含む。

いくつかの態様では、機能的ゲノム及びエピジェネティック研究のための、体液から細胞を保存及び単離するための方法、並びにバイオマーカーの発見が提供される。さらに本開示は、より詳細に後述されるように、Ｔ細胞等の稀な保存された細胞を、体液（例えば唾液、尿）から単離するためのデバイス、溶液及び方法を提供する。

サンプル収集デバイスのいくつかの態様は、蓋及び管等の２つのはめ合わせ体を含み得る。いくつかの態様では、蓋は、管とはめ合わされて閉じたサンプル収集デバイスを構成するために、（毒性であり得る）保存溶液を保持する内部空間等の閉じた空洞を含み得る。管は、１つ以上の体液（例えば唾液、尿）等のドナー試料を受け取るように設定され得る。いくつかの態様では、蓋及び／または管は、ドナーが試料を置き、そして蓋で管を閉じる時に保存溶液を保持し得る蓋中の空洞が開き、保存溶液を放出し、それがドナー試料と混合させ得るように設定され得る。

当業者は、本明細書において発表される収集デバイスのいくつかの態様について、例えば唾液収集用のマウスアダプター、尿収集用のじょうご及びホース等を含む、収集デバイス内への試料の配置を楽にする付属物との組み合わせにおいて使用され得るようなことを理解するだろう。

いくつかの態様では、サンプル収集デバイスは、内部に筋を伴う外壁を有する蓋を含んで成り得る。さらにサンプル収集デバイスは、壁中の内部空間及び筋をつけた開口部を定義する壁を含んで成るチャンバーにより流体を保持する内部チャンバーを含み得る。壁中の開口部は、遮断部材が管中の連結部材をかみ合わせるためのかみ合わせ部材を含み得る場合に、筋に沿った移動式遮断部材により密閉され得るので、（いくつかの態様において）蓋が管に沿って筋をつけられている場合、遮断部材が取り除かれ、そして開口部が開く。いくつかの態様では、サンプル収集デバイスは、サンプル収集用の内腔または容器を定義する封じ込め壁、蓋の外壁の内側の筋に相補的な外側の筋、及び蓋中のかみ合わせ部材に相補的な外形を有する連結部材、を含んで成る管をさらに含み得る。

いくつかの態様では、筋に沿った移動式遮断部材は、内部チャンバーの開口部に押され、回転され、ねじ留められ、筋をつけられ、及び／またははめ合わされることの少なくとも１つが当てはまる円盤型の部材であってよく、そして蓋が管上で回転またはねじ留めされる場合、蓋のかみ合わせ部材と管の連結部材との間の相互作用により、チャンバー中に押され、回転され、ねじ留められ、筋をつけられ、及び／またははめ合わされることの少なくとも１つが当てはまり得る。かみ合わせ部材は、それぞれ少なくとも１つが管の中心に、または管中に偏心して設置された連結部材と共に円盤型の部材の中心に、または円盤型の部材中に偏心して設置され得る。

本明細書において開示される用語、押し出す（push）、回転する（rotate）、ねじ留める（screw）、はめ合わせる（mate）・筋をつける（thread）、連結する（couple）、及び取り付ける（attach）、並びに対応のその時制及び複数形（さらに用語「特徴（feature(s)）」を含める）は、２つ（またはそれ以上）の部品（例えば「ねじ留め手段（screw means）」、「はめ合わせ手段（mating means）」、「連結特徴（coupling feature）」、「かみ合わせ特徴（engagement feature）」）を（永続的または一時的に）接続するための（当業者に周知の）構造に対応する。例えば、「押すこと」に関するかかる手段は、「スナップ式（snap-fit）」タイプの構造をカバーでき；回転手段は、一方の部品がもう一方の部品と関連して回転する時に、はみ出した部材が、対応の凹部により受け止められる手段をカバーし得る。「ねじ留めされた（screwed）」及び「筋に沿って（treadably）」は、らせん状の筋をつけたかみ合わせ等をカバーする。したがって、任意のこれらの用語（またはその時制）の使用は、任意のかかる手段またはその同等物とのかかる接続もカバーし得る。

いくつかの態様では、筋に沿った移動式環状部材は、開口部に適合せず、むしろ内部チャンバーの外側から開口部を覆い得る。かかる態様における環状部材は、内部チャンバーまたは内部空間の外側における筋に相補的である内部の筋を有し得る。環状遮断部材の連結特徴と管の連結部材との間の相互作用は、開口部から離れて、環状部材を内部チャンバーの外側でねじ留めさせ得る。

いくつかの態様では、例えばドナーによって、蓋が管上に接続、またはねじ留めされた場合、ドナーにより蓋が管から取り外され得ないように、サンプル収集デバイスは、ロックまたは密閉手段をさらに含み得る。適切なロック部材は、蓋上のくさび及び管上のはめ合わせフランジを含み得るし、または逆の場合も同様である。くさび及びフランジは、蓋及び管の内側、または蓋及び管の外側のいずれかにあり得る。適切な密閉手段は、密閉溶液、例えば接着剤（glue）を含む密閉された空洞を含み、ここでの密閉溶液は、管上で蓋が押され、回転され、またはねじ留めされた時に放出され、そしてその後に蓋と管の間での脱かみ合わせを防ぐために硬化する。いくつかの態様では、密閉溶液は、エポキシ等の２つの成分の接着剤であってよく、蓋が管上にねじ留めされる時に、筋内で２つの成分が混合するように、一方の成分は蓋中に密閉され、他方の成分は管中に密閉される。他の態様では、密閉溶液は、シアノアクリレートに基づく接着剤等の単一の成分であってよく、蓋が管上にねじ留めされた時に、密閉溶液が筋中に放出されるように、蓋または管において密閉された空洞中にあり得る。いくつかの態様では、密閉溶液は、一般に使用者による管及び蓋の間のかみ合わせ解除を防ぐことができるように、蓋及び管の間でかみ合わされた後にすぐに硬化し得る。

或いは、またはさらにいくつかの態様は、蓋が管上にねじ留めされた後の蓋の取り外しが、蓋と環状部材の間の結合を壊し、それにより管が開かれたことを示すように、蓋の底部で、部分的に蓋にしっかり固定される環状部材をさらに含み得る。この「不正開封明示」態様は、炭酸飲料の容器に蓋を取り付けるために使用されるものに似ている。

いくつかの態様にかかるサンプル収集デバイスは、ポリプロピレン、ポリスチレン及びポリカーボネート等の任意の適切なプラスチックで作られ得る。デバイスの寸法は、特有の処理にかけられるサンプルに適合するように修正され得る。特定の態様では、典型的な寸法は、以下を含む。蓋の内部チャンバーの容積は、約３ｍＬ〜約１０ｍＬであり、典型的に約６ｍＬである。管の内腔の容積は、約１５ｍＬ〜約５０ｍＬであり、典型的には約２５ｍＬである。他の容積は、本開示のいくつかの態様の範囲内にある。

図面に関し、図１は、蓋１２及び管１４を含んで成るサンプル収集デバイス１０の態様の説明である。管は、１つ以上のサンプル体液の収集のために設定され、且つ蓋は、１つ以上の保存液を貯蔵するために設定され得る。さらに蓋１２及び管１４は、貯蔵及び船積みのために、少なくともサンプル体液をしっかり固定した封じ込めを提供するために、もう一方としっかりはめ合わせられるように設定され得る。さらに蓋１２及び管１４をしっかりはめ合わすためにサンプル収集デバイス１０において実行され得る機構は、蓋１２及び管１４の間での脱かみ合わせを妨げ得る。蓋１２及び管１４の間の脱かみ合わせを妨げることの１つの利益は、それが少なくとも、例えば管中に含まれるサンプルの封じ込め、及び蓋１２中に含まれるもの等の任意の（毒性であり得る）保蔵溶液のサンプルドナーへの曝露を妨げ得ることである。

図１Ａは、いくつかの態様にかかる少なくとも１つの外壁２４及び少なくとも１つの内壁１８により定義され得る、蓋１２の実施例内部チャンバー１６を示す。少なくとも１つの内壁１８は、内部空間２０及び開口部２２をさらに定義し得る。さらに外壁２４は、管１４をかみ合わせるために、外壁２４の少なくとも１つの側面で沿う１つ以上の蓋かみ合わせ特徴３４を含み得る。例えば図１Ａにおいて示されている外壁２４の内面２６は、管１４と関連した筋等の１つ以上の相補的な管かみ合わせ特徴３８をかみ合わせ、且つはめ合わせるための筋等の１つ以上の蓋かみ合わせ特徴３４を含み得る。管１４は、唾液または尿等のサンプル体液を収集及び貯蔵するための容器４０を定義付け得る、少なくとも１つの封じ込め壁３２を含んで成り得る。封じ込め壁３２の外面３０は、筋等の１つ以上の管かみ合わせ特徴２８を含み得る。

蓋１２は、１つ以上の筋等の開口部かみ合わせ特徴４２を有する開口部２２をさらに含み得る。さらに蓋２２は、開口部かみ合わせ特徴４２のための筋等の１つ以上の遮断部材かみ合わせ特徴４４を有し得る遮断部材４６を含み得る。例えば遮断部材４６は、遮断部材が開口部にしっかりと固定されている場合に、１つ以上の流体または材料が、蓋の内部空間２０中に含まれ得るように、開口部２２に取り外し可能式に連結され得る。しかしながら遮断部材４６の開口部２２への脱連結の際に、１つ以上の流体または材料が蓋１２中の内部空間２０から放出され得る。例えば一度蓋１２が管１４に少なくとも部分的にしっかり固定されたならば、遮断部材４６は、開口部２２から脱連結し、その後に内部空間２０中の流体または材料を、管１４の容器４０中に放出し得る。蓋１２における内部空間２０中に含まれる１つ以上の流体または材料は、少なくとも貯蔵及び船積みの間に、管１４の容器４０中に含まれるサンプル体液の保存を支援し得る。本明細書中で検討される任意のかみ合わせ特徴は、サンプル収集デバイス１０の２つの部分または特徴の間に一時的または永続的なかみ合わせを可能にするための任意の数のかみ合わせ特徴であり得るし、また本開示において検討される実施例に限定されない。

遮断部材４６は、管１４の一部分を含んで成る１つ以上の連結部材５０を、連結特徴４８とかみ合わせ、且つ連結させることを可能にし得る、１つ以上の連結特徴４８も含み得る。連結特徴４８と連結部材５０の間の連結は、遮断部材４６を開口部２２から脱連結するのを支援し得る。例えば蓋１２が管１４にしっかり固定されていれば、ねじの先端と相互作用するねじ回しの先端と似ているように、連結部材５０は、遮断部材４６の連結特徴４８とかみ合わされ、そして相互作用し得る。遮断部材４６は、筋をつけた開口部かみ合わせ特徴と筋に沿ってかみ合わされてよく、且つ連結特徴４８及び連結部材５０の連結及び相互作用は、遮断部材４６と開口部２２の間で筋をつけたかみ合わせを解除し得る。遮断部材４６と開口部２２の間で筋をつけたかみ合わせは、例えば開口部２２に対する遮断部材４６の回転のせいで解除され得る。任意の数の解除可能なかみ合わせは、遮断部材４６と開口部２２の間のかみ合わせが、蓋を管１４へしっかり固定した際に解除され得るように、遮断部材４６を開口部２２にかみ合わせるために使用され得る。同様に任意の数の特徴は、蓋が少なくとも部分的に管１４にしっかり固定されるまで溶液が放出されないように、蓋１２または管１４の一部分において溶液の封じ込めを許容し得るサンプル収集デバイス１０において統合され得る。

図１Ａにおける管１４は、遮断部材４６中に連結特徴４８を含んで成る四角い刻み目に相補的な四角いくいの外形において連結部材５０を有するように実施例の方法により示されている。さらに連結部材５０は、管１４中の中心に設置され、且つ連結特徴は、遮断部材４６の底の中心に設置され得る。したがって蓋１２と管１４の間で筋をつけたかみ合わせにおいて、四角いくいの連結部材５０は、遮断部材４６中の四角い刻み目の連結特徴４８の中に伸び、そしてかみ合わされ得るので、遮断部材４６が連結部材５０に対して回転するのを阻止される。しかしながら遮断部材４６は、連結部材５０に対する回転を阻止され得るが、遮断部材４６は、開口部２２に対して回転し得るし、そして遮断部材４６と開口部２２の間で筋をつけたかみ合わせを解除する等、開口部２２からの脱かみ合わせとなり得る。図１Ｂは、２つ以上の十字部材５４により管１４の封じ込め壁の内面５２にしっかり固定された実施例の連結部材５０を示す。１つ以上の十字部材５４は、連結部材５０の位置をしっかり固定するのを支援し得る一方で、容器４０中への流体または材料の通路のための空間を許容する。

サンプル収集デバイス１０の実施例の使用方法は、内部空間２０中にサンプル保存液を含ませるために、蓋１２の内部空間２０中にサンプル保存液、及び開口部２２と筋に沿ってかみ合わされる遮断部材４６を提供するサンプル収集デバイス１０を含み得る。唾液または尿等のサンプル流体は、その後にドナーにより管１４の容器４０中に置かれ得る。蓋１２は、その後に管１４上にねじ留めされ得る。管１４上への蓋１２のねじ留めは、管１４中の連結部材５０に遮断部材４６の連結特徴４８をかみ合わせ、そして開口部２２から、そして蓋１２の内部空間２０中へ遮断部材４８のねじ留めを外し得る。開口部２２からの遮断部材４８の脱連結は、サンプル保存液が管４０の容器４０中に流れることを可能にし得る。管１４の容器４０中へのサンプル保存液放出後に、サンプル保存液は、ドナーのサンプル流体と混合されることにより、ドナーのサンプル流体を保存し得る。

本説明では四角いくいとして示されているが、管１４の連結部材５０は、遮断部材４６が開口部２２から脱連結できるようにするような、遮断部材４６の連結特徴４８と外形において相補的である任意の外形であり得る。連結特徴４８は、それぞれ遮断部材４６または管１４の中のいずれかにあってよく、且つ相補的連結部材５０は、管１４または遮断部材４６の中のいずれかにあってよい。これらに限定されないが、溝、つまみ、規則的なねじ回し及びねじ留めのようなもの、または十字型の対、フィリップスねじ回し及びねじ留めのようなものを含む他の外形は、当業者に明白であるだろう。

さらなる態様のサンプル収集デバイス１００は、図２Ａ及び２Ｂにおける実施例の方法により示されている。サンプル収集デバイス１００は、蓋１２または管１４のいずれかから偏心して置かれ得る１つ以上の連結部材５０、及び相補的な連結特徴４８を含み得る。図２Ｂに示されるように、適切に機能するために、連結部材５０が１つだけの十字部材５４により適切な位置付けを維持するように、より少ない材料及び部品が本態様に要求され得る。連結部材５０は、管１４の封じ込め壁３２から伸びている１つだけの十字部材５４により位置を保持しているように示されているが、本開示の範囲から逸脱せずに、任意の数の配置及び十字部材５４が使用され、連結部材５０を位置づけ得る。

もう一つの態様のサンプル収集デバイス２００は、図３Ａ〜３Ｃにおける実施例の方法により示されている。より詳細には、図３Ａは、管１４に連結される前の蓋１２の横断面を示す。蓋１２は、外壁２４、及び外壁２４の内面２６に沿う蓋かみ合わせ部材３４を含み得る。内部空間２０は、蓋１２の少なくとも１つの内壁１８または外壁２４により、少なくとも部分的に定義され得る。さらに内壁１８は、内壁１８の表面に沿って、筋等のかみ合わせ特徴６０を含み得る。内壁１８は、開口部２２に対する環状遮断部材６２の位置に応じて開き、または閉じ得る環状開口部２２をさらに定義し得る。図３Ａに示されるように、環状遮断部材６２が開口部２２を覆うようにして開口部２２が閉じた時に、内部空間２０中に含まれ得るサンプル保存液または材料７０等の流体または材料は、内部空間２０の外側に進み得ない。しかしながら図３Ｂに示されるように、環状遮断部材６２が開口部２２を覆わないように開口部２２が開いた時に、内部空間２０中に含まれ得る流体または材料７０は、管１４の容器４０の中へ進むように、内部空間２０の外側に進み得る。上記と同様に、内部空間中に含まれる流体または材料７０は、管１４の容器４０中に置かれた体液等（すなわち唾液、尿等）のサンプル７２を保存するのに有益であり得る。さらに任意の数の機構は、蓋１２が少なくとも部分的に管１４にしっかりと固定されるまで、サンプル保存液または材料７２が、内部空間２０から放出されるのを妨げ得る。

図３Ａ〜３Ｃにおける実施例の方法により示される態様において、環状遮断部材６２は、蓋１２が管１４としっかり連結されるように、管１４の連結部材５０等の１つ以上の特徴と相互作用するように設定されてよく、管１４または環状遮断部材６２のいずれか１つ以上の特徴は、環状遮断部材６２が開口部２２を覆うところの位置から、環状遮断部材６２が開口部２２を覆わないところの位置まで、環状遮断部材６２を移動させ得るので、サンプル保蔵液または材料７２を内部空間２０から放出できるようにし、そしてサンプル７２と接触できるようにしている。

図３Ｃは、サンプル収集のための容器４０を定義する、封じ込め壁３２を有する管１４の十字区画を示す。管１４は、環状遮断部材６２の連結特徴４８をかみ合わせるための連結部材５０を含み得る。

サンプル収集デバイス２００の実施例の使用方法は、蓋１２の内部空間２０中のサンプル保存液７０、及び開口部２２を通してサンプル保存液７０の通路を妨げるための開口部２２を覆う環状遮断部材６２を供給するサンプル収集デバイス２００を含み得る。本態様では、唾液または尿等のサンプル液７２は、管１４の容器４０中に置かれ得る。蓋１２は、管１４の容器４０中に置かれ得る。その後に蓋１２は、環状遮断部材６２の連結特徴４８に管１４の連結部材５０をかみ合わせる管１４上に、筋に沿ってかみ合わされるなどして、しっかりと連結され得る。その後に環状遮断部材６２は、内壁の側面に沿う筋等のかみ合わせ特徴を、筋に沿ってかみ合わせ得る。これは、環状遮断部材６２がもはや開口部２２を覆っていないので、それを開口部２２から離れるように動かし得る。これは、少なくともいくつかのサンプル保存液７０が、サンプル液７２と混合され得る際に、同様に管１４の容器４０中に放出されることにより、それを保存し得る。

いくつかの態様では、図４Ａ及び４Ｂ中の実施例の方法により示されるように、サンプル収集デバイス３００は、蓋１２が、管１４の相補的な連結特徴またはフランジ９２と相互作用するように形づけられ、且つ設定された、少なくとも１つの連結特徴またはくさび９０を含む。本態様では、くさび９０及びフランジ９２は、蓋１２及び管１４の内面に沿って伸びている。例えば蓋１２が管１４と連結される時、くさび９０は、フランジ９２をかみ合わせ、そして蓋１２と管１４の間でしっかり固定されたかみ合わせを形成し得る。さらに図４Ｂ中の実施例の方法により示されるロックされた配置９６のように、一度くさび９０及びフランジ９２が互いに完全にかみ合わされたら、くさび９０とフランジ９２の間のかみ合わせは、少なくともサンプルドナーにより解除され得ない。したがってくさび９０及びフランジ９２が互いにしっかりと固定されるように、一度蓋１２が管１４へかみ合わされたら、蓋１２は、少なくともサンプルドナーにより、もはや管１４から脱かみ合わせされ得ない。これは、少なくともサンプルドナーが、管１４中に置かれたサンプル体液を汚さないようにし得るし、そしてサンプルドナーを、サンプル保存溶液との接触から保護し得る。図４Ｂは、くさび９０とフランジ９２の間でロックされていない配置９４、及びロックされている配置９６のサンプル態様を示す。

いくつかの態様では、図５Ａ及び５Ｂ中の実施例の方法により示されるようなサンプル収集デバイス４００は、くさび９０及びフランジ９２が、それぞれ蓋１２及び管１４の外面に沿って伸びている。図５Ｂは、くさび９０とフランジ９２の間でロックされていない配置９４及びロックされている配置９６のサンプル態様を示す。

いくつかの態様では、図６中の実施例の方法により示されるようなサンプル収集デバイス５００は、蓋１２が接着剤等の密閉物質１１２を含む１つ以上の密閉された空洞１１０を含む。任意の１つの密閉された空洞１１０は、蓋１２が管１４に連結した時、１つ以上の密閉された空洞１１０が管１２の１つ以上の特徴または端１５０により壊され得るように、蓋１２上で、筋等のかみ合わせ特徴３４に動作可能式に関連し、または隣接して位置し得る。密閉された空洞１１０が一度壊されたら、接着剤等の密閉物質１１２は、密閉された空洞１１０から放出され、そして蓋１２を管１４に永続的にしっかりと固定させ得る。

任意の数の特徴は、蓋１２または管１４と共に含められよく、それは、汚染防止のような、望まれない蓋１２の管１４からの脱連結を防ぐことを支援し得る。さらに、または或いは、蓋１２または管１４は、蓋１２が管１４から好ましくないように脱連結されたら、それが使用者またはサンプル収集者に知られ得るように変わり得る「不正開封明示」特徴１６０を含み得る。図７Ａ及び７Ｂ中の実施例の方法により示されるように、蓋１２は、図７Ｂにおいて示されるように蓋１２が管１４から好ましくないように脱連結された時に、不正開封明示特徴１６０が、蓋１２からその取り付けを永続的に解除し得るように、蓋１２の開口端１６２に解除できるように取り付けられた環を含んで成り得る不正開封明示特徴１６０を含み得る。一度、不正開封明示特徴１６０が蓋１２から永続的に引き離されたら、蓋１２の任意の監視者は、蓋１２が管１２から好ましくないように脱連結されたことを判断し得るので、例えばサンプル汚染の警告を提供し得る。

それらの当業者は、本明細書において開示されたサンプル収集デバイスにより提供される利益を得るために、非常に多くの同等の態様が使用され得ることを認識するだろう。例えば本明細書は、蓋１２中の特定の要素、及び管１４中のその他について言及するが、当業者は、蓋１２中の要素を管１４中にあるものとして置き換えること、そして逆もまた同様に同等物であるだろうということを認識するだろう。

いくつかの態様では、唾液及び尿等の１つ以上の体液中で細胞を保存するための溶液が開示される。細胞を保存するための溶液は、体液中の細胞の貯蔵を可能にし、それらの抗原性及び細胞構造を保持する、細胞タイプへのさらなる分離、及び下流の分子解析に有益であり得る。溶液は、これに限定されないがパラホルムアルデヒド等の少なくとも１つの化学固定剤、及び少なくとも１つのプロテアーゼ阻害剤を含み得る。いくつかの態様では、溶液は、１つ以上の少なくとも１つの抗微生物剤、並びにヒト及び／または他の動物種から由来する血清タンパク質をさらに含み得る。溶液は、約６．４〜約８．４、好適には約７．２〜約７．６のｐＨで緩衝され得る。

本開示の目的の「細胞を保存すること」は、それらが、それらの抗原に基づき精製され、または富み得るように、細胞が劣化したそれらの抗原を有し得ず、そして細胞のエピゲノムにおける変化を防ぐことを意味する。「エピゲノム」は、ＤＮＡ、またはＤＮＡに結合したタンパク質の共有結合修飾によるゲノムＤＮＡの変化の状態、または変化の様式を意味する。かかる変化の例は、ＣｐＧジヌクレオチド中のシトシンの５位でのメチル化、ヒストンのリシン残基のアセチル化、及び基本的なＤＮＡ配列における変化に起因しない他の遺伝性、または非遺伝性の変化を含む。

いくつかの態様では、以下の説明中の試薬の濃度は、溶液自体を保存するサンプルの濃度であり得る。体液に応じて、また唾液の場合において、等容積の溶液及び体液については一緒に混合され得る。これは、好適には少なくとも１週間、室温で細胞の抗原性、及びＤＮＡ完全性を保持している体液由来の細胞をもたらす。

本開示のいくつかの態様では、デバイス内で保持され、且つ配備された保存溶液の容積は、約１００〜約５００ｍＬであってよく、それは例えば尿中の細胞を保存するために関連性がある。そのようなものとして、尿用の保存溶液は、尿に対し約１０倍（１０×）濃溶液から１．５倍（１．５×）溶液の範囲にあり得る。

いくつかの態様にかかる「化学固定剤」は、細胞が劣化に侵されないように細胞成分を変えるために使用される化学的架橋化合物である。化学固定剤は、架橋ヒストン、及び他のＤＮＡへのＤＮＡ結合タンパク質にも役立ち得る。かかる試薬は当業界において公知であり、且つこれらに限定されないが、パラホルムアルデヒド、ホルムアルデヒド、ホルマリン、アルデヒド、アルコール、酸化剤、水銀剤、ピクリン酸塩、Ｈｅｐｅｓ−グルタミン酸緩衝剤を介した有機溶媒保護効果（ＨＯＰＥ）、Ｚａｍｂｏｎｉｓ固定剤等の固定剤の組み合わせ、アルデヒドの組み合わせ、及び合成架橋試薬を含む。いくつかの態様では、化学固定剤は、パラホルムアルデヒドである。いくつかの態様では、化学固定剤は、約１％（ｖ／ｖ）の濃度で存在する。

体液中に存在するプロテアーゼによる劣化から細胞を保護するために、いくつかの態様では、溶液は、少なくとも１つのプロテアーゼ阻害剤を含み得る。いくつかの態様では、プロテアーゼ阻害剤は、アスパラギン酸プロテアーゼ阻害剤、システインプロテアーゼ阻害剤、メタロプロテアーゼ阻害剤、セリンプロテアーゼ阻害剤（例えばセルピン）、トレオニンプロテアーゼ阻害剤、トリプシン阻害剤、及びＫｕｎｉｔｚ ＳＴＩプロテアーゼ阻害剤から成る群から選定され得る。いくつかの特異的、非限定的な例は、アジ化ナトリウム、ＰＭＳＦ、アプロチニン、ロイペプチン、ペプスタチン、天然または合成プロテイナーゼ阻害剤、及びプロテアーゼ阻害剤のカクテル混合物を含む。これらの阻害剤の適切な濃度は、これらに限定されないが、約０．１〜１ｍＭでＰＭＳＦ（フェニルメチルスルホニルフッ化物）セリンプロテアーゼ、約１ｍＭでベンズアミジンセリンプロテアーゼ、約１μｇ／ｍＬでペプスタチンＡ 酸プロテアーゼ、約１μｇ／ｍＬでロイペプチンチオールプロテアーゼ、約５μｇ／ｍＬでアプロチニンセリンプロテアーゼ、及び約１μｇ／ｍＬでアンチパインチオールプロテアーゼを含み得る。特定の態様では、プロテアーゼ阻害剤は、約０．０１％（ｗ／ｖ）の濃度でのアジ化ナトリウムである。

微生物汚染から細胞への損傷を防ぐために、いくつかの態様の溶液は、少なくとも１つの抗微生物剤を含む。適切な抗微生物剤は、これらに限定されないが、抗細菌性及び抗真菌性抗生剤を含む。

細胞構造の保存は、いくつかの態様において溶液に任意に添加され得る血清タンパク質の存在により増強される。さらに血清タンパク質は、細胞と溶液の間の浸透性の差異を中和するために使用され得る。これらは、ヒトまたは他の動物起源であり得る。いくつかの場合では、全血清が使用され得る。例えばウシ胎仔血清は、いくつかの態様では約１％（ｖ／ｖ）で添加され得る。

本開示にかかる溶液は、前記の態様の任意の組み合せを含み得る。

本開示のいくつかの態様では、１つ以上の体液中の細胞を保存するための方法が開示される。細胞を保存するための方法は、体液を本開示にかかる溶液と接触させることを含んで成り得る。体液は、多様な細胞タイプを含み得るし、そして体液中の細胞は、本開示にかかる溶液により保存され得る。本開示にとって不可欠なものではないが、約１：１の溶液対体液の比率が典型的に使用される。

以下の実施例は、体液中の細胞を保存するための溶液及び方法のいくつかの態様をさらに説明することを意図し、そして本開示の範囲を制限するとは解釈されない。

例えばｐＨ７．４のＰＢＳ、１％のパラホルムアルデヒド、１％のＦＢＳ、及び０．０１％のＮａＮ３の溶液は、唾液と１：１の比率で添加されてよく、その後にＴ細胞は、精製され、そしてＤＮＡ抽出が成され得る。かかる工程の結果は、図８において示されている。これらの結果は、Ｔ細胞の抗原性及びＤＮＡの完全性が、少なくとも１週間維持されたことを実証し得る。

本開示のいくつかの態様では、化学的に固定された細胞を含んで成る唾液または尿等の１つ以上の体液のサンプルを提供する方法を開示し、そして任意に体液サンプルを遠心分離にかけ、ＤＮＡ及び他の溶解性材料を、細菌及び破片を含む細胞のペレットから分離する方法が開示される。本方法は、他のペレットの内容物から、リンパ球を含む白血球を富ませることをさらに含み得る。さらに特異的な細胞は、細胞特異的マーカーを標的にした磁気ビーズに結合した抗体を用いて単離され得る。

いくつかの態様では、本開示は、これらに限定されないが、特にリンパ球を含む特定の白血球のタイプを、体液（すなわち唾液、尿等）から単離するための方法を提供する。本方法は、例えば１つ以上の（及びいくつかの態様では、いくつかの、または全てのステップ）：化学的に固定された細胞を含んで成る体液サンプルを提供すること、任意に体液サンプルを遠心分離にかけ、細胞を含んで成るペレットを獲得すること、任意に緩衝剤中のペレットを再懸濁させること、再懸濁したペレットを密度勾配分離にかけ、白血球タイプ（リンパ球を含む）の混合物の層を獲得すること、細胞タイプの混合物を、特定の白血球のタイプにおいて見出されるエピトープに対する特異的結合剤を含む溶液と接触させること、そして特定の白血球のタイプ（リンパ球を含む）を、白血球タイプの混合物から分離することを含んで成る。

いくつかの態様では、特異的結合剤は、特定の白血球のタイプにおいて見出されるエピトープに特異的な抗体に連結した磁気ビーズを含むことができ、そして細胞タイプを互いから分離するための任意の方法（及び対応するシステム／デバイス）は、本開示の範囲内にあるにもかかわらず、分離は、特定の白血球のタイプ（リンパ球を含む）を、白血球タイプの混合物から磁気的に分離することを含んで成り得る。磁気分離は、そうするためのまさに一つの方法である。

細胞は、本開示にかかる方法にかけられる前に、化学的に固定され得る。細胞は、例えば唾液のサンプルを化学的固定剤と接触させることにより、化学的に固定され得る。これは、周囲温度で、ゆっくり時間をかけて細胞を保存するために行われる。これは、ヒストン修飾及び他のタンパク質−ＤＮＡ相互反応が、提供された体液サンプルから研究され得るように、エピゲノムの完全な研究も可能にし得る。研究されるためにヒストンは、ＤＮＡに化学的に固定されなければならない。固定されなければ、一般にヒストンは、ＤＮＡに結合したままの状態に成り得ず、そしてタンパク質は、経時的に劣化し得る。

いくつかの態様では、緩衝剤は、アジ化ナトリウムを含んで成ることができ、緩衝剤は、リン酸塩緩衝生理食塩水及びアジ化ナトリウムを含んで成り得る。いくつかの態様では、緩衝剤は、ウシ胎仔血清をさらに含んで成り得る。いくつかの態様では、緩衝剤は、約７．２〜約７．６のｐＨである。

いくつかの態様では、細胞は、緩衝剤中で一度洗浄される。実行において、これは、溶解性材料を取り除き、そして唾液の場合では、それは、「口腔内の（buccal）」層として分類されたもの（Ｄｏｓ-Ｓａｎｔｏｓ等、２００９）を取り除く。

いくつかの態様では、白血球の混合物は、分離の前に緩衝剤中で１回以上洗浄される。これは、好適には任意の残存する密度勾配溶液を、細胞タイプの混合物から取り除くために成される。

本工程では、抗体は、特定の白血球のタイプと結合し得るので、特定の白血球のタイプを磁気ビーズに結合させる。その後に磁場に磁気ビーズを置くことにより、特定の白血球のタイプを任意の他の細胞タイプから分離し、そして任意の残存する液体を取り除き、特定の白血球のタイプの単離細胞を獲得し得る。

いくつかの態様では、リンパ球がＴ細胞であり得る場合に、特定の白血球のタイプはリンパ球であり得る。かかる態様では、使用される抗体は、Ｔ細胞に特異的な抗原（例えばＣＤ４である抗原）に特異的であり得る。いくつかの態様では、単離された血液細胞は、その後にエピジェネティック分析等のさらなる処理に先立ち凍結され得る。

以下の実施例は、本開示の実施例方法態様をさらに説明することを意図し、また本開示の範囲を制限することを意図しない。

体液（例えば唾液）からのＴ細胞の単離

唾液を収集し、そしてその唾液を保存溶液と混合する。その後に細胞を遠心分離によりペレット化させ、そして処理溶液を除去する。その後に細胞を、約６ｍＬの緩衝剤（ＰＢＳ、ｐＨ７．４）、１％のＦＢＳ、０．０１％のＮａＮ３中で再懸濁させ、その後に緩衝剤中で一度洗浄し、そして再度ペレット化させる。ペレットを、約６ｍＬのＰＢＳ-１５ ＦＢＳ-０.０１％のＮａＮ３中で再懸濁させ、そして１．０８２〜１．０７２ｇ/ｍＬのＦｉｃｏｌｌ（登録商標）（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を用いて密度勾配遠心分離にかける。白血球は、細菌、破片、及び任意の他の粒子状物質が管の底でペレット化した間に、多糖及び緩衝剤の界面に回転する。細胞を管から抽出し、そして新しい管の中に置く。その後に細胞をハンクス平衡塩類溶液で一度洗浄し、そしてその後にＰＢＳ−ＮａＮ３−ＦＢＳ緩衝剤中で一度洗浄し、界面から白血球を抽出する間に採取され得る残りの密度勾配溶液を除去する。

ここでのサンプルは、最小限の細菌及び最小限の破片と共に、非常に富む白血球を含む。本ステップは、さらに上皮細胞等の他の細胞タイプを大幅に減少させ得る。その後に細胞は、緩衝剤（ＰＢＳ−ＮａＮ３−ＦＢＳ）中で、磁気ビーズ（Ｄｙｎａｂｅａｄｓ（登録商標）Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ（登録商標））に結合したＣＤ４に対して標的化された抗体と共に培養され得る。その後にサンプルを磁場に置き、ビーズを管の側面に持っていき、そして液体を除去し得る。液体は、抗体を通してビーズに結合していない全てのものを含み得る。Ｔ細胞は抗体に結合し、そして磁場のせいで除去され得ない。唾液または尿等の体液中で見出される任意の非特異的、または弱く結合している他の細胞、細菌、または他の破片を除去するために、ビーズ及び付着した細胞は、緩衝剤中で洗浄され得る。後の下流の工程及び分析のために、その後に細胞は、凍結乾燥され得る。Ｔ細胞の単離は、光学顕微鏡検査により確認され得る（Ｔ細胞は、上皮細胞及び細菌と比較して、はっきりと異なる）（図９を参照）。さらにＣＤ３、ＣＤ４、及びＣＤ８に対する抗体を用いるフローサイトメトリー及びＦ.Ａ.Ｃ.Ｓ.分析は、単離された細胞の視覚的評価を裏付け得る。その後にＴ細胞は、体液から滴定され、下流の実験に十分な数の細胞について、唾液または尿等の体液の量を決定するために、体液単位（ｍＬ）あたりのＴ細胞の数が決定され得る（図９及び１０を参照）。単離された細胞は、劣化がなく、また下流での使用に適したＤＮＡを有することを示し得る（図８を参照）。

これらに限定されないが、特許、特許出願、論文、ウェブページ、書籍等を含む本出願において示されている刊行物または他の文書への任意及び全ての参照は、それらの全体において、参照により本明細書中に組み込まれている。

いくつかのバリエーションは、上記に詳細に発表されているが、他の変更は可能である。例えば付随の図面において描かれている、及び本明細書において発表されている任意の論理の流れは、望ましい結果を達成するために、示されている特定の順序、順次的な順番を要求しない。他の実施は、少なくともいくつかの例示的な特許請求の範囲内にあり得る。

デバイス、システム及び方法の実施例の態様は、本明細書において発表されている。他の場所に示されているようなこれらの態様は、説明の目的のためだけに発表されており、且つ限定的なものではない。本明細書中に含まれる技術から明白であるだろう他の態様は可能であり、且つ本開示によりカバーされている。したがって本開示の幅、及び範囲は、任意の上記発表された態様により限定されるべきではないが、本開示によりサポートされた特許請求の範囲、及びそれらの同等物に従ってのみ定義されるべきである。さらに主題開示の態様は、体液（例えば唾液、尿）由来の細胞の収集、保存、分離及び単離、並びに毒性のある、及び／または危険な物質／流体を含む他の物質の収集（並びにその成分の保存、分離及び単離）に対応する任意及び全ての要素を含む任意の他の開示された方法、システム、及びデバイスからの任意及び全ての要素をさらに含み得る方法、システム及びデバイスを含み得る。言い換えれば、１つ、またはもう１つの開示された態様からの要素は、他の開示された態様からの要素と置き換え可能であり得る。

参照（参照により本明細書中に組み込まれる）：

Claims (12)

1. 唾液中の細胞の貯蔵を可能とし、それらの抗原性及び細胞構造が保持される、細胞タイプへのさらなる分離、及び下流のエピジェネティック分析のための、唾液中の細胞を保存するための溶液であって、
   パラホルムアルデヒド、
   アジ化ナトリウム、及び
   ウシ胎仔血清
   を含んで成り、
   前記溶液は、緩衝剤によって、約6.4〜約8.4のpHで緩衝される、前記溶液。
2. 少なくとも１つの抗微生物剤をさらに含んで成る、請求項１に記載の溶液。
3. 前記パラホルムアルデヒドが、約１％（v/v）の濃度で存在する、請求項１に記載の溶液。
4. 前記抗微生物剤が、抗細菌性及び抗真菌性の抗生剤から成る群から選定される、請求項２に記載の溶液。
5. 前記溶液が、約7.2〜約7.6のpHで緩衝される、請求項１に記載の溶液。
6. 前記緩衝剤がリン酸塩緩衝剤である、請求項１に記載の溶液。
7. 約１％（v/v）のウシ胎仔血清を含む、請求項１に記載の溶液。
8. 前記アジ化ナトリウムは、約0.01％（w/v）の濃度で存在する、請求項１に記載の溶液。
9. 前記溶液が、約１％（v/v）のパラホルムアルデヒド、約１％（v/v）のウシ胎仔血清、及び約0.01％（w/v）のアジ化ナトリウムを含む、請求項１に記載の溶液。
10. 唾液中の細胞を保存して、それらの抗原性及び細胞構造を保持するための方法であって、前記唾液を、請求項１〜９のいずれか１項に記載の溶液と接触させることを含んで成り、
    前記細胞が、細胞タイプへのさらなる分離、及び下流のエピジェネティック分析のために保存される、前記方法。
11. 前記唾液は、１：１（v/v）の比率で前記溶液と接触される、請求項10に記載の方法。
12. 前記唾液は、少なくとも１週間、室温で前記溶液と接触される、請求項10に記載の方法。

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