JP2021087455A - Bcmaを標的とするキメラ抗原受容体及びその使用方法 - Google Patents

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Abstract

【課題】本出願は、抗BCMA単一ドメイン抗体(sdAb)、1つ以上の抗BCMA sdAb(VHHフラグメント等)を含むキメラ抗原受容体(CAR)、操作された免疫エフェクター細胞、及びがん免疫療法におけるその使用方法を提供することを課題とする。【解決手段】抗BCMA単一ドメイン抗体(sdAb)、1つ以上の抗BCMA sdAb(VHHフラグメント等)を含むキメラ抗原受容体(CAR)、操作された免疫エフェクター細胞、及びがん免疫療法におけるその使用方法を見出した。【選択図】図1A

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2016年8月10日に出願された国際特許出願第PCT/CN2016/094408号の優先権の利益を主張するものであり、この内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
ASCIIテキストファイルでの配列表の提出
ASCIIテキストファイルでの以下の提出の内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる:コンピュータ可読形式(CRF)の配列表(ファイル名:761422000640SEQLISTING.txt、記録日:2017年8月10日、サイズ:520KB)。
本発明は、BCMAを標的とする単一ドメイン抗体、キメラ抗原受容体、及び操作された免疫エフェクター細胞、ならびにその使用方法に関する。
腫瘍免疫療法及び臨床技術の発達とともに、キメラ抗原受容体T細胞(CAR−T)免疫療法は、現在、最も有望な腫瘍免疫療法アプローチのうちの1つである。一般に、キメラ抗原受容体(CAR)は、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、及び細胞内シグナル伝達ドメインを含む。細胞外抗原結合ドメインは、特定された腫瘍抗原を標的とする一本鎖可変フラグメント(scFv)を含み得る。CARは、遺伝子トランスフェクション技術を使用して、T細胞の表面上に発現させることができる。標的腫瘍抗原に結合すると、CARは、標的腫瘍抗原に特異的な主要組織適合性複合体(MHC)の利用可能性によって制限されることなく、抗原依存的様態で、特異的な抗腫瘍応答を開始するように、T細胞を活性化することができる。
単一ドメイン抗体(sdAb)は、単一の単量体抗体可変ドメインを有することにより、従来の4鎖抗体とは異なる。例えば、ラクダ科の動物及びサメは、重鎖のみ抗体(HcAb)と命名されたsdAbを産生し、これは、軽鎖を天然に欠いている。ラクダ科重鎖のみ抗体の各アームにおける抗原結合フラグメントは、単一の重鎖可変ドメイン(VH)を有し、これは、軽鎖の援助なしに抗原に対する高い親和性を有することができる。ラクダ科VHは、およそ15kDの分子量を有する最小の機能的抗原結合フラグメントとして既知である。
多発性骨髄腫(MM)は、不治の侵襲性血漿悪性腫瘍であり、これは、B細胞新形成に分類され、制御不能な方法で骨髄内に増殖し、血液細胞の正常な代謝産生を妨害し、有痛性骨病変を引き起こす(Garfall,A.L.et al.,Discovery Med.2014,17,37)。多発性骨髄腫は、高カルシウム血症、腎不全、貧血症、骨病変、細菌感染、過粘稠、及びアミロイドーシスを臨床的に呈し得る(Robert
Z.Orlowski,Cancer Cell.2013,24(3))。研究及び統計によれば、毎年ほぼ86,000人の患者が骨髄腫と診断される一方で、約63,000人の患者が毎年この疾患関連の合併症で死亡する(Becker,2011)。高齢化大衆のため、骨髄腫の症例数が年々増加することが予測される。多くのがんと同様に、多発性骨髄腫の原因は知られておらず、治療法も存在しない。多発性骨髄腫のいくつかの治療は、化学療法または放射線療法、幹細胞移植または骨髄移植、標的療法、または生物学的療法等の他のがんの治療と類似している(George,2014)。抗体に基づく細胞免疫療法が、血液学的悪性腫瘍、具体的には、B細胞非ホジキンリンパ腫を有する患
者に対する実質的な臨床的利益を実証している。多発性骨髄腫の現在の療法は、しばしば、寛解をもたらすが、ほぼ全ての患者が最終的に再発する。多発性骨髄腫の治療に有効な免疫療法薬が必要とされている。
本発明に開示されているLCAR−B38Mは、難治性または再発性多発性骨髄腫患者の治療における安全性及び有効性の両方に関して、臨床的利点が臨床試験において既に示されているCAR−Tを標的とする二価BCMAである。初期臨床試験において、35人のうちの33人(94%)の患者は、LCAR−B38M CAR−T細胞を受けた際に多発性骨髄腫の臨床的寛解を有した。ほとんどの患者は、軽度の副作用のみを有した。研究は、2017年ASCO年次総会(要約LBA3001)及び広範なマスコミ報道を動員した記者会見(http://www.ascopost.com/News/55713)の両方で主要な発明者らによって提示された。
全体的に、客観的奏功率は、100%であり、33人の患者(94%)が、CAR T細胞を受けた2カ月以内に、骨髄腫の明らかな臨床的寛解(完全奏功、非常に良好な部分奏功、または部分奏功)を有した。この群を、4カ月を超える期間にわたって追跡後、有効性において、19人の患者のうち14人は、ストリンジェントな完全奏功基準に達し、1人の患者は、部分奏功に達し、4人の患者は、非常に良好な部分寛解基準を達成した。
LCAR−B38M臨床試験から得られた優れた有効性及び安全性プロファイルは、免疫療法分野において「革命的な飛躍的進歩」として広く認識されていた、ASCOにおいて同時に報告された、いくつかの他のBCMA CAR−T試験よりも著しく優れている。これら全てのBCMA CAR設計は、BCMA抗原結合ドメインが一価ScFv抗体から成る従来のCARであることに注目すべきである。
本明細書において参照される全ての公開物、特許、特許出願、及び公開された特許出願の開示は、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
本出願は、抗BCMA単一ドメイン抗体(sdAb)、1つ以上の抗BCMA sdAb(VHフラグメント等)を含むキメラ抗原受容体(CAR)、操作された免疫エフェクター細胞、及びがん免疫療法におけるその使用方法を提供する。
本出願の一態様は、配列番号115〜152のうちのいずれか1つのCDR領域を含む抗BCMA sdAbを提供する。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、以下:(1)配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列を含むCDR3、(2)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号78のアミノ酸配列を含むCDR3、(3)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号79のアミノ酸配列を含むCDR3、(4)配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号80のアミノ酸配列を含むCDR3、(5)配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3、(6)配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3、(7)配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3、(8)配列番号8のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3、(9)配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号85のアミノ酸配列を含
むCDR3、(10)配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3、(11)配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3、(12)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3、(13)配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3、(14)配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3、(15)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3、(16)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3、(17)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3、(18)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3、(19)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3、(20)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3、(21)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号97のアミノ酸配列を含むCDR3、(22)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号98のアミノ酸配列を含むCDR3、(23)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号99のアミノ酸配列を含むCDR3、(24)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号100のアミノ酸配列を含むCDR3、(25)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号101のアミノ酸配列を含むCDR3、(26)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号102のアミノ酸配列を含むCDR3、(27)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号103のアミノ酸配列を含むCDR3、(28)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号104のアミノ酸配列を含むCDR3、(29)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号105のアミノ酸配列を含むCDR3、(30)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号106のアミノ酸配列を含むCDR3、(31)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号107のアミノ酸配列を含むCDR3、(32)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号108のアミノ酸配列を含むCDR3、(33)配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR3、(34)配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR3、(35)配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号73のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR3、(36)配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号74のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR3、(37)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号75のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR3、または(38)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号76のアミノ酸配列を含むCDR2
、及び配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR3、のうちのいずれか1つを含む。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、配列番号115〜152から成る群から選択されるアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。
いくつかの実施形態では、抗BCMA重鎖のみ抗体(HCAB)、または上に記載される抗BCMA sdAbのうちのいずれか1つを含む抗原結合タンパク質が提供される。上に記載される抗BCMA sdAbのうちのいずれか1つが、上に記載される抗BCMA sdAbのうちのいずれか1つと競合する抗BCMA抗体(抗BCMA sdAb等)に特異的に結合するBCMAエピトープも提供される。
上に記載される抗BCMA sdAbのうちのいずれか1つに従ういくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ラクダ科抗体である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、キメラ抗体である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ヒト化である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、VHフラグメントである。
本出願の一態様は、(a)抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメイン(上に記載される抗BCMA sdAbのうちのいずれか1つ等)と、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む、ポリペプチドを含むBCMAキメラ抗原受容体を提供する。いくつかの実施形態では、CARは、単一特異性である。いくつかの実施形態では、CARは、一価である。いくつかの実施形態では、CARは、多価(二価または三価等)である。いくつかの実施形態では、CARは、多重特異性(二重特異性等)である。いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、少なくとも2つの抗BCMA sdAb(上に記載される抗BCMA sdAbのうちのいずれか1つ以上等)を含む。
本出願の一態様は、(a)第1のBCMA結合部分及び第2のBCMA結合部分を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む、ポリペプチドを含む多価キメラ抗原受容体(CAR)を提供する。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分及び第2のBCMA結合部分のうちの1つ以上は、抗BCMA sdAbである。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分は、第1の抗BCMA sdAbであり、第2のBCMA結合部分は、第2の抗BCMA
sdAbである。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分は、抗BCMA sdAbであり、第2のBCMA結合部分は、ヒト抗体に由来する。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分は、抗BCMA sdAbであり、第2のBCMA結合部分は、BCMAのポリペプチドリガンドである。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分及び第2のBCMA結合部分は、BCMA上の同じエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分及び第2のBCMA結合部分は、BCMA上の異なるエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分及び/または第2のBCMA結合部分は、配列番号388〜394から選択されるアミノ酸配列に由来するBCMA上のエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分は、配列番号389及び/または390に由来するエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、第2のBCMA結合部分は、配列番号391及び/または392に由来するエピトープに特異的に結合する。
本出願の一態様は、(a)第1の抗BCMA sdAb(上に記載される抗BCMA sdAbのうちのいずれか1つ等)及び第2の抗BCMA sdAb(上に記載される抗BCMA sdAbのうちのいずれか1つ等)を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む、ポリペプチドを含む多価(二価または三価等)キメラ抗原受容体を提供する。いくつかの実施形態では、第1
の抗BCMA sdAb及び第2の抗BCMA sdAbは、BCMA上の同じエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA sdAb及び第2の抗BCMA sdAbは、BCMA上の異なるエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA sdAb及び/または第2の抗BCMA sdAbは、配列番号388〜394から選択されるアミノ酸配列に由来するBCMA上のエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号389及び/または390に由来するエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、第2の抗BCMA sdAbは、配列番号391及び/または392に由来するエピトープに特異的に結合する。
上に提供される多価CARのうちのいずれか1つに従ういくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分(例えば、第1の抗BCMA sdAb)は、第2のBCMA結合部分(例えば、第2の抗BCMA sdAb)のN末端に位置している。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分(例えば、第1の抗BCMA sdAb)は、第2のBCMA結合部分(例えば、第2の抗BCMA sdAb)のC末端に位置している。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分(例えば、第1の抗BCMA sdAb)及び第2のBCMA結合部分(例えば、第2の抗BCMA sdAb)は、ペプチド結合を介して互いに直接融合される。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分(例えば、第1の抗BCMA sdAb)及び第2のBCMA結合部分(例えば、第2の抗BCMA sdAb)は、ペプチドリンカーを介して互いに融合される。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、約50個以下(約35、25、20、15、10、または5個以下等のいずれかの個数)のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、配列番号208〜215から選択されるアミノ酸配列を含む。
上に記載されるCAR(多価CARを含む)のうちのいずれか1つに従ういくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8α、CD4、CD28、CD137、CD80、CD86、CD152、及びPD1から成る群から選択される分子に由来する。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8αまたはCD28に由来する。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、配列番号193または194のアミノ酸配列を含む。
上に記載されるCAR(多価CARを含む)のうちのいずれか1つに従ういくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫エフェクター細胞(T細胞等)の一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζに由来する。いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号197または198のアミノ酸配列を含む。
上に記載されるCAR(多価CARを含む)のうちのいずれか1つに従ういくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、CD137、OX40、CD30、CD40、CD3、LFA−1、ICOS、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、CD83のリガンド、及びこれらの組み合わせから成る群から選択される共刺激分子に由来する。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、CD28の細胞質ドメイン及び/またはCD137の細胞質ドメインを含む。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、配列番号195及び/または配列番号196のアミノ酸配列を含む。
上に記載されるCAR(多価CARを含む)のうちのいずれか1つに従ういくつかの実施形態では、CARは、細胞外抗原結合ドメインのC末端と膜貫通ドメインのN末端との間に位置するヒンジドメインをさらに含む。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、CD8αに由来する。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、配列番号192の
アミノ酸配列を含む。
上に記載されるCAR(多価CARを含む)のうちのいずれか1つに従ういくつかの実施形態では、CARは、ポリペプチドのN末端に位置するシグナルペプチドをさらに含む。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、CD8α、GM−CSF受容体α、及びIgG1重鎖から成る群から選択される分子に由来する。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、CD8αに由来する。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、配列番号191のアミノ酸配列を含む。
本出願の一態様は、表4及び5に列記されるCARを提供する。いくつかの実施形態では、CARは、配列番号216〜256及び298〜335から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む。
本出願の一態様は、配列番号115〜152、216〜256、及び298〜335から成る群から選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドを提供する。
本出願の一態様は、上に記載される、抗BCMA sdAbまたはCAR(多価CARを含む)のうちのいずれか1つをコードする核酸配列を含む、単離された核酸を提供する。いくつかの実施形態では、核酸配列は、配列番号153〜190、257〜297、及び336〜373から成る群から選択される。いくつかの実施形態では、単離された核酸は、第1のCARをコードする第1の核酸配列をさらに含み、第2のCARをコードする第2の核酸配列は、T2A、P2A、またはF2Aペプチド等の自己開裂ペプチドをコードする第3の核酸配列を介して、第1の核酸配列に操作可能に連結される。第3の核酸配列は、配列番号385である。いくつかの実施形態では、単離された核酸は、DNA分子である。いくつかの実施形態では、単離された核酸は、RNA分子である。
本出願の一態様は、上に記載される単離された核酸のうちのいずれか1つを含むベクターを提供する。いくつかの実施形態では、ベクターは、発現ベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターは、ウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターは、レンチウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターは、非ウイルスベクターである。
本出願の一態様は、上に提供されるCAR(多価CARを含む)のうちのいずれか1つ、または上に記載される単離された核酸のうちのいずれか1つ、または上に記載されるベクターのうちのいずれか1つを含む、操作された免疫エフェクター細胞を提供する。いくつかの実施形態では、免疫エフェクター細胞は、T細胞、NK細胞、末梢血単核細胞(PBMC)、造血幹細胞、多能性幹細胞、または胚幹細胞である。いくつかの実施形態では、免疫エフェクター細胞は、T細胞である。
本出願の一態様は、上に記載される操作された免疫エフェクター細胞のうちのいずれか1つと、薬学的に許容される担体と、を含む、薬学的組成物を提供する。個体におけるがんを治療する方法がさらに提供され、個体に有効量の上に記載される薬学的組成物のうちのいずれか1つを投与することを含む。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、自己由来である。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、同種異系である。いくつかの実施形態では、がんは、液体癌である。いくつかの実施形態では、がんは、多発性骨髄腫、急性リンパ性白血病、または慢性リンパ性白血病である。いくつかの実施形態では、がんは、膠芽腫等の固体がんである。いくつかの実施形態では、がんは、難治性または再発性多発性骨髄腫である。
本出願の一態様は、上に記載される抗BCMA sdAbのうちのいずれか1つと、薬
学的に許容される担体とを含む、薬学的組成物を提供する。いくつかの実施形態では、個体における疾患(がん等)を治療する方法がさらに提供され、個体に有効量の薬学的組成物を投与することを含む。
上に記載される、抗BCMA sdAb、CAR(多価CARを含む)、操作された免疫エフェクター細胞、単離された核酸、またはベクターのうちのいずれか1つを含む、使用方法、キット、及び製品も提供される。
RPMI8226.Luc細胞(図1A)、またはU87MG.Luc細胞(図1B)に対する様々な抗BCMA sdAbを含む例示的な単一特異性CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 RPMI8226.Luc細胞(図1A)、またはU87MG.Luc細胞(図1B)に対する様々な抗BCMA sdAbを含む例示的な単一特異性CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 RPMI8226.Luc細胞(図2A)、K562.BCMA.Luc細胞(図2B)、またはK562.CD19.Luc細胞(図2C)に対する様々な抗BCMA sdAbを含む例示的な単一特異性CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 RPMI8226.Luc細胞(図2A)、K562.BCMA.Luc細胞(図2B)、またはK562.CD19.Luc細胞(図2C)に対する様々な抗BCMA sdAbを含む例示的な単一特異性CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 RPMI8226.Luc細胞(図2A)、K562.BCMA.Luc細胞(図2B)、またはK562.CD19.Luc細胞(図2C)に対する様々な抗BCMA sdAbを含む例示的な単一特異性CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 K562.BCMA.Luc細胞に対する様々な抗BCMA sdAbを含む例示的な単一特異性CARを発現するT細胞のインビトロIFNγ放出アッセイの結果を示す。 図4Aは、RPMI8226.Luc細胞(図4A〜4B)またはU87MG.Luc細胞(図4C)に対する例示的な多価BCMA CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 図4Aは、RPMI8226.Luc細胞(図4A〜4B)またはU87MG.Luc細胞(図4C)に対する例示的な多価BCMA CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 図4Aは、RPMI8226.Luc細胞(図4A〜4B)またはU87MG.Luc細胞(図4C)に対する例示的な多価BCMA CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 RPMI8226.Luc細胞(図5A)、K562.CD19.Luc細胞(図5B)、A549.Luc細胞(図5C)、U87MG.Luc細胞(図5D)、またはRaji.Luc細胞(図5E)に対する例示的な二価BCMA CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 RPMI8226.Luc細胞(図5A)、K562.CD19.Luc細胞(図5B)、A549.Luc細胞(図5C)、U87MG.Luc細胞(図5D)、またはRaji.Luc細胞(図5E)に対する例示的な二価BCMA CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 RPMI8226.Luc細胞(図5A)、K562.CD19.Luc細胞(図5B)、A549.Luc細胞(図5C)、U87MG.Luc細胞(図5D)、またはRaji.Luc細胞(図5E)に対する例示的な二価BCMA CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 RPMI8226.Luc細胞(図5A)、K562.CD19.Luc細胞(図5B)、A549.Luc細胞(図5C)、U87MG.Luc細胞(図5D)、またはRaji.Luc細胞(図5E)に対する例示的な二価BCMA CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 RPMI8226.Luc細胞(図5A)、K562.CD19.Luc細胞(図5B)、A549.Luc細胞(図5C)、U87MG.Luc細胞(図5D)、またはRaji.Luc細胞(図5E)に対する例示的な二価BCMA CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 図5Fは、K562.BCMA.Luc細胞及びK562.CD38.Luc細胞に対する例示的な二価BCMA CARを発現するT細胞のインビトロ細胞毒性アッセイの結果を示す。 2つの異なるエフェクター細胞対標的細胞比でK562.BCMA.Luc細胞に対する例示的な二価BCMA CARを発現するT細胞のインビトロIFNγ放出アッセイの結果を示す。 RPMI8226.Luc、A549.Luc、K562.CD38.Luc、及びRaji.Luc細胞に対する例示的な二価BCMA CARを発現するT細胞のインビトロIFNγ放出アッセイの結果を示す。 図7A〜図7Cは、K562.BCMA.Luc細胞及びK562.CD38.Luc細胞(陰性対照)に対する3つの例示的なVHHフラグメントの結合を示す。 図7A〜図7Cは、K562.BCMA.Luc細胞及びK562.CD38.Luc細胞(陰性対照)に対する3つの例示的なVHHフラグメントの結合を示す。 図7A〜図7Cは、K562.BCMA.Luc細胞及びK562.CD38.Luc細胞(陰性対照)に対する3つの例示的なVHHフラグメントの結合を示す。 BCMAの細胞外ドメインの結晶構造を示す。 BCMAエピトープペプチドを示す。 図9A及び図9BはVHH1及びVHH2のエピトープマッピングアッセイの結果を示す。 図9A及び図9BはVHH1及びVHH2のエピトープマッピングアッセイの結果を示す。 CHO−BCMA細胞を用いた競合結合アッセイの結果を示す。 RPMI8226.Luc細胞に対してLCAR−B38Mを発現するドナー由来T細胞のインビトロ細胞毒性を示す。 図12Aは、RPMI8226.Luc細胞に対して選択されたドナーから調製されたLCAR−B38M CAR−T細胞のインビトロ細胞毒性を示す。 図12Bは、腫瘍異種移植片マウスモデルにおけるLCAR−B38M CAR−T細胞のインビボ抗腫瘍活性を示す。LCAR−B38M CAR−T処置マウス及び非形質導入T細胞(UnT)処置マウスにおける生物発光画像化データを示す。 図12Cは、腫瘍異種移植片マウスモデルにおけるLCAR−B38M CAR−T細胞のインビボ抗腫瘍活性を示す。CAR−T群及びUnT群におけるマウスの研究設計及び生物発光画像を示す。 図12Dは、腫瘍異種移植片マウスモデルにおけるLCAR−B38M CAR−T細胞のインビボ抗腫瘍活性を示す。UnT処置マウスからの肝臓の画像を示す。 図12Eは、腫瘍異種移植片マウスモデルにおけるLCAR−B38M CAR−T細胞のインビボ抗腫瘍活性を示す。UnT処置マウスの肝臓中の腫瘍を検証するエクスビボルシフェラーゼアッセイを示す。 図13A〜図13Fは、LCAR−B38M CAR−T細胞で処置した2匹のサルの臨床パラメータを示す。研究でモニタリングされた臨床パラメータは、体温(図13A)、体重(図13B)、完全血球算定(CBC、図13C及び13D)、ならびに血液生化学検査及びサイトカインレベル(図13E及び13F)を含む。 図13A〜図13Fは、LCAR−B38M CAR−T細胞で処置した2匹のサルの臨床パラメータを示す。研究でモニタリングされた臨床パラメータは、体温(図13A)、体重(図13B)、完全血球算定(CBC、図13C及び13D)、ならびに血液生化学検査及びサイトカインレベル(図13E及び13F)を含む。 図13A〜図13Fは、LCAR−B38M CAR−T細胞で処置した2匹のサルの臨床パラメータを示す。研究でモニタリングされた臨床パラメータは、体温(図13A)、体重(図13B)、完全血球算定(CBC、図13C及び13D)、ならびに血液生化学検査及びサイトカインレベル(図13E及び13F)を含む。 図13A〜図13Fは、LCAR−B38M CAR−T細胞で処置した2匹のサルの臨床パラメータを示す。研究でモニタリングされた臨床パラメータは、体温(図13A)、体重(図13B)、完全血球算定(CBC、図13C及び13D)、ならびに血液生化学検査及びサイトカインレベル(図13E及び13F)を含む。 図13A〜図13Fは、LCAR−B38M CAR−T細胞で処置した2匹のサルの臨床パラメータを示す。研究でモニタリングされた臨床パラメータは、体温(図13A)、体重(図13B)、完全血球算定(CBC、図13C及び13D)、ならびに血液生化学検査及びサイトカインレベル(図13E及び13F)を含む。 図13A〜図13Fは、LCAR−B38M CAR−T細胞で処置した2匹のサルの臨床パラメータを示す。研究でモニタリングされた臨床パラメータは、体温(図13A)、体重(図13B)、完全血球算定(CBC、図13C及び13D)、ならびに血液生化学検査及びサイトカインレベル(図13E及び13F)を含む。 図14A〜図14Cは、同じ3人の多発性骨髄腫患者から調製されたLCAR−B38M CAR−T細胞及びLCAR−B27S CAR−T細胞について、それぞれ、インビトロ細胞毒性アッセイを示す。図14Aは、多発性骨髄腫患者Aから調製されたLCAR−B38M CAR−T細胞及びLCAR−B27S CAR−T細胞のインビトロ細胞毒性の結果を示す。図14Bは、多発性骨髄腫患者Bから調製されたLCAR−B38M CAR−T細胞及びLCAR−B27S CAR−T細胞のインビトロ細胞毒性の結果を示す。図14Cは、多発性骨髄腫患者Cから調製されたLCAR−B38M CAR−T細胞及びLCAR−B27S CAR−T細胞のインビトロ細胞毒性の結果を示す。 図14A〜図14Cは、同じ3人の多発性骨髄腫患者から調製されたLCAR−B38M CAR−T細胞及びLCAR−B27S CAR−T細胞について、それぞれ、インビトロ細胞毒性アッセイを示す。図14Aは、多発性骨髄腫患者Aから調製されたLCAR−B38M CAR−T細胞及びLCAR−B27S CAR−T細胞のインビトロ細胞毒性の結果を示す。図14Bは、多発性骨髄腫患者Bから調製されたLCAR−B38M CAR−T細胞及びLCAR−B27S CAR−T細胞のインビトロ細胞毒性の結果を示す。図14Cは、多発性骨髄腫患者Cから調製されたLCAR−B38M CAR−T細胞及びLCAR−B27S CAR−T細胞のインビトロ細胞毒性の結果を示す。 図14A〜図14Cは、同じ3人の多発性骨髄腫患者から調製されたLCAR−B38M CAR−T細胞及びLCAR−B27S CAR−T細胞について、それぞれ、インビトロ細胞毒性アッセイを示す。図14Aは、多発性骨髄腫患者Aから調製されたLCAR−B38M CAR−T細胞及びLCAR−B27S CAR−T細胞のインビトロ細胞毒性の結果を示す。図14Bは、多発性骨髄腫患者Bから調製されたLCAR−B38M CAR−T細胞及びLCAR−B27S CAR−T細胞のインビトロ細胞毒性の結果を示す。図14Cは、多発性骨髄腫患者Cから調製されたLCAR−B38M CAR−T細胞及びLCAR−B27S CAR−T細胞のインビトロ細胞毒性の結果を示す。 図15Aは、VHに基づくCARの構造と、従来のscFvに基づくCARの構造とを比較する。左の概略構造は、VHHドメインを含む細胞外抗原結合ドメインを有する、例示的な単一特異性一価CARを示す。右の概略構造は、scFvドメインを含む細胞外抗原結合ドメインを有する、例示的な単一特異性一価CARを示す。 図15Bは、2つの抗原結合部位を有するVHに基づくCARの構造と、2つの抗原結合部位を有する従来のscFvに基づくCARの構造とを比較する。左の概略構造は、2つのVHドメインを含む細胞外抗原結合ドメインを有する、例示的なCARである。2つのVHドメインは、同じであってもよく、または異なってもよい。右の概略構造は、2つのscFvドメインを含む細胞外抗原結合ドメインを有する、例示的なCARを示す。2つのscFvドメインは、同じであってもよく、または異なってもよい。 図15Cは、例示的な二価及び二重特異性VHに基づくCARの概略構造を示す。左上パネルの概略構造は、2つの同一のVHドメインを含む細胞外抗原結合ドメインを有する例示的な1つのエピトープ、二価CARを示し、これらのそれぞれは、抗原Aのエピトープ1に特異的に結合する。右上のパネルの概略構造は、抗原Aのエピトープ1に特異的に結合する第1のVHドメイン及び抗原Aのエピトープ2に特異的に結合する第2のVHドメインを含む細胞外抗原結合ドメインを有する、例示的な2つのエピトープ、二価CARを示す。抗原Aのエピトープ1及びエピトープ2は、それらの構造及び/または配列において異なり得る。左下のパネルの概略構造は、抗原Aに特異的に結合する第1のVHドメイン及び抗原Bに特異的に結合する第2のVHドメインを含む細胞外抗原結合ドメインを有する、例示的な二重特異性CARを示す。抗原A及び抗原Bは、異なる抗原である。 図15Dは、3つ以上のVHドメインを有する、例示的なVHに基づくCARの概略構造を示す。CARは、互い直接、またはペプチドリンカーを介して融合される複数のVHドメインを有し得る。VHドメインは、同じであってもよく、または異なってもよい。異なるVHドメインは、同じ抗原または異なる抗原上の異なるエピトープに特異的に結合し得る。 図15Eは、2つの異なるVHに基づくCARを共発現する、例示的な操作された免疫エフェクター細胞を示す。左のパネルの例示的な操作された免疫エフェクター細胞は、2つの異なる単一特異性、一価CARを共発現する。中央のパネルの例示的な操作された免疫エフェクター細胞は、単一特異性、一価CAR、及び二重特異性または二価CARを共発現する。右のパネルの例示的な操作された免疫エフェクター細胞は、2つの異なる二重特異性または二価CARを共発現する。CARは、異なる抗原を認識し得る。
本出願は、抗BCMA単一ドメイン抗体(sdAb)、及び1つ以上のBCMA結合部分(抗BCMA sdAb等)を含む細胞外抗原結合ドメインを含むキメラ抗原受容体(CAR)を提供する。単一抗原に特異的に結合する、少なくとも2つの結合部分(sdAb等)を含む多価CARもまた、提供される。いくつかの実施形態では、本出願は、少なくとも2つの抗BCMA sdAbを含む多価(二価または三価等)CARを提供する。いくつかの実施形態では、少なくとも2つの抗BCMA sdAbは、BCMA上の異なるエピトープに特異的に結合する、異なる抗BCMA sdAbである。抗BCMA sdAb、CAR、及び本出願に記載されるCARを発現する操作された免疫エフェクター細胞は、がん治療のための有用な薬剤である。
特に、本出願は、ヒト患者の間で多発性骨髄腫を治療する際に、異なるBCMAエピトープを標的とする2つの抗BCMA sdAbを含む二価の2つのエピトープCAR(例えば、LCAR−B38M)の優れた有効性を実証している。第I/II相臨床試験の中
間分析では、再発性または難治性多発性骨髄腫を有する患者が、LCAR−B38M CAR−T治療に対して100%応答した。94%の患者は、CAR−T治療を受ける2カ月以内に骨髄腫の明らかな臨床的寛解を有した。ストリンジェントな完全奏効(sCR)基準に達した患者は、CAR−T治療を受けた1年超後に、最小の残留疾患がない状態を維持した。さらに、LCAR−B38M CAR−T治療は、ほとんどの患者がCAR−T細胞に基づいた治療の一般的な副作用である、軽度及び管理可能なサイトカイン放出症候群のみを経験したため、患者によって良好な耐容性を示した。患者は、神経学的副作用を経験しなかった。相対的に、単一の抗BCMA sdAbを含む一価CARのパイロット臨床研究は、治療された患者間のより低い客観的応答率及び完全寛解率、ならびにより高い再発率を示した。本出願前に、臨床研究下で全てのBCMA CARは、細胞外抗原結合ドメインにおいて1つのみのBCMA結合部分を有した。本出願の多価BCMA CARの改善された臨床的有効性及び安全性は予想外である。
したがって、本出願の一態様は、(a)BCMAに特異的に結合する複数の単一ドメイン抗体(sdAb)を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む、ポリペプチドを含む、多価CARを提供する。
別の態様では、(a)BCMAの第1のエピトープに特異的に結合する第1のBCMA結合部分(第1の抗BCMA sdAb等)、及びBCMAの第2のエピトープに特異的に結合する第2のBCMA結合部分(第2の抗BCMA sdAb等)を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む、ポリペプチドを含む、多価CARが提供され、第1のエピトープは、第2のエピトープとは異なる。
本明細書に記載の抗BCMA sdAbのうちの任意の1つ以上を含む新規の抗BCMA sdAb及びCARが、さらに提供される。
CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)、操作された免疫エフェクター細胞またはsdAbを使用してがんを治療する薬学的組成物、キット、製品、及び方法も本明細書に記載される。
I.定義
「抗体」という用語は、モノクローナル抗体(免疫グロブリンFc領域を有する全長4鎖抗体または全長重鎖のみ抗体を含む)、ポリエピトープ特異性を有する抗体組成物、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体、ダイアボディ、及び一本鎖分子)、ならびに抗体フラグメント(例えば、Fab、F(ab’)、及びFv)を含む。「免疫グロブリン」(Ig)という用語は、本明細書において「抗体」と同義に使用される。本明細書において企図される抗体は、重鎖のみ抗体等の単一ドメイン抗体を含む。
基本的な4鎖抗体ユニットは、2本の同一の軽(L)鎖及び2本の同一の重(H)鎖から構成されるヘテロ四量体糖タンパク質である。IgM抗体は、5つの基本的なヘテロ四量体ユニットに加えて、J鎖と呼ばれる追加のポリペプチドから成り、10個の抗原結合部位を含有しているが、一方でIgA抗体は、2〜5個の基本的な4鎖ユニットから構成されており、このユニットは、重合してJ鎖と組み合わさった多価集合体を形成することができる。IgGの場合、4鎖ユニットは、一般に、約150,000ダルトンである。各L鎖は、1つのジスルフィド共有結合によってH鎖に連結されているが、一方で2本のH鎖は、H鎖アイソタイプに応じて1つ以上のジスルフィド結合によって互いに連結されている。H鎖及びL鎖はそれぞれ、規則的に離間した鎖間ジスルフィド架橋も有する。各H鎖は、N末端に可変ドメイン(V)を有し、続いて、α及びγ鎖の各々については3つの定常ドメイン(C)、ならびにμ及びεアイソタイプについては4つのCドメイ
ンを有する。各L鎖は、N末端に可変ドメイン(V)を有し、続いてその反対側の端部に定常ドメインを有する。Vは、Vと整合しており、Cは、重鎖の第1の定常ドメイン(C1)と整合している。特定のアミノ酸残基が軽鎖可変ドメインと重鎖可変ドメインとの間に界面を形成すると考えられている。VとVとが一緒に対合することにより、単一の抗原結合部位を形成する。異なるクラスの抗体の構造及び特性については、例えば、Basic and Clinical Immunology,8th Edition,Daniel P.Sties,Abba I.Terr and Tristram G.Parsolw(eds),Appleton & Lange,Norwalk,Conn.,1994、71頁及び6章を参照されたい。任意の脊椎動物種に由来するL鎖は、それらの定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパ及びラムダと呼ばれる2つの明確に異なる種類のうちの1つに割り当てられ得る。それらの重鎖の定常ドメイン(C)のアミノ酸配列に応じて、免疫グロブリンは、異なるクラスまたはアイソタイプに割り当てられ得る。5つのクラスの免疫グロブリン:IgA、IgD、IgE、IgG、及びIgMがあり、それぞれ、α、δ、ε、γ、及びμと表記される重鎖を有する。γ及びαクラスは、C配列及び機能における比較的わずかな相違に基づいてさらにサブクラスに分類され、例えば、ヒトは、以下のサブクラス:IgG1、IgG2A、IgG2B、IgG3、IgG4、IgA1、及びIgA2を発現する。
「重鎖のみ抗体」または「HCAb」という用語は、重鎖を含むが、4鎖抗体に通常見出される軽鎖を欠いている、機能的抗体を指す。ラクダ科動物(ラクダ、ラマ、またはアルパカ等)は、HCAbを産生することが既知である。
「単一ドメイン抗体」または「sdAb」という用語は、3つの相補性決定領域(CDR)を有する、単一の抗原結合ポリペプチドを指す。sdAbは、単独で、対応するCDR含有ポリペプチドと対合せずに、抗原に結合することが可能である。いくつかの場合では、単一ドメイン抗体は、ラクダ科HCAbから操作され、それらの重鎖可変ドメインは、本明細書で「VH」と称される。いくつかのVHはまた、ナノボディとしても既知であり得る。ラクダ科sdAbは、最小の既知の抗原結合抗体フラグメントのうちの1つである(例えば、Hamers−Casterman et al.,Nature 363:446−8(1993)、Greenberg et al.,Nature 374:168−73(1995)、Hassanzadeh−Ghassabeh et
al.,Nanomedicine(Lond),8:1013−26(2013)を参照のこと)。基本的なVHは、N末端からC末端まで、以下の構造:FR1−CDR1−FR2−CDR2−FR3−CDR3−FR4を有し、ここでは、FR1〜FR4は、それぞれフレームワーク領域1〜4を指し、CDR1〜CDR3は、相補性決定領域1〜3を指す。
「単離された」抗体は、その産生環境(例えば、天然または組換え)の成分から特定、分離、及び/または回収されたものである。好ましくは、単離されたポリペプチドは、その産生環境からの全ての他の成分との会合を含まない。組換えトランスフェクト細胞に起因するもの等のその産生環境の混入成分は、抗体の研究、診断的、または治療的使用を典型的に妨げるであろう材料であり、これらとしては、酵素、ホルモン、及び他のタンパク質性もしくは非タンパク質性の溶質が挙げられ得る。好ましい実施形態では、ポリペプチドは、(1)例えば、ローリー法によって決定される、抗体の95重量%超、いくつかの実施形態では、99重量%超になるまで、(1)スピニングカップシークエネーターを使用して、N末端または内部アミノ酸配列の少なくとも15個の残基を得るのに十分な程度まで、または(3)クマシーブルー、または好ましくはシルバー染色を使用して、非還元または還元条件下でSDS−PAGEによって均質性が得られるまで、精製されるであろう。単離された抗体には、抗体の自然環境の少なくとも1つの成分が存在しないため、組換え細胞内でインサイツの抗体が含まれる。しかしながら、通常、単離されたポリペプチ
ドまたは抗体は、少なくとも1つの精製ステップによって調製される。
抗体の「可変領域」または「可変ドメイン」とは、抗体の重鎖または軽鎖のアミノ末端ドメインを指す。重鎖及び軽鎖の可変ドメインは、それぞれ、「V」及び「V」と称され得る。これらのドメインは、一般に、抗体の最も可変性の高い部分であり(同じクラスの他の抗体と比べて)、抗原結合部位を含有する。ラクダ科種からの重鎖のみ抗体は、単一の重鎖可変領域を有し、これは、「VH」と称される。このため、VHは、Vの特殊なタイプである。
「可変」という用語は、可変ドメインのある特定のセグメントが、抗体によって配列が大幅に異なるという事実を指す。Vドメインは、抗原結合を媒介し、特定の抗体の、その特定の抗原に対する特異性を定義する。しかしながら、可変性は、可変ドメイン全体に均等に分布しているわけではない。むしろ、それは、軽鎖及び重鎖の両方の可変ドメインにおいて、超可変領域(HVR)と呼ばれる3つのセグメントに集中している。可変ドメインのより高度に保存された部分は、フレームワーク領域(FR)と呼ばれる。天然の重鎖及び軽鎖の可変ドメインは各々、ベータ−シート構造を接続し、いくつかの場合では、ベータ−シート構造の一部を形成するループを形成する3つのHVRによって連結されたベータシート立体配置を大いに採用する4つのFR領域を含む。各鎖のHVRは、FR領域によって極めて近接して一緒に保持され、他方の鎖からのHVRとともに、抗体の抗原結合部位の形成に寄与する(Kabat et al.,Sequences of Immunological Interest,Fifth Edition,National Institute of Health,Bethesda,Md.(1991)を参照されたい)。定常ドメインは、抗原への抗体の結合に直接関与しないが、抗体依存性細胞毒性における抗体の関与等の種々のエフェクター機能を示す。
「モノクローナル抗体」という用語は、本明細書で使用されるとき、実質的に同種の抗体集団から得られる抗体を指す、すなわち、その集団に含まれる個々の抗体は、微量で存在し得る可能性のある自然に発生する変異及び/または翻訳後修飾(例えば、異性化、アミド化)を除き、同一である。モノクローナル抗体は、高度に特異的であり、単一の抗原部位を対象としている。異なる決定基(エピトープ)を対象とする異なる抗体を典型的に含むポリクローナル抗体調製物とは対照的に、各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基を対象としている。それらの特異性に加えて、モノクローナル抗体は、それらが、ハイブリドーマ培養により合成され、他の免疫グロブリンが混入されていないという点で、有利である。「モノクローナル」という修飾語は、実質的に同種の抗体集団から得られるという抗体の特徴を示し、任意の特定の方法による抗体の産生を必要とするものと解釈されるべきではない。例えば、本出願に従って使用されるモノクローナル抗体は、例えば、ハイブリドーマ法(例えば、Kohler and Milstein.,Nature,256:495−97(1975)、Hongo et al.,Hybridoma,14(3):253−260(1995)、Harlow et al.,Antibodies:A Laboratory Manual,(Cold Spring Harbor Laboratory Press,2nded.1988)、Hammerling et al.,in:Monoclonal Antibodies and T−Cell Hybridomas 563−681(Elsevier,N.Y.,1981))、組換えDNA法(例えば、米国特許第4,816,567号を参照されたい)、ファージディスプレイ技術(例えば、Clackson et al.,Nature,352:624−628(1991)、Marks et al.,J.Mol.Biol.222:581−597(1992)、Sidhu et al.,J.Mol.Biol.338(2):299−310(2004)、Lee et al.,J.Mol.Biol.340(5):1073−1093(2004)、Fellouse,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101(34):1246
7−12472(2004);及びLee et al.,J.Immunol.Methods 284(1−2):119−132(2004)を参照されたい)、及びヒト免疫グロブリン配列をコードするヒト免疫グロブリン遺伝子座または遺伝子の一部または全てを有する動物におけるヒト抗体またはヒト様抗体の産生技術(例えば、WO1998/24893、WO1996/34096、WO1996/33735、WO1991/10741、Jakobovits et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:2551(1993)、Jakobovits et al.,Nature 362:255−258(1993)、Bruggemann et al.,Year in Immunol.7:33(1993);米国特許第5,545,807号、同第5,545,806号、同第5,569,825号、同第5,625,126号、同第5,633,425号、及び同第5,661,016号、Marks et
al.,Bio/Technology 10:779−783(1992)、Lonberg et al.,Nature 368:856−859(1994)、Morrison,Nature 368:812−813(1994)、Fishwild et al.,Nature Biotechnol.14:845−851(1996)、Neuberger,Nature Biotechnol.14:826(1996)、ならびにLonberg and Huszar,Intern.Rev.Immunol.13:65−93(1995)を参照されたい)を含む様々な技術によって作製され得る。
「ネイキッド抗体」という用語は、細胞毒性部分または放射標識にコンジュゲートしていない抗体を指す。
「全長抗体」、「インタクトな抗体」、または「全抗体」という用語は、抗体フラグメントとは対照的に、その実質的にインタクトな形態にある抗体を指して同義に使用される。具体的には、全長4鎖抗体Fc領域を含む重鎖及び軽鎖を有するものを含む。全長重鎖のみ抗体は、重鎖(VH等)及びFc領域を含む。定常ドメインは、天然配列の定常ドメイン(例えば、ヒト天然配列の定常ドメイン)またはそのアミノ酸配列変異形であり得る。いくつかの場合では、インタクトな抗体は、1つ以上のエフェクター機能を有し得る。
「抗体フラグメント」は、インタクトな抗体の一部分、好ましくはインタクト抗体の抗原結合領域及び/または可変領域を含む。抗体フラグメントの例としては、Fab、Fab’、F(ab’)、及びFvフラグメント;ダイアボディ;直鎖抗体(米国特許第5,641,870号、実施例2、Zapata et al.,Protein Eng.8(10):1057−1062[1995]を参照されたい);一本鎖抗体分子;単一ドメイン抗体(VH等)、ならびに抗体フラグメントから形成された多重特異性抗体が挙げられる。抗体のパパイン消化により、「Fab」フラグメントと呼ばれる2つの同一の抗原結合フラグメントと、容易に結晶化する能力を反映して表記される残りの「Fc」フラグメントとが得られた。Fabフラグメントは、L鎖全体に加えて、H鎖の可変領域ドメイン(V)、ならびに1つの重鎖の第1の定常ドメイン(C1)からなる。各Fabフラグメントは、抗原結合に関しては一価である、すなわち、単一の抗原結合部位を有する。抗体のペプシン処理により、単一の大きいF(ab’)フラグメントが得られ、これは、異なる抗原結合活性を有する2つのFabフラグメントがジスルフィド結合したものにほぼ相当し、依然として抗原に架橋することが可能である。Fab’フラグメントは、抗体ヒンジ領域からの1つ以上のシステインを含め、C1ドメインのカルボキシ末端に数個の追加の残基を有することが、Fabフラグメントとは異なる。Fab’−SHは、定常ドメインのシステイン残基(複数可)が遊離チオール基を持つFab’の本明細書における表記である。F(ab’)抗体フラグメントは、元来、間にヒンジシステインを有するFab’フラグメントの対として産生されたものであった。抗体フラグメ
ントの他の化学的カップリングも既知である。
Fcフラグメントは、ジスルフィドによって一緒に保持された両方のH鎖のカルボキシ末端を含む。抗体のエフェクター機能は、Fc領域における配列によって決定され、この領域はまた、ある特定の細胞型に見られるFc受容体(FcR)によって認識される。
「Fv」は、完全な抗原認識部位及び抗原結合部位を含有する最小の抗体フラグメントである。このフラグメントは、1つの重鎖可変領域ドメインと1つの軽鎖可変領域ドメインが、非共有結合で緊密に結合した二量体から成る。これらの2つのドメインの折り畳みにより、抗原結合のためのアミノ酸残基を提供し、抗原結合特異性を抗体に与える、6つの超可変ループ(H鎖及びL鎖からそれぞれ3つのループ)が生じる。しかしながら、全結合部位よりも低い親和性であるが、単一の可変ドメイン(または抗原に特異的なHVRを3つしか含まないFvの半分)でさえも、抗原を認識し、それに結合する能力を有する。
「sFv」または「scFv」とも略称される「一本鎖Fv」は、連結されて単一のポリペプチド鎖となったV及びV抗体ドメインを含む抗体フラグメントである。好ましくは、sFvポリペプチドは、V及びVドメイン間にポリペプチドリンカーをさらに含んでおり、sFvが抗原結合に所望される構造を形成することを可能にする。sFvの概説については、Pluckthun in The Pharmacology of
Monoclonal Antibodies,vol.113,Rosenburg
and Moore eds.,Springer−Verlag,New York,pp.269−315(1994)を参照されたい。
本明細書に記載の抗体の「機能性フラグメント」は、インタクトな抗体の一部分を含み、これには、一般に、インタクトな抗体の抗原結合領域もしくは可変領域、またはFcR結合能力を保持するかもしくは修飾されたFcR結合能力を有する抗体のFc領域が含まれる。抗体フラグメントの例としては、直鎖抗体、一本鎖抗体分子、及び抗体フラグメントから形成された多重特異性抗体が挙げられる。
「ダイアボディ」という用語は、鎖内ではなく鎖間のVドメイン対合を達成し、それによって二価フラグメント、すなわち、2つの抗原結合部位を有するフラグメントが得られるようにV及びVドメイン間に短いリンカー(約5〜10個の残基)を用いてsFvフラグメント(前の段落を参照されたい)を構築することによって調製された小さい抗体フラグメントを指す。二重特異性ダイアボディは、2つの抗体のV及びVドメインが異なるポリペプチド鎖に存在している、2つの「交差」sFvフラグメントのヘテロ二量体である。ダイアボディは、例えば、欧州特許第404,097号、国際公開第WO93/11161号、Hollinger et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444−6448(1993)を参照されたい。
本明細書におけるモノクローナル抗体は、重鎖及び/または軽鎖の一部分が、特定の種に由来するか、または特定の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体における対応する配列と同一または同種である一方で、鎖(複数可)の残りが、別の種に由来するか、または別の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体における対応する配列と同一または同種である「キメラ」抗体(免疫グロブリン)、ならびにかかる抗体のフラグメントを特異的に含むが、これは、それらが所望の生物学的活性を呈する場合に限る(米国特許第4,816,567号、Morrison et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851−6855(1984))。本明細書における目的とするキメラ抗体としては、PRIMATTZFD(登録商標)抗体が含まれ、ここで、この抗体の抗原結合領域は、例えば、マカクザルに目的とする抗原で免疫化を行うことによ
って産生される抗体に由来する。本明細書で使用されるとき、「ヒト化抗体」は、「キメラ抗体」のサブセットとして使用される。
非ヒト(例えば、ラクダ科)抗体の「ヒト化」形態は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小配列を含むキメラ抗体である。いくつかの実施形態では、ヒト化抗体は、レシピエントのHVR(以下に定義される)からの残基が、所望される特異性、親和性、及び/または能力を有するマウス、ラット、ウサギ、または非ヒト霊長類等の非ヒト種(ドナー抗体)のHVRからの残基で置き換えられている、ヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)である。いくつかの事例では、ヒト免疫グロブリンのフレームワーク(「FR」)残基は、対応する非ヒト残基で置き換えられている。さらに、ヒト化抗体は、レシピエント抗体にも供与体抗体にも見られない残基を含み得る。これらの修飾は、結合親和性等の抗体の性能をさらに改良するために行われ得る。一般に、ヒト化抗体は、少なくとも1つ、典型的には2つの可変ドメインの実質的に全てを含むことになり、ここで、超可変ループの全てまたは実質的に全てが、非ヒト免疫グロブリン配列のものに対応し、FR領域の全てまたは実質的に全てが、ヒト免疫グロブリン配列のものに対応するが、FR領域には、結合親和性、異性体化、免疫原性等の抗体の性能を向上させる1つ以上の個々のFR残基置換が含まれてもよい。FRにおけるこれらのアミノ酸置換の数は、典型的に、H鎖では6個以下であり、L鎖では3個以下である。ヒト化抗体はまた、任意に、免疫グロブリン定常領域の少なくとも一部分(Fc)、典型的にはヒト免疫グロブリンの少なくとも一部分を含む。さらなる詳細については、例えば、Jones et al.,Nature 321:522−525(1986)、Riechmann et al.,Nature 332:323−329(1988)、及びPresta,Curr.Op.Struct.Biol.2:593−596(1992)を参照されたい。例えば、Vaswani and Hamilton,Ann.Allergy,Asthma & Immunol.1:105−115(1998)、Harris,Biochem.Soc.Transactions 23:1035−1038(1995)、Hurle and Gross,Curr.Op.Biotech.5:428−433(1994)、ならびに米国特許第6,982,321号及び同第7,087,409号も参照されたい。
「ヒト抗体」は、ヒトによって産生された抗体のアミノ酸配列に対応するアミノ酸配列を有する抗体、及び/または本明細書に開示されるヒト抗体を作製する技術のうちの任意のものを用いて作製された抗体である。ヒト抗体のこの定義は、非ヒト抗原結合残基を含むヒト化抗体を明確に除外する。ヒト抗体は、ファージディスプレイライブラリを含む当技術分野で既知の種々の技術を使用して産生され得る。Hoogenboom and Winter,J.Mol.Biol.,227:381(1991)、Marks et al.,J.Mol.Biol.,222:581(1991)。Cole et al.,Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,p.77(1985)、Boerner et al.,J.Immunol.,147(1):86−95(1991)に記載される方法も、ヒトモノクローナル抗体の調製のために利用可能である。van Dijk and
van de Winkel,Curr.Opin.Pharmacol.,5:368−74(2001)も参照されたい。ヒト抗体は、抗原攻撃に応答してかかる抗体を産生するように修飾されているが、その内因性遺伝子座が無効化されているトランスジェニック動物、例えば、免疫化異種マウスに抗原を投与することにより調製され得る(例えば、XENOMOUSE(商標)技術に関しては、米国特許第6,075,181号及び同第6,150,584号を参照されたい)。例えば、ヒトB細胞ハイブリドーマ技術により生成されるヒト抗体についても、Li et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,103:3557−3562(2006)を参照されたい。
本明細書で使用されるとき、「超可変領域」、「HVR」、または「HV」という用語は、配列が超可変性であり、及び/または構造的に定義されたループを形成する抗体可変ドメインの領域を指す。一般に、sdAbは、3つのHVR(またはCDR):HVR1(またはCDR1)、HVR2(またはCDR2)、及びHVR3(またはCDR3)を含む。HVR3は、3つのHVRのうちの最も高い多様性を呈し、抗体への優れた特異性を与える上で特有の役割を果たすと考えられる。例えば、Hamers−Casterman et al.,Nature 363:446−448(1993)、Sheriff et al.,Nature Struct.Biol.3:733−736(1996)を参照されたい。
「相補性決定領域」または「CDR」という用語は、Kabat方式によって定義されるような超可変領域を指すために使用される。Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991)を参照されたい。
いくつかのHVR描写が本明細書で使用され、本明細書に包含される。Kabat相補性決定領域(CDR)は、配列可変性に基づくものであり、最も一般的に使用されている(Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991)を参照されたい)。Chothiaは、代わりに、構造ループの位置を示す(Chothia and Lesk,J.Mol.Biol.196:901−917(1987))。AbM HVRは、Kabat HVRとChothia構造的ループとの間の妥協案を示し、Oxford MolecularのAbM抗体モデリングソフトウェアにより使用される。「接触」HVRは、利用可能な複合体結晶構造の分析に基づく。これらのHVRの各々の残基を、以下の表1に記載する。
Figure 2021087455
HVRは、以下の「伸長HVR」を含み得る:Vにおいて、24〜36または24〜34(L1)、46〜56または50〜56(L2)、及び89〜97または89〜96(L3)、ならびにVにおいて、26〜35(H1)、50〜65または49〜65(
H2)、及び93〜102、94〜102、または95〜102(H3)。可変ドメイン残基は、これらの定義の各々について、Kabat et al.(上記参照)に従って番号付けされる。
sdAb(VH等)のアミノ酸残基は、Riechmann and Muyldermans,J.Immunol.Methods 2000 Jun.23;240(1−2):185−195の論文において、ラクダ科からのVHドメインに適用されるように、Kabat et al.(「Sequence of proteins of immunological interest」,US Public Health Services,NIH Bethesda,Md.,Publication
No.91)によって与えられる、Vドメインに対する一般的な番号付けに従って番号付けされる。この番号付けによれば、VHのFR1は、1〜30位のアミノ酸残基を含み、VHのCDR1は、31〜35位のアミノ酸残基を含み、VHのFR2は、36〜49位のアミノ酸残基を含み、VHのCDR2は、50〜65位のアミノ酸残基を含み、VHのFR3は、66〜94位のアミノ酸残基を含み、VHのCDR3は、95〜102位のアミノ酸残基を含み、VHのFR4は、103〜113位のアミノ酸残基を含む。この点に関して、当該技術分野で周知であるが、Vドメインについて、及びVHドメインについて、CDRの各々におけるアミノ酸残基の総数は変動し得、Kabat番号付けによって示されるアミノ酸残基の総数に対応しない場合がある(つまり、Kabat番号付けによる1つ以上の位置が、実際の配列において占有されない場合があるか、または実際の配列が、Kabat番号付けによって許容される数よりも多いアミノ酸残基を含有する場合がある)ことに留意すべきである。
「Kabatにあるような可変ドメイン残基番号付け」または「Kabatにあるようなアミノ酸位置番号付け」という表現、及びそれらの変形形態は、Kabatら(上記)における抗体の編成において重鎖可変ドメインまたは軽鎖可変ドメインに使用されている番号付けシステムを指す。この番号付けシステムを使用して、実際の直鎖状アミノ酸配列は、可変ドメインのFRもしくはHVRの短縮、またはそれへの挿入に対応するより少ないアミノ酸または追加のアミノ酸を含有し得る。例えば、重鎖可変ドメインは、H2の残基52後に単一のアミノ酸挿入(Kabatに従って残基52a)を、そして重鎖FR残基82後に挿入された残基(例えば、Kabatに従って残基82a、82b、及び82c等)を含んでもよい。残基のKabat番号付けは、所与の抗体に対して、抗体の配列と「標準の」Kabatによって番号付けされた配列との相同領域での整合によって決定され得る。
本明細書において別途指示がない限り、免疫グロブリン重鎖内の残基の番号付けは、上記のKabat et al.にあるようなEU指標のものである。「KabatにあるようなEU指標」は、ヒトIgG1 EU抗体の残基番号付けを指す。
「フレームワーク」または「FR」残基は、本明細書に定義されるHVR残基以外の可変ドメイン残基である。
「ヒトコンセンサスフレームワーク」または「アクセプターヒトフレームワーク」は、ヒト免疫グロブリンVまたはVフレームワーク配列の選択において最も一般的に生じるアミノ酸残基を表すフレームワークである。一般に、ヒト免疫グロブリンVまたはV配列の選択は、可変ドメイン配列のサブグループからである。一般に、配列のサブグループは、Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5thEd.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991)にあるようなサブグループである。例とし
ては、Vに関するものが含まれ、サブグループは、上記のKabat et al.にあるようなサブグループカッパI、カッパII、カッパIII、またはカッパIVであり得る。さらに、VHについては、サブグループは、Kabat et al.にあるようなサブグループI、サブグループII、またはサブグループIIIであり得る。あるいは、ヒトコンセンサスフレームワークは、特定の残基、例えば、ドナーフレームワーク配列を種々のヒトフレームワーク配列の集合と整合することによって、ヒトフレームワーク残基が、ドナーフレームワークに対するその相同性に基づいて選択される場合等、上記のものに由来し得る。ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワーク「に由来する」アクセプターヒトフレームワークは、それと同じアミノ酸配列を含んでもよく、またはそれは既存のアミノ酸配列変化を含有してもよい。いくつかの実施形態では、既存のアミノ酸変化の数は、10個以下、9個以下、8個以下、7個以下、6個以下、5個以下、4個以下、3個以下、または2個以下である。
例えば、Fc領域の指定された位置における「アミノ酸修飾」は、指定された残基の置換もしくは欠失、または指定された残基に隣接する少なくとも1個のアミノ酸残基の挿入を指す。指定された残基に「隣接する」挿入とは、その1〜2個の残基内への挿入を意味する。挿入は、指定された残基のN末端側またはC末端側であり得る。本明細書における好ましいアミノ酸修飾は、置換である。
「親和性成熟」抗体は、その1つ以上のHVRに1つ以上の変化を有し、これらの変化が、それらの変化(複数可)を有しない親抗体と比較して、抗原に対する抗体の親和性の向上をもたらすものである。いくつかの実施形態では、親和性成熟抗体は、標的抗原に対するナノモルまたはさらにはピコモルの親和性を有する。親和性成熟抗体は、当該技術分野で既知の手順によって産生される。例えば、Marks et al.,Bio/Technology 10:779−783(1992)は、V及びVドメインシャフリングによる親和性成熟を記載している。HVR及び/またはフレームワーク残基のランダム変異生成は、例えば、Barbas et al.Proc Nat.Acad.Sci.USA 91:3809−3813(1994)、Schier et al.Gene 169:147−155(1995)、Yelton et al.J.Immunol.155:1994−2004(1995)、Jackson et al.,J.Immunol.154(7):3310−9(1995)、及びHawkins et al,J.Mol.Biol.226:889−896(1992)に記載されている。
本明細書で使用されるとき、「特異的に結合する」、「特異的に認識する」、または「に対して特異的な」という用語は、標的と抗原結合タンパク質(CARまたはsdAb等)との間の結合等の測定可能及び再生可能な相互作用を指し、それは、生体分子を含む分子の不均一な集団の存在下で標的の存在を確定させる。例えば、標的(エピトープであり得る)に特異的に結合する抗原結合タンパク質(CARまたはsdAb等)は、他の標的に結合するよりも高い親和性、結合力で、より容易に、及び/またはより長い持続時間でこの標的に結合する、抗原結合タンパク質(CARまたはsdAb等)である。いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質(CARまたはsdAb等)が無関係の標的に結合する程度は、例えば、ラジオイムノアッセイ(RIA)によって測定される際、抗原結合タンパク質(CARまたはsdAb等)の約10%未満である。いくつかの実施形態では、標的に特異的に結合する抗原結合タンパク質(CARまたはsdAb等)は、1μM以下、100nM以下、10nM以下、1nM以下、または0.1nM以下の解離定数(Kd)を有する。いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質(CARまたはsdAb等)は、異なる種由来のタンパク質間で保存されるタンパク質上のエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、特異的結合は、排他的結合を含み得るが、それを必要としない。
「特異性」という用語は、抗原の特定のエピトープに対する抗原結合タンパク質(CARまたはsdAb等)の選択的認識を指す。例えば、自然抗体は、単一特異性である。「多重特異性」という用語は、本明細書で使用されるとき、抗原結合タンパク質(CARまたはsdAb等)が、2つ以上の抗原結合部位を有し、これらの少なくとも2つは、異なる抗原に結合することを示す。「二重特異性」は、本明細書で使用されるとき、抗原結合タンパク質(CARまたはsdAb等)が、2つの異なる抗原結合特異性を有することを示す。「単一特異性」CARという用語は、本明細書で使用されるとき、各々が同じ抗原に結合する、1つ以上の結合部位を有する、抗原結合タンパク質(CARまたはsdAb等)を示す。
「価」という用語は、本明細書で使用されるとき、抗原結合タンパク質(CARまたはsdAb等)における指定された数の結合部位の存在を示す。例えば、自然抗体、または全長抗体は、2つの結合部位を有し、二価である。したがって、「三価」、「四価」、「五価」、及び「六価」という用語は、抗原結合タンパク質(CARまたはsdAb等)における、それぞれ、2つの結合部位、3つの結合部位、4つの結合部位、5つの結合部位、及び6つの結合部位の存在を示す。
抗体の「エフェクター機能」は、抗体のFc領域(天然配列のFc領域またはアミノ酸配列変異形Fc領域)に帰属する生物学的活性を指し、抗体のアイソタイプに応じて多様である。抗体エフェクター機能の例としては、C1q結合及び補体依存性細胞毒性;Fc受容体結合;抗体依存性細胞媒介細胞毒性(ADCC);食作用;細胞表面受容体(例えば、B細胞受容体)の下方制御;及びB細胞活性化が挙げられる。「低減または最小化された」抗体エフェクター機能は、野生型または未修飾抗体から少なくとも50%(あるいは、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%)低減されていることを示す。抗体エフェクター機能の決定は、当業者によって容易に決定可能かつ測定可能である。好ましい実施形態では、補体結合、補体依存性細胞毒性、及び抗体依存性細胞毒性の抗体エフェクター機能が、影響される。いくつかの実施形態では、エフェクター機能は、グリコシル化を排除した定常領域における変異、例えば、「エフェクターレス変異」を通じて排除される。一態様では、エフェクターレス変異は、C2領域におけるN297AまたはDANA変異(D265A+N297A)である。Shields et al.,J.Biol.Chem.276(9):6591−6604(2001)。あるいは、低減または排除されたエフェクター機能をもたらす追加の変異としては、K322A及びL234A/L235A(LALA)が挙げられる。あるいは、エフェクター機能は、グリコシル化しない宿主細胞(例えば、E.coli.)、またはエフェクター機能を促進する際に非効果的であるか、もしくはあまり効果的ではない、改変されたグリコシル化パターンをもたらす宿主細胞における発現等の産生技術を通じて、低減または排除され得る(例えば、Shinkawa et al.,J.Biol.Chem.278(5):3466−3473(2003)。
「抗体依存性細胞媒介性細胞毒性」またはADCCは、ある特定の細胞毒性細胞(例えばナチュラルキラー(NK)細胞、好中球、及びマクロファージ)上に存在するFc受容体(FcR)と結合した分泌Igが、これらの細胞毒性エフェクター細胞が抗原保有標的細胞と特異的に結合して、続いて細胞毒を用いて標的細胞を死滅させることができるようにする細胞毒性の形態を指す。抗体は、細胞毒性細胞で「武装」し、この機序により標的細胞を死滅させるために必要である。ADCCを媒介するための初代細胞であるNK細胞がFcγRIIIのみを発現する一方で、単球は、FcγRI、FcγRII、及びFcγRIIIを発現する。造血細胞上のFc発現は、Ravetch and Kinet,Annu.Rev.Immunol.9:457−92(1991)の464頁の表3に要約されている。目的とする分子のADCC活性を評価するために、米国特許第5,5
00,362号または同第5,821,337号に記載のアッセイ等のインビトロADCCアッセイが行われ得る。このようなアッセイのための有用なエフェクター細胞には、末梢血単核細胞(PBMC)及びナチュラルキラー(NK)細胞が含まれる。あるいは、または加えて、目的とする分子のADCC活性は、インビボで、例えば、Clynes et al.,PNAS USA 95:652−656(1998)に開示されるもの等の動物モデルで評価されてもよい。
本明細書における「Fc領域」という用語は、免疫グロブリン重鎖のC末端領域を定義して使用され、天然配列のFc領域及び変異形Fc領域が含まれる。免疫グロブリン重鎖のFc領域の境界は様々であり得るが、ヒトIgG重鎖Fc領域は通常、Cys226位のアミノ酸残基から、またはPro230から、そのカルボキシル末端まで伸びると定義される。Fc領域のC末端リジン(EU番号付けシステムによると残基447)は、例えば、抗体の産生もしくは精製の間に、または抗体の重鎖をコードする核酸を組換え操作することによって、除去されてもよい。したがって、インタクトな抗体の組成物は、全K447残基が除去された抗体集団、除去されたK447残基がない抗体集団、及びK447残基を有する抗体と有しない抗体との混合物を有する抗体集団を含んでもよい。本明細書に記載の抗体における使用に好適な天然配列のFc領域としては、ヒトIgG1、IgG2(IgG2A、IgG2B)、IgG3、及びIgG4が挙げられる。
「結合親和性」は、一般に、分子(例えば、抗体またはCAR)の単一結合部位とその結合パートナー(例えば、抗原)との間の非共有結合的相互作用の合計の強度を指す。別途示されない限り、本明細書で使用されるとき、「結合親和性」は、結合対のメンバー(例えば、抗体及び抗原、またはCAR及び抗原)間の1:1の相互作用を反映する、固有の結合親和性を指す。分子XのそのパートナーYに対する親和性は、一般に、解離定数(Kd)で表され得る。親和性は、本明細書に記載のものを含む当該技術分野で既知の一般的な方法によって測定され得る。低親和性抗体は、一般に、抗原にゆっくり結合し、容易に解離する傾向があるが、高親和性抗体は、一般に、抗原により早く結合し、より長く結合したままである傾向がある。結合親和性を測定する様々な方法が当該技術分野で既知であり、これらのいずれも、本出願の目的のために使用することができる。結合親和性を測定するための具体的な例証的及び例示的な実施形態が、以下に記載される。
「遮断」抗体または「アンタゴニスト」抗体は、それが結合する抗原の生物活性を阻害または低減するものである。いくつかの実施形態では、遮断抗体またはアンタゴニスト抗体は、抗原の生物活性を実質的にまたは完全に阻害する。
ペプチド、ポリペプチド、または抗体配列に関して、「アミノ酸配列同一性パーセント(%)」及び「相同性」は、配列同一性最大パーセントを達成するために、配列を整合させ、必要に応じてギャップを導入した後の、配列同一性の一部としていずれの保存的置換も考慮しない、特定のペプチドもしくはポリペプチド配列におけるアミノ酸残基と同一である、候補配列におけるアミノ酸残基の割合として定義される。アミノ酸配列同一性パーセントを決定する目的のための整合は、当該技術分野の技術範囲内である種々の方法で、例えば、BLAST、BLAST−2、ALIGN、またはMEGALIGN(商標)(DNASTAR)ソフトウェア等の公的に入手可能なコンピュータソフトウェアを使用して達成され得る。当業者は、比較される配列の全長にわたって最大の整合を達成するために必要な任意のアルゴリズムを含む、整合を測定するための適切なパラメータを決定することができる。
本明細書で使用される「キメラ抗原受容体」または「CAR」とは、T細胞等の免疫エフェクター細胞に1つ以上の抗原特異性をグラフとするために使用され得る遺伝子操作された受容体を指す。いくつかのCARは、「人工T細胞受容体」、「キメラT細胞受容体
」、または「キメラ免疫受容体」としても既知である。いくつかの実施形態では、CARは、T細胞及び/または他の受容体の1つ以上の抗原(腫瘍抗原等)、膜貫通ドメイン、及び細胞内シグナル伝達ドメインに特異的な細胞外抗原結合ドメインを含む。「CAR−T」とは、CARを発現するT細胞を指す。「BCMA CAR」は、BCMAに特異的な細胞外抗原結合ドメインを有する、CARを指す。「2つのエピトープCAR」とは、BCMA上の2つの異なるエピトープに特異的な細胞外結合ドメインを有する、CARを指す。
本明細書に記載のCARまたはsdAbをコードする「単離された」核酸分子は、それが産生された環境において通常会合している少なくとも1つの混入核酸分子から特定及び分離される核酸分子である。好ましくは、単離された核酸は、産生環境に関連する全ての成分との会合を含まない。本明細書のポリペプチド及び抗体をコードする単離された核酸分子は、それが天然に見られる形態または設定以外の形態である。したがって、単離された核酸分子は、細胞中に天然に存在する本明細書のポリペプチド及び抗体をコードする核酸とは区別される。
「制御配列」という用語は、特定の宿主生物における、操作可能に連結されたコード配列の発現に必要なDNA配列を指す。原核生物に好適な制御配列には、例えば、プロモーター、任意にオペレーター配列、及びリボソーム結合部位が挙げられる。真核細胞は、プロモーター、ポリアデニル化シグナル、及びエンハンサーを用いることで知られている。
核酸は、それが別の核酸配列と機能的な関係性に置かれるとき、「操作可能に連結」されている。例えば、プレ配列または分泌リーダーのDNAは、ポリペプチドの分泌に関与するプレタンパク質として発現する場合、ポリペプチドのDNAに操作可能に連結しているか、プロモーターまたはエンハンサーは、それがコード配列の転写に影響を及ぼす場合、その配列に操作可能に連結しているか、あるいはリボソーム結合部位は、それが翻訳を促進するように配置されている場合、コード配列に操作可能に連結されている。一般に、「操作可能に連結」されるとは、連結しているDNA配列が連続的であること、及び分泌リーダーの場合、連続しており、リーディング相にあることを意味する。しかしながら、エンハンサーは、連続していなくてもよい。連結は、好都合な制限部位でのライゲーションによって達成される。かかる部位が存在していない場合、合成オリゴヌクレオチドアダプターまたはリンカーが、従来の慣例に従って使用される。
本明細書で使用されるとき、「ベクター」という用語は、それが結合している別の核酸を増殖させることができる核酸分子を指す。この用語は、自己複製核酸構造としてのベクター、及び中に導入される宿主細胞のゲノム内に組み込まれたベクターを含む。ある特定のベクターは、それらが操作可能に連結している核酸の発現を誘導することができる。かかるベクターは、本明細書で「発現ベクター」と称される。
本明細書で使用されるとき、「自己由来」という用語は、それが後に個体に再導入される同じ個体に由来する任意の材料を指すよう意図されている。
「同種」とは、同じ種の異なる個体に由来するグラフトを指す。
本明細書で使用される「トランスフェクトされた」または「形質転換された」または「形質導入された」という用語は、外因性核酸が宿主細胞に移入または導入されるプロセスを指す。「トランスフェクト」または「形質転換」または「形質導入」細胞は、外因性核酸でトランスフェクト、形質転換、または形質導入された細胞である。この細胞は、初代対象細胞及びその子孫を含む。
本明細書で使用されるとき、「細胞」、「細胞株」、及び「細胞培養物」という表現は、同義に使用され、全てのかかる指名は、子孫を含む。したがって、「トランスフェクタント」及び「トランスフェクト細胞」は、初代対象細胞及び移入の数にかかわらずそれに由来する培養物を含む。全ての子孫が、故意のまたは偶発的な変異により、DNA含有量の点で厳密に同一でない場合があることも理解される。最初に形質転換された細胞についてスクリーニングされたものと同じ機能または生物学的活性を有する変異形子孫が含まれる。
「宿主細胞」、「宿主細胞株」、及び「宿主細胞培養」という用語は、同義に使用され、外因性核酸が中に導入された細胞を指し、かかる細胞の子孫を含む。宿主細胞としては、「形質転換体」及び「形質転換細胞」が挙げられ、これらは、初代形質転換細胞及び継代の数にかかわらずそれに由来する子孫を含む。子孫は、親細胞と核酸含有量の点で完全に同一ではないが、変異を含み得る。最初に形質転換された細胞についてスクリーニングまたは選択されたものと同じ機能または生物学的活性を有する変異子孫が、本明細書に含まれる。
本明細書で使用されるとき、「治療」または「治療する」とは、臨床結果を含む有益なまたは所望の結果を得るためのアプローチである。本発明の目的のために、有益なまたは所望の臨床結果としては、以下:疾患に起因する1つ以上の症状の緩和、疾患の程度の弱化、疾患の安定化(例えば、疾患の悪化の予防または遅延)、疾患の蔓延(例えば、転移)の予防または遅延、疾患の再発の予防または遅延、疾患の進行の遅延または減速、病状の改善、疾患の寛解(部分的または全体的)の提供、疾患の治療に必要な1つ以上の他の薬剤の用量の低減、疾患の進行の遅延、生活の質の向上、及び/または生存期間の延長のうちの1つ以上が挙げられるが、これらに限定されないがんの病理学的帰結の軽減も「治療」に包含される。がんの病理学的帰結の軽減も「治療」に包含される。本出願の方法は、これらの治療態様のうちのいずれか1つ以上を企図する。
本明細書で使用されるとき、「個体」または「対象」とは、ヒト、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、齧歯類、または霊長類を含むが、これらに限定されない哺乳動物を指す。いくつかの実施形態では、個体は、ヒトである。
本明細書で使用される「有効量」という用語は、特定の障害、状態、または疾患を治療するのに、例えば、その症状のうちの1つ以上を改善、緩和、軽減、及び/または遅延するのに十分な薬剤の量、例えば、sdAb、操作された免疫エフェクター細胞、またはその薬学的組成物の量を指す。がんに関して、有効量は、腫瘍の縮小を引き起こし、及び/または腫瘍の成長速度を低下させる(例えば、腫瘍成長を抑圧する)か、または他の望ましくない細胞増殖を阻止または遅延させるのに十分な量を含む。いくつかの実施形態では、有効量は、発症を遅延させるのに十分な量である。いくつかの実施形態では、有効量は、再発を予防または遅延させるのに十分な量である。有効量は、1回以上の投与で投与され得る。有効量の薬物または組成物は、(i)がん細胞の数を減少させ、(ii)腫瘍サイズを減少させ、(iii)末梢器官へのがん細胞浸潤を阻止し、遅らせ、ある程度遅延させ、好ましくは停止し、(iv)腫瘍転移を阻止し(すなわち、ある程度遅延させ、好ましくは停止し)、(v)腫瘍成長を阻止し、(vi)腫瘍の発生及び/または再発を予防または遅延し、及び/または(vii)がんに関連する症状のうちの1つ以上をある程度軽減し得る。
「補助状況」とは、個体ががんの病歴を有しており、(必ずしもではないが)一般に手術(例えば、切除手術)、放射線療法、及び化学療法を含むが、これらに限定されない療法に応答している臨床状況を指す。しかしながら、固体のがんの病歴のため、これらの個体は、疾患を発症する危険性があると見なされる。「アジュバント状況」における治療ま
たは投与とは、その後の治療様式を指す。危険性の程度(例えば、アジュバント状況にある個体が「高リスク」または「低リスク」と見なされる場合)は、いくつかの要因、最も一般的には最初に治療されたときの疾患の程度に依存する。
「ネオアジュバント状況」とは、本方法が一次/原因療法前に行われる臨床状況を指す。
本明細書で使用されるとき、がんの発症を「遅延させる」とは、疾患の発症を保留し、妨害し、遅延させ、遅らせ、安定させ、及び/または延期することを意味する。この遅延は、治療されている病歴及び/または個体に応じて異なる期間であり得る。当業者に明らかであるように、十分なまたは著しい遅延は、事実上、個体が疾患を発症しないという点で予防を包含し得る。がんの発症を「遅延」させる方法は、その方法を使用しないときと比較して、所与の時間枠内で疾患発症の可能性を低減させ、及び/または所与の時間枠内で疾患の程度を低減させる方法である。かかる比較は、典型的には、統計的に有意な数の個体を使用する臨床研究に基づく。がん発症は、コンピュータ断層撮影(CATスキャン)、磁気共鳴映像法(MRI)、腹部超音波検査、凝固検査、動脈造影法、または生検を含むが、これらに限定されない標準の方法を使用して検出可能であり得る。発症は、初期に検出不可能であり得るがん進行も指し、発生、再発、及び発症を含む。
「薬学的製剤」という用語は、活性成分の生物学的活性を有効にさせる形態であり、製剤が投与される対象に許容しがたい程度に毒性のさらなる成分を含有しない調製物を指す。かかる製剤は、滅菌である。「滅菌」製剤は、無菌であるか、または全ての生存微生物及びそれらの胞子を含まない。
本明細書で使用される「担体」は、用いられる投与量及び濃度でそれに曝露されている細胞または哺乳動物に非毒性の薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定剤を含む。多くの場合、生理的に許容される担体は、pH緩衝水溶液である。生理学的に許容される担体の例としては、リン酸、クエン酸、及び他の有機酸等の緩衝液;アスコルビン酸及びメチオニンを含む抗酸化物質;防腐剤(塩化オクタデシルジメチルベンジルアンモニウム;塩化ヘキサメトニウム;塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチル、またはベンジルアルコール;アルキルパラベン、例えば、メチルまたはプロピルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3−ペンタノール;及びm−クレゾール等);低分子量(約10残基未満)ポリペプチド;タンパク質、例えば、血清アルブミン、ゼラチン、または免疫グロブリン;親水性ポリマー、例えば、ポリビニルピロリドン;アミノ酸、例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン、またはリジン;単糖、二糖、及び他の炭水化物、例えば、グルコース、マンノース、またはデキストリン;キレート剤、例えば、EDTA;糖、例えば、スクロース、マンニトール、トレハロース、またはソルビトール;塩形成対イオン、例えば、ナトリウム;金属錯体(例えば、Zn−タンパク質錯体);ならびに/または非イオン性界面活性剤、例えば、TWEEN(商標)、ポリエチレングリコール(PEG)、及びPLURONICS(商標)、またはポリエチレングリコール(PEG)が挙げられる。
目的とする「希釈剤」は、本明細書において、薬学的に許容され(ヒトへの投与について安全かつ非毒性である)、液体製剤の調製物、例えば凍結乾燥後に再構成される製剤に有用なものである。例示的な希釈剤としては、滅菌水、静菌性の注射用水(BWFI)、pH緩衝溶液(例えばリン酸緩衝生理食塩水)、滅菌食塩水溶液、リンゲル液、またはデキストロース溶液が挙げられる。代替の一実施態様では、希釈剤は、塩の水溶液及び/または緩衝液を含み得る。
「防腐剤」は、細菌活性を低減するために本明細書における製剤に添加され得る化合物
である。防腐剤の添加は、例えば、複数回使用(複数回用量)製剤の製造を容易にし得る。可能な防腐剤の例としては、例えば、オクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロリド、ヘキサメトニウムクロライド、ベンザルコニウムクロライド(アルキル基が長鎖化合物であるアルキルベンジルジメチルアンモニウムクロライドの混合物)及びベンゼトニウムクロライドが挙げられる。他のタイプの防腐剤としては、芳香族アルコール、例えば、フェノール、ブチル、及びベンジルアルコール、アルキルパラベン、例えば、メチルまたはプロピルパラベン、カテコール、レゾルシノール、シクロヘキサノール、3−ペンタノール、及びm−クレゾールが挙げられる。本明細書において最も好ましい防腐剤は、ベンジルアルコールである。
「安定した」製剤とは、中のタンパク質が保管時に物理的及び化学的安定性及び完全性を本質的に保持するものである。タンパク質安定性を測定するための種々の分析技術が当該技術分野で利用可能であり、Peptide and Protein Drug Delivery,247−301,Vincent Lee Ed.,Marcel Dekker,Inc.,New York,N.Y.,Pubs.(1991)及びJones,A.Adv.Drug Delivery Rev.10:29−90(1993)に概説されている。安定性は、選択された温度で選択された期間にわたって測定され得る。迅速なスクリーニングのために、製剤が40℃で2週間〜1ヶ月間保存され得、その時点で安定性が測定される。製剤が2〜8℃で保管される場合、一般に、製剤は、30℃または40℃で少なくとも1ヶ月間安定しているべきであり、及び/または2〜8℃で少なくとも2年間安定しているべきである。製剤が30℃で保管される場合、一般に、製剤は、30℃で少なくとも2年間安定しているべきであり、及び/または40℃で少なくとも6ヶ月間安定しているべきである。例えば、保管中の凝集の程度は、タンパク質安定性の指標として使用され得る。したがって、「安定した」製剤は、タンパク質の約10%未満、好ましくは約5%未満が製剤中に凝集体として存在するものであり得る。他の実施形態では、製剤の保管中の凝集体形成のいずれの増加も決定することができる。
「再構成された」製剤とは、タンパク質が全体に分散するように希釈剤中に凍結乾燥タンパク質または抗体製剤を溶解させることによって調製されたものである。再構成された製剤は、目的とするタンパク質で治療される患者への投与(例えば、皮下投与)に好適であり、本出願のいくつかの実施形態では、非経口または静脈内投与に好適なものであり得る。
「等張」製剤は、ヒト血液と本質的に同じ浸透圧を有するものである。等張製剤は、一般に、約250〜350mOsmの浸透圧を有する。「低張」という用語は、ヒト血液の浸透圧よりも低い浸透圧を有する製剤を説明する。同様に、「高張」という用語は、ヒト血液の浸透圧よりも高い浸透圧を有する製剤を説明するために使用される。等張性は、例えば、蒸気圧または氷結型浸透圧計を使用して測定され得る。本発明の製剤は、塩及び/または緩衝液の添加の結果として高張である。
本明細書に記載の本出願の実施形態が、実施形態「から成る」及び/または「から本質的に成る」を含むことが理解される。
本明細書における「約」値またはパラメータへの言及は、その値またはパラメータ自体を対象とする変形を含む(及び説明する)。例えば、「約X」について言及する記述は、「X」の記述を含む。
本明細書で使用されるとき、ある値またはパラメータ「ではない」への言及は、一般に、ある値またはパラメータ「以外」を意味及び説明する。例えば、タイプXのがんを治療するための方法が使用されないとは、X以外のタイプのがんを治療するための方法が使用
されることを意味する。
本明細書で使用される「約X−Y」という用語は、「約X〜約Y」と同じ意味を有する。
本明細書及び添付の特許請求の範囲で使用されるとき、単数形「a」、「or」、及び「the」は、文脈が別途明確に指示しない限り、複数指示対象を含む。
II.抗BCMA単一ドメイン抗体
本出願の一態様は、ヒトBCMA等のBCMAに特異的に結合する単離された単一ドメイン抗体(本明細書で「抗BCMA sdAb」と称される)を提供する。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、BCMA活性を調節する。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、アンタゴニスト抗体である。本明細書に記載の抗BCMA
sdAbのいずれか1つに由来する抗原結合フラグメント、及び本明細書に記載の抗BCMA sdAbのいずれか1つを含む抗原結合タンパク質が、さらに提供される。例示的な抗BCMA sdAbは、以下の表2に列記されている。
Figure 2021087455


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B細胞成熟抗原(BCMA)(別名、CD269)は、腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーのメンバー、すなわち、TNFRSF17である(Thompson et al.,J.Exp.Medicine,192(1):129−135、2000)。ヒトBCMAは、形質細胞及び多発性骨髄腫細胞でほぼ例外なく発現される(例えば、Novak et al.,Blood,103(2):689−694,2004、Neri et al.,Clinical Cancer Research,73(19):5903−5909、Felix et al.,Mol.Oncology,9(7):1348−58,2015)。BCMAは、B細胞活性化因子(BAFF)及び増殖を含むリガンド(APRIL)に結合することができる(例えば、Mackay et al.,2003及びKalled et al.,Immunological Review,204:43−54,2005)。BCMAは、多発性骨髄腫に対する免疫療法薬に好適な腫瘍抗原標的であり得る。高親和性の抗体は、BCMAとその天然リガンドBAFF及びAPRILとの間の結合を遮断し得る。抗BCMA sdAbを、CAR−T細胞を使用する細胞免疫療法と組み合わせて使用して、例えば、腫瘍細胞に対する細胞毒性効果を増強することができる。
いくつかの実施形態では、配列番号115のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号116のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号117のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号118のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号119のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号120のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号121のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号122のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号123のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号124のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号125のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番
号126のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号127のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号128のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号129のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号130のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号131のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号132のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号133のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号134のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号135のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号136のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号137のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号138のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号139のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号140のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号141のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号142のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号143のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号144のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号145のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号146のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号147のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号148のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号149のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号150のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号151のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号152のアミノ酸配列の1つ、2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ラクダ科である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ヒト化である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、受容体ヒトフレームワーク、例えば、ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークを含む。
いくつかの実施形態では、(a)配列番号1〜38から選択されるアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号39〜76から選択されるアミノ酸配列を含むCDR2、及び
(c)配列番号77〜114から選択されるアミノ酸配列を含むCDR3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ラクダ科である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ヒト化である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、受容体ヒトフレームワーク、例えば、ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークを含む。
いくつかの実施形態では、(a)配列番号1〜38から選択されるアミノ酸配列と少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%のうちのいずれか1つの配列同一性を有するCDR1、(b)配列番号39〜76から選択されるアミノ酸配列と少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%のうちのいずれか1つの配列同一性を有するCDR2、及び(c)配列番号77〜114から選択されるアミノ酸配列と少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%のうちのいずれか1つの配列同一性を有するCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%のうちのいずれか1つの同一性を有するCDRは、参照配列と比較して置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含むが、その配列を含む抗BCMA sdAbは、BCMAに結合する能力を保持する。いくつかの実施形態では、(a)配列番号1〜38から選択されるアミノ酸配列に対して約1、2、3、または4つのいずれか1つのアミノ酸置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を有するCDR1、(b)配列番号39〜76から選択されるアミノ酸配列に対して約1、2、3、または4つのいずれか1つのアミノ酸置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を有するCDR2、(c)配列番号77〜114から選択されるアミノ酸配列に対して約1、2、3、または4つのいずれか1つのアミノ酸置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を有するCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、親和性成熟である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ラクダ科である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ヒト化である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、受容体ヒトフレームワーク、例えば、ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークを含む。
いくつかの実施形態では、(a)配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号77のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号78のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号79のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号80のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号6のアミノ酸配列を含
むCDR1、(b)配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号8のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA
sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA
sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号97のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号98のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号99のアミノ酸配列
を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号100のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号101のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号102のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号103のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号104のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号105のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号106のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号107のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号108のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号73のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号74のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号75のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、(a)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1、(b)配列番号76のアミノ酸配列を含むCDR2、及び(c)配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、3つのCDRを含む抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ラクダ科である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ヒト化である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、受容体ヒトフレームワーク、例えば、ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークを含む。
いくつかの実施形態では、上に記載される実施形態のうちのいずれかを含む、抗BCM
A sdAb(すなわち、特定のCDR1、CDR2、及び/またはCDR3を含む抗BCMA sdAb)は、配列番号115〜152から選択されるアミノ酸配列と少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%のうちのいずれか1つの配列同一性を有するVHドメインを含む。いくつかの実施形態では、少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%のうちのいずれか1つの同一性を有するVH配列は、参照配列と比較して置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含むが、その配列を含む抗BCMA sdAbは、BCMAに結合する能力を保持する。いくつかの実施形態では、合計1〜10個のアミノ酸が、配列番号115〜152から選択されるアミノ酸配列に置換されており、挿入されており、及び/または欠失している。いくつかの実施形態では、置換、挿入、または欠失は、CDRの外側の領域で(すなわち、FR内で)生じる。任意に、抗BCMA sdAbは、その配列の翻訳後修飾を含む配列番号115〜152から選択されるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、配列番号115〜152から成る群から選択されるアミノ酸配列を有するVHドメインを含む単離された抗BCMA sdAbが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号115〜152から成る群から選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチドが提供される。
いくつかの実施形態では、機能的エピトープは、コンビナトリアルアラニンスキャニングによってマッピングされ得る。このプロセスでは、コンビナトリアルアラニンスキャニング戦略を使用して、抗BCMA sdAbとの相互作用に必要なBCMAタンパク質中のアミノ酸を特定することができる。いくつかの実施形態では、エピトープは、立体配座であり、BCMAに結合している抗BCMA sdAbの結晶構造を用いて、エピトープを特定することができる。いくつかの実施形態では、本出願は、配列番号388〜394から成る群から選択されるアミノ酸配列に由来するBCMAのエピトープを提供する。いくつかの実施形態では、本出願は、配列番号388〜394から成る群から選択されるアミノ酸配列を含むBCMAのエピトープを提供する。
いくつかの実施形態では、本出願は、BCMAに結合するために本明細書に記載の抗BCMA sdAbのうちのいずれか1つと競合する抗体を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、BCMA上のエピトープに結合するために本明細書に提供される抗BCMA sdAbと競合する抗体を提供する。いくつかの実施形態では、配列番号115〜152から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む抗BCMA sdAbと同じエピトープに結合する抗体が、提供される。いくつかの実施形態では、配列番号115〜152から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む抗BCMA sdAbと競合してBCMAに特異的に結合する抗体が、提供される。
いくつかの実施形態では、競合アッセイは、BCMAに結合するために本明細書に記載の抗BCMA sdAbと競合するモノクローナル抗体を特定するために使用され得る。競合アッセイは、2つの抗体が、同一または立体的に重なるエピトープまたは別の抗体の抗原への結合を競合的に阻害する1つの抗体を認識することによって同じエピトープに結合するかどうかを判定するために使用することができる。ある特定の実施形態では、このような競合抗体は、本明細書に記載の抗体によって結合される同じエピトープ(例えば、配列番号388〜394から成る群から選択されるアミノ酸配列に由来するBCMAエピトープ)に結合する。例示的な競合アッセイとしては、Harlow and Lane(1988) Antibodies:A Laboratory Manual ch.14(Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,N.Y.)に提供されるもの等の日常的なアッセイが挙げら
れるが、これに限定されない。抗体が結合するエピトープをマッピングするための詳細な例示的な方法が、Morris(1996)“Epitope Mapping Protocols,”in Methods in Molecular Biology vol.66(Humana Press,Totowa,N.J.)に提供される。いくつかの実施形態では、2つの抗体は、それぞれがもう一方の結合を50%以上遮断する場合、同じエピトープに結合すると言われている。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗BCMA sdAbと競合する抗体は、ラクダ科、キメラ、ヒト化、またはヒト抗体である。いくつかの実施形態では、本出願は、本明細書に記載のラクダ科、キメラ、ヒト化、またはヒト抗BCMA sdAbと競合する抗体を提供する。
いくつかの実施形態では、上に記載される抗BCMA sdAbのうちのいずれか1つを含む抗BCMA抗体または抗原結合タンパク質結合が提供される。いくつかの実施形態では、抗BCMA抗体は、ラクダ科、キメラ、ヒト化、またはヒト抗体を含むモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、抗BCMA抗体は、抗体フラグメント、例えば、VHフラグメントである。いくつかの実施形態では、抗BCMA抗体は、IgG1またはIgG4等の任意の抗体クラスまたはアイソタイプのFc領域を含む全長重鎖のみ抗体である。いくつかの実施形態では、Fc領域は、低減または最小化されたエフェクター機能を有する。
いくつかの実施形態では、上述の実施形態のうちのいずれかによる抗BCMA抗体(抗BCMA sdAb等)または抗原結合タンパク質は、以下の「抗体の特徴」の第1〜7節に記載の特徴のうちのいずれかを単独でまたは組み合わせで組み込み得る。
いくつかの実施形態では、上に記載される抗BCMA抗体(抗BCMA sdAb等)のうちのいずれか1つをコードする単離された核酸が提供される。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbをコードする単離された核酸が提供され、この核酸は、配列番号153〜190から成る群から選択される核酸配列と少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%のうちのいずれか1つの配列同一性を有する配列を含む。いくつかの実施形態では、配列番号153〜190から成る群から選択される核酸配列を含む単離された核酸が提供される。いくつかの実施形態では、かかる核酸を含むベクター(例えば、発現ベクター)が提供される。いくつかの実施形態では、かかる核酸を含む宿主細胞が提供される。いくつかの実施形態では、抗BCMA抗体を作製する方法が提供され、この方法は、上に提供される抗BCMA抗体をコードする核酸を含む宿主細胞を抗BCMA抗体の発現に好適な条件下で培養することと、任意に、抗BCMA抗体を宿主細胞(または宿主細胞培養培地)から回収することとを含む。
抗体の特徴
1.抗体親和性
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される抗BCMA抗体は、1μM以下、100nM以下、10nM以下、1nM以下、0.1nM以下、0.01nM以下、または0.001nM以下(例えば、10−8M以下、例えば、10−8M〜10−13M、例えば、10−9M〜10−13M)の解離定数(Kd)を有する。
いくつかの実施形態では、Kdは、以下のアッセイによって説明されるように、目的とする抗体のFabバージョンまたはVHフラグメント及びその抗原を用いて行われる放射性標識抗原結合アッセイ(RIA)によって測定される。例えば、抗体に対するFabの溶液結合親和性は、非標識抗原の一連の滴定の存在下で、Fabを最低濃度の(125I)標識抗原と平衡させ、次いで、抗Fab抗体をコーティングしたプレートで結合した抗体を捕捉することによって測定される(例えば、Chen et al.,J.Mol
.Biol.293:865−881(1999)を参照されたい)。
いくつかの実施形態では、Kdは、約10応答単位(RU)の固定化抗原CM5チップを有するBIACORE(登録商標)−2000またはBIACORE(登録商標)−3000(BIAcore,Inc.、Piscataway,NJ)を25℃で使用する表面プラズモン共鳴アッセイを使用して測定される。簡潔には、カルボキシメチル化デキストランバイオセンサーチップ(CM5、BIACORE,Inc.)を、供給業者の指示に従って、N−エチル−N’−(3−ジメチルアミノプロピル)−カルボジイミド塩酸塩(EDC)及びN−ヒドロキシスクシンイミド(NHS)で活性化する。10mMの酢酸ナトリウム(pH4.8)を用いて抗原を5μg/mL(約0.2μM)になるまで希釈した後、5μL/分の流量で注入して、およそ10応答単位(RU)のカップリングしたタンパク質を得る。抗原の注入後、1Mのエタノールアミンを注入して、未反応基を遮断する。反応速度測定のために、目的とする抗体のFabまたはVHの2倍連続希釈液(0.78nM〜500nM)を、25℃の0.05%ポリソルベート20(TWEEN−20(商標))界面活性剤(PBST)を有するPBS中におよそ25μL/分の流量で注入する。会合速度(kon)及び解離速度(koff)は、単純な1対1ラングミュア結合モデル(BIACORE(登録商標)評価ソフトウェアバージョン3.2)を使用して、会合センサグラムと解離センサグラムを同時に当てはめることによって計算される。平衡解離定数(Kd)は、koff/kon比として計算される。例えば、Chen et al.,J.Mol.Biol.293:865−881(1999)を参照されたい。オン速度が上述の表面プラズモン共鳴アッセイによって10−1−1を超える場合、オン速度は、ストップフローを装備した分光光度計(Aviv Instruments)または撹拌キュベットを備える8000シリーズSLM−AMINCO(商標)分光光度計(ThermoSpectronic)等の分光計で測定される漸増濃度の抗原の存在下で、PBS(pH7.2)中20nM抗抗原抗体(Fab形態)の25℃での蛍光発光強度(励起=295nm、発光=340nm、16nm帯域通過)の増加または減少を測定する蛍光消光技術を使用することによって決定され得る。
2.抗体フラグメント
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される抗体は、抗体フラグメントである。抗体フラグメントとしては、Fab、Fab’、Fab’−SH、F(ab’)、Fv、及びscFvフラグメント、VH、ならびに以下に記載の他のフラグメントが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の抗体フラグメントの概説については、Hudson et al.Nat.Med.9:129−134(2003)にも記載されている。scFvの概説については、例えば、Pluckthun,in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies,vol.113,Rosenburg and Moore eds.,(Springer−Verlag,New York),pp.269−315(1994)を参照されたく、また、WO93/16185、ならびに米国特許第5,571,894号及び同第5,587,458号も参照されたい。サルベージ受容体結合エピトープ残基を含み、かつ増加したインビボ半減期を有するFab及びF(ab’)フラグメントの考察については、米国特許第5,869,046号を参照されたい。
ダイアボディは、二価または二重特異性であり得る2つの抗原結合部位を有する抗体フラグメントである。例えば、EP404,097、WO1993/01161、及びHudson et al.,Nat.Med.9:129−134(2003)、及びHollinger et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444−6448(1993)を参照されたい。トリアボディ及びテトラボディについては、Hudson et al.,Nat.Med.9:129−134(2003)にも記載されている。
抗体フラグメントは、本明細書に記載の、インタクトな抗体のタンパク質消化、ならびに組換え宿主細胞(例えば、E.coliまたはファージ)による産生を含むが、これらに限定されない、種々の技術によって作製され得る。
3.キメラ抗体及びヒト化抗体
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される抗体は、キメラ抗体である。ある特定のキメラ抗体は、例えば、米国特許第4,816,567号及びMorrison et
al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851−6855(1984))に記載されている。一例では、キメラ抗体は、非ヒト可変領域(例えば、ラマ等のラクダ科種に由来する可変領域)及びヒト定常領域を含む。さらなる例では、キメラ抗体は、そのクラスまたはサブクラスが、親抗体のクラスまたはサブクラスから変化した「クラススイッチした」抗体である。キメラ抗体は、その抗原結合フラグメントを含む。
いくつかの実施形態では、キメラ抗体は、ヒト化抗体である。典型的には、非ヒト抗体は、ヒト化されてヒトに対する免疫原性を低減する一方で、親非ヒト抗体の特異性及び親和性を保持する。一般に、ヒト化抗体は、HVR、例えば、CDR(またはそれらの部分)が非ヒト抗体に由来し、FR(またはそれらの部分)がヒト抗体配列に由来する、1つ以上の可変ドメインを含む。ヒト化抗体は、任意に、ヒト定常領域の少なくとも一部も含むことになる。いくつかの実施形態では、ヒト化抗体中のいくつかのFR残基は、例えば、抗体特異性または親和性を復元または改善するために、非ヒト抗体(例えば、HVR残基が由来する抗体)由来の対応する残基で置換される。
ヒト化抗体及びそれらの作製方法は、例えば、Almagro and Fransson,Front.Biosci.13:1619−1633(2008)に概説され、例えば、Riechmann et al.,Nature 332:323−329(1988)、Queen et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 86:10029−10033(1989)、米国特許第5,821,337号、同第7,527,791号、同第6,982,321号、及び同第7,087,409号、Kashmiri et al.,Methods 36:25−34(2005)(SDR(a−CDR)グラフトについて記載)、Padlan,Mol.Immunol.28:489−498(1991)(「表面再構成」について記載)、Dall’Acqua et al.,Methods 36:43−60(2005)(「FRシャッフリング」について記載)、ならびにOsbourn et al.,Methods 36:61−68(2005)及びKlimka et al.,Br.J.Cancer,83:252−260(2000)(FRシャッフリングへの「誘導選択」アプローチについて記載)にさらに記載されている。
ヒト化に使用され得るヒトフレームワーク領域には、「ベストフィット」法を使用して選択されるフレームワーク領域(例えば、Sims et al.J.Immunol.151:2296(1993)を参照されたい)、軽鎖可変領域または重鎖可変領域の特定のサブグループのヒト抗体のコンセンサス配列に由来するフレームワーク領域(例えば、Carter et al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA,89:4285(1992)、及びPresta et al.J.Immunol.,151:2623(1993)を参照されたい)、ヒト成熟(体細胞変異)フレームワーク領域またはヒト生殖系フレームワーク領域(例えば、Almagro and Fransson,Front.Biosci.13:1619−1633(2008)を参照されたい)、ならびにFRライブラリのスクリーニングから得られるフレームワーク領域(例えば、Baca et al.,J.Biol.Chem.272:10678−1068
4(1997)及びRosok et al.,J.Biol.Chem.271:22611−22618(1996)を参照されたい)が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、sdAbは、抗原に対するドメインの生来の親和性を低下させることなく、一方で、異種種に対するその免疫原性を減少させるように修飾、例えば、ヒト化される。例えば、ラマ抗体の抗体可変ドメイン(VH)のアミノ酸残基が決定され得、例えば、フレームワーク領域内のラクダ科アミノ酸のうちの1つ以上が、ポリペプチドがその典型的な特徴を失うことなく、すなわち、ヒト化が結果として生じるポリペプチドの抗原結合能力に著しく影響を及ぼさないように、ヒトコンセンサス配列に見られるようなそれらのヒト対応物に置き換えられる。ラクダ科sdAbのヒト化は、単一ポリペプチド鎖内の限定された量のアミノ酸の導入及び変異誘発を必要とする。これは、2つの鎖(軽鎖及び重鎖)へのアミノ酸変化の導入、ならびに両方の鎖のアセンブリの保存を必要とするscFv、Fab’、(Fab’)2、及びIgGのヒト化とは対照的である。
Hドメインを含む単一ドメイン抗体は、ヒト様配列を有するようにヒト化され得る。いくつかの実施形態では、本明細書で使用されるVHドメインのFR領域は、ヒトVフレームワーク領域に対する少なくとも約50%、60%、70%、80%、90%、95%、またはそれ以上のアミノ酸配列相同性のうちのいずれか1つを含む。ヒト化VHドメインの1つの例示的なクラスは、VHが、Kabat番号付けに従って、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、チロシン、トリプトファン、メチオニン、セリン、トレオニン、アスパラギン、またはグルタミンから成る群からのアミノ酸を45位に(例えば、L45等)、トリプトファンを103位に保有することを特徴とする。したがって、このクラスに属するポリペプチドは、ヒトVフレームワーク領域に対して高いアミノ酸配列相同性を示し、前記ポリペプチドは、それからの望ましくない免疫応答を予期することなく、かつさらなるヒト化に負担をかけることなくヒトに直接投与され得る。
ヒト化ラクダ科sdAbの別の例示的なクラスがWO03/035694に記載されており、典型的にはヒト起源のまたは他の種由来の従来の抗体に見られるが、二本鎖抗体由来のVに存在する保存されたトリプトファン残基を103位の荷電アルギニン残基で置換することによりこの親水性損失を補償する疎水性FR2残基を含有する。したがって、これらの2つのクラスに属するペプチドは、ヒトVフレームワーク領域に対して高いアミノ酸配列相同性を示し、前記ペプチドは、それからの望ましくない免疫応答を予期することなく、さらなるヒト化に負担をかけることなくヒトに直接投与され得る。
4.ヒト抗体
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される抗体は、ヒト抗体である。ヒト抗体は、当該技術分野で既知の種々の技術を使用して産生され得る。ヒト抗体は、概して、van Dijk and van de Winkel,Curr.Opin.Pharmacol.5:368−74(2001)及びLonberg,Curr.Opin.Immunol.20:450−459(2008)に記載されている。完全ヒトsdAbを産生することができるトランスジェニックマウスまたはラットが当該技術分野で既知である。例えば、US20090307787A1、米国特許第8,754,287号、US20150289489A1、US20100122358A1、及びWO2004049794を参照されたい。
ヒト抗体は、抗原投与に応答してヒト可変領域を有するインタクトなヒト抗体またはインタクトな抗体を産生するように修飾されたトランスジェニック動物に免疫原を投与することによって調製することができる。かかる動物は、典型的には、内因性免疫グロブリン
遺伝子座を置き換えるか、または染色体外に存在するか、もしくはその動物の染色体にランダムに組み込まれるヒト免疫グロブリン遺伝子座の全てまたは一部を含有する。かかるトランスジェニックマウスにおいて、内因性免疫グロブリン遺伝子座は、一般に、不活性化されている。トランスジェニック動物からヒト抗体を得るための方法の概説については、Lonberg,Nat.Biotech.23:1117−1125(2005)を参照されたい。例えば、米国特許第6,075,181号及び同第6,150,584(XENOMOUSE(商標)技術を記載)、米国特許第5,770,429号(HUMAB(登録商標)技術を記載)、米国特許第7,041,870号(K−M MOUSE(登録商標)技術を記載)、ならびに米国特許出願公開第US2007/0061900号(VELOCIMOUSE(登録商標)技術を記載)も参照されたい。かかる動物によって生成されるインタクトな抗体からのヒト可変領域は、例えば、異なるヒト定常領域と組み合わせることによってさらに修飾され得る。
ヒト抗体は、ハイブリドーマに基づく方法によって作製することもできる。ヒトモノクローナル抗体の産生のためのヒト骨髄腫及びマウス−ヒトヘテロ骨髄腫細胞株について説明されている。(例えば、Kozbor J.Immunol.,133:3001(1984)、Brodeur et al.,Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications,pp.51−63(Marcel Dekker,Inc.,New York,1987)、及びBoerner et al.,J.Immunol.,147:86(1991)を参照されたい。) ヒトB細胞ハイブリドーマ技術により生成されるヒト抗体についても、Li et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,103:3557−3562(2006)に記載されている。さらなる方法としては、例えば、米国特許第7,189,826号(ハイブリドーマ細胞株からのモノクローナルヒトIgM抗体の産生について記載)及びNi,Xiandai Mianyixue,26(4):265−268(2006)(ヒト−ヒトハイブリドーマについて記載)に記載されるものが挙げられる。ヒトハイブリドーマ技術(トリオーマ技術)については、Vollmers and Brandlein,Histology and Histopathology,20(3):927−937(2005)及びVollmers and Brandlein,Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology,27(3):185:91(2005)にも記載されている。
ヒト抗体は、ヒト由来のファージディスプレイライブラリから選択されるFvクローン可変ドメイン配列を単離することによって生成することもできる。その後、かかる可変ドメイン配列は、所望のヒト定常ドメインと組み合わせられ得る。抗体ライブラリからヒト抗体を選択するための技術が以下に記載される。
特定の抗原もしくは標的に対して指向されるVH配列を得るための1つの技術は、重鎖抗体を発現することができるトランスジェニック哺乳動物を好適に免疫化することと(すなわち、免疫応答及び/または前記抗原もしくは標的に対して指向される重鎖抗体をもたらすように)、前記VH配列(をコードする核酸配列)を含有する前記トランスジェニック哺乳動物から好適な生体試料(血液試料、血清試料、またはB細胞試料等)を得ることと、その後、前記試料から開始して、本来既知の任意の好適な技術(本明細書に記載の方法またはハイブリドーマ技術のうちのいずれか等)を使用して前記抗原もしくは標的に対して指向されるVH配列を生成することを伴う。例えば、この目的のために、WO02/085945、WO04/049794、及びWO06/008548、ならびにJanssens et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.2006 Oct.10;103(41):15130−5に記載の重鎖抗体発現マウスならびにさらなる方法及び技術が使用され得る。例えば、かかる重鎖抗体発現マウスは、天
然源由来の(単一)可変ドメイン(例えば、ヒト(単一)可変ドメイン、ラクダ科(単一)可変ドメインまたはサメ(単一)可変ドメイン)、ならびに例えば合成または半合成(単一)可変ドメイン等の任意の好適な(単一)可変ドメインを有する重鎖抗体を発現させることができる。
5.ライブラリ由来抗体
本出願の抗体は、所望の活性(複数可)を有する抗体についてコンビナトリアルライブラリをスクリーニングすることによって単離され得る。例えば、ファージディスプレイライブラリを生成し、所望の結合特性を保有する抗体についてかかるライブラリをスクリーニングするための様々な方法が当該技術分野で既知である。かかる方法は、例えば、Hoogenboom et al.in Methods in Molecular Biology 178:1−37(O’Brien et al.,ed.,Human
Press,Totowa,NJ,2001)に概説され、例えば、McCafferty et al.,Nature 348:552−554、Clackson et
al.,Nature 352:624−628(1991)、Marks et al.,J.Mol.Biol.222:581−597(1992)、Marks and Bradbury,in Methods in Molecular Biology 248:161−175(Lo,ed.,Human Press,Totowa,NJ,2003)、Sidhu et al.,J.Mol.Biol.338(2):299−310(2004)、Lee et al.,J.Mol.Biol.340(5):1073−1093(2004)、Fellouse,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101(34):12467−12472(2004);及びLee et al.,J.Immunol.Methods 284(1−2):119−132(2004)にさらに記載されている。sdAbライブラリを構築するための方法が説明されており、例えば、米国特許第7371849号を参照されたい。
ある特定のファージディスプレイ法では、V及びV遺伝子のレパートリーがポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって別個にクローニングされ、ファージライブラリ内でランダムに組換えられ、その後、これが、Winter et al.,Ann.Rev.Immunol.,12:433−455(1994)に記載されるように、抗原結合ファージについてスクリーニングされ得る。ファージは、典型的には、一本鎖Fv(scFv)フラグメントまたはFabフラグメントのいずれかとして抗体フラグメントをディスプレイする。免疫化源由来のライブラリは、ハイブリドーマの構築を必要とすることなく、免疫原に高親和性抗体を提供する。あるいは、Griffiths et al.,EMBO J,12:725−734(1993)に記載されるように、ナイーブレパートリーが(例えば、ヒトから)クローニングされて、免疫化することなく、広範な非自己抗原及び自己抗原に対する単一源の抗体を提供することができる。最後に、Hoogenboom and Winter,J.Mol.Biol.,227:381−388(1992)に記載されるように、幹細胞からの再編成されていないV遺伝子セグメントをクローニングし、ランダム配列を含有するPCRプライマーを使用して高度に可変的なCDR3領域をコードし、インビトロでの再編成を達成することによってナイーブライブラリを合成的に作製することもできる。ヒト抗体ファージライブラリについて記載する特許公報としては、例えば、米国特許第5,750,373号、ならびに米国特許公開第2005/0079574号、同第2005/0119455号、同第2005/0266000号、同第2007/0117126号、同第2007/0160598号、同第2007/0237764号、同第2007/0292936号、及び同第2009/0002360号が挙げられる。
ヒト抗体ライブラリから単離された抗体または抗体フラグメントは、本明細書においてヒト抗体またはヒト抗体フラグメントと見なされる。
6.多重特異性抗体
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される抗体は、多重特異性抗体、例えば、二重特異性抗体である。多重特異性抗体は、少なくとも2つの異なる部位に対して結合特異性を有する抗体である。いくつかの実施形態では、一方の結合特異性は、CD19、CD20、BCMA、及びCD38から成る群から選択される抗原に対してであり、他方は、任意の他の抗原に対してである。いくつかの実施形態では、二重特異性抗体は、CD19、CD20、BCMA、及びCD38から成る群から選択される抗原の2つの異なるエピトープに結合することができる。二重特異性抗体を使用して、CD19、CD20、BCMA、及びCD38から成る群から選択される抗原を発現させる細胞に対して細胞毒性薬を局在化させることもできる。
二重特異性抗体は、全長抗体または抗体フラグメントとして調製することができる。多重特異性抗体を作製するための技術としては、異なる特異性を有する2つの免疫グロブリン重鎖−軽鎖対の組換え共発現(Milstein and Cuello,Nature 305:537(1983))、WO93/08829、及びTraunecker
et al.,EMBOJ.10:3655(1991)を参照されたい)、及び「ノブインホール」操作(例えば、米国特許第5,731,168号を参照されたい)が挙げられるが、これらに限定されない。多重特異性抗体は、静電ステアリング効果を操作して抗体Fc−ヘテロ二量体分子を作製すること(WO2009/089004A1)、2つ以上の抗体またはフラグメントを架橋すること(例えば、米国特許第4,676,980号、及びBrennan et al.,Science,229:81(1985)を参照されたい)、ロイシンジッパーを使用して二重特異性抗体を産生すること(例えば、Kostelny et al.,J.Immunol.,148(5):1547−1553(1992)を参照されたい)、「ダイアボディ」技術を使用して二重特異性抗体フラグメントを作製すること(例えば、Hollinger et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA、90:6444−6448(1993)を参照されたい)、及び一本鎖Fv(sFv)二量体を使用すること(例えば、Gruber et al.,J.Immunol.,152:5368(1994)を参照されたい)、ならびに三重特異性抗体を調製すること(例えば、Tutt et al.J.Immunol.147:60(1991)、ならびにタンデム単一ドメイン抗体を含むポリペプチドを作製すること(例えば、米国特許出願第20110028695号、及びConrath et al.J.Biol.Chem.,2001;276(10):7346−50を参照されたい)によっても作製され得る。「オクトパス抗体」を含む、3つ以上の機能的抗原結合部位を有する操作された抗体も本明細書に含まれる(例えば、US2006/0025576A1を参照されたい)。
7.抗体変異形
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される抗体のアミノ酸配列変異形が企図される。例えば、抗体の結合親和性及び/または他の生物学的特性を改善することが望ましい場合がある。抗体のアミノ酸配列変異形は、抗体をコードする核酸配列に適切な修飾を導入することによって、またはペプチド合成によって調製され得る。かかる修飾には、例えば、抗体のアミノ酸配列内の残基からの欠失、及び/またはそれへの挿入、及び/またはその置換が含まれる。最終構築物に到達ために欠失、挿入、及び置換の任意の組み合わせを行うことができるが、最終構築物が所望の特性、例えば、抗原結合を保有することを条件とする。
a)置換、挿入、及び欠失変異形
いくつかの実施形態では、1つ以上のアミノ酸置換を有する抗体変異形が提供される。置換型変異誘発のための目的とする部位には、HVR及びFRが含まれる。保存的置換は
、表3の「好ましい置換」という見出しの下に示される。より実質的な変化は、表3の「例示的な置換」という見出しの下に提供され、アミノ酸側鎖クラスを参照して以下にさらに記載される。アミノ酸置換が目的とする抗体に導入され、生成物が所望の活性、例えば、抗原結合の保持/改善、免疫原性の低減、またはADCCまたはCDCの改善についてスクリーニングされ得る。
Figure 2021087455
アミノ酸は、一般的な側鎖特性に従って群分けされ得る。
(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile
(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln
(3)酸性:Asp、Glu
(4)塩基性:His、Lys、Arg
(5)鎖配向に影響を及ぼす残基:Gly、Pro
(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe。
非保存的置換は、これらのクラスのうちの1つのあるメンバーと別のクラスとの交換を伴うことになる。
ある種類の置換型変異形は、親抗体(例えば、ヒト化抗体またはヒト抗体)の1つ以上の超可変領域残基を置換することを伴う。一般に、さらなる試験のために選択される結果として生じる変異形(複数可)は、親抗体と比較してある特定の生物学的特性(例えば、親和性の増加、免疫原性の低減)の修正(例えば、改善)を有し、及び/または実質的に保持された親抗体のある特定の生物学的特性を有する。例示的な置換型変異形は、例えば、本明細書に記載の技術等のファージディスプレイに基づく親和性成熟技術を使用して好都合に生成され得る親和性成熟抗体である。簡潔には、1つ以上のHVR残基が変異され、変異形抗体がファージ上にディスプレイされ、特定の生物学的活性(例えば、結合親和性)についてスクリーニングされる。
改変(例えば、置換)は、例えば、抗体親和性を改善するために、HVR内に行われてもよい。かかる改変は、HVR「ホットスポット」、すなわち体細胞成熟プロセス中に高頻度で変異を経るコドンによってコードされる残基(例えば、Chowdhury,Methods Mol.Biol.207:179−196(2008))、及び/またはSDR(a−CDR)に行われてもよく、結果として生じる変異形VまたはVが結合親和性について試験される。二次ライブラリの構築及びそこからの再選択による親和性成熟は、例えば、Hoogenboom et al.in Methods in Molecular Biology 178:1−37(O’Brien et al.,ed.,Human Press,Totowa,NJ,(2001))に記載されている。親和性成熟のいくつかの実施形態では、様々な方法(例えば、エラープローンPCR、鎖シャッフリング、またはオリゴヌクレオチド指向性変異誘発)のいずれかによって、成熟のために選択される可変遺伝子に多様性が導入される。次いで、二次ライブラリが作製される。次いで、このライブラリをスクリーニングして、所望の親和性を有する任意の抗体変異形を識別する。多様性を導入する別の方法は、いくつかのHVR残基(例えば、一度に4〜6個の残基)がランダム化されるHVR指向性アプローチを伴う。抗原結合に関与するHVR残基は、例えば、アラニンスキャニング変異誘発またはモデリングを使用して、特異的に識別され得る。多くの場合、CDR−H3及びCDR−L3がとりわけ標的とされる。
いくつかの実施形態では、置換、挿入、または欠失は、かかる改変が抗体の抗原に結合する能力を実質的に低減させない限り、1つ以上のHVR内で生じ得る。例えば、結合親和性を実質的に低減させない保存的改変(例えば、本明細書に提供される保存的置換)が、HVR内で行われてもよい。かかる改変は、HVR「ホットスポット」またはCDR外であり得る。上に提供される変異形VH配列のいくつかの実施形態では、各HVRは、改変されていないか、または1つ、2つ、または3つ以下のアミノ酸置換を有するかのいずれかである。
変異誘発の標的とされ得る抗体の残基または領域の識別のための有用な方法は、「アラニンスキャニング変異誘発」と称され、Cunningham and Wells(1989) Science,244:1081−1085に記載されている。この方法において、標的残基(例えば、Arg、Asp、His、Lys、及びGlu等の荷電残基)の残基または基が識別され、中性または負に荷電されたアミノ酸(例えば、アラニンまたはポリアラニン)によって置き換えられて、抗体の抗原との相互作用が影響されたかを決定する。さらなる置換が最初の置換に対する機能感受性を示すアミノ酸位置に導入され得る。あるいは、または加えて、抗体と抗原との間の接触点を識別するための抗原−抗体複合体の結晶構造。かかる接触残基及び隣接する残基が置換の候補として標的とされ得る
か、または排除され得る。変異形をスクリーニングして、それらが所望の特性を有するかを決定することができる。
アミノ酸配列挿入としては、1個の残基から100個以上の残基を含有するポリペプチドの範囲の長さを有するアミノ末端及び/またはカルボキシル末端の融合、ならびに単一または複数のアミノ酸残基の配列内挿入が挙げられる。末端挿入の例としては、N末端メチオニル残基を有する抗体が挙げられる。抗体分子の他の挿入型変異形には、酵素(例えば、ADEPTのため)または抗体の血清半減期を増加させるポリペプチドへの抗体のN末端またはC末端の融合が含まれる。
b)グリコシル化変異形
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される抗体は、抗体がグリコシル化される程度を増加または減少させるように改変される。抗体へのグリコシル化部位の付加または欠失は、1つ以上のグリコシル化部位が作製または除去されるようにアミノ酸配列を改変することによって好都合に達成され得る。
抗体がFc領域を含む場合、それに結合する炭水化物を改変してもよい。哺乳動物細胞によって産生される天然抗体は、典型的には、一般にN結合によってFc領域のCH2ドメインのAsn297に結合される分岐状の二分岐オリゴ糖を含む。例えば、Wright et al.TIBTECH 15:26−32(1997)を参照されたい。オリゴ糖には、種々の炭水化物、例えば、マンノース、N−アセチルグルコサミン(GlcNAc)、ガラクトース、及びシアル酸、ならびに二分岐オリゴ糖構造の「幹」中のGlcNAcに結合したフコースが含まれ得る。いくつかの実施形態では、ある特定の改善された特性を有する抗体変異形を作製するために、本出願の抗体中のオリゴ糖の修飾が行われ得る。
いくつかの実施形態では、Fc領域に(直接または間接的に)結合したフコースを欠く炭水化物構造を有する抗体変異形が提供される。例えば、かかる抗体中のフコースの量は、1%〜80%、1%〜65%、5%〜65%、または20%〜40%であり得る。フコースの量は、例えば、WO2008/077546に記載されるように、MALDI−TOF質量分析によって測定される、Asn297に結合した全ての糖構造(例えば、複合体、ハイブリッド、及び高マンノース構造)の合計に対する、Asn297での糖鎖内のフコースの平均量を計算することによって決定される。Asn297は、Fc領域内の約297位(Fc領域残基のEU番号付け)に位置するアスパラギン残基を指すが、Asn297はまた、抗体における小規模な配列変異に起因して、297位から約±3アミノ酸、上流または下流、すなわち、294〜300位の間に位置してもよい。かかるフコシル化変異形は、改善されたADCC機能を有し得る。例えば、米国特許公開第US2003/0157108号(Presta,L.)、US2004/0093621号(Kyowa Hakko Kogyo Co.,Ltd)を参照されたい。「脱フコシル化」または「フコース欠損」抗体変異形に関する出版物の例としては、US2003/0157108、WO2000/61739、WO2001/29246、US2003/0115614、US2002/0164328、US2004/0093621、US2004/0132140、US2004/0110704、US2004/0110282、US2004/0109865、WO2003/085119、WO2003/084570、WO2005/035586、WO2005/035778、WO2005/053742、WO2002/031140、Okazaki et al.J.Mol.Biol.336:1239−1249(2004)、Yamane−Ohnuki et
al.Biotech.Bioeng.87:614(2004)が挙げられる。脱フコシル化抗体を産生することができる細胞株の例としては、タンパク質フコシル化が欠損したLec13 CHO細胞(Ripka et al.Arch.Biochem.B
iophys.249:533−545(1986)、米国特許出願第US2003/0157108 A1号(Presta,L、及びWO2004/056312 A1、Adams et al.、特に実施例11)、及びアルファ−1,6−フコシルトランスフェラーゼ遺伝子、FUT8、ノックアウトCHO細胞等のノックアウト細胞株(例えば、Yamane−Ohnuki et al.Biotech.Bioeng.87:614(2004)、Kanda,Y.et al.,Biotechnol.Bioeng.,94(4):680−688(2006)、及びWO2003/085107を参照されたい)が挙げられる。
例えば、抗体のFc領域に結合した二分岐オリゴ糖がGlcNAcによって二分されている二分オリゴ糖を有する抗体変異形がさらに提供される。かかる抗体変異形は、低減されたフコシル化及び/または改善されたADCC機能を有し得る。かかる抗体変異形の例は、例えば、WO2003/011878(Jean−Mairet et al.)、米国特許第6,602,684号(Umana et al.)、及びUS2005/0123546(Umana et al.)に記載されている。Fc領域に結合したオリゴ糖内に少なくとも1つのガラクトース残基を有する抗体変異形も提供される。かかる抗体変異形は、改善されたCDC機能を有し得る。かかる抗体変異形は、例えば、WO1997/30087(Patel et al.)、WO1998/58964(Raju,S.)、及びWO1999/22764(Raju,S.)に記載されている。
c)Fc領域変異形
いくつかの実施形態では、1つ以上のアミノ酸修飾が本明細書に提供される抗体のFc領域に導入され、それによりFc領域変異形が生成され得る。Fc領域変異形は、1つ以上のアミノ酸位置にアミノ酸修飾(例えば、置換)を含むヒトFc領域配列(例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4 Fc領域)を含み得る。
いくつかの実施形態では、本出願は、全てではないがいくつかのエフェクター機能を保有し、それにより抗体のインビボでの半減期が重要であるが、特定のエフェクター機能(補体及びADCC等)が不要または有害である用途に望ましい候補となる抗体変異形を企図する。インビトロ及び/またはインビボ細胞毒性アッセイを行って、CDC及び/またはADCC活性の低減/枯渇を確認することができる。例えば、Fc受容体(FcR)結合アッセイを行って、抗体がFcγR結合を欠く(それ故にADCC活性を欠く可能性が高い)が、FcRn結合能力を保持することを確実にすることができる。ADCCを媒介するための初代細胞であるNK細胞がFc(RIIIのみを発現する一方で、単球は、Fc(RI、Fc(RII、及びFc(RIIIを発現する。造血細胞でのFcR発現は、Ravetch and Kinet,Annu.Rev.Immunol.9:457−492(1991)の464頁の表3に要約されている。目的とする分子のADCC活性を評価するためのインビトロアッセイの非限定的な例は、米国特許第5,500,362号(例えば、Hellstrom,I.et al.Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 83:7059−7063(1986)を参照されたい)、及びHellstrom,I et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA
82:1499−1502(1985)、5,821,337(Bruggemann,M.et al.,J.Exp.Med.166:1351−1361(1987)を参照されたい)に記載されている。あるいは、非放射性アッセイ方法を用いてもよい(例えば、フローサイトメトリーのためのACTI(商標)非放射性細胞毒性アッセイ(CellTechnology,Inc.Mountain View,CA、及びCytoTox 96(登録商標)非放射性細胞毒性アッセイ(Promega、Madison,WI)を参照されたい。かかるアッセイに有用なエフェクター細胞としては、末梢血単核細胞(PBMC)及びナチュラルキラー(NK)細胞が挙げられる。あるいは、または加えて、目的とする分子のADCC活性は、インビボで、例えば、Clynes et
al.Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 95:652−656(1998)に開示される動物モデルにおいて評価することができる。C1q結合アッセイを実施して、抗体がC1qに結合することができず、それによりCDC活性を欠くことを確認することもできる。例えば、WO2006/029879及びWO2005/100402におけるC1q及びC3c結合ELISAを参照されたい。補体活性化を評価するために、CDCアッセイが行われ得る(例えば、Gazzano−Santoro et al.,J.Immunol.Methods 202:163(1996)、Cragg,M.S.et al.,Blood 101:1045−1052(2003)、及びCragg,M.S.and M.J.Glennie,Blood 103:2738−2743(2004)を参照されたい)。FcRn結合及びインビボクリアランス/半減期の決定は、当該技術分野で既知の方法を使用して行うこともできる(例えば、Petkova,S.B.et al.,Int’l.Immunol.18(12):1759−1769(2006)を参照されたい)。
低減したエフェクター機能を有する抗体としては、Fc領域残基238、265、269、270、297、327、及び329のうちの1つ以上の置換を有する抗体が挙げられる(米国特許第6,737,056号)。かかるFc変異体としては、アミノ酸265、269、270、297、及び327位のうちの2つ以上での置換を有するFc変異体、例えば、残基265及び297のアラニンへの置換を有するいわゆる「DANA」Fc変異体が挙げられる(米国特許第7,332,581号)。
FcRへの結合が改善または低減されたある特定の抗体変異形が記載される。(例えば、米国特許第6,737,056号、WO2004/056312、及びShields
et al.,J.Biol.Chem.9(2):6591−6604(2001)を参照されたい。)
いくつかの実施形態では、抗体変異形は、ADCCを改善する1つ以上のアミノ酸置換、例えば、Fc領域の298、333、及び/または334位(残基のEU番号付け)での置換を有するFc領域を含む。
いくつかの実施形態では、例えば、米国特許第6,194,551号、WO99/51642、及びIdusogie et al.J.Immunol.164:4178−4184(2000)に記載されるように、Fc領域でもたらされた改変の結果、改変された(すなわち、改善または低減のいずれか)C1q結合及び/または補体依存性細胞毒性(CDC)をもたらす。
半減期の延長及び母体IgGの胎児への移送に関与する新生児Fc受容体(FcRn)への結合の改善を有する抗体(Guyer et al.,J.Immunol.117:587(1976)、及びKim et al.,J.Immunol.24:249(1994))については、US2005/0014934A1(Hintonら)に記載されている。それらの抗体は、Fc領域のFcRnへの結合を改善する1つ以上の置換をそこに有するFc領域を含む。かかるFc変異形は、Fc領域残基:238、256、265、272、286、303、305、307、311、312、317、340、356、360、362、376、378、380、382、413、424、または434のうちの1つ以上での置換、例えば、Fc領域残基434の置換を有するものを含む(米国特許第7,371,826号)。
Fc領域変異形の他の例に関して、Duncan & Winter,Nature 322:738−40(1988)、米国特許第5,648,260号、米国特許第5,624,821号、及びWO94/29351も参照されたい。
d)システイン操作された抗体変異形
いくつかの実施形態では、抗体の1つ以上の残基がシステイン残基で置換されているシステイン操作された抗体、例えば、「thioMab」を作製することが望ましい場合がある。特定の実施形態では、置換された残基は、抗体のアクセス可能な部位で生じる。これらの残基をシステインで置換することによって、反応性のチオール基がそれにより抗体のアクセス可能な部位に位置付けられ、それを使用して、抗体を他の部分、例えば、薬物部分またはリンカー−薬物部分にコンジュゲートして、本明細書にさらに記載されるイムノコンジュゲートを作製することができる。いくつかの実施形態では、以下の残基のうちのいずれか1つ以上がシステインで置換され得る:重鎖のA118(EU番号付け)、及び重鎖Fc領域のS400(EU番号付け)。システイン操作された抗体は、例えば、米国特許第7,521,541号に記載されるように生成され得る。
e)抗体誘導体
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される抗体は、当該技術分野で既知であり、容易に入手可能な追加の非タンパク質性部分を含有するようにさらに修飾され得る。抗体の誘導体化に好適な部分には、水溶性ポリマーが含まれるが、これに限定されない。水溶性ポリマーの非限定的な例としては、ポリエチレングリコール(PEG)、エチレングリコール/プロピレングリコールのコポリマー、カルボキシメチルセルロース、デキストラン、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、ポリ−1,3−ジオキソラン、ポリ−1,3,6−トリオキサン、エチレン/無水マレイン酸コポリマー、ポリアミノ酸(ホモポリマーまたはランダムコポリマーのいずれか)、及びデキストランまたはポリ(n−ビニルピロリドン)ポリエチレングリコール、プロプロピレングリコールホモポリマー、プロリプロピレンオキシド/エチレンオキシドコポリマー、ポリオキシエチル化ポリオール(例えば、グリセロール)、ポリビニルアルコール、ならびにこれらの混合物が含まれるが、これらに限定されない。ポリエチレングリコールプロピオンアルデヒドは、水中でのその安定性のため、製造時に有利であり得る。ポリマーは、任意の分子量のものであり得、分岐状または非分岐状であり得る。抗体に結合したポリマーの数は異なり得、1つ以上のポリマーが結合している場合、それらは同じかまたは異なる分子であり得る。一般に、誘導体化に使用されるポリマーの数及び/または種類は、改善される抗体の特定の特性または機能、抗体の誘導体が規定の条件下で療法に使用されるか等を含むが、これらに限定されない、検討事項に基づいて決定され得る。
いくつかの実施形態では、放射線への曝露によって選択的に加熱され得る抗体及び非タンパク質性部分のコンジュゲートが提供される。いくつかの実施形態では、非タンパク質性部分は、カーボンナノチューブである(Kam et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102:11600−11605(2005))。放射線は、通常の細胞を傷つけないが、抗体−非タンパク質性部分に近位の細胞を死滅させる温度まで非タンパク質性部分を加熱する波長を含むが、これらに限定されない、任意の波長のものであり得る。
調製方法
本明細書に記載の抗体(sdAb等)は、当該技術分野で既知のまたは本明細書に記載の任意の方法を使用して調製され得る。
sdAbを調製する方法が説明されている。例えば、Els Pardon et al,Nature Protocol,2014;9(3):674を参照されたい。単一ドメイン抗体(VH等)は、当該技術分野で既知の方法を使用して、例えば、ラクダ科種(ラクダまたはラマ等)を免疫化し、それからハイブリドーマを得ることによって、または当該技術分野で既知の分子生物学技術を使用してsdAbのライブラリをクローニ
ングし、その後、選択されていないライブラリの個々のクローンをELISAによりまたはファージディスプレイを使用して選択することによって得られ得る。
sdAbの組換え産生について、sdAbをコードする核酸が単離され、さらなるクローニング(DNAの増幅)または発現のために複製可能なベクターに挿入される。sdAbをコードするDNAは、従来の手法を使用して(例えば、抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを使用することによって)容易に単離及び配列決定される。多くのベクターが利用可能である。ベクターの選択は、使用される宿主細胞に部分的に依存する。一般に、好ましい宿主細胞は、原核生物起源または真核生物(一般に、哺乳類)起源のいずれかのものである。
1.ポリクローナル抗体
ポリクローナル抗体は、一般に、関連抗原及びアジュバントの複数の皮下(sc)または腹腔内(ip)注入によって動物において産生される。二機能性または誘導化剤、例えば、マレイミドベンゾイルスルホスクシンイミドエステル(システイン残基を介したコンジュゲーション)、N−ヒドロキシスクシンイミド(リジン残基を介する)、グルタルアルデヒド、コハク酸無水物、SOCl、またはRN=C=NR(式中、R及びRが独立して低級アルキル基である)を使用して、関連抗原を、免疫する種において免疫原性であるタンパク質、例えば、キーホールリンペットヘモシアニン(KLH)、血清アルブミン、ウシサイログロブリン、またはダイズトリプシン阻害剤にコンジュゲートすることが有用であり得る。用いられ得るアジュバントの例としては、フロイント完全アジュバント、及びMPL−TDMアジュバント(モノホスホリル脂質A、合成トレハロースジコリノミコール酸塩)が挙げられる。免疫化プロトコルは、過度な実験なしに当業者によって選択され得る。
動物は、例えば、100μgまたは5μgのタンパク質またはコンジュゲート(それぞれ、ウサギまたはマウスの場合)を、3体積のフロイントの完全なアジュバントと組み合わせ、複数の部位で溶液を皮内注入することによって、抗原、免疫原性コンジュゲート、または誘導体に対して免疫化される。1ヶ月後、動物は、複数の部位での皮下注入により完全フロイントアジュバント中のペプチドまたはコンジュゲートの元の量の1/5〜1/10で追加免疫される。7〜14日後、動物が採血され、血清が抗体力価についてアッセイされる。動物は、力価がプラトーに到達するまで追加免疫される。コンジュゲートは、タンパク質融合物として組換え細胞培養物でも作製され得る。また、ミョウバン等の凝集剤も免疫応答の増強に好適である。
2.モノクローナル抗体
モノクローナル抗体は、実質的に同種の抗体集団から得られ、すなわち、その集団に含まれる個々の抗体は、微量で存在し得る可能な自然に生じる変異及び/または翻訳後修飾(例えば、異性化、アミド化)を除いて同一である。したがって、「モノクローナル」という修飾語は、別個の抗体の混合物ではないという抗体の特徴を示す。
例えば、モノクローナル抗体は、最初にKohler et al.,Nature,256:495(1975)により記載されるハイブリドーマ法を使用して作製され得るか、または組換えDNA法により作製され得る(米国特許第4,816,567号)。
ハイブリドーマ法において、マウス、またはハムスター等の他の適切な宿主動物が、上述のように免疫化されて、免疫化のために使用されるタンパク質に特異的に結合するであろう抗体を産生するか、または産生することができるリンパ球が誘発される。あるいは、リンパ球は、インビトロで免疫化され得る。次いで、リンパ球は、ポリエチレングリコール等の好適な融合剤を使用して骨髄腫細胞で融合されて、ハイブリドーマ細胞を形成する
(Goding,Monoclonal Antibodies:Principles
and Practice,pp.59−103(Academic Press,1986)。
免疫化剤は、典型的には、抗原タンパク質またはその融合変異形を含む。一般に、ヒト起源の細胞が所望される場合に抹消血リンパ球(「PBL」)が使用されるか、または非ヒト哺乳類起源が所望される場合に脾臓細胞もしくはリンパ節細胞が使用されるかのいずれかである。その後、リンパ球は、ポリエチレングリコール等の好適な融合剤を使用して不死化細胞株と融合されて、ハイブリドーマ細胞を形成する。Goding,Monoclonal Antibodies:Principles and Practice,Academic Press(1986),pp.59−103。
不死化細胞株は、通常、形質転換された哺乳類細胞、特に齧歯類、ウシ、及びヒト起源の骨髄腫細胞である。通常、ラットまたはマウス骨髄腫細胞系が用いられる。このように調製されたハイブリドーマ細胞は、播種され、融合されていない親骨髄腫細胞の成長または生存を阻害する1つ以上の物質を好ましくは含有する好適な培養培地で成長する。例えば、親骨髄腫細胞が、酵素ヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HGPRTまたはHPRT)を欠く場合、ハイブリドーマのための培養培地は、典型的には、ヒポキサンチン、アミノプテリン、及びチミジン(HAT培地)を含み、これらは、HGPRT欠損細胞の成長を阻止する物質である。
好ましい不死化骨髄腫細胞は、効率的に融合し、選択された抗体産生細胞による安定した高レベルの抗体産生を支援し、HAT培地等の培地に感受性を示すものである。これらの中でもとりわけ、Salk Institute Cell Distribution Center,San Diego,Calif.USAから入手可能なMOPC−21及びMPC−11マウス腫瘍に由来するもの、ならびにAmerican Type
Culture Collection,Manassas,Va.USAから入手可能なSP−2細胞(及びその誘導体、例えば、X63−Ag8−653)等のマウス骨髄腫株が好ましい。ヒト骨髄腫及びマウス−ヒトヘテロ骨髄腫細胞株も、ヒトモノクローナル抗体の産生に関して記載されている(Kozbor,J.Immunol.,133:3001(1984)、Brodeur et al.,Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications,pp.51−63(Marcel Dekker,Inc.,New York,1987))。
ハイブリドーマ細胞が成長する培養培地は、抗原に対して指向されたモノクローナル抗体の産生に関してアッセイされる。好ましくは、ハイブリドーマ細胞によって産生されるモノクローナル抗体の結合特異性は、免疫沈降またはインビトロ結合アッセイ、例えば、ラジオイムノアッセイ(RIA)または酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)によって決定される。
ハイブリドーマ細胞が培養される培養培地は、所望の抗原に対して指向されたモノクローナル抗体の存在についてアッセイされ得る。好ましくは、モノクローナル抗体の結合親和性及び特異性は、免疫沈降またはインビトロ結合アッセイ、例えば、ラジオイムノアッセイ(RIA)または酵素結合アッセイ(ELISA)によって決定され得る。かかる技術及びアッセイは、当該技術分野で既知である。例えば、結合親和性は、Munson et al.,Anal.Biochem.,107:220(1980)のスキャチャード分析によって決定され得る。
所望の特異性、親和性、及び/または活性を有する抗体を産生するハイブリドーマ細胞
が特定された後、クローンが限界希釈手技によってサブクローニングされ、標準の方法によって成長し得る(Goding(上記参照))。この目的に好適な培養培地としては、例えば、D−MEMまたはRPMI−1640培地が挙げられる。加えて、ハイブリドーマ細胞は、哺乳動物における腫瘍としてインビボで成長し得る。
サブクローンにより分泌されるモノクローナル抗体は、例えば、タンパク質A−セファロース、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析、または親和性クロマトグラフィー等の従来の免疫グロブリン精製手順によって、培養培地、腹水、または血清から好適に分離される。
モノクローナル抗体は、米国特許第4,816,567号に記載される方法及び上に記載される方法等の組換えDNA法によっても作製され得る。モノクローナル抗体をコードするDNAは、従来の手順を使用して(例えば、マウス抗体の重及び軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを使用することにより)容易に単離及び配列決定される。ハイブリドーマ細胞は、かかるDNAの好ましい源としての機能を果たす。単離されると、DNAが発現ベクター内に配置され得、その後、これが、宿主細胞、例えば、E.coli細胞、サルCOS細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、または免疫グロブリンタンパク質を別様に産生しない骨髄腫細胞にトランスフェクトされて、かかる組換え宿主細胞内でモノクローナル抗体を合成する。抗体をコードするDNAの細菌における組換え発現に関する概説論文としては、Skerra et al.,Curr.Opinion in Immunol.,5:256−262(1993)及びPliickthun,Immunol.Revs.130:151−188(1992)が挙げられる。
さらなる一実施形態では、抗体は、McCafferty et al.,Nature,348:552−554(1990)に記載される技術を使用して生成された抗体ファージライブラリから単離され得る。Clackson et al.,Nature,352:624−628(1991)、及びMarks et al.,J.Mol.Biol.,222:581−597(1991)は、それぞれ、ファージライブラリを使用したマウス及びヒト抗体の単離を記載する。続報は、鎖シャッフリングによる高親和性(nM範囲)ヒト抗体の産生(Marks et al.,Bio/Technology,10:779−783(1992))、ならびに非常に大きなファージライブラリを構築するための戦略としてのコンビナトリアル感染及びインビボ組換えを記載する(Waterhouse et al.,Nucl.Acids Res.,21:2265−2266(1993))。したがって、これらの技術は、モノクローナル抗体を単離するための従来のモノクローナル抗体ハイブリドーマ技術の実行可能な代替案である。
DNAは、例えば、相同マウス配列の代わりにヒト重鎖及び軽鎖定常ドメインのコード配列を置換することによって(米国特許第4,816,567号;Morrison、et al.,Proc.Natl Acad.Sci.USA,81:6851(1984))、または非免疫グロブリンポリペプチドのコード配列の全てもしくは一部を免疫グロブリンコード配列に共有結合することによっても修飾され得る。典型的には、かかる非免疫グロブリンポリペプチドは、抗体の定常ドメインの代わりに置換されるか、またはそれらが、抗体の1つの抗原結合部位の可変ドメインの代わりに置換されて、抗原に対して特異性を有する1つの抗原結合部位、及び異なる抗原に対して特異性を有する別の抗原結合部位を含むキメラ二価抗体を作製する。
本明細書に記載のモノクローナル抗体は一価であり得、その調製は、当該技術分野で既知である。例えば、1つの方法は、免疫グロブリン軽鎖及び修飾された重鎖の組換え発現を伴う。重鎖は、重鎖架橋を防止するように、一般にFc領域内の任意の点で切断される
。あるいは、関連システイン残基は、別のアミノ酸残基で置換され得るか、または架橋を防止するように欠失される。インビトロ方法も、一価抗体の調製に好適である。そのフラグメント、具体的には、Fabフラグメントを産生するための抗体の消化は、当該技術分野で既知の日常的な技法を使用して達成され得る。
キメラまたはハイブリッド抗体も、架橋剤を伴うものを含む合成タンパク質化学で既知の方法を使用してインビトロで調製され得る。例えば、免疫毒素は、ジスルフィド交換反応を使用して、またはチオエーテル結合を形成することによって構築され得る。この目的に好適な試薬としては、イミノチオレート及びメチル−4−メルカプトブチルイミデート(mercaptobutyrimidate)が挙げられる。
3.原核生物細胞における組換え産生
a)ベクター構築
本出願の抗体をコードするポリヌクレオチド配列は、標準の組換え技法を使用して得られ得る。所望のポリヌクレオチド配列は、ハイブリドーマ細胞等の抗体産生細胞から単離及び配列決定され得る。あるいは、ポリヌクレオチドは、ヌクレオチド合成機またはPCR技術を使用して合成され得る。得られた時点で、ポリペプチドをコードする配列は、原核生物宿主内で異種ポリヌクレオチドを複製及び発現することができる組換えベクターに挿入される。利用可能であり、 当該技術分野で既知である多くのベクターが本発明で使用され得る。適切なベクターの選択は、ベクターに挿入される核酸の大きさ及びベクターで形質転換される特定の宿主細胞に主に依存する。各ベクターは、その機能(異種ポリヌクレオチドの増幅もしくは発現、またはこれらの両方)及びそれが存在する特定の宿主細胞とのその適合性に応じて種々の成分を含有する。ベクター成分としては、一般に、複製起点、選択マーカー遺伝子、プロモーター、リボソーム結合部位(RBS)、シグナル配列、異種核酸挿入、及び転写終結配列が挙げられるが、これらに限定されない。
一般に、宿主細胞と適合性のある種由来のレプリコン及び制御配列を含有するプラスミドベクターが、これらの宿主に関連して使用される。このベクターは、通常、複製部位、及び形質転換細胞において表現型選択を提供することができるマーキング配列を持つ。例えば、E.coliは、典型的には、E.coli種由来のプラスミドであるpBR322を使用して形質転換される。pBR322は、アンピシリン(Amp)及びテトラサイクリン(Tet)耐性をコードする遺伝子を含有し、それ故に形質転換細胞を特定するための容易な手段を提供する。pBR322、その誘導体、または他の微生物プラスミドもしくはバクテリオファージは、内因性タンパク質の発現のための微生物によって使用され得るプロモーターも含有し得るか、またはそれを含有するように修飾され得る。特定の抗体の発現のために使用されるpBR322誘導体の例は、Carter et al.,米国特許第5,648,237号に詳細に記載されている。
加えて、宿主微生物と適合性のあるレプリコン及び制御配列を含有するファージベクターは、これらの宿主に関連して形質転換ベクターとして使用され得る。例えば、GEM(商標)−11等のバクテリオファージが、E.coli LE392等の感受性宿主細胞を形質転換するために使用され得る組換えベクターを作製する際に利用され得る。
本出願の発現ベクターは、ポリペプチド成分の各々をコードする2つ以上のプロモーター−シストロン対を含み得る。プロモーターは、その発現を調節するシストロンの上流(5′)に位置する非翻訳制御配列である。原核生物プロモーターは、典型的には、2つのクラス、誘導プロモーター及び構成プロモーターに分けられる。誘導プロモーターは、培養条件の変化、例えば、栄養素の存在もしくは不在、または温度の変化に応答してその制御下で増加したレベルのシストロンの転写を開始するプロモーターである。
様々な潜在的宿主細胞によって認識される多数のプロモーターが周知である。選択されたプロモーターは、制限酵素消化によりソースDNAからプロモーターを除去し、単離されたプロモーター配列を本出願のベクターに挿入することによって、軽鎖または重鎖をコードするシストロンDNAに作動可能に結合し得る。天然プロモーター配列も多くの異種プロモーターもいずれも、標的遺伝子の増幅及び/または発現を誘導するために使用され得る。いくつかの実施形態では、異種プロモーターが一般に天然標的ポリペプチドプロモーターと比較して発現された標的遺伝子のより大きい転写及びより高い収率をもたらすため、異種プロモーターが利用される。
原核生物宿主との使用に好適なプロモーターとしては、PhoAプロモーター、−ラクタマーゼ及びラクトースプロモーター系、トリプトファン(trp)プロモーター系、及びハイブリッドプロモーター、例えば、tacまたはtrcプロモーターが挙げられる。しかしながら、細菌において機能的な他のプロモーター(他の既知の細菌またはファージプロモーター等)も好適である。それらの核酸配列が公開されており、それにより、当業者が、任意の必要な制限部位を提供するためにリンカーまたはアダプターを使用して、それらを標的軽鎖及び重鎖をコードするシストロンに作動可能に連結することを可能にする(Siebenlist et al.(1980) Cell 20:269)。
一態様では、組換えベクター内の各シストロンは、膜にわたる発現ポリペプチドの転位を誘導する分泌シグナル配列成分を含む。一般に、シグナル配列は、ベクターの成分であり得るか、またはベクターに挿入される標的ポリペプチドDNAの一部であり得る。本発明の目的のために選択されるシグナル配列は、宿主細胞によって認識及びプロセシングされる(すなわち、シグナルペプチダーゼによって切断される)ものであるべきである。異種ポリペプチドに天然のシグナル配列を認識もプロセシングもしない原核生物宿主細胞について、シグナル配列は、例えば、アルカリ性ホスファターゼ、ペニシリナーゼ、Ipp、または熱安定性エンテロトキシンII(STII)リーダー、LamB、PhoE、PelB、OmpA、及びMBPから成る群から選択される原核生物シグナル配列により置換される。本出願のいくつかの実施形態では、発現系の両方のシストロンで使用されるシグナル配列は、STIIシグナル配列またはその変異形である。
いくつかの実施形態では、本出願による抗体の産生は、宿主細胞の細胞質で生じ得、それ故に、各シストロン内の分泌シグナル配列の存在を必要としない。いくつかの実施形態では、ポリペプチド成分、例えば、第2の抗原結合部分に任意に融合される第1の抗原結合部分のVドメインをコードするポリペプチド及び第2の抗原結合部分に任意に融合される第1の抗原結合部分のVドメインをコードするポリペプチド等が発現され、折り畳まれ、アセンブリされて、細胞質内に機能的抗体を形成する。ある特定の宿主株(例えば、E.coli trxB株)は、ジスルフィド結合形成に好ましい細胞質条件を提供し、それにより発現タンパク質サブユニットの適切な折り畳み及びアセンブリを可能にする。Proba and Pluckthun Gene,159:203(1995)。
本発明は、分泌及び適切にアセンブリされた本出願の抗体の収率を最大化するために発現ポリペプチド成分の量比が調節され得る発現系を提供する。かかる調節は、ポリペプチド成分の翻訳強度を同時に調節することによって少なくとも部分的に達成される。翻訳強度を調節するための1つの技術が、Simmons et al.,米国特許第5,840,523号に開示されている。それは、シストロン内の翻訳開始領域(TIR)の変異形を利用する。所与のTIRについて、一連のアミノ酸または核酸配列変異形がある範囲の翻訳強度で作製され、それによりこの因子を特定の鎖の所望の発現レベルに調整するための便利な手段を提供することができる。TIR変異形は、アミノ酸配列を改変することができるコドン変化をもたらす従来の変異誘発技法によって生成され得るが、核酸配列の
サイレント変化が好ましい。TIRの改変は、例えば、シグナル配列の改変に加えて、シャイン・ダルガノ配列の数またはスペーシングの改変を含み得る。変異シグナル配列を生成するための1つの方法は、シグナル配列のアミノ酸配列を変化させない(すなわち、変化がサイレントである)コード配列の始めに「コドンバンク」を生成することである。これは、各コドンの第3のヌクレオチド位置を変化させることによって達成され得、加えて、ロイシン、セリン、及びアルギニン等のいくつかのアミノ酸は、バンクの作製を複雑にし得る複数の第1及び第2の位置を有する。この変異誘発法は、Yansura et al.(1992) METHODS:A Companion to Methods
in Enzymol.4:151−158に詳細に記載されている。
好ましくは、一組のベクターは、その内部の各シストロンのある範囲のTIR強度で生成される。この限定された組は、各鎖の発現レベルの比較、ならびに種々のTIR強度組み合わせ下での所望のタンパク質産物の収率を提供する。TIR強度は、Simmons
et al.米国特許第5,840,523号に詳細に記載されるように、レポーター遺伝子の発現レベルを定量することによって決定され得る。翻訳強度比較に基づいて、所望の個々のTIRが、本出願の発現ベクター構築物において組み合わせられるように選択される。
b)原核生物宿主細胞
本出願の抗体の発現に好適な原核生物宿主細胞としては、グラム陰性またはグラム陽性生物等のArchaebacteria及びEubacteriaが挙げられる。有用な細菌の例としては、Escherichia(例えば、E.coli)、Bacilli(例えば、B.subtilis)、Enterobacteria、Pseudomonas種(例えば、P.aeruginosa)、Salmonella typhimurium、Serratia marcescans、Klebsiella、Proteus、Shigella、Rhizobia、Vitreoscilla、またはParacoccusが挙げられる。いくつかの実施形態では、グラム陰性細胞が使用される。いくつかの実施形態では、E.coli細胞が、本発明の宿主として使用される。E.coli株の例としては、株W3110(Bachmann,Cellular and Molecular Biology,vol.2(Washington,D.C.:American Society for Microbiology,1987),pp.1190−1219、ATCC寄託番号27,325)及びその誘導体(遺伝子型W3110 AfhuA(AtonA)ptr3 lac Iq lacL8 AompT A(nmpc−fepE)degP41 kanを有する株33D3を含む)が挙げられる(米国特許第5,639,635号)。他の株及びそれらの誘導体、例えば、E.coli 294(ATCC 31,446)、E.coli B、E.coli
1776(ATCC 31,537)及びE.coli RV308(ATCC 31,608)も好適である。これらの例は、限定するものではなく、例証するものである。定義された遺伝子型を有する上述の細菌のうちのいずれかの誘導体の構築方法は、当該技術分野で既知であり、例えば、Bass et al.,Proteins,8:309−314(1990)に記載されている。一般に、細菌の細胞におけるレプリコンの複製可能性を考慮して適切な細菌を選択することが必要である。例えば、pBR322、pBR325、pACYC177、またはpKN410等の周知のプラスミドを使用してレプリコンを提供する場合、E.coli、Serratia、またはSalmonella種が宿主として好適に使用され得る。
典型的には、宿主細胞は、最小量のタンパク質分解酵素しか分泌すべきでなく、さらなるプロテアーゼ阻害剤が細胞培養物に組み込まれることが望ましくあり得る。
c)タンパク質の産生
宿主細胞は、上述の発現ベクターで形質転換され、プロモーターの誘導、形質転換体の選択、または所望の配列をコードする遺伝子の増幅に適切になるように修飾された従来の栄養素培地で培養される。形質転換とは、DNAが染色体外要素として、または染色体組み込み体によってのいずれかで複製可能になるように、DNAを原核生物宿主に導入することを意味する。使用される宿主細胞に応じて、形質転換がかかる細胞に適切な標準の技術を使用して行われる。一般に、塩化カルシウムを用いるカルシウム処理が、実質的な細胞壁障壁を含有する細菌細胞に使用される。形質転換の別の方法は、ポリエチレングリコール/DMSOを用いる。使用されるさらに別の技術は、電気穿孔法である。
本出願の抗体を産生するために使用される原核生物細胞は、当該技術分野で既知であり、かつ選択された宿主細胞の培養に好適な培地で成長する。好適な培地の例としては、必要な栄養補助剤を含むルリアブロス(LB)が挙げられる。いくつかの実施形態では、培地は、発現ベクターを含有する原核生物細胞の成長を選択的に許容するために、発現ベクターの構築に基づいて選択された選択剤も含有する。例えば、アンピシリンは、アンピシリン耐性遺伝子を発現する細胞を成長させるための培地に添加される。
炭素、窒素、及び無機リン酸塩源に加えて、任意の必要な補助剤も、単独で、または複合窒素源等の別の補助剤もしくは培地との混合物として導入される適切な濃度で含まれ得る。任意に、培養培地は、グルタチオン、システイン、シスタミン、チオグリコレート、ジチオエリトリトール、及びジチオスレイトールから成る群から選択される1つ以上の還元剤を含有し得る。
原核生物宿主細胞は、好適な温度で培養される。E.coli成長の場合、例えば、好ましい温度は、約20℃〜約39℃の範囲、より好ましくは約25℃〜約37℃の範囲、さらにより好ましくは約30℃である。培地のpHは、主に宿主生物に応じて約5〜約9の範囲の任意のpHであり得る。E.coliの場合、pHは、好ましくは約6.8〜約7.4、より好ましくは約7.0である。
誘導プロモーターが本出願の発現ベクターに使用される場合、タンパク質発現は、プロモーターの活性化に好適な条件下で誘導される。本出願の一態様では、PhoAプロモーターは、ポリペプチドの転写を制御するために使用される。したがって、形質転換宿主細胞は、誘導のためにリン酸塩制限培地で培養される。好ましくは、リン酸塩制限培地は、C.R.A.P培地である(例えば、Simmons et al.,J.Immunol.Methods(2002),263:133−147を参照されたい)。様々な他の誘導因子が、当該技術分野で既知の用いられるベクター構築物に従って使用され得る。
本出願の発現抗体は、宿主細胞の周辺質に分泌され、それから回収される。タンパク質回収は、典型的には、一般に浸透圧ショック、超音波処理、または溶解等の手段による微生物の破壊を伴う。細胞が破壊されると、細胞残屑または全細胞は、遠心分離または濾過によって除去され得る。タンパク質は、例えば、親和性樹脂クロマトグラフィーによってさらに精製される。あるいは、タンパク質は、培養培地に輸送され、その中で単離され得る。細胞が培養物から除去され得、培養上清が、産生されたタンパク質のさらなる精製のために濾過及び濃縮される。発現ポリペプチドは、ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)及びウエスタンブロットアッセイ等の一般に既知の方法を使用してさらに単離及び特定され得る。
あるいは、タンパク質産生は、発酵プロセスによって大量に行われる。種々の大規模供給バッチ発酵手技が、組換えタンパク質の産生に利用可能である。大規模発酵は、少なくとも1000リットルの容量、好ましくは約1,000〜100,000リットルの容量を有する。これらの発酵槽は、酸素及び栄養素、特にグルコース(好ましい炭素/エネル
ギー源)を分布させるために撹拌インペラーを使用する。小規模発酵とは、一般に、容積がおよそ100リットル以下であり、及び約1リットル〜約100リットルの範囲であり得る発酵槽での発酵を指す。
発酵プロセス中、タンパク質発現の誘導は、典型的には、細胞が所望の密度、例えば、約180〜220のOD550になるまで好適な条件下で成長した後に開始され、その段階で、細胞は、初期静止期にある。様々な誘導因子が、当該技術分野で既知の上述の用いられるベクター構築物に従って使用され得る。細胞は、誘導前により短い期間成長し得る。細胞は、通常、約12〜50時間誘導されるが、より長いまたはより短い誘導時間も使用され得る。
本出願の抗体の産生収率及び品質を改善するために、種々の発酵条件が修正され得る。例えば、分泌ポリペプチドの適切なアセンブリ及び折り畳みを改善するために、シャペロンタンパク質、例えば、Dsbタンパク質(DsbA、DsbB、DsbC、DsbD、及び/またはDsbG)またはFkpA(シャペロン活性を有するペプチジルプロリルシス,トランス−イソメラーゼ)を過剰発現するさらなるベクターを使用して、宿主原核生物細胞を共形質転換することができる。シャペロンタンパク質が細菌宿主細胞において産生される異種タンパク質の適切な折り畳み及び溶解を容易にすることが実証されている。Chen et al.(1999) J Bio Chem 274:19601−19605、Georgiou et al.,米国特許第6,083,715号、Georgiou et al.,米国特許第6,027,888号、Bothmann and Pluckthun(2000)J.Biol.Chem.275:17100−17105、Ramm and Pluckthun(2000)J.Biol.Chem.275:17106−17113、Arie et al.(2001) Mol.Microbiol.39:199−210。
発現異種タンパク質(特にタンパク質分解感受性のもの)のタンパク質分解を最小限に抑えるために、タンパク質分解酵素が欠損したある特定の宿主株が本発明に使用され得る。例えば、宿主細胞株は、既知の細菌プロテアーゼ、例えば、プロテアーゼIII、OmpT、DegP、Tsp、プロテアーゼI、プロテアーゼMi、プロテアーゼV、プロテアーゼVI、及びそれらの組み合わせをコードする遺伝子において遺伝子変異(複数可)をもたらすように修飾され得る。いくつかのE.coliプロテアーゼ欠損株が利用可能であり、例えば、Joly et al.(1998)(上記を参照)、Georgiou et al.,米国特許第5,264,365号、Georgiou et al.,米国特許第5,508,192号、Hara et al.,Microbial Drug Resistance,2:63−72(1996)に記載されている。
タンパク質分解酵素が欠損し、1つ以上のシャペロンタンパク質を過剰発現するプラスミドで形質転換されたE.coli株が、本出願の抗体をコードする発現系における宿主細胞として使用され得る。
d)タンパク質の精製
本明細書における産生された抗体は、さらなるアッセイ及び使用のためにさらに精製されて実質的に同種の調製物を得る。当該技術分野で既知の標準のタンパク質精製方法が用いられ得る。以下の手技:免疫親和性またはイオン交換カラムでの分画、エタノール沈殿、逆相HPLC、DEAE等のシリカまたは陽イオン交換樹脂でのクロマトグラフィー、クロマトフォーカシング、SDS−PAGE、硫酸アンモニウム沈殿、及び例えばSephadex G−75を使用したゲル濾過が、好適な精製手技の例示である。
一態様では、固相上に固定化されたタンパク質Aは、本出願のFc領域を含む抗体の免
疫親和性精製のために使用される。タンパク質Aは、高親和性で抗体のFc領域に結合するStaphylococcus aureas由来の41kDの細胞壁タンパク質である。Lindmark et al(1983)J.Immunol.Meth.62:1−13。タンパク質Aが固定化される固相は、好ましくは、ガラスまたはシリカ表面を含むカラム、より好ましくは、制御孔ガラスカラムまたはケイ酸カラムである。いくつかの適用では、カラムは、混入物質の非特異的付着を阻止するためにグリセロール等の試薬でコーティングされている。その後、固相が洗浄されて、固相に非特異的に結合している混入物質を除去する。最後に、目的とする抗体が溶出により固相から回収される。
4.真核生物細胞における組換え産生
真核生物発現の場合、ベクター成分としては、一般に、シグナル配列、複製起点、1つ以上のマーカー遺伝子、及びエンハンサー要素、プロモーター、及び転写終結配列のうちの1つ以上が挙げられるが、これらに限定されない。
a)シグナル配列成分
真核生物宿主で使用するためのベクターは、成熟タンパク質またはポリペプチドのN末端に特異的切断部位を有するシグナル配列または他のポリペプチドをコードする挿入物でもあり得る。選択された異種シグナル配列は、好ましくは、宿主細胞によって認識及びプロセシングされる(すなわち、シグナルペプチダーゼによって切断される)ものである。哺乳動物細胞発現において、哺乳動物シグナル配列、ならびにウイルス分泌リーダー、例えば、単純ヘルペスgDシグナルが利用可能である。
かかる前駆体領域のDNAは、本出願の抗体をコードするDNAに対するリーディングフレーム内でライゲーションされる。
b)複製起点
一般に、複製起点成分は、哺乳類発現ベクターには必要ではない(SV40起点は、典型的には、それが初期プロモーターを含有するという理由のみで使用され得る)。
c)選択遺伝子成分
発現及びクローニングベクターは、選択遺伝子、別名、選択可能なマーカーを含有し得る。典型的な選択遺伝子は、(a)抗生物質もしくは他の毒素、例えば、アンピシリン、ネオマイシン、メトトレキサート、もしくはテトラサイクリンへの耐性を与えるか、(b)栄養要求性欠損を補完するか、または(c)複合培地から入手不可能な必須の栄養素、例えば、BacilliのためのD−アラニンラセマーゼをコードする遺伝子を供給するタンパク質をコードする。
選択スキームの一例は、宿主細胞の成長を停止する薬物を利用する。異種遺伝子を用いた形質転換に成功した細胞は、薬物耐性を与え、したがって選択レジメンで生き残るタンパク質を産生する。かかる優性選択の例は、薬物ネオマイシン、ミコフェノール酸、及びハイグロマイシンを使用する。
哺乳類細胞に好適な選択可能なマーカーの別の例は、DHFR、チミジンキナーゼ、メタロチオネイン−I及び−II、好ましくは、霊長類メタロチオネイン遺伝子、アデノシンデアミナーゼ、オルニチンデカルボキシラーゼ等の本出願の抗体をコードする核酸を取り込むための細胞成分の特定を可能にするものである。
例えば、DHFR選択遺伝子で形質転換された細胞は、最初に、DHFRの競合アンタゴニストであるメトトレキサート(Mtx)を含有する培養培地中で全ての形質転換体を培養することによって特定される。野生型DHFRが用いられるときに適切な宿主細胞は
、DHFR活性が欠損したチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞株(例えば、ATCC CRL−9096)である。
あるいは、ポリペプチドコードDNA配列、野生型DHFRタンパク質、及びアミノグリコシド3’−ホスホトランスフェラーゼ(APH)等の別の選択可能なマーカーで形質転換または共形質転換された宿主細胞(特に、内因性DHFRを含有する野生型宿主)は、アミノグリコシド抗生物質、例えば、カナマイシン、ネオマイシン、またはG418等の選択可能なマーカーのための選択剤を含有する培地中での細胞成長によって選択され得る。米国特許第4,965,199号を参照されたい。
d)プロモーター成分
発現及びクローニングベクターは、通常、宿主生物によって認識され、及び所望のポリペプチド配列をコードする核酸に操作可能に連結するプロモーターを含有する。実質的に全ての真核生物遺伝子が、転写が開始される部位からおよそ25〜30塩基上流に位置するATに富んだ領域を有する。多くの遺伝子の転写開始から70〜80塩基上流に見られる別の配列は、Nが任意のヌクレオチドであり得るCNCAAT領域である。大半の真核生物の3’末端は、コード配列の3’末端へのポリA尾部の付加のためのシグナルであり得るAATAAA配列である。これらの配列は全て、真核生物発現ベクターに挿入され得る。
原核生物宿主との使用に好適な他のプロモーターとしては、phoAプロモーター、−ラクタマーゼ及びラクトースプロモーター系、アルカリ性ホスファターゼプロモーター、トリプトファン(trp)プロモーター系、及びハイブリッドプロモーター、例えば、tacプロモーターが挙げられる。しかしながら、他の既知の細菌プロモーターも好適である。細菌系で使用するためのプロモーターは、抗体をコードするDNAに操作可能に連結するシャイン・ダルガノ(S.D.)配列も含有する。
哺乳類宿主細胞中のベクターからのポリペプチド転写は、例えば、ポリオーマウイルス、鶏痘ウイルス、アデノウイルス(アデノウイルス2等)、ウシ乳頭腫ウイルス、トリ肉腫ウイルス、サイトメガロウイルス、レトロウイルス、B型肝炎ウイルス、及び最も好ましくはサルウイルス40(SV40)等のウイルスのゲノムから、異種哺乳類プロモーター、例えば、アクチンプロモーターまたは免疫グロブリンプロモーターから、熱ショックプロモーターから得られるプロモーターによって制御されるが、但し、かかるプロモーターが宿主細胞系と適合性であることを条件とする。
SV40ウイルスの初期及び後期プロモーターは、SV40ウイルス複製起点も含有するSV40制限フラグメントとして好都合に得られる。ヒトサイトメガロウイルスの最初期プロモーターは、HindIII E制限フラグメントとして好都合に得られる。ウシ乳頭腫ウイルスをベクターとして使用して哺乳動物宿主におけるDNAを発現させるための系は、米国特許第4,419,446号で開示される。この系の修飾は、米国特許第4,601,978号に記載される。単純ヘルペスウイルスからのチミジンキナーゼプロモーターの制御下でのマウス細胞内のヒト−インターフェロンcDNAの発現に関しては、Reyes et al.,Nature 297:598−601(1982)も参照されたい。あるいは、ラウス肉腫ウイルス長末端反復がプロモーターとして使用され得る。
e)エンハンサー要素成分
より高次の真核生物による本出願の抗体をコードするDNAの転写は、多くの場合、エンハンサー配列をベクターに挿入することによって増加する。哺乳動物遺伝子(グロビン、エラスターゼ、アルブミン、α−フェトプロテイン、及びインスリン)由来の多くのエ
ンハンサー配列が現在知られている。しかしながら、典型的には、真核細胞ウイルス由来のエンハンサーが使用されるであろう。例としては、複製起点の後半側のSV40エンハンサー(bp100〜270)、サイトメガロウイルス初期プロモーターエンハンサー、複製起点の後半側のポリオーマエンハンサー、及びアデノウイルスエンハンサーが挙げられる。真核プロモーターの活性化のための増強要素に関しては、Yaniv,Nature 297:17−18(1982)も参照されたい。エンハンサーは、ポリペプチドコード配列の5′位または3′位でベクターにスプライスされ得るが、好ましくは、プロモーターから5′部位に位置する。
f)転写終結成分
真核宿主細胞(酵母、真菌、昆虫、植物、動物、ヒト、または他の多細胞生物由来の有核細胞)で使用される発現ベクターは、転写終結及びmRNAの安定化に必要な配列も含有するであろう。かかる配列は、一般的には、真核生物またはウイルスDNAまたはcDNAの5′非翻訳領域、時折、3′非翻訳領域から入手可能である。これらの領域は、ポリペプチドコードmRNAの非翻訳部分内のポリアデニル化フラグメントとして転写されたヌクレオチドセグメントを含有する。1つの有用な転写終結構成成分は、ウシ成長ホルモンポリアデニル化領域である。WO94/11026及びそれらで開示される発現ベクターを参照されたい。
g)宿主細胞の選択及び形質転換
本明細書におけるベクター中のDNAのクローニングまたは発現に好適な宿主細胞としては、脊椎動物宿主細胞を含む本明細書に記載のより高次の真核生物細胞が挙げられる。培養物(組織培養物)中での脊椎動物細胞の繁殖は、日常的な手技になっている。有用な哺乳動物宿主細胞株の例は、SV40によって形質転換されたサル腎臓CV1株(COS−7、ATCC CRL 1651)、ヒト胚腎臓株(293細胞または懸濁培養物中での成長のためにサブクローン化された293細胞、Graham et al.,J.Gen Virol.36:59(1977))、ベビーハムスター腎細胞(BHK、ATCC CCL 10)、チャイニーズハムスター卵巣細胞/−DHFR(CHO、Urlaub et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4216(1980))、マウスセルトリ細胞(TM4、Mather,Biol.Reprod.23:243−251(1980))、サル腎臓細胞(CV1 ATCC CCL 70)、アフリカミドリザル腎臓細胞(VERO−76、ATCC CRL−1587)、ヒト子宮頸癌腫細胞(HELA、ATCC CCL 2)、イヌ腎臓細胞(MDCK、ATCC CCL 34)、バッファローラット肝細胞(BRL 3A、ATCC CRL 1442)、ヒト肺細胞(W138、ATCC CCL 75)、ヒト肝細胞(Hep G2、HB 8065)、マウス乳房腫瘍(MMT 060562、ATCC CCL51)、TR1細胞(Mather et al.,Annals N.Y.Acad.Sci.383:44−68(1982))、MRC5細胞、FS4細胞、及びヒト肝臓癌株(Hep G2)である。
宿主細胞は、抗体産生のための上述の発現またはクローニングベクターで形質転換され、プロモーターの誘導、形質転換体の選択、または所望の配列をコードする遺伝子の増幅に適切になるように修飾された従来の栄養素培地中で培養される。
h)宿主細胞の培養
本出願の抗体を産生するために使用される宿主細胞は、様々な培地中で培養され得る。Ham’s F10(Sigma)、最小必須培地((MEM)、(Sigma)、RPMI−1640(Sigma)、及びダルベッコ修飾イーグル培地((DMEM)、Sigma)等の市販されている培地は、宿主細胞の培養に好適である。加えて、Ham et al.,Meth.Enz.58:44(1979)、Barnes et al.
,Anal.Biochem.102:255(1980)、米国特許第4,767,704号、同第4,657,866号、同第4,927,762号、同第4,560,655号、もしくは同第5,122,469号、WO90/03430、WO87/00195、または米国特許再発行第30,985号に記載される培地のいずれも、宿主細胞のための培養培地として使用され得る。これらの培地のいずれにも、必要に応じて、ホルモン及び/または他の増殖因子(インスリン、トランスフェリン、または上皮増殖因子など)、塩(塩化ナトリウム、カルシウム、マグネシウム、及びリン酸塩など)、緩衝液(HEPESなど)、ヌクレオチド(アデノシン及びチミジンなど)、抗生物質(GENTAMYCIN(商標)薬など)、微量要素(マイクロモルの範囲の最小濃度で通常存在する無機化合物と定義される)、及びグルコースまたは同等のエネルギー源が補充され得る。任意の他の必要な補充物も、当業者には既知であろう適切な濃度で含まれ得る。温度、pH等の培養条件は、発現のために選択された宿主細胞とともにこれまでに使用されているものであり、当業者には明らかであろう。
i)タンパク質の精製
組換え技術を使用する際、抗体は、細胞内、周辺腔内で産生され得るか、または培地に直接分泌され得る。抗体が細胞内で産生される場合、第1のステップとして、微粒子残屑(宿主細胞または溶解フラグメントのいずれか)が、例えば、遠心分離または限外濾過により除去される。Carter et al.,Bio/Technology 10:163−167(1992)は、E.coliの細胞膜周辺腔に分泌される抗体を単離するための手順を記載する。簡潔には、細胞ペーストが、酢酸ナトリウム(pH3.5)、EDTA、及びフッ化フェニルメチルスルホニル(PMSF)の存在下で、約30分間にわたって解凍される。細胞残屑は、遠心分離によって除去され得る。抗体が培地に分泌される場合、かかる発現系の上清は、一般に、市販のタンパク質濃縮フィルター、例えば、AmiconまたはMillipore Pellicon限外濾過ユニットを使用して最初に濃縮される。PMSF等のプロテアーゼ阻害剤は、タンパク質分解を阻害するために前述のステップのうちのいずれかに含まれ得、抗生物質は、外来性混入物質の成長を阻止するために含まれ得る。
細胞から調製されたタンパク質組成物は、例えば、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析、及び親和性クロマトグラフィーを使用して精製され得、親和性クロマトグラフィーが好ましい精製技法である。親和性リガンドとしてのタンパク質Aの好適性は、抗体に存在する任意の免疫グロブリンFcドメインの種及びアイソタイプに依存する。タンパク質Aを使用して、1つ、2つ、または4つの重鎖を含有するヒト免疫グロブリンに基づく抗体を精製することができる(Lindmark et al.,J.Immunol.Meth.62:1−13(1983))。タンパク質Gは、全てのマウスアイソタイプ及びヒト3に推奨される(Guss et al.,EMBO J.5:15671575(1986))。親和性リガンドが結合する基質は、ほとんどの場合アガロースであるが、他の基質も利用可能である。制御細孔ガラスまたはポリ(スチレン−ジビニル)ベンゼン等の機械的に安定した基質は、アガロースで達成され得るものよりも速い流速及び短いプロセシング時間を可能にする。抗体がC3ドメインを含む場合、Bakerbond ABXTM樹脂(J.T.Baker,Phillipsburg,N.J.)が精製に有用である。イオン交換カラム上での分画、エタノール沈降、逆相HPLC、シリカ上でのクロマトグラフィー、陰イオンまたは陽イオン交換樹脂(ポリアスパラギン酸カラム等)上でのヘパリンSEPHAROSE(商標)クロマトグラフィー上でのクロマトグラフィー、クロマトフォーカシング、SDS−PAGE、及び硫酸アンモニウム沈降等のタンパク質精製のための他の技法も、回収される抗体に応じて利用可能である。
任意の予備精製ステップ(複数可)後、目的とする抗体及び汚染物質を含む混合物が、
約2.5〜4.5のpHの溶出緩衝液を使用して、低pH疎水性相互作用クロマトグラフィーに供され得、好ましくは、低塩濃度(例えば、約0〜0.25Mの塩)で行われ得る。
イムノコンジュゲート
いくつかの実施形態では、本出願は、化学療法剤もしくは薬、成長阻害剤、毒素(例えば、タンパク質毒素、細菌、真菌、植物、もしくは動物起源の酵素的に活性な毒素、またはそのフラグメント)、または放射性同位体等の1つ以上の細胞毒性薬にコンジュゲートした本明細書に記載の抗体(sdAb等)のうちのいずれかを含むイムノコンジュゲートも提供する。
いくつかの実施形態では、イムノコンジュゲートは、抗体が、マイタンシノイド(米国特許第5,208,020号、同第5,416,064号、及び欧州特許第EP0425235 B1号を参照されたい);モノメチルオーリスタチン薬物部分DE及びDF(MMAE及びMMAF)等のオーリスタチン(米国特許第5,635,483号、及び同第5,780,588号、及び同第7,498,298号を参照されたい);ドラスタチン;カリケアマイシンまたはその誘導体(米国特許第5,712,374号、同第5,714,586号、同第5,739,116号、同第5,767,285号、同第5,770,701号、同第5,770,710号、同第5,773,001号、及び同第5,877,296号、Hinman et al.,Cancer Res.53:3336−3342(1993)、ならびにLode et al.,Cancer Res.58:2925−2928(1998)を参照されたい);ダウノマイシンまたはドキソルビシン等のアントラサイクリン(Kratz et al.,Current Med.Chem.13:477−523(2006)、Jeffrey et al.,Bioorganic & Med.Chem.Letters 16:358−362(2006)、Torgov et al.,Bioconj.Chem.16:717−721(2005)、Nagy et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 97:829−834(2000)、Dubowchik et al.,Bioorg.& Med.Chem.Letters 12:1529−1532(2002)、King et al.,J.Med.Chem.45:4336−4343(2002)、及び米国特許第6,630,579号を参照されたい);メトトレキサート;ビンデシン;ドセタキセル、パクリタキセル、ラロタキセル、テセタキセル、及びオルタタキセル等のタキサン;トリコテセン;ならびにCC1065を含むが、これらに限定されない、1つ以上の薬物にコンジュゲートする抗体−薬物コンジュゲート(ADC)である。
いくつかの実施形態では、イムノコンジュゲートは、ジフテリアA鎖、ジフテリア毒素の非結合活性フラグメント、外毒素A鎖(Pseudomonas aeruginosa由来)、リシンA鎖、アブリンA鎖、モデシンA鎖、アルファ−サルシン、Aleurites fordiiタンパク質、ジアンシンタンパク質、Phytolaca americanaタンパク質(PAPI、PAPII、及びPAP−S)、momordica charantia阻害剤、クルシン、クロチン、sapaonaria officinalis阻害剤、ゲロニン、ミトゲリン、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシン、及びトリコテセンを含むが、これらに限定されない、酵素的に活性な毒素またはそのフラグメントにコンジュゲートした本明細書に記載の抗体を含む。
いくつかの実施形態では、イムノコンジュゲートは、放射性原子にコンジュゲートして放射性コンジュゲートを形成する本明細書に記載の抗体を含む。様々な放射性同位体が、放射性コンジュゲートの産生のために利用可能である。例としては、At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212、及びLuの放射性同位体が挙げられる。放射性コンジュゲートが検出のために
使用される場合、それは、シンチグラフィー研究のための放射性原子、例えば、tc99mもしくはI123、または核磁気共鳴(NMR)画像法(別名、磁気共鳴画像法、mri)のためのスピン標識、例えば、この場合もやはりヨウ素−123、ヨウ素−131、インジウム−111、フッ素−19、炭素−13、窒素−15、酸素−17、ガドリニウム、マンガン、もしくは鉄を含み得る。
抗体及び細胞毒性剤のコンジュゲートは、N−スクシンイミジル−3−(2−ピリジルジチオ)プロピオネート(SPDP)、スクシンイミジル−4−(N−マレイミドメチル)シクロヘキサン−1−カルボキシレート(SMCC)、イミノチオラン(IT)、イミドエステルの二官能性誘導体(例えば、アジプイミド酸ジメチルHCl)、活性エステル(例えば、スベリン酸ジスクシンイミジル)、アルデヒド(例えば、グルタルアルデヒド)、ビス−アジド化合物(例えば、ビス(p−アジドベンゾイル)ヘキサンジアミン)、ビス−ジアゾニウム誘導体(例えば、ビス−(p−ジアゾニウムベンゾイル)−エチレンジアミン)、ジイソシアネート(例えば、トルエン2,6−ジイソシアネート)、及びビス−活性フッ素化合物(例えば、1,5−ジフルオロ−2,4−ジニトロベンゼン)等の様々な二官能性タンパク質結合剤を使用して作製され得る。例えば、リシン免疫毒素を、Vitetta et al.,Science 238:1098(1987)に記載されるように調製することができる。炭素−14で標識された1−イソチオシアナトベンジル−3−メチルジエチレントリアミンペンタ酢酸(MX−DTPA)は、放射性ヌクレオチドの抗体へのコンジュゲーションのための例示的なキレート剤である。WO94/11026を参照されたい。リンカーは、細胞内において細胞毒性薬物の放出を容易にする「切断可能リンカー」であってもよい。例えば、酸不安定性リンカー、ペプチダーゼ感受性リンカー、感光性リンカー、ジメチルリンカー、またはジスルフィド含有リンカー(Chari et al.,Cancer Res.52:127−131(1992)、米国特許第5,208,020号)を使用してもよい。
本明細書のイムヌオコンジュゲート(immunuoconjugate)またはADCは、BMPS、EMCS、GMBS、HBVS、LC−SMCC、MBS、MPBH、SBAP、SIA、SIAB、SMCC、SMPB、SMPH、スルホ−EMCS、スルホ−GMBS、スルホ−KMUS、スルホ−MBS、スルホ−SIAB、スルホ−SMCC、及びスルホ−SMPB、ならびに市販される(例えば、Pierce Biotechnology,Inc.,Rockford,IL.,U.S.Aから)SVSB(スクシンイミジル−(4−ビニルスルホン)ベンゾエート)を含むが、これらに限定されない、架橋剤試薬で調製されたかかるコンジュゲートを明白に企図するが、これらに限定されない。
診断及び検出のための方法及び組成物
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される抗体(sdAb等)のうちのいずれも、生体試料中のBCMAの存在の検出に有用である。「検出すること」という用語は、本明細書で使用されるとき、定量または定性検出を包含する。ある特定の実施形態では、生体試料は、血液、血清、または生体起源の他の液体試料である。いくつかの実施形態では、生体試料は、細胞または組織を含む。
いくつかの実施形態では、診断または検出方法に使用するための抗BCMA抗体(本明細書に記載の抗BCMA sdAbのうちのいずれか1つ等)が提供される。さらなる態様では、生体試料中のBCMAの存在を検出する方法が提供される。ある特定の実施形態では、本方法は、生体試料中のBCMAタンパク質の存在を検出することを含む。ある特定の実施形態では、BCMAは、ヒトBCMAである。ある特定の実施形態では、本方法は、抗BCMA抗体のBCMAへの結合を許容する条件下で生体試料を本明細書に記載の抗BCMA抗体と接触させることと、複合体が抗BCMA抗体とBCMAとの間に形成さ
れたかを検出することと、を含む。かかる方法は、インビトロ方法またはインビボ方法であり得る。いくつかの実施形態では、抗BCMA抗体は、抗BCMA抗体での治療に適格な対象を選択するために使用され、例えば、BCMAは、患者の選択のためのバイオマーカーである。
ある特定の実施形態では、標識された抗BCMA sdAbが提供される。標識としては、直接検出される標識または部分(蛍光標識、発色団標識、電子密度の高い標識、化学発光標識、及び放射性標識等)、ならびに間接的に、例えば、酵素反応または分子相互作用により検出される酵素またはリガンド等の部分が挙げられるが、これらに限定されない。例示的な標識としては、放射性同位体32P、14C、125I、H、及び131I、フルオロフォア、例えば、希土類キレートまたはフルオレセイン及びその誘導体、ローダミン及びその誘導体、ダンシル、ウンベリフェロン、ルセリフェラーゼ(luceriferase)、例えば、蛍ルシフェラーゼ及び細菌ルシフェラーゼ(米国特許第4,737,456号)、ルシフェリン、2,3−ジヒドロフタラジンジオン、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)、アルカリ性ホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼ、グルコアミラーゼ、リゾチーム、サッカリドオキシダーゼ、例えば、グルコースオキシダーゼ、ガラクトースオキシダーゼ、及びグルコース−6−リン酸デヒドロゲナーゼ、過酸化水素を用いて色素前駆体を酸化する酵素(HRP、ラクトペルオキシダーゼ、またはミクロペルオキシダーゼ等)とカップリングした複素環オキシダーゼ、例えば、ウリカーゼ及びキサンチンオキシダーゼ、ビオチン/アビジン、スピン標識、バクテリオファージ標識、安定フリーラジカル等が挙げられるが、これらに限定されない。
III.キメラ抗原受容体
本出願の一態様は、1つ以上の単一ドメイン抗体(VH等)を含む細胞外抗原結合ドメインを含むキメラ抗原受容体(CAR)を提供する。第II節に記載の抗BCMA sdAbのうちのいずれか1つが、本明細書に記載のCARで使用され得る。CARの例示的な構造を、図15A〜15Dに示す。
いくつかの実施形態では、(a)抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含むBCMAを標的とするCAR(本明細書で「BCMA CAR」と称される)が提供される。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ラクダ科、キメラ、ヒト、またはヒト化である。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫エフェクター細胞(T細胞等)の一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζに由来する。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、CD137、OX40、CD30、CD40、CD3、LFA−1、ICOS、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、CD83のリガンド、及びこれらの組み合わせから成る群から選択される共刺激分子に由来する。いくつかの実施形態では、BCMA CARは、細胞外抗原結合ドメインのC末端と膜貫通ドメインのN末端との間に位置するヒンジドメイン(CD8αヒンジドメイン等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、BCMA CARは、ポリペプチドのN末端に位置するシグナルペプチド(CD8αシグナルペプチド等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、N末端からC末端まで、CD8αシグナルペプチド、細胞外抗原結合ドメイン、CD8αヒンジドメイン、CD28膜貫通ドメイン、CD28に由来する第1の共刺激シグナル伝達ドメイン、CD137に由来する第2の共刺激シグナル伝達ドメイン、及びCD3ζに由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、N末端からC末端まで、CD8αシグナルペプチド、細胞外抗原結合ドメイン、CD8αヒンジドメイン、CD8α膜貫通ドメイン、CD137に由来する共刺激シグナル伝達ドメイン、
及びCD3ζに由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、BCMA CARは、単一特異性である。いくつかの実施形態では、BCMA CARは、一価である。
いくつかの実施形態では、(a)抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含むBCMA CARが提供され、抗BCMA sdAbは、以下:(1)配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列を含むCDR3、(2)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号78のアミノ酸配列を含むCDR3、(3)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号79のアミノ酸配列を含むCDR3、(4)配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号80のアミノ酸配列を含むCDR3、(5)配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3、(6)配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3、(7)配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3、(8)配列番号8のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3、(9)配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3、(10)配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3、(11)配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3、(12)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3、(13)配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3、(14)配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3、(15)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3、(16)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3、(17)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3、(18)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3、(19)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3、(20)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3、(21)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号97のアミノ酸配列を含むCDR3、(22)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号98のアミノ酸配列を含むCDR3、(23)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号99のアミノ酸配列を含むCDR3、(24)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号100のアミノ酸配列を含むCDR3、(25)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号101のアミノ酸配列を含むCDR3、(26)配列番号26のアミノ酸配列を
含むCDR1、配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号102のアミノ酸配列を含むCDR3、(27)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号103のアミノ酸配列を含むCDR3、(28)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号104のアミノ酸配列を含むCDR3、(29)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号105のアミノ酸配列を含むCDR3、(30)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号106のアミノ酸配列を含むCDR3、(31)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号107のアミノ酸配列を含むCDR3、(32)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号108のアミノ酸配列を含むCDR3、(33)配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR3、(34)配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR3、(35)配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号73のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR3、(36)配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号74のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR3、(37)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号75のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR3、または(38)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号76のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR3、のうちの任意の1つを含む。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ラクダ科、キメラ、ヒト、またはヒト化である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、配列番号115〜152から成る群から選択されるアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫エフェクター細胞(T細胞等)の一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζに由来する。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、CD137、OX40、CD30、CD40、CD3、LFA−1、ICOS、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、CD83のリガンド、及びこれらの組み合わせから成る群から選択される共刺激分子に由来する。いくつかの実施形態では、BCMA CARは、細胞外抗原結合ドメインのC末端と膜貫通ドメインのN末端との間に位置するヒンジドメイン(CD8αヒンジドメイン等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、BCMA CARは、ポリペプチドのN末端に位置するシグナルペプチド(CD8αシグナルペプチド等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、N末端からC末端まで、CD8αシグナルペプチド、細胞外抗原結合ドメイン、CD8αヒンジドメイン、CD28膜貫通ドメイン、CD28に由来する第1の共刺激シグナル伝達ドメイン、CD137に由来する第2の共刺激シグナル伝達ドメイン、及びCD3ζに由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、N末端からC末端まで、CD8αシグナルペプチド、細胞外抗原結合ドメイン、CD8αヒンジドメイン、CD8α膜貫通ドメイン、CD137に由来する共刺激シグナル伝達ドメイン、及びCD3ζに由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、BCMA CARは、単一特異性である。いくつかの実施形態では、BCMA CARは、一価である。
いくつかの実施形態では、配列番号216〜256及び298〜335から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、また
は100%のうちのいずれか1つの配列同一性を有するポリペプチドを含むBCMA CARが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号216〜256及び298〜335から成る群から選択されるアミノ酸配列を含むBCMA CARが提供される。配列番号216〜256及び298〜335から成る群から選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドも提供される。
いくつかの実施形態では、本明細書に提供されるBCMA CARのうちのいずれかをコードする単離された核酸が提供される。いくつかの実施形態では、配列番号257〜297及び336〜373から成る群から選択される核酸配列と少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%のうちのいずれか1つの配列同一性を有する単離された核酸が提供される。いくつかの実施形態では、配列番号257〜297及び336〜373から成る群から選択される核酸配列を含む単離された核酸が提供される。いくつかの実施形態では、単離された核酸は、DNAである。いくつかの実施形態では、単離された核酸は、RNAである。いくつかの実施形態では、上に記載されるBCMA CARをコードする核酸のうちのいずれか1つを含むベクターが提供される。いくつかの実施形態では、ベクターは、発現ベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターは、レンチウイルスベクター等のウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターは、非ウイルスベクターである。例示的な一価BCMA CARを、以下の表4に示す。
Figure 2021087455

Figure 2021087455
Figure 2021087455
多価キメラ抗原受容体
本出願は、BCMA等の抗原に特異的に結合する、2つ以上(約2、3、4、5、6、またはそれ以上のうちのいずれか1つ等)の結合部分を有する多価CARも提供する。いくつかの実施形態では、結合部分のうちの1つ以上は、抗原結合フラグメントである。いくつかの実施形態では、結合部分のうちの1つ以上は、単一ドメイン抗体を含む。いくつかの実施形態では、結合部分のうちの1つ以上は、ラクダ科抗体に由来する。いくつかの実施形態では、結合部分のうちの1つ以上は、4鎖抗体に由来する。いくつかの実施形態では、結合部分のうちの1つ以上は、scFvである。いくつかの実施形態では、結合部分のうちの1つ以上は、ヒト抗体に由来する。いくつかの実施形態では、結合部分のうちの1つ以上は、ポリペプチドリガンド、または抗原に特異的に結合する他の非抗体ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、多価CARは、単一特異性であり、多価CARは、単一の抗原を標的とし、単一の抗原に対する2つ以上の結合部位を含む。いくつかの実施形態では、多価CARは、多重特異性であり、すなわち、多価CARは、2つ以上の抗原を標的とし、多価CARは、少なくとも1つの抗原に対する2つを超える結合部位を含む。同じ抗原に特異的な結合部分は、抗原の同じエピトープ(すなわち、「1つのエピトープCAR」)に結合し得るか、または抗原の異なるエピトープ(すなわち、2つのエ
ピトープCARまたは3つのエピトープCAR等の「マルチエピトープCAR」)に結合し得る。同じ抗原に特異的な結合部位は、同じまたは異なるsdAbを含み得る。
いくつかの実施形態では、本出願は、(a)抗原(腫瘍抗原等)に特異的に結合する複数(少なくとも約2、3、4、5、6つまたはそれ以上のうちの1つ)の結合部分を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価(二価、三価、またはより高い数の価数)のキメラ抗原受容体を提供する。いくつかの実施形態では、抗原は、CD19、CD20、CD22、CD33、CD38、BCMA、CS1、ROR1、GPC3、CD123、IL−13R、CD138、c−Met、EGFRvIII、GD−2、NY−ESO−1、MAGE A3、及び糖脂質F77から成る群から選択される。
いくつかの実施形態では、本出願は、(a)抗原(腫瘍抗原等)に特異的に結合する複数(少なくとも約2、3、4、5、6つまたはそれ以上のうちの1つ)の単一ドメイン抗体(sdAb)を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価(二価、三価、またはより高い数の価数)のキメラ抗原受容体を提供する。いくつかの実施形態では、抗原は、CD19、CD20、CD22、CD33、CD38、BCMA、CS1、ROR1、GPC3、CD123、IL−13R、CD138、c−Met、EGFRvIII、GD−2、NY−ESO−1、MAGE A3、及び糖脂質F77から成る群から選択される。
いくつかの実施形態では、本出願は、(a)抗原(腫瘍抗原等)の第1のエピトープに特異的に結合する第1の結合部分と、抗原の第2のエピトープに特異的に結合する第2の結合部分とを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価(二価、三価、またはより高い数の価数)のキメラ抗原受容体を提供し、第1のエピトープ及び第2のエピトープは異なる。いくつかの実施形態では、抗原は、CD19、CD20、CD22、CD33、CD38、BCMA、CS1、ROR1、GPC3、CD123、IL−13R、CD138、c−Met、EGFRvIII、GD−2、NY−ESO−1、MAGE A3、及び糖脂質F77から成る群から選択される。いくつかの実施形態では、第1の結合部分は、sdAbであり、第2の結合部分は、ヒト抗体(例えば、scFv)に由来する。いくつかの実施形態では、第1の結合部分は、sdAbであり、第2の結合部分は、ポリペプチドリガンドである。いくつかの実施形態では、第1のエピトープは、第2のエピトープと同じである。いくつかの実施形態では、第1のエピトープは、第2のエピトープとは異なる。いくつかの実施形態では、多価CARは、抗原上の2つの異なるエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、多価CARは、抗原上の3つ以上の異なるエピトープに特異的に結合する。
いくつかの実施形態では、本出願は、(a)抗原(腫瘍抗原等)の第1のエピトープに特異的に結合する第1のsdAbと、抗原の第2のエピトープに特異的に結合する第2のsdAbとを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価(二価、三価、またはより高い数の価数)のキメラ抗原受容体を提供し、第1のエピトープ及び第2のエピトープは異なる。いくつかの実施形態では、抗原は、CD19、CD20、CD22、CD33、CD38、BCMA、CS1、ROR1、GPC3、CD123、IL−13R、CD138、c−Met、EGFRvIII、GD−2、NY−ESO−1、MAGE A3、及び糖脂質F77から成る群から選択される。
いくつかの実施形態では、sdAb(複数のsdAb、または第1のsdAb及び/または第2のsdAbを含む)等の結合部分は、ラクダ科、キメラ、ヒト、またはヒト化で
ある。いくつかの実施形態では、結合部分またはsdAbは、ペプチド結合またはペプチドリンカーを介して互いに融合される。いくつかの実施形態では、各ペプチドリンカーは、約50以下(約35、25、20、15、10、または5以下のうちのいずれか1つ等)のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8α、CD4、CD28、CD137、CD80、CD86、CD152、及びPD1から成る群から選択される。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫エフェクター細胞(T細胞等)の一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζに由来する。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、CD137、OX40、CD30、CD40、CD3、LFA−1、ICOS、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、CD83のリガンド、及びこれらの組み合わせから成る群から選択される共刺激分子に由来する。いくつかの実施形態では、多価CARは、細胞外抗原結合ドメインのC末端と膜貫通ドメインのN末端との間に位置するヒンジドメイン(CD8αヒンジドメイン等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、多価CARは、ポリペプチドのN末端に位置するシグナルペプチド(CD8αシグナルペプチド等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、N末端からC末端まで、CD8αシグナルペプチド、細胞外抗原結合ドメイン、CD8αヒンジドメイン、CD8α膜貫通ドメイン、CD137に由来する共刺激シグナル伝達ドメイン、及びCD3ζに由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、多価CARは、単一特異性である。いくつかの実施形態では、多価CARは、二重特異性等の多重特異性である。
本明細書に記載の多価CARは、異なる抗原結合部位による相乗的結合を介する多量体抗原の標的に、または抗原に対する結合親和性または結合力の増強に特に好適であり得る。本明細書に記載の抗BCMA sdAbのうちのいずれも、本明細書に記載の多価CARの細胞外抗原結合ドメインで使用され得る。例示的な多価BCMA CAR、例示的な配列、構築、及びそれらのベクターのリストを表5に示す。
いくつかの実施形態では、(a)複数(少なくとも約2、3、4、またはそれ以上のうちの1つ)のBCMA結合部分(例えば、抗BCMA sdAb)を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むBCMAを標的とする多価CARが提供される。抗BCMA sdAbのうちのいずれかを使用して、多価BCMA CARを構築することができる。いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、BCMAの単一のエピトープに特異的に結合し、これらのCARは、本明細書で1つのエピトープの多価BCMA CARと称される。
いくつかの実施形態では、(a)複数(少なくとも約2、3、4、またはそれ以上のうちの1つ)の抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む多価BCMA CARが提供され、抗BCMA sdAbは、配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列を含むCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、(a)少なくとも2つ(2、3、4つ、またはそれ以上のうちの任意の1つ等)のBCMA結合部分を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む多価BCMA CAR(本明細書で「マルチエピトープの多価CAR」とも称される)が提供され、少なくとも2つのBCMA結合部分は、BCMA上の少なくとも2つの異なるエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、第1のBCMA結合部分及び第2のBCMA結合部分を含む。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分は、抗BCMA sdAbであり、第2のBCMA結合部分は、ヒト抗体(例えば、scFv
)に由来する。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分は、sdAbであり、第2のBCMA結合部分は、BCMAポリペプチドリガンドである。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA結合部分及び/または第2のBCMA結合部分は、配列番号388〜394から選択されるアミノ酸配列に由来するBCMA上のエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分は、配列番号389及び/または390に由来するエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、第2のBCMA結合部分は、配列番号391及び/または392に由来するエピトープに特異的に結合する。
いくつかの実施形態では、(a)第1の抗BCMA sdAb及び第2の抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む多価BCMA CARが提供され、第1の抗BCMA sdAb及び第2の抗BCMA sdAbは、BCMA上の異なるエピトープに特異的に結合する。抗BCMA sdAbのうちのいずれかを使用して、多価BCMA CARを構築することができる。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA sdAb及び/または第2の抗BCMA sdAbは、配列番号388〜394から選択されるアミノ酸配列に由来するBCMA上のエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号389及び/または390に由来するエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、第2の抗BCMA sdAbは、配列番号391及び/または392に由来するエピトープに特異的に結合する。
いくつかの実施形態では、(a)第1の抗BCMA sdAb及び第2の抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む多価BCMA CARが提供され、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号79のアミノ酸配列を含むCDR3を含み、第2の抗BCMA sdAbは、配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3を含む。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号117のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。いくつかの実施形態では、第2の抗BCMA sdAbは、配列番号124のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号124のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。いくつかの実施形態では、第2の抗BCMA sdAbは、配列番号117のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。
いくつかの実施形態では、(a)第1の抗BCMA sdAb及び第2の抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む多価BCMA CARが提供され、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3を含み、抗BCMA sdAbは、配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3を含む。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号124のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。いくつかの実施形態では、第2の抗BCMA sdAbは、配列番号125のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。
いくつかの実施形態では、(a)第1の抗BCMA sdAb及び第2の抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む多価BCMA CARが提供され、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号45のアミノ酸配列を含む
CDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3を含み、抗BCMA sdAbは、配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3を含む。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号121のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。いくつかの実施形態では、第2の抗BCMA sdAbは、配列番号125のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。
いくつかの実施形態では、(a)第1の抗BCMA sdAb及び第2の抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む多価BCMA CARが提供され、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3を含み、抗BCMA sdAbは、配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3を含む。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号129のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。いくつかの実施形態では、第2の抗BCMA sdAbは、配列番号132のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。
いくつかの実施形態では、(a)第1の抗BCMA sdAb及び第2の抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む多価BCMA CARが提供され、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3を含み、抗BCMA sdAbは、配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3を含む。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号132のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。いくつかの実施形態では、第2の抗BCMA sdAbは、配列番号134のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。
いくつかの実施形態では、(a)第1の抗BCMA sdAb及び第2の抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含む多価BCMA CARが提供され、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3を含み、抗BCMA sdAbは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号104のアミノ酸配列を含むCDR3を含む。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA sdAbは、配列番号134のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。いくつかの実施形態では、第2の抗BCMA sdAbは、配列番号142のアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。
いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分(例えば、第1の抗BCMA sdAb)は、第2のBCMA結合部分(例えば、第2の抗BCMA sdAb)のN末端に位置している。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分(例えば、第1の抗BCMA sdAb)は、第2のBCMA結合部分(例えば、第2の抗BCMA sdAb)のC末端に位置している。いくつかの実施形態では、第1のBCMA結合部分(例えば、第1の抗BCMA sdAb)及び第2のBCMA結合部分(例えば、第2の抗BCMA sdAb)は、ペプチド結合またはペプチドリンカーを介して互いに融合される。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、約50以下(約35、25、20、15、10、または5以下のうちのいずれか1つ等)のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫エフェクター細胞(T細胞等)の一次細胞内
シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζに由来する。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、CD137、OX40、CD30、CD40、CD3、LFA−1、ICOS、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、CD83のリガンド、及びこれらの組み合わせから成る群から選択される共刺激分子に由来する。いくつかの実施形態では、多価BCMA CARは、細胞外抗原結合ドメインのC末端と膜貫通ドメインのN末端との間に位置するヒンジドメイン(CD8αヒンジドメイン等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、多価BCMA CARは、ポリペプチドのN末端に位置するシグナルペプチド(CD8αシグナルペプチド等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、N末端からC末端まで、CD8αシグナルペプチド、細胞外抗原結合ドメイン、CD8αヒンジドメイン、CD8α膜貫通ドメイン、CD137に由来する共刺激シグナル伝達ドメイン、及びCD3ζに由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、多価BCMA CARは、二価である。いくつかの実施形態では、多価BCMA CARは、三価である。いくつかの実施形態では、多価BCMA CARは、BCMA上の2つの異なるエピトープに特異的に結合する。いくつかの実施形態では、多価BCMA CARは、BCMA上の3つ以上の異なるエピトープに特異的に結合する。
いくつかの実施形態では、配列番号298〜335から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%のうちのいずれか1つの配列同一性を有するポリペプチドを含む多価BCMA CARが提供される。いくつかの実施形態では、配列番号298〜335から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む多価BCMA CARが提供される。配列番号298〜335から成る群から選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドも提供される。
いくつかの実施形態では、本明細書に提供される多価BCMA CARのうちのいずれかをコードする単離された核酸が提供される。いくつかの実施形態では、配列番号336〜373から成る群から選択される核酸配列と少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%のうちのいずれか1つの配列同一性を有する単離された核酸が提供される。いくつかの実施形態では、配列番号336〜373から成る群から選択される核酸配列を含む単離された核酸が提供される。いくつかの実施形態では、単離された核酸は、DNAである。いくつかの実施形態では、単離された核酸は、RNAである。いくつかの実施形態では、上に記載される多価BCMA CARをコードする核酸のうちのいずれか1つを含むベクターが提供される。いくつかの実施形態では、ベクターは、発現ベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターは、レンチウイルスベクター等のウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターは、非ウイルスベクターである。例示的な多価BCMA CARを、以下の表5に示す。
Figure 2021087455
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多重特異性キメラ抗原受容体
本出願は、2つ以上(約2、3、4、5、6、またはそれ以上のうちのいずれか1つ等)の異なる抗原を標的とする多重特異性キメラ抗原受容体をさらに提供する。いくつかの実施形態では、多重特異性CARは、各抗原に対する1つの抗原結合部位を有する。いくつかの実施形態では、多重特異性CARは、少なくとも1つの抗原に対する2つを超える結合部位を有する。各抗原結合部位は、sdAbを含み得る。例えば、いくつかの実施形態では、多重特異性CARは、抗原に各々特異的に結合する2つの異なるsdAbを含む細胞外抗原結合ドメインを含む二重特異性CARである。いくつかの実施形態では、多重特異性CARは、抗原に各々特異的に結合する3つの異なるsdAbを含む細胞外抗原結
合ドメインを含む三重特異性CARである。
いくつかの実施形態では、(a)BCMAに特異的に結合する第1の単一ドメイン抗体(sdAb)及び第2の抗原(腫瘍抗原等)に特異的に結合する第2の単一ドメイン抗体(sdAb)を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多重特異性(二重特異性)キメラ抗原受容体(CAR)が提供され、第1の抗原は、第2の抗原とは異なる。いくつかの実施形態では、第2の抗原は、CD19、CD20、CD22、CD33、CD38、CS1、ROR1、GPC3、CD123、IL−13R、CD138、c−Met、EGFRvIII、GD−2、NY−ESO−1、MAGE A3、及び糖脂質F77から成る群から選択される。いくつかの実施形態では、第1のsdAb及び/または第2のsdAbは、ラクダ科、キメラ、ヒト、またはヒト化である。いくつかの実施形態では、第1のsdAb及び第2のsdAbは、ペプチド結合またはペプチドリンカーを介して互いに融合される。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、約50以下(約35、25、20、15、10、または5以下のうちのいずれか1つ等)のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8α、CD4、CD28、CD137、CD80、CD86、CD152、及びPD1から成る群から選択される。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫エフェクター細胞(T細胞等)の一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζに由来する。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、CD137、OX40、CD30、CD40、CD3、LFA−1、ICOS、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、CD83のリガンド、及びこれらの組み合わせから成る群から選択される共刺激分子に由来する。いくつかの実施形態では、多重特異性CARは、細胞外抗原結合ドメインのC末端と膜貫通ドメインのN末端との間に位置するヒンジドメイン(CD8αヒンジドメイン等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、多重特異性CARは、ポリペプチドのN末端に位置するシグナルペプチド(CD8αシグナルペプチド等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、N末端からC末端まで、CD8αシグナルペプチド、細胞外抗原結合ドメイン、CD8αヒンジドメイン、CD8α膜貫通ドメイン、CD137に由来する共刺激シグナル伝達ドメイン、及びCD3ζに由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、N末端からC末端まで、CD8αシグナルペプチド、細胞外抗原結合ドメイン、CD8αヒンジドメイン、CD28膜貫通ドメイン、CD28に由来する共刺激シグナル伝達ドメイン、及びCD3ζに由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。
細胞外抗原結合ドメイン
本明細書に記載のCARの細胞外抗原結合ドメインは、sdAb等の1つ以上(1、2、3、4、5、6つ、またはそれ以上のうちのいずれか1つ等)の結合部分を含む。いくつかの実施形態では、1つ以上の結合部分は、抗体またはその抗原結合フラグメントである。いくつかの実施形態では、1つ以上の結合部分は、4鎖抗体に由来する。いくつかの実施形態では、1つ以上の結合部分は、ラクダ科抗体に由来する。いくつかの実施形態では、1つ以上の結合部分は、ヒト抗体に由来する。いくつかの実施形態では、1つ以上の結合部分は、非抗体結合タンパク質、例えば、ポリペプチドリガンド、または抗原に結合する操作されたタンパク質である。結合部分は、ペプチド結合またはペプチドリンカーを介して互いに直接融合され得る。
1.単一ドメイン抗体
いくつかの実施形態では、CARは、1つ以上のsdAbを含む細胞外抗原結合ドメインを含む。sdAbは、同じまたは異なる起源のものであり得、同じまたは異なるサイズ
のものであり得る。例示的なsdAbとしては、重鎖のみ抗体(例えば、VHまたはVNAR)からの重鎖可変ドメイン、軽鎖を天然に欠いている結合分子、従来の4鎖抗体に由来する単一ドメイン(VまたはV等)、ヒト化重鎖のみ抗体、ヒト重鎖セグメントを発現させるトランスジェニックマウスまたはラットによって産生されるヒトsdAb、及び抗体に由来するもの以外の操作されたドメイン及び単一ドメインスキャフォールドが挙げられるが、これらに限定されない。本出願の第II節に記載のsdAbを含む、当該技術分野で既知のまたは発明人によって開発された任意のsdAbを使用して、本明細書に記載のCARを構築することができる。sdAbは、マウス、ラット、ヒト、ラクダ、ラマ、ヤツメウナギ、魚、サメ、ヤギ、ウサギ、及びウシを含むが、これらに限定されない任意の種に由来し得る。本明細書で企図される単一ドメイン抗体は、ラクダ科及びサメ以外の種からの天然に存在するsdAbも含む。
いくつかの実施形態では、軽鎖を欠いている重鎖抗体(本明細書で「重鎖のみ抗体」とも称される)として既知の天然に存在する単一ドメイン抗原結合分子に由来する。かかる単一ドメイン分子は、例えば、WO94/04678及びHamers−Casterman,C.et al.(1993) Nature 363:446−448に開示されている。明確化のために、軽鎖を天然に欠いている重鎖分子に由来する可変ドメインは、それを4鎖免疫グロブリンの従来のVと区別するためにVHとして本明細書で既知である。かかるVH分子は、ラクダ科種、例えば、ラクダ、ラマ、ビクーナ、ヒトコブラクダ、アルパカ、及びグアナコで産生される抗体に由来し得る。ラクダ科以外の他の種が、軽鎖を天然に欠いている重鎖分子を産生することができ、かかるVHは、本出願の範囲内である。
ラクダ科からのVH分子は、IgG分子よりも約10倍小さい。それらは、単一ポリペプチドであり、非常に安定しており、極度のpH及び温度条件に耐性を示すことができる。さらに、それらは、プロテアーゼ作用に耐性を示すことができ、従来の4鎖抗体には当てはまらない。さらに、VHのインビトロ発現は、高収率の適切に折り畳まれた機能的VHをもたらす。加えて、ラクダ科で生成された抗体は、抗体ライブラリの使用により、またはラクダ科以外の哺乳動物の免疫化により、インビトロで生成された抗体によって認識されるエピトープ以外のエピトープを認識することができる(例えば、WO9749805を参照されたい)。したがって、1つ以上のVHドメインを含む多重特異性または多価CARは、従来の4鎖抗体に由来する抗原結合フラグメントを含む多重特異性または多価CARよりも効率的に標的と相互作用することができる。VHが空洞または溝等の「異常な」エピトープに結合することで知られているため、かかるVHを含むCARの親和性は、従来の多重特異性ポリペプチドよりも治療的治療に好適であり得る。
いくつかの実施形態では、sdAbは、軟骨魚に見られる免疫グロブリンの可変領域に由来する。例えば、sdAbは、サメ血清に見られる新規抗原受容体(NAR)として既知の免疫グロブリンアイソタイプに由来し得る。NARの可変領域(「IgNAR」)に由来する単一ドメイン分子を産生する方法は、WO03/014161及びStreltsov(2005)Protein Sci.14:2901−2909に記載されている。
いくつかの実施形態では、sdAbは、組換え、CDRグラフト、ヒト化、ラクダ化、脱免疫化、及び/またはインビトロ生成された(例えば、ファージディスプレイによって選択された)ものである。いくつかの実施形態では、フレームワーク領域のアミノ酸配列は、フレームワーク領域内の特定のアミノ酸残基の「ラクダ化」によって改変され得る。ラクダ化は、従来の4鎖抗体由来の(天然に存在する)Vドメインのアミノ酸配列内の1つ以上のアミノ酸残基の、重鎖抗体のVHドメイン内の対応する位置(複数可)で生じるアミノ酸残基のうちの1つ以上による置き換えまたは置換を指す。これは、例えば、
本明細書におけるさらなる記述に基づいて当業者に明らかになる本来既知の様態において行われ得る。かかる「ラクダ化」置換は、好ましくは、V−V界面を形成し、及び/またはその界面に存在するアミノ酸位置に、及び/または本明細書に定義されるいわゆるラクダ科特徴残基に挿入される(例えば、WO94/04678、Davies and
Riechmann FEBS Letters 339:285−290,1994、Davies and Riechmann Protein Engineering 9(6):531−537,1996、Riechmann J.Mol.Biol.259:957−969,1996、及びRiechmann and Muyldermans J.Immunol.Meth.231:25−38,1999を参照されたい)。
いくつかの実施形態では、sdAbは、ヒト重鎖セグメントを発現させるトランスジェニックマウスまたはラットによって産生されるヒトsdAbである。例えば、US20090307787A1、米国特許第8,754,287号、US20150289489A1、US20100122358A1、及びWO2004049794を参照されたい。いくつかの実施形態では、sdAbは、親和性成熟である。
いくつかの実施形態では、特定の抗原または標的に対する天然に存在するVHドメインは、ラクダ科VH配列の(天然または免疫)ライブラリから得られ得る。かかる方法は、本来既知の1つ以上のスクリーニング技術を使用した、前記抗原または標的、または少なくとも1つの部分、フラグメント、抗原決定基、またはそのエピトープを使用するかかるライブラリのスクリーニングを伴っても伴わなくてもよい。かかるライブラリ及び技術は、例えば、WO99/37681、WO01/90190、WO03/025020、及びWO03/035694に記載されている。あるいは、例えば、WO00/43507に記載のランダム変異誘発及び/またはCDRシャッフリング等の技術により(天然または免疫)VHライブラリから得られるVHライブラリ等の(天然または免疫)VHライブラリに由来する改善された合成または半合成ライブラリが使用され得る。
いくつかの実施形態では、sdAbは、従来の4鎖抗体から生成される。例えば、EP
0 368 684、Ward et al.(Nature 1989 Oct.12;341(6242):544−6)、Holt et al.,Trends Biotechnol.,2003,21(11):484−490、WO06/030220、及びWO06/003388を参照されたい。
2.抗原
本出願のCARによって標的とされる抗原(複数可)は、細胞表面分子である。結合部分(sdAb等)は、特殊な病状に関連する標的細胞上の細胞表面マーカーとしての役割を果たす抗原を認識するように選択され得る。いくつかの実施形態では、抗原(第1の抗原及び/または第2の抗原等)は、腫瘍抗原である。いくつかの実施形態では、多重特異性CARは、2つ以上の腫瘍抗原を標的とする。いくつかの実施形態では、腫瘍抗原は、B細胞悪性腫瘍に関連する。腫瘍は、免疫応答、具体的には、T細胞媒介免疫応答に対する標的抗原としての機能を果たすことができるいくつかのタンパク質を発現する。CARによって標的とされる抗原は、単一の疾患細胞上の抗原または各々が疾患に寄与する異なる細胞上で発現する抗原であり得る。CARによって標的とされる抗原は、疾患に直接または間接的に関与し得る。
腫瘍抗原は、免疫応答、具体的には、T細胞媒介免疫応答を誘発することができる腫瘍細胞によって産生されるタンパク質である。本発明の標的とされた抗原の選択は、治療される特定の種類のがんに依存するであろう。例示的な腫瘍抗原としては、例えば、神経膠腫関連抗原、がん胎児性抗原(CEA)、β−ヒト絨毛性ゴナドトロピン、アルファフェ
トプロテイン(AFP)、レクチン反応性AFP、サイログロブリン、RAGE−1、MN−CAIX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、RU1、RU2(AS)、腸カルボキシルエステラーゼ、mut hsp70−2、M−CSF、プロスターゼ、前立腺特異的抗原(PSA)、PAP、NY−ESO−1、LAGE−la、p53、プロステイン、PSMA、HER2/neu、スルビビン及びテロメラーゼ、前立腺癌腫瘍抗原−1(PCTA−1)、MAGE、ELF2M、好中球エラスターゼ、エフリンB2、CD22、インスリン成長因子(IGF)−I、IGF−II、IGF−I受容体、ならびにメソテリンが挙げられる。
いくつかの実施形態では、腫瘍抗原は、悪性腫瘍に関連する1つ以上の抗原癌エピトープを含む。悪性腫瘍は、免疫攻撃に対する標的抗原としての機能を果たすことができるいくつかのタンパク質を発現する。これらの分子としては、組織特異的抗原、例えば、黒色腫におけるMART−1、チロシナーゼ、及びgp100、ならびに前立腺癌における前立腺酸性ホスファターゼ(PAP)及び前立腺特異的抗原(PSA)が挙げられるが、これらに限定されない。他の標的分子は、がん遺伝子HER2/Neu/ErbB−2等の形質転換関連分子の群に属する。標的抗原のさらに別の群は、がん胎児性抗原(CEA)等のがん胎児抗原である。B細胞リンパ腫において、腫瘍特異的イディオタイプ免疫グロブリンは、個々の腫瘍に特有の真に腫瘍特異的な免疫グロブリン抗原を構成する。CD19、CD20、及びCD37等のB細胞分化抗原は、B細胞リンパ腫における標的抗原の他の候補である。
いくつかの実施形態では、腫瘍抗原は、腫瘍特異的抗原(TSA)または腫瘍関連抗原(TAA)である。TSAは、腫瘍細胞に特有であり、体内の他の細胞に生じない。TAA関連抗原は、腫瘍細胞に特有ではなく、代わりに、抗原に対する免疫学的寛容の状態を誘導することができない条件下で正常細胞でも発現する。腫瘍上での抗原の発現は、免疫系が抗原に応答することを可能にする条件下で生じ得る。TAAは、免疫系が未熟であり、応答することができない場合に胎児発育中に正常細胞で発現する抗原であり得るか、またはそれらは、通常非常に低レベルで正常細胞上に存在するが、はるかにより高いレベルで、腫瘍細胞で発現する抗原であり得る。
TSAまたはTAA抗原の非限定的な例としては、以下:分化抗原、例えば、MART−1/MelanA(MART−I)、gp 100(Pmel 17)、チロシナーゼ、TRP−1、TRP−2、及び腫瘍特異的多系列抗原、例えば、MAGE−1、MAGE−3、BAGE、GAGE−1、GAGE−2、pl5;過剰発現胚抗原、例えば、CEA;過剰発現癌遺伝子及び変異腫瘍サプレッサー遺伝子、例えば、p53、Ras、HER2/neu;染色体転座に起因する特有の腫瘍抗原、例えば、BCR−ABL、E2A−PRL、H4−RET、IGH−IGK、MYL−RAR、ならびにウイルス抗原、例えば、エプスタイン・バーウイルス抗原EBVA及びヒト乳頭腫ウイルス(HPV)抗原E6及びE7が挙げられる。他の大きいタンパク質に基づく抗原としては、TSP−180、MAGE−4、MAGE−5、MAGE−6、RAGE、NY−ESO、pl85erbB2、pl80erbB−3、c−met、nm−23HI、PSA、TAG−72、CA 19−9、CA 72−4、CAM 17.1、NuMa、K−ras、ベータ−カテニン、CDK4、Mum−1、p 15、p 16、43−9F、5T4、791Tgp72、アルファ−フェトプロテイン、ベータ−HCG、BCA225、BTAA、CA 125、CA 15−3\CA 27.29\BCAA、CA 195、CA 242、CA−50、CAM43、CD68\P1、CO−029、FGF−5、G250、Ga733\EpCAM、HTgp−175、M344、MA−50、MG7−Ag、MOV18、NB/70K、NY−CO− 1、RCAS 1、SDCCAG16、TA−90\Mac−2結合タンパク質\サイクロフィリンC関連タンパク質、TAAL6、TAG72、TLP、及びTPSが挙げられる。
いくつかの実施形態では、抗原(第1の抗原及び/または第2の抗原等)は、CD19、CD20、CD22、CD33、CD38、BCMA、CS1、ROR1、GPC3、CD123、IL−13R、CD138、c−Met、EGFRvIII、GD−2、NY−ESO−1、MAGE A3、及び糖脂質F77から成る群から選択される。
3.ペプチドリンカー
本明細書に記載の多重特異性または多価CARにおける種々の結合部分(sdAb等)は、ペプチドリンカーを介して互い融合され得る。いくつかの実施形態では、結合部分(sdAb等)は、いかなるペプチドリンカーもなしで互いに直接融合される。異なる結合部分(sdAb等)を連結するペプチドリンカーは、同じであってもよく、または異なってもよい。CARの異なるドメインも、ペプチドリンカーを介して互いに融合され得る。
CARにおける各ペプチドリンカーは、sdAb及び/または種々のドメインの構造的及び/または機能的特徴に応じて同じまたは異なる長さ及び/または配列を有し得る。各ペプチドリンカーは、独立して選択及び最適化され得る。CARで使用されるペプチドリンカー(複数可)の長さ、可撓度、及び/または他の特性は、1つ以上の特定の抗原またはエピトープに対する親和性、特異性、または結合力を含むが、これらに限定されない、特性に何らかの影響を及ぼし得る。例えば、より長いペプチドリンカーは、2つの隣接するドメインが互いに立体的に妨害しないことを確実にするために選択され得る。例えば、多量体抗原に対して指向されたsdAbを含む本出願の多価または多重特異性CARにおいて、ペプチドリンカーの長さ及び可撓性は、好ましくは、多価CARにおける各sdAbが多量体のサブユニットの各々上の抗原決定基に結合することを可能にするようなものである。いくつかの実施形態では、短いペプチドリンカーは、CARの膜貫通ドメインと細胞内シグナル伝達ドメインとの間に配置され得る。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、隣接するドメインが互いに対して自由に移動することができるように、可撓性残基(グリシン及びセリン等)を含む。例えば、グリシン−セリンダブレットは、好適なペプチドリンカーであり得る。
ペプチドリンカーは、任意の好適な長さのものであり得る。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、少なくとも約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、35、40、50、75、100、またはそれ以上のうちのいずれかのアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、約100、75、50、40、35、30、25、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5以下、またはそれ以下のうちのいずれかのアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーの長さは、約1アミノ酸〜約10アミノ酸、約1アミノ酸〜約20アミノ酸、約1アミノ酸〜約30アミノ酸、約5アミノ酸〜約15アミノ酸、約10アミノ酸〜約25アミノ酸、約5アミノ酸〜約30アミノ酸、約10アミノ酸〜約30アミノ酸長、約30アミノ酸〜約50アミノ酸、約50アミノ酸〜約100アミノ酸、または約1アミノ酸〜約100アミノ酸のうちのいずれかである。
ペプチドリンカーは、天然に存在する配列、または天然に存在しない配列を有し得る。例えば、重鎖のみ抗体のヒンジ領域に由来する配列は、リンカーとして使用され得る。例えば、WO1996/34103を参照されたい。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、可撓性リンカーである。例示的な可撓性リンカーとしては、グリシンポリマー(G)、グリシン−セリンポリマー(例えば、(GS)、(GSGGS)、(GGGS)、及び(GGGGS)を含み、式中、nは、少なくとも1の整数である)、グリシン−アラニンポリマー、アラニン−セリンポリマー、及び当該技術分野で既知の他の可撓性リンカーが挙げられる。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、アミノ酸
配列GGGGS(配列番号208)、(GGGGS)(配列番号209)、(GGGS)(配列番号210)、GGGGSGGGGSGGGGGGSGSGGGGS(配列番号211)、GGGGSGGGGSGGGGGGSGSGGGGSGGGGSGGGGS(配列番号212)、(GGGGS)(配列番号213)、(GGGGS)(配列番号214)、または(GGGGS)(配列番号215)を含む。
膜貫通ドメイン
本出願のCARは、細胞外抗原結合ドメインに直接または間接的に融合され得る膜貫通ドメインを含む。膜貫通ドメインは、天然源または合成源のいずれかに由来し得る。本明細書で使用されるとき、「膜貫通ドメイン」とは、細胞膜、好ましくは、真核生物細胞膜内で熱力学的に安定している任意のタンパク質構造を指す。本明細書に記載のCARでの使用に適合性のある膜貫通ドメインは、天然に存在するタンパク質から得られ得る。あるいは、それは、合成の天然に存在しないタンパク質セグメント、例えば、細胞膜内で熱力学的に安定している疎水性タンパク質セグメントであり得る。
膜貫通ドメインは、膜貫通ドメインの三次元構造に基づいて分類される。例えば、膜貫通ドメインは、アルファヘリックス、2つ以上のアルファヘリックスの複合体、ベータバレル、または細胞のリン脂質二重層にまたがることができる任意の他の安定した構造を形成し得る。さらに、膜貫通ドメインは、加えて、または代替的に、膜貫通ドメインが膜を通過する回数及びタンパク質の配向を含む膜貫通ドメイントポロジーに基づいて分類され得る。例えば、単回通過膜タンパク質は、細胞膜を1回横断し、複数回通過膜タンパク質は、細胞膜を少なくとも2回(例えば、2回、3回、4回、5回、6回、7回、またはそれ以上の回数)横断する。膜タンパク質は、細胞の内外に対するそれらの末端及び膜通過セグメント(複数可)のトポロジーに応じて、I型、II型、またはIII型と定義され得る。I型膜タンパク質は、単一膜にまたがる領域を有し、タンパク質のN末端が細胞の脂質二重層の細胞外側に存在し、タンパク質のC末端が細胞質側に存在するように配向される。II型膜タンパク質も単一膜にまたがる領域を有するが、タンパク質のC末端が細胞の脂質二重層の細胞外側に存在し、タンパク質のN末端が細胞質側に存在するように配向される。III型膜タンパク質は、複数膜にまたがるセグメントを有し、膜貫通セグメントの数ならびにN末端及びC末端の位置に基づいてさらに下位分類され得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のCARの膜貫通ドメインは、I型単回通過膜タンパク質に由来する。いくつかの実施形態では、複数回通過膜タンパク質由来の膜貫通ドメインも、本明細書に記載のCARでの使用に適合性があり得る。複数回通過膜タンパク質は、複合(少なくとも2、3、4、5、6、7、またはそれ以上の)アルファヘリックスまたはベータシート構造を含み得る。好ましくは、複数回通過膜タンパク質のN末端及びC末端は、脂質二重層の反対側に存在し、例えば、タンパク質のN末端は、脂質二重層の細胞質側に存在し、タンパク質のC末端は、細胞外側に存在する。
いくつかの実施形態では、CARの膜貫通ドメインは、T細胞受容体のアルファ鎖、ベータ鎖、またはゼータ鎖の膜貫通ドメイン、CD28、CD3エプシロン、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154、KIRDS2、OX40、CD2、CD27、LFA−1(CDl la、CD18)、ICOS(CD278)、4−1BB(CD137)、GITR、CD40、BAFFR、HVEM(LIGHTR)、SLAMF7、NKp80(KLRFl)、CD160、CD19、IL−2Rベータ、IL−2Rガンマ、IL−7R a、ITGA1、VLA1、CD49a、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA−6、CD49f、ITGAD、CDl ld、ITGAE、CD103、ITGAL、CDl la、LFA−1、ITGAM、CDl lb、ITGAX、CDl lc、ITGB1、CD29、ITGB2、CD1
8、LFA−1、ITGB7、TNFR2、DNAM1(CD226)、SLAMF4(CD244、2B4)、CD84、CD96(Tactile)、CEACAM1、CRT AM、Ly9(CD229)、CD160(BY55)、PSGL1、CDIOO(SEMA4D)、SLAMF6(NTB−A、Lyl08)、SLAM(SLAMF1、CD150、IPO−3)、BLAME(SLAMF8)、SELPLG(CD162)、LTBR、PAG/Cbp、NKp44、NKp30、NKp46、NKG2D、及び/またはNKG2Cから選択される膜貫通ドメインを含む。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8α、CD4、CD28、CD137、CD80、CD86、CD152、及びPD1から成る群から選択される分子に由来する。
いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、CD28に由来する。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、配列番号194のアミノ酸配列を含むCD28の膜貫通ドメインである。いくつかの実施形態では、CD28の膜貫通ドメインは、配列番号203の核酸配列によってコードされる。
いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8αに由来する。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、配列番号193のアミノ酸配列を含むCD8αの膜貫通ドメインである。いくつかの実施形態では、CD8αの膜貫通ドメインは、配列番号202の核酸配列によってコードされる。
本明細書に記載のCARで使用するための膜貫通ドメインは、合成の天然に存在しないタンパク質セグメントの少なくとも一部も含み得る。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、合成の天然に存在しないアルファヘリックスまたはベータシートである。いくつかの実施形態では、タンパク質セグメントは、少なくともおよそ20アミノ酸、例えば、少なくとも18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、またはそれ以上のアミノ酸である。合成膜貫通ドメインの例は、当該技術分野で既知であり、例えば、米国特許第7,052,906 B1号及びPCT公開第WO2000/032776 A2号にあり、これらの関連開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
膜貫通ドメインは、膜貫通ドメインのC末端側に位置する膜貫通領域及び細胞質領域を含み得る。膜貫通ドメインの細胞質領域は、3つ以上のアミノ酸を含み得、いくつかの実施形態では、脂質二重層内で膜貫通ドメインを配向させる助けとなる。いくつかの実施形態では、1つ以上のシステイン残基が、膜貫通ドメインの膜貫通領域に存在する。いくつかの実施形態では、1つ以上のシステイン残基が、膜貫通ドメインの細胞質領域に存在する。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインの細胞質領域は、正荷電アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインの細胞質領域は、アミノ酸、アルギニン、セリン、及びリジンを含む。
いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインの膜貫通領域は、疎水性アミノ酸残基を含む。いくつかの実施形態では、CARの膜貫通ドメインは、人工疎水性配列を含む。例えば、フェニルアラニン、トリプトファン、及びバリンのトリプレットが、膜貫通ドメインのC末端に存在し得る。いくつかの実施形態では、膜貫通領域は、主に疎水性のアミノ酸残基、例えば、アラニン、ロイシン、イソロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、トリプトファン、またはバリンを含む。いくつかの実施形態では、膜貫通領域は、疎水性である。いくつかの実施形態では、膜貫通領域は、ポリ−ロイシン−アラニン配列を含む。タンパク質またはタンパク質セグメントのハイドロパシーまたは疎水性もしくは親水性特徴は、当該技術分野で既知の任意の方法、例えば、カイト及びドゥーリトルのハイドロパシー分析によって評定され得る。
細胞内シグナル伝達ドメイン
本出願のCARは、細胞内シグナル伝達ドメインを含む。細胞内シグナル伝達ドメインは、CARを発現する免疫エフェクター細胞の正常なエフェクター機能のうちの少なくとも1つの活性化の原因である。「エフェクター機能」という用語は、細胞の特殊化機能を指す。例えば、T細胞のエフェクター機能は、細胞溶解活性またはサイトカインの分泌を含むヘルパー活性であり得る。したがって、「細胞質シグナル伝達ドメイン」という用語は、エフェクター機能シグナルを形質導入し、細胞に特殊化機能を行うように指示するタンパク質の一部を指す。通常、全細胞質シグナル伝達ドメインが用いられ得るが、多くの場合、全鎖を使用する必要はない。細胞質シグナル伝達ドメインの切断部分が使用される程度まで、かかる切断部分は、それがエフェクター機能シグナルを形質導入する限り、インタクトな鎖の代わりに使用され得る。したがって、細胞質シグナル伝達ドメインという用語は、エフェクター機能シグナルを形質導入するのに十分な細胞質シグナル伝達ドメインの任意の切断部分を含むよう意図されている。
いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫エフェクター細胞の一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、CARは、免疫エフェクター細胞の一次細胞内シグナル伝達ドメインから本質的に成る細胞内シグナル伝達ドメインを含む。「一次細胞内シグナル伝達ドメイン」とは、刺激様態で作用して免疫エフェクター機能を誘導する細胞質シグナル伝達配列を指す。いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫受容体チロシンに基づく活性化モチーフまたはITAMとして既知のシグナル伝達モチーフを含有する。本明細書で使用される「ITAM」とは、一般に多くの免疫細胞で発現するシグナル伝達分子の尾部分に存在する保存されたタンパク質モチーフである。このモチーフは、6〜8個のアミノ酸によって分離されたアミノ酸配列YxxL/Iの2つの繰り返しを含み得、式中、各xは独立して、保存されたモチーフYxxL/Ix(6−8)YxxL/Iをもたらす任意のアミノ酸である。シグナル伝達分子内のITAMは、細胞内のシグナル形質導入に必要であり、これは、シグナル伝達分子の活性化後にITAM内のチロシン残基のリン酸化によって少なくとも部分的に媒介される。ITAMは、シグナル伝達経路に関与する他のタンパク質のドッキング部位としての機能も果たし得る。例示的なITAM含有初代細胞質シグナル伝達配列としては、CD3ζ、FcRガンマ(FCER1G)、FcRベータ(FcエプシロンRib)、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD3エプシロン、CD5、CD22、CD79a、CD79b、及びCD66dに由来するものが挙げられる。
いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζに由来する。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの細胞質シグナル伝達ドメインから成る。いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、野生型CD3ζの細胞質シグナル伝達ドメインである。いくつかの実施形態では、野生型CD3ζの一次細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号197のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、Q65K等の1つ以上の変異を含むCD3ζの細胞質シグナル伝達ドメインの機能的変異体である。いくつかの実施形態では、変異体CD3ζの一次細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号198のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号206または207の核酸配列によってコードされる。
共刺激シグナル伝達ドメイン
多くの免疫エフェクター細胞は、細胞増殖、分化、及び生存を促進し、細胞のエフェクター機能を活性化するために、抗原特異的シグナルの刺激に加えて共刺激を必要とする。いくつかの実施形態では、CARは、少なくとも1つの共刺激シグナル伝達ドメインを含む。本明細書で使用される「共刺激シグナル伝達ドメイン」という用語は、細胞内のシグナル形質導入を媒介してエフェクター機能等の免疫応答を誘導するタンパク質の少なくと
も一部を指す。本明細書に記載のキメラ受容体の共刺激シグナル伝達ドメインは、シグナルを形質導入し、免疫細胞、例えば、T細胞、NK細胞、マクロファージ、好中球、または好酸球によって媒介される応答を調節する共刺激タンパク質からの細胞質シグナル伝達ドメインであり得る。「共刺激シグナル伝達ドメイン」は、共刺激分子の細胞質部分であり得る。「共刺激分子」という用語は、共刺激リガンドに特異的に結合し、それにより、増殖及び生存等であるが、これらに限定されない免疫細胞による共刺激応答を媒介する免疫細胞(T細胞等)上の同族結合パートナーを指す。
いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、単一の共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、2つ以上(約2つ、3つ、4つ、またはそれ以上のうちのいずれか等)の共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、同じ共刺激シグナル伝達ドメインのうちの2つ以上、例えば、CD28の共刺激シグナル伝達ドメインの2つのコピーを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、本明細書に記載のいずれか2つ以上の共刺激タンパク質等の異なる共刺激タンパク質由来の2つ以上の共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、一次細胞内シグナル伝達ドメイン(CD3ζの細胞質シグナル伝達ドメイン等)及び1つ以上の共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、1つ以上の共刺激シグナル伝達ドメイン及び一次細胞内シグナル伝達ドメイン(CD3ζの細胞質シグナル伝達ドメイン等)は、任意のペプチドリンカーを介して互いに融合される。一次細胞内シグナル伝達ドメイン及び1つ以上の共刺激シグナル伝達ドメインは、任意の好適な順序で配置され得る。いくつかの実施形態では、1つ以上の共刺激シグナル伝達ドメインは、膜貫通ドメインと一次細胞内シグナル伝達ドメイン(CD3ζの細胞質シグナル伝達ドメイン等)との間に位置する。複数の共刺激シグナル伝達ドメインが、相加的または相乗的刺激効果を提供し得る。
宿主細胞(例えば、免疫細胞)内の共刺激シグナル伝達ドメインの活性化は、細胞が、サイトカインの産生及び分泌、食作用特性、増殖、分化、生存、及び/または細胞毒性を増加または減少するように誘導し得る。任意の共刺激分子の共刺激シグナル伝達ドメインは、本明細書に記載のCARでの使用に適合性があり得る。共刺激シグナル伝達ドメインのタイプ(複数可)は、エフェクター分子が発現される免疫エフェクター細胞のタイプ(例えば、T細胞、NK細胞、マクロファージ、好中球、または好酸球)、及び所望の免疫エフェクター機能(例えば、ADCC効果)等の因子に基づいて選択される。CARで使用するための共刺激シグナル伝達ドメインの例は、B7/CD28ファミリーのメンバー(例えば、B7−1/CD80、B7−2/CD86、B7−H1/PD−L1、B7−H2、B7−H3、B7−H4、B7−H6、B7−H7、BTLA/CD272、CD28、CTLA−4、Gi24/VISTA/B7−H5、ICOS/CD278、PD−1、PD−L2/B7−DC、及びPDCD6)、TNFスーパーファミリーのメンバー(例えば、4−1BB/TNFSF9/CD137、4−1BBリガンド/TNFSF9、BAFF/BLyS/TNFSF13B、BAFF R/TNFRSF13C、CD27/TNFRSF7、CD27リガンド/TNFSF7、CD30/TNFRSF8、CD30リガンド/TNFSF8、CD40/TNFRSF5、CD40/TNFSF5、CD40リガンド/TNFSF5、DR3/TNFRSF25、GITR/TNFRSF18、GITRリガンド/TNFSF18、HVEM/TNFRSF14、LIGHT/TNFSF14、リンホトキシン−アルファ/TNF−ベータ、OX40/TNFRSF4、OX40リガンド/TNFSF4、RELT/TNFRSF19L、TACI/TNFRSF13B、TL1A/TNFSF15、TNF−アルファ、及びTNF RII/TNFRSF1B)、SLAMファミリーのメンバー(例えば、2B4/CD244/SLAMF4、BLAME/SLAMF8、CD2、CD2F−10/SLAMF9、CD48/SLAMF2、CD58/LFA−3、CD84/SLAMF5、CD229/
SLAMF3、CRACC/SLAMF7、NTB−A/SLAMF6、及びSLAM/CD150)、ならびに任意の他の共刺激分子、例えば、CD2、CD7、CD53、CD82/Kai−1、CD90/Thy1、CD96、CD160、CD200、CD300a/LMIR1、HLAクラスI、HLA−DR、Ikaros、インテグリンアルファ4/CD49d、インテグリンアルファ4ベータ1、インテグリンアルファ4ベータ7/LPAM−1、LAG−3、TCL1A、TCL1B、CRTAM、DAP12、デクチン−1/CLEC7A、DPPIV/CD26、EphB6、TIM−1/KIM−1/HAVCR、TIM−4、TSLP、TSLP R、リンパ球機能関連抗原−1(LFA−1)、及びNKG2Cを含むが、これらに限定されない、共刺激タンパク質の細胞質シグナル伝達ドメインであり得る。
いくつかの実施形態では、1つ以上の共刺激シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、4−1BB、OX40、CD30、CD40、CD3、リンパ球機能関連抗原−1(LFA−1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、及びCD83に特異的に結合するリガンドから成る群から選択される。
いくつかの実施形態では、本出願のCARにおける細胞内シグナル伝達ドメインは、CD28に由来する共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの細胞質シグナル伝達ドメイン及びCD28の共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号195のアミノ酸配列を含むCD28の共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、CD28の共刺激シグナル伝達ドメインは、配列番号204の核酸配列によってコードされる。
いくつかの実施形態では、本出願のCARにおける細胞内シグナル伝達ドメインは、CD137(すなわち、4−1BB)に由来する共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの細胞質シグナル伝達ドメイン及びCD137の共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号196のアミノ酸配列を含むCD137の共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、CD137の共刺激シグナル伝達ドメインは、配列番号205の核酸配列によってコードされる。
いくつかの実施形態では、本出願のCARにおける細胞内シグナル伝達ドメインは、CD28の共刺激シグナル伝達ドメイン及びCD137の共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζの細胞質シグナル伝達ドメイン、CD28の共刺激シグナル伝達ドメイン、及びCD137の共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、N末端からC末端まで、CD28の共刺激シグナル伝達ドメイン、CD137の共刺激シグナル伝達ドメイン、及びCD3ζの細胞質シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、配列番号195のアミノ酸配列を含むCD28の共刺激シグナル伝達ドメイン。いくつかの実施形態では、配列番号196のアミノ酸配列を含むCD137の共刺激シグナル伝達ドメイン。
共刺激シグナル伝達ドメインが免疫細胞の免疫応答を調節することができるように、本明細書に記載の共刺激シグナル伝達ドメインのうちのいずれかの変異形も本開示の範囲内である。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、野生型対応物と比較して、最大10個のアミノ酸残基変形(例えば、1、2、3、4、5、または8個)を含む。1つ以上のアミノ酸変形を含む、かかる共刺激シグナル伝達ドメインは、変異形と称され得る。共刺激シグナル伝達ドメインのアミノ酸残基の変異は、変異を含まない共刺激シグナル伝達ドメインと比較して、シグナル伝達形質導入の増加及び免疫応答の刺激の増
強をもたらし得る。共刺激シグナル伝達ドメインのアミノ酸残基の変異は、変異を含まない共刺激シグナル伝達ドメインと比較して、シグナル伝達形質導入の減少及び免疫応答の刺激の低減をもたらし得る。
ヒンジ領域
本出願のCARは、細胞外抗原結合ドメインと膜貫通ドメインとの間に位置するヒンジドメインを含み得る。ヒンジドメインは、一般にタンパク質の2つのドメイン間に見られるアミノ酸セグメントであり、タンパク質の可撓性及びそれらのドメインの一方または両方の互いに対する移動を許容し得る。エフェクター分子の膜貫通ドメインに対する細胞外抗原結合ドメインのかかる可撓性及び移動を提供する任意のアミノ酸配列が使用され得る。
ヒンジドメインは、約10〜100個のアミノ酸、例えば、約15〜75個のアミノ酸、20〜50個のアミノ酸、または30〜60個のアミノ酸のうちのいずれか1つを含有し得る。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、少なくとも約10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45、50、55、60、65、70、または75アミノ酸長のうちのいずれか1つであり得る。
いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、天然に存在するタンパク質のヒンジドメインである。ヒンジドメインを含むための当該技術分野で既知の任意のタンパク質のヒンジドメインは、本明細書に記載のキメラ受容体での使用に適合性がある。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、天然に存在するタンパク質のヒンジドメインの少なくとも一部であり、キメラ受容体に可撓性を付与する。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、CD8αに由来する。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、CD8αのヒンジドメインの一部、例えば、少なくとも15個(例えば、20、25、30、35、または40個)の連続アミノ酸を含有するCD8αのヒンジドメインのフラグメントである。いくつかの実施形態では、CD8αのヒンジドメインは、配列番号192のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、CD8αのヒンジドメインは、配列番号201の核酸配列によってコードされる。
IgG、IgA、IgM、IgE、またはIgD抗体等の抗体のヒンジドメインは、本明細書に記載のpH依存性キメラ受容体系での使用にも適合性がある。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、抗体の定常ドメインCH1及びCH2を連結するヒンジドメインである。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、抗体のヒンジドメイン及び抗体の1つ以上の定常領域を含む抗体のものである。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、抗体のヒンジドメイン及び抗体のCH3定常領域を含む。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、抗体のヒンジドメインならびに抗体のCH2及びCH3定常領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、IgG、IgA、IgM、IgE、またはIgD抗体である。いくつかの実施形態では、抗体は、IgG抗体である。いくつかの実施形態では、抗体は、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4抗体である。いくつかの実施形態では、ヒンジ領域は、IgG1抗体のヒンジ領域ならびにCH2及びCH3定常領域を含む。いくつかの実施形態では、ヒンジ領域は、IgG1抗体のヒンジ領域及びCH3定常領域を含む。
天然に存在しないペプチドは、本明細書に記載のキメラ受容体のヒンジドメインとしても使用され得る。いくつかの実施形態では、Fc受容体の細胞外リガンド結合ドメインのC末端と膜貫通ドメインのN末端との間のヒンジドメインは、ペプチドリンカー、例えば、(GxS)nリンカーであり、式中、x及びnは独立して、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、またはそれ以上を含む3〜12の整数であり得る。
シグナルペプチド
本出願のCARは、ポリペプチドのN末端にシグナルペプチド(別名、シグナル配列)を含み得る。一般に、シグナルペプチドは、ポリペプチドを細胞内の所望の部位に標的するペプチド配列である。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、エフェクター分子を細胞の分泌経路に標的し、エフェクター分子の脂質二重層への組み込み及び繋留を可能にする。本明細書に記載のCARでの使用に適合性のある天然に存在するタンパク質のシグナル配列または合成の天然に存在しないシグナル配列を含むシグナルペプチドは、当業者に明らかであろう。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、CD8α、GM−CSF受容体α、及びIgG1重鎖から成る群から選択される分子に由来する。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、CD8αに由来する。いくつかの実施形態では、CD8αのシグナルペプチドは、配列番号191のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、CD8αのシグナルペプチドは、配列番号199または200の核酸配列によってコードされる。
IV.操作された免疫エフェクター細胞
本明細書に記載のCARのうちのいずれか1つを含む宿主細胞(免疫エフェクター細胞等)が本出願にさらに提供される。
したがって、いくつかの実施形態では、(a)BCMAの第1のエピトープに特異的に結合する第1のBCMA結合部分及びBCMAの第2のエピトープに特異的に結合する第2のBCMA結合部分を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)が提供され、第1のエピトープ及び第2のエピトープは異なる。
いくつかの実施形態では、(a)BCMAの第1のエピトープに特異的に結合する第1の抗BCMA sdAb及びBCMAの第2のエピトープに特異的に結合する第2の抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)が提供され、第1のエピトープ及び第2のエピトープは異なる。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA sdAb及び/または第2の抗BCMA sdAbは、ラクダ科、キメラ、ヒト、またはヒト化である。いくつかの実施形態では、第1の抗BCMA及び第2の抗BCMAは、ペプチド結合またはペプチドリンカーを介して互いに融合される。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、約50以下(約35、25、20、15、10、または5以下のうちのいずれか1つ等)のアミノ酸長である。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8α、CD4、CD28、CD137、CD80、CD86、CD152、及びPD1から成る群から選択される。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫エフェクター細胞(T細胞等)の一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζに由来する。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、CD137、OX40、CD30、CD40、CD3、LFA−1、ICOS、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、CD83のリガンド、及びこれらの組み合わせから成る群から選択される共刺激分子に由来する。いくつかの実施形態では、多価CARは、細胞外抗原結合ドメインのC末端と膜貫通ドメインのN末端との間に位置するヒンジドメイン(CD8αヒンジドメイン等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、多価CARは、ポリペプチドのN末端に位置するシグナルペプチド(CD8αシグナルペプチド等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、N末端からC末端まで、CD8αシグナルペプチド、
細胞外抗原結合ドメイン、CD8αヒンジドメイン、CD8α膜貫通ドメイン、CD137に由来する共刺激シグナル伝達ドメイン、及びCD3ζに由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、T細胞、NK細胞、末梢血単核細胞(PBMC)、造血幹細胞、多能性幹細胞、または胚幹細胞である。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、自己由来である。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、同種異系である。
いくつかの実施形態では、(a)抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含むBCMA CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)が提供され、抗BCMA sdAbは、以下:(1)配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列を含むCDR3、(2)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号78のアミノ酸配列を含むCDR3、(3)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号79のアミノ酸配列を含むCDR3、(4)配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号80のアミノ酸配列を含むCDR3、(5)配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3、(6)配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3、(7)配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3、(8)配列番号8のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3、(9)配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3、(10)配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3、(11)配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3、(12)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3、(13)配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3、(14)配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3、(15)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3、(16)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3、(17)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3、(18)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3、(19)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3、(20)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3、(21)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号97のアミノ酸配列を含むCDR3、(22)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号98のアミノ酸配列を含むCDR3、(23)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号99のアミノ酸配列を含むCDR3、(24)配列番号24のアミノ
酸配列を含むCDR1、配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号100のアミノ酸配列を含むCDR3、(25)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号101のアミノ酸配列を含むCDR3、(26)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号102のアミノ酸配列を含むCDR3、(27)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号103のアミノ酸配列を含むCDR3、(28)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号104のアミノ酸配列を含むCDR3、(29)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号105のアミノ酸配列を含むCDR3、(30)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号106のアミノ酸配列を含むCDR3、(31)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号107のアミノ酸配列を含むCDR3、(32)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号108のアミノ酸配列を含むCDR3、(33)配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR3、(34)配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR3、(35)配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号73のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR3、(36)配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号74のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR3、(37)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号75のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR3、または(38)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号76のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR3、のうちの任意の1つを含む。いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、少なくとも2つの抗BCMA sdAbを含む。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ラクダ科、キメラ、ヒト、またはヒト化である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、配列番号115〜152から成る群から選択されるアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫エフェクター細胞(T細胞等)の一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3ζに由来する。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、共刺激シグナル伝達ドメインは、CD27、CD28、CD137、OX40、CD30、CD40、CD3、LFA−1、ICOS、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、CD83のリガンド、及びこれらの組み合わせから成る群から選択される共刺激分子に由来する。いくつかの実施形態では、BCMA CARは、細胞外抗原結合ドメインのC末端と膜貫通ドメインのN末端との間に位置するヒンジドメイン(CD8αヒンジドメイン等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、BCMA CARは、ポリペプチドのN末端に位置するシグナルペプチド(CD8αシグナルペプチド等)をさらに含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、N末端からC末端まで、CD8αシグナルペプチド、細胞外抗原結合ドメイン、CD8αヒンジドメイン、CD28膜貫通ドメイン、CD28に由来する第1の共刺激シグナル伝達ドメイン、CD137に由来する第2の共刺激シグナル伝達ドメイン、及びCD3ζに由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、N末端からC末端まで、CD8αシグナルペプチド、細胞外抗原結合ドメイン、CD8αヒンジドメイン、CD8α膜貫通ドメイン、CD137に由来する共刺激シグナル伝達ドメイン、及びCD3ζに由来する一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。いくつかの実施形態では、BCMA CARは、配列番号216〜256、298〜335から成る群から選択
されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、T細胞、NK細胞、末梢血単核細胞(PBMC)、造血幹細胞、多能性幹細胞、または胚幹細胞である。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、自己由来である。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、同種異系である。
2つ以上の異なるCARを含む(または発現する)操作された免疫エフェクター細胞も提供される。本明細書に記載のCARのうちのいずれか2つ以上が組み合わせで発現される。CARは、異なる抗原を標的とし、それにより相乗的または相加的効果をもたらすことができる。CARの細胞外抗原結合ドメイン内の単一ドメイン抗体は、単一の抗原可変鎖(重鎖等)のみを有し、かかるCAR発現細胞は、2つ以上のscFvに基づくCARを共発現する操作された免疫エフェクター細胞で見られる可変鎖誤対合問題を有しない。2つのVHHに基づくCARを共発現する例示的な操作された免疫エフェクター細胞が、図15Eに例証される。当業者であれば、他のsdAbに基づくCARまたは本明細書に記載の他の構造を有するCARが操作された免疫エフェクター細胞でも共発現され得ることを認識するであろう。2つ以上のCARは、同じベクターまたは異なるベクター上でコードされ得る。
操作された免疫エフェクター細胞は、1つ以上の治療用タンパク質及び/または免疫調節剤、例えば、免疫チェックポイント阻害剤をさらに発現し得る。例えば、国際特許出願第 PCT/CN2016/073489号及び同第PCT/CN2016/087855号を参照されたく、これらは、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
ベクター
本出願は、本明細書に記載のCARのうちのいずれか1つをクローニング及び発現するためのベクターを提供する。いくつかの実施形態では、ベクターは、哺乳類細胞等の真核生物細胞における複製及び組み込みに好適である。いくつかの実施形態では、ベクターは、ウイルスベクターである。ウイルスベクターの例としては、アデノウイルスベクター、アデノ関連ウイルスベクター、レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクター、ワクシニアベクター、単純ヘルペスウイルスベクター、及びそれらの誘導体が挙げられるが、これらに限定されない。ウイルスベクター技術は、当該技術分野で周知であり、例えば、Sambrook et al.(2001,Molecular Cloning:A
Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory,New York)、及び他のウイルス学及び分子生物学手引き書に記載されている。
いくつかのウイルスベースの系が、哺乳類細胞への遺伝子導入のために開発されている。例えば、レトロウイルスは、遺伝子送達系に好都合なプラットフォームを提供する。異種核酸は、ベクターに挿入され、当該技術分野で既知の技術を使用してレトロウイルス粒子内にパッケージングされ得る。その後、組換えウイルスは、単離され、操作された哺乳類細胞にインビトロまたはエクスビボ送達され得る。いくつかのレトロウイルス系が当該技術分野で既知である。いくつかの実施形態では、アデノウイルスベクターが使用される。いくつかのアデノウイルスベクターが当該技術分野で既知である。いくつかの実施形態では、レンチウイルスベクターが使用される。いくつかの実施形態では、自己不活性化レンチウイルスベクターが使用される。例えば、免疫調節剤(免疫チェックポイント阻害剤等)コード配列を持つ自己不活性化レンチウイルスベクター及び/またはCARを持つ自己不活性化レンチウイルスベクターが、当該技術分野で既知のプロトコルとともにパッケージングされ得る。結果として生じるレンチウイルスベクターは、当該技術分野で既知の方法を使用して哺乳類細胞(初代ヒトT細胞等)を形質導入するために使用され得る。レンチウイルス等のレトロウイルスに由来するベクターは、それらが導入遺伝子の長期の安
定した組み込み及び子孫細胞におけるその繁殖を可能にするため、長期遺伝子導入を達成するのに好適なツールである。レンチウイルスベクターは、低免疫原性も有し、非増殖細胞を形質導入することができる。
いくつかの実施形態では、ベクターは、非ウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターは、トランスポゾン、例えば、スリーピングビューティー(SB)トランスポゾン系、またはPiggyBacトランスポゾン系である。いくつかの実施形態では、ベクターは、例えば、ポリ(乳酸−コ−グリコール酸)(PLGA)及びポリ乳酸(PLA)、ポリ(エチレンイミン)(PEI)、及びデンドリマーを含む、ポリマーに基づく非ウイルスベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターは、陽イオン性脂質に基づく非ウイルスベクター、例えば、陽イオン性リポソーム、脂質ナノエマルション、及び固体脂質ナノ粒子(SLN)である。いくつかの実施形態では、ベクターは、ペプチドに基づく遺伝子非ウイルスベクター、例えば、ポリ−L−リジンである。ゲノム編集に好適な既知の非ウイルスベクターのいずれも、CARをコードする核酸を操作された免疫エフェクター細胞に導入するために使用され得る。例えば、Yin H.et al.Nature Rev.Genetics(2014) 15:521−555、Aronovich EL et al.“The Sleeping Beauty transposon system:a non−viral vector for gene therapy.” Hum.Mol.Genet.(2011) R1:R14−20、及びZhao S.et al.“PiggyBac transposon vectors:the tools of the human gene editing.” Transl.Lung Cancer Res.(2016) 5(1):120−125を参照されたく、これらは、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、CARをコードする核酸のうちの1つ以上は、電気穿孔法、ソノポレーション、フォトポレーション、マグネトフェクション、ヒドロポレーションを含むが、これらに限定されない、物理学的方法によって操作された免疫エフェクター細胞に導入される。
いくつかの実施形態では、ベクターは、本明細書に記載のCARをコードする核酸のうちのいずれか1つを含む。核酸は、当該技術分野で既知の任意の分子クローニング法を使用して、例えば、制限エンドヌクレアーゼ部位及び1つ以上の選択可能なマーカーを使用して、ベクターにクローニングされ得る。いくつかの実施形態では、核酸は、プロモーターに操作可能に連結される。様々なプロモーターが哺乳類細胞での遺伝子発現について調査されており、当該技術分野で既知のプロモーターのうちのいずれかが本発明で使用され得る。プロモーターは、構成的プロモーターまたは制御プロモーター、例えば、誘導性プロモーターとして大まかに分類され得る。
いくつかの実施形態では、CARをコードする核酸は、構成的プロモーターに操作可能に連結される。構成的プロモーターは、異種遺伝子(導入遺伝子とも称される)を宿主細胞で構成的に発現させる。本明細書で企図される例示的な構成的プロモーターとしては、サイトメガロウイルス(CMV)プロモーター、ヒト伸長因子−1アルファ(hEF1α)、ユビキチンCプロモーター(UbiC)、ホスホグリセロキナーゼプロモーター(PGK)、サルウイルス40初期プロモーター(SV40)、及びCMV初期エンハンサーとカップリングしたトリβ−アクチンプロモーター(CAGG)が挙げられるが、これらに限定されない。導入遺伝子発現の駆動におけるかかる構成的プロモーターの効率は、多数の研究において広く比較されている。例えば、Michael C.Miloneらは、初代ヒトT細胞でのCAR発現を駆動するためのCMV、hEF1α、UbiC、及びPGKの効率を比較し、hEF1αプロモーターが、最も高いレベルの導入遺伝子発現を誘導しただけでなく、CD4及びCD8 ヒトT細胞で最適に維持されたという結論を下した(Molecular Therapy,17(8):1453−1464(200
9))。いくつかの実施形態では、CARをコードする核酸は、hEF1αプロモーターに操作可能に連結される。
いくつかの実施形態では、CARをコードする核酸は、誘導性プロモーターに操作可能に連結される。誘導性プロモーターは、制御プロモーターのカテゴリーに属する。誘導性プロモーターは、物理的条件、操作された免疫エフェクター細胞の微環境、または操作された免疫エフェクター細胞、誘導因子(すなわち、誘導剤)、もしくはそれらの組み合わせの生理学的状態等の1つ以上の条件によって誘導され得る。いくつかの実施形態では、誘導条件は、操作された哺乳類細胞及び/または薬学的組成物を受ける対象における内在性遺伝子発現を誘導しない。いくつかの実施形態では、誘導条件は、操作された哺乳類細胞の誘導因子、放射線照射(イオン化放射、光等)、温度(熱等)、レドックス状態、腫瘍環境、及び活性化状態から成る群から選択される。
いくつかの実施形態では、ベクターは、レンチウイルスベクターによりトランスフェクトされた宿主細胞集団からCARを発現する細胞を選択するために選択可能なマーカー遺伝子またはレポーター遺伝子も含有する。選択可能なマーカー及びレポーター遺伝子はいずれも適切な制御配列と隣接して、宿主細胞での発現を可能にし得る。例えば、ベクターは、転写及び翻訳ターミネーター、開始配列、及び核酸配列の発現の制御に有用なプロモーターを含有し得る。
いくつかの実施形態では、ベクターは、CARをコードする核酸を2つ以上含む。いくつかの実施形態では、ベクターは、第1のCARをコードする第1の核酸配列及び第2のCARをコードする第2の核酸配列を含む核酸を含み、第1の核酸は、自己開裂ペプチドをコードする第3の核酸配列を介して第2の核酸に操作可能に連結される。いくつかの実施形態では、自己開裂ペプチドは、T2A、P2A、及びF2Aから成る群から選択される。いくつかの実施形態では、T2Aペプチドは、配列番号385のアミノ酸配列を有する。
免疫エフェクター細胞
「免疫エフェクター細胞」は、免疫エフェクター機能を実行することができる免疫細胞である。いくつかの実施形態では、免疫エフェクター細胞は、少なくともFcγRIIIを発現し、ADCCエフェクター機能を実行する。ADCCを媒介する免疫エフェクター細胞の例としては、末梢血単核細胞(PBMC)、ナチュラルキラー(NK)細胞、単球、細胞毒性T細胞、好中球、及び好酸球が挙げられる。
いくつかの実施形態では、免疫エフェクター細胞は、T細胞である。いくつかの実施形態では、T細胞は、CD4+/CD8−、CD4−/CD8+、CD4+/CD8+、CD4−/CD8−、またはこれらの組み合わせである。いくつかの実施形態では、T細胞は、CARの発現及びCD20+またはCD19+腫瘍細胞等の標的細胞への結合時にIL−2、TFN、及び/またはTNFを産生する。いくつかの実施形態では、CD8+T細胞は、CARの発現及び標的細胞への結合時に抗原特異的標的細胞を溶解する。
いくつかの実施形態では、免疫エフェクター細胞は、NK細胞である。他の実施形態では、免疫エフェクター細胞は、確立された細胞株、例えば、NK−92細胞であり得る。
いくつかの実施形態では、免疫エフェクター細胞は、造血幹細胞、多能性幹細胞、iPS、または胚幹細胞等の幹細胞から分化される。
操作された免疫エフェクター細胞は、CARをT細胞等の免疫エフェクター細胞に導入することによって調製される。いくつかの実施形態では、CARは、第III節に記載の
単離された核酸のうちのいずれか1つまたはベクターのうちのいずれか1つをトランスフェクトすることによって免疫エフェクター細胞に導入される。いくつかの実施形態では、CARは、タンパク質を細胞膜に挿入しながら、細胞をCELL SQUEEZE(登録商標)等のマイクロ流体系に通過させることによって免疫エフェクター細胞に導入される(例えば、米国特許出願公開第20140287509号を参照されたい)。
ベクターまたは単離された核酸を哺乳類細胞に導入する方法が当該技術分野で既知である。記載のベクターは、物理的、化学的、または生物学的方法によって免疫エフェクター細胞に移入される。
ベクターを免疫エフェクター細胞に導入するための物理的方法としては、リン酸カルシウム沈殿、リポフェクション、粒子衝突、微量注入法、電気穿孔法等が挙げられる。ベクター及び/または外因性核酸を含む細胞を産生するための方法が、当該技術分野で周知である。例えば、Sambrook et al.(2001) Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory,New Yorkを参照されたい。いくつかの実施形態では、ベクターは、電気穿孔法によって細胞に導入される。
ベクターを免疫エフェクター細胞に導入するための生物学的方法は、DNA及びRNAベクターの使用を含む。ウイルスベクターは、遺伝子を哺乳類細胞、例えば、ヒト細胞に挿入するための最も広く使用されている方法である。
ベクターを免疫エフェクター細胞に導入するための化学的手段には、コロイド分散系、例えば、巨大分子複合体、ナノカプセル、ミクロスフェア、ビーズ、ならびに水中油エマルジョン、ミセル、混合ミセル、及びリポソームを含む脂質に基づく系が含まれる。インビトロで送達ビヒクルとして使用するための例示的なコロイド系は、リポソーム(例えば、人工膜小胞)である。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のCARのうちのいずれかをコードするRNA分子は、従来の方法(例えば、インビトロ転写)によって調製され、その後、mRNA電気穿孔法等の既知の方法によって免疫エフェクター細胞に導入され得る。例えば、Rabinovich et al.,Human Gene Therapy 17:1027−1035を参照されたい。
いくつかの実施形態では、形質導入またはトランスフェクトされた免疫エフェクター細胞は、ベクターまたは単離された核酸の導入後にエクスビボで繁殖する。いくつかの実施形態では、形質導入またはトランスフェクトされた免疫エフェクター細胞は、培養されて、少なくとも約1日間、2日間、3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、10日間、12日間、または14日間のうちのいずれかにわたって繁殖する。いくつかの実施形態では、形質導入またはトランスフェクトされた免疫エフェクター細胞は、さらに評価またはスクリーニングされて、操作された哺乳類細胞を選択する。
レポーター遺伝子は、トランスフェクトされた可能性のある細胞を特定し、制御配列の機能性を評価するために使用され得る。一般に、レポーター遺伝子は、レシピエント生物もしくは組織に存在せず、またはそれによって発現されず、発現がいくつかの容易に検出可能な特性、例えば、酵素活性により明らかになるポリペプチドをコードする遺伝子である。レポーター遺伝子の発現は、DNAがレシピエント細胞に導入された後の好適な時点でアッセイされる。好適なレポーター遺伝子としては、ルシフェラーゼ、ベータ−ガラクトシダーゼ、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ、分泌アルカリ性ホスファターゼ、または緑色蛍光タンパク質遺伝子をコードする遺伝子が挙げられ得る(例えば
、Ui−Tei et al.FEBS Letters 479:79−82(2000))。好適な発現系が周知であり、既知の技法を使用して調製されるか、または商業的に入手され得る。
操作された免疫エフェクター細胞におけるCARをコードする核酸の存在を確認するための他の方法としては、例えば、サザンブロット法及びノーザンブロット法、RT−PCR及びPCR等の当業者に周知の分子生物学的アッセイ、例えば、免疫学的方法(ELISA及びウエスタンブロット法等)による特定のペプチドの存在または不在の検出等の生化学的アッセイが挙げられる。
1.T細胞源
T細胞の増殖及び遺伝子修飾前に、T細胞源が個体から得られる。T細胞は、末梢血単核細胞、骨髄、リンパ節組織、臍帯血、胸腺組織、感染部位からの組織、腹水、胸水、脾臓組織、及び腫瘍を含むいくつかの源から得られ得る。いくつかの実施形態では、当該技術分野で入手可能な任意の数のT細胞株が使用され得る。いくつかの実施形態では、T細胞は、FICOLL(商標)分離等の当業者に既知の任意の数の技法を使用して対象から収集される血液単位から得られ得る。いくつかの実施形態では、個体の循環血液由来の細胞は、アフェレーシスによって得られる。アフェレーシス産物は、典型的には、T細胞、単球、顆粒球、B細胞、他の有核白血球細胞、赤血球細胞、及び血小板を含むリンパ球を含有する。いくつかの実施形態では、アフェレーシスによって収集された細胞は、洗浄されて血漿画分を除去し、細胞をその後の処理ステップに適切な緩衝液または培地中に置いてもよい。いくつかの実施形態では、細胞は、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で洗浄される。いくつかの実施形態では、洗浄溶液は、カルシウムを欠き、マグネシウムを欠き得、または全てではないが多くの二価陽イオンを欠き得る。この場合もやはり、驚くべきことに、カルシウムの不在下での初期活性化ステップが、活性化の拡大をもたらす。当業者であれば容易に理解するであろうように、洗浄ステップは、当業者に既知の方法によって、例えば、製造業者の指示に従って半自動「貫流」遠心分離機(例えば、Cobe 2991細胞処理装置、Baxter CytoMate、またはHaemonetics Cell Saver 5)を使用することによって達成され得る。洗浄後、細胞は、様々な生体適合性緩衝液、例えば、Ca2+を含まないPBS、Mg2+を含まないPBS、PlasmaLyte A、または他の生理食塩水溶液(緩衝液の有無にかかわらず)等に再懸濁され得る。あるいは、アフェレーシス試料の望ましくない成分が除去され、細胞が培養培地に直接再懸濁され得る。
いくつかの実施形態では、T細胞は、赤血球細胞を溶解し、例えば、PERCOLL(商標)勾配による遠心分離または向流遠心分離水簸によって単球を枯渇させることによって、末梢血リンパ球から単離される。CD3+、CD28+、CD4+、CD8+、CD45RA+、及びCD45RO+T細胞等のT細胞の特定の下位集団は、陽性または陰性選択技法によってさらに単離され得る。例えば、いくつかの実施形態では、T細胞は、所望のT細胞の陽性選択に十分な時間にわたる、抗CD3/抗CD28(すなわち、3×28)コンジュゲートビーズ、例えば、DYNABEADS(登録商標)M−450 CD3/CD28 Tとのインキュベーションによって単離される。いくつかの実施形態では、時間は、約30分間である。さらなる一実施形態では、時間は、30分間〜36時間以上の範囲及びそれらの間の全ての整数値である。さらなる一実施形態では、時間は、少なくとも1、2、3、4、5、または6時間である。いくつかの実施形態では、時間は、10〜24時間である。いくつかの実施形態では、インキュベーション時間は、24時間である。白血病を有する患者からのT細胞の単離の場合、24時間等のより長いインキュベーション時間により、細胞収率が高まり得る。より長いインキュベーション時間を使用して、例えば、腫瘍組織または免疫が低下した個体から腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を単離する際に、他の細胞型と比較してわずかなT細胞しか存在しない任意の状況下でT細胞を
単離することができる。さらに、より長いインキュベーション時間の使用により、CD8+T細胞の捕捉効率が高まり得る。したがって、T細胞がCD3/CD28ビーズに結合することができる時間を短縮もしくは延長することによって、及び/または(本明細書にさらに記載されるように)ビーズのT細胞に対する比率を増加もしくは減少させることによって、T細胞の下位集団は、培養開始時またはプロセス中の他の時点で賛否について優先的に選択され得る。加えて、ビーズまたは他の表面上の抗CD3及び/または抗CD28抗体の比率を増加または減少させることによって、T細胞の下位集団は、培養開始時または他の所望の時点で賛否について優先的に選択され得る。当業者であれば、複数回の選択ラウンドを使用することもできることを認識するであろう。いくつかの実施形態では、選択手順を実行し、活性化及び増殖プロセスで「選択されていない」細胞を使用することが望ましい場合がある。「選択されていない」細胞は、さらなる選択ラウンドにも供され得る。
陰性選択によるT細胞集団の富化は、陰性選択された細胞に特有の表面マーカーに指向された抗体の組み合わせを用いて達成され得る。1つの方法は、陰性選択された細胞に存在する細胞表面マーカーに指向されたモノクローナル抗体のカクテルを使用する陰性磁気免疫付着またはフローサイトメトリーによる細胞選別及び/または選択である。例えば、陰性選択によりCD4+細胞を富化するために、モノクローナル抗体のカクテルは、典型的には、CD14、CD20、CD11b、CD16、HLA−DR、及びCD8に対する抗体を含む。ある特定の実施形態では、典型的にはCD4+、CD25+、CD62Lhi、GITR+、及びFoxP3+を発現する制御T細胞を富化するか、またはそれを陽性選択することが望ましい場合がある。あるいは、ある特定の実施形態では、制御T細胞は、抗C25コンジュゲートビーズまたは他の同様の選択方法によって枯渇される。
陽性または陰性選択による所望の細胞集団を単離するために、細胞及び表面(例えば、ビーズ等の粒子)の濃度を変化させることができる。ある特定の実施形態では、細胞とビーズの最大接触を確実にするために、ビーズ及び細胞が一緒に混合される体積を著しく減少させる(すなわち、細胞の濃度を増加させる)ことが望ましい場合がある。例えば、一実施形態では、20億細胞/mLの濃度が使用される。一実施形態では、10億細胞/mLの濃度が使用される。さらなる一実施形態では、1億細胞/mL超が使用される。さらなる一実施形態では、1000万、1500万、2000万、2500万、3000万、3500万、4000万、4500万、または5000万個の細胞/mLの細胞濃度が使用される。なお別の実施形態では、7500万、8000万、8500万、9000万、9500万、または1億個の細胞/mLの細胞濃度が使用される。さらなる実施形態では、1億2500万または1億5000万個の細胞/mLの濃度が使用され得る。高濃度の使用により、細胞収率、細胞活性化、及び細胞増殖の増加がもたらされ得る。さらに、高細胞濃度の使用により、CD28陰性T細胞等の目的とする標的抗原を弱く発現し得る細胞、または多くの腫瘍細胞が存在する試料(すなわち、白血病血液、腫瘍組織等)由来の細胞のより効率的な捕捉が可能になる。かかる細胞集団は、治療値を有し得、得ることが望ましいであろう。例えば、高濃度の細胞の使用により、通常より弱いCD28発現を有するCD8+T細胞のより効率的な選択が可能になる。
いくつかの実施形態では、より低い濃度の細胞を使用することが望ましい場合がある。T細胞と表面(例えば、ビーズ等の粒子)との混合物を著しく希釈することにより、粒子と細胞との間の相互作用が最小限に抑えられる。これにより、粒子に結合する多量の所望の抗原を発現する細胞が選択される。例えば、CD4+T細胞は、より高いレベルのCD28を発現し、希釈濃度でCD8+T細胞よりも効率的に捕捉される。いくつかの実施形態では、使用される細胞濃度は、5×10/mLである。いくつかの実施形態では、使用される細胞濃度は、約1×10/mL〜1×10/mL、及びそれらの間の任意の整数値であり得る。
いくつかの実施形態では、細胞は、回転子上で、2〜10℃または室温のいずれかで、様々な速度で様々な長さの時間にわたってインキュベートされ得る。
刺激用のT細胞は、洗浄ステップ後に凍結することもできる。理論に拘束されることを望まないが、凍結ステップ及びその後の解凍ステップにより、細胞集団における顆粒球を除去し、単球をある程度除去することによってより均一な生成物が提供される。血漿及び血小板を除去する洗浄ステップ後、細胞は、凍結溶液中に懸濁され得る。多くの凍結溶液及びパラメータが当該技術分野で既知であり、この状況において有用である一方で、1つの方法は、20%DMSO及び8%ヒト血清アルブミンを含有するPBS、または10%デキストラン40及び5%デキストロース、20%ヒト血清アルブミン及び7.5%DMSO、または31.25%Plasmalyte−A、31.25%デキストロース5%、0.45%NaCl、10%デキストラン40及び5%デキストロース、20%ヒト血清アルブミン、及び7.5%DMSOを含有する培養培地、または例えば、Hespan及びPlasmalyte Aを含有する他の好適な細胞凍結培地の使用を伴い、その後、細胞は、1℃/分の速度で−80℃になるまで凍結され、液体窒素貯蔵タンクの気相中に貯蔵される。他の制御凍結方法、ならびに−20℃でまたは液体窒素中での直後の非制御凍結方法が使用され得る。
いくつかの実施形態では、凍結保存細胞が解凍され、本明細書に記載されるように洗浄され、室温で1時間静置させた後、活性化する。
本明細書に記載の細胞の増殖が必要とされ得る前の時点での対象からの血液試料またはアフェレーシス産物の収集も本出願で企図される。したがって、増殖される細胞の源は、必要な任意の時点で収集され、T細胞等の所望の細胞が単離され、本明細書に記載の疾患または状態等のT細胞療法の利益を享受するであろう任意の数の疾患または状態のためのT細胞療法での後の使用のために凍結される。一実施形態では、血液試料またはアフェレーシスは、一般に健常な対象から採取される。ある特定の実施形態では、血液試料またはアフェレーシスは、疾患を発症する危険性があるが、疾患をまだ発症していない一般に健常な対象から採取され、目的とする細胞が単離され、後の使用のために凍結される。ある特定の実施形態では、T細胞が増殖され、凍結され、後に使用され得る。ある特定の実施形態では、試料は、本明細書に記載の特定の疾患の診断直後であるが、任意の治療の前に患者から収集される。さらなる一実施形態では、細胞は、薬剤、例えば、ナタリズマブ、エファリズマブ、抗ウイルス剤、化学療法、放射線、免疫抑制剤、例えば、シクロスポリン、アザチオプリン、メトトレキサート、ミコフェノール酸、及びFK506、抗体、または他の免疫除去剤(immunoablative agent)、例えば、CAMPATH、抗CD3抗体、シトキサン、フルダラビン、シクロスポリン、FK506、ラパマイシン、ミコフェノール酸、ステロイド、FR901228、及び放射線照射での治療を含むが、これらに限定されない、任意の数の関連治療法前に対象由来の血液試料またはアフェレーシスから単離される。これらの薬物は、カルシウム依存性ホスファターゼカルシニューリン(シクロスポリン及びFK506)または成長因子によって誘導されるシグナル伝達に重要なp70S6キナーゼ(ラパマイシン)のいずれかを阻害する(Liu et al.,Cell 66:807−815,1991、Henderson et
al.,Immun 73:316−321,1991、Bierer et al.,Curr.Opin.Immun.5:763−773,1993)。さらなる一実施形態では、細胞は、患者のために単離され、骨髄もしくは幹細胞移植、フルダラビン等のいずれかの化学療法薬を使用したT細胞除去療法、外部ビーム放射線療法(XRT)、シクロホスファミド、または抗体、例えば、OKT3もしくはCAMPATHと併せて(例えば、その前に、同時に、またはその後に)後の使用のために凍結される。別の実施形態では、細胞は、CD20と反応する薬剤、例えば、リツキサン等のB細胞除去療法前に単
離され、B細胞除去療法前後の治療のために後の使用のために凍結され得る。
いくつかの実施形態では、T細胞は、治療後に患者から直接得られる。この点について、ある特定のがん治療後、具体的には、免疫系を損傷する薬物での治療後、治療直後、患者が通常治療から回復する期間中、得られたT細胞の質が最適であるか、またはエクスビボで増殖するそれらの能力について改善され得ることが観察されている。同様に、本明細書に記載の方法を使用したエクスビボ操作後、これらの細胞は、移植の増強及びインビボ増殖に好ましい状態にあり得る。したがって、この回復期中のT細胞、樹状細胞、または造血系列の他の細胞を含む血液細胞の収集が、本発明の文脈内で企図される。さらに、ある特定の実施形態では、動員(例えば、GM−CSFでの動員)及び前処置(conditioning)レジメンを使用して、特に、療法後の定義された期間中に、特定の細胞型の再増殖、再循環、再生、及び/または増殖が好ましい状態を対象に作り出すことができる。例証的な細胞型としては、T細胞、B細胞、樹状細胞、及び免疫系の他の細胞が挙げられる。
2.T細胞の活性化及び増殖
本明細書に記載のCARでのT細胞の遺伝子修飾の前または後にかかわらず、T細胞は、例えば、米国特許第6,352,694号、同第6,534,055号、同第6,905,680号、同第6,692,964号、同第5,858,358号、同第6,887,466号、同第6,905,681号、同第7,144,575号、同第7,067,318号、同第7,172,869号、同第7,232,566号、同第7,175,843号、同第5,883,223号、同第6,905,874号、同第6,797,514号、同第6,867,041号、及び米国特許出願公開第20060121005号に記載の方法を一般に使用して活性化及び増殖され得る。
一般に、T細胞は、CD3/TCR複合体関連シグナルを刺激する薬剤及びT細胞の表面上の共刺激分子を刺激するリガンドに結合した表面との接触によって増殖され得る。具体的には、T細胞集団は、本明細書に記載されるように、例えば、抗CD3抗体もしくはその抗原結合フラグメント、または表面上に固定化された抗CD2抗体との接触によって、またはカルシウムイオノフォアと併せたタンパク質キナーゼC活性化因子(例えば、ブリオスタチン)との接触によって刺激され得る。T細胞の表面上のアクセサリー分子の共刺激のために、アクセサリー分子に結合するリガンドが使用される。例えば、T細胞集団は、T細胞の増殖を刺激するのに適切な条件下で抗CD3抗体及び抗CD28抗体と接触し得る。CD4+T細胞またはCD8+T細胞のいずれかの増殖を刺激するために、抗CD3抗体及び抗CD28抗体。抗CD28抗体の例としては、9.3、B−T3、XR−CD28(Diaclone,Besancon,France)が挙げられ、当該技術分野で一般に既知の他の方法として使用され得る(Berg et al.,Transplant Proc.30(8):3975−3977,1998、Haanen et al.,J.Exp.Med.190(9):13191328,1999、Garland et al.,J.Immunol Meth.227(1−2):53−63,1999)。
いくつかの実施形態では、T細胞の一次刺激シグナル及び共刺激シグナルは、異なるプロトコルによって提供され得る。例えば、各シグナルを提供する薬剤は、溶液中に存在し得るか、または表面にカップリングし得る。表面にカップリングすると、薬剤は、同じ表面にカップリングし得る(すなわち、「シス」形成)か、または表面を分離し得る(すなわち、「トランス」形成)。あるいは、一方の薬剤が表面にカップリングし、他方の薬剤が溶液中に存在し得る。一実施形態では、共刺激シグナルを提供する薬剤は、細胞表面に結合し、一次活性化シグナルを提供する薬剤は、溶液中に存在するか、または表面に結合する。ある特定の実施形態では、両方の薬剤が溶液中に存在し得る。別の実施形態では、
薬剤は、可溶性形態であり得、表面、例えば、Fc受容体もしくは抗体を発現する細胞、または薬剤に結合する他の結合剤に架橋し得る。この点について、例えば、米国特許出願公開第20040101519号及び同第20060034810号(本発明におけるT細胞の活性化及び増殖での使用に企図される人工抗原提示細胞(aAPC))を参照されたい。
いくつかの実施形態では、T細胞は、薬剤でコーティングされたビーズと合わせられ、その後、ビーズとT細胞が分離され、次いで、T細胞が培養される。代替の一実施形態では、培養前に、薬剤でコーティングされたビーズと細胞は分離されず、一緒に培養される。さらなる一実施形態では、ビーズ及び細胞は、磁力等の力を加えることによって最初に濃縮され、細胞表面マーカーのライゲーションの増加がもたらされ、それにより細胞刺激を誘導する。
一例として、細胞表面タンパク質は、抗CD3及び抗CD28が結合する常磁性ビーズ(3×28個のビーズ)をT細胞と接触させることによってライゲーションされ得る。一実施形態では、細胞(例えば、10〜10個のT細胞)及びビーズ(例えば、DYNABEADS(登録商標)M−450 CD3/CD28 T常磁性ビーズ1:1の比率))が、緩衝液、好ましくは、PBS(カルシウム及びマグネシウム等の二価陽イオンなし)中で合わせられる。この場合もやはり、当業者であれば、任意の細胞濃度が使用され得ることを容易に理解することができる。例えば、標的細胞は、試料中では非常に稀であり、試料の0.01%を構成し得るか、または全試料(すなわち、100%)が目的とする標的細胞を含み得る。したがって、任意の細胞数は、本発明の文脈内である。ある特定の実施形態では、粒子及び細胞が一緒に混合される体積を著しく減少させて(すなわち、細胞濃度を増加させて)、細胞と粒子との最大接触を確実にすることが望ましい場合がある。例えば、一実施形態では、約20億個の細胞/mLの濃度が使用される。別の実施形態では、1億個の細胞/mL超が使用される。さらなる一実施形態では、1000万、1500万、2000万、2500万、3000万、3500万、4000万、4500万、または5000万個の細胞/mLの細胞濃度が使用される。なお別の実施形態では、7500万、8000万、8500万、9000万、9500万、または1億個の細胞/mLの細胞濃度が使用される。さらなる実施形態では、1億2500万または1億5000万個の細胞/mLの濃度が使用され得る。高濃度の使用により、細胞収率、細胞活性化、及び細胞増殖の増加がもたらされ得る。さらに、高細胞濃度の使用により、CD28陰性T細胞等の目的とする標的抗原を弱く発現し得る細胞のより効率的な捕捉が可能になる。ある特定の実施形態では、かかる細胞集団は、治療値を有し得、取得することが望ましいであろう。例えば、高濃度の細胞の使用により、通常より弱いCD28発現を有するCD8+T細胞のより効率的な選択が可能になる。
いくつかの実施形態では、混合物は、数時間(約3時間)〜約14日間またはそれらの間の任意の時間単位の整数値にわたって培養され得る。別の実施形態では、混合物は、21日間にわたって培養され得る。本発明の一実施形態では、ビーズ及びT細胞は、約8日間にわたって一緒に培養される。別の実施形態では、ビーズ及びT細胞は、2〜3日間にわたって一緒に培養される。T細胞の培養時間が60日間以上になり得るように、いくつかの刺激サイクルも所望され得る。T細胞培養に適切な条件は、血清(例えば、ウシまたはヒト胎児血清)、インターロイキン−2(IL−2)、インスリン、IFN−γ、IL−4、IL−7、GM−CSF、IL−10、IL−12、IL−15、TGFβ、及びTNF−α、または当業者に既知の細胞成長のための任意の他の添加物を含む増殖及び生存に必要な因子を含有し得る適切な培地(例えば、最小必須培地またはRPMI培地1640またはX−vivo 15(Lonza))を含む。細胞成長のための他の添加物としては、界面活性剤、プラスマネート、ならびに還元剤、例えば、N−アセチル−システイン及び2−メルカプトエタノールが挙げられるが、これらに限定されない。培地は、ア
ミノ酸、ピルビン酸ナトリウム、及びビタミンが添加され、無血清であるか、または適切な量の血清(もしくは血漿)または定義された組のホルモン、及び/またはT細胞の成長及び増殖に十分な量のサイトカイン(複数可)を補充しているかのいずれかのRPMI1640、AIM−V、DMEM、MEM、α−MEM、F−12、X−Vivo 15、及びX−Vivo 20、Optimizerを含み得る。抗生物質、例えば、ペニシリン及びストレプトマイシンは、実験培養物にのみ含まれ、対象に注入される細胞の培養物には含まれない。標的細胞は、成長を支援するのに必要な条件下、例えば、適切な温度(例えば、37℃)及び大気(例えば、空気+5%CO)で維持される。様々な刺激時間に曝露されたT細胞は、異なる特徴を呈し得る。例えば、典型的な血液またはアフェレーシス末梢血単核細胞産物は、細胞毒性またはサプレッサーT細胞集団(TC、CD8)を超えるヘルパーT細胞集団(TH、CD4+)を有する。CD3及びCD28受容体の刺激によるT細胞のエクスビボ増殖により、約8〜9日目前に主にTH細胞から成るT細胞集団が産生される一方で、約8〜9日目後、T細胞集団は、次第により多くのTC細胞集団を含む。したがって、治療目的に応じて、対象にTH細胞から主に成るT細胞集団を注入することが有利であり得る。同様に、抗原特異的TC細胞サブセットが単離された場合、このサブセットをより大きな程度に増殖することが有益であり得る。
さらに、CD4及びCD8マーカーに加えて、他の表現型マーカーが、細胞増殖プロセスの過程中に著しく変化するが、主に、再現可能に変化する。したがって、かかる再現性により、特定の目的のために活性化T細胞産物を調整する能力が有効になる。
V.薬学的組成物
抗BCMA単一ドメイン抗体のうちのいずれか1つ、または本明細書に記載のCARのうちのいずれか1つ(BCMA CAR等)を含む操作された免疫エフェクター細胞のうちのいずれか1つと、薬学的に許容される担体と、を含む薬学的組成物が、本出願によってさらに提供される。薬学的組成物は、所望の純度を有するsdAb、または複数の操作された免疫エフェクター細胞を、任意の薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定剤(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.(1980))と混合することによって凍結乾燥製剤または水溶液の形態で調製され得る。
許容される担体、賦形剤、または安定剤は、用いられる投薬量及び濃度ではレシピエントに非毒性であり、緩衝液、アスコルビン酸、メチオニン、ビタミンE、メタ重亜硫酸ナトリウムを含む抗酸化物質、防腐剤、等張化剤、安定剤、金属錯体(例えば、Zn−タンパク質錯体);キレート剤、例えば、EDTA及び/または非イオン性界面活性剤を含む。
緩衝液は、特に安定性がpH依存性である場合、治療有効性を最適化する範囲内でpHを制御するために使用される。緩衝液は、好ましくは、約50mM〜約250mMの範囲の濃度で存在する。本発明での使用に好適な緩衝剤は、有機酸及び無機酸の両方、ならびにそれらの塩を含む。例えば、クエン酸塩、リン酸塩、コハク酸塩、酒石酸塩、フマル酸塩、グルコン酸塩、シュウ酸塩、乳酸塩、酢酸塩。さらに、緩衝液は、ヒスチジン及びトリメチルアミン塩、例えば、トリスを含み得る。
防腐剤は、微生物成長を遅延させるために添加され、典型的には、0.2w/v%〜1.0w/v%の範囲で存在する。本発明での使用に好適な防腐剤としては、オクタデシルジメチルベンジル塩化アンモニウム;塩化ヘキサメトニウム;ベンザルコニウムハロゲン化物(例えば、塩化物、臭化物、ヨウ化物)、塩化ベンゼトニウム;チメロサール、フェノール、ブチルまたはベンジルアルコール;アルキルパラベン、例えば、メチルまたはプロピルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール、3−ペンタノール
、及びm−クレゾールが挙げられる。
時折「安定剤」としても既知の等張化剤は、組成物中の液体の等張性を調整または維持するために存在する。タンパク質及び抗体等の大きい荷電した生体分子とともに使用される場合、それらが、荷電したアミノ酸側鎖群と相互作用し、それにより分子間及び分子内相互作用の可能性を低減するため、それらは、多くの場合、「安定剤」と称される。等張化剤は、他の成分の相対量を考慮して、0.1%〜25重量%、好ましくは、1〜5%の任意の量で存在し得る。好ましい等張化剤としては、多価糖アルコール、好ましくは、三価以上の糖アルコール、例えば、グリセリン、エリトリトール、アラビトール、キシリトール、ソルビトール、及びマンニトールが挙げられる。
さらなる賦形剤としては、以下:(1)増量剤、(2)溶解度向上剤、(3)安定剤、及び(4)変性または容器の壁への付着を阻止する薬剤のうちの1つ以上としての機能を果たし得る薬剤が挙げられる。かかる賦形剤としては、多価糖アルコール(上に列挙されるもの);アミノ酸、例えば、アラニン、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、リジン、オルニチン、ロイシン、2−フェニルアラニン、グルタミン酸、トレオニン等;有機糖または糖アルコール、例えば、スクロース、ラクトース、ラクチトール、トレハロース、スタキオース、マンノース、ソルボース、キシロース、リボース、リビトール、ミオイニシトース(myoinisitose)、ミオイニシトール(myoinisitol)、ガラクトース、ガラクチトール、グリセロール、シクリトール(例えば、イノシトール)、ポリエチレングリコール;硫黄含有還元剤、例えば、尿素、グルタチオン、チオクト酸、チオグリコール酸ナトリウム、チオグリセロール、α−モノチオグリセロール、及びチオ硫酸ナトリウム;低分子量タンパク質、例えば、ヒト血清アルブミン、ウシ血清アルブミン、ゼラチン、または他の免疫グロブリン;親水性ポリマー、例えば、ポリビニルピロリドン;単糖(例えば、キシロース、マンノース、フルクトース、グルコース;二糖(例えば、ラクトース、マルトース、スクロース);三糖、例えば、ラフィノース;ならびに多糖、例えば、デキストリンまたはデキストランが挙げられる。
非イオン性界面活性剤または洗剤(別名、「湿潤剤」)は、治療薬の可溶化を助けるために、かつ撹拌によって誘導される凝集から治療用タンパク質を保護するために存在し、それにより、活性治療用タンパク質または抗体の変性を引き起こすことなく製剤が剪断表面応力に曝露されることも可能になる。非イオン性界面活性剤は、約0.05mg/mL〜約1.0mg/mL、好ましくは、約0.07mg/mL〜約0.2mg/mLの範囲で存在する。
好適な非イオン性界面活性剤としては、ポリソルベート(20、40、60、65、80等)、ポリオキサマー(polyoxamer)(184、188等)、PLURONIC(登録商標)ポリオール、TRITON(登録商標)、ポリオキシエチレンソルビタンモノエーテル(TWEEN(登録商標)−20、TWEEN(登録商標)−80等)、ラウロマクロゴール400、ステアリン酸ポリオキシル40、ポリオキシエチレン硬化ヒマシ油10、50、及び60、モノステアリン酸グリセロール、スクロース脂肪酸エステル、メチルセルロース、ならびにカルボキシメチルセルロースが挙げられる。使用され得る陰イオン性洗剤は、ラウリル硫酸ナトリウム、ジオクチルスルホコハク酸ナトリウム、及びジオクチルスルホン酸ナトリウムを含む。陽イオン性洗剤は、塩化ベンザルコニウムまたは塩化ベンゼトニウムを含む。
薬学的組成物がインビボ投与に使用されるために、それらは、滅菌でなければならない。薬学的組成物は、滅菌濾過膜を通す濾過によって滅菌にされる。本明細書の薬学的組成物は、一般に、滅菌アクセスポートを有する容器、例えば、皮下注射針によって穿刺可能
なストッパーを有する静脈用溶液袋またはバイアルに入れられる。
投与経路は、好適な様態での、例えば、皮下、静脈内、腹腔内、筋肉内、動脈内、病巣内、もしくは関節内経路による注射もしくは注入、局所投与、吸入、または持続放出もしくは徐放手段による長期にわたる単回もしくは複数回ボーラスまたは注入等の既知の認められている方法に従う。
徐放性調製物が調製され得る。徐放性調製物の好適な例としては、アンタゴニストを含有する固体疎水性ポリマーの半透過性マトリックスが挙げられ、このマトリックスは、成形品、例えば、フィルムまたはマイクロカプセルの形態である。徐放性マトリックスの例としては、ポリエステル、ヒドロゲル(例えば、ポリ(2−ヒドロキシエチル−メタクリレート)またはポリ(ビニルアルコール))、ポリラクチド(米国特許第3,773,919号)、L−グルタミン酸とL−グルタミン酸エチルのコポリマー、非分解性エチレン酢酸ビニル、分解性乳酸−グリコール酸コポリマー、例えば、LUPRON DEPOT(商標)(乳酸−グリコール酸コポリマー及び酢酸ロイプロリドから成る注射用ミクロスフェア)、及びポリ−D−(−)−3−ヒドロキシ酪酸が挙げられる。
本明細書に記載の薬学的組成物は、治療される特定の適応症に必要な2つ以上の活性化合物または薬剤、好ましくは、互いに悪影響を及ぼさない相補的活性を有するものも含有し得る。あるいは、または加えて、本組成物は、細胞毒性薬、化学療法剤、サイトカイン、免疫抑制剤、または成長阻害剤を含み得る。かかる分子は、意図される目的に有効な量で、組み合わせで好適に存在する。
活性成分は、例えば、液滴形成技法または界面重合によって調製されるマイクロカプセル、例えば、それぞれ、ヒドロキシメチルセルロースまたはゼラチン−マイクロカプセル及びポリ−(メチルメタクリレート)マイクロカプセル、コロイド状薬物送達系(例えば、リポソーム、アルブミンミクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子及びナノカプセル)、またはマクロエマルジョンにも封入され得る。かかる技法は、Remington’s Pharmaceutical Sciences 18th editionに開示されている。
VI.治療方法
本出願はさらに、細胞免疫療法で使用するための方法及び組成物に関する。いくつかの実施形態では、細胞免疫療法は、血液学的悪性腫瘍及び固形腫瘍を含むが、これらに限定されない、がんを治療するためのものである。本明細書に記載の抗BCMA sdAb、CAR、及び操作された免疫エフェクター細胞(CAR−T細胞等)のうちのいずれも、がんの治療方法で使用され得る。本明細書に記載のCARは、抗原損失エスケープ変異を有する腫瘍の治療、及び既存の療法への耐性の低減に有用であり得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法及び組成物は、例えば、自己免疫疾患等の単一ドメイン抗体またはCARによって特異的に認識される抗原に関連する他の疾患を治療するために使用され得る。
いくつかの実施形態では、個体(ヒト個体等)におけるがん(例えば、多発性骨髄腫、例えば、再発性または難治性多発性骨髄腫)を治療する方法であって、個体に、(1)(a)BCMAの第1のエピトープに特異的に結合する第1のBCMA結合部分及びBCMAの第2のエピトープに特異的に結合する第2のBCMA結合部分を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)(第1のエピトープ及び第2のエピトープは異なる)と、(2)薬学的に許容される担体と、を含む有効量の薬学的組成物を投与することを含む、方法が提供される。いくつかの実施形
態では、個体(ヒト個体等)におけるがん(例えば、多発性骨髄腫、例えば、再発性または難治性多発性骨髄腫)を治療する方法であって、個体に、(1)(a)BCMAの第1のエピトープに特異的に結合する第1の抗BCMA sdAb及びBCMAの第2のエピトープに特異的に結合する第2の抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)(第1のエピトープ及び第2のエピトープは異なる)と、(2)薬学的に許容される担体と、を含む有効量の薬学的組成物を投与することを含む、方法が提供される。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、自己由来である。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、同種異系である。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、CAR−T細胞である。いくつかの実施形態では、がんは、液体がん、例えば、多発性骨髄腫、急性リンパ性白血病、または慢性リンパ性白血病である。いくつかの実施形態では、がんは、難治性または再発性多発性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、約10〜約10個の細胞/kg、例えば、約3×10〜約7×10個の細胞/kg、または約3×10個の細胞/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、静脈内注入によって投与される。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、約1週間にわたって3つの分割用量で投与される。
いくつかの実施形態では、個体(ヒト個体等)におけるがん(例えば、多発性骨髄腫、例えば、再発性または難治性多発性骨髄腫)を治療する方法であって、個体に、(1)(a)抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含むBCMA CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)、(2)薬学的に許容される担体と、を含む有効量の薬学的組成物を投与することを含む、方法が提供され、抗BCMA sdAbは、以下:(1)配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列を含むCDR3、(2)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号78のアミノ酸配列を含むCDR3、(3)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号79のアミノ酸配列を含むCDR3、(4)配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号80のアミノ酸配列を含むCDR3、(5)配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3、(6)配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3、(7)配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3、(8)配列番号8のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3、(9)配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3、(10)配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3、(11)配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3、(12)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3、(13)配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3、(14)配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3、(15)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、
及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3、(16)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3、(17)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3、(18)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3、(19)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3、(20)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3、(21)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号97のアミノ酸配列を含むCDR3、(22)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号98のアミノ酸配列を含むCDR3、(23)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号99のアミノ酸配列を含むCDR3、(24)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号100のアミノ酸配列を含むCDR3、(25)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号101のアミノ酸配列を含むCDR3、(26)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号102のアミノ酸配列を含むCDR3、(27)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号103のアミノ酸配列を含むCDR3、(28)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号104のアミノ酸配列を含むCDR3、(29)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号105のアミノ酸配列を含むCDR3、(30)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号106のアミノ酸配列を含むCDR3、(31)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号107のアミノ酸配列を含むCDR3、(32)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号108のアミノ酸配列を含むCDR3、(33)配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR3、(34)配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR3、(35)配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号73のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR3、(36)配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号74のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR3、(37)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号75のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR3、または(38)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号76のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR3、のうちの任意の1つを含む。いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、少なくとも2つの抗BCMA sdAbを含む。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ラクダ科、キメラ、ヒト、またはヒト化である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、配列番号115〜152から成る群から選択されるアミノ酸配列を含むVHドメインを含む。いくつかの実施形態では、BCMA CARは、配列番号216〜256及び298〜335から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、自己由来である。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、同種異系である。いくつかの実施形態では、がんは、液体がん、例えば、多発性骨髄腫、急性リンパ性白血病、または慢性リンパ性白血病である。いくつ
かの実施形態では、がんは、難治性または再発性多発性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、約10〜約10個の細胞/kg、例えば、約3×10〜約7×10個の細胞/kg、または約3×10個の細胞/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、静脈内注入によって投与される。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、約1週間にわたって3つの分割用量で投与される。
いくつかの実施形態では、多発性骨髄腫(例えば、再発性または難治性多発性骨髄腫)に罹患している個体における部分的または完全臨床的寛解を得る方法であって、個体に、(1)(a)BCMAの第1のエピトープに特異的に結合する第1のBCMA結合部分(第1の抗BCMA sdAb等)、及びBCMAの第2のエピトープに特異的に結合する第2のBCMA結合部分(第2の抗BCMA sdAb等)を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)(第1のエピトープ及び第2のエピトープは異なる)と、(2)薬学的に許容される担体と、を含む有効量の薬学的組成物を投与することを含む、方法が提供される。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、自己由来である。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、同種異系である。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、CAR−T細胞である。いくつかの実施形態では、がんは、液体がん、例えば、多発性骨髄腫、急性リンパ性白血病、または慢性リンパ性白血病である。いくつかの実施形態では、がんは、難治性または再発性多発性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、約10〜約10個の細胞/kg、例えば、約3×10〜約7×10個の細胞/kg、または約3×10個の細胞/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、静脈内注入によって投与される。いくつかの実施形態では、操作された免疫エフェクター細胞は、約1週間にわたって3つの分割用量で投与される。
いくつかの実施形態では、個体(ヒト個体等)におけるがん(例えば、多発性骨髄腫、例えば、再発性または難治性多発性骨髄腫)を治療する方法であって、個体に、抗BCMA sdAb及び薬学的に許容される担体を含む有効量の薬学的組成物を投与することを含み、抗BCMA sdAbは、以下:(1)配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列を含むCDR3、(2)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号78のアミノ酸配列を含むCDR3、(3)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号79のアミノ酸配列を含むCDR3、(4)配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号80のアミノ酸配列を含むCDR3、(5)配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3、(6)配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3、(7)配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3、(8)配列番号8のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3、(9)配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3、(10)配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3、(11)配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3、(12)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号50のアミノ酸配列を含む
CDR2、及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3、(13)配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3、(14)配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3、(15)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3、(16)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3、(17)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3、(18)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3、(19)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3、(20)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3、(21)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号97のアミノ酸配列を含むCDR3、(22)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号98のアミノ酸配列を含むCDR3、(23)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号99のアミノ酸配列を含むCDR3、(24)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号100のアミノ酸配列を含むCDR3、(25)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号101のアミノ酸配列を含むCDR3、(26)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号102のアミノ酸配列を含むCDR3、(27)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号103のアミノ酸配列を含むCDR3、(28)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号104のアミノ酸配列を含むCDR3、(29)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号105のアミノ酸配列を含むCDR3、(30)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号106のアミノ酸配列を含むCDR3、(31)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号107のアミノ酸配列を含むCDR3、(32)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号108のアミノ酸配列を含むCDR3、(33)配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR3、(34)配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR3、(35)配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号73のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR3、(36)配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号74のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR3、(37)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号75のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR3、または(38)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号76のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR3、のうちの任意の1つを含む。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、ラクダ科、キメラ、ヒト、またはヒト化である。いくつかの実施形態では、抗BCMA sdAbは、配列番号115〜152から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、がんは、液体がん、例えば、多発性骨髄腫、急性リンパ性白血病、また
は慢性リンパ性白血病である。いくつかの実施形態では、がんは、難治性または再発性多発性骨髄腫である。
本明細書に記載の方法は、固形がん及び液体がんの両方を含む種々のがんの治療に好適である。これらの方法は、早期、進行期、及び転移がんを含む全ての病期のがんに適用される。本明細書に記載の方法は、補助状況または新補助状況下で、第1の療法、第2の療法、第3の療法、または当該技術分野で既知の他の種類の癌療法、例えば、化学療法、手術、放射線、遺伝子療法、免疫療法、骨髄移植、幹細胞移植、標的療法、凍結療法、超音波療法、光線力学療法、高周波アブレーション等との併用療法として使用され得る。
いくつかの実施形態では、がんは、多発性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、がんは、Durie−Salmon病期分類システムに基づいた、ステージI、ステージII、もしくはステージIII、及び/またはステージAもしくはステージBの多発性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、がんは、国際骨髄腫作業グループ(IMWG)によって刊行される国際病期分類システムに基づいた、ステージI、ステージII、またはステージIIIの多発性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、がんは、意義不明の単クローン性ガンマグロブリン血症(MGUS)である。いくつかの実施形態では、がんは、無症候性(くすぶり型/遅発性)骨髄腫である。いくつかの実施形態では、がんは、症候性または急性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、がんは、難治性多発性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、がんは、転移性多発性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、個体は、多発性骨髄腫に対するこれまでの治療に応答しなかった。いくつかの実施形態では、個体は、多発性骨髄腫のこれまでの治療後に進行性疾患を有する。いくつかの実施形態では、個体は、多発性骨髄腫に対する治療を少なくとも約2、3、4回、またはそれ以上のうちのいずれかの回数これまでに受けたことがある。いくつかの実施形態では、がんは、再発性多発性骨髄腫である。
いくつかの実施形態では、個体は、急性多発性骨髄腫を有する。いくつかの実施形態では、個体は、少なくとも10%のクローン骨髄形質細胞を有する。いくつかの実施形態では、個体は、生検により確定診断された骨または髄外形質細胞腫を有する。いくつかの実施形態では、個体は、基礎にある形質細胞増殖疾患に起因し得る末端器官障害の証拠を有する。いくつかの実施形態では、個体は、例えば、血清カルシウムが正常上限>0.25mmol/L(>1mg/dL)である、または>2.75mmol/L(>11mg/dL)よりも高い高カルシウム血症を有する。いくつかの実施形態では、個体は、例えば、<40mL/分のクレアチニンクリアランスまたは>177μmol/L(>2mg/dL)の血清クレアチニンである、腎不全を有する。いくつかの実施形態では、個体は、例えば、正常値最下限を下回る>20g/Lのヘモグロビン値、または<100g/Lのヘモグロビン値である、貧血を有する。いくつかの実施形態では、個体は、1つ以上の骨病変、例えば、骨格X線撮影、CT、またはPET/CT上の1つ以上の骨破壊性病変を有する。いくつかの実施形態では、個体は、悪性腫瘍(MDE)の以下のバイオマーカー:(1)骨髄検査における60%以上のクローン形質細胞、(2)100またはそれ以上の血清病変部/非病変部の遊離軽鎖比であるが、但し、病変部軽鎖の絶対レベルが少なくとも100mg/Lであるものとする、(3)サイズが少なくとも5mm以上であるMRI上の1つを超える局所性病変、のうちの1つ以上を有する。
薬学的組成物の投与は、注入、摂取、輸液、植え込み、または移植を含む任意の好都合な様態で行われ得る。本組成物は、患者に、経動脈、皮下、皮内、腫瘍内、結節内、髄内、筋肉内、静脈内、または腹腔内投与され得る。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、全身投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、静脈内注入等の注入によって個体に投与される。免疫療法のための注入技法は、当該技術分野で既知である(例えば、Rosenberg et al.,New Eng.J.of Med.319
:1676(1988)を参照されたい)。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、個体に、皮内または皮下注射によって投与される。いくつかの実施形態では、本組成物は、静脈注射によって投与される。いくつかの実施形態では、本組成物は、腫瘍またはリンパ節に直接注射される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、腫瘍部位に、例えば、腫瘍細胞に直接、または腫瘍細胞を有する組織に局所投与される。
本発明の薬学的組成物の投薬量及び所望の薬物濃度は、想定される特定の使用に応じて異なり得る。適切な投薬量または投与経路の決定は、十分に当業者の技術の範囲内である。動物実験により、ヒト療法に有効な用量を決定するのに信頼できるガイダンスが提供される。有効な用量の種間スケーリングが、Mordenti,J.and Chappell,W.“The Use of Interspecies Scaling in
Toxicokinetics,” In Toxicokinetics and New Drug Development,Yacobi et al.,Eds,Pergamon Press,New York 1989,pp.42−46によって設定された原理に従って行われ得る。異なる製剤が異なる治療及び異なる障害に有効であり、特定の器官または組織を治療するよう意図された投与が別の器官または組織とは異なる様態での送達を必要とし得ることは、本出願の範囲内である。
薬学的組成物が本明細書に記載のsdAbのうちのいずれか1つを含むいくつかの実施形態では、薬学的組成物は、投与経路に応じて、約10ng/個体体重kg/日〜最大約100mg/個体体重kg/日以上の投薬量で、例えば、約1mg/kg/日〜10mg/kg/日で投与される。特定の投薬量及び送達方法に関するガイダンスが文献に提供されており、例えば、米国特許第4,657,760号、同第5,206,344号、または同第5,225,212号を参照されたい。
薬学的組成物が本明細書に記載の操作された免疫細胞のうちのいずれか1つを含むいくつかの実施形態では、薬学的組成物は、少なくとも約10、10、10、10、10、または10個の細胞/個体体重kgのうちのいずれかの投薬量で投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、約10〜約10、約10〜約10、約10〜約10、約10〜約10、約10〜約10、約10〜約10、約10〜約10、約10〜約10、または約10〜約10細胞/個体体重kgのうちのいずれかの投薬量で投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、少なくとも約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10個の細胞/kgまたはそれ以上のうちのいずれかの用量で投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、少なくとも約3×10〜約7×10個の細胞/kg、または約3×10個の細胞/kgの用量で投与される。
いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、単回投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、複数回(2回、3回、4回、5回、6回、またはそれ以上の回数のうちのいずれか等)投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、1週間に1回、2週間に1回、3週間に1回、4週間に1回、1ヶ月に1回、2ヶ月に1回、3ヶ月に1回、4ヶ月に1回、5ヶ月に1回、6ヶ月に1回、7ヶ月に1回、8ヶ月に1回、9ヶ月に1回、または1年に1回投与される。いくつかの実施形態では、投与間の間隔は、約1週間〜2週間、2週間〜1ヶ月、2週間〜2ヶ月、1ヶ月〜2ヶ月、1ヶ月〜3ヶ月、3ヶ月〜6ヶ月、または6ヶ月〜1年のうちのいずれか1つである。特定の患者に最適な投薬量及び治療レジーム(regime)は、患者を疾患の兆候について監視し、適宜に治療を調整することによって、医学分野の技術者によって容易に決定され得る。
さらに、投薬量は、1回以上の別個の投与によって、または持続注入によって投与され得る。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、約2回、3回、4回、5回、またはそれ以上の回数のうちのいずれかの1つの用量等の分割用量で投与される。いくつかの実施形態では、分割用量は、約1週間にわたって投与される。いくつかの実施形態では、分割用量は、等しく分割される。いくつかの実施形態では、分割用量は、総用量の約20%、約30%、及び約50%である。いくつかの実施形態では、連続した分割用量間の間隔は、約1日、2日、3日、またはそれ以上である。数日間以上にわたる反復投与の場合、状態に応じて、疾患症状の所望の抑制が生じるまで治療が継続される。しかしながら、他の投薬量レジメンも有用であり得る。この療法の進行は、従来の技法及びアッセイによって容易に監視される。
いくつかの実施形態では、薬学的組成物の量は、個体における客観的臨床応答を引き起こすのに有効である。いくつかの実施形態では、多発性骨髄腫(例えば、再発性または難治性多発性骨髄腫)に罹患している個体における客観的臨床的反応を得る方法であって、個体に、(1)(a)BCMAの第1のエピトープに特異的に結合する第1のBCMA結合部分(第1の抗BCMA sdAb等)、及びBCMAの第2のエピトープに特異的に結合する第2のBCMA結合部分(第2の抗BCMA sdAb等)を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)(第1のエピトープ及び第2のエピトープは異なる)と、(2)薬学的に許容される担体と、を含む有効量の薬学的組成物を投与することを含む、方法が提供される。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな臨床奏効(sCR)は、個体において得られる。
いくつかの実施形態では、薬学的組成物の量は、個体における疾患寛解(部分的または完全)を引き起こすのに有効である。いくつかの実施形態では、多発性骨髄腫(例えば、再発性または難治性多発性骨髄腫)に罹患している個体における疾患寛解(部分的または完全)を引き起こす方法であって、個体に、(1)(a)BCMAの第1のエピトープに特異的に結合する第1のBCMA結合部分(第1の抗BCMA sdAb等)、及びBCMAの第2のエピトープに特異的に結合する第2のBCMA結合部分(第2の抗BCMA
sdAb等)を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)(第1のエピトープ及び第2のエピトープは異なる)と、(2)薬学的に許容される担体と、を含む有効量の薬学的組成物を投与することを含む、方法が提供される。いくつかにおいて、臨床的寛解は、個体が薬学的組成物を受けてから約6カ月、5カ月、4カ月、3カ月、2カ月、1カ月、またはそれ以下の後に得られる。
いくつかの実施形態では、薬学的組成物の量は、個体におけるがんの再発または疾患の進行を防ぐのに有効である。いくつかの実施形態では、多発性骨髄腫(例えば、再発性または難治性多発性骨髄腫)に罹患している個体における再発または疾患の進行を防ぐ方法であって、個体に、(1)(a)BCMAの第1のエピトープに特異的に結合する第1のBCMA結合部分(第1の抗BCMA sdAb等)、及びBCMAの第2のエピトープに特異的に結合する第2のBCMA結合部分(第2の抗BCMA sdAb等)を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)(第1のエピトープ及び第2のエピトープは異なる)と、(2)薬学的に許容される担体と、を含む有効量の薬学的組成物を投与することを含む、方法が提供される。いくつかの実施形態では、再発または疾患の進行を、少なくとも約6カ月、1年、2年、3年、4年、5年、またはそれ以上の間防ぐ。
いくつかの実施形態では、薬学的組成物の量は、個体における生存(無病生存等)を延
長するのに有効である。いくつかの実施形態では、生存は、少なくとも約2、3、4、5、6、12、または24カ月の間延長される。いくつかの実施形態では、多発性骨髄腫(例えば、再発性または難治性多発性骨髄腫)に罹患している個体の生存期間を延長する方法であって、個体に、(1)(a)BCMAの第1のエピトープに特異的に結合する第1のBCMA結合部分(第1の抗BCMA sdAb等)、及びBCMAの第2のエピトープに特異的に結合する第2のBCMA結合部分(第2の抗BCMA sdAb等)を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)(第1のエピトープ及び第2のエピトープは異なる)と、(2)薬学的に許容される担体と、を含む有効量の薬学的組成物を投与することを含む、方法が提供される。
いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、個体における生活の質を改善するのに有効である。いくつかの実施形態では、多発性骨髄腫(例えば、再発性または難治性多発性骨髄腫)に罹患している個体の生活の質を改善する方法であって、個体に、(1)(a)BCMAの第1のエピトープに特異的に結合する第1のBCMA結合部分(第1の抗BCMA sdAb等)、及びBCMAの第2のエピトープに特異的に結合する第2のBCMA結合部分(第2の抗BCMA sdAb等)を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)(第1のエピトープ及び第2のエピトープは異なる)と、(2)薬学的に許容される担体と、を含む有効量の薬学的組成物を投与することを含む、方法が提供される。
いくつかの実施形態では、薬学的組成物の量は、固体腫瘍またはリンパ系腫瘍の成長を阻害するか、またはそのサイズを低減するのに有効である。いくつかの実施形態では、固体腫瘍またはリンパ系腫瘍のサイズは、少なくとも約10%(例えば、少なくとも約20%、30%、40%、60%、70%、80%、90%、または100%のうちのいずれかを含む)低減される。いくつかの実施形態では、個体における固体腫瘍またはリンパ系腫瘍の成長を阻害するか、またはそのサイズを低減する方法が、提供される。
いくつかの実施形態では、薬学的組成物の量は、個体における腫瘍転移を阻害するのに有効である。いくつかの実施形態では、少なくとも約10%(例えば、少なくとも約20%、30%、40%、60%、70%、80%、90%、または100%のうちのいずれかを含む)の転移が阻害される。いくつかの実施形態では、多発性骨髄腫(例えば、再発性または難治性多発性骨髄腫)に罹患している個体の腫瘍転移を阻害する方法であって、個体に、(1)(a)BCMAの第1のエピトープに特異的に結合する第1のBCMA結合部分(第1の抗BCMA sdAb等)、及びBCMAの第2のエピトープに特異的に結合する第2のBCMA結合部分(第2の抗BCMA sdAb等)を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む多価CARを含む操作された免疫エフェクター細胞(T細胞等)(第1のエピトープ及び第2のエピトープは異なる)と、(2)薬学的に許容される担体と、を含む有効量の薬学的組成物を投与することを含む、方法が提供される。いくつかの実施形態では、リンパ節への転移を阻害する方法が提供される。いくつかの実施形態では、肺への転移を阻害する方法が提供される。いくつかの実施形態では、肝臓への転移を阻害する方法が提供される。転移は、当該技術分野における任意の既知の方法、例えば、血液試験、骨スキャン、X線スキャン、CTスキャン、PETスキャン、及び生検によって評価され得る。
VII.キット及び製品
本明細書に記載の単一ドメイン抗体、キメラ抗原受容体、または操作された免疫エフェクター細胞のうちのいずれかを含むキット、単位投薬量、及び製品がさらに提供される。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の薬学的組成物のうちのいずれか1つを含むキットが提供され、好ましくは、その使用に関する指示を提供する。
本出願のキットは、好適なパッケージング内に存在する。好適なパッケージングとしては、バイアル、ボトル、瓶、可撓性パッケージング(例えば、密封マイラーまたはプラスチック袋)等が挙げられるが、これらに限定されない。キットは、任意に、緩衝液及び解釈情報等の追加の成分を提供し得る。したがって、本出願は、バイアル(密封バイアル等)、ボトル、瓶、可撓性パッケージング等を含む製品も提供する。
製品は、容器及び容器上のまたは容器に関連するラベルまたは添付文書を含み得る。好適な容器としては、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ等が挙げられる。容器は、ガラスまたはプラスチック等の様々な材料から形成され得る。一般に、容器は、本明細書に記載の疾患または障害(がん等)の治療に有効な組成物を保持し、滅菌アクセスポートを有し得る(例えば、容器は、皮下注射針によって穿刺可能なストッパーを有する静脈用溶液袋またはバイアルである)。ラベルまたは添付文書は、組成物が個体における特定の状態の治療のために使用されることを示す。ラベルまたは添付文書は、個体への組成物の投与に関する指示をさらに含む。ラベルは、再構成及び/または使用に関する指示を示し得る。薬学的組成物を保持する容器は、再構成された製剤の繰り返し投与(例えば、2〜6回の投与)を可能にする複数回使用バイアルであり得る。添付文書とは、かかる治療薬の適応症、使用、投薬量、投与、禁忌、及び/またはその使用に関する警告についての情報を含む、治療薬の商業用パッケージに通例含まれる指示を指す。さらに、製品は、薬学的に許容される緩衝液、例えば、注射用静菌水(BWFI)、リン酸緩衝生理食塩水、リンガー溶液、及びデキストロース溶液を含む第2の容器をさらに含み得る。製品は、他の緩衝剤、希釈剤、フィルター、針、及びシリンジを含む、商業的観点及びユーザの観点から望ましい他の材料をさらに含み得る。
キットまたは製品は、薬局、例えば、病院薬局及び配合薬局での保管及び使用に十分な量でパッケージングされる、薬学的組成物の複数の単位用量及び使用に関する指示を含み得る。
以下の実施例及び例示的な実施形態は、単に本発明の例示となるよう意図されており、それ故に、決して本発明を限定するものと見なされるべきではない。以下の実施例及び例示的な実施形態は、限定するものではなく、例証として提供されている。
VIII.例示的な実施形態
本発明は、以下の実施形態を提供する:
実施形態1.以下:(1)配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列を含むCDR3、(2)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号78のアミノ酸配列を含むCDR3、(3)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号79のアミノ酸配列を含むCDR3、(4)配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号80のアミノ酸配列を含むCDR3、(5)配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3、(6)配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3、(7)配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3、(8)配列番号8のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号46のアミノ酸配列を含むCD
R2、及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3、(9)配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3、(10)配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3、(11)配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3、(12)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3、(13)配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3、(14)配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3、(15)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3、(16)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3、(17)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3、(18)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3、(19)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3、(20)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3、(21)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号97のアミノ酸配列を含むCDR3、(22)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号98のアミノ酸配列を含むCDR3、(23)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号99のアミノ酸配列を含むCDR3、(24)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号100のアミノ酸配列を含むCDR3、(25)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号101のアミノ酸配列を含むCDR3、(26)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号102のアミノ酸配列を含むCDR3、(27)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号103のアミノ酸配列を含むCDR3、(28)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号104のアミノ酸配列を含むCDR3、(29)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号105のアミノ酸配列を含むCDR3、(30)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号106のアミノ酸配列を含むCDR3、(31)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号107のアミノ酸配列を含むCDR3、(32)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号108のアミノ酸配列を含むCDR3、(33)配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR3、(34)配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR3、(35)配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号73のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR3、(36)配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号74のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR3、(37)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号75
のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR3、または(38)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号76のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR3、のうちのいずれか1つを含む、抗BCMA単一ドメイン抗体(sdAb)。
実施形態2.抗BCMA sdAbが、配列番号115〜152から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態1に記載の抗BCMA sdAb。
実施形態3.実施形態1または2に記載の抗BCMA sdAbと競合する、抗BCMA抗体。
実施形態4.抗BCMA抗体が、sdAbである、実施形態3に記載の抗BCMA抗体。
実施形態5.抗BCMA sdAbが、ラクダ科抗体である、実施形態1、2、及び4のいずれか1つに記載の抗BCMA sdAb。
実施形態6.抗BCMA sdAbが、キメラ抗体である、実施形態1、2、及び4のいずれか1つに記載の抗BCMA sdAb。
実施形態7.抗BCMA sdAbが、ヒト化である、実施形態1、2、及び4のいずれか1つに記載の抗BCMA sdAb。
実施形態8.抗BCMA sdAbが、VHフラグメントである、実施形態1〜2及び4〜7のいずれか1つに記載の抗BCMA sdAb。
実施形態9.(a)実施形態1〜2及び4〜7のいずれか1つに記載の抗BCMA sdAbを含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む、キメラ抗原受容体(CAR)。
実施形態10.細胞外抗原結合ドメインが、少なくとも2つの抗BCMA sdAbを含む、実施形態9に記載のCAR。
実施形態11.(a)少なくとも2つのBCMA結合部分を含む細胞外抗原結合ドメインと、(b)膜貫通ドメインと、(c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含むポリペプチドを含む、多価キメラ抗原受容体(CAR)。
実施形態12.細胞外抗原結合ドメインが、第1のBCMA結合部分及び第2のBCMA結合部分を含む、実施形態11に記載の多価CAR。
実施形態13.第1のBCMA結合部分及び第2のBCMA結合部分のうちの1つ以上が、sdAbである、実施形態12に記載の多価CAR。
実施形態14.第1のBCMA結合部分が、第1の抗BCMA sdAbであり、第2のBCMA結合部分が、第2の抗BCMA sdAbである、実施形態12または13に記載の多価CAR。
実施形態15.第1のBCMA結合部分が、抗BCMA sdAbであり、第2のBCMA結合部分が、ヒト抗体に由来する、実施形態12または13に記載の多価CAR。
実施形態16.第1のBCMA結合部分が、抗BCMA sdAbであり、第2のBCMA結合部分が、BCMAのポリペプチドリガンドである、実施形態12または13に記載の多価CAR。
実施形態17.第1のBCMA結合部分及び第2のBCMA結合部分が、BCMA上の同じエピトープに特異的に結合する、実施形態12〜16のいずれか1つに記載の多価CAR。
実施形態18.第1のBCMA結合部分及び第2のBCMA結合部分が、BCMA上の異なるエピトープに特異的に結合する、実施形態12〜16のいずれか1つに記載の多価CAR。
実施形態19.第1のBCMA結合部分及び/または第2のBCMA結合部分が、配列番号388〜394から選択されるアミノ酸配列に由来するBCMA上のエピトープに特異的に結合する、実施形態12〜18のいずれか1つに記載の多価CAR。
実施形態20.第1のBCMA結合部分及び第2のBCMA結合部分のうちの1つ以上が、実施形態1の抗BCMA sdAbである、実施形態12〜19のいずれか1つに記載の多価CAR。
実施形態21.第1のBCMA結合部分が、第2のBCMA結合部分のN末端に位置している、実施形態12〜20のいずれか1つに記載の多価CAR。
実施形態22.第1のBCMA結合部分が、第2のBCMA結合部分のC末端に位置している、実施形態12〜20のいずれか1つに記載の多価CAR。
実施形態23.第1のBCMA結合部分及び第2のBCMA結合部分が、ペプチドリンカーを介して互いに融合される、実施形態12〜22のいずれか1つに記載の多価CAR。
実施形態24.ペプチドリンカーが、約50以下のアミノ酸長である、実施形態23に記載の多価CAR。
実施形態25.ペプチドリンカーが、配列番号208〜215から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む、実施形態24に記載の多価CAR。
実施形態26.膜貫通ドメインが、CD8α、CD4、CD28、CD137、CD80、CD86、CD152、及びPD1から成る群から選択される分子に由来する、実施形態9〜25のいずれか1つに記載のCARまたは多価CAR。
実施形態27.膜貫通ドメインが、CD8αまたはCD28に由来する、実施形態26に記載のCARまたは多価CAR。
実施形態28.膜貫通ドメインが、配列番号193または194のアミノ酸配列を含む、実施形態27に記載のCARまたは多価CAR。
実施形態29.細胞内シグナル伝達ドメインが、免疫エフェクター細胞の一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む、実施形態9〜28のいずれか1つに記載のCARまたは多価CAR。
実施形態30.一次細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ζに由来する、実施形態29に記載のCARまたは多価CAR。
実施形態31.一次細胞内シグナル伝達ドメインが、配列番号197または198のアミノ酸配列を含む、実施形態30に記載のCARまたは多価CAR。
実施形態32.細胞内シグナル伝達ドメインが、共刺激シグナル伝達ドメインを含む、実施形態9〜31のいずれか1つに記載のCARまたは多価CAR。
実施形態33.共刺激シグナル伝達ドメインが、CD27、CD28、CD137、OX40、CD30、CD40、CD3、LFA−1、ICOS、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、CD83のリガンド、及びこれらの組み合わせから成る群から選択される共刺激分子に由来する、実施形態32に記載のCARまたは多価CAR。
実施形態34.共刺激シグナル伝達ドメインが、CD28の細胞質ドメイン及び/またはCD137の細胞質ドメインを含む、実施形態33に記載のCARまたは多価CAR。
実施形態35.共刺激シグナル伝達ドメインが、配列番号195及び/または配列番号196のアミノ酸配列を含む、実施形態34に記載のCARまたは多価CAR。
実施形態36.細胞内シグナル伝達ドメインが、少なくとも2つの共刺激シグナル伝達ドメインを含む、実施形態32〜35のいずれか1つに記載のCARまたは多価CAR。
実施形態37.細胞外抗原結合ドメインのC末端と膜貫通ドメインのN末端との間に位置するヒンジドメインをさらに含む、実施形態9〜36のいずれか1つに記載のCARまたは多価CAR。
実施形態38.ヒンジドメインが、CD8αに由来する、実施形態37に記載のCARまたは多価CAR。
実施形態39.ヒンジドメインが、配列番号192のアミノ酸配列を含む、実施形態38に記載のCARまたは多価CAR。
実施形態40.ポリペプチドのN末端に位置するシグナルペプチドをさらに含む、実施形態9〜39のいずれか1つに記載のCARまたは多価CAR。
実施形態41.シグナルペプチドが、CD8αに由来する、実施形態40に記載のCARまたは多価CAR。
実施形態42.シグナルペプチドが、配列番号191のアミノ酸配列を含む、実施形態41に記載のCARまたは多価CAR。
実施形態43.配列番号216〜256及び298〜335から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む、キメラ抗原受容体。
実施形態44.実施形態11〜43のいずれか1つに記載のCARまたは多価CARをコードする核酸配列を含む、単離された核酸。
実施形態45.配列番号257〜297及び336〜373から成る群から選択される
核酸配列を含む、実施形態44に記載の単離された核酸。
実施形態46.第2のCARをコードする第2の核酸配列をさらに含み、CARをコードする核酸配列が、自己開裂ペプチドをコードする第3の核酸配列を介して、第2の核酸配列に操作可能に連結される、実施形態45に記載の単離された核酸。
実施形態47.自己開裂ペプチドが、T2A、P2A、及びF2Aから成る群から選択される、実施形態46に記載の単離された核酸。
実施形態48.第3の核酸配列が、配列番号385である、実施形態47に記載の単離された核酸。
実施形態49.単離された核酸が、RNA分子である、実施形態44〜48のいずれか1つに記載の単離された核酸。
実施形態50.実施形態44〜49のいずれか1つに記載の単離された核酸を含む、ベクター。
実施形態51.ベクターが、発現ベクターである、実施形態50に記載のベクター。
実施形態52.ベクターが、ウイルスベクターである、実施形態50または51に記載のベクター。
実施形態53.ベクターが、レンチウイルスベクターである、実施形態52に記載のベクター。
実施形態54.ベクターが、非ウイルスベクターである、実施形態50または51に記載のベクター。
実施形態55.実施形態9〜43のいずれか1つに記載のCARまたは多価CAR、実施形態44〜49のいずれか1つに記載の単離された核酸、または実施形態50〜54のいずれか1つに記載のベクターを含む、操作された免疫エフェクター細胞。
実施形態56.免疫エフェクター細胞が、T細胞、NK細胞、末梢血単核細胞(PBMC)、造血幹細胞、多能性幹細胞、または胚幹細胞である、実施形態55に記載の操作された免疫エフェクター細胞。
実施形態57.免疫エフェクター細胞が、T細胞である、実施形態56に記載の操作された免疫エフェクター細胞。
実施形態58.実施形態55〜57のいずれか1つに記載の操作された免疫エフェクター細胞と、薬学的に許容される担体と、を含む、薬学的組成物。
実施形態59.個体におけるがんを治療する方法であって、個体に、有効量の実施形態58に記載の薬学的組成物を投与することを含む、前記方法。
実施形態60.がんが、多発性骨髄腫である、実施形態59に記載の方法。
実施形態61.がんが、難治性または再発性多発性骨髄腫である、実施形態60に記載の方法。
実施形態62.操作された免疫エフェクター細胞が、自己由来である、実施形態59〜61のいずれか1つに記載の方法。
実施形態63.操作された免疫エフェクター細胞が、同種異系である、実施形態59〜61のいずれか1つに記載の方法。
実施形態64.個体が、ヒトである、実施形態59〜63のいずれか1つに記載の方法。
実施形態65.薬学的組成物が、静脈内に投与される、実施形態59〜64のいずれか1つに記載の方法。
実施形態66.薬学的組成物が、約1×10〜約1×10個の細胞/kgの用量で投与される、実施形態59〜65のいずれか1つに記載の方法。
実施形態67.薬学的組成物が、約1週間にわたって3回の分割用量で投与される、実施形態59〜66のいずれか1つに記載の方法。
実施形態68.個体におけるがんを治療するための実施形態58に記載の薬学的組成物の使用。
実施形態69.個体におけるがんを治療するための薬剤の調製時に実施形態58に記載の薬学的組成物の使用。
実施形態70.実施形態1〜8のいずれか1つに記載の抗BCMA sdAbを含む、薬学的組成物。
実施形態71.個体における疾患を治療する方法であって、個体に、有効量の実施形態70の薬学的組成物を投与することを含む、前記方法。
実施形態72.疾患が、がんである、実施形態71に記載の方法。
以下に論じられる実施例は、単に本発明の例示となるよう意図されており、決して本発明を限定するものと見なされるべきではない。実施例は、以下の実験が行われる全ての実験または唯一の実験であることを表すようには意図されていない。使用される数(例えば、量、温度等)に対する正確さを確保するよう努力されているが、いくつかの実験誤差及び偏差が計上されるべきである。別途示されない限り、部は、重量部であり、分子量は、重量平均分子量であり、温度は、摂氏温度であり、圧力は、大気圧であるか、またはそれに近い。
実施例1.抗BCMA sdAbの調製
BCMAに対して高結合親和性を有するsdAbを開発するために、ラマを組換えBCMA抗原で免疫化した。次いで、ファージディスプレイライブラリを構築して、VHリードを特定した。はっきりと異なるクローンをランダムに選び、抗原結合において重要な役割を果たし得る領域である重鎖相補性決定領域3(CDR3)に従って分類した。例示的なプロトコルが、以下に記載されている。sdAbを調製するための他のプロトコルが、記載されている。例えば、Els Pardon et al,Nature Protocol,2014;9(3):674を参照されたい。
1.動物免疫化及び免疫応答アッセイ
1.1動物免疫化
C末端のFcタグを有する組換えヒトBCMAタンパク質を含む免疫原(ACRO Biosystems、カタログ番号BC7−H5254)を、アジュバントまたはPBSと混合し、ラマに注入した。動物を、サービスベンダー(Cedarline)によって、典型的には、200μgの免疫原及びCFA(完全フロインドアジュバント)で、毎回約1週間〜2週間間隔で7回免疫化した。末梢血試料を、免疫化前段階で、5回目及び7回目の免疫化後に収集した。複数回の免疫化後、標的抗原に対するラマの免疫反応を評価して、抗原特異的sdAbの力価を確認した。リンパ球を、約100mLの末梢血から勾配遠心分離によって単離した。細胞にRNALATER(商標)を補充し、−80℃で保管した。血清を、抗凝固血液試料の遠心分離によって得て、−80℃で保管した。
1.2 IgG分画
IgGサブクラス分画を、GenScriptの標準操作手順に従って行った。IgGサブクラスを、タンパク質G及びタンパク質A樹脂を使用して最終出血血清から分画した。1mLの血清試料を1mLのHITRAP(登録商標)タンパク質G HPカラムに装填し、カラムを10mLのリン酸緩衝液(20mM、pH7.0)で洗浄した。IgG3(分子量100,000Da)画分を0.15MのNaCl、0.58%酢酸(pH3.5)で溶出し、溶出液を1Mのトリス−HCl(pH9.0)でpH7.4に中和した。その後、IgG1(分子量170,000Da)画分を0.1Mのグリシン−HCl(pH2.7)で溶出し、溶出液を1Mのトリス−HCl(pH8.5)でpH7.4に中和した。その後、HITRAP(登録商標)タンパク質G HPカラムの貫流液を1mLのHITRAP(登録商標)タンパク質A HPカラムに充填し、カラムを20mLのリン酸緩衝液(20mM、pH7.0)で洗浄した。IgG2(分子量100,000Da)画分を0.15MのNaCl、0.58%酢酸(pH4.5)で溶出し、溶出液を1Mのトリス−HCl(pH9.0)でpH7.4に中和した。精製されたIgG1、IgG2、及びIgG3抗体の濃度をOD280によって決定し、各々の純度を還元SDS−PAGE分析及び非還元SDS−PAGE分析の両方によって評定した。
1.3 免疫応答アッセイ
ラマの免疫応答をELISAによって評価し、血清試料及び精製されたIgGを固定化免疫原への結合についてアッセイした。免疫化前、5回目の免疫化後、及び最終出血時に収集した血清を評価した。抗原(すなわち、組換えヒト抗原タンパク質)をコーティング緩衝液中に4μg/mLで希釈した。マイクロタイタープレートを希釈抗原で、4℃で一晩コーティングした。その後、プレートを洗浄緩衝液で3回洗浄し、続いて、室温で2時間遮断した。その後、プレートを洗浄緩衝液で4回洗浄した。一連の希釈血清またはIgGをプレートに添加し、室温で1.5時間インキュベートした。その後、プレートを洗浄緩衝液で4回洗浄した。HRPコンジュゲート抗ラマIgG二次抗体をプレートに添加し、室温で1時間インキュベートした。洗浄後、TMB基質を各ウェルに添加し、10分間インキュベートした後、1MのHClで停止した。結合を定量するために、450nmでの吸光度を、MK3分光計を使用して各ウェルについて測定した。
2.VHファージディスプレイライブラリの構築
2.1 RNA抽出
全RNAを、製造業者のプロトコルに従ってTRIZOL(登録商標)試薬を使用して単離されたリンパ球(1.1.1)から抽出した。全RNAの量及び質をゲル電気泳動によって評定し、OD260/280で吸光度を測定することによって定量した。
2.2 RT−PCR及びVH増幅
全RNAを、製造業者のプロトコルに従ってPRIMESCRIPT(商標)第一鎖cDNA合成キットを使用して、オリゴ(dT)20プライマーでcDNAに逆転写した。6つの順方向特異的縮重プライマー及び2つの逆方向特異的縮重プライマーを、2つのBglI制限部位が導入されたVHフラグメントを増幅するように設計した。VHフラグメントを、以下に記載のGenScriptの標準操作手順に従って増幅した。
重鎖免疫グロブリンの可変領域(すなわち、VH)を、二段階ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を使用して増幅した。第1のPCRにおいて、100ngのcDNA鋳型をプライマーCALL001(配列番号374)及びCALL002(配列番号375)と混合した。第1のPCR反応由来のDNA産物をアガロースゲル電気泳動によって分析した。ゲル精製後、第1のPCRのDNA産物を第2のPCRにおける鋳型として使用した。第2のPCRを、プライマーBACK−1(配列番号376)、BACK−2(配列番号377)、及びPMCF(配列番号378)で行った。VH PCRフラグメントを含有する増幅された第2のPCR産物をゲル精製し、酵素消化し、その後、ファージミドプラスミドに挿入した。VH遺伝子フラグメントを有する組換えプラスミドをE.coli細胞に電気移動させて、ファージディスプレイVH免疫ライブラリを生成した。
PCR反応の手順は、94℃で7分間の初期変性ステップ、その後、94℃で1分間、55℃で1分間、及び72℃で1分間の30サイクル、その後、72℃で7分間の最終伸長ステップを有する。
2.3 ファージライブラリの構築
H PCR産物を、異なるプライマー対を使用して増幅によって得た。その後、PCR産物をBglIで消化し、ゲル精製した。ゲル精製されたフラグメントをGenScriptの社内ファージミドベクターに挿入した。パイロットライブラリを、ライゲーション及び変換条件を最適化するように構築した。最適化されたライゲーション及び変換条件を用いて、ファージミドライブラリを開発した。形質転換細胞のほんの一部を希釈し、100μg/mLのアンピシリンを補充した2×YTプレートに画線した。コロニーを計数して、ライブラリサイズを計算した。陽性クローンをランダムに選択し、配列決定して、ライブラリの質を評定した。形質転換細胞の残りを、100μg/mLのアンピシリン及び2%グルコースを補充したYTプレート上に画線した。コロニーのローンをプレートから擦り取った。ほんの一定分量の細胞をライブラリプラスミド単離に使用した。残りにグリセロールを補充し、ストックとして−80℃で保管した。
3.ファージディスプレイパニング
3.1バイオパニング
構築されたVHファージライブラリを、GenScriptによって開発された標準手順を使用して、それぞれ、組換えヒトBCMAタンパク質及びヒトBCMAを発現するCHO細胞(すなわち、Legend Biotecによって社内で調製されたCHO−BCMA細胞)に対してパニングした。ライブラリストックを対数期まで成長させ、その後、ライブラリをM13KO7ヘルパーファージでレスキューし、振盪機内で、25℃で一晩増幅した。その後、ファージをPEG/NaClで沈殿させ、PBS中に再懸濁し、−80℃で保管した。固相パニングの場合、マイクロプレートウェルにPBS中の組換えヒトBCMAタンパク質を4℃で一晩コーティングした。液体相パニングの場合、CHO−BCMA細胞をブロッキング緩衝液で、室温で1時間遮断した。コーティングまたはブロッキングステップ中、ファージ粒子をマイクロプレートウェル内でブロッキング緩衝液及びFc対照タンパク質とプレインキュベートした。プレインキュベートした後、ファージ粒子を、それぞれ、BCMAタンパク質またはCHO−BCMA溶液をコーティングしたウェルに添加し、1時間インキュベートした。インキュベートした後、結合していないファージ及び非特異的に結合したファージを、ウェルをすすぐことによって洗い流すか、
またはCHO−BCMA細胞をPBSTで6回洗浄し、PBSでさらに2回洗浄した。結合したファージ粒子を100mMのトリエチルアミン(TEA)によって溶出し、溶出液を1MのTris−HCl(pH7.4)によって中和した。その後、溶出液の半分を使用して、出力滴定のために指数関数的成長するE.coli TG1細胞(OD600=0.4〜0.6)を感染させた。
3.2 ファージELISA
ファージELISAを行って、標的抗原に特異的なクローンを特定した。個々の出力ファージクローンを、96ウェルプレートで成長させ、M13KO7ヘルパーファージによって一晩レスキューした。抗原タンパク質に結合するクローンを特定するために、96ウェルELISAマイクロタイタープレートに、それぞれ、コーティング緩衝液中の組換えヒトBCMAタンパク質及びFc対照タンパク質を4℃で一晩コーティングし、その後、プレートをブロッキング緩衝液でブロックした。ブロックした後、一晩細胞培養由来のおよそ50μL/ウェルのファージ上清をプレートに添加し、4℃で1.5時間インキュベートした。プレートを4回洗浄し、HRPコンジュゲート抗M13モノクローナル抗体をプレートに添加し、4℃で45分間インキュベートした。プレートを再度5回洗浄し、基質溶液をウェルに添加して発色させた。450nmでの吸光を各ウェルについて測定した。
CHO−BCMA細胞に結合するクローンを特定するために、CHO−BCMA細胞をブロッキング緩衝液で、室温で1時間ブロックした。ブロックした後、一晩細胞培養からのおよそ20μL/ウェルのファージ上清を細胞溶液に添加し、室温で1時間インキュベートした。細胞を4回洗浄した後、HRPコンジュゲート抗M13モノクローナル抗体を添加し、室温で30分間インキュベートした。細胞を5回洗浄し、その後、基質溶液を添加して発色させた。吸光を450nmで測定した。パニング後、ELISA陽性ファージクローンをランダムに選択し、プラスミド抽出キットを使用してDNAを出力ファージから調製した。プラスミドへの抗BCMA VHを配列決定した。
実施例2.例示的な一価BCMAキメラ抗原受容体の調製
N末端からC末端まで、CD8αヒンジドメイン、CD28膜貫通ドメイン、CD28細胞質ドメイン、CD137細胞質ドメイン、及びCD3ζ細胞質ドメインを含むCAR骨格ポリペプチドをコードする核酸配列を化学的に合成し、構成的hEF1αプロモーターの下流に、及びそれに操作可能に連結された事前修飾レンチウイルスベクターにクローニングした。結果として生じたCAR骨格ベクターを「PLLV−hEF1α−8281373」と命名した。ベクター内の多クローニング部位(MCS)は、VHフラグメントのN末端に融合されたCD8αシグナルペプチドをコードする核酸配列に操作可能に連結されたKozak配列(配列番号379)を含む核酸配列の、CAR骨格配列の上流にかつそれに操作可能に連結されたPLLV−hEF1α−8281373ベクターへの挿入を可能にした。
PLLV−hEF1α−8281373骨格を使用して単一VHドメインを有する単一特異性CARを構築するために、VHドメインをコードする核酸配列を、CD8αシグナルペプチドをコードする核酸配列の3’に操作可能に連結した。融合核酸配列を化学的に合成し、当該技術分野で既知の分子クローニング技法により、EcoRI(配列番号380:5’−GAATTC−3’)及びSpeI(配列番号381:5’−ACTAGT−3’)制限部位を介してPLLV−hEF1α−8281373 CAR骨格にクローニングした。表4は、例示的な単一特異性の一価抗BCMA CARを発現するように構築されたベクターを列記する。
単一特異性CAR構築物を設計する際に、第2のVHをコードするヌクレオチド等の
追加配列のさらなる挿入を容易にするために、HpaI(配列番号382:5’−GTTAAC−3’)、MluI(配列番号383:5’−ACGCGT−3’)、NsiI(配列番号384:5’−ATGCAT−3’)部位を含む制限部位を、CD8αシグナルペプチド核酸配列とVH核酸配列との間に含めた。
pCMV−ΔR−8.74及びpMD2.Gを含むレンチウイルスパッケージングプラスミド混合物(Addgene番号12259)を、ポリエーテルイミド(PEI)との事前最適化比率でVHフラグメントを有するベクターPLLV−hEF1α−8281373と事前混合し、その後、適切に混合し、室温で5分間インキュベートした。その後、トランスフェクション混合物をHEK293細胞に滴加し、穏やかに混合した。その後、細胞を37℃及び5%CO細胞インキュベーター内で一晩インキュベートした。4℃、500gで10分間遠心分離した後、上清を収集した。
ウイルス含有上清を、0.45μmのPESフィルターを通して濾過し、その後、レンチウイルス濃縮のために超遠心分離した。超遠心分離後、上清を慎重に処分し、ウイルスペレットを予冷DPBSで慎重にすすいだ。ウイルスを適切に一定分量に分割し、その直後に−80℃で保管した。ウイルス力価を、GenScriptによって開発されたHTRFキットに基づいてp24によって決定した。
PBMCの調製
白血球をアフェレーシスによって健常ドナーから収集し、細胞濃度をR10培地中5×10個の細胞/mLに調整した。その後、白血球を0.9%NaCl溶液と1:1(v/v)比で混合した。3mLのLymphoprep培地を15mLの遠心分離管に添加し、6mLの希釈リンパ球混合物をLymphoprep培地の上部に緩徐に層化した。リンパ球混合物を、制動なしで、20℃、800gで30分間遠心分離した。その後、リンパ球バフィーコートを200μLのピペットで収集した。収集した画分を0.9%NaClまたはR10で少なくとも6倍希釈し、溶液の密度を低減した。その後、収集した画分を、20℃、250gで10分間遠心分離した。上清を完全に吸引し、10mLのR10を細胞ペレットに添加して、細胞ペレットを再懸濁した。混合物を、20℃、250gで10分間さらに遠心分離した。上清を再度吸引した。100IU/mLのIL−2を有する2mLの37℃で予温したR10を細胞ペレットに添加し、細胞ペレットを緩やかに再懸濁した。細胞の数をトリパンブルー染色に従って決定し、このPBMC試料を後の実験に準備させた。
T細胞の精製
ヒトT細胞を、以下に記載の製造業者のプロトコルに従ってMiltenyi Pan
T細胞単離キット(カタログ番号130−096−535)を使用してPBMCから精製した。細胞の数を最初に決定し、細胞懸濁液を300gで10分間遠心分離した。その後、上清を完全に吸引し、細胞ペレットを40μL/10個の全細胞の緩衝液中に再懸濁した。10μL/10個の全細胞のPan T細胞ビオチン−抗体カクテルを添加し、完全に混合し、冷蔵庫(2〜8℃)内で約5分間インキュベートした。その後、30μL/10個の細胞の緩衝液を添加した。20μL/10個の細胞のPan T細胞マイクロビーズカクテルを添加した。細胞懸濁液混合物を十分に混合し、冷蔵庫(2〜8℃)内でさらに10分間インキュベートした。磁気分離には最小500μLが必要である。磁気分離のために、LSカラムを好適なMACS分離器の磁場に置いた。カラムを3mLの緩衝液ですすぐことによって調製した。その後、細胞懸濁液をカラムに塗布し、非標識細胞を含有する貫流液を収集し、これは、富化T細胞画分となった。カラムを3mLの緩衝液で洗浄し、通過した非標識細胞を収集することによって、さらなるT細胞を収集した。これらの非標識細胞は、この場合もやはり、富化T細胞となり、これらを先のステップからの貫流物と合わせた。その後、プールされた富化T細胞を遠心分離し、R10+10
0IU/mLのIL−2中に再懸濁した。
その後、調製されたT細胞を、抗CD3/CD28 MACSiBead粒子を1:2のビーズ:細胞比で添加した製造業者のプロトコルに従ってヒトT細胞活性化/増殖キット(Miltenyi番号130−091−441)で48〜96時間事前活性化した。
インビトロ細胞毒性アッセイ
事前活性化されたT細胞を、1200g、32℃で1.5時間遠心分離しながら、7μg/mLのポリブレンの存在下で、レンチウイルスストックで形質導入した。その後、形質導入された細胞を細胞培養インキュベーターに移して、好適な条件下で導入遺伝子を発現させた。
形質導入後3日目または7日目に、形質導入されたT細胞を収集し、20:1のエフェクター(CAR−T):標的細胞比で腫瘍細胞と20時間共インキュベートした。標的細胞は、ヒト多発性骨髄腫細胞株RPMI8226.Luc、ヒト細胞株K562.BCMA.Luc細胞(BCMAを組換え発現した)、K562.CD19.Luc細胞株(CD19を組換え発現した)、またはヒト膠芽腫細胞株U87MG.Luc細胞であった。細胞株の全てを、社内で操作された蛍ルシフェラーゼを発現させたものであった。腫瘍細胞へのCAR−Tの細胞毒性をアッセイするために、ONE−GLO(商標)発光ルシフェラーゼアッセイ試薬(Promega番号E6110)を製造業者のプロトコルに従って調製し、共培養細胞に添加して、ウェル内の残りのルシフェラーゼ活性を検出した。ルシフェラーゼが標的細胞でのみ発現するため、ウェル内の残りのルシフェラーゼ活性は、ウェル内の生存標的細胞の数に直接相関する。最大ルシフェラーゼ活性を、培養培地をエフェクター細胞の不在下で標的細胞に添加することによって得た。最小ルシフェラーゼ活性を、細胞毒性アッセイを開始した時点でTriton X−100を1%の最終濃度で添加することによって決定した。特異的細胞毒性を以下の式によって計算した:特異的細胞毒性%=100%*(1−(RLU試料−RLU最小)/(RLU最大−RLU最小))。
BCMA(CD269)を標的とする例示的な一価CARを、細胞毒性アッセイにおいて選択し、試験した。図1Aに示されるように、試験した一価BCMA CARの第1の基の間で、選択されたクローンは、多発性骨髄腫細胞株RPMI8226.Luc細胞に対して異なるレベルの細胞毒性を呈し、60%超の一価VHに基づくCAR−Tが、RPMI8226.Luc細胞に対して50%超の細胞毒性を示した。クローン269A37346、269A37348、269A37353、及び269A37355に基づくCAR−Tをさらなる試験のために選択した。具体的には、クローン269A37346、269A37348、267A37353、及び269A37355に基づくCAR−Tは、多発性骨髄腫細胞株RPMI8226.Luc細胞に対して強力な細胞毒性を呈し、非形質導入対照T細胞(UnT)と比較してCAR−T処置によるRPMI8226.Luc細胞死滅が20%超〜30%増加した。それにもかかわらず、かかる細胞毒性増加は、ヒト膠芽腫細胞株U87MG.Luc細胞では生じなかった(図1Bを参照されたい)。UnT対照と比較してこれらの一価VHに基づくCAR−T細胞によるU87MG.Lucに対するいずれの有意な細胞毒性影響も検出されなかった。上述の観察は、これらのクローンのうちのいくつかが標的特異的であり、BCMA陽性細胞で強力であり得ることを示した。
例示的な一価BCMA CARの第2の群を、インビトロ細胞毒性について評価した。GSS005(抗BMCA scFvを含むCAR)は、陽性対照として役割を果たした。GSI026(抗EGFRvIII scFvを含むCAR)は、陰性対照として役割を果たした。図2A〜2Bに示されるように、選択されたクローンは、多発性骨髄腫細胞
毒性RPMI8226.Luc、及びBCMAを過剰発現する安定な細胞株K562.BCMA.Lucに対して異なるレベルの細胞毒性を呈した。BCMA陰性細胞株K562.CD19.Luc(図2C)に対していかなるクローンも強力な細胞毒性を示さなかった。これらのクローンの間で、269B005S、269B028S、269B030S、269B054S、269B060S、269B069S、269B093S、269B094S、269B104S、269B109S、269B110S、及び269B129Sに基づくCAR−Tは、細胞毒性データに従って最も強力であった。
IFNガンマ放出
加えて、インビトロ共培養アッセイからの上清を収集して、CARによって誘導されるサイトカイン放出、例えば、インターフェロンガンマ(すなわち、IFNγ)放出を評価した。図3に示すように、選択された一価BCMA CARを発現するT細胞は、BCMAを発現する標的細胞K562.BCMA.Lucで共培養する際に、高レベルのIFNγを放出した。GSI026等の非特異的CAR−T、またはT細胞(UnT)は、共培養物中のIFNγの放出を誘導しなかった。サイトカイン放出データは、インビトロ細胞毒性データと一致する。
実施例3.例示的な多価BCMAキメラ抗原受容体の調製
多価VHに基づくCARを、ペプチドリンカーを介して互いに融合される複数のコピーのVH、またはCARシグナルドメイン骨格ベクターにペプチドリンカーを介して互いに融合される複数の異なるVHをコードする核酸配列をクローニングすることによって構築することができる。例示的な多価BCMA CAR構築物を、表5に示す。これらの構築物を、グリシン−セリンペプチドリンカーにより2〜3つの抗BCMA VHを融合し、続いて、この融合配列をKozak−CD8αシグナルペプチド核酸配列と組み合わせて直接合成し、EcoRI及びSpeI制限部位を介してPLLV−hEF1α−81373 CAR骨格にクローニングすることによって調製した。一価BCMA CAR構築物を、対照(例えば、GSI5011、GSI5019、及びGSI5020、表4)としての役割を果たすのと同じPLLV−hEF1α−81373 CAR骨格にもクローニングした。
CAR遺伝子を持つレンチウイルスベクターをパッケージングし、実施例2に記載のプロトコルで滴定した。実施例2に記載のプロトコルを使用して、ヒトPBMCを志願者の末梢血から調製し、MiltenyiヒトPan T細胞単離キットを使用して初代ヒトT細胞をさらに単離した。精製されたT細胞を事前活性化し、実施例2に記載のMiltenyi抗CD3/CD28マイクロビーズを使用して増殖させた。その後、事前活性化されたT細胞を、1200g、32℃で1.5時間の遠心分離により、7μg/mLのポリブレンの存在下で、レンチウイルスストックで形質導入した。その後、形質導入された細胞を細胞培養インキュベーターに移して、好適な条件下で導入遺伝子を発現させた。
インビトロ細胞毒性アッセイ
形質導入後3日目に、形質導入されたT細胞を収集し、腫瘍細胞と共インキュベートした。腫瘍細胞へのCAR−Tの細胞毒性をアッセイするために、ONE−GLO(商標)発光ルシフェラーゼアッセイ試薬を共培養細胞に添加し、各CAR−Tの特異的細胞毒性を実施例2に記載されるように測定した。
第1の実験において、T細胞を発現する一価BCMA CAR(GSI5011)、二価BCMA CAR(GSI5014)、及び三価BCMA CAR(GSI5015)を、RPMI8226.Luc細胞と20:1のエフェクター対標的比で20時間共培養した。3つのCAR構築物は全て、クローン269A37346の抗BCMA VHHドメインを含む。図4Aに示されるように、RPMI8226.Luc細胞の特異的溶解の
割合は、非形質導入対照T細胞(UnT)での0.05%±2.33%と比較して、GSI5011を発現するCAR−T細胞では63.25±2.64%であり、GSI5014を発現するCAR−T細胞では61.04±2.75%であり、GSI5015を発現するCAR−T細胞では59.57±2.64%であった。異なる抗原結合様式を有する試験したBCMA CARは、BCMA陽性細胞に対して強力な抗腫瘍活性を有した。
第2の実験において、2つの異なるBCMA結合部分269A37353及び269A37917を有する例示的な二価BCMA CAR(GSI5021−GSI5026)を試験した。各二価BCMA CARを発現する操作されたT細胞を、RPMI8226.Luc細胞と20:1のエフェクター対標的比で20時間共培養した。一価BCMA CAR、GSI5019及びGSI5020もまた、比較のために試験した。図4Bに示されるように、RPMI8226.Luc細胞の特異的溶解の割合は、非形質導入対照T細胞(UnT)での13.49%±1.75%と比較して、それぞれ、GSI5019を発現するCAR−T細胞では88.21±1.29%であり、GSI5020を発現するCAR−T細胞では93.84±1.13%であり、GSI5021を発現するCAR−T細胞では71.45±1.79%であり、GSI5022を発現するCAR−T細胞では99.80±0.45%であり、GSI5023を発現するCAR−T細胞では97.46±0.50%であり、GSI5024を発現するCAR−T細胞では81.29±1.27%であり、GSI5025を発現するCAR−T細胞では93.50±0.47%であり、GSI5026を発現するCAR−T細胞では87.83±0.23%であった。また、図4Cに示されるように、BCMA陰性細胞株U87MG.Lucの特異的溶解の割合は、非形質導入対照T細胞(UnT)での12.49%±3.79%と比較して、GSI5019を発現するCAR−T細胞では2.84±7.41%であり、GSI5020を発現するCAR−T細胞では15.50±2.24%であり、GSI5021を発現するCAR−T細胞では6.74±3.37%であり、GSI5022を発現するCAR−T細胞では8.03±2.36%であり、GSI5023を発現するCAR−T細胞では9.00±1.88%であり、GSI5024を発現するCAR−T細胞では17.03±2.27%であり、GSI5025を発現するCAR−T細胞では16.81±1.98%であり、GSI5026を発現するCAR−T細胞では−11.55±5.43%であった。データは、異なる抗原結合様式を有する二価CARが、BCMA陽性細胞に対して強力な抗腫瘍活性を有したが、BCMA陰性細胞に対しては強力な抗腫瘍活性を有しなかったことを示唆する。
第3の実験において、2つの異なるBCMA結合部分を有する例示的な二価BCMA CAR(すなわち、BCAR001〜BCAR008)を構築し、二価BCMA CARを発現する操作されたCAR−T細胞を、R/R MM患者ドナー#13から得られた初代T細胞から調製した。RPMI8226(ヒト多発性骨髄腫細胞株)、A549(ヒト肺癌細胞株)、U87−MG(ヒト膠芽腫細胞株)、及びRaji(ヒトバーキットリンパ腫細胞株)を含む、社内で開発された蛍ルシフェラーゼを発現する細胞株を、標的細胞として使用し、並んで形質導入したT細胞の各群(20:1または5:1のエフェクター:標的細胞比)と37℃/5% CO細胞インキュベーター内で20時間共培養した。共培養の完了時に、残存するルシフェラーゼ活性(相対発光量、RLU)を、各CAR−Tの細胞毒性を評価するために、ONE−GLO(商標)発光ルシフェラーゼアッセイキット(Promega)でアッセイした。図5A〜5Eに示されるように、二価BCMA
CAR−Tは、RPMI8226.Luc、K562.BCMA.Luc、及びRaji.Luc細胞に対して用量依存性細胞毒性を有したが、BCMA陰性A549.Luc及びU87−MG.Luc細胞に対してはほとんど細胞毒性を有しなかった。図5F中のデータでは、腫瘍細胞に対する二価BCMA CAR−T細胞の細胞毒性は、このCAR−T細胞がCD38/BCMAであったK562.C38.Luc細胞に対して細胞毒性を有しなかったため、BCMA特異的であることを示す。BCAR001〜BCAR
008のCAR−T細胞で処理したK562.BCMA.Lucのみが、残存するルシフェラーゼ活性(すなわち、生存細胞)を示した(100±3.95%のUnTと比較して、BCAR001〜BCAR008に対して、それぞれ、2.88±0.45%、12.84±1.67%、2.22±0.56%、1.77±0.14%、2.59±0.28%、6.58±1.19%、2.47±0.20%、6.61±1.47%、平均±標準誤差)。これらの結果は、K562.BCMA.Luc細胞に対する二価BCMA CAR−T細胞の強力な細胞毒性を示す。BCAR001〜BCAR008のCAR−T細胞は、UnTで処理した標的細胞と比較して、ルシフェラーゼ活性の有意な減少が検出されなかったため、K562.CD38.Luc細胞に対して有意な細胞毒性を有しなかった(100±6.58%のUnTと比較して、BCAR001〜BCAR008に対して、それぞれ、111.82±5.11%、111.72±3.43%、104.74±0.24%、95.04±2.70%、93.93±7.23%、97.72±1.86%、111.90±2.01%、108.33±4.05%、平均±標準誤差)。これらのデータは、二価BCMA CAR−Tの細胞毒性がBCMA依存性であることを示唆した。
IFNガンマ放出
加えて、インビトロ共培養アッセイからの上清を収集して、CARによって誘導されるサイトカイン放出、例えば、インターフェロンガンマ(すなわち、IFNγ)放出を評価した。図6A〜6Bに示されるように、共培養アッセイにおけるIFNγ放出は、CAR依存性及びBCMA特異的であり、これは、インビトロ細胞毒性データと一致する(表6)。
Figure 2021087455
組み込まれたCAR遺伝子のコピー数
各形質導入されたT細胞群のCAR遺伝子のコピー数を半定量PCR(q−PCR)アッセイによって決定した。簡潔には、CAR−Tの各群からのゲノムDNAをGentra Puregene細胞キット(Qiagen)で調製した。ゲノムDNAの濃度をNanodropによって決定し、10ngのゲノムDNA試料を、CAR特異的プライマー(順方向プライマー137P2F、配列番号398:5’−GTCCTTCTCCTGTCACTGGTTAT−3’、及び逆方向プライマー137P2R、配列番号399:5’−TCTTCTTCTTCTGGAAATCGGCA−3’)を使用してABI番号7300 q−PCR器具上でSYBR Green Realtime PCRマスタ
ーミックスプラス(Toyobo)を用いて標準化q−PCRアッセイのために処理した。各組み込まれたCAR遺伝子の相対コピー数を、標的配列を含有するプラスミドを使用して確立された標準曲線に基づいて計算した。
表7に示されるように、CARベクターの高いコピー数を、各CAR−T調製物のT細胞のゲノムに組み込んだ。
Figure 2021087455
実施例4.LCAR−B38Mにおける2つのVHドメインのエピトープマッピング及び差次的エピトープ結合
4つの抗BCMA VHドメインのエピトープをマッピングした。BCMAの異なるエピトープに特異的に結合する2つの異なる抗BCMA VHドメインを有する例示的な二価BCMA CARを構築した。LCAR−B38M CARと命名されたVH1及びVH2を含む二価/2つのエピトープCARは、表5に列挙される1つの多価BCMA CARである。
表面プラズモン共鳴(SPR)アッセイ
4つの例示的な抗BCMA VH配列の各々を、BCMA VH−hIgG1Fcの組換え発現を促進するために、ヒトIgG1 Fcフラグメント(hIgG1Fc)配列を含有するベクターにクローンした。組換えタンパク質を得、SPRアッセイについて精製した。
BCMAに対して各VH−hIgG1Fcの親和性を、BIACORE(登録商標)2000分析システム(GE Healthcare)を使用してSPRによって決定した。簡潔には、各VH−hIgG1Fcタンパク質を、4μg/mLのVH−hIgG1Fcを使用してCM5(複数可)センサチップに共有結合させた。組換えBCMA−Hisタンパク質(ACRO Biosystems、カタログ番号BCA−H522y)を、泳動緩衝液(10mM HEPES、150mM NaCl、3mM EDTA、0.05% Tween−20、pH7.4)中で連続的に希釈し、10μL/分の流量で注入し、続いて、解離した。会合及び解離速度定数は、BIACORE(登録商標)2000評価ソフトウェアバージョン3.0(Langmuir結合、ローカルフィット、1:1の結合モデル)を使用して決定した。4つのVH−hIgG1Fcの結合親和性を、表8に示す。
Figure 2021087455
標的細胞への組換えVH−Hisタンパク質の結合
組換え抗BCMA VH−Hisタンパク質を、N末端でヒトアルブミンシグナルペプチド配列(N’−MKWVTFISLLFLFSSAYS−C’、配列番号386)、及びC末端で6xHis−tag(N’−GSGHHHHHH−C’、配列番号387)に、抗BCMA VH配列を融合することによって構築した。コドンは、哺乳動物宿主細胞中の最適発現のためにさらに最適化された。その後、得られたヌクレオチド配列を、プラスミド、pTT5−LAB001(VH1に対して)、pTT5−LAB002(VH2に対して)、及びpTT5−LAB003(VH1xVH2に対して)を提供するために、5’−XbaI及び3’−HindIII制限部位を介して哺乳動物発現ベクターpTT5にクローンした。
組換えBCMA VHタンパク質を得るために、HEK293T細胞を、プラスミドで一過性にトランスフェクトした。簡潔には、5×10個のHEK293T細胞を、トランスフェクションから1日前に、10cmの細胞培養皿に播種した。翌日、細胞を、製造業者の手引き書に従ってLIPOFECTAMINE(商標)2000試薬(Thermofisher Scientific、カタログ番号11668−019)を使用して各プラスミドでトランスフェクトした。トランスフェクションから4日後に、上清を収穫し、抗体の発現レベルを、HRP抗His Tag(Biolegend、カタログ番号652504)を使用してELSIAによって検出した。LAB001、LAB002、及びLAB003の発現レベルは、それぞれ、109.31ng/mL、152.48ng/mL、及び396.62ng/mLであった。
LAB001、LAB002、及びLAB003抗BCMA VH−Hisタンパク質の結合親和性は、細胞に基づくアッセイを使用して決定した。簡潔には、連続的に希釈した抗BCMA VH−Hisタンパク質を、1×10個の標的細胞(K562.BCMA.LucまたはK562.CD38.Luc細胞のいずれか、これらは、BCMAまたはCD39を、それぞれ、安定して発現する社内で開発された細胞株であった)で、4℃で2時間インキュベートした。その後、細胞を、300gで10分間遠心分離し、上清を廃棄した。細胞ペレットを、DPBSで再懸濁した。細胞ペレットを洗浄し、遠心分離し、上清をさらに2回廃棄した。その後、細胞ペレットを、45分間緩衝液を含有する検出抗体(THE(商標)Hisタグ抗体[FITC]、GenScriptカタログ番号A01620)で、4℃で2時間再懸濁した。その後、細胞を、300gで10分間遠心分離し、上清を廃棄した。細胞ペレットを洗浄し、遠心分離し、上清をさらに2回廃棄した。LAB001、LAB002、及びLAB003の、K562.BCMA.LucまたはK562.CD38.Luc細胞のいずれかへの結合親和性は、ATTUNE(商標)Nxtフローサイトメーターを使用して決定した。データを、「One site−Specific binding with Hill slope」を使用してGraphPad PRISM(商標)バージョン6.0によって適合した。
図7A〜7Cに示されるように、LAB001、LAB002、及びLAB003は、
用量依存性様式でK562.BCMA.Luc細胞に特異的に結合する。結合親和性は、それぞれ、0.079nM、0.035nM、及び0.0047nMである。抗体のいずれも、BCMA陰性細胞株K562.CD38.Lucに対して有意な結合を示さなかった。さらに、LAB003(VH1xVH2)は、LAB001(VH1)またはLAB002(VH2)のいずれかよりも有意に高い結合親和性(0.0047nM)を示した。
エピトープ結合
BCMA(NP_001183、UniProt#Q02223)は、184のアミノ酸長の膜貫通タンパク質である。ヒトBCMAは、細胞外ドメイン(ECD、アミノ残基番号1〜54)、膜貫通ドメイン(TM、アミノ残基番号55〜77)、及び細胞質ドメイン(CD、アミノ残基番号78〜184)から成る。加えて、配列分析は、BCMAがそのN末端で認識できるシグナルペプチドを有しないことを示唆している(Laabi Y et al.(1992) EMBO J 11:3897−3904、Laabi
Y et al.(1994) Nucleic Acids Res 22:1147−1154、Gras M P(1995) Int Immunol 7:1093−1106、Hong−Bing Shu and Holly Johnson(2000):Proc.Natl.Acad.Sci.USA,10.1073)。
オンラインのデータベースUniProt(worldwide web.uniprot.org/uniprot/Q02223)によっても示されるため、3ジスルフィド結合(Cys−Cys)は、8〜21、24〜37、及び28〜41の位置である、BCMAのECDに位置する(表9)。N末端からC末端までのBCMA ECDの二次構造は、ベータ鎖(aa12〜15)、ターン(aa16〜19)、ベータ鎖(aa20〜23)、ヘリックス(aa24〜27)、ベータ鎖(aa30〜32)、ヘリックス(aa35〜37)、ターン(aa38〜40)、及びターン(aa42〜44)から成る。BCMA ECDの構造を、図8Aに示し、これは、PDBデータベースworldwide web.ebi.ac.uk/pdbe/entry/pdb/2kn1/からの構造から複製される。
Figure 2021087455
BCMAエピトープペプチド(269EP001〜269EP007)を、図8B及び表10に示されるように設計し、N末端で化学的に合成し、ビオチン化した。VH1−hIgG1FcまたはVH2−hIgG1Fcの結合親和性は、ELISAを使用して決定した。簡潔には、上に記載されるペプチドは、1μMでMAXISORP(商標)ELISAプレート上に、4℃で一晩コーティングした。翌日、プレートを、PBST(0.5% TWEEN−20を添加した)で2回洗浄し、続いて、室温で1時間0.5% BSAでプレートブロッキングした。その後、プレートを、PBSTで2回洗浄し、続いて、10nMで連続的に希釈したVH1−hIgG1FcまたはVH2−hIgG1Fcを添加し、4℃で2時間インキュベートした。その後、プレートを、冷却PBSTで3回洗浄し、その後、ヤギ抗ラマ−HRP(1:1500、Bethyl Lab#A160)を各ウェルに添加し、室温で1時間さらにインキュベートした。その後、プレートを、PBSTで4回洗浄し、TMB基質を各ウェルに添加し、室温で10〜30分間インキュベートした。その後、プレートを、450nmで吸光度を有するTECAN(登録商標)10Mマイクロプレートリーダー上で読み取った。
Figure 2021087455
図9Aに示されるように、VH1は、269EP005ペプチド、続いて、269EP004ペプチドへの最も強い結合を示した。しかしながら、269EP003及び269EP006へのVH1の結合は、269EP005及び269EP004と比較して比較的弱かった。VH1は、269EP005ペプチド(すなわち、BCMA ECDのアミノ酸24〜36)に位置するエピトープに結合する傾向があり、これは、ヘリックス(aa24〜27)、ベータ鎖(aa30〜32)、及びヘリックス(aa35〜37)の二次構造を含有する。
図9Bに示されるように、VH2は、269EP002ペプチド、続いて、269EP003ペプチドへの最も強い結合を示した。しかしながら、269EP001及び269EP004へのVH1の結合は、269EP002及び269EP003と比較して比較的弱かった。BCMA ECDの第1のベータ鎖(aa12〜15)及びベータ鎖(aa20〜23)は、269EP002(aa8〜21)及び269EP003(aa11〜23)によって覆われた配列に主に位置付けられており、VH2は、初めの2つのベータ鎖に位置付けられるエピトープに結合する傾向がある。
競合結合アッセイ
H1及びVH2の差次的エピトープ結合は、細胞に基づく競合結合アッセイによってさらに実証された。ヒトBCMAを過剰発現する安定したCHO細胞株(「CHO−BCMA」)を、アッセイで使用した。
簡潔には、0.5×10個のCHO−BCMA細胞を、12.5ng/mLのLAB001(C末端で6xHisタグを含有する)で、二重に4℃で0.5時間事前インキュベートした。その後、連続的に希釈したVH2−hIgG1Fc組換え抗体をプレートの各ウェルに添加し、4℃でさらに1時間さらにインキュベートした。インキュベーション後、細胞を500μLのDPBSで洗浄し、300gで10分間遠心分離した。細胞ペレットを、抗Hisタグ−FITCを含有するDPBS(1:200、GenScriptカタログ番号A16020)で再懸濁し、その後、細胞を500μLのDPBSで洗浄し、300gで10分間遠心分離した。細胞ペレットを、DPBSで再懸濁し、その後、ATTUNE(商標)Nxtフローサイトメーター上でFACS分析に供した。アッセイ対照として、連続的に希釈したVH2−hIgG1Fcを、上記のような並列の同一の手順に従って、LAB001が存在することなくCHO−BCMA細胞で直接インキュベートした。ヤギ抗ヒトIgG(Fc特異的)−FITC抗体(Sigma Aldrichカタログ番号F9512)を、VH2−hIgG1FcのCHO−BCMA細胞への
結合を検出するために使用した。図10に示されるように、VH2−hIgG1Fc単独は、用量依存性様式でCHO−BCMAに結合する。しかしながら、VH2−hIgG1Fcは、CHO−BCMA細胞に結合するVH1−Hisと競合することができず、BCMA上のVH1及びVH2の異なる結合部位を示す。
実施例5.腫瘍異種移植片マウスモデルにおけるLCAR−B38M CAR−Tのインビボ有効性
LCAR−B38M CAR−T細胞のインビボ抗腫瘍有効性は、多発性骨髄腫腫瘍異種移植片を有するNCGマウスモデル(NOD−Prkdcem26Cd52Il2rgem26Cd22/NjuCrl)において評価された。LCAR−B38M CARは、異なるBCMAエピトープを標的とする2つの抗BCMA VHドメインを有する二価BCMA CARである。
NCGマウスモデルは、NOD/NjuマウスにおけるPrkdc及びIl2rg遺伝子座の逐次的CRISPR/Cas9編集によって作製され、但しマウスがNOD/Njuに対してコアイソジェニックであるものとする。NOD/Njuマウスは、外来造血幹細胞の移植を可能にするSirpa(SIRP α)遺伝子において変異を保因する。Prkdcノックアウトは、適切なT細胞及びB細胞形成を欠くSCID様表現型を生成する。Il2rg遺伝子のノックアウトは、SCID様表現型をさらに悪化させるが、さらに、NK細胞産生の減少をもたらす。したがって、NCGマウスは、SCID及びヌードマウスを含む一般に使用される免疫不全マウス株よりもさらに免疫不全である「三重免疫不全」マウス株である。
Prkdc及びIl2rgは、T細胞、B細胞、NK細胞、それほどではないが、樹状細胞の変異及び形成に影響を与える遺伝子のSCID(重症複合免疫不全)ファミリーの一部である。Prkdcは、DNA依存性タンパク質キナーゼ酵素の触媒サブユニットをコードし、これは、T及びB細胞を成熟させる際に抗体多様性を広めるのに必要なプロセスであるV(D)Jの組換えに必要である。Il2rgは、IL−2及び複数のIL受容体(IL−4、IL−7、IL−9、IL−15、及びIL−21)をコードし、これらは、未成熟リンパ球(例えば、T、B、及びNK細胞)及び他の白血球の成熟のためにサイトカイン媒介性シグナル伝達を誘導するために必要とされる。
LCAR−B38M CAR−T細胞を、インビトロでRPMI8226.Luc細胞の死滅に最も高い有効性を有するCAR−Tを産出するT細胞源をスクリーニングするために、様々なドナーからのT細胞を用いて調製した(図11)。図11の結果に基づいて、LCAR−B38M CAR−T細胞を、インビボ動物アッセイにおいて選択されたドナーのT細胞を用いて調製した。図12Aは、LCAR−B38M CAR−T細胞のこのバッチの用量依存性のインビトロ細胞毒性を示す。腫瘍異種移植片を作製するために、NCGマウスに、RPMI8226.Luc細胞を静脈内注入した。14日後、腫瘍移植マウスを、LCAR−B38M CAR−T細胞または非形質導入T細胞で処理し、続いて、インビボ生物発光画像法(BLI)を行った。
図12B〜12Cに示されるように、LCAR−B38M CAR−T細胞は、NCGマウスにおける移植RPMI8226.Luc腫瘍細胞を根絶し、マウスを救出するのに効果的であったが、対照(UnT)群のほとんどのマウスは、4週間以内に死亡した。興味深いことには、剖検中、多くの転移性腫瘍は、UnT群の全てのマウスの肝臓に観察された。この観察は、腫瘍サンプルからのエクスビボルシフェラーゼ活性を評価することによってさらに実証された(図12D〜12E)。対照的に、LCAR−B38M CAR−Tで処理されたマウスは、肝臓中に転移性腫瘍を有しなかった。要約すると、インビボ研究は、NCGマウスからの多発性骨髄腫細胞(例えば、RPMI8226.Luc)の
根絶におけるLCAR−B38M CAR−T細胞の効力を示す。
実施例6.非ヒト霊長類におけるLCAR−B38M CAR−T処置の安全性研究
LCAR−B38M CAR−T細胞のインビボ安全性は、カニクイザルモデルにおいて評価された。PBMCは、2匹のサル(NHP#120117及びNHP#120545、共に雄、約4kg)の末梢血サンプルから得られ、密度勾配遠心分離法によって調製された。カニクイザルT細胞は、製造業者の手引き書に従って非ヒト霊長類Pan T細胞単離キット(Miltenyi#130−091−993)を使用してPBMCから単離された。調製したサルT細胞は、非ヒト霊長類T細胞活性化/増殖キット(Miltenyi#130−092−919)、ヒトIL−2、及び自己血清で3日間事前活性化した。その後、事前活性化したT細胞を、LCAR−B38Mレンチウイルスで形質導入し、続いて、さらに10日間増殖した。
自己CAR−T細胞の注入の3日前に、サルを、静脈内注入により22mg/体重kgの用量のシクロホスファミドで前処置した。自己注入の当日、細胞を、穏やかに旋回させることによって37℃の水浴中で解凍させ、5分以内に動物の静脈内に直ちに注入した。サルNHP#120117を、5×10個/kgのCAR−T細胞で注入し、サルNHP#120545を、4×10個/kgのCAR−T細胞で注入した。
サルは、T細胞投与後に、発熱、呼吸困難、食欲の変化、下痢、及び体重減少についてモニタリングされた。投与前及び投与後の血液サンプルを得、CBC、血清化学、及びサイトカインレベルについて検査した。図13A〜13Fに示されるように、CAR−T細胞は、サルにおいて有意な毒性を有しなかった。
実施例7.難治性/再発性多発性骨髄腫に罹患しているヒト患者におけるLCAR−B38M CAR−Tの臨床研究
単一アーム非盲検多施設第1/2相臨床研究は、難治性または再発性多発性骨髄腫(「r/r MM」)と診断されたヒト患者を処置する際に、LCAR−B38M CAR−T細胞の安全性及び有効性を決定するために行われた。臨床試験の情報は、識別子NCT03090659を有するworldwide web.clinicaltrials.govにおいて見出され得る。
研究では、難治性/再発性多発性骨髄腫患者は、患者の自己T細胞由来のLCAR−B38M CAR−T細胞で処置された。0.5×10〜5×10個の細胞/体重kgの総用量は、一週間の期間(例えば、0、2、及び6日目)にわたって3回の分割用量(それぞれ、20%、30%、及び50%)で静脈内注入により各患者に投与された。研究の1〜30日目の間、患者は、有害事象についてモニタリングされ、患者サンプルは、実験評価のために得られた。全ての患者は、CAR−T投与後少なくとも36カ月間経過観察される。
研究の主要転帰は、LCAR−B38M CAR−T細胞の注入後の1〜30日以内に、有害事象共通用語規準(CTCAE)v4.0によって評価されるように、処置関連有害事象の発生を測定する。二次転帰は、例えば、LCAR−B38M CAR−T細胞の投与前及び投与後の患者の血清中の異常免疫グロブリンレベル、及びその骨髄の多発性骨髄腫細胞の数を決定することによってCAR−Tによって誘導される抗骨髄腫反応を評価する。研究の有効性目的には、病理学的完全奏功率、3年の疾患生存率、3年の無進行生存率が含まれる。
18〜75歳の患者は、(1)患者が更新されたIMWG基準によって定義されるような、事前に確定診断された活性の多発性骨髄腫を有する場合、(2)明らかなBCMA発
現が、フローサイトメトリーまたは免疫組織化学によって骨髄または形質細胞腫のいずれかから悪性形質細胞において検出される場合、及び(3)患者が、ボルテゾミブを含む少なくとも3つの事前治療レジメンを受けたことがあると定義される、またはそうでなければ臨床医によって特定されるような、難治性多発性骨髄腫に罹患している場合、あるいは、患者が腫瘍学:多発性骨髄腫におけるNCCN臨床実践ガイドライン(2016 V2)によって定義されるような、再発性多発性骨髄腫を有する場合、この研究の対象となる。
以下の患者:(1)出産の可能性がある、または妊娠中もしくは授乳中の女性、(2)あらゆる活性及び制御されていない感染:B型肝炎、C型肝炎、HIV、または他の致死的ウイルス及び細菌感染を有する患者、(3)5mg/日超のプレドニゾンの全身性コルチコステロイドステロイド療法を受けたことがある、または同等用量の別のコルチコステロイドが、必要とされる白血球除去輸血前もしくはコンディショニング化学療法レジメン開始前のいずれかの2週間以内に許容されない患者、(4)あらゆる制御されない併発疾患または重篤な制御されない医学的障害を有する患者、(5)CNS転移または症候性CNS関与(脳神経障害または腫瘤病変及び脊髄圧迫を含む)を有する患者、(6)登録から6カ月以内に、同種幹細胞移植の経歴を有する、活性の急性もしくは慢性移植片対宿主病(GVHD)を有する、またはGVHDに対して免疫抑制剤を必要とする患者、または(7)乾癬等の活性の自己免疫皮膚疾患、もしくはリウマチ性関節炎等の他の活性の自己免疫疾患を有する患者は、この研究から除外される。
2017年5月の中間分析では、再発性または治療抵抗性(難治性)多発性骨髄腫を有する35人の患者が、LCAR−B38M CAR−T治療を受けた。治療有効性の第1の兆候は、CAR−T細胞の初期注入から早ければ10日後に見られた。全体的に、客観的奏功率は、100%であり、35人の患者のうち33人(94%)が、CAR T細胞を受けた2カ月以内に、骨髄腫の明らかな臨床的寛解(完全奏功または非常に良好な部分奏功)を有した。
分析時までに、19人の患者を、国際骨髄腫作業グループ(IMWG)コンセンサス基準によって完全有効性評価のための4カ月を超える事前設定時間、追跡した。1人の患者は、有効性において、部分奏功に達し、4人の患者は、非常に良好な部分奏功基準(VgPR)を達成した。ストリンジェントな完全奏効(「sCR」)基準に達した患者は、再発しなかった。1年を超えて(12〜14カ月)追跡した5人の患者は、sCR状態を維持し、最小の残留疾患がなかった(すなわち、骨髄中にがん細胞が検出できなかった)。
サイトカイン放出症候群(「CRS」)は、CAR T細胞療法の一般的及び潜在的に危険な副作用である。35人の患者のうちの85%が、一過性CRSのみ経験した。CRS症状には、発熱、低血圧、呼吸困難、及び複数の臓器の問題が含まれる。患者の大部分において、CRS症状は軽度であり、管理可能であった。2人の患者のみが、重篤なCRS(グレード3)を経験したが、トシリズマブ(CAR−T細胞療法の臨床試験においてCRSを管理するために一般的に使用される炎症を抑える処置)を受けて回復した。CAR T細胞療法からの、神経学的副作用、別の一般的かつ重篤な合併症を経験した患者はいなかった。
中間臨床試験データは、難治性/再発性多発性骨髄腫に罹患しているヒト患者におけるLCAR−B38M CAR−T治療の強力な有効性及び安全性を示す。
パイロット臨床研究において、3人の患者は、一価BCMA CARを発現する自己T細胞、すなわち、LCAR−B27S CAR−T細胞で処置された。LCAR−B27S CAR(表4に列挙される1つの一価BCMA CAR)は、BCMA分子の単一の
エピトープを認識する単一のVHフラグメントを含有する抗原結合ドメインを有する。このVHドメインは、2つのエピトープ/二価LCAR−B38M CARの第2のVHドメインと同一である。
インビトロ細胞毒性アッセイにおいて、LCAR−B27S CAR−T細胞は、それぞれ、3人の多発性骨髄腫患者から調製され、LCAR−B38M CAR−T細胞はまた、対照として同じ3人の多発性骨髄腫患者からそれぞれ調製された。CAR−T細胞は両方とも、RPMI8226.Luc細胞で20:1及び5:1のエフェクター対標的比(E/T比)で20時間共培養した。図14Aに示されるように、CAR−T細胞を、患者AからのT細胞を使用して調製した。残存する生存細胞の割合は、RPMI8226.Luc細胞中の残留するルシフェラーゼ活性によって評価されるように、E/T比が20:1であるとき、LCAR−B38Mについては3.97±0.75%、及びLCAR−B27Sについては3.17±0.57%であった。しかしながら、E/T比が5:1であったとき、LCAR−B38Mは、LCAR−B27Sと比較して、RPMI8226.Luc細胞の死滅に高い効力を示した(LCAR−B38Mについては33.37±0.75%の残存する生存細胞、LCAR−B27Sについては68.60±1.60%)。図14Bに示されるように、CAR−T細胞を、患者BからのT細胞を使用して調製した。残存する生存細胞の割合は、RPMI8226.Luc細胞中の残留するルシフェラーゼ活性によって評価されるように、E/T比が20:1であるとき、LCAR−B38Mについては4.45±0.57%、及びLCAR−B27Sについては9.32±1.16%であった。しかしながら、E/T比が5:1であったとき、LCAR−B38Mは、LCAR−B27Sと比較して、この場合もやはり、RPMI8226.Luc細胞の死滅に高い効力を示した(LCAR−B38Mについては40.92±3.00%の残存する生存細胞、LCAR−B27Sについては84.05±1.56%)。図14Cに示されるように、CAR−T細胞を、患者CからのT細胞を使用して調製した。残存する生存細胞の割合は、RPMI8226.Luc細胞中の残留するルシフェラーゼ活性によって評価されるように、E/T比が20:1であるとき、LCAR−B38Mについては2.56±0.88%、及びLCAR−B27Sについては10.12±1.83%であった。しかしながら、E/T比が5:1であったとき、LCAR−B38Mは、LCAR−B27Sと比較して、この場合もやはり、RPMI8226.Luc細胞の死滅に高い効力を示した(LCAR−B38Mについては29.99±3.13%の残存する生存細胞、LCAR−B27Sについては100.93±9.25%)。
パイロット臨床研究において、3人の患者は、LCAR−B27S CAR−T細胞で処置され、前処置、注入、及び追跡プロトコルは全て、二価LCAR−B38M CARを用いた臨床研究のものと同一であった。CAR−T細胞で修飾された自己LCAR−B27Sの3×10個の細胞/体重kg(患者A)、5×10個の細胞/体重kg(患者B)、及び7×10個の細胞/体重kg(患者C)の総用量は、それぞれ、一週間の期間(例えば、0、2、及び6日目)にわたって3回の分割用量(それぞれ、20%、30%、及び50%)で静脈内注入により各患者に投与された。研究の1〜30日目の間、患者は、有害事象についてモニタリングされ、患者サンプルは、実験評価のために得られた。全ての患者は、CAR−T投与後少なくとも36カ月間追跡した。
3人の患者のうち2人は、非常に良好な部分奏功(VgPR)に達したが、両方の患者は、CAR−T注入から6カ月以内に再発した。第3の患者は、いかなる臨床反応も示さなかった。LCAR−B27Sを用いたパイロット研究は、その結果として、さらなる患者が登録されることなく、IRBによって終了した。
このパイロット一価BCMA CAR研究(LCAR−B27S)及び二価BCMA CAR研究(LCAR−B38M CAR−T)からの客観的奏功率、完全寛解率及び再
発率を、以下の表11に示す。二価BCMA CAR−Tは、一価BCMA CAR−Tと比較して、優れた臨床有効性を有した。
Figure 2021087455

Claims (33)

  1. ポリペプチドを含むキメラ抗原受容体(CAR)であって、
    (a)第1のBCMA結合部分及び第2のBCMA結合部分を含む細胞外抗原結合ドメインであって、前記第1のBCMA結合部分が、第1の抗BCMA単一ドメイン抗体(sdAb)であり、前記第2のBCMA結合部分が、第2の抗BCMA sdAbである、細胞外抗原結合ドメインと、
    (b)膜貫通ドメインと、
    (c)細胞内シグナル伝達ドメインと、を含み、
    前記第1の抗BCMA sdAb及び前記第2の抗BCMA sdAbが、それぞれ独立して、
    (1)配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (2)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号78のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (3)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号79のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (4)配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号80のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (5)配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (6)配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (7)配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (8)配列番号8のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (9)配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (10)配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (11)配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (12)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (13)配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (14)配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (15)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (16)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (17)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (18)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (19)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (20)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号58のアミノ酸配列
    を含むCDR2、及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (21)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号97のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (22)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号98のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (23)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号99のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (24)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号100のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (25)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号101のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (26)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号102のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (27)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号103のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (28)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号104のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (29)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号105のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (30)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号106のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (31)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号107のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (32)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号108のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (33)配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (34)配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (35)配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号73のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (36)配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号74のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (37)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号75のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR3、および
    (38)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号76のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR3
    から成る群から選択されるいずれかを含むsdAbである、前記キメラ抗原受容体(CAR)。
  2. (i)前記第1の抗BCMA sdAbが、配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列を含むCDR3を含み、および
    (ii)前記第2の抗BCMA sdAbが、配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、請求項1に記載のCAR。
  3. 前記第1の抗BCMA sdAbが、配列番号115のアミノ酸配列を含み、および
    前記第2の抗BCMA sdAbが、配列番号115のアミノ酸配列を含む、請求項2に記載のCAR。
  4. (i)前記第1の抗BCMA sdAbが、配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3を含み、および
    (ii)前記第2の抗BCMA sdAbが、配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、請求項1に記載のCAR。
  5. 前記第1の抗BCMA sdAbが、配列番号124のアミノ酸配列を含み、および
    前記第2の抗BCMA sdAbが、配列番号125のアミノ酸配列を含む、請求項4に記載のCAR。
  6. (i)前記第1の抗BCMA sdAbが、配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3を含み、および
    (ii)前記第2の抗BCMA sdAbが、配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3を含む、請求項1に記載のCAR。
  7. 前記第1の抗BCMA sdAbが、配列番号121のアミノ酸配列を含み、および
    前記第2の抗BCMA sdAbが、配列番号125のアミノ酸配列を含む、請求項6に記載のCAR。
  8. 前記第1の抗BCMA sdAbが、前記第2の抗BCMA sdAbのN末端に位置している、請求項1〜7のいずれか1項に記載のCAR。
  9. 前記第1の抗BCMA sdAbが、前記第2の抗BCMA sdAbのC末端に位置している、請求項1〜7のいずれか1項に記載のCAR。
  10. 以下:
    (1)配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号77のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (2)配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号78のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (3)配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号79のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (4)配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号80のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (5)配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号81のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (6)配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号82のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (7)配列番号7のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号83のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (8)配列番号8のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号84のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (9)配列番号9のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号85のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (10)配列番号10のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号86のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (11)配列番号11のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号87のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (12)配列番号12のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号88のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (13)配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号89のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (14)配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号90のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (15)配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号91のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (16)配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号92のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (17)配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号93のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (18)配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号94のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (19)配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号95のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (20)配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号58のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号96のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (21)配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号59のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号97のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (22)配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号60のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号98のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (23)配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号61のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号99のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (24)配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号62のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号100のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (25)配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号63のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号101のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (26)配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号64のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号102のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (27)配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号65のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号103のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (28)配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号66のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号104のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (29)配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号67のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号105のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (30)配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号68のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号106のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (31)配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号69のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号107のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (32)配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号70のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号108のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (33)配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号71のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号109のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (34)配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号72のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号110のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (35)配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号73のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号111のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (36)配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号74のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号112のアミノ酸配列を含むCDR3、
    (37)配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号75のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号113のアミノ酸配列を含むCDR3、または
    (38)配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR1、配列番号76のアミノ酸配列を含むCDR2、及び配列番号114のアミノ酸配列を含むCDR3、のうちの任意の1つを含む、抗BCMA単一ドメイン抗体(sdAb)。
  11. 前記抗BCMA sdAbが、配列番号115〜152から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項10に記載の抗BCMA sdAb。
  12. 前記抗BCMA sdAbが、ラクダ科抗体である、または前記抗BCMA sdAbが、キメラ抗体である、請求項10に記載の抗BCMA sdAb。
  13. 前記抗BCMA sdAbが、VHフラグメントである、請求項10に記載の抗BCMA sdAb。
  14. 前記膜貫通ドメインが、CD8α、CD4、CD28、CD137、CD80、CD86、CD152、及びPD1から成る群から選択される分子に由来する、請求項1〜9のいずれか1項に記載のCAR。
  15. 前記膜貫通ドメインが、CD8αまたはCD28に由来する、請求項14に記載のCAR。
  16. 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、免疫エフェクター細胞の一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む、請求項1〜9、14及び15のいずれか1項に記載のCAR。
  17. 前記一次細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ζに由来する、請求項16に記載のCAR。
  18. 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、共刺激シグナル伝達ドメインを含む、請求項1〜9及び14〜17のいずれか1項に記載のCAR。
  19. 前記共刺激シグナル伝達ドメインが、CD27、CD28、CD137、OX40、CD30、CD40、CD3、LFA−1、ICOS、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、CD83のリガンド、及びこれらの組み合わせから成る群から選択される共刺激分子に由来する、請求項18に記載のCAR。
  20. 前記共刺激シグナル伝達ドメインが、CD28の細胞質ドメイン及び/またはCD137の細胞質ドメインを含む、請求項19に記載のCAR。
  21. 前記細胞外抗原結合ドメインのC末端と前記膜貫通ドメインのN末端との間に位置するヒンジドメインをさらに含む、請求項1〜9及び14〜20のいずれか1項に記載のCAR。
  22. 前記ヒンジドメインが、CD8αに由来する、請求項21に記載のCAR。
  23. 前記ポリペプチドのN末端に位置するシグナルペプチドをさらに含む、請求項1〜9及び14〜20のいずれか1項に記載のCAR。
  24. 前記シグナルペプチドが、CD8αに由来する、請求項23に記載のCAR。
  25. 配列番号216〜256、306〜315、317〜321、323〜327、329〜333、及び335から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む、キメラ抗原受容体。
  26. 請求項1〜9及び14〜25のいずれか1項に記載のCARをコードする核酸配列を含む、単離された核酸。
  27. 請求項26に記載の単離された核酸を含む、ベクター。
  28. 請求項1〜9及び14〜25のいずれか1項に記載のCAR、請求項26に記載の単離された核酸、または請求項27に記載のベクターを含む、操作された免疫エフェクター細胞。
  29. 前記免疫エフェクター細胞が、T細胞である、請求項28に記載の操作された免疫エフェクター細胞。
  30. 請求項28もしくは29に記載の操作された免疫エフェクター細胞、または請求項10〜13のいずれか1項に記載の抗BCMA sdAb、及び薬学的に許容される担体を含む、薬学的組成物。
  31. 個体におけるがんを治療するための医薬品の製造における、請求項28もしくは29に記載の操作された免疫エフェクター細胞、または請求項10〜13のいずれか1項に記載の抗BCMA sdAbの使用であって、前記がんが、BCMAを発現している細胞を含むがんである、使用。
  32. 前記がんが、多発性骨髄腫である、請求項31に記載の使用。
  33. 前記がんが、難治性または再発性多発性骨髄腫である、請求項32に記載の使用。
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