JP7237926B2 - 抗cd19/cd20免疫療法によりがんを処置するための組成物および方法 - Google Patents

抗cd19/cd20免疫療法によりがんを処置するための組成物および方法 Download PDF

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Description

関連出願の相互参照
本出願は、米国特許法第119条(e)の下で、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、2017年7月31日出願の米国仮特許出願第62/539,483号に対する優先権の利益を主張する。
配列表
本出願は、ASCII形式で電子的に提出された、その全体にわたって参照により本明細書に組み込まれる配列表を含む。2018年7月31日に作成された前記ASCIIコピーはSequence_Listing.txtと名付けられ、64キロバイトのサイズである。
本開示の分野
本出願は、がんの分野、特に、CD19/CD20抗原結合性ドメイン、およびこのようなCD19/CD20抗原結合性ドメインを含むキメラ抗原受容体(CAR)、およびその使用方法に関する。
背景
がんは、ヒトの健康に対する最も致命的な脅威の1つである。米国だけで、がんは毎年ほぼ130万人の新たな患者が罹患し、心血管疾患に次いで2番目に多い死因であり、死亡数の約4分の1を占めている。固形腫瘍が、これらの死亡のほとんどの原因である。ある特定のがんの医学的処置においては顕著な進歩があったものの、全てのがんについての5年全生存率は過去20年間で約10%しか改善しなかった。がんまたは悪性腫瘍は、制御されずに迅速に転移および成長するため、処置は非常に困難である。
CD19は、85~95kDaの膜貫通細胞表面糖タンパク質受容体である。CD19は、免疫グロブリン(Ig)スーパーファミリーのタンパク質のメンバーであり、2つの細胞外Ig様ドメイン、膜貫通および細胞内シグナル伝達ドメインを含有する(Tedder TF、Isaacs,CM、1989年、J Immunol 143巻:712~171頁)。CD19は、B細胞受容体シグナル伝達を修飾し、抗原についてのB細胞受容体の誘発閾値を低下させ(Carter,RHおよびFearon,DT、1992年、Science、256巻:105~107頁)、CD81およびCD21と協調して、この本質的なB細胞シグナル伝達複合体を調節する(Bradbury,LE、Kansas GS、Levy S、Evans RL、Tedder TF、1992年、J Immunol、149巻:2841~50頁)。B細胞発生中、CD19は、抗原受容体とは独立にプロB、プレ-プレB細胞、プレB、初期B細胞段階においてシグナル伝達することができ、Srcファミリータンパク質チロシンキナーゼと会合し、チロシンリン酸化され、細胞内カルシウム動員およびイノシトールリン脂質シグナル伝達の両方を誘導する(Uckun FM、Burkhardt AL、Jarvis L、Jun X、Stealy B、Dibirdik I、Myers DE、Tuel-Ahlgren L、Bolen JB、1983年、J Biol Chem 268巻:21172~84頁)。B細胞悪性腫瘍の処置に関連する重要な点は、CD19が、IgH遺伝子再配置の段階における初期B細胞前駆体、成熟B細胞に限定され、しかし造血幹細胞または成熟血漿細胞上では発現されないように厳しく調節された様式で正常B細胞上で発現されことである(Anderson,KC、Bates,MP、Slaughenhout BL、Pinkus GS、Schlossman SF、Nadler LM、1984年、Blood 63巻:1424~1433頁)。
CD20(LEU-16、MS4A1とも呼ばれる)は、プロB相から成熟B細胞相までB細胞の表面上に発現され、B細胞発達および分化において役割を果たす膜貫通4Aファミリータンパク質である。CD20抗原は、様々な血液腫瘍上でも発現され、様々なモノクローナル抗CD20抗体は、CD20陽性悪性腫瘍の処置に何年にもわたり適用されている(Lim、Sean H.ら「Anti-CD20 Monoclonal Antibodies:Historical and Future Perspectives.」Haematologica 95.1巻(2010年):135~143頁.PMC.Web.2017年7月31日で概略される)。抗CD20モノクローナル抗体リツキシマブ(Rituxan(登録商標))は、B細胞リンパ腫、例えば、濾胞性リンパ腫(FL)およびびまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、ならびに慢性リンパ性白血病(CLL)の処置において広く使用されている(Rituxan処方情報)。
B系統白血病およびリンパ腫のための伝統的な処置手法は、化学療法、放射線療法、および幹細胞移植に関連し得る(ワールドワイドウェブmayclinic.orgを参照)。これらの処置に関連する高い毒性、および再発、二次的悪性腫瘍またはGVHDなどの合併症リスクが、より良好な治療用代替物の探求を促す。成人および小児(プレB-ALL)両方のB細胞悪性腫瘍においてCD19が発現することから、抗体およびキメラ抗原受容体(CAR)-T細胞ベースの療法の両方のためにこの標的を利用することとなった(Kochenderfer JN、Wilson WH、Janik JE、Dudley ME、Stetler-Stevenson M、Feldman SA、Maric I、Raffeld M、Nathan DA、Lanier BJ、Morgan RA、Rosenberg SA、2010年、Blood 116巻:4099~102頁;Lee DW、Kochenderfer JN、Stetler-Stevenson M、Cui YK、Delbrook C、Feldman SA、Orentas R、Sabatino M、Shah NN、Steinberg SM、Stroncek D、Tschernia N、Yuan C、Zhang H、Zhang L、Rosenberg SA、Wayne AS、Mackall CL、2015年、Lancet 385巻:517~28頁)。さらに、リンパ腫(DLBCL、FL)および白血病(CLL)におけるCD20抗原の存在のために、CD20抗原は、効率的な腫瘍排除のためおよび腫瘍抗原エスケープの予防のための魅力的なさらなる標的である。
B系統白血病のためのケアの現在の標準は、高用量の化学療法または高線量の放射線による寛解導入処置からなる場合があり、その後地固めが続き、必要に応じて幹細胞移植およびさらなる化学療法の過程を特徴とし得る(ワールドワイドウェブcancer.govを参照)。これらの処置に関連する高い毒性、および再発、二次的悪性腫瘍またはGVHDなどの合併症リスクが、より良好な治療用代替物の探求を促す。成人および小児(プレB-ALL)両方のB細胞悪性腫瘍におけるCD19の発現から、抗体およびキメラ抗原受容体(CAR)-T細胞ベースの療法の両方のためにこの標的を利用することとなった(Kochenderfer JN、Wilson WH、Janik JE、Dudley ME、Stetler-Stevenson M、Feldman SA、Maric I、Raffeld M、Nathan DA、Lanier BJ、Morgan RA、Rosenberg SA、2010年、Blood 116巻:4099~102頁;Lee DW、Kochenderfer JN、Stetler-Stevenson M、Cui YK、Delbrook C、Feldman SA、Orentas R、Sabatino M、Shah NN、Steinberg SM、Stroncek D、Tschernia N、Yuan C、Zhang H、Zhang L、Rosenberg SA、Wayne AS、Mackall CL、2015年、Lancet 385巻:517~28頁)。
抗CD19または抗CD20結合性モチーフをT細胞結合性モチーフに連結する二重特異性抗体を含む、B細胞白血病およびリンパ腫を処置するためのいくつかの新規の手法が開発されている(即ち、フィラデルフィア染色体陰性再発性または難治性B細胞前駆体急性リンパ芽球性白血病(ALL)の処置に適応となるブリナツモマブ、Blincyto(登録商標))。今日までに、CAR構築物において使用されているCD19またはCD20についての結合性部分の多くは、マウス抗体に由来するドメインを利用する。NovartisおよびKite Pharmaceuticalsにより開発されたものを含む、いくつかのこれらの製品は、現在、承認を検討されている。2017年4月に、Novartisは、CTL019(チサゲンレクロイセル)が、2以上の前療法に失敗した難治性または再発性(r/r)DLBCL(びまん性大細胞型B細胞リンパ腫)を有する成人患者の処置のためのFDA画期的治療薬指定を受け、この指定をr/r B細胞急性リンパ芽球性白血病(ALL)の処置に追加したことを発表した。これらの適応症は、それぞれ、フェーズII JULIET研究(NCT02445248)およびELIANA研究(NCT02435849)に基づいた。JULIET試験は、3カ月で45%の奏効率(ORR)を示し、37%の完全奏効(CR)および8%の部分奏効(PR)を有した。ELIANA研究において、製品を注入された患者の82%が、CRまたは回復不完全を伴うCRを達成し、6カ月での無再発生存率は60%であった。Kite PharmaceuticalsからのCAR-T製品(KTE-C19、アキシカブタゲンシロロイセル)は、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、形質転換型濾胞性リンパ腫(TFL)、および縦隔原発B細胞性リンパ腫(PMBCL)のための画期的治療薬指定を承認された。r/r ALLにおけるKTE-C19のKite ZUMA-3フェーズII試験において、73%のCRが報告された(2カ月以上で)。CAR-T療法の抗体が利用されるかどうかにかかわらず、これらの療法により救済されない顕著な数の患者がまだ存在しており、治療的手法の改善についてかなりの余地がある。
キメラ抗原受容体(CAR)は、3つの本質的な単位を含むハイブリッド分子である:(1)細胞外抗原結合性モチーフ、(2)連結/膜貫通モチーフ、および(3)細胞内T細胞シグナル伝達モチーフ(Long AH、Haso WM、Orentas RJ.Lessons learned from a highly-active CD2-specific chimeric antigen receptor.Oncoimmunology.2013年;2巻(4号):e23621頁)。CARの抗原結合性モチーフは一般に、免疫グロブリン(Ig)分子の最小の結合性ドメインである単鎖断片可変(ScFv)を基にして作られる。代替の抗原結合性モチーフとして、例えば、受容体リガンド(即ち、IL-13は、腫瘍が発現するIL-13受容体に結合するように操作されている)、インタクトな免疫受容体、ライブラリー由来ペプチド、および自然免疫系エフェクター分子(例えば、NKG2D)も操作されている。CAR発現のための代替の細胞標的(例えば、NKまたはガンマ-デルタT細胞)も開発中である(Brown CEら Clin Cancer Res.2012年;18巻(8号):2199~209頁;Lehner Mら PLoS One.2012年;7巻(2号):e31210頁)。CARベクターを形質導入するための最も活性なT細胞集団を定義すること、最適な培養および増殖の技術を決定すること、ならびにCARタンパク質構造自体の分子的詳細を定義することに関して、いまだにかなりのかける労力を要している。
CARの連結モチーフは、IgGの定常ドメインなどの比較的安定な構造ドメインとするか、または伸長された可撓性リンカーとなるように設計することができる。IgGの定常ドメインに由来するものなどの構造モチーフを使用して、ScFv結合性ドメインをT細胞原形質膜表面から離れて延在させることができる。これは、結合性ドメインが腫瘍細胞表面膜に特に近い一部の腫瘍標的にとって重要であり得る(例えば、ジシアロガングリオシドGD2にとって;Orentasら、未公開の観察)。今日まで、CARにおいて使用されるシグナル伝達モチーフは常にCD3-ζ鎖を含んでいるが、それは、このコアモチーフが、T細胞活性化のための重要なシグナルであるからである。最初に報告された第2世代CARは、CD28シグナル伝達ドメインおよびCD28膜貫通配列を特徴としていた。このモチーフは、CD137(4-1BB)シグナル伝達モチーフを含有する第3世代CARでも同様に使用された(Zhao Yら J Immunol.2009年;183巻(9号):5563~74頁)。新たなテクノロジーの進歩に伴い、抗CD3および抗CD28抗体に連結されたビーズによるT細胞の活性化、ならびにCD28由来のカノニカルな「シグナル2」の存在がCAR自体によってコードされる必要はもはやなくなった。ビーズ活性化を使用して、第3世代ベクターは、in vitroアッセイにおいて第2世代ベクターよりも優れているわけではないことが見出され、また、白血病のマウスモデルにおいては第2世代ベクターを超える明らかな利益は得られなかった(Haso W、Lee DW、Shah NN、Stetler-Stevenson M、Yuan CM、Pastan IH、Dimitrov DS、Morgan RA、FitzGerald DJ、Barrett DM、Wayne AS、Mackall CL、Orentas RJ.Anti-CD22-chimeric antigen receptors targeting B cell precursor acute lymphoblastic leukemia,Blood.2013年;121巻(7号):1165~74頁;Kochenderfer JNら Blood.2012年;119巻(12号):2709~20頁)。これは、第2世代CD28/CD3-ζ(Lee DWら American Society of Hematology Annual Meeting.New Orleans、LA;12月7~10日、2013年)およびCD137/CD3-ζシグナル伝達形式(Porter DLら N Engl J Med.2011年;365巻(8号):725~33頁)のCD19特異的CARの臨床的成功によって裏付けられている。CD137に加えて、OX40などの他の腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバーも、CARが形質導入されたT細胞において重要な持続シグナルを提供することができる(Yvon Eら Clin Cancer Res.2009年;15巻(18号):5852~60頁)。CAR T細胞集団が培養された培養条件、例えば、サイトカインIL-2、IL-7、および/またはIL-15を含めることも等しく重要である(Kaiser ADら Cancer Gene Ther.2015年;22巻(2号):72~78頁)。
がんに対するCAR療法のより広範で有効な適応における現在の課題は、説得力のある標的の不足に関する。細胞表面抗原への結合因子を創出することは、現在容易に達成可能であるが、正常組織を見逃しながら腫瘍に対して特異的な細胞表面抗原を発見することは、依然として厄介な課題である。CAR発現T細胞により高い標的細胞特異性を与えるための1つの潜在的な方法は、コンビナトリアルCARアプローチを使用することである。1つのシステムでは、CD3-ζとCD28シグナル単位が、同じ細胞において発現される2つの異なるCAR構築物間で分割される;別のシステムでは、2つのCARが、同じT細胞において発現されるが、一方はより低い親和性を有し、したがって第2のCARの完全な活性のために代替的CARが最初に結合されることを必要とする(Lanitis Eら Cancer Immunol Res.2013年;1巻(1号):43~53頁;Kloss CCら Nat Biotechnol.2013年;31巻(1号):71~5頁)。免疫療法剤としての単一のScFvベースのCARの生成のための第2の課題は、腫瘍細胞の不均一性である。少なくとも1つのグループは、標的抗原陰性集団の成長を回避することを期待して、エフェクター細胞集団が複数の抗原(HER2、IL-13Ra、EphA2)を同時に標的化する、神経膠芽腫のためのCAR戦略を開発している(Hegde Mら Mol Ther.2013年;21巻(11号):2087~101頁)。
T細胞ベースの免疫療法は、合成生物学における新たな領域になっている;複数のプロモーターおよび遺伝子産物は、これらの高度に強力な細胞を腫瘍微小環境に導くことが想定され、ここで、T細胞は、負の調節シグナルを免れることができ、かつ有効な腫瘍死滅を媒介できる。誘導性カスパーゼ9構築物の化学物質ベースの二量体化薬、例えばAP1903との薬物誘導性二量体化を介した望ましくないT細胞の排除は、T細胞集団を制御できる強力なスイッチが薬理学的に開始され得る1つの方法を実証している(Di Stasi Aら N Engl J Med.2011年;365巻(18号):1673~83頁)。デコイ受容体の発現によるトランスフォーミング成長因子-βの負の調節効果に対して免疫性であるエフェクターT細胞集団の創出は、エフェクターT細胞が最適な抗腫瘍活性のために操作され得る程度をさらに実証している(Foster AEら J Immunother.2008年;31巻(5号):500~5頁)。したがって、CARは、内因性T細胞受容体と類似した様式でT細胞活性化を誘発できるようであるが、今日までのこのテクノロジーの臨床適用に対する主要な障害は、CAR+T細胞の限定的なin vivo増殖、注入後の細胞の迅速な消失、および期待外れの臨床活性である。これは一部には、使用されたCAR配列の一部のマウス起源のためであり得る。
ブリナツモマブ(二重特異性抗CD19および抗CD3抗体)の使用は、この療法を投与された重症患者についてすばらしい結果を示した。それにもかかわらず、長期寛解率は40%未満であり、最高でもレスポンダーの50%しか造血幹細胞移植(HSCT)まで救済することができない(Goreら、2014年、NCT01471782およびVon Stackelbergら、2014年、NCT01471782を参照、Benjamin,JE、Stein AS、2016年、Therapeutic Advances in Hematology 7巻:142~156頁に要約されている)。二重特異性抗体またはCAR-T療法のいずれかを投与された患者が長期応答を維持するためにHSCTを続いて受ける必要は、まだ活発に議論されている。CD19 CAR-T試験について高応答が報告されており、一部は90%を超えるものさえあるが、試験が「治療意図」試験として改められた場合、数値は70%近くであり得る(Davis KL、Mackall CL、2016年、Blood Advances 1巻:265~268頁)。報告されたCAR19処置12カ月後における最も良好な結果は、ペンシルバニア大学においてT細胞製品を投与してもらうことができた患者において55%のRFSおよび79%のOSを示す(Maude SL、Teachey DT、Rheingold SR、Shaw PA、Aplenc R、Barrett DM、Barker CS、Callahan C、Frey NV、Farzana N、Lacey SF、Zheng A、Levine B、Melenhorst JJ、Motley L、Prter DL、June CH、Grupp SA、2016年、J Clin Oncol 34巻、15号補遺(2016年5月)3011~3011頁)。
したがって、上述の欠点なしに特異的かつ有効な抗腫瘍効果を示し得る手法を使用する、B-ALLならびに他のCD19および/またはCD20発現B細胞悪性腫瘍の処置のための新規の組成物および方法を発見する、当該分野における緊急かつ長年にわたる要求が存在する。
本発明は、CAR組成物、ならびにがんならびに他の疾患および/または状態を処置するために使用され得る治療的方法を提供することによって、これらの要求に対処する。特に、本明細書に開示および記載される本発明は、CD19および/またはCD20発現の調節不全と関連する疾患、障害または状態の処置に使用可能なCARを提供し、ここでCARは、形質導入T細胞において高い表面発現を示し、CD19発現細胞の高度の細胞溶解を示し、形質導入T細胞がin vivoでの増殖および持続を実証するタンデムCD19/CD20抗原結合性ドメインを含む。
概要
アミノ酸配列においてCD19標的化部分がCD20標的化部分の前または後のいずれかに位置する新規のタンデムCD19およびCD20標的化抗体またはその抗原結合性ドメイン(本明細書で以下「CD19/CD20」)、およびこのようなCD19および/またはCD20抗原結合性ドメインを含むキメラ抗原受容体(タンデムCAR)、および受容体を発現する宿主細胞(例えばT細胞)、および受容体をコードする核酸分子が本明細書で提供される。CARは、形質導入T細胞での高い表面発現、高度の細胞溶解ならびに形質導入T細胞のin vivoでの増殖および持続を示す。例えば対象におけるがんを処置するための、開示されるCAR、宿主細胞、および核酸分子を使用する方法も提供される。
一態様において、N末端からC末端へ、少なくとも1つのCD19/CD20抗原結合性ドメイン、少なくとも1つの膜貫通ドメイン、および少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含むタンデムCD19/CD20キメラ抗原受容体(CAR)をコードする、単離された核酸分子が提供され、タンデムCD19/CD20 CARは、配列番号1および3からなる群から選択される核酸配列を含む。
一態様において、N末端からC末端へ、少なくとも1つのCD19/CD20抗原結合性ドメイン、少なくとも1つの膜貫通ドメイン、および少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含むタンデムCD19/CD20キメラ抗原受容体(CAR)をコードする、単離された核酸分子が提供され、配列番号1および3からなる群から選択される核酸配列によってコードされるタンデムCD19/CD20 CARは、配列番号2および4からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むタンデムCD19/CD20 CARをコードする。
一実施形態では、コードされる細胞外CD19/CD20抗原結合性ドメインが、CD19/CD20に結合する抗体の少なくとも1つの単鎖可変断片を含む、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
別の実施形態では、コードされる細胞外CD19/CD20抗原結合性ドメインが、CD19/CD20に結合する抗体の少なくとも1つの重鎖可変領域を含む、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
さらに別の実施形態では、コードされるCAR細胞外CD19/CD20抗原結合性ドメインが、CD19/CD20に結合する少なくとも1つのリポカリンベースの抗原結合性抗原(アンチカリン)をさらに含む、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
一実施形態では、コードされる細胞外CD19/CD20抗原結合性ドメインが、リンカードメインによって膜貫通ドメインに接続される、単離された核酸分子が提供される。
別の実施形態では、コードされるCD19/CD20細胞外抗原結合性ドメインに、リーダーまたはシグナルペプチドをコードする配列が先行する、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
さらに別の実施形態では、配列番号1および3にそれぞれ含まれるCD19/CD20ヌクレオチド配列を含むヌクレオチド配列によりコードされる少なくとも1つのCD19/CD20抗原結合性ドメインを含むCARをコードする、単離された核酸分子が提供され、CARは、CD22、ROR1、メソセリン、CD33、CD38、CD123(IL3RA)、CD138、BCMA(CD269)、GPC2、GPC3、FGFR4、c-Met、PSMA、糖脂質F77、EGFRvIII、GD-2、TSLPR、NY-ESO-1 TCR、MAGE A3 TCR、またはそれらの任意の組合せを含むがこれらに限定されない抗原を標的化する細胞外抗原結合性ドメインをさらにコードする。
ある特定の実施形態では、さらにコードされる細胞外抗原結合性ドメインが、抗CD22 ScFv抗原結合性ドメイン、抗ROR1 ScFv抗原結合性ドメイン、抗メソセリンScFv抗原結合性ドメイン、抗CD33 ScFv抗原結合性ドメイン、抗CD38 ScFv抗原結合性ドメイン、抗CD123(IL3RA)ScFv抗原結合性ドメイン、抗CD138 ScFv抗原結合性ドメイン、抗BCMA(CD269)ScFv抗原結合性ドメイン、抗GPC2 ScFv抗原結合性ドメイン、抗GPC3 ScFv抗原結合性ドメイン、抗FGFR4 ScFv抗原結合性ドメイン、抗TSLPR ScFv抗原結合性ドメイン、抗c-Met ScFv抗原結合性ドメイン、抗PMSA ScFv抗原結合性ドメイン、抗糖脂質F77 ScFv抗原結合性ドメイン、抗EGFRvIII ScFv抗原結合性ドメイン、抗GD-2 ScFv抗原結合性ドメイン、抗NY-ESO-1 TCR ScFv抗原結合性ドメイン、抗MAGE A3 TCR ScFv抗原結合性ドメイン、またはそれに対して85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列、あるいはそれらの任意の組合せを含む、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
一態様では、本明細書で提供されるCARはリンカーまたはスペーサードメインをさらに含む。
一実施形態では、細胞外CD19/CD20抗原結合性ドメイン、細胞内シグナル伝達ドメイン、またはその両方が、リンカーまたはスペーサードメインによって膜貫通ドメインに接続される、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
一実施形態では、コードされるリンカードメインが、CD8またはCD28の細胞外ドメインに由来し、膜貫通ドメインに連結される、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
別の実施形態では、コードされるCARが、T細胞受容体のアルファ、ベータもしくはゼータ鎖、CD28、CD3イプシロン、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD83、CD86、CD134、CD137、およびCD154、またはそれらの組合せからなる群から選択されるタンパク質の膜貫通ドメインを含む膜貫通ドメインをさらに含む、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
さらに別の実施形態では、コードされる細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ゼータ細胞内ドメインをさらに含む、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
一実施形態では、コードされる細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ゼータ細胞内ドメインに対してC末端側に配置される、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
別の実施形態では、コードされる少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインが、共刺激ドメイン、一次シグナル伝達ドメイン、またはそれらの組合せを含む、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
さらなる実施形態では、コードされる少なくとも1つの共刺激ドメインが、OX40、CD70、CD27、CD28、CD5、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、DAP10、DAP12および4-1BB(CD137)の機能的シグナル伝達ドメイン、またはそれらの組合せを含む、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
一実施形態では、リーダー配列またはシグナルペプチドをさらに含み、リーダーまたはシグナルペプチドのヌクレオチド配列が配列番号11のヌクレオチド配列を含む、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
さらに別の実施形態では、コードされるリーダー配列が配列番号12のアミノ酸配列を含む、CARをコードする単離された核酸分子が提供される。
一態様では、N末端からC末端へ、少なくとも1つのCD19/CD20抗原結合性ドメイン、少なくとも1つの膜貫通ドメイン、および少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含むキメラ抗原受容体(CAR)が本明細書で提供される。
一実施形態では、細胞外CD19/CD20抗原結合性ドメインが、抗原に結合する抗体の少なくとも1つの単鎖可変断片、または抗原に結合する抗体の少なくとも1つの重鎖可変領域、またはそれらの組合せを含む、CARが提供される。
別の実施形態において、少なくとも1つの膜貫通ドメインが、T細胞受容体のアルファ、ベータもしくはゼータ鎖、CD28、CD3イプシロン、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154、TNFRSF19、またはそれらの組合せからなる群から選択されるタンパク質の膜貫通ドメインを含む、CARが提供される。
一部の実施形態において、CARが、CD22、ROR1、メソセリン、CD33、CD38、CD123(IL3RA)、CD138、BCMA(CD269)、GPC2、GPC3、FGFR4、TSLPR、c-Met、PSMA、糖脂質F77、EGFRvIII、GD-2、TSLPR、NY-ESO-1 TCR、MAGE A3 TCR、またはそれに対して85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらの任意の組合せを含む細胞外抗原結合性ドメインをさらにコードする、CARが提供される。
一実施形態では、細胞外抗原結合性ドメインが、抗CD22 ScFv抗原結合性ドメイン、抗ROR1 ScFv抗原結合性ドメイン、抗メソセリン ScFv抗原結合性ドメイン、抗CD33 ScFv抗原結合性ドメイン、抗CD38 ScFv抗原結合性ドメイン、抗CD123(IL3RA)ScFv抗原結合性ドメイン、抗CD138 ScFv抗原結合性ドメイン、抗BCMA(CD269)ScFv抗原結合性ドメイン、抗GPC2 ScFv抗原結合性ドメイン、抗GPC3 ScFv抗原結合性ドメイン、抗FGFR4 ScFv抗原結合性ドメイン、抗TSLPR ScFv抗原結合性ドメイン、抗c-Met ScFv抗原結合性ドメイン、抗PMSA ScFv抗原結合性ドメイン、抗糖脂質F77 ScFv抗原結合性ドメイン、抗EGFRvIII ScFv抗原結合性ドメイン、抗GD-2 ScFv抗原結合性ドメイン、抗NY-ESO-1 TCR ScFv抗原結合性ドメイン、抗MAGE A3 TCR ScFv抗原結合性ドメイン、またはそれに対して85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列、またはそれらの任意の組合せを含む、CARが提供される。
別の実施形態において、少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインが共刺激ドメインおよび一次シグナル伝達ドメインを含むCARが提供される。
さらに別の実施形態では、少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインが、OX40、CD70、CD27、CD28、CD5、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、DAP10、DAP12、および4-1BB(CD137)、またはそれらの組合せからなる群から選択されるタンパク質の機能的シグナル伝達ドメインを含む共刺激ドメインを含む、CARが提供される。
一実施形態では、CARをコードする核酸配列は配列番号1(リーダー-CD19 VL-WhitlowリンカーCD19 VH(GGGGS)-5 CD20 VH(GGGGS)-3 CD20 VL CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z(構築物CAR1920)のヌクレオチド配列(図10A))の核酸配列を含む。一実施形態では、核酸配列は配列番号2 リーダー-CD19 VL-WhitlowリンカーCD19 VH(GGGGS)-5 CD20 VH(GGGGS)-3 CD20 VL CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z(構築物CAR1920)((図10A))のアミノ酸配列を含むCARをコードする。
別の実施形態では、CARをコードする核酸配列は配列番号3(リーダー-CD20 VH(GGGGS)3-CD20 VL-(GGGGS)5-CD19 VL-Whitlowリンカー-CD19 VH CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z(構築物2019)のヌクレオチド配列(図10B))の核酸配列を含む。一実施形態では、核酸配列は配列番号4(リーダー-CD20 VH(GGGGS)-CD20 VL-(GGGGS)-CD19 VL-Whitlowリンカー-CD19 VH CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z CARアミノ酸配列(図10B))のアミノ酸配列を含むCARをコードする。
一態様では、本明細書で開示されるCARは、診断、がん患者の無増悪生存期間などの処置転帰のモニタリングおよび/もしくは予測における使用のため、またはかかる処置の進行をモニタリングするために、検出可能なマーカーを発現または含有するように改変される。
一実施形態では、開示されたCARをコードする核酸分子は、ウイルスベクターなどのベクター中に含有され得る。ベクターは、DNAベクター、RNAベクター、プラスミドベクター、コスミドベクター、ヘルペスウイルスベクター、麻疹ウイルスベクター、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、もしくはレトロウイルスベクター、またはそれらの組合せである。
ある特定の実施形態では、ベクターは、誘導性プロモーター、組織特異的プロモーター、構成的プロモーター、自殺プロモーターまたはそれらの任意の組合せであるプロモーターをさらに含む。
さらに別の実施形態では、CARを発現するベクターは、自殺スイッチによって、CAR T細胞の発現を制御するため、またはCAR-T細胞を排除するために、1または複数の作動可能なエレメントを含むようにさらに改変され得る。自殺スイッチには、例えば、アポトーシス誘導性シグナル伝達カスケード、または細胞死を誘導する薬物が含まれ得る。好ましい実施形態では、CARを発現するベクターは、チミジンキナーゼ(TK)またはシトシンデアミナーゼ(CD)などの酵素を発現するようにさらに改変され得る。
別の態様では、CARをコードする核酸分子を含む宿主細胞もまた提供される。一部の実施形態では、宿主細胞は、T細胞、例えば、対象から得られた初代T細胞である。一実施形態では、宿主細胞はCD8T細胞である。
さらに別の態様では、抗腫瘍有効量のヒトT細胞集団を含む医薬組成物であって、T細胞が配列番号2および4のアミノ酸配列を含むキメラ抗原受容体(CAR)をコードする核酸配列を含み、CARが、CD19/CD20抗原結合性ドメインを含む少なくとも1つの細胞外抗原結合性ドメイン、少なくとも1つのリンカードメイン、少なくとも1つの膜貫通ドメイン、および少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含み、T細胞ががんを有するヒトのT細胞である、医薬組成物が提供される。がんは、とりわけ血液学的がん、例えば、白血病(例えば、慢性リンパ性白血病(CLL)、急性リンパ性白血病(ALL)もしくは慢性骨髄性白血病(CML))、リンパ腫(例えば、マントル細胞リンパ腫、非ホジキンリンパ腫またはホジキンリンパ腫)または多発性骨髄腫、あるいはそれらの組合せを含む。
一実施形態において、CARの少なくとも1つの膜貫通ドメインが、T細胞受容体のアルファ、ベータもしくはゼータ鎖、CD28、CD3イプシロン、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、メソセリン、CD33、CD37、CD64、CD80、CD83、CD86、CD134、CD137、およびCD154、TNFRSF19、またはそれらの組合せからなる群から選択されるタンパク質の膜貫通ドメインを含む、医薬組成物が提供される。
別の実施形態では、ヒトのがんは、口腔および咽頭がん(舌、口、咽頭、頭頸部)、消化器系がん(食道、胃、小腸、結腸、直腸、肛門、肝臓、肝内胆管、胆嚢、膵臓)、呼吸器系がん(喉頭、肺および気管支)、骨および関節のがん、軟組織がん、皮膚がん(黒色腫、基底細胞癌および扁平上皮癌)、小児腫瘍(神経芽細胞腫、横紋筋肉腫、骨肉腫、ユーイング肉腫)、中枢神経系の腫瘍(脳腫瘍、星状細胞腫、神経膠芽腫、神経膠腫)、ならびに乳房、生殖系(子宮頸部、子宮体、卵巣、外陰部、腟、前立腺、精巣、陰茎、子宮内膜)、泌尿器系(膀胱、腎臓および腎盂、尿管)、眼および眼窩、内分泌系(甲状腺)ならびに脳および他の神経系のがん、またはそれらの任意の組合せを含む成人癌を含む、医薬組成物が提供される。
さらに別の実施形態では、がんを有するヒトのヒトT細胞の集団の抗腫瘍有効量を含む医薬組成物であって、がんが、1または複数の化学療法剤に対して非応答性の難治性がんである、医薬組成物が提供される。がんは、造血がん、骨髄異形成症候群、膵がん、頭頸部がん、皮膚腫瘍、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)における微小残存病変(MRD)、CLL(慢性リンパ性白血病)、CML(慢性骨髄性白血病)、非ホジキンリンパ腫(NHL)を含む成人B細胞悪性疾患、小児B細胞悪性疾患(B細胞系譜ALL(急性リンパ性白血病)を含む)、多発性骨髄腫、肺がん、乳房がん、卵巣がん、前立腺がん、結腸がん、黒色腫もしくは他の血液学的がんおよび固形腫瘍、またはそれらの任意の組合せを含む。
別の態様では、CAR含有T細胞(以下「CAR T細胞」)を作製する方法が提供される。この方法は、CD19/CD20に特異的に結合する開示されるCARをコードするベクターまたは核酸分子をT細胞に形質導入し、それによって、CAR T細胞を作製することを含む。
さらに別の態様では、RNA操作された細胞の集団を生成する方法であって、開示されるCARをコードする核酸分子のin vitro転写されたRNAまたは合成RNAを対象の細胞中に導入し、CAR細胞を生成することを含む方法が提供される。
一実施形態において、CD19発現と関連する疾患、障害または状態は、造血がん、骨髄異形成症候群、膵がん、頭頸部がん、皮膚腫瘍、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)における微小残存病変(MRD)、CLL(慢性リンパ性白血病)、CML(慢性骨髄性白血病)、非ホジキンリンパ腫(NHL)を含む成人B細胞悪性疾患、小児B細胞悪性疾患(B細胞系譜ALL(急性リンパ性白血病)を含む)、多発性骨髄腫、肺がん、乳房がん、卵巣がん、前立腺がん、結腸がん、黒色腫もしくはその他の血液学的がんおよび固形腫瘍、またはそれらの任意の組合せを含むがんである。
別の実施形態において、CD19/CD20を発現する細胞により媒介されるT細胞阻害を遮断し、哺乳動物における腫瘍増殖を阻害するように腫瘍微小環境を変化させる方法であって、配列番号2および4からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むCARを含む有効量の組成物を哺乳動物に投与するステップを含む方法が提供される。一実施形態において、細胞は、CD19および/またはCD20を発現する腫瘍細胞、腫瘍関連マクロファージ、およびそれらの任意の組合せからなる群から選択される。
別の実施形態において、哺乳動物における抗腫瘍または抗がん免疫応答の免疫抑制を阻害、抑制または防止する方法であって、配列番号2および4からなる群から選択されるCARを含む有効量の組成物を哺乳動物に投与するステップを含む方法が提供される。一実施形態において、CARは、第1の細胞とT細胞の間の相互作用を阻害し、第1の細胞は、CD19および/またはCD20を発現する腫瘍細胞、腫瘍関連マクロファージ、およびそれらの任意の組合せからなる群から選択される。
別の態様では、哺乳動物において抗腫瘍免疫を誘導する方法であって、開示されるCARをコードするベクターまたは核酸分子が形質導入された治療有効量のT細胞を哺乳動物に投与するステップを含む、方法が提供される。
別の実施形態では、哺乳動物においてがんを処置または予防する方法であって、1つまたは複数の開示されるCARを、哺乳動物におけるがんを処置または予防するのに有効な量で哺乳動物に投与するステップを含む、方法が提供される。方法は、対象において、CARの抗原結合性ドメインと、CD19および/またはCD20および/または1つまたは複数の上述の抗原の細胞外ドメインとの免疫複合体を形成するのに十分な条件下で、CD19および/またはCD20および/または1つまたは複数の上述の抗原に特異的に結合する開示されるCARを発現する治療有効量の宿主細胞を対象に投与するステップを含む。
さらに別の実施形態では、腫瘍抗原の上昇した発現と関連する疾患、障害または状態を有する哺乳動物を処置する方法であって、抗腫瘍有効量のT細胞集団を含む医薬組成物を対象に投与するステップを含み、T細胞がキメラ抗原受容体(CAR)をコードする核酸配列を含み、CARが、少なくとも1つの細胞外CD19および/またはCD20抗原結合性ドメインまたはそれらの任意の組合せ、少なくとも1つのリンカーまたはスペーサードメイン、少なくとも1つの膜貫通ドメイン、少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含み、T細胞ががんを有する対象のT細胞である、方法が提供される。
さらに別の実施形態では、それを必要とする対象におけるがんを処置する方法であって、抗腫瘍有効量のT細胞集団を含む医薬組成物を対象に投与するステップを含み、T細胞がキメラ抗原受容体(CAR)をコードする核酸配列を含み、CARが配列番号2および4のアミノ酸配列、またはそれらの任意の組合せ、少なくとも1つのリンカーまたはスペーサードメイン、少なくとも1つの膜貫通ドメイン、少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含み、T細胞ががんを有する対象のT細胞である、方法が提供される。上述の方法の一部の実施形態では、少なくとも1つの膜貫通ドメインが、T細胞受容体の膜貫通アルファ、ベータもしくはゼータ鎖、CD28、CD3イプシロン、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD19、CD22、メソセリン、CD33、CD37、CD64、CD80、CD83、CD86、CD134、CD137、およびCD154、TNFRSF16、TNFRSF19、またはそれらの組合せを含む。
さらに別の実施形態では、がんと診断されたヒトにおいて、遺伝子操作されたT細胞の持続性の集団を生成するための方法が提供される。一実施形態では、方法は、CARを発現するように遺伝子操作されたT細胞をヒトに投与するステップであって、CARが配列番号2および4のアミノ酸配列、またはそれらの任意の組合せ、少なくとも1つの膜貫通ドメイン、および少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含み、遺伝子操作されたT細胞の持続性の集団、またはT細胞の子孫の集団が、投与の後少なくとも1カ月、2カ月、3カ月、4カ月、5カ月、6カ月、7カ月、8カ月、9カ月、10カ月、11カ月、12カ月、2年または3年にわたって、ヒトにおいて持続する、ステップを含む。
一実施形態では、ヒト中の子孫T細胞は、メモリーT細胞を含む。別の実施形態では、T細胞は自家T細胞である。
本明細書に記載される方法の態様および実施形態の全てにおいて、腫瘍抗原の上昇した発現と関連する上述のがん、疾患、障害または状態のいずれかは、本明細書に開示されるCARのうち1または複数を使用して、処置または予防または寛解され得る。
さらに別の態様では、上記キメラ抗原受容体T細胞を作製するためのキット、または上記対象において、腫瘍抗原の上昇した発現と関連するがん、疾患、障害もしくは状態のいずれかを予防、処置もしくは寛解するためのキットであって、上に開示された核酸分子、ベクター、宿主細胞もしくは組成物のいずれか1つまたはそれらの任意の組合せを含むコンテナ、およびキットを使用するための指示書を含むキットが提供される。
CAR、宿主細胞、核酸ならびに方法は、本明細書に詳細に記載される具体的な態様および実施形態を超えて有用であることが理解される。本開示の前述の特色および利点は、添付の図面を参照して進む以下の詳細な説明からより明らかになる。
CD19およびCD20を標的化するCARの構築を示す。図1A:Leu-16(CD20)のモノクローナル抗体FMC-63(CD19)の単鎖断片可変領域をインフレームで、CD8ヒンジおよび膜貫通ドメイン、4-1BB(CD137)シグナル伝達ドメインならびにCD3ゼータシグナル伝達ドメインに連結することにより、抗CD19および抗CD20シングル標的化CAR構築物を生成した。構築物19Aおよび19Bは、FMC63の重鎖と軽鎖とを接続するリンカー配列においてのみ異なる。CD20およびCD19の単鎖断片可変領域を可撓性リンカーにより互いに連続的に連結し、その後CD8、4-1BBおよびCD3ゼータドメインに連結したことを除いては、タンデム標的化構築物2019および1920を、シングル標的化構築物と同様の様式で生成した。 CD19およびCD20を標的化するCARの構築を示す。図1B:CD19およびCD20腫瘍抗原を標的化するタンデムCAR T細胞の略図。タンデムCAR 1920(左)および2019(右)は、インフレームで、CD8由来ヒンジおよび膜貫通ドメイン、その後4-1BB共刺激ドメインならびにCD3ゼータ活性化ドメインに連結されたタンデム細胞外標的化ドメインからなる。各CAR T構築物は、CD19またはCD20腫瘍抗原のいずれか、または両方への結合を介して活性化することができる。 図2A:ヒト初代T細胞上のシングルおよびタンデムCAR T構築物の表面発現。フローサイトメトリーによりCAR T発現を決定した。材料および方法に記載されるように、IL-2の存在下でMiltenyi Biotec TransAct(商標)CD3 CD28試薬にてT細胞を活性化し、LVを形質導入した。培養10日目に、3種の染色試薬:タンパク質L(縦列1);CD19 Fc、その後抗Fc-AF647(縦列2);またはCD20-ビオチン、その後ストレプトアビジン-PE染色(縦列3)のうちの1つを使用して、形質導入した生T細胞(7-AAD陰性)のCAR表面発現についてアッセイを行った。形質導入において使用したLVは、各横列の左に列挙する。非形質導入T細胞対照に関連するCAR T陽性集団のパーセンテージは、各ヒストグラムの右側の隅に示す。GFP形質導入細胞は、さらなる陰性対照として機能した。3人の別々のドナーの代表的なデータを示す。 図2B:各タンデムCARによるCD19抗原結合対CD20抗原結合の比を、CD19 Fcが結合する細胞パーセントに対するCD20ビオチンが結合する細胞パーセントの比として表す。3人のドナーを使用した3回の別々の実験の平均+SDを示す(**p<0.01)。 in vitroでのCAR T細胞傷害性を示す。ルシフェラーゼが安定に形質導入された、K562、K562 CD19+もしくはK562 CD20+細胞株(図3A)、または白血病もしくはリンパ腫細胞株(Raji、NALM6、REH;図3B)を使用して、ルシフェラーゼベースの細胞傷害性アッセイを行った。CAR T細胞および標的腫瘍細胞を、列挙されるエフェクター対標的(E:T)比(x軸)で一晩コインキュベートした。一元配置ANOVAおよびダネットの事後検定を使用して群間の差を決定した。平均値+SD、****p<0.0001、**p<0.01対同じドナーからの非形質導入対照(N.T.)。 in vitroでのCAR T細胞傷害性を示す。ルシフェラーゼが安定に形質導入された、K562、K562 CD19+もしくはK562 CD20+細胞株(図3A)、または白血病もしくはリンパ腫細胞株(Raji、NALM6、REH;図3B)を使用して、ルシフェラーゼベースの細胞傷害性アッセイを行った。CAR T細胞および標的腫瘍細胞を、列挙されるエフェクター対標的(E:T)比(x軸)で一晩コインキュベートした。一元配置ANOVAおよびダネットの事後検定を使用して群間の差を決定した。平均値+SD、****p<0.0001、**p<0.01対同じドナーからの非形質導入対照(N.T.)。 白血病細胞株に応答したCAR Tサイトカイン放出。フローベースのビーズアレイを使用して、x軸に列挙されるCAR-Tによる、Raji白血病株とのE:T比10:1での一晩の共培養に際しての、サイトカイン産生を測定した。バーは、反復試料の平均値+SDを表す。データは、3人の別々のドナーからのCAR T細胞で行った3回の独立実験の代表値である。 CAR T構築物のin vivo活性を示す。図5Aは、マウス全身生体発光に基づく腫瘍増殖の経時変化を示す。CAR T処置群当たり10匹のマウス、および対照群当たり5匹のマウスを研究した。 CAR T構築物のin vivo活性を示す。図5Bは、マウス当たりのシグナル平均値±SDを示すプロットである。二元配置ANOVAおよびダネットの多重比較検定を使用した、処置なし群に対する、25日目(処置なし対照群の対象が生存していた最後の時点)の統計解析を示す。平均値+SD、***P<0.001。 Raji腫瘍エスケープバリアントを強固に選択するシングルCAR19構築物を示す。図6A:腫瘍エスケープ実験のための実験設計の図。RajiおよびCAR T細胞をE:T比1:1で一晩または4日間共培養した。一晩のインキュベーション後および4日目に、培養物を採取し、フローサイトメトリーにより生Raji細胞を、CD19、CD20およびCD22表面発現について調べた。 Raji腫瘍エスケープバリアントを強固に選択するシングルCAR19構築物を示す。図6B:共培養物からの生Raji細胞(7AAD-およびCD3-)を分析するために使用したフローサイトメトリー分析のためのゲーティング法を、代表的な処置群について示し、縦列1に示す。縦列2、3および4は、Raji細胞がT細胞なし(横列1)、19A CAR(横列2)または2019 CAR(横列3)と共培養された場合の、それぞれ、CD19、CD20およびCD22発現レベルを示す。 Raji腫瘍エスケープバリアントを強固に選択するシングルCAR19構築物を示す。図6C:フローサイトメトリーにより決定される、x軸上に列挙されるCAR T細胞との一晩または4日間の共培養後の生RajiおよびNALM-6細胞におけるCD19、CD20およびCD22表面発現(それぞれ、黒色、白色、灰色)のグラフ。バーは、群平均値+SDを表す。統計解析は、同じドナーからのN.T.(非形質導入T細胞)対照に対して、一元配置ANOVAおよびダネットの多重比較検定により行った(*p<0.05)。T.A.-腫瘍単独対照群。 Raji表面上のCD19、CD20およびCD22の下方調節は、CART細胞との直接接触を必要とする。トランズウェルインサートを伴うマルチウェルプレートを、この実験で使用した。各ウェルの下部において5x10の各RajiおよびCAR T細胞を組み合わせ、トランズウェル上部部分において2.5x10のRaji細胞をT細胞の非存在下で培養した。一晩のインキュベーション後、上部トランズウェル区画からの細胞および下部区画からの細胞を採取し、フローサイトメトリーにより生Raji細胞を、CD19、CD20およびCD22(それぞれ、黒色、薄灰色および濃灰色のバー)表面発現について調べた。下部区画に含まれる特異的CAR T(x軸)に関連する各マーカーについての表面発現を示す。バーは、3人の異なるドナーに由来するCAR T細胞を使用して行われた3回の独立実験の平均値+SDを示す。一元配置ANOVA、ダネットの多重比較検定*p<0.05。 CAR19構築物による、C19全長タンパク質およびCD19スプライスバリアントの下方調節を示す。Raji細胞をCAR T細胞とともにE:T比1:1でコインキュベートした。一晩のインキュベーション後、磁気ビーズを使用してコインキュベートした細胞集団からT細胞を除去した。フローサイトメトリーおよびウェスタンブロットにより精製Raji集団上のCD19発現を研究した。図8A:Raji細胞試料を、抗CD19抗体で染色し、フローサイトメトリーにより得た。各処置群を代表するRaji細胞についての蛍光強度中央値を示す。バーは、3人の異なるドナーに由来するCAR T細胞を使用して行われた3回の独立実験の平均値+SDを示す。一元配置ANOVA、ダネットの多重比較検定*p<0.05。 CAR19構築物による、C19全長タンパク質およびCD19スプライスバリアントの下方調節を示す。Raji細胞をCAR T細胞とともにE:T比1:1でコインキュベートした。一晩のインキュベーション後、磁気ビーズを使用してコインキュベートした細胞集団からT細胞を除去した。フローサイトメトリーおよびウェスタンブロットにより精製Raji集団上のCD19発現を研究した。図8B:材料および方法に記載されるように、コインキュベート群の各々(CAR-T識別は各ラインの上に列挙する)からの精製Raji細胞の溶解物を、4%~12%SDSポリアクリルアミドゲル上で分解し、CD19分子のC末端を標的化する抗体またはβ-アクチン(ローディング対照)で調査した。 CAR19構築物による、C19全長タンパク質およびCD19スプライスバリアントの下方調節を示す。Raji細胞をCAR T細胞とともにE:T比1:1でコインキュベートした。一晩のインキュベーション後、磁気ビーズを使用してコインキュベートした細胞集団からT細胞を除去した。フローサイトメトリーおよびウェスタンブロットにより精製Raji集団上のCD19発現を研究した。図8C:Image Studioソフトウェア(LI-COR Biosciences)を使用して、全長CD19タンパク質(FL CD19)およびエクソン2スプライスCD19バリアント(Δ2CD19)を代表する特異的免疫反応バンドの強度を定量した。CD19バンドの相対的バンド強度をシグナルCD19/シグナルβアクチンとして計算した。 高腫瘍負荷モデルにおけるCAR T細胞のin vivo活性を示す。0日目に、NSGマウス(n=6)にRaji-ルシフェラーゼ細胞を静脈内注射し、図に示すように、12日目に、CAR T細胞で処置した。図9A:疾患負荷を、生体発光シグナル平均(放射輝度平均値[p/s/cm2/sr])±SEMとしてプロットする。25日目までにマウスの半分未満しか生存しなかった群は、点線としてプロットする。半分を超えて生存した群は、実線としてプロットする。 高腫瘍負荷モデルにおけるCAR T細胞のin vivo活性を示す。0日目に、NSGマウス(n=6)にRaji-ルシフェラーゼ細胞を静脈内注射し、図に示すように、12日目に、CAR T細胞で処置した。図9B:腫瘍生着後25日目の、上記のプロットで示されるシングルおよびタンデムCAR T構築物で処置したマウスにおける腫瘍負荷の生体発光画像を示す。赤色Xは、研究25日目まで生存しなかったマウスを示す。 CAR T構築物の核酸配列およびコードされるアミノ酸配列を示す。図10Aは、CARリーダー-CD19 VL-WhitlowリンカーCD19 VH(GGGGS)-5 CD20 VH(GGGGS)-3 CD20 VL CD8 ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z(CD1920 CAR構築物)核酸配列を発現するレンチウイルスベクター、およびコードされるアミノ酸配列を示す。 CAR T構築物の核酸配列およびコードされるアミノ酸配列を示す。図10Bは、リーダー-CD20 VH(GGGGS)3-CD20 VL-(GGGGS)5-CD19 VL-WhitlowリンカーCD19 VH CD8 ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z(CD2019 CAR構築物)核酸配列を含有するCARを発現するレンチウイルスベクター、およびコードされるアミノ酸配列を示す。 CD19_20(図11A)およびCD20_19(図11B)タンデムCARをコードするタンデムCARレンチウイルスベクター(LV)のプラスミドマップを示す。CD19_20およびCD20_19タンデムCARは、CD8、41BBおよびCD3ゼータシグナル伝達ドメインに連結された、ヒトEF-1アルファ内部プロモーター(EF1a)、リーダー配列(リーダー)、FMC63およびLeu16抗体からのVHおよびVL配列(それぞれ、CD19VL、CD19VH、CD20VL、CD20VH)、鎖間リンカー配列ならびにscFv内配列を特徴とするレンチウイルス骨格プラスミドを使用して発現された。 CD19_20(図11A)およびCD20_19(図11B)タンデムCARをコードするタンデムCARレンチウイルスベクター(LV)のプラスミドマップを示す。CD19_20およびCD20_19タンデムCARは、CD8、41BBおよびCD3ゼータシグナル伝達ドメインに連結された、ヒトEF-1アルファ内部プロモーター(EF1a)、リーダー配列(リーダー)、FMC63およびLeu16抗体からのVHおよびVL配列(それぞれ、CD19VL、CD19VH、CD20VL、CD20VH)、鎖間リンカー配列ならびにscFv内配列を特徴とするレンチウイルス骨格プラスミドを使用して発現された。
詳細な説明
定義
本明細書で使用する場合、単数形「1つの(a)」、「1つの(an)」および「この(the)」とは、文脈が明らかに他を示さない限り、単数形および複数形の両方を指す。例えば、用語「1つの抗原」は、単数または複数の抗原を含み、語句「少なくとも1つの抗原」と等価とみなされ得る。本明細書で使用する場合、用語「含む(comprises)」とは、「含む(includes)」を意味する。したがって、「1つの抗原を含む(comprising)」とは、他の要素を排除することなく、「1つの抗原を含む(including)」を意味する。語句「および/または」とは、「および」または「または」を意味する。核酸またはポリペプチドについて与えられた任意のおよび全ての塩基サイズまたはアミノ酸サイズ、ならびに全ての分子量または分子質量値は、特記しない限り、おおよそであり、便宜的に提供されていることをさらに理解すべきである。本明細書に記載されるものと類似または等価な多くの方法および材料が使用され得るが、特に適切な方法および材料が以下に記載される。矛盾する場合、用語の説明を含む本明細書が支配する。さらに、材料、方法および実施例は、例示にすぎず、限定を意図しない。種々の実施形態の再検討を容易にするために、以下の用語の説明が提供される。
用語「約」とは、測定可能な値、例えば、量、時間的持続期間などに言及する場合、特定された値から±20%、または一部の例では±10%、または一部の例では±5%、または一部の例では±1%、または一部の例では±0.1%の変動を包含することを意味し、かかる変動は、開示される方法を実施するために適切である。
特記しない限り、本明細書の技術用語は、従来の用法に従って使用される。分子生物学における一般的用語の定義は、Oxford University Pressによって刊行されたBenjamin Lewin、Genes VII、1999年;Blackwell Science Ltd.によって刊行されたKendrewら(編)The Encyclopedia of Molecular Biology、1994年;およびVCH Publishers,Inc.によって刊行されたRobert A.Meyers(編)、Molecular Biology and Biotechnology:a Comprehensive Desk Reference、1995年;および他の類似の参考文献中に見出すことができる。
本開示は、CD19/CD20抗体またはその断片、およびこのようなCD19/CD20抗原結合性ドメインを有するキメラ抗原受容体(CAR)を提供する。CARの機能的活性の増強は、CARを発現するT細胞の機能的活性の増強に直接関連する。これらの1つまたは複数の改変の結果として、CARは、形質導入されたCAR発現T細胞のin vivoでのT細胞増殖および持続レベルの増大と共に、高度のサイトカイン誘導性細胞溶解および形質導入T細胞での細胞表面発現の両方を示す。本開示のCARは、1種類のCARTレンチウイルス製品が多数の患者集団(即ち、CD19+、CD20+または二重CD19+CD20+がん患者)を処置するために利用することができ、このことはリソースが限定されている状況においてフレキシビリティーを許容する点で有益である。
様々なタンパク質ドメインに由来する機能性部分を組み合わせる独自の能力が、キメラ抗原受容体(CAR)の重要かつ革新的な特色である。これらのタンパク質ドメイン各々の選択は、これらの具体的な組合せ方と同様に、重要な設計特色である。各設計ドメインは、様々なCARプラットフォームでリンパ球の機能を操作するのに使用可能な必須の構成要素である。例えば、細胞外結合性ドメインの選択によって、それ以外の場合では無効のCARを有効にすることができる。
CARの細胞外抗原結合性ドメインを作り出すのに使用される、免疫グロブリン由来のタンパク質配列の非可変フレームワーク構成要素は、完全に中立であるか、自己会合してT細胞を代謝疲弊の状態にすることがあり、そのためこのCARを発現する治療的T細胞が極度に無効となる。このことは、このCARドメインの抗原結合機能とは無関係に起こる。さらに、細胞内シグナル伝達ドメイン(複数可)の選択によっても、免疫療法に使用される治療的リンパ球集団の活性および耐久性が決定され得る。これらの細胞外および細胞内ドメインによって、標的抗原と結合する能力および活性化シグナルをT細胞に伝達する能力がそれぞれ、CAR設計の重要な側面である一方で、細胞外抗原結合性断片の供給源の選択が、CARの有効性に対して顕著な効果を有し、それゆえにCARの機能および臨床的有用性において決定的な役割を有し得ることも明らかとなっている。
本明細書で開示されるCARは、細胞において高レベルで発現される。CARを発現する細胞は、in vivoで高い増殖速度を有し、多量のサイトカインを産生し、CARが結合するCD19/CD20抗原を表面に有する細胞に対し高い細胞傷害活性を有する。細胞外CD19/CD20抗原結合性ドメインの使用により、in vivoでより良好に機能するCARの生成がもたらされ、一方で宿主免疫応答での抗CAR免疫の誘導およびCAR T細胞集団の死滅が回避される。細胞外CD19/CD20 ScFv抗原結合性ドメインを発現するCARは、i)マウス由来の結合性配列で見られる、CAR Tの持続および機能不足の防止;ii)有効となるべきCARの局所(即ち、胸膜内)送達がないこと;ならびにiii)CD19/CD20に対し高親和性および低親和性を有するバインダー両方に基づいてCAR T細胞設計を生成する能力、を含む優れた活性/特性を示す。この最後の特性により、腫瘍には正常な組織よりもCD19/CD20が多く発現していることで、親和性がより小さいバインダーは正常な組織よりも腫瘍に対しより大きい特異性を有することができ、それによりオンターゲットな腫瘍以外への毒性およびバイスタンダー細胞の死滅が防止され得るため、研究者は、CAR T産物の毒性に対する有効性、および/または組織特異性をよりよく調整することができる。
CAR、抗体およびその抗原結合性断片、コンジュゲート、ヌクレオチド、発現、ベクターおよび宿主細胞、開示されたCARを使用する処置の方法、組成物およびキットのさらなる記載と共に、それらの細胞外CD19/CD20抗原結合性ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞内ドメインの記載を含む本発明のCARの詳細な記載は以下である。
A.キメラ抗原受容体(CAR)
本明細書で開示されるCARは、CD19/CD20に結合することが可能な少なくとも1つのCD19/CD20抗原結合性ドメイン、少なくとも1つの膜貫通ドメイン、および少なくとも1つの細胞内ドメインを含む。
キメラ抗原受容体(CAR)は、膜貫通ドメインを介してT細胞シグナル伝達ドメインに連結された、抗体の抗原結合性ドメイン(例えば、単鎖可変断片(ScFv))を含有する、人工的に構築されたハイブリッドタンパク質またはポリペプチドである。CARの特徴には、非MHC拘束様式で、モノクローナル抗体の抗原結合特性を活用して、選択された標的に向かってT細胞の特異性および反応性を再指向させるそれらの能力が含まれる。非MHC拘束的な抗原認識は、CARを発現するT細胞に、抗原プロセシングと無関係に抗原を認識する能力を与え、そうして、腫瘍エスケープの主要な機構を迂回する。さらに、T細胞中で発現される場合、CARは、有利なことに、内因性T細胞受容体(TCR)のアルファ鎖およびベータ鎖と二量体化しない。
本明細書に開示するように、CARの細胞内T細胞シグナル伝達ドメインには、例えば、T細胞受容体シグナル伝達ドメイン、T細胞共刺激シグナル伝達ドメイン、またはその両方が含まれ得る。T細胞受容体シグナル伝達ドメインとは、T細胞受容体の細胞内ドメイン、例えば、限定としてではなく、CD3ゼータタンパク質の細胞内部分などを含む、CARの一部分を指す。共刺激シグナル伝達ドメインとは、抗原に対するリンパ球の効率的な応答に必要とされる、抗原受容体またはそれらのリガンド以外の細胞表面分子である共刺激分子の細胞内ドメインを含む、CARの一部分を指す。
1.細胞外ドメイン
一実施形態では、CARは、さもなければ抗原結合性ドメインまたは部分と呼ばれる標的特異的結合エレメントを含む。ドメインの選択は、標的細胞の表面を規定するリガンドの型および数に依存する。例えば、抗原結合性ドメインは、特定の疾患状態と関連する標的細胞上の細胞表面マーカーとして作用するリガンドを認識するように選択され得る。したがって、CAR中の抗原結合性ドメインに対するリガンドとして作用し得る細胞表面マーカーの例には、ウイルス、細菌および寄生生物感染、自己免疫疾患ならびにがん細胞と関連するものが含まれる。
一実施形態では、CARは、腫瘍細胞上の抗原に特異的に結合する所望の抗原結合性ドメインを操作することによって、目的の腫瘍抗原を標的化するように操作され得る。腫瘍抗原は、免疫応答、特にT細胞媒介性免疫応答を惹起する、腫瘍細胞によって産生されるタンパク質である。抗原結合性ドメインの選択は、処置される特定の型のがんに依存する。腫瘍抗原は、例えば、神経膠腫関連抗原、癌胎児性抗原(CEA)、ベータ-ヒト絨毛性ゴナドトロピン、アルファフェトプロテイン(AFP)、レクチン反応性AFP、サイログロブリン、RAGE-1、MN-CA IX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、RU1、RU2(AS)、腸カルボキシルエステラーゼ、mut hsp70-2、M-CSF、プロスターゼ(prostase)、前立腺特異的抗原(PSA)、PAP、NY-ESO-1、LAGE-1a、p53、プロステイン(prostein)、PSMA、Her2/neu、サバイビンおよびテロメラーゼ、前立腺癌腫瘍抗原-1(PCTA-1)、MAGE、ELF2M、好中球エラスターゼ、エフリンB2、CD22、インスリン様成長因子(insulin growth factor)(IGF)-I、IGF-II、IGF-I受容体ならびにCD19/CD20が含まれる。本明細書に開示される腫瘍抗原は、例として含まれるにすぎない。このリストは、排他的である意図はなく、さらなる例が、当業者に容易に明らかである。
一実施形態では、腫瘍抗原は、悪性腫瘍と関連する1または複数の抗原性がんエピトープを含む。悪性腫瘍は、免疫攻撃のための標的抗原として機能し得るいくつかのタンパク質を発現する。これらの分子には、組織特異的抗原、例えば、黒色腫におけるMART-1、チロシナーゼおよびGP 100、ならびに前立腺がんにおける前立腺酸性ホスファターゼ(PAP)および前立腺特異的抗原(PSA)が含まれるがこれらに限定されない。他の標的分子は、癌遺伝子HER-2/Neu/ErbB-2などの形質転換関連分子の群に属する。標的抗原のさらに別の群は、癌胎児性抗原(CEA)などのがん胎児性抗原である。B細胞リンパ腫では、腫瘍特異的イディオタイプ免疫グロブリンが、個々の腫瘍に独自の真に腫瘍特異的な免疫グロブリン抗原を構成する。B細胞分化抗原、例えば、CD19、CD20、CD22、BCMA、ROR1、およびCD37は、B細胞リンパ腫における標的抗原の他の候補である。これらの抗原の一部(CEA、HER-2、CD19、CD20、イディオタイプ)は、限定的な成功で、モノクローナル抗体による受動免疫療法の標的として使用されている。
好ましい一実施形態において、腫瘍抗原はCD19/CD20であり、CD19/CD20発現と関連する腫瘍は、高レベルの細胞外タンパク質CD19/CD20を発現する肺中皮腫、卵巣および膵がん、またはそれらの任意の組合せを含む。
腫瘍抗原の型は、腫瘍特異的抗原(TSA)または腫瘍関連抗原(TAA)でもあり得る。TSAは、腫瘍細胞に独自であり、身体中の他の細胞上には存在しない。TAAは、腫瘍細胞に独自ではなく、その代わり、抗原に対する免疫学的寛容の状態を誘導できない条件下で正常細胞上でも発現される。腫瘍上での抗原の発現は、免疫系が抗原に応答できるようにする条件下で生じ得る。TAAは、免疫系が未熟であり応答できない胎児発生の間に正常細胞上で発現される抗原であり得、または正常細胞上では非常に低いレベルで通常存在するが、腫瘍細胞上ではかなり高いレベルで発現される抗原であり得る。
TSAまたはTAAの非限定的な例には、以下が含まれる:分化抗原、例えば、MART-1/MelanA(MART-I)、gp100(Pmel 17)、チロシナーゼ、TRP-1、TRP-2および腫瘍特異的多系列抗原、例えば、MAGE-1、MAGE-3、BAGE、GAGE-1、GAGE-2、p15;過剰発現された胚抗原、例えば、CEA;過剰発現された癌遺伝子および変異した腫瘍サプレッサー遺伝子、例えば、p53、Ras、HER-2/neu;染色体転座から生じる独自の腫瘍抗原;例えば、BCR-ABL、E2A-PRL、H4-RET、IGH-IGK、MYL-RAR;ならびにウイルス抗原、例えば、エプスタイン・バーウイルス抗原EBVAおよびヒトパピローマウイルス(HPV)抗原E6およびE7。他の大きいタンパク質ベースの抗原には、TSP-180、MAGE-4、MAGE-5、MAGE-6、RAGE、NY-ESO、p185erbB2、p180erbB-3、c-met、nm-23H1、PSA、TAG-72、CA 19-9、CA 72-4、CAM 17.1、NuMa、K-ras、ベータ-カテニン、CDK4、Mum-1、p 15、p 16、43-9F、5T4、791Tgp72、アルファ-フェトプロテイン、ベータ-HCG、BCA225、BTAA、CA 125、CA 15-3/CA 27.29/BCAA、CA 195、CA 242、CA-50、CAM43、CD68/P1、CO-029、FGF-5、G250、Ga733/EpCAM、HTgp-175、M344、MA-50、MG7-Ag、MOV18、NB/70K、NY-CO-1、RCAS1、SDCCAG16、TA-90/Mac-2結合タンパク質/シクロフィリンC関連タンパク質、TAAL6、TAG72、TLPおよびTPSが含まれる。
一実施形態では、CARの抗原結合性ドメイン部分は、CD19、CD20、CD22、ROR1、CD33、CD38、CD123、CD138、BCMA、c-Met、PSMA、糖脂質F77、EGFRvIII、GD-2、FGFR4、TSLPR、NY-ESO-1 TCR、MAGE A3 TCRなどを含むがこれらに限定されない抗原を標的化する。
好ましい実施形態において、CARの抗原結合性ドメイン部分は、細胞外CD19/CD20抗原を標的化する。
本明細書で開示されるCD19/CD20特異的CARについての種々の実施形態では、一般的図式が図1Aおよび1Bに示され、N末端からC末端へ、シグナルまたはリーダーペプチド、抗CD19/CD20ScFv、細胞外リンカー、CD8膜貫通部、4-1BB、CD3ゼータを含む。
一実施形態において、CARをコードする核酸配列は、配列番号1(リーダー-CD19 VL-WhitlowリンカーCD19 VH(GGGGS)-5 CD20 VH(GGGGS)-3 CD20 VL CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z(構築物CAR1920))の核酸配列を含み、配列番号2(リーダー-CD19 VL-WhitlowリンカーCD19 VH(GGGGS)-5 CD20 VH(GGGGS)-3 CD20 VL CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z(構築物CAR1920)に示すアミノ酸配列(図10Aに示す)]を含むCARをコードする。
一実施形態において、CARをコードする核酸配列は、配列番号1の核酸配列、またはそれに対して85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する配列を含み、配列番号2に示すアミノ酸配列、またはそれに対して85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する配列(リーダー-CD19 VL-WhitlowリンカーCD19 VH(GGGGS)-5 CD20 VH(GGGGS)-3 CD20 VL CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z(構築物CAR1920))アミノ酸配列(図10Aに示す)]を含むCARをコードする。
別の実施形態において、CARをコードする核酸配列は、配列番号3(リーダー-CD20 VH(GGGGS)3-CD20 VL-(GGGGS)5-CD19 VL-Whitlowリンカー-CD19 VH CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z(構築物2019)(図2B)))の核酸配列を含み、配列番号4[リーダー-CD20 VH(GGGGS)3-CD20 VL-(GGGGS)5-CD19 VL-Whitlowリンカー-CD19 VH CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z CARアミノ酸配列(図10Bに示す)]に示すアミノ酸配列を含むCARをコードする。
別の実施形態において、CARをコードする核酸配列は、配列番号3の核酸配列、またはそれに対して85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する配列を含み、配列番号4に示すアミノ酸配列、またはそれに対して85%、90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を有する配列[リーダー-CD20 VH(GGGGS)3-CD20 VL-(GGGGS)5-CD19 VL-Whitlowリンカー-CD19 VH CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z CARアミノ酸配列(図10Bに示す)]を含むCARをコードする。
CD19/CD20抗原と反応する免疫グロブリン重鎖可変ドメイン(VH)および単鎖断片可変(ScFv)配列を組み込んだ抗CD19/CD20 CARの表面発現について、以下の実施例1に示す。ScFvを含む各CARについての発現レベルは、3つの検出方法:i)タンパク質L-ビオチン、その後ストレプトアビジンPE;ii)CD19Fc組換えタンパク質、その後抗Fc AF647(APC);iii)組換えCD20ビオチンコンジュゲート、その後ストレプトアビジンPEのうちの1つを使用する、健康なドナー由来のLV形質導入T細胞のフローサイトメトリー分析により決定した。ScFvベースの抗CD19/CD20 CAR構築物LTG1920およびLTG2019は、非形質導入T細胞対照(ゲーティングされなかった細胞集団)と比較して、ヒト初代T細胞(ゲーティングされた集団により示される)で高度に発現された。
実施例1ならびに図3Aおよび3Bで示されるように、CD19/CD20 CARの高い細胞傷害活性が実証された。ヒト初代T細胞に、CAR構築物(19A、19B、20A、1920、2019、方法を参照)をコードするLVを形質導入し、次いでホタルルシフェラーゼが安定に形質導入されたRaji、NALM-6、REH、K562または293T細胞株とともに18時間インキュベートし、発光に基づくin vitro死滅アッセイを行った。試験された全ての白血病株は、それらの表面上にCD19を発現するが、陰性対照、K562および293Tは発現しない。CD20発現は、腫瘍株間で変動した。Raji株はCD20陽性であるが、REHはCD20陰性であり、対照株K562および293Tも陰性である。NALM-6株は、弱いが検出可能なCD20発現を有する。さらなる対照として、CD19を発現するK562株(K562-19+)またはCD20を発現するK562株(K562-20+)を作り出した。
K562-19+は、CAR 19Aおよび18B構築物、タンデムCAR構築物1920および2019により溶解されたが、シングル20A CARによっては溶解されなかった(図3A)。K562-CD20+は、シングルCAR19構築物以外の全てのCART構築物により溶解され、標的抗原限定的死滅を実証した。試験された他の白血病細胞株で同様の結果が見られた。CD19を標的化するシングルおよびタンデムCAR T構築物は、Raji、NALM-6およびREHを溶解したが、293T(図3B)またはK562(図3A)は溶解しなかった。特に、20Aシングル標的化CAR構築物は、CD20陰性REH株に対して特異的死滅活性を有しなかったが、低いが検出可能なレベルのCD20表面発現を有するNALM-6の死滅を実証した。さらに、また、フローサイトメトリーによりCD19-Fcへの結合よりも低いCD20ペプチドへの結合を示すように見えたタンデムCAR 1920は、K562-19+およびK562-20+に対してより低い細胞傷害性を有するが、CD19+CD20-REHに対してはより低い細胞傷害性を有しない。このことは、1920タンデムCARは、一部の腫瘍標的について2019タンデムCARよりも劣っていることを示唆し得る。
次いで、抗CD19/CD20 CAR T細胞のサイトカイン分泌能力を評価した。腫瘍細胞をCAR T細胞または対照T細胞とともに、エフェクター対標的比10:1で一晩コインキュベートし、培養上清をELISAによりIFNガンマ、TNFアルファ、IL-2およびGM-CSFについて分析した(図4参照)。全てのCAR T群は、腫瘍細胞に応答してサイトカインを誘導したが、陰性対照(非形質導入、N.T.)およびGFPはサイトカイン誘導をほとんど生じなかった。5つのCAR T群のうち、シングルCAR T 20Aは、最も高レベルのサイトカインを産生したが、19Aおよび19B CAR Tは、最も低レベルのサイトカイン誘導を有した。特に、タンデムCAR T発現細胞LTG1920および/またはLTG2019は、中レベルのIFNガンマ、TNFアルファ、IL-2およびGM-CSFを示し、これは、臨床的安全性の関係およびサイトカイン放出症候群の回避に有用であることを証明し得る。
任意の特定の作用機構に限定する意図はないが、本発明の例示的なCARと関連する増強された治療機能の可能な理由には、例えば、限定としてではなく、a)より効率的なシグナル伝達を可能にする、原形質膜内での改善された側方の動き、b)脂質ラフトなどの原形質膜マイクロドメイン内の優れた位置、およびT細胞活性化と関連する膜貫通シグナル伝達カスケードと相互作用するより高い能力、c)抑制的もしくは下方調節性の相互作用から離れる優先的な動きによる、原形質膜内の優れた位置、例えば、CD45などのホスファターゼとあまり近接していないこと、もしくはそれとのより少ない相互作用、ならびにd)T細胞受容体シグナル伝達複合体(即ち、免疫シナプス)への優れたアセンブリ、またはそれらの任意の組合せが含まれると考えられる。
本開示は、例示的な細胞外CD19/CD20可変重鎖単独およびScFv抗原結合性ドメインを用いて例示しているが、本明細書に記載されるCARにおいて使用するためのCD19/CD20抗原結合性ドメインを得るのに、CD19/CD20可変重鎖単独およびScFv抗原結合性ドメイン内のその他のヌクレオチドおよび/またはアミノ酸バリアントを使用してもよい。
標的化される所望の抗原に依存して、CARは、所望の抗原標的に対して特異的な適切な抗原結合性ドメインを含むようにさらに操作され得る。例えば、CD19/CD20が標的化される所望の抗原である場合、CD19/CD20に対する抗体が、CAR中への抗原結合ドメイン取込みとして使用され得る。
例示的な一実施形態では、CARの抗原結合性ドメイン部分は、CD33をさらに標的化する。好ましくは、CAR中の抗原結合性ドメインは、抗CD33 ScFvであり、ここで、抗CD33 ScFvの核酸配列は、配列番号46に示される配列を含む。一実施形態では、抗CD33 ScFvは、配列番号46のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。別の実施形態では、CARの抗CD19/CD20 ScFv部分は、配列番号47に示されるアミノ酸配列を含む。
例示的な一実施形態では、CARの抗原結合性ドメイン部分は、メソセリンをさらに標的化する。好ましくは、CAR中の抗原結合性ドメインは、抗メソセリンScFvであり、ここで、抗メソセリンScFvの核酸配列は、配列番号48に示される配列を含む。一実施形態では、抗メソセリンScFvは、配列番号48のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。別の実施形態では、CARの抗メソセリンScFv部分は、配列番号49に示されるアミノ酸配列を含む。
本発明の一態様では、例えば、限定としてではなく、レトロウイルス科(例えば、ヒト免疫不全ウイルス、例えば、HIV-1およびHIV-LP)、ピコルナウイルス科(例えば、ポリオウイルス、A型肝炎ウイルス、エンテロウイルス、ヒトコクサッキーウイルス、ライノウイルスおよびエコーウイルス)、風疹ウイルス、コロナウイルス、水疱性口内炎ウイルス、狂犬病ウイルス、エボラウイルス、パラインフルエンザウイルス、ムンプスウイルス、麻疹ウイルス、呼吸器多核体ウイルス、インフルエンザウイルス、B型肝炎ウイルス、パルボウイルス、アデノウイルス科、ヘルペスウイルス科[例えば、1型および2型単純ヘルペスウイルス(HSV)、水痘帯状疱疹ウイルス、サイトメガロウイルス(CMV)ならびにヘルペスウイルス]、ポックスウイルス科(例えば、天然痘ウイルス、ワクシニアウイルスおよびポックスウイルス)もしくはC型肝炎ウイルスに由来する抗原、またはそれらの任意の組合せを含む非TSAまたは非TAAに結合することが可能なCARが提供される。
本発明の別の態様では、Staphylococci、Streptococcus、Escherichia coli、PseudomonasまたはSalmonellaの細菌株に由来する抗原に結合することが可能なCARが提供される。特に、感染性細菌、例えば、Helicobacter pyloris、Legionella pneumophilia、Mycobacteria sps.の細菌株(例えば、M.tuberculosis、M.avium、M.intracellulare、M.kansaiiまたはM.gordonea)、Staphylococcus aureus、Neisseria gonorrhoeae、Neisseria meningitides、Listeria monocytogenes、Streptococcus pyogenes、A群Streptococcus、B群Streptococcus(Streptococcus agalactiae)、Streptococcus pneumoniaeもしくはClostridium tetaniに由来する抗原、またはそれらの組合せに結合することが可能なCARが提供される。
2.膜貫通ドメイン
膜貫通ドメインに関して、CARは、CARの細胞外CD19/CD20抗原結合性ドメインに融合された1つまたは複数の膜貫通ドメインを含む。
膜貫通ドメインは、天然供給源または合成供給源のいずれかに由来し得る。供給源が天然である場合、ドメインは、任意の膜結合型または膜貫通タンパク質に由来し得る。
本明細書に記載されるCARにおいて特に使用される膜貫通領域は、T細胞受容体のアルファ、ベータまたはゼータ鎖、CD28、CD3イプシロン、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、メソセリン、CD33、CD37、CD64、CD80、CD83、CD86、CD134、CD137、CD154、TNFRSF16またはTNFRSF19に由来し得る(即ち、それらの膜貫通領域(複数可)を少なくとも含み得る)。あるいは、膜貫通ドメインは、合成であり得、その場合、ロイシンおよびバリンなどの疎水性残基を優勢に含む。好ましくは、フェニルアラニン、トリプトファンおよびバリンの三つ組が、合成膜貫通ドメインの各末端において見出される。任意選択で、短いオリゴペプチドリンカーまたはポリペプチドリンカー、好ましくは2アミノ酸長と10アミノ酸長との間が、CARの膜貫通ドメインと細胞質シグナル伝達ドメインとの間での連結を形成し得る。グリシン-セリン二つ組は、特に適切なリンカーを提供する。
一実施形態では、CAR中のドメインの1つと天然に関連する膜貫通ドメインが、上記膜貫通ドメインに加えて使用される。
一部の場合には、膜貫通ドメインは、受容体複合体の他のメンバーとの相互作用を最小化するために、かかるドメインの、同じまたは異なる表面膜タンパク質の膜貫通ドメインへの結合を回避するために、アミノ酸置換により選択され得る。
一実施形態では、本発明のCAR中の膜貫通ドメインは、CD8膜貫通ドメインである。一実施形態では、CD8膜貫通ドメインは、配列番号35の核酸配列を含む。一実施形態では、CD8膜貫通ドメインは、配列番号36のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。別の実施形態では、CD8膜貫通ドメインは、配列番号36のアミノ酸配列を含む。
一実施形態において、コードされる膜貫通ドメインは、配列番号28のアミノ酸配列の少なくとも1つ、2つもしくは3つの改変(例えば、置換)であるが20、10もしくは5以下の改変(例えば、置換)を有するアミノ酸配列、または配列番号28のアミノ酸配列に対し95~99%の同一性を有する配列を含む。
一部の場合には、CARの膜貫通ドメインは、CD8アルファヒンジドメインを含む。一実施形態では、CD8ヒンジドメインは、配列番号37の核酸配列を含む。一実施形態では、CD8ヒンジドメインは、配列番号38のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。別の実施形態において、CD8ヒンジドメインは、配列番号38のアミノ酸配列、またはそれに対して95~99%の同一性を有する配列を含む。
一実施形態では、コードされるリンカードメインが、CD8の細胞外ドメインに由来し、膜貫通CD8ドメイン、膜貫通CD28ドメイン、またはそれらの組合せに連結される、単離された核酸分子が提供される。
3.スペーサードメイン
CARでは、スペーサードメインは、細胞外ドメインと膜貫通ドメインとの間、または細胞内ドメインと膜貫通ドメインとの間に配置され得る。スペーサードメインは、膜貫通ドメインを細胞外ドメインと連結させるように、および/または膜貫通ドメインを細胞内ドメインと連結させるように機能する、任意のオリゴペプチドまたはポリペプチドを意味する。スペーサードメインは、最大で300アミノ酸、好ましくは10~100アミノ酸、最も好ましくは25~50アミノ酸を含む。
いくつかの実施形態では、リンカーは、存在する場合には、リンカーのサイズを増加させ、その結果、エフェクター分子または検出可能なマーカーと抗体または抗原結合性断片との間の距離が増加される、スペーサーエレメントを含み得る。例示的なスペーサーは、当業者に公知であり、これには、米国特許第7,964,566号、米国特許第7,498,298号、米国特許第6,884,869号、米国特許第6,323,315号、米国特許第6,239,104号、米国特許第6,034,065号、米国特許第5,780,588号、米国特許第5,665,860号、米国特許第5,663,149号、米国特許第5,635,483号、米国特許第5,599,902号、米国特許第5,554,725号、米国特許第5,530,097号、米国特許第5,521,284号、米国特許第5,504,191号、米国特許第5,410,024号、米国特許第5,138,036号、米国特許第5,076,973号、米国特許第4,986,988号、米国特許第4,978,744号、米国特許第4,879,278号、米国特許第4,816,444号および米国特許第4,486,414号、ならびに米国特許出願公開第20110212088号および米国特許出願公開第20110070248号中に列挙されるものが含まれ、その各々は、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる。
スペーサードメインは、好ましくは、抗原とのCARの結合を促進し、細胞中へのシグナル伝達を増強する配列を有する。結合を促進すると予測されるアミノ酸の例には、システイン、荷電アミノ酸、ならびに潜在的グリコシル化部位中のセリンおよびスレオニンが含まれ、これらのアミノ酸は、スペーサードメインを構成するアミノ酸として使用され得る。
スペーサードメインとして、CD8アルファ(NCBI RefSeq:NP_001759.3)のヒンジ領域であるアミノ酸番号137~206(配列番号39)、CD8ベータ(GenBank:AAA35664.1)のアミノ酸番号135~195、CD4(NCBI RefSeq:NP_000607.1)のアミノ酸番号315~396、またはCD28(NCBI RefSeq:NP_006130.1)のアミノ酸番号137~152の全体または一部が使用され得る。また、スペーサードメインとして、抗体H鎖またはL鎖の定常領域の一部が使用され得る。さらに、スペーサードメインは、人工的に合成された配列であり得る。
さらにCARでは、シグナルペプチド配列を、N末端に連結することができる。シグナルペプチド配列は、多くの分泌タンパク質および膜タンパク質のN末端に存在し、15~30アミノ酸の長さを有する。細胞内ドメインとして上で言及されるタンパク質分子の多くは、シグナルペプチド配列を有するので、これらのシグナルペプチドがCARのためのシグナルペプチドとして使用され得る。一実施形態では、シグナルペプチドは、配列番号18に示されるアミノ酸配列を含む。
4.細胞内ドメイン
CARの細胞質ドメインまたはさもなければ細胞内シグナル伝達ドメインは、CARが中に置かれた免疫細胞の正常なエフェクター機能のうち少なくとも1つの活性化を担う。用語「エフェクター機能」とは、細胞の特殊化した機能を指す。例えば、T細胞のエフェクター機能は、サイトカインの分泌を含む細胞溶解活性またはヘルパー活性であり得る。したがって、用語「細胞内シグナル伝達ドメイン」とは、エフェクター機能シグナルを伝達し、特殊化した機能を実行するように細胞を指示する、タンパク質の部分を指す。通常は細胞内シグナル伝達ドメイン全体が使用され得るが、多くの場合、鎖全体を使用する必要はない。細胞内シグナル伝達ドメインの短縮された部分が使用される限りにおいて、かかる短縮された部分は、それがエフェクター機能シグナルを伝達する限り、インタクトな鎖の代わりに使用され得る。したがって、用語、細胞内シグナル伝達ドメインとは、エフェクター機能シグナルを伝達するのに十分な、細胞内シグナル伝達ドメインの任意の短縮された部分を含むことを意味する。
CARでの使用のための細胞内シグナル伝達ドメインの好ましい例には、抗原受容体係合後にシグナル伝達を開始させるように協力して作用するT細胞受容体(TCR)および共受容体の細胞質配列、ならびにこれらの配列の任意の誘導体もしくはバリアント、および同じ機能的能力を有する任意の合成配列が含まれる。
TCR単独を通じて生成されるシグナルが、T細胞の完全な活性化には不十分であること、および二次または共刺激シグナルもまた必要とされることは公知である。したがって、T細胞活性化は、2つの別個のクラスの細胞質シグナル伝達配列によって媒介されると言われ得る:TCRを介した抗原依存的な一次活性化を開始させるもの(一次細胞質シグナル伝達配列)および二次または共刺激シグナルを提供するように抗原依存的に作用するもの(二次細胞質シグナル伝達配列)。
一次細胞質シグナル伝達配列は、刺激性の方法または阻害性の方法のいずれかで、TCR複合体の一次活性化を調節する。刺激性の様式で作用する一次細胞質シグナル伝達配列は、免疫受容活性化チロシンモチーフまたはITAMとして公知のシグナル伝達モチーフを含有し得る。
本明細書に開示されるCARにおいて特に使用される一次細胞質シグナル伝達配列を含有するITAMの例には、TCRゼータ(CD3ゼータ)、FcRガンマ、FcRベータ、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD3イプシロン、CD5、CD22、CD79a、CD79bおよびCD66dに由来するものが含まれる。ITAMの具体的な非限定的な例には、CD3ゼータ(NCBI RefSeq:NP_932170.1)のアミノ酸番号51~164、FcイプシロンRIガンマ(NCBI RefSeq:NP_004097.1)のアミノ酸番号45~86、FcイプシロンRIベータ(NCBI RefSeq:NP_000130.1)のアミノ酸番号201~244、CD3ガンマ(NCBI RefSeq:NP_000064.1)のアミノ酸番号139~182、CD3デルタ(NCBI RefSeq:NP_000723.1)のアミノ酸番号128~171、CD3イプシロン(NCBI RefSeq:NP_000724.1)のアミノ酸番号153~207、CD5(NCBI RefSeq:NP_055022.2)のアミノ酸番号402~495、0022(NCBI RefSeq:NP_001762.2)のアミノ酸番号707~847、CD79a(NCBI RefSeq:NP_001774.1)のアミノ酸番号166~226、CD79b(NCBI RefSeq:NP_000617.1)のアミノ酸番号182~229、およびCD66d(NCBI RefSeq:NP_001806.2)のアミノ酸番号177~252の配列を有するペプチド、ならびにこれらのペプチドが有するのと同じ機能を有するそれらのバリアントが含まれる。本明細書に記載されるNCBI RefSeq IDまたはGenBankのアミノ酸配列情報に基づくアミノ酸番号は、各タンパク質の前駆体(シグナルペプチド配列などを含む)の全長に基づいて番号付けされる。一実施形態では、CAR中の細胞質シグナル伝達分子は、CD3ゼータに由来する細胞質シグナル伝達配列を含む。
好ましい実施形態では、CARの細胞内ドメインは、それ自体で、またはCARの状況で有用な任意の他の所望の細胞質ドメイン(複数可)と組み合わせて、CD3-ゼータシグナル伝達ドメインを含むように設計され得る。例えば、CARの細胞内ドメインは、CD3ゼータ鎖部分および共刺激シグナル伝達領域を含み得る。共刺激シグナル伝達領域とは、共刺激分子の細胞内ドメインを含むCARの一部分を指す。共刺激分子は、抗原に対するリンパ球の効率的な応答のために必要とされる、抗原受容体またはそれらのリガンド以外の細胞表面分子である。かかる共刺激分子の例には、CD27、CD28、4-1BB(CD137)、OX40、CD30、CD40、PD-1、ICOS、リンパ球機能関連抗原-1(LFA-1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7-H3、およびCD83と特異的に結合するリガンドなどが含まれる。かかる共刺激分子の具体的な非限定的な例には、CD2(NCBI RefSeq:NP_001758.2)のアミノ酸番号236~351、CD4(NCBI RefSeq:NP_000607.1)のアミノ酸番号421~458、CD5(NCBI RefSeq:NP_055022.2)のアミノ酸番号402~495、CD8アルファ(NCBI RefSeq:NP_001759.3)のアミノ酸番号207~235、CD83(GenBank:AAA35664.1)のアミノ酸番号196~210、CD28(NCBI RefSeq:NP_006130.1)のアミノ酸番号181~220、CD137(4-1BB、NCBI RefSeq:NP_001552.2)のアミノ酸番号214~255、CD134(OX40、NCBI RefSeq:NP_003318.1)のアミノ酸番号241~277およびICOS(NCBI RefSeq:NP_036224.1)のアミノ酸番号166~199の配列を有するペプチド、ならびにこれらのペプチドが有するのと同じ機能を有するそれらのバリアントが含まれる。したがって、本明細書の開示は、4-1BBを共刺激シグナル伝達エレメントとして主に例示するが、他の共刺激エレメントが本開示の範囲内である。
CARの細胞質シグナル伝達部分内の細胞質シグナル伝達配列は、ランダムにまたは特定された順序で、互いに連結され得る。任意選択で、短いオリゴペプチドリンカーまたはポリペプチドリンカー、好ましくは2アミノ酸長と10アミノ酸長との間が、連結を形成し得る。グリシン-セリン二つ組は、特に適切なリンカーを提供する。
一実施形態では、細胞内ドメインは、CD3-ゼータのシグナル伝達ドメインおよびCD28のシグナル伝達ドメインを含むように設計される。別の実施形態では、細胞内ドメインは、CD3-ゼータのシグナル伝達ドメインおよび4-1BBのシグナル伝達ドメインを含むように設計される。さらに別の実施形態では、細胞内ドメインは、CD3-ゼータのシグナル伝達ドメインならびにCD28および4-1BBのシグナル伝達ドメインを含むように設計される。
一実施形態では、CAR中の細胞内ドメインは、4-1BBのシグナル伝達ドメインおよびCD3-ゼータのシグナル伝達ドメインを含むように設計され、ここで、4-1BBのシグナル伝達ドメインは、配列番号40に示される核酸配列を含み、CD3-ゼータのシグナル伝達ドメインは、配列番号42に示される核酸配列を含む。
一実施形態では、CAR中の細胞内ドメインは、4-1BBのシグナル伝達ドメインおよびCD3-ゼータのシグナル伝達ドメインを含むように設計され、ここで、4-1BBのシグナル伝達ドメインは、配列番号41のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含み、CD3-ゼータのシグナル伝達ドメインは、配列番号43のアミノ酸配列をコードする核酸配列を含む。
一実施形態では、CAR中の細胞内ドメインは、4-1BBのシグナル伝達ドメインおよびCD3-ゼータのシグナル伝達ドメインを含むように設計され、ここで、4-1BBのシグナル伝達ドメインは、配列番号41に示されるアミノ酸配列を含み、CD3-ゼータのシグナル伝達ドメインは、配列番号43に示されるアミノ酸配列を含む。
5.CARのさらなる記載
本明細書で開示されるCARの機能的部分もまた、本発明の範囲内に明示的に含まれる。用語「機能的部分」とは、CARに関して使用する場合、本明細書に開示されるCARの1または複数の任意の一部または断片を指し、この一部または断片は、それがその一部であるCAR(親CAR)の生物学的活性を保持する。機能的部分は、例えば、親CARと類似の程度、同じ程度、またはより高い程度まで、標的細胞を認識する能力、または疾患を検出、処置もしくは予防する能力を保持する、CRAの一部を包含する。親CARに関して、機能的部分は、例えば、親CARの約10%、25%、30%、50%、68%、80%、90%、95%またはそれ超を構成し得る。
機能的部分は、その部分のアミノ末端もしくはカルボキシ末端において、または両方の末端において、さらなるアミノ酸を含み得、このさらなるアミノ酸は、親CARのアミノ酸配列中には見出されない。望ましくは、さらなるアミノ酸は、例えば、標的細胞を認識し、がんを検出し、がんを処置または予防するなどの、機能的部分の生物学的機能を妨害しない。より望ましくは、さらなるアミノ酸は、親CARの生物学的活性と比較して、その生物学的活性を増強する。
本明細書に開示されるCARの機能的バリアントが、本開示の範囲内に含まれる。用語「機能的バリアント」とは、本明細書で使用する場合、親CARに対する実質的なまたは著しい配列同一性または類似性を有するCAR、ポリペプチドまたはタンパク質を指し、この機能的バリアントは、それがそのバリアントであるCARの生物学的活性を保持する。機能的バリアントは、例えば、親CARと類似の程度、同じ程度、またはより高い程度まで、標的細胞を認識する能力を保持する、本明細書に記載されるCAR(親CAR)のバリアントを包含する。親CARに関して、機能的バリアントは、例えば、親CARに対して、少なくとも約30%、50%、75%、80%、90%、98%またはそれ超、アミノ酸配列が同一であり得る。
機能的バリアントは、例えば、少なくとも1つの保存的アミノ酸置換を有する親CARのアミノ酸配列を含み得る。あるいは、またはさらに、機能的バリアントは、少なくとも1つの非保存的アミノ酸置換を有する親CARのアミノ酸配列を含み得る。この場合、非保存的アミノ酸置換は、機能的バリアントの生物学的活性を妨害も阻害もしないことが好ましい。非保存的アミノ酸置換は、機能的バリアントの生物学的活性を増強し得、その結果、機能的バリアントの生物学的活性は、親CARと比較して増加される。
CARのアミノ酸置換は、好ましくは、保存的アミノ酸置換である。保存的アミノ酸置換は、当該分野で公知であり、これには、ある特定の物理的および/または化学的特性を有する1つのアミノ酸が、同じまたは類似の化学的または物理的特性を有する別のアミノ酸に交換されるアミノ酸置換が含まれる。例えば、保存的アミノ酸置換は、酸性/負に荷電した別の極性アミノ酸(例えば、AspまたはGlu)を置換する酸性/負に荷電した極性アミノ酸、非極性側鎖を有する別のアミノ酸(例えば、Ala、Gly、Val、He、Leu、Met、Phe、Pro、Trp、Cys、Valなど)を置換する非極性側鎖を有するアミノ酸、塩基性/正に荷電した別の極性アミノ酸(例えば、Lys、His、Argなど)を置換する塩基性/正に荷電した極性アミノ酸、極性側鎖を有する別の非荷電アミノ酸(例えば、Asn、Gin、Ser、Thr、Tyrなど)を置換する極性側鎖を有する非荷電アミノ酸、ベータ分岐側鎖を有する別のアミノ酸(例えば、He、ThrおよびVal)を置換するベータ分岐側鎖を有するアミノ酸、芳香族側鎖を有する別のアミノ酸(例えば、His、Phe、TrpおよびTyr)を置換する芳香族側鎖を有するアミノ酸などであり得る。
CARは、本明細書に記載される特定されたアミノ酸配列(単数または複数)から本質的になり得、その結果、他の構成要素、例えば、他のアミノ酸は、機能的バリアントの生物学的活性を著しくは変化させない。
CAR(機能的部分および機能的バリアントを含む)は、任意の長さであり得る、即ち、任意の数のアミノ酸を含み、但し、CAR(またはその機能的部分もしくは機能的バリアント)は、それらの生物学的活性、例えば、抗原に特異的に結合する能力、哺乳動物において罹患細胞を検出する能力、または哺乳動物において疾患を処置もしくは予防する能力などを保持する。例えば、CARは、約50~約5000アミノ酸長、例えば、50、70、75、100、125、150、175、200、300、400、500、600、700、800、900、1000またはそれ超アミノ酸長であり得る。
CAR(本発明の機能的部分および機能的バリアントを含む)は、1または複数の天然に存在するアミノ酸の代わりに合成アミノ酸を含み得る。かかる合成アミノ酸は、当該分野で公知であり、これには、例えば、アミノシクロヘキサンカルボン酸、ノルロイシン、-アミノ n-デカン酸、ホモセリン、S-アセチルアミノメチル-システイン、トランス-3-ヒドロキシプロリンおよびトランス-4-ヒドロキシプロリン、4-アミノフェニルアラニン、4-ニトロフェニルアラニン、4-クロロフェニルアラニン、4-カルボキシフェニルアラニン、β-フェニルセリン、β-ヒドロキシフェニルアラニン、フェニルグリシン、a-ナフチルアラニン、シクロヘキシルアラニン、シクロヘキシルグリシン、インドリン-2-カルボン酸、1,2,3,4-テトラヒドロイソキノリン-3-カルボン酸、アミノマロン酸、アミノマロン酸モノアミド、N’-ベンジル-N’-メチル-リシン、Ν’,Ν’-ジベンジル-リシン、6-ヒドロキシリシン、オルニチン、-アミノシクロペンタンカルボン酸、a-アミノシクロヘキサンカルボン酸、a-アミノシクロヘプタンカルボン酸、a-(2-アミノ-2-ノルボルナン)-カルボン酸、γ-ジアミノ酪酸、β-ジアミノプロピオン酸、ホモフェニルアラニンおよびa-tert-ブチルグリシンが含まれる。
CAR(機能的部分および機能的バリアントを含む)は、グリコシル化、アミド化、カルボキシル化、リン酸化、エステル化、N-アシル化、例えばジスルフィド架橋を介した環化、もしくは酸付加塩へ変換および/または任意選択で二量体化もしくは重合、あるいはコンジュゲートされ得る。
CAR(その機能的部分および機能的バリアントを含む)は、当該分野で公知の方法によって得られ得る。CARは、ポリペプチドまたはタンパク質を作製する任意の適切な方法によって作製され得る。ポリペプチドおよびタンパク質をデノボ合成する適切な方法は、Chanら、Fmoc Solid Phase Peptide Synthesis、Oxford University Press、Oxford、United Kingdom、2000年;Peptide and Protein Drug Analysis、Reid,R.編、Marcel Dekker,Inc.、2000年;Epitope Mapping、Westwoodら編、Oxford University Press、Oxford、United Kingdom、2001年;および米国特許第5,449,752号などの参考文献に記載されている。また、ポリペプチドおよびタンパク質は、標準的な組換え法を使用し、本明細書に記載される核酸を用いて組換え産生可能である。例えば、Sambrook et al.、Molecular Cloning:A Laboratory Manual、3rd ed.、Cold Spring Harbor Press、Cold Spring Harbor、NY 2001;およびAusubel et al.、Current Protocols in Molecular Biology、Greene Publishing Associates and John Wiley & Sons、NY、1994を参照のこと。さらに、一部のCAR(機能性部分およびその機能性バリアントを含む)は、植物、細菌、昆虫、哺乳動物、例えばラット、ヒトなどの供給源から単離および/または精製することができる。単離および精製方法は当技術分野で周知である。あるいは、本明細書に記載されるCAR(機能性部分およびその機能性バリアントを含む)を、企業が商業的に合成することもできる。この点で、CARは合成であっても、組換えであっても、単離されていても、かつ/または精製されていてもよい。
B.抗体および抗原結合性断片
一実施形態は、CAR、CARを発現するT細胞、本明細書で開示された抗原のうち1または複数に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性ドメインもしくは部分をさらに提供する。本明細書で使用する場合、「CARを発現するT細胞」または「CAR T細胞」とは、CARを発現するT細胞を意味し、例えば、CARの抗体由来の標的化ドメインによって決定される抗原特異性を有する。
本明細書で使用する場合、「抗原結合性ドメイン」は、抗体およびその抗原結合性断片を含み得る。用語「抗体」は、最も広い意味で本明細書において使用され、それらが所望の抗原結合活性を示す限り、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多特異的抗体(例えば、二重特異的抗体)、およびそれらの抗原結合性断片を含むがこれらに限定されない種々の抗体構造を包含する。抗体の非限定的な例には、例えば、当該分野で公知のインタクトな免疫グロブリン、ならびに抗原に対する結合親和性を保持するそのバリアントおよび断片が含まれる。
「モノクローナル抗体」は、実質的に均質な抗体の集団から得られた抗体である、即ち、集団を構成する個々の抗体は、微量で存在し得る可能な天然に存在する変異を除いて同一である。モノクローナル抗体は、高度に特異的であり、単一の抗原性エピトープに対するものである。修飾語「モノクローナル」は、抗体の実質的に均質な集団から得られるという抗体の特徴を示すのであって、任意の特定の方法による抗体の産生を必要とすると解釈すべきではない。一部の例では、モノクローナル抗体は、単一クローンのBリンパ球によって産生された抗体、または単一の抗体(またはその抗原結合性断片)の抗体の軽鎖および重鎖可変領域をコードする核酸がトランスフェクトされた細胞、もしくはその子孫によって産生された抗体である。一部の例では、モノクローナル抗体は、対象から単離される。モノクローナル抗体は、抗原結合または他の免疫グロブリン機能に対する影響を実質的に有さない保存的アミノ酸置換を有し得る。モノクローナル抗体の産生の例示的な方法は公知であり、例えば、Harlow & Lane、Antibodies,A Laboratory Manual、第2版 Cold Spring Harbor Publications、New York(2013年)を参照のこと。
典型的には、免疫グロブリンは、ジスルフィド結合によって相互接続された重(H)鎖および軽(L)鎖を有する。免疫グロブリン遺伝子は、カッパ、ラムダ、アルファ、ガンマ、デルタ、イプシロンおよびミュー定常領域遺伝子、ならびに無数の免疫グロブリン可変ドメイン遺伝子を含む。2つの型の軽鎖、ラムダ(λ)およびカッパ(κ)が存在する。抗体分子の機能的活性を決定する5つの主要な重鎖クラス(またはアイソタイプ):IgM、IgD、IgG、IgAおよびIgEが存在する。
各重鎖および軽鎖は、定常領域(または定常ドメイン)および可変領域(または可変ドメインを含有する;例えば、Kindtら Kuby Immunology、第6版、W.H.Freeman and Co.、91頁(2007年)を参照のこと)。いくつかの実施形態では、重鎖および軽鎖の可変領域は、組み合わさって、抗原に特異的に結合する。さらなる実施形態では、重鎖可変領域のみが必要とされる。例えば、重鎖のみからなる天然に存在するラクダ科動物(camelid)抗体は、軽鎖の非存在下で機能的かつ安定である(例えば、Hamers-Castermanら、Nature、363巻:446~448頁、1993年;Sheriffら、Nat.Struct.Biol.、3巻:733~736頁、1996年を参照のこと)。「VH」または「VH」への言及は、抗原結合性断片、例えば、Fv、ScFv、dsFvまたはFabのものを含む、抗体重鎖の可変領域を指す。「VL」または「VL」への言及は、Fv、ScFv、dsFvまたはFabのものを含む、抗体軽鎖の可変ドメインを指す。
軽鎖および重鎖の可変領域は、「相補性決定領域」または「CDR」とも呼ばれる3つの超可変領域によって中断された「フレームワーク」領域を含有する(例えば、Kabatら、Sequences of Proteins of Immunological Interest、U.S.Department of Health and Human Services、1991年を参照のこと)。異なる軽鎖または重鎖のフレームワーク領域の配列は、種内で比較的保存されている。構成成分である軽鎖および重鎖の組み合わされたフレームワーク領域である抗体のフレームワーク領域は、3次元空間にCDRを位置付けアラインさせるように機能する。
CDRは主に、抗原のエピトープへの結合を担う。所与のCDRのアミノ酸配列境界は、Kabatら(「Sequences of Proteins of Immunological Interest」、第5版 Public Health Service、National Institutes of Health、Bethesda、MD、1991年;「Kabat」番号付けスキーム)、Al-Lazikaniら、(JMB 273巻、927~948頁、1997年;「Chothia」番号付けスキーム)、およびLefrancら(「 IMGT unique numbering for immunoglobulin and T cell receptor variable domains and Ig superfamily V-like domains」、Dev.Comp.Immunol.、27巻:55~77頁、2003年;「IMGT」番号付けスキーム)に記載されるものを含む、いくつかの周知のスキームのいずれかを使用して容易に決定され得る。各鎖のCDRは、典型的には、CDR1、CDR2およびCDR3(N末端からC末端へ)と呼ばれ、典型的には、特定のCDRが位置する鎖によっても同定される。したがって、VH CDR3は、それが見出される抗体の重鎖の可変ドメイン由来のCDR3であるが、VL CDR1は、それが見出される抗体の軽鎖の可変ドメイン由来のCDR1である。軽鎖CDRは、LCDR1、LCDR2およびLCDR3と呼ばれる場合もある。重鎖CDRは、LCDR1、LCDR2およびLCDR3と呼ばれる場合もある。
「抗原結合性断片」は、同族抗原を特異的に認識する能力を保持する全長抗体の部分、ならびにかかる部分の種々の組合せである。抗原結合性断片の非限定的な例には、Fv、Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)2;ディアボディ(diabody);直鎖状抗体;単鎖抗体分子(例えば、ScFv);および抗体断片から形成された多特異的抗体が含まれる。抗体断片には、抗体全体の改変によって産生された抗原結合性断片、または組換えDNA方法論を使用してde novoで合成された抗原結合性断片が含まれる(例えば、KontermannおよびDubel(編)、Antibody Engineering、1~2巻、第2版、Springer Press、2010年を参照のこと)。
単鎖抗体(ScFv)は、適切なポリペプチドリンカーによって連結された1または複数の抗体(複数可)のVHおよびVLドメインを遺伝学的に融合された単鎖分子として含有する遺伝子操作された分子である(例えば、Birdら、Science、242巻:423~426頁、1988年;Hustonら、Proc.Natl.Acad.Sci.、85巻:5879~5883頁、1988年;Ahmadら、Clin.Dev.Immunol.、2012年、doi:10.1155/2012/980250;Marbry、IDrugs、13巻:543~549頁、2010年を参照のこと)。ScFv中のVHドメインおよびVLドメインの分子内配向は、典型的には、ScFvにとって決定的ではない。したがって、両方の可能な配置(VHドメイン-リンカードメイン-VLドメイン;VLドメイン-リンカードメイン-VHドメイン)を有するScFvが使用され得る。
dsFvでは、重鎖および軽鎖の可変鎖は、鎖の会合を安定化させるために、ジスルフィド結合を導入するように変異されている。VHおよびVLドメインが、単一のポリペプチド鎖上で発現されるが、同じ鎖上の2つのドメイン間のペアリングを可能にするには短すぎるリンカーを使用し、それによって、そのドメインを別の鎖の相補的ドメインとペアリングさせ、2つの抗原結合部位を創出する、二価の二重特異的抗体であるディアボディもまた含まれる(例えば、Holligerら、Proc.Natl.Acad.Sci.、90巻:6444~6448頁、1993年;Poljakら、Structure、2巻:1121~1123頁、1994年を参照のこと)。
抗体は、キメラ抗体(例えば、ヒト化マウス抗体)およびヘテロコンジュゲート抗体(例えば、二重特異的抗体)などの、遺伝子操作された形態もまた含む。Pierce Catalog and Handbook、1994~1995年(Pierce Chemical Co.、Rockford、IL);Kuby,J.、Immunology、第3版、W.H.Freeman & Co.、New York、1997年もまた参照のこと。
天然に存在しない抗体は、固相ペプチド合成を使用して構築され得、組換え産生され得、または、例えば、参照により本明細書に組み込まれるHuseら、Science 246巻:1275~1281頁(1989年)に記載されるように、可変重鎖および可変軽鎖からなるコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングすることによって得られ得る。例えば、キメラ、ヒト化、CDR移植、単鎖および二機能性抗体を作製するこれらおよび他の方法は、当業者に周知である(WinterおよびHarris、Immunol.Today 14巻:243~246頁(1993年);Wardら、Nature 341巻:544~546頁(1989年);HarlowおよびLane、上記、1988年;Hilyardら、Protein Engineering:A practical approach(IRL Press 1992年);Borrabeck、Antibody Engineering、第2版(Oxford University Press 1995年);その各々は、参照により本明細書に組み込まれる)。
参照抗体と「同じエピトープに結合する抗体」とは、競合アッセイにおいてその抗原への参照抗体の結合を50%またはそれ超遮断する抗体を指し、逆に、参照抗体は、競合アッセイにおいてその抗原への抗体の結合を50%またはそれ超遮断する。抗体競合アッセイは公知であり、例示的な競合アッセイが本明細書で提供される。
「ヒト化」抗体または抗原結合性断片は、ヒトフレームワーク領域および非ヒト(例えば、マウス、ラットまたは合成)抗体または抗原結合性断片由来の1または複数のCDRを含む。CDRを提供する非ヒト抗体または抗原結合性断片は、「ドナー」と呼ばれ、フレームワークを提供するヒト抗体または抗原結合性断片は、「アクセプター」と呼ばれる。一実施形態では、全てのCDRが、ヒト化免疫グロブリン中のドナー免疫グロブリン由来である。定常領域は、存在する必要はないが、存在する場合には、ヒト免疫グロブリン定常領域と実質的に同一、例えば、少なくとも約85~90%、例えば、約95%またはそれ超同一であり得る。したがって、ヒト化抗体または抗原結合性断片の全ての部分は、おそらくはCDRを除いて、天然ヒト抗体配列の対応する部分と実質的に同一である。
「キメラ抗体」は、典型的には異なる種のものである2つの異なる抗体に由来する配列を含む抗体である。一部の例では、キメラ抗体は、1つのヒト抗体由来の1または複数のCDRおよび/またはフレームワーク領域ならびに別のヒト抗体由来のCDRおよび/またはフレームワーク領域を含む。
「完全ヒト抗体」または「ヒト抗体」は、ヒトゲノム由来の(またはヒトゲノムに由来する)配列を含むが、別の種由来の配列を含まない抗体である。一部の実施形態では、ヒト抗体は、ヒトゲノム由来の(またはヒトゲノムに由来する)CDR、フレームワーク領域および(存在する場合には)Fc領域を含む。ヒト抗体は、例えば、ファージディスプレイによって、ヒトゲノムに由来する配列に基づいて配列を創出するためのテクノロジーを使用して、またはトランスジェニック動物を使用して、同定および単離され得る(例えば、Barbasら Phage display:A Laboratory Manuel.第1版 New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press、2004年 Print.;Lonberg、Nat.Biotech.、23巻:1117~1125頁、2005年;Lonenberg、Curr.Opin.Immunol.、20巻:450~459頁、2008年を参照のこと)。
抗体は、1または複数の結合部位を有し得る。1よりも多い結合部位が存在する場合、これらの結合部位は、互いに同一であってもよく、異なってもよい。例えば、天然に存在する免疫グロブリンは、2つの同一の結合部位を有し、単鎖抗体またはFab断片は、1つの結合部位を有するが、二重特異的または二機能性抗体は、2つの異なる結合部位を有する。
CARの任意の機能的部分に結合する能力について抗体を試験する方法は、当該分野で公知であり、これには、任意の抗体-抗原結合アッセイ、例えば、ラジオイムノアッセイ(RIA)、ELISA、ウェスタンブロット、免疫沈降および競合阻害アッセイなどが含まれる(例えば、Janewayら、以下、米国特許出願公開第2002/0197266号Al、および米国特許第7,338,929号を参照のこと)。
また、CAR、CARを発現するT細胞、抗体またはその抗原結合性部分は、検出可能な標識、例えば、放射性同位体、フルオロフォア(例えば、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)、フィコエリトリン(PE))、酵素(例えば、アルカリホスファターゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ)および元素粒子(例えば、金粒子)などを含むように改変され得る。
C.コンジュゲート
CAR、CARを発現するT細胞、または本明細書に開示された抗原のうち1もしくは複数に対して特異的なモノクローナル抗体もしくはその抗原結合性断片は、当業者に公知のいくつもの手段を使用して、エフェクター分子または検出可能なマーカーなどの薬剤にコンジュゲートされ得る。共有結合および非共有結合の両方の手段が使用され得る。コンジュゲートには、本明細書に開示された抗原のうち1または複数に特異的に結合する抗体または抗原結合性断片へのエフェクター分子または検出可能なマーカーの共有結合的連結が存在する分子を含むがこれらに限定されない。当業者は、化学療法剤、抗血管新生剤、毒素、放射活性剤、例えば、125I、32P、14C、Hおよび35S、ならびに他の標識、標的部分およびリガンドなどを含む(がこれらに限定されない)種々のエフェクター分子および検出可能なマーカーが使用され得ることを理解する。
特定のエフェクター分子または検出可能なマーカーの選択は、特定の標的分子または細胞、および所望の生物学的効果に依存する。したがって、例えば、エフェクター分子は、特定の標的細胞(例えば、腫瘍細胞)の死をもたらすために使用される細胞毒であり得る。
エフェクター分子または検出可能なマーカーを抗体または抗原結合性断片に結合させるための手順は、エフェクターの化学構造に従って変動する。ポリペプチドは、典型的には、種々の官能基;例えば、カルボン酸(COOH)、遊離アミン(-NH)またはスルフヒドリル(-SH)基を含有し、これらは、エフェクター分子または検出可能なマーカーの結合を生じるための、抗体上の適切な官能基との反応のために利用可能である。あるいは、抗体または抗原結合性断片は、さらなる反応性官能基を曝露または結合するために誘導体化される。誘導体化は、Pierce Chemical Company、Rockford、ILから入手可能なものなどの、いくつかの公知のリンカー分子のいずれかの結合を含み得る。リンカーは、抗体または抗原結合性断片をエフェクター分子または検出可能なマーカーに結合させるために使用される任意の分子であり得る。リンカーは、抗体または抗原結合性断片およびエフェクター分子または検出可能なマーカーの両方への共有結合を形成することが可能である。適切なリンカーは、当業者に周知であり、これには、直鎖もしくは分岐鎖炭素リンカー、複素環式炭素リンカーまたはペプチドリンカーが含まれるがこれらに限定されない。抗体または抗原結合性断片およびエフェクター分子または検出可能なマーカーがポリペプチドである場合、リンカーは、それらの側基を介して(例えば、システインへのジスルフィド連結を介して)構成成分アミノ酸に、または末端アミノ酸のアルファ炭素のアミノおよびカルボキシル基に結合され得る。
いくつかの実施形態では、リンカーは、存在する場合には、リンカーのサイズを増加させ、その結果、エフェクター分子または検出可能なマーカーと抗体または抗原結合性断片との間の距離が増加される、スペーサーエレメントを含み得る。例示的なスペーサーは、当業者に公知であり、これには、米国特許第7,964,566号、米国特許第7,498,298号、米国特許第6,884,869号、米国特許第6,323,315号、米国特許第6,239,104号、米国特許第6,034,065号、米国特許第5,780,588号、米国特許第5,665,860号、米国特許第5,663,149号、米国特許第5,635,483号、米国特許第5,599,902号、米国特許第5,554,725号、米国特許第5,530,097号、米国特許第5,521,284号、米国特許第5,504,191号、米国特許第5,410,024号、米国特許第5,138,036号、米国特許第5,076,973号、米国特許第4,986,988号、米国特許第4,978,744号、米国特許第4,879,278号、米国特許第4,816,444号および米国特許第4,486,414号、ならびに米国特許出願公開第20110212088号および米国特許出願公開第20110070248号中に列挙されるものが含まれ、その各々は、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる。
一部の実施形態では、リンカーは、細胞内条件下で切断可能であり、その結果、リンカーの切断は、細胞内環境中で、抗体または抗原結合性断片からエフェクター分子または検出可能なマーカーを放出させる。さらに他の実施形態では、リンカーは切断不能であり、エフェクター分子または検出可能なマーカーは、例えば、抗体分解によって放出される。一部の実施形態では、リンカーは、細胞内環境中(例えば、リソソームまたはエンドソームまたはカベオラ内)に存在する切断剤によって切断可能である。リンカーは、例えば、リソソームまたはエンドソームプロテアーゼを含むがこれらに限定されない細胞内ペプチダーゼまたはプロテアーゼ酵素によって切断されるペプチドリンカーであり得る。一部の実施形態では、ペプチドリンカーは、少なくとも2アミノ酸長または少なくとも3アミノ酸長である。しかし、リンカーは、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15アミノ酸長、例えば、1~2、1~3、2~5、3~10、3~15、1~5、1~10、1~15アミノ酸長であり得る。プロテアーゼには、カテプシンBおよびDならびにプラスミンが含まれ得、その全ては、ジペプチド薬物誘導体を加水分解して、標的細胞の内側での活性薬物の放出を生じることが公知である(例えば、DubowchikおよびWalker、1999年、Pharm.Therapeutics 83巻:67~123頁を参照のこと)。例えば、チオール依存的プロテアーゼであるカテプシンBによって切断可能なペプチドリンカーが使用され得る(例えば、フェニルアラニン-ロイシンまたはグリシン-フェニルアラニン-ロイシン-グリシンリンカー)。かかるリンカーの他の例は、例えば、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第6,214,345号に記載されている。具体的な実施形態では、細胞内プロテアーゼによって切断可能なペプチドリンカーは、バリン-シトルリン(Citruline)リンカーまたはフェニルアラニン-リシンリンカーである(例えば、バリン-シトルリンリンカーを用いたドキソルビシンの合成を記載する米国特許第6,214,345号を参照のこと)。
他の実施形態では、切断可能なリンカーは、pH感受性、即ち、ある特定のpH値において加水分解に対して感受性である。典型的には、pH感受性リンカーは、酸性条件下で加水分解可能である。例えば、リソソームにおいて加水分解可能な酸不安定性リンカー(例えば、ヒドラゾン、セミカルバゾン、チオセミカルバゾン、シス-アコニットアミド(cis-aconitic amide)、オルトエステル、アセタール、ケタールなど)が使用され得る(例えば、米国特許第5,122,368号;米国特許第5,824,805号;米国特許第5,622,929号;DubowchikおよびWalker、1999年、Pharm.Therapeutics 83巻:67~123頁;Nevilleら、1989年、Biol.Chem.264巻:14653~14661頁を参照のこと)。かかるリンカーは、血液中などの中性のpH条件下で比較的安定であるが、リソソームのおよそのpHであるpH5.5または5.0を下回るpHでは不安定である。ある特定の実施形態では、加水分解可能なリンカーは、チオエーテルリンカー(例えば、アシルヒドラゾン結合を介して治療剤に結合されたチオエーテルなど)である(例えば、米国特許第5,622,929号を参照のこと)。
他の実施形態では、リンカーは、還元条件下で切断可能である(例えば、ジスルフィドリンカー)。種々のジスルフィドリンカーが当該分野で公知であり、これには、例えば、SATA(N-スクシンイミジル-S-アセチルチオアセテート)、SPDP(N-スクシンイミジル-3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート)、SPDB(N-スクシンイミジル-3-(2-ピリジルジチオ)ブチレート)およびSMPT(N-スクシンイミジル-オキシカルボニル-アルファ-メチル-アルファ-(2-ピリジル-ジチオ)トルエン)-、SPDBおよびSMPTを使用して形成され得るものが含まれる(例えば、Thorpeら、1987年、Cancer Res.47巻:5924~5931頁;Wawrzynczakら、Immunoconjugates:Antibody Conjugates in Radioimagery and Therapy of Cancer(C.W.Vogel編、Oxford U.Press、1987年);Phillipsら、Cancer Res.68巻:9280~9290頁、2008年を参照のこと)。米国特許第4,880,935号もまた参照のこと。
さらに他の具体的な実施形態では、リンカーは、マロネートリンカー(Johnsonら、1995年、Anticancer Res.15巻:1387~93頁)、マレイミドベンゾイルリンカー(Lauら、1995年、Bioorg-Med-Chem.3巻(10号):1299~1304頁)または3’-N-アミドアナログ(Lauら、1995年、Bioorg-Med-Chem.3巻(10号):1305~12頁)である。
さらに他の実施形態では、リンカーは切断不能であり、エフェクター分子または検出可能なマーカーは、抗体分解によって放出される(その全内容が参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願公開第2005/0238649号を参照のこと)。
いくつかの実施形態では、リンカーは、細胞外環境中での切断に対して抵抗性である。例えば、コンジュゲートが細胞外環境中(例えば、血漿中)に存在する場合、コンジュゲートのサンプル中のリンカーの約20%以下、約15%以下、約10%以下、約5%以下、約3%以下、または約1%以下が切断される。リンカーが細胞外環境中での切断に対して抵抗性であるか否かは、例えば、目的のリンカーを含有するコンジュゲートを、所定の期間(例えば、2、4、8、16または24時間)にわたって血漿と共にインキュベートし、次いで、血漿中に存在する遊離のエフェクター分子または検出可能なマーカーの量を定量することによって決定され得る。コンジュゲート中で使用され得る種々の例示的なリンカーは、WO2004-010957、米国特許出願公開第2006/0074008号、米国特許出願公開第20050238649号および米国特許出願公開第2006/0024317号に記載されており、その各々は、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、CARのコンジュゲート、CARを発現するT細胞、抗体またはその抗原結合性部分、および1または複数の小分子毒素、例えば、カリチアマイシン、マイタンシノイド(maytansinoid)、ドラスタチン、アウリスタチン(auristatin)、トリコテシンおよびCC1065ならびに毒素活性を有するこれらの毒素の誘導体が提供される。
マイタンシノイド毒素部分としての使用に適切なマイタンシン(maytansine)化合物は、当該分野で周知であり、公知の方法に従って天然供給源から単離され得、遺伝子操作技術(Yuら(2002年)PNAS 99巻:7968~7973頁を参照のこと)、または公知の方法に従って合成により調製されたマイタンシノール(maytansinol)およびマイタンシノールアナログを使用して産生され得る。マイタンシノイドは、チューブリン重合を阻害することによって作用する有糸分裂阻害剤である。マイタンシンは、東アフリカの低木Maytenus serrataから最初に単離された(米国特許第3,896,111号)。引き続いて、ある特定の微生物もまた、マイタンシノールおよびC-3マイタンシノールエステルなどのマイタンシノイドを産生することが発見された(米国特許第4,151,042号)。合成マイタンシノールならびにその誘導体およびアナログは、例えば、米国特許第4,137,230号;米国特許第4,248,870号;米国特許第4,256,746号;米国特許第4,260,608号;米国特許第4,265,814号;米国特許第4,294,757号;米国特許第4,307,016号;米国特許第4,308,268号;米国特許第4,308,269号;米国特許第4,309,428号;米国特許第4,313,946号;米国特許第4,315,929号;米国特許第4,317,821号;米国特許第4,322,348号;米国特許第4,331,598号;米国特許第4,361,650号;米国特許第4,364,866号;米国特許第4,424,219号;米国特許第4,450,254号;米国特許第4,362,663号;および米国特許第4,371,533号に開示されており,その各々は、参照により本明細書に組み込まれる。マイタンシノイドを含有するコンジュゲート、それを作製する方法、およびそれらの治療的使用は、例えば、米国特許第5,208,020号;米国特許第5,416,064号;米国特許第6,441,163号および欧州特許EP0 425 235 B1に開示されており、それらの開示は、参照により本明細書に明示的に組み込まれる。
さらなる毒素が、CAR、CARを発現するT細胞、抗体またはその抗原結合性部分と共に使用され得る。例示的な毒素には、Pseudomonas外毒素(PE)、ヒマ毒、アブリン、ジフテリア毒素およびそのサブユニット、リボトキシン(ribotoxin)、リボヌクレアーゼ、サポリンおよびカリチアマイシン、ならびにボツリヌス毒素A~Fが含まれる。これらの毒素は、当該分野で周知であり、多くは、商業的供給源(例えば、Sigma Chemical Company、St.Louis、MO)から容易に入手可能である。企図される毒素には、これらの毒素のバリアントも含まれる(例えば、米国特許第5,079,163号および米国特許第4,689,401号を参照のこと)。
サポリンは、リボソーム複合体の60S部分を不活性化することによってタンパク質合成を破壊する、Saponaria officinalisに由来する毒素である(Stirpeら、Bio/Technology、10巻:405~412頁、1992年)。しかし、この毒素は、細胞中への特異的進入のための機構を有さず、したがって、細胞によって効率的に取り込まれるために、内在化される細胞表面タンパク質を認識する抗体または抗原結合性断片へのコンジュゲートを必要とする。
ジフテリア毒素は、Corynebacterium diphtheriaeから単離される。典型的には、免疫毒素における使用のためのジフテリア毒素は、非特異的毒性を低減または排除するために変異される。完全な酵素活性を有するが非特異的毒性が顕著に低減された、CRM107として公知の変異体は、1970年代以降公知であり(LairdおよびGroman、J.Virol.19巻:220頁、1976年)、ヒト臨床試験において使用されてきた。米国特許第5,792,458号および米国特許第5,208,021号を参照のこと。
ヒマ毒は、Ricinus communis(トウゴマ)由来のレクチンRCA60である。ヒマ毒の例については、米国特許第5,079,163号および米国特許第4,689,401号を参照のこと。Ricinus communisアグルチニン(RCA)は、それぞれ、およそ65kDおよび120kDの分子量に従って、RCA60およびRCA120と称される2つの形態で存在する(NicholsonおよびBlaustein、J.Biochim.Biophys.Acta 266巻:543頁、1972年)。A鎖は、タンパク質合成の不活性化および細胞の死滅を担う。B鎖は、ヒマ毒を細胞表面ガラクトース残基に結合させ、細胞質ゾル中へのA鎖の輸送を促進する(Olsnesら、Nature 249巻:627~631頁、1974年および米国特許第3,060,165号)。
リボヌクレアーゼもまた、免疫毒素としての使用のために標的化分子にコンジュゲートされてきた(Suzukiら、Nat.Biotech.17巻:265~70頁、1999年を参照のこと)。例示的なリボトキシン、例えば、α-サルシン(α-sarcin)およびレストリクトシン(restrictocin)は、例えば、Rathoreら、Gene 190巻:31~5頁、1997年;ならびにGoyalおよびBatra、Biochem.345巻2部:247~54頁、2000年で議論されている。カリチアマイシンは、Micromonospora echinosporaから最初に単離されたものであり、DNA中にアポトーシスをもたらす二本鎖切断を生じさせて、エンジイン抗腫瘍抗生物質ファミリーのメンバーである(例えば、Leeら、J.Antibiot.42巻:1070~87頁、1989年を参照のこと)。この薬物は、臨床試験中の免疫毒素の毒性部分である(例えば、Gillespieら、Ann.Oncol.11巻:735~41頁、2000年を参照のこと)。
アブリンは、Abrus precatorius由来の毒性レクチンを含む。毒性素であるアブリンa、b、cおよびdは、約63kDおよび67kDの分子量を有し、2つのジスルフィド連結されたポリペプチド鎖AおよびBから構成される。A鎖はタンパク質合成を阻害する;B鎖(アブリン-b)は、D-ガラクトース残基に結合する(Funatsuら、Agr.Biol.Chem.52巻:1095頁、1988年;およびOlsnes、Methods Enzymol.50巻:330~335頁、1978年を参照のこと)。
CAR、CARを発現するT細胞、本明細書に開示された抗原のうち1または複数に対して特異的なモノクローナル抗体、その抗原結合性断片はまた、検出可能なマーカー;例えば、ELISA、分光光度法、フローサイトメトリー、顕微鏡法または画像診断技術(例えば、コンピューター断層撮影(CT)、コンピューター体軸断層撮影(computed axial tomography)(CAT)スキャン、磁気共鳴画像法(MRI)、核磁気共鳴画像法(NMRI)、磁気共鳴断層撮影(MTR)、超音波、光ファイバー試験および腹腔鏡下試験)による検出が可能な検出可能なマーカーとコンジュゲートされ得る。検出可能なマーカーの具体的な非限定的な例には、フルオロフォア、化学発光剤、酵素的連結、放射活性同位体および重金属または化合物(例えば、MRIによる検出のための超常磁性酸化鉄ナノ結晶)が含まれる。例えば、有用な検出可能なマーカーには、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ローダミン、5-ジメチルアミン-1-ナフタレンスルホニル(napthalenesulfonyl)塩化物、フィコエリトリン、ランタニドリン光体などを含む蛍光化合物が含まれる。ルシフェラーゼ、緑色蛍光タンパク質(GFP)、黄色蛍光タンパク質(YFP)などの生物発光マーカーもまた使用される。CAR、CARを発現するT細胞、抗体またはその抗原結合性部分は、検出のために有用な酵素、例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、β-ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼ、アルカリホスファターゼ、グルコースオキシダーゼなどにもコンジュゲートされ得る。CAR、CARを発現するT細胞、抗体またはその抗原結合性部分が、検出可能な酵素とコンジュゲートされる場合、それは、識別できる反応産物を産生するために酵素が使用するさらなる試薬を添加することによって検出され得る。例えば、薬剤西洋ワサビペルオキシダーゼが存在する場合、過酸化水素およびジアミノベンジジンの添加が、視覚的に検出可能な着色反応産物をもたらす。CAR、CARを発現するT細胞、抗体またはその抗原結合性部分はまた、ビオチンとコンジュゲートされ得、アビジンまたはストレプトアビジンの結合の間接的な測定を介して検出され得る。アビジン自体が酵素または蛍光標識とコンジュゲートされ得ることに留意すべきである。
CAR、CARを発現するT細胞、抗体またはその抗原結合性部分は、ガドリニウムなどの常磁性薬剤とコンジュゲートされ得る。超常磁性酸化鉄などの常磁性薬剤もまた、標識として使用される。抗体は、ランタニド(例えば、ユーロピウムおよびジスプロシウム)およびマンガンともコンジュゲートされ得る。抗体または抗原結合性断片はまた、二次レポーターによって認識される所定のポリペプチドエピトープ(例えば、ロイシンジッパー対配列、二次抗体への結合部位、金属結合ドメイン、エピトープタグ)で標識され得る。
CAR、CARを発現するT細胞、抗体またはその抗原結合性部分はまた、放射標識されたアミノ酸とコンジュゲートされ得る。放射標識は、診断目的および治療目的の両方のために使用され得る。例えば、放射標識は、x線、発光スペクトルまたは他の診断技術によって本明細書に開示された抗原および抗原発現細胞のうち1または複数を検出するために使用され得る。さらに、放射標識は、対象における腫瘍の処置のため、例えば、神経芽細胞腫の処置のために、毒素として治療的に使用され得る。ポリペプチドのための標識の例には、以下の放射性同位体または放射性ヌクレオチド(radionucleotide)が含まれるがこれらに限定されない:H、14C、15N、35S、90Y、99Tc、111In、125I、131I。
かかる検出可能なマーカーを検出する手段は、当業者に周知である。したがって、例えば、放射標識は、写真フィルムまたはシンチレーションカウンターを使用して検出され得、蛍光マーカーは、発せられた照明を検出するために光検出器を使用して検出され得る。酵素標識は、典型的には、酵素に基質を提供し、基質に対する酵素の作用によって産生された反応産物を検出することによって検出され、発色標識は、着色標識を単純に可視化することによって検出される。
D.ヌクレオチド、発現、ベクターおよび宿主細胞
本明細書に記載されるCAR、抗体またはその抗原結合性部分(その機能的部分および機能的バリアントを含む)のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む核酸が、本発明の一実施形態によってさらに提供される。本発明の核酸は、本明細書に記載されるリーダー配列、抗原結合性ドメイン、膜貫通ドメインおよび/または細胞内T細胞シグナル伝達ドメインのいずれかをコードするヌクレオチド配列を含み得る。
一部の実施形態では、ヌクレオチド配列は、コドン改変され得る。特定の理論に束縛されないが、ヌクレオチド配列のコドン最適化は、mRNA転写物の翻訳効率を増加させると考えられる。ヌクレオチド配列のコドン最適化は、ネイティブコドンを、同じアミノ酸をコードするが、細胞内でより容易に利用可能なtRNAによって翻訳され得る別のコドンに置換し、そうして翻訳効率を増加させることを含み得る。ヌクレオチド配列の最適化はまた、翻訳を妨害する二次mRNA構造を低減させ得、そうして翻訳効率を増加させる。
本発明の実施形態では、核酸は、本発明のCARの抗原結合性ドメインをコードするコドン改変されたヌクレオチド配列を含み得る。本発明の別の実施形態では、核酸は、本明細書に記載されるCAR(その機能的部分および機能的バリアントを含む)のいずれかをコードするコドン改変されたヌクレオチド配列を含み得る。
「核酸」は、本明細書で使用する場合、「ポリヌクレオチド」、「オリゴヌクレオチド」および「核酸分子」を含み、一般に、一本鎖または二本鎖の、合成のまたは天然供給源から得られた(例えば、単離および/または精製された)ものであり得、天然、非天然または変更されたヌクレオチドを含有し得、未改変のオリゴヌクレオチドのヌクレオチド間に見出されるホスホジエステルの代わりに、天然、非天然または変更されたヌクレオチド間連結、例えば、ホスホロアミデート(phosphoroamidate)連結またはホスホロチオエート連結を含有し得る、DNAまたはRNAのポリマーを意味する。一部の実施形態では、核酸は、いずれの挿入、欠失、逆位および/または置換も含まない。しかし、一部の場合には、本明細書で議論されるように、核酸は、1または複数の挿入、欠失、逆位および/または置換を含むことが適切であり得る。
組換え核酸は、天然に存在しない配列を有するもの、または配列の2つのさもなければ分離されたセグメントの人工的な組合せによって作製される配列を有するものであり得る。この人工的な組合せは、化学的合成によって、またはより一般的には、例えばSambrookら、上記に記載されるものなどの遺伝子操作技術による、核酸の単離されたセグメントの人工的操作によって達成される場合が多い。核酸は、当該分野で公知の手順を使用する化学的合成および/または酵素的ライゲーション反応に基づいて構築され得る。例えば、Sambrookら、上記およびAusubelら、上記を参照のこと。例えば、核酸は、天然に存在するヌクレオチド、または分子の生物学的安定性を増加させるように、もしくはハイブリダイゼーションの際に形成される二重鎖の物理的安定性を増加させるように設計された種々に改変されたヌクレオチド(例えば、ホスホロチオエート誘導体およびアクリジン置換ヌクレオチド)を使用して化学合成され得る。核酸を生成するために使用され得る改変型ヌクレオチドの例には、5-フルオロウラシル、5-ブロモウラシル、5-クロロウラシル、5-ヨードウラシル、ヒポキサンチン、キサンチン、4-アセチルシトシン、5-(カルボキシヒドロキシメチル)ウラシル、5-カルボキシメチルアミノメチル-2-チオウリジン、5-カルボキシメチルアミノメチルウラシル、ジヒドロウラシル、ベータ-D-ガラクトシルキューオシン(galactosylqueosine)、イノシン、N6-イソペンテニルアデニン、1-メチルグアニン、1-メチルイノシン、2,2-ジメチルグアニン、2-メチルアデニン、2-メチルグアニン、3-メチルシトシン、5-メチルシトシン、N6-置換されたアデニン、7-メチルグアニン、5-メチルアミノメチルウラシル、5-メトキシアミノメチル-2-チオウラシル、ベータ-D-マンノシルキューオシン(mannosylqueosine)、5’-メトキシカルボキシメチルウラシル、5-メトキシウラシル、2-メチルチオ-N6-イソペンテニルアデニン、ウラシル-5-オキシ酢酸(v)、ウブトキソシン(wybutoxosine)、シュードウラシル、キューオシン(queosine)、2-チオシトシン、5-メチル-2-チオウラシル、2-チオウラシル、4-チオウラシル、5-メチルウラシル、ウラシル-5-オキシ酢酸メチルエステル、3-(3-アミノ-3-N-2-カルボキシプロピル)ウラシルおよび2,6-ジアミノプリンが含まれるがこれらに限定されない。あるいは、本発明の核酸のうち1または複数は、Integrated DNA Technologies(Coralville、IA、USA)などの会社から購入できる。
核酸は、CARまたはその機能的部分もしくは機能的バリアントのいずれかをコードする任意の単離または精製されたヌクレオチド配列を含み得る。あるいは、ヌクレオチド配列は、配列のいずれかと縮重するヌクレオチド配列、または縮重配列の組合せを含み得る。
一実施形態は、本明細書に記載される核酸のいずれかのヌクレオチド配列と相補的であるヌクレオチド配列、または本明細書に記載される核酸のいずれかのヌクレオチド配列とストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、単離または精製された核酸もまた提供する。
ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列は、高いストリンジェンシーの条件下でハイブリダイズし得る。「高いストリンジェンシーの条件」とは、ヌクレオチド配列が、非特異的ハイブリダイゼーションよりも検出可能に強い量で、標的配列(本明細書に記載される核酸のいずれかのヌクレオチド配列)に特異的にハイブリダイズすることを意味する。高いストリンジェンシーの条件には、ヌクレオチド配列と一致したいくつかの小領域(例えば、3~10塩基)を偶然に有するランダム配列から、正確に相補的な配列を有するポリヌクレオチド、またはいくつかの散在するミスマッチしか含有しないポリヌクレオチドを識別する条件が含まれる。相補性のかかる小領域は、14~17またはそれ超塩基の全長相補体よりも容易に融解され、高いストリンジェンシーのハイブリダイゼーションは、それらを容易に識別可能にする。比較的高いストリンジェンシーの条件には、例えば、約0.02~0.1MのNaClまたは等価物によって、約50~70℃の温度で提供されるような、低塩および/または高温条件が含まれる。かかる高いストリンジェンシーの条件は、存在するとしても、ヌクレオチド配列と鋳型または標的鎖との間のミスマッチをほとんど忍容せず、本発明のCARのいずれかの発現を検出するのに特に適切である。一般に、条件は、漸増量のホルムアミドの添加によって、よりストリンジェントにされ得ることが理解される。
本明細書に記載される核酸のいずれかに対して、少なくとも約70%またはそれ超、例えば、約80%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%または約99%同一であるヌクレオチド配列を含む核酸もまた提供される。
一実施形態では、核酸は、組換え発現ベクター中に取り込まれ得る。これに関して、一実施形態は、核酸のいずれかを含む組換え発現ベクターを提供する。本明細書の目的のために、用語「組換え発現ベクター」とは、構築物が、mRNA、タンパク質、ポリペプチドまたはペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む場合、およびベクターが、mRNA、タンパク質、ポリペプチドまたはペプチドが細胞内で発現されるのに十分な条件下で細胞と接触させられる場合に、宿主細胞によるmRNA、タンパク質、ポリペプチドまたはペプチドの発現を可能にする、遺伝子改変されたオリゴヌクレオチドまたはポリヌクレオチド構築物を意味する。ベクターは、全体としては天然に存在しない。
しかし、ベクターの一部は、天然に存在し得る。組換え発現ベクターは、一本鎖または二本鎖の、合成または一部天然供給源から得られたものであり得、天然、非天然または変更されたヌクレオチドを含有し得る、DNAおよびRNAを含むがこれらに限定されない任意の型のヌクレオチドを含み得る。組換え発現ベクターは、天然に存在するもしくは天然に存在しないヌクレオチド間連結、またはその両方の型の連結を含み得る。好ましくは、天然に存在しないまたは変更されたヌクレオチドまたはヌクレオチド間連結は、ベクターの転写も複製も邪魔しない。
一実施形態では、組換え発現ベクターは、任意の適切な組換え発現ベクターであり得、任意の適切な宿主細胞を形質転換またはトランスフェクトするために使用され得る。適切なベクターには、プラスミドおよびウイルスなどの、繁殖および増殖のためもしくは発現のため、またはその両方のために設計されたものが含まれる。ベクターは、pUCシリーズ(Fermentas Life Sciences、Glen Burnie、MD)、pBluescriptシリーズ(Stratagene、LaJolla、CA)、pETシリーズ(Novagen、Madison、WI)、pGEXシリーズ(Pharmacia Biotech、Uppsala、Sweden)およびpEXシリーズ(Clontech、Palo Alto、CA)からなる群から選択され得る。
バクテリオファージベクター、例えば、λυΤΙ Ο、λυΤΙ 1、λZapII(Stratagene)、EMBL4およびλΝΜΙ 149もまた使用され得る。植物発現ベクターの例には、pBIOl、pBI101.2、pBHOl.3、pBI121およびpBIN19(Clontech)が含まれる。動物発現ベクターの例には、pEUK-Cl、pMAMおよびpMAMneo(Clontech)が含まれる。組換え発現ベクターは、ウイルスベクター、例えば、レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターであり得る。レンチウイルスベクターは、特に、Miloneら、Mol.Ther.17巻(8号):1453~1464頁(2009年)に提供されるような自己不活性化レンチウイルスベクターを含む、レンチウイルスゲノムの少なくとも一部分に由来するベクターである。クリニックにおいて使用され得るレンチウイルスベクターの他の例には、例えば、限定としてではなく、Oxford BioMedica plcのLENTIVECTOR(登録商標)遺伝子送達テクノロジー、LentigenのLENTIMAX(商標)ベクター系などが含まれる。非臨床型のレンチウイルスベクターもまた利用可能であり、当業者に公知である。
いくつかのトランスフェクション技術が、当該分野で一般に公知である(例えば、Grahamら、Virology、52巻:456~467頁(1973年);Sambrookら、上記;Davisら、Basic Methods in Molecular Biology、Elsevier(1986年);およびChuら、Gene、13巻:97頁(1981年)を参照のこと)。
トランスフェクション方法には、リン酸カルシウム共沈(例えば、Grahamら、上記を参照のこと)、培養細胞中への直接的マイクロインジェクション(例えば、Capecchi、Cell、22巻:479~488頁(1980年)を参照のこと)、エレクトロポレーション(例えば、Shigekawaら、BioTechniques、6巻:742~751頁(1988年)を参照のこと)、リポソーム媒介性遺伝子移入(例えば、Manninoら、BioTechniques、6巻:682~690頁(1988年)を参照のこと)、脂質媒介性形質導入(例えば、Feignerら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、84巻:7413~7417頁(1987年)を参照のこと)および高速微小推進剤(high velocity microprojectile)を使用する核酸送達(例えば、Kleinら、Nature、327巻:70~73頁(1987年)を参照のこと)が含まれる。
一実施形態では、組換え発現ベクターは、例えば、Sambrookら、上記およびAusubelら、上記に記載される、標準的な組換えDNA技術を使用して調製され得る。環状または直鎖状である発現ベクターの構築物は、原核生物または真核生物宿主細胞において機能的な複製系を含有するように調製され得る。複製系は、例えば、ColEl、2μプラスミド、λ、SV40、ウシパピローマウイルスなどに由来し得る。
組換え発現ベクターは、ベクターがDNAベースであるかRNAベースであるかを考慮に入れて、必要に応じて、ベクターが導入される宿主細胞の型(例えば、細菌、真菌、植物または動物)に特異的な調節配列、例えば、転写および翻訳開始および終結コドンを含み得る。組換え発現ベクターは、クローニングを容易にするための制限部位を含み得る。
組換え発現ベクターは、形質転換またはトランスフェクトされた宿主細胞の選択を可能にする、1または複数のマーカー遺伝子を含み得る。マーカー遺伝子には、殺生物剤耐性、例えば、抗生物質、重金属などに対する耐性、原栄養性を提供するための栄養要求性宿主における補完などが含まれる。本発明の発現ベクターに適切なマーカー遺伝子には、例えば、ネオマイシン/G418耐性遺伝子、ハイグロマイシン耐性遺伝子、ヒスチジノール耐性遺伝子、テトラサイクリン耐性遺伝子およびアンピシリン耐性遺伝子が含まれる。
組換え発現ベクターは、CAR(その機能的部分および機能的バリアントを含む)をコードするヌクレオチド配列に、またはCARをコードするヌクレオチド配列に対して相補的なもしくはかかるヌクレオチド配列にハイブリダイズするヌクレオチド配列に作動可能に連結したネイティブまたは非ネイティブのプロモーターを含み得る。プロモーターの選択、例えば、強い、弱い、誘導性、組織特異的および発生特異的は、当業者の技術範囲内である。同様に、ヌクレオチド配列をプロモーターと組み合わせることもまた、当業者の技術範囲内である。プロモーターは、非ウイルスプロモーターまたはウイルスプロモーター、例えば、サイトメガロウイルス(CMV)プロモーター、SV40プロモーター、RSVプロモーター、またはマウス幹細胞ウイルスの末端反復配列において見出されるプロモーターであり得る。
組換え発現ベクターは、一過性の発現のため、安定な発現のため、またはその両方のために設計され得る。また、組換え発現ベクターは、構成的発現または誘導性発現のために作製され得る。
さらに、組換え発現ベクターは、自殺遺伝子を含むように作製され得る。本明細書で使用する場合、用語「自殺遺伝子」とは、自殺遺伝子を発現する細胞を死なせる遺伝子を指す。自殺遺伝子は、この遺伝子が発現される細胞に薬物などの薬剤に対する感受性を付与する遺伝子、または細胞が薬剤と接触した場合もしくは薬剤に曝露された場合にその細胞を死なせる遺伝子であり得る。自殺遺伝子は、当該分野で公知であり(例えば、Suicide Gene Therapy: Methods and Reviews、Springer、Caroline J.(Cancer Research UK Centre for Cancer Therapeutics at the Institute of Cancer Research、Sutton、Surrey、UK)、Humana Press、2004年を参照のこと)、これには、例えば、単純ヘルペスウイルス(HSV)チミジンキナーゼ(TK)遺伝子、シトシンデアミナーゼ(daminase)、プリンヌクレオシドホスホリラーゼおよびニトロレダクターゼが含まれる。
一実施形態は、本明細書に記載される組換え発現ベクターのいずれかを含む宿主細胞をさらに提供する。本明細書で使用する場合、用語「宿主細胞」とは、本発明の組換え発現ベクターを含有し得る任意の型の細胞を指す。宿主細胞は、真核生物細胞、例えば、植物、動物、真菌もしくは藻類であり得る、または原核生物細胞、例えば、細菌もしくは原生生物であり得る。宿主細胞は、培養細胞または初代細胞であり得る、即ち、ヒトなどの生物から直接単離され得る。宿主細胞は、接着細胞または懸濁細胞、即ち、懸濁物中で成長する細胞であり得る。適切な宿主細胞は、当該分野で公知であり、これには、例えば、DH5a E.coli細胞、チャイニーズハムスター卵巣細胞、サルVERO細胞、COS細胞、HEK293細胞などが含まれる。組換え発現ベクターを増幅または複製することを目的とすると、宿主細胞は、原核生物細胞、例えば、DH5a細胞であり得る。組換えCARを産生することを目的とすると、宿主細胞は、哺乳動物細胞であり得る。宿主細胞は、ヒト細胞であり得る。宿主細胞は任意の細胞型のものであり得、任意の型の組織に起源し得、任意の発生段階のものであり得るが、宿主細胞は、末梢血リンパ球(PBL)または末梢血単核球(PBMC)であり得る。宿主細胞は、T細胞であり得る。
本明細書の目的のために、T細胞は、任意のT細胞、例えば、培養T細胞、例えば、初代T細胞、または培養T細胞株、例えば、Jurkat、SupTlなど由来のT細胞、または哺乳動物から得られたT細胞であり得る。哺乳動物から得られる場合、T細胞は、血液、骨髄、リンパ節、胸腺または他の組織もしくは体液を含むがこれらに限定されない多数の供給源から得られ得る。T細胞はまた、富化または精製され得る。T細胞は、ヒトT細胞であり得る。T細胞は、ヒトから単離されたT細胞であり得る。T細胞は、CD4/CD8二重陽性T細胞、CD4ヘルパーT細胞、例えば、Th1およびTh2細胞、CD8T細胞(例えば、細胞傷害性T細胞)、腫瘍浸潤性細胞、メモリーT細胞、メモリー幹細胞、即ち、Tscm、ナイーブT細胞などを含むがこれらに限定されない、任意の型のT細胞であり得、任意の発生段階のものであり得る。T細胞は、CD8T細胞またはCD4T細胞であり得る。
一実施形態では、本明細書に記載されるCARは、適切な非T細胞において使用され得る。かかる細胞は、免疫エフェクター機能を有する細胞、例えば、多能性幹細胞から生成されたNK細胞およびT様細胞などである。
本明細書に記載される少なくとも1つの宿主細胞を含む細胞の集団もまた、一実施形態によって提供される。細胞の集団は、いずれの組換え発現ベクターも含まない少なくとも1つの他の細胞、例えば宿主細胞(例えば、T細胞)、またはT細胞以外の細胞、例えば、B細胞、マクロファージ、好中球、赤血球、肝細胞、内皮細胞、上皮細胞、筋肉細胞、脳細胞などに加えて、記載される組換え発現ベクターのいずれかを含む宿主細胞を含む不均一な集団であり得る。あるいは、細胞の集団は、実質的に均質な集団であり得、ここで、集団は主に、組換え発現ベクターを含む(例えば、それらから本質的になる)宿主細胞を含む。集団はまた、細胞のクローン性集団であり得、ここで、集団の全ての細胞は、組換え発現ベクターを含む単一の宿主細胞のクローンであり、その結果、集団の全ての細胞は、その組換え発現ベクターを含む。本発明の一実施形態では、細胞の集団は、本明細書に記載される組換え発現ベクターを含む宿主細胞を含むクローン性集団である。
CAR(その機能的部分およびバリアントを含む)、核酸、組換え発現ベクター、宿主細胞(その集団を含む)および抗体(その抗原結合性部分を含む)は、単離および/または精製され得る。例えば、精製(または単離)された宿主細胞の調製物は、宿主細胞が身体内のその天然環境中の細胞よりも純粋である調製物である。かかる宿主細胞は、例えば、標準的な精製技術によって産生され得る。一部の実施形態では、宿主細胞の調製物は精製され、その結果、宿主細胞は、調製物の総細胞含量の少なくとも約50%、例えば、少なくとも約70%を示す。例えば、純度は、少なくとも約50%であり得、約60%、約70%もしくは約80%よりも上であり得、または約100%であり得る。
E.処置の方法
本明細書で開示されるCARは、哺乳動物において疾患を処置または予防する方法において使用され得ることが企図される。これに関して、一実施形態は、CAR、核酸、組換え発現ベクター、宿主細胞、細胞の集団、抗体および/もしくはその抗原結合性部分、ならびに/または医薬組成物を、哺乳動物においてがんを処置または予防するのに有効な量で哺乳動物に投与するステップを含む、哺乳動物においてがんを処置または予防する方法を提供する。
一実施形態は、本明細書に開示されるCARを投与するステップの前に、哺乳動物をリンパ枯渇させる(lymphodepleting)ステップをさらに含む。リンパ枯渇の例には、非骨髄破壊的リンパ枯渇性化学療法、骨髄破壊的リンパ枯渇性化学療法、全身照射などが含まれ得るがこれらに限定されない。
宿主細胞、または細胞の集団が投与される方法を目的として、細胞は、哺乳動物にとって同種または自家である細胞であり得る。好ましくは、細胞は、哺乳動物にとって自家である。本明細書で使用する場合、同種とは、材料が導入される個体と同じ種の異なる動物に由来する任意の材料を意味する。1または複数の遺伝子座において遺伝子が同一でない場合、2以上の個体は、互いに同種であると言われる。一部の態様では、同じ種の個体由来の同種材料は、抗原性に相互作用するのに十分に遺伝的に異なり得る。本明細書で使用する場合、「自家」とは、個体に後に再導入される、同じ個体に由来する任意の材料を意味する。
本明細書で言及される哺乳動物は、任意の哺乳動物であり得る。本明細書で使用する場合、用語「哺乳動物」とは、齧歯目の哺乳動物、例えば、マウスおよびハムスター、ならびにウサギ(Logomorpha)目の哺乳動物、例えば、ウサギを含むがこれらに限定されない任意の哺乳動物を指す。哺乳動物は、ネコ(Feline)(ネコ(cat))およびイヌ(Canine)(イヌ(dog))を含む食肉目由来であり得る。哺乳動物は、ウシ(Bovine)(ウシ(cow))およびブタ(Swine)(ブタ(pig))を含む偶蹄目由来、またはウマ(Equine)(ウマ(horse))を含む奇蹄目(Perssodactyla)のものであり得る。哺乳動物は、霊長目、新世界ザル(Ceboid)目もしくはサル(Simoid)目(サル(monkey))または類人猿(Anthropoid)目(ヒトおよび類人猿(ape))のものであり得る。好ましくは、哺乳動物はヒトである。
これらの方法に関して、がんは、急性リンパ性がん、急性骨髄性白血病、胞巣状横紋筋肉腫、膀胱がん(例えば、膀胱癌)、骨がん、脳がん(例えば、髄芽腫)、乳房がん、肛門、肛門管もしくは肛門直腸のがん、眼のがん、肝内胆管のがん、関節のがん、頸部、胆嚢もしくは胸膜のがん、鼻、鼻腔もしくは中耳のがん、口腔のがん、外陰部のがん、慢性リンパ性白血病、慢性骨髄性がん(chronic myeloid cancer)、結腸がん、食道がん、子宮頸がん、線維肉腫、消化管カルチノイド腫瘍、頭頸部がん(例えば、頭頸部扁平上皮癌)、ホジキンリンパ腫、下咽頭がん、腎臓がん、喉頭がん、白血病、液性腫瘍、肝臓がん、肺がん(例えば、非小細胞肺癌および肺腺癌)、リンパ腫、中皮腫、肥満細胞腫、黒色腫、多発性骨髄腫、上咽頭がん、非ホジキンリンパ腫、B-慢性リンパ性白血病、ヘアリー細胞白血病、急性リンパ性白血病(ALL)およびバーキットリンパ腫、卵巣がん、膵がん、腹膜、網および腸間膜のがん、咽頭がん、前立腺がん、直腸がん、腎がん、皮膚がん、小腸がん、軟組織がん、固形腫瘍、滑膜肉腫、胃がん、精巣がん、甲状腺がんならびに尿管がんのいずれかを含む任意のがんであり得る。
用語「処置する」および「予防する」ならびにそれらから派生した単語は、本明細書で使用する場合、100%または完全な処置または予防を必ずしも意味しない。むしろ、当業者が潜在的な有益な効果または治療効果を有すると認識する、種々の程度の処置または予防が存在する。これに関して、この方法は、任意の量または任意のレベルの、哺乳動物におけるがんの処置または予防を提供し得る。
さらに、この方法によって提供される処置または予防には、処置または予防されているがんなどの疾患の1または複数の状態または症状の処置または予防が含まれ得る。また、本明細書の目的のために、「予防」は、疾患、またはその症状もしくは状態の発病を遅延させることを包含し得る。
別の実施形態は、哺乳動物におけるがんの存在を検出する方法であって、(a)哺乳動物由来の1または複数の細胞を含む試料を、CAR、核酸、組換え発現ベクター、宿主細胞、細胞の集団、抗体および/もしくはその抗原結合性部分、または医薬組成物と接触させ、それによって、複合体を形成するステップ、ならびに(b)複合体を検出するステップであって、複合体の検出が、哺乳動物におけるがんの存在を示す、ステップを含む方法を提供する。
試料は、任意の適切な方法、例えば、生検または剖検によって得られ得る。生検は、個体からの組織および/または細胞の取り出しである。かかる取り出しは、取り出された組織および/または細胞に対する実験を実施するために、個体から組織および/または細胞を収集することであり得る。この実験には、個体がある特定の状態もしくは疾患状態を有するかどうか、および/またはある特定の状態もしくは疾患状態に罹患しているかどうかを決定するための実験が含まれ得る。状態または疾患は、例えば、がんであり得る。
哺乳動物における増殖障害、例えばがんの存在を検出する方法の実施形態に関して、哺乳動物の細胞を含む試料は、細胞全体、その溶解物、または細胞全体溶解物の画分、例えば、核もしくは細胞質画分、タンパク質全体画分、または核酸画分を含む試料であり得る。試料が細胞全体を含む場合、これらの細胞は、哺乳動物の任意の細胞、例えば、血液細胞または内皮細胞を含む任意の臓器または組織の細胞であり得る。
接触させるステップは、哺乳動物に関してin vitroまたはin vivoで起こり得る。好ましくは、接触させるステップは、in vitroである。
また、複合体の検出は、当該分野で公知の多くの方法によって行われ得る。例えば、本明細書に記載される、本明細書に開示されるCAR、ポリペプチド、タンパク質、核酸、組換え発現ベクター、宿主細胞、細胞の集団、または抗体もしくはその抗原結合性部分は、検出可能な標識、例えば、上に開示される放射性同位体、フルオロフォア(例えば、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)、フィコエリトリン(PE))、酵素(例えば、アルカリホスファターゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ)および元素粒子(例えば、金粒子)などで標識され得る。
標的細胞を認識する能力および抗原特異性についてCARを試験する方法は、当該分野で公知である。例えば、Clayら、J.Immunol、163巻:507~513頁(1999年)は、サイトカイン(例えば、インターフェロン-γ、顆粒球/単球コロニー刺激因子(granulocyte/monocyte colony stimulating factor)(GM-CSF)、腫瘍壊死因子a(TNF-a)またはインターロイキン2(IL-2))の放出を測定する方法を教示している。さらに、CAR機能は、Zhaoら、J.Immunol.174巻:4415~4423頁(2005年)に記載されるように、細胞傷害性の測定によって評価され得る。
別の実施形態は、本発明のCAR、核酸、組換え発現ベクター、宿主細胞、細胞の集団、抗体もしくはその抗原結合性部分、および/または医薬組成物の使用、哺乳動物におけるがんなどの増殖障害の処置または予防を提供する。がんは、本明細書に記載されるがんのいずれかであり得る。
局所および全身投与を含む任意の投与方法が、開示された治療剤のために使用され得る。例えば、外用、経口、静脈内などの血管内、筋内、腹腔内、鼻腔内、皮内、くも膜下腔内および皮下投与が使用され得る。特定の投与様式および投薬レジメンは、症例の特徴(例えば、対象、疾患、関与する疾患状態、および処置が予防的かどうか)を考慮して、担当の臨床医によって選択される。1よりも多い薬剤または組成物が投与されている場合、1または複数の投与経路が使用され得る;例えば、化学療法剤は、経口投与され得、抗体もしくは抗原結合性断片またはコンジュゲートまたは組成物は、静脈内投与され得る。投与方法には、CAR、CAR T細胞、コンジュゲート、抗体、抗原結合性断片または組成物が、非毒性の薬学的に許容される担体、例えば、水、食塩水、リンゲル溶液、デキストロース溶液、5%ヒト血清アルブミン、固形油、オレイン酸エチルまたはリポソーム中に提供される注射が含まれる。一部の実施形態では、開示された化合物の局所投与は、例えば、腫瘍が除去された組織の領域、または腫瘍発達の傾向があると疑われる領域に、抗体または抗原結合性断片を適用することによって使用され得る。一部の実施形態では、治療有効量の抗体または抗原結合性断片を含む医薬調製物の持続性の腫瘍内(または腫瘍近傍)放出が有益であり得る。他の例では、コンジュゲートが、角膜に点眼薬として外用で、または目に硝子体内で適用される。
開示された治療剤は、正確な投薬量の個々の投与に適切な単位剤形で製剤化され得る。さらに、開示された治療剤は、単一の用量でまたは複数用量のスケジュールで投与され得る。複数用量のスケジュールは、処置の主要な過程が、1よりも多い別々の用量、例えば1~10用量と、その後の、組成物の作用を維持または強化するために必要に応じて引き続く時間間隔で与えられる他の用量とによるものであり得るスケジュールである。処置は、数日~数カ月またはさらには数年の期間にわたる、1日用量または複数の1日用量の化合物(複数可)を含み得る。したがって、投薬レジームはまた、処置される対象の特定の要求に基づいて少なくとも一部決定され、投与する実務者の判断に依存する。
抗体またはコンジュゲートの典型的な投薬量は、約0.01~約30mg/kg、例えば、約0.1~約10mg/kgの範囲であり得る。
特定の例では、対象には、複数の1日投薬スケジュールで、例えば、少なくとも2連続日、10連続日など、例えば、数週間、数カ月または数年の期間にわたって、コンジュゲート、抗体、組成物、CAR、CAR T細胞またはさらなる薬剤のうち1または複数を含む治療組成物が投与される。一例では、対象には、少なくとも30日、例えば、少なくとも2カ月、少なくとも4カ月、少なくとも6カ月、少なくとも12カ月、少なくとも24カ月または少なくとも36カ月の期間にわたって、コンジュゲート、抗体、組成物またはさらなる薬剤が投与される。
一部の実施形態では、開示された方法は、開示された抗体、抗原結合性断片、コンジュゲート、CARまたはCARを発現するT細胞と組み合わせて、手術、放射線療法および/または化学療法薬を(例えば、連続的に、実質的に同時にまたは同時に)対象に提供することを含む。かかる薬剤および処置の方法および治療的投薬量は、当業者に公知であり、熟練の臨床医によって決定され得る。さらなる薬剤についての調製および投薬スケジュールは、製造業者の指示に従って使用され得る、または当業者によって実験的に決定される通りであり得る。かかる化学療法についての調製および投薬スケジュールは、Chemotherapy Service、(1992年)M.C.Perry編、Williams & Wilkins、Baltimore、Mdにも記載されている。
一部の実施形態では、併用治療は、治療有効量のさらなるがん阻害剤の、対象への投与を含み得る。併用治療で使用され得るさらなる治療剤の非限定的な例には、微小管結合剤、DNAインターカレーターまたはクロスリンカー、DNA合成阻害剤、DNAおよびRNA転写阻害剤、抗体、酵素、酵素阻害剤、遺伝子調節因子ならびに血管新生阻害剤が含まれる。これらの薬剤(治療有効量で投与される)および処置は、単独でまたは組み合わせて使用され得る。例えば、任意の適切な抗がん剤または抗血管新生剤は、本明細書に開示されるCAR、CAR-T細胞、抗体、抗原結合性断片またはコンジュゲートと組み合わせて投与され得る。方法およびかかる薬剤の治療的投薬量は、当業者に公知であり、熟練の臨床医によって決定され得る。
さらなる化学療法剤には、アルキル化剤、例えば、ナイトロジェンマスタード(例えば、クロラムブシル、クロルメチン、シクロホスファミド、イホスファミドおよびメルファラン)、ニトロソウレア(例えば、カルムスチン、ホテムスチン、ロムスチンおよびストレプトゾシン)、白金化合物(例えば、カルボプラチン、シスプラチン、オキサリプラチンおよびBBR3464)、ブスルファン、ダカルバジン、メクロレタミン、プロカルバジン、テモゾロミド、チオテパおよびウラムスチン(uramustine);代謝拮抗薬、例えば、葉酸(例えば、メトトレキサート、ペメトレキセドおよびラルチトレキセド)、プリン(例えば、クラドリビン、クロファラビン、フルダラビン、メルカプトプリンおよびチオグアニン)、ピリミジン(例えば、カペシタビン)、シタラビン、フルオロウラシルおよびゲムシタビン;植物アルカロイド、例えば、ポドフィルム(例えば、エトポシドおよびテニポシド)、タキサン(例えば、ドセタキセルおよびパクリタキセル)、ビンカ(例えば、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシンおよびビノレルビン);細胞傷害性/抗腫瘍抗生物質、例えば、アントラサイクリンファミリーのメンバー(例えば、ダウノルビシン、ドキソルビシン、エピルビシン、イダルビシン、ミトキサントロンおよびバルルビシン)、ブレオマイシン、リファンピシン、ヒドロキシウレアおよびマイトマイシン;トポイソメラーゼ阻害剤、例えば、トポテカンおよびイリノテカン;モノクローナル抗体、例えば、アレムツズマブ、ベバシズマブ、セツキシマブ、ゲムツズマブ、リツキシマブ、パニツムマブ、ペルツズマブおよびトラスツズマブ;腫瘍親和性感光色素、例えば、アミノレブリン酸、アミノレブリン酸メチル、ポルフィマーナトリウムおよびベルテポルフィン;ならびに他の薬剤、例えば、アリトレチノイン、アルトレタミン、アムサクリン、アナグレリド、三酸化ヒ素、アスパラギナーゼ、アキシチニブ、ベキサロテン、ベバシズマブ、ボルテゾミブ、セレコキシブ、デニロイキンジフチトクス、エルロチニブ、エストラムスチン、ゲフィチニブ、ヒドロキシカルバミド、イマチニブ、ラパチニブ、パゾパニブ、ペントスタチン、マソプロコール、ミトタン、ペグアスパルガーゼ、タモキシフェン、ソラフェニブ、スニチニブ、ベムラフェニブ(vemurafinib)、バンデタニブおよびトレチノインが含まれるがこれらに限定されない。かかる薬剤の選択および治療的投薬量は、当業者に公知であり、熟練の臨床医によって決定され得る。
併用療法は、相乗作用を提供し得、相乗的であることが証明され得る、即ち、活性成分が一緒に使用される場合に達成される効果は、それらの化合物を別々に使用することから生じ得る効果の合計よりも大きい。相乗効果は、活性成分が、(1)共製剤化され、併用される単位投薬製剤と同時に投与もしくは送達される場合;(2)別々の製剤として交互にもしくは並行して送達される場合;または(3)一部の他のレジメンによる場合に、達成され得る。交互に送達される場合、相乗効果は、それらの化合物が、例えば、別々のシリンジ中の異なる注射によって連続的に投与または送達される場合に達成され得る。一般に、交代の間、有効投薬量の各活性成分が、連続的に、即ち、順次に投与されるが、併用療法では、有効投薬量の2以上の活性成分が一緒に投与される。
一実施形態では、本明細書に開示された抗原のうち1もしくは複数に特異的に結合する抗体もしくは抗原結合性断片またはそのコンジュゲートの有効量が、抗がん処置後に腫瘍を有する対象に投与される。投与された抗体もしくは抗原結合性断片またはコンジュゲートがそれぞれのがん細胞上で発現された抗原と免疫複合体を形成するのに十分な量の時間が経過した後で、免疫複合体が検出される。免疫複合体の存在(または非存在)は、処置の有効性を示す。例えば、処置の前に採取された対照と比較した免疫複合体の増加は、その処置が有効でないことを示し、処置の前に採取された対照と比較した免疫複合体の減少は、その処置が有効であることを示す。
F.バイオ医薬組成物
担体(例えば、薬学的に許容される担体)中に、開示されたCAR、またはCARを発現するT細胞、抗体、抗原結合性断片、コンジュゲート、CAR、または本明細書に開示された1もしくは複数の抗原に特異的に結合するCARを発現するT細胞のうち1または複数を含む、遺伝子治療、免疫療法および/または細胞療法における使用のためのバイオ医薬組成物または生物製剤組成物(本明細書で以下「組成物」)が、本明細書で提供される。これらの組成物は、対象への投与のために単位投薬形態で調製され得る。所望の転帰を達成するための投与の量およびタイミングは、処置を行う臨床医の裁量である。これらの組成物は、全身(例えば、静脈内)または局所(例えば、腫瘍内)投与のために製剤化され得る。一例では、開示されたCAR、またはCARを発現するT細胞、抗体、抗原結合性断片、コンジュゲートは、静脈内投与などの非経口投与のために製剤化される。本明細書に開示されるCAR、またはCARを発現するT細胞、コンジュゲート、抗体もしくは抗原結合性断片を含む組成物は、腫瘍、例えば、限定としてではなく、神経芽細胞腫の、例えば、処置および検出などのために使用される。一部の例では、これらの組成物は、癌の処置または検出に有用である。本明細書に開示されるCAR、またはCARを発現するT細胞、コンジュゲート、抗体もしくは抗原結合性断片を含む組成物は、例えば、病理学的血管新生の検出にも使用される。
投与のための組成物には、水性担体などの薬学的に許容される担体中に溶解されたCAR、またはCARを発現するT細胞、コンジュゲート、抗体もしくは抗原結合性断片の溶液が含まれ得る。例えば緩衝食塩水などの種々の水性担体が使用され得る。これらの溶液は無菌であり、一般に、望ましくない物質を含まない。組成物は、従来の周知の無菌化技術によって無菌化され得る。組成物は、生理学的条件に近付くのに必要な薬学的に許容される補助的物質、例えば、pH調整剤および緩衝剤、毒性調整剤、アジュバント薬剤など、例えば、酢酸ナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、塩化カルシウム、乳酸ナトリウムなどを含有し得る。これらの製剤中のCAR、またはCARを発現するT細胞、抗体もしくは抗原結合性断片またはコンジュゲートの濃度は、広く変動し得、選択された特定の投与様式および対象の要求に従って、液量、粘度、体重などに主に基づいて選択される。遺伝子治療、免疫療法および/または細胞療法における使用のためのかかる投薬形態を調製する実際の方法は、当業者に公知であり、または明らかとなる。
静脈内投与のための典型的な組成物は、1日当たり対象1人当たり約0.01~約30mg/kgの抗体もしくは抗原結合性断片またはコンジュゲート(あるいは対応する用量のCAR、またはCARを発現するT細胞、抗体もしくは抗原結合性断片を含むコンジュゲート)を含む。投与可能な組成物を調製するための実際の方法は、当業者に公知または明らかであり、Remington’s Pharmaceutical Science、第19版、Mack Publishing Company、Easton、PA(1995年)などの刊行物中により詳細に記載されている。
CAR、またはCARを発現するT細胞、抗体、抗原結合性断片、またはコンジュゲートは、凍結乾燥形態で提供され得、投与前に無菌水で再水和され得るが、これらは、既知の濃度の無菌溶液中でも提供される。次いで、CAR、またはCARを発現するT細胞、抗体もしくは抗原結合性断片またはコンジュゲートの溶液が、0.9%塩化ナトリウム、USPを含有する注入バッグに添加され、一部の場合には、0.5~15mg/体重kgの投薬量で投与される。抗体または抗原結合性断片およびコンジュゲート薬物の投与では、当該分野でかなりの経験が利用可能である;例えば、抗体薬物は、1997年のRituxan(登録商標)の承認以降、米国で市販されている。CAR、またはCARを発現するT細胞、抗体、抗原結合性断片およびそれらのコンジュゲートは、静注または静脈内ボーラスでではなく、緩徐な注入によって投与され得る。一例では、より高い負荷用量が、より低いレベルで投与される引き続く維持用量と共に投与される。例えば、4mg/kgの初期負荷用量の抗体または抗原結合性断片(または対応する用量の、抗体もしくは抗原結合性断片を含むコンジュゲート)が、およそ90分の期間にわたって注入され得、その後、以前の用量が十分に忍容された場合に30分の期間にわたって注入される4~8週間にわたる2mg/kgの毎週の維持用量が注入され得る。
制御放出非経口製剤は、インプラント、油性注射として、または粒状の系として作製され得る。タンパク質送達系の広い概説については、Banga,A.J.、 Therapeutic Peptides and Proteins: Formulation,Processing,and Delivery Systems、Technomic Publishing Company,Inc.、Lancaster、PA(1995年)を参照のこと。粒状の系には、ミクロスフェア、マイクロ粒子、マイクロカプセル、ナノカプセル、ナノスフェアおよびナノ粒子が含まれる。マイクロカプセルは、中心コアとして、細胞毒または薬物などの治療的タンパク質を含有する。ミクロスフェアでは、治療薬は、粒子の至る所に分散される。約1μmよりも小さい粒子、ミクロスフェアおよびマイクロカプセルは一般に、それぞれ、ナノ粒子、ナノスフェアおよびナノカプセルと呼ばれる。毛細管は、ナノ粒子だけが静脈内投与されるように、およそ5μmの直径を有する。マイクロ粒子は、典型的には、直径がおよそ100μmであり、皮下または筋内投与される。例えば、Kreuter,J.、Colloidal Drug Delivery Systems、J.Kreuter編、Marcel Dekker,Inc.、New York、NY、219~342頁(1994年);ならびにTiceおよびTabibi、Treatise on Controlled Drug Delivery、A.Kydonieus編、Marcel Dekker,Inc.New York、NY、315~339頁(1992年)を参照のこと。
ポリマーは、本明細書に開示されるCAR、またはCARを発現するT細胞、抗体もしくは抗原結合性断片またはコンジュゲート組成物のイオン制御された放出のために使用され得る。制御された薬物送達に使用される種々の分解性および非分解性ポリマーマトリックスは、当該分野で公知である(Langer、Accounts Chem.Res.26巻:537~542頁、1993年)。例えば、ブロックコポリマーであるpolaxamer 407は、低温で粘性であるがなお可動性の液体として存在するが、体温では半流動性ゲルを形成する。これは、組換えインターロイキン-2およびウレアーゼの製剤化および持続性送達のための有効なビヒクルであることが示されている(Johnstonら、Pharm.Res.9巻:425~434頁、1992年;およびPecら、J.Parent.Sci.Tech.44巻(2号):58~65頁、1990年)。あるいは、ヒドロキシアパタイトが、タンパク質の制御された放出のための微小担体として使用されてきた(Ijntemaら、Int.J.Pharm.112巻:215~224頁、1994年)。さらに別の態様では、リポソームが、脂質カプセル化薬物の制御された放出および薬物標的化に使用される(Betageriら、Liposome Drug Delivery Systems、Technomic Publishing Co.,Inc.、Lancaster、PA(1993年))。治療的タンパク質の制御された送達のための多数のさらなる系が公知である(米国特許第5,055,303号;米国特許第5,188,837号;米国特許第4,235,871号;米国特許第4,501,728号;米国特許第4,837,028号;米国特許第4,957,735号;米国特許第5,019,369号;米国特許第5,055,303号;米国特許第5,514,670号;米国特許第5,413,797号;米国特許第5,268,164号;米国特許第5,004,697号;米国特許第4,902,505号;米国特許第5,506,206号;米国特許第5,271,961号;米国特許第5,254,342号および米国特許第5,534,496号を参照のこと)。
G.キット
一態様では、本明細書に開示されるCARを使用するキットもまた提供される。例えば、対象における腫瘍を処置するためのキットまたは本明細書に開示されるCARのうち1もしくは複数を発現するCAR T細胞を作製するためのキット。キットは、典型的には、本明細書に開示される、開示された抗体、抗原結合性断片、コンジュゲート、核酸分子、CARまたはCARを発現するT細胞を含む。開示された抗体、抗原結合性断片、コンジュゲート、核酸分子、CARまたはCARを発現するT細胞のうち1よりも多くが、キット中に含まれ得る。
キットは、コンテナ、およびコンテナ上のまたはコンテナと関連したラベルまたは添付文書を含み得る。適切なコンテナには、例えば、瓶、バイアル、シリンジなどが含まれる。コンテナは、ガラスまたはプラスチックなどの種々の材料から形成され得る。コンテナは、典型的には、開示された抗体、抗原結合性断片、コンジュゲート、核酸分子、CARまたはCARを発現するT細胞のうち1または複数を含む組成物を保持する。いくつかの実施形態では、コンテナは、無菌アクセスポートを有し得る(例えば、コンテナは、皮下注射針によって貫通可能なストッパーを有する静脈内溶液バッグまたはバイアルであり得る)。ラベルまたは添付文書は、その組成物が特定の状態を処置するために使用されることを示す。
ラベルまたは添付文書は、典型的には、例えば、腫瘍を処置もしくは予防する方法、またはCAR T細胞を作製する方法における、開示された抗体、抗原結合性断片、コンジュゲート、核酸分子、CARまたはCARを発現するT細胞の使用のための指示書をさらに含む。添付文書は、典型的には、治療的製品の使用に関する、適応症、用法、投薬量、投与、禁忌および/またはかかる警告についての情報を含む、治療的製品の市販の包装中に習慣的に含まれる指示書を含む。教材は、電子的形態(例えば、コンピューターディスケットまたはコンパクトディスク)で書かれ得、または視覚的(例えば、動画ファイル)であり得る。キットは、キットが設計される特定の適用を容易にするためのさらなる構成要素もまた含み得る。したがって、例えば、キットは、標識を検出する手段(例えば、酵素標識のための酵素基質、蛍光標識を検出するためのフィルターセット、二次抗体などの適切な二次標識など)をさらに含み得る。キットは、特定の方法の実施のために慣用的に使用される緩衝液および他の試薬をさらに含み得る。かかるキットおよび適切な内容物は、当業者に周知である。
本発明は以下の実施例によってさらに例証され、これらの実施例は決して本発明の範囲に制約を課すものとして解釈すべきではない。反対に、その様々な他の実施形態、変更形態、および均等物に頼らなければならず、これらは本明細書の記載を読んだ後、本発明の精神および/または添付の特許請求の範囲から逸脱せずに、当業者の念頭に浮かび得ることは容易に理解される。
実施例1
タンデムCD19/CD20 CARレンチウイルスベクターは、白血病細胞株においてオンターゲットおよびオフターゲット抗原調節を駆動する
遺伝子操作された自家ヒトT細胞によるがんのための養子免疫療法は、現在多くの拠点で評価されている。養子免疫療法のための細胞集団を作り出すための通常の一手法は、[1]で概略される、患者からアフェレーシスによりT細胞を単離すること、およびex vivoでこれらの細胞に、ホストゲノムに組み込まれキメラ抗原受容体(CAR)を発現するレトロウイルスまたはレンチウイルスベクターを形質導入することである。キメラ抗原受容体は、免疫学的に活性なタンパク質の様々なサブユニットからの機能的配列ドメインを連結することにより作り出される。例えば、抗CD19または抗CD20抗体のVHおよびVLドメインから作り出されたscFvドメインは、CD28またはCD8に由来する膜貫通配列に連結され、次いでCD3-ゼータ鎖およびCD28またはCD137に由来する細胞内シグナル伝達ドメインに連結され得る[2、3]。したがって、CARは、単一の膜貫通タンパク質内にscFvに由来する結合性ドメインおよび連結されたシグナル伝達ドメインの両方を与え、これは、ベクターが形質導入されたT細胞の活性化を可能にする。これで、この形質導入されたT細胞集団(CAR-T)は、活性細胞溶解、およびインターフェロン-ガンマ(IFNγ)、インターロイキン-2(IL-2)および腫瘍壊死因子-アルファ(TNFα)などのサイトカイン産生により組織される間接的免疫エフェクター機構による破壊について、同族抗原を有する細胞を機能的に標的化し得る。CD19を特異的に標的化するキメラ抗原受容体改変T細胞による養子免疫療法は、小児プレB ALLに対する有効性を証明した[4、5]。成人血液悪性腫瘍におけるCAR改変T細胞の有効性は、より不均一である。
ペンシルバニア大学における3人のCLL患者による抗CD19 CAR-T療法での経験は、普遍的な陽性応答を示すように見え、NCIのSurgery Branchは、成人B細胞悪性腫瘍を有する8人の患者の多様な収集物において部分奏効、安定疾患および1つの完全奏効の混合を報告した[6、7]。したがって、抗CD19 CARは、不偏的に有効ではなく、その抗腫瘍標的化可能性のさらなる増強から利益を得ることができる。Thomas-Tikhonenkoの研究室は、抗CD19 CAR-T療法中にB-ALLにより使用されるエスケープ機構を見事に説明し、これは、CD19の選択的スプライシング、フレームシフト変異およびミスセンス変異を含む[8]。CAR-T製品の標的範囲を広げるため、およびより大きな効果で悪性腫瘍を標的化するための一手段は、単一のCAR構造内に2つの結合性ドメインを含めることである。タンデムCD19およびCD20発現悪性腫瘍としては、慢性リンパ性白血病(CLL)、有毛細胞白血病(HCL)、マントル細胞リンパ腫(MCL)、前リンパ球性白血病(PLL)および絨毛リンパ球を伴う脾リンパ腫(SLVL)が挙げられる[9]。両方の抗原を標的化する単一のCARベクターは、より広い様々な血液悪性腫瘍を標的化し、潜在的にそれらをより有効に標的化し得る。
この実施例では、タンデムCAR構築物の有効性の増大は、一連のシングル特異性およびタンデム特異的CAR-T構築物の両方との共培養の際のCD19+CD20+Raji細胞株上の両方の標的抗原の発現を試験することによりモデリングされる。存在する迅速なCD19標的抗原下方調節機構は、この白血病細胞株において実証される。驚くべきことに、標的抗原下方調節は、ベクター構築物のいずれによっても標的化されていないCD22を含む非標的化B細胞受容体分子も含んだ。私たちのタンデム標的化ベクターによる標的細胞数のより迅速な減少は、より強い抗白血病免疫圧(immune pressure)の存在を示す。特に、シングル特異性CARが使用された場合の、白血病細胞株による免疫圧からのエスケープの動態は、遺伝的エスケープ変異体についての選択に依存する標的抗原調節または喪失の機構とは対照的に、抗原性調節が白血病細胞の既存の特性であることを示す。
材料および方法
細胞株(PBMCおよび標的)
特記しない限り、全ての細胞株および試薬を、American Tissue Culture Collection(ATCC、Manassas、VA)から購入した。バーキットリンパ腫細胞株Raji、急性リンパ性白血病細胞株REHおよびNALM-6(ACC-128 DSMZ、Leibniz Institute DSMZ、Braunschwieg、Germany)ならびに慢性骨髄性白血病株K562を、10%熱不活化ウシ胎児血清(FBS、Hyclone、Logan、UT)および2mM L-Glutamax(Thermo Fisher Scientific、Grand Island、NY)を添加したRPMI-1640培地で培養した。ヒト胚腎臓細胞株293Tを、10%熱不活化FBSを添加したダルベッコ変法イーグル培地で増殖させた。
野生型腫瘍株にホタルルシフェラーゼ(Lentigen Technology,Inc.、Gaithersburg、MD)をコードするレンチウイルスベクターを安定に形質導入し、その後ルシフェラーゼ陽性クローンをクローニングおよび選択することにより、ルシフェラーゼ発現細胞株のシングルセルクローンを生成した。NALM6細胞株について以前に報告されているように[10]、ホタルルシフェラーゼを安定に発現するRajiクローンをNSGマウス(NOD.Cg-Prkdcscid Il2rgtm1Wjl/SzJ、The Jackson Laboratory Sacramento、CA)に生着させ、陽性選択(CD19マイクロビーズ、ヒト、Miltenyi Biotec、Bergisch Gladbach、Germany)または陰性選択(マウス細胞枯渇キット、Miltenyi Biotec)のいずれかによりマウス脾臓から生着したRaji-luc腫瘍細胞を単離し、培養で増殖させ、再クローニングしてホタルルシフェラーゼ高発現を有するクローンの選択を促進することにより、マウスに適合させたRaji-luc株を生成した。
Oklahoma Blood Institute(OBI)において健康なボランティアから全血をドナーの同意書とともに収集した。処理済み軟膜を、OBI(Oklahoma City、OK)から購入した。CD4マイクロビーズおよびCD8マイクロビーズ(Miltenyi Biotec)の1:1混合物を製造業者のプロトコールに従って使用する陽性選択により、CD4陽性およびCD8陽性ヒトT細胞を軟膜から精製した。
キメラ抗原受容体(CAR)発現ベクターの作出
CAR抗原結合性ドメイン、scFv、配列は、追加ファイルの節のように、CD19についてマウスハイブリドーマFMC-63(FMC-63:AA 1~267、GenBank ID:HM852952.1)およびCD20についてLeu-16[15](VLおよびVHの全配列)に由来した。
CAR19A、CAR19BおよびCAR20Aを、各抗体のscFvをインフレームで、CD8ヒンジおよび膜貫通ドメイン(AA 123~191、参照配列ID NP_001759.3)、4-1BB(CD137、AA 214~255、UniProt配列ID Q07011)トランス活性化ドメインならびにCD3ゼータシグナル伝達ドメイン(CD247、AA 52~163、参照配列ID:NP_000725.1.)に連結することにより生成した。構築物19Aおよび19Bは、scFv結合性ドメインの可変H鎖およびL鎖を接続する可撓性リンカーを除いては同一であり、19AではWhitlowリンカー[11]および19Bでは(GGGGS)(配列番号13)リンカーを使用した。タンデム標的化構築物、CAR1920およびCAR2019を、同様の様式で生成した。19Aおよび20AのscFv領域を、順に可撓性鎖間リンカー(GGGGS)(配列番号14)により連結し、その後CD8、4-1BBおよびCD3ゼータドメインに連結した。[12]で報告されているように、ヒト顆粒球マクロファージコロニー刺激因子受容体アルファサブユニットからのリーダー配列を、全ての構築物に含めた。CAR構築物配列を、コドン最適化し(DNA2.0、Newark、CA)、ヒトEF-1αプロモーターの調節下で第3世代レンチウイルスプラスミド骨格(Lentigen Technology Inc.、Gaithersburg、MD)にクローニングした。以前に報告されているように[13]、HEK293T細胞の一過性トランスフェクションによりレンチウイルスベクター(LV)を含む上清を生成した。採取、ペレット化したレンチウイルスベクターを含む上清を、-80℃で保存した。
初代T細胞形質導入
正常なドナー由来の選択したCD4+およびCD8+ヒト初代T細胞を、密度0.3~2x10細胞/mlで、40IU/ml IL-2を添加したTexMACS培地(血清非含有)で培養し、CD3/CD28MACS(登録商標)GMP TransAct(商標)試薬(Miltenyi Biotec)で活性化し、3日目に10μg/ml硫酸プロタミン(Sigma-Aldrich、St.Louis、MO)存在下で一晩、CAR構築物をコードするレンチウイルスベクターを形質導入し、4日目に培地を交換した。5日目に、200IU/ml IL-2を添加したTexMACS培地に培養物を移し、10~13日目の採取まで繁殖させた。
免疫エフェクターアッセイ(CTLおよびサイトカイン)
細胞媒介性の細胞傷害性を決定するため(CTLアッセイ)、ホタルルシフェラーゼが安定に形質導入された標的細胞5,000個を種々のエフェクター対標的比でCAR T細胞と組み合わせ、一晩インキュベートした。SteadyGlo試薬(Promega、Madison WI)を各ウェルに添加し、生じた発光をEnSpireプレートリーダー(Perkin Elmer、Shelton、Connecticut)で分析し、秒あたりのカウントとして記録した(試料CPS)。標的のみのウェル(最大CPS)および1%Tween-20を加えた標的のみのウェル(最小CPS)を使用してアッセイ範囲を決定した。特異的な溶解のパーセントを(1-(試料CPS-最小CPS)/(最大CPS-最小CPS))として算出した。サイトカイン放出アッセイのために、エフェクターおよび標的細胞を比10:1で混合し、一晩インキュベートした。MACSplexヒト12サイトカインビーズアレイキット(Miltenyi Biotec)を使用して製造業者の指示に従って、分泌されたサイトカインについて採取した上清を分析した。CAR T処置群において、IFNγ、TNFα、IL-2およびGM-CSFの強い誘導が検出された。以下のサイトカインは検出することができなかった:IL-4、IL-5、IL-6、IL-12p70、IL-17A、IL-10、IFNα。IL-9は、一部の試料において低レベルで検出され、報告されなかった。全ての試料は、二重または三重で行われた。特記しない限り、示される全てのデータは、3回以上の独立実験の代表値である。
ウェスタンブロット
200万個のCAR T細胞を、冷PBS(Lonza、Walkersville、MD)で2回洗浄し、次いでプロテアーゼおよびホスファターゼ阻害剤混合物(Thermo-Fisher Scientific、Grand Island、NY)を含有する100μl冷RIPA緩衝液(Sigma-Aldrich、St.Louis、MO)で溶解した。溶解物を4℃で20分間インキュベートし、4℃で卓上遠心分離機において13000RPMにて10分間ペレット化し、上清を収集し、-20℃で凍結した。試料を還元ローディング緩衝液(Invitrogen)中で70℃にて10分間変性させ、MOPS緩衝液(Thermo-Fisher Scientific、Grand Island、NY)中での還元条件下において製造業者のプロトコールに従って4%~12%勾配SDS-PAGEゲルで展開した。タンパク質を0.45ミクロンニトロセルロース転写膜(BioRad、Hercules、CA)に移し、全CD3ゼータに対する抗体(クローンab40804、Abcam、Cambridge、MA)で調査した。Vectastain ABC-AMP試薬キット(Vector Laboratories、Burlingame、CA)を使用して製造業者のプロトコールに従ってバンドを現像し、Odyssey画像化システムおよびImage Studio liteソフトウェア(LI-COR、Lincoln、Nebraska)でバンドを可視化および定量した。Raji腫瘍細胞について、CD19についてのウェスタンブロットも行った。簡潔に言えば、Raji細胞とCAR T細胞との一晩のインキュベーション後、CD3磁気ビーズ(Miltenyi Biotec)を使用するLDカラムにより製造業者のプロトコールに従ってCD3陽性細胞を枯渇させ、回復したRaji細胞を上記のようにプロセスした。CD19 C末端(sc-69735、Santa Cruz、CA)およびベータ-アクチン(8457、Cell Signaling Technology、Danvers、MA)に対する抗体を使用して特異的バンドを検出した。Image Studioソフトウェア(LI-COR、Lincoln、Nebraska)により、バンド強度を定量した。全長CD19およびΔエクソン2 CD19イソ型の相対的バンド強度を、シグナルCD19/シグナルβアクチンとして計算した。
フローサイトメトリー分析
特記しない限り、フローサイトメトリーのための全ての細胞染色試薬は、Miltenyi Biotecからのものであった。100万個のCAR T形質導入細胞を培養物から採取し、冷染色緩衝液(0.5%ウシ血清アルブミンを含むAutoMACS溶液)で2回洗浄し、350xgで4℃にて5分間ペレット化した。
形質導入T細胞上のCAR表面発現を、タンパク質L-ビオチンコンジュゲート(ストック1mg/ml、1:1000希釈、GenScript、Piscataway、NJ)で4℃にて30分間染色し、その後2回洗浄し、ストレプトアビジン-PEコンジュゲート(ストック:1.0ml、1:200希釈、Jackson ImmunoResearch Laboratories、West Grove、PA)で4℃にて30分間染色することにより検出した。非形質導入細胞、およびストレプトアビジン-PEのみで染色した形質導入細胞を、陰性対照として使用した。CAR T陽性集団のCD4対CD8比を決定するために抗CD4抗体を使用し、第2のインキュベーションステップ中に添加した。7AAD染色(BD Biosciences、San Jose、CA)により死滅細胞を除外した。細胞を2回洗浄し、200μl染色緩衝液に再懸濁し、その後フローサイトメトリーにより定量分析を行った。
Fcタグ付きCD19ペプチド(以下に説明する、1μg/ml)を細胞と4℃で15分間インキュベートし、その後抗Fc-AF647F(ab’)2断片(Jackson Immuno Research、1:200)と4℃で15分間インキュベートすることにより特異的CAR T染色を行い、APCチャネルにおいて検出した。ビオチニル化CD20ペプチド(Bachem、Torrance、CA)およびストレプトアビジン PE(両方とも1μg/ml)を細胞に同時に添加し、暗室において室温で10分間インキュベートした。MACSQuant(登録商標)10分析器(Miltenyi Biotec)でフローサイトメトリー分析を行った。CD19-FITC、CD20 VioBlueおよびCD22-APC抗体を使用して、標的腫瘍株およびルシフェラーゼ陽性サブクローンの特徴付けを行った。7AAD染色(BD Biosciences、San Jose、CA)により死滅細胞を分析から除外した。
Fcタグ付きCD19ペプチドの生成
組換えヒトCD19ペプチドの産生のために、細胞外ドメイン(アミノ酸20~291、Uniprot P15391)をヒトIgG1 Fc(CD19-Fc)に融合し、HEK293細胞における形質導入によりCMV駆動哺乳動物発現ベクターにおいて発現した。トランスフェクトした細胞をDMEM、5% FBSで培養し、HYPERFlask(登録商標)細胞培養容器(Corning)中でのインキュベーション10および20日後に、CD19-Fcを含有する細胞培養上清を採取した。細胞屑を除去するための遠心分離および0.22μm滅菌濾過後、タンパク質Aクロマトグラフィー(HiTrap MabSelect、GE Healthcare)によりCD19-Fcを精製し、PBS中で4℃にて保存した。SDS-PAGEおよびクーマシーブルー染色により決定されるように、純度は97%を超えた。トリプシン消化(Miltenyi Biotec、Bergisch Gladbach、Germany)後のインタクト質量分析およびペプチドマスフィンガープリント法により、CD19-Fcの同一性が確認された。
CAR-T活性のin vivo分析
全ての動物研究は、Jackson Laboratory Animal Care and Use Committee(Sacramento、CA)により承認された。NSG(NOD.Cg-Prkdcscid Il2rgtm1Wjl/SzJ)マウスの尾部静脈に50万個のマウス適合Raji-luc細胞を注射した。Raji-luc注射後6日目に、150mg/kgルシフェリンのi.p.注射および10分後のXenogen IVIS-200器具(Caliper Biosciences、現Perkin Elmer、Shelton、Connecticut)での40秒間の画像化により腫瘍生着を測定した。Living Image、第4.1版ソフトウェア(Perkin Elmer)を使用して画像を分析し、各マウスについての生体発光シグナル束を放射輝度平均(光子/秒/cm2/ステラジアン)として表した。7日目に、マウスに尾部静脈注射によりCAR T細胞を投与した。注射後4、6、11、14、18、25、32、46日目に画像化を行って、腫瘍増殖の動態およびCAR T細胞による根絶を確立した。
高腫瘍負荷in vivo研究のために、0日目に、NSGマウスにRaji-ルシフェラーゼ細胞をi.v.注射した。11日目に、腫瘍負荷に基づいてマウスを研究群に均等に分布させた。次いで研究12日目に、タンデムCAR 2019のCAR T細胞調製物、または等しいCART+細胞数で混合した2つのシングルCAR T組合せ調製物(19A+20A、19B+20A)をi.v.投与した。全てのCAR T調製物は、全部で5x10のCAR T細胞/マウスで試験された。同じドナーからの非形質導入T細胞(N.T.)および腫瘍単独群は、対照として機能した。研究18および25日目に、マウス全身放射輝度平均に基づいて腫瘍増殖を評価した。N=6/群。
白血病免疫回避のin vitro分析
Raji腫瘍エスケープバリアントを分析するために、CAR TおよびRaji細胞を、in vitroでエフェクター対標的比1:1にて混合した。共培養物の一晩のインキュベーション後および4日目に、フローサイトメトリーにより、生存Raji細胞について、CD19、CD20およびCD22の表面発現を決定した。培養物を採取し、洗浄し、CD3-PE、CD19-FITC、CD20-VioBlue、CD22-APC(Miltenyi Biotec)および7AADに特異的な抗体で染色した。各Raji:T細胞共培養物中の生存Raji細胞の分析を促進するために、私たちは、CD3陰性7AAD陰性(即ち、生Raji)細胞集団についてゲーティングし、この集団を、次いでCD19、CD20およびCD22の残留の表面発現について分析した。
トランズウェル共培養アッセイにおいて、それぞれ5x10のCAR TおよびRaji細胞を、24トランズウェルプレート(Costar、REF 3470、0.4μM孔膜)の下部区画に、1mlのTexMACS培地中にて播種した。2.5x10のRaji細胞を、上部トランズウェル区画に、TexMACS培地中にてT細胞の非存在下で播種した。一晩のインキュベーション後、上部および下部区画からの細胞を、上記に説明するようにフローサイトメトリーにより分析した。各群についてのRaji細胞上のCD19、CD20およびCD22の発現パーセンテージを測定した。示されるデータは、3人の異なるドナーからの、3回の独立実験からの平均値+SDを示す。統計解析は、Raji単独対照に対して、一元配置ANOVAおよびダネットの多重比較検定により行った(*p<0.01)。
統計解析
GraphPad Prism 7.01ソフトウェアを使用して、統計解析を行った。in vitro死滅アッセイにおいて、反復決定についての群平均値を、二元配置分散分析(ANOVA)、続いてダネットの多重比較検定により比較して、個々の処置群と非形質導入対照との間の差を同定した。第1のin vivo研究において、全ての群が生存マウスを有した最後の測定日である実験25日目のIVIS放射輝度データを、処置なし群に対して、二元配置ANOVA、続いてダネットの多重比較検定により分析した。CAR T細胞との一晩および4日間の共培養後のRajiおよびNALM-6細胞におけるCD19、CD20およびCD22発現の分析を、N.T.(同じドナーからの非形質導入T細胞)対照に対して、一元配置ANOVA、続いてダネットの多重比較検定により行った。タンデムCARにおけるCD20/CD19結合比の分析を、スチューデントt検定により行った。
結果
タンデムCD19およびCD20標的化CARの有効性を研究するために、マウス抗体FMC63およびLeu16からの抗原結合性ドメインをコードする配列を、(GGGGS)5(配列番号14)配列と連結した。この研究における全ての構築物について、連結、膜貫通およびシグナル伝達ドメインは同一であり、以前に報告されているように[12](図1A)、それぞれ、ヒトCD8由来ヒンジおよび膜貫通ドメイン、CD137シグナル伝達ドメインならびにCD3-ゼータ由来シグナル伝達ドメインをコードする。最初に公開されるように(GenBank ID HM852952.1、AA 130~148、Whitlowリンカーとして公知)[11]、FMC63の重鎖および軽鎖をともにscFv構造に連結し、一方、Leu16の重鎖および軽鎖は(GGGGS)3(配列番号13)配列により連結した。そのうえ、単一の転写産物においてFMC63由来およびLeu16由来の重鎖および軽鎖配列を多GGGGS(配列番号15)配列で結合することによって、タンデムCARを作り出した。それらのシングル特異性相対物とは異なり、タンデムCARは、CD19またはCD20のいずれかを発現する標的細胞に遭遇することにより、CAR発現T細胞の活性化を誘導し得る。
40IU/ml IL-2中で抗CD3/CD28ナノマトリックスにより、初代ヒトT細胞を活性化し、3日後にCARをコードするレンチウイルスベクターを形質導入し、その後培養期間全体を通して維持された200IU/ml IL-2中で増殖させた。ビオチニル化タンパク質Lを使用したフローサイトメトリー、続いてストレプトアビジン-PEによる染色により、形質導入T細胞の表面上のCAR発現を測定した(図2A)。形質導入T細胞の表面上のCAR発現は、61%~93%に及んだ。両方のscFv結合性ドメインがインタクトであることを確証するために、私たちは、また、CAR T細胞をCD19-Fc融合タンパク質またはビオチニル化CD20ペプチドとともにコインキュベートした(方法を参照)。タンデム特異的構築物において、両方のドメインは、標的抗原に結合する能力を保持していた。CAR2019について、タンパク質L染色は89%発現を与え、CD19-Fc発現は80%であり、CD20ペプチド発現は85%であった。CAR 1920について、タンパク質L染色は85%CAR発現を与え、CD19-Fc染色は80%を生じ、CD20ペプチドは68%であった。3人の別々のドナーから生成されたCAR T細胞において、この観察は再現された。
抗原結合における差を比較するために、CAR T CD20/CD19結合比を計算した。この比は、CD20可溶性ペプチドで陽性染色されたタンデムCAR T細胞のパーセンテージを、同じ試料中のCD19-Fcペプチドにより陽性染色されたCAR T細胞のパーセンテージで割ったものとして定義された。3人の別々のドナーのT細胞形質導入についてのCD20/CD19結合比の平均値は、CAR 1920について0.74±0.06、およびCAR 2019について1.05±0.02であった(図2B)。したがって、CAR T構築物2019において、可溶性CD19およびCD20ペプチドの結合は同様であり、タンパク質L結合に匹敵するが、CAR 1920構築物におけるCD20結合は、部分的に立体障害を受け得る。
フロープロファイルが単一のより大きな転写産物によることを確証するために、CARタンパク質の分子量を、還元条件下でのウェスタンブロットにより確証した(データは示さない)。シングル(54KDa)およびタンデム(81KDa)CARについて、予測されたサイズの特異的バンドが検出された。相対的発現レベルを把握するために、内因性CD3ゼータに対するCAR関連ゼータ鎖シグナルの比を計算することにより、バンド強度を比較した。CAR 19B単鎖ベクターにおけるCAR発現レベルを1(任意単位)に正規化すると、19A、20A、1920および2019についての発現は、それぞれ、1.8、1.5、0.9および1.2であった。したがって、タンデムCARの発現レベルは、シングルCAR発現ベクターで見られた変動性の範囲内に入る。タンデムCARを発現するLVを作り出すことが可能であり、また2つの機能的scFvを発現するT細胞表面上の全長CARタンパク質の発現が今や実証されているので、タンデムCAR構築物の抗白血病活性を、次いでin vitroアッセイにおいて評価した。
ヒト初代T細胞に、CAR構築物(19A、19B、20A、1920、2019、方法を参照)をコードするLVを形質導入し、次いでホタルルシフェラーゼが安定に形質導入されたRaji、NALM-6、REH、K562または293T細胞株とともに18時間インキュベートし、発光に基づくin vitro死滅アッセイを行った。試験された全ての白血病株は、それらの表面上にCD19を発現するが、陰性対照、K562および293Tは発現しない。CD20発現は、腫瘍株間で変動した。Raji株はCD20陽性であるが、REHはCD20陰性であり、対照株K562および293Tも陰性である。NALM-6株は、弱いが検出可能なCD20発現を有する。さらなる対照として、CD19を発現するK562株(K562-19+)またはCD20を発現するK562株(K562-20+)を作り出した。
K562-19+は、CAR 19Aおよび18B構築物、タンデムCAR構築物1920および2019により溶解されたが、シングル20A CARによっては溶解されなかった(図3A)。K562-CD20+は、シングルCAR19構築物以外の全てのCART構築物により溶解され、標的抗原限定的死滅を実証した。試験された他の白血病細胞株で同様の結果が見られた。CD19を標的化するシングルおよびタンデムCAR T構築物は、Raji、NALM-6およびREHを溶解したが、293T(図3B)またはK562(図3A)は溶解しなかった。特に、20Aシングル標的化CAR構築物は、CD20陰性REH株に対して特異的死滅活性を有しなかったが、低いが検出可能なレベルのCD20表面発現を有するNALM-6の死滅を実証した。さらに、また、フローサイトメトリーによりCD19-Fcへの結合よりも低いCD20ペプチドへの結合を示すように見えたタンデムCAR 1920は、K562-19+およびK562-20+に対してより低い細胞傷害性を有するが、CD19+CD20-REHに対してはより低い細胞傷害性を有しない。このことは、1920タンデムCARは、一部の腫瘍標的について2019タンデムCARよりも劣っていることを示唆し得る。
次いで、腫瘍活性化CAR T細胞によるサイトカイン分泌を調べた。10:1の比でのCAR-TエフェクターおよびRaji細胞株との一晩のインキュベーション後、共培養培地上清を採取し、12種の異なるサイトカインの同時検出を可能にするMACSPlexサイトカイン特異的ビーズアレイにより分析した(図4)。全てのCAR T構築物は、Raji細胞とともに共培養された場合、非形質導入T細胞と比較して、IFNガンマ、TNFアルファ、IL-2およびGM-CSFについてサイトカインレベルの増大を生じたが、陰性対照群N.T.およびGFPのサイトカインレベルは検出不可能であった。特に、20A CARは、一貫してIL-2、IFNガンマ、TNFアルファおよびGM-CSFを最も高く産生した。これは、CD4/CD8比における上下いずれかの見られる小変化が一致しないので、CD4+T細胞集団の優先的増殖のためではなかった(以下の補足表1)。
Figure 0007237926000001
補足表1について、3人の別々のドナーからのCAR T細胞調製物におけるCD4/CD8比を、フローサイトメトリーにより決定した。CD4およびCD8T細胞を軟膜から共精製し、細胞をIL-2の存在下でTransAct CD3 CD28試薬にて活性化し、材料および方法で説明するようにLVを形質導入し、免疫機能についてアッセイを行った培養10日目にCD4/CD8組成についてアッセイを行った。3人のドナーのそれぞれについてのCD4/CD8細胞の比は縦列に示し、CAR T群は横列に示す。
両方のタンデム構築物、CAR 1920およびCAR 2019は、腫瘍標的の存在下で大きさが同様、かつ非形質導入対照に対して有意な強いサイトカイン誘導を生じた。MACSPlexサイトカインアレイにおいてこれらもまた調査されたサイトカインIFN-α、IL-4、IL-5、IL-6、IL-9、IL-10、IL-12p70、IL-17Aは、私たちの試料においては有意なレベルで検出されなかった。
CAR改変ヒトT細胞のin vivo活性を評価するために、0日目に、0.5x10Raji-Luc細胞を、NSGマウスにi.v.注射した。6日目に、画像化により生着した白血病の存在を確証し、マウスを実験群にランダム化した。7日目に、CAR構築物を形質導入した10x10ヒトT細胞をi.v.注射し、IVIS画像化により疾患をモニターした。代表的な画像は、各群における疾患の進行または退行を示す(図5A)。20AシングルCARまたはタンデムCAR 1920もしくは2019を投与した動物において、腫瘍負荷は、11日目にピークに達し、18日目までに処置前レベル未満まで低下した。シングルCAR19群における腫瘍排除は、比較するとより遅かった。興味深いことに、ScFv重鎖および軽鎖がGly-Serリンカーにより接続されたCAR 19Bは、Whitlowリンカーを伴うCAR 19Aより良好に機能した(図5B)。全体的に、CAR 1920およびCAR 2019タンデムCAR構築物の両方は、このモデル系において、シングルCAR 19のin vivo活性より優れたin vivo活性を実証した。さらに、このデータは、細胞傷害性、サイトカイン産生およびNSGマウス系におけるin vivo活性がそれぞれ重要であることを強調するが、データは、形質導入T細胞集団の生物学を理解するためにまとめて解釈されなければならない。
一連の一重および二重特異的CARを確立したので、それらの活性をさらに活用した。特に、白血病エスケープ機構の最近の説明に照らして、in vitroでのタンデムCAR構築物の相対的有効性を探索するために、私たちは、Raji細胞株(CD19、CD20およびCD22を発現する)およびNALM-6細胞株(CD19、CD22および低レベルのCD20を発現する)を使用して、CAR-Tの強いエフェクター活性を回避する白血病細胞株の能力を探索した(図6A)。CAR T免疫圧下での白血病細胞エスケープをモデル化するために、CAR-Tを、白血病細胞とともに低いエフェクター対標的(E:T)比1:1でコインキュベートした。E:Tがより高い場合、全ての白血病細胞が排除された。短期(一晩)またはより長期(4日)の共培養後、白血病細胞株の表面上の3種のB細胞マーカーの発現を、フローサイトメトリーにより分析した(図6B、6C)。CD22は、私たちのCAR-T細胞により特異的に標的化されておらず、その喪失は、多抗原喪失バリアントを生成する、より全体的な免疫エスケーププログラムの開始を示し得るので、興味深いものであった。
RajiがCAR19-T細胞と一晩共培養された場合、CD19抗原は、迅速に細胞表面から下方調節された(図6B、6C)。CD20は比較的一定であり、CD22においては、抗原陰性細胞小集団が出現し始めた。タンデム構築物2019がRajiと共培養された場合、CD19は下方調節され、CD20も中程度に下方調節され、CD22発現も半分近くが失われた。4日目に調べた場合、全てのB細胞抗原が大きく低減していた(図6C)。CD19単独の標的化(構築物19Aおよび19B)は、CD19発現に対して最も高い影響を有した。タンデム構築物2019は、代替的1920構築物より大きな影響を有し、より強い免疫圧が2019により媒介されたことを示した。短期共培養であるか、長期共培養であるかにかかわらず、CD20は、免疫圧を生き延びる細胞からあまり失われることができない。シングルCD20標的化構築物20Aと比較して、タンデム構築物2019は、よりCD19エピトープ喪失を生成したが、他の標的化抗原CD20および非標的化抗原CD22に対して同様の組み合わさった圧を発揮するように見えた。
NALM-6白血病細胞株が標的として使用された場合、CD20標的化CAR 20Aが利用された場合を除いては、CD20発現に対する影響はほとんど見られなかった(図6C)。このことは再度、白血病細胞株の表面上のCD20発現を変更することに対するより大きな抵抗を反映し得る。一晩の共培養物において、CD19発現は、再度、高度に可塑的であり、生存細胞集団上の抗原喪失が容易に実証された。4日目に、研究に使用可能なNALM-6細胞はほとんどなかった。これは、間接的サイトカインおよび直接的細胞媒介死滅効果の両方に対するNALM-6のはるかにより大きな感受性のためのようである。特に、CD22のみ陽性の細胞は検出されず、免疫エフェクター機構に対するこの株の全体的な感受性、即ち、非選択的細胞喪失を示した。
慢性リンパ性白血病における炎症促進性サイトカインによる腫瘍表面分子の発現調節は、以前に報告されている[30]。図4に示されるように、CAR T細胞は、腫瘍細胞に曝露された場合、高レベルの炎症促進性サイトカインを産生するので、CART細胞とのコインキュベーション後のRaji細胞上のCD19、CD22またはCD20の下方調節は、CAR T-腫瘍細胞接触の直接的効果であるか、またはCAR T細胞により培地に放出された可溶性因子のためであるかを決定することが求められた。RajiおよびCAR T細胞を、トランズウェルプレートの下部においてエフェクター対標的(E:T)比1:1で混合した。上部区画に、私たちは、Raji細胞のみを入れた。一晩のインキュベーション後、トランズウェル区画からの細胞およびウェルの下部からの細胞を採取し、フローサイトメトリーにより、生Raji細胞上のCD19、CD20およびCD22の細胞表面発現を分析した(図7)。私たちの以前の結果と一致して、CAR T細胞とコインキュベートされたRaji細胞は、CAR 19Aおよび19BによるCD19表面発現の劇的な低減、およびCD20およびCD22のより中程度であるが有意な低減を実証した。対照的に、上部トランズウェル区画から回復されたRaji細胞は、CD19、CD20およびCD22の完全な発現を保存し、陰性対照群:N.T.、GFPおよびRaji単独と区別不能であった。それゆえ、CAR T細胞19Aおよび19BによるCD19 Raji発現の下方調節は、腫瘍:CAR T接触の直接的効果である。
CD19保有腫瘍は、FMC63の結合性エピトープを含有するCD19細胞外ドメインの一部を除去する、エクソン2を欠くスプライスバリアントの優先的発現を通して、CAR19による排除を避け得ることが最近報告されている[8]。Raji白血病細胞株上のCD19可塑性を探索するために、共培養実験を行った。Raji細胞を、CAR Tとともに一晩共培養し、次いでフローサイトメトリーにより分析して、CD19発現のアッセイを行った。19Aおよび19B実験群の両方において、CD19 MFIの有意な低減が測定された(図8A)。次いで、共培養物を枯渇させるために免疫磁気ビーズを使用し、精製Raji細胞をウェスタンブロッティングにより分析した(図8B、C)。
エクソン2のスプライシングが全長CAR 19タンパク質の発現の減少に寄与したかどうかを評価するために、以前に報告されているように[8]、ウェスタンブロット分析を行った。Raji細胞は、標準培養物(Raji単独群)において全長およびΔ2スプライスCD19イソ型の両方を発現した(図8B)。全長CD19の発現とそのΔ2スプライスバリアントの発現との間の関係を定量するために、ウェスタンブロットバンドの強度を分析した(図8C)。全長CD19イソ型の発現の減少は、私たちのフローサイトメトリーの結果と一致して、CAR19構築物19Aおよび19Bで処置した群において起こった。逆に、Δ2スプライスCD19の発現は、CAR T処置にかかわらず、比較的安定なままであった(図8C)。CAR Tが共培養物から除去され、精製Rajiが単独でインキュベートされた場合、全ての処置群は、4日目までに標的抗原CD19、CD20およびCD22を非処置レベルで(98%以上、示さない)再発現した。このことは、細胞表面タンパク質発現の非常に動的な調節を実証する。
シングルCARとタンデムCARとの間の腫瘍排除の差をさらに探索するために、Raji腫瘍を、CAR T投与前に、7日目までではなく、12日目まで増殖させる、さらなる研究を行った(図9Aおよび9B)。12日目の腫瘍保有マウスは、形質導入T細胞製品を投与され、シングルCARまたはタンデム2019 CARについてマウス1匹当たり5x10CAR T+細胞であった。CD19A+20AまたはCD19B+20A CARの別々の形質導入を含有する、2種のT細胞製品を同時に共投与した。各構築物について全部で2.5x10CAR T細胞を得た(全部で5x10)。タンデムCAR2019は、死滅を伴わずに腫瘍負荷において強い低減を達成したが、組合せ処置19A+20Aおよび19B+20Aは、有効であるが高度に毒性であり、各群において6匹のマウスのうちの2匹のみが25日目まで生存した。シングルCAR 19Aおよび19B群について、腫瘍負荷は、比較的高いままであり、各群における6匹のマウスのうちの5匹のみが25日目まで生存した。シングル20A群において、腫瘍は効率的に取り除かれたが、6匹のうちの2匹のマウスのみが生存した。驚くべきことに、研究は、CAR投与の毒性を強調し、これはシングル20A群で、または20Aが19Aまたは19B CAR T細胞と混合された場合、最も大きかった。
考察
抗CD19および抗Her2ドメインの単一のタンデムCAR(著者によりTanCARと呼ばれる)への連結は、二重特異的キメラ抗原受容体(CAR)の生成が可能であるという多くの研究者による理論上の提案を実施することとなった[14]。血液悪性腫瘍の養子免疫療法のための改善されたCARを作り出そうとして、抗CD19および抗CD20ベースの結合性モチーフを、単一の膜貫通糖タンパク質に連結して、一連のタンデムCARを作り出した。図1Aおよび1Bに示されるように、これらのCAR構築物は、CD19またはCD20腫瘍分子いずれかの結合を介して活性化することができ、モデル白血病細胞株に対してin vitroおよびin vivoの両方で有効である。標準の動物モデルは、明確な利点を示さなかったか、またはCAR構造それ自体内のCD19およびCD20 scFvの好ましい順序を確立しなかった。それにもかかわらず、2019 CAR構築物は、フローサイトメトリーによりCD20ペプチド染色試薬のより良好な結合、およびin vitroでの一部の腫瘍細胞株の死滅の改善を示した(図2A、2B、3Aおよび3B)。さらに、一晩および4日の共培養実験における免疫圧の分析は、2019 CARが、標的白血病細胞株に対してより強い免疫圧を発揮し得ることを示した(図6A~6Cおよび8A~8C)。
CARタンパク質のポリペプチド配列に関して、VHおよびVLドメインの両方をポリグリシンリンカー(GGGGS;配列番号15)と連結すること、およびタンデムCAR構造における2つの独立したscFvの連結の有効性が示された。VHおよびVL連結配列の長さ、およびそれらのアミノ酸組成は、ディアボディ形成およびscFvドメインの適切な折り畳みを支配することが示されているので[15]、これは重要である。私たちのデータは、(GGGGS;配列番号15)配列を使用して独立したCD19およびCD20 scFvドメインを連結することができたZahらの発見[16]も支持する。ウェスタンブロット分析により実証されるように、ネイティブCD3-ゼータ鎖バンドの強度は、ゼータ鎖のようなTCR関連転写産物の転写または翻訳が、LV系におけるEF-1-アルファ駆動CARペイロードを使用するCAR転写により圧倒または置換されないことを示す(Schneiderら Journal for ImmunoTherapy of Cancer(2017年)5巻:42号の図3は、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる)。
CD19およびCD20の組換え断片の発現により生成される一連の独特なツールを使用して、CARおよびタンデムCARベクターによりコードされるscFvによる標的タンパク質に結合する能力の実証が達成された(図2Aおよび2B)。以前の報告は、細胞表面CAR発現について染色するために、カッパー軽鎖配列に結合するタンパク質Lを使用した[12]。CD19に特異的な両方のFMC63ベースのscFv CAR(構築物19A、19B)について、タンパク質Lは十分に結合したが、元のWhitlowリンカーはより明るいMFIを有した。組換えCD19断片での染色についても、このことは当てはまったが、差はあまり大きくなかった。タンパク質Lおよび組換えCD20ペプチドは、Leu16ベースの抗CD20 CAR(構築物20A)について非常に類似する結果を与えた。タンデムCARにおいて、タンパク質L染色は、同等に強かった。標的ペプチドの抗CD19 scFv結合は、タンデムおよびシングルCARにおいて本質的に同等であったが、CD20-ビオチンベースの染色のシグナルは、2019と比較して、構築物1920において減少し(図2B)、これは、この構築物におけるCD20への結合についての立体障害を示し得る。CD20陰性白血病細胞株において、私たちは、CAR 2019タンデムベクターとは反対に、CAR 1920による、いくらかより低い溶解レベルを観察した。この機能の違いについての可能性のある1つの説明は、タンデムCARにおいて、CD19バインダーは、CD19エピトープの腫瘍細胞表面からの距離を適合させるためにT細胞膜の近くに位置していなければならないというものである。この考えは、細胞外スペーサーの長さが、CAR腫瘍認識の決定において決定的であった、ROR1 CARの例[17]により支持される。興味深いことに、T細胞膜に近位のCD19バインダーの設置は、現在開発中の別のタンデムCAR、CD22_CD19 CARの最適機能にも必要とされた(W.Haso、非公開の観察)。CD20バインダーは、適切なVH対VL折り畳みが起きるためにはカルボキシ末端が繋がれていない状態にある必要があること、または1920構築物においては、CD20結合部位が隣接リンカー-CD19ドメインにより隠されてしまうことを、2019 CARによるより良好な抗原結合が反映し得ることが仮定される。
in vitroサイトカイン放出活性も、タンデムCAR活性を実証した(図4)。しかしながら、CD20特異的CAR 20Aは、Th-1様サイトカイン:IFN-ガンマ、IL-2およびTNF-アルファ、ならびにGM-CSFの産生においてタンデムおよびシングルCD19 CAR構築物より優れていた。両方のタンデムCARは、サイトカイン産生において同様であり、シングル19Aおよび19B構築物より大きかった。タンデムCAR構築物1920および2019により産生されたサイトカインレベルは、CD20認識により主に駆動され、別のタンデムCAR利点を反映し得る、つまり、各バインダーからの最適特徴は、より良好な治療効果可能性のために保存された。
in vivoで、CAR 19Bは、CAR 19Aより良好に機能した(図5Aおよび5B)。これは、一部には、私たちがヒトサイトカインの添加により補完しなかったNSGマウスモデルにおいてIL-2を産生し、したがってT細胞活性を維持する19Bの優れた能力のためであり得る。これらのデータを一緒にすると、NSGマウス系における抗白血病CARのin vivo活性を予測することにおいて、サイトカイン産生は重要であることが示される。
次いで、白血病表現型を調節するCAR媒介免疫圧の能力を試験した。この目標を達成するために、CTLアッセイにおいてエフェクター対標的比5:1以上が白血病細胞を有効に排除するが、より低いエフェクター対標的比1:1が使用された場合、私たちは、生存白血病細胞をそれでも採取し、それらの表面抗原発現を分析することができることが分かった。フローサイトメトリーにより、操作者は生細胞をゲーティングし、T細胞を排除し、抗原発現を定量することができる(図6A、6B)。19Aおよび19B CARとの一晩のインキュベーション後、CD19の強い下方調節が見られた。タンデムCARは、より少ない抗原喪失しか誘導しなかったが、残っている細胞は、はるかにより少なかった。CD20発現の調節は減少していた。興味深いことに、一部のCD22下方調節も検出された。このことは、エスケープの抗原特異的および非抗原特異的機構の両方が、分析されたRaji細胞集団において可能であることを示し得る。次いで、RajiおよびNALM-6細胞株で、一晩および4日のCARコインキュベーションの両方を行った(図6C)。NALM-6の分析は、活性化リンパ球に対するNALM-6のより一般的な感受性により限定された。低いE:T比1:1でさえも、4日目の分析のために、共培養物からのNALM-6白血病細胞はほとんど使用可能でなかった。一晩のインキュベーション後、CD19発現の強い下方調節が見られ、CAR 19Aおよび19B LV形質導入T細胞は最大の効果を有した。タンデムCARおよび驚くべきことに、20A CD20 CARの全ては、CD19に対して測定可能な効果を有した(図6C)。CD22発現が15~20%減少し、非標的化B細胞分化抗原も影響されることを示すことも留意される。Raji細胞株を使用して、CD20に対するCAR媒介免疫圧の効果を観察することはより容易であった。CAR-T共培養実験において、CD20は、表面抗原発現の喪失に関して非標的化抗原CD22より変動性が低かった。NALM-6と同様に、CD19下方調節は迅速であり、大多数の細胞において起こった。Raji細胞における4日間の免疫圧後、全ての3種のB細胞抗原は中程度に下方調節されたので、タンデムCAR 2019および1920は、免疫圧を維持するように見えた。特に、CD19シングル特異性ベクターで、CD19発現は、強く下方調節されたままであった。20A CAR免疫圧は、一晩および4日目の両方で、エスケープ変異体を選択するより小さい能力しか示さず、おそらく、その発現なしで済ませるか、またはその発現を変更するRaji細胞のより小さい能力を示す。
炎症性細胞により産生される可溶性サイトカインによる腫瘍抗原表面発現の下方調節は、慢性リンパ性白血病において記録されている[30]。次いで、トランズウェル共培養アッセイにおいて、共培養されたCAR Tおよび腫瘍細胞の培地中に存在する可溶性因子が、Raji細胞上のCD19、CD20およびCD22の下方調節の原因であるかどうかを研究した。私たちは、Raji腫瘍細胞とCAR T細胞との間の直接接触が、CD19、CD20およびCD22のRaji表面発現を下方調節するために必要であることを見出した。
フローサイトメトリーにより抗体染色に関するCD19喪失の機構を調査するために、Thomas-Tikhonenko研究室の発見を使用して、CAR Tに曝露されたRaji細胞におけるCD19イソ型の出現率を研究した[8]。その目標を達成するために、Raji細胞をCAR-Tと共培養し、次いで一晩のインキュベーションの終わりにフローサイトメトリーによりそれらを分析して、CD19発現における低減を実証した。続いて、私たちは免疫磁気ビーズを使用して、T細胞の共培養物を枯渇させた。分離されたRaji細胞をウェスタンブロッティングにより分析した。驚くべきことに、全長CD19イソ型の低減が、CD19染色において観察された減少の主な原因であったこと、およびΔ2 CD19イソ型のレベルは、処置にかかわらず比較的安定なままであったことが分かった。
B細胞表面抗原発現の変動が非常に意味深かったので、私たちは、その相対的永久性を研究したいと考えた。言い換えれば、これは真の変異効果であったか、それとも表現型適応であったか。この疑問に取り組むために、CAR Tを分離したRaji細胞を培養に戻し、次いで4日目に再度フローサイトメトリーにより分析した。全ての腫瘍集団は、完全な回復を実証し、CD19、CD20およびCD22発現は98%を超えた。
腫瘍抗原エスケープは、養子細胞療法の分野が今日直面している主要な問題の1つである。CAR19を使用した再発性または難治性ALLの処置において達成された顕著な進歩にもかかわらず、腫瘍細胞上でCD19エピトープを下方調節することによる腫瘍エスケープが報告されており[5、18、19]、疾患再発のかなりの部分の原因である。特に、[20]において概略される、NHLなどの、小児プレB-ALLよりも処置が困難である疾患タイプにおいて、コンビナトリアル手法が、血液悪性腫瘍における腫瘍エスケープを克服するために必要であることが明らかになっている。さらに、白血病のCAR19処置について証明されるように、かつPSCAおよびMUC1陽性腫瘍のin vivoモデルにおいても示されたように[21]、単一のCAR T療法が使用された場合、不均一な標的抗原発現は、腫瘍エスケープバリアントをもたらし得る。それゆえ、単一のCAR T療法製品で多数の腫瘍抗原を標的化することは、腫瘍抗原エスケープを軽減し得る。
Sotilloおよび共同研究者ら[8]は、CD19喪失は、変異およびCD19陰性バリアントの増殖の両方、ならびにエクソン2欠損CD19バリアントを生じる選択的スプライシングを含む様々な機構により、CAR19圧下で原発性疾患ならびに白血病およびリンパ腫細胞株において起こることを実証した。最近の研究は、CD19抗原に対する長期CAR-T免疫圧後、腫瘍は、CD19陰性骨髄性表現型に戻ることによっても、検出を回避し得ることを示した[22、23]。使用された実験モデルにおいて、CD19 CAR構築物19Aおよび19Bの存在下におけるRaji白血病上のCD19下方調節は迅速であり、CAR Tとのただ一晩の共培養後に、検出されるCD19発現の顕著な喪失が起こった。CD19発現の喪失は、CAR T細胞が培養物から除去された後4日以内に完全に回復した。変化の迅速さが測定されていることを考え、かつRaji細胞が約20時間毎に1回複製することを考慮すると、私たちのモデルにおいて実際のCD19喪失変異およびCD19陰性リンパ腫クローンの優先的増殖によるCD19下方調節は、起こりそうにない。さらに、フローサイトメトリーにより調査される減少したCD19染色と一致して、シングルCAR19構築物19Aおよび19Bの存在下で、Raji全細胞溶解物中の全長CD19タンパク質の量は低減されるが、エクソン2スプライスCD19の量は、使用されたCAR Tのタイプにかかわらず、比較的安定なままであったことが決定された。それゆえ、CD19エクソン2の選択的スプライシングは、全長CD19のCAR媒介下方調節により修飾されない。
CD19はB細胞共受容体であり、それは、初期および後期B細胞発達において変異、増殖および生存の正のレギュレーターとして働く[24、25]。CD19は、リガンドによるその嵌合後にB細胞受容体とともに内部移行される。同様に、CD19は、特異的抗体による結合後に内部移行される場合があり、これは抗体コンジュゲート(ADC)療法において活用される事実である。B細胞表面からのCD20の内部移行も、治療用抗体リツキシマブの使用後に起こることが公知である[26]。CAR19圧は、CD19内部移行を引き起こし得ることも推測することができた。しかしながら、私たちの系において、単なるCD19の内部移行は、ウェスタンブロットにより示されるように、19Aおよび19B処置後に全長CD19タンパク質レベルが減少するという事実を説明することができなかった。したがって、CD19タンパク質下方調節は、CAR駆動内部移行の際に、転写もしくは翻訳レベルで、またはCD19タンパク質の分解の増大により起こるはずである。この効果は非常に動的であり、CAR19圧が除去された後すぐに元に戻る。
腫瘍増殖についてのCAR T療法への曝露によるCD19発現の低減の意義は、未だ完全に解明されてはいない。機構的に言えば、CD19は、B細胞受容体-抗原マイクロクラスター形成を促進することにより、B細胞活性化閾値を低減し、いくつかの下流のシグナル伝達経路を開始する[27]。CD19は典型的に、リンパ腫形成のプロモーターと考えられ、MYC腫瘍性タンパク質による正のフィードバックループを介してB細胞増殖を駆動することが示されている[28、29]。しかしながら、CD19は、CLL、B-PLL、SLVLおよびMCLを含む一部のタイプの白血病B細胞上で下方調節される[9]。それゆえ、CD19標的化CART細胞により選択圧が適用された場合などの一部の場合、CD19喪失が腫瘍増殖利益を与え得る可能性がある。白血病細胞で証明されたCD19の可塑性は、正常B細胞の生物学から保存されている特徴である可能性があり、これがここでは悪性腫瘍にさらなる生存利益を提供してしまう。
最後に、より高い腫瘍負荷を有するより進行した疾患環境において、タンデムCAR対シングルCARの活性を試験した。それぞれシングルCD19-CARまたはCD20-CARを発現する2つのCAR製品を混合して、1つのエフェクター集団にした単純化した手法も比較した(図9Aおよび9B)。CD2019 CARは、腫瘍を制御することができた唯一の処置群であり、この群では全ての対象が研究25日目まで生存した。シングルCAR 19Aおよび19Bそれら自体は、強い抗疾患効果を有さず、各群から1匹のマウスが失われた。20A CARそれ自体、またはいずれかのCD19 CARとの組合せの20A CARは、明らかにマウスから疾患を取り除いたが、6匹のマウスのうちの4匹は、25日目まで生存しなかった。これは、20A CARと比較して、タンデム2019 CARが腫瘍細胞により活性化されるより大きな可能性、およびそのより中程度のサイトカイン産生プロファイルのためであり得る(図4)。この研究において、私たちは、進行疾患による死亡またはCAR関連毒性による死亡を区別することができなかった。しかしながら、生存マウスからの疾患の完全な除去のために、20A CAR関連毒性が役割を果たした可能性が疑われる。私たちは、モデル腫瘍細胞株を使用しているので、私たちの研究の全てにおいて同種抗原反応性が役割を果たし得るが、使用されるアッセイのいずれかにおけるGFPまたはN.T.対照の活性の欠損は、それが主要な効果ではないことを実証する。
結論
本明細書で説明される研究それ自体は、CAR T免疫圧が持続的エスケープ変異体を生成することを証明しないが、今日までの臨床経験は、CD19陰性再発は稀な事象ではないことを示している[8、18、19]。さらに、データは、CD19抗原調節は非常に迅速な事象であること、および2つの抗原を同時に標的化することは、この問題に取り組むための合理的な手法であり得ることを実証する。高腫瘍負荷研究は、タンデムCAR T製品に起因し得る興味深い新しい生物学を強調し、翻訳研究のための優れたCAR設計形式を示し得る。あるいは、この研究において、有効なin vitro活性、特にサイトカイン産生と死滅活性との間で独特な平衡が達成されており、これは、エフェクター細胞により発現されるCARおよび全体的な疾患負荷の両方を考慮することによる最適in vivo活性のために確認される必要がある。
略語
AA-アミノ酸、7AAD- 7-アクチノマイシンD、AF-alexa fluor、ALL-急性リンパ芽急性白血病、ANOVA-分散分析、APC-アロフィコシアニン、CAR T-キメラ抗原受容体T細胞、CD-表面抗原分類、CLL-慢性リンパ性白血病、CPS-カウント毎秒、CTL-細胞傷害性Tリンパ球、ELISA-酵素結合免疫吸着アッセイ、FBS-ウシ胎児血清、Fc-Fc領域(fragment crystallizable region)、FITC-フルオレセインイソチオシアネート、GFP-緑色蛍光タンパク質、GM-CSF-顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、GMP-優良医薬品製造基準、HCL-有毛細胞白血病、HEK-ヒト胚腎臓細胞、Her2-ヒト上皮増殖因子受容体2、IFNγ-インターフェロンガンマ、IL-2-インターロイキン2、IU-国際単位、LV-レンチウイルスベクター、Luc-ホタルルシフェラーゼ、MCL-マントル細胞リンパ腫、MOPS- 3-(N-モルホリノ)プロパンスルホン酸、NSG-NOD.Cg-Prkdcscid Il2rgtm1Wjl/SzJ、N.T.-同じドナーからの非形質導入T細胞対照、OBI-Oklahoma Blood Institute、PE-フィコエリスリン、PLL-前リンパ球性白血病、ROR1-受容体チロシンキナーゼ様オーファン受容体1、RPM-毎分回転数、scFv-単鎖可変断片、SDS-PAGE-ドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル電気泳動、SLVL-絨毛リンパ球を伴う脾リンパ腫、T.A.-腫瘍単独対照群、TNFα-腫瘍壊死因子アルファ、VH-可変重鎖ドメイン、VL-可変軽鎖ドメイン。
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均等物
本文中に引用したそれぞれの出願と特許、および(訴訟中のそれぞれの交付済特許、「出願引用文書」を含めた)それぞれの出願と特許中で引用されたそれぞれの文書または参照文献、およびこれらの出願と特許のいずれかに対応するおよび/またはその優先権を主張するそれぞれのPCTと外国出願または特許、およびそれぞれの出願引用文書中で引用もしくは参照されたそれぞれの文書は、ここで明確に参照により本明細書に組み込まれ、本発明を実施する際に利用することができる。より一般的には、文書または参照文献は本文中、特許請求の範囲の前の参照文献一覧中、または本文自体中のいずれかに引用され、それぞれのこれらの文書または参照文献(「本明細書中引用参照文献」)、および(任意の製造者の仕様書、説明書などを含めた)それぞれの本明細書中引用参照文献中に引用されたそれぞれの文書または参照文献は、ここで明確に参照により本明細書に組み込まれる。
一部の具体的実施形態の前述の記載によって、他者が、本発明の知識を適用することによって、一般的概念から逸脱せずに、具体的実施形態などの様々な適用例に関して容易に変更または適合させることができるのに充分な情報を与え、したがってこのような適合および変更形態は、開示した実施形態の均等物の意味および範囲内と理解すべきであり、理解することが意図されている。本明細書で利用する語句または述語は、限定の目的ではなく記載の目的であることは理解される。図面および記載中、例示的実施形態を開示しており、特異的用語が利用された可能性はあるが、他に言及しない限り、それらは限定の目的ではなく一般的および叙述的な意味でのみ使用され、したがって特許請求の範囲もそのように限定されない。さらに当業者は、本明細書で論じた方法の、ある特定ステップは別の順序で順に並べることができ、またはステップを組み合わせることができることを理解する。したがって、添付の特許請求の範囲は本明細書で開示した詳細な実施形態に限られないことが意図される。当業者は、ごく普通の実験を使用した、本明細書に記載した本発明の実施形態の多くの均等物を理解し、把握することができる。このような均等物は以下の特許請求の範囲によって包含される。
本開示の配列
以下に列挙する核酸およびアミノ酸配列は、37C.F.R.1.822で規定されるように、ヌクレオチド塩基用の標準的な略語、およびアミノ酸用の3文字コードを使用して示される。各核酸配列のうち一方の鎖のみが示されているが、相補鎖は、示される鎖を参照することによって含まれるものと理解される。添付の配列表では:
配列番号1 リーダー-CD19 VL-WhitlowリンカーCD19 VH(GGGGS)-5 CD20 VH(GGGGS)-3 CD20 VL CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z(構築物CAR1920)のヌクレオチド配列
ATGCTCCTTCTCGTGACCTCCCTGCTTCTCTGCGAACTGCCCCATCCTGCCTTCCTGCTG
ATTCCCGACATTCAGATGACTCAGACCACCTCCTCCCTGTCCGCCTCCCTGGGCGACCGC
GTGACCATCTCATGCCGCGCCAGCCAGGACATCTCGAAGTACCTCAACTGGTACCAGCAG
AAGCCCGACGGAACCGTGAAGCTCCTGATCTACCACACCTCCCGGCTGCACAGCGGAGTG
CCGTCTAGATTCTCGGGTTCGGGGTCGGGAACTGACTACTCCCTTACTATTTCCAACCTG
GAGCAGGAGGATATTGCCACCTACTTCTGCCAACAAGGAAACACCCTGCCGTACACTTTT
GGCGGGGGAACCAAGCTGGAAATCACTGGCAGCACATCCGGTTCCGGGAAGCCCGGCTCC
GGAGAGGGCAGCACCAAGGGGGAAGTCAAGCTGCAGGAATCAGGACCTGGCCTGGTGGCC
CCGAGCCAGTCACTGTCCGTGACTTGTACTGTGTCCGGAGTGTCGCTCCCGGATTACGGA
GTGTCCTGGATCAGGCAGCCACCTCGGAAAGGATTGGAATGGCTCGGAGTCATCTGGGGT
TCCGAAACCACCTATTACAACTCGGCACTGAAATCCAGGCTCACCATTATCAAGGATAAC
TCCAAGTCACAAGTGTTCCTGAAGATGAATAGCCTGCAGACTGACGACACGGCGATCTAC
TATTGCGCCAAGCACTACTACTACGGCGGATCCTACGCTATGGACTACTGGGGCCAGGGG
ACCAGCGTGACCGTGTCATCCGGAGGCGGCGGCAGCGGCGGGGGAGGGTCCGGAGGGGGT
GGTTCTGGTGGAGGAGGATCGGGAGGCGGTGGCAGCGAGGTGCAGTTGCAACAGTCAGGA
GCTGAACTGGTCAAGCCAGGAGCCAGCGTGAAGATGAGCTGCAAGGCCTCCGGTTACACC
TTCACCTCCTACAACATGCACTGGGTGAAACAGACCCCGGGACAAGGGCTCGAATGGATT
GGCGCCATCTACCCCGGGAATGGCGATACTTCGTACAACCAGAAGTTCAAGGGAAAGGCC
ACCCTGACCGCCGACAAGAGCTCCTCCACCGCGTATATGCAGTTGAGCTCCCTGACCTCC
GAGGACTCCGCCGACTACTACTGCGCACGGTCCAACTACTATGGAAGCTCGTACTGGTTC
TTCGATGTCTGGGGGGCCGGCACCACTGTGACCGTCAGCTCCGGGGGCGGAGGATCCGGT
GGAGGCGGAAGCGGGGGTGGAGGATCCGACATTGTGCTGACTCAGTCCCCGGCAATCCTG
TCGGCCTCACCGGGCGAAAAGGTCACGATGACTTGTAGAGCGTCGTCCAGCGTGAACTAC
ATGGATTGGTACCAAAAGAAGCCTGGATCGTCACCCAAGCCTTGGATCTACGCTACATCT
AACCTGGCCTCCGGCGTGCCAGCGCGGTTCAGCGGGTCCGGCTCGGGCACCTCATACTCG
CTGACCATCTCCCGCGTGGAGGCTGAGGACGCCGCGACCTACTACTGCCAGCAGTGGTCC
TTCAACCCGCCGACTTTTGGAGGCGGTACTAAGCTGGAGATCAAAGCGGCCGCAACTACC
ACCCCTGCCCCTCGGCCGCCGACTCCGGCCCCAACCATCGCAAGCCAACCCCTCTCCTTG
CGCCCCGAAGCTTGCCGCCCGGCCGCGGGTGGAGCCGTGCATACCCGGGGGCTGGACTTT
GCCTGCGATATCTACATTTGGGCCCCGCTGGCCGGCACTTGCGGCGTGCTCCTGCTGTCG
CTGGTCATCACCCTTTACTGCAAGAGGGGCCGGAAGAAGCTGCTTTACATCTTCAAGCAG
CCGTTCATGCGGCCCGTGCAGACGACTCAGGAAGAGGACGGATGCTCGTGCAGATTCCCT
GAGGAGGAAGAGGGGGGATGCGAACTGCGCGTCAAGTTCTCACGGTCCGCCGACGCCCCC
GCATATCAACAGGGCCAGAATCAGCTCTACAACGAGCTGAACCTGGGAAGGAGAGAGGAG
TACGACGTGCTGGACAAGCGACGCGGACGCGACCCGGAGATGGGGGGGAAACCACGGCGG
AAAAACCCTCAGGAAGGACTGTACAACGAACTCCAGAAAGACAAGATGGCGGAAGCCTAC
TCAGAAATCGGGATGAAGGGAGAGCGGAGGAGGGGAAAGGGTCACGACGGGCTGTACCAG
GGACTGAGCACCGCCACTAAGGATACCTACGATGCCTTGCATATGCAAGCACTCCCACCC
CGG
配列番号2 リーダー-CD19 VL-WhitlowリンカーCD19 VH(GGGGS)-5 CD20 VH(GGGGS)-3 CD20 VL CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z(構築物CAR1920)のアミノ酸配列
MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIPDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEITGSTSGSGKPGSGEGSTKGEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLQQSGAELVKPGASVKMSCKASGYTFTSYNMHWVKQTPGQGLEWIGAIYPGNGDTSYNQKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLTSEDSADYYCARSNYYGSSYWFFDVWGAGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIVLTQSPAILSASPGEKVTMTCRASSSVNYMDWYQKKPGSSPKPWIYATSNLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISRVEAEDAATYYCQQWSFNPPTFGGGTKLEIKAAATTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR
配列番号3 リーダー-CD20 VH(GGGGS)3-CD20 VL-(GGGGS)5-CD19 VL-Whitlowリンカー-CD19 VH CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3z(構築物2019)のヌクレオチド配列
ATGCTCCTTCTCGTGACCTCCCTGCTTCTCTGCGAACTGCCCCATCCTGCCTTCCTGCTG
ATTCCCGAGGTGCAGTTGCAACAGTCAGGAGCTGAACTGGTCAAGCCAGGAGCCAGCGTG
AAGATGAGCTGCAAGGCCTCCGGTTACACCTTCACCTCCTACAACATGCACTGGGTGAAA
CAGACCCCGGGACAAGGGCTCGAATGGATTGGCGCCATCTACCCCGGGAATGGCGATACT
TCGTACAACCAGAAGTTCAAGGGAAAGGCCACCCTGACCGCCGACAAGAGCTCCTCCACC
GCGTATATGCAGTTGAGCTCCCTGACCTCCGAGGACTCCGCCGACTACTACTGCGCACGG
TCCAACTACTATGGAAGCTCGTACTGGTTCTTCGATGTCTGGGGGGCCGGCACCACTGTG
ACCGTCAGCTCCGGGGGCGGAGGATCCGGTGGAGGCGGAAGCGGGGGTGGAGGATCCGAC
ATTGTGCTGACTCAGTCCCCGGCAATCCTGTCGGCCTCACCGGGCGAAAAGGTCACGATG
ACTTGTAGAGCGTCGTCCAGCGTGAACTACATGGATTGGTACCAAAAGAAGCCTGGATCG
TCACCCAAGCCTTGGATCTACGCTACATCTAACCTGGCCTCCGGCGTGCCAGCGCGGTTC
AGCGGGTCCGGCTCGGGCACCTCATACTCGCTGACCATCTCCCGCGTGGAGGCTGAGGAC
GCCGCGACCTACTACTGCCAGCAGTGGTCCTTCAACCCGCCGACTTTTGGAGGCGGTACT
AAGCTGGAGATCAAAGGAGGCGGCGGCAGCGGCGGGGGAGGGTCCGGAGGGGGTGGTTCT
GGTGGAGGAGGATCGGGAGGCGGTGGCAGCGACATTCAGATGACTCAGACCACCTCCTCC
CTGTCCGCCTCCCTGGGCGACCGCGTGACCATCTCATGCCGCGCCAGCCAGGACATCTCG
AAGTACCTCAACTGGTACCAGCAGAAGCCCGACGGAACCGTGAAGCTCCTGATCTACCAC
ACCTCCCGGCTGCACAGCGGAGTGCCGTCTAGATTCTCGGGTTCGGGGTCGGGAACTGAC
TACTCCCTTACTATTTCCAACCTGGAGCAGGAGGATATTGCCACCTACTTCTGCCAACAA
GGAAACACCCTGCCGTACACTTTTGGCGGGGGAACCAAGCTGGAAATCACTGGCAGCACA
TCCGGTTCCGGGAAGCCCGGCTCCGGAGAGGGCAGCACCAAGGGGGAAGTCAAGCTGCAG
GAATCAGGACCTGGCCTGGTGGCCCCGAGCCAGTCACTGTCCGTGACTTGTACTGTGTCC
GGAGTGTCGCTCCCGGATTACGGAGTGTCCTGGATCAGGCAGCCACCTCGGAAAGGATTG
GAATGGCTCGGAGTCATCTGGGGTTCCGAAACCACCTATTACAACTCGGCACTGAAATCC
AGGCTCACCATTATCAAGGATAACTCCAAGTCACAAGTGTTCCTGAAGATGAATAGCCTG
CAGACTGACGACACGGCGATCTACTATTGCGCCAAGCACTACTACTACGGCGGATCCTAC
GCTATGGACTACTGGGGCCAGGGGACCAGCGTGACCGTGTCATCCGCGGCCGCAACTACC
ACCCCTGCCCCTCGGCCGCCGACTCCGGCCCCAACCATCGCAAGCCAACCCCTCTCCTTG
CGCCCCGAAGCTTGCCGCCCGGCCGCGGGTGGAGCCGTGCATACCCGGGGGCTGGACTTT
GCCTGCGATATCTACATTTGGGCCCCGCTGGCCGGCACTTGCGGCGTGCTCCTGCTGTCG
CTGGTCATCACCCTTTACTGCAAGAGGGGCCGGAAGAAGCTGCTTTACATCTTCAAGCAG
CCGTTCATGCGGCCCGTGCAGACGACTCAGGAAGAGGACGGATGCTCGTGCAGATTCCCT
GAGGAGGAAGAGGGGGGATGCGAACTGCGCGTCAAGTTCTCACGGTCCGCCGACGCCCCC
GCATATCAACAGGGCCAGAATCAGCTCTACAACGAGCTGAACCTGGGAAGGAGAGAGGAG
TACGACGTGCTGGACAAGCGACGCGGACGCGACCCGGAGATGGGGGGGAAACCACGGCGG
AAAAACCCTCAGGAAGGACTGTACAACGAACTCCAGAAAGACAAGATGGCGGAAGCCTAC
TCAGAAATCGGGATGAAGGGAGAGCGGAGGAGGGGAAAGGGTCACGACGGGCTGTACCAG
GGACTGAGCACCGCCACTAAGGATACCTACGATGCCTTGCATATGCAAGCACTCCCACCC
CGG
配列番号4 リーダー-CD20 VH(GGGGS)3-CD20 VL-(GGGGS)5-CD19 VL-Whitlowリンカー-CD19 VH CD8ヒンジ+TM-4-1BB-CD3zアミノ酸配列(構築物CAR2019)
MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIPEVQLQQSGAELVKPGASVKMSCKASGYTFTSYNMHWVKQTPGQGLEWIGAIYPGNGDTSYNQKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLTSEDSADYYCARSNYYGSSYWFFDVWGAGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIVLTQSPAILSASPGEKVTMTCRASSSVNYMDWYQKKPGSSPKPWIYATSNLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISRVEAEDAATYYCQQWSFNPPTFGGGTKLEIKGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTFGGGTKLEITGSTSGSGKPGSGEGSTKGEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSAAATTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR
配列番号5 CD19 LTG1494(CAR 19A)のヌクレオチド配列
ATGGTCATGCTTCTCCTGGTCACCTCCCTGCTCCTCTGCGAACTGCCTCACCCTGCCTTC
CTTCTGATTCCTGACACTGACATTCAGATGACTCAGACCACCTCTTCCTTGTCCGCGTCA
CTGGGAGACAGAGTGACCATCTCGTGTCGCGCAAGCCAGGATATCTCCAAGTACCTGAAC
TGGTACCAACAGAAGCCCGACGGGACTGTGAAGCTGCTGATCTACCACACCTCACGCCTG
CACAGCGGAGTGCCAAGCAGATTCTCCGGCTCCGGCTCGGGAACCGATTACTCGCTTACC
ATTAGCAACCTCGAGCAGGAGGACATCGCTACCTACTTCTGCCAGCAAGGAAATACCCTG
CCCTACACCTTCGGCGGAGGAACCAAATTGGAAATCACCGGCTCCACGAGCGGCTCCGGG
AAGCCTGGTTCCGGGGAAGGCTCCACTAAGGGTGAAGTGAAGCTCCAGGAGTCCGGCCCC
GGCCTGGTGGCGCCGTCGCAATCACTCTCTGTGACCTGTACCGTGTCGGGAGTGTCCCTG
CCTGATTACGGCGTGAGCTGGATTCGGCAGCCGCCGCGGAAGGGCCTGGAATGGCTGGGT
GTCATCTGGGGATCCGAGACTACCTACTACAACTCGGCCCTGAAGTCCCGCCTGACTATC
ATCAAAGACAACTCGAAGTCCCAGGTCTTTCTGAAGATGAACTCCCTGCAAACTGACGAC
ACCGCCATCTATTACTGTGCTAAGCACTACTACTACGGTGGAAGCTATGCTATGGACTAC
TGGGGCCAGGGGACATCCGTGACAGTCAGCTCCGCGGCCGCAACTACCACCCCTGCCCCT
CGGCCGCCGACTCCGGCCCCAACCATCGCAAGCCAACCCCTCTCCTTGCGCCCCGAAGCT
TGCCGCCCGGCCGCGGGTGGAGCCGTGCATACCCGGGGGCTGGACTTTGCCTGCGATATC
TACATTTGGGCCCCGCTGGCCGGCACTTGCGGCGTGCTCCTGCTGTCGCTGGTCATCACC
CTTTACTGCAAGAGGGGCCGGAAGAAGCTGCTTTACATCTTCAAGCAGCCGTTCATGCGG
CCCGTGCAGACGACTCAGGAAGAGGACGGATGCTCGTGCAGATTCCCTGAGGAGGAAGAG
GGGGGATGCGAACTGCGCGTCAAGTTCTCACGGTCCGCCGACGCCCCCGCATATCAACAG
GGCCAGAATCAGCTCTACAACGAGCTGAACCTGGGAAGGAGAGAGGAGTACGACGTGCTG
GACAAGCGACGCGGACGCGACCCGGAGATGGGGGGGAAACCACGGCGGAAAAACCCTCAG
GAAGGACTGTACAACGAACTCCAGAAAGACAAGATGGCGGAAGCCTACTCAGAAATCGGG
ATGAAGGGAGAGCGGAGGAGGGGAAAGGGTCACGACGGGCTGTACCAGGGACTGAGCACC
GCCACTAAGGATACCTACGATGCCTTGCATATGCAAGCACTCCCACCCCGG
配列番号6 CD19 LTG1494(CAR 19A)タンパク質のアミノ酸配列
MVMLLLVTSLLLCELPHPAFLLIPDTDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLN
WYQQKPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTL
PYTFGGGTKLEITGSTSGSGKPGSGEGSTKGEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSL
PDYGVSWIRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDD
TAIYYCAKHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSAAATTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEA
CRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMR
PVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVL
DKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRGKGHDGLYQGLST
ATKDTYDALHMQALPPR
配列番号7 CD19 LTG1538(CAR 19B)DNAのヌクレオチド配列
ATGCTTCTCCTGGTCACCTCCCTGCTCCTCTGCGAACTGCCTCACCCTGCCTTCCTTCTG
ATTCCTGACATTCAGATGACTCAGACCACCTCTTCCTTGTCCGCGTCACTGGGAGACAGA
GTGACCATCTCGTGTCGCGCAAGCCAGGATATCTCCAAGTACCTGAACTGGTACCAACAG
AAGCCCGACGGGACTGTGAAGCTGCTGATCTACCACACCTCACGCCTGCACAGCGGAGTG
CCAAGCAGATTCTCCGGCTCCGGCTCGGGAACCGATTACTCGCTTACCATTAGCAACCTC
GAGCAGGAGGACATCGCTACCTACTTCTGCCAGCAAGGAAATACCCTGCCCTACACCTTC
GGCGGAGGAACCAAATTGGAAATCACCGGCGGAGGAGGCTCCGGGGGAGGAGGTTCCGGG
GGCGGGGGTTCCGAAGTGAAGCTCCAGGAGTCCGGCCCCGGCCTGGTGGCGCCGTCGCAA
TCACTCTCTGTGACCTGTACCGTGTCGGGAGTGTCCCTGCCTGATTACGGCGTGAGCTGG
ATTCGGCAGCCGCCGCGGAAGGGCCTGGAATGGCTGGGTGTCATCTGGGGATCCGAGACT
ACCTACTACAACTCGGCCCTGAAGTCCCGCCTGACTATCATCAAAGACAACTCGAAGTCC
CAGGTCTTTCTGAAGATGAACTCCCTGCAAACTGACGACACCGCCATCTATTACTGTGCT
AAGCACTACTACTACGGTGGAAGCTATGCTATGGACTACTGGGGGCAAGGCACTTCGGTG
ACTGTGTCAAGCGCGGCCGCAACTACCACCCCTGCCCCTCGGCCGCCGACTCCGGCCCCA
ACCATCGCAAGCCAACCCCTCTCCTTGCGCCCCGAAGCTTGCCGCCCGGCCGCGGGTGGA
GCCGTGCATACCCGGGGGCTGGACTTTGCCTGCGATATCTACATTTGGGCCCCGCTGGCC
GGCACTTGCGGCGTGCTCCTGCTGTCGCTGGTCATCACCCTTTACTGCAAGAGGGGCCGG
AAGAAGCTGCTTTACATCTTCAAGCAGCCGTTCATGCGGCCCGTGCAGACGACTCAGGAA
GAGGACGGATGCTCGTGCAGATTCCCTGAGGAGGAAGAGGGGGGATGCGAACTGCGCGTC
AAGTTCTCACGGTCCGCCGACGCCCCCGCATATCAACAGGGCCAGAATCAGCTCTACAAC
GAGCTGAACCTGGGAAGGAGAGAGGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGACGCGGACGCGAC
CCGGAGATGGGGGGGAAACCACGGCGGAAAAACCCTCAGGAAGGACTGTACAACGAACTC
CAGAAAGACAAGATGGCGGAAGCCTACTCAGAAATCGGGATGAAGGGAGAGCGGAGGAGG
GGAAAGGGTCACGACGGGCTGTACCAGGGACTGAGCACCGCCACTAAGGATACCTACGAT
GCCTTGCATATGCAAGCACTCCCACCCCGG
配列番号8 CD19 LTG1538(CAR 19B)のアミノ酸配列
MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIPDIQMTQTTSSLSASLGDRVTISCRASQDISKYLNWYQQ
KPDGTVKLLIYHTSRLHSGVPSRFSGSGSGTDYSLTISNLEQEDIATYFCQQGNTLPYTF
GGGTKLEITGGGGSGGGGSGGGGSEVKLQESGPGLVAPSQSLSVTCTVSGVSLPDYGVSW
IRQPPRKGLEWLGVIWGSETTYYNSALKSRLTIIKDNSKSQVFLKMNSLQTDDTAIYYCA
KHYYYGGSYAMDYWGQGTSVTVSSAAATTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGG
AVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQE
EDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRD
PEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYD
ALHMQALPP
配列番号9 CD20A LTG1495(CAR 20A)のヌクレオチド配列
ATGCTCCTTCTCGTGACCTCCCTGCTTCTCTGCGAACTGCCCCATCCTGCCTTCCTGCTG
ATTCCCGAGGTGCAGTTGCAACAGTCAGGAGCTGAACTGGTCAAGCCAGGAGCCAGCGTG
AAGATGAGCTGCAAGGCCTCCGGTTACACCTTCACCTCCTACAACATGCACTGGGTGAAA
CAGACCCCGGGACAAGGGCTCGAATGGATTGGCGCCATCTACCCCGGGAATGGCGATACT
TCGTACAACCAGAAGTTCAAGGGAAAGGCCACCCTGACCGCCGACAAGAGCTCCTCCACC
GCGTATATGCAGTTGAGCTCCCTGACCTCCGAGGACTCCGCCGACTACTACTGCGCACGG
TCCAACTACTATGGAAGCTCGTACTGGTTCTTCGATGTCTGGGGGGCCGGCACCACTGTG
ACCGTCAGCTCCGGGGGCGGAGGATCCGGTGGAGGCGGAAGCGGGGGTGGAGGATCCGAC
ATTGTGCTGACTCAGTCCCCGGCAATCCTGTCGGCCTCACCGGGCGAAAAGGTCACGATG
ACTTGTAGAGCGTCGTCCAGCGTGAACTACATGGATTGGTACCAAAAGAAGCCTGGATCG
TCACCCAAGCCTTGGATCTACGCTACATCTAACCTGGCCTCCGGCGTGCCAGCGCGGTTC
AGCGGGTCCGGCTCGGGCACCTCATACTCGCTGACCATCTCCCGCGTGGAGGCTGAGGAC
GCCGCGACCTACTACTGCCAGCAGTGGTCCTTCAACCCGCCGACTTTTGGAGGCGGTACT
AAGCTGGAGATCAAAGCGGCCGCAACTACCACCCCTGCCCCTCGGCCGCCGACTCCGGCC
CCAACCATCGCAAGCCAACCCCTCTCCTTGCGCCCCGAAGCTTGCCGCCCGGCCGCGGGT
GGAGCCGTGCATACCCGGGGGCTGGACTTTGCCTGCGATATCTACATTTGGGCCCCGCTG
GCCGGCACTTGCGGCGTGCTCCTGCTGTCGCTGGTCATCACCCTTTACTGCAAGAGGGGC
CGGAAGAAGCTGCTTTACATCTTCAAGCAGCCGTTCATGCGGCCCGTGCAGACGACTCAG
GAAGAGGACGGATGCTCGTGCAGATTCCCTGAGGAGGAAGAGGGGGGATGCGAACTGCGC
GTCAAGTTCTCACGGTCCGCCGACGCCCCCGCATATCAACAGGGCCAGAATCAGCTCTAC
AACGAGCTGAACCTGGGAAGGAGAGAGGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGACGCGGACGC
GACCCGGAGATGGGGGGGAAACCACGGCGGAAAAACCCTCAGGAAGGACTGTACAACGAA
CTCCAGAAAGACAAGATGGCGGAAGCCTACTCAGAAATCGGGATGAAGGGAGAGCGGAGG
AGGGGAAAGGGTCACGACGGGCTGTACCAGGGACTGAGCACCGCCACTAAGGATACCTAC
GATGCCTTGCATATGCAAGCACTCCCACCCCGG
配列番号10 CD20A 1495(CAR 20A)のアミノ酸配列
MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIPEVQLQQSGAELVKPGASVKMSCKASGYTFTSYNMHWVK
QTPGQGLEWIGAIYPGNGDTSYNQKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLTSEDSADYYCAR
SNYYGSSYWFFDVWGAGTTVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIVLTQSPAILSASPGEKVTM
TCRASSSVNYMDWYQKKPGSSPKPWIYATSNLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISRVEAED
AATYYCQQWSFNPPTFGGGTKLEIKAAATTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAG
GAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQ
EEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGR
DPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTY
DALHMQALPPR
配列番号11 リーダー/シグナルペプチド配列(LP)のヌクレオチド配列
atgctgctgctggtgaccagcctgctgctgtgcgaactgccgcatccggcgtttctgctgattccg
配列番号12 リーダー/シグナルペプチド配列(LP)のアミノ酸配列
MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP
配列番号35 DNA CD8膜貫通ドメインのヌクレオチド配列
atttgggccccgctggccggcacttgcggcgtgctcctgctgtcgctggtcatcaccctt
tactgc
配列番号36 CD8膜貫通ドメインのアミノ酸配列
Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu
Val Ile Thr Leu Tyr Cys
配列番号37 DNA CD8ヒンジドメインのヌクレオチド配列
actaccacccctgcccctcggccgccgactccggccccaaccatcgcaagccaacccctc
tccttgcgccccgaagcttgccgcccggccgcgggtggagccgtgcatacccgggggctg
gactttgcctgcgatatctac
配列番号38 CD8ヒンジドメインのアミノ酸配列
Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala
Ser Gln Pro Leu Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly
Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr
配列番号39 CD8.アルファのアミノ酸番号137~206のヒンジおよび膜貫通領域(NCBI参照配列:NP.sub.--001759.3)のアミノ酸配列
Thr Thr Thr Pro Ala Pro Arg Pro Pro Thr Pro Ala Pro Thr Ile Ala Ser Gln Pro Leu
Ser Leu Arg Pro Glu Ala Cys Arg Pro Ala Ala Gly Gly Ala Val His Thr Arg Gly Leu Asp Phe Ala Cys Asp Ile Tyr Ile Trp Ala Pro Leu Ala Gly Thr Cys Gly Val Leu Leu Leu Ser Leu Val Ile Thr Leu Tyr Cys
配列番号40 4-1BBのDNAシグナル伝達ドメインのヌクレオチド配列
aagaggggccggaagaagctgctttacatcttcaagcagccgttcatgcggcccgtgcag
acgactcaggaagaggacggatgctcgtgcagattccctgaggaggaagaggggggatgc
gaactg
配列番号41 4-1BBのシグナル伝達ドメインのアミノ酸配列
Lys Arg Gly Arg Lys Lys Leu Leu Tyr Ile Phe Lys Gln Pro Phe Met
Arg Pro Val Gln Thr Thr Gln Glu Glu Asp Gly Cys Ser Cys Arg Phe
Pro Glu Glu Glu Glu Gly Gly Cys Glu Leu
配列番号42 CD3-ゼータのDNAシグナル伝達ドメインのヌクレオチド配列
cgcgtcaagttctcacggtccgccgacgcccccgcatatcaacagggccagaatcagctc
tacaacgagctgaacctgggaaggagagaggagtacgacgtgctggacaagcgacgcgga
cgcgacccggagatgggggggaaaccacggcggaaaaaccctcaggaaggactgtacaac
gaactccagaaagacaagatggcggaagcctactcagaaatcgggatgaagggagagcgg
aggaggggaaagggtcacgacgggctgtaccagggactgagcaccgccactaaggatacc
tacgatgccttgcatatgcaagcactcccaccccgg
配列番号43 CD3ゼータのアミノ酸配列
Arg Val Lys Phe Ser Arg Ser Ala Asp Ala Pro Ala Tyr Gln Gln Gly Gln Asn Gln Leu Tyr Asn Glu Leu Asn Leu Gly Arg Arg Glu Glu Tyr Asp Val Leu Asp Lys Arg Arg Gly Arg Asp Pro Glu Met Gly Gly Lys Pro Arg Arg Lys Asn Pro Gln Glu Gly Leu Tyr Asn Glu Leu Gln Lys Asp Lys Met Ala Glu Ala Tyr Ser Glu Ile Gly Met Lys Gly Glu Arg Arg Arg Gly Lys Gly His Asp Gly Leu Tyr Gln Gly Leu Ser Thr Ala Thr Lys Asp Thr Tyr Asp Ala Leu His Met Gln Ala Leu Pro Pro Arg
配列番号44 ScFv CD19(FMC63)のヌクレオチド配列
gacattcagatgactcagaccacctcttccttgtccgcgtcactgggagacagagtgaccat
ctcgtgtcgcgcaagccaggatatctccaagtacctgaactggtaccaacagaagcccga
cgggactgtgaagctgctgatctaccacacctcacgcctgcacagcggagtgccaagcag
attctccggctccggctcgggaaccgattactcgcttaccattagcaacctcgagcagga
ggacatcgctacctacttctgccagcaaggaaataccctgccctacaccttcggcggagg
aaccaaattggaaatcaccggcggaggaggctccgggggaggaggttccgggggcggggg
ttccgaagtgaagctccaggagtccggccccggcctggtggcgccgtcgcaatcactctc
tgtgacctgtaccgtgtcgggagtgtccctgcctgattacggcgtgagctggattcggca
gccgccgcggaagggcctggaatggctgggtgtcatctggggatccgagactacctacta
caactcggccctgaagtcccgcctgactatcatcaaagacaactcgaagtcccaggtctt
tctgaagatgaactccctgcaaactgacgacaccgccatctattactgtgctaagcacta
ctactacggtggaagctatgctatggactactgggggcaaggcacttcggtgactgtgtc
aagc
配列番号45 ScFv CD19(FMV63)のアミノ酸配列
Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Lys Tyr Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu Ile Tyr His Thr Ser Arg Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Gln Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Phe Cys Gln Gln Gly Asn Thr Leu Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Thr Gly Gly Gly GlySer Gly Gly Gly Gly Ser Gl yGly Gly Gly Ser Glu Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Ala Pro Ser Gln Ser Leu Ser Val Thr Cys Thr Val Ser Gly Val Ser Leu Pro Asp Tyr Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Arg Lys Gly Leu Glu Trp Leu Gly Val Ile Trp Gly Ser Glu Thr Thr Tyr Tyr Asn Ser Ala Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ile Lys Asp Asn Ser Lys Ser Gln Val Phe Leu Lys Met Asn Ser Leu Gln Thr Asp Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys Ala Lys His Tyr Tyr Tyr Gly Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser
配列番号46 抗CD33 CAR(LTG1936)のヌクレオチド配列
ATGCTGCTGCTGGTGACCAGCCTGCTGCTGTGCGAACTGCCGCATCCGGCGTTTCTGCTGATTCCGCAGGTGCAGCTGGTGCAATCTGGGGCAGAGGTGAAAAAGCCCGGGGAGTCTCTGAGGATCTCCTGTAAGGGTTCTGGATTCAGTTTTCCCACCTACTGGATCGGCTGGGTGCGCCAGATGCCCGGGAAAGGCCTGGAGTGGATGGGGATCATCTATCCTGGTGACTCTGATACCAGATACAGCCCGTCCTTCCAAGGCCAGGTCACCATCTCAGCCGACAAGTCCATCAGCACCGCCTACCTGCAGTGGAGCAGCCTGAAGGCCTCGGACACCGCCATGTATTACTGTGCGAGACTAGTTGGAGATGGCTACAATACGGGGGCTTTTGATATCTGGGGCCAAGGGACAATGGTCACCGTCTCTTCAGGAGGTGGCGGGTCTGGTGGTGGCGGTAGCGGTGGTGGCGGATCCGATATTGTGATGACCCACACTCCACTCTCTCTGTCCGTCACCCCTGGACAGCCGGCCTCCATCTCCTGCAAGTCTAGTCAGAGCCTCCTGCATAGTAATGGAAAGACCTATTTGTATTGGTACCTGCAGAAGCCAGGCCAGCCTCCACAGCTCCTGATCTATGGAGCTTCCAACCGGTTCTCTGGAGTGCCAGACAGGTTCAGTGGCAGCGGGTCAGGGACAGATTTCACACTGAAAATCAGCCGGGTGGAGGCTGAGGATGTTGGGGTTTATTACTGCATGCAAAGTATACAGCTTCCTATCACCTTCGGCCAAGGGACACGACTGGAGATTAAAGCGGCCGCAACTACCACCCCTGCCCCTCGGCCGCCGACTCCGGCCCCAACCATCGCAAGCCAACCCCTCTCCTTGCGCCCCGAAGCTTGCCGCCCGGCCGCGGGTGGAGCCGTGCATACCCGGGGGCTGGACTTTGCCTGCGATATCTACATTTGGGCCCCGCTGGCCGGCACTTGCGGCGTGCTCCTGCTGTCGCTGGTCATCACCCTTTACTGCAAGAGGGGCCGGAAGAAGCTGCTTTACATCTTCAAGCAGCCGTTCATGCGGCCCGTGCAGACGACTCAGGAAGAGGACGGATGCTCGTGCAGATTCCCTGAGGAGGAAGAGGGGGGATGCGAACTGCGCGTCAAGTTCTCACGGTCCGCCGACGCCCCCGCATATCAACAGGGCCAGAATCAGCTCTACAACGAGCTGAACCTGGGAAGGAGAGAGGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGACGCGGACGCGACCCGGAGATGGGGGGGAAACCACGGCGGAAAAACCCTCAGGAAGGACTGTACAACGAACTCCAGAAAGACAAGATGGCGGAAGCCTACTCAGAAATCGGGATGAAGGGAGAGCGGAGGAGGGGAAAGGGTCACGACGGGCTGTACCAGGGACTGAGCACCGCCACTAAGGATACCTACGATGCCTTGCATATGCAAGCACTCCCACCCCGG
配列番号47 抗CD33 CAR(LTG1936)のアミノ酸配列
MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIPQVQLVQSGAEVKKPGESLRISCKGSGFSFPTYWIGWVRQMPGKGLEWMGIIYPGDSDTRYSPSFQGQVTISADKSISTAYLQWSSLKASDTAMYYCARLVGDGYNTGAFDIWGQGTMVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSDIVMTHTPLSLSVTPGQPASISCKSSQSLLHSNGKTYLYWYLQKPGQPPQLLIYGASNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCMQSIQLPITFGQGTRLEIKAAATTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPP
配列番号48 抗メソセリンCAR(LTG1904)のヌクレオチド配列
ATGCTGCTGCTGGTGACCAGCCTGCTGCTGTGCGAACTGCCGCATCCGGCGTTTCTGCTGATTCCGGAGGTCCAGCTGGTACAGTCTGGGGGAGGCTTGGTACAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACCTTTGATGATTATGCCATGCACTGGGTCCGGCAAGCTCCAGGGAAGGGCCTGGAGTGGGTCTCAGGTATTAGTTGGAATAGTGGTAGCATAGGCTATGCGGACTCTGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAACGCCAAGAACTCCCTGTATCTGCAAATGAACAGTCTGAGAGCTGAGGACACGGCCTTGTATTACTGTGCAAAAGATTTATCGTCAGTGGCTGGACCCTTTAACTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTCACCGTCTCCTCAGGAGGTGGCGGGTCTGGTGGAGGCGGTAGCGGCGGTGGCGGATCCTCTTCTGAGCTGACTCAGGACCCTGCTGTGTCTGTGGCCTTGGGACAGACAGTCAGGATCACATGCCAAGGAGACAGCCTCAGAAGCTATTATGCAAGCTGGTACCAGCAGAAGCCAGGACAGGCCCCTGTACTTGTCATCTATGGTAAAAACAACCGGCCCTCAGGGATCCCAGACCGATTCTCTGGCTCCAGCTCAGGAAACACAGCTTCCTTGACCATCACTGGGGCTCAGGCGGAGGATGAGGCTGACTATTACTGTAACTCCCGGGACAGCAGTGGTAACCATCTGGTATTCGGCGGAGGCACCCAGCTGACCGTCCTCGGTGCGGCCGCAACTACCACCCCTGCCCCTCGGCCGCCGACTCCGGCCCCAACCATCGCAAGCCAACCCCTCTCCTTGCGCCCCGAAGCTTGCCGCCCGGCCGCGGGTGGAGCCGTGCATACCCGGGGGCTGGACTTTGCCTGCGATATCTACATTTGGGCCCCGCTGGCCGGCACTTGCGGCGTGCTCCTGCTGTCGCTGGTCATCACCCTTTACTGCAAGAGGGGCCGGAAGAAGCTGCTTTACATCTTCAAGCAGCCGTTCATGCGGCCCGTGCAGACGACTCAGGAAGAGGACGGATGCTCGTGCAGATTCCCTGAGGAGGAAGAGGGGGGATGCGAACTGCGCGTCAAGTTCTCACGGTCCGCCGACGCCCCCGCATATCAACAGGGCCAGAATCAGCTCTACAACGAGCTGAACCTGGGAAGGAGAGAGGAGTACGACGTGCTGGACAAGCGACGCGGACGCGACCCGGAGATGGGGGGGAAACCACGGCGGAAAAACCCTCAGGAAGGACTGTACAACGAACTCCAGAAAGACAAGATGGCGGAAGCCTACTCAGAAATCGGGATGAAGGGAGAGCGGAGGAGGGGAAAGGGTCACGACGGGCTGTACCAGGGACTGAGCACCGCCACTAAGGATACCTACGATGCCTTGCATATGCAAGCACTCCCACCCCGG
配列番号49 抗メソセリンCAR(LTG1904)のアミノ酸配列
MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIPEVQLVQSGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFDDYAMHWVRQAPGKGLEWVSGISWNSGSIGYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYYCAKDLSSVAGPFNYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSSSELTQDPAVSVALGQTVRITCQGDSLRSYYASWYQQKPGQAPVLVIYGKNNRPSGIPDRFSGSSSGNTASLTITGAQAEDEADYYCNSRDSSGNHLVFGGGTQLTVLGAAATTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR

Claims (7)

  1. リンパ腫を治療するための医薬を製造するためのT細胞の集団の使用であって、T細胞はキメラ抗原受容体(CAR)をコードする核酸配列を含み、ここにおいてCARは、配列番号2または4のアミノ酸配列を含むCD19/CD20抗原結合性ドメインを含む少なくとも1つの細胞外抗原結合性ドメイン、少なくとも1つのリンカーまたはスペーサードメイン、少なくとも1つの共刺激ドメイン、少なくとも1つの膜貫通ドメイン、および少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインを含み、ここにおいて核酸配列はEF-1アルファプロモーターに作動可能に連結され、配列番号1または3を含むか、または、それに対して85%の同一性を有する配列を含み、ここにおいてT細胞は、がん患者のT細胞であり、ここにおいて投与がリンパ腫を治療する、使用。
  2. 少なくとも1つの膜貫通ドメインが、T細胞受容体のアルファ鎖、T細胞受容体のベータ鎖もしくはT細胞受容体のゼータ鎖、CD28、CD3イプシロン、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154、およびTNFRSF19からなる群から選択されたタンパク質の膜貫通ドメインを含む、請求項1に記載の使用。
  3. 少なくとも1つのCD19/CD20抗原結合性ドメイン、前記少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメイン、またはその両方が、少なくとも1つのリンカーまたはスペーサードメインによって膜貫通ドメインに接続されている、請求項1に記載の使用。
  4. 少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ゼータ細胞内ドメインをさらに含む、請求項1に記載の使用。
  5. 少なくとも1つの細胞内シグナル伝達ドメインが、追加的な共刺激ドメインおよび一次シグナル伝達ドメインの少なくとも1つを含む、請求項1に記載の使用。
  6. 少なくとも1つの共刺激ドメインが、OX40、CD70、CD27、CD28、CD5、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)、DAP10、DAP12、および4-1BB(CD137)からなる群から選択された少なくとも1つの機能的シグナル伝達ドメインを含む、請求項5に記載の使用。
  7. 前記リンパ腫が、マントル細胞リンパ腫、非ホジキンリンパ腫またはホジキンリンパ腫である、請求項1に記載の使用。
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