JP2016505256A - 配列操作のためのCRISPR−Cas成分系、方法および組成物 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、それぞれBroad参照番号BI−2011/008/WSGR整理番号44063−701.101、BI−2011/008/WSGR整理番号44063−701.102、Broad参照番号BI−2011/008/VP整理番号44790.01.2003、BI−2011/008/VP整理番号44790.02.2003およびBI−2011/008/VP整理番号44790.03.2003を有する米国仮特許出願第61/736,527号明細書、同第61/748,427号明細書、同第61/768,959号明細書、同第61/791,409号明細書および同第61/835,931号明細書の優先権を主張し、これらは全て標題SYSTEMS METHODS AND COMPOSITIONS FOR SEQUENCE MANIPULATIONであり、それぞれ2012年12月12日、2013年1月2日、2013年2月25日、2013年3月15日および2013年6月17日に出願されたものである。
米国仮特許出願第61/758,468号明細書;同第61/769,046号明細書;同第61/802,174号明細書;同第61/806,375号明細書;同第61/814,263号明細書;同第61/819,803号明細書および同第61/828,130号明細書が参照され、それぞれ、標題ENGINEERING AND OPTIMIZATION OF SYSTEMS,METHODS AND COMPOSITIONS FOR SEQUENCE MANIPULATIONであり、それぞれ、2013年1月30日;2013年2月25日;2013年3月15日;2013年3月28日;2013年4月20日;2013年5月6日および2013年5月28日に出願されたものである。それぞれ2013年6月17日に出願された米国仮特許出願第61/835,936号明細書、同第61/836,127号明細書、同第61/836,101号明細書、同第61/836,080号明細書、同第61/836,123号明細書および同第61/835,973号明細書も参照される。それぞれBroad参照番号BI−2011/008Aを有する米国仮特許出願第61/842,322号明細書および米国特許出願第14/054,414号明細書も参照され、標題CRISPR−CAS SYSTEMS AND METHODS FOR ALTERING EXPRESSION OF GENE PRODUCTSを有し、それぞれ2013年7月2日および2013年10月15日に出願されたものである。
本発明は、米国国立衛生研究所(National Institutes of Health)により助成されたNIHパイオニアアワードDP1MH100706のもと政府支援によりなされた。米国政府は本発明において一定の権利を有する。
例示的なII型CRISPR系は、4つの遺伝子Cas9、Cas1、Cas2、およびCsn1のクラスター、ならびに2つの非コードRNAエレメント、tracrRNAおよび非反復配列の短いストレッチ(スペーサー、それぞれ約30bp)により間隔が空いている反復配列の特徴的アレイ(ダイレクトリピート)を含有する化膿性連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)SF370からのII型CRISPR遺伝子座である。この系において、ターゲティングされるDNA二本鎖切断(DSB)を4つの連続ステップにおいて生成する(図2A)。第1に、2つの非コードRNA、プレcrRNAアレイおよびtracrRNAがCRISPR遺伝子座から転写される。第2に、tracrRNAがプレcrRNAのダイレクトリピートにハイブリダイズし、次いでそれが個々のスペーサー配列を含有する成熟crRNAにプロセシングされる。第3に、成熟crRNA:tracrRNA複合体がCas9を、crRNAのスペーサー領域とプロトスペーサーDNAとの間のヘテロ二本鎖形成を介してプロトスペーサーおよび対応するPAMからなるDNA標的に指向する。最後に、Cas9は、PAMの上流の標的DNAの開裂を媒介してプロトスペーサー内でDSBを創成する(図2A)。この例は、このRNAプログラマブルヌクレアーゼ系を適応させて真核細胞の核中のCRISPR複合体活性を指向する例示プロセスを記載する。
ヒト胚腎臓(HEK)細胞系HEK293FT(Life Technologies)を、10%のウシ胎仔血清(HyClone)、2mMのGlutaMAX(Life Technologies)、100U/mLのペニシリン、および100μg/mLのストレプトマイシンが補給されたダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中で37℃において5%のCO2インキュベーションで維持した。マウスneuro2A(N2A)細胞系(ATCC)を、5%のウシ胎仔血清(HyClone)、2mMのGlutaMAX(Life Technologies)、100U/mLのペニシリン、および100μg/mLのストレプトマイシンが補給されたDMEMにより、37℃、5%のCO2で維持した。
HEK293FTまたはN2A細胞を、上記プラスミドDNAにより形質移入した。形質移入後、細胞を37℃において72時間インキュベートしてからゲノムDNAを抽出した。ゲノムDNAは、QuickExtractDNA抽出キット(Epicentre)を製造業者のプロトコルに従って使用して抽出した。手短に述べると、細胞をQuickExtract溶液中で再懸濁させ、65℃において15分間および98℃において10分間インキュベートした。抽出されたゲノムDNAを直ちに処理または−20℃において貯蔵した。
HEK293FTおよびN2A細胞を、プラスミドDNAにより形質移入し、37℃において72時間インキュベートしてから上記のとおりゲノムDNAを抽出した。相同組換え(HR)テンプレートのホモロジーアーム外側のプライマーを使用して標的ゲノム領域をPCR増幅した。PCR産物を1%のアガロースゲル上で分離し、MinElute GelExtraction Kit(Qiagen)により抽出した。精製産物をHindIII(Fermentas)により消化し、6%のNovex TBEポリアクリルアミドゲル(Life Technologies)上で分析した。
RNA二次構造予測は、Institute for Theoretical Chemistry at the University of Viennaにおいて開発されたオンラインウェブサーバーRNAfoldを使用し、セントロイド構造予測アルゴリズムを使用して実施した(例えば、A.R.Gruber et al.,2008,Cell 106(1):23−24;およびPA Carr and GM Church,2009,Nature Biotechnology 27(12):1151−62参照)。
CRISPR活性に十分な化膿性連鎖球菌(S.pyogenes)CRISPR遺伝子座1のエレメントを、pCRISPRプラスミドを使用して大腸菌(E.coli)中で再構成した(図10Aに模式的に説明する)。pCRISPRは、tracrRNA、SpCas9、およびcrRNAアレイをドライブするリーダー配列を含有した。スペーサー(「ガイド配列」とも称される)を、説明のとおりアニールされたオリゴヌクレオチドを使用してcrRNAアレイ中にBsaI部位間で挿入した。干渉アッセイにおいて使用されるチャレンジプラスミドは、プロトスペーサー(「標的配列」とも称される)配列を、隣接CRISPRモチーフ配列(PAM)とともにpUC19中に挿入することにより構築した(図10B参照)。チャレンジプラスミドは、アンピシリン耐性を含有した。図10Cは、干渉アッセイの模式的表示を提供する。既にpCRISPRおよび適切なスペーサーを担持する化学コンピテント大腸菌(E.coli)株を、対応するプロトスペーサー−PAM配列を含有するチャレンジプラスミドにより形質転換した。pUC19を使用してそれぞれのpCRISPR担持コンピテント株の形質転換効率を評価した。CRISPR活性は、プロトスペーサーを担持するpPSPプラスミドの開裂をもたらし、そうでなければプロトスペーサーを欠くpUC19により付与されるアンピシリン耐性を除外した。図10Dは、図4Cに説明されるアッセイにおいて使用されたそれぞれのpCRISPR担持大腸菌(E.coli)株のコンピテンスを説明する。
HEK293FT細胞を上記のとおり維持および形質移入した。細胞をトリプシン処理により回収し、次いでリン酸緩衝生理食塩水(PBS)中で洗浄した。トータル細胞RNAをTRI試薬(Sigma)により製造業者のプロトコルに従って抽出した。抽出されたトータルRNAをNaonodrop(Thermo Scientific)を使用して定量し、同一濃度に正規化した。
RNAを等容量の2×ローディング緩衝液(Ambion)と混合し、95℃に5分間加熱し、氷上で1分間冷蔵し、次いで8%の変性ポリアクリルアミドゲル(SequaGel,National Diagnostics)上に、少なくとも30分間のゲルのプレラン後にロードした。試料を40W限界において1.5時間電気泳動した。その後、RNAをHybond N+メンブレン(GE Healthcare)に300mAにおいてセミドライ転写装置(Bio−rad)中で室温において1.5時間転写した。Stratagene UV CrosslinkerのStratalinker(Stratagene)上のオートクロスリンクボタンを使用してRNAをメンブレンに架橋させた。メンブレンをULTRAhyb−オリゴハイブリダイゼーション緩衝液(Ambion)中で回転させながら42℃において30分間プレハイブリダイズさせ、次いでプローブを添加し、一晩ハイブリダイズさせた。プローブはIDTに発注し、T4ポリヌクレオチドキナーゼ(New England Biolabs)を用いて[ガンマ−32P]ATP(Perkin Elmer)により標識した。メンブレンを予備加温(42℃)された2×SSC、0.5%のSDSにより1分間1回洗浄し、次いで42℃において30分間2回洗浄した。メンブレンを蛍光スクリーンに室温において1時間または一晩曝露させ、次いでphosphorimager(Typhoon)によりスキャンした。
tracrRNA、Cas9、およびリーダーを含むCRISPR遺伝子座エレメントを、化膿性連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)SF370ゲノムDNAから、ギブソン・アセンブリ(Gibson Assembly)のためのフランキングホモロジーアームを用いてPCR増幅した。2つのBsaI IIS型部位を2つのダイレクトリピート間に導入してスペーサーの容易な挿入を促進した(図9)。Gibson Assembly Master Mix(NEB)を使用してPCR産物をEcoRV消化pACYC184中にtetプロモーターの下流でクローニングした。Csn2の最後の50bpは除き、他の内因性CRISPR系エレメントは除外した。相補的オーバーハングを有するスペーサーをコードするオリゴ(Integrated DNA Technology)をBsaI消化ベクターpDC000(NEB)中にクローニングし、次いでT7リガーゼ(Enzymatics)によりライゲートしてpCRISPRプラスミドを生成した。PAM配列(本明細書において「CRISPRモチーフ配列」とも称される)を有するスペーサーを含有するチャレンジプラスミドを、同等のオーバーハングを担持するハイブリダイズされたオリゴ(Integrated DNA Technology)をBamHI消化pUC19中にライゲートすることにより創成した。全ての構築物のためのクローニングは、大腸菌(E.coli)株JM109(Zymo Research)中で実施した。
配列特異的DNA開裂をプログラミングするためにRNAを使用する技能は、種々の研究および産業用途のための新たなクラスのゲノムエンジニアリングツールを定義する。CRISPR系のいくつかの態様は、CRISPRターゲティングの効率および多用途性を増加させるようにさらに改善することができる。最適なCas9活性は、哺乳動物核中に存在するものよりも高いレベルにおけるフリーMg2+の利用可能性に依存し得(例えば、Jinek et al.,2012,Science,337:816参照)、プロトスペーサーのすぐ下流のNGGモチーフについての優先性は、ヒトゲノム中で平均12bpごとでターゲティング能を制限する(図11、ヒト染色体配列のプラスおよびマイナス鎖の両方を評価)。これらの拘束の一部は、微生物メタゲノムにわたるCRISPR遺伝子座の多様性を利用することにより克服することができる(例えば、Makarova et al.,2011,Nat Rev Microbiol,9:467参照)。他のCRISPR遺伝子座を、実施例1に記載のものと同様の方法により哺乳動物細胞環境中に移植することができる。例えば、図12は、CRISPR媒介ゲノム編集を達成するための哺乳動物細胞中の異種発現のためのストレプトコッカス・サーモフィラス(Streptococcus thermophilus)LMD−9のCRISPR1からのII型CRISPR系の適応を説明する。図12Aは、S.サーモフィラス(S.thermophilus)LMD−9のCRISPR1の模式的説明を提供する。図12Bは、S.サーモフィラス(S.thermophilus)CRISPR系のための発現系の設計を説明する。ヒトコドン最適化hStCas9を、構成的EF1αプロモーターを使用して発現させる。tracrRNAおよびcrRNAの成熟バージョンを、U6プロモーターを使用して発現させて正確な転写開始を促進する。成熟crRNAおよびtracrRNAからの配列を説明する。crRNA配列中の小文字「a」により示される単一塩基を使用してRNApolIII転写ターミネーターとして機能するポリU配列を除去する。図12Cは、ヒトEMX1遺伝子座ターゲティングするガイド配列を示す模式図およびそれらの予測二次構造を提供する。それぞれの標的部位における改変効率を、RNA二次構造の下方に示す。この構造を生成するアルゴリズムは、それぞれの塩基を予測二次構造を仮定するその確率に従って着色し、これを図12Cにグレースケールで再現されるレインボースケールにより示す。図12Dは、Surveyorアッセイを使用する標的遺伝子座中のhStCas9媒介開裂の結果を示す。RNAガイドスペーサー1および2は、それぞれ14%および6.4%を誘導した。これらの2つのプロトスペーサー部位における生物学的複製物にわたる開裂活性の統計分析も図6に提供する。図16は、ヒトEMX1遺伝子座中のS.サーモフィラス(S.thermophilus)CRISPR系の追加のプロトスペーサーおよび対応するPAM配列標的の模式図を提供する。2つのプロトスペーサー配列を強調し、NNAGAAWモチーフを満たすそれらの対応するPAM配列を対応する強調配列に対して3’側で下線を付けることにより示す。両方のプロトスペーサーは、アンチセンス鎖をターゲティングする。
規定のCRISPR酵素についての所望のガイド配列長およびCRISPRモチーフ配列(PAM)に基づきインプットDNA配列の両方の鎖上の候補CRISPR標的配列を同定するためのソフトウェアプログラムを設計する。例えば、化膿性連鎖球菌(S.pyogenes)からのCas9についての標的部位は、PAM配列NGGを用いて、インプット配列およびインプットの逆相補鎖の両方の上の5’−Nx−NGG−3’を探索することにより同定することができる。同様に、S.サーモフィラス(S.thermophilus)CRISPR1のCas9についての標的部位は、PAM配列NNAGAAWを用いて、インプット配列およびインプットの逆相補鎖の両方の上の5’−Nx−NNAGAAW−3’を探索することにより同定することができる。同様に、S.サーモフィラス(S.thermophilus)CRISPR3のCas9についての標的部位は、PAM配列NGGNGを用いて、インプット配列およびインプットの逆相補鎖の両方の上の5’−Nx−NGGNG−3’を探索することにより同定することができる。Nx中の値「x」は、プログラムにより固定し、または使用者により規定することができ、例えば、20である。
本実施例は、異なる長さの野生型tracrRNA配列を取り込むtracr配列を有するキメラRNA(chiRNA;ガイド配列、tracrメイト配列、およびtracr配列を単一転写物中で含む)について得られた結果を記載する。図18aは、キメラRNAおよびCas9のためのバイシストロニック発現ベクターの模式図を説明する。Cas9はCBhプロモーターによりドライブされ、キメラRNAはU6プロモーターによりドライブされる。キメラガイドRNAは、からなる。示される種々の位置においてトランケートされたtracr配列(下方の鎖の最初の「U」から転写物の末端に及ぶ)に結合している20bpのガイド配列(N)からなる。ガイドおよびtracr配列は、tracrメイト配列GUUUUAGAGCUAと、それに続くループ配列GAAAにより離隔している。ヒト遺伝子座EMX1およびPVALB遺伝子座におけるCas9媒介インデルについてのSURVEYORアッセイの結果を、それぞれ図18bおよび18cに説明する。矢印は、予測SURVEYOR断片を示す。chiRNAをそれらの「+n」表記により示し、crRNAは、ガイドおよびtracr配列が別個の転写物として発現されるハイブリッドRNAを指す。トリプリケートで実施されたこれらの結果の定量を、図19aおよび19bにヒストグラムにより示し、それぞれ図18bおよび18cに対応する(「N.D.」は、インデルが検出されなかったことを示す)。プロトスペーサーIDおよびそれらの対応するゲノム標的、プロトスペーサー配列、PAM配列、および鎖局在を表Dに提供する。ガイド配列は、ハイブリッド系における別個の転写物の場合、プロトスペーサー配列全体に相補的であるように、またはキメラRNAの場合、下線部にのみ相補的であるように設計した。
ヒト胚腎臓(HEK)細胞系293FT(Life Technologies)を、10%のウシ胎仔血清(HyClone)、2mMのGlutaMAX(Life Technologies)、100U/mLのペニシリン、および100μg/mLのストレプトマイシンが補給されたダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中で37℃において5%のCO2インキュベーションで維持した。293FT細胞を24ウェルプレート(Corning)上に、形質移入24時間前に1ウェル当たり150,000個の細胞の密度において播種した。Lipofectamine2000(Life Technologies)を製造業者の推奨プロトコルに従って使用して細胞を形質移入した。24ウェルプレートのそれぞれのウェルについて、合計500ngのプラスミドを使用した。
293FT細胞を上記プラスミドDNAにより形質移入した。細胞を37℃において形質移入後72時間インキュベートしてからゲノムDNAを抽出した。ゲノムDNAは、QuickExtract DNA Extraction Solution(Epicentre)を製造業者のプロトコルに従って使用して抽出した。手短に述べると、ペレット化細胞をQuickExtract溶液中で再懸濁させ、65℃において15分間および98℃において10分間インキュベートした。それぞれの遺伝子についてのCRISPR標的部位をフランキングするゲノム領域を、PCR増幅し(表Eに列記のプライマー)、QiaQuick Spin Column(Qiagen)を製造業者のプロトコルに従って使用して産物を精製した。合計400ngの精製PCR産物を2μlの10×Taq DNA Polymerase PCR緩衝液(Enzymatics)と混合し、超純水で20μlの最終容量とし、リアニーリングプロセスに供してヘテロ二本鎖形成を可能とした:95℃において10分間、−2℃/秒における傾斜で95℃から85℃、−0.25℃/秒における85℃から25℃、および25℃において1分間維持。リアニーリング後、産物をSURVEYORヌクレアーゼおよびSURVEYORエンハンサーS(Transgenomics)により製造業者の推奨プロトコルに従って処理し、4〜20%のNovex TBEポリアクリルアミドゲル(Life Technologies)上で分析した。ゲルをSYBR Gold DNA染色(Life Technologies)により30分間染色し、Gel Docゲルイメージングシステム(Bio−rad)によりイメージングした。定量は、相対バンド強度に基づくものであった。
ヒト、マウス、ラット、ゼブラフィッシュ、ミバエ、および線虫(C.elegans)ゲノム中の化膿性連鎖球菌(S.pyogenes)SF370Cas9(SpCas9)酵素についてのユニーク標的部位を同定するため、本出願人らは、DNA配列の両方の鎖をスキャンし、考えられる全てのSpCas9標的部位を同定するためのソフトウェアパッケージを開発した。この実施例について、それぞれのSpCas9標的部位を20bp配列と、それに続くNGGプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列として操作上定義し、本出願人らは、全ての染色体上のこの5’−N20−NGG−3’定義を満たす全ての配列を同定した。非特異的ゲノム編集を防止するため、全ての潜在的な部位を同定した後、全ての標的部位をそれらが関連参照ゲノム中で出現する回数に基づきフィルタリングした。例えば、PAM配列から5’側の約11〜12bp配列であり得る「シード」配列により付与されるCas9活性の配列特異性を利用するため、5’−NNNNNNNNNN−NGG−3’配列を関連ゲノム中でユニークであると選択した。全てのゲノム配列をUCSCゲノムブラウザからダウンロードした(ヒトゲノムhg19、マウスゲノムmm9、ラットゲノムrn5、ゼブラフィッシュゲノムdanRer7、キイロショウジョウバエ(D.melanogaster)ゲノムdm4および線虫(C.elegans)ゲノムce10)。全探索結果は、UCSCゲノムブラウザ情報を使用して閲覧利用可能である。ヒトゲノム中の一部の標的部位の例示的可視化を図21に提供する。
U6−短鎖tracrRNA(化膿連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)SF370):
本出願人らは、CRISPR関連エンドヌクレアーゼCas9を使用して肺炎連鎖球菌(Streptococcus pneumoniae)および大腸菌(Escherichia coli)のゲノム中に正確な突然変異を導入した。このアプローチは、非突然変異細胞を殺傷するためのターゲティングされる部位におけるCas9指向開裂に依存し、選択可能なマーカーまたはカウンターセレクション系の必要性を回避した。Cas9特異性は、編集テンプレート上で担持される単一および多ヌクレオチド変化を作製するように短鎖CRISPR RNA(crRNA)配列を変化させることによりリプログラミングした。2つのcrRNAの同時使用により、複数の突然変異導入が可能になった。肺炎連鎖球菌(S.pneumoniae)において、Cas9開裂から生存した細胞のほぼ100%が、所望の突然変異を含有し、大腸菌(E.coli)におけるリコンビニアリングとの組合せで使用された場合は65%が所望の突然変異を含有した。本出願人らは、もっぱら、ターゲティング可能な配列の範囲を定義するためのCas9標的要件を徹底的に分析し、それらの要件に合致しない編集部位のための方針を示し、このことは、細菌ゲノムエンジニアリングのためのこの技術の多用途性を示唆した。
肺炎連鎖球菌(S.pneumoniae)株crR6は、バクテリオファージφ8232.5中に存在する標的配列を開裂するCas9ベースCRISPR系を含有する。この標的を第2の株R68232.5のsrtA染色体遺伝子座中にインテグレートした。PAM領域中の突然変異を含有する変化標的配列を第3の株R6370.1のsrtA遺伝子座中にインテグレートし、この株をCRISPR開裂に対して「免疫性」とした(図28a)。本出願人らは、R68232.5およびR6370.1細胞をcrR6細胞からのゲノムDNAにより形質転換し、R68232.5細胞の良好な形質転換が標的遺伝子座の開裂および細胞死をもたらすはずであることを予測した。この予測とは逆に、本出願人らは、R6370.1形質転換体よりも約10倍小さい効率にもかかわらず、R68232.5形質転換体を単離した(図28b)。8つのR68232.5形質転換体の遺伝子分析(図28)により、大多数は、φ8232.5標的をCas9認識に要求されるプロトスペーサーを含有しないcrR6ゲノム野生型srtA遺伝子座により置き換えることによりCas9ターゲティングの毒性を排除する二重組換えイベントの産物であることが明らかになった。これらの結果は、ゲノム遺伝子座をターゲティングするCRISPR系(ターゲティング構築物)の、ターゲティングされる遺伝子座中への組換えのためのテンプレート(編集テンプレート)と一緒の同時導入はターゲティングされるゲノム編集をもたらす証明であった(図23a)。
ランダム化PAM:ランダム化PAM実験について、crR6について3,429,406リード、R6について3,253,998リードが得られた。これらの半数のみがPAM標的に対応する一方、他の半数がPCR産物の他の末端をシーケンシングすることが予測される。crR6リードの1,623,008およびR6リードの1,537,131は、エラーのない標的配列を担持した。これらのリードの中のそれぞれの考えられるPAMの発生率を補足ファイルに示す。PAMの機能性を推定するため、R6試料に対するcrR6試料中のその相対比率を計算し、rijklm(式中、I、j、k、l、mは、4つの考えられる塩基の1つである)で示す。以下の統計モデルを構築した:
log(rijklm)=μ+b2i+b3j+b4k+b2b3i,j+b3b4j,k+εijklm
(式中、εは、残差であり、b2は、PAMの第2の塩基の効果であり、b3は、第3の塩基の効果であり、b4は、第4の塩基の効果であり、b2b3は、第2の塩基と第3の塩基との間の相互作用であり、b3b4は、第3の塩基と第4の塩基との間の相互作用である)。分散分析を実施した。
NAGNNパターンは、全ての他のパターンと有意に異なるが、NGGNNよりもかなり少ない効果を有する(以下のテューキーのHSD検定参照)。
ランダム化標的実験について、crR6について540,726リードが、R6について753,570リードが得られた。上記のとおり、リードの半数のみがPCR産物の目的末端をシーケンシングすることが予測される。エラーフリーまたは単一の点突然変異を有する標的を担持するリードをフィルタリングした後、crR6およびR6についてそれぞれ217,656および353,141リードが残存した。R6試料に対するcrR6試料におけるそれぞれの突然変異体の相対比率を計算した(図24c)。シード配列の外側(PAMから13〜20塩基離れている)の全ての突然変異は、完全干渉を示す。これらの配列を参照として使用してシード配列の内側の他の突然変異が干渉を有意に破壊し得ると考えられるか否かを決定した。MASS Rパッケージのfitdistr関数を使用して正規分布をこれらの配列にフィットさせた。フィットされた分布の0.99分位点を図24cに点線として示す。図72は、フィットされた正規分布(黒線)および0.99分位点(点線)を有するデータ密度のヒストグラムを示す。
本出願人らは、tracrRNAおよびダイレクトリピート配列を突然変異させ、またはキメラガイドRNAを突然変異させて細胞中のRNAを向上させた。
最適化tracrRNA1(下線は突然変異):
元のガイドRNA:
本出願人らは、図4に示されるガイドキメラRNAを設計した。
CRISPR−Cas系は、細菌から古細菌にわたる多様な種により用いられる侵入外因性DNAに対する適応免疫機序である。II型CRISPR−Cas9系は、CRISPR遺伝子座中への外来DNAの「獲得」を担うタンパク質をコードする遺伝子のセット、およびDNA開裂機序の「実行」をコードする遺伝子のセットからなり;これらは、DNAヌクレアーゼ(Cas9)、非コードトランス活性化crRNA(tracrRNA)、およびダイレクトリピートによりフランキングされている外来DNA由来スペーサーのアレイ(crRNA)を含む。Cas9による成熟時、tracRNAおよびcrRNA二本鎖は、Cas9ヌクレアーゼをスペーサーガイド配列により規定される標的DNA配列にガイドし、開裂に要求され、それぞれのCRISPR−Cas系に特異的な標的DNA中の短鎖配列モチーフ付近のDNAの二本鎖切断を媒介する。II型CRISPR−Cas系は、細菌界全体にわたり見出されており、Cas9タンパク質配列およびサイズ、tracrRNAおよびcrRNAダイレクトリピート配列、それらのエレメントのゲノム構成、および標的開裂のためのモチーフ要件は高度に多様である。ある種は、複数の区別されるCRISPR−Cas系を有し得る。
細胞培養および形質移入
ヒト胚腎臓(HEK)細胞系293FT(Life Technologies)を、10%のウシ胎仔血清(HyClone)、2mMのGlutaMAX(Life Technologies)、100U/mLのペニシリン、および100μg/mLのストレプトマイシンが補給されたダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中で37℃において5%のCO2インキュベーションで維持した。
293FT細胞を上記のとおりプラスミドDNAにより形質移入した。細胞を37℃において形質移入後72時間インキュベートしてからゲノムDNAを抽出した。ゲノムDNAは、QuickExtract DNA Extraction Solution(Epicentre)を製造業者のプロトコルに従って使用して抽出した。手短に述べると、ペレット化細胞をQuickExtract溶液中で懸濁させ、65℃において15分間および98℃において10分間インキュベートした。
ノザンブロットを、上記のとおり実施した。手短に述べると、RNAを95℃に5分間加熱してから8%の変性ポリアクリルアミドゲル(SequaGel,National Diagnostics)上にロードした。その後、RNAを事前にハイブリダイズさせたHybond N+メンブレン(GE Healthcare)に転写し、Stratagene UV Crosslinker(Stratagene)により架橋した。プローブをT4ポリヌクレオチドキナーゼ(New England Biolabs)を用いて[ガンマ−32P]ATP(Perkin Elmer)により標識した。洗浄後、メンブレンを蛍光スクリーンに1時間曝露し、phosphorimager(Typhoon)によりスキャンした。
HEK293FT細胞を、上記のとおりCas9により形質移入した。ゲノムDNAをDNeasy Blood&Tissue Kit(Qiagen)により単離し、バイサルファイトをEZ DNA Methylation−Lightning Kit(Zymo Research)により変換した。バイサルファイトPCRは、Bisulfite Primer Seekerを使用して設計されたプライマー(Zymo Research、表JおよびK)を用いてKAPA2G Robust HotStart DNA Polymerase(KAPA Biosystems)を使用して実施した。得られたPCRアンプリコンをゲル精製し、EcoRIおよびHindIIIにより消化し、形質転換前にpUC19骨格中にライゲートした。次いで、個々のクローンをサンガーシーケンシングしてDNAメチル化状態を評価した。
HEK293FT細胞を上記のとおりCas9により形質移入した。次いで、ホールセル溶解物を、Protease Inhibitor Cocktail(Roche)が補給された溶解緩衝液(20mMのHEPES、100mMのKCl、5mMのMgCl2、1mMのDTT、5%のグリセロール、0.1%のTriton X−100)を用いて調製した。カスタムオリゴ(実施例10)およびHiScribe T7 In Vitro Transcription Kit(NEB)を製造業者の推奨プロトコルに従って使用してT7によりドライブされるsgRNAをインビトロで転写させた。メチル化標的部位を調製するため、pUC19プラスミドをM.SssIによりメチル化し、次いでNheIにより線形化した。インビトロ開裂アッセイを以下のとおり実施した:20uLの開裂反応物について、10uLの細胞溶解物を2uLの開裂緩衝液(100mMのHEPES、500mMのKCl、25mMのMgCl2、5mMのDTT、25%のグリセロール)、インビトロ転写されたRNA、300ngのpUC19プラスミドDNAとともにインキュベートした。
96ウェルプレート中でプレーティングされたHEK293FT細胞を、Cas9プラスミドDNAおよび単一ガイドRNA(sgRNA)PCRカセットにより72時間形質移入してからゲノムDNAを抽出した(図72)。それぞれの遺伝子についてのCRISPR標的部位をフランキングするゲノム領域を、融合PCR法により増幅してIllumina P5アダプターおよびユニークな試料特異的バーコードを標的アンプリコン(図73に記載の模式図)に付着させた(図74、図80(実施例10)。PCR産物は、EconoSpin96ウェルFilter Plates(Epoch Life Sciences)を製造業者の推奨プロトコルに従って使用して精製した。
MiSeqリードは、少なくとも23の平均Phredクオリティ(Qスコア)ならびにバーコードおよびアンプリコンフォワードプライマーとの完全配列マッチを要求することによりフィルタリングした。オンおよびオフターゲット遺伝子座からのリードは、標的部位の上流および下流の50ヌクレオチド(合計120bp)を含むアンプリコン配列に対してSmith−Watermanアラインメントを最初に実施することにより分析した。その一方、アラインメントを標的部位の上流の5ヌクレオチドから下流の5ヌクレオチド(合計30bp)のインデルについて分析した。これらのアラインメントの一部がMiSeqリード自体の外側に収まる場合、またはマッチした塩基対がそれらの全長の85%未満を含む場合に分析された標的領域を廃棄した。
24ウェルプレート中でプレーティングされた293FT細胞を、上記のとおり形質移入した。形質移入72時間後、トータルRNAをmiRNeasy Micro Kit(Qiagen)により回収した。sgRNAについての逆鎖合成は、qScript Flex cDNAキット(VWR)およびカスタム第1鎖合成プライマー(表JおよびK)を用いて実施した。qPCR分析は、GAPDHを内因性対照として使用してFast SYBR Green Master Mix(Life Technologies)およびカスタムプライマー(表JおよびK)を用いて実施した。相対定量をΔΔCT法により算出した。
全ての配列は、5’から3’方向である。U6転写のため、下線付きのTのストリングが転写ターミネーターとして機能する。
>U6−短鎖tracrRNA(化膿性連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)SF370)
オリゴ相同組換え試験は、異なるCas9バリアントおよび異なるHRテンプレート(オリゴ対プラスミド)にわたる効率の比較である。
近年の大規模シーケンシング構想は、疾患に関連する多数の遺伝子を生じさせた。遺伝子の発見は、その遺伝子が何であるか、およびいかにそれが疾患表現型をもたらすのかの理解の始まりにすぎない。候補遺伝子を研究するための現在の技術およびアプローチは、緩慢で煩雑である。代表的な基準である遺伝子ターゲティングおよび遺伝子ノックアウトは、金銭および研究人材の両方の観点から時間および資源のかなりの投資を要求する。本出願人らは、hSpCas9ヌクレアーゼを利用して多くの標的遺伝子をターゲティングし、任意の他の技術と比較して高い効率および低いターンアラウンドでそれを行うように設定した。hSpCas9の高い効率のため、本出願人らは、RNAインジェクションをマウス接合子中に行い、mESCにおけるいかなる予備遺伝子ターゲティングを行うことも必要とせずにゲノム改変動物を直ちに得ることができる。
図67は、転写活性化活性を有するCRISPR−TF(転写因子)の設計を示す。キメラRNAをU6プロモーターにより発現させる一方、3つのNLSおよびVP64機能ドメインに作動可能に結合しているCas9タンパク質のヒトコドン最適化二重突然変異体バージョン(hSpCas9m)をEF1aプロモーターにより発現させる。二重突然変異D10AおよびH840Aにより、cas9タンパク質がいかなる開裂も導入し得なくなるが、キメラRNAによりガイドされた場合に標的DNAに結合するその能力は維持された。
293FT細胞を、2つの成分を含有するプラスミドにより形質移入した:(1)異なるNLS設計を有するCas9(野生型ヒトコドン最適化SpCas9)の発現をドライブするEF1aプロモーター(2)ヒトEMX1遺伝子座をターゲティングする同一キメラRNAをドライブするU6プロモーター。
Cas9を送達する方法
Chlamydomonas Resource Centerからのコナミドリムシ(Chlamydomonas reinhardtii)株CC−124およびCC−125を、エレクトロポレーションに使用する。エレクトロポレーションプロトコルは、GeneArt Chlamydomonas Engineeringキットからの標準的な推奨プロトコルに従う。
pChlamy1−Cas9:
転写を人工的に制御する技能は、遺伝子機能の研究および所望の特性を有する合成遺伝子ネットワークの構築の両方に不可欠である。本出願人らは、本明細書において、プログラマブル転写リプレッサーとしてのRNAによりガイドされるCas9タンパク質の使用を記載する。
1.1つ以上のベクターを含むベクター系であって、
a.traerメイト配列およびガイド配列をtraerメイト配列の上流に挿入するための1つ以上の挿入部位に作動可能に結合している第1の調節エレメント(ガイド配列は、発現された場合、真核細胞中の標的配列へのCRISPR複合体の配列特異的結合を指向し、CRISPR複合体は、(1)標的配列にハイブリダイズされるガイド配列、および(2)traer配列にハイブリダイズされるtraerメイト配列と複合体形成しているCRISPR酵素を含む);ならびに
b.核局在化配列を含む前記CRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント
を含み;
成分(a)および(b)は、系の同一または異なるベクター上にある
ベクター系。
b.核局在化配列を含む前記CRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント
を含む真核宿主細胞。
a.traerメイト配列およびガイド配列をtraerメイト配列の上流に挿入するための1つ以上の挿入部位に作動可能に結合している第1の調節エレメント(ガイド配列は、発現された場合、真核細胞中の標的配列へのCRISPR複合体の配列特異的結合を指向し、CRISPR複合体は、(1)標的配列にハイブリダイズされるガイド配列、および(2)traer配列にハイブリダイズされるtraerメイト配列と複合体形成しているCRISPR酵素を含む);ならびに/または
b.核局在化配列を含む前記CRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント
を含むキット。
a.前記核酸配列を受容および/または保存するように構成された記憶装置;および
b.(i)前記核酸配列内のCRISPRモチーフ配列を局在化し、(ii)前記局在化されたCRISPRモチーフ配列に隣接する配列を、CRISPR複合体が結合する候補標的配列として選択するようにプログラミングされた単独または組合せにおける1つ以上のプロセッサ
を含むシステム。
a.1つ以上のベクターを真核細胞に導入すること(1つ以上のベクターは、CRISPR酵素、traerメイト配列に結合しているガイド配列、およびtraer配列の1つ以上の発現をドライブする);および
b.CRISPR複合体を標的ポリヌクレオチドに結合させて前記疾患遺伝子内の標的ポリヌクレオチドの開裂を生じさせ(CRISPR複合体は、(1)標的ポリヌクレオチド内の標的配列にハイブリダイズされるガイド配列、および(2)traer配列にハイブリダイズされるtraerメイト配列と複合体形成しているCRISPR酵素を含む)、それにより、突然変異疾患遺伝子を含むモデル真核細胞を生成することを含む方法。
a.試験化合物を、段落86〜90のいずれか1つに記載のモデル細胞と接触させること;および
b.前記疾患遺伝子中の前記突然変異に関連する細胞シグナリングイベントの低減または増大を示すリードアウトの変化を検出し、それにより、前記疾患遺伝子に関連する前記細胞シグナリングイベントをモジュレートする前記生物活性剤を開発することを含む方法。
1.Urnov,F.D.,Rebar,E.J.,Holmes,M.C.,Zhang,H.S.&Gregory,P.D.Genome editing with engineered zinc finger nucleases.Nat.Rev.Genet.11,636−646(2010).
2.Bogdanove,A.J.&Voytas,D.F.TAL effectors:customizable proteins for DNA targeting.Science 333,1843−1846(2011).
3.Stoddard,B.L.Homing endonuclease structure and function.Q.Rev.Biophys.38,49−95(2005).
4.Bae,T.&Schneewind,O.Allelic replacement in Staphylococcus aureus with inducible counter−selection.Plasmid 55,58−63(2006).
5.Sung,C.K.,Li,H.,Claverys,J.P.&Morrison,D.A.An rpsL cassette,janus,for gene replacement through negative selection in Streptococcus pneumoniae.Appl.Environ.Microbiol.67,5190−5196(2001).
6.Sharan,S.K.,Thomason,L.C.,Kuznetsov,S.G.&Court,D.L.Recombineering:a homologous recombination−based method of genetic engineering.Nat.Protoc.4,206−223(2009).
7.Jinek,M.et al.A programmable dual−RNA−guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity.Science 337,816−821(2012).
8.Deveau,H.,Garneau,J.E.&Moineau,S.CRISPR/Cas system and its role in phage−bacteria interactions.Annu.Rev.Microbiol.64,475−493(2010).
9.Horvath,P.&Barrangou,R.CRISPR/Cas,the immune system of bacteria and archaea.Science 327,167−170(2010).
10.Terns,M.P.&Terns,R.M.CRISPR−based adaptive immune systems.Curr.Opin.Microbiol.14,321−327(2011).
11.van der Oost,J.,Jore,M.M.,Westra,E.R.,Lundgren,M.&Brouns,S.J.CRISPR−based adaptive and heritable immunity in prokaryotes.Trends.Biochem.Sci.34,401−407(2009).
12.Brouns,S.J.et al.Small CRISPR RNAs guide antiviral defense in prokaryotes.Science 321,960−964(2008).
13.Carte,J.,Wang,R.,Li,H.,Terns,R.M.&Terns,M.P.Cas6 is an endoribonuclease that generates guide RNAs for invader defense in prokaryotes.Genes Dev.22,3489−3496(2008).
14.Deltcheva,E.et al.CRISPR RNA maturation by trans−encoded small RNA and host factor RNase III.Nature 471,602−607 (2011).
15.Hatoum−Aslan,A.,Maniv,I.&Marraffini,L.A.Mature clustered,regularly interspaced,short palindromic repeats RNA(crRNA)length is measured by a ruler mechanism anchored at the precursor processing site.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.108,21218−21222(2011).
16.Haurwitz,R.E.,Jinek,M.,Wiedenheft,B.,Zhou,K.&Doudna,J.A.Sequence−and structure−specific RNA processing by a CRISPR endonuclease.Science 329,1355−1358(2010).
17.Deveau,H.et al.Phage response to CRISPR−encoded resistance in Streptococcus thermophilus.J.Bacteriol.190,1390−1400(2008).
18.Gasiunas,G.,Barrangou,R.,Horvath,P.&Siksnys,V.Cas9−crRNA ribonucleoprotein complex mediates specific DNA cleavage for adaptive immunity in bacteria.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.(2012).
19.Makarova,K.S.,Aravind,L.,Wolf,Y.I.&Koonin,E.V.Unification of Cas protein families and a simple scenario for the origin and evolution of CRISPR−Cas systems.Biol.Direct.6,38(2011).
20.Barrangou,R.RNA−mediated programmable DNA cleavage.Nat.Biotechnol.30,836−838(2012).
21.Brouns,S.J.Molecular biology.A Swiss army knife of immunity.Science 337,808−809(2012).
22.Carroll,D.A CRISPR Approach to Gene Targeting.Mol.Ther.20,1658−1660(2012).
23.Bikard,D.,Hatoum−Aslan,A.,Mucida,D.&Marraffini,L.A.CRISPR interference can prevent natural transformation and virulence acquisition during in vivo bacterial infection.Cell Host Microbe 12,177−186(2012).
24.Sapranauskas,R.et al.The Streptococcus thermophilus CRISPR/Cas system provides immunity in Escherichia coli.Nucleic Acids Res.(2011).
25.Semenova,E.et al.Interference by clustered regularly interspaced short palindromic repeat(CRISPR)RNA is governed by a seed sequence.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.(2011).
26.Wiedenheft,B.et al.RNA−guided complex from a bacterial immune system enhances target recognition through seed sequence interactions.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.(2011).
27.Zahner,D.&Hakenbeck,R.The Streptococcus pneumoniae beta−galactosidase is a surface protein.J.Bacteriol.182,5919−5921(2000).
28.Marraffini,L.A.,Dedent,A.C.&Schneewind,O.Sortases and the art of anchoring proteins to the envelopes of gram−positive bacteria.Microbiol.Mol.Biol.Rev.70,192−221(2006).
29.Motamedi,M.R.,Szigety,S.K.&Rosenberg,S.M.Double−strand−break repair recombination in Escherichia coli:physical evidence for a DNA replication mechanism in vivo.Genes Dev.13,2889−2903(1999).
30.Hosaka,T.et al.The novel mutation K87E in ribosomal protein S12 enhances protein synthesis activity during the late growth phase in Escherichia coli.Mol.Genet.Genomics 271,317−324(2004).
31.Costantino,N.&Court,D.L.Enhanced levels of lambda Red−mediated recombinants in mismatch repair mutants.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.100,15748−15753(2003).
32.Edgar,R.&Qimron,U.The Escherichia coli CRISPR system protects from lambda lysogenization,lysogens,and prophage induction.J.Bacteriol.192,6291−6294(2010).
33.Marraffini,L.A.&Sontheimer,E.J.Self versus non−self discrimination during CRISPR RNA−directed immunity.Nature 463,568−571(2010).
34.Fischer,S.et al.An archaeal immune system can detect multiple Protospacer Adjacent Motifs(PAMs)to target invader DNA.J.Biol.Chem.287,33351−33363(2012).
35.Gudbergsdottir,S.et al.Dynamic properties of the Sulfolobus CRISPR/Cas and CRISPR/Cmr systems when challenged with vector−borne viral and plasmid genes and protospacers.Mol.Microbiol.79,35−49(2011).
36.Wang,H.H.et al.Genome−scale promoter engineering by coselection MAGE.Nat Methods 9,591−593(2012).
37.Cong,L.et al.Multiplex Genome Engineering Using CRISPR/Cas Systems.Science In press(2013).
38.Mali,P.et al.RNA−Guided Human Genome Engineering via Cas9.Science In press(2013).
39.Hoskins,J.et al.Genome of the bacterium Streptococcus pneumoniae strain R6.J.Bacteriol.183,5709−5717(2001).
40.Havarstein,L.S.,Coomaraswamy,G.&Morrison,D.A.An unmodified heptadecapeptide pheromone induces competence for genetic transformation in Streptococcus pneumoniae.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.92,11140−11144(1995).
41.Horinouchi,S.&Weisblum,B.Nucleotide sequence and functional map of pC194,a plasmid that specifies inducible chloramphenicol resistance.J.Bacteriol.150,815−825(1982).
42.Horton,R.M.In Vitro Recombination and Mutagenesis of DNA:SOEing Together Tailor−Made Genes.Methods Mol.Biol.15,251−261(1993).
43.Podbielski,A.,Spellerberg,B.,Woischnik,M.,Pohl,B.&Lutticken,R.Novel series of plasmid vectors for gene inactivation and expression analysis in group A streptococci(GAS).Gene 177,137−147(1996).
44.Husmann,L.K.,Scott,J.R.,Lindahl,G.&Stenberg,L.Expression of the Arp protein,a member of the M protein family,is not sufficient to inhibit phagocytosis of Streptococcus pyogenes.Infection and immunity 63,345−348(1995).
45.Gibson,D.G.et al.Enzymatic assembly of DNA molecules up to several hundred kilobases.Nat Methods 6,343−345(2009).
Claims (34)
- 天然に存在しないまたはエンジニアリングされた組成物であって、
I.CRISPR−Cas系キメラRNA(chiRNA)ポリヌクレオチド配列に作動可能に結合している第1の調節エレメントであって、前記ポリヌクレオチド配列は、
(a)真核細胞中の標的配列にハイブリダイズし得るガイド配列、
(b)tracrメイト配列、および
(c)tracr配列
を含む、第1の調節エレメント、および
II.CRISPR酵素の末端に近接する少なくとも1つ以上の核局在化配列(NLS)を含むCRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント
を含む1つ以上のベクターを含むベクター系を含み、
(a)、(b)および(c)は、5’から3’配向で配置されており、
成分IおよびIIは、前記系の同一または異なるベクター上にあり、
前記tracrメイト配列は、転写された場合、前記tracr配列にハイブリダイズし、前記ガイド配列は、前記標的配列へのCRISPR複合体の配列特異的結合を指向し、
前記CRISPR複合体は、(1)前記標的配列にハイブリダイズされる前記ガイド配列、および(2)前記tracr配列にハイブリダイズされる前記tracrメイト配列と複合体形成している前記CRISPR酵素を含み、
前記キメラRNAポリヌクレオチド配列は、2つ以上のヘアピンを含む
天然に存在しないまたはエンジニアリングされた組成物。 - 複数のchiRNAポリヌクレオチド配列が使用されて多重化系が提供される、請求項1に記載の組成物。
- 多重化CRISPR酵素系であって、
I.CRISPR−Cas系キメラRNA(chiRNA)ポリヌクレオチド配列に作動可能に結合している第1の調節エレメントであって、前記ポリヌクレオチド配列は、
(a)真核細胞中の標的配列にハイブリダイズし得るガイド配列、
(b)tracrメイト配列、および
(c)tracr配列
を含む、第1の調節エレメント、および
II.CRISPR酵素の末端に近接する少なくとも1つ以上の核局在化配列(NLS)を含むCRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント
を含む1つ以上のベクターを含むベクター系を含み、
(a)、(b)および(c)は、5’から3’配向で配置されており、
成分IおよびIIは、前記系の同一または異なるベクター上にあり、
前記tracrメイト配列は、転写された場合、前記tracr配列にハイブリダイズし、前記ガイド配列は、前記標的配列へのCRISPR複合体の配列特異的結合を指向し、
前記CRISPR複合体は、(1)前記標的配列にハイブリダイズされる前記ガイド配列、および(2)前記tracr配列にハイブリダイズされる前記tracrメイト配列と複合体形成している前記CRISPR酵素を含み、
前記chiRNAポリヌクレオチド配列は、2つ以上のヘアピンを含み、
前記多重化系において複数のchiRNAポリヌクレオチド配列が使用される
多重化CRISPR酵素系。 - 前記第1の調節エレメントが、ポリメラーゼIIIプロモーターである、請求項1〜3のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記第2の調節エレメントが、ポリメラーゼIIプロモーターである、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、真核細胞の核中の検出可能な量の前記CRISPR酵素の蓄積をドライブするために十分な強度の1つ以上のNLSを含む、請求項1〜5のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記tracr配列が、最適にアラインされた場合に前記tracrメイト配列の長さに沿って少なくとも50%の配列相補性を示す、請求項1〜6のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、II型CRISPR系酵素である、請求項1〜7のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、Cas9酵素である、請求項1〜8のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、真核細胞中の発現のためにコドン最適化されている、請求項1〜9のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記ガイド配列が、少なくとも15ヌクレオチド長である、請求項1〜10のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記キメラRNAポリヌクレオチド配列が、2、3、4または5つのヘアピンを含む、請求項1〜11のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 天然に存在しないまたはエンジニアリングされた組成物であって、
I.第1の調節エレメントであって、
(a)真核細胞中の標的配列にハイブリダイズし得るガイド配列、および
(b)tracrメイト配列
に作動可能に結合している第1の調節エレメント、
II.CRISPR酵素の末端に近接する少なくとも1つ以上の核局在化配列(NLS)を含むCRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント、ならびに
III.tracr配列に作動可能に結合している第3の調節エレメント
を含む1つ以上のベクターを含むベクター系を含み、
成分I、IIおよびIIIは、前記系の同一または異なるベクター上にあり、
前記tracrメイト配列は、転写された場合、前記tracr配列にハイブリダイズし、前記ガイド配列は、前記標的配列へのCRISPR複合体の配列特異的結合を指向し、
前記CRISPR複合体は、(1)前記標的配列にハイブリダイズされる前記ガイド配列、および(2)前記tracr配列にハイブリダイズされる前記tracrメイト配列と複合体形成している前記CRISPR酵素を含む
天然に存在しないまたはエンジニアリングされた組成物。 - 複数のガイド配列および単一tracr配列が使用されて多重化系が提供される、請求項13に記載の組成物。
- 多重化CRISPR酵素系であって、
I.第1の調節エレメントであって、
(a)真核細胞中の標的配列にハイブリダイズし得るガイド配列、および
(b)tracrメイト配列
に作動可能に結合している第1の調節エレメント、
II.CRISPR酵素の末端に近接する少なくとも1つ以上の核局在化配列(NLS)を含むCRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント、ならびに
III.tracr配列に作動可能に結合している第3の調節エレメント
を含む1つ以上のベクターを含むベクター系を含み、
成分I、IIおよびIIIは、前記系の同一または異なるベクター上にあり、
前記tracrメイト配列は、転写された場合、前記tracr配列にハイブリダイズし、前記ガイド配列は、前記標的配列へのCRISPR複合体の配列特異的結合を指向し、
前記CRISPR複合体は、(1)前記標的配列にハイブリダイズされる前記ガイド配列、および(2)前記tracr配列にハイブリダイズされる前記tracrメイト配列と複合体形成している前記CRISPR酵素を含み、
前記多重化系において複数のガイド配列および単一tracr配列が使用される
多重化CRISPR酵素系。 - 前記第1の調節エレメントが、ポリメラーゼIIIプロモーターである、請求項13〜15のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記第2の調節エレメントが、ポリメラーゼIIプロモーターである、請求項13〜16のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記第3の調節エレメントが、ポリメラーゼIIIプロモーターである、請求項13〜17のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、真核細胞の核中の検出可能な量の前記CRISPR酵素の蓄積をドライブするために十分な強度の1つ以上のNLSを含む、請求項13〜18のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記tracr配列が、最適にアラインされた場合に前記tracrメイト配列の長さに沿って少なくとも50%の配列相補性を示す、請求項13〜19のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、II型CRISPR系酵素である、請求項13〜20のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、Cas9酵素である、請求項13〜21のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、真核細胞中の発現のためにコドン最適化されている、請求項13〜22のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記ガイド配列が、少なくとも15ヌクレオチド長である、請求項13〜23のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 請求項1〜24のいずれか一項に記載の組成物または系を含む真核宿主細胞。
- 請求項25に記載の真核宿主細胞を含む生物。
- 請求項25に記載の真核宿主細胞を含む非ヒト生物。
- 請求項1〜24のいずれか一項に記載の組成物およびキットの使用指示書を含むキット。
- 真核細胞中の目的ゲノム遺伝子座の発現を変化させる方法であって、
前記ゲノム遺伝子座を請求項1〜24のいずれか一項に記載の組成物と接触させること、および
前記ゲノム遺伝子座の発現が変化したか否かを決定すること
含む方法。 - 前記ガイド配列が、CRISPRモチーフ配列の存在に基づき前記標的配列への前記CRISPR複合体の配列特異的結合を指向する、請求項29に記載の方法。
- 前記CRISPRモチーフ配列が、NAGである、請求項30に記載の方法。
- 1つ以上の原核細胞中の遺伝子中の1つ以上の突然変異を導入することにより1つ以上の原核細胞を選択する方法であって、
1つ以上のベクターを前記原核細胞中に導入することであって、前記1つ以上のベクターは、CRISPR酵素、tracrメイト配列に結合しているガイド配列、tracr配列、および編集テンプレートの1つ以上の発現をドライブし;
前記編集テンプレートは、CRISPR酵素開裂を停止させる前記1つ以上の突然変異を含むこと;
前記編集テンプレートと、選択すべき前記細胞中の標的ポリヌクレオチドとを相同組換えさせること;
CRISPR複合体を標的ポリヌクレオチドに結合させて前記遺伝子内の前記標的ポリヌクレオチドの開裂を生じさせることであって、前記CRISPR複合体は、(1)前記標的ポリヌクレオチド内の前記標的配列にハイブリダイズされる前記ガイド配列、および(2)前記tracr配列にハイブリダイズされる前記tracrメイト配列と複合体形成している前記CRISPR酵素を含み、
前記標的ポリヌクレオチドへの前記CRISPR複合体の結合は、細胞死を誘導し、
それにより、1つ以上の突然変異が導入された1つ以上の原核細胞の選択を可能とすること
を含む方法。 - 前記CRISPR酵素が、II型CRISPR系酵素である、請求項32に記載の方法。
- 前記CRISPR酵素が、Cas9である、請求項33に記載の方法。
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Cited By (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2019162113A (ja) * | 2012-12-12 | 2019-09-26 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッ | 配列操作のためのCRISPR−Cas成分系、方法および組成物 |
US11008588B2 (en) | 2013-06-17 | 2021-05-18 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, engineering and optimization of tandem guide systems, methods and compositions for sequence manipulation |
US11041173B2 (en) | 2012-12-12 | 2021-06-22 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, engineering and optimization of systems, methods and compositions for sequence manipulation and therapeutic applications |
US11155795B2 (en) | 2013-12-12 | 2021-10-26 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR-Cas systems, crystal structure and uses thereof |
US11407985B2 (en) | 2013-12-12 | 2022-08-09 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the CRISPR-Cas systems and compositions for genome editing |
US11578312B2 (en) | 2015-06-18 | 2023-02-14 | The Broad Institute Inc. | Engineering and optimization of systems, methods, enzymes and guide scaffolds of CAS9 orthologs and variants for sequence manipulation |
US11591581B2 (en) | 2013-12-12 | 2023-02-28 | The Broad Institute, Inc. | Compositions and methods of use of CRISPR-Cas systems in nucleotide repeat disorders |
US11597919B2 (en) | 2013-12-12 | 2023-03-07 | The Broad Institute Inc. | Systems, methods and compositions for sequence manipulation with optimized functional CRISPR-Cas systems |
US11597949B2 (en) | 2013-06-17 | 2023-03-07 | The Broad Institute, Inc. | Optimized CRISPR-Cas double nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation |
US11624078B2 (en) | 2014-12-12 | 2023-04-11 | The Broad Institute, Inc. | Protected guide RNAS (pgRNAS) |
Families Citing this family (711)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US9314005B2 (en) | 2009-07-01 | 2016-04-19 | Transposagen Biopharmaceuticals, Inc. | Genetically modified rat models for severe combined immunodeficiency (SCID) |
US10920242B2 (en) | 2011-02-25 | 2021-02-16 | Recombinetics, Inc. | Non-meiotic allele introgression |
US9528124B2 (en) | 2013-08-27 | 2016-12-27 | Recombinetics, Inc. | Efficient non-meiotic allele introgression |
EP2734621B1 (en) | 2011-07-22 | 2019-09-04 | President and Fellows of Harvard College | Evaluation and improvement of nuclease cleavage specificity |
US11021737B2 (en) | 2011-12-22 | 2021-06-01 | President And Fellows Of Harvard College | Compositions and methods for analyte detection |
GB201122458D0 (en) | 2011-12-30 | 2012-02-08 | Univ Wageningen | Modified cascade ribonucleoproteins and uses thereof |
WO2013119602A1 (en) | 2012-02-06 | 2013-08-15 | President And Fellows Of Harvard College | Arrdc1-mediated microvesicles (armms) and uses thereof |
US9637739B2 (en) | 2012-03-20 | 2017-05-02 | Vilnius University | RNA-directed DNA cleavage by the Cas9-crRNA complex |
PL2847335T3 (pl) | 2012-04-25 | 2019-01-31 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Celowanie dużymi wektorami do celowania wspomagane nukleazą |
WO2013163628A2 (en) | 2012-04-27 | 2013-10-31 | Duke University | Genetic correction of mutated genes |
DE202013012242U1 (de) | 2012-05-25 | 2016-02-02 | Emmanuelle Charpentier | Zusammensetzungen für die durch RNA gesteuerte Modifikation einer Ziel-DNA und für die durch RNA gesteuerte Modulation der Transkription |
CA2877290A1 (en) | 2012-06-19 | 2013-12-27 | Daniel F. Voytas | Gene targeting in plants using dna viruses |
US10648001B2 (en) | 2012-07-11 | 2020-05-12 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Method of treating mucopolysaccharidosis type I or II |
WO2014011237A1 (en) | 2012-07-11 | 2014-01-16 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for the treatment of lysosomal storage diseases |
CN105188767A (zh) * | 2012-07-25 | 2015-12-23 | 布罗德研究所有限公司 | 可诱导的dna结合蛋白和基因组干扰工具及其应用 |
DE202013012597U1 (de) | 2012-10-23 | 2017-11-21 | Toolgen, Inc. | Zusammensetzung zum Spalten einer Ziel-DNA, umfassend eine für die Ziel-DNA spezifische guide-RNA und eine Cas-Protein-codierende Nukleinsäure oder ein Cas-Protein, sowie deren Verwendung |
WO2014071182A1 (en) | 2012-11-01 | 2014-05-08 | Massachusetts Institute Of Technology | Directed evolution of synthetic gene cluster |
PL3138910T3 (pl) | 2012-12-06 | 2018-01-31 | Sigma Aldrich Co Llc | Oparta na CRISPR modyfikacja i regulacja genomu |
EP3434776A1 (en) | 2012-12-12 | 2019-01-30 | The Broad Institute, Inc. | Methods, models, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof |
US20140186843A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-07-03 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof |
PL2931898T3 (pl) | 2012-12-12 | 2016-09-30 | Le Cong | Projektowanie i optymalizacja systemów, sposoby i kompozycje do manipulacji sekwencją z domenami funkcjonalnymi |
US8697359B1 (en) | 2012-12-12 | 2014-04-15 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products |
JP6552965B2 (ja) | 2012-12-12 | 2019-07-31 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド | 配列操作のための改善された系、方法および酵素組成物のエンジニアリングおよび最適化 |
WO2014099744A1 (en) * | 2012-12-17 | 2014-06-26 | President And Fellows Of Harvard College | Rna-guided human genome engineering |
EP3919505B1 (en) | 2013-01-16 | 2023-08-30 | Emory University | Uses of cas9-nucleic acid complexes |
US10660943B2 (en) * | 2013-02-07 | 2020-05-26 | The Rockefeller University | Sequence specific antimicrobials |
US11135273B2 (en) | 2013-02-07 | 2021-10-05 | The Rockefeller University | Sequence specific antimicrobials |
US10138509B2 (en) | 2013-03-12 | 2018-11-27 | President And Fellows Of Harvard College | Method for generating a three-dimensional nucleic acid containing matrix |
WO2014150624A1 (en) | 2013-03-14 | 2014-09-25 | Caribou Biosciences, Inc. | Compositions and methods of nucleic acid-targeting nucleic acids |
KR102210319B1 (ko) | 2013-03-15 | 2021-02-01 | 더 제너럴 하스피탈 코포레이션 | 특정 게놈 좌위에 대한 유전적 및 후성적 조절 단백질의 rna-안내 표적화 |
US20140364333A1 (en) * | 2013-03-15 | 2014-12-11 | President And Fellows Of Harvard College | Methods for Live Imaging of Cells |
WO2014204578A1 (en) | 2013-06-21 | 2014-12-24 | The General Hospital Corporation | Using rna-guided foki nucleases (rfns) to increase specificity for rna-guided genome editing |
US10760064B2 (en) | 2013-03-15 | 2020-09-01 | The General Hospital Corporation | RNA-guided targeting of genetic and epigenomic regulatory proteins to specific genomic loci |
US9234213B2 (en) | 2013-03-15 | 2016-01-12 | System Biosciences, Llc | Compositions and methods directed to CRISPR/Cas genomic engineering systems |
WO2014165825A2 (en) | 2013-04-04 | 2014-10-09 | President And Fellows Of Harvard College | Therapeutic uses of genome editing with crispr/cas systems |
HUE040575T2 (hu) | 2013-04-16 | 2019-03-28 | Regeneron Pharma | A patkány genom célzott módosítása |
JP7065564B2 (ja) * | 2013-05-29 | 2022-05-12 | セレクティス | Cas9ニッカーゼ活性を用いて正確なdna切断をもたらすための方法 |
US9873907B2 (en) | 2013-05-29 | 2018-01-23 | Agilent Technologies, Inc. | Method for fragmenting genomic DNA using CAS9 |
US20140356956A1 (en) | 2013-06-04 | 2014-12-04 | President And Fellows Of Harvard College | RNA-Guided Transcriptional Regulation |
WO2014197568A2 (en) | 2013-06-04 | 2014-12-11 | President And Fellows Of Harvard College | Rna-guideded transcriptional regulation |
EP3539573B1 (en) * | 2013-06-05 | 2024-02-14 | Duke University | Rna-guided gene editing and gene regulation |
EP3008181B1 (en) | 2013-06-11 | 2019-11-06 | The Regents of The University of California | Methods and compositions for target dna modification |
RU2716421C2 (ru) | 2013-06-17 | 2020-03-11 | Те Брод Инститьют Инк. | Доставка, применение и применения в терапии систем crispr-cas и композиций для целенаправленного воздействия на нарушения и заболевания с использованием вирусных компонентов |
BR112015031608A2 (pt) | 2013-06-17 | 2017-08-22 | Massachusetts Inst Technology | Aplicação e uso dos sistemas crispr-cas, vetores e composições para direcionamento e terapia hepáticos |
WO2014204727A1 (en) | 2013-06-17 | 2014-12-24 | The Broad Institute Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions methods, screens and applications thereof |
JP2016528890A (ja) | 2013-07-09 | 2016-09-23 | プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ | CRISPR/Cas系を用いるゲノム編集の治療用の使用 |
US9163284B2 (en) | 2013-08-09 | 2015-10-20 | President And Fellows Of Harvard College | Methods for identifying a target site of a Cas9 nuclease |
US9359599B2 (en) | 2013-08-22 | 2016-06-07 | President And Fellows Of Harvard College | Engineered transcription activator-like effector (TALE) domains and uses thereof |
EP3611268A1 (en) | 2013-08-22 | 2020-02-19 | E. I. du Pont de Nemours and Company | Plant genome modification using guide rna/cas endonuclease systems and methods of use |
EP3041498B1 (en) * | 2013-09-05 | 2022-02-16 | Massachusetts Institute of Technology | Tuning microbial populations with programmable nucleases |
US9340799B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-05-17 | President And Fellows Of Harvard College | MRNA-sensing switchable gRNAs |
US9388430B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-07-12 | President And Fellows Of Harvard College | Cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof |
US9526784B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-12-27 | President And Fellows Of Harvard College | Delivery system for functional nucleases |
DE202014010413U1 (de) * | 2013-09-18 | 2015-12-08 | Kymab Limited | Zellen und Organismen |
WO2015054507A1 (en) | 2013-10-10 | 2015-04-16 | Pronutria, Inc. | Nutritive polypeptide production systems, and methods of manufacture and use thereof |
WO2015065964A1 (en) | 2013-10-28 | 2015-05-07 | The Broad Institute Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, screens and applications thereof |
DK3066201T3 (en) | 2013-11-07 | 2018-06-06 | Editas Medicine Inc | CRISPR-RELATED PROCEDURES AND COMPOSITIONS WITH LEADING GRADES |
WO2015070062A1 (en) | 2013-11-07 | 2015-05-14 | Massachusetts Institute Of Technology | Cell-based genomic recorded accumulative memory |
MX2016007654A (es) | 2013-12-11 | 2017-08-15 | Regeneron Pharma | Metodos y composiciones para la modificacion dirigida de un genoma. |
US11053481B2 (en) | 2013-12-12 | 2021-07-06 | President And Fellows Of Harvard College | Fusions of Cas9 domains and nucleic acid-editing domains |
EP3080266B1 (en) | 2013-12-12 | 2021-02-03 | The Regents of The University of California | Methods and compositions for modifying a single stranded target nucleic acid |
SG10201804975PA (en) | 2013-12-12 | 2018-07-30 | Broad Inst Inc | Delivery, Use and Therapeutic Applications of the Crispr-Cas Systems and Compositions for HBV and Viral Diseases and Disorders |
EP3079726B1 (en) | 2013-12-12 | 2018-12-05 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using particle delivery components |
EP3080259B1 (en) | 2013-12-12 | 2023-02-01 | The Broad Institute, Inc. | Engineering of systems, methods and optimized guide compositions with new architectures for sequence manipulation |
ES2918501T3 (es) | 2013-12-19 | 2022-07-18 | Novartis Ag | Receptores de antígenos quiméricos de mesotelina humana y usos de los mismos |
US9963689B2 (en) | 2013-12-31 | 2018-05-08 | The Regents Of The University Of California | Cas9 crystals and methods of use thereof |
PL3105328T3 (pl) | 2014-02-11 | 2020-10-19 | The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate | Umożliwiana przez CRISPR multipleksowa modyfikacja genomu |
JP2017506893A (ja) | 2014-02-18 | 2017-03-16 | デューク ユニバーシティ | ウイルス複製不活化組成物並びにその製造方法及び使用 |
CA2940653A1 (en) | 2014-02-27 | 2015-09-03 | Vijay Kuchroo | T cell balance gene expression, compositions of matters and methods of use thereof |
CA3194412A1 (en) | 2014-02-27 | 2015-09-03 | Monsanto Technology Llc | Compositions and methods for site directed genomic modification |
EP3613854A1 (en) | 2014-03-05 | 2020-02-26 | National University Corporation Kobe University | Genomic sequence modification method for specifically converting nucleic acid bases of targeted dna sequence, and molecular complex for use in same |
WO2015134812A1 (en) | 2014-03-05 | 2015-09-11 | Editas Medicine, Inc. | Crispr/cas-related methods and compositions for treating usher syndrome and retinitis pigmentosa |
US9938521B2 (en) | 2014-03-10 | 2018-04-10 | Editas Medicine, Inc. | CRISPR/CAS-related methods and compositions for treating leber's congenital amaurosis 10 (LCA10) |
US11339437B2 (en) | 2014-03-10 | 2022-05-24 | Editas Medicine, Inc. | Compositions and methods for treating CEP290-associated disease |
US11141493B2 (en) | 2014-03-10 | 2021-10-12 | Editas Medicine, Inc. | Compositions and methods for treating CEP290-associated disease |
WO2015142675A2 (en) | 2014-03-15 | 2015-09-24 | Novartis Ag | Treatment of cancer using chimeric antigen receptor |
US10349639B2 (en) | 2014-03-26 | 2019-07-16 | University Of Maryland, College Park | Targeted genome editing in zygotes of domestic large animals |
US11242525B2 (en) | 2014-03-26 | 2022-02-08 | Editas Medicine, Inc. | CRISPR/CAS-related methods and compositions for treating sickle cell disease |
US20170029850A1 (en) * | 2014-04-02 | 2017-02-02 | Editas Medicine, Inc. | Crispr/cas-related methods and compositions for treating primary open angle glaucoma |
DK3129470T3 (da) | 2014-04-07 | 2021-07-05 | Novartis Ag | Behandling af cancer ved anvendelse af anti-CD19-kimær antigenreceptor |
HUE051354T2 (hu) * | 2014-04-14 | 2021-03-01 | Nemesis Bioscience Ltd | Terapeutikum |
GB201406968D0 (en) | 2014-04-17 | 2014-06-04 | Green Biologics Ltd | Deletion mutants |
GB201406970D0 (en) * | 2014-04-17 | 2014-06-04 | Green Biologics Ltd | Targeted mutations |
EP3140403A4 (en) * | 2014-05-09 | 2017-12-20 | Université Laval | Prevention and treatment of alzheimer's disease by genome editing using the crispr/cas system |
EP3145934B1 (en) | 2014-05-19 | 2020-11-11 | Pfizer Inc | Substituted-6,8-dioxabicyclo[3.2.1]octane-2,3-diol compounds as targeting agents of asgpr |
WO2015192020A1 (en) | 2014-06-13 | 2015-12-17 | Children's Medical Center Corporation | Products and methods to isolate mitochondria |
ES2888976T3 (es) | 2014-06-23 | 2022-01-10 | Massachusetts Gen Hospital | Identificación no sesgada pangenómica de DSBs evaluada por secuenciación (GUIDE-Seq.) |
CA2954686A1 (en) * | 2014-07-11 | 2016-01-14 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Agronomic trait modification using guide rna/cas endonuclease systems and methods of use |
US10676754B2 (en) | 2014-07-11 | 2020-06-09 | E I Du Pont De Nemours And Company | Compositions and methods for producing plants resistant to glyphosate herbicide |
EP3169310A1 (en) | 2014-07-15 | 2017-05-24 | Life Technologies Corporation | Compositions with lipid aggregates and methods for efficient delivery of molecules to cells |
US11542488B2 (en) | 2014-07-21 | 2023-01-03 | Novartis Ag | Sortase synthesized chimeric antigen receptors |
JP2017528433A (ja) | 2014-07-21 | 2017-09-28 | ノバルティス アーゲー | 低い免疫増強用量のmTOR阻害剤とCARの組み合わせ |
KR102612313B1 (ko) | 2014-07-21 | 2023-12-12 | 노파르티스 아게 | 인간화 항-bcma 키메라 항원 수용체를 사용한 암의 치료 |
KR102594343B1 (ko) | 2014-07-21 | 2023-10-26 | 노파르티스 아게 | Cd33 키메라 항원 수용체를 사용한 암의 치료 |
US10077453B2 (en) | 2014-07-30 | 2018-09-18 | President And Fellows Of Harvard College | CAS9 proteins including ligand-dependent inteins |
EP4205749A1 (en) | 2014-07-31 | 2023-07-05 | Novartis AG | Subset-optimized chimeric antigen receptor-containing cells |
US10513711B2 (en) | 2014-08-13 | 2019-12-24 | Dupont Us Holding, Llc | Genetic targeting in non-conventional yeast using an RNA-guided endonuclease |
EP3180359A1 (en) | 2014-08-14 | 2017-06-21 | Novartis AG | Treatment of cancer using gfr alpha-4 chimeric antigen receptor |
EP3686279B1 (en) | 2014-08-17 | 2023-01-04 | The Broad Institute, Inc. | Genome editing using cas9 nickases |
SG11201700770PA (en) | 2014-08-19 | 2017-03-30 | Novartis Ag | Anti-cd123 chimeric antigen receptor (car) for use in cancer treatment |
SG11201701245QA (en) * | 2014-08-27 | 2017-03-30 | Caribou Biosciences Inc | Methods for increasing cas9-mediated engineering efficiency |
WO2016033298A1 (en) | 2014-08-28 | 2016-03-03 | North Carolina State University | Novel cas9 proteins and guiding features for dna targeting and genome editing |
US10570418B2 (en) * | 2014-09-02 | 2020-02-25 | The Regents Of The University Of California | Methods and compositions for RNA-directed target DNA modification |
RU2017112324A (ru) | 2014-09-12 | 2018-10-15 | Пайонир Хай-Бред Интернэшнл, Инк. | Создание сайтов сайт-специфической интеграции для сложных локусов признаков в кукурузе и сое, а также способы применения |
AU2015317608B2 (en) | 2014-09-17 | 2021-03-11 | Novartis Ag | Targeting cytotoxic cells with chimeric receptors for adoptive immunotherapy |
US9616114B1 (en) | 2014-09-18 | 2017-04-11 | David Gordon Bermudes | Modified bacteria having improved pharmacokinetics and tumor colonization enhancing antitumor activity |
EA201790675A1 (ru) | 2014-09-23 | 2017-08-31 | Эгдженетикс, Инк. | Материалы и способы для выведения животных с короткой шерстью |
WO2016049024A2 (en) | 2014-09-24 | 2016-03-31 | The Broad Institute Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for modeling competition of multiple cancer mutations in vivo |
WO2016049163A2 (en) | 2014-09-24 | 2016-03-31 | The Broad Institute Inc. | Use and production of chd8+/- transgenic animals with behavioral phenotypes characteristic of autism spectrum disorder |
WO2016049251A1 (en) | 2014-09-24 | 2016-03-31 | The Broad Institute Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for modeling mutations in leukocytes |
US10040048B1 (en) | 2014-09-25 | 2018-08-07 | Synthego Corporation | Automated modular system and method for production of biopolymers |
WO2016049258A2 (en) | 2014-09-25 | 2016-03-31 | The Broad Institute Inc. | Functional screening with optimized functional crispr-cas systems |
WO2016061073A1 (en) * | 2014-10-14 | 2016-04-21 | Memorial Sloan-Kettering Cancer Center | Composition and method for in vivo engineering of chromosomal rearrangements |
CN105602935B (zh) * | 2014-10-20 | 2020-11-13 | 聂凌云 | 一种新型线粒体基因组编辑工具 |
US20170247762A1 (en) | 2014-10-27 | 2017-08-31 | The Board Institute Inc. | Compositions, methods and use of synthetic lethal screening |
US9816080B2 (en) | 2014-10-31 | 2017-11-14 | President And Fellows Of Harvard College | Delivery of CAS9 via ARRDC1-mediated microvesicles (ARMMs) |
CN107406838A (zh) | 2014-11-06 | 2017-11-28 | 纳幕尔杜邦公司 | Rna引导的内切核酸酶向细胞中的肽介导的递送 |
EP3215617B1 (en) | 2014-11-07 | 2024-05-08 | Editas Medicine, Inc. | Systems for improving crispr/cas-mediated genome-editing |
LT3221457T (lt) | 2014-11-21 | 2019-06-10 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Nukreipiančios genetinės modifikacijos būdai ir kompozicijos, naudojant suporuotas kreipiančiąsias rnr sekas |
EP3224381B1 (en) | 2014-11-25 | 2019-09-04 | The Brigham and Women's Hospital, Inc. | Method of identifying a person having a predisposition to or afflicted with a cardiometabolic disease |
EP3224362A4 (en) | 2014-11-26 | 2018-06-06 | The Regents of The University of California | Therapeutic compositions comprising transcription factors and methods of making and using the same |
WO2016082135A1 (zh) * | 2014-11-27 | 2016-06-02 | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 | 一种利用定点切割系统对猪h11位点定点插入的方法 |
GB201421096D0 (en) | 2014-11-27 | 2015-01-14 | Imp Innovations Ltd | Genome editing methods |
JP7068821B2 (ja) | 2014-12-03 | 2022-05-17 | アジレント・テクノロジーズ・インク | 化学修飾を有するガイドrna |
WO2016094679A1 (en) | 2014-12-10 | 2016-06-16 | Regents Of The University Of Minnesota | Genetically modified cells, tissues, and organs for treating disease |
EP3230452A1 (en) | 2014-12-12 | 2017-10-18 | The Broad Institute Inc. | Dead guides for crispr transcription factors |
WO2016094880A1 (en) | 2014-12-12 | 2016-06-16 | The Broad Institute Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of crispr systems and compositions for genome editing as to hematopoietic stem cells (hscs) |
WO2016094874A1 (en) | 2014-12-12 | 2016-06-16 | The Broad Institute Inc. | Escorted and functionalized guides for crispr-cas systems |
WO2016100333A1 (en) | 2014-12-15 | 2016-06-23 | Syngenta Participations Ag | Pesticidal microrna carriers and use thereof |
EP3234150A1 (en) * | 2014-12-16 | 2017-10-25 | Danisco US Inc. | Fungal genome modification systems and methods of use |
CA2971391C (en) * | 2014-12-17 | 2023-05-09 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Compositions and methods for efficient gene editing in e. coli using guide rna/cas endonuclease systems in combination with circular polynucleotide modification templates. |
WO2016100974A1 (en) | 2014-12-19 | 2016-06-23 | The Broad Institute Inc. | Unbiased identification of double-strand breaks and genomic rearrangement by genome-wide insert capture sequencing |
US20190054117A1 (en) | 2014-12-19 | 2019-02-21 | Novartis Ag | Dimerization switches and uses thereof |
US10190106B2 (en) | 2014-12-22 | 2019-01-29 | Univesity Of Massachusetts | Cas9-DNA targeting unit chimeras |
WO2016106236A1 (en) | 2014-12-23 | 2016-06-30 | The Broad Institute Inc. | Rna-targeting system |
CA2969151A1 (en) | 2014-12-23 | 2016-06-30 | Syngenta Participations Ag | Methods and compositions for identifying and enriching for cells comprising site specific genomic modifications |
EP3702456A1 (en) | 2014-12-24 | 2020-09-02 | The Broad Institute, Inc. | Crispr having or associated with destabilization domains |
WO2016108926A1 (en) | 2014-12-30 | 2016-07-07 | The Broad Institute Inc. | Crispr mediated in vivo modeling and genetic screening of tumor growth and metastasis |
WO2016109840A2 (en) | 2014-12-31 | 2016-07-07 | Synthetic Genomics, Inc. | Compositions and methods for high efficiency in vivo genome editing |
US11208638B2 (en) | 2015-01-12 | 2021-12-28 | The Regents Of The University Of California | Heterodimeric Cas9 and methods of use thereof |
EP3250689B1 (en) | 2015-01-28 | 2020-11-04 | The Regents of The University of California | Methods and compositions for labeling a single-stranded target nucleic acid |
LT3250691T (lt) | 2015-01-28 | 2023-09-11 | Caribou Biosciences, Inc. | Crispr hibridiniai dnr/rnr polinukleotidai ir naudojimo būdai |
WO2016130600A2 (en) | 2015-02-09 | 2016-08-18 | Duke University | Compositions and methods for epigenome editing |
WO2016138488A2 (en) | 2015-02-26 | 2016-09-01 | The Broad Institute Inc. | T cell balance gene expression, compositions of matters and methods of use thereof |
JP6871169B2 (ja) | 2015-03-02 | 2021-05-12 | シナイ ヘルス システム | 相同組換え因子 |
EP3858990A1 (en) | 2015-03-03 | 2021-08-04 | The General Hospital Corporation | Engineered crispr-cas9 nucleases with altered pam specificity |
CN104673816A (zh) * | 2015-03-05 | 2015-06-03 | 广东医学院 | 一种pCr-NHEJ载体及其构建方法及其用于细菌基因定点敲除的应用 |
US10450576B2 (en) | 2015-03-27 | 2019-10-22 | E I Du Pont De Nemours And Company | Soybean U6 small nuclear RNA gene promoters and their use in constitutive expression of small RNA genes in plants |
CN107787367B (zh) | 2015-04-06 | 2021-10-26 | 里兰斯坦福初级大学理事会 | 用于crispr/cas介导的基因调控的化学修饰的引导rna |
WO2016168594A1 (en) * | 2015-04-16 | 2016-10-20 | President And Fellows Of Harvard College | Sensor systems for target ligands and uses thereof |
GB201506509D0 (en) | 2015-04-16 | 2015-06-03 | Univ Wageningen | Nuclease-mediated genome editing |
EP3286211A1 (en) | 2015-04-23 | 2018-02-28 | Novartis AG | Treatment of cancer using chimeric antigen receptor and protein kinase a blocker |
JP2018522249A (ja) | 2015-04-24 | 2018-08-09 | エディタス・メディシン、インコーポレイテッド | Cas9分子/ガイドrna分子複合体の評価 |
WO2016176617A2 (en) | 2015-04-29 | 2016-11-03 | New York University | Method for treating high-grade gliomas |
CN106191040B (zh) * | 2015-04-30 | 2021-09-14 | 杭州菁因康生物科技有限公司 | 基因打靶方法 |
IL310108A (en) | 2015-05-06 | 2024-03-01 | Snipr Tech Ltd | Changing bacterial populations and microbiota adaptation |
WO2016182893A1 (en) | 2015-05-08 | 2016-11-17 | Teh Broad Institute Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems for saturating mutagenesis of non-coding elements, compositions, methods, libraries and applications thereof |
WO2016182959A1 (en) | 2015-05-11 | 2016-11-17 | Editas Medicine, Inc. | Optimized crispr/cas9 systems and methods for gene editing in stem cells |
US20180291372A1 (en) * | 2015-05-14 | 2018-10-11 | Massachusetts Institute Of Technology | Self-targeting genome editing system |
US11371050B2 (en) | 2015-05-15 | 2022-06-28 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Rapid characterization of Cas endonuclease systems, PAM sequences and guide RNA elements |
WO2016187904A1 (zh) * | 2015-05-22 | 2016-12-01 | 深圳市第二人民医院 | CRISPR-Cas9特异性敲除猪CMAH基因的方法及用于特异性靶向CMAH基因的sgRNA |
WO2016191684A1 (en) * | 2015-05-28 | 2016-12-01 | Finer Mitchell H | Genome editing vectors |
EA201792663A1 (ru) * | 2015-05-29 | 2018-04-30 | Норт Каролина Стейт Юниверсити | Способы скрининга бактерий, архей, водорослей и дрожжей с использованием нуклеиновых кислот crispr |
EP3303585A4 (en) | 2015-06-03 | 2018-10-31 | Board of Regents of the University of Nebraska | Dna editing using single-stranded dna |
EP3303634B1 (en) | 2015-06-03 | 2023-08-30 | The Regents of The University of California | Cas9 variants and methods of use thereof |
EP3302525A2 (en) | 2015-06-05 | 2018-04-11 | Novartis AG | Methods and compositions for diagnosing, treating, and monitoring treatment of shank3 deficiency associated disorders |
EP3307887A1 (en) | 2015-06-09 | 2018-04-18 | Editas Medicine, Inc. | Crispr/cas-related methods and compositions for improving transplantation |
MX2017015962A (es) | 2015-06-10 | 2018-07-06 | Univ Texas | Uso de exosomas para el tratamiento de enfermedades. |
WO2016198500A1 (en) * | 2015-06-10 | 2016-12-15 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Methods and compositions for rna-guided treatment of human cytomegalovirus (hcmv) infection |
WO2016200263A1 (en) * | 2015-06-12 | 2016-12-15 | Erasmus University Medical Center Rotterdam | New crispr assays |
EP3310932B1 (en) | 2015-06-17 | 2023-08-30 | The UAB Research Foundation | Crispr/cas9 complex for genomic editing |
US11555207B2 (en) | 2015-06-17 | 2023-01-17 | The Uab Research Foundation | CRISPR/Cas9 complex for introducing a functional polypeptide into cells of blood cell lineage |
WO2016205728A1 (en) | 2015-06-17 | 2016-12-22 | Massachusetts Institute Of Technology | Crispr mediated recording of cellular events |
EP3436575A1 (en) | 2015-06-18 | 2019-02-06 | The Broad Institute Inc. | Novel crispr enzymes and systems |
CA2989830A1 (en) | 2015-06-18 | 2016-12-22 | The Broad Institute, Inc. | Crispr enzyme mutations reducing off-target effects |
AU2016279077A1 (en) | 2015-06-18 | 2019-03-28 | Omar O. Abudayyeh | Novel CRISPR enzymes and systems |
US9790490B2 (en) | 2015-06-18 | 2017-10-17 | The Broad Institute Inc. | CRISPR enzymes and systems |
US10648020B2 (en) | 2015-06-18 | 2020-05-12 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR enzymes and systems |
WO2016205745A2 (en) | 2015-06-18 | 2016-12-22 | The Broad Institute Inc. | Cell sorting |
AU2016285724A1 (en) | 2015-06-29 | 2017-11-16 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Modified CRISPR RNA and modified single CRISPR RNA and uses thereof |
KR102461443B1 (ko) | 2015-07-13 | 2022-10-31 | 피벗 바이오, 인크. | 식물 형질 개선을 위한 방법 및 조성물 |
US11479793B2 (en) | 2015-07-15 | 2022-10-25 | Rutgers, The State University Of New Jersey | Nuclease-independent targeted gene editing platform and uses thereof |
WO2017015637A1 (en) | 2015-07-22 | 2017-01-26 | Duke University | High-throughput screening of regulatory element function with epigenome editing technologies |
CA2993431A1 (en) | 2015-07-31 | 2017-02-09 | Regents Of The University Of Minnesota | Nuclease based knockouts of immunological checkpoint genes in immune cells |
US9580727B1 (en) | 2015-08-07 | 2017-02-28 | Caribou Biosciences, Inc. | Compositions and methods of engineered CRISPR-Cas9 systems using split-nexus Cas9-associated polynucleotides |
EP3331913A1 (en) | 2015-08-07 | 2018-06-13 | Novartis AG | Treatment of cancer using chimeric cd3 receptor proteins |
AU2016309948B2 (en) | 2015-08-14 | 2021-05-20 | The University Of Sydney | Connexin 45 inhibition for therapy |
EP3337908A4 (en) | 2015-08-18 | 2019-01-23 | The Broad Institute, Inc. | METHOD AND COMPOSITIONS FOR CHANGING THE FUNCTION AND STRUCTURE OF CHROMATIN GRINDING AND / OR DOMAINS |
MX2018002339A (es) | 2015-08-25 | 2018-12-19 | Univ Duke | Composiciones y metodos de mejora de la especificidad en ingenieria genomica usando endonucleasas guiadas por arn. |
US9512446B1 (en) | 2015-08-28 | 2016-12-06 | The General Hospital Corporation | Engineered CRISPR-Cas9 nucleases |
US9926546B2 (en) | 2015-08-28 | 2018-03-27 | The General Hospital Corporation | Engineered CRISPR-Cas9 nucleases |
WO2017040348A1 (en) | 2015-08-28 | 2017-03-09 | The General Hospital Corporation | Engineered crispr-cas9 nucleases |
WO2017043656A1 (ja) | 2015-09-09 | 2017-03-16 | 国立大学法人神戸大学 | 標的化したdna配列の核酸塩基を特異的に変換する、グラム陽性菌のゲノム配列の変換方法、及びそれに用いる分子複合体 |
IL241462A0 (en) | 2015-09-10 | 2015-11-30 | Yeda Res & Dev | Heterologous engineering of betalain pigments in plants |
JP2018530536A (ja) | 2015-09-11 | 2018-10-18 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレイション | ヌクレアーゼDSBの完全照合およびシーケンシング(FIND−seq) |
WO2017053879A1 (en) | 2015-09-24 | 2017-03-30 | Editas Medicine, Inc. | Use of exonucleases to improve crispr/cas-mediated genome editing |
EP3356526B1 (en) | 2015-09-30 | 2021-08-25 | The General Hospital Corporation | Comprehensive in vitro reporting of cleavage events by sequencing (circle-seq) |
US11479516B2 (en) | 2015-10-05 | 2022-10-25 | Massachusetts Institute Of Technology | Nitrogen fixation using refactored NIF clusters |
US20190255107A1 (en) | 2015-10-09 | 2019-08-22 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Modulation of novel immune checkpoint targets |
AU2016338785B2 (en) | 2015-10-12 | 2022-07-14 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Protected DNA templates for gene modification and increased homologous recombination in cells and methods of use |
EP4089175A1 (en) | 2015-10-13 | 2022-11-16 | Duke University | Genome engineering with type i crispr systems in eukaryotic cells |
WO2017064566A2 (en) * | 2015-10-16 | 2017-04-20 | Astrazeneca Ab | Inducible modification of a cell genome |
JP2018531024A (ja) | 2015-10-20 | 2018-10-25 | パイオニア ハイ−ブレッド インターナショナル, イン | マーカーフリーゲノム改変のための方法および組成物 |
JP7059179B2 (ja) | 2015-10-20 | 2022-04-25 | アンスティチュ ナショナル ドゥ ラ サンテ エ ドゥ ラ ルシェルシュ メディカル | 遺伝子操作のための方法及び製品 |
EP3365441A1 (en) | 2015-10-22 | 2018-08-29 | The Broad Institute Inc. | Type vi-b crispr enzymes and systems |
IL310721A (en) | 2015-10-23 | 2024-04-01 | Harvard College | Nucleobase editors and their uses |
ES2699848T3 (es) | 2015-10-23 | 2019-02-13 | Caribou Biosciences Inc | Acido nucleico CRISPR clase 2 de tipo cruzado modificado que se dirige a ácidos nucleicos |
EP3368687B1 (en) | 2015-10-27 | 2021-09-29 | The Broad Institute, Inc. | Compositions and methods for targeting cancer-specific sequence variations |
WO2017075294A1 (en) | 2015-10-28 | 2017-05-04 | The Board Institute Inc. | Assays for massively combinatorial perturbation profiling and cellular circuit reconstruction |
WO2017075465A1 (en) | 2015-10-28 | 2017-05-04 | The Broad Institute Inc. | Compositions and methods for evaluating and modulating immune responses by detecting and targeting gata3 |
WO2017075265A1 (en) | 2015-10-28 | 2017-05-04 | The Broad Institute, Inc. | Multiplex analysis of single cell constituents |
WO2017075451A1 (en) | 2015-10-28 | 2017-05-04 | The Broad Institute Inc. | Compositions and methods for evaluating and modulating immune responses by detecting and targeting pou2af1 |
WO2017075478A2 (en) | 2015-10-28 | 2017-05-04 | The Broad Institute Inc. | Compositions and methods for evaluating and modulating immune responses by use of immune cell gene signatures |
CN108474022A (zh) | 2015-11-03 | 2018-08-31 | 哈佛学院董事及会员团体 | 用于包含三维核酸的基质容积成像的设备和方法 |
AU2016349738A1 (en) * | 2015-11-06 | 2018-05-24 | The Jackson Laboratory | Large genomic DNA knock-in and uses thereof |
JP2018537448A (ja) | 2015-11-12 | 2018-12-20 | ファイザー・インコーポレイテッド | CRISPR−Cas9を用いた組織特異的ゲノム操作 |
WO2017083766A1 (en) * | 2015-11-13 | 2017-05-18 | Massachusetts Institute Of Technology | High-throughput crispr-based library screening |
CN108699542A (zh) | 2015-11-13 | 2018-10-23 | 阿维利诺美国实验室股份有限公司 | 用于治疗角膜营养不良的方法 |
KR20180081600A (ko) | 2015-11-16 | 2018-07-16 | 리서치 인스티튜트 앳 네이션와이드 칠드런스 하스피탈 | 티틴-기반 근증 및 다른 티틴성병증의 치료를 위한 물질 및 방법 |
WO2017087708A1 (en) | 2015-11-19 | 2017-05-26 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Lymphocyte antigen cd5-like (cd5l)-interleukin 12b (p40) heterodimers in immunity |
CN108495932B (zh) * | 2015-11-27 | 2022-08-09 | 国立大学法人神户大学 | 用于特异性转换靶向dna序列的核酸碱基的单子叶植物的基因组序列的转换方法、及其使用的分子复合体 |
WO2017095944A1 (en) | 2015-11-30 | 2017-06-08 | Flagship Pioneering, Inc. | Methods and compositions relating to chondrisomes from blood products |
CN105296518A (zh) * | 2015-12-01 | 2016-02-03 | 中国农业大学 | 一种用于CRISPR/Cas9技术的同源臂载体构建方法 |
CA3004757C (en) | 2015-12-04 | 2020-07-21 | Caribou Biosciences, Inc. | Engineered nucleic-acid targeting nucleic acids |
US11208649B2 (en) | 2015-12-07 | 2021-12-28 | Zymergen Inc. | HTP genomic engineering platform |
CA3007635A1 (en) | 2015-12-07 | 2017-06-15 | Zymergen Inc. | Promoters from corynebacterium glutamicum |
US9988624B2 (en) | 2015-12-07 | 2018-06-05 | Zymergen Inc. | Microbial strain improvement by a HTP genomic engineering platform |
US20180362961A1 (en) | 2015-12-11 | 2018-12-20 | Danisco Us Inc. | Methods and compositions for enhanced nuclease-mediated genome modification and reduced off-target site effects |
WO2017105991A1 (en) | 2015-12-18 | 2017-06-22 | Danisco Us Inc. | Methods and compositions for t-rna based guide rna expression |
US11542466B2 (en) | 2015-12-22 | 2023-01-03 | North Carolina State University | Methods and compositions for delivery of CRISPR based antimicrobials |
WO2017114497A1 (en) | 2015-12-30 | 2017-07-06 | Novartis Ag | Immune effector cell therapies with enhanced efficacy |
IL304088A (en) | 2016-01-11 | 2023-08-01 | Univ Leland Stanford Junior | Systems containing chimeric proteins and their uses for controlling gene expression |
JP7012645B2 (ja) | 2016-01-11 | 2022-01-28 | ザ ボード オブ トラスティーズ オブ ザ レランド スタンフォード ジュニア ユニバーシティー | キメラタンパク質および免疫治療の方法 |
WO2017132239A1 (en) | 2016-01-26 | 2017-08-03 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Waxy corn |
WO2017139309A1 (en) | 2016-02-12 | 2017-08-17 | Ceres, Inc. | Methods and materials for high throughput testing of mutagenized allele combinations |
EP3881857A1 (en) | 2016-02-18 | 2021-09-22 | The Penn State Research Foundation | Generating gabaergic neurons in brains |
US20190249172A1 (en) | 2016-02-18 | 2019-08-15 | The Regents Of The University Of California | Methods and compositions for gene editing in stem cells |
WO2017147196A1 (en) | 2016-02-22 | 2017-08-31 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods for identifying and modulating immune phenotypes |
US10538750B2 (en) | 2016-02-29 | 2020-01-21 | Agilent Technologies, Inc. | Methods and compositions for blocking off-target nucleic acids from cleavage by CRISPR proteins |
WO2017155714A1 (en) | 2016-03-11 | 2017-09-14 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Novel cas9 systems and methods of use |
WO2017155715A1 (en) | 2016-03-11 | 2017-09-14 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Novel cas9 systems and methods of use |
EP3426778A1 (en) | 2016-03-11 | 2019-01-16 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Novel cas9 systems and methods of use |
WO2017161043A1 (en) | 2016-03-16 | 2017-09-21 | The J. David Gladstone Institutes | Methods and compositions for treating obesity and/or diabetes and for identifying candidate treatment agents |
WO2017161325A1 (en) | 2016-03-17 | 2017-09-21 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods for identifying and modulating co-occurant cellular phenotypes |
EP3219799A1 (en) | 2016-03-17 | 2017-09-20 | IMBA-Institut für Molekulare Biotechnologie GmbH | Conditional crispr sgrna expression |
AU2017238512B2 (en) | 2016-03-23 | 2022-12-08 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Methods for enhancing the efficiency of gene editing |
EP3433363A1 (en) | 2016-03-25 | 2019-01-30 | Editas Medicine, Inc. | Genome editing systems comprising repair-modulating enzyme molecules and methods of their use |
EP3433364A1 (en) | 2016-03-25 | 2019-01-30 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for treating alpha 1-antitrypsin (a1at) deficiency |
WO2017180694A1 (en) | 2016-04-13 | 2017-10-19 | Editas Medicine, Inc. | Cas9 fusion molecules gene editing systems, and methods of use thereof |
KR20220133318A (ko) | 2016-04-15 | 2022-10-04 | 노파르티스 아게 | 선택적 단백질 발현을 위한 조성물 및 방법 |
WO2017184786A1 (en) | 2016-04-19 | 2017-10-26 | The Broad Institute Inc. | Cpf1 complexes with reduced indel activity |
CN105861485B (zh) * | 2016-04-20 | 2021-08-17 | 上海伊丽萨生物科技有限公司 | 一种提高基因置换效率的方法 |
US11286501B2 (en) * | 2016-04-20 | 2022-03-29 | Centro De Investigaciones Energeticas, Medioambientales Y Tecnologicas O.A, M.P. | Methods of treating or preventing pyruvate kinase deficiency |
CA3022290A1 (en) | 2016-04-25 | 2017-11-02 | President And Fellows Of Harvard College | Hybridization chain reaction methods for in situ molecular detection |
US20190203207A1 (en) * | 2016-05-20 | 2019-07-04 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Anabolic Enhancers for Ameliorating Neurodegeneration |
CA3025171A1 (en) | 2016-05-24 | 2017-11-30 | Indiana University Research And Technology Corporation | Ku inhibitors and their use for gene editing |
GB201609811D0 (en) | 2016-06-05 | 2016-07-20 | Snipr Technologies Ltd | Methods, cells, systems, arrays, RNA and kits |
US10767175B2 (en) | 2016-06-08 | 2020-09-08 | Agilent Technologies, Inc. | High specificity genome editing using chemically modified guide RNAs |
JP7267013B2 (ja) | 2016-06-17 | 2023-05-01 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド | Vi型crisprオルソログ及び系 |
US11202840B2 (en) | 2016-06-21 | 2021-12-21 | The Curators Of The University Of Missouri | Modified dystrophin proteins |
LT3474669T (lt) | 2016-06-24 | 2022-06-10 | The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate | Barkodu pažymėtų kombinatorinių bibliotekų generavimo būdai |
US11471462B2 (en) | 2016-06-27 | 2022-10-18 | The Broad Institute, Inc. | Compositions and methods for detecting and treating diabetes |
KR102345898B1 (ko) | 2016-06-30 | 2022-01-03 | 지머젠 인코포레이티드 | 글루코오스 투과 효소 라이브러리를 생성하는 방법 및 이의 용도 |
US10544390B2 (en) | 2016-06-30 | 2020-01-28 | Zymergen Inc. | Methods for generating a bacterial hemoglobin library and uses thereof |
US11359234B2 (en) * | 2016-07-01 | 2022-06-14 | Microsoft Technology Licensing, Llc | Barcoding sequences for identification of gene expression |
US20180004537A1 (en) | 2016-07-01 | 2018-01-04 | Microsoft Technology Licensing, Llc | Molecular State Machines |
EP3484870B1 (en) | 2016-07-13 | 2022-11-16 | Vertex Pharmaceuticals Incorporated | Methods, compositions and kits for increasing genome editing efficiency |
CA3030837A1 (en) | 2016-07-15 | 2018-01-18 | Novartis Ag | Treatment and prevention of cytokine release syndrome using a chimeric antigen receptor in combination with a kinase inhibitor |
EP3494220A1 (en) | 2016-08-02 | 2019-06-12 | Editas Medicine, Inc. | Compositions and methods for treating cep290 associated disease |
US11078481B1 (en) | 2016-08-03 | 2021-08-03 | KSQ Therapeutics, Inc. | Methods for screening for cancer targets |
CA3032699A1 (en) | 2016-08-03 | 2018-02-08 | President And Fellows Of Harvard College | Adenosine nucleobase editors and uses thereof |
AU2017308889B2 (en) | 2016-08-09 | 2023-11-09 | President And Fellows Of Harvard College | Programmable Cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof |
WO2018030874A1 (ko) * | 2016-08-12 | 2018-02-15 | 주식회사 툴젠 | 조작된 면역조절요소 및 이에 의해 변형된 면역 활성 |
JP7215808B2 (ja) * | 2016-08-12 | 2023-01-31 | ツールゲン インコーポレイテッド | 操作された免疫調節エレメントおよび変更された免疫 |
US11352647B2 (en) | 2016-08-17 | 2022-06-07 | The Broad Institute, Inc. | Crispr enzymes and systems |
WO2018035364A1 (en) | 2016-08-17 | 2018-02-22 | The Broad Institute Inc. | Product and methods useful for modulating and evaluating immune responses |
EP3500967A1 (en) | 2016-08-17 | 2019-06-26 | The Broad Institute, Inc. | Methods for identifying class 2 crispr-cas systems |
CN109963945A (zh) | 2016-08-20 | 2019-07-02 | 阿维利诺美国实验室股份有限公司 | 单一向导rna、crispr/cas9系统及其使用方法 |
WO2020225754A1 (en) | 2019-05-06 | 2020-11-12 | Mcmullen Tara | Crispr gene editing for autosomal dominant diseases |
WO2018039438A1 (en) | 2016-08-24 | 2018-03-01 | President And Fellows Of Harvard College | Incorporation of unnatural amino acids into proteins using base editing |
US11078483B1 (en) | 2016-09-02 | 2021-08-03 | KSQ Therapeutics, Inc. | Methods for measuring and improving CRISPR reagent function |
JP7256739B2 (ja) | 2016-09-07 | 2023-04-12 | サンガモ セラピューティクス, インコーポレイテッド | 肝臓遺伝子のモジュレーション |
WO2018049025A2 (en) | 2016-09-07 | 2018-03-15 | The Broad Institute Inc. | Compositions and methods for evaluating and modulating immune responses |
IL247752A0 (en) | 2016-09-11 | 2016-11-30 | Yeda Res & Dev | Compositions and methods for modulating gene expression for site-directed mutagenesis |
US20190225974A1 (en) | 2016-09-23 | 2019-07-25 | BASF Agricultural Solutions Seed US LLC | Targeted genome optimization in plants |
EP3519577A1 (en) | 2016-09-28 | 2019-08-07 | Novartis AG | Porous membrane-based macromolecule delivery system |
EP3523426A4 (en) | 2016-09-30 | 2020-01-22 | The Regents of The University of California | RNA GUIDED NUCLEIC ACID MODIFYING ENZYMES AND METHOD FOR USE THEREOF |
WO2018067546A1 (en) | 2016-10-03 | 2018-04-12 | President And Fellows Of Harvard College | Delivery of therapeutic rnas via arrdc1-mediated microvesicles |
US10669539B2 (en) | 2016-10-06 | 2020-06-02 | Pioneer Biolabs, Llc | Methods and compositions for generating CRISPR guide RNA libraries |
US20200016202A1 (en) | 2016-10-07 | 2020-01-16 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Modulation of novel immune checkpoint targets |
CA3037560A1 (en) | 2016-10-13 | 2018-04-19 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Generating northern leaf blight resistant maize |
CN110214180A (zh) | 2016-10-14 | 2019-09-06 | 哈佛大学的校长及成员们 | 核碱基编辑器的aav递送 |
GB201617559D0 (en) | 2016-10-17 | 2016-11-30 | University Court Of The University Of Edinburgh The | Swine comprising modified cd163 and associated methods |
EP3529359B1 (en) | 2016-10-18 | 2023-12-13 | Regents of the University of Minnesota | Tumor infiltrating lymphocytes for use in therapy |
US11427824B2 (en) * | 2016-10-28 | 2022-08-30 | Genethon | Compositions and methods for the treatment of myotonic dystrophy |
WO2018081531A2 (en) | 2016-10-28 | 2018-05-03 | Ariad Pharmaceuticals, Inc. | Methods for human t-cell activation |
WO2018076335A1 (en) | 2016-10-31 | 2018-05-03 | Institute Of Genetics And Developmental Biology, Chinese Academy Of Sciences | Compositions and methods for enhancing abiotic stress tolerance |
EP3535396A1 (en) | 2016-11-01 | 2019-09-11 | Novartis AG | Methods and compositions for enhancing gene editing |
EP4256951A3 (en) | 2016-11-04 | 2023-12-06 | Flagship Pioneering Innovations V. Inc. | Novel plant cells, plants, and seeds |
US20180135080A1 (en) | 2016-11-15 | 2018-05-17 | Genomic Vision Sa | Method for the monitoring of modified nucleases induced-gene editing events by molecular combing |
CN110199031A (zh) | 2016-11-29 | 2019-09-03 | 基因组影像公司 | 设计用于分析感兴趣的遗传区域中的特定事件的一组多核苷酸序列的方法 |
US9816093B1 (en) | 2016-12-06 | 2017-11-14 | Caribou Biosciences, Inc. | Engineered nucleic acid-targeting nucleic acids |
US11180535B1 (en) | 2016-12-07 | 2021-11-23 | David Gordon Bermudes | Saccharide binding, tumor penetration, and cytotoxic antitumor chimeric peptides from therapeutic bacteria |
US11129906B1 (en) | 2016-12-07 | 2021-09-28 | David Gordon Bermudes | Chimeric protein toxins for expression by therapeutic bacteria |
JP7317706B2 (ja) | 2016-12-14 | 2023-07-31 | リガンダル インコーポレイテッド | 核酸およびタンパク質ペイロード送達のための方法および組成物 |
WO2018119359A1 (en) | 2016-12-23 | 2018-06-28 | President And Fellows Of Harvard College | Editing of ccr5 receptor gene to protect against hiv infection |
CN110520163A (zh) | 2017-01-05 | 2019-11-29 | 新泽西鲁特格斯州立大学 | 独立于dna双链断裂的靶向基因编辑平台及其用途 |
WO2018127585A1 (en) | 2017-01-06 | 2018-07-12 | Txcell | Monospecific regulatory t cell population with cytotoxicity for b cells |
EP3346001A1 (en) | 2017-01-06 | 2018-07-11 | TXCell | Monospecific regulatory t cell population with cytotoxicity for b cells |
WO2018129440A1 (en) | 2017-01-09 | 2018-07-12 | University Of Massachusetts | Complexes for gene deletion and editing |
CA3049258A1 (en) | 2017-01-12 | 2018-07-19 | Pivot Bio, Inc. | Methods and compositions for improving plant traits |
EP3574005B1 (en) | 2017-01-26 | 2021-12-15 | Novartis AG | Cd28 compositions and methods for chimeric antigen receptor therapy |
US11624071B2 (en) | 2017-01-28 | 2023-04-11 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Method of creating a plurality of targeted insertions in a plant cell |
US20190375815A1 (en) | 2017-01-31 | 2019-12-12 | Novartis Ag | Treatment of cancer using chimeric t cell receptor proteins having multiple specificities |
TW201839136A (zh) | 2017-02-06 | 2018-11-01 | 瑞士商諾華公司 | 治療血色素異常症之組合物及方法 |
WO2018148511A1 (en) | 2017-02-10 | 2018-08-16 | Zymergen Inc. | A modular universal plasmid design strategy for the assembly and editing of multiple dna constructs for multiple hosts |
US20190381192A1 (en) * | 2017-02-22 | 2019-12-19 | Io Biosciences, Inc. | Nucleic acid constructs comprising gene editing multi-sites and uses thereof |
US10828330B2 (en) | 2017-02-22 | 2020-11-10 | IO Bioscience, Inc. | Nucleic acid constructs comprising gene editing multi-sites and uses thereof |
WO2018160731A1 (en) | 2017-02-28 | 2018-09-07 | Novartis Ag | Shp inhibitor compositions and uses for chimeric antigen receptor therapy |
EP3592853A1 (en) | 2017-03-09 | 2020-01-15 | President and Fellows of Harvard College | Suppression of pain by gene editing |
US11542496B2 (en) | 2017-03-10 | 2023-01-03 | President And Fellows Of Harvard College | Cytosine to guanine base editor |
EP3596217A1 (en) | 2017-03-14 | 2020-01-22 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for the treatment of hemoglobinopathies |
WO2018170333A1 (en) | 2017-03-15 | 2018-09-20 | The Broad Institute, Inc. | Novel cas13b orthologues crispr enzymes and systems |
WO2018170436A1 (en) | 2017-03-16 | 2018-09-20 | Jacobs Farm Del Cabo | Basil with high tolerance to downy mildew |
WO2018170515A1 (en) | 2017-03-17 | 2018-09-20 | The Broad Institute, Inc. | Methods for identifying and modulating co-occurant cellular phenotypes |
CN110914426A (zh) | 2017-03-23 | 2020-03-24 | 哈佛大学的校长及成员们 | 包含核酸可编程dna结合蛋白的核碱基编辑器 |
WO2018183908A1 (en) | 2017-03-31 | 2018-10-04 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Compositions and methods for treating ovarian tumors |
AU2018243654A1 (en) | 2017-03-31 | 2019-10-17 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Expression modulating elements and use thereof |
WO2018183921A1 (en) | 2017-04-01 | 2018-10-04 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for detecting and modulating an immunotherapy resistance gene signature in cancer |
EP3610009A1 (en) | 2017-04-12 | 2020-02-19 | The Broad Institute, Inc. | Novel type vi crispr orthologs and systems |
US20210115407A1 (en) | 2017-04-12 | 2021-04-22 | The Broad Institute, Inc. | Respiratory and sweat gland ionocytes |
EP3610266A4 (en) | 2017-04-12 | 2021-04-21 | Massachusetts Eye and Ear Infirmary | TUMOR SIGNATURE OF METASTASIS, COMPOSITIONS OF SUBSTANCES AND USES THEREOF |
WO2018191750A2 (en) | 2017-04-14 | 2018-10-18 | The Broad Institute Inc. | Novel delivery of large payloads |
EP3612629A1 (en) | 2017-04-18 | 2020-02-26 | The Broad Institute, Inc. | Compositions for detecting secretion and methods of use |
US11834670B2 (en) | 2017-04-19 | 2023-12-05 | Global Life Sciences Solutions Usa Llc | Site-specific DNA modification using a donor DNA repair template having tandem repeat sequences |
EP3612232A1 (en) | 2017-04-21 | 2020-02-26 | The Broad Institute, Inc. | Targeted delivery to beta cells |
CA3059956A1 (en) | 2017-04-21 | 2018-10-25 | The General Hospital Corporation | Variants of cpf1 (cas12a) with altered pam specificity |
EP3615068A1 (en) | 2017-04-28 | 2020-03-04 | Novartis AG | Bcma-targeting agent, and combination therapy with a gamma secretase inhibitor |
US11499151B2 (en) | 2017-04-28 | 2022-11-15 | Editas Medicine, Inc. | Methods and systems for analyzing guide RNA molecules |
EP3615055A1 (en) | 2017-04-28 | 2020-03-04 | Novartis AG | Cells expressing a bcma-targeting chimeric antigen receptor, and combination therapy with a gamma secretase inhibitor |
WO2018204777A2 (en) | 2017-05-05 | 2018-11-08 | The Broad Institute, Inc. | Methods for identification and modification of lncrna associated with target genotypes and phenotypes |
WO2018209158A2 (en) | 2017-05-10 | 2018-11-15 | Editas Medicine, Inc. | Crispr/rna-guided nuclease systems and methods |
WO2018209320A1 (en) | 2017-05-12 | 2018-11-15 | President And Fellows Of Harvard College | Aptazyme-embedded guide rnas for use with crispr-cas9 in genome editing and transcriptional activation |
KR20200026804A (ko) | 2017-05-18 | 2020-03-11 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | 표적화된 핵산 편집을 위한 시스템, 방법 및 조성물 |
WO2018218166A1 (en) | 2017-05-25 | 2018-11-29 | The General Hospital Corporation | Using split deaminases to limit unwanted off-target base editor deamination |
EP3409104A1 (en) | 2017-05-31 | 2018-12-05 | Vilmorin et Cie | Tomato plant resistant to tomato yellow leaf curl virus, powdery mildew, and nematodes |
WO2020249996A1 (en) | 2019-06-14 | 2020-12-17 | Vilmorin & Cie | Resistance in plants of solanum lycopersicum to the tobamovirus tomato brown rugose fruit virus |
EP3409106A1 (en) | 2017-06-01 | 2018-12-05 | Vilmorin et Cie | Tolerance in plants of solanum lycopersicum to the tobamovirus tomato brown rugose fruit virus (tbrfv) |
JP7196104B2 (ja) | 2017-06-05 | 2022-12-26 | リサーチ インスティチュート アット ネイションワイド チルドレンズ ホスピタル | 増強された改変ウイルスカプシドタンパク質 |
EP3635113A4 (en) | 2017-06-05 | 2021-03-17 | Fred Hutchinson Cancer Research Center | GENOMIC SAFE HARBORS FOR GENETIC THERAPIES IN HUMAN STEM CELLS AND MANIPULATED NANOPARTICLES TO DELIVER TARGETED GENETIC THERAPIES |
CA3061984A1 (en) | 2017-06-06 | 2018-12-13 | Zymergen Inc. | A htp genomic engineering platform for improving fungal strains |
US20200370058A1 (en) | 2017-06-06 | 2020-11-26 | Zymergen Inc. | A htp genomic engineering platform for improving escherichia coli |
PT3636753T (pt) | 2017-06-08 | 2024-04-23 | Univ Osaka | Método de fabrico de uma célula eucariótica editada por um adn |
WO2018226972A2 (en) | 2017-06-09 | 2018-12-13 | Vilmorin & Cie | Compositions and methods for genome editing |
WO2018227114A1 (en) | 2017-06-09 | 2018-12-13 | Editas Medicine, Inc. | Engineered cas9 nucleases |
JP2020524993A (ja) | 2017-06-13 | 2020-08-27 | フラッグシップ パイオニアリング イノベーションズ ブイ, インコーポレイテッド | クロンを含む組成物及びその使用 |
EP3638218A4 (en) | 2017-06-14 | 2021-06-09 | The Broad Institute, Inc. | COMPOSITIONS AND METHOD OF TARGETING COMPLEMENTING COMPONENT 3 FOR INHIBITION OF TUMOR GROWTH |
CA3067382A1 (en) | 2017-06-15 | 2018-12-20 | The Regents Of The University Of California | Targeted non-viral dna insertions |
US9982279B1 (en) | 2017-06-23 | 2018-05-29 | Inscripta, Inc. | Nucleic acid-guided nucleases |
US10011849B1 (en) | 2017-06-23 | 2018-07-03 | Inscripta, Inc. | Nucleic acid-guided nucleases |
JP7454494B2 (ja) | 2017-06-26 | 2024-03-22 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド | 標的化された核酸編集のためのcrispr/cas-アデニンデアミナーゼ系の組成物、系及び方法 |
US10392616B2 (en) | 2017-06-30 | 2019-08-27 | Arbor Biotechnologies, Inc. | CRISPR RNA targeting enzymes and systems and uses thereof |
EP3645021A4 (en) | 2017-06-30 | 2021-04-21 | Intima Bioscience, Inc. | ADENO-ASSOCIATED VIRAL VECTORS FOR GENE THERAPY |
EP3645721A1 (en) | 2017-06-30 | 2020-05-06 | Novartis AG | Methods for the treatment of disease with gene editing systems |
US11866726B2 (en) | 2017-07-14 | 2024-01-09 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for targeted integration and genome editing and detection thereof using integrated priming sites |
CA3067124A1 (en) * | 2017-07-18 | 2019-01-24 | Genovie Ab | A two-component vector library system for rapid assembly and diversification of full-length t-cell receptor open reading frames |
US10510743B2 (en) * | 2017-07-18 | 2019-12-17 | Hong Kong Applied Science and Technology Research Institute Company, Limited | Step fin field-effect-transistor (FinFET) with slim top of fin and thick bottom of fin for electro-static-discharge (ESD) or electrical over-stress (EOS) protection |
WO2019023291A2 (en) | 2017-07-25 | 2019-01-31 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | COMPOSITIONS AND METHODS FOR PRODUCTION AND DECODING OF GUIDE RNA LIBRARIES AND USES THEREOF |
CN111801345A (zh) | 2017-07-28 | 2020-10-20 | 哈佛大学的校长及成员们 | 使用噬菌体辅助连续进化(pace)的进化碱基编辑器的方法和组合物 |
WO2019030306A1 (en) | 2017-08-08 | 2019-02-14 | Depixus | ISOLATION AND IN VITRO ENRICHMENT OF NUCLEIC ACIDS USING SITE-SPECIFIC NUCLEASES |
US10476825B2 (en) | 2017-08-22 | 2019-11-12 | Salk Institue for Biological Studies | RNA targeting methods and compositions |
US11970720B2 (en) | 2017-08-22 | 2024-04-30 | Salk Institute For Biological Studies | RNA targeting methods and compositions |
US11286468B2 (en) | 2017-08-23 | 2022-03-29 | The General Hospital Corporation | Engineered CRISPR-Cas9 nucleases with altered PAM specificity |
MX2020001790A (es) | 2017-08-25 | 2020-07-22 | Codiak Biosciences Inc | Preparacion de exosomas terapeuticos mediante el uso de proteinas de membrana. |
US11319532B2 (en) | 2017-08-30 | 2022-05-03 | President And Fellows Of Harvard College | High efficiency base editors comprising Gam |
AR113064A1 (es) | 2017-09-15 | 2020-01-22 | Covercress Inc | Composición que comprende harina de carraspique con bajo contenido de fibras y métodos para su elaboración |
CN109517820B (zh) | 2017-09-20 | 2021-09-24 | 北京宇繁生物科技有限公司 | 一种靶向HPK1的gRNA以及HPK1基因编辑方法 |
KR20200090151A (ko) | 2017-09-20 | 2020-07-28 | 더 유니버시티 오브 브리티쉬 콜롬비아 | 신규한 항-hla-a2 항체 및 이의 용도 |
US11917978B2 (en) | 2017-09-21 | 2024-03-05 | The Conard Pyle Company | Miniature rose plant named ‘meibenbino’ |
US11252928B2 (en) | 2017-09-21 | 2022-02-22 | The Condard-Pyle Company | Miniature rose plant named ‘Meibenbino’ |
EP3684389A4 (en) | 2017-09-21 | 2021-06-16 | Dana Farber Cancer Institute, Inc. | INSULATION, PRESERVATION, COMPOSITIONS AND USES OF EXTRACTS FROM JUSTICIA PLANTS |
CN111511388A (zh) | 2017-09-21 | 2020-08-07 | 博德研究所 | 用于靶向核酸编辑的系统、方法和组合物 |
US20200255828A1 (en) | 2017-10-04 | 2020-08-13 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for altering function and structure of chromatin loops and/or domains |
WO2019075197A1 (en) | 2017-10-11 | 2019-04-18 | The General Hospital Corporation | METHODS OF DETECTION OF INDIVIDUAL SITE-SPECIFIC PARASITE GENOMIC DEAMINATION BY BASE EDITING TECHNOLOGIES |
US11680296B2 (en) | 2017-10-16 | 2023-06-20 | Massachusetts Institute Of Technology | Mycobacterium tuberculosis host-pathogen interaction |
CA3076253A1 (en) | 2017-10-16 | 2019-04-25 | Centro De Investigaciones Energeticas, Medioambientales Y Tecnologicaso.A., M.P. | Lentiviral vectors for delivery of pklr to treat pyruvate kinase deficiency |
AU2018352592A1 (en) | 2017-10-16 | 2020-06-04 | Beam Therapeutics, Inc. | Uses of adenosine base editors |
BR112020007823A2 (pt) | 2017-10-20 | 2020-10-27 | Fred Hutchinson Cancer Research Center | sistemas e métodos para produzir células b geneticamente modificadas para expressar anticorpos selecionados |
EP3701040A4 (en) | 2017-10-25 | 2021-08-25 | Pivot Bio, Inc. | METHODS AND COMPOSITIONS FOR IMPROVING GENETICALLY MODIFIED MICROBES THAT BIND NITROGEN |
BR112020008201A2 (pt) | 2017-10-27 | 2020-10-06 | The Regents Of The University Of California | substituição-alvo de receptores de células t endógenos |
US20210179709A1 (en) | 2017-10-31 | 2021-06-17 | Novartis Ag | Anti-car compositions and methods |
WO2019089803A1 (en) | 2017-10-31 | 2019-05-09 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for studying cell evolution |
AU2018358051A1 (en) | 2017-11-01 | 2020-05-14 | The Regents Of The University Of California | CasZ compositions and methods of use |
US20210180053A1 (en) | 2017-11-01 | 2021-06-17 | Novartis Ag | Synthetic rnas and methods of use |
AU2018360068A1 (en) | 2017-11-02 | 2020-05-14 | Arbor Biotechnologies, Inc. | Novel CRISPR-associated transposon systems and components |
US20210363260A1 (en) | 2017-11-13 | 2021-11-25 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for treating cancer by targeting the clec2d-klrb1 pathway |
AU2018368786A1 (en) | 2017-11-17 | 2020-06-18 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | TIL expansion from fine needle aspirates and small biopsies |
CA3083118A1 (en) | 2017-11-22 | 2019-05-31 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Expansion of peripheral blood lymphocytes (pbls) from peripheral blood |
US11098328B2 (en) | 2017-12-05 | 2021-08-24 | Synthetic Genomics, Inc. | Algal lipid productivity via genetic modification of a signaling protein |
US11332736B2 (en) | 2017-12-07 | 2022-05-17 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for multiplexing single cell and single nuclei sequencing |
US11124798B2 (en) | 2017-12-08 | 2021-09-21 | Synthetic Genomics, Inc. | Algal lipid productivity via genetic modification of a TPR domain containing protein |
AU2018386002A1 (en) | 2017-12-15 | 2020-05-28 | Danisco Us Inc | CAS9 variants and methods of use |
JP2021506814A (ja) | 2017-12-15 | 2021-02-22 | デイナ ファーバー キャンサー インスティチュート,インコーポレイテッド | 安定化ペプチドによって介在される標的タンパク質の分解 |
US10723782B2 (en) | 2017-12-28 | 2020-07-28 | Codiak Biosciences, Inc. | Exosomes for immuno-oncology and anti-inflammatory therapy |
US20190201548A1 (en) | 2017-12-29 | 2019-07-04 | Rubius Therapeutics, Inc. | Gene editing and targeted transcriptional modulation for engineering erythroid cells |
US11994512B2 (en) | 2018-01-04 | 2024-05-28 | Massachusetts Institute Of Technology | Single-cell genomic methods to generate ex vivo cell systems that recapitulate in vivo biology with improved fidelity |
CA3086620A1 (en) | 2018-01-12 | 2019-07-18 | Basf Se | Gene underlying the number of spikelets per spike qtl in wheat on chromosome 7a |
CN111757876B (zh) | 2018-01-17 | 2024-03-22 | 沃泰克斯药物股份有限公司 | Dna-pk抑制剂 |
EA202091707A1 (ru) | 2018-01-17 | 2020-12-02 | Вертекс Фармасьютикалз Инкорпорейтед | Хиноксалиноновые соединения, композиции, способы и наборы для повышения эффективности редактирования генома |
EP3740479A1 (en) | 2018-01-17 | 2020-11-25 | Vertex Pharmaceuticals Incorporated | Dna-pk inhibitors |
US20190233816A1 (en) | 2018-01-26 | 2019-08-01 | Massachusetts Institute Of Technology | Structure-guided chemical modification of guide rna and its applications |
US11926835B1 (en) | 2018-01-29 | 2024-03-12 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Methods for efficient tomato genome editing |
KR102136132B1 (ko) * | 2018-01-31 | 2020-07-22 | 서울대학교 산학협력단 | CRISPR/Cas9 시스템을 통한 닭 백혈병 바이러스(Avian Leukosis Virus, ALV) 저항성 조류의 제조방법 |
JP2021512617A (ja) | 2018-02-08 | 2021-05-20 | ザイマージェン インコーポレイテッド | CorynebacteriumにおいてCRISPRを使用するゲノム編集 |
WO2019173125A1 (en) | 2018-03-09 | 2019-09-12 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Compositions and methods for modification of fatty acids in soybean |
DK3765615T3 (da) | 2018-03-14 | 2023-08-21 | Arbor Biotechnologies Inc | Nye enzymer og systemer til målretning af crispr dna |
ES2953541T3 (es) | 2018-03-14 | 2023-11-14 | Arbor Biotechnologies Inc | Sistemas y enzimas novedosos de direccionamiento a ADN y ARN de CRISPR |
US10760075B2 (en) | 2018-04-30 | 2020-09-01 | Snipr Biome Aps | Treating and preventing microbial infections |
AU2019247490A1 (en) | 2018-04-06 | 2020-10-22 | Children's Medical Center Corporation | Compositions and methods for somatic cell reprogramming and modulating imprinting |
WO2019197678A1 (en) | 2018-04-13 | 2019-10-17 | Sangamo Therapeutics France | Chimeric antigen receptor specific for interleukin-23 receptor |
CN112313241A (zh) | 2018-04-17 | 2021-02-02 | 总医院公司 | 核酸结合、修饰、和切割试剂的底物偏好和位点的灵敏体外试验 |
GB2587970B (en) | 2018-04-19 | 2023-02-08 | Univ California | Compositions and methods for gene editing |
WO2019204585A1 (en) | 2018-04-19 | 2019-10-24 | Massachusetts Institute Of Technology | Single-stranded break detection in double-stranded dna |
SI3560330T1 (sl) | 2018-04-24 | 2022-08-31 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Rastline z izboljšano prebavljivostjo in markerskimi haplotipi |
US11957695B2 (en) | 2018-04-26 | 2024-04-16 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions targeting glucocorticoid signaling for modulating immune responses |
WO2019210153A1 (en) | 2018-04-27 | 2019-10-31 | Novartis Ag | Car t cell therapies with enhanced efficacy |
CN112368003A (zh) | 2018-04-27 | 2021-02-12 | 艾欧凡斯生物治疗公司 | 肿瘤浸润淋巴细胞的基因编辑及其在免疫治疗中的用途 |
CA3098127A1 (en) | 2018-04-27 | 2019-10-31 | Genedit Inc. | Cationic polymer and use for biomolecule delivery |
US20210147831A1 (en) | 2018-04-27 | 2021-05-20 | The Broad Institute, Inc. | Sequencing-based proteomics |
US20210386829A1 (en) | 2018-05-04 | 2021-12-16 | The Broad Institute, Inc. | Compositions and methods for modulating cgrp signaling to regulate innate lymphoid cell inflammatory responses |
KR20210045360A (ko) | 2018-05-16 | 2021-04-26 | 신테고 코포레이션 | 가이드 rna 설계 및 사용을 위한 방법 및 시스템 |
WO2019222555A1 (en) | 2018-05-16 | 2019-11-21 | Arbor Biotechnologies, Inc. | Novel crispr-associated systems and components |
CN112204156A (zh) | 2018-05-25 | 2021-01-08 | 先锋国际良种公司 | 用于通过调节重组率来改善育种的系统和方法 |
CN108707628B (zh) * | 2018-05-28 | 2021-11-23 | 上海海洋大学 | 斑马鱼notch2基因突变体的制备方法 |
WO2019232542A2 (en) | 2018-06-01 | 2019-12-05 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods and compositions for detecting and modulating microenvironment gene signatures from the csf of metastasis patients |
US11866719B1 (en) | 2018-06-04 | 2024-01-09 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Heterologous integration of regulatory elements to alter gene expression in wheat cells and wheat plants |
EP3578658A1 (en) * | 2018-06-08 | 2019-12-11 | Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt | Method for generating a gene editing vector with fixed guide rna pairs |
US20220403001A1 (en) | 2018-06-12 | 2022-12-22 | Obsidian Therapeutics, Inc. | Pde5 derived regulatory constructs and methods of use in immunotherapy |
BR112020025048A2 (pt) | 2018-06-13 | 2021-04-06 | Novartis Ag | Receptores de antígeno quimérico de bcma e usos dos mesmos |
CA3102264A1 (en) * | 2018-06-19 | 2019-12-26 | Lunella Biotech, Inc. | "energetic" cancer stem cells (e-cscs): a new hyper-metabolic and proliferative tumor cell phenotype, driven by mitochondrial energy |
KR20210024009A (ko) | 2018-06-26 | 2021-03-04 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | Crispr/cas 및 트랜스포사제 기반 증폭 조성물, 시스템 및 방법 |
CN112543812A (zh) | 2018-06-26 | 2021-03-23 | 麻省理工学院 | 基于crispr效应系统的扩增方法、系统和诊断 |
EP3814302A4 (en) | 2018-06-27 | 2022-06-29 | Pivot Bio, Inc. | Agricultural compositions comprising remodeled nitrogen fixing microbes |
WO2020002579A1 (en) | 2018-06-29 | 2020-01-02 | Stichting Het Nederlands Kanker Instituut - Antoni Van Leeuwenhoek Ziekenhuis | Tweak-receptor agonists for use in combination with immunotherapy of a cancer |
CN112513270A (zh) | 2018-07-13 | 2021-03-16 | 加利福尼亚大学董事会 | 基于逆转录转座子的递送媒介物及其使用方法 |
WO2020018142A1 (en) | 2018-07-16 | 2020-01-23 | Arbor Biotechnologies, Inc. | Novel crispr dna targeting enzymes and systems |
WO2020028555A2 (en) | 2018-07-31 | 2020-02-06 | The Broad Institute, Inc. | Novel crispr enzymes and systems |
WO2020028729A1 (en) | 2018-08-01 | 2020-02-06 | Mammoth Biosciences, Inc. | Programmable nuclease compositions and methods of use thereof |
CA3106035A1 (en) | 2018-08-07 | 2020-02-13 | The Broad Institute, Inc. | Cas12b enzymes and systems |
US20210292389A1 (en) | 2018-08-10 | 2021-09-23 | Sangamo Therapeutics France | New car constructs comprising tnfr2 domains |
EP3607819A1 (en) | 2018-08-10 | 2020-02-12 | Vilmorin et Cie | Resistance to xanthomonas campestris pv. campestris (xcc) in cauliflower |
KR20210044795A (ko) | 2018-08-15 | 2021-04-23 | 지머젠 인코포레이티드 | 고 처리량 대사 공학에서 CRISPRi의 응용 |
WO2020041380A1 (en) | 2018-08-20 | 2020-02-27 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for optochemical control of crispr-cas9 |
US20210324357A1 (en) | 2018-08-20 | 2021-10-21 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Degradation domain modifications for spatio-temporal control of rna-guided nucleases |
KR20210049124A (ko) | 2018-08-23 | 2021-05-04 | 상가모 테라퓨틱스, 인코포레이티드 | 조작된 표적 특이적 염기 편집기 |
US11459551B1 (en) | 2018-08-31 | 2022-10-04 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Compositions, systems, and methods for genome editing |
WO2020051507A1 (en) | 2018-09-06 | 2020-03-12 | The Broad Institute, Inc. | Nucleic acid assemblies for use in targeted delivery |
US20220098613A1 (en) | 2018-09-12 | 2022-03-31 | Fred Hutchinson Cancer Research Center | Reducing cd33 expression to selectively protect therapeutic cells |
WO2020061229A2 (en) | 2018-09-18 | 2020-03-26 | Vnv Newco Inc. | Arc-based capsids and uses thereof |
CN109265562B (zh) * | 2018-09-26 | 2021-03-30 | 北京市农林科学院 | 一种切刻酶及其在基因组碱基替换中的应用 |
GB201815820D0 (en) | 2018-09-28 | 2018-11-14 | Univ Wageningen | Off-target activity inhibitors for guided endonucleases |
EP3861120A4 (en) | 2018-10-01 | 2023-08-16 | North Carolina State University | RECOMBINANT TYPE I CRISPR-CAS SYSTEM |
WO2020077236A1 (en) | 2018-10-12 | 2020-04-16 | The Broad Institute, Inc. | Method for extracting nuclei or whole cells from formalin-fixed paraffin-embedded tissues |
US11851663B2 (en) | 2018-10-14 | 2023-12-26 | Snipr Biome Aps | Single-vector type I vectors |
WO2020081730A2 (en) | 2018-10-16 | 2020-04-23 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods and compositions for modulating microenvironment |
WO2020086910A1 (en) | 2018-10-24 | 2020-04-30 | Genedit Inc. | Cationic polymer with alkyl side chains and use for biomolecule delivery |
WO2020086742A1 (en) | 2018-10-24 | 2020-04-30 | Obsidian Therapeutics, Inc. | Er tunable protein regulation |
US11407995B1 (en) | 2018-10-26 | 2022-08-09 | Inari Agriculture Technology, Inc. | RNA-guided nucleases and DNA binding proteins |
EP3875469A4 (en) * | 2018-10-29 | 2022-08-17 | China Agricultural University | NEW CRISPR/CAS12F ENZYME AND SYSTEM |
MX2021005028A (es) | 2018-10-31 | 2021-08-24 | Zymergen Inc | Ensamble determinista multiplexado de genotecas de adn. |
JP2022505671A (ja) | 2018-10-31 | 2022-01-14 | パイオニア ハイ-ブレッド インターナショナル, インコーポレイテッド | オクロバクトラム媒介遺伝子編集のための組成物及び方法 |
WO2020093025A1 (en) * | 2018-11-01 | 2020-05-07 | Synthego Corporation | Methods for knock-out of a target sequence through introduction of a premature stop codon |
US11434477B1 (en) | 2018-11-02 | 2022-09-06 | Inari Agriculture Technology, Inc. | RNA-guided nucleases and DNA binding proteins |
AU2019377422A1 (en) | 2018-11-05 | 2021-05-27 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Treatment of NSCLC patients refractory for anti-PD-1 antibody |
TW202039830A (zh) | 2018-11-05 | 2020-11-01 | 美商艾歐凡斯生物治療公司 | 用於製造腫瘤浸潤性淋巴細胞之方法及其在免疫療法中之用途 |
US20230039976A1 (en) | 2018-11-05 | 2023-02-09 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Selection of improved tumor reactive t-cells |
US20220033775A1 (en) | 2018-11-05 | 2022-02-03 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Expansion of tils utilizing akt pathways inhibitors |
US20220282275A1 (en) | 2018-11-15 | 2022-09-08 | The Broad Institute, Inc. | G-to-t base editors and uses thereof |
US11166996B2 (en) | 2018-12-12 | 2021-11-09 | Flagship Pioneering Innovations V, Inc. | Anellovirus compositions and methods of use |
KR20210104068A (ko) | 2018-12-14 | 2021-08-24 | 파이어니어 하이 부렛드 인터내쇼날 인코포레이팃드 | 게놈 편집을 위한 신규한 crispr-cas 시스템 |
US20220062394A1 (en) | 2018-12-17 | 2022-03-03 | The Broad Institute, Inc. | Methods for identifying neoantigens |
EP3898958A1 (en) | 2018-12-17 | 2021-10-27 | The Broad Institute, Inc. | Crispr-associated transposase systems and methods of use thereof |
EP3877525A2 (en) | 2018-12-18 | 2021-09-15 | Braskem S.A. | Co-production pathway for 3-hp and acetyl-coa derivatives from malonate semialdehyde |
WO2020131547A1 (en) | 2018-12-19 | 2020-06-25 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Methods of expanding tumor infiltrating lymphocytes using engineered cytokine receptor pairs and uses thereof |
AU2019401485A1 (en) | 2018-12-21 | 2021-06-24 | Pivot Bio, Inc. | Methods, compositions, and media for improving plant traits |
BR112021012231A2 (pt) | 2018-12-28 | 2021-09-28 | Braskem S.A. | Modulação do fluxo de carbono através das vias de meg e c3 para a produção melhorada de monoetileno glicol e compostos c3 |
JP2022517324A (ja) | 2019-01-03 | 2022-03-08 | アンスティチュ ナショナル ドゥ ラ サンテ エ ドゥ ラ ルシェルシュ メディカル | 癌を患っている被験者における、cd8陽性t細胞依存性免疫応答を増強させるための方法及び医薬組成物 |
WO2020142754A2 (en) | 2019-01-04 | 2020-07-09 | Mammoth Biosciences, Inc. | Programmable nuclease improvements and compositions and methods for nucleic acid amplification and detection |
US11739156B2 (en) | 2019-01-06 | 2023-08-29 | The Broad Institute, Inc. Massachusetts Institute of Technology | Methods and compositions for overcoming immunosuppression |
WO2020148206A1 (en) | 2019-01-14 | 2020-07-23 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Methods and kits for generating and selecting a variant of a binding protein with increased binding affinity and/or specificity |
WO2020163396A1 (en) | 2019-02-04 | 2020-08-13 | The General Hospital Corporation | Adenine dna base editor variants with reduced off-target rna editing |
EP3921416A1 (en) | 2019-02-06 | 2021-12-15 | Fred Hutchinson Cancer Research Center | Minicircle producing bacteria engineered to differentially methylate nucleic acid molecules therein |
WO2020163856A1 (en) | 2019-02-10 | 2020-08-13 | The J. David Gladstone Institutes, A Testamentary Trust Established Under The Will Of J. David Gladstone | Modified mitochondrion and methods of use thereof |
MX2021010288A (es) | 2019-03-01 | 2021-09-23 | Iovance Biotherapeutics Inc | Expansion de linfocitos infiltrantes de tumores a partir de tumores liquidos y usos terapeuticos de los mismos. |
EP3921435A1 (en) | 2019-03-01 | 2021-12-15 | Braskem S.A. | Method for the in vivo synthesis of 4-hydroxymethylfurfural and derivatives thereof |
CN110177061B (zh) * | 2019-03-01 | 2023-04-07 | 致讯科技(天津)有限公司 | 一种异构网络中信号干扰的协调方法 |
WO2020181195A1 (en) | 2019-03-06 | 2020-09-10 | The Broad Institute, Inc. | T:a to a:t base editing through adenine excision |
WO2020181202A1 (en) | 2019-03-06 | 2020-09-10 | The Broad Institute, Inc. | A:t to t:a base editing through adenine deamination and oxidation |
WO2020181193A1 (en) | 2019-03-06 | 2020-09-10 | The Broad Institute, Inc. | T:a to a:t base editing through adenosine methylation |
WO2020181180A1 (en) | 2019-03-06 | 2020-09-10 | The Broad Institute, Inc. | A:t to c:g base editors and uses thereof |
WO2020181178A1 (en) | 2019-03-06 | 2020-09-10 | The Broad Institute, Inc. | T:a to a:t base editing through thymine alkylation |
DE212020000516U1 (de) | 2019-03-07 | 2022-01-17 | The Regents of the University of California | CRISPR-CAS-Effektorpolypeptide |
AU2020235865A1 (en) | 2019-03-08 | 2021-09-23 | Obsidian Therapeutics, Inc. | Human carbonic anhydrase 2 compositions and methods for tunable regulation |
US11053515B2 (en) | 2019-03-08 | 2021-07-06 | Zymergen Inc. | Pooled genome editing in microbes |
CN113728106A (zh) | 2019-03-08 | 2021-11-30 | 齐默尔根公司 | 微生物中的迭代基因组编辑 |
JP7461368B2 (ja) | 2019-03-18 | 2024-04-03 | リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド | タウの播種または凝集の遺伝的修飾因子を同定するためのcrispr/casスクリーニングプラットフォーム |
JP7389135B2 (ja) | 2019-03-18 | 2023-11-29 | リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド | タウ凝集に関連する遺伝的脆弱性を明らかにするためのcrispr/casドロップアウトスクリーニングプラットフォーム |
AU2020242032A1 (en) | 2019-03-19 | 2021-10-07 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods and compositions for editing nucleotide sequences |
WO2020206036A1 (en) | 2019-04-01 | 2020-10-08 | The Broad Institute, Inc. | Novel nucleic acid modifier |
RU2710731C1 (ru) * | 2019-04-02 | 2020-01-10 | Общество с ограниченной ответственностью "Зеленые линии" | Система редактирования генома дрожжей debaryomyces hansenii на основе crispr/cas9 |
CN114008197A (zh) | 2019-04-04 | 2022-02-01 | 布拉斯科公司 | 用于同时消耗木糖和葡萄糖以从第二代糖产生化学物质的代谢工程 |
EP3956349A1 (en) | 2019-04-17 | 2022-02-23 | The Broad Institute, Inc. | Adenine base editors with reduced off-target effects |
KR20220005019A (ko) | 2019-04-23 | 2022-01-12 | 진에딧 인코포레이티드 | 알킬 곁사슬을 갖는 양이온성 폴리머 |
JP2022529531A (ja) | 2019-04-24 | 2022-06-22 | ピボット バイオ, インコーポレイテッド | 植物形質を改善するために窒素固定を標的とする遺伝子標的 |
EP3959320A1 (en) | 2019-04-24 | 2022-03-02 | Novartis AG | Compositions and methods for selective protein degradation |
US20220220495A1 (en) | 2019-05-10 | 2022-07-14 | Basf Se | Regulatory nucleic acid molecules for enhancing gene expression in plants |
EP3969607A1 (en) | 2019-05-13 | 2022-03-23 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Drought tolerance in corn |
US20220249559A1 (en) | 2019-05-13 | 2022-08-11 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Methods and compositions for selecting tumor infiltrating lymphocytes and uses of the same in immunotherapy |
WO2020236972A2 (en) | 2019-05-20 | 2020-11-26 | The Broad Institute, Inc. | Non-class i multi-component nucleic acid targeting systems |
WO2020236967A1 (en) | 2019-05-20 | 2020-11-26 | The Broad Institute, Inc. | Random crispr-cas deletion mutant |
EP3973054A1 (en) | 2019-05-20 | 2022-03-30 | The Broad Institute Inc. | Aav delivery of nucleobase editors |
AR118995A1 (es) | 2019-05-25 | 2021-11-17 | Kws Saat Se & Co Kgaa | Mejorador de la inducción de haploides |
JP2022534245A (ja) | 2019-05-28 | 2022-07-28 | ジーンエディット インコーポレイテッド | 生体分子送達のための複数の機能化側鎖を含むポリマー |
US20220243178A1 (en) | 2019-05-31 | 2022-08-04 | The Broad Institute, Inc. | Methods for treating metabolic disorders by targeting adcy5 |
EP3976073A4 (en) * | 2019-06-01 | 2023-08-02 | Sivec Biotechnologies, LLC | BACTERIAL PLATFORM FOR DELIVERING GENE EDITING SYSTEMS TO EUKARYOT CELLS |
WO2020244759A1 (en) | 2019-06-05 | 2020-12-10 | Klemm & Sohn Gmbh & Co. Kg | New plants having a white foliage phenotype |
AU2020290509A1 (en) | 2019-06-14 | 2021-11-11 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Models of tauopathy |
WO2020254850A1 (en) | 2019-06-21 | 2020-12-24 | Vilmorin & Cie | Improvement of quality and permanence of green color of peppers at maturity and over-maturity |
WO2020263825A1 (en) | 2019-06-24 | 2020-12-30 | Promega Corporation | Modified polyamine polymers for delivery of biomolecules into cells |
CA3138663A1 (en) | 2019-06-25 | 2020-12-30 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Improved homology dependent repair genome editing |
JP2022539248A (ja) | 2019-07-02 | 2022-09-07 | フレッド ハッチンソン キャンサー リサーチ センター | 組換えad35ベクター及び関連遺伝子治療改善 |
GB201909597D0 (en) | 2019-07-03 | 2019-08-14 | Univ Wageningen | Crispr type v-u1 system from mycobacterium mucogenicum and uses thereof |
CA3145385A1 (en) | 2019-07-08 | 2021-01-14 | Steven D. Goodman | Antibody compositions for disrupting biofilms |
CN110387405A (zh) * | 2019-07-17 | 2019-10-29 | 浙江善测禾骑士生物科技有限公司 | 一种快速检测核酸的(rt)raa-crispr系统 |
CN110452966A (zh) * | 2019-07-17 | 2019-11-15 | 浙江善测禾骑士生物科技有限公司 | 一种利用raa-crispr蛋白酶系统快速检测方法 |
WO2021009299A1 (en) | 2019-07-17 | 2021-01-21 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Bcl-xl:fkbp12 fusion proteins suitable for screening agents capable of slowing down the aging process |
WO2021019272A1 (en) | 2019-07-31 | 2021-02-04 | Vilmorin & Cie | Tolerance to tolcndv in cucumber |
EP3772542A1 (en) | 2019-08-07 | 2021-02-10 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Modifying genetic variation in crops by modulating the pachytene checkpoint protein 2 |
WO2021028359A1 (en) | 2019-08-09 | 2021-02-18 | Sangamo Therapeutics France | Controlled expression of chimeric antigen receptors in t cells |
EP4013859A4 (en) * | 2019-08-15 | 2023-10-11 | The Rockefeller University | CRISPR-BASED GENOME EDITING WITH CELL SURFACE DISPLAY TO PRODUCE HOMOZYGOTICLY ENGINEERED EUKARYOTIC CELLS |
WO2021030666A1 (en) | 2019-08-15 | 2021-02-18 | The Broad Institute, Inc. | Base editing by transglycosylation |
WO2021041922A1 (en) | 2019-08-30 | 2021-03-04 | The Broad Institute, Inc. | Crispr-associated mu transposase systems |
US20220348937A1 (en) | 2019-09-06 | 2022-11-03 | Obsidian Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for dhfr tunable protein regulation |
CA3150334A1 (en) | 2019-09-12 | 2021-03-18 | Frank Meulewaeter | REGULATORY NUCLEIC ACID MOLECULES TO ENHANCE GENE EXPRESSION IN PLANTS |
CN110541001A (zh) * | 2019-09-20 | 2019-12-06 | 福建上源生物科学技术有限公司 | 精确大片段基因删除结合终止密码子插入的基因敲除法 |
AU2020348879A1 (en) | 2019-09-20 | 2022-04-14 | Massachusetts Institute Of Technology | Novel type VI CRISPR enzymes and systems |
CN114391040A (zh) | 2019-09-23 | 2022-04-22 | 欧米茄治疗公司 | 用于调节载脂蛋白b(apob)基因表达的组合物和方法 |
US11987791B2 (en) | 2019-09-23 | 2024-05-21 | Omega Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for modulating hepatocyte nuclear factor 4-alpha (HNF4α) gene expression |
US11981922B2 (en) | 2019-10-03 | 2024-05-14 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Methods and compositions for the modulation of cell interactions and signaling in the tumor microenvironment |
WO2021069387A1 (en) | 2019-10-07 | 2021-04-15 | Basf Se | Regulatory nucleic acid molecules for enhancing gene expression in plants |
EP3808766A1 (en) | 2019-10-15 | 2021-04-21 | Sangamo Therapeutics France | Chimeric antigen receptor specific for interleukin-23 receptor |
US20230357788A1 (en) | 2019-10-17 | 2023-11-09 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Enhanced disease resistance of crops by downregulation of repressor genes |
EP4048295A1 (en) | 2019-10-25 | 2022-08-31 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Gene editing of tumor infiltrating lymphocytes and uses of same in immunotherapy |
WO2021094805A1 (en) | 2019-11-14 | 2021-05-20 | Vilmorin & Cie | Resistance to acidovorax valerianellae in corn salad |
CN114980864A (zh) | 2019-11-22 | 2022-08-30 | 哈佛大学校长及研究员协会 | 用于药物递送的离子液体 |
WO2021108717A2 (en) | 2019-11-26 | 2021-06-03 | The Broad Institute, Inc | Systems and methods for evaluating cas9-independent off-target editing of nucleic acids |
US20230002455A1 (en) | 2019-11-29 | 2023-01-05 | Basf Se | Increasing resistance against fungal infections in plants |
AU2020394910A1 (en) * | 2019-12-02 | 2022-06-23 | Council Of Scientific & Industrial Research | Method and kit for detection of polynucleotide |
AU2020396138A1 (en) | 2019-12-03 | 2022-06-16 | Basf Se | Regulatory nucleic acid molecules for enhancing gene expression in plants |
WO2021118990A1 (en) | 2019-12-11 | 2021-06-17 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Processes for the production of tumor infiltrating lymphocytes (tils) and methods of using the same |
EP4074821A4 (en) | 2019-12-13 | 2024-01-17 | Chugai Pharmaceutical Co Ltd | SYSTEM FOR DETECTING EXTRACELLULAR PURINERGIC RECEPTOR LIGANDS AND NON-HUMAN ANIMAL INTO WHICH SUCH LIGAND WAS TRANSFERRED |
WO2021122687A1 (en) | 2019-12-19 | 2021-06-24 | Basf Se | Increasing space-time-yield, carbon-conversion-efficiency and carbon substrate flexibility in the production of fine chemicals |
JP2023508871A (ja) | 2019-12-20 | 2023-03-06 | ビーエーエスエフ ソシエタス・ヨーロピア | テルペンの毒性の低減および微生物中での生成可能性の増大 |
JP2023510872A (ja) | 2020-01-13 | 2023-03-15 | サナ バイオテクノロジー,インコーポレイテッド | 血液型抗原の修飾 |
WO2021221690A1 (en) | 2020-05-01 | 2021-11-04 | Pivot Bio, Inc. | Modified bacterial strains for improved fixation of nitrogen |
IL294715A (en) | 2020-01-23 | 2022-09-01 | Childrens Medical Ct Corp | Inducible t-cell differentiation from human pluripotent stem cells |
US20230235309A1 (en) | 2020-02-05 | 2023-07-27 | The Broad Institute, Inc. | Adenine base editors and uses thereof |
EP3872190A1 (en) | 2020-02-26 | 2021-09-01 | Antibodies-Online GmbH | A method of using cut&run or cut&tag to validate crispr-cas targeting |
JP2023517326A (ja) | 2020-03-11 | 2023-04-25 | オメガ セラピューティクス, インコーポレイテッド | フォークヘッドボックスp3(foxp3)遺伝子発現をモジュレートするための組成物および方法 |
WO2021186056A1 (en) | 2020-03-20 | 2021-09-23 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Chimeric antigen receptor specific for human cd45rc and uses thereof |
US20210319851A1 (en) | 2020-04-03 | 2021-10-14 | Creyon Bio, Inc. | Oligonucleotide-based machine learning |
WO2021216622A1 (en) | 2020-04-21 | 2021-10-28 | Aspen Neuroscience, Inc. | Gene editing of gba1 in stem cells and method of use of cells differentiated therefrom |
WO2021216623A1 (en) | 2020-04-21 | 2021-10-28 | Aspen Neuroscience, Inc. | Gene editing of lrrk2 in stem cells and method of use of cells differentiated therefrom |
CA3172322A1 (en) | 2020-05-01 | 2021-11-04 | Karsten TEMME | Modified bacterial strains for improved fixation of nitrogen |
BR112022021723A2 (pt) | 2020-05-01 | 2022-12-06 | Pivot Bio Inc | Sistema para cultivo de plantas, métodos para detectar a incorporação de nitrogênio em uma planta e para identificação de uma cepa bacteriana fixadora de nitrogênio, bactéria geneticamente modificada, e, composição |
WO2021226061A1 (en) | 2020-05-04 | 2021-11-11 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Processes for production of tumor infiltrating lymphocytes and uses of the same in immunotherapy |
US20230193212A1 (en) | 2020-05-06 | 2023-06-22 | Orchard Therapeutics (Europe) Limited | Treatment for neurodegenerative diseases |
CA3177481A1 (en) | 2020-05-08 | 2021-11-11 | David R. Liu | Methods and compositions for simultaneous editing of both strands of a target double-stranded nucleotide sequence |
CA3172323A1 (en) | 2020-05-13 | 2021-11-18 | Pivot Bio, Inc. | De-repression of nitrogen fixation in gram-positive microorganisms |
GB202007943D0 (en) | 2020-05-27 | 2020-07-08 | Snipr Biome Aps | Products & methods |
PE20230080A1 (es) | 2020-05-29 | 2023-01-11 | Kws Saat Se And Co Kgaa | Induccion de haploides en plantas |
WO2021245435A1 (en) | 2020-06-03 | 2021-12-09 | Vilmorin & Cie | Melon plants resistant to scab disease, aphids and powdery mildew |
EP4161552A1 (en) | 2020-06-05 | 2023-04-12 | The Broad Institute, Inc. | Compositions and methods for treating neoplasia |
CN115867129A (zh) | 2020-06-05 | 2023-03-28 | 维尔莫林公司 | 番茄植物对ToBRFV的抗性 |
CN116096862A (zh) | 2020-06-11 | 2023-05-09 | 诺华股份有限公司 | Zbtb32抑制剂及其用途 |
US20230235315A1 (en) | 2020-07-10 | 2023-07-27 | Horizon Discovery Limited | Method for producing genetically modified cells |
US20230323299A1 (en) | 2020-08-03 | 2023-10-12 | Inserm (Institut National De La Santé Et De La Recherch Médicale) | Population of treg cells functionally committed to exert a regulatory activity and their use for adoptive therapy |
CN116096378A (zh) | 2020-08-10 | 2023-05-09 | 诺华股份有限公司 | 视网膜变性疾病的治疗 |
CA3186862A1 (en) | 2020-08-18 | 2022-02-24 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Multiple disease resistance genes and genomic stacks thereof |
WO2022040454A1 (en) | 2020-08-20 | 2022-02-24 | A2 Biotherapeutics, Inc. | Compositions and methods for treating mesothelin positive cancers |
JP2023538116A (ja) | 2020-08-20 | 2023-09-06 | エー2 バイオセラピューティクス, インコーポレイテッド | Egfr陽性がんを治療するための組成物及び方法 |
IL300497A (en) | 2020-08-20 | 2023-04-01 | A2 Biotherapeutics Inc | Compositions and methods for treating CEACAM-positive cancer |
CN112080587A (zh) * | 2020-08-31 | 2020-12-15 | 上海海关动植物与食品检验检疫技术中心 | 用于高效检测新型冠状病毒的raa-crispr扩增引物组、试剂盒及方法 |
KR102424351B1 (ko) * | 2020-09-21 | 2022-08-05 | 한국과학기술원 | 파브알부민 유전자 발현 억제용 CRISPR/Cas9 시스템 및 이의 용도 |
US11944063B2 (en) | 2020-09-30 | 2024-04-02 | Spring Meadow Nursery, Inc. | Hydrangea ‘SMNHPH’ |
WO2022188039A1 (en) | 2021-03-09 | 2022-09-15 | Huigene Therapeutics Co., Ltd. | Engineered crispr/cas13 system and uses thereof |
WO2022068912A1 (en) | 2020-09-30 | 2022-04-07 | Huigene Therapeutics Co., Ltd. | Engineered crispr/cas13 system and uses thereof |
IL301846A (en) | 2020-10-02 | 2023-06-01 | Vilmorin & Cie | A hotel with an extended shelf life |
CA3195019A1 (en) | 2020-10-06 | 2022-04-14 | Maria Fardis | Treatment of nsclc patients with tumor infiltrating lymphocyte therapies |
WO2022076606A1 (en) | 2020-10-06 | 2022-04-14 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Treatment of nsclc patients with tumor infiltrating lymphocyte therapies |
EP4321015A3 (en) | 2020-10-16 | 2024-04-17 | Klemm & Sohn GmbH & Co. KG | Double-flowering dwarf calibrachoa |
US11155884B1 (en) | 2020-10-16 | 2021-10-26 | Klemm & Sohn Gmbh & Co. Kg | Double-flowering dwarf Calibrachoa |
US20230147779A1 (en) | 2020-10-28 | 2023-05-11 | GeneEdit, Inc. | Polymer with cationic and hydrophobic side chains |
US11530419B2 (en) | 2020-10-30 | 2022-12-20 | Fortiphyte, Inc. | Pathogen resistance in plants |
IL302700A (en) | 2020-11-13 | 2023-07-01 | Novartis Ag | Combined treatments with cells expressing chimeric antigens (vehicle) |
EP4001429A1 (en) | 2020-11-16 | 2022-05-25 | Antibodies-Online GmbH | Analysis of crispr-cas binding and cleavage sites followed by high-throughput sequencing (abc-seq) |
US20240049668A1 (en) | 2020-12-03 | 2024-02-15 | Vilmorin & Cie | Tomato plants resistant to tobrfv, tmv, tomv and tommv and corresponding resistance genes |
US20240123067A1 (en) | 2020-12-17 | 2024-04-18 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Treatment of cancers with tumor infiltrating lymphocyte therapies |
WO2022133140A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Treatment with tumor infiltrating lymphocyte therapies in combination with ctla-4 and pd-1 inhibitors |
IL303892A (en) | 2020-12-23 | 2023-08-01 | Flagship Pioneering Innovations V Inc | In vitro assembly of RNA-encapsulating enalavirus capsids |
CA3207144A1 (en) | 2021-01-05 | 2022-07-14 | Horizon Discovery Limited | Method for producing genetically modified cells |
WO2022150776A1 (en) * | 2021-01-11 | 2022-07-14 | Vedere Bio Ii, Inc. | OPTOGENETIC COMPOSITIONS COMPRISING A CBh PROMOTER SEQUENCE AND METHODS FOR USE |
EP4277989A2 (en) | 2021-01-12 | 2023-11-22 | March Therapeutics, Inc. | Context-dependent, double-stranded dna-specific deaminases and uses thereof |
JP2024506557A (ja) | 2021-01-29 | 2024-02-14 | アイオバンス バイオセラピューティクス,インコーポレイテッド | 修飾された腫瘍浸潤リンパ球を作製する方法及び養子細胞療法におけるそれらの使用 |
AU2022221606A1 (en) | 2021-02-16 | 2023-08-24 | A2 Biotherapeutics, Inc. | Compositions and methods for treating her2 positive cancers |
WO2022188797A1 (en) | 2021-03-09 | 2022-09-15 | Huigene Therapeutics Co., Ltd. | Engineered crispr/cas13 system and uses thereof |
CA3212439A1 (en) | 2021-03-19 | 2022-09-22 | Michelle SIMPSON-ABELSON | Methods for tumor infiltrating lymphocyte (til) expansion related to cd39/cd69 selection and gene knockout in tils |
WO2022213118A1 (en) | 2021-03-31 | 2022-10-06 | Entrada Therapeutics, Inc. | Cyclic cell penetrating peptides |
WO2022208489A1 (en) | 2021-04-02 | 2022-10-06 | Vilmorin & Cie | Semi-determinate or determinate growth habit trait in cucurbita |
KR20240007651A (ko) | 2021-04-16 | 2024-01-16 | 빔 테라퓨틱스, 인크. | 간세포의 유전적 변형 |
WO2022225981A2 (en) | 2021-04-19 | 2022-10-27 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Chimeric costimulatory receptors, chemokine receptors, and the use of same in cellular immunotherapies |
WO2022235929A1 (en) | 2021-05-05 | 2022-11-10 | Radius Pharmaceuticals, Inc. | Animal model having homologous recombination of mouse pth1 receptor |
EP4337263A1 (en) | 2021-05-10 | 2024-03-20 | Entrada Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for modulating interferon regulatory factor-5 (irf-5) activity |
JP2024518476A (ja) | 2021-05-10 | 2024-05-01 | エントラーダ セラピューティクス,インコーポレイティド | mRNAスプライシングを調節するための組成物及び方法 |
EP4337264A1 (en) | 2021-05-10 | 2024-03-20 | Entrada Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for modulating tissue distribution of intracellular therapeutics |
WO2022240824A1 (en) | 2021-05-13 | 2022-11-17 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Compositions and methods for treating sickle cell diseases |
EP4340850A1 (en) | 2021-05-17 | 2024-03-27 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Pd-1 gene-edited tumor infiltrating lymphocytes and uses of same in immunotherapy |
US20240102007A1 (en) | 2021-06-01 | 2024-03-28 | Arbor Biotechnologies, Inc. | Gene editing systems comprising a crispr nuclease and uses thereof |
WO2022261509A1 (en) | 2021-06-11 | 2022-12-15 | The Broad Institute, Inc. | Improved cytosine to guanine base editors |
WO2022261561A1 (en) | 2021-06-11 | 2022-12-15 | Genedit Inc. | Biodegradable polymer comprising side chains with polyamine and polyalkylene oxide groups |
WO2022266105A1 (en) * | 2021-06-14 | 2022-12-22 | The University Of Chicago | Characterization and treatment of asthma |
KR20240038967A (ko) | 2021-06-23 | 2024-03-26 | 엔트라다 테라퓨틱스, 인크. | Cug 반복을 표적화하기 위한 안티센스 화합물 및 방법 |
CA3218556A1 (en) | 2021-07-02 | 2023-01-05 | Pivot Bio, Inc. | Genetically-engineered bacterial strains for improved fixation of nitrogen |
EP4367242A2 (en) | 2021-07-07 | 2024-05-15 | Omega Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for modulating secreted frizzled receptor protein 1 (sfrp1) gene expression |
CA3226111A1 (en) | 2021-07-22 | 2023-01-26 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Method for cryopreservation of solid tumor fragments |
EP4377446A1 (en) | 2021-07-28 | 2024-06-05 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Treatment of cancer patients with tumor infiltrating lymphocyte therapies in combination with kras inhibitors |
EP4376596A1 (en) | 2021-07-30 | 2024-06-05 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Plants with improved digestibility and marker haplotypes |
EP4175968A1 (en) | 2021-07-30 | 2023-05-10 | Helaina, Inc. | Methods and compositions for protein synthesis and secretion |
WO2023012325A1 (en) | 2021-08-06 | 2023-02-09 | Vilmorin & Cie | Resistance to leveillula taurica in pepper |
WO2023031885A1 (en) | 2021-09-02 | 2023-03-09 | SESVanderHave NV | Methods and compositions for ppo herbicide tolerance |
WO2023039586A1 (en) | 2021-09-10 | 2023-03-16 | Agilent Technologies, Inc. | Guide rnas with chemical modification for prime editing |
AU2022358523A1 (en) | 2021-09-30 | 2024-03-14 | The Board Of Regents Of The Universityof Texas System | Slc13a5 gene therapy vectors and uses thereof |
AU2022359915A1 (en) | 2021-10-08 | 2024-05-02 | President And Fellows Of Harvard College | Ionic liquids for drug delivery |
WO2023077015A2 (en) | 2021-10-27 | 2023-05-04 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Systems and methods for coordinating manufacturing of cells for patient-specific immunotherapy |
WO2023077148A1 (en) | 2021-11-01 | 2023-05-04 | Tome Biosciences, Inc. | Single construct platform for simultaneous delivery of gene editing machinery and nucleic acid cargo |
CA3237482A1 (en) | 2021-11-03 | 2023-05-11 | The J. David Gladstone Institutes, A Testamentary Trust Established Under The Will Of J. David Gladstone | Precise genome editing using retrons |
AU2022381188A1 (en) * | 2021-11-03 | 2024-05-23 | Salk Institute For Biological Studies | Serine recombinases |
CA3237410A1 (en) | 2021-11-10 | 2023-05-19 | Friedrich Graf Finck VON FINCKENSTEIN | Methods of expansion treatment utilizing cd8 tumor infiltrating lymphocytes |
WO2023092153A2 (en) * | 2021-11-22 | 2023-05-25 | The Texas A&M University System | Methods and compositions targeting nucleus accumbens-associated protein-1 for treatment of autoimmune disorders and cancers |
WO2023096996A2 (en) | 2021-11-24 | 2023-06-01 | Research Institute At Nationwide Children's Hospital | Chimeric hsv expressing hil21 to boost anti-tumor immune activity |
WO2023093862A1 (en) | 2021-11-26 | 2023-06-01 | Epigenic Therapeutics Inc. | Method of modulating pcsk9 and uses thereof |
WO2023102406A1 (en) | 2021-12-01 | 2023-06-08 | The Board Of Regents Of The Univesity Of Texas System | Vector genome design to express optimized cln7 transgene |
WO2023102518A1 (en) | 2021-12-03 | 2023-06-08 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Gnao1 gene therapy vectors and uses thereof |
GB202118058D0 (en) | 2021-12-14 | 2022-01-26 | Univ Warwick | Methods to increase yields in crops |
US20230279442A1 (en) | 2021-12-15 | 2023-09-07 | Versitech Limited | Engineered cas9-nucleases and method of use thereof |
WO2023115041A1 (en) | 2021-12-17 | 2023-06-22 | Sana Biotechnology, Inc. | Modified paramyxoviridae attachment glycoproteins |
TW202342498A (zh) | 2021-12-17 | 2023-11-01 | 美商薩那生物科技公司 | 經修飾副黏液病毒科融合醣蛋白 |
WO2023122805A1 (en) | 2021-12-20 | 2023-06-29 | Vestaron Corporation | Sorbitol driven selection pressure method |
WO2023122764A1 (en) | 2021-12-22 | 2023-06-29 | Tome Biosciences, Inc. | Co-delivery of a gene editor construct and a donor template |
WO2023122800A1 (en) | 2021-12-23 | 2023-06-29 | University Of Massachusetts | Therapeutic treatment for fragile x-associated disorder |
WO2023133595A2 (en) | 2022-01-10 | 2023-07-13 | Sana Biotechnology, Inc. | Methods of ex vivo dosing and administration of lipid particles or viral vectors and related systems and uses |
WO2023141602A2 (en) | 2022-01-21 | 2023-07-27 | Renagade Therapeutics Management Inc. | Engineered retrons and methods of use |
WO2023147476A1 (en) | 2022-01-28 | 2023-08-03 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Transgene casette designed to express the human codon-optimized gene fmr1 |
WO2023147488A1 (en) | 2022-01-28 | 2023-08-03 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Cytokine associated tumor infiltrating lymphocytes compositions and methods |
WO2023150518A1 (en) | 2022-02-01 | 2023-08-10 | Sana Biotechnology, Inc. | Cd3-targeted lentiviral vectors and uses thereof |
WO2023150647A1 (en) | 2022-02-02 | 2023-08-10 | Sana Biotechnology, Inc. | Methods of repeat dosing and administration of lipid particles or viral vectors and related systems and uses |
WO2023156587A1 (en) | 2022-02-18 | 2023-08-24 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Use of tcr-deficient car-tregs in combination with anti-tcr complex monoclonal antibodies for inducing durable tolerance |
WO2023196802A1 (en) | 2022-04-04 | 2023-10-12 | The Broad Institute, Inc. | Cas9 variants having non-canonical pam specificities and uses thereof |
WO2023196877A1 (en) | 2022-04-06 | 2023-10-12 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Treatment of nsclc patients with tumor infiltrating lymphocyte therapies |
EP4256950A1 (en) | 2022-04-06 | 2023-10-11 | Vilmorin et Cie | Tolerance to cgmmv in cucumber |
WO2023201369A1 (en) | 2022-04-15 | 2023-10-19 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Til expansion processes using specific cytokine combinations and/or akti treatment |
WO2023205744A1 (en) | 2022-04-20 | 2023-10-26 | Tome Biosciences, Inc. | Programmable gene insertion compositions |
WO2023212715A1 (en) | 2022-04-28 | 2023-11-02 | The Broad Institute, Inc. | Aav vectors encoding base editors and uses thereof |
WO2023215831A1 (en) | 2022-05-04 | 2023-11-09 | Tome Biosciences, Inc. | Guide rna compositions for programmable gene insertion |
WO2023220043A1 (en) | 2022-05-09 | 2023-11-16 | Synteny Therapeutics, Inc. | Erythroparvovirus with a modified genome for gene therapy |
WO2023220040A1 (en) | 2022-05-09 | 2023-11-16 | Synteny Therapeutics, Inc. | Erythroparvovirus with a modified capsid for gene therapy |
WO2023219933A1 (en) | 2022-05-09 | 2023-11-16 | Entrada Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for delivery of nucleic acid therapeutics |
WO2023220035A1 (en) | 2022-05-09 | 2023-11-16 | Synteny Therapeutics, Inc. | Erythroparvovirus compositions and methods for gene therapy |
WO2023220608A1 (en) | 2022-05-10 | 2023-11-16 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Treatment of cancer patients with tumor infiltrating lymphocyte therapies in combination with an il-15r agonist |
WO2023225670A2 (en) | 2022-05-20 | 2023-11-23 | Tome Biosciences, Inc. | Ex vivo programmable gene insertion |
WO2023230570A2 (en) | 2022-05-25 | 2023-11-30 | Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc | Compositions and methods for modulating genetic drivers |
WO2023230573A2 (en) | 2022-05-25 | 2023-11-30 | Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc | Compositions and methods for modulation of immune responses |
WO2023230578A2 (en) | 2022-05-25 | 2023-11-30 | Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc | Compositions and methods for modulating circulating factors |
WO2023230549A2 (en) | 2022-05-25 | 2023-11-30 | Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc | Compositions and methods for modulation of tumor suppressors and oncogenes |
WO2023230566A2 (en) | 2022-05-25 | 2023-11-30 | Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc | Compositions and methods for modulating cytokines |
EP4299739A1 (en) | 2022-06-30 | 2024-01-03 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Compositions, systems, and methods for genome editing |
EP4299733A1 (en) | 2022-06-30 | 2024-01-03 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Compositions, systems, and methods for genome editing |
WO2024005864A1 (en) | 2022-06-30 | 2024-01-04 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Compositions, systems, and methods for genome editing |
WO2024005863A1 (en) | 2022-06-30 | 2024-01-04 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Compositions, systems, and methods for genome editing |
WO2024006802A1 (en) | 2022-06-30 | 2024-01-04 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Artificial intelligence-mediated methods and systems for genome editing |
GB2621813A (en) | 2022-06-30 | 2024-02-28 | Univ Newcastle | Preventing disease recurrence in Mitochondrial replacement therapy |
WO2024020346A2 (en) | 2022-07-18 | 2024-01-25 | Renagade Therapeutics Management Inc. | Gene editing components, systems, and methods of use |
WO2024020587A2 (en) | 2022-07-22 | 2024-01-25 | Tome Biosciences, Inc. | Pleiopluripotent stem cell programmable gene insertion |
WO2024023578A1 (en) | 2022-07-28 | 2024-02-01 | Institut Pasteur | Hsc70-4 in host-induced and spray-induced gene silencing |
WO2024026406A2 (en) | 2022-07-29 | 2024-02-01 | Vestaron Corporation | Next Generation ACTX Peptides |
WO2024036190A2 (en) | 2022-08-09 | 2024-02-15 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Guide polynucleotide multiplexing |
WO2024040083A1 (en) | 2022-08-16 | 2024-02-22 | The Broad Institute, Inc. | Evolved cytosine deaminases and methods of editing dna using same |
WO2024040222A1 (en) | 2022-08-19 | 2024-02-22 | Generation Bio Co. | Cleavable closed-ended dna (cedna) and methods of use thereof |
WO2024044655A1 (en) | 2022-08-24 | 2024-02-29 | Sana Biotechnology, Inc. | Delivery of heterologous proteins |
WO2024044723A1 (en) | 2022-08-25 | 2024-02-29 | Renagade Therapeutics Management Inc. | Engineered retrons and methods of use |
WO2024042199A1 (en) | 2022-08-26 | 2024-02-29 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Use of paired genes in hybrid breeding |
WO2024047605A1 (en) | 2022-09-01 | 2024-03-07 | SESVanderHave NV | Methods and compositions for ppo herbicide tolerance |
WO2024050544A2 (en) | 2022-09-01 | 2024-03-07 | J.R. Simplot Company | Enhanced targeted knock-in frequency in host genomes through crispr exonuclease processing |
WO2024052318A1 (en) | 2022-09-06 | 2024-03-14 | Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale | Novel dual split car-t cells for the treatment of cd38-positive hematological malignancies |
WO2024064824A2 (en) | 2022-09-21 | 2024-03-28 | Yale University | Compositions and methods for identification of membrane targets for enhancement of nk cell therapy |
WO2024064838A1 (en) | 2022-09-21 | 2024-03-28 | Sana Biotechnology, Inc. | Lipid particles comprising variant paramyxovirus attachment glycoproteins and uses thereof |
WO2024081820A1 (en) | 2022-10-13 | 2024-04-18 | Sana Biotechnology, Inc. | Viral particles targeting hematopoietic stem cells |
WO2024083579A1 (en) | 2022-10-20 | 2024-04-25 | Basf Se | Regulatory nucleic acid molecules for enhancing gene expression in plants |
WO2024098027A1 (en) | 2022-11-04 | 2024-05-10 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Methods for tumor infiltrating lymphocyte (til) expansion related to cd39/cd103 selection |
WO2024098024A1 (en) | 2022-11-04 | 2024-05-10 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Expansion of tumor infiltrating lymphocytes from liquid tumors and therapeutic uses thereof |
WO2024102434A1 (en) | 2022-11-10 | 2024-05-16 | Senda Biosciences, Inc. | Rna compositions comprising lipid nanoparticles or lipid reconstructed natural messenger packs |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2012149470A1 (en) * | 2011-04-27 | 2012-11-01 | Amyris, Inc. | Methods for genomic modification |
WO2013176772A1 (en) * | 2012-05-25 | 2013-11-28 | The Regents Of The University Of California | Methods and compositions for rna-directed target dna modification and for rna-directed modulation of transcription |
Family Cites Families (79)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US44790A (en) | 1864-10-25 | Improvement in force-pumps | ||
US2011A (en) | 1841-03-18 | Appabatxts for piling saws | ||
US2011008A (en) | 1929-04-15 | 1935-08-13 | Rca Corp | Electric discharge tube |
US4217344A (en) | 1976-06-23 | 1980-08-12 | L'oreal | Compositions containing aqueous dispersions of lipid spheres |
US4235871A (en) | 1978-02-24 | 1980-11-25 | Papahadjopoulos Demetrios P | Method of encapsulating biologically active materials in lipid vesicles |
US4186183A (en) | 1978-03-29 | 1980-01-29 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Army | Liposome carriers in chemotherapy of leishmaniasis |
US4261975A (en) | 1979-09-19 | 1981-04-14 | Merck & Co., Inc. | Viral liposome particle |
US4485054A (en) | 1982-10-04 | 1984-11-27 | Lipoderm Pharmaceuticals Limited | Method of encapsulating biologically active materials in multilamellar lipid vesicles (MLV) |
US4501728A (en) | 1983-01-06 | 1985-02-26 | Technology Unlimited, Inc. | Masking of liposomes from RES recognition |
US4946787A (en) | 1985-01-07 | 1990-08-07 | Syntex (U.S.A.) Inc. | N-(ω,(ω-1)-dialkyloxy)- and N-(ω,(ω-1)-dialkenyloxy)-alk-1-yl-N,N,N-tetrasubstituted ammonium lipids and uses therefor |
US5049386A (en) | 1985-01-07 | 1991-09-17 | Syntex (U.S.A.) Inc. | N-ω,(ω-1)-dialkyloxy)- and N-(ω,(ω-1)-dialkenyloxy)Alk-1-YL-N,N,N-tetrasubstituted ammonium lipids and uses therefor |
US4897355A (en) | 1985-01-07 | 1990-01-30 | Syntex (U.S.A.) Inc. | N[ω,(ω-1)-dialkyloxy]- and N-[ω,(ω-1)-dialkenyloxy]-alk-1-yl-N,N,N-tetrasubstituted ammonium lipids and uses therefor |
US4797368A (en) | 1985-03-15 | 1989-01-10 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Adeno-associated virus as eukaryotic expression vector |
US4774085A (en) | 1985-07-09 | 1988-09-27 | 501 Board of Regents, Univ. of Texas | Pharmaceutical administration systems containing a mixture of immunomodulators |
DE122007000007I1 (de) | 1986-04-09 | 2007-05-16 | Genzyme Corp | Genetisch transformierte Tiere, die ein gewünschtes Protein in Milch absondern |
US4837028A (en) | 1986-12-24 | 1989-06-06 | Liposome Technology, Inc. | Liposomes with enhanced circulation time |
US4873316A (en) | 1987-06-23 | 1989-10-10 | Biogen, Inc. | Isolation of exogenous recombinant proteins from the milk of transgenic mammals |
US5264618A (en) | 1990-04-19 | 1993-11-23 | Vical, Inc. | Cationic lipids for intracellular delivery of biologically active molecules |
AU7979491A (en) | 1990-05-03 | 1991-11-27 | Vical, Inc. | Intracellular delivery of biologically active substances by means of self-assembling lipid complexes |
US5173414A (en) | 1990-10-30 | 1992-12-22 | Applied Immune Sciences, Inc. | Production of recombinant adeno-associated virus vectors |
US7150982B2 (en) | 1991-09-09 | 2006-12-19 | Third Wave Technologies, Inc. | RNA detection assays |
US5587308A (en) | 1992-06-02 | 1996-12-24 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health & Human Services | Modified adeno-associated virus vector capable of expression from a novel promoter |
US6534261B1 (en) | 1999-01-12 | 2003-03-18 | Sangamo Biosciences, Inc. | Regulation of endogenous gene expression in cells using zinc finger proteins |
US7868149B2 (en) | 1999-07-20 | 2011-01-11 | Monsanto Technology Llc | Plant genome sequence and uses thereof |
US6603061B1 (en) | 1999-07-29 | 2003-08-05 | Monsanto Company | Agrobacterium-mediated plant transformation method |
US20090100536A1 (en) | 2001-12-04 | 2009-04-16 | Monsanto Company | Transgenic plants with enhanced agronomic traits |
AU2003224897A1 (en) | 2002-04-09 | 2003-10-27 | Kenneth L. Beattie | Oligonucleotide probes for genosensor chips |
US8053232B2 (en) | 2004-01-23 | 2011-11-08 | Virxsys Corporation | Correction of alpha-1-antitrypsin genetic defects using spliceosome mediated RNA trans splicing |
US20050220796A1 (en) | 2004-03-31 | 2005-10-06 | Dynan William S | Compositions and methods for modulating DNA repair |
AU2006239169A1 (en) | 2005-04-28 | 2006-11-02 | Benitec, Limited. | Multiple-RNAi expression cassettes for simultaneous delivery of RNAi agents related to heterozygotic expression patterns |
US7892224B2 (en) | 2005-06-01 | 2011-02-22 | Brainlab Ag | Inverse catheter planning |
CN101273141B (zh) | 2005-07-26 | 2013-03-27 | 桑格摩生物科学股份有限公司 | 外源核酸序列的靶向整合和表达 |
WO2007106690A2 (en) | 2006-03-15 | 2007-09-20 | Siemens Healthcare Diagnostics Inc. | Degenerate nucleobase analogs |
WO2008093152A1 (en) * | 2007-02-01 | 2008-08-07 | Cellectis | Obligate heterodimer meganucleases and uses thereof |
ES2719789T3 (es) | 2007-03-02 | 2019-07-16 | Dupont Nutrition Biosci Aps | Cultivos con resistencia mejorada a fagos |
WO2010011961A2 (en) | 2008-07-25 | 2010-01-28 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Prokaryotic rnai-like system and methods of use |
US20100076057A1 (en) * | 2008-09-23 | 2010-03-25 | Northwestern University | TARGET DNA INTERFERENCE WITH crRNA |
US9404098B2 (en) | 2008-11-06 | 2016-08-02 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Method for cleaving a target RNA using a Cas6 polypeptide |
US20110016540A1 (en) | 2008-12-04 | 2011-01-20 | Sigma-Aldrich Co. | Genome editing of genes associated with trinucleotide repeat expansion disorders in animals |
CA2745031C (en) | 2008-12-04 | 2018-08-14 | Sangamo Biosciences, Inc. | Genome editing in rats using zinc-finger nucleases |
WO2010075424A2 (en) * | 2008-12-22 | 2010-07-01 | The Regents Of University Of California | Compositions and methods for downregulating prokaryotic genes |
US20110239315A1 (en) | 2009-01-12 | 2011-09-29 | Ulla Bonas | Modular dna-binding domains and methods of use |
US8889394B2 (en) | 2009-09-07 | 2014-11-18 | Empire Technology Development Llc | Multiple domain proteins |
CN102725412B (zh) | 2009-11-27 | 2017-09-22 | 巴斯夫植物科学有限公司 | 优化的内切核酸酶及其用途 |
US10087431B2 (en) | 2010-03-10 | 2018-10-02 | The Regents Of The University Of California | Methods of generating nucleic acid fragments |
MX2012013037A (es) | 2010-05-10 | 2013-07-29 | Univ California | Composiciones de endorribonucleasa y metodos de uso de las mismas. |
WO2011146121A1 (en) | 2010-05-17 | 2011-11-24 | Sangamo Biosciences, Inc. | Novel dna-binding proteins and uses thereof |
KR101613612B1 (ko) | 2010-07-29 | 2016-04-20 | 다카라 바이오 가부시키가이샤 | 표적 염기를 검출하기 위한 rna를 함유한 프로브를 제조하기 위한 방법 |
US9081737B2 (en) | 2010-08-02 | 2015-07-14 | Integrated Dna Technologies, Inc. | Methods for predicting stability and melting temperatures of nucleic acid duplexes |
US9405700B2 (en) | 2010-11-04 | 2016-08-02 | Sonics, Inc. | Methods and apparatus for virtualization in an integrated circuit |
WO2012164565A1 (en) | 2011-06-01 | 2012-12-06 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Compositions and methods for downregulating prokaryotic genes |
US8555733B2 (en) | 2011-09-23 | 2013-10-15 | Airgas, Inc. | System and method for analyzing a refrigerant sample |
EP2591770B1 (en) | 2011-11-14 | 2016-03-16 | Silenseed Ltd | Compositions for siRNA delivery and methods of manufacturing and using same |
US8450107B1 (en) | 2011-11-30 | 2013-05-28 | The Broad Institute Inc. | Nucleotide-specific recognition sequences for designer TAL effectors |
GB201122458D0 (en) | 2011-12-30 | 2012-02-08 | Univ Wageningen | Modified cascade ribonucleoproteins and uses thereof |
BR112014021104B1 (pt) | 2012-02-29 | 2023-03-28 | Sangamo Biosciences, Inc | Proteína de fusão de ocorrência não natural compreendendo um domínio de ligação de dna de dedo de zinco manipulado que se liga a um gene htt, seu uso, método in vitro de modificação da expressão de um gene htt em uma célula, e método de geração de um sistema modelo para o estudo da doença de huntington |
WO2013141680A1 (en) * | 2012-03-20 | 2013-09-26 | Vilnius University | RNA-DIRECTED DNA CLEAVAGE BY THE Cas9-crRNA COMPLEX |
US9637739B2 (en) * | 2012-03-20 | 2017-05-02 | Vilnius University | RNA-directed DNA cleavage by the Cas9-crRNA complex |
DE202013012597U1 (de) * | 2012-10-23 | 2017-11-21 | Toolgen, Inc. | Zusammensetzung zum Spalten einer Ziel-DNA, umfassend eine für die Ziel-DNA spezifische guide-RNA und eine Cas-Protein-codierende Nukleinsäure oder ein Cas-Protein, sowie deren Verwendung |
PL3138910T3 (pl) | 2012-12-06 | 2018-01-31 | Sigma Aldrich Co Llc | Oparta na CRISPR modyfikacja i regulacja genomu |
WO2014093479A1 (en) | 2012-12-11 | 2014-06-19 | Montana State University | Crispr (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) rna-guided control of gene regulation |
US20140186843A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-07-03 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof |
WO2014093701A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-06-19 | The Broad Institute, Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, knock out libraries and applications thereof |
WO2014093694A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-06-19 | The Broad Institute, Inc. | Crispr-cas nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation in eukaryotes |
JP6552965B2 (ja) | 2012-12-12 | 2019-07-31 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド | 配列操作のための改善された系、方法および酵素組成物のエンジニアリングおよび最適化 |
EP3434776A1 (en) | 2012-12-12 | 2019-01-30 | The Broad Institute, Inc. | Methods, models, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof |
US20140189896A1 (en) * | 2012-12-12 | 2014-07-03 | Feng Zhang | Crispr-cas component systems, methods and compositions for sequence manipulation |
SG10201707569YA (en) | 2012-12-12 | 2017-10-30 | Broad Inst Inc | Delivery, Engineering and Optimization of Systems, Methods and Compositions for Sequence Manipulation and Therapeutic Applications |
PL2931898T3 (pl) | 2012-12-12 | 2016-09-30 | Le Cong | Projektowanie i optymalizacja systemów, sposoby i kompozycje do manipulacji sekwencją z domenami funkcjonalnymi |
US8697359B1 (en) | 2012-12-12 | 2014-04-15 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products |
MX2015007549A (es) | 2012-12-12 | 2017-01-20 | Broad Inst Inc | Modificaciones de sistemas, métodos y composiciones guía optimizadas para la manipulación de secuencias. |
WO2014099744A1 (en) | 2012-12-17 | 2014-06-26 | President And Fellows Of Harvard College | Rna-guided human genome engineering |
US10660943B2 (en) * | 2013-02-07 | 2020-05-26 | The Rockefeller University | Sequence specific antimicrobials |
WO2014165825A2 (en) * | 2013-04-04 | 2014-10-09 | President And Fellows Of Harvard College | Therapeutic uses of genome editing with crispr/cas systems |
RU2716421C2 (ru) | 2013-06-17 | 2020-03-11 | Те Брод Инститьют Инк. | Доставка, применение и применения в терапии систем crispr-cas и композиций для целенаправленного воздействия на нарушения и заболевания с использованием вирусных компонентов |
KR20160034901A (ko) | 2013-06-17 | 2016-03-30 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | 서열 조작에 최적화된 crispr-cas 이중 닉카아제 시스템, 방법 및 조성물 |
AU2014281026B2 (en) | 2013-06-17 | 2020-05-28 | Massachusetts Institute Of Technology | Delivery, engineering and optimization of tandem guide systems, methods and compositions for sequence manipulation |
EP3079726B1 (en) | 2013-12-12 | 2018-12-05 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using particle delivery components |
US20180141992A1 (en) * | 2014-11-06 | 2018-05-24 | President And Fellows Of Harvard College | Cells lacking b2m surface expression and methods for allogeneic administration of such cells |
-
2013
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Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2012149470A1 (en) * | 2011-04-27 | 2012-11-01 | Amyris, Inc. | Methods for genomic modification |
WO2013176772A1 (en) * | 2012-05-25 | 2013-11-28 | The Regents Of The University Of California | Methods and compositions for rna-directed target dna modification and for rna-directed modulation of transcription |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
CELL HOST MICROBE. (AUG 2012) VOL.12, ISSUE 2, P.177-186, SUPPLEMENTAL INFORMATION, JPN6018000047, ISSN: 0003715518 * |
NAT. BIOTECHNOL. (EPUB 2013-01-29) VOL.31, NO.3, P.233-239, SUPPLEMENTARY INFORMATION, JPN6018000044, ISSN: 0003944431 * |
Cited By (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2019162113A (ja) * | 2012-12-12 | 2019-09-26 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッ | 配列操作のためのCRISPR−Cas成分系、方法および組成物 |
US11041173B2 (en) | 2012-12-12 | 2021-06-22 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, engineering and optimization of systems, methods and compositions for sequence manipulation and therapeutic applications |
JP2021166513A (ja) * | 2012-12-12 | 2021-10-21 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド | 配列操作のためのCRISPR−Cas成分系、方法および組成物 |
JP7269990B2 (ja) | 2012-12-12 | 2023-05-09 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド | 配列操作のためのCRISPR-Cas成分系、方法および組成物 |
US11008588B2 (en) | 2013-06-17 | 2021-05-18 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, engineering and optimization of tandem guide systems, methods and compositions for sequence manipulation |
US11597949B2 (en) | 2013-06-17 | 2023-03-07 | The Broad Institute, Inc. | Optimized CRISPR-Cas double nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation |
US11155795B2 (en) | 2013-12-12 | 2021-10-26 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR-Cas systems, crystal structure and uses thereof |
US11407985B2 (en) | 2013-12-12 | 2022-08-09 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the CRISPR-Cas systems and compositions for genome editing |
US11591581B2 (en) | 2013-12-12 | 2023-02-28 | The Broad Institute, Inc. | Compositions and methods of use of CRISPR-Cas systems in nucleotide repeat disorders |
US11597919B2 (en) | 2013-12-12 | 2023-03-07 | The Broad Institute Inc. | Systems, methods and compositions for sequence manipulation with optimized functional CRISPR-Cas systems |
US11624078B2 (en) | 2014-12-12 | 2023-04-11 | The Broad Institute, Inc. | Protected guide RNAS (pgRNAS) |
US11578312B2 (en) | 2015-06-18 | 2023-02-14 | The Broad Institute Inc. | Engineering and optimization of systems, methods, enzymes and guide scaffolds of CAS9 orthologs and variants for sequence manipulation |
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