JP2021166513A - 配列操作のためのCRISPR−Cas成分系、方法および組成物 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】(a)少なくとも1つの核局在化シグナル(NLS)を含むS.pyogenes等のCas9タンパク質、又はCas9タンパク質をコードするポリヌクレオチド、及び(b)Cas9タンパク質によって認識されるプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)の5’に位置する真核細胞のゲノム配列を標的とするCRISPR−Cas系RNA、又はCRISPR−Cas系RNAをコードするポリヌクレオチド、を含むCRISPR−Cas系で真核細胞を処理することによってex vivo又はin vitroで得られ、CRISPR複合体によりゲノム配列が切断され1以上のヌクレオチドの挿入、削除又は置換を含む、エンジニアリングされた真核細胞又はその子孫を提供する。
【選択図】図2B
Description
本出願は、それぞれBroad参照番号BI−2011/008/WSGR整理番号44063−701.101、BI−2011/008/WSGR整理番号44063−701.102、Broad参照番号BI−2011/008/VP整理番号44790.01.2003、BI−2011/008/VP整理番号44790.02.2003およびBI−2011/008/VP整理番号44790.03.2003を有する米国仮特許出願第61/736,527号明細書、同第61/748,427号明細書、同第61/768,959号明細書、同第61/791,409号明細書および同第61/835,931号明細書の優先権を主張し、これらは全て標題SYSTEMS METHODS AND COMPOSITIONS FOR SEQUENCE MANIPULATIONであり、それぞれ2012年12月12日、2013年1月2日、2013年2月25日、2013年3月15日および2013年6月17日に出願されたものである。 米国仮特許出願第61/758,468号明細書;同第61/769,046号明細書;同第61/802,174号明細書;同第61/806,375号明細書;同第61/814,263号明細書;同第61/819,803号明細書および同第61/828,130号明細書が参照され、それぞれ、標題ENGINEERING AND OPTIMIZATION OF SYSTEMS,METHODS AND COMPOSITIONS FOR SEQUENCE MANIPULATIONであり、それぞれ、2013年1月30日;2013年2月25日;2013年3月15日;2013年3月28日;2013年4月20日;2013年5月6日および2013年5月28日に出願されたものである。それぞれ2013年6月17日に出願された米国仮特許出願第61/835,936号明細書、同第61/836,127号明細書、同第61/836,101号明細書、同第61/836,080号明細書、同第61/836,123号明細書および同第61/835,973号明細書も参照される。それぞれBroad参照番号BI−2011/008Aを有する米国仮特許出願第61/842,322号明細書および米国特許出願第14/054,414号明細書も参照され、標題CRISPR−CAS SYSTEMS AND METHODS FOR ALTERING EXPRESSION OF GENE PRODUCTSを有し、それぞれ2013年7月2日および2013年10月15日に出願されたものである。
本発明は、米国国立衛生研究所(National Institutes of Health)により助成されたNIHパイオニアアワードDP1MH100706のもと政府支援によりなされた。米国政府は本発明において一定の権利を有する。
ォラ病は、青年期において癲癇性発作として始まり得る進行性ミオクローヌス癲癇を特徴とする常染色体劣性病態である。この疾患の数例は、未だ同定されていない遺伝子の突然変異により引き起こされ得る。この疾患は、発作、筋痙攣、歩行困難、認知症、および最終的に死亡を引き起こす。現在、疾患進行に対して有効であることが証明されている治療は存在しない。癲癇に関連する他の遺伝子異常を、CRISPR−Cas系によりターゲティングすることもでき、基礎となる遺伝学は、Genetics of Epilepsy and Genetic Epilepsies,Giuliano Avanzini,Jeffrey L.Noebelsにより編集,Mariani Foundation Paediatric Neurology:20;2009)にさらに記載されている。
s I.Traboulsiにより編集,Oxford University Press,2012にさらに記載されているいくつかの遺伝子突然変異から生じる眼の異常を補正することができる。
はDMPK(筋緊張性異栄養症タンパク質キナーゼ)、FXN(フラタキシン)、ATX
N2(アタキシン2)が挙げられる。
例示的なII型CRISPR系は、4つの遺伝子Cas9、Cas1、Cas2、およびCsn1のクラスター、ならびに2つの非コードRNAエレメント、tracrRNAおよび非反復配列の短いストレッチ(スペーサー、それぞれ約30bp)により間隔が空いている反復配列の特徴的アレイ(ダイレクトリピート)を含有する化膿性連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)SF370からのII型CRISPR遺伝子座である。この系において、ターゲティングされるDNA二本鎖切断(DSB)を4つの連続ステップにおいて生成する(図2A)。第1に、2つの非コードRNA、プレcrRNAアレイおよびtracrRNAがCRISPR遺伝子座から転写される。第2に、tracrRNAがプレcrRNAのダイレクトリピートにハイブリダイズし、次いでそれが個々のスペーサー配列を含有する成熟crRNAにプロセシングされる。第3に、成熟crRNA:tracrRNA複合体がCas9を、crRNAのスペーサー領域とプロトスペーサーDNAとの間のヘテロ二本鎖形成を介してプロトスペーサーおよび対応するPAMからなるDNA標的に指向する。最後に、Cas9は、PAMの上流の標的DNAの開裂を媒介してプロトスペーサー内でDSBを創成する(図2A)。この例は、このRNAプログラマブルヌクレアーゼ系を適応させて真核細胞の核中のCRISPR複合体活性を指向する例示プロセスを記載する。
ヒト胚腎臓(HEK)細胞系HEK293FT(Life Technologies)を、10%のウシ胎仔血清(HyClone)、2mMのGlutaMAX(Life Technologies)、100U/mLのペニシリン、および100μg/mLのストレプトマイシンが補給されたダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中で37℃において5%のCO2インキュベーションで維持した。マウスneuro2A(N2A)細胞系(ATCC)を、5%のウシ胎仔血清(HyClone)、2mMのGlutaMAX(Life Technologies)、100U/mLのペニシリン、および100μg/mLのストレプトマイシンが補給されたDMEMにより、37℃、5%のCO2で維持した。
HEK293FTまたはN2A細胞を、上記プラスミドDNAにより形質移入した。形質移入後、細胞を37℃において72時間インキュベートしてからゲノムDNAを抽出した。ゲノムDNAは、QuickExtractDNA抽出キット(Epicentre)を製造業者のプロトコルに従って使用して抽出した。手短に述べると、細胞をQuickExtract溶液中で再懸濁させ、65℃において15分間および98℃において10分間インキュベートした。抽出されたゲノムDNAを直ちに処理または−20℃において貯蔵した。
HEK293FTおよびN2A細胞を、プラスミドDNAにより形質移入し、37℃において72時間インキュベートしてから上記のとおりゲノムDNAを抽出した。相同組換え(HR)テンプレートのホモロジーアーム外側のプライマーを使用して標的ゲノム領域をPCR増幅した。PCR産物を1%のアガロースゲル上で分離し、MinElute GelExtraction Kit(Qiagen)により抽出した。精製産物をHindIII(Fermentas)により消化し、6%のNovex TBEポリアクリルアミドゲル(Life Technologies)上で分析した。
RNA二次構造予測は、Institute for Theoretical Chemistry at the University of Viennaにおいて開発されたオンラインウェブサーバーRNAfoldを使用し、セントロイド構造予測アルゴリズムを使用して実施した(例えば、A.R.Gruber et al.,2008,Cell 106(1):23−24;およびPA Carr and GM Church,2009,Nature Biotechnology 27(12):1151−62参照)。
CRISPR活性に十分な化膿性連鎖球菌(S.pyogenes)CRISPR遺伝子座1のエレメントを、pCRISPRプラスミドを使用して大腸菌(E.coli)中で再構成した(図10Aに模式的に説明する)。pCRISPRは、tracrRNA、SpCas9、およびcrRNAアレイをドライブするリーダー配列を含有した。スペーサー(「ガイド配列」とも称される)を、説明のとおりアニールされたオリゴヌクレオチドを使用してcrRNAアレイ中にBsaI部位間で挿入した。干渉アッセイにおいて使用されるチャレンジプラスミドは、プロトスペーサー(「標的配列」とも称される)配列を、隣接CRISPRモチーフ配列(PAM)とともにpUC19中に挿入することにより構築した(図10B参照)。チャレンジプラスミドは、アンピシリン耐性を含有した。図10Cは、干渉アッセイの模式的表示を提供する。既にpCRISPRおよび適切なスペーサーを担持する化学コンピテント大腸菌(E.coli)株を、対応するプロトスペーサー−PAM配列を含有するチャレンジプラスミドにより形質転換した。pUC19を使用してそれぞれのpCRISPR担持コンピテント株の形質転換効率を評価した。CRISPR活性は、プロトスペーサーを担持するpPSPプラスミドの開裂をもたらし、そうでなければプロトスペーサーを欠くpUC19により付与されるアンピシリン耐性を除外した。図10Dは、図4Cに説明されるアッセイにおいて使用されたそれぞれのpCRISPR担持大腸菌(E.coli)株のコンピテンスを説明する。
HEK293FT細胞を上記のとおり維持および形質移入した。細胞をトリプシン処理により回収し、次いでリン酸緩衝生理食塩水(PBS)中で洗浄した。トータル細胞RNAをTRI試薬(Sigma)により製造業者のプロトコルに従って抽出した。抽出されたトータルRNAをNaonodrop(Thermo Scientific)を使用して定量し、同一濃度に正規化した。
RNAを等容量の2×ローディング緩衝液(Ambion)と混合し、95℃に5分間加熱し、氷上で1分間冷蔵し、次いで8%の変性ポリアクリルアミドゲル(SequaGel,National Diagnostics)上に、少なくとも30分間のゲルのプレラン後にロードした。試料を40W限界において1.5時間電気泳動した。その後、RNAをHybond N+メンブレン(GE Healthcare)に300mAにおいてセミドライ転写装置(Bio−rad)中で室温において1.5時間転写した。Stratagene UV CrosslinkerのStratalinker(Stratagene)上のオートクロスリンクボタンを使用してRNAをメンブレンに架橋させた。メンブレンをULTRAhyb−オリゴハイブリダイゼーション緩衝液(Ambion)中で回転させながら42℃において30分間プレハイブリダイズさせ、次いでプローブを添加し、一晩ハイブリダイズさせた。プローブはIDTに発注し、T4ポリヌクレオチドキナーゼ(New England Biolabs)を用いて[ガンマ−32P]ATP(Perkin Elmer)により標識した。メンブレンを予備加温(42℃)された2×SSC、0.5%のSDSにより1分間1回洗浄し、次いで42℃において30分間2回洗浄した。メンブレンを蛍光スクリーンに室温において1時間または一晩曝露させ、次いでphosphorimager(Typhoon)によりスキャンした。
tracrRNA、Cas9、およびリーダーを含むCRISPR遺伝子座エレメントを、化膿性連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)SF370ゲノムDNAから、ギブソン・アセンブリ(Gibson Assembly)のためのフランキングホモロジーアームを用いてPCR増幅した。2つのBsaI IIS型部位を2つのダイレクトリピート間に導入してスペーサーの容易な挿入を促進した(図9)。Gibson Assembly Master Mix(NEB)を使用してPCR産物をEcoRV消化pACYC184中にtetプロモーターの下流でクローニングした。Csn2の最後の50bpは除き、他の内因性CRISPR系エレメントは除外した。相補的オーバーハングを有するスペーサーをコードするオリゴ(Integrated DNA Technology)をBsaI消化ベクターpDC000(NEB)中にクローニングし、次いでT7リガーゼ(Enzymatics)によりライゲートしてpCRISPRプラスミドを生成した。PAM配列(本明細書において「CRISPRモチーフ配列」とも称される)を有するスペーサーを含有するチャレンジプラスミドを、同等のオーバーハングを担持するハイブリダイズされたオリゴ(Integrated DNA Technology)をBamHI消化pUC19中にライゲートすることにより創成した。全ての構築物のためのクローニングは、大腸菌(E.coli)株JM109(Zymo Research)中で実施した。
配列特異的DNA開裂をプログラミングするためにRNAを使用する技能は、種々の研究および産業用途のための新たなクラスのゲノムエンジニアリングツールを定義する。CRISPR系のいくつかの態様は、CRISPRターゲティングの効率および多用途性を増加させるようにさらに改善することができる。最適なCas9活性は、哺乳動物核中に存在するものよりも高いレベルにおけるフリーMg2+の利用可能性に依存し得(例えば、Jinek et al.,2012,Science,337:816参照)、プロトスペーサーのすぐ下流のNGGモチーフについての優先性は、ヒトゲノム中で平均12bpごとでターゲティング能を制限する(図11、ヒト染色体配列のプラスおよびマイナス鎖の両方を評価)。これらの拘束の一部は、微生物メタゲノムにわたるCRISPR遺伝子座の多様性を利用することにより克服することができる(例えば、Makarova et al.,2011,Nat Rev Microbiol,9:467参照)。他のCRISPR遺伝子座を、実施例1に記載のものと同様の方法により哺乳動物細胞環境中に移植することができる。例えば、図12は、CRISPR媒介ゲノム編集を達成するための哺乳動物細胞中の異種発現のためのストレプトコッカス・サーモフィラス(Streptococcus thermophilus)LMD−9のCRISPR1からのII型CRISPR系の適応を説明する。図12Aは、S.サーモフィラス(S.thermophilus)LMD−9のCRISPR1の模式的説明を提供する。図12Bは、S.サーモフィラス(S.thermophilus)CRISPR系のための発現系の設計を説明する。ヒトコドン最適化hStCas9を、構成的EF1αプロモーターを使用して発現させる。tracrRNAおよびcrRNAの成熟バージョンを、U6プロモーターを使用して発現させて正確な転写開始を促進する。成熟crRNAおよびtracrRNAからの配列を説明する。crRNA配列中の小文字「a」により示される単一塩基を使用してRNApolIII転写ターミネーターとして機能するポリU配列を除去する。図12Cは、ヒトEMX1遺伝子座ターゲティングするガイド配列を示す模式図およびそれらの予測二次構造を提供する。それぞれの標的部位における改変効率を、RNA二次構造の下方に示す。この構造を生成するアルゴリズムは、それぞれの塩基を予測二次構造を仮定するその確率に従って着色し、これを図12Cにグレースケールで再現されるレインボースケールにより示す。図12Dは、Surveyorアッセイを使用する標的遺伝子座中のhStCas9媒介開裂の結果を示す。RNAガイドスペーサー1および2は、それぞれ14%および6.4%を誘導した。これらの2つのプロトスペーサー部位における生物学的複製物にわたる開裂活性の統計分析も図6に提供する。図16は、ヒトEMX1遺伝子座中のS.サーモフィラス(S.thermophilus)CRISPR系の追加のプロトスペーサーおよび対応するPAM配列標的の模式図を提供する。2つのプロトスペーサー配列を強調し、NNAGAAWモチーフを満たすそれらの対応するPAM配列を対応する強調配列に対して3’側で下線を付けることにより示す。両方のプロトスペーサーは、アンチセンス鎖をターゲティングする。
規定のCRISPR酵素についての所望のガイド配列長およびCRISPRモチーフ配列(PAM)に基づきインプットDNA配列の両方の鎖上の候補CRISPR標的配列を同定するためのソフトウェアプログラムを設計する。例えば、化膿性連鎖球菌(S.pyogenes)からのCas9についての標的部位は、PAM配列NGGを用いて、インプット配列およびインプットの逆相補鎖の両方の上の5’−Nx−NGG−3’を探索することにより同定することができる。同様に、S.サーモフィラス(S.thermophilus)CRISPR1のCas9についての標的部位は、PAM配列NNAGAAWを用いて、インプット配列およびインプットの逆相補鎖の両方の上の5’−Nx−NNAGAAW−3’を探索することにより同定することができる。同様に、S.サーモフィラス(S.thermophilus)CRISPR3のCas9についての標的部位は、PAM配列NGGNGを用いて、インプット配列およびインプットの逆相補鎖の両方の上の5’−Nx−NGGNG−3’を探索することにより同定することができる。Nx中の値「x」は、プログラムにより固定し、または使用者により規定することができ、例えば、20である。
本実施例は、異なる長さの野生型tracrRNA配列を取り込むtracr配列を有するキメラRNA(chiRNA;ガイド配列、tracrメイト配列、およびtracr配列を単一転写物中で含む)について得られた結果を記載する。図18aは、キメラRNAおよびCas9のためのバイシストロニック発現ベクターの模式図を説明する。Cas9はCBhプロモーターによりドライブされ、キメラRNAはU6プロモーターによりドライブされる。キメラガイドRNAは、からなる。示される種々の位置においてトランケートされたtracr配列(下方の鎖の最初の「U」から転写物の末端に及ぶ)に結合している20bpのガイド配列(N)からなる。ガイドおよびtracr配列は、tracrメイト配列GUUUUAGAGCUAと、それに続くループ配列GAAAにより離隔
している。ヒト遺伝子座EMX1およびPVALB遺伝子座におけるCas9媒介インデルについてのSURVEYORアッセイの結果を、それぞれ図18bおよび18cに説明する。矢印は、予測SURVEYOR断片を示す。chiRNAをそれらの「+n」表記により示し、crRNAは、ガイドおよびtracr配列が別個の転写物として発現されるハイブリッドRNAを指す。トリプリケートで実施されたこれらの結果の定量を、図19aおよび19bにヒストグラムにより示し、それぞれ図18bおよび18cに対応する(「N.D.」は、インデルが検出されなかったことを示す)。プロトスペーサーIDおよびそれらの対応するゲノム標的、プロトスペーサー配列、PAM配列、および鎖局在を表Dに提供する。ガイド配列は、ハイブリッド系における別個の転写物の場合、プロトスペーサー配列全体に相補的であるように、またはキメラRNAの場合、下線部にのみ相補的であるように設計した。
ヒト胚腎臓(HEK)細胞系293FT(Life Technologies)を、10%のウシ胎仔血清(HyClone)、2mMのGlutaMAX(Life Technologies)、100U/mLのペニシリン、および100μg/mLのストレプトマイシンが補給されたダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中で37℃において5%のCO2インキュベーションで維持した。293FT細胞を24ウェルプレート(Corning)上に、形質移入24時間前に1ウェル当たり150,000個の細胞の密度において播種した。Lipofectamine2000(Life Technologies)を製造業者の推奨プロトコルに従って使用して細胞を形質移入した。24ウェルプレートのそれぞれのウェルについて、合計500ngのプラスミドを使用した。
293FT細胞を上記プラスミドDNAにより形質移入した。細胞を37℃において形質移入後72時間インキュベートしてからゲノムDNAを抽出した。ゲノムDNAは、QuickExtract DNA Extraction Solution(Epicentre)を製造業者のプロトコルに従って使用して抽出した。手短に述べると、ペレット化細胞をQuickExtract溶液中で再懸濁させ、65℃において15分間および98℃において10分間インキュベートした。それぞれの遺伝子についてのCRISPR標的部位をフランキングするゲノム領域を、PCR増幅し(表Eに列記のプライマー)、QiaQuick Spin Column(Qiagen)を製造業者のプロトコルに従って使用して産物を精製した。合計400ngの精製PCR産物を2μlの10×Taq DNA Polymerase PCR緩衝液(Enzymatics)と混合し、超純水で20μlの最終容量とし、リアニーリングプロセスに供してヘテロ二本鎖形成を可能とした:95℃において10分間、−2℃/秒における傾斜で95℃から85℃、−0.25℃/秒における85℃から25℃、および25℃において1分間維持。リアニーリング後、産物をSURVEYORヌクレアーゼおよびSURVEYORエンハンサーS(Transgenomics)により製造業者の推奨プロトコルに従って処理し、
4〜20%のNovex TBEポリアクリルアミドゲル(Life Technologies)上で分析した。ゲルをSYBR Gold DNA染色(Life Technologies)により30分間染色し、Gel Docゲルイメージングシステム(Bio−rad)によりイメージングした。定量は、相対バンド強度に基づくものであった。
ヒト、マウス、ラット、ゼブラフィッシュ、ミバエ、および線虫(C.elegans)ゲノム中の化膿性連鎖球菌(S.pyogenes)SF370Cas9(SpCas9)酵素についてのユニーク標的部位を同定するため、本出願人らは、DNA配列の両方の鎖をスキャンし、考えられる全てのSpCas9標的部位を同定するためのソフトウェアパッケージを開発した。この実施例について、それぞれのSpCas9標的部位を20bp配列と、それに続くNGGプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列として操作上定義し、本出願人らは、全ての染色体上のこの5’−N20−NGG−3’定義を満たす全ての配列を同定した。非特異的ゲノム編集を防止するため、全ての潜在的な部位を同定した後、全ての標的部位をそれらが関連参照ゲノム中で出現する回数に基づきフィルタリングした。例えば、PAM配列から5’側の約11〜12bp配列であり得る「シード」配列により付与されるCas9活性の配列特異性を利用するため、5’−NNNNNNNNNN−NGG−3’配列を関連ゲノム中でユニークであると選択した。全てのゲノム配列をUCSCゲノムブラウザからダウンロードした(ヒトゲノムhg19、マウスゲノムmm9、ラットゲノムrn5、ゼブラフィッシュゲノムdanRer7、キイロショウジョウバエ(D.melanogaster)ゲノムdm4および線虫(C.elegans)ゲノムce10)。全探索結果は、UCSCゲノムブラウザ情報を使用して閲覧利用可能である。ヒトゲノム中の一部の標的部位の例示的可視化を図21に提供する。
列を有するSpCas9を含むキメラRNAの発現のための例示的なバイシストロニック
発現ベクターを説明する。SpCas9は、CBhプロモーターから発現され、bGHポ
リAシグナル(bGHpA)により終結される。模式図の直下に説明される拡大配列は、
ガイド配列挿入部位を包囲する領域に対応し、5’から3’でU6プロモーターの3’部分(最初の陰影領域)、BbsI開裂部位(矢印)、部分ダイレクトリピート(tracrメイト配列GTTTTAGAGCTA、下線付き)、ループ配列GAAA、および+85tracr配列(ループ配列後の下線付き配列)を含む。例示的なガイド配列インサートを、ガイド配列挿入部位の下方に説明し、選択される標的についてのガイド配列のヌクレオチドを「N」により表す。
U6−短鎖tracrRNA(化膿連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)SF370):
本出願人らは、CRISPR関連エンドヌクレアーゼCas9を使用して肺炎連鎖球菌(Streptococcus pneumoniae)および大腸菌(Escherichia coli)のゲノム中に正確な突然変異を導入した。このアプローチは、非突然変異細胞を殺傷するためのターゲティングされる部位におけるCas9指向開裂に依存し、選択可能なマーカーまたはカウンターセレクション系の必要性を回避した。Cas9特異性は、編集テンプレート上で担持される単一および多ヌクレオチド変化を作製するように短鎖CRISPR RNA(crRNA)配列を変化させることによりリプログラミングした。2つのcrRNAの同時使用により、複数の突然変異導入が可能になった。肺炎連鎖球菌(S.pneumoniae)において、Cas9開裂から生存した細胞のほぼ100%が、所望の突然変異を含有し、大腸菌(E.coli)におけるリコンビニアリングとの組合せで使用された場合は65%が所望の突然変異を含有した。本出願人らは、もっぱら、ターゲティング可能な配列の範囲を定義するためのCas9標的要件を徹底的に分析し、それらの要件に合致しない編集部位のための方針を示し、このことは、細菌ゲノムエンジニアリングのためのこの技術の多用途性を示唆した。
肺炎連鎖球菌(S.pneumoniae)株crR6は、バクテリオファージφ8232.5中に存在する標的配列を開裂するCas9ベースCRISPR系を含有する。この標的を第2の株R68232.5のsrtA染色体遺伝子座中にインテグレートした。PAM領域中の突然変異を含有する変化標的配列を第3の株R6370.1のsrtA遺伝子座中にインテグレートし、この株をCRISPR開裂に対して「免疫性」とした(図28a)。本出願人らは、R68232.5およびR6370.1細胞をcrR6細胞からのゲノムDNAにより形質転換し、R68232.5細胞の良好な形質転換が標的遺伝子座の開裂および細胞死をもたらすはずであることを予測した。この予測とは逆に、本出願人らは、R6370.1形質転換体よりも約10倍小さい効率にもかかわらず、R68232.5形質転換体を単離した(図28b)。8つのR68232.5形質転換体の遺伝子分析(図28)により、大多数は、φ8232.5標的をCas9認識に要求されるプロトスペーサーを含有しないcrR6ゲノム野生型srtA遺伝子座により置き換えることによりCas9ターゲティングの毒性を排除する二重組換えイベントの産物であることが明らかになった。これらの結果は、ゲノム遺伝子座をターゲティングするCRISPR系(ターゲティング構築物)の、ターゲティングされる遺伝子座中への組換えのためのテンプレート(編集テンプレート)と一緒の同時導入はターゲティングされるゲノム編集をもたらす証明であった(図23a)。
、ギブソン・アセンブリのためのフランキングホモロジーアームを用いて化膿性連鎖球菌
(Streptococcos pyogenes)SF370ゲノムDNAから増幅し
た。tracrRNAおよびCas9は、オリゴHC008およびHC010を用いて増幅した。リーダーおよびCRISPR配列は、スペーサーの容易な挿入を促進するために2つのBsaI IIS型部位が2つのダイレクトリピート間に導入されるようにHC011/HC014およびHC015/HC009を用いて増幅した。
DNAをPromega Wizardキットにより抽出した。プライマーB250/B251を使用して標的領域を増幅した。PCR産物をタグ化し、1つのIllumina MiSeqペアエンドレーン上で300サイクルを使用して流した。
ランダム化PAM:ランダム化PAM実験について、crR6について3,429,406リード、R6について3,253,998リードが得られた。これらの半数のみがPAM標的に対応する一方、他の半数がPCR産物の他の末端をシーケンシングすることが予測される。crR6リードの1,623,008およびR6リードの1,537,131は、エラーのない標的配列を担持した。これらのリードの中のそれぞれの考えられるPAMの発生率を補足ファイルに示す。PAMの機能性を推定するため、R6試料に対するcrR6試料中のその相対比率を計算し、rijklm(式中、I、j、k、l、mは、4つの考えられる塩基の1つである)で示す。以下の統計モデルを構築した:
log(rijklm)=μ+b2i+b3j+b4k+b2b3i,j+b3b4j,
k+εijklm
(式中、εは、残差であり、b2は、PAMの第2の塩基の効果であり、b3は、第3の塩基の効果であり、b4は、第4の塩基の効果であり、b2b3は、第2の塩基と第3の塩基との間の相互作用であり、b3b4は、第3の塩基と第4の塩基との間の相互作用である)。分散分析を実施した。
NAGNNパターンは、全ての他のパターンと有意に異なるが、NGGNNよりもかなり少ない効果を有する(以下のテューキーのHSD検定参照)。
ランダム化標的実験について、crR6について540,726リードが、R6について753,570リードが得られた。上記のとおり、リードの半数のみがPCR産物の目的末端をシーケンシングすることが予測される。エラーフリーまたは単一の点突然変異を有する標的を担持するリードをフィルタリングした後、crR6およびR6についてそれぞれ217,656および353,141リードが残存した。R6試料に対するcrR6試料におけるそれぞれの突然変異体の相対比率を計算した(図24c)。シード配列の外側(PAMから13〜20塩基離れている)の全ての突然変異は、完全干渉を示す。これらの配列を参照として使用してシード配列の内側の他の突然変異が干渉を有意に破壊し得ると考えられるか否かを決定した。MASS Rパッケージのfitdistr関数を使用して正規分布をこれらの配列にフィットさせた。フィットされた分布の0.99分位点を図24cに点線として示す。図72は、フィットされた正規分布(黒線)および0.99分位点(点線)を有するデータ密度のヒストグラムを示す。
本出願人らは、tracrRNAおよびダイレクトリピート配列を突然変異させ、またはキメラガイドRNAを突然変異させて細胞中のRNAを向上させた。
最適化tracrRNA1(下線は突然変異):
元のガイドRNA:
本出願人らは、図4に示されるガイドキメラRNAを設計した。
CRISPR−Cas系は、細菌から古細菌にわたる多様な種により用いられる侵入外因性DNAに対する適応免疫機序である。II型CRISPR−Cas9系は、CRISPR遺伝子座中への外来DNAの「獲得」を担うタンパク質をコードする遺伝子のセット、およびDNA開裂機序の「実行」をコードする遺伝子のセットからなり;これらは、DNAヌクレアーゼ(Cas9)、非コードトランス活性化crRNA(tracrRNA)、およびダイレクトリピートによりフランキングされている外来DNA由来スペーサーのアレイ(crRNA)を含む。Cas9による成熟時、tracRNAおよびcrRNA二本鎖は、Cas9ヌクレアーゼをスペーサーガイド配列により規定される標的DNA配列にガイドし、開裂に要求され、それぞれのCRISPR−Cas系に特異的な標的DNA中の短鎖配列モチーフ付近のDNAの二本鎖切断を媒介する。II型CRISPR−Cas系は、細菌界全体にわたり見出されており、Cas9タンパク質配列およびサイズ、tracrRNAおよびcrRNAダイレクトリピート配列、それらのエレメントのゲノム構成、および標的開裂のためのモチーフ要件は高度に多様である。ある種は、複数の区別されるCRISPR−Cas系を有し得る。
細胞培養および形質移入
ヒト胚腎臓(HEK)細胞系293FT(Life Technologies)を、10%のウシ胎仔血清(HyClone)、2mMのGlutaMAX(Life Technologies)、100U/mLのペニシリン、および100μg/mLのストレプトマイシンが補給されたダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)中で37℃において5%のCO2インキュベーションで維持した。
293FT細胞を上記のとおりプラスミドDNAにより形質移入した。細胞を37℃において形質移入後72時間インキュベートしてからゲノムDNAを抽出した。ゲノムDNAは、QuickExtract DNA Extraction Solution(Epicentre)を製造業者のプロトコルに従って使用して抽出した。手短に述べると、ペレット化細胞をQuickExtract溶液中で懸濁させ、65℃において15分間および98℃において10分間インキュベートした。
ノザンブロットを、上記のとおり実施した。手短に述べると、RNAを95℃に5分間加熱してから8%の変性ポリアクリルアミドゲル(SequaGel,National Diagnostics)上にロードした。その後、RNAを事前にハイブリダイズさせたHybond N+メンブレン(GE Healthcare)に転写し、Stratagene UV Crosslinker(Stratagene)により架橋した。プローブをT4ポリヌクレオチドキナーゼ(New England Biolabs)を用いて[ガンマ−32P]ATP(Perkin Elmer)により標識した。洗浄後、メンブレンを蛍光スクリーンに1時間曝露し、phosphorimager(Typhoon)によりスキャンした。
HEK293FT細胞を、上記のとおりCas9により形質移入した。ゲノムDNAをDNeasy Blood&Tissue Kit(Qiagen)により単離し、バイサルファイトをEZ DNA Methylation−Lightning Kit(Zymo Research)により変換した。バイサルファイトPCRは、Bisulfite Primer Seekerを使用して設計されたプライマー(Zymo Research、表JおよびK)を用いてKAPA2G Robust HotStart DNA Polymerase(KAPA Biosystems)を使用して実施した。得られたPCRアンプリコンをゲル精製し、EcoRIおよびHindIIIにより消化し、形質転換前にpUC19骨格中にライゲートした。次いで、個々のクローンをサンガーシーケンシングしてDNAメチル化状態を評価した。
HEK293FT細胞を上記のとおりCas9により形質移入した。次いで、ホールセル溶解物を、Protease Inhibitor Cocktail(Roche)が補給された溶解緩衝液(20mMのHEPES、100mMのKCl、5mMのMgCl2、1mMのDTT、5%のグリセロール、0.1%のTriton X−100)を用いて調製した。カスタムオリゴ(実施例10)およびHiScribe T7 In Vitro Transcription Kit(NEB)を製造業者の推奨プロトコルに従って使用してT7によりドライブされるsgRNAをインビトロで転写させた。メチル化標的部位を調製するため、pUC19プラスミドをM.SssIによりメチル化し、次いでNheIにより線形化した。インビトロ開裂アッセイを以下のとおり実施した:20uLの開裂反応物について、10uLの細胞溶解物を2uLの開裂緩衝液(100mMのHEPES、500mMのKCl、25mMのMgCl2、5mMのDTT、25%のグリセロール)、インビトロ転写されたRNA、300ngのpUC19プラスミドDNAとともにインキュベートした。
96ウェルプレート中でプレーティングされたHEK293FT細胞を、Cas9プラスミドDNAおよび単一ガイドRNA(sgRNA)PCRカセットにより72時間形質移入してからゲノムDNAを抽出した(図72)。それぞれの遺伝子についてのCRISPR標的部位をフランキングするゲノム領域を、融合PCR法により増幅してIllum
ina P5アダプターおよびユニークな試料特異的バーコードを標的アンプリコン(図73に記載の模式図)に付着させた(図74、図80(実施例10)。PCR産物は、EconoSpin96ウェルFilter Plates(Epoch Life Sciences)を製造業者の推奨プロトコルに従って使用して精製した。
MiSeqリードは、少なくとも23の平均Phredクオリティ(Qスコア)ならびにバーコードおよびアンプリコンフォワードプライマーとの完全配列マッチを要求することによりフィルタリングした。オンおよびオフターゲット遺伝子座からのリードは、標的部位の上流および下流の50ヌクレオチド(合計120bp)を含むアンプリコン配列に対してSmith−Watermanアラインメントを最初に実施することにより分析した。その一方、アラインメントを標的部位の上流の5ヌクレオチドから下流の5ヌクレオチド(合計30bp)のインデルについて分析した。これらのアラインメントの一部がMiSeqリード自体の外側に収まる場合、またはマッチした塩基対がそれらの全長の85%未満を含む場合に分析された標的領域を廃棄した。
24ウェルプレート中でプレーティングされた293FT細胞を、上記のとおり形質移入した。形質移入72時間後、トータルRNAをmiRNeasy Micro Kit(Qiagen)により回収した。sgRNAについての逆鎖合成は、qScript Flex cDNAキット(VWR)およびカスタム第1鎖合成プライマー(表JおよびK)を用いて実施した。qPCR分析は、GAPDHを内因性対照として使用してFast SYBR Green Master Mix(Life Technologies)およびカスタムプライマー(表JおよびK)を用いて実施した。相対定量をΔΔCT法により算出した。
全ての配列は、5’から3’方向である。U6転写のため、下線付きのTのストリングが転写ターミネーターとして機能する。
>U6−短鎖tracrRNA(化膿性連鎖球菌(Streptococcus pyogenes)SF370)
オリゴ相同組換え試験は、異なるCas9バリアントおよび異なるHRテンプレート(オリゴ対プラスミド)にわたる効率の比較である。
近年の大規模シーケンシング構想は、疾患に関連する多数の遺伝子を生じさせた。遺伝子の発見は、その遺伝子が何であるか、およびいかにそれが疾患表現型をもたらすのかの理解の始まりにすぎない。候補遺伝子を研究するための現在の技術およびアプローチは、緩慢で煩雑である。代表的な基準である遺伝子ターゲティングおよび遺伝子ノックアウトは、金銭および研究人材の両方の観点から時間および資源のかなりの投資を要求する。本出願人らは、hSpCas9ヌクレアーゼを利用して多くの標的遺伝子をターゲティングし、任意の他の技術と比較して高い効率および低いターンアラウンドでそれを行うように設定した。hSpCas9の高い効率のため、本出願人らは、RNAインジェクションをマウス接合子中に行い、mESCにおけるいかなる予備遺伝子ターゲティングを行うことも必要とせずにゲノム改変動物を直ちに得ることができる。
つのgRNAを設計した。ノックアウトは、hSpCas9ヌクレアーゼが二本鎖切断、
およびエラープローンDNA修復経路、非相同末端結合を作製し、切断を補正し、突然変
異を創成した後に生じる。最も可能性が高い結果は、遺伝子をノックアウトするフレーム
シフト突然変異である。ターゲティング方針は、PAM配列NGGを有し、ゲノム中でユ
ニークな遺伝子のエキソン中のプロトスペーサーを見出すことを含んだ。遺伝子に最も有
害である第1のエキソン中のプロトスペーサーを優先した。
図67は、転写活性化活性を有するCRISPR−TF(転写因子)の設計を示す。キメラRNAをU6プロモーターにより発現させる一方、3つのNLSおよびVP64機能ドメインに作動可能に結合しているCas9タンパク質のヒトコドン最適化二重突然変異体バージョン(hSpCas9m)をEF1aプロモーターにより発現させる。二重突然変異D10AおよびH840Aにより、cas9タンパク質がいかなる開裂も導入し得なくなるが、キメラRNAによりガイドされた場合に標的DNAに結合するその能力は維持された。
293FT細胞を、2つの成分を含有するプラスミドにより形質移入した:(1)異なるNLS設計を有するCas9(野生型ヒトコドン最適化SpCas9)の発現をドライブするEF1aプロモーター(2)ヒトEMX1遺伝子座をターゲティングする同一キメラRNAをドライブするU6プロモーター。
Cas9を送達する方法
NAをドライブするT7プロモーターを含有するベクターを使用して送達する。
Chlamydomonas Resource Centerからのコナミドリムシ(Chlamydomonas reinhardtii)株CC−124およびCC−125を、エレクトロポレーションに使用する。エレクトロポレーションプロトコルは、GeneArt Chlamydomonas Engineeringキットからの標準的な推奨プロトコルに従う。
pChlamy1−Cas9:
転写を人工的に制御する技能は、遺伝子機能の研究および所望の特性を有する合成遺伝子ネットワークの構築の両方に不可欠である。本出願人らは、本明細書において、プログラマブル転写リプレッサーとしてのRNAによりガイドされるCas9タンパク質の使用を記載する。
1.1つ以上のベクターを含むベクター系であって、
a.traerメイト配列およびガイド配列をtraerメイト配列の上流に挿入するための1つ以上の挿入部位に作動可能に結合している第1の調節エレメント(ガイド配列は、発現された場合、真核細胞中の標的配列へのCRISPR複合体の配列特異的結合を指向し、CRISPR複合体は、(1)標的配列にハイブリダイズされるガイド配列、および(2)traer配列にハイブリダイズされるtraerメイト配列と複合体形成しているCRISPR酵素を含む);ならびに
b.核局在化配列を含む前記CRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント
を含み;
成分(a)および(b)は、系の同一または異なるベクター上にある
ベクター系。
b.核局在化配列を含む前記CRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント
を含む真核宿主細胞。
a.traerメイト配列およびガイド配列をtraerメイト配列の上流に挿入するための1つ以上の挿入部位に作動可能に結合している第1の調節エレメント(ガイド配列は、発現された場合、真核細胞中の標的配列へのCRISPR複合体の配列特異的結合を指向し、CRISPR複合体は、(1)標的配列にハイブリダイズされるガイド配列、および(2)traer配列にハイブリダイズされるtraerメイト配列と複合体形成しているCRISPR酵素を含む);ならびに/または
b.核局在化配列を含む前記CRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント
を含むキット。
a.前記核酸配列を受容および/または保存するように構成された記憶装置;および
b.(i)前記核酸配列内のCRISPRモチーフ配列を局在化し、(ii)前記局在化されたCRISPRモチーフ配列に隣接する配列を、CRISPR複合体が結合する候補標的配列として選択するようにプログラミングされた単独または組合せにおける1つ以上のプロセッサ
を含むシステム。
のコンピュータシステム。
メイト配列に結合している方法。
a.1つ以上のベクターを真核細胞に導入すること(1つ以上のベクターは、CRISPR酵素、traerメイト配列に結合しているガイド配列、およびtraer配列の1つ以上の発現をドライブする);および
b.CRISPR複合体を標的ポリヌクレオチドに結合させて前記疾患遺伝子内の標的ポリヌクレオチドの開裂を生じさせ(CRISPR複合体は、(1)標的ポリヌクレオチド内の標的配列にハイブリダイズされるガイド配列、および(2)traer配列にハイブリダイズされるtraerメイト配列と複合体形成しているCRISPR酵素を含む)、それにより、突然変異疾患遺伝子を含むモデル真核細胞を生成することを含む方法。
a.試験化合物を、段落86〜90のいずれか1つに記載のモデル細胞と接触させること;および
b.前記疾患遺伝子中の前記突然変異に関連する細胞シグナリングイベントの低減または増大を示すリードアウトの変化を検出し、それにより、前記疾患遺伝子に関連する前記細胞シグナリングイベントをモジュレートする前記生物活性剤を開発することを含む方法。
えポリヌクレオチド。
1.Urnov,F.D.,Rebar,E.J.,Holmes,M.C.,Zhang,H.S.&Gregory,P.D.Genome editing with engineered zinc finger nucleases.Nat.Rev.Genet.11,636−646(2010).
2.Bogdanove,A.J.&Voytas,D.F.TAL effectors:customizable proteins for DNA targeting.Science 333,1843−1846(2011).
3.Stoddard,B.L.Homing endonuclease structure and function.Q.Rev.Biophys.38,49−95(2005).
4.Bae,T.&Schneewind,O.Allelic replacement in Staphylococcus aureus with inducible counter−selection.Plasmid 55,58−63(2006).
5.Sung,C.K.,Li,H.,Claverys,J.P.&Morrison,D.A.An rpsL cassette,janus,for gene replacement through negative selection in Streptococcus pneumoniae.Appl.Environ.Microbiol.67,5190−5196(2001).
6.Sharan,S.K.,Thomason,L.C.,Kuznetsov,S.G.&Court,D.L.Recombineering:a homologous recombination−based method of genetic engineering.Nat.Protoc.4,206−223(2009).
7.Jinek,M.et al.A programmable dual−RNA−guided DNA endonuclease in adaptive bacterial immunity.Science 337,816−821(2012).
8.Deveau,H.,Garneau,J.E.&Moineau,S.CRISPR/Cas system and its role in phage−bacteria interactions.Annu.Rev.Microbiol.64,475−493(2010).
9.Horvath,P.&Barrangou,R.CRISPR/Cas,the immune system of bacteria and archaea.Science 327,167−170(2010).
10.Terns,M.P.&Terns,R.M.CRISPR−based adaptive immune systems.Curr.Opin.Microbiol.14,321−327(2011).
11.van der Oost,J.,Jore,M.M.,Westra,E.R.,Lundgren,M.&Brouns,S.J.CRISPR−based adaptive and heritable immunity in prokaryotes.Trends.Biochem.Sci.34,401−407(2009).
12.Brouns,S.J.et al.Small CRISPR RNAs guide antiviral defense in prokaryotes.Science 321,960−964(2008).
13.Carte,J.,Wang,R.,Li,H.,Terns,R.M.&Terns,M.P.Cas6 is an endoribonuclease that generates guide RNAs for invader defense in prokaryotes.Genes Dev.22,3489−3496(2008).
14.Deltcheva,E.et al.CRISPR RNA maturation by trans−encoded small RNA and host factor RNase III.Nature 471,602−607 (2011).
15.Hatoum−Aslan,A.,Maniv,I.&Marraffini,L.A.Mature clustered,regularly interspaced,short palindromic repeats RNA(crRNA)length is measured by a ruler mechanism anchored at the precursor processing site.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.108,21218−21222(2011).
16.Haurwitz,R.E.,Jinek,M.,Wiedenheft,B.,Zhou,K.&Doudna,J.A.Sequence−and structure−specific RNA processing by a CRISPR endonuclease.Science 329,1355−1358(2010).
17.Deveau,H.et al.Phage response to CRISPR−encoded resistance in Streptococcus thermophilus.J.Bacteriol.190,1390−1400(2008).
18.Gasiunas,G.,Barrangou,R.,Horvath,P.&Siksnys,V.Cas9−crRNA ribonucleoprotein complex mediates specific DNA cleavage for adaptive immunity in bacteria.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.(2012).
19.Makarova,K.S.,Aravind,L.,Wolf,Y.I.&Koonin,E.V.Unification of Cas protein families and a simple scenario for the origin and evolution of CRISPR−Cas systems.Biol.Direct.6,38(2011).
20.Barrangou,R.RNA−mediated programmable DNA cleavage.Nat.Biotechnol.30,836−838(2012).
21.Brouns,S.J.Molecular biology.A Swiss army knife of immunity.Science 337,808−809(2012).
22.Carroll,D.A CRISPR Approach to Gene Targeting.Mol.Ther.20,1658−1660(2012).
23.Bikard,D.,Hatoum−Aslan,A.,Mucida,D.&Marraffini,L.A.CRISPR interference can prevent natural transformation and virulence acquisition during in vivo bacterial infection.Cell Host Microbe 12,177−186(2012).
24.Sapranauskas,R.et al.The Streptococcus thermophilus CRISPR/Cas system provides immunity in Escherichia coli.Nucleic Acids Res.(2011).
25.Semenova,E.et al.Interference by clustered regularly interspaced short palindromic repeat(CRISPR)RNA is governed by a seed sequence.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.(2011).
26.Wiedenheft,B.et al.RNA−guided complex from a bacterial immune system enhances target recognition through seed sequence interactions.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.(2011).
27.Zahner,D.&Hakenbeck,R.The Streptococcus pneumoniae beta−galactosidase is a surface protein.J.Bacteriol.182,5919−5921(2000).
28.Marraffini,L.A.,Dedent,A.C.&Schneewind,O.Sortases and the art of anchoring proteins to the envelopes of gram−positive bacteria.Microbiol.Mol.Biol.Rev.70,192−221(2006).
29.Motamedi,M.R.,Szigety,S.K.&Rosenberg,S.M.Double−strand−break repair recombination in Escherichia coli:physical evidence for a DNA replication mechanism in vivo.Genes Dev.13,2889−2903(1999).
30.Hosaka,T.et al.The novel mutation K87E in ribosomal protein S12 enhances protein synthesis activity during the late growth phase in Escherichia coli.Mol.Genet.Genomics 271,317−324(2004).
31.Costantino,N.&Court,D.L.Enhanced levels of lambda Red−mediated recombinants in mismatch repair mutants.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.100,15748−15753(2003).
32.Edgar,R.&Qimron,U.The Escherichia coli CRISPR system protects from lambda lysogenization,lysogens,and prophage induction.J.Bacteriol.192,6291−6294(2010).
33.Marraffini,L.A.&Sontheimer,E.J.Self versus non−self discrimination during CRISPR RNA−directed immunity.Nature 463,568−571(2010).
34.Fischer,S.et al.An archaeal immune system can detect multiple Protospacer Adjacent Motifs(PAMs)to target invader DNA.J.Biol.Chem.287,33351−33363(2012).
35.Gudbergsdottir,S.et al.Dynamic properties of the Sulfolobus CRISPR/Cas and CRISPR/Cmr systems when challenged with vector−borne viral and plasmid genes and protospacers.Mol.Microbiol.79,35−49(2011).
36.Wang,H.H.et al.Genome−scale promoter engineering by coselection MAGE.Nat Methods 9,591−593(2012).
37.Cong,L.et al.Multiplex Genome Engineering Using CRISPR/Cas Systems.Science In press(2013).
38.Mali,P.et al.RNA−Guided Human Genome Engineering via Cas9.Science In press(2013).
39.Hoskins,J.et al.Genome of the bacterium Streptococcus pneumoniae strain R6.J.Bacteriol.183,5709−5717(2001).
40.Havarstein,L.S.,Coomaraswamy,G.&Morrison,D.A.An unmodified heptadecapeptide pheromone induces competence for genetic transformation in Streptococcus pneumoniae.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.92,11140−11144(1995).
41.Horinouchi,S.&Weisblum,B.Nucleotide sequence and functional map of pC194,a plasmid that specifies inducible chloramphenicol resistance.J.Bacteriol.150,815−825(1982).
42.Horton,R.M.In Vitro Recombination and Mutagenesis of DNA:SOEing Together Tailor−Made Genes.Methods Mol.Biol.15,251−261(1993).
43.Podbielski,A.,Spellerberg,B.,Woischnik,M.,Pohl,B.&Lutticken,R.Novel series of plasmid vectors for gene inactivation and expression analysis in group A streptococci(GAS).Gene 177,137−147(1996).
44.Husmann,L.K.,Scott,J.R.,Lindahl,G.&Stenberg,L.Expression of the Arp protein,a member of the M protein family,is not sufficient to inhibit phagocytosis of Streptococcus pyogenes.Infection and immunity 63,345−348(1995).
45.Gibson,D.G.et al.Enzymatic assembly of DNA molecules up to several hundred kilobases.Nat Methods 6,343−345(2009).
Claims (34)
- 天然に存在しないまたはエンジニアリングされた組成物であって、
I.CRISPR−Cas系キメラRNA(chiRNA)ポリヌクレオチド配列に作動可能に結合している第1の調節エレメントであって、前記ポリヌクレオチド配列は、
(a)真核細胞中の標的配列にハイブリダイズし得るガイド配列、
(b)tracrメイト配列、および
(c)tracr配列
を含む、第1の調節エレメント、および
II.CRISPR酵素の末端に近接する少なくとも1つ以上の核局在化配列(NLS)を含むCRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント
を含む1つ以上のベクターを含むベクター系を含み、
(a)、(b)および(c)は、5’から3’配向で配置されており、
成分IおよびIIは、前記系の同一または異なるベクター上にあり、
前記tracrメイト配列は、転写された場合、前記tracr配列にハイブリダイズし、前記ガイド配列は、前記標的配列へのCRISPR複合体の配列特異的結合を指向し、前記CRISPR複合体は、(1)前記標的配列にハイブリダイズされる前記ガイド配列、および(2)前記tracr配列にハイブリダイズされる前記tracrメイト配列と複合体形成している前記CRISPR酵素を含み、
前記キメラRNAポリヌクレオチド配列は、2つ以上のヘアピンを含む
天然に存在しないまたはエンジニアリングされた組成物。 - 複数のchiRNAポリヌクレオチド配列が使用されて多重化系が提供される、請求項1に記載の組成物。
- 多重化CRISPR酵素系であって、
I.CRISPR−Cas系キメラRNA(chiRNA)ポリヌクレオチド配列に作動可能に結合している第1の調節エレメントであって、前記ポリヌクレオチド配列は、
(a)真核細胞中の標的配列にハイブリダイズし得るガイド配列、
(b)tracrメイト配列、および
(c)tracr配列
を含む、第1の調節エレメント、および
II.CRISPR酵素の末端に近接する少なくとも1つ以上の核局在化配列(NLS)を含むCRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント
を含む1つ以上のベクターを含むベクター系を含み、
(a)、(b)および(c)は、5’から3’配向で配置されており、
成分IおよびIIは、前記系の同一または異なるベクター上にあり、
前記tracrメイト配列は、転写された場合、前記tracr配列にハイブリダイズし、前記ガイド配列は、前記標的配列へのCRISPR複合体の配列特異的結合を指向し、前記CRISPR複合体は、(1)前記標的配列にハイブリダイズされる前記ガイド配列、および(2)前記tracr配列にハイブリダイズされる前記tracrメイト配列と複合体形成している前記CRISPR酵素を含み、
前記chiRNAポリヌクレオチド配列は、2つ以上のヘアピンを含み、
前記多重化系において複数のchiRNAポリヌクレオチド配列が使用される
多重化CRISPR酵素系。 - 前記第1の調節エレメントが、ポリメラーゼIIIプロモーターである、請求項1〜3のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記第2の調節エレメントが、ポリメラーゼIIプロモーターである、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、真核細胞の核中の検出可能な量の前記CRISPR酵素の蓄積をドライブするために十分な強度の1つ以上のNLSを含む、請求項1〜5のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記tracr配列が、最適にアラインされた場合に前記tracrメイト配列の長さに沿って少なくとも50%の配列相補性を示す、請求項1〜6のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、II型CRISPR系酵素である、請求項1〜7のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、Cas9酵素である、請求項1〜8のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、真核細胞中の発現のためにコドン最適化されている、請求項1〜9のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記ガイド配列が、少なくとも15ヌクレオチド長である、請求項1〜10のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記キメラRNAポリヌクレオチド配列が、2、3、4または5つのヘアピンを含む、請求項1〜11のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 天然に存在しないまたはエンジニアリングされた組成物であって、
I.第1の調節エレメントであって、
(a)真核細胞中の標的配列にハイブリダイズし得るガイド配列、および
(b)tracrメイト配列
に作動可能に結合している第1の調節エレメント、
II.CRISPR酵素の末端に近接する少なくとも1つ以上の核局在化配列(NLS)を含むCRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント、ならびに
III.tracr配列に作動可能に結合している第3の調節エレメント
を含む1つ以上のベクターを含むベクター系を含み、
成分I、IIおよびIIIは、前記系の同一または異なるベクター上にあり、
前記tracrメイト配列は、転写された場合、前記tracr配列にハイブリダイズし、前記ガイド配列は、前記標的配列へのCRISPR複合体の配列特異的結合を指向し、前記CRISPR複合体は、(1)前記標的配列にハイブリダイズされる前記ガイド配列、および(2)前記tracr配列にハイブリダイズされる前記tracrメイト配列と複合体形成している前記CRISPR酵素を含む
天然に存在しないまたはエンジニアリングされた組成物。 - 複数のガイド配列および単一tracr配列が使用されて多重化系が提供される、請求項13に記載の組成物。
- 多重化CRISPR酵素系であって、
I.第1の調節エレメントであって、
(a)真核細胞中の標的配列にハイブリダイズし得るガイド配列、および
(b)tracrメイト配列
に作動可能に結合している第1の調節エレメント、
II.CRISPR酵素の末端に近接する少なくとも1つ以上の核局在化配列(NLS)を含むCRISPR酵素をコードする酵素コード配列に作動可能に結合している第2の調節エレメント、ならびに
III.tracr配列に作動可能に結合している第3の調節エレメント
を含む1つ以上のベクターを含むベクター系を含み、
成分I、IIおよびIIIは、前記系の同一または異なるベクター上にあり、
前記tracrメイト配列は、転写された場合、前記tracr配列にハイブリダイズし、前記ガイド配列は、前記標的配列へのCRISPR複合体の配列特異的結合を指向し、前記CRISPR複合体は、(1)前記標的配列にハイブリダイズされる前記ガイド配列、および(2)前記tracr配列にハイブリダイズされる前記tracrメイト配列と複合体形成している前記CRISPR酵素を含み、
前記多重化系において複数のガイド配列および単一tracr配列が使用される
多重化CRISPR酵素系。 - 前記第1の調節エレメントが、ポリメラーゼIIIプロモーターである、請求項13〜15のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記第2の調節エレメントが、ポリメラーゼIIプロモーターである、請求項13〜16のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記第3の調節エレメントが、ポリメラーゼIIIプロモーターである、請求項13〜17のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、真核細胞の核中の検出可能な量の前記CRISPR酵素の蓄積をドライブするために十分な強度の1つ以上のNLSを含む、請求項13〜18のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記tracr配列が、最適にアラインされた場合に前記tracrメイト配列の長さに沿って少なくとも50%の配列相補性を示す、請求項13〜19のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、II型CRISPR系酵素である、請求項13〜20のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、Cas9酵素である、請求項13〜21のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記CRISPR酵素が、真核細胞中の発現のためにコドン最適化されている、請求項13〜22のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 前記ガイド配列が、少なくとも15ヌクレオチド長である、請求項13〜23のいずれか一項に記載の組成物または系。
- 請求項1〜24のいずれか一項に記載の組成物または系を含む真核宿主細胞。
- 請求項25に記載の真核宿主細胞を含む生物。
- 請求項25に記載の真核宿主細胞を含む非ヒト生物。
- 請求項1〜24のいずれか一項に記載の組成物およびキットの使用指示書を含むキット。
- 真核細胞中の目的ゲノム遺伝子座の発現を変化させる方法であって、
前記ゲノム遺伝子座を請求項1〜24のいずれか一項に記載の組成物と接触させること、および
前記ゲノム遺伝子座の発現が変化したか否かを決定すること
含む方法。 - 前記ガイド配列が、CRISPRモチーフ配列の存在に基づき前記標的配列への前記CRISPR複合体の配列特異的結合を指向する、請求項29に記載の方法。
- 前記CRISPRモチーフ配列が、NAGである、請求項30に記載の方法。
- 1つ以上の原核細胞中の遺伝子中の1つ以上の突然変異を導入することにより1つ以上の原核細胞を選択する方法であって、
1つ以上のベクターを前記原核細胞中に導入することであって、前記1つ以上のベクターは、CRISPR酵素、tracrメイト配列に結合しているガイド配列、tracr配列、および編集テンプレートの1つ以上の発現をドライブし;
前記編集テンプレートは、CRISPR酵素開裂を停止させる前記1つ以上の突然変異を含むこと;
前記編集テンプレートと、選択すべき前記細胞中の標的ポリヌクレオチドとを相同組換えさせること;
CRISPR複合体を標的ポリヌクレオチドに結合させて前記遺伝子内の前記標的ポリヌクレオチドの開裂を生じさせることであって、前記CRISPR複合体は、(1)前記標的ポリヌクレオチド内の前記標的配列にハイブリダイズされる前記ガイド配列、および(2)前記tracr配列にハイブリダイズされる前記tracrメイト配列と複合体形成している前記CRISPR酵素を含み、
前記標的ポリヌクレオチドへの前記CRISPR複合体の結合は、細胞死を誘導し、
それにより、1つ以上の突然変異が導入された1つ以上の原核細胞の選択を可能とすること
を含む方法。 - 前記CRISPR酵素が、II型CRISPR系酵素である、請求項32に記載の方法。
- 前記CRISPR酵素が、Cas9である、請求項33に記載の方法。
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KR102182847B1 (ko) * | 2012-10-23 | 2020-11-27 | 주식회사 툴젠 | 표적 DNA에 특이적인 가이드 RNA 및 Cas 단백질을 암호화하는 핵산 또는 Cas 단백질을 포함하는, 표적 DNA를 절단하기 위한 조성물 및 이의 용도 |
WO2014071182A1 (en) | 2012-11-01 | 2014-05-08 | Massachusetts Institute Of Technology | Directed evolution of synthetic gene cluster |
EP3617309A3 (en) | 2012-12-06 | 2020-05-06 | Sigma Aldrich Co. LLC | Crispr-based genome modification and regulation |
WO2014093595A1 (en) * | 2012-12-12 | 2014-06-19 | The Broad Institute, Inc. | Crispr-cas component systems, methods and compositions for sequence manipulation |
US8697359B1 (en) | 2012-12-12 | 2014-04-15 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products |
KR20150105634A (ko) | 2012-12-12 | 2015-09-17 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | 서열 조작을 위한 개선된 시스템, 방법 및 효소 조성물의 유전자 조작 및 최적화 |
EP3064585B1 (en) | 2012-12-12 | 2020-02-05 | The Broad Institute, Inc. | Engineering and optimization of improved systems, methods and enzyme compositions for sequence manipulation |
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ES2741951T3 (es) | 2012-12-17 | 2020-02-12 | Harvard College | Modificación por ingeniería genética del genoma humano guiada por ARN |
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US10660943B2 (en) * | 2013-02-07 | 2020-05-26 | The Rockefeller University | Sequence specific antimicrobials |
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AU2014227653B2 (en) | 2013-03-15 | 2017-04-20 | The General Hospital Corporation | Using RNA-guided foki nucleases (RFNs) to increase specificity for RNA-guided genome editing |
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WO2014165825A2 (en) | 2013-04-04 | 2014-10-09 | President And Fellows Of Harvard College | Therapeutic uses of genome editing with crispr/cas systems |
SI2986729T1 (sl) | 2013-04-16 | 2019-02-28 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Ciljana sprememba genoma podgane |
US20160122774A1 (en) * | 2013-05-29 | 2016-05-05 | Cellectis | A method for producing precise dna cleavage using cas9 nickase activity |
US11414695B2 (en) | 2013-05-29 | 2022-08-16 | Agilent Technologies, Inc. | Nucleic acid enrichment using Cas9 |
US20140356956A1 (en) * | 2013-06-04 | 2014-12-04 | President And Fellows Of Harvard College | RNA-Guided Transcriptional Regulation |
MY197877A (en) * | 2013-06-04 | 2023-07-22 | Harvard College | Rna-guided transcriptional regulation |
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EP3008181B1 (en) | 2013-06-11 | 2019-11-06 | The Regents of The University of California | Methods and compositions for target dna modification |
EP3725885A1 (en) | 2013-06-17 | 2020-10-21 | The Broad Institute, Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions methods, screens and applications thereof |
SG11201510284XA (en) | 2013-06-17 | 2016-01-28 | Broad Inst Inc | Delivery and use of the crispr-cas systems, vectors and compositions for hepatic targeting and therapy |
AU2014281027A1 (en) | 2013-06-17 | 2016-01-28 | Massachusetts Institute Of Technology | Optimized CRISPR-Cas double nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation |
CN106062197A (zh) | 2013-06-17 | 2016-10-26 | 布罗德研究所有限公司 | 用于序列操纵的串联指导系统、方法和组合物的递送、工程化和优化 |
EP3011034B1 (en) * | 2013-06-17 | 2019-08-07 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using viral components |
US10011850B2 (en) | 2013-06-21 | 2018-07-03 | The General Hospital Corporation | Using RNA-guided FokI Nucleases (RFNs) to increase specificity for RNA-Guided Genome Editing |
WO2015006498A2 (en) | 2013-07-09 | 2015-01-15 | President And Fellows Of Harvard College | Therapeutic uses of genome editing with crispr/cas systems |
US20150044192A1 (en) | 2013-08-09 | 2015-02-12 | President And Fellows Of Harvard College | Methods for identifying a target site of a cas9 nuclease |
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CA3221516A1 (en) * | 2013-08-22 | 2015-02-26 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Plant genome modification using guide rna/cas endonuclease systems and methods of use |
WO2015034872A2 (en) * | 2013-09-05 | 2015-03-12 | Massachusetts Institute Of Technology | Tuning microbial populations with programmable nucleases |
US9340800B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-05-17 | President And Fellows Of Harvard College | Extended DNA-sensing GRNAS |
US9526784B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-12-27 | President And Fellows Of Harvard College | Delivery system for functional nucleases |
US9322037B2 (en) | 2013-09-06 | 2016-04-26 | President And Fellows Of Harvard College | Cas9-FokI fusion proteins and uses thereof |
ES2844174T3 (es) * | 2013-09-18 | 2021-07-21 | Kymab Ltd | Métodos, células y organismos |
WO2015054507A1 (en) | 2013-10-10 | 2015-04-16 | Pronutria, Inc. | Nutritive polypeptide production systems, and methods of manufacture and use thereof |
WO2015065964A1 (en) | 2013-10-28 | 2015-05-07 | The Broad Institute Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, screens and applications thereof |
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MX2016007654A (es) | 2013-12-11 | 2017-08-15 | Regeneron Pharma | Metodos y composiciones para la modificacion dirigida de un genoma. |
EP4219699A1 (en) | 2013-12-12 | 2023-08-02 | The Broad Institute, Inc. | Engineering of systems, methods and optimized guide compositions with new architectures for sequence manipulation |
US20150166985A1 (en) | 2013-12-12 | 2015-06-18 | President And Fellows Of Harvard College | Methods for correcting von willebrand factor point mutations |
KR20160089527A (ko) | 2013-12-12 | 2016-07-27 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | 게놈 편집을 위한 crispr-cas 시스템 및 조성물의 전달, 용도 및 치료적 응용 |
JP6793547B2 (ja) | 2013-12-12 | 2020-12-02 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド | 最適化機能CRISPR−Cas系による配列操作のための系、方法および組成物 |
WO2015089364A1 (en) | 2013-12-12 | 2015-06-18 | The Broad Institute Inc. | Crystal structure of a crispr-cas system, and uses thereof |
KR20160089530A (ko) | 2013-12-12 | 2016-07-27 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | Hbv 및 바이러스 질병 및 질환을 위한 crisprcas 시스템 및 조성물의 전달,용도 및 치료적 적용 |
BR112016013213A2 (pt) | 2013-12-12 | 2017-12-05 | Massachusetts Inst Technology | administração, uso e aplicações terapêuticas dos sistemas crispr-cas e composições para visar distúrbios e doenças usando componentes de administração de partículas |
EP3835419A1 (en) | 2013-12-12 | 2021-06-16 | The Regents of The University of California | Methods and compositions for modifying a single stranded target nucleic acid |
BR112016013520A2 (pt) | 2013-12-12 | 2017-10-03 | Broad Inst Inc | Composições e métodos de uso de sistemas crispr-cas em distúrbios de repetições de nucleotídeos |
JP6779785B2 (ja) | 2013-12-19 | 2020-11-04 | ノバルティス アーゲー | ヒトメソテリンキメラ抗原受容体およびその使用 |
US9963689B2 (en) | 2013-12-31 | 2018-05-08 | The Regents Of The University Of California | Cas9 crystals and methods of use thereof |
WO2015123339A1 (en) * | 2014-02-11 | 2015-08-20 | The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate | Crispr enabled multiplexed genome engineering |
AU2015219167A1 (en) | 2014-02-18 | 2016-09-08 | Duke University | Compositions for the inactivation of virus replication and methods of making and using the same |
CA3194412A1 (en) | 2014-02-27 | 2015-09-03 | Monsanto Technology Llc | Compositions and methods for site directed genomic modification |
EP3514246B1 (en) | 2014-02-27 | 2021-11-17 | The Broad Institute, Inc. | T cell balance gene expression and methods of use thereof |
US11028388B2 (en) | 2014-03-05 | 2021-06-08 | Editas Medicine, Inc. | CRISPR/Cas-related methods and compositions for treating Usher syndrome and retinitis pigmentosa |
EP3115457B1 (en) | 2014-03-05 | 2019-10-02 | National University Corporation Kobe University | Genomic sequence modification method for specifically converting nucleic acid bases of targeted dna sequence, and molecular complex for use in same |
DK3116997T3 (da) | 2014-03-10 | 2019-08-19 | Editas Medicine Inc | Crispr/cas-relaterede fremgangsmåder og sammensætninger til behandling af lebers kongenitale amaurose 10 (lca10) |
US11339437B2 (en) | 2014-03-10 | 2022-05-24 | Editas Medicine, Inc. | Compositions and methods for treating CEP290-associated disease |
US11141493B2 (en) | 2014-03-10 | 2021-10-12 | Editas Medicine, Inc. | Compositions and methods for treating CEP290-associated disease |
US20170335281A1 (en) | 2014-03-15 | 2017-11-23 | Novartis Ag | Treatment of cancer using chimeric antigen receptor |
EP3122880B1 (en) | 2014-03-26 | 2021-05-05 | Editas Medicine, Inc. | Crispr/cas-related methods and compositions for treating sickle cell disease |
JP6815986B2 (ja) | 2014-03-26 | 2021-01-20 | ユニバーシティ オブ メリーランド, カレッジ パーク | 大型家畜の接合体における標的化ゲノム編集 |
EP3540061A1 (en) * | 2014-04-02 | 2019-09-18 | Editas Medicine, Inc. | Crispr/cas-related methods and compositions for treating primary open angle glaucoma |
LT3129470T (lt) | 2014-04-07 | 2021-07-12 | Novartis Ag | Vėžio gydymas naudojant anti-cd19 chimerinį antigeno receptorių |
ES2827279T3 (es) * | 2014-04-14 | 2021-05-20 | Nemesis Bioscience Ltd | Terapéutico |
GB201406968D0 (en) | 2014-04-17 | 2014-06-04 | Green Biologics Ltd | Deletion mutants |
GB201406970D0 (en) | 2014-04-17 | 2014-06-04 | Green Biologics Ltd | Targeted mutations |
CA2948429A1 (en) * | 2014-05-09 | 2015-11-12 | Universite Laval | Prevention and treatment of alzheimer's disease by genome editing using the crispr/cas system |
BR112016026809A2 (pt) | 2014-05-19 | 2017-12-12 | Pfizer | compostos de 6,8-dioxabiciclo[3.2.1]octano-2,3-diol substituído como agentes de alvejamento de asgpr |
CA2952121A1 (en) | 2014-06-13 | 2015-12-17 | Childrens' Medical Center Corporation | Products and methods to isolate mitochondria |
EP3919621A1 (en) | 2014-06-23 | 2021-12-08 | The General Hospital Corporation | Genomewide unbiased identification of dsbs evaluated by sequencing (guide-seq) |
AU2015288157A1 (en) | 2014-07-11 | 2017-01-19 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Compositions and methods for producing plants resistant to glyphosate herbicide |
BR112017000621B1 (pt) * | 2014-07-11 | 2024-03-12 | Pioneer Hi-Bred International, Inc | Método para melhorar um traço agronômico de uma planta de milho ou de soja |
WO2016011203A1 (en) | 2014-07-15 | 2016-01-21 | Life Technologies Corporation | Compositions with lipid aggregates and methods for efficient delivery of molecules to cells |
KR102594343B1 (ko) | 2014-07-21 | 2023-10-26 | 노파르티스 아게 | Cd33 키메라 항원 수용체를 사용한 암의 치료 |
US11542488B2 (en) | 2014-07-21 | 2023-01-03 | Novartis Ag | Sortase synthesized chimeric antigen receptors |
RU2751660C2 (ru) | 2014-07-21 | 2021-07-15 | Новартис Аг | Лечение злокачественного новообразования с использованием гуманизированного химерного антигенного рецептора против всма |
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CA2958200A1 (en) | 2014-08-14 | 2016-02-18 | Novartis Ag | Treatment of cancer using a gfr alpha-4 chimeric antigen receptor |
WO2016028682A1 (en) | 2014-08-17 | 2016-02-25 | The Broad Institute Inc. | Genome editing using cas9 nickases |
EP3183268B1 (en) | 2014-08-19 | 2020-02-12 | Novartis AG | Anti-cd123 chimeric antigen receptor (car) for use in cancer treatment |
NZ728437A (en) * | 2014-08-27 | 2018-02-23 | Caribou Biosciences Inc | Methods for increasing cas9-mediated engineering efficiency |
US10450584B2 (en) | 2014-08-28 | 2019-10-22 | North Carolina State University | Cas9 proteins and guiding features for DNA targeting and genome editing |
EP3188763B1 (en) * | 2014-09-02 | 2020-05-13 | The Regents of The University of California | Methods and compositions for rna-directed target dna modification |
WO2016040030A1 (en) | 2014-09-12 | 2016-03-17 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Generation of site-specific-integration sites for complex trait loci in corn and soybean, and methods of use |
PL3194443T3 (pl) | 2014-09-17 | 2022-01-31 | Novartis Ag | Nakierowywanie komórek cytotoksycznych za pośrednictwem receptorów chimerycznych do immunoterapii adoptywnej |
US9616114B1 (en) | 2014-09-18 | 2017-04-11 | David Gordon Bermudes | Modified bacteria having improved pharmacokinetics and tumor colonization enhancing antitumor activity |
US10716298B2 (en) | 2014-09-23 | 2020-07-21 | Acceligen, Inc. | Materials and methods for producing animals with short hair |
WO2016049251A1 (en) | 2014-09-24 | 2016-03-31 | The Broad Institute Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for modeling mutations in leukocytes |
WO2016049163A2 (en) | 2014-09-24 | 2016-03-31 | The Broad Institute Inc. | Use and production of chd8+/- transgenic animals with behavioral phenotypes characteristic of autism spectrum disorder |
WO2016049024A2 (en) * | 2014-09-24 | 2016-03-31 | The Broad Institute Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for modeling competition of multiple cancer mutations in vivo |
WO2016049258A2 (en) | 2014-09-25 | 2016-03-31 | The Broad Institute Inc. | Functional screening with optimized functional crispr-cas systems |
US10040048B1 (en) | 2014-09-25 | 2018-08-07 | Synthego Corporation | Automated modular system and method for production of biopolymers |
WO2016061073A1 (en) * | 2014-10-14 | 2016-04-21 | Memorial Sloan-Kettering Cancer Center | Composition and method for in vivo engineering of chromosomal rearrangements |
CN105602935B (zh) * | 2014-10-20 | 2020-11-13 | 聂凌云 | 一种新型线粒体基因组编辑工具 |
WO2016069591A2 (en) | 2014-10-27 | 2016-05-06 | The Broad Institute Inc. | Compositions, methods and use of synthetic lethal screening |
US9816080B2 (en) * | 2014-10-31 | 2017-11-14 | President And Fellows Of Harvard College | Delivery of CAS9 via ARRDC1-mediated microvesicles (ARMMs) |
DK3215611T3 (da) | 2014-11-06 | 2019-11-25 | Du Pont | Peptid-medieret indgivelse af rna-guidet endonuklease i celler |
EP3215617B1 (en) | 2014-11-07 | 2024-05-08 | Editas Medicine, Inc. | Systems for improving crispr/cas-mediated genome-editing |
ES2731437T3 (es) | 2014-11-21 | 2019-11-15 | Regeneron Pharma | Métodos y composiciones para la modificación genética dirigida mediante el uso de pares de ARN guías |
WO2016086197A1 (en) | 2014-11-25 | 2016-06-02 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Method of identifying and treating a person having a predisposition to or afflicted with a cardiometabolic disease |
US20180057839A1 (en) | 2014-11-26 | 2018-03-01 | The Regents Of The University Of California | Therapeutic compositions comprising transcription factors and methods of making and using the same |
US20180105834A1 (en) * | 2014-11-27 | 2018-04-19 | Institute Of Animal Sciences, Chinese Academy Of Agrigultural Sciences | A method of site-directed insertion to h11 locus in pigs by using site-directed cutting system |
GB201421096D0 (en) | 2014-11-27 | 2015-01-14 | Imp Innovations Ltd | Genome editing methods |
CA2969619A1 (en) | 2014-12-03 | 2016-06-09 | Agilent Technologies, Inc. | Guide rna with chemical modifications |
CN116059378A (zh) | 2014-12-10 | 2023-05-05 | 明尼苏达大学董事会 | 用于治疗疾病的遗传修饰的细胞、组织和器官 |
EP3230451B1 (en) | 2014-12-12 | 2021-04-07 | The Broad Institute, Inc. | Protected guide rnas (pgrnas) |
WO2016094872A1 (en) | 2014-12-12 | 2016-06-16 | The Broad Institute Inc. | Dead guides for crispr transcription factors |
WO2016094874A1 (en) | 2014-12-12 | 2016-06-16 | The Broad Institute Inc. | Escorted and functionalized guides for crispr-cas systems |
WO2016094880A1 (en) | 2014-12-12 | 2016-06-16 | The Broad Institute Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of crispr systems and compositions for genome editing as to hematopoietic stem cells (hscs) |
WO2016100333A1 (en) | 2014-12-15 | 2016-06-23 | Syngenta Participations Ag | Pesticidal microrna carriers and use thereof |
JP6814142B2 (ja) * | 2014-12-16 | 2021-01-13 | ダニスコ・ユーエス・インク | 真菌ゲノム改変システムおよび使用方法 |
CA2971391C (en) * | 2014-12-17 | 2023-05-09 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Compositions and methods for efficient gene editing in e. coli using guide rna/cas endonuclease systems in combination with circular polynucleotide modification templates. |
WO2016100974A1 (en) | 2014-12-19 | 2016-06-23 | The Broad Institute Inc. | Unbiased identification of double-strand breaks and genomic rearrangement by genome-wide insert capture sequencing |
WO2016098078A2 (en) | 2014-12-19 | 2016-06-23 | Novartis Ag | Dimerization switches and uses thereof |
US10190106B2 (en) | 2014-12-22 | 2019-01-29 | Univesity Of Massachusetts | Cas9-DNA targeting unit chimeras |
EP3237624B1 (en) | 2014-12-23 | 2020-01-29 | Syngenta Participations AG | Methods and compositions for identifying and enriching for cells comprising site specific genomic modifications |
WO2016106236A1 (en) | 2014-12-23 | 2016-06-30 | The Broad Institute Inc. | Rna-targeting system |
WO2016106244A1 (en) | 2014-12-24 | 2016-06-30 | The Broad Institute Inc. | Crispr having or associated with destabilization domains |
WO2016108926A1 (en) | 2014-12-30 | 2016-07-07 | The Broad Institute Inc. | Crispr mediated in vivo modeling and genetic screening of tumor growth and metastasis |
JP2018500037A (ja) | 2014-12-31 | 2018-01-11 | シンセティック ジェノミクス インコーポレーテッド | 高効率なインビボゲノム編集のための組成物及び方法 |
EP3245232B1 (en) | 2015-01-12 | 2021-04-21 | The Regents of The University of California | Heterodimeric cas9 and methods of use thereof |
WO2016123243A1 (en) | 2015-01-28 | 2016-08-04 | The Regents Of The University Of California | Methods and compositions for labeling a single-stranded target nucleic acid |
KR102319192B1 (ko) | 2015-01-28 | 2021-10-28 | 카리부 바이오사이언시스 인코포레이티드 | Crispr 하이브리드 dna/rna 폴리뉴클레오티드 및 사용 방법 |
JP6929791B2 (ja) | 2015-02-09 | 2021-09-01 | デューク ユニバーシティ | エピゲノム編集のための組成物および方法 |
EP3262193A2 (en) | 2015-02-26 | 2018-01-03 | The Broad Institute Inc. | T cell balance gene expression, compositions of matters and methods of use thereof |
WO2016138574A1 (en) | 2015-03-02 | 2016-09-09 | Sinai Health System | Homologous recombination factors |
KR20230156800A (ko) * | 2015-03-03 | 2023-11-14 | 더 제너럴 하스피탈 코포레이션 | 변경된 PAM 특이성을 갖는 조작된 CRISPR-Cas9 뉴클레아제 |
CN104673816A (zh) * | 2015-03-05 | 2015-06-03 | 广东医学院 | 一种pCr-NHEJ载体及其构建方法及其用于细菌基因定点敲除的应用 |
WO2016160389A1 (en) | 2015-03-27 | 2016-10-06 | E I Du Pont De Nemours And Company | Soybean u6 small nuclear rna gene promoters and their use in constitutive expression of small rna genes in plants |
EP3280803B1 (en) | 2015-04-06 | 2021-05-26 | The Board of Trustees of the Leland Stanford Junior University | Chemically modified guide rnas for crispr/cas-mediated gene regulation |
WO2016168594A1 (en) * | 2015-04-16 | 2016-10-20 | President And Fellows Of Harvard College | Sensor systems for target ligands and uses thereof |
GB201506509D0 (en) | 2015-04-16 | 2015-06-03 | Univ Wageningen | Nuclease-mediated genome editing |
EP3286211A1 (en) | 2015-04-23 | 2018-02-28 | Novartis AG | Treatment of cancer using chimeric antigen receptor and protein kinase a blocker |
EP3286571B1 (en) | 2015-04-24 | 2021-08-18 | Editas Medicine, Inc. | Evaluation of cas9 molecule/guide rna molecule complexes |
WO2016176617A2 (en) | 2015-04-29 | 2016-11-03 | New York University | Method for treating high-grade gliomas |
CN106191040B (zh) * | 2015-04-30 | 2021-09-14 | 杭州菁因康生物科技有限公司 | 基因打靶方法 |
RU2017142352A (ru) | 2015-05-06 | 2019-06-06 | Снипр Текнолоджиз Лимитед | Изменение популяций микроорганизмов и модификация микробиоты |
WO2016182893A1 (en) | 2015-05-08 | 2016-11-17 | Teh Broad Institute Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems for saturating mutagenesis of non-coding elements, compositions, methods, libraries and applications thereof |
AU2016261358B2 (en) | 2015-05-11 | 2021-09-16 | Editas Medicine, Inc. | Optimized CRISPR/Cas9 systems and methods for gene editing in stem cells |
WO2016183438A1 (en) * | 2015-05-14 | 2016-11-17 | Massachusetts Institute Of Technology | Self-targeting genome editing system |
WO2016186946A1 (en) | 2015-05-15 | 2016-11-24 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Rapid characterization of cas endonuclease systems, pam sequences and guide rna elements |
WO2016187904A1 (zh) * | 2015-05-22 | 2016-12-01 | 深圳市第二人民医院 | CRISPR-Cas9特异性敲除猪CMAH基因的方法及用于特异性靶向CMAH基因的sgRNA |
WO2016191684A1 (en) * | 2015-05-28 | 2016-12-01 | Finer Mitchell H | Genome editing vectors |
AU2016270649B2 (en) * | 2015-05-29 | 2022-04-21 | North Carolina State University | Methods for screening bacteria, archaea, algae, and yeast using crispr nucleic acids |
EP3303585A4 (en) | 2015-06-03 | 2018-10-31 | Board of Regents of the University of Nebraska | Dna editing using single-stranded dna |
EP3303634B1 (en) | 2015-06-03 | 2023-08-30 | The Regents of The University of California | Cas9 variants and methods of use thereof |
WO2016193945A2 (en) | 2015-06-05 | 2016-12-08 | Novartis Ag | Methods and compositions for diagnosing, treating, and monitoring treatment of shank3 deficiency associated disorders |
WO2016201047A1 (en) | 2015-06-09 | 2016-12-15 | Editas Medicine, Inc. | Crispr/cas-related methods and compositions for improving transplantation |
KR20180017119A (ko) | 2015-06-10 | 2018-02-20 | 보드 오브 리전츠, 더 유니버시티 오브 텍사스 시스템 | 질환의 치료를 위한 엑소좀의 용도 |
WO2016198500A1 (en) * | 2015-06-10 | 2016-12-15 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Methods and compositions for rna-guided treatment of human cytomegalovirus (hcmv) infection |
US20180187190A1 (en) * | 2015-06-12 | 2018-07-05 | Erasmus University Medical Center Rotterdam | New crispr assays |
WO2016205728A1 (en) | 2015-06-17 | 2016-12-22 | Massachusetts Institute Of Technology | Crispr mediated recording of cellular events |
EP3310932B1 (en) | 2015-06-17 | 2023-08-30 | The UAB Research Foundation | Crispr/cas9 complex for genomic editing |
WO2016205680A1 (en) | 2015-06-17 | 2016-12-22 | The Uab Research Foundation | Crispr/cas9 complex for introducing a functional polypeptide into cells of blood cell lineage |
US10648020B2 (en) | 2015-06-18 | 2020-05-12 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR enzymes and systems |
WO2016205759A1 (en) | 2015-06-18 | 2016-12-22 | The Broad Institute Inc. | Engineering and optimization of systems, methods, enzymes and guide scaffolds of cas9 orthologs and variants for sequence manipulation |
EP3129393B1 (en) * | 2015-06-18 | 2021-08-04 | The Broad Institute Inc. | Crispr enzyme mutations reducing off-target effects |
AU2016279062A1 (en) | 2015-06-18 | 2019-03-28 | Omar O. Abudayyeh | Novel CRISPR enzymes and systems |
WO2016205745A2 (en) | 2015-06-18 | 2016-12-22 | The Broad Institute Inc. | Cell sorting |
EP3666895A1 (en) | 2015-06-18 | 2020-06-17 | The Broad Institute, Inc. | Novel crispr enzymes and systems |
US9790490B2 (en) * | 2015-06-18 | 2017-10-17 | The Broad Institute Inc. | CRISPR enzymes and systems |
US11414657B2 (en) | 2015-06-29 | 2022-08-16 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Modified CRISPR RNA and modified single CRISPR RNA and uses thereof |
RU2769873C2 (ru) | 2015-07-13 | 2022-04-07 | Пивот Байо, Инк. | Способы и композиции для улучшения признаков растений |
CA3168241A1 (en) | 2015-07-15 | 2017-01-19 | Rutgers. The State University of New Jersey | Nuclease-independent targeted gene editing platform and uses thereof |
US10676735B2 (en) | 2015-07-22 | 2020-06-09 | Duke University | High-throughput screening of regulatory element function with epigenome editing technologies |
US20170119820A1 (en) | 2015-07-31 | 2017-05-04 | Regents Of The University Of Minnesota | Modified cells and methods of therapy |
WO2017027392A1 (en) | 2015-08-07 | 2017-02-16 | Novartis Ag | Treatment of cancer using chimeric cd3 receptor proteins |
US9580727B1 (en) | 2015-08-07 | 2017-02-28 | Caribou Biosciences, Inc. | Compositions and methods of engineered CRISPR-Cas9 systems using split-nexus Cas9-associated polynucleotides |
US10709726B2 (en) | 2015-08-14 | 2020-07-14 | The University Of Sydney | Connexin 45 inhibition for therapy |
WO2017031370A1 (en) | 2015-08-18 | 2017-02-23 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for altering function and structure of chromatin loops and/or domains |
IL288662B2 (en) | 2015-08-25 | 2023-09-01 | Univ Duke | Preparations and methods for improving specificity in genomic engineering using RNA-guided endonucleases |
US9512446B1 (en) | 2015-08-28 | 2016-12-06 | The General Hospital Corporation | Engineered CRISPR-Cas9 nucleases |
WO2017040348A1 (en) | 2015-08-28 | 2017-03-09 | The General Hospital Corporation | Engineered crispr-cas9 nucleases |
US9926546B2 (en) | 2015-08-28 | 2018-03-27 | The General Hospital Corporation | Engineered CRISPR-Cas9 nucleases |
JP6664693B2 (ja) | 2015-09-09 | 2020-03-13 | 国立大学法人神戸大学 | 標的化したdna配列の核酸塩基を特異的に変換する、グラム陽性菌のゲノム配列の変換方法、及びそれに用いる分子複合体 |
IL241462A0 (en) | 2015-09-10 | 2015-11-30 | Yeda Res & Dev | Heterologous engineering of betalain pigments in plants |
CN108350453A (zh) | 2015-09-11 | 2018-07-31 | 通用医疗公司 | 核酸酶dsb的完全查询和测序(find-seq) |
US11667911B2 (en) | 2015-09-24 | 2023-06-06 | Editas Medicine, Inc. | Use of exonucleases to improve CRISPR/CAS-mediated genome editing |
CA3000762A1 (en) | 2015-09-30 | 2017-04-06 | The General Hospital Corporation | Comprehensive in vitro reporting of cleavage events by sequencing (circle-seq) |
JP2018537119A (ja) | 2015-10-05 | 2018-12-20 | マサチューセッツ インスティテュート オブ テクノロジー | リファクターされたnifクラスターを使用する窒素固定 |
WO2017069958A2 (en) | 2015-10-09 | 2017-04-27 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Modulation of novel immune checkpoint targets |
WO2017066175A1 (en) | 2015-10-12 | 2017-04-20 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Protected dna templates for gene modification and increased homologous recombination in cells and methods of use |
EP3362571A4 (en) | 2015-10-13 | 2019-07-10 | Duke University | GENOMIC ENGINEERING WITH TYPE I CRISPRISMS IN EUKARYOTIC CELLS |
JP6936952B2 (ja) * | 2015-10-16 | 2021-09-22 | アストラゼネカ アクチボラグ | 細胞ゲノムの誘導性改変 |
WO2017068077A1 (en) | 2015-10-20 | 2017-04-27 | Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale (Inserm) | Methods and products for genetic engineering |
CA2996329A1 (en) | 2015-10-20 | 2017-04-27 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Restoring function to a non-functional gene product via guided cas systems and methods of use |
CN116814590A (zh) | 2015-10-22 | 2023-09-29 | 布罗德研究所有限公司 | Vi-b型crispr酶和系统 |
DK3350327T3 (en) | 2015-10-23 | 2019-01-21 | Caribou Biosciences Inc | CONSTRUCTED CRISPR CLASS-2-NUCLEIC ACID TARGETING-NUCLEIC ACID |
JP7067793B2 (ja) | 2015-10-23 | 2022-05-16 | プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ | 核酸塩基編集因子およびその使用 |
US11492670B2 (en) | 2015-10-27 | 2022-11-08 | The Broad Institute Inc. | Compositions and methods for targeting cancer-specific sequence variations |
WO2017075465A1 (en) | 2015-10-28 | 2017-05-04 | The Broad Institute Inc. | Compositions and methods for evaluating and modulating immune responses by detecting and targeting gata3 |
WO2017075478A2 (en) | 2015-10-28 | 2017-05-04 | The Broad Institute Inc. | Compositions and methods for evaluating and modulating immune responses by use of immune cell gene signatures |
WO2017075451A1 (en) | 2015-10-28 | 2017-05-04 | The Broad Institute Inc. | Compositions and methods for evaluating and modulating immune responses by detecting and targeting pou2af1 |
WO2017075294A1 (en) | 2015-10-28 | 2017-05-04 | The Board Institute Inc. | Assays for massively combinatorial perturbation profiling and cellular circuit reconstruction |
US11092607B2 (en) | 2015-10-28 | 2021-08-17 | The Board Institute, Inc. | Multiplex analysis of single cell constituents |
GB2559526B (en) | 2015-11-03 | 2021-02-17 | Harvard College | Method and apparatus for volumetric imaging of a three-dimensional nucleic acid containing matrix |
AU2016349738A1 (en) * | 2015-11-06 | 2018-05-24 | The Jackson Laboratory | Large genomic DNA knock-in and uses thereof |
US10851367B2 (en) | 2015-11-12 | 2020-12-01 | Pfizer Inc. | Tissue-specific genome engineering using CRISPR-Cas9 |
ES2905558T3 (es) | 2015-11-13 | 2022-04-11 | Avellino Lab Usa Inc | Procedimientos para el tratamiento de las distrofias corneales |
WO2017083766A1 (en) * | 2015-11-13 | 2017-05-18 | Massachusetts Institute Of Technology | High-throughput crispr-based library screening |
BR112018009954A2 (pt) | 2015-11-16 | 2018-11-13 | Res Inst Nationwide Childrens Hospital | materiais e métodos para o tratamento de miopatias baseadas em titinas e outras titinopatias |
EP3377086B1 (en) | 2015-11-19 | 2024-05-01 | The Brigham and Women's Hospital, Inc. | Lymphocyte antigen cd5-like (cd5l)-interleukin 12b (p40) heterodimers in immunity |
CN108495932B (zh) * | 2015-11-27 | 2022-08-09 | 国立大学法人神户大学 | 用于特异性转换靶向dna序列的核酸碱基的单子叶植物的基因组序列的转换方法、及其使用的分子复合体 |
WO2017095940A1 (en) | 2015-11-30 | 2017-06-08 | Flagship Pioneering, Inc. | Methods and compositions relating to chondrisomes from cultured cells |
CN105296518A (zh) * | 2015-12-01 | 2016-02-03 | 中国农业大学 | 一种用于CRISPR/Cas9技术的同源臂载体构建方法 |
EP3371310B1 (en) | 2015-12-04 | 2019-05-01 | Caribou Biosciences, Inc. | Engineered nucleic-acid targeting nucleic acids |
US11208649B2 (en) | 2015-12-07 | 2021-12-28 | Zymergen Inc. | HTP genomic engineering platform |
JP6821598B2 (ja) | 2015-12-07 | 2021-01-27 | ザイマージェン インコーポレイテッド | Corynebacterium glutamicum由来のプロモーター |
US9988624B2 (en) | 2015-12-07 | 2018-06-05 | Zymergen Inc. | Microbial strain improvement by a HTP genomic engineering platform |
EP3387134B1 (en) | 2015-12-11 | 2020-10-14 | Danisco US Inc. | Methods and compositions for enhanced nuclease-mediated genome modification and reduced off-target site effects |
EP3390631B1 (en) | 2015-12-18 | 2020-04-08 | Danisco US Inc. | Methods and compositions for t-rna based guide rna expression |
US11542466B2 (en) | 2015-12-22 | 2023-01-03 | North Carolina State University | Methods and compositions for delivery of CRISPR based antimicrobials |
JP2019500394A (ja) | 2015-12-30 | 2019-01-10 | ノバルティス アーゲー | 有効性が増強された免疫エフェクター細胞治療 |
IL260532B2 (en) | 2016-01-11 | 2023-12-01 | Univ Leland Stanford Junior | Systems containing chaperone proteins and their uses for controlling gene expression |
EA201891614A1 (ru) | 2016-01-11 | 2019-02-28 | Те Борд Оф Трастиз Оф Те Лилэнд Стэнфорд Джуниор Юниверсити | Химерные белки и способы иммунотерапии |
BR112018015348A2 (pt) | 2016-01-26 | 2018-12-18 | Pioneer Hi Bred Int | método para obter uma planta de milho ceroso, planta, semente, polinucleotídeo-guia e método para produzir uma planta híbrida de milho ceroso |
WO2017139309A1 (en) | 2016-02-12 | 2017-08-17 | Ceres, Inc. | Methods and materials for high throughput testing of mutagenized allele combinations |
US20190249172A1 (en) | 2016-02-18 | 2019-08-15 | The Regents Of The University Of California | Methods and compositions for gene editing in stem cells |
EP3881857A1 (en) | 2016-02-18 | 2021-09-22 | The Penn State Research Foundation | Generating gabaergic neurons in brains |
EP3420102B1 (en) | 2016-02-22 | 2024-04-03 | Massachusetts Institute of Technology | Methods for identifying and modulating immune phenotypes |
US10538750B2 (en) | 2016-02-29 | 2020-01-21 | Agilent Technologies, Inc. | Methods and compositions for blocking off-target nucleic acids from cleavage by CRISPR proteins |
WO2017155715A1 (en) | 2016-03-11 | 2017-09-14 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Novel cas9 systems and methods of use |
EP3426780A1 (en) | 2016-03-11 | 2019-01-16 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Novel cas9 systems and methods of use |
CA3010628A1 (en) | 2016-03-11 | 2017-09-14 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Novel cas9 systems and methods of use |
JP2019515654A (ja) | 2016-03-16 | 2019-06-13 | ザ ジェイ. デヴィッド グラッドストーン インスティテューツ | 肥満及び/又は糖尿病を処置するための方法及び組成物、並びに候補処置薬剤を識別するための方法及び組成物 |
EP3219799A1 (en) | 2016-03-17 | 2017-09-20 | IMBA-Institut für Molekulare Biotechnologie GmbH | Conditional crispr sgrna expression |
US11427861B2 (en) | 2016-03-17 | 2022-08-30 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods for identifying and modulating co-occurant cellular phenotypes |
CA3016504A1 (en) * | 2016-03-23 | 2017-09-28 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Methods for enhancing the efficiency of gene editing |
US11597924B2 (en) | 2016-03-25 | 2023-03-07 | Editas Medicine, Inc. | Genome editing systems comprising repair-modulating enzyme molecules and methods of their use |
US11512311B2 (en) | 2016-03-25 | 2022-11-29 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for treating alpha 1-antitrypsin (A1AT) deficiency |
EP3443086B1 (en) | 2016-04-13 | 2021-11-24 | Editas Medicine, Inc. | Cas9 fusion molecules, gene editing systems, and methods of use thereof |
BR112018071096A2 (pt) | 2016-04-15 | 2019-02-26 | Novartis Ag | composições e métodos para a expressão da proteína seletiva |
EP3445853A1 (en) | 2016-04-19 | 2019-02-27 | The Broad Institute, Inc. | Cpf1 complexes with reduced indel activity |
CN105861485B (zh) * | 2016-04-20 | 2021-08-17 | 上海伊丽萨生物科技有限公司 | 一种提高基因置换效率的方法 |
CN109641063B (zh) | 2016-04-20 | 2022-11-15 | 能源环境和技术研究中心O.A., M.P. | 用于增强pklr的基因表达的组合物和方法 |
EP3449016A4 (en) | 2016-04-25 | 2019-10-02 | President and Fellows of Harvard College | HYBRIDIZATION CHAIN REACTION PROCESS FOR IN-SITU MOLECULE DETECTION |
WO2017201425A1 (en) * | 2016-05-20 | 2017-11-23 | The Trustees Columbia University In The City Of New York | Anabolic enhancers for ameliorating neurodegeneration |
EP3463371B1 (en) | 2016-05-24 | 2022-02-23 | Indiana University Research & Technology Corporation | Ku inhibitors and their use |
GB201609811D0 (en) | 2016-06-05 | 2016-07-20 | Snipr Technologies Ltd | Methods, cells, systems, arrays, RNA and kits |
US10767175B2 (en) | 2016-06-08 | 2020-09-08 | Agilent Technologies, Inc. | High specificity genome editing using chemically modified guide RNAs |
WO2017219027A1 (en) | 2016-06-17 | 2017-12-21 | The Broad Institute Inc. | Type vi crispr orthologs and systems |
US11202840B2 (en) | 2016-06-21 | 2021-12-21 | The Curators Of The University Of Missouri | Modified dystrophin proteins |
EP3474669B1 (en) | 2016-06-24 | 2022-04-06 | The Regents of The University of Colorado, A Body Corporate | Methods for generating barcoded combinatorial libraries |
US11471462B2 (en) | 2016-06-27 | 2022-10-18 | The Broad Institute, Inc. | Compositions and methods for detecting and treating diabetes |
US10544411B2 (en) | 2016-06-30 | 2020-01-28 | Zymergen Inc. | Methods for generating a glucose permease library and uses thereof |
EP3478833A4 (en) | 2016-06-30 | 2019-10-02 | Zymergen, Inc. | METHODS OF GENERATING A BACTERIAL HEMOGLOBIN LIBRARY AND USES THEREOF |
US20180004537A1 (en) | 2016-07-01 | 2018-01-04 | Microsoft Technology Licensing, Llc | Molecular State Machines |
US11359234B2 (en) * | 2016-07-01 | 2022-06-14 | Microsoft Technology Licensing, Llc | Barcoding sequences for identification of gene expression |
WO2018013840A1 (en) | 2016-07-13 | 2018-01-18 | Vertex Pharmaceuticals Incorporated | Methods, compositions and kits for increasing genome editing efficiency |
CN110461315A (zh) | 2016-07-15 | 2019-11-15 | 诺华股份有限公司 | 使用与激酶抑制剂组合的嵌合抗原受体治疗和预防细胞因子释放综合征 |
CA3032822A1 (en) | 2016-08-02 | 2018-02-08 | Editas Medicine, Inc. | Compositions and methods for treating cep290 associated disease |
US11078481B1 (en) | 2016-08-03 | 2021-08-03 | KSQ Therapeutics, Inc. | Methods for screening for cancer targets |
KR102547316B1 (ko) | 2016-08-03 | 2023-06-23 | 프레지던트 앤드 펠로우즈 오브 하바드 칼리지 | 아데노신 핵염기 편집제 및 그의 용도 |
US11661590B2 (en) | 2016-08-09 | 2023-05-30 | President And Fellows Of Harvard College | Programmable CAS9-recombinase fusion proteins and uses thereof |
WO2018030874A1 (ko) * | 2016-08-12 | 2018-02-15 | 주식회사 툴젠 | 조작된 면역조절요소 및 이에 의해 변형된 면역 활성 |
AU2017308473B2 (en) * | 2016-08-12 | 2021-08-19 | Toolgen Incorporated | Manipulated immunoregulatory element and immunity altered thereby |
US11630103B2 (en) | 2016-08-17 | 2023-04-18 | The Broad Institute, Inc. | Product and methods useful for modulating and evaluating immune responses |
US20210166783A1 (en) | 2016-08-17 | 2021-06-03 | The Broad Institute, Inc. | Methods for identifying class 2 crispr-cas systems |
WO2018035388A1 (en) | 2016-08-17 | 2018-02-22 | The Broad Institute, Inc. | Novel crispr enzymes and systems |
WO2020225754A1 (en) | 2019-05-06 | 2020-11-12 | Mcmullen Tara | Crispr gene editing for autosomal dominant diseases |
JP2019524149A (ja) * | 2016-08-20 | 2019-09-05 | アベリノ ラボ ユーエスエー インコーポレイテッドAvellino Lab USA, Inc. | 一本鎖ガイドRNA、CRISPR/Cas9システム、及びそれらの使用方法 |
US11542509B2 (en) | 2016-08-24 | 2023-01-03 | President And Fellows Of Harvard College | Incorporation of unnatural amino acids into proteins using base editing |
US11078483B1 (en) | 2016-09-02 | 2021-08-03 | KSQ Therapeutics, Inc. | Methods for measuring and improving CRISPR reagent function |
WO2018049025A2 (en) | 2016-09-07 | 2018-03-15 | The Broad Institute Inc. | Compositions and methods for evaluating and modulating immune responses |
WO2018049009A2 (en) | 2016-09-07 | 2018-03-15 | Sangamo Therapeutics, Inc. | Modulation of liver genes |
IL247752A0 (en) | 2016-09-11 | 2016-11-30 | Yeda Res & Dev | Compositions and methods for modulating gene expression for site-directed mutagenesis |
US20190225974A1 (en) | 2016-09-23 | 2019-07-25 | BASF Agricultural Solutions Seed US LLC | Targeted genome optimization in plants |
WO2018064387A1 (en) | 2016-09-28 | 2018-04-05 | Novartis Ag | Porous membrane-based macromolecule delivery system |
MX2019003674A (es) | 2016-09-30 | 2021-01-08 | Univ California | Enzimas modificadoras de ácido nucleico guiadas por arn y métodos de uso de estas. |
EP3518981A4 (en) | 2016-10-03 | 2020-06-10 | President and Fellows of Harvard College | DELIVERING THERAPEUTIC RNAS VIA ARRDC1-MEDIATED MICROVESICLES |
US10669539B2 (en) | 2016-10-06 | 2020-06-02 | Pioneer Biolabs, Llc | Methods and compositions for generating CRISPR guide RNA libraries |
WO2018067991A1 (en) | 2016-10-07 | 2018-04-12 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Modulation of novel immune checkpoint targets |
CN109844121A (zh) | 2016-10-13 | 2019-06-04 | 先锋国际良种公司 | 产生北方叶枯病抗性玉蜀黍 |
US11306324B2 (en) | 2016-10-14 | 2022-04-19 | President And Fellows Of Harvard College | AAV delivery of nucleobase editors |
GB201617559D0 (en) | 2016-10-17 | 2016-11-30 | University Court Of The University Of Edinburgh The | Swine comprising modified cd163 and associated methods |
GB2573406B (en) | 2016-10-18 | 2021-11-10 | Univ Minnesota | Tumor infiltrating lymphocytes and methods of therapy |
EP3532615A1 (en) * | 2016-10-28 | 2019-09-04 | Genethon | Compositions and methods for the treatment of myotonic dystrophy |
WO2018081531A2 (en) | 2016-10-28 | 2018-05-03 | Ariad Pharmaceuticals, Inc. | Methods for human t-cell activation |
WO2018076335A1 (en) | 2016-10-31 | 2018-05-03 | Institute Of Genetics And Developmental Biology, Chinese Academy Of Sciences | Compositions and methods for enhancing abiotic stress tolerance |
EP3535396A1 (en) | 2016-11-01 | 2019-09-11 | Novartis AG | Methods and compositions for enhancing gene editing |
CA3042259A1 (en) | 2016-11-04 | 2018-05-11 | Flagship Pioneering Innovations V. Inc. | Novel plant cells, plants, and seeds |
WO2018091971A1 (en) | 2016-11-15 | 2018-05-24 | Genomic Vision | Method for the monitoring of modified nucleases induced-gene editing events by molecular combing |
CN110199031A (zh) | 2016-11-29 | 2019-09-03 | 基因组影像公司 | 设计用于分析感兴趣的遗传区域中的特定事件的一组多核苷酸序列的方法 |
US9816093B1 (en) | 2016-12-06 | 2017-11-14 | Caribou Biosciences, Inc. | Engineered nucleic acid-targeting nucleic acids |
US11180535B1 (en) | 2016-12-07 | 2021-11-23 | David Gordon Bermudes | Saccharide binding, tumor penetration, and cytotoxic antitumor chimeric peptides from therapeutic bacteria |
US11129906B1 (en) | 2016-12-07 | 2021-09-28 | David Gordon Bermudes | Chimeric protein toxins for expression by therapeutic bacteria |
JP7317706B2 (ja) | 2016-12-14 | 2023-07-31 | リガンダル インコーポレイテッド | 核酸およびタンパク質ペイロード送達のための方法および組成物 |
US10745677B2 (en) | 2016-12-23 | 2020-08-18 | President And Fellows Of Harvard College | Editing of CCR5 receptor gene to protect against HIV infection |
WO2018129129A1 (en) | 2017-01-05 | 2018-07-12 | Rutgers, The State University Of New Jersey | Targeted gene editing platform independent of dna double strand break and uses thereof |
WO2018127585A1 (en) | 2017-01-06 | 2018-07-12 | Txcell | Monospecific regulatory t cell population with cytotoxicity for b cells |
EP3346001A1 (en) | 2017-01-06 | 2018-07-11 | TXCell | Monospecific regulatory t cell population with cytotoxicity for b cells |
US11519009B2 (en) | 2017-01-09 | 2022-12-06 | University Of Massachusetts | Complexes for gene deletion and editing |
EP3568385A4 (en) | 2017-01-12 | 2021-03-03 | Pivot Bio, Inc. | PROCEDURES AND COMPOSITIONS FOR IMPROVING PLANT PROPERTIES |
WO2018140725A1 (en) | 2017-01-26 | 2018-08-02 | Novartis Ag | Cd28 compositions and methods for chimeric antigen receptor therapy |
EP3573448A4 (en) | 2017-01-28 | 2020-09-02 | Inari Agriculture, Inc. | NEW PLANT CELLS, PLANTS AND SEEDS |
CN110582509A (zh) | 2017-01-31 | 2019-12-17 | 诺华股份有限公司 | 使用具有多特异性的嵌合t细胞受体蛋白治疗癌症 |
TW201839136A (zh) | 2017-02-06 | 2018-11-01 | 瑞士商諾華公司 | 治療血色素異常症之組合物及方法 |
WO2018148511A1 (en) | 2017-02-10 | 2018-08-16 | Zymergen Inc. | A modular universal plasmid design strategy for the assembly and editing of multiple dna constructs for multiple hosts |
US10828330B2 (en) | 2017-02-22 | 2020-11-10 | IO Bioscience, Inc. | Nucleic acid constructs comprising gene editing multi-sites and uses thereof |
CA3054307A1 (en) * | 2017-02-22 | 2018-08-30 | Io Biosciences, Inc. | Nucleic acid constructs comprising gene editing multi-sites and uses thereof |
EP3589647A1 (en) | 2017-02-28 | 2020-01-08 | Novartis AG | Shp inhibitor compositions and uses for chimeric antigen receptor therapy |
WO2018165504A1 (en) | 2017-03-09 | 2018-09-13 | President And Fellows Of Harvard College | Suppression of pain by gene editing |
EP3592777A1 (en) | 2017-03-10 | 2020-01-15 | President and Fellows of Harvard College | Cytosine to guanine base editor |
EP3596217A1 (en) | 2017-03-14 | 2020-01-22 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for the treatment of hemoglobinopathies |
EP4361261A2 (en) | 2017-03-15 | 2024-05-01 | The Broad Institute Inc. | Novel cas13b orthologues crispr enzymes and systems |
US20180265887A1 (en) | 2017-03-16 | 2018-09-20 | Jacobs Farm Del Cabo | Basil Plants With High Tolerance to Downy Mildew |
WO2018170515A1 (en) | 2017-03-17 | 2018-09-20 | The Broad Institute, Inc. | Methods for identifying and modulating co-occurant cellular phenotypes |
IL306092A (en) | 2017-03-23 | 2023-11-01 | Harvard College | Nucleic base editors that include nucleic acid programmable DNA binding proteins |
WO2018183908A1 (en) | 2017-03-31 | 2018-10-04 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Compositions and methods for treating ovarian tumors |
CN110709519B (zh) | 2017-03-31 | 2023-09-15 | 先锋国际良种公司 | 表达调控元件及其用途 |
WO2018183921A1 (en) | 2017-04-01 | 2018-10-04 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for detecting and modulating an immunotherapy resistance gene signature in cancer |
BR112019021378A2 (pt) | 2017-04-12 | 2020-05-05 | Massachusetts Inst Technology | ortólogos de crispr tipo vi inovadores e sistemas |
US20200071773A1 (en) | 2017-04-12 | 2020-03-05 | Massachusetts Eye And Ear Infirmary | Tumor signature for metastasis, compositions of matter methods of use thereof |
US20210115407A1 (en) | 2017-04-12 | 2021-04-22 | The Broad Institute, Inc. | Respiratory and sweat gland ionocytes |
US20200405639A1 (en) | 2017-04-14 | 2020-12-31 | The Broad Institute, Inc. | Novel delivery of large payloads |
MX2019012398A (es) | 2017-04-18 | 2020-09-25 | Broad Inst Inc | Composiciones para detectar secreciones y metodos de uso. |
US11834670B2 (en) | 2017-04-19 | 2023-12-05 | Global Life Sciences Solutions Usa Llc | Site-specific DNA modification using a donor DNA repair template having tandem repeat sequences |
CN110799525A (zh) | 2017-04-21 | 2020-02-14 | 通用医疗公司 | 具有改变的PAM特异性的CPF1(CAS12a)的变体 |
WO2018195486A1 (en) | 2017-04-21 | 2018-10-25 | The Broad Institute, Inc. | Targeted delivery to beta cells |
US20200179511A1 (en) | 2017-04-28 | 2020-06-11 | Novartis Ag | Bcma-targeting agent, and combination therapy with a gamma secretase inhibitor |
EP3615672A1 (en) | 2017-04-28 | 2020-03-04 | Editas Medicine, Inc. | Methods and systems for analyzing guide rna molecules |
EP3615055A1 (en) | 2017-04-28 | 2020-03-04 | Novartis AG | Cells expressing a bcma-targeting chimeric antigen receptor, and combination therapy with a gamma secretase inhibitor |
US11591601B2 (en) | 2017-05-05 | 2023-02-28 | The Broad Institute, Inc. | Methods for identification and modification of lncRNA associated with target genotypes and phenotypes |
EP3622070A2 (en) | 2017-05-10 | 2020-03-18 | Editas Medicine, Inc. | Crispr/rna-guided nuclease systems and methods |
WO2018209320A1 (en) | 2017-05-12 | 2018-11-15 | President And Fellows Of Harvard College | Aptazyme-embedded guide rnas for use with crispr-cas9 in genome editing and transcriptional activation |
AU2018270088B2 (en) | 2017-05-18 | 2024-05-16 | Massachusetts Institute Of Technology | Systems, methods, and compositions for targeted nucleic acid editing |
CA3063449A1 (en) | 2017-05-25 | 2018-11-29 | The General Hospital Corporation | Using split deaminases to limit unwanted off-target base editor deamination |
EP3409104A1 (en) | 2017-05-31 | 2018-12-05 | Vilmorin et Cie | Tomato plant resistant to tomato yellow leaf curl virus, powdery mildew, and nematodes |
WO2020249996A1 (en) | 2019-06-14 | 2020-12-17 | Vilmorin & Cie | Resistance in plants of solanum lycopersicum to the tobamovirus tomato brown rugose fruit virus |
EP3409106A1 (en) | 2017-06-01 | 2018-12-05 | Vilmorin et Cie | Tolerance in plants of solanum lycopersicum to the tobamovirus tomato brown rugose fruit virus (tbrfv) |
WO2018226762A1 (en) | 2017-06-05 | 2018-12-13 | Fred Hutchinson Cancer Research Center | Genomic safe harbors for genetic therapies in human stem cells and engineered nanoparticles to provide targeted genetic therapies |
AU2018280116A1 (en) | 2017-06-05 | 2020-01-02 | Research Institute At Nationwide Children's Hospital | Enhanced modified viral capsid proteins |
US20200370058A1 (en) | 2017-06-06 | 2020-11-26 | Zymergen Inc. | A htp genomic engineering platform for improving escherichia coli |
CA3061984A1 (en) | 2017-06-06 | 2018-12-13 | Zymergen Inc. | A htp genomic engineering platform for improving fungal strains |
BR112019025717A2 (pt) * | 2017-06-08 | 2020-09-01 | Osaka University | método para produzir célula eucariótica de dna editado e kit usado no mesmo |
WO2018226972A2 (en) | 2017-06-09 | 2018-12-13 | Vilmorin & Cie | Compositions and methods for genome editing |
US10428319B2 (en) | 2017-06-09 | 2019-10-01 | Editas Medicine, Inc. | Engineered Cas9 nucleases |
RU2020100074A (ru) | 2017-06-13 | 2021-08-03 | Флэгшип Пайониринг Инновейшнз V, Инк. | Композиции, содержащие куроны, и пути их применения |
WO2018232195A1 (en) | 2017-06-14 | 2018-12-20 | The Broad Institute, Inc. | Compositions and methods targeting complement component 3 for inhibiting tumor growth |
CA3067382A1 (en) | 2017-06-15 | 2018-12-20 | The Regents Of The University Of California | Targeted non-viral dna insertions |
US9982279B1 (en) | 2017-06-23 | 2018-05-29 | Inscripta, Inc. | Nucleic acid-guided nucleases |
US10011849B1 (en) | 2017-06-23 | 2018-07-03 | Inscripta, Inc. | Nucleic acid-guided nucleases |
JP7454494B2 (ja) | 2017-06-26 | 2024-03-22 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド | 標的化された核酸編集のためのcrispr/cas-アデニンデアミナーゼ系の組成物、系及び方法 |
US10392616B2 (en) | 2017-06-30 | 2019-08-27 | Arbor Biotechnologies, Inc. | CRISPR RNA targeting enzymes and systems and uses thereof |
WO2019003193A1 (en) | 2017-06-30 | 2019-01-03 | Novartis Ag | METHODS FOR TREATING DISEASES USING GENE EDITING SYSTEMS |
EP3645021A4 (en) | 2017-06-30 | 2021-04-21 | Intima Bioscience, Inc. | ADENO-ASSOCIATED VIRAL VECTORS FOR GENE THERAPY |
US11866726B2 (en) | 2017-07-14 | 2024-01-09 | Editas Medicine, Inc. | Systems and methods for targeted integration and genome editing and detection thereof using integrated priming sites |
WO2019016175A1 (en) * | 2017-07-18 | 2019-01-24 | Genovie Ab | TWO-COMPONENT VECTOR LIBRARY SYSTEM FOR RAPID ASSEMBLY AND DIVERSIFICATION OF FULL-LENGTH T-CELL RECEPTOR OPEN READER FRAMES |
US10510743B2 (en) * | 2017-07-18 | 2019-12-17 | Hong Kong Applied Science and Technology Research Institute Company, Limited | Step fin field-effect-transistor (FinFET) with slim top of fin and thick bottom of fin for electro-static-discharge (ESD) or electrical over-stress (EOS) protection |
WO2019023291A2 (en) | 2017-07-25 | 2019-01-31 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | COMPOSITIONS AND METHODS FOR PRODUCTION AND DECODING OF GUIDE RNA LIBRARIES AND USES THEREOF |
CN111801345A (zh) | 2017-07-28 | 2020-10-20 | 哈佛大学的校长及成员们 | 使用噬菌体辅助连续进化(pace)的进化碱基编辑器的方法和组合物 |
EP3625356B1 (en) | 2017-08-08 | 2021-05-19 | Depixus | In vitro isolation and enrichment of nucleic acids using site-specific nucleases |
US10476825B2 (en) | 2017-08-22 | 2019-11-12 | Salk Institue for Biological Studies | RNA targeting methods and compositions |
US11970720B2 (en) | 2017-08-22 | 2024-04-30 | Salk Institute For Biological Studies | RNA targeting methods and compositions |
US11286468B2 (en) | 2017-08-23 | 2022-03-29 | The General Hospital Corporation | Engineered CRISPR-Cas9 nucleases with altered PAM specificity |
US10195290B1 (en) | 2017-08-25 | 2019-02-05 | Codiak Biosciences, Inc. | Preparation of therapeutic exosomes using membrane proteins |
US11319532B2 (en) | 2017-08-30 | 2022-05-03 | President And Fellows Of Harvard College | High efficiency base editors comprising Gam |
AR113064A1 (es) | 2017-09-15 | 2020-01-22 | Covercress Inc | Composición que comprende harina de carraspique con bajo contenido de fibras y métodos para su elaboración |
JP7317023B2 (ja) | 2017-09-20 | 2023-07-28 | ザ・ユニバーシティ・オブ・ブリティッシュ・コロンビア | 新規抗hla-a2抗体、およびその使用 |
CN109517820B (zh) | 2017-09-20 | 2021-09-24 | 北京宇繁生物科技有限公司 | 一种靶向HPK1的gRNA以及HPK1基因编辑方法 |
EP3684389A4 (en) | 2017-09-21 | 2021-06-16 | Dana Farber Cancer Institute, Inc. | INSULATION, PRESERVATION, COMPOSITIONS AND USES OF EXTRACTS FROM JUSTICIA PLANTS |
CA3073848A1 (en) | 2017-09-21 | 2019-03-28 | The Broad Institute, Inc. | Systems, methods, and compositions for targeted nucleic acid editing |
US11252928B2 (en) | 2017-09-21 | 2022-02-22 | The Condard-Pyle Company | Miniature rose plant named ‘Meibenbino’ |
US11917978B2 (en) | 2017-09-21 | 2024-03-05 | The Conard Pyle Company | Miniature rose plant named ‘meibenbino’ |
US20200255828A1 (en) | 2017-10-04 | 2020-08-13 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for altering function and structure of chromatin loops and/or domains |
US11725228B2 (en) | 2017-10-11 | 2023-08-15 | The General Hospital Corporation | Methods for detecting site-specific and spurious genomic deamination induced by base editing technologies |
US11642422B2 (en) | 2017-10-16 | 2023-05-09 | Centro de Investigaciones Energéticas, Medioambientales y Tecnológicas, O.A, M.P. | Lentiviral vectors for delivery of PKLR to treat pyruvate kinase deficiency |
JP2021500036A (ja) | 2017-10-16 | 2021-01-07 | ザ ブロード インスティテュート, インコーポレーテッドThe Broad Institute, Inc. | アデノシン塩基編集因子の使用 |
US11680296B2 (en) | 2017-10-16 | 2023-06-20 | Massachusetts Institute Of Technology | Mycobacterium tuberculosis host-pathogen interaction |
JP7383607B2 (ja) | 2017-10-20 | 2023-11-20 | フレッド ハッチンソン キャンサー センター | 選択された抗体を発現するように遺伝子改変されたb細胞を産生するシステム及び方法 |
JP7420712B2 (ja) | 2017-10-25 | 2024-01-23 | ピボット バイオ, インコーポレイテッド | 窒素を固定する操作された微生物を改良するための方法および組成物 |
CA3080415A1 (en) | 2017-10-27 | 2019-05-02 | The Regents Of The University Of California | Targeted replacement of endogenous t cell receptors |
WO2019089803A1 (en) | 2017-10-31 | 2019-05-09 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for studying cell evolution |
US20210179709A1 (en) | 2017-10-31 | 2021-06-17 | Novartis Ag | Anti-car compositions and methods |
US20210180053A1 (en) | 2017-11-01 | 2021-06-17 | Novartis Ag | Synthetic rnas and methods of use |
KR20200091858A (ko) | 2017-11-01 | 2020-07-31 | 더 리젠츠 오브 더 유니버시티 오브 캘리포니아 | CasZ 조성물 및 사용 방법 |
WO2019090175A1 (en) | 2017-11-02 | 2019-05-09 | Arbor Biotechnologies, Inc. | Novel crispr-associated transposon systems and components |
EP3710039A4 (en) | 2017-11-13 | 2021-08-04 | The Broad Institute, Inc. | METHODS AND COMPOSITIONS FOR CANCER TREATMENT BY TARGETING THE CLEC2D-KLRB1 PATH |
US20200277573A1 (en) | 2017-11-17 | 2020-09-03 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Til expansion from fine needle aspirates and small biopsies |
JP2021503885A (ja) | 2017-11-22 | 2021-02-15 | アイオバンス バイオセラピューティクス,インコーポレイテッド | 末梢血からの末梢血リンパ球(pbl)の拡大培養 |
WO2019112982A1 (en) * | 2017-12-05 | 2019-06-13 | Synthetic Genomics, Inc | Improving algal lipid productivity via genetic modification of a signaling protein |
WO2019113506A1 (en) | 2017-12-07 | 2019-06-13 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for multiplexing single cell and single nuclei sequencing |
US11124798B2 (en) | 2017-12-08 | 2021-09-21 | Synthetic Genomics, Inc. | Algal lipid productivity via genetic modification of a TPR domain containing protein |
CA3078682A1 (en) | 2017-12-15 | 2019-06-20 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Stabilized peptide-mediated targeted protein degradation |
EP3707253A1 (en) | 2017-12-15 | 2020-09-16 | Danisco US Inc. | Cas9 variants and methods of use |
EA202091134A1 (ru) | 2017-12-28 | 2020-11-20 | Кодиак Байосайенсес, Инк. | Экзосомы для иммуноонкологической и противовоспалительной терапии |
WO2019133881A1 (en) | 2017-12-29 | 2019-07-04 | Rubius Therapeutics, Inc. | Gene editing and targeted transcriptional modulation for enginerering erythroid cells |
US11994512B2 (en) | 2018-01-04 | 2024-05-28 | Massachusetts Institute Of Technology | Single-cell genomic methods to generate ex vivo cell systems that recapitulate in vivo biology with improved fidelity |
CN111566121A (zh) | 2018-01-12 | 2020-08-21 | 巴斯夫欧洲公司 | 小麦7a染色体上决定每穗小穗数QTL的基因 |
IL276082B2 (en) | 2018-01-17 | 2024-01-01 | Vertex Pharma | DNA-PK inhibitor compounds, preparations containing them and their uses |
EA202091708A1 (ru) | 2018-01-17 | 2020-11-10 | Вертекс Фармасьютикалз Инкорпорейтед | Ингибиторы днк-пк |
CN111770921B (zh) | 2018-01-17 | 2024-03-22 | 沃泰克斯药物股份有限公司 | 用于提高基因组编辑效率的喹喔啉酮化合物,组合物,方法和试剂盒 |
US20190233816A1 (en) | 2018-01-26 | 2019-08-01 | Massachusetts Institute Of Technology | Structure-guided chemical modification of guide rna and its applications |
US11926835B1 (en) | 2018-01-29 | 2024-03-12 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Methods for efficient tomato genome editing |
KR102136132B1 (ko) * | 2018-01-31 | 2020-07-22 | 서울대학교 산학협력단 | CRISPR/Cas9 시스템을 통한 닭 백혈병 바이러스(Avian Leukosis Virus, ALV) 저항성 조류의 제조방법 |
CN111699254A (zh) | 2018-02-08 | 2020-09-22 | 齐默尔根公司 | 使用crispr在棒状杆菌属中进行基因组编辑 |
US11390876B2 (en) | 2018-03-09 | 2022-07-19 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Compositions and methods for modification of fatty acids in soybean |
CA3093334A1 (en) | 2018-03-14 | 2019-09-19 | Arbor Biotechnologies, Inc. | Novel crispr dna targeting enzymes and systems |
PT3765616T (pt) | 2018-03-14 | 2023-08-28 | Arbor Biotechnologies Inc | Novas enzimas e sistemas de direcionamento de dna e rna crispr |
US10760075B2 (en) | 2018-04-30 | 2020-09-01 | Snipr Biome Aps | Treating and preventing microbial infections |
CA3096274A1 (en) | 2018-04-06 | 2019-10-10 | Children's Medical Center Corporation | Compositions and methods for somatic cell reprogramming and modulating imprinting |
KR20210005879A (ko) | 2018-04-13 | 2021-01-15 | 상가모 테라퓨틱스 프랑스 | 인터류킨-23 수용체에 특이적인 키메라 항원 수용체 |
WO2019204378A1 (en) | 2018-04-17 | 2019-10-24 | The General Hospital Corporation | Sensitive in vitro assays for substrate preferences and sites of nucleic acid binding, modifying, and cleaving agents |
WO2019204585A1 (en) | 2018-04-19 | 2019-10-24 | Massachusetts Institute Of Technology | Single-stranded break detection in double-stranded dna |
SG11202009783WA (en) | 2018-04-19 | 2020-11-27 | Univ California | Compositions and methods for gene editing |
ES2922902T3 (es) | 2018-04-24 | 2022-09-21 | Kws Saat Se & Co Kgaa | Plantas con digestibilidad mejorada y haplotipos marcadores |
US11957695B2 (en) | 2018-04-26 | 2024-04-16 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions targeting glucocorticoid signaling for modulating immune responses |
WO2019210268A2 (en) | 2018-04-27 | 2019-10-31 | The Broad Institute, Inc. | Sequencing-based proteomics |
JP2021522385A (ja) | 2018-04-27 | 2021-08-30 | ジーンエディット インコーポレイテッド | カチオン性ポリマーおよびその生体分子送達のための使用 |
SG11202010319RA (en) | 2018-04-27 | 2020-11-27 | Iovance Biotherapeutics Inc | Closed process for expansion and gene editing of tumor infiltrating lymphocytes and uses of same in immunotherapy |
US20210047405A1 (en) | 2018-04-27 | 2021-02-18 | Novartis Ag | Car t cell therapies with enhanced efficacy |
US20210386829A1 (en) | 2018-05-04 | 2021-12-16 | The Broad Institute, Inc. | Compositions and methods for modulating cgrp signaling to regulate innate lymphoid cell inflammatory responses |
JP2021523745A (ja) | 2018-05-16 | 2021-09-09 | シンテゴ コーポレイション | ガイドrna設計および使用のための方法およびシステム |
US20210198664A1 (en) | 2018-05-16 | 2021-07-01 | Arbor Biotechnologies, Inc. | Novel crispr-associated systems and components |
WO2019226984A2 (en) | 2018-05-25 | 2019-11-28 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Systems and methods for improved breeding by modulating recombination rates |
CN108707628B (zh) * | 2018-05-28 | 2021-11-23 | 上海海洋大学 | 斑马鱼notch2基因突变体的制备方法 |
WO2019232542A2 (en) | 2018-06-01 | 2019-12-05 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods and compositions for detecting and modulating microenvironment gene signatures from the csf of metastasis patients |
US11866719B1 (en) | 2018-06-04 | 2024-01-09 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Heterologous integration of regulatory elements to alter gene expression in wheat cells and wheat plants |
EP3578658A1 (en) * | 2018-06-08 | 2019-12-11 | Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt | Method for generating a gene editing vector with fixed guide rna pairs |
EP3806888B1 (en) | 2018-06-12 | 2024-01-31 | Obsidian Therapeutics, Inc. | Pde5 derived regulatory constructs and methods of use in immunotherapy |
WO2019241426A1 (en) | 2018-06-13 | 2019-12-19 | Novartis Ag | Bcma chimeric antigen receptors and uses thereof |
US11441195B2 (en) * | 2018-06-19 | 2022-09-13 | Lunella Biotech, Inc. | Energetic cancer stem cells (e-CSCs): a new hyper-metabolic and proliferative tumor cell phenotype, driven by mitochondrial energy |
JP2021528975A (ja) | 2018-06-26 | 2021-10-28 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッド | Crispr/cas及びトランスポザーゼを利用した増幅用の組成物、システム、及び方法 |
MX2020013836A (es) | 2018-06-26 | 2021-05-27 | Massachusetts Inst Technology | Métodos, sistemas y diagnósticos de amplificación basados en el sistema efector crispr. |
BR112020026771A2 (pt) | 2018-06-27 | 2021-03-30 | Pivot Bio, Inc. | Composições agrícolas que compreendem micróbios de fixação de nitrogênio remodelados |
EP3814369A1 (en) | 2018-06-29 | 2021-05-05 | Stichting Het Nederlands Kanker Instituut- Antoni van Leeuwenhoek Ziekenhuis | Tweak-receptor agonists for use in combination with immunotherapy of a cancer |
WO2020014528A1 (en) | 2018-07-13 | 2020-01-16 | The Regents Of The University Of California | Retrotransposon-based delivery vehicle and methods of use thereof |
US20210301288A1 (en) | 2018-07-16 | 2021-09-30 | Arbor Biotechnologies, Inc. | Novel crispr dna targeting enzymes and systems |
SG11202102068TA (en) | 2018-07-31 | 2021-03-30 | Broad Inst Inc | Novel crispr enzymes and systems |
WO2020028729A1 (en) | 2018-08-01 | 2020-02-06 | Mammoth Biosciences, Inc. | Programmable nuclease compositions and methods of use thereof |
CA3106035A1 (en) | 2018-08-07 | 2020-02-13 | The Broad Institute, Inc. | Cas12b enzymes and systems |
EP3607819A1 (en) | 2018-08-10 | 2020-02-12 | Vilmorin et Cie | Resistance to xanthomonas campestris pv. campestris (xcc) in cauliflower |
MX2021001592A (es) | 2018-08-10 | 2021-09-21 | Sangamo Therapeutics France | Nuevas construcciones de car que comprenden dominios de tnfr2. |
WO2020086144A2 (en) | 2018-08-15 | 2020-04-30 | Zymergen Inc. | APPLICATIONS OF CRISPRi IN HIGH THROUGHPUT METABOLIC ENGINEERING |
US20210324357A1 (en) | 2018-08-20 | 2021-10-21 | The Brigham And Women's Hospital, Inc. | Degradation domain modifications for spatio-temporal control of rna-guided nucleases |
US20210317429A1 (en) | 2018-08-20 | 2021-10-14 | The Broad Institute, Inc. | Methods and compositions for optochemical control of crispr-cas9 |
JP2021536229A (ja) | 2018-08-23 | 2021-12-27 | サンガモ セラピューティクス, インコーポレイテッド | 操作された標的特異的な塩基エディター |
US11479762B1 (en) | 2018-08-31 | 2022-10-25 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Compositions, systems, and methods for genome editing |
WO2020051507A1 (en) | 2018-09-06 | 2020-03-12 | The Broad Institute, Inc. | Nucleic acid assemblies for use in targeted delivery |
EP4268831A3 (en) | 2018-09-12 | 2024-05-22 | Fred Hutchinson Cancer Center | Reducing cd33 expression to selectively protect therapeutic cells |
US20220088224A1 (en) | 2018-09-18 | 2022-03-24 | Vnv Newco Inc. | Arc-based capsids and uses thereof |
CN109265562B (zh) * | 2018-09-26 | 2021-03-30 | 北京市农林科学院 | 一种切刻酶及其在基因组碱基替换中的应用 |
GB201815820D0 (en) | 2018-09-28 | 2018-11-14 | Univ Wageningen | Off-target activity inhibitors for guided endonucleases |
EP3861120A4 (en) | 2018-10-01 | 2023-08-16 | North Carolina State University | RECOMBINANT TYPE I CRISPR-CAS SYSTEM |
US20220411783A1 (en) | 2018-10-12 | 2022-12-29 | The Broad Institute, Inc. | Method for extracting nuclei or whole cells from formalin-fixed paraffin-embedded tissues |
US11851663B2 (en) | 2018-10-14 | 2023-12-26 | Snipr Biome Aps | Single-vector type I vectors |
WO2020081730A2 (en) | 2018-10-16 | 2020-04-23 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods and compositions for modulating microenvironment |
WO2020086910A1 (en) | 2018-10-24 | 2020-04-30 | Genedit Inc. | Cationic polymer with alkyl side chains and use for biomolecule delivery |
WO2020086742A1 (en) | 2018-10-24 | 2020-04-30 | Obsidian Therapeutics, Inc. | Er tunable protein regulation |
US11407995B1 (en) | 2018-10-26 | 2022-08-09 | Inari Agriculture Technology, Inc. | RNA-guided nucleases and DNA binding proteins |
CN111757889B (zh) * | 2018-10-29 | 2021-05-25 | 中国农业大学 | 新型CRISPR/Cas12f酶和系统 |
KR20210088615A (ko) | 2018-10-31 | 2021-07-14 | 지머젠 인코포레이티드 | Dna 라이브러리의 다중 결정적 어셈블리 |
JP2022505671A (ja) | 2018-10-31 | 2022-01-14 | パイオニア ハイ-ブレッド インターナショナル, インコーポレイテッド | オクロバクトラム媒介遺伝子編集のための組成物及び方法 |
WO2020093025A1 (en) * | 2018-11-01 | 2020-05-07 | Synthego Corporation | Methods for knock-out of a target sequence through introduction of a premature stop codon |
US11434477B1 (en) | 2018-11-02 | 2022-09-06 | Inari Agriculture Technology, Inc. | RNA-guided nucleases and DNA binding proteins |
EP3877513A2 (en) | 2018-11-05 | 2021-09-15 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Processes for production of tumor infiltrating lymphocytes and uses of the same in immunotherapy |
JP2022512899A (ja) | 2018-11-05 | 2022-02-07 | アイオバンス バイオセラピューティクス,インコーポレイテッド | 抗pd-1抗体に対して不応性のnsclc患者の治療 |
MX2021004775A (es) | 2018-11-05 | 2021-06-08 | Iovance Biotherapeutics Inc | Expansion de linfocitos infiltrantes de tumores (tils) usando inhibidores de la via de proteina cinasa b (akt). |
JP2022512915A (ja) | 2018-11-05 | 2022-02-07 | アイオバンス バイオセラピューティクス,インコーポレイテッド | 改良された腫瘍反応性t細胞の選択 |
WO2020102659A1 (en) | 2018-11-15 | 2020-05-22 | The Broad Institute, Inc. | G-to-t base editors and uses thereof |
US11166996B2 (en) | 2018-12-12 | 2021-11-09 | Flagship Pioneering Innovations V, Inc. | Anellovirus compositions and methods of use |
CA3117228A1 (en) | 2018-12-14 | 2020-06-18 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Novel crispr-cas systems for genome editing |
WO2020131586A2 (en) | 2018-12-17 | 2020-06-25 | The Broad Institute, Inc. | Methods for identifying neoantigens |
CA3124110A1 (en) | 2018-12-17 | 2020-06-25 | The Broad Institute, Inc. | Crispr-associated transposase systems and methods of use thereof |
EP3877525A2 (en) | 2018-12-18 | 2021-09-15 | Braskem S.A. | Co-production pathway for 3-hp and acetyl-coa derivatives from malonate semialdehyde |
CA3123392A1 (en) | 2018-12-19 | 2020-06-25 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Methods of expanding tumor infiltrating lymphocytes using engineered cytokine receptor pairs and uses thereof |
CN113825393A (zh) | 2018-12-21 | 2021-12-21 | 皮沃特生物股份有限公司 | 改善植物性状的方法、组合物和培养基 |
US20200208160A1 (en) | 2018-12-28 | 2020-07-02 | Braskem S.A. | Modulation of carbon flux through the meg and c3 pathways for the improved production of monoethylene glycol and c3 compounds |
US20220073626A1 (en) | 2019-01-03 | 2022-03-10 | Institut National De La Santé Et De La Recheche Médicale (Inserm) | Methods and pharmaceutical compositions for enhancing cd8+ t cell-dependent immune responses in subjects suffering from cancer |
EP3931313A2 (en) | 2019-01-04 | 2022-01-05 | Mammoth Biosciences, Inc. | Programmable nuclease improvements and compositions and methods for nucleic acid amplification and detection |
US11739156B2 (en) | 2019-01-06 | 2023-08-29 | The Broad Institute, Inc. Massachusetts Institute of Technology | Methods and compositions for overcoming immunosuppression |
EP3911746A1 (en) | 2019-01-14 | 2021-11-24 | Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) | Methods and kits for generating and selecting a variant of a binding protein with increased binding affinity and/or specificity |
US11946040B2 (en) | 2019-02-04 | 2024-04-02 | The General Hospital Corporation | Adenine DNA base editor variants with reduced off-target RNA editing |
AU2020219078A1 (en) | 2019-02-06 | 2021-08-26 | Fred Hutchinson Cancer Center | Minicircle producing bacteria engineered to differentially methylate nucleic acid molecules therein |
US20220145330A1 (en) | 2019-02-10 | 2022-05-12 | The J. David Gladstone Institutes, a testamentary trust established under the Will of J. David Glads | Modified mitochondrion and methods of use thereof |
CN110177061B (zh) * | 2019-03-01 | 2023-04-07 | 致讯科技(天津)有限公司 | 一种异构网络中信号干扰的协调方法 |
CN113748211A (zh) | 2019-03-01 | 2021-12-03 | 布拉斯科公司 | 用于4-羟甲基糠醛及其衍生物的体内合成的方法 |
WO2020180733A1 (en) | 2019-03-01 | 2020-09-10 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Expansion of tumor infiltrating lymphocytes from liquid tumors and therapeutic uses thereof |
WO2020181180A1 (en) | 2019-03-06 | 2020-09-10 | The Broad Institute, Inc. | A:t to c:g base editors and uses thereof |
WO2020181195A1 (en) | 2019-03-06 | 2020-09-10 | The Broad Institute, Inc. | T:a to a:t base editing through adenine excision |
US20220170013A1 (en) | 2019-03-06 | 2022-06-02 | The Broad Institute, Inc. | T:a to a:t base editing through adenosine methylation |
WO2020181178A1 (en) | 2019-03-06 | 2020-09-10 | The Broad Institute, Inc. | T:a to a:t base editing through thymine alkylation |
WO2020181202A1 (en) | 2019-03-06 | 2020-09-10 | The Broad Institute, Inc. | A:t to t:a base editing through adenine deamination and oxidation |
MX2021010559A (es) | 2019-03-07 | 2021-12-15 | Univ California | Polipéptidos efectores de crispr-cas y métodos de uso de estos. |
CN113966397A (zh) | 2019-03-08 | 2022-01-21 | 黑曜石疗法公司 | 人碳酸酐酶2组合物和用于可调调节的方法 |
WO2020185590A1 (en) | 2019-03-08 | 2020-09-17 | Zymergen Inc. | Iterative genome editing in microbes |
US11053515B2 (en) | 2019-03-08 | 2021-07-06 | Zymergen Inc. | Pooled genome editing in microbes |
SG11202108090XA (en) | 2019-03-18 | 2021-08-30 | Regeneron Pharma | Crispr/cas dropout screening platform to reveal genetic vulnerabilities associated with tau aggregation |
IL286357B1 (en) | 2019-03-18 | 2024-06-01 | Regeneron Pharma | A CRISPR/CAS screening platform to identify genetic modifiers of tau seeding or aggregation |
AU2020242032A1 (en) | 2019-03-19 | 2021-10-07 | Massachusetts Institute Of Technology | Methods and compositions for editing nucleotide sequences |
US20220162649A1 (en) | 2019-04-01 | 2022-05-26 | The Broad Institute, Inc. | Novel nucleic acid modifiers |
RU2710731C1 (ru) * | 2019-04-02 | 2020-01-10 | Общество с ограниченной ответственностью "Зеленые линии" | Система редактирования генома дрожжей debaryomyces hansenii на основе crispr/cas9 |
JP2022528894A (ja) | 2019-04-04 | 2022-06-16 | ブラスケム エス.エー. | 第二世代の糖から化学物質を生成するためのキシロースおよびグルコースの同時消費のための代謝工学 |
US20220307003A1 (en) | 2019-04-17 | 2022-09-29 | The Broad Institute, Inc. | Adenine base editors with reduced off-target effects |
WO2020219776A1 (en) | 2019-04-23 | 2020-10-29 | Genedit Inc. | Cationic polymer with alkyl side chains |
AR118793A1 (es) | 2019-04-24 | 2021-11-03 | Pivot Bio Inc | Dianas genéticas para dirigir la fijación de nitrógeno para mejorar las características de plantas |
WO2020219742A1 (en) | 2019-04-24 | 2020-10-29 | Novartis Ag | Compositions and methods for selective protein degradation |
AU2020274594A1 (en) | 2019-05-10 | 2022-01-20 | Basf Se | Regulatory nucleic acid molecules for enhancing gene expression in plants |
WO2020229533A1 (en) | 2019-05-13 | 2020-11-19 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Drought tolerance in corn |
WO2020232029A1 (en) | 2019-05-13 | 2020-11-19 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Methods and compositions for selecting tumor infiltrating lymphocytes and uses of the same in immunotherapy |
US20220220469A1 (en) | 2019-05-20 | 2022-07-14 | The Broad Institute, Inc. | Non-class i multi-component nucleic acid targeting systems |
EP3973054A1 (en) | 2019-05-20 | 2022-03-30 | The Broad Institute Inc. | Aav delivery of nucleobase editors |
WO2020236967A1 (en) | 2019-05-20 | 2020-11-26 | The Broad Institute, Inc. | Random crispr-cas deletion mutant |
AR118995A1 (es) | 2019-05-25 | 2021-11-17 | Kws Saat Se & Co Kgaa | Mejorador de la inducción de haploides |
WO2020243370A1 (en) | 2019-05-28 | 2020-12-03 | Genedit Inc. | Polymer comprising multiple functionalized sidechains for biomolecule delivery |
WO2020243661A1 (en) | 2019-05-31 | 2020-12-03 | The Broad Institute, Inc. | Methods for treating metabolic disorders by targeting adcy5 |
JP2022534437A (ja) * | 2019-06-01 | 2022-07-29 | シベック バイオテクノロジーズ,リミティド ライアビリティ カンパニー | 真核細胞への遺伝子編集システムの送達のための細菌プラットフォーム |
WO2020244759A1 (en) | 2019-06-05 | 2020-12-10 | Klemm & Sohn Gmbh & Co. Kg | New plants having a white foliage phenotype |
US11845957B2 (en) | 2019-06-14 | 2023-12-19 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Models of tauopathy |
WO2020254850A1 (en) | 2019-06-21 | 2020-12-24 | Vilmorin & Cie | Improvement of quality and permanence of green color of peppers at maturity and over-maturity |
AU2020308448A1 (en) | 2019-06-24 | 2022-02-03 | Promega Corporation | Modified polyamine polymers for delivery of biomolecules into cells |
MX2021014861A (es) | 2019-06-25 | 2022-06-22 | Inari Agriculture Tech Inc | Edicion genomica de reparacion dependiente de homologia mejorada. |
MX2021015433A (es) | 2019-07-02 | 2022-06-08 | Hutchinson Fred Cancer Res | Vectores ad35 recombinantes y mejoras de la terapia génica relacionadas. |
GB201909597D0 (en) | 2019-07-03 | 2019-08-14 | Univ Wageningen | Crispr type v-u1 system from mycobacterium mucogenicum and uses thereof |
EP4361171A2 (en) | 2019-07-08 | 2024-05-01 | Research Institute at Nationwide Children's Hospital | Antibody compositions for disrupting biofilms |
CN110452966A (zh) * | 2019-07-17 | 2019-11-15 | 浙江善测禾骑士生物科技有限公司 | 一种利用raa-crispr蛋白酶系统快速检测方法 |
CN110387405A (zh) * | 2019-07-17 | 2019-10-29 | 浙江善测禾骑士生物科技有限公司 | 一种快速检测核酸的(rt)raa-crispr系统 |
WO2021009299A1 (en) | 2019-07-17 | 2021-01-21 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Bcl-xl:fkbp12 fusion proteins suitable for screening agents capable of slowing down the aging process |
WO2021019272A1 (en) | 2019-07-31 | 2021-02-04 | Vilmorin & Cie | Tolerance to tolcndv in cucumber |
EP3772542A1 (en) | 2019-08-07 | 2021-02-10 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Modifying genetic variation in crops by modulating the pachytene checkpoint protein 2 |
WO2021028359A1 (en) | 2019-08-09 | 2021-02-18 | Sangamo Therapeutics France | Controlled expression of chimeric antigen receptors in t cells |
US20220282284A1 (en) * | 2019-08-15 | 2022-09-08 | The Rockefeller University | Crispr genome editing with cell surface display to produce homozygously edited eukaryotic cells |
WO2021030666A1 (en) | 2019-08-15 | 2021-02-18 | The Broad Institute, Inc. | Base editing by transglycosylation |
US20220298501A1 (en) | 2019-08-30 | 2022-09-22 | The Broad Institute, Inc. | Crispr-associated mu transposase systems |
WO2021046451A1 (en) | 2019-09-06 | 2021-03-11 | Obsidian Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for dhfr tunable protein regulation |
EP4028530A1 (en) | 2019-09-12 | 2022-07-20 | Basf Se | Regulatory nucleic acid molecules for enhancing gene expression in plants |
CN110541001A (zh) * | 2019-09-20 | 2019-12-06 | 福建上源生物科学技术有限公司 | 精确大片段基因删除结合终止密码子插入的基因敲除法 |
EP4031660A1 (en) | 2019-09-20 | 2022-07-27 | The Broad Institute, Inc. | Novel type vi crispr enzymes and systems |
CN114729376A (zh) | 2019-09-23 | 2022-07-08 | 欧米茄治疗公司 | 用于调节肝细胞核因子4α(HNF4α)基因表达的组合物和方法 |
AU2020355000A1 (en) | 2019-09-23 | 2022-03-17 | Omega Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for modulating apolipoprotein B (APOB) gene expression |
US11981922B2 (en) | 2019-10-03 | 2024-05-14 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Methods and compositions for the modulation of cell interactions and signaling in the tumor microenvironment |
WO2021069387A1 (en) | 2019-10-07 | 2021-04-15 | Basf Se | Regulatory nucleic acid molecules for enhancing gene expression in plants |
EP3808766A1 (en) | 2019-10-15 | 2021-04-21 | Sangamo Therapeutics France | Chimeric antigen receptor specific for interleukin-23 receptor |
AU2020366566A1 (en) | 2019-10-17 | 2022-04-21 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Enhanced disease resistance of crops by downregulation of repressor genes |
JP2022553389A (ja) | 2019-10-25 | 2022-12-22 | アイオバンス バイオセラピューティクス,インコーポレイテッド | 腫瘍浸潤リンパ球の遺伝子編集及び免疫療法におけるその使用 |
EP4057802A1 (en) | 2019-11-14 | 2022-09-21 | Vilmorin & Cie | Resistance to acidovorax valerianellae in corn salad |
US20240016735A1 (en) | 2019-11-22 | 2024-01-18 | President And Fellows Of Harvard College | Ionic liquids for drug delivery |
US20230086199A1 (en) | 2019-11-26 | 2023-03-23 | The Broad Institute, Inc. | Systems and methods for evaluating cas9-independent off-target editing of nucleic acids |
EP4064830A1 (en) | 2019-11-29 | 2022-10-05 | Basf Se | Increasing resistance against fungal infections in plants |
WO2021111466A1 (en) * | 2019-12-02 | 2021-06-10 | Council Of Scientific & Industrial Research | Method and kit for detection of polynucleotide |
AU2020396138A1 (en) | 2019-12-03 | 2022-06-16 | Basf Se | Regulatory nucleic acid molecules for enhancing gene expression in plants |
EP4073236A1 (en) | 2019-12-11 | 2022-10-19 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Processes for the production of tumor infiltrating lymphocytes (tils) and methods of using the same |
CN114787362A (zh) | 2019-12-13 | 2022-07-22 | 中外制药株式会社 | 检测细胞外嘌呤受体配体的系统和导入该系统的非人动物 |
JP2023506284A (ja) | 2019-12-19 | 2023-02-15 | ビーエーエスエフ ソシエタス・ヨーロピア | ファインケミカルを生成する際の空時収率、炭素変換効率、及び炭素基質適応性の増加 |
US20230041211A1 (en) | 2019-12-20 | 2023-02-09 | Basf Se | Decreasing toxicity of terpenes and increasing the production potential in micro-organisms |
US20230272429A1 (en) | 2020-01-13 | 2023-08-31 | Sana Biotechnology, Inc. | Modification of blood type antigens |
WO2021221690A1 (en) | 2020-05-01 | 2021-11-04 | Pivot Bio, Inc. | Modified bacterial strains for improved fixation of nitrogen |
MX2022008648A (es) | 2020-01-23 | 2022-12-15 | The Children´S Medical Center Corp | Diferenciacion de celulas t sin estroma a partir de celulas madre pluripotentes humanas. |
US20230235309A1 (en) | 2020-02-05 | 2023-07-27 | The Broad Institute, Inc. | Adenine base editors and uses thereof |
EP3872190A1 (en) | 2020-02-26 | 2021-09-01 | Antibodies-Online GmbH | A method of using cut&run or cut&tag to validate crispr-cas targeting |
JP2023517326A (ja) | 2020-03-11 | 2023-04-25 | オメガ セラピューティクス, インコーポレイテッド | フォークヘッドボックスp3(foxp3)遺伝子発現をモジュレートするための組成物および方法 |
IL296546A (en) | 2020-03-20 | 2022-11-01 | Inst Nat Sante Rech Med | Chimeric receptor for human cd45rc-specific antigen and its uses |
WO2021202938A1 (en) | 2020-04-03 | 2021-10-07 | Creyon Bio, Inc. | Oligonucleotide-based machine learning |
WO2021216622A1 (en) | 2020-04-21 | 2021-10-28 | Aspen Neuroscience, Inc. | Gene editing of gba1 in stem cells and method of use of cells differentiated therefrom |
WO2021216623A1 (en) | 2020-04-21 | 2021-10-28 | Aspen Neuroscience, Inc. | Gene editing of lrrk2 in stem cells and method of use of cells differentiated therefrom |
WO2021222567A2 (en) | 2020-05-01 | 2021-11-04 | Pivot Bio, Inc. | Modified bacterial strains for improved fixation of nitrogen |
CA3172637A1 (en) | 2020-05-01 | 2021-11-04 | Pivot Bio, Inc. | Measurement of nitrogen fixation and incorporation |
CA3176826A1 (en) | 2020-05-04 | 2021-11-11 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Processes for production of tumor infiltrating lymphocytes and uses of the same in immunotherapy |
EP4146797A1 (en) | 2020-05-06 | 2023-03-15 | Orchard Therapeutics (Europe) Limited | Treatment for neurodegenerative diseases |
BR112022022603A2 (pt) | 2020-05-08 | 2023-01-17 | Broad Inst Inc | Métodos e composições para edição simultânea de ambas as fitas de sequência alvo de nucleotídeos de fita dupla |
BR112022022714A2 (pt) | 2020-05-13 | 2023-03-28 | Pivot Bio Inc | Bactéria diazotrófica gram-positiva geneticamente modificada, composição microbiana, método para fornecer nitrogênio fixo a uma planta, gene glnr, proteína glnr, e, método para identificar reguladores de um operon nif |
GB202007943D0 (en) | 2020-05-27 | 2020-07-08 | Snipr Biome Aps | Products & methods |
WO2021239986A1 (en) | 2020-05-29 | 2021-12-02 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Plant haploid induction |
WO2021245435A1 (en) | 2020-06-03 | 2021-12-09 | Vilmorin & Cie | Melon plants resistant to scab disease, aphids and powdery mildew |
EP4161552A1 (en) | 2020-06-05 | 2023-04-12 | The Broad Institute, Inc. | Compositions and methods for treating neoplasia |
MA59015B1 (fr) | 2020-06-05 | 2023-11-30 | Vilmorin & Cie | Résistance des plants de tomate - solanum lycopersicum - au tobrfv |
CN116096862A (zh) | 2020-06-11 | 2023-05-09 | 诺华股份有限公司 | Zbtb32抑制剂及其用途 |
WO2022008935A1 (en) | 2020-07-10 | 2022-01-13 | Horizon Discovery Limited | Method for producing genetically modified cells |
WO2022029080A1 (en) | 2020-08-03 | 2022-02-10 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Population of treg cells functionally committed to exert a regulatory activity and their use for adoptive therapy |
US20240011030A1 (en) | 2020-08-10 | 2024-01-11 | Novartis Ag | Treatments for retinal degenerative diseases |
BR112023002885A2 (pt) | 2020-08-18 | 2023-03-21 | Pioneer Hi Bred Int | Genes de resistência a múltiplas doenças e seus empilhamentos genômicos |
JP2023538114A (ja) | 2020-08-20 | 2023-09-06 | エー2 バイオセラピューティクス, インコーポレイテッド | メソテリン陽性がんを治療するための組成物及び方法 |
MX2023002017A (es) | 2020-08-20 | 2023-04-28 | A2 Biotherapeutics Inc | Composiciones y métodos para tratar cánceres positivos para ceacam. |
WO2022040444A1 (en) | 2020-08-20 | 2022-02-24 | A2 Biotherapeutics, Inc. | Compositions and methods for treating egfr positive cancers |
CN112080587A (zh) * | 2020-08-31 | 2020-12-15 | 上海海关动植物与食品检验检疫技术中心 | 用于高效检测新型冠状病毒的raa-crispr扩增引物组、试剂盒及方法 |
KR102424351B1 (ko) * | 2020-09-21 | 2022-08-05 | 한국과학기술원 | 파브알부민 유전자 발현 억제용 CRISPR/Cas9 시스템 및 이의 용도 |
WO2022188039A1 (en) | 2021-03-09 | 2022-09-15 | Huigene Therapeutics Co., Ltd. | Engineered crispr/cas13 system and uses thereof |
WO2022068912A1 (en) | 2020-09-30 | 2022-04-07 | Huigene Therapeutics Co., Ltd. | Engineered crispr/cas13 system and uses thereof |
US11944063B2 (en) | 2020-09-30 | 2024-04-02 | Spring Meadow Nursery, Inc. | Hydrangea ‘SMNHPH’ |
IL301846A (en) | 2020-10-02 | 2023-06-01 | Vilmorin & Cie | A hotel with an extended shelf life |
WO2022076606A1 (en) | 2020-10-06 | 2022-04-14 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Treatment of nsclc patients with tumor infiltrating lymphocyte therapies |
US20230372397A1 (en) | 2020-10-06 | 2023-11-23 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Treatment of nsclc patients with tumor infiltrating lymphocyte therapies |
EP3984355B1 (en) | 2020-10-16 | 2024-05-15 | Klemm & Sohn GmbH & Co. KG | Double-flowering dwarf calibrachoa |
US11155884B1 (en) | 2020-10-16 | 2021-10-26 | Klemm & Sohn Gmbh & Co. Kg | Double-flowering dwarf Calibrachoa |
US20230147779A1 (en) | 2020-10-28 | 2023-05-11 | GeneEdit, Inc. | Polymer with cationic and hydrophobic side chains |
WO2022093977A1 (en) | 2020-10-30 | 2022-05-05 | Fortiphyte, Inc. | Pathogen resistance in plants |
IL302700A (en) | 2020-11-13 | 2023-07-01 | Novartis Ag | Combined treatments with cells expressing chimeric antigens (vehicle) |
EP4001429A1 (en) | 2020-11-16 | 2022-05-25 | Antibodies-Online GmbH | Analysis of crispr-cas binding and cleavage sites followed by high-throughput sequencing (abc-seq) |
IL303102A (en) | 2020-12-03 | 2023-07-01 | Vilmorin & Cie | Tomato plants resistant to TOMMV, TOMV, TMV, TOBRFV and suitable resistant genes |
CA3202483A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Maria Fardis | Treatment with tumor infiltrating lymphocyte therapies in combination with ctla-4 and pd-1 inhibitors |
WO2022133149A1 (en) | 2020-12-17 | 2022-06-23 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Treatment of cancers with tumor infiltrating lymphocytes |
BR112023012460A2 (pt) | 2020-12-23 | 2023-11-07 | Flagship Pioneering Innovations V Inc | Conjunto in vitro de capsídeos de anellovirus que envolvem rna |
EP4274893A1 (en) | 2021-01-05 | 2023-11-15 | Horizon Discovery Limited | Method for producing genetically modified cells |
WO2022150776A1 (en) * | 2021-01-11 | 2022-07-14 | Vedere Bio Ii, Inc. | OPTOGENETIC COMPOSITIONS COMPRISING A CBh PROMOTER SEQUENCE AND METHODS FOR USE |
JP2024502630A (ja) | 2021-01-12 | 2024-01-22 | マーチ セラピューティクス, インコーポレイテッド | コンテキスト依存性二本鎖dna特異的デアミナーゼ及びその使用 |
JP2024506557A (ja) | 2021-01-29 | 2024-02-14 | アイオバンス バイオセラピューティクス,インコーポレイテッド | 修飾された腫瘍浸潤リンパ球を作製する方法及び養子細胞療法におけるそれらの使用 |
JP2024507129A (ja) | 2021-02-16 | 2024-02-16 | エー2 バイオセラピューティクス, インコーポレイテッド | Her2陽性がんを治療するための組成物及び方法 |
WO2022188797A1 (en) | 2021-03-09 | 2022-09-15 | Huigene Therapeutics Co., Ltd. | Engineered crispr/cas13 system and uses thereof |
US20240191191A1 (en) | 2021-03-19 | 2024-06-13 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Methods for infiltrating lymphocyte (til) expansion related to cd39/cd69 selection and gene knockout in tils |
KR20240009393A (ko) | 2021-03-31 | 2024-01-22 | 엔트라다 테라퓨틱스, 인크. | 사이클릭 세포 침투 펩티드 |
WO2022208489A1 (en) | 2021-04-02 | 2022-10-06 | Vilmorin & Cie | Semi-determinate or determinate growth habit trait in cucurbita |
WO2022221699A1 (en) | 2021-04-16 | 2022-10-20 | Beam Therapeutics, Inc. | Genetic modification of hepatocytes |
KR20240037185A (ko) | 2021-04-19 | 2024-03-21 | 이오반스 바이오테라퓨틱스, 인크. | 키메라 공동자극 수용체, 케모카인 수용체, 및 세포 면역치료에서의 이의 용도 |
WO2022235929A1 (en) | 2021-05-05 | 2022-11-10 | Radius Pharmaceuticals, Inc. | Animal model having homologous recombination of mouse pth1 receptor |
EP4337261A2 (en) | 2021-05-10 | 2024-03-20 | Entrada Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for modulating mrna splicing |
JP2024518068A (ja) | 2021-05-10 | 2024-04-24 | エントラーダ セラピューティクス,インコーポレイティド | 細胞内治療のための組成物及び方法 |
EP4337263A1 (en) | 2021-05-10 | 2024-03-20 | Entrada Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for modulating interferon regulatory factor-5 (irf-5) activity |
WO2022240824A1 (en) | 2021-05-13 | 2022-11-17 | The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Compositions and methods for treating sickle cell diseases |
EP4340850A1 (en) | 2021-05-17 | 2024-03-27 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Pd-1 gene-edited tumor infiltrating lymphocytes and uses of same in immunotherapy |
KR20240031238A (ko) | 2021-06-01 | 2024-03-07 | 아버 바이오테크놀로지스, 인크. | Crispr 뉴클레이스를 포함하는 유전자 편집 시스템 및 이의 용도 |
EP4352131A1 (en) | 2021-06-11 | 2024-04-17 | Genedit Inc. | Biodegradable polymer comprising side chains with polyamine and polyalkylene oxide groups |
WO2022261509A1 (en) | 2021-06-11 | 2022-12-15 | The Broad Institute, Inc. | Improved cytosine to guanine base editors |
WO2022266105A1 (en) * | 2021-06-14 | 2022-12-22 | The University Of Chicago | Characterization and treatment of asthma |
WO2022271818A1 (en) | 2021-06-23 | 2022-12-29 | Entrada Therapeutics, Inc. | Antisense compounds and methods for targeting cug repeats |
AU2022301301A1 (en) | 2021-07-02 | 2023-12-14 | Pivot Bio, Inc. | Genetically-engineered bacterial strains for improved fixation of nitrogen |
EP4367242A2 (en) | 2021-07-07 | 2024-05-15 | Omega Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for modulating secreted frizzled receptor protein 1 (sfrp1) gene expression |
CA3226111A1 (en) | 2021-07-22 | 2023-01-26 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Method for cryopreservation of solid tumor fragments |
TW202327631A (zh) | 2021-07-28 | 2023-07-16 | 美商艾歐凡斯生物治療公司 | 利用腫瘤浸潤性淋巴球療法與kras抑制劑組合治療癌症患者 |
WO2023007468A1 (en) | 2021-07-30 | 2023-02-02 | Helaina, Inc. | Methods and compositions for protein synthesis and secretion |
CA3221517A1 (en) | 2021-07-30 | 2023-02-02 | Monika KLOIBER-MAITZ | Plants with improved digestibility and marker haplotypes |
IL310564A (en) | 2021-08-06 | 2024-03-01 | Vilmorin & Cie | Resistance to Leveillula Taurica in pepper plant |
WO2023031885A1 (en) | 2021-09-02 | 2023-03-09 | SESVanderHave NV | Methods and compositions for ppo herbicide tolerance |
KR20240055811A (ko) | 2021-09-10 | 2024-04-29 | 애질런트 테크놀로지스, 인크. | 프라임 편집을 위한 화학적 변형을 갖는 가이드 rna |
CA3233427A1 (en) | 2021-09-30 | 2023-04-06 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Slc13a5 gene therapy vectors and uses thereof |
IL311885A (en) | 2021-10-08 | 2024-06-01 | Harvard College | Ionic liquids for drug delivery |
AR127482A1 (es) | 2021-10-27 | 2024-01-31 | Iovance Biotherapeutics Inc | Sistemas y métodos para coordinar la fabricación de células para inmunoterapia específica de paciente |
WO2023077148A1 (en) | 2021-11-01 | 2023-05-04 | Tome Biosciences, Inc. | Single construct platform for simultaneous delivery of gene editing machinery and nucleic acid cargo |
WO2023081756A1 (en) | 2021-11-03 | 2023-05-11 | The J. David Gladstone Institutes, A Testamentary Trust Established Under The Will Of J. David Gladstone | Precise genome editing using retrons |
WO2023081762A2 (en) * | 2021-11-03 | 2023-05-11 | The Regents Of The University Of California | Serine recombinases |
CA3237410A1 (en) | 2021-11-10 | 2023-05-19 | Friedrich Graf Finck VON FINCKENSTEIN | Methods of expansion treatment utilizing cd8 tumor infiltrating lymphocytes |
WO2023092153A2 (en) * | 2021-11-22 | 2023-05-25 | The Texas A&M University System | Methods and compositions targeting nucleus accumbens-associated protein-1 for treatment of autoimmune disorders and cancers |
WO2023096996A2 (en) | 2021-11-24 | 2023-06-01 | Research Institute At Nationwide Children's Hospital | Chimeric hsv expressing hil21 to boost anti-tumor immune activity |
WO2023093862A1 (en) | 2021-11-26 | 2023-06-01 | Epigenic Therapeutics Inc. | Method of modulating pcsk9 and uses thereof |
WO2023102406A1 (en) | 2021-12-01 | 2023-06-08 | The Board Of Regents Of The Univesity Of Texas System | Vector genome design to express optimized cln7 transgene |
WO2023102518A1 (en) | 2021-12-03 | 2023-06-08 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Gnao1 gene therapy vectors and uses thereof |
GB202118058D0 (en) | 2021-12-14 | 2022-01-26 | Univ Warwick | Methods to increase yields in crops |
US20230279442A1 (en) | 2021-12-15 | 2023-09-07 | Versitech Limited | Engineered cas9-nucleases and method of use thereof |
TW202342757A (zh) | 2021-12-17 | 2023-11-01 | 美商薩那生物科技公司 | 經修飾副黏液病毒科附著醣蛋白 |
TW202342498A (zh) | 2021-12-17 | 2023-11-01 | 美商薩那生物科技公司 | 經修飾副黏液病毒科融合醣蛋白 |
WO2023122805A1 (en) | 2021-12-20 | 2023-06-29 | Vestaron Corporation | Sorbitol driven selection pressure method |
WO2023122764A1 (en) | 2021-12-22 | 2023-06-29 | Tome Biosciences, Inc. | Co-delivery of a gene editor construct and a donor template |
CA3240593A1 (en) | 2021-12-23 | 2023-06-29 | Joel D. Richter | Therapeutic treatment for fragile x-associated disorder |
WO2023133595A2 (en) | 2022-01-10 | 2023-07-13 | Sana Biotechnology, Inc. | Methods of ex vivo dosing and administration of lipid particles or viral vectors and related systems and uses |
WO2023141602A2 (en) | 2022-01-21 | 2023-07-27 | Renagade Therapeutics Management Inc. | Engineered retrons and methods of use |
WO2023147488A1 (en) | 2022-01-28 | 2023-08-03 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Cytokine associated tumor infiltrating lymphocytes compositions and methods |
WO2023147476A1 (en) | 2022-01-28 | 2023-08-03 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Transgene casette designed to express the human codon-optimized gene fmr1 |
WO2023150518A1 (en) | 2022-02-01 | 2023-08-10 | Sana Biotechnology, Inc. | Cd3-targeted lentiviral vectors and uses thereof |
WO2023150647A1 (en) | 2022-02-02 | 2023-08-10 | Sana Biotechnology, Inc. | Methods of repeat dosing and administration of lipid particles or viral vectors and related systems and uses |
WO2023156587A1 (en) | 2022-02-18 | 2023-08-24 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Use of tcr-deficient car-tregs in combination with anti-tcr complex monoclonal antibodies for inducing durable tolerance |
WO2023196802A1 (en) | 2022-04-04 | 2023-10-12 | The Broad Institute, Inc. | Cas9 variants having non-canonical pam specificities and uses thereof |
EP4256950A1 (en) | 2022-04-06 | 2023-10-11 | Vilmorin et Cie | Tolerance to cgmmv in cucumber |
WO2023196877A1 (en) | 2022-04-06 | 2023-10-12 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Treatment of nsclc patients with tumor infiltrating lymphocyte therapies |
WO2023201369A1 (en) | 2022-04-15 | 2023-10-19 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Til expansion processes using specific cytokine combinations and/or akti treatment |
WO2023205744A1 (en) | 2022-04-20 | 2023-10-26 | Tome Biosciences, Inc. | Programmable gene insertion compositions |
WO2023212715A1 (en) | 2022-04-28 | 2023-11-02 | The Broad Institute, Inc. | Aav vectors encoding base editors and uses thereof |
WO2023215831A1 (en) | 2022-05-04 | 2023-11-09 | Tome Biosciences, Inc. | Guide rna compositions for programmable gene insertion |
WO2023219933A1 (en) | 2022-05-09 | 2023-11-16 | Entrada Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for delivery of nucleic acid therapeutics |
WO2023220043A1 (en) | 2022-05-09 | 2023-11-16 | Synteny Therapeutics, Inc. | Erythroparvovirus with a modified genome for gene therapy |
WO2023220035A1 (en) | 2022-05-09 | 2023-11-16 | Synteny Therapeutics, Inc. | Erythroparvovirus compositions and methods for gene therapy |
WO2023220040A1 (en) | 2022-05-09 | 2023-11-16 | Synteny Therapeutics, Inc. | Erythroparvovirus with a modified capsid for gene therapy |
WO2023220608A1 (en) | 2022-05-10 | 2023-11-16 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Treatment of cancer patients with tumor infiltrating lymphocyte therapies in combination with an il-15r agonist |
WO2023225670A2 (en) | 2022-05-20 | 2023-11-23 | Tome Biosciences, Inc. | Ex vivo programmable gene insertion |
WO2023230570A2 (en) | 2022-05-25 | 2023-11-30 | Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc | Compositions and methods for modulating genetic drivers |
WO2023230566A2 (en) | 2022-05-25 | 2023-11-30 | Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc | Compositions and methods for modulating cytokines |
WO2023230578A2 (en) | 2022-05-25 | 2023-11-30 | Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc | Compositions and methods for modulating circulating factors |
WO2023230549A2 (en) | 2022-05-25 | 2023-11-30 | Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc | Compositions and methods for modulation of tumor suppressors and oncogenes |
WO2023230573A2 (en) | 2022-05-25 | 2023-11-30 | Flagship Pioneering Innovations Vii, Llc | Compositions and methods for modulation of immune responses |
EP4299739A1 (en) | 2022-06-30 | 2024-01-03 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Compositions, systems, and methods for genome editing |
EP4299733A1 (en) | 2022-06-30 | 2024-01-03 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Compositions, systems, and methods for genome editing |
GB2621813A (en) | 2022-06-30 | 2024-02-28 | Univ Newcastle | Preventing disease recurrence in Mitochondrial replacement therapy |
WO2024005863A1 (en) | 2022-06-30 | 2024-01-04 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Compositions, systems, and methods for genome editing |
WO2024006802A1 (en) | 2022-06-30 | 2024-01-04 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Artificial intelligence-mediated methods and systems for genome editing |
WO2024005864A1 (en) | 2022-06-30 | 2024-01-04 | Inari Agriculture Technology, Inc. | Compositions, systems, and methods for genome editing |
WO2024020346A2 (en) | 2022-07-18 | 2024-01-25 | Renagade Therapeutics Management Inc. | Gene editing components, systems, and methods of use |
WO2024020587A2 (en) | 2022-07-22 | 2024-01-25 | Tome Biosciences, Inc. | Pleiopluripotent stem cell programmable gene insertion |
WO2024023578A1 (en) | 2022-07-28 | 2024-02-01 | Institut Pasteur | Hsc70-4 in host-induced and spray-induced gene silencing |
WO2024026406A2 (en) | 2022-07-29 | 2024-02-01 | Vestaron Corporation | Next Generation ACTX Peptides |
WO2024036190A2 (en) | 2022-08-09 | 2024-02-15 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Guide polynucleotide multiplexing |
WO2024040083A1 (en) | 2022-08-16 | 2024-02-22 | The Broad Institute, Inc. | Evolved cytosine deaminases and methods of editing dna using same |
WO2024040222A1 (en) | 2022-08-19 | 2024-02-22 | Generation Bio Co. | Cleavable closed-ended dna (cedna) and methods of use thereof |
WO2024044655A1 (en) | 2022-08-24 | 2024-02-29 | Sana Biotechnology, Inc. | Delivery of heterologous proteins |
WO2024044723A1 (en) | 2022-08-25 | 2024-02-29 | Renagade Therapeutics Management Inc. | Engineered retrons and methods of use |
WO2024042199A1 (en) | 2022-08-26 | 2024-02-29 | KWS SAAT SE & Co. KGaA | Use of paired genes in hybrid breeding |
WO2024047605A1 (en) | 2022-09-01 | 2024-03-07 | SESVanderHave NV | Methods and compositions for ppo herbicide tolerance |
WO2024050544A2 (en) | 2022-09-01 | 2024-03-07 | J.R. Simplot Company | Enhanced targeted knock-in frequency in host genomes through crispr exonuclease processing |
WO2024052318A1 (en) | 2022-09-06 | 2024-03-14 | Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale | Novel dual split car-t cells for the treatment of cd38-positive hematological malignancies |
WO2024064838A1 (en) | 2022-09-21 | 2024-03-28 | Sana Biotechnology, Inc. | Lipid particles comprising variant paramyxovirus attachment glycoproteins and uses thereof |
WO2024064824A2 (en) | 2022-09-21 | 2024-03-28 | Yale University | Compositions and methods for identification of membrane targets for enhancement of nk cell therapy |
WO2024081820A1 (en) | 2022-10-13 | 2024-04-18 | Sana Biotechnology, Inc. | Viral particles targeting hematopoietic stem cells |
WO2024083579A1 (en) | 2022-10-20 | 2024-04-25 | Basf Se | Regulatory nucleic acid molecules for enhancing gene expression in plants |
WO2024098024A1 (en) | 2022-11-04 | 2024-05-10 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Expansion of tumor infiltrating lymphocytes from liquid tumors and therapeutic uses thereof |
WO2024098027A1 (en) | 2022-11-04 | 2024-05-10 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Methods for tumor infiltrating lymphocyte (til) expansion related to cd39/cd103 selection |
WO2024102434A1 (en) | 2022-11-10 | 2024-05-16 | Senda Biosciences, Inc. | Rna compositions comprising lipid nanoparticles or lipid reconstructed natural messenger packs |
WO2024112571A2 (en) | 2022-11-21 | 2024-05-30 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Two-dimensional processes for the expansion of tumor infiltrating lymphocytes and therapies therefrom |
WO2024118836A1 (en) | 2022-11-30 | 2024-06-06 | Iovance Biotherapeutics, Inc. | Processes for production of tumor infiltrating lymphocytes with shortened rep step |
WO2024119157A1 (en) | 2022-12-02 | 2024-06-06 | Sana Biotechnology, Inc. | Lipid particles with cofusogens and methods of producing and using the same |
WO2024123786A1 (en) | 2022-12-06 | 2024-06-13 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Methods and compositions for co-delivery of t-dnas expressing multiple guide polynucleotides into plants |
Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2009502170A (ja) * | 2005-07-26 | 2009-01-29 | サンガモ バイオサイエンシズ インコーポレイテッド | 外来核酸配列の標的化された組込み及び発現 |
WO2011064736A1 (en) * | 2009-11-27 | 2011-06-03 | Basf Plant Science Company Gmbh | Optimized endonucleases and uses thereof |
WO2011146121A1 (en) * | 2010-05-17 | 2011-11-24 | Sangamo Biosciences, Inc. | Novel dna-binding proteins and uses thereof |
WO2012014988A1 (ja) * | 2010-07-29 | 2012-02-02 | タカラバイオ株式会社 | 標的塩基検出用rna含有プローブの製造方法 |
JP2012510812A (ja) * | 2008-12-04 | 2012-05-17 | サンガモ バイオサイエンシーズ, インコーポレイテッド | 亜鉛フィンガーヌクレアーゼを使用したラットのゲノム編集 |
WO2014089290A1 (en) * | 2012-12-06 | 2014-06-12 | Sigma-Aldrich Co. Llc | Crispr-based genome modification and regulation |
JP2016505256A (ja) * | 2012-12-12 | 2016-02-25 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッ | 配列操作のためのCRISPR−Cas成分系、方法および組成物 |
Family Cites Families (74)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US44790A (en) | 1864-10-25 | Improvement in force-pumps | ||
US2011A (en) | 1841-03-18 | Appabatxts for piling saws | ||
US2011008A (en) | 1929-04-15 | 1935-08-13 | Rca Corp | Electric discharge tube |
US4217344A (en) | 1976-06-23 | 1980-08-12 | L'oreal | Compositions containing aqueous dispersions of lipid spheres |
US4235871A (en) | 1978-02-24 | 1980-11-25 | Papahadjopoulos Demetrios P | Method of encapsulating biologically active materials in lipid vesicles |
US4186183A (en) | 1978-03-29 | 1980-01-29 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Army | Liposome carriers in chemotherapy of leishmaniasis |
US4261975A (en) | 1979-09-19 | 1981-04-14 | Merck & Co., Inc. | Viral liposome particle |
US4485054A (en) | 1982-10-04 | 1984-11-27 | Lipoderm Pharmaceuticals Limited | Method of encapsulating biologically active materials in multilamellar lipid vesicles (MLV) |
US4501728A (en) | 1983-01-06 | 1985-02-26 | Technology Unlimited, Inc. | Masking of liposomes from RES recognition |
US5049386A (en) | 1985-01-07 | 1991-09-17 | Syntex (U.S.A.) Inc. | N-ω,(ω-1)-dialkyloxy)- and N-(ω,(ω-1)-dialkenyloxy)Alk-1-YL-N,N,N-tetrasubstituted ammonium lipids and uses therefor |
US4946787A (en) | 1985-01-07 | 1990-08-07 | Syntex (U.S.A.) Inc. | N-(ω,(ω-1)-dialkyloxy)- and N-(ω,(ω-1)-dialkenyloxy)-alk-1-yl-N,N,N-tetrasubstituted ammonium lipids and uses therefor |
US4897355A (en) | 1985-01-07 | 1990-01-30 | Syntex (U.S.A.) Inc. | N[ω,(ω-1)-dialkyloxy]- and N-[ω,(ω-1)-dialkenyloxy]-alk-1-yl-N,N,N-tetrasubstituted ammonium lipids and uses therefor |
US4797368A (en) | 1985-03-15 | 1989-01-10 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Adeno-associated virus as eukaryotic expression vector |
US4774085A (en) | 1985-07-09 | 1988-09-27 | 501 Board of Regents, Univ. of Texas | Pharmaceutical administration systems containing a mixture of immunomodulators |
DE122007000007I2 (de) | 1986-04-09 | 2010-12-30 | Genzyme Corp | Genetisch transformierte Tiere, die ein gewünschtes Protein in Milch absondern |
US4837028A (en) | 1986-12-24 | 1989-06-06 | Liposome Technology, Inc. | Liposomes with enhanced circulation time |
US4873316A (en) | 1987-06-23 | 1989-10-10 | Biogen, Inc. | Isolation of exogenous recombinant proteins from the milk of transgenic mammals |
US5264618A (en) | 1990-04-19 | 1993-11-23 | Vical, Inc. | Cationic lipids for intracellular delivery of biologically active molecules |
WO1991017424A1 (en) | 1990-05-03 | 1991-11-14 | Vical, Inc. | Intracellular delivery of biologically active substances by means of self-assembling lipid complexes |
US5173414A (en) | 1990-10-30 | 1992-12-22 | Applied Immune Sciences, Inc. | Production of recombinant adeno-associated virus vectors |
US7150982B2 (en) | 1991-09-09 | 2006-12-19 | Third Wave Technologies, Inc. | RNA detection assays |
US5587308A (en) | 1992-06-02 | 1996-12-24 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health & Human Services | Modified adeno-associated virus vector capable of expression from a novel promoter |
US6534261B1 (en) | 1999-01-12 | 2003-03-18 | Sangamo Biosciences, Inc. | Regulation of endogenous gene expression in cells using zinc finger proteins |
US7868149B2 (en) | 1999-07-20 | 2011-01-11 | Monsanto Technology Llc | Plant genome sequence and uses thereof |
US6603061B1 (en) | 1999-07-29 | 2003-08-05 | Monsanto Company | Agrobacterium-mediated plant transformation method |
US20090100536A1 (en) | 2001-12-04 | 2009-04-16 | Monsanto Company | Transgenic plants with enhanced agronomic traits |
AU2003224897A1 (en) | 2002-04-09 | 2003-10-27 | Kenneth L. Beattie | Oligonucleotide probes for genosensor chips |
US8053232B2 (en) | 2004-01-23 | 2011-11-08 | Virxsys Corporation | Correction of alpha-1-antitrypsin genetic defects using spliceosome mediated RNA trans splicing |
US20050220796A1 (en) | 2004-03-31 | 2005-10-06 | Dynan William S | Compositions and methods for modulating DNA repair |
AU2006239169A1 (en) | 2005-04-28 | 2006-11-02 | Benitec, Limited. | Multiple-RNAi expression cassettes for simultaneous delivery of RNAi agents related to heterozygotic expression patterns |
US7892224B2 (en) | 2005-06-01 | 2011-02-22 | Brainlab Ag | Inverse catheter planning |
US9677123B2 (en) | 2006-03-15 | 2017-06-13 | Siemens Healthcare Diagnostics Inc. | Degenerate nucleobase analogs |
WO2008093152A1 (en) * | 2007-02-01 | 2008-08-07 | Cellectis | Obligate heterodimer meganucleases and uses thereof |
MX2009009071A (es) | 2007-03-02 | 2009-09-24 | Danisco | Cultivos con resistencia mejorada a fagos. |
US8546553B2 (en) | 2008-07-25 | 2013-10-01 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Prokaryotic RNAi-like system and methods of use |
US20100076057A1 (en) * | 2008-09-23 | 2010-03-25 | Northwestern University | TARGET DNA INTERFERENCE WITH crRNA |
US9404098B2 (en) | 2008-11-06 | 2016-08-02 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Method for cleaving a target RNA using a Cas6 polypeptide |
US20110016540A1 (en) | 2008-12-04 | 2011-01-20 | Sigma-Aldrich Co. | Genome editing of genes associated with trinucleotide repeat expansion disorders in animals |
WO2010075424A2 (en) * | 2008-12-22 | 2010-07-01 | The Regents Of University Of California | Compositions and methods for downregulating prokaryotic genes |
US20110239315A1 (en) | 2009-01-12 | 2011-09-29 | Ulla Bonas | Modular dna-binding domains and methods of use |
US8889394B2 (en) | 2009-09-07 | 2014-11-18 | Empire Technology Development Llc | Multiple domain proteins |
US10087431B2 (en) | 2010-03-10 | 2018-10-02 | The Regents Of The University Of California | Methods of generating nucleic acid fragments |
JP5926242B2 (ja) | 2010-05-10 | 2016-05-25 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | エンドリボヌクレアーゼ組成物およびその使用方法 |
US9081737B2 (en) | 2010-08-02 | 2015-07-14 | Integrated Dna Technologies, Inc. | Methods for predicting stability and melting temperatures of nucleic acid duplexes |
US9405700B2 (en) | 2010-11-04 | 2016-08-02 | Sonics, Inc. | Methods and apparatus for virtualization in an integrated circuit |
CA2834375C (en) * | 2011-04-27 | 2020-07-14 | Amyris, Inc. | Methods for genomic modification |
WO2012164565A1 (en) | 2011-06-01 | 2012-12-06 | Yeda Research And Development Co. Ltd. | Compositions and methods for downregulating prokaryotic genes |
US8555733B2 (en) | 2011-09-23 | 2013-10-15 | Airgas, Inc. | System and method for analyzing a refrigerant sample |
US20130122096A1 (en) | 2011-11-14 | 2013-05-16 | Silenseed Ltd. | Compositions for drug delivery and methods of manufacturing and using same |
US8450107B1 (en) | 2011-11-30 | 2013-05-28 | The Broad Institute Inc. | Nucleotide-specific recognition sequences for designer TAL effectors |
GB201122458D0 (en) | 2011-12-30 | 2012-02-08 | Univ Wageningen | Modified cascade ribonucleoproteins and uses thereof |
CA2865011C (en) | 2012-02-29 | 2021-06-15 | Sangamo Biosciences, Inc. | Methods and compositions for treating huntington's disease |
US9637739B2 (en) * | 2012-03-20 | 2017-05-02 | Vilnius University | RNA-directed DNA cleavage by the Cas9-crRNA complex |
WO2013141680A1 (en) * | 2012-03-20 | 2013-09-26 | Vilnius University | RNA-DIRECTED DNA CLEAVAGE BY THE Cas9-crRNA COMPLEX |
MA37663B1 (fr) | 2012-05-25 | 2019-12-31 | Univ California | Procédés et compositions permettant la modification de l'adn cible dirigée par l'arn et la modulation de la transcription dirigée par l'arn |
KR102182847B1 (ko) * | 2012-10-23 | 2020-11-27 | 주식회사 툴젠 | 표적 DNA에 특이적인 가이드 RNA 및 Cas 단백질을 암호화하는 핵산 또는 Cas 단백질을 포함하는, 표적 DNA를 절단하기 위한 조성물 및 이의 용도 |
WO2014093479A1 (en) | 2012-12-11 | 2014-06-19 | Montana State University | Crispr (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) rna-guided control of gene regulation |
DK2931898T3 (en) | 2012-12-12 | 2016-06-20 | Massachusetts Inst Technology | CONSTRUCTION AND OPTIMIZATION OF SYSTEMS, PROCEDURES AND COMPOSITIONS FOR SEQUENCE MANIPULATION WITH FUNCTIONAL DOMAINS |
PT2771468E (pt) | 2012-12-12 | 2015-06-02 | Harvard College | Engenharia de sistemas, métodos e composições-guia otimizadas para manipulação de sequências |
EP3064585B1 (en) | 2012-12-12 | 2020-02-05 | The Broad Institute, Inc. | Engineering and optimization of improved systems, methods and enzyme compositions for sequence manipulation |
US20140310830A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-10-16 | Feng Zhang | CRISPR-Cas Nickase Systems, Methods And Compositions For Sequence Manipulation in Eukaryotes |
KR20150105634A (ko) | 2012-12-12 | 2015-09-17 | 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 | 서열 조작을 위한 개선된 시스템, 방법 및 효소 조성물의 유전자 조작 및 최적화 |
US8697359B1 (en) | 2012-12-12 | 2014-04-15 | The Broad Institute, Inc. | CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products |
EP2931899A1 (en) | 2012-12-12 | 2015-10-21 | The Broad Institute, Inc. | Functional genomics using crispr-cas systems, compositions, methods, knock out libraries and applications thereof |
WO2014093709A1 (en) | 2012-12-12 | 2014-06-19 | The Broad Institute, Inc. | Methods, models, systems, and apparatus for identifying target sequences for cas enzymes or crispr-cas systems for target sequences and conveying results thereof |
IL293526A (en) | 2012-12-12 | 2022-08-01 | Harvard College | Providing, engineering and optimizing systems, methods and compositions for sequence manipulation and therapeutic applications |
ES2741951T3 (es) | 2012-12-17 | 2020-02-12 | Harvard College | Modificación por ingeniería genética del genoma humano guiada por ARN |
US10660943B2 (en) * | 2013-02-07 | 2020-05-26 | The Rockefeller University | Sequence specific antimicrobials |
WO2014165825A2 (en) * | 2013-04-04 | 2014-10-09 | President And Fellows Of Harvard College | Therapeutic uses of genome editing with crispr/cas systems |
CN106062197A (zh) | 2013-06-17 | 2016-10-26 | 布罗德研究所有限公司 | 用于序列操纵的串联指导系统、方法和组合物的递送、工程化和优化 |
EP3011034B1 (en) | 2013-06-17 | 2019-08-07 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, use and therapeutic applications of the crispr-cas systems and compositions for targeting disorders and diseases using viral components |
AU2014281027A1 (en) | 2013-06-17 | 2016-01-28 | Massachusetts Institute Of Technology | Optimized CRISPR-Cas double nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation |
BR112016013213A2 (pt) | 2013-12-12 | 2017-12-05 | Massachusetts Inst Technology | administração, uso e aplicações terapêuticas dos sistemas crispr-cas e composições para visar distúrbios e doenças usando componentes de administração de partículas |
WO2016073955A2 (en) * | 2014-11-06 | 2016-05-12 | President And Fellows Of Harvard College | Cells lacking b2m surface expression and methods for allogeneic administration of such cells |
-
2013
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2022
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2023
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- 2023-04-13 US US18/134,317 patent/US20230374527A1/en active Pending
- 2023-04-24 JP JP2023070572A patent/JP2023093658A/ja active Pending
- 2023-08-23 US US18/454,343 patent/US20240117365A1/en active Pending
Patent Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2009502170A (ja) * | 2005-07-26 | 2009-01-29 | サンガモ バイオサイエンシズ インコーポレイテッド | 外来核酸配列の標的化された組込み及び発現 |
JP2012510812A (ja) * | 2008-12-04 | 2012-05-17 | サンガモ バイオサイエンシーズ, インコーポレイテッド | 亜鉛フィンガーヌクレアーゼを使用したラットのゲノム編集 |
WO2011064736A1 (en) * | 2009-11-27 | 2011-06-03 | Basf Plant Science Company Gmbh | Optimized endonucleases and uses thereof |
WO2011146121A1 (en) * | 2010-05-17 | 2011-11-24 | Sangamo Biosciences, Inc. | Novel dna-binding proteins and uses thereof |
WO2012014988A1 (ja) * | 2010-07-29 | 2012-02-02 | タカラバイオ株式会社 | 標的塩基検出用rna含有プローブの製造方法 |
WO2014089290A1 (en) * | 2012-12-06 | 2014-06-12 | Sigma-Aldrich Co. Llc | Crispr-based genome modification and regulation |
JP2016505256A (ja) * | 2012-12-12 | 2016-02-25 | ザ・ブロード・インスティテュート・インコーポレイテッ | 配列操作のためのCRISPR−Cas成分系、方法および組成物 |
Non-Patent Citations (11)
Title |
---|
BIORESEARCH OPEN ACCESS, JUN. 2012, VOL.1, P.99-108, JPN6017007679, ISSN: 0004854838 * |
METHODS, 2011, VOL.53, P.339-346, JPN6016021647, ISSN: 0004854840 * |
NATURE METHODS, AUG. 2012, VOL.9, P.805-807, JPN6017007680, ISSN: 0004854839 * |
NUCLEIC ACIDS RES., vol. 39, JPN6017006440, 2011, pages 9275 - 9282, ISSN: 0004854843 * |
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2009, VOL.37, P.5725-5736, JPN6016030415, ISSN: 0004854842 * |
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2011, VOL.39, E82, JPN6016021644, ISSN: 0004854835 * |
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2011, VOL.40, P.3443-3455, JPN6016021650, ISSN: 0004854841 * |
PNAS, 2011, VOL.108, P.2623-2628, JPN6016021645, ISSN: 0004854836 * |
SCIENCE, 2003, VOL.300, P.763, JPN6017007678, ISSN: 0004854837 * |
SCIENCE, vol. 337, JPN6016021641, 2012, pages 816 - 821, ISSN: 0004854833 * |
ZEBRAFISH, 2011, VOL.8, P.147-149, JPN6016021642, ISSN: 0004854834 * |
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