JPH09511250A - 核酸治療に有用な修飾オリゴヌクレオチド及び中間体 - Google Patents

核酸治療に有用な修飾オリゴヌクレオチド及び中間体

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JPH09511250A JP7525825A JP52582595A JPH09511250A JP H09511250 A JPH09511250 A JP H09511250A JP 7525825 A JP7525825 A JP 7525825A JP 52582595 A JP52582595 A JP 52582595A JP H09511250 A JPH09511250 A JP H09511250A
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Abstract

(57)【要約】 本発明は、核酸治療及び診断分野で使用できるヌクレアーゼ耐性3’−炭素修飾オリゴヌクレオチドを提供する。本発明の修飾オリゴヌクレオチドは、ヌクレオチド間結合の3’位置で二価酸素部分が4価炭素部分で置換されている修飾ヌクレオチド間結合を少なくとも1個有する。3’−炭素修飾ヌクレオチド間結合は好ましくは3’−メチレン又は3’−ヒドロキシメチレン結合である。本発明の修飾オリゴヌクレオチドを製造するための方法並びに単量体ヌクレオシド及びヌクレオチド中間体も提供する。

Description

【発明の詳細な説明】 核酸治療に有用な修飾オリゴヌクレオチド及び中間体 発明の分野 本発明は治療の分野、特に核酸治療の分野に関する。背景 在来の薬剤開発方法は、疾患またはその他の不健康な状態に関与するタンパク 質と直接的に相互作用し得る治療薬の使用という1点に集中している。このよう な在来方法から生まれた薬剤として、例えば、合成ホルモン類(体内に存在する のが望ましいタンパク質主体のホルモンの機能を模倣する)、抗生物質類(外来 タンパク質、即ち微生物を攻撃する)、及び、ビタミン類(ある種のタンパク質 が体内で正常機能を果たすために必要とする構造単位をこれらのタンパク質に提 供する)がある。もっと新しいオリゴヌクレオチドの形態の治療薬は、あらゆる タンパク質の合成をコントロールする設計図または機構を遺伝子レベルで改変す ることによってタンパク質の機能を間接的に調節もしくはコントロールしたりま たはその他の影響を与えたりするように設計されている。各遺伝子が特定タンパ ク質の多数コピーの作製に必要な情報を含んでいるので、これらの核酸 治療薬の各々は、標的タンパク質との直接的相互作用に依存する在来の高分子薬 に比べてより多い数のタンパク質分子に対してその間接的相互作用を介して影響 を与え得る。 核酸治療化合物は多くの異なる方法で作用し得るであろうが、極めて一般的に は、2つの種類のいずれか一方に所属するように分類されている。第一の種類は 、所望の遺伝子効果を何らかの方法で模倣または増強するオリゴヌクレオチドを 包含する。この種の核酸治療化合物によって刺激される活性は一般に「遺伝子治 療」と呼ばれている。第二の種類の核酸治療化合物は抑制性オリゴヌクレオチド を包含し、この核酸治療化合物は不都合なタンパク質の産生を阻害する。アンチ センスオリゴヌクレオチドは抑制性核酸治療化合物のサブクラスを形成している が、一般にこのサブクラスに所属する化合物が常に正しい「アンチセンス」方法 で作用するとは限らない。これらの2種類の治療用オリゴヌクレオチドに加えて 、在来治療薬と極めて類似した方法で標的タンパク質と直接的に相互作用し得る 核酸治療化合物が存在することにも注目されたい。 正確なアンチセンス相互作用は、相補的オリゴヌクレオチド(従って、「アン チセンス」と命名されている)とその選択さ れた核酸標的(例えば、ウイルスDNAまたは他の不都合な遺伝メッセージ)と の配列特異的なハイブリダイゼーションを含み、その結果、単独でまたは他の( 1種または複数の)試薬(例えば、RNアーゼのような酵素)と組合わせて形成 された複合体は遺伝情報をタンパク質に翻訳する鋳型としてはもはや機能しない 。他の抑制性オリゴヌクレオチドは、標的配列に必ずしも相補的でないがアンチ センスオリゴヌクレオチドと同様に不都合な遺伝物質の発現(例えば、複製及び /または翻訳)を妨害する潜在能力を有する配列を有している。アンチセンスオ リゴヌクレオチドは、外来遺伝子(例えば、HIVのようなウイルス遺伝子)の 発現または内在性遺伝子の異常発現(例えば、突然変異した癌遺伝子として異常 発現する正常遺伝子)を妨害するように設計され得る。これらの不都合な遺伝メ ッセージは、ウイルス感染症及び癌腫のような多くの疾病状態に関与する。抑制 性オリゴヌクレオチドは、在来薬剤のように疾病進行の後期に生じたタンパク質 を攻撃するのでなく、複製及び発現の初期に疾病状態を治療的に阻止する可能性 を増大する。 遺伝子治療に使用されるオリゴヌクレオチドは、所望の効果を有する筈である が患者の体内では欠如しているかまたは損傷 されているオリゴヌクレオチドまたは合成遺伝子を提供するように設計されてい る。ヒトの体内に正常に存在する遺伝子の各々は、身体の構造または機能を担当 する特定のタンパク質を製造するという任務を有している。この遺伝子の欠陥ま たは欠損が生じたとき、タンパク質合成にも欠陥または欠損が生じ、奇形または 遺伝病につながる。核酸治療化合物はレトロウイルスのようなビヒクルによって 患者の細胞の遺伝物質に取り込まれ、その結果として、必要なタンパク質の産生 を可能にする。 核酸治療化合物が遺伝子治療もしくはアンチセンス療法を対象として設計され ているかまたは遺伝レベルもしくは他のレベルでタンパク質に影響を与えること が望まれる他の何らかの状態を対象として設計されているかに関わりなく、これ らの合成オリゴヌクレオチドの設計は、達成可能な成功のレベルを握る基幹要因 である。重視すべきは、これらのオリゴヌクレオチドがヒトまたは動物の身体に 内在する種々のヌクレアーゼの存在下で生存できるように、通常はオリゴヌクレ オチドを修飾してオリゴヌクレオチドにヌクレアーゼ耐性を与えなければならな いことである。血清サンプルの分析に使用されるオリゴヌクレオチドプローブに 関しても事情は同じである。何故なら、人体 内に存在したときに非修飾の治療用オリゴヌクレオチドを分解させ得る外因性の 同じヌクレアーゼは、ヒト血清中にも存在して血清サンプル中の非修飾のオリゴ ヌクレオチドプローブをも分解させるからである。 より詳細には、非修飾(即ち「野生型」)オリゴヌクレオチドは、完成オリゴ ヌクレオチド中の個々のヌクレオチド単位を互いに結合しているヌクレオチド間 結合の3′−位及び5′−位の双方でヌクレアーゼ分解に感受性である。従って 、治療用オリゴヌクレオチドにヌクレアーゼ耐性を与える研究はこのヌクレオチ ド間結合を修飾することを目的としており、得られた成功は主として天然に産生 するホスホジエステル結合中の「非架橋」酸素原子の修飾に関しては好結果が得 られている。(例えば、1つの非架橋酸素がイオウ原子で置換されたホスホロチ オエート修飾オリゴヌクレオチド(米国特許第3,846,402号)及び双方 の非架橋酸素原子がイオウ原子で置換されたホスホロジチオエート修飾オリゴヌ クレオチド(米国特許第5,218,103号))。しかしながら、これらのイ オウ含有オリゴヌクレオチドはタンパク質に結合し、許容できないレベルの非特 異的活性を示すことが判明している。更に、ホスホロチ オエート修飾オリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオチド間結合の3′−位でヌク レアーゼ分解に感受性であり、特にヌクレオチド間結合の開裂後に5′−ホスフ ェートを脱離させるヌクレアーゼによるヌクレアーゼ分解に感受性である。その 理由は、ホスホジエステル結合中の「非架橋」酸素原子のうちの1つだけが修飾 されているからである。 修飾された主鎖を有するオリゴヌクレオチドを作製するために使用され得る常 用のオリゴヌクレオチド合成方法は多数存在する。これらの方法として、溶液合 成法または固相合成法がある。より伝統的な溶液主体の合成方法は、モノヌクレ オチドシントン(synthon)試薬の必要量が比較的少ないにもかかわらず 、有意量の所望最終産物を提供し得る。しかしながら溶液合成法には、モノヌク レオチドサブユニットを添加する度毎に中間生成物の単離及び精製という冗長な 処理が伴うという欠点がある。その結果、溶液主体のホスホトリエステル化学法 は、核酸治療で使用するために必要なより長いオリゴヌクレオチド(即ち、長さ 6塩基を上回るオリゴヌクレオチド)の実用的な合成には適さない。固相合成法 の場合には、全反応連鎖が固体支持体上で行われ、モノヌクレオチドサブユニッ トを順次 付加することによって、一端がポリマー系支持体に結合された成長鎖を形成する 。従って、固相法では試薬を容易に分離できる。この方法は、過剰量のモノヌク レオチドシントン試薬(溶液合成法における必要量の数倍)及び他の高価な試薬 を要するという物的な欠点だけを有している。 核酸治療化合物または診断用プローブとして使用するための適当な長さを有し ており且つ修飾オリゴヌクレオチドにヌクレアーゼ耐性を与える十分な数の修飾 結合を有しているイオウ非含有の修飾オリゴヌクレオチドが要望されている。更 に、このようなイオウ非含有の修飾オリゴヌクレオチドのポリマー支持法による 合成方法が要望されている。イオウ非含有修飾の例としては、非修飾ホスホジエ ステル結合の3′−位のP−O結合をP−C結合によって置換して、3′−炭素 修飾ヌクレアーゼ間結合を形成させるものがある。この修飾ホスホジエステル結 合を溶液主体の方法で調製するための中間体として必要な低分子3′−メチレン ホスホネートヌクレオチドは溶液化学法を用いて調製されている。例えば、Al brechtら,Tetrahedron,40,79−85(1984);A lbrechtら,J.Amer.Chem.Soc.,92,551 1−5513(1970;Morrら,GBF Monogr.Ser.,Ch em.Syn.Mol.Biol.,8,107−113(1987)。 在来のホスホジエステル溶液相合成法では、これらの単量体の修飾オリゴヌク レオチドサブユニットが、完全修飾リボヌクレオチド3′−メチレンホスホネー トダイマー及びトリマーに取込まれる。Jonesら,J.Amer.Chem .Soc.,92,5310−5511(1970,analog incor porated into dimer);Mazurら,Tetrahedr on,40(20),3949−3956(1984)(analog inc orporated into trimer)。更に、Morrら,GBF Monogr.Ser.,Chem.Syn.Mol.Biol.,前出,は、 同じ単量体の3′−メチレンホスホネートヌクレオシドから修飾デオキシリボヌ クレオチド3′−メチレンホスホネートダイマーを合成し、次いで、修飾ダイマ ー(2つの単量体サブユニット間に1つの修飾されたヌクレオチド間結合を含む )をより長いオリゴヌクレオチドに組込む方法を報告している。Heinema nn ら,Nucleic Acids Res.,19,427(1991)。しか しながら、これらの手順は余りにも繁雑であるため、修飾オリゴヌクレオチドの 量産には向かない。 ホスホトリエステル化学法には固有の制約があるので、オリゴヌクレオチドに ヌクレアーゼ耐性を与えるために必要な多数3′−修飾が三量体よりも長いデオ キシオリゴヌクレオチド中で観察されたことはない。更に、従来技術の溶液相法 の方法論は、より迅速で効率のよいポリマー支持法によるオリゴヌクレオチド合 成法の方法論に応用できない。その理由は、ホスホトリエステル法で使用される ホスホネートシントンは溶液相の外部で有効に作用できる十分なカップリング効 率を有していないからである。 従って、本発明の1つの目的は、ポリマー支持法による3′−炭素修飾オリゴ ヌクレオチドの合成に有用な単量体オリゴヌクレオチド中間体を提供することで ある。 本発明の別の目的は、多数3′−炭素修飾を有するオリゴヌクレオチドのポリ マー支持法による合成方法を提供することである。 本発明の更に別の目的は、核酸治療及び/または核酸診断に 有用な3′−炭素修飾を少なくとも1つ有しているオリゴヌクレオチドを提供す ることである。発明の概要 本発明は、核酸治療及び核酸診断の分野で使用できるヌクレアーゼ耐性3′− 炭素修飾オリゴヌクレオチドを提供する。本発明の修飾オリゴヌクレオチドは、 少なくとも1つの修飾ヌクレオチド間結合を有し、ヌクレオチド間結合の3′− 位の二価の酸素部分が四価の炭素部分によって置換されている。また、本発明の 修飾オリゴヌクレオチドの作製方法及びその作製に用いる中間体が提供される。発明の詳細な説明 本発明は、核酸治療及び核酸診断に有用なヌクレアーゼ耐性の3′−炭素修飾 オリゴヌクレオチドを提供する。本発明によれば、オリゴヌクレオチドの1つま たはそれ以上のヌクレオチド間結合の3′−位の二価の酸素原子が四価の炭素原 子によって置換され、その結果として、3′−位に追加の2つの置換基が存在す る。本発明はまた、これらの修飾オリゴヌクレオチドの作製方法を包含する。3 ′−炭素修飾オリゴヌクレオチドの作製に有用な新規な単量体のヌクレオシド及 びヌクレオチドの ような中間体も本発明の範囲内に包含される。 本発明の3′−炭素修飾オリゴヌクレオチドは少なくとも1つの修飾ヌクレオ チド間結合を有しており、かかる結合においては、天然に産生するホスホジエス テル結合の3′−位のP−O結合がP−C結合で置換されている。天然に産生す るホスホジエステル結合の3′−位のP−O結合と違って、3′−炭素修飾結合 のP−C結合は正常な生理的条件下でヌクレアーゼによって開裂されない。この P−C結合は、ヌクレオチド間ホスホジエステル結合の3′−酸素を、3′−メ チレン(−CH2−)、3′−ヒドロキシメチレン(−CHOH−)または他の 修飾炭素官能基(−CXY−)で置換することによって得られる。 本発明の理解を容易にするために、本文中で使用した用語を以下に定義する。 「オリゴヌクレオチド」は、少なくとも2つのヌクレオシド単位を有し、個々 のヌクレオシド単位の各々が少なくとも1つの他のヌクレオシド単位に1つのリ ン部分を介して共有結合しているポリマーを意味する。天然に産生するオリゴヌ クレオチドの場合、ヌクレオシド単位間の共有結合はホスホジエステル 結合である。しかしながら、本文中で使用した「オリゴヌクレオチド」なる用語 は、(天然に産生するオリゴヌクレオチドに比較して)以下のいずれか1つ以上 に関して修飾されたオリゴヌクレオチドを意味する。(1)ヌクレオシド単位間 のホスホジエステル結合、(2)個々のヌクレオシド単位自体、及び/または( 3)ヌクレオシド単位のリボースまたは糖部分。 特に注釈がない限り、「塩基」または「核塩基(nucleobase)」なる用語は、ア デニン、グアニン、シトシン、チミジン及びウラシルのようなプリンまたはピリ ミジンを示し、また、5−メチルシトシン及び5−プロピニルピリミジンのよう なこれらの塩基の修飾形を意味する。 「ヌクレオシド」は、5炭素糖の1′−位に共有結合した塩基からなる個々の 単量体ヌクレオシド単位を意味する。代表的な5炭素糖はデオキシリボース、リ ボースまたはアラビノースのような天然糖であるが、いかなる5炭素糖またはそ の修飾形でもよく、その非限定例としては2′−フルオロ−2′−デオキシリボ ースがあり、または糖環の酸素原子が炭素官能基で置換された炭素環糖(即ち6 炭素アナローグ)がある。一般に、塩基は、アデニン、グアニン及び他のプリン 類のN9またはシ トシン、ウラシル及び他のピリミジン類のN1のような従来の位置で糖部分に結 合するであろう。 「ヌクレオチド」は、糖の3′−位または5′−位でヌクレオシドの糖部分に 共有結合したリン部分を更に有する単量体ヌクレオシド単位を意味する。 「修飾ヌクレオチド間結合」は、天然に産生するオリゴヌクレオチド中で個々 のヌクレオシド単位を接合しているホスホジエステル結合の修飾を意味する。 「修飾オリゴヌクレオチド」は、少なくとも1つの修飾ヌクレオチド間結合を 有するオリゴヌクレオチドを特定的に意味する。 「部分修飾オリゴヌクレオチド」は、ヌクレオチド間結合の少なくとも1つが 修飾されているが全部は修飾されていない修飾オリゴヌクレオチドを意味する。 「完全修飾オリゴヌクレオチド」は、全部のヌクレオチド間結合が修飾されて いる修飾オリゴヌクレオチドを意味する。 「3′−炭素ヌクレオチド間結合」または「3′−炭素結合」または「3′− 炭素修飾結合」は、ホスホジエステルヌクレオチド間結合の3′−位の二価の酸 素部分が四価の炭素部分によ って置換されているヌクレオチド間結合を意味する。 「3′−メチレンヌクレオチド間結合」または「3′−メチレン結合」または 「3′−メチレン修飾結合」は、3′−炭素結合の3′位の四価の炭素原子が2 個の水素原子に独立に共有結合している3′−炭素ヌクレオチド間結合を意味す る。 「3′−ヒドロキシメチレンヌクレオチド間結合」または「3′−ヒドロキシ メチレン結合」または「3′−ヒドロキシメチレン修飾結合」は、3′−炭素結 合の3′位の四価の炭素原子が水素原子及びヒドロキシル基に独立に共有結合し ている3′−ヒドロキシメチレンヌクレオチド間結合を意味する。 「3′−炭素修飾オリゴヌクレオチド」は、少なくとも1つの3′−炭素結合 を有するオリゴヌクレオチドを意味する。 「3′−メチレン修飾オリゴヌクレオチド」は、少なくとも1つの3′−メチ レン結合を有するオリゴヌクレオチドを意味する。 「3′−ヒドロキシメチレン修飾オリゴヌクレオチド」は、少なくとも1つの 3′−ヒドロキシメチレン結合を有するオリゴヌクレオチドを意味する。 「標的配列」は、オリゴヌクレオチドまたは修飾オリゴヌク レオチドとハイリブリダイズするように設計されたヌクレオチド配列を意味する 。抑制性オリゴヌクレオチドの場合には、「標的配列」は、ウイルスタンパク質 、癌関連タンパク質または疾病状態に関与する他のタンパク質をコードする天然 産生メッセンジャーRNAを意味するが、必ずしもこれらに限定はされない。 より詳細には、本発明の3′−炭素修飾オリゴヌクレオチドは、以下に示すよ うな3′−炭素修飾ヌクレオチド間結合を少なくとも1つ有している。 この構造中のC1及びC2は夫々、オリゴヌクレオチド中で本発明の3′−炭 素修飾ヌクレオチド間結合を介して互いに接合されているヌクレオシド単位の3 ′−位及び5′−位を示す。 この3′−炭素修飾ヌクレオチド間結合を以下の構造に基づいてより十分に説 明する。以下の構造は、この特定の結合を包囲する個々のヌクレオシド単位をよ り詳細に示している。 このオリゴヌクレオチド構造中、Bは、プリンまたはピリミジン塩基、代表的 にはアデニン、グアニン、シトシンもしくはチミン(DNAの場合)またはウラ シル(RNAの場合)を示す。Zは、Bがオリゴヌクレオチドの末端塩基である 場合に水素(−H−)原子を示し、または、オリゴヌクレオチドの次のヌクレオ チド間結合中のリン原子を示す。R4は、代表的には水素(−H−)原子(DN Aの場合)またはヒドロキシル(−H−)部分(RNAの場合、または、主鎖に アラビノース単位を有するオリゴヌクレオチドの場合)を示すが、オリゴヌクレ オチドの主鎖中に他の5炭素糖が使用されている場合にはフッ素(−F−)のよ うな他の原子または部分であってもよい。 R5は、ヌクレオチド間結合中の負に荷電した単結合酸素原子に対する適当な 対イオンを示す。3′−炭素結合中の好ましいR5官能基は、本発明の3′−炭 素修飾オリゴヌクレオチドの選択された特定用途次第で違っており、本文中で提 供した教示に基づいて当業者に明らかであろう。例えば、普通はR5がナトリウ ム、アンモニウムまたはアルキルアンモニウムのような適当な対イオンであるの が好ましく、その理由は、この種の部分はオリゴヌクレオチドの天然構造を最も 破壊し難いからである。また、これらは塩の形態で存在するので野生型オリゴヌ クレオチド中に最も頻出する対イオンである。しかしながら、オリゴヌクレオチ ドの化学合成においては、R5は、ヌクレオチド間結合が比較的苛酷な化学的条 件下に置かれているときに該結合を保護する適当な保護基であってもよい。 −CXY−で示されている3′−官能基は炭素官能基を示しており、このX及 びYは、一般には(1)ヌクレオチド間結合の構造の最小限の分裂しか生じさせ ないように設計され、またはいくつかの場合には(2)修飾オリゴヌクレオチド を同定またはターゲッティングするラベルまたは他の手段を直接または間接に( 即ち、誘導体化を介して)提供するように設計されて いる一価のリガンドの組合わせを示す。前者の場合には、3′−修飾結合の−C XY−官能基は、得られた3′−炭素修飾オリゴヌクレオチドが、天然に産生す る核酸の能力、例えばその予定標的に強力にハイブリダイズする能力を効率よく 模倣できるように十分に小さくなければならない。この点で好ましいX部分及び Y部分は、水素(−H−)及びフッ素(−F−)原子並びにヒドロキシル(−O H−)基である。また、水素原子はオリゴヌクレオチドの天然構造に最少量の分 裂を生じさせると予測できるので、X部分及びY部分の双方が水素原子である( 即ち、3′−炭素結合が3′−メチレン結合である)のが更に好ましい。 しかしながら、RNアーゼHが3′−炭素修飾を含む核酸二重鎖を認識するこ とが必要であるようないくつかの場合には、ヒドロキシル(−H−)基またはフ ッ素(−F−)原子のような親水性官能基を3′−修飾ヌクレオチド間結合の3 ′−炭素に組込んで、天然に発生するヌクレオチド間ホスホジエステル結合の電 気陰性3′−酸素のより有効な置換を得るのが望ましい。その理由は、3′−炭 素(−CXY−)官能基に親水性を与える修飾は、3′−メチレン(−CH2− )修飾中の2つの 水素原子のようなより疎水性の修飾よりも野生型オリゴヌクレオチドのより有効 な模倣であると予測されるからである。従って、好ましい3′−炭素修飾はまた 、XまたはYの一方がヒドロキシル基である3′−ヒドロキシメチレン結合でも よい。この場合、多数の修飾結合を含むオリゴヌクレオチドはヌクレオチド間結 合の周囲でより有効な水和を示し、これらの核酸アナローグは天然に産生する対 応化合物と同様の溶液構造を示すと予測される。 オリゴヌクレオチドの化学合成中、成長するオリゴヌクレオチドに付加される 各ヌクレオシド単位のカップリング反応の効率は反応の総効率に多大な影響を与 える。例えば、各カップリング反応の効率が95%であるような塩基の逐次付加 によって合成された18量体の理論的収率は僅か42%である。効率が90%で あるような逐次カップリング反応で得られる同じ18量体の理論的収率はたった 17%である。効率95%を有するカップリング反応を用いて作製された6量体 でさえも理論的収率は74%に過ぎない。各カップリング反応後に成長するオリ ゴヌクレオチド産物をバックグラウンド材料から分離することが極めて難しく、 時間がかかり、溶液主体の合成の場合には効 率も悪いので、これらの旧式のオリゴヌクレオチド合成方法は、診断目的及び治 療目的に一般に必要な長さの修飾オリゴヌクレオチドを作製するために有効に使 用することができない。更に、溶液主体の合成は時間がかかり目的産物のコスト を高騰させるので、この合成方法を実際にオリゴヌクレオチドの大量生産に使用 することはできない。勿論例外はあり、タンパク質と直接に相互作用するように 設計され得る二量体を代表例とする短いオリゴヌクレオチドの場合は例外と考え られる。これらの短いオリゴヌクレオチドの作製においては溶液主体の合成法の 時間浪費性は致命的な要因にはならない。 本発明は更に、上記のような3′−炭素修飾結合を含むオリゴヌクレオチドを ポリマー支持法(polymer-supported method)で作製する迅速で効率的な方法を提 供する。この高速全自動方法は、在来のポリマー支持法によって作製された非修 飾オリゴヌクレオチドの長さと同等の長さの3′−炭素修飾オリゴヌクレオチド の作製に適している。この方法が重要な理由は、大腸菌のような簡単なゲノムの 配列特異的プローブとして使用するために必要なオリゴヌクレオチドの長さが一 般に約10〜12塩基またはそれ以上であると考えられるからである。約60ヌ クレオチド塩基という上限を定温過程で確認した。その理由は、より長いオリゴ ヌクレオチド産物の溶融温度(Tm)はこの点またはその周囲の同じ値に収束す るからである。他方、アンチセンスオリゴヌクレオチドは生理温度で有効である ことが必要であり、一般には約15〜25ヌクレオチドの長さである。大きいゲ ノム中で偶発する確率が低いという理由から、概してこの範囲内のより長いアン チセンスオリゴヌクレオチドが望ましい。例えば、17量体オリゴヌクレオチド は哺乳類ゲノムに特有であろう。他方、アンチセンスオリゴヌクレオチドが過度 に長いとき(即ち、実質的に25ヌクレオチドを上回るとき)、他の非標的配列 に非特異的にハイブリダイズすることがある。緊縮性を増すために患者の生理的 体温を調節することはできないので、この種の非特異的ハイブリダイゼーション は不可避である。 本発明の方法では、所望の目的産物である3′−炭素修飾オリゴヌクレオチド に到達する途中で多数のヌクレオシド中間体の合成が必要である。基幹的な単量 体中間体としては、ヌクレオシド基質、3′−アルケニルヌクレオシド、3′− アルデヒドヌクレオシド及びヌクレオチドシントンがある。簡単に説明 すると、アルデヒドヌクレオシドはアルデヒド保護されたヌクレオチドシントン に結合して、ポリマー支持合成法の最終カップリング段階で3′−炭素修飾ヌク レオチド間結合を形成する。第二のシントン、即ちヒドロキシ保護されたヌクレ オチドシントンも提供される。この第二のシントンは、溶液合成中に3′−炭素 修飾結合を生成させるためまたはポリマー支持合成中に被修飾3′−位を提供す るために使用され得る。後で図示するこれらの構造中で、本発明のヌクレオシド 中間体及びヌクレオチド中間体はデオキシリボヌクレオシド及びデオキシリボヌ クレオチドとして示されているが、リボースのような他の糖を含有するヌクレオ シド及びヌクレオチドも修飾オリゴヌクレオチドに至る中間体として本文中の教 示を逸脱することなく使用し得ることも理解及び認識されよう。 通常は、本発明の多段階合成手順の出発材料として市販のヌクレオシドを使用 するのが好ましい。合成を開始するために、先ず市販のヌクレオシド単位のリボ ース環またはデオキシリボース環の5′−位を保護し、次いで環の3′−位を誘 導体化して、フェニルチオノカーボネートのような適当な反応性基を形成するこ とによってヌクレオシド基質を形成するのが好ましい。 デオキシリボヌクレオシド基質を以下に示す。式中のBは塩基を示し、Rは5′ −位の保護基を示し、R1はヌクレオシドの3′−位の反応性基を示す。 上掲のヌクレオシド基質の化学式に基づいて、市販のヌクレオシドであるチミ ジン(“T”、ピリミジン、化合物1〜3)及びN6−ベンゾイル−2′−デオ キシアデノシン(“ABz”、塩基保護プリン、化合物4〜6)からヌクレオシド 基質を調製する一連の段階を示すためにいくつかの例を表Iに示す。 表Iの化合物1は市販のチミジンヌクレオシド試薬の非誘導体化形態を示し、 化合物4は市販の2′−デオキシアデノシン試薬のアミノ保護形態を示す。化合 物2及び5は夫々、3′−ヒドロキシル基を所望のチオノカーボネート(化合物 3及び6)に変換する前に5′−ヒドロキシル基をt−ブチルジメチルシリル官 能基で誘導体化することによって保護した同じチミジン及びN6−ベンゾイル− 2′−デオシアデノシンヌクレオシド試薬を示す。個々のヌクレオシド単位の糖 部分の5′−ヒドロキシル基を保護するために、t−ブチルジメチルシリル以外 の保護基(例えばジヒドロピラノシル)を使用してもよい。誘導 体化が要求される特定のヌクレオシド、他の化学的方法との適合性、他の実用上 及び経済上の要件などの要因を考慮に入れて好ましい保護基は当業者に明らかで あろう。 第二の基幹的な中間体は、糖環の3′−位に二重結合炭素官能基を有し、3′ −アルケニルヌクレオシドと呼ばれるヌクレオシドアナローグである。この第二 の中間体は、上記のヌクレオシド基質から調製される。より詳細には、これらの 3′−アルケニルヌクレオシド中間体は、表Iの化合物3及び6のような対応す るチオノカーボネートから調製され得る。3′−アルケニルヌクレオシドは以下 の一般式を有している。 適当なヌクレオシド基質(例えばチオノカーボネート)から所望の3′−炭素 誘導体化ヌクレオシドを生成させるためには、アルキル化反応が必要である。ヌ クレオシド化学法でアルキル 化を行うためには一般にシアノ基(−CN)アルキル化試薬が使用されている。 しかしながら、反応条件及び使用されるヌクレオシド基質次第では、この種のア ルキル化試薬は、得られる3′−炭素誘導体化ヌクレオシドの光学的に不純なラ セミ混合物を生成し得る。ラセミ混合物はオリゴヌクレオチドの作製に使用でき ない。その理由は、3′−炭素結合の立体化学が正しくないのでヌクレオチド間 結合が不正確になり、従ってオリゴヌクレオチドの生物活性に必要な適正な螺旋 構造が阻止されるからである。しかしながら意外にも、以下の一般式で示される 炭素−炭素二重結合を有するエチレン型のスズ含有アルキル化試薬を使用すると ヌクレオシド基質から光学的に純粋な3′−アルケニルヌクレオシドを作製し得 ることが知見された。 アルキル化試薬のR2及びR3は、アルキル化試薬の反応性または反応産物の立 体化学を妨害しないいかなる有機基であってもよい。しかしながら、以下の表II の好ましいトリブチルス ズエチルアクリレートに示すように、R2はエチルカルボキシレート基(CO2E t)であり、R3はブチル基であるのが好ましい。アルキル化試薬がシス形であ るのが更に好ましい。 アルキル化試薬のスズ部分はラジカル化学作用を促進すると考えられている。 スズアルキル化試薬は従来技術のシアノラジカルアルキル化試薬よりも嵩高いの で、スズアルキル化試薬は立体障害という利点を有し、全部の置換を強制的にヌ クレオシドのリボース環またはデオキシリボース環(または他の糖)の一方側か ら生じさせるので、光学的に純粋な中間体を生成させると考えられる。言い換え ると、得られた3′−アルケニルヌクレオシドの3′−位に新しく形成された炭 素−炭素結合は完全にリボースまたはデオキシリボース環の一方の面に存在する であろう。 上述のように、適当なヌクレオシド基質を好ましいシス形t−ブチルスズエチ ルアクリレートアルキル化試薬と接触させることによって生成された3′−アル ケニルヌクレオシドの例を表IIIに示す。 この種のスズアルキル化試薬は、Baldwinら,J.Chem.Soc. Chem.Comm.,133−134(1984)及びBaldwinら,J .Chem.Soc.Chem.Comm.,682−684(1985)によ って記載されたように非ヌクレオチド合成に関して記載した手順に対する変更に 由来し、これらの手順は本文中に教示したヌクレオシド化学に適応し得る。更に 、有効なビニル伝達基であると報告されたこの一般構造の更に別の誘導体を適応 させることも可能であろう。Crisp and Flynn,Tetra hedron Letters,31,1347−1350(1990);Fl ynnら,Nucleosides and Nucleotides,10, 763−779(1991)。 表IIIに示した化合物9及び10のような化合物は、第三の基幹的な中間体、 即ち以下に示す化学式を有し表IVに例示するヌクレオシド3′−アルデヒド誘導 体及び等価の化合物に有効に変換されるので、修飾オリゴヌクレオチドを合成す るための適当な中間体である。 これらのヌクレオシドアルデヒドは本発明の3′−炭素修飾オリゴヌクレオチ ドを合成するための直接中間体または基質として機能する。これらの3′−炭素 修飾オリゴヌクレオチドを生成させる基本的反応は新しいカップリング反応を介 して生じ、この反応においては、上記の3′−アルデヒドヌクレオシド中間体と 以下に示す一般式を有するカップリング試薬とが塩基性触媒の存在下で反応する 。 オリゴヌクレオチドを合成する場合、R5は保護基であり、R6は通常はヌクレ オチド成分であろう。言い換えると、カップリング試薬は更に十分に後述するよ うなヌクレオチドシントンであろう。R6がヌクレオチド成分でない状況では、 R6は一般にはオリゴヌクレオチドの最終修飾に有用な部分であろう。 以下の表Vに示す化合物12、13及び14は、3′−アルデヒドヌクレオシ ド前駆物質をオリゴヌクレオチドに組込むために使用されるカップリング試薬の 特定例である。この表において、化合物12は市販のジメチルホスファイトであ る。化合 物13及び14は3′−ヒドロキシ保護されたヌクレオチドシントンである。 カップリング試薬と3′−アルデビトヌクレオシド中間体との反応の結果とし て、以下の一般式を有する修飾ヌクレオチドが形成される。 以下の表VIは、tert−ブチルジメチルシリル保護されたチミジン3′−ア ルデヒドデオキシリボヌクレオシドとカップリング試薬13とから生成した修飾 ヌクレオチド(化合物15)を示す。 3′−アルデヒドヌクレオシド中間体と3′−ヒドロキシ保護されたヌクレオ チドシントン(例えば、上記のカップリング試薬13及び14)との間のカップ リング反応は、本発明の3′−炭素修飾結合を含むより短いオリゴヌクレオチド の溶液主体の合成に直接応用可能である。更に、ジメチルホスファイト(化合物 12)のようなジアルキルホスファイトは、3′−アルデヒドヌクレオシド中間 体に結合して、ヌクレオシド3′−モノホスフェート及びジヌクレオシド3′− モノホスホネートを生成し得る。 しかしながら、ポリマー支持法によって3′−炭素修飾ヌクレオチド間結合を 連続的に合成するためには、3′−アルデヒド保護ヌクレオチドシントンが必要 である。この3′−アルデヒド保護ヌクレオチドシントンを得るためには、先ず 3′−アルデヒドヌクレオシドのアルデヒド官能基を、慣用のオリゴヌクレオチ ド合成中のジメトキシトリチル基のトリクロロ酢酸による開裂と同様に比較的穏 やかな条件を用いて開裂できる保護基によって保護する。この種の保護基の例は 、ジチオアセタール官能基及び以下に示すN,N−ジフェニルイミダゾリジン官 能基である。 3′−アルデヒドヌクレオシドのアルデヒド官能基の保護に適した他の保護基 は、本発明の教示に従って当業者に明らかであろう。その例としては、アセター ル、オキサチオラン及びその他の公認のアルデヒド保護基がある。以下の表VII はN,N−ジフェニルイミダゾリジノアルデヒド保護ヌクレオシドの変種を示す 。 化合物16及び18は5′−位に追加の基(R)を有している。化合物16の アルデヒド保護ヌクレオシドの場合には、5′−位の脱保護によって、遊離5′ −ヒドロキシル(化合物17)が生成され、このヒドロキシルは更に誘導体化さ れてヌクレオシドアルキルホスファイト(化合物18)を生成し得る。このアル デヒド保護ヌクレオチドシントンは、固体支持体上で 3′−炭素修飾ヌクレオチド間結合を段階的に構築する合成サイクルで使用され 得る。 3′−アルデヒド保護ヌクレオチドシントン中の活性リン部分は5′−位に結 合しているので、ポリマー支持法による修飾オリゴヌクレオチドの合成は、慣用 の非修飾オリゴヌクレオチドの合成法と対照的に、5′から3′の方向に進行し なければならない。ポリマー支持法による非修飾オリゴヌクレオチド合成に関し ては、慣用でない5′から3′への合成方向は公知であるが、この方向の合成が 緩慢であることは周知であり、従って商業的環境では不利である。しかしながら 意外にも、本発明のアルデヒド保護ヌクレオチドシントンは5′から3′の方向 で3′−炭素修飾結合を迅速に合成し得ることが知見された。 通常は、オリゴヌクレオチドのポリマー支持合成法は、固体支持体に結合され たヌクレオシドを出発点として開始される。本発明方法はこの点では全く違って いない。より詳細には、化合物17のような、保護アルデヒド官能基を含むが5 ′−位が非保護のヌクレオシドアナローグを先ず、確立された合成方法に従って 非保護5′−位を誘導体化することによって適当な固 体支持体に結合させる。好ましい固体支持体はCPG(コントロールドポアガラ ス)であるが、他の固体支持体が当業界で公知であり本発明方法による合成に好 適であり得ることは理解されよう。最初のヌクレオシドを固体支持体に結合する ためには、慣用のスクシニルまたはサルコシニルリンカーを使用し得るが、これ らの反応に限定はされない。次に、得られた適正に誘導体化された固体支持体を 用い、慣用のDNA/RNAシンセサイザーを以下の方法に従って使用して5′ から3′の方向の固相合成を開始し3′−炭素修飾オリゴヌクレオチドを得る。 先ず、最初に結合したヌクレオシドからアルデヒド保護基を開裂する酸によっ て支持体を処理する。次に、この結合ヌクレオシドの遊離アルデヒドを化合物1 8のような3′−アルデヒド保護ヌクレオチドシントンと結合させて、固体支持 体上にヒドロキシメチレン修飾ダイマーオリゴヌクレオチドを生成させる。ポリ マー支持されたオリゴヌクレオチドの数回の洗浄段階後、支持体を再び酸処理し て、修飾オリゴヌクレオチド鎖を成長させるアルデヒド官能基を再生する。カッ プリング段階の反復によってオリゴヌクレオチド鎖は毎回1塩基ずつ延長される 。 しかしながら、合成すべき特定のオリゴヌクレオチド産物の要件次第では、こ のサイクルに多くの異なる変更を加えることが可能であることは理解されよう。 (例えば、部分修飾オリゴヌクレオチドの合成)。これらの変更を以下に要約す る。 慣用のオリゴヌクレオチド合成においては、不適格な配列の不都合なカップリ ングが進行することを防止するために“キャッピング”段階が必要である。本発 明の合成方法の場合、不適格な配列の不都合な副反応を防止するために、ジメチ ルホスファイト(化合物12)を用いて樹脂のキャッピングを行い、不適格な配 列の成長鎖を終止させる。 本文中に記載されたカップリング反応は、化合物18のような3′−アルデヒ ド保護されたヌクレオチドシントンの結合に限定されない。例えば、化合物14 のような3′−ヒドロキシ保護されたヌクレオシドも一連のカップリング反応の 終端段階として結合し、オリゴヌクレオチドの3′−端の保護された3′−ヒド ロキシを脱離し得る。これは特に、以後の高速液体クロマトグラフィー(HPL C)によるオリゴヌクレオチドの精製を容易にするであろう。または、化合物1 2を3′−末端に結合させてもよい。同様に、他のホスファイトシントンはオ リゴヌクレオチドの3′−末端に結合し得る。例えば、表Vに示すカップリング 試薬のR6部分の非限定例としては、3′−ジデオキシヌクレオシドまたはコレ ステロールのような分子またはフルオレセインのようなある種の蛍光分子または この化学作用と適合する任意の望ましい分子がある。 本発明のカップリング反応は、修飾オリゴヌクレオチドの3′−炭素に遊離ヒ ドロキシル基を生成する。従って、3′−ヒドロキシメチレン結合が望まれる場 合、3′−炭素をそれ以上修飾する必要はない。しかしながら、他の3′−炭素 修飾結合が望まれる場合には、オリゴヌクレオチドの合成中または合成後にヒド ロキシル官能基を修飾し得る。例えば、ヒドロキシル基を水素原子によって置換 してもよく(3′−メチレン結合の場合)またはフッ素原子または他の原子もし くは基によって置換してもよい。修飾オリゴヌクレオチドが3′−修飾結合だけ を含むことが望ましい場合(即ち、完全3′−炭素修飾オリゴヌクレオチド)、 遊離ヒドロキシル基の置換は所望のオリゴヌクレオチド配列の構築後に1段階で 行う。しかしながら、非修飾(ホスホジエステル)結合のような異なるヌクレオ チド間結合を部分修飾オリゴヌクレオチド産物に組込む必要がある場 合、3′−炭素修飾結合の遊離ヒドロキシル基の置換は、合成サイクル中で個々 の3′−炭素修飾結合の各々を構築した後に行わなければならない。 本発明の合成方法は、当業界で現行のポリマー支持法によるオリゴヌクレオチ ドの全自動合成法に適合する。従って、ホスホジエステル合成においてホスホジ エステル結合が3′−炭素修飾ヌクレオシドの組込みに使用されるのと同じ慣用 でない5′から3′の方向で行われる限り、3′−炭素修飾結合と非修飾(ホス ホジエステル)結合とから成る部分修飾オリゴヌクレオチドの合成は容易に行わ れ得る。例えば、3′−炭素修飾結合の組込みに関して上述したように最初にホ スホネートの合成を開始させると仮定した場合、先ず所望数の3′−炭素修飾結 合が合成され、次いで鎖中に生成した最終の3′−アルデヒドが、上記の化合物 14のような5′−アルキル−3′−ジメトキシトリチル化−ホスファイトに結 合される。このカップリング反応後に、遊離ヒドロキシメチレンホスホネートを 上述のように修飾するかまたは例えば無水酢酸で「キャッピング」することによ って保護し得る。最後に3′−末端ジメトキシトリチル官能基を酸脱保護するこ とによって、3′−ヒドロキシル 基が生成する。この基は適当な5′−ホスホルアミダイトとカップリングするこ とによってホスホジエステル結合を合成し得る。ホスホネート化学作用に戻るこ とが望ましい場合には、末端3′−ヒドロキシル基を化合物19のような保護さ れたアルデヒド官能基を含む5′−ホスホルアミダイトシントンと反応させ得る 。 このようにして、所望の任意の位置に少なくとも1つの修飾ホスホネート結合 をもつオリゴヌクレオチドアナローグを構築し得る。同様にして、これらの化学 作用を、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、メチルホスホノチオエー ト及びメチルホスホネートのような他のホスホルアミダイト主体の方法と組合わ せることも可能である。 また、R5官能基が必ずしもメチル基(MeすなわちCH3)に限定されないこ とも理解されよう。この場合、化学作用と適合性の任意の保護基を使用し得る。 または、適正なホスファイト/ホスホルアミダイト(該当するR5を含む化合物 12、14、18、19)の合成によって、修飾ヌクレオチド間結合の非架橋原 子を介して他の生物学的に望ましい部分を修飾オリゴヌクレオチドに結合させ得 る。 修飾オリゴヌクレオチドは、非修飾オリゴヌクレオチドに関して確立されたプ ロトコルに従って脱保護され得る。例えば、リン部分にメチル保護を使用した場 合、保護されたオリゴヌクレオチドを先ずチオフェノールまたは公認の等価試薬 によって処理してメチル官能基を除去する。この反応後に、オリゴヌクレオチド をアンモニアで適当な時間処理して、オリゴヌクレオ チド産物を固体支持体から開裂させ、塩基保護基を除去し、HPLCまたはポリ アクリルアミドゲル電気泳動のような公認の標準法に従って精製する。 以下の実施例は本発明の理解を助けるために提示したものであり、本発明の適 正な範囲は請求の範囲に記載されている。本発明の要旨を逸脱することなく記載 の手順の変更が可能であることは理解されよう。 特段の注釈がない限り、溶媒及び試薬は市販ソースから入手した。3′−Q− tert−ブチルジメチルシリルチミジンは、市販の5′−Q−(4,4′−ジ メトキシトリチル)チミジンとtert−ブチルジメチルシリルクロリドとを反 応させ、次いでp−トルエンスルホン酸によってトリチル基を除去することによ って調製した。3′−O−(4,4′−ジメトキシトリチル)チミジンは、5′ −Q−tert−ブチルジメチルシリルチミジン(実施例1で調製)と4,4′ −ジメトキシトリチルクロリドとを反応させ、次いでシリル基をテトラブチルア ンモニウムフルオリドで除去することによって調製した。 実施例1 5’−O−tert−ブチルジメチルシリルチミジン(化合物2)の合成) 5’−O−tert−ブチルジメチルシリルチミジン(化合物2、表I)を下 記の手順で製造した。チミジン(25g、0.10mole)、4−N,N−ジ メチルアミノピリジン(3.15g、0.026mol)及びトリエチルアミン (13.5g、18.6ml、0.13mol)をアルゴン流下で200mlの 乾燥N,N−ジメチルホルムアミドに溶解した。該溶解混合物に19.4g(0 .13mol)のtert−ブチルジメチルクロロシランを加え、混合物全体を 6時間撹拌した後、溶媒を蒸発させた。得られたゴム状物質を30mlの酢酸エ チルに溶解し、該溶液を重炭酸ナトリウム飽和溶液10ml、水30ml及びブ ライン30mlで抽出した。有機層を乾燥した後、残渣を、ジクロロメタン/エ タノール(50/1)を溶離剤として用いるフラッシュクロマトグラフィーで精 製した。生成物含有フラクションを蒸発させると、所望の5’−O−tert− ブチルジメチルシリルチミジンが白色泡状物質として31.5g得られた(収率 86%)。 実施例2 5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−O−フェノキシチオカルボ ニルチミジン(化合物3)の合成 下記の手順で5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−O−フェノ キシチオカルボニルチミジン(化合物3、表I)を製造した。実施例1の5’− O−tert−ブチルジメチルシリルチミジン7.29g(20.4mmol) を100mlの乾燥ジクロロメタンに溶解し、次いで3.89g(31.8mm ol)の4−N,N−ジメチルアミノピリジン及び3.58g(20.74mm ol)のフェニルクロロチオノホルメートを加え、その後室温で4時間撹拌し、 その時点で10mlの水を加え、有機層を水で抽出した。有機層を蒸発させ、残 渣を、ジクロロメタン中2%エタノールを溶離剤として用いるクロマトグラフィ ーで精製した。生成物含有フラクションから溶媒を蒸発させると、保護されたヌ クレオシド5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−O−フェノキシ チオカルボニルチミジンが白色泡状物質として7.9g得られた(収率79%) 。 実施例3 6−ベンゾイル−5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−2’−デオキ シアデノシン(化合物5)の合成 実施例1に記載の5’−O−tert−ブチルジメチルシリルチミジンの製造 に使用したものと類似の手順で、但しN6−ベンゾイル−2’−デオキシアデノ シン(10g、26.9mmol)、4−N,N−ジメチルアミノピリジン(0 .86g、7.0mmol)、トリエチルアミン(3.6g、4.96ml、3 5.4mmol)及びtert−ブチルジメチルクロロシラン(5.33g、3 5.4mmol)を100mlの乾燥N,N−ジメチルホルムアミドに溶解して 、N6−ベンゾイル−5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−2’−デオ キシアデノシン(化合物5、表1)を製造した。反応混合物を2時間撹拌してか ら実施例1に記載のように処理した。ジクロロメタン/エタノール(20/1) を溶離剤として用いてクロマトグラフィーを実施した結果、N6−ベンゾイル− 5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−2’−デオキシアデノシンが白色 泡状物質として9.6g得られた(収率73%)。 実施例4 6−ベンゾイル−5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−2’−デオキ シ−3’−O−フェノキシチオカルボニルアデノシン(化合物6)の合成 実施例2に記載の5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−O−フ ェノキシチオカルボニルチミジンの製造に使用したものと類似の手順で、但し実 施例3のN6−ベンゾイル−5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−2’ −デオキシアデノシン0.5g(1.0mmol)、4−N,N−ジメチルアミ ノピリジン(0.26g、2.1mmol)及びフェニルクロロチオノホルメー ト(0.24g、1.4mmol)を20mlの乾燥ジクロロメタンに溶解して 、N6−ベンゾイル−5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−2’−デオ キシ−3’−O−フェノキシチオカルボニルアデノシンを製造した。この場合は 、反応混合物を通常のように処理する前に16時間撹拌した。トルエン中酢酸エ チルを溶離剤として用いてクロマトグラフィーを実施した結果、保護されたヌク レオシドN6−ベンゾイル−5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−2’ −デオキシ−3’−O−フェノキシチオカルボニル アデノシンが0.39g得られた(化合物6、収率61%)。 実施例5 エチル−3−トリブチルスタンニル−2−プロペノエート(化合物7及び8)の 合成 アルキル化試薬として使用するためのエチル−3−トリブチルスタンニル−2 −プロペノエート(シス及びトランス形態、化合物7及び8、表II)を下記の手 順で製造した。エチルプロピオレート(57.18g、0.58mol)、水素 化トリブチルスズ(140g、129ml、0.48mol)及びアゾ−ビス− イソブチロニトリル(1g、0.007mol)を1l丸底フラスコ内で混合し た。この混合物を凍結−ポンプ−解凍脱ガス(freeze-pump-thaw degassed)に3 回かけ、次いで油浴中80℃で4時間撹拌し(この反応は潜在的に爆発性である ため十分な注意を要する)、4時間が経過した時点で反応混合物を油浴から取り 出し、室温に冷却する。冷却した混合物を100mlの酢酸エチルと一緒に蒸発 させ、得られた残渣を、ヘキサン/ジクロロメタン(99/1)を溶離剤として 用いるカラムクロマトグラフィーで精製した。生成物含有フラクションを蒸発さ せた結果、73.5gのシス−エチル−3−トリブ チルスタンニル−2−プロペノエートアルキル化試薬(化合物7、収率32%) 、及び66.8gのトランス−エチル−3−トリブチルスタンニル−2−プロペ ノエートアルキル化試薬(化合物8、収率29%)が得られた。 実施例6 5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−デオキシ−3’−エチルア クリルイルチミジン(化合物9)の合成 下記の手順で5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−デオキシ− 3’−エチルアクリルイルチミジンを製造した。5’−O−tert−ブチルジ メチルシリル−3’−O−フェノキシチオカルボニルチミジン(1.4g、2. 8mmol)、ヘキサメチルジチン(0.46g、1.4mmol)を100m l丸底フラスコ内でシス−エチル−3−トリブチルスタンニル−2−プロペノエ ート(3.06g、7.9mmol)に懸濁し、該溶液に0.14g(1mmo l)のアゾ−ビス−イソブチロニトリルを加えた。該混合物を凍結−ポンプ−解 凍脱ガスに3回かけ、次いで油浴中に87℃で2日間配置した。約12時間毎に 別の0.14gアリコートのアゾ−ビス−イソブチロニトリル(0.14g)を 反応混合物に加えた。2日間 インキュベートした後、反応混合物を冷却し、溶媒を蒸発によって除去した。ジ クロロメタン/エタノール(100/1)を用いて残渣をクロマトグラフィーに かけると、適当なフラクションの蒸発後に、0.90gの5’−O−tert− ブチルジメチルシリル−3’−デオキシ−3’−エチルアクリリルチミジン(化 合物9、表III)が白色泡状物質として得られた(収率72%)。 実施例7 6−ベンゾイル−5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−2’,3’− ジデオキシ−3’−エチルアクリルイルアデノシン(化合物10)の合成 下記の手順でN6−ベンゾイル−5’−O−tert−ブチルジメチルシリル −2’,3’−ジデオキシ−3’−エチリアクリルイルアデノシン(化合物10 、表III)を製造した。N6−ベンゾイル−5’−O−tert−ブチルジメチル シリル−2’−デオキシ−3’−O−フェノキシチオカルボニルアデノシン(5 0mg、0.08mmol)、シス−エチル−3−トリブチルスタンニル−2− プロペノエート(92mg、0.236mmol)及びヘキサメチルジチン(1 3mg、 0.04mmol)を40mlシュレンク管内で2mlのトルエンに溶解し、次 いで該混合物に15mg(0.11mmol)のアゾ−ビス−イソブチロニトリ ルを加えた。得られた混合物を凍結−ポンプ−解凍脱ガスに3回かけ、次いで油 浴中87℃で3日間加熱した。約12時間毎に、新たに15mgのアゾ−ビス− イソブチロニトリルを反応混合物に加えた。3日間インキュベートした後、反応 混合物を冷却し、溶媒を蒸発させ、残渣を、ジクロロメタン中1%エタノールを 溶離剤としてクロマトグラフィーにかけた。適当なフラクションの蒸発後にN6 −ベンゾイル−5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−2’,3’−ジデ オキシ−3’−エチルアクリルイルアデノシンが白色固体物質として19mg得 られた(収率42%)。 実施例8 5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−デオキシ−3’−ホルミル チミジン(化合物11)の合成 下記の手順で5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−デオキシ− 3’−ホルミルチミジン(化合物11、表VII)を製造した。5’−O−ter t−ブチルジメチルシリル−3’−デオキシ−3’−エチルアクリルイルチミジ ン(1g、 2.3mmol)及び4−メチルモルホリン−N−オキシド(0.52g、4. 4mmol)をアセトン40mlと水4mlとの溶液中に溶解して、透明薄黄色 溶液を形成した。次いで、四酸化オスミウム水溶液(11.2ml、0.050 g/ml、2.2.mmol)を加え、得られた薄黄色混合物を2時間撹拌した 。2時間が経過した時点で、反応混合物に1.17gの過ヨウ素酸ナトリウム( 5.47mmol)を加え、撹拌を更に1時間続けた。次いで撹拌混合物を0. 60gの重亜硫酸ナトリウムで処理し、該反応混合物を更に1時間撹拌した。1 時間が経過した時点で溶媒を蒸発させ、残渣を30mlの酢酸エチルに再溶解し た。再溶解残渣を含む溶液を水(3×20ml)で洗浄し、次いで無水硫酸ナト リウムで乾燥した。溶媒を蒸発させると、5’−O−tert−ブチルジメチル シリル−3’−デオキシ−3’−ホルミルチミジンが未精製の赤色泡状物質とし て0.59g得られた(収率71%)。この生成物は通常、それ以上精製しない で使用する。 実施例9 3’−O−tert−ブチルジメチルシリルチミジン−5’−O−メチル ホスフ ァイト(化合物13)の合成 下記の手順で3’−O−tert−ブチルジメチルシリルチミジン−5’−O −メチルホスファイト(化合物13、表VIII)を製造した。まず、3’−O−t ert−ブチルジメチルシリルチミジン(1.3g、3.6mmol)を乾燥ジ クロロメタン(15ml)及びトリエチルアミン(2ml)に溶解し、この溶液 にN,N−ジイソプロピルメチルホスホナミド酸クロリド(1.28ml、6. 6mmol)を加えた。この混合物を15分間撹拌した後、酢酸エチル(50m l)中に希釈した。有機層を重炭酸ナトリウム飽和溶液(50ml)及び水(5 0ml)で洗浄し、溶媒を蒸発させた。残渣をアセトニトリル(15ml)に再 溶解し、該溶液に水(0.53ml、29mmol)及びテトラゾール溶液(0 .5M、7.3ml、3.6mmol)を加えた。該反応混合物を20分間撹拌 した後、ジクロロメタン(50ml)中に希釈した。この有機溶液を重炭酸ナト リウム飽和溶液(50ml)、炭酸ナトリウム10%溶液(50ml)及びブラ イン(50ml)で洗浄し、 無水硫酸ナトリウムで乾燥した。濾過及び溶媒の蒸発後に得られたゴム状物質を クロマトグラフィーカラムで精製した。まずカラムをクロロホルム及びクロロホ ルム中2%エタノールで順次溶離し、その後生成物をクロロホルム中4%エタノ ールで溶離した。溶媒の蒸発後に、生成物3’−O−tert−ブチルジメチル シリルチミジン−5’−O−メチルホスファイトがゴム状物質として得られた( 1.1g、69%)。 実施例10 3’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−5’−O−メチルホス ファイト(化合物14)の合成 下記の手順で3’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジン−5’− O−メチルホスフィト(化合物14、表VIII)を製造した。3’−O−(4,4 ’−ジメトキシトリチル)チミジン(0.85g、1.56mmol)を乾燥ピ リジン(20ml)と一緒に2回蒸発させ、乾燥ジクロロメタン(8.5ml) 及びトリエチルアミン(0.68ml)に溶解した。該溶液をドライアイス/ア セトン浴中で−78℃に冷却し、これにN,N−ジイソプロピルメチルホスホナ ミド酸クロリド(0.49ml、2.52mmol)を加えた。この混合 物を20分間撹拌した後、酢酸エチル(50ml)中に希釈した。有機層を重炭 酸ナトリウム飽和溶液(50ml)及び水(50ml)で洗浄し、溶媒を蒸発さ せた。残渣をアセトニトリル(15ml)に再溶解し、次いで該アセトニトリル 混合物に水(0.25ml、13.9mmol)及びテトラゾール溶液(0.5 M、5.1ml、2.6mmol)を加えた。該反応混合物を20分間撹拌した 後、ジクロロメタン(50ml)中に希釈した。この有機溶液を重炭酸ナトリウ ム飽和溶液(50ml)、炭酸ナトリウム10%溶液(50ml)及びブライン (50ml)で洗浄し、次いで無水硫酸ナトリウムで乾燥した。濾過及び溶媒の 蒸発後に得られたゴム状物質を酢酸エチル(10ml)に溶解して、生成物をペ ンタン(500ml)中に沈殿させた。濾過し、真空下で一晩乾燥すると、生成 物3’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)チミジニル−5’−O−メチル ホスファイト(化合物14、表VIII)が白色固体物質として0.75g、即ち収 率77%で得られた。 実施例11 5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−デオキシ−3’−メトキシ ホスホニルヒドロキシメチルチミジニル−(3’→5’)−3’−O−tert −ブチルジメチルシリルチミジン(化合物15)の合成 下記の手順で5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−デオキシ− 3’−メトキシホスホニルヒドロキシメチルチミジニル−(3’→5’)−3’ −O−tert−ブチルジメチルシリルチミジン(化合物15、表IX)を製造し た。まず、未精製5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−デオキシ −3’−ホルミルチミジン(化合物11、0.78g、2.11mmol、実施 例8の1gの化合物9から得た)を乾燥ピリジン(14ml)に溶解した。この 溶液をベンゼン(20ml)中の3’−O−tert−ブチルジメチルシリルチ ミジン−5’−O−メチル−H−ホスホネート(1.91g、4.4mmol) 溶液と混合し、該混合物に1,8−ジアザビシクロ[5.4.0]ウンデク−7 −エン(DBU、165μl、1.1mmol)を加えた。該混合物を30分間 撹拌した後、溶媒を蒸発させ、残渣をクロマトグラフィーで精製した。 生成物の溶離は、ジクロロメタン中5%エタノールを溶離剤として用いて実施し た。その結果、所望の生成物(化合物15、1.02g、化合物9から計算して 56%)が黄色がかった白色の泡状物質として得られた。 実施例12 5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−デオキシ−3’−(2−N ,N−ジフェニルイミダゾリジノ)−チミジン(化合物16)の合成 下記の手順で5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−デオキシ− 3’−(2−N,N−ジフェニルイミダゾリジノ)−チミジン(化合物16、表 X)を製造した。5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−デオキシ −3’−ホルミルチミジン(1.3g、3.5mmol)を30mlのベンゼン に溶解し、次いで該溶液に1.5g(7.0mmol)の1,2−ジアニリノエ タンを加えた。得られた混合物を60℃で一晩撹拌した。この時点で20mlの 重炭酸ナトリウム飽和水溶液を加え、該溶液を酢酸エチル(3×30ml)で抽 出した。無水硫酸ナトリウムで乾燥した後、有機層を蒸発させ、残渣を、エタノ ール/トリエチルアミン/ジクロロメタン (1/2/97)を溶離剤としてクロマトグラフィーにかけた。適当なフラクシ ョンを蒸発させると、5’−O−tert−ブチルジメチルシリル−3’−デオ キシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミダゾリジノ)−チミジンが淡褐色固 体物質として1.25g得られた(収率63%)。 実施例13 3’−デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミダゾリジノ)−チミジン (化合物17)の合成 3’−デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミダゾリジノ)−チミジ ン(化合物17、表X)を下記の手順で製造した。5’−O−tert−ブチル ジメチルシリル−3’−デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミダゾリ ジノ)−チミジン(0.8g、1.4mmol)を50mlのTHFに溶解し、 撹拌し、次いで該撹拌溶液にフッ化テトラブチルアンモニウム(THF中1M溶 液、8.3ml、8.3mmol)を加えた。得られた混合物を30分間撹拌し た。トリエチルアミン(2ml)を加えた後、溶媒を蒸発させた。エタノール/ トリエチルアミン/ジクロロメタン(2/2/96)を溶離剤として用いるフラ ッシュクロマトグラフィーで残渣を精製した。 生成物含有フラクションを蒸発させ、残渣をペンタン中に沈殿させると、3’− デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミダゾリジノ)−チミジンが淡褐 色固体物質として0.63g得られた(収率99%)。 実施例14 3’−デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミダゾリジノ)−チミジン −5’−O−メチルホスファイト(化合物18)の合成 3’−デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミダゾリジノ)−チミジ ン−5’−O−メチルホスファイト(化合物18、表X)を下記の手順で製造し た。3’−デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミダゾリジノ)−チミ ジン(200mg、0.45mmol)を乾燥ピリジン(20ml)と一緒に2 回蒸発させ、乾燥ジクロロメタン(5ml)及びトリエチルアミン(0.17m l)に溶解した。該溶液をドライアイス/アセトン浴で−78℃に冷却し、これ にN,N−ジイソプロピルメチルホスホナミド酸クロリド(0.14ml、0. 72mmol)を加えた。この混合物を20分間撹拌し、その時点でN,N−ジ イソプロピルメチルホスホナミド酸クロ リド(0.02ml、0.01mmol)を更に加えた。更に15分後、該混合 物を酢酸エチル(50ml)中に希釈した。有機層を重炭酸ナトリウム飽和溶液 (50ml)及び水(50ml)で洗浄し、次いで溶媒を蒸発させた。残渣をア セトニトリル(5ml)に溶解し、次いで該アセトニトリル混合物に水(0.1 6ml、2.9mmol)及びテトラゾール溶液(0.5M、1.0ml、0. 5mmol)を加えた。該反応混合物を20分間撹拌した後、ジクロロメタン( 50ml)中に希釈した。この有機溶液を重炭酸ナトリウム飽和溶液(50ml )、炭酸ナトリウム10%溶液(50ml)及びブライン(50ml)で洗浄し 、次いで無水硫酸ナトリウムで乾燥した。濾過及び溶媒の蒸発後に得られたゴム 状物質を酢酸エチル(3ml)に溶解した。ペンタン(400ml)を加えて生 成物を沈殿させた。上澄みを静かに流し捨て、固体物質をペンタンで洗浄した後 、真空下で一晩乾燥すると、生成物が180mg得られた。これは収率76%に 相当する。 実施例15 3’−デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミダゾリジノ)−チミジン −5’−N,N−ジイソプロピル−O−メチルホスホルアミダイト(化合物19 )の合成 3’−デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミダゾリジノ)−チミジ ン−5’−N,N−ジイソプロピル−O−メチルホスホルアミダイト(化合物1 9、表10)を下記の手順で製造した。3’−デオキシ−3’−(2−N,N− ジフェニルイミダゾリジノ)−チミジン(200mg、0.45mmol)を乾 燥ピリジン(20ml)と一緒に2回蒸発させ、次いで得られた固体を乾燥ジク ロロメタン(5ml)及びトリエチルアミン(0.17ml)に溶解した。この 溶液に室温でN,N−ジイソプロピルメチルホスホナミド酸クロリド(0.12 ml、0.62mmol)を加えた。15分後、該混合物を酢酸エチル(50m l)中に希釈した。この有機溶液を重炭酸ナトリウム飽和溶液(50ml)、炭 酸ナトリウム10%溶液(50ml)及びブライン(50ml)で洗浄し、次い で無水硫酸ナトリウムで乾燥した。濾過及び溶媒の蒸発後に得られたゴム状物質 を酢酸エチル(3ml)に溶解した。ペンタン (400ml)を加えて生成物を沈殿させた。上澄みを静かに流し捨て、固体物 質をペンタンで洗浄した後、真空下で一晩乾燥した(収率160g、59%)。 実施例16 オリゴヌクレオチド類似体の合成 A. 固体支持体への3’−デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミダ ゾリジノ)−ヌクレオシドの結合 類似体合成が5’→3’方向に進行し得るように5’−ヒドロキシルを介して 適当な固体支持体に誘導体化(derivatized)ヌクレオシドを結合す る。例えば、3’−デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミダゾリジノ )チミジン(200mg、0.43mmol)及び4−N,N−ジメチルアミノ ピリジン(78.5mg、0.65mmol)を乾燥ピリジン(2×20ml) と一緒に蒸発させた。得られた残渣を乾燥ピリジン(20ml)に溶解し、該溶 液に無水コハク酸(34.4mg、0.34mmol)を加えた。この反応混合 物を一晩撹拌した。次いで溶媒を蒸発させ、残渣をトルエンと一緒に蒸発させた 後、ジクロロメタン(50ml)に溶解した。有機層を水(20ml)で2回洗 浄し、無水硫酸ナトリウムで 乾燥した。濾過後に得られた透明溶液を約10mlに濃縮し、生成物をヘキサン /エーテル(1/1、50ml)中に沈殿させた。生成物3’−デオキシ−3’ −(2−N,N−ジフェニルイミダゾリジノ)−チミジン−5’−O−スクシネ ート(195mg、80%)を濾過によって分離し、それ以上精製せずに使用し た。 スクシニル化ヌクレオシド(240mg、0.43mmol)を乾燥ピリジン (5ml)と乾燥ジオキサン(5ml)との混合物に溶解した。該溶液に1,3 −ジシクロヘキシルカルボジイミド(177mg、0.86mmol)及び4− ニトロフェノール(60mg、0.43mmol)を加え、該反応混合物を一晩 撹拌した。この時点で沈殿物を濾過し、溶媒を蒸発させた。残渣をトルエン(1 0ml)と一緒に2回蒸発させ、未精製3’−デオキシ−3’−(2−N,N− ジフェニルイミダゾリジノ)−チミジン−5’−O−スクシネート−(4−ニト ロフェニル)エステルをコントロールドポアガラス(controlled p ore glass)の誘導体化に使用した。 長鎖アルキルアミン誘導体化コントロールドポアガラス (89μmol/g)を乾燥テトラヒドロフラン(THF、5ml)に懸濁し、 これに未精製3’−デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミダゾリジノ )−チミジン−5’−O−スクシネート−4−ニトロフェニルエステルをTHF (3ml)及びトリエチルアミン(2.3ml)中溶液の形態で加えた。この混 合物を一晩振盪し、誘導体化支持体を濾過によって分離した。該支持体をN,N −ジメチルホルムアミド(3×10ml)、ジオキサン(3×10ml)、メタ ノール(5×10ml)及びエーテル(3×10ml)で洗浄した。 下記の手順で樹脂のキャッピングを行った。コントロールドポアガラスを乾燥 ピリジンに懸濁し、無水酢酸(0.5ml)で処理した。この混合物を30分間 振盪した。次いで、完全に官能化した支持体を濾過し、メタノール(6×10m l)及びエーテル(3×10ml)で洗浄した後、乾燥した。 B. オリゴヌクレオチドホスホネートの合成 Applied Biosystems 394 DNA/RNA合成器を用 いて、オリゴヌクレオチド類似体の合成を行った。前記装置を用いれば、前述の 試薬を使用して、均一な又は断続的なホスホネート官能基を含む類似体を合成し 得る。 C. 完全修飾オリゴヌクレオチドの合成 最も簡単な事例では、3’−デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニルイミ ダゾリジノ)−ヌクレオシドで修飾した固体支持体を酸の存在下で脱ブロックし て、樹脂に結合した3’−ホルミルヌクレオシドを得る。酸を除去するために樹 脂を洗浄した後、DBU(ピリジン中53mM)を活性剤として用いて、化合物 18(ベンゼン中0.1M)のような3’−修飾−5’−ホスファイトの存在下 でカップリングを生起させる。合成は5’→3’方向に進行する。更に別の洗浄 ステップ後に、化合物18のような単量体構築ブロックを用いてサイクルを繰り 返し、適当な配列を形成する。14(ベンゼン中0.1M)のような3’−O− ジメトキシトリチル化ホスファイトを配列中の最終(3’末端)ヌクレオチドと してカップリングさせた。例えば、核塩基(nucleobase)(約0.5 μMのスケール)としてのチミジンとの間に6個の均一ヒドロキシメチレンホス ホネート結合を合成するのに必要とされる自動化ステップは下記の通りであった : この方法で、6個の連続した3’−ヒドロキシメチレンホスホネートヌクレオ チド間結合を有する完全修飾7量体T******T(*は3’−ヒドロキ シメチレン修飾ヌク レオチド間結合を表す)が合成され、収率は71%であった(31P NMR( D2O);δ19−20ppm)。この修飾オリゴヌクレオチドを、トリチルを 保護基として用いて標準的HPLC法(例えば、Evaluating and Isolating Synthetic Oligonucleotide , User Bulletin 13(Applied Biosyste ms Inc.1987参照)で精製し、次いでSynthesis and Purification of Phosphorodithioate D NA,from Protocols for Oligonucleotid es and Analogs;Synthesis and Propert ies ,191−206(Agrawal編,Humana Press 19 93)に記載のWieslerらの方法で脱トリチル化した。 D. 部分修飾オリゴヌクレオチドの合成 この実施例は、ホスホネート結合を形成するために使用する化学を、ホスホル アミダイト(phosphoramidite)化学のようなオリゴヌクレオチ ド化学の一般的方法と一緒に使用する方法を説明する。一具体例を、修飾オリゴ ヌクレオ チドTT*TTTTTTTTTTTT(*は3’−ヒドロキシメチレン修飾ヌクレ オチド間結合の位置を示す)の合成について示す。但し、実施例16Cに記載の 完全修飾オリゴヌクレオチドの合成と同様に、合成は5’→3’方向に進行する 。この実施例では、市販の3’−ジメトキシトリチル化固体支持体を、標準的機 械プロトコルを用いて脱トリチル化し、テトラゾール(アセトニトリル中0.5 M)の存在下で5分間にわたり3’−デオキシ−3’−(2−N,N−ジフェニ ルイミダゾリジノ)−チミジン−5’−N,N−ジイソプロピル−O−メチルホ スホルアミダイト(化合物19、アセトニトリル中0.1M)にカップリングし た。カップリング後は標準的キャッピング及び酸化プロトコルを適用する。この ジヌクレオチド単位の合成後、均一ヒドロキシメチレンホスホネートに関する前 記サイクルのセクション8で概要を説明したプロトコルを適用して、末端3’− ジメトキシトリチル官能基との単一ヒドロキシメチレンホスホネート結合を形成 した。この時点で、固体支持体を機械キャッピング溶液で5分間処理した。配列 の残りは、市販の5’−O−シアノエチル−N,N−ジイソプロピルホスホルア ミダイト(この実施例ではチミジンの)を使用して、これらのホスホ ルアミダイトに関する標準的機械プロトコルを用いて完成させる。 ヒドロキシメチレンホスホネート結合を一つ有する14量体オリゴチミジレー ト(oligothymidylate)(収率18%:31P NMR(D2O );δ19−20ppmヒドロキシメチレンホスホネート;0ppmホスホジエ ステル)。 E. 誘導体化CPGローディング能力の測定 単一カップリングサイクルを実施することにより、修飾デオキシリボヌクレオ シドのローディングを評価した。この場合は、樹脂をトリクロロ酢酸で処理し、 溶媒で洗浄し、DBU(ピリジン中53mM)の存在下で3’−O−(4,4’ −ジメトキシトリチル)チミジン−5’−O−メチルホスファイト(化合物14 、ベンゼン中0.1M)とカップリングした。次いで、固体支持体を塩化メチレ ン中トリクロロ酢酸で処理した時のジメトキシトリチルカチオン放出量の測定値 を用いて、CPGに対する修飾ヌクレオシドローディングを評価した。 トリチルフラクションを10mlメスフラスコ内に回収し、明るい橙色のトリ チルカチオン溶液を0.1Mp−トルエンス ルホン酸で10mlに希釈した。アセトニトリル中0.1Mp−トルエンスルホ ン酸800μl中の前記溶液200μlは、下記のようなローディング能力の計 算を可能にする吸光度読取値を与えた: 前記式中、A498は溶液の498nmの吸光度を表し、Vは原液の総容量を表 し、Eはジメトキシトリチルカチオン(7×104l/mol)の吸光係数を表 す。 この方法で得られた誘導体化固体支持体の修飾ヌクレオシドローディングは4 〜10μmol/gであった。 F. ヌクレオチド間ホスホネートトリエステルの脱保護及び支持体からの開裂 オリゴヌクレオチドCPG(アルゴン乾燥)の1μmol合成物に、ジナトリ ウム2−カルバモイル−2−シアノエチレン−1,1−ジチオレートの(ジメチ ルホルムアミド中)1M溶液を1ml加えた。脱保護を室温で一晩(16時間) 生起させた。終了後、CPGを水で3回洗浄し、次いでアセトンで3回洗浄した 。次いでCPG結合ホスホジエステルをアルゴン下で 乾燥し、2mlの30%NH4OHの添加により支持体から開裂した。開裂は室 温で3時間後に完了した。真空乾燥後に得られた残渣は、1mlの水中への溶解 及び260ラムダの吸光度測定よって定量が可能であった。 文献に記載の方法(Dahlら,Acta Chemica,44,639− 641(Scandinavica,1996))で、ジナトリウム2−カルバ モイル−2−シアノエチレン−1,1−ジチオレートを製造した。 ナトリウム(4.6g、0.2mol)をエタノール(125ml)中に注意 深く溶解した。この溶液に、エタノール(50ml)中のシアノアセトアミド( 16.8g、0.2mol)の懸濁液を滴下した。得られた懸濁液に二硫化炭素 (12.2ml、0.2mol)を加え、該混合物を1時間撹拌した。ナトリウ ム(4.6g、0.2mol)を更にエタノール(125ml)中溶液として加 えた。添加後、該混合物を一晩冷蔵して生成物を沈殿させた。固体を濾過し、次 いでエタノールで洗浄した。この粗物質を80%メタノール水溶液(100ml )に再溶解し、該溶液にエタノール(300ml)を加えた。生成物を4℃で一 晩結晶化させ、その後濾過によっ て回収した(収率36.4g、70%)。 実施例17 修飾オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性 この実施例は、3’−エキソヌクレアーゼ及び5’−エキソヌクレアーゼと接 触させた時の本発明の修飾オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性を、非修飾( 野生型)オリゴヌクレオチドと比較して示す。実施例16Cの3’−ヒドロキシ メチレン7量体を代表的3’−炭素修飾オリゴヌクレオチドとして使用した。配 列は同じであるが非修飾ホスホジエステル結合しか含んでいない対応する非修飾 7量体オリゴヌクレオチドを、下記の操作で対照として使用するために、自動合 成器で、標準的ポリマー支持合成法に従って合成した。 3’−メチレン修飾オリゴヌクレオチドを、二つの異なる方法で、ヌクレアー ゼ消化に対する感受性について分析した。第一の方法では、修飾オリゴヌクレオ チド及び非修飾対照の両方をそれぞれの5’末端で放射性リン(32P)で標識し 、次いで安定性を、まずオリゴヌクレオチドを3’−エキソヌクレアーゼ、ヘビ 毒ホスホジエステラーゼと接触させ、次いで形成されたオリゴヌクレオチド生成 物の大きさをポリアクリルアミドゲ ル電気泳動(PAGE)を用いて標準的方法で測定することにより評価した。第 二の方法では、修飾オリゴヌクレオチド及び対応する非修飾オリゴヌクレオチド を、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)を用いて、5’−エキソヌクレア ーゼ子ウシ脾臓ホスホジエステラーゼの存在下でのヌクレアーゼによる分解につ いて分析した。 A. ヘビ毒ホスホジエステラーゼに対する耐性 γ−32P−ATP及びポリヌクレオチドキナーゼを用いて、当業者に公知の標 準的方法で、修飾オリゴヌクレオチド及び対応するホスホジエステルオリゴヌク レオチド(対照)の両方を標識した。過剰γ−32P−ATPをG−50Seph adex(登録商標)(Pharmacia)でのゲル濾過によりオリゴヌクレ オチドから分離した。 3.4pmolのオリゴヌクレオチドを含む放射性オリゴヌクレオチド溶液を 、それぞれ0、0.3×10-5、0.6×10-5、1.2×10-5、2.4×1 0-5及び4.8×10-5単位のヘビ毒ホスホジエステラーゼ(ドイツ、マンハイ ム、Boehringer)で処理し、得られた溶液を37℃で30分間インキ ュベートした。インキュベーション後、ブロモ フェノールブルー、キシレンシアノール及び25mM EDTAを含む同量の9 0%ホルムアミドを各オリゴヌクレオチド溶液に加え、該混合物を90℃で5分 間加熱した。次いで、20%変性ポリアクリルアミドゲル上で分離することによ り試料を分析した。 ホスホジエステル(非修飾)オリゴヌクレオチドは、0単位反応を除く総ての 反応で分解した。1.2×10-5以上の単位の酵素を使用すると、分解は総ての 反応で完了した。これに対し、修飾(ヒドロキシメチレンホスホネート)オリゴ ヌクレオチドの有意な分解はどの反応でも観察されなかった。 B. 子ウシ脾臓ホスホジエステラーゼに対する耐性 250μl単位のエキソヌクレアーゼ、子ウシ脾臓ホスホジエステラーゼ(B oehringer Mannheim)懸濁液を所期の各オリゴヌクレオチド 溶液(0.5A260単位)に加え、該溶液をトリス−EDTA緩衝液(0.1M )で総量300μlにした。室温で30分間インキュベートした後、50mMリ ン酸ナトリウム、pH6、を水性相として使用し、25分間にわたり0〜30% アセトニトリル勾配でHPLCにかけて、反応溶液を分析した。標準試料のクロ マトグラフとの 比較により、生成物を同定した。 これらの条件下で、ホスホジエステル(非修飾)オリゴヌクレオチドは酵素に より80%分解したが、修飾オリゴヌクレオチドに関しては、約16%の開裂生 成物が観察された。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI C07H 19/16 8615−4C C07H 19/16 21/04 8615−4C 21/04 Z // A61K 31/70 ADU 9284−4C A61K 31/70 ADU ADY 9284−4C ADY (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M C,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF,CG ,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,SN, TD,TG),AP(KE,MW,SD,SZ,UG), AM,AT,AU,BB,BG,BR,BY,CA,C H,CN,CZ,DE,DK,EE,ES,FI,GB ,GE,HU,JP,KE,KG,KP,KR,KZ, LK,LR,LT,LU,LV,MD,MG,MN,M W,MX,NL,NO,NZ,PL,PT,RO,RU ,SD,SE,SG,SI,SK,TJ,TT,UA, UG,UZ,VN

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1. 少なくとも10個の塩基からなり、少なくとも2個の3’−炭素修飾ヌク レオチド間結合を含む、下記の構造: [式中、R5は対イオンであり、X及びYは水素(−H−)、フッ素(−F−) 又はヒドロキシル(−OH−)部分の中から選択される] を有する修飾オリゴヌクレオチド。 2. 10〜60塩基の長さを有する請求項1に記載の修飾オリゴヌクレオチド 。 3. 少なくとも3個の3’−炭素修飾ヌクレオチド間結合を有する請求項2に 記載の修飾オリゴヌクレオチド。 4. 前記3個の3’−炭素修飾ヌクレオチド間結合が前記修飾オリゴヌクレオ チドの3’−末端にある請求項3に記載の修飾オリゴヌクレオチド。 5. 前記ヌクレオチド間結合の総てが3’−炭素修飾ヌクレオチド間結合であ る請求項1に記載の修飾ヌクレオチド。 6. X及びYが水素原子である請求項1に記載の修飾オリゴヌクレオチド。 7. 12〜16塩基の長さを有する請求項6に記載の修飾オリゴヌクレオチド 。 8. 少なくとも3個の3’−メチレン修飾ヌクレオチド間結合を有する請求項 7に記載の修飾オリゴヌクレオチド。 9. 前記ヌクレオチド間結合の総てが3’−メチレン修飾ヌクレオチド間結合 である請求項8に記載の修飾オリゴヌクレオチド。 10. X及びYが独立して水素原子及びヒドロキシル基を表す請求項1に記載 の修飾オリゴヌクレオチド。 11. 12〜60塩基の長さを有する請求項10に記載の修飾オリゴヌクレオ チド。 12. 少なくとも3個の3’−ヒドロキシメチレン修飾ヌクレオチド間結合を 有する請求項11に記載の修飾オリゴヌクレオチド。 13. 前記ヌクレオチド間結合の総てが3’−ヒドロキシメ チレン修飾ヌクレオチド間結合である請求項12に記載の修飾オリゴヌクレオチ ド。 14. ヌクレオシド基質を下記の構造: [式中、R3及びR4は有機基である] のアルキル化試薬でアルキル化することからなる3’−アルケニルヌクレオシド の製造方法。 15. 前記アルキル化試薬のR3がエチルカルボキシレート基(CO2Et)で あり、前記アルキル化試薬のR4がブチル基である請求項14に記載の方法。 16. (a)ヌクレオシド基質をアルキル化して3’−アルケニルヌクレオシ ドを形成し、 (b)前記3’−アルケニルヌクレオシドのアルケニル官能基を開裂し て3’−アルデヒドヌクレオシドを形成し、 (c)前記3’−アルデヒドヌクレオシド上の3’−アルデヒド部分を 保護し、 (d)前記保護3’−アルデヒドヌクレオシドの5’位置でヒドロキシ ル基を誘導体化して前記5’位置にホスファイト官能基を形成するステップから なる3’−アルデヒド保護 ヌクレオチドシントンの製造方法。 17. 3’−アルデヒドヌクレオシドを3’−アルデヒド保護ヌクレオチドシ ントンとカップリングすることからなる修飾オリゴヌクレオチドの合成方法。 18. 前記3’−アルデヒド保護ヌクレオチドシントンが下記の構造: [式中、Phはフェニル基であり、Rは保護基であり、Bはアデニン、チミジン 、グアニン、シトシン及びウラシルの中から選択した塩基である] を有する請求項17に記載の方法。 19. 下記の構造: [式中、Phはフェニル基であり、Rは保護基であり、Bはアデニン、チミジン 、グアニン、シトシン及びウラシルの中から選択した塩基である] を有するN,N−ジフェニルイミダゾリジノアルデヒド保護ヌクレオシド。
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