BR112021008967A2 - moduladores da expressão de irf5 - Google Patents

moduladores da expressão de irf5 Download PDF

Info

Publication number
BR112021008967A2
BR112021008967A2 BR112021008967-5A BR112021008967A BR112021008967A2 BR 112021008967 A2 BR112021008967 A2 BR 112021008967A2 BR 112021008967 A BR112021008967 A BR 112021008967A BR 112021008967 A2 BR112021008967 A2 BR 112021008967A2
Authority
BR
Brazil
Prior art keywords
compound
certain embodiments
seq
modified
modified oligonucleotide
Prior art date
Application number
BR112021008967-5A
Other languages
English (en)
Inventor
Susan M. Freier
Original Assignee
Ionis Pharmaceuticals, Inc.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ionis Pharmaceuticals, Inc. filed Critical Ionis Pharmaceuticals, Inc.
Publication of BR112021008967A2 publication Critical patent/BR112021008967A2/pt

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088—Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/7105—Natural ribonucleic acids, i.e. containing only riboses attached to adenine, guanine, cytosine or uracil and having 3'-5' phosphodiester links
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/04—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10—Type of nucleic acid
    • C12N2310/11—Antisense
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
    • C12N2310/312—Phosphonates
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/31—Chemical structure of the backbone
    • C12N2310/315—Phosphorothioates
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/321—2'-O-R Modification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/32—Chemical structure of the sugar
    • C12N2310/323—Chemical structure of the sugar modified ring structure
    • C12N2310/3231—Chemical structure of the sugar modified ring structure having an additional ring, e.g. LNA, ENA
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/33—Chemical structure of the base
    • C12N2310/334—Modified C
    • C12N2310/3341—5-Methylcytosine
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/34—Spatial arrangement of the modifications
    • C12N2310/341—Gapmers, i.e. of the type ===---===
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00—Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/30—Chemical structure
    • C12N2310/35—Nature of the modification
    • C12N2310/352—Nature of the modification linked to the nucleic acid via a carbon atom
    • C12N2310/3521—Methyl

Abstract

MODULADORES DA EXPRESSÃO DE IRF5. A presente invenção refere-se a métodos, compostos e composições úteis para inibir a expressão de IRF5, que podem ser úteis para tratar, prevenir ou aliviar uma doença associada a IRF5.

Description

Relatório Descritivo da Patente de Invenção para "MODULADORES DA EXPRESSÃO DE IRF5".
REFERÊNCIA REMISSIVA A PEDIDO RELACIONADO
[0001] O presente pedido reivindica a prioridade ao pedido de patente provisório US N° 62/767.615, depositado em 15 de novembro de 2018, cuja revelação está aqui incorporada em sua totalidade por referência.
LISTAGEM DE SEQUÊNCIA
[0002] O presente pedido é depositado com uma listagem de sequências em formato eletrônico. A listagem de sequências é fornecida como um arquivo intitulado BIOL0341USLSEQ_ST25.txt, criado em 5 de novembro de 2018, tendo aproximadamente 324 kb de tamanho. As informações no formato eletrônico da listagem de sequências estão aqui incorporadas, a título de referência em sua totalidade.
CAMPO DA INVENÇÃO
[0003] As presentes modalidades fornecem métodos, compostos e composições úteis para inibir o fator regulador de interferon 5 (IRF5; Humirf5) e, em certos casos, reduzir a quantidade de proteína IRF5 em uma célula ou animal, que pode ser útil para tratar, evitar ou aliviar uma doença associada ao IRF5.
ANTECEDENTES
[0004] O fator regulador de interferon 5 ou IRF5 é um importante regulador de inflamação e autoimunidade. Há um grande corpo de evidência que liga alelos de risco de IRF5, que estão associados com alta expressão, ao risco de doenças autoimunes, como lúpus eritematoso sistêmico, artrite reumatoide, esclerose sistêmica, doença inflamatória intestinal e esclerose múltipla (Hedl e Abhaham, J. Immunol., 2012, 188: 5348-5356; Kristjansdottir et al., J. Med. Genet. 2008, 45: 362-369; Graham et al., Nature Genet. 2006, 38: 550-555; Graham et al., PNAS, 2007, 104: 6758-6763).
[0005] O padrão atual de cuidados médicos para doença de Crohn e colite ulcerativa, as duas formas principais de doença inflamatória intestinal em seres humanos, envolve o tratamento com agentes anti- inflamatórios, corticoesteroides, imunomoduladores, incluindo azatioprina, ou seu metabólito ativo 6-mercaptopurina, metotrexato, agentes biológicos, incluindo terapias antagonistas do fator de necrose tumoral, terapias anti-integrina, e terapia anti-interleucina (IL) 12/23. É um objetivo da presente invenção fornecer compostos e composições de alta eficácia e tolerabilidade para o tratamento das doenças aqui reveladas.
SUMÁRIO
[0006] Certas modalidades aqui fornecidas são compostos e métodos para reduzir a quantidade ou atividade de mRNA de IRF5 e, em certas modalidades, reduzir a quantidade de proteína IRF5 em uma célula ou indivíduo. Em certas modalidades, o indivíduo tem uma doença gastrointestinal. Em certas modalidades, o indivíduo tem uma doença inflamatória intestinal. Em certas modalidades, a doença inflamatória intestinal é doença de Crohn. Em certas modalidades, a doença autoimune é doença inflamatória intestinal (DII). Em certas modalidades, a doença é colite ulcerativa. Em certas modalidades, a doença é lúpus eritematoso sistêmico (LES). Em certas modalidades, a doença é artrite reumatoide. Em certas modalidades, o distúrbio imune é cirrose biliar primária. Em certas modalidades, a doença autoimune é esclerose múltipla. Em certas modalidades, o distúrbio imune é Síndrome de Sjogren. Em certas modalidades, a doença autoimune é esclerose múltipla. Em certas modalidades, o retinoide é escleroderma. Em certas modalidades, a doença é doença pulmonar intersticial (SSc- ILD). Em certas modalidades, a doença é doença renal policística (PKD). Em certas modalidades, a doença é doença renal crônica (CKD). Em certas modalidades, a doença é NASH. Em certas modalidades, a doença é fibrose hepática. Em certas modalidades, a doença é asma. Em certas modalidades, a doença é asma grave. Certos compostos aqui fornecidos são direcionados a compostos e composições que reduzem a inflamação em um animal.
[0007] Certas modalidades aqui fornecidas são direcionadas a compostos e composições potentes e toleráveis úteis para inibir a expressão de IRF5, que podem ser úteis para tratar, evitar, aliviar ou retardar a progressão de uma doença inflamatória. Certas modalidades aqui fornecidas são direcionadas a compostos e composições que são mais potentes ou têm maior valor terapêutico do que os compostos publicamente revelados.
DESCRIÇÃO DETALHADA
[0008] Deve-se entender que tanto a descrição geral supracitada e a descrição detalhada a seguir são apenas exemplificadores e explicativas e não são restritivas das modalidades, conforme reivindicado. Na presente invenção, o uso do singular inclui o plural, exceto onde especificado em contrário. Como usado na presente invenção, o uso de "ou" significa "e/ou", exceto onde especificado em contrário. Além disso, o uso do termo "incluindo" bem como outras formas, como "inclui" e "incluído", não é limitador.
[0009] Os títulos de seção usados na presente invenção se destinam apenas a propósitos de organização e não devem ser interpretados como limitadores da matéria descrita. Todos os documentos, ou porções de documentos, citados neste pedido, incluindo, mas não se limitando a, patentes, pedidos de patente, artigos, livros, tratados e registros de sequências de referência GenBank e NCBI estão aqui expressamente incorporados, a título de referência, para as porções do documento aqui discutido, bem como em sua totalidade.
[0010] Entende-se que a sequência apresentada em cada SEQ ID Nº nos exemplos aqui contidos é independente de qualquer modificação em uma porção açúcar, uma ligação internucleosídica ou uma nucleobase. Dessa forma, os compostos definidos por uma SEQ ID Nº podem compreender, independentemente, uma ou mais modificações em uma porção açúcar, uma ligação internucleosídica, ou uma nucleobase. Os compostos descritos pelo número ION indicam uma combinação de sequência de nucleobases, modificação química, e motivo. Definições
[0011] Exceto onde indicado o contrário, os seguintes termos têm os seguintes significados:
[0012] "Porção 2'-desoxifuranosila de açúcar " ou "açúcar 2'- desoxifuranosila" significa uma porção furanosila de açúcar tendo dois hidrogênios na posição 2'. As porções 2'-desoxifuranosila de açúcar podem ser não modificadas ou modificadas e podem ser substituídas em outras posições além da posição 2' ou não substituídas. Uma porção β-D- 2'-desoxirribosila de açúcar no contexto de um oligonucleotídeo é uma 2'-desoxifuranosila não substituída e não modificada e é encontrada em ácidos desoxirribonucleicos (DNA) de ocorrência natural.
[0013] "2'-desoxinucleosídeo" significa um nucleosídeo que compreende uma porção 2'-H(H) furanosila de açúcar conforme encontrada em ácidos desoxirribonucleicos (DNA) de ocorrência natural. Em certas modalidades, um 2'-desoxinucleosídeo pode compreender uma nucleobase modificada ou pode compreender uma nucleobase RNA (uracil).
[0014] "2'-O-metoxietila" (também 2'-MOE) refere-se a um 2'- O(CH2)2-OCH3) no lugar do grupo 2'-OH de um anel de ribosila. Um açúcar modificado com 2'-O-metoxietila é um açúcar modificado.
[0015] "Nucleosídeo 2'-MOE" (também nucleosídeo 2'-O- metoxietila) significa um nucleosídeo que compreende uma porção açúcar modificada com 2'-MOE.
[0016] "Nucleosídeo 2'-substituído" ou "nucleosídeo 2-modificado" significa um nucleosídeo que compreende uma porção açúcar 2'- substituída ou 2'-modificada. Como usado aqui, "2'-substituída" ou "2- modificada em referência a uma porção açúcar significa uma porção açúcar compreendendo pelo menos um grupo 2'-substituinte diferente de H ou OH.
[0017] "Sítio-alvo 3'" refere-se ao nucleotídeo de um ácido nucleico- alvo que é complementar ao nucleotídeo mais 3' de um composto específico.
[0018] "Sítio-alvo 5'" refere-se ao nucleotídeo de um ácido nucleico- alvo que é complementar ao nucleotídeo mais 5' de um composto específico.
[0019] "5-metilcitosina" significa uma citosina com um grupo metila fixado à posição 5.
[0020] "Cerca de" significa dentro de ± 10% de um valor. Por exemplo, se for declarado, "os compostos afetaram cerca de 70% de inibição do PNPLA3", está implícito que os níveis de PNPLA3 são inibidos dentro de uma faixa de 60% e 80%.
[0021] "Administração" ou "administrar" refere-se a vias de introdução de um composto ou composição aqui fornecidos a um indivíduo para executar sua função pretendida. Um exemplo de uma via de administração que pode ser usada inclui, mas não se limita a, administração parenteral, como injeção ou infusão subcutânea, intravenosa ou intramuscular.
[0022] "Administrado concomitantemente" ou "coadministração" significa a administração de dois ou mais compostos de qualquer maneira na qual os efeitos farmacológicos de ambos se manifestam no paciente. A administração concomitante não exige que ambos os compostos sejam administrados em uma única composição farmacêutica, na mesma forma de dosagem, pela mesma via de administração, ou ao mesmo tempo. Os efeitos de ambos os compostos não precisam se manifestar ao mesmo tempo. Os efeitos só precisam ser sobrepostos por um período de tempo e não precisam ser coextensivos. A administração ou coadministração concomitante abrange a administração em paralelo ou sequencialmente.
[0023] "Alívio" refere-se a uma melhora ou diminuição de ao menos um indicador, sinal ou sintoma de uma doença, distúrbio ou condição associada. Em certas modalidades, o alívio inclui um atraso ou desaceleração na progressão ou gravidade de um ou mais indicadores de uma condição ou doença. A progressão ou gravidade dos indicadores pode ser determinada por medidas subjetivas ou objetivas, que são conhecidas pelos versados na técnica.
[0024] "Animal" refere-se a um animal humano ou não humano, incluindo, mas não se limitando a, camundongos, ratos, coelhos, cães, gatos, porcos e primatas não humanos, incluindo, mas não se limitando a, macacos e chimpanzés.
[0025] "Atividade antissenso" significa qualquer atividade detectável e/ou mensurável atribuível à hibridização de um composto antissenso com seu ácido nucleico-alvo. Em certas modalidades, a atividade antissenso é uma diminuição na quantidade ou expressão de um ácido nucleico-alvo ou proteína-alvo codificada por tal ácido nucleico-alvo em comparação com os níveis de ácido nucleico-alvo ou níveis de proteína-alvo na ausência do composto antissenso para o alvo.
[0026] "Composto antissenso" significa um composto que compreende um oligonucleotídeo e, opcionalmente, uma ou mais características adicionais, como um grupo conjugado ou grupo terminal. Exemplos de compostos antissenso incluem compostos de fita simples e de fita dupla, como oligonucleotídeos, ribozimas, siRNAs, shRNAs, ssRNAs, e compostos baseados em ocupação.
[0027] "Inibição antissenso" significa a redução dos níveis de ácido nucleico-alvo na presença de um composto antissenso complementar a um ácido nucleico em comparação com os níveis de ácido nucleico-alvo na ausência do composto antissenso.
[0028] "Mecanismos antissenso" são todos aqueles mecanismos que envolvem a hibridização de um composto com ácido nucleico-alvo, sendo que o resultado ou efeito da hibridização é a degradação-alvo ou a ocupação-alvo com estol concomitante do maquinário celular envolvendo, por exemplo, transcrição ou emenda.
[0029] O termo "oligonucleotídeo antissenso" significa um oligonucleotídeo tendo uma sequência de nucleobases que é complementar a um ácido nucleico-alvo ou região ou segmento do mesmo. Em certas modalidades, um oligonucleotídeo antissenso é especificamente hibridizável a um ácido nucleico-alvo ou região ou segmento do mesmo.
[0030] "Nucleosídeo bicíclico" ou "BNA" significa um nucleosídeo compreendendo uma porção açúcar bicíclica. "Açúcar bicíclico" ou "porção açúcar bicíclica" significa uma porção açúcar modificada compreendendo dois anéis, sendo que o segundo anel é formado através de uma ponte que conecta dois dos átomos no primeiro anel, formando, assim, uma estrutura bicíclica. Em certas modalidades, o primeiro anel da porção açúcar bicíclica é uma porção furanosila. Em certas modalidades, a porção açúcar bicíclica não compreende uma porção furanosila.
[0031] "Grupo de ramificação" significa um grupo de átomos tendo pelo menos 3 posições que são capazes de formar ligações covalentes com pelo menos 3 grupos. Em certas modalidades, um grupo de ramificação fornece uma pluralidade de sítios reativos para conectar ligantes ancorados a um oligonucleotídeo através de um ligante conjugado e/ou uma porção clivável.
[0032] "Porção de direcionamento celular" significa um grupo conjugado ou porção de um grupo conjugado que é capaz de se ligar a um tipo de célula específico ou tipos de célula específicos.
[0033] "cEt" ou "etila constrita" significa uma porção açúcar ribosila bicíclica na qual o segundo anel do açúcar bicíclico é formado através de uma ponte que conecta o carbono 4' e o carbono 2", sendo que a ponte tem a fórmula: 4'-CH(CH3)-O-2', e sendo que o grupo metila da ponte está na configuração S.
[0034] "Nucleosídeo cEt" significa um nucleosídeo compreendendo uma porção açúcar modificada com cEt.
[0035] "Modificação química" em um composto descreve as substituições ou alterações através da reação química, de qualquer das unidades no composto em relação ao estado original de tal unidade. "Nucleosídeo modificado" refere-se a um nucleosídeo tendo, independentemente, uma porção açúcar modificada e/ou uma nucleobase modificada. "Oligonucleotídeo modificado" significa um oligonucleotídeo que compreende ao menos uma ligação internucleosídica modificada, um açúcar modificado e/ou uma nucleobase modificada.
[0036] "Região quimicamente distinta" refere-se a uma região de um composto que é de alguma forma quimicamente diferente de uma outra região do mesmo composto. Por exemplo, uma região tendo nucleotídeos 2'-O-metoxietila é quimicamente distinta de uma região tendo nucleotídeos sem modificações de 2'-O-metoxietila.
[0037] "Compostos antissenso quiméricos" significa compostos antissenso que têm pelo menos duas regiões quimicamente distintas, cada posição tendo uma pluralidade de subunidades.
[0038] "Ligação clivável" significa qualquer ligação química capaz de ser dividida. Em certas modalidades, uma ligação clivável é selecionada dentre: uma amida, uma poliamida, um éster, um éter, um ou ambos os ésteres de um fosfodiéster, um éster de fosfato, um carbamato, um dissulfeto ou um peptídeo.
[0039] "Porção clivável" significa uma ligação ou grupo de átomos que é clivado sob condições fisiológicas, por exemplo, dentro de uma célula, um animal, ou um ser humano.
[0040] "Complementar" em referência a um oligonucleotídeo significa que a sequência de nucleobases de tal oligonucleotídeo ou uma ou mais regiões do mesmo está(ão) pareada(s) com a sequência de nucleobases de um outro oligonucleotídeo ou ácido nucleico ou uma ou mais regiões do mesmo quando as duas sequências de nucleobases são alinhadas em direções opostas. Os pareamentos das nucleobases ou nucleobases complementares, conforme descrito na presente invenção, são limitados aos seguintes pares: adenina (A) e timina (T), adenina (A) e uracil (U), citosina (C) e guanina (G), e 5-metilcitosina (mC) e guanina (G), exceto onde especificado em contrário. Os oligonucleotídeos e/ou os ácidos nucleicos complementares não precisam ter complementaridade de nucleobase em cada nucleosídeo e podem incluir um ou mais pareamentos incorretos de nucleobases. Em contraste, "totalmente complementar" ou "100% complementar", em referência aos oligonucleotídeos, significa que tais oligonucleotídeos têm pareamentos de nucleobases em cada nucleosídeo sem quaisquer pareamentos incorretos de nucleobases.
[0041] "Grupo conjugado" significa um grupo de átomos que é fiado a um oligonucleotídeo. Os grupos conjugados incluem uma porção conjugada e um ligante conjugado que fixa a porção conjugada ao oligonucleotídeo.
[0042] "Ligante conjugado" significa um grupo de átomos compreendendo ao menos uma ligação que conecta uma porção conjugada a um oligonucleotídeo.
[0043] "Porção conjugada" significa um grupo de átomos que é fixado a um oligonucleotídeo por meio de um ligante conjugado.
[0044] "Contíguo" no contexto de um oligonucleotídeo refere-se a nucleosídeos, nucleobases, porções açúcar ou ligações internucleosídicas que são imediatamente adjacentes umas às outras. Por exemplo, "nucleobases contíguas" significa nucleobases que são imediatamente adjacentes umas às outras em uma sequência.
[0045] "Desenhoar" ou "desenhoado para" refere-se ao processo de projetar um composto que hibridiza especificamente com uma molécula de ácido nucleico selecionada.
[0046] "Diluente" significa um ingrediente em uma composição que não tem atividade farmacológica, mas é farmaceuticamente necessário ou desejável. Por exemplo, o diluente em uma composição injetada pode ser um líquido, por exemplo uma solução salina.
[0047] "Diferentemente modificado" significa modificações químicas ou substituintes químicos que são diferentes uns dos outros, incluindo ausência de modificações. Dessa forma, por exemplo, um nucleosídeo MOE e um nucleosídeo de DNA não modificado são "diferentemente modificados", embora o nucleosídeo de DNA não seja modificado. De modo semelhante, o DNA e o RNA são "diferentemente modificados", embora ambos sejam nucleosídeos não modificados de ocorrência natural. Os nucleosídeos que são iguais, mas que compreendem diferentes nucleobases não são diferentemente modificados. Por exemplo, um nucleosídeo compreendendo um açúcar modificado com 2'-OMe e uma nucleobase adenina não modificada e um nucleosídeo compreendendo um açúcar modificado com 2'-OMe e uma nucleobase timina não modificada não são diferentemente modificados.
[0048] "Dose" significa uma quantidade especificada de um composto ou agente farmacêutico fornecido em uma única administração, ou em um período de tempo especificado. Em certas modalidades, uma dose pode ser administrada em dois ou mais bolos, comprimidos ou injeções. Por exemplo, em certas modalidades, quando a administração subcutânea é desejada, a dose desejada pode exigir um volume não facilmente acomodado por uma única injeção. Nessas modalidades, duas ou mais injeções podem ser usadas para se obter a dose desejada. Em certas modalidades, uma dose pode ser administrada em duas ou mais injeções para minimizar a reação do local de injeção em um indivíduo. Em outras modalidades, o composto ou agente farmacêutico é administrado por infusão durante um período de tempo prolongado ou continuamente. As doses podem ser especificadas como a quantidade de agente farmacêutico por hora, dia, semana ou mês.
[0049] "Regime de dosagem" é uma combinação de doses projetadas para alcançar um ou mais efeitos desejados.
[0050] "Composto antissenso de fita dupla" significa um composto antissenso compreendendo dois compostos oligoméricos que são complementares um ao outro e formam um dúplex, e sendo que um dos dois ditos compostos oligoméricos compreende um oligonucleotídeo.
[0051] "Quantidade eficaz" significa a quantidade de composto suficiente para efetuar um resultado fisiológico desejado em um indivíduo que necessita do composto. A quantidade eficaz pode variar entre indivíduos dependendo da saúde e das condições físicas do indivíduo a ser tratado, do grupo taxonômico dos indivíduos a serem tratados, da formulação da composição, da avaliação da condição médica do indivíduo e de outros fatores relevantes.
[0052] "Eficácia" significa a capacidade de produzir um efeito desejado.
[0053] "Expressão" inclui todas as funções pelas quais as informações codificadas de um gene são convertidas em estruturas presentes e que operam em uma célula. Tais estruturas incluem, mas não se limitam a, os produtos de transcrição e tradução.
[0054] ""gapmer"" significa um oligonucleotídeo compreendendo uma região interna tendo uma pluralidade de nucleosídeos que suportam a clivagem da RNase H posicionada entre regiões externas tendo um ou mais nucleosídeos, sendo que os nucleosídeos compreendendo a região interna são quimicamente distintos do nucleosídeo ou nucleosídeos compreendendo as regiões externas. A região interna pode ser chamada de "lacuna" e as regiões externas podem ser chamadas de "asas".
[0055] "Hibridização" significa o anelamento de oligonucleotídeos e/ou ácidos nucleicos. Embora não se limite a um mecanismo específico, o mecanismo mais comum de hibridização envolve ligação ao hidrogênio, que pode ser ligação de hidrogêniode Watson-Crick, Hoogsteen ou Hoogsteen invertido, entre nucleobases complementares. Em certas modalidades, as moléculas de ácido nucleico complementares incluem, mas não se limitam a, um composto antissenso e um ácido nucleico-alvo. Em certas modalidades, as moléculas de ácido nucleico complementares incluem, mas não se limitam a, um oligonucleotídeo e um ácido nucleico-alvo.
[0056] "Imediatamente adjacente" significa que não há elementos intervenientes entre os elementos imediatamente adjacentes do mesmo tipo (por exemplo, nenhuma nucleobase interveniente entre as nucleobases imediatamente adjacentes).
[0057] "Indivíduo" significa um ser humano ou animal não humano selecionado para tratamento ou terapia.
[0058] "Inibir a expressão ou atividade" refere-se a uma redução ou bloqueio da expressão ou atividade em relação à expressão da atividade em uma amostra de controle ou não tratada e não indica necessariamente uma eliminação total da expressão ou atividade.
[0059] "Ligação internucleosídica" significa um grupo ou ligação que forma uma ligação covalente entre nucleosídeos adjacentes em um oligonucleotídeo. "Ligação internucleosídica modificada" significa qualquer ligação internucleosídica diferente de uma ligação internucleosídica de ocorrência natural. As ligações sem fosfato são chamadas na presente invenção de ligações internucleosídicas modificadas.
[0060] "IRF5" significa qualquer ácido nucleico ou proteína de IRF5. "Ácido nucleico de IRF5" significa qualquer ácido nucleico que codifica IRF5. Por exemplo, em certas modalidades, um ácido nucleico de IRF5 inclui uma sequência de DNA que codifica IRF5, uma sequência de RNA transcrita de DNA que codifica IRF5 (incluindo DNA genômico compreendendo íntrons e éxons) e uma sequência de mRNA que codifica IRF5. "IRF5 mRNA" significa um mRNA que codifica uma proteína IRF5. O alvo pode ser referido em letras maiúsculas ou minúsculas.
[0061] "Inibidor específico de IRF5" refere-se a qualquer agente capaz de inibir especificamente a expressão ou atividade de RNA de IRF5 e/ou da proteína IRF5 no nível molecular. Por exemplo, inibidores específicos de IRF5 incluem ácidos nucleicos (incluindo compostos antissenso), peptídeos, anticorpos, moléculas pequenas e outros agentes capazes de inibir a expressão de RNA de IRF5 e/ou proteína IRF5.
[0062] Os "oligonucleotídeos alongados" são aqueles que têm um ou mais nucleosídeos adicionais em relação a um oligonucleotídeo revelado na presente invenção, por exemplo, um oligonucleotídeo parental.
[0063] "Nucleosídeos ligados" significa nucleosídeos adjacentes ligados um ao outro por uma ligação internucleosídica.
[0064] O termo "nucleosídeo de ligação" significa um nucleosídeo que liga um oligonucleotídeo a uma porção conjugada. Os nucleosídeos de ligação estão localizados no ligante conjugado de um composto. Os nucleosídeos de ligação não são considerados parte da porção oligonucleotídeo de um composto mesmo que sejam contíguos ao oligonucleotídeo.
[0065] "Pareamento incorreto" ou "desemparelhamento" ou "não complementar" significa uma nucleobase de um primeiro oligonucleotídeo que não é complementar à nucleobase correspondente de um segundo oligonucleotídeo ou ácido nucleico-alvo quando o primeiro e o segundo oligonucleotídeos são alinhados. Por exemplo, as nucleobases que incluem, mas não se limitam a, uma nucleobase universal, inosina e hipoxantina, são capazes de hibridizar com ao menos uma nucleobase, mas ainda são pareadas incorretamente ou não são complementares em relação à nucleobase com a qual ela se hibridizou. Como um outro exemplo, uma nucleobase de um primeiro oligonucleotídeo que não é capaz de hibridizar com a nucleobase correspondente de um segundo oligonucleotídeo ou ácido nucleico- alvo, quando o primeiro e o segundo oligonucleotídeos são alinhados, é uma nucleobase desemparelhada ou não complementar.
[0066] "Modular" refere-se à alteração ou ajuste de uma característica em uma célula, tecido, órgão ou organismo. Por exemplo, a modulação do RNA de IRF5 pode significar aumentar ou diminuir o nível de RNA de IRF5 e/ou de proteína IRF5 em uma célula, tecido, órgão ou organismo. Um "modulador" afeta a alteração na célula, tecido, órgão ou organismo. Por exemplo, um composto de diminui a quantidade de IRF5 pode ser um modulador que diminui a quantidade de RNA de IRF5 e/ou de proteína IRF5 em uma célula, tecido, orgão ou organismo.
[0067] "MOE" significa metoxietila.
[0068] "Monômero" refere-se a uma única unidade de um oligômero. Os monômeros incluem, mas não se limitam a, nucleosídeos e nucleotídeos.
[0069] "Motivo" significa o padrão de porções açúcar, nucleobases,
e/ou ligações internucleosídicas não modificadas e/ou modificadas em um oligonucleotídeo.
[0070] "Natural" ou "de ocorrência natural" significa encontrado na natureza.
[0071] "Açúcar não bicíclico modificado" ou "porção açúcar não bicíclica modificada" significa uma porção açúcar modificada que compreende uma modificação, como um substituinte, que não forma uma ponte entre dois átomos do açúcar para formar um segundo anel.
[0072] "Ácido nucleico" refere-se a moléculas compostas de nucleotídeos monoméricos. Um ácido nucleico inclui, mas não se limita a, ácidos ribonucleicos (RNA), ácidos desoxirribonucleicos (DNA), ácidos nucleicos de fita simples e ácidos nucleicos de fita dupla.
[0073] "Nucleobase" significa uma porção heterocíclica capaz de parear com uma base de um outro ácido nucleico. Como usado aqui, uma "nucleobase de ocorrência natural" é adenina (A), timina (T), citosina (C), uracil (U) e guanina (G). Uma "nucleobase modificada" é uma nucleobase de ocorrência natural que é quimicamente modificada. Uma "base universal" ou "nucleobase universal" é uma nucleobase diferente de uma nucleobase de ocorrência natural e uma nucleobase modificada, e é capaz de parear com qualquer nucleobase.
[0074] "Sequência de nuclease" significa a ordem de nucleobases contíguas em um ácido nucleico ou oligonucleotídeo independente de qualquer açúcar ou ligação internucleosídica.
[0075] "Nucleosídeo" significa um composto que compreende uma nucleobase e uma porção açúcar. A nucleobase e a porção açúcar são, cada uma, independentemente, não modificadas ou modificadas. "Nucleosídeo modificado" significa um nucleosídeo que compreende uma nucleobase modificada e/ou uma porção açúcar modificada. Os nucleosídeos modificados incluem nucleosídeos abásicos, que não têm uma nucleobase.
[0076] "Composto oligomérico" significa um composto que compreende um único oligonucleotídeo e, opcionalmente, uma ou mais características adicionais, como um grupo conjugado ou grupo terminal.
[0077] "Oligonucleotídeo" significa um polímero de nucleosídeos ligados, cada um dos quais pode ser modificado ou não modificado, independente um do outro. Exceto onde indicado em contrário, os oligonucleotídeos consistem em 8 a 80 nucleosídeos ligados. O termo "oligonucleotídeo modificado" significa um oligonucleotídeo em que ao menos um açúcar, nucleobase ou ligação internucleosídica é modificado (a). "Oligonucleotídeo não modificado" significa um oligonucleotídeo que não compreende qualquer modificação de açúcar, nucleobase ou internucleosídeo.
[0078] "Oligonucleotídeo parental" significa um oligonucleotídeo cuja sequência é usada como a base de desenho para mais oligonucleotídeos de sequências similares, mas com diferentes comprimentos, motivos e/ou espécies químicas. Os oligonucleotídeos recém-projetados podem ter a mesma sequência ou sequência de sobreposição do oligonucleotídeo parental.
[0079] "Administração parenteral" significa administração através de injeção ou infusão. A administração parenteral inclui administração subcutânea, administração intravenosa, administração intramuscular, administração intra-arterial, administração intraperitoneal ou administração intracraniana, por exemplo, administração intratecal ou intracerebroventricular.
[0080] "Veículo ou diluente farmaceuticamente aceitável" significa qualquer substância adequada para uso na administração a um indivíduo. Por exemplo, um veículo farmaceuticamente aceitável pode ser uma solução aquosa estéril, como PBS ou água para injeção.
[0081] "Sais farmaceuticamente aceitáveis significa sais fisiologicamente e farmaceuticamente aceitáveis dos compostos, como os compostos ou oligonucleotídeo oligoméricos, isto é, sais que retêm a atividade biológica desejada do composto parental e não conferem efeitos toxicológicos indesejados aos mesmos.
[0082] "Agente farmacêutico" significa um composto que fornece um benefício terapêutico quando administrado a um indivíduo.
[0083] "Composição farmacêutica" significa uma mistura de substâncias adequadas para administração a um indivíduo. Por exemplo, uma composição farmacêutica pode compreender um ou mais compostos ou sal dos mesmos e uma solução aquosa estéril.
[0084] "Ligação de fosforotioato" significa uma ligação de fosfato modificada na qual um dos átomos de oxigênio não ligantes (não formador de ponte) é substituído por um átomo de enxofre. Uma ligação internucleosídica de fosforotioato é uma ligação internucleosídica modificada.
[0085] "Porção fósforo" significa um grupo de átomos compreendendo um átomo de fósforo. Em certas modalidades, uma porção fósforo compreende um mono, di ou trifosfato ou fosforotioato.
[0086] "Porção" significa um número definido de nucleobases contíguas (isto é, ligadas) de um ácido nucleico. Em certas modalidades, uma porção é um número definido de nucleobases contíguas de um ácido nucleico-alvo. Em certas modalidades, uma porção é um número definido de nucleobases contíguas de um composto oligomérico.
[0087] "Evitar" refere-se a atrasar ou impedir o início, desenvolvimento ou progressão de uma doença, distúrbio ou condição por um período de tempo de minutos a indefinidamente.
[0088] "Profármaco" significa um composto em uma forma fora do corpo que, quando administrado a um indivíduo, é metabolizado em uma outra forma dentro do corpo ou células do mesmo. Em certas modalidades, a forma metabolizada é a forma ativa, ou mais ativa, do composto (por exemplo, fármaco). Tipicamente, a conversão de um pró- fármaco dentro do corpo é facilitada pela ação de uma enzima (s) (por exemplo, enzima endógena ou viral) ou produto(s) químico(s) presente(s) em células ou tecidos, e/ou por condições fisiológicas.
[0089] "Reduzir" significa diminuir em uma extensão, tamanho, quantidade ou número menor.
[0090] "RefSeq No." é uma combinação exclusiva de letras e números atribuídos a uma sequência para indicar que a sequência é para um transcrito-alvo específico (por exemplo, gene-alvo). Tal sequência e informações sobre o gene-alvo (coletivamente, o registro do gene) podem ser encontradas em uma base de dados de sequências genéticas. As bases de dados de sequências genéticas incluem a base de dados de sequências de referência NCBI, GenBank, o European Nucleotide Archive e o DNA Data Bank do Japão (os três últimos formando a International Nucleotide Sequence Datasase Collaboration ou INSDC).
[0091] "Região" é definida como uma porção do ácido nucleico-alvo tendo pelo menos uma estrutura, função ou característica identificável.
[0092] "Composto de RNAi" significa um composto antissenso que atua, ao menos em parte, através de RISC ou Ago2, mas não através de RNase H, para modular um ácido nucleico-alvo e/ou uma proteína codificada por um ácido nucleico-alvo. Os compostos de RNAi incluem, mas não se limitam a, siRNA de fita dupla, RNA de fita simples (ssRNA) e microRNA, incluindo microRNA miméticos.
[0093] "Segmentos" são definidos como menores ou sub-porções de regiões dentro de um ácido nucleico.
[0094] "Efeitos colaterais" significa doença e/ou condições fisiológicas atribuíveis a um tratamento diferente dos efeitos desejados. Em certas modalidades, os efeitos colaterais incluem reações no local da injeção, anormalidades de teste da função hepática, anormalidades de função renal, toxicidade hepática, toxicidade renal, anormalidades do sistema nervoso central, miopatias e mal-estar. Por exemplo, níveis aumentados de aminotransferase no soro podem indicar toxicidade hepática ou anormalidade da função hepática. Por exemplo, bilirrubina aumentada pode indicar toxicidade hepática ou anormalidade da função hepática.
[0095] O termo "fita simples", em referência a um composto, significa que o composto tem apenas um oligonucleotídeo.
[0096] "Autocomplementar" significa um oligonucleotídeo que hibridiza ao menos parcialmente consigo mesmo. Um composto consistindo em um oligonucleotídeo, sendo que o oligonucleotídeo do composto é autocomplementar, é um composto de fita simples. Um composto de fita simples pode ser capaz de se ligar a um composto complementar para formar um duplex.
[0097] "Sítios" são definidos como posições de nucleobase únicas dentro de um ácido nucleico-alvo.
[0098] "Especificamente hibridizável" refere-se a um oligonucleotídeo que tem um grau suficiente de complementaridade entre o oligonucleotídeo e um ácido nucleico-alvo para induzir um efeito desejado, enquanto apresenta pouco ou nenhum efeito sobre ácidos nucleicos não-alvo. Em certas modalidades, a hibridização específica ocorre sob condições fisiológicas.
[0099] "Inibir especificamente" com referência a um ácido nucleico- alvo significa reduzir ou bloquear a expressão do ácido nucleico-alvo enquanto apresenta menos, mínimo ou nenhum efeito sobre os ácidos nucleicos não alvo. A redução não indica necessariamente uma eliminação total da expressão do ácido nucleico-alvo.
[0100] "Ensaio de célula padrão" significa o(s) ensaio(s) descrito(s) nos exemplos e variações razoáveis dos mesmos.
[0101] "Experimento in vivo padrão" significa os procedimentos descritos nos exemplos e variações razoáveis dos mesmos.
[0102] "Centro quiral estereoaleatório" no contexto de uma população de moléculas de fórmula molecular idêntica significa um centro quiral tendo uma configuração estereoquímica aleatória. Por exemplo, em uma população de moléculas compreendendo um centro quiral estereoaleatório, o número de moléculas tendo a configuração (S) do centro quiral estereoaleatório pode ser, mas não é necessariamente o mesmo que o número de moléculas tendo a configuração (R) do centro quiral estereoaleatório. A configuração estereoquímica de um centro quiral é considerada aleatória quando é o resultado de um método sintético que não é projetado para controlar a configuração estereoquímica. Em certas modalidades, um centro quiral estereoaleatório é uma ligação internucleosídica de fosforotioato estereoaleatória.
[0103] "Porção açúcar" significa uma porção açúcar não modificada ou uma porção açúcar modificada. Como usado aqui, "porção açúcar não modificada" significa uma porção β-D-ribosila, como encontrada no RNA de ocorrência natural, ou uma porção β-D-2'-desoxirribosila de açúcar, como encontrada no DNA de ocorrência natural. Como usado aqui, "porção açúcar modificada" ou "açúcar modificado" significa um substituto de açúcar ou uma outra porção furanosila de açúcar além de uma β-D-ribosila ou uma β-D-2'-desoxirribosila. As porções furanosila de açúcar modificadas podem ser modificadas ou substituídas em uma certa posição ou posições da porção açúcar, substituída ou não substituída, e podem ou não ter uma estereoconfiguração diferente de β-D-ribosila. As porções furanosila de açúcar modificadas incluem açúcares bicíclicos e açúcares não bicíclicos.
[0104] "Substituto de açúcar" significa uma porção açúcar modificada que não compreende um anel furanosila ou tetra- hidrofuranila (não é uma "porção furanosila de açúcar ") e que pode ligar uma nucleobase a um outro grupo, como uma ligação internucleosídica,
um grupo conjugado ou um grupo terminal em um oligonucleotídeo. Os nucleosídeos modificados compreendendo substitutos de açúcar podem ser incorporados em uma ou mais posições dentro de um oligonucleotídeo e tais oligonucleotídeos são capazes de hibridizar com compostos oligoméricos ou ácidos nucleicos complementares.
[0105] "Sinergia" ou "sinergizar" refere-se a um efeito de uma combinação que é maior que os efeitos aditivos de cada componente sozinho nas mesmas doses.
[0106] "Gene-alvo" refere-se a um gene que codifica um alvo.
[0107] "Direcionamento" significa a hibridização específica de um composto com um ácido nucleico-alvo para induzir um efeito desejado.
[0108] "Ácido nucleico-alvo", "RNA-alvo", "transcrito de RNA-alvo" e "ácido nucleico-alvo" significam um ácido nucleico capaz de ser direcionado pelos compostos aqui descritos.
[0109] "Região-alvo" significa uma porção de um ácido nucleico- alvo à qual um ou mais compostos são direcionados.
[0110] "Segmento-alvo" significa a sequência de nucleotídeos de um ácido nucleico-alvo à qual um composto é direcionado. "Sítio-alvo 5' " refere-se ao nucleotídeo mais 5' de um segmento-alvo. "Sítio-alvo 3' " refere-se ao nucleotídeo mais 3' de um segmento-alvo.
[0111] "Grupo terminal" significa um grupo químico ou grupo de átomos que é ligado covalentemente a um terminal de um oligonucleotídeo.
[0112] "Quantidade terapeuticamente eficaz" significa uma quantidade de um composto, agente farmacêutico, ou composição que fornece um benefício terapêutico a um indivíduo.
[0113] "Tratamento" refere-se à administração de um composto ou composição farmacêutica a um animal para efetuar uma alteração ou melhora de uma doença, distúrbio ou condição no animal.
Certas modalidades
[0114] Certas modalidades fornecem métodos, compostos e composições para inibir a expressão do fator regulador de interferon 5 (IRF5).
[0115] Certas modalidades fornecem compostos direcionados para um ácido nucleico de IRF5. Em certas modalidades, o ácido nucleico de IRF5 tem a sequência apresentada no documento RefSeq ou número de acesso do Genbank U51127.1 (incorporado por referência, aqui revelado como SEQ ID Nº: 4); número de acesso do GENBANK NT_007933.14 truncado a partir dos nucleotídeos 53761170 a 53774065 (incorporado a título de referência, aqui revelado como SEQ ID Nº: 2); número de acesso do GENBANK DC427600.1 (incorporado por referência, aqui revelado como SEQ ID Nº: 5); número de acesso do GENBANK NM_001098627.3 (incorporado a título de referência, aqui revelado como SEQ ID Nº: 1); número de acesso do GENBANK NM_001098629.2 (aqui incorporado a título de referência, revelado como SEQ ID Nº: 3); número de acesso do GENBANK NM_001098630.2 (aqui incorporado a título de referência, revelado como SEQ ID Nº: 6); número de acesso do GENBANK NM_001242452.2 (aqui incorporado a título de referência, revelado como SEQ ID Nº: 7); número de acesso do GENBANK NM_032643.4 (incorporado por referência, aqui revelado como SEQ ID Nº: 8); e número de acesso do GENBANK NC_000007.14 truncado a partir dos nucleotídeos 128935001 a 128953000 (incorporados a título de referência, aqui revelados como SEQ ID Nº: 9). Em certas modalidades, o composto é um composto antissenso ou composto oligomérico antissenso. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo é de fita simples. Em certas modalidades, o composto é de fita dupla.
[0116] Em certas modalidades, o composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 16 nucleosídeos ligados de comprimento. Em certas modalidades, o composto é um composto antissenso ou composto oligomérico antissenso.
[0117] Certas modalidades fornecem um composto compreendendo um nucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tendo uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, o composto é um composto antissenso ou composto oligomérico antissenso. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo é de fita simples. Em certas modalidades, o composto é de fita dupla. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado tem 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento.
[0118] Certas modalidades fornecem um composto compreendendo um oligonucleotídeo modificado que consiste na sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, o composto é um composto antissenso ou composto oligomérico antissenso. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo é de fita simples. Em certas modalidades, o composto é de fita dupla.
[0119] Certas modalidades fornecem um composto compreendendo um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e complementar dentro das nucleobases 4366-4381, 5141-5156, 5140-5160, 5179-5194, 11544- 11559, 11542-11596, 11736-11751, 11737-11752, 11720-11790, ou 11794-11809 da SEQ ID Nº: 2, e sendo que o dito oligonucleotídeo modificado é pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, ou 100% complementar à SEQ ID Nº: 2. Em certas modalidades, o composto é um composto antissenso ou composto oligomérico antissenso. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo é de fita simples. Em certas modalidades, o composto é de fita dupla. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado tem 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento.
[0120] Em certas modalidades, os compostos direcionam os nucleotídeos 11737-11752 de um ácido nucleico de IRF5. Em certas modalidades, os compostos direcionam dentro dos nucleotídeos 4366- 4381, 5141-5156, 5140-5160, 5179-5194, 11544-11559, 11542-11596, 11736-11751, 11737-11752, 11720-11790, ou 11794-11809 de um ácido nucleico de IRF5 tendo a sequência de nucleobases da SEQ ID Nº: 2. Em certas modalidades, os compostos têm ao menos uma porção de nucleobases contíguas 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 ou 16 complementares a uma porção de comprimento igual dentro dos nucleotídeos 4366-4381, 5141-5156, 5140-5160, 5179-5194, 11544- 11559, 11542-11596, 11736-11751, 11737-11752, 11720-11790 ou 11794-11809 de um ácido nucleico de IRF5 tendo a sequência de nucleobases da SEQ ID Nº: 2. Em certas modalidades, esses compostos são compostos antissenso, compostos oligoméricos ou oligonucleotídeos.
[0121] Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tendo uma sequência de nucleobases compreendendo ao menos uma porção de 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 ou 16 nucleobases contígua de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 168, 228, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado tem 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento.
[0122] Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tendo uma sequência de nucleobases compreendendo qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado tem 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento.
[0123] Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado tendo uma sequência de nucleobases que consiste em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294.
[0124] Em certas modalidades, os compostos direcionados para IRF5 são ION 729018, 728958, 785525, 785674, 785675, 786503, 786524 e 786548. Entre mais de 1.320 compostos que foram triados conforme descrito na seção de exemplos abaixo, ION 729018, 728958, 785525, 785674, 785675, 786503, 786524 e 786548 surgiram como os compostos líderes superiores. Em particular, ION 729018 apresentou eficácia e tolerabilidade significativas entre mais de 1.320 compostos.
[0125] Em certas modalidades, qualquer dos oligonucleotídeos modificados anteriormente mencionados compreende ao menos uma ligação internucleosídica modificada, ao menos um açúcar modificado, e/ou ao menos uma nucleobase modificada.
[0126] Em certas modalidades, qualquer dos oligonucleotídeos modificados anteriormente mencionados compreende ao menos um açúcar modificado. Em certas modalidades, ao menos um açúcar modificado compreende um grupo 2'-O-metoxietila. Em certas modalidades, ao menos um açúcar modificado é um açúcar bicíclico, como um grupo 4'-CH(CH3)-O-2', um grupo 4'-CH2-O-2', ou um grupo 4'-(CH2)2-O-2'.
[0127] Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado compreende ao menos uma ligação internucleosídica modificada, como uma ligação internucleosídica de fosforotioato.
[0128] Em certas modalidades, qualquer dos oligonucleotídeos anteriores modificados compreende ao menos uma nucleobase modificada, como 5-metilcitosina.
[0129] Em certas modalidades, qualquer dos oligonucleotídeos modificados anteriormente mencionados compreende:
um segmento de lacuna que consiste em desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', e sendo que cada nucleosídeo de cada segmento de asa compreende um açúcar modificado. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado tem 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência citada em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado tem 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência citada em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado tem 16 nucleosídeos ligados de comprimento tendo uma sequência de nucleobases que consiste na sequência citada em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294.
[0130] Em certas modalidades, um composto compreende ou consistem em um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleobases ligadas de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreen- dendo a sequência citada em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 1270, 1272 e 1294, sendo que o oligonucleotídeo modificado compreende: um segmento de lacuna que consiste em dez desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em três nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em três nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', sendo que cada nucleosídeo de cada segmento de asa compreende um açúcar cEt; em que cada ligação internucleosídica é uma ligação de fosforotioato e em que cada citosina é uma 5-metilcitosina. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 a 30 nucleosídeos ligados. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 nucleosídeos ligados.
[0131] Em certas modalidades, um composto consiste em um oligonucleotídeo modificado de 16 nucleobases ligadas de comprimento tendo uma sequência de nucleobases que consiste na sequência citada na SEQ ID Nº: 228, sendo que o oligonucleotídeo modificado compreende: um segmento de lacuna que consiste em dez desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em três nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em três nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', sendo que cada nucleosídeo de cada segmento de asa compreende um açúcar cEt; em que cada ligação internucleosídica é uma ligação de fosforotioato e em que cada citosina é uma 5-metilcitosina.
[0132] Em certas modalidades, um composto compreende ou consistem em um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleobases ligadas de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência citada em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 717, sendo que o oligonucleotídeo modificado compreende:
um segmento de lacuna que consiste em dez desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em dois nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em quatro nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', sendo que cada nucleosídeo no segmento de asa 5' compreende um açúcar cEt (kk); sendo que os nucleosídeos do segmento de asa 3' compreendem da direção 5' a 3' de um açúcar cEt, um açúcar 2'-MOE, um açúcar cEt e um açúcar 2'-MOE (keke); em que cada ligação internucleosídica é uma ligação de fosforotioato e em que cada citosina é uma 5-metilcitosina. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 a 30 nucleosídeos ligados. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 nucleosídeos ligados.
[0133] Em certas modalidades, um composto compreende ou consistem em um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleobases ligadas de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência citada em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 717 e 1340, sendo que o oligonucleotídeo modificado compreende: um segmento de lacuna que consiste em nove desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em dois nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em cinco nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', sendo que cada nucleosídeo no segmento de asa 5' compreende um açúcar cEt (kk);
sendo que os nucleosídeos do segmento de asa 3' da direção 5' a 3' de um açúcar cEt, um açúcar 2'-MOE, um açúcar 2'-MOE, um açúcar 2'- MOE, um açúcar cEt e um açúcar cEt (eeekk); em que cada ligação internucleosídica é uma ligação de fosforotioato e em que cada citosina é uma 5-metilcitosina. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 a 30 nucleosídeos ligados. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 nucleosídeos ligados.
[0134] Em certas modalidades, um composto compreende ou consiste em ION 729018 ou sal do mesmo, tendo a seguinte estrutura química:
[0135] Em certas modalidades, um composto compreende ou consiste no sal de sódio de ION 729018, tendo a seguinte estrutura química:
[0136] Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto ou oligonucleotídeo pode ser ao menos 85%, ao menos 90%, ao menos 95%, ao menos 98%, ao menos 99% ou 100% complementar a um ácido nucleico que codifica IRF5.
[0137] Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser de fita simples. Em certas modalidades, o composto compreende desoxirribonucleotídeos. Em certas modalidades, o composto é de fita dupla. Em certas modalidades, o composto é de fita dupla e compreende ribonucleotídeos. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser um composto antissenso ou um composto oligomérico.
[0138] Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser 8 a 80, 10 a 30, 12 a 50, 13 a 30, 13 a 50, 14 a 30, 14 a 50, 15 a 30, 15 a 50, 16 a 30, 16 a 50, 17 a 30, 17 a 50, 18 a 22, 18 a 24, 18 a 30, 18 a 50, 19 a 22, 19 a 30, 19 a 50 ou 20 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento. Em certas modalidades, o composto compreende ou consiste em um oligonucleotídeo.
[0139] Em certas modalidades, os compostos ou composições aqui fornecidos compreendem um sal farmaceuticamente aceitável do oligonucleotídeo modificado. Em certas modalidades, o sal é cloreto de sódio. Em certas modalidades, o sal é um sal de potássio.
[0140] Em certas modalidades, os compostos ou composições, conforme descrito na presente invenção, são ativos por terem pelo menos um dentre um IC50 in vitro menor que 2 µM, menor que 1,5 µM, menor que 1 µM, menor que 0,9 µM, menor que 0,8 µM, menor que 0,7 µM, menor que 0,6 µM, menor que 0,5 µM, menor que 0,4 µM, menor que 0,3 µM, menor que 0,2 µM, menor que 0,1 µM, menor que 0,05 µM, menor que 0,04 µM, menor que 0,03 µM, menor que 0,02 µM, ou menor que 0,01 µM.
[0141] Em certas modalidades, os compostos ou composições, conforme descrito na presente invenção, são altamente toleráveis conforme demonstrado pelo fato de terem pelo menos um dentre um aumento no valor de alanina transaminase (ALT) ou aspartato transaminase (AST) de no máximo 4 vezes, 3 vezes, ou 2 vezes em relação aos animais de controle, ou um aumento no peso do fígado, do baço ou dos rins de no máximo 30%, 20%, 15%, 12%, 10%, 5% ou 2% em comparação com os animais de controle. Em certas modalidades, os compostos ou composições, conforme descrito na presente invenção, são altamente toleráveis, conforme demonstrado por não terem aumento de ALT ou AST em relação aos animais de controle. Em certas modalidades, os compostos ou composições, conforme descrito na presente invenção, são altamente toleráveis, conforme demonstrado por não terem aumento no peso do fígado, do baço ou dos rins em relação aos animais de controle.
[0142] Certas modalidades fornecem uma composição que compreende o composto de qualquer das modalidades anteriormente mencionadas ou qualquer sal farmaceuticamente aceitável do mesmo e pelo menos um dentre um veículo ou diluente farmaceuticamente aceitável. Em certas modalidades, a composição tem uma viscosidade menor que cerca de 40 centipoise (cP), menor que cerca de 30 centipoise (cP), menor que cerca de 20 centipoise (cP), menor que cerca de 15 centipoise (cP), ou menor que cerca de 10 centipoise (cP). Em certas modalidades, a composição tendo qualquer das viscosidades mencionadas anteriormente compreende um composto aqui fornecido em uma concentração de cerca de 100 mg/mL, cerca de 125 mg/mL, cerca de 150 mg/mL, cerca de 175 mg/mL, cerca de 200 mg/mL, cerca de 225 mg/mL, cerca de 250 mg/mL, cerca de 275 mg/mL ou cerca de 300 mg/mL. Em certas modalidades, a composição tendo qualquer das viscosidades e/ou concentrações de composto mencionadas anteriormente tem uma temperatura de temperatura ambiente, ou cerca de 20°C, cerca de 21°C, cerca de 22°C, cerca de 23°C, cerca de 24°C, cerca de 25°C, cerca de 26°C, cerca de 27°C, cerca de 28°C, cerca de 29°C ou cerca de 30°C. Certas Indicações
[0143] Certas modalidades aqui fornecidas referem-se a métodos de inibição da expressão de IRF5, que podem ser úteis para tratar, evitar ou aliviar uma doença associada ao IRF5 em um indivíduo, pela administração de um composto que tem como alvo IRF5. Em certas modalidades, o composto pode ser um inibidor específico de IRF5. Em certas modalidades, o composto pode ser um composto antissenso, um composto oligomérico ou um oligonucleotídeo direcionado para IRF5.
[0144] Exemplos de doenças associadas ao IRF5 tratáveis, evitáveis e/ou aliviáveis com os métodos aqui fornecidos incluem doença inflamatória intestinal (DII), colite ulcerativa, doença de Crohn, lúpus eritematoso sistêmico (LES), artrite reumatoide, cirrose biliar primária, esclerose sistêmica, síndrome de Sjogren, esclerose múltipla, escleroderma, doença pulmonar intersticial (SSc-ILD), doença renal policística (PKD), doença renal crônica (CKD), NASH, fibrose hepática, asma e asma grave. Certos compostos aqui fornecidos são direcionados a compostos e composições que reduzem a inflamação, cirrose, fibrose, proteinúria, inflamação articular, produção de autoanticorpos, infiltração de células inflamatórias, depósitos de colágeno ou produção de citocina inflamatória em um indivíduo. Certos compostos aqui fornecidos são direcionados a compostos e composições que reduzem a inflamação no trato gastrointestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, aumento da frequência intestinal, tenesmo ou espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional em um indivíduo, compreendendo administrar um composto direcionado para IRF5 ao indivíduo, reduzindo ou inibindo, assim, a inflamação no trato gastrointestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, frequência intestinal aumentada, tenesmo ou espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional no indivíduo.
[0145] Em certas modalidades, um método para tratar, evitar ou aliviar uma doença associada ao IRF5 em um indivíduo, que compreende administrar ao indivíduo um composto que compreende um inibidor específico de IRF5, desse modo tratando, evitando, ou aliviando a doença. Em certas modalidades, o indivíduo é identificado como tendo, ou em risco de ter, uma doença associada ao IRF5. Em certas modalidades, a doença é uma doença inflamatória. Em certas modalidades, a doença é uma doença gastrointestinal. Em certas modalidades, a doença gastrointestinal é colite ulcerativa ou doença de
Crohn.
Em certas modalidades, o composto compreende um composto antissenso direcionado para IRF5. Em certas modalidades, o composto compreende um oligonucleotídeo direcionado para IRF5. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tendo uma sequência de nucleobases compreendendo ao menos 8 nucleobases contíguas de qualquer das sequências de nucleobases das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um nucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tem uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado consistindo na sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado tendo uma sequência de nucleobases que consiste em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, o composto é ION 729018, 728958, 785525, 785674, 785675, 786503, 786524 ou 786548. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser de fita simples ou de fita dupla.
Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser um composto antissenso ou um composto oligomérico.
Em certas modalidades, o composto é administrado parenteralmente ao indivíduo.
Em certas modalidades, a administração do composto melhora, preserva ou evita inflamação, cirrose, fibrose, proteinúria, inflamação articular, produção de autoanticorpos, infiltração de células inflamatórias, depósitos de colágeno ou produção de citocina inflamatória em um animal.
[0146] Em certas modalidades, um método para tratar, evitar ou aliviar inflamação, cirrose, fibrose, proteinúria, inflamação articular, produção de autoanticorpos, infiltração de células inflamatórias, depósitos de colágeno ou produção de citocina inflamatória em um animal compreende administrar ao indivíduo um composto que compreende um inibidor específico de IRF5, assim, tratar, evitar ou melhorar a inflamação, cirrose, fibrose, proteinúria, inflamação articular, produção de autoanticorpos, infiltração de células inflamatórias, depósitos de colágeno ou produção de citocina inflamatória. Em certas modalidades, um método para tratar, evitar, ou aliviar a inflamação no trato intestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, aumento da frequência intestinal, tenesmo espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional em um indivíduo, compreende administrar um composto direcionado para IRF5 ao indivíduo, reduzindo ou inibindo, assim, a inflamação no trato gastrointestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, frequência intestinal aumentada, tenesmo ou espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional no indivíduo. Em certas modalidades, o composto compreende um composto antissenso direcionado para IRF5. Em certas modalidades, o composto compreende um oligonucleotídeo direcionado para IRF5. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tendo uma sequência de nucleobases compreendendo ao menos 8 nucleobases contíguas de qualquer das sequências de nucleobases das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um nucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tem uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado consistindo na sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado tendo uma sequência de nucleobases que consiste em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, o composto é ION 729018, 728958, 785525, 785674, 785675, 786503, 786524 ou 786548. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser de fita simples ou de fita dupla.
Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser um composto antissenso ou um composto oligomérico.
Em certas modalidades, o composto é administrado parenteralmente ao indivíduo.
Em certas modalidades, a administração do composto melhora, preserva ou evita inflamação, cirrose, fibrose, proteinúria, inflamação articular, produção de autoanticorpos, infiltração de células inflamatórias, depósitos de colágeno ou produção de citocina inflamatória.
Em certas modalidades, a administração do composto melhora, preserva ou evita a inflamação no trato gastrointestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, aumento da frequência intestinal, tenesmo ou espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional em um indivíduo. Em certas modalidades, o indivíduo é identificado como tendo, ou em risco de ter, uma doença associada ao IRF5.
[0147] Em certas modalidades, um método para inibir a expressão de IRF5 em um indivíduo tendo, ou em risco de ter, uma doença associada ao IRF5 compreende administrar ao indivíduo um composto que compreende um inibidor específico de IRF5, inibindo assim a expressão de IRF5 no indivíduo. Em certas modalidades, a administração do composto inibe a expressão do IRF5 no trato gastrointestinal. Em certas modalidades, a administração do composto inibe a expressão de IRF5 no fígado. Em certas modalidades, a administração do composto inibe a expressão de IRF5 nos pulmões. Em certas modalidades, a administração do composto inibe a expressão de IRF5 nos rins. Em certas modalidades, a administração do composto inibe a expressão de IRF5 nas articulações. Em certas modalidades, a doença é uma doença inflamatória. Em certas modalidades, a doença é uma doença gastrointestinal. Em certas modalidades, a doença gastrointestinal é colite ulcerativa ou doença de Crohn. Em certas modalidades, o indivíduo tem, ou está em risco de ter, doença inflamatória intestinal (DII), lúpus eritematoso sistêmico (LES), artrite reumatoide, cirrose biliar primária, esclerose sistêmica, síndrome de Sjogren, esclerose múltipla, escleroderma, doença pulmonar intersticial (SSc-ILD), doença renal policística (PKD), doença renal crônica (CKD), NASH, fibrose hepática, asma ou asma grave. Em certas modalidades, o indivíduo tem, ou está em risco de ter, inflamação, cirrose, fibrose, proteinúria, inflamação articular, produção de autoanticorpos, infiltração de células inflamatórias, depósitos de colágeno ou produção de citocina inflamatória. Em certas modalidades, o indivíduo tem, ou está em risco de ter inflamação no trato gastrointestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, aumento da frequência intestinal, tenesmo ou espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional no indivíduo.
Em certas modalidades, o composto compreende um composto antissenso direcionado para IRF5. Em certas modalidades, o composto compreende um oligonucleotídeo direcionado para IRF5. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tendo uma sequência de nucleobases compreendendo ao menos 8 nucleobases contíguas de qualquer das sequências de nucleobases das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um nucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tem uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado consistindo na sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado tendo uma sequência de nucleobases que consiste em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, o composto é ION 729018, 728958, 785525, 785674, 785675, 786503, 786524 ou 786548. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser de fita simples ou de fita dupla.
Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser um composto antissenso ou um composto oligomérico.
Em certas modalidades, o composto é administrado parenteralmente ao indivíduo.
Em certas modalidades, a administração do composto melhora, preserva ou evita inflamação, cirrose, fibrose, proteinúria, inflamação articular, produção de autoanticorpos, infiltração de células inflamatórias, depósitos de colágeno ou produção de citocina inflamatória. Em certas modalidades, a administração do composto melhora, preserva ou evita a inflamação no trato gastrointestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, aumento da frequência intestinal, tenesmo ou espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional.
[0148] Em certas modalidades, um método para inibir a expressão de IRF5 em uma célula compreende colocar a célula em contato com um composto compreendendo um inibidor específico de IRF5, desse modo inibindo a expressão de IRF5 na célula. Em certas modalidades, a célula é uma célula do trato gastrointestinal. Em certas modalidades, a célula é uma célula de fígado. Em certas modalidades, a célula é uma célula do rim. Em certas modalidades, a célula é uma célula do pulmão. Em certas modalidades, a célula está no trato gastrointestinal, nos pulmões, no fígado, no rim ou em qualquer outro órgão. Em certas modalidades, a célula está no trato gastrointestinal de um indivíduo que tem, ou está em risco de ter, inflamação no trato gastrointestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, aumento da frequência intestinal, tenesmo ou espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional. Em certas modalidades, o composto compreende um composto antissenso direcionado para IRF5. Em certas modalidades, o composto compreende um oligonucleotídeo direcionado para IRF5. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tendo uma sequência de nucleobases compreendendo ao menos 8 nucleobases contíguas de qualquer das sequências de nucleobases das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um nucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tem uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado consistindo na sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado tendo uma sequência de nucleobases que consiste em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, o composto é ION 729018, 728958, 785525, 785674, 785675, 786503, 786524 ou 786548. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser de fita simples ou de fita dupla. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser um composto antissenso ou um composto oligomérico.
[0149] Em certas modalidades, um método para reduzir ou inibir inflamação, cirrose, fibrose, proteinúria, inflamação articular, produção de autoanticorpos, infiltração de células inflamatórias, depósitos de colágeno ou produção de citocina inflamatória em um indivíduo tendo, ou em risco de ter, uma doença associada ao IRF5 compreende administrar ao indivíduo um composto que compreende um inibidor específico de IRF5, reduzindo ou inibindo assim inflamação, cirrose, fibrose, proteinúria, inflamação articular, produção de autoanticorpos, infiltração de células inflamatórias, depósitos de colágeno ou produção de citocina inflamatória no indivíduo. Em certas modalidades, um método para reduzir ou inibir inflamação no trato gastrointestinal diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, aumento da frequência intestinal, tenesmo espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional em um indivíduo, tendo, ou em risco de ter, uma doença associada com IRF5 compreende administrar um composto direcionado a IRF5 ao indivíduo, reduzindo ou inibindo, assim, a inflamação no trato gastrointestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, frequência intestinal aumentada, tenesmo ou espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional no indivíduo.
Em certas modalidades, o indivíduo tem, ou está em risco de ter, doença inflamatória intestinal (DII), lúpus eritematoso sistêmico (LES), artrite reumatoide, cirrose biliar primária, esclerose sistêmica, síndrome de Sjogren, esclerose múltipla, escleroderma, doença pulmonar intersticial (SSc-ILD), doença renal policística (PKD), doença renal crônica (CKD), NASH, fibrose hepática, asma ou asma grave.
Em certas modalidades, o composto compreende um composto antissenso direcionado para IRF5. Em certas modalidades, o composto compreende um oligonucleotídeo direcionado para IRF5. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tendo uma sequência de nucleobases compreendendo ao menos 8 nucleobases contíguas de qualquer das sequências de nucleobases das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um nucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tem uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado consistindo na sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado tendo uma sequência de nucleobases que consiste em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, o composto é ION 729018, 728958, 785525, 785674, 785675, 786503, 786524 ou 786548. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser de fita simples ou de fita dupla. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser um composto antissenso ou um composto oligomérico. Em certas modalidades, o composto é administrado parenteralmente ao indivíduo. Em certas modalidades, o indivíduo é identificado como tendo, ou em risco de ter, uma doença associada ao IRF5.
[0150] Certas modalidades são direcionadas a um composto compreendendo um inibidor específico de IRF5 para uso no tratamento de uma doença associada ao IRF5. Em certas modalidades, a doença é doença inflamatória intestinal (DII), lúpus eritematoso sistêmico (LES), artrite reumatoide, cirrose biliar primária, esclerose sistêmica, síndrome de Sjogren, esclerose múltipla, escleroderma, doença pulmonar intersticial (SSc-ILD), doença renal policística (PKD), doença renal crônica (CKD), NASH, fibrose hepática, asma ou asma grave. Em certas modalidades, o composto compreende um composto antissenso direcionado para IRF5. Em certas modalidades, o composto compreende um oligonucleotídeo direcionado para IRF5. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tendo uma sequência de nucleobases compreendendo ao menos 8 nucleobases contíguas de qualquer das sequências de nucleobases das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um nucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tem uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado consistindo na sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado tendo uma sequência de nucleobases que consiste em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, o composto é ION 729018, 728958, 785525, 785674, 785675, 786503, 786524 ou 786548. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser de fita simples ou de fita dupla. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser um composto antissenso ou um composto oligomérico. Em certas modalidades, o composto é administrado parenteralmente ao indivíduo.
[0151] Certas modalidades são direcionadas a um composto compreendendo um inibidor específico de IRF5 para uso na redução ou inibição de inflamação, cirrose, fibrose, proteinúria, inflamação articular, produção de autoanticorpos, infiltração de células inflamatórias, depósitos de colágeno, ou produção de citocina inflamatória em um indivíduo que tem, ou está em risco de ter, doença inflamatória intestinal (DII), lúpus eritematoso sistêmico (LES), artrite reumatoide, cirrose biliar primária, esclerose sistêmica, síndrome de Sjogren, esclerose múltipla, escleroderma, doença pulmonar intersticial (SSc-ILD), doença renal policística (PKD), doença renal crônica (CKD), NASH, fibrose hepática, asma ou asma grave.
Em certas modalidades, o inibidor específico de IRF5 para uso reduz ou inibe inflamação no trato gastrointestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, aumento da frequência intestinal, tenesmo ou espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional em um indivíduo.
Em certas modalidades, o composto compreende um composto antissenso direcionado para IRF5. Em certas modalidades, o composto compreende um oligonucleotídeo direcionado para IRF5. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tendo uma sequência de nucleobases compreendendo ao menos 8 nucleobases contíguas de qualquer das sequências de nucleobases das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um nucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tem uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado consistindo na sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado tendo uma sequência de nucleobases que consiste em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades,
o composto é ION 729018, 728958, 785525, 785674, 785675, 786503, 786524 ou 786548. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser de fita simples ou de fita dupla. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser um composto antissenso ou um composto oligomérico.
[0152] Certas modalidades são direcionadas ao uso de um composto compreendendo um inibidor específico de IRF5 para a fabricação ou preparação de um medicamento para tratar uma doença associada ao IRF5. Certas modalidades são direcionadas ao uso de um composto compreendendo um inibidor específico de IRF5 para a preparação de um medicamento para tratar uma doença associada ao IRF5. Em certas modalidades, a doença é uma doença inflamatória. Em certas modalidades, a doença é uma doença gastrointestinal. Em certas modalidades, a doença gastrointestinal é colite ulcerativa ou doença de Crohn. Em certas modalidades, a doença é doença inflamatória intestinal (DII), lúpus eritematoso sistêmico (LES), artrite reumatoide, cirrose biliar primária, esclerose sistêmica, síndrome de Sjogren, esclerose múltipla, escleroderma, doença pulmonar intersticial (SSc- ILD), doença renal policística (PKD), doença renal crônica (CKD), NASH, fibrose hepática, asma ou asma grave. Em certas modalidades, o composto compreende um composto antissenso direcionado para IRF5. Em certas modalidades, o composto compreende um oligonucleotídeo direcionado para IRF5. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tendo uma sequência de nucleobases compreendendo ao menos 8 nucleobases contíguas de qualquer das sequências de nucleobases das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um nucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tem uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado consistindo na sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado tendo uma sequência de nucleobases que consiste em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, o composto é ION 729018, 728958, 785525, 785674, 785675, 786503, 786524 ou 786548. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser de fita simples ou de fita dupla. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser um composto antissenso ou um composto oligomérico.
[0153] Certas modalidades são direcionadas ao uso de um composto compreendendo um inibidor específico de IRF5 para a fabricação ou preparação de um medicamento para reduzir ou inibir inflamação, cirrose, fibrose, proteinúria, inflamação articular, produção de autoanticorpos, infiltração de células inflamatórias, depósitos de colágeno ou produção de citocina inflamatória em um indivíduo tendo, ou em risco de ter, uma doença associada ao IRF5. Em certas modalidades, o inibidor específico de IRF5 para a fabricação ou preparo do medicamento reduz a inflamação no trato gastrointestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, aumento da frequência intestinal, tenesmo ou espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional em um indivíduo. Em certas modalidades, a doença é doença inflamatória intestinal (DII),
lúpus eritematoso sistêmico (LES), artrite reumatoide, cirrose biliar primária, esclerose sistêmica, síndrome de Sjogren, esclerose múltipla, escleroderma, doença pulmonar intersticial (SSc-ILD), doença renal policística (PKD), doença renal crônica (CKD), NASH, fibrose hepática, asma ou asma grave.
Certas modalidades são direcionadas ao uso de um composto que compreende um inibidor específico de IRF5 para a preparação de um medicamento para tratar uma doença associada ao IRF5. Em certas modalidades, a doença é doença inflamatória intestinal (DII), lúpus eritematoso sistêmico (LES), artrite reumatoide, cirrose biliar primária, esclerose sistêmica, síndrome de Sjogren, esclerose múltipla, escleroderma, doença pulmonar intersticial (SSc-ILD), doença renal policística (PKD), doença renal crônica (CKD), NASH, fibrose hepática, asma ou asma grave.
Em certas modalidades, o composto compreende um composto antissenso direcionado para IRF5. Em certas modalidades, o composto compreende um oligonucleotídeo direcionado para IRF5. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tendo uma sequência de nucleobases compreendendo ao menos 8 nucleobases contíguas de qualquer das sequências de nucleobases das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um nucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e tem uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado consistindo na sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, um composto compreende um oligonucleotídeo modificado de 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades,
um composto compreende um oligonucleotídeo modificado tendo uma sequência de nucleobases que consiste em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294. Em certas modalidades, o composto é ION 729018, 728958, 785525, 785674, 785675, 786503, 786524 ou 786548. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser de fita simples ou de fita dupla. Em qualquer das modalidades anteriormente mencionadas, o composto pode ser um composto antissenso ou um composto oligomérico.
[0154] Em qualquer dos métodos ou usos anteriormente mencionados, o composto pode ser direcionado para IRF5. Em certas modalidades, o composto compreende ou consiste em um oligonucleotídeo modificado, por exemplo, um oligonucleotídeo modificado de 8 a 80 nucleosídeos ligados de comprimento, 10 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento, 12 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento ou 20 nucleosídeos ligados de comprimento. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado é ao menos 80%, ao menos 85%, ao menos 90%, ao menos 95% ou 100% complementar a qualquer das sequências de nucleobases mencionadas nas SEQ ID Nºs: 37 a
1356. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado compreende ao menos uma ligação internucleosídica modificada, ao menos um açúcar modificado e/ou ao menos uma nucleobase modificada. Em certas modalidades, a ligação internucleosídica modificada é uma ligação internucleosídica de fosforotioato, o açúcar modificado é um açúcar bicíclico ou um açúcar modificado com 2'-O- metoxietila, e a nucleobase modificada é uma 5-metilcitosina. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado compreende um segmento de lacuna que consiste em desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em nucleosídeos ligados, sendo que o segmento de lacuna é posicionado imediatamente adjacente a e entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', e sendo que cada nucleosídeo de cada segmento de asa compreende um açúcar modificado.
[0155] Em qualquer das modalidades anteriores, o oligonucleotídeo modificado tem 12 a 30, 15 a 30, 15 a 25, 15 a 24, 16 a 24, 17 a 24, 18 a 24, 19 a 24, 20 a 24, 19 a 22, 20 a 22, 16 a 20, ou 16 ou 20 nucleosídeos ligados de comprimento. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado é ao menos 80%, ao menos 85%, ao menos 90%, ao menos 95% ou 100% complementar a qualquer das sequências de nucleobases mencionadas nas SEQ ID Nºs: 37 a 1356.
[0156] Em certas modalidades, um composto compreende ou consistem em um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleobases ligadas de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência citada em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 1270, 1272 e 1294, sendo que o oligonucleotídeo modificado compreende: um segmento de lacuna que consiste em dez desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em três nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em três nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', sendo que cada nucleosídeo de cada segmento de asa compreende um açúcar cEt; em que cada ligação internucleosídica é uma ligação de fosforotioato e em que cada citosina é uma 5-metilcitosina. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 a 30 nucleosídeos ligados. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 nucleosídeos ligados.
[0157] Em certas modalidades, um composto consiste em um oligonucleotídeo modificado de 16 nucleobases ligadas de comprimento tendo uma sequência de nucleobases que consiste na sequência citada na SEQ ID Nº: 228, sendo que o oligonucleotídeo modificado compreende: um segmento de lacuna que consiste em dez desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em três nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em três nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', sendo que cada nucleosídeo de cada segmento de asa compreende um açúcar cEt; em que cada ligação internucleosídica é uma ligação de fosforotioato e em que cada citosina é uma 5-metilcitosina.
[0158] Em certas modalidades, um composto compreende ou consistem em um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleobases ligadas de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência citada em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 717, sendo que o oligonucleotídeo modificado compreende: um segmento de lacuna que consiste em dez desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em dois nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em quatro nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', sendo que cada nucleosídeo no segmento de asa 5' compreende um açúcar cEt (kk);
sendo que os nucleosídeos do segmento de asa 3' compreendem da direção 5' a 3' de um açúcar cEt, um açúcar 2'-MOE, um açúcar cEt e um açúcar 2'-MOE (keke); em que cada ligação internucleosídica é uma ligação de fosforotioato e em que cada citosina é uma 5-metilcitosina. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 a 30 nucleosídeos ligados. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 nucleosídeos ligados.
[0159] Em certas modalidades, um composto compreende ou consistem em um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleobases ligadas de comprimento tendo uma sequência de nucleobases compreendendo a sequência citada em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 717 e 1340, sendo que o oligonucleotídeo modificado compreende: um segmento de lacuna que consiste em nove desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em dois nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em cinco nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', sendo que cada nucleosídeo no segmento de asa 5' compreende um açúcar cEt (kk); sendo que os nucleosídeos do segmento de asa 3' da direção 5' a 3' de um açúcar cEt, um açúcar 2'-MOE, um açúcar 2'-MOE, um açúcar 2'- MOE, um açúcar cEt e um açúcar cEt (eeekk); em que cada ligação internucleosídica é uma ligação de fosforotioato e em que cada citosina é uma 5-metilcitosina. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 a 30 nucleosídeos ligados. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 nucleosídeos ligados.
[0160] Em certas modalidades, um composto compreende ou consiste em ION 729018 ou sal do mesmo, tendo a seguinte estrutura química:
[0161] Em certas modalidades, um composto compreende ou consiste no sal de sódio de ION 729018, tendo a seguinte estrutura química:
[0162] Em qualquer dos métodos ou usos anteriormente mencionados, o composto pode ser administrado parenteralmente. Por exemplo, em certas modalidades, o composto pode ser administrado através de injeção ou infusão. A administração parenteral inclui administração subcutânea, administração intravenosa, administração intramuscular, administração intra-arterial, administração intraperitoneal ou administração intracraniana, por exemplo, administração intratecal ou intracerebroventricular. Certos Compostos
[0163] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos podem ser compostos antissenso. Em certas modalidades, o composto antissenso compreende ou consiste em um composto oligomérico. Em certas modalidades, o composto oligomérico compreende um oligonucleotídeo modificado. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado tem uma sequência de nucleobases complementar àquela de um ácido nucleico-alvo.
[0164] Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende ou consiste em um oligonucleotídeo modificado. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado tem uma sequência de nucleobases complementar àquela de um ácido nucleico-alvo.
[0165] Em certas modalidades, um composto ou composto antissenso é de fita simples. Tal composto de fita simples ou composto antissenso compreende ou consiste em um composto oligomérico. Em certas modalidades, tal composto oligomérico compreende ou consiste em um oligonucleotídeo e, opcionalmente, um grupo conjugado. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo é um oligonucleotídeo antissenso. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo é modificado. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo de um composto antissenso de fita simples ou composto oligomérico compreende uma sequência de nucleobases autocomplementares.
[0166] Em certas modalidades, os compostos são de fita dupla. Tais compostos de fita dupla compreendem um primeiro oligonucleotídeo modificado tendo uma região complementar a um ácido nucleico-alvo e um segundo oligonucleotídeo modificado tendo uma região complementar ao primeiro oligonucleotídeo modificado. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado é um oligonucleotídeo de RNA. Em tais modalidades, a nucleobase timina no oligonucleotídeo modificado é substituída por uma nucleobase uracil. Em certas modalidades, o composto compreende um grupo conjugado. Em certas modalidades, um dos oligonucleotídeos modificados é conjugado. Em certas modalidades, ambos os oligonucleotídeos modificados são conjugados. Em certas modalidades, o primeiro oligonucleotídeo modificado é conjugado. Em certas modalidades, o segundo oligonucleotídeo modificado é conjugado. Em certas modalidades, o primeiro oligonucleotídeo modificado tem 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento e o segundo oligonucleotídeo modificado tem 16 a 30 nucleosídeos ligados de comprimento. Em certas modalidades, um dos oligonucleotídeos modificados tem uma sequência de nucleobases compreendendo ao menos 8 nucleobases contíguas de qualquer das SEQ ID Nºs: 37 a 1356.
[0167] Em certas modalidades, os compostos antissenso são de fita dupla. Tais compostos antissenso de fita dupla compreendem um primeiro composto oligomérico tendo uma região complementar a um ácido nucleico-alvo e um segundo composto oligomérico tendo uma região complementar ao primeiro composto oligomérico. O primeiro composto oligomérico de tais compostos antissenso de fita dupla tipicamente compreende ou consiste em um oligonucleotídeo modificado e, opcionalmente, um grupo conjugado. O oligonucleotídeo do segundo composto oligomérico desse composto antissenso de fita dupla pode ser modificado ou não modificado. Um ou ambos os compostos oligoméricos de um composto antissenso de fita dupla podem compreender um grupo conjugado. Os compostos oligoméricos de compostos antissenso de fita dupla podem incluir nucleosídeos pendentes não complementares.
[0168] Exemplos de compostos de fita simples e fita dupla incluem, mas não se limitam a, oligonucleotídeos, siRNAs, oligonucleotídeos de direcionamento de microRNA e compostos de RNAi de fita simples, como RNAs em forma de pequenos "grampos" (hairpins) (shRNAs), siRNAs de fita simples (ssRNAs), e microRNA miméticos.
[0169] Em certas modalidades, um composto aqui descrito tem uma sequência de nucleobases que, quando escrita na direção 5' a 3', compreende o complemento reverso do segmento-alvo de um ácido nucleico-alvo ao qual ele é direcionado.
[0170] Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 12 a 30 subunidades ligadas de comprimento.
Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 12 a 22 subunidades ligadas de comprimento.
Em certas modalidades, o composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 14 a 30 subunidades ligadas de comprimento.
Em certas modalidades, o composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 14 a 20 subunidades ligadas de comprimento.
Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 15 a 30 subunidades ligadas de comprimento.
Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 15 a 20 subunidades ligadas de comprimento.
Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 16 a 30 subunidades ligadas de comprimento.
Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 16 a 20 subunidades ligadas de comprimento.
Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 17 a 30 subunidades ligadas de comprimento.
Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 17 a 20 subunidades ligadas de comprimento.
Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 18 a 30 subunidades ligadas de comprimento.
Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 18 a 20 subunidades ligadas de comprimento.
Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 20 a 30 subunidades ligadas de comprimento.
Em outras palavras, tais oligonucleotídeos são 12 a 30 subunidades ligadas, 14 a 30 subunidades ligadas, 14 a 20 subunidades ligadas, 15 a 30 subunidades ligadas, 15 a 20 subunidades ligadas, 16 a 30 subunidades ligadas, 16 a 20 subunidades ligadas, 17 a 30 subunidades ligadas, 17 a 20 subunidades ligadas, 18 a 30 subunidades ligadas, 18 a 20 subunidades ligadas, 20 a 30 subunidades ligadas de comprimento, respectivamente. Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 14 subunidades ligadas de comprimento. Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 16 subunidades ligadas de comprimento. Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 17 subunidades ligadas de comprimento. Em certas modalidades, o composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 18 subunidades ligadas de comprimento. Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 19 subunidades ligadas de comprimento. Em certas modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 20 subunidades ligadas de comprimento. Em outras modalidades, um composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo 8 a 80, 12 a 50, 13 a 30, 13 a 50, 14 a 30, 14 a 50, 15 a 30, 15 a 50, 16 a 30, 16 a 50, 17 a 30, 17 a 50, 18 a 22, 18 a 24, 18 a 30, 18 a 50, 19 a 22, 19 a 30, 19 a 50 ou 20 a 30 subunidades ligadas. Em certas tais modalidades, o composto aqui descrito compreende um oligonucleotídeo de 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ou 30 subunidades ligadas de comprimento, ou uma faixa definida por quaisquer dois dos valores acima. Em algumas modalidades, as subunidades ligadas são nucleotídeos, nucleosídeos ou nucleobases.
[0171] Em certas modalidades, o composto pode compreender adicionalmente características ou elementos adicionais, como um grupo conjugado, que são fixados ao oligonucleotídeo. Em certas modalidades, tais compostos são compostos antissenso. Em certas modalidades, tais compostos são compostos oligoméricos. Em modalidades nas quais um grupo conjugado compreende um nucleosídeo (isto é, um nucleosídeo que liga o grupo conjugado ao oligonucleotídeo), o nucleosídeo do grupo conjugado não é contado no comprimento do oligonucleotídeo.
[0172] Em certas modalidades, os compostos podem ser encurtados ou truncados. Por exemplo, uma única subunidade pode ser deletada da extremidade 5' (truncamento 5') ou, alternativamente, da extremidade 3' (truncamento 3'). Um composto encurtado ou truncado direcionado a um ácido nucleico de IRF5 pode ter duas subunidades deletadas da extremidade 5', ou alternativamente, pode ter duas subunidades deletadas da extremidade 3' do composto. Alternativamente, os nucleosídeos deletados podem ser dispersos por todo o composto.
[0173] Quando uma única subunidade adicional está presente em um composto alongado, a subunidade adicional pode estar situada na extremidade 5' ou 3' do composto. Quando duas ou mais subunidades adicionais estão presentes, as subunidades adicionadas podem ser adjacentes umas às outras, por exemplo, em um composto tendo duas subunidades adicionadas à extremidade 5' (adição 5'), ou alternativamente, à extremidade 3' (adição 3') do composto. Alternativamente, as subunidades adicionadas podem ser dispersas por todo o composto.
[0174] É possível aumentar ou diminuir o comprimento de um composto, como um oligonucleotídeo, e/ou introduzir bases mal pareadas sem eliminar a atividade (Woolf et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89:7305-7309; Gautschi et al. J. Natl. Cancer Inst. março de 2001, 93:463-471; Maher e Dolnick Nuc. Acid. Res. 1998, 16:3341- 3358). Entretanto, aparentemente pequenas alterações na sequência de oligonucleotídeos, química e motivo podem fazer grandes diferenças em uma ou mais das muitas propriedades necessárias para o desenvolvimento clínico (Seth et al. J. Med. Chem. 2009, 52, 10; Egli et al. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 16642).
[0175] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos são compostos de RNA de interferência (RNAi), que incluem compostos de RNA de fita dupla (também chamados de RNA de pequena interferência ou siRNA) e compostos de RNAi de fita simples (ou ssRNA). Tais compostos funcionam ao menos em parte através da via RISC para degradar e/ou sequestrar um ácido nucleico-alvo (dessa forma, incluem compostos de microRNA/mímicos de microRNA). Como usado na presente invenção, o termo siRNA se destina a ser equivalente a outros termos usados para descrever moléculas de ácido nucleico que são capazes de mediar RNAi específico para sequência, por exemplo, RNA de pequena interferência (siRNA), RNA de fita dupla (dsRNA), micro- RNA (miRNA), RNA em forma de pequeno grampo (shRNA), oligonu- cleotídeo de pequena interferência, ácido nucleico de pequena interfe- rência, oligonucleotídeo modificado de pequena interferência, siRNA quimicamente modificado, RNA silenciador gênico pós-transcricional (ptgsRNA), e outros. Além disso, como usado aqui, o termo "RNAi" se destina a ser equivalente a outros termos usados para descrever interferência de RNA específica para a sequência, como silenciamento gênico pós-transcricional, inibição translacional ou epigenética.
[0176] Em certas modalidades, um composto aqui descrito pode compreender qualquer das sequências de oligonucleotídeos direcionadas para IRF5 aqui descritas. Em certas modalidades, o composto pode ser de fita dupla. Em certas modalidades, o composto compreende uma primeira fita compreendendo ao menos uma porção de 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 ou 16 nucleobases contíguas de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37-1356 e uma segunda fita. Em certas modalidades, o composto compreende uma primeira fita compreendendo a sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37-1356 e uma segunda fita. Em certas modalidades, o composto compreende ribonucleotídeos nos quais a primeira fita tem uracil (U) no lugar de timina (T) em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a
1356. Em certas modalidades, o composto compreende (i) uma primeira fita compreendendo uma sequência de nucleobases complementar ao sítio em IRF5 ao qual qualquer das SEQ ID Nºs: 37-1356 é direcionada, e (ii) uma segunda fita. Em certas modalidades, o composto compreende um ou mais nucleotídeos modificados nos quais a posição 2' do açúcar contém um halogênio (como grupo flúor; 2'-F) ou contém um grupo alcoxila (como um grupo metoxila; 2'-OMe). Em certas modalidades, o composto compreende ao menos uma modificação de açúcar 2'-F e ao menos uma modificação de açúcar 2'-OMe. Em certas modalidades, a pelo menos uma modificação de açúcar 2'-F e a ao menos uma modificação de açúcar 2'-OMe são dispostas em um padrão alternado para ao menos 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 ou 20 nucleobases contíguas ao longo de uma fita do composto de dsRNA. Em certas modalidades, o composto compreende uma ou mais ligações entre nucleotídeos adjacentes além de uma ligação de fosfodiéster de ocorrência natural. Exemplos de tais ligações incluem ligações de fosforamida, fosforotioato e fosforoditioato. Os compostos podem também ser moléculas de ácido nucleico quimicamente modificadas, conforme apresentado na patente US No.
6.673.661. Em outras modalidades, o composto contém uma ou duas fitas capeadas, conforme revelado, por exemplo, em WO 00/63364, depositado em 19 de abril de 2000.
[0177] Em certas modalidades, a primeira fita do composto é uma fita guia de siRNA e a segunda fita do composto é uma fita passageira de siRNA. Em certas modalidades, a segunda fita do composto é complementar à primeira fita. Em certas modalidades, cada fita do composto tem 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22 ou 23 nucleosídeos ligados de comprimento. Em certas modalidades, a primeiro ou a segunda fita do composto pode compreender um grupo conjugado.
[0178] Em certas modalidades, um composto aqui descrito pode compreender qualquer das sequências de oligonucleotídeos direcionadas para IRF5 aqui descritas.
Em certas modalidades, o composto é de fita simples.
Em certas modalidades, tal composto é um composto de RNAi de fita simples (ssRNAi). Em certas modalidades, o composto compreende ao menos uma porção de 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, ou 16 nucleobases contíguas de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, o composto compreende a sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, o composto compreende ribonucleotídeos nos quais uracil (U) está no lugar de timina (T) em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356. Em certas modalidades, o composto compreende uma sequência de nucleobases complementar ao sítio em IRF5 ao qual qualquer das SEQ ID Nºs: 37-1356 é direcionada.
Em certas modalida- des, o composto compreende um ou mais nucleotídeos modificados nos quais a posição 2' no açúcar contém um halogênio (como grupo flúor; 2'-F) ou contém um grupo alcoxila (como um grupo metoxila; 2'-OMe). Em certas modalidades, o composto compreende ao menos uma modificação de açúcar 2'-F e ao menos uma modificação de açúcar 2'- OMe.
Em certas modalidades, a pelo menos uma modificação de açúcar 2'-F e a ao menos uma modificação de açúcar 2'-OMe são dispostas em um padrão alternado para ao menos 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 ou 20 nucleobases contíguas ao longo de uma fita do composto.
Em certas modalidades, o composto compreende uma ou mais ligações entre nucleotídeos adjacentes além de uma ligação de fosfodiéster de ocorrência natural.
Exemplos de tais ligações incluem ligações de fosforamida, fosforotioato e fosforoditioato.
Os compostos podem também ser moléculas de ácido nucleico quimicamente modificadas, conforme apresentado na patente US no 6.673.661. Em outras modalidades, o composto contém uma fita capeada, conforme revelado, por exemplo, em WO 00/63364, depositado em 19 de abril de
2000. Em certas modalidades, o composto consiste em 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22 ou 23 nucleosídeos ligados. Em certas modalidades, o composto pode compreender um grupo conjugado. Certos Mecanismos
[0179] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem ou consistem em oligonucleotídeos modificados. Em certas modalidades, os compostos aqui descritos são compostos antissenso. Em certas modalidades, os compostos compreendem compostos oligoméricos. Em certas modalidades, os compostos aqui descritos são capazes de hibridizar com um ácido nucleico-alvo, resultando em pelo menos uma atividade antissenso. Em certas modalidades, os compostos aqui descritos afetam seletivamente um ou mais ácidos nucleicos-alvo. Tais compostos compreendem uma sequência de nucleobases que hibridiza com um ou mais ácidos nucleicos-alvo, resultando em uma ou mais atividades antissenso desejadas e não hibridiza com um ou mais ácidos nucleicos não alvo ou não hibridiza com um ou mais ácidos nucleicos não alvo de tal forma que resulta em uma atividade antissenso indesejada significativa.
[0180] Em certas atividades antissenso, a hibridização de um composto aqui descrito com um ácido nucleico-alvo resulta no recrutamento de uma proteína que cliva o ácido nucleico-alvo. Por exemplo, certos compostos aqui descritos resultam na clivagem mediada por RNase H do ácido nucleico-alvo. A RNase H é uma endonuclease celular que cliva a fita de RNA de um RNA:DNA dúplex. O DNA nesse tipo de RNA:DNA duplex não precisa ser DNA não modificado. Em certas modalidades, os compostos aqui descritos são suficientemente "semelhantes a DNA" para induzir atividade de RNase H. Adicionalmente, em certas modalidades, um ou mais nucleosídeos não semelhantes a DNA na lacuna de um "gapmer" são tolerados.
[0181] Em certas atividades antissenso, os compostos aqui descritos ou uma porção do composto é carregada em um complexo de silenciamento induzido por RNA (RISC), resultando, por fim, na clivagem do ácido nucleico-alvo. Por exemplo, certos compostos aqui descritos resultam na clivagem do ácido nucleico-alvo por Argonaute. Os compostos que são carregados em RISC são compostos de RNAi. Os compostos de RNAi podem ser de fita dupla (siRNA) ou de fita simples (ssRNA).
[0182] Em certas modalidades, a hibridização dos compostos aqui descritos com um ácido nucleico-alvo não resulta no recrutamento de uma proteína que cliva aquele ácido nucleico-alvo. Em certas tais modalidades, a hibridização do composto com o ácido nucleico-alvo resulta na alteração de emenda do ácido nucleico-alvo. Em certas modalidades, a hibridização do composto com um ácido nucleico-alvo resulta na inibição de uma interação de ligação entre o ácido nucleico- alvo e uma proteína ou outro ácido nucleico. Em certas tais modalidades, a hibridização do composto com um ácido nucleico-alvo resulta na alteração da tradução do ácido nucleico-alvo.
[0183] As atividades antissenso podem ser observadas direta ou indiretamente. Em certas modalidades, a observação ou detecção de uma atividade antissenso envolve observação ou detecção de uma alteração em uma quantidade de um ácido nucleico-alvo ou proteína- alvo codificada por tal ácido nucleico-alvo, uma alteração na razão de variantes de emenda de um ácido nucleico ou proteína e/ou uma alteração fenotípica em uma célula ou animal. Ácidos nucleicos-alvo, regiões-alvo e sequências de nucleotídeos
[0184] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem ou consistem em um oligonucleotídeo compreendendo uma região que é complementar a um ácido nucleico-alvo. Em certas modalidades, o ácido nucleico-alvo é uma molécula de RNA endógena.
Em certas modalidades, o ácido nucleico-alvo codifica uma proteína. Em certas tais modalidades, o ácido nucleico-alvo é selecionado dentre um mRNA e um pre-mRNA, incluindo regiões intrônicas, exônicas e não traduzidas. Em certas modalidades, o RNA-alvo é um mRNA. Em certas modalidades, o ácido nucleico-alvo é um pre-mRNA. Em certas tais modalidades, a região-alvo está totalmente dentro de um íntron. Em certas modalidades, a região-alvo abrange uma junção íntron/éxon. Em certas modalidades, a região-alvo está ao menos 50% dentro de um íntron.
[0185] As sequências de nucleotídeos que codificam IRF5 incluem, mas não se limitam a, as seguintes: RefSeq ou número de acesso do GENBANK U51127.1 (aqui incorporado por referência, revelado como SEQ ID Nº: 4); número de acesso do GENBANK NT_007933.14 truncado a partir dos nucleotídeos 53761170 a 53774065 (incorporado a título de referência, aqui revelado como SEQ ID Nº: 2); número de acesso do GENBANK DC427600.1 (incorporado por referência, aqui revelado como SEQ ID Nº: 5); número de acesso do GENBANK NM_001098627.3 (incorporado a título de referência, aqui revelado como SEQ ID Nº: 1); número de acesso do GENBANK NM_001098629.2 (aqui incorporado a título de referência, revelado como SEQ ID Nº: 3); número de acesso do GENBANK NM_001098630.2 (aqui incorporado a título de referência, revelado como SEQ ID Nº: 6); número de acesso do GENBANK NM_001242452.2 (aqui incorporado a título de referência, revelado como SEQ ID Nº: 7); número de acesso do GENBANK NM_032643.4 (incorporado por referência, aqui revelado como SEQ ID Nº: 8); e número de acesso do GENBANK NC_000007.14 truncado a partir dos nucleotídeos 128935001 a 128953000 (incorporados a título de referência, aqui revelados como SEQ ID Nº: 9).
Hibridização
[0186] Em algumas modalidades, a hibridização ocorre entre um composto revelado na presente invenção e um ácido nucleico de IRF5. O mecanismo de hibridização mais comum envolve ligação ao hidrogênio (por exemplo, ligação de hidrogênio de Watson-Crick, Hoogsteen ou Hoogsteen invertido) entre nucleobases complementares das moléculas de ácido nucleico.
[0187] A hibridização pode ocorrer sob diferentes condições. As condições de hibridização são dependentes da sequência e são determinadas pela natureza e composição das moléculas de ácido nucleico a serem hibridizadas.
[0188] Os métodos para determinar se uma sequência é especificamente hibridizável com um ácido nucleico-alvo são bem conhecidos na técnica. Em certas modalidades, os compostos aqui fornecidos são especificamente hibridizáveis com um ácido nucleico de IRF5. Complementaridade
[0189] Um oligonucleotídeo é considerado complementar a um outro ácido nucleico quando a sequência de nucleobases desse oligonucleotídeo ou uma ou mais regiões do mesmo está(ão) pareada(s) com a sequência de nucleobases de um outro oligonucleotídeo ou ácido nucleico ou uma ou mais regiões do mesmo quando as duas sequências de nucleobases são alinhadas em direções opostas. Os pareamentos de nucleobases ou nucleobases complementares, conforme descrito na presente invenção, são limitados aos seguintes pares: adenina (A) e timina (T), adenina (A) e uracil (U), citosina (C) e guanina (G), e 5- metilcitosina (mC) e guanina (G), exceto onde especificado em contrário. Os oligonucleotídeos e/ou os ácidos nucleicos complementares não precisam ter complementaridade de nucleobase em cada nucleosídeo e podem incluir um ou mais pareamentos incorretos de nucleobases. Um oligonucleotídeo é totalmente complementar ou 100% complementar quando tais oligonucleotídeos apresentam pareamentos de nucleobases em cada nucleosídeo sem pareamentos incorretos de nucleobases.
[0190] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem ou consistem em oligonucleotídeos modificados. Em certas modalidades, os compostos aqui descritos são compostos antissenso. Em certas modalidades, os compostos compreendem compostos oligoméricos. Nucleobases não complementares entre um composto e um ácido nucleico de IRF5 podem ser toleradas desde que o composto permaneça capaz de hibridizar especificamente com um ácido nucleico-alvo. Além disso, um composto pode hibridizar ao longo de um ou mais segmentos de um ácido nucleico de IRF5 de modo que segmentos intermediários ou adjacentes não estejam envolvidos no evento de hibridização (por exemplo, uma estrutura em laço, pareamento incorreto ou estrutura de grampo).
[0191] Em certas modalidades, os compostos aqui fornecidos, ou uma porção especificada dos mesmos, são pelo menos, ou são até 70%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, ou 100% complementares a um ácido nucleico de IRF5, uma região-alvo, um segmento-alvo, ou uma porção especificada dos mesmos. Em certas modalidades, os compostos aqui fornecidos, ou uma porção especificada dos mesmos, são 70% a 75%, 75% a 80%, 80% a 85%, 85% a 90%, 90% a 95%, 95% a 100%, ou qualquer número entre estas faixas, complementares a um ácido nucleico de IRF5, uma região-alvo, um segmento-alvo, ou uma porção especificada dos mesmos. A complementaridade porcentual de um composto com um ácido nucleico-alvo pode ser determinada com o uso de métodos rotineiros.
[0192] Por exemplo, um composto no qual 18 de 20 nucleobases do composto são complementares a uma região-alvo e, portanto, hibridizaria especificamente, representaria 90 por cento de complementaridade. Nesse exemplo, as nucleobases não complementares restantes podem ser agrupadas ou intercaladas com nucleobases complementares e não precisam ser contíguas umas às outras ou a nucleobases complementares. Dessa forma, um composto que tem 18 nucleobases de comprimento tendo quatro nucleobases não complementares que são flanqueadas por duas regiões de complementaridade completa com o ácido nucleico-alvo teria 77,8% de complementaridade total com o ácido nucleico-alvo. A complementaridade porcentual de um composto com uma região de um ácido nucleico-alvo pode ser determinada rotineiramente com o uso de programas BLAST (ferramentas de busca básicas de alinhamento local) e programas PowerBLAST conhecidos na técnica (Altschul et al., J. Mol. Biol., 1990, 215, 403 410; Zhang e Madden, Genome Res., 1997, 7, 649 656). A porcentagem de homologia, identidade de sequência ou complementaridade, pode ser determinada, por exemplo, pelo programa Gap (Wisconsin Sequence Analysis Package, Versão 8 para Unix, Genetics Computer Group, University Research Park, Madison Wis., EUA), com o uso de configurações padrão, que usa o algoritmo de Smith e Waterman (Adv. Appl. Math., 1981, 2, 482 489).
[0193] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos, ou porções especificadas dos mesmos, são totalmente complementares (isto é, 100% complementares) a um ácido nucleico-alvo, ou porção especificada do mesmo. Por exemplo, um composto pode ser totalmente complementar a um ácido nucleico de IR5, ou uma região- alvo, ou um segmento-alvo ou sequência-alvo do mesmo. Como usado aqui, "totalmente complementar" significa que cada nucleobase de um composto é complementar à nucleobase correspondente de um ácido nucleico-alvo. Por exemplo, um composto de 20 nucleobases é totalmente complementar a uma sequência-alvo que tem 400 nucleobases de comprimento, contanto que haja uma porção de 20 nucleobases correspondentes do ácido nucleico-alvo que é totalmente complementar ao composto. "Totalmente complementar" pode também ser usado em referência a uma porção especificada do primeiro e/ou do segundo ácido nucleico. Por exemplo, uma porção de 20 nucleobases de um composto de 30 nucleobases pode ser "totalmente complementar" a uma sequência-alvo que tem 400 nucleobases de comprimento. A porção de 20 nucleobases do composto de 30 nucleobase é totalmente complementar à sequência-alvo se a sequência-alvo tiver uma porção de 20 nucleobases correspondentes, sendo que cada nucleobase é complementar à porção de 20 nucleobases do composto. Ao mesmo tempo, o composto de 30 nucleobases inteiro pode ou não ser totalmente complementar à sequência-alvo, dependendo de se as 10 nucleobases restantes do composto também são complementares à sequência-alvo.
[0194] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem uma ou mais nucleobases pareadas incorretamente em relação ao ácido nucleico-alvo. Em certas tais modalidades, a atividade antissenso contra o alvo é reduzida por esse desemparelhamento, mas a atividade contra um não alvo é reduzida por uma quantidade maior. Dessa forma, em certas tais modalidades, a seletividade do composto é aprimorada. Em certas modalidades, o desemparelhamento é especificamente posicionado dentro de um oligonucleotídeo tendo um motivo "gapmer". Em certas tais modalidades, o desemparelhamento está na posição 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 ou 8 a partir da extremidade 5' da região de lacuna. Em certas tais modalidades, o desemparelhamento está na posição 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 1 a partir da extremidade 3' da região de lacuna. Em certas tais modalidades, o desemparelhamento está na posição 1, 2, 3 ou 4 a partir da extremidade 5' da região de asa.
Em certas tais modalidades, o desemparelhamento está na posição 4, 3, 2, ou 1 a partir da extremidade 3' da região de asa. Em certas modalidades, o desemparelhamento é especificamente posicionada dentro de um oligonucleotídeo não tendo um motivo "gapmer". Em certas tais modalidades, o desemparelhamento está na posição 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 ou 12 a partir da extremidade 5' do oligonucleotídeo. Em certas tais modalidades, o desemparelhamento está na posição, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 ou 12 a partir da extremidade 3' do oligonucleotídeo.
[0195] A localização de uma nucleobase não complementar pode estar na extremidade 5' ou na extremidade 3' do composto. Alternativamente, a nucleobase ou nucleobases não complementares podem estar em uma posição interna do composto. Quando duas ou mais nucleobases não complementares estão presentes, elas podem ser contíguas (isto é, ligadas) ou não contíguas. Em uma modalidade, uma nucleobase não complementar está situada no segmento da asa de um oligonucleotídeo "gapmer".
[0196] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos que têm, ou têm até 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 ou 20 nucleobases de comprimento compreendem não mais que 4, não mais que 3, não mais que 2, ou não mais que 1 nucleobase(s) não complementar(es) em relação a um ácido nucleico-alvo, como um ácido nucleico de IRF5, ou porção especificada do mesmo.
[0197] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos que têm, ou têm até 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29 ou 30 nucleobases de comprimento compreendem não mais que 6, não mais que 5, não mais que 4, não mais que 3, não mais que 2, ou não mais que 1 nucleobase(s) não complementar(es) em relação a um ácido nucleico-alvo, como um ácido nucleico de IRF5, ou porção especificada do mesmo.
[0198] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos também incluem aqueles que são complementares a uma porção de um ácido nucleico-alvo. Como usado aqui, "porção" refere-se a um número definido de nucleobases contíguas (isto é, ligadas) dentro de uma região ou segmento de um ácido nucleico-alvo. Uma "porção" também pode se referir a um número definido de nucleobases contíguas de um composto. Em certas modalidades, os compostos são complementares a ao menos uma porção de 8 nucleobases de um segmento-alvo. Em certas modalidades, os compostos são complementares a ao menos uma porção de 9 nucleobases de um segmento-alvo. Em certas modalidades, os compostos são complementares a ao menos uma porção de 10 nucleobases de um segmento-alvo. Em certas modalidades, os compostos são complementares a ao menos uma porção de 11 nucleobases de um segmento-alvo. Em certas modalidades, os compostos são complementares a ao menos uma porção de 12 nucleobases de um segmento-alvo. Em certas modalidades, os compostos são complementares a ao menos uma porção de 13 nucleobases de um segmento-alvo. Em certas modalidades, os compostos são complementares a ao menos uma porção de 14 nucleobases de um segmento-alvo. Em certas modalidades, os compostos são complementares a ao menos uma porção de 15 nucleobases de um segmento-alvo. Em certas modalidades, os compostos são complementares a ao menos uma porção de 16 nucleobases de um segmento-alvo. Também são contemplados compostos que são complementares a ao menos uma porção de 9, 10, 17, 18, 19, 20 ou mais nucleobases de um segmento- alvo, ou uma faixa definida por quaisquer dois destes valores. Identidade
[0199] Os compostos aqui fornecidos podem também ter uma porcentagem de identidade definida com uma sequência de nucleotídeos específica, SEQ ID Nº, ou composto representado por um número ION específico, ou porção do mesmo. Em certas modalidades, os compostos aqui descritos são compostos antissenso ou compostos oligoméricos. Em certas modalidades, os compostos aqui descritos são oligonucleotídeos modificados. Como usado aqui, um composto é idêntico à sequência revelada na presente invenção se ele tiver a mesma capacidade de pareamento de nucleobases. Por exemplo, um RNA que contém uracil no lugar de timidina em uma sequência de DNA revelada seria considerado idêntico à sequência de DNA uma vez que tanto uracil quanto timidina fazem par com adenina. Também são contempladas versões encurtadas e alongadas dos compostos aqui descritos, bem como dos compostos tendo bases não idênticas em relação aos compostos aqui fornecidos. As bases não idênticas podem ser adjacentes umas às outras ou dispersas por todo o composto. A porcentagem de identidade de um composto é calculada de acordo com o número de bases que têm pareamento de bases idêntico em relação à sequência à qual ele está sendo comparado.
[0200] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos, ou porções dos mesmos, são, ou são ao menos, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou 100% idênticos a um ou mais dos compostos ou SEQ ID Nºs, ou uma porção dos mesmos, aqui revelados. Em certas modalidades, os compostos aqui descritos são cerca de 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% ou 99% idênticos, ou qualquer porcentagem entre tais valores, a uma sequência de nucleotídeos específica, SEQ ID Nº, ou composto representado por um número ION específico, ou porção do mesmo, nos quais os compostos compreendem um oligonucleotídeo tendo uma ou mais nucleobases desemparelhadas. Em certas tais modalidades, o desemparelhamento está na posição 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 ou 12 a partir da extremidade 5' do oligonucleotídeo. Em certas tais modalidades, o desemparelhamento está na posição, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 ou 12 a partir da extremidade 3' do oligonucleotídeo.
[0201] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem ou consistem em compostos antissenso. Em certas modalidades, uma porção do composto antissenso é comparada a uma porção de comprimento igual do ácido nucleico-alvo. Em certas modalidades, uma porção de 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 ou 25 nucleobases é comparada a uma porção de comprimento igual do ácido nucleico-alvo.
[0202] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem ou consistem em oligonucleotídeos. Em certas modalidades, uma porção do oligonucleotídeo é comparada a uma porção de comprimento igual do ácido nucleico-alvo. Em certas modalidades, uma porção de 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 ou 25 nucleobases é comparada a uma porção de comprimento igual do ácido nucleico-alvo. Certos Compostos Modificados
[0203] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem ou consistem em oligonucleotídeos que consistem em nucleosídeos ligados. Os oligonucleotídeos podem ser oligonucleotídeos não modificados (RNA ou DNA) ou podem ser oligonucleotídeos modificados. Os oligonucleotídeos modificados compreendem ao menos uma modificação em relação ao RNA ou DNA não modificado (isto é, compreendem ao menos um nucleosídeo modificado (que compreende uma porção açúcar modificada e/ou uma nucleobase modificada) e/ou ao menos uma ligação internucleosídica modificada). A. Nucleosídeos Modificados
[0204] Os nucleosídeos modificados compreendem uma porção açúcar modificada ou uma nucleobase modificada ou tanto uma porção açúcar modificada quanto uma nucleobase modificada.
1. Porções Açúcar Modificadas
[0205] Em certas modalidades, as porções açúcar são porções açúcar não bicíclicas modificadas. Em certas modalidades, as porções açúcar modificadas são porções açúcar bicíclicas ou tricíclicas. Em certas modalidades, as porções açúcar modificadas são substitutos de açúcar. Tais substitutos de açúcar podem compreender uma ou mais substituições correspondentes àquelas de outros tipos de porções açúcar modificadas.
[0206] Em certas modalidades, as porções açúcar modificadas são porções furanosila de açúcar não bicíclicas modificadas que compreendem um ou mais substituintes acíclicos, incluindo, mas não se limitando a, substituintes nas posições 2', 4' e/ou 5'. Em certas modalidades, a porção furanosila de açúcar é uma porção ribosila de açúcar. Em certas modalidades, um ou mais substituinte(s) acíclico(s) das porções açúcar não bicíclicas modificadas é/são ramificado(s). Exemplos de grupos 2'-substituintes adequados para porções açúcar não bicíclicas modificadas incluem, mas não se limitam a: 2'-F, 2'-OCH3 ("OMe" ou "O-metila"), e 2'-O(CH2)2OCH3 ("MOE"). Em certas modalidades, os grupos 2'-substituintes são selecionados dentre: halo, alila, amino, azido, SH, CN, OCN, CF3, OCF3, alcoxila O-C1-C10, alcoxila O-C1-C10 substituída, alquila O-C1-C10, alquila O-C1-C10 substituída, S- alquila, N(Rm)-alquila, O-alquenila, S-alquenila, N(Rm)-alquenila, O- alquinila, S-alquinila, N(Rm)-alquinila, O-alquilenil-O-alquila, alquinila, alcarila, aralquila, O-alcarila, O-aralquila, O(CH2)2SCH3,O(CH2)2ON(Rm)(Rn) ou OCH2C(=O)-N(Rm)(Rn), em que cada Rm e Rn é, independentemente, H, um grupo protetor de amino, ou alquila C1-C10 substituída ou não substituída, e os grupos 2'- substituintes descritos em Cook et al., US 6.531.584; Cook et al., US
5.859.221; e Cook et al., US 6.005.087. Em certas modalidades, esses grupos 2'-substituintes podem ser adicionalmente substituídos com um ou mais grupos substituintes independentemente selecionados dentre: hidroxila, amino, alcoxila, carboxila, benzila, fenila, nitro (NO2), tiol, tioalcoxila, tioalquila, halogênio, alquila, arila, alquenila e alquinila. Exemplos de grupos 4'-substituintes adequados para porções açúcar linearmente modificadas, não bicíclicas, incluem, mas não se limitam a, alcoxila (por exemplo, metoxila), alquila e aqueles descritos em Manoharan et al., WO 2015/106128. Exemplos de grupos 5'- substituintes adequados para porções açúcar não bicíclicas modificadas incluem, mas não se limitam a: 5'-metila (R ou S), 5'-vinila, e 5'-metoxila. Em certas modalidades, os açúcares não bicíclicos modificados compreendem mais de um substituinte de açúcar não ligante, por exemplo, porções 2'-F-5'-metila de açúcar e as porções açúcar modificadas e os nucleosídeos modificados descritos em Migawa et al., WO 2008/101157 e Rajeev et al., US2013/0203836.
[0207] Em certas modalidades, um nucleosídeo 2'-substituído ou nucleosídeo 2'-não bicíclico modificado compreende uma porção açúcar que compreende um grupo 2'-substituinte linear selecionado dentre: F, NH2, N3, OCF3, OCH3, O(CH2)3NH2, CH2CH=CH2, OCH2CH=CH2, OCH2CH2OCH3, O(CH2)2SCH3, O(CH2)2ON(Rm)(Rn), O(CH2)2 O(CH2)2 N(CH3)2, e acetamida N-substituída (OCH2C(=O)-N(Rm)(Rn)), em que cada Rm e Rn é, independentemente, H, um grupo protetor de amino, ou alquila C1-C10 substituída ou não substituída.
[0208] Em certas modalidades, um nucleosídeo 2'-substituído ou nucleosídeo 2'-não bicíclico modificado compreende uma porção açúcar que compreende um grupo 2'-substituinte linear selecionado dentre: F, OCF3, OCH3, OCH2CH2OCH3, O(CH2)2SCH3, O(CH2)2ON(CH3)2, O(CH2)2O(CH2)2N(CH3)2, e OCH2C(=O)-N(H)CH3 ("NMA").
[0209] Em certas modalidades, um nucleosídeo 2'-substituído ou nucleosídeo 2'-não bicíclico modificado compreende uma porção açúcar que compreende um grupo 2'-substituinte linear selecionado dentre: F, OCH3 e OCH2CH2OCH3.
[0210] Os nucleosídeos compreendendo porções açúcar modificadas, como porções açúcar não bicíclicas modificadas, são chamados de acordo com as posições das substituições na porção açúcar do nucleosídeo. Por exemplo, os nucleosídeos compreendendo porções açúcar 2'-substituídas ou 2'-modificadas são chamados de nucleosídeos 2'-substituídos ou nucleosídeos 2'-modificados.
[0211] Certas porções açúcar modificadas compreendem um substituinte de açúcar ligante que forma um segundo anel resultando em uma porção açúcar bicíclica. Em certas tais modalidades, a porção açúcar bicíclica compreende uma ponte entre os átomos do anel furanose 4' e 2'. Em certas tais modalidades, o anel furanose é um anel ribose. Exemplos de tais substituintes de açúcar ligantes 4' a 2' incluem, mas não se limitam a: 4'-CH2-2', 4'-(CH2)2-2', 4'-(CH2)3-2', 4'-CH2-O-2' ("LNA"), 4'-CH2-S-2', 4'-(CH2)2-O-2' ("ENA"), 4'-CH(CH3)-O-2' (chamado de "etila constrita" ou "cEt" quando na configuração S), 4'-CH2-O-CH2- 2', 4'-CH2-N(R)-2', 4'-CH(CH2OCH3)-O-2' ("MOE constrito" ou "cMOE") e análogos dos mesmos (consulte, por exemplo, Seth et al., US
7.399.845, Bhat et al., US 7.569.686, Swayze et al., US 7.741.457, e Swayze et al., US 8.022.193), 4'-C(CH3)(CH3)-O-2' e análogos dos mesmos (consulte, por exemplo, Seth et al., US 8.278.283), 4'-CH2- N(OCH3)-2' e análogos dos mesmos (consulte, por exemplo, Prakash et al., US 8.278.425), 4'-CH2-O-N(CH3)-2' (consulte, por exemplo, Allerson et al., US 7.696.345 e Allerson et al., US 8.124.745), 4'-CH2-C(H)(CH3)- 2' (consulte, por exemplo, Zhou, et al., J. Org. Chem.,2009, 74, 118- 134), 4'-CH2-C(=CH2)-2' e análogos dos mesmos (consulte, por exemplo, Seth et al., US 8,278,426), 4'-C(RaRb)-N(R)-O-2', 4'-C(RaRb)- O-N(R)-2', 4'-CH2-O-N(R)-2', e 4'-CH2-N(R)-O-2', em que cada R, Ra, e
Rb é, independentemente, H, um grupo protetor, ou alquila C1-C12 (consulte, por exemplo Imanishi et al., U.S. 7.427.672).
[0212] Em certas modalidades, tais ligantes de 4' a 2' compreen- dem, independentemente, de 1 a 4 grupos ligados independentemente selecionados dentre: -[C(Ra)(Rb)]n-, -[C(Ra)(Rb)]n-O-, -C(Ra)=C(Rb)-, -C(Ra)=N-, -C(=NRa)-, -C(=O)-, -C(=S)-, -O-, -Si(Ra)2-, -S(=O)x- e -N(Ra)-; sendo que: x é 0, 1, ou 2; n é 1, 2, 3 ou 4; cada Ra e Rb é, independentemente, H, um grupo protetor, hidroxila, alquila C1-C12, alquila C1-C12 substituída, alquenila C2-C12, alquenila C2-C12 substituída, alquinila C2-C12, alquinila C2-C12 substituída, arila C5-C20, arila C5-C20 substituída, um radical heterociclo, um radical heterociclo substituído, heteroarila, heteroarila substituída, radical alicíclico C5-C7, radical alicílico substituído C5-C7, halogênio, OJ1, NJ1J2, SJ1, N3, COOJ1, acila (C(═O)-H), acila substituída, CN, sulfonila (S(=O)2-J1), ou sulfoxila (S(═O)-J1); e cada J1 e J2 é, independente- mente, H, alquila C1-C12, alquila C1-C12 substituída, alquenila C2-C12, alquenila C2-C12 substituída, alquinila C2-C12, alquinila C2-C12 substi- tuída, arila C5-C20, arila C5-C20 substituída, acila (C(=O)-H), acila substi- tuída, um radical heterociclo, um radical heterociclo substituído, amino- alquila C1-C12, aminoalquila C1-C12 substituída ou um grupo protetor.
[0213] Porções açúcar bicíclicas adicionais são conhecidas na técnica, consulte, por exemplo: Freier et al., Nucleic Acids Research, 1997, 25(22), 4429-4443, Albaek et al., J. Org. Chem., 2006, 71, 7731- 7740, Singh et al., Chem. Commun., 1998, 4, 455-456; Koshkin et al., Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630; Wahlestedt et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2000, 97, 5633-5638; Kumar et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1998, 8, 2219-2222; Singh et al., J. Org. Chem., 1998, 63, 10035-
10039; Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc., 2007, 129, 8362-8379; Elayadi et al., Curr. Opinion Invens. Drugs, 2001, 2, 558-561; Braasch et al., Chem. Biol., 2001, 8, 1-7; Orum et al., Curr. Opinion Mol. Ther., 2001, 3, 239-243; Wengel et al., US 7.053.207, Imanishi et al., US
6.268.490, Imanishi et al. US 6.770.748, Imanishi et al., US RE44.779; Wengel et al., US 6.794.499, Wengel et al., US 6.670.461; Wengel et al., US 7.034.133, Wengel et al., US 8.080.644; Wengel et al., US
8.034.909; Wengel et al., US 8.153.365; Wengel et al., US 7.572.582; e Ramasamy et al., US 6.525.191, Torsten et al., WO 2004/106356, Wengel et al., WO 1999/014226; Seth et al., WO 2007/134181; Seth et al., US 7.547.684; Seth et al., US 7.666.854; Seth et al., US 8.088.746; Seth et al., US 7.750.131; Seth et al., US 8.030.467; Seth et al., US
8.268.980; Seth et al., US 8.546.556; Seth et al., US 8.530.640; Migawa et al., US 9.012.421; Seth et al., US 8.501.805; Allerson et al., US2008/0039618; e Migawa et al., US2015/0191727.
[0214] Em certas modalidades, as porções açúcar bicíclicas e os nucleosídeos que incorporam tais porções açúcar bicíclicas são adicionalmente definidas por uma configuração isomérica. Por exemplo, um nucleosídeo de LNA (aqui descrito) pode estar na configuração α-L ou na configuração β-D.
[0215] Nucleosídeos bicíclicos de α-L-metilenoxila (4'-CH2-O-2') ou α-L-LNA foram incorporados em oligonucleotídeos que mostraram atividade antissenso (Frieden et al., Nucleic Acids Research, 2003, 21, 6365-6372). Na presente invenção, as descrições gerais de nucleosídeos bicíclicos incluem ambas as configurações isoméricas. Quando as posições de nucleosídeos bicíclicos específicos (por exemplo, LNA ou cEt) são identificadas nas modalidades exemplificadas na presente invenção, elas estão na configuração β-D, exceto onde especificado em contrário.
[0216] Em certas modalidades, as porções açúcar modificadas compreendem um ou mais substituintes de açúcar não ligantes e um ou mais substituintes de açúcar ligantes (por exemplo, açúcares 5' substituídos e com ligação 4'-2').
[0217] Em certas modalidades, as porções açúcar modificadas são substitutos de açúcar. Em certas tais modalidades, o átomo de oxigênio da porção açúcar é substituído, por exemplo, por um átomo de enxofre, carbono ou nitrogênio. Em certas tais modalidades, tais porções açúcar modificadas também compreendem substituintes de ligação e/ou de não ligação, conforme descrito na presente invenção. Por exemplo, certos substitutos de açúcar compreendem um átomo de 4'-enxofre e uma substituição na posição 2' (consulte, por exemplo, Bhat et al., US
7.875.733 e Bhat et al., US 7.939.677) e/ou na posição 5'.
[0218] Em certas modalidades, os substitutos de açúcar compreendem anéis tendo diferente número de átomos além de 5. Por exemplo, em certas modalidades, um substituto de açúcar compreende uma tetra-hidropirano de seis membros ("THP"). Tais tetra-hidropiranos podem ser adicionalmente modificados ou substituídos. Os nucleosídeos que compreendem tais tetra-hidropiranos modificados incluem, mas não se limitam a, ácido nucleico de hexitol ("HNA"), ácido nucleico de anitol ("ANA"), ácido nucleico de manitol ("MNA") (consulte, por exemplo, Leumann, CJ. Bioorg. & Med. Chem. 2002, 10, 841-854), fluoro HNA:
("F-HNA", consulte, por exemplo, Swayze et al., US
8.088.904; Swayze et al., US 8.440.803; e Swayze et al., US 9.005.906) F-HNA pode também ser chamado de F-THP ou 3'-fluoro tetra- hidropirano, e nucleosídeos compreendendo compostos THP modificados adicionais tendo a seguinte fórmula: sendo que, independentemente, para cada um dos ditos nucleosídeos THP modificados: Bx é uma porção nucleobase; T3 e T4 são, cada um, independentemente, um grupo de ligação internucleosídica que liga o nucleosídeo THP modificado ao restante de um oligonucleotídeo, ou um dentre T3 e T4 é um grupo de ligação internucleosídica que liga o nucleosídeo THP modificado ao restante de um oligonucleotídeo e o outro dentre T3 e T4 é H, um grupo protetor hidroxila, um grupo conjugado ligado, ou um grupo terminal 5' ou 3'; q1, q2, q3, q4, q5, q6 e q7 são, cada um, independentemente, H, alquila C1-C6, alquila C1-C6 substituída, alquenila C2-C6, alquenila C2-C6 substituída, alquinila C2-C6, ou alquinila C2-C6 substituída; e cada um dentre R1 e R2 é independentemente selecionado dentre: hidrogênio,
halogênio, alcoxila substituído ou não substituído, NJ1J2, SJ1, N3, OC(=X)J1, OC(=X)NJ1J2, NJ3C(=X)NJ1J2, e CN, sendo que X é O, S ou NJ1, e cada J1, J2, e J3 é, independentemente, H ou alquila C1-C6.
[0219] Em certas modalidades, os nucleosídeos THP modificados são fornecidos em que q1, q2, q3, q4, q5, q6 e q7 são, cada um, H. Em certas modalidades, ao menos um dentre q1, q2, q3, q4, q5, q6 e q7 é diferente de H. em certas modalidades, ao menos um dentre q1, q2, q3, q4, q5, q6 e q7 é metila. Em certas modalidades, os nucleosídeos THP modificados são fornecidos em que um de R1 e R2 é F. em certas modalidades, R1 é F e R2 é H, em certas modalidades, R1 é metoxila e R2 é H, e em certas modalidades, R1 é metoxietoxila e R2 é H.
[0220] Em certas modalidades, os substitutos de açúcar compreendem anéis tendo mais de 5 átomos e mais de um heteroátomo. Por exemplo, nucleosídeos que compreendem porções açúcar morfolino e seu uso em oligonucleotídeos foram relatados (consulte, por exemplo, Braasch et al., Biochemistry, 2002, 41, 4503- 4510 e Summerton et al., US 5.698.685; Summerton et al., US
5.166.315; Summerton et al., US 5.185.444; e Summerton et al., US
5.034.506). Como usado aqui, o termo "morfolino" significa um substituto de açúcar que tem a seguinte estrutura: O Bx
O N
[0221] Em certas modalidades, os morfolinos podem ser modificados, por exemplo, pela adição ou alteração de vários grupos substituintes a partir da estrutura morfolino acima. Tais substitutos de açúcar são chamados na presente invenção de "morfolinos modificados".
[0222] Em certas modalidades, os substitutos de açúcar compreendem porções acíclicas. Exemplos de nucleosídeos e oligonucleotídeos compreendendo tais substitutos de açúcar acíclicos incluem, mas não se limitam a: ácido nucleico peptídico ("PNA"), ácido nucleico butílico acíclico (consulte, por exemplo, Kumar et al., Org. Biomol. Chem., 2013, 11, 5853-5865), e nucleosídeos e oligonucleotídeos descritos em Manoharan et al., US2013/130378.
[0223] Muitos outros sistemas de anéis substitutos de açúcar bicíclicos e tricíclicos são conhecidos na técnica que podem ser usados em nucleosídeos modificados.
2. Nucleobases Modificadas
[0224] Modificações ou substituições de nucleobases (ou base) são estruturalmente distinguíveis de, mas funcionalmente intercambiáveis com, nucleobases de ocorrência natural ou sintéticas não modificadas. As nucleobases naturais e as nucleobases modificadas são capazes de participar na ligação de hidrogênio. Tais modificações de nucleobase podem conferir estabilidade de nuclease, afinidade de ligação ou alguma outra propriedade biológica benéfica aos compostos antissenso.
[0225] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem oligonucleotídeos modificados. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos modificados compreendem um ou mais nucleosídeos compreendendo uma nucleobase não modificada. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos modificados compreendem um ou mais nucleosídeos que compreendem uma nucleobase modificada. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos modificados compreendem um ou mais nucleosídeos que não compreendem uma nucleobase, chamada de nucleosídeo abásico.
[0226] Em certas modalidades, as nucleobases modificadas são selecionadas dentre: pimidinas 5-substituídas, 6-azapirimidinas, pirimidinas substituídas por alquila ou alquinila, purinas substituídas por alquila, e purinas substituídas por N-2, N-6 e O-6. Em certas modalidades, as nucleobases modificadas são selecionadas dentre: 2- aminopropiladenina, 5-hidroximetilcitosina, 5-metilcitosina, xantina, hipoxantina, 2-aminoadenina, 6-N-metilguanina, 6-N-metiladenina, 2- propiladenina, 2-tiouracil, 2-tiotimina e 2-tiocitosina, 5-propinil (CC-CH3) uracil, 5-propinilcitosina, 6-azouracil, 6-azocitosina, 6-azotimina, 5- ribosiluracil (pseudouracil), 4-tiouracil, 8-halo, 8-amino, 8-tiol, 8- tioalquila, 8-hidroxila, 8-aza e outras purinas 8-substituídas, 5-halo, particularmente, 5-bromo, 5-trifluorometila, 5-halouracil e 5-halocitosina, 7-metilguanina, 7-metiladenina, 2-F-adenina, 2-aminoadenina, 7- deazaguanina, 7-deaza-adenina, 3-deazaguanina, 3-deaza-adenina, 6- N-benzoiladenina, 2-N-isobutirilguanina, 4-N-benzoilcitosina, 4-N- benzoiluracil, 5-metil-4-N-benzoilcitosina, 5-metil-4-N-benzoiluracil, bases universais, bases hidrofóbicas, bases promíscuas, bases de tamanho expandido e bases fluoradas. Nucleobases modificadas adicionais incluem pirimidinas tricíclicas, como 1,3-diazafenoxazina-2- ona, 1,3-diazafenotiazina-2-ona, e 9-(2-aminoetóxi)-1,3- diazafenoxazina-2-ona (G-clamp). As nucleobases modificadas podem também incluir aquelas nas quais a base de purina ou de pirimidina é substituída por outros heterociclos, por exemplo, 7-deaza-adenina, 7- deazaguanosina, 2-aminopiridina e 2-piridona. Nucleobases adicionais incluem as reveladas em Merigan et al., US 3.687.808, as reveladas em The Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engineering, Kroschwitz, J.I., Ed., John Wiley & Sons, 1990, 858-859; Englisch et al., Angewandte Chemie, International Edition, 1991, 30, 613; Sanghvi, Y.S., Capítulo 15, Antisense Research and Applications, Crooke, S.T. e Lebleu, B.,Eds., CRC Press, 1993, 273-288; e aqueles revelados nos capítulos 6 e 15, Antisense Drug Technology, Crooke S.T., Ed., CRC Press, 2008, 163-166 e 442-443.
[0227] Publicações que ensinam a preparação de certas nucleobases modificadas observadas acima, bem como outras nucleobases modificadas incluem sem limitação, Manoharan et al., US2003/0158403, Manoharan et al., US2003/0175906; Dinh et al., US
4.845.205; Spielvogel et al., US 5.130.302; Rogers et al., US 5.134.066; Bischofberger et al., US 5.175.273; Urdea et al., Urdea et al. 5.367.066; Benner et al., US 5.432.272; Matteucci et al., US 5.434.257; Gmeiner et al., US 5.457.187; Cook et al., US 5.459.255; Froehler et al., US
5.484.908; Matteucci et al., US 5.502.177; Hawkins et al., US 5.525.711; Haralambidis et al., US 5.552.540; Cook et al., US 5.587.469; Froehler et al., US 5.594.121; Switzer et al., US 5.596.091; Cook et al., US
5.614.617; Froehler et al., US 5.645.985; Cook et al., US 5.681.941; Cook et al., US 5.811.534; Cook et al., US 5.750.692; Cook et al., US
5.948.903; Cook et al., US 5.587.470; Cook et al., US 5.457.191; Matteucci et al., US 5.763.588; Froehler et al., US 5.830.653; Cook et al., US 5.808.027; Cook et al., US 6.166.199; e Matteucci et al., US
6.005.096.
[0228] Em certas modalidades, os compostos direcionados a um ácido nucleico de IRF5 compreendem uma ou mais nucleobases modificadas. Em certas modalidades, a nucleobase modificada é 5- metilcitosina. Em certas modalidades, cada citosina é uma 5-metilcitosina. Ligações Internucleosídicas Modificadas
[0229] A ligação internucleosídica de ocorrência natural de RNA e DNA é uma ligação fosfodiéster 3' a 5'. Em certas modalidades, os compostos aqui descritos tendo uma ou mais ligações internucleosídicas modificadas, isto é, que não de ocorrência natural são frequentemente selecionados em relação aos compostos tendo ligações internucleosídicas de ocorrência natural devido a propriedades desejáveis como, por exemplo, absorção celular intensificada, afinidade intensificada por ácidos nucleicos-alvo, e estabilidade aumentada na presença de nucleases.
[0230] As ligações internucleosídicas representativas tendo um centro quiral incluem, mas não se limitam a, alquilfosfonatos e fosforotioatos.
Os oligonucleotídeos modificados que compreendem ligações internucleosídicas tendo um centro quiral podem ser preparados como populações de oligonucleotídeos modificados compreendendo ligações internucleosídicas estereoaleatórias ou como populações de oligonucleotídeos modificados compreendendo ligações de fosforotioato em configurações estereoquímicas específicas.
Em certas modalidades, as populações de oligonucleotídeos modificados compreendem ligações internucleosídicas de fosforotioato em que todas as ligações internucleosídicas de fosforotioato são estereoaleatórias.
Tais oligonucleotídeos modificados podem ser gerados com o uso de métodos sintéticos que resultam na seleção aleatória da configuração estereoquímica de cada ligação de fosforotioato.
No entanto, como é bem compreendido pelos versados na técnica, cada fosforotioato individual de cada molécula de oligonucleotídeo individual tem uma estereoconfiguração definida.
Em certas modalidades, as populações de oligonucleotídeos modificados são enriquecidas para oligonucleotídeos modificados compreendendo uma ou mais ligações internucleosídicas de fosforotioato específicas em uma configuração estereoquímica específica, independentemente selecionada.
Em certas modalidades, a configuração específica da ligação de fosforotioato específica está presente em ao menos 65% das moléculas na população.
Em certas modalidades, a configuração específica da ligação de fosforotioato específica está presente em ao menos 70% das moléculas na população.
Em certas modalidades, a configuração específica da ligação de fosforotioato específica está presente em ao menos 80% das moléculas na população.
Em certas modalidades, a configuração específica da ligação de fosforotioato específica está presente em ao menos 90% das moléculas na população. Em certas modalidades, a configuração específica da ligação de fosforotioato específica está presente em ao menos 99% das moléculas na população. Tais populações quiralmente enriquecidas de oligonucleotídeos modificados podem ser geradas com o uso de métodos sintéticos conhecidos na técnica, por exemplo, os métodos descritos em Oka et al., JACS 125, 8307 (2003), Wan et al. Nuc. Acid. Res. 42, 13456 (2014) e WO 2017/015555. Em certas modalidades, uma população de oligonucleotídeos modificados é enriquecida para oligonucleotídeos modificados tendo ao menos um fosforotioato indicado na configuração (Sp). Em certas modalidades, uma população de oligonucleotídeos modificados é enriquecida para oligonucleotídeos modificados tendo ao menos um fosforotioato na configuração (Rp). Em certas modalidades, os oligonucleotídeos modificados compreendendo fosforotioatos (Rp) e/ou (Sp) compreendem uma ou mais das seguintes fórmulas, respectivamente, sendo que "B" indica uma nucleobase:
[0231] Exceto onde indicado em contrário, as ligações internucleosídicas quirais de oligonucleotídeos modificados aqui descritos podem ser estereoaleatórias ou em uma configuração estereoquímica específica.
[0232] Em certas modalidades, os compostos direcionados para um ácido nucleico de IRF5 compreendem uma ou mais ligação internucleosídica modificada. Em certas modalidades, as ligações internucleosídicas modificadas são ligações de fosforotioato. Em certas modalidades, cada ligação internucleosídica de um composto antissenso é uma ligação internucleosídica de fosforotioato.
[0233] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem oligonucleotídeos. Os oligonucleotídeos tendo ligações internucleosídicas modificadas incluem ligações internucleosídicas que retêm um átomo de fósforo bem como ligações internucleosídicas que não têm um átomo de fósforo. As ligações internucleosídicas contendo fósforo representativas incluem, mas não se limitam a, fosfodiésteres, fosfotriésteres, metilfosfonatos, fosforamidato e fosforotioatos. Os métodos de preparação de ligações contendo fósforo e não contendo fósforo são bem conhecidos.
[0234] Em certas modalidades, os nucleosídeos de oligonucleotídeos modificados podem ser ligados um ao outro por meio de qualquer ligação internucleosídica. As duas classes principais de grupos de ligação internucleosídica são definidas pela presença ou ausência de um átomo de fósforo. As ligações internucleosídicas contendo fósforo representativas incluem, mas não se limitam a, fosfatos, que contêm uma ligação fosfodiéster ("P=O") (também chamada de ligações não modificadas ou de ocorrência natural), fosfotriésteres, metilfosfonatos, fosforamidatos e fosforotioatos ("P=S") e fosforoditioatos ("HS-P=S"). Os grupos de ligação internucleosídica não contendo fósforo representativos incluem, mas não se limitam a, metilenometilimino (-CH2-N(CH3)-O-CH2), tiodiéster, tionocarbamato (-O-C(=O)(NH)-S-); siloxano (-O-SiH2-O-); e N,N'-dimetil-hidrazina (- CH2-N(CH3)-N(CH3)-). As ligações internucleosídicas modificadas, em comparação com as ligações de fosfato de ocorrência natural, podem ser usadas para alterar, tipicamente, aumentar, a resistência à nuclease do oligonucleotídeo. Em certas modalidades, as ligações internucleosídicas tendo um átomo quiral podem ser preparadas como uma mistura racêmica ou como enantiômeros separados. As ligações internucleosídicas quirais representativas incluem, mas não se limitam a, alquilfosfonatos e fosforotioatos. Os métodos de preparação de ligações internucleosídicas contendo fósforo e não contendo fósforo são bem conhecidos pelos versados na técnica.
[0235] As ligações internucleosídicas neutras incluem, mas não se limitam a, fosfotriésteres, metilfosfonatos, MMI (3'-CH2-N(CH3)-O-5'), amida-3 (3'-CH2-C(=O)-N(H)-5'), amida-4 (3'-CH2-N(H)-C(=O)-5'), formacetal (3'-O-CH2-O-5'), metoxipropila e tioformacetal (3'-S-CH2-O- 5'). As ligações internucleosídicas neutras adicionais incluem ligações não iônicas compreendendo siloxano (dialquilsiloxano), éster carboxilato, carboxamida, sulfeto, éster sulfonato e amidas (consulte, por exemplo: Carbohydrate Modifications in Antisense Research; Y. S. Sanghvi e P.D. Cook, Eds., ACS Symposium Series 580; Capítulos 3 e 4, 40-65). As ligações internucleosídicas neutras adicionais incluem ligações não iônicas compreendendo partes de componente N, O, S e CH2 misturadas.
[0236] Em certas modalidades, os oligonucleotídeos compreendem ligações internucleosídicas modificadas dispostas ao longo do oligonucleotídeo ou região do mesmo em um padrão ou motivo definido de ligação internucleosídica modificado. Em certas modalidades, as ligações internucleosídicas são dispostas em um motivo com lacuna. Em tais modalidades, as ligações internucleosídicas em cada uma das duas regiões de asa são diferentes das ligações internucleosídicas na região de lacuna. Em certas modalidades, as ligações internucleosídicas nas asas são fosfodiéster e as ligações internucleosídicas na lacuna são fosforotioato. O motivo de nucleosídeo é independentemente selecionado, de modo que tais oligonucleotídeos tendo um motivo de ligação internucleosídica com lacunas podem ou não ter um motivo de nucleosídeo com lacunas e, se têm um motivo de nucleosídeocleosídico com lacunas, os comprimentos de asa e lacuna podem ou não ser iguais.
[0237] Em certas modalidades, os oligonucleotídeos compreendem uma região tendo um motivo de ligação internucleosídica alternado. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos compreendem uma região de ligações internucleosídicas uniformemente modificadas. Em certas tais modalidades, o oligonucleotídeo compreende uma região que é uniformemente ligada por ligações internucleosídicas de fosforotioato. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo é uniformemente ligado por fosforotioato. Em certas modalidades, cada ligação internucleosídica do oligonucleotídeo é selecionada dentre fosfodiéster e fosforotioato. Em certas modalidades, cada ligação internucleosídica do oligonucleotídeo é selecionada dentre fosfodiéster e fosforotioato e ao menos uma ligação internucleosídica é fosforotioato.
[0238] Em certas modalidades, o oligonucleotídeo compreende ao menos 6 ligações internucleosídicas de fosforotioato. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo compreende ao menos 8 ligações internucleosídicas de fosforotioato. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo compreende ao menos 10 ligações internucleosídicas de fosforotioato. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo compreende ao menos um bloco de ao menos 6 ligações internucleosídicas de fosforotioato consecutivas. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo compreende ao menos um bloco de ao menos 8 ligações internucleosídicas de fosforotioato consecutivas. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo compreende ao menos um bloco de ao menos 10 ligações internucleosídicas de fosforotioato consecutivas. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo compreende ao menos um bloco de ao menos 12 ligações internucleosídicas de fosforotioato consecutivas. Em certas tais modalidades, ao menos um bloco está situado na extremidade 3' do oligonucleotídeo. Em certas tais modalidades, ao menos um bloco está situado dentro de 3 nucleosídeos da extremidade 3' do oligonucleotídeo.
[0239] Em certas modalidades, os oligonucleotídeos compreendem uma ou mais ligações de fosfonato de metila. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos tendo um motivo "gapmer" de nucleosídeo compreendem um motivo de ligação compreendendo todas as ligações de fosforotioato, exceto uma ou duas ligações de metilfosfonato. Em certas modalidades, uma ligação de fosfonato de metila está na lacuna central de um oligonucleotídeo tendo um motivo "gapmer" de nucleosídeo.
[0240] Em certas modalidades, é desejável dispor o número de ligações internucleosídicas de fosforotiato e ligações internucleosídicas de fosfodiéster para manter a resistência à nuclease. Em certas modalidades, é desejável dispor o número e a posição de ligações internucleosídicas de fosforotioato e o número e a posição de ligações internucleosídicas de fosfodiéster para manter a resistência à nuclease. Em certas modalidades, o número de ligações internucleosídicas de fosforotioato pode ser diminuído e o número de ligações internucleosídicas fosfodiéster pode ser aumentado. Em certas modalidades, o número de ligações internucleosídicas de fosforotioato pode ser diminuído e o número de ligações internucleosídicas de fosfodiéster pode ser aumentado enquanto ainda mantém a resistência à nuclease. Em certas modalidades, é desejável diminuir o número de ligações internucleosídicas de fosforotioato enquanto se retém a resistência da nuclease. Em certas modalidades, é desejável aumentar o número de ligações internucleosídicas de fosfodiéster enquanto se retém a resistência da nuclease.
3. Certos Motivos
[0241] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem oligonucleotídeos. Os oligonucleotídeos podem ter um motivo, por exemplo, um padrão de porções açúcar, nucleobases, e/ou ligações internucleosídicas modificadas e/não modificadas. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos modificados compreendem um ou mais nucleosídeos modificados compreendendo um açúcar modificado. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos modificados compreendem um ou mais nucleosídeos modificados compreendendo nucleobase modificada. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos modificados compreendem uma ou mais ligações internucleosídicas modificadas. Em tais modalidades, as porções açúcar, nucleobases e/ou ligações internucleosídicas modificadas, não modificadas e diferentemente modificadas de um oligonucleotídeo modificado definem um padrão ou motivo. Em certas modalidades, os padrões das porções açúcar, nucleobases e ligações internucleosídicas são, cada um, independentes uns dos outros. Dessa forma, um oligonucleotídeo modificado pode ser descrito por seu motivo de açúcar, motivo de nucleobase e/ou motivo de ligação internucleosídica (como usado aqui, o motivo de nucleobase descreve as modificações às nucleobases independentes da sequência de nucleobases). a. Certos Motivos de Açúcar
[0242] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem oligonucleotídeos. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos compreendem um ou mais tipos de açúcar modificado e/ou de porção açúcar não modificada dispostos ao longo do oligonucleotídeo ou região do mesmo em um padrão ou motivo de açúcar definidos. Em certos casos, tais motivos de açúcar incluem, mas não se limitam a, qualquer das modificações de açúcar discutidas na presente invenção.
[0243] Em certas modalidades, os oligonucleotídeos modificados compreendem ou consistem em uma região tendo um motivo "gapmer",
que compreende duas regiões externas ou "asas" e uma região central ou interna ou "lacuna". As três regiões de um motivo "gapmer" (a asa 5', a lacuna e a asa 3') formam uma sequência contígua de nucleosídeos, sendo que ao menos algumas das porções açúcar dos nucleosídeos de cada uma das asas diferem de ao menos algumas das porções açúcar dos nucleosídeos da lacuna. Especificamente, ao menos as porções açúcar dos nucleosídeos de cada asa que estão mais próximas da lacuna (o nucleosídeo mais 3' da asa 5' e o nucleosídeo mais 5' da asa 3') diferem da porção açúcar dos nucleosídeos de lacuna vizinhos, definindo assim o limite entre as asas e a lacuna (isto é, a junção asa/lacuna). Em certas modalidades, as porções açúcar dentro da lacuna são iguais entre si. Em certas modalidades, a lacuna inclui um ou mais nucleosídeos tendo uma porção açúcar que difere da porção açúcar de um ou mais outros nucleosídeos da lacuna. Em certas modalidades, os motivos de açúcar das duas asas são iguais entre si ("gapmer" simétrico). Em certas modalidades, o motivo de açúcar da asa 5' difere do motivo de açúcar da asa 3' ("gapmer" assimétrico).
[0244] Em certas modalidades, as asas de um "gapmer" compreendem 1 a 5 nucleosídeos. Em certas modalidades, as asas de um "gapmer" compreendem 2 a 5 nucleosídeos. Em certas modalidades, as asas de um "gapmer" compreendem 3 a 5 nucleosídeos. Em certas modalidades, os nucleosídeos de um "gapmer" são todos nucleosídeos modificados.
[0245] Em certas modalidades, a lacuna de um "gapmer" compreende 7 a 12 nucleosídeos. Em certas modalidades, a lacuna de um "gapmer" compreende 7 a 10 nucleosídeos. Em certas modalidades, a lacuna de um "gapmer" compreende 8 a 10 nucleosídeos. Em certas modalidades, a lacuna de um "gapmer" compreende 10 nucleosídeos. Em certas modalidades, cada nucleosídeo da lacuna de um "gapmer" é um 2'-desoxinucleosídeo não modificado.
[0246] Em certas modalidades, o "gapmer" é um desoxi "gapmer". Em tais modalidades, os nucleosídeos no lado da lacuna de cada junção de asa/lacuna são nucleosídeos 2'-desoxinucleosídeos não modificados e os nucleosídeos nos lados de asa de cada junção de asa/lacuna são nucleosídeos modificados. Em certas tais modalidades, cada nucleosídeo da lacuna é um 2'-desoxinucleosídeo não modificado. Em certas tais modalidades, cada nucleosídeo de cada asa é um nucleosídeo modificado.
[0247] Em certas modalidades, um oligonucleotídeo modificado tem um motivo de açúcar completamente modificado, sendo que cada nucleosídeo do oligonucleotídeo modificado compreende uma porção açúcar modificada. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos modificados compreendem ou consistem em uma região tendo um motivo de açúcar completamente modificado em que cada nucleosídeo da região compreende uma porção açúcar modificada. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos modificados compreendem ou consistem em uma região que tem um motivo de açúcar completamente modificado, em que cada nucleosídeo dentro da região completamente modificada compreende a mesma porção açúcar modificada, chamada na presente invenção de motivo de açúcar uniformemente modificado. Em certas modalidades, um oligonucleotídeo completamente modificado é um oligonucleotídeo uniformemente modificado. Em certas modalidades, cada nucleosídeo de oligonucleotídeo uniformemente modificado compreende a mesma 2'-modificação. b. Certos Motivos de Nucleobase
[0248] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem oligonucleotídeos. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos compreendem nucleobases modificadas e/ou não modificadas dispostas ao longo do oligonucleotídeo ou região do mesmo em um padrão ou motivo definido. Em certas modalidades, cada nucleobase é modificada. Em certas modalidades, nenhuma das nucleobases é modificada. Em certas modalidades, cada purina ou cada pirimidina é modificada. Em certas modalidades, cada adenina é modificada. Em certas modalidades, cada guanina é modificada. Em certas modalidades, cada timina é modificada. Em certas modalidades, cada uracil é modificada. Em certas modalidades, cada citosina é modificada. Em certas modalidades, algumas ou todas as nucleobases de citosina em um oligonucleotídeo modificado são 5-metilcitosinas.
[0249] Em certas modalidades, os oligonucleotídeos modificados compreendem um bloco de nucleobases modificadas. Em certas modalidades, o bloco está na extremidade 3' do oligonucleotídeo. Em certas modalidades, o bloco está dentro de 3 nucleosídeos da extremidade 3' do oligonucleotídeo. Em certas modalidades, o bloco está na extremidade 5' do oligonucleotídeo. Em certas modalidades, o bloco está dentro de 3 nucleosídeos da extremidade 5' do oligonucleotídeo.
[0250] Em certas modalidades, os oligonucleotídeos tendo um motivo "gapmer" compreendem um nucleosídeo compreendendo uma nucleobase modificada. Em certas tais modalidades, um nucleosídeo que compreende uma nucleobase modificada está na lacuna central de um oligonucleotídeo tendo um motivo "gapmer". Em certas tais modalidades, a porção açúcar do dito nucleosídeo é uma porção 2'- desoxirribosila. Em certas modalidades, a nucleobase modificada é selecionada dentre: uma 2-tiopirimidina e uma 5-propinopirimidina. c. Certos Motivos de Ligação Internucleosídica
[0251] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem oligonucleotídeos. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos compreendem ligações internucleosídicas modificadas e/ou não modificadas dispostas ao longo do oligonucleotídeo ou região do mesmo em um padrão ou motivo definido.
Em certas modalidades, essencialmente cada grupo de ligação internucleosídica é uma ligação internucleosídica de fosfato (P=O). Em certas modalidades, cada grupo de ligação internucleosídica de um oligonucleotídeo modificado é um fosforotioato (P=S). Em certas modalidades, cada grupo de ligação internucleosídica de um oligonucleotídeo modificado é independentemente selecionado a partir de uma ligação internucleosídica de fosforotioato e fosfato. Em certas modalidades, o motivo de açúcar de um oligonucleotídeo modificado é um "gapmer" e as ligações internucleosídicas dentro da lacuna são todas modificadas. Em certas tais modalidades, algumas ou todas as ligações internucleosídicas nas asas são ligações fosfato não modificadas. Em certas modalidades, as ligações internucleosídicas terminais são modificadas. Em certas modalidades, o motivo de açúcar de um oligonucleotídeo modificado é um "gapmer", e o motivo de ligação internucleosídica compreende ao menos uma ligação internucleosídica de fosfodiéster em ao menos uma asa, sendo que a ao menos uma ligação de fosfodiéster não é uma ligação internucleosídica terminal e as ligações internucleosídicas restantes são ligações internucleosídicas de fosforotioato. Em certas tais modalidades, todas as ligações de fosforotioato são estereoaleaórias. Em certas modalidades, todas as ligações de fosforotioato nas asas são fosforotioatos (Sp), e a lacuna compreende ao menos um motivo Sp, Sp, Rp. Em certas modalidades, as populações de oligonucleotídeos modificados são enriquecidas para oligonucleotídeos modificados que compreendem tais motivos de ligação internucleosídica.
4. Certos Oligonucleotídeos Modificados
[0252] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem oligonucleotídeos modificados. Em certas modalidades, as modificações acima (açúcar, nucleobase, ligação internucleosídica) são incorporadas em um oligonucleotídeo modificado. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos modificados são caracterizados por sua modificação, motivos e comprimentos gerais.
Em certas modalidades, tais parâmetros são, cada um, independentes um do outro.
Dessa forma, exceto onde indicado em contrário, cada ligação internucleosídica de um oligonucleotídeo tendo um motivo "gapmer" de açúcar pode ser modificada ou não modificada e pode ou não seguir o padrão "gapmer" de modificação das modificações de açúcar.
Por exemplo, as ligações internucleosídicas dentro das regiões de asa de um "gapmer" de açúcar podem ser iguais ou diferentes umas das outras e podem ser iguais ou diferentes das ligações internucleosídicas da região de lacuna do motivo de açúcar.
De modo semelhante, tais oligonucleotídeos "gapmer"s podem compreender uma ou mais nucleobases modificadas independentemente do padrão "gapmer" das modificações de açúcar.
Além disso, em certos casos, um oligonucleotídeo é descrito por um comprimento ou faixa geral e por comprimentos ou faixas de comprimentos de duas ou mais regiões (por exemplo, regiões de nucleosídeos tendo modificações de açúcar especificadas). Em tais circunstâncias, pode ser possível selecionar números para cada faixa que resultam em um oligonucleotídeo tendo um comprimento geral fora da faixa especificada.
Em tais circunstâncias, ambos os elementos precisam ser satisfeitos.
Por exemplo, em certas modalidades, um oligonucleotídeo modificado consiste em 15 a 20 nucleosídeos ligados e tem um motivo de açúcar que consiste em três regiões, A, B e C, sendo que a região A consiste em 2 a 6 nucleosídeos ligados tendo um motivo de açúcar especificado, a região B consiste em 6 a 10 nucleosídeos ligados tendo um motivo de açúcar especificado, e a região C consiste em 2 a 6 nucleosídeos ligados tendo um motivo de açúcar especificado.
Tais modalidades não incluem oligonucleotídeos modificados em que A e C consistem, cada um, em 6 nucleosídeos ligados e B consistem em 10 nucleosídeos ligados (embora esses números de nucleosídeos sejam permitidos dentro dos requisitos para A, B e C) porque o comprimento geral de tal oligonucleotídeo será 22, que excede o limite superior do comprimento geral do oligonucleotídeo modificado (20). Na presente invenção, se uma descrição de um oligonucleotídeo não menciona um ou mais parâmetros, tal parâmetro não é limitado. Dessa forma, um oligonucleotídeo modificado descrito apenas como tendo um motivo "gapmer" de açúcar sem descrição adicional pode ter qualquer comprimento, motivo de ligação internucleosídica e motivo de nucleobase. Exceto onde indicado em contrário, todas as modificações são independentes da sequência de nucleobases. Certos Compostos Conjugados
[0253] Em certas modalidades, os compostos aqui descritos compreendem ou consistem em um oligonucleotídeo (modificado ou não modificado) e, opcionalmente, um ou mais grupos conjugados e/ou grupos terminais. Os grupos conjugados consistem em uma ou mais porções conjugadas e um ligante conjugado que liga a porção conjugada ao oligonucleotídeo. Os grupos conjugados podem ser fixados a uma ou ambas as extremidades de um oligonucleotídeo e/ou em qualquer posição interna. Em certas modalidades, os grupos conjugados são fixados à posição 2' de um nucleosídeo de um oligonucleotídeo modificado. Em certas modalidades, os grupos conjugados que são fixados a uma ou ambas as extremidades de um oligonucleotídeo são grupos terminais. Em certas tais modalidades, grupos conjugados ou grupos terminais são fixados à extremidade 3' e/ou 5' de oligonucleotídeos. Em certas tais modalidades, os grupos conjugados (ou grupos terminais) são fixados à extremidade 3' dos oligonucleotídeos. Em certas modalidades, os grupos conjugados são fixados próximos à extremidade 3' dos oligonucleotídeos. Em certas modalidades, os grupos conjugados (ou grupos terminais) são fixados à extremidade 5' dos oligonucleotídeos. Em certas modalidades, os grupos conjugados são fixados próximos à extremidade 5' dos oligonucleotídeos.
[0254] Em certas modalidades, o oligonucleotídeo é modificado. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo de um composto tem uma sequência de nucleobases que é complementar a um ácido nucleico- alvo. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos são complementares a um RNA mensageiro (mRNA). Em certas modalidades, os oligonucleotídeos são complementares a um pre-mRNA. Em certas modalidades, os oligonucleotídeos são complementares a uma transcrição senso.
[0255] Exemplos de grupos terminais incluem, mas não se limitam a, grupos conjugados, grupos terminais, porções fosfato, grupos protetores, nucleosídeos modificados ou não modificados, e dois ou mais nucleosídeos que são independentemente modificados ou não modificados. Composições e Métodos para a Formulação de Composições Farmacêuticas
[0256] Os compostos aqui descritos podem ser misturados com substâncias ativas ou inertes farmaceuticamente aceitáveis para a preparação de composições ou formulações farmacêuticas. As composições e os métodos para a formulação de composições farmacêuticas dependem de vários critérios, incluindo, mas não se limitando a, via de administração, extensão da doença ou dose a ser administrada.
[0257] Certas modalidades fornecem composições farmacêuticas que compreendem um ou mais compostos ou um sal dos mesmos. Em certas modalidades, os compostos são compostos antissenso ou compostos oligoméricos. Em certas modalidades, os compostos compreendem ou consistem em um oligonucleotídeo modificado. Em certas tais modalidades, a composição farmacêutica compreende um diluente ou veículo farmaceuticamente aceitável adequado. Em certas modalidades, uma composição farmacêutica compreende uma solução salina estéril e um ou mais compostos. Em certas modalidades, tal composição farmacêutica consiste em uma solução salina estéril e um ou mais compostos. Em certas modalidades, a solução salina estéril é solução salina de grau farmacêutico. Em certas modalidades, uma composição farmacêutica compreende um ou mais compostos e água estéril. Em certas modalidades, uma composição farmacêutica consiste em um composto e água estéril. Em certas modalidades, a água estéril é água de grau farmacêutico. Em certas modalidades, uma composição farmacêutica compreende um ou mais compostos e solução salina tamponada com fosfato (PBS). Em certas modalidades, uma composição farmacêutica consiste em um ou mais compostos e PBS estéril. Em certas modalidades, a PBS estéril é PBS de grau farmacêutico. As composições e os métodos para a formulação de composições farmacêuticas dependem de vários critérios, incluindo, mas não se limitando a, via de administração, extensão da doença ou dose a ser administrada.
[0258] Um composto aqui descrito direcionado ao ácido nucleico de IRF5 pode ser usado em composições farmacêuticas pela combinação do composto com um diluente ou veículo farmaceuticamente aceitável adequado. Em certas modalidades, um diluente farmaceuticamente aceitável é água, como água estéril adequada para injeção. Conse- quentemente, em uma modalidade, usada nos métodos aqui descritos é uma composição farmacêutica que compreende um composto direcionado ao ácido nucleico de IRF5 e um diluente farmaceuticamente aceitável. Em certas modalidades, o diluente farmaceuticamente aceitável é água. Em certas modalidades, o composto compreende ou consiste em um oligonucleotídeo modificado aqui fornecido.
[0259] As composições farmacêuticas que compreendem os compostos aqui fornecidos abrangem quaisquer sais farmaceutica- mente aceitáveis, ésteres ou sais de tais ésteres, ou qualquer outro oligonucleotídeo que, após a administração a um animal, incluindo um ser humano, é capaz de fornecer (direta ou indiretamente) o metabólito biologicamente ativo ou resíduo do mesmo. Em certas modalidades, os compostos são compostos antissenso ou compostos oligoméricos. Em certas modalidades, o composto compreende ou consiste em um oligo- nucleotídeo modificado. Consequentemente, por exemplo, a revelação é também direcionada a sais farmaceuticamente aceitáveis de compostos, pró-fármacos, sais farmaceuticamente aceitáveis de tais pró-fármacos e outros bioequivalentes. Sais farmaceuticamente aceitá- veis adequados incluem, mas não se limitam a, sais de sódio e potássio.
[0260] Um pró-fármaco pode incluir a incorporação de nucleosídeos adicionais em uma ou ambas as extremidades de um composto que são clivadas por nucleases endógenas dentro do corpo, para formar o composto ativo.
[0261] Em certas modalidades, os compostos ou as composições compreendem um veículo ou diluente farmaceuticamente aceitável. Certos Compostos Selecionados
[0262] Aproximadamente 1.320 compostos recém-projetados de vários comprimentos, espécies químicas e motivos foram testados quanto ao seu efeito no mRNA de IRF5 humano in vitro em vários tipos de células (Exemplos 1 e 2). Dos 1.320 compostos testados quanto à potência em uma dose única in vitro, mais de 110 compostos selecionados foram testados quanto à inibição dose-dependente em células THP-1, bem como em células KARPAS-229 (Exemplo 3).
[0263] Esses oligonucleotídeos foram então testados quanto à tolerabilidade em modelos pré-clínicos de roedores (Exemplos 4 e 5). Pesos corporais e pesos dos órgãos, marcadores de função hepática
(como alanina transaminase, aspartato transaminase e bilirrubina), marcadores hematológicos (como níveis de hemoglobina e hematócrito, bem como contagens de células sanguíneas individuais) e marcadores de função renal (como BUN e creatinina) foram medidos. Dos mais de 110 compostos testados por ensaios de resposta à dosagem, 53 compostos foram adicionalmente triados quanto à tolerabilidade em um modelo de camundongo CD-1. Dezenove oligonucleotídeos foram triados adicionalmente no modelo de rato Sprague-Dawley.
[0264] Doze compostos foram então selecionados e testados em um modelo de xenoenxerto de camundongo, no qual os camundongos foram inoculados com células de linfoma de células humanas de linfoma não Hodgkin de grandes células (KARPAS-229) e tratados com os compostos (Exemplo 6). A eficácia e tolerabilidade dos compostos foram, então, testadas. Oito compostos foram então selecionados para serem testados quanto à eficácia em duas doses separadas em um modelo de camundongo transgênico de IRF5 (Exemplo 7).
[0265] IONs 729018, 728958, 785525, 785674, 785675, 786503, 786524 e 786548 foram testados quanto à tolerabilidade em macacos cinomolgos (Exemplo 8). O tratamento com os compostos foi bem tolerado nos macacos, particularmente o tratamento com ION 729018. Uma análise adicional foi feita com estes compostos, incluindo a medição da viscosidade, avaliação dos efeitos pró-inflamatórios e ensaios de confirmação da inibição dependente da dose.
[0266] Oligonucleotídeos modificados com diferentes modificações químicas foram também projetados sobrepondo-se às regiões-alvo de três compostos, IONs 729018, 786503 e 785675 (Exemplo 13). Esses compostos recém-projetados juntamente com os três oligonucleotídeos parentais foram testados em um ensaio de múltiplas doses. Muitos dos compostos recém-projetados demonstraram forte eficácia na inibição de IRF5.
[0267] Consequentemente, são aqui fornecidos compostos com qualquer uma ou mais das propriedades aprimoradas. Em certas modalidades, os compostos conforme descritos na presente invenção são potentes e toleráveis. Exemplos
[0268] Os exemplos abaixo descrevem o processo de triagem para identificar compostos-protótipos direcionados a IRF5. ION 728958, 729018, 785525, 785674, 785675, 786503, 786524 e 786548 resultaram em alta potência e tolerabilidade. Por exemplo, ION 729018 apresentou elevada potência e tolerabilidade. Revelação não Limitadora e Incorporação por Referência
[0269] Embora a listagem de sequências que acompanha este depósito identifique cada sequência como "RNA" ou "DNA" conforme necessário, essas sequências podem ser modificadas com qualquer combinação de modificações químicas. O versado na técnica compreenderá prontamente que tal desenhoação "RNA" ou "DNA" para descrever oligonucleotídeos modificados é, em certos casos, arbitrária. Por exemplo, um oligonucleotídeo compreendendo nucleosídeo compreendendo uma porção açúcar 2'-OH e uma base de timina poderia ser descrito como um DNA que tem um açúcar modificado (2'- OH para o 2'-H natural de DNA) ou como um RNA que tem uma base modificada (timina (uracil metilada) para uracil natural de RNA).
[0270] Consequentemente, as sequências de ácidos nucleicos aqui fornecidas, incluindo, mas não se limitando àquelas na listagem de sequências, destinam-se a abranger ácidos nucleicos contendo qualquer combinação de RNA e/ou DNA naturais ou modificados, incluindo, mas não se limitando a, tais ácidos nucleicos tendo nucleobases modificadas. A título de exemplo adicional e sem limitação, um oligonucleotídeo tendo a sequência de nucleobases "ATCGATCG" abrange quaisquer oligonucleotídeos tendo essa sequência de nucleobases, modificados ou não modificados, incluindo, mas não se limitando a, tais compostos compreendendo bases de RNA, como aquelas tendo a sequência "AUCGAUCG" e aquelas tendo algumas bases de DNA e algumas bases de RNA como "AUCGATCG" e compostos tendo outras nucleobases modificadas, como "ATmCGAUCG", em que m C indica uma base de citosina que compreende um grupo metila na posição 5.
[0271] Certos compostos aqui descritos (por exemplo, oligonucleotídeos modificados) têm um ou mais centros assimétricos e, dessa forma, dão origem a enantiômeros, diastereômeros e outras configurações estereoisoméricas que podem ser definidas, em termos de estereoquímica absoluta, como (R) ou (S), como α ou β, como anômeros de açúcar, ou como (D) ou (L), como aminoácidos, etc. Os compostos aqui fornecidos que são projetados ou descritos como tendo certas configurações estereoisoméricas incluem apenas os compostos indicados. Os compostos aqui fornecidos que são projetados ou descritos com estereoquímica indefinida incluem todos esses isômeros possíveis, incluindo suas formas estereoaleatórias e opticamente puras. De modo semelhante, todas as formas tautoméricas dos compostos aqui fornecidas estão incluídas, exceto onde indicado em contrário. Exceto onde indicado em contrário, os compostos oligoméricos e os oligonucleotídeos modificados aqui descritos destinam-se a incluir formas de sal correspondentes.
[0272] Os compostos aqui descritos incluem variações nas quais um ou mais átomos são substituídos por um isótopo não radioativo ou um isótopo radioativo do elemento indicado. Por exemplo, os compostos da presente invenção que compreendem átomos de hidrogênio abrangem todas as possíveis substituições de deutério para cada um dos átomos de hidrogênio 1H. As substituições isotópicas abrangidas pelos compostos da presente invenção incluem, mas não se limitam a:
H ou 3H no lugar de 1H, 13C ou 14C no lugar de 12C, 15N no lugar de 14N, 17 O ou 18O no lugar de 16O, e 33S, 34S, 35S, ou 36S no lugar de 32S.
[0273] Embora certos compostos, composições e métodos aqui descritos tenham sido descritos com especificidade de acordo com certas modalidades, os exemplos a seguir servem apenas para ilustrar os compostos aqui descritos e não se destinam a limitar os mesmos. Cada uma das referências citadas no presente pedido está aqui incorporada na presente invenção a título de referência em sua totalidade. Exemplo 1: Inibição antissenso de IRF5 humano em células THP-1 por "gapmer"s cEt
[0274] Os oligonucleotídeos modificados foram projetados para direcionar um ácido nucleico de IRF5 e foram testados quanto a seu efeito sobre os níveis de RNA de IRF5 in vitro. Os oligonucleotídeos modificados foram testados em uma série de experimentos que tinham condições de cultura similares. Os resultados para cada experimento são apresentados em tabelas separadas mostradas abaixo.
[0275] Os oligonucleotídeos recentemente modificados projetados nas tabelas abaixo foram projetados como "gapmer"s cEt 3-10-3. Os "gapmer"s têm 16 nucleosídeos de comprimento, sendo que o segmento de lacuna central compreende dez 2'-desoxinucleosídeos e é flanqueado por segmentos de asa na direção 5' e na direção 3' compreendendo cada três nucleosídeos. Cada nucleosídeo no segmento de asa 5' e cada nucleosídeo no segmento de asa 3' tem uma modificação de açúcar cEt. As ligações internucleosídicas de cada "gapmer" são ligações fosforotioato (P=S). Todos os resíduos de citosina em cada "gapmer" são 5-metilcitosinas.
[0276] "Sítio de início" indica o nucleosídeo mais 5' ao qual o "gapmer" é direcionado na sequência de genes humanos. "Sítio de parada" indica o nucleosídeo mais 3' ao qual o "gapmer" é direcionado na sequência de genes humanos. A maioria dos oligonucleotídeos modificados mostrados nas tabelas abaixo são direcionados a qualquer mRNA de IRF5 humano, desenhoado na presente invenção como SEQ ID Nº: 1 (número de acesso no GENBANK NM_001098627.3) ou à sequência genômica IRF5 humana, desenhoada aqui como SEQ ID Nº: 2 (número de acesso no GENBANK NT_007933.14 truncado a partir dos nucleotídeos 53761170 a 53774065). Além disso, um pequeno número de oligonucleotídeos modificados é direcionado para o mRNA de IRF5 desenhado na presente invenção como SEQ ID Nº: 3 (número de acesso do GENBANK NM_001098629.1). 'N/A' indica que o oligonucleotídeo modificado não direcionada aquela sequência gênica com 100% de complementaridade.
[0277] Células THP-1 cultivadas a uma densidade de 30.000 células por poço foram transfectadas com o uso de eletroporação com
2.000 nM de oligonucleotídeo modificado. Após um período de tratamento de aproximadamente 24 horas, o RNA foi isolado das células e os níveis de RNA de IRF5 foram medidos por RTPCR quantitativo em tempo real. O conjunto de sonda-primer humano HTS4167 (sequência direta GCCAAGGAGACAGGGAAATACA, desenhada na presente invenção como SEQ ID Nº: 11; sequência reversa GCAGGTTGGCCTTCCACTT; desenhada na presente invenção como SEQ ID Nº: 12; sequência de sonda CGAAGGCGTGGATGAAGCCGATC, desenhada na presente invenção como SEQ ID Nº: 13) foi usado para medir os níveis de RNA. Os níveis de RNA de IRF5 foram ajustados de acordo com o teor total de RNA, conforme medido por RIBOGREEN®. Os resultados são apresentados como porcentagem de inibição de IRF5 em relação às células de controle não tratadas. Como usado na presente invenção, um valor de '0' indica que o tratamento com o oligonucleotídeo modificado não inibiu os níveis de mRNA de IRF5. 'N.D.' indica que a % de inibição não é definida para aquele oligonucleotídeo modificado naquele experimento.
A atividade desse oligonucleotídeo modificado pode ser definida em um experimento diferente.
Tabela 1 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2 SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) ID Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665773 N/A N/A 4534 4549 GGTTCATGGCAGAGGG 46 37
665775 N/A N/A 4545 4560 TGGGATGGACTGGTTC 35 38
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 70 39
728374 N/A N/A 402 417 CCGCCAACCTGCCGGG 3 40
728375 N/A N/A 404 419 GTCCGCCAACCTGCCG 0 41
728376 N/A N/A 408 423 GCCGGTCCGCCAACCT 12 42
728377 N/A N/A 410 425 CCGCCGGTCCGCCAAC 0 43
728378 N/A N/A 412 427 TCCCGCCGGTCCGCCA 7 44
728379 N/A N/A 414 429 CCTCCCGCCGGTCCGC 7 45
728380 N/A N/A 416 431 CGCCTCCCGCCGGTCC 18 46
728381 N/A N/A 418 433 TGCGCCTCCCGCCGGT 9 47
728382 N/A N/A 430 445 CTCTGCCCAGGCTGCG 17 48
728383 N/A N/A 440 455 CCAAGCTGAGCTCTGC 29 49
728384 N/A N/A 442 457 GACCAAGCTGAGCTCT 22 50
728385 N/A N/A 445 460 CGGGACCAAGCTGAGC 17 51
728386 N/A N/A 447 462 GGCGGGACCAAGCTGA 0 52
728387 N/A N/A 450 465 GGCGGCGGGACCAAGC 6 53
728388 N/A N/A 459 474 CACCGGCCGGGCGGCG 0 54
728389 N/A N/A 461 476 AGCACCGGCCGGGCGG 0 55
728390 N/A N/A 463 478 GGAGCACCGGCCGGGC 9 56
728391 N/A N/A 466 481 CAGGGAGCACCGGCCG 15 57
728392 N/A N/A 468 483 GCCAGGGAGCACCGGC 0 58
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) ID Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728393 N/A N/A 470 485 GCGCCAGGGAGCACCG 4 59
728394 N/A N/A 472 487 CTGCGCCAGGGAGCAC 4 60
728395 N/A N/A 474 489 GGCTGCGCCAGGGAGC N.D. 61
728396 N/A N/A 476 491 GTGGCTGCGCCAGGGA 8 62
728397 N/A N/A 492 507 TCTGCGGTGCGCCTGC 25 63
728398 N/A N/A 494 509 TGTCTGCGGTGCGCCT 31 64
728401 210 225 4535 4550 TGGTTCATGGCAGAGG 50 65
728402 211 226 4536 4551 CTGGTTCATGGCAGAG 44 66
728403 213 228 4538 4553 GACTGGTTCATGGCAG 25 67
728404 214 229 4539 4554 GGACTGGTTCATGGCA 32 68
728405 216 231 4541 4556 ATGGACTGGTTCATGG 49 69
728406 217 232 4542 4557 GATGGACTGGTTCATG 42 70
728407 218 233 4543 4558 GGATGGACTGGTTCAT 47 71
728408 219 234 4544 4559 GGGATGGACTGGTTCA 53 72
728409 223 238 4548 4563 CACTGGGATGGACTGG 40 73
728410 225 240 4550 4565 GCCACTGGGATGGACT 16 74
728411 227 242 4552 4567 GAGCCACTGGGATGGA 40 75
728412 253 268 4578 4593 CAGCCGCACGCGGCGG 6 76
728413 255 270 4580 4595 TTCAGCCGCACGCGGC 44 77
728414 257 272 4582 4597 GCTTCAGCCGCACGCG 27 78
728415 259 274 4584 4599 GGGCTTCAGCCGCACG 8 79
728416 284 299 4609 4624 AGCTGTTCACCTGGGC 5 80
728417 286 301 4611 4626 GCAGCTGTTCACCTGG 3 81
728418 288 303 4613 4628 TGGCAGCTGTTCACCT 0 82
728419 290 305 4615 4630 ACTGGCAGCTGTTCAC 5 83
728420 292 307 4617 4632 GTACTGGCAGCTGTTC 0 84
728421 294 309 4619 4634 GGGTACTGGCAGCTGT 9 85
728422 296 311 4621 4636 CTGGGTACTGGCAGCT 0 86
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) ID Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728423 298 313 4623 4638 CCCTGGGTACTGGCAG 24 87
728424 300 315 4625 4640 AGCCCTGGGTACTGGC 0 88
728425 302 317 4627 4642 GAAGCCCTGGGTACTG 0 89
728426 304 319 4629 4644 TTGAAGCCCTGGGTAC 11 90
728427 306 321 4631 4646 CATTGAAGCCCTGGGT 13 91
728428 308 323 4633 4648 CCCATTGAAGCCCTGG 15 92
728429 310 325 4635 4650 GACCCATTGAAGCCCT 14 93
728430 312 327 4637 4652 TTGACCCATTGAAGCC 11 94
728431 314 329 4639 4654 CGTTGACCCATTGAAG 0 95
728432 316 331 4641 4656 CCCGTTGACCCATTGA 25 96
728433 318 333 4643 4658 TCCCCGTTGACCCATT 6 97
728434 320 335 4645 4660 TTTCCCCGTTGACCCA 20 98
728435 322 337 4647 4662 CTTTTCCCCGTTGACC 12 99
728436 324 339 4649 4664 TTCTTTTCCCCGTTGA 13 100
728437 326 341 4651 4666 ATTTCTTTTCCCCGTT 7 101
728438 328 343 4653 4668 TAATTTCTTTTCCCCG 19 102
728439 356 371 4681 4696 TTGTGGCATGCCTCCA 25 103
728440 358 373 4683 4698 CCTTGTGGCATGCCTC 31 104
728441 360 375 4685 4700 TGCCTTGTGGCATGCC 7 105
728442 362 377 4687 4702 CATGCCTTGTGGCATG 5 106
728443 364 379 4689 4704 ACCATGCCTTGTGGCA 5 107
728444 366 381 4691 4706 GGACCATGCCTTGTGG 6 108
728445 368 383 4693 4708 TGGGACCATGCCTTGT 10 109
728446 371 386 4696 4711 GGCTGGGACCATGCCT 0 110
728447 377 392 4702 4717 CGTCCTGGCTGGGACC 2 111
728448 380 395 4705 4720 CTCCGTCCTGGCTGGG 18 112
Tabela 2 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2 SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) ID Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665795 385 400 4710 4725 GTTATCTCCGTCCTGG 58 113
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 75 39
728449 381 396 4706 4721 TCTCCGTCCTGGCTGG 2 114
728450 382 397 4707 4722 ATCTCCGTCCTGGCTG 3 115
728451 383 398 4708 4723 TATCTCCGTCCTGGCT 0 116
728452 384 399 4709 4724 TTATCTCCGTCCTGGC 11 117
728453 386 401 4711 4726 TGTTATCTCCGTCCTG 14 118
728454 387 402 4712 4727 GTGTTATCTCCGTCCT 27 119
728455 388 403 4713 4728 GGTGTTATCTCCGTCC 18 120
728456 389 404 4714 4729 TGGTGTTATCTCCGTC 31 121
728457 390 405 4715 4730 ATGGTGTTATCTCCGT 17 122
728458 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC 50 123
728459 394 409 4719 4734 GAAGATGGTGTTATCT 14 124
728460 396 411 4721 4736 TTGAAGATGGTGTTAT 15 125
728461 398 413 4723 4738 CCTTGAAGATGGTGTT 29 126
728462 400 415 N/A N/A GGCCTTGAAGATGGTG 4 127
728492 490 505 8383 8398 CTTGTTAAGGGCACAG 26 128
728493 491 506 8384 8399 TCTTGTTAAGGGCACA 30 129
728494 492 507 8385 8400 CTCTTGTTAAGGGCAC 45 130
728495 494 509 8387 8402 GGCTCTTGTTAAGGGC 17 131
728496 496 511 8389 8404 CCGGCTCTTGTTAAGG 5 132
728497 498 513 8391 8406 TCCCGGCTCTTGTTAA 14 133
728498 500 515 8393 8408 AGTCCCGGCTCTTGTT 57 134
728499 502 517 8395 8410 GAAGTCCCGGCTCTTG 45 135
728500 504 519 8397 8412 CGGAAGTCCCGGCTCT 43 136
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) ID Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728501 506 521 8399 8414 GGCGGAAGTCCCGGCT 13 137
728502 508 523 8401 8416 GAGGCGGAAGTCCCGG 35 138
728503 510 525 8403 8418 ATGAGGCGGAAGTCCC 23 139
728504 512 527 8405 8420 AGATGAGGCGGAAGTC 21 140
728505 514 529 8407 8422 GTAGATGAGGCGGAAG 29 141
728506 538 553 8431 8446 AGGTGGCATGTCCCGG 41 142
728507 540 555 8433 8448 TGAGGTGGCATGTCCC 40 143
728508 542 557 8435 8450 GCTGAGGTGGCATGTC 33 144
728509 544 559 8437 8452 GGGCTGAGGTGGCATG 44 145
728510 546 561 8439 8454 TAGGGCTGAGGTGGCA 41 146
728511 552 567 8445 8460 ATCTTGTAGGGCTGAG 29 147
728512 554 569 8447 8462 AGATCTTGTAGGGCTG 45 148
728513 556 571 8449 8464 GTAGATCTTGTAGGGC 36 149
728514 572 587 8465 8480 CATTGGAGCAGACCTC 0 150
728515 574 589 8467 8482 GCCATTGGAGCAGACC 13 151
728516 576 591 8469 8484 GGGCCATTGGAGCAGA 15 152
728517 578 593 8471 8486 CAGGGCCATTGGAGCA 15 153
728518 580 595 8473 8488 AGCAGGGCCATTGGAG 13 154
728519 582 597 8475 8490 GGAGCAGGGCCATTGG 24 155
728520 591 606 N/A N/A GAGTCTGTGGGAGCAG 35 156
728521 614 629 8973 8988 AAGAGTAATCCTCAGG 22 157
728522 616 631 8975 8990 AAAAGAGTAATCCTCA 0 158
728523 618 633 8977 8992 CCAAAAGAGTAATCCT 6 159
728524 620 635 8979 8994 CACCAAAAGAGTAATC 1 160
Tabela 3 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2 SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) ID Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 75 39
665985 1981 1996 11546 11561 CTCCTATACAGCTAGG 49 161
665987 1993 2008 11558 11573 CTTAGGCAATTCCTCC 50 162
666005 2159 2174 11724 11739 CTAAGTGCTCACTCAT 64 163
666007 2183 2198 11748 11763 AGCCTTGAGCATCTGA 63 164
666009 2186 2201 11751 11766 GCCAGCCTTGAGCATC 50 165
728956 1977 1992 11542 11557 TATACAGCTAGGCCCC 32 166
728957 1978 1993 11543 11558 CTATACAGCTAGGCCC 43 167
728958 1979 1994 11544 11559 CCTATACAGCTAGGCC 68 168
728959 1980 1995 11545 11560 TCCTATACAGCTAGGC 39 169
728960 1982 1997 11547 11562 CCTCCTATACAGCTAG 48 170
728961 1983 1998 11548 11563 TCCTCCTATACAGCTA 46 171
728962 1984 1999 11549 11564 TTCCTCCTATACAGCT 60 172
728963 1985 2000 11550 11565 ATTCCTCCTATACAGC 35 173
728964 1986 2001 11551 11566 AATTCCTCCTATACAG 28 174
728965 1988 2003 11553 11568 GCAATTCCTCCTATAC 61 175
728966 1989 2004 11554 11569 GGCAATTCCTCCTATA 60 176
728967 1992 2007 11557 11572 TTAGGCAATTCCTCCT 51 177
728968 1994 2009 11559 11574 CCTTAGGCAATTCCTC 64 178
728969 1995 2010 11560 11575 CCCTTAGGCAATTCCT 68 179
728970 1996 2011 11561 11576 ACCCTTAGGCAATTCC 77 180
728971 1998 2013 11563 11578 CCACCCTTAGGCAATT 46 181
728972 2000 2015 11565 11580 GGCCACCCTTAGGCAA 62 182
728973 2003 2018 11568 11583 GTGGGCCACCCTTAGG 58 183
728974 2006 2021 11571 11586 AGAGTGGGCCACCCTT 33 184
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) ID Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728975 2008 2023 11573 11588 CAAGAGTGGGCCACCC 45 185
728976 2010 2025 11575 11590 CACAAGAGTGGGCCAC 37 186
728977 2012 2027 11577 11592 ATCACAAGAGTGGGCC 52 187
728978 2014 2029 11579 11594 CAATCACAAGAGTGGG 59 188
728979 2016 2031 11581 11596 GGCAATCACAAGAGTG 47 189
728980 2033 2048 11598 11613 GTTGCCAGAGGAAATG 13 190
728981 2035 2050 11600 11615 TTGTTGCCAGAGGAAA 15 191
728982 2037 2052 11602 11617 TTTTGTTGCCAGAGGA 19 192
728983 2040 2055 11605 11620 GGCTTTTGTTGCCAGA 17 193
728984 2047 2062 11612 11627 ACACTCTGGCTTTTGT 11 194
728985 2049 2064 11614 11629 CAACACTCTGGCTTTT 0 195
728986 2051 2066 11616 11631 CACAACACTCTGGCTT 44 196
728987 2059 2074 11624 11639 ACTTGGCCCACAACAC 9 197
728988 2061 2076 11626 11641 GGACTTGGCCCACAAC 29 198
728989 2086 2101 11651 11666 CATGCCCTGCAGAGGC 44 199
728990 2095 2110 11660 11675 AATCAGGGCCATGCCC 0 200
728991 2097 2112 11662 11677 GAAATCAGGGCCATGC 9 201
728992 2106 2121 11671 11686 CAAACCAGGGAAATCA 26 202
728993 2108 2123 11673 11688 CTCAAACCAGGGAAAT 51 203
728994 2110 2125 11675 11690 GTCTCAAACCAGGGAA 63 204
728995 2112 2127 11677 11692 GAGTCTCAAACCAGGG 61 205
728996 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG 71 206
728997 2117 2132 11682 11697 GAAGTGAGTCTCAAAC 58 207
728998 2119 2134 11684 11699 AGGAAGTGAGTCTCAA 68 208
728999 2121 2136 11686 11701 TGAGGAAGTGAGTCTC 20 209
729000 2141 2156 11706 11721 TATCTCAGAGGACAGG 63 210
729001 2143 2158 11708 11723 ATTATCTCAGAGGACA 67 211
729002 2145 2160 11710 11725 ATATTATCTCAGAGGA 61 212
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) ID Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729003 2148 2163 11713 11728 CTCATATTATCTCAGA 64 213
729004 2152 2167 11717 11732 CTCACTCATATTATCT 50 214
729005 2154 2169 11719 11734 TGCTCACTCATATTAT 20 215
729006 2155 2170 11720 11735 GTGCTCACTCATATTA 53 216
729007 2156 2171 11721 11736 AGTGCTCACTCATATT 38 217
729008 2157 2172 11722 11737 AAGTGCTCACTCATAT 44 218
729009 2158 2173 11723 11738 TAAGTGCTCACTCATA 45 219
729010 2160 2175 11725 11740 CCTAAGTGCTCACTCA 63 220
729011 2161 2176 11726 11741 ACCTAAGTGCTCACTC 64 221
729012 2162 2177 11727 11742 TACCTAAGTGCTCACT 34 222
729013 2163 2178 11728 11743 ATACCTAAGTGCTCAC 56 223
729014 2164 2179 11729 11744 GATACCTAAGTGCTCA 60 224
729015 2166 2181 11731 11746 ATGATACCTAAGTGCT 57 225
729016 2168 2183 11733 11748 ATATGATACCTAAGTG 53 226
729017 2170 2185 11735 11750 TGATATGATACCTAAG 46 227
729018 2172 2187 11737 11752 TCTGATATGATACCTA 71 228
729019 2174 2189 11739 11754 CATCTGATATGATACC 63 229
729020 2176 2191 11741 11756 AGCATCTGATATGATA 65 230
729021 2178 2193 11743 11758 TGAGCATCTGATATGA 60 231
729022 2179 2194 11744 11759 TTGAGCATCTGATATG 37 232
729023 2180 2195 11745 11760 CTTGAGCATCTGATAT 36 233
729024 2181 2196 11746 11761 CCTTGAGCATCTGATA 56 234
729025 2182 2197 11747 11762 GCCTTGAGCATCTGAT 54 235
729026 2185 2200 11750 11765 CCAGCCTTGAGCATCT 51 236
729027 2187 2202 11752 11767 TGCCAGCCTTGAGCAT 14 237
Tabela 4 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665830 680 695 9499 9514 TGAGGCTCAGGCTTGG 65 238
715 730 9755 9770 665840 CGGCTGCAGAGTGGGC 43 239 760 775 9800 9815
717 732 9757 9772 665842 GGCGGCTGCAGAGTGG 43 240 762 777 9802 9817
718 733 9758 9773 665843 GGGCGGCTGCAGAGTG 53 241 763 778 9803 9818
720 735 9760 9775 665845 GTGGGCGGCTGCAGAG 43 242 750 765 9790 9805
721 736 9761 9776 665846 AGTGGGCGGCTGCAGA 28 243 751 766 9791 9806
722 737 9762 9777 665847 GAGTGGGCGGCTGCAG 24 244 752 767 9792 9807
724 739 9764 9779 665848 CAGAGTGGGCGGCTGC 40 245 754 769 9794 9809
725 740 9765 9780 665853 GCAGAGTGGGCGGCTG 11 246 755 770 9795 9810
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 72 39
728525 622 637 8981 8996 TGCACCAAAAGAGTAA 22 247
728526 624 639 8983 8998 CCTGCACCAAAAGAGT 31 248
728527 626 641 8985 9000 CTCCTGCACCAAAAGA 39 249
728528 628 643 8987 9002 CTCTCCTGCACCAAAA 31 250
728529 663 678 9482 9497 AACATCCTCTGCAGCT 29 251
728530 666 681 9485 9500 GGCAACATCCTCTGCA 36 252
728531 668 683 9487 9502 TTGGCAACATCCTCTG 45 253
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728532 670 685 9489 9504 GCTTGGCAACATCCTC 53 254
728533 672 687 9491 9506 AGGCTTGGCAACATCC 66 255
728534 675 690 9494 9509 CTCAGGCTTGGCAACA 42 256
728535 678 693 9497 9512 AGGCTCAGGCTTGGCA 60 257
728536 681 696 9500 9515 GTGAGGCTCAGGCTTG 44 258
728537 682 697 9501 9516 TGTGAGGCTCAGGCTT 34 259
728538 684 699 N/A N/A TCTGTGAGGCTCAGGC 41 260
728544 N/A N/A 9690 9705 CAGACTGCACTGCATC 29 261
728545 N/A N/A 9692 9707 GCCAGACTGCACTGCA 8 262
728546 N/A N/A 9694 9709 GGGCCAGACTGCACTG 28 263
728547 N/A N/A 9711 9726 AATAGGGTGTCATGTG 6 264
728548 N/A N/A 9713 9728 AGAATAGGGTGTCATG 0 265
728549 N/A N/A 9715 9730 AAAGAATAGGGTGTCA 17 266
728550 N/A N/A 9717 9732 GTAAAGAATAGGGTGT 14 267
728551 N/A N/A 9719 9734 GAGTAAAGAATAGGGT 24 268
728552 N/A N/A 9721 9736 TTGAGTAAAGAATAGG 12 269
728553 N/A N/A 9723 9738 CTTTGAGTAAAGAATA 8 270
728554 N/A N/A 9725 9740 CTCTTTGAGTAAAGAA 0 271
728555 N/A N/A 9727 9742 TCCTCTTTGAGTAAAG 14 272
728556 N/A N/A 9729 9744 CATCCTCTTTGAGTAA 21 273
728557 N/A N/A 9731 9746 GACATCCTCTTTGAGT 11 274
728558 N/A N/A 9733 9748 TTGACATCCTCTTTGA 32 275
728559 N/A N/A 9735 9750 ACTTGACATCCTCTTT 16 276
728560 699 714 9739 9754 GGCCACTTGACATCCT 6 277
728561 701 716 9741 9756 GCGGCCACTTGACATC 31 278
728562 703 718 9743 9758 GGGCGGCCACTTGACA 13 279
728563 705 720 9745 9760 GTGGGCGGCCACTTGA 40 280
728564 707 722 9747 9762 GAGTGGGCGGCCACTT 12 281
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728565 709 724 9749 9764 CAGAGTGGGCGGCCAC 38 282
728566 711 726 9751 9766 TGCAGAGTGGGCGGCC 21 283
728567 726 741 9766 9781 CGCAGAGTGGGCGGCT 18 284
728568 727 742 9767 9782 CCGCAGAGTGGGCGGC 17 285
728569 731 746 9771 9786 GCGGCCGCAGAGTGGG 4 286
728570 733 748 9773 9788 AGGCGGCCGCAGAGTG 20 287
728571 735 750 9775 9790 GTAGGCGGCCGCAGAG 14 288
728572 737 752 9777 9792 GAGTAGGCGGCCGCAG 11 289
728573 739 754 9779 9794 CAGAGTAGGCGGCCGC 25 290
728574 741 756 9781 9796 TGCAGAGTAGGCGGCC 12 291
728575 743 758 9783 9798 GCTGCAGAGTAGGCGG 44 292
728576 745 760 9785 9800 CGGCTGCAGAGTAGGC 37 293
728577 747 762 9787 9802 GGCGGCTGCAGAGTAG 45 294
728578 756 771 9796 9811 TGCAGAGTGGGCGGCT 9 295
728579 764 779 9804 9819 CGGGCGGCTGCAGAGT 61 296
728580 765 780 9805 9820 ACGGGCGGCTGCAGAG 28 297
728581 767 782 9807 9822 CCACGGGCGGCTGCAG 17 298
728582 768 783 9808 9823 ACCACGGGCGGCTGCA 29 299
728583 769 784 9809 9824 CACGGGCGGCTGC 26 300
728584 771 786 9811 9826 AGCACCACGGGCGGCT 7 301
728585 773 788 9813 9828 CCAGCACCACGGGCGG 41 302
728586 775 790 9815 9830 ACCCAGCACCACGGGC 19 303
728587 777 792 9817 9832 GGACCCAGCACCACGG 41 304
728588 830 845 9870 9885 AGCCAGCAGGGTTGCC 26 305
728589 832 847 9872 9887 GAAGCCAGCAGGGTTG 16 306
728590 834 849 9874 9889 CTGAAGCCAGCAGGGT 26 307
728591 845 860 9885 9900 AGAGAAGCTCCCTGAA 8 308
728592 849 864 9889 9904 TCAGAGAGAAGCTCCC 3 309
Tabela 5 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) ID Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
642685 1098 1113 10331 10346 AAGCGCACTTGCTCCA 33 310
665862 913 928 9953 9968 GTCTGGCAGGAGCTGT 51 311
665878 1096 1111 10329 10344 GCGCACTTGCTCCAGG 58 312
665884 1181 1196 10414 10429 GGATGAGCCCGCGGTC 56 313
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 76 39
728593 853 868 9893 9908 GACCTCAGAGAGAAGC 10 314
728594 862 877 9902 9917 AGGCTCCAGGACCTCA 7 315
728595 902 917 9942 9957 GCTGTTCGCCTGCAGG 59 316
728596 904 919 9944 9959 GAGCTGTTCGCCTGCA 14 317
728597 906 921 9946 9961 AGGAGCTGTTCGCCTG 4 318
728598 908 923 9948 9963 GCAGGAGCTGTTCGCC 44 319
728599 909 924 9949 9964 GGCAGGAGCTGTTCGC 30 320
728600 910 925 9950 9965 TGGCAGGAGCTGTTCG 15 321
728601 911 926 9951 9966 CTGGCAGGAGCTGTTC 34 322
728602 912 927 9952 9967 TCTGGCAGGAGCTGTT 33 323
728603 914 929 9954 9969 GGTCTGGCAGGAGCTG 49 324
728604 915 930 9955 9970 AGGTCTGGCAGGAGCT 60 325
728605 916 931 9956 9971 CAGGTCTGGCAGGAGC 53 326
728606 918 933 9958 9973 AGCAGGTCTGGCAGGA 35 327
728607 922 937 9962 9977 GATCAGCAGGTCTGGC 17 328
728608 924 939 9964 9979 CTGATCAGCAGGTCTG 34 329
728609 926 941 9966 9981 GGCTGATCAGCAGGTC 38 330
728610 945 960 N/A N/A GTCAGAGGCAGCATGT 24 331
728611 947 962 N/A N/A CGGTCAGAGGCAGCAT 54 332
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) ID Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728612 949 964 N/A N/A GTCGGTCAGAGGCAGC 44 333
728613 952 967 N/A N/A CAGGTCGGTCAGAGGC 47 334
728614 954 969 N/A N/A TCCAGGTCGGTCAGAG 24 335
728615 1001 1016 10234 10249 TGATGGTGAGGGCCCG 18 336
728616 1003 1018 10236 10251 GCTGATGGTGAGGGCC 14 337
728617 1005 1020 10238 10253 TTGCTGATGGTGAGGG 37 338
728618 1024 1039 10257 10272 GAGCCGGCAGCCATGG 13 339
728619 1032 1047 10265 10280 CTGTAGAAGAGCCGGC 0 340
728620 1034 1049 10267 10282 GGCTGTAGAAGAGCCG 0 341
728621 1036 1051 10269 10284 CTGGCTGTAGAAGAGC 21 342
728622 1038 1053 10271 10286 AGCTGGCTGTAGAAGA 9 343
728623 1040 1055 10273 10288 CCAGCTGGCTGTAGAA 5 344
728624 1067 1082 10300 10315 AGAGTTCCACCTGCTC 23 345
728625 1069 1084 10302 10317 GAAGAGTTCCACCTGC 14 346
728626 1072 1087 10305 10320 GCCGAAGAGTTCCACC 22 347
728627 1074 1089 10307 10322 GGGCCGAAGAGTTCCA 13 348
728628 1091 1106 10324 10339 CTTGCTCCAGGCTTAT 24 349
728629 1093 1108 10326 10341 CACTTGCTCCAGGCTT 46 350
728630 1094 1109 10327 10342 GCACTTGCTCCAGGCT 66 351
728631 1095 1110 10328 10343 CGCACTTGCTCCAGGC 62 352
728632 1097 1112 10330 10345 AGCGCACTTGCTCCAG 55 353
728633 1099 1114 10332 10347 GAAGCGCACTTGCTCC 43 354
728634 1100 1115 10333 10348 GGAAGCGCACTTGCTC 57 355
728635 1101 1116 10334 10349 GGGAAGCGCACTTGCT 59 356
728636 1117 1132 10350 10365 GATGTCCTCAGGGCTG 22 357
728637 1134 1149 10367 10382 CGCTGCTTGTCACTGG 67 358
728638 1161 1176 10394 10409 ACATCCAGCAGCTGGT 0 359
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) ID Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728639 1163 1178 10396 10411 GGACATCCAGCAGCTG 8 360
728640 1170 1185 10403 10418 CGGTCCAGGACATCCA 32 361
728641 1172 1187 10405 10420 CGCGGTCCAGGACATC 47 362
728642 1174 1189 10407 10422 CCCGCGGTCCAGGACA 11 363
728643 1176 1191 10409 10424 AGCCCGCGGTCCAGGA 20 364
728644 1177 1192 10410 10425 GAGCCCGCGGTCCAGG 48 365
728645 1179 1194 10412 10427 ATGAGCCCGCGGTCCA 44 366
728646 1180 1195 10413 10428 GATGAGCCCGCGGTCC 59 367
728647 1182 1197 10415 10430 AGGATGAGCCCGCGGT 49 368
728648 1183 1198 10416 10431 GAGGATGAGCCCGCGG 36 369
728649 1184 1199 10417 10432 GGAGGATGAGCCCGCG 14 370
728650 1185 1200 10418 10433 TGGAGGATGAGCCCGC 27 371
728651 1186 1201 10419 10434 CTGGAGGATGAGCCCG 17 372
728652 1188 1203 10421 10436 AGCTGGAGGATGAGCC 0 373
728653 1190 1205 10423 10438 GTAGCTGGAGGATGAG 13 374
728654 1192 1207 10425 10440 CTGTAGCTGGAGGATG 3 375
728655 1194 1209 10427 10442 CCCTGTAGCTGGAGGA 4 376
728656 1196 1211 10429 10444 GGCCCTGTAGCTGGAG 24 377
728657 1198 1213 10431 10446 CTGGCCCTGTAGCTGG 9 378
728658 1201 1216 10434 10449 GTCCTGGCCCTGTAGC 25 379
728659 1203 1218 10436 10451 AGGTCCTGGCCCTGTA 43 380
728660 1205 1220 10438 10453 AAAGGTCCTGGCCCTG 23 381
728661 1207 1222 10440 10455 ATAAAGGTCCTGGCCC 10 382
728662 1209 1224 10442 10457 GCATAAAGGTCCTGGC 31 383
728663 1211 1226 10444 10459 TGGCATAAAGGTCCTG 46 384
728664 1213 1228 10446 10461 GATGGCATAAAGGTCC 42 385
728665 1215 1230 10448 10463 CGGATGGCATAAAGGT 39 386
Tabela 6 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665892 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA 68 387
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 65 39
665894 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG 42 388
665895 1242 1257 10475 10490 CTCCAGAACACCTTGC 44 389
665900 1272 1287 10505 10520 CATGAGTCATGGGCTG 54 390
665902 1301 1316 10534 10549 TCTTGACCTCCCGCTG 37 391
665903 1309 1324 10542 10557 AAGCTTGGTCTTGACC 49 392
665908 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG 66 393
728666 1217 1232 10450 10465 GGCGGATGGCATAAAG 32 394
728667 1223 1238 10456 10471 GACACAGGCGGATGGC 49 395
728668 1224 1239 10457 10472 TGACACAGGCGGATGG 27 396
728669 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT 51 397
728670 1230 1245 10463 10478 TTGCACTGACACAGGC 68 398
728671 1231 1246 10464 10479 CTTGCACTGACACAGG 42 399
728672 1232 1247 10465 10480 CCTTGCACTGACACAG 56 400
728673 1233 1248 10466 10481 ACCTTGCACTGACACA 60 401
728674 1234 1249 10467 10482 CACCTTGCACTGACAC 57 402
728675 1237 1252 10470 10485 GAACACCTTGCACTGA 34 403
728676 1238 1253 10471 10486 AGAACACCTTGCACTG 39 404
728677 1239 1254 10472 10487 CAGAACACCTTGCACT 25 405
728678 1240 1255 10473 10488 CCAGAACACCTTGCAC 30 406
728679 1241 1256 10474 10489 TCCAGAACACCTTGCA 39 407
728680 1243 1258 10476 10491 GCTCCAGAACACCTTG 39 408
728681 1244 1259 10477 10492 CGCTCCAGAACACCTT 59 409
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728682 1245 1260 10478 10493 CCGCTCCAGAACACCT 37 410
728683 1246 1261 10479 10494 CCCGCTCCAGAACACC 41 411
728684 1247 1262 10480 10495 GCCCGCTCCAGAACAC 19 412
728685 1249 1264 10482 10497 AGGCCCGCTCCAGAAC 24 413
728686 1251 1266 10484 10499 CAAGGCCCGCTCCAGA 28 414
728687 1253 1268 10486 10501 CACAAGGCCCGCTCCA 16 415
728688 1255 1270 10488 10503 GGCACAAGGCCCGCTC 12 416
728689 1257 1272 10490 10505 GAGGCACAAGGCCCGC 17 417
728690 1259 1274 10492 10507 CTGAGGCACAAGGCCC 13 418
728691 1264 1279 10497 10512 ATGGGCTGAGGCACAA 42 419
728692 1267 1282 10500 10515 GTCATGGGCTGAGGCA 51 420
728693 1268 1283 10501 10516 AGTCATGGGCTGAGGC 52 421
728694 1269 1284 10502 10517 GAGTCATGGGCTGAGG 59 422
728695 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGGCTGAG 67 423
728696 1271 1286 10504 10519 ATGAGTCATGGGCTGA 75 424
728697 1273 1288 10506 10521 GCATGAGTCATGGGCT 23 425
728698 1274 1289 10507 10522 GGCATGAGTCATGGGC 47 426
728699 1296 1311 10529 10544 ACCTCCCGCTGGATGG 45 427
728700 1297 1312 10530 10545 GACCTCCCGCTGGATG 38 428
728701 1298 1313 10531 10546 TGACCTCCCGCTGGAT 53 429
728702 1299 1314 10532 10547 TTGACCTCCCGCTGGA 38 430
728703 1300 1315 10533 10548 CTTGACCTCCCGCTGG 33 431
728704 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT 56 432
728705 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC 71 433
728706 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC 73 434
728707 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC 79 435
728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT 79 436
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728709 1310 1325 10543 10558 AAAGCTTGGTCTTGAC 46 437
728710 1311 1326 10544 10559 AAAAGCTTGGTCTTGA 29 438
728711 1312 1327 10545 10560 GAAAAGCTTGGTCTTG 24 439
728712 1313 1328 10546 10561 TGAAAAGCTTGGTCTT 11 440
728713 1314 1329 10547 10562 CTGAAAAGCTTGGTCT 13 441
728714 1316 1331 10549 10564 GGCTGAAAAGCTTGGT 11 442
728715 1318 1333 10551 10566 CAGGCTGAAAAGCTTG 1 443
728716 1320 1335 10553 10568 TCCAGGCTGAAAAGCT 5 444
728717 1340 1355 N/A N/A TGAGCTCATTGAGAAA 10 445
728718 1342 1357 N/A N/A GATGAGCTCATTGAGA 33 446
728719 1344 1359 N/A N/A AGGATGAGCTCATTGA 55 447
728720 1346 1361 N/A N/A ACAGGATGAGCTCATT 41 448
728721 1348 1363 N/A N/A GAACAGGATGAGCTCA 45 449
728722 1350 1365 10671 10686 TGGAACAGGATGAGCT 47 450
728723 1358 1373 10679 10694 GGCCCTTTTGGAACAG 29 451
728724 1359 1374 10680 10695 TGGCCCTTTTGGAACA 34 452
728725 1360 1375 10681 10696 CTGGCCCTTTTGGAAC 20 453
728726 1361 1376 10682 10697 TCTGGCCCTTTTGGAA 14 454
728727 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA 33 455
728728 1364 1379 10685 10700 TGGTCTGGCCCTTTTG 56 456
728729 1365 1380 10686 10701 TTGGTCTGGCCCTTTT 54 457
728730 1366 1381 10687 10702 GTTGGTCTGGCCCTTT 53 458
728731 1367 1382 10688 10703 TGTTGGTCTGGCCCTT 50 459
728732 1368 1383 10689 10704 GTGTTGGTCTGGCCCT 47 460
728733 1386 1401 10707 10722 ATCTCGAAGGGTGGTG 40 461
728734 1389 1404 10710 10725 AAGATCTCGAAGGGTG 52 462
728735 1392 1407 10713 10728 AAGATCTCGAAGG 28 463
Tabela 7 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 73 39
665925 1506 1521 11071 11086 GATAGCTCCCCTGAGA 29 464
665926 1512 1527 11077 11092 GACCAAGATAGCTCCC 50 465
665929 1530 1545 11095 11110 AGCCGGATACTATCAG 49 466
665930 1536 1551 11101 11116 ATCTGTAGCCGGATAC 39 467
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 62 468
728736 1394 1409 10715 10730 AGAAGATCTCGAA 13 469
728737 1396 1411 10717 10732 GCAGAAGAAGATCTCG 45 470
728738 1419 1434 10740 10755 CGGTCAGGCCATTCTT 52 471
728739 1421 1436 10742 10757 TGCGGTCAGGCCATTC 68 472
728740 1423 1438 10744 10759 TTTGCGGTCAGGCCAT 37 473
728741 1426 1441 10747 10762 GGGTTTGCGGTCAGGC 71 474
728742 1441 1456 10762 10777 GAGCTTCTTCTCTCGG 22 475
728743 1443 1458 10764 10779 ATGAGCTTCTTCTCTC 0 476
728744 1445 1460 10766 10781 TAATGAGCTTCTTCTC 14 477
728745 1447 1462 10768 10783 AGTAATGAGCTTCTTC 36 478
728746 1449 1464 10770 10785 ACAGTAATGAGCTTCT 30 479
728747 1451 1466 10772 10787 GTACAGTAATGAGCTT 26 480
728748 1453 1468 10774 10789 CTGTACAGTAATGAGC 37 481
728749 1455 1470 10776 10791 ACCTGTACAGTAATGA 28 482
728750 1457 1472 N/A N/A CCACCTGTACAGTAAT 27 483
728751 1459 1474 N/A N/A CACCTGTACAGTA 42 484
728752 1461 1476 N/A N/A GGCACCACCTGTACAG 27 485
728753 1463 1478 N/A N/A CAGGCACCACCTGTAC 53 486
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728754 1465 1480 N/A N/A TACAGGCACCACCTGT 0 487
728755 1467 1482 11032 11047 GCTACAGGCACCACCT 37 488
728756 1469 1484 11034 11049 CTGCTACAGGCACCAC 53 489
728757 1471 1486 11036 11051 AGCTGCTACAGGCACC 41 490
728758 1473 1488 11038 11053 CGAGCTGCTACAGGCA 54 491
728759 1475 1490 11040 11055 GTCGAGCTGCTACAGG 63 492
728760 1477 1492 11042 11057 CAGTCGAGCTGCTACA 34 493
728761 1479 1494 11044 11059 AGCAGTCGAGCTGCTA 3 494
728762 1481 1496 11046 11061 GCAGCAGTCGAGCTGC 13 495
728763 1483 1498 11048 11063 CAGCAGCAGTCGAGCT 16 496
728764 1485 1500 11050 11065 TCCAGCAGCAGTCGAG 23 497
728765 1487 1502 11052 11067 TCTCCAGCAGCAGTCG 30 498
728766 1489 1504 11054 11069 CATCTCCAGCAGCAGT 31 499
728767 1492 1507 11057 11072 GAACATCTCCAGCAGC 47 500
728768 1495 1510 11060 11075 TGAGAACATCTCCAGC 33 501
728769 1497 1512 11062 11077 CCTGAGAACATCTCCA 60 502
728770 1499 1514 11064 11079 CCCCTGAGAACATCTC 43 503
728771 1501 1516 11066 11081 CTCCCCTGAGAACATC 42 504
728772 1502 1517 11067 11082 GCTCCCCTGAGAACAT 55 505
728773 1503 1518 11068 11083 AGCTCCCCTGAGAACA 54 506
728774 1504 1519 11069 11084 TAGCTCCCCTGAGAAC 29 507
728775 1505 1520 11070 11085 ATAGCTCCCCTGAGAA 15 508
728776 1507 1522 11072 11087 AGATAGCTCCCCTGAG 42 509
728777 1508 1523 11073 11088 AAGATAGCTCCCCTGA 52 510
728778 1509 1524 11074 11089 CAAGATAGCTCCCCTG 64 511
728779 1510 1525 11075 11090 CCAAGATAGCTCCCCT 50 512
728780 1511 1526 11076 11091 ACCAAGATAGCTCCCC 21 513
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728781 1513 1528 11078 11093 TGACCAAGATAGCTCC 43 514
728782 1514 1529 11079 11094 CTGACCAAGATAGCTC 51 515
728783 1515 1530 11080 11095 GCTGACCAAGATAGCT 23 516
728784 1516 1531 11081 11096 AGCTGACCAAGATAGC 31 517
728785 1517 1532 11082 11097 CAGCTGACCAAGATAG 34 518
728786 1519 1534 11084 11099 ATCAGCTGACCAAGAT 28 519
728787 1521 1536 11086 11101 CTATCAGCTGACCAAG 48 520
728788 1523 1538 11088 11103 TACTATCAGCTGACCA 49 521
728789 1525 1540 11090 11105 GATACTATCAGCTGAC 58 522
728790 1526 1541 11091 11106 GGATACTATCAGCTGA 51 523
728791 1527 1542 11092 11107 CGGATACTATCAGCTG 55 524
728792 1528 1543 11093 11108 CCGGATACTATCAGCT 41 525
728793 1529 1544 11094 11109 GCCGGATACTATCAGC 68 526
728794 1531 1546 11096 11111 TAGCCGGATACTATCA 40 527
728795 1532 1547 11097 11112 GTAGCCGGATACTATC 48 528
728796 1533 1548 11098 11113 TGTAGCCGGATACTAT 34 529
728797 1534 1549 11099 11114 CTGTAGCCGGATACTA 52 530
728798 1535 1550 11100 11115 TCTGTAGCCGGATACT 53 531
728799 1537 1552 11102 11117 GATCTGTAGCCGGATA 46 532
728800 1538 1553 11103 11118 AGATCTGTAGCCGGAT 67 533
728801 1543 1558 11108 11123 GTTTGAGATCTGTAGC 55 534
728802 1556 1571 11121 11136 CTTTGAGGTCTGGGTT 63 535
728803 1557 1572 11122 11137 TCTTTGAGGTCTGGGT 55 536
728804 1558 1573 11123 11138 GTCTTTGAGGTCTGGG 61 537
728805 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG 58 538
728806 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG 74 539
728807 1562 1577 11127 11142 TGCGGTCTTTGAGGTC 58 540
Tabela 8 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2 SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 72 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 62 468
665942 1613 1628 11178 11193 ACCGCTGCTGGGACTG 40 541
728808 1563 1578 11128 11143 ATGCGGTCTTTGAGGT 37 542
728809 1564 1579 11129 11144 CATGCGGTCTTTGAGG 17 543
728810 1565 1580 11130 11145 CCATGCGGTCTTTGAG 43 544
728811 1566 1581 11131 11146 ACCATGCGGTCTTTGA 26 545
728812 1568 1583 11133 11148 CCACCATGCGGTCTTT 9 546
728813 1570 1585 11135 11150 CTCCACCATGCGGTCT 22 547
728814 1572 1587 11137 11152 TGCTCCACCATGCGGT 23 548
728815 1574 1589 11139 11154 ATTGCTCCACCATGCG 0 549
728816 1576 1591 11141 11156 GAATTGCTCCACCATG 0 550
728817 1578 1593 11143 11158 TTGAATTGCTCCACCA 0 551
728818 1580 1595 11145 11160 CCTTGAATTGCTCCAC 0 552
728819 1582 1597 11147 11162 CTCCTTGAATTGCTCC 0 553
728820 1584 1599 11149 11164 AGCTCCTTGAATTGCT 0 554
728821 1586 1601 11151 11166 GGAGCTCCTTGAATTG 0 555
728822 1588 1603 11153 11168 ATGGAGCTCCTTGAAT 2 556
728823 1590 1605 11155 11170 TGATGGAGCTCCTTGA 0 557
728824 1592 1607 11157 11172 TGTGATGGAGCTCCTT 0 558
728825 1594 1609 11159 11174 GATGTGATGGAGCTCC 30 559
728826 1596 1611 11161 11176 CAGATGTGATGGAGCT 27 560
728827 1600 1615 11165 11180 CTGCCAGATGTGATGG 7 561
728828 1602 1617 11167 11182 GACTGCCAGATGTGAT 0 562
728829 1604 1619 11169 11184 GGGACTGCCAGATGTG 31 563
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728830 1606 1621 11171 11186 CTGGGACTGCCAGATG 40 564
728831 1608 1623 11173 11188 TGCTGGGACTGCCAGA 24 565
728832 1609 1624 11174 11189 CTGCTGGGACTGCCAG 19 566
728833 1610 1625 11175 11190 GCTGCTGGGACTGCCA 24 567
728834 1612 1627 11177 11192 CCGCTGCTGGGACTGC 37 568
728835 1614 1629 11179 11194 AACCGCTGCTGGGACT 19 569
728836 1616 1631 11181 11196 GCAACCGCTGCTGGGA 38 570
728837 1618 1633 11183 11198 CTGCAACCGCTGCTGG 26 571
728838 1620 1635 11185 11200 GGCTGCAACCGCTGCT 2 572
728839 1624 1639 11189 11204 CACAGGCTGCAACCGC 26 573
728840 1626 1641 11191 11206 GCCACAGGCTGCAACC 21 574
728841 1628 1643 11193 11208 GGGCCACAGGCTGCAA 37 575
728842 1650 1665 11215 11230 AGGCCTGCTCCAGGAG 0 576
728843 1654 1669 11219 11234 ACCAAGGCCTGCTCCA 30 577
728844 1656 1671 11221 11236 ACACCAAGGCCTGCTC 41 578
728845 1659 1674 11224 11239 CCAACACCAAGGCCTG 8 579
728846 1661 1676 11226 11241 GGCCAACACCAAGGCC 0 580
728847 1663 1678 11228 11243 CTGGCCAACACCAAGG 18 581
728848 1666 1681 11231 11246 CCCCTGGCCAACACCA 0 582
728849 1668 1683 11233 11248 GGCCCCTGGCCAACAC 0 583
728850 1670 1685 11235 11250 AGGGCCCCTGGCCAAC 21 584
728851 1676 1691 11241 11256 TAGGCCAGGGCCCCTG 0 585
728852 1678 1693 11243 11258 CATAGGCCAGGGCCCC 0 586
728853 1680 1695 11245 11260 TGCATAGGCCAGGGCC 0 587
728854 1682 1697 11247 11262 GGTGCATAGGCCAGGG 0 588
728855 1684 1699 11249 11264 TGGGTGCATAGGCCAG 0 589
728856 1687 1702 11252 11267 AGCTGGGTGCATAGGC 0 590
728857 1690 1705 11255 11270 GCCAGCTGGGTGCATA 15 591
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728858 1693 1708 11258 11273 CATGCCAGCTGGGTGC 28 592
728859 1695 1710 11260 11275 TGCATGCCAGCTGGGT 32 593
728860 1697 1712 11262 11277 ATTGCATGCCAGCTGG 34 594
728861 1699 1714 11264 11279 TTATTGCATGCCAGCT 19 595
728862 1701 1716 11266 11281 TGTTATTGCATGCCAG 35 596
728863 1703 1718 11268 11283 CTTGTTATTGCATGCC 51 597
728864 1705 1720 11270 11285 GCCTTGTTATTGCATG 16 598
728865 1707 1722 11272 11287 CAGCCTTGTTATTGCA 3 599
728866 1709 1724 11274 11289 TGCAGCCTTGTTATTG 0 600
728867 1711 1726 11276 11291 TCTGCAGCCTTGTTAT 0 601
728868 1713 1728 11278 11293 CGTCTGCAGCCTTGTT 43 602
728869 1715 1730 11280 11295 ACCGTCTGCAGCCTTG 51 603
728870 1717 1732 11282 11297 TCACCGTCTGCAGCCT 14 604
728871 1719 1734 11284 11299 AGTCACCGTCTGCAGC 36 605
728872 1721 1736 11286 11301 CCAGTCACCGTCTGCA 57 606
728873 1723 1738 11288 11303 GGCCAGTCACCGTCTG 6 607
728874 1725 1740 11290 11305 AGGGCCAGTCACCGTC 28 608
728875 1727 1742 11292 11307 CCAGGGCCAGTCACCG 30 609
728876 1731 1746 11296 11311 GAAGCCAGGGCCAGTC 30 610
728877 1742 1757 11307 11322 CCGCCACCCAGGAAGC 30 611
728878 1744 1759 11309 11324 CACCGCCACCCAGGAA 9 612
728879 1746 1761 11311 11326 CGCACCGCCACCCAGG 46 613
728880 1748 1763 11313 11328 TCCGCACCGCCACCCA 29 614
728881 1749 1764 11314 11329 GTCCGCACCGCCACCC 30 615
728882 1750 1765 11315 11330 AGTCCGCACCGCCACC 27 616
728883 1751 1766 11316 11331 CAGTCCGCACCGCCAC 56 617
Tabela 9 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2 SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 74 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 60 468
665962 1753 1768 11318 11333 ATCAGTCCGCACCGCC 53 618
665964 1765 1780 11330 11345 TCACATCTCCACATCA 36 619
665973 1903 1918 11468 11483 AGACCAGAGACAGCCC 30 620
665975 1911 1926 11476 11491 GGCTGACCAGACCAGA 40 621
665981 1951 1966 11516 11531 GAGTTCTTTCCCTGCT 41 622
728884 1752 1767 11317 11332 TCAGTCCGCACCGCCA 46 623
728885 1754 1769 11319 11334 CATCAGTCCGCACCGC 23 624
728886 1755 1770 11320 11335 ACATCAGTCCGCACCG 48 625
728887 1756 1771 11321 11336 CACATCAGTCCGCACC 57 626
728888 1757 1772 11322 11337 CCACATCAGTCCGCAC 37 627
728889 1758 1773 11323 11338 TCCACATCAGTCCGCA 24 628
728890 1760 1775 11325 11340 TCTCCACATCAGTCCG 33 629
728891 1761 1776 11326 11341 ATCTCCACATCAGTCC 56 630
728892 1762 1777 11327 11342 CATCTCCACATCAGTC 37 631
728893 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT 56 632
728894 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG 65 633
728895 1766 1781 11331 11346 GTCACATCTCCACATC 47 634
728896 1767 1782 11332 11347 TGTCACATCTCCACAT 21 635
728897 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA 46 636
728898 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC 73 637
728899 1770 1785 11335 11350 GGCTGTCACATCTCCA 64 638
728900 1786 1801 11351 11366 GCCAGGTGCTCATCGG 37 639
728901 1788 1803 11353 11368 CAGCCAGGTGCTCATC 37 640
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728902 1790 1805 11355 11370 GCCAGCCAGGTGCTCA 42 641
728903 1803 1818 11368 11383 GTAGGACCCTGCAGCC 31 642
728904 1805 1820 11370 11385 AGGTAGGACCCTGCAG 6 643
728905 1807 1822 11372 11387 AGAGGTAGGACCCTGC 60 644
728906 1810 1825 11375 11390 CCCAGAGGTAGGACCC 42 645
728907 1812 1827 11377 11392 AACCCAGAGGTAGGAC 32 646
728908 1814 1829 11379 11394 GAAACCCAGAGGTAGG 44 647
728909 1825 1840 11390 11405 TCCACTTCCAGGAAAC 25 648
728910 1833 1848 11398 11413 GGCCCAAATCCACTTC 11 649
728911 1835 1850 11400 11415 TTGGCCCAAATCCACT 9 650
728912 1837 1852 11402 11417 TCTTGGCCCAAATCCA 22 651
728913 1839 1854 11404 11419 CTTCTTGGCCCAAATC 15 652
728914 1841 1856 11406 11421 TCCTTCTTGGCCCAAA 31 653
728915 1859 1874 11424 11439 CTCGGGCCTTTCTCCC 2 654
728916 1861 1876 11426 11441 GGCTCGGGCCTTTCTC 10 655
728917 1884 1899 11449 11464 AGAGAAAGGCCCGGGA 0 656
728918 1886 1901 11451 11466 GGAGAGAAAGGCCCGG 0 657
728919 1898 1913 11463 11478 AGAGACAGCCCAGGAG 13 658
728920 1901 1916 11466 11481 ACCAGAGACAGCCCAG 52 659
728921 1902 1917 11467 11482 GACCAGAGACAGCCCA 42 660
728922 1904 1919 11469 11484 CAGACCAGAGACAGCC 38 661
728923 1905 1920 11470 11485 CCAGACCAGAGACAGC 17 662
728924 1906 1921 11471 11486 ACCAGACCAGAGACAG 30 663
728925 1907 1922 11472 11487 GACCAGACCAGAGACA 14 664
728926 1908 1923 11473 11488 TGACCAGACCAGAGAC 7 665
728927 1910 1925 11475 11490 GCTGACCAGACCAGAG 26 666
728928 1912 1927 11477 11492 AGGCTGACCAGACCAG 14 667
728929 1916 1931 11481 11496 AGCCAGGCTGACCAGA 13 668
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
728930 1919 1934 11484 11499 GAGAGCCAGGCTGACC 26 669
728931 1923 1938 11488 11503 TCCCGAGAGCCAGGCT 26 670
728932 1925 1940 11490 11505 TTTCCCGAGAGCCAGG 26 671
728933 1928 1943 11493 11508 GAATTTCCCGAGAGCC 34 672
728934 1930 1945 11495 11510 CTGAATTTCCCGAGAG 33 673
728935 1932 1947 11497 11512 GGCTGAATTTCCCGAG 39 674
728936 1934 1949 11499 11514 ATGGCTGAATTTCCCG 39 675
728937 1936 1951 11501 11516 TCATGGCTGAATTTCC 36 676
728938 1938 1953 11503 11518 GCTCATGGCTGAATTT 30 677
728939 1940 1955 11505 11520 CTGCTCATGGCTGAAT 40 678
728940 1942 1957 11507 11522 CCCTGCTCATGGCTGA 51 679
728941 1946 1961 11511 11526 CTTTCCCTGCTCATGG 45 680
728942 1947 1962 11512 11527 TCTTTCCCTGCTCATG 54 681
728943 1948 1963 11513 11528 TTCTTTCCCTGCTCAT 16 682
728944 1949 1964 11514 11529 GTTCTTTCCCTGCTCA 56 683
728945 1950 1965 11515 11530 AGTTCTTTCCCTGCTC 56 684
728946 1952 1967 11517 11532 AGAGTTCTTTCCCTGC 56 685
728947 1953 1968 11518 11533 GAGAGTTCTTTCCCTG 54 686
728948 1954 1969 11519 11534 GGAGAGTTCTTTCCCT 32 687
728949 1955 1970 11520 11535 GGGAGAGTTCTTTCCC 1 688
728950 1956 1971 11521 11536 TGGGAGAGTTCTTTCC 24 689
728951 1958 1973 11523 11538 GTTGGGAGAGTTCTTT 29 690
728952 1970 1985 11535 11550 CTAGGCCCCAGGGTTG 35 691
728953 1972 1987 11537 11552 AGCTAGGCCCCAGGGT 23 692
728954 1974 1989 11539 11554 ACAGCTAGGCCCCAGG 64 693
728955 1976 1991 11541 11556 ATACAGCTAGGCCCCA 14 694
Tabela 10 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2 SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 73 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 69 468
666013 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA 65 695
666015 2228 2243 11793 11808 ATTTCTGCTCCAGGTT 54 696
729028 2190 2205 11755 11770 AGCTGCCAGCCTTGAG 50 697
729029 2191 2206 11756 11771 TAGCTGCCAGCCTTGA 57 698
729030 2192 2207 11757 11772 GTAGCTGCCAGCCTTG 65 699
729031 2194 2209 11759 11774 GGGTAGCTGCCAGCCT 41 700
729032 2210 2225 11775 11790 TGGACTCTCAAGAAGG 55 701
729033 2211 2226 11776 11791 TTGGACTCTCAAGAAG 37 702
729034 2212 2227 11777 11792 CTTGGACTCTCAAGAA 38 703
729035 2213 2228 11778 11793 TCTTGGACTCTCAAGA 0 704
729036 2214 2229 11779 11794 TTCTTGGACTCTCAAG 55 705
729037 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA 80 706
729038 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC 85 707
729039 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT 74 708
729040 2219 2234 11784 11799 CCAGGTTCTTGGACTC 67 709
729041 2220 2235 11785 11800 TCCAGGTTCTTGGACT 39 710
729042 2222 2237 11787 11802 GCTCCAGGTTCTTGGA 11 711
729043 2223 2238 11788 11803 TGCTCCAGGTTCTTGG 44 712
729044 2224 2239 11789 11804 CTGCTCCAGGTTCTTG 62 713
729045 2225 2240 11790 11805 TCTGCTCCAGGTTCTT 60 714
729046 2226 2241 11791 11806 TTCTGCTCCAGGTTCT 54 715
729047 2227 2242 11792 11807 TTTCTGCTCCAGGTTC 63 716
729048 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT 63 717
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729049 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG 76 718
729050 2231 2246 11796 11811 ATTATTTCTGCTCCAG 76 719
729051 2232 2247 11797 11812 AATTATTTCTGCTCCA 58 720
729052 2260 2275 11825 11840 AACATTCATTAATCCA 55 721
729053 2278 2293 11843 11858 ACAGCTGAGTCTGTTT 26 722
729055 2300 2315 11865 11880 TGGTAGTAGTAAAAGG 24 723
729060 2310 2325 11875 11890 TGGGAGCAACTGGTAG 33 724
729064 2322 2337 11887 11902 GGTGGAGCAGCATGGG 14 725
729067 2336 2351 11901 11916 CCGAAACAGGGCCTGG 33 726
729072 2346 2361 11911 11926 CAGTTGGCATCCGAAA 8 727
729077 2385 2400 11950 11965 AATGGTCGCAAGCTGG 26 728
729082 2395 2410 11960 11975 TCCCAGTGCCAATGGT 5 729
729086 2417 2432 11982 11997 CATCAGCCCAGAAGCC 12 730
729090 2427 2442 11992 12007 CCAACTGACCCATCAG 8 731
729095 2437 2452 12002 12017 TTATGAAGGCCCAACT 0 732
729100 2447 2462 12012 12027 AGGTGAGTGTTTATGA 33 733
729105 2457 2472 12022 12037 AAAGCCAGCCAGGTGA 30 734
729106 2486 2501 12051 12066 TTGCTTCAGCCAGCTT 15 735
729110 2496 2511 12061 12076 TTCCACACCCTTGCTT 11 736
729112 2515 2530 12080 12095 ACTGTGCACACATTTA 53 737
729116 2525 2540 12090 12105 AGTTTTCCAGACTGTG 28 738
729120 2536 2551 12101 12116 CTGATTCTGACAGTTT 0 739
729123 2547 2562 12112 12127 TTATGGGAAAACTGAT 0 740
729125 2557 2572 12122 12137 GCCCACCCTTTTATGG 0 741
729129 2567 2582 12132 12147 TGCAATGCTAGCCCAC 54 742
729134 2577 2592 12142 12157 CAAATGCAGCTGCAAT 27 743
729139 2588 2603 12153 12168 TTGAATGGTCCCAAAT 22 744
729144 2599 2614 12164 12179 GAGTGACAGATTTGAA 55 745
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729146 2620 2635 12185 12200 AGCACAGGAATATACA 36 746
729150 2637 2652 12202 12217 GCCCTGATATATTTAA 0 747
729155 2647 2662 12212 12227 TACATGCACTGCCCTG 31 748
729160 2657 2672 12222 12237 CAGGATGATTTACATG 5 749
729164 2703 2718 12268 12283 ACTGTCCCCACCTCGG 10 750
729165 2720 2735 12285 12300 ACTAAGAGAACTCACT 31 751
729167 2747 2762 12312 12327 GGCTCTTTAACAACCA 20 752
729170 2761 2776 12326 12341 GCGGGTAGGTGCCAGG 40 753
729175 2771 2786 12336 12351 TGAAGTGAGAGCGGGT 45 754
729180 2789 2804 12354 12369 GTGCAGAGATGACACA 0 755
729182 2800 2815 12365 12380 TGGGCTGGAGTGCA 30 756
729185 2820 2835 12385 12400 CAATGGCTGAAGGCAG 14 757
729190 2876 2891 12441 12456 GCTGGGCATCAAGATT 7 758
729194 2885 2900 12450 12465 GTTCTGATGGCTGGGC 50 759
729251 N/A N/A 176 191 CTGGAATGGCAAAACT 12 760
729252 N/A N/A 197 212 GCCACTGGCTCTTTTG 0 761
729253 N/A N/A 207 222 CCCTAGACTGGCCACT 1 762
729254 N/A N/A 218 233 ACGGCGCGGTGCCCTA 10 763
729255 N/A N/A 257 272 AGCCTCGGGCCAGGCC 12 764
729256 N/A N/A 267 282 ATCCGGGCTGAGCCTC 8 765
729257 N/A N/A 292 307 CCCCGCACTGACCTGG 43 766
729258 N/A N/A 302 317 CCACTCCGGGCCCCGC 0 767
729259 N/A N/A 312 327 CCCCGCGAATCCACTC 0 768
729260 N/A N/A 364 379 CGCCCCTGGGCAGCTG 0 769
729635 N/A N/A 228 243 GAGATGCCAGACGGCG 0 770
729636 N/A N/A 344 359 TGAGCTCCGGGCGCGG 5 771
Tabela 11 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2 SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 74 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 57 468
729261 N/A N/A 502 517 GACCCACCTGTCTGCG 7 772
729262 N/A N/A 512 527 CGGCGGCCGGGACCCA 18 773
729263 N/A N/A 532 547 CGGACGCAGAGAGGAG 20 774
729264 N/A N/A 561 576 CTCCCGCCACCCTCGG 9 775
729265 N/A N/A 571 586 GCCGGCACCGCTCCCG 0 776
729266 N/A N/A 594 609 TAGGCCTAGACTTGGG 26 777
729267 N/A N/A 635 650 TCCCGCCGCCCGCAGG 10 778
729268 N/A N/A 645 660 CCAGTCTTCATCCCGC 33 779
729269 N/A N/A 656 671 CCCGCCCTACTCCAGT 26 780
729270 N/A N/A 686 701 CTCGCTTTCCAGGCGC 4 781
729271 N/A N/A 696 711 CCCCCCCGAGCTCGCT 8 782
729272 N/A N/A 706 721 GCTGTAGGCACCCCCC 19 783
729273 N/A N/A 736 751 TGGAAGTCCCAGGCCG 21 784
729274 N/A N/A 767 782 CCCCAAACCGATCGGG 0 785
729275 N/A N/A 801 816 CCGCCTGGGTCACTGG 11 786
729276 N/A N/A 811 826 GCCCACTCCGCCGCCT 0 787
729277 N/A N/A 866 881 CTGGGCGATGGCGAGG 10 788
729278 N/A N/A 876 891 AACCCCCATTCTGGGC 6 789
729279 N/A N/A 886 901 GGCTCCCGGGAACCCC 11 790
729280 N/A N/A 911 926 TGTGGTCCAAGCCAGC 29 791
729281 N/A N/A 931 946 AGGATCGGGCCTCGCT 30 792
729282 N/A N/A 941 956 ATCGAAAGTAAGGATC 17 793
729283 N/A N/A 957 972 GAGCAAGGGCGAGTGC 29 794
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729284 N/A N/A 967 982 GGCCCGGTAAGAGCAA 6 795
729285 N/A N/A 986 1001 TTTCCGAAAGGGTGAG 32 796
729286 N/A N/A 1028 1043 GCCTGAAGATCCCGGG 14 797
729287 N/A N/A 1038 1053 CCTGCCATTGGCCTGA 14 798
729288 N/A N/A 1057 1072 CCCAAACTCTTGCACA 25 799
729289 N/A N/A 1074 1089 ACCTGACACCATCTTC 9 800
729290 N/A N/A 1085 1100 ACGCAGCCTCTACCTG 0 801
729291 N/A N/A 1096 1111 CGAGCCCAGGGACGCA 16 802
729292 N/A N/A 1107 1122 ATTCCCGGCCGCGAGC 19 803
729293 N/A N/A 1117 1132 AGAGTCTGCCATTCCC 44 804
729294 N/A N/A 1157 1172 GAACTATTGCGCCCCA 35 805
729295 N/A N/A 1167 1182 ACCAGCCCAGGAACTA 15 806
729296 N/A N/A 1177 1192 ACCTGAGGAAACCAGC 15 807
729297 N/A N/A 1190 1205 GTTCTGGGACAGGACC 19 808
729298 N/A N/A 1213 1228 CCTCTTCATTGTTGCC 42 809
729299 N/A N/A 1244 1259 CATGCTAGCCTCACTT 23 810
729300 N/A N/A 1268 1283 AACCATCTCCCCACGC 21 811
729301 N/A N/A 1278 1293 GTCCGGAGACAACCAT 13 812
729302 N/A N/A 1308 1323 TCCCAGGTACCCGCTC 7 813
729303 N/A N/A 1330 1345 AGTCCCCCACTCCAGC 23 814
729304 N/A N/A 1342 1357 CGAGGCTGGGAAAGTC 18 815
729305 N/A N/A 1370 1385 CCTCGCCCTGCTGTGT 18 816
729306 N/A N/A 1380 1395 GCACCCCGGTCCTCGC 27 817
729307 N/A N/A 1557 1572 ATTCTGGGCCCTCGAG 3 818
729308 N/A N/A 1579 1594 CTGGTTCTGGTCACTT 41 819
729309 N/A N/A 1591 1606 GCCGAGCCCTCTCTGG 13 820
729310 N/A N/A 1601 1616 CATCGATACAGCCGAG 42 821
729311 N/A N/A 1638 1653 CTTGCCAGAGGGCCTC 40 822
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729312 N/A N/A 1676 1691 CCATAACTACTGGG 20 823
729313 N/A N/A 1702 1717 GAACCCCTCAGCCCCA 8 824
729314 N/A N/A 1712 1727 TTGACTCTTGGAACCC 40 825
729315 N/A N/A 1722 1737 AGTGCTTCCCTTGACT 20 826
729316 N/A N/A 1748 1763 CTTTAGATAAAAAGGG 12 827
729317 N/A N/A 1758 1773 AAAGTAGGGCCTTTAG 27 828
729318 N/A N/A 1833 1848 GCCCAGAAAGAAGCTT 5 829
729319 N/A N/A 1867 1882 GGTCCAGACAGGCTGA 15 830
729320 N/A N/A 1909 1924 CTCCGGGTCAGCTGCC 25 831
729321 N/A N/A 1919 1934 AATCCCACCCCTCCGG 8 832
729322 N/A N/A 1942 1957 CCCTGTACAGGCCCTG 1 833
729323 N/A N/A 1992 2007 ACATGTCTCCTTGCAA 6 834
729324 N/A N/A 2002 2017 GGTCTGGGTCACATGT 33 835
729325 N/A N/A 2036 2051 GCCAGACAGCAGGCGC 11 836
729326 N/A N/A 2047 2062 TAGTAAGAGTGGCCAG 16 837
729327 N/A N/A 2058 2073 CACAGCAGTCCTAGTA 9 838
729328 N/A N/A 2068 2083 GAGGAAGTGCCACAGC 17 839
729329 N/A N/A 2100 2115 TGCAATTCATGGGCAC 18 840
729330 N/A N/A 2110 2125 ACCCAGGAGCTGCAAT 4 841
729331 N/A N/A 2129 2144 AGACAGTGCCCCCACC 5 842
729332 N/A N/A 2170 2185 TAAGCCCACAGCTCAC 0 843
729333 N/A N/A 2187 2202 GACCTGCTGAGGTGGG 15 844
729637 N/A N/A 716 731 GGCGCACCCTGCTGTA 17 845
729638 N/A N/A 1234 1249 TCACTTTTCCTCCACG 38 846
729639 N/A N/A 1452 1467 GGGCCAGCCCGCGGAG 15 847
729640 N/A N/A 1611 1626 CAGTTTCCTACATCGA 22 848
Tabela 12 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2 SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 73 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 63 468
729195 N/A N/A 3775 3790 TCGGGTAGCACTTAGG 53 849
729334 N/A N/A 2204 2219 AGTGGGCAGCCCTAGA 12 850
729335 N/A N/A 2224 2239 TGTGAGGCAGCGAAGC 32 851
729336 N/A N/A 2234 2249 CCTACAATTGTGTGAG 10 852
729337 N/A N/A 2258 2273 GAAATCCAACAGCCTG 25 853
729338 N/A N/A 2274 2289 AGCCCCGGAAGGTGGG 11 854
729339 N/A N/A 2284 2299 AATGGACCTGAGCCCC 25 855
729340 N/A N/A 2304 2319 TGGAGCCCTAGACCTA 13 856
729341 N/A N/A 2314 2329 GTGAAATGTATGGAGC 20 857
729342 N/A N/A 2324 2339 GAGTCTCTGGGTGAAA 16 858
729343 N/A N/A 2334 2349 CCAGGCTCCGGAGTCT 0 859
729344 N/A N/A 2365 2380 TGGAAGTTCGGTGTCA 27 860
729345 N/A N/A 2376 2391 GCCCATGACTTTGGAA 8 861
729346 N/A N/A 2386 2401 CCCAATCAAGGCCCAT 16 862
729347 N/A N/A 2405 2420 TAGGTCTAATTCAGAC 6 863
729348 N/A N/A 2415 2430 AGAAAAGGGCTAGGTC 0 864
729349 N/A N/A 2444 2459 TCCATCCTCCTAGAAG 0 865
729350 N/A N/A 2454 2469 CCGAACAGCATCCATC 3 866
729351 N/A N/A 2464 2479 GAGCTCTAACCCGAAC 0 867
729352 N/A N/A 2507 2522 AGGGACTCAGCCTCAA 18 868
729353 N/A N/A 2517 2532 ATGCCACAGAAGGGAC 15 869
729354 N/A N/A 2527 2542 TCTGTCCACCATGCCA 6 870
729355 N/A N/A 2538 2553 ATGAGCGAGAGTCTGT 25 871
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729356 N/A N/A 2615 2630 GTGTCAGAGGGCCGCG 28 872
729357 N/A N/A 2625 2640 TCCGACCTCAGTGTCA 20 873
729358 N/A N/A 2635 2650 AAATGATAACTCCGAC 27 874
729359 N/A N/A 2658 2673 GTTTAATACAGAGCAA 36 875
729360 N/A N/A 2668 2683 CAACACGGCTGTTTAA 0 876
729361 N/A N/A 2695 2710 CTGTCAGTCCAGCAGT 29 877
729362 N/A N/A 2708 2723 TGCCTGCCCCCTACTG 5 878
729363 N/A N/A 2755 2770 GAGGCCGTGCAGGCGC 23 879
729364 N/A N/A 2768 2783 GACCCCCTGGGCTGAG 17 880
729365 N/A N/A 2778 2793 CTTCCCTAATGACCCC 19 881
729366 N/A N/A 2799 2814 TCTGCACAGAATCGGG 18 882
729367 N/A N/A 2823 2838 CAAGGGTGGACAGAGG 14 883
729368 N/A N/A 2833 2848 TCTGGCCGAGCAAGGG 24 884
729369 N/A N/A 2843 2858 GGCACACAATTCTGGC 3 885
729370 N/A N/A 2874 2889 GCCCTAGAATAGAGGG 9 886
729371 N/A N/A 2884 2899 AGAGGCCTTGGCCCTA 5 887
729372 N/A N/A 2911 2926 ACCCATAGTTGTATCT 13 888
729373 N/A N/A 2935 2950 GGTTTATAACATGGGT 11 889
729374 N/A N/A 2974 2989 GCACCCCAAACTTGCA 11 890
729375 N/A N/A 2984 2999 GCTGTTCCCCGCACCC 17 891
729376 N/A N/A 2995 3010 TCCCACCCAGAGCTGT 7 892
729377 N/A N/A 3016 3031 CCCCAGACCAAATTTC 0 893
729378 N/A N/A 3026 3041 CGAGTGGGTCCCCCAG 17 894
729379 N/A N/A 3052 3067 ACTCACTGTGGGCTGA 22 895
729380 N/A N/A 3080 3095 GGCTAGACCGGGACAA 29 896
729381 N/A N/A 3090 3105 AAACGAAAGTGGCTAG 11 897
729382 N/A N/A 3108 3123 TCCACCCGGCCCCAGG 3 898
729383 N/A N/A 3329 3344 CCCAGTACCTTTTGGG 0 899
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729384 N/A N/A 3339 3354 AAATTCCCTGCCCAGT 6 900
729385 N/A N/A 3372 3387 TGGCCTTGCAGCATGG 27 901
729386 N/A N/A 3386 3401 GTCTGGGCCTGCTTTG 23 902
729387 N/A N/A 3396 3411 AACTCCCTGTGTCTGG 18 903
729388 N/A N/A 3447 3462 CATCAGAAGTGAATGT 8 904
729389 N/A N/A 3458 3473 ACAGCACAGCCCATCA 14 905
729390 N/A N/A 3468 3483 GGGTCATTACACAGCA 23 906
729391 N/A N/A 3509 3524 GCCCTTCACTTGAGAC 13 907
729392 N/A N/A 3519 3534 CATGCCCTTGGCCCTT 8 908
729393 N/A N/A 3530 3545 CTCCCCTTACCCATGC 0 909
729394 N/A N/A 3556 3571 GTCCTGAGTCCCCTTC 0 910
729395 N/A N/A 3567 3582 AACTCTCCACAGTCCT 10 911
729396 N/A N/A 3631 3646 AGGCCAGAGGGACCCT 0 912
729397 N/A N/A 3648 3663 ACTGCCTCCCTGGAGT 0 913
729398 N/A N/A 3695 3710 TGCTACCTACCCAGGG 2 914
729399 N/A N/A 3705 3720 CAGCTCTAACTGCTAC 0 915
729400 N/A N/A 3729 3744 GAAGGCTACAGGAAAC 0 916
729401 N/A N/A 3739 3754 AGCCTGTTAGGAAGGC 0 917
729402 N/A N/A 3749 3764 CGCCTGCCGGAGCCTG 18 918
729403 N/A N/A 3762 3777 AGGAAGGCCCTAACGC 0 919
729641 N/A N/A 2214 2229 CGAAGCATCCAGTGGG 20 920
729642 N/A N/A 2474 2489 AGGTCCACACGAGCTC 30 921
729643 N/A N/A 2593 2608 CAGGCAGCTTAGGGAG 1 922
729644 N/A N/A 2945 2960 CATTTAGTGTGGTTTA 28 923
729645 N/A N/A 3362 3377 GCATGGAGCCTCAGTT 33 924
729646 N/A N/A 3499 3514 TGAGACCCCTGGGTGG 21 925
Tabela 13 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2 SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 83 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 59 468
666150 N/A N/A 3779 3794 GCATTCGGGTAGCACT 46 926
666168 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC 62 927
729196 N/A N/A 3776 3791 TTCGGGTAGCACTTAG 49 928
729197 N/A N/A 3777 3792 ATTCGGGTAGCACTTA 36 929
729198 N/A N/A 3778 3793 CATTCGGGTAGCACTT 33 930
729199 N/A N/A 3780 3795 CGCATTCGGGTAGCAC 46 931
729200 N/A N/A 3781 3796 ACGCATTCGGGTAGCA 40 932
729201 N/A N/A 3782 3797 CACGCATTCGGGTAGC 59 933
729202 N/A N/A 3783 3798 ACACGCATTCGGGTAG 36 934
729203 N/A N/A 3784 3799 GACACGCATTCGGGTA 35 935
729204 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT 50 936
729205 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA 72 937
729206 N/A N/A 5284 5299 CACTGTGTACCCC 71 938
729207 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC 57 939
729208 N/A N/A 5287 5302 AATCACCACTGTGTAC 20 940
729209 N/A N/A 5288 5303 AAATCACCACTGTGTA 32 941
729210 N/A N/A 5289 5304 CAAATCACCACTGTGT 12 942
729211 N/A N/A 5290 5305 TCAAATCACCACTGTG 44 943
729212 N/A N/A 5291 5306 ATCAAATCACCACTGT 42 944
729404 N/A N/A 3812 3827 CTTGGTCCTCCCCCTT 21 945
729405 N/A N/A 3822 3837 CATCTAGGTTCTTGGT 27 946
729406 N/A N/A 3835 3850 CTCTAGGGCCATTCAT 19 947
729407 N/A N/A 3855 3870 GCACCAAACAGATGTT 19 948
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729408 N/A N/A 3885 3900 ACCAACTCAACCCACC 13 949
729409 N/A N/A 3895 3910 AATCCCATCAACCAAC 15 950
729410 N/A N/A 3905 3920 TCTTTAGAGAAATCCC 38 951
729411 N/A N/A 3943 3958 AAGGACACCTGCCCTC 6 952
729412 N/A N/A 3954 3969 CTGGAGCTCCCAAGGA 17 953
729413 N/A N/A 3965 3980 AAGAATCTCATCTGGA 4 954
729414 N/A N/A 3975 3990 TGCCCTCAACAAGAAT 0 955
729415 N/A N/A 3995 4010 CTGAGAGTTCCCTCCG 22 956
729416 N/A N/A 4059 4074 CTCCTGCTCAGTCTAC 21 957
729417 N/A N/A 4100 4115 CTGGGACAGCGAGCGC 47 958
729418 N/A N/A 4120 4135 TCTTGTCTCAAGCTGG 32 959
729419 N/A N/A 4140 4155 TGACACCAAAAGCCCG 37 960
729420 N/A N/A 4150 4165 AGTGACTGCCTGACAC 11 961
729421 N/A N/A 4185 4200 GCCCACCCCTTGCTCT 11 962
729422 N/A N/A 4205 4220 CTACTCACACCACAGG 38 963
729423 N/A N/A 4215 4230 CCGCCTTCCACTACTC 26 964
729424 N/A N/A 4225 4240 GGCCAGAGAACCGCCT 14 965
729425 N/A N/A 4241 4256 CAGCAAGCAGCCCGTT 21 966
729426 N/A N/A 4251 4266 CTGCTAACAGCAGCAA 10 967
729427 N/A N/A 4261 4276 CATTCTCCAACTGCTA 43 968
729428 N/A N/A 4272 4287 GCAGAGGCATCCATTC 19 969
729429 N/A N/A 4292 4307 CCCCAGGTGCCCTTTA 7 970
729430 N/A N/A 4304 4319 CTGCGGGCGCGGCCCC 22 971
729431 N/A N/A 4324 4339 GAGTTACGAGTTAGTG 49 972
729432 N/A N/A 4357 4372 TCATGGAATTTTGTGT 31 973
729433 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG 64 974
729434 N/A N/A 4379 4394 GCATCAGCTTTCTTGT 39 975
729435 N/A N/A 4401 4416 TAAGGCCAATTCTCTT 19 976
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729436 N/A N/A 4412 4427 ATCTAGGTATTTAAGG 19 977
729437 N/A N/A 4422 4437 TCTCCAGTCCATCTAG 15 978
729438 N/A N/A 4432 4447 AAGGATGGTCTCCA 14 979
729439 N/A N/A 4457 4472 CTCAGAGGTCAAGCTA 30 980
729440 N/A N/A 4484 4499 GGTCTGCAGGTGGATG 26 981
729441 N/A N/A 4730 4745 GGGCTTACCTTGAAGA 20 982
729442 N/A N/A 4744 4759 CAACCTCCTCCCCGGG 12 983
729443 N/A N/A 4754 4769 GAGGTCCAGCCAACCT 1 984
729444 N/A N/A 4790 4805 TTATGTGCGCTCCTCT 26 985
729445 N/A N/A 4806 4821 GAGCTGCCTGTGTGCG 31 986
729446 N/A N/A 4817 4832 CCAGCCTCGAGGAGCT 4 987
729447 N/A N/A 4853 4868 CCGGCATCAGCAGCAG 57 988
729448 N/A N/A 4897 4912 AAAGGTGTACCCTGTG 36 989
729449 N/A N/A 5076 5091 AAGATGTGCCCTAGGC 35 990
729450 N/A N/A 5087 5102 GCAGGTTAGAAAAGAT 16 991
729451 N/A N/A 5097 5112 GCTCTAGGGTGCAGGT 49 992
729452 N/A N/A 5107 5122 TCCCCACGATGCTCTA 14 993
729453 N/A N/A 5140 5155 CGAGTTATGGGAAGGC 66 994
729454 N/A N/A 5170 5185 AGGAGTGAGACGAGCA 75 995
729455 N/A N/A 5190 5205 AACAAGTCCTCATGAG 19 996
729456 N/A N/A 5213 5228 TCCTTTAGCATATGCG 67 997
729647 N/A N/A 3845 3860 GATGTTACCTCTCTAG 38 998
729648 N/A N/A 4016 4031 AGTTTTCTCACCCTCC 49 999
729649 N/A N/A 4049 4064 GTCTACACCCCTAGTT 24 1000
729650 N/A N/A 4195 4210 CACAGGTTAGGCCCAC 44 1001
729651 N/A N/A 4467 4482 GGACAGGGTACTCAGA 26 1002
Tabela 14 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2 SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 23 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 46 468
666178 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA 51 1003
666184 N/A N/A 6972 6987 TGCCTTTTAATGTTGA 36 1004
666187 N/A N/A 7176 7191 CTAGACAAATATGCAG 29 1005
729213 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC 71 1006
729214 N/A N/A 6541 6556 TGCATTCCATATACAC 28 1007
729215 N/A N/A 6542 6557 TTGCATTCCATATACA 27 1008
729216 N/A N/A 6543 6558 TTTGCATTCCATATAC 3 1009
729217 N/A N/A 6544 6559 TTTTGCATTCCATATA 19 1010
729218 N/A N/A 6545 6560 ATTTTGCATTCCATAT 20 1011
729219 N/A N/A 6969 6984 CTTTTAATGTTGAATT 0 1012
729220 N/A N/A 6970 6985 CCTTTTAATGTTGAAT 0 1013
729221 N/A N/A 6971 6986 GCCTTAATGTTGAA 50 1014
729222 N/A N/A 6973 6988 ATGCCTTAATGTTG 0 1015
729223 N/A N/A 6974 6989 TATGCCTTAATGTT 10 1016
729224 N/A N/A 6975 6990 CTATGCCTTAATGT 0 1017
729225 N/A N/A 6976 6991 TCTATGCCTTAATG 13 1018
729226 N/A N/A 7171 7186 CAAATATGCAGATATC 3 1019
729227 N/A N/A 7173 7188 GACAAATATGCAGATA 0 1020
729228 N/A N/A 7174 7189 AGACAAATATGCAGAT 1 1021
729229 N/A N/A 7175 7190 TAGACAAATATGCAGA 27 1022
729230 N/A N/A 7177 7192 TCTAGACAAATATGCA 18 1023
729231 N/A N/A 7178 7193 GTCTAGACAAATATGC 0 1024
729232 N/A N/A 7179 7194 AGTCTAGACAAATATG 12 1025
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729233 N/A N/A 7180 7195 AAGTCTAGACAAATAT 0 1026
729234 N/A N/A 7181 7196 TAAGTCTAGACAAATA 0 1027
729457 N/A N/A 5292 5307 TATCAAATCACCACTG 0 1028
729458 N/A N/A 5302 5317 TCACTGTGCTTATCAA 22 1029
729459 N/A N/A 5314 5329 TACCTGATCTGATCAC 0 1030
729460 N/A N/A 5325 5340 GATATGCTAAGTACCT 43 1031
729461 N/A N/A 5368 5383 GTTTGTTCCCAACACA 34 1032
729462 N/A N/A 5393 5408 GTATCTGAATCTTATA 22 1033
729463 N/A N/A 5403 5418 GATTGATGATGTATCT 0 1034
729464 N/A N/A 5413 5428 ACAATTGAAAGATTGA 0 1035
729465 N/A N/A 5464 5479 ATCTGGTCAACAGTGT 21 1036
729466 N/A N/A 5606 5621 CAAGGAGGTTGAGATG 0 1037
729467 N/A N/A 5804 5819 GTAGTACATCAATTAA 0 1038
729468 N/A N/A 5814 5829 ATGTACAGTTGTAGTA 0 1039
729469 N/A N/A 5868 5883 AACACTAGGCAACAGA 0 1040
729470 N/A N/A 5878 5893 CCAATGGTGCAACACT 0 1041
729471 N/A N/A 5888 5903 CCACTGCTCACCAATG 0 1042
729472 N/A N/A 5910 5925 TGGAGGTTGTGCTATG 0 1043
729473 N/A N/A 5921 5936 TTGAGCTGAGTTGGAG 0 1044
729474 N/A N/A 6478 6493 ACATCCTAGCATTAAG 0 1045
729475 N/A N/A 6495 6510 AAACTATTATGCGAGG 55 1046
729476 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC 64 1047
729477 N/A N/A 6559 6574 TTCACTTGATTCCAAT 14 1048
729478 N/A N/A 6614 6629 AAGGAAAGCTGATCCT 0 1049
729479 N/A N/A 6624 6639 GTATGTTGGAAAGGAA 19 1050
729480 N/A N/A 6639 6654 AAAAGTGATGTGGACG 23 1051
729481 N/A N/A 6666 6681 CATTCCAGTGGAAATT 2 1052
729482 N/A N/A 6679 6694 AATTGTGCTAAACCAT 10 1053
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729483 N/A N/A 6689 6704 TCAGTGACCAAATTGT 30 1054
729484 N/A N/A 6710 6725 CAAGTATCTAAAAACC 0 1055
729485 N/A N/A 6752 6767 CATGACAATGTGGTTT 37 1056
729486 N/A N/A 6762 6777 AGACAGCCTACATGAC 23 1057
729487 N/A N/A 6772 6787 GGAAGCATTAAGACAG 6 1058
729488 N/A N/A 6799 6814 CCCAAAATAATTGAGG 0 1059
729489 N/A N/A 6810 6825 GGAAATCAACCCCCAA 21 1060
729490 N/A N/A 6840 6855 TTGCCTTTGACCCAGC 34 1061
729491 N/A N/A 6887 6902 GCCCAAAAACTAAGAA 0 1062
729492 N/A N/A 6897 6912 TAAGGATCAAGCCCAA 26 1063
729493 N/A N/A 6947 6962 CTGTATTACCTATACA 0 1064
729494 N/A N/A 6958 6973 GAATTTTGTGACTGTA 56 1065
729495 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT 53 1066
729496 N/A N/A 6998 7013 GAGACTTTTTGCTCTA 0 1067
729497 N/A N/A 7019 7034 GTGATGAACCAGGGAA 44 1068
729498 N/A N/A 7045 7060 GGAAAGGCTAGGGAGG 1 1069
729499 N/A N/A 7059 7074 ACGGCTGCCTCTAGGG 9 1070
729500 N/A N/A 7128 7143 AGGATAGTTCCATATT 15 1071
729501 N/A N/A 7145 7160 TATGAAAAGTAGAGGA 0 1072
729502 N/A N/A 7156 7171 CTAGCATTTCTTATGA 2 1073
729503 N/A N/A 7184 7199 TATTAAGTCTAGACAA 0 1074
729504 N/A N/A 7194 7209 CGTCAAGAAGTATTAA 0 1075
729505 N/A N/A 7208 7223 TGACATGTAGCAATCG 28 1076
729652 N/A N/A 6458 6473 TTGGAGAGAGCACAGT 11 1077
729653 N/A N/A 6654 6669 AATTCTACAGTCACGA 26 1078
729654 N/A N/A 7106 7121 CATGTGCATAAATC 0 1079
Tabela 15
Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2 SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 78 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 58 468
666188 N/A N/A 7391 7406 AGAAGCATTCACACAA 41 1080
729235 N/A N/A 7387 7402 GCATTCACACAAAATA 52 1081
729236 N/A N/A 7388 7403 AGCATTCACACAAAAT 54 1082
729237 N/A N/A 7389 7404 AAGCATTCACACAAAA 27 1083
729238 N/A N/A 7390 7405 GAAGCATTCACACAAA 39 1084
729239 N/A N/A 7392 7407 TAGAAGCATTCACACA 41 1085
729240 N/A N/A 7393 7408 ATAGAAGCATTCACAC 22 1086
729241 N/A N/A 7394 7409 CATAGAAGCATTCACA 46 1087
729242 N/A N/A 7395 7410 TCATAGAAGCATTCAC 50 1088
729243 N/A N/A 7396 7411 ATCATAGAAGCATTCA 59 1089
729506 N/A N/A 7218 7233 GTTTATAAGCTGACAT 39 1090
729507 N/A N/A 7228 7243 GCAGGAAACTGTTTAT 55 1091
729508 N/A N/A 7253 7268 ACTGGGCAGCACAAAA 25 1092
729509 N/A N/A 7271 7286 ACCCATTGAATGAAAA 23 1093
729510 N/A N/A 7281 7296 ATTACGGCCAACCCAT 0 1094
729511 N/A N/A 7291 7306 GGCTGGTGAAATTACG 10 1095
729512 N/A N/A 7306 7321 CATCCATCAATGAGGG 51 1096
729513 N/A N/A 7316 7331 CCCAATGCAACATCCA 69 1097
729514 N/A N/A 7328 7343 TGACCCAAAATACCCA 44 1098
729515 N/A N/A 7338 7353 GTGTAAAAGATGACCC 37 1099
729516 N/A N/A 7349 7364 AGCAGTGCTGTGTGTA 48 1100
729517 N/A N/A 7372 7387 ATTGCACACACAAAGT 10 1101
729518 N/A N/A 7397 7412 TATCATAGAAGCATTC 24 1102
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729519 N/A N/A 7426 7441 CTATTTGATTTCTAGG 18 1103
729520 N/A N/A 7437 7452 TTTTAACCCAGCTATT 6 1104
729521 N/A N/A 7460 7475 GGTTACCAACATTTCT 42 1105
729522 N/A N/A 7470 7485 GTGAGGTGAGGGTTAC 38 1106
729523 N/A N/A 7508 7523 ACACTGGAGCTGTTGG 51 1107
729524 N/A N/A 7519 7534 ACAGGCTCGAGACACT 31 1108
729525 N/A N/A 7529 7544 TGCACATAGGACAGGC 22 1109
729526 N/A N/A 7550 7565 TAAAGCACTCAGAGCT 16 1110
729527 N/A N/A 7560 7575 TTGATGTCCGTAAAGC 53 1111
729528 N/A N/A 7876 7891 AGCGAAGACTCAAGGG 48 1112
729529 N/A N/A 7887 7902 CATGGAGTGGCAGCGA 42 1113
729530 N/A N/A 7899 7914 AGTTGCCCACCTCATG 22 1114
729531 N/A N/A 7909 7924 ATCTCCTCACAGTTGC 28 1115
729532 N/A N/A 7920 7935 CCTTTGTCTTGATCTC 48 1116
729533 N/A N/A 7936 7951 GCCATGTCACTGCCTC 30 1117
729534 N/A N/A 7953 7968 CGCCAGCTGTGTGCCA 28 1118
729535 N/A N/A 7966 7981 TGGAAGTGCCCCGC 34 1119
729536 N/A N/A 7976 7991 GGTTTGAATCTGGAAG 31 1120
729537 N/A N/A 8000 8015 GGTGAGCACCCTGGAG 30 1121
729538 N/A N/A 8027 8042 TCTAAGGAGGACAGCG 35 1122
729539 N/A N/A 8043 8058 GTGAAACAGTGTGATC 40 1123
729540 N/A N/A 8064 8079 ATAGTCCCTGCTCCTG 49 1124
729541 N/A N/A 8144 8159 GTGGGAGTCTGCCACA 6 1125
729542 N/A N/A 8159 8174 GACCTGGTTTGCAGCG 34 1126
729543 N/A N/A 8171 8186 CGCTGAGCCCCAGACC 0 1127
729544 N/A N/A 8181 8196 GGCTGAGCCTCGCTGA 22 1128
729545 N/A N/A 8194 8209 AACTTCGGCTACAGGC 39 1129
729546 N/A N/A 8213 8228 GACTCTACTGTGTGGG 38 1130
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729547 N/A N/A 8266 8281 CACAGAGAACCTCATC 11 1131
729548 N/A N/A 8276 8291 AATAGCCGACCACAGA 10 1132
729549 N/A N/A 8489 8504 GCCTGATACCTGTGGG 3 1133
729550 N/A N/A 8525 8540 ATTGCACAGCCTCCCA 8 1134
729551 N/A N/A 8555 8570 ACCCAAGAGCTCATGG 6 1135
729552 N/A N/A 8569 8584 CTTGGCCTGCCTGCAC 10 1136
729553 N/A N/A 8598 8613 TTCCTGGACCACTGCC 15 1137
729554 N/A N/A 8617 8632 GCGGGAGCCCCCGCAT 22 1138
729555 N/A N/A 8637 8652 GCCCTGGGTGTCATGA 17 1139
729556 N/A N/A 8648 8663 CACTCCTGGAAGCCCT 0 1140
729557 N/A N/A 8661 8676 GACCCATCCCAGCCAC 7 1141
729558 N/A N/A 8671 8686 ATATGCCAGTGACCCA 15 1142
729559 N/A N/A 8681 8696 GCCATTCCTGATATGC 28 1143
729560 N/A N/A 8691 8706 TGCACGCCAAGCCATT 28 1144
729561 N/A N/A 8711 8726 GAAGCACCCAGGTCCC 24 1145
729562 N/A N/A 8722 8737 ATGGTAAGGAAGAAGC 18 1146
729563 N/A N/A 8732 8747 AACGAGGGCAATGGTA 11 1147
729564 N/A N/A 8763 8778 CCATGAGACCTAGGCT 3 1148
729565 N/A N/A 8773 8788 ACTCCATGGGCCATGA 3 1149
729566 N/A N/A 8794 8809 GGATTGGGAAAGACCT 15 1150
729567 N/A N/A 8817 8832 CGAGGTGGAGGGCACA 11 1151
729568 N/A N/A 8827 8842 CAACACAGGGCGAGGT 8 1152
729569 N/A N/A 8859 8874 TATGCAGCTTCTGCCT 3 1153
729655 N/A N/A 7480 7495 TGGCAATTAGGTGAGG 48 1154
729656 N/A N/A 8101 8116 CAAGCTACATGAAATC 11 1155
729657 N/A N/A 8627 8642 TCATGACCTAGCGGGA 11 1156
Tabela 16
Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG 83 39
665933 1561 1576 11126 11141 GCGGTCTTTGAGGTCT 64 468
666208 N/A N/A 9349 9364 CAGTTTAGCTCAGGCA 69 1157
729244 N/A N/A 9344 9359 TAGCTCAGGCAAGACC 32 1158
729245 N/A N/A 9345 9360 TTAGCTCAGGCAAGAC 17 1159
729246 N/A N/A 9346 9361 TTTAGCTCAGGCAAGA 23 1160
729247 N/A N/A 9347 9362 GTTTAGCTCAGGCAAG 24 1161
729248 N/A N/A 9348 9363 AGTTTAGCTCAGGCAA 47 1162
729249 N/A N/A 9353 9368 GCCTCAGTTTAGCTCA 23 1163
729250 N/A N/A 9354 9369 AGCCTCAGTTTAGCTC 9 1164
729570 N/A N/A 8869 8884 CTGTAGCTCCTATGCA 14 1165
729571 N/A N/A 8895 8910 AGAAGCAAGATCCCCT 2 1166
729572 N/A N/A 8905 8920 ATGTCGGAGGAGAAGC 0 1167
729573 N/A N/A 8915 8930 AAAGGAGTCAATGTCG 0 1168
729574 N/A N/A 8925 8940 GCAGGGCAGTAAAGGA 12 1169
729575 N/A N/A 8948 8963 GTCTGCACAGCAGGGA 24 1170
729576 N/A N/A 9021 9036 AACCCACACTCACCTC 25 1171
729577 N/A N/A 9046 9061 CGTCCAGGGCTCCACC 13 1172
729578 N/A N/A 9060 9075 GACAGCAGAGAGCTCG 9 1173
729579 N/A N/A 9082 9097 GCGGAAACCTAAGGCC 12 1174
729580 N/A N/A 9118 9133 ATTGAGAGGGCCACGG 27 1175
729581 N/A N/A 9133 9148 GAAACAAGGAGAACTA 29 1176
729582 N/A N/A 9151 9166 TTCAGAATCCCAGGAG 21 1177
729583 N/A N/A 9167 9182 GACTGTGCTCCTATCG 27 1178
729584 N/A N/A 9195 9210 GACAATGCCCTGGGAA 55 1179
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729585 N/A N/A 9205 9220 ACAGGGTAATGACAAT 28 1180
729586 N/A N/A 9219 9234 CGTGGGTCACACACAC 39 1181
729587 N/A N/A 9233 9248 AGCCCCAACTGCTGCG 25 1182
729588 N/A N/A 9249 9264 GGAGTCAGACCTACCA 18 1183
729589 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC 73 1184
729590 N/A N/A 9285 9300 GCCCTTTGCCTCACTT 17 1185
729591 N/A N/A 9324 9339 CTCCGGTCCCAGCTCG 6 1186
729592 N/A N/A 9334 9349 AAGACCCTGCCTCCGG 23 1187
729593 N/A N/A 9355 9370 TAGCCTCAGTTTAGCT 0 1188
729594 N/A N/A 9375 9390 GAACTATGAGGCAACT 10 1189
729595 N/A N/A 9385 9400 TAACAGGCGAGAACTA 9 1190
729596 N/A N/A 9427 9442 GAAAGGAGGACAGGTT 0 1191
729597 N/A N/A 9467 9482 TGAAGGGACACCACCA 31 1192
729598 N/A N/A 9533 9548 TAGACCCCCAACCACC 5 1193
729599 N/A N/A 9553 9568 CCTATAGCTTCTCTGT 51 1194
729600 N/A N/A 9567 9582 AGGTACCTATGGTACC 9 1195
729601 N/A N/A 9578 9593 AGCCCCCTTCCAGGTA 28 1196
729602 N/A N/A 9590 9605 TAGCCTCCCATCAGCC 11 1197
729603 N/A N/A 9602 9617 CCTGGGCCACCCTAGC 11 1198
729604 N/A N/A 9634 9649 CGAACTGCCTCCCAGG 7 1199
729605 N/A N/A 9645 9660 TGCCACCTCCACGAAC 39 1200
729606 N/A N/A 9655 9670 CGGCTGTCAGTGCCAC 17 1201
729607 N/A N/A 9683 9698 CACTGCATCTACAGAG 17 1202
729608 N/A N/A 9998 10013 CAGCCATGGGTCCTTA 18 1203
729609 N/A N/A 10009 10024 TTCCCCGTGCCCAGCC 0 1204
729610 N/A N/A 10025 10040 AATCCCCCAGCACTGC 22 1205
729611 N/A N/A 10041 10056 TTGCCAATCCTACCCC 31 1206
729612 N/A N/A 10073 10088 CACCCAAGGGAGTCCA 22 1207
SEQ ID SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do IRF5 (% de SEQ ID Nº: Sítio Sítio de Sítio de Sítio de Sequência (5' a 3') composto inibição) Nº de início 1 parada 1 início 2 parada 2
729613 N/A N/A 10099 10114 AGCCCCATCCGCCCTC 3 1208
729614 N/A N/A 10157 10172 GGCCCATCCCGTCCTT 0 1209
729615 N/A N/A 10183 10198 GGTCGGTCACTGTGGG 8 1210
729616 N/A N/A 10581 10596 CTTTGGGCCCTCACCA 0 1211
729617 N/A N/A 10591 10606 AGGATCACAGCTTTGG 12 1212
729618 N/A N/A 10616 10631 ATGCCCTGGGCAAGAG 8 1213
729619 N/A N/A 10627 10642 AGGCTGGAACCATGCC 0 1214
729620 N/A N/A 10637 10652 CCCTAGTCAGAGGCTG 11 1215
729621 N/A N/A 10647 10662 AAATCAAGGTCCCTAG 2 1216
729622 N/A N/A 10658 10673 GCTCTGCATCAAAATC 7 1217
729623 N/A N/A 10780 10795 ATGTACCTGTACAGTA 14 1218
729624 N/A N/A 10800 10815 CCGACTTTGGGATAGG 15 1219
729625 N/A N/A 10810 10825 CAAGCCAAGGCCGACT 36 1220
729626 N/A N/A 10820 10835 CCCCAGTTTTCAAGCC 13 1221
729627 N/A N/A 10833 10848 TAGCCCCAGGATTCCC 5 1222
729628 N/A N/A 10883 10898 AAGTTCACACTGCTCA 38 1223
729629 N/A N/A 10914 10929 CGGCTCTGAGCCTTGA 0 1224
729630 N/A N/A 10933 10948 AGTAATAGACCGCATT 21 1225
729631 N/A N/A 10952 10967 AGGACAGCCATCAGGG 8 1226
729632 N/A N/A 10962 10977 GCTGTGCATGAGGACA 17 1227
729633 N/A N/A 10972 10987 GCCAGATCCAGCTGTG 0 1228
729634 N/A N/A 11023 11038 ACCACCTGGGAGGCAA 16 1229
729658 N/A N/A 8885 8900 TCCCCTGAGAGGCTGC 20 1230
729659 N/A N/A 9543 9558 CTCTGTATACTAGACC 64 1231
729660 N/A N/A 10134 10149 ACGCCTCCCCATTCTG 6 1232
729661 N/A N/A 10894 10909 CTCTGGCCGCCAAGTT 5 1233
Tabela 17 Inibição de RNA de IRF5 por "gapmers" cEt 3-10-3 direcionados para as SEQ ID Nºs: 3 SEQ ID Nº: 3 Número do SEQ ID Nº: 3 IRF5 (% de SEQ ID Local de Sequência (5' a 3') composto Iniciar Local inibição) Nº Parada 728399 96 111 TCTGTCTGCGGTGCGC 26 1234 728400 98 113 GGTCTGTCTGCGGTGC 23 1235 728539 591 606 GCATCTGTGAGGCTCA 21 1236 728540 593 608 CTGCATCTGTGAGGCT 30 1237 728541 595 610 CACTGCATCTGTGAGG 8 1238 728542 597 612 TGCACTGCATCTGTGA 20 1239 728543 599 614 ACTGCACTGCATCTGT 12 1240 Exemplo 2: Inibição antissenso de IRF5 humano em células KARPAS- 229 por oligonucleotídeos modificados
[0278] No segundo estágio da triagem, os oligonucleotídeos modificados foram projetados para sítios adjacentes aos protótipos/sítios mais ativos do primeiro estágio da triagem descrito acima. Resumidamente, os protótipos ativos da primeira fase da triagem foram submetidos a "microwalk" até que os sítios previamente testados ou rejeitados foram aproximadamente atingidos. Várias modificações químicas diferentes foram testadas, que são especificadas na coluna de notação química das tabelas abaixo, sendo que a notação "d" refere-se a um açúcar 2'-desoxirribose, a notação "s" refere-se a uma ligação internucleosídica de fosforotioato, a notação "k" refere-se a um açúcar modificado cEt e a notação "mC" refere-se a uma 5-metilcitosina.
[0279] Células KARPAS-229 cultivadas a uma densidade de 10.000 células por poço foram tratadas com o uso de absorção livre com 4.000 nM de oligonucleotídeo modificado. Após um período de tratamento de aproximadamente 48 horas, o RNA foi isolado das células e os níveis de mRNA de IRF5 foram medidos por PCR em tempo real quantitativo (RT-qPCR). Conjunto de sonda-primer humana RTS4524 (sequência direta TTCGAGATCTTCTTCTGCTTTGG, desenhada na presente invenção como SEQ ID Nº: 14; Sequência reversa GCACCACCTGTACAGTAATGAGCTT; desenhada na presente invenção como SEQ ID Nº: 15; sequência de sonda CCTGACCGCAAACCCCGAGAGAA, desenhada na presente invenção como SEQ ID Nº: 16) foi usado para medir os níveis de mRNA. Os níveis de mRNA de IRF5 foram ajustados de acordo com o teor total de RNA, conforme medido por RIBOGREEN®. Os resultados são apresentados como porcentagem de inibição de IRF5 em relação às células de controle não tratadas. Como usado na presente invenção, um valor de '0' indica que o tratamento com o oligonucleotídeo modificado não inibiu os níveis de mRNA de IRF5. 'N/A' indica que o oligonucleotídeo modificado não direcionada aquela sequência gênica com 100% de complementaridade. Tabela 18 Inibição de mRNA de IRF5 por oligonucleotídeos modificados direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número Sequência (% de Nº: Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio SEQ do com- Notação química Inibi- Sítio de de de início de (5' a 3') ID Nº posto ção) início 1 parada 1 2 parada 2 666178 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA GksmCksAksTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCdsAksmCksAk 21 1003 728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCksmCksTk 48 436 728894 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG mCksAksmCksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCksAksGk 45 633 729213 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mCksAksTksTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCdsAdsmCksAksmCk 28 1006 729476 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC TksmCksmCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTdsTksmCksmCk 79 1047 785370 1762 1777 11327 11342 CATCTCCACATCAGTC mCksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCksAesGksTesmCk 25 631 785371 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG mCksAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAksTesmCksAesGk 15 633 785392 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mCksAdsTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCksAesmCksAesmCk 31 1006 785393 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA GksmCdsAdsTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAksmCesAksmCesAk 39 1003 785394 N/A N/A 6547 6562 CAATTTTGCATTCCAT mCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTdsTksmCesmCksAesTk 21 1241 785395 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC TksmCdsmCdsAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAksTesTksmCesmCk 37 1047
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número Sequência (% de Nº: Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio SEQ do com- Notação química Inibi- Sítio de de de início de (5' a 3') ID Nº posto ção) início 1 parada 1 2 parada 2
785425 1762 1777 11327 11342 CATCTCCACATCAGTC mCksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAdsTksmCesAksGesTksmCe 32 631
785426 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG mCksAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCksAesTksmCesAksGe 2 633
785447 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mCksAdsTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAksmCesAksmCesAksmCe 7 1006
785448 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA GksmCdsAdsTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTksAesmCksAesmCksAe 34 1003
785449 N/A N/A 6547 6562 CAATTTTGCATTCCAT mCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTksTesmCksmCesAksTe 19 1241
785450 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC TksmCdsmCdsAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCksAesTksTesmCksmCe 6 1047
785471 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG mC ksAes CksAdsTds CdsTds Cds CdsAds CdsAdsTes CesAksGk m m m m m m 26 633
785483 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mCksAesTksTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCdsAesmCesAksmCk 24 1006
785484 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA GksmCesAksTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCesAesmCksAk 48 1003
785485 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC TksmCesmCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTesTesmCksmCk 76 1047
785513 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT AksmCksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCksAesGksTe 36 632
785514 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG mCksAksmCdsAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAdsTksmCesAksGe 23 633
785535 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mCksAksTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCdsAksmCesAksmCe 30 1006
785536 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA GksmCksAdsTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCksAesmCksAe 37 1003
785537 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mCksmCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTdsTksmCesmCksAe 57 1242
785538 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC TksmCksmCdsAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTksTesmCksmCe 40 1047
785558 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT AksmCksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAesTesmCesAesGksTk 24 632
785570 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mC ksAksTdsTds Cds CdsAdsTdsAdsTdsAes CesAes CesAks Ck m m m m m 21 1006
785571 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mCksmCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAesTesTesmCesmCksAk 48 1242
785609 1762 1777 11327 11342 CATCTCCACATCAGTC mCksAksTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAdsTksmCesAksGesTksmCk 23 631
785610 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT AksmCksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAksTesmCksAesGksTk 15 632
785611 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG mCksAksmCdsAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCksAesTksmCesAksGk 17 633
785640 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mCksAksTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAksmCesAksmCesAksmCk 17 1006
785641 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA GksmCksAdsTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTksAesmCksAesmCksAk 0 1003
785642 N/A N/A 6547 6562 CAATTTTGCATTCCAT mC ksAksAdsTdsTdsTdsTdsGds CdsAdsTksTes Cks CesAksTk m m m 32 1241
785643 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mCksmCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAksTesTksmCesmCksAk 39 1242
785644 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC TksmCksmCdsAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCksAesTksTesmCksmCk 15 1047
785667 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT AksmCksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAdsTesmCesAesGksTk 41 632
785679 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mCksAksTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCesAesmCesAksmCk 21 1006
785680 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mCksmCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTesTesmCesmCksAk 30 1242
785697 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT AksmCksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAdsTksmCdsAksGdsTk 28 632
785709 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mCksAksTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCksAdsmCksAdsmCk 25 1006
785710 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mCksmCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTksTdsmCksmCdsAk 42 1242
785738 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT AksmCksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAdsTksmCesAksGesTk 16 632
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número Sequência (% de Nº: Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio SEQ do com- Notação química Inibi- Sítio de de de início de (5' a 3') ID Nº posto ção) início 1 parada 1 2 parada 2
785739 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG mCksAksmCdsAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAksTesmCksAesGk 22 633
785760 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mCksAksTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCksAesmCksAesmCk 54 1006
785761 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA GksmCksAdsTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAksmCesAksmCesAk 2 1003
785762 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mCksmCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTksTesmCksmCesAk 11 1242
785763 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC TksmCksmCdsAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAksTesTksmCesmCk 29 1047
785784 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG mC ksAks CksAdsTds CdsTds Cds CdsAds CdsAksTds CksAdsGk m m m m m m 39 633
785796 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mC ksAksTksTds Cds CdsAdsTdsAdsTdsAds CksAds CksAds Ck m m m m m 40 1006
785797 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA GksmCksAksTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAksmCdsAksmCdsAk 0 1003
785798 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC TksmCksmCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAksTdsTksmCdsmCk 32 1047
785826 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT AksmCksAksTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAdsTksmCesAksGesTk 14 632
785827 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG mCksAksmCksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAksTesmCksAesGk 43 633
785848 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mCksAksTksTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCksAesmCksAesmCk 32 1006
785849 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA GksmCksAksTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAksmCesAksmCesAk 0 1003
785850 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mCksmCksAksAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTksTesmCksmCesAk 42 1242
785851 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC TksmCksmCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAksTesTksmCesmCk 51 1047
785872 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG mCksAksmCksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAdsTksmCesAksGe 38 633
785884 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mCksAksTksTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCdsAksmCesAksmCe 28 1006
785885 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA GksmCksAksTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCksAesmCksAe 45 1003
785886 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC TksmCksmCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTksTesmCksmCe 14 1047
785914 1763 1778 11328 11343 ACATCTCCACATCAGT AksmCksAksTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCksAksGksTe 11 632
785915 1764 1779 11329 11344 CACATCTCCACATCAG mCksAksmCksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsAdsmCdsAdsTksmCksAksGe 25 633
785936 N/A N/A 6539 6554 CATTCCATATACACAC mCksAksTksTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCdsAksmCksAksmCe 39 1006
785937 N/A N/A 6540 6555 GCATTCCATATACACA GksmCksAksTdsTdsmCdsmCdsAdsTdsAdsTdsAdsmCksAksmCksAe 25 1003
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mCksmCksAksAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTdsTksmCksmCksAe 80 1242
785939 N/A N/A 6549 6564 TCCAATTTTGCATTCC TksmCksmCksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTksTksmCksmCe 7 1047
786505 N/A N/A 6546 6561 AATTTTGCATTCCATA AksAksTksTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTdsTdsmCdsmCdsAksTksAk 41 1243
786506 N/A N/A 6547 6562 CAATTTTGCATTCCAT mCksAksAksTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTdsTdsmCdsmCksAksTk 52 1241
786507 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mCksmCksAksAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTdsTdsmCksmCksAk 78 1242
786508 N/A N/A 6550 6565 TTCCAATTTTGCATTC TksTksmCksmCdsAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTksTksmCk 39 1244
786509 N/A N/A 6551 6566 ATTCCAATTTTGCATT AksTksTksmCdsmCdsAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAksTksTk 21 1245
786510 N/A N/A 6553 6568 TGATTCCAATTTTGCA TksGksAksTdsTdsmCdsmCdsAdsAdsTdsTdsTdsTdsGksmCksAk 17 1246
786511 N/A N/A 6555 6570 CTTGATTCCAATTTTG mCksTksTksGdsAdsTdsTdsmCdsmCdsAdsAdsTdsTdsTksTksGk 20 1247
786512 N/A N/A 6557 6572 CACTTGATTCCAATTT mCksAksmCksTdsTdsGdsAdsTdsTdsmCdsmCdsAdsAdsTksTksTk 36 1248
Tabela 19 Inibição de mRNA de IRF5 por oligonucleotídeos modificados direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número Sequência Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio (% de SEQ ID do com- Notação química de de de de parada (5' a 3') Inibi-ção) Nº posto início 1 parada 1 início 2 2 GTTATCTCCGTC GksTksTksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsm 665795 385 400 4710 4725 31 113 CTGG CdsmCdsTksGksGk AAGGGCACAGC AksAksGksGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCds 728489 484 499 8377 8392 0 1249 GCAGG GdsmCdsAksGksGk TGAGTCATGGG TksGksAksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmC 728695 1270 1285 10503 10518 0 423 CTGAG dsTdsGksAksGk ATGAGTCATGG AksTksGksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGds 728696 1271 1286 10504 10519 21 424 GCTGA mC dsTksGksAk AGCTTGGTCTTG AksGksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGd 728708 1308 1323 10541 10556 38 436 ACCT m m sAds Cks CksTk TATCTCCGTCCT TksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsmCdsmC 785345 383 398 4708 4723 0 116 GGCT m dsTksGesGks CesTk GTTATCTCCGTC GksTdsTdsAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsm 785346 385 400 4710 4725 0 113 CTGG CksmCesTksGesGk GGGCACAGCGC GksGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCdsGdsmC 785350 482 497 8375 8390 37 1250 AGGTT dsAksGesGksTesTk AAGGGCACAGC AksAdsGdsGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCds 785351 484 499 8377 8392 0 1249 GCAGG GksmCesAksGesGk AGTCATGGGCT AksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCdsTdsG 785355 1268 1283 10501 10516 25 421 GAGGC m ksAesGksGes Ck GAGTCATGGGC GksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCdsT 785356 1269 1284 10502 10517 0 422 TGAGG ksGesAksGesGk TGAGTCATGGG TksGdsAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmC 785357 1270 1285 10503 10518 0 423 CTGAG ksTesGksAesGk ATGAGTCATGG AksTdsGdsAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGks 785358 1271 1286 10504 10519 0 424 GCTGA mC T G A es ks es k 785405 482 497 8375 8390 GGGCACAGCGC GksGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCdsGdsmC 33 1250
AGGTT ksAesGksGesTksTe
AAGGGCACAGC AksAdsGdsGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCks 785406 484 499 8377 8392 0 1249 GCAGG GesmCksAesGksGe
AGTCATGGGCT AksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCdsTksG 785410 1268 1283 10501 10516 17 421 GAGGC m esAksGesGks Ce
GAGTCATGGGC GksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCksT 785411 1269 1284 10502 10517 0 422 TGAGG esGksAesGksGe
TGAGTCATGGG TksGdsAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGksmC 785412 1270 1285 10503 10518 0 423 CTGAG esTksGesAksGe
ATGAGTCATGG AksTdsGdsAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGksGes 785413 1271 1286 10504 10519 7 424 GCTGA mC T G A ks es ks e
GTTATCTCCGTC GksTesTksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsm 785457 385 400 4710 4725 13 113 CTGG CdsmCesTesGksGk
AAGGGCACAGC AksAesGksGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCds 785460 484 499 8377 8392 0 1249 GCAGG GdsmCesAesGksGk
TGAGTCATGGG TksGesAksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmC 785462 1270 1285 10503 10518 12 423 CTGAG dsTesGesAksGk
ATGAGTCATGG AksTesGksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGds 785463 1271 1286 10504 10519 0 424 GCTGA mC T G A es es ks k
TTATCTCCGTCCT TksTksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsmCds 785489 384 399 4709 4724 0 117 GGC mC T G G mC ds ks es ks e
GTTATCTCCGTC GksTksTdsAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsm 785490 385 400 4710 4725 0 113 CTGG CdsmCksTesGksGe
AAGGGCACAGC AksAksGdsGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCds 785495 484 499 8377 8392 0 1249 GCAGG GdsmCksAesGksGe
GAGTCATGGGC GksAksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCdsT 785499 1269 1284 10502 10517 40 422 TGAGG dsGksAesGksGe
TGAGTCATGGG TksGksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmC 785500 1270 1285 10503 10518 0 423 CTGAG dsTksGesAksGe
ATGAGTCATGG AksTksGdsAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGds 785501 1271 1286 10504 10519 0 424 GCTGA mC T G A ks es ks e
TTATCTCCGTCCT TksTksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsmCes 785545 384 399 4709 4724 0 117 GGC mC T G G mC es es es ks k
GAGTCATGGGC GksAksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCesT 785550 1269 1284 10502 10517 5 422 TGAGG esGesAesGksGk
TGAGTCATGGG TksGksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGesmC 785551 1270 1285 10503 10518 15 423 CTGAG esTesGesAksGk
TATCTCCGTCCT TksAksTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsmCdsmC 785575 383 398 4708 4723 6 116 GGCT m ksTesGksGes CksTk
TTATCTCCGTCCT TksTksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsmCks 785576 384 399 4709 4724 0 117 GGC mC T G G mC es ks es ks k
GTTATCTCCGTC GksTksTdsAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTksm 785577 385 400 4710 4725 0 113 CTGG CesmCksTesGksGk
GGGCACAGCGC GksGksGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCdsGdsmC 785583 482 497 8375 8390 61 1250 AGGTT ksAesGksGesTksTk
AAGGGCACAGC AksAksGdsGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCks 785584 484 499 8377 8392 0 1249 GCAGG GesmCksAesGksGk
AGTCATGGGCT AksGksTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCdsTksG 785590 1268 1283 10501 10516 17 421 GAGGC m esAksGesGks Ck
GAGTCATGGGC GksAksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCksT 785591 1269 1284 10502 10517 0 422 TGAGG esGksAesGksGk
TGAGTCATGGG TksGksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGksmC 785592 1270 1285 10503 10518 0 423 CTGAG esTksGesAksGk
ATGAGTCATGG AksTksGdsAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGksGes 785593 1271 1286 10504 10519 0 424 GCTGA mC ksTesGksAk
TTATCTCCGTCCT TksTksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsmCds 785654 384 399 4709 4724 5 117 GGC mC T G G mC es es es ks k
GAGTCATGGGC GksAksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCdsT 785659 1269 1284 10502 10517 30 422 TGAGG esGesAesGksGk
TGAGTCATGGG TksGksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmC 785660 1270 1285 10503 10518 16 423 CTGAG esTesGesAksGk
TTATCTCCGTCCT TksTksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsmCds 785684 384 399 4709 4724 14 117 GGC mC T G G mC ks ds ks ds k
GAGTCATGGGC GksAksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCdsT 785689 1269 1284 10502 10517 31 422 TGAGG ksGdsAksGdsGk
785690 1270 1285 10503 10518 TGAGTCATGGG TksGksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmC 12 423
CTGAG ksTdsGksAdsGk
TTATCTCCGTCCT TksTksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsmCds 785714 384 399 4709 4724 0 117 GGC mC T G G mC ks es ks es k
GTTATCTCCGTC GksTksTdsAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsm 785715 385 400 4710 4725 0 113 CTGG CksmCesTksGesGk
AAGGGCACAGC AksAksGdsGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCds 785720 484 499 8377 8392 0 1249 GCAGG GksmCesAksGesGk
GAGTCATGGGC GksAksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCdsT 785724 1269 1284 10502 10517 15 422 TGAGG ksGesAksGesGk
TGAGTCATGGG TksGksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmC 785725 1270 1285 10503 10518 0 423 CTGAG ksTesGksAesGk
ATGAGTCATGG AksTksGdsAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGks 785726 1271 1286 10504 10519 0 424 GCTGA mC T G A es ks es k
GTTATCTCCGTC GksTksTksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsm 785770 385 400 4710 4725 27 113 CTGG CksmCdsTksGdsGk
AAGGGCACAGC AksAksGksGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCds 785773 484 499 8377 8392 12 1249 GCAGG GksmCdsAksGdsGk
TGAGTCATGGG TksGksAksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCk 785775 1270 1285 10503 10518 3 423 CTGAG sTdsGksAdsGk
ATGAGTCATGG AksTksGksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGks 785776 1271 1286 10504 10519 0 424 GCTGA mC T G A ds ks ds k
TTATCTCCGTCCT TksTksAksTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsmCds 785802 384 399 4709 4724 0 117 GGC mC T G G mC ks es ks es k
GTTATCTCCGTC GksTksTksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsm 785803 385 400 4710 4725 0 113 CTGG CksmCesTksGesGk
AAGGGCACAGC AksAksGksGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCds 785808 484 499 8377 8392 0 1249 GCAGG GksmCesAksGesGk
GAGTCATGGGC GksAksGksTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCdsTk 785812 1269 1284 10502 10517 0 422 TGAGG sGesAksGesGk
TGAGTCATGGG TksGksAksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCk 785813 1270 1285 10503 10518 0 423 CTGAG sTesGksAesGk
ATGAGTCATGG AksTksGksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGks 785814 1271 1286 10504 10519 0 424 GCTGA mC T G A es ks es k
GTTATCTCCGTC GksTksTksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsm 785858 385 400 4710 4725 0 113 CTGG CdsmCksTesGksGe
AAGGGCACAGC AksAksGksGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCds 785861 484 499 8377 8392 0 1249 GCAGG GdsmCksAesGksGe
TGAGTCATGGG TksGksAksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmC 785863 1270 1285 10503 10518 17 423 CTGAG dsTksGesAksGe
ATGAGTCATGG AksTksGksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGds 785864 1271 1286 10504 10519 9 424 GCTGA mC T G A ks es ks e
TTATCTCCGTCCT TksTksAksTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsmCds 785890 384 399 4709 4724 0 117 GGC mC T G G mC ds ks ks ks e
GTTATCTCCGTC GksTksTksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsm 785891 385 400 4710 4725 33 113 CTGG CdsmCksTksGksGe
AAGGGCACAGC AksAksGksGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCds 785896 484 499 8377 8392 3 1249 GCAGG GdsmCksAksGksGe
GAGTCATGGGC GksAksGksTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmCdsT 785900 1269 1284 10502 10517 0 422 TGAGG dsGksAksGksGe
TGAGTCATGGG TksGksAksGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGdsmC 785901 1270 1285 10503 10518 11 423 CTGAG dsTksGksAksGe
ATGAGTCATGG AksTksGksAdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsGds 785902 1271 1286 10504 10519 20 424 GCTGA mC ksTksGksAe
CCAATTTTGCAT mC mC A A T T T T G mC A T ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds 785938 N/A N/A 6548 6563 71 1242 TCCA m m dsTks Cks CksAe
GTTATCTCCGTC GksTdsTdsAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTksm 786473 385 400 4710 4725 0 113 CTGG CesmCksTesGksGe
TATCTCCGTCCT TksAdsTdsmCdsTdsmCdsmCdsGdsTdsmCdsmC 786474 383 398 4708 4723 0 116 GGCT m ksTesGksGes CksTe
AGGGCACAGCG AksGksGksGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCdsGds 786495 483 498 8376 8391 2 1251 CAGGT mC A G G T ds ds ks ks k
TAAGGGCACAG TksAksAksGdsGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsm 786496 485 500 8378 8393 0 1252 CGCAG CdsGdsmCksAksGk
TTAAGGGCACA TksTksAksAdsGdsGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsG 786497 486 501 8379 8394 0 1253 GCGCA m m ds CdsGks CksAk
Tabela 20 Inibição de mRNA de IRF5 por oligonucleotídeos modificados direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2
SEQ ID SEQ ID
SEQ ID SEQ ID Número Nº: Sítio Nº: Sítio Sequência Nº: Nº: Sítio (% de SEQ do de de Notação química Sítio de de início (5' a 3') Inibição) ID Nº composto parada parada início 1 2 1 2 665892 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA mCksAksmCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCdsGksGksAk 1 387 665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG GksmCksAksmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCksGksGk 14 39 728466 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC GksGksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCdsmCdsmCdsTdsGksTksmCk 10 1254 728489 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG AksAksGksGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCdsGdsmCdsAksGksGk 48 1249 728670 1230 1245 10463 10478 TTGCACTGACACAGGC TksTksGksmCdsAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGksGksmCk 18 398 728705 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC GksGksTksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCdsmCksGksmCk 33 433 728706 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mC T T G G T mC T T G A mC mC T mC mC ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks k 41 434 728707 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCksTksmCk 43 435 728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCksmCksTk 14 436 729037 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCdsTksmCksAk 68 706 785354 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG GksmCdsAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGksGesmCksGesGk 0 39 785359 1301 1316 10534 10549 TCTTGACCTCCCGCTG TksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCdsmCksGesmCksTesGk 46 391 785360 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC GksGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCksmCesmCksGesmCk 37 433 785361 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCksmCesTksmCesmCk 0 434 785362 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCdsTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAksmCesmCksTesmCk 18 435 785363 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGdsmCdsTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGksAesmCksmCesTk 0 436 785409 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG GksmCdsAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAksGesGksmCesGksGe 0 39 785414 1301 1316 10534 10549 TCTTGACCTCCCGCTG TksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCksmCesGksmCesTksGe 40 391 785415 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC GksGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTksmCesmCksmCesGksmCe 35 433 785416 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAksmCesmCksTesmCksmCe 0 434 785417 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCdsTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGksAesmCksmCesTksmCe 17 435 785418 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGdsmCdsTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTksGesAksmCesmCksTe 14 436 785464 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC GksGesTksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCesmCesGksmCk 33 433 785465 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mCksTesTksGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCesTesmCksmCk 36 434 785466 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCesTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCesmCesTksmCk 46 435
SEQ ID SEQ ID
SEQ ID SEQ ID Número Nº: Sítio Nº: Sítio Sequência Nº: Nº: Sítio (% de SEQ do de de Notação química Sítio de de início Inibição) ID Nº composto parada parada (5' a 3') início 1 2 1 2 785467 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGesmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAesmCesmCksTk 38 436 785498 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG TksGksmCdsAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGksGesmCksGe 16 388 785502 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT GksTksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCdsmCksGesmCksTe 65 432 785503 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC GksGksTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCksmCesGksmCe 0 433 785504 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCksTesmCksmCe 39 434 785505 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCksmCesTksmCe 9 435 785506 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGksmCdsTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAksmCesmCksTe 0 436 785549 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG TksGksmCdsAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCesAesGesGesmCksGk 0 388 785552 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT GksTksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCesmCesmCesGesmCksTk 34 432 785553 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAesmCesmCesTesmCksmCk 20 434 785554 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGesAesmCesmCesTksmCk 19 435 785588 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG GksmCksAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAksGesGksmCesGksGk 0 39 785589 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG TksGksmCdsAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCksAesGksGesmCksGk 0 388 785594 1301 1316 10534 10549 TCTTGACCTCCCGCTG TksmCksTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCksmCesGksmCesTksGk 19 391 785595 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT GksTksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCksmCesmCksGesmCksTk 26 432 785596 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC GksGksTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTksmCesmCksmCesGksmCk 44 433 785597 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAksmCesmCksTesmCksmCk 0 434 785598 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGksAesmCksmCesTksmCk 21 435 785599 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGksmCdsTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTksGesAksmCesmCksTk 0 436 785658 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG TksGksmCdsAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAesGesGesmCksGk 18 388 785661 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT GksTksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCesmCesGesmCksTk 54 432 785662 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCesmCesTesmCksmCk 11 434 785663 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAesmCesmCesTksmCk 10 435 785688 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG TksGksmCdsAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAksGdsGksmCdsGk 0 388 785691 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT GksTksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCksmCdsGksmCdsTk 46 432 785692 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCksmCdsTksmCdsmCk 13 434 785693 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAksmCdsmCksTdsmCk 11 435 785723 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG TksGksmCdsAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAksGesGksmCesGk 0 388
SEQ ID SEQ ID
SEQ ID SEQ ID Número Nº: Sítio Nº: Sítio Sequência Nº: Nº: Sítio (% de SEQ do de de Notação química Sítio de de início Inibição) ID Nº composto parada parada (5' a 3') início 1 2 1 2 785727 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT GksTksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCksmCesGksmCesTk 40 432 785728 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC GksGksTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCksmCesmCksGesmCk 7 433 785729 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCksmCesTksmCesmCk 3 434 785730 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAksmCesmCksTesmCk 33 435 785731 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGksmCdsTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGksAesmCksmCesTk 8 436 785777 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC GksGksTksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCksmCdsmCksGdsmCk 4 433 785778 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mC T T G G T mC T T G A mC mC T mC mC ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ks ds ks ds k 19 434 785779 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAksmCdsmCksTdsmCk 30 435 785780 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGksAdsmCksmCdsTk 12 436 785811 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG TksGksmCksAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAksGesGksmCesGk 0 388 785815 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT GksTksmCksTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCksmCesGksmCesTk 23 432 785816 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC GksGksTksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCksmCesmCksGesmCk 29 433 785817 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mCksTksTksGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCksmCesTksmCesmCk 1 434 785818 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAksmCesmCksTesmCk 0 435 785819 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGksAesmCksmCesTk 3 436 785865 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC GksGksTksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCksmCesGksmCe 7 433 785866 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mCksTksTksGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCksTesmCksmCe 15 434 785867 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCksmCesTksmCe 35 435 785868 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAksmCesmCksTe 26 436 785899 1229 1244 10462 10477 TGCACTGACACAGGCG TksGksmCksAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGksGksmCksGe 0 388 785903 1302 1317 10535 10550 GTCTTGACCTCCCGCT GksTksmCksTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCdsmCksGksmCksTe 51 432 785904 1303 1318 10536 10551 GGTCTTGACCTCCCGC GksGksTksmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCdsTdsmCdsmCksmCksGksmCe 22 433 785905 1306 1321 10539 10554 CTTGGTCTTGACCTCC mCksTksTksGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCksTksmCksmCe 6 434 785906 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCksmCksTksmCe 29 435 785907 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAksmCksmCksTe 10 436 785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mCksmCksAksAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTdsTksmCksmCksAe 30 1242
Tabela 21 Inibição de mRNA de IRF5 por oligonucleotídeos modificados direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número Sequência Nº: Nº: Sítio Nº: Nº: Sítio (% de SEQ do Notação química Sítio de de Sítio de de Inibição) ID Nº composto (5' a 3') início 1 parada 1 início 2 parada 2 665908 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG GksGksTksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTdsTksGksGk 16 393 728466 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC GksGksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCdsmCdsmCdsTdsGksTksmCk 50 1254 728670 1230 1245 10463 10478 TTGCACTGACACAGGC TksTksGksmCdsAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGksGksmCk 8 398 728707 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCksTksmCk 0 435 728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCksmCksTk 16 436 729037 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCdsTksmCksAk 0 706 729038 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGksGksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCksTksmCk 0 707 729039 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT mCksAksGksGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTksmCksTk 0 708 785364 1361 1376 10682 10697 TCTGGCCCTTTTGGAA TksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTdsTksGesGksAesAk 0 454 785365 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG GksGdsTdsmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTksTesTksGesGk 0 393 785378 2214 2229 11779 11794 TTCTTGGACTCTCAAG TksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCdsTksmCesAksAesGk 0 705 785379 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA GksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCksTesmCksAesAk 35 695 785380 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTksmCesTksmCesAk 9 706 785381 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGdsGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCksTesmCksTesmCk 34 707 785382 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT mCksAdsGdsGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAksmCesTksmCesTk 0 708 785419 1361 1376 10682 10697 TCTGGCCCTTTTGGAA TksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTksTesGksGesAksAe 0 454 785420 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG GksGdsTdsmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTksTesTksTesGksGe 0 393 785433 2214 2229 11779 11794 TTCTTGGACTCTCAAG TksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCksTesmCksAesAksGe 0 705 785434 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA GksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTksmCesTksmCesAksAe 0 695 785435 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCksTesmCksTesmCksAe 0 706 785436 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGdsGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAksmCesTksmCesTksmCe 0 707 785437 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT mC ksAdsGdsGdsTdsTds CdsTdsTdsGdsGksAes CksTes CksTe m m m 0 708 785468 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG GksGesTksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTesTesGksGk 13 393 785475 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGesTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCesTesmCksAk 60 706 785476 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGesGksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTesmCesTksmCk 0 707
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número Sequência Nº: Nº: Sítio Nº: Nº: Sítio (% de SEQ do Notação química Sítio de de Sítio de de Inibição) ID Nº composto (5' a 3') início 1 parada 1 início 2 parada 2
785477 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT mC ksAesGksGdsTdsTds CdsTdsTdsGdsGdsAds CesTes CksTk m m m 48 708
785507 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA GksTksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTdsTksGesGksAe 0 455
785508 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG GksGksTdsmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTksTesGksGe 0 393
785521 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA GksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCdsTksmCesAksAe 27 695
785522 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCksTesmCksAe 51 706
785523 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGksGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTksmCesTksmCe 41 707
785524 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT mCksAksGdsGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCksTesmCksTe 28 708
785555 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA GksTksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTesTesTesGesGksAk 0 455
785562 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA GksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTesmCesTesmCesAksAk 8 695
785563 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCesTesmCesTesmCksAk 54 706
785564 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGksGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAesmCesTesmCesTksmCk 17 707
785600 1361 1376 10682 10697 TCTGGCCCTTTTGGAA TksmCksTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTksTesGksGesAksAk 0 454
785601 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA GksTksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTksTesTksGesGksAk 0 455
785602 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG GksGksTdsmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTksTesTksTesGksGk 0 393
785621 2214 2229 11779 11794 TTCTTGGACTCTCAAG TksTksmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCksTesmCksAesAksGk 0 705
785622 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA GksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTksmCesTksmCesAksAk 0 695
785623 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCksTesmCksTesmCksAk 0 706
785624 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGksGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAksmCesTksmCesTksmCk 0 707
785625 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT mCksAksGdsGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGksAesmCksTesmCksTk 0 708
785664 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA GksTksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTesTesGesGksAk 0 455
785671 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA GksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCesTesmCesAksAk 22 695
785672 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTesmCesTesmCksAk 48 706
785673 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGksGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCesTesmCesTksmCk 0 707
785694 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA GksTksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTksTdsGksGdsAk 0 455
785701 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA GksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCksTdsmCksAdsAk 20 695
785702 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTksmCdsTksmCdsAk 29 706
785703 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGksGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCksTdsmCksTdsmCk 36 707
785732 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA GksTksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTksTesGksGesAk 0 455
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número Sequência Nº: Nº: Sítio Nº: Nº: Sítio (% de SEQ do Notação química Sítio de de Sítio de de Inibição) ID Nº composto (5' a 3') início 1 parada 1 início 2 parada 2
785733 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG GksGksTdsmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTksTesTksGesGk 3 393
785746 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA GksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCksTesmCksAesAk 31 695
785747 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTksmCesTksmCesAk 0 706
785748 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGksGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCksTesmCksTesmCk 38 707
785749 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT mCksAksGdsGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAksmCesTksmCesTk 0 708
785781 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG GksGksTksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTksTdsTksGdsGk 0 393
785788 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTksmCdsTksmCdsAk 28 706
785789 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGksGksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCksTdsmCksTdsmCk 0 707
785790 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT mCksAksGksGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAksmCdsTksmCdsTk 0 708
785820 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA GksTksmCksTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTksTesGksGesAk 0 455
785821 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG GksGksTksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTksTesTksGesGk 2 393
785834 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA GksTksTksmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCksTesmCksAesAk 0 695
785835 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTksmCesTksmCesAk 25 706
785836 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGksGksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCksTesmCksTesmCk 8 707
785837 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT mCksAksGksGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAksmCesTksmCesTk 0 708
785869 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG GksGksTksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTksTesGksGe 17 393
785876 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCksTesmCksAe 48 706
785877 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGksGksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTksmCesTksmCe 0 707
785878 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT mCksAksGksGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCksTesmCksTe 1 708
785908 1362 1377 10683 10698 GTCTGGCCCTTTTGGA GksTksmCksTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTdsTksGksGksAe 0 455
785909 1363 1378 10684 10699 GGTCTGGCCCTTTTGG GksGksTksmCdsTdsGdsGdsmCdsmCdsmCdsTdsTdsTksTksGksGe 0 393
785922 2215 2230 11780 11795 GTTCTTGGACTCTCAA GksTksTksmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCdsTksmCksAksAe 37 695
785923 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCksTksmCksAe 0 706
785924 2217 2232 11782 11797 AGGTTCTTGGACTCTC AksGksGksTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTksmCksTksmCe 19 707
785925 2218 2233 11783 11798 CAGGTTCTTGGACTCT mCksAksGksGdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCksTksmCksTe 0 708
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mCksmCksAksAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTdsTksmCksmCksAe 71 1242
Tabela 22 Inibição de mRNA de IRF5 por oligonucleotídeos modificados direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio Sequência (% de SEQ do Notação química de de para- de início de para- (5' a 3') Inibição) ID Nº composto início 1 da 1 2 da 2 728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCksmCksTk 12 436 728898 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC GksmCksTksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCdsmCksAksmCk 33 637 729049 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG TksTksAksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCdsAksGksGk 55 718 729589 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC mCksmCksTksTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAdsGksTksmCk 0 1184 785372 1767 1782 11332 11347 TGTCACATCTCCACAT TksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCdsmCksAesmCksAesTk 16 635 785373 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC GksmCdsTdsGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTksmCesmCksAesmCk 17 637 785383 2228 2243 11793 11808 ATTTCTGCTCCAGGTT AksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCdsAksGesGksTesTk 39 696 785384 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG TksTdsAdsTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCksmCesAksGesGk 0 718 785400 N/A N/A 9257 9272 TTCTGCAGGGAGTCAG TksTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAdsGksTesmCksAesGk 4 1255 785401 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC mCksmCdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGksAesGksTesmCk 0 1184 785427 1767 1782 11332 11347 TGTCACATCTCCACAT TksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCksmCesAksmCesAksTe 0 635 785428 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC GksmCdsTdsGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCksTesmCksmCesAksmCe 0 637 785438 2228 2243 11793 11808 ATTTCTGCTCCAGGTT AksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCksAesGksGesTksTe 13 696 785439 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG TksTdsAdsTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTksmCesmCksAesGksGe 0 718 785455 N/A N/A 9257 9272 TTCTGCAGGGAGTCAG TksTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAksGesTksmCesAksGe 0 1255 785456 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC mC mC T T mC T G mC A G G G A G T mC ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks es ks e 0 1184 785472 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC GksmCesTksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCesmCesAksmCk 0 637 785478 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG TksTesAksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCesAesGksGk 56 718 785488 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC mCksmCesTksTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAesGesTksmCk 14 1184 785515 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA mCksTksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCdsmCksAesmCksAe 19 636 785516 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC GksmCksTdsGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCksmCesAksmCe 8 637 785525 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT TksAksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCdsAksGesGksTe 49 717 785526 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG TksTksAdsTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCksAesGksGe 26 718 785543 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA mC T T mC T G mC A G G G A G T mC A ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks e 8 1256 785544 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC mCksmCksTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAksGesTksmCe 0 1184 785559 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA mCksTksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTesmCesmCesAesmCksAk 11 636 785565 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT TksAksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCesmCesAesGesGksTk 43 717 785574 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA mCksTksTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGesAesGesTesmCksAk 0 1256 785612 1767 1782 11332 11347 TGTCACATCTCCACAT TksGksTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCksmCesAksmCesAksTk 0 635 785613 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA mCksTksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTksmCesmCksAesmCksAk 0 636 785614 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC GksmCksTdsGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCksTesmCksmCesAksmCk 29 637 785626 2228 2243 11793 11808 ATTTCTGCTCCAGGTT AksTksTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCksAesGksGesTksTk 6 696 785627 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT TksAksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCksmCesAksGesGksTk 0 717 785628 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG TksTksAdsTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTksmCesmCksAesGksGk 0 718 785651 N/A N/A 9257 9272 TTCTGCAGGGAGTCAG TksTksmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAksGesTksmCesAksGk 0 1255 785652 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA mCksTksTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGksAesGksTesmCksAk 0 1256 785653 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC mCksmCksTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGksGesAksGesTksmCk 0 1184 785668 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA mCksTksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCesmCesAesmCksAk 10 636 785674 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT TksAksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCesAesGesGksTk 44 717
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio Sequência (% de SEQ do Notação química de de para- de início de para- (5' a 3') Inibição) ID Nº composto início 1 da 1 2 da 2 785683 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA mC T T mC T G mC A G G G A G T mC A ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds es es es ks k 0 1256 785698 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA mCksTksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCksmCdsAksmCdsAk 6 636 785704 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT TksAksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCksAdsGksGdsTk 27 717 785713 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA mCksTksTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAksGdsTksmCdsAk 0 1256 785740 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA mCksTksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCksmCesAksmCesAk 23 636 785741 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC GksmCksTdsGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTksmCesmCksAesmCk 5 637 785750 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT TksAksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCksAesGksGesTk 5 717 785751 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG TksTksAdsTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCksmCesAksGesGk 9 718 785768 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA mCksTksTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAksGesTksmCesAk 0 1256 785769 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC mCksmCksTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGksAesGksTesmCk 0 1184 785785 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC GksmCksTksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTksmCdsmCksAdsmCk 35 637 785791 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG TksTksAksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCksmCdsAksGdsGk 57 718 785801 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC mC mC T T mC T G mC A G G G A G T mC ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ks ds ks ds k 0 1184 785828 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA mCksTksGksTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCksmCesAksmCesAk 0 636 785829 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC GksmCksTksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTksmCesmCksAesmCk 0 637 785838 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT TksAksTksTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCksAesGksGesTk 24 717 785839 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG TksTksAksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCksmCesAksGesGk 23 718 785856 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA mCksTksTksmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAksGesTksmCesAk 0 1256 785857 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC mCksmCksTksTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGksAesGksTesmCk 0 1184 785873 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC GksmCksTksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCksmCesAksmCe 3 637 785879 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG TksTksAksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCksAesGksGe 43 718 785889 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC mCksmCksTksTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAksGesTksmCe 1 1184 785916 1768 1783 11333 11348 CTGTCACATCTCCACA mC T G T mC A mC A T mC T mC mC A mC A ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks ks e 28 636 785917 1769 1784 11334 11349 GCTGTCACATCTCCAC GksmCksTksGdsTdsmCdsAdsmCdsAdsTdsmCdsTdsmCksmCksAksmCe 23 637 785926 2229 2244 11794 11809 TATTTCTGCTCCAGGT TksAksTksTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCdsAksGksGksTe 45 717 785927 2230 2245 11795 11810 TTATTTCTGCTCCAGG TksTksAksTdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsTdsmCdsmCksAksGksGe 28 718 785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mCksmCksAksAdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsAdsTdsTksmCksmCksAe 75 1242 785944 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA mCksTksTksmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAdsGksTksmCksAe 0 1256 785945 N/A N/A 9259 9274 CCTTCTGCAGGGAGTC mCksmCksTksTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAksGksTksmCe 0 1184 786513 N/A N/A 9250 9265 GGGAGTCAGACCTACC GksGksGksAdsGdsTdsmCdsAdsGdsAdsmCdsmCdsTdsAksmCksmCk 0 1257 786514 N/A N/A 9252 9267 CAGGGAGTCAGACCTA mCksAksGksGdsGdsAdsGdsTdsmCdsAdsGdsAdsmCdsmCksTksAk 0 1258 786515 N/A N/A 9254 9269 TGCAGGGAGTCAGACC TksGksmCksAdsGdsGdsGdsAdsGdsTdsmCdsAdsGdsAksmCksmCk 0 1259 786516 N/A N/A 9256 9271 TCTGCAGGGAGTCAGA TksmCksTksGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAdsGdsTdsmCdsAksGksAk 0 1260 786517 N/A N/A 9257 9272 TTCTGCAGGGAGTCAG TksTksmCksTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAdsGdsTdsmCksAksGk 0 1255 786518 N/A N/A 9258 9273 CTTCTGCAGGGAGTCA mCksTksTksmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAdsGdsTksmCksAk 0 1256 786519 N/A N/A 9260 9275 GCCTTCTGCAGGGAGT GksmCksmCksTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGdsAksGksTk 0 1261 786520 N/A N/A 9261 9276 TGCCTTCTGCAGGGAG TksGksmCksmCdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGdsGksAksGk 0 1262 786521 N/A N/A 9262 9277 TTGCCTTCTGCAGGGA TksTksGksmCdsmCdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsAdsGdsGksGksAk 0 1263 786522 N/A N/A 9264 9279 ATTTGCCTTCTGCAGG AksTksTksTdsGdsmCdsmCdsTdsTdsmCdsTdsGdsmCdsAksGksGk 0 1264 786523 N/A N/A 9266 9281 TCATTTGCCTTCTGCA TksmCksAksTdsTdsTdsGdsmCdsmCdsTdsTdsmCdsTdsGksmCksAk 6 1265
Tabela 23 Inibição de mRNA de IRF5 por oligonucleotídeos modificados direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2 SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do SEQ ID Nº: Sítio SEQ ID Nº: Sítio Sequência (% de SEQ Sítio de Sítio de Notação química composto de parada 1 de início 2 (5' a 3') Inibição) ID Nº início 1 parada 2
GGTGTATTTC GksGksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmC 728466 427 442 8320 8335 37 1254 CCTGTC ds Cds CdsTdsGksTks Ck m m m
AGCTTGGTCT AksGksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCds 728708 1308 1323 10541 10556 37 436 TGACCT TdsTdsGdsAdsmCksmCksTk
AGGAAGTGAG AksGksGksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGd 728998 2119 2134 11684 11699 42 208 TCTCAA sTds CdsTds CksAksAk m m
TCTGATATGAT TksmCksTksGdsAdsTdsAdsTdsGdsAd 729018 2172 2187 11737 11752 63 228 ACCTA sTdsAdsmCdsmCksTksAk
AGGAGTGAGA AksGksGksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAd 729454 N/A N/A 5170 5185 56 995 CGAGCA smCdsGdsAdsGksmCksAk
GAAGTGAGTC GksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGdsTdsm 785376 2117 2132 11682 11697 44 207 TCAAAC CdsTdsmCksAesAksAesmCk
AGGAAGTGAG AksGdsGdsAdsAdsGdsTdsGdsAdsG 785377 2119 2134 11684 11699 11 208 TCTCAA dsTdsmCksTesmCksAesAk
GAGTGAGACG GksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAdsmCds 785387 N/A N/A 5168 5183 18 1266 AGCAAA GdsAdsGksmCesAksAesAk
AGGAGTGAGA AksGdsGdsAdsGdsTdsGdsAdsGdsA 785388 N/A N/A 5170 5185 37 995 CGAGCA dsmCdsGksAesGksmCesAk
GAAGTGAGTC GksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGdsTdsm 785431 2117 2132 11682 11697 11 207 TCAAAC CdsTksmCesAksAesAksmCe
AGGAAGTGAG AksGdsGdsAdsAdsGdsTdsGdsAdsG 785432 2119 2134 11684 11699 23 208 TCTCAA dsTksmCesTksmCesAksAe
GAGTGAGACG GksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAdsmCds 785442 N/A N/A 5168 5183 6 1266 AGCAAA GdsAksGesmCksAesAksAe
AGGAGTGAGA AksGdsGdsAdsGdsTdsGdsAdsGdsA 785443 N/A N/A 5170 5185 0 995 CGAGCA dsmCksGesAksGesmCksAe
AGGAAGTGAG AksGesGksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGd 785474 2119 2134 11684 11699 43 208 TCTCAA sTdsmCdsTesmCesAksAk
AGGAGTGAGA AksGesGksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAd 785480 N/A N/A 5170 5185 22 995 CGAGCA smCdsGdsAesGesmCksAk
SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do SEQ ID Nº: Sítio SEQ ID Nº: Sítio Sequência (% de SEQ Sítio de Sítio de Notação química composto de parada 1 de início 2 (5' a 3') Inibição) ID Nº início 1 parada 2
GGAAGTGAGT GksGksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGdsTd 785519 2118 2133 11683 11698 55 1267 CTCAAA s CdsTds CksAesAksAe m m
AGGAAGTGAG AksGksGdsAdsAdsGdsTdsGdsAdsGd 785520 2119 2134 11684 11699 39 208 TCTCAA sTdsmCdsTksmCesAksAe
GGAGTGAGAC GksGksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAdsm 785529 N/A N/A 5169 5184 33 1268 GAGCAA CdsGdsAdsGksmCesAksAe
AGGAGTGAGA AksGksGdsAdsGdsTdsGdsAdsGdsAd 785530 N/A N/A 5170 5185 28 995 CGAGCA smCdsGdsAksGesmCksAe
GGAAGTGAGT GksGksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGdsTd 785561 2118 2133 11683 11698 34 1267 CTCAAA smCesTesmCesAesAksAk
GGAGTGAGAC GksGksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAdsm 785567 N/A N/A 5169 5184 17 1268 GAGCAA CdsGesAesGesmCesAksAk
GAAGTGAGTC GksAksAdsGdsTdsGdsAdsGdsTdsm 785618 2117 2132 11682 11697 27 207 TCAAAC CdsTksmCesAksAesAksmCk
GGAAGTGAGT GksGksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGdsTd 785619 2118 2133 11683 11698 36 1267 CTCAAA smCksTesmCksAesAksAk
AGGAAGTGAG AksGksGdsAdsAdsGdsTdsGdsAdsGd 785620 2119 2134 11684 11699 20 208 TCTCAA sTks CesTks CesAksAk m m
GAGTGAGACG GksAksGdsTdsGdsAdsGdsAdsmCds 785632 N/A N/A 5168 5183 17 1266 AGCAAA GdsAksGesmCksAesAksAk
GGAGTGAGAC GksGksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAdsm 785633 N/A N/A 5169 5184 38 1268 GAGCAA CdsGksAesGksmCesAksAk
AGGAGTGAGA AksGksGdsAdsGdsTdsGdsAdsGdsAd 785634 N/A N/A 5170 5185 35 995 CGAGCA smCksGesAksGesmCksAk
GGAAGTGAGT GksGksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGdsTd 785670 2118 2133 11683 11698 32 1267 CTCAAA smCdsTesmCesAesAksAk
GGAGTGAGAC GksGksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAdsm 785676 N/A N/A 5169 5184 25 1268 GAGCAA CdsGdsAesGesmCesAksAk
GGAAGTGAGT GksGksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGdsTd 785700 2118 2133 11683 11698 12 1267 CTCAAA smCdsTksmCdsAksAdsAk
GGAGTGAGAC GksGksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAdsm 785706 N/A N/A 5169 5184 16 1268 GAGCAA CdsGdsAksGdsmCksAdsAk
SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do SEQ ID Nº: Sítio SEQ ID Nº: Sítio Sequência (% de SEQ Sítio de Sítio de Notação química composto de parada 1 de início 2 (5' a 3') Inibição) ID Nº início 1 parada 2
GGAAGTGAGT GksGksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGdsTd 785744 2118 2133 11683 11698 25 1267 CTCAAA s CdsTks CesAksAesAk m m
AGGAAGTGAG AksGksGdsAdsAdsGdsTdsGdsAdsGd 785745 2119 2134 11684 11699 42 208 TCTCAA sTdsmCksTesmCksAesAk
GGAGTGAGAC GksGksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAdsm 785754 N/A N/A 5169 5184 27 1268 GAGCAA CdsGdsAksGesmCksAesAk
AGGAGTGAGA AksGksGdsAdsGdsTdsGdsAdsGdsAd 785755 N/A N/A 5170 5185 36 995 CGAGCA smCdsGksAesGksmCesAk
AGGAAGTGAG AksGksGksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGd 785787 2119 2134 11684 11699 40 208 TCTCAA sTdsmCksTdsmCksAdsAk
AGGAGTGAGA AksGksGksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAd 785793 N/A N/A 5170 5185 37 995 CGAGCA smCdsGksAdsGksmCdsAk
GGAAGTGAGT GksGksAksAdsGdsTdsGdsAdsGdsTd 785832 2118 2133 11683 11698 45 1267 CTCAAA s CdsTks CesAksAesAk m m
AGGAAGTGAG AksGksGksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGd 785833 2119 2134 11684 11699 24 208 TCTCAA sTdsmCksTesmCksAesAk
GGAGTGAGAC GksGksAksGdsTdsGdsAdsGdsAdsm 785842 N/A N/A 5169 5184 5 1268 GAGCAA CdsGdsAksGesmCksAesAk
AGGAGTGAGA AksGksGksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAd 785843 N/A N/A 5170 5185 24 995 CGAGCA smCdsGksAesGksmCesAk
AGGAAGTGAG AksGksGksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGd 785875 2119 2134 11684 11699 21 208 TCTCAA sTdsmCdsTksmCesAksAe
AGGAGTGAGA AksGksGksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAd 785881 N/A N/A 5170 5185 42 995 CGAGCA smCdsGdsAksGesmCksAe
GGAAGTGAGT GksGksAksAdsGdsTdsGdsAdsGdsTd 785920 2118 2133 11683 11698 49 1267 CTCAAA smCdsTdsmCksAksAksAe
AGGAAGTGAG AksGksGksAdsAdsGdsTdsGdsAdsGd 785921 2119 2134 11684 11699 47 208 TCTCAA sTdsmCdsTksmCksAksAe
GGAGTGAGAC GksGksAksGdsTdsGdsAdsGdsAdsm 785930 N/A N/A 5169 5184 33 1268 GAGCAA CdsGdsAdsGksmCksAksAe
AGGAGTGAGA AksGksGksAdsGdsTdsGdsAdsGdsAd 785931 N/A N/A 5170 5185 37 995 CGAGCA smCdsGdsAksGksmCksAe
SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do SEQ ID Nº: Sítio SEQ ID Nº: Sítio Sequência (% de SEQ Sítio de Sítio de Notação química composto de parada 1 de início 2 (5' a 3') Inibição) ID Nº início 1 parada 2
CCAATTTTGCA mCksmCksAksAdsTdsTdsTdsTdsGdsm 785938 N/A N/A 6548 6563 10 1242 TTCCA CdsAdsTdsTksmCksmCksAe
GGAAGTGAGT GksGksAksAdsGdsTdsGdsAdsGdsTd 786501 2118 2133 11683 11698 51 1267 CTCAAA smCdsTdsmCdsAksAksAk
GAGGAAGTGA GksAksGksGdsAdsAdsGdsTdsGdsAd 786502 2120 2135 11685 11700 0 1269 GTCTCA sGdsTdsmCdsTksmCksAk
CTGATATGATA mCksTksGksAdsTdsAdsTdsGdsAdsTd 786503 2171 2186 11736 11751 59 1270 CCTAA sAdsmCdsmCdsTksAksAk
ATCTGATATGA AksTksmCksTdsGdsAdsTdsAdsTdsGd 786504 2173 2188 11738 11753 36 1271 TACCT sAdsTdsAdsmCksmCksTk
ACGAGTTATG AksmCksGksAdsGdsTdsTdsAdsTdsG 786524 N/A N/A 5141 5156 74 1272 GGAAGG dsGdsGdsAdsAksGksGk
GGACGAGTTA GksGksAksmCdsGdsAdsGdsTdsTdsA 786525 N/A N/A 5143 5158 37 1273 TGGGAA dsTdsGdsGdsGksAksAk
TAGGACGAGT TksAksGksGdsAdsmCdsGdsAdsGdsT 786526 N/A N/A 5145 5160 25 1274 TATGGG dsTdsAdsTdsGksGksGk
AGTAGGACGA AksGksTksAdsGdsGdsAdsmCdsGds 786527 N/A N/A 5147 5162 0 1275 GTTATG AdsGdsTdsTdsAksTksGk
TGAGTAGGAC TksGksAksGdsTdsAdsGdsGdsAdsmC 786528 N/A N/A 5149 5164 18 1276 GAGTTA dsGdsAdsGdsTksTksAk
GGTGAGTAGG GksGksTksGdsAdsGdsTdsAdsGdsGd 786529 N/A N/A 5151 5166 48 1277 ACGAGT sAdsmCdsGdsAksGksTk
AGGGTGAGTA AksGksGksGdsTdsGdsAdsGdsTdsAd 786530 N/A N/A 5153 5168 19 1278 GGACGA sGdsGdsAdsmCksGksAk
AAAGGGTGAG AksAksAksGdsGdsGdsTdsGdsAdsGd 786531 N/A N/A 5155 5170 24 1279 TAGGAC sTdsAdsGdsGksAksmCk
GCAAAGGGTG GksmCksAksAdsAdsGdsGdsGdsTds 786532 N/A N/A 5157 5172 24 1280 AGTAGG GdsAdsGdsTdsAksGksGk
GAGCAAAGGG GksAksGksmCdsAdsAdsAdsGdsGds 786533 N/A N/A 5159 5174 0 1281 TGAGTA GdsTdsGdsAdsGksTksAk
ACGAGCAAAG AksmCksGksAdsGdsmCdsAdsAdsAds 786534 N/A N/A 5161 5176 47 1282 GGTGAG GdsGdsGdsTdsGksAksGk
SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: Número do SEQ ID Nº: Sítio SEQ ID Nº: Sítio Sequência (% de SEQ Sítio de Sítio de Notação química composto de parada 1 de início 2 (5' a 3') Inibição) ID Nº início 1 parada 2
AGACGAGCAA AksGksAksmCdsGdsAdsGdsmCdsAds 786535 N/A N/A 5163 5178 35 1283 AGGGTG AdsAdsGdsGdsGksTksGk
GAGACGAGCA GksAksGksAdsmCdsGdsAdsGdsmCd 786536 N/A N/A 5164 5179 40 1284 AAGGGT sAdsAdsAdsGdsGksGksTk
TGAGACGAGC TksGksAksGdsAdsmCdsGdsAdsGdsm 786537 N/A N/A 5165 5180 22 1285 AAAGGG CdsAdsAdsAdsGksGksGk
GTGAGACGAG GksTksGksAdsGdsAdsmCdsGdsAds 786538 N/A N/A 5166 5181 49 1286 CAAAGG GdsmCdsAdsAdsAksGksGk
AGTGAGACGA AksGksTksGdsAdsGdsAdsmCdsGds 786539 N/A N/A 5167 5182 16 1287 GCAAAG AdsGdsmCdsAdsAksAksGk
GAGTGAGACG GksAksGksTdsGdsAdsGdsAdsmCds 786540 N/A N/A 5168 5183 27 1266 AGCAAA GdsAdsGdsmCdsAksAksAk
GGAGTGAGAC GksGksAksGdsTdsGdsAdsGdsAdsm 786541 N/A N/A 5169 5184 37 1268 GAGCAA CdsGdsAdsGdsmCksAksAk
TAGGAGTGAG TksAksGksGdsAdsGdsTdsGdsAdsGd 786542 N/A N/A 5171 5186 1 1288 ACGAGC sAdsmCdsGdsAksGksmCk
ATAGGAGTGA AksTksAksGdsGdsAdsGdsTdsGdsAd 786543 N/A N/A 5172 5187 16 1289 GACGAG sGdsAds CdsGksAksGk m
AATAGGAGTG AksAksTksAdsGdsGdsAdsGdsTdsGd 786544 N/A N/A 5173 5188 25 1290 AGACGA sAdsGdsAdsmCksGksAk
TAATAGGAGT TksAksAksTdsAdsGdsGdsAdsGdsTds 786545 N/A N/A 5174 5189 12 1291 GAGACG GdsAdsGdsAksmCksGk
GTAATAGGAG GksTksAksAdsTdsAdsGdsGdsAdsGd 786546 N/A N/A 5175 5190 11 1292 TGAGAC sTdsGdsAdsGksAksmCk
GAGTAATAGG GksAksGksTdsAdsAdsTdsAdsGdsGd 786547 N/A N/A 5177 5192 33 1293 AGTGAG sAdsGdsTdsGksAksGk
ATGAGTAATA AksTksGksAdsGdsTdsAdsAdsTdsAds 786548 N/A N/A 5179 5194 56 1294 GGAGTG GdsGdsAdsGksTksGk
TCATGAGTAAT TksmCksAksTdsGdsAdsGdsTdsAdsA 786549 N/A N/A 5181 5196 11 1295 AGGAG dsTdsAdsGdsGksAksGk
CCTCATGAGT mCksmCksTksmCdsAdsTdsGdsAdsGd 786550 N/A N/A 5183 5198 0 1296 AATAGG sTdsAdsAdsTdsAksGksGk
Tabela 24 Inibição de mRNA de IRF5 por oligonucleotídeos modificados direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio Sequência % de SEQ do Notação química de início de de de (5' a 3') Inibição ID Nº composto 1 parada 1 início 2 parada 2 665892 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA mCksAksmCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCdsGksGksAk 0 387 665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG GksmCksAksmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCksGksGk 0 39 728466 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC GksGksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCdsmCdsmCdsTdsGksTksmCk 27 1254 728489 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG AksAksGksGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCdsGdsmCdsAksGksGk 42 1249 728670 1230 1245 10463 10478 TTGCACTGACACAGGC TksTksGksmCdsAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGksGksmCk 21 398 728707 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCksTksmCk 52 435 728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCksmCksTk 40 436 728958 1979 1994 11544 11559 CCTATACAGCTAGGCC mCksmCksTksAdsTdsAdsmCdsAdsGdsmCdsTdsAdsGdsGksmCksmCk 0 168 729037 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCdsTksmCksAk 68 706 729494 N/A N/A 6958 6973 GAATTTTGTGACTGTA GksAksAksTdsTdsTdsTdsGdsTdsGdsAdsmCdsTdsGksTksAk 57 1065 729495 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT AksmCksmCksAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCdsTksTksTk 70 1066 785352 1225 1240 10458 10473 CTGACACAGGCGGATG mCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCdsGksGesAksTesGk 0 1297 785353 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA mCksAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGksmCesGksGesAk 0 387 785396 N/A N/A 6979 6994 CATTCTATGCCTTTTA mCksAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCdsTksTesTksTesAk 37 1298 785397 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT AksmCdsmCdsAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCksmCesTksTesTk 0 1066 785407 1225 1240 10458 10473 CTGACACAGGCGGATG mCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCksGesGksAesTksGe 0 1297 785408 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA mCksAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGksGesmCksGesGksAe 0 387 785451 N/A N/A 6979 6994 CATTCTATGCCTTTTA mCksAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCksTesTksTesTksAe 13 1298 785452 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT AksmCdsmCdsAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGksmCesmCksTesTksTe 10 1066 785461 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA mCksAesmCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCesGesGksAk 0 387 785486 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT AksmCesmCksAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCesTesTksTk 51 1066 785496 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT AksmCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCdsGksGesAksTe 0 397 785497 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA mCksAksmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCksGesGksAe 0 387 785539 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT mCksmCksAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCdsTksTesTksTe 61 1299 785540 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT AksmCksmCdsAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCksTesTksTe 51 1066 785548 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT AksmCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGesmCesGesGesAksTk 0 397
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número Sequência Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio % de SEQ do Notação química de início de de de (5' a 3') Inibição ID Nº composto 1 parada 1 início 2 parada 2
785572 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT mCksmCksAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCesmCesTesTesTksTk 17 1299
785585 1225 1240 10458 10473 CTGACACAGGCGGATG mCksTksGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCksGesGksAesTksGk 0 1297
785586 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT AksmCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGksmCesGksGesAksTk 0 397
785587 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA mCksAksmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGksGesmCksGesGksAk 0 387
785645 N/A N/A 6979 6994 CATTCTATGCCTTTTA mCksAksTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCksTesTksTesTksAk 56 1298
785646 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT mCksmCksAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCksmCesTksTesTksTk 3 1299
785647 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT AksmCksmCdsAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGksmCesmCksTesTksTk 0 1066
785657 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT AksmCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCesGesGesAksTk 0 397
785681 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT mC mC A T T mC T A T G mC mC T T T T ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds es es es ks k 50 1299
785687 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT AksmCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCksGdsGksAdsTk 6 397
785711 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT mCksmCksAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCksTdsTksTdsTk 46 1299
785721 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT AksmCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCksGesGksAesTk 0 397
785722 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA mCksAksmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGksmCesGksGesAk 0 387
785764 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT mC mC A T T mC T A T G mC mC T T T T ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks es k 62 1299
785765 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT AksmCksmCdsAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCksmCesTksTesTk 40 1066
785774 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA mCksAksmCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGksmCdsGksGdsAk 0 387
785799 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT AksmCksmCksAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCksmCdsTksTdsTk 11 1066
785809 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT AksmCksTksGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCksGesGksAesTk 0 397
785810 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA mCksAksmCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGksmCesGksGesAk 0 387
785852 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT mCksmCksAksTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCksTesTksTesTk 44 1299
785853 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT AksmCksmCksAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCksmCesTksTesTk 15 1066
785862 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA mCksAksmCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCksGesGksAe 0 387
785887 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT AksmCksmCksAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCksTesTksTe 49 1066
785897 1226 1241 10459 10474 ACTGACACAGGCGGAT AksmCksTksGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCdsGksGksAksTe 0 397
785898 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA mCksAksmCksTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCksGksGksAe 0 387
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mC mC A A T T T T G mC A T T mC mC A ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks ks e 0 1242
785940 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT mC mC A T T mC T A T G mC mC T T T T ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks ks e 58 1299
785941 N/A N/A 6981 6996 ACCATTCTATGCCTTT AksmCksmCksAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCksTksTksTe 59 1066
786551 N/A N/A 6979 6994 CATTCTATGCCTTTTA mCksAksTksTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCdsTdsTdsTksTksAk 24 1298
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número Sequência Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio % de SEQ do Notação química de início de de de (5' a 3') Inibição ID Nº composto 1 parada 1 início 2 parada 2
786552 N/A N/A 6980 6995 CCATTCTATGCCTTTT mCksmCksAksTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCdsTdsTksTksTk 43 1299
786553 N/A N/A 6982 6997 AACCATTCTATGCCTT AksAksmCksmCdsAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCdsmCksTksTk 33 1300
786554 N/A N/A 6983 6998 AAACCATTCTATGCCT AksAksAksmCdsmCdsAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGdsmCksmCksTk 0 1301
786555 N/A N/A 6984 6999 TAAACCATTCTATGCC TksAksAksAdsmCdsmCdsAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTdsGksmCksmCk 9 1302
786556 N/A N/A 6985 7000 CTAAACCATTCTATGC mCksTksAksAdsAdsmCdsmCdsAdsTdsTdsmCdsTdsAdsTksGksmCk 0 1303
786557 N/A N/A 6987 7002 CTCTAAACCATTCTAT mCksTksmCksTdsAdsAdsAdsmCdsmCdsAdsTdsTdsmCdsTksAksTk 0 1304
786558 N/A N/A 6989 7004 TGCTCTAAACCATTCT TksGksmCksTdsmCdsTdsAdsAdsAdsmCdsmCdsAdsTdsTksmCksTk 0 1305
786559 N/A N/A 6991 7006 TTTGCTCTAAACCATT TksTksTksGdsmCdsTdsmCdsTdsAdsAdsAdsmCdsmCdsAksTksTk 2 1306
786560 N/A N/A 6994 7009 CTTTTTGCTCTAAACC mC ksTksTksTdsTdsTdsGds CdsTds CdsTdsAdsAdsAks Cks Ck m m m m 0 1307
786561 N/A N/A 6997 7012 AGACTTTTTGCTCTAA AksGksAksmCdsTdsTdsTdsTdsTdsGdsmCdsTdsmCdsTksAksAk 0 1308
786587 N/A N/A 6948 6963 ACTGTATTACCTATAC AksmCksTksGdsTdsAdsTdsTdsAdsmCdsmCdsTdsAdsTksAksmCk 22 1309
786588 N/A N/A 6949 6964 GACTGTATTACCTATA GksAksmCksTdsGdsTdsAdsTdsTdsAdsmCdsmCdsTdsAksTksAk 41 1310
786589 N/A N/A 6950 6965 TGACTGTATTACCTAT TksGksAksmCdsTdsGdsTdsAdsTdsTdsAdsmCdsmCdsTksAksTk 18 1311
786590 N/A N/A 6951 6966 GTGACTGTATTACCTA GksTksGksAdsmCdsTdsGdsTdsAdsTdsTdsAdsmCdsmCksTksAk 62 1312
786591 N/A N/A 6952 6967 TGTGACTGTATTACCT TksGksTksGdsAdsmCdsTdsGdsTdsAdsTdsTdsAdsmCksmCksTk 81 1313
786592 N/A N/A 6953 6968 TTGTGACTGTATTACC TksTksGksTdsGdsAdsmCdsTdsGdsTdsAdsTdsTdsAksmCksmCk 56 1314
786593 N/A N/A 6954 6969 TTTGTGACTGTATTAC TksTksTksGdsTdsGdsAdsmCdsTdsGdsTdsAdsTdsTksAksmCk 50 1315
786594 N/A N/A 6955 6970 TTTTGTGACTGTATTA TksTksTksTdsGdsTdsGdsAdsmCdsTdsGdsTdsAdsTksTksAk 2 1316
786595 N/A N/A 6956 6971 ATTTTGTGACTGTATT AksTksTksTdsTdsGdsTdsGdsAdsmCdsTdsGdsTdsAksTksTk 4 1317
786596 N/A N/A 6957 6972 AATTTTGTGACTGTAT AksAksTksTdsTdsTdsGdsTdsGdsAdsmCdsTdsGdsTksAksTk 0 1318
786597 N/A N/A 6959 6974 TGAATTTTGTGACTGT TksGksAksAdsTdsTdsTdsTdsGdsTdsGdsAdsmCdsTksGksTk 64 1319
786598 N/A N/A 6960 6975 TTGAATTTTGTGACTG TksTksGksAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsTdsGdsAdsmCksTksGk 45 1320
786599 N/A N/A 6961 6976 GTTGAATTTTGTGACT GksTksTksGdsAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsTdsGdsAksmCksTk 0 1321
786600 N/A N/A 6962 6977 TGTTGAATTTTGTGAC TksGksTksTdsGdsAdsAdsTdsTdsTdsTdsGdsTdsGksAksmCk 26 1322
Tabela 25 Inibição de mRNA de IRF5 por oligonucleotídeos modificados direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2 SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: % de Número do Sequência SEQ Sítio de início Sítio de parada Sítio de início Sítio de parada Notação química Ini- composto (5' a 3') ID Nº 1 1 2 2 bição
GGTGTATTT GksGksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCd 728466 427 442 8320 8335 12 1254 CCCTGTC s Cds CdsTdsGksTks Ck m m m
AAGGGCACA AksAksGksGdsGdsmCdsAdsmCdsAds 728489 484 499 8377 8392 0 1249 GCGCAGG GdsmCdsGdsmCdsAksGksGk
TTGCACTGA TksTksGksmCdsAdsmCdsTdsGdsAdsm 728670 1230 1245 10463 10478 6 398 CACAGGC CdsAdsmCdsAdsGksGksmCk
AGCTTGGTC AksGksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsT 728708 1308 1323 10541 10556 11 436 TTGACCT dsTdsGdsAdsmCksmCksTk
CCCAATGCA mCksmCksmCksAdsAdsTdsGdsmCdsA 729513 N/A N/A 7316 7331 12 1097 ACATCCA dsAdsmCdsAdsTdsmCksmCksAk
GGTGTATTT GksGdsTdsGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCd 785349 427 442 8320 8335 0 1254 CCCTGTC smCdsmCksTesGksTesmCk
CAATGCAAC mCksAdsAdsTdsGdsmCdsAdsAdsmCds 785398 N/A N/A 7314 7329 0 1323 ATCCATC AdsTdsmCksmCesAksTesmCk
CCCAATGCA mCksmCdsmCdsAdsAdsTdsGdsmCdsA 785399 N/A N/A 7316 7331 0 1097 ACATCCA dsAdsmCdsAksTesmCksmCesAk
GGTGTATTT GksGdsTdsGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCd 785404 427 442 8320 8335 0 1254 CCCTGTC s Cks CesTksGesTks Ce m m m
CAATGCAAC mCksAdsAdsTdsGdsmCdsAdsAdsmCds 785453 N/A N/A 7314 7329 0 1323 ATCCATC AdsTksmCesmCksAesTksmCe
CCCAATGCA mCksmCdsmCdsAdsAdsTdsGdsmCdsA 785454 N/A N/A 7316 7331 0 1097 ACATCCA dsAdsmCksAesTksmCesmCksAe
GGTGTATTT GksGesTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCd 785459 427 442 8320 8335 5 1254 CCCTGTC smCdsmCdsTesGesTksmCk
CCCAATGCA mCksmCesmCksAdsAdsTdsGdsmCdsA 785487 N/A N/A 7316 7331 0 1097 ACATCCA dsAds CdsAdsTes Ces CksAk m m m
GTGTATTTC GksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCdsmC 785493 426 441 8319 8334 0 1324 CCTGTCT dsmCdsTdsGksTesmCksTe
GGTGTATTT GksGksTdsGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCd 785494 427 442 8320 8335 21 1254 CCCTGTC smCdsmCdsTksGesTksmCe
CCAATGCAA mCksmCksAdsAdsTdsGdsmCdsAdsAds 785541 N/A N/A 7315 7330 0 1325 CATCCAT mC dsAdsTds Cks CesAksTe m m
CCCAATGCA mCksmCksmCdsAdsAdsTdsGdsmCdsA 785542 N/A N/A 7316 7331 0 1097 ACATCCA dsAdsmCdsAdsTksmCesmCksAe
785547 426 441 8319 8334 GTGTATTTC GksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCdsmC 0 1324
SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: % de Número do Sequência SEQ Sítio de início Sítio de parada Sítio de início Sítio de parada Notação química Ini- composto (5' a 3') ID Nº 1 1 2 2 bição
CCTGTCT ds CesTesGesTes CksTk m m
CCAATGCAA mCksmCksAdsAdsTdsGdsmCdsAdsAds 785573 N/A N/A 7315 7330 0 1325 CATCCAT mCdsAesTesmCesmCesAksTk
GTGTATTTC GksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCdsmC 785581 426 441 8319 8334 0 1324 CCTGTCT dsmCksTesGksTesmCksTk
GGTGTATTT GksGksTdsGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCd 785582 427 442 8320 8335 0 1254 CCCTGTC smCksmCesTksGesTksmCk
CAATGCAAC mCksAksAdsTdsGdsmCdsAdsAdsmCds 785648 N/A N/A 7314 7329 0 1323 ATCCATC AdsTksmCesmCksAesTksmCk
CCAATGCAA mCksmCksAdsAdsTdsGdsmCdsAdsAds 785649 N/A N/A 7315 7330 0 1325 CATCCAT mCdsAksTesmCksmCesAksTk
CCCAATGCA mCksmCksmCdsAdsAdsTdsGdsmCdsA 785650 N/A N/A 7316 7331 0 1097 ACATCCA dsAds CksAesTks Ces CksAk m m m
GTGTATTTC GksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCdsmC 785656 426 441 8319 8334 16 1324 CCTGTCT dsmCdsTesGesTesmCksTk
CCAATGCAA mCksmCksAdsAdsTdsGdsmCdsAdsAds 785682 N/A N/A 7315 7330 0 1325 CATCCAT mCdsAdsTesmCesmCesAksTk
GTGTATTTC GksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCdsmC 785686 426 441 8319 8334 0 1324 CCTGTCT ds CdsTksGdsTks CdsTk m m
CCAATGCAA mCksmCksAdsAdsTdsGdsmCdsAdsAds 785712 N/A N/A 7315 7330 0 1325 CATCCAT mCdsAdsTksmCdsmCksAdsTk
GTGTATTTC GksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCdsmC 785718 426 441 8319 8334 0 1324 CCTGTCT ds CdsTksGesTks CesTk m m
GGTGTATTT GksGksTdsGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCd 785719 427 442 8320 8335 26 1254 CCCTGTC s Cds CksTesGksTes Ck m m m
CCAATGCAA mCksmCksAdsAdsTdsGdsmCdsAdsAds 785766 N/A N/A 7315 7330 0 1325 CATCCAT mCdsAdsTksmCesmCksAesTk
CCCAATGCA mCksmCksmCdsAdsAdsTdsGdsmCdsA 785767 N/A N/A 7316 7331 0 1097 ACATCCA dsAds CdsAksTes Cks CesAk m m m
GGTGTATTT GksGksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCd 785772 427 442 8320 8335 1 1254 CCCTGTC smCdsmCksTdsGksTdsmCk
CCCAATGCA mCksmCksmCksAdsAdsTdsGdsmCdsA 785800 N/A N/A 7316 7331 0 1097 ACATCCA dsAdsmCdsAksTdsmCksmCdsAk
GTGTATTTC GksTksGksTdsAdsTdsTdsTdsmCdsmC 785806 426 441 8319 8334 0 1324 CCTGTCT dsmCdsTksGesTksmCesTk
GGTGTATTT GksGksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCd 785807 427 442 8320 8335 0 1254 CCCTGTC smCdsmCksTesGksTesmCk
CCAATGCAA mCksmCksAksAdsTdsGdsmCdsAdsAds 785854 N/A N/A 7315 7330 0 1325 CATCCAT mCdsAdsTksmCesmCksAesTk
SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: SEQ ID Nº: % de Número do Sequência SEQ Sítio de início Sítio de parada Sítio de início Sítio de parada Notação química Ini- composto (5' a 3') ID Nº 1 1 2 2 bição
CCCAATGCA mCksmCksmCksAdsAdsTdsGdsmCdsA 785855 N/A N/A 7316 7331 0 1097 ACATCCA dsAds CdsAksTes Cks CesAk m m m
GGTGTATTT GksGksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCd 785860 427 442 8320 8335 0 1254 CCCTGTC smCdsmCdsTksGesTksmCe
CCCAATGCA mCksmCksmCksAdsAdsTdsGdsmCdsA 785888 N/A N/A 7316 7331 0 1097 ACATCCA dsAdsmCdsAdsTksmCesmCksAe
GTGTATTTC GksTksGksTdsAdsTdsTdsTdsmCdsmC 785894 426 441 8319 8334 30 1324 CCTGTCT dsmCdsTdsGksTksmCksTe
GGTGTATTT GksGksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCd 785895 427 442 8320 8335 0 1254 CCCTGTC smCdsmCdsTksGksTksmCe
CCAATTTTG mCksmCksAksAdsTdsTdsTdsTdsGdsm 785938 N/A N/A 6548 6563 61 1242 CATTCCA CdsAdsTdsTksmCksmCksAe CCAATGCAA mCksmCksAksAdsTdsGdsmCdsAdsAds 785942 N/A N/A 7315 7330 16 1325 CATCCAT mC dsAdsTds Cks CksAksTe m m
CCCAATGCA mCksmCksmCksAdsAdsTdsGdsmCdsA 785943 N/A N/A 7316 7331 0 1097 ACATCCA dsAdsmCdsAdsTksmCksmCksAe
CGGTGTATT mCksGksGksTdsGdsTdsAdsTdsTdsTd 786494 428 443 8321 8336 0 1326 TCCCTGT smCdsmCdsmCdsTksGksTk
ACATCCATC AksmCksAksTdsmCdsmCdsAdsTdsmCd 786562 N/A N/A 7307 7322 0 1327 AATGAGG sAdsAdsTdsGdsAksGksGk
CAACATCCA mCksAksAksmCdsAdsTdsmCdsmCdsAd 786563 N/A N/A 7309 7324 0 1328 TCAATGA sTdsmCdsAdsAdsTksGksAk
TGCAACATC TksGksmCksAdsAdsmCdsAdsTdsmCds 786564 N/A N/A 7311 7326 0 1329 CATCAAT mC dsAdsTds CdsAksAksTk m
ATGCAACAT AksTksGksmCdsAdsAdsmCdsAdsTdsm 786565 N/A N/A 7312 7327 0 1330 CCATCAA CdsmCdsAdsTdsmCksAksAk AATGCAACA AksAksTksGdsmCdsAdsAdsmCdsAdsT 786566 N/A N/A 7313 7328 0 1331 TCCATCA dsmCdsmCdsAdsTksmCksAk
CAATGCAAC mCksAksAksTdsGdsmCdsAdsAdsmCds 786567 N/A N/A 7314 7329 0 1323 ATCCATC AdsTdsmCdsmCdsAksTksmCk
CCAATGCAA mCksmCksAksAdsTdsGdsmCdsAdsAds 786568 N/A N/A 7315 7330 0 1325 CATCCAT mCdsAdsTdsmCdsmCksAksTk
ACCCAATGC AksmCksmCksmCdsAdsAdsTdsGdsmC 786569 N/A N/A 7317 7332 33 1332 AACATCC dsAdsAdsmCdsAdsTksmCksmCk
TACCCAATG TksAksmCksmCdsmCdsAdsAdsTdsGds 786570 N/A N/A 7318 7333 0 1333 CAACATC mCdsAdsAdsmCdsAksTksmCk
ATACCCAAT AksTksAksmCdsmCdsmCdsAdsAdsTds 786571 N/A N/A 7319 7334 1 1334 GCAACAT GdsmCdsAdsAdsmCksAksTk
Tabela 26 Inibição de mRNA de IRF5 por oligonucleotídeos modificados direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID
SEQ Sequência Número do Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio % de Notação química ID composto de início de de início de Inibição (5' a 3') Nº 1 parada 1 2 parada 2 665892 1227 1242 10460 10475 CACTGACACAGGCGGA mC A mC T G A mC A mC A G G mC G G A ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks k 0 387 665893 1228 1243 10461 10476 GCACTGACACAGGCGG GksmCksAksmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGdsGdsmCksGksGk 0 39 666168 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC AksTksmCksAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAksmCksmCk 11 927 728458 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC AksGksAksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCdsTksmCksmCk 0 123 728466 427 442 8320 8335 GGTGTATTTCCCTGTC GksGksTksGdsTdsAdsTdsTdsTdsmCdsmCdsmCdsTdsGksTksmCk 37 1254 728489 484 499 8377 8392 AAGGGCACAGCGCAGG AksAksGksGdsGdsmCdsAdsmCdsAdsGdsmCdsGdsmCdsAksGksGk 2 1249 728670 1230 1245 10463 10478 TTGCACTGACACAGGC TksTksGksmCdsAdsmCdsTdsGdsAdsmCdsAdsmCdsAdsGksGksmCk 0 398 728707 1307 1322 10540 10555 GCTTGGTCTTGACCTC GksmCksTksTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCdsmCksTksmCk 0 435 728708 1308 1323 10541 10556 AGCTTGGTCTTGACCT AksGksmCksTdsTdsGdsGdsTdsmCdsTdsTdsGdsAdsmCksmCksTk 41 436 728958 1979 1994 11544 11559 CCTATACAGCTAGGCC mC mC T A T A mC A G mC T A G G mC mC ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks k 0 168 728996 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG GksTksGksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCdsmCksAksGk 9 206 729037 2216 2231 11781 11796 GGTTCTTGGACTCTCA GksGksTksTdsmCdsTdsTdsGdsGdsAdsmCdsTdsmCdsTksmCksAk 47 706 785347 390 405 4715 4730 ATGGTGTTATCTCCGT AksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCdsTksmCesmCksGesTk 0 122 785348 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC AksGdsAdsTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTksmCesTksmCesmCk 0 123 785374 2112 2127 11677 11692 GAGTCTCAAACCAGGG GksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCdsmCksAesGksGesGk 0 205 785375 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG GksTdsGdsAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAksmCesmCksAesGk 0 206 785390 N/A N/A 5284 5299 CACTGTGTACCCC mC A mC mC A mC T G T G T A mC mC mC mC ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks es k 0 938 785391 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC AksTdsmCdsAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGksTesAksmCesmCk 0 927 785402 390 405 4715 4730 ATGGTGTTATCTCCGT AksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCksTesmCksmCesGksTe 0 122 785403 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC AksGdsAdsTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAksTesmCksTesmCksmCe 0 123 785429 2112 2127 11677 11692 GAGTCTCAAACCAGGG GksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCksmCesAksGesGksGe 6 205 785430 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG GksTdsGdsAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAksAesmCksmCesAksGe 0 206 785445 N/A N/A 5284 5299 CACTGTGTACCCC mC A mC mC A mC T G T G T A mC mC mC mC ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks es ks e 0 938 785446 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC AksTdsmCdsAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTksGesTksAesmCksmCe 0 927 785458 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC AksGesAksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCesTesmCksmCk 0 123
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID
SEQ Sequência Número do Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio % de Notação química ID composto de início de de início de (5' a 3') Inibição Nº 1 parada 1 2 parada 2 785473 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG GksTesGksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCesmCesAksGk 22 206 785482 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC AksTesmCksAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTesAesmCksmCk 0 927 785491 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG GksAksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCdsTksmCesmCksGe 0 1335 785492 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC AksGksAdsTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCksTesmCksmCe 0 123 785517 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG TksGksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCdsmCksAesGksGe 7 1336 785518 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG GksTksGdsAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCksmCesAksGe 31 206 785533 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC TksmCksAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAksmCesmCksmCe 0 939 785534 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC AksTksmCdsAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTksAesmCksmCe 0 927 785546 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG GksAksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTesmCesTesmCesmCksGk 0 1335 785560 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG TksGksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAesmCesmCesAesGksGk 0 1336 785569 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC TksmCksAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGesTesAesmCesmCksmCk 0 939 785578 390 405 4715 4730 ATGGTGTTATCTCCGT AksTksGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCksTesmCksmCesGksTk 0 122 785579 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG GksAksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTksmCesTksmCesmCksGk 0 1335 785580 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC AksGksAdsTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAksTesmCksTesmCksmCk 0 123 785615 2112 2127 11677 11692 GAGTCTCAAACCAGGG GksAksGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCksmCesAksGesGksGk 0 205 785616 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG TksGksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAksmCesmCksAesGksGk 0 1336 785617 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG GksTksGdsAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAksAesmCksmCesAksGk 9 206 785637 N/A N/A 5284 5299 CACTGTGTACCCC mC A mC mC A mC T G T G T A mC mC mC mC ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks es ks k 0 938 785638 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC TksmCksAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGksTesAksmCesmCksmCk 0 939 785639 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC AksTksmCdsAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTksGesTksAesmCksmCk 0 927 785655 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG GksAksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCesTesmCesmCksGk 0 1335 785669 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG TksGksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCesmCesAesGksGk 0 1336 785678 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC TksmCksAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTesAesmCesmCksmCk 0 939 785685 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG GksAksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCksTdsmCksmCdsGk 0 1335 785699 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG TksGksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCksmCdsAksGdsGk 0 1336 785708 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC TksmCksAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTksAdsmCksmCdsmCk 0 939 785716 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG GksAksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCksTesmCksmCesGk 0 1335 785717 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC AksGksAdsTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTksmCesTksmCesmCk 0 123
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID
SEQ Sequência Número do Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Sítio % de Notação química ID composto de início de de início de (5' a 3') Inibição Nº 1 parada 1 2 parada 2 785742 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG TksGksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCksmCesAksGesGk 0 1336 785743 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG GksTksGdsAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAksmCesmCksAesGk 0 206 785758 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC TksmCksAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTksAesmCksmCesmCk 0 939 785759 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC AksTksmCdsAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGksTesAksmCesmCk 0 927 785771 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC AksGksAksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTksmCdsTksmCdsmCk 0 123 785786 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG GksTksGksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAksmCdsmCksAdsGk 0 206 785795 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC AksTksmCksAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGksTdsAksmCdsmCk 0 927 785804 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG GksAksTksGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCksTesmCksmCesGk 0 1335 785805 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC AksGksAksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTksmCesTksmCesmCk 0 123 785830 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG TksGksAksGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCksmCesAksGesGk 0 1336 785831 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG GksTksGksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAksmCesmCksAesGk 0 206 785846 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC TksmCksAksmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTksAesmCksmCesmCk 0 939 785847 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC AksTksmCksAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGksTesAksmCesmCk 0 927 785859 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC AksGksAksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCksTesmCksmCe 8 123 785874 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG GksTksGksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCksmCesAksGe 0 206 785883 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC AksTksmCksAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTksAesmCksmCe 0 927 785892 391 406 4716 4731 GATGGTGTTATCTCCG GksAksTksGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCdsTksmCksmCksGe 0 1335 785893 392 407 4717 4732 AGATGGTGTTATCTCC AksGksAksTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCksTksmCksmCe 0 123 785918 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG TksGksAksGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCdsmCksAksGksGe 0 1336 785919 2114 2129 11679 11694 GTGAGTCTCAAACCAG GksTksGksAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCksmCksAksGe 44 206 785934 N/A N/A 5285 5300 TCACCACTGTGTACCC TksmCksAksmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAksmCksmCksmCe 21 939 785935 N/A N/A 5286 5301 ATCACCACTGTGTACC AksTksmCksAdsmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTksAksmCksmCe 19 927 785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mC mC A A T T T T G mC A T T mC mC A ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks ks e 68 1242 786493 393 408 4718 4733 AAGATGGTGTTATCTC AksAksGksAdsTdsGdsGdsTdsGdsTdsTdsAdsTdsmCksTksmCk 0 1337 786499 2113 2128 11678 11693 TGAGTCTCAAACCAGG TksGksAksGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCdsmCdsAksGksGk 16 1336 786500 2115 2130 11680 11695 AGTGAGTCTCAAACCA AksGksTksGdsAdsGdsTdsmCdsTdsmCdsAdsAdsAdsmCksmCksAk 0 1338
Tabela 27 Inibição de mRNA de IRF5 por oligonucleotídeos modificados direcionados para as SEQ ID Nºs: 1 e 2
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número do Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Nº: Sítio Sequência % de SEQ Notação química composto de de Sítio de de (5' a 3') Inibição ID Nº início 1 parada 1 início 2 parada 2 728806 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG mC G G T mC T T T G A G G T mC T G ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks k 32 539 729205 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA AksmCksmCksAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCdsmCdsmCksmCksAk 75 937 729433 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG TksTksGksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAdsTksGksGk 60 974 785368 1558 1573 11123 11138 GTCTTTGAGGTCTGGG GksTdsmCdsTdsTdsTdsGdsAdsGdsGdsTdsmCksTesGksGesGk 0 537 785369 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG mC G G T mC T T T G A G G T mC T G ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks es k 68 539 785385 N/A N/A 4365 4380 GTCTAGTGTCATGGAA GksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAdsTksGesGksAesAk 42 1339 785386 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG TksTdsGdsTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCksAesTksGesGk 44 974 785389 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA AksmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCksmCesmCksmCesAk 43 937 785423 1558 1573 11123 11138 GTCTTTGAGGTCTGGG GksTdsmCdsTdsTdsTdsGdsAdsGdsGdsTksmCesTksGesGksGe 33 537 785424 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG mC G G T mC T T T G A G G T mC T G ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks es ks e 40 539 785440 N/A N/A 4365 4380 GTCTAGTGTCATGGAA GksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAksTesGksGesAksAe 35 1339 785441 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG TksTdsGdsTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTksmCesAksTesGksGe 8 974 785444 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA AksmCdsmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAksmCesmCksmCesmCksAe 40 937 785470 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG mC G G T mC T T T G A G G T mC T G ks es ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds es es ks k 49 539 785479 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG TksTesGksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAesTesGksGk 55 974 785481 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA AksmCesmCksAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCdsmCesmCesmCksAk 63 937 785511 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG GksGksTdsmCdsTdsTdsTdsGdsAdsGdsGdsTdsmCksTesGksGe 67 538 785512 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG mC G G T mC T T T G A G G T mC T G ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks e 43 539 785527 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA TksGksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAdsTksGesGksAe 44 1340 785528 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG TksTksGdsTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAksTesGksGe 38 974 785531 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT mCksmCksAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCdsmCdsmCksmCesAksTe 19 936 785532 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA AksmCksmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCdsmCksmCesmCksAe 66 937
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número do Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Nº: Sítio Sequência % de SEQ Notação química composto de de Sítio de de (5' a 3') Inibição ID Nº início 1 parada 1 início 2 parada 2
785557 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG GksGksTdsmCdsTdsTdsTdsGdsAdsGdsGesTesmCesTesGksGk 56 538
785566 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA TksGksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCesAesTesGesGksAk 54 1340
785568 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT mCksmCksAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCesmCesmCesmCesAksTk 44 936
785606 1558 1573 11123 11138 GTCTTTGAGGTCTGGG GksTksmCdsTdsTdsTdsGdsAdsGdsGdsTksmCesTksGesGksGk 34 537
785607 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG GksGksTdsmCdsTdsTdsTdsGdsAdsGdsGksTesmCksTesGksGk 52 538
785608 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG mC G G T mC T T T G A G G T mC T G ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks es ks k 33 539
785629 N/A N/A 4365 4380 GTCTAGTGTCATGGAA GksTksmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAksTesGksGesAksAk 9 1339
785630 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA TksGksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCksAesTksGesGksAk 10 1340
785631 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG TksTksGdsTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTksmCesAksTesGksGk 0 974
785635 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT mC mC A mC T G T G T A mC mC mC mC A T ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks es ks k 0 936
785636 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA AksmCksmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAksmCesmCksmCesmCksAk 15 937
785666 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG GksGksTdsmCdsTdsTdsTdsGdsAdsGdsGdsTesmCesTesGksGk 74 538
785675 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA TksGksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAesTesGesGksAk 60 1340
785677 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT mCksmCksAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCdsmCesmCesmCesAksTk 64 936
785696 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG GksGksTdsmCdsTdsTdsTdsGdsAdsGdsGdsTksmCdsTksGdsGk 56 538
785705 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA TksGksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAksTdsGksGdsAk 40 1340
785707 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT mCksmCksAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCdsmCksmCdsmCksAdsTk 54 936
785736 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG GksGksTdsmCdsTdsTdsTdsGdsAdsGdsGdsTksmCesTksGesGk 54 538
785737 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG mC G G T mC T T T G A G G T mC T G ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks es k 44 539
785752 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA TksGksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAksTesGksGesAk 44 1340
785753 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG TksTksGdsTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCksAesTksGesGk 24 974
785756 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT mCksmCksAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCdsmCksmCesmCksAesTk 42 936
785757 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA AksmCksmCdsAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCksmCesmCksmCesAk 17 937
785783 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG mC G G T mC T T T G A G G T mC T G ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ks ds ks ds k 57 539
785792 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG TksTksGksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCksAdsTksGdsGk 36 974
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número do Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Nº: Sítio Sequência % de SEQ Notação química composto de de Sítio de de (5' a 3') Inibição ID Nº início 1 parada 1 início 2 parada 2
785794 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA AksmCksmCksAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCksmCdsmCksmCdsAk 40 937
785824 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG GksGksTksmCdsTdsTdsTdsGdsAdsGdsGdsTksmCesTksGesGk 46 538
785825 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG mC G G T mC T T T G A G G T mC T G ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks es k 56 539
785840 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA TksGksTksmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAksTesGksGesAk 57 1340
785841 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG TksTksGksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCksAesTksGesGk 16 974
785844 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT mC mC A mC T G T G T A mC mC mC mC A T ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks es k 10 936
785845 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA AksmCksmCksAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCksmCesmCksmCesAk 6 937
785871 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG mC G G T mC T T T G A G G T mC T G ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks es ks e 38 539
785880 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG TksTksGksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAksTesGksGe 39 974
785882 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA AksmCksmCksAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCdsmCksmCesmCksAe 39 937
785912 1559 1574 11124 11139 GGTCTTTGAGGTCTGG GksGksTksmCdsTdsTdsTdsGdsAdsGdsGdsTdsmCksTksGksGe 33 538
785913 1560 1575 11125 11140 CGGTCTTTGAGGTCTG mC G G T mC T T T G A G G T mC T G ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks ks e 32 539
785928 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA TksGksTksmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAdsTksGksGksAe 39 1340
785929 N/A N/A 4367 4382 TTGTCTAGTGTCATGG TksTksGksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAksTksGksGe 20 974
785932 N/A N/A 5282 5297 CCACTGTGTACCCCAT mC mC A mC T G T G T A mC mC mC mC A T ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks ks e 57 936
785933 N/A N/A 5283 5298 ACCACTGTGTACCCCA AksmCksmCksAdsmCdsTdsGdsTdsGdsTdsAdsmCdsmCksmCksmCksAe 47 937
785938 N/A N/A 6548 6563 CCAATTTTGCATTCCA mC mC A A T T T T G mC A T T mC mC A ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks ks e 75 1242
786572 N/A N/A 4358 4373 GTCATGGAATTTTGTG GksTksmCksAdsTdsGdsGdsAdsAdsTdsTdsTdsTdsGksTksGk 54 1341
786573 N/A N/A 4360 4375 GTGTCATGGAATTTTG GksTksGksTdsmCdsAdsTdsGdsGdsAdsAdsTdsTdsTksTksGk 58 1342
786574 N/A N/A 4362 4377 TAGTGTCATGGAATTT TksAksGksTdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsAdsAdsTksTksTk 38 1343
786575 N/A N/A 4363 4378 CTAGTGTCATGGAATT mC T A G T G T mC A T G G A A T T ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks k 34 1344
786576 N/A N/A 4364 4379 TCTAGTGTCATGGAAT TksmCksTksAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGdsAksAksTk 14 1345
786577 N/A N/A 4365 4380 GTCTAGTGTCATGGAA GksTksmCksTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAdsTdsGdsGksAksAk 38 1339
786578 N/A N/A 4366 4381 TGTCTAGTGTCATGGA TksGksTksmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAdsTdsGksGksAk 61 1340
786579 N/A N/A 4368 4383 CTTGTCTAGTGTCATG mC T T G T mC T A G T G T mC A T G ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks k 58 1346
SEQ ID SEQ ID SEQ ID SEQ ID Número do Nº: Sítio Nº: Sítio Nº: Nº: Sítio Sequência % de SEQ Notação química composto de de Sítio de de (5' a 3') Inibição ID Nº início 1 parada 1 início 2 parada 2 786580 N/A N/A 4369 4384 TCTTGTCTAGTGTCAT TksmCksTksTdsGdsTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCksAksTk 0 1347 786581 N/A N/A 4370 4385 TTCTTGTCTAGTGTCA TksTksmCksTdsTdsGdsTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTksmCksAk 49 1348 786582 N/A N/A 4371 4386 TTTCTTGTCTAGTGTC TksTksTksmCdsTdsTdsGdsTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGksTksmCk 53 1349 786583 N/A N/A 4372 4387 CTTTCTTGTCTAGTGT mC T T T mC T T G T mC T A G T G T ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks k 48 1350 786584 N/A N/A 4374 4389 AGCTTTCTTGTCTAGT AksGksmCksTdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsTdsmCdsTdsAksGksTk 20 1351 786585 N/A N/A 4376 4391 TCAGCTTTCTTGTCTA TksmCksAksGdsmCdsTdsTdsTdsmCdsTdsTdsGdsTdsmCksTksAk 15 1352 786586 N/A N/A 4378 4393 CATCAGCTTTCTTGTC mC A T mC A G mC T T T mC T T G T mC ks ks ks ds ds ds ds ds ds ds ds ds ds ks ks k 28 1353 Exemplo 3: Inibição dose-dependente de IRF5 humano por "gapmer"s cEt
[0280] Os oligonucleotídeos modificados descritos nos estudos acima que mostraram inibição significativa in vitro de RNA de IRF5 foram selecionados e testados em várias doses em células THP-1, bem como em células KARPAS-229. Os oligonucleotídeos modificados foram testados em uma série de experimentos que tinham condições de cultura similares. Os resultados para cada experimento são apresentados em tabelas separadas mostradas abaixo. Ensaio em Células THP-1
[0281] Células THP-1 cultivadas a uma densidade de 30.000 células por poço foram transfectadas com o uso de eletroporação com oligonucleotídeos modificados diluídos em diferentes concentrações, conforme especificado nas tabelas abaixo. Após um período de tratamento de aproximadamente 24 horas, os níveis de RNA de IRF5 foram medidos conforme descrito anteriormente com o uso do conjunto de primer e sonda de IRF5 humano HTS4167. Os níveis de RNA de IRF5 foram ajustados de acordo com o teor total de RNA, conforme medido por RIBOGREEN®. Os resultados são apresentados nas tabelas abaixo como porcentagem de inibição de IRF5 em relação às células de controle não tratadas.
A metade da concentração inibitória máxima (IC50) de cada oligonucleotídeo modificado também é apresentada.
A IC50 foi calculada com o uso de uma regressão linear em uma plotagem log/linear dos dados em excel.
Tabela 28 Ensaio de múltiplas doses de oligonucleotídeos modificados em células THP-1
% de Inibição
N° do composto 185,19 nM 555,56 nM 1.666,67 nM 5.000,00 nM IC50 (µM)
665795 36 57 76 85 0,4
665892 40 59 74 82 0,3
665893 26 53 74 83 0,6
665908 19 45 57 73 1,1
665933 30 38 66 79 0,8
728408 19 32 55 82 1,1
728458 29 45 58 80 0,8
728498 24 31 61 81 1,0
728670 58 51 70 79 0,1
728673 25 32 51 84 1,1
728695 23 54 72 80 0,6
728696 38 62 73 89 0,3
728705 39 57 71 82 0,4
728706 35 55 72 92 0,4
728707 50 64 74 85 0,2
728708 53 69 86 88 0,1
728806 33 47 74 87 0,5
Tabela 29 Ensaio de múltiplas doses de oligonucleotídeos modificados em células THP-1
% de inibição
185,19 185,19 nM 5.000,0 555,5556 nM N° do composto nM nM IC50 (µM)
665893 25 50 64 81 0,7
665933 18 30 67 69 1,2
728739 14 26 55 58 2,2
728741 13 35 65 82 1,0
728759 40 49 49 68 0,8
728778 10 32 46 79 1,5
728793 10 21 39 68 2,4
728800 23 39 62 68 1,1
728802 20 35 34 65 2,5
728887 8 34 60 72 1,4
728891 43 23 50 74 1,2
728893 9 28 45 74 1,7
728894 20 42 68 85 0,8
728898 16 41 69 86 0,8
728899 10 34 65 79 1,1
728905 21 31 57 77 1,2
728944 15 21 71 79 1,1
728954 7 21 60 82 1,3
728970 30 50 78 85 0,5
Tabela 30 Ensaio de múltiplas doses de oligonucleotídeos modificados em células THP-1
% de inibição
N° do composto 185,19 nM 555,56 nM 1.666,67 nM 5.000,00 nM IC50 (µM)
665893 38 59 72 83 0,4
665933 13 39 52 71 1,4
666168 29 30 60 82 0,9
728958 30 43 68 83 0,7
728969 30 55 81 89 0,5
728996 36 57 73 84 0,4
728998 27 56 73 85 0,5
729018 33 52 69 85 0,5
729037 58 64 86 94 0,1
729038 41 65 89 92 0,3
729039 40 50 77 90 0,39
729049 35 57 76 85 0,4
729050 21 52 75 90 0,6
729205 23 42 73 84 0,7
729206 11 40 54 73 1,3
729433 25 41 65 86 0,8
729453 16 43 61 80 1,0
729454 31 40 69 87 0,7
729456 11 38 63 80 1,1
Tabela 31 Ensaio de múltiplas doses de oligonucleotídeos modificados em células THP-1
% de Inibição
185,19 555,56 1.666,67 nM 5.000,00 nM N° do composto nM nM IC50 (µM)
665893 24 53 74 86 0,6
665933 13 36 58 71 1,3
666178 29 46 65 82 0,7
666208 0 24 50 73 1,8
729201 18 35 49 73 1,4
729207 12 34 60 84 1,1
729213 19 47 70 85 0,7
729221 5 31 53 73 1,5
729243 5 34 54 77 1,4
729447 0 0 10 53 >5,0
729460 18 31 63 81 1,1
729475 22 39 57 80 1,0
729476 42 63 85 91 0,3
729494 27 42 67 80 0,8
729495 16 57 74 86 0,6
729497 0 35 48 72 1,7
729513 18 41 67 89 0,8
729589 14 47 70 85 0,8
729659 3 32 60 85 1,2
Ensaio em células KARPAS-229
[0282] Células KARPAS-229 cultivadas a uma densidade de 10.000 células por poço foram tratadas com o uso de absorção livre com oligonucleotídeos modificados diluídos em diferentes concentrações, conforme especificado nas tabelas abaixo. Após um período de tratamento de aproximadamente 24 horas, os níveis de mRNA de IRF5 foram medidos conforme anteriormente descrito com o uso do conjunto de primer e sonda de IRF5 humano RTS4524. Os níveis de mRNA de IRF5 foram ajustados de acordo com o teor total de RNA, conforme medido por RIBOGREEN®. Os resultados são apresentados nas tabelas abaixo como porcentagem de inibição de IRF5 em relação às células de controle não tratadas.
[0283] A metade da concentração inibitória máxima (IC50) de cada oligonucleotídeo modificado também é apresentada. A IC50 foi calculada com o uso de uma regressão linear em uma plotagem log/linear dos dados em excel. 'N.D.' indica que a % de Inibição não é definida para aquela dosagem com o oligonucleotídeo modificado.
Tabela 32 Ensaio de múltiplas doses de oligonucleotídeos modificados em células KARPAS-229
% de inibição N° do composto 1.333,33 4.000,00 12.000,00 IC50 (µM) 444,44 nM nM nM nM
728466 32 38 56 69 2,6
729037 52 65 79 86 0,3
729476 38 66 78 83 0,7
785350 23 40 62 87 2,0
785475 31 44 66 81 1,6
785477 34 48 62 74 1,6
785478 53 69 80 86 0,3
785485 42 68 78 82 0,5
785502 38 47 69 78 1,2
785522 39 59 73 84 0,8
785537 47 66 75 82 0,4
785563 25 51 64 77 1,8
785583 15 32 66 76 2,7
785661 22 32 41 58 7,0
785672 46 64 73 84 0,5
785791 42 62 67 79 0,7
785876 41 56 67 81 0,9
785938 61 79 84 88 0,1
786507 51 74 83 89 0,3
Tabela 33 Ensaio de múltiplas doses de oligonucleotídeos modificados em células KARPAS-229
% de inibição N° do composto 444,44 1.333,33 4.000,00 12.000,00 IC50 (µM) nM nM nM nM
729018 59 68 78 83 0,1
729049 51 66 77 84 0,3
729454 12 41 58 70 3,0
729495 44 60 74 86 0,7
785519 6 12 49 65 5,5
785525 40 53 71 79 1,0
785674 57 71 77 83 0,1
785764 29 N.D. 61 81 1,8
785920 21 13 71 76 2,9
785926 46 52 67 74 0,8
785938 54 75 87 91 0,2
786501 27 39 68 79 1,9
786503 42 45 76 77 1,0
786524 50 54 73 81 0,6
786538 60 49 74 77 0,3
786548 15 46 52 70 3,0
786590 9 39 70 81 2,3
786591 38 44 66 78 1,4
786597 32 59 70 81 1,1
Tabela 34 Ensaio de múltiplas doses de oligonucleotídeos modificados em células KARPAS-229
% de Inibição N° do composto 1.333,33 4.000,00 12.000,00 IC50 (µM) 444,44 nM nM nM nM
728466 25 56 50 67 2,4
728708 33 41 46 55 6,1
729037 54 72 75 82 0,2
729205 16 41 57 65 3,3
729433 37 N.D. 70 84 1,1
729494 41 66 67 78 0,7
785369 31 29 46 57 6,5
785481 28 45 62 77 1,9
785511 39 43 63 72 1,6
785532 26 38 56 70 2,7
785539 37 45 62 73 1,6
785666 22 58 69 79 1,5
785675 33 50 57 70 1,9
785677 14 39 55 71 3,1
785919 23 39 50 59 4,4
785938 62 82 87 88 <0,4
785940 31 44 70 78 1,6
785941 33 56 61 75 1,3
786578 0 42 65 74 3,3
Exemplo 4: Tolerabilidade de oligonucleotídeos modificados direcionados para IRF5 humano em camundongos CD-1
[0284] Camundongos CD-1 são um modelo multiuso de camundongo multiuso frequentemente usado para testes de segurança e eficácia. Os camundongos foram tratados com oligonucleotídeos modificados selecionados dentre os estudos descritos acima e avaliados quanto às alterações nos níveis de vários marcadores químicos plasmáticos. Estudo 1 Tratamento
[0285] Grupos de camundongos CD-1 machos com 6 a 8 semanas de idade foram injetados subcutaneamente uma vez por semana durante sete semanas (em um total de 7 tratamentos) com 50 mg/kg de oligonucleotídeos modificados. Um grupo de camundongos CD-1 machos foi injetado com PBS. Os camundongos foram sacrificados 48 horas após a administração final. Marcadores Químicos Plasmáticos
[0286] Para avaliar o efeito dos oligonucleotídeos modificados sobre a função hepática, os níveis plasmáticos de nitrogênio de ureia sanguínea (BUN), albumina, alanina aminotransferase (ALT), aspartato aminotransferase (AST) e bilirrubina total (TBIL) foram medidos com o uso de um analisador de química clínica automatizado (Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY, EUA). Os resultados são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos modificados que causaram alterações nos níveis de qualquer um dos marcadores de função hepática ou renal fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos em estudos adicionais.
Tabela 35 Marcadores químicos plasmáticos em camundongos machos CD-1
BUN Albumina AST ALT TBIL N° do composto (mg/dL) (g/dL) (IU/L) (IU/L) (mg/dL) PBS 25 3,5 57 45 0,2 665795 27 3,2 237 541 0,3 665892 35 3,3 212 245 0,2 665893 25 3,5 210 290 0,2 665908 29 4,1 4665 6042 0,5 665933 31 3,8 767 1353 0,3 666168 26 3,4 3931 3855 0,7 666178 30 2,9 16490 14669 6,4 728458 32 3,7 821 1311 0,2 728706 28 3,7 2893 3673 0,8 728708 24 3,9 1770 3270 0,2 728759 22 3,7 860 599 0,2 728806 38 3,8 2503 2422 0,4 728958 23 3,0 214 158 0,2 728969 22 3,5 70 59 0,2 728970 20 3,6 157 140 0,2 728998 24 3,5 583 865 0,2 729018 19 3,2 86 66 0,2 729049 21 3,7 425 771 0,2 729050 22 3,5 193 246 0,2 729213 25 3,1 344 411 0,2 729433 26 3,7 802 791 0,2 729454 25 3,6 3958 4541 0,5 729476 77 2,7 1660 2046 0,7 729494 20 3,2 157 149 0,2 729495 57 3,2 240 254 0,1 729513 23 4,8 1558 2743 0,4
Pesos Corporais e de Órgãos
[0287] Os pesos corporais dos camundongos CD-1 foram medidos nos dias 1 e 44, e o peso corporal médio para cada grupo é apresentado na tabela abaixo. Os pesos do coração, rins, baço, fígado e timo foram medidos no final do estudo e são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos modificados que causaram quaisquer alterações nos pesos dos órgãos fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos de estudos adicionais. Tabela 36 Pesos corporais e de órgãos (em gramas) N° do Peso corporal (g) Coração (g) Rim (g) Baço (g) Fígado (g) Timo (g) composto Dia 1 Dia 44 PBS 34 37 0,2 0,7 0,1 2,2 0,05 665795 34 40 0,2 0,7 0,2 2,6 0,03 665892 34 38 0,2 0,8 0,2 2,9 0,02 665893 34 39 0,2 0,8 0,2 2,6 0,02 665908 34 35 0,2 0,6 0,2 3,5 0,02 665933 34 39 0,2 0,7 0,1 3,1 0,02 666168 34 31 0,2 0,4 0,2 2,3 0,01 666178 33 28 0,1 0,6 0,1 1,8 0,02 728458 34 37 0,2 0,8 0,2 3,3 0,05 728706 34 31 0,2 0,6 0,1 2,3 0,01 728708 33 36 0,2 0,7 0,2 3,0 0,03 728759 33 39 0,2 0,7 0,1 3,5 0,04 728806 33 33 0,1 0,6 0,1 3,0 0,02 728958 34 39 0,2 0,8 0,2 2,8 0,03 728969 34 38 0,2 0,6 0,1 2,2 0,05 728970 32 37 0,2 0,6 0,1 2,3 0,04 728998 34 41 0,2 0,7 0,2 3,2 0,05 729018 34 37 0,2 0,7 0,1 2,2 0,04 729049 34 36 0,2 0,6 0,2 2,6 0,02 729050 34 36 0,2 0,6 0,1 2,4 0,04 729213 33 35 0,2 0,7 0,1 2,0 0,01 729433 32 32 0,1 0,6 0,1 2,7 0,02 729454 32 36 0,2 0,6 0,1 3,2 0,02 729476 33 32 0,2 0,5 0,1 2,2 0,04 729494 33 40 0,2 0,7 0,2 2,5 0,02 729495 32 26 0,1 0,5 0,04 1,4 0,01 729513 33 30 0,2 0,5 0,1 2,8 0,01
Estudo 2 Tratamento
[0288] Grupos de camundongos CD-1 machos de 6 a 7 semanas de idade (obtidos junto à Charles River) foram injetados subcutaneamente uma vez por semana durante quatro semanas (para um total de 5 tratamentos) com 50 mg/kg de oligonucleotídeos modificados. Um grupo de camundongos CD-1 machos foi injetado com PBS. Os camundongos foram sacrificados 48 horas após a administração final. Marcadores Químicos Plasmáticos
[0289] Para avaliar o efeito dos oligonucleotídeos modificados sobre a função hepática, os níveis plasmáticos de nitrogênio de ureia sanguínea (BUN), albumina, alanina aminotransferase (ALT), aspartato aminotransferase (AST) e bilirrubina total (TBIL) foram medidos com o uso de um analisador de química clínica automatizado (Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY, EUA). Os resultados são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos modificados que causaram alterações nos níveis de qualquer um dos marcadores de função hepática ou renal fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos em estudos adicionais. Tabela 37 Marcadores químicos plasmáticos em camundongos machos CD-1 N° do composto BUN (mg/dL) Albumina (g/dL) AST (IU/L) ALT (IU/L) TBIL (mg/dL) PBS 19 2,6 91 132 0,3 785478 19 2,6 175 228 0,2 785502 23 2,5 479 639 0,5 785525 19 2,4 197 265 0,2 785532 15 2,2 471 591 0,3 785537 17 2,6 420 335 0,3 785539 17 2,4 143 145 0,2 785674 18 2,8 118 101 0,2 785675 19 2,7 85 62 0,2 785677 18 2,9 311 526 0,2 785920 20 3,0 875 1356 0,3 785926 24 3,3 197 232 0,2 785940 19 2,4 1201 754 0,2 786524 18 2,8 175 208 0,2 786538 18 2,9 569 1514 0,2
Pesos Corporais e de Órgãos
[0290] Os pesos corporais dos camundongos CD-1 foram medidos nos dias 1 e 28, e o peso corporal médio para cada grupo é apresentado na tabela abaixo. Os pesos dos rins, baço e fígado foram medidos no final do estudo e são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos modificados que causaram quaisquer alterações nos pesos dos órgãos fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos de estudos adicionais. Tabela 38 Pesos corporais e de órgãos (em gramas) Peso corporal (g) N° do composto Rim (g) Baço (g) Fígado (g) Dia 1 Dia 28 PBS 29 38 0,6 0,1 1,9 785478 30 39 0,7 0,2 2,3 785502 29 35 0,6 0,2 1,6 785525 29 37 0,6 0,2 2,2 785532 28 33 0,6 0,4 2,7 785537 30 36 0,6 0,2 2,0 785539 30 41 0,6 0,2 2,4 785674 30 40 0,8 0,2 2,3 785675 30 39 0,7 0,2 2,5 785677 28 37 0,6 0,3 2,2 785920 29 39 0,7 0,4 3,4 785926 29 36 0,6 0,2 1,8 785940 29 30 0,6 0,1 1,8 786524 30 39 0,6 0,2 2,4 786538 30 38 0,6 0,2 3,3
Estudo 3 Tratamento
[0291] Grupos de camundongos CD-1 machos com 6 a 7 semanas de idade (obtidos junto à Charles River) foram injetados subcutaneamente uma vez por semana durante seis semanas (para um total de 7 tratamentos) com 50 mg/kg de oligonucleotídeos modificados. Um grupo de camundongos CD-1 machos foi injetado com PBS. Os camundongos foram sacrificados 48 horas após a administração final. Marcadores Químicos Plasmáticos
[0292] Para avaliar o efeito dos oligonucleotídeos modificados sobre a função hepática, os níveis plasmáticos de nitrogênio de ureia sanguínea (BUN), albumina, alanina aminotransferase (ALT), aspartato aminotransferase (AST) e bilirrubina total (TBIL) foram medidos com o uso de um analisador de química clínica automatizado (Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY, EUA). Os resultados são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos modificados que causaram alterações nos níveis de qualquer um dos marcadores de função hepática ou renal fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos em estudos adicionais. Tabela 39 Marcadores químicos plasmáticos em camundongos machos CD-1 N° do composto BUN (mg/dL) Albumina (g/dL) AST (IU/L) ALT (IU/L) TBIL (mg/dL) PBS 25 2,5 69 60 0,2 729049 22 2,7 214 322 0,2 785478 20 2,5 166 237 0,1 785525 21 2,6 172 134 0,2 785539 18 2,6 96 64 0,2 785674 22 2,4 129 83 0,1 785675 23 2,4 98 100 0,1 785764 19 2,5 89 49 0,2 786503 20 2,4 74 47 0,1 786524 20 2,6 136 145 0,1 786548 22 2,3 132 125 0,1 786597 21 2,4 127 69 0,2
Pesos Corporais e de Órgãos
[0293] Os pesos corporais dos camundongos CD-1 foram medidos nos dias 1 e 43, e o peso corporal médio para cada grupo é apresentado na tabela abaixo. Os pesos dos rins, baço e fígado foram medidos no final do estudo e são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos modificados que causaram quaisquer alterações nos pesos dos órgãos fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos de estudos adicionais. Tabela 40 Pesos corporais e de órgãos (em gramas) Peso corporal (g) N° do composto Rim (g) Baço (g) Fígado (g) Dia 1 Dia 43 PBS 28 41 0,7 0,1 2,1 729049 30 39 0,7 0,2 2,2 785478 29 39 0,7 0,2 2,4 785525 28 39 0,7 0,3 2,2 785539 28 45 0,7 0,2 2,6 785674 28 37 0,6 0,3 2,1 785675 29 41 0,7 0,2 2,7 785764 28 43 0,7 0,3 2,5 786503 29 41 0,7 0,2 2,4 786524 29 41 0,6 0,2 2,5 786548 27 41 0,6 0,2 2,4 786597 30 41 0,6 0,2 2,5 Estudo 4
[0294] Camundongos CD-1 foram tratados com oligonucleotídeos modificados selecionados dentre os estudos descritos acima e avaliados quanto às alterações nos níveis de vários marcadores químicos plasmáticos.
Tratamento
[0295] Grupos de camundongos CD-1 machos com 6 semanas de idade (obtidos junto à Charles River) foram injetados subcutaneamente uma vez por semana durante quatro semanas (para um total de 5 tratamentos) com 50 mg/kg de oligonucleotídeos modificados. Um grupo de camundongos CD-1 machos foi injetado com PBS. Os camundongos foram sacrificados 48 horas após a administração final. Marcadores Químicos Plasmáticos
[0296] Para avaliar o efeito dos oligonucleotídeos modificados sobre a função hepática, os níveis plasmáticos de nitrogênio de ureia sanguínea (BUN), albumina, alanina aminotransferase (ALT), aspartato aminotransferase (AST) e bilirrubina total (TBIL) foram medidos com o uso de um analisador de química clínica automatizado (Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY, EUA). Os resultados são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos modificados que causaram alterações nos níveis de qualquer um dos marcadores de função hepática ou renal fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos em estudos adicionais. Tabela 41 Marcadores químicos plasmáticos em camundongos machos CD-1 N° do composto BUN (mg/dL) Albumina (g/dL) AST (IU/L) ALT (IU/L) TBIL (mg/dL) PBS 23 2,7 80 59 0,2 728466 25 3,0 463 868 0,3 729049 24 2,6 246 253 0,2 729205 22 2,4 649 1130 0,6 729433 23 2,4 660 579 0,5 785485 25 2,6 559 701 0,3 785666 21 2,5 273 321 0,3 785764 21 2,6 78 46 0,2 785791 30 3,1 754 937 0,3 785938 24 2,7 402 348 0,4 786501 23 3,2 733 1258 0,4 786503 21 2,7 86 44 0,3 786548 22 2,6 135 142 0,2 786578 19 1,5 664 439 0,4 786597 20 2,4 136 70 0,2
Pesos Corporais e de Órgãos
[0297] Os pesos corporais dos camundongos CD-1 foram medidos nos dias 1 e 43, e o peso corporal médio para cada grupo é apresentado na tabela abaixo. Os pesos dos rins, baço e fígado foram medidos no final do estudo e são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos modificados que causaram quaisquer alterações nos pesos dos órgãos fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos de estudos adicionais. Tabela 42 Pesos Corporais e de Órgãos (em gramas) N° do Peso corporal (g) Rim (g) Baço (g) Fígado (g) composto Dia 1 Dia 43 PBS 26 33 0,6 0,1 1,9 728466 27 33 0,4 0,2 2,4 729049 26 35 0,6 0,2 2,2 729205 24 33 0,5 0,3 3,0 729433 25 29 0,4 0,1 1,9 785485 25 28 0,4 0,2 1,4 785666 26 33 0,4 0,2 2,2 785764 25 38 0,7 0,2 2,3 785791 27 33 0,6 0,1 1,9 785938 28 31 0,4 0,3 1,6 786501 27 38 0,6 0,5 3,7 786503 26 35 0,6 0,2 2,1 786548 26 38 0,6 0,1 2,2 786578 27 37 0,6 0,2 1,7 786597 28 40 0,6 0,3 2,5
Estudo 5
[0298] Camundongos CD-1 foram tratados com oligonucleotídeos modificados selecionados dentre os estudos descritos acima e avaliados quanto às alterações nos níveis de vários marcadores químicos plasmáticos. Tratamento
[0299] Grupos de camundongos CD-1 machos com 6 a 7 semanas de idade (obtidos junto à Charles River) foram injetados subcutaneamente uma vez por semana durante seis semanas (para um total de 7 tratamentos) com 50 mg/kg de oligonucleotídeos modificados. Um grupo de camundongos CD-1 machos foi injetado com PBS. Os camundongos foram sacrificados 48 horas após a administração final. Marcadores Químicos Plasmáticos
[0300] Para avaliar o efeito dos oligonucleotídeos modificados sobre a função hepática, os níveis plasmáticos de nitrogênio de ureia sanguínea (BUN), albumina, alanina aminotransferase (ALT), aspartato aminotransferase (AST) e bilirrubina total (TBIL) foram medidos com o uso de um analisador de química clínica automatizado (Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY, EUA). Os resultados são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos modificados que causaram alterações nos níveis de qualquer um dos marcadores de função hepática ou renal fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos em estudos adicionais.
Tabela 43 Marcadores químicos plasmáticos em camundongos machos CD-1 BUN Albumina AST ALT TBIL N° do composto (mg/dL) (g/dL) (IU/L) (IU/L) (mg/dL) PBS 29 3,0 57 42 0,2 665892 27 3,1 275 265 0,2 665893 25 3,2 1718 2229 2,9 728958 26 2,6 88 57 0,1 728969 27 3,4 149 142 0,2 728970 33 3,5 1142 631 0,4 729018 23 2,9 187 101 0,2 729050 26 3,1 141 119 0,2 729494 26 2,9 178 53 0,2 Pesos corporais e de órgãos
[0301] Os pesos corporais dos camundongos CD-1 foram medidos nos dias 1 e 43, e o peso corporal médio para cada grupo é apresentado na tabela abaixo. Os pesos dos rins, baço e fígado foram medidos no final do estudo e são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos modificados que causaram quaisquer alterações nos pesos dos órgãos fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos de estudos adicionais.
Tabela 44 Pesos corporais e de órgãos (em gramas) Peso corporal (g) N° do composto Rim (g) Baço (g) Fígado (g) Dia 1 Dia 43 PBS 29 37 0,6 0,1 1,8 665892 31 36 0,6 0,2 2,3 665893 30 35 0,6 0,2 2,4 728958 31 38 0,7 0,2 2,0 728969 30 37 0,6 0,2 2,3 728970 29 37 0,5 0,2 2,7 729018 31 41 0,8 0,3 2,4 729050 29 35 0,6 0,2 2,1 729494 29 37 0,6 0,2 2,2 Exemplo 5: Tolerabilidade de oligonucleotídeos modificados direcionados para IRF5 humano em ratos Sprague-Dawley
[0302] Ratos Sprague-Dawley são um modelo multiuso usado para avaliações de segurança e eficácia. Os ratos foram tratados com oligonucleotídeos Ionis modificados dos estudos descritos nos exemplos acima e avaliados quanto às alterações nos níveis de vários marcadores químicos plasmáticos. Estudo 1 Tratamento
[0303] Ratos machos Sprague-Dawley foram mantidos em um ciclo de claro/escuro de 12 horas e alimentados ad libitum com ração normal de ratos Purina. Cada grupo de 4 ratos Sprague-Dawley foi injetado semanalmente por via subcutânea com 50 mg/kg de oligonucleotídeo
Ionis durante 6 semanas (total de 7 doses). Quarenta e oito horas após a última dose, os ratos foram sacrificados e órgãos, urina e plasma foram coletados para análise posterior. Marcadores Químicos Plasmáticos
[0304] Para avaliar o efeito dos oligonucleotídeos Ionis sobre a função hepática, os níveis plasmáticos de transaminases foram medidos com o uso de um analisador de química clínica automatizado (Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY, EUA). Os níveis plasmáticos de ALT (alanina transaminase) e AST (aspartato transaminase) foram medidos e os resultados são apresentados na tabela abaixo expressos em IU/L. Os níveis plasmáticos de bilirrubina total (TBIL), creatinina, albumina e nitrogênio de ureia sanguínea (BUN) também foram medidos com o uso do mesmo analisador de química clínica e os resultados também são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos Ionis modificados que causaram alterações nos níveis de quaisquer marcadores de função hepática fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos em estudos adicionais. Tabela 45 Marcadores químicos plasmáticos em ratos Sprague-Dawley ALT AST BUN Albumina Creatinina TBIL N° do composto (IU/L) (IU/L) (mg/dL) (g/dL) (mg/dL) (mg/dL) PBS 57 83 16 4,9 0,4 0,2 665892 216 319 25 4,6 0,5 0,2 665893 365 472 31 4,0 0,6 0,3 728958 90 118 26 3,3 0,5 0,1 728969 154 175 24 3,4 0,5 0,2 728970 309 274 34 3,1 0,6 0,2 729018 70 98 23 3,3 0,5 0,1 729050 118 115 86 1,6 1,1 0,1 729494 60 97 43 1,6 0,5 0,1
Ensaios Hematológicos
[0305] O sangue obtido a partir de grupos de camundongos na semana 6 foi enviado para IDEXX BioResearch para medição das contagens de células sanguíneas. As contagens obtidas incluem contagem de eritrócitos (RBC), contagem de leucócitos (WBC), hemoglobina (HGB), hematócrito (HCT) e –––– (MON), neutrófilos (NEU), linfócitos (LYM) e plaquetas (PLT). Os resultados são apresentados nas tabelas abaixo. Os oligonucleotídeos Ionis que causaram alterações na contagem de células sanguíneas fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos em estudos adicionais. Tabela 46 Contagem de células sanguíneas em ratos Sprague-Dawley N° do composto WBC RBC HGB HCT PBS 15 9 17 54 665892 11 9 16 51 665893 13 9 17 54 728958 18 8 14 45 728969 10 8 15 49 728970 14 8 15 49 729018 8 8 15 48 729050 16 8 13 44 729494 17 4 7 24
Tabela 47 Contagem de células sanguíneas em ratos Sprague-Dawley N° do composto NEU LYM MON PLT PBS 14 81 3,6 720 665892 15 80 4,6 620 665893 13 80 5,9 647 728958 14 82 4,1 944 728969 12 83 4,8 857 728970 12 79 8,6 837 729018 10 85 4,4 801 729050 13 75 10,1 324 729494 13 77 9,5 777 Função Renal
[0306] Para avaliar o efeito dos oligonucleotídeos Ionis sobre a função renal, os níveis urinários de proteína total e creatinina foram medidos com o uso de um analisador de química clínica automatizado (Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY, EUA). As razões entre proteína total e creatinina (razão P/C) são apresentadas na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos Ionis que causaram alterações nos níveis da razão fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos em estudos adicionais.
Tabela 48 Razão entre proteína total e creatinina em ratos Sprague-Dawley N° do composto Razão P/C PBS 0,7 665892 5,6 665893 5,9 728958 5,3 728969 4,1 728970 6,0 729018 4,3 729050 8,2 729494 17,2 Pesos dos órgãos
[0307] Os pesos de fígado, coração, baço e rim foram medidos no final do estudo e são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos Ionis que causaram quaisquer alterações nos pesos dos órgãos fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos de estudos adicionais. Tabela 49 Pesos dos órgãos (g) N° do composto Fígado (g) Rim (g) Baço (g) PBS 17 3,7 0,8 665892 16 3,1 1,4 665893 14 3,1 1,0 728958 17 3,2 1,6 728969 15 3,8 1,5 728970 12 3,3 1,5 729018 15 3,1 1,7 729050 13 3,8 1,4 729494 15 4,1 2,0
Estudo 2 Tratamento
[0308] Ratos machos Sprague-Dawley foram mantidos em um ciclo de claro/escuro de 12 horas e alimentados ad libitum com ração normal de ratos Purina. Cada grupo de 4 ratos Sprague-Dawley foi injetado semanalmente por via subcutânea com 50 mg/kg de oligonucleotídeo Ionis durante 6 semanas (total de 7 doses). Quarenta e oito horas após a última dose, os ratos foram sacrificados; e órgãos, urina e plasma foram coletados para análise adicional. Marcadores Químicos Plasmáticos
[0309] Para avaliar o efeito dos oligonucleotídeos Ionis sobre a função hepática, os níveis plasmáticos de transaminases foram medidos com o uso de um analisador de química clínica automatizado (Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY, EUA). Os níveis plasmáticos de ALT (alanina transaminase) e AST (aspartato transaminase) foram medidos e os resultados são apresentados na tabela abaixo expressos em IU/L. Os níveis plasmáticos de bilirrubina total (TBIL), albumina e nitrogênio de ureia sanguínea (BUN) também foram medidos com o uso do mesmo analisador de química clínica e os resultados também são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos Ionis modificados que causaram alterações nos níveis de quaisquer marcadores de função hepática fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos em estudos adicionais.
Tabela 50 Marcadores químicos plasmáticos em ratos Sprague-Dawley ALT AST BUN Albumina TBIL N° do composto (IU/L) (IU/L) (mg/dL) (g/dL) (mg/dL) PBS 41 73 18 3,4 0,2 729049 70 121 154 1,4 0,1 785478 68 112 41 1,7 0,1 785525 78 118 20 3,3 0,1 785539 60 128 55 2,4 0,1 785674 64 131 22 3,2 0,1 785675 123 139 18 3,4 0,2 785764 65 95 60 1,7 0,2 786503 33 72 17 2,9 0,1 786524 64 105 21 3,1 0,2 786548 34 67 20 3,2 0,1 786597 40 66 19 2,8 0,1 Ensaios Hematológicos
[0310] O sangue obtido a partir de grupos de camundongos na semana 6 foi enviado para IDEXX BioResearch para medição das contagens de células sanguíneas. As contagens obtidas incluem contagem de eritrócitos (RBC), contagem de leucócitos (WBC), hemoglobina (HGB), hematócrito (HCT) e –––– (MON), neutrófilos (NEU), linfócitos (LYM) e plaquetas (PLT). Os resultados são apresentados nas tabelas abaixo. Os oligonucleotídeos Ionis que causaram alterações na contagem de células sanguíneas fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos em estudos adicionais.
Tabela 51 Contagem de células sanguíneas em ratos Sprague-Dawley
N° do composto WBC RBC HGB HCT PBS 14 8 16 50 729049 30 5 9 27 785478 45 7 12 37 785525 18 8 14 44 785539 32 4 8 25 785674 34 8 14 43 785675 16 9 15 47 785764 22 6 10 33 786503 20 7 14 39 786524 16 8 14 44 786548 18 8 14 43 786597 28 4 7 24
Tabela 52 Contagem de células sanguíneas em ratos Sprague-Dawley
Composto N° NEU LYM MON PLT
PBS 10 84 5,5 904 729049 47 45 3,8 1418 785478 11 89 1,0 383 785525 13 77 8,6 881 785539 34 57 9,0 734 785674 12 79 7,0 731 785675 9 81 9,2 783 785764 17 76 6,8 1231 786503 10 81 7,5 650 786524 6 87 6,6 731 786548 4 87 6,6 653 786597 15 77 6,9 965
Função Renal
[0311] Para avaliar o efeito dos oligonucleotídeos Ionis sobre a função renal, os níveis urinários de proteína total e creatinina foram medidos com o uso de um analisador de química clínica automatizado (Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY, EUA). As razões entre proteína total e creatinina (razão P/C) são apresentadas na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos Ionis que causaram alterações nos níveis da razão fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos em estudos adicionais. Tabela 53 Razão entre proteína total e creatinina em ratos Sprague-Dawley N° do composto Razão P/C PBS 0,8 729049 11,1 785478 15,0 785525 7,4 785539 51,1 785674 4,4 785675 2,1 785764 20,8 786503 2,5 786524 1,7 786548 2,5 786597 14,4 Pesos dos Órgãos
[0312] Os pesos de fígado, coração, baço e rim foram medidos no final do estudo e são apresentados na tabela abaixo. Os oligonucleotídeos Ionis que causaram quaisquer alterações nos pesos dos órgãos fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados foram excluídos de estudos adicionais. Tabela 54 Pesos dos órgãos (g) N° do composto Fígado Rim Baço PBS 19 3,3 1,0 729049 19 3,5 1,1 785478 19 4,2 2,3 785525 18 3,4 1,5 785539 18 4,3 2,3 785674 17 2,7 1,6 785675 13 2,8 1,4 785764 18 4,5 2,7 786503 16 2,8 1,8 786524 14 3,2 1,8 786548 13 2,6 1,4 786597 16 3,6 2,4 Exemplo 6: Efeito de oligonucleotídeos modificados sobre a expressão de IRF5 humano em um modelo de xenoenxerto de KARPAS-229 em camundongos NOD Scid
[0313] Machos, camundongos NOD Scid de 14 a 15 semanas de idade (Jackson Laboratory) foram inoculados com células KARPAS-229 humanas de linfoma não Hodgkin de grandes células e tratados com os oligonucleotídeos modificados descritos nas tabelas acima ou com PBS.
Foram avaliados os efeitos dos oligonucleotídeos modificados sobre a expressão de RNA de IRF5 nos tumores e a tolerabilidade nos camundongos. Tratamento
[0314] Os camundongos foram inoculados subcutaneamente no flanco com 2 milhões de células KARPAS-229 em suspensão 1:1 + KARPAS-299 para o desenvolvimento tumoral. O tratamento com oligonucleotídeo modificado se iniciou quando o tamanho médio do tumor atingiu 100 mm3. Os camundongos foram injetados subcutaneamente com oligonucleotídeo modificado em uma concentração de 250 mg/kg/semana durante duas semanas, durante um total de oito doses. Um grupo de controle adicional foi tratado de modo similar com PBS por 8 doses. No dia 12 após o início do tratamento, os camundongos foram sacrificados e os níveis de IRF5 no tumor foram medidos. Análise de RNA
[0315] O conjunto de primer e sonda HTS4167 foi usado para medir os níveis de RNA de IRF5 humano. Os resultados são apresentados como alteração porcentual de RNA, em relação ao controle de PBS, normalizados para GAPDH humana e para beta-actina ou ACTB humana. Conforme apresentado na tabela abaixo, o tratamento com oligonucleotídeos Ionis modificados resultou em redução significativa de RNA de IRF5 em comparação com o controle de PBS. '0' indica que os oligonucleotídeos não inibiram a expressão de RNA.
Tabela 55 Inibição mediada por oligonucleotídeo modificado da expressão de RNA de IRF5 humano no modelo KARPAS-229 % de Inibição N° do composto Normalizado para Normalizado para
GAPDH ACTB PBS 0 0 728969 14 18 729018 34 47 729049 43 54 785478 34 33 785525 32 43 785674 0 26 785675 0 13 785764 0 7 786503 0 29 786524 31 43 786597 45 55 Espécies Químicas no Plasma
[0316] Além disso, os níveis plasmáticos de ALT (alanina transaminase) e AST (aspartato transaminase) foram medidos com o uso de um analisador de química clínica automatizado (Hitachi Olympus AU400c, Melville, NY, EUA) e os resultados são apresentados na tabela abaixo expressos em IU/L. Os níveis plasmáticos de bilirrubina, albumina e BUN também foram medidos com o uso do mesmo analisador de química clínica e os resultados também são apresentados na tabela abaixo. N/A refere-se aos grupos em que os dados não estão disponíveis, geralmente devido à morte do animal. Tabela 56 Marcadores químicos plasmáticos em modelo de xenoenxerto N° do ALT AST BUN Albumina Bilirubina composto (U/l) (U/l) (mg/dL) (g/dL) (mg/dL) PBS 28 80 24 2. 0,2 728969 81 114 28 2,7 0,2 729018 317 257 22 2,5 0,2 729049 3640 2555 22 2,7 1,2 785478 4243 2610 20 2,8 1,1 785525 3989 3936 21 2,7 5,2 785674 1289 939 20 2,6 0,2 785675 411 368 18 2,5 0,1 785764 462 736 11 3,1 10,5 786503 630 717 24 2,5 0,2 786524 5094 3564 32 2,5 8,9 786597 2705 2479 24 2,4 10,7 Exemplo 7: Efeito da inibição antissenso de IRF5 humano em modelo de camundongo transgênico
[0317] Um modelo de camundongo transgênico foi desenvolvido internamente com o uso de Fosmid ABC10-44445800E12 (NCBI Clone DB ID:6338898). O clone foi digerido em sítios de restrição SpeI e FspI para produzir uma região contendo o gene IRF5 humano com 12.002 bp a montante e 5159 bp a jusante do gene IRF5 incluído. O fragmento de gene foi introduzido em ovos fertilizados de camundongos C57BL/6 por injeção pronuclear para produzir quatro linhagens fundadoras. A linhagem C57BL/6-Tg(IRF5)F20.11 foi usada nos experimentos aqui descritos. A expressão de RNA de IRF5 humano é encontrada nas células de exsudato pulmonar, baço, rim e peritoneal (PEC) neste modelo. A eficácia dos oligonucleotídeos Ionis foi avaliada neste modelo. Tratamento
[0318] Os camundongos transgênicos foram mantidos em um ciclo de claro/escuro de 12 horas e foram alimentados ad libitum com ração normal de camundongo Purina. Os animais foram aclimatados por pelo menos 7 dias na instalação de pesquisa antes do início do experimento. Os oligonucleotídeos modificados foram preparados em PBS e esterilizados por filtração através de um filtro de 0,2 mícron.
[0319] Os camundongos transgênicos foram divididos em grupos de 4 camundongos cada para tratamento com oligonucleotídeo modificado. Os grupos receberam injeções subcutâneas de oligonucleotídeo Ionis em uma dose de 35 mg/kg uma vez por semana ou 70 mg/kg uma vez por semana durante três semanas (4 tratamentos). Um grupo de quatro camundongos recebeu injeções subcutâneas de PBS uma vez por semana durante três semanas (4 tratamentos). O grupo injetado com PBS serviu como o grupo de controle ao qual os grupos tratados com oligonucleotídeo foram comparados. Análise de RNA
[0320] No dia 23, o RNA foi extraído de PECs, pulmão e baço para análise de RTPCR em tempo real da expressão de RNA de IRF5. O conjunto de primer e sonda HTS4167 foi usado para medir os níveis de RNA de IRF5 humano. Os resultados são apresentados como alteração porcentual de RNA, em relação ao controle de PBS, normalizada para GAPDH de camundongo.
[0321] Conforme apresentado nas tabelas abaixo, o tratamento com oligonucleotídeos Ionis modificados resultou em redução significativa de RNA de IRF5 em comparação com o controle de PBS. '0' indica que os oligonucleotídeos não inibiram a expressão de RNA.
Tabela 57 Inibição (%) mediada por oligonucleotídeo modificado de IRF5 humano em modelo transgênico (dados normalizados para GAPDH de camundongo)
Dose (mg/kg) N° do composto PEC Pulmão Baço
PBS 0 0 0 728958 75 20 44
729018 53 27 30 785525 2 20 54
785674 30 7 27 35 785675 57 12 36
786503 53 29 55 786524 64 27 9
786548 35 2 10 728958 23 0 23 729018 72 19 58
785525 45 32 49 785674 76 12 49 70 785675 47 37 63
786503 61 23 47 786524 81 30 0 786548 75 14 52
Exemplo 8: Efeito de oligonucleotídeos modificados direcionados para IRF5 humano em macacos cinomolgos
[0322] Macacos cinomolgos foram tratados com oligonucleotídeos Ionis modificados selecionados dentre os estudos descritos nos exemplos acima. A tolerabilidade do oligonucleotídeo modificado foi avaliada. Tratamento
[0323] Antes do estudo, os macacos foram mantidos em quarentena durante os animais foram observados diariamente quanto à saúde geral. Os macacos tinham 2 a 4 anos de idade e pesavam 2 a 4 kg. Nove grupos de 4 macacos cinomolgos machos aleatoriamente atribuídos foram injetados subcutaneamente com oligonucleotídeo Ionis ou solução salina em uma rotação em sentido horário entre quatro locais diferentes nas costas. Após as doses de carregamento nos dias 1, 4 e 7, os macacos foram dosados uma vez por semana (nos dias 14, 21, 28, 35, 42, 49, 56, 63, 70, 77 e 84) com 35 mg/kg de oligonucleotídeo Ionis. Um grupo de controle de 4 macacos cinomolgos foi injetado com 0,9% de solução salina de maneira similar e serviu como o grupo de controle.
[0324] Durante o período do estudo, os macacos foram observados duas vezes ao dia quanto a sinais de doença ou desconforto. Qualquer animal que experimentou dor ou desconforto mais que momentâneos ou leves devido ao tratamento, lesão ou doença foi tratado pela equipe veterinária com analgésicos ou agentes aprovados para aliviar a dor após consulta com o Diretor de Estudo. Qualquer animal com saúde insatisfatória ou em uma possível condição moribunda foi identificado para monitoramento adicional e possível eutanásia. A eutanásia programada dos animais foi realizada no dia 86 aproximadamente 48 horas após a última dose por exsanguinação sob anestesia profunda. Os protocolos descritos no exemplo foram aprovados pelo Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC).
Medições de Pesos Corporais e de Órgãos
[0325] Para avaliar o efeito dos oligonucleotídeos Ionis sobre a saúde geral dos animais, os pesos do corpo e do órgão foram medidos. O peso corporal final foi medido antes da necropsia. Os pesos dos órgãos também foram medidos e todas as medições de peso são apresentadas na tabela abaixo. Os resultados indicam que o efeito do tratamento com oligonucleotídeos modificados sobre os pesos do corpo e dos órgãos estava dentro da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados. Especificamente, o tratamento com ION 729018 foi bem tolerado em termos de pesos corporais e de órgãos dos macacos. Tabela 58 Pesos corporal e de órgãos (g) N° do Peso corporal Coração Rim Baço Testes Timo Fígado composto (g) Dia 86 Solução 2828 12 14 2 2 3 59 salina 728958 2791 10 17 3 1 3 72 729018 2726 11 14 4 1 3 66 785525 3017 12 17 5 1 4 78 785674 2618 10 15 4 1 2 63 785675 2793 11 16 3 2 3 63 786503 2926 10 17 4 1 3 73 786524 2917 11 16 5 1 4 67 786548 2668 9 16 4 1 3 66 Função Renal e Hepática
[0326] Para avaliar o efeito dos oligonucleotídeos Ionis sobre a função hepática e renal, amostras sanguíneas foram coletadas de todos os grupos de estudo no dia 86. Os macacos foram deixados em jejum de um dia para o outro antes da coleta de sangue. O sangue foi coletado em tubos sem anticoagulante para separação de soro. Os tubos foram mantidos à temperatura ambiente durante um mínimo de 90 minutos e, então, centrifugados a 3.000 rpm durante 10 minutos para se obter o soro. Os níveis de vários marcadores da função hepática foram medidos com o uso de um analisador de química Toshiba 200 FR NEO (Toshiba Co., Japão). Os níveis plasmáticos de nitrogênio de ureia sanguínea (BUN), creatinina (CREA), proteína total (TP), albumina (ALB), alanina aminotransferase (ALT), aspartato aminotransferase (AST) e bilirrubina total (TBIL) foram medidos e os resultados são apresentados na tabela abaixo. Os resultados indicam que os oligonucleotídeos modificados não tiveram efeito sobre a função hepática ou renal fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados. Especificamente, o tratamento com ION 729018 foi bem tolerado em termos da função hepática e renal em macacos. Tabela 59 Marcadores de função hepática e renal em plasma de macacos cinomolgos
AST TBIL N° do BUN CREA TP ALB ALT (IU/ (mg/d composto (mg/dL) (mg/dL) (g/dL) (g/dL) (IU/L) L) L) Solução salina 24 0,8 7,1 4,2 44 75 0,3 728958 26 0,8 7,0 4,2 55 99 0,2 729018 23 0,9 7,0 4,0 73 95 0,3 785525 24 1,0 7,0 4,0 44 102 0,2 785674 26 0,9 7,1 3,8 53 110 0,2 785675 25 0,8 6,8 4,0 57 96 0,3 786503 28 0,9 6,7 3,9 58 108 0,2 786524 27 0,9 7,6 3,7 58 93 0,2 786548 27 0,9 7,0 4,0 58 102 0,3
Análise de Proteínas Pró-inflamatórias
[0327] Para avaliar qualquer efeito inflamatório dos oligonucleotídeos Ionis em macacos cinomolgos, amostras de sangue foram coletadas para análise. Os macacos foram deixados em jejum de um dia para o outro antes da coleta de sangue. No dia 84 (pré-dose e 24 horas após a dose), aproximadamente 0,8 mL de sangue foi coletado de cada animal e colocado em tubos sem anticoagulante para separação de soro. Os tubos foram mantidos à temperatura ambiente durante um mínimo de 90 minutos e, então, centrifugados a 3.000 rpm durante 10 minutos à temperatura ambiente para se obter o soro. O complemento C3 foi medido com o uso de um analisador de química Toshiba 120 FR NEO (Toshiba Co., Japão). Os resultados indicam que o tratamento com ION 729018 não causou qualquer inflamação em macacos. Um outro marcador de inflamação, proteína C-reativa (CRP), foi testado no dia 86. Tabela 60 Análise de proteína pró-inflamatória em macacos cinomolgos Complemento C3 (mg/dL) CRP (mg/L) N° do composto Dia 84 (após a Dia 84 (pré-dose) dia 86 dose inicial) Solução salina 106 104 0,1 728958 96 91 0,1 729018 93 84 0,1 785525 90 88 0,2 785674 79 71 0,1 785675 82 83 0,1 786503 93 101 0,1 786524 86 78 0,6 786548 87 92 1,2
Hematologia
[0328] Para avaliar qualquer efeito dos oligonucleotídeos Ionis em macacos cinomolgos sobre os parâmetros hematológicos, amostras de sangue de aproximadamente 0,5 mL de sangue foram coletadas de cada um dos animais do estudo disponíveis no dia 86. As amostras foram coletadas em tubos contendo K2-EDTA. As amostras foram analisadas para contagem de eritrócitos (RBC), hemoglobina (HGB), hematócrito (HCT), contagem de plaquetas (PLT), contagem de leucócitos (WBC), contagem de leucócitos individuais, como os de monócitos (MON), neutrófilos (NEU) e linfócitos (LYM) com o uso de um analisador hematológico ADVIA2120i (Siemens, EUA).
[0329] Os dados indicam que os oligonucleotídeos não causaram quaisquer alterações nos parâmetros hematológicos fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados nessa dose. Especificamente, o tratamento com ION 729018 foi bem tolerado em termos dos parâmetros hematológicos dos macacos. Tabela 61 Contagens de células sanguíneas em macacos cinomolgos
RBC HGB (g/dL) HCT (%) PLT (103/µL) 6 N° do composto (x10 /µL) Solução salina 5,6 13,0 43 312 728958 5,7 12,7 43 442 729018 6,1 13,4 44 334 785525 5,4 12,2 41 459 785674 5,6 13,1 43 405 785675 5,9 13,5 45 342 786503 5,6 12,5 43 378 786524 5,8 12,6 44 252 786548 5,9 13,3 45 390
Tabela 62 Contagens de células sanguíneas em macacos cinomolgos N° do composto WBC (x103/µL) NEU (%) LYM (%) MON (%) Solução salina 11 4 7 0,3 728958 10 4 6 0,3 729018 9 4 5 0,2 785525 12 4 7 0,3 785674 16 8 7 0,4 785675 9 1 7 0,3 786503 16 4 11 0,3 786524 9 4 4 0,3 786548 10 3 6 0,2 Coagulação
[0330] Para avaliar o efeito dos oligonucleotídeos modificados com Ionis sobre a coagulação em macacos cinomolgos, amostras de sangue de aproximadamente 0,9 mL foram coletadas de cada um dos animais de estudo disponíveis no dia 86. As amostras foram coletadas em tubos contendo 3,2% de citrato de sódio. Os parâmetros de coagulação testados incluem tempo de tromboplastina parcial ativada (APTT), tempo de protrombina (PT) e fibrinogênio (FIB).
[0331] Os dados indicam que os oligonucleotídeos modificados não causaram quaisquer alterações nos parâmetros de coagulação fora da faixa esperada para oligonucleotídeos modificados nessa dose. Especificamente, o tratamento com ION 729018 foi bem tolerado em termos dos parâmetros de coagulação dos macacos.
Tabela 63 Parâmetros de coagulação em macacos cinomolgos N° do composto PT (seg) FIB (mg/dL) APTT (seg) Solução salina 10 195 18 728958 10 249 19 729018 10 219 18 785525 10 208 20 785674 9 238 19 785675 9 216 19 786503 10 226 18 786524 10 235 18 786548 10 302 16 Análise Farmacocinética
[0332] O acúmulo de oligonucleotídeos modificados no fígado e nos rins foi medido em tecidos coletados na necropsia. 729018 mostrou perfis de acúmulo de tecido no rim e no fígado que eram típicos para essa classe de composto.
Tabela 64 Concentração média de tecido no dia 86 após 12 semanas de administração subcutânea
Órgão N° do composto Concentração média (µg/g)
728958 2078
729018 1472
785525 1702
785674 2169 Córtex renal 785675 1444
786503 1180
786524 1679
786548 1513
728958 657
729018 763
785525 732
785674 773 Fígado 785675 753
786503 496
786524 409
786548 392
Exemplo 9: Medição da viscosidade de oligonucleotídeos modificados direcionados para IRF5 humano
[0333] A viscosidade dos oligonucleotídeos modificados selecionados dos estudos descritos acima foi medida com o objetivo de separar os oligonucleotídeos modificados que tinham uma viscosidade maior que 40 centipoise (cP). Os oligonucleotídeos modificados tendo uma viscosidade maior que 40 cP teriam uma viscosidade menor que a ideal.
[0334] Os oligonucleotídeos (32 a 38 mg) foram pesados em um frasco de vidro; aproximadamente 100 µL de água foram adicionados, e o oligonucleotídeo modificado foi dissolvido na solução mediante aquecimento do frasco até 55 °C. Parte (75 µL) da amostra pré- aquecida foi pipetada para um microviscosímetro (viscosímetro PAC Cambridge Viscosity). A temperatura do microviscosímetro foi ajustada para 25 °C e a viscosidade da amostra foi medida. Todos os 75 µL da amostra foram combinados com a porção restante da amostra e diluídos adequadamente para leitura de UV a 260 nM (instrumento Cary UV). Os dados abaixo indicam que todas as soluções de oligonucleotídeos modificados são ótimas em sua viscosidade sob o critério declarado acima. Tabela 65 Viscosidade dos oligonucleotídeos modificados Concentração em peso Concentração por UV N° do composto Viscosidade (cP) (mg/mL) (mg/mL) 728958 300 201 17 729018 350 262 24 785524 350 277 14 785674 350 280 16 786503 300 218 40 786548 270 214 17 785675 250 209 6 786524 250 208 36
Exemplo 10: Confirmação de inibição dose-dependente de "gapmer"s de IRF5 humano
[0335] Os oligonucleotídeos modificados descritos nos estudos acima que mostraram inibição significativa in vitro de RNA de IRF5 foram selecionados e testados em várias doses em células A-431 e células SH-SY5Y humanas. Estudo 1
[0336] Células A-431 cultivadas a uma densidade de 11.000 células por poço foram tratadas com o uso de absorção livre com oligonucleotídeos modificados diluídos em diferentes concentrações, conforme especificado nas tabelas abaixo. Após um período de tratamento de aproximadamente 48 horas, os níveis de mRNA de IRF5 foram medidos com o uso do conjunto de primer e sonda de IRF5 humano RTS37490 ((sequência direta CCACCTCAGCCCTACAAGA, desenhoada na presente invenção como SEQ ID Nº: 17; sequência reversa TCAGGCTTGGCAACATCC; desenhoada na presente invenção como SEQ ID Nº: 18; sequência de sonda CCTGCTCCCACAGACTCCCAG, desenhoada na presente invenção como SEQ ID Nº: 19). Os níveis de mRNA de IRF5 foram normalizados para GAPDH humana medida pelo conjunto de primer e sonda RTS104. Os resultados são apresentados nas tabelas abaixo como porcentagem de inibição de IRF5 em relação às células de controle não tratadas.
[0337] A metade da concentração inibitória máxima (IC50) de cada oligonucleotídeo modificado também é apresentada. A IC50 foi calculada com o uso de uma regressão linear em uma plotagem log/linear dos dados em excel.
Tabela 66 Ensaio de múltiplas doses de oligonucleotídeos modificados em células A-431 % de Inibição N° do IC50 composto (µM) 23,44 nM 93,75 nM 375,00 nM 1.500,00 nM 6.000,00 nM 728958 0 16 36 57 71 1,07 729018 31 72 93 98 99 0,05 785525 32 68 88 95 97 0,05 785675 7 27 57 80 90 0,28 786503 29 70 93 98 99 0,05 Estudo 2
[0338] Células SH-SY5Y cultivadas a uma densidade de 45.000 células por poço foram tratadas com o uso de eletroporação com oligonucleotídeos modificados diluídos em diferentes concentrações, conforme especificado nas tabelas abaixo. Após um período de tratamento de aproximadamente 24 horas, os níveis de mRNA de IRF5 foram medidos conforme anteriormente descrito com o uso do conjunto de primer e sonda de IRF5 humano RTS37490. Os níveis de mRNA de IRF5 foram normalizados para GAPDH humana medida pelo conjunto de primer e sonda RTS104. Os resultados são apresentados nas tabelas abaixo como porcentagem de inibição de IRF5 em relação às células de controle não tratadas.
[0339] A metade da concentração inibitória máxima (IC50) de cada oligonucleotídeo modificado também é apresentada. A IC50 foi calculada com o uso de uma regressão linear em uma plotagem log/linear dos dados em excel.
Tabela 67 Ensaio de múltiplas doses de oligonucleotídeos modificados em células SH-SY5Y % de Inibição N° do 375,00 1.500,00 6.000,00 IC50 composto 23,44 nM 93,75 nM nM nM nM (µM) 728958 0 0 23 47 64 1,07 729018 8 19 46 66 80 0,05 785525 8 15 36 68 80 0,05 785675 0 0 17 42 65 0,28 786503 22 15 32 64 80 0,05 Exemplo 11: Avaliação de efeitos pró-inflamatórios no ensaio de hPBMC
[0340] Oligonucleotídeos modificados com IRF5 humano foram testados quanto às propriedades imunoestimulatórias potenciais em um ensaio in vitro de ativação de células mononucleares de sangue periférico humanas (PBMC, "peripheral blood mononuclear cell"). PBMCs humanas foram isoladas de sangue integral fresco doado por doadores saudáveis (com consentimento informado na clínica US HealthWorks, Carlsbad). O sangue foi coletado em tubos de CPT Vacutainer de 8 mL que continham anticoagulante à base de citrato de sódio e meio de densidade Ficoll com barreira de gel de poliéster separando aqueles líquidos. Após a centrifugação dos tubos de CPT a 1215 rpm na centrífuga Beckman Allegra 6R, os eritrócitos e os granulócitos foram separados do plasma e PBMCs por barreira de gel de poliéster. As PBMCs se acumularam na interface entre Ficoll e plasma, logo acima da camada de gel polimérico. As PBMCs purificadas foram lavadas com PBS (livre de Ca++, Mg++), e ressuspensas em meio de cultura RPMI (RPMI contendo 10% de FBS e penicilina e estreptomicina). Apenas preparações de PBMCs com viabilidade >80% foram usadas para o ensaio. A viabilidade média das PBMCs usadas nestes ensaios foi 86,6%.
[0341] Para as culturas, as PBMCs foram plaqueadas a 5 x 105 células/poço em placas de polipropileno estéreis de fundo redondo de 96 poços. As células foram tratadas com concentrações crescentes de oligonucleotídeos modificados direcionados para IRF5 humano (conforme indicado nas tabelas abaixo) e incubadas durante 24 horas a 37°C e 5% de CO2. Número ION 353512 ("gapmer" 3-14-3 MOE, TCCCATTTCAGGAGACCTGG, desenhado aqui como SEQ ID Nº: 35) é um padrão interno conhecido por ser um alto respondedor para a liberação de IL-6 no ensaio. Número ION 104838 ("gapmer" 5-10-5 MOE, GCTGATTAGAGAGAGGTCCC, desenhoado aqui como SEQ ID Nº: 36) é um padrão interno conhecido por ser um não respondedor no ensaio (um controle negativo). Após uma incubação de 24 horas, as placas foram centrifugadas a 330 g durante 5 minutos; os sobrenadantes foram coletados para a realização do ensaio de citocinas usando-se o painel pro-inflamatório humano 1_V-plex (4-plex personalizado) da MSD (Meso Scale Discovery). O ensaio de citocinas multiplex da MSD foi realizado seguindo as instruções do fabricante para medir os níveis de IL-6, IL-10, e TNF-α no sobrenadante. A eletroquimioluminescência foi medida com o uso do Sector Imager 2400 (Meso Scale Discovery) e os dados analisados com o uso do software MSD Discovery Workbench®.
[0342] Os níveis de IL-6, IL-10 e TNF-α medidos são apresentados nas tabelas abaixo. Muitos dos oligonucleotídeos testados foram considerados toleráveis. Número ION 729018 consistentemente induziu uma produção de citocina similar ou menor que a do oligonucleotídeo de controle negativo.
Tabela 68 Níveis de IL-6 após o tratamento de PBMCs humanas com oligonucleotídeos modificados N° do composto Concentração (µM) 728958 729018 785525 785674 785675 786503 786524 786548 353512 104838
0 172 162 144 148 219 193 198 194 213 205
0,0128 212 180 211 201 245 159 189 247 198 211
0,064 228 201 211 211 217 207 204 184 206 307
0,32 264 183 301 298 292 246 212 297 381 339
1,6 216 208 355 391 376 271 208 273 332 258
8,0 254 243 370 353 436 341 242 290 472 297
40,0 326 276 456 417 491 342 217 282 470 332
200,0 2709 286 745 502 738 446 286 452 632 524
Tabela 69 Níveis de IL-10 após o tratamento de PBMCs humanas com oligonucleotídeos modificados N° do composto Concentração (µM) 728958 729018 785525 785674 785675 786503 786524 786548 353512 104838
0 7 12 6 8 10 9 9 9 8 7
0,0128 7 8 10 8 10 7 8 8 13 6
0,064 27 36 9 12 13 10 8 9 43 12
0,32 13 15 20 28 37 25 9 14 66 24
1,6 10 24 40 47 55 31 13 18 52 24
8,0 14 26 29 43 60 34 18 20 28 21
40,0 9 17 11 20 27 15 21 13 11 11
200,0 13 5 7 9 9 8 15 5 8 6
Tabela 70 Níveis de TNF-α após o tratamento de PBMCs humanas com oligonucleotídeos modificados N° do composto Concentração (µM) 728958 729018 785525 785674 785675 786503 786524 786548 353512 104838 0 11 10 9 9 11 10 10 11 12 12 0,0128 9 10 11 12 12 14 10 11 11 11 0,064 15 22 10 10 10 10 9 10 14 12 0,32 16 11 13 12 13 11 8 11 17 14 1,6 11 13 19 16 17 15 10 13 22 15 8,0 13 14 25 20 25 20 12 15 35 20 40,0 22 20 40 32 35 26 16 19 41 28 200,0 92 28 115 50 63 36 24 29 89 55 Exemplo 12: Inibição dose-dependente de IRF5 humano em células A- 431 por oligonucleotídeos modificados
[0343] Os oligonucleotídeos modificados descritos nos estudos acima que mostraram inibição significativa in vitro de RNA de IRF5 foram selecionados e testados em várias doses em células A-431 humanas.
[0344] Células A-431 cultivadas a uma densidade de 10.000 células por poço foram tratadas com o uso de absorção livre com oligonucleotídeos modificados diluídos em diferentes concentrações, conforme especificado nas tabelas abaixo. Após um período de tratamento de aproximadamente 48 horas, os níveis de mRNA de IRF5 foram medidos conforme anteriormente descrito com o uso do conjunto de primer e sonda de IRF humano RTS4524. Os níveis de mRNA de IRF5 foram ajustados de acordo com o teor total de RNA, conforme medido por RIBOGREEN®. Os resultados são apresentados nas tabelas abaixo como porcentagem de inibição de IRF5 em relação às células de controle não tratadas. A metade da concentração inibitória máxima (IC50) de cada oligonucleotídeo modificado também é apresentada.
Tabela 71 Ensaio de múltiplas doses de oligonucleotídeos modificados em células A-431 N° do % de Inibição IC50 (µM) composto 4,57 nM 13,72 nM 41,152 nM 123,457 nM 370,37 nM 1111,111 nM 3333,33 nM 10.000,0 nM 729018 0 11 41 64 77 83 86 88 0,1 786503 0 2 26 57 71 82 88 89 0,1 786524 0 10 28 53 78 85 88 89 0,1 Exemplo 13: Desenho e inibição dose-dependente de oligonucleotídeos modificados direcionado para IRF5 humano
[0345] Oligonucleotídeos modificados com modificações químicas adicionais foram projetados sobrepondo-se aos sítios ativos de 729018, 786503 e 785675, que foram selecionados com base nos estudos acima. Os oligonucleotídeos recém-projetados foram testados quanto à inibição in vitro do mRNA de IRF5 humano em células A-431 humanas. Várias modificações químicas diferentes foram testadas, que são especificadas na coluna de notação química das tabelas abaixo, sendo que a notação "d" refere-se a um açúcar 2'-desoxirribose, a notação "s" refere-se a uma ligação internucleosídica fosforotioato, a notação "k" refere-se a um açúcar modificado cEt, a notação "y" refere-se a um açúcar 2'-o-metil-ribose, a notação "MOP" refere-se a uma ligação internucleosídica de fosfonato metoxipropila e a notação "mC" refere-se a uma 5-metilcitosina. Em alguns casos, a timina foi substituída por uracil.
Tabela 72 Lista de oligonucleotídeos modificados projetados para o estudo de inibição dose-dependente
N° do SEQ ID Nº: Sítio Sequência (5' a 3') Notação química SEQ ID Nº composto de início 2
785675 4366 TGTCTAGTGTCATGGA TksGksTdsmCdsTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAesTesGesGksAk 1340
1073764 4366 TksGksTdsmCksTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAesTesGesGksAk TGTCTAGTGTCATGGA 1340
1073765 4366 TksGksTdsmCdsTksAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAesTesGesGksAk TGTCTAGTGTCATGGA 1340
1073766 4366 TksGksTdsmCdMOPTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAesTesGesGksAk TGTCTAGTGTCATGGA 1340
1073767 4366 TksGksTdsmCdsTdMOPAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAesTesGesGksAk TGTCTAGTGTCATGGA 1340
1073768 4366 TksGksTdsCysTdsAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAesTesGesGksAk TGTCTAGTGTCATGGA 1340
1073769 4366 TGTCUAGTGTCATGGA TksGksTdsmCdsUysAdsGdsTdsGdsTdsmCdsAesTesGesGksAk 1356
786503 11736 CTGATATGATACCTAA mCksTksGksAdsTdsAdsTdsGdsAdsTdsAdsmCdsmCdsTksAksAk 1270
1072783 11736 mCksTksGksAdsTksAdsTdsGdsAdsTdsAdsmCdsmCdsTksAksAk CTGATATGATACCTAA 1270
1072784 11736 mCksTksGksAdsTdsAksTdsGdsAdsTdsAdsmCdsmCdsTksAksAk CTGATATGATACCTAA 1270
1072785 11736 mC ksTksGksAdsTdMOPAdsTdsGdsAdsTdsAds Cds CdsTksAksAk m m CTGATATGATACCTAA 1270
1072786 11736 mCksTksGksAdsTdsAdMOPTdsGdsAdsTdsAdsmCdsmCdsTksAksAk CTGATATGATACCTAA 1270
1072788 11736 CTGATATGATACCTAA mCksTksGksAdsTdsAysTdsGdsAdsTdsAdsmCdsmCdsTksAksAk 1270
1072787 11736 CTGAUATGATACCTAA mC ksTksGksAdsUysAdsTdsGdsAdsTdsAds Cds CdsTksAksAk m m 1355
729018 11737 TCTGATATGATACCTA TksmCksTksGdsAdsTdsAdsTdsGdsAdsTdsAdsmCdsmCksTksAk 228
1072777 11737 TCTGATATGATACCTA TksmCksTksGdsAksTdsAdsTdsGdsAdsTdsAdsmCdsmCksTksAk 228
1072778 11737 TksmCksTksGdsAdsTksAdsTdsGdsAdsTdsAdsmCdsmCksTksAk TCTGATATGATACCTA 228
1072779 11737 TksmCksTksGdsAdMOPTdsAdsTdsGdsAdsTdsAdsmCdsmCksTksAk TCTGATATGATACCTA 228
1072780 11737 TksmCksTksGdsAdsTdMOPAdsTdsGdsAdsTdsAdsmCdsmCksTksAk TCTGATATGATACCTA 228
1072781 11737 TksmCksTksGdsAysTdsAdsTdsGdsAdsTdsAdsmCdsmCksTksAk TCTGATATGATACCTA 228
1072782 11737 TCTGAUATGATACCTA TksmCksTksGdsAdsUysAdsTdsGdsAdsTdsAdsmCdsmCksTksAk 1354
[0346] Células A-431 cultivadas a uma densidade de 10.000 células por poço foram tratadas com o uso de absorção livre com oligonucleotídeos modificados diluídos em diferentes concentrações, conforme especificado nas tabelas abaixo. Após um período de tratamento de aproximadamente 72 horas, os níveis de mRNA de IRF5 foram medidos com o uso do conjunto de primer e sonda de IRF5 humano RTS4524. Os níveis de RNA de IRF5 foram ajustados de acordo com o teor total de RNA, conforme medido por RIBOGREEN®. Os resultados são apresentados como porcentagem de inibição de IRF5 em relação às células de controle não tratadas. Como usado na presente invenção, um valor de '0' indica que o tratamento com o oligonucleotídeo modificado não inibiu os níveis de mRNA de IRF5.
[0347] A metade da concentração inibitória máxima (IC50) de cada oligonucleotídeo modificado também é apresentada. A IC50 foi calculada com o uso de uma regressão linear em uma plotagem log/linear dos dados em excel. Os dados abaixo mostram que 729018 mostra atividade significativa contra IRF5 humano em comparação com todos os outros oligonucleotídeos modificados testados.
Tabela 73 Ensaio de múltiplas doses de oligonucleotídeos modificados em células A-431
% de Inibição N° do composto 4,12 nM 12,25 nM 37,04 nM 111,11 nM 333,33 nM 1.000 nM
729018 8 27 54 78 89 92
1072777 0 7 43 65 81 85
1072778 4 8 36 54 69 74
1072779 10 14 43 66 80 87
1072780 10 6 38 56 71 77
1072781 1 8 35 57 77 81
1072782 0 12 35 58 79 83
786503 13 29 54 80 88 90
1072783 20 29 38 64 83 83
1072784 18 23 41 63 80 75
1072785 11 22 29 56 76 78
1072786 0 15 25 54 71 71
1072787 6 23 41 64 82 82
1072788 1 14 31 56 74 79
785675 0 0 24 44 59 69
785675 4 2 28 44 60 74
1073764 0 5 6 24 23 41
1073765 0 0 9 17 13 29
1073766 0 15 10 39 58 75
1073767 2 11 4 8 18 32
1073768 0 11 5 15 25 33
1073769 0 7 10 26 46 62

Claims (59)

REIVINDICAÇÕES
1. Composto caracterizado por compreender um oligonucleotídeo modificado de 8 a 80 nucleosídeos ligados de comprimento, tendo uma sequência de nucleobases que compreende ao menos 8, ao menos 9, ao menos 10, ao menos 11, ou ao menos 12 nucleobases contíguas de qualquer das sequências de nucleobases da SEQ ID Nº: 228, SEQ ID Nºs: 37 a 227, e SEQ ID Nºs: 229 a 1356.
2. Composto caracterizado por compreender um oligonucleotídeo modificado de 8 a 80 nucleosídeos de comprimento e ter uma sequência de nucleobases que compreende a sequência de nucleobases de qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356.
3. Composto caracterizado por compreender um oligonucleotídeo modificado tendo uma sequência de nucleobases que consiste em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 37 a 1356.
4. Composto caracterizado por compreender um oligonucleotídeo modificado de 8 a 80 nucleosídeos ligados de comprimento, sendo que o oligonucleotídeo modificado tem uma sequência de nucleobases que compreende uma porção de ao menos 8 nucleobases contíguas 100% complementares a uma porção de comprimento igual de nucleobases 4366 a 4381, 5141 a 5156, 5140 a 5160, 5179 a 5194, 11544 a 11559, 11542 a 11596, 11736 a 11751, 11737 a 11752, 11720 a 11790, ou 11794 a 11809 da SEQ ID Nº: 2, e sendo que a sequência de nucleobases do oligonucleotídeo modificado é ao menos 85%, ao menos 90%, ao menos 95%, ou 100% complementar à SEQ ID Nº: 2.
5. Composto caracterizado por compreender um oligonucleotídeo modificado de 8 a 80 nucleosídeos ligados de comprimento, sendo que o oligonucleotídeo modificado tem uma sequência de nucleobases complementar nas nucleobases 5567 a 5642, 5644 a 5731, 5567 a 5731, 5567 a 5620, 13697 a 13733, 20553 a 20676, 20664 a 20824, 20553 a 20824 e 25844 a 25912 da SEQ ID Nº: 2, e sendo que o dito oligonucleotídeo modificado é pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, ou 100% complementar à SEQ ID Nº: 2.
6. Composto caracterizado por compreender um oligonucleotídeo modificado de 8 a 80 nucleosídeos ligados de comprimento, sendo que o oligonucleotídeo modificado tem uma sequência de nucleobases que compreende uma porção de ao menos 8 nucleobases contíguas complementares a uma porção de comprimento igual de nucleobases 5567 a 5642, 5644 a 5731, 5567 a 5731, 5567 a 5620, 13697 a 13733, 20553 a 20676, 20664 a 20824, 20553 a 20824, e 25844 a 25912 de um ácido nucleico IRF5 tendo a sequência de nucleobases da SEQ ID Nº: 2, sendo que a sequência de nucleobases do oligonucleotídeo modificado é complementar à SEQ ID Nº: 2.
7. Composto caracterizado por compreender um oligonucleotídeo modificado de 8 a 80 nucleosídeos ligados de comprimento, sendo que o oligonucleotídeo modificado tem uma sequência de nucleobases que compreende uma porção de 16 nucleobases complementar a uma porção de comprimento igual de nucleobases 5567 a 5642, 5644 a 5731, 5567 a 5731, 5567 a 5620, 13697 a 13733, 20553 a 20676, 20664 a 20824, 20553 a 20824, e 25844 a 25912 da SEQ ID Nº: 2.
8. Composto caracterizado por compreender um oligonucleotídeo modificado de 8 a 80 nucleosídeos ligados de comprimento, sendo que o oligonucleotídeo modificado tem uma sequência de nucleobases que compreende qualquer uma das SEQ ID Nºs: 168, 228, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294.
9. Composto caracterizado por compreender um oligonucleotídeo modificado que tem uma sequência de nucleobases que consiste em qualquer uma das SEQ ID Nº: 168, 228, 717, 1340, 1270, 1272, e 1294.
10. Composto, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 9, caracterizado por o oligonucleotídeo ser ao menos 80%, ao menos 85%, ao menos 90%, ao menos 95% ou 100% complementar à SEQ ID Nº: 2 em todo o comprimento do oligonucleotídeo.
11. Composto, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 10, caracterizado por o oligonucleotídeo modificado compreender ao menos uma modificação selecionada dentre ao menos uma ligação internucleosídica modificada, ao menos um açúcar modificado, e ao menos uma nucleobase modificada.
12. Composto, de acordo com a reivindicação 11, caracterizado por a ligação internucleosídica modificada ser uma ligação internucleosídica de fosforotioato.
13. Composto, de acordo com a reivindicação 11 ou 12, caracterizado por o açúcar modificado ser um açúcar bicíclico.
14. Composto, de acordo com a reivindicação 13, caracterizado por o açúcar bicíclico ser selecionado do grupo que consiste em: 4'-(CH2)-O-2' (LNA); 4'-(CH2)2-O-2' (ENA); e 4'-CH(CH3)-O-2' (cEt).
15. Composto, de acordo com a reivindicação 11 ou 12, caracterizado por o açúcar modificado ser 2'-O-metoxietila.
16. Composto, de acordo com qualquer uma das reivindicações 11 a 15, caracterizado por a nucleobase modificada ser uma 5-metilcitosina.
17. Composto de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 16, caracterizado por o oligonucleotídeo modificado compreender: um segmento de lacuna que consiste em desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado imediatamente adjacente a e entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', e sendo que cada nucleosídeo de cada segmento de asa compreende um açúcar modificado.
18. Composto, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 17, caracterizado por o composto ser de fita simples.
19. Composto, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 17, caracterizado por o composto ser de fita dupla.
20. Composto, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 19, caracterizado por o composto compreender ribonucleotídeos.
21. Composto, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 19, caracterizado por o composto compreender desoxirribonucleotídeos.
22. Composto de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 21, caracterizado por o oligonucleotídeo modificado consistir em 10 a 30 nucleosídeos ligados.
23. Composto, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 21, caracterizado por o oligonucleotídeo modificado consistir em 12 a 30 nucleosídeos ligados.
24. Composto, de acordo com qualquer uma das reivindicações 1 a 21, caracterizado por o oligonucleotídeo modificado consistir em 15 a 30 nucleosídeos ligados.
25. Composto caracterizado por compreender um oligonucleotídeo modificado de 16 nucleosídeos ligados de comprimento, sendo que o oligonucleotídeo modificado tem uma sequência de nucleobases que compreende qualquer uma das SEQ ID Nºs: 168, 228, 717, 1340, 1270, 1272 e 1294, sendo que o oligonucleotídeo modificado compreende:
um segmento de lacuna que consiste em desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', e sendo que cada nucleosídeo de cada segmento de asa compreende um açúcar modificado.
26. Composto caracterizado por compreender ou consistir em um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleobases ligadas de comprimento que tem uma sequência de nucleobases que compreende a sequência mencionada em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 228, 168, 1270, 1272 e 1294, sendo que o oligonucleotídeo modificado compreende: um segmento de lacuna que consiste em dez desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em três nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em três nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', sendo que cada nucleosídeo de cada segmento de asa compreende um açúcar cEt; em que cada ligação internucleosídica é uma ligação de fosforotioato e em que cada citosina é uma 5-metilcitosina. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 a 30 nucleosídeos ligados. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 nucleosídeos ligados.
27. Composto caracterizado por consistir em um oligonucleotídeo modificado de 16 nucleobases ligadas de comprimento tendo uma sequência de nucleobases que consiste na sequência mencionada na SEQ ID Nº: 228, sendo que o oligonucleotídeo modificado compreende: um segmento de lacuna que consiste em dez desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em três nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em três nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', sendo que cada nucleosídeo de cada segmento de asa compreende um açúcar cEt; em que cada ligação internucleosídica é uma ligação de fosforotioato e em que cada citosina é uma 5-metilcitosina.
28. Composto caracterizado por compreender ou consistir em um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleobases ligadas de comprimento que tem uma sequência de nucleobases que compreende a sequência mencionada em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 717, sendo que o oligonucleotídeo modificado compreende: um segmento de lacuna que consiste em dez desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em dois nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em quatro nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', sendo que cada nucleosídeo no segmento de asa 5' compreende um açúcar cEt (kk);
sendo que os nucleosídeos do segmento de asa 3' compreendem da direção 5' a 3' de um açúcar cEt, um açúcar 2'-MOE, um açúcar cEt e um açúcar 2'-MOE (keke); em que cada ligação internucleosídica é uma ligação de fosforotioato e em que cada citosina é uma 5-metilcitosina. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 a 30 nucleosídeos ligados. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 nucleosídeos ligados.
29. Composto caracterizado por compreender ou consistir em um oligonucleotídeo modificado de 12 a 30 nucleobases ligadas de comprimento que tem uma sequência de nucleobases que compreende a sequência mencionada em qualquer uma das SEQ ID Nºs: 717 e 1340, sendo que o oligonucleotídeo modificado compreende: um segmento de lacuna que consiste em nove desoxinucleosídeos ligados; um segmento de asa 5' que consiste em dois nucleosídeos ligados; e um segmento de asa 3' que consiste em cinco nucleosídeos ligados; sendo que o segmento de lacuna é posicionado entre o segmento de asa 5' e o segmento de asa 3', sendo que cada nucleosídeo no segmento de asa 5' compreende um açúcar cEt (kk); sendo que os nucleosídeos do segmento de asa 3' da direção 5' a 3' de um açúcar cEt, um açúcar 2'-MOE, um açúcar 2'-MOE, um açúcar 2'- MOE, um açúcar cEt e um açúcar cEt (eeekk); em que cada ligação internucleosídica é uma ligação de fosforotioato e em que cada citosina é uma 5-metilcitosina. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modifi- cado consiste em 16 a 30 nucleosídeos ligados. Em certas modalidades, o oligonucleotídeo modificado consiste em 16 nucleosídeos ligados.
30. Composto caracterizado por ter a seguinte fórmula ou sal do mesmo:
31. Composto caracterizado por ter a seguinte fórmula:
32. Composto ou oligonucleotídeo modificado, como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 30, caracterizado por o composto de oligonucleotídeo modificado estar em uma forma de sal farmaceuticamente aceitável.
33. Composto ou oligonucleotídeo modificado, de acordo com a reivindicação 32, caracterizado por o sal farmaceuticamente aceitável ser um sal de sódio.
34. Composto ou oligonucleotídeo modificado, de acordo com a reivindicação 32, caracterizado por o sal farmaceuticamente aceitável ser um sal de potássio.
35. Composição caracterizada por compreender o composto ou o oligonucleotídeo modificado como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 34 e um veículo farmaceuticamente aceitável.
36. Composição caracterizada por compreender um composto ou um oligonucleotídeo modificado como definido em qualquer uma das reivindicações anteriores, para uso em terapia.
37. Método para tratar, prevenir ou aliviar uma doença associada à IRF5 em um indivíduo, caracterizado por compreender administrar ao indivíduo um composto direcionado ao IRF5, tratando, prevenindo, ou aliviando, assim, a doença.
38. Método para administrar o composto como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 34, ou a composição como definida na reivindicação 35 ou 36, a um indivíduo.
39. Método, de acordo com a reivindicação 37, caracterizado por o composto ser um composto antissenso direcionado a IRF5.
40. Método, de acordo com a reivindicação 42 ou 43, caracterizado por a doença ser uma doença inflamatória intestinal.
41. Método, de acordo com a reivindicação 40, caracterizado por a doença inflamatória intestinal ser colite ulcerativa.
42. Método, de acordo com a reivindicação 40, caracterizado por a doença inflamatória intestinal ser doença de Crohn.
43. Método, de acordo com qualquer das reivindicações 38 a 42, caracterizado por a administração do composto inibir ou reduzir a inflamação no trato gastrointestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, aumento da frequência intestinal, tenesmo ou espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional no indivíduo.
44. Método de inibição da expressão de IRF5 em uma célula, caracterizado por compreender colocar a célula em contato com um composto direcionado a IRF5, inibindo, assim, a expressão de IRF5 na célula.
45. Método, de acordo com a reivindicação 44, caracterizado por a célula estar no trato gastrointestinal de um indivíduo.
46. Método, de acordo com a reivindicação 45, caracterizado por o indivíduo ter, ou estar em risco de ter, uma doença inflamatória intestinal.
47. Método para reduzir ou inibir inflamação no trato gastrointestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, aumento da frequência intestinal, tenesmo espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional em um indivíduo, caracterizado por compreender a administração de um composto direcionado a IRF5 ao indivíduo, reduzindo ou inibindo, assim, a inflamação no trato gastrointestinal, diarreia, dor, fadiga, cólicas abdominais, sangue nas fezes, inflamação intestinal, ruptura da barreira epitelial do trato gastrointestinal, disbiose, frequência intestinal aumentada, tenesmo ou espasmos dolorosos do esfíncter anal, constipação ou perda de peso não intencional no indivíduo.
48. Método, de acordo com a reivindicação 50, caracterizado por o indivíduo ter, ou estar em risco de ter, uma doença inflamatória intestinal.
49. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 47 a 51, caracterizado por o composto ser um composto antissenso direcionado a IRF5.
50. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 47 a 49, caracterizado por o composto ser o composto como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 34 ou a composição como definida na reivindicação 35 ou 36.
51. Método, de acordo com a reivindicação 44 ou 47, caracterizado por o composto ou a composição ser administrado(a) intranasalmente.
52. Uso de um composto direcionado a IRF5, caracterizado por se destinar a tratar, prevenir ou aliviar uma doença associada ao IRF5.
53. Uso, de acordo com a reivindicação 52, caracterizado por a doença ser uma doença inflamatória intestinal.
54. Uso, de acordo com a reivindicação 52 ou 53, caracterizado por o composto ser um composto antissenso direcionado a IRF5.
55. Uso, de acordo com qualquer uma das reivindicações 52 a 54, caracterizado por o composto ser o composto como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 34 ou a composição como definida na reivindicação 35 ou 36.
56. Uso de um composto direcionado a IRF5 caracterizado por se destinar à fabricação de um medicamento para tratar, prevenir ou aliviar uma doença associada a IRF5.
57. Uso, de acordo com a reivindicação 56, caracterizado por a doença ser uma doença inflamatória intestinal.
58. Uso, de acordo com a reivindicação 56 ou 57, caracterizado por o composto ser um composto antissenso direcionado a IRF5.
59. Uso, de acordo com qualquer uma das reivindicações 56 a 58, caracterizado por o composto ser o composto como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 34 ou a composição como definida na reivindicação 35 ou 36.
BR112021008967-5A 2018-11-15 2019-11-15 moduladores da expressão de irf5 BR112021008967A2 (pt)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201862767615P 2018-11-15 2018-11-15
US62/767,615 2018-11-15
PCT/US2019/061629 WO2020102630A1 (en) 2018-11-15 2019-11-15 Modulators of irf5 expression

Publications (1)

Publication Number Publication Date
BR112021008967A2 true BR112021008967A2 (pt) 2021-08-17

Family

ID=70730871

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
BR112021008967-5A BR112021008967A2 (pt) 2018-11-15 2019-11-15 moduladores da expressão de irf5

Country Status (21)

Country Link
US (2) US11208650B2 (pt)
EP (1) EP3880821A4 (pt)
JP (1) JP2022509059A (pt)
KR (1) KR20210092761A (pt)
CN (1) CN113646430A (pt)
AR (1) AR117094A1 (pt)
AU (1) AU2019380940A1 (pt)
BR (1) BR112021008967A2 (pt)
CA (1) CA3119456A1 (pt)
CL (1) CL2021001246A1 (pt)
CO (1) CO2021007006A2 (pt)
CR (1) CR20210311A (pt)
EA (1) EA202191342A1 (pt)
IL (1) IL283072A (pt)
JO (1) JOP20210108A1 (pt)
MX (1) MX2021005758A (pt)
PE (1) PE20211869A1 (pt)
PH (1) PH12021551053A1 (pt)
SG (1) SG11202104666SA (pt)
TW (1) TW202039840A (pt)
WO (1) WO2020102630A1 (pt)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
TW202216171A (zh) * 2020-07-01 2022-05-01 美商健生生物科技公司 Ｉｒｆ５反義寡核苷酸之安全投予之方法
WO2022240721A1 (en) * 2021-05-10 2022-11-17 Entrada Therapeutics, Inc. Compositions and methods for modulating interferon regulatory factor-5 (irf-5) activity

Family Cites Families (184)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US44779A (en) 1864-10-25 Improved clothes-wringer
US34036A (en) 1861-12-24 Improvement in mode of attaching breeching to shafts of carriages
US3687808A (en) 1969-08-14 1972-08-29 Univ Leland Stanford Junior Synthetic polynucleotides
US4458066A (en) 1980-02-29 1984-07-03 University Patents, Inc. Process for preparing polynucleotides
US4500707A (en) 1980-02-29 1985-02-19 University Patents, Inc. Nucleosides useful in the preparation of polynucleotides
US5132418A (en) 1980-02-29 1992-07-21 University Patents, Inc. Process for preparing polynucleotides
US4469863A (en) 1980-11-12 1984-09-04 Ts O Paul O P Nonionic nucleic acid alkyl and aryl phosphonates and processes for manufacture and use thereof
US4973679A (en) 1981-03-27 1990-11-27 University Patents, Inc. Process for oligonucleo tide synthesis using phosphormidite intermediates
US4668777A (en) 1981-03-27 1987-05-26 University Patents, Inc. Phosphoramidite nucleoside compounds
US4415732A (en) 1981-03-27 1983-11-15 University Patents, Inc. Phosphoramidite compounds and processes
US5023243A (en) 1981-10-23 1991-06-11 Molecular Biosystems, Inc. Oligonucleotide therapeutic agent and method of making same
US4476301A (en) 1982-04-29 1984-10-09 Centre National De La Recherche Scientifique Oligonucleotides, a process for preparing the same and their application as mediators of the action of interferon
DE3329892A1 (de) 1983-08-18 1985-03-07 Köster, Hubert, Prof. Dr., 2000 Hamburg Verfahren zur herstellung von oligonucleotiden
US5118800A (en) 1983-12-20 1992-06-02 California Institute Of Technology Oligonucleotides possessing a primary amino group in the terminal nucleotide
US5550111A (en) 1984-07-11 1996-08-27 Temple University-Of The Commonwealth System Of Higher Education Dual action 2',5'-oligoadenylate antiviral derivatives and uses thereof
FR2567892B1 (fr) 1984-07-19 1989-02-17 Centre Nat Rech Scient Nouveaux oligonucleotides, leur procede de preparation et leurs applications comme mediateurs dans le developpement des effets des interferons
US5367066A (en) 1984-10-16 1994-11-22 Chiron Corporation Oligonucleotides with selectably cleavable and/or abasic sites
FR2575751B1 (fr) 1985-01-08 1987-04-03 Pasteur Institut Nouveaux nucleosides de derives de l'adenosine, leur preparation et leurs applications biologiques
US5506337A (en) 1985-03-15 1996-04-09 Antivirals Inc. Morpholino-subunit combinatorial library and method
US5185444A (en) 1985-03-15 1993-02-09 Anti-Gene Deveopment Group Uncharged morpolino-based polymers having phosphorous containing chiral intersubunit linkages
US5166315A (en) 1989-12-20 1992-11-24 Anti-Gene Development Group Sequence-specific binding polymers for duplex nucleic acids
US5405938A (en) 1989-12-20 1995-04-11 Anti-Gene Development Group Sequence-specific binding polymers for duplex nucleic acids
US5034506A (en) 1985-03-15 1991-07-23 Anti-Gene Development Group Uncharged morpholino-based polymers having achiral intersubunit linkages
US5235033A (en) 1985-03-15 1993-08-10 Anti-Gene Development Group Alpha-morpholino ribonucleoside derivatives and polymers thereof
DE3788914T2 (de) 1986-09-08 1994-08-25 Ajinomoto Kk Verbindungen zur Spaltung von RNS an eine spezifische Position, Oligomere, verwendet bei der Herstellung dieser Verbindungen und Ausgangsprodukte für die Synthese dieser Oligomere.
US5264423A (en) 1987-03-25 1993-11-23 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Inhibitors for replication of retroviruses and for the expression of oncogene products
US5276019A (en) 1987-03-25 1994-01-04 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Inhibitors for replication of retroviruses and for the expression of oncogene products
AU598946B2 (en) 1987-06-24 1990-07-05 Howard Florey Institute Of Experimental Physiology And Medicine Nucleoside derivatives
US4924624A (en) 1987-10-22 1990-05-15 Temple University-Of The Commonwealth System Of Higher Education 2,',5'-phosphorothioate oligoadenylates and plant antiviral uses thereof
US5188897A (en) 1987-10-22 1993-02-23 Temple University Of The Commonwealth System Of Higher Education Encapsulated 2',5'-phosphorothioate oligoadenylates
DE3855864T2 (de) 1987-11-30 1997-09-25 Univ Iowa Res Found Durch modifikationen an der 3'-terminalen phosphodiesterbindung stabilisierte dna moleküle, ihre verwendung als nukleinsäuresonden sowie als therapeutische mittel zur hemmung der expression spezifischer zielgene
US5403711A (en) 1987-11-30 1995-04-04 University Of Iowa Research Foundation Nucleic acid hybridization and amplification method for detection of specific sequences in which a complementary labeled nucleic acid probe is cleaved
EP0406309A4 (en) 1988-03-25 1992-08-19 The University Of Virginia Alumni Patents Foundation Oligonucleotide n-alkylphosphoramidates
US5278302A (en) 1988-05-26 1994-01-11 University Patents, Inc. Polynucleotide phosphorodithioates
US5216141A (en) 1988-06-06 1993-06-01 Benner Steven A Oligonucleotide analogs containing sulfur linkages
US5175273A (en) 1988-07-01 1992-12-29 Genentech, Inc. Nucleic acid intercalating agents
US5194599A (en) 1988-09-23 1993-03-16 Gilead Sciences, Inc. Hydrogen phosphonodithioate compositions
US5256775A (en) 1989-06-05 1993-10-26 Gilead Sciences, Inc. Exonuclease-resistant oligonucleotides
US5134066A (en) 1989-08-29 1992-07-28 Monsanto Company Improved probes using nucleosides containing 3-dezauracil analogs
US5591722A (en) 1989-09-15 1997-01-07 Southern Research Institute 2'-deoxy-4'-thioribonucleosides and their antiviral activity
US5721218A (en) 1989-10-23 1998-02-24 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotides with inverted polarity
US5399676A (en) 1989-10-23 1995-03-21 Gilead Sciences Oligonucleotides with inverted polarity
US5264564A (en) 1989-10-24 1993-11-23 Gilead Sciences Oligonucleotide analogs with novel linkages
US5264562A (en) 1989-10-24 1993-11-23 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotide analogs with novel linkages
DK0497875T3 (da) 1989-10-24 2000-07-03 Gilead Sciences Inc 2'-modificerede oligonukleotider
US5177198A (en) 1989-11-30 1993-01-05 University Of N.C. At Chapel Hill Process for preparing oligoribonucleoside and oligodeoxyribonucleoside boranophosphates
US5130302A (en) 1989-12-20 1992-07-14 Boron Bilogicals, Inc. Boronated nucleoside, nucleotide and oligonucleotide compounds, compositions and methods for using same
US5670633A (en) 1990-01-11 1997-09-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Sugar modified oligonucleotides that detect and modulate gene expression
US5646265A (en) 1990-01-11 1997-07-08 Isis Pharmceuticals, Inc. Process for the preparation of 2'-O-alkyl purine phosphoramidites
US5587470A (en) 1990-01-11 1996-12-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. 3-deazapurines
US5587361A (en) 1991-10-15 1996-12-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides having phosphorothioate linkages of high chiral purity
US5859221A (en) 1990-01-11 1999-01-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-modified oligonucleotides
US6005087A (en) 1995-06-06 1999-12-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-modified oligonucleotides
US5457191A (en) 1990-01-11 1995-10-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. 3-deazapurines
US5681941A (en) 1990-01-11 1997-10-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Substituted purines and oligonucleotide cross-linking
US7101993B1 (en) 1990-01-11 2006-09-05 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides containing 2′-O-modified purines
US5459255A (en) 1990-01-11 1995-10-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. N-2 substituted purines
US5623065A (en) 1990-08-13 1997-04-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. Gapped 2' modified oligonucleotides
US5149797A (en) 1990-02-15 1992-09-22 The Worcester Foundation For Experimental Biology Method of site-specific alteration of rna and production of encoded polypeptides
US5220007A (en) 1990-02-15 1993-06-15 The Worcester Foundation For Experimental Biology Method of site-specific alteration of RNA and production of encoded polypeptides
US5321131A (en) 1990-03-08 1994-06-14 Hybridon, Inc. Site-specific functionalization of oligodeoxynucleotides for non-radioactive labelling
US5470967A (en) 1990-04-10 1995-11-28 The Dupont Merck Pharmaceutical Company Oligonucleotide analogs with sulfamate linkages
GB9009980D0 (en) 1990-05-03 1990-06-27 Amersham Int Plc Phosphoramidite derivatives,their preparation and the use thereof in the incorporation of reporter groups on synthetic oligonucleotides
DE69032425T2 (de) 1990-05-11 1998-11-26 Microprobe Corp Teststreifen zum Eintauchen für Nukleinsäure-Hybridisierungsassays und Verfahren zur kovalenten Immobilisierung von Oligonucleotiden
US5223618A (en) 1990-08-13 1993-06-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. 4'-desmethyl nucleoside analog compounds
US5602240A (en) 1990-07-27 1997-02-11 Ciba Geigy Ag. Backbone modified oligonucleotide analogs
US5610289A (en) 1990-07-27 1997-03-11 Isis Pharmaceuticals, Inc. Backbone modified oligonucleotide analogues
US5541307A (en) 1990-07-27 1996-07-30 Isis Pharmaceuticals, Inc. Backbone modified oligonucleotide analogs and solid phase synthesis thereof
US5623070A (en) 1990-07-27 1997-04-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. Heteroatomic oligonucleoside linkages
US5378825A (en) 1990-07-27 1995-01-03 Isis Pharmaceuticals, Inc. Backbone modified oligonucleotide analogs
US5608046A (en) 1990-07-27 1997-03-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Conjugated 4'-desmethyl nucleoside analog compounds
US5677437A (en) 1990-07-27 1997-10-14 Isis Pharmaceuticals, Inc. Heteroatomic oligonucleoside linkages
US5386023A (en) 1990-07-27 1995-01-31 Isis Pharmaceuticals Backbone modified oligonucleotide analogs and preparation thereof through reductive coupling
US5489677A (en) 1990-07-27 1996-02-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleoside linkages containing adjacent oxygen and nitrogen atoms
US5618704A (en) 1990-07-27 1997-04-08 Isis Pharmacueticals, Inc. Backbone-modified oligonucleotide analogs and preparation thereof through radical coupling
WO1992002258A1 (en) 1990-07-27 1992-02-20 Isis Pharmaceuticals, Inc. Nuclease resistant, pyrimidine modified oligonucleotides that detect and modulate gene expression
DK0541722T3 (da) 1990-08-03 1996-04-22 Sterling Winthrop Inc Forbindelser og fremgangsmåder til inhibering af genekspression
US5177196A (en) 1990-08-16 1993-01-05 Microprobe Corporation Oligo (α-arabinofuranosyl nucleotides) and α-arabinofuranosyl precursors thereof
US5214134A (en) 1990-09-12 1993-05-25 Sterling Winthrop Inc. Process of linking nucleosides with a siloxane bridge
US5561225A (en) 1990-09-19 1996-10-01 Southern Research Institute Polynucleotide analogs containing sulfonate and sulfonamide internucleoside linkages
CA2092002A1 (en) 1990-09-20 1992-03-21 Mark Matteucci Modified internucleoside linkages
US5432272A (en) 1990-10-09 1995-07-11 Benner; Steven A. Method for incorporating into a DNA or RNA oligonucleotide using nucleotides bearing heterocyclic bases
US6582908B2 (en) 1990-12-06 2003-06-24 Affymetrix, Inc. Oligonucleotides
US5948903A (en) 1991-01-11 1999-09-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Synthesis of 3-deazapurines
US5672697A (en) 1991-02-08 1997-09-30 Gilead Sciences, Inc. Nucleoside 5'-methylene phosphonates
US7015315B1 (en) 1991-12-24 2006-03-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Gapped oligonucleotides
US5571799A (en) 1991-08-12 1996-11-05 Basco, Ltd. (2'-5') oligoadenylate analogues useful as inhibitors of host-v5.-graft response
ES2103918T3 (es) 1991-10-17 1997-10-01 Ciba Geigy Ag Nucleosidos biciclicos, oligonucleotidos, procedimiento para su obtencion y productos intermedios.
US5594121A (en) 1991-11-07 1997-01-14 Gilead Sciences, Inc. Enhanced triple-helix and double-helix formation with oligomers containing modified purines
AU3222793A (en) 1991-11-26 1993-06-28 Gilead Sciences, Inc. Enhanced triple-helix and double-helix formation with oligomers containing modified pyrimidines
TW393513B (en) 1991-11-26 2000-06-11 Isis Pharmaceuticals Inc Enhanced triple-helix and double-helix formation with oligomers containing modified pyrimidines
US5484908A (en) 1991-11-26 1996-01-16 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotides containing 5-propynyl pyrimidines
US5792608A (en) 1991-12-12 1998-08-11 Gilead Sciences, Inc. Nuclease stable and binding competent oligomers and methods for their use
US5359044A (en) 1991-12-13 1994-10-25 Isis Pharmaceuticals Cyclobutyl oligonucleotide surrogates
US5700922A (en) 1991-12-24 1997-12-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. PNA-DNA-PNA chimeric macromolecules
FR2687679B1 (fr) 1992-02-05 1994-10-28 Centre Nat Rech Scient Oligothionucleotides.
US5633360A (en) 1992-04-14 1997-05-27 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotide analogs capable of passive cell membrane permeation
US5434257A (en) 1992-06-01 1995-07-18 Gilead Sciences, Inc. Binding compentent oligomers containing unsaturated 3',5' and 2',5' linkages
EP0577558A2 (de) 1992-07-01 1994-01-05 Ciba-Geigy Ag Carbocyclische Nukleoside mit bicyclischen Ringen, Oligonukleotide daraus, Verfahren zu deren Herstellung, deren Verwendung und Zwischenproduckte
US5652355A (en) 1992-07-23 1997-07-29 Worcester Foundation For Experimental Biology Hybrid oligonucleotide phosphorothioates
US5476925A (en) 1993-02-01 1995-12-19 Northwestern University Oligodeoxyribonucleotides including 3'-aminonucleoside-phosphoramidate linkages and terminal 3'-amino groups
GB9304618D0 (en) 1993-03-06 1993-04-21 Ciba Geigy Ag Chemical compounds
GB9304620D0 (en) 1993-03-06 1993-04-21 Ciba Geigy Ag Compounds
ES2107205T3 (es) 1993-03-30 1997-11-16 Sanofi Sa Analogos de nucleosidos aciclicos y secuencias oligonucleotidas que los contienen.
CA2159629A1 (en) 1993-03-31 1994-10-13 Sanofi Oligonucleotides with amide linkages replacing phosphodiester linkages
US5502177A (en) 1993-09-17 1996-03-26 Gilead Sciences, Inc. Pyrimidine derivatives for labeled binding partners
US5801154A (en) 1993-10-18 1998-09-01 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotide modulation of multidrug resistance-associated protein
US5457187A (en) 1993-12-08 1995-10-10 Board Of Regents University Of Nebraska Oligonucleotides containing 5-fluorouracil
ES2149962T3 (es) 1993-12-09 2000-11-16 Univ Jefferson Compuestos y metodos para mutaciones dirigidas al sitio en celulas eucarioticas.
US5446137B1 (en) 1993-12-09 1998-10-06 Behringwerke Ag Oligonucleotides containing 4'-substituted nucleotides
US5519134A (en) 1994-01-11 1996-05-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Pyrrolidine-containing monomers and oligomers
US5596091A (en) 1994-03-18 1997-01-21 The Regents Of The University Of California Antisense oligonucleotides comprising 5-aminoalkyl pyrimidine nucleotides
US5627053A (en) 1994-03-29 1997-05-06 Ribozyme Pharmaceuticals, Inc. 2'deoxy-2'-alkylnucleotide containing nucleic acid
US5625050A (en) 1994-03-31 1997-04-29 Amgen Inc. Modified oligonucleotides and intermediates useful in nucleic acid therapeutics
US5646269A (en) 1994-04-28 1997-07-08 Gilead Sciences, Inc. Method for oligonucleotide analog synthesis
US5525711A (en) 1994-05-18 1996-06-11 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services Pteridine nucleotide analogs as fluorescent DNA probes
US5597909A (en) 1994-08-25 1997-01-28 Chiron Corporation Polynucleotide reagents containing modified deoxyribose moieties, and associated methods of synthesis and use
US5652356A (en) 1995-08-17 1997-07-29 Hybridon, Inc. Inverted chimeric and hybrid oligonucleotides
EP0862439A4 (en) 1995-11-22 2001-01-10 O Paul O P Ts LIGANDS FOR INCREASING THE CELLULAR UPtake OF BIOMOLECULES
US6770748B2 (en) 1997-03-07 2004-08-03 Takeshi Imanishi Bicyclonucleoside and oligonucleotide analogue
JP3756313B2 (ja) 1997-03-07 2006-03-15 武 今西 新規ビシクロヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体
US7572582B2 (en) 1997-09-12 2009-08-11 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
US6794499B2 (en) 1997-09-12 2004-09-21 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
EP2341057A3 (en) 1997-09-12 2011-11-23 Exiqon A/S Oligonucleotide Analogues
US20030228597A1 (en) 1998-04-13 2003-12-11 Cowsert Lex M. Identification of genetic targets for modulation by oligonucleotides and generation of oligonucleotides for gene modulation
US6300319B1 (en) 1998-06-16 2001-10-09 Isis Pharmaceuticals, Inc. Targeted oligonucleotide conjugates
US6043352A (en) 1998-08-07 2000-03-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-O-Dimethylaminoethyloxyethyl-modified oligonucleotides
AU758956B2 (en) 1999-02-12 2003-04-03 Daiichi Sankyo Company, Limited Novel nucleosides and oligonucleotide analogues
US7084125B2 (en) 1999-03-18 2006-08-01 Exiqon A/S Xylo-LNA analogues
IL145778A0 (en) 1999-04-21 2002-07-25 American Home Prod Methods and compositions for inhibiting the function of polynucleotide sequences
EP1178999B1 (en) 1999-05-04 2007-03-14 Santaris Pharma A/S L-ribo-lna analogues
US6525191B1 (en) 1999-05-11 2003-02-25 Kanda S. Ramasamy Conformationally constrained L-nucleosides
JP4151751B2 (ja) 1999-07-22 2008-09-17 第一三共株式会社 新規ビシクロヌクレオシド類縁体
US7491805B2 (en) 2001-05-18 2009-02-17 Sirna Therapeutics, Inc. Conjugates and compositions for cellular delivery
EP1314734A1 (en) 2000-08-29 2003-05-28 Takeshi Imanishi Novel nucleoside analogs and oligonucleotide derivatives containing these analogs
US6426220B1 (en) 2000-10-30 2002-07-30 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense modulation of calreticulin expression
AU2002217980A1 (en) 2000-12-01 2002-06-11 Cell Works Inc. Conjugates of glycosylated/galactosylated peptide
US20030175906A1 (en) 2001-07-03 2003-09-18 Muthiah Manoharan Nuclease resistant chimeric oligonucleotides
US20030158403A1 (en) 2001-07-03 2003-08-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Nuclease resistant chimeric oligonucleotides
CA2459347C (en) 2001-09-04 2012-10-09 Exiqon A/S Locked nucleic acid (lna) compositions and uses thereof
WO2004044136A2 (en) 2002-11-05 2004-05-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions comprising alternating 2’-modified nucleosides for use in gene modulation
WO2004041889A2 (en) 2002-11-05 2004-05-21 Isis Pharmaceuticals, Inc. Polycyclic sugar surrogate-containing oligomeric compounds and compositions for use in gene modulation
EP2305812A3 (en) 2002-11-14 2012-06-06 Dharmacon, Inc. Fuctional and hyperfunctional sirna
US6673661B1 (en) 2002-12-20 2004-01-06 Taiwan Semiconductor Manufacturing Co., Ltd. Self-aligned method for forming dual gate thin film transistor (TFT) device
US7723509B2 (en) 2003-04-17 2010-05-25 Alnylam Pharmaceuticals IRNA agents with biocleavable tethers
WO2004106356A1 (en) 2003-05-27 2004-12-09 Syddansk Universitet Functionalized nucleotide derivatives
ES2382807T3 (es) 2003-08-28 2012-06-13 Takeshi Imanishi Nuevos ácidos nucleicos artificiales del tipo de enlace N-O con reticulación
JP5379347B2 (ja) 2003-09-18 2013-12-25 アイシス ファーマシューティカルズ， インコーポレーテッド ４’−チオヌクレオシドおよびオリゴマー化合物
AU2005248147A1 (en) 2004-05-11 2005-12-08 Alphagen Co., Ltd. Polynucleotides for causing RNA interference and method for inhibiting gene expression using the same
WO2006070860A1 (ja) 2004-12-28 2006-07-06 The University Of Tokyo 炎症性サイトカイン抑制剤の新規スクリーニング方法
US20060148740A1 (en) 2005-01-05 2006-07-06 Prosensa B.V. Mannose-6-phosphate receptor mediated gene transfer into muscle cells
CA2640171C (en) 2006-01-27 2014-10-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. 6-modified bicyclic nucleic acid analogs
US7569686B1 (en) 2006-01-27 2009-08-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for synthesis of bicyclic nucleic acid analogs
WO2007115207A2 (en) 2006-03-31 2007-10-11 Regents Of The University Of Minnesota Irf-5 haplotypes in systemic lupus erythematosus
US7666854B2 (en) 2006-05-11 2010-02-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bis-modified bicyclic nucleic acid analogs
ES2389737T3 (es) 2006-05-11 2012-10-31 Isis Pharmaceuticals, Inc. Análogos de ácidos nucleicos bicíclicos modificados en 5'
US9550988B2 (en) 2006-10-18 2017-01-24 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Antisense compounds
EP2125852B1 (en) 2007-02-15 2016-04-06 Ionis Pharmaceuticals, Inc. 5'-substituted-2'-f modified nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
WO2008150729A2 (en) 2007-05-30 2008-12-11 Isis Pharmaceuticals, Inc. N-substituted-aminomethylene bridged bicyclic nucleic acid analogs
EP2173760B2 (en) 2007-06-08 2015-11-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Carbocyclic bicyclic nucleic acid analogs
US8278283B2 (en) 2007-07-05 2012-10-02 Isis Pharmaceuticals, Inc. 6-disubstituted or unsaturated bicyclic nucleic acid analogs
KR101654007B1 (ko) 2007-08-15 2016-09-05 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 테트라하이드로피란 핵산 유사체
US20090123928A1 (en) * 2007-10-11 2009-05-14 The Johns Hopkins University Genomic Landscapes of Human Breast and Colorectal Cancers
WO2009067647A1 (en) 2007-11-21 2009-05-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Carbocyclic alpha-l-bicyclic nucleic acid analogs
AU2008333811B2 (en) 2007-12-04 2014-05-01 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Carbohydrate conjugates as delivery agents for oligonucleotides
EP2265627A2 (en) 2008-02-07 2010-12-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic cyclohexitol nucleic acid analogs
JP5788312B2 (ja) 2008-04-11 2015-09-30 アルニラム ファーマスーティカルズ インコーポレイテッドＡｌｎｙｌａｍ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ， Ｉｎｃ． 標的リガンドをエンドソーム分解性成分と組み合わせることによる核酸の部位特異的送達
EP2356129B1 (en) 2008-09-24 2013-04-03 Isis Pharmaceuticals, Inc. Substituted alpha-l-bicyclic nucleosides
EP2462153B1 (en) 2009-08-06 2015-07-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic cyclohexose nucleic acid analogs
WO2011123621A2 (en) 2010-04-01 2011-10-06 Alnylam Pharmaceuticals Inc. 2' and 5' modified monomers and oligonucleotides
US10913767B2 (en) 2010-04-22 2021-02-09 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides comprising acyclic and abasic nucleosides and analogs
CA2812046A1 (en) 2010-09-15 2012-03-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Modified irna agents
US20140030218A1 (en) 2011-01-05 2014-01-30 Imperial Innovations Limited Treatment And Screening
EP3467109A1 (en) 2011-02-08 2019-04-10 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof
JP5937197B2 (ja) * 2011-04-08 2016-06-22 ユニバーシティー オブ レスター Ｍａｓｐ−２依存性補体活性化に関連した状態を治療するための方法
DK2751270T3 (en) 2011-08-29 2018-10-29 Ionis Pharmaceuticals Inc OLIGOMER-CONJUGATE COMPLEXES AND THEIR USE
EP3336189A1 (en) 2012-04-20 2018-06-20 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof
US9695418B2 (en) 2012-10-11 2017-07-04 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleosides and uses thereof
EP3459549B1 (en) * 2012-10-12 2022-04-06 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Selective antisense compounds and uses thereof
EP2920304B1 (en) 2012-11-15 2019-03-06 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotide conjugates
NZ631512A (en) 2013-05-01 2016-10-28 Ionis Pharmaceuticals Inc Compositions and methods for modulating apolipoprotein (a) expression
WO2015137459A1 (ja) 2014-03-13 2015-09-17 協和発酵キリン株式会社 Ｉｒｆ５の発現を抑制する核酸
MA43072A (fr) 2015-07-22 2018-05-30 Wave Life Sciences Ltd Compositions d'oligonucléotides et procédés associés
US10420792B2 (en) * 2017-02-24 2019-09-24 The University of Pittsburgh—Of the Commonwealth System of Higher Education Method of treating severe asthma

Also Published As

Publication number Publication date
JP2022509059A (ja) 2022-01-20
CO2021007006A2 (es) 2021-06-10
CA3119456A1 (en) 2020-05-22
WO2020102630A1 (en) 2020-05-22
US11208650B2 (en) 2021-12-28
KR20210092761A (ko) 2021-07-26
US20200208147A1 (en) 2020-07-02
US20220049248A1 (en) 2022-02-17
IL283072A (en) 2021-06-30
EP3880821A1 (en) 2021-09-22
PH12021551053A1 (en) 2021-12-06
JOP20210108A1 (ar) 2023-01-30
SG11202104666SA (en) 2021-06-29
TW202039840A (zh) 2020-11-01
CL2021001246A1 (es) 2021-10-29
WO2020102630A8 (en) 2021-02-18
AU2019380940A1 (en) 2021-06-03
EA202191342A1 (ru) 2021-08-10
MX2021005758A (es) 2021-09-21
AR117094A1 (es) 2021-07-07
PE20211869A1 (es) 2021-09-21
EP3880821A4 (en) 2023-01-25
CR20210311A (es) 2021-07-22
CN113646430A (zh) 2021-11-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP6684707B2 (ja) タウ発現を調節するための組成物
US20210403916A1 (en) Compounds and methods for modulation of dystrophia myotonica-protein kinase (dmpk) expression
ES2762326T3 (es) Métodos para modular la expresión de C9ORF72
JP7422816B2 (ja) Ｐｎｐｌａ３発現のモジュレーター
WO2016112132A1 (en) Compositions for modulating expression of c9orf72 antisense transcript
EP3601569B1 (en) Modulators of pcsk9 expression
US9404113B2 (en) Antisense modulation of PTP1B expression
CA3023514A1 (en) Modulation of gys1 expression
BR112020016001A2 (pt) Moduladores de expressão irf4
JP2023075283A (ja) Ａｐｏｌ１発現のモジュレーター
US20220049248A1 (en) Modulators of irf5 expression
US20210290653A1 (en) Modulation of lnc05 expression
EA044295B1 (ru) Модуляторы экспрессии apol1
NZ794156A (en) Modulators of pcsk9 expression
BR112021011899A2 (pt) Moduladores da expressão de hsd17b13
EP3620520A1 (en) Novel target to treat a metabolic disease in an individual

Legal Events

Date Code Title Description
B11A Dismissal acc. art.33 of ipl - examination not requested within 36 months of filing
B11Y Definitive dismissal - extension of time limit for request of examination expired [chapter 11.1.1 patent gazette]