JP2769305B2 - トリコダーマにおいてタンパク質生成物を産生するための方法 - Google Patents
トリコダーマにおいてタンパク質生成物を産生するための方法Info
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Description
【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、トリコダーマの形
質転換に使用するためのベクターシステム、トリコダー
マにおけるタンパク質の高レベルでの発現及び分泌のた
めの方法、DNA組換え体ベクター及び形質転換された
トリコダーマ菌株に関する。 【0002】 【発明の背景】繊維状菌類は、種々の発酵生成物を製造
するために生物工学に広く使用される下等真核生物であ
る。菌類は多くの工業的に重要な酵素、たとえばグルコ
アミラーゼ、プロテアーゼ、ラクターゼ、ペクチナーゼ
及びグルコセオキシダーゼを分泌する。 【0003】繊維状菌類は多くの生物工学的利点を有す
る。それらは一般的に高い量のタンパク質を産生し、大
規模での培養は複雑でなく、そして発酵の後、培養液体
からの菌糸体の分離が容易である。 【0004】中温性不完全菌類トリコダーマ リーセイ
〔以前はT.ビリデ(T.viride)〕(参照1)
は、セルロースバイオマスの転換に必要とされる酵素を
産生し、そしてたぶん最も広く研究されたセルラーゼ産
生生物である。 【0005】セルロースのグリコースへの加水分解のた
めには、3種のタイプの酵素活性が必要とされる;通
常、置換された可溶性基質を攻撃し、そして結晶性セル
ロースに親和性を示さない、ランダム切断性エンドグル
カナーゼ(1,4−β−D−グルカングルカノヒドロラ
ーゼ、EC.3,2,1,4);結晶性セルロースを分
解することができるが、しかし誘導体化されたセルロー
スに対する活性を持たないセルロビオヒドロラーゼ
(1,4−β−D−グルカン セルロビオヒドロラー
ゼ、EC.3,2,1,91)及びグルコースを得るた
めにセロビオース及びセロ−オリゴ糖を攻撃するβ−グ
ルコシダーゼ(β−D−グルコシド グルコヒドロラー
ゼ、EC.3,2,1,21)。いくらかのこれらの酵
素間の相乗作用が示された(参照2〜4)。 【0006】菌類のセルラーゼが精製され、そして特徴
づけられ、そしてすべての3種の主要タイプの酵素は、
多種の形で存在することが示された(参照5)。2つの
免疫学的に異なるセルロビオヒドロラーゼ、すなわちC
BHI及びCBHIIは、T.リーセイの培養培地から検
出された(参照4,6)。5〜8の電気泳動的に異なる
エンドグルカナーゼが報告され、それらの多くは、基質
特異性を変えることを示した(参照7,8,9,1
0)。2つの細胞外β−グルコシダーゼの特徴化が報告
された(参照11)。 【0007】突然変異及びスクリーニングの直接的アプ
ローチを用いて開発された多くの菌株は、いくつかの高
収率のT.リーセイ突然変異株を好結果をもたらして産
生した(参照11〜22)。最良のT.リーセイ突然変
異体によって産生された細胞外タンパク質の量は、培養
流体1l当り20〜30gであり、これは合計細胞タン
パク質の50%以上である。分泌されたタンパク質の主
要部分は、セルラーゼを含み、そしてその間には、CB
HI成分が最も豊富であり、そして分泌されたセルラー
ゼタンパク質の60%まで示す。 【0008】CBHIのための遺伝子は、Shoema
kerなど(参照23)及びTeeriなど(参照2
4)によってクローンされ、そして該遺伝子の完全なヌ
クレオチド配列は公表されている(参照23)。T.リ
ーセイからまた、主なエンドグルカナーゼEGIのため
の遺伝子がクローンされ、そして特徴づけられた(参照
25,26,27)。他の単離されたセルラーゼ遺伝子
はcbh2(参照28,29)及びegl3(参照3
0)である。 【0009】産業的に重要な繊維状菌類の分子生物学
は、一般的に良く知られていない。これは一部、有性生
殖サイクル及び/又は遺伝的な形質転換システムの不十
分な認識による。最近、形質転換システムが、ネウロス
ポク クラサ(参照31)、A.ニジュランス(参照3
2,33,34)及びA.ニガー(A.niger)参
照35)のために開発され、そしてそれらは、ベクター
分子によって担持されるそれぞれの機能性遺伝子により
突然変異宿主の相補性においてそれらの主成分を一般的
に有する。しかしながら、これらの菌類の中でA.ニガ
ーのみが当座は、産業的興味の対象である。 【0010】菌類の分類において、属アスペルジラス
は、綱アスコマイセティス(Ascomycete
s)、サブクラス ユーアスコマイセティス(Euas
comycetes)に含まれる。ユーアスコマイセテ
ィスは、子実体に基づいて3つの群、すなわちプレクト
マイセティス(Plectomycetos)、ピレノ
マイセティス(Pyrenomycetes)及びジス
コマイセティス(Discomycetes)に分けら
れる。最も重要な属は、アスペルジラス及びペニシリア
ム(参照56)である。代わりに、トリコダーマが不完
全菌類のメンバーとして分類される。不完全菌類は、有
性生殖又は有性生殖属との明確な類似性を持たない菌
類、たとえばひじょうに特徴的なアスペルジラスのキャ
ッチ−オール カテゴリーである。トリコダーマは、完
全なアスコマイセティス種ハイポクレア(Hypocr
ea)(参照57)の不完全状態である不十分に定義さ
れた生殖段階を有することを報告されたけれども、属ア
スペルジラス及びトリコダーマは明らかに、分類学上ひ
じょうに異なると思われる。アスペルジラス ニジュラ
ンスからのargb遺伝子及びネウロスポラ クラサか
らのpyr4遺伝子は、非ストリンジェント条件下でそ
れぞれのトリコダーマの遺伝子にハイブリダイズせず、
従ってトリコダーマは他のアスコマイセテス(Asco
mycetes)と進化論的にまったく異なるという考
えを推定できることもまた示された(Vananen,
S.,調製において)。 【0011】増殖培地中にタンパク質を分泌する、その
例外的能力によって、トリコダーマリーセイは、タンパ
ク質の産生のための可能な宿主として良好な候補者であ
ると思われる。しかしながら、これまでは、T.リーセ
イの遺伝研究は、該菌類のセルラーゼ産生特性を改良す
ることにほとんど向けられ、そしてハイパ−セルロチッ
ク(Hypercellulotic)トリコダーマ菌
株の開発のために使用される技術は、単に従来の突然変
異生成及びスクリーニングであった。トリコダーマのた
めの形質転換システムは、今まで開発されていない。 【0012】トリコダーマ リーセイのための有効な宿
主−ベクターシステムを提供し、トリコダーマ中に異質
のタンパク質の高い発現及び分泌レベルを得、又は同質
のタンパク質の産生を高めることが本発明の主な目的で
ある。 【0013】本発明の明細書において、表現“トリコダ
ーマに異質のタンパク質”とは、トリコダーマによって
天然に産生されないタンパク質を意味し、ところが“ト
リコダーマに同質のタンパク質”とは、トリコダーマ自
体によって産生されるタンパク質を意味する。 【0014】初めに開発された菌類の形質転換システム
において、すなわちアスペルジラス及びネウロスポラに
おいては、形質転換がプロトプラストを用いて行なわれ
る。形質転換性DNAが通常、宿主のゲノム中に組込ま
れる。安定した形質転換体を同定するための選択システ
ムを得るためには、ベクターシステムが、宿主ゲノムの
対応する突然変異を補足するか、又は特定の増殖培地上
での原栄養株の増殖のために必要な活性、通常酵素を供
給する機能的な遺伝子(選択マーカー)を担持すべきか
である。 【0015】 【発明の要約】本発明は、トリコダーマの形質転換のた
めの組換え体DNAクローニングベクターシステムを記
載する。このDNAクローニングベクターシステムが目
的とするタンパク質生成物をコードする DNA配列を
含有する場合、本発明のベクターシステムによるトリコ
ダーマの形質転換は、形質転換された微生物が適切な培
養培地中において増殖される場合、目的とするタンパク
質の高レベルの発現及び分泌を提供するであろう。 【0016】その第1の観点によれば、本発明は、 a)目的とするタンパク質生成物をコードする遺伝子、 b)目的とする生成物の発現を制御するために機能可能
的に結合されたプロモーター/エンハンサーを含む遺伝
子発現を促進する機能、 c)場合によっては、目的とする生成物のために該遺伝
子の5′末端の上流に融合されたシグナル/リーダー配
列及び d)選択マーカーを含んで成るベクターシステムを提供
する。 【0017】その第2の観点によれば、本発明は、トリ
コダーマの形質転換のための方法を提供し、ここで適切
なトリコダーマ菌株が本発明のベクターシステムにより
形質転換される。 【0018】その第3の観点によれば、本発明は、本発
明のベクターシステムによりトリコダーマを形質転換
し、該形質転換された菌株を適切な培地中で培養し、そ
して発現され、そして分泌された生成物を該培地から回
収することを含んで成る、トリコダーマにおけるタンパ
ク質の産生のための方法を提供する。 【0019】本発明はまた、トリコダーマ中にタンパク
質の産生のための方法も提供し、この方法によって、ベ
クターシステムにより形質転換されたトリコダーマ菌株
は、適切な培地中で培養され、そして発現され、そして
分泌されたタンパク質が該培養培地から回収される。本
発明はさらに、安定して形質転換されたトリコダーマ菌
株を提供する。 【0020】本明細書に使用される場合、“ベクターシ
ステム”とは、宿主ゲノム中に組込まれるべきDNA−
情報を共に含む単一のベクター又はプラスミドもしくは
複数のベクター又はプラスミドを含む。該ベクター又は
プラスミドは、線状又は閉環状分子である。トリコダー
マ中における自己複製プラスミドは現在知られていない
が、本発明はまた、のちに見出されるにちがいない、そ
のような自己複製プラスミドも包含する。 【0021】本発明のベクターシステムは、プロモータ
ー、エンハンサー及び転写開始部位並びにターミネータ
ーを含む遺伝子発現を促進する機能をコードするDNA
−配列、形質転換体の選択のためのマーカー及び目的の
タンパク質をコードするDNA配列を含んで成る。 【0022】発現された生成物の分泌を確保するため
に、目的とする生成物のための遺伝子は、好ましくは、
細胞の分泌路中に、発現された生成物の有効な方向を確
保する前領域を提供される。この前領域(天然に存在す
るシグナル又はリーダーペプチドもしくはその一部であ
る)は一般的に、分泌の間、目的の生成物から切断さ
れ、この後、その成熟した生成物は、培養培地から単離
され得る。目的とする生成物のための遺伝子は、ゲノム
遺伝子又はcDNAクローンから得られる。DNA−配
列はまた、合成され得る。 【0023】シグナル/リーダー配列は、目的とするタ
ンパク質をコードする遺伝子のシグナル/リーダー配列
に由来し、又はトリコダーマ又は他の生物源のいづれか
からの他の分泌されたタンパク質のための遺伝子に由来
する。トリコダーマによって分泌されるタンパク質をコ
ードする遺伝子に由来するシグナル/リーダー配列の例
は、cbh1シグナル配列又はegl1シグナル配列又
はその一部である。トリコダーマに異質の分泌されたタ
ンパク質をコードする遺伝子に由来するシグナル/リー
ダー配列は、アスペルジラスのアミラーゼ又はグルコア
ミラーゼのための遺伝子に由来する。また合成シグナル
/リーダー配列も使用され得る。 【0024】プロモーターは、トリコダーマ中に転写活
性を示すDNA配列であり、そしてトリコダーマに同質
か又は異質の遺伝子に由来することができる。トリコダ
ーマに同質のタンパク質をコードする遺伝子に由来する
プロモーターの例は、CBHIプロモーター又はEGI
プロモーターもしくはその一部である。トリコダーマに
異質のタンパク質のための遺伝子に由来するプロモータ
ーの例は、アスペルジラスのグルコアミラーゼ プロモ
ーターである。転写ターミネーターは、プロモーターと
同じ源に由来する。また合成プロモーター又はターミネ
ーター配列も使用され得る。 【0025】特別に言及されたすべてのDNA配列は、
コードされた生成物の機能に不可欠な塩基の数個を補正
又は欠失することによって変性され得ることが理解さ
れ、そしてそれは当業者にとっては明らかである。たと
えば、cbh1又はegl1シグナル又はプロモーター
配列に実質的に類似するDNA配列は、それらがトリコ
ダーマ中において意図された機能を示すかぎり使用され
得る。また目的とするタンパク質のための遺伝子は、こ
れがタンパク質の活性に対して悪影響を持たないかぎ
り、変えられ得る。 【0026】異なった選択マーカー、たとえばargB
(A.ニジュランス又はT.リーセイ)、amdS
(A.ニジュランス)及びpyr4(ネウロスポラ ク
ラサ又はT.リーセイ)が使用され得る。 【0027】宿主菌株は、形質転換方法に使用される選
択マーカーに依存して、原栄養性又は栄養要求性トリコ
ダーマ菌株である。本明細書の実験部分に示されている
ように、A.ニジュランスからのamdS遺伝子は、原
栄養性I.リーセイの形質転換のために使用され得る。
T.リーセイは単一の窒素源としてアセトアミド上で完
全に増殖せず、そしてその増殖は培地上にCsClを添
加することによってさらに阻害され得る。従って、Cs
Clの存在下で単一の窒素源としてアセトアミド上での
増殖は、amdS+ 形質転換体を同定するために選択培
地として使用され得る。 【0028】宿主ゲノムの対応する突然変異を相補する
選択マーカーが使用される場合、栄養要求性トリコダー
マ突然変異体が構成されるべきである。栄養要求性トリ
コダーマ突然変異体は、突然変異株を産生するための既
知方法によって製造され得る。 【0029】増殖のためにウラシル、トリプトファン又
はアルギニンを必要とする栄養要求性トリコダーマ突然
変異体は、Nevalainen(参照36)によって
記載されているようにして、濾過濃縮技法(filtr
ation enrichment techniqu
e)によって単離された。アルギニン要求性栄養要求体
から、argB遺伝子を欠失する突然変異体が、アルギ
ニン生合成において異なった中間体によって供給される
一連の最少プレートを用いることによって同定された。
ウラシル要求性突然変異体から、pyr4遺伝子を欠失
する菌株を、菌糸体調製物(参照37)においてオロチ
ジン−5′−ホスフェートデカルボキシラーゼ(OMP
decase)の活性を測定することによって見出す
ことができる。 【0030】trp1遺伝子欠失の突然変異体は、それ
らの菌糸体におけるPRAイソメラーゼ−InGPシン
セターゼ活性の欠失によって特徴づけられる(参照4
0)。酵素活性を示さない突然変異体のtrp1−特性
は、たとえばN.クラサのtrp1プラスミド(参照4
1)又はA.ニジュランスのtrpC−プラスミド(参
照34)による形質転換及び相補性によって確認され得
る。 【0031】使用される形質転換技法はA.ニジュラン
スの形質転換法(参照32,33)から改造された方法
である。プロトプラストは、寒天プレート上で菌糸体を
増殖し、そしてNovozym(登録商標)234の緩
衝溶液中に菌糸体を懸濁することによる既知の方法によ
って調製される。従来のNovozym(登録商標)2
34のスクロース溶液の代わりに、ソルビトール溶液が
好都合に使用され得る。次に、本発明の実験部にさらに
詳しく記載しているようにして、形質転換性DNAが前
記プロトプラスト溶液に添加される。形質転換は普通、
同時形質転換として行なわれ、それによって、選択不可
能なプラスミドがもう1つのプラスミド中に挿入される
選択可能なマーカー(たとえばp3SR2中へのamd
S又はpSa143中へのargB)を用いて高頻度で
T.リーセイ中に同時形質転換される。等モル量のDN
Aが形質転換のために使用される場合、高い割合の形質
転換体が、ゲノム中に組込まれた選択不可能なプラスミ
ドを含む。argB- T.リーセイ菌株が、等モル量の
プラスミドp3SR2及びpSa143による形質転換
に使用される場合、形質転換体を、二重選択培地(最少
培地、アセトアミド、CsCl)上に得ることができ
る。他方、単鎖のプラスミドは、形質転換のために使用
され得、ここでまた、マーカーが挿入される。 【0032】次に、形質転換体は、適切な培地中で培養
される。単純な培地中に目的とする生成物を産生するこ
とができるためには、グルコース誘導性プロモーターが
使用される。トリコダーマが1%グルコースを含む培地
上で増殖される場合、プロテアーゼを含む、すべての細
胞外タンパク質の分泌が強く抑制される。目的とする酵
素をコードする遺伝子がグルコース含有性培地中におい
て強く発現されるプロモーターに連結される場合、目的
とする酵素は増殖培地に分泌される。他のタンパク質は
これらの条件下で産生されないので、目的とする酵素
は、培地中に分泌される主なタンパク質である。 【0033】菌類の菌糸体が除去される場合、目的とす
るタンパク質は、種々の純粋な形でその得られた溶液に
存在する。必要により、それはさらにひじょうに容易
に、精製され得る。なぜならば、それはほとんどタンパ
ク質のみであるからである。 【0034】本発明はまた、宿主生物のある酵素活性を
産生する遺伝子を変性又は不活性化するためにも使用さ
れ得る。例として、セルラーゼ−陰性T.リーセイ菌株
が構成され得る。この突然変異生成は、欠失されたセル
ラーゼ遺伝子を担持するプラスミドによるトリコダーマ
リーセイの形質転換に基づかれる。染色体セルラーゼ
遺伝子産でのプラスミドの同質組換えは、内存性T.リ
ーセイ セルラーゼ遺伝子の挿入不活性化を引き起こ
す。形質転換のために使用されるプラスミドは、セルラ
ーゼコード領域の一部のみを含み、そして不活性タンパ
ク質を産生する。5′を末端とする配列は含まれない。
フレームシフト変異がまた、切断されたコード領域に導
入され得る。選択マーカー(argB)又はスクリーニ
ングのためのマーカー(lacZ)が形質転換のために
使用されるプラスミドに連結され得る。組換えの後、マ
ーカーは、2種の得られた欠陥性セルラーゼ遺伝子の間
に、配置されるであろう。その方法の原理は第1図に示
される。 【0035】本発明は、キモシン及びトリコダーマ リ
ーセイのエンドグルカナーゼI(EGI)によって例示
される。プロモーター、シグナル及びリーダー並びにタ
ーミネーター配列は、アスペルジラス ニガーからのグ
ルコアミラーゼ遺伝子又はトリコダーマ リーセイのc
bh1遺伝子のいづれかに由来した。選択マーカーとし
て、A.ニジュランスからのamdS遺伝子が使用され
た。 【0036】材 料 プラスミド: p285:ATCC 20681 pCAMG91:参照56 piC19R:参照57 pSa143:参照48+51 p3R2:参照30+32 pDJB2:参照35 pMC1817:参照43 pTT01,pTT11:参照27 pUC 9,pUC13:参照59 pUC18,pUC19:参照55 【0037】菌株:E.コリ(E.coli)株、JM
101,JM 109及びDHI(参照59)がE.
コリ クローニングにおいて宿主として使用される。ト
リコダーマリーセイ菌株QM9414(ATCC 26
921)及びRUT−C−30(ATCC 5676
5)が菌類の形質転換及び発現研究に使用される。 【0038】トリコダーマの最少培地: グルコース 2g (NH4 )2 SO4 5g KH2 PO4 15g MgSO4 0.6g CaCl 0.6g FeSO4 ,7H2 O 5mg MnSO4 ,H2 O 1.56mg ZnSO4 ,7H2 O 1.4mg CoCl2 2mg/1H2 O 【0039】 【実施例】 実 験 例 1 栄養要求性T.リーセイ突然変異菌株の誘導、濃縮及び
単離。 増殖のためにウラシル、トリプトファン又はアルギニン
を必要とする栄養要求性突然変異体を、Nevalai
nen(参照36)によって記載されているようにし
て、濾過濃縮法を用いて単離する。使用される突然変異
誘発剤は、紫外線である。アルギニン要求性の栄養要求
体から、argB遺伝子を欠失する突然変異体が、アル
ギニン生合成において異なった中間体によって供給され
る一連の最少プレートを用いることによって同定される
(参照36)。増殖のためにシトルリンを必要とする突
然変異体は、可能性あるargB- 突然変異体として考
慮される。単離された突然変異体のargB- 特性は、
A.ニジュランスのargB遺伝子(例4)を含むプラ
スミドpSa143を用いて原栄養体中にそれらを形質
転換することによって確認される。 【0040】ウラシル要求性突然変異体から、pyr4
遺伝子を欠失する菌株が捜し求められる。これらの突然
変異体のpyr4- 特性を、N.クラサのpyr4遺伝
子(参照38)を含むプラスミドによる形質転換によっ
て確認した。 【0041】例 2 プロトプラストの調製。 菌糸体をポテトデキストロース寒天プレート(Difc
o)上のセロファンディスク上で増殖する。5枚のセロ
ファン培養物からの菌糸体を、0.1Mリン酸カリウム
によりpH5.6で緩衝化された、1.2Mソルビトール
中Novozym(登録商標)234の5mg/ml溶液1
5ml中に懸濁する。その混合物を30℃で1.5〜2時
間、インキュベートする。焼結ガラス濾過(多孔度1)
により菌糸体破壊物からプロトプラストを分離し、40
00gで5分間ペレット化し、そして1.2Mソルビト
ール−10mMのTris,HCl(pH7.5)溶液によ
り2度洗浄する。 【0042】プロトプラストのより良好な精製は、Ti
llburnなど(参照33)によって記載された方法
を用いることによって達成され得る。pH5.8で緩衝化
された、1.2MのMgSO4 中、Novozym(登
録商標)234の5mg/ml溶液を、プロトプラスティン
グのために使用する。インキュベーション及び濾過の
後、そのプロトプラスト懸濁液を、0.6Mソルビトー
ル−100mMのTris,HCl(pH7.0)の等体積
と共に4000gで15分間、遠心分離する。プロトプ
ラストは、管の中間に鋭いバンドを形成する。そのプロ
トプラストを、1.2Mソルビトール−10mMのTri
s,HCl溶液(pH7.5)1体積中に懸濁し、回転沈
殿せしめ、そして1.2Mソルビトール−10mMのTr
is,HCl溶液(pH7.5)により2度洗浄する。そ
のプロトプラストを、5×106 〜5×107 個のプロ
トプラスト/mlの濃度で、1.2Mソルビトール−10
mMのCaCl2 −10mMのTris,HCl溶液(pH
7.5)中に懸濁する。 【0043】プロトプラストの生存率を、浸透圧安定剤
として1Mソルビトールを含むトリコダーマの最少培地
上で評価する。その再生頻度は、菌株QM9414(A
TCC 26921)のためには40〜80%である。 【0044】例 3 A.ニジュランスのアセトアミダーゼ(amdS)を用
いてT.リーセイの形質転換。 プラスミドp3SR2を、形質転換に使用する。それ
は、完全なアセトアミダーゼ構造遺伝子amdS及びそ
の調節領域amdIを担持するA.ニジュランスDNA
を含む(参照45及び33)。 【0045】形質転換性DNA20μl(4〜10μ
g)を、プロトプラスト溶液200μl中に添加する。
25%PEG 6000−50mMのCaCl2 −10mM
のTris,HCl溶液(pH7.5)50μlを添加
し、そしてその混合物を、氷上で20分間、インキュベ
ートする。PEG溶液2mlを添加し、そしてその混合物
を、室温でさらに5分間、インキュベートする。1.2
Mソルビトール−10mMのCaCl2 −10mMのTri
s,HCl溶液(pH7.5)4mlを添加し、そしてその
プロトプラストを3%寒天表面上にプレートする。その
選択培地は、(NH 4 )2 SO4 の代わりに単一の窒素
源として10mMアセトアミドを有するトリコダーマ最少
培地であり、そして浸透圧安定剤として1Mソルビトー
ル及びバックグラウンド増殖を抑制するために12.5
mMのCsClにより補充される。 【0046】40〜600個の形質転換体/DNAμg
の形質転換頻度を、菌株QM9414(ATCC 26
921)のために得る。最も高い頻度は、DNAが2サ
イクルのCsCl/エチジウムブロミド遠心分離により
精製される場合に得られる。 【0047】胞子形成は選択培地上ではめったに観察さ
れないが、しかしポテト デキストロース寒天に移され
る場合、通常、その形質転換体は胞子形成する。アセト
アミド上で増殖するそれらの能力は多様である。選択培
地上でのコロニィーの直径は、1mm以下から10〜20
mmの範囲である。 【0048】形質転換体の有糸分裂安定性を調べた。種
々のサイズの10個の大きな形質転換体を、アセトアミ
ド−CsClプレート上に継代培養し、ポテト デキス
トロース(PD)上に胞子形成し、そしてPD上に再プ
レートした。ヘテロカリオシスによって引き起こされた
異質性(heterogeneity)を除くために、
1つの胞子から生まれる個々のコロニィーをAmdS+
表現型について試験した。おのおのの元の形質転換体か
らの1つの陽性クローンを、非選択性培地上で連続プレ
ーチング(5増殖サイクル)にゆだね、そしておのおの
の世代の後、表現型を選択培地上で試験した。1つのサ
イクルの後、10個の大きな形質転換体を非選択培地上
で試験し、その10個の形質転換のうち6個は100%
のAmdS+ 分生子を与え、3個は47〜87%の分生
子を与え、そして1つの形質転換体は、AmdS+ 分生
子を与えなかった。この結果は、5つの非選択性増殖サ
イクルを通して同様のままであり、初めの不安定なAm
dS+ 表現型が後で安定化され得ることを示唆した。 【0049】元の10個の小さなコロニィーのうち、3
個は、種々の頻度のAmdS+ 表現型を有する胞子を与
えた(94%,44%及び5%の胞子)。他の7個のク
ローンは、アセトアミド上で増殖し得ない胞子のみを与
えた。興味あることには、得られたすべてのAmdS+
は、大きなコロニィーの形質転換体の特徴を有する、活
発な増殖をアセトアミドプレート上で示した。 【0050】形質転換体におけるプラスミドDNAの存
在を全DNAのサザン法によって分析し、形質転換体か
ら単離し(Raeder及びBrodaに従って、参照
44)、XhoI又はSalI及びEcoRIにより切
断した。ベクターpUC18及びプラスミドp3SR2
のamdS遺伝子を含むSalI−EcoRIフラグメ
ントを、プローブとして使用する。その形質転換体は、
トリコダーマのゲノムDNA中の多くの異なった部位
で、すなわちゲノム当り1〜数個のコピィーでの組換え
によって生じることが示された。 【0051】例 4 A.ニジュランス及びN.クラサのプラスミドによる
T.リーセイの形質転換。 異質DNAによる栄養要求性突然変異の相補性をT.リ
ーセイにおいて示す。A.ニジュランスからのargB
遺伝子を含むプラスミドpSa143を使用して、T.
リーセイのargB- 突然変異体株を形質転換する。
N.クラサからのpyr4遺伝子を含むプラスミドpD
JB2を用いて、T.リーセイのpyr4 - 突然変異体
株を形質転換する。その形質転換体を、アルギニン又は
30μg/mlウラシルを含まない最少培地上でそれぞれ
選択した。両者の場合の形質転換の頻度は、約300個
の形質転換体/DNAμgである。 【0052】染色体DNAを、その形質転換体から単離
し、そしてサザン ハイブリダイゼーション実験のため
に使用し、T.リーセイの染色体DNA中へのプラスミ
ドDNAの正しい組込みを確めた。複数のタンデムコピ
ーのpSal143を、ゲノム中に組込んだ。サザン及
びドット ブロット ハイブリダイゼーションは、分析
された形質転換において、argBのコピー数がおよそ
2〜100以上異なることを示した。ArgB+ 形質転
換体は、少なくとも3世代を通して、表現型的に100
%安定していることが示された。これは、完全培地上で
5個の形質転換からの分生子の連続プレーチングによっ
て試験し、そしてその後、最少培地(50〜80個のコ
ロニィー/形質転換体)上でArg+ 表現型を試験し
た。 【0053】例 5 amdS及びargBプラスミドによるT.リーセイの
同時形質転換。 非選択性プラスミドによりトリコダーマを同時形質転換
するための可能性は、アルギニン栄養要求性変異体によ
り最初に示された。 【0054】argB- T.リーセイ株を、等モル量の
A.ニジュランスプラスミドpSa143(argB)
及びp3SR2(amdS)により形質転換し、形質転
換体をArg+ 表現型について選択し、そしてアセトア
ミド−CsCl−プレート上で画線培養することによっ
てamdSの取得について試験した。ArgB形質転換
体のうち、86%がまたAmdS+ であった。同時形質
転換体のサザン分析は、両プラスミドが、ゲノム中のい
くつかの異なった位置に種々の量のコピーとして組込ま
れたことを指摘した(データは示されていない)。 【0055】アセトアミド−CsCl最少培地上での二
重選択は、DNAμg当り約100個のAmd+ Arg
+ 形質転換体及びamdS形質転換の特徴を示す多くの
小さなコロニィーをもたらした。 【0056】argB amdS同時形質転換体のAr
gB+ 表現型の安定性を試験する場合、5個のうち3個
が100%安定していると判明され、ところが他は、分
析された子孫の7%又は80%においてArgB+ 特性
を失っていた。同じ個々のコロニィーはまた、AmdS
+ 表現型も失なっていた。この不安定性が、たとえば、
同じ染色体位置へのamdSと共にargBの同時組込
みによって引き起こされたかどうかは、知られていな
い。 【0057】E.コリのlacZ遺伝子を含むプラスミ
ドpAN5−4IBがプロモーターに位相が一致して結
合し、そしてA.ニジュランスのグリセルアルデヒデホ
スフェート デヒドロゲナーゼ遺伝子(gpd)(参照
62)のN−末端タンパク質コード領域をまた同時形質
転換のために使用した。さらに、このプラスミドは、
A.ニジュランスのargB遺伝子及びpBR322配
列を含む。原栄養性T.リーセイ(QM9414)を、
プラスミドp3SR2(amdS)及びpAN5−4I
Bにより同時形質転換し、形質転換体をAmd+ 表現型
について選択し、そしてXgalを含むアセトアミド−
CsCl−プレート上でβ−gal発現についてスクリ
ーンした。グルコースが培地中に存在し、そしてXga
lプレートのpHが中性である場合、内在性T.リーセイ
のβ−ガラクトシダーゼ活性は検出され得なかった。 【0058】1〜4日の増殖の後、青色が見られた。
1.0/0.7のモル比のプラスミド(p3SR2/p
AN5−4IB)を形質転換に使用する場合、13%の
大きなAmd+ クローン及び6%の小さなAmd+ クロ
ーンがβ−ガラクトシダーゼ活性を示し、そして1.0
/2.6モル比で、39%及び7%のXgal+ クロー
ンがそれぞれ得られた。青色を示すAmd+ 形質転換体
における両プラスミドの存在は、サザンハイブリダイゼ
ーションによって確められた(データは示されていな
い)。 【0059】例 6 cbh1 トリコダーマ リーセイ株の構成。 記載された方法による異なったセルラーゼ遺伝子の活性
化は、特定の組合せのcbh1- 株を産生する一連の
T.リーセイ株の構成を可能にする。cbh1-株はま
た、cbh1プロモーターを用いる場合、異質タンパク
質の有効な産生のためにも重要である。トリコダーマ
リーセイ株 QM9414(ATCC 26921)
は、cbh1特異性プローブを用いるサザン 【0060】ハイブリダイゼーションによってcbh1
遺伝子の1つの染色体コピーのみを含むことが示され、
そしてその結果、1回の組換え結果が、その遺伝子を不
活性化すべきである。不活性遺伝子を次のようにして構
成した。ベクターpUC8中のcbh1遺伝子の完全な
長さのcDNAクローンを含むプラスミドpTTO1
(参照27)を、制限酵素BglI及びBglIIにより
切断した。cbh1遺伝子の5′末端領域からの0.8
Kbフラグメントを、従来の技法によって、アガロースゲ
ルから単離した。そのフラグメントを、S1ヌクレアー
ゼを用いてブラント末端化し、そしてそれを、EcoR
Iにより切断され、ブラント末端化されたpUC18ベ
クターに連結し、そしてE.コリJM109に形質転換
した。cbh1遺伝子フラグメントを含むクローンから
のDNAを単離し、そしてcbh1のBglI−Bgl
IIフラグメントの中間を切断する制限酵素EcoRIに
より消化した。EcoRIにより生成された末端をフィ
ルインし、そしてバック連結した。切断されたcbh1
遺伝子フラグメントの中間にフレームシフト変異を含む
プラスミドpMS4を得た(第2図)。 【0061】トリコダーマを、プラスミドpMS4及び
3〜4倍のモル過剰のプラスミドpMS4と共にプラス
ミドp3SR2を含むA.ニジュランス amdSによ
り同時形質転換した。形質転換体を、例3に記載してい
るようにしてamdS+ 表現型に基づいて選択し、そし
て単一の炭素源としてアセトアミドを含む選択培地上で
精製した。精製された形質転換体を、炭素源として1%
Solka flocセルロース及び窒素源として0.
2%プロテオースペプトンを含むトリコダーマ最少培地
200μlのマイクロタイタープレート上で増殖した。
そのセルラーゼ表現型を、参照59に記載しているよう
にしてCBHI特異的抗血清(羊)に対する希釈されて
いない増殖培地を用いるオクテルロニーの免疫拡散によ
って試験した。多くの形質転換体(正常な量のCBHII
を産生するが、しかし検出できるCBHIを産生しな
い)が同定された。 【0062】例 7 I.プロキモシン遺伝子を含むプラスミド285′pr
oCの調製(第3図)。 T.リーセイにおける異質タンパク質の例として、本発
明者は、プロキモシンcDNAを発現することを選択し
た(第3図)。プレプロキモシン遺伝子を子牛の胃のc
DNAライブラリィから単離し、そしてG−Cテイリン
グ(参照49及び50)によってpBR322のpst
1部位中に挿入し、pR26を得た。pUC9をSal
Iにより切断し、そしてクレノウポリマラーゼにより補
充し、そしてT4リガーゼにより連結した。その得られ
たプラスミドをBamHI−EcoRIにより切断し、
そして2.7Kbの大フラグメントを、pR26からの
0.47KbのBamHI−EcoRIフラグメントと連
結し、プロキモシン遺伝子のN−末端にHind III部
位を含むpUC9′を得た。pUC13をBamHI−
NarI及びNarI−XmaIにより切断し、そして
それぞれ大小のフラグメントをpR26の0.64Kbの
XmaI−BclIフラグメントと連結し、プロキモシ
ン遺伝子のC−末端にXbaI−部位を含むプラスミド
pUC13′を得た。pUC13′からの0.65Kbの
XmaI−XbaIフラグメントを、第5図に示されて
いるようにしてpUC9′の0.46KbのHind III
−XmaIフラグメント及びp285の11KbのXba
I−Hind IIIフラグメントと連結し、プロキモシン
遺伝子を含むプラスミドp285′proCを得た。 【0063】II.プラスミドpAMG/Termの構
成。 pCAMG91をSalI及びPstI制限エンドヌク
レアーゼにより消化する。そのような消化物から698
bpのフラグメントをアガロースゲル上に単離した。この
SalI−PstIフラグメントは、グルコアミラーゼ
mRNAの140bp3′非翻訳部+540bpの3′〜ポ
リ(A)付加部位をコードする領域を含む。XbaIリ
ンカーの添加及びXbaI制限酵素による消化の前、こ
の3′フラグメントをT4−DNAポリマラーゼにより
処理し、その制限部位を“ブラント末端”にした。この
グルコアミラーゼ遺伝子の3′末端を、XbaIにより
線状にされたpUC13に連結し、グルコアミラーゼ遺
伝子poly(A)付加領域を含むプラスミドpAMG
/Termを得た。 【0064】III .プラスミドpMT837の構成。 プロモーター及びグルコアミラーゼ(AMG)シグナル
及びリーダーペプチドをコードする配列を含むpCAM
G91の0.5KbのSmaII−BssHIIフラグメント
を、SmaI−BamHIにより消化されたpUC13
及びプロキモシンの最初の6個のアミノ酸をコードする
合成BssHII−BamHIアダプターに連結した。こ
の得られたプラスミド、pMT626から、0.8Kbの
NdeI−BamHIフラグメントを単離し、そしてp
roCのN末端半分についての配列を含むp285′p
roCからの0.5KbのBamHI−EcoRIフラグ
メント及びproCについての配列のC末端部を含むp
MT622の3.0KbのEcoRI−NdeIフラグメ
ントに連結した。(pMT622は単に、pUC13に
おいてp285′proCのEcoRI−XbaIサブ
クローンである)。その得られたプラスミドpMT64
8(第4図を参照のこと)は、完全なプロキモシン遺伝
子、その先にAMGプロモーター及びシグナル/リーダ
ーコード配列を含む。pMT648は、A.ニジュラン
スのargB遺伝子を含むようにさらに変性された(参
照51)。1.8KbのNarI−フィルインされたpM
T648のXbaIフラグメントを、6.8KbのCla
I−フィルインされたpSal43のEcoRIフラグ
メントに連結し、pMT651を得た。AMGプロモー
ターのさらに上流の配列(上流の活性化配列;UAS)
をさらに挿入した。これは、元のクローンpCAMG9
1からの3.7KbのClaI−BssHIIフラグメント
を、proC配列を含むpMT648からの1.1Kbの
BssHII−フィルインされたXbaIフラグメント及
びpMT813からの3.1KbのClaI−フィルイン
されたEcoRIフラグメントとしてargB遺伝子
(pMT813は、EcoRV−BglIIにより切断さ
れたpiC19R中にクローンされた3.1KbのBam
HI−NruIフラグメントとしてクローンされたar
gB遺伝子である)に連結することによって達成され
た。その得られたプラスミドpMT830は、AMGか
らのUAS、プロモーター、シグナル及びリーダー配列
及びproCのための完全な遺伝子を含む発現ユニット
を有する。最後に、AMGのターミネーター配列は、プ
ラスミドpAMG/Termから0.6KbのXbaI−
XbaIフラグメントとして取られ、そしてXbaIに
より切断され、そして脱リン酸化されたpMT830中
に挿入され、pMT837が得られた。pMT837の
構成が第5図に例示される。 【0065】例 8 pMT837を用いてキモシンの産生。 T.リーセイ株QM9414及びRUT−C−30を、
プラスミドpMT837及びp3SR2により同時形質
転換した。プラスミドpMT837は、プロキモシン遺
伝子の先にAMGプロモーター及びシグナル/リーダー
配列を含む。プラスミドpMT837の構成法は例7に
記載されている(また第3〜5図を参照のこと)。同時
形質転換及び選択を例5におけるようにして行なった。 【0066】キモシン産生のためには、1%Solka
flocセルロース及び0.2%プロテオースペプト
ンを含む最少培地上で形質転換体を培養した。その菌糸
体を集め、そして必要な場合、TCA沈殿法によってそ
の上清液を濃縮し、そして2MのNaOH、10mMのT
ris溶液(pH8.5)中に希釈した。そのサンプルを
SDS−ページ(7.5%〜15%のポリアクリルアミ
ドグラジェント)上で分別し、そしてニトロセルロース
フィルターにエレクトロブロットした。そのフィルター
を、ウサギプロキモシン抗血清と共にインキュベート
し、そしてシグマから購入されたα−ウサギ−IgG−
ペルオキシダーゼ接合体を用いて4−クロロ−1−ナフ
トールにより染色した。 【0067】キモシンは、およそ1μg/lのレベルで
培地中に分泌されることを示された。AMGプロモータ
ーは、明らかにT.リーセイにおいて非能率的に機能す
るので、相同のT.リーセイプロモーター−ターミネー
ターベクターが、キモシンの産生レベルを改良するため
に構成された。 【0068】例 9 cbh1プロモーターを用いて、T.リーセイ中におい
て子牛プロキモシンの産生のための異質発現ベクターの
構成。 I.cbh1ターミネーター領域へのプロキモシン遺伝
子の連結。 子牛プロキモシン遺伝子を、プラスミドpR27から得
た(第6図)。ほとんど全体の遺伝子を含むPstI−
PstIフラグメント(約1110bp)を、従来の技法
によってアガロースゲルから単離し、そしてpUC19
のPst1部位に連結した。 【0069】このプラスミドをPstIにより一部消化
し、末端をS1ヌクレアーゼによりブラント化し、そし
てcbh1遺伝子(クレノウフラグメントによるブラン
ト末端)のAvaIIターミネーターフラグメント(〜7
50bp)をこのプラスミドに連結した。cbh1遺伝子
のターミネーター領域を、pBR322(参照24)中
にサブクローンされたcbh1cDNAの末端の1.8
KbBamHIフラグメントから得た。pUC19におい
て、cbh1遺伝子のターミネーター領域と連結したp
roCフラグメントを含むこのプラスミドをpAMH1
00(第7図)と言及した。 【0070】II.BglI−SacIIアダプターを用い
て、CBHIプロモーター領域及びプロキモシンコード
領域の融合。 プロキモシンのN−末端領域をコードするSacII−P
stIフラグメント(80bp)を、プラスミドpR27
(第6図を参照のこと)から単離した。ゲノムクローン
λ44Aからのcbh1プロモーター領域をまず、2.
8Kbの長さのEcoRI−EcoRIフラグメントとし
てpUC18(プラスミドpUA01、第8図)中にサ
ブクローンし、そして次に約2.2Kbの長さのEcoR
I−BglIフラグメントをこのサブクローンから単離
した。BglI部位は、cbh1遺伝子のシグナル配列
の中間に配置される。cbh1遺伝子のプロモーター及
びシグナルペプチドのコード領域の約半分を含む、約
2.2Kbの長さのEcoRI−BglIフラグメントの
約80bpのSacII−PstIプロキモシン フラグメ
ントへの正確な連結は、BglI−SacIIアダプター
(NOR202+NOR203、第10図)によって仲
介される。アダプターと共にこれらのフラグメントを、
EcoRI−PstIにより消化されたpUC19中に
連結した。このプラスミドは、プロキモシンの第1アミ
ノ酸に融合されたCBHIの完全なシグナル配列、次に
そのN−末端配列のいくらかをコードする。最後に、こ
の構造体からEcoRI−pcbh1ss−proC−
PstIフラグメントを単離し、SalI及びPstI
により消化されたpAMH100中にその3′末端から
連結した。そのフラグメントの5′末端及びプラスミド
pAMH100のEcoRI末端をクレノウによりフィ
ルインし、そして連結した。cbh1遺伝子のプロモー
ター及びproC′フラグメントを、cbh1ターミネ
ーター領域の前の′proCの前に移した。この構成体
を、pAMH102(第11図)と名付けた。 【0071】III .クロモシン発現プラスミドへの選択
マーカーの付加。 発現プラスミドにおける選択マーカーとして、A.ニジ
ュランスのamdS遺伝子(参照42,30)又はA.
ニジュランスのargB遺伝子(参照48)のいづれか
を使用することができる。amdS遺伝子を、p3SR
2からPvuI−SalIフラグメントとして単離し、
そしてpAMH102の6Kbの長さのPvuI−Sal
Iフラグメントに連結する。この選択可能なベクター
を、pAMH104(第11図)として命名した。 【0072】IV.オリゴヌクレオチドを用いてcbh1
プロモーター及びプレプロキモシンコード酸列の正確な
融合。 プレプロキモシンのアミノ末端PstIフラグメント
(約150bp)を、pBR322においてPstI部位
に挿入されたATGから12bp上流で始まる、完全なプ
レプロキモシンcDNAクローンを含むpR26(第3
図)から単離した。このフラグメントを、pTZ19R
のポリリンカー中に、cbhI(第8図)のシグナル配
列のコードする領域も含む、cbhIEcoRI−Sa
cI(約2.6Kb)プロモーターフラグメントと共にサ
ブクローンした。cbhIEcoRI−SacIフラグ
メントを、元のλ44Aクローン(参照24)の、pU
C18(pUA01、第8図)における2.8KbのEc
oRI−EcoRIサブクローンから得た。pTZ19
R(Pharmacia)は、複製のF1起源及びオリ
ゴヌクレオチドの突然変異生成のために単鎖鋳型の使用
を可能にするT7プロモーターを含む、pUC19基礎
プラスミドである。この得られたプラスミド(pAMH
105)の構成法は第8図に例示されている。このプラ
スミドから、cbh1プロモーター領域とproC A
TGとの間の配列を、特定のオリゴヌクレオチド、OA
MH3(第10図)を用いてループ−突然変異生成によ
って削除した。オリゴヌクレオチド指図の突然変異生成
の実施は第9図に例示されている。問題のオリゴヌクレ
オチドをリン酸化し、それぞれモル比20:1でpAM
H105の単鎖DNA(参照60、単鎖DNAは、Ph
armaciaによって記載されているようにしてJM
103/pAMH105から単離された)にアニールし
た。オリゴヌクレオチド プライマーを、参照60に記
載しているようにしてクレノウポリマラーゼ及びT4リ
ガーゼを用いて延長した。その延長された混合物を、S
maI(pTZ19Rのポリリンカーに存在する、第9
図を参照のこと)により消化し、その後、E.コリのm
utL不適正修復欠失性株、BMH71.18中に形質
転換した。形質転換体のプールを、5mlの液体培養(1
00μg/mlのアンピシリンを含む、参照62に記載の
ようなLuriaブイヨン)中で1晩増殖した。プラス
ミドDNAを、形質転換体のプールから単離し、そして
それをSmaIにより再消化し、そしてE.コリJM1
09株中に再形質転換した。可能性ある欠失クローンの
スクリーニングを、異なった制限酵素を用いる消化によ
って行ない、そして欠失の特異性もさらに、配列決定す
ることによって確認した。その得られたプラスミドをp
AMH1101(第12図)と呼ぶ。このプラスミド
を、さらにEcoRI及びPstIにより消化し、そし
てその得られたpcbh1−preproCフラグメン
トを単離し(第14図)、そしてPstI及びSalI
により消化されたpAMH100プラスミドにそのPs
tI末端で連結した。その得られた連結フラグメントの
末端を、クレノウによってフラントし、そして連結し
た。その得られたプラスミドをpAMH101と呼び、
そしてそれは、プロキモシンのシグナル配列に融合され
たcbh1プロモーター及びcbh1遺伝子のターミネ
ーター領域に融合された全プロキモシンコード領域を含
む(第14図)。 【0073】V.オリゴヌクレオチドを用いることによ
って行なわれたシグナル配列融合による、cbh1プロ
モーター及びpreproC遺伝子の正確な融合。 前のチャプターIVに詳しく記載されたpAMH1101
の構成と本質的に同じようにしてプラスミドpAMH1
103(第12図)の構成を行なった。但し、この構成
のために使用された特異的オリゴヌクレオチドはOAM
H1(第10及び9図)であった。その得られたプラス
ミドpAMH1103は、proC遺伝子のコード領域
のアミノ末端部分(〜140bp)の先のpreproC
シグナル配列からのaa12〜16に融合された、cb
h1シグナル配列からのアミノ酸(aa)1〜12を含
むシグナル配列融合体を含む(第12図)。プラスミド
pAMH1103からのpcbh1−sso−pro
C′(0=融合)フラグメントを、本質的に前のチャプ
ターIVに記載しているようにしてpAMH100にサブ
クローンした(第12図を参照のこと)。この得られた
プラスミドpAMH103は、cbh1ターミネーター
領域に融合されたproCコード領域の先のcbh1の
プロモーター領域及びcbh1及びpreproCのシ
グナル配列融合体を含む。 【0074】VI.オリゴヌクレオチドを用いることによ
るproCコード領域へのcbh1コード領域の正確な
融合。 プラスミドpAMH1106(第13図)の構成を、本
質的に前のチャプターIVに詳しく記載されたpAMH1
101の構成と同じようにして行なった。但し、この構
成のために使用された特異的オリゴヌクレオチドはOA
MH2(第10及び9図)であった。cbh1のプロモ
ーター領域、cbh1のシグナル配列及びproCのコ
ード領域に融合された、成熟CBHIの初めの1〜20
のaaのコード領域を含むその得られたプラスミドpA
MH1106からの、pcbh1成熟o−proC′を
含むフラグメントを、本質的に前のチャプターIVに記載
しているようにしてpAMH100中にサブクローンし
た(第12図)。その得られたプラスミドpAMH10
6は、cbh1のプロモーター領域、cbh1のシグナ
ル配列、proCのコード領域に融合された成熟CBH
Iのアミノ酸1〜20のコード領域を含む。 【0075】例10 pAMH102及びpAMH104 を用いてキモシンの産
生。 T.リーセイ株QM9414及びRUT−C−30を、
それぞれ5:1のモル比でプラスミドpAMH102及
びp3SR2により同時形質転換した。プラスミドpA
MH102の構成法は例9のチャプターIIに記載され
た。同時形質転換及び選択を例5におけるようにして行
なった。その形質転換体を、例3に記載されたようにし
て、選択性アセトアミドプレート上で精製した。 【0076】キモシン産生のために、形質転換体を、1
%Solk flocセルロース及び0.2%プロテオ
ースペプトンを含む最少培地(10〜50ml)上で培養
した。その菌糸体を集め、そしてその上清液をTCA沈
殿法によって濃縮し、そして2MのNaOH、10mMの
Tris(pH8.5)の溶液中に希釈した。その菌糸体
を液体窒素の存在下で破壊し、その破壊された細胞をペ
レット化し、そしてその上清液を、前記培養培地と同じ
方法で処理した。そのサンプルを、SDS−page
(7.5%〜15%のポリアクリルアミド グラジェン
ト)上で画分し、そしてニトロセルロースフィルターに
エレクトロブロットした。そのフィルターを、ウサギプ
ロキモシン抗血清及びα−ウサギ−IgG−AP(アル
カリホスファターゼ)接合体と共にインキュベートし、
そしてPromega Biotecから購入されたニ
トロプルーテトラゾリウム及び5−ブロモ−4−クロロ
−3−インドリルにより染色した。菌糸体の内部及び外
部のキモシンの量を比較した(第17図)。菌糸染色体
DNA中に組込まれたプラスミドpAMH102の高い
数のコピィーを含むクローンがまたよりキモシンを産生
したことが、サザンハイブリダイゼーションによって示
された。1つのコピィーの形質転換体を用いる場合、分
泌されたキモシンの量は1lの培養培地当り100μg
であった(ウェスターンゲルから近づいた場合)(第1
7図)。分泌されたプロキモシンは、ウェスターンゲル
によって及び凝乳活性(β−カセイン決定基の切断によ
るキモシン凝乳)によって活性キモシンにプロセスされ
ることが示された(参照63)。菌糸体の内部の種々の
形のキモシン(preproC,proC,C及び細胞
の内部の分解生成物に由来したキモシン)の量は、菌糸
体の合計タンパク質の0.04%であることが測定され
(第17図)、そして分泌されたキモシンの量は、産生
された合計キモシンの60%であった。これは、菌糸体
の外部でさえ異質遺伝子生成物を分泌するT.リーセイ
の能力を示す。 【0077】プラスミドpAMH104(第11図)の
いくつかのコピィーを有する形質転換体(多量のプロキ
モシンを分泌できる)を、増殖培地の凝乳活性を決定す
ることによって、スクリーンした。研究された40のう
ち最良の形質転換体は、ウェスターンゲル上で及び凝乳
活性によって測定される場合、培養培地1l当り500
μgを分泌することが見出された。 【0078】培養物が小規模な培養(10〜50ml)と
比べて、51ラボラトリィファーメンター中において増
殖される場合、分泌される、活性キモシンの量は、20
0倍増大されるので、この型の菌株によって産生された
キモシンの量は、約100mg/lである。 【0079】例11 T.リーセイにおける同質及び異質のタンパク質の産生
のための一般的発現ベクターの構成。 T.リーセイにおいて種々のタンパク質の産生のための
ベクターを構成するために、cbh1遺伝子のプロモー
ター及びターミネーター領域を含む一般的発現ベクター
を構成した。cbh1ターミネーターを、3個の読み枠
が整合してSTOPコドンTAAを含むアダプターと共
に、pUC19のpstI部位にサブクローンし、プラ
スミドpAMH110′(第15図)を得た。pstI
ターミネーターフラグメントをpAMH110′から単
離し、cbh1プロモーターを、proC遺伝子のアミ
ノ末端を含むEcoRI−PstIフラグメントとして
pAMH102から単離し、そしてこれらのフラグメン
トを、EcoRI−PstIにより消化されたpUC1
9* (これから、このサブクローン段階の前、1つのN
deI部位がクレノウによりブラントされた)中にサブ
クローンした。その得られたプラスミドpAMH110
は、cbh1遺伝子のプロモーター及びターミネーター
及びこれらの配列の間に、SacII及びNdeIによる
消化によって除去され得るスタファー(stuffe
r)フラグメントを含む。末端がブラントされた後、遺
伝子のcDNA又は染色体コピィーを、プロモーター及
びターミネーターの間に挿入することができる(第15
図)。 【0080】例12 cbh1プロモーター下でT.リーセイエンドグルカナ
ーゼIの発現。 産生されるエンドグルカナーゼの量を増大せしめるため
に、egl1遺伝子を、より強力なcbh1プロモータ
ーに連結した。T.リーセイエンドグルカナーゼIのた
めのcDNAを、スタファーフラグメントを削除するた
めにまずSacII−NdeIにより消化された一般的な
発現ベクターpAMH110(例11に記載された)中
にEcoRI−BamHIフラグメントとしてサブクロ
ーンした(第16図)。cbh1遺伝子のプロモーター
及びターミネーターの間にegl1遺伝子を含む、その
得られたプラスミドpAMH111を、それぞれ5:1
のモル比でp3SR2と共に、T.リーセイQM941
4(ATCC 26921)に同時形質転換した。形質
転換体を、Amds+ 表現型について選択し、そしてさ
らに選択培地上で精製した。6個の個々の形質転換体
を、50mlの液体培養において、セルラーゼ含有培地
(炭素源としてSolka floc,1%)中で4日
間、増殖せしめた。次にその培養上清液を、ヒドロキシ
エチルセルロース(0.1%、参照12)からの還元性
糖の放出を測定することによってエンドグルカナーゼ活
性について試験した。形質転換体のEGI活性を対照
(QM9414)と比較し、そして最良の形質転換体
は、対照菌株のエンドグルカナーゼ活性の4倍分泌する
ことが示された。この例は、それぞれのプロモーターを
変えることによって、T.リーセイにおいて、異なった
セルロース分解酵素の量を調整することが可能であるこ
とを示す。 【0081】参考文献 1.Simmons, E.G., いくつかのセルラーゼ産生トリコ
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質転換に使用するためのベクターシステム、トリコダー
マにおけるタンパク質の高レベルでの発現及び分泌のた
めの方法、DNA組換え体ベクター及び形質転換された
トリコダーマ菌株に関する。 【0002】 【発明の背景】繊維状菌類は、種々の発酵生成物を製造
するために生物工学に広く使用される下等真核生物であ
る。菌類は多くの工業的に重要な酵素、たとえばグルコ
アミラーゼ、プロテアーゼ、ラクターゼ、ペクチナーゼ
及びグルコセオキシダーゼを分泌する。 【0003】繊維状菌類は多くの生物工学的利点を有す
る。それらは一般的に高い量のタンパク質を産生し、大
規模での培養は複雑でなく、そして発酵の後、培養液体
からの菌糸体の分離が容易である。 【0004】中温性不完全菌類トリコダーマ リーセイ
〔以前はT.ビリデ(T.viride)〕(参照1)
は、セルロースバイオマスの転換に必要とされる酵素を
産生し、そしてたぶん最も広く研究されたセルラーゼ産
生生物である。 【0005】セルロースのグリコースへの加水分解のた
めには、3種のタイプの酵素活性が必要とされる;通
常、置換された可溶性基質を攻撃し、そして結晶性セル
ロースに親和性を示さない、ランダム切断性エンドグル
カナーゼ(1,4−β−D−グルカングルカノヒドロラ
ーゼ、EC.3,2,1,4);結晶性セルロースを分
解することができるが、しかし誘導体化されたセルロー
スに対する活性を持たないセルロビオヒドロラーゼ
(1,4−β−D−グルカン セルロビオヒドロラー
ゼ、EC.3,2,1,91)及びグルコースを得るた
めにセロビオース及びセロ−オリゴ糖を攻撃するβ−グ
ルコシダーゼ(β−D−グルコシド グルコヒドロラー
ゼ、EC.3,2,1,21)。いくらかのこれらの酵
素間の相乗作用が示された(参照2〜4)。 【0006】菌類のセルラーゼが精製され、そして特徴
づけられ、そしてすべての3種の主要タイプの酵素は、
多種の形で存在することが示された(参照5)。2つの
免疫学的に異なるセルロビオヒドロラーゼ、すなわちC
BHI及びCBHIIは、T.リーセイの培養培地から検
出された(参照4,6)。5〜8の電気泳動的に異なる
エンドグルカナーゼが報告され、それらの多くは、基質
特異性を変えることを示した(参照7,8,9,1
0)。2つの細胞外β−グルコシダーゼの特徴化が報告
された(参照11)。 【0007】突然変異及びスクリーニングの直接的アプ
ローチを用いて開発された多くの菌株は、いくつかの高
収率のT.リーセイ突然変異株を好結果をもたらして産
生した(参照11〜22)。最良のT.リーセイ突然変
異体によって産生された細胞外タンパク質の量は、培養
流体1l当り20〜30gであり、これは合計細胞タン
パク質の50%以上である。分泌されたタンパク質の主
要部分は、セルラーゼを含み、そしてその間には、CB
HI成分が最も豊富であり、そして分泌されたセルラー
ゼタンパク質の60%まで示す。 【0008】CBHIのための遺伝子は、Shoema
kerなど(参照23)及びTeeriなど(参照2
4)によってクローンされ、そして該遺伝子の完全なヌ
クレオチド配列は公表されている(参照23)。T.リ
ーセイからまた、主なエンドグルカナーゼEGIのため
の遺伝子がクローンされ、そして特徴づけられた(参照
25,26,27)。他の単離されたセルラーゼ遺伝子
はcbh2(参照28,29)及びegl3(参照3
0)である。 【0009】産業的に重要な繊維状菌類の分子生物学
は、一般的に良く知られていない。これは一部、有性生
殖サイクル及び/又は遺伝的な形質転換システムの不十
分な認識による。最近、形質転換システムが、ネウロス
ポク クラサ(参照31)、A.ニジュランス(参照3
2,33,34)及びA.ニガー(A.niger)参
照35)のために開発され、そしてそれらは、ベクター
分子によって担持されるそれぞれの機能性遺伝子により
突然変異宿主の相補性においてそれらの主成分を一般的
に有する。しかしながら、これらの菌類の中でA.ニガ
ーのみが当座は、産業的興味の対象である。 【0010】菌類の分類において、属アスペルジラス
は、綱アスコマイセティス(Ascomycete
s)、サブクラス ユーアスコマイセティス(Euas
comycetes)に含まれる。ユーアスコマイセテ
ィスは、子実体に基づいて3つの群、すなわちプレクト
マイセティス(Plectomycetos)、ピレノ
マイセティス(Pyrenomycetes)及びジス
コマイセティス(Discomycetes)に分けら
れる。最も重要な属は、アスペルジラス及びペニシリア
ム(参照56)である。代わりに、トリコダーマが不完
全菌類のメンバーとして分類される。不完全菌類は、有
性生殖又は有性生殖属との明確な類似性を持たない菌
類、たとえばひじょうに特徴的なアスペルジラスのキャ
ッチ−オール カテゴリーである。トリコダーマは、完
全なアスコマイセティス種ハイポクレア(Hypocr
ea)(参照57)の不完全状態である不十分に定義さ
れた生殖段階を有することを報告されたけれども、属ア
スペルジラス及びトリコダーマは明らかに、分類学上ひ
じょうに異なると思われる。アスペルジラス ニジュラ
ンスからのargb遺伝子及びネウロスポラ クラサか
らのpyr4遺伝子は、非ストリンジェント条件下でそ
れぞれのトリコダーマの遺伝子にハイブリダイズせず、
従ってトリコダーマは他のアスコマイセテス(Asco
mycetes)と進化論的にまったく異なるという考
えを推定できることもまた示された(Vananen,
S.,調製において)。 【0011】増殖培地中にタンパク質を分泌する、その
例外的能力によって、トリコダーマリーセイは、タンパ
ク質の産生のための可能な宿主として良好な候補者であ
ると思われる。しかしながら、これまでは、T.リーセ
イの遺伝研究は、該菌類のセルラーゼ産生特性を改良す
ることにほとんど向けられ、そしてハイパ−セルロチッ
ク(Hypercellulotic)トリコダーマ菌
株の開発のために使用される技術は、単に従来の突然変
異生成及びスクリーニングであった。トリコダーマのた
めの形質転換システムは、今まで開発されていない。 【0012】トリコダーマ リーセイのための有効な宿
主−ベクターシステムを提供し、トリコダーマ中に異質
のタンパク質の高い発現及び分泌レベルを得、又は同質
のタンパク質の産生を高めることが本発明の主な目的で
ある。 【0013】本発明の明細書において、表現“トリコダ
ーマに異質のタンパク質”とは、トリコダーマによって
天然に産生されないタンパク質を意味し、ところが“ト
リコダーマに同質のタンパク質”とは、トリコダーマ自
体によって産生されるタンパク質を意味する。 【0014】初めに開発された菌類の形質転換システム
において、すなわちアスペルジラス及びネウロスポラに
おいては、形質転換がプロトプラストを用いて行なわれ
る。形質転換性DNAが通常、宿主のゲノム中に組込ま
れる。安定した形質転換体を同定するための選択システ
ムを得るためには、ベクターシステムが、宿主ゲノムの
対応する突然変異を補足するか、又は特定の増殖培地上
での原栄養株の増殖のために必要な活性、通常酵素を供
給する機能的な遺伝子(選択マーカー)を担持すべきか
である。 【0015】 【発明の要約】本発明は、トリコダーマの形質転換のた
めの組換え体DNAクローニングベクターシステムを記
載する。このDNAクローニングベクターシステムが目
的とするタンパク質生成物をコードする DNA配列を
含有する場合、本発明のベクターシステムによるトリコ
ダーマの形質転換は、形質転換された微生物が適切な培
養培地中において増殖される場合、目的とするタンパク
質の高レベルの発現及び分泌を提供するであろう。 【0016】その第1の観点によれば、本発明は、 a)目的とするタンパク質生成物をコードする遺伝子、 b)目的とする生成物の発現を制御するために機能可能
的に結合されたプロモーター/エンハンサーを含む遺伝
子発現を促進する機能、 c)場合によっては、目的とする生成物のために該遺伝
子の5′末端の上流に融合されたシグナル/リーダー配
列及び d)選択マーカーを含んで成るベクターシステムを提供
する。 【0017】その第2の観点によれば、本発明は、トリ
コダーマの形質転換のための方法を提供し、ここで適切
なトリコダーマ菌株が本発明のベクターシステムにより
形質転換される。 【0018】その第3の観点によれば、本発明は、本発
明のベクターシステムによりトリコダーマを形質転換
し、該形質転換された菌株を適切な培地中で培養し、そ
して発現され、そして分泌された生成物を該培地から回
収することを含んで成る、トリコダーマにおけるタンパ
ク質の産生のための方法を提供する。 【0019】本発明はまた、トリコダーマ中にタンパク
質の産生のための方法も提供し、この方法によって、ベ
クターシステムにより形質転換されたトリコダーマ菌株
は、適切な培地中で培養され、そして発現され、そして
分泌されたタンパク質が該培養培地から回収される。本
発明はさらに、安定して形質転換されたトリコダーマ菌
株を提供する。 【0020】本明細書に使用される場合、“ベクターシ
ステム”とは、宿主ゲノム中に組込まれるべきDNA−
情報を共に含む単一のベクター又はプラスミドもしくは
複数のベクター又はプラスミドを含む。該ベクター又は
プラスミドは、線状又は閉環状分子である。トリコダー
マ中における自己複製プラスミドは現在知られていない
が、本発明はまた、のちに見出されるにちがいない、そ
のような自己複製プラスミドも包含する。 【0021】本発明のベクターシステムは、プロモータ
ー、エンハンサー及び転写開始部位並びにターミネータ
ーを含む遺伝子発現を促進する機能をコードするDNA
−配列、形質転換体の選択のためのマーカー及び目的の
タンパク質をコードするDNA配列を含んで成る。 【0022】発現された生成物の分泌を確保するため
に、目的とする生成物のための遺伝子は、好ましくは、
細胞の分泌路中に、発現された生成物の有効な方向を確
保する前領域を提供される。この前領域(天然に存在す
るシグナル又はリーダーペプチドもしくはその一部であ
る)は一般的に、分泌の間、目的の生成物から切断さ
れ、この後、その成熟した生成物は、培養培地から単離
され得る。目的とする生成物のための遺伝子は、ゲノム
遺伝子又はcDNAクローンから得られる。DNA−配
列はまた、合成され得る。 【0023】シグナル/リーダー配列は、目的とするタ
ンパク質をコードする遺伝子のシグナル/リーダー配列
に由来し、又はトリコダーマ又は他の生物源のいづれか
からの他の分泌されたタンパク質のための遺伝子に由来
する。トリコダーマによって分泌されるタンパク質をコ
ードする遺伝子に由来するシグナル/リーダー配列の例
は、cbh1シグナル配列又はegl1シグナル配列又
はその一部である。トリコダーマに異質の分泌されたタ
ンパク質をコードする遺伝子に由来するシグナル/リー
ダー配列は、アスペルジラスのアミラーゼ又はグルコア
ミラーゼのための遺伝子に由来する。また合成シグナル
/リーダー配列も使用され得る。 【0024】プロモーターは、トリコダーマ中に転写活
性を示すDNA配列であり、そしてトリコダーマに同質
か又は異質の遺伝子に由来することができる。トリコダ
ーマに同質のタンパク質をコードする遺伝子に由来する
プロモーターの例は、CBHIプロモーター又はEGI
プロモーターもしくはその一部である。トリコダーマに
異質のタンパク質のための遺伝子に由来するプロモータ
ーの例は、アスペルジラスのグルコアミラーゼ プロモ
ーターである。転写ターミネーターは、プロモーターと
同じ源に由来する。また合成プロモーター又はターミネ
ーター配列も使用され得る。 【0025】特別に言及されたすべてのDNA配列は、
コードされた生成物の機能に不可欠な塩基の数個を補正
又は欠失することによって変性され得ることが理解さ
れ、そしてそれは当業者にとっては明らかである。たと
えば、cbh1又はegl1シグナル又はプロモーター
配列に実質的に類似するDNA配列は、それらがトリコ
ダーマ中において意図された機能を示すかぎり使用され
得る。また目的とするタンパク質のための遺伝子は、こ
れがタンパク質の活性に対して悪影響を持たないかぎ
り、変えられ得る。 【0026】異なった選択マーカー、たとえばargB
(A.ニジュランス又はT.リーセイ)、amdS
(A.ニジュランス)及びpyr4(ネウロスポラ ク
ラサ又はT.リーセイ)が使用され得る。 【0027】宿主菌株は、形質転換方法に使用される選
択マーカーに依存して、原栄養性又は栄養要求性トリコ
ダーマ菌株である。本明細書の実験部分に示されている
ように、A.ニジュランスからのamdS遺伝子は、原
栄養性I.リーセイの形質転換のために使用され得る。
T.リーセイは単一の窒素源としてアセトアミド上で完
全に増殖せず、そしてその増殖は培地上にCsClを添
加することによってさらに阻害され得る。従って、Cs
Clの存在下で単一の窒素源としてアセトアミド上での
増殖は、amdS+ 形質転換体を同定するために選択培
地として使用され得る。 【0028】宿主ゲノムの対応する突然変異を相補する
選択マーカーが使用される場合、栄養要求性トリコダー
マ突然変異体が構成されるべきである。栄養要求性トリ
コダーマ突然変異体は、突然変異株を産生するための既
知方法によって製造され得る。 【0029】増殖のためにウラシル、トリプトファン又
はアルギニンを必要とする栄養要求性トリコダーマ突然
変異体は、Nevalainen(参照36)によって
記載されているようにして、濾過濃縮技法(filtr
ation enrichment techniqu
e)によって単離された。アルギニン要求性栄養要求体
から、argB遺伝子を欠失する突然変異体が、アルギ
ニン生合成において異なった中間体によって供給される
一連の最少プレートを用いることによって同定された。
ウラシル要求性突然変異体から、pyr4遺伝子を欠失
する菌株を、菌糸体調製物(参照37)においてオロチ
ジン−5′−ホスフェートデカルボキシラーゼ(OMP
decase)の活性を測定することによって見出す
ことができる。 【0030】trp1遺伝子欠失の突然変異体は、それ
らの菌糸体におけるPRAイソメラーゼ−InGPシン
セターゼ活性の欠失によって特徴づけられる(参照4
0)。酵素活性を示さない突然変異体のtrp1−特性
は、たとえばN.クラサのtrp1プラスミド(参照4
1)又はA.ニジュランスのtrpC−プラスミド(参
照34)による形質転換及び相補性によって確認され得
る。 【0031】使用される形質転換技法はA.ニジュラン
スの形質転換法(参照32,33)から改造された方法
である。プロトプラストは、寒天プレート上で菌糸体を
増殖し、そしてNovozym(登録商標)234の緩
衝溶液中に菌糸体を懸濁することによる既知の方法によ
って調製される。従来のNovozym(登録商標)2
34のスクロース溶液の代わりに、ソルビトール溶液が
好都合に使用され得る。次に、本発明の実験部にさらに
詳しく記載しているようにして、形質転換性DNAが前
記プロトプラスト溶液に添加される。形質転換は普通、
同時形質転換として行なわれ、それによって、選択不可
能なプラスミドがもう1つのプラスミド中に挿入される
選択可能なマーカー(たとえばp3SR2中へのamd
S又はpSa143中へのargB)を用いて高頻度で
T.リーセイ中に同時形質転換される。等モル量のDN
Aが形質転換のために使用される場合、高い割合の形質
転換体が、ゲノム中に組込まれた選択不可能なプラスミ
ドを含む。argB- T.リーセイ菌株が、等モル量の
プラスミドp3SR2及びpSa143による形質転換
に使用される場合、形質転換体を、二重選択培地(最少
培地、アセトアミド、CsCl)上に得ることができ
る。他方、単鎖のプラスミドは、形質転換のために使用
され得、ここでまた、マーカーが挿入される。 【0032】次に、形質転換体は、適切な培地中で培養
される。単純な培地中に目的とする生成物を産生するこ
とができるためには、グルコース誘導性プロモーターが
使用される。トリコダーマが1%グルコースを含む培地
上で増殖される場合、プロテアーゼを含む、すべての細
胞外タンパク質の分泌が強く抑制される。目的とする酵
素をコードする遺伝子がグルコース含有性培地中におい
て強く発現されるプロモーターに連結される場合、目的
とする酵素は増殖培地に分泌される。他のタンパク質は
これらの条件下で産生されないので、目的とする酵素
は、培地中に分泌される主なタンパク質である。 【0033】菌類の菌糸体が除去される場合、目的とす
るタンパク質は、種々の純粋な形でその得られた溶液に
存在する。必要により、それはさらにひじょうに容易
に、精製され得る。なぜならば、それはほとんどタンパ
ク質のみであるからである。 【0034】本発明はまた、宿主生物のある酵素活性を
産生する遺伝子を変性又は不活性化するためにも使用さ
れ得る。例として、セルラーゼ−陰性T.リーセイ菌株
が構成され得る。この突然変異生成は、欠失されたセル
ラーゼ遺伝子を担持するプラスミドによるトリコダーマ
リーセイの形質転換に基づかれる。染色体セルラーゼ
遺伝子産でのプラスミドの同質組換えは、内存性T.リ
ーセイ セルラーゼ遺伝子の挿入不活性化を引き起こ
す。形質転換のために使用されるプラスミドは、セルラ
ーゼコード領域の一部のみを含み、そして不活性タンパ
ク質を産生する。5′を末端とする配列は含まれない。
フレームシフト変異がまた、切断されたコード領域に導
入され得る。選択マーカー(argB)又はスクリーニ
ングのためのマーカー(lacZ)が形質転換のために
使用されるプラスミドに連結され得る。組換えの後、マ
ーカーは、2種の得られた欠陥性セルラーゼ遺伝子の間
に、配置されるであろう。その方法の原理は第1図に示
される。 【0035】本発明は、キモシン及びトリコダーマ リ
ーセイのエンドグルカナーゼI(EGI)によって例示
される。プロモーター、シグナル及びリーダー並びにタ
ーミネーター配列は、アスペルジラス ニガーからのグ
ルコアミラーゼ遺伝子又はトリコダーマ リーセイのc
bh1遺伝子のいづれかに由来した。選択マーカーとし
て、A.ニジュランスからのamdS遺伝子が使用され
た。 【0036】材 料 プラスミド: p285:ATCC 20681 pCAMG91:参照56 piC19R:参照57 pSa143:参照48+51 p3R2:参照30+32 pDJB2:参照35 pMC1817:参照43 pTT01,pTT11:参照27 pUC 9,pUC13:参照59 pUC18,pUC19:参照55 【0037】菌株:E.コリ(E.coli)株、JM
101,JM 109及びDHI(参照59)がE.
コリ クローニングにおいて宿主として使用される。ト
リコダーマリーセイ菌株QM9414(ATCC 26
921)及びRUT−C−30(ATCC 5676
5)が菌類の形質転換及び発現研究に使用される。 【0038】トリコダーマの最少培地: グルコース 2g (NH4 )2 SO4 5g KH2 PO4 15g MgSO4 0.6g CaCl 0.6g FeSO4 ,7H2 O 5mg MnSO4 ,H2 O 1.56mg ZnSO4 ,7H2 O 1.4mg CoCl2 2mg/1H2 O 【0039】 【実施例】 実 験 例 1 栄養要求性T.リーセイ突然変異菌株の誘導、濃縮及び
単離。 増殖のためにウラシル、トリプトファン又はアルギニン
を必要とする栄養要求性突然変異体を、Nevalai
nen(参照36)によって記載されているようにし
て、濾過濃縮法を用いて単離する。使用される突然変異
誘発剤は、紫外線である。アルギニン要求性の栄養要求
体から、argB遺伝子を欠失する突然変異体が、アル
ギニン生合成において異なった中間体によって供給され
る一連の最少プレートを用いることによって同定される
(参照36)。増殖のためにシトルリンを必要とする突
然変異体は、可能性あるargB- 突然変異体として考
慮される。単離された突然変異体のargB- 特性は、
A.ニジュランスのargB遺伝子(例4)を含むプラ
スミドpSa143を用いて原栄養体中にそれらを形質
転換することによって確認される。 【0040】ウラシル要求性突然変異体から、pyr4
遺伝子を欠失する菌株が捜し求められる。これらの突然
変異体のpyr4- 特性を、N.クラサのpyr4遺伝
子(参照38)を含むプラスミドによる形質転換によっ
て確認した。 【0041】例 2 プロトプラストの調製。 菌糸体をポテトデキストロース寒天プレート(Difc
o)上のセロファンディスク上で増殖する。5枚のセロ
ファン培養物からの菌糸体を、0.1Mリン酸カリウム
によりpH5.6で緩衝化された、1.2Mソルビトール
中Novozym(登録商標)234の5mg/ml溶液1
5ml中に懸濁する。その混合物を30℃で1.5〜2時
間、インキュベートする。焼結ガラス濾過(多孔度1)
により菌糸体破壊物からプロトプラストを分離し、40
00gで5分間ペレット化し、そして1.2Mソルビト
ール−10mMのTris,HCl(pH7.5)溶液によ
り2度洗浄する。 【0042】プロトプラストのより良好な精製は、Ti
llburnなど(参照33)によって記載された方法
を用いることによって達成され得る。pH5.8で緩衝化
された、1.2MのMgSO4 中、Novozym(登
録商標)234の5mg/ml溶液を、プロトプラスティン
グのために使用する。インキュベーション及び濾過の
後、そのプロトプラスト懸濁液を、0.6Mソルビトー
ル−100mMのTris,HCl(pH7.0)の等体積
と共に4000gで15分間、遠心分離する。プロトプ
ラストは、管の中間に鋭いバンドを形成する。そのプロ
トプラストを、1.2Mソルビトール−10mMのTri
s,HCl溶液(pH7.5)1体積中に懸濁し、回転沈
殿せしめ、そして1.2Mソルビトール−10mMのTr
is,HCl溶液(pH7.5)により2度洗浄する。そ
のプロトプラストを、5×106 〜5×107 個のプロ
トプラスト/mlの濃度で、1.2Mソルビトール−10
mMのCaCl2 −10mMのTris,HCl溶液(pH
7.5)中に懸濁する。 【0043】プロトプラストの生存率を、浸透圧安定剤
として1Mソルビトールを含むトリコダーマの最少培地
上で評価する。その再生頻度は、菌株QM9414(A
TCC 26921)のためには40〜80%である。 【0044】例 3 A.ニジュランスのアセトアミダーゼ(amdS)を用
いてT.リーセイの形質転換。 プラスミドp3SR2を、形質転換に使用する。それ
は、完全なアセトアミダーゼ構造遺伝子amdS及びそ
の調節領域amdIを担持するA.ニジュランスDNA
を含む(参照45及び33)。 【0045】形質転換性DNA20μl(4〜10μ
g)を、プロトプラスト溶液200μl中に添加する。
25%PEG 6000−50mMのCaCl2 −10mM
のTris,HCl溶液(pH7.5)50μlを添加
し、そしてその混合物を、氷上で20分間、インキュベ
ートする。PEG溶液2mlを添加し、そしてその混合物
を、室温でさらに5分間、インキュベートする。1.2
Mソルビトール−10mMのCaCl2 −10mMのTri
s,HCl溶液(pH7.5)4mlを添加し、そしてその
プロトプラストを3%寒天表面上にプレートする。その
選択培地は、(NH 4 )2 SO4 の代わりに単一の窒素
源として10mMアセトアミドを有するトリコダーマ最少
培地であり、そして浸透圧安定剤として1Mソルビトー
ル及びバックグラウンド増殖を抑制するために12.5
mMのCsClにより補充される。 【0046】40〜600個の形質転換体/DNAμg
の形質転換頻度を、菌株QM9414(ATCC 26
921)のために得る。最も高い頻度は、DNAが2サ
イクルのCsCl/エチジウムブロミド遠心分離により
精製される場合に得られる。 【0047】胞子形成は選択培地上ではめったに観察さ
れないが、しかしポテト デキストロース寒天に移され
る場合、通常、その形質転換体は胞子形成する。アセト
アミド上で増殖するそれらの能力は多様である。選択培
地上でのコロニィーの直径は、1mm以下から10〜20
mmの範囲である。 【0048】形質転換体の有糸分裂安定性を調べた。種
々のサイズの10個の大きな形質転換体を、アセトアミ
ド−CsClプレート上に継代培養し、ポテト デキス
トロース(PD)上に胞子形成し、そしてPD上に再プ
レートした。ヘテロカリオシスによって引き起こされた
異質性(heterogeneity)を除くために、
1つの胞子から生まれる個々のコロニィーをAmdS+
表現型について試験した。おのおのの元の形質転換体か
らの1つの陽性クローンを、非選択性培地上で連続プレ
ーチング(5増殖サイクル)にゆだね、そしておのおの
の世代の後、表現型を選択培地上で試験した。1つのサ
イクルの後、10個の大きな形質転換体を非選択培地上
で試験し、その10個の形質転換のうち6個は100%
のAmdS+ 分生子を与え、3個は47〜87%の分生
子を与え、そして1つの形質転換体は、AmdS+ 分生
子を与えなかった。この結果は、5つの非選択性増殖サ
イクルを通して同様のままであり、初めの不安定なAm
dS+ 表現型が後で安定化され得ることを示唆した。 【0049】元の10個の小さなコロニィーのうち、3
個は、種々の頻度のAmdS+ 表現型を有する胞子を与
えた(94%,44%及び5%の胞子)。他の7個のク
ローンは、アセトアミド上で増殖し得ない胞子のみを与
えた。興味あることには、得られたすべてのAmdS+
は、大きなコロニィーの形質転換体の特徴を有する、活
発な増殖をアセトアミドプレート上で示した。 【0050】形質転換体におけるプラスミドDNAの存
在を全DNAのサザン法によって分析し、形質転換体か
ら単離し(Raeder及びBrodaに従って、参照
44)、XhoI又はSalI及びEcoRIにより切
断した。ベクターpUC18及びプラスミドp3SR2
のamdS遺伝子を含むSalI−EcoRIフラグメ
ントを、プローブとして使用する。その形質転換体は、
トリコダーマのゲノムDNA中の多くの異なった部位
で、すなわちゲノム当り1〜数個のコピィーでの組換え
によって生じることが示された。 【0051】例 4 A.ニジュランス及びN.クラサのプラスミドによる
T.リーセイの形質転換。 異質DNAによる栄養要求性突然変異の相補性をT.リ
ーセイにおいて示す。A.ニジュランスからのargB
遺伝子を含むプラスミドpSa143を使用して、T.
リーセイのargB- 突然変異体株を形質転換する。
N.クラサからのpyr4遺伝子を含むプラスミドpD
JB2を用いて、T.リーセイのpyr4 - 突然変異体
株を形質転換する。その形質転換体を、アルギニン又は
30μg/mlウラシルを含まない最少培地上でそれぞれ
選択した。両者の場合の形質転換の頻度は、約300個
の形質転換体/DNAμgである。 【0052】染色体DNAを、その形質転換体から単離
し、そしてサザン ハイブリダイゼーション実験のため
に使用し、T.リーセイの染色体DNA中へのプラスミ
ドDNAの正しい組込みを確めた。複数のタンデムコピ
ーのpSal143を、ゲノム中に組込んだ。サザン及
びドット ブロット ハイブリダイゼーションは、分析
された形質転換において、argBのコピー数がおよそ
2〜100以上異なることを示した。ArgB+ 形質転
換体は、少なくとも3世代を通して、表現型的に100
%安定していることが示された。これは、完全培地上で
5個の形質転換からの分生子の連続プレーチングによっ
て試験し、そしてその後、最少培地(50〜80個のコ
ロニィー/形質転換体)上でArg+ 表現型を試験し
た。 【0053】例 5 amdS及びargBプラスミドによるT.リーセイの
同時形質転換。 非選択性プラスミドによりトリコダーマを同時形質転換
するための可能性は、アルギニン栄養要求性変異体によ
り最初に示された。 【0054】argB- T.リーセイ株を、等モル量の
A.ニジュランスプラスミドpSa143(argB)
及びp3SR2(amdS)により形質転換し、形質転
換体をArg+ 表現型について選択し、そしてアセトア
ミド−CsCl−プレート上で画線培養することによっ
てamdSの取得について試験した。ArgB形質転換
体のうち、86%がまたAmdS+ であった。同時形質
転換体のサザン分析は、両プラスミドが、ゲノム中のい
くつかの異なった位置に種々の量のコピーとして組込ま
れたことを指摘した(データは示されていない)。 【0055】アセトアミド−CsCl最少培地上での二
重選択は、DNAμg当り約100個のAmd+ Arg
+ 形質転換体及びamdS形質転換の特徴を示す多くの
小さなコロニィーをもたらした。 【0056】argB amdS同時形質転換体のAr
gB+ 表現型の安定性を試験する場合、5個のうち3個
が100%安定していると判明され、ところが他は、分
析された子孫の7%又は80%においてArgB+ 特性
を失っていた。同じ個々のコロニィーはまた、AmdS
+ 表現型も失なっていた。この不安定性が、たとえば、
同じ染色体位置へのamdSと共にargBの同時組込
みによって引き起こされたかどうかは、知られていな
い。 【0057】E.コリのlacZ遺伝子を含むプラスミ
ドpAN5−4IBがプロモーターに位相が一致して結
合し、そしてA.ニジュランスのグリセルアルデヒデホ
スフェート デヒドロゲナーゼ遺伝子(gpd)(参照
62)のN−末端タンパク質コード領域をまた同時形質
転換のために使用した。さらに、このプラスミドは、
A.ニジュランスのargB遺伝子及びpBR322配
列を含む。原栄養性T.リーセイ(QM9414)を、
プラスミドp3SR2(amdS)及びpAN5−4I
Bにより同時形質転換し、形質転換体をAmd+ 表現型
について選択し、そしてXgalを含むアセトアミド−
CsCl−プレート上でβ−gal発現についてスクリ
ーンした。グルコースが培地中に存在し、そしてXga
lプレートのpHが中性である場合、内在性T.リーセイ
のβ−ガラクトシダーゼ活性は検出され得なかった。 【0058】1〜4日の増殖の後、青色が見られた。
1.0/0.7のモル比のプラスミド(p3SR2/p
AN5−4IB)を形質転換に使用する場合、13%の
大きなAmd+ クローン及び6%の小さなAmd+ クロ
ーンがβ−ガラクトシダーゼ活性を示し、そして1.0
/2.6モル比で、39%及び7%のXgal+ クロー
ンがそれぞれ得られた。青色を示すAmd+ 形質転換体
における両プラスミドの存在は、サザンハイブリダイゼ
ーションによって確められた(データは示されていな
い)。 【0059】例 6 cbh1 トリコダーマ リーセイ株の構成。 記載された方法による異なったセルラーゼ遺伝子の活性
化は、特定の組合せのcbh1- 株を産生する一連の
T.リーセイ株の構成を可能にする。cbh1-株はま
た、cbh1プロモーターを用いる場合、異質タンパク
質の有効な産生のためにも重要である。トリコダーマ
リーセイ株 QM9414(ATCC 26921)
は、cbh1特異性プローブを用いるサザン 【0060】ハイブリダイゼーションによってcbh1
遺伝子の1つの染色体コピーのみを含むことが示され、
そしてその結果、1回の組換え結果が、その遺伝子を不
活性化すべきである。不活性遺伝子を次のようにして構
成した。ベクターpUC8中のcbh1遺伝子の完全な
長さのcDNAクローンを含むプラスミドpTTO1
(参照27)を、制限酵素BglI及びBglIIにより
切断した。cbh1遺伝子の5′末端領域からの0.8
Kbフラグメントを、従来の技法によって、アガロースゲ
ルから単離した。そのフラグメントを、S1ヌクレアー
ゼを用いてブラント末端化し、そしてそれを、EcoR
Iにより切断され、ブラント末端化されたpUC18ベ
クターに連結し、そしてE.コリJM109に形質転換
した。cbh1遺伝子フラグメントを含むクローンから
のDNAを単離し、そしてcbh1のBglI−Bgl
IIフラグメントの中間を切断する制限酵素EcoRIに
より消化した。EcoRIにより生成された末端をフィ
ルインし、そしてバック連結した。切断されたcbh1
遺伝子フラグメントの中間にフレームシフト変異を含む
プラスミドpMS4を得た(第2図)。 【0061】トリコダーマを、プラスミドpMS4及び
3〜4倍のモル過剰のプラスミドpMS4と共にプラス
ミドp3SR2を含むA.ニジュランス amdSによ
り同時形質転換した。形質転換体を、例3に記載してい
るようにしてamdS+ 表現型に基づいて選択し、そし
て単一の炭素源としてアセトアミドを含む選択培地上で
精製した。精製された形質転換体を、炭素源として1%
Solka flocセルロース及び窒素源として0.
2%プロテオースペプトンを含むトリコダーマ最少培地
200μlのマイクロタイタープレート上で増殖した。
そのセルラーゼ表現型を、参照59に記載しているよう
にしてCBHI特異的抗血清(羊)に対する希釈されて
いない増殖培地を用いるオクテルロニーの免疫拡散によ
って試験した。多くの形質転換体(正常な量のCBHII
を産生するが、しかし検出できるCBHIを産生しな
い)が同定された。 【0062】例 7 I.プロキモシン遺伝子を含むプラスミド285′pr
oCの調製(第3図)。 T.リーセイにおける異質タンパク質の例として、本発
明者は、プロキモシンcDNAを発現することを選択し
た(第3図)。プレプロキモシン遺伝子を子牛の胃のc
DNAライブラリィから単離し、そしてG−Cテイリン
グ(参照49及び50)によってpBR322のpst
1部位中に挿入し、pR26を得た。pUC9をSal
Iにより切断し、そしてクレノウポリマラーゼにより補
充し、そしてT4リガーゼにより連結した。その得られ
たプラスミドをBamHI−EcoRIにより切断し、
そして2.7Kbの大フラグメントを、pR26からの
0.47KbのBamHI−EcoRIフラグメントと連
結し、プロキモシン遺伝子のN−末端にHind III部
位を含むpUC9′を得た。pUC13をBamHI−
NarI及びNarI−XmaIにより切断し、そして
それぞれ大小のフラグメントをpR26の0.64Kbの
XmaI−BclIフラグメントと連結し、プロキモシ
ン遺伝子のC−末端にXbaI−部位を含むプラスミド
pUC13′を得た。pUC13′からの0.65Kbの
XmaI−XbaIフラグメントを、第5図に示されて
いるようにしてpUC9′の0.46KbのHind III
−XmaIフラグメント及びp285の11KbのXba
I−Hind IIIフラグメントと連結し、プロキモシン
遺伝子を含むプラスミドp285′proCを得た。 【0063】II.プラスミドpAMG/Termの構
成。 pCAMG91をSalI及びPstI制限エンドヌク
レアーゼにより消化する。そのような消化物から698
bpのフラグメントをアガロースゲル上に単離した。この
SalI−PstIフラグメントは、グルコアミラーゼ
mRNAの140bp3′非翻訳部+540bpの3′〜ポ
リ(A)付加部位をコードする領域を含む。XbaIリ
ンカーの添加及びXbaI制限酵素による消化の前、こ
の3′フラグメントをT4−DNAポリマラーゼにより
処理し、その制限部位を“ブラント末端”にした。この
グルコアミラーゼ遺伝子の3′末端を、XbaIにより
線状にされたpUC13に連結し、グルコアミラーゼ遺
伝子poly(A)付加領域を含むプラスミドpAMG
/Termを得た。 【0064】III .プラスミドpMT837の構成。 プロモーター及びグルコアミラーゼ(AMG)シグナル
及びリーダーペプチドをコードする配列を含むpCAM
G91の0.5KbのSmaII−BssHIIフラグメント
を、SmaI−BamHIにより消化されたpUC13
及びプロキモシンの最初の6個のアミノ酸をコードする
合成BssHII−BamHIアダプターに連結した。こ
の得られたプラスミド、pMT626から、0.8Kbの
NdeI−BamHIフラグメントを単離し、そしてp
roCのN末端半分についての配列を含むp285′p
roCからの0.5KbのBamHI−EcoRIフラグ
メント及びproCについての配列のC末端部を含むp
MT622の3.0KbのEcoRI−NdeIフラグメ
ントに連結した。(pMT622は単に、pUC13に
おいてp285′proCのEcoRI−XbaIサブ
クローンである)。その得られたプラスミドpMT64
8(第4図を参照のこと)は、完全なプロキモシン遺伝
子、その先にAMGプロモーター及びシグナル/リーダ
ーコード配列を含む。pMT648は、A.ニジュラン
スのargB遺伝子を含むようにさらに変性された(参
照51)。1.8KbのNarI−フィルインされたpM
T648のXbaIフラグメントを、6.8KbのCla
I−フィルインされたpSal43のEcoRIフラグ
メントに連結し、pMT651を得た。AMGプロモー
ターのさらに上流の配列(上流の活性化配列;UAS)
をさらに挿入した。これは、元のクローンpCAMG9
1からの3.7KbのClaI−BssHIIフラグメント
を、proC配列を含むpMT648からの1.1Kbの
BssHII−フィルインされたXbaIフラグメント及
びpMT813からの3.1KbのClaI−フィルイン
されたEcoRIフラグメントとしてargB遺伝子
(pMT813は、EcoRV−BglIIにより切断さ
れたpiC19R中にクローンされた3.1KbのBam
HI−NruIフラグメントとしてクローンされたar
gB遺伝子である)に連結することによって達成され
た。その得られたプラスミドpMT830は、AMGか
らのUAS、プロモーター、シグナル及びリーダー配列
及びproCのための完全な遺伝子を含む発現ユニット
を有する。最後に、AMGのターミネーター配列は、プ
ラスミドpAMG/Termから0.6KbのXbaI−
XbaIフラグメントとして取られ、そしてXbaIに
より切断され、そして脱リン酸化されたpMT830中
に挿入され、pMT837が得られた。pMT837の
構成が第5図に例示される。 【0065】例 8 pMT837を用いてキモシンの産生。 T.リーセイ株QM9414及びRUT−C−30を、
プラスミドpMT837及びp3SR2により同時形質
転換した。プラスミドpMT837は、プロキモシン遺
伝子の先にAMGプロモーター及びシグナル/リーダー
配列を含む。プラスミドpMT837の構成法は例7に
記載されている(また第3〜5図を参照のこと)。同時
形質転換及び選択を例5におけるようにして行なった。 【0066】キモシン産生のためには、1%Solka
flocセルロース及び0.2%プロテオースペプト
ンを含む最少培地上で形質転換体を培養した。その菌糸
体を集め、そして必要な場合、TCA沈殿法によってそ
の上清液を濃縮し、そして2MのNaOH、10mMのT
ris溶液(pH8.5)中に希釈した。そのサンプルを
SDS−ページ(7.5%〜15%のポリアクリルアミ
ドグラジェント)上で分別し、そしてニトロセルロース
フィルターにエレクトロブロットした。そのフィルター
を、ウサギプロキモシン抗血清と共にインキュベート
し、そしてシグマから購入されたα−ウサギ−IgG−
ペルオキシダーゼ接合体を用いて4−クロロ−1−ナフ
トールにより染色した。 【0067】キモシンは、およそ1μg/lのレベルで
培地中に分泌されることを示された。AMGプロモータ
ーは、明らかにT.リーセイにおいて非能率的に機能す
るので、相同のT.リーセイプロモーター−ターミネー
ターベクターが、キモシンの産生レベルを改良するため
に構成された。 【0068】例 9 cbh1プロモーターを用いて、T.リーセイ中におい
て子牛プロキモシンの産生のための異質発現ベクターの
構成。 I.cbh1ターミネーター領域へのプロキモシン遺伝
子の連結。 子牛プロキモシン遺伝子を、プラスミドpR27から得
た(第6図)。ほとんど全体の遺伝子を含むPstI−
PstIフラグメント(約1110bp)を、従来の技法
によってアガロースゲルから単離し、そしてpUC19
のPst1部位に連結した。 【0069】このプラスミドをPstIにより一部消化
し、末端をS1ヌクレアーゼによりブラント化し、そし
てcbh1遺伝子(クレノウフラグメントによるブラン
ト末端)のAvaIIターミネーターフラグメント(〜7
50bp)をこのプラスミドに連結した。cbh1遺伝子
のターミネーター領域を、pBR322(参照24)中
にサブクローンされたcbh1cDNAの末端の1.8
KbBamHIフラグメントから得た。pUC19におい
て、cbh1遺伝子のターミネーター領域と連結したp
roCフラグメントを含むこのプラスミドをpAMH1
00(第7図)と言及した。 【0070】II.BglI−SacIIアダプターを用い
て、CBHIプロモーター領域及びプロキモシンコード
領域の融合。 プロキモシンのN−末端領域をコードするSacII−P
stIフラグメント(80bp)を、プラスミドpR27
(第6図を参照のこと)から単離した。ゲノムクローン
λ44Aからのcbh1プロモーター領域をまず、2.
8Kbの長さのEcoRI−EcoRIフラグメントとし
てpUC18(プラスミドpUA01、第8図)中にサ
ブクローンし、そして次に約2.2Kbの長さのEcoR
I−BglIフラグメントをこのサブクローンから単離
した。BglI部位は、cbh1遺伝子のシグナル配列
の中間に配置される。cbh1遺伝子のプロモーター及
びシグナルペプチドのコード領域の約半分を含む、約
2.2Kbの長さのEcoRI−BglIフラグメントの
約80bpのSacII−PstIプロキモシン フラグメ
ントへの正確な連結は、BglI−SacIIアダプター
(NOR202+NOR203、第10図)によって仲
介される。アダプターと共にこれらのフラグメントを、
EcoRI−PstIにより消化されたpUC19中に
連結した。このプラスミドは、プロキモシンの第1アミ
ノ酸に融合されたCBHIの完全なシグナル配列、次に
そのN−末端配列のいくらかをコードする。最後に、こ
の構造体からEcoRI−pcbh1ss−proC−
PstIフラグメントを単離し、SalI及びPstI
により消化されたpAMH100中にその3′末端から
連結した。そのフラグメントの5′末端及びプラスミド
pAMH100のEcoRI末端をクレノウによりフィ
ルインし、そして連結した。cbh1遺伝子のプロモー
ター及びproC′フラグメントを、cbh1ターミネ
ーター領域の前の′proCの前に移した。この構成体
を、pAMH102(第11図)と名付けた。 【0071】III .クロモシン発現プラスミドへの選択
マーカーの付加。 発現プラスミドにおける選択マーカーとして、A.ニジ
ュランスのamdS遺伝子(参照42,30)又はA.
ニジュランスのargB遺伝子(参照48)のいづれか
を使用することができる。amdS遺伝子を、p3SR
2からPvuI−SalIフラグメントとして単離し、
そしてpAMH102の6Kbの長さのPvuI−Sal
Iフラグメントに連結する。この選択可能なベクター
を、pAMH104(第11図)として命名した。 【0072】IV.オリゴヌクレオチドを用いてcbh1
プロモーター及びプレプロキモシンコード酸列の正確な
融合。 プレプロキモシンのアミノ末端PstIフラグメント
(約150bp)を、pBR322においてPstI部位
に挿入されたATGから12bp上流で始まる、完全なプ
レプロキモシンcDNAクローンを含むpR26(第3
図)から単離した。このフラグメントを、pTZ19R
のポリリンカー中に、cbhI(第8図)のシグナル配
列のコードする領域も含む、cbhIEcoRI−Sa
cI(約2.6Kb)プロモーターフラグメントと共にサ
ブクローンした。cbhIEcoRI−SacIフラグ
メントを、元のλ44Aクローン(参照24)の、pU
C18(pUA01、第8図)における2.8KbのEc
oRI−EcoRIサブクローンから得た。pTZ19
R(Pharmacia)は、複製のF1起源及びオリ
ゴヌクレオチドの突然変異生成のために単鎖鋳型の使用
を可能にするT7プロモーターを含む、pUC19基礎
プラスミドである。この得られたプラスミド(pAMH
105)の構成法は第8図に例示されている。このプラ
スミドから、cbh1プロモーター領域とproC A
TGとの間の配列を、特定のオリゴヌクレオチド、OA
MH3(第10図)を用いてループ−突然変異生成によ
って削除した。オリゴヌクレオチド指図の突然変異生成
の実施は第9図に例示されている。問題のオリゴヌクレ
オチドをリン酸化し、それぞれモル比20:1でpAM
H105の単鎖DNA(参照60、単鎖DNAは、Ph
armaciaによって記載されているようにしてJM
103/pAMH105から単離された)にアニールし
た。オリゴヌクレオチド プライマーを、参照60に記
載しているようにしてクレノウポリマラーゼ及びT4リ
ガーゼを用いて延長した。その延長された混合物を、S
maI(pTZ19Rのポリリンカーに存在する、第9
図を参照のこと)により消化し、その後、E.コリのm
utL不適正修復欠失性株、BMH71.18中に形質
転換した。形質転換体のプールを、5mlの液体培養(1
00μg/mlのアンピシリンを含む、参照62に記載の
ようなLuriaブイヨン)中で1晩増殖した。プラス
ミドDNAを、形質転換体のプールから単離し、そして
それをSmaIにより再消化し、そしてE.コリJM1
09株中に再形質転換した。可能性ある欠失クローンの
スクリーニングを、異なった制限酵素を用いる消化によ
って行ない、そして欠失の特異性もさらに、配列決定す
ることによって確認した。その得られたプラスミドをp
AMH1101(第12図)と呼ぶ。このプラスミド
を、さらにEcoRI及びPstIにより消化し、そし
てその得られたpcbh1−preproCフラグメン
トを単離し(第14図)、そしてPstI及びSalI
により消化されたpAMH100プラスミドにそのPs
tI末端で連結した。その得られた連結フラグメントの
末端を、クレノウによってフラントし、そして連結し
た。その得られたプラスミドをpAMH101と呼び、
そしてそれは、プロキモシンのシグナル配列に融合され
たcbh1プロモーター及びcbh1遺伝子のターミネ
ーター領域に融合された全プロキモシンコード領域を含
む(第14図)。 【0073】V.オリゴヌクレオチドを用いることによ
って行なわれたシグナル配列融合による、cbh1プロ
モーター及びpreproC遺伝子の正確な融合。 前のチャプターIVに詳しく記載されたpAMH1101
の構成と本質的に同じようにしてプラスミドpAMH1
103(第12図)の構成を行なった。但し、この構成
のために使用された特異的オリゴヌクレオチドはOAM
H1(第10及び9図)であった。その得られたプラス
ミドpAMH1103は、proC遺伝子のコード領域
のアミノ末端部分(〜140bp)の先のpreproC
シグナル配列からのaa12〜16に融合された、cb
h1シグナル配列からのアミノ酸(aa)1〜12を含
むシグナル配列融合体を含む(第12図)。プラスミド
pAMH1103からのpcbh1−sso−pro
C′(0=融合)フラグメントを、本質的に前のチャプ
ターIVに記載しているようにしてpAMH100にサブ
クローンした(第12図を参照のこと)。この得られた
プラスミドpAMH103は、cbh1ターミネーター
領域に融合されたproCコード領域の先のcbh1の
プロモーター領域及びcbh1及びpreproCのシ
グナル配列融合体を含む。 【0074】VI.オリゴヌクレオチドを用いることによ
るproCコード領域へのcbh1コード領域の正確な
融合。 プラスミドpAMH1106(第13図)の構成を、本
質的に前のチャプターIVに詳しく記載されたpAMH1
101の構成と同じようにして行なった。但し、この構
成のために使用された特異的オリゴヌクレオチドはOA
MH2(第10及び9図)であった。cbh1のプロモ
ーター領域、cbh1のシグナル配列及びproCのコ
ード領域に融合された、成熟CBHIの初めの1〜20
のaaのコード領域を含むその得られたプラスミドpA
MH1106からの、pcbh1成熟o−proC′を
含むフラグメントを、本質的に前のチャプターIVに記載
しているようにしてpAMH100中にサブクローンし
た(第12図)。その得られたプラスミドpAMH10
6は、cbh1のプロモーター領域、cbh1のシグナ
ル配列、proCのコード領域に融合された成熟CBH
Iのアミノ酸1〜20のコード領域を含む。 【0075】例10 pAMH102及びpAMH104 を用いてキモシンの産
生。 T.リーセイ株QM9414及びRUT−C−30を、
それぞれ5:1のモル比でプラスミドpAMH102及
びp3SR2により同時形質転換した。プラスミドpA
MH102の構成法は例9のチャプターIIに記載され
た。同時形質転換及び選択を例5におけるようにして行
なった。その形質転換体を、例3に記載されたようにし
て、選択性アセトアミドプレート上で精製した。 【0076】キモシン産生のために、形質転換体を、1
%Solk flocセルロース及び0.2%プロテオ
ースペプトンを含む最少培地(10〜50ml)上で培養
した。その菌糸体を集め、そしてその上清液をTCA沈
殿法によって濃縮し、そして2MのNaOH、10mMの
Tris(pH8.5)の溶液中に希釈した。その菌糸体
を液体窒素の存在下で破壊し、その破壊された細胞をペ
レット化し、そしてその上清液を、前記培養培地と同じ
方法で処理した。そのサンプルを、SDS−page
(7.5%〜15%のポリアクリルアミド グラジェン
ト)上で画分し、そしてニトロセルロースフィルターに
エレクトロブロットした。そのフィルターを、ウサギプ
ロキモシン抗血清及びα−ウサギ−IgG−AP(アル
カリホスファターゼ)接合体と共にインキュベートし、
そしてPromega Biotecから購入されたニ
トロプルーテトラゾリウム及び5−ブロモ−4−クロロ
−3−インドリルにより染色した。菌糸体の内部及び外
部のキモシンの量を比較した(第17図)。菌糸染色体
DNA中に組込まれたプラスミドpAMH102の高い
数のコピィーを含むクローンがまたよりキモシンを産生
したことが、サザンハイブリダイゼーションによって示
された。1つのコピィーの形質転換体を用いる場合、分
泌されたキモシンの量は1lの培養培地当り100μg
であった(ウェスターンゲルから近づいた場合)(第1
7図)。分泌されたプロキモシンは、ウェスターンゲル
によって及び凝乳活性(β−カセイン決定基の切断によ
るキモシン凝乳)によって活性キモシンにプロセスされ
ることが示された(参照63)。菌糸体の内部の種々の
形のキモシン(preproC,proC,C及び細胞
の内部の分解生成物に由来したキモシン)の量は、菌糸
体の合計タンパク質の0.04%であることが測定され
(第17図)、そして分泌されたキモシンの量は、産生
された合計キモシンの60%であった。これは、菌糸体
の外部でさえ異質遺伝子生成物を分泌するT.リーセイ
の能力を示す。 【0077】プラスミドpAMH104(第11図)の
いくつかのコピィーを有する形質転換体(多量のプロキ
モシンを分泌できる)を、増殖培地の凝乳活性を決定す
ることによって、スクリーンした。研究された40のう
ち最良の形質転換体は、ウェスターンゲル上で及び凝乳
活性によって測定される場合、培養培地1l当り500
μgを分泌することが見出された。 【0078】培養物が小規模な培養(10〜50ml)と
比べて、51ラボラトリィファーメンター中において増
殖される場合、分泌される、活性キモシンの量は、20
0倍増大されるので、この型の菌株によって産生された
キモシンの量は、約100mg/lである。 【0079】例11 T.リーセイにおける同質及び異質のタンパク質の産生
のための一般的発現ベクターの構成。 T.リーセイにおいて種々のタンパク質の産生のための
ベクターを構成するために、cbh1遺伝子のプロモー
ター及びターミネーター領域を含む一般的発現ベクター
を構成した。cbh1ターミネーターを、3個の読み枠
が整合してSTOPコドンTAAを含むアダプターと共
に、pUC19のpstI部位にサブクローンし、プラ
スミドpAMH110′(第15図)を得た。pstI
ターミネーターフラグメントをpAMH110′から単
離し、cbh1プロモーターを、proC遺伝子のアミ
ノ末端を含むEcoRI−PstIフラグメントとして
pAMH102から単離し、そしてこれらのフラグメン
トを、EcoRI−PstIにより消化されたpUC1
9* (これから、このサブクローン段階の前、1つのN
deI部位がクレノウによりブラントされた)中にサブ
クローンした。その得られたプラスミドpAMH110
は、cbh1遺伝子のプロモーター及びターミネーター
及びこれらの配列の間に、SacII及びNdeIによる
消化によって除去され得るスタファー(stuffe
r)フラグメントを含む。末端がブラントされた後、遺
伝子のcDNA又は染色体コピィーを、プロモーター及
びターミネーターの間に挿入することができる(第15
図)。 【0080】例12 cbh1プロモーター下でT.リーセイエンドグルカナ
ーゼIの発現。 産生されるエンドグルカナーゼの量を増大せしめるため
に、egl1遺伝子を、より強力なcbh1プロモータ
ーに連結した。T.リーセイエンドグルカナーゼIのた
めのcDNAを、スタファーフラグメントを削除するた
めにまずSacII−NdeIにより消化された一般的な
発現ベクターpAMH110(例11に記載された)中
にEcoRI−BamHIフラグメントとしてサブクロ
ーンした(第16図)。cbh1遺伝子のプロモーター
及びターミネーターの間にegl1遺伝子を含む、その
得られたプラスミドpAMH111を、それぞれ5:1
のモル比でp3SR2と共に、T.リーセイQM941
4(ATCC 26921)に同時形質転換した。形質
転換体を、Amds+ 表現型について選択し、そしてさ
らに選択培地上で精製した。6個の個々の形質転換体
を、50mlの液体培養において、セルラーゼ含有培地
(炭素源としてSolka floc,1%)中で4日
間、増殖せしめた。次にその培養上清液を、ヒドロキシ
エチルセルロース(0.1%、参照12)からの還元性
糖の放出を測定することによってエンドグルカナーゼ活
性について試験した。形質転換体のEGI活性を対照
(QM9414)と比較し、そして最良の形質転換体
は、対照菌株のエンドグルカナーゼ活性の4倍分泌する
ことが示された。この例は、それぞれのプロモーターを
変えることによって、T.リーセイにおいて、異なった
セルロース分解酵素の量を調整することが可能であるこ
とを示す。 【0081】参考文献 1.Simmons, E.G., いくつかのセルラーゼ産生トリコ
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【図面の簡単な説明】
【図1】これは、染色体セルラーゼ遺伝子の不活性化の
原理を示す。 【図2】これは、T.リーセイの染色体CBHI遺伝子
座の挿入突然変異生成のために使用されるプラスミドp
MS4の構成を示す。EcoRI部位の不活性化によっ
て生成されたフレームシフト突然変異の位置は*により
マークされている。 【図3】これは、プラスミドp285′proCの構成
法を示す。 【図4】これは、プラスミドpMT648及び15pM
T813の構成法を示す。 【図5】これは、プラスミドpMT837の構成法を示
す。 【図6】これは、プラスミドpR27の制限地図を示
す。 【図7】これは、プラスミドpAMH100の制限地図
を示す。 【図8】これは、プラスミドpAMH105の構成法を
示す。 【図9】これは、合成されたオリゴヌクレオチド、OA
MH1,OAMH2及びOAMH3を用いてループ−突
然変異生成することによるプラスミドpAMH110
3,pAMH1106及びpAMH1101の構成法を
示す。 【図10】これは、リンカーNOR202,NOR20
3,OAMH1,OAMH2及びOAMH3を示す。 【図11】これは、プラスミドpAMH102及びpA
MH104の制限地図を示す。 【図12】これは、プラスミドpAMH1103の制限
地図及びpAMH103の構成法を示す。 【図13】これは、プラスミドpAMH1106の制限
地図及びpAMH106の構成法を示す。 【図14】これは、プラスミドpAMH1101の制限
地図及びpAMH101の構成法を示す。 【図15】これは、プラスミドpAMH110の構成法
を示す。 【図16】これは、CGHIプロモーター機能下でEG
Iの発現のために使用されるプラスミドpAMH111
の構成法を示す。 【図17】これは、T.リーセイにおけるキモシンの発
現を示す。ウェスターンブロットレーン1;精製された
プロキモシンの対照、微量のプスウドウキモシン及びキ
モシンを含む、レーン2;pAMH102を含む株の増
殖からの培養上清液、レーン3;プラスミドを含まない
株からの培養上清液、レーン4;pAMH102を含む
株からの菌糸体。これは、図面に代わる写真である。
原理を示す。 【図2】これは、T.リーセイの染色体CBHI遺伝子
座の挿入突然変異生成のために使用されるプラスミドp
MS4の構成を示す。EcoRI部位の不活性化によっ
て生成されたフレームシフト突然変異の位置は*により
マークされている。 【図3】これは、プラスミドp285′proCの構成
法を示す。 【図4】これは、プラスミドpMT648及び15pM
T813の構成法を示す。 【図5】これは、プラスミドpMT837の構成法を示
す。 【図6】これは、プラスミドpR27の制限地図を示
す。 【図7】これは、プラスミドpAMH100の制限地図
を示す。 【図8】これは、プラスミドpAMH105の構成法を
示す。 【図9】これは、合成されたオリゴヌクレオチド、OA
MH1,OAMH2及びOAMH3を用いてループ−突
然変異生成することによるプラスミドpAMH110
3,pAMH1106及びpAMH1101の構成法を
示す。 【図10】これは、リンカーNOR202,NOR20
3,OAMH1,OAMH2及びOAMH3を示す。 【図11】これは、プラスミドpAMH102及びpA
MH104の制限地図を示す。 【図12】これは、プラスミドpAMH1103の制限
地図及びpAMH103の構成法を示す。 【図13】これは、プラスミドpAMH1106の制限
地図及びpAMH106の構成法を示す。 【図14】これは、プラスミドpAMH1101の制限
地図及びpAMH101の構成法を示す。 【図15】これは、プラスミドpAMH110の構成法
を示す。 【図16】これは、CGHIプロモーター機能下でEG
Iの発現のために使用されるプラスミドpAMH111
の構成法を示す。 【図17】これは、T.リーセイにおけるキモシンの発
現を示す。ウェスターンブロットレーン1;精製された
プロキモシンの対照、微量のプスウドウキモシン及びキ
モシンを含む、レーン2;pAMH102を含む株の増
殖からの培養上清液、レーン3;プラスミドを含まない
株からの培養上清液、レーン4;pAMH102を含む
株からの菌糸体。これは、図面に代わる写真である。
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(51)Int.Cl.6 識別記号 FI
C12R 1:885)
(C12P 21/00
C12R 1:885)
(72)発明者 メルヤ ペントティレ
フィンランド国,00390 ヘルシンキ,
ファンハ ヘムゼンキレンティー,5−
7アー
(72)発明者 モゲンズ トリエル ハンセン
デンマーク国,デーコー−3650 エール
スティゲ,ビンケルベイ 21
(56)参考文献 特開 昭62−175183(JP,A)
GENE,VOL.36,NO.3,
(1985)P.321−331
(58)調査した分野(Int.Cl.6,DB名)
C12N 15/09
BIOSIS(DIALOG)
WPI(DIALOG)
Claims (1)
- (57)【特許請求の範囲】 1.トリコダーマ(Trichoderma)において
タンパク質生成物を産生するための方法であって、 a)目的とするタンパク質生成物をコードする遺伝子、 b)目的とする生成物の発現を制御するために機能可能
的に前記遺伝子に結合されたプロモーター/エンハンサ
ーを含んで成るDNA配列を含む遺伝子発現を促進する
機能、及び c)安定したトリコダーマ形質転換体を選択できる選択
マーカーを含んで成る菌株を適切な培養培地中で培養
し、そして分泌されたタンパク質生成物を前記培養培地
から回収する方法。 2.トリコダーマにおいてタンパク質生成物を産生する
ための方法であって、 a)目的とするタンパク質生成物をコードする遺伝子、 b)目的とする生成物の発現を制御するために機能可能
的に前記遺伝子に結合されたプロモーター/エンハンサ
ーを含んで成るDNA配列を含む遺伝子発現を促進する
機能、及び c)安定性トリコダーマ形質転換体を選択できる選択マ
ーカーを含んで成る、形質転換された適切な安定性宿主
微生物を適切な培養培地中で培養し、そして分泌された
タンパク質生成物を前記培養培地から回収することを含
んで成る方法。 3.前記宿主微生物が原栄養性T.リーセイ菌株である
特許請求の範囲第1又は2項記載の方法。 4.前記宿主微生物が栄養要求性T.リーセイ菌株であ
る特許請求の範囲第1又は2項記載の方法。 5.前記宿主菌株が目的としない生成物をコードするい
づれの遺伝子も欠失している特許請求の範囲第1〜4項
のいづれか1項記載の方法。 6.前記宿主株がcbhI遺伝子を欠失している特許請
求の範囲第5項記載の方法。
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