TWI454480B - 催乳激素受體(prlr)之專一性抗體及其用途 - Google Patents

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Jason Damiano
Mohammad Luqman
Linda Masat
Amer Mirza
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Description

催乳激素受體(PRLR)之專一性抗體及其用途
本發明係關於藉由投與催乳激素受體(PRLR)之專一性抗體來預防及治療癌症之方法。
癌症在美國為第二主要死因。儘管"癌症"係用以描述許多不同類型之癌症,亦即,乳癌、前列腺癌、肺癌、結腸癌、胰腺癌,但是癌症之各個類型在表型水平及遺傳水平上不同。當一或多種基因之表現由於突變而變得不正常,且細胞生長不能再受控制時,癌症之未經調節之生長特徵發生。
基因常分成2個種類,即癌基因及腫瘤抑制基因。癌基因為其正常功能為促進細胞生長,但僅在特定條件下促進細胞生長之基因。當癌基因獲得突變且隨後失去彼控制時,其在所有條件下促進生長。然而,已發現,對欲成為真正成功之癌症而言,癌症必須亦獲得腫瘤抑制基因之突變。腫瘤抑制基因之正常功能為停止細胞生長。腫瘤抑制基因之實例包括p53、p16、p21及APC,當正常作用時,其全部停止細胞不可控制之分開及生長。當腫瘤抑制基因突變或損失時,對細胞生長之制動亦損失,使細胞現能生長而無限制。
催乳激素受體(PRLR)為單膜跨越類1細胞激素受體,其與細胞激素總科之成員之受體,諸如IL2、IL3、IL4、IL6、IL7、紅血球生成素及GM-CSF之受體同源。PRLR涉及多種生物學功能,包括細胞生長、分化、發展、泌乳及再生。其不具有內在酪胺酸激酶活性;配位體結合導致受體二聚、Jak2之交叉磷酸化及下游信號傳輸。人類催乳激素受體cDNA最初係自肝癌及乳癌庫分離(Boutin,J.-M.等人,Molec.Endocr.3:1455-1461,1989)。核苷酸序列預測具有比大鼠肝PRL受體長更多之細胞質域的598個胺基酸之成熟蛋白質。催乳激素受體基因駐留於與生長激素受體基因相同之染色體區域中,其已映射至5;13-p12(Arden,K.C.等人Cytogenet.Cell Gene 53:161-165,1990;Arden,K.C.等人,(摘要)AM.J.Hum.Genet.45(補充):僅A129,1989)。生長激素亦結合於催乳激素受體且活化該受體。
已測定人類PRLR基因之染色體組組織(Hu,Z.-Z.等人,J.Clin.Endocr.Metab.84:1153-1156,1999)。PRLR基因之5-第一-未轉譯區域含有2種替代性第一外顯子:E13,即大鼠及小鼠E13之人類對應物,及稱為E1N之新穎人類類型之替代性第一外顯子。5-第一-未轉譯區域亦含有常見非編碼外顯子2及外顯子3之部分,其含有轉譯起始密碼子。E13及E1N外顯子係在彼此之800個鹼基對內。該2種外顯子係表現於人類乳房組織、乳癌細胞、性腺及肝中。總體上,含有E13之轉錄物普遍存在於大多數組織中。PRLR基因產物係藉由外顯子3-10來編碼,其中外顯子10編碼大部分細胞內域。E13及E1N外顯子係分別自替代性啟動子PIII及PN轉錄。PIII啟動子含有與齧齒動物啟動子中之彼等者相同之Sp1及C/EBP元素,且81%相似於大鼠及小鼠中之區域-480/-106。PN啟動子含有用於ETS家族蛋白質之推定結合位點及用於核受體之半位點。
PRLR以許多不同同功異型物而存在,該等同功異型物在其細胞質域之長度上不同。已經證明4種PRLR mRNA同功異型物(L、I、S1a及S1b)係在人類皮下腹部脂肪組織及乳房脂肪組織中(Ling,C.等人,J.Clin.Endocr.Metab.88:1804-1808,2003)。另外,其使用免疫墨點分析偵測到在人類皮下腹部脂肪組織及乳房脂肪組織中之L-PRLR及I-PRLR蛋白質表現。與對照組比較,PRL降低人類脂肪組織中之脂蛋白脂肪酶活性。Ling等人暗示,該等結果證明PRL經由功能性PRLR在降低人類脂肪組織中之LPL活性中之直接效應,且該等結果暗示LPL亦可在泌乳期間以該方式來調節。已經說明該等PRLR同功異型物在大鼠中之功能(Perrot-Applanat,M.等人,Molec.Endocr.11:1020-1032,1997)。如同已知之長形式(591個胺基酸),缺乏細胞質域之198個胺基酸之Nb2形式能夠傳輸催乳信號。相反,缺乏細胞質域之291個胺基酸之短形式為非活性的。在長形式及短形式之共轉染後,檢查短形式之功能。該等結果展示,短形式經由非活性異源二聚體之形成而擔當顯性-負性抑制劑,產生Janus激酶2活化之抑制。Perrot-Applanat等人暗示,PRLR之異源二聚作用可積極或消極地活化PRL轉錄。
近期報導已暗示,PRLR過度表現於人類乳癌及前列腺癌組織中(Li等人,Cancer Res.,64:4774-4782,2004;Gill等人,J Clin Pathol.,54:956-960,2001;Touraine等人,J Clin Endocrinol Metab.,83:667-674,1998)。Li等人報導,在54%之前列腺癌試樣中,Stat5活化及PRLR表現係與高組織學級別相關(Li等人,同上)。其他報導已暗示,在菌落形成分析中,原發性乳癌試樣對PRL起反應,且血漿PRL濃度與乳癌風險有關(Tworoger等人,Cancer Res.,64:6814-6819,2004;Tworoger等人,Cancer Res.,66:2476-2482,2006)。另一報導指示,PRL轉殖基因小鼠發展惡性乳腺癌瘤或前列腺增生(Wennbo等人,J Clin Invest.,100:2744-2751,1997;Wennbo等人,Endocrinology,138:4410-4415,1997)。
PRLR單株抗體降低小鼠中之乳腺腫瘤發生率(Sissom等人,Am.J.Pathol.133:589-595,1988)。另外,PRL拮抗劑(S179D突變體PRL)抑制人類前列腺癌瘤細胞株、DU-145之活體外增殖及DU-145誘導之腫瘤之活體內增殖(Xu等人,Cancer Res.,61:6098-6104,2001)。
因此,存在對識別調節PRLR及其在該等癌症中之作用之組合物及方法的需要。本發明係針對該等需要以及其他重要需要。
PRLR之核苷酸序列陳列於SEQ ID NO:1中,且胺基酸序列陳列於SEQ ID NO:2中。細胞外域(ECD)由SEQ ID NO:2之胺基酸25至234組成,其可分成2個主要域,即S1(胺基酸25-122)及S2(胺基酸123-234)。已經識別PRLR之許多不同同功異型物:長形式(L)、中間形式(I)、△S1、非活性可溶形式(PRLBP)及非活性短形式S1a及S1b。含在各同功異型物中之外顯子及核苷酸區域顯示於圖1中。在示範性實施例中,本發明涵蓋結合於S1域及/或S2域之抗體。結合於S2域之該等抗體可靶向所有活性同功異型物。本發明亦涵蓋專一地結合於一種同功異型物且不結合另一種(例如,結合中間形式且不結合S1a或S1b)之抗體,或結合於活性同功異型物(長形式、中間形式及△S1)但不結合於非活性同功異型物(S1a及S1b)之抗體。
本發明之物質及方法實現此項技術中之上述需要及其他相關需要。
在一實施例中,提供以10-6 M或更低之平衡解離常數(KD )結合PRLR之細胞外域且與以下抗體之任何抗體競爭對PRLR超過75%之結合之抗體:chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189或XHA.06.907。就術語"10-6 M或更低之平衡解離常數(KD )"而言,其意謂(例如)10-6 、10-7 M、10-8 M、10-9 M、10-10 M、10-11 M或10-12 M(亦即,小於10-6 M之數)之平衡解離常數。在另一實施例中,抗體結合於與以下抗體之任何抗體相同之PRLR的抗原決定基:chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189或XHA.06.907。
在另一實施例中,上述抗體包含以下抗體之任何抗體之1、2、3、4、5或6個CDR:chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189或XHA.06.907。在另一實施例中,上述抗體為嵌合抗體、人化抗體、人類工程化抗體、人類抗體、單鏈抗體或抗體片段。在另一實施例中,提供其中CDR內之至少一個胺基酸經另一抗PRLR抗體的相應CDR之相應殘基取代之上述抗體。在一示範性實施例中,提供其中來自選自由以下者組成之群之抗體的CDR內之至少一個胺基酸經另一抗PRLR抗體之相應CDR之相應殘基取代的上述抗體:chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189或XHA.06.907。在另一示範性實施例中,提供其中來自選自由以下者組成之群之抗體的CDR內之至少一個胺基酸經另一抗體之相應CDR之相應殘基取代的上述抗體:chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189或XHA.06.907,該另一抗體係選自由以下者組成之群:chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189或XHA.06.907。在另一實施例中,提供其中CDR內之一或兩個胺基酸經修飾之上述抗體。
在本發明之另一實施例中,提供在輕鏈或重鏈可變區範圍內保留與以下抗體之至少60、65、70、75、80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98或99%一致性的上述抗體:chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189或XHA.06.907。
在另一實施例中,上述抗體包含人類抗體序列之恆定區及人類抗體序列之一或多個重鏈及輕鏈可變構架區。在本發明之另一實施例中,提供其中人類抗體序列為個別人類序列、人類一致序列、個別人類生殖系序列或人類一致生殖系序列之上述抗體。
在另一實施例中,提供其中重鏈恆定區為經修飾或未經修飾之IgG、IgM、IgA、IgD、IgE、其片段或其組合之上述抗體。在另一實施例中,提供其中重鏈恆定區為經修飾或未經修飾IgG1、IgG2、IgG3或IgG4之上述抗體。在另一實施例中,提供具有對PRLR之10-6 、10-7 、10-8 或10-9 M或更低之平衡解離常數的上述抗體。在另一實施例中,提供包含CDR之保守取代之上述抗體。在另一實施例中,提供包含低風險及中等風險殘基之保守或非保守改變之上述抗體。在另一實施例中,提供其中輕鏈恆定區為經修飾或未經修飾之λ輕鏈恆定區、輕鏈恆定區、其片段或其組合之上述抗體。
在另一實施例中,提供上述抗體,其抑制PRLR二聚,抑制PRLR細胞內磷酸化,抑制MAPK磷酸化之誘導,抑制Stat5磷酸化之誘導,抑制AKT磷酸化之誘導及/或抑制PRL與PRLR之結合。
在其他實施例中,上述抗體另外抑制VEGF產生及/或血管生成。
在另一實施例中,提供抑制癌細胞之增殖之上述抗體。在另一實施例中,抗體抑制乳癌、前列腺癌或肺癌細胞之增殖。
除癌症外,本發明之另一實施例提供用於預防及/或治療自體免疫及發炎性疾病或病症之上述抗體。抗體尤其適用於預防、改善或治療包含自體免疫及/或發炎性組分之疾病。該等疾病包括(但不限於)自體免疫及發炎性疾病,諸如全身性紅斑狼瘡(SLE),盤狀狼瘡,狼瘡腎炎,類肉瘤病,包括(但不限於)青少年關節炎、類風濕性關節炎、牛皮癬性關節炎、雷特氏症候群(Reiter's syndrome)、強直性脊椎炎及痛風性關節炎之發炎性關節炎,器官或組織移植之排斥反應,超急性、急性或慢性排斥反應及/或移植物抗宿主疾病,多發性硬化症,高IgE症候群,結節性多動脈炎,原發性膽汁性肝硬化症,發炎性腸道疾病,克隆氏病(Crohn's disease),腹腔疾病(麩酪素-敏感性腸病),自體免疫肝炎,惡性貧血,自體免疫性溶血性貧血,牛皮癬、硬皮病、重症肌無力,自體免疫性血小板減少性紫癜、自體免疫甲狀腺炎,格雷夫氏疾病(Grave's disease),橋本氏甲狀腺炎,免疫複合病,慢性疲勞免疫功能障礙症候群(CFIDS),多肌炎及皮肌炎,冷凝球蛋白血症,血栓溶解(thrombolysis),心肌症,尋常天疱瘡,肺間質纖維化,I型及II型糖尿病,1、2、3及4型延遲型過敏,過敏症或過敏性疾患,對治療性蛋白質之不需要/不欲之免疫反應,哮喘,徹奇-斯全司症候群(Churg-Strauss syndrome)(過敏性肉芽腫),異位性皮膚炎,過敏及刺激接觸性皮炎,癮疹(urtecaria),IgE介導之過敏症,動脈粥樣硬化,脈管炎,特發性發炎性肌病,溶血性疾病,阿茲海默症(Alzheimer's disease),慢性發炎性髓鞘脫失多發性神經病及其類似疾病。
在另一實施例中,提供與另一診斷劑或治療劑結合之上述抗體。
在另一實施例中,提供篩選適用於治療癌症之PRLR蛋白質之細胞外域的抗體之方法,其包含之步驟為:使包含PRLR之ECD之多肽與含有以下抗體之至少1、2、3、4、5或6個CDR之候選抗體接觸:chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189及XHA.06.907;偵測候選抗體與多肽之結合親和力,及若偵測到10-6 M或更低之平衡解離常數,則將該候選抗體識別為適用於治療癌症之抗體。
在另一實施例中,提供系統地改變抗體及篩選適用於治療癌症之PRLR蛋白質的細胞外域之抗體之方法,其包含之步驟為:製備含有對以下抗體之CDR內之一或兩個胺基酸的修飾之候選抗體:chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189及XHA.06.907;使包含PRLR之ECD之多肽與該候選抗體接觸;偵測候選抗體與多肽之結合親和力;及若偵測到10-6 M或更低之平衡解離常數,則將該候選抗體識別為適用於治療癌症之抗體。
在另一實施例中,提供篩選適用於治療癌症之PRLR蛋白質之細胞外域的抗體之方法,其包含之步驟為:使乳房、肺或前列腺細胞與含有以下抗體之至少1、2、3、4、5或6個CDR之候選抗體接觸:chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189及XHA.06.907或含有一或多個CDR內之一或兩個胺基酸之修飾的抗體;偵測該細胞之增殖或存活;及若偵測到細胞增殖或存活之降低,則將該候選抗體識別為適用於治療癌症之抗體。
在另一實施例中,提供治療遭受癌症之受檢者,包括遭受0、I、II、III、IV或V階段癌症之受檢者之方法,其包含投與呈治療有效量之上述抗體之步驟。在一相關實施例中,癌症為乳癌、肺癌或前列腺癌。在另一實施例中,投與第二治療劑。在一示範性實施例中,第二治療劑為阿黴素(doxorubicin)、道諾黴素(daunorubicin)或其他蒽環黴素(anthracycline)或拓撲異構酶(topoisomerase)抑制劑。在其他實施例中,上述拓撲異構酶抑制劑之任何者係與chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4一起投與。在另一實施例中,另外用輻射療法或手術治療受檢者。在本發明之另一實施例中,受檢者對PRLR表現及HER2-neu表現而言為陽性的,且其中該第二治療劑為抗Her2-neu抗體。在一相關實施例中,受檢者對PRLR表現及ER表現而言為陽性的,且其中該第二治療劑為抗ER抗體。在另一實施例中,本發明提供適用於醫學,包括適用於治療癌症之本發明之抗體。在其他實施例中,本發明提供本發明之抗體在製造用於治療癌症之藥劑中的用途。藥劑可與第二治療劑組合及/或與輻射療法組合來投與至患者。
在本發明之另一實施例中,提供靶向表現PRLR之腫瘤細胞之方法,其包含投與結合於放射性核種或其他毒素之上述抗體之步驟。在另一實施例中,受檢者為哺乳動物。在另一實施例中,受檢者為人類。
在另一實施例中,提供包含編碼上述抗體之重鏈或輕鏈之核苷酸序列之經分離核酸分子。在另一實施例中,提供表現載體,其包含可操作連接於調節控制序列之上述核酸分子。在另一實施例中,提供宿主細胞,其包含上述載體或上述核酸分子。
在另一實施例中,提供使用上述宿主細胞來產生抗體之方法,其包含在適合條件下培養宿主細胞且回收該抗體。在另一實施例中,提供藉由上述方法產生之抗體。
在另一實施例中,提供純化至至少95重量%均質性之上述抗體。在另一實施例中,提供醫藥組合物,其包含上述抗體及醫藥學上可接受之載劑。
在另一實施例中,提供包含包括封裝於容器中之治療有效量之本發明的抗體之上述抗體之套組,該套組視情況含有第二治療劑且另外包含附著於容器或與容器一起封裝之標籤,該標籤描述容器之內含物且提供關於使用容器之內含物來治療癌症之指示及/或說明書。在另一實施例中,提供其中容器為小瓶或瓶子或預填充注射器之套組。
在本發明之另一實施例中,提供結合PRLR之細胞外域之抗體,其包含選自由以下者組成之群之可變輕鏈胺基酸序列:SEQ ID NO:21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、82、84、86、88、91、95及96。在另一實施例中,提供結合PRLR之細胞外域之抗體,其包含選自由以下者組成之群之可變重鏈胺基酸序列:SEQ ID NO:20、2、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、83、85、87、89、90、93、94、97及98。在另一實施例中,提供結合PRLR之細胞外域之抗體,其包含可變輕鏈胺基酸序列SEQ ID NO:88及SEQ ID NO:89之可變重鏈胺基酸序列。在另一實施例中,提供結合PRLR之細胞外域之抗體,其包含可變輕鏈胺基酸序列SEQ ID NO:88及SEQ ID NO:90之可變重鏈胺基酸序列。
在本發明之另一實施例中,提供結合PRLR之細胞外域之抗體,其包含SEQ ID NO:91之可變輕鏈胺基酸序列及SEQ ID NO:93之可變重鏈胺基酸序列。在另一實施例中,提供結合PRLR之細胞外域之抗體,其包含SEQ ID NO:91之可變輕鏈胺基酸序列及SEQ ID NO:94之可變重鏈胺基酸序列。在另一實施例中,提供結合PRLR之細胞外域之抗體,其包含SEQ ID NO:92之可變輕鏈胺基酸序列及SEQ ID NO:93之可變重鏈胺基酸序列。在本發明之另一實施例中,提供結合PRLR之細胞外域之抗體,其包含SEQ ID NO:92之可變輕鏈胺基酸序列及SEQ ID NO:94之可變重鏈胺基酸序列。
在本發明之另一實施例中,提供結合PRLR之細胞外域之抗體,其包含SEQ ID NO:95之可變輕鏈胺基酸序列及SEQ ID NO:97之可變重鏈胺基酸序列。在另一實施例中,提供結合PRLR之細胞外域之抗體,其包含SEQ ID NO:95之可變輕鏈胺基酸序列及SEQ ID NO:98之可變重鏈胺基酸序列。在另一實施例中,提供結合PRLR之細胞外域之抗體,其包含SEQ ID NO:96之可變輕鏈胺基酸序列及SEQ ID NO:97之可變重鏈胺基酸序列。在另一實施例中,提供結合PRLR之細胞外域之抗體,其包含SEQ ID NO:96之可變輕鏈胺基酸序列及SEQ ID NO:98之可變重鏈胺基酸序列。
在本發明之另一實施例中,提供結合人類PRLR之細胞外域之抗體,其以比鼠類PRLR之細胞外域低至少10至25,000倍、100至20,000倍、1,000至18,000倍、5,000至17,000倍、8,000至16,000倍、10,000至15,000倍、12,000至15,000倍或13,000至14,000倍之KD來結合。在一相關實施例中,上述抗體結合與he.06.275-4相同之抗原決定基。在另一實施例中,提供結合人類PRLR之細胞外域、鼠類PRLR之細胞外域及大鼠PRLR之細胞外域之抗體。在另一實施例中,提供結合人類、鼠類及大鼠PRLR之細胞外域之抗體,其以10-6 M或更低之平衡解離常數(KD )來結合。在一相關實施例中,上述抗體結合與he.06.642-2相同之抗原決定基。
在另一實施例中,上述方法可用以識別需要用抗PRLR抗體之治療之受檢者,其係藉由(例如)(a)自受檢者獲得樣本;及(b)分析樣本之PRLR、Jak2、Mapk、Stat5、Erk1/2及/或Akt之磷酸化水平來識別;其中PRLR、Jak2、Mapk、Stat5、Erk1/2及/或Akt之磷酸化水平為需要用抗PRLR抗體之治療之指示。在另一實施例中,提供監控受癌症痛苦之受檢者之癌症療法的方法,其包含之步驟為:(a)在用癌症治療劑之治療起始之前,分析來自受檢者之第一樣本之PRLR的磷酸化水平;及(b)在用癌症治療劑之治療起始之後,分析第二樣本,其中在用癌症治療劑之治療起始之後,經磷酸化PRLR之水平之降低指示,患者正接受治療有效劑量之癌症治療劑。在一相關實施例中,癌症治療劑為根據上文所述實施例之任一實施例之抗體。
本發明提供PRLR專一性抗體、含有該等抗體之醫藥調配物、製備該等抗體及醫藥調配物之方法及用該等醫藥調配物及化合物治療患者之方法。根據本發明之抗體可具有以下所要生物活性:結合於PRLR及/或抑制PRLR之二聚及/或抑制PRLR細胞內磷酸化,及/或抑制(例如)經由Jak2、Mapk、Stat5、Erk1/2及/或Akt之磷酸化之PRLR下游信號傳輸,及抑制與癌症或腫瘤相關之細胞增殖。因此,涵蓋藉由偵測其磷酸化或藉由評估諸如Jak2、Stat5、Erk1/2及/或Akt之其他下游信號傳輸搭配物之磷酸化狀態來直接分析PRLR活化。下游信號傳輸路徑之分析因此可用以識別需要抗PRLR抗體之患者,或用以監控已用抗PRLR抗體治療之患者。
根據本發明之抗體或者(或另外)可具有結合於癌細胞上所表現之PRLR之所要生物活性,因此用以將細胞毒素療法靶向癌細胞。
本發明另外係關於識別PRLR基因或基因產物及其變體之拮抗劑或促效劑之篩選分析。因此,本發明係關於用於識別PRLR基因或基因產物及其變體之促效劑或拮抗劑之方法,及該促效劑或拮抗劑治療或預防如本文中所述之癌症之用途。另外,本發明涵蓋PRLR基因所編碼之基因產物之核酸分子、多肽及/或拮抗劑或促效劑用以篩選、診斷、預防及/或治療特徵為PRLR之異常表現或活性的病症之用途,該等病症包括癌症,諸如但不限於肺、乳房及前列腺之癌症。
若干具有如藉由活體外分析所量測之高親和力及效能之較佳鼠類或嵌合抗體係基於Studnicka等人之人類工程化TM 方法而在人類中修飾成更小免疫原性的。簡言之,重鏈及輕鏈可變區之表面暴露胺基酸殘基在經測定為不可能不利地影響抗原結合或蛋白質摺疊之位置上修飾成人類殘基,同時降低其關於人類環境之免疫原性。含有經修飾重鏈及/或輕鏈可變區之合成基因經建構且連接於人類γ重鏈及/或輕鏈恆定區。任何人類重鏈及輕鏈恆定區可與人類工程化TM 抗體可變區組合使用。將人類重鏈及輕鏈基因引入哺乳動物細胞中,且獲得及表徵所得重組免疫球蛋白產物。
根據本發明之示範性抗體包括chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189及XHA.06.907。以下分泌抗體之融合瘤係依據2006年8月17日之布達佩斯條約(Budapest Treaty)之規定,以美國典型微生物菌種保藏中心(ATCC),10801 University Blvd.,Manassaa,VA 20110-2209(USA)來寄存:
提供下文之定義作為對更完全地理解本發明之幫助。
通用定義
如本文中所使用之標靶抗原人類"PRLR"係指具有大體上與SEQ ID NO:2相同之胺基酸序列之人類多肽及其天然存在對偶基因及/或結合變體。如本文中所使用之"PRLR之ECD"係指藉由SEQ ID NO:2之胺基酸25至234表示的PRLR之細胞外部分。
如本文中所使用之"腫瘤"係指無論惡性或良性,所有贅生性細胞生長及增殖,以及所有癌前性及癌性細胞及組織。
術語"癌症"及"癌性"係指或描述通常特徵為未經調節之細胞生長之哺乳動物的生理病狀。癌症之實例包括(但不限於)乳癌、結腸癌、腎癌、肝癌、肺癌、淋巴癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、子宮癌、子宮頸癌或皮膚癌。
"治療"為出於預防病症發展或改變病症病理目的而執行之介入。因此,"治療"係指治療性治療及預防性手段(prophylactic or preventative measures)兩者。需要治療之彼等者包括已具有病症之彼等者以及其中欲預防病症之彼等者。在腫瘤(例如,癌症)治療中,治療劑可直接減少腫瘤細胞之病理,或使腫瘤細胞更易於藉由例如放射及/或化學療法之其他治療劑之治療。治療遭受疾病之臨床、生物化學、放射性或主觀症狀之患者可包括減輕一些或所有該等症狀或降低對疾病之素因。癌症之"病理學"包括所有折衷患者良好狀態之現象。其包括(不限於)異常或不可控制之細胞生長、轉移、干擾鄰近細胞之正常功能、釋放處於異常水平之細胞激素或其他分泌產物、抑制或惡化發炎性或免疫學反應等。因此,治療後之改善可顯示為降低之腫瘤尺寸、腫瘤生長率之下降、現存腫瘤細胞或轉移性細胞之破壞及/或轉移之尺寸減少或數量之降低。
用於治療目的之"哺乳動物"係指分類為哺乳動物之任何動物,包括人類、家畜及農畜,及動物園動物、運動會動物或寵物,諸如狗、馬、貓、牛等。較佳地,哺乳動物為人類。
如本文中所使用,片語"治療有效量"意欲指將適於本發明之實施例之治療性或預防性抗體的量,其將在當根據所要治療方案投與時,引出包括減輕一些或所有該等疾病症狀或降低對疾病之素因之所要治療性或預防性效應或反應。
抗體
"親和力"或"結合親和力"常藉由平衡締合常數(KA )或平衡解離常數(KD )來量測。術語"免疫專一性"或"專一地結合"意謂,抗體以大於或等於約106 M-1 ,大於或等於約107 M-1 ,大於或等於約108 M-1 或大於或等於約109 M-1 、1010 M-1 、1011 M-1 或1012 M-1 之平衡締合常數(KA )結合於PRLR或其ECD。與其他無關分子比較,抗體可具有對標靶抗原之大體上更大的親和力。與異物種同源基因物或同系物比較,抗體亦可具有對標靶抗原之大體上更大之親和力,例如對標靶抗原之相關親和力之至少1.5倍、2倍、5倍、10倍、100倍、103 倍、104 倍、105 倍、106 倍或更大。或者,可適用的為抗體與已知同系物或異物種同源基因物交叉反應。
本發明之抗體亦可藉由平衡解離常數(KD )10-4 M、10-6 M至10-7 M,或10-8 M、10-10 M、10-11 M或10-12 M或更低來表徵。該等親和力可易於使用習知技術來測定,諸如藉由平衡透析;藉由使用BIAcore 2000器具,使用由製造商概述之通用程序;藉由使用經放射標記之標靶抗原之放射免疫檢定;或藉由為熟習此項技術者所知之另一方法。親和力資料可(例如)藉由Scatchard等人,Ann N.Y.Acad.Sci.,51:660(1949)之方法來分析。
"中和抗體"意謂能夠消除或顯著減少其所結合之標靶抗原之效應子功能的抗體分子。因此,"中和"抗標靶抗體能夠消除或顯著減少諸如酶活性、配位體結合或胞內信號傳輸之效應子功能。
術語"抗體"係在廣義上使用且包括完全裝配之抗體、單株抗體、多株抗體、多專一性抗體(例如雙專一性抗體)、可結合抗原之抗體片段(例如Fab'、F'(ab)2、Fv、單鏈抗體、雙功能抗體)、駱駝抗體及包含上述者之重組肽,只要其顯示所要生物活性即可。抗體片段可藉由重組DNA技術或藉由完整抗體之酶促分裂或化學分裂來產生且進一步描述於下文。單株抗體之非限制性實例包括鼠類、嵌合、人化、人類及人類工程化TM 免疫球蛋白,抗體,具有得自免疫球蛋白之序列之嵌合融合蛋白質或其突變蛋白質或其衍生物,各自進一步描述於下文。涵蓋完整分子及/或片段之多聚體或聚集體,包括化學衍生抗體。根據本發明,涵蓋任何同型種類或子類之抗體。
如本文中所使用之術語"單株抗體"係指自大體上同源抗體群獲得之抗體,亦即,除少量存在之可能的天然發生突變外,組成群體之個別抗體為相同的。單株抗體對單一抗原性位點為高度專一的。此外,與通常包括針對不同決定子(抗原決定基)之不同抗體之習知(多株)抗體製劑相反,各單株抗體係針對抗原上之單一決定子。除其專一性外,單株抗體為有利的,因為其係藉由未經具有不同專一性及特徵之其他免疫球蛋白污染之同源培養物來合成。
修飾語"單株"指示當自抗體之大體上同類群體獲得時,抗體之特徵,且並非欲解釋為需要藉由任何特定方法產生抗體。舉例而言,欲根據本發明來使用之單株抗體可藉由先由Kohler等人,Nature 256:495[19751]所述之融合瘤方法來製得,或可藉由重組DNA方法(參見(例如),美國專利第4,816,567號)來製得。"單株抗體"亦可為(例如)重組的、嵌合的、人化的、人類的、人類工程化TM 的,或抗體片段。
"經分離"抗體為已經識別及分離且自其自然環境之組份回收之抗體。其自然環境之污染物組份為將干擾對抗體之診斷或治療性用途之物質,且可包括酶、激素及其他蛋白質或非蛋白質溶質。在較佳實施例中,該抗體將(1)如藉由Lowry方法所測定,純化至大於95重量%之抗體,且最佳大於99重量%,(2)純化至足以藉由使用旋杯式定序儀獲得至少15個殘基之N-末端或內部胺基酸序列之程度,或(3)使用考馬斯藍(Coomassie blue)或較佳銀染劑,在還原條件或非還原條件下,藉由SDS-PAGE純化至均質性。經分離抗體包括重組細胞內之原位抗體,因為抗體之天然環境之至少一種組份將不存在。然而,通常,經分離抗體將藉由至少一個純化步驟來製備。
"免疫球蛋白"或"天然抗體"為四聚醣蛋白。在天然存在免疫球蛋白中,各四聚體包含兩個相同的多肽鏈對,各個對具有一條"輕"鏈(約25 kDa)及一條"重"鏈(約50-70 kDa)。各鏈之胺基末端部分包括主要負責抗原識別之約100至110個或110個以上胺基酸之可變區。各鏈之羧基末端部分定義主要負責效應子功能之恆定區。免疫球蛋白可視其重鏈之恆定域之胺基酸序列而指派至不同種類。重鏈分類為謬(mu)(μ)、德耳塔(delta)(△)、伽瑪(gamma)(γ)、阿伐(alpha)(α)及厄普西隆(epsilon)(ε),且分別將抗體之同型定義為IgM、IgD、IgG、IgA及IgE。若干該等者可進一步分成子類或同型,例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2。不同同型具有不同效應子功能;例如IgG1及IgG3同型具有ADCC活性。人類輕鏈分類為卡帕(kappa)()及拉目達(lambda)(λ)輕鏈。在輕鏈及重鏈中,可變區及恆定區係藉由約12個或12個以上胺基酸之"J"區來連接,重鏈亦包括約10個或10個以上胺基酸之"D"區。一般參見,Fundamental Immunology第7章(Paul,W.編輯,第2版,Raven Press,N.Y.(1989))。
就抗體結構及產生之詳細說明而言,參見Roth,D.B.及Craig,N.L.,Cell, 94:411-414(1998),其以引用之方式全部併入本文中。簡言之,用於產生編碼重鏈及輕鏈免疫球蛋白基因之DNA之方法主要在發展B細胞中發生。在各種免疫球蛋白基因區段之重排及接合之前,通常發現在單染色體上V、D、J及恆定(C)基因區段相對接近。在B細胞分化期間,V、D、J(或在輕鏈基因狀況下,僅V及J)基因區段之適當家族成員的各者之一經重組以形成功能性重排之重及輕免疫球蛋白基因。該基因區段重排方法欲呈現為連續的。首先,進行重鏈D與J之接合,接著重鏈V與DJ接合及輕鏈V與J接合。除V、D及J區段之重排外,在免疫球蛋白重鏈及輕鏈之主要集合(repertoire)中,藉由在其中輕鏈之V及J區段接合且其中重鏈之D及J區段接合之位置上的可變重組而產生其他多樣性。輕鏈中之該變化通常在V基因區段之最後一個密碼子及J區段之第一個密碼子內發生。接合中之類似不精密性發生於D與JH 區段之間的重鏈染色體上,且可遍布多10個核苷酸。此外,若干核苷酸可插入未經基因組DNA編碼之D與JH 基因區段之間及VH 與D基因區段之間。該等核苷酸之添加稱為N區多樣性。可變區基因區段中之該等重排及可在該接合期間發生之可變重組的淨效應為主要抗體集合之產生。
"抗體片段"包含完整全長抗體(包括(例如)人類抗體)之部分,較佳為完整抗體之抗原結合區或可變區,且包括自抗體片段形成之多專一性抗體。抗體片段之非限制性實例包括Fab、Fab'、F(ab')2、Fv、域抗體(dAb)、互補判定區(CDR)片段、單鏈抗體(scFv)、單鏈抗體片段、雙功能抗體、三功能抗體、四功能抗體、微型抗體、直鏈抗體(Zapata等人,Protein Eng.,8(10):1057-1062(1995));螯合重組抗體、三體或雙體、胞內抗體、奈米抗體(nanobody)、小模組免疫醫藥品(SMIP)、抗原結合域免疫球蛋白融合蛋白質、駱駝化抗體(camelized antibody)、含有VHH之抗體或突變蛋白質或其衍生物,及只要抗體保留所要生物活性即可含有足以將專一性抗原結合性賦予多肽之免疫球蛋白的至少一部分(諸如CDR序列)之多肽。
抗體之木瓜酵素消化產生兩個相同之抗原結合片段(稱為"Fab"片段,各具有單個抗原結合位點)及殘餘"Fc"片段,其名稱反映其易使35結晶之能力。胃蛋白酶處理產生具有2個"Fv"片段之F(ab')2片段。"Fv"片段為含有完整抗原識別及結合位點之最小抗體片段。該區域由呈緊密、非共價締合之一重鏈可變域及一輕鏈可變域之二聚物組成。各可變域之三個CDR係以該構型相互作用以界定VH VL二聚體表面上之抗原結合位點。總起來說,六個CDR賦予抗體抗原結合專一性。然而,即使單可變域(或僅包含3個對抗原有專一性之CDR之Fv的一半)亦具有識別及結合抗原之能力。
"單鏈Fv"或"sFv"或"scFv"抗體片段包含抗體之VH及VL域,其中該等域存在於單多肽鏈中。較佳地,Fv多肽另外包含VH與VL域之間的多肽連接子,其使Fv能夠形成用於抗原結合之所要結構。為回顧sFv,參見Pluckthun,於The Pharmacology of Monoclonal Antibodies,第13卷中,Rosenburg及Moore編,Springer-Verlag,New York,第269-315頁(1994)。
Fab片段亦含有輕鏈之恆定域及重鏈之第一恆定域(CH1)。Fab片段不同於Fab'片段之處在於在重鏈CH1域之羧基端基處添加若干殘基,其包括來自抗體鉸鏈區之一或多個半胱胺酸。Fab'-SH在本文中為其中恆定域之半胱胺酸殘基帶有游離硫醇基之Fab'的名稱。最初F(ab')2抗體片段經製造為其間具有鉸鏈半胱胺酸之Fab'片段對。
術語"高變"區係指負責抗原結合之抗體之胺基酸殘基。高變區包含來自"互補判定區"或CDR之胺基酸殘基[亦即,如由Kabat等人,Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991)所述,輕鏈可變域中之殘基24-34(L1)、50-56(L2)及89-97(L3)及重鏈可變域中之31-35(H1)、50-65(H2)及95-102(H3)]及/或來自高變環(亦即,如由[Chothia等人,J.Mol.Biol.196 :901-917(1987)]所述,輕鏈可變域中之殘基26-32(L1)、50-52(L2)及91-96(L3)及重鏈可變域中之26-32(H1)、53-55(H2)及96-101(H3))之彼等殘基。
"構架"或FR殘基為不同於高變區殘基之彼等可變域殘基。
片語"恆定區"係指賦予效應子功能之抗體分子之部分。
如本文所使用之片語"嵌合抗體"係指含有得自通常源於不同物種之兩種不同抗體之序列的抗體(參見(例如)美國專利第4,816,567號)。最通常地,嵌合抗體包含人類及鼠類抗體片段,通常為人類恆定區及小鼠可變區。
術語"突變蛋白質"或"變體"可交替地使用且係指抗體之多肽序列,其在可變區或相當於可變區之部分中含有至少一種胺基酸取代、缺失或插入,其限制條件為突變蛋白質或變體保留所要結合親和力或生物活性。突變蛋白質可為大體上同源的或大體上相同於母體抗體的。
當連同本發明之抗體一起使用時,術語"衍生物"係指經諸如以下者之技術共價修飾之抗體:泛素化、與治療劑或診斷劑之結合、標記(例如,用放射性核種或各種酶標記)、諸如聚乙二醇化(用聚乙二醇之衍生作用)之共價聚合物連接及藉由非天然胺基酸之化學合成之插入或取代。本發明之衍生物將保留本發明之未經衍生分子的結合性質。
當在本文中使用時,術語"抗體"特別地包括保留結合PRLR之細胞外部分之能力的以下抗體之任一者:1)具有陳列於圖7A-7C或圖8中之胺基酸序列之母體抗體的胺基酸突變蛋白質,其包括包含可變重鏈胺基酸序列及/或包含可變輕鏈胺基酸序列之突變蛋白質,考慮用於同源性測定之相似胺基酸,該可變重鏈胺基酸序列係與母體胺基酸序列至少60、65、70、75、80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98或99%同源,該可變輕鏈胺基酸序列係與母體胺基酸序列至少60、65、70、75、80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98或99%同源;2)具有陳列於圖7A-7C或圖8中之胺基酸序列之PRLR結合多肽,其包含母體抗體之一或多個互補決定區(CDR),較佳至少包含重鏈之CDR3,且較佳包含2個或2個以上,或3個或3個以上,或4個或4個以上,或5個或5個以上,或全部6個CDR;3)藉由根據陳述於Studnicka等人,美國專利第5,766,886號及本文中實例5中之方法,使用Kabat編號以識別低、中等及高風險殘基來改變母體序列而產生之人類工程化TM 抗體;該等抗體包含以下重鏈之至少一者反以下輕鏈之至少一者:(a)其中所有不同於人類參考免疫球蛋白中之相應殘基之低風險齧齒動物殘基已修飾成與人類參考免疫球蛋白序列中之人類殘基相同的重鏈,或(b)其中所有低及中等風險齧齒動物殘基已(必要時)修飾成與人類參考免疫球蛋白序列中相同之殘基之重鏈,(c)其中所有低風險殘基已(必要時)修飾成與人類參考免疫球蛋白序列相同之殘基之輕鏈,或(d)其中所有低及中等風險殘基已(必要時)修飾成與人類參考免疫球蛋白序列相同之殘基之輕鏈;4)先前段落(3)中之上述抗體之變體,其包含具有與原始齧齒動物輕鏈之至少60%胺基酸序列一致性之重鏈或輕鏈或重鏈可變區或輕鏈可變區,更佳至少80%,更佳至少85%,更佳至少90%,且最佳至少95%,包括(例如)65%、70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%及100%之一致性;5)PRLR結合多肽,其包含齧齒動物抗體之一或多個CDR之高風險殘基,且較佳包含2個或2個以上,或3個或3個以上,或4個或4個以上,或5個或5個以上,或全部6個CDR之高風險殘基,且視情況包含在低或中等風險殘基處之一或多種改變;舉例而言,其包含在低風險殘基處之一或多種改變及在中等風險殘基處之保守取代,或舉例而言,其保留中等及高風險胺基酸殘基且包含在低風險殘基處之一或多種變化,其中,改變包括插入、缺失或取代,且可為保守取代,或可使工程化抗體依次接近人類輕鏈或重鏈序列、人類生殖系輕鏈或重鏈序列、一致人類輕鏈或重鏈序列或一致人類生殖系輕鏈或重鏈序列;該等所涵蓋之改變亦可在如下之序列格式中顯示。在AKKLVHTPYSFKEDF之假想序列中,其中根據Studnicka等人,美國專利第5,766,886號分配於各殘基之各別風險,為HMLHMLHMLHMLHML(H=高,M=中間,L=低),對假想序列之低風險殘基之示範性改變可顯示為:AKXLVXTPXSFXEDX,其中X為任何胺基酸,或者其中X為在彼位置處之原始殘基之保守取代,且對低及中等風險殘基之示範性改變可同樣地顯示,例如AYXLYXTYXSYXEYX,其中X為任何胺基酸且Y為在彼位置處之原始殘基之保守取代。
術語"競爭抗體"包括1)結合於與以下抗體相同之PRLR之抗原決定基的非鼠類或非齧齒動物單株抗體:chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189或XHA.06.907,例如,如經由X射線結晶學來測定;及/或2)與以下抗體競爭超過75%、超過80%或超過81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%或95%之非鼠類或非齧齒動物單株抗體:chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189或XHA.06.907;或者,將以下者之結合降低至少2、3、4、5、6、10、20、50、100倍或更大之非鼠類或非齧齒動物單株抗體:chXHA.06.642、chXHA.06.275、he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4、XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239、XPA.06.145、XHA.06.567、XHA.06.642、XHA.06.983、XHA.06.275、XHA.06.189或XHA.06.907。在一實施例中,非鼠類或非齧齒動物單株抗體係呈50倍莫耳過量。
本發明之抗體較佳以10-6 、10-7 、10-8 、10-9 M、10-10 M、10-11 M、10-12 M或更低之平衡解離常數結合於PRLR的ECD,且較佳抑制PRLR細胞內磷酸化及(例如)經由STAT5、MAPK或AKT之活化的下游PRLR信號傳輸之活化。
視情況,在其申請日期之前公開揭示或在其申請日期之前,在所申請申請案中揭示的任何嵌合、人類或人化抗體係自本發明之範疇排除。
如本文中所廣泛定義,"非齧齒動物"單株抗體為任何抗體,其不為藉由齧齒動物融合瘤產生之完全完整齧齒動物單株抗體。因此,非齧齒動物抗體特別包括(但不限於)齧齒動物抗體之突變蛋白質、齧齒動物抗體片段、直鏈抗體、嵌合抗體、人化抗體、人類工程化TM 抗體及人類抗體,包括自轉殖基因動物或經由噬菌體顯示技術產生之人類抗體。同樣地,非鼠類抗體包括(但不限於)鼠類抗體之突變蛋白質、鼠類抗體片段、直鏈抗體、嵌合抗體、人化抗體、人類工程化TM 抗體及人類抗體。
標靶抗原
欲用於產生抗體之標靶抗原可為(例如)PRLR之細胞外部分,或保留所要抗原決定基之片段,其視情況融合至容許抗原決定基以其天然構形顯示之另一多肽。或者,表現於細胞表面上之完整PRLR可用以產生抗體。該等細胞可經轉形以表現PRLR或可為表現PRLR之其他天然存在細胞。適用於產生抗體之PRLR多肽之其他形式將對熟習此項技術者而言為明顯的。
多株抗體
多株抗體較佳係藉由多次皮下(sc)或腹膜內(ip)注射相關抗原及佐劑而在動物中產生。可藉由使用雙功能或衍化劑,例如馬來醯亞胺苄醯基磺酸基琥珀醯亞胺酯(經由半胱胺酸殘基結合)、N-羥基琥珀醯亞胺(經由離胺酸殘基)、戊二醛、琥珀酸酐或此項技術中已知之其他藥劑,使相關抗原結合於在欲免疫之物種中為免疫原性之蛋白質,例如匙孔螺血氰蛋白、血清白蛋白、牛甲狀腺球蛋白或大豆胰蛋白酶抑制劑,來獲得改良之抗體反應。
動物係藉由將(例如)100 μg或5 μg之蛋白質或結合物(分別對兔或鼠而言)與3體積之弗氏(Freund's)完全佐劑組合且在多個位點皮內注射該溶液來對抗原、免疫原性結合物或衍生物免疫。一個月後,動物係藉由在多個位點處之皮下注射,用弗氏完全佐劑中之1/5至{分率(1/10)}初始量之肽或結合物來加強。在加強注射後7-14天,取動物血液且檢定血清之抗體效價。將動物加強直至效價平穩。較佳地,用相同抗原之結合物加強動物,但該抗原結合於不同蛋白質及/或經由不同交聯劑結合。結合物亦可在重組細胞培養物中作為蛋白融合物來製得。又,諸如明礬之聚集劑適用於增強免疫反應。
單株抗體
單株抗體可使用先由Kohler等人,Nature,256:495(1975)所述之融合瘤方法來製得,或可藉由重組DNA方法來製得。
在融合瘤方法中,小鼠或諸如倉鼠或獼猴(macaque monkey)之其他適當宿主動物係如本文中所述來免疫,以引出產生或能夠產生將專一地結合於用於免疫之蛋白質之抗體的淋巴細胞。或者,可活體外免疫淋巴細胞。隨後使用諸如聚乙二醇之適合融合劑使淋巴細胞與骨髓瘤細胞融合,以形成融合瘤細胞(Goding,Monoclonal Antibodies:Principles and Practice,第59-103頁(Academic Press,1986)),或可使用電子細胞融合來融合。
將因此製備之融合瘤細胞接種,且在較佳含有一或多種抑制未融合、親代骨髓瘤細胞之生長或存活之物質的適合培養基中生長。舉例而言,若親代骨髓瘤細胞缺乏酵素次黃嘌呤鳥嘌呤磷酸核糖轉移酶(HGPRT或HPRT),則用於融合瘤之培養基中通常將包括次黃嘌呤、胺基蝶呤及胸苷(HAT培養基),該等物質阻止缺HGPRT細胞之生長。
較佳骨髓瘤細胞為彼等細胞,其有效地融合、支持藉由經選擇產生抗體之細胞之抗體的穩定高水平產生,且對培養基敏感。亦已描述用於產生人類單株抗體之人類骨髓瘤及小鼠-人類雜骨髓瘤(heteromyeloma)細胞株(Kozbor,J.Immunol.,133:3001(1984);Brodeur等人,Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications,第51-63頁(Marcel Dekker,Inc.,New York,1987))。示範性鼠類骨髓瘤系包括得自MOP-21及M.C.-11小鼠腫瘤之彼等者,其可購自Salk Institute Cell Distribution Center,San Diego,Calif.USA,及SP-2或X63-Ag8-653細胞,其可購自American Type Culture Collection,Rockville,Md.USA。
就產生針對抗原之單株抗體而言,檢定其中融合瘤細胞生長之培養基。較佳地,藉由融合瘤細胞產生之單株抗體之結合專一性係藉由免疫沈澱法或藉由活體外結合檢定,諸如放射免疫檢定(RIA)或酶聯免疫吸附檢定(ELISA)來測定。單株抗體之結合親和力可(例如)藉由Scatchard分析來測定(Munson等人,Anal.Biochem.,107:220(1980))。
在識別產生具有所要專一性、親和力及/或活性之抗體之融合瘤細胞後,可藉由有限稀釋程序次選殖純系且藉由標準方法使其生長(Goding,Monoclonal Antibodies:Principles and Practice,第59-103頁(Academic Press,1986))。用於該目的之適合培養基包括(例如)D-MEM或RPMI-1640培養基。另外,融合瘤細胞可作為動物之腹水腫瘤而活體內生長。藉由諸如蛋白質A-瓊脂糖、羥磷灰石層析、凝膠電泳、透析或親和力層析之習知免疫球蛋白純化程序,使藉由次純系分泌之單株抗體與培養基、腹水液體或血清適當分離。
編碼單株抗體之DNA可使用習知程序(例如,藉由使用能夠專一結合於編碼單株抗體之重鏈及輕鏈之基因的寡核苷酸探針)自融合瘤細胞分離且定序。序列測定通常將需要分離所關注之基因或cDNA之至少一部分。通常,其需要選殖編碼單株抗體之DNA或較佳地,mRNA(亦即,cDNA)。選殖係使用標準技術進行(參見(例如),Sambrook等人(1989)Molecular Cloning:A Laboratory Guide,第1-3卷,Cold Spring Harbor Press,其以引用之方式併入本文)。舉例而言,cDNA庫可藉由聚A+mRNA,較佳膜相關mRNA之反轉錄來建構,且使用對人類免疫球蛋白多肽基因序列具有專一性之探針來篩選庫。然而,在一較佳實施例中,聚合酶鏈反應(PCR)係用以擴增編碼所關注之免疫球蛋白基因區段(例如,輕鏈可變區段)之cDNA(或全長cDNA之部分)。經擴增序列可易選殖至例如表現載體、微型基因載體或噬菌體顯示載體之任何適合載體中。應瞭解,所使用之特定選殖方法不為關鍵的,只要可能測定所關注之免疫球蛋白多肽之一些部分的序列即可。如本文中所使用,"經分離"核酸分子或"經分離"核酸序列為(1)自至少一種通常在核酸之天然來源中與其相關之污染物核酸分子識別及分離的核酸分子,或(2)經選殖、擴增、標記或另外區別於背景核酸以便可測定所關注之核酸序列之核酸分子,其視為經分離的。經分離核酸分子不同於其天然所見之形式或配置。因此經分離核酸分子區別於當其存在於天然細胞中時之核酸分子。然而,經分離核酸分子包括通常表現抗體之細胞中含有之核酸分子,其中(例如)該核酸分子係在不同於天然細胞之彼者之染色體位置中。
用於選殖及定序之RNA之一來源為藉由自轉殖基因小鼠獲得B細胞且將B細胞融合於永生細胞而產生之融合瘤。使用融合瘤之優點為,其可易篩選且可易選擇產生所關注之人類單株抗體之融合瘤。或者,RNA可自免疫動物之B細胞(或整個脾臟)分離。當使用不同於融合瘤之來源時,可需要篩選編碼具有專一性結合特徵之免疫球蛋白或免疫球蛋白多肽之序列。用於該篩選之一方法為使用噬菌體顯示技術。噬菌體顯示描述於(例如)Dower等人,WO 91/17271,McCafferty等人,WO 92/01047,及Caton及Koprowski,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,87:6450-6454(1990),其各自以引用之方式併入本文。在使用噬菌體顯示技術之一實施例中,分離來自免疫轉殖基因小鼠之cDNA(例如總脾臟cDNA),聚合酶鏈反應係用以擴增編碼例如CDR區域之免疫球蛋白多肽之部分的cDNA序列,且將經擴增序列插入噬菌體載體中。編碼例如具有所要結合特徵之可變區肽之所關注肽的cDNA係藉由諸如淘選之標準技術來識別。
隨後測定經擴增或選殖核酸之序列。通常測定編碼免疫球蛋白多肽之整個可變區之序列,然而,有時僅對可變區之部分,例如編碼CDR之部分進行定序為足夠的。通常,所定序部分將為長度至少30個鹼基,更通常將定序編碼可變區長度之至少約三分之一或至少約一半的鹼基。
定序可在自cDNA庫分離之純系上進行,或當使用PCR時,在次選殖經擴增序列之後進行,或藉由經擴增區段之直接PCR定序來進行。定序係使用標準技術進行(參見(例如),Sambrook等人(1989)Molecular Cloning:A Laboratory Guide,第1-3卷,Cold Spring Harbor Press,及Sanger,F.等人(1977)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 74:5463-5467,其以引用之方式併入本文)。藉由比較經選殖核酸之序列與人類免疫球蛋白基因及cDNA之公開序列,熟習此項技術者將易能夠視所定序之區域而確定(i)融合瘤免疫球蛋白多肽(包括重鏈之同型)之生殖系區段用法,及(ii)重鏈及輕鏈可變區之序列,包括自N區添加及體細胞突變方法產生之序列。免疫球蛋白基因序列資訊之一來源為National Center for Biotechnology Information,National Library of Medicine,National Institutes of Health,Bethesda,Md。
抗體片段
如上所述,抗體片段包含完整全長抗體之部分,較佳為完整抗體之抗原結合區或可變區,且包括自抗體片段形成之直鏈抗體及多專一性抗體。抗體片段之非限制性實例包括Fab、Fab'、F(ab')2、Fv、Fd、域抗體(dAb)、互補判定區(CDR)片段、單鏈抗體(scFv)、單鏈抗體片段、雙功能抗體、三功能抗體、四功能抗體、微型抗體、直鏈抗體、螯合重組抗體、三體或雙體、胞內抗體、奈米抗體、小模組免疫醫藥品(SMIP)、抗原結合域免疫球蛋白融合蛋白質、駱駝化抗體、含有VHH之抗體或突變蛋白質或其衍生物,及只要抗體保留所要生物活性即可含有足以將專一性抗原結合性賦予多肽之免疫球蛋白的至少一部分(諸如CDR序列)之多肽。該等抗原片段可藉由修飾整個抗體來產生,或使用重組DNA技術或肽合成來重新合成。
術語"雙功能抗體"係指具有兩個抗原結合位點之小抗體片段,該等片段包含在同一多肽鏈(VH VL)中連接於輕鏈可變域(VL)之重鏈可變域(VH)。藉由使用過短而不允許相同鏈上之兩個域之間進行配對之連接子,迫使該等域與另一鏈之互補域配對且產生兩個抗原結合位點。雙功能抗體更全面地描述於(例如)EP 404,097、WO 93/11161;及Hollinger等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444-6448(1993)中。
"單鏈Fv"或"scFv"抗體片段包含抗體之VH 及VL 域,其中該等域係存在於單多肽鏈中,且視情況包含VH 與VL 域之間的能使Fv形成用於抗原結合之所要結構之多肽連接子(Bird等人,Science 242:423-426,1988,及Huston等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883,1988)。Fd片段由VH 及CH 1域組成。
額外抗體片段包括由VH 域組成之域抗體(dAb)片段(Ward等人,Nature 341:544-546,1989)。
"直鏈抗體"包含一對串聯Fd片段(VH -CH 1-VH -CH 1),其形成一對抗原結合區。直鏈抗體可為雙專一性的或單專一性的(Zapata等人Protein Eng.8:1057-62(1995))。
"微型抗體"由經由肽連接子(無鉸鏈的)或經由IgG鉸鏈融合於CH3之scFv組成,該微型抗體已描述於Olafsen,等人,Protein Eng Des Sel.2004Apr;17(4):315-23中。
無輕鏈之功能性重鏈抗體係天然存在於護士鯊(Greenberg等人,Nature 374:168-73,1995)、帶紋鯊(Nuttall等人,Mol Immunol. 38:313-26,2001)及駱駝科(Camelidae )(Hamers-Casterman等人,Nature 363:446-8,1993;Nguyen等人,J.Mol.Biol. 275:413,1998),諸如駱駝、單峰駝、羊駝及美洲駝(llamas)。抗原結合位點在該等動物中減小至單域,即VHH 域。該等抗體僅使用重鏈可變區形成抗原結合區,亦即,該等功能性抗體為僅具有結構H2 L2 之重鏈之同源二聚體(稱為"重鏈抗體"或"HCAb")。據報導,駱駝化VHH 與含有鉸鏈域、CH2域及CH3域且缺乏CH1域之IgG2及IgG3恆定區重組(Hamers-Casterman等人,用上)。舉例而言,美洲駝IgG1為習知(H2 L2 )抗體同型,其中VH 與含有鉸鏈域、CH1域、CH2域及CH3域之恆定區重組,而美洲駝IgG2及IgG3為缺乏CH1域且不包含輕鏈之僅具重鏈同型。典型的僅具VH片段難以以可溶性形式產生,但當將構架殘基改變成更像VHH 時,可獲得可溶性及專一性結合之改良。(參見(例如),Reichman,等人,J Immunol Methods 1999,231:25-38)。已發現駱駝化VHH 域以高親和力結合於抗原(Desmyter等人,J.Biol.Chem. 276:26285-90,2001)且在溶液中擁有高穩定性(Ewert等人,Biochemistry 41:3628-36,2002)。產生具有駱駝化重鏈之抗體之方法描述於(例如)美國專利公開案第20050136049及20050037421號中。
因為重鏈抗體之可變域為具有僅15 kDa之分子量之最小完全功能性抗原結合片段,所以該實體稱為奈米抗體(Cortez-Retamozo等人,Cancer Research 64:2853-57,2004)。奈米抗體庫可如Conrath等人(Antimicrob Agents Chemother 45:2807-12,2001)中所述,自免疫單峰駝產生,或使用如所述之重組方法產生。
胞內抗體為單鏈抗體,其證明細胞內表現且可操縱細胞內蛋白質功能(Biocca,等人,EMBO J. 9:101-108,1990;Colby等人,Proc Natl Acad Sci U S A. 101:17616-21,2004)。包含保留細胞內區域中之抗體構築體之細胞信號序列的胞內抗體可如Mhashilkar等人(EMBO J 14:1542-51,1995)及Wheeler等人(FASEB J. 17:1733-5.2003)中所述來產生。穿透抗體為可滲透細胞之抗體,其中蛋白質轉導域(PTD)係與單鏈可變片段(scFv)抗體融合,Heng等人(Med Hypotheses. 64:1105-8,2005)。
另外涵蓋為對標靶蛋白質具有專一性之SMIP或結合域免疫球蛋白融合蛋白質之抗體。該等構築體為包含融合於進行抗體效應子功能所必需之免疫球蛋白域之抗原結合域的單鏈多肽。參見(例如),WO 03/041600、美國專利公開案20030133939及美國專利公開案20030118592。
多價抗體
在一些實施例中,可需要產生多價或甚至多專一性(例如,雙專一性、三專一性等)單株抗體。該抗體可對標靶抗原之至少2個不同抗原決定基具有結合專一性,或者其可結合於2種不同分子,例如結合於標靶抗原及細胞表面蛋白質或受體。舉例而言,雙專一性抗體可包括結合於標靶之臂及結合於白血球上之觸發分子(以便將細胞防衛機制集中於表現標靶之細胞)之另一臂,該觸發分子諸如T-細胞受體分子(例如CD2或CD3),或IgG之Fc受體(FcγR),諸如FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)及FcγRIII(CD16)。作為另一實例,雙專一性抗體可用以將細胞毒性劑定位於表現標靶抗原之細胞。該等抗體擁有標靶結合臂及結合細胞毒性劑(例如沙泊寧(saporin)、抗干擾素60、長春花鹼(vinca alkaloid)、蓖麻毒素A鏈、甲胺喋呤或放射性同位素半抗原)之臂。多專一性抗體可製備為全長抗體或抗體片段。
雙專一性抗體包括交聯抗體或"雜結合"抗體。舉例而言,雜結合物中之抗體之一可偶合於抗生蛋白,另一者偶合於生物素。雜結合抗體可使用任何方便之交聯方法製得。適合交聯劑在此項技術中為熟知的,且連同大量交聯技術揭示於美國專利第4,676,980號。
根據製造雙專一性抗體之另一方法,可將一對抗體分子之間的介面工程化以最大化自重組細胞培養物回收之異源二聚體百分比。較佳介面包含抗體恆定域之CH 3域之至少部分。在該方法中,來自第一抗體分子介面之一或多個小胺基酸側鏈經較大側鏈(例如酪胺酸或色胺酸)置換。藉由用較小胺基酸側鏈(例如丙胺酸或蘇胺酸)置換大胺基酸側鏈,在第二抗體分子介面上產生大側鏈之具有相同或相似尺寸之補償"空腔"。其提供使異源二聚體之產率增加超過諸如同源二聚體之其他不需要之終點產物的機制。參見1996年9月6日公開之WO 96/27011。
自抗體片段產生雙專一性抗體之技術亦已描述於文獻中。舉例而言,可使用化學鍵聯製備雙專一性抗體。Brennan等人,Science,229:81(1985)描述一種將完整抗體蛋白水解分裂以產生F(ab')2 片段之程序。在二硫醇錯合劑亞砷酸鈉存在下,還原該等片段以穩定鄰近二硫醇且防止分子間二硫化物形成。隨後將所產生之Fab'片段轉化成硫代硝基苯甲酸酯(TNB)衍生物。隨後藉由用巰基乙胺之還原,將Fab'-TNB衍生物之一再轉化成Fab'-硫醇,且將其與等莫耳量之另一Fab'-TNB衍生物混合以形成雙專一性抗體。所產生之雙專一性抗體可用作用於選擇性固定酵素之藥劑。Better等人,Science 240:1041-1043(1988)揭示自細菌分泌功能性抗體片段(參見(例如),Better等人,Skerra等人Science 240:1038-1041(1988))。舉例而言,Fab'-SH片段可直接自大腸桿菌(E.coli)回收且化學偶合以形成雙專一性抗體(Carter等人,Bio/Technology 10:163-167(1992);Shalaby等人,J.Exp.Med.175:217-225(1992))。
Shalaby等人,J.Exp.Med.175:217-225(1992)描述完全人化雙專一性抗體F(ab')2 分子之產生。各Fab'片段係分離地自大腸桿菌分泌且經受活體外定向化學偶合以形成雙專一性抗體。因此形成之雙專一性抗體能夠結合於過度表現HER2受體之細胞及正常人類T細胞,以及觸發人類細胞毒性淋巴細胞對人類乳房腫瘤標靶之溶解活性。
亦已描述直接自重組細胞培養物製造及分離雙專一性抗體片段之各種技術。舉例而言,已使用例如GCN4之白胺酸拉鏈產生雙專一性抗體。(一般參見Kostelny等人,J.Immunol.,148(5):1547-1553(1992))。藉由基因融合,將來自Fos及Jun蛋白質之白胺酸拉鏈肽連接於兩種不同抗體之Fab'部分。在鉸鏈區還原抗體同源二聚體以形成單體,且隨後再氧化以形成抗體異源二聚體。該方法亦可用於產生抗體同源二聚體。
術語"雙功能抗體"係指具有兩個抗原結合位點之小抗體片段,該等片段包含在同一多肽鏈(VHVL)中連接於輕鏈可變域(VL)之重鏈可變域(VH)。藉由使用過短而不允許相同鏈上之兩個域之間進行配對之連接子,迫使該等域與另一鏈之互補域配對且產生兩個抗原結合位點。參見(例如),Hollinger等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:6444-6448(1993)。
亦已報導藉由使用單鏈Fv(sFv)二聚體來製造雙專一性抗體片段之另一策略。參見Gruber等人,J.Immunol.152:5368(1994)。
或者,雙專一性抗體可為如Zapata等人Protein Eng.8(10):1057-1062(1995)中所述產生之"直鏈抗體"。簡言之,該等抗體包含一對串聯Fd片段(VH -CH 1-VH -CH 1),其形成一對抗原結合區。直鏈抗體可為雙專一性或單專一性的。
亦涵蓋具有多於二價之抗體。舉例而言,可製備三專一性抗體。(Tutt等人J.Immunol. 147:60(1991))。
"螯合重組抗體"為雙專一性抗體,其識別標靶抗原之鄰近及非重疊抗原決定基,且為足夠可撓的以同時結合於2個抗原決定基(Neri等人,J Mol Biol. 246:367-73,1995)。雙專一性Fab-scFv("雙體")及三專一性Fab-(scFv)(2)("三體")之產生描述於Schoonjans等人(J Immunol. 165:7050-57,2000)及Willems等人(J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci. 786:161-76,2003)中。對雙體或三體而言,scFv分子融合於VL-CL(L)及VH-CH1 (Fd)鏈之一或兩者,例如,為產生三體,2個scFv融合於Fab之C-末端,而在雙體中,一個scFv融合於Fab之C-末端。
抗體之重組產生
抗體可藉由重組DNA方法,使用此項技術中熟知之抗體表現系統之一來產生(參見(例如),Harlow and Lane,Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory(1988))。
編碼本發明之抗體之DNA可置放於表現載體中,隨後將其轉染至不另外產生免疫球蛋白蛋白質之諸如大腸桿菌細胞、猴COS細胞、人類胎腎293細胞(例如293E細胞)、中國倉鼠卵巢(CHO)細胞或骨髓瘤細胞之宿主細胞中,以在重組宿主細胞中獲得單株抗體之合成。抗體之重組產生在此項技術中為熟知的。抗體片段已經由完整抗體之蛋白水解消化得到(參見(例如),Morimoto等人,Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24:107-117(1992)及Brennan等人,Science 229:81(1985))。然而,該等片段現可藉由重組宿主細胞直接產生。包括肽合成及共價鍵聯之用於產生抗體片段之其他技術將對熟習此項技術者而言為明顯的。
表現控制序列係指在特定宿主生物體中表現經可操作連接之編碼序列所必需之DNA序列。適於原核生物之控制序列(例如)包括啟動子、視情況操作序列及核糖體結合位點。已知真核細胞利用啟動子、多聚腺嘌呤信號及強化子。
核酸在當將其置放於與另一核酸序列之功能性關係中時為可操作連接的。舉例而言,若前序列或分泌前導區之DNA表現為參與多肽之分泌的前蛋白質,則其係可操作連接於多肽之DNA;若啟動子或強化子影響序列之轉錄,則其係可操作連接於編碼序列;或若核糖體結合位點經定位以便促進轉譯,則其係可操作連接於編碼序列。通常,經可操作連接意謂所連接之DNA序列為鄰近的,且在分泌前導區狀況下,為鄰近的且在閱讀相中。然而,強化子不必為鄰近的。連接係藉由在適宜限制位點處之連接反應來完成。若該等位點不現存,則根據習知實踐,使用合成寡核苷酸接附子或連接子。
細胞、細胞株及細胞培養物常可交替地使用且所有該等名稱在本文中包括子代。轉型體及轉型細胞包括原生受檢者細胞及自其得到之培養物,不考慮轉移數量。亦應瞭解,由於有意或無意突變,所有子代之DNA含量可不精確相等。包括具有與原始經轉型細胞中所篩選之細胞相同功能或生物學活性之突變子代。在相異名稱為吾人所欲時,其將自上下文而為明顯的。
在一替代性實施例中,所關注之免疫球蛋白之胺基酸序列可藉由直接蛋白質定序來測定。適合編碼核苷酸序列可根據通用密碼子表來設計。
所要抗體之胺基酸序列突變蛋白質可藉由將適當核苷酸改變引入編碼DNA中,或藉由狀合成來製備。該等突變蛋白質包括(例如)抗體胺基酸序列內之殘基缺失及/或插入及/或取代。進行缺失、插入及取代之任何組合以達到最終構築體,其限制條件為最終構築體擁有所要特徵。胺基酸改變亦可改變單株抗體、人類抗體、人化抗體、人類工程化TM 抗體或突變蛋白質抗體之後轉譯方法,諸如改變糖基化位點之數量或位置。
編碼抗體之胺基酸序列突變蛋白質之核酸分子係藉由此項技術中已知之各種方法製備。該等方法包括(但不限於)自天然來源(在天然存在之胺基酸序列突變蛋白質之狀況下)之分離或藉由寡核苷酸介導(或定位)突變之製備、PCR突變及早先所製備之抗體之突變蛋白質或非突變蛋白質型式的卡匣突變(cassette mutagenesis)。
本發明亦提供視情況可操作連接於藉由宿主細胞識別之控制序列之編碼本發明抗體的經分離核酸,包含核酸之載體及宿主細胞,及用於產生抗體之重組技術,其可包含培養宿主細胞以便表現核酸,且視情況自宿主細胞培養物或培養基回收抗體。
為重組產生抗體,將編碼其之核酸分離且插入可複製載體中用於進一步選殖(擴增DNA)或表現。易使用習知程序來分離編碼單株抗體之DNA且定序(例如,藉由使用能夠專一結合於編碼抗體重鏈及輕鏈之基因之寡核苷酸探針)。許多載體為可用的。載體組分通常包括(但不限於)以下者之一或多者:信號序列、複製起點、一或多個選擇標記基因、強化子元素、啟動子及轉錄終止序列。
(1)信號序列組分本發明之抗體不僅可直接重組地產生,而且可產生為具有異源多肽之融合多肽,其較佳為在成熟蛋白質或多肽之N-末端處具有特定分裂位點之信號序列或其他多肽。所選信號序列較佳為藉由宿主細胞識別及處理(亦即,藉由信號肽酶分裂)之信號序列。若原核宿主細胞不識別及處理天然抗體信號序列,則信號序列可經選自(例如)果膠酸解離酶(例如pelB)、鹼性磷酸酶、青黴素酶、lpp或熱穩定腸毒素II前導區之群之信號序列取代。對酵母分泌而言,天然信號序列可經(例如)以下者取代:酵母轉化酶前導區、α因子前導區(包括酵母菌屬(Saccharomyces)及刻魯維拉菌(Kluyveromyces)α-因子前導區),或酸性磷酸酶前導區、白色念珠菌(C.albicans)葡糖澱粉酶前導區或WO 90/13646中所述之信號。在哺乳動物細胞表現中,哺乳動物信號序列以及病毒性分泌前導區,例如單純疱疹gD信號為可用的。
該前驅區之DNA係在閱讀框架中接合於編碼抗體之DNA。
(2)複製起源組分表現載體及選殖載體含有使載體能夠在一或多個所選宿主細胞中複製之核酸序列。通常,在選殖載體中,該序列為使載體能夠獨立於宿主染色體DNA而複製之序列,且包括複製起源或自主複製序列。熟知該等序列用於各種細菌、酵母及病毒。來自質體pBR322之複製起源適於大多數革蘭氏陰性細菌,2 μ質體起源適於酵母,且各種病毒性起源適用於在哺乳動物細胞中之選殖載體。通常,對哺乳動物表現載體而言,不需要複製起源組分(可通常僅使用SV40起源,因為其含有早期啟動子)。
(3)選擇性標記組分表現載體及選殖載體可含有選擇性基因,亦稱為可選擇標記物。典型選擇基因編碼蛋白質,其(a)賦予對抗生素或其他毒素,例如安比西林(ampicillin)、新黴素(neomycin)、甲胺喋呤、四環素(tetracycline)、G418、遺傳黴素(geneticin)、組胺醇或黴酚酸之抵抗力(b)補足營養缺陷,或對(c)供應不可自複合培養基獲得之關鍵養分,例如編碼桿菌屬(Bacilli)之D-丙胺酸消旋酶之基因。
選擇方案之一實例利用藥物以阻止宿主細胞之生長。經異源基因成功轉型之彼等細胞產生賦予藥物抗性之蛋白質且因此在選擇方案中存活。該顯性選擇之實例使用藥物甲胺喋呤、新黴素、組胺醇、嘌黴素(puromycin)、黴酚酸及濕黴素(hygromycin)。
用於哺乳動物細胞之適合可選擇標記物之另一實例為使得能夠識別勝任吸收編碼抗體之核酸之細胞的彼等可選標記物,諸如DHFR、胸苷激酶、金屬硫蛋白-I及II(較佳為靈長類動物金屬硫蛋白基因)、腺苷脫胺酶、鳥胺酸脫羧酶等。
舉例而言,經DHFR選擇基因轉型之細胞係先藉由在含有甲胺喋呤(Mtx),一種DHFR之競爭性拮抗劑之培養基中培養所有轉型體來識別。當使用野生型DHFR時,適當宿主細胞為缺乏DHFR活性之中國倉鼠卵巢(CHO)細胞株。
或者,經編碼本發明之抗體之DNA序列、野生型DHFR蛋白及諸如胺基糖苷3'-磷酸轉移酶(APH)的另一可選標記物轉型或共轉型之宿主細胞(尤其為含有內源DHFR之野生型宿主),可藉由在含有諸如胺基糖苷抗生素之可選擇標記物之選擇劑,例如康黴素(kanamycin)、新黴素或G418的培養基中之細胞生長來選擇。參見美國專利第4,965,199號。
適用於酵母之適合選擇基因為存在於酵母質體YRp7中之trp1基因(Stinchcomb等人,Nature,282:39(1979))。trp1基因提供用於缺乏在色胺酸中生長之能力之酵母突變株的選擇標記,例如,ATCC第44076號或PEP4-1.Jones,Genetics,85:12(1977)。trp1病變在酵母宿主細胞基因組中之存在則提供用於藉由在不存在色胺酸下之生長來偵測轉型之有效環境。同樣地,缺Leu2酵母菌株(ATCC 20,622或38,626)係藉由帶有Leu2基因之已知質體來補充。缺Ura 3酵母菌株係藉由帶有ura3基因之質體來補充。
另外,得自1.6 μm圓形質體pKD1之載體可用於刻魯維拉菌酵母之轉型。或者,用於重組小牛凝乳酶之大規模生產之表現系統經報導用於乳酸刻魯維拉菌酵母(K.lactis)。Van den Berg,Bio/Technology,8:135(1990)。亦已揭示用於藉由刻魯維拉菌之工業菌株分泌成熟重組人血清白蛋白之穩定多複本表現載體。Fleer等人,Bio/Technology,9:968-975(1991)。
(4)啟動子組分表現載體及選殖載體通常含有藉由宿主生物體識別且可操作連接於編碼抗體之核酸之啟動子。適於供原核宿主使用之啟動子包括阿拉伯糖(例如araB)啟動子、phoA啟動子、β-內醯胺酶及乳糖啟動子系統、鹼性磷酸酶、色胺酸(trp)啟動子系統及諸如tac啟動子之雜交啟動子。然而,其他已知細菌啟動子為適合的。用於細菌系統中之啟動子亦將含有可操作連接於編碼本發明之抗體之DNA的Shine-Dalgarno(S.D.)序列。
已知用於真核生物之啟動子序列。實際上,所有真核基因具有位於離轉錄起始位點上游大致25至30個鹼基處之AT富集區。在離許多基因之轉錄開始處上游70至80個鹼基處所發現之另一序列為CNCAAT區,其中N可為任何核苷酸。大多數真核基因之3'末端處的為AATAAA序列,其可為將聚A尾(poly A tail)增加至編碼序列之3'末端之信號。所有該等序列均被適合地插入真核表現載體中。
供酵母宿主使用之適合促進序列之實例包括3-磷酸甘油激酶或諸如以下者之其他解糖酶之啟動子:烯醇酶、甘油醛-3-磷酸脫氫酶、己糖激酶、丙酮酸脫羧酶、磷果糖激酶、葡萄糖-6-磷酸異構酶、3-磷酸甘油變位酶、丙酮酸激酶、丙糖磷酸異構酶、磷葡糖異構酶及葡糖激酶。
為具有藉由生長條件所控制之轉錄之額外優點的可誘導啟動子之其他酵母啟動子為以下者之啟動子區域:醇脫氫酶2、異細胞色素C、酸性磷酸酶、與氮代謝相關之降解酶、金屬硫蛋白、甘油醛-3-磷酸脫氫酶及負責麥芽糖及半乳糖應用之酶。適用於酵母表現之適合載體及啟動子另外描述於EP 73,657中。酵母強化子亦係有利地與酵母啟動子一起使用。
在哺乳動物宿主細胞中,自載體之抗體轉錄係藉由(例如)自諸如Abelson白血病病毒(Abelson leukemia virus)、多瘤病毒、禽痘病毒、腺病毒(諸如腺病毒2)、牛乳頭狀瘤病毒、禽肉瘤病毒,最佳為細胞巨大病毒、反轉錄病毒、B型肝炎病毒及猴病毒40(SV40)之病毒之基因組,自例如肌動蛋白啟動子或免疫球蛋白啟動子之異源哺乳動物啟動子,自熱休克啟動子所獲得之啟動子來控制,其限制條件為該等啟動子與宿主細胞系統相容。
SV40病毒之早期及晚期啟動子係作為亦含有SV40病毒複製起源之SV40限制片段而便利地獲得。人類細胞巨大病毒之即刻早期啟動子係作為HindIII E限制片段而便利地獲得。使用牛乳頭狀瘤病毒作為載體在哺乳動物宿主中表現DNA之系統揭示於美國專利第4,419,446號中。該系統之修改描述於美國專利第4,601,978號中。對在胸苷激酶啟動子之控制下,在小鼠細胞中自疱疹單純型病毒表現人類β-干擾素cDNA而言,亦參見,Reyes等人,Nature 297 :598-601(1982)。或者,勞斯肉瘤病毒(rous sarcoma virus)長末端重複序列可用作啟動子。
(5)強化子元素組分藉由高級真核生物轉錄編碼本發明抗體之DNA常藉由將強化子序列插入載體中來增加。現已知許多來自哺乳動物基因(血球蛋白、彈性蛋白酶、白蛋白、α-胎蛋白及胰島素)之強化子序列。然而,通常,熟習此項技術者將使用來自真核細胞病毒之強化子。實例包括複製起源(bp 100-270)後側上之SV40強化子、細胞巨大病毒早期啟動子強化子、複製起源後側上之多瘤病毒強化子及腺病毒強化子。對用於活化真核啟動子之強化元素而言,亦參見,Yaniv,Nature 297 :17-18(1982)。強化子可在編碼抗體之序列之5'或3'位置處剪接至載體中,但較佳位於來自啟動子之5'位點處。
(6)轉錄終止組分用於真核宿主細胞(酵母、真菌、昆蟲、植物、動物、人類或來自其他多細胞生物體之有核細胞)中之表現載體亦將含有終止轉錄及穩定mRNA所必需之序列。該等序列通常可自真核或病毒DNA或cDNA之5'且有時3'未轉譯區得到。該等區含有轉錄為編碼抗體之mRNA之未轉譯部分中之多聚腺嘌呤化片段的核苷酸區段。一種有效轉錄終止組分為牛生長激素多聚腺嘌呤化區。參見WO 94/11026及其中所揭示之表現載體。另一者為小鼠免疫球蛋白輕鏈轉錄終止子。
(7)宿主細胞之選擇及轉型用於在本文中之載體中選殖或表現DNA的適合宿主細胞為上述原核生物、酵母或高級真核生物細胞。用於該目的之適合原核生物包括真細菌,諸如革蘭氏陰性或革蘭氏陽性生物體,例如,腸內菌科(Enterobacteriaceae )諸如大腸桿菌屬(Escherichia ),例如大腸桿菌,腸內桿菌屬(Enterobacter ),伊文氏桿菌屬(Erwinia ),克雷伯氏菌屬(Klebsiella ),變形桿菌屬(Proteus ),沙門氏菌屬(Salmonella ),例如,鼠傷寒沙門桿菌(Salmonella typhimurium ),沙雷氏菌屬(Serratia ),例如黏質沙雷菌(Serratia marcescans ),及志賀氏桿菌屬(Shigella ),以及桿菌屬(Bacilli ),諸如枯草桿菌(B.subtilis )及地衣芽孢桿菌(B.licheniformis )(例如,揭示於1989年4月12日公開之DD 266,710中之地衣芽孢桿菌41 P),假單胞菌屬(Pseudomonas ),諸如綠膿桿菌(P.aeruginosa )及鏈黴菌屬(Streptomyces )。儘管諸如大腸桿菌B、大腸桿菌X1776(ATCC 31,537)及大腸桿菌W3110(ATCC 27,325)之其他菌株為適合的,但是一較佳大腸桿菌選殖宿主為大腸桿菌294(ATCC 31,446)。該等實例為說明性的而非限制性的。
除原核生物外,諸如絲狀真菌或酵母之真核微生物為用於編碼抗體之載體之適合選殖或表現宿主。在低級真核宿主微生物中,釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae )或普通貝克氏酵母(baker's yeast)為最常用的。然而,許多其他屬、種及菌株常為可用且適用於本文中,諸如粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe );刻魯維拉菌宿主,諸如乳酸刻魯維酵母、脆壁刻魯維酵母(K.fragilis )(ATCC 12,424)、保加利亞刻魯維酵母(K.bulgaricus )(ATCC 16,045)、維克刻魯維酵母(K.wickeramii )(ATCC 24,178)、華特刻魯維酵母(K.waltii )(ATCC 56,500)、果蠅刻魯維酵母(K.drosophilarum )(ATCC 36,906)、嗜熱刻魯維酵母(K.thermotolerans )及馬克斯刻魯維酵母(K.marxianus );耶羅威亞酵母(yarrowia )(EP 402,226);巴斯德畢赤酵母(Pichia pastors )(EP 183,070);念珠菌屬(Candida );瑞斯木黴菌(Trichoderma reesia )(EP 244,234);粗厚神經胞子菌(Neurospora crassa );許旺酵母屬(Schwanniomyces ),諸如西方許旺酵母(Schwanniomyces occidentalis );及絲狀真菌,諸如紅黴屬(Neurospora )、青黴菌屬(Penicillium )、彎頸黴屬(Tolypocladium ),及麴菌宿主,諸如構巢麯黴(A.nidulans )及黑麴黴(A.niger )。
用於表現糖基化抗體之適合宿主細胞係得自多細胞生物體。無脊椎生物細胞之實例包括植物及昆蟲細胞。已經識別許多桿狀病毒菌株及變體及來自諸如草地黏蟲(Spodoptera frugiperda)(毛蟲)、埃及伊蚊(Aedes aegypti)(蚊子)、白紋伊蚊(Aedes albopictus)(蚊子)、黑腹果蠅(Drosophila melanogaster)(果蠅)及中國種家蠶(Bombyx mori)之宿主之相應許可昆蟲宿主細胞。用於轉染之各種病毒株為公開可用的,例如,苜蓿丫紋夜蛾(Autographa californica)NPV之L-1變體及中國種家蠶NPV之Bm-5菌株,且該等病毒可根據本發明用作本文中之病毒,尤其用於轉染草地黏蟲細胞。
棉花、玉米、馬鈴薯、黃豆、矮牽牛、番茄、煙草、浮萍及其他植物細胞之植物細胞培養物亦可用作宿主。
然而,最關注脊椎動物細胞,且脊椎動物細胞於培養物(組織培養物)中之增長已成為常規程序。有效哺乳動物宿主細胞株之實例為中國倉鼠卵巢細胞,包括CHOK1細胞(ATCC CCL61)、DXB-11、DG-44及中國倉鼠卵巢細胞/-DHFR(CHO,Urlaub等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:4216(1980));藉由SV40轉型之猴腎CV1系(COS-7,ATCC CRL 1651);人類胎腎系(經次選殖用於在懸浮培養物中生長之293或293細胞),[Graham等人,J.Gen Virol.36 :59(1977)];嬰兒倉鼠腎細胞(BHK,ATCC CCL 10);小鼠足細胞(TM4,Mather,Biol.Reprod.23:243-251(1980));猴腎細胞(CV1 ATCC CCL 70);非洲綠色猴腎細胞(VERO-76,ATCC CRL-1587);人類宮頸癌細胞(HELA,ATCC CCL 2);犬腎細胞(MDCK,ATCC CCL 34);水牛大鼠肝細胞(BRL 3A,ATCC CRL 1442);人類肺細胞(W138,ATCC CCL 75);人類肝細胞(Hep G2,HB 8065);小鼠乳腺腫瘤(MMT 060562,ATCC CCL51);TRI細胞(Mather等人,Annals N.Y Acad.Sci.383:44-68(1982));MRC 5細胞;FS4細胞;及人類肝癌系(Hep G2)。
用上述用於抗體產生之表現載體或選殖載體來轉型或轉染宿主細胞,且在經適當改質用於誘導啟動子、選擇轉型體或擴增編碼所要序列之基因之習知營養培養基中培養。另外,新穎載體及具有藉由選擇性標記分離之轉錄單元之多複本的經轉染細胞株尤其適用於且較佳用於表現抗體。
(8)培養宿主細胞用以產生本發明之抗體之宿主細胞可在各種培養基中培養。市售培養基,諸如Ham氏F10(Sigma)、最低必需培養基(MEM)(Sigma)、RPMI-1640(Sigma)及Dulbecco氏經修飾Eagle氏培養基(DMEM)(Sigma),適於培養宿主細胞。另外,描述於Ham等人,Meth.Enz.58:44(1979),Barnes等人,Anal.Biochem.102:255(1980),美國專利第4,767,704;4,657,866;4,927,762;4,560,655;或5,122,469號;WO 90103430;WO 87/00195;或美國專利參照案第30,985號中之培養基之任何者可用作宿主細胞之培養基。該等培養基之任何者可視情況補充激素及/或其他生長因子(諸如胰島素、運鐵蛋白或表皮生長因子)、鹽(諸如氯化鈉、鈣、鎂及磷酸鹽)、緩衝液(諸如HEPES)、核苷酸(諸如腺苷及胸苷)、抗生素(諸如GentamycinTM 藥物)、微量元素(定義為無機化合物,其通常以在微莫耳範圍內之最終濃度存在)及葡萄糖或等效能源。在為熟習此項技術者所知之適當濃度下,亦可包括任何其他必要補充物。諸如溫度、pH及其類似物之培養物條件為先前供經選擇用於表現之宿主細胞使用之彼等條件,且將對熟習此項技術者而言為明顯的。
(9)抗體之純化當使用重組技術時,抗體可於細胞內產生,在細胞周質空間中產生或直接分泌至包括來自微生物培養物之培養基中。若抗體於細胞內產生,則作為第一步驟,(例如)藉由離心或超濾移除微粒碎片,即宿主細胞片段或已溶解片段。Better等人Science 240:1041-1043(1988);ICSU Short Reports 10:105(1990);及Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:457-461(1993)描述用於分離分泌至大腸桿菌之細胞周質空間中之抗體的程序。(亦參見,[Carter等人,Bio/Technology 10 :163-167(1992)]。
自微生物或哺乳動物細胞製備之抗體組合物可使用(例如)羥基磷灰石層析陽離子或禽類交換層析法及親和力層析來純化,親和力層析為較佳純化技術。蛋白A作為親和力配位體之適合性視物種及存在於抗體中之任何免疫球蛋白Fc域的同型而定。蛋白A可用以純化基於人類γ1、γ2或γ4重鏈之抗體(Lindmark等人,J.Immunol.Meth. 62:1-13(1983))。推薦蛋白質G用於所有小鼠同型及用於人類γ3(Guss等人,EMBO J.5:15671575(1986))。親和力配位體所連接之基質最常見為瓊脂糖,但其他基質為可用的。與使用瓊脂糖可達成之流動速率及處理時間相比,諸如受控微孔玻璃或聚(苯乙烯二乙烯基)苯之機械穩定性基質允許更快之流動速率及更短之處理時間。在抗體包含CH 3域時,Bakerbond ABXTM 樹脂(J.T.Baker,Phillipsburg,N.J.)適用於純化。用於蛋白質純化之其他技術,諸如離子交換管柱分餾、乙醇沈澱、逆相HPLC、矽石層析、肝素SEPHAROSETM 層析、陰離子或陽離子交換樹脂(諸如聚天冬胺酸管柱)層析、層析聚焦、SDS-PAGE及硫酸銨沈澱,亦視欲回收之抗體而為可用的。
嵌合抗體
在人中單獨或作為結合物反覆活體內投藥之齧齒動物抗體將在接受者中產生抵抗齧齒動物抗體之免疫反應;所謂HAMA反應(人類抗小鼠抗體)。若需要反覆給藥,則HAMA反應可限制醫藥品之有效性。抗體之免疫原性可藉由用諸如聚乙二醇之親水性聚合物化學修飾抗體來降低,或藉由使用遺傳工程方法以製造更像人類之抗體結構,例如嵌合抗體、人化抗體、人類抗體或人類工程化TM 抗體而降低。因為該等工程化抗體在人類中比親代小鼠單株抗體免疫原性更低,所以其可用於人類之具有遠更低之過敏性風險的治療。因此,該等抗體可較佳用於涉及向人類活體內投藥之治療性應用。
其中小鼠單株抗體之可變Ig域融合於人類恆定Ig域之嵌合單株抗體可使用此項技術中已知之標準程序來產生(參見Morrison,S.L.,等人(1984)Chimeric Human Antibody Molecules;Mouse Antigen Binding Domains with Human Constant Region Domains,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81,6841-6855;及,Boulianne,G.L.等人,Nature 312,643-646.(1984))。舉例而言,結合CEA之齧齒動物抗體之可變域之基因序列可經人類骨髓瘤蛋白之可變域取代,因此產生重組嵌合抗體。該等程序詳述於EP 194276、EP 0120694、EP 0125023、EP 0171496、EP 0173494及WO 86/01533中。儘管已經證明一些嵌合單株抗體在人類中免疫原性更低,但是小鼠可變Ig域可仍導致顯著的人類抗小鼠反應。
人化抗體
人化抗體可藉由包括(例如)以下者之各種方法達到:(1)將非人類互補判定區(CDR)移植於人類構架區及恆定區上(在此項技術中稱為經由"CDR移植"之人化的方法),或者,(2)移植整個非人類可變域,但藉由置換表面殘基,用類似人類之表面將其"覆蓋"(在此項技術中稱為"面飾法"的方法)。在本發明中,人化抗體將包括"人化"抗體及"面飾"抗體。該等方法揭示於(例如)Jones等人,Nature 321:522 525(1986);Morrison等人,Proc.Natl.Acad.Sci.,U.S.A.,81:6851 6855(1984);Morrison及Oi,Adv.Immunol.,44:65 92(1988);Verhoeyer等人,Science 239:1534 1536(1988);Padlan,Molec.Immun.28:489 498(1991);Padlan,Molec.Immunol.31(3):169 217(1994);及Kettleborough,C.A.等人,Protein Eng.4(7):773 83(1991)中,其各自以引用之方式併入本文。
舉例而言,齧齒動物抗體之CDR之基因序列可經分離或合成且經同源人類抗體基因之相應序列區域取代,產生具有原始齧齒動物抗體之專一性之人類抗體。該等程序描述於EP 023940、WO 90/07861及WO 91/09967中。
CDR移植涉及將來自小鼠重鏈及輕鏈可變Ig域之6個CDR之一或多者引入人類可變Ig域之適當4個構架區中。該技術(Riechmann,L.,等人,Nature 332,323(1988))利用保守構架區(FR1-FR4)作為骨架以支撐為與抗原之主要接觸點之CDR環。然而,CDR移植之缺點為其可產生具有大體上比原始小鼠抗體更低之結合親和力之人化抗體,因為構架區之胺基酸可有助於抗原結合,且因為CDR環之胺基酸可影響2個可變Ig域之締合。為維持人化單株抗體之親和力,CDR移植技術可藉由選擇大多數精密類似於原始小鼠抗體之構架區之人類構架區,及藉由計算機模型化抗原結合位點所輔助之單一胺基酸在構架或CDR中之定位突變來改良(例如Co,M.S.,等人(1994),J.Immunol.152,2968-2976)。
人化抗體之一方法包含將非人類重鏈及輕鏈序列與人類重鏈及輕鏈序列比對,基於該比對,選擇非人類構架且用人類構架置換非人類構架,分子模型化以預測人化序列之構形且與母體抗體之構形比較。該方法之後進行殘基在CDR區域中之反覆回復突變,其干擾CDR之結構直至人化序列模型之預測構形精密近似母體非人類抗體之非人類CDR之構形。該等人化抗體可進一步經衍生以促進(例如)經由Ashwell受體之吸收及清除(參見(例如),美國專利第5,530,101及5,585,089號,該等專利以引用之方式併入本文)。
已經報導許多藉由合理設計之小鼠單株抗體之人化(參見(例如)2002年7月11日公開之20020091240,WO 92/11018及美國專利第5,693,762號、美國專利第5,766,866號)。
人類工程化 TM 抗體
片語"人類工程化TM 抗體"係指得自非人類抗體,通常小鼠單株抗體之抗體。或者,人類工程化TM 抗體可得自嵌合抗體,其保留或大體上保留親代、非人類抗體之抗原結合性質,但當向人類投予時,與親代抗體比較,其顯示降低之免疫原性。
抗體可變域之人類工程化TM 已由Studnicka[參見(例如)Studnicka等人美國專利第5,766,886號;Studnicka等人Protein Engineering 7:805-814(1994)]描述為降低免疫原性同時維持抗體分子之結合活性之方法。根據該方法,各可變區胺基酸已分配一定的取代風險。胺基酸取代係藉由3種風險種類之一來區分:(1)低風險改變為具有降低免疫原性之最大可能性與破壞抗原結合之最小概率之彼等改變;(2)中等風險改變為將進一步降低免疫原性,但具有影響抗原結合或蛋白質摺疊之更大概率之彼等改變;(3)高風險殘基為對結合或維持抗體結構為重要的且具有抗原結合或蛋白質摺疊將受影響之最高風險之彼等殘基。由於脯胺酸之三維結構作用,脯胺酸之修飾通常視為至少中等風險改變,即使該位置通常為低風險位置。
齧齒動物抗體之輕鏈及重鏈之可變區經如下人類工程化TM 以取代在經測定不可能不利地影響抗原結合或蛋白質摺疊,但可能降低在人類環境中之免疫原性之位置處的人類胺基酸。在"低風險"位置處且為根據該方法之修飾之候選者的胺基酸殘基係藉由將齧齒動物可變區之胺基酸序列與人類可變區序列比對來識別。可使用任何人類可變區,包括個別VH或VL序列或人類一致VH或VL序列或個別或一致人類生殖系序列。可改變在任何數量之低風險位置處或在所有低風險位置處之胺基酸殘基。舉例而言,在其中經對準之鼠類及人類胺基酸殘基不同之各低風險位置處,引入用人類殘基置換齧齒動物殘基之胺基酸修飾。或者,可改變在所有低風險位置處及在任何數量之中等風險位置處之胺基酸殘基。理想地,為達到最小免疫原性,將所有低及中等風險位置自齧齒動物改變至人類序列。
含有經修飾重鏈及/或輕鏈可變區之合成基因經建構且連接於人類γ重鏈及/或輕鏈恆定區。任何人類重鏈及輕鏈恆定區可與人類工程化TM 抗體可變區組合使用,包括IgA(其任何子類,諸如IgA1或IgA2)、IgD、IgE、IgG(其任何子類,諸如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4)或IgM。將人類重鏈及輕鏈基因引入諸如哺乳動物細胞之宿主細胞中,且獲得及表徵所得重組免疫球蛋白產物。
來自轉殖基因動物之人類抗體
標靶抗原之人類抗體亦可使用轉殖基因動物產生,該等轉殖基因動物不具有內源性免疫球蛋白產生且經工程化以含有人類免疫球蛋白基因座。舉例而言,WO 98/24893揭示具有人類Ig基因座之轉殖基因動物,其中該等動物由於內源性重鏈及輕鏈基因座之失活而不產生功能性內源性免疫球蛋白。WO 91/10741亦揭示能夠發動對於免疫原之免疫反應之轉殖基因非靈長類哺乳動物宿主,其中抗體具有靈長類動物恆定及/或可變區,且其中內源性免疫球蛋白編碼基因座為經取代或失活的。WO 96/30498揭示Cre/Lox系統在哺乳動物中修飾免疫球蛋白基因座之用途,諸如置換所有或一部分恆定或可變區以形成經修飾抗體分子。WO 94/02602揭示具有失活內源性Ig基因座及功能性人類Ig基因座之非人類哺乳動物宿主。美國專利第5,939,598號揭示製造轉殖基因小鼠之方法,其中該小鼠缺乏內源性重鏈,且表現包含一或多個異種異體恆定區之外生免疫球蛋白基因座。
使用上述轉殖基因動物,可對所選抗原性分子產生免疫反應,且產生抗體之細胞可自動物移除且用以產生分泌人類單株抗體之融合瘤。免疫法協定、佐劑及其類似物在此項技術中為已知的,且如WO 96/33735中所述,用於(例如)轉殖基因小鼠之免疫。該公開案揭示抵抗包括IL 6、IL 8、TNFa、人類CD4、L選擇蛋白、gp39及破傷風類毒素之各種抗原性分子之單株抗體。可測試單株抗體之抑制或中和相應蛋白質之生物活性或生理效應的能力。WO 96/33735揭示抵抗IL-8之單株抗體,其得自用IL-8免疫之轉殖基因小鼠之免疫細胞,阻斷嗜中性白血球之經IL-8誘導之功能。具有對用以免疫轉殖基因動物之抗原之專一性的人類單株抗體亦揭示於WO 96/34096及美國專利申請案第20030194404號;及美國專利申請案第20030031667號中。亦參見Jakobovits等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90:2551(1993);Jakobovits等人,Nature,362:255-258(1993);Bruggermann等人,Year in Immuno.,7:33(1993);及美國專利第5,591,669號、美國專利第5,589,369號、美國專利第5,545,807號;及美國專利申請案第20020199213號、WO 96/34096及美國專利申請案第20030194404號;及美國專利申請案第20030031667號。
適用於製造單株抗體之額外轉殖基因動物包括Medarex HuMAb-MOUSE,其描述於美國專利第5,770,429號及Fishwild,等人(Nat.Biotechnol.14:845-851,1996)中,其含有來自編碼人類抗體之重鏈及輕鏈之未重排人類抗體基因之基因序列。HuMAb-MOUSE之免疫能使標靶蛋白質之單株抗體產生。
又,Ishida等人(Cloning Stem Cells.4:91-102,2002)描述TransChromo小鼠(TCMOUSETM ),其包含人類DNA之大鹼基尺寸區段(megabase-sized segment)且併入整個人類免疫球蛋白(hIg)位置。TCMOUSE具有hIg之完全互異之集合,包括IgG之所有子類(IgG1-G4)。用各種人類抗原免疫TC小鼠產生包含人類抗體之抗體反應。
美國專利申請案第20030092125號描述使動物之免疫反應偏移至所要抗原決定基之方法。人類抗體亦可藉由活體外活化之B細胞來產生(參見美國專利第5,567,610及5,229,275號)。
來自噬菌體顯示技術之抗體
用於製造重組人類抗體基因之集合及在絲狀噬菌體表面上顯示經編碼之抗體片段的技術之發展,已提供用於直接製造及選擇人類抗體之重組手段,其亦可應用於人化抗體、嵌合抗體、鼠類抗體或突變蛋白質抗體。藉由噬菌體技術產生之抗體係作為抗原結合片段-通常為Fv或Fab片段-在細菌中產生,且因此缺乏效應子功能。效應子功能可藉由2種策略之一來引入:片段可工程化至用於在哺乳動物細胞中表現之完整抗體中,或工程化至具有能夠觸發效應子功能之第二結合位點之雙專一性抗體片段中。
通常,抗體之Fd片段(VH -CH 1)及輕鏈(VL -CL )係藉由PCR分離地選殖且隨機重組於組合噬菌體顯示庫中,隨後可就結合於特定抗原而言來選擇。Fab片段係表現於噬菌體表面上,亦即,物理連接於編碼其之基因。因此,藉由抗原結合之Fab之選擇共同選擇Fab編碼序列,隨後可將其擴增。藉由若干回之抗原結合及再擴增,即稱為淘選之程序,對於抗原具有專一性之Fab經富集且最後被分離。
在1994年,描述了稱為"指導選擇"之人化抗體之方法。指導選擇利用噬菌體顯示技術之力量用於人化小鼠單株抗體(參加Jespers,L.S.,等人,Bio/Technology 12,899-903(1994))。對其而言,小鼠單株抗體之Fd片段可與人類輕鏈庫組合顯示,且可隨後用抗原選擇所得雜交Fab庫。小鼠Fd片段進而提供指導選擇之模板。隨後,將所選人類輕鏈與人類Fd片段庫組合。所得庫之選擇產生全部人類Fab。
已經描述用於自噬菌體顯示庫得到人類抗體之各種程序(參見(例如),Hoogenboom等人,J.Mol.Biol.,227:381(1991);Marks等人,J.Mol.Biol,222:581-597(1991);美國專利第5,565,332及5,573,905號;Clackson,T.,and Wells,J.A.,TIBTECH 12,173-184(1994))。詳言之,得自噬菌體顯示庫之抗體之活體外選擇及演變已成為強有力之工具(參見Burton,D.R.及Barbas III,C.F.,Adv.Immunol.57,191-280(1994);及,Winter,G.,等人,Annu.Rev.Immunol.12,433-455(1994);美國專利申請案第20020004215號及WO 92/01047;2003年10月9日公開之美國專利申請案第20030190317號及美國專利第6,054,287號;美國專利第5,877,293號)。
Watkins,"Screening of Phage-Expressed Antibody Libraries by Capture Lift," Methods in Molecular Biology,Antibody Phage Display:Methods and Protocols 178:187-193及2003年3月6日公開之美國專利申請案第200120030044772號描述藉由俘獲升降來篩選噬菌體表現抗體庫或其他結合分子之方法,一種涉及將候選結合分子固定於固體支撐物上之方法。
可使用如本文中標題為"篩選方法"之部分中所述之檢定或使用此項技術中已知之任何適合檢定,篩選抗體產物在本發明之治療方法中之活性及適合性。
胺基酸序列突變蛋白質
本發明之抗體包括母體抗體之突變蛋白質或變體,其中母體抗體之多肽序列已經藉由在可變區或相當於可變區之部分中,包括在CDR中之至少一種胺基酸取代、缺失或插入來改變,其限制條件為突變蛋白質或變體保留所要結合親和力或生物活性。突變蛋白質可大體上同源於或大體上相同於母體抗體,例如至少65%、70%、75%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%相同或同源。關於該序列之一致性或同源性在本文中定義為胺基酸殘基在與母體序列相同之候選序列中之百分比,其在對準序列且(必要時)引入間隙後,達到最大序列百分比一致性,且不將任何保守取代視為序列一致性之部分。抗體序列中之N-末端、C-末端或內部延長、缺失或插入無一者應解釋為影響序列一致性或同源性。因此,序列一致性可藉由通常用以比較2個多肽之胺基酸之位置相似性的標準方法來測定。使用諸如BLAST或FASTA之電腦程式,對準2個多肽以用於最佳匹配其各別胺基酸(沿1或2個序列之全長,或沿1或2個序列之預定部分)。該程式提供預設開口損失及預設間隙損失,且諸如PAM 250之計分矩陣[一種標準計分矩陣;參見Dayhoff等人,inAtlas of Protein Sequence and Structure ,第5卷,增刊3(1978)]可連同該電腦程式一起使用。舉例而言,百分比一致性可隨後計算為:相同匹配總數乘以100,且隨後除以匹配跨距內較長序列之長度及引入較長序列中以對準2個序列之間隙數量之總和。
本發明之抗體亦可包括恆定區之多肽序列中之改變,其將不影響結合親和力,但可改變效應子功能,諸如抗體依賴性細胞毒性(ADCC)、補體依賴性細胞毒性(CDC)或清除及吸收(及對半衰期之所得效應)。
插入
胺基酸序列插入包括在一個殘基至含有一百個或一百個以上殘基之多肽之長度範圍內變化之胺基末端及/或羧基末端融合,以及單一或多個(例如,2個、3個或3個以上)胺基酸殘基之序列內插入。末端插入之實例包括具有N-末端甲硫胺醯基殘基之抗體或融合於抗原決定基標記或救助受體抗原決定基之抗體(包括抗體片段)。抗體分子之其他插入突變蛋白質包括添加糖基化位點、添加用於分子內或分子間鍵合之半胱胺酸,或融合於增加抗體之血清半衰期之多肽,例如在N-末端或C-末端處融合。舉例而言,可將半胱胺酸鍵添加至抗體中以改良其穩定性(尤其在抗體為諸如Fv片段之抗體片段時改良)。
抗體之糖基化通常為N連接或O連接。N連接係指碳水化合物部分連接於天冬醯胺殘基之側鏈。三肽序列天冬醯胺-X-絲胺酸及天冬醯胺-X-蘇胺酸為碳水化合物部分與天冬醯胺側鏈酶促連接之識別序列,其中X為除脯胺酸外之任何胺基酸。在多肽中,該等三肽序列之任一者之存在產生潛在糖基化位點。因此,N連接糖基化位點可藉由改變胺基酸序列以便其含有該等三肽序列之一或多者而添加至抗體中。O連接糖基化係指糖N-乙醯基半乳胺糖、半乳糖或木糖之一連接於羥基胺基酸,最通常為絲胺酸或蘇胺酸,儘管亦可使用5-羥基脯胺酸或5-羥基離胺酸。O連接糖基化位點可藉由將一或多個絲胺酸或蘇胺酸殘基插入或取代至原始抗體之序列中而添加至抗體中。
術語"經抗原決定基標記"係指融合於抗原決定基標記之抗體。抗原決定基標記多肽具有足夠殘基以提供抗原決定基,相對該抗原決定基可產生抵抗其之抗體,但足夠短以便其不干擾抗體之活性。抗原決定基標記較佳為足夠獨特的以便抵抗其之抗體不大體上與其他抗原決定基交叉反應。適合標記多肽通常具有至少6個胺基酸殘基及通常約8-50之間的胺基酸殘基(較佳約9-30殘基之間)。實例包括流感HA標記多肽及其抗體12CA5[Field等人,Mol.Cell.Biol.8 :2159-2165(1988)];c-myc標記及其之8F9、3C7、6E10、G4、B7及9E10抗體[Evan等人,Mol.Cell.Biol.5(12) :3610-3616(1985)];及疱疹單純型病毒醣蛋白D(gD)標記及其抗體[Paborsky等人,Protein Engineering 3(6) :547-553(1990)]。其他示範性標記為聚組胺酸序列,通常為約6個組胺酸殘基,其允許使用鎳螯合作用分離如此標記之化合物。諸如FLAG標記(Eastman Kodak,Rochester,NY)之此項技術中熟知及常規使用之其他標記(label)及標記(tag)係由本發明涵蓋。
如本文中所使用,術語"救助受體結合抗原決定基"係指IgG分子(例如IgG1 、IgG2 、IgG3 或IgG4 )之Fc區域之抗原決定基,其負責增加IgG分子之活體內血清半衰期。
缺失
胺基酸序列缺失包括在一個至一百個或一百個以上殘基之長度範圍內變化,並產生保留對標靶抗原之結合親和力之片段的胺基末端及/或羧基末端缺失,以及單一或多個(例如,2個、3個或3個以上)胺基酸殘基之序列內缺失。舉例而言,糖基化位點可藉由刪去用於糖基化之部分或全部三肽或其他識別序列來刪去或移動至不同位置。
取代
另一類型之突變蛋白質為胺基酸取代突變蛋白質。該等突變蛋白質具有所移除之抗體分子中之至少一個胺基酸殘基及插入於其位置中之不同殘基。涵蓋在高變區或CDR區或構架區之任何者中之取代突變。保守取代展示於表1中。大多數保守取代見於標題"較佳取代"中。若該等取代不造成生物活性之改變,則可引入更多實質性修改(在表1中命名為"示範性取代",或如下文參考胺基酸種類進一步所述),且篩選產物。
抗體生物性質之實質修飾可藉由選擇取代來完成,該等取代在其對維持以下者之效應上顯著不同:(a)取代區域中多肽骨架之結構,例如摺疊(sheet)或螺旋構形;(b)分子在標靶位點處之電荷或疏水性;或(c)側鏈松密度。基於共同側鏈性質將天然存在之殘基分組:(1)疏水性:正白胺酸、met、ala、val、leu、ile;(2)中性親水性:cys、ser、thr;(3)酸性:asp、glu;(4)鹼性:asn、gln、his、lys、arg;(5)影響鏈定向之殘基:gly、pro;及(6)芳族:trp、tyr、phe。
保守取代涉及用具種類之另一成員置換胺基酸。非保守取代涉及用另一種類之成員置換該等種類之一者的成員。
不涉及維持抗體之適當構形之任何半胱胺酸殘基亦可經取代(通常經蘇胺酸)以改良分子之氧化穩定性且阻止異常交聯。
親和力成熟通常涉及製備及篩選在母體抗體之CDR內具有取代之抗體變體,及選擇具有相對於母體抗體之改良生物性質(諸如結合親和力)之變體。產生該等取代變體之一適宜方式為使用噬菌體顯示之親和力成熟。簡言之,使若干高變區位點(例如6-7個位點)突變以在各位點處產生所有可能之胺基酸取代。因此產生之抗體變體係以單價方式自絲狀噬菌體粒子顯示為與封裝於各粒子內之M13之基因III產物的融合物。隨後篩選噬菌體顯示變體之生物活性(例如結合親和力)。參見(例如)WO 92/01047、WO 93/112366、WO 95/15388及WO 93/19172。
當前抗體親和力成熟方法屬於2種突變類別:隨機的及非隨機的。傾向誤差之PCR,突變基因細菌菌株(Low等人,J.Mol.Biol. 260,359-68,1996)及飽和突變(Nishimiya等人,J.Biol.Chem. 275:12813-20,2000;Chowdhury,P.S.Methods Mol.Biol. 178,269-85,2002)為隨機突變方法之典型實例(Rajpal等人,Proc Natl Acad Sci U S A. 102:8466-71,2005)。非隨機技術常使用丙胺酸掃描或定位突變以產生專一性變體之有限集合。一些方法進一步詳述於下文中。
經由淘選方法之親和力成熟 -重組抗體之親和力成熟通常係在降低量之抗原存在下,經由候選抗體之若干回淘選來執行。每回降低抗原之量選擇對抗原具有最高親和力之抗體,進而自起始物質之大池產生具有高親和力之抗體。經由淘選之親和力成熟在此項技術中為熟知的且描述於(例如)Huls等人(Cancer Immunol Immunother. 50:163-71,2001)中。使用噬菌體顯示技術之親和力成熟方法描述於本文中之其他處且在此項技術中為已知的(參見(例如),Daugherty等人,Proc Natl Acad Sci U S A. 97:2029-34,2000)。
透視突變 -透視突變(LTM)(Rajpal等人,Proc Natl Acad Sci U S A. 102:8466-71,2005)提供用於快速映射抗體結合位點之方法。對LTM而言,選擇代表藉由20種天然胺基酸提供之主要側鏈化學作用之9種胺基酸,以分割結合於抗體之所有6個CDR中之每一位置的功能性側鏈作用。LTM在CDR內產生一系列位置之單一突變,其中各"野生型"殘基系統地經9種所選胺基酸之一取代。組合經突變CDR,以產生具有增加複雜性及尺寸而不禁止所有變體之定量顯示之組合單鏈可變片段(scFv)庫。正性選擇後,將具有改良結合之純系定序,且映射有益突變。
傾向誤差之PCR -傾向誤差之PCR涉及核酸在不同選擇回數之間的隨機化。隨機化藉由所使用之聚合酶之固有誤差速率,以低速率發生,但可藉由傾向誤差之PCR(Zaccolo等人,J.Mol.Biol.285:775-783,1999),在轉錄期間使用具有高固有誤差速率之聚合酶(Hawkins等人,J Mol Biol.226:889-96,1992)來增強。突變循環後,使用此項技術中之常規方法選擇具有對抗原之改良親和力之純系。
DNA改組 -核酸改組為將具有較短或較小多核苷酸之池活體外或活體內同源重組以產生變體多核苷酸之方法。DNA改組已描述於美國專利第6,605,449號、美國專利6,489,145、WO 02/092780及Stemmer,Proc.Natl.Acad.Sci.USA ,91:10747-51(1994)中。通常,DNA改組由3個步驟組成:用DNase I使欲改組之基因斷裂,藉由在DNA聚合酶存在下之PCR(性PCR)將片段隨機雜交且重裝配或填充破碎基因,及藉由習知PCR擴增重裝配產物。
DNA改組不同於傾向誤差之PCR,因為其為反鏈反應。在傾向誤差之PCR中,聚合酶起始位點之數量及分子數量按指數增長。相反,在隨機多核苷酸之核酸重裝配或改組中,起始位點數量及隨機多核苷酸數量(並非尺寸)隨時間降低。
在抗體狀況下,DNA改組容許(例如)所有CDR1與所有CDR2與所有CDR3之自由組合締合。所涵蓋的為,多個家族之序列可在相同反應中改組。另外,改組通常保存相對次序,以便(例如)CDR1將不見於CDR2之位置中。稀有改組物將含有大量最好(例如最高親和力)CDR且該等稀有改組物可基於其優越之親和力來選擇。
可用於DNA改組中之模板多核苷酸可為DNA或RNA。其可視欲重組或重裝配之基因或較短或較小多核苷酸之尺寸而具有各種長度。較佳地,模板多核苷酸為50 bp至50 kb。模板多核苷酸應常為雙股的。
所涵蓋的為,可將具有與模板多核苷酸一致之區域及與模板多核苷酸異源之區域的單股或雙股核酸多核苷酸在基因選擇之初始步驟期間添加至模板多核苷酸中。亦涵蓋的為,2種不同但相關之多核苷酸模板可在初始步驟期間混合。
丙胺酸掃描 -可執行丙胺酸掃描突變以識別對抗原結合有顯著貢獻之高變區殘基。Cunningham及Wells(Science 244:1081-1085,1989)。識別殘基或標靶殘基之群(例如帶電殘基,諸如arg、asp、his、lys及glu)且藉由中性或帶負電胺基酸(最佳為丙胺酸或聚丙胺酸)置換以影響胺基酸與抗原之相互作用。隨後藉由在(或對)取代位點引入另外或其他變體來改進證明對取代有功能敏感性之彼等胺基酸位置。因此,雖然引入胺基酸序列變化之位點為預定的,但是突變本身之性質不需要預定。舉例而言,為分析在給定位點處突變之效能,在標靶密碼子或區域處進行ala掃描或隨機突變,且篩選所表現之抗體突變蛋白質之所要活性。
電腦輔助設計 -或者或另外,有益的可為分析抗原-抗體複合物之晶體結構以識別抗體與抗原之間的接觸點,或使用電腦軟體以模型化該等接觸點。該等接觸殘基及相鄰殘基為用於根據本文詳述之技術之取代的候選者。一旦產生該等變體,變體組就經受如本文所述之篩選,且可在一或多個相關檢定中選擇具有優越性質之抗體用於進一步研發。
親和力成熟涉及製備及篩選在母體抗體之CDR內具有取代之抗體突變蛋白質,及選擇具有相對於母體抗體之改良生物性質(諸如結合親和力)之突變蛋白質。產生該等取代突變蛋白質之一適宜方式為使用噬菌體顯示之親和力成熟。簡言之,使若干高變區位點(例如6-7個位點)突變,以在各位點處產生所有可能之胺基酸取代。因此產生之抗體突變蛋白質係以單價方式自絲狀噬菌體粒子顯示為與封裝於各粒子內之M13之基因III產物的融合物。隨後篩選噬菌體顯示突變蛋白質之生物活性(例如結合親和力)。
可執行丙胺酸掃描突變以識別對抗原結合有顯著貢獻之高變區殘基。另外或其他,有益的可為分析抗原-抗體複合物之晶體結構以識別抗體與抗原之間的接觸點。該等接觸殘基及相鄰殘基為用於根據本文詳述之技術之取代的候選者。一旦產生該等突變蛋白質,突變蛋白質組就經受如本文所述之篩選,且可在一或多個相關檢定中選擇具有優越性質之抗體用於進一步研發。
經改變之效應子功能
涵蓋抗體之其他修飾。舉例而言,可需要關於效應子功能而修飾本發明之抗體,以便增強抗體在治療(例如)癌症中之有效性。舉例而言,可將半胱胺酸殘基引入Fc區域中,進而容許在該區域中之鏈間雙硫鍵形成。因此產生之同源二聚抗體可具有改良之內化能力及/或增加之補體介導之細胞殺死及抗體依賴性細胞毒性(ADCC)。參見Caron等人,J.Exp Med.176:1191-1195(1992)及Shopes,B.J.Immunol.148:2918-2922(1992)。具有增強活性之同源二聚抗體亦可如Wolff等人,Cancer Research 53:2560-2565(1993)中所述,使用具源雙功能交叉連接子來製備。或者,具有雙Fc區之抗體可經工程化且可進而具有增強之補體溶解及ADCC能力。參見Stevenson等人,Anti-Cancer Drug Design 3 :219-230(1989)。另外,已展示CDR內之序列可使抗體結合於MHC II類且觸發不需要之輔助T-細胞反應。保守取代可使抗體保留結合活性,但損失其觸發不需要之T-細胞反應之能力。亦參見Steplewski等人,Proc Natl Acad Sci U S A.1988;85(13):4852-6,其以引用之方式全部併入本文,其描述嵌合抗體,其中鼠類可變區與人類γ1、γ2、γ3及γ4恆定區接合在一起。
在本發明之某些實施例中,可需要使用抗體片段而非完整抗體以增加(例如)腫瘤滲透。在該狀況下,可需要修飾抗體片段以增加其血清半衰期,例如,將諸如PEG之分子或包括多醣聚合物之其他水溶性聚合物添加至抗體片段中以增加半衰期。其亦可(例如)藉由將救助受體結合抗原決定基併入抗體片段中來達到(例如,藉由抗體片段中之適當區域之突變或藉由將抗原決定基併入肽標記中,隨後藉由DNA或肽合成,在末端或中間處將其融合於抗體片段)(參見(例如),WO 96/32478)。
救助受體結合抗原決定基較佳構成區域,其中來自Fc域之1或2個環之任何一或多個胺基酸殘基轉移至抗體片段之類似位置。甚至更佳地,轉移來自Fc域之1或2個環之3個或3個以上殘基。仍更佳地,抗原決定基係取自Fc區域(例如IgG)之CH2域,且轉移至抗體之CH1、CH3或VH區域,或1個以上之該區域中。或者,抗原決定基係取自Fc區域之CH2域且轉移至抗體片段之C.sub.L區域或V.sub.L區域或兩個區域中。亦參見國際申請案WO 97/34631及WO 96/32478,其描述Fc變體及其與救助受體之相互作用。
因此,本發明之抗體可包含人類Fc部分、人類一致Fc部分,或保留與Fc救助受體相互作用之能力之其突變蛋白質,包括其中涉及雙硫鍵合之半胱胺酸經修飾或移除之突變蛋白質,及/或其中在N-末端添加met及/或N-末端20種胺基酸之一或多者經移除,及/或諸如C1q結合位點之與補體相互作用之區域經移除,及/或ADCC位點經移除之突變蛋白質[參見(例如)Molec.Immunol.29(5):633-9(1992)]。IgG類之抗體亦可包括不同恆定區,例如IgG2抗體可經修飾以顯示IgG1或IgG4恆定區。
在IgG1狀況下,對恆定區,尤其鉸鏈區或CH2區之修飾可增加或降低包括ADCC及/或CDC活性之效應子功能。在其他實施例中,IgG2恆定區經修飾以減少抗體-抗原聚集體形成。在IgG4狀況下,對恆定區,尤其鉸鏈區之修飾可減少半抗體之形成。在特定示範性實施例中,使IgG4鉸鏈序列Cys-Pro-Ser-Cys突變成IgG1鉸鏈序列Cys-Pro-Pro-Cys。
早先之研究主要將FcR之人類及鼠類IgG上之結合位點映射於包含IgG殘基233-239之低鉸鏈區。其他研究建議例如人類Fc受體I之Gly316-Lys338、人類Fc受體III之Lys274-Arg301及Tyr407-Arg416之額外寬的區段,或發現少數超出低鉸鏈範圍之專一性殘基,例如與鼠類Fc受體II相互作用之鼠類IgG2b之Asn297及Glu318。具有人類Fc受體IIIA之人類IgG1 Fc片段之3.2-晶體結構的報導敍述,當涉及結合於Fc受體IIIA時之IgG1殘基Leu234-Ser239、Asp265-Glu269、Asn297-Thr299及Ala327-Ile332。已基於晶體結構暗示,除低鉸鏈(Leu234-Gly237)外,IgG CH2域環FG中之殘基(殘基326-330)及BC中之殘基(殘基265-271)可起結合於Fc受體IIA之作用。參見Shields等人,J.Biol.Chem.,276(9):6591-6604(2001),其以引用之方式全部併入本文。Fc受體結合位點內之殘基突變可產生經改變之效應子功能,諸如經改變之ADCC或CDC活性,或經改變之半衰期。如上所述,可能的突變包括一或多個殘基之插入、缺失或取代,包括經丙胺酸取代、保守取代、非保守取代,或經在相同位置之來自不同IgG子類之相應胺基酸殘基置換(例如,經在彼位置之相應IgG2殘基置換IgG1殘基)。
Shields等人報導,涉及結合於所有人類Fc受體之IgG1殘基係位於鄰近於鉸鏈之CH2域內且分成如下之2種類別:1)可直接與所有FcR相互作用之位置包括Leu234-Pro238、Ala327及Pro329(及可能為Asp265);2)影響碳水化合物性質或位置之位置包括Asp265及Asn297。影響與Fc受體II結合之額外IgG1殘基如下:(最大影響)Arg255、Thr256、Glu258、Ser267、Asp270、Glu272、Asp280、Arg292、Ser298,及(較小影響)His268、Asn276、His285、Asn286、Lys290、Gln295、Arg301、Thr307、Leu309、Asn315、Lys322、Lys326、Pro331、Ser337、Ala339、Ala378及Lys414。A327Q、A327S、P329A、D265A及D270A降低結合。除上文對所有FcR而言所識別之殘基外,降低與Fc受體IIIA之結合40%或40%以上之額外IgG1殘基如下:Ser239、Ser267(僅Gly)、His268、Glu293、Gln295、Tyr296、Arg301、Val303、Lys338及Asp376。改良與FcRIIIA之結合之突變蛋白質包括T256A、K290A、S298A、E333A、K334A及A339T。Lys414展示對FcRIIA及FcRIIB結合之40%降低率,Arg416展示對FcRIIA及FcRIIIA結合之30%降低率,Gln419展示對FcRIIA結合之30%降低率及對FcRIIB結合之40%降低率,及Lys360展示對FcRIIIA結合之23%降低率。亦參見Presta等人,Biochem.Soc.Trans.(2001)30,487-490。
舉例而言,以引用之方式全部併入本文之美國專利第6,194,551號描述具有經改變之效應子功能之突變蛋白質,其在人類IgG Fc區域內,在胺基酸位置329、331或322處(使用Kabat編號)含有突變,一些該等突變蛋白質顯示降低之Clq結合或CDC活性。作為另一實例,以引用之方式全部併入本文之美國專利第6,737,056號描述具有經改變之效應子或Fc-γ-受體結合之突變蛋白質,其在人類IgG Fc區域內,在以下胺基酸位置處含有突變:238、239、248、249、252、254、255、256、258、265、267、268、269、270、272、276、278、280、283、285、286、289、290、292、294、295、296、298、301、303、305、307、309、312、315、320、322、324、326、327、329、330、331、333、334、335、337、338、340、360、373、376、378、382、388、389、398、414、416、419、430、434、435、437、438或439(使用Kabat編號),一些該等突變蛋白質顯示與降低之ADCC或CDC活性相關之受體結合概況。該等者中,在胺基酸位置238、265、269、270、327或329處之突變陳述為降低與FcRI之結合,在以下胺基酸位置處之突變:238、265、269、270、292、294、295、298、303、324、327、329、333、335、338、373、376、414、416、419、435、438或439陳述為降低與FcRII之結合,且在以下胺基酸位置處之突變:238、239、248、249、252、254、265、268、269、270、272、278、289、293、294、295、296、301、303、322、327、329、338、340、373、376、382、388、389、416、434、435或437陳述為降低與FcRIII之結合。
以引用之方式全部併入本文之美國專利第5,624,821號報導,鼠類抗體之Clq結合活性可藉由使重鏈之胺基酸殘基318、320或322突變來改變,且置換殘基297(Asn)產生溶解活性之移除。
以引用之方式全部併入本文之美國申請公開案第20040132101號描述具有在以下胺基酸位置處之突變之突變蛋白質:240、244、245、247、262、263、266、299、313、325、328或332(使用Kabat編號)或位置234、235、239、240、241、243、244、245、247、262、263、264、265、266、267、269、296、297、298、299、313、325、327、328、329、330或332(使用Kabat編號),其中在以下位置之突變:234、235、239、240、241、243、244、245、247、262、263、264、265、266、267、269、296、297、298、299、313、325、327、328、329、330或332可降低ADCC活性或降低與Fcγ受體之結合。
以引用之方式全部併入本文之Chappel等人,Proc Natl Acad Sci U S A.1991;88(20):9036-40報導,IgG1之嗜細胞活性為其重鏈CH2域之固有性質。在IgG1之胺基酸殘基234-237之任何處的單點突變顯著降低或消除其活性。需要所有IgG1殘基234-237(LLGG)於IgG2及IgG4中之取代以恢復全部結合活性。觀察到含有整個ELLGGP序列(殘基233-238)之IgG2抗體比野生型IgG1更有活性。
以引用之方式全部併入本文之Isaacs等人,J Immunol.1998;161(8):3862-9報導,具有對Fc γR結合為關鍵之基元(麩胺酸233至脯胺酸、白胺酸/苯丙胺酸234至纈胺酸及白胺酸235至丙胺酸)之突變完全防止標靶細胞之耗盡。突變麩胺酸318至丙胺酸消除小鼠IgG2b之效應子功能以及降低人類IgG4之效能。
以引用之方式全部併入本文之Armour等人,Mol Immunol.2003;40(9):585-93識別IgG1突變蛋白質,其與活化受體FcγRIIa之反應,比與野生型IgG1之反應的有效性低至少10倍,但其與抑制性受體FcγRIIb之結合僅降低4倍。在胺基酸233-236之區域中及/或在胺基酸位置327、330及331處進行突變。亦參見WO 99/58572,其以引用之方式全部併入本文。
以引用之方式全部併入本文之Xu等人,J Biol Chem.1994;269(5):3469-74報導,將IgG1 Pro331突變至Ser顯著降低Clq結合且實際上消除溶解活性。相反,在IgG4中將Pro取代成Ser331給予IgG4 Pro331突變蛋白質部分溶解活性(40%)。
以引用之方式全部併入本文之Schuurman等人,Mol Immunol.2001;38(1):1-8報導,將涉及重鏈間鍵形成之鉸鏈半胱胺酸之一,即Cys226突變至絲胺酸產生更穩定之重鏈間鍵聯。將IgG4鉸鏈序列Cys-Pro-Ser-Cys突變至IgG1鉸鏈序列Cys-Pro-Pro-Cys亦顯著穩定重鏈之間的共價相互作用。
以引用之方式全部併入本文之Angal等人,Mol Immunol.1993;30(1):105-8報導,將IgG4中之胺基酸位置241處之絲胺酸突變至脯胺酸(見於IgG1及IgG2中之彼位置)引起同質抗體之產生,以及與原始嵌合IgG4比較,延長血清半衰期且改良組織分布。
本發明亦涵蓋具有經改變之碳水化合物結構,產生經改變之效應子活性的抗體分子之產生,包括不存在或具有降低海藻糖基化之抗體分子,其顯示改良之ADCC活性。在此項技術中已知完成其之各種方式。舉例而言,ADCC效應子活性係藉由使抗體分子結合於FcγRIII受體來介導,已展示其視CH2域之Asn-297處之N連接糖基化的碳水化合物結構而定。非海藻糖基化抗體以增加之親和力結合該受體,且觸發比天然、海藻糖基化抗體更有效之FcγRIII介導效應子功能。舉例而言,在其中α-1,6-海藻糖基轉移酶酵素已敲出之CHO細胞中重組產生非海藻糖基化抗體,產生具有增加100倍之ADCC活性之抗體[γamane-Ohnuki等人,Biotechnol Bioeng.2004 Sep 5;87(5):614-22]。相似效應可經由降低該酵素或其他酵素在海藻糖基化路徑中之活性來完成,例如經由siRNA或反義RNA處理,將細胞株工程化以敲出酵素或用選擇性糖基化抑制劑培養來完成[Rothman等人,Mol Immunol.1989 Dec;26(12):1113-23]。一些宿主細胞菌株,例如Lec13或大鼠融合瘤YB2/0細胞株天然產生具有較低海藻糖基化水平之抗體。Shields等人,J Biol Chem.2002 Jul 26;277(30):26733-40;Shinkawa等人,J Biol Chem.2003 Jan 31;278(5):3466-73。(例如)經由在過度表現GnTIII酵素之細胞中重組產生抗體之平分碳水化合物水平的增加亦已經測定可增加ADCC活性。Umana等人,Nat Biotechnol.1999 Feb;17(2):176-80。已預測僅缺少2種海藻糖殘基之一者可足以增加ADCC活性。Ferrara等人,J Biol Chem.2005 Dec 5;[Epub ahead of print]。
其他共價修飾
抗體之共價修飾亦包括在本發明之範疇內。其可藉由化學合成或(適合時)藉由抗體之酶促或化學分裂來進行。抗體之其他類型之共價修飾係藉由使抗體之標靶胺基酸殘基與能夠與所選側鏈或N-末端殘基或C-末端殘基反應之有機衍生劑反應而引入分子中。
半胱胺醯基殘基係最通常與α-鹵乙酸(及相應胺),諸如氯乙酸或氯乙醯胺反應,以得到羧甲基或羧基醯胺基甲基衍生物。半胱胺醯基殘基亦藉由與以下者反應來衍生:溴三氟丙酮、α-溴-β-(5-亞胺醯基)丙酸、磷酸氯乙醯酯、N-烷基馬來醯亞胺、3-硝基-2-吡啶基二硫化物、甲基2-吡啶基二硫化物、對氯汞苯甲酸、2-氯汞基-4-硝基酚或氯-7-硝基苯并-2-噁-1,3-二唑。
組胺醯基殘基係藉由在pH 5.5-7.0下與焦碳酸二乙酯反應來衍生,因為該藥劑對組胺醯基側鏈具有相對專一性。對溴苄醯甲基溴亦為有效的;反應較佳係在pH 6.0下,在0.1 M二甲胂酸鈉中執行。
離胺醯基及胺基-末端殘基係與琥珀酸或其他羧酸酐反應。以該等藥劑之衍生具有使離胺醯基殘基之電荷反向的效應。用於衍生含有α-胺基之殘基之其他適合試劑包括諸如吡啶甲醯亞胺酸甲酯之亞胺酯、磷酸吡哆醛、吡哆醛、氯硼氫化物、三硝基苯磺酸、O-甲基異尿素、2,4-戊二酮及與乙醛酸之轉胺酶催化反應。
精胺醯基殘基係藉由與一或若干種習知試劑之反應來修飾,其中該等習知試劑為苯基乙醛、2,3-丁二酮、1,2-環己二酮及茚滿三酮。精胺酸殘基之衍生由於胍官能基之高pKa 而需要在鹼性條件下執行反應。此外,該等試劑可與離胺酸之基團以及精胺酸ε-胺基反應。
可進行酪胺醯基殘基之專一性修飾,尤其關注藉由與芳族重氮化合物或四硝基甲烷之反應將光譜標記引入酪胺醯基殘基中。最通常地,N-乙醯基咪唑及四硝基甲烷係分別用以形成O-乙醯基酪胺醯基物質及3-硝基衍生物。酪胺醯基殘基係使用125 I或131 I碘化以製備適用於放射免疫檢定之標記蛋白質。
羧基側基(天冬胺醯基或麩胺醯基)係藉由與諸如1-環己基-3-(2-嗎啉基-4-乙基)碳化二醯亞胺或1-乙基-3-(4-氮鎓-4,4-二甲基戊基)碳化二醯亞胺之碳化二醯亞胺(R-N.dbd.C.dbd.N-R')(其中R及R'為不同烷基)之反應來選擇性修飾。此外,藉由與銨離子之反應將天冬胺醯基及麩胺醯基殘基轉化成天冬醯胺醯基及麩醯胺醯基殘基。
麩醯胺醯基及天冬醯胺醯基殘基常常分別去醯胺化成相應麩胺醯基及天冬胺醯基殘基。該等殘基係在中性或鹼性條件下去醯胺化。該等殘基之去醯胺化形式落在本發明之範疇內。
其他修飾包括脯胺酸及離胺酸之羥基化,絲胺醯基或蘇胺醯基殘基之羥基之磷酸化,離胺酸、精胺酸及組胺酸側鏈之α-胺基之甲基化作用(T.E.Creighton,Proteins:Structure and Molecular Properties,W.H.Freeman & Co.,San Francisco,pp.79-86(1983)),N-末端胺之乙醯化及任何C-末端羧基之醯胺化。
另一類型之共價修飾涉及使糖苷化學或酶促偶合於抗體。該等程序為有利的,因為其不需要在具有對N連接或O連接糖基化具有糖基化能力之宿主細胞中產生抗體。視所使用之偶合模式而定,糖可連接於(a)精胺酸及組胺酸、(b)游離羧基、(c)諸如半胱胺酸之彼等者之游離硫氫基、(d)諸如絲胺酸、蘇胺酸或羥基脯胺酸之彼等者之游離羥基、(e)諸如苯丙胺酸、酪胺酸或色胺酸之彼等者之芳族殘基或(f)麩醯胺酸之醯胺基團。該等方法描述於1987年9月11日公開之WO87/05330,及Aplin及Wriston,CRC Crit.Rev.Biochem.,第259-306(1981)頁中。
存在於抗體上之任何碳水化合物部分之移除可化學地或酶促地完成。化學去糖基化需要使抗體暴露於化合物三氟甲烷磺酸或等價化合物。該處理產生除連接糖(N-乙醯基葡糖胺或N-乙醯基半乳胺糖)外之大多數或所有糖之分裂,同時留下完整抗體。化學去糖基化係由Hakimuddin,等人Arch.Biochem.Biophys.259:52(1987)及由Edge等人Anal.Biochem.,118:131(1981)描述。抗體上之碳水化合物部分之酶促分裂可如由Thotakura等人Meth.Enzymol.138:350(1987)所述,藉由使用各種內及外醣苷酶來達到。
抗體之另一類型之共價修飾包含將抗體連接於例如以下者之各種非蛋白質聚合物之一:聚乙二醇、聚丙二醇、聚氧乙烯多元醇、聚氧乙烯山梨聚糖醇、聚氧乙烯葡萄糖、聚氧乙烯甘油、聚氧化烯或諸如葡聚糖之多醣聚合物。該等方法在此項技術中為已知的,參見(例如)美國專利第4,640,835;4,496,689;4,301,144;4,670,417;4,791,192、4,179,337、4,766,106、4,179,337、4,495,285、4,609,546號或EP 315 456。
各抗體分子可連接於一或多種(亦即,1、2、3、4、5種或5種以上)聚合物分子。聚合物分子較佳藉由連接子分子連接於抗體。聚合物一般可為合成或天然存在聚合物,例如,視情況經取代直鏈或支鏈聚烯烴、聚伸烯烴或聚氧化烯聚合物或分支或未分支多醣,例如同源或異源多醣。較佳聚合物為聚氧化乙烯多元醇及聚乙二醇(PEG)。PEG在室溫下可溶於水且具有通式:R(O--CH2--CH2)n O--R,其中R可為氫或諸如烷基或烷醇基團之保護基。較佳地,保護基具有在1與8之間的碳,更佳地,其為甲基。符號n為正整數,較佳在1與1,000之間,更佳在2與500之間。PEG具有在1000與40,000之間,更佳在2000與20,000之間,最佳在3,000與12,000之間的較佳平均分子量。較佳地,PEG具有至少一個羥基,更佳地,其為末端羥基。該羥基較佳經活化以與抑制劑上之游離胺基反應。然而,應瞭解反應性基團之類型及數量可變化以達到本發明之共價結合PEG/抗體。較佳聚合物及將其連接於肽之方法展示於美國專利第4,766,106;4,179,337;4,495,285;及4,609,546號中,其全部在此以引用之方式全部併入。
基因療法
將治療性抗體傳遞至適當細胞中可藉由使用此項技術中已知之任何合適方法,經由離體、原位或活體內基因療法來實現,包括藉由使用物理DNA轉移方法(例如脂質體或化學治療)或藉由使用病毒載體(例如腺病毒、腺相關病毒或反轉錄病毒)來實現。舉例而言,對活體內療法而言,編碼所要抗體之核酸可單獨或連同載體、脂質體或沈澱物一起直接注射至受檢者中,且在一些實施例中,可在其中需要表現抗體化合物之位點處注射。對離體治療而言,移除受檢者之細胞,將核酸引入該等細胞中,且將經修飾細胞直接返回至受檢者或(例如)包裹於植入患者中之多孔膜中。參見(例如)美國專利第4,892,538及5,283,187號。各種技術可用於將核酸引入活細胞中。技術視核酸係活體外轉移至所培養之細胞中還是在所欲宿主之細胞中活體內而變化。適於將核酸活體外轉移至哺乳動物細胞中之技術包括使用脂質體、電穿孔、微注射、細胞融合、DEAE-葡聚糖及磷酸鈣沈澱方法。用於離體傳遞核酸之常用載體為反轉錄病毒。
其他活體內核酸轉移技術包括用病毒載體(諸如腺病毒、單純疱疹I病毒或腺相關病毒)及基於脂質之系統來轉染。核酸及轉染劑視情況與微粒締合。示範性轉染劑包括磷酸鈣或氯化鈣共沈澱、DEAE-葡聚糖介導之轉染、四級銨兩親分子DOTMA(溴化(二油醯基氧基丙基)三甲基銨,由GIBCO-BRL以Lipofectin銷售)(Felgner等人,(1987)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 84,7413-7417;Malone等人(1989)Proc.Natl Acad.Sci.USA 86 6077-6081);具有側接三甲基銨頭之親脂性麩胺酸二酯(Ito等人(1990)Biochem.Biophys.Acta 1023,124-132);諸如陽離子脂質二(十八烷基)醯胺基甘胺醯基精胺(DOGS、Transfectam、Promega)及二軟脂醯基磷脂醯基乙醇戊基精胺(DPPES)之可代謝母體脂質(J.P.Behr(1986)Tetrahedron Lett.27,5861-5864;J.P.Behr等人(1989)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86,6982-6986);可代謝四級銨鹽(DOTB、N-(1-[2,3-二油醯基氧基]丙基)-N,N,N-三甲基銨硫酸甲酯(DOTAP)(Boehringer Mannheim)、聚乙烯亞胺(PEI)、二油醯基酯、ChoTB、ChoSC、DOSC)(Leventis等人(1990)Biochim.Inter.22,235-241);3β[N-(N',N'-二甲基胺基乙烷)-胺甲醯基]膽固醇(DC-Chol)、呈1比1混合物之二油醯基磷脂醯基乙醇胺(DOPE)/3β[N-(N',N'-二甲基胺基乙烷)-胺甲醯基]膽固醇DC-Chol(Gao等人,(1991)Biochim.Biophys.Acta 1065,8-14)、精胺、亞精胺、脂質多元胺(Behr等人,Bioconjugate Chem,1994,5:382-389)、親脂性聚離胺酸(LPLL)(Zhou等人,(1991)Biochim.Biophys.Acta 939,8-18)、具有過量磷脂醯膽鹼/膽固醇之[[(1,1,3,3-四甲基丁基)甲苯氧基]乙氧基]乙基]二甲基苄基銨氫氧化物(DEBDA氫氧化物)(Ballas等人,(1988)Biochim.Biophys.Acta 939,8-18)、溴化十六烷基三甲基銨(CTAB)/DOPE混合物(Pinnaduwage等人,(1989)Biochim.Biophys.Acta 985,33-37)、麩胺酸(TMAG)與DOPE之親脂性二酯、CTAB、DEBDA、溴化二(十二烷基)銨(DDAB)及呈與磷脂醯乙醇胺之混合物之十八烷醯基胺(Rose等人,(1991)Biotechnique 10,520-525)、DDAB/DOPE(TransfectACE,BRL)及具有脂質之寡聚半乳糖。增加轉移效率之示範性轉染強化劑包括(例如)DEAE-葡聚糖、凝聚胺(polybrene)、溶酶體分裂性肽(Ohmori N I等人,Biochem Biophys Res Commun Jun.27,1997;235(3):726-9)、基於軟骨素之蛋白聚糖、硫酸化蛋白聚糖、聚伸乙基亞胺、聚離胺酸(Pollard H等人J Biol Chem,1998 273(13):7507-11)、整合素-結合肽CYGGRGDTP、直鏈葡聚糖壬醣、甘油、繫栓在寡核苷酸之3'-末端核苷間連接處之膽固醇基(Letsinger,R.L.1989 Proc Natl Acad Sci USA 86:(17):6553-6)、脫脂酸燐脂、溶血磷脂醯膽鹼、溶血磷脂醯乙醇胺及1-油醯基溶血磷脂醯膽鹼。
在一些情況下,可需要將核酸與將含有核酸之載體導向標靶細胞之藥劑一起傳遞。該等"靶向"分子包括對標靶細胞上之細胞表面膜蛋白質有專一性之抗體,或用於標靶細胞上之受體之配位體。在使用脂質體時,結合於與內飲作用相關之細胞表面膜蛋白質之蛋白質可用於靶向及/或促進吸收。該等蛋白質之實例包括對特定細胞類型為向性(tropic)之衣殼蛋白及其片段、在循環中經歷內化之蛋白質之抗體,及靶向細胞內定位及增強細胞內半衰期之蛋白質。在其他實施例中,可使用受體介導之內飲作用。該等方法描述於(例如)Wu等人,1987或Wagner等人,1990。對當前已知基因標記及基因療法協定之評論而言,參見Anderson 1992。亦參見WO 93/25673及其中引用之參考文獻。對基因療法技術之額外評論而言,參見Friedmann,Science,244:1275-1281(1989);Anderson,Nature,第392卷之補充,第6679期,第25-30頁(1998);Verma,Scientific American:68-84(1990);及Miller,Nature,357:455460(1992)。
篩選方法
本發明之另一態樣針對識別調節(亦即,降低)PRLR之活性之抗體的方法,其包含使PRLR與抗體接觸,及測定抗體是否修改PRLR之活性。將在測試抗體存在下之活性與不存在測試抗體時之活性比較。在含有測試抗體之樣本之活性比缺乏測試抗體之樣本中之活性更低時,抗體將具有抑制活性。有效療法視識別缺乏顯著毒性之有效藥劑而定。可藉由此項技術中已知之方法來篩選抗體之結合親和力。舉例而言,可使用凝膠移位檢定、西方墨點、放射性標記競爭檢定、藉由層析之共分餾、共沈澱、交聯、ELISA、表面電漿共振(例如,Biacore)、時差式螢光測定法(例如,DELFIA)及其類似方法,其均描述於(例如)Current Protocols in Molecular Biology(1999),Current Protocols in Immunology(2007)John Wiley & Sons,NY,其以引用之方式全部併入本文。另外,表面電漿共振(例如,Biacore)可用以評估2種抗體之間的競爭(參見(例如),下文實例7)。時差式螢光測定法(例如,DELFIA)亦可用以評估2種抗體之間的競爭水平。舉例而言,基於競爭性篩選DELFIA檢定之微定量盤(Perkin Elmer)可根據藉由製造商提供之協定來執行。
為用於結合於標靶抗原上之所要抗原決定基之抗體的初始篩選,可執行常規交叉阻斷檢定(cross-blocking assay),諸如描述於Antibodies,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory,Ed Harlow and David Lane(1988)中之彼檢定。亦可使用常規競爭性結合檢定,其中未知抗體係藉由其抑制標靶與本發明之標靶專一性抗體之結合的能力來表徵。可使用完整抗原、諸如細胞外域之其片段或直鏈抗原決定基。抗原決定基映射描述於Champe等人,J.Biol.Chem.270:1388-1394(1995)中。
在活體外結合檢定之一變化中,本發明提供包含以下步驟之方法:(a)使固定PRLR與候選抗體接觸,及(b)偵測候選抗體與PRLR之結合。在一替代性實施例中,固定候選抗體且偵測PRLR之結合。使用此項技術中熟知之方法之任何方法來完成固定,包括與支撐物、珠粒或層析樹脂之共價鍵合,以及非共價、高親和力相互作用,諸如抗體結合或使用抗生蛋白鏈菌素/生物素結合,其中所固定化合物包括生物素部分。可(i)使用未經固定之化合物上之放射性標記,(ii)使用非固定化合物上之螢光標記,(iii)使用對非固定化合物具有免疫專一性之抗體,(iv)使用激發固定化合物所連接之螢光支撐物之非固定化合物上的標記,以及此項技術中熟知且常規實踐之其他技術來完成結合之偵測。
調節(亦即,增加、降低或阻斷)標靶抗原之活性之抗體可藉由將候選抗體與標靶抗原(或表現標靶抗原之細胞)一起培育,及測定候選抗體對標靶抗原之活性或表現之效應來識別。將在測試抗體存在下之活性與不存在測試抗體時之活性比較。在含有測試抗體之樣本之活性比缺乏測試抗體之樣本中之活性更低時,抗體將具有抑制活性。調節標靶抗原多肽或多核苷酸之活性之抗體的選擇可藉由將其對標靶抗原之效應與其對其他相關化合物之效應比較來評估。
在特定示範性實施例中,涵蓋的為測試抗體在培養細胞系統中之效應,以測定其防止PRLR二聚及/或中和誘導STAT5及/或MAPK及/或AKT磷酸化中之PRLR或PRLR信號傳輸之其他指示物之能力。另外,包括如本文中所述之增殖檢定、軟瓊脂檢定及/或細胞毒性檢定之細胞檢定可用以評估特定PRLR抗體。
特定抗體或抗體之組合之生物活性可使用適合動物模型活體內評估。舉例而言,可使用其中將人類癌細胞引入諸如裸小鼠或SCID小鼠之免疫功能不全動物中之異型發生癌症模型。可使用量測腫瘤形成、腫瘤退化或轉移及其類似物之抑制之檢定來預測功效。
本發明亦包含識別與標靶抗原相互作用或抑制標靶抗原之生物活性(亦即,抑制酶促活性、結合活性、細胞內信號傳輸等)之抗體的高生產量篩選(HTS)檢定。HTS檢定允許以有效方式篩選大量化合物。涵蓋基於細胞之HTS系統,以研究標靶抗原與其結合搭配物之間的相互作用。HTS檢定經設計以識別具有所要性質之"採樣數"或"先導化合物",自其之修飾可經設計以改良所要性質。
在本發明之另一實施例中,使用用於抗體片段或具有對胺基酸之1、2、3種或3種以上修飾之CDR的高生產量篩選,該等胺基酸係在具有對標靶抗原多肽之適合結合親和力之CDR內。
組合治療
已經識別1種以上之在動物模型中為有效之抗體,另外有利的可為將兩種或兩種以上該等抗體混合在一起(其結合於相同或不同標靶抗原)以提供更為改良之功效。包含一或多種抗體之組合物可投與至遭受癌症或傾向於遭受癌症之人或哺乳動物。2種治療劑之合併投藥不需要同時投與藥劑或藉由相同路線投與藥劑,只要存在在藥劑發揮其治療效應期間之時間週期內之重疊即可。涵蓋同時或連續投藥,如在不同天或不同週投藥。
儘管抗體療法可用於癌症之所有階段,但是抗體療法可尤其適當用於晚期或轉移性癌症。將抗體療法方法與化學療劑或輻射方案組合,在還未接受化學療劑治療之患者中可為較佳的,而可指示用抗體療法之治療用於已接受一或多種化學療法之患者。另外,抗體療法亦可致能降低劑量之伴隨化學療法尤其在不能極好耐受化學療劑之毒性的患者中之使用。
本發明之方法涵蓋投與單一抗體,以及不同抗體之組合或"混合物(cocktail)"。該等抗體混合物由於其含有開發不同效應子機制之抗體或直接將細胞毒素抗體與依賴免疫效應子功能性之抗體組合,而可具有某些優點。呈組合之該等抗體可顯示協同治療效應。舉例而言,本發明之方法涵蓋投與M-CSF、RANKL、剋癌易TM (TaxotereTM )、賀癌平TM (HerceptinTM )、癌思停TM (AvastinTM )、爾必得舒TM (ErbituxTM )之抗體或抗EGFR抗體及他莫昔芬(Tamoxifen)。
細胞毒性劑係指抑制或防止細胞之功能及/或引起細胞之破壞之物質。術語意欲包括放射性同位素(例如I131 、I125 、Y90 及Re186 )、化學療劑及毒素,諸如細菌來源、真菌來源、植物來源或動物來源之酶促活性毒素或合成毒素或其片段。非細胞毒性劑係指不抑制或防止細胞之功能及/或不引起細胞之破壞之物質。非細胞毒性劑可包括可活化為細胞毒素之藥劑。非細胞毒性劑可包括珠粒、脂質體、基質或粒子(參見(例如),美國專利公開案2003/0028071及2003/0032995,其以引用之方式併入本文)。該等藥劑可與根據本發明之抗體結合、偶合、連接或相關。
癌症化學療劑包括(但不限於)烷化劑,諸如卡鉑(carboplatin)及順鉑(cisplatin);氮芥烷化劑;亞硝基脲烷化劑,諸如卡莫司汀(carmustine)(BCNU);抗代謝物,諸如甲胺喋呤;醛葉酸;類嘌呤抗代謝物,即硫醇嘌呤;類嘧啶抗代謝物,諸如氟尿嘧啶(5-FU)及吉西他濱(gemcitabine)(Gemzar);激素抗贅生劑,諸如戈舍瑞林(goserelin)、亮丙瑞林(leuprolide)及他莫西芬;天然抗贅生劑,諸如阿地介白素(aldesleukin)、介白素-2、多西紫杉醇(docetaxel)、依託泊苷(etoposide)(VP-16)、干擾素α、太平洋紫杉醇(paclitaxel)(Taxol)及維甲酸(ATRA);抗生素天然抗贅生劑,諸如博來黴素(bleomycin)、放線菌素(dactinomycin)、道諾黴素(daunorubicin)、阿黴素(doxorubicin)、道諾黴素(daunomycin)及絲裂黴素(mitomycin),包含絲裂黴素C;及長春鹼類(vinca alkaloid)天然抗贅生劑,諸如長春鹼(vinblastine)、長春新鹼(vincristine)、長春地辛(vindesine);羥基尿素;醋葡醛內酯(aceglatone)、阿德力黴素(adriamycin)、異環磷醯胺(ifosfamide)、依諾他濱(enocitabine)、環硫雄醇(epitiostanol)、阿克拉黴素(aclarubicin)、環胞苷(ancitabine)、尼莫司汀(nimustine)、鹽酸甲基苄肼(procarbazine hydrochloride)、卡波昆(carboquone)、卡鉑(carboplatin)、卡莫氟(carmofur)、色黴素(chromomycin)A3、抗癌多醣、抗癌血小板因子、環磷醯胺(Cytoxin)、裂褶多糖(Schizophyllan)、阿糖胞苷(cytarabine)(胞嘧啶阿拉伯糖)、達卡巴嗪(dacarbazine)、硫肌苷(thioinosine)、噻替派(thiotepa)、喃氟啶(tegafur)、海兔毒素(dolastatin)、諸如奧力斯廳(auristatin)之類海兔毒素、CPT-11(伊立替康(irinotecan))、米托蒽醌(mitozantrone)、滅癌平(vinorelbine)、替尼泊甙(teniposide)、胺基蝶呤(aminopterin)、洋紅黴素(carminomycin)、埃斯波黴素類(esperamicin)(參見(例如)美國專利第4,675,187號)、新製癌菌素(neocarzinostatin)、OK-432、博萊黴素(bleomycin)、氟鐵龍(furtulon)、溴尿苷(broxuridine)、白消安(busulfan)、已烯雌酚雙磷酸脂(honvan)、派來黴素(peplomycin)、貝他定(bestatin)(Ubenimex)、干擾素-β、美溴沙侖(mepitiostane)、二溴甘露醇(mitobronitol)、美法侖(melphalan)、昆布胺酸(laminin)肽、香菇多糖(lentinan)、雲芝(Coriolus versicolor)萃取物、喃氟啶/尿嘧啶、雌莫司汀(estramustine)(雌激素/氮芥(mechlorethamine))。
另外,用作用於癌症患者之療法之額外藥劑包括EPO、G-CSF、更昔洛韋(ganciclovir);抗生素,即亮丙瑞林;嘜啶(meperidine);齊多夫定(zidovudine)(AZT);介白素1至18,包括突變體及類似物;干擾素或細胞激素,諸如干擾素α、β及γ激素,諸如促黃體素釋放激素(LHRH)及類似物及促性腺激素釋放激素(GnRH);生長因子,諸如轉型生長因子-β(TGF-β)、纖維母細胞生長因子(FGF)、神經生長因子(NGF)、生長激素釋放因子(GHRF)、表皮生長因子(EGF)、纖維母細胞生長因子同源因子(FGFHF)、肝細胞生長因子(HGF)及胰島素生長因子(IGF);腫瘤壞死因子-α&β(TNF-α&β);侵入抑制因子-2(IIF-2);骨形態發生蛋白質1-7(BMP 1-7);生長抑素;胸腺素-α-1;γ-球蛋白;超氧化歧化酶(SOD);EGFR(表皮生長因子受體)拮抗劑,諸如西妥昔單抗(Cetuximab)及吉非替尼(Gefitinib);PR(孕酮受體)拮抗劑及調節劑,諸如美服培酮(Mifepristone)及奧那司酮TM (OnapristoneTM );阿羅托斯抑制劑(aromatoase inhibitor),諸如安美達錠(Anastrozole)、依西美坦(Exemestane)及來曲唑(Letrozole);抗雌激素藥劑、雌激素受體拮抗劑及調節劑,諸如他莫昔芬、托瑞米芬(Toremifene)及氟維司群(Fulvestrant);補體因子;抗血管生成因子;抗原性物質;及前藥。
前藥係指醫藥學上活性物質之前驅物或衍生形式,與母體藥物比較,其對腫瘤細胞具有更小細胞毒性或非細胞毒性且能夠酶促活化或轉化成活性或更具活性之母體形式。參見(例如),Wilman,"Prodrugs in Cancer Chemotherapy"Biochemical Society Transactions ,14,第375-382頁,第615屆Meeting Belfast(1986)及Stella等人,"Prodrugs:A Chemical Approach to Targeted Drug Delivery," Directed Drug Delivery,Borchardt等人,(編),第247-267頁,Humana Press(1985)。前藥包括(但不限於):含磷酸鹽之前藥、含硫代磷酸鹽之前藥、含硫酸鹽之前藥、含肽之前藥、經D-胺基酸修飾之前藥、糖基化前藥、含β-內醯胺之前藥、含視情況經取代苯氧基乙醯胺之前藥或含視情況經取代苯乙醯胺之前藥、可轉化成更具活性之細胞毒性游離藥物之5-氟胞嘧啶及其他5-氟尿苷前藥。可衍生為用於本文之前藥形式之細胞毒性藥物的實例包括(但不限於)上述彼等化學療劑。
投藥及製備
本發明之抗體可調配成包含適於所要傳遞方法之載劑之醫藥組合物。適合載劑包括當與抗體組合時,保留抗體之所要活性且不與受檢者之免疫系統反應之任何物質。實例包括(但不限於)大量標準醫藥載劑之任何者,諸如無菌磷酸鹽緩衝鹽水溶液、製菌水及其類似物。可使用各種水性載劑,例如水、緩衝水、0.4%鹽水、0.3%甘胺酸及其類似物,且可包括經受適度化學修飾或其類似物之用於增強穩定性之其他蛋白質,諸如白蛋白、脂蛋白、球蛋白等。
藉由以凍乾調配物或水溶液形式混合具有所要純度之抗體與任選生理學上可接受之載劑、賦形劑或穩定劑(Remington's Pharmaceutical Sciences第16版,Osol,A.編(1980))來製備用於儲存之抗體的治療調配物。可接受之載劑、賦形劑或穩定劑在所用劑量及濃度下對接受者為無毒的,且包括諸如磷酸鹽、檸檬酸鹽及其他有機酸之緩衝液;包括抗壞血酸及甲硫胺酸之抗氧化劑;防腐劑(諸如十八烷基二甲基苄基氯化銨;氯化六羥季銨;氯化苯甲烴銨、苄索氯銨;苯酚、丁醇或苄醇;對羥基苯甲酸烷酯,諸如對羥基苯甲酸甲酯或對羥基苯甲酸丙酯;兒茶酚;間苯二酚;環己醇;3-戊醇;及間甲酚);低分子量(少於約10個殘基)多肽;蛋白質,諸如血清白蛋白、明膠或免疫球蛋白;親水聚合物,諸如聚乙烯吡咯啶酮;胺基酸,諸如甘胺酸、麩胺醯胺、天冬醯胺、組胺酸、精胺酸或離胺酸;單醣、二醣及其他碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或糊精;螯合劑,諸如EDTA;糖,諸如蔗糖、甘露醇、海藻糖或山梨糖醇;成鹽抗衡離子,諸如鈉離子;金屬錯合物(例如Zn-蛋白質錯合物);及/或非離子界面活性劑,諸如TWEENTM 、PLURONICSTM 或聚乙二醇(PEG)。
本文之調配物亦可含有一種以上為所治療之特定適應症所必需之活性化合物,較佳為具有彼此無不利影響之互補活性之彼等活性化合物。該等分子適於以有效用於所欲目的之量存在於組合中。
活性成份亦可截留於(例如)在膠狀藥物傳遞系統(例如脂質體、白蛋白微球體、微乳液、奈米粒子及奈米膠囊)或巨乳液中藉由凝聚技術或藉由界面聚合所製備之微膠囊中,例如,分別截留於羥甲基纖維素或明膠-微膠囊及聚(甲基丙烯酸甲酯)微膠囊中。該等技術揭示於Remington's Pharmaceutical Sciences第16版,Osol,A.編(1980)中。
欲用於活體內投藥之調配物必須為無菌的。其易藉由經無菌過濾膜之過濾來完成。
抗體係藉由任何適合方法來投與,包括非經腸、皮下、腹膜內、肺內及鼻內投藥,且若需要用於局部治療,則病灶內投藥。非經腸輸液包括靜脈內、動脈內、腹膜內、肌肉內、皮內或皮下投藥。另外,抗體係藉由脈衝輸液適當地投與,尤其用遞減劑量之抗體來投與。較佳地,給藥係藉由注射,最佳為靜脈內或皮下注射來給予。涵蓋其他投藥方法,包括局部投藥,尤其為經皮、經黏膜、經直腸、經口投藥或(例如)經由置放於接近所要位點之導管之局部投藥。
對鼻部投藥而言,醫藥調配物及藥劑可為含有適當溶劑及視情況其他化合物之噴霧或氣溶膠,該等其他化合物諸如(但不限於)穩定劑、抗微生物劑、抗氧化劑、pH調節劑、界面活性劑、生物可用性改質劑及該等者之組合。氣溶膠調配物之推進劑可包括壓縮空氣、氮、二氧化碳或烴基低沸點溶劑。
可注射劑型通常包括水性懸浮液或油性懸浮液,其可使用合適分散劑或濕潤劑及懸浮劑來製備。可注射形式可於溶液相中或呈懸浮液形式,其係用溶劑或稀釋劑來製備。可接受之溶劑或媒劑包括無菌水、林格溶液(Ringer's solution)或等張鹽水溶液。
就注射而言,醫藥調配物及/或藥劑可為適於用如上所述之適當溶液復水之粉末。該等粉末之實例包括(但不限於)經冷凍乾燥、旋轉乾燥或噴霧乾燥之粉末、非晶形粉末、顆粒、沈澱物或微粒。就注射而言,調配物可視情況含有穩定劑、pH調節劑、界面活性劑、生物可用性改質劑及該等者之組合。
可製備持續釋放製劑。持續釋放製劑之適合實例包括含有抗體之固體疏水性聚合物之半透性基質,該等基質係呈成形物品形式,例如薄膜或微膠囊。持續釋放基質之實例包括聚酯、水凝膠(例如聚(2-羥基乙基-甲基丙烯酸酯)或聚(乙烯醇))、聚乳酸交酯(美國專利第3,773,919號)、L-麩胺酸與γ乙基-L-麩胺酸酯之共聚物、不可降解乙烯-乙酸乙烯酯、諸如LUPRON DEPOTTM (包含乳酸-乙醇酸共聚物及乙酸亮丙瑞林之可注射微球體)之可降解乳酸-乙醇酸共聚物及聚-D-(-)-3-羥基丁酸。雖然諸如乙烯-乙酸乙烯酯及乳酸-乙醇酸之聚合物能使分子釋放超過100天,但是某些水凝膠釋放蛋白質歷時較短時間週期。當經囊封之抗體歷時長時間保留於體內時,其可由於暴露於37℃之濕氣而變性或聚集,造成生物活性損失及免疫原性之可能改變。可視所涉及之機制而設計用於穩定之合理策略。舉例而言,若發現聚集機制為經由硫代物-二硫化物互換而形成分子間S--S鍵,則穩定可藉由修飾硫氫基殘基,自酸性溶液冷凍乾燥,控制濕氣含量,使用適當添加劑及研發特定聚合物基質組合物來達到。可使用此項技術中已知之其他策略。
本發明之調配物可設計為短期作用、快速釋放,長期作用的或如本文所述之持續釋放的。因此,醫藥調配物亦可經調配用於受控釋放或緩慢釋放。
瞬時組合物亦可包含(例如)微胞或脂質體,或一些其它囊封形式,或可以延長釋放形式來投與以提供延續儲存及/或遞送效應。因此,醫藥調配物及藥劑可壓縮成小球或圓柱體,且作為積存注射液或作為諸如血管支架之植入物來肌肉內或皮下植入。該等植入物可使用諸如聚矽氧及可生物降解聚合物之已知惰性材料。
除上述之彼等代表性劑型外,醫藥學上可接受之賦形劑及載劑通常為熟習此項技術者所知,且因此包括於本發明中。該等賦形劑及載劑描述於(例如)"Remingtons Pharmaceutical Sciences"Mack Pub.Co.,New Jersey(1991),其係以引用之方式併入本文。
可視疾病之病狀,受檢者之年齡、體重、一般健康狀況、基因型、性別及飲食,劑量時間間隔,投藥路線,排泄速率及藥物之組合而調節特定劑量。含有效量之上述劑型之任何者完全在常規實驗之範圍內,且因此完全在本發明之範疇內。
本發明之抗體將常製備為大體上不含其他天然存在免疫球蛋白或其他生物分子。在當投與至受癌症痛苦,或傾向於遭受癌症之哺乳動物時,較佳抗體亦將顯示最小毒性。
本發明之組合物可藉由習知、熟知之滅菌技術來滅菌。所得溶液可經封裝用於使用或在無菌條件下過濾且冷凍乾燥,經冷凍乾燥之製劑在投藥前與無菌溶液組合。組合物可按需要含有醫藥學上可接受之助劑物質以接近生理條件,諸如pH調節劑及緩衝劑、張力調節劑及其類似物,例如乙酸鈉、乳酸鈉、氯化鈉、氯化鉀、氯化鈣及穩定劑(例如120%麥芽糖等)。
本發明之抗體亦可經由脂質體來投與,該等脂質體為適用於傳遞藥物(諸如本文所揭示之抗體及視情況化學療劑)之包含各種類型之脂質及/或磷脂及/或界面活性劑的小微脂粒。脂質體包括乳液、泡沫、微胞、不溶性單層、磷脂分散液、薄片層及其類似物,且可用作媒劑以將抗體靶向至特定組織以及增加組合物之半衰期。如(例如)美國專利第4,837,028及5,019,369號中所述之各種方法可用於製備脂質體,該等專利係以引用之方式併入本文。
含有抗體之脂質體係藉由此項技術中已知之方法,諸如描述於Epstein等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:3688(1985);Hwang等人,Proc.Natl Acad.Sci.USA 77:4030(1980);及美國專利第4,485,045及4,544,545號中之方法來製備。具有增強循環時間之脂質體揭示於美國專利第5,013,556號中。尤其有效之脂質體可藉由用包含磷脂醯膽鹼、膽固醇及PEG衍生磷脂醯乙醇胺(PEG-PE)之脂質組合物之逆相蒸發方法來產生。脂質體係經由具有界定孔徑之過濾器來擠出以產生具有所要直徑之脂質體。本發明之抗體之Fab'片段可如Martin等人,J.Biol.Chem.257:286-288(1982)所述,經由二硫化物互換反應而結合於脂質體。化學療劑(諸如阿黴素)視情況含在脂質體內[參見(例如)Gabizon等人,J.National Cancer Inst.81(19):1484(1989)]。
根據所選特定投藥模式,該等組合物中之抗體濃度可廣泛變化,亦即小於約10重量%,通常至少約25重量%至多達75重量%或90重量%,且將主要藉由流體體積、黏度等來選擇。用於製備可經口、局部及非經腸投藥之組合物之實際方法將對熟習此項技術者而言為已知或明顯的,且詳細描述於(例如)Remington's Pharmaceutical Science,第19版,Mack Publishing Co.,Easton,PA(1995)中,其以引用之方式併入本文。
在患者中治療疾病之本發明組合物之有效量的測定可經由此項技術中熟知之標準經驗方法來完成。
本發明之組合物係以足以防止或至少部分地阻止疾病之發展之量投與至已遭受,或傾向於或冒有(例如)乳癌、前列腺癌或肺癌之風險的哺乳動物。足以達到其之量係定義為"治療有效劑量"。抗體之有效量將變化且視疾病之嚴重性及所治療患者之體重及一般狀態而定,但通常在約1.0 μg/kg至約100 mg/kg體重之範圍變化。示範性劑量可在每次應用約10 μg/kg至約30 mg/kg,或約0.1 mg/kg至約20 mg/kg或約1 mg/kg至約10 mg/kg之範圍變化。抗體亦可藉由體表面積來給藥(例如至多4.5 g/平方公尺)。抗體之其他示範性劑量包括在單一投藥中,總共至多8 g(假定體重為80 kg或體表面積為1.8平方公尺)。
投藥可藉由此項技術中已知之任何方式進行。舉例而言,抗體可藉由一或多次分離快速投藥來投與,或藉由在(例如)5、10、15、30、60、90、120分鐘或120分鐘以上之時期內之短期或長期輸液來投與。在初始治療時期後且視患者之反應及療法之耐受性而定,維持劑量可按維持患者反應所需而(例如)每週、雙週、每3週、每4週、每月、雙月、每3個月或每6個月來投與。可需要更頻繁之劑量直至疾病症狀之所要抑制發生,且劑量可按需要來調節。該治療進程易藉由習知技術及檢定來監控。療法可歷時所定義之時期或可為慢性的且在數年之時期內持續直至疾病進程或死亡。
組合物之單次或多次投藥可以由治療醫師所選之劑量水準及方式來執行。為預防或治療疾病,抗體之適當劑量將視如上文所定義之欲治療之疾病類型,疾病之嚴重性及病程,投與抗體用於預防性目的還是治療性目的,先前療法,患者之臨床病史及對抗體之反應,及主治醫師之判斷而定。抗體適於一次性或經一系列治療投與至患者。
無論如何,調配物應隨時間提供大量足以發揮所要生物活性,例如防止或最小化癌症之嚴重性之治療性抗體。本發明之組合物可單獨投與或作為連同此項技術中已知用於治療該等疾病之其他治療劑之佐劑療法來投與。
抗體組合物將以與良好醫療實踐一致之方式來調配、給藥及投藥。在本文中所考慮之因素包括所治療之特定病症、所治療之特定哺乳動物、個別患者之臨床病狀、病症之病因、傳遞藥劑之位點、投藥方法、投藥排程及醫學從業者已知之其他因素。欲投與之抗體之治療有效量將藉由該等考慮控制,且為防止、改善或治療標靶介導疾病、病狀或病症所必需之最小量。該量較佳低於對宿主有毒性之量或使宿主顯著更易受感染之量。
抗體無需但視情況可與一或多種當前用以預防或治療所討論病症之藥劑一起調配。該等其他藥劑之有效量視存在於調配物中之抗體之量,疾病、病狀或病症之類型或治療類型,及上述其他因子而定。該等藥劑通常係以與上文所用相同之劑量及投藥路線來使用,或以上文所用劑量之約1%至99%來使用。
在本發明之另一實施例中,提供含有適用於治療所要病狀之物質之製造物品。該製造物品包含容器及標籤。適合容器包括(例如)瓶子、小瓶、注射器及試管。容器可自諸如玻璃或塑膠之各種材料形成。容器保持對治療病狀有效之組合物且可具有無菌接取端口(例如,容器可為靜脈內溶液包或具有可藉由皮下注射針刺穿之塞子之小瓶)。組合物中之活性劑為本發明之抗體。容器上或與容器相關之標籤指示,組合物係用於治療所選病狀。製造物品可另外包含含有第二治療劑(包括用於本文中討論之疾病或此項技術中已知之第二治療劑之任何者)之第二容器。製造物品可另外包含另一容器,其含有醫藥學上可接受之緩衝液,諸如用於使冷凍乾燥抗體調配物復水之磷酸鹽緩衝鹽水、林格溶液或右旋糖溶液。就商業及使用者觀點而言,其可另外包括所要之其他物質,包括其他緩衝液、稀釋劑、過濾器、針、注射器及具有使用說明書之包裝插頁。
免疫療法
適用於治療患癌症患者之抗體包括能夠引發抵抗腫瘤之有效免疫反應之彼等抗體及能夠引導細胞毒性之彼等抗體。結合於細胞毒性劑之抗體可用以將細胞毒性劑靶向表現PRLR之腫瘤組織。或者,抗體可藉由補體介導或抗體依賴細胞毒性(ADCC)機制來引出腫瘤細胞溶解,兩種機制均需要免疫球蛋白分子之完整Fc部分以用於與效應子細胞Fc受體位點或補體蛋白質之相互作用。另外,運用對腫瘤生長之直接生物效應之抗體可用於本發明實務。該等直接細胞毒素抗體可藉由此作用之可能機制包括抑制細胞生長、調節細胞分化、調節腫瘤血管生成因子概況及誘導細胞凋亡。特定抗體藉由此發揮抗腫瘤效應之機制可如此項技術中通常所知,使用許多經設計用以測定ADCC、ADMMC、補體介導細胞溶解等之活體外檢定來評估。
在一個實施例中,使用結合於PRLR且抑制PRLR之活化之抗體來進行免疫療法。
抗PRLR抗體可以其"裸露"或非結合形式來投與,或可直接結合於其他治療劑或診斷劑,或可間接結合於包含該等其他治療劑或診斷劑之載劑聚合物。
抗體可經由使用以下者來可偵測標記:放射性同位素,親和力標記(諸如生物素、抗生物素蛋白等),酶促標記(諸如辣根過氧化物酶、鹼性磷酸酶等),螢光或發光或生物發光標記(諸如FITC或若丹明(rhodamine)等),順磁性原子及其類似物。用於完成該標記之程序在此項技術中為熟知的;舉例而言,參見(Sternberger,L.A.等人,J.Histochem.Cytochem.18:315(1970);Bayer,E.A.等人,Meth.Enzym.62:308(1979);Engval,E.等人,Immunol.109:129(1972);Goding,J.W.J.Immunol.Meth.13:215(1976))。
抗體部分之結合描述於美國專利第6,306,393號中。通用技術亦描述於Shih等人,Int.J.Cancer 41:832-839(1988);Shih等人,Int.J.Cancer 46:1101-1106(1990);及Shih等人,美國專利第5,057,313號中。該通用方法涉及使具有經氧化碳水化合物部分之抗體組分與載劑聚合物反應,該載劑聚合物具有至少一種游離胺功能且經複數個藥物、毒素、螯合劑、硼添加物或其他治療劑加載。該反應產生初始席夫鹼(Schiff base)(亞胺)鍵聯,其可藉由還原成二級胺以形成最終結合物來穩定。
載劑聚合物可為(例如)具有至少50個胺基酸殘基之胺基葡聚糖或多肽。用於將藥物或其他藥劑結合於載劑聚合物之各種技術在此項技術為已知的。可使用多肽載劑替代胺基葡聚糖,但多肽載劑應在鏈中具有至少50個胺基酸殘基,較佳100-5000個胺基酸殘基。至少一些胺基酸應為離胺酸殘基或麩胺酸或天冬胺酸殘基。離胺酸殘基之側位胺及麩醯胺酸及天冬胺酸之側位羧酸酯便於連接藥物、毒素、免疫調節劑、螯合劑、硼添加物或其他治療劑。適合多肽載劑之實例包括聚離胺酸、聚麩胺酸、聚天冬胺酸、其共聚物,及該等胺基酸及例如絲胺酸之其它胺基酸之混合聚合物,其給與所得加載載劑及結合物所要可溶性性質。
或者,結合抗體可藉由直接使抗體組分與治療劑結合來製備。除治療劑係直接連接於氧化抗體組分外,通用程序係類似於結合之間接方法。舉例而言,抗體之碳水化合物部分可連接於聚乙二醇以延長半衰期。
或者,治療劑可經由雙硫鍵形成或使用諸如3-(2-吡啶基二硫基)丙酸N-琥珀醯酯(SPDP)之異源雙功能交叉連接子連接在還原抗體組分之鉸鏈區。Yu等人,Int.J.Cancer56:244(1994)。該等結合之通用技術在此項技術中為熟知的。參見(例如),Wong,Chemistry Of Protein Conjugation and Cross-Linking(CRC Press 1991);Upeslacis等人,"Modification of Antibodies by Chemical Methods,"in Monoclonal Antibodies:Principles and Applications,Birch等人(編),pages 187-230(Wiley-Liss,Inc.1995);Price,"Production and Characterization of Synthetic Peptide-Derived Antibodies,"in MonocLonal Antibodies:Production,Enineering and Clinical Application,Ritter等人(編),第60-84頁(Cambridge University Press 1995)。各種雙功能蛋白偶合劑在此項技術中為已知的,諸如N-琥珀醯基-3-(2-吡啶基二硫基)丙酸酯(SPDP)、亞胺基硫雑環戊烷(IT)、醯亞胺酯之雙功能衍生物(諸如己二亞胺酸二甲酯HCL)、活性酯(諸如辛二酸二琥珀醯亞胺酯)、醛類(諸如戊二醛)、雙-疊氮基化合物(諸如雙-(對疊氮基苄醯基)己二胺)、雙-重氮鹽衍生物(諸如雙-(對重氮鹽苄醯基)-乙二胺)、二異氰酸酯(諸如甲苯2,6-二異氰酸酯)及雙活性氟化合物(諸如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。
最後,可建構包含一或多種抗PRLR抗體部分及另一多肽之融合蛋白質。製造抗體融合蛋白質之方法在此項技術中為熟知的。參見(例如)美國專利第6,306,393號。包含介白素-2部分之抗體融合蛋白質係藉由Boleti等人,Ann.Oncol.6:945(1995),Nicolet等人,Cancer Gene Ther.2:161(1995),Becker等人,Proc.Nat'l Acad.Sci.USA 93:7826(1996),Hank等人,Clin.Cancer Res.2:1951(1996)及Hu等人,Cancer Res.56:4998(1996)來描述。
在一實施例中,本發明之抗體係用作放射增敏劑。在該等實施例中,抗體係結合於放射增敏劑。如本文中所使用之術語"放射增敏劑"係定義為分子,較佳為低分子量分子,其係以治療有效量投與至動物以增加欲放射增敏之細胞對電磁輻射之敏感性,及/或促進可用電磁輻射治療之疾病之治療。可用電磁輻射治療之疾病包括贅生性疾病、良性及惡性腫瘤及癌性細胞。
如本文中所使用之術語"電磁輻射"及"輻射"包括(但不限於)具有10-20 至100公尺之波長之輻射。本發明之較佳實施例使用以下電磁輻射:γ輻射(10-20 至10-13 m)、X射線輻射(10-12 至10-9 m)、紫外光(10 nm至400 nm)、可見光(400 nm至700 nm)、紅外輻射(700 nm至1.0 mm)及微波輻射(1 mm至30 cm)。
已知放射增敏劑增加癌性細胞對電磁輻射之毒性效應之敏感性。當前許多癌症治療協定使用藉由X射線之電磁輻射活化之放射增敏劑。X射線活化放射增敏劑之實例包括(但不限於)以下者:甲硝噠唑(metronidazole)、迷索硝唑(misonidazole)、去甲基迷索硝唑、哌莫硝唑(pimonidazole)、依他硝唑(etanidazole)、尼莫唑(nimorazole)、絲裂黴素C、RSU 1069、SR 4233、EO9、RB 6145、煙鹼醯胺、5-溴脫氧尿苷(BUdR)、5-碘脫氧尿苷(IUdR)、溴脫氧胞嘧啶核苷、氟脫氧尿苷(FUdR)、羥基尿素、順鉑及其治療有效性類似物及衍生物。
癌症之光動力療法(PDT)使用可見光作為敏化劑之輻射活化劑。光動力放射增敏劑之實例包括(但不限於)以下者:血紫質衍生物、福得靈(Photofrin)、苯紫質衍生物、NPe6、錫本紫質(SnET2)、去鎂葉綠素酸(pheoborbide)-a、細菌葉綠素-a、萘酞菁類、酞菁類、鋅酞菁及其治療有效性類似物及衍生物。
在另一實施例中,抗體可結合於用於腫瘤預靶向之受體(諸如抗生蛋白鏈菌素),其中將抗體-受體結合物投與患者,接著使用清洗劑自循環移除未結合之結合物,且隨後投與結合於細胞毒性劑(例如,放射性核種)之配位體(例如,抗生物素蛋白)。
"標記"係指直接或間接結合於抗體之可偵測化合物或組合物。標記其自身可為可獨立偵測的(例如,放射性同位素標記或螢光標記)或在酶促標記狀況下,可催化可偵測之受質化合物或組合物之化學改變。或者,標記其自身可不為可偵測的,但可為藉由另一可偵測藥劑(例如,抗原決定基標記或諸如生物素-抗生物素蛋白之結合搭配物對之一等)結合之元素。因此,抗體可包含促進其分離之標記(label)或標記(tag),且本發明之識別抗體之方法包括經由與標記(label)或標記(tag)之相互作用分離抗體之步驟。
示範性治療性免疫結合物包含本文中所述結合於諸如化學治療劑、毒素(例如,細菌、真菌、植物或動物來源之酶促活性毒素,或其片段)或放射性同位素(亦即,放射性結合物)之細胞毒性劑之抗體。融合蛋白質進一步詳述於下文中。
用於放射性金屬或磁共振強化子之螯合劑在此項技術中為熟知的。典型的為乙二胺四乙酸(EDTA)及二伸乙三胺五乙酸(DTPA)之衍生物。該等螯合劑通常在側鏈上具有螯合劑可藉由其連接於載劑之基團。該等基團包括(例如)苄基異硫氰酸酯,DTPA或EDTA可藉由其偶合於載劑之胺基。或者,螯合劑上之羧基或胺基可藉由活化或預衍生及隨後偶合來偶合於載劑,其全部係藉由熟知方式進行。
諸如碳硼烷之硼添加物可藉由習知方法連接於抗體組分。舉例而言,碳硼烷可如此項技術中所熟知,經製備具有側位側鏈上之羧基功能。該等碳硼烷與例如胺基葡聚糖之載劑之連接可藉由活化碳硼烷之羧基,且與載劑上之胺縮合以產生中間結合物來達到。該等中間結合物隨後連接於抗體組分以產生如下文所述之治療有效免疫結合物。
可使用多肽載劑替代胺基葡聚糖,但多肽載劑應在鏈中具有至少50個胺基酸殘基,較佳100-5000個胺基酸殘基。至少一些胺基酸應為離胺酸殘基或麩胺酸或天冬胺酸殘基。離胺酸殘基之側位胺及麩醯胺酸及天冬胺酸之側位羧酸鹽便於連接藥物、毒素、免疫調節劑、螯合劑、硼添加物或其他治療劑。適合多肽載劑之實例包括聚離胺酸、聚麩胺酸、聚天冬胺酸、其共聚物,及該等胺基酸及例如絲胺酸之其它胺基酸之混合聚合物,其給與所得加載載劑及免疫結合物物所要可溶性性質。
中間結合物與抗體組分之結合係藉由氧化抗體組分之碳水化合物部分,且在用藥物、毒素、螯合劑、免疫調節劑、硼添加物或其他治療劑加載後,使所得醛(及酮)羰基與保留在載劑上之胺基反應來實現。或者,中間結合物可經由已在用治療劑加載後引入中間結合物中之胺基連接於氧化抗體組分。氧化係在化學上(例如)用NaIO4 或其他解糖試劑,或酶促地(例如)用神經胺糖酸酶及半乳糖氧化酶來方便地實現。在胺基葡聚糖載劑之狀況下,並非胺基葡聚糖之所有胺通常用於加載治療劑。胺基葡聚糖之剩餘胺與氧化抗體組分縮合以形成席夫鹼加合物,隨後通常用氫硼化物還原劑將其還原性穩定。
類似程序係用以產生根據本發明之其他免疫結合物。經加載多肽載劑較佳具有留下用於與抗體組分之氧化碳水化合物部分縮合之游離離胺酸殘基。多肽載劑上之羧基可(必要時)藉由(例如)用DCC之活化且與過量二胺反應而轉化成胺。
最終免疫結合物係使用諸如於Sephacry1 S-300上之尺寸層析(sizing chromatography)或使用一或多個CD84Hy抗原決定基之親和力層析之習知技術來純化。
或者,免疫結合物可藉由直接使抗體組分與治療劑結合來製備。除治療劑係直接連接於氧化抗體組分外,通用程序係類似於結合之間接方法。
應瞭解,其他治療劑可替代本文中所述之螯合劑。熟習此項技術者將能設計結合流程而無需不適當之實驗。
作為另一說明,治療劑可經由雙硫鍵形成而連接在還原抗體組分之鉸鏈區。舉例而言,可建構具有用以將肽連接於抗體組分之單半胱胺酸殘基之破傷風類毒素肽。作為替代物,該等肽可使用諸如3-(2-吡啶基二硫基)丙酸N-琥珀醯酯(SPDP)之異源雙功能交叉連接子連接於抗體組分。Yu等人,Int.J.Cancer56:244(1994)。該等結合之通用技術在此項技術中為熟知的。參見(例如),Wong,Chemistry Of Protein Conjugation and Cross-Linking(CRC Press 1991);Upeslacis等人,"Modification of Antibodies by Chemical Methods," in Monoclonal Antibodies:Principles and A pplications,Birch等人(編),第187-230頁(Wiley-Liss,Inc.1995);Price,"Production and Characterization of Synthetic Peptide-Derived Antibodies," in M onoclonal Antibodies:Production,Enineering and Clinical Application,Ritter等人(編),第60-84頁(Cambridge University Press 1995)。
抗體及細胞毒性劑之結合物係使用諸如以下者之各種雙功能蛋白偶合劑來製得:N-琥珀醯亞胺-3-(2-吡啶基二硫基)丙酸酯(SPDP)、亞胺基硫雑環戊烷(IT)、醯亞胺酯之雙功能衍生物(諸如己二亞胺酸二甲酯HCL)、活性酯(諸如辛二酸二琥珀醯亞胺酯)、醛類(諸如戊二醛)、雙-疊氮基化合物(諸如雙-(對疊氮基苄醯基)己二胺)、雙-重氮鹽衍生物(諸如雙-(對重氮鹽苄醯基)-乙二胺)、二異氰酸酯(諸如甲苯2,6-二異氰酸酯)及雙活性氟化合物(諸如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。舉例而言,蓖麻毒素免疫毒素可如Vitetta等人,Science,238:1098(1987)中所述來製備。碳14標記之1-異硫氰基苄基-3-甲基二伸乙三胺五乙酸(MX-DTPA)為用於放射性核種與抗體之結合之示範性螯合劑(參見(例如),WO 94/11026)。
如上所述,抗體之Fc區域中之碳水化合物部分可用以結合治療劑。然而,若抗體片段係用作免疫結合物之抗體組分,則Fc區域可不存在。然而,可能將碳水化合物部分引入抗體或抗體片段之輕鏈可變區中。參見(例如),Leung等人,J.Im munol.154:5919(1995);Hansen等人,美國專利第5,443,953號。隨後,經工程化之碳水化合物部分係用以連接治療劑。
另外,熟習此項技術者將認識到,結合方法之許多可能的變化。舉例而言,碳水化合物部分可用以連接聚乙二醇以延長完整抗體或其抗原結合片段在血液、淋巴或其他細胞外液中之半衰期。另外,可能藉由將治療劑連接於碳水化合物部分及游離硫氫基來建構"二價免疫結合物"。該游離硫氫基可位於抗體組分之鉸鏈區中。
抗體融合蛋白質
本發明涵蓋包含一或多種抗體部分及諸如免疫調節劑或毒素部分之另一多肽之融合蛋白質之用途。製造抗體融合蛋白質之方法在此項技術中為熟知的。參見(例如)美國專利第6,306,393號。包含介白素-2部分之抗體融合蛋白質係藉由Boleti等人,Ann.Oncol.6:945(1995),Nicolet等人,Cancer Gene Ther.2:161(1995),Becker等人,Proc.Nat'l Acad.Sci.USA 93:7826(1996),Hank等人,Clin.Cancer Res.2:1951(1996)及Hu等人,Cancer Res.56:4998(1996)來描述。另外,Yang等人,Hum.Antibodies Hybridomas 6:129(1995),描述包括F(ab')2 片段及腫瘤壞死因子α部分之融合蛋白質。
製造其中重組分子包含一或多種抗體組分及毒素或化學療劑之抗體-毒素融合蛋白質之方法亦對熟習此項技術者而言為已知的。舉例而言,抗體-假單胞菌外毒素A融合蛋白質已藉由Chaudhary等人,Nature 339:394(1989),Brinkmann等人,Proc.Nat'l Acad.Sci.USA 88:8616(1991),Batra等人,Proc.Nat'l Acad.Sci.USA 89:5867(1992),Friedman等人,J.Immunol.150:3054(1993),Wels等人,Int.J.Can.60:137(1995),Fominaya等人,J.Biol.Chem.271:10560(1996),Kuan等人,Biochemistry 35:2872(1996)及Schmidt等人,Int.J.Can.65:538(1996)來描述。含有白喉毒素部分之抗體-毒素融合蛋白質已藉由Kreitman等人,Leukemia 7:553(1993),Nicholls等人,J.Biol.Chem.268:5302(1993),Thompson等人,J.Biol.Chem.270:28037(1995)及Vallera等人,Blood 88:2342(1996)來描述。Deonarain等人,Tumor Targeting 1:177(1995),已描述具有RNase部分之抗體-毒素融合蛋白質,而Linardou等人,Cell Biophys.24-25:243(1994),產生包含DNase I組分之抗體-毒素融合蛋白質。天堂果蛋白係用作Wang等人,Abstracts of第209屆ACS National Meeting,Anaheim,Calif.,1995年,4月2-6日,第1部分,BIOT005之抗體-毒素融合蛋白質中之毒素部分。作為另一實例,Dohlsten等人,Proc.Nat'l Acad.Sci.USA 91:8945(1994),報導包含葡萄球菌腸毒素-A之抗體-毒素融合蛋白質。
適用於該等結合物之製備之毒素的說明為篦麻毒素、相思子鹼、核糖核酸酶、DNase I、葡萄球菌腸毒素-A、商陸抗病毒蛋白、天堂果蛋白、白喉毒素、假單胞菌外毒素及假單胞菌內毒素。參見(例如),Pastan等人,Cell 47:641(1986)及Goldenberg,CA--A Cancer Journal for Clinicians 44:43(1994)。其他適合毒素對熟習此項技術者而言為已知的。
本發明之抗體亦可藉由將抗體結合於將前藥(例如,肽基化學療劑,參見WO 81/01145)轉化成活性抗癌藥物之前藥活化酵素而用於ADEPT中。參見(例如),WO 88/07378及美國專利第4,975,278號。
適用於ADEPT之免疫結合物之酵素組分包括任何能夠以將其轉化成其更具活性、細胞毒性之形式的方式對前藥作用的酵素。
適用於本發明之方法之酵素包括(但不限於),適用於將含磷酸鹽之前藥轉化成游離藥物之鹼性磷酸酶;適用於將含硫酸鹽之前藥轉化成游離藥物之芳基硫酸酯酶;適用於將無毒5-氟胞嘧啶轉化成抗癌藥物,即5-氟尿嘧啶之胞嘧啶去胺酶;蛋白酶,諸如沙雷氏菌蛋白酶(serratia protease)、嗜熱菌蛋白酶、枯草菌蛋白、羧基肽酶及組織蛋白酶(諸如組織蛋白酶B及L),其適用於將含肽之前藥轉化成游離藥物;適用於轉化含有D-胺基酸取代基之前藥之D-丙胺醯基羧基肽酶;碳水化合物分裂酵素,諸如適用於將糖基化前藥轉化成游離藥物之β-半乳糖苷酶及神經胺糖酸酶;適用於將用β-內醯胺衍生之藥物轉化成游離藥物之β-內醯胺酶;及盤尼西林醯胺酶(penicillin amidase),諸如盤尼西林V醯胺酶或盤尼西林G醯胺酶,其適用於將在其胺氮處,用苯氧基乙醯基或苯基乙醯基衍生之藥物分別轉化成游離藥物。或者,亦在此項技術中已知作為催化性抗體之具有酶促活性之抗體可用以將本發明之前藥轉化成游離活性藥物(參見(例如),Massey,Nature 328:457-458(1987))。抗體-催化性抗體結合物可如本文中所述來製備以用於將催化性抗體傳遞至腫瘤細胞群體。
本發明之酵素可藉由此項技術中熟知之技術,諸如使用上述異源雙功能交聯試劑來共價結合於抗體。或者,至少包含連接於本發明之酵素之至少一個功能性活性部分的本發明之抗體之抗原結合區域的融合蛋白質可使用此項技術中熟知之重組DNA技術來建構(參見(例如),Neuberger等人,Nature 312:604-608(1984))。
非治療性用途
本發明之抗體可用作標靶抗原之親和力純化藥劑或用於標靶抗原之診斷檢定中,例如,偵測其在特定細胞、組織或血清中之表現。抗體亦可用於活體內診斷檢定。通常,為該等目的,抗體係用放射性核種(諸如111 In、99 Tc、14 C、131 I、125 I、3 H、32 P或35 S)來標記以便腫瘤可使用免疫閃爍照相術定位。
本發明之抗體可用於任何已知檢定方法中,諸如競爭性結合檢定、直接及間接夾心檢定,諸如ELISA及免疫沈澱檢定。Zola,Monoclonal Antibodies:A Manual of Techniques,第147-158頁(CRC Press,Inc.1987)。抗體亦可用於免疫組織化學,用以使用此項技術中已知之方法標記腫瘤樣本。
為方便起見,本發明之抗體可提供於套組中,亦即,呈預定量之試劑與用於執行診斷檢定之說明書之封裝組合。在抗體係用酵素標記時,套組將包括酵素所需之受質及輔因子(例如,提供可偵測發色團或螢光團之受質前驅物)。另外,可包括諸如穩定劑、緩衝液(例如,阻斷緩衝液或溶解緩衝液)及其類似物之其他添加劑。各種試劑之相對量可廣泛變化以在試劑溶液中提供大體上最佳化檢定之敏感性之濃度。詳言之,試劑可提供為乾粉,通常為經冷凍乾燥的,其包括在溶解時將提供具有適當濃度之試劑溶液之賦形劑。
本發明藉由以下實例說明,其並非意欲以任何方式限制。
實例 實例1
製備PRLR之ECD、S1及S2域片段 如下進行相應於PRLR之細胞外域(ECD,SEQ ID NO:2之胺基酸25-234)、S1域(SEQ ID NO:2之胺基酸25-125)及S2域(SEQ ID NO:2之胺基酸126-234)之PRLR片段之重組表現及純化。用於ECD、S1及S2之昆蟲表現之表現構築體係如表2中所示來設計,且設計引子以用於基於其各別胺基酸序列(如表3中所示)來選殖片段。
為選殖S1及S2域,採用巢套式PCR方法以併入標記且工程化3'/5'區域。對S1而言,存在用於選殖之6個前向巢套引子及1個反向引子。對S2而言,存在用於選殖之5個前向巢套引子及3個反向引子。
根據製造商之推薦,使用PfuUltraTM Hotstart PCR Master Mix(Stratagene)進行PCR擴增。用於擴增之模板為在pDEST3218中選殖之PRLR ECD片段(資料未圖示)。使用拓撲異構酶選殖策略,將ECD PCR產物選殖至BlueBac4.5/V5-His TOPO-TA(Invitrogen)中。使用閘道技術(Invitrogen)將S1及S2 PCR產物選殖至經內部修改之pAcMP3中。藉由雙股定序確認最終所選純系。製備10-20 μg之DNA用於昆蟲轉染。
重組構築體係如下用以在昆蟲細胞中表現各別PRLR片段。藉由編碼PRLR之細胞外域之質體DNA與SapphireTM 染色體組苜蓿丫紋夜蛾DNA共轉染之空斑純化來分離桿狀病毒。將重組病毒擴增且用以在每m11×106 -1.5×106 個細胞範圍變化之密度,2-10於10L(工作體積)波生物反應器中之moi範圍下,感染Tn5昆蟲細胞。48小時感染後,將細胞及上清液收集,離心且使上清液備用於濃縮。在用切向流式10 kDa MW截止膜之5×濃縮前,在0.45 μm中空纖維濾筒上澄清上清液。在蛋白質純化之前,將上清液過濾滅菌w/1L,0.2 μm微孔真空燒瓶。
除S1片段在純化之前不濃縮且S2片段在5kDa MW濾筒上濃縮外,相似方法係用以昆蟲細胞中表現S1及S2域。
PRLR片段係如下純化。自純的或經具有1或5 kD標稱分子量截止之堆疊膜卡匣裝置(Pall Filtron)濃縮至多10×之表現基團,接受含有所表現PRLR ECD或子域之昆蟲細胞-培養物上清液。當實踐時,經由0.2微米過濾器過濾上清液。直接將上清液加載至PBS平衡管柱上。
經His標記之蛋白質係在製造商之推薦流動速率下,在1-mL或5-mL HisTrap管柱(GE Healthcare)上純化。經Glu標記之蛋白質係在如下製備之固定抗glu單株抗體管柱上純化:將在3-10 mg/mL之濃度下,在PBS中純化之抗glu單株抗體結合於Affi-凝膠10(Bio-Rad),即經n-羥基琥珀醯亞胺活化之瓊脂糖凝膠(根據製造商之說明)。將抗glu瓊脂糖裝填至XK 16管柱(GE Healthcare)中,且在15-30 cm/hr之線性流動速率下運作。
溶離HisTrap管柱之蛋白質係藉由自緩衝液A(PBS)至緩衝液B(PBS+0.25 M咪唑(IX-0005,EM Merck)pH 7.4)之20柱體積梯度溶離來進行。溶離來自抗glu管柱之蛋白質係藉由含有0.1 mg/mL之肽EYMPTD之PBS來進行,該肽EYMPTD與Glu-Glu抗原決定基競爭。藉由SDS-PAGE及西方墨點或質譜法檢查溶離份且適當地彙集。
經彙集PRLR ECD或子域係進一步藉由尺寸排阻層析,使用平衡於PBS中之Superdex 7526/60管柱(GE Healthcare)來純化,且在2.5 mL/min下運作。加載於該等管柱上之量不大於10 mL。藉由SDS-PAGE檢查溶離份且適當地彙集。
實例2
自人類抗體噬菌體顯示庫分離標靶專一性抗體 為分離能夠中和人類PRLR之活性之抗體組,平行研究3種表現scFv片段之人類抗體噬菌體顯示庫。用於庫淘選之標靶為如上文實例1中所述來製備之催乳激素受體之可溶性細胞外域(ECD)(人類催乳激素受體胺基酸25-234)。將受體生物素化(NHS-LC生物素,Pierce)且在生物素化ECD上執行可溶性淘選。
根據由Marks等人(Methods Mol Biol. 248:161-76,2004)描述之方法,進行自噬菌體顯示之標靶專一性抗體之選擇。簡言之,在室溫下,用50 pmol之生物素化ECD將噬菌體顯示庫培育1 hr,且隨後使用100 l之抗生蛋白鏈菌素珠粒懸浮液(DynabeadsM-280抗生蛋白鏈菌素,Invitrogen)俘獲所形成之複合物。藉由用洗滌緩衝液(PBS+5%乳劑)洗滌珠粒來移除非專一性噬菌體。用0.5 ml之100 nM三乙胺(TEA)溶離結合噬菌體,且立即藉由添加相等體積之1M TRIS-Cl pH 7.4中和。所溶離噬菌體池係用以感染在對數期生長之TG1大腸桿菌細胞,且如所述(Methods Mol Biol. 248:161-76,2004)救助噬質體。重複選擇總共三回。篩選來自第三回淘選之自用所溶離噬菌體感染之TG1細胞獲得的單一菌落在ELISA檢定中之結合活性。簡言之,自用所溶離噬菌體感染之TG1細胞獲得之單一菌落係用以在96孔板中接種培養基。使微型培養物生長至OD600 =0.6,在該點時,可溶性抗體片段之表現係藉由在30℃下,在搖動恆溫箱中隔夜培養後,添加1 mM IPTG來誘導。使細菌旋轉下降且製備周質萃取物且用以按照由微定量盤製造商提供之標準ELISA協定,偵測抗體對固定於96孔微定量盤(96孔平底免疫吸收盤,Nunc)上之ECD之結合活性。
使用Biacore2000估算用於結合於重組細胞外域(ECD)之抗催乳激素受體(PRLR)抗體之親和力,且用於抗體之親和力分級。蛋白質A/G俘獲表面係用於人類scFv-Fc融合物且兔抗小鼠IgG-Fc(RAM-Fc)抗體俘獲表面係用於藉由融合瘤產生之抗體。蛋白質A/G及RAM-Fc俘獲晶片為CM5感應器晶片,其具有根據來自BiacoreInc之推薦協定,經由標準EDC-NHS胺偶合化學作用固定於所有4個流槽(flow cell)上之最大水平之俘獲分子(蛋白質A/G或RAM-Fc)。運作緩衝液為HBS-EP(Biacore,Inc.),溫度設定在25℃,且流動速率初始為10 μL/min。將經純化抗體稀釋於HBS-EP中至大致1-3 μg/mL之間的濃度,且經俘獲晶片注射1至2分鐘。將流動速率增加至25至30 μL/min。將PRLR之重組ECD稀釋至1 μg/mL,且注射5至6分鐘,同時10分鐘解離。
使用BIAEvaluation軟件執行擬合且用以計算動力學締合及解離速率常數(分別為kon 及koff )。具有質量輸送校正之1:1蘭牟而相互作用模型(Langmuir interaction model)係用以在各樣本上同時執行ka/kd擬合。擬合若干樣本,同時,將Rmax、kon 及koff 參數設定至局部擬合。當發生基線漂移時,使用具有設定至恆定之漂移值之漂移基線模型且手動輸入。漂移值自-0.03變化至+0.05 RU/秒。
亦藉由使用螢光活化細胞分類(FACS)分析及螢光微體積檢定技術(FMAT)量測與表現催乳激素受體之細胞之結合來評估抗體結合(Swartzman等人,Anal Biochem. 271:143-51,1999)。將藉由FACS或FMAT檢定而展示結合之純系分析序列,且如下文實例3中所述,將編碼獨特重鏈CDR3及輕鏈CDR3蛋白質序列之純系重定格式至scFv-Fc。如下文實例5及6中所述,測試該等scFv-Fc抑制PRLR誘導之ERK1/2磷酸化及PRLR誘導之BaF3/PRLR細胞株增殖之能力。如實例7所述,進一步表徵所選抗體與ECD、S1及S2之結合以及抗體對之間對與PRLRECD之結合的相對競爭。所選抗體之資料顯示於下文表4中。
實例3
純系向scFv-Fc格式之重定格式 對在實例2中識別之各獨特scFv純系而言,藉由PCR自噬菌體顯示載體擴增編碼scFv片段之cDNA且接合至哺乳動物表現載體中,該哺乳動物表現載體為XOMA's專屬表現載體之修飾物(描述於WO 2004/033693中,其編碼卡帕()、拉目達(λ)或伽瑪-2(γ2)恆定區基因),容許在scFv-Fc蛋白質中表現各抗體,其中蛋白質之Fc部分表示IgG1分子之CH2及CH3域。scFv-Fc融合蛋白質之構建在此項技術中為熟知的,例如參見Fredericks等人,Protein Eng Des Sel.2004 Jan;17(1):95-106 ,Powers等人,J Immunol Methods.2001 May 1;251(1-2):123-35 ,或Shu等人,Proc.Nat.Acad.Sci.USA 1993,90,7995-7998 。美國專利5,892,019亦描述Fc融合蛋白質載體之構建及scFv-Fc融合蛋白質之表現。
融合蛋白質之表現係藉由使用製造商之說明,用Lipofectamine 2000(Invitrogen)轉染293E懸浮液細胞來執行。5天後,藉由離心移除細胞且使用製造商所建議之協定,使用蛋白質A瓊脂糖(GE Healthcare)自上清液純化scFv-Fc融合物。
實例4
識別藉由鼠類融合瘤分泌之標靶專一性抗體 如下產生抵抗人類催乳激素受體(PRLR)之細胞外域(ECD)之小鼠抗體。經由皮下注射,用重組PRLR細胞外域(上述)使6隻Balb/C小鼠免疫。小鼠經28天時期接受10次注射。最終注射後4天,使小鼠犧牲且收穫排洩淋巴結。在使來自淋巴結之細胞懸浮後,藉由使用BTX ECM2001電子細胞操縱器(Harvard Apparatus)之電子細胞融合,使其與小鼠骨髓瘤細胞株P3xAg8.653融合。
融合後,將細胞取出塗於大致40個96孔板中。12天後,藉由抵抗重組ECD之ELISA及在FMAT中篩選板。FMAT檢定使用經穩定轉染以表現高水平PRLR受體之CHO細胞株。
如下文實例5及6中所述,測試所選融合瘤抑制PRLR誘導之ERK1/2磷酸化及PRLR誘導之BaF3/PRLR細胞株增殖之能力。如實例7所述,進一步表徵所選抗體與重組ECD、S1及S2之結合以及抗體對之間對與PRLR ECD之結合的相對競爭。所選抗體之資料顯示於上文表4中。
實例5
測定抗體對ERK1/2磷酸化之效應 5小時血清饑餓後,在37℃下,將T47D細胞接種於完整生長培養基中之微量滴定板中歷時24小時。用磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)將細胞洗滌2次且在37℃下,用稀釋於含有0.1% BSA之無血清培養基中之抗體培育30分鐘。抗體之最終起始濃度為40 μg/ml。移除培養基且添加稀釋於含有0.1% BSA之無血清培養基中之催乳激素至30 ng/ml之最終濃度。在37℃下,用催乳激素將細胞培育30分鐘,接著用冰冷PBS洗滌2次。添加含有清潔劑、螯合劑及各種蛋白酶及磷酸酶抑制劑之標準溶解緩衝液以產生細胞溶胞物。根據DUOSETIC Phospho-ERKl/ERK2,R & D Systems,Inc之說明,使用標準ELISA量測磷酸化ERK1/2(pERK1/2)之水平。代表性檢定之結果顯示於圖2、3及4中,且對所選抗體之檢定結果展示於上文表4中。
圖7A-7C展示在pERK檢定中具有大於80%抑制率之抗體之VH及VL胺基酸序列。
實例6
測定抗體對PRL反應性細胞株之增殖之效應 藉由用含有全長人類PRLR及新黴素抵抗性卡匣之表現載體電穿孔鼠類前B細胞株BaF3來產生BaF3/PRLR細胞。歷時7天,在用G418(1 mg/ml)及rmIL-3(10 ng/ml)補充之培養基中選擇細胞,接著在不含G418或IL-3之rhPRL(1 μg/ml)中之7天選擇時期。經14天時期,將培養基PRL濃度逐步降低直至達到50 ng/ml之維持水平。實驗當天,將1x104 個細胞接種至平底96孔板之各孔中。在具有或不具有50 ng/ml rhPRL時,將抗體(呈scFv-Fc融合格式)以10 μg/ml之濃度添加至孔中。將板培育48 hr且使用CellTiter Glo試劑來分析。將樣本運作三次,藉由在不存在PRL下藉由抗體誘導之細胞增殖來評估激動作用,而藉由在PRL存在下之細胞增殖測定拮抗作用。所選抗體之該增殖檢定結果展示於上文表4中。
為分析PRL誘導之增殖及藉由抗PRLR抗體抑制增殖,以每ml之正常生長培養基(無酚紅RPMI/10% FCS)1×106 之密度將T47D或MCF7-NCI細胞分裂至T75燒瓶(總體積12 ml)中。分裂後72 hrs,將細胞胰蛋白酶化、計數且以平底96孔板(每孔100 μl)之每孔5 K(T47D)或每孔20 K(MCF7)之密度來接種。在無血清及無酚紅RPMI中接種MCF7細胞,在無血清RPMI或含有10%木炭-溶離血清之RPMI中接種T47D細胞。接種後24 hrs,將PRL及抗PRLR抗體添加至孔中(50 μl,濃縮3×)。培育72 hrs後,在37°恆溫箱中,將3 [H]胸苷(每孔1 μci)添加至板中歷時最少6 hrs。使用胰蛋白酶及Tomtec 96孔板細胞收集器收穫細胞。隨後將過濾器轉移至Trilux光度計且分析(1 min計數)。圖5中之增殖研究結果展示,scFv抑制催乳激素介導之增殖增加。
實例7
經由BIACORE量測結合親和力及競爭 除S1、S2或ECD蛋白質係在10 μg/mL下,以15 μL/分鐘來注射2分鐘外,重複如上文實例2中所述之BIACORE分析,以測定所選抗體與如上所述之PRLR之ECD、S1及S2域之相對結合。藉由Biacore控制軟體收集來自該檢定之資料作為報導點(共振單位(RU)),且藉由所結合抗原之量除以所俘獲抗體之量來標準化。資料展示於下文表5中。
藉由在Biacore2000上執行一系列注射來測定純化抗體之親和力。所產生之親和力及速率常數關聯於在25℃下,在HBS-EP緩衝系統中結合催乳激素受體(PRLR)之重組細胞外域(ECD)之該等抗體。根據來自BiacoreInc.之推薦協定,經由標準EDC-NHS胺偶合化學作用製備具有大致5000-1000 RU之蛋白質A/G之CM5感應器晶片且用以俘獲抗體。在HBS-EP緩衝液中將純化抗體粗略稀釋至1 μg/mL以用於俘獲。測定得到250與400 RU之間的抗體俘獲所需要之注射時間。用於動力分析之抗體俘獲係藉由以10 μL/分鐘將抗體注射1.5至3分鐘來執行,其視俘獲水平最佳化之結果而定。
對動力分析而言,流動速率設定在40 μL/分鐘下。在自148 nM(4 μg/mL)或37 nM(1 μg/mL)之1:3連續稀釋液中製備5種濃度之PRLR ECD。將各濃度加緩衝液對照(零濃度)注射2次。兩次參照資料組且使用1:1蘭牟而結合相互作用模型全面地擬合。亦執行該相同分析用於IgG1及IgG2構築體之XPA.06.167之IgG重定格式構築體。
用於將所選抗體結合於PRLR之ECD之動力學常數及親和力顯示於下文表6中。
相似程序係用以測定額外抗體之動力學常數及親和力(概述於下文表7中)。
抗體對(例如,成對分析)之間對結合於PRLR之相對競爭或干擾係如下在連續競爭檢定策略中測定。在該方法中,直接地或經由俘獲劑將一個抗體固定於感應器晶片上,且容許其在ECD被注射至固定抗體時,結合ECD。必要時,藉由注射高濃度之不相關IgG來阻斷過量俘獲劑(例如,當測試2種鼠類抗體時,使用兔-抗小鼠IgG俘獲表面)。隨後注射欲測試競爭之抗體,且測定其結合由第一抗體所俘獲之ECD之能力。若2個抗體結合於ECD上之空間分離抗原決定基,則第二抗體應亦能夠結合ECD/第一抗體複合物。若2個抗體干擾或競爭,則第二抗體將亦或根本不能夠結合於ECD/第一抗體複合物。該競爭分析之結果顯示於上文表4中(若2個抗體具有相同抗原決定基組數量,則其將彼此競爭對ECD之結合且其將顯示相對來自其他組之抗體之競爭的相同模式)。本發明特別涵蓋識別如同在本文所述之組中之抗體的任何者一般結合於PRLR之相同抗原決定基或與該等抗體競爭結合PRLR ECD之其他抗體。
實例8
藉由西方墨點之對PRL誘導PRLR、STAT5 & AKT磷酸化之效應如下測定所選抗體抑制STAT5及AKT之PRL誘導磷酸化之能力。在6孔板中,在無酚紅RPMI/10% FBS中以3×105 細胞/ml之密度將細胞接種隔夜。第二天,用無血清RPMI置換培養基歷時30 min。在一些實驗中,在該血清饑餓時期期間,用細胞培育抗PRLR或非專一性對照抗體。隨後將50 ng/ml PRL添加至孔中歷時30 min,其後在PBS中將細胞沖洗1次,且溶解於由pH 7.5之50 mM Tris-HCl、150 mM NaCl、1 mM EDTA、1% NP-40、1 mM Na3OV4、50 mM NaF、0.25%去氧膽酸鹽及蛋白酶抑制劑組成之緩衝液中。在冷凍微量離心機中,在14,000 rpm下將管旋轉下降,且使用BCA試劑定量溶胞物。藉由10% SDS-PAGE分離30 μg之全部細胞溶胞物,且使用STAT5A/B(Y694/Y699,Upstate)或PRLR(Y546/Y611,內部)及ECL之磷酸基專一性抗體偵測蛋白質。藉由用對全部STAT5(BD)或PRLR(Zymed)或AKT(Cell Signalling)具有專一性之抗體之染色來測定相等蛋白質加載量。PRLR專一性抗體對PRLR細胞內磷酸化之效應之代表性檢定結果展示於圖6中。
實例9
鼠類抗體之人化 該實例陳列用於人化鼠類抗PRLR抗體之程序。
設計人化PRLR抗體輕鏈及重鏈之基因 鼠類抗體XHA.06.983、XHA.06.275及XHA.06.642之VL及VH胺基酸序列陳述於圖10中。使用National Biomedical Foundation Protein Identification Resource或相似資料庫識別之人類抗體之序列係用以提供人化抗體之構架。為選擇人化重鏈之序列,將鼠類重鏈序列與人類抗體重鏈之序列比對。除非位置落在下文定義之4個類別之任一者中,否則在各位置處,選擇人類抗體胺基酸用於人化序列,在位置落在下文定義之4個類別之任一者中之狀況下選擇鼠類胺基酸:(1)如由Kabat,J.Immunol.,125,961-969(1980)所定義,位置落在互補判定區(CDR)內;(2)人類抗體胺基酸在彼位置對人類重鏈而言為稀有的,而鼠類胺基酸在彼位置對人類重鏈而言為常見的;(3)位置直接鄰近於鼠類重鏈之胺基酸序列中之CDR;或(4)鼠類抗體之3維模型暗示,胺基酸物理上接近於抗原結合區域。
為選擇人化輕鏈之序列,將鼠類輕鏈序列與人類抗體輕鏈之序列比對。除非位置再次落在上述及下文重複所述類別之一者中,否則在各位置處選擇人類抗體胺基酸用於人化序列:(1)CDR's;(2)鼠類胺基酸比人類抗體更典型;(3)鄰近於CDR's;或(4)可能3維接近結合區域。
重鏈及輕鏈基因之實際核苷酸序列係如下選擇:(1)編碼如上述所選之胺基酸序列之核苷酸序列;(2)該等編碼序列之5',編碼前導區(信號)序列之核苷酸序列。該等前導區序列係選作抗體之典型;(3)編碼序列之3',核苷酸序列為跟隨在小鼠輕鏈J5區段及小鼠重鏈J2區段後之序列,其為鼠類序列之部分。包括該等序列,因為其含有接合供體信號;及(4)在序列之各末端處的為Xba I位點,其容許在Xba I位點剪切且選殖至載體之Xba I位點中。
構建人化輕鏈及重鏈基因 為合成重鏈,使用Applied Biosystems 380B DNA合成器將4種寡核苷酸合成。寡核苷酸之2者為重鏈之各股之部分,且各寡核苷酸重疊下一者約20個核苷酸以容許黏接。合起來,寡核苷酸覆蓋整個人化重鏈可變區,同時在各末端處之幾個額外核苷酸容許在Xba I位點處之剪切。寡核苷酸係自聚丙烯醯胺凝膠純化。
使用ATP及T4多核苷酸激酶,藉由標準程序將各寡核苷酸磷酸化(Maniatis等人,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,第2版,Cold Spring Harbor Laboratory,Cold Spring Harbor,N.Y.(1989))。為黏接磷酸化寡核苷酸,以各自約3.75 μM之濃度,將其一起懸浮於40 μl之TA(pH 7.9之33 mM Tris乙酸鹽、66 mM乙酸鉀、10 mM乙酸鎂)中,加熱至95℃歷時4 min.且緩慢冷卻至4℃。為藉由合成各寡核苷酸之相反股而自寡核苷酸合成完整基因,以100 μl之最終體積來添加以下組分:
在37℃下將混合物培育30 min。隨後,添加10 μ之T4 DNA連接酶且使37℃下之培育再繼續30 min。藉由在70℃下將反應培育15 min使聚合酶及連接酶失活。為用Xba I消化基因,將含有200 μg/ml之BSA及1 mM之DTT、43 μl之水及於5 μl中之50 μ Xba I之50 μl的2 X TA添加至反應中。在37℃下將反應培育3 hr,且隨後凝膠純化。自凝膠純化Xba I片段且藉由標準方法將其選殖至質體pUC19之Xba I位點中。使用標準技術純化質體且使用雙去氧方法定序。
構建質體以表現人化輕鏈及重鏈係藉由以下方法完成:自已插入其中之pUC19質體分離輕鏈及重鏈Xba I片段,且隨後將其插入當轉染至適當宿主細胞中時將表現高水平完整重鏈之適當表現載體之Xba I位點中。
人化抗體之合成及親和力 將表現載體轉染至小鼠Sp2/0細胞中,且藉由標準方法,基於藉由表現載體給與之可選擇標記來選擇合併質體之細胞。為驗證該等細胞分泌結合於PRLR之抗體,用已知表現PRLR之細胞培育來自細胞之上清液。洗滌後,用螢光素結合山羊抗人類抗體培育細胞,洗滌且在FACSCAN細胞螢光計上分析螢光。
活體外培養產生人化抗體之細胞。根據標準技術,藉由通過蛋白質A(Pro-Chem Inc.,Littleton,MA或等價物)之親和力管柱,自細胞上清液將人化抗體純化至實質上均質性。根據此項技術中已知之技術測定人化抗體相對於原始鼠類抗體之親和力。
實例10
鼠類抗體之人類工程化 TM 該實例描述人類工程化TM 抗體之選殖及表現,以及該等抗體之純化及結合活性之測試。
設計人類工程化 TM 序列 抗體可變域之人類工程化TM 已由Studnicka[參見(例如),Studnicka等人美國專利第5,766,886號;Studnicka等人Protein Engineering 7:805-814(1994)]描述為降低免疫原性同時維持抗體分子之結合活性之方法。根據該方法,各可變區胺基酸已分配一定的取代風險。胺基酸取代係藉由3種風險類別之一來區分:(1)低風險改變為具有降低免疫原性之最大可能性與破壞抗原結合之最小概率之彼等改變;(2)中等風險改變為將進一步降低免疫原性,但具有影響抗原結合或蛋白質摺疊之更大概率之彼等改變;(3)高風險殘基為對結合或維持抗體結構為重要的且具有抗原結合或蛋白質摺疊將受影響之最高風險之彼等殘基。由於脯胺酸之三維結構作用,脯胺酸之修飾通常視為至少中等風險改變,即使該位置通常為低風險位置。圖10展示鼠類抗體XHA.06.983、XHA.06.275及XHA.06.642之輕鏈及重鏈可變區胺基酸序列。
鼠類抗體之輕鏈及重鏈之可變區係使用該方法來人類工程化TM 。為根據該方法之修飾之候選者的處於低風險位置之胺基酸殘基係藉由將鼠類可變區之胺基酸序列與人類可變區序列比對來識別。可使用任何人類可變區,包括個別VH或VL序列或人類一致VH或VL序列。可改變在任何數量之低風險位置處或在所有低風險位置處之胺基酸殘基。
同樣地,為根據該方法之修飾之候選者的處於所有低及中等風險位置之胺基酸殘基係藉由將鼠類可變區之胺基酸序列與人類可變區序列比對來識別。可改變在任何數量之低或中等風險位置,或全部低及中等風險位置處之胺基酸殘基。
製備人類工程化 TM 抗體序列 使用合成核苷酸合成方法建構編碼人類工程化TM 重鏈及輕鏈V區域序列連同信號序列(例如,抗體衍生信號序列)之DNA片段。將編碼本文中所述之輕鏈V區域胺基酸序列之各者的DNA插入含有人類或λ輕鏈恆定區之載體中。將編碼本文中所述之重鏈V區域胺基酸序列之各者的DNA插入含有人類γ-1、2、3或4重鏈恆定區之載體中。所有該等載體視其用於瞬間表現或穩定細胞株發展之用途而含有啟動子(例如,hCMV啟動子)及3'未轉譯區域(例如,小鼠輕鏈3'未轉譯區域)連同額外調節序列(US 2006/0121604)。
為使用含有可變區序列之上述載體來表現人類工程化TM 抗體,可自低風險輕鏈、低+中等風險輕鏈、低風險重鏈及低+中等風險重鏈之不同組合產生至少4種變體。在彼等實例中,當中等風險改變不包括在輕鏈或重鏈之任一者或兩者中時,相應地產生較少變體。
製備用於瞬間表現之表現載體 建構含有上述輕鏈或重鏈基因之載體以用於瞬間轉染。除上述人類工程化TM 抗體序列、啟動子及輕鏈3'未轉譯區域外,該等載體較佳含有用於在表現愛波斯坦-巴爾病毒(Epstein-Barr virus)核抗原之HEK293細胞中複製之愛波斯坦-巴爾病毒ori P。
在HEK293E細胞中瞬間表現人類工程化 TM PRLR抗體 如US 2006/0121604所述,將各自含有來自愛波斯坦-巴爾病毒之ori P及上述輕鏈或重鏈基因之分離載體瞬間轉染至HEK293E細胞中。使瞬間轉染細胞培育至多10天,其後回收上清液且使用蛋白質A層析純化抗體。
製備用於永久細胞株發展之表現載體 除上述人類工程化TM 抗體序列、啟動子及輕鏈3'未轉譯區域外,用於永久細胞株發展之載體含有可選擇標記基因,諸如分別用於選擇G418-或組胺醇-抗性轉染物之neohis 。建構含有重鏈之一複本及輕鏈編碼區之一複本之最終載體。
永久轉染CHO-K1細胞之發展 將一起含有輕及重基因之各者之一複本的上述載體轉染至Ex-細胞302-修改CHO-K1細胞中。適應於在Ex-細胞302培養基中之懸浮液生長之CHO-K1細胞通常係使用線性聚乙烯亞胺(PEI),用線性化載體來轉染。將細胞塗於含有用1% FBS及G418補充之Ex-細胞302培養基之96孔板中。在96孔板中篩選純系,且將來自各轉染之頂部約10%之純系轉移至含有用G418補充之Ex-細胞302培養基之深孔96孔板中。
在深孔96孔板中,在用於培養物生長之Ex-細胞302培養基中將生產力測試執行14天,在該時間時,藉由IgG之免疫球蛋白ELISA檢定測試培養物上清液之所分泌抗體之水平。
將頂部純系轉移至含有Ex-細胞302培養基之搖瓶中。用Ex-細胞302培養基中之該等純系執行搖瓶測試。在含有25 ml培養基之125 ml錐形瓶中使細胞生長14天。在培育期結束時,藉由IgG ELISA或HPLC測定培養基中之免疫球蛋白多肽水平。用2或3種多單元轉錄載體多次連續轉染相同細胞株產生純系及細胞株,其顯示免疫球蛋白產生水平之進一步增加,較佳增加至300 μg/ml或300 μg/ml以上。
純化 可設計用於自根據本發明之載體及所有系純化免疫球蛋白多肽之方法(參見(例如),US 2006/0121604)。舉例而言,根據此項技術中熟知之方法,在終止後藉由過濾移除細胞。將濾液加載於蛋白質A管柱上(若需要,則多次通過)。洗滌管柱且隨後自管柱溶離所表現及分泌之免疫球蛋白多肽。為製備抗體產物,將蛋白質A池保持在低pH下(pH3歷時最少30分鐘及最大1小時)作為病毒失活步驟。吸附陽離子交換步驟接著用以進一步純化產物。使來自吸附分離管柱之溶離物通過保留病毒之過濾器以提供可能病毒粒子之進一步清除。藉由通過產物不結合於其中之陰離子交換管柱進一步純化濾液。最後,經由透濾作用,藉由將產物轉移至調配物緩衝液中來結束純化方法。將保留物調節至至少1 mg/mL之蛋白質濃度且添加穩定劑。
結合活性 評估重組人類工程化TM 抗體之PRLR結合活性。藉由傳遞經過蛋白質A管柱自搖瓶培養物上清液純化蛋白質,接著藉由A280 之濃度測定。如其他實例中所述執行結合檢定。
實例11
人類工程化抗體 通常如實例10中所述將上述鼠類抗體中之三者人類工程化TM
催乳激素受體抗體XHA.06.642及XHA.06.275之人類工程化 TM 對XHA.06.642而言,在11個低風險或13個低加中等風險位置將重鏈人類工程化TM ;僅在低風險位置將輕鏈人類工程化TM (14次改變),因為所有中等風險位置已經為人類胺基酸。對XHA.06.275而言,在7個低風險或11個低加中等風險位置將重鏈人類工程化TM ;在8個低風險或10個低加中等風險位置將輕鏈人類工程化TM
下文展示得自XHA.06.642、XHA.06.275及XHA.06.983之人類工程化TM 可變區之胺基酸序列(CDR經劃線)。該等可變區係以各種組合(例如,SEQ ID NO:88及SEQ ID NO:89;SEQ ID NO:88及SEQ ID NO:90;SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:93;SEQ ID NO:91及SEQ ID NO:94;SEQ ID NO:92及SEQ ID NO:93;或SEQ ID NO:92及SEQ ID NO:94)來裝配以產生人類工程化TM 抗體he.06.642-1、he.06.642-2、he.06.275-1、he.06.275-2、he.06.275-3、he.06.275-4。
he.06.642 LC可變區低風險(SEQ ID NO:88): DIVLTQSPDSLAVSLGERATINCKASKSVSTSGYTYMH WYQQKPGQPPKLLIYLASNRES GVPDRFSGSGSGTDFTLTISPVQAEDVATYYCQHSGELPPS FGQGTKLEIK
he.06.642 HC可變區低風險(SEQ ID NO:89): EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAVSGFTFSSYGMS WVRQAPGKRLEWVATVSSGGTYTYYPDSVKG RFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAMYYCARHRGNYYATYYYAMDY WGQGTLVTVSS
he.06.642 HC可變區低加中等風險(SEQ ID NO:90): EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAVSGFTFSSYGMS WVRQAPGKGLEWVATVSSGGTYTYYPDSVKG RFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARHRGNYYATYYYAMDY WGQGTLVTVSS
he.06.275 LC可變區低風險(SEQ ID NO:91): DVQITQSPSSLSASPGDRITLTCRASKNIYKYLA WYQEKPGKTNNLLIYSGSTLHS GIPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAMYYCQQHNDYPYT FGQGTKLEIK
he.06.275 LC可變區低加中等風險(SEQ ID NO:92): DVQITQSPSSLSASPGDRITLTCRASKNIYKYLA WYQEKPGKANKLLIYSGSTLHS GIPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFAMYYCQQHNDYPYT FGQGTKLEIK
he.06.275 HC可變區低風險(SEQ ID NO:93): DVQLQESGPGLVKPSQTLSLTCTVTGYSITSDYAWN WIRQFPGKKLEWMGYISYSGSTSYNPSLKS RITISRDTSKNQFSLQLNSVTAADTATYFCARDYGYVFDY WGQGTTLTVSS
he.06.275 HC可變區低加中等風險(SEQ ID NO:94): QVQLQESGPGLVKPSQTLSLTCTVSGYSITSDYAWN WIRQFPGKGLEWMGYISYSGSTSYNPSLKS RITISRDTSKNQFSLQLNSVTAADTAVYFCARDYGYVFDY WGQGTTLTVSS
he.06.983 LC可變區低風險(SEQ ID NO:95): DIVMTQSPDSLAVSAGERVTINCKASQGVSNDVA WFQQKPGQSPKLLIYSASTRYT GVPDRLSGSGSGTDFTFTISSVQAEDVAVYFCQQDYTSPT FGQGTKLEIK
he.06.983 LC可變區低加中等風險(SEQ ID NO:96): DIVMTQSPDSLAVSLGERVTINCKASQGVSNDVA WFQQKPGQSPKLLIYSASTRES GVPDRLSGSGSGTDFTFTISSVQAEDVAVYFCQQDYTSPT FGQGTKLEIK
he.06.983 HC可變區低風險(SEQ ID NO:97): DVQLVESGGGLVQPGGSRRLSCAASGFAFSSFGMQ WVRQAPGKGLEWVAYISSGSSTIYYADTVKG RFTISRDNPKNTLYLQMNSLRAEDTAMYYCVRSGRDY WGQGTLVTVSS
he.06.983 HC可變區低加中等風險(SEQ ID NO:98): EVQLVESGGGLVQPGGSRRLSCAASGFAFSSFGMQ WVRQAPGKGLEWVAYISSGSSTIYYADSVKG RFTISRDNPKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCVRSGRDY WGQGTLVTVSS
實例12
he.06.642及he.06.275抗體之表現及純化 將人類工程化TM he.06.642及he.06.275輕鏈及重鏈V區域分別融合於人類及γ-1或γ-2恆定區。隨後將重鏈及輕鏈基因融合於強啟動子及有效3'未轉譯區域,且選殖至含有愛波斯坦-巴爾病毒複製起源之瞬間表現載體中。
在HEK293細胞中,使用以通常如實例10中所述之各種低或低+中等風險組合來編碼抗體重鏈及輕鏈序列之分離質體來瞬間表現抗體。重鏈:輕鏈DNA之比率為1:2。在1:2之DNA:PEI比率及1 μg/mL之DNA濃度下,用PEI執行細胞之轉染。細胞密度為8e5細胞/mL。使用標準Qiagen套組製備DNA。在2 L燒瓶中之IS293培養基(Irvine Scientific)+1%低Ig FBS(Hyclone)中使表現培養物生長(每個燒瓶400 mL培養基)。培養條件為37℃,5% CO2 及在90-95 RPM下攪動。在培養物中5-7天後,將培養基收穫且澄清作為純化輸入。
上述抗體之嵌合及人類工程化TM 型式之純化係藉由將瞬間表現培養物上清液直接傳遞經過重組蛋白質A速流管柱(GE Healthcare)而單步達到。主峰之溶離係藉由pH 3.5之0.1 mM甘胺酸進行。將所彙集之物質透析至PBS中且在離心濃縮器中,用30 kD之標稱分子量截止來濃縮。最終純度為>95%且總產率為大致60%。使用Endosafe PTS LAL單元(Charles River)或QCL-1000產色LAL端點檢定(Lonza)來檢定最終池之內毒素,且結果對全部抗體而言為<0.05 EU/mg(偵測限制以下)。藉由在Superdex 200 10/300 GL管柱(GE Healthcare)上之SEC,測定欲為單體之嵌合抗體he.06.642之聚集狀態。
在單一層析步驟中將chXHA.06.642分離至>95%之純度,接著用於緩衝液交換之透析。以3 mg/mL將chXHA.06.642溶於PBS中,且如藉由尺寸排阻層析所量測,未偵測到主要雜質或聚集。
藉由流式細胞儀測試人類工程化抗人類PRLR抗體 將表現CHO-K1親代及人類催乳激素受體(PRLR)之細胞收穫,離心且以大致5x106 細胞/ml再懸浮於含有2% FBS及0.1%疊氮化鈉之1X PBS(FACS緩衝液)中。在FACS緩衝液中將人類工程化抗人類PRLR及抗KLH同型對照抗體稀釋至2X最終濃度且添加至適當樣本孔(50 ml/孔)中。對第二抗體及自發螢光對照物而言,將50 ml FACS緩衝液添加至適當孔中。50 ml之細胞懸浮液添加至各樣本孔中。在4℃下將樣本培育1小時,用冷FACS緩衝液洗滌2×且以1:100稀釋再懸浮於含有PE結合山羊抗人類IgG(Jackson Immunoresearch,West Grove,PA)之FACS緩衝液中。在4℃下之30分鐘培育後,用冷FACS緩衝液將細胞洗滌2×,再懸浮於含有1 mg/ml碘化丙啶(Invitrogen,San Diego,CA)之FACS緩衝液中且藉由流式細胞儀分析。如表7中所示,抗PRLR抗體結合於表現PRLR之細胞而非親代細胞。
實例13
人類工程化 TM 抗體之親和力 藉由Biacore分析測定嵌合及人類工程化TM 抗體之親和力。簡言之,經由NHS/EDC,用蛋白質A/G(Pierce)固定之CM5感應器晶片(Biacore)係用以在晶片表面上俘獲大致600 RU之抗體。在動力學滴定注射模式中,自最低至最高濃度注射5種濃度之以5 μg/mL(185 nM)開始且在5×稀釋連續稀釋至0.3 nM之PRLR ECD,且收集15分鐘之解離資料。將實驗確定基準2次,亦即,自動減去鄰近流槽反應,且自實驗資料組減去自緩衝液注射實驗之反應。藉由使用慣用於動力學滴定注射模式之BiaEval軟體來擬合於1:1蘭牟而模型,測定動力學及所得參數(ka 、kd 及KD )。嵌合及全部人類工程化TM 抗體相對人類及猴PRLR ECD之親和力量測概述於表8及表9中。
為使用共價固定抗體比較大鼠及小鼠交叉反應性,根據來自BiacoreInc之推薦協定,經由標準EDC-NHS胺偶合化學作用,將CM4晶片與he.06.642-2及he.06.275-4抗體偶合。在5種濃度下,在以111 nM開始且下降至1.37 nM之3倍滴定系列中執行PRLR ECD注射。用甘胺酸pH 3.0執行再生。XHA.06.642及XHA.06.275之所有HE變體之親和力極相似於親代嵌合抗體之親和力。抗體he.06.642-2以相等親和力結合於人類、小鼠及大鼠PRLR。其以比人類PRLR弱15倍之親和力結合於猴PRLR。抗體he.06.275-4以比人類PRLR弱5倍之親和力結合於猴PRLR。抗體he.06.275-4不有效地結合於小鼠或大鼠PRLR。資料之概述提供於表10中。
猴KD/人類KD=15鼠類KD/人類KD=1大鼠KD/人類KD=0.75 猴KD/人類KD=5鼠類KD/人類KD=13,548大鼠KD/人類KD=
實例14
抑制BaF/PRLR細胞增殖及存活及抑制PRLR誘導之ERK1/2磷酸化 分析嵌合mAb抑制BaF/PRLR細胞之增殖及存活之能力[圖11]。發現所有所測試之嵌合物已保留其相對於其相應融合瘤純系之效能。實際上,在嵌合後,在該檢定中發現XHA.06.642及XHA.06.275已獲得效能。為評估嵌合抗體在人類乳癌模型中之PRLR信號中和能力,在PRL刺激之前,用1 ug/ml mAb將T47D細胞處理30 min。同時,單獨用抗體培育額外細胞樣本以檢查經由抗體候選者之嵌合獲得之任何可能的激動作用。如可在圖12中所見,所有嵌合抗體保留其阻斷T47D中之PRL誘導信號傳輸之能力,而僅chXHA.06.983展示藉由磷酸基-PRLR及磷酸基-Stat5表示之PRLR信號傳輸之可偵測誘導(小但可重現之效應)。
測定抗體對ERK1/2磷酸化之效應 如下文及在上文實例5中所述,測試所選人類工程化TM 抗體抑制PRLR誘導之ERK1/2磷酸化之能力。
5小時血清饑餓後,在37℃下,將T47D細胞接種於完整生長培養基中之微量滴定板中歷時24小時。用磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)將細胞洗滌2次且在37℃下,用稀釋於含有0.1% BSA之無血清培養基中之抗體培育30分鐘。抗體之最終起始濃度為40 μg/ml。移除培養基且添加稀釋於含有0.1% BSA之無血清培養基中之催乳激素至30 ng/ml之最終濃度。在37℃下,用催乳激素將細胞培育30分鐘,接著用冰冷PBS洗滌2次。添加含有清潔劑、螯合劑及各種蛋白酶及磷酸酶抑制劑之標準溶解緩衝液以產生細胞溶胞物。根據DUOSETIC Phospho-ERK1/ERK2,R & D Systems,Inc之說明,使用標準ELISA量測磷酸化ERK1/2(pERK1/2)之水平。代表性檢定之結果顯示於圖13中。
實例15
A. mAb候選者相對於表現PRLR之標靶細胞介導ADCC之能力。
抗PRLR mAb之所欲作用機制之一為介導抗體依賴細胞毒性(ADCC)之能力。為評估候選抗體之ADCC之能力,將T47D細胞用作表現PRLR之乳房上皮標靶。如圖14中所示,嵌合抗PRLR mAb之兩者能夠誘導藉由純化人類NK細胞介導之ADCC。證明chXHA.06.275誘導標靶細胞在4 hr內之大致30%專一性溶解。由於chXHA.06.642之延長產生時間,該候選者不包括在原始ADCC檢定中。
B.抗PRLR抗體對細胞激素水平之效應。
研究在乳癌細胞中藉由PRL之可能細胞激素調節。在該實驗中,在具有或不具有chXHA.06.642時,將MCF7或T47D細胞暴露於PRL歷時48 hrs之時期。使用來自MesoScale Diagnostics之多路傳輸夾心免疫檢定(multiplex sandwich immunoassay)以量測chXHA.06.642對可能的經PRL調節之細胞激素之效應。據發現,PRL誘導自T47D細胞之VEGF分泌,且該效應在添加抗體chXHA.06.642時完全消除。在該等實驗中,未偵測到藉由PRL或抗PRLR mAb之IL-1β、IL-6、IL-8、IL-10、IL-12 p70、IFN-γ或TNF-α之顯著調節。該等結果暗示,PRL/PRLR路徑可有助於乳房腫瘤中之血管生成以及細胞生長及存活且抑制該VEGF-調節路徑可為抗PRLR治療性抗體之另一可能的活體內作用機制。
C.利用抗PRLR mAb及化學療劑之活體外組合研究。
由於可能的抗PRLR治療性抗體可在診所中連同細胞毒性藥物方案一起投與之可能性,研究該等組合療法對培養物中之細胞存活之效應。為此,用處於各種濃度之chXHA.06.642或chXHA.06.275平行地與化學療劑一起處理BaF3/PRLR細胞5天,其後使用CellTiter Glo作為細胞數量之標記來評估細胞存活。在該檢定中利用一系列臨床相關且機械互異細胞毒性劑:阿黴素(蒽環黴素Topo II抑制劑)、紫杉酚(微管穩定劑)、氟達拉賓(Fludarabine)(抗代謝物)及順鉑(以鉑為主之DNA交聯藥物)。據發現,chXHA.06.275及(在更大程度上)chXHA.06.642與阿黴素協同作用以增加BaF/PRLR細胞中之細胞死亡[參見圖15]。在具有及不具有抗PRLR mAb chXHA.06.642及chXHA.06.275時之化學療劑IC50值之所得差異概述於表11中。
D.抗PRLR mAb之抗PRLR功能活性 在標靶調節及細胞增殖檢定中評估抗體。圖16描述2種濃度之chXHA.06.642及人類工程化TM 抗體he.06.642-1及he.06.642-2對T47D細胞中之PRL誘導Stat5磷酸化的效應。如藉由完整p-Stat5信號消除所證明,兩者均保留有效對抗性質。另外,抗體或單獨用mAb處理之細胞均不顯示任何促效活性。對chXHA.06.275變體而言,發現相似結果。因此,人類工程化TM 不影響該等抗體之總體對抗或促效品質。
利用BaF/PRLR細胞增殖檢定以測定抗PRLR嵌合及人類工程化TM 抗體之相關IC50值[參見圖17]。作為該等實驗之結果,所有人類工程化TM 抗體具有大致等價於鼠類對應物之效能。
實例16
在Nb2-C11大鼠淋巴瘤模型中評估抗PRLR抗體之抗腫瘤活性 在Nb2-C11腫瘤異種移植模型中用chXHA.06.642進行單一劑量PD研究,以測定抗PRLR mAb是否可達到腫瘤及阻斷信號傳輸。抗體chXHA.06.642係基於其對大鼠PRLR(上述)之親和力而用於該研究中。所監控之PD標記為p-STAT5,一種PRLR信號傳輸之下游介體,其可使用免疫墨點或IHC方法來偵測。因為Nb2-C11腫瘤異種移植中之基線p-STAT5水平太低以致不足以偵測,所以小鼠接受外生綿羊(o)PRL刺激以增加基線p-STAT5水平,且因此提供更適合之動態範圍。
與用鹽水注射之對照組比較,在用綿羊PRL注射之具有Nb2-Cc11腫瘤之動物中,藉由西方墨點及IHC分析來偵測p-STAT5之誘導[參見圖18A及B]。在用10 mg/kg chXHA.06.642在oPRL注射之前處理48小時之小鼠中且並非在KLH IgG1治療之對照動物中觀察到p-STAT5之抑制。
為測定PRLR信號傳輸之抑制是否與Nb2-C11腫瘤生長抑制相關,以每週1次投與chXHA.06.642來執行多劑量功效研究[參見圖19A及B]。給藥在用10 mg/kg之chXHA.06.642或KLH IgG1,或鹽水對照之細胞植入後4天(在腫瘤為明顯之前)起始。給與每週4次腹膜內劑量之mAb。模型使用條件存活或達到進程之時間之端點,因為該等腫瘤侵入肌肉中且因此難以用測徑規精確量測。在chXHA.06.642治療群中,未偵測到腫瘤直至植入後約11週(第4次mAb劑量後7.5週),此時在該群中15隻動物之2隻死於腫瘤負荷。在鹽水及KLH IgG1對照治療群中,中間存活為細胞植入後20天(p<0.0001),在該點,動物由於腫瘤負荷而安樂死。在chXHA.06.642治療群中,動物增加體重,而對照動物維持或損失體重,估計可能由於疾病負荷。
在該研究中包括第二功效臂,其中具有所建立腫瘤之動物在細胞植入後12天登記進入研究中[參見圖20A及B]。平均腫瘤體積在給藥起始時為135 mm3 。以10 mg/kg每週1次對動物腹膜內給藥,chXHA.06.642或KLH IgG1對照抗體歷經2次劑量。在第2次劑量後2天(植入後3週),腫瘤看來似乎完全退化。然而,大致2週後,腫瘤在小鼠中開始重現。相比較,KLH IgG1對照動物具有重腫瘤負荷,其具有>600 mm3 之平均體積。因為該等腫瘤直接生長至肌肉中,所以平均腫瘤體積可比藉由測徑規量測所記錄之彼者更大。在鹽水及KLH IgG1群中,中間存活為細胞植入後23天(p=0<0.0001)。如在初始研究中一樣,在chXHA.06.642治療群中,動物增加體重,而對照動物維持或損失體重。因此,chXHA.06.642 mAb不僅有效抵抗低數量之腫瘤細胞(植入後4天起始治療),而且亦能夠使侵襲性建立之Nb2-C11腫瘤完全退化超過2週。
Nb2-C11模型已證明,抗PRLR mAb具有活體內有效靶向表現抗原之腫瘤,抑制腫瘤內之PLR驅動信號傳輸,且誘導腫瘤負荷之可量測結果之能力,即使當動物具有侵襲性建立之腫瘤時亦如此。
實例17
用於PD評估之人類乳癌T47D模型 使用乳癌T47D細胞,用實例16中所測試之抗體chXHA.06.642活體內執行單劑量PD研究。評估oPRL刺激PRLR信號傳輸之能力以及chXHA.06.642活體內抑制該信號傳輸之能力。經腫瘤植入之動物接受鹽水、KLH IgG1對照mAb或chXHA.06.642之腹膜內注射,且48小時後,藉由快速注射接受鹽水或20 ug oPRL。40分鐘後收集腫瘤組織。如藉由西方墨點法所評估(儘管其藉由IHC分析而稍有變化),在來自oPRL快速治療之動物之腫瘤中而非鹽水對照動物中觀察到p-STAT5之顯著誘導。p-AKT及p-ERK之水平不藉由活體內oPRL刺激而增加。顯著地,用chXHA.06.642而非KLH IgG1對照組之治療證明,在oPRL快速注射後p-STAT5誘導之強的抑制。IHC分析通常確認該結果。顯著地,藉由西方墨點法及IHC分析,在來自4隻chXHA.06.642治療動物之4者中之腫瘤中抑制p-STAT5。
實例18
PRLR表現及PRLR表現與ER及Her2-neu表現之相關性 在正常組織中,如藉由RT-PCR所定量,PRLR表現在乳房及子宮中最高,接著為腎、肝、前列腺及卵巢。PRLR mRNA之水平在氣管、大腦及肺中最低(Pierce SK,等人,J Endocr;171(1):R1-R4(2001))。
可如下進行免疫組織化學(IHC)分析。將來自癌症患者之冷凍組織樣本包埋於最佳切割溫度(OCT)化合物中且在異戊烷中用乾冰速凍。用Leica 3050 CM微切割刀(mictrotome),以5 μm厚度切割冷凍切片且解凍安裝於經vectabound塗佈之載片上。在-20℃下用乙醇固定切片且使其在室溫下風乾隔夜。在-80℃下儲存固定切片直至使用。擷取組織切片,且先在室溫下,在阻斷緩衝液(PBS、5%正常山羊血清、0.1% Tween 20)中培育30分鐘,且然後用稀釋於阻斷緩衝液中之癌症相關蛋白質專一性單株抗體及對照單株抗體(1 μg/ml)培育120分鐘。隨後用阻斷緩衝液將切片洗滌3次。在pH 5.05之0.1 M乙酸鈉緩衝液及0.003%過氧化氫(Sigma目錄號H1009)中,用山羊抗小鼠IgG+IgM(H+L)F(ab')2-過氧化酶結合物及過氧化酶受質二胺基聯苯胺(1 mg/ml,Sigma目錄號D 5637)偵測所結合之單株抗體。用蘇木精將染色載片複染色且在Nikon顯微鏡下檢查。
抵抗癌症相關蛋白質(抗原)之單株抗體係用以測試與來自不同類型組織之各種細胞株之反應性。不使用蛋白酶,自生長表面將來自不同的所建立細胞株之細胞移除,封裝且包埋於OCT化合物中。將細胞冷凍且切片,隨後使用標準IHC協定來染色。CellArrayTM 技術描述於WO 01/43869中。將藉由外科切除術獲得之正常組織(人類)冷凍且安裝。用Leica 3050 CM微切割刀,以5 μm厚度切割冷凍切片且解凍安裝於經vectabound塗佈之載片上。在-20℃下用乙醇固定切片且使其在室溫下風乾隔夜。PolyMICATM 偵測套組係用以測定癌症相關抗原專一性單株抗體與正常組織之結合。以1 μg/ml之最終濃度使用初級單株抗體。
為研究PRLR表現之發生率及其與ER及Her2-neu表現之相關性,使用免疫組織化學(IHC)評估122個侵襲性乳癌患者樣本。總體而言,62/122(50%)之樣本表現PRLR,58/122(47%)表現ER,且32/122(26%)表現Her2-neu。96(78%)個樣本由侵襲性乳腺癌瘤組成,其中48(50%)個表現PRLR。該等樣本中,24/48(50%)亦表現ER+且13/48(26%)亦表現Her2-neu。
本說明書所參考及/或列於申請資料表中之所有上述美國專利、美國專利申請公開案、美國專利申請案、外國專利、外國專利申請案及非專利公開案係以引用之方式全部併入本文。
由前文應瞭解,儘管已出於說明目的而描述本發明之特定實施例,但可在不偏離本發明之主旨及範疇時進行各種修改。
圖1 展示PRLR之各種同功異型物中之基因排列及外顯子。
圖2、34 展示經選擇PRLR專一性抗體對pERK1/2磷酸化之效應。[mAb 1167為對照鼠類抗PRLR單株抗體;R&D系統,目錄# MAB1167]
圖5 展示PRLR-專一性抗體對PRL反應性腫瘤細胞株之增殖之效應。
圖6 展示PRLR專一性抗體對PRLR細胞內磷酸化之效應。
圖7A-7C 展示以下抗體之VH及VL胺基酸序列以及CDR(劃線的)之位置:XPA.06.128、XPA.06.129、XPA.06.130、XPA.06.131、XPA.06.141、XPA.06.147、XPA.06.148、XPA.06.158、XPA.06.159、XPA.06.163、XPA.06.167、XPA.06.171、XPA.06.178、XPA.06.181、XPA.06.192、XPA.06.202、XPA.06.203、XPA.06.206、XPA.06.207、XPA.06.210、XPA.06.212、XPA.06.217、XPA.06.219、XPA.06.229、XPA.06.233、XPA.06.235、XPA.06.239,該等抗體在pERK分析中具有大於80%之抑制率。
圖8 展示抗體XPA.06.145之VH及VL胺基酸序列。
圖9 展示抗體XHA.06.983、XHA.06.275及XHA.06.642之前導序列及VH及VL核苷酸序列。
圖10 展示抗體XHA.06.983、XHA.06.275及XHA.06.642之VH及VL胺基酸序列(CDR經劃線)。
圖11 展示嵌合抗PRLR mAbs chXHA.06.642、chXHA.06.275及chXHA.06.983有效地抑制BaF/PRLR細胞之增殖及存活。KLH-G1為非專一性同型匹配對照抗體。右邊之面板展示相應小鼠mAbs之IC50值。
圖12 展示嵌合抗PRLR mAbs抑制T47D細胞中之STAT5信號傳輸。細胞在用50 ng/ml PRL之30 min刺激之前,用1 μg/ml mAb預處理。使用對PRLR之磷酸酪胺酸殘基546及611具有專一性之抗體來分析溶胞產物之磷酸基-PRLR的存在。
圖13 展示人類工程化TM 抗體對pERK1/2磷酸化之效應。
圖14 展示藉由嵌合抗PRLR mAbs介導之ADCC。T47D-T2細胞在以10:1之效應子-比-標靶比率應用mAb(1 μg/ml)及經純化人類NK細胞之前,用鈣黃綠素-AM標記。在4 hr培育後,量測釋放入上清液中之鈣黃綠素-AM。抗KLH抗體及賀癌平(Herceptin)係分別用作負性及正性對照。專一性溶解百分比係計算為(實驗釋放值-自發釋放值)/(最大釋放值-自發釋放值)×100。
圖15 展示組合研究中抗PRLR mAbs與細胞毒性藥協同作用。阿黴素(頂部面板)及順鉑(底部面板)係與抗KLH對照Ab、抗PRLR mAb chXHA.06.642或抗PRLR mAb chXHA.06.275共同投與(全部呈1 μg/ml)。藉由CellTiter Glo分析測定細胞存活且報導為RLU(y軸)。
圖16 展示在STAT5磷酸化分析中,人類工程化TM mAb保留抗PRLR功能特徵。用1或10 μg/ml mAb培養T47D細胞,隨後用或不用PRL(50 ng/ml)另外處理30 min。
圖17A及B 展示人化抗PRLR抗體候選者有效地抑制PRL依賴性BaF3/PRLR細胞之生長。BaF3/PRLR細胞係與抗KLH對照抗體(頂部線)、嵌合抗體或人類工程化TM 型式一起在PRL(50 ng/ml)存在下生長48 hr。EC50值係使用曲線擬合之非線性回歸分析來計算。
圖18A及B 展示p-STAT5在經chXHA.06.642治療之動物之Nb2-C11腫瘤中的抑制。用chXHA.06.642或KLH對照IgG1 mAb腹膜內注射具有皮下Nb2-c11腫瘤之無胸腺小鼠。2天後,投與20 μg快速腹膜內注射之oPRL。用鹽水注射對照動物。2天後,腹膜內投與20 μg快速注射之oPRL,且40分鐘後,收集腫瘤且藉由免疫墨點或IHC評估p-STAT5。圖18A,80 μg之Tyr694 p-STAT5之西方墨點;圖18B,Tyr694 p-STAT5之IHC。
圖19A及B 展示在2種不同研究中,在SCID小鼠中,chXHA.06.642在Nb2-c11大鼠淋巴瘤模型中為有效的。
圖20A及B 展示在SCID小鼠中,chXHA.06.642使建立之Nb2-C11大鼠淋巴瘤腫瘤消退。圖20A顯示腫瘤體積;圖20B顯示條件性存活。
圖21A及B 展示腹膜內快速注射之oPRL誘導p-STAT5,且用chA64.1之治療抑制T47D人類乳房異種移植物中之p-STAT5誘導。chXHA.06.642或KLH對照IgG1腹膜內注射入帶有T47D腫瘤之免疫功能不全小鼠中,該小鼠係用0.18 mg/日雌二醇(E2 )小球植入以提供生長。2天後,腹膜內投與20 μg快速注射之oPRL,且40分鐘後,收集T47D腫瘤且藉由免疫墨點或IHC評估p-STAT5。亦藉由免疫墨點評估p-ERK或p-AKT水平。圖21A,80 μg之Tyr694 p-STAT5之西方墨點;圖21B,Tyr694 p-STAT5之IHC。
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(無元件符號說明)

Claims (19)

  1. 一種經分離之抗體,其以10-6 M或更低之平衡解離常數(KD )結合SEQ ID NO:2之催乳激素受體(PRLR)之細胞外域且包含(a)載於SEQ ID NO:88之胺基酸序列位置24至38、位置54至60及位置93至101之互補判定區(CDR)及(b)載於SEQ ID NO:90之胺基酸序列位置31至35、位置50至66及位置99至113之CDR。
  2. 如請求項1之抗體,其中該抗體為嵌合抗體、人化抗體、人類工程化抗體、人類抗體、單鏈抗體或抗體片段。
  3. 如請求項1之抗體,其包含人類抗體序列之恆定區及人類抗體序列之一或多個重鏈及輕鏈可變構架區。
  4. 如請求項3之抗體,其中該人類抗體序列為個別人類序列、人類一致序列、個別人類生殖系序列或人類一致生殖系序列。
  5. 如請求項1之抗體,其中該重鏈恆定區為經修飾或未經修飾IgG、IgM、IgA、IgD、IgE、其片段或其組合。
  6. 如請求項5之抗體,其中該重鏈恆定區為經修飾或未經修飾IgG1、IgG2、IgG3或IgG4。
  7. 如請求項1之抗體,其針對PRLR具有10-7 、10-8 或10-9 M或更低之平衡解離常數(KD )。
  8. 如請求項1之抗體,其中輕鏈恆定區為經修飾或未經修飾λ輕鏈恆定區、κ輕鏈恆定區、其片段或其組合。
  9. 如請求項1之抗體,其可抑制PRLR細胞內磷酸化作用。
  10. 如請求項1之抗體,其可抑制Stat5磷酸化作用之誘導。
  11. 如請求項1之抗體,其可抑制乳癌細胞之增殖。
  12. 如請求項1之抗體,其共軛至另一診斷劑或治療劑。
  13. 如請求項1之抗體,其係經純化至至少95重量%均質性。
  14. 如請求項1之抗體,其結合人類PRLR之細胞外域時之平衡解離常數(KD )比結合鼠類PRLR之細胞外域時之平衡解離常數(KD )低至少10,000至15,000倍。
  15. 一種醫藥組合物,其包含如請求項13之抗體及醫藥學上可接受之載劑。
  16. 一種套組,其包含治療有效量之如請求項1之抗體,其係封裝於容器中,該套組含有第二治療劑,且另外包含附著於該容器或與該容器一起封裝之標籤,該標籤描述該容器之該等內含物且提供關於使用該容器之該等內含物來治療乳癌之指示及/或說明。
  17. 如請求項16之套組,其中該容器為一小瓶或瓶子或預填充注射器。
  18. 一種經分離之抗體,其結合PRLR之細胞外域,包含SEQ ID NO:88之可變輕鏈胺基酸序列及SEQ ID NO:90之可變重鏈胺基酸序列。
  19. 一種如請求項1至14及18中任一項之抗體之用途,其係用於製備治療乳癌之藥物。
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