JP6907124B2 - Cdh3及びcd3に対する二重特異性抗体構築物 - Google Patents
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Description
カドヘリンのスーパーファミリーは、ヒトにおいて、いわゆる古典的カドヘリンのP−カドヘリン、E−カドヘリン、N−カドヘリン及びR−カドヘリンを含む100超のメンバーを包含し、その古典的カドヘリンの各々は個々の組織セットにおいて活性である(Takeichi M.Development,102:639−55(1988),van Roy F.,Nature Rev.,V14:121−134(2014))。カドヘリンは、とりわけ、成体組織及び器官の発達に加えて、様々な組織のホメオスタシスにおいて不可欠な役割を果たす(Conacci−Sorrell M,et al.,J Clin Invest,109:987−91,(2002))。カドヘリンは、カルシウム依存性結合の形成により、また機械刺激を電気化学的活性に変換すること、すなわち、メカノトランスダクションと称されるプロセスにより、細胞−細胞接着プロセスを調節する膜貫通糖タンパク質である(Gumbiner J.Cell.Biol.,148:399−404(2000);Yagi,et al.,Genes Dev.,14:1169−1180(2000,Parades et al.Biochimica et Biophysica Acta 1826,297−311(2012))。
本明細書に開示される様々ながん型の処置に関して利用可能なさらなる選択肢を有することが依然として必要であるため、本願では、CDH3を対象とする1つの結合ドメインを有し、かつT細胞上のCD3を対象とする第2結合ドメインを有する二重特異性抗体構築物の形態で、この問題を解決するための手段及び方法が提供される。
・配列番号:155に示されるVH領域及び配列番号:156に示されるVL領域、
・配列番号:165に示されるVH領域及び配列番号:166に示されるVL領域、
・配列番号:175に示されるVH領域及び配列番号:176に示されるVL領域;または
・配列番号:185に示されるVH領域及び配列番号:186に示されるVL領域
を含む抗体と同じエピトープに結合するか、またはCDH3との結合についてそれと競合する。
・配列番号:295に示されるVH領域及び配列番号:296に示されるVL領域、
・配列番号:305に示されるVH領域及び配列番号:306に示されるVL領域、または
・配列番号:315に示されるVH領域及び配列番号:316に示されるVL領域
を含む抗体と同じエピトープに結合するか、またはCDH3との結合についてそれと競合する。
[本発明1001]
標的細胞の表面上におけるヒトCDH3のエピトープクラスターに結合する第1ヒト結合ドメインを含み、かつT細胞の表面上におけるヒトCD3に結合する第2結合ドメインを含む、二重特異性抗体構築物であって、ヒトCDH3の前記エピトープクラスターが、ヒトCDH3のアミノ酸291〜363位(配列番号:36)内に含まれる、前記二重特異性抗体構築物。
[本発明1002]
前記第1結合ドメインが、ヒトCDH3のアミノ酸291〜327位(配列番号:34)内に含まれるエピトープに結合する、本発明1001の抗体構築物。
[本発明1003]
前記第1結合ドメインが、ヒトCDH3のアミノ酸328〜363位(配列番号:35)内に含まれるエピトープに結合する、本発明1001の抗体構築物。
[本発明1004]
前記第1結合ドメインが、ヒトCDH3のアミノ酸404〜440位(配列番号:390)内に含まれるエピトープにも結合する、本発明1003の抗体構築物。
[本発明1005]
前記第1結合ドメインが、マカクCDH3、好ましくはカニクイザル(Macaca fascicularis)CDH3にも結合する、先行本発明のいずれかの抗体構築物。
[本発明1006]
前記第1結合ドメインが、
a)配列番号:149に示されるCDR−H1、配列番号:150に示されるCDR−H2、配列番号:151に示されるCDR−H3、配列番号:152に示されるCDR−L1、配列番号:153に示されるCDR−L2及び配列番号:154に示されるCDR−L3;
b)配列番号:159に示されるCDR−H1、配列番号:160に示されるCDR−H2、配列番号:161に示されるCDR−H3、配列番号:162に示されるCDR−L1、配列番号:163に示されるCDR−L2及び配列番号:164に示されるCDR−L3;
c)配列番号:169に示されるCDR−H1、配列番号:170に示されるCDR−H2、配列番号:171に示されるCDR−H3、配列番号:172に示されるCDR−L1、配列番号:173に示されるCDR−L2及び配列番号:174に示されるCDR−L3;
d)配列番号:179に示されるCDR−H1、配列番号:180に示されるCDR−H2、配列番号:181に示されるCDR−H3、配列番号:182に示されるCDR−L1、配列番号:183に示されるCDR−L2及び配列番号:184に示されるCDR−L3;
e)配列番号:189に示されるCDR−H1、配列番号:190に示されるCDR−H2、配列番号:191に示されるCDR−H3、配列番号:192に示されるCDR−L1、配列番号:193に示されるCDR−L2及び配列番号:194に示されるCDR−L3;
f)配列番号:199に示されるCDR−H1、配列番号:200に示されるCDR−H2、配列番号:201に示されるCDR−H3、配列番号:202に示されるCDR−L1、配列番号:203に示されるCDR−L2及び配列番号:204に示されるCDR−L3;
g)配列番号:209に示されるCDR−H1、配列番号:210に示されるCDR−H2、配列番号:211に示されるCDR−H3、配列番号:212に示されるCDR−L1、配列番号:213に示されるCDR−L2及び配列番号:214に示されるCDR−L3;
h)配列番号:219に示されるCDR−H1、配列番号:220に示されるCDR−H2、配列番号:221に示されるCDR−H3、配列番号:222に示されるCDR−L1、配列番号:223に示されるCDR−L2及び配列番号:224に示されるCDR−L3;
i)配列番号:229に示されるCDR−H1、配列番号:230に示されるCDR−H2、配列番号:231に示されるCDR−H3、配列番号:232に示されるCDR−L1、配列番号:233に示されるCDR−L2及び配列番号:234に示されるCDR−L3;ならびに
j)配列番号:239に示されるCDR−H1、配列番号:240に示されるCDR−H2、配列番号:241に示されるCDR−H3、配列番号:242に示されるCDR−L1、配列番号:243に示されるCDR−L2及び配列番号:244に示されるCDR−L3
からなる群より選択されるCDR−H1、CDR−H2及びCDR−H3を含むVH領域ならびにCDR−L1、CDR−L2及びCDR−L3を含むVL領域を含む、
本発明1001、1002及び1005のいずれかの抗体構築物。
[本発明1007]
前記第1結合ドメインが、
a)配列番号:279に示されるCDR−H1、配列番号:280に示されるCDR−H2、配列番号:281に示されるCDR−H3、配列番号:282に示されるCDR−L1、配列番号:283に示されるCDR−L2及び配列番号:284に示されるCDR−L3;
b)配列番号:289に示されるCDR−H1、配列番号:290に示されるCDR−H2、配列番号:291に示されるCDR−H3、配列番号:292に示されるCDR−L1、配列番号:293に示されるCDR−L2及び配列番号:294に示されるCDR−L3;
c)配列番号:299に示されるCDR−H1、配列番号:300に示されるCDR−H2、配列番号:301に示されるCDR−H3、配列番号:302に示されるCDR−L1、配列番号:303に示されるCDR−L2及び配列番号:304に示されるCDR−L3;
d)配列番号:309に示されるCDR−H1、配列番号:310に示されるCDR−H2、配列番号:311に示されるCDR−H3、配列番号:312に示されるCDR−L1、配列番号:313に示されるCDR−L2及び配列番号:314に示されるCDR−L3;
e)配列番号:319に示されるCDR−H1、配列番号:320に示されるCDR−H2、配列番号:321に示されるCDR−H3、配列番号:322に示されるCDR−L1、配列番号:323に示されるCDR−L2及び配列番号:324に示されるCDR−L3;
f)配列番号:329に示されるCDR−H1、配列番号:330に示されるCDR−H2、配列番号:331に示されるCDR−H3、配列番号:332に示されるCDR−L1、配列番号:333に示されるCDR−L2及び配列番号:334に示されるCDR−L3;
g)配列番号:339に示されるCDR−H1、配列番号:340に示されるCDR−H2、配列番号:341に示されるCDR−H3、配列番号:342に示されるCDR−L1、配列番号:343に示されるCDR−L2及び配列番号:344に示されるCDR−L3;ならびに
h)配列番号:349に示されるCDR−H1、配列番号:350に示されるCDR−H2、配列番号:351に示されるCDR−H3、配列番号:352に示されるCDR−L1、配列番号:353に示されるCDR−L2及び配列番号:354に示されるCDR−L3
からなる群より選択されるCDR−H1、CDR−H2及びCDR−H3を含むVH領域ならびにCDR−L1、CDR−L2及びCDR−L3を含むVL領域を含む、
本発明1001、1003、1004及び1005のいずれかの抗体構築物。
[本発明1008]
前記第1結合ドメインが、配列番号:155、配列番号:165、配列番号:175、配列番号:185、配列番号:195、配列番号:205、配列番号:215、配列番号:225、配列番号:235、及び配列番号:245に示されるVH領域からなる群より選択されるVH領域を含む、本発明1006の抗体構築物。
[本発明1009]
前記第1結合ドメインが、配列番号:285、配列番号:295、配列番号:305、配列番号:315、配列番号:325、配列番号:335、配列番号:345、及び配列番号:355に示されるVH領域からなる群より選択されるVH領域を含む、本発明1007の抗体構築物。
[本発明1010]
前記第1結合ドメインが、配列番号:156、配列番号:166、配列番号:176、配列番号:186、配列番号:196、配列番号:206、配列番号:216、配列番号:226、配列番号:236、及び配列番号:246に示されるVL領域からなる群より選択されるVL領域を含む、本発明1006または1008の抗体構築物。
[本発明1011]
前記第1結合ドメインが、配列番号:286、配列番号:296、配列番号:306、配列番号:316、配列番号:326、配列番号:336、配列番号:346、及び配列番号:356に示されるVL領域からなる群より選択されるVL領域を含む、本発明1007または1009の抗体構築物。
[本発明1012]
前記第1結合ドメインが、配列番号:155+156、配列番号:165+166、配列番号:175+176、配列番号:185+186、配列番号:195+196、配列番号:205+206、配列番号:215+216、配列番号:225+226、配列番号:235+236、及び配列番号:245+246に示されるVH領域及びVL領域の対からなる群より選択されるVH領域及びVL領域を含む、本発明1006、1008または1010のいずれかの抗体構築物。
[本発明1013]
前記第1結合ドメインが、配列番号:285+286、配列番号:295+296、配列番号:305+306、配列番号:315+316、配列番号:325+326、配列番号:335+336、配列番号:345+346、及び配列番号:355+356に示されるVH領域及びVL領域の対からなる群より選択されるVH領域及びVL領域を含む、本発明1007、1009または1011のいずれかの抗体構築物。
[本発明1014]
(scFv) 2 、scFv−単一ドメインmAb、ダイアボディ及び前述の形式のオリゴマーからなる群より選択される形式である、先行本発明のいずれかの抗体構築物。
[本発明1015]
前記第1結合ドメインが、配列番号:157、配列番号:167、配列番号:177、配列番号:187、配列番号:197、配列番号:207、配列番号:217、配列番号:227、配列番号:237、及び配列番号:247に示される配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、本発明1006、1008、1010、1012または1014のいずれかの抗体構築物。
[本発明1016]
前記第1結合ドメインが、配列番号:287、配列番号:297、配列番号:307、配列番号:317、配列番号:327、配列番号:337、配列番号:347、及び配列番号:357に示される配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、本発明1007、1009、1011、1013または1014のいずれかの抗体構築物。
[本発明1017]
前記第2結合ドメインが、ヒト及びコモンマーモセット(Callithrix jacchus)、ワタボウシタマリン(Saguinus Oedipus)またはコモンリスザル(Saimiri sciureus)のCD3イプシロンに結合する、先行本発明のいずれかの抗体構築物。
[本発明1018]
配列番号:158、配列番号:168、配列番号:178、配列番号:188、配列番号:198、配列番号:208、配列番号:218、配列番号:228、配列番号:238、及び配列番号:248に示される配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、本発明1006、1008、1010、1012、1014、1015または1017のいずれかの抗体構築物。
[本発明1019]
配列番号:288、配列番号:298、配列番号:308、配列番号:318、配列番号:328、配列番号:338、配列番号:348、及び配列番号:358に示される配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、本発明1007、1009、1011、1013、1014、1016または1017のいずれかの抗体構築物。
[本発明1020]
配列番号:379、配列番号:380、配列番号:381、配列番号:382、配列番号:383、配列番号:384、配列番号:385、配列番号:386、配列番号:387、配列番号:388、配列番号:389、配列番号:422、配列番号:423、配列番号:424、配列番号:425、配列番号:426及び配列番号:427に示される配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、本発明1006、1008、1010、1012、1014、1015、1017または1018のいずれかの抗体構築物。
[本発明1021]
先行本発明のいずれかに定義される抗体構築物をコードするポリヌクレオチド。
[本発明1022]
本発明1021に定義されるポリヌクレオチドを含むベクター。
[本発明1023]
本発明1021に定義される前記ポリヌクレオチドもしくは本発明1022に定義される前記ベクターで形質転換されるまたは本発明1021に定義される前記ポリヌクレオチドもしくは本発明1022に定義される前記ベクターをトランスフェクトされる、宿主細胞。
[本発明1024]
本発明1001〜1020のいずれかの抗体構築物の産生方法であって、本発明1001〜1020のいずれかに定義される前記抗体構築物の発現を可能にする条件下で本発明1023に定義される宿主細胞を培養することと、産生された抗体構築物を培養物から回収することとを含む、前記方法。
[本発明1025]
本発明1001〜1020のいずれかの抗体構築物または本発明1024の方法により産生される抗体構築物を含む、医薬組成物。
[本発明1026]
腫瘍またはがんの予防、処置または改善に使用するための、本発明1001〜1020のいずれかの抗体構築物または本発明1024の方法により産生される抗体構築物。
[本発明1027]
前記がんが、肺癌腫、頭頸部癌腫、原発性または二次性CNS腫瘍、原発性または二次性脳腫瘍、原発性CNSリンパ腫、脊髄軸腫瘍、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、副腎皮質がん、食道癌腫、結腸がん、乳がん、卵巣がん、NSCLC(非小細胞肺がん)、SCLC(小細胞肺がん)、子宮内膜がん、子宮頸がん、子宮がん、移行上皮癌腫、骨がん、膵臓がん、皮膚がん、皮膚または眼内黒色腫、肝がん、胆管がん、胆嚢がん、腎臓がん、直腸がん、肛門部のがん、胃がん、胃腸(胃、結腸直腸、及び十二指腸)がん、小腸のがん、胆道がん、尿道のがん、腎細胞癌腫、子宮内膜の癌腫、甲状腺がん、精巣がん、皮膚扁平上皮細胞がん、黒色腫、胃がん、前立腺がん、膀胱がん、骨肉腫、中皮腫、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫、慢性または急性白血病、慢性骨髄性白血病、リンパ球性リンパ腫、多発性骨髄腫、線維肉腫、神経芽細胞腫、網膜芽細胞腫、及び軟部肉腫からなる群より選択される、本発明1026の抗体構築物。
[本発明1028]
前記がんが扁平上皮癌腫である、本発明1027の抗体構築物。
[本発明1029]
腫瘍またはがんの処置、予防または改善の方法であって、それを必要とする対象に、本発明1001〜1020のいずれかの抗体構築物または本発明1024の方法により産生される抗体構築物を投与するステップを含む、前記方法。
[本発明1030]
前記がんが、肺癌腫、頭頸部癌腫、原発性または二次性CNS腫瘍、原発性または二次性脳腫瘍、原発性CNSリンパ腫、脊髄軸腫瘍、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、副腎皮質がん、食道癌腫、結腸がん、乳がん、卵巣がん、NSCLC(非小細胞肺がん)、SCLC(小細胞肺がん)、子宮内膜がん、子宮頸がん、子宮がん、移行上皮癌腫、骨がん、膵臓がん、皮膚がん、皮膚または眼内黒色腫、肝がん、胆管がん、胆嚢がん、腎臓がん、直腸がん、肛門部のがん、胃がん、胃腸(胃、結腸直腸、及び十二指腸)がん、小腸のがん、胆道がん、尿道のがん、腎細胞癌腫、子宮内膜の癌腫、甲状腺がん、精巣がん、皮膚扁平上皮細胞がん、黒色腫、胃がん、前立腺がん、膀胱がん、骨肉腫、中皮腫、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫、慢性または急性白血病、慢性骨髄性白血病、リンパ球性リンパ腫、多発性骨髄腫、線維肉腫、神経芽細胞腫、網膜芽細胞腫、及び軟部肉腫からなる群より選択される、本発明1029の方法。
[本発明1031]
前記がんが扁平上皮癌腫である、本発明1030の方法。
[本発明1032]
本発明1001〜1020のいずれかの抗体構築物、本発明1024の方法により産生される抗体構築物、本発明1022に定義されるベクター、及び/または本発明1023に定義される宿主細胞
を含む、キット。
a)配列番号:149に示されるCDR−H1、配列番号:150に示されるCDR−H2、配列番号:151に示されるCDR−H3、配列番号:152に示されるCDR−L1、配列番号:153に示されるCDR−L2及び配列番号:154に示されるCDR−L3;
b)配列番号:159に示されるCDR−H1、配列番号:160に示されるCDR−H2、配列番号:161に示されるCDR−H3、配列番号:162に示されるCDR−L1、配列番号:163に示されるCDR−L2及び配列番号:164に示されるCDR−L3;
c)配列番号:169に示されるCDR−H1、配列番号:170に示されるCDR−H2、配列番号:171に示されるCDR−H3、配列番号:172に示されるCDR−L1、配列番号:173に示されるCDR−L2及び配列番号:174に示されるCDR−L3;
d)配列番号:179に示されるCDR−H1、配列番号:180に示されるCDR−H2、配列番号:181に示されるCDR−H3、配列番号:182に示されるCDR−L1、配列番号:183に示されるCDR−L2及び配列番号:184に示されるCDR−L3;
e)配列番号:189に示されるCDR−H1、配列番号:190に示されるCDR−H2、配列番号:191に示されるCDR−H3、配列番号:192に示されるCDR−L1、配列番号:193に示されるCDR−L2及び配列番号:194に示されるCDR−L3;
f)配列番号:199に示されるCDR−H1、配列番号:200に示されるCDR−H2、配列番号:201に示されるCDR−H3、配列番号:202に示されるCDR−L1、配列番号:203に示されるCDR−L2及び配列番号:204に示されるCDR−L3;
g)配列番号:209に示されるCDR−H1、配列番号:210に示されるCDR−H2、配列番号:211に示されるCDR−H3、配列番号:212に示されるCDR−L1、配列番号:213に示されるCDR−L2及び配列番号:214に示されるCDR−L3;
h)配列番号:219に示されるCDR−H1、配列番号:220に示されるCDR−H2、配列番号:221に示されるCDR−H3、配列番号:222に示されるCDR−L1、配列番号:223に示されるCDR−L2及び配列番号:224に示されるCDR−L3;
i)配列番号:229に示されるCDR−H1、配列番号:230に示されるCDR−H2、配列番号:231に示されるCDR−H3、配列番号:232に示されるCDR−L1、配列番号:233に示されるCDR−L2及び配列番号:234に示されるCDR−L3;ならびに
j)配列番号:239に示されるCDR−H1、配列番号:240に示されるCDR−H2、配列番号:241に示されるCDR−H3、配列番号:242に示されるCDR−L1、配列番号:243に示されるCDR−L2及び配列番号:244に示されるCDR−L3
からなる群より選択されるCDR−H1、CDR−H2及びCDR−H3を含むVH領域ならびにCDR−L1、CDR−L2及びCDR−L3を含むVL領域を含む。
a)配列番号:279に示されるCDR−H1、配列番号:280に示されるCDR−H2、配列番号:281に示されるCDR−H3、配列番号:282に示されるCDR−L1、配列番号:283に示されるCDR−L2及び配列番号:284に示されるCDR−L3;
b)配列番号:289に示されるCDR−H1、配列番号:290に示されるCDR−H2、配列番号:291に示されるCDR−H3、配列番号:292に示されるCDR−L1、配列番号:293に示されるCDR−L2及び配列番号:294に示されるCDR−L3;
c)配列番号:299に示されるCDR−H1、配列番号:300に示されるCDR−H2、配列番号:301に示されるCDR−H3、配列番号:302に示されるCDR−L1、配列番号:303に示されるCDR−L2及び配列番号:304に示されるCDR−L3;
d)配列番号:309に示されるCDR−H1、配列番号:310に示されるCDR−H2、配列番号:311に示されるCDR−H3、配列番号:312に示されるCDR−L1、配列番号:313に示されるCDR−L2及び配列番号:314に示されるCDR−L3;
e)配列番号:319に示されるCDR−H1、配列番号:320に示されるCDR−H2、配列番号:321に示されるCDR−H3、配列番号:322に示されるCDR−L1、配列番号:323に示されるCDR−L2及び配列番号:324に示されるCDR−L3;
f)配列番号:329に示されるCDR−H1、配列番号:330に示されるCDR−H2、配列番号:331に示されるCDR−H3、配列番号:332に示されるCDR−L1、配列番号:333に示されるCDR−L2及び配列番号:334に示されるCDR−L3;
g)配列番号:339に示されるCDR−H1、配列番号:340に示されるCDR−H2、配列番号:341に示されるCDR−H3、配列番号:342に示されるCDR−L1、配列番号:343に示されるCDR−L2及び配列番号:344に示されるCDR−L3;ならびに
h)配列番号:349に示されるCDR−H1、配列番号:350に示されるCDR−H2、配列番号:351に示されるCDR−H3、配列番号:352に示されるCDR−L1、配列番号:353に示されるCDR−L2及び配列番号:354に示されるCDR−L3
からなる群より選択されるCDR−H1、CDR−H2及びCDR−H3を含むVH領域ならびにCDR−L1、CDR−L2及びCDR−L3を含むVL領域を含む。
・配列番号:157、配列番号:167、配列番号:177、配列番号:187、配列番号:197、配列番号:207、配列番号:217、配列番号:227、配列番号:237、配列番号:247、配列番号:287、配列番号:297、配列番号:307、配列番号:317、配列番号:327、配列番号:337、配列番号:347、及び配列番号:357からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する第1結合ドメイン;
・配列番号:392〜400からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するペプチドリンカー;
・配列番号:453、配列番号:462、配列番号:471、配列番号:480、配列番号:489、配列番号:498、配列番号:507、配列番号:516、配列番号:525、配列番号:534、及び配列番号:537からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する第2結合ドメイン;ならびに
・場合により配列番号:392〜400からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するペプチドリンカー;ならびに
・配列番号:437、443及び444からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチド
を含む。
(a)第1結合ドメイン;
(b)配列番号:393、399及び400からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するペプチドリンカー;
(c)第2結合ドメイン;
(d)配列番号:392、393、395、396、397、399、及び400からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するペプチドリンカー;
(e)第3ドメイン(ヒンジ、CH2及びCH3ドメインを含む)の第1ポリペプチド単量体;
(f)配列番号:402、403、404及び405からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するペプチドリンカー;ならびに
(g)第3ドメイン(ヒンジ、CH2及びCH3ドメインを含む)の第2ポリペプチド単量体
を含んでよい。
(a)配列番号:157、配列番号:167、配列番号:177、配列番号:187、配列番号:197、配列番号:207、配列番号:217、配列番号:227、配列番号:237、配列番号:247、配列番号:287、配列番号:297、配列番号:307、配列番号:317、配列番号:327、配列番号:337、配列番号:347、及び配列番号:357からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する第1結合ドメイン;
(b)配列番号:393、399及び400からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するペプチドリンカー;
(c)配列番号:453、配列番号:462、配列番号:471、配列番号:480、配列番号:489、配列番号:498、配列番号:507、配列番号:516、配列番号:525、配列番号:534、及び配列番号:537からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する第2結合ドメイン;
(d)配列番号:392、393、395、396、397、399、及び400からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するペプチドリンカー;ならびに
(e)配列番号:414〜421からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する第3ドメイン
を含むことも好ましい。
a)放射性同位体または重同位体であってよい同位体標識、例えば、放射性同位体または放射性核種など(例えば、3H、14C、15N、35S、89Zr、90Y、99Tc、111In、125I、131I)
b)磁気標識(例えば、磁気粒子)
c)酸化還元活性部分
d)光学色素(発色団、リン光体及びフルオロフォアを含むが、これらに限定されない)、例えば、蛍光基(例えば、FITC、ローダミン、ランタニドリン光体)、化学発光基、及び「小分子」蛍光体またはタンパク質性蛍光体のいずれかであり得るフルオロフォアなど
e)酵素基(例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼ、アルカリホスファターゼ)
f)ビオチン化基
g)二次レポーターによって認識される所定のポリペプチドエピトープ(例えば、ロイシンジッパー対配列、二次抗体の結合部位、金属結合ドメイン、エピトープタグなど)
を含むが、これらに限定されない。
(a)WO2008/119567の配列番号:27に示されるCDR−L1、WO2008/119567の配列番号:28に示されるCDR−L2及びWO2008/119567の配列番号:29に示されるCDR−L3;
(b)WO2008/119567の配列番号:117に示されるCDR−L1、WO2008/119567の配列番号:118に示されるCDR−L2及びWO2008/119567の配列番号:119に示されるCDR−L3;ならびに
(c)WO2008/119567の配列番号:153に示されるCDR−L1、WO2008/119567の配列番号:154に示されるCDR−L2及びWO2008/119567の配列番号:155に示されるCDR−L3
から選択されるCDR−L1、CDR−L2及びCDR−L3を含むVL領域を含むことが、本発明の抗体構築物について特に好ましい。
(a)WO2008/119567の配列番号:12に示されるCDR−H1、WO2008/119567の配列番号:13に示されるCDR−H2及びWO2008/119567の配列番号:14に示されるCDR−H3;
(b)WO2008/119567の配列番号:30に示されるCDR−H1、WO2008/119567の配列番号:31に示されるCDR−H2及びWO2008/119567の配列番号:32に示されるCDR−H3;
(c)WO2008/119567の配列番号:48に示されるCDR−H1、WO2008/119567の配列番号:49に示されるCDR−H2及びWO2008/119567の配列番号:50に示されるCDR−H3;
(d)WO2008/119567の配列番号:66に示されるCDR−H1、WO2008/119567の配列番号:67に示されるCDR−H2及びWO2008/119567の配列番号:68に示されるCDR−H3;
(e)WO2008/119567の配列番号:84に示されるCDR−H1、WO2008/119567の配列番号:85に示されるCDR−H2及びWO2008/119567の配列番号:86に示されるCDR−H3;
(f)WO2008/119567の配列番号:102に示されるCDR−H1、WO2008/119567の配列番号:103に示されるCDR−H2及びWO2008/119567の配列番号:104に示されるCDR−H3;
(g)WO2008/119567の配列番号:120に示されるCDR−H1、WO2008/119567の配列番号:121に示されるCDR−H2及びWO2008/119567の配列番号:122に示されるCDR−H3;
(h)WO2008/119567の配列番号:138に示されるCDR−H1、WO2008/119567の配列番号:139に示されるCDR−H2及びWO2008/119567の配列番号:140に示されるCDR−H3;
(i)WO2008/119567の配列番号:156に示されるCDR−H1、WO2008/119567の配列番号:157に示されるCDR−H2及びWO2008/119567の配列番号:158に示されるCDR−H3;ならびに
(j)WO2008/119567の配列番号:174に示されるCDR−H1、WO2008/119567の配列番号:175に示されるCDR−H2及びWO2008/119567の配列番号:176に示されるCDR−H3
から選択されるCDR−H1、CDR−H2及びCDR−H3を含むVH領域を含む。
(a)WO2008/119567の配列番号:17または21に示されるVL領域及びWO2008/119567の配列番号:15または19に示されるVH領域;
(b)WO2008/119567の配列番号:35または39に示されるVL領域及びWO2008/119567の配列番号:33または37に示されるVH領域;
(c)WO2008/119567の配列番号:53または57に示されるVL領域及びWO2008/119567の配列番号:51または55に示されるVH領域;
(d)WO2008/119567の配列番号:71または75に示されるVL領域及びWO2008/119567の配列番号:69または73に示されるVH領域;
(e)WO2008/119567の配列番号:89または93に示されるVL領域及びWO2008/119567の配列番号:87または91に示されるVH領域;
(f)WO2008/119567の配列番号:107または111に示されるVL領域及びWO2008/119567の配列番号:105または109に示されるVH領域;
(g)WO2008/119567の配列番号:125または129に示されるVL領域及びWO2008/119567の配列番号:123または127に示されるVH領域;
(h)WO2008/119567の配列番号:143または147に示されるVL領域及びWO2008/119567の配列番号:141または145に示されるVH領域;
(i)WO2008/119567の配列番号:161または165に示されるVL領域及びWO2008/119567の配列番号:159または163に示されるVH領域;ならびに
(j)WO2008/119567の配列番号:179または183に示されるVL領域及びWO2008/119567の配列番号:177または181に示されるVH領域
からなる群より選択されるVL領域及びVH領域を含む、T細胞の表面上におけるヒトCD3に結合する第2結合ドメインを特徴とする。
・荷電アミノ酸、好ましくはリジン、酢酸リジン、アルギニン、グルタミン酸塩及び/またはヒスチジンを含む、アミノ酸、例えば、グリシン、アラニン、グルタミン、アスパラギン、トレオニン、プロリン、2−フェニルアラニンなど
・抗菌剤、例えば、抗細菌剤及び抗真菌剤など
・抗酸化剤、例えば、アスコルビン酸、メチオニン、亜硫酸ナトリウムまたは亜硫酸水素ナトリウムなど;
・組成物を生理学的pHで、またはそれよりもわずかに低いpHで、典型的には約5〜約8または9のpH範囲内に維持するために使用される緩衝液、緩衝系及び緩衝剤;緩衝液の例は、ホウ酸塩、重炭酸塩、Tris−HCl、クエン酸塩、リン酸塩またはその他の有機酸、コハク酸塩、リン酸塩、ヒスチジン及び酢酸塩であり;例えば、約pH7.0〜8.5のTris緩衝液、または約pH4.0〜5.5の酢酸緩衝液;
・非水性溶媒、例えば、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、植物油、例えば、オリーブ油など、及び注射可能な有機エステル、例えば、オレイン酸エチルなど;
・生理食塩水及び緩衝媒体を含む、水、アルコール/水溶液、エマルジョンまたは懸濁液を含む水性担体;
・生分解性ポリマー、例えば、ポリエステルなど;
・増量剤、例えば、マンニトールまたはグリシンなど;
・キレート剤、例えば、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)など;
・等張剤及び吸収遅延剤;
・錯化剤、例えば、カフェイン、ポリビニルピロリドン、ベータ−シクロデキストリンまたはヒドロキシプロピル−ベータ−シクロデキストリンなど)
・充填剤;
・単糖類;二糖類;及びその他の炭水化物(グルコース、マンノースまたはデキストリンなど);炭水化物は、非還元糖、好ましくはトレハロース、スクロース、オクタスルフェート、ソルビトールまたはキシリトールであってよい;
・(低分子量)タンパク質、ポリペプチドまたはタンパク質性担体、例えば、ヒトまたはウシ血清アルブミン、ゼラチンまたは好ましくはヒト起源の免疫グロブリンなど;
・着色及び香味剤;
・イオウ含有還元剤、例えば、グルタチオン、チオクト酸、チオグリコール酸ナトリウム、チオグリセロール、[アルファ]−モノチオグリセロール、及びチオ硫酸ナトリウムなど
・希釈剤;
・乳化剤;
・親水性ポリマー、例えば、ポリビニルピロリドンなど)
・塩形成対イオン、例えば、ナトリウムなど;
・防腐剤、例えば、抗菌剤、抗酸化剤、キレート化剤、不活性ガスなど;例は、塩化ベンザルコニウム、安息香酸、サリチル酸、チメロサール、フェネチルアルコール、メチルパラベン、プロピルパラベン、クロルヘキシジン、ソルビン酸または過酸化水素である);
・金属錯体、例えば、Zn−タンパク質錯体など;
・溶媒及び共溶媒(グリセリン、プロピレングリコールまたはポリエチレングリコールなど);
・糖及び糖アルコール、例えば、トレハロース、スクロース、オクタスルフェート、マンニトール、ソルビトールまたはキシリトールスタキオース、マンノース、ソルボース、キシロース、リボース、ミオイニシトース(myoinisitose)、ガラクトース、ラクチトール、リビトール、ミオイニシトール、ガラクチトール、グリセロース、シクリトール(例えば、イノシトール)、ポリエチレングリコール;及び多価糖アルコールなど;
・懸濁化剤;
・界面活性剤または湿潤剤、例えば、pluronic、PEG、ソルビタンエステル、ポリソルベート20などのポリソルベート、ポリソルベート、triton、トロメタミン、レシチン、コレステロール、チロキサパル(tyloxapal)など;界面活性剤は、好ましくは>1.2KDの分子量を有する洗剤及び/または好ましくは>3KDの分子量を有するポリエーテルであってよく;好ましい洗剤の非限定的な例は、Tween20、Tween40、Tween60、Tween80及びTween85であり;好ましいポリエーテルの非限定的な例は、PEG3000、PEG3350、PEG4000及びPEG5000である;
・安定性増強剤、例えば、スクロースまたはソルビトールなど;
・張度増強剤、例えば、アルカリ金属ハロゲン化物、好ましくは塩化ナトリウムまたは塩化カリウム、マンニトールソルビトールなど;
・塩化ナトリウム溶液、リンゲルデキストロース、デキストロース及び塩化ナトリウム、乳酸リンゲル、または固定油を含む非経口送達ビヒクル;
・水分及び栄養補充剤、電解質補充剤(リンゲルデキストロースに基づくものなど)を含む静脈内送達ビヒクル
が挙げられてよいが、これらに限定されない。
・局所経路(皮膚上、吸入、鼻、眼、耳介/耳、膣、粘膜など);
・経腸経路(口、胃腸、舌下、唇下、頬側、直腸など);及び
・非経口経路(静脈内、動脈内、骨内、筋内、脳内、脳室内、硬膜外、髄腔内、皮下、腹腔内、羊膜外、関節内、心臓内、皮内、病巣内、子宮内、膀胱内、硝子体内、経皮、鼻腔内、経粘膜、滑液嚢内、管腔内など)
が挙げられるが、これらに限定されない。
野生型及びキメラCDH3を発現するCHO細胞の生成
エピトープマッピングに使用するキメラ分子の構築のために、ヒトCDH3の5つの各細胞外ドメインDom1〜Dom5(またはD1〜D5)の配列及びそれらのサブドメイン(A、B及びC)の配列を、対応するマウス配列で置き換えた。以下の20の分子を生成した;図1及び図2も参照のこと。
●Hu CDH3/Dom1 mu(aa 108−215)配列番号:13
○Hu CDH3/Dom1A mu(aa 108−143)配列番号:14
○Hu CDH3/Dom1B mu(aa 144−179)配列番号:15
○Hu CDH3/Dom1C mu(aa 180−215)配列番号:16
●Hu CDH3/Dom2 mu(aa 216−327)配列番号:17
○Hu CDH3/Dom2A mu(aa 216−252)配列番号:18
○Hu CDH3/Dom2B mu(aa 253−290)配列番号:19
○Hu CDH3/Dom2C mu(aa 291−327)配列番号:20
●Hu CDH3/Dom3 mu(aa 328−440)配列番号:21
○Hu CDH3/Dom3A mu(aa 328−363)配列番号:22
○Hu CDH3/Dom3B mu(aa 364−403)配列番号:23
○Hu CDH3/Dom3C mu(aa 404−440)配列番号:24
●Hu CDH3/Dom4 mu(aa 441−546)配列番号:25
○Hu CDH3/Dom4A mu(aa 441−474)配列番号:26
○Hu CDH3/Dom4B mu(aa 475−511)配列番号:27
○Hu CDH3/Dom4C mu(aa 512−546)配列番号:28
●Hu CDH3/Dom5 mu(aa 547−650)配列番号:29
○Hu CDH3/Dom5A mu(aa 547−581)配列番号:30
○Hu CDH3/Dom5B mu(aa 582−616)配列番号:31
○Hu CDH3/Dom5C mu(aa 617−650)配列番号:32
を使用する標準的なクローニングによって得た。配列分析により、アカゲザルCDH3GenBank配列(JU473826、JU473827)と比較して、コア細胞外ドメインのアミノ酸配列類似性が明らかとなった。全てのクローニング手順は、標準的なプロトコール(Sambrook,Molecular Cloning;A Laboratory Manual,3rd edition,Cold Spring Harbour Laboratory Press,Cold Spring Harbour,New York(2001))に従って実施した。各構築物について、対応するプラスミドを、Kaufman R.J.(1990)Methods Enzymol.185,537−566によって記載されているように、真核生物発現のためにDHFR欠損CHO細胞にトランスフェクトした。
マウスscFv断片のエピトープクラスタリング
ヒトもしくはマウスCDH3をトランスフェクトした細胞、またはキメラヒト/マウスCDH3分子をトランスフェクトした細胞(実施例1を参照のこと)を、ヒト/マカクCDH3に結合するscFvを含有する粗非希釈ペリプラズム抽出物で染色した。結合したscFv分子を、マウスモノクローナル抗FLAG−M2抗体(1μg/ml;PBS/2%FCS中に50μl;Sigma F1804)、続いて抗マウスIgG Fcγ−PE(1:100、50μl;Jackson Immunoresearch番号115−116−071)で検出した。全ての抗体を、2%FCSを用いたPBSで希釈した。陰性対照として、細胞を、ペリプラズム抽出物の代わりにPBS/2%FCSでインキュベートした。試料をフローサイトメトリーにより測定した。結果を図4に示す。
ヒト及びカニクイザルCDH3に対する抗体親和性のBiacoreに基づく決定
Biacore分析実験を、ヒトアルブミン(HALB)との組換えCDH3(それぞれヒト及びcynoCDH3)融合タンパク質を使用して実施し、本発明の抗体のCDH3標的結合を決定した。
・31.8±1.9nMのKD(hu)、40.9±3.89nMのKD(cyno)及び1.29の親和性ギャップ、ならびに
・12.95±0.5nMのKD(hu)、12.35±0.35nMのKD(cyno)及び0.95の親和性ギャップをそれぞれ有することが示された。
標的抗原陽性細胞上におけるヒト及びマカクCDH3に対するCDH3×CD3二重特異性抗体親和性のスキャッチャードに基づく分析ならびに種間親和性ギャップの決定
ヒトまたはマカクCDH3をトランスフェクトしたCHO細胞に対するCDH3×CD3二重特異性抗体の親和性もまた、ヒトCDH3とマカクCDH3との間の潜在的な親和性ギャップを測定する最も信頼できる方法としてスキャッチャード分析を用いて決定した。スキャッチャード分析では、飽和結合実験を、一価検出システムを使用して実施し、CDH3×CD3二重特異性抗体と各々の細胞株との一価結合を正確に決定する。
・0.37±0.11nMの細胞に基づく親和性(hu)、0.35±0.08nMの細胞に基づく親和性(cyno)及び0.95の親和性ギャップ、ならびに
・0.32±0.003nMの細胞に基づく親和性(hu)、0.5±0.09nMの細胞に基づく親和性(cyno)及び1.56の親和性ギャップをそれぞれ
有することが示された。
二重特異性結合及び種間交差反応
ヒトCDH3及びCD3への結合ならびにcynoCDH3及びCD3への結合を確認するために、二重特異性抗体を、
・ヒト及びcynoCDH3のそれぞれをトランスフェクトしたCHO細胞、
・ヒトCDH3陽性類表皮癌腫細胞株A431、
・CD3発現ヒトT細胞白血病細胞株HPB−all(DSMZ、ブラウンシュヴァイク、ACC483)、ならびに
・カニクイザルCD3発現T細胞株HSC−F
を使用してフローサイトメトリーにより試験した。さらに、マウスCDH3トランスフェクトCHO細胞を陰性対照として使用した。
ヒト及びマカクパラログに対する結合の不在の確認
ヒト及びマカクCDH3パラログ(CDH1=E−カドヘリン、CDH2=N−カドヘリン、CDH4=R−カドヘリン、及びCDH5=VE−カドヘリン)を、dhfr−/−CHO細胞に安定にトランスフェクトした。タンパク質発現を、各々のパラログに特異的な抗体を用いてFACS分析で確認した。抗体は、R&D MAB18381(CDH1用)、eBioscience 12−3259−41(CDH2用)、R&D SystemsポリクローナルAF2217(CDH4用)及びBD Bioscience番号555661(CDH5用)であった。
NM_004360[ヒトCDH1]
NM_001792[ヒトCDH2]
NM_001794[ヒトCDH4]
NM_001795[ヒトCDH5]
XM_002802516[マカクCDH1]
JU321883[マカクCDH2]
XM_002802511[マカクCDH5]
ヒト生殖細胞系との同一性
ヒト抗体生殖細胞系遺伝子に対する抗体配列の同一性/類似性を分析するために、本発明のCDH3バインダーを以下の通りにアラインメントした:全てのCDRを含む完全VLをヒト抗体生殖細胞系遺伝子(Vbase)に対してアラインメントし;CDR1及び2を含むが、CDR3は除く完全VHをヒト抗体生殖細胞系遺伝子(Vbase)に対してアラインメントした。さらなる詳細については、本出願の明細書中に見出すことができる。結果を以下の表4に示す。
細胞傷害活性
CDH3発現標的細胞に対するエフェクターT細胞の再指向における、本発明のCDH3×CD3二重特異性抗体の効力を5つのインビトロ細胞傷害性アッセイで分析した:
・ヒトCDH3トランスフェクトCHO細胞に対する刺激ヒトCD8+エフェクターT細胞の再指向における、CDH3×CD3二重特異性抗体の効力を、18時間の51クロム放出アッセイで測定した。結果は、図6を参照のこと。
・CDH3陽性ヒト癌腫細胞株A431に対する刺激ヒトCD8+エフェクターT細胞の再指向における、CDH3×CD3二重特異性抗体の効力を、18時間の51クロム放出アッセイで測定した。結果は、図7を参照のこと。
・ヒトCDH3トランスフェクトCHO細胞に対する未刺激ヒトPBMC中のT細胞の再指向における、CDH3×CD3二重特異性抗体の効力を、48時間のFACSに基づく細胞傷害性アッセイで測定した。結果は、図8を参照のこと。
・CDH3陽性ヒト癌腫細胞株A431に対する未刺激ヒトPBMC中のT細胞の再指向における、CDH3×CD3二重特異性抗体の効力を、48時間のFACSに基づく細胞傷害性アッセイで測定した。結果は、図9を参照のこと。
・交差反応性CDH3×CD3二重特異性抗体が、マカクCDH3トランスフェクトCHO細胞に対してマカクT細胞を再指向させることができることを確認するために、48時間のFACSに基づく細胞傷害性アッセイを、エフェクターT細胞としてマカクT細胞株を用いて実施した。結果は、図10を参照のこと。
刺激ヒトT細胞を用いたクロム放出アッセイ
CD8+T細胞について濃縮した刺激T細胞を以下に記載するように得た。ペトリ皿(直径145mm、Greiner bio−one GmbH、クレムスミュンスター)を、市販の抗CD3特異的抗体(OKT3、Orthoclone)を用いて1μg/mlの最終濃度において1時間37℃でコーティングした。非結合タンパク質を、PBSを用いた1回の洗浄ステップにより除去した。3〜5×107ヒトPBMCを、安定化グルタミン/10%FCS/IL−2 20U/ml(Proleukin(登録商標)、Chiron)を含む120mlのRPMI1640でプレコートしたペトリ皿に添加し、2日間刺激した。3日目に細胞を収集し、RPMI1640で1回洗浄した。IL−2を20U/mlの最終濃度まで添加し、細胞を上記と同じ細胞培養培地中で再度1日培養した。CD8+細胞傷害性Tリンパ球(CTL)を、製造業者のプロトコールに従ってDynal−Beadsを使用し、CD4+T細胞及びCD56+NK細胞の枯渇により濃縮した。
ヒトCDH3トランスフェクトCHO細胞に対する刺激ヒトエフェクターT細胞の再指向に関する効力
本発明によるCDH3×CD3二重特異性抗体の細胞傷害活性を、標的細胞としてヒトCDH3をトランスフェクトしたCHO細胞、及びエフェクター細胞として刺激ヒトCD8+T細胞を使用して、51クロム(51Cr)放出細胞傷害性アッセイで分析した。実験を実施例8.1に記載の通りに実施した。
CDH3陽性ヒト癌腫株A431に対する刺激ヒトエフェクターT細胞の再指向に関する効力
CDH3×CD3二重特異性抗体の細胞傷害活性を、標的細胞の供給源としてCDH3陽性ヒト類表皮癌腫細胞株A431、及びエフェクター細胞として刺激ヒトCD8+T細胞を使用して、51クロム(51Cr)放出細胞傷害性アッセイで分析した。アッセイを実施例8.1に記載の通りに実施した。
未刺激ヒトPBMCを用いたFACSに基づく細胞傷害性アッセイ
エフェクター細胞の単離
ヒト末梢血単核細胞(PBMC)を、濃縮リンパ球調製物(バフィーコート)、すなわち、輸血のために血液を収集する血液バンクの副産物からFicoll密度勾配遠心分離により調製した。バフィーコートは、地域の血液バンクにより供給されて、PBMCを血液採取と同じ日に調製した。Ficoll密度遠心分離及びダルベッコPBS(Gibco)を用いた広範囲な洗浄後、残留する赤血球を、赤血球溶解緩衝液(155mMのNH4Cl、10mMのKHCO3、100μMのEDTA)とのインキュベーションにより、PBMCから除去した。血小板を、100×gでPBMCを遠心分離する際に上清から除去した。残留するリンパ球は、主にBリンパ球及びTリンパ球、NK細胞ならびに単球を包含する。PBMCを37℃/5%CO2で、10%FCS(Gibco)を含むRPMI培地(Gibco)中における培養下で維持した。
CD14+細胞の枯渇には、ヒトCD14マイクロビーズ(Milteny Biotec、MACS、番号130−050−201)を使用し、NK細胞の枯渇には、ヒトCD56マイクロビーズ(MACS、番号130−050−401)を使用した。PBMCを計数し、10分間室温において300×gで遠心分離した。上清を廃棄し、細胞ペレットを、MACS単離緩衝液[80μL/107細胞;PBS(Invitrogen、番号20012−043)、0.5%(v/v)FBS(Gibco、番号10270−106)、2mMのEDTA(Sigma−Aldrich、番号E−6511)]中で再懸濁した。CD14マイクロビーズ及びCD56マイクロビーズ(20μL/107細胞)を添加し、15分間4〜8℃でインキュベートした。細胞をMACS単離緩衝液(1〜2mL/107細胞)で洗浄した。遠心分離(上記を参照のこと)後、上清を廃棄して、細胞をMACS単離緩衝液(500μL/108細胞)中で再懸濁した。次いで、CD14/CD56陰性細胞を、LSカラム(Miltenyi Biotec、番号130−042−401)を使用して単離した。CD14+/CD56+細胞を含まないPBMCを、RPMI完全培地、すなわち、10%FBS(Biochrom AG、番号S0115)、1×非必須アミノ酸(Biochrom AG、番号K0293)、10mMのHepes緩衝液(Biochrom AG、番号L1613)、1mMのピルビン酸ナトリウム(Biochrom AG、番号L0473)及び100U/mLのペニシリン/ストレプトマイシン(Biochrom AG、番号A2213)を補充したRPMI1640(Biochrom AG、番号FG1215)中において、37℃でインキュベーター内において必要になるまで培養した。
フローサイトメトリーアッセイにおける細胞溶解の分析のために、蛍光膜色素DiOC18(DiO)(Molecular Probes、番号V22886)を使用して、標的細胞としてヒトCDH3またはマカクCDH3トランスフェクトCHO細胞を標識し、それらをエフェクター細胞と区別した。簡潔に述べると、細胞を採取してPBSで1回洗浄し、2%(v/v)FBS及び膜色素DiO(5μL/106細胞)を含有するPBS中で106細胞/mLに調整した。37℃で3分間のインキュベーション後、細胞を完全RPMI培地中で2回洗浄し、細胞数を1.25×105細胞/mLに調整した。細胞の生命力を、0.5%(v/v)等張性EosinG溶液(Roth、番号45380)を使用して測定した。
このアッセイは、CDH3二重特異性抗体の段階希釈物の存在下における、cynoまたはヒトCDH3トランスフェクトCHO細胞の溶解を定量化するように設計した。等体積のDiO標識標的細胞及びエフェクター細胞(すなわち、CD14+細胞を含まないPBMC)を混合して、E:T細胞比を10:1とした。160μLのこの懸濁液を、96ウェルプレートの各ウェルに移した。40μLのCDH3×CD3二重特異性抗体の段階希釈物及び陰性対照二重特異性(無関係な標的抗原を認識するCD3に基づく二重特異性抗体)またはさらなる陰性対照としてのRPMI完全培地を添加した。二重特異性抗体媒介性細胞傷害反応は、7%CO2加湿インキュベーター中において48時間進めた。次いで、細胞を新しい96ウェルプレートに移して、標的細胞膜完全性の喪失を、ヨウ化プロピジウム(PI)を1μg/mLの最終濃度で添加することによりモニターした。PIは、通常は生細胞から排除される膜不透過性色素であるのに対して、死細胞はそれを取込むため、蛍光放射により同定可能となる。
ヒトCDH3トランスフェクトCHO細胞に対する未刺激ヒトPBMCの再指向に関する効力
CDH3×CD3二重特異性抗体の細胞傷害活性を、標的細胞としてヒトCDH3をトランスフェクトしたCHO細胞、及びエフェクター細胞として未刺激ヒトPBMCを使用して、FACSに基づく細胞傷害性アッセイで分析した。アッセイを上記の実施例8.4に記載の通りに実施した。
CDH3陽性ヒト癌腫株A431に対する未刺激ヒトPBMCの再指向に関する効力
CDH3×CD3二重特異性抗体の細胞傷害活性を、標的細胞の供給源としてCDH3陽性ヒト類表皮癌腫細胞株A431及びエフェクター細胞として未刺激ヒトPBMCを使用して、FACSに基づく細胞傷害性アッセイでさらに分析した。アッセイを上記の実施例8.4に記載の通りに実施した。結果を図9及び表8に示す。CDH3−25×F12q−HALB及びCDH3−13×I2C−HLE(Fc)を、別個のアッセイで各々測定し、それぞれ2.3pM及び32pMのEC50を有することが示された。
予想したように、EC50値は、刺激ヒトCD8+T細胞を使用した細胞傷害性アッセイと比較して、エフェクター細胞として未刺激PBMCを用いた細胞傷害性アッセイにおいて一般により高かった。
マカクCDH3発現CHO細胞に対するマカクT細胞の再指向に関する効力
最後に、CDH3×CD3二重特異性抗体の細胞傷害活性を、標的細胞としてマカク(cyno)CDH3をトランスフェクトしたCHO細胞、及びエフェクター細胞の供給源としてマカクT細胞株を使用して、FACSに基づく細胞傷害性アッセイで分析した。マカクT細胞株4119LnPx(Knappe et al.Blood 95:3256−61(2000))を、エフェクター細胞の供給源として使用した。マカクCDH3トランスフェクトCHO細胞の標的細胞標識化及び細胞傷害活性のフローサイトメトリーに基づく分析を、上記の通りに実施した。
(i)3回の凍結/解凍サイクル及び(ii)250μg/mlでの7日間のインキュベーション後における単量体から二量体への転化
二重特異性CDH3×CD3抗体単量体を、異なるストレス条件に曝露し、続いて高性能SECを行って初期単量体抗体のパーセンテージを決定したが、これは抗体二量体に転化された。
熱安定性
抗体凝集温度を以下の通りに決定した:40μlの250μg/mlでの抗体溶液を単回使用キュベットに移して、Wyatt動的光散乱デバイスDynaPro Nanostar(Wyatt)内に置いた。試料を0.5℃/分の加熱速度で40℃〜70℃に加熱し、測定された半径を一定して取得した。タンパク質の融解及び凝集を示す半径の増加を、DLSデバイスとともに供給されたソフトウェアパッケージにより使用して、抗体の凝集温度を算出した。
ヒト血漿における24時間のインキュベーション後の安定性
精製二重特異性抗体を、1:5の比でヒト血漿プール中において、37℃で24時間〜96時間、2〜20μg/mlの最終濃度でインキュベートした。血漿インキュベーション後、抗体を、51クロム放出アッセイにおいて刺激ヒトT細胞及びCDH3トランスフェクトCHO細胞と、0.01〜0.1μg/mlの開始濃度で、10:1のエフェクター細胞対標的細胞(E:T)比を用いて比較した(刺激ヒトT細胞を用いた実施例8.1のクロム放出アッセイに記載したアッセイ)。インキュベートしていない、新鮮な解凍二重特異性抗体を対照として含んだ。結果を表12に示す。試験した全ての抗体が、≦4の良好な血漿安定性(EC50血漿/EC50対照)を有して、D3Aに結合する抗体の群は、さらに≦3の血漿安定性を有した。CDH3−25×F12q−HALB及びCDH3−13×I2C−HLE(Fc)を、別個のアッセイで各々測定し、
・4.4pMの血漿を伴うEC50、3.6pMの血漿を伴わないEC50、及び1.2の血漿対対照比、ならびに
・3.4pMの血漿を伴うEC50、8.9pMの血漿を伴わないEC50、及び0.4の血漿対対照比
をそれぞれ有することが示された。
2500μg/mlの抗体濃度における濁度
1mlの250μg/mlの精製単量体抗体溶液を、スピン濃縮ユニットにより2500μg/mlまで濃縮した。5℃で16時間保存後、抗体溶液の濁度を、一般的な製剤緩衝液に対するOD340nm光吸収測定により測定した。結果を以下の表13に示す。試験した全ての抗体は、≦0.05の非常に良好な濁度を有している。CDH3−25×F12q−HALB及びCDH3−13×I2C−HLE(Fc)を、別個のアッセイで各々測定し、2500μg/mlでそれぞれ0.066及び0.026の濁度を有することが示された。
ヒト腫瘍異種移植モデルにおけるCDH3×CD3二重特異性抗体の治療効力
試験の1日目に、ヒト類表皮癌腫細胞株A−431の細胞及び新たに単離したヒトPBMCを、雌NOD/SCIDマウスの右背側側腹部の皮下に同時注射した(E:T細胞比1:2)。ビヒクル対照群1のマウス(n=5)にはエフェクター細胞を注射せずに、ビヒクル対照群2(n=10、エフェクター細胞を注射)との比較のために非移植対照として使用し、抗体の不在下における腫瘍成長に対するPBMCの影響をモニターした。
HCT−116腫瘍モデルにおけるCDH3×CD3二重特異性HLE抗体の抗腫瘍活性
アッセイを、ヒトHCT−116結腸癌腫細胞を皮下に注射した雌NOD/SCIDマウスにおいて実施した。エフェクター細胞をインビトロで増殖させて、ヒトCD3+T細胞を活性化した(12日目)。処置は、腫瘍が約200mm3の体積に到達した時点で開始した(17日目)。対照群は、T細胞を用いたq5dビヒクル処置群であった。配列番号:425を有する抗体を、5日ごと(q5d)に5mg/kg/投与(群2)及び0.5mg/kg/投与(群3)の濃度で、静脈内ボーラス注射により投与した。結果を図12A及び図12Bに示す。特に、図12Bは、応答動物(7/10)及び非応答動物(3/10)の観点から結果を区別する。動物の30%における非応答の理由は定かではないが、図12Bは、応答動物に対する5mg/kg濃度での半減期延長二重特異性構築物の投与が、抗体投与の時点から開始している腫瘍成長の停止をもたらすことを示す。
T細胞活性化活性化アッセイ
健康なヒトドナーからの単離PBMCを、CDH3−13×I2CまたはCDH3−13×I2C−HALB二重特異性抗体構築物の濃度を増加させながら(0.001pM〜20μMの段階希釈物)、48時間培養した。CD4+及びCD8+T細胞上での活性化マーカーCD69の発現を、免疫染色及びフローサイトメトリーならびに抗原特異的複合体mAbにより確認した。結果を図13に示し、本明細書において上で考察されている。
半減期延長CDH3×CD3構築物のCyno薬物動態試験
雌カニクイザルに60分間、0.015mg/kgの半減期延長CDH3×CD3二重特異性抗体構築物(投与体積1ml/kg)を含む緩衝液を用いて、i.v.注入を行った。試験した3つのHLE形式は、P156、HALB、及びHALBバリアント1(配列番号:437、443、及び444を参照のこと)であり、各々を各構築物のC末端に融合した。cynoモデルにおけるこれらのHLE構築物の半減期を、投与後96時間の時点から試験終了の時点まで、4つ(P156)及び6つ(HALB、HALBバリアント1)の時点で分析したそれらの血漿濃度に基づいて算出した。結果として、それぞれP156でのHLE構築物は57時間の半減期を示し、HALBでのHLE構築物は63〜85時間の半減期を示し、HALBバリアント1でのHLE構築物は68時間の半減期を示した。これらのPK特性は、ヒトにおいて週に1回のi.v.投薬を提案する。
Claims (23)
- 標的細胞の表面上のヒトCDH3のエピトープクラスターに結合する第1ヒト結合ドメインとT細胞の表面上のヒトCD3に結合する第2結合ドメインとを含む、二重特異性一本鎖抗体構築物であって、前記第1結合ドメインが、マカクCDH3にも結合し、前記ヒトCDH3のエピトープクラスターが、配列番号:1に示されるヒトCDH3のアミノ酸291〜363位(配列番号:36)内に含まれ、前記結合ドメインが、一本鎖抗体(scFv)の形式であるVH領域及びVL領域の対を含み、かつ前記抗体構築物によるT細胞の動員を介した標的細胞の再指向された溶解が、細胞溶解シナプスの形成ならびにパーフォリン及びグランザイムの送達を伴う、前記二重特異性一本鎖抗体構築物。
- 前記マカクCDH3がカニクイザル(Macaca fascicularis)CDH3である、請求項1に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。
- 前記第1結合ドメインが、配列番号:1に示されるヒトCDH3のアミノ酸291〜327位(配列番号:34)内に含まれるエピトープに結合する、請求項1または2に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。
- 前記第1結合ドメインが、配列番号:1に示されるヒトCDH3のアミノ酸328〜363位(配列番号:35)内に含まれるエピトープに結合するか;または
前記第1結合ドメインが、配列番号:1に示されるヒトCDH3のアミノ酸328〜363位(配列番号:35)内に含まれるエピトープ、及び配列番号:1に示されるヒトCDH3のアミノ酸404〜440位(配列番号:390)内に含まれるエピトープに結合する、
請求項1または2に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。 - 前記第1結合ドメインが、
a)配列番号:149に示されるCDR−H1、配列番号:150に示されるCDR−H2、配列番号:151に示されるCDR−H3、配列番号:152に示されるCDR−L1、配列番号:153に示されるCDR−L2及び配列番号:154に示されるCDR−L3;
b)配列番号:159に示されるCDR−H1、配列番号:160に示されるCDR−H2、配列番号:161に示されるCDR−H3、配列番号:162に示されるCDR−L1、配列番号:163に示されるCDR−L2及び配列番号:164に示されるCDR−L3;
c)配列番号:169に示されるCDR−H1、配列番号:170に示されるCDR−H2、配列番号:171に示されるCDR−H3、配列番号:172に示されるCDR−L1、配列番号:173に示されるCDR−L2及び配列番号:174に示されるCDR−L3;
d)配列番号:179に示されるCDR−H1、配列番号:180に示されるCDR−H2、配列番号:181に示されるCDR−H3、配列番号:182に示されるCDR−L1、配列番号:183に示されるCDR−L2及び配列番号:184に示されるCDR−L3;
e)配列番号:189に示されるCDR−H1、配列番号:190に示されるCDR−H2、配列番号:191に示されるCDR−H3、配列番号:192に示されるCDR−L1、配列番号:193に示されるCDR−L2及び配列番号:194に示されるCDR−L3;
f)配列番号:199に示されるCDR−H1、配列番号:200に示されるCDR−H2、配列番号:201に示されるCDR−H3、配列番号:202に示されるCDR−L1、配列番号:203に示されるCDR−L2及び配列番号:204に示されるCDR−L3;
g)配列番号:209に示されるCDR−H1、配列番号:210に示されるCDR−H2、配列番号:211に示されるCDR−H3、配列番号:212に示されるCDR−L1、配列番号:213に示されるCDR−L2及び配列番号:214に示されるCDR−L3;
h)配列番号:219に示されるCDR−H1、配列番号:220に示されるCDR−H2、配列番号:221に示されるCDR−H3、配列番号:222に示されるCDR−L1、配列番号:223に示されるCDR−L2及び配列番号:224に示されるCDR−L3;
i)配列番号:229に示されるCDR−H1、配列番号:230に示されるCDR−H2、配列番号:231に示されるCDR−H3、配列番号:232に示されるCDR−L1、配列番号:233に示されるCDR−L2及び配列番号:234に示されるCDR−L3;ならびに
j)配列番号:239に示されるCDR−H1、配列番号:240に示されるCDR−H2、配列番号:241に示されるCDR−H3、配列番号:242に示されるCDR−L1、配列番号:243に示されるCDR−L2及び配列番号:244に示されるCDR−L3
からなる群より選択されるCDR−H1、CDR−H2及びCDR−H3を含むVH領域ならびにCDR−L1、CDR−L2及びCDR−L3を含むVL領域を含む、
請求項1〜3のいずれか1項に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。 - 前記第1結合ドメインが、
a)配列番号:279に示されるCDR−H1、配列番号:280に示されるCDR−H2、配列番号:281に示されるCDR−H3、配列番号:282に示されるCDR−L1、配列番号:283に示されるCDR−L2及び配列番号:284に示されるCDR−L3;
b)配列番号:289に示されるCDR−H1、配列番号:290に示されるCDR−H2、配列番号:291に示されるCDR−H3、配列番号:292に示されるCDR−L1、配列番号:293に示されるCDR−L2及び配列番号:294に示されるCDR−L3;
c)配列番号:299に示されるCDR−H1、配列番号:300に示されるCDR−H2、配列番号:301に示されるCDR−H3、配列番号:302に示されるCDR−L1、配列番号:303に示されるCDR−L2及び配列番号:304に示されるCDR−L3;
d)配列番号:309に示されるCDR−H1、配列番号:310に示されるCDR−H2、配列番号:311に示されるCDR−H3、配列番号:312に示されるCDR−L1、配列番号:313に示されるCDR−L2及び配列番号:314に示されるCDR−L3;
e)配列番号:319に示されるCDR−H1、配列番号:320に示されるCDR−H2、配列番号:321に示されるCDR−H3、配列番号:322に示されるCDR−L1、配列番号:323に示されるCDR−L2及び配列番号:324に示されるCDR−L3;
f)配列番号:329に示されるCDR−H1、配列番号:330に示されるCDR−H2、配列番号:331に示されるCDR−H3、配列番号:332に示されるCDR−L1、配列番号:333に示されるCDR−L2及び配列番号:334に示されるCDR−L3;
g)配列番号:339に示されるCDR−H1、配列番号:340に示されるCDR−H2、配列番号:341に示されるCDR−H3、配列番号:342に示されるCDR−L1、配列番号:343に示されるCDR−L2及び配列番号:344に示されるCDR−L3;ならびに
h)配列番号:349に示されるCDR−H1、配列番号:350に示されるCDR−H2、配列番号:351に示されるCDR−H3、配列番号:352に示されるCDR−L1、配列番号:353に示されるCDR−L2及び配列番号:354に示されるCDR−L3
からなる群より選択されるCDR−H1、CDR−H2及びCDR−H3を含むVH領域ならびにCDR−L1、CDR−L2及びCDR−L3を含むVL領域を含む、
請求項1、2及び4のいずれか1項に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。 - 前記第1結合ドメインが、配列番号:155、配列番号:165、配列番号:175、配列番号:185、配列番号:195、配列番号:205、配列番号:215、配列番号:225、配列番号:235、及び配列番号:245に示されるVH領域からなる群より選択されるVH領域を含む;ならびに/または
前記第1結合ドメインが、配列番号:156、配列番号:166、配列番号:176、配列番号:186、配列番号:196、配列番号:206、配列番号:216、配列番号:226、配列番号:236、及び配列番号:246に示されるVL領域からなる群より選択されるVL領域を含む、
請求項5に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。 - 前記第1結合ドメインが、配列番号:285、配列番号:295、配列番号:305、配列番号:315、配列番号:325、配列番号:335、配列番号:345、及び配列番号:355に示されるVH領域からなる群より選択されるVH領域を含む;ならびに/または
前記第1結合ドメインが、配列番号:286、配列番号:296、配列番号:306、配列番号:316、配列番号:326、配列番号:336、配列番号:346、及び配列番号:356に示されるVL領域からなる群より選択されるVL領域を含む、
請求項6に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。 - 前記第1結合ドメインが、配列番号:155+156、配列番号:165+166、配列番号:175+176、配列番号:185+186、配列番号:195+196、配列番号:205+206、配列番号:215+216、配列番号:225+226、配列番号:235+236、及び配列番号:245+246に示されるVH領域及びVL領域の対からなる群より選択されるVH領域及びVL領域を含む、請求項5または7に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。
- 前記第1結合ドメインが、配列番号:285+286、配列番号:295+296、配列番号:305+306、配列番号:315+316、配列番号:325+326、配列番号:335+336、配列番号:345+346、及び配列番号:355+356に示されるVH領域及びVL領域の対からなる群より選択されるVH領域及びVL領域を含む、請求項6または8に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。
- 前記第1結合ドメインが、配列番号:157、配列番号:167、配列番号:177、配列番号:187、配列番号:197、配列番号:207、配列番号:217、配列番号:227、配列番号:237、及び配列番号:247に示される配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、請求項5、7及び9のいずれか1項に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。
- 前記第1結合ドメインが、配列番号:287、配列番号:297、配列番号:307、配列番号:317、配列番号:327、配列番号:337、配列番号:347、及び配列番号:357に示される配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、請求項6、8及び10のいずれか1項に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。
- 前記第2結合ドメインが、ヒト及びコモンマーモセット(Callithrix jacchus)、ワタボウシタマリン(Saguinus Oedipus)またはコモンリスザル(Saimiri sciureus)のCD3イプシロンに結合する、請求項1に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。
- 配列番号:158、配列番号:168、配列番号:178、配列番号:188、配列番号:198、配列番号:208、配列番号:218、配列番号:228、配列番号:238、及び配列番号:248に示される配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むか;または
配列番号:379、配列番号:380、配列番号:381、配列番号:382、配列番号:383、配列番号:384、配列番号:385、配列番号:386、配列番号:387、配列番号:388、配列番号:389、配列番号:422、配列番号:423、配列番号:424、配列番号:425、配列番号:426、及び配列番号:427に示される配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、
請求項5、7、9、11及び13のいずれか1項に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。 - 配列番号:288、配列番号:298、配列番号:308、配列番号:318、配列番号:328、配列番号:338、配列番号:348、及び配列番号:358に示される配列からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、請求項6、8、10、12及び13のいずれか1項に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物。
- 請求項1〜15のいずれか1項に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物をコードする、ポリヌクレオチド。
- 請求項16に記載のポリヌクレオチドを含む、宿主細胞を形質転換またはトランスフェクトするためのベクター。
- 請求項1〜15のいずれか1項に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物を含む、医薬組成物。
- 腫瘍またはがんの予防、処置または改善に使用するための、請求項18に記載の医薬組成物。
- 前記がんが、肺癌腫、頭頸部癌腫、原発性または二次性CNS腫瘍、原発性または二次性脳腫瘍、原発性CNSリンパ腫、脊髄軸腫瘍、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、副腎皮質がん、食道癌腫、結腸がん、乳がん、卵巣がん、NSCLC(非小細胞肺がん)、SCLC(小細胞肺がん)、子宮内膜がん、子宮頸がん、子宮がん、移行上皮癌腫、骨がん、膵臓がん、皮膚がん、皮膚または眼内黒色腫、肝がん、胆管がん、胆嚢がん、腎臓がん、直腸がん、肛門部のがん、胃がん、胃腸(胃、結腸直腸、及び十二指腸)がん、小腸のがん、胆道がん、尿道のがん、腎細胞癌腫、子宮内膜の癌腫、甲状腺がん、精巣がん、皮膚扁平上皮細胞がん、黒色腫、胃がん、前立腺がん、膀胱がん、骨肉腫、中皮腫、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫、慢性または急性白血病、慢性骨髄性白血病、リンパ球性リンパ腫、多発性骨髄腫、線維肉腫、神経芽細胞腫、網膜芽細胞腫、及び軟部肉腫からなる群より選択される、請求項19に記載の医薬組成物。
- 前記がんが扁平上皮癌腫である、請求項20に記載の医薬組成物。
- 請求項1〜15のいずれか1項に記載の二重特異性一本鎖抗体構築物、請求項18〜21のいずれか1項に記載の医薬組成物、及び/または請求項17に記載のベクターを含む、キットであって、
投与に適切な用量で前記抗体構築物、前記医薬組成物、及び/または前記ベクターを含有する、任意の適切な形状、サイズ及び材料のバイアル、アンプル、容器、シリンジ、ボトル、バッグなどの1つ以上の入れ物をさらに含む、前記キット。 - 前記入れ物が、防水性であるか、またはプラスチック製もしくはガラス製である、請求項22に記載のキット。
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