实施方案
参考对本文所述的本发明,以下是与其相关的具体和优选的实施方案。
本发明的一个具体的实施方案是其中R0是一个键。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R0是二氟亚甲基。
本发明的一个具体的实施方案是其中R1是氢或任选地被取代的低级脂族基。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R1是氢或低级烷基。
本发明的优选实施方案是其中R1是氢。
本发明的一个具体的实施方案是其中R2是任选地被取代的低级脂族基或任选地被取代的单环基团。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R2是任选地被取代的低级烷基、任选地被取代的低级链烯基或任选地被取代的单环环烷基。
本发明的进一步具体的实施方案是,其中R2是羧基甲基、1-羧基-2-苯基乙基、环丙基、环丁基、1-环己基乙基、1-苯基乙基、丁-2-基、1-吡啶-4-基乙基、丙烯-3-基或3-甲基丁-2-基;更优选环丙基。
本发明的一个具体的实施方案是其中R3是任选地被取代的低级脂族基亚甲基。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R3是任选地被卤素取代的低级(烷基或链烯基)亚甲基。
本发明的优选实施方案是,其中R3是丙基亚甲基、2,2-二氟乙基亚甲基、2,2,2-三氟亚甲基或丙烯-3-基亚甲基;更优选的R3是丙基亚甲基或2,2-二氟乙基亚甲基;进一步优选的R3是丙基亚甲基。
本发明的一个具体的实施方案是其中R4是氢或任选地被取代的低级脂族基。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R4是氢或低级烷基。
本发明的优选实施方案是其中R4是氢。
本发明的一个具体的实施方案是其中R5是任选地被取代的低级脂族基亚甲基。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R5是任选地被(苯基、羧基、羧酰氨基或烷氧羰基)取代的低级(烷基或链烯基)亚甲基。
本发明的优选实施方案是其中R5是甲基亚甲基、异丙基亚甲基、叔丁基亚甲基、丁-2-基亚甲基、丁基亚甲基、苄基亚甲基、3-甲基丁基亚甲基、2-甲基丙基-亚甲基、羧基甲基亚甲基、羧酰氨基甲基亚甲基、苄氧羰基甲基亚甲基、苄氧羰基丙基亚甲基或苯基丙烯-3-基亚甲基;更优选的R5是异丙基亚甲基或叔丁基-亚甲基。
本发明的一个具体的实施方案是其中R6是氢或任选地被取代的低级脂族基。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R6是氢或低级烷基。
本发明的优选实施方案是其中R6是氢。
本发明的一个具体的实施方案是其中R7是任选地被取代的低级脂族基亚甲基、任选地被取代的低级环基团亚甲基或任选地被取代的单环(芳基或杂芳基)亚甲基。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R7是任选地被取代的低级烷基亚甲基、任选地被取代的低级环烷基亚甲基或任选地被取代的苯基亚甲基。
本发明的优选实施方案是其中R7是甲基亚甲基、异丙基亚甲基、正丙基亚甲基、苯基亚甲基、环己基亚甲基、环戊基亚甲基、叔丁基亚甲基、仲丁基亚甲基、环己基甲基亚甲基或苯基甲基亚甲基;更优选的是异丙基亚甲基、环己基亚甲基、环戊基亚甲基、叔丁基亚甲基或仲丁基亚甲基。
本发明的优选实施方案还是其中每一个R3、R5和R7是单取代的亚甲基。
本发明的优选实施方案还是其中R3是单取代的亚甲基,并在连接至-C(O)-R0-C(O)-NR1R2部分上的碳上具有(S)构型。
本发明的一个具体的实施方案是其中R8是氢或任选地被取代的低级脂族基。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R8是氢或低级烷基。
本发明的优选实施方案是其中R8是氢。
本发明的一个具体的实施方案是其中R9是任选地被取代的低级脂族基或任选地被取代的单环芳族基。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R9是任选地被取代的低级烷基或任选地被取代的单环杂芳基。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R9是任选地被(羧基、(低级烷基)SO2NH-、(低级烷基)HNCO-、羟基、苯基、杂芳基或(低级烷基)OC(O)NH-)-取代的低级烷基,或任选地被取代的单环杂芳基。
本发明的进一步优选的实施方案是其中R9是被(单-或二-)MeOC(O)NH-取代的低级烷基;更优选的是1,2-二(MeOC(O)NH)乙基或1-(MeOC(O)NH)乙基。
本发明的优选实施方案是其中R9是(羧基、(低级烷基)HNCO-或四唑基)取代的低级烷基;更优选的3-羧基丙基、2-四唑-5-基丙基、3-(N-甲基羧酰氨基)丙基或3-羧基-2,2-二甲基丙基;更优选的是3-羧基丙基、2-四唑-5-基丙基或3-(N-甲基羧酰氨基)丙基。
本发明另一个优选的实施方案是其中R9是任选地被取代的低级烷基;更优选的是1-羟基-2-苯基乙基、甲基、异丙基或叔丁基;更优选的是甲基、异丙基或叔丁基。
本发明另一个优选的实施方案是其中R9是吡嗪基。
本发明的一个具体的实施方案是其中R10是氢或任选地被取代的低级脂族基。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R10是氢或低级烷基。
本发明的优选实施方案是其中R10是氢。
本发明的优选实施方案是其中
作为取代的单环氮杂环基是取代的吡咯烷基。
本发明的优选实施方案是其中
作为取代的单环氮杂环基是任选地被取代的
或任选地被取代的
其中Ar是包含芳族部分的R
2;更优选的是任选地被取代的
进一步优选的是任选地被取代的
进一步优选的任选地取代的
是
或
进一步优选的
或
本发明的另一个优选的实施方案是其中
作为任选地被取代的多环氮杂环基是任选地被取代的
更优选的是任选地被取代的
的具体取代基是羟基、氟或氧代。
本发明的另一个优选的实施方案是其中
作为任选地被取代的多环氮杂环烯基是任选地被取代的
更优选的是
进一步优选的是
本发明的另一个优选的实施方案是其中
作为任选地被取代的多环氮杂环烯基是任选地被取代的
本发明的优选实施方案是其中连接在
上的-C(O)-N(R4)-R3-C(O)R0C(O)NR2R1部分连接在相对于氮原子处于α-位的碳上。
本发明的优选实施方案是其中L是-C(O)-或-OC(O)-。
本发明的优选实施方案是其中n为0。
本发明的另一个优选的实施方案是其中n为1。
本发明的优选实施方案是其中R11是-CO2R13。
本发明的一个具体的实施方案是其中R13是任选地被取代的脂族基。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R13是烷基。
本发明的优选实施方案是其中R13是低级烷基。
本发明的另一个优选的实施方案是其中R13是甲基。
本发明的优选实施方案是其中R14是-CO2R16。
本发明的一个具体的实施方案是其中R15是烷基。
本发明的优选实施方案是其中R15是低级烷基。
本发明的优选实施方案是其中R15是甲基。
本发明的一个具体的实施方案是其中R16是任选地被取代的脂族基。
本发明的另一个具体的实施方案是其中R16是烷基。
本发明的优选实施方案是其中R16是低级烷基。
本发明的优选实施方案是其中R16是t-Bu。
本发明的一个具体的实施方案是其中R17是任选地被取代的芳基。
本发明的优选实施方案是其中R17是苯基。
本发明的一个具体的实施方案是其中R18是任选地被取代的芳基。
本发明的优选实施方案是其中R18是苯基。
本发明的一个具体的实施方案是其中p°选自BOC、CBz和-CO2烷基。
本发明的优选实施方案是其中p°是BOC。
可以理解,本发明包括本文所述具体的和优选的集合的所有适宜的组合。
本发明具体的化合物选自一组化合物A-FH
FG,和
或其药用盐或前药,或此化合物、其盐或其前药的溶剂化物。
优选的化合物选自S、U、BW、BX、BY、BZ、CE、CU、CW、CY、DZ、EA、EC、EJ、FH、EW、EO、EZ、FG和EN,其药用盐或前药,或此化合物、其盐或其前药的溶剂化物。
本发明另一个优选的实施方案选自下述化合物:
或其药用盐或前药,或此化合物、其盐或其前药的溶剂化物。
本发明另一个优选的实施方案是下式的化合物或其药用盐或前药,或此化合物、其盐或其前药的溶剂化物。
本发明的另一个优选的实施方案是式1的化合物,其中:
R0是一个键;
R1是氢;
R2是任选地被1至3个脂族基取代基取代的低级烷基;或任选地被1至3个环取代基取代的低级环烷基;
R3和R5彼此独立地是任选地被1至3个脂族基取代基取代的亚甲基;
R4、R6、R8和R10是氢;
R7是被环烷基,低级烷基或芳基取代的亚甲基;或任选地被环烷基,低级烷基或芳基取代的(1,1-或1,2-)环烯基;
R9是任选地被1至3脂族基取代基取代的低级烷基;或任选地被1至3个环基团取代基取代的杂芳基;或任选地被1至3个环基团取代基取代的杂环;是任选地被1至3个环基团取代基取代的单环氮杂环基、多环氮杂环基或多环氮杂环烯基;且
L是-C(O)-、-OC(O)-。
本发明另一个优选的实施方案是选自下述的化合物:
FG,和
或其药用盐或前药,或此化合物、其盐或其前药的溶剂化物。
本发明另一个优选的实施方案是式1的化合物,其中R9的任选地被取代的脂族基,任选地被取代的环基团或任选地被取代的芳族基被至少一个杂芳基取代基取代。
本发明另一个优选的实施方案是式1的化合物,其中R9的任选地被取代的芳族基是任选地被取代的杂芳基。
本发明另一个优选的实施方案是式1的化合物,其中R9的任选地被取代的脂族基是任选地被取代的烷基杂芳基。
本发明另一个优选的实施方案是以下的化合物,其中R9的任选地被取代的杂芳基是吡嗪基、四唑基、喹啉基、咪唑基、异噁唑基和吡啶酮基(pyradonyl),所述基团任选地被环基团取代基取代。
本发明的化合物任选地作为其盐供应。这些可药用盐具有特殊的意义,因为它们可为医药用途而将前述化合物给药。不可药用的盐可用于生产过程中,用于分离和纯化目的,在某些时候,可于分离本发明化合物的立体异构形式。后者特别真实的情形是由旋光胺制备的胺盐。
在本发明的化合物包含羧基时,或者足够的酸性生物等排体时,可形成碱加成盐,碱加成盐是一种更为便利使用的形式;实际上,盐形式的使用内在地等同于使用游离酸形式。
同样,当本发明的化合物包含碱性基团时,或者足够的碱性生物等排体时,可形成酸加成盐,酸加成盐是一种更为便利使用的形式;实际上,盐形式的使用内在地等同于使用游离碱形式。
本发明方法的优选的实施方案是一种用于对患有HCV感染或与该感染相关的生理学病症的患者进行治疗,包括向患者给药药学有效量的式1的化合物。
本发明治疗方法的另一个优选的实施方案是用于对患有HCV感染或与该感染相关的生理学病症的患者进行治疗,包含向患者联合给药药学有效量的式1化合物和药学有效量的另一种抗HCV治疗剂。
本发明的另一个目的是提供药物组合物,其除包含一种或多种HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂之外,还包含一种或多种显示抗HCV活性的干扰素和/或一种或多种具有抗HCV活性的化合物,包括免疫调节化合物如显示HCV抗病毒活性的免疫刺激性细胞因子,和可药用载体或稀释剂。
本发明的另一个目的是提供一种药物组合物,其有效地用于及其本身用于效益联合治疗,因为其包含多种可依据本发明使用的活性组分。
本发明也提供组合两种或更多种用于治疗或预防患者HCV感染的活性成分的药盒或单个药包。药盒可提供(单独或与可药用稀释剂或载体一起)式1的化合物和另外的活性组分(单独或与稀释剂或载体组合)其它抗HCV治疗剂。
式1的化合物可采用或改进迄今采用或在文献中描述的公知的方法制备,或者采用本发明中的方法制备。
本发明的另一个目的是提供治疗或预防有此需要的患者中HCV感染的方法,包含向所述患者联合给药药学有效量的一种或多种HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂;一种或多种显示抗HCV活性的干扰素;和/或一种或多种具有抗HCV活性的化合物,包括免疫调节化合物如显示HCV抗病毒活性的免疫刺激性细胞因子。
本发明的另一个目的是一种或多种HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂与一种或多种显示抗HCV活性的干扰素和/或一种或多种具有抗HCV活性的化合物,包括免疫调节化合物如显示HCV抗病毒活性的免疫刺激性细胞因子的组合在制备用于治疗或预防有此需要的患者HCV感染的药物中的用途。
本发明的另一个目的是一种用于治疗或预防患者中HCV感染的药盒或药包,其中,所述药盒或药包包含多个分开的容器,其中至少一个所述容器包含一种或多种HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂,至少另一种所述容器包含一种或多种干扰素或能够诱导产生显示抗HCV活性的干扰素的化合物(单独或与可药用载体或稀释剂组合),以及任选地,至少另一种所述容器包含一种或多种具有抗HCV活性的化合物(单独或与可药用载体或稀释剂组合),包括免疫调节化合物如显示HCV抗病毒活性的免疫刺激性细胞因子。
本发明的另一个目的是提供一种抑制细胞中丙型肝炎病毒复制的方法,包括使所述细胞、丙型肝炎病毒丝氨酸蛋白酶抑制剂,和任选的能够诱导产生具有抗丙型肝炎病毒活性的干扰素的干扰素或化合物进行接触。
在上述各种应用中HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂、干扰素或抗HCV化合物的用量均可以是药学有效量、亚临床抗HCV有效量或其组合,只要HCV蛋白酶抑制剂,干扰素,和/或抗HCV化合物的最终浓度包含药学有效量的能够有效地治疗或预防患者中HCV感染的化合物。
本发明的另一个目的是提供一种制备用于制备式1化合物的手性双环脯氨酸酯化合物的方法。本发明化合物的制备
本发明化合物的原料和中间体可按照公知方法或公知方法的改进形式,例如在参考实施例中所述的方法或它们明显的化学等同方法制备。
本发明化合物可采用公知方法或公知方法的改进形式制备,其中公知方法是指迄今使用的方法或在文献中所述的方法,例如以下述文献中所述的方法:R.C.Larock,综合的有机转化(ComprehensiveOrganic Transformations),VCH出版者(1989)。
式1的化合物,其中变量和其
部分如本文所述,可通过处理式2的化合物来制备,
其中,变量和其
部分如本文所述,其中所述处理是采用适宜的氧化剂,并在适宜的条件下进行。具体的氧化剂是DMP试剂。具体的条件包括在适宜的有机溶剂如二氯甲烷中在约室温下进行氧化。
式2的化合物,其中变量和其
部分如本文所述,可以由式3化合物与式4化合物的偶联反应制备,其中变量和其
部分如本文所述,
其中其变量如本文所述,该反应采用适宜的偶联剂,并在适宜的条件下进行。具体的偶联剂和条件包括采用适宜有机溶剂如DMF中的DIC和HOAt,在约0℃下进行,或者采用在适宜的有机溶剂如二氯甲烷中的PyBop和DIPEA,在约室温下进行。
式3的化合物,其中变量和其
部分如本文所述,可以由式5的化合物与式6的化合物通过偶联反应制备,其中其变量如本文所述,
其中P
2是酸保护基,并且其
部分如本文所述,该反应采用适宜的偶联剂,并在适宜的偶联条件下进行,接着用适宜的脱保护剂和在适宜的脱保护条件下进行。具体的偶联剂和条件包括采用在适宜有机溶剂如DMF或二氯甲烷中的DIC、DCC和HOAt,在约0℃至约室温下进行。脱保护反应采用适宜的脱保护剂,这取决于保护剂的性质,即,是否其是在酸性、碱性或氢化条件下可脱除(不稳定),以及进行脱保护的化合物中的其它反应性部分,即选择脱保护剂以进行脱保护,但不影响其它反应性部分,除非希望有伴随反应。具体的酸保护剂为C
1至C
8低级烷基;更具体的是甲基。具体的脱保护剂是无机碱如碱金属氢氧化物;更具体的是NaOH。具体的脱保护条件包括在醇溶剂如甲醇或乙醇中,在约室温下进行脱保护。
式5的化合物,其中n为0,其它变量如本文所述,即化合物5a,可以通过使式7的化合物脱保护制备
其中P
2是酸保护基团,且其它变量如本文所述,该反应采用适宜的脱保护剂,并在适宜的条件下进行。脱保护反应采用适宜的脱保护剂,这取决于保护剂的性质,即,是否其是在酸性、碱性或氢化条件下可脱除(不稳定),以及进行脱保护的化合物中的其它反应性部分,即选择脱保护剂以进行脱保护,但不影响其它反应性部分,除非希望有伴随反应。具体的酸保护剂为C
1至C
8低级烷基;更具体的是甲基。具体的脱保护剂是无机碱如碱金属氢氧化物;更具体的是NaOH。具体的脱保护条件包括在醇溶剂如甲醇或乙醇中,在约室温下进行脱保护。
式7的化合物,其中其变量如本文所述,可以通过式8的化合物(其中变量如本文所述)用式9的化合物(其中M是可置换的部分,其它变量如本文所述)进行酰基化反应制备该反应在适宜的条件下进行。具体的偶联条件是采用在适宜的有机溶剂如DMF或二氯甲烷中的DIC或DCC和HOAt,在约0℃至约室温下进行,或者是在适宜的有机溶剂如DMF或二氯甲烷中的PyBop和DIPEA在约室温下进行;优选后一种条件。具体的L是羰基。具体的M是羟基或N-氧基琥珀酰亚胺。
式5的化合物,其中n为1和其它变量如本文所述,即,化合物5b,可以由式10的化合物脱保护制备,其中P2是酸保护基,且其它变量如本文所述,该反应采用适宜的脱保护剂,并在适宜的条件下进行。脱保护反应采用适宜的脱保护剂,这取决于酸保护剂的性质,即,是否其是在酸性、碱性或氢化条件下可脱除(不稳定),以及进行脱保护的化合物中的其它反应性部分,即选择脱保护剂以进行脱保护,但不影响其它反应性部分,除非希望有伴随反应。具体的酸保护剂为C1至C8低级烷基;更具体的是甲基。具体的脱保护剂是无机碱如碱金属氢氧化物;更具体的是NaOH。具体的脱保护条件包括在醇溶剂如甲醇或乙醇中,在约室温下进行脱保护。
式10的化合物,其中变量如本文所述,可以通过式11的化合物(其中变量如本文所述)用式9的化合物(其中变量如本文所述)进行酰基化反应制备该反应在适宜的条件下进行。具体的偶联条件是采用在适宜的有机溶剂如DMF或二氯甲烷中的DIC或DCC和HOAt,在约0℃至约室温下进行,或者是在适宜的有机溶剂如DMF或二氯甲烷中的PyBop和DIPEA在约室温下进行;优选后一种条件。具体的L是羰基。具体的M是羟基或N-氧基琥珀酰亚胺。
式11的化合物,其中变量如本文所述,可以由式12的化合物脱保护制备,
其中P
1是胺保护基,且其它变量如本文所述,该反应采用适宜的脱保护剂,并在适宜的条件下进行。脱保护反应采用适宜的脱保护剂,这取决于胺保护剂的性质,即,是否其是在酸性、碱性或氢化条件下可脱除(不稳定),以及进行脱保护的化合物中的其它反应性部分,即选择脱保护剂以进行脱保护,但不影响其它反应性部分,除非希望有伴随反应。具体的胺保护剂是Cbz或BOC;更具体的是Cbz。具体的脱保护剂是酸,如HCl或H
2/Pd(OH)
2;更具体的是H
2/Pd(OH)
2。具体的脱保护条件包括在醇溶剂如甲醇或乙醇或链烷酸烷基酯溶剂如乙酸乙酯中,在约室温下进行脱保护。
式12的化合物,其中变量如本文所述,可以通过式13的化合物(其中变量如本文所述)与式14的化合物(其中变量如本文所述)进行偶联反应制备该反应在适宜的条件下进行。具体的偶联条件是采用在适宜的有机溶剂如THF中的HOAt/DIC和DIPEA,在约室温下进行。
式4的化合物,其中变量如本文所述,可以由式15的化合物脱保护制备其中变量如本文所述,该反应采用适宜的脱保护剂,并在适宜的条件下进行。脱保护反应采用适宜的脱保护剂,这取决于胺保护剂的性质,即,是否其是在酸性、碱性或氢化条件下可脱除(不稳定),以及进行脱保护的化合物中的其它反应性部分,即选择脱保护剂以进行脱保护,但不影响其它反应性部分,除非希望有伴随反应。具体的胺保护剂是Cbz或BOC;更具体的是Cbz。具体的脱保护剂是酸,如HCl或H2/Pd(OH)2;更具体的是H2/Pd(OH)2。具体的脱保护条件包括在醇溶剂如甲醇或乙醇或链烷酸烷基酯溶剂如乙酸乙酯中,在约室温下进行脱保护。
式15的化合物,其中变量如本文所述,可以通过式16的化合物(其中变量如本文所述)与式17的化合物(其中变量如本文所述)进行偶联反应制备
该反应在适宜的条件下进行。具体的胺保护剂是Cbz或BOC;更具体的是Cbz。具体的偶联条件采用在适宜有机溶剂如二氯甲烷中的HOBT,PyBop和DIPEA,在约0℃至约室温下进行。
式16的化合物,其中变量如本文所述,可以由式18的化合物脱保护制备,
其中变量如本文所述,该反应采用适宜的脱保护剂,并在适宜的条件下进行。脱保护反应采用适宜的脱保护剂,这取决于酸保护剂的性质,即,是否其是在酸性、碱性或氢化条件下可脱除(不稳定),以及进行脱保护的化合物的其它反应性部分,即选择脱保护剂以进行脱保护,但不影响其它反应性部分,除非希望有伴随反应。具体的胺保护剂Cbz。具体的酸保护剂为C
1至C
8低级烷基;更具体的是甲基。具体的脱保护剂是无机碱如碱金属氢氧化物;更具体的是NaOH。具体的脱保护条件包括在醇溶剂如甲醇或乙醇中,在约室温下进行脱保护。
式18的化合物,其中R0是一个键和其它变量如本文所述,可以通过用式19的化合物(其中变量如本文所述)保护式20的化合物(其中变量如本文所述)来制备,该反应在适宜的条件下进行。具体的胺保护剂是Cbz或BOC。具体的偶联条件采用适宜有机溶剂如二氯甲烷,在约0℃至约室温下进行。
式20的化合物,其中R
4是氢且其它变量如本文所述,可通过氢化式21的化合物制备,
其中变量如本文所述,其中氢化是采用适宜的氢化剂和适宜的条件。具体的氢化剂是H
2/Pd(OH)
2。具体的氢化条件包括在醇溶剂如甲醇或乙醇中或链烷酸烷基酯如乙酸乙酯中,在约室温下进行氢化。
式20的化合物(其中R4是任选地被取代的脂族基,且其它变量如本文所述)可通过用式22的化合物(烷化剂,其中R4是任选地被取代的脂族基,且Q是可置换的基团如卤化物、甲苯磺酸酯或磺酸酯)将式20’的化合物(其中变量如本文所述)在适宜的条件下烷基化来制备。适宜的烷化剂包括脂族烷化剂(卤化物、甲苯磺酸酯或磺酸酯)。适宜的烷基化条件包括在适宜的有机溶剂如醇溶剂如甲醇或乙醇或醚溶剂如醚或四氢呋喃中,在约室温至约回流下进行烷基化反应。
式21的化合物(其中变量如本文所述)可以通过用式23的化合物(其中R3’独立地是本文所述的任选地被取代的取代的脂族基、任选地被取代的环基团或任选地被取代的芳族基)将式22的化合物(其中变量如本文所述)烷基化来制备。反应在适宜的条件下进行。具体的烷基化条件包括采用在醇溶剂如甲醇或乙醇中的强碱如叔丁醇钾进行烷基化反应,反应在约室温下进行。
式24的化合物,其中变量如本文所述,可以通过用亚胺甘氨酰亚胺衍生物对式29的Michael受体(其中变量如本文所述)进行Michael加成反应制备
Michael加成反应包含适宜的质子惰性极性溶剂,碱金属甲基氢氧化物碱和适宜的温度。Michael加成反应可参看:Corey,E.J.;Noe,M.C.;Xu,F.Tetrahedron Letter 1998,39,5347。手性相转移催化剂的合成参看:Corey,E.J.;Noe,M.C.;Xu,F.J.Am.Chem.Soc.1997,119,12414。适宜的溶剂包括DCM、ACN或THF,这取决于反应条件。适宜的碱包括CsOH、NaOH、KOH和LiOH。适宜的温度范围是约-78℃至约0℃,更具体的是约-60℃。用于本发明中的亚胺甘氨酰亚胺类如本文所述。优选的亚胺甘氨酰亚胺是N-(二苯基亚甲基)甘氨酸叔丁酯。此外,Michael加成条件可用或不用相转移催化剂(PTC)(手性和非手性)来影响。
优选的PTC是O-[9]烯丙基-N-9-蒽基甲基辛可尼定溴化物。
式25的化合物,其中变量如本文所述,可以通过式24的亚胺分裂和环化制备。分裂和环化过程参看Javidan,A.;Schfer,K.;Pyne,S.Synlett1996,100;Tatsukawa,A.;Dan,M.;Ohbatake,M.;Kawatake,K.;Fukata,T.;Wada,E.;Kanemase,S.;Kakei,S.J.Org.Chem.1993,58,4221。分裂和环化条件包括使用极性溶剂、酸试剂和约室温至约150℃的温度。优选的条件包括使用EtOH、AcONa和NH2OH·HCl,和约所用溶剂的沸点的温度。
式26的化合物,其中变量如本文所述,可以用适宜的酰胺保护基如BOC保护式25化合物的酰胺(其中变量如本文所述)制备。其它适宜的保护基包括CBz、-CO
2烷基。其它的胺保护基同样参看:Greene,T.W.;P.G.M.有机合成中的保护基,Wiley,New York,1991。保护条件包括采用质子惰性极性溶剂,有机碱作催化剂,温度为约0℃-100℃。优选的条件包括使用ACN、二甲基氨基吡啶、温度为约室温。
式27的化合物,其中变量如本文所述,可以通过还原式26的被保护的化合物,其中变量如本文所述制备。
事实上进行两步还原。第一步还原是采用DIBALH或超氢化物[LiBEt
3H]进行的酰胺至半缩醛胺(hemiaminal)的还原。第二步还原是半缩醛胺至胺的还原,采用Et
3SiH和BF
3·OEt
2。还原条件参看Collado,I;Ezquerra,J.;Mateo,A.I.;Rubio,A.,J.Org.Chem.1998,631995-2001和Ezqueera,J.;Pedregal,C.;Yruretagoyena,B.;Rubio,A.;Carreno,M.C.;Escribano,A.;Garcia Ruano,J.L.J.Org.Chem.1995,60,2925。其它有用的转化焦谷氨酸酯至吡咯烷类的条件是采用BH
3·SMe
2。
式28的化合物,其中变量如本文所述,可以由式27的化合物,其中变量如本文所述脱保护制备。
在叔丁酯存在下选择性地除去N-BOC保护基的条件参看Gibson,F.G.;Bermeier,S.C.;Rapoport,H.,J.Org Chem.1994,59,3216-3218。本领域的技术人员知道,脱保护条件取决于保护基的选择。例如,如果采用CBz,可采用氢化或碱性条件。优选地,如果采用BOC,则可采用1N HCl的乙酸乙酯溶液。参看Greene,T.W.;P.G.M.有机合成中的保护基,Wiley,New York,1991。
本领域的技术人员可以理解,式3的化合物可通过使式5的化合物与式28的化合物在本文上述条件下进行偶联反应制备。
用于制备R3、R5或R7作为任选地被取代的乙烷二基部分的方法包括本领域技术人员公知的那些,这些方法描述于“β-内酰胺有机化学”中,G.Georg编辑,VCH Publishers,Inc.(1993),例如第240-241页和303-305页。
以下列举的反应路线1-11分类了制备任选地被取代的多环氮杂环基的方法。在以下反应路线中的方法也可应用于其它任选地被取代的多环氮杂环基,包括相容的类似取代基。反应路线1
反应路线2
反应路线3
反应路线4
反应路线5
反应路线6
反应路线7
反应路线8
反应路线9
反应路线10
反应路线11
包括含有一个或多个氮环原子的基团优选亚胺(=N-)的式1的化合物可以转化为对应的化合物,其中该基团的一个或多个氮原子被氧化成N-氧化物,优选通过与过酸,如在乙酸中的过乙酸或在惰性溶剂如二氯甲醇中的间氯过苯甲酸,在大约室温至回流温度下,优选在高温下反应。
在下文所述的反应中,可能需要保护在终产物中所需的反应性官能团,如羟基、氨基、亚氨基、硫基(thio)或羧基,以避免所不期望它们参与反应。可以根据标准实践使用常规保护基,例如参见T.W.Green和P.G.M.Wuts in″Protective Group in OrganicChemistry(有机化学中的保护基)″John Wiley和Sons(1991);J.F.W.McOmie in″Protective Group in Organic Chemistry″PlenumPress,1973。
可以通过常规方法从反应混合物中收集按本文所述制备的化合物。例如,所述化合物可以通过以下方法收集:从反应混合物中蒸馏出溶剂,或者如果需要的话,在从反应混合物中蒸馏出溶剂之后,将残余物倾入水中,然后用水不混溶性有机溶剂萃取,并从萃取物中蒸馏出溶剂。此外,如果需要的话,可以通过多种已知的技术,如重结晶、沉淀或多种色谱技术,特别是柱色谱法或制备薄层色谱法进一步纯化产物。
根据本发明的另一个特征,可以通过相互转化本发明的其它化合物而制备本发明的化合物。
作为相互转换方法的一个实例,包含亚砜键的式1的化合物可以通过氧化相应的包含-S-键的化合物而制备。例如,可以通过与过酸,如3-氯过苯甲酸,优选在惰性溶剂,如二氯甲烷中,优选在或接近室温下反应,或者可通过与过氧一硫酸氢钾在缓冲至大约pH5的介质如甲醇水溶液中,在大约0℃和室温之间的温度下反应来方便地进行氧化反应。对于包含酸不稳定基团的化合物优选后一种方法。
作为所述相互转换方法的另一实例,可以通过氧化相应的含-S-或亚砜键的化合物而制备含砜键的式1的化合物。例如,可以通过与过氧酸,如3-氯过苯甲酸,优选在惰性溶剂,如二氯甲醇中,在或接近室温下反应来方便地进行所述的氧化反应。
可以理解,关于本文的芳基和杂芳基的芳香性指示包括任何高度共振的不饱和环结构。可选择地,如果指出的话,双键的位置代表所描绘的化合物的一种可能的结构,但可以理解它包括所述化合物的其它共振状态以及质子化和带电的种类,可以仅显示其中的一种。
可以认识到本发明的化合物可以包含不对称中心。这些不对称中心可以独立地为R或S构型。本领域技术人员可以明了,本发明的某些化合物还可以表现出几何异构现象。可以理解,本发明包括本发明化合物的单独的几何异构体和立体异构体以及它们的混合物,包括外消旋混合物。这些异构体可以通过应用或改良已知的方法,如色谱技术和重结晶技术而从它们的混合物中分离,或者它们独立地由它们的中间产物的适宜的异构体制备。
为本发明目的,应理解在所述基团的列举中包括互变异构形式,如硫代/巯基或氧代/羟基。
使用其中存在碱官能团如氨基、烷基氨基或二烷基氨基的本发明的化合物形成酸加成盐。优选药学上可接受的,即无毒的酸加成盐。选择的盐最好与常规的药物赋形剂相容并适于口服或肠胃外给药。可以应用或改良已知的方法,通过游离碱与适宜的酸反应而制备本发明化合物的酸加成盐。例如,本发明化合物的酸加成盐可以通过以下方法制备:将游离碱溶于含有适宜的酸的水或水醇溶液或其它适宜溶剂,并通过蒸发溶液来分离盐,或者使游离碱与酸在有机溶剂中反应,在这种情况下,盐直接分离或可以通过浓缩溶液而获得。用于制备这些盐的某些适宜的酸为盐酸、氢溴酸、磷酸、硫酸、多种有机羧酸和磺酸如乙酸、柠檬酸、丙酸、琥珀酸、苯甲酸、酒石酸、富马酸、扁桃酸、抗坏血酸、苹果酸、甲磺酸、甲苯磺酸、脂肪酸、己二酸盐、藻酸盐、抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡萄糖酸盐、十二烷基硫酸盐、硫酸氢盐、丁酸盐、乳酸盐、月桂酸盐、月桂基硫酸盐、苹果酸盐、氢碘酸盐、2-羟基-乙磺酸盐、甘油磷酸盐、苦味酸盐、新戊酸盐、双羟萘酸盐、果胶酯酸盐、过硫酸盐、3-苯基丙酸盐、硫氰酸盐、2-萘磺酸盐、十一酸盐、烟酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐等等。
本发明化合物的酸加成盐可以通过应用或改良已知方法而由盐再生。例如,本发明的母体化合物可以通过用碱如碳酸氢钠水溶液或氨水溶液处理它们的酸加成盐而再生。
本发明的化合物可以通过应用或改良已知的方法而由它们的碱加成盐再生。例如,本发明的母体化合物可以通过用酸如盐酸处理它们的碱加成盐而再生。
可以制备碱加成盐,其中本发明的化合物包含羧基或充足的酸性生物电子等排体。可以用于制备碱加成盐的碱优选包括这样的碱:当它与游离的酸结合时产生药学上可接受的盐,即药学剂量的该盐的阳离子对患者无毒,从而使这些游离碱的固有的有效的抑制作用不被这些阳离子的副作用损害。本发明范围内的药学上可接受的盐,包括由碱金属和碱土金属盐衍生的盐包括由以下碱衍生的盐:氢化钠、氢氧化钠、氢氧化钾、氢氧化钙、氢氧化铝、氢氧化锂、氢氧化镁、氢氧化锌、氨、乙二胺、N-甲基-葡糖胺、赖氨酸、精氨酸、鸟氨酸、胆碱、N,N′-二苄基乙二胺、氯普鲁卡因、二乙醇胺、普鲁卡因、N-苄基苯乙基胺、二乙胺、哌嗪、三(羟基甲基)-氨基甲烷、四甲基氢氧化铵等等。
在本发明的方法中可以方便地制备或形成作为溶剂化物(如水合物)的本发明的化合物。本发明化合物的水合物可以方便地通过使用有机溶剂如二噁烷、四氢呋喃或甲醇,从水/有机溶剂混合物中重结晶而方便地制备。
可以通过应用或改良已知的方法制备原料和中间产物,例如在参考实施例中描述的方法或它们明显的化学等同方法。
通过检查以下的实施例似乎将更清楚地看出本发明的化合物,它们的方法或制备以及它们的生物活性,这些实施例仅作为举例出现而不应被认为是对本发明范围的限定。
通过TLC、NMR、RP-HPLC或EA法分析样品。
通过检验以下的实施例似乎将更清楚地看出本发明的化合物、它们的方法或制备和它们的生物活性,这些实施例仅作为举例出现而不应被理解为对本发明范围的限定。
通过TLC、NMR、RP-HPLC或EA法分析样品。实施例1-化合物A-E:
将TFA(4mL)加到化合物xi(310mg,0.39mmol)的DCM溶液(10mL)中。在大约室温下将反应物搅拌5小时。此时,真空下除去溶剂。通过反相HPLC纯化所得的残余物以得到195mg(68%)化合物A。
根据上述方法并使用适宜的原料,制备下列化合物B-E:
实施例2-化合物F-M:
将DMP试剂(307mg,0.73mmol)加到化合物xii(350mg,0.56mmol)的DCM溶液(10mL)。在大约室温下将反应物搅拌2小时,然后用10% Na2SO3中止反应30分钟。然后用EtOAC(75mL)萃取反应混合物并用盐水洗涤。干燥有机层并真空浓缩。用硅胶色谱法纯化所得的残余物(80-90% EtOAc/己烷)得到248mg(71%)化合物F。
根据上述方法并使用适宜的原料,制备以下的化合物G-M:
实施例3-化合物N-R:
将DMP试剂(146mg,0.34mmol)加到化合物xix(约0.22mmol)的DCM溶液(4mL)。在大约室温下将反应物搅拌2小时,然后用10%Na2SO3中止反应。用DCM稀释反应混合物。分离有机层并用10% Na2SO3洗涤两次并有盐水洗涤。将所得的有机层干燥并真空浓缩得到残余物,通过硅胶色谱法纯化(5% EtOH/EtOAc)得到78mg(56%)所需化合物N。
根据上述方法并使用适宜的原料,制备化合物O-R:实施例4-化合物S-W:
将DMP试剂(272mg,0.65mmol)加到化合物xxv(320mg,0.5mmol)的DCM溶液(10mL)。在大约室温下将反应物搅拌2小时,并用10% Na
2SO
3中止反应20分钟。然后用EtOAc萃取所得的混合物。用盐水洗涤有机层,干燥并真空浓缩。通过硅胶色谱法纯化所得的残余物(80% EtOAc/己烷)得到170mg(53%)化合物S,
根据上述方法并使用适宜的原料,制备以下化合物T-W:
实施例5-化合物X-AD:
将DMP试剂(329mg,0.78mmol)加到化合物xxvi(400mg,0.6mmol)的DCM溶液(20mL)。在大约室温下将反应物搅拌1.5小时,并用10% Na
2SO
3中止反应20分钟。然后用EtOAc萃取所得的混合物。用盐水洗涤有机层,干燥并真空浓缩。通过硅胶色谱法纯化所得的残余物(70-100% EtOAc/己烷)得到210mg(53%)化合物X,
根据上述方法并使用适宜的原料,制备以下化合物Y-AD:
实施例6-化合物AE-AI:
将化合物xxxiii(150mg;0.076mmol)溶于5mL TFA,并搅拌二天。用RP-HPLC法纯化产物得到40mg(33%产率)的化合物AE,
根据上述方法并使用适宜的原料,制备以下化合物AF-AI:实施例7-化合物AJ:
将化合物xxxviii(180mg,0.21mmol)溶于纯净的TFA(5mL)并在大约室温下放置3天。此时,真空浓缩反应混合物得到残余物,通过反相HPLC法纯化得到50mg(32%)化合物AJ,实施例8-化合物AK-AM
将化合物xxxxiii(150mg;0.16mmol)溶于4.5mL TFA并搅拌3天。通过RP-HPLC法将产物纯化得到70mg(54%产率)化合物AK,
根据上述方法并使用适宜的原料,制备以下化合物AL-AM:实施例9-化合物AN:
将化合物lii(80mg)溶于3mL TFA和3mL DCM。在大约室温下将混合物搅拌5小时。蒸发除去溶剂。通过HPLC法纯化所得的残余物得到62mg(83%)化合物AN,
实施例10-化合物AO:
将化合物liii(160mg;0.2mmol)溶于5mL DCM并加入DMP试剂(170mg;0.4mmol)。在大约室温下将混合物搅拌三小时。蒸发除去溶剂并将残余物溶于50%乙腈/水并通过RP-HPLC法纯化得到51mg(32%)化合物AO,实施例11-化合物AP:
将化合物lix(162mg;0.22mmol)溶于8mL DCM并加入DMP试剂(189mg;0.44mmol)。在大约室温下将混合物搅拌3小时。蒸发除去溶剂并通过RP-HPLC法纯化产物得到41mg(25%)化合物AP,实施例12-化合物AQ:
将化合物lx(70mg;0.09mmol)溶于5mL TFA和5mL DCM。在大约室温下将混合物搅拌3小时。真空除去溶剂并将残余物溶于50%乙腈/水,并冻干得到化合物AQ,为一种粉末,
实施例13-化合物AR-BG:
在TFA(5mL)和DCM(5mL)的溶液中将化合物lxvi(223mg,0.326mmol)搅拌4小时。TLC(硅胶:2% MeOH/EtOAc)表明完全转化成移动较慢的产物。减压下除去溶剂并冻干产物得到198mg(97%)化合物AR,
根据上述方法并使用适宜的原料,制备以下化合物AS-BG:
实施例14-化合物BH-BS:
将化合物lxxiii(150mg,0.15mmol)置于DCM(3mL)。将TFA(1.5mL)加到此溶液。将所得的溶液搅拌过夜。此时,真空浓缩反应物以得到残余物。通过反相HPLC纯化残余物并冻干得到60mg(50%)化合物BH,
根据上述方法并使用适宜的原料,制备以下化合物BI-BS:
实施例15-化合物BT-BU:
根据实施例12的方法并使用适宜的原料,制备以下化合物BT-BU:实施例16-化合物BV:
将DMP试剂(165mg,0.39mmol)加到化合物lxxvii(143mg,0.21mmol)的二氯甲烷溶液(4.2mL)。在大约室温下将反应物搅拌2小时并用10% Na
2SO
3(水溶液)中止反应20分钟。用EtOAC萃取所得的混合物。用盐水洗涤有机层,用MgSO
4干燥并浓缩得到一种黄色油。通过硅胶色谱法纯化(5%EtOH/EtOAc)得到124mg(79%)化合物BV,
实施例17-化合物BW-CA:
将DMP试剂(342mg,0.81mmol)加到化合物lxxxix(420mg,0.62mmol)的二氯甲烷溶液(20mL)。在大约室温下将反应物搅拌1小时,并用10% Na2SO3中止反应20分钟。然后用EtOAc萃取所得的混合物。用盐水洗涤有机层,干燥并真空浓缩。通过硅胶色谱法纯化所得的残余物(80% EtOAc/己烷)得到208mg(50%)化合物BW,
根据上述的方法但使用适宜的原料,制备以下化合物BX-CA:
实施例18-化合物CB-CC:
将DMP试剂(227mg,0.54mmol)加到化合物lxxxvii(200mg,0.3mmol)的二氯甲烷溶液(6.5mL)。在大约室温下将反应物搅拌2小时并用10% Na
2SO
3(水溶液)中止反应20分钟。用EtOAC萃取所得的混合物。用盐水洗涤有机层,用MgSO
4干燥并浓缩得到一种油。硅胶色谱法纯化(5%EtOH/EtOAc)得到138mg(70%)化合物CB,
根据以上方法但使用适宜的原料,制备以下化合物CC:
实施例19-化合物CD:
将化合物lxxxxviii(40mg,0.05mmol)置于TFA(3mL)中。将溶液搅拌两个晚上并浓缩。用反相HPLC纯化残余物得到25mg(74%)化合物CD,实施例20-化合物CE:
根据实施例17的方法并使用适宜的原料,制备以下化合物CE:
实施例21-化合物CF-CG:
根据实施例14的方法并使用适宜的原料,制备以下化合物CF-CG:
实施例22-化合物CH:
根据实施例16的方法并使用适宜的原料,制备以下化合物CH:实施例23-化合物CI-CM
将化合物cxi(490mg,0.75mmol)溶于DCM(6mL)。将DMP试剂(380mg,0.9mmol)加到此溶液并搅拌1小时。用10% Na2SO3溶液中止反应混合物,然后用饱和的NaHCO3和盐水洗涤有机相。浓缩有机相,然后用70% EtOAc/己烷将所得的残余物色谱纯化得到化合物CI(325mg,66.4%)。
根据制备以上化合物的以上方法和关于制备其中间产物的方法,但使用适宜的原料,制备以下化合物CJ-CM:
和
实施例24-化合物CN
将DMP试剂(300mg,0.69mmol)加到化合物cxviii(335mg,0.46mmol)的DCM/THF溶液(3mL/3mL)。室温下将反应混合物搅拌2小时并用10% Na2SO3(水溶液)中止反应20分钟。用EtOAC萃取所得的混合物。用盐水洗涤有机相,用MgSO4干燥并浓缩得到一种黄色油。通过硅胶色谱法纯化(80%EtOAc/己烷)得到化合物CN(220mg,67%)。实施例25-化合物CO-CR
将DMP试剂(159mg,0.38mmol)加到化合物cxix(164mg,0.25mmol)的DCM/THF溶液(1.5mL/1.5mL)。室温下将反应混合物搅拌2小时并用10% Na2SO3(水溶液)中止反应20分钟。用EtOAC萃取所得的混合物。用盐水洗涤有机相,用MgSO4干燥并浓缩至黄色油。通过硅胶色谱法纯化(70% EtOAc/己烷)得到化合物CO(100mg,61%)。
根据制备以上化合物的以上方法和关于制备其中间产物的方法,但使用适宜的原料,制备以下化合物CP-CR: 和实施例26-化合物CS-CT
将化合物cxx溶于DCM(3mL)。将DMP试剂(180mg,0.41mmol)加到此溶液,然后搅拌1小时。用10% Na2SO3中止反应混合物,然后用饱和NaHCO3和盐水洗涤有机相。在浓缩有机相之后,用100% EtOAc经色谱法纯化残余物得到化合物CS(95mg,43.7%)。
根据制备以上化合物的以上方法和关于制备其中间产物的方法,但使用适宜的原料制备以下化合物CT:
实施例27-化合物CU、EI、EK-EM、EO-EZ和FA-FG
将化合物cxxviii(356mg,0.52mmol)溶于DCM(5mL)。将DMP试剂(270mg,0.63mmol)加到此溶液并搅拌1小时。用10% Na2SO3中止反应混合物,然后分离有机相并用饱和NaHCO3和盐水洗涤。在浓缩有机溶剂之后,用100% EtOAc经色谱纯化残余物得到化合物CU(200mg,56.3%)。mp225-235℃。
根据制备以上化合物的以上方法和关于制备其中间产物的方法,但使用适宜的原料制备以下化合物EI、EK-EM、EO-EZ和FA-FH:
FG,和
实施例28-化合物CV-DC
将化合物cxxx(330mg,0.46mmol)溶于DCM(5mL)。将DMP试剂(240mg,0.56mmol)加到此溶液并搅拌1小时。用10% Na2SO3中止反应混合物,用饱和NaHCO3和盐水洗涤有机相。
在浓缩有机相之后,用100% EtOAc经色谱纯化所得的残余物得到化合物cxxx(280mg,85.9%)。
根据制备以上化合物的以上方法和关于制备其中间产物的方法,但使用适宜的原料制备以下化合物CW-DC:
和
实施例29-化合物DD-DE
将DMP试剂(362mg,0.85mmol)加到化合物cxxxviii(400mg,0.57mmol)的DCM溶液(6mL)。室温下将反应混合物搅拌2小时并用10% Na2SO3(水溶液)中止反应20分钟。用EtOAC萃取所得的混合物。用盐水洗涤萃取的有机相,用MgSO4干燥并浓缩得到黄色油。用硅胶(70% EtOAc/己烷)纯化得到化合物DD(201mg,51%)。
根据制备以上化合物的以上方法和关于制备其中间产物的方法,但使用适宜的原料制备以下化合物DE:实施例30-化合物DF
将化合物cxxxxiii(165mg,0.24mmol)溶于DCM(5mL)。将DMP试剂(125mg,0.29mmol)加到此溶液并搅拌1小时。用10% Na
2SO
3中止反应混合物,并用饱和的NaHCO
3和盐水洗涤有机相。在浓缩有机相之后,用70% EtOAc/己烷经色谱纯化所得的残余物得到化合物DF(108mg,65.6%)。
实施例31-化合物DG-DJ
将DMP试剂(0.281g,0.671mmol)加到冰浴冷却的在DCM(15mL)中的化合物cil(0.350g,0.516mmol)的溶液。室温下将混合物搅拌2小时,然后用10% Na
2SO
3溶液中止反应,并搅拌20分钟。用DCM(3×20mL)萃取所得的混合物并干燥(MgSO
4)该有机萃取物。在过滤除去MgSO
4之后,浓缩滤液并通过柱色谱法(70%乙酸乙酯/己烷)纯化得到最终化合物DG(0.265g,76%),为一种白色固体。
根据制备以上化合物的以上方法和关于制备其中间产物的方法,但使用适宜的原料制备以下化合物DH-DJ:
和
实施例32-化合物DK-DN
用DMP试剂(78mg,0.185mmol)处理化合物clx(108mg,0.123mmol)的DCM溶液。室温下搅拌1小时后,用EtOAC(50mL)稀释反应混合物,然后用10% Na
2SO
3中止反应。搅拌30分钟后,分离有机相并用NaHCO
3和盐水洗涤。干燥有机相并真空浓缩得到一种残余物,硅胶色谱法(80% EtOAc/己烷)纯化残余物得到化合物DK(84mg,78%)。
根据制备以上化合物的以上方法和关于制备其中间产物的方法,但使用适宜的原料制备以下化合物DL-DN。
和
实施例33-化合物DO-DS
使用Pd/C(30% eq.,60 mg,10%钯含量)将化合物clxii(174mg,0.189mmol)的EtOH溶液(10mL)氢化2.5小时。滤出催化剂。真空浓缩所得的滤液得到一种残余物,通过半制备反相色谱法纯化残余物并冻干得到化合物DO,70%产率。
根据制备以上化合物的以上方法和关于制备其中间产物的方法,但使用适宜的原料制备以下化合物DP-DS。
和
实施例34-化合物CW:
将化合物clxiii(175mg,0.24mmol)置于DCM(3mL)。将DMP试剂(120mg,0.28mmol)加到此溶液并搅拌1小时。用10% Na2SO3中止反应并用饱和的NaHCO3和盐水洗涤。用70% EtOAc纯化得到化合物CW(134mg,75%)。实施例35-化合物CY和DT-DX:
将DMP试剂(239mg,0.56mmol)加到clxxii(290mg,0.43mmol)的DCM溶液(15mL)。室温下将反应物搅拌1小时,并用10% Na2SO3中止反应20分钟。然后用EtOAc萃取所得的混合物。用盐水洗涤有机层,干燥并真空浓缩。通过硅胶色谱法纯化所得的残余物(8-100%EtOAc/己烷)得到化合物CY(151mg,52%)。
根据制备以上化合物的以上方法和关于制备其中间产物的方法,但使用适宜的原料制备以下化合物DT-DX。
和
实施例36-化合物DY:
将化合物lxxxv(1.17mmol)置于DCM(5mL)。将DMP试剂(545mg,1.3mmol)加到此溶液并搅拌1小时。用P-Na2SO3(1.5mmol/g树脂)中止反应并搅拌1小时。加入P-TBD净化树脂*(2.5mmol/g树脂)并搅拌45分钟。过滤所得的混合物并用50% EtOAc纯化得到化合物DY(440mg,50.2%,经过两步)。
关于P-TBD净化树脂的参考文献:J.Parlow等,Tetrahedron,55,6785-6796(1999)。
实施例37-化合物DZ:
将原料化合物clxxxxi(94mg,0.14mmole)溶于THF(10mL)和DCM(20mL)的混合物。然后加入DMP试剂(118mg,0.28mmol)。在室温下搅拌2小时后,将反应物倾入包含Dri Solv THF(120mL)的分离漏斗。用10% Na
2SO
3(50mL)洗涤反应物,然后用盐水(75mL)洗涤。随后分离有机层,用MgSO
4干燥,并在减压下除去溶剂。色谱处理(硅胶:洗脱剂50% Dri Solv THF/EtOAc,然后4% MeOH/THF)后,通过MS检查馏分。将适宜的级分冻干得到化合物DZ(38.8mg,41%)。
实施例38-化合物EA-EB:
将原料化合物clxxxxv(185mg,0.26mmol)溶于THF(20mL)。然后加入DMP试剂(219mg,0.52mmol)。室温下搅拌1小时后,TLC表明完全转化为酮(5% MeOH/THF)。将反应物倾入包含Dri Solv THF(120mL)的分离漏斗。用10% Na2SO3(50mL)洗涤反应物,然后用盐水(75mL)洗涤。随后分离有机层,用MgSO4干燥并减压除去溶剂得到一种残余物,通过色谱法纯化残余物(硅胶:洗脱剂50% Dri SolvTHF/EtOAc,然后4% MeOH/THF),并用UV和MS检查级分。将适宜的级分冻干得到化合物EA(159mg,88%)。
根据制备以上化合物的以上方法和关于制备其中间产物的方法,但使用适宜的原料制备以下化合物EB:实施例39-化合物EC-ED:
将DMP试剂(0.277g,0.654mmol)加到在冰浴中冷却的在DCM(15mL)中的化合物clxxxxviii(0.341g,0.503mmol)的溶液。室温下将混合物搅拌2小时,然后用10% Na
2SO
3溶液中止反应,并搅拌20分钟。用DCM(3×20mL)萃取所得的混合物并干燥(MgSO
4)有机萃取物。在过滤除去MgSO
4后,浓缩滤液并用柱色谱法(70% EtOAc/己烷)纯化得到化合物EC(0.183g,54%),为一种白色固体。
根据制备以上化合物的以上方法和关于制备其中间产物的方法,但使用适宜的原料制备以下化合物ED:
实施例40-化合物EE-EG:
将化合物ccii(290mg,0.37mmol)置于DCM(5mL)。将DMP试剂(175mg,0.41mmol)加到此溶液并搅拌1小时。用P-Na2SO3(1.5mmol/g树脂)终止反应并搅拌1小时。用P-TBD(2.5mmol/g树脂)净化中止反应的DMP试剂并搅拌1小时。过滤所得的混合物并用DCM冲洗,然后浓缩成残余物。用50% EtOAc/己烷纯化所得的残余物得到化合物EE(440mg,28%)。
根据制备以上化合物的以上方法和关于制备其中间产物的方法,但使用适宜的原料制备以下化合物EF-EG:
和
实施例41-化合物EH:
将DMP试剂(133mg,0.3mmol)加到化合物cciii(140mg,0.2mmol)的DCM溶液(3mL)。室温下将反应物搅拌2小时并用10% Na
2SO
3(水溶液)中止反应20分钟。用EtOAC萃取所得的混合物。用盐水洗涤有机层,用MgSO
4干燥,浓缩得到一种黄色油,用硅胶(70% EtOAc/己烷)纯化,并在冻干后得到化合物EH(50mg,38%)。
实施例42-化合物EJ
将化合物ixxxiii(520mg,1mmol)置于DCM(5mL)。将PyBOP(624mg,1.2mmol)加到以上溶液并搅拌5分钟。将在THE(5mL)中的化合物cdviii(300mg,1.2mmol)滴加到此溶液,然后加入DIPEA(0.22ml,1.2mmol)。室温和氮气氛下将反应物搅拌过夜。此时,用THE(5mL)稀释反应物,用饱和的NaHCO
3和盐水洗涤。用MgSO
4干燥有机相,过滤并浓缩得到粗品偶联中间产物cdix。
将此中间产物cdix(~1mmol)置于DCM(10mL)。将Dess-MartinPeriodinane(466mg,1.1mmol)加到此溶液。室温下搅拌1小时后,用结合聚合物的Na2SO3(740mg,1.5mmol DMP/g树脂)中止反应并搅拌45分钟。然后用结合聚合物的TBD树脂(440mg,2.5mmol DMP/g树脂)净化反应混合物。将所得的混合物搅拌45分钟,然后过滤。用5% EtOH/EtOAc完成纯化得到化合物EJ(245mg,32%,经过两步)。关于处理方法的文献参考可见Tetrahedron(四面体)55(1999)6785-6796。实施例43-化合物EN
将中间产物化合物cdvii(415mg,0.59mmol)置于DCM(10mL)和THF(10mL)。加入t-BuOH(300μL),然后加入Dess-MartinPeriodinane(750mg,1.77mmol)。将反应物搅拌50分钟,然后用P-Na
2SO
3(1.5mmol DMP/g树脂)中止反应。室温下搅拌20分钟后,用P-TBD(2.5mmol DMP/g树脂)净化反应混合物。搅拌1小时后,将所得的混合物过滤并浓缩。通过硅胶色谱法(50%至70% EtOAc/己烷)纯化产物得到化合物EN(220mg,53%)。
如以下表1所示,获得以下化合物的质谱[M]。
表1LY#
实施例
发现的质量
A 733.3
B 747.2
C 657.2
D 769.4
E 733.4
F 625.4
G 639.3
H 661.4
I 643.4
J 707.3
K 641.3
L 689.3
M 639.3
N 639.4
O 731.4
P 687.4
Q 653.4
R 701.4
S 639.3
T 747.1
U 655.4
V 653.4
W 703.4
X 661.3
Y 647.3
Z 663.3
AA 667.4
AB 711.4
AC 725.4
AD 647.3
AE 779.4
AF 689.3AG 671.4AK 806.4AH 687.5AI 735.4AJ 736.5AM 870.4AN 813.3AP 724.4AQ 653.4AR 628.2AW 642.2AX 614.2AY 628.3BD 570.3BE 520.2BF 534.3BG 584.3BU 890.3BV 685.4BW 679.3BX 695.3BY 697.3BZ 787.4CA 701.3CB 669.4CC 733.5CD 643.3CE 653.5CH 749.4CI 653.3CJ 717.5CK 683.4CL 669.3CM 675.2CN 717.2CO 653.3CP 683.3CQ 669.3CR 675.2CT 661.8CS 639.3CU 679.2CV 709.3CW 743.3CX 695.3CY 665.2CZ 681.3DA 695.3DB 701.2DC 673.3DD 693.3DE 757.4DF 682.3DG 676.3DH 676.2DI 692.5DJ 605.2DK 874.4DL 924.5DM 924.2DN 952.7DO 830DP 842.5DT 667.4DU 639.2DV 740.3DW 684.2DX 678.5DY 749.3DZ 685.3EA 649.3EB 700.3EC 702.3ED 730.3EE 775.3EF 749.3EG 722.3EH 665.2EI 796.4EJ 744.3EK 730.5EL 730.5EM 757.3EN 703.5EO 715.5EP 679.2EQ 651.3ER 715.3ES 668.5ET 732.5EU 743.3EV 683.3EW 750.4EX 786.4EY 744.5EZ 780.4FB 693.4FC 655.3FD 655.3FE 774.4FF 681.5FG 667.5
如下表2所示,获得以下化合物的高分辨率质谱(HRMS)。
表2
实施例 |
分子式(M+1) |
MS计算值(M+1) |
MS实测值(M+1) |
L |
C37H52N7O6 |
690.3979 |
690.3986 |
M |
C33H50N7O6 |
640.3822 |
640.3822 |
Z |
C32H48F2N7O6 |
664.3634 |
664.3627 |
AB |
C36H48F2N7O6 |
712.3634 |
712.3649 |
CE |
C34H52N7O6 |
654.3979 |
654.3967 |
EN |
C35H52N7O6F2 |
704.3947 |
704.3945 |
EK |
C37H63N6O8S |
751.4428 |
750.4350(M) |
EC |
C36H59N6O8 |
703.4395 |
703.4382 |
CA |
C35H50N7O6F2 |
702.3790 |
702.3801 |
EZ |
C40H55N8O6F2 |
781.4213 |
781.4196 |
EU |
C36H52N7O6F2 |
716.3947 |
716.3929 |
CY |
C35H52N7O6 |
666.3979 |
666.3966 |
BX |
C37H58N7O6 |
696.4448 |
696.4432 |
S |
C33H50N7O6 |
640.3823 |
640.3831 |
BW |
C36H54N7O6 |
680.4136 |
680.4126 |
CU |
C36H54N7O6 |
680.4136 |
680.4128 |
EJ |
C40H57N8O6 |
745.4401 |
745.4417 |
EM |
C35H54N7O6 |
668.4136 |
668.4139 |
无 |
C41H58N7O6 |
744.4448 |
744.4691 |
中间产物实施例1-化合物ii
-10℃下将NaBH
4(924mg,24.4mmol)加到化合物i(8.1g,24.4mmol)的乙醇溶液(40mL)中。
室温下将反应物搅拌30分钟,然后用AcOH(3mL)中止反应。用EtOAC(250mL)稀释反应混合物,并用NaHCO
3和盐水洗涤。干燥有机层并真空浓缩得到一种残余物,用硅胶色谱法(50% EtOAc/己烷)纯化得到7.85g(97%)化合物ii,
中间产物实施例2-化合物iii
将0℃的NaH(699mg,60%,17.42mmol)加到化合物ii(4.48g,13.4mmol)的THF溶液(70mL)。在此温度下搅拌40分钟,加入纯净的MeI(1.25mL,20.1mmol)。在大约室温下将反应物搅拌过夜。此时,在0℃下小心地用饱和NH
4Cl溶液中止反应。用Et
2O和EtOAc萃取反应混合物。用水、盐水洗涤有机层并用Na
2SO
4干燥。真空浓缩如此得到的有机层得到黄原酸盐化合物iii,
中间产物实施例3-化合物iv
将黄原酸盐化合物iii(~13.4mmol)溶于甲苯(100mL)。将AIBN(216mg,1.34mmol)加到此溶液。用干燥氮将所得的溶液脱气,然后用n-Bu
3SnH(5.4mL,20.1mmol)处理。在90℃下将反应混合物加热3小时。此时,将反应物冷却至室温并真空浓缩。用硅胶色谱法(15-20% EtOAc/己烷)纯化所得的残余物得到2.8g(66%,从化合物ii开始计算的)化合物iv,
中间产物实施例4-化合物v
在氮气流下将Pd(OH)2/C(655mg,20%,0.95mmo)加到化合物iv(1g,3.15mmol)的乙醇溶液(21mL)中。将所得的反应混合物进行标准氢化(1.5atm)。5小时后,除去氢源并过滤反应物。真空浓缩滤液得到游离胺化合物v,中间产物实施例5-化合物vi
在大约室温下将HOAt(265mg,1.95mmol)加到化合物vii(629mg,1.95mmol)的DCM溶液(10mL),然后加入在DCM(1.95mL,1.95mmol)中的1MDCC溶液。搅拌30分钟后,将化合物v(1.5mmol)的DCM溶液(3mL)加到上述HOAt-活化的酸。在大约室温下将反应物搅拌过夜。此时,通过硅藻土过滤反应物。用EtOAC(75mL)稀释滤液并用水和盐水洗涤。将有机层干燥并真空浓缩。通过硅胶色谱法纯化所得的残余物(70-80%EtOAc/己烷)得到620mg(85%)化合物vi,中间产物实施例6-化合物viii
将2N NaOH水溶液(1.26mL,2.52mmol)加到化合物vi(615mg,1.26mmol)的乙醇溶液(10mL)。在大约室温下将反应物搅拌过夜,然后用Dowex酸性树脂酸化至pH3。滤出固体并在真空下浓缩滤液得到一种残余物,将此残余物溶于1∶1 CH3CN/H2O。将此溶液冻干得到495mg(85%)化合物viii,中间产物实施例7-化合物ix
将PyBop(417mg,0.8mmol)加到化合物viii(230mg,0.5mmol)的DCM溶液(10mL)。在大约室温下将混合物搅拌30分钟。然后将化合物x(263mg,0.75mmol)的THF溶液(5.25mL)加到此溶液,然后加入DIPEA(0.174mL,1mmol)。
在大约室温下将反应物搅拌过夜,然后用水(30mL)中止反应30分钟。用EtOAC(100mL)萃取反应混合物。用盐水洗涤有机层和干燥并真空浓缩得到一种残余物,通过硅胶色谱法(5% EtOH/EtOAc)纯化此残余物得到~400mg(100%)化合物ix,
中间产物实施例8-化合物xi
将DMP试剂(278mg,0.65mmol)加到化合物ix(396mg,0.5mmol)的DCM溶液(10mL)。在大约室温下将反应物搅拌1小时,然后用10%Na2SO3终止30分钟。用EtOAC(75mL)萃取反应混合物并用盐水洗涤。将有机层干燥并真空浓缩。用硅胶色谱法(70% EtOAc/己烷)纯化所得的残余物得到320mg(81%)of化合物xi,中间产物实施例9-化合物xii
将PyBop(417mg,0.8mmol)加到化合物viii(230mg,0.5mmol)的DCM溶液(10mL)溶液。在大约室温下将反应物搅拌30分钟。将化合物xiii(140mg,0.75mmol)的THF溶液(3.5mL)加到此溶液,然后加入DIPEA(0.174mL,1mmol)。在大约室温下将反应物搅拌过夜,然后用水(30mL)终止30分钟。用EtOAC(75mL)萃取反应混合物。用盐水洗涤有机层,并干燥和真空浓缩得到一种残余物,通过硅胶色谱法(5% EtOH/EtOAc)纯化此残余物,以定量产率得到化合物xii,中间产物实施例10-化合物i′
将(BOC)2O(3.3g,15.1mmol)和H2/Pd(OH)2/C(1.6g,10% Pd含量)加到化合物i(5g,15.1mmol)的甲醇溶液(30mL)。在大约室温下将反应物搅拌2小时,然后通过硅藻土过滤两次。用DCM冲洗硅藻土床。真空浓缩合并的滤液得到一种油状残余物,用硅胶色谱法(40%EtOAc/己烷)纯化此残余物得到3.8g(85%)化合物i′,中间产物实施例11-化合物ii′
0℃下将NaBH4(0.805g,21mmol)加到化合物i′(3.7g,12.5mmol)的甲醇溶液(111mL)。0℃下搅拌2.5小时,真空下缓慢蒸发反应溶剂得到一种残余物,用EtOAc稀释此残余物。然后用水洗涤溶液两次。用EtOAc萃取水层。用MgSO4干燥合并的有机层并过滤和真空浓缩,得到一种残余物,用色谱法纯化得到3.76g(99%)化合物ii′,中间产物实施例12-化合物xiv
0℃下将DMAP(5g,40.1mmol)加到化合物ii′(3.76g,12.3mmol)的DCM溶液(180mL),然后加入Tf2O(4mL,23.7mmol)。在0℃下将反应物搅拌1小时,并在大约室温下再搅拌1.5小时。然后用5% NaHCO3洗涤反应混合物两次并用MgSO4干燥。真空浓缩如此得到的有机层得到三氟乙酸盐粗产物。将所得的三氟乙酸盐(2.7g,6mmol)溶于DCM(120mL)。将DMAP(2.5g,20.5mmol)加到此溶液。将所得的反应混合物加热至回流过夜。此时,将反应物冷却至室温,并用5% NaHCO3洗涤两次。用MgSO4干燥反应混合物,过滤并真空浓缩得到一种褐色油状残余物,将其纯化(1% MeOH/DCM)得到500mg(30%)化合物xiv,中间产物实施例13-化合物xv
将化合物xiv(500mg,1.8mmol)溶于在二噁烷(6.75mL)中的4N HCl。在大约室温下将反应物搅拌约4小时。此时,真空下除去溶剂。用二乙醚将所得的残余物滴定两次,几乎以定量产率得到化合物xv的HCl盐,
中间产物实施例14-化合物xvi
将HOAt(245mg,1.8mmol)和DCC(1.8ml,1M DCM溶液)加到化合物vii(579mg,1.8mmol)的THF溶液(7mL)。得到悬浮液。在大约室温下搅拌15分钟后,将化合物xv(1.8mmol)和DIPEA(0.63ml,3.6mmol)的THF溶液(6mL)加到以上悬浮液。其后再加入DIPEA(0.8mL)。在大约室温下将反应混合物搅拌过夜。此时,滤出如此形成的白色固体。用THF冲洗该白色固体。真空浓缩合并的滤液和洗液得到粗产物,用硅胶色谱法(100% EtOAc)纯化该粗产物得到665mg(76%)化合物xvi,
中间产物实施例15-化合物xvii
0℃下将1N NaOH(2.4mmol)水溶液加到7(665mg,1.37mmol)的乙醇溶液。在大约室温下将反应物搅拌过夜,然后用Dowex酸性树脂酸化至pH3。过滤固体。真空浓缩所得的滤液得到一种浅黄色残余物,将此残余物溶于1∶1 CH3CN/H2O,并冻干得到467mg(74%)化合物xvii,中间产物实施例16-化合物xix
在大约室温下用PyBop(207mg,0.4mmol)对化合物xvii(100mg,0.22mmol)的DCM溶液(4mL)处理20分钟。此时,用化合物xviii(65mg,0.32mmol)的THF溶液(2.6mL)处理以上溶液,然后用DIPEA
(0.076mL)处理。在大约室温下搅拌7小时后,用水中止反应。用DCM(60mL)稀释反应混合物。分离有机层,用盐水洗涤两次并用MgSO
4干燥。过滤后,浓缩并进行硅胶色谱处理(5% EtOH/EtOAc),得到148mg(~100%)化合物xix。
中间产物实施例17-化合物xx
将HOBT(7.72g,57.2mmol)和EDCI(10.98g,57.2mmol)加到N-Cbz-L-缬氨酸(14.4g,57.2mmol)的THF溶液(100mL)。在大约室温下搅拌20分钟后,将含有叔-L-亮氨酸甲酯-盐酸盐(10.4g,57.2mmol)和DIPEA(11.9ml,68.7mmol)的THF溶液(50mL)加到以上溶液。在大约室温下将反应物搅拌过夜。在进行标准水后处理和硅胶色谱处理(30% EtOAc/己烷)后,得到14g(64%)化合物xx。
中间产物实施例18-化合物xxi
将(在N
2气流下)Pd/C(1.88g,10% Pd含量)加到xx(6.71g,17.7mmol)的甲醇溶液(80mL)。在大约室温下将反应容器氢化(1atmH
2)过夜。此时,通过硅藻土垫过滤反应混合物,并真空浓缩得到相应的用于下一步的游离胺粗产物。将此胺(~17.7mmol)的THF溶液加到包含2-吡嗪-甲酸(2.85g,23mmol)、Hobbit(3.12g,23mmol)和EDCl(4.41g,23mmol)的THF(46mL)和DMF(5mL)溶液中。将DIPEA(3.08g,17.7mmol)加入所得的混合物。在大约室温下将反应物搅拌过夜,然后用水中止反应。用EtOAc萃取反应混合物。用盐水洗涤有机层并真空浓缩得到一种残余物,通过硅胶色谱法(40-50%EtOAc/己烷)纯化得到3.9g(63%)化合物xxi,
中间产物实施例19-化合物xxii
将2N NaOH(10ml,20mmol)加到化合物xxi(4.67g,13.34mmol)的甲醇溶液(40mL)。在大约室温下将反应物搅拌2小时。此时,将附加量的2N NaOH(3.3ml,6.67mmol)加到此反应混合物。在大约室温下搅拌过夜后,使用酸性树脂将反应物酸化至pH3。然后过滤反应物,并将滤液真空浓缩得到一种残余物,将其溶于1∶1 CH
3CN/H
2O用于冻干。获得4.15g(93%)化合物xxii。
中间产物实施例20-化合物xxiii
用HOAt(371mg,2.73mmol)和DCC(2.73ml,1M,2.73mmol)处理化合物xxii(917mg,2.73mmol)的DCM溶液(10mL)。搅拌30分钟后,用化合物v(500mg,2.73mmol)的THF溶液(10mL)处理反应混合物。在大约室温下搅拌过夜后,过滤白色固体(尿素)。真空浓缩滤液得到一种残余物,通过硅胶色谱法(60-70% EtOAc/己烷)纯化此残余物得到1.06g(77%)化合物xxiii,
中间产物实施例21-化合物xxiv
用2N NaOH(2.11ml,4.23mmol)处理化合物xxiii(1.06g,2.11mmol)的乙醇溶液(20mL)。在大约室温下搅拌过夜后,用酸性树脂将反应混合物酸化至pH3。滤出固体。真空浓缩所得的滤液得到一种残余物,将此残余物冻干得到~1g(100%)化合物xxiv,中间产物实施例22-化合物xxv
用PyBop(417mg,0.8mmol)处理化合物xxiv(236.7mg,0.5mmol)的DCM溶液(10mL)。在大约室温下搅拌20分钟后,用化合物xiii(139.5mg,0.75mmol)的DMF溶液(5.6mL)处理反应混合物,然后用DIPEA(0.174ml,1mmol)处理。在大约室温下搅拌8小时后,用水中止反应并用EtOAc萃取。用盐水洗涤所得的有机层,干燥并真空浓缩得到一种残余物,通过硅胶色谱法(5% EtOH/EtOAc)纯化此残余物得到~320mg(100%)化合物xxv,
中间产物实施例23-化合物xxvi
用PyBop(622mg,1.2mmol)处理化合物xxiv(355mg,0.75mmol)的DCM溶液(15mL)。在大约室温下搅拌20分钟后,用化合物xxvii′(156mg,0.75mmol)的THF溶液(10mL)处理反应混合物,然后用DIPEA(0.26ml,1.5mmol)处理。在大约室温下搅拌过夜后,用水中止反应并用EtOAc萃取。用盐水洗涤所得的有机层,干燥并真空浓缩得到一种残余物,通过硅胶色谱法(2%EtOH/EtOAc)纯化此残余物得到~400mg(80%)的化合物xxvi,中间产物实施例24-5-氰基戊酸甲酯
将氰化钾(4g,61.44mmol)溶于70mL水和200mL甲醇。加入10g(51.2mmol)5-溴戊酸甲酯溶液并将混合物回流过夜。将反应混合物浓缩至干。将100ml EtOAc加到此残余物以萃取产物。用水洗涤有机层三次,干燥并浓缩得到5.37g(74%)5-氰基戊酸甲酯,为一种油。中间产物实施例25-5-四唑-5-基戊酸甲酯
将5-氰基戊酸甲酯(4.8g,34mmol)溶于甲苯,加入氯化三乙基铵(14g,102mmol)和叠氮化钠(6.63,102mmol)。加热混合物至回流过夜。将反应混合物冷却至室温,加入水以从有机层中萃取(3×100mL)5-四唑-5-基戊酸甲酯。将浓HCl加到水相以调节pH至2。用EtOAC(3×50mL)从水溶液中萃取产物。合并有机层,干燥并浓缩得到4.25g(68%)5-四唑-5-基戊酸甲酯。中间产物实施例26-5-[N-(1,1-二甲基苄基)四唑-5-基]戊酸甲酯
将5-四唑-5-基戊酸甲酯(4.23g,23mmol)和三氯乙酸(8.69g,53mmol)溶于50mLCHCl3。将α-甲基苯乙烯(2.72,23mmol)滴加到此溶液,并在大约室温下将反应混合物搅拌过夜。用EtOAc将反应混合物稀释至200ml,用10% KOH水溶液和盐水洗涤有机层。干燥有机层,浓缩。通过闪烁柱色谱法纯化产物得到6.6g(95%)5-[N-(1,1二甲基苄基)四唑-5-基]戊酸甲酯。中间产物实施例2 7-5-[N-(1,1-二甲基苄基)四唑-5-基]戊酸
将5-[N-(1,1-二甲基苄基)四唑-5-基]戊酸甲酯(6.6g,21.8mmol)溶于甲醇(100mL)并加入23mL 1N NaOH水溶液。将混合物搅拌过夜并浓缩除去甲醇。将残余物溶于水(100mL),并通过加入同当量的1N HCl水溶液中和此溶液。用EtOAC(3×50mL)萃取产物。将有机层干燥并浓缩得到4.75g(75%)5[N-(1,1-二甲基苄基)四唑-5-基]戊酸。中间产物实施例28-化合物xxviii
将5-[N-(1,1-二甲基苄基)四唑-5-基]戊酸(4.75g,16.5mmol)溶于DCM(100mL),加入4.8g(24.8mmol)EDCl和6mL DIPEA。将N-羟基琥珀酰亚胺(3.8g,33mmol)加到此混合物。在大约室温下将此反应混合物搅拌3小时。用DCM将混合物稀释至200mL,并用水将溶液洗涤三次。将有机层干燥并浓缩得到4.79g(75%)化合物xxviii,
中间产物实施例29-化合物xxix
将二肽H-Val-Val-OH(3.22g,14.9mmol)悬浮在50mL N,N-二甲基甲酰胺(DMF),并加入4.75g(12.42mmol)化合物xxviii,然后加入3.4mL(18.63mmol)二异丙基乙基胺(DIPEA)。将混合物加热至40℃并搅拌过夜。高度真空下蒸发溶剂。将残余物溶于EtOAc,并用1N HCl和盐水洗涤得到5.52g(91%)化合物xxix,中间产物实施例30-化合物xxx
将1.6g(3.29mmol)化合物xxix溶于20mL DCM,加入在THF中的3.3mL 1M的DCC溶液。将500mg(2.73mmol)化合物v加到此混合物。在大约室温下将混合物搅拌过夜。用EtOAc将混合物稀释至100mL并用1N HCl、NaHCO
3和盐水洗涤。通过柱色谱法(50% EtOAc/己烷)纯化得到1.02g(58%)化合物xxx,
中间产物实施例31-化合物xxxi
将化合物xxx(1.02g,1.57mmol)溶于10mL MeOH,并加入2mL1N NaOH水溶液。将混合物搅拌过夜。蒸发除去甲醇,将残余物溶于水,并用2mL HCl中和。在用EtOAc萃取后,得到1.00g(~100%)化合物xxxi。中间产物实施例32-化合物xxxii
将化合物xxxi(300mg,0.48mmol)和PyBop(300mg,0.58mmol)溶于10mL DCM。将化合物x(201mg,0.58mmol)加到此溶液,然后加入DIPEA(104μL)。在大约室温下将混合物搅拌过夜。然后用EtOAc将反应混合物稀释至100mL,用1N HCl洗涤两次,用NaHCO3洗涤两次并用盐水洗涤三次。干燥有机层并浓缩。通过柱色谱法(100%EtOAc)纯化残余物得到450mg(98%)化合物xxxii,中间产物实施例33-化合物xxxiii
将化合物xxxii 360mg(0.38mmol)溶于8mL DCM并加入240mg(0.57mmol)DMP试剂。在大约室温下将混合物搅拌3小时。用EtOAc将混合物稀释至50mL,并用盐水洗涤三次。通过柱色谱法(25%乙醇/EtOAc)纯化产物得到300mg(83%)化合物xxxiii,中间产物实施例34-化合物xxxiv
将PyBop(1.7g,3.36mmol)和Hobbit(450mg,3.36mmol)加到xxxv(790mg,2.80mmol)的DCM溶液(10mL)。将所得的溶液冷却至0℃并用(s)-α-(4-吡啶基)乙基胺(410mg,3.36mmol)的DCM溶液(3mL)处理。然后加入DIPEA(0.5ml,3.36mmol)。在大约室温下将反应物搅拌过夜。此时,用EtOAc稀释反应混合物。用饱和NaHCO3和盐水洗涤全部混合物。将如此得到的有机层干燥并真空浓缩。通过硅胶色谱法纯化所得的残余物(5% EtOH/EtOAc)得到630mg(58%)化合物xxxiv,注:(s)-α-(4-吡啶基)乙基胺由其D-酒石酸盐通过碱洗(1N NaOH)和随后的EtOAc萃取而获得。回收率为89%。中间产物实施例35-化合物xxxvi
N2 Pd/C(150mg,10%钯含量)下加入化合物xxxiv(630mg,1.64mmol)的甲醇溶液(15mL)。在H2下将反应物搅拌过夜。通过Celite521垫过滤反应混合物。真空浓缩滤液得到420mg(~100%)化合物xxxvi,中间产物实施例36-化合物xxxvii
将PyBop(270mg,0.52mmol)加到化合物xxxi(270mg,0.43mmol)的DCM溶液(3mL)。然后加入化合物xxxvi(160mg,0.64mmol)和DIPEA(0.09ml,0.52mmol)。在大约室温下搅拌反应物。此时,用EtOAc稀释产物并用0.1N HCl洗涤,然后加入饱和的NaHCO3和盐水。将所得的有机层干燥和浓缩得到化合物xxxvii(430mg总质量)用于下一步。中间产物实施例37-化合物xxxviii
将DMP试剂(280mg,0.65mmol)加到化合物xxxvii(370mg,0.43mmol)和DCM溶液(3mL)。在大约室温下将反应物搅拌2小时,然后用10% Na2SO3中止反应。搅拌30分钟后,用EtOAc萃取反应物。用饱和NaHCO3和盐水洗涤有机层。将所得的有机层干燥并真空浓缩得到一种残余物,通过硅胶色谱法(5% EtOH/EtOAc)纯化残余物得到180mg(49%,两步)化合物xxxviii,中间产物实施例38-化合物xxxx
将化合物xxix(2.5g,5mmol)溶于40mL DCM,将5.1mL在THF中的1M DCC溶液加到此溶液中,向该混合物中加入1.08g(3.53mmol)化合物xxxix。在大约室温下将混合物搅拌过夜。
用EtOAc将混合物稀释至100ml,连续地用1N HCl、NaHCO
3和盐水洗涤,然后通过柱色谱法(80% EtOAc/己烷)纯化得到2.59g(95%)化合物xxxx,
中间产物实施例39-化合物xxxxi
将化合物xxxx(2.59g,3.35mmol)溶于20mL MeOH并加入4mL1N NaOH水溶液。将混合物搅拌过夜,然后旋转蒸发留下残余物。将残余物溶于水并用2mL HCl中和。然后EtOAc萃取中和的溶液得到2.49g(~100%)化合物xxxxi,
中间产物实施例40-化合物xxxxii
将化合物xxxxi(847mg,1.16mmol)和724mg(1.39mmol)PyBop溶于10mL DCM。将化合物xiii(260mg,1.39mmol)加到此溶液,然后加入DIPEA(209μl)。在大约室温下将混合物搅拌过夜。然后用EtOAc将反应混合物稀释至100mL,用1N HCl洗涤两次,用NaHCO
3洗涤两次并用盐水洗涤三次。干燥有机层并浓缩。通过柱色谱法(5%乙醇/EtOAc)纯化残余物得到930mg(86%)化合物xxxxii,
中间产物实施例41-化合物xxxxiii
将化合物xxxxii(350mg,0.38mmol)溶于10mL DCM,并加入242mg(0.57mmol)DMP试剂。在大约室温下将混合物搅拌三小时。用EtOAc将混合物稀释至50mL,并用盐水洗涤三次。通过柱色谱法(100% EtOAc)纯化产物得到180mg(51%)化合物xxxxiii,
中间产物实施例42-化合物xxxxv
将H-Val-Val-OH(5g,23mmol)悬浮在100mL DMF中,并加入化合物xxxxiv(8.3g,27.6mmol),然后加入6.2mL(35.5mmol)DIPEA。40℃下将混合物搅拌2天。在高度真空下除去溶剂,将残余物溶于100mL EtOAc,用1N HCl洗涤三次并用盐水洗涤两次。得到9.14g(99%)化合物xxxxv。中间产物实施例43-化合物xxxxvi
将化合物xxxxv(2.8g,7mmol)和954mg(7mmol)HOAt溶于100mL DCM。加入7mL 1M DCC/DCM。将化合物xxxix(2.15g)加到此反应混合物,并在大约室温下将反应混合物搅拌过夜。将混合物浓缩至干并将残余物溶于EtOAc,用柱色谱法(100% EtOAc)纯化得到4.57g(95%)化合物xxxxvi,中间产物实施例44-化合物xxxxvii
将化合物xxxxvi(4.57g,6.65mmol)溶于10mL TFA和10mLDCM。在大约室温下将混合物搅拌4小时。真空下除去溶剂,将残余物溶于50∶50乙腈/水,并冻干得到一种粉末化合物xxxxvii,
中间产物实施例45-化合物xxxxviii
将化合物xxxxvii(1g,1.59mmol)和990mg(2.28mmol)PyBop溶于20mL DCM,并加入在THF中的1.6mL 1M甲胺。在大约室温下将混合物搅拌4小时。用EtOAc将反应混合物稀释到100mL,并用1NHCl、NaHCO
3和盐水洗涤。通过闪烁柱色谱法(10% EtOH/EtOAc)纯化残余物得到1g(98%)化合物xxxxviii,
中间产物实施例46-化合物xxxxix
将化合物xxxxviii(1g,1.55mmol)溶于10mL MeOH,并加入2mL 1N NaOH。在大约室温下将混合物搅拌过夜。蒸发除去溶剂。将残余物溶于水,中和并用EtOAc萃取得到960mg(98%)化合物xxxxix,
中间产物实施例47-化合物li
将化合物xxxxix(315mg,0.5mmol)和312mg(0.6mmol)PyBop溶于10mL DCM。加入化合物1(56mg,0.6mmol)和108μl DIPEA。
在大约室温下将混合物搅拌过夜,用EtOAc稀释至100mL,并用1NHCl、NaHCO
3和盐水洗涤。通过柱色谱法(15% EtOH/EtOAc)纯化得到400mg(92%)化合物li,
中间产物实施例48-化合物lii
将化合物li(400mg,0.46mmol)溶于10mL DCM,并加入292mg(0.69mmol)DMP试剂。在大约室温下将混合物搅拌3小时。蒸发除去溶剂并通过RP-HPLC法纯化得到130mg(32%)化合物lii,中间产物实施例49-化合物liii
将化合物xxxxix(210mg,0.33mmol)和208mg(0.4mmol)PyBop溶于10mL DCM。将化合物xiii(154mg,0.83mmol)加到此溶液,然后加入DIPEA(72μl,0.4mmol)。在大约室温下将混合物搅拌过夜。用EtOAc将反应混合物稀释至100mL,用1N HCl、NaHCO
3和盐水洗涤,然后通过闪烁柱色谱法(10% EtOH/EtOAc)纯化得到250mg(95%)化合物liii,
中间产物实施例50-化合物liv
将化合物xxxxv(755mg,1.88mmol)和255mg(1.88mmol)HOAt溶于20mL DCM。将1.88mL 1M DCC/DCM加到反应混合物,加入化合物v(288mg),并在大约室温下将反应混合物搅拌2小时。将混合物浓缩至干,将残余物溶于EtOAc,并通过柱色谱法(80% EtOAc/己烷)纯化得到800mg(90%)化合物liv,中间产物实施例51-化合物lv
将化合物liv(800mg,1.41mmol)溶于10mL MeOH并加入2mLNaOH。在大约室温下将混合物搅拌过夜。真空除去溶剂,将残余物溶于水,并用2mL 1N HCl中和。用EtOAc萃取产物。蒸发萃取溶剂得到760mg(~100%)lv,
中间产物实施例52-化合物lvii
将化合物lv(760mg,1.41mmol)和880mg(1.69mmol)PyBop溶于5mL DCM。将化合物lvi(530mg,2.12mmol)加到此溶液,然后加入0.31 DIPEA。
在大约室温下将混合物搅拌过夜。用EtOAc将反应混合物稀释至100mL,用1N HCl、NaHCO3和盐水洗涤,然后通过闪烁柱色谱法(100%EtOAc)纯化得到870mg(80%)化合物lvii,中间产物实施例53-化合物lviii
化合物lvii(350mg,0.45mmol)溶于5mL TFA和5mL DCM,并在大约室温下将混合物搅拌3小时。蒸发除去溶剂通过RP-HPLC纯化产物,得到了220mg(69%)化合物lviii,
中间产物实施例54-化合物lix
将化合物lviii(200mg,0.28mmol)和218mg(0.42mmol)PyBop溶于5mL DCM。加入甲胺(0.28mL,2M THF溶液)。在大约室温下将混合物搅拌过夜。用EtOAc将混合物稀释至100mL,用1NHCl、NaHCO3和盐水洗涤,并通过柱色谱法(15% EtOH/EtOAc)纯化得到168mg(79%)lix,中间产物实施例55-化合物lx
将化合物lviii(200mg,0.26mmol)溶于4mL DCM,并加入165mg(0.39mmol)DMP试剂。在大约室温下将混合物搅拌3小时。蒸发除去溶剂。将残余物溶于50%乙腈/水,过滤并通过RP-HPLC纯化得到140mg(70%)化合物lx,中间产物实施例56-化合物ii
在N2气氛下将化合物i(4g,12.1mmol)的DCM(30mL)和EtOH(30mL)溶液冷却到-10℃。加入NaBH4(458mg,12.1mmol)并在-10℃下将溶液搅拌50分钟。TLC(50% EtOAc/己烷)表明完成转化为移动较慢的斑点。用冰小心地中止反应,然后用冷的饱和NH4Cl溶液(10mL)终止。将混合物倾入DCM(300mL)。用NH4Cl(60mL)将有机层洗涤一次,并用盐水(60mL)洗涤两次。然后分离有机层,用MgSO4干燥并真空浓缩,得到3.5g化合物ii(87%)。中间产物实施例57-化合物lxi
在配备H2气囊的250mL圆底烧瓶中,在大约室温下对化合物ii(3.5g,10.5mmol)的乙醇溶液(50mL)实施标准氢化条件[20%Pd(OH)2/C(1.47g,2.1mmol)]持续5小时。通过硅藻土滤出催化剂并用DCM洗涤。然后在减压下除去溶剂得到2g(96%)化合物lxi,中间产物实施例58-化合物lxii
在惰性气氛下,将在无水DMF(6mL)中的化合物lxi(200mg,1mmol)、化合物lxiii(233mg,1.1mmol)、
HOAt(1-羟基-7-氮杂苯并三唑)(156mg,1.15mmol)的溶液搅拌20分钟。然后将温度降至0℃,随后加入DIC(0.18ml,1.15mmol)。在大约室温下将反应物搅拌过夜。用EtOAc稀释溶液,然后用1N HCl洗涤两次,用饱和NaHCO
3水溶液和盐水洗涤两次。分离出有机层,用MgSO
4干燥,并在减压下除去溶剂。通过色谱法(硅胶:70% EtOAc/DCM)净化残余物得到45%产率的化合物lxii。
中间产物实施例59-化合物lxiv
在大约室温下将在二噁烷(6mL)和0.5M NaOH(6mL)中的化合物lxii(777mg,2mmol)的溶液搅拌5小时。TLC(100% EtOAc)检查表明完全转化成在起始位置的点。用冰浴冷却反应,然后加入1N HCl(4mL)。然后加入固体NaCl,并用EtOAC(2×150mL)萃取整个混合物两次。合并有机萃取物,用MgSO
4干燥并在减压下除去溶剂得到化合物lxiv,产率为92%。
中间产物实施例60-化合物lxv
在惰性气氛下,将在无水DMF(6mL)中的化合物x(203mg,0.58mmol)、化合物lxiv(276mg,0.775mmol)、HOAt(1-羟基-7-氮杂苯并三唑)(126mg,0.93mmol)的溶液搅拌20分钟。然后将温度降至0℃,随后加入DIC(0.14ml,0.93mmol)。在大约室温下将反应物搅拌过夜。用EtOAc稀释溶液,然后用1N HCl洗涤两次,用饱和NaHCO
3水溶液和盐水洗涤两次。分离有机层,用MgSO
4干燥并在减压下除去溶剂。通过色谱法(硅胶:50% EtOAc/DCM至80∶19∶1 EtOAC/DCM/MeOH)纯化残余物得到化合物lxv,产率为62%。
中间产物实施例61-化合物lxvi
在惰性气氛下,将DMP试剂(605mg,1.43mmol)加到在无水DCM(15mL)中的化合物lxv(287mg,0.42mmol)的溶液。在大约室温下将反应物搅拌2小时。(注意.-假设双倍量的DMP试剂和反应时间使醇基团完全氧化成相应的酮基团)。TLC(硅胶:2% MeOH/EtOAc)检查表明完全转化成移动较快的产物。用DCM(150mL)稀释反应物,然后用10%亚硫酸钠水溶液(2×50mL)洗涤两次,用饱和NaHCO
3水溶液洗涤两次,并用盐水洗涤。分离有机层,用MgSO
4干燥并在减压下除去溶剂。通过色谱法(硅胶:50% EtOAC/DCM至80∶19∶1 EtOAC/DCM/MeOH)纯化残余物以77%产率得到化合物lxvi。
中间产物实施例62-化合物lxvii
将PyBOP(7.5g,14.4mmol)加到L-3-苯基乳酸(2g,12mmol)的DCM溶液(60ml)。将包含L-缬氨酸甲酯HCl(2.4g,14.4mmol)和DIPEA(2.6mL,14.4mmol)的DCM溶液(20mL)加到此溶液。在大约室温下将所得的反应混合物搅拌过夜。此时,用EtOAC(30mL)稀释反应物,用NaHCO3(30mL)和盐水(15mL)洗涤。用Na2SO4干燥有机层,过滤并浓缩。用50% EtOAc/己烷在硅胶上完成纯化得到2.97g(89%)化合物lxvii,中间产物实施例63-化合物lxviii
将化合物lxvii(2.97g,10.6mmol)置于DCM(50mL),并在冰浴中冷却。将TBSCl(2.1g,13.8mmol)加到此溶液,然后加入咪唑(0.94g,13.8mmol)。将所得的溶液搅拌过夜。然后用EtOAC(50mL)稀释反应物,用NaHCO3和盐水洗涤。用Na2SO4干燥有机层,过滤并浓缩。用20% EtOAc/己烷在硅胶上完成纯化得到3.79g(90%)化合物lxviii,中间产物实施例64-化合物lxix
将1N NaOH水溶液(14.4ml,14.4mmol)加到化合物lxviii(3.78g,9.6mmol)的甲醇(50ml)溶液。将所得的溶液搅拌过夜。真空下部分除去溶剂。然后使用1N HCl水溶液将反应混合物的pH降低到3。用EtOAc和盐水稀释此溶液。用EtOAC(3×50ml)萃取目标产物。合并有机层,用Na
2SO
4干燥,过滤并浓缩得到3.5g(96%)化合物lxix,
中间产物实施例65-化合物lxx
将HOAt(0.44g,3.2mmol)加到包含化合物lxix(1.1g,2.9mmol)的DCM(15mL)溶液,然后加入在DCM中的1M DCC(3.2ml,3.2mmol)溶液。在大约室温下搅拌20分钟后,加入化合物xxxix(970mg,3.2mmol)的DCM(15mL)溶液。N2下将反应物搅拌过夜。然后用EtOAC(30mL)稀释反应物,通过硅胶垫过滤,用0.1N HCl、NaHCO3和盐水洗涤。用Na2SO4干燥有机层,过滤并真空浓缩。用50% EtOAc/己烷在硅胶上完成纯化得到1.5g(77%)化合物lxx,中间产物实施例66-化合物lxxi
将1N NaOH水溶液(3.6ml,3.6mmol)加到化合物xx(1.5g,2.4mmol)的甲醇溶液(30mL)。将所得的溶液搅拌过夜。此时,部分除去溶剂,并使用1N HCl水溶液将反应混合物的pH调节至3。然后用EtOAC(50mL)和盐水(20mL)稀释反应物。用EtOAC(50mL)和盐水(20mL)稀释反应物。用EtOAC(3×50mL)萃取含水层。合并有机层,用Na
2SO
4干燥,过滤并浓缩得到1.3g(92%)化合物lxxi,
中间产物实施例67-化合物lxxii
将PyBOP(175mg,0.34mmol)和DIPEA(0.06ml,0.34mmol)加到包含化合物lxxi(180mg,0.28mmol)的DCM(2mL)溶液,然后加入化合物x(150mg,0.41mmol)的DCM溶液(3mL)。在N2下将所得的溶液搅拌过夜。然后用EtOAC(30mL)稀释反应物,用NaHCO3和盐水洗涤。用Na2SO4干燥有机层,过滤并浓缩。用100% EtOAc在硅胶上完成纯化得到270mg(98%)化合物lxxii,中间产物实施例68-化合物lxxiii
将DMP试剂(140mg,0.33mmol)加到化合物lxxii(270mg,0.27mmol)的DCM(3mL)溶液。在大约室温下搅拌1.5小时后,用10% Na2SO3(10mL)中止反应。用EtOAC(30mL)稀释反应物并搅拌10分钟。用NaHCO3和盐水洗涤有机层。用Na2SO4干燥有机层,过滤并浓缩。用EtOAc/己烷完成纯化得到150mg(56%)化合物lxxiii,中间产物实施例69-化合物lxi
在氮气流下将Pd(OH)2/C(1.47g,20% Pd含量,2.1mmol)加到化合物ii(3.5g,10.5mmol)的乙醇溶液(50mL)。在1atm压力下对反应物进行氢化。反应完成时,通过硅藻土垫过滤催化剂,并用二氯甲烷洗涤。真空浓缩滤液得到2g(96%)化合物lxi。中间产物实施例70-化合物lxxiv
将HOAt(4g,29.4mmol)和1,3-二异丙基碳化二亚胺(3.7g,29.4mmol)加到化合物vii(9.1g,28.2mmol)的DMF溶液(60mL)。在大约室温下搅拌30分钟后,将化合物lxi(5.1g,25.6mmol)的DMF溶液(10mL)加到上述溶液。在大约室温下将反应物搅拌过夜。此时,滤出白色固体。真空过滤滤液得到一种残余物,通过硅胶色谱法纯化得到9.5g(67%)化合物lxxiv,
中间产物实施例71-化合物lxxv
在大约室温下将EtiPr
2N(0.78ml,4.5mmol)加到在无水THF(25mL)中的化合物lxxiv(1.5g,3mmol)的溶液。将混合物冷却至0℃并滴加MOMCl(1.5ml,19.7mmol)。将反应物加热至室温并搅拌过夜。然后用乙醚稀释溶液,并用水洗涤(3次)。进一步用乙醚萃取含水层,用MgSO
4干燥所有有机层,然后浓缩得到一种黄色油。通过硅胶色谱法(EtOAc/己烷5/2)分离化合物lxxv的所希望的异构体,
产率为40%并清楚地分离非对映异构体。中间产物实施例72-化合物lxxvi
0℃下将2N NaOH水溶液(0.9ml,1.8mmol)滴加到在EtOH(5mL)中的化合物lxxv(502mg,0.9mmol)的溶液。将反应物加热到室温并搅拌过夜。在完成皂化时,用Dowex 50W8X-200酸性树脂将溶液酸化至pH3。滤出固体并真空浓缩所得的滤液得到一种油状残余物,将其冻干得到370mg(80%)化合物lxxvi,
中间产物实施例73-化合物lxxvii
用PyBOP(200mg,0.38mmol)处理化合物lxxvi(110mg,0.21mmol)的二氯甲烷溶液(4mL)。在大约室温下搅拌30分钟后,往反应混合物中加入化合物xiii(60mg,0.32mmol)的THF溶液(3.2mL),然后加入EtiPr2N。在大约室温下搅拌过夜后,用水中止反应并用EtOAc萃取。用盐水洗涤所得的有机层并用MgSO4干燥,然后浓缩得到一种油。通过硅胶色谱法(5% EtOH/EtOAc)纯化得到143mg(100%)化合物lxxvii,中间产物实施例74-化合物lxxviii
将HOBt(2.63g,19.4mmol)和EDCI(3.72g,19.4mmol)加到H-Chg-OH2(5g,19.4mmol)的THF溶液(50mL)。在大约室温下搅拌20分钟后,将包含叔-L-亮氨酸甲酯-盐酸盐(19.4mmol)和DIPEA(6.75ml,38.8mmol)的THF(19mL)和DMF(10mL)溶液加到以上溶液。在大约室温下将反应物搅拌过夜。进行标准水处理和硅胶色谱处理(15-20% EtOAc/己烷)得到2.27g(30%)化合物lxxviii,
中间产物实施例75-化合物lxxix
将在二噁烷(7.38mL,29.5mmol)中的4N HCl溶液加到化合物lxxviii(2.27g,5.91mmol)的THF溶液(12mL)。在大约室温下将反应物搅拌过夜。此时,在减压下除去溶剂得到化合物lxxix,将此化合物直接用于下一反应。中间产物实施例76-化合物lxxx
将化合物lxxix(5.9mmol)的THF溶液加到包含2-吡嗪甲酸(878mg,7.08mmol)、HOBt(957mg,7.08mmol)和EDCI(1.36g,7.08mmol)的THF(20mL)溶液。然后将DIPEA(2.05ml,11.8mmol)加到所得的混合物。在大约室温下将反应物搅拌过夜,然后用水中止反应。用EtOAc萃取反应混合物。用盐水洗涤有机层并真空浓缩得到一种残余物,通过硅胶色谱法(40-50% EtOAc/己烷)纯化得到1g(36%)化合物lxxx,中间产物实施例77-化合物lxxxi
将2N NaOH(3.2ml,6.4mmol)加到化合物lxxx(1g,2.56mmol)的甲醇溶液(20mL)。在大约室温下将反应物搅拌过夜。此时,用5N HCl将反应物酸化至pH3。用EtOAC(75mL)稀释反应物,并用水和盐水洗涤。干燥如此得到的有机层并真空浓缩得到一种残余物,将此残余物溶于1∶1 CH
3CN/H
2O用于冻干。获得总共~1g(100%)化合物lxxxi。
中间产物实施例78-化合物lxxxii
用HOAt(348mg,2.56mmol)和DCC(2.56ml,1M,2.56mmol)处理化合物lxxxi(2.56mmol)的二氯甲烷溶液(10mL)。搅拌30分钟后,用化合物v(2.56mmol)的THF溶液(5mL)处理反应混合物。在大约室温下搅拌过夜后,过滤除去白色固体(尿素)。将滤液真空浓缩得到一种残余物,通过硅胶色谱法纯化此残余物得到1.4g(100%)化合物lxxxii,中间产物实施例79-化合物lxxxiii
用2N NaOH(2.58ml,5.17mmol)处理化合物lxxxii(1.4g,2.58mmol)的乙醇溶液(15mL)。在大约室温下搅拌过夜后,用酸性树脂将反应混合物酸化至pH3。滤出固体。真空浓缩所得的滤液得到一种残余物,将此残余物冻干得到1.32g(~100%)化合物lxxxiii,
中间产物实施例80-化合物lxxxiv
用PyBOP(582mg,1.12mmol)处理化合物lxxxiii(360mg,0.7mmol)的二氯甲烷溶液(15mL)。在大约室温下搅拌20分钟后,用化合物xiii(195.6mg,1.05mmol)的THF溶液(10mL)处理反应混合物,然后用DIPEA(0.25ml,1.40mmol)处理。在大约室温下搅拌过夜后,用水中止反应,并用EtOAc萃取。用盐水洗涤所得的有机层,干燥并真空浓缩得到一种残余物,用硅胶色谱法(3% EtOH/EtOAc)纯化此残余物得到420mg(88%)化合物lxxxiv,
中间产物实施例81-化合物ii
在N2(g)气氛下将无水二氯甲烷和醚(20mL∶20mL)的混合物冷却至-78℃。将TiCl4(1M,二氯甲烷溶液,10ml,10mmol)加到此溶液,然后加入MeLi(1.4M醚溶液,7.1ml,10mmol),同时在-78℃下再搅拌30分钟。在相同的温度下在15分钟内将在10mL二氯甲烷中的化合物i(2g,6mmol)的溶液滴加到此混合物中。将此溶液缓慢加热到-40℃,保持10分钟,然后在0℃下搅拌2小时。通过将混合物倾入水/醚混合物(1∶1)而中止反应,然后分离各层。进一步用醚萃取水层两次。用水、盐水洗涤所有有机层,并用MgSO4干燥,然后浓缩得到一种黄色油。通过硅胶色谱法(EtOAc/己烷2/1)分离目标化合物ii,产率为83%。中间产物实施例82-化合物lxi′
将担载于C上的10wt%Pd(0.53g,0.5mmol)加到化合物ii(1.7g,5mmol),然后加入MeOH(17mL)。使氢气冲洗通过反应混合物,并将氢气在1atm下保持过夜。然后过滤反应混合物,并浓缩得到929mg(87%)化合物lxi′,为一种无色油。
中间产物实施例83-化合物lxxxv
在大约室温下将HOAt(0.41g,3mmol)加到化合物xxii(1g,3mmol)的THF溶液(16mL),然后加入1M DCC的二氯甲烷溶液(3ml,3mmol)。在大约室温下搅拌30分钟后,将化合物1xi′的二氯甲烷溶液(6mL)加到以上HOAt活化的酸。在大约室温下将反应物搅拌过夜。此时,通过硅藻土过滤反应物。用EtOAC(120mL)稀释滤液,用水洗涤,然后用盐水洗涤。干燥有机层并浓缩至一种黄色油,通过硅胶色谱法(100% EtOAc)纯化此油得到1g(65%)化合物lxxxv,
中间产物实施例84-化合物lxxxvi
将2N NaOH水溶液(1.7ml,3.4mmol)加到化合物lxxxv(920mg,1.7mmol)的乙醇溶液(8mL)。在大约室温下将反应物搅拌过夜,然后通过Dowes酸性树脂酸化至pH3。滤出固体并将滤液浓缩得到一种无色的油,将此油再溶于1∶1 CH
3CN/H
2O,并冻干得到800mg(93%)化合物lxxxvi。HPLC表明一种单一产物峰。
中间产物实施例85-化合物lxxxvii
将PyBOP(250mg,0.47mmol)加到化合物lxxxvi(150mg,0.3mmol)的二氯甲烷溶液(4mL)。在大约室温下将溶液搅拌30分钟。将化合物xiii(84mg,0.45mmol)的THF(4.5mL)溶液加到此溶液,然后加入EtiPr
2N(0.1ml,0.6mmol)。将反应物在大约室温下搅拌过夜,然后用水(25mL)中止反应30分钟。随后用EtOAc萃取混合物。用盐水洗涤所得的有机层,并用MgSO
4干燥,然后浓缩至一种黄色的油。硅胶色谱法(5% EtOH/EtOAc)纯化得到200mg(100%)化合物lxxxvii,
中间产物实施例86-化合物lxxxix
将化合物lxxxviii,N-Cbz-L-缬氨酸(2.5g,9.9mmol)置于THF(30mL)。
加入EDCI(2.29g,11.9mmol)和HOBT(1.62g,11.9mmol),并将混合物搅拌5分钟。加入在THF(23.9mL)中的L-叔-亮氨酸甲酯盐酸盐(2.17g,11.9mmol),然后加入DIPEA(2.1mL)。在氮下将反应混合物搅拌过夜。用乙酸乙酯稀释反应混合物,用1N HCl、饱和碳酸氢钠和盐水洗涤。用硫酸钠干燥有机相,过滤并浓缩。用25%乙酸乙酯/己烷纯化浓缩残余物得到1.1g(29%)化合物lxxxix,
中间产物实施例87-化合物lxxxx
在标准条件下,使用甲醇(0.3M)和1N NaOH(1.5eq)将化合物Lxxxix水解得到1.03g(95%)化合物lxxxx,中间产物实施例88-化合物lxxxxi
将化合物lxxxx(385mg,1.06mmol)置于二氯甲烷(3mL)。加入DCC(1.4mmol),然后加入HOAt(190mg,1.4mmol)。随后加入在二氯甲烷(3mL)中的化合物v(260mg,1.4mmol)。将所得的混合物在氮气氛下搅拌过夜。用乙酸乙酯稀释反应物,通过硅胶过滤并浓缩。用50%乙酸乙酯/己烷纯化残余物得到440mg(80%)化合物lxxxxi,
中间产物实施例89-化合物lxxxxii
在标准条件下使用乙醇(0.3M)和1N NaOH(1.5eq)将化合物lxxxxi水解得到390mg化合物lxxxxii,
中间产物实施例90-化合物lxxxxiii
将化合物lxxxxii(350mg,0.7mmol)置于二氯甲烷(3mL)。加入PyBOP(480mg,0.91mmol),然后加入化合物xiii(170mg,0.91mmol)。加入DIPEA(0.16ml,0.91mmol)并将混合物搅拌过夜。浓缩反应混合物并用100%乙酸乙酯纯化得到420mg(90%)化合物lxxxxiii,
中间产物实施例91-化合物lxxxxiv
在氢气氛下使用在甲醇中的10%Pd/C(1%mol)将化合物lxxxxiii氢化得到335mg(100%)化合物lxxxxiv,
中间产物实施例92-化合物lxxxxv
将1H-四唑-5-乙酸乙酯(5g,32mmol)置于氯仿(80mL)。加入三氯乙酸(12.03g,73.65mmol),然后加入α-甲基苯乙烯(3.78g,32mmol)。将反应混合物搅拌过夜。第二天,用乙酸乙酯稀释此溶液,用10% KOH和盐水洗涤。用硫酸镁干燥有机相,过滤并浓缩得到8g(96%)相应的N-保护的四唑-5-乙酸乙酯。使用乙醇(0.3M)和1N NaOH(3eq)给此物质实施标准水解条件得到7g(99%)化合物lxxxxv,
中间产物实施例93-化合物lxxxxvi
将化合物lxxxxv(3.62g,14.7mmol)置于二氯甲烷(50mL)。加入EDCI(4.32g,22.1mmol)和DIPEA(5.1ml,29.4mmol),并搅拌5分钟。加入N-羟基琥珀酰亚胺(3.38g,29.4mmol)并搅拌3小时。用二氯甲烷稀释反应物,并用水洗涤三次。用硫酸镁干燥有机层,过滤并浓缩得到3.66g(73%)化合物lxxxxvi,中间产物实施例94-化合物lxxxxvii
将化合物lxxxxiv(335mg,0.62mmol)和化合物lxxxxvi(343mg,1mmol)置于二氯甲烷(6mL)。加入DIPEA(0.17ml,1mmol)并将反应混合物搅拌过夜。用乙酸乙酯稀释反应物,用饱和碳酸氢钠、盐水洗涤并浓缩。用5%乙醇/乙酸乙酯纯化残余物得到80mg(16%)化合物lxxxxvii,中间产物实施例95-化合物lxxxxviii
将化合物lxxxxvii(80mg,0.11mmol)置于二氯甲烷(3mL)。加入DMP试剂(55mg,0.13mmol)并搅拌1小时。用乙酸乙酯稀释反应混合物并用10%亚硫酸钠溶液中止反应。用饱和碳酸氢钠和盐水洗涤有机相。将有机相浓缩并用100%乙酸乙酯将所得的残余物纯化得到40mg(48%)化合物Ixxxxviii,
中间产物实施例96-化合物xxxix
将化合物ic,N-Cbz-4-羟基Pro甲酯,
(2.1g,7.9mmoL,以定量产率由化合物c,N-Cbz-4-羟基Pro制备)
溶于DCM(25mL)。将CDI(1.54g,9.5mmol)和DI PEA(1.7ml,9.5mmol)加到此溶液,并搅拌10分钟。将1,2,3,4-四氢异喹啉(TIQ)(1.2ml,9.5mmol)滴加到反应混合物并搅拌5分钟。用水、1N HCl和盐水洗涤有机相。在浓缩三种有机相后,用40% EtOAc/己烷将所得的残余物色谱纯化得到化合物ci,N-Cbz-4-TIQ羰氧基-Pro甲酯,(2.5g,75%)。
将化合物ci(2.5g,5.9mmol)溶于MeOH(75mL)。用N2冲洗此溶液并加入Pd/C(10%,300mg)。用H2冲洗反应混合物并搅拌过夜。通过硅藻土过滤反应混合物并浓缩得到化合物xxxix,4-(TIQ-羰氧基)-Pro,甲酯,(1.49g,83%)。中间产物实施例97-化合物vii
将化合物cii,N-吡嗪-2-基羰基-Val-Val甲酯,(10.9g,32.4mmol)
溶于THF(80mL),然后加入NaOH水溶液(48.6ml,48.6mmol)。将所得的混合物搅拌48小时,然后再加入NaOH(16.3ml,16.3mmol),并将混合物加热到40℃,持续3小时。随后将反应混合物的pH降至3,并用EtOAc萃取水相,然后浓缩得到化合物vii粗产物,N-吡嗪-2-基羰基-Val-Val酸(10.6g,100%)。中间产物实施例98-化合物ciii
将化合物cii(4.1g,12.7mmol)溶于DCM(20mL)。将HOAt(1.73g,12.7mmol)和DCC(12.7mmol)加到此溶液,并将溶液搅拌1小时。将在DCM(10mL)中的化合物xxxix(3.22g,10.6mmol)加到反应混合物。在N
2气氛下将所得的混合物搅拌过夜。使反应混合物通过硅胶过滤并浓缩。通过硅胶色谱法(50%至80% EtOAc/己烷梯度)纯化所得的残余物得到化合物ciii,N-吡嗪-2-基羰基-Val-Val-4-(TIQ羰氧基)-Pro甲酯,(5.27g,81.7%)。
中间产物实施例99-化合物civ
将化合物ciii(650mg,1.29mmol)溶于THF(5mL)。加入NaOH水溶液(1.42ml,1.42mmol),然后将溶液搅拌过夜。将此溶液的pH降至3,分离有机层,并浓缩得到一种残余物。使用在乙腈/水中的反相HPLC纯化残余物得到化合物civ,N-吡嗪-2基羰基-Val-Val-4-(TIQ羰氧基)-Pro酸,(600mg,95%)。中间产物实施例100-化合物cv
将N-Boc-L-叔-亮氨酸(2.3g,10mmol)和L-叔-亮氨酸甲酯盐酸盐(2g,11mmol)合并至DMF(30mL)。然后将HOAt(1.6g,11.5mmol)加到此溶液。在N
2下将所得的混合物搅拌20分钟,然后降温至0℃,此时加入DIC(1.8ml,11.5mmol)和2,4,6-三甲基吡啶(1.45ml,11mmol)。将所得的溶液搅拌过夜并加热至室温。用EtOAc稀释反应混合物,并用1N HCl、饱和的NaHCO
3和盐水洗涤有机相。在浓缩有机相之后,用20%-30% EtOAc/己烷梯度色谱纯化所得的残余物得到化合物cv(3.3g,92%)。
中间产物实施例101-化合物cvi
使用二噁烷(40mL)和0.5N NaOH(37ml,18.4mmol)水解化合物cv(3.3g,9.2mmol)得到化合物cvi(2.9g,92%)。中间产物实施例102-化合物cvii
将化合物cvi(2g,5.8mmol)和化合物v(1g,5.5mmol)溶于DMF(20mL)。然后将HOAt(832mg,6.6mmol)和DIC(1.1ml,6.6mmol)加到此溶液。在N
2下将所得的溶液搅拌过夜。用EtOAc稀释反应混合物,用1N HCl、饱和NaHCO
3和盐水洗涤有机相。在浓缩有机相之后,用20%-30% EtOAc/己烷梯度色谱纯化所得的残余物得到化合物cvii(2.4g,81%)。
中间产物实施例103-化合物cviii
将化合物cvii(2.4g,4.72mmol)溶于DCM(10mL)。将TFA(10mL)加到此溶液。将所得的溶液搅拌4小时。浓缩反应混合物,将其溶于EtOAc,然后用1N NaOH和盐水洗涤有机相。将有机相浓缩得到化合物cviii(1.084g,56.1%)。中间产物实施例104-化合物cix
将2-吡嗪甲酸(181mg,1.46mmol)和化合物cviii(541mg,1.325mmol)溶于DMF(15mL)。将HOAt(207mg,1.52mmol)和DIC(0.24ml,1.52mmol)加到此溶液。在N2气氛下将所得的溶液搅拌过夜。用EtOAc稀释反应混合物,用1N HCl、饱和的NaHCO3和盐水洗涤有机相。在浓缩有机相之后,用20%-30%-35% EtOAc/己烷梯度色谱纯化所得的残余物得到化合物cix(430mg,63%)。中间产物实施例105-化合物cx
使用EtOH(7mL)和1N NaOH(4.7mL,4.7mmol)将化合物cix水解得到化合物cx(700mg,91.6%)。
中间产物实施例106-化合物cxi
将化合物cx(690mg,1.42mmol)溶于DCM(9mL)。然后将PyBOP(890mg,1.7mmol)加到此溶液,随后加入化合物xiii′(320mg,1.7mmol)。
将DIPEA(0.3ml,1.7mmol)加到所得的混合物。在N
2气氛下将此反应混合物搅拌过夜。然后用EtOAc稀释反应混合物,用饱和的NaHCO
3和盐水洗涤。在浓缩有机相之后,用100% EtOAc色谱纯化所得的残余物得到化合物cxi(490mg,52.7%)。
中间产物实施例107-化合物cxiv
将化合物cxii(1.2g,3.06mmol)溶于MeOH(12mL)。
在用N
2完全冲洗之后,加入10wt%担载在炭上的Pd(OH)
2(0.6g),将混合物氢化过夜,此时TLC表明形成完全反应混合物。通过过滤从固体物质中分离此溶液,并浓缩得到相应的去保护的化合物cxiii,为一种无色的油(100%)
此物质不经进一步纯化用于下一步骤。
将2-吡嗪甲酸(400mg,3.2mmol,1.1eq)溶于DCM/THF(4mL/4mL),然后加入HOAt(440mg,3.2mmol)和DCC(343ml,1M的DCM)。室温下搅拌20分钟后,将先前获得的化合物cxiii(0.96g,3.2mmol)溶于DCM(6.4mL),并加到活化的混合物。在室温下搅拌过夜后,通过硅藻土过滤反应混合物,通过柱色谱法(30% EtOAc/己烷)纯化化合物cxiv
得到一种白色固体(0.8g,80%)。中间产物实施例108-化合物cxv
将化合物cxiv(0.8g,2.2mmol)溶于MeOH(10mL),然后加入2N NaOH(水溶液)(3.3ml,6.6mmol)。室温下将此溶液搅拌过夜,此时由TLC(50% EtOAc/己烷)表明形成完全反应混合物。用5N HCl酸化至pH3,并用EtOAc稀释,然后萃取有机层。用盐水洗涤萃取的有机层,用MgSO4干燥,浓缩得到化合物cxv(0.74,95%)。中间产物实施例109-化合物cxvi
室温下将HOAt(290mg,2.1mmol)加到化合物cxv(0.74g,2.1mmol)的DCM溶液(6mL),然后加入在DCM(2.2ml,2.2mmol)中的1M DCC溶液。室温下搅拌30分钟后,将化合物v(2.1mmol)的THF溶液(10.5ml,0.2M)加到上述HOAt-活化的酸。室温下将反应混合物搅拌过夜。此时,通过硅藻土过滤反应混合物。用EtOAc(120mL)稀释滤液并用水和盐水洗涤。将有机相干燥并浓缩得到一种黄色的油,将此通过硅胶色谱法(50% EtOAc/己烷)纯化得到化合物cxvi(0.714g,66%)。
中间产物实施例110-化合物cxvii
将2N NaOH水溶液(2ml,4mmol)加到化合物cxvi(0.7g,1.4mmol)的EtOH溶液。室温下将此混合物搅拌过夜,然后用5N HCl酸化至pH3,用EtOAc稀释,然后萃取有机相。用盐水洗涤萃取的有机相,用MgSO4干燥,浓缩得到化合物cxvii(95%)。中间产物实施例111-化合物cxviii
将PyBOP(416mg,0.8mmol)加到化合物cvii(300mg,0.6mmol)的DCM/THF溶液(10mL/2mL)。室温下将此溶液搅拌30分钟。将化合物xxxvi′(200mg,0.8mmol)加到此溶液,
然后加入DIPEA(0.22ml,1.2mmol)。室温下将反应混合物搅拌过夜,然后用水(25mL)中止反应30分钟。随后用EtOAc萃取混合物。用盐水洗涤所得的有机相,用MgSO
4干燥,然后浓缩得到一种黄色的油。硅胶色谱法(3-5% EtOH/EtOAc)纯化得到化合物cxviii(335mg,76%)。
中间产物实施例112-化合物cxix
将PyBOP(470mg,0.9mmol)加到化合物cxvii(340mg,0.6mmol)的DCM溶液(10mL)。室温下将此溶液搅拌30分钟。然后将化合物xiii′(170mg,0.9mmol)加到此溶液,随后加入DIPEA(0.24ml,1.2mmol)。室温下将反应混合物搅拌过夜,然后用水(25mL)中止反应30分钟。然后用EtOAc萃取混合物。用盐水洗涤所得的有机相,用MgSO4干燥,然后浓缩得到一种黄色的油。硅胶色谱法(3-5%EtOH/EtOAc)纯化得到化合物cxix(164mg,36%)。中间产物实施例113-化合物xx
将N-Cbz-L-缬氨酸(6.28g,25mmol)溶于DCM(30mL)。将HOBT(3.38g,25mmol)和DCC(25ml,1M溶液)加到此溶液并搅拌5分钟。加入L-叔-亮氨酸甲酯盐酸盐(25ml,1M溶液),并在N2气氛下搅拌过夜。用EtOAc稀释反应混合物,用1N HCl、饱和NaHCO3和盐水洗涤。用Na2SO4干燥有机相,过滤并浓缩。通过20%-30% EtOAc/己烷将残余物色谱纯化得到化合物xx(2.96g,31%)。中间产物实施例114-化合物xxi
在H2气氛下使用在MeOH(40mL)中的10% Pd/C(800mg)将化合物xx(2.95g,7.8mmol)氢化得到以下相应的游离胺(1.9g,100%)。
将2-吡嗪-甲酸(970mg,7.8mmol)溶于DCM(20mL)。将PyBOP(4.06g,7.8mmol)加到此溶液。将在DCM(15mL)中的游离胺(1.9g,7.8mmol)加到此溶液,然后加入DIPEA(1.36ml,7.8mmol)。在N
2气氛下将所得的混合物搅拌过夜。用EtOAc稀释反应混合物,用饱和NaHCO
3和盐水洗涤有机相。在浓缩有机相之后,用30%-40% EtOAc/己烷将残余物色谱纯化得到化合物xxi(2.07g,75.8%)。
中间产物实施例115-化合物xxii
使用MeOH(20mL)和1N NaOH(3eq)将化合物xxi水解得到化合物xxii(1.82g,93.9%)。
中间产物实施例116-化合物xxiii
将化合物xxii(895mg,2.66mmol)溶于DCM(10mL)。将DCC(3.2mmol)加到此溶液,然后加入HOAt(435mg,3.2mmol)。随后加入在THF(16mL)中的化合物v(3.2mmol)。在N2气氛分下将所得的混合物搅拌过夜。用EtOAc稀释反应混合物,通过硅胶过滤,并浓缩。用50% EtOAc/己烷将所得的残余物色谱纯化得到化合物xxiii(730mg,54.8%)。中间产物实施例117-化合物xxiv
使用EtOH(5mL)和1N NaOH(1.5eq)将化合物xxiii水解得到化合物xxiv(690mg,100%)。中间产物实施例118-化合物cxx
将化合物xxiv(245mg,0.52mmol)溶于DCM(3mL)。将PyBOP(330mg,0.62mmol)加到此溶液,然后加入化合物xiii′(120mg,0.62mmol)。将DIPEA(0.11mL,0.62mmol)加到所得的混合物。在N
2气氛下将反应混合物搅拌过夜。用EtOAc稀释反应混合物,用饱和的NaHCO
3和盐水洗涤有机相。在浓缩有机相之后,用5% EtOH/EtOAc将残余物色谱纯化得到化合物cxx(220mg,60%)。
中间产物实施例119-化合物xiii′
将Boc-NVA-OH(24.96g,114.9mmol)溶于THF(200mL)。
将CDI(22.35,137.8mmol)滴加到此溶液,并将此溶液搅拌30分钟。将N,O-二甲基羟基胺盐酸盐(12.33g,126.4mmol)溶于DMF(50mL),然后将DIPEA(22ml,126.4mmol)加到此溶液。室温下将DMF溶液搅拌20分钟,然后将其加至THF溶液。在N
2气氛下将所得的混合物搅拌一个周末。真空浓缩反应混合物至100mL总体积。用1N HCl、饱和NaHCO
3和盐水洗涤有机相。将有机相浓缩得到化合物cxxi粗产物(25.3g)。
N
2气氛下将在1M Et
2O溶液中的LAH(107.3mmol)加到干燥的1-L圆底烧瓶。将溶液降温至0℃,然后滴加在Et
2O(100mL)中的化合物cxxi(97.5mmol)。完成加入时,将所得的混合物搅拌30分钟。0℃下通过缓慢加入EtOAC(50mL),然后缓慢加入5% KHSO
4(50mL)溶液中止反应。将此混合物搅拌30分钟。用1N HCl、饱和NaHCO
3和盐水洗涤有机相。将有机相浓缩得到化合物cxxii粗产物(22.28g)。
将化合物cxxii溶于MeOH(100mL)。将Na
2S
2O
4(16.82g,96.6mmol)溶于水(100mL),然后在0℃下加到化合物cxxii的溶液。在电冰箱中将此混合物保存(5℃)过夜。将在水(100mL)中的KCN(7.53g,115.9mmol)加到反应混合物并在室温下搅拌1.5小时。用EtOAC(3×100mL)萃取化合物。用盐水(3×50mL)洗涤有机相,用MgSO
4干燥,过滤并浓缩得到化合物cxxiii粗产物(15.86g)。
将化合物cxxiii(15.86g)溶于二噁烷(100mL)。将浓HCl(37%,100mL)加到此溶液,然后加入茴香醚(10mL)并进行回流(110℃)。将反应物搅拌1.5小时。当将反应混合物冷却至室温时,真空下除去溶剂得到一种干燥的糊状物。在高度真空下将残余物干燥得到化合物cxxiv粗产物。
将化合物cxxiv(69.6mmol)溶于DMF(60mL)和THF(60mL)。将N-(苄基-氧羰氧基)琥珀酰亚胺(17.33g,69.6mmol)加到混合物,然后加入DIPEA(12.1ml,69.6mmol)。在N2气氛下将反应混合物搅拌过夜。将混合物浓缩至减少的体积(50mL)并用EtOAc稀释。用0.1N HCl(2×100mL)和盐水洗涤有机相得到化合物cxxv(17.5g,54.2%,经5步)。
将化合物cxxv(5.66g,20.14mmol)溶于DCM(60mL)。将PyBOP(12.57g,24.2mmol)和HOBT(3.27g,24.2mmol)加到此溶液并搅拌5分钟。将所得的混合物降温至0℃,然后加入环丙基胺(1.67ml,24.2mmol)和DIPEA(4.2ml,24.2mmol)。将反应混合物搅拌过夜,并温热至室温。用0.1N HCl、饱和NaHCO3和盐水洗涤反应混合物。然后浓缩有机相并用70% EtOAc/己烷色谱纯化得到化合物cxxvi(3.18g,49.3%)。
使用在MeOH(70mL)中的10% Pd/C(600mg)氢化化合物cxxvi(3.18g,9.94mmol)。在H
2下将反应混合物搅拌过夜,通过硅藻土过滤,并浓缩得到化合物xiii′粗产物(2.1g,100%)。
中间产物实施例120-化合物cxxvii
将N-Cbz-L-环己基甘氨酸(3g,10.3mmol)溶于DCM(36mL)。将HOAt(1.5g,11.28mmol)和DCC(11.28ml,11.28mmol)加到此溶液,并搅拌5分钟。将L-叔-亮氨酸甲酯盐酸盐(103ml,1M溶液,10.3mmol)加到此混合物并在N2下搅拌过夜。通过硅藻土过滤反应混合物,用EtOAc冲洗并浓缩成一种残余物,使用20%-30% EtOAc/己烷将残余物色谱纯化得到化合物cxxvii(2.2g,52%)。中间产物实施例121-化合物lxxix′
在H2下使用在MeOH(15mL)中的20% Pd(OH)2/C(1g)氢化化合物cxxvii(2.2g,5.2mmol)得到化合物lxxix′(1.4g,98%)。中间产物实施例122-化合物Ixxx
将2-吡嗪甲酸(360mg,2.9mmol)溶于DCM(10mL)。将PyBOP(1.81g,3.5mmol)加到此溶液。然后将在THF(10mL)中的化合物lxxix′(825mg,2.9mmol)加到此溶液,随后加入DIPEA(0.5ml,2.9mmol)。在N2气氛下将所得的混合物搅拌过夜。用EtOAc稀释反应混合物,用饱和NaHCO3和盐水洗涤有机层。用30% EtOAc/己烷将通过浓缩有机层而得到的残余物色谱纯化得到化合物lxxx(780mg,69%)。中间产物实施例123-化合物lxxxi
使用MeOH(10mL)和1N NaOH(3eq)将化合物lxxx水解得到化合物lxxxi(615mg,81.8%)。中间产物实施例124-化合物lxxxii
将化合物lxxxi(610mg,1.6mmol)溶于DCM(10mL)。然后将DCC(1.94ml,1.94mmol)加到此溶液,随后加入HOAt(270mg,1.94mmol)。将在THF(19.4mL)中的化合物v(1.94mmol)加到此溶液。在N2气氛下将所得的混合物搅拌两夜。用EtOAc稀释反应混合物,通过硅胶过滤,并浓缩。用40% EtOAc/己烷将所得的残余物色谱纯化得到化合物lxxxii(450mg,83.4%)。中间产物实施例125-化合物lxxxiii
使用EtOH(10mL)和1N NaOH(3eq)将化合物lxxxi水解得到化合物lxxxiii(650mg,99%)。中间产物实施例126-化合物cxxviii
将化合物lxxxiii(400mg,0.78mmol)溶于DCM(5mL)。将PyBOP(610mg,1.2mmol)加到此溶液,然后加入化合物xiii′(230mg,1.2mmol)。将DIPEA(0.2ml,1.2mmol)加到所得的混合物。在N
2气氛下将反应物搅拌过夜。用EtOAc稀释反应混合物,用饱和NaHCO
3和盐水洗涤有机相。在浓缩有机相之后,通过100% EtOAc至5% EtOH/EtOAc梯度色谱纯化残余物得到化合物cxxviii(365mg,68.7%)。
中间产物实施例127-化合物cxxx
将化合物lxxxiii(365mg,0.7mmol)溶于DCM(5mL)。将PyBOP(440mg,0.84mmol)加到此溶液,然后加入在THF(8.4mL)中的化合物cxxix(0.84mmol)。
将DIPEA(0.1ml,0.84mmol)加到所得的混合物。在N
2气氛下将反应混合物搅拌过夜。用EtOAc稀释反应混合物,并用NaHCO
3和盐水洗涤有机相。在浓缩有机相之后,通过100% EtOAc色谱纯化所得的残余物得到化合物cxxx(350mg,70%)。
中间产物实施例128-化合物cxxxi
将化合物cxxv(2.54g,9.05mmol)溶于DCM(30mL)。将PyBOP(5.65g,10.9mmol)和HOBT(1.47g,10.9mmol)加到此溶液并搅拌5分钟。将所得的混合物降温到0℃,此时加入(S)-(+)-3-甲基-2-丁基胺(1.27ml,10.9mmol)和DIPEA(1.9ml,10.9mmol)。将反应混合物搅拌过夜,并温热至室温。用0.1N HCl、饱和NaHCO3和盐水洗涤有机相。在浓缩有机相之后,通过30% EtOAc/己烷色谱纯化所得的残余物得到化合物cxxxi(1.44g,45.5%)。中间产物实施例129-化合物cxxix
使用在MeOH(40mL)中的10% Pd/C(500mg)氢化化合物cxxxi(1.3g,3.7mmol)。在H
2气氛下将反应混合物搅拌过夜。通过硅藻土过滤反应混合物并将有机相浓缩得到粗化合物cxxix(800mg,100%)。
中间产物实施例130-化合物cxxxiv
将化合物cxxxii(1.6g,3.7mmol)溶于MeOH(12mL)。
在用N
2完全冲洗后,加入担载在炭上的10wt% Pd(OH)
2(0.74g),并将混合物氢化,此时TLC(30% EtOAc/己烷)表明得到完全反应混合物。通过过滤从固体物质中分离溶液,并浓缩得到化合物cxxxiii,为一种无色油(100%),
将此油不经纯化用于下一步骤。将2-吡嗪甲酸(400mg,3.2mmol,1.1eq)溶于DCM/THF(4mL/4mL),然后加入HOAt(440mg,3.2mmol)和DCC(3.3ml,1M,DCM溶液)。室温下搅拌20分钟后,将先前获得的化合物cxxxiii(0.96g,3.2mmol)溶于DCM(6.4mL),并将其加到活化的混合物。室温下搅拌2天以后,通过硅藻土过滤反应混合物,并浓缩得到一种残余物,通过柱色谱法(50%EtOAc/己烷)纯化残余物得到化合物cxxxiv,为一种白色固体(1.06g,83%)。
中间产物实施例131-化合物cxxxv
将化合物cxxxiv(1.06g,2.6mmol)溶于MeOH(10mL),然后加入2N NaOH(水溶液)(4ml,8mmol)。室温下将溶液搅拌过夜,此时T LC(50% EtOAc/己烷)表明水解完全。用5N HCl将溶液酸化至pH3,用EtOAc稀释,然后萃取有机相。用盐水洗涤萃取的有机相,用MgSO
4干燥浓缩得到化合物cxxxv(100%)。
中间产物实施例132-化合物cxxxvi
室温下将HOAt(500mg,3.7mmol)加到化合物cxxxv(1.44g,3.7mmol)的DCM溶液(8mL),然后加入在DCM(3.7ml,3.7mmol)中的1M DCC溶液。室温下搅拌30分钟后,将化合物v(3.7mmol)的THF溶液(18.5ml,0.2M)加到上述HOAt-活化的酸。室温下将反应混合物搅拌过夜。通过硅藻土过滤反应混合物。用EtOAC(120mL)稀释滤液并用水和盐水洗涤。干燥有机相并浓缩得到黄色油,通过硅胶色谱法(70% EtOAc/己烷)纯化得到化合物cxxxvi(1g,71%)。
中间产物实施例133-化合物cxxxvii
将2N NaOH水溶液(2.7ml,5.4mmol)加到化合物cxxxvi(1g,1.8mmol)的EtOH溶液(8mL)。室温下将反应混合物搅拌过夜,然后用5N HCl酸化至pH3,用EtOAc稀释,然后萃取有机相。用盐水洗涤萃取的有机相,并用MgSO4干燥浓缩得到化合物cxxxvii(88%)。中间产物实施例133-化合物cxxxviii
将PyBOP(450mg,0.86mmol)加到化合物cxxxvii(350mg,0.6mmol)的DCM溶液(10mL)。室温下将溶液搅拌30分钟,将化合物xiii′(160mg,0.86mmol)加入此溶液,然后加入DIPEA(0.23ml,1.3mmol)。室温下将反应混合物搅拌过夜,然后用水(25ml)中止反应30分钟。随后用EtOAc萃取混合物。用盐水洗涤萃取的有机相,用MgSO
4干燥,然后浓缩得到黄色油。通过硅胶色谱法(5% EtOH/EtOAc)纯化得到化合物cxxxviii(407mg,88%)。
中间产物实施例134-化合物cxxxix
5-甲基异噁唑-3-甲酸(200mg,2.05mmol)溶于DCM(5mL)。将PyBOP(1.07g,2.05mmol)加到此溶液。将在DCM(5mL)中的化合物lxxix′(582mg,2.05mmol)加到此溶液,然后加入DIPEA(0.36ml,2.05mmol)。在N
2气氛下将所得的混合物搅拌过夜。用EtOAc稀释反应混合物,并用饱和NaHCO
3和盐水洗涤有机相。将有机相浓缩,并用30% EtOAc/己烷将所得的残余物色谱纯化得到化合物cxxxix(495mg,61.4%)。
中间产物实施例135-化合物cxxxx
用MeOH(10mL)和1N NaOH(3eq)将化合物cxxxix水解得到化合物cxxxx(430mg,90%)。中间产物实施例136-化合物cxxxxi
将化合物cxxxx(380mg,1mmol)溶于DCM(5mL)。然后将DCC(1.2mmol)加到此溶液,随后加入HOAt(165mg,1.2mmol)。接着加入在THF(12mL)中的化合物v(1.2mmol)。在N2气氛下将所得的混合物搅拌过夜。用EtOAc稀释反应混合物,通过硅胶过滤并浓缩。用35% EtOAc/己烷将所得的残余物色谱纯化得到化合物cxxxxi(320mg,58%)。中间产物实施例137-化合物cxxxxii
使用EtOH(10mL)和1N NaOH(3eq)将化合物cxxxxi水解得到化合物cxxxxii(730mg,94.3%)。中间产物实施例138-化合物cxxxxiii
将化合物cxxxxii(240mg,0.46mmol)溶于DCM(5mL)。然后将PyBOP(295mg,0.56mmol)加到此溶液,接着加入化合物xiii′(110mg,0.56mmol)。将DIPEA(0.1ml,0.56mmol)加到所得的混合物。在N
2气氛下将反应混合物搅拌两夜。用EtOAc稀释反应混合物,用饱和NaHCO
3和盐水洗涤有机相。在浓缩有机相之后,用90% EtOAc/己烷色谱纯化所得的残余物得到化合物cxxxxiii(168mg,53%)。
中间产物实施例139-化合物cxxxxiv
5℃下将L-丙氨酸(5.00g,56.1mmol)加到NaOH溶液(2N,42.1mL,84.2mmol)中。搅拌10分钟,同时滴加氯甲酸甲酯(6.5ml,84.2mmol)和NaOH(2N,42.1ml,84.2mmol)。在冰浴上将溶液搅拌2小时,然后在室温下搅拌1小时。用Et
2O(2×50mL)洗涤混合物,用5NHCl将含水层中和至pH~2,并用EtOAC(3×50mL)萃取。用盐水洗涤萃取的有机相,用MgSO
4干燥并浓缩得到化合物cxxxxiv
N-甲酯基-1-丙氨酸,(4.54g,54%),为一种无色油。中间产物实施例140-化合物cxxxxvi
5℃下用HOAt(1.28g,9.44mmol)处理在THF中的化合物cxxxxv(3.57g,9.44mmol)的溶液,
然后加入DCC(9.50ml,9.50mmol)。在冰浴上搅拌45分钟后,加入在THF中的化合物v的溶液(104ml,10.4mmol)。室温下将混合物搅拌过夜。将混合物冷却至5℃并用饱和NaHCO
3中止反应。过滤除去沉淀的DCU之后,将混合物溶于EtOAC(100mL),用饱和NaHCO
3、盐水洗涤,然后用MgSO
4干燥并浓缩至一种残余物,通过硅胶柱色谱法(25% EtOAc/己烷)纯化残余物得到化合物cxxxxvi(2.91g,57%),为胶质泡沫。
中间产物实施例141-化合物cviii
将Pd/C缓慢加至在N2气流下被冰浴冷却的在MeOH中的化合物cxxxxvi的溶液(25mL)。在1atm下将混合物氢化过夜。过滤除去催化剂,将滤液与5mL DMF合并,并真空干燥得到化合物cviii。中间产物实施例142-化合物cxxxxvii
用DCC(2.05ml,2.05mmol)处理在冰浴中冷却的在THF中的化合物cxxxxiv(0.298g,2.03mmol)和HOAt(0.276g,2.03mmol)的溶液。在冰浴上搅拌0.5小时后,加入在THF中的化合物cviii的溶液,然后加入DIPEA(0.39ml,2.2mmol)。室温下将混合物搅拌过夜,然后用冰浴冷却,用饱和NaHCO3终止。过滤沉淀的DCU,并将滤液溶于EtOAC(100mL)。用饱和NaHCO3、盐水洗涤有机相,然后用MgSO4干燥。在除去有机溶剂之后,通过硅胶柱色谱法(60% EtOAc/己烷)纯化得到化合物cxxxxvii(0.47g,48%),为粘性泡沫。中间产物实施例143-化合物cxxxxviii
5℃下将NaOH(2N,1.31ml,2.62mmol)加到在EtOH(5mL)中的化合物cxxxxvii(0.47g,0.847mmol)的溶液。室温下将混合物搅拌4小时。用HCl(1N)将溶液酸化至pH~2,通过旋转蒸发除去EtOH。用EtOAC(3×30mL)萃取混合物,用盐水洗涤合并的萃取物,然后用MgSO4干燥。除去溶剂,并将残余物真空干燥得到化合物cxxxxviii(0.366g,82%),为胶质泡沫。中间产物实施例144-化合物cil
用冰浴冷却在DCM中的化合物cxxxxviii(0.366g,0.718mmol)的溶液,并用PyBop(0.599g,1.15mmol)处理。室温下搅拌0.5小时后,用冰浴冷却混合物,并用在THF和DIPEA(0.250ml,1.44mmol)中的化合物xiii′(0.200g,1.08mmol)的溶液处理。室温下将混合物搅拌过夜,然后用NH
4Cl溶液中止反应。浓缩溶剂并将混合物溶于EtOAC(100mL)。用饱和NaHCO
3、盐水洗涤有机相,然后用MgSO
4干燥。除去有机溶剂后,通过柱色谱法(5% EtOH/EtOAc)纯化残余物得到化合物cil(0.35g,72%)。
中间产物实施例145-化合物cxxi
将CDI(7.79g,48mmol)加到N-Boc-Nva-OH(化合物1)(8.68g,40mmol)的THF溶液(85mL)。室温下搅拌30分钟后,用含有N,O-二甲基-羟基胺盐酸盐(4.25g,44mmol)和DIPEA(7.66ml,44mmol)的DMF溶液(25mL)处理上述溶液。室温下将反应混合物搅拌过夜。然后真空浓缩反应混合物。用EtOAc(300mL)稀释所得的残余物。依次0.1N HCl(50mL)、饱和NaHCO3(3×50mL)和盐水洗涤此溶液。真空浓缩有机相得到一种残余物,用硅胶色谱法(40% EtOAc/己烷)纯化此残余物得到化合物cxxi(9.38g,94%)。中间产物实施例146-化合物cxxii
将LAH(34.7ml,1M,34.7mmol)(缓慢)加到冷却至0℃的化合物cxxi(9.38g,31.9mmol)的Et2O溶液(50mL)。在LAH加入期间保持反应瓶的温度在5℃以下。加入完成后,向反应中加入EtOAc(20mL)以中止过量的LAH。然后滴加KHSO4水溶液(5%,20mL)以保持温度低于5℃。分离有机相,然后依次用1N HCl(3×30mL)、饱和NaHCO3(3×30mL)和盐水洗涤。浓缩有机相并真空干燥得到化合物cxxii粗产物(5.18g,69%)。中间产物实施例147-化合物cl
回流下将0.2mL EtOC(O)CF
2Br加到Zn(2.75g,42mmol)的THF(25mL)悬浮液。然后缓慢加入化合物cxxii(3.05g,15.0mmol)和EtOC(O)CF
2Br(4.84ml,37.5mmol)的THF溶液(25mL)。在完成两种试剂的加入时,将反应混合物进一步回流30分钟。将反应混合物冷却至室温,用DCM(200mL)稀释。用1N KHSO
4洗涤有机相。浓缩有机相并真空干燥得以一种残余物,通过硅胶色谱法(20% EtOAc/己烷)纯化得到化合物cl(2.78g,57%)。
此制备基本上与Thaisrivongs等.,J.Med.Chem.,29,2080-2087(1986)公开的制备相同。中间产物实施例148-化合物cli
用1N NaOH(12.8ml,12.8mmol)处理化合物cl(2.78g,8.53mmol)的THF溶液(40mL)。室温下搅拌过夜后,真空下部分除去溶剂。用水(50mL)稀释剩余的反应混合物并冻干得到化合物cli粗产物(2.82g,>100%),为它的钠盐。此制备基本上与Thaisrivongs等.,J.Med.Chem.,29,2080-2087(1986)公开的制备相同。中间产物实施例149-化合物clii
用HOBT(436mg,3.23mmol)和DIC(0.328ml,2.09mmol)处理化合物cli粗产物(516mg,1.61mmol)的DCM溶液(10mL)。室温下搅拌30分钟后,用含有甘氨酸苄基酯-TsOH盐(815mg,2.42mmol)和DIPEA(0.422ml,2.42mmol)的DCM溶液(5mL)处理反应混合物。室温下搅拌12小时后,用水中止反应混合物,并用EtOAc萃取。将有机相干燥并真空浓缩,用硅胶色谱法(40% EtOAc/己烷)纯化得到化合物clii(495mg,69%)。
化合物clii的
1H NMR(400MHz,CDCl
3):δ7.29-7.21(m,5H),5.16(bs,2H),4.89(bs,1H),4.20-3.90(m,4H),3.80(bs,1H),1.75-1.42(m,4H),1.38(s,9H),0.87(m,3H)。
从化合物cli粗产物开始,以与关于化合物clii所述的相同方法制备化合物cliii(83%)和cliv(50%)。
化合物cliii的1H NMR(400MHz,CDCl3):δ7.49(bs,1H),7.34-7.24(m,5H),5.13(ABq,J=12.2Hz,J′=23.9Hz,2H),4.88(bd,J=8.8Hz,1H),4.53(m,1H),3.98-3.91(m,2H),3.82(m,1H),1.65-1.20[m,16H,包括1.37(9H)处的单峰],0.86(t,J=7.3Hz,3H)。
化合物cliv的
1H NMR(400MHz,CDCl
3):δ7.60-7.0(m,10H),5.30-5.00(m,2H),5.00-4.75(m,2H),4.15-3.70(m,3H),3.30-3.00(m,2H),1.75-1.20[m,13H,包括1.36(9H)处的单峰],0.86(bs,3H)。
中间产物实施例150-化合物clv
将HOBT(634mg,4.69mmol)和EDCI(781mg,4.07mmol)加到DCM(10mL)和化合物cli粗产物(1g,3.13mmol)的THF(5mL)溶液,然后加入(s)-α-甲基苄基胺(0.604ml,4.69mmol)。室温下将反应混合物搅拌过夜,然后用水中止反应。用EtOAc萃取反应混合物。用盐水洗涤有机相并用Na
2SO
4干燥。真空浓缩有机相得到一种残余物,用硅胶色谱法(20% EtOAc/己烷)纯化此残余物得到化合物clv(459mg,37%)。化合物clv的
1H NMR(400MHz,CDCl
3):δ7.32-7.21(m,6H),5.00(m,1H),4.75(m,1H),3.94(m,2H),3.70(m,1H),1.65-1.15[m,16H,包括1.51处的双峰(J=6.8Hz,3H),1.39处的单峰(9H)],0.82(m,3H)。
中间产物实施例151-化合物clvi
将化合物clv(220mg,0.55mmol)溶于在二噁烷(10mL)中的4N HCl。室温下将反应混合物搅拌2小时,然后真空浓缩得到化合物clvi粗产物(~100%),为它的HCl盐。
根据以上关于制备化合物clvi所述的方法,以几乎定量的产率由化合物cli粗产物制得了化合物clvii、clviii和clix。中间产物实施例152-化合物clx
用PyBOP(120mg,0.23mmol)和DIPEA(0.1ml,0.576mmol)处理化合物vii(96mg,0.144mmol)的HCl盐的DCM溶液(4mL)。室温下搅拌30分钟后,用含化合物clv(0.288mmol)和DIPEA(0.2ml,1.152mmol)的THF溶液(4mL)处理此溶液。室温下将反应混合物搅拌过夜。然后用EtOAC(50mL)稀释反应混合物,随后用NaHCO3和盐水洗涤有机相。真空浓缩有机相,并通过硅胶色谱法(80% EtOAc/己烷)纯化残余物得到化合物clx(113mg,89%)。中间产物实施例153-化合物clxi
用PyBOP(196mg,0.376mmol)将化合物vii(140mg,0.235mmol)的DCM溶液(6mL)处理30分钟。然后将化合物clvii(~0.47mmol)和DIPEA(0.327ml,1.88mmol)的THF溶液(6mL)加到上述溶液。室温下将反应混合物搅拌过夜并用水中止反应(30分钟)。用EtOAC(50mL)萃取反应混合物。用NaHCO3和盐水洗涤有机相。用EtOAC(50mL)萃取回合并的水相。将合并的有机相干燥并真空浓缩。用硅胶色谱法(80-100 EtOAc/己烷)纯化所得的残余物得到化合物clxi(104mg,48%)。中间产物实施例154-化合物clxii
将DMP试剂(193mg,0.456mmol)加到化合物clxi(280mg,0.304mmol)的DCM溶液(10mL)。室温下将反应混合物搅拌3小时,并用10% Na
2SO
3中止反应。用NaHCO
3和盐水洗涤有机相。将所得的有机相干燥并真空浓缩得到一种残余物,用硅胶色谱法(80-100% EtOAc/己烷)纯化得到化合物clxii(271mg,97%)。
中间产物实施例155-化合物clxiii
将化合物lxxxiii(220mg,0.43mmol)置于DCM(5mL)。将PyBOP(270mg,0.51mmol)加到此DCM溶液并搅拌5分钟。将在THF(5.1mL)中的化合物xxxvi′(0.51mmol)滴加到此溶液。将DIPEA(0.09ml,0.51mmol)加到反应混合物,并在N
2气氛下下搅拌过夜。第二天,用EtOAc稀释反应混合物,用饱和NaHCO
3洗涤,用盐水洗涤。用70%至90% EtOAc/己烷梯度纯化得到化合物clxiii(180mg,56%)。
中间产物实施例156-化合物clxiv
将化合物cxxv(2.09g,7.4mmol)置于DCM(20mL)。将PyBOP(4.64g,8.9mmol)和HOBt(1.2g,8.9mmol)加到此溶液并搅拌5分钟。将所得的混合物降温至0℃,其中加入S(-)-α-甲基苄基胺(1.15ml,8.9mmol)和DIPEA(1.55ml,8.9mmol)。将反应物搅拌过夜,并加热至室温。用0.1N HCl、饱和NaHCO
3和盐水洗涤反应混合物。用30% EtOAc/己烷纯化得到化合物clxiv(1.6g,56.3%)。
中间产物实施例157-化合物xxxvi′
用在MeOH(50mL)中的10% Pd/C(300mg)将化合物clxiv(1.48g,3.8mmol)氢化。在H2气氛下将反应混合物搅拌过夜。通过硅藻土过滤反应混合物,并浓缩得到化合物xxxvi′(895mg,94.2%)。中间产物实施例158-化合物clxvi:
将HOAt(1.34g,9.84mmol)和DCC(9.84ml,1M,9.84mmol)加到化合物clxv(2g,8.2mmol)的DCM溶液(15mL)。
室温下搅拌20分钟后,将包含叔-L-亮氨酸甲酯-盐酸盐(9.84mmol)和DIPEA(1.72ml,9.84mmol)的THF溶液(9.84mL)加到上述溶液。然后室温下加入DMAP(1g,8.2mmol)。室温下将反应物搅拌过夜。在标准水处理和硅胶色谱处理(20% EtOAc/己烷)之后,获得化合物clxvi(1.75g,58%)。
中间产物实施例159-化合物clxvii:
将在二噁烷(11.8ml,47.3mmol)中的4N HCl溶液加到化合物clxvi(1.75g,4.73mmol)的THF溶液(35mL)。室温下将反应物搅拌过夜。此时在减压下除去溶剂得到clxvii粗产物(~100%),将其再溶于DMF并直接用于下一反应。中间产物实施例160-化合物clxviii:
将化合物clxvii(811mg,3mmol)的DMF溶液(15mL)加到包含2-吡嗪甲酸(447mg,3.6mmol)、PyBOP(1.87g,3.6mmol)的DCM溶液(15mL)。将DIPEA(0.63ml,3.6mmol)加到所得的混合物。室温下将反应物搅拌过夜,然后用水中止反应。用EtOAc萃取反应混合物。用盐水洗涤有机层并真空干燥得到一种残余物,通过硅胶色谱法(40% EtOAc/己烷)将其纯化得到化合物clxviii(0.93g,82%)。中间产物实施例161-化合物clxix:
将2N NaOH(3.71ml,7.41mmol)加到化合物clxviii(0.93g,2.47mmol)的MeOH溶液(10mL)。室温下将反应物搅拌过夜。然后用1N HCl将反应物酸化至pH3。用EtOAC(75mL)稀释反应物,用水和盐水洗涤。将如此得到的有机层干燥并真空浓缩得到化合物clxix(~100%)。中间产物实施例162-化合物clxx:
用HOAt(436mg,3.21mmol)和DCC(3.2ml,1M,3.2mmol)处理化合物clxix(2.47mmol)的DCM溶液(10mL)。在搅拌30分钟后,用化合物v(499mg,2.72mmol)的THF溶液(13.6mL)处理反应混合物。室温下搅拌过夜后,过滤白色固体(尿素)。真空浓缩滤液得到一种残余物,硅胶色谱法纯化此残余物得到化合物clxx(0.99g,76%)。中间产物实施例163-化合物clxxi:
用2N NaOH(2.81mL,5.63mmol)处理化合物clxx(0.99g,1.88mmol)的EtOH溶液(20mL)。室温下搅拌过夜后,用1N HCl将反应混合物酸化至pH3。用EtOAC(75mL)萃取反应混合物。将有机层干燥并真空浓缩得到化合物clxxi(772mg,82%)。中间产物实施例164-化合物clxxi:
用PyBOP(484mg,0.93mmol)处理化合物clxxi(290mg,0.58mmol)的DCM溶液(10mL)。室温下搅拌20分钟后,用化合物xiii′(140mg,0.75mmol)的THF溶液(7.5mL)处理反应混合物,然后用DIPEA(0.13mL,0.75mmol)处理。室温下搅拌过夜后,用水中止反应并用EtOAc萃取。用盐水洗涤所得的有机层,干燥并真空浓缩。通过硅胶色谱法纯化所得的残余物(5% EtOH/EtOAc)得到化合物clxxii 290mg(75%)。中间产物实施例165-化合物clxxiv:
将化合物lxxxiii(600mg,1.17mmol)置于DCM(4mL)。加入PyBOP(670mg,1.3mmol),搅拌5分钟,并冷却至0℃。将在THF(13mL)中的化合物clxxiii(333mg,1.3mmol)滴加到此溶液。
将DIPEA(0.23ml,1.3mmol)加到反应混合物并将其温热至室温,同时搅拌两夜。第二天,浓缩反应物并用2% EtOH/EtOAc纯化得到化合物clxxiv粗产物(900mg,100%的过量)。
中间产物实施例166-化合物clxxxv:
将化合物cxxv(3.01g,10.7mmol)置于DCM(30mL),并将温度降至-78℃。将PyBOP(6.1g,11.7mmol)和HOBT(1.58g,11.7mmol)加到此溶液,然后加入(S)-(+)-1-环己基乙基胺、化合物clxxv(1.74ml,11.7mmol)和DIPEA(2.1mL,11.7mmol)。将所得的混合物在室温下搅拌过夜。第二天,用EtOAc稀释反应混合物,用0.1N HCl、饱和NaHCO
3和盐水洗涤。用40% EtOAc/己烷将产物纯化得到2g(47.8%)化合物clxxvi。
中间产物实施例167-化合物clxxiii:
使用在MeOH(40mL)中的10% Pd/C(500mg)将化合物clxxvi(2g,5.13mmol)氢化。在H2下将反应混合物搅拌过夜。通过硅藻土过滤反应混合物并浓缩得到化合物clxxiii(1.31g,99.8%)。中间产物实施例168-化合物clxxix:
在圆底烧瓶中,在惰性气氛下,将化合物clxxvii[(S)-(-)-2-氧代-1,5-咪唑啉二甲酸1-苄基酯](290mg,1.1mmol)
溶于无水DMF(6mL)。加入HOAt(151mg,1.2mmol)并在室温下将反应物搅拌25分钟。在冰浴中冷却反应物。然后加入DIC(0.2ml,0.16g,1.2mmol),随后加入在无水DMF(4mL)中的化合物clxxviii(1mmol,435mg.)。将反应物缓慢升温至室温,并搅拌2天。然后将反应物倾入包含120mL EtOAc的分离漏斗,用1N HCl(50mL)洗涤两次并用盐水洗涤一次。分离有机层,用MgSO
4干燥。减压下蒸发溶剂,通过硅胶色谱法(担载在DCM上,用30% EtOAc/DCM洗脱,然后用50%EtOAc/DCM洗脱,然后用2% MeOH/EtOAc洗脱)纯化残余物得到产物clxxix(434mg,64%)。
中间产物实施例169-化合物clxxx:
将原料clxxix(434mg,0.64mmol)溶于二噁烷(6mL)和0.5MNaOH水溶液(4ml,3eq.)。进行反应过夜。用100% EtOAC的TLC(使用PMA染色)表明除了在原始位置的预期的酸产物之外,还有跑得更快的产物。使用1N HCl将反应混合物酸化至pH2,然后用EtOAc萃取两次。将固体NaCl加到水溶液以沉淀萃取物。合并有机萃取物,用MgSO
4干燥并减压蒸发。MS表明通过水解除去了CBZ基团。将所得的化合物clxxx(定量产率)用于下一步骤。
中间产物实施例170-化合物clxxxi:
在圆底烧瓶中,在惰性气氛下,将化合物clxxx(279mg,0.54mmol)溶于无水DMF(6mL)。加入HOAt(82mg,0.65mmol),并在室温下将反应物搅拌25分钟。然后在冰浴上冷却反应。随后加入DIC(0.11ml,0.65mmol),接着加入在无水DMF(4mL)中的化合物xiii′(0.7mmol)。将反应物缓慢升温至室温,并搅拌21小时。然后将反应物倾入包含120mL的EtOAc的分离漏斗,并用1N HCl(50mL)洗涤两次,用盐水洗涤一次。分离有机层,用MgSO
4干燥。减压蒸发溶剂并通过硅胶色谱法净化产物(硅胶担载在DCM上,用50% EtOAc/己烷洗脱,然后用3% MeOH/EtOAc洗脱,然后用20% EtOH/EtOAc洗脱)。除去溶剂后,将残余物再溶于Dri Solv THE,并过滤除去任何硅胶。除去溶剂得到化合物clxxxi(434mg,64%产率)。
中间产物实施例171-化合物clxxxiii:
在圆底烧瓶中,在惰性气氛下,将6-羟基吡啶甲酸(153mg,1.1mmol)
溶于无水DMF(6mL)。加入HOAt(151mg,1.2mmol),然后在室温下将反应物搅拌25分钟。随后在冰浴中冷却反应物。随后加入DIC(0.2ml,0.16g,1.2mmol),接着加入在无水DMF(4mL)中的化合物clxxxii(1.0mmol,435mg.)。
将反应物缓慢升温至室温,并搅拌2天。将反应物倾入包含120ml EtOAc的分离漏斗,用1N HCl(50mL)洗涤两次,并用盐水洗涤一次。分离有机层,用MgSO
4干燥。减压蒸发溶剂,并用硅胶色谱法(硅胶担载于DCM,用30% EtOAc/DCM洗脱,然后用50% EtOAc/DCM洗脱,然后用2% MeOH/EtOAc洗脱)纯化收集得到化合物clxxxiii(314mg,56%)。
中间产物实施例172-化合物clxxxiv:
将原料clxxxiii(314mg,0.56mmo)溶于二噁烷(5mL)和0.5M NaOH(3.4ml,3eq)。进行反应过夜。使用100% EtOAC的TLC(使用UV)表明完全转化在原始位置缓慢跑动的酸产物。用1N HCl将反应物酸化至pH2,然后用EtOAc萃取两次。将固体NaCl加到此水溶液以利于萃取。然后合并原始萃取物,用MgSO
4干燥,然后减压蒸发得到化合物clxxxiv(0.5mmol,89%),将此化合物用于下一步。
中间产物实施例173-化合物clxxxv:
在圆底烧瓶中,在惰性气氛下,将酸性化合物clxxxiv(265mg,0.5mmol)溶于无水DMF(6mL)。加入HOAT(75.6mg,0.6mmol)并在室温下将反应物搅拌25分钟。然后在冰浴中冷却反应物。随后加入DIC(0.1ml,0.6mmol),接着加入在无水DMF(4mL)中的化合物xiii′(0.65mmol)。将反应物缓慢升温至室温,并搅拌21小时。将反应物倾入包含EtOAC(120mL)的分离漏斗,用1N HCl(50mL)洗涤两次,并用盐水洗涤一次。分离有机层,用MgSO4干燥。通过减压蒸发溶剂,并通过硅胶色谱法(硅胶担载于DCM,用50% EtOAc/己烷洗脱,然后用纯EtOAc洗脱,然后用4% MeOH/EtOAc洗脱)纯化产物得到化合物clxxxv(185mg,52%)。中间产物实施例174-化合物cxxxxiv′:
0℃下将在乙醚(30mL)中的MeOC(O)Cl(6.5ml,84.2mmol)溶液加到在1N NaOH(152ml,152mmol)中的D-丙氨酸(5g,56.1mmol)溶液。在冰浴中将混合物搅拌3小时,然后用1N NaOH调节至pH9。在室温下搅拌1小时后,用乙醚(3×50mL)洗涤混合物,用5N HCl酸化至pH~2,用EtOAC(5×50mL)萃取。用水、盐水洗涤有机萃取物,然后干燥(MgSO4)。除去溶剂得到化合物cxxxiv,
N-甲氧羰基-D-丙氨酸,为一种无色油(6.48g,79%)。
中间产物实施例175-化合物clxxxvi:
用DCC(1.31ml,1.31mmol)处理在冰浴中冷却的在DCM(10mL)中的N-甲氧羰基-D-丙氨酸(0.193g,1.31mmol)和HOAt(0.177g,1.31mmol)的溶液。冰浴中搅拌0.5小时后,加入在THF(8.8mL)中的制备的化合物clxxxii(0.88mmol)的溶液。将混合物温热至室温并搅拌过夜,在冰浴中冷却,并用饱和NaHCO3溶液中止反应。过滤沉淀,并将滤液置于EtOAC(100mL)。用饱和NaHCO3溶液、盐水洗涤有机层,然后干燥(MgSO4)。除去溶剂后,通过硅胶色谱法(60% EtOAc/己烷)纯化残余物得到化合物clxxxvi,为胶质泡沫(0.321g,68%)。中间产物实施例176-化合物clxxxvii:
5℃下将2N NaOH(1.05ml,2.1mmol)加到在EtOH(5mL)中的化合物clxxxvi(0.321g,0.597mmol)的溶液。室温下将混合物搅拌4小时。用1N HCl将溶液酸化至pH~2,并通过旋转蒸发除去EtOH。用EtOAC(3×30mL)萃取混合物,用盐水洗涤合并的萃取物,然后干燥(MgSO
4)。除去溶剂,并真空干燥残余物得到化合物clxxxvii,为胶质泡沫(0.235g,77%)。
中间产物实施例177-化合物clxxxviii:
在冰浴中冷却在DCM(10mL)中的化合物clxxxvii(0.363g,0.712mmol)的溶液,并用PyBOP(0.594g,1.14mmol)处理。室温下搅拌0.5小时后,在冰浴中冷却混合物,用在THE(11mL)和DIPEA(0.249ml,1.42mmol)中的化合物xiii′(1.1mmol)的溶液处理。室温下将混合物搅拌过夜,并用NH4Cl溶液终止。浓缩溶剂,并交将混合物置于EtOAC(100mL)。用饱和NaHCO3溶液、盐水洗涤有机层,然后干燥(MgSO4)。除去溶剂后,通过柱色谱法(5% EtOH/EtOAc)纯化残余物得到clxxxviii(0.341g,71%)。中间产物实施例178-化合物clxxxix:
将二氨基丙酸(3g,28.7mmol)置于1M NaOH(86.2ml,86.2mmol),并冷却到0℃,然后加入在Et
2O(25mL)中的MeOC(O)Cl(5.54ml,71.75mmol)。将所得的混合物搅拌过夜,并温热到室温。将反应混合物的pH降至2,并用EtOAc萃取水层3次。合并萃取物,并用Na
2SO
4干燥,过滤并浓缩得到化合物clxxxix(3.09g,48.9%)。
中间产物实施例179-化合物cc:
将化合物clxxxix(340mg,1.55mmol)置于DCM(4mL)。加入DCC(1.7mmol)和HOAt(235mg,1.7mmol),然后加入在DCM(3.4mL)中的化合物clxxxii(1.7mmol)。将反应混合物搅拌过夜。第二天,通过硅藻土垫过滤反应混合物并浓缩。用75% EtOAc/己烷完成纯化得到化合物clxxxx(715mg,72.4%)。
中间产物实施例180-化合物clxxxxi:
在标准条件下使用EtOH(4mL)和1N NaOH(3eq)水解化合物clxxxx(715mg,1.12mmol)得到化合物clxxxxi(600mg,88.0%)。
中间产物实施例181-化合物clxxxxii:
将化合物clxxxxi(550mg,0.9mmol)置于DCM(8mL)。加入PyBOP(675mg,1.3mmol),然后加入在THF(1.3mL)中的化合物xiii′(1.3mmol)。加入DIPEA(0.23ml,1.3mmol)并将所得的溶液搅拌过夜。第二天,用EtOAc稀释反应物,用饱和NaHCO3洗涤,然后用盐水洗涤,随后浓缩得到一种残余物。用5% EtOH/EtOAc将所得的残余物纯化得到化合物clxxxxii(290mg,41.5%)。中间产物实施例182-化合物clxxxxiii:
在标准条件下使用MeOH(60mL)和1N NaOH(52.8ml,3eq)将Cbz-环己基甘氨酸-叔-亮氨酸甲酯(7.36g,17.6mmol)水解得到中间产物clxxxxiii(92%)。
中间产物实施例183-化合物clxxxxiv:
将化合物clxxxxiii(3.82g,9.46mmol)置于DCM(30mL)。加入在DCM(11.35mL)中的DCC(11.35mmol),然后加入HOAt(1.54g,11.35mmol)。将所得的混合物搅拌5分钟,并加入在THF(40mL)中的化合物v(9.46mmol)。将所得的混合物搅拌过夜。第二天,用EtOAc稀释反应混合物,用1N HCl洗涤,用饱和NaHCO3洗涤,然后用盐水洗涤,随后浓缩得到一种残余物。在硅胶上用20%至30%梯度纯化所得的残余物得到化合物clxxxxiv(3.03g,56.3%)。中间产物实施例183-化合物clxxxii:
在H2气氛下使用在MeOH(30mL)中的10% Pd/C(500mg)将化合物clxxxxiv(3.03g,5.33mmol)氢化4小时得到化合物clxxxii(2.3g,99%)。中间产物实施例184-化合物clxxxxv:
0℃下将SOCl2(3mL)滴加到在MeOH(40mL)中的1-氨基-1-环己烷甲酸(2.86g,20mmol)溶液。将混合物缓慢加热到室温,然后回流5小时。随后将Et2O加到澄清溶液,并分离沉淀物。进一步在真空下干燥固体得到化合物clxxxxv(95%),为白色粉末。中间产物实施例185-化合物clxxxxvi:
加入在DCM中的HOAt(1.1g,8mmol)和DCC(8ml,1M)而将2-吡嗪甲酸(1g,8mmol,1eq)溶于DCM(15mL)。室温下搅拌20分钟后,将化合物clxxxxv(1.3g,8mmol)加到活化的混合物。之后加入DIPEA(2ml,12mmol),然后加入DMAP(1.5g,12mmol)。室温下搅拌3天后,通过硅藻土过滤反应混合物,浓缩并用柱色谱法(50% EtOAc/己烷)纯化所需产物clxxxxvi,为黄色油(2.1g,100%)。
中间产物实施例186-化合物clxxxxvii:
加入2N NaOH(水溶液)(12ml,24mmol)而将化合物clxxxxvi(1.06g,2.6mmol)溶于MeOH(30mL)。室温下将溶液搅拌过夜,随后TLC(50% EtOAc/己烷)表明完全水解。用5N HCl将溶液酸化至pH3,用EtOAc稀释,然后萃取有机层。然后用盐水洗涤有机层,用MgSO4干燥浓缩得到化合物clxxxxvii(84%)。中间产物实施例187-化合物clxxxxviii:
将化合物clxxxvii(1.6g,6.4mmol)溶于DCM(18mL),然后在室温下加入HOAt(0.96g,7mmol)和DCC(7ml,1M,在DCM中)。室温下搅拌20分钟后,将L-叔-亮氨酸甲酯盐酸盐(7ml,1M,THF溶液)加到此活化的混合物。随后加入DIPEA(1.2ml,7mmol),然后加入DMAP(1.2g,9.8mmol)。室温下搅拌3天后,通过硅藻土过滤反应混合物,通过柱色谱法纯化并浓缩得到化合物clxxxxviii(60%EtOAc/己烷),为白色固体(1.74g,72%)。
中间产物实施例188-化合物cic:
加入2N NaOH(水溶液)(7ml,14mmol)而将化合物clxxxxviii(1.74g,4.6mmol)溶于MeOH(22mL)。室温下将溶液搅拌过夜,随后的TLC(50% EtOAc/己烷)表明完全水解。用5N HCl将溶液酸化至pH3,用EtOAc稀释,然后萃取有机层。用盐水洗涤有机层,用MgSO4干燥,然后浓缩得到化合物cic(100%)。中间产物实施例189-化合物cc:
室温下将HOAt(610mg,4.5mmol)加到化合物cic(1.5g,4.1mmol)的DCM溶液(15mL),然后加入在DCM(4.5ml,4.5mmol)中的1M DCC溶液。室温下搅拌30分钟后,加入化合物v(4mmol)的THF溶液(20ml,0.2M)。室温下将反应物搅拌过夜。然后,通过硅藻土过滤反应物。浓缩滤液得到一种黄色油,通过硅胶色谱法(50%EtOAc/己烷)纯化得到化合物cci(660mg,32%)。中间产物实施例190-化合物cci:
将2N NaOH(1.7ml,3.4mmol)加到化合物cc(600mg,1.13mmol)的EtOH溶液(6mL)。室温下将反应物搅拌2小时,用5N HCl酸化至pH3。然后用EtOAc稀释混合物,随后萃取有机层。接着用盐水洗涤有机层,而后用MgSO
4干燥浓缩得到化合物cci(92%)。
中间产物实施例191-化合物ccii:
将PyBOP(420mg,0.8mmol)加到ccii(310mg,0.62mmol)的DCM溶液(8mL)。室温下将溶液搅拌30分钟。将在THF中的化合物xiii′(8ml,0.1M)加到此溶液,然后加入DI PEA(0.23ml,1.3mmol)。在室温下将反应物搅拌过夜,然后用水(25mL)终止30分钟。随后用EtOAc萃取混合物。用盐水洗涤所得的有机层,然后用MgSO4干燥,然后浓缩得到一种黄色油。硅胶色谱法(3% EtOH/EtOAc)纯化得到化合物ccii(140mg,33%)。中间产物实施例192-化合物ccxiv
在N2气氛下,在-60℃下,将CsOH·H2O(6.9g,0.0412mmol)加到在无水DCM(48mL)中的化合物cciii、(N-二苯基亚甲基)-甘氨酸叔丁酯(6g,0.0206mmol)和手性PTC(1.08g,0.00206mmol)的溶液。将在10mL DCM中的1-羧基-1-环戊烯甲酯(5.2ml,0.0412mmol)加到反应混合物。在-60℃下将混合物搅拌4天,然后用200mLEt2O稀释,并加入15mL饱和NH4Cl水溶液。分离相,并用15mL水和15mL盐水洗涤有机相。用100mL Et2O萃取水相。合并有机相并用Na2SO4干燥。将通过除去溶剂而得到的粗产物溶于100mL EtOH,然后加入NH2OH·HCl(1.43g,0.0206mmol)和NaOAC(1.68g,0.0206mmol)。将混合物回流48小时。然后除去溶剂,并通过闪烁色谱法将所得的粗产物直接纯化,用30%-50%EtOAc/己烷洗脱得到化合物cciv(65%),为一种白色固体。C12H19NO3(MW=225.29);MS:m/z(M++1)=226.5.对映异构过量:18%ee,通过手性HPLC测定。中间产物实施例193-化合物ccv
将催化量的DMAP(0.216g,0.0017mmol)和在30mL ACN中的二碳酸二叔丁酯(2.49g,0.011mmol)溶液加到在60mL ACN中的化合物cciv(2g,0.0088mmol)的溶液。室温下将混合物搅拌14小时,然后用100mL DCM稀释,并用饱和NaHCO3(10mL)和盐水(10mL)洗涤。用Na2SO4干燥有机相。蒸发溶剂得到一种粗产物,在硅胶柱上纯化粗产物,用15% EtOAc/己烷洗脱得到化合物ccv(86%),为白色固体。C17H27NO5 MW=325,40MS:m/z(M++1)=326.2中间产物实施例194-化合物ccvi
-78℃下将DIBAL-H(7.8ml,0.0078mmol)加到在50mL THF(0.14M)中的化合物ccv(1.7g,0.0052mmol)的溶液。将混合物搅拌1小时,然后加入10mL MeOH。用25mL EtOAc和25mL饱和的酒石酸钠水溶液稀释混合物,然后在室温下将其搅拌1小时。分离相,并用50mL EtOAc萃取水相一次。合并有机相并用Na2SO4干燥。蒸发溶剂得到一种粗产物,将其不经任何纯化而使用。将粗品溶于25mLDCM,加入Et3Si(0.84ml,0.0052mmol),然后将混合物冷却到-78℃,随后滴加BF3OEt2(0.71ml,0.0061mmol)。30分钟后,加入Et3Si(0.84mL)和BF3OEt2(0.71mL),并在-78℃下将混合物搅拌2小时。然后用饱和NaHCO3水溶液(10mL)中止反应,并用DCM(2×20mL)萃取。合并有机相并用Na2SO4干燥。蒸发溶剂得到一种粗产物,通过闪烁色谱法进行纯化,用13% EtOAc/己烷洗脱得到化合物ccvi(87%)。C17H29NO4 MW=311,42MS:m/z(M++1)=312.6。中间产物实施例195-化合物ccvii
将化合物ccvi(0.5g,0.0016mmol)溶于8mL在EtOAc中的1N HCl(通过将干燥的HCl通入无水EtOAc,然后再用EtOAc稀释至1N而制得的)。室温下将混合物搅拌6小时。真空下除去溶剂,并将所得的沉淀溶于Et
2O。将混合物搅拌15分钟后,在减压下除去溶剂。用Et
2O洗涤所得的白色固体,并过滤分离化合物ccvii(0.27g,80%产率)。C
12H
21NO
2 MW 211,15 MS:m/z(M
++1)=212.6
中间产物实施例196-化合物v
将TFA(2.85mL)加到在DCM(3.7mL)中的化合物ccxvi(0.230g,0.74mmol)的溶液。将混合物搅拌过夜后,真空下除去溶剂至干燥,并将残余物溶于EtOH(7.5mL)。在0℃下冷却混合物并滴加SOCl2(0.22ml,2.96mmol),然后回流2小时。减压下除去EtOH并将残余物溶于DCM(10mL)。用饱和NaHCO3水溶液(5mL)将所得的溶液洗涤两次。分离相并用Na2SO4干燥有机相,真空下除去溶剂得到化合物v(80%),为油。C10H17NO2 M.W.:183.25MS:m/z(M++1)=184.2。中间产物实施例197-化合物cd
将1-苄基咪唑(6g,37.9mmol)置于Et
2O(180mL)。将所得的溶液降温到-60℃并用n-BuLi(1.6M,24mL)处理。将反应物搅拌30分钟,然后使CO
2冒泡通过混合物15分钟。过滤沉淀物,用Et
2O冲洗,并再次置于H
2O。用5N HCl将此溶液酸化至pH3。冻干后分离所需产物,cd,为一种白色固体。
中间产物实施例198-化合物cdi
0℃下用DAST(9.2ml,69.8mmol)处理化合物i(9.25g,27.9mmol)的DCM溶液(100mL)。在室温下搅拌过夜后,用冰终止反应,并用DCM(200mL)萃取。用盐水洗涤有机层并真空浓缩。用硅胶色谱法(30% EtOAc/己烷)纯化残余物得到8.5g(86%)目标氟化中间产物。将部分此中间产物(4.5g,14.2mmol)溶于EtOH(75mL)。使用Pd(OH)2/C(2.98g,20% Pd含量,4.26mmol)使此溶液接触标准氢化条件。室温下搅拌过夜后,通过硅藻土过滤反应混合物。真空浓缩滤液得到化合物cdi(2.5g,96%)。中间产物实施例199-化合物cdii
将化合物cd(890mg,4.4mmol)的溶液置于DCM(15mL)。加入HOBT(595mg,4.4mmol)和DCC(4.4mmol,1M DCM溶液)并搅拌20分钟。将lxxix′(990mg,3.5mmol)的DCM溶液(15mL)加到此混合物。在氮气氛下将所得的混合物搅拌过夜。用EtOAc稀释反应混合物,用饱和NaHCO3和盐水洗涤。真空浓缩有机层得到一种残余物,用30% EtOAc/己烷将其纯化得到化合物cdii(666mg,41%)。中间产物实施例200-化合物cdiii
在标准水解条件下,使用甲醇(10mL)和1N NaOH(3eq)由化合物cdii制备化合物cdiii。回收到565mg化合物cdiii(88%)。中间产物实施例201-化合物cdiv
将化合物cdiii(1.24mmol)置于DCM(5mL)。加入DCC(1.6mmol,1M DCM),然后加入HOAT(1.6mmol)。将所得的混合物搅拌20分钟,并滴加在THF(8mL)中的化合物cdi(1.6mmol)。将反应物搅拌过夜。将反应物过滤并用EtOAc冲洗。用饱和NaHCO
3、盐水洗涤合并的有机层,用MgSO
4干燥,并浓缩。用30%EtOAc/己烷完成纯化得到化合物cdiv(565mg,70%)。
中间产物实施例202-cdv
在标准水解条件下,使用乙醇(10mL)和1N NaOH(3eq)由化合物cdiv制备化合物cdv(565mg,0.86mmol)。回收490mg(91%)化合物cdv。
中间产物实施例203-cdvi
将化合物cdv(490mg,0.78mmol)置于DCM(10mL)。将PyBOP(520mg,1mmol)加到DCM溶液,然后加入xiii(186mg,1mmol)的THF溶液(10mL)。将DIEA(0.18ml,1mmol)加到此反应混合物并在氮下搅拌过夜。第二天,用EtOAc稀释反应物,用饱和NaHCO
3和盐水洗涤。用100% EtOAc完成纯化得到化合物cdvi(478mg,77%)。
中间产物实施例204-cdvii
使用在MeOH(40mL)中的Pd(OH)
2/C(按20%无水计,100mg)氢化化合物cdvi(478mg,0.6mmol)。在氢气氛下将反应混合物搅拌过夜。此时,通过硅藻土过滤反应混合物,并浓缩得到化合物cdvii(417mg,98%)。
中间产物实施例205-cdx
将化合物cxxv(购自Albany Molecular Research Inc.,1.5g,5.2mmol)置于DCM(15mL)。将PyBOP(2.7g,5.2mmol)和HOBT(700mg,5.2mmol)加到此溶液。将(-)-α-(4-吡啶基)乙基胺(640mg,5.2mmol)的THF溶液(15mL)加到上述溶液,然后加入DIEA(0.93ml,5.2mmol)。[(-)-α-(4-吡啶基)乙基胺由(-)-α-(4-吡啶基)乙基胺(Aldrich)的酒石酸盐通过以下方法获得:与1N NaOH(2eq)一起搅拌1小时,然后用EtOAC(3x)萃取,回收率为70%]。室温下搅拌反应物。用饱和NaHCO
3和盐水洗涤反应物。用5% EtOH/EtOAc纯化产物得到2g(99%)中间产物化合物cdx。
中间产物实施例206-cdviii
采用在MEOH(50mL)中的10% Pd/C(500mg)氢化化合物cdx(2g,5.2mmol)。将反应混合物在氢气氛下过夜搅拌。将产物用硅藻土过滤,浓缩,得到化合物cdviii(1.3,g 98%)。 药理学
按照如本文所述的能够用于抑制HCV蛋白酶的本发明的化合物,因此,也适用于抑制HCV复制。
因此,本发明涉及抑制HCV蛋白酶的方法,包括以抗HCV蛋白酶抑制量的式1的化合物和包含HCV蛋白酶的组合物接触。
本文的又一项发明涉及抑制HCV复制的方法,包括以有效量的化学式1的化合物与HCV接触。
此外,本发明的另一项涉及患有或易于进行HCV感染的患者的治疗方法,包括给予患者施用药学有效量的式1的化合物。本文所指的治疗HCV感染应该理解成包括预防或抑制感染的预防性治疗,以及治疗已有的急性或慢性HCV感染或与HCV感染有关的生理学症状,以基本上治愈感染的患者、抑制感染的程度(量)或者改善与其有关的生理学症状。″有效量″意欲描述在合理的生物学判断范围内有效的,适于与人和其它哺乳动物细胞无过度毒性、刺激、过敏性反应等接触,并且在治疗HCV感染中和合理的优点/风险比匹配从而产生希望的治疗作用的本发明化合物的量。
本文讨论的生理学症状包括一些,但不是全部,批准抗HCV治疗的可能的临床情形。本领域的有经验人员对任何需要抗HCV治疗的情形有良好地意识。
本发明特别的方面提供按照本发明的化合物以药物组合物形式给药,尽管这种化合物可以单独给药。″药物组合物″指包含式1的化合物和至少一种选自下列的组分的组合物:药学上可接受的载体、稀释剂、包衣剂、助剂、赋形剂或载体,例如防腐剂、填充剂、崩解剂、润湿剂、乳化剂、乳液稳定剂、悬浮剂、等渗剂、增甜剂、矫臭剂、香味剂、着色剂、抗细菌剂、抗真菌剂、其它的治疗剂、润滑剂、吸收延缓和促进剂和分粉剂,取决于给药模式和剂型。组合物可以是以下形式:片剂、丸剂、颗粒剂、粉剂、水溶液或悬浮液、注射液、酏剂或糖浆剂。示例的悬浮剂包括乙氧基化异硬脂醇、聚氧乙烯山梨醇和脱水山梨醇酯、微晶纤维素、间氢氧化铝(aluminummetahydroxide)、膨润土、琼脂和西黄蓍胶,或者这些物质的混合物。预防微生物作用的示例性的抗细菌和抗真菌剂包括尼泊金、氯代丁醇、苯酚、山梨酸等。示例性的等渗剂包括糖、氯化钠等。示例性的延长吸收的吸收延缓剂包括一硬脂酸铝和明胶。示例性的增强吸收的吸收促进剂包括二甲亚砜和有关类似物。示例性的载体、稀释剂、溶剂、赋形剂、增溶剂、乳化剂和乳液稳定剂包括水、氯仿、蔗糖、乙醇、异丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苄醇、四氢糠基醇、苯甲酸苄酯、多元醇、丙二醇、1,3-丁二醇、甘油、聚乙二醇、二甲基甲酰胺、吐温60、斯盘80、十六醇十八醇混合物、肉豆蔻醇、单硬脂酸甘油酯和十二烷基硫酸钠、脱水山梨醇脂肪酸酯、植物油(如棉子油、花生油、玉米胚油、橄榄油、蓖麻子油和芝麻油)和注射用有机酯,如油酸乙酯等,或者这些物质适合的混合物。示例性的赋形剂包括乳糖、乳糖、柠檬酸钠、碳酸钙、磷酸二钙。示例性的崩解剂包括淀粉、海藻酸和某些复合硅酸盐。示例性的润滑剂包括硬脂酸镁、十二烷基硫酸钠、滑石,以及高分子量聚乙二醇类。
其它的可与本发明的化合物联合使用的治疗剂包括其它的抗HCV剂。一些示例性的已知抗HCV剂包括免疫调节剂,如α-、β-或γ-干扰素;聚乙二醇化衍生的干扰素-α化合物,其它的抗病毒剂如利巴韦林和金钢烷胺;其它的丙型肝炎蛋白酶抑制剂;HCV生命周期内包括解螺旋酶、聚合酶、金属蛋白酶、内部核糖体进入的其它目标的抑制剂,或者广谱抗病毒化合物,如VX-497,一种细胞肌苷一磷酸脱氢酶,IMPDH,的抑制剂,美国专利No.5,807,876覆盖;或者它们的组合。和本发明的化合物联合使用的治疗剂可单独、同时或按顺序给药。
药物组合物中除了式1的化合物之外的物质的选择通常根据活性化合物的化学性质(如溶解度)、具体的给药方式确定和制药实践中注意到的需要确定。例如,如乳糖、柠檬酸钠、碳酸钙、磷酸二钙的赋形剂和如淀粉、海藻酸、某些复合硅酸盐的崩解剂与如硬脂酸镁、十二烷基硫酸钠和滑石的润滑剂的混合可用于制备片剂。
出现的药物组合物可以分类,例如片剂、丸剂、颗粒剂、粉剂、水溶液或悬浮液、注射液、酏剂或糖浆剂。
″液体剂型″意指该剂量的对患者给药的活性化合物是液体形式,例如,药学上可接受的乳剂、溶液、悬浮液、糖浆剂和酏剂。除了活性化合物之外,液体剂型可包含本领域通常使用的惰性稀释剂,例如溶剂、助溶剂和乳化剂。
在软或硬胶囊中采用的固体组合物作为填充剂使用例如乳糖或乳糖以及高分子量聚乙二醇等的赋形剂。
使用水悬浮液时,它们可包含乳化剂或悬浮促进剂。
乳剂药物组合物的油相可由已知的组分以已知方式组成。油相仅包括乳化剂(又称为乳化剂(emulgent)))时,它希望包括至少一种乳化剂和脂肪或油或者与脂肪和油的混合物。优选地,亲水性乳化剂与充当稳定剂的亲脂性乳化剂一起包含在组合物中。既包括油又包括脂肪同样是优选的。同时,具有或不具有稳定剂的乳化剂组成乳化蜡,并且加油和脂肪的方法组成乳化软膏基质,它形成膏剂的油分散相。
如果希望,霜剂基质的水相包括,例如,至少30% w/w的多元醇,即具有两个或更多个羟基基团的醇,例如丙二醇、1,3-丁二醇、甘露醇、山梨醇、甘油和聚乙二醇(包括PEG 400)和它们的混合物。局部制剂希望包括增强活性组分经皮或其它受影响区吸收或渗透的化合物。
适于制剂的适当的油或脂肪的选择基于获得希望的化妆性能。因此,霜剂应该优选是非多脂的、非染色或可洗的产品,它具有避免从管或其它容器中渗漏的适当的稠度。可以采用直或支链、一元或二元烷基酯,例如肉豆蔻酸二异丙酯、油酸癸酯、棕榈酸异丙酯、硬脂酯丁酯、棕榈酸2-乙基己酯或者称为Crodamol CAP的支链酯的混合物。根据需要的性能这些可以单独或联合使用。选择性地,可以使用高熔点的脂,例如白软石蜡和/或液体石蜡或者其它的矿物油。
实践中,本发明的化合物/药物组合物可以以适当的制剂通过局部或全身给药于人或动物,包括口服、吸入、直肠、经鼻、颊、舌下、阴道、结肠、非胃肠道(包括皮下、肌内、静脉内、真皮内、鞘内和硬膜外)、脑池内和腹膜内。优选的途径理解为可以随受体的情况变化。
″药学上可接受的剂型″指本发明化合物的剂型,并且包括例如片剂、糖衣丸剂、粉剂、酏剂、糖浆剂,液体制剂,包括悬浮液、喷雾剂、吸入片剂、锭剂、乳剂、溶液、颗粒剂和栓剂,以及注射用液体制剂,包括脂质体制剂。技术和制剂通常可见于Remington药物科学,Mack Publishing Co.,Easton,PA,最近一版。
″适于口服给药的制剂″可表示为离散的单元,如胶囊、扁囊剂或片剂,每个含有预定量的活性组分;如粉剂或颗粒剂;如含水液体或非水液体的溶液或悬浮液;或者如水包油液体乳剂或油包水液体乳剂。活性组分也可作为大丸剂、药糖剂或糊剂使用。
片剂可通过压缩或模制制备,任选地和一种或多种辅助组分。压缩片可通过在适当的机器中压缩自油流动形式(如粉末或颗粒)的活性组分,任选与粘合剂、润滑剂、惰性稀释剂、防腐剂、表面活性剂或分散剂混合。模制片可通过在适当的机器中模制以惰性液体润湿的粉末状化合物制备。片剂任选被包衣或刻线,并且可以被配制成能够提供延缓或控制其中活性组分释放的形式。
直肠给药的固体组合物包括以已知方法配制的、含有本发明至少一种化合物的栓剂。
如果希望,并且为了更有效的分配,化合物能够被微胶囊化,或者连接在缓慢释放或靶输送系统,例如生物相容的、生物可降解的聚合物基质(例如,聚(d,1-丙交酯共-乙交酯)、脂质体和微球上,并且通过称之为皮下或肌内贮存的技术皮下或肌内注射,以提供化合物在2周或更长时期内持续缓慢释放。可将化合物灭菌,例如,通过经细菌截留滤器过滤,或者通过在可在临用前溶于无菌水或一些其它无菌注射介质的无菌固体组合物中掺入灭菌剂。
″适于鼻或吸入给药的制剂″意指适于对患者经鼻或吸入给药形式的制剂。该制剂可含有载体,粉末形式,粒度例如在1至500微米之间(包括20至500微米之间的粒度,增量为5微米,如30微米、35微米,等)。其中载体是液体以便例如作为鼻喷雾剂或作为滴鼻剂给药的适合的制剂,包括活性组分的水或油溶液。适于气溶胶给药的制剂可按照常规方法制备,并且可与其它治疗剂一起输送。吸入治疗通过计量剂量的吸入器轻易地给药。
″适于口服给药的制剂″指适于经口对患者给药形式的制剂。这种制剂可作为离散单元提供,如胶囊、扁囊剂或片剂,每个含有预定量的活性组分;如粉剂或颗粒剂;如含水液体或非水液体形式的溶液或悬浮液;或者如水包油液体乳剂或油包水液体乳剂。活性组分也可以作为大丸剂、药糖剂或糊剂使用。
″非胃肠道给药的制剂″指适于对患者非胃肠道给药形式的制剂。该制剂是无菌的并且包括乳剂、悬浮液、水和非水注射液,它们含有悬浮剂和增稠剂和抗氧化剂、缓冲剂、制菌剂和致使制剂和预期受体血液等渗的溶质,并且具有适当调节的pH。
″适于直肠或阴道给药的制剂″指适于对患者直肠或阴道给药形式的制剂。该制剂优选是栓剂形式,它能够通过混合本发明的化合物和适当的非刺激赋形剂或载体(如椰子油、聚乙二醇或栓剂蜡,它们在常温是固体,但是在体温是液体,因此,在直肠或阴道腔内熔化并释放活性组分)制备。
″适于全身给药的制剂″指适于对患者全身给药形式的制剂。该制剂优选通过注射给药,包括肌肉、静脉内、腹膜内和皮下注射。为了注射,本发明的化合物配制成液体溶液,优选生理学相容的缓冲剂,如Hank氏溶液或Ringer氏溶液。此外,该化合物可配制成固体形式并且在临使用之前再溶解或悬浮。也可包括冻干形式。全身给药也可通过透粘膜或透皮途径,或者该化合物可经口给药。为了透粘膜或透皮给药,在制剂中使用适于待渗透屏障的渗透剂。这种渗透剂通常是本领域已知的,并且包括,例如,适于透皮给药的胆汁盐和褐霉酸衍生物。此外,可使用洗剂以促进渗透。透粘膜给药可通过,例如,使用鼻喷雾剂,或栓剂。为了口服给药,化合物配制成常规口服给药形式,如胶囊剂、片剂和滋补形式制剂。
″适于局部给药的制剂″指适于对患者局部给药形式的制剂。该制剂可以是局部软膏、油膏、粉剂、喷雾剂和吸入剂、凝胶(以水或醇为基质)、霜剂,如本领域公知的,或者被掺入用于片的基质,它会允许化合物经透皮屏障控制释放。当配制成软膏时,活性组分可与或者石蜡或水可混合的软膏基质一起使用。或者,可用水包油霜剂基质将活性组分配制成霜剂。适于眼内局部给药的制剂包括滴眼剂,其中活性组分溶于或悬浮于适当载体,特别是适于活性组分的水溶剂。适于口腔局部给药的制剂包括糖锭,它含矫味成分,通常是蔗糖和阿拉伯胶或西黄蓍胶;如明胶和甘油(或者蔗糖和阿拉伯胶)的惰性成分中包括活性组分的锭剂;适当液体载体中包括活性组分的漱口剂。
″固体剂型″指本发明的化合物的剂型是固体形式,例如胶囊、片剂、丸剂、粉剂、糖衣丸或颗粒剂。在这种固体剂型中,本发明的化合物与至少一种惰性常规赋形剂(或载体)如柠檬酸钠或磷酸二钙或者(a)填充剂或增量剂,例如淀粉、乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露醇和硅酸,(b)粘合剂,例如羧甲基纤维素、藻酸盐、明胶、聚乙烯吡咯烷酮、蔗糖和阿拉伯胶,(c)湿润剂,例如,甘油,(d)崩解剂,例如,琼脂、碳酸钙、马铃薯或木薯淀粉、海藻酸、某些复合硅酸盐和碳酸钠,(e)溶液阻滞剂,例如石蜡,(f)吸收促进剂,例如,季铵化合物,(g)润湿剂,例如,鲸蜡醇和单硬脂酸甘油酯,(h)吸附剂,例如,高岭土和膨润土,(i)润滑剂,例如滑石、硬脂酸钙、硬脂酸镁、固体聚乙二醇、十二烷基硫酸钠,(j)不透明剂,(k)缓冲剂,和在肠道的某一部分以延迟方式释放本发明化合物的药剂。
可以变化本发明组合物中活性组分的实际剂量水平,这样以致于对于特别的组合物和患者的给药方法,获得有效得到希望的治疗反应的活性组分量。因此适于任何特别患者的选择剂量水平取决于许多因素,包括希望的治疗作用、给药途径、希望的治疗周期、疾病的病因和严重性、患者的身体状况、体重、性别、饮食和年龄、每种活性组分的类型和效力、吸收速率、代谢和或排泄以及其它因素。
本发明化合物以单次或分为多次剂量给予患者的日总剂量可以是,例如,每天约0.001至约100mg/kg体重并且优选0.01至10mg/kg/天。例如,成年人中,剂量通常是每天吸入约0.01至约100,优选约0.01至约10,mg/kg体重,每天口服给药约0.01至约100,优选0.1至70,更特别0.5至10,mg/kg体重,并且静脉内给药约0.01至约50,优选0.01至10,mg/kg体重。组合物中的活性组分的百分比可以变化,尽管它应当组成足以获得适当剂量的比例。剂量单位的组合物包含如此量的这样约数,于是可用于组成每天剂量。明显地,几个单位剂型在大约同一时刻可同时给药。需要时可经常给予剂量,以便获得希望的治疗作用。一些患者会对较高或较低剂量迅速反应,并且发现更弱的适当的维持剂量。对于其它患者,根据每个特别患者的生理学需要,每天1至4剂量的速率进行长期治疗是必需的。不言自明,对于其它患者,处方不超过每天一次或两次剂量是必需的。
通过任何药剂学领域公知的方法能够制备单位剂型的制剂。这些方法包括使活性组分和组成一个或多个辅助组分的载体混合在一起的步骤。一般,制剂通过均匀且紧密地使活性组分和液体载体或细粉碎的固体载体或两者混合来开始制备,接着,如果需要,将产品成形。
制剂可以单位剂量或多剂量容器出现,例如密闭的安瓿和具有弹性塞的小瓶,并且可以在冷冻-干燥(冻干)条件下贮藏,临使用之前仅仅需要加入无菌液体载体,例如注射用水。临时注射溶液和悬浮液可由先前的描述过的无菌粉末、颗粒和片剂制备。
按照文献和以下描述的试验,本发明范围内的化合物显示显著药理学活性,这些试验结果确信与人和其它哺乳动物的药理学活性相关。体外酶分析步骤抑制HCV NS3丝氨酸蛋白酶
如先前描述过的表达和纯化HCV NS3蛋白酶域(Vertex,PCT公开W098/17679;将其引入本文作为参考)。American Peptide Com(Ca)常规合成NS3蛋白酶用的显色肽底物、EDVVAbuC-p-硝基酰苯胺(nitroanilide)以及NS4A辅助因子片段(-KKGSVVIVGRIVLSGK-)。采用分光光度计分析,以EDVVAbuC-p-硝基酰苯胺作为底物分析本发明的化合物抑制HCV NS3蛋白酶活性的能力。采用具有动力能力的SpectraMax 250阅读器(Molecular Devices,Sunnyvale,CA)在96孔微量滴定板上进行该分析。HCV NS3蛋白酶(0.5μM)纯化的EDVVAbuC-p-硝基酰苯胺(500μM)底物的剪切在无或含有试验化合物的情形下,于30℃在含有30μM NS4A片段、46mM Hepes、pH8.0、92mM NaCl、18%甘油、5mM DTT和7.5%DMSO的缓冲液中实施。在405nm监测反应中pNA(p-硝基苯胺)的释放。
包括Vmax、Km和Vmax/Km的动力参数的测量在如上所述的条件下进行。在固定的酶和底物浓度下,通过将数据非线性最小二乘方拟合至用于紧密结合竞争性抑制的Morrison方程上,由速率vs.[抑制剂]曲线计算Ki[J.F.Morrison,Biochim.Biophvs.Acta.,185,269-286(1969)].Prism程序(GraphPad Software,Inc.)用于此步骤。
本文公开的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂能够与其它分子联合使用,这些分子或者在感染HCV感染风险的患者中预防性地直接显示或间接引起抗HCV活性,或者在已经感染的患者中治疗患者。术语″抗HCV活性″指与HCV病毒粒子在无该分子情形下蓄积相比,该分子存在时完全抑制或减少HCV病毒粒子蓄积的能力,和/或分子减轻或改善与HCV感染或患者发病有关的症状或综合征的能力。具有抗HCV活性的分子包括中断HCV感染或复制的一个或多个步骤的那些,以及引起宿主细胞中免疫调节和抗增生作用的那些。具有抗HCV活性的分子能够抑制HCV特异性复制型事件,例如但不限于HCV-定向核酸或蛋白合成。具有抗HCV活性的分子可作用的HCV复制阶段包括细胞进入(例如,附着;渗入);HCV基因组的脱壳和释放;HCV基因组的复制(例如,病毒RNA基因组的任何链的复制;病毒信使RNA的转录);HCV蛋白的翻译;HCV蛋白的翻译后修饰(例如,解蛋白剪切;糖基化);病毒蛋白的胞内转运;病毒粒子组分的装配;病毒颗粒的释放(例如,出芽)。具有抗病毒活性分子的种类包括但不限于可溶的受体引诱物和抗受体抗体;离子通道阻滞剂、壳体稳定剂和融合蛋白抑制剂;病毒聚合酶、逆转录酶、解螺旋酶、引发酶或整合酶的抑制剂;反义寡核苷酸和核糖酶;免疫调节和免疫刺激剂,包括细胞因子如干扰素,以及肽激动剂、类固醇、和如左旋咪唑的典型药物;调节蛋白抑制剂;蛋白酶抑制剂;装配蛋白抑制剂;和抗病毒抗体和细胞毒素淋巴细胞。术语″抗HCV有效量″或″药学有效量″指如本文公开的化合物或化合物的组合的用量,在减轻或改善与HCV感染有关的或与患者发病有关的症状或综合征中,或者在减少病毒体外或体内水平中有效。体外应用包括如下所述的Replicon分析系统,这里这些量有效减少HCV复制子RNA蓄积和/或由其中包含的基因编码的蛋白的蓄积。
本文公开的具有抗HCV活性意欲用于组合物和联合治疗方法的化合物包括但不限于免疫调节分子,包括免疫刺激细胞因子和其它已知具有HCV抗病毒活性的化合物,如各种抗病毒核苷和核苷酸。
本文公开的意欲用于组合HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂的免疫调节分子包括但不限于干扰素-α 2B(Intron A,Schering Plough);Rebatron(Schering Plough,干扰素-α 2B+利巴韦林);聚乙二醇化干扰素α(Reddy,K.R.等.Efficacy and safety of pegylated(40-kd)interferon alpha-2a compared with interferon alpha-2a in noncirrhotic patients with chronic hepatitis C.Hepatology 33,433-438(2001));共有序列干扰素(Kao,J.H.,Chen,P.J.,Lai,M.Y.& Chen,D.S.Efficacy of consensusinterferon in the treatment of chronic hepatitis C.J.Gastroenterol.Hepatol.15,1418-1423(2000));干扰素-α 2A(Roferon A;Roche);淋巴母细胞样或″天然″干扰素;干扰素τ(Clayette,P.等.IFN-tau,a new interferon type I withantiretroviral activity.Pathol.Biol.(Paris)47,553-559(1999));白细胞间介素2(Davis,G.L.,Nelson,D.R.& Reyes,G.R.Future options for the management of hepatitis C.Seminarsin Liver Disease19,103-112(1999));白细胞间介素6(Davis,G.L.,Nelson,D.R.& Reyes,G.R.Future options for themanagement of hepatitis C.Seminars in Liver Disease19,103-112(1999));白细胞间介素12(Davis,G.L.,Nelson,D.R.& Reyes,G.R.Future options for the management of hepatitisC.Seminars in Liver Disease19,103-112(1999));利巴韦林;和增强1型辅助T细胞反应发展的化合物(Davis,G.L.,Nelson,D.R.& Reyes,G.R.Future options for the management of hepatitisC.Seminars in Liver Disease19,103-112(1999))。干扰素通过执行间接抗病毒作用和/或通过修正对感染的免疫反应改善病毒感染。干扰素的抗病毒作用通常通过病毒侵入或脱壳、病毒RNA的合成、病毒蛋白的翻译和/或病毒装配和释放的抑制调节。
刺激细胞内干扰素合成的化合物(Tazulakhova,E.B.,Parshina,O.V.,Gusev,T.S.& Ershov,F.I.Russian Experience inScreening,Analysis,and Clinical Application of NovelInterferon Induces.J.干扰素Cytokine Res.21,65-73))包括但不限于单独或与妥布霉素联合的双链RNA,和咪喹莫特(3M制药)(Sauder,D.N.Immunomodulatory and pharmacologicproperties of imiquimod.J.Am.Acad.Dermatol.43,S6-11(2000))。
根据非免疫调节机理,已知具有,或者可能具有,HCV抗病毒活性的其它化合物包括但不限于利巴韦林(ICN制药);肌苷5′-一磷酸脱氢酶抑制剂(VX-497,Vertex制药研发);金刚烷胺和金刚乙胺(Younossi,A.M.and Perillo,R.P.The roles of amantadine,rimantadine,ursodeoxycholic acid,NSAIDs,alone or incombination with alpha interferons,in the treatment ofchronic hepatitis C.Seminars in Liver Disease19,95-102(1999));LY217896(美国专利4,835,168)(Colacino,J.M.等.Evaluation of the anti-influenza virus activities of1,3,4-thiadiazol-2-ylcyanamide(LY217896)and its sodium salt.Antimicrobial Agents & Chemotherapy 34,2156-2163(1990));和9-羟基亚氨基-6-甲氧基-1,4a-二甲基-1,2,3,4,4 a,9,10,10a-八氢-菲-1-甲酸甲酯;6-甲氧基-1,4a二甲基-9-(4-甲基-哌嗪-1-基亚氨基)-1,2,3,4,4a,9,10,10a-八氢-菲-1-甲酸甲酯-盐酸盐;1-(2-氯-苯基)-3-(2,2-二苯基-乙基)-脲(美国专利6,127,422)。
适于前述分子的给药制剂、剂量和途径或者在以下引用的参考中教导,或者是本领域公知的,例如,如下公开的:F.G.Hayden,Goodman& Gilman′s The Pharmacological Basis of Therapeutics,第九版,Hardman等.,Eds.,McGraw-Hill,New York(1996),50章,pp.1191-1223,以及其中引用的参考。选择性地,一旦已经鉴别出显示HCV抗病毒活性的化合物,采用本领域技术人员已知的技术可测定该化合物的药学有效量。参见例如,Benet等.,Goodman & Gilman′s ThePhannacological Basis of Therapeutics,第九版,Hardman等.,Eds.,McGraw-Hill,New York(1996),1章,pp.3-27,以及其中引用的参考。因此,可通过常规方法轻易地确定这类化合物的适当制剂、剂量范围和给药方案。
本发明的药物组合可提供给细胞或细胞群,患者,或者以单独的同时或按顺序给药的药学上可接受的制剂,含有多于一种的治疗剂的制剂或者通过单一药剂和多种药剂制剂的分类。然而给药时,这些药物组合形成抗HCV有效量的成分。
本发明的方法能够使用的大量的其它免疫调节剂和免疫刺激剂目前是可得到的并且包括:AA-2G;金钢烷基酰胺二肽;腺苷脱氨酶,Enzon;佐剂,Alliance;佐剂Ribi;佐剂,Vaxcel;Adjuvax;agelasphin-11;AIDS治疗剂,Chiron;藻葡聚糖,SRI;algammulin,Anutech;Anginlyc;抗细胞因子,Yeda;Anticort;抗胃泌素-17免疫原,Ap;抗原递送系统,Vac;抗原制剂,IDBC;抗GnRH免疫原,Aphton;Antiherpin;Arbidol;azarole;Bay-q-8939;Bay-r-1005;BCH-1393;Betafectin;Biostim;BL-001;BL-009;Broncostat;Cantastim;CDRI-84-246;头孢地嗪;化学促活抑制剂,ICOS;CMV肽,City of Hope;CN-5888;细胞因子释放剂,St;DHEAS,Paradigm;DISC TA-HSV;J07B;I01A;I01Z;二硫卡钠;ECA-10-142;ELS-1;内毒素,Novartis;FCE-20696;CE-24089;FCE-24578;FLT-3配体,Immunex;FR-900483;FR-900494;FR-901235;FTS-Zn;G-蛋白,Cadus;gludapcin;glutaurine;葡萄糖磷酸肽(glycophosphopeptical);GM-2;GM-53;GMDP;生长因子疫苗,EntreM;H-BIG,NABI;H-CIG,NABI;HAB-439;幽门螺杆菌疫苗;疱疹-特异性免疫因子;HIV治疗,United Biomed;HyperGAM+CF;ImmuMax;Immun BCG;免疫疗法,Connective;免疫调节剂,Evans;免疫调节剂,Novacell;imreg-1;imreg-2;Indomune;肌苷pranobex;干扰素,Dong-A(α2);干扰素,Genentech(γ);干扰素,Novartis(α);白细胞间介素-12,Genetics Ins;白细胞间介素-15,Immunex;白细胞间介素-16,Research Cor;ISCAR-1;J005X;L-644257;licomarasminic acid;LipoTher;LK-409;LK-410;LP-2307;LT(R1926);LW-50020;MAF,Shionogi;MDP衍生物,Merck;间-脑啡肽TNI;甲基呋喃基丁内酯;MIMP;米立司亭;混合的细菌疫苗,Tem;MM-1;moniliastat;MPLA,Ribi;MS-705;莫拉丁酯;莫拉丁酯,Vacsyn;胞壁酰基二肽衍生物;胞壁酰基肽衍生物myelopid;-563;NACOS-6;NH-765;NISV,Proteus;NPT-16416;NT-002;PA-485;PEFA-814;肽,Scios;肽葡聚糖,Pliva;Perthon,Advanced Plant;PGM衍生物,Pliva;Pharmaprojects No.1099;No.1426;No.1549;No.1585;No.1607;No.1710;No.1779;No.2002;No.2060;No.2795;No.3088;No.3111;No.3345;No.3467;No.3668;No.3998;No.3999;No.4089;No.4188;No.4451;No.4500;No.4689;No.4833;No.494;No.5217;No.530;匹多莫德;匹美劳肽;吡萘非特;PMD-589;鬼臼霉素,Conpharm;POL-509;聚-ICLC;聚-ICLC,Yamasa Shoyu;聚A-聚U;多糖A;蛋白A,Berlox Bioscience;PS34WO;假单胞菌属MAbs,Teijin;Psomaglobin;PTL-78419;Pyrexol;pyriferone;Retrogen;Retropep;RG-003;Rhinostat;利福克昔rifamaxil;RM-06;Rollin;罗莫肽;RU-40555;RU-41821;Rubella抗体,ResCo;S-27609;SB-73;SDZ-280-636;SDZ-MRL-953;SK & F-107647;SL04;SL05;SM-4333;Solutein;SRI-62-834;SRL-172;ST-570;ST-789;staphage溶胞产物;促病毒素;suppressin;T-150R1;T-LCEF;他比劳肽;替莫肽;Theradigm-HBV;Theradigm-HPV;Theradigm-HSV;THF,Pharm & Upjohn;THF,Yeda;thymalfasin;胸腺激素成分;胸腺卡汀;thymolymphotropin;胸腺增生素;胸腺增生素类似物;胸腺增生素,Peptech;胸腺素成分5,α;胸腺刺激素;胸腺曲南;TMD-232;TO-115;转移因子,Viragen;他福新,Selavo;乌苯美司;Ulsastat;ANGG-;CD-4+;Collag+;COLSF+;COM+;DA-A+;GAST-;GF-TH+;GP-120-;IF+;IF-A+;IF-A-2+;IF-B+;IF-G+;IF-G-1B+;IL-2+;IL-12+;IL-15+;IM+;LHRH-;LIPCOR+L LYM-B+;LYM-NK+;LYM-T+;OPI+;PEP+;PHG-MA+;RNA-SYN-;SY-CW-;TH-A-1+;TH-5+;TNF+;UN。
用于本发明的代表性的核苷和核苷酸化合物包括但不限于:(+)-顺式-5-氟-1-[2-(羟基-甲基)-[1,3-氧硫杂环戊烷-5-基]胞嘧啶;(-)-2′-脱氧-3′-硫代胞苷-5′-三磷酸盐(3TC);(-)-顺式-5-氟-1-[2-(羟基-甲基)-[1,3-氧硫杂环戊烷-5-基]胞嘧啶(FTC);(-)2′,3′,二脱氧-3′-硫杂胞苷[(-)-SddC];1-(2′-脱氧-2′-氟-β-D-阿糖呋喃基)-5-碘代胞嘧啶(FIAC);1-(2′-脱氧-2′-氟-β-D-阿糖呋喃基)-5-碘代胞嘧啶三磷酸盐(FIACTP);1-(2′-脱氧-2′-氟-β-D-阿糖呋喃基)-5-甲尿嘧啶(FMAU);1-β-D-呋喃核糖基-1,2,4-三唑-3-甲酰胺;2′,3′-二脱氧-3′-氟-5-甲基-脱氧胞苷(Fdd MeCyt);2′,3′-二脱氧-3′-氯-5-甲基-脱氧胞苷(ClddMeCyt);2′,3′-二脱氧-3′-氨基-5-甲基-脱氧胞苷(Add MeCyt);2′,3′-二脱氧-3′-氟-5-甲基-胞苷(FddMeCyt);2′,3′-二脱氧-3′-氯-5-甲基-胞苷(ClddMeCyt);2′,3′-二脱氧-3′-氨基-5-甲基-胞苷(AddMeCyt);2′,3′-二脱氧-3′-氟代胸腺密啶核苷(FddThd);2′,3′-二脱氧-β-L-5-氟代胞苷(β-L-FddC);2′,3′-二脱氧-β-L-5-噻胞苷;2′,3′-二脱氧-β-L-5-胞苷(β-1-ddC);9-(1,3-二羟基-2-丙氧基甲基)鸟嘌呤;2′-脱氧-3′-硫杂-5-氟胞嘧啶;3′-氨基-5-甲基-脱氧胞苷(AddMeCyt);2-氨基-1,9-[(2-羟基甲基-1-(羟基甲基)乙氧基]甲基]-6H-嘌呤-6-酮(更昔洛韦);2-[2-(2-氨基-9H-嘌呤-9-基)乙基]-1,3-propandil二醋酸盐(famciclovir);2-氨基-1,9-二氢-9-[(2-羟基-乙氧基)甲基]6H-嘌呤-6-酮(阿昔洛韦);9-(4-羟基-3-羟基甲基-丁-1-基)鸟嘌呤(喷昔洛韦);9-(4-羟基-3-羟基甲基-丁-1-基)-6-脱氧-鸟嘌呤二醋酸盐(法昔洛韦);3′-叠氮-3′-脱氧胸腺密啶核苷(AZT);3′-氯-5-甲基-脱氧胞苷(ClddMeCyt);9-(2-膦酰基-甲氧基乙基)-2′,6′-二氨基嘌呤-2′,3′-二脱氧核苷;9-(2-膦酰基甲氧基乙基)腺嘌呤(PMEA);阿昔洛韦三磷酸盐(ACVTP);D-碳环-2′-脱氧鸟苷(CdG);二脱氧-胞苷;二脱氧-胞嘧啶(ddC);二脱氧-鸟嘌呤(ddG);二脱氧-肌苷(ddI);E-5-(2-溴代乙烯基)-2′-脱氧尿苷三磷酸盐;氟-阿糖呋喃基-碘尿嘧啶;1-(2′-脱氧-2′-氟-1-β-D-阿糖呋喃基)-5-碘代-尿嘧啶(FlAU);斯塔夫定;9-β-D-阿糖呋喃基-9H-嘌呤-6-胺一水合物(Ara-A);9-β-D-阿糖呋喃基-9H-嘌呤-6-胺-5′-一磷酸盐一水合物(Ara-AMP);2-脱氧-3′-硫杂-5-氟胞苷;2′,3′-二脱氧-鸟嘌呤;和2′,3′-二脱氧-鸟苷。
用于制备本发明的核苷和核苷酸的合成方法是本领域公知的,如以下所公开的:Acta Biochim.Pol.,43,25-36(1996);Swed.Nucleosides Nucleotides 15,361-378(1996);Synthesis12,1465-1479(1995);Carbohyd.Chem.27,242-276(1995);Chem.Nucleosides Nucleotides 3,421-535(1994);Ann.Reports in Med.Chem.,Academic Press;and Exp.Opin.Invest.Drugs 4,95-115(1995)。
以上引用的参考文献介绍的化学反应一般公开了它们在本发明的化合物的制备中的最广泛应用。有时候,这些反应不能如所述的那样用于包括在本文公开的化合物范围内的每个化合物。本领域熟练人员易于确定发生此情形的化合物。所有这种情形下,或者通过通常本领域熟练人员已知的常规修正成功地实施该反应,例如,通过适当的保护干扰基团,通过改变可选择的常规试剂,通过反应条件的常规修正,等,或者本文公开的其它反应或别的常规方式能应用于本发明相应化合物的制备。在所有制备方法中,所有原料是已知的或易于由已知原料制备。
当核苷类似物通常像抗病毒剂一样使用时,有时核苷酸(核苷磷酸)必须转化成核苷以便促进它们经细胞膜的转运。能够进入细胞的化学改性的核苷酸的例子是S-1-3-羟基-2-膦酰基甲氧基丙基胞嘧啶(HPMPC,Gilead Sciences).为酸的本发明的核苷和核苷酸化合物能形成盐。例子包括碱金属盐或碱土金属盐,如钠、钾、钙或镁,或者有机碱或碱性季铵盐。
用于本发明的联合治疗方法的免疫调节剂和免疫刺激剂能以低于本领域常规量的剂量施用。例如,干扰素α通常以约1×106单位/人每周三次至约10×106单位/人每周三次的剂量给予患者用于治疗HCV感染(Simon等.,Hepatology 25:445-448(1997))。在本发明的方法和组合物中,此剂量的范围是约0.1×106单位/人每周三次至约7.5×106单位/人每周三次;更优选约0.5×106单位/人每周三次至约5×106单位/人每周三次;最优选约1×106单位/人每周三次至约3×106单位/人每周三次。由于在有本发明的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂的情形下,免疫调节剂和免疫刺激剂增强的丙型肝炎病毒抗病毒效力,在本文公开的方法和组合物中可采用减少量的这些免疫调节剂/免疫刺激剂。类似地,由于在有免疫调节剂和免疫刺激剂的情形下,目前的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂的强丙型肝炎病毒抗病毒效力,在本文公开的方法和组合物中可采用减少量的这些HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂。在感染的经受治疗的患者中通过常规监测丙型肝炎病毒滴度能够测定该减少数量。这可通过以下方案实现,例如,由狭线印迹、斑点印迹或RT-PCR技术,或者由HCV表面或其它抗原测量监测患者血清中HCV RNA。在采用本文公开的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和其它具有抗HCV病毒活性的化合物(例如核苷和/或核苷酸抗病毒剂)的联合治疗期间,同样可监测患者以测定联合使用时每个的最低有效剂量。
本文公开的联合治疗方法中,核苷或核苷酸抗病毒化合物,或其混合物,能以约0.1mg/人/天至约500mg/人/天的量对人给药;优选约10mg/人/天至约300mg/人/天;更优选约25mg/人/天至约200mg/人/天;甚至更优选约50mg/人/天至约150mg/人/天;并且最优选约1mg/人/天至约50mg/人/天的范围。
化合物的剂型可以以单次剂量或适当的多次亚剂量对病人给药。在后者中,剂量单位组合物可以包含其亚多次用量以组成每天剂量的量。每天多剂量亦能增加每天总剂量,这应是开药物处方的人希望的。
以本发明的化合物和/或组合物治疗患有HCV感染的患者的方案根据多种因素选择,这些因素包括年龄、体重、性别、饮食,和患者的医学症状、感染的严重性、给药途径,药理学考虑,如活性、功效、药动学和采用具体化合物的毒理学曲线,以及是否采用药物输送系统。本文公开的药物组合的给药通常应该持续几周至几月或几年的周期,直到病毒滴度达到可接受的水平,这表明已经控制或根除感染。经受本文公开的药物联合治疗的患者可通过由狭线印迹、斑点印迹或RT-PCR技术测量肝炎病毒RNA进行常规监测,或者由血清中丙型肝炎病毒抗原(如表面抗原)测量确定治疗的效力来进行常规监测。这些方法得到的数据的连续分析允许治疗期间修正治疗方案,这样以致于服用组合中每个组分的优化量,并且也可测定治疗的持续时间。因此,在治疗过程中能合理地修改治疗方案/给药时间表,这样以致于服用每种共同显示满意地抗丙型肝炎病毒效力的联合使用的抗病毒化合物的最低量,并且以致于这些组合的抗病毒化合物仅仅连续给药,只要这对于成功治疗感染是必需的。
本发明包括使用本文公开的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂与前述和类似类型的具有抗HCV活性的化合物的各种组合,以治疗或预防患者的HCV感染。例如,一种或多种HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂可用于与下列物质组合:一种或多种干扰素或具有抗HCV活性的干扰素衍生物;一种或多种具有抗HCV活性的非-干扰素化合物;或一种或多种干扰素或具有抗HCV活性的干扰素衍生物和一种或多种具有抗HCV活性的非-干扰素化合物。联合用于治疗或预防患者HCV感染时,任何目前公开的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和前述具有抗HCV活性的化合物可以药学上或抗HCV有效量存在。由于它们的加和作用或协同作用,在用于上述组合时,每个亦可为亚临床药学有效或抗HCV有效量存在,即若单独使用时,与这些以药学有效量使用时HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和具有抗HCV活性的化合物相比,在完全抑制或减少HCV病毒粒子蓄积和/或减轻或改善与HCV感染有关的症状或综合征或患者的发病中提供减少的药效的量。此外,本发明包括如上所述的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和具有抗HCV活性的化合物联合使用,以治疗或预防HCV感染,这里一个或多个的这些抑制剂或化合物以药学有效量存在,并且其它的由于它们的加和或协同作用是以亚临床药学有效或抗HCV有效量存在。如本文使用的,术语″加和作用″描述两个(或多个)药物活性剂等于每个单独给药的药剂作用之和的联合作用。协同作用是两个(或多个)药物活性剂的联合作用大于每个单独给药的药剂作用之和。
实施例42
当前丙型肝炎病毒(HCV)感染的治疗标准是以免疫调节剂α-干扰素治疗(Chronic Hepatitis C:Current Disease Management,U.S.Department of Health and Human Services,National Institutesof Health,1999)。这种疗法在大多数HCV患者中无效,他们或者无应答,或者甚至在延长干扰素治疗之后复发。另外,这里有与干扰素治疗有关的严重副作用。
考虑到对于新型、更有效的治疗HCV感染患者的抗病毒药的紧迫需要,本发明人已经研发了一系列的抑制HCV丝氨酸蛋白酶的化合物(HCV病毒蛋白NS3和NS4A的复合体)。这些化合物可以单独使用,彼此共同使用,以及组合其它类的化合物,以治疗或预防HCV感染。本实施例描述了三种典型的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂的实验,即化合物CU、化合物EP和化合物EC,在HCV次基因组RNA复制子分析(RepliconAssay)中单独和组合一组干扰素(干扰素α-2B(Schering Plough),干扰素α-2A(PBL Biomedical Laboratories,New Brunswick,NJ),干扰素β(Research Diagnostics Inc,Flanders,NJ),和羊-干扰素τ(Research Diagnostics Inc,Flanders,NJ))的个体以测定是否两个化合物共同作用以减少HCV RNA的蓄积。相对于未治疗细胞内复制子RNA的数量,在药物治疗两天之后复制子分析测量保留在复制子细胞内的HCV次基因组RNA(复制子RNA)的含量(Lohmann等人,Science,285:110-113(1999))。此分析中,化合物作为HCV抗病毒药物的效力直接与复制子RNA蓄积的抑制水平成比例。
在体外复制子分析系统内组合分析这两个药物以确定一起使用时它们是否显示加和或协同的抗HCV活性。采用复制子分析作为体外HCV感染的替代模型以评价免疫调节剂,例如干扰素-α2B((Intron A);Schering Plough),和HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂,例如化合物CU,的联合作用。如下所示,结果证明,采用分析它们在复制子分析中减少HCV RNA水平能力的协同性的形式数学测定测量时,这两类的药物有明显的抗HCV协同作用。复制子分析
Lohmann等于Scienee 285:110-113(1999)描述了采用含有自我复制HCV次基因组RNA(复制子)细胞系的复制子分析。在本文介绍的实验使用的复制子序列的Genbank入藏登记号在此参考中列为AJ242654。该文献公开了RNA由复制子cDNA的体外转录、复制子RNA通过电穿孔转染入Huh7细胞,和采用抗生素G418选择包含复制子RNA的细胞的方法。Huh7细胞是得自Fox Chase癌症研究中心(Philadelphia)William Mason博士的肝细胞瘤细胞。这些细胞以公众名义得自Fox Chase,并且已经被广泛描述在科技文献中(Nakabayashi等。Cancer Res.42:3858-3863(1982))。在本文描述的分析中,所有的模板DNA在这种RNA电穿孔入Huh7细胞之前,通过DNase的多步处理(三次连续处理)自体外转录的复制子RNA制剂除去。
如下详细介绍的实施复制子分析。简要地,复制子细胞以每孔10000个细胞的密度置于96孔盘且在37℃培养。这些细胞在补充10%胎牛血清、谷氨酰胺、非必需氨基酸和抗生素G418(0.25mg/ml)的DMEM(Dulbecco′s极限必需培养基)中培养。过夜培养之后,培养基以含有2%胎牛血清和各种浓度的丝氨酸蛋白酶抑制剂,如化合物CU,和/或干扰素,如干扰素-α2B(Intron A,Schering Plough)的DMEM代替。在6至8个不同浓度测试每个化合物。对于该浓度范围的一个极点,选择在治疗两天后会导致复制子RNA蓄积几乎完全抑制的高浓度的化合物。由这些开始浓度,制备系列稀释液,这样以致于复制子分析中的浓度范围包括其中化合物极有效的浓度,以及其中无显著作用的浓度。未加入任何干扰素,以及加入6至8个不同干扰素剂量,测试每个HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂浓度。同样地,未加入任何HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂,测试干扰素。以这种化合物培养48小时之后,由板除去培养基,采用Qiagen公司(Valencia,CA)制造的RNeasy-96药盒由细胞中提取总细胞RNA。接着通过定量RT-PCR,或TaqMan(Applied Biosystems,Foster City CA)分析这种RNA。TaqManRT-PCR靶是复制子RNA中新霉素耐药基因。配置板,这样以致于每个药物治疗样品有5个平行测定,未治疗样品有16个平等测定。这使定量RT-PCR数据有极大的统计学置信度。
复制子分析数据的分析产生两个用于评估有效HCV病毒剂功效的值。在每个分析的化合物浓度,要相对于未治疗细胞内复制子RNA的数量,测定治疗两天期间化合物引起的复制子RNA蓄积的抑制水平。这报道为抑制百分比。当获得通过在浓度范围内细胞治疗产生的一系列数据点时,产生IC50值,即,HCV复制子RNA蓄积通过该合物减少50%的化合物浓度。通过重复HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂在复制子分析中的分析,确定IC50具有约20%的变异系数百分比(IC50/平均IC50中%CV或100% x的标准误差)。IC50是用于把此分析中分析的各个化合物基于它们作为HCV抗病毒剂的功效分类的值。简单的IC50测定对于评估联合中使用的化合物的应用是不充分的。采用各种干扰素和丝氨酸蛋白酶抑制剂的所有组合产生的分析数据的最有效的分析需要采用以下描述的数学方法评价如表7所示的抑制百分比,该方法被设计成确定联合治疗是否是竞争、加和或协同的。
复制子分析的细节如下:在HCV复制子分析中采用TaqMan RT-PCR定量分析HCV复制子RNA 的方法
采用复制子分析测量有效的HCV抗病毒化合物抑制HCV次基因组RNA复制子分子在Huh7细胞系中蓄积的能力(Lohmann等.Replication of Subgenomic Hepatitis CVirus RNAs in a HepatomaCell Line.Science 285,110-113(1999))。此分析包括三个操作组分:(1)复制子细胞保养,分析板装置,和化合物应用;(2)由复制子细胞提取总的细胞RNA;和(3)实时RT-PCR(TaqMan)以测量每个样品内复制子RNA的数量。复制子分析需要实施至少4天;然而,步骤之间可中断该方法并且冷冻样品。以下描述每个分析组分。1.复制子细胞保养,分析板装置,和化合物施用
1.1复制子细胞系保养
如Lohmann等所述(Replication of Subgenomic Hepatitis CVirus RNAs in a Hepatoma Cell Line.Science 285,110-113(1999))生产用于复制子分析的细胞系。含有复制子细胞的150cm2细胞培养瓶(Costar)于37℃和5%CO2培养且融合之后,细胞以1∶10,v/v,稀释入新鲜的150cm2细胞培养瓶。培养基是含有10%胎牛血清(FBS)、1X非必需氨基酸(NEAA)、1X谷氨酰胺(Glu)和0.25mg/ml G418的DMEM。进行三个连续传代,每个时间允许细胞融合,之后细胞稀释入新鲜的150cm2细胞培养瓶。这些细胞,称为″原始细胞,″接着等分并贮藏以便将来用于复制子分析。进行TaqMan基分析以确定每个细胞HCV复制子基因组数量,它显示每个细胞有~150个拷贝的复制子。这基于复制子RNA的拷贝与两倍的人apoB基因(单倍体基因组数目)的拷贝的比值。
1.1.1原始细胞贮藏于液态N2。对于用于复制子分析的细胞,20连续传代后,抛弃细胞,由液态N2贮藏复苏新鲜批量。
1.2细胞在复制子分析用96孔盘上的接种
1.2.1.为了制备96孔板,胰蛋白酶化75cm2烧瓶75%融合的含复制子的细胞,并在10ml培养基A中再悬浮。通过除去培养基,加入1ml0.25% w/v胰蛋白酶-EDTA,接着除去胰蛋白酶-EDTA进行胰蛋白酶化。5-10分钟之后,细胞从烧瓶释放并在培养基中再悬浮。
1.2.2.采用血球计数器计数细胞,并且细胞浓度调节至105个细胞/ml。
1.2.3.每个孔采用Impact 2多通道移液管(Matrix)接种100μl细胞悬浮液,单个细胞悬浮液不再接种超过4个的96孔板
1.2.4.96-孔板在37℃培养过夜。
1.3.化合物稀释并应用至复制子细胞盘
1.3.1.HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂化合物溶于二甲基亚砜(DMSO),至最终浓度20mM。干扰素悬浮于含有0.1%w/v牛血清白蛋白的磷酸盐缓冲的生理盐水溶液。
1.3.2.20mM化合物溶液以DMSO稀释至1mM。
1.3.3.50μl溶于DMSO的化合物加至10ml培养基B(化合物浓度是5mM,并且DMSO浓度现在是0.5%),或20μl的1mM化合物和30μl DMSO加至10ml培养基B(化合物浓度是2μM)。
1.3.4.通过混合化合物/培养基B溶液和培养基C(含有0.5% DMSO)完成化合物稀释至最终浓度。在2ml聚丙烯96孔区以培养基C进行化合物的连续1至5次稀释,获得希望的最终浓度的化合物。
1.3.5.细胞板由37℃培养器移走,在盖的右角和底部的右侧标记。培养基倾入到96孔板上。
1.3.6.源自96孔稀释区的每个孔的100μl化合物/培养基溶液采用Impact2移液管加至96孔细胞板。
1.3.7.按照表3,100μl培养基C加至所有未处理孔以便在或者1、3,或者6个不同浓度分析化合物。″ Untx ″指模拟处理的细胞(DMSO以和处理细胞中一样的浓度加入);″Con.″指化合物浓度。
表3
2个化合物,6种浓度,5个平行测定
化合物1 化合物2
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12A untx untx untx untx untx untx untx untx untx untxB con.1 con.1 con.1 con.1 con.1 con.1 con.1 con.1 con.1 con.1C con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2D con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3E con.4 con.4 con.4 con.4 con.4 con.4 con.4 con.4 con.4 con.4F con.5 con.5 con.5 con.5 con.5 con.5 con.5 con.5 con.5 con.5G con.6 con.6 con.6 con.6 con.6 con.6 con.6 con.6 con.6 con.6H untx untx untx untx untx untx untx untx untx untx
4个化合物,3种浓度,5个平行测定
化合物1 化合物2
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12A untx untx untx untx untx untx untx untx untx untxB con.1 con.1 con.1 con.1 con.1 con 1 con.1 con.1 con.1 con.1C con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2D con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3E con.1 con.1 con.1 con.1 con.1 con.1 con.1 con.1 con.1 con.1F con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2 con.2G con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3 con.3H untx untx untx untx untx untx untx untx untx untx
化合物3 化合物4
16个化合物,1种浓度,4个平行测定。
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12A untx cpd1 cpd2 cpd3 cpd4 cpd5 cpd6 cpd7 cpd8 untxB untx cpd1 cpd2 cpd3 cpd4 cpd5 cpd6 cpd7 cpd8 untxC untx cpd1 cpd2 cpd3 cpd4 cpd5 cpd6 cpd7 cpd8 untxD untx cpd1 cpd2 cpd3 cpd4 cpd5 cpd6 cpd7 cpd8 untxE untx cpd9 cpd10 cpd11 cpd12 cpd13 cpd14 cpd15 cpd16 untxF untx cpd9 cpd10 cpd11 cpd12 cpd13 cpd14 cpd15 cpd16 untxG untx cpd9 cpd10 cpd11 cpd12 cpd13 cpd14 cpd15 cpd16 untxH untx cpd9 cpd10 cpd11 cpd12 cpd13 cpd14 cpd15 cpd16 untx
12个化合物,1种浓度,5个平行测定。
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12A untx untx untx untx untx untx untx untx untx untxB cpd1 cpd1 cpd1 cpd1 cpd1 cpd7 cpd7 cpd7 cpd7 cpd7C cpd2 cpd2 cpd2 cpd2 cpd2 cpd8 cpd8 cpd8 cpd8 cpd8D cpd3 cpd3 cpd3 cpd3 cpd3 cpd9 cpd9 cpd9 cpd9 cpd9E cpd4 cpd4 cpd4 cpd4 cpd4 cpd10 cpd10 cpd10 cpd10 cpd10F cpd5 cpd5 cpd5 cpd5 cpd5 cpd11 cpd11 cpd11 cpd11 cpd11G cpd6 cpd6 cpd6 cpd6 cpd6 cpd12 cpd12 cpd12 cpd12 cpd12H untx untx untx untx untx untx untx untx untx untx
1.4.板于37℃培养48小时,接着进行RNA提取。
表4
用于细胞培养和化合物混合的设备和原料的概要 |
8通道Impact2移液管,1250μl |
cat no 2004 |
Matrix |
2ml聚丙烯深孔区,96孔,无菌 |
cat no 4222 |
Matrix |
25ml试剂储罐,无菌 |
cat no.8096 |
Matrix |
1250μl X-tra长吸管尖 |
cat no.8255 |
Matrix |
96孔板 |
cat no.3595 |
Costar |
血细胞计数器 |
明线改善Neubauer 0.1mm 深 |
Reichert |
|
DMEM |
cat no.51444-79P |
JRH |
L-谷氨酰胺(Glu) |
cat no.12403-010 |
GIBCO-BRL |
非必需氨基酸(NEAA) |
cat no.11140-050 |
GIBCO-BRL |
胎牛血清(FBS) |
cat no.16250-078 |
GIBCO-BRL |
G418 |
cat no.55-0273 |
Invitrogen |
DMSO |
cat no.D-2650 |
Sigma |
培养基A |
DMEM,10% FBS,1X NEAA,1X Glu,0.25mg/ml G418 |
培养基B |
DMEM,2% FBS,1X NEAA,1X Glu |
培养基C |
DMEM,2% FBS,1X NEAA,1X Glu,0.5% DMSO |
胰蛋白酶-EDTA 0.25% |
GIBCO-BRL |
|
2.复制子细胞的总细胞RNA的提取
2.1介绍
该方法的目的是由体外组织培养样品提取RNA,这样以致于病毒或细胞RNA定量回收,并且纯度足够定量HCV RT-PCR测定分析。
为了在RNA提取的效率中允许变异的检测,标准量的牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、与HCV某些相似的RNA病毒,在RNA提取之前加至每个细胞样品。因此,在最终的多倍RT-PCR反应中检测的BVDV RNA水平在所有孔之间应当在复制子分析相关的变异限度内一致。在以下的TaqMan章节进下讨论了这种RNA提取效率内部控制。
使用的RNA提取方法是Qiagen公司(Valencia,CA).制备的RNeasy-96方法。这种方法采用96个二氧化硅基小型柱,以与96孔组织培养操作兼容的阵列安置它们。RNA提取技术是Boom法的修正,其中所有的蛋白和核酸,包括核酸酶,首先以强离液盐(硫氰酸胍)变性。在此环境中,核酸对二氧化硅(小型圆柱中的材料)具有强的亲和性;然而,蛋白和其它污染物不结合二氧化硅,并流过该柱。以离液/乙醇溶液洗涤该柱之后,样品部分干燥,核酸接着以小体积的水由该柱释放。
为了在回收HCV RNA中减少差异,要关心柱洗涤和部分干燥条件。柱上有少量乙醇存在会污染最终的RNA并干扰RT-PCR检测系统。在此方法的所有阶段需要小心,由于起始样品是生物危险的,离液盐是高腐蚀性的,并且作为一种硫氰酸盐,如果允许与酸性环境接触,它能产生毒性的氰化物气体。
表5
HCV RNA提取方法所需的设备和原料的概要 |
|
RNeasy 96药盒(24) |
cat no.74183 |
Qiagen |
QIAvac 96岐管 |
cat no.19504 |
Qiagen |
离心机4-15C,2×96板用,6000xg |
cat no.81010 |
Qiagen |
2×96板用板转子 |
cat no.81031 |
Qiagen |
| | |
200标准普通乙醇8通道Impact2移液管,250μl |
cat no.2002 |
Matrix |
8通道Impact2移液管,1250μl |
cat no.2004 |
Matrix |
2ml聚丙烯深孔区,96孔,无菌 |
cat no.4222 |
Matrix |
25ml试剂储罐,无菌 |
cat no.8096 |
Matrix |
1250μl X-tra长吸管尖 |
cat no.8255 |
Matrix |
200μl吸管尖 |
cat no.7275 |
Matrix |
不合血清的MEM培养基 |
cat no.11095-80 |
GIBCOBRL |
2.2方法:
2.2.1细胞溶解
2.2.1.1.制备溶解缓冲液:向一个96-孔板,加入150μl β-巯基乙醇(β-ME)和1μl BVDV储液(加入之前涡动储液)至15ml RLT缓冲液(RNeasy药盒的一种成分,Qiagen)。这种储液通过以BVDV感染MDBK细胞(牛肾细胞,#CCL-22,得自美国典型培养物收藏中心(AmericanType Culture Collection),Manassas VA)且在致细胞病变效应(CPE)峰值收获培养物。此储液具有约1×107pfu/ml的感染滴度。在TaqMan分析中这给予BVDV约22的阈循环(Ct)。BVDV储液在-80℃冷冻机中贮藏。
2.2.1.2.以150μl不含血清MEM培养基洗涤细胞(8通道电子移液管P1250的程序4:填充1250,Disp 150×8)。向每个孔加入150μl溶解缓冲液(同样程序)。
2.2.1.3.立即提取RNA,或者在-80℃冷冻细胞。
2.2.2.制备RNA提取用试剂和原料。
2.2.2.1.注意RPE和RNeasy 96药盒的组#(lot#)。
2.2.2.2. RPE:720ml的100%乙醇加入一瓶RPE(Qiagen),并且良好混合;RPE瓶在使用之前总是良好摇动。
2.2.2.3. 70%乙醇:150ml焦碳酸二乙酯(DEPC)水加入350ml100%乙醇并良好混合。
2.2.3.以RNeasy 96药盒制备RNA
2.2.3.1.冷冻样品室温下解冻40分钟。同时,用于每板的一列提取对照品解冻(提取对照品:RNeasy提取对照品是彼此相连的8管装置。每管内有170μl的细胞溶解物,以及一定比例的HCV阳性和阴性细胞。由顶至底部是两个每个分别是低、中、高和零数对照品(参见以下方案的2.3节)。
2.2.3.2.通过移取100μl,前后五次,混合样品。整个样品转入2ml Matrix方孔区的列1-10(P250程序1:混合100×5,填充170,净化)。
2.2.3.3. 150μl的复制子标准品转入列11(列12无样品)。
2.2.3.4. 150μl的70%乙醇(EtOH)加至每个样品(P1250的程序4:填充1250,Disp 150)。
2.2.3.5.标记适当板号的RNeasy 96板置于真空岐管。混合并转移溶解物/乙醇至RNeasy 96板(P1250程序1:混合200,5次,填充330,并净化)。任何未使用的孔以透明塞(Qiagen提供)封闭,通常是列12。
2.2.3.6.抽真空(近似800mbar)以将样品装至小型柱上
2.2.3.7. RNeasy-96板以1000μl RW1缓冲液(Qiagen)/孔洗涤(P1250的程序2:填充1000,Disp 1000)。
2.2.3.8.滤过RW1缓冲液时过滤器抽真空,流出通道排空。
2.2.3.9. RNeasy-96板以1000μl RPE缓冲液/孔(P1250程序2)洗涤。
2.2.3.10.滤过RPE缓冲液时过滤器抽真空。
2.2.3.11.重复步骤2.2.3.9
2.2.3.12.滤过RPE缓冲液时抽真空,保持真空3分钟。
2.2.3.13.干燥RNeasy 96板:RNeasy-96板置于微管收集架(Qiagen提供)上,盖上提供的AirPore塞,并且此单元在6000xg离心10分钟(Qiagen Sigma离心机;4-15℃)。
2.2.3.15.由RNeasy 96孔板洗脱RNA:RNeasy-96板转移至新微管收集架的顶部。70μl的无Rnase水加至每个孔的中间(P1250程序3:填充850,Disp 70)。
2.2.3.16.室温下培养1分钟,接着在板上放置新AirPore塞。
2.2.3.17.此单元接着在Sigma 4-15C离心机内以6000xg离心4分钟。洗脱体积测量在28μl和50μl之间。
2.2.3.18.弃去RNeasy-96板,管收集架以Qiagen提供的盖子密闭(每带8个)。
2.2.3.19.洗脱出的RNA在-80℃贮藏,或者立即以TaqNan分析。
2.3提取对照物制备
第1天
2.3.1.1.在150cm2组织培养瓶中(T-150)接种2.5×107复制子-生成细胞。
2.3.1.2.在75cm2的组织培养瓶中(T-75)接种2.0×106Huh7细胞。
2.3.1.3 37℃培养过夜。
第2天
2.3.1.4.以溶解缓冲液溶解细胞。
2.3.1.5.由Huh7和复制子-生成细胞除去上清液,以10ml无血清培养基(MEM)洗涤单层。
2.3.1.6.向Huh7细胞加入30ml溶解缓冲液(具有1μl BVDV储液/15ml溶解缓冲液),通过反复移液混合,并且细胞溶解物置于50ml锥形底组织培养离心管。
2.3.1.7.向复制子-生成细胞加入10.5ml溶解缓冲液,通过反复移液混合,并且细胞溶解物置于15ml锥形底组织培养离心管。
2.3.2.高提取标准:170μl等分试样的复制子-形成细胞细胞溶解物进入两个Matrix 0.75ml管架的5和6行。
2.3.3.中等提取标准:加1.0ml复制子-形成细胞细胞溶解物至9ml Huh7溶解物,良好混合。170μl等分试样的此混合物至两个Matrix0.75ml管架的3和4行。
2.3.4.低提取标准:加50μL复制子-形成细胞细胞溶解物至10mlHuh7溶解物,良好混合。170μl等分试样的此混合物至两个Matrix0.75ml管架的1和2行。
2.3.5.零提取对照:170μl等分试样Huh7细胞溶解物至两个Matrix 0.75ml管架的7和8行。
2.3.6.在-80℃贮藏对照品。
3. TaqMan
RT-PCR和数据分析
3.1引入:采用实时定量RT-PCR测量每个样品内HCV复制子RNV的量。该技术亦称为PCR-基5′核酸酶分析,和TaqMan。分析仪器是Applied Biosystems 7700 Prism Sequence Detection System(Applied Biosystems,Foster City,CA)。这种仪器实质上是与热循环计耦合的时间-多路激光诱发的荧光光谱仪。它监测96孔样品盘的每个孔内PCR扩增子在该PCR过程内的蓄积。
3.2.使用BVDV内部对照:如先前章节所述,每个样品内掺入内部阳性对照。这用作RNA提取效率的测量,并且显示样品内是否含有抑制TaqManPCR的污染物。BVDV与离液细胞溶解缓冲液在施用这种溶解缓冲液至细胞之前混合。尽管每个样品中有阳性对照,BVDV内部阳性对照分析仅仅在HCV复制子RNA分析数据在预期限度之外时实施,这表明样品中可能存在问题。通过采用以两种不同的荧光报道染料标记的检测探针,7700能够同时监测同一试管内两个不同的PCR扩增子的蓄积(″多重″)。数据分析节(3.6)描述了引出样品板BVDV内部阳性对照用的TaqMan分析的具体标准。
3.3 HCV复制子RNA TaqMan探针和引物。由于预期的遗传稳定性和复制子内编码的新霉素耐药基因(neo)通常缺乏RNA二级结构,采用在该区域结合的引物和探针。复制子RNA的片段从8001碱基对复制子(SEQ ID NO:1)的碱基342-1193延伸:301 gtgcttgcga gtgccccggg aggtctcgta gaccgtgcac catgagcacg aatcctaaac361 ctcaaagaaa aaccaaacgt aacaccaacg ggcgcgccat gattgaacaa gatggattgc421 acgcaggttc tccggccgct tgggtggaga ggctattcgg ctatgactgg gcacaacaga481 caatcggctg ctctgatgcc gccgtgttcc ggctgtcagc gcaggggcgc ccggttcttt541 ttgtcaagac cgacctgtcc ggtgccctga atgaactgca ggacgaggca gcgcggctat601 cgtggctggc cacgacgggc gttccttgcg cagctgtgct cgacgttgtc actgaagcgg661 gaagggactg gctgctattg ggcgaagtgc cggggcagga tctcctgtca tctcaccttg721 ctcctgccga gaaagtatcc atcatggctg atgcaatgcg gcggctgcat acgcttgatc781 cggctacctg cccattcgac caccaagcga aacatcgcat cgagcgagca cgtactcgga841 tggaagccgg tcttgtcgat caggatgatc tggacgaaga gcatcagggg ctcgcgccag901 ccgaactgtt cgccaggctc aaggcgcgca tgcccgacgg cgaggatctc gtcgtgaccc961 atggcgatgc ctgcttgccg aatatcatgg tggaaaatgg CCGCTTTTCT GGATTCATCG
正向引物1021 aCTGTGGCCG GCTGGGTGTG GcggacCgct atcaggacat agcgttggct acccgtgata
TaqMan*探针1081 ttgctgaaga gcTTGGCGGC GAATGGGctg accgcttcct cgtgctttac ggtatcgccg
反向引物1141 ctcccgattc gcagcgcatc gccttctatc gccttcttga cgagttcttc tgagtttaaa
3.4.方法
3.4.1. NEO和BVDV RT-PCR用1x主混合物的制备方法
表6
制备RT-PCR 10-板主混合物的设备和原料的概要 |
设备和原料 |
序数 |
供应商 |
0.5-10μl移液管 |
22 47 005-1 2000系列 |
Eppendorf |
2-20μl移液管 |
22 47 015-9 2000系列 |
Eppendorf |
10-100μl移液管 |
22 47 020-5 2000系列 |
Eppendorf |
50-200μl移液管 |
22 47 025-6 2000系列 |
Eppendorf |
100-1000μl移液管 |
22 47 030-2 2000系列 |
Eppendorf |
1250μl Matrix吸头 |
cat no.8255 |
Matrix |
200μl Matrix吸头 |
cat no.7275 |
MatrixMolecular BioproductsMolecular BioproductsMolecular Bioproducts |
10μl ART吸头 |
cat no.2140 |
20μl ART吸头 |
cat no.2149P |
100μl ART吸头 |
cat no.2065E |
200μl ART吸头 |
cat no.2069 |
Molecular BioproductsMolecular BioproductsMatrix |
1000μl ART吸头 |
cat no.2079E |
电子移液管,Impact2 |
cat no.2001 |
1.5ml无RNase microfuge管 |
cat no.12450 |
Ambion |
14ml聚丙烯管 |
cat no.352059 |
Falcon |
25ml试剂储罐 |
cat no.8096 |
Matrix |
96孔反应板 |
cat no.N801-0560 |
Applied Biosystems |
光学帽带(optical cap strips) |
cat no.N801-0935 |
Applied Biosystems |
易处理的无菌长外衣 |
cat no.9515-E |
Baxter |
试剂 |
序数 |
供应商 |
酸 |
0.1N HCl |
Fisher |
RNAseZap |
cat no.9780 |
AmbionMolecular Bioproducts |
RNAse away |
cat no.7005 |
10-pak,EZ RT-PCR核心药盒,5x反应缓冲液,25mM醋酸锰,脱氧NTPs |
cat no.403028 |
Applied Biosystems |
VIC NEO探针,2μM(=10x),每个等分试样550μl |
cat no.450003,定制,5′-VIC-CTG TGG CCG GCTGGG TGT GG-TAMRA-3′(SEQ ID NO:2) |
Applied Biosystems |
VIC BVDV探针,2μM(=10x),每个等分试样550μl(Vertex) |
cat no.450003,定制,5′-VIC-CCC TCG TCC ACGTGG CAT CTC GA-TAMRA-3′(SEQ ID NO:3) |
Applied Biosystems |
NEO正向引物,3μM(=10x) |
cat no.4304972,定制,5′- |
Applied Biosystems |
正向/反向引物混合物,每个等分试样550μl |
CCG CTT TTC TGG ATTCAT CG-3'(SEQ ID NO:4) | |
NEO反向引物,3μM(=10x)正向/反向引物混合物。每个等分试样550μl |
cat no.4304972,定制,5'-CCC ATT CGC CGC CAA-3'(SEQ ID NO:5) |
Applied Biosystems |
BVDV正向引物,3μM(=10x)正向/反向引物混合物,每个等分试样550μl |
定制,5'-CAG GGT AGTCGT CAG TGG TTC G-3'(SEQ ID NO:6),1.0μM规模w/凝胶纯化 |
Oligos etcOligos etc |
BVDV反向引物,3μM(=10x)正向/反向引物混合物,每个等分试样550μl |
定制,5'-GGC CTC TGCAGC ACC CTA TC-3'(SEQID NO:7),1.0μM规模w/凝胶纯化 |
NEO RNA标准 |
由含有HCV复制子RNA新基因部分采用T7 RNA聚合酶体外转录RNA。该体外转录的RNA基于转录物已知分子量和纯化转录溶液的UV吸收定量。稀释RNA,等份且于-80℃贮藏。各个等分试样融化用于每个TaqMan分析。 |
从HCV复制子细胞(该方案第2节)分离的待试验RNA样品,10μl/96孔板 | |
无核酸酶水(非DEPC处理的) |
cat no.9930 |
Ambion |
3.4.2.主混合物用试剂的制备
3.4.2.1.按照以下两个步骤清洗工作台,并且以RNAse away擦移液管。
RNAse Zap(Ambion,Austin,TX)
RNAse Away(Mo1ecular Bioproducts,San Diego,CA)
3.4.2.2.打开核心EZ RT-PCR试剂(Applied Biosystems)并且将5x缓冲液放于冰上,室温融化冷冻试剂约15分钟,接着将它们放在冰上。可以使用一种EZ RT-PCR药盒分析两个96孔RNA提取物。
3.4.2.3.由-20℃取一管2μM VIC探针(NEO或BVDV,每管550μl)并置于冰上。
3.4.2.4.由-20℃取一管3μM正向/反向引物混合物(NEO或BVDV,每管550μ1)并置于冰上。
3.4.2.5.由-80℃取一管(30μl)标准RNA转录物(108拷贝/10μl)并置于冰上。
3.4.2.6.取一管室温Ambion水。
3.4.3.用于一个96孔板反应的主混合物系统。
3.4.3.1.用1ml移液管以转移5x缓冲液(Applied Biosystems)至14ml管;加入的总体积是1100μl。
3.4.3.2.用1ml移液管以加25mM Mn(OAc)2(Applied Biosystems)至14ml管;加入的总体积是660μl。
3.4.3.3.用200μl移液管以加165μl 10mM dATP至14ml管。10mMdCTP,20mM dUTP,和10mM dGTP同样处理。
3.4.3.4.用1ml移液管以添加550μl 10x 3μM正向/反向引物混合物。
3.4.3.5.用1ml移液管以添加550μl 10x 2μM探针。
3.4.3.6.用1ml移液管以添加220μl rTth DNA聚合酶(AppliedBiosystems)。
3.4.3.7.用100μl移液管以添加55μl AmpErase UNG(AppliedBiosystems)。
3.4.3.8.用1ml移液管以添加605μl Ambion H2O至14ml管;最终体积总计是4400μl。
3.4.3.9.转移这种4400μl主混合物至25ml试剂储罐。
3.4.3.10.对于所有的96孔采用8通道移液管每孔分散40μl。
3.4.3.11.采用8通道移液管转移10μl提取的未知样品到反应板的孔,列接列,由列1至列11。转移之后每个列都盖上。
3.4.3.12.加270μl Ambion H2O至30μl 108拷贝/10μl RNA转录物,以便用于标准曲线和混合。现有107拷贝的HCV复制子数量的标准RNA/10μl。
3.4.4.每次运行调置ABI 7700
3.4.4.1每次运行之前,重新启动ABI 7700用计算机并重建桌面。
3.4.4.2从硬盘驱动器关闭和删除任何多余的程序;弃出超出运行的数据。
3.4.4.3打开Sequence Detector v1.7程序(SDS software)。
3.4.4.5打开″复制子分析运行″文件夹。
3.4.4.6打开″复制子分析″模板板。程式化入该模板的热循环计条件如下所示:
阶段1:50℃ 2分钟。
阶段2:60℃ 30分钟。
阶段3:95℃ 5分钟。
阶段4:95℃ 15秒。
阶段5:60℃ 60秒。
阶段4-5循环重复次数:40。
模板仪器:诊断:高级选项:
选择窗口:mse显示。
选择窗口:最佳适配显示。
选择杂项:参照染料ROX。
3.4.4.7以″复制子分析运行″文件夹″存储″(未″存储″)文件。
3.4.4.8显示安装:击RUN。
3.5使用SDS软件运行之后制备ABI7700数据。
3.5.1.由ABI7700除去分析板并不打开地弃去。这极大地减少了PCR交叉污杂的实验室问题。
3.5.2.采用Sequence Detector系统软件V1.7分析数据。
3.5.3.开始采用默认设置设置阈级。
3.5.4.数据舍去标准:可以舍去数据点或全部系列板。如果方案存在显著偏差、试剂故障或不幸之事,或者ABI 7700运行失败,可以舍去数据。为了由明显正常运行舍去任何数据点,必须符合这些标准的一个或多个。
3.5.4.1.阈循环计算。通常采用SDS软件用的默认值。如果大多数浓缩样品的Ct小于15,于是需要时改变阈值限值至更低的值,这样以致于最高浓度样品的Ct大于限值。进行此变化之后更新计算。
3.5.3.2.如由新RNA标准分析产生线的斜率和y轴截距的平均值的偏差所指示的,考虑舍去完全异常的TaqMan运行。那些值可接受的范围是:
斜率值应在3.0和3.6之间
y-截距循环应在36和41个循环之间。
3.5.4.3.如极值Rn/ΔRn所指示的异常的个别TaqMan孔可以在数据分析之前删去,这样以致于它们不会影响SDS软件计算。
3.5.4.4.检查和记录无-模板对照Ct值并确认它们>7.0Ct(>100X),高于任何化合物治疗样品的Ct。
3.5.5. HCV RNA标准Ct值与先前结果比较。
3.5.6. HCV RNA标准曲线与先前结果比较。
3.5.7.如果在个别孔异常的放大是明显的,识别并记录那些孔。
3.5.8.″结果″文件由7700计算机输出并转移至采用MicrosoftExcel分析的另一计算机。
3.5.9.报道在采用的试剂制备或稀释中的任何以下变化。
卖方新探针或引物合成。
新探针或引物稀释并等份。
新标准RNA转录物制备。
新标准RNA转录物稀释并等份。
新BVDV病毒制备。
新列11标准的制备。
3.6 TaqMan数据分析。
3.6.1.复制和粘贴TaqManHCV Ct值,并且由TaqMan结果文件复制值进入复制子分析数据分析Microsoft Excel宏的适当小区,运行该宏。
3.6.2.由宏表复制TaqMan结果表至另一表上,输入化合物序号和批号。
3.6.3由此excel表,计算5个平行测定和无化合物对照中的所有稀释点的平均、标准偏差和化合物抑制活性的CV百分比,以及HCV复制数、HCV Ct值和BVDV Ct值(如果有用)。
3.6.4. BVDV对照TaqMan的数据舍去和执行标准。检查所有计算。舍去数据点或全部系板。如果方案存在显著偏差、试剂故障或不幸之事,或者ABI 7700运行失败,可以舍去数据。为了由明显正常运行舍去任何数据点,必须符合这些标准的一个或多个。活性化合物中抑制百分比的标准偏差应小于30%。HCV复制数的%CV应小于30%。所有样品的HCV Ct标准偏差应小于0.5;大多数样品中这通常是约0.1至0.3。如果HCV Ct标准偏差大于0.5,于是返回原始数据表,并检查5个平行测定的Ct值。如果任何一个孔的Ct值是不同于5个平行测定的平均Ct值的2Ct,于是此孔应从该分析中忽略。如果超过3个孔(不在同一列上)具有不寻常的Ct值,于是应该实行BVDV TaqMan内部对照分析。如果BVDV数据显示不规则,于是再试验该化合物。
3.6.5. IC50计算:复制和粘贴平均抑制数据和标准偏差进入具有采用非线性回归法的变斜率计算器的S形剂量反应。采用这种工具,使用两种方法计算IC50:固定顶点仅在100%抑制,或者固定顶点在100%抑制,底在0%抑制。接着报道每个化合物产生最清楚配合的方法。最可信IC50来自具有最低标准误差的计算。如果由这两个曲线拟合选项计算的IC50显示大于一倍差异,或者如果IC50 SD大于IC50,在调整过的浓度应再试验该化合物。
HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂组合干扰素作用的计算
在复制子分析中通过有各种水平的干扰素时产生HSPI剂量反应曲线,或者通过测定有各种HSPI水平时干扰素的剂量反应曲线,可以评估HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂(HSPI)和干扰素的组合作用。目标是评估如果这两种药物产生对RNA的加和作用,是否有比预期更多或较少的病毒RNA蓄积抑制。更具体地,使用Lowe的加法性定义((1928)DieQuantitation Probleme der Pharmakologic,Ergebn.Physiol.,27,47-187)。这如下定义。令DE,INF为产生作用E的干扰素浓度,并且令DE,HSPI为产生作用E的蛋白酶抑制剂浓度。 接着通过以下关系定义无相互作用或低加法性,这里D1浓度的INF和D2浓度的HSPI的组合产生作用E。
协同或拮抗程度以等效曲线或Isobol表示。组合(D1,D2)是轴是干扰素和HSPI浓度的图中的点(图2)。所有产生有效水平E的这种组合形成E作用Isobol。(DE,INF,0)和(0,DE,HSPI)是Isobol上的点的情形是必需的。当满足加和关系(1)时Isobol是直线连接点(DE,INF,0)和(0,DE,HSPI)。
上凹的Isobol表示协同,下凹的Isobol表示拮抗。按照Berenbaum指南,M.C.((1985)The expected effect of acombination of agents:the general solution.J.Theor.Biol.,114,413-431),以及Greco,Park和Rustom((1990)Applicationof a New Approach for the Quantitation of Drug Synergism tothe Combination of cis-Diamminedichloroplatinumand 1-β-D-Arabinofuranosylcytosine,Cancer Research,50,5318-5327),加一项至(1)以计算协同或拮抗。该方程定义为在所有治疗组合适于百分比对照值的反应面。源自这种适合的反应面的轮廓绘图是Isobol。
反应面模型假定适于每个化合物的S形剂量反应如(2)定义。
单独产生规定水平活度E的浓度由(3)给出
为了满足Greco等.(1990)的模型,对于产生反应水平E的药物的每一组合,药物的联合作用接着必需满足方程(4)。
参数α测量相互作用的量。α的零值指无相互作用或加法性,由于该方程在=0时减少至(1)。给出IC50、Hill斜率(m)、最大值(Emax)和最小值(B),解方程,得出由组合[INF]和[HSPI]的任何治疗产生的作用。因此,此方程定义为反应表面。给出[INF]和[HSPI]变动的试验,采用非线性加权最小二乘回归选择参数。参数α与协同测量S相关(Hewlett,P.S.(1969)Measurement of potencies of drugmixtures.Biometrics,25,477-487),它直接取自50%作用时的Isobol。S是原点至Isobol定义加法性的距离,原料至拟合数据Isobol的距离,沿该线于与轴成45度时的比(S=ON/OM参见图3)。关系是α=4(S2-S)。
在评估一系列实验测试HSPI组合几种不同的干扰素的协同度之后是以上Greco等。(1990)讨论的用于拟合反应表面和测定具有显著水平的协同参数α的方法。然而,需要具有较低计数的加权观测大于具有较高计数的那些。这种计数直接与百分比对照相关,这是作用E。采用Carroll,R.J.和Rupert,D.((1988)描述的方法((1988)(Transformation and Weighting in Regression,Chapmanand Hall,New York),观察孔至孔的变异性,以增加平均百分比对照值的平方。因此,加权的观测在拟合百分比对照值(E)平方之上。用于分析这些试验的方差和加权与研究分析放射性配体分析用方法的研究人员观测的变异性关系一致(Finney,D.J.,(1976),Radioligandassay,Biometrics,32,721-740,and Dudley,R.A.Edwards,P.,Ekins,R.P.,McKinzie,1.G.M.,Raab,G.M.,Rodbard,D.andRodgers,R.P.C.(1985),Guidelines for Immunoassay DataProcessing,Clinical Chemistry,31/8,1264-1271)。
结果
初期的实验中,试验3μM至0.0123μM浓度范围,即244倍范围的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂化合物CU。干扰素-α 2B浓度在每个样品30单位至每个样品0.0096单位变动,即3125倍范围。
如表7所示,当作为单一药物治疗时,化合物CU显示0.48μM的IC50,干扰素IC50是2.19U。在复制子分析的精密度内,大约为20%,干扰素-α 2B的添加导致复制子RNA蓄积抑制以剂量依赖方式增加。例如,以0.333μM化合物CU治疗的细胞导致28%的复制子RNA蓄积抑制。细胞以0.333μM化合物CU(它是IC50(0.469μM)剂量的71%)和0.24U干扰素-α 2B(它是干扰素-α 2B IC50(2.05μM)剂量的11%)联合治疗时,导致49%的复制子RNA蓄积抑制。因此,71%一个IC50剂量组合11%的其它物质导致49%的抑制复制子RNA累积。采用直觉方法确定联合治疗是否是协同或加和或者拮抗,人们可以预期,如果组合治疗的作用仅是加和性的,则人们可以期望得到49%的复制子RNA蓄积抑制所需的这两种IC50剂量的结合部分是98%。我们的实验结果证实采用71%加11%,即82%的IC50剂量而不是98%,达到复制子RNA蓄积的抑制水平,正如联合治疗的加和作用所预言的。因此,在化合物的这些浓度,作用似乎是协同的,由于获得49%的HCV复制子RNA抑制所使用的每个化合物的IC50剂量比任一单独化合物所需的(其中将需要98%的IC50剂量)较少部分剂量。该联合治疗的结果如表8所示和图1所图示。
表7
以化合物CU和干扰素-α 2B个别或组合干扰素-α 2B(单位)治疗48小时之后复制子RNA蓄积的抑制化合物 30U 6U 1.2U 0.24U 0.048U 0.0096U 0UCU(浓度)
99% 99% 99% 99% 98% 98% 98%99% 98% 96% 95% 92% 93% 88%94% 87% 66% 49% 33% 27% 28%93% 79% 46% 29% 12% 15% 11%92% 78% 44% 21% 2% 7% 8%92% 78% 44% 20% 19% 19% 5%89% 73% 38% 16% 8% 12% 0% |
3μM1μM0.333μM0.1111μM0.0370μM0.0123μM0μM
这些原始结果,如较早声明的经由利用体外复制子分析和通过该分析产生数据的简单加和性分析得到的,证明复制子细胞以HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和干扰素联合治疗至少产生加和性抗病毒作用,并且有可能是协同抗病毒作用。
采用上述的形式数学工具再分析前面的数据,确定HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂CU和干扰素α-2B之间的关系是否为协同、加和或拮抗。表8以数字、图4以图示显示了再分析的数据。
表8进一步概述了以各种本发明的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和几种不同的干扰素个别或联合治疗含复制子细胞48小时之后,复制子分析中所得的结果。我们指出在复制子分析中测量抑制HCV复制子RNA的值的标准偏差是~20%。在广泛的浓度范围内和不引起HCV复制子RNA浓度显著抑制的较低化合物浓度试验化合物。由于分析的标准偏差是~20%,一些数据点会产生负数。负抑制数表明在个别试验中,化合物治疗的样品内的平均HCV复制子RNA分子多于模拟治疗样品。
表8
以HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和
各种干扰素个别或联合治疗48小时之后
复制子RNA蓄积的抑制
实验1
IFN alpha-2B(单位)30.00 6.00 1.20 0.24 0.048 0.0096 0.000
89% 73% 38% 16% 8% 12% 0%92% 78% 44% 20% 19% 19% 5%92% 78% 44% 21% 2% 7% 8%93% 79% 46% 29% 12% 15% 11%94% 87% 66% 49% 33% 27% 28%99% 98% 96% 95% 92% 93% 88%99% 99% 99% 99% 98% 98% 98% |
0.000化合物 0.012CU 0.0370.111(μM) 0.3331.0003.000
实验2
IFN alpha-2A(单位)30 6 1.2 0.24 0.048 0.0096 0
86% 61% 27% 4% -7% 5% 0%87% 66% 17% -23% 8% 8% 10%85% 62% 13% -2% 0% -1% 1%87% 68% 37% 20% -6% 12% 10%92% 77% 58% 41% 26% 25% 44%98% 96% 90% 86% 84% 83% 85%99% 99% 98% 98% 98% 98% 98% |
0化合物 0.0123CU 0.37(μM) 0.11110.33313
实验3
化合物CU(μM)3 1.5 0.75 0.375 0.1875 0.0938 0.0469 0.0234 0
98% 93% 62% 23% 12% -2% -4% -2% 098% 95% 70% 39% 12% 2% 6% 9% 3%98% 95% 70% 43% 15% 7% 2% 5% 2%98% 95% 73% 46% 16% 14% 7% 19% -3%98% 95% 82% 56% 43% 34% 28% 32% 28%98% 98% 87% 71% 51% 54% 49% 52% 45%99% 98% 92% 82% 74% 71% 69% 71% 59%99% 98% 96% 89% 87% 85% 85% 85% 80%99% 99% 98% 95% 93% 92% 92% 93% 89% |
00.049干扰素 0.123alpha-2B 0.307(单位) 0.7681.9204.812.030.0
实验4
化合物CU(μM)3 1.5 0.75 0.375 0.1875 0.0938 0.0469 0.0234 0
98% 94% 74% 38% 17% 3% -1% 6% 0%98% 93% 60% 22% 29% 21% -9% -6% 6%98% 93% 67% 29% 21% 12% 3% 2% -8%98% 93% 66% 29% 22% 4% -3% -4% 10%98% 95% 67% 46% 24% 21% 20% 9% 15%98% 96% 73% 48% 43% 44% 27% 33% 29%98% 97% 82% 61% 61% 59% 52% 55% 43%99% 98% 91% 75% 76% 72% 71% 74% 73%99% 98% 96% 89% 86% 85% 84% 84% 83% |
00.049干扰素 0.123alpha-2A 0.307(单位) 0.7681.9204.812.030.0
实验5
化合物CU(μM)3 1.5 0.75 0.375 0.1875 0.0938 0.0469 0.0234 0
98% 95% 65% 24% -1% -14% -14% -12% 097% 95% 72% 41% 17% 11% 12% 6% 17%97% 95% 71% 40% 31% 18% 18% 11% 4%98% 96% 75% 44% 38% 25% 34% 18% 17%98% 96% 82% 61% 42% 37% 25% 26% 36%98% 97% 84% 64% 59% 61% 56% 51% 53%98% 98% 90% 79% 72% 68% 65% 68% 68%98% 98% 93% 87% 80% 80% 74% 77% 82%98% 98% 95% 92% 86% 87% 86% 86% 87% |
0.00.93751.875羊干扰素 3.75tau(单位) 7.5153060120
实验6
化合物EC(μM)3 1.5 0.75 0.375 0.1875 0.0938 0.0469 0.0234 0
96% 93% 81% 56% 29% 23% 19% 1% 096% 92% 80% 60% 31% 15% 19% 29% 6%96% 94% 78% 58% 32% 13% 20% 20% 4%97% 95% 82% 60% 38% 32% 34% 42% 23%97% 95% 87% 66% 43% 41% 46% 43% 25%98% 97% 90% 73% 62% 51% 54% 58% 47%98% 97% 94% 87% 76% 73% 78% 76% 69%98% 98% 96% 92% 86% 86% 86% 85% 84%98% 98% 96% 96% 93% 92% 92% 95% 91% |
00.0492干扰素 0.1229alpha 0.30722B(单位) 0.7681.924.812.030.0
实验7
化合物EC(μM)3.0 1.5 0.75 0.375 0.1875 0.0938 0.0469 0.02344 0
96% 92% 81% 47% 28% 17% -1% -8% 096% 93% 78% 58% 21% 8% -12% 10% -17%5% 93% 79% 64% 14% 5% 14% 7% -22%95% 91% 80% 64% 22% 15% 5% 2% -5%96% 95% 81% 64% 34% 21% 19% 20% 4%96% 95% 88% 78% 44% 41% 19% 33% 21%97% 95% 91% 85% 60% 58% 60% 53% 49%97% 97% 95% 91% 77% 72% 76% 70% 71%98% 98% 97% 94% 91% 86% 85% 85% 84% |
00.0492干扰素 0.1229alpha-2A 0.3072(单位) 0.7681.924.812.030.0
实验8
化合物CU(μM)3.0 1.5 0.75 0.375 0.1875 0.0938 0.0469 0.02344 0
97% 95% 77% 34% 16% 6% -7% 0% 098% 97% 83% 49% 31% 19% -21% -7% 1%98% 96% 84% 56% 39% 27% 10% -3% 21%98% 97% 91% 73% 54% 42% 31% 15% 30%98% 98% 95% 80% 65% 58% 65% 60% 60%98% 98% 97% 92% 86% 81% 77% 73% 79%99% 98% 98% 96% 93% 93% 93% 90% 92%99% 99% 99% 97% 97% 96% 97% 95% 96%99% 99% 99% 99% 98% 99% 98% 98% 97% |
00.2344干扰素 0.4688beta(单位) 0.93751.8753.757.515.030.0
实验9
化合物EP(μM)8 4 2 1 0.5 0.25 0.125 0.0625 0
94% 96% 96% 92% 64% 36% 23% 8% 095% 96% 96% 91% 67% 25% 28% 8% 3%95% 97% 96% 91% 65% 44% 4% 11% 4%95% 97% 96% 91% 71% 46% 20% 8% 20%96% 97% 97% 93% 75% 49% 36% 24% 24%96% 97% 97% 94% 82% 67% 49% 52% 54%96% 98% 97% 96% 90% 79% 75% 75% 70%97% 98% 98% 97% 94% 89% 89% 87% 83%97% 98% 98% 98% 96% 94% 94% 95% 92% |
0干扰素 0.0492alpha-2B 0.1229(单位) 0.30720.76801.924.81230
实验10
利巴韦林(μM)200 80 32 12.8 5.12 2.048 0.8192 0.3277 0
85% 62% 43% 3% -8% -17% -22% -6% 087% 66% 48% 44% 11% -4% -10% 11% -7%84% 64% 53% 40% 26% -12% -5% 11% -9%86% 70% 62% 44% 28% 1% 6% 14% 7%90% 80% 72% 65% 38% 30% 28% 44% 29%93% 85% 77% 76% 61% 57% 58% 50% 46%96% 92% 87% 83% 82% 74% 71% 77% 72%97% 95% 93% 91% 90% 89% 90% 89% 85%98% 97% 96% 95% 94% 94% 93% 95% 94% |
0干扰素 0.0492alpha-2B 0.1229(单位) 0.30720.76801.924.81230
如图4-13所示,它以图显示描述表8中采用上述测量协同的数学方法绘制的数据,试验的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和干扰素的所有组合的Isobol曲线是上凹的,表明复制子分析中治疗的抗病毒作用是协同的。表9列出了这些结果,它表示联合治疗的有关协同水平和个别使用抗病毒化合物的IC50值。表9的关键因素是测定用的α值和p-值。α术语是每个联合治疗的Isobol的最大感染的度量。α值为零值表明加和,负值表示拮抗,并且在以以上所示的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和干扰素联合治疗的情形时远大于表示协同数的值。α参数越大,协同越强。如表9显示HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和干扰素组会所示,即使忽略每个试验的显著水平,基于这9个平均α值为0(无相互作用)的试验的t检验的p值为0.00014,表明结果极显著。
基于用于此分析的Greco Rustom法((1990)Application of aNew Approach for the Quantitation of Drug Synergism至theCombination of cisDiamminedchloroplatinum and 1-β-D-Arabinofuranosylcytosine,Cancer Research,50,5318-5327)的协同的计算是评价可采用HCV复制子分析产生的这种类型实验数据的理想工具。还有其它的用于抗病毒化合物研究的方法,例如Pritchard和Shipman(Prichard,M.N.,and Shipman,C.Jr.,(1990)″Athree-dimensional model to analyze drug-drug interactions(review),″Antiviral Res14:181-206)。应用它们的协同计算方法至表8所示的数据亦表明复制子细胞与HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和干扰素联合治疗会产生HCV复制子RNA蓄积的协同抑制(未显示数据)。
表9
联合治疗的协同的相对水平和
个别使用抗病毒化合物的IC50值
HCV丝氨酸 IC50INF IC50HSPI α P-值
蛋白酶 干扰素 (单位) (μM) (SE)1 α>0
抑制剂
(HSPI)
实验1 化合物 CU IFN alpha-2B 2.05 0.469 0.477(0.09) <0.0001实验2 化合物 CU IFN alpha-2A 3.72 0.446 0.770(0.12) <0.0001实验3 化合物 CU IFN alpha-2B 2.36 0.587 0.730(0.08) <0.0001实验4 化合物 CU IFN alpha-2A 5.67 0.633 0.438(0.08) <0.0001实验5 化合物 Cu IFN tau 13.22 0.605 0.328(0.07) <0.0001买验6 化合物 EC IFN alpha-2B 2.53 0.384 0.516(0.10) <0.0001实验7 化合物 EC IFN alpha-2A 5.50 0.312 1.24(0.20) <0.0001实验8 化合物 CU IFN beta l.82 0.466 0.551(0.09) <0.0001实验9 化合物 EP IFN alpha-2B 3.06 0.426 0.490(0.12) <0.0001 |
实验10 利巴韦林 IFN alpha-2B 1.22 145 -0.24(0.067) 0.0004 |
1(SE)标准误差
评价采用目前的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和干扰素的抗HCV药物治疗的协同本质的另一措施是使用以上描述的相同方法评价目前HCV标准联合治疗,即,在复制子分析中干扰素α-2B组合利巴韦林。表9的最后一行表示干扰素α-2B和利巴韦林混合物的α参数是负数,表明在这两上药之间有少量的拮抗。这进一步强调本文公开的采用目前的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂组合干扰素的联合治疗的显著性在于这些治疗明显产生协同,而用于HCV(干扰素α-2B组和利巴韦林)的标准联合治疗在复制子分析中无协同。
先前在复制子分析中采用目前HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂加干扰素对利巴韦林加干扰素的联合治疗的比较清楚地表明前者是协同,后者不是。采用复制子分析得到的实验结果表明如果使用干扰素组合HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂,比组合利巴韦林使用干扰素α-2B时更低剂量的干扰素会是有效的。复制子分析是一种有效的检验有效的抗HCV化合物的模型系统,目前作为有效的抗HCV活性化合物预测者广泛地被依赖。注意,例如,Blight等.(2000)Efficient Initiation of HCVRNA Replication in Cell Culture.Science 8;290:1972-1974,和Chung等.(2001)Hepatitis C virus replication is directlyinhibited by IFN-a in a full-length binary expression system.Proc.Nat.Acad.Sci.U.S.A.98(17):9847-52。单独的利巴韦林对于减少复制子分析中HCV复制子RNA的蓄积或多或少地有效(表8,实验10和表9的最后一行)。这个结果显然与体内研究矛盾,这里单独使用时,利巴韦林无显著的适于HCV治疗的治疗价值。相反,在复制子分析中,如以下讨论的校正细胞毒性,利巴韦林具有145μM的IC50。这个结果可通过意识到复制子分析允许评价高利巴韦林浓度(归因于体内细胞毒性这在人体治疗中会是不可能的)解释(ChutaputtiA.(2000)Adverse effects and other safety aspects of thehepatitis C antivirals.Journal of Gastroenterology andHepatology.15 Suppl:E156-63)。
这种评价必需需要利巴韦林细胞毒性评估。这种毒性发生在患者和细胞分析内(Shiffman M.L.,Verbeke S.B.,Kimball P.M.(2000)α interferon combined with ribavirin potentiatesproliferative suppression but not cytokine production inmitogenically stimulated human lymphocytes.AntiviralResearch.48(2):91-9)。在本文公开的试验中,两种方法观察和测量复制子分析中的利巴韦林细胞毒性。在确定复制子细胞生存力的XTT代谢分析(Roehm N.W.,Rodgers G.H.,Hatfield S.M.,GlasebrookA.L.(1991)An improved colorimetric assay for cellproliferation and viability utilizing the tetrazolium saltXTT.Journal of Immunol.Methods.142(2):257-65)和测量复制子分析内治疗和未治疗细胞的甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)mRNA水平的TaqMan定量RT-PCR分析内(Brink N.,S amel M.,Young A.R.,Wittern K.P.,BergemannJ.(2000)Comparative quantificationof IL-1β,IL-10,IL-10r,TNFα and IL-7 mRNA levels in UV-irradiated human skin in vivo.Inflamation Research.49(6):290-6),观察到显著的利巴韦林诱发的细胞毒性,但是作如下校正。假定GAPDH mRNA水平,它是连续表达的持家基因,在所有活细胞内一样。由以转录抑制剂放线菌素D治疗的细胞内GAPDH mRNA水平的测量,已知GAPDH mRNA的半哀期仅仅是几个小时(数据未显示)。因此,如采用TaqMan技术测定人细胞内特定mRNA水平的其它方法一样,假定在任何给定样品内,GAPDH mRNA水平与活细胞数量(VCN)成比例,关系是VCN=2Λ(40-CtGAPDH mRNA)。计算每个复制子分析样品孔的VCN,接着我们以该孔的VCN去除特定孔的HCV复制子RNA复制数。一旦计算出,使用该比例代替HCV复制数以计算抑制(″Avg.Inh using ratio″;Fig 14.A)。没有校正这种细胞毒性的复制子分析数据,这种细胞毒性被当作HCV RNA复制子蓄积的假阳性抑制。在复制子分析中,假定测量的HCV RNA复制子蓄积抑制是HCV RNA复制子蓄积的实际抑制和归因于细胞毒性的HCV RNA复制子蓄积表面抑制的和。进一步假定,基于细胞毒性的XTT和TaqManGAPDH mRNA测量的紧密相关,由复制子分析中试验的化合物引起的GAPDH mRNA蓄积抑制是归因于细胞毒性的HCV RNA复制子累积的表面抑制的可靠量度。因此,在校正常规细胞毒性的复制子分析内化合物真实的抗HCV活性可通过VCN去除每个样品内测量的HCV复制子RNA分子数估计,从而标准化每个样品内活细胞数目。采用这种方法,图14显示复制子分析中利巴韦林真实的抗HCV活性的估计(″Avg.Inh using ratio″)。利巴韦林IC50的估计采用这种方法最好计算。图14.A中,″Avg.Inh original″显示利巴韦林未校正的IC50,它大约是80μM,而由″Avg.Inh using ratio″曲线计算的校正的IC50值大约是145μM。鉴于复制子分析的~20%CV,作为干扰素α-2B治疗(图14.B)的结果,校正和测量的HCV RNA复制子蓄积抑制之间差别不明显。如同干扰素α-2B,在本实施例中试验的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂显示在采用的浓度无显著的细胞毒性。这采用XTT分析测定,其中各种化合物的TC50值是:CU=64.7μM,EP>10μM,tEC>50μM。这些IC50值比表9所示IC50值大20-140倍。因此,复制子分析内,在该分析的精密度内,这些化合物的细胞毒性对HCV RNA的蓄积无显著影响,由于这种细胞毒性仅仅在HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂浓度显著高于复制子分析内试验的那些时发生。
关于个别和组合的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和干扰素功效的结论
本发明HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和各种干扰素单独使用时的抗HCV活性在HCV复制子分析中如个别实验组成的仅采用一种抗病毒剂的表8的列和行所示。表9列出单独使用时测量的每个抗病毒化合物的IC50值。先前的结果,利用这种体外复制子分析得到的,亦证实以本发明的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂和各种干扰素联合治疗复制子细胞产生协同抗病毒作用。完全希望这些作用会转化成体内效力。
采用本发明的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂联合治疗具有优于单一药物治疗的几种主要优点。首先,通过进行可能具有低于单独使用时可能剂量的剂量的各自药物治疗,人们会期望减少与治疗有关的毒性和副作用。这在干扰素治疗的情形下是特别重要的,这里的副作用是严重的,并且业已被显示与患者给药剂量成比例。先前的数据表明,HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂如CU在IC95水平的剂量可联合一定剂量(例如IC50水平)的干扰素α,并且结果会是比单独的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂所能达到的更有效的治疗,没有不利的由高剂量的干扰素α引起的副作用。联合治疗的第二主要优点在于由于这两种药物独立的作用,耐治疗的突变体HCV菌株发展的机会很少。耐药性的发展是如HCV的RNA病毒的主要考虑。由于它们的高变异率,这种病毒能够迅速适应外界影响。联合治疗的第三优点是成本减少,归因于需要更低量的有效治疗所需的治疗剂。
本文公开的方法中能够采用的另外的免疫调节剂包括,例如,α干扰素2A、共有干扰素,τ干扰素、干扰素+利巴韦林(Rebatron),聚乙二醇化干扰素和干扰素基因表达促进剂。可以完全预见,这些化合物的抗HCV活性例如在组合本文公开的那些的HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂时会被改善。由于已知干扰素体内和复制子分析内有活性,预计本发明HCV丝氨酸蛋白酶抑制剂体内亦有活性,并且更重要地,在与干扰素、其免疫系统刺激剂或其它通过除了HCV丝氨酸蛋白酶抑制之外机理作用的具有HCV抗病毒活性的化合物联合使用时,能够引起协同活性。
目前最好的HCV治疗采用干扰素α和拟核苷利巴韦林。这种治疗仅仅是或多或少的有效,并且导致显著的副作用,即降低患者的配合性(Chronic Hepatitis C:Current Disease Management,U.S.Department of Health and Human Services,National Institutesof Health,1999)。此外,在移植患者中,利巴韦林-干扰素联合治疗是不明确的,并且事实上会比单独的干扰素差(Chronic HepatitisC:Current Disease Management,U.S.Department of Health andHuman Services,National Institutes of Health,1999)。
以上所示的结果证实干扰素与一种新类别的HCV抗病毒剂(本发明的丝氨酸蛋白酶抑制剂)使用时的协同组合作用。我们完全希望本文公开的体外结果会产生比目前可行的单独使用干扰素治疗更有效的HCV患者治疗。干扰素的亚治疗剂量会调动患者的免疫系统更好的斗争病毒,并且丝氨酸蛋白酶抑制剂会直接攻击病毒,经由不同的作用机理处置病毒两个分叉的攻击。因此,由于有效HCV抗病毒治疗所需的两种药物减小,患者能够获得减少成本的HCV感染治疗,这是基于减少的副作用和更少的必需药剂款项。
本发明可以由不背离属于其精神或实质的其它特定形式实施。