CN109689063A

CN109689063A - 含有炔烃的核苷酸和核苷治疗组合物及其相关用途

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Publication number: CN109689063A
Application number: CN201780038569.9A
Authority: CN
Inventors: 格雷戈里·布鲁姆林; 亚伯·德拉罗莎; 乔治·佩因特; 达米安·凯珀; 亚历山大·科雷哈洛夫
Original assignee: AMORY UNIV
Current assignee: AMORY UNIV; Emory University
Priority date: 2016-04-28
Filing date: 2017-04-28
Publication date: 2019-04-26
Also published as: CA3022119A1; EP3448392A1; WO2017189978A1; JP7129703B2; JP2024038012A; US20230062181A1; EP3448392A4; US20190144484A1; JP2019515930A; US11192914B2; EA201892448A1; JP2022106920A

Abstract

本公开涉及核苷酸和核苷治疗组合物以及在治疗感染性疾病、病毒感染和癌症中的用途，其中所述核苷酸或核苷的碱基含有至少一个硫醇、硫酮或硫醚。

Description

含有炔烃的核苷酸和核苷治疗组合物及其相关用途

技术领域

本公开涉及含有炔烃的核苷酸和核苷治疗组合物及其相关用途。在某些实施方案中，本公开涉及任选地缀合至磷氧化物或其盐的核苷。在某些实施方案中，本公开涉及偶联化合物或其盐，其包含氨基酸酯、类脂或由磷氧化物连接到核苷酸或核苷的鞘脂或衍生物。在某些实施方案中，本公开设想了包含用于治疗传染病、病毒感染和癌症的这些化合物的药物组合物。

背景技术

核苷和核苷酸磷酸盐和膦酸盐在临床上可用作抗病毒剂。两个例子是用于治疗人类免疫缺陷病毒的富马酸替诺福韦酯和用于治疗乙型肝炎病毒感染的阿德福韦酯。组合施用三种或更多种抗逆转录病毒剂，例如高效抗逆转录病毒疗法(HAART)，显著降低了与HIV感染相关的发病率和死亡率。然而，越来越需要新的抗病毒剂来解决抵抗和渗透到病毒保护区(通常称为特殊隔室)的关键问题。对特殊隔室的渗透性可能是目前化疗无法完全清除HIV感染患者和抗性出现的部分原因。

需要将为未磷酸化的核苷酸和核苷酸衍生物的抗病毒剂磷酸化以主动抑制病毒复制。核苷类似物通过两种类型的广谱特异性转运蛋白、同心核苷转运蛋白(CNT)和平衡核苷转运蛋白(ENT)进入细胞。一旦进入，它们利用宿主的核苷补救途径通过脱氧核苷激酶(dNK)、脱氧核苷单磷酸激酶(dNMPK)和核苷二磷酸激酶(NDPK)顺序磷酸化。然而，这些化合物的胞内活化常常受到宿主内源性激酶的高底物特异性影响。体外和体内研究已经证明，由dNK和dNMPK催化的第一和/或第二磷酸化通常代表核苷类似物活化中的限速步骤。因此，需要鉴定具有由细胞激酶充分活化的结构特征的改进的抗病毒核苷类似物。

McGuigan等人，J Med Chem，2005年，第48卷第10期，第3504-3515页，报道了阿巴卡韦的苯基甲氧基丙氨酰氨基磷酸酯作为前药导致增强抗病毒效力。Painter等人，Antimicrob Agents Chemother，2007年，第51卷第10期，第3505-3509页，报道了用十六烷氧基丙基前药酯(称为CMX157)促进替诺福韦的口服利用。

鞘脂在细胞-细胞和细胞-基质相互作用中起作用，并通过多种机制帮助调节生长和分化，例如抑制生长因子受体激酶和对许多细胞信号转导系统的影响。美国专利6,610,835公开了鞘氨醇类似物。还公开了治疗感染和癌症的方法。Pruett等人，J.LipidRes.2008年，第49卷第8期，第1621-1639页，对鞘氨醇和衍生物进行了报道。Bushnev等人，ARKIVOC，2010年，第viii期，第263-277页，报道了用于制备鞘脂衍生物的不对称合成方法。Dougherty等人，Org.Lett.2006年，第8卷第4期，第649-652页，报道了1-脱氧鞘氨醇衍生物的合成。Wiseman等人，Org.Lett.2005年，第7卷第15期，第3155-3157页，报道了1-脱氧-5-羟基鞘脂在抗癌和2-氨基-3，5-二醇的立体选择性合成中的作用。

本文引用的参考文献不是对现有技术的承认。

发明内容

本公开涉及含有炔烃的核苷酸和核苷治疗组合物及其相关用途。包括任选地缀合至磷氧化物或其盐的核苷、前药或偶联化合物或其盐，其包含氨基酸酯、类脂或由磷氧化物连接到核苷酸或核苷的鞘脂或衍生物。

具体实施方式

在某些实施方案中，本公开涉及2’-炔烃的磷氧化物前药，其包含通过靶向病毒编码的RNA依赖性RNA聚合酶(RdRp)来治疗正义和负义RNA病毒感染的核苷。本公开还提供了类脂和鞘脂的一般用途，以提供用于治疗传染病和癌症的核苷类似物。

在某些实施方案中，本公开涉及偶联化合物或其盐，其包含由磷氧化物连接到核苷酸或核苷的鞘脂或衍生物。在某些实施方案中，磷氧化物为磷酸酯、膦酸酯、聚磷酸酯、或聚膦酸酯，其中所述磷酸酯、膦酸酯或聚磷酸酯或聚膦酸酯中的磷酸酯任选地为硫代磷酸酯或氨基磷酸酯。在某些实施方案中，类脂或鞘脂通过氨基或羟基共价结合到磷氧化物。

该核苷酸或核苷包含具有两个或更多个氮杂原子的杂环，其中该取代的杂环任选地被一个或多个相同或不同的烷基、卤素、或环烷基取代。

在某些实施方案中，鞘脂为任选地被一个或多个取代基取代的饱和或不饱和的2-氨基烷基或2-氨基十八烷。在某些实施方案中，鞘脂衍生物为任选地被一个或多个取代基取代的饱和或不饱和的2-氨基十八烷-3-醇。在某些实施方案中，鞘脂衍生物为任选地被一个或多个取代基取代的饱和或不饱和的2-氨基十八烷-3，5-二醇。

在某些实施方案中，本公开设想了包含本文所公开的任何化合物和药用赋形剂的药物组合物。在某些实施方案中，药物组合物为丸剂、胶囊、片剂、或包含糖类的盐水缓冲液的形式。在某些实施方案中，该组合物可包含第二活性剂诸如镇痛药、抗炎剂、非甾族抗炎剂、抗病毒剂、抗生素、或抗癌剂。

在某些实施方案中，本公开涉及治疗或预防感染的方法，该方法包括向对其有需要的受试者施用有效量的本文所公开的化合物。通常，受试者被诊断患有或有风险感染病毒、细菌、真菌、原生动物、或寄生虫。

在某些实施方案中，本公开涉及治疗病毒感染的方法，该方法包括向对其有需要的受试者施用有效量的本文所公开的药物组合物。在某些实施方案中，受试者为哺乳动物，例如人。在某些实施方案中，受试者被诊断为慢性病毒感染。在某些实施方案中，在使得病毒感染不再被检测到的条件下施用。在某些实施方案中，受试者被诊断为带有RNA病毒、DNA病毒、或逆转录病毒。在某些实施方案中，受试者被诊断为带有病毒，该病毒是双链DNA病毒、有义单链DNA病毒、双链RNA病毒、有义单链RNA病毒、反义单链RNA病毒、有义单链RNA逆转录病毒或双链DNA逆转录病毒。

在某些实施方案中，受试者被诊断为带有包括亚型H1N1、H3N2、H7N9、或H5N1的甲型流感病毒、乙型流感病毒、丙型流感病毒、轮状病毒A、轮状病毒B、轮状病毒C、轮状病毒D、轮状病毒E、人冠状病毒、SARS冠状病毒、MERS冠状病毒、人腺病毒类型(HAdV-1至55)、类型16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58和59人乳头瘤病毒(HPV)、细小病毒B19、传染性软疣病毒、JC病毒(JCV)、BK病毒、默克尔细胞多瘤病毒、柯萨奇A病毒、诺罗病毒、风疹病毒、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(LCMV)、登革热病毒、基孔肯雅病毒、东部马脑炎病毒(EEEV)、西部马脑炎病毒(WEEV)、委内瑞拉马脑炎病毒(VEEV)、罗斯河病毒、巴马森林病毒、黄热病病毒、麻疹病毒、腮腺炎病毒、呼吸道合胞病毒、牛瘟病毒、加州脑炎病毒、汉坦病毒、狂犬病病毒、埃博拉病毒、马尔堡病毒、单纯疱疹病毒-1(HSV-1)、单纯疱疹病毒-2(HSV-2)、水痘带状疱疹病毒(VZV)、爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)、巨细胞病毒(CMV)、疱疹淋巴细胞病毒、玫瑰疹病毒、卡波西肉瘤相关疱疹病毒或甲型肝炎、乙型肝炎、丙型肝炎、丁型肝炎、戊型肝炎或人类免疫缺陷病毒(HIV)。

在某些实施方案中，受试者被诊断为带有包括亚型H1N1、H3N2、H7N9或H5N1(低致病性)的甲型流感病毒、H5N1(高致病性)乙型流感病毒、丙型流感病毒、轮状病毒A、轮状病毒B、轮状病毒C、轮状病毒D、轮状病毒E、SARS冠状病毒、MERS-CoV、人腺病毒类型(HAdV-1至55)、类型16、18、31、33、35、39、45、51、52、56、58和59人乳头瘤病毒(HPV)、细小病毒B19、传染性软疣病毒、JC病毒(JCV)、BK病毒、默克尔细胞多瘤病毒、柯萨奇A病毒、诺罗病毒、风疹病毒、淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(LCMV)、黄热病病毒、麻疹病毒、腮腺炎病毒、呼吸道合胞病毒、副流感病毒1和3、牛瘟病毒、基孔肯雅病毒、东部马脑炎病毒(EEEV)、委内瑞拉马脑炎病毒(VEEV)、西部马脑炎病毒(WEEV)、加州脑炎病毒、日本脑炎病毒、裂谷热病毒(RVFV)、汉坦病毒、登革热病毒血清型1、2、3和4、西尼罗河病毒、寨卡病毒、玻瓦桑病毒、塔卡里伯病毒、胡宁病毒、狂犬病病毒、埃博拉病毒、马尔堡病毒、腺病毒、单纯疱疹病毒-1(HSV-1)、单纯疱疹病毒-2(HSV-2)、水痘带状疱疹病毒(VZV)、爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)、巨细胞病毒(CMV)、疱疹嗜淋巴细胞病毒、玫瑰疹病毒、或卡波西肉瘤相关疱疹病毒、甲型肝炎、乙型肝炎、丙型肝炎、丁型肝炎、戊型肝炎或人类免疫缺陷病毒(HIV)。

在某些实施方案中，受试者被诊断为患有胃肠炎、急性呼吸系统疾病、严重急性呼吸系统综合征、病毒后疲劳综合征、病毒性出血热、获得性免疫缺陷综合症或肝炎。

在某些实施方案中，本文所公开的药物组合物可与如下专利中所述的任一者组合施用：US 8466159；US8492386；US6056961、US6143752、US6403564、US6475985、US6689814、US6849254、US6936629、US6995174、US7012066、US7105499、US7125855、US7153848、US7202224、US7205330、US7244721、US7348425、US7423058、US7429572、US7470664、US7491794、US7514557、US7585845、US7592316、US7601820、US7608600、US7648998、US7728027、US7754699、US7772178、US7777395、US7793040、US7820671、US7893264、US7906619、US7910728、US7915291、US7939667、US7951787、US7951789、US7964580、US7973040、US8017771、US8067438、US8080654、US8088368、US8101765、US8106187、US8119602、US8148399、US8178491、US8216999、US8252923、US8466159、US8492386、US20020022015、US20020119122、US20020183690、US20030004119、US20030032590、US20030044824、US20030109697、US20030138403、US20030187000、US20030199518、US20040198840、US20040202641、US20050085528、US20050123628、US20050187170、US20050245502、US20050249702、US20050288245、US20060083785、US20060100148、US20060105063、US20060142238、US20060228333、US20060229293、US20060275366、US20060276404、US20060276406、US20060276407、US20060281689、US20060287248、US20060293267、US20070004635、US20070021351、US20070092512、US20070105781、US20070207949、US20070224167、US20070232527、US20070237818、US20070274951、US20070287664、US20080004236、US20080019950、US20080050336、US20080070861、US20080081791、US20080161232、US20080261906、US20080269205、US20080275005、US20080275141、US20090017457、US20090028824、US20090041716、US20090047245、US20090053263、US20090076100、US20090082366、US20090082414、US20090098123、US20090105471、US20090156545、US20090202476、US20090234102、US20090286843、US20090297518、US20090298916、US20100009970、US20100028301、US20100034839、US20100041617、US20100055055、US20100056770、US20100068182、US20100081672、US20100093792、US20100099695、US20100158866、US20100166661、US20100216725、US20100221217、US20100226885、US20100233122、US20100234585、US20100254942、US20100256217、US20100272682、US20100286083、US20100291034、US20100297080、US20100298257、US20100310512、US20100316594、US20100317568、US20100330173、US20110020272、US20110038833、US20110045001、US20110117055、US20110117057、US20110160149、US20110200582、US20110245484、US20110250176、US20110251152、US20110257122、US20110268697、US20110306541、US20110311482、US20110312973、US20110319323、US20120009148、US20120010170、US20120052046、US20120058084、US20120059033、US20120071434、US20120101049、US20120107278、US20120135949、US20120157404、US20120171157、US20120196272、US20120196794、US20120232247、US20130102526、US20130102557、US20130137084、US20130164261、USRE40525、USRE43298、CA2518115C、DE102005038768A1、EP1627641A1、EP1646639A2、EP1827450A2、EP1970372B1、JP2000212099A、KR20010068676A、MD2549F1、MD3477F1、MD20060037A、MXPA05012606A、RO118842B、RU2158604C2、RU2212248C1、RU2293572C1、RU2306134C2、RU2306934C1、RU2336096C1、RU2345787C2、RU2348412C1、RU2373952C1、RU2398582C1、RU2400229C1、RU2424794C1、RU2429877C1、UA64191A、UA68233A、WO1991009605A1、WO1994001125A1、WO1996018419A1、WO1996029336A1、WO1996036351A1、WO1997027866A1、WO1997033565A1、WO1998014181A1、WO1998019670A2、WO1998048621A1、WO1998049281A1、WO1999015194A1、WO1999018993A1、WO1999029321A1、WO1999030721A1、WO2000001715A1、WO2000023454A1、WO2000037097A1、WO2000037110A2、WO2000047240A1、WO2000061161A2、WO2001007454A1、WO2001012214A2、WO2001077091A2、WO2001079540A2、WO2002003886A1、WO2002010743A1、WO2002018369A2、WO2002030259A2、WO2002030455A2、WO2002032414A2、WO2002053096A2、WO2002055100A2、WO2002079234A1、WO2002089731A2、WO2002091989A2、WO2003002152A2、WO2003007981A1、WO2003024461A1、WO2003028754A1、WO2003028755A1、WO2003030923A1、WO2003037312A2、WO2003037908A1、WO2003040104A1、WO2003042377A1、WO2003049760A1、WO2003072135A2、WO2003101199A1、WO2003101478A1、WO2004019934A1、WO2004039996A1、WO2004043435A2、WO2004047673A2、WO2004073599A2、WO2004078127A2、WO2004078191A1、WO2004078194A1、WO2004094452A2、WO2004103396A1、WO2004112720A2、WO2005000308A2、WO2005010143A2、WO2005012327A2、WO2005016288A2、WO2005018330A1、WO2005023289A1、WO2005025583A2、WO2005037214A2、WO2005037274A1、WO2005038056A1、WO2005040816A1、WO2005042020A2、WO2005043118A2、WO2005062949A2、WO2005063281A2、WO2005067454A2、WO2005067963A1、WO2005102353A1、WO2005108418A1、WO2005123076A2、WO2006005610A1、WO2006016930A2、WO2006038088A1、WO2006039488A2、WO2006043153A2、WO2006046039A2、WO2006050250A2、WO2006063149A1、WO2006064026A1、WO2006067606A1、WO2006072347A2、WO2006084141A2、WO2006085747A1、WO2006089113A2、WO2006096285A2、WO2006110656A2、WO2006113937A2、WO2006119646A1、WO2006127289A1、WO2006127482A1、WO2006127757A2、WO2006130532A2、WO2006130626A2、WO2006130686A2、WO2006133092A1、WO2007021494A2、WO2007022459A2、WO2007049265A2、WO2007056016A2、WO2007058384A1、WO2007059221A2、WO2007062272A1、WO2007064691A1、WO2007075896A2、WO2007081974A2、WO2007098270A2、WO2007109080A2、WO2007109604A2、WO2007109605A2、WO2007111866A2、WO2007112028A2、WO2007138116A2、WO2007143164A1、WO2007146712A2、WO2007149382A2、WO2008005511A2、WO2008008502A1、WO2008017692A2、WO2008022006A2、WO2008024763A2、WO2008024843A2、WO2008033413A2、WO2008033466A2、WO2008039179A1、WO2008058393A1、WO2008063727A2、WO2008086161A1、WO2008089034A2、WO2008091763A1、WO2008092954A2、WO2008106151A2、WO2008106167A1、WO2008116194A2、WO2008118013A2、WO2008121634A3、WO2008124384A2、WO2008137126A2、WO2008137779A2、WO2008141227A1、WO2008143647A2、WO2008144072A1、WO2008153610A2、WO2009009951A1、WO2009015336A2、WO2009026292A1、WO2009032198A1、WO2009033183A2、WO2009038663A1、WO2009039127A1、WO2009039134A1、WO2009039248A2、WO2009043176A1、WO2009046369A2、WO2009061395A2、WO2009062737A1、WO2009082701A1、WO2009085267A1、WO2009085659A1、WO2009131696A1、WO2009134616A2、WO2009138146A2、WO2009149179A2、WO2009149377A1、WO2009150194A1、WO2009152589A1、WO2010017178A1、WO2010017432A1、WO2010020676A1、WO2010021681A2、WO2010024384A1、WO2010025380A2、WO2010027921A1、WO2010030359A2、WO2010031832A2、WO2010033443A1、WO2010034670A2、WO2010036799A1、WO2010038796A1、WO2010039801A2、WO2010042683A1、WO2010045266A1、WO2010049438A2、WO2010053942A1、WO2010076323A1、WO2010081082A2、WO2010093843A2、WO2010099458A1、WO2010101649A2、WO2010122538A1、WO2010132601A1、WO2010151472A1、WO2010151487A1、WO2010151488A1、WO2011009961A1、WO2011013019A1、WO2011014882A1、WO2011038224A1、WO2011041551A1、WO2011046811A1、WO2011053617A1、WO2011056630A2、WO2011056650A2、WO2011066082A2、WO2011066260A2、WO2011072370A1、WO2011079016A1、WO2011094489A1、WO2011112558A2、WO2011156578A1、WO2011156757A1、WO2012009503A1、WO2012015712A1、WO2012016995A1、WO2012018829A1、WO2012041771A1、WO2012050850A1、WO2012087596A1、WO2012139028A2、WO2012175733A1、WO2013000855A1、WO2013000856A1、WO2013024155A1、WO2013024158A1、WO2013025975A1、WO2013028953A1、WO2013040492A2、WO2013066753A1、US8680106、US8685984、US8809265、US8853176、US8889159、US8969357、US8993578、US20140080868US20140080886、US20150174194、WO2014152514A1、或WO2014152635A1。

在某些实施方案中，本文公开的药物组合物与第二抗病毒剂组合施用，诸如ABT-450、ABT-267、ABT-333、ABT-493、ABT-530、阿巴卡韦、阿昔洛韦、阿昔洛韦、阿德福韦、金刚烷胺、安普那韦、安普利近、阿比朵尔、阿扎那韦、立普妥、博赛泼维、西多福韦、可比韦、达卡他韦、地瑞那韦、达塞布韦、地拉夫定、地达诺新、二十二烷醇、依度尿苷、依非韦伦、恩曲他滨、恩夫韦地、恩替卡韦、泛昔洛韦、福米韦生、夫沙那韦、膦甲酸、磷乙酸、更昔洛韦、伊巴他滨、异丙肌苷、疱疹净、咪喹莫特、茚地那韦、肌苷、III型干扰素、II型干扰素、I型干扰素、拉米夫定、雷迪帕韦、洛匹那韦、洛韦胺、马拉韦罗、吗啉胍、甲吲噻腙、奈非那韦、奈韦拉平、奈克沙韦、奥比他韦、奥司他韦、帕利瑞韦、聚乙二醇干扰素α-2a、喷昔洛韦、帕拉米韦、普拉康纳利、鬼臼毒素、雷特格韦、利巴韦林、金刚烷乙胺、利托那韦、嘧胺、沙奎那韦、西咪匹韦、索非布韦、司他夫定、特拉匹韦、替比夫定、替诺福韦、替诺福韦、替拉那韦、三氟尿苷、三协唯、曲金刚胺、特鲁瓦达、伐昔洛韦、缬更昔洛韦、维克韦罗、阿糖腺苷、维拉米定、扎西他滨、扎那米韦、或齐多夫定及其组合。

在某些实施方案中，本公开涉及治疗癌症的方法，该方法包括向对其有需要的受试者施用有效量的本文所公开的药物组合物。在某些实施方案中，癌症选自膀胱癌、肺癌、乳腺癌、黑素瘤、结肠和直肠癌、非霍奇金淋巴瘤、子宫内膜癌、胰腺癌、肾癌、前列腺癌、白血病、甲状腺癌和脑癌。

在某些实施方案中，组合物与第二抗癌剂组合施用，诸如替莫唑胺、贝伐单抗、甲基苄肼、洛莫司汀、长春新碱、吉非替尼、厄洛替尼、多西他赛、顺铂、5-氟尿嘧啶、吉西他滨、替加氟、雷替曲塞、甲氨蝶呤、阿糖胞苷、羟基脲、阿霉素、博来霉素、多柔比星、柔红霉素、表柔比星、伊达比星、丝裂霉素-C、更生霉素和光神霉素、长春碱、长春地辛、长春瑞滨、紫杉醇、多西他赛、依托泊苷、替尼泊苷、安吖啶、拓扑替康、喜树碱、硼替佐米、阿那格雷、他莫昔芬、托瑞米芬、雷洛昔芬、屈洛昔芬、碘昔芬、氟维司群、比卡鲁胺，氟他胺、尼鲁米特、环丙孕酮、戈舍瑞林、亮丙瑞林、布舍瑞林、甲地孕酮、阿那曲唑、来曲唑、伏氯唑、依西美坦、非那雄胺、马立马司他、曲妥珠单抗、西妥昔单抗、达沙替尼、伊马替尼、康普瑞汀、沙利度胺和/或来那度胺或其组合。

在某些实施方案中，本公开涉及本文所公开的化合物在治疗或预防传染病、病毒感染、或癌症的药物的制备或制造中的用途。

在某些实施方案中，本公开涉及本文或下式中任一者所公开的化合物的衍生物。

本公开的额外优点将在以下说明书中部分地阐述。应当理解，上述一般描述和以下详细描述仅仅是示例性和说明性的，并不限制所要求保护的本公开。

应当理解，本公开不限于所描述的特定实施方案。还应当理解，本文使用的术语仅用于描述特定实施方案的目的，并不意欲限制本公开的范围，本公开的范围将仅由所附权利要求书限制。

除非另有定义，否则本文所用的所有技术和科学术语的含义与本公开所属领域的普通技术人员通常理解的含义相同。尽管与本文所述的那些方法和材料相似或等同的任何方法和材料也可用于实践或测试本公开，但是现在描述了优选的方法和材料。

本说明书中引用的所有出版物和专利均以引用的方式并入本文，如同每个单独的出版物或专利被具体和单独地指出以引用方式并入并且以引用的方式并入本文以公开和描述与这些出版物被引用相关的方法和/或材料。任何出版物的引用用于其在提交日之前的公开内容，并且不应被解释为承认本公开无权凭借在先公开而先于此类出版物。另外，提供的出版物的日期可以不同于可能需要独立确认的实际出版日期。

对于本领域技术人员在阅读本公开内容时将显而易见的是，本文描述和示出的每个单独实施方案具有分立的部件和特征，其可在不脱离本公开的范围或实质的情况下容易地与其他几个实施方案中任一者的特征分离或组合。任何列举的方法可按照所述事件的顺序或以逻辑上可能的任何其他顺序进行。

除非另外指明，否则本公开的实施方案将采用药物、有机化学、生物化学、分子生物学、药理学等技术，这些技术在本领域的技术范围内。此类技术在文献中被充分解释。

需注意，如说明书和所附权利要求书中所用，单数形式“一”、“一个”和“该”包括多个指代物，除非上下文另外明确指出。在本说明书和随后的权利要求书中，将提及的许多术语应被定义为具有下列含义，除非有明显的相反意图。

在描述各种实施方案之前，除非另外指明，否则提供以下定义并应当使用。

如本文所用，术语“磷氧化物”是指含有磷-氧(P-O或P＝O)键的任何种类的化学部分。当在本文中用作连接基团时，连接的分子可与氧键合或直接与磷原子键合。该术语旨在包括但不限于其中磷通常与四个氧键合的磷酸酯，以及其中磷通常与一个碳和三个氧键合的膦酸酯。“聚磷酸酯”一般是指通过至少一种磷-氧-磷(P-O-P)键连接在一起的磷酸酯。“聚膦酸酯”是指包含至少一个磷-碳(C-P-O-P)键的聚磷酸酯。除了含磷-氧键之外，磷氧化物还可包含磷-硫醇(P-S或P＝S)键和/或磷-胺(P-N)键，分别称为硫代磷酸酯或氨基磷酸酯。在磷氧化物中，氧原子可与磷形成双键或单键或组合，并且氧可与其他原子(诸如碳)进一步键合，或者可作为与阳离子(例如，金属或季铵)平衡的阴离子存在。

如本文所用，“烷基”是指非环状、环状、直链或支链、不饱和或饱和的烃，诸如含有1至22个碳原子的那些烃，并且具体地讲包括甲基、乙基、丙基、异丙基、环丙基、丁基、异丁基、叔丁基、戊基、环戊基、异戊基、新戊基、己基、异己基、环己基、环己基甲基、3-甲基戊基、2，2-二甲基丁基和2，3-二甲基丁基。该术语包括取代和未取代的烷基两者。烷基可任选地被一个或多个部分取代，所述一个或多个部分选自例如羟基、氨基、卤、氘基、烷基氨基、芳基氨基、烷氧基、芳氧基、硝基、氰基、磺酸、硫酸根、膦酸、磷酸根、或膦酸根，或者如有必要，不抑制该化合物的药理活性的未受保护或受保护的任何其他可用官能团，如本领域技术人员已知的，例如，如在T.W.Greene和P.G.M.Wuts，“Protective Groups in OrganicSynthesis”，第3版，John Wiley&Sons，1999年中所教导的，该文献据此以引用方式并入。

如本文所用，并且除非另外指明，否则术语“低级烷基”是指C1至C4饱和的直链、支链或(如果合适的话)环状(例如，环丙基)烷基，包括取代和未取代的两种形式。除非在本申请中另外具体说明，否则当烷基是合适的部分时，优选低级烷基。

如本文所用，术语“卤”或“卤素”包括氯、溴、碘和氟。

非芳族单或多环烷基在本文中称为含有3至30个碳原子的“碳环”或“碳环基”。代表性的饱和碳环包括环丙基、环丁基、环戊基、环己基等；而不饱和碳环包括环戊烯基和环己烯基等。

“杂碳环”或“杂碳环基”是含有1至4个独立地选自氮、氧和硫的杂原子的碳环，其可以是饱和的或不饱和的(但不是芳族的)、单环的或多环的，并且其中氮和硫杂原子可任选地被氧化，并且氮杂原子可任选地被季铵化。杂碳环包括吗啉基、吡咯烷酮基、吡咯烷基、哌啶基、乙内酰脲基、戊内酰胺基、环氧乙烷基、氧杂环丁烷基、四氢呋喃基、四氢吡喃基、四氢吡啶基、四氢嘧啶基、四氢噻吩基、四氢噻喃基、四氢嘧啶基、四氢噻吩基、四氢噻喃基等等。

“芳基”是指含有6至32个碳原子的芳族碳环单环或多环，诸如苯基或萘基。多环的环系可以但不要求含有一个或多个非芳族环，只要其中一个环是芳族的即可。

如本文所用，“杂芳基”是指具有1至4个选自氮、氧和硫的杂原子并且含有至少1个碳原子的芳族杂碳环，包括单环和多环环系两者。多环的环系可以但不要求含有一个或多个非芳族环，只要其中一个环是芳族的即可。代表性的杂芳基是呋喃基、苯并呋喃基、噻吩基、苯并噻吩基、吡咯基、吲哚基、异吲哚基、氮杂吲哚基、吡啶基、喹啉基、异喹啉基、噁唑基、异噁唑基、苯并噁唑基、吡唑基、咪唑基、苯并咪唑基、噻唑基、苯并噻唑基、异噻唑基、哒嗪基、嘧啶基、吡嗪基、三嗪基、噌啉基、酞嗪基和喹唑啉基。设想术语“杂芳基”的使用包括N-烷基化衍生物，诸如1-甲基咪唑-5-基取代基。

如本文所用，“杂环”或“杂环基”是指具有1至4个选自氮、氧和硫的杂原子并且含有至少1个碳原子的单环和多环环系。单环和多环环系可以是芳族环、非芳族环或芳族环和非芳族环的混合物。杂环包括杂碳环、杂芳基等。

“烷硫基”是指如上文所定义的通过硫桥连接的烷基。烷硫基的例子是甲硫基，(即，-S-CH₃)。

“烷氧基”是指如上文所定义的通过氧桥连接的烷基。烷氧基的例子包括但不限于甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、仲丁氧基、叔丁氧基、正戊氧基和仲戊氧基。优选的烷氧基为甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、仲丁氧基和叔丁氧基。

“烷基氨基”是指如上文所定义的通过氨基桥连接的烷基。烷基氨基的例子为甲氨基，(即，-NH-CH₃)。

“烷酰基”是指如上文所定义的通过羰基桥连接的烷基(即，-(C＝O)烷基)。

“烷基磺酰基”是指如上文所定义的通过磺酰基桥连接的烷基(即，-S(＝O)₂烷基)诸如甲磺酰基等，并且“芳磺酰基”是指通过磺酰基桥连接的芳基(即，-S(＝O)₂芳基)。

“烷基亚磺酰基”是指如上文所定义的通过亚磺酰基桥连接的烷基(即，-S(＝O)烷基)。

术语“取代的”是指其中至少一个氢原子被取代基取代的分子。当被取代时，基团中的一个或多个为“取代基”。该分子可被多重取代。在氧代取代基(“＝O”)的情况下，两个氢原子被取代。在本上下文中的示例性取代基可包括卤素、羟基、烷基、烷氧基、硝基、氰基、氧、碳环基、碳环烷基、杂碳环基、杂碳环烷基、芳基、芳基烷基、杂芳基、杂芳基烷基、-NRaRb、-NRaC(＝O)Rb、-NRaC(＝O)NRaNRb、-NRaC(＝O)ORb、-NRaSO₂Rb、-C(＝O)Ra、-C(＝O)ORa、-C(＝O)NRaRb、-OC(＝O)NRaRb、-ORa、-SRa、-SORa、-S(＝O)₂Ra、-OS(＝O)₂Ra和-S(＝O)₂ORa。在该上下文中，Ra和Rb可以相同或不同并且独立地为氢、卤素羟基、烷基、烷氧基、烷基、氨基、烷基氨基、二烷基氨基、碳环基、碳环烷基、杂碳环基、杂碳环烷基、芳基、芳烷基、杂芳基、杂芳基烷基。

如本文所用，术语“任选地取代的”是指取代是任选的并且因此指定的原子有可能未被取代。

如本文所用，“盐”是指所公开化合物的衍生物，其中母体化合物被改性，形成其酸或碱盐。盐的例子包括但不限于碱性残基(诸如胺、烷基胺、二烷基胺)的无机、或有机酸盐；酸性残基(诸如羧酸)的碱金属或有机盐等等。在典型的实施方案中，盐是常规的无毒的药学上可接受的盐，包括所形成的母体化合物的季铵盐，以及无毒的无机或有机酸。优选的盐包括衍生自无机酸诸如盐酸、氢溴酸、硫酸、氨基磺酸、磷酸、硝酸等的那些；以及由有机酸诸如乙酸、丙酸、琥珀酸、乙醇酸、硬脂酸、乳酸、苹果酸、酒石酸、柠檬酸、抗坏血酸、双羟萘酸、马来酸、羟基马来酸、苯乙酸、谷氨酸、苯甲酸、水杨酸、磺胺酸、2-乙酰氧基苯甲酸、富马酸、甲苯磺酸、甲磺酸、乙烷二磺酸、草酸、羟乙磺酸等制备的盐。

“受试者”是指任何动物，优选地人类患者、牲畜、啮齿动物、猴子或家庭宠物。

术语“前药”是指在体内转化成生物活性形式的试剂。前药通常是有用的，因为在一些情况下，它们可能比母体化合物更容易施用。它们可例如通过口服而为生物可利用的，而母体化合物则不能。与母体药物相比，前药在药物组合物中的溶解度也可提高。前药可通过各种机制转化为母体药物，包括酶促过程和代谢水解。

如本文所用，术语“衍生物”是指结构上类似的化合物，其保留所鉴定的类似物的足够的功能属性。衍生物可以在结构上相似，因为它缺少一个或多个原子，被一个或多个取代基取代，盐，处于不同的水合/氧化状态，例如取代单键或双键，用羟基取代酮，或者因为分子内的一个或多个原子被替代，诸如但不限于用硫或氮原子取代氧原子或用羟基取代氨基，或者反之亦然。在芳环中用氮取代碳得到预期的衍生物。该衍生物可为前药。衍生物可通过化学文献中或者在合成或有机化学教科书中提出的各种合成方法或适当的调整制备，诸如在“March′s Advanced Organic Chemistry：Reactions，Mechanisms，andStructure”，Wiley，第6版(2007)Michael B.Smith或“Domino Reactions in OrganicSynthesis”，Wiley(2006)Lutz F.Tietze中提供的那些，所述文献据此以引用方式并入。

如本文所用，术语“预防”(“prevent”和“preventing”)包括对所引用的病理状况或疾病的复发、扩散或发作的全部或部分抑制。本公开不旨在限于完全预防。在一些实施方案中，发作延迟，或疾病的严重程度降低。

如本文所用，术语“治疗”(“treat”和“treating”)不限于受试者(例如，患者)被治愈并且疾病被根除的情况。相反，本公开的实施方案也设想仅仅减少症状和/或延迟疾病进展的治疗。

如本文所用，术语“与...组合”当用于描述用另外的治疗剂给药时意指该药剂可在另外的治疗剂之前、同时或之后或其组合施用。

核苷类似物作为抗病毒剂

核苷类似物利用宿主的核苷补救途径通过脱氧核苷激酶(dNK)、脱氧核苷单磷酸激酶(dNMPK)和核苷二磷酸激酶(NDPK)顺序磷酸化。然而，这些化合物的胞内活化常常受到宿主内源性激酶的高底物特异性影响。体外和体内研究已经证明，由dNK和dNMPK催化的第一和/或第二磷酸化通常代表核苷类似物活化中的限速步骤。给定核苷类似物的磷酸化级联中的这些显著阻滞将导致细胞测定中缺乏任何可观察到的活性。为了避免这些阻滞，已经开发了几种激酶旁路策略。例如，McGuigan氨基磷酸酯是用于激酶旁路的化学偶联物。参见Serpi等人，J Med Chem，2012年，第55卷第10期，第4629-4639页。这些前药的代谢开始于羧酸酯的酯酶催化裂解，随后是几个化学重排步骤，产生氨基酸氨基磷酸酯。最后的切割通过几种内源性磷酰胺酶之一进行，其中一种已被鉴定为组氨酸三联体核苷酸结合蛋白1(hINT1)。

避免这些阻滞的另一种前药策略是利用鞘氨醇碱来掩盖核苷酸类似物磷酸酯。鞘氨醇碱具有用于将核苷酸类似物磷酸酯递送到关键组织诸如大脑的潜力。推动使用鞘氨醇碱形成核苷-类脂偶联物的设计概念基于观察到鞘氨醇碱类似物：(a)口服后良好吸收，(b)对肠上皮细胞中的氧化分解代谢具有抗性，以及(c)实现大脑中的高浓度。基于小鼠中传统磷脂药物偶联物的肠吸收数据和我们的大鼠鞘氨醇碱口服吸收数据，我们的鞘氨醇碱偶联物应该被很好地吸收并抵抗首过代谢。吸收后，鞘氨醇碱(包括鞘氨醇-1-磷酸)通过脂蛋白和游离血浆蛋白如白蛋白在血液中转运。已经证实，通过ABC转运蛋白CFTR发生活跃的上皮细胞摄取鞘氨醇碱磷酸酯，但也可能是被动的蛋白质转运和内吞摄取；据信，细胞外递送的药物偶联物将由中枢神经系统(CNS)和肠相关淋巴组织(GALT)中的靶细胞类似地加工。上述大鼠鞘脂PK研究结果是，24小时组织浓度超过血浆Cmax浓度10至300多倍，肺和脑水平特别高并且没有毒性证据。该方法具有将高药物浓度的偶联物递送至关键组织的显著潜力。

化合物

在某些实施方案中，本公开涉及偶联至磷部分的核苷或其药学上可接受的盐。

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R为OH、F、Cl、或NH₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

芳基为苯基、1-萘基、2-萘基、芳族、杂芳族、4-取代的苯基、4-氯苯基、或4-溴苯基；

R²为氢、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、乙基、环丙基、氟、氯、羟甲基、氨基甲基、乙烯基、或环丁基；

R⁴为氢、甲基、乙基、异丙基、环戊基、环己基、新戊基、苄基、烷基、支链烷基、环烷基、或类脂；

R⁵为氢、氘、羟基、氰基、叠氮基、氨基、取代的氨基、芳基、杂芳基、取代的芳基、类脂、C_1-22烷氧基、C_1-22烷基、C_2-22烯基、C_2-22炔基、或取代的杂芳基；

R⁶为甲基、乙基、叔丁基、C_1-22烷氧基、C_1-22烷基、支链烷基、环烷基、芳基、取代的芳基、或烷氧基；

R⁷为H、D、羟基、硫醇、氨基、烷基、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、烷氧基、取代的氨基、或氰基；

R⁸为H、D、羟基、硫醇、氨基、烷基、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、烷氧基、取代的氨基、或氰基。

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R为OH、F、Cl、或NH₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M+⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R为OH、F、Cl、或NH₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R⁸为H、D、羟基、硫醇、氨基、烷基、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、甲氧基、乙氧基、烷氧基、取代的氨基、或氰基。

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R⁸为D、羟基、硫醇、氨基、烷基、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、烷氧基、取代的氨基、或氰基。

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R⁷为D、羟基、硫醇、氨基、烷基、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、烷氧基、取代的氨基、或氰基。

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R²为甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、乙基、环丙基、氟、氯、羟甲基、氨基甲基、乙烯基、或环丁基；

R⁶为甲基、乙基、叔丁基、C_1-22烷氧基、C_1-22烷基、支链烷基、环烷基、芳基、取代的芳基、或烷氧基。

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

Y³为OH、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R²为氢、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、乙基、环丙基、氟、羟甲基、氨基甲基、乙烯基、或环丁基；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

Q为N或CR⁹；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R⁸为D、羟基、硫醇、氨基、烷基、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、烷氧基、取代的氨基、或氰基；

R⁹为D、羟基、硫醇、氨基、烷基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、烷氧基、取代的氨基、或氰基。

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe；

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R²为氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、乙基、环丙基、氟、羟甲基、氨基甲基、乙烯基、或环丁基；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R⁷为D、羟基、硫醇、氨基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、烷氧基、取代的氨基、或氰基。

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R²为甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、乙基、环丙基、氟、羟甲基、氨基甲基、乙烯基、或环丁基；

R⁸为H、D、羟基、硫醇、氨基、烷基、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、烷氧基、取代的氨基、或氰基。在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe或OCH₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R⁸为H、D、硫醇、烷基、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、或氰基。

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂或OCHMe；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R⁸为H、D、硫醇、氨基、烷基、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、取代的氨基、或氰基。

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R⁸为D、羟基、硫醇、氨基、烷基、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、烷氧基、取代的氨基、或氰基。在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R⁷为H、D、羟基、硫醇、氨基、烷基、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、烷氧基、取代的氨基、或氰基。

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R²为甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、环丙基、氟、羟甲基、氨基甲基、乙烯基、或环丁基；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂或OCHMe；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在示例性实施方案中，该化合物选自：

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、或OCF₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或CD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R⁸为D、羟基、硫醇、氨基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、烷氧基、或取代的氨基。

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R⁸为D、羟基、硫醇、氨基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、羟甲基、烯基、炔基、乙炔基、叠氮基、卤、氟、氯、溴、碘、酰基、酯基、甲酰基、烷氧基、取代的氨基、或氰基。

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及用于下式的化合物的方法：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及用于下式的化合物的方法：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及用于下式的化合物的方法：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及用于下式的化合物的方法：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及用于下式的化合物的方法：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

在某些实施方案中，本发明涉及具有以下结构的化合物：

在某些实施方案中，本发明涉及用于下式的化合物的方法：

如本文所用，类脂是C_6-22烷基、烷氧基、聚乙二醇或被烷基取代的芳基。

在某些实施方案中，类脂为衍生自必需和非必需脂肪酸的脂肪醇、脂肪胺、或脂肪硫醇。

在某些实施方案中，类脂为衍生自必需和非必需脂肪酸的不饱和、多不饱和、ω不饱和或ω多不饱和脂肪醇、脂肪胺或脂肪硫醇。

在某些实施方案中，类脂为衍生自必需和非必需脂肪酸的脂肪醇、脂肪胺或脂肪硫醇，其一个或多个碳单元被氧、氮或硫取代。

在某些实施方案中，类脂为衍生自必需和非必需脂肪酸的不饱和、多不饱和、ω不饱和或ω多不饱和脂肪醇、脂肪胺或脂肪硫醇，其一个或多个碳单元被氧、氮或硫取代。

在某些实施方案中，类脂为衍生自必需和非必需脂肪酸的任选被取代的脂肪醇、脂肪胺或脂肪硫醇。

在某些实施方案中，类脂为衍生自必需和非必需脂肪酸的任选被取代的不饱和、多不饱和、ω不饱和或ω多不饱和脂肪醇、脂肪胺或脂肪硫醇。

在某些实施方案中，类脂为衍生自必需和非必需脂肪酸的任选被取代的脂肪醇、脂肪胺或脂肪硫醇，其一个或多个碳单元被氧、氮或硫取代。

在某些实施方案中，类脂为衍生自必需和非必需脂肪酸的任选被取代的不饱和、多不饱和、ω不饱和或ω多不饱和脂肪醇、脂肪胺或脂肪硫醇，其一个或多个碳单元被氧、氮或硫取代。

在某些实施方案中，类脂为十六烷氧基丙基。

在某些实施方案中，类脂为2-氨基十六烷氧基丙基。

在某些实施方案中，类脂为2-氨基花生基。

在某些实施方案中，类脂为2-苄氧基十六烷氧基丙基。

在某些实施方案中，类脂为月桂基、肉豆蔻基、棕榈基、硬脂基、花生基、二十二烷基或二十四烷基。

在某些实施方案中，类脂为具有下式的鞘脂：

其中，

鞘脂的R⁸为氢、烷基、C(＝O)R¹²、C(＝O)OR¹²或C(＝O)NHR¹²；

鞘脂的R⁹为氢、氟、OR¹²、OC(＝O)R¹²、OC(＝O)OR¹²或OC(＝O)NHR¹²；

鞘脂的R¹⁰为大于6且小于22个碳的饱和或不饱和烷基链，其任选地被一个或多个卤素或羟基或下式的结构取代：

n为8至14或小于或等于8至小于或等于14，o为9至15或小于或等于9至小于或等于15，m和n的总和为8至14或小于或等于8至小于或等于14，m和o的总和为9至15或小于或等于9至小于或等于15；或

n为4至10或小于或等于4至小于或等于10，o为5至11或小于或等于5至小于或等于11，m和n的总和为4至10或小于或等于4至小于或等于10，m和o的总和为5至11或小于或等于5至小于或等于11；或

n为6至12或者n小于或等于6至小于或等于12，m和n的总和为6至12或者n小于或等于6至小于或等于12；

鞘脂的R¹¹为OR¹²、OC(＝O)R¹²、OC(＝O)OR¹²或OC(＝O)NHR¹²；

鞘脂的R¹²为氢，支链或直链C_1-12烷基、C_13-22烷基、环烷基或选自苄基或苯基的芳基，其中芳基任选地被一个或多个相同或不同的R¹³取代；并且

鞘脂的R¹³为卤素、硝基、氰基、羟基、三氟甲氧基、三氟甲基、氨基、甲酰基、羧基、氨基甲酰基、巯基、氨磺酰基、甲基、乙基、甲氧基、乙氧基、乙酰基、乙酰氧基、甲氨基、乙氨基、二甲氨基、二乙氨基、N-甲基-N-乙氨基、乙酰氨基、N-甲基氨基甲酰基，N-乙基氨基甲酰基、N，N-二甲基氨基甲酰基、N，N-二乙基氨基甲酰基、N-甲基-N-乙基氨基甲酰基、甲硫基、乙硫基、甲基亚磺酰基、乙基亚磺酰基、甲磺酰基、乙磺酰基、甲氧基羰基、乙氧基羰基、N-甲基氨磺酰基、N-乙基氨磺酰基、N，N-二甲基氨磺酰基、N，N-二乙基氨磺酰基、N-甲基-N-乙基氨磺酰基、碳环基、芳基或杂环基。

在某些实施方案中，鞘脂的R¹²为H、烷基、甲基、乙基、丙基、正丁基、支链烷基、异丙基、2-丁基、1-乙基丙基、1-丙基丁基、环烷基、环丙基、环丁基、环戊基、环己基、苄基、苯基、单取代的苯基、二取代的苯基、三取代的苯基，或饱和或不饱和的C12-C19长链烷基。

在某些实施方案中，鞘脂具有下式：

其中，

鞘脂的R⁸为氢、羟基、氟、OR¹²、OC(＝O)R¹²、OC(＝O)OR¹²或OC(＝O)NHR¹²；

鞘脂的R⁹为氢、羟基、氟、OR¹²、OC(＝O)R¹²、OC(＝O)OR¹²或OC(＝O)NHR¹²；

鞘脂的R¹⁰为大于6且小于22个碳的饱和或不饱和烷基链，其任选地被一个或多个卤素或下式的结构取代：

n为8至14或小于或等于8至小于或等于14，m和n的总和为8至14或小于或等于8至小于或等于14；

鞘脂的R¹³为卤素、硝基、氰基、羟基、三氟甲氧基、三氟甲基、氨基、甲酰基、羧基、氨基甲酰基、巯基、氨磺酰基、甲基、乙基、甲氧基、乙氧基、乙酰基、乙酰氧基、甲氨基、乙氨基、二甲氨基、二乙氨基、N-甲基-N-乙氨基、乙酰氨基、N-甲基氨基甲酰基，N-乙基氨基甲酰基、N，N-二甲基氨基甲酰基、N，N-二乙基氨基甲酰基、N-甲基-N-乙基氨基甲酰基、甲硫基、乙硫基、甲基亚磺酰基、乙基亚磺酰基、甲磺酰基、乙磺酰基、甲氧基羰基、乙氧基羰基、N-甲基氨磺酰基、N-乙基氨磺酰基、N，N-二甲基氨磺酰基、N，N-二乙基氨磺酰基、N-甲基-N-乙基氨磺酰基、碳环基、芳基、或杂环基。

在某些实施方案中，鞘脂的R¹²为H、烷基、甲基、乙基、丙基、正丁基、支链烷基、异丙基、2-丁基、1-乙基丙基、1-丙基丁基、环烷基、环丙基、环丁基、环戊基、环己基、苄基、苯基、单取代的苯基、二取代的苯基、三取代的苯基，或饱和或不饱和的C₁₂-C₁₉长链烷基。

合适的鞘脂包括但不限于鞘氨醇、神经酰胺或鞘磷脂，或任选地被一个或多个取代基取代的2-氨基烷基。

其他合适的鞘脂包括但不限于2-氨基十八烷-3，5-二醇；(2S，3S，5S)-2-氨基十八烷-3，5-二醇；(2S，3R，5S)-2-氨基十八烷-3，5-二醇；2-(甲氨基)十八烷-3，5-二醇；(2S，3R，5S)-2-(甲氨基)十八烷-3，5-二醇；2-(二甲基氨基)十八烷-3，5-二醇；(2R，3S，5S)-2-(二甲基氨基)十八烷-3，5-二醇；1-(吡咯烷-2-基)十六烷-1，3-二醇；(1S，3S)-1-((S)-吡咯烷-2-基)十六烷-1，3-二醇；2-氨基-11，11-二氟十八烷-3，5-二醇；(2S，3S，5S)-2-氨基-11，11-二氟十八烷-3，5-二醇；11，11-二氟-2-(甲氨基)十八烷-3，5-二醇；(2S，3S，5S)-11，11-二氟-2-(甲氨基)十八烷-3，5-二醇；N-((2S，3S，5S)-3，5-二羟基十八烷-2-基)乙酰胺；N-((2S，3S，5S)-3，5-二羟基十八烷-2-基)棕榈酰胺；1-(1-氨基环丙基)十六烷-1，3-二醇；(1S，3R)-1-(1-氨基环丙基)十六烷-1，3-二醇；(1S，3S)-1-(1-氨基环丙基)十六烷-1，3-二醇；2-氨基-2-甲基十八烷-3，5-二醇；(3S，5S)-2-氨基-2-甲基十八烷-3，5-二醇；(3S，5R)-2-氨基-2-甲基十八烷-3，5-二醇；(3S，5S)-2-甲基-2-(甲氨基)十八烷-3，5-二醇；2-氨基-5-羟基-2-甲基十八烷-3-酮；(Z)-2-氨基-5-羟基-2-甲基十八烷-3-酮肟；(2S，3R，5R)-2-氨基-6，6-二氟十八烷-3，5-二醇；(2S，3S，5R)-2-氨基-6，6-二氟十八烷-3，5-二醇；(2S，3R，5S)-2-氨基-6，6-二氟十八烷-3，5-二醇；(2S，3R，5S)-2-氨基-6，6-二氟十八烷-3，5-二醇；以及(2S，3S，5S)-2-氨基-18，18，18-三氟十八烷-3，5-二醇；其可任选地被一个或多个取代基取代。

传染病

本文所提供的化合物可用于治疗病毒性传染病。病毒感染的例子包括但不限于由RNA病毒引起的感染(包括负链RNA病毒、正链RNA病毒、双链RNA病毒和逆转录病毒)或DNA病毒。本文设想了RNA病毒和DNA病毒的所有毒株、类型和亚型。

RNA病毒的例子包括但不限于小核糖核酸病毒，其包括口蹄疫病毒(例如，口蹄疫病毒O、A、C、Asia 1、SAT1、SAT2和SAT3)、心脏病毒(例如，脑心肌炎病毒和Theiler氏鼠脑脊髓炎病毒)、肠道病毒(例如，脊髓灰质炎病毒1、2和3，人肠道病毒A-D，牛肠道病毒1和2，人柯萨奇病毒A1-A22和A24，人柯萨奇病毒B1-B5，人艾柯病毒1-7、9、11-12、24、27、29-33，人肠道病毒68-71，猪肠道病毒8-10和猿猴肠道病毒1-18)、马鼻病毒(例如，马鼻炎病毒)、肝病毒(例如，人甲型肝炎病毒和猿猴甲型肝炎病毒)、嵴病毒(例如，牛嵴病毒和爱知病毒)、副肠孤病毒(例如，人副肠孤病毒1和人副肠孤病毒2)、鼻病毒(例如，鼻病毒A、鼻病毒B、鼻病毒C、HRV₁₆、HRV₁₆(VR-11757)、HRV₁₄(VR-284)或HRV_1A(VR-1559)、人鼻病毒1-100和牛鼻病毒1-3)和捷申病毒(例如，猪捷申病毒)。

RNA病毒的另外的例子包括杯状病毒，其包括诺罗病毒(例如，诺瓦克病毒)、沙波病毒(例如，札幌病毒)、兔病毒(例如，兔出血病病毒和欧洲褐色野兔综合症)和疱疹病毒(例如，猪病毒和猫杯状病毒的水疱疹)。其他RNA病毒包括星状病毒，其包括哺乳动物星状病毒和禽星状病毒。披盖病毒也是RNA病毒。披盖病毒包括甲病毒(例如，基孔肯雅病毒、辛德毕斯病毒、塞姆利基森林病毒、西部马脑炎病毒、东部盖塔病毒、埃沃格雷病毒、委内瑞拉马脑炎病毒、罗斯河病毒、巴马森林病毒和奥拉病毒)以及风疹病毒。RNA病毒的其他例子包括黄病毒(例如，蜱传脑炎病毒(西方、西伯利亚和远东亚型)、鄂木斯克出血热病毒、库阿撒鲁尔森林病毒、Alkhurma病毒、羊跳跃病病毒、秋列尼病毒、阿罗阿病毒、M病毒(1至4型)、凯杜古病毒、日本脑炎病毒(JEV)、西尼罗河病毒(WNV)、登革热病毒(包括基因型1-4)、寨卡病毒、玻瓦桑病毒、科科贝拉病毒、恩塔亚病毒、斯庞德温尼病毒、黄热病病毒、恩德培蝙蝠病毒、莫多克病毒、里约布拉沃病毒、细胞融合剂病毒、瘟病毒、GB病毒A、GBV-A样病毒、GB病毒C、庚型肝炎病毒、肝炎病毒(丙型肝炎病毒(HCV))所有六种基因型)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)1型和2型，以及GB病毒B)。

RNA病毒的其他例子是冠状病毒，其包括人呼吸道冠状病毒，诸如SARS-CoV、HCoV-229E、HCoV-NL63和HCoV-OC43。冠状病毒还包括蝙蝠SARS样CoV、中东呼吸综合症冠状病毒(MERS)、火鸡冠状病毒、鸡冠状病毒、猫冠状病毒和犬冠状病毒。其他RNA病毒包括动脉炎病毒(例如，马动脉炎病毒、猪生殖和呼吸综合征病毒，小鼠的乳酸脱氢酶升高病毒和猿猴出血热病毒)。其他RNA病毒包括弹状病毒，其包括狂犬病病毒(例如，狂犬病、拉各斯蝙蝠病毒、莫科拉病毒、杜文海格病毒和欧洲蝙蝠狂犬病病毒)、水泡病毒(例如，VSV-Indiana、VSV-New Jersey、VSV-Alagoas、皮里病毒、科卡尔病毒、马拉巴病毒、伊斯法罕病毒和金迪普拉病毒)，以及暂时热病毒(例如，牛暂时热病毒、阿德莱德河病毒和贝里马病毒)。RNA病毒的另外的例子包括丝状病毒。这些包括马尔堡病毒和埃博拉病毒(例如，EBOV-Z、EBOV-S、EBOV-IC和EBOV-R)。

副粘病毒也是RNA病毒。这些病毒的例子是腮腺炎病毒(例如，腮腺炎、副流感病毒5、人副流感病毒2型、马普埃拉病毒和猪腮腺炎病毒)、禽腮腺炎病毒(例如，新城鸡瘟病毒)、呼吸道病毒(例如，仙台病毒、人副流感病毒1型和3型、牛副流感病毒3型)、亨尼巴病毒(例如，亨得拉病毒和尼帕病毒)、麻疹病毒(例如，麻疹、鲸类麻疹病毒、犬瘟热病毒、小反刍兽疫病毒、海豹瘟热病毒和牛瘟病毒)、肺病毒(例如，人呼吸道合胞病毒(RSV)A2、B1和S2，牛呼吸道合胞病毒和小鼠肺炎病毒)、偏肺病毒(例如，人偏肺病毒和禽类偏肺病毒)。其他副粘病毒包括美洲洼蛇病毒、树鼩副粘病毒、梅南高病毒、刁曼病毒、Beilong病毒、J病毒、莫斯曼病毒、Salem病毒和纳里瓦病毒。

另外的RNA病毒包括正粘病毒。这些病毒包括流感病毒和毒株(例如，甲型流感、甲型流感病毒株A/Victoria/3/75、甲型流感病毒株A/Puerto Rico/8/34、甲型H1N1流感(包括但不限于A/WS/33、A/NWS/33和A/California/04/2009毒株)、乙型流感、乙型流感毒株Lee和丙型流感病毒)H2N2、H3N2、H5N1、H7N7、H1N2、H9N2、H7N2、H7N3和H10N7)，以及禽流感(例如，毒株H5N1、H5N1Duck/MN/1525/81、H5N2、H7N1、H7N7和H9N2)托高土病毒和鲑传贫病毒。正布尼亚病毒(例如，赤羽病毒、加利福尼亚脑炎、卡奇谷病毒、雪鞋兔病毒)、内罗病毒(例如，内罗毕羊病毒，克里米亚刚果出血热病毒群和休斯病毒)、白蛉病毒(例如，坎迪鲁病毒、帕库伊病毒、裂谷热病毒、白蛉热病毒、那不勒斯病毒、托斯卡纳病毒、西西里病毒和查格雷斯病毒)，以及汉坦病毒(例如，汉坦病毒、多伯伐病毒、汉城病毒、普马拉病毒、辛诺柏病毒、牛轭湖病毒、污黑小河沟病毒、安第斯病毒和索托帕拉雅病毒)也是RNA病毒。沙粒病毒，诸如淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒、卢约病毒、拉沙热病毒、阿根廷出血热病毒、玻利维亚出血热病毒、委内瑞拉出血热病毒、SABV和WWAV也是RNA病毒。博尔纳病病毒也是RNA病毒。丁型肝炎(δ)病毒和戊型肝炎也是RNA病毒。

另外的RNA病毒包括呼肠孤病毒、轮状病毒、双核糖核酸病毒、金色病毒、囊状病毒、低毒病毒、分病毒和totovirus。环状病毒，诸如非洲马瘟病毒、蓝舌病毒、钱吉诺拉病毒、秦纽达病毒、Chobar GorgeCorriparta病毒、流行性出血病病毒、马脑病病毒、北澳蚊病毒、伊理病毒、大岛病毒、莱邦博病毒、奥轮谷病毒、巴尼亚姆病毒、秘鲁马病病毒、圣克罗伊河病毒、尤马蒂拉病毒、瓦德麦达尼病毒、沃洛尔病毒、沃里戈病毒和王戈尔病毒也是RNA病毒。逆转录病毒包括α逆转录病毒(例如，劳氏肉瘤病毒和禽白血病病毒)、β逆转录病毒(例如，小鼠乳腺肿瘤病毒、梅森-菲舍猴病毒和绵羊肺腺瘤病毒)、γ逆转录病毒(例如，鼠白血病病毒和猫白血病病毒)、δ逆转录病毒(例如，人T细胞白血病病毒(HTLV-1、HTLV-2)、牛白血病病毒、STLV-1和STLV-2)、ε逆转录病毒(例如，大眼鲈真皮肉瘤病毒和大眼鲈表皮过度增生病毒1)、网状内皮增生症病毒(例如，鸡合胞体病毒、慢病毒(例如，人类免疫缺陷病毒(HIV)1型、人类免疫缺陷病毒(HIV)2型、人类免疫缺陷病毒(HIV)3型、猿猴免疫缺陷病毒、马传染性贫血病毒、猫免疫缺陷病毒、山羊关节炎脑炎病毒和维斯纳梅迪病毒)和泡沫病毒(例如，人泡沫病毒和猫合胞体形成病毒)。

DNA病毒的例子包括多瘤病毒(例如，猿猴病毒40、猿猴病毒12、BK病毒、JC病毒、默克尔细胞多瘤病毒、牛多瘤病毒和淋巴细胞乳多空病毒)、乳头瘤病毒(例如，人乳头瘤病毒、牛乳头瘤病毒)、腺病毒(例如，腺病毒A-F、I型犬腺病毒、2型犬腺病毒)、圆环病毒(例如，猪圆环病毒和喙羽病病毒(BFDV))、细小病毒(例如，犬细小病毒)、红病毒(例如，腺病毒相关病毒1-8型)、β细小病毒、阿留申病毒、浓核病毒、重复病毒、短浓核病毒、环星黑烟浓稠病毒、疱疹病毒1、2、3、4、5、6、7和8(例如，单纯疱疹病毒1、单纯疱疹病毒2、水痘-带状疱疹病毒、爱泼斯坦-巴尔病毒、巨细胞病毒、卡波西肉瘤相关疱疹病毒、人疱疹病毒-6变体A、人疱疹病毒-6变体B和猕猴疱疹病毒1(B病毒))、痘病毒(例如，天花(variola)、牛痘、猴痘、牛痘病毒、瓦森伊修病病毒、骆驼痘、伪牛痘、鸽痘、马痘、禽痘、火鸡痘和猪痘)和嗜肝DNA病毒(例如，乙型肝炎和乙型肝炎样病毒)。本文还设想了包含不止一个病毒基因组部分的嵌合病毒。

在一些实施方案中，本公开涉及治疗或预防病毒、细菌、真菌、原生动物和寄生虫感染。在一些实施方案中，本公开涉及治疗病毒感染的方法，包括向被诊断患有、怀疑患有或表现出病毒感染的症状的受试者施用本文的化合物。

病毒是通常可在生物体的活细胞内复制的传染剂。病毒粒子(病毒体)通常由核酸、蛋白质外壳和在某些情况下包围蛋白质外壳的脂质包膜组成。病毒的形状从简单的螺旋形和二十面体形式到更复杂的结构。病毒编码的蛋白质亚基将自组装形成衣壳，通常需要病毒基因组的存在。复杂的病毒可以编码有助于构建其衣壳的蛋白质。与核酸相关的蛋白质称为核蛋白，并且病毒衣壳蛋白与病毒核酸的结合称为核衣壳。

病毒通过多种方法传播，包括直接或体液接触，例如血液、眼泪、精液、前期精液、唾液、乳汁、阴道分泌物、病变；液滴接触，粪口接触，或由于动物咬伤或分娩。病毒具有DNA或RNA基因，并且分别称为DNA病毒或RNA病毒。病毒基因组为单链或双链。一些病毒包含部分双链和部分单链的基因组。对于具有RNA或单链DNA的病毒，这些链被认为是正义(称为正链)或负义(称为负链)，这取决于它是否与病毒信使RNA(mRNA)互补。正义病毒RNA与病毒mRNA相同，因此可被宿主细胞立即翻译。负义病毒RNA与mRNA互补，因此必须在翻译前通过RNA聚合酶转化为正义RNA。DNA命名法类似于RNA命名法，因为病毒mRNA的编码链与其互补(负)，而非编码链是其拷贝(正)。

抗原转变或重配可产生新的菌株。病毒通过若干机制进行遗传改变。这些包括称为遗传漂变的过程，其中DNA或RNA中的个别碱基突变为其他碱基。当病毒基因组发生重大变化时，会发生抗原转变。这可以是重组或重配的结果。RNA病毒通常作为相同物种的准种或成群病毒存在，但具有略微不同的基因组核苷序列。

病毒内的遗传物质以及复制材料的方法因不同类型的病毒而异。大多数DNA病毒的基因组复制发生在细胞核中。如果细胞在其表面上具有合适的受体，则这些病毒通过与细胞膜融合或通过内吞作用进入细胞。大多数DNA病毒完全依赖于宿主DNA和RNA合成机器以及RNA加工机器。复制通常发生在细胞质中。RNA病毒通常使用它们自己的RNA复制酶来创建其基因组的拷贝。

巴尔的摩病毒分类基于mRNA产生的机制。病毒必须从其基因组中生成mRNA以产生蛋白质并自我复制，但是使用不同的机制来实现这一点。病毒基因组可以是单链(ss)或双链(ds)，RNA或DNA，并且可使用或可不使用逆转录酶(RT)。另外，ssRNA病毒可以是有义(+)或反义(-)。该分类将病毒分为七组：I，dsDNA病毒(例如，腺病毒、疱疹病毒、痘病毒)；II，ssDNA病毒(+)有义DNA(例如，细小病毒)；III，dsRNA病毒(例如，呼肠孤病毒)；四，(+)ssRNA病毒(+)有义RNA(例如，小核糖核酸病毒、披盖病毒)；五，(-)ssRNA病毒(-)有义RNA(例如，正粘病毒、弹状病毒)；VI，在生命周期中具有DNA中间体的ssRNA-RT病毒(+)有义RNA(例如，逆转录病毒)；以及VII，dsDNA-RT病毒(例如，嗜肝病毒)。

人类免疫缺陷病毒(HIV)是引起获得性免疫缺陷综合症(AIDS)的慢病毒(逆转录病毒家族成员)。慢病毒作为单链、正义、包膜RNA病毒传播。在进入靶细胞后，通过病毒编码的逆转录酶将病毒RNA基因组转化为双链DNA。然后通过病毒编码的整合酶以及宿主细胞辅因子将该病毒DNA整合到细胞DNA中。有两种HIV。HIV-1有时称为LAV或HTLV-III。

HIV主要感染人体免疫系统中的活细胞，诸如辅助性T细胞(CD4+T细胞)、巨噬细胞和树突细胞。HIV感染导致低水平的CD4+T细胞。当CD4+T细胞数量降至临界水平以下时，细胞介导的免疫力丧失，并且身体逐渐变得更容易受到其他病毒或细菌感染。患有HIV的受试者通常会发展与免疫系统进行性衰竭相关的恶性肿瘤。

当新形成的病毒粒子从细胞发芽时，病毒包膜由取自人细胞膜的两层磷脂组成。嵌入病毒包膜中的是来自宿主细胞的蛋白质和称为Env的HIV蛋白质。Env含有糖蛋白gp120和gp41。RNA基因组由结构标志(LTR、TAR、RRE、PE、SLIP、CRS和INS)和编码19种蛋白质的9种基因(gag、pol和env、tat、rev、nef、vif、vpr、vpu，有时还包括第十个tev，它是tat env和rev的融合)组成。这些基因中的三个gag、pol和env包含为新病毒粒子制备结构蛋白所需的信息。HIV-1诊断通常通过在ELISA、蛋白质印迹或免疫亲和测定中的抗体或通过核酸测试(例如，病毒RNA或DNA扩增)进行。

HIV通常用抗病毒剂的组合治疗，例如两种核苷类似物逆转录抑制剂和一种非核苷类似物逆转录抑制剂或蛋白酶抑制剂。三种药物组合通常被称为三重混合物。在某些实施方案中，本公开涉及通过将本文公开的药物组合物与两种核苷类似物逆转录抑制剂和一种非核苷类似物逆转录抑制剂或蛋白酶抑制剂组合施用来治疗被诊断为HIV的受试者。

在某些实施方案中，本公开涉及通过施用本文公开的化合物恩曲他滨、替诺福韦和依非韦伦治疗受试者。在某些实施方案中，本公开涉及通过施用本文公开的化合物恩曲他滨、替诺福韦和雷特格韦治疗受试者。在某些实施方案中，本公开涉及通过施用本文公开的化合物恩曲他滨、替诺福韦、利托那韦和地瑞那韦治疗受试者。在某些实施方案中，本公开涉及通过施用本文公开的化合物恩曲他滨、替诺福韦、利托那韦和阿扎那韦治疗受试者。

香蕉凝集素(BanLec或BanLec-1)是成熟香蕉果肉中的主要蛋白质之一，并且对甘露糖和含甘露糖的寡糖具有结合特异性。BanLec与HIV-1包膜蛋白gp120结合。在某些实施方案中，本公开涉及通过将本文公开的化合物与香蕉凝集素组合施用来治疗病毒感染，诸如HIV。

丙型肝炎病毒是单链、正义RNA病毒。它是黄病毒(Flaviviridae)科中肝炎病毒属的唯一已知成员。丙型肝炎病毒有六种主要的基因型，用数字表示。丙型肝炎病毒粒子由遗传物质(RNA)核心组成，被二十面体保护壳包围，并进一步包裹在脂质包膜中。两种病毒包膜糖蛋白E1和E2嵌入脂质包膜中。基因组由被翻译以产生单个蛋白质的单个开放阅读框组成。这种大的前蛋白质稍后被细胞和病毒蛋白酶切割成较小的蛋白质，允许病毒在宿主细胞内复制，或组装成成熟的病毒粒子，例如E1、E2、NS2、NS3、NS4、NS4A、NS4B、NS5、NS5A和NS5B。

HCV导致肝的炎症，并且慢性感染导致肝硬化。大多数丙型肝炎感染者都具有慢性型。HCV的诊断可通过5′-非编码区的核酸分析进行。可进行ELISA测定以检测丙型肝炎抗体，并进行RNA测定以确定病毒载量。感染HCV的受试者可能表现出腹痛、腹水、尿赤、疲劳、全身性瘙痒、黄疸、发烧、恶心、苍白或粘土色粪便和呕吐的症状。

在某些情况下，治疗剂可能长时间抑制病毒。典型的药物是干扰素α和利巴韦林的组合。受试者可以接受聚乙二醇化干扰素α的注射。基因型1和4对基于干扰素的治疗的反应性低于其他基因型(2、3、5和6)。在某些实施方案中，本公开涉及通过向表现出HCV症状或诊断患有HCV的受试者施用本文公开的化合物来治疗患有HCV的受试者。在某些实施方案中，化合物与干扰素α和另一种抗病毒剂诸如利巴韦林和/或蛋白酶抑制剂诸如特拉匹韦或博赛泼维联合施用。在某些实施方案中，受试者被诊断为具有基因型2、3、5或6。在其他实施方案中，受试者被诊断为具有基因型1或4。

在某些实施方案中，受试者通过核酸检测或病毒抗原检测被诊断为有病毒。巨细胞病毒(CMV)属于疱疹病毒科的β-疱疹病毒亚科。在人中，它通常称为HCMV或人疱疹病毒5(HHV-5)。疱疹病毒通常具有长时间保持在体内潜伏的特征能力。对于免疫受损的患者，HCMV感染可能危及生命。在某些实施方案中，本公开涉及通过施用本文公开的化合物治疗被诊断患有巨细胞病毒或预防巨细胞病毒感染的受试者的方法。在某些实施方案中，受试者是免疫受损的。在典型的实施方案中，受试者是器官移植受体，经历血液透析，被诊断患有癌症，接受免疫抑制药物并且/或者被诊断患有HIV感染。在某些实施方案中，受试者可被诊断患有巨细胞病毒性肝炎、急性肝衰竭的原因、巨细胞病毒性视网膜炎(视网膜炎症，可通过检眼镜检查检测)、巨细胞病毒性结肠炎(大肠炎症)、巨细胞病毒性肺炎、巨细胞病毒性食管炎、巨细胞病毒性单核细胞增多症、多发性神经根病、横贯性脊髓炎和亚急性脑炎。在某些实施方案中，本文公开的化合物与抗病毒剂诸如缬更昔洛韦或更昔洛韦组合施用。在某些实施方案中，受试者经历定期血清监测。

怀孕受试者的HCMV感染可能导致先天性异常。当母亲在怀孕期间遭受原发感染(或再激活)时，就会发生先天性HCMV感染。在某些实施方案中，本公开涉及通过施用本文公开的化合物治疗被诊断患有巨细胞病毒或预防有风险、试图成为或目前怀孕的受试者的巨细胞病毒感染的怀孕受试者的方法。

已经感染CMV的受试者通常会产生针对该病毒的抗体。已经开发了检测针对CMV的这些抗体的许多实验室测试。可从获自尿液、咽喉拭子、支气管灌洗液和组织样品中的标本培养病毒以检测活动性感染。可使用PCR监测CMV感染的受试者的病毒载量。CMV pp65抗原血症试验是一种基于免疫亲和力的试验，用于鉴定外周血白细胞中巨细胞病毒的pp65蛋白。如果患者有传染性单核细胞增多症的症状，但单核细胞增多症和爱泼斯坦-巴尔病毒的检测结果为阴性，或者如果他们出现肝炎的迹象，但对甲型肝炎、乙型肝炎和丙型肝炎的检测结果为阴性，则应怀疑CMV。可在受试者有症状的任何时间进行病毒培养。可进行针对CMV的抗体的实验室测试以确定受试者是否已患有CMV感染。

酶联免疫吸附测定(或ELISA)是用于测量针对CMV的抗体的最常见的可用血清测试。该结果可用于确定在婴儿中是否存在急性感染、先前感染或被动获得的母体抗体。其他测试包括各种荧光测定、间接血凝、(PCR)和胶乳凝集。可获得用于CMV特异性IgM的ELISA技术。

乙型肝炎病毒是嗜肝病毒。病毒粒子(病毒体)由外部脂质包膜和由蛋白质组成的二十面体核衣壳核心组成。HBV的基因组由环状DNA组成，但DNA不是完全双链的。链的一端与病毒DNA聚合酶连接。病毒借助于逆转录通过RNA中间体形式复制。复制通常发生在引起炎症(肝炎)的肝脏中。病毒传播到受感染人群的血液中，在该血液中发现病毒特异性蛋白质及其对应抗体。这些蛋白质和抗体的血液检测用于诊断感染。

乙型肝炎病毒通过内吞作用进入细胞。由于病毒通过宿主酶产生的RNA繁殖，所以病毒基因组DNA必须通过宿主伴侣转移到细胞核。然后使部分双链病毒DNA完全双链并转化成共价闭合环状DNA(cccDNA)，其用作病毒mRNA转录的模板。该病毒基于其包膜蛋白上呈现的抗原表位分为四种主要血清型(adr、adw、ayr、ayw)，并根据基因组的总核苷酸序列变异分为八种基因型(A-H)。

乙型肝炎表面抗原(HBsAg)通常用于筛查这种感染的存在。它是在感染期间出现的第一可检测病毒抗原。然而，在感染早期，这种抗原可能不存在，并且如果它被宿主清除，它可能在感染后期检测不到。感染性病毒体包含封闭病毒基因组的内部“核心粒子”。二十面体核心粒子由核心蛋白质，或者称为乙型肝炎核心抗原或HBcAg制成。针对乙型肝炎核心抗原的IgM抗体(抗HBc IgM)可用作血清学标志物。可能出现乙型肝炎e抗原(HBeAg)。宿主血清中HBeAg的存在与病毒复制的高速率相关。乙型肝炎病毒的某些变体不会产生‘e’抗原，

如果宿主能够清除感染，通常HBsAg将变得无法检测，并且随后将出现针对乙型肝炎表面抗原和核心抗原的IgG抗体(抗HB和抗HBc IgG)。HBsAg去除和抗HB出现之间的时间称为窗口期。对HBsAg为阴性但对抗HB为阳性的人要么已清除了感染，要么先前已接种过疫苗。保持HBsAg为阳性至少六个月的个体被认为是乙型肝炎携带者。病毒的携带者可患有慢性乙型肝炎，这将通过由活检可鉴定的血清丙氨酸氨基转移酶水平和肝脏炎症反映出来。已经开发出核酸(PCR)测试来检测和测量临床标本中HBV DNA的量。

乙型肝炎病毒的急性感染与急性病毒性肝炎有关。急性病毒性肝炎通常始于一般健康状况不佳、食欲不振、恶心、呕吐、身体疼痛、轻度发烧、尿赤的症状，然后发展为黄疸。乙型肝炎病毒的慢性感染可能是无症状的，也可能与肝脏的慢性炎症(慢性肝炎)有关，可能导致肝硬化。患有慢性乙型肝炎感染会增加肝细胞癌(肝癌)的发病率。

在HBV感染期间，宿主免疫应答引起肝细胞损伤和病毒清除。适应性免疫应答，特别是病毒特异性细胞毒性T淋巴细胞(CTL)，导致与HBV感染相关的大部分肝损伤。通过杀死受感染的细胞并通过产生能够从活肝细胞中清除HBV的抗病毒细胞因子，CTL消除了病毒。虽然肝脏损伤由CTL引发和介导，但抗原非特异性炎症细胞可使CTL诱导的免疫病理恶化，并且在感染部位激活的血小板可促进CTL在肝脏中的积累。

治疗剂可阻止病毒复制，从而最大程度地减少肝脏损伤。在某些实施方案中，本公开涉及通过施用本文公开的本文公开的化合物治疗被诊断患有HBV的受试者的方法。在某些实施方案中，受试者是免疫受损的。在某些实施方案中，化合物与另一种抗病毒剂如拉米夫定、阿德福韦、替诺福韦、替比夫定和恩替卡韦和/或免疫系统调节剂干扰素α-2a和聚乙二醇化干扰素α-2a(派罗欣)联合使用。在某些实施方案中，本公开涉及通过施用本文公开的药物组合物以及任选的一种或多种抗病毒剂来预防具有感染风险的免疫受损受试者的HBV感染。在某些实施方案中，受试者具有感染风险，因为受试者的性伴侣被诊断为患有HBV。

寨卡病毒(ZIKV)是黄病毒科(黄病毒(flavivirus)属)中新出现的节肢动物传播的人类病原体，其首先于1947年在乌干达的寨卡森林中从发热的哨兵恒河猴中分离出来。虽然主要通过埃及伊蚊传播，但目前的报道强烈表明该病毒在围产期传播、通过性传播和通过输血传播。ZIKV感染通常是自限性的，80％的感染个体临床上无症状。患病的患者的症状通常是轻微的，没有生命危险。症状包括发烧，黄斑皮疹，关节疼痛和/或结膜炎，肌肉疼痛，头痛和复古轨道疼痛。症状包括发烧、斑丘疹、关节疼痛和/或结膜炎、肌肉疼痛、头痛和后眼窝痛。最近，非脊髓灰质炎病毒相关的急性弛缓性麻痹的最常见原因是Gullain-Barre综合征(GBS)的发病率高于正常，并且先天性小头畸形病例与法属波利尼西亚和巴西的ZIKV暴发有关。GBS是一种严重的疾病，据信是由免疫介导的对某些病毒或细菌感染的抗原暴露的反应引发的。大约20％的患者患有严重残疾，并且约5％的患者死亡。同样值得关注的是2015年在巴西报告的ZIKV感染与小头畸形病例发生率增加20倍的明显相关性。在这些症状中，最常见的是癫痫发作、精神发育迟滞、发育迟缓、脑瘫、听力和视力丧失。目前，没有用于预防或治疗ZIKV感染的疫苗或治疗选择。

ZIKV的感染机制尚未得到很好的研究，但病毒的复制周期可类似于其他黄病毒诸如DFV。用来自ZIKV感染的蚊子的唾液接种的人皮肤导致表皮角质细胞、皮肤成纤维细胞和朗格汉斯细胞的感染。ZIKV继续通过淋巴结和血流在人类宿主中传播。ZIKV基因组复制通过由病毒非结构蛋白、病毒RNA和宿主蛋白组成的膜结合病毒复制复合体发生在内质网中的细胞内区室，其特性大多是未知的。ZIKV的基因组是长度约10.7kb的单链(+)-RNA分子，其具有两个非编码侧翼区(NCR)，称为5′-NCR和3′-NCR。ZIKV RNA基因组包含编码3,419个氨基酸的多肽的单个开放阅读框(ORF)，该多肽被切割成三种结构蛋白(C、prM和E)和七种非结构蛋白(NS1、NS2a、NS2b、NS3、NS4a、NS4b和NS5)。该复合物首先将基因组正链RNA转录成互补的负链RNA中间体，导致双链体RNA的形成。该双链体的负链用作多轮正链RNA合成的模板。病毒RNA合成通过不对称复制循环发生，其中合成比负链RNA多十倍的正链。

还提供了在受试者中治疗HCV感染的方法。该方法包括施用本发明化合物以提供至少两种含有或不含有利巴韦林的直接作用抗病毒剂(DAA)，持续不超过十二周的持续时间，或如本文所述的另一持续时间。在一个实施方案中，治疗的持续时间不超过十二周。在另一个实施方案中，治疗的持续时间不超过八周。优选地，两种或更多种含有或不含有利巴韦林的直接作用抗病毒剂(DAA)以有效提供持续病毒学应答(SVR)或在受试者中实现另一种所需的有效性量度的量施用。该受试者在治疗方案期间未被施用干扰素。换句话讲，在一个实施方案中，该方法不包括向受试者施用干扰素，从而避免与干扰素相关的副作用。在一些实施方案中，该方法还包括向受试者施用细胞色素P-450的抑制剂(诸如利托那韦)以改善一种或多种DAA的药动学或生物利用率。

作为另一个方面，提供了在受试者中治疗HCV感染的方法。该方法包括向受试者施用(a)蛋白酶抑制剂，(b)至少一种聚合酶抑制剂，其中至少一者是本发明的聚合酶及其组合，含有或不含有(c)利巴韦林和/或(d)抑制剂或细胞色素P-450，持续不超过十二周的持续时间，或如本文所述的另一持续时间(例如，治疗方案可持续不超过8周的持续时间)。优选地，化合物以在受试者中有效提供高SVR速率或另一种有效性量度的量施用。作为非限制性例子，化合物可被共同配制并每天施用一次，并且治疗方案优选地持续八周或六周。

作为另一方面，提供了用于治疗具有HCV感染的受试者群体的方法。该方法包括向受试者施用至少两种DAA，其中一种DAA是本发明的化合物，含有或不含有利巴韦林，持续时间不超过12或8或6周。优选地，将至少两种DAA以有效地在至少约70％的群体(优选地，至少90％的群体)中产生SVR或另一种有效性量度的量施用于受试者。

在前述方法以及下文所述的方法中，DAA可选自蛋白酶抑制剂、核苷或核苷酸聚合酶抑制剂(本文提供了其中的一种)、非核苷聚合酶抑制剂、NS3B抑制剂、NS4A抑制剂、NS5A抑制剂、NS5B抑制剂、亲环蛋白抑制剂以及任何前述物质的组合。例如，在一些实施方案中，本方法中使用的DAA包含本文提供的至少一种HCV蛋白酶抑制剂和至少一种HCV聚合酶抑制剂或由其组成。

HCV聚合酶抑制剂中的至少一种为本发明的化合物中的一种(如本文所述)。以举例的方式，本发明的化合物可以约100mg至约250mg的总日剂量施用，或者以约150mg至约250mg的剂量每日一次施用。

在一些实施方案中，所述至少两种DAA包含至少一种本发明的HCV聚合酶抑制剂和至少一种NS5A抑制剂。以举例的方式，本发明的聚合酶抑制剂可以约100mg至约250mg的总日剂量施用，并且NS5A抑制剂可以约25mg至约200mg的总日剂量施用。利托那韦(或另一种细胞色素P4503A4抑制剂)可与其共同施用以改善化合物的药动学和生物利用率。

在前述方法以及本文所述的方法中，含有或不含有利巴韦林的DAA可以任何有效的给药方案和/或频率施用，例如，它们可以每天施用。每种DAA可以单独施用或组合施用，并且每种DAA可以每天施用至少一次，一天至少两次，或一天至少三次。同样地，利巴韦林可单独地或与一种或多种DAA联合，每天施用至少一次，一天至少两次，或者一天至少三次。在一些优选的实施方案中，化合物每天施用一次。

在一些方面，本技术提供了治疗HCV感染的方法，其包括向有此需要的受试者施用含有或不含有利巴韦林的至少两种DAA，持续不超过12或8或6周的持续时间，其中受试者在所述持续时间内未被施用干扰素。在一些方面，含有或不含有利巴韦林的至少两种DAA以有效产生SVR的量施用。一些方法还包括向受试者施用细胞色素P450的抑制剂。在一些方面，持续时间不超过八周。

在另一方面，所述至少两种直接作用的抗病毒剂包含选自下述的药物组合：本发明的化合物，与ABT-450和/或ABT-267和/或ABT-333和/或ABT-493和/或ABT-530的一者或多者；本发明的新型化合物与如下专利的任一个中公开的化合物：US 2010/0144608；US61/339,964；US 2011/0312973；WO 2009/039127；US 2010/0317568；2012/151158；US2012/0172290；WO 2012/092411；WO 2012/087833；WO 2012/083170；WO 2009/039135；US2012/0115918；WO 2012/051361；WO 2012/009699；WO 2011/156337；US 2011/0207699；WO2010/075376；US 7,9105,95；WO 2010/120935；WO 2010/111437；WO 2010/111436；US2010/0168384或US 2004/0167123；本发明的化合物与西咪匹韦和/或gsk805中的一者或多者；本发明的化合物与阿那匹韦和/或达卡他韦和/或BMS 325中的一者或多者；本发明的化合物与GS-9451和/或阿那匹韦和/或雷迪帕韦和/或GS-9669中的一者或多者；本发明的化合物与ACH-2684和/或ACH-3102和/或ACH-3422中的一者或多者；本发明的化合物与博赛泼维和/或MK-8742中的一者或多者；本发明的化合物与法拉瑞韦和/或Deleobuvir中的一者或多者；本发明的化合物与PPI 668；本发明的化合物与特拉匹韦和/或VX-135中的一者或多者；本发明的化合物与Samatasvir和/或IDX-437中的一者或多者；本发明的化合物与PSI-7977和/或PSI-938，本发明的化合物与BMS-790052和/或BMS-650032；本发明的化合物与GS-5885和/或GS-9451；本发明的化合物与GS-5885、GS-9190和/或GS-9451；本发明的化合物与BI-201335和/或BI-27127组合；本发明的化合物与特拉匹韦和/或VX-222组合；本发明的化合物与PSI-7977和/或TMC-435组合；以及本发明的化合物与丹诺普韦和/或R7128组合。

在又一个方面，所述至少两种直接作用的抗病毒剂包括本发明的化合物与PSI-7977和/或BMS-790052(达卡他韦)组合。在又一个方面，所述至少两种直接作用的抗病毒剂包括本发明的化合物与PSI-7977和/或BMS-650032(阿那匹韦)组合。在另一方面，所述至少直接作用的抗病毒剂包括本发明的化合物与PSI-7977、BMS-650032(阿那匹韦)和/或BMS-790052(达卡他韦)组合。可将本发明的化合物添加到这些组合中或用于替换所列出的聚合酶。

在另一方面，本技术的特征在于用于治疗HCV感染的至少两种DAA的组合，其中治疗方案的持续时间不超过十二周(例如，持续时间为12周；或持续时间为11、10、9、8、7、6、5.4或3周)。治疗包括向感染HCV的受试者施用至少两种DAA。治疗的持续时间可以是12周并且还持续，例如，不超过8周(例如，持续时间为8周；或持续时间为7、6、5、4或3周)。治疗可包括施用利巴韦林但不包括施用干扰素。如果一种DAA需要药动学增强，则治疗还可包括施用利托那韦或另一种CYP3A4抑制剂(例如，可比司他)。至少两种DAA可同时或顺序施用。例如，一种DAA可每天施用一次，另一种DAA可每天施用两次。又如，两种DAA每天施用一次。又如，将两种DAA共同配制在单一组合物中并同时施用(例如，每天一次)。作为非限制性例子，被治疗的患者可感染HCV基因型1，例如基因型1a或1b。作为另一个非限制性例子，患者可感染HCV基因型2或3。作为另一个非限制性例子，患者可以是初次接受HCV治疗的患者，经HCV治疗的患者，无干扰素无应答者(例如，无应答者、部分应答者或复发者)，或者不是干扰素治疗的候选者。

在另一个方面，本技术特征在于组合用于治疗HCV感染的至少两种DAA，其中所述组合包括将本发明的化合物与选自以下各项的化合物组合：

PSI-7977和/或PSI-938的组合；

BMS-790052和/或BMS-650032的组合；

GS-5885和/或GS-9451的组合；

GS-5885、GS-9190和/或GS-9451的组合；

BI-201335和/或BI-27127的组合；

特拉匹韦和/或VX-222的组合；

PSI-7977和/或TMC-435的组合；

丹诺普韦和/或R7128的组合；

ABT-450和/或ABT-267和/或ABT-333和/或ABT-493和/或ABT-530的组合；

下列蛋白酶抑制剂中的一种或多种：ABT450、ABT-493、西咪匹韦、阿那匹韦、GS-9451、ACH-2684、博赛泼维、MK-5172、法拉瑞韦和特拉匹韦；

下列NS5A抑制剂中的一种或多种：ABT-267、ABT-530、GSK805、达卡他韦、Dedipasvir、GS-5816、ACH-3102、MK-8742、PPI-668和Samatasvir；下列非核苷NS5B抑制剂中的一种或多种：ABT-333、TMC055、BMS-325、GS-9669和Deleobuvir。

在一个实施方案中，用于上述组合疗法中的本发明的化合物是1911、2023或2024。在当前优选的实施方案中，用于上述组合疗法中的本发明的新化合物是2023。1911、2033和2024中的一者或多者可与ABT-450、ABT-267和/或ABT-333和/或ABT-493和/或ABT-530和/或以下专利中所公开的化合物中的一者或多者组合使用：US 2010/0144608、US 61/339,964、US 2011/0312973、WO 2009/039127、US 2010/0317568、2012/151158、US 2012/0172290、WO 2012/092411、WO 2012/087833、WO 2012/083170、WO 2009/039135、US 2012/0115918、WO 2012/051361、WO 2012/009699、WO 2011/156337、US 2011/0207699、WO 2010/075376、US 7,9105,95、WO 2010/120935、WO 2010/111437、WO 2010/111436、US 2010/0168384或US 2004/0167123。

在又一个方面，本技术特征在于至少两种DAA的组合用于治疗HCV感染中，其中所述组合包括将本发明的化合物与选自以下各项的化合物组合：

ABT-450和/或ABT-267和/或ABT-333和/或以下专利中所公开的化合物：US 2010/0144608、US 61/339,964、US 2011/0312973、WO 2009/039127、US 2010/0317568、2012/151158、US 2012/0172290、WO 2012/092411、WO 2012/087833、WO 2012/083170、WO 2009/039135、US 2012/0115918、WO 2012/051361、WO 2012/009699、WO 2011/156337、US 2011/0207699、WO 2010/075376、US 7,9105,95、WO 2010/120935、WO 2010/111437、WO 2010/111436、US 2010/0168384或US 2004/0167123；

PSI-797和/或BMS-790052的组合；

PSI-7977和/或BMS-650032的组合；

PSI-7977、BMS-790052和/或BMS-650032的组合；

INX-189和/或BMS-790052的组合；

INX-189和/或BMS-650032的组合；或

INX-189、BMS-790052和/或BMS-650032的组合。

在又一个方面，本技术特征在于PSI-7977或至少两种DAA的组合用于治疗HCV感染中，其中所述组合包括将本发明的化合物与选自以下各项的化合物组合：

Mericitabine和/或丹诺普韦的组合；

达卡他韦和/或BMS-791325的组合；并且

PSI-7977和/或GS-5885的组合；

治疗包括向感染HCV的受试者施用PSI-7977或DAA组合。

在又一个方面，本技术特征在于具有PSI-7977的本发明的化合物或至少两种DAA的组合用于治疗HCV感染中，其中所述组合包括选自以下各项的组合：

Mericitabine和/或丹诺普韦的组合；

INX-189、达卡他韦和/或BMS-791325的组合；并且

PSI-7977和/或GS-5885的组合；

治疗包括向感染HCV的受试者施用PSI-7977或DAA组合。

在又一个方面，本技术特征在于至少两种DAA的组合用于治疗HCV感染中，其中所述组合包括选自本发明的化合物与以下各项组合的组合：

Tegobuvir和/或GS-9256的组合；

BMS-791325、阿那匹韦和/或达卡他韦的组合；并且

TMC-435和/或达卡他韦的组合。

治疗包括向感染HCV的受试者施用DAA组合。

在又一个方面，本技术特征在于本发明的化合物与PSI-7977和/或BMS-790052组合以用于治疗HCV感染中。治疗包括向感染HCV的受试者施用DAA组合。

在又一个方面，本技术特征在于本发明的化合物与PSI-7977和/或TMC-435组合以用于治疗HCV感染中。

在又一个方面，本技术特征在于本发明的化合物与丹诺普韦和/或Mercitabine组合以用于治疗HCV感染中。

在又一个方面，本技术特征在于本发明的化合物与丹诺普韦和/或BMS-791325组合以用于治疗HCV感染中。治疗包括向感染HCV的受试者施用DAA组合。

在又一个方面，本技术特征在于本发明的化合物与PSI-7977和/或GS-5885组合以用于治疗HCV感染中。治疗包括向感染HCV的受试者施用DAA组合。

治疗方案的持续时间不超过十六周(例如，持续时间为16周；或者持续时间为14周、12周或10周、9周、8周、7周、6周、5周、4周、3周、2周或1周)。治疗包括施用利巴韦林但不包括施用干扰素。如果一种DAA需要药动学增强，则治疗可包括施用利托那韦或另一种CYP3A4抑制剂(例如，可比司他)。两种DAA可同时或顺序施用。例如，一种DAA可每天施用一次，另一种DAA可每天施用两次。又如，两种DAA每天施用一次。又如，将两种DAA共同配制在单一组合物中并同时施用(例如，每天一次)。作为非限制性示例，被治疗的患者可用HCV基因型1来感染，诸如基因型1a或1b。作为另一个非限制性示例，患者可用HCV基因型2或3来感染。作为另一个非限制性示例，患者可以是初次接受HCV治疗的患者，经受过HCV治疗的患者，干扰素无应答者(例如，无应答者)，或者不是干扰素治疗的候选者。

在本发明的该方面的又一个实施方案中，该至少两种DAA包括本发明的HCV蛋白酶抑制剂和HCV聚合酶抑制剂。治疗可持续例如但不限于不超过12周，诸如8周、9周、10周、11周或12周。优选地，治疗持续12周。治疗还可持续8周。被治疗的受试者可以是例如初次接受治疗的患者。受试者也可以是经受过治疗的患者或者干扰素无应答者(例如，无效应答者)。优选地，被治疗的受试者用HCV基因型1感染，例如HCV基因型1a。作为另一个非限制性示例，被治疗的受试者用HCV基因型3感染。

在本发明的该方面的又一个实施方案中，该至少两种DAA包括本发明的具有HCV蛋白酶抑制剂和非核苷类或非核苷酸类HCV聚合酶抑制剂的化合物。治疗可持续例如但不限于不超过12周，诸如8周、9周、10周、11周或12周。优选地，治疗持续12周。治疗还可持续8周。被治疗的受试者可以是例如初次接受治疗的患者。受试者也可以是经受过治疗的患者或者干扰素无应答者(例如，无效应答者)。优选地，被治疗的受试者用HCV基因型1(例如，HCV基因型1a)感染。作为另一个非限制性示例，被治疗的受试者用HCV基因型3感染。

在本发明的该方面的又一个实施方案中，DAA包括本发明的具有HCV蛋白酶抑制剂和HCV NS5A抑制剂的化合物。

在本发明的该方面的又一个实施方案中，该至少两种DAA包括本发明的HCV蛋白酶抑制剂和HCV NS5A抑制剂。

在本发明的该方面的又一个实施方案中，DAA包括本发明的化合物以及HCV非核苷类或非核苷酸类聚合酶抑制剂和HCV NS5A抑制剂。

在本发明的该方面的又一个实施方案中，DAA可包括本发明的HCV核苷类或核苷酸类聚合酶抑制剂以及HCV NS5A抑制剂。

在本发明的该方面的又一个实施方案中，该至少两种DAA包括本发明的具有PSI-7977和/或TMC-435的化合物。

在本发明的该方面的又一个实施方案中，DAA包括本发明的具有PSI-7977和/或达卡他韦的化合物。

在本发明的该方面的又一个实施方案中，DAA包括本发明的具有PSI-7977和/或GS-5885的化合物。

在本发明的该方面的又一个实施方案中，DAA包括本发明的具有Mericitabine和/或丹诺普韦的化合物。

在本发明的该方面的又一个实施方案中，DAA包括本发明的具有BMS-790052和/或BMS-650032的化合物。

在本发明的该方面的又一个实施方案中，DAA包括本发明的化合物以及INX-189、达卡他韦和/或BMS-791325。

本技术的治疗方案通常构成完整的治疗方案，即，未计划后续的包含干扰素的方案。因此，本文所述的治疗或使用通常不包括任何后续的包含干扰素的治疗。

在本公开的一个方面，“感染”或“细菌感染”是指由不动杆菌属、拟杆菌属、伯克氏菌属、弯曲杆菌属，衣原体属、嗜衣原体属、梭菌属、肠杆菌属、肠球菌属、埃希氏菌属、梭杆菌属、加德纳菌属、嗜血杆菌属、螺杆菌属、克雷伯氏菌属、军团菌属、莫拉克斯氏菌属、摩根氏菌属、支原体属、奈瑟菌属、消化球菌属、消化链球菌属、变形杆菌属、假单胞菌属、沙门氏菌属、沙雷氏菌属、葡萄球菌属、链球菌属、窄食单胞菌属或脲原体属引起的感染。

在本公开的一个方面，“感染”或“细菌感染”是指由鲍曼不动杆菌、溶血不动杆菌、琼氏不动杆菌、约氏不动杆菌、鲁氏不动杆菌、二路拟杆菌、脆弱拟杆菌、洋葱伯克氏菌、空肠弯曲杆菌、肺炎衣原体、泌尿道衣原体、肺炎嗜衣原体、艰难梭菌、产气肠杆菌、阴沟肠杆菌、粪肠球菌、屎肠球菌、大肠杆菌、阴道加德纳菌、副流感嗜血杆菌、流感嗜血杆菌、幽门螺杆菌、克雷伯氏肺炎菌、嗜肺性军团杆菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌、卡他莫拉菌、摩氏摩根氏菌、肺炎支原体、淋病奈瑟氏菌、耐青霉素肺炎链球菌、青霉素敏感肺炎链球菌、大消化链球菌、微小消化链球菌、厌氧消化链球菌、不解糖消化链球菌、普氏消化链球菌、四联消化链球菌、阴道消化链球菌、奇异变形杆菌、绿脓假单胞菌、耐喹诺酮金黄色葡萄球菌、耐喹诺酮表皮葡萄球菌、伤寒沙门氏菌、甲型副伤寒沙门氏菌、肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、粘质沙雷氏菌、金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、腐生葡萄球菌、无乳链球菌、肺炎链球菌、酿脓链球菌、嗜麦芽窄食单胞菌、解脲支原体、耐万古霉素屎肠球菌、耐万古霉素粪肠球菌、耐万古霉素金黄色葡萄球菌、耐万古霉素表皮葡萄球菌、结核杆菌、产气荚膜梭菌、产酸克雷伯氏菌、脑膜炎奈瑟菌、普通变形杆菌或凝固酶阴性葡萄球菌(包括路邓葡萄球菌、头状葡萄球菌、人葡萄球菌或腐生葡萄球菌)引起的感染。

在本公开的一个方面，“感染”或“细菌感染”是指需氧菌、专性厌氧菌、兼性厌氧菌、革兰氏阳性细菌、革兰氏阴性细菌、革兰氏不定细菌或非典型呼吸病原体。

在一些实施方案中，本公开涉及治疗细菌感染，诸如妇科感染、呼吸道感染(RTI)、性传播疾病或尿道感染。

在一些实施方案中，本公开涉及治疗细菌感染，诸如由耐药细菌引起的感染。

在一些实施方案中，本公开涉及治疗细菌感染，诸如社区获得性肺炎、医院获得性肺炎、皮肤和皮肤结构感染、淋菌性宫颈炎、淋菌性尿道炎、发热性嗜中性球减少症、骨髓炎、心内膜炎、尿道感染以及由耐药细菌(诸如，耐青霉素肺炎链球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林表皮葡萄球菌和耐万古霉素肠球菌)、梅毒、呼吸机相关肺炎、内腹腔感染、淋球菌、脑膜炎、破伤风或肺结核引起的感染。

在一些实施方案中，本公开涉及治疗真菌感染，诸如由花斑癣、小孢子菌、毛癣菌、表皮癣菌、念珠菌、隐球菌或曲霉引起的感染。

在一些实施方案中，本公开涉及治疗由原生动物引起的感染，这包括但不限于疟疾、阿米巴病、梨形鞭毛虫病、弓形虫病、隐孢子虫病、滴虫病、利什曼病、昏睡病或痢疾。

本文所公开的某些化合物可用于预防或治疗疟原虫在受试者中的感染并且/或者用于预防、治疗和/或减轻与其相关联的并发症和/或症状，然后可用于制备用于治疗和/或预防此类疾病的药物。疟疾可由镰状疟原虫、间日疟原虫、卵形疟原虫或三日疟原虫引起。

在一个实施方案中，在受试者已经暴露于疟原虫之后对其施用该化合物。在另一个实施方案中，在受试者到疟疾流行的国家旅行之前对其施用本文所公开的化合物。

化合物或上述药物组合物还可与一种或多种其他可用于治疗的物质组合使用，该其他可用于治疗的物质选自抗疟疾药如喹啉(例如，奎宁、氯喹、阿莫地喹、甲氟喹、伯氨喹、他非诺喹)；过氧化物抗疟疾药(例如，青蒿素、青蒿素甲醚、青蒿琥酯)；磺胺多辛-乙胺嘧啶抗疟疾药(例如，治疟宁)；氢萘喹啉(例如，阿托伐醌)；acroline型抗疟疾药(例如，咯萘啶)；以及抗原虫剂，诸如乙睇胺、羟芪巴脒、喷他脒、替巴脒、喹哪匹拉明、嘌呤霉素、普罗帕脒、硝呋莫司、美拉胂醇、尼莫唑、硝呋醛肟、醋胺硝唑等。

在一个实施方案中，本文所公开的化合物可与一个另外的药物组合使用，该另外的药物选自氯喹、蒿素、青蒿素、8-氨基喹啉、阿莫地喹、蒿乙醚、蒿甲醚、青蒿提取物、青蒿琥酯、青蒿脂、蒿醚林酸、阿托喹酮、阿奇霉素、双胍类、磷酸氯喹、氯丙胍、环氯胍、氨苯砜、去丁基卤泛群、地昔帕明、多西环素、二氢叶酸还原酶抑制剂、双嘧达莫、卤泛群、氟哌啶醇、硫酸羟基氯喹、丙咪嗪、甲氟喹、五氟利多、磷脂抑制剂、伯氨喹、氯胍、乙胺嘧啶、咯萘啶、奎宁、奎尼丁、奎纳克林青蒿素、磺胺类、砜类、磺胺邻二甲氧嘧啶、磺胺甲氧吡嗪、他非诺喹、四环素、汉防己甲素、三嗪类、盐或它们的混合物。

癌症

在一个典型的实施方案中，本公开涉及治疗癌症的方法，该方法包括向患者施用本文所公开的化合物。在一些实施方案中，本公开涉及一种本文所公开的化合物或其可药用盐，其用于治疗癌症。

在一些实施方案中，本公开涉及一种本文所公开的化合物或其可药用盐，如本文所定义的，其用于治疗乳腺癌、结肠直肠癌、肺癌(包括小细胞肺癌、非小细胞肺癌和支气管肺泡癌)和前列腺癌。

在一些实施方案中，本公开涉及一种本文所公开的化合物或其可药用盐，如本文所定义的，其用于治疗胆管癌、骨癌、膀胱癌、头颈癌、肾癌、肝癌、胃肠组织癌、食道癌、卵巢癌、子宫内膜癌、胰腺癌、皮肤癌、睾丸癌、甲状腺癌、子宫癌、宫颈癌、外阴癌、白血病(包括ALL和CML)、多发性骨髓瘤和淋巴瘤。

在一些实施方案中，本公开涉及一种本文所公开的化合物或其可药用盐，如本文所定义的，其用于治疗肺癌、前列腺癌、黑色素瘤、卵巢癌、乳腺癌、子宫内膜癌、肾癌、胃癌、肉瘤、头颈癌、中枢神经系统肿瘤及其转移性肿瘤，还用于治疗胶质母细胞瘤。

在一些实施方案中，本文所公开的化合物可单独作为单一药剂或与其他临床相关药剂组合用于临床。该化合物还可预防由于一组基因突变而可能产生的潜在癌症抗性机制。

本文所定义的抗癌治疗剂可作为单一治疗剂施用，或者除了本公开的化合物之外，还可包括常规外科手术、放射疗法或化学疗法。此类化学疗法可包括一种或多种以下类别的抗肿瘤剂：

(i)用于医学肿瘤学的抗增殖药物/抗肿瘤药物及其组合，诸如烷基化剂(例如顺铂、卡铂、环磷酰胺、氮芥、美法仑、苯丁酸氮芥、白消安和亚硝基脲)；抗代谢物(例如抗叶酸剂，诸如氟嘧啶(如5-氟尿嘧啶和吉西他滨)、喃氟啶、雷替曲塞、甲氨蝶呤、胞嘧啶阿拉伯糖苷和羟基脲)；抗肿瘤抗生素(例如蒽环类抗生素，如阿霉素、博来霉素、多柔比星、道诺霉素、表柔比星、伊达比星、丝裂霉素C、更生霉素和光辉霉素等蒽环类抗生素)；抗有丝分裂剂(例如长春花生物碱(如长春新碱、长春碱、长春地辛和长春瑞滨)和紫杉烷类(如紫杉醇和泰索帝))；以及拓扑异构酶抑制剂(例如表鬼臼毒素(如依托泊苷和替尼泊苷)、安吖啶、拓扑替康和喜树碱)；以及蛋白酶体抑制剂(例如硼替佐米)；以及药剂阿那格雷以及药剂α-干扰素；

(ii)细胞抑制剂诸如抗雌激素(例如他莫昔芬、托瑞米芬、雷洛昔芬、屈洛昔芬和iodoxyfene)、雌激素受体向下调节剂(例如氟维司群)、抗雄激素(例如比卡鲁胺、氟他胺、尼鲁米特和醋酸环丙孕酮)、LHRH拮抗剂或LHRH激动剂(例如戈舍瑞林、亮丙瑞林和布舍瑞林)、孕激素(例如醋酸甲地孕酮)、芳香酶抑制剂(例如阿那曲唑、来曲唑、vorazole和依西美坦)和5α-还原酶抑制剂(诸如非那雄胺)；

(iii)抑制癌细胞侵入的药剂(例如金属蛋白酶抑制剂(如marimastat)和尿激酶血纤维蛋白溶酶原激活物受体功能抑制剂)；

(iv)生长因子功能抑制剂，例如包括以下药物的此类抑制剂：生长因子抗体、生长因子受体抗体(例如抗erbb2抗体曲妥珠单抗[赫赛汀^TM]和抗erbb1抗体西妥昔单抗)、法呢基转移酶抑制剂、酪氨酸激酶抑制剂和丝氨酸/苏氨酸激酶抑制剂，例如表皮生长因子家族的抑制剂，例如EGFR家族酪氨酸激酶抑制剂(诸如：N-(3-氯-4-氟苯基)-7-甲氧基-6-(3-吗啉代丙氧基)喹唑啉-4-胺(吉非替尼)、N-(3-乙炔基苯基)-6，7-双(2-甲氧基乙氧基)喹唑啉-4-胺(厄洛替尼)和6-丙烯酰氨基-N-(3-氯-4-氟苯基)-7-(3-吗啉代丙氧基)喹唑啉-4-胺(CI 1033))，例如血小板衍生生长因子家族的抑制剂，例如肝细胞生长因子家族的抑制剂，例如磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)的抑制剂，例如丝裂原活化蛋白激酶(MEK1/2)的抑制剂，例如蛋白激酶B(PKB/Akt)的抑制剂，例如Src酪氨酸激酶家族和/或Abelson(AbI)酪氨酸激酶家族的抑制剂(诸如达沙替尼(BMS-354825)和甲磺酸伊马替尼(Gleevec^TM))；以及任何改性STAT信令的药剂；

(v)抗血管生成剂，诸如抑制血管内皮生长因子作用的那些(例如抗血管内皮细胞生长因子抗体贝伐单抗[Avastin^TM])和通过其他机制起作用的化合物(例如利诺胺、整合素ocvβ3功能抑制剂和血管抑制素)；

(vi)血管损伤剂，诸如康普瑞汀；

(vii)反义疗法，例如涉及上述靶标的反义疗法，例如抗ras反义；

(viii)基因治疗方法，包括例如置换异常基因(诸如异常p53或异常BRCA1或BRCA2、GDEPT)的方法(基因导向酶前药治疗)，诸如那些使用胞嘧啶脱氨酶、胸苷激酶或细菌硝基还原酶的那些方法，以及提高患者对化学疗法或放射疗法的耐受性的方法(诸如多种药物抗性基因治疗)；并且

(ix)免疫治疗方法，包括例如用于提高患者肿瘤细胞的免疫原性诸如利用细胞因子(诸如白细胞介素2、白细胞介素4或粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子)的转染的体外和体内方法、降低T细胞无反应性的方法、使用转染的免疫细胞诸如细胞因子转染的树突状细胞的方法、使用细胞因子转染的肿瘤细胞系的方法和使用抗独特型抗体的方法，以及使用免疫调节药物沙利度胺和来那度胺的方法

此类联合治疗剂可通过同时、顺序或分开施用治疗剂的各个组分来实现。此类组合产品在上文所述的剂量范围内使用本公开的化合物或其可药用盐，并且在批准的剂量范围内使用其他药学活性剂。

制剂

本文所公开的药物组合物可以是可药用的盐的形式，如下文一般性描述的。合适的可药用的有机酸和/或无机酸的一些优选但非限制性的示例是盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、乙酸和柠檬酸，以及本身已知的可药用的酸(参考下文提及的参考文献)。

当本公开的化合物包含酸性基团和碱性基团时，本公开的化合物也可形成内盐，并且此类化合物在本公开的范围内。当本公开的化合物包含供氢杂原子(例如NH)时，本公开还涵盖通过将氢原子转移至分子内的碱性基团或原子而形成的盐和/或异构体。

化合物的可药用的盐包括其酸加成盐和碱盐。合适的酸加成盐由形成无毒盐的酸形成。示例包括乙酸盐、己二酸盐、天冬氨酸盐、苯甲酸盐、苯磺酸盐、碳酸氢盐/碳酸盐、硫酸氢盐/硫酸盐、硼酸盐、樟脑磺酸盐、柠檬酸盐、环磺酸盐、乙二磺酸盐、乙磺酸盐、甲酸盐、延胡索酸盐、葡庚糖酸盐、葡糖酸盐、葡糖醛酸盐、六氟磷酸盐、海苯酸盐、盐酸盐/氯化物、氢溴酸盐/溴化物、氢碘酸盐/碘化物、羟乙基磺酸盐、乳酸盐、苹果酸盐、马来酸盐、丙二酸盐、甲磺酸盐、甲基硫酸盐、萘酸盐、2-萘磺酸盐、烟酸盐、硝酸盐、乳清酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、双羟萘酸盐、磷酸盐/磷酸氢盐/磷酸二氢盐、焦谷氨酸盐、糖酸盐、硬脂酸盐、琥珀酸盐、丹宁酸盐、酒石酸盐、甲苯磺酸盐、三氟乙酸盐和昔萘酸盐。合适的碱盐由形成无毒盐的碱形成。示例包括铝盐、精氨酸盐、苄星青霉素盐、钙盐、胆碱盐、二乙胺盐、二乙醇胺盐、甘氨酸盐、赖氨酸盐、镁盐、葡甲胺盐、乙醇胺盐、钾盐、钠盐、氨丁三醇盐和锌盐。也可形成酸和碱的半盐，例如半硫酸盐和半钙盐。关于合适的盐的综述，参见Stahl和Wermuth的“Handbook of Pharmaceutical Salts：Properties，Selection，and Use”(Wiley-VCH，2002年)，该文献以引用方式并入本文。

本文所述的化合物可以前药的形式施用。前药可包括在施用于哺乳动物受试者时释放活性母体药物的共价结合的载体。前药可通过修饰化合物中存在的官能团来制备，使得修饰产物在常规操作中或在体内裂解成母体化合物。前药包括例如其中羟基与任何基团键合的化合物，当使用给哺乳动物受试者时，所述羟基裂解形成游离羟基。前药的示例包括但不限于化合物中醇官能团的乙酸酯、甲酸酯和苯甲酸酯衍生物。构建化合物作为前药的方法是已知的，例如，在Testa和Mayer发表的“Hydrolysis in Drug and ProdrugMetabolism”(Wiley，2006年)中。典型的前药通过由水解酶转化前药、酰胺、内酰胺、肽、羧酸酯、环氧化物的水解或无机酸酯的裂解而形成活性代谢物。已发现，酯类前药易于在体内降解以释放相应的醇。参见例如Imai，Drug Metab Pharmacokinet，2006年，第21卷第3期，第173-85页，“Human carboxylesterase isozymes：catalytic properties and rationaldrug design”。

用于本公开的药物组合物通常包含有效量的化合物和合适的可药用的载体。制剂可根据已知的方式制备，其通常包括将根据本公开的至少一种化合物与一种或多种药学上可接受的载体混合，并且如果需要，必要时在无菌条件下与其他药学活性化合物结合。参考美国专利No.6,372,778、美国专利No.6,369,086、美国专利No.6,369,087、美国专利No.6,372,733、上述其他参考文献，以及标准手册，例如最新版的“Remington′s PharmaceuticalSciences”。

一般来讲，对于药物用途，化合物可配制成药物制剂，其包含至少一种化合物和至少一种药学上可接受的载体、稀释剂或赋形剂，以及任选的一种或多种其他药学活性化合物。

本公开的药物制剂优选为单位剂型，并且可适当地包装，例如，在盒子、泡罩、小瓶、瓶子、小袋、安瓿或任何其他合适的单剂量或多剂量保持器或容器(可适当标记)中；任选地，包含产品信息和/或使用说明的一张或多张说明书。一般来讲，此类单位剂量将包含介于1至1000mg(通常介于5至500mg)的至少一种本公开的化合物，例如，约10、25、50、100、200、300或400mg每单位剂量。

化合物可通过多种途径施用，所述途径包括口、眼、直肠、透皮、皮下、静脉内、肌内或鼻内途径，这主要取决于所用的具体制剂。化合物通常以“有效量”施用，“有效量”是指在适当施用后足以对施用的受试者达到所需的治疗效果或预防效果的任何量的化合物。通常，取决于要预防或治疗的病症和给药途径，此类有效量通常为每天每千克患者体重0.01至1000mg，更通常为0.1至500mg，诸如1至250mg，例如每天每千克患者体重约5、10、20、50、100、150、200或250mg，其可作为单日剂量施用，也可分成一日或多日剂量施用。待施用量、给药途径和进一步治疗方案可由治疗临床医生根据诸如患者的年龄、性别和大致病症以及待治疗的疾病/症状的性质和严重性等因素来确定。参考美国专利No.6,372,778、美国专利No.6,369,086、美国专利No.6,369,087、美国专利No.6,372,733、上述其他参考文献，以及标准手册，例如最新版的“Remington′s Pharmaceutical Sciences”。

对于口服给药形式，可将化合物与合适的添加剂诸如赋形剂、稳定剂或惰性稀释剂混合，并通过常规方法将其制成合适的给药形式，诸如片剂、包衣片剂、硬胶囊以及水性、醇性或油性溶液。合适的惰性载体的示例是阿拉伯树胶、氧化镁、碳酸镁、磷酸钾、乳糖、葡萄糖或淀粉，尤其是玉米淀粉。在这种情况下，制备过程可在干燥颗粒和湿润颗粒两种形式下进行。合适的油性赋形剂或溶剂为植物油或动物油，诸如向日葵油或鱼肝油。合适的用于水溶液或醇溶液的溶剂为水、乙醇、糖溶液或其混合物。聚乙二醇和聚丙二醇也可用作其他给药形式的其他助剂。作为立即释放片剂，这些组合物可包含微晶纤维素、磷酸二钙、淀粉、硬脂酸镁和乳糖和/或本领域已知的其它赋形剂、粘合剂、增量剂、崩解剂、稀释剂和润滑剂。

当通过鼻气雾剂或吸入施用时，组合物可根据药物制剂领域熟知的技术制备，并且可使用苯甲醇或其它合适的防腐剂、用于提高生物利用率的吸收促进剂、氟碳化合物和/或本领域已知的其它增溶剂或分散剂制备盐水溶液。用于以气溶胶或喷雾剂形式给药的合适药物制剂为例如本公开化合物的溶液、悬浮液、乳液或其在药学上可接受的溶剂(诸如乙醇或水)或此类溶剂的混合物中的生理学上可耐受的盐。如果需要，制剂可另外包含其它药物助剂，诸如表面活性剂、乳化剂和稳定剂以及推进剂。

对于皮下或静脉内给药，如果需要，将化合物与常规物质诸如增溶剂、乳化剂或其它助剂一起加入溶液、悬浮液或乳液中。还可将化合物冻干，并将所获得的冻干物用于例如注射制剂或输注制剂的生产。合适的溶剂为例如水、生理盐水溶液、醇(例如乙醇、丙醇、甘油)、糖溶液(诸如葡萄糖)、甘露糖醇溶液或所述各种溶剂的混合物。可注射溶液或悬浮液可根据已知技术使用合适的无毒、非肠道可接受的稀释剂或溶剂(诸如甘露醇、1，3-丁二醇、水、林格氏溶液或等渗氯化钠溶液)或合适的分散剂或润湿剂和悬浮剂(诸如无菌、温和的固定油，包括合成的甘油单酯或甘油二酯和脂肪酸，包括油酸)配制。

当以栓剂形式进行直肠施用时，可通过将化学式I的化合物与合适的非刺激性赋形剂混合来制备制剂，所述赋形剂为诸如可可脂、合成甘油酯或聚乙二醇，它们在常温下是固体，但在直肠腔中液化和/或溶解以释放药物。

在某些实施方案中，预期这些组合物可以是缓释制剂。典型的缓释形式利用肠溶衣。通常，将阻隔物应用于口服药物，所述阻隔物控制消化系统中口服药物被吸收的位置。肠溶衣可防止药物在到达小肠前释放。肠溶衣可包含多糖的聚合物，诸如麦芽糖糊精、黄原胶、小核菌葡聚糖、淀粉、藻酸盐、支链淀粉、透明质酸、甲壳质、壳聚糖等；其他天然聚合物，诸如蛋白质(白蛋白、明胶等)、聚-L-赖氨酸；聚(丙烯酸)钠；聚(甲基丙烯酸羟烷基酯)(例如聚(甲基丙烯酸羟乙酯))；聚羧乙烯(例如Carbopol^TM)；卡波姆；聚乙烯吡咯烷酮；树胶，诸如瓜尔豆胶、阿拉伯树胶、刺梧桐树胶、印度树胶、刺槐豆胶、罗望子胶、结冷胶、黄蓍胶、琼脂、果胶、麸质等；聚(乙烯醇)；乙烯-乙烯基醇；聚乙二醇(PEG)；以及纤维素醚，诸如羟甲基纤维素(HMC)、羟乙基纤维素(HEC)、羟丙基纤维素(HPC)、甲基纤维素(MC)、乙基纤维素(EC)、羧乙基纤维素(CEC)、乙基羟乙基纤维素(EHEC)、羧甲基羟乙基纤维素(CMHEC)、羟丙基甲基纤维素(HPMC)、羟丙基乙基纤维素(HPEC)和羧甲基纤维素钠(Na-CMC)；以及任何上述聚合物的共聚物和/或(简单)混合物。某些上述聚合物可通过标准技术进一步交联。

聚合物的选择将根据在本公开的组合物中采用的活性成分/药物的性质以及所需的释放速率来确定。具体地讲，本领域技术人员应当理解，例如在HPMC的情况下，一般来讲，较高分子量的药物从组合物中释放的速率将更慢。此外，在HPMC的情况下，甲氧基和羟丙氧基的不同取代度将引起药物从组合物中释放速率的变化。就这一点而言，并且如上所述，可能希望以涂料的形式提供本发明的组合物，其中聚合物载体通过两种或更多种聚合物(例如，不同分子量的聚合物)的混合物提供，以产生特定所需的或期望的释放曲线。

聚丙交酯、聚乙交酯和它们的共聚物聚(丙交酯-乙交酯)的微球可用于形成缓释蛋白递送系统。蛋白质可通过多种方法包埋在聚(丙交酯-乙交酯)微球库中，所述方法包括用水性蛋白质和有机溶剂型聚合物形成油包水乳液(乳液法)、用分散在溶剂基聚合物溶液中的固体蛋白质形成固体蛋白质悬浮液(悬浮法)，或通过将蛋白质溶解在溶剂基聚合物溶液中(溶解法)。可以将聚(乙二醇)连接到蛋白质(聚乙二醇化)以增加循环治疗性蛋白质的体内半衰期并降低免疫应答的机会。

脂质体悬浮液(包括靶向病毒抗原的脂质体)也可通过常规方法制备，以制备药学上可接受的载体。这可适合于递送根据本发明的核苷化合物的游离核苷、酰基核苷或磷酸酯前药形式。

应当理解，本发明的核苷具有多个手性中心，并且可以光学活性和外消旋形式存在并分离。一些化合物可表现出多态性。应当理解，本发明涵盖具有本文所述的有用性质的本发明化合物的任何外消旋、光学活性、非对映、多态性、立体异构形式或它们的混合物。制备光学活性形式的方法(例如，通过由重结晶技术拆分外消旋形式、通过由光学活性起始物合成、通过手性合成或通过使用手性固定相进行色谱分离)是本领域所熟知的。

核苷的碳是手性的，它们的非氢取代基(分别为碱基和CHOR基团)可以是相对于糖环体系的顺式(在同一侧)或反式(在相对侧)。因此，四种光学异构体由以下构型表示(当将糖部分定向在水平面中使得氧原子在后面时)：顺式(其中两个基团“在上方”，对应于天然存在的β-D核苷的构型)、顺式(其中两个基团“在下方”，这是一种非自然存在的β-L构型)、反式(其中C2′取代基“在上方”，并且C4′取代基“在下方”)和反式(其中C2′取代基“在下方”，并且C4′取代基“在上方”)。“D-核苷”是天然构型的顺式核苷，“L-核苷”是非天然存在构型的顺式核苷。

同样，大多数氨基酸是手性的(指定为L或D，其中L对映体是天然存在的构型)并且可作为单独的对映体存在。

获得光学活性材料的方法的示例是本领域已知的，并且至少包括以下方法：i)晶体的物理分离-一种手动分离各个对映体的宏观晶体的技术。如果存在单独的对映体的晶体，即该材料是聚集体，并且晶体在视觉上不同，则可使用该技术；ii)同时结晶-一种各个对映体从外消旋体的溶液中单独结晶(仅在后者是固态的聚集体时才可能实现)的技术；iii)酶促拆分-一种通过对映体与酶的不同反应速率部分或完全分离外消旋物的技术；iv)酶促不对称合成-一种至少一个合成步骤使用酶促反应来获得所需对映体的对映体纯的或富集的合成前体的合成技术；v)化学不对称合成-一种所需对映体由非手性前体在产物中产生不对称性(即手性)的条件下合成的合成技术，这可使用手性催化剂或手性助剂实现；vi)非对映体分离-一种这样的技术，将外消旋化合物与对映体纯试剂(手性助剂)反应，所述对映体纯试剂将各个对映体转化为非对映体。然后通过色谱法或结晶法分离所得非对映体(因为它们现在的结构差异更明显)，随后除去手性助剂以获得所需对映体；vii)一级和二级不对称转化-一种这样的技术，使来自外消旋物的非对映体平衡以在所需对映体的非对映体溶液中产生优势，或者非对映体从所需对映体中优先结晶扰乱平衡，使得最后原则上所有材料均从所需对映体转化为结晶非对映体。然后从非对映体中释放出所需的对映体；viii)动力学拆分-这种技术是指通过在动力学条件下对映体与手性非外消旋试剂或催化剂的不同反应速率，实现部分或完全拆分外消旋物(或进一步拆分部分拆分的化合物)；ix)从非外消旋前体的对映特异性合成-一种这样的合成技术，所需对映体从非手性起始物中获得，并且其中立体化学完整性在合成过程中不会受到损害或仅受到最小程度的损害；x)手性液相色谱法-一种外消旋体的对映体由于它们与固定相的不同相互作用而在液体流动相中分离的技术。固定相可由手性材料制成，或者流动相可包含另外的手性材料，以引起不同的相互作用；xi)手性气相色谱法-一种这样的技术，由于外消旋体和对映体在气态流动相中与含有固定非外消旋手性吸附剂相的色谱柱的相互作用不同，使外消旋体挥发并使对映体分离；xii)用手性溶剂萃取-一种通过优先将一种对映体溶解到特定的手性溶剂中来分离对映体的技术；xiii)跨手性膜传输-一种外消旋体与薄膜阻隔物接触的技术。阻隔物通常分离两种可混溶的流体，一种包含外消旋物，并且驱动力诸如浓度差或压差引起优先通过膜阻隔物传输。分离是由于膜的非外消旋手性性质仅允许外消旋体的一种对映体通过而发生的。在一个实施方案中使用手性色谱法，包括模拟移动床色谱法。各种手性固定相可商购获得。

本文所述的一些化合物含有烯属双键，除非另有说明，否则意味着包括E和Z几何异构体。

此外，本文所述的一些核苷可以互变异构体形式存在，例如酮-烯醇互变异构体。各个互变异构体及其混合物旨在包括在本发明的化合物中。

实施例

实施例1.

偶联物的制备

已制备了几组单磷酸盐和二磷酸盐前药。参见Jessen等人，“BioreversibleProtection of Nucleoside Diphosphates”，Angewandte Chemie-InternationalEdition English，2008年，第47卷第45期，第8719-8722页，该文献以引用方式并入本文。为了防止P-O-P酸酐键破裂，利用一个迅速断裂的侧基(例如，双-(4-酰氧基苄基)-核苷二磷酸盐(BAB-NDP)被内源性酯酶脱酰化)在第二个磷酸盐上产生一个负电荷。还可参见Routledge等人，“Synthesis，Bioactivation and Anti-HIV Activity of 4-Acyloxybenzyl-bis(nucleosid-5′-yl)Phosphates”，Nucleosides&Nucleotides，1995年，第14卷第7期，第1545-1558页，以及Meier等人，“Comparative study of bis(benzyl)phosphate triesters of 2′，3′-dideoxy-2′，3′-didehydrothymidine(d4T)andcycloSal-d4TMP-hydrolysis，mechanistic insights and anti-HIV activity”，Antiviral Chemistry and Chemotherapy，2002年，第13期，第101-114页，这两篇文献均以引用方式并入本文。一旦发生这种情况，P-O-P酸酐键较不易于裂解，并且剩余的保护基团可随后进行最终的解聚以产生核苷二磷酸盐。

制备二磷酸盐和单硫代磷酸盐前药的其他方法如图5所示。标准偶联条件用于制备鞘脂-核苷单磷酸盐前药。相应的二磷酸盐前药可根据图5所示出的并且如以下文献所提供的方案制备：Smith等人，“Substituted Nucleotide Analogs”，美国专利申请2012/0071434；Skowronska等人，“Reaction of Oxophosphorane-Sulfenyl andOxophosphorane-Selenenyl Chlorides with Dialkyl Trimethylsilyl Phosphites-Novel Synthesis of Compounds Containing a Sulfur or Selenium Bridge Between 2Phosphoryl Centers”，Journal of the Chemical Society-Perkin Transactions 1，1988年，第8期，第2197-2201页；Dembinski等人，“An Expedient Synthesis ofSymmetrical Tetra-Alkyl Mono-thiopyrophosphates”，Tetrahedron Letters，1994年，第35卷第34期，第6331-6334页；Skowronska等人，“Novel Synthesis of SymmetricalTetra-Alkyl Monothiophosphates”，Tetrahedron Letters，第1987年，第28卷第36期，第4209-4210页；以及Chojnowski等人，“Methods of Synthesis of O，O-BisTrimethylSilyl Phosphorothiolates”，Synthesis-Stuttgart，1977年，第10期，第683-686页，所有这些文献全文均以引用方式并入本文。

实施例2.

2-氟核苷的活性

当被激活成相应的三磷酸盐时，核糖核苷类似物通过充当病毒编码的RdRp的竞争性底物抑制剂来抑制RNA依赖性RNA病毒复制。该治疗类中的化合物可用于治疗在但不限于沙粒病毒科、本扬病毒科、黄病毒科、正黏液病毒科、副黏液病毒科和披盖病毒科中发现的病毒。预期本文所公开的某些化合物具有以下优点：诸如抗病毒抗性的高遗传屏障；病毒家族内的广谱活动；以及口服生物利用度高，可靶向递送至感染部位。

核苷类似物被设计为具有2′-α-氟取代基以模拟天然核糖核苷。C-F键长类似于C-O键长氟为使氟取代基为异极性并且取代羟基的氢键受体。与目前用于治疗HCV感染的临床试验中的核糖核苷类似物不同，在某些实施方案中，本公开所涵盖的2′，3′-双脱氧-2′-氟核苷类似物缺乏3′-羟基，因此是病毒复制的专性链终止剂。一旦核苷转化为其三磷酸盐，它们就充当病毒编码的RdRp的竞争性底物抑制剂。在将链终止剂掺入新生RNA后，病毒复制停止。专性链终止剂的一个优点是它们在治疗慢性疾病时对宿主没有诱变作用。

实施例3.

ZIKV NS5 RNA依赖性RNA聚合酶测定结果

下表显示了针对ZIKV NS5 RdRp的选择的模拟三磷酸盐的活性。

实施例4.ZIKV感染性测定结果

实施例5.

碱基耦联的一般过程

在氮气下，在装有干燥核碱基(15.5mmol)、三甲基氯硅烷(12.21mmol)和双(三甲基甲硅烷基)胺(22.2mmol)的圆底烧瓶中制备全硅烷基化的核碱基。将混合物搅拌回流过夜(16小时)直至所有固体溶解。将混合物冷却至室温，通过旋转蒸发除去挥发物，然后高真空，得到全硅烷基化的核碱基。立即将该化合物用于下一步骤。

在室温下，将新制备的全硅烷基化的核碱基(15.50mmol)在氮气下搅拌溶解在1，2-二氯乙烷(50mL)或氯苯(50mL)中。将β-D-呋喃核糖1，2，3，5-四乙酸酯(7.75mmol)的1，2-二氯乙烷(50mL)或氯苯(50mL)溶液一次性全部加入到搅拌的混合物中。

通过注射器向混合物中滴加SnCl₄(11.63mmol)，并将混合物在室温下搅拌6小时直至所有起始物都被消耗。将混合物冷却至0℃并加入饱和NaHCO₃水溶液(125mL)。将混合物温热至室温并搅拌30分钟。用EtOAc(2×200mL)萃取混合物，并用盐水(1×100mL)洗涤合并的有机层，用Na₂SO₄干燥，过滤，并通过旋转蒸发浓缩得到5.5g粗产物。将粗物质溶于二氯甲烷中，固定在硅藻土上，并进行快速色谱分离，得到所需的乙酸酯保护的产物。使用一般的脱保护条件去保护核糖核苷。

实施例6.

一般胞嘧啶类似物偶联

在装有N⁴-苯甲酰基保护的胞嘧啶类似物(0.793mmol)的烧瓶中，在N₂下加入双(三甲基甲硅烷基)胺(8.45mmol)和硫酸铵(0.02mmol)。将其回流加热2小时，在冷却至室温后，真空移除溶剂，并在高真空下进一步干燥1小时。将残余物溶于无水氯苯(10ml)中，加入β-D-呋喃核糖1，2，3，5-四乙酸酯(0.53mmol)。然后滴加SnCl₄(0.27ml，2.3mmol)。在室温下搅拌1小时后，然后将其加热至60℃过夜。冷却至0℃后，加入固体碳酸氢钠(0.85g)，然后加入EtOAc(5mL)。将其搅拌15分钟，然后缓慢加入水(0.5mL)。滤除不溶物质并用更多EtOAc(2.5mL)洗涤。将滤液用水洗涤一次，用盐水洗涤一次，干燥((Na₂SO₄)并真空浓缩。通过SiO₂柱色谱法纯化粗物质。

实施例7.

一般脱氨基化条件

将苯甲酰保护的胞苷核糖核苷(1.02mmol)的80％AcOH水溶液(30mL)加热回流16小时。然后将溶剂在真空下移除并在高真空下干燥。将白色固体用乙醚研磨，滤除并用更多的乙醚洗涤，得到所需产物。

实施例8.

一般苯甲酰脱保护条件

将苯甲酰保护的核糖核苷类似物(0.25mmol)与7N氨的MeOH溶液在室温下搅拌15.5h。然后除去溶剂，通过SiO₂柱色谱法纯化粗物质，得到所需的核糖核苷。

实施例9.

甲基-β-D-2′-螺环氧化物核糖的合成

1的制备过程。在0℃的氩气气氛下，通过注射器在15分钟内将甲基β-D-核糖苷溶液(40.9mmol，1.0当量)滴加到1，3-二氯-1，1，3，3-四异丙基二硅氧烷(45.0mmol，1.1当量)中。将反应混合物温热至室温并进一步搅拌3小时。用MeOH(10mL)淬灭反应，并蒸发溶剂。将粘性残余物溶于DCM(400mL)中并用饱和NaCO₃H溶液、盐水洗涤，并用MgSO₄干燥。蒸发溶剂，并将其与甲苯共蒸发以除去痕量的吡啶。通过硅胶柱色谱法，用己烷∶乙酸乙酯(3∶2)洗脱来纯化产物，得到所需产物。

2的制备过程。在0℃下，将受保护的核糖苷1(32.9mmol，1当量)的DCM(150mL)溶液加入Dess-Martin过碘烷(18.1g，42.7mmol，1.3当量)。将反应混合物在25-30℃下搅拌24小时。在此之后，蒸发约75mL的DCM，将二乙醚(400mL)加入到反应混合物中，并通过硅藻土滤除沉淀物。分别用300mL含有18.5g Na₂S₂O₃的饱和NaHCO₃溶液和盐水洗涤所得滤液。用无水Na₂SO₄干燥有机层，并蒸发有机层，得到2，其无需进一步纯化即可用于下一步骤。

3的制备过程。在-78℃的氩气氛下，在20分钟的过程中将酮2(8.87mmol，1当量)和DCM(2.28mL，35.5mmol，4.0当量)的THF(50mL)溶液加入LDA溶液(31.1mL，1.0M，3.5当量)。将反应混合物在-78℃下搅拌3小时，然后在室温下搅拌过夜。用饱和NH₄Cl溶液淬灭反应。用二乙醚(150mL×2)萃取溶液。将合并的有机层用盐水洗涤，用MgSO₄干燥，蒸发，然后通过硅胶柱色谱法用己烷∶乙酸乙酯(3∶1)洗脱来纯化，得到3。然后可以用氯化钠、叠氮化钠对环氧化物进行一般地环氧化物开环，然后用TBAF还原。在将所得醛转化为炔烃后，可对核糖苷进行一般地碱偶联，然后进行脱保护。

实施例10.

醛到炔烃的一般转化

可使用以下方案将由上述环氧化物开环得到的2′-醛转化为醛。在0℃的氩气下，在10分钟内将2′-醛的无水DCM(10mL/mmol核糖苷)溶液用四溴化碳(2.0当量)处理，然后用三苯基膦(2.0当量)的无水DCM(10mL/mmol核糖苷)处理。将反应搅拌过夜，同时温热至室温。然后将反应混合物用石油醚稀释，过滤，并减压浓缩。在硅胶色谱法后得到纯化的产物。然后在氩气下将纯化的中间体溶解在无水THF(10mL/mmol)中，并将反应混合物冷却至-78℃。向溶液中加入丁基锂(2当量)。将反应在搅拌下进行1小时，并用氯化铵或适当的亲电试剂淬灭。将反应混合物温热至室温，然后用水和盐水洗涤。将有机层用MgSO₄干燥，过滤，并减压浓缩。将产物在二氧化硅上纯化。如果产物是碳水化合物，则产物可经受一般性碱偶联过程，然后经受适当的脱保护条件，但产物是受保护的核糖核苷，该产物可经受适当的脱保护条件。

实施例11.

2′-氯取代的螺环氧化核糖核苷类似物的一般合成

11的制备过程。在0℃的氩气气氛下，通过注射器在15分钟内将核糖核苷溶液(40.9mmol，1.0当量)滴加到1，3-二氯-1，1，3，3-四异丙基二硅氧烷(45.0mmol，1.1当量)中。将反应混合物温热至室温并进一步搅拌3小时。用MeOH(10mL)淬灭反应，并蒸发溶剂。将粘性残余物溶于DCM(400mL)中并用饱和NaCO3H溶液、盐水洗涤，并用MgSO₄干燥。蒸发溶剂，并将其与甲苯共蒸发以除去痕量的吡啶。通过硅胶柱色谱法，用己烷∶乙酸乙酯(3∶2)洗脱来纯化产物，得到所需产物。

12的制备过程。在0℃下，将受保护的核糖核苷11(32.9mmol，1当量)的DCM(150mL)溶液加入Dess-Martin过碘烷(18.1g，42.7mmol，1.3当量)。将反应混合物在25-30℃下搅拌24小时。在此之后，蒸发约75mL的DCM，将二乙醚(400mL)加入到反应混合物中，并通过硅藻土滤除沉淀物。分别用300mL含有18.5g Na₂S₂O₃的饱和NaHCO₃溶液和盐水洗涤所得滤液。用无水Na₂SO₄干燥有机层，并蒸发有机层，得到12，其无需进一步纯化即可用于下一步骤。

13的制备过程。在-78℃的氩气氛下，在20分钟的过程中将酮12(8.87mmol，1当量)和DCM(2.28mL，35.5mmol，4.0当量)的THF(50mL)溶液加入LDA溶液(31.1mL，1.0M，3.5当量)。将反应混合物在-78℃下搅拌3小时，然后在室温下搅拌过夜。用饱和NH₄Cl溶液淬灭反应。用二乙醚(150mL×2)萃取溶液。将合并的有机层用盐水洗涤，用MgSO₄干燥，蒸发，然后通过硅胶柱色谱法用己烷∶乙酸乙酯(3∶1)洗脱来纯化，得到13。尿苷核糖核苷类似物在核碱基的N3位置用PMB基团进一步保护。

实施例12.

PMB保护的一般过程

在0℃的氩气氛下，将PMBCl(1.2当量)和K₂CO₃(1.5当量)加入到尿苷核糖核苷类似物的DMF溶液中。然后将混合物在室温下搅拌12-16小时。将混合物用水淬灭并用乙酸乙酯萃取三次。将有机萃取物合并，用盐水洗涤，用MgSO₄干燥，过滤，并减压浓缩。将粗产物在硅胶上纯化，用己烷/乙酸乙酯洗脱或不经进一步纯化使用。

实施例13.

用氯化钠打开环氧化物的一般条件

14的合成过程。在室温下，向13(7.50mmol，1.0当量)和15-冠-5(1.48mL，7.50mmol，1.0当量)的DMF(10mL)溶液中加入氯化钠(4.38g，75.0mmol，10.0当量)。将混合物在45℃下搅拌16小时。然后冷却至室温，并用DCM(150mL)稀释。将溶液用水(2x)、盐水洗涤，用MgSO₄干燥，蒸发，并通过硅胶柱色谱法用己烷∶乙酸乙酯洗脱而纯化，得到所需产物。然后可使产物经受形成炔烃的一般条件。

实施例14.

用叠氮化钠打开环氧化物的一般条件

15的制备过程。在室温下，向13(3.75mmol，1.0当量)和15-冠-5(0.74mL，3.75mmol，1.0当量)的DMF(10mL)溶液中加入叠氮化钠(1.2g，18.7mmol，5当量)。将混合物在30℃下搅拌2小时。然后冷却至室温，并用DCM(100mL)稀释。将溶液用水(2x)、盐水洗涤，用MgSO₄干燥，蒸发，并通过硅胶柱色谱法用己烷∶乙酸乙酯(3∶1)洗脱而纯化，得到所需产物。然后可使产物经受形成炔烃的一般条件。

实施例15.

用TBAF打开环氧化物的一般条件

16的制备过程。在室温下搅拌13(3.75mmol，1.0当量)和TBAF(6.0当量)的DMF(10mL)溶液。将混合物在30℃下搅拌2小时。然后冷却至室温，并用DCM(100mL)稀释。将溶液用水(2x)、盐水洗涤，用MgSO₄干燥，蒸发，并通过硅胶柱色谱法用己烷∶乙酸乙酯(3∶1)洗脱而纯化，得到所需产物。然后用TBSCl将所需产物再保护。然后可使产物经受形成炔烃的一般条件。

实施例16.

叠氮化物还原的一般条件

通过以下过程将2′-叠氮基核糖核苷类似物还原成2′-氨基核糖核苷类似物。将2′-叠氮基核糖核苷类似物溶解在甲醇中，然后在碳上加上氢氧化钯。然后将反应混合物在氢气氛下在室温下搅拌30分钟。将反应混合物通过硅藻土垫过滤，用甲醇洗涤。减压移除溶剂，并通过硅胶色谱法用DCM和甲醇洗脱而纯化产物。

实施例17.

一般脱甲硅烷基化条件

将甲硅烷基保护的核糖核苷类似物溶解在THF中，然后在室温下加入1M TBAF(2.1当量)。将反应溶液在室温下搅拌20分钟。然后在减压下移除溶剂，将所得残余物溶于DCM中并装载到硅胶柱上。用DCM和甲醇洗脱所需的核糖核苷类似物。

实施例18.

一般脱苄基化条件

在-78℃的氩气气氛下，用1M BCl₃(3当量)的DCM溶液处理苄基保护的核糖核苷类似物的无水DCM溶液。将反应溶液在-78℃下搅拌2-4小时。在-78℃下缓慢加入甲醇淬灭混合物，并在减压下移除溶剂。通过硅胶色谱法用DCM和甲醇洗脱而纯化所需的核糖核苷类似物。

另选地，向核苷的MeOH溶液中在碳上加入20％氢氧化钯(II)。将反应容器用气球吹扫并在氢气气氛下保持24小时。一旦反应完成，滤除催化剂，减压移除溶剂，得到所需产物。

实施例19.

移除PMB基团的一般条件

向PMB保护的核糖核苷类似物的MeCN∶H₂O(3∶1)溶液中加入CAN(3当量)。将反应溶液在室温下搅拌12-16小时。然后用乙酸乙酯萃取反应溶液。将有机萃取物用MgSO₄干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶色谱法纯化所需产物。

实施例20.

尿苷保护

在0℃的氩气气氛下，通过注射器在15分钟内将尿苷的无水吡啶溶液(10.0g，40.9mmol，1.0当量)滴加到1，3-二氯-1，1，3，3-四异丙基二硅氧烷(14.4mL，45.0mmol，1.1当量)中。将反应混合物温热至室温并进一步搅拌3小时。用MeOH(10mL)淬灭反应，并蒸发溶剂。将粘性残余物溶于DCM(400mL)中并用饱和NaCO3H溶液、盐水洗涤，并用MgSO₄干燥。蒸发溶剂，并将其与甲苯共蒸发以除去痕量的吡啶。通过硅胶柱色谱法，用己烷∶乙酸乙酯(3∶2)洗脱来纯化产物，得到白色泡沫状的17(17.0g，85％产率)。

实施例21.

受保护的尿苷的氧化

在0℃下，将受保护的糖17(16.0g，32.9mmol，1当量)的DCM(150mL)溶液加入Dess-Martin过碘烷(18.1g，42.7mmol，1.3当量)。将反应混合物在25-30℃下搅拌24小时。之后，蒸发约75mL的DCM，将二乙醚(400mL)加入到反应混合物中，并通过硅藻土滤除沉淀物。分别用300mL含有18.5g Na₂S₂O₃的饱和NaHCO₃溶液和盐水洗涤所得滤液。用无水Na₂SO₄干燥有机层，并蒸发有机层，得到白色泡沫状的18(15.1g，95％产率)，其无需进一步纯化即可用于下一步骤。

实施例22.

环氧化物的形成

在-78℃的氩气氛下，在20分钟的过程中将酮18(4.30g，8.87mmol，1当量)和DCM(2.28mL，35.5mmol，4.0当量)的THF(50mL)溶液加入LDA溶液(31.1mL，1.0M，3.5当量)。将反应混合物在-78℃下搅拌3小时，然后在室温下搅拌过夜。用饱和NH₄Cl溶液淬灭反应。用二乙醚(150mL×2)萃取溶液。将合并的有机层用盐水洗涤，用MgSO₄干燥，蒸发，然后通过硅胶柱色谱法用己烷∶乙酸乙酯(3∶1)洗脱来纯化，得到19(1.90g，40％产率)。

实施例23.

用叠氮化钠打开环氧化物

在室温下，向19(2.0g，3.75mmol，1.0当量)和15-冠-5(0.74mL，3.75mmol，1.0当量)的DMF(10mL)溶液中加入叠氮化钠(1.2g，18.7mmol，5当量)。将混合物在30℃下搅拌2小时。然后冷却至室温，并用DCM(100mL)稀释。将溶液用水(2x)、盐水洗涤，用MgSO₄干燥，蒸发，并通过硅胶柱色谱法用己烷∶乙酸乙酯(3∶1)洗脱而纯化，得到浅棕色泡沫状的20(1.71g，84％产率)。

实施例24.

用氯化钠打开环氧化物

在室温下，向19(4.0g，7.50mmol，1.0当量)和15-冠-5(1.48mL，7.50mmol，1.0当量)的DMF(10mL)溶液中加入氯化钠(4.38g，75.0mmol，10.0当量)。将混合物在45℃下搅拌16小时。然后冷却至室温，并用DCM(150mL)稀释。将溶液用水(2x)、盐水洗涤，用MgSO₄干燥，蒸发，并通过硅胶柱色谱法用己烷∶乙酸乙酯(3∶1)洗脱而纯化，得到淡黄色泡沫状的21(2.60g，65％产率)。

实施例25.

在氩气下将乙炔基三甲基硅烷(37mmol，3当量)溶解在无水THF(40mL)中，然后将反应烧瓶冷却至-78℃。逐滴加入正丁基锂(37mmol，3当量，2.5M己烷溶液)。将所得混合物搅拌30分钟。滴加酮(12.4mmol，1当量)的THF(15ml)溶液。将反应在-78℃下搅拌3小时。在温热至室温后，用饱和NH₄Cl水溶液猝灭反应，并用二乙醚萃取。将有机层合并，用MgSO₄干燥，过滤，并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法，用己烷∶乙酸乙酯(3∶1)洗脱来纯化粗残余物，得到纯产物。

在-78℃下，向搅拌的所得醇(1g，1.72mmol)的甲苯(8.6mL，0.2M)溶液中滴加DAST(1.13mL，8.58mmol)。搅拌3小时后，用饱和NaHCO₃水溶液(100mL)淬灭反应，并用3×100mL乙酸乙酯萃取。萃取物用硫酸钠干燥，过滤，并减压浓缩至糊剂，并通过硅胶色谱法，用25％-75％乙酸乙酯的己烷溶液洗脱而纯化，得到所需产物。

实施例26.

将搅拌的DMP(27.5g，64.9mmol)的DCM(162mL，0.2M)溶液冷却至0℃并加入23(15g，32.4mmol)。将反应在0℃下搅拌并使其温热至室温。搅拌18小时后，将反应混合物减压浓缩至糊剂，然后将其在100mL乙醚中浆化，然后通过50g二氧化硅/硫酸镁质量之比为1∶1的垫过滤，并用总共400mL乙醚洗涤。醚层用含2.5g硫代硫酸钠的15mL水溶液洗涤，然后用2×30mL冷却的碳酸氢钠洗涤，最后用30mL盐水洗涤。然后将滤液用硫酸钠干燥，过滤，并减压浓缩，得到泡沫状物，其无需进一步纯化即可使用。在用于下一步骤之前，制备酮(32.6mmol)的DCM(200mL)溶液，并在室温下与5g硫酸镁一起搅拌过夜。搅拌18小时后，过滤溶液并减压浓缩。

在氩气下，向-78℃的TMS乙烯(11.4mL，80mmol)的无水THF(100mL)溶液中加入丁基锂(30.5mL，2.5M己烷，76mmol)。搅拌30分钟后，将锂化炔烃插入-78℃的无水CeCl₃(33.5g，90mmol，在高真空下150℃干燥过夜)的无水THF(130mL)悬浮液中，用2×15mL THF冲洗。搅拌90分钟后，通过插管(用2×10mL THF冲洗)加入24(32.4mmol)的无水THF(50mL)溶液。搅拌3小时后，将所得溶液用饱和氯化铵水溶液(100mL)淬灭。将反应温热至室温并通过硅藻土垫过滤。用乙醚(3×100mL)和饱和氯化铵水溶液(100mL)洗涤硅藻土垫。分离滤液，并用饱和氯化铵水溶液(100mL)和盐水(100mL)洗涤有机物。将滤液用硫酸钠干燥，过滤，并减压浓缩，得到油状物，将其通过硅胶色谱法用10％-50％乙酸乙酯的己烷溶液洗脱而纯化，得到产物，其为异头物的混合物。

在氩气下，向搅拌的0℃上述产物(32.4mmol)的无水DCM(163mL，0.2M)溶液中依次加入三乙胺(18mL，130mmol)、DMAP(3.98g，32.4mmol)和苯甲酰氯(9.46mL，82mmol)。搅拌16小时后，将反应混合物减压浓缩，然后在200mL乙醚中浆化并过滤。减压浓缩有机物，得到糊剂，将其通过硅胶色谱法用10％-25％乙酸乙酯的己烷溶液洗脱而纯化，得到25，其为异头物的混合物。然后可使化合物25经受一般的碱偶合条件，然后经受适当的脱保护条件。

实施例27.

2′-乙炔基尿苷(27)

将11mL乙腈和3mL BSA(4当量)中的尿嘧啶(5.19g，2.1当量)悬浮液加热30分钟使其温度达到90℃，然后将其冷却至室温。将化合物25(14.6g，1当量)在12mL的乙腈中共沸成糊状物，然后将其再次溶解在6mL乙腈中。经由套管将化合物25溶液加入到碱中，期间进行2×3mL次冲洗。然后在5分钟的时间段内滴加SnCl₄(1.5mL，4.25当量)。然后将反应物加热2小时，使其温度达到到90℃。通过TLC(5％甲醇的DCM溶液)监测反应。将反应物搅拌30分钟，然后将其冷却至0℃。然后向反应物中加入5g的NaCO₃和5g的硅藻土。然后用20mL的乙酸乙酯稀释反应物，并且向其中加入10mL的饱和NaCO₃水溶液(气体析出很可观)。在搅拌15分钟之后，通过硅藻土垫过滤反应物。以2×50mL的方式用乙酸乙酯洗涤硅藻土垫。用75mL的饱和NaCO₃水溶液和75mL的盐水洗涤合并的有机物。以2×100mL的方式用乙酸乙酯反萃取水层。用硫酸钠干燥合并的有机物，过滤，并且减压浓缩成泡沫。硅胶色谱法(用0％至2.5％至5％甲醇的DCM溶液洗脱)提供了1.74g的化合物26。

在234mL的7M氨的甲醇溶液中制备化合物26的溶液。将反应物搅拌18小时。在20g的硅藻土上浓缩反应物并且通过硅胶色谱法将其纯化，其中用1％至10％甲醇的DCM溶液洗脱，得到1g的化合物27。

实施例28.

2′-乙炔基尿苷-5′-单磷酸盐

在5分钟的时间段内，向在0℃下搅拌的化合物27(0.186mmol，1当量)的POMe₃(1.86mL)溶液中滴加POCl₃(0.317mmol，1.7当量)。在3小时的时间段内，将反应物从0℃升温至室温(rt)。通过TLC(7∶2∶2的IPA、NH₄OH、H₂O)监测反应物。用水(50mL)淬灭反应，并且用氯仿(2×100mL)萃取。然后使用浓缩的氢氧化铵(500uL)将水层的pH调为碱性。用氯仿(2×100mL)再萃取水层。然后减压浓缩水层。然后用硅胶色谱法(用16∶1∶1的IPA、NH₄OH、H₂O至8∶1∶1的IPA、NH₄OH、H₂O至7∶2∶2的IPA、NH₄OH、H₂O洗脱)对产物进行几次纯化，以在冷冻干燥之后得到8％产量的纯单磷酸盐。

实施例29.

2′-乙炔基-5-氟尿苷(29)

在氩气下将5-氟尿嘧啶(1.96g，15.1mmol)和硫酸铵(50mg，cat)悬浮在HMDS(25mL)中，并且加热至125℃过夜。真空移除溶剂，并且向残余物中加入化合物25(5g，7.55mmol)的MeCN(100mL)溶液，然后加入SnCl₄(DCM中1M，26.5mL，26.5mmol)，并且加热至40℃过夜。通过TLC(33％EtOAc的己烷溶液)监测反应。完成后，用EtOAc稀释反应混合物，然后先后用饱和的NaHCO₃水溶液和盐水洗涤。用MgSO₄干燥有机层，过滤并真空浓缩。将所得残余物从最少量的DCM加样到硅胶柱上。用20％(增加至33％)EtOAc的己烷溶液洗脱产物。分离产物得到白色泡沫固体3.34g，4.98mmol，产量66％。

在密封管中，将受保护的核苷28(3.3g，4.92mmol)溶解在7N的氨甲醇(50mL)中，并且搅拌过夜。在硅胶柱上浓缩反应混合物，并且用5％(增加至20％)甲醇的DCM溶液洗脱产物。收集主斑点并且在硅胶上再次纯化，其中用13％MeOH的DCM溶液等强洗脱。最后，通过C18 ultra柱纯化产物，其中用4％MeOH的水溶液等强洗脱。收集产物并冷冻干燥，以得到白色固体1.21g，4.23mmol，产量86％。

实施例30.

2′-乙炔基-2-氨基嘌呤呋喃糖苷(32)

在乙腈(15mL)中制备2-氨基嘌呤(0.459g，1.5当量)和25(1.5g，1当量)的搅拌悬浮液。下一步，加入BSA(2.49mL，4.5当量)和TMSOTf(1.227mL，3当量)。然后在微波中将反应溶液加热至130℃，加热持续1小时。用1.2mL的1M三乙醇胺淬灭反应，并且将其搅拌30分钟。在硅藻土上减压浓缩反应物，并且将其施加到果胶柱。得到的期望产物为混合物。

将上述混合物溶解在7N氨的甲醇(40mL)溶液中，并且搅拌16小时。在硅藻土上减压浓缩反应物。通过凝胶色谱法纯化产物，其中用0％至15％甲醇的DCM溶液洗脱。得到两种产物，期望的N9-32(171mg)和N7-33(265mg)。

实施例31.

2′-乙炔基尿苷-5′-单磷酸盐双-POM(34)

向装有((羟基磷酰基)双(氧基))双(亚甲基)双(2，2-二甲基丙酯)(313mg，0.960mmol)的25mL梨形烧瓶中加入无水THF(4mL)，以得到无色溶液。对其进行真空处理并且装入氩气。然后滴加三乙胺(147μl，1.056mmol)。在室温下搅拌30分钟之后，加入化合物27(148mg，0.480mmol)。将其冷却至0℃，然后加入N-乙基-N-异丙基丙烷-2-胺(334μl，1.920mmol)、双(2-氧代噁唑烷-3-基)次膦酰氯(306mg，1.200mmol)和3-硝基-1H-1，2，4-三唑(137mg，1.200mmol)。将反应物搅拌过夜，同时逐渐升温至室温。用EtOAc稀释反应物，并且用饱和NaHCO3水溶液淬灭反应。分离有机层，用Na₂SO₄干燥，过滤并真空浓缩。通过ISCO硅胶柱色谱法(12g柱)纯化粗物质，用100％DCM至5％MeOH的DCM溶液洗脱，以得到期望产物。

实施例32.

2′-乙炔基尿苷-5′-单磷酸盐单-POM(35)

通过将240mg的氯化钠溶解在24mL的水中来制备NaCl的溶液。用2M磷酸氢二钠的水溶液将pH调整为7.3。制备化合物34的悬浮液，并且将反应物加热至37℃。4天之后，反应停止。加入另外的240mg NaCl，并且将反应物再搅拌16小时。反应物看起来已经进一步反应。在25℃下，将反应物减压浓缩至5mL。将所得残余物加样到100g C18柱上，用0％至100％乙腈水溶液洗脱。将含有产物的级分合并，浓缩，然后使用50g C18柱再次纯化。将级分合并、浓缩并冻干，以得到36mg的期望产物。

实施例33.

2′-乙炔基-5-氟尿苷-5′-单磷酸盐双-POM(36)

向搅拌的((羟基磷酰基)双(氧基))双(亚甲基)双(2，2-二甲基丙酯)(230mg，2当量)和化合物29(101mg，1当量)的THF(7mL)溶液中加入三乙胺(0.1mL，2.2当量)。10小时之后，将反应物冷却至0℃，并且依次加入N，N-二异丙基乙基胺(0.25mL，4当量)、BOPCl(225mg，2.5当量)和3-硝基-1H-1，2，4-三唑(101mg，2.5当量)。将反应物搅拌14小时。然后在硅藻土上减压浓缩反应混合物。将硅藻土垫放置在硅胶柱上，并且用1％至7％甲醇的DCM溶液洗脱产物。获得的产物(31mg)为白色固体。

实施例34.

用于碱基耦联的替代方法

将核碱基(9.05mmol)和25(4.53mmol)的混合物与无水甲苯(x3)共蒸发，然后在高真空线上干燥两小时。将残余物溶于无水MeCN(50mL)中，加入BSA(4.4mL，18.11mmol)，并且将混合物在70℃下加热一小时，以允许核碱基完全溶解。将混合物冷却至室温，以经由注射器加入SnCl₄(DCM中1M，18.1mL，18.1mmol)，然后在70℃下加热过夜。在冷却至室温之后，真空去除溶剂，并且将残余物溶于DCM和吡啶中以沉淀Sn盐。通过硅藻土过滤之后，浓缩有机物，然后将其溶于乙酸乙酯中，并且用NaHCO₃和盐水洗涤。然后干燥有机层，过滤并浓缩，以得到固体。通过柱色谱法纯化(SNAP 50g，0％至100％EA的DCM溶液)，得到回收的糖供体和期望核苷。用乙醚研磨得到的白色固体期望核苷。

实施例35.

使用用于碱基耦联的替代方法制备的胞苷核苷以及一般苯甲酰脱保护条件

实施例36.

N-叔丁氧羰基-鞘氨醇(124)

根据Boumendjel，Ahcene和Miller，Stephen的“Journal of Lipid Research”1994年，35，2305来制备。

用二异丙基乙胺(0.53mL，3.01mmol)逐滴处理4℃下的鞘氨醇(450mg，1.50mmol)和二叔丁酯(0.656g，3.01mmol)的二氯甲烷(100mL)混合物。在逐渐升温至室温之后，将混合物再搅拌12小时，然后用二氯甲烷(100mL)稀释，随后用水(30mL)和盐水(30mL)洗涤。用硫酸钠干燥有机相，过滤并浓缩至干。使用50％乙酸乙酯的己烷溶液，通过硅胶(19mm×175mm)快速柱色谱法纯化粗残余物，以得到白色固体的N-叔丁氧羰基-鞘氨醇(540mg，90％)。

¹H NMR(300MHz，Chloroform-d)δ5.77(dt，J＝15.4，8.4Hz，1H)，5.52(dd，J＝15.4，8.4Hz，1H)，3.93(dd，J＝11.4，3.7Hz，1H)，3.70(dd，J＝11.4，3.7Hz，1H)，3.59(s，3H)，2.05(q，J＝7.0Hz，2H)，1.52(s，9H)，1.25(s，22H)，0.87(t，J＝6.5Hz，3H)。

实施例37.

N-叔丁氧羰基-鞘氨醇-1-O-二甲基磷酸酯(125)

通过与无水吡啶(2×12mL)共蒸发使N-叔丁氧羰基-鞘氨醇124(540mg，1.35mmol)变为无水。然后将残余物溶解于无水吡啶中，并且用四溴化碳(622mg，1.88mmol)处理。将混合物冷却至0℃并在30分钟内用三甲基亚磷酸酯(0.25mL，2.10mmol)的无水吡啶(3mL)溶液逐滴处理。在室温下放置另外12小时后，LCMS和tlc(5％甲醇的二氯甲烷溶液)分析表明完全转化。将混合物用水(2mL)淬灭，然后浓缩至干。将所得深色油状物溶解于乙酸乙酯(150mL)中，用3％HCl溶液(2×20mL)洗涤，然后用饱和碳酸氢钠溶液(30mL)洗涤。用硫酸钠干燥有机层，过滤并浓缩。使用2％甲醇的二氯甲烷溶液，通过硅胶(19mm×175mm)快速柱色谱法纯化粗残余物，以得到胶状的N-叔丁氧羰基-鞘氨醇-1-O-二甲基磷酸酯125(350mg，51％)。

¹H NMR(400MHz，Chloroform-d)δ5.82(dt，J＝15.4，7.1Hz，1H)，5.48(dd，J＝15.4，7.1Hz，1H)，4.99(d，J＝8.9Hz，1H)，4.32(ddd，J＝10.7，8.0，4.6Hz，1H)，4.11(ddt，J＝10.7，7.4，3.1Hz，2H)，3.77(dd，J＝11.1，2.1Hz，6H)，2.01(q，J＝7.1Hz，2H)，1.41(s，9H)，1.34(m，2H)，1.23(m，20H)，0.86(t，J＝6.4Hz，3H)。

³¹P NMR(162MHz，Chloroform-d)δ2.00。

MS C17H25NO4[M+Na+]；计算值：330.2，实测值：330.2。

实施例38.

鞘氨醇-1-磷酸盐(126)。

在0℃下用三甲基甲硅烷基溴(0.45mL，3.45mmol)逐滴处理N-叔丁氧羰基-鞘氨醇-1-O-二甲基磷酸酯125(350mg，0.689mmol)的无水二氯甲烷(8mL)溶液。在升温至室温之后，将混合物在室温下搅拌6小时，然后浓缩至干。将所得残余物与二氯甲烷共蒸发，以去除过量的三甲基甲硅烷基溴，然后用66％的THF(6mL)水溶液处理。通过过滤收集所得沉淀，以得到白色固体的鞘氨醇-1-磷酸盐126(218mg，83％)。

¹H NMR(400MHz，Methanol-d₄+CD₃CO₂D)δ5.84(dt，J＝15.5，6.7Hz，1H)，5.46(dd，J＝15.5，6.7Hz，1H)，4.33(t，J＝6.0Hz，1H)，4.13(ddd，J＝11.8，7.7，3.6Hz，1H)，4.03(dt，J＝11.8，8.4Hz，1H)，3.47(ddd，J＝8.3，4.8，3.2Hz，1H)，2.10-1.99(m，2H)，1.37(m，2H)，1.24(m，20H)，0.83(t，J＝6.4Hz，3H)。

³¹P NMR(162MHz，Chloroform-d)δ0.69。

MS C₁₈H₃₈NO₅P[M-H⁺]；计算值：378.2，实测值：378.2。

实施例39.

N-三氟乙酰基-植物鞘氨醇(131)。

向植物鞘氨醇(4g，12.6mmol)和无水粉末状碳酸钾(5.22g，37.8mmol)的二氯甲烷(85mL)浆液中加入三氟乙酸酐(1.96mL，13.9mmol)。将混合物在室温下搅拌18小时，然后用二氯甲烷(500mL)稀释。用水(100mL)洗涤混合物。加入甲醇(60mL)以破坏乳液。然后用硫酸钠干燥有机相，过滤并浓缩，以得到白色固体的131(4.9g，94％)。

¹H NMR(400MHz，DMSO-d₆)δ8.90(s，1H)，4.90-4.68(m，1H)，4.56(d，J＝6.1Hz，1H)，4.43(s，1H)，3.97(d，J＝7.6Hz，1H)，3.65(d，J＝10.8Hz，1H)，3.46(t，J＝10.2Hz，1H)，3.32-3.16(m，1H)，1.42(tt，J＝15.7，7.5Hz，2H)，1.20(s，24H)，0.83t，J＝6.8Hz，3H)。

实施例40.

1-O-叔丁基二苯基甲硅烷基-2-N-三氟乙酰基-植物鞘氨醇(132)

用DMAP(56mg，0.45mmol)处理N-三氟乙酰基-植物鞘氨醇(131，1.88g，4.5mmol)的无水吡啶(23mL)溶液，然后滴加叔丁基二苯基甲硅烷基氯(1.38g，5.0mmol)。18小时后浓缩至干。将所得残余物溶于乙酸乙酯(200mL)中，用饱和氯化铵(2×50mL)洗涤，然后用盐水(50mL)洗涤。用乙酸乙酯(50mL)反萃取水相。将合并的有机相用硫酸钠干燥并浓缩，得到粗制1-O-叔丁基二苯基甲硅烷基-2-N-三氟乙酰基-植物鞘氨醇132(3g，100％)，为胶状物。该物质无需进一步纯化即可用于下一步骤。

¹H NMR(400MHz，Chloroform-d)δ7.62(m，2H)，7.60-7.56(m，2H)，7.47-7.31(m，6H)，7.07(d，J＝8.4Hz，1H)，4.23(dd，J＝8.5，4.1Hz，1H，4.04(dt，J＝11.0，2.5Hz，1H)，3.82(ddd，J＝11.0，4.3，1.8Hz，1H)，3.64(dq，J＝10.6，6.0，4.3Hz，2H)，1.45(m，2H)，1.39-1.15(m，24H)，1.05(m，9H)，0.94-0.80(t，J＝6.9Hz 3H)。

实施例41.

1-O-叔丁基二苯基甲硅烷基-3，4-O-亚异丙基-2-N-三氟乙酰基-植物鞘氨醇(133)

用催化量的对甲苯磺酸(87mg，0.45mmol)处理1-O-叔丁基二苯基甲硅烷基-2-N-三氟乙酰基-植物鞘氨醇132(3g，4.5mmol)的1/1(v/v)2，2-二甲氧基丙烷/THF溶液，并在室温下搅拌16小时。将混合物用饱和碳酸氢钠(30mL)淬灭，然后在真空下除去过量的THF/2，2-二甲氧基丙烷。用乙酸乙酯(200mL)萃取混合物。用盐水洗涤后，将有机层用硫酸钠干燥，过滤并浓缩。用己烷/乙酸乙酯流动相，通过硅胶(25mm×175mm)柱色谱法纯化粗制油状物，得到133(2.45g，78％)。

¹H NMR(400MHz，Chloroform-d)δ7.68-7.63(m，2H)，7.63-7.57(m，2H)，7.39(m，6H)，6.54(d，J＝9.4Hz，1H)，4.23(dd，J＝8.2，5.6Hz，1H)，4.12(ddd，J＝13.3，6.9，3.8Hz，2H)，3.96(dd，J＝10.5，3.9Hz，1H)，3.69(dd，J＝10.5，2.9Hz，1H)，1.52-1.36(m，2H)，1.33(s，3H)，1.31(s，3H)，1.24(m，24H)，1.03(s，9H)，0.86(t，J＝53.7，6.9Hz，3H)。

实施例42.

3，4-O-亚异丙基-2-N-三氟乙酰基-植物鞘氨醇(134)

用四丁基氟化铵(4.25mL 1.0M THF溶液，4.25mmol)处理1-O-叔丁基二苯基甲硅烷基-3，4-O-亚异丙基-2-N-三氟乙酰基-植物鞘氨醇133(2.45g，3.54mmol)的THF(18mL)溶液，并在室温下搅拌12小时。将混合物用乙酸乙酯(100mL)和饱和氯化铵(2×50mL)稀释，然后用盐水(50mL)稀释。将有机相用硫酸钠干燥，过滤并浓缩，得到白色固体。用9∶1己烷∶乙酸乙酯流动相，通过硅胶(25mm×175mm)柱色谱法进一步纯化该白色固体，得到134(1.5g，93％)，为白色固体。

¹H NMR(300MHz，Chloroform-d)δ6.92(d，J＝8.7Hz，1H)，4.31-4.16(m，2H)，4.11(dq，J＝11.7，3.7Hz，1H)，4.00(dd，J＝11.5，2.6Hz，1H)，3.70(dd，J＝11.5，3.6Hz，1H)，1.48(s，3H)，1.35(s，3H)，1.25(m，26H)，0.88(t，J＝6.9Hz 3H)。

实施例43.

3，4-O-亚异丙基-2-N-三氟乙酰基-植物鞘氨醇-1-O-二甲基磷酸酯(135)

通过与无水吡啶(2×12mL)共蒸发使3，4-O-亚异丙基-2-N-三氟乙酰基-植物鞘氨醇134(630mg，1.39mmol)的溶液变为无水。然后将残余物溶于无水吡啶(12mL)中并用四溴化碳(533mg，1.67mmol)处理。将混合物冷却至0℃并在30分钟内用三甲基亚磷酸酯(0.23mL，1.95mmol)的无水吡啶(3mL)溶液逐滴处理。在室温下放置另外12小时后，LCMS和tlc(5％甲醇的二氯甲烷溶液)分析表明完全转化。将混合物用水(2mL)淬灭，然后浓缩至干。将所得深色油状物溶于乙酸乙酯(100mL)中，用3％HCl溶液(2×20mL)洗涤，然后用饱和碳酸氢钠溶液(30mL)洗涤。将有机层用硫酸钠干燥，过滤并浓缩。使用2％甲醇的二氯甲烷溶液，通过硅胶(19mm×175mm)快速柱色谱法纯化粗制残余物，得到135(650mg，83％)。

¹H NMR(300MHz，Chloroform-d)δ7.42(d，J＝8.8Hz，1H)，4.36(td，J＝10.9，5.0Hz，1H)，4.25(m，1H)，4.19(m，J＝6.5，2.0Hz，3H)，3.77(dd，J＝11.2，7.5Hz，6H)，1.44(s，3H)，1.33(s，3H)，1.25(m，26H)，0.87(t，J＝6.6Hz，3H)。

³¹PNMR(121MHz，Chloroform-d)δ1.69。

MS C₂₅H₄₇F₃NO₇P[M-H⁺]；计算值：560.3，实测值：560.2。

实施例44.

3，4-O-亚异丙基-2-N-三氟乙酰基-植物鞘氨醇-1-磷酸酯(136)

在0℃下用三甲基甲硅烷基溴(0.81mL，6.23mmol)逐滴处理3，4-O-亚异丙基-2-N-三氟乙酰基-植物鞘氨醇-1-O-二甲基磷酸酯135(650mg，1.16mmol)的无水二氯甲烷(12mL)溶液。在室温下12小时后，将混合物浓缩至干，并将所得残余物与二氯甲烷(3×50mL)共蒸发以除去过量的三甲基甲硅烷基溴。然后将残余物溶于冷(4℃)1％NH₄OH溶液中，同时保持pH7-8。在室温下10分钟后，将混合物浓缩至干，并将所得固体用甲醇/乙腈研磨。过滤收集固体，用乙腈洗涤，并在高真空下干燥，得到136(500mg，75％)，为白色固体。

¹H NMR(300MHz，Methanol-d₄)δ4.31(dd，J＝8.7，5.4Hz，1H)，4.09(m，4H)，1.42(s，3H)，1.36(s，3H)，1.31(m，26H)，0.89(t，J＝6.4Hz，3H)。

³¹P NMR(121MHz，Methanol-d₄)δ1.28。

¹⁹F NMR(282MHz，Methanol-d₄)δ-77.13。

HRMS C₂₃H₄₂F₃NO₇P[M-H⁺]；计算值：532.26565，实测值：532.26630。

实施例45.

2′，3′-二2脱氧-2′-氟-5′-(N-三氟乙酰基-3，4-O-亚异丙基-植物鞘氨醇-1-磷酸)-7-脱氮鸟苷(137)

通过与无水吡啶(3×10mL)共蒸发使N-三氟乙酰基-植物鞘氨醇-1-磷酸酯136(200mg，0.373mmol)和2′，3′-二脱氧-2′-氟-7-脱氮鸟嘌呤(100mg，0.373mmol)的混合物变为无水。然后将所得残余物溶于无水吡啶(4mL)中，并用二异丙基碳二亚胺(127mg，1.01mmol)和HOBt(60mg，0.447mmol)处理。在75℃下24小时后，将反应混合物冷却至室温并浓缩至干。使用5至7.5％甲醇的氯仿溶液与1％(v/v)NH₄OH的溶剂梯度，通过硅胶(19mm×170mm)快速柱色谱法纯化粗制物质，得到137(80mg，27％)，为白色固体。

¹H NMR(300MHz，Methanol-d₄)δ6.88(d，J＝3.8Hz，1H)，6.46(d，J＝3.8Hz，1H)，6.24(d，J＝19.9Hz，1H)，5.34(dd，J＝52.4，4.6Hz，1H)，4.53(s，1H)，4.34-3.97(m，6H)，2.63-2.17(m，2H)，1.40(s，3H)，1.30(s，3H)，1.27(m，26H)，0.89(t，J＝6.6Hz，3H)。

³¹P NMR(121MHz，Methanol-d₄)δ12.50。

¹⁹F NMR(282MHz，Methanol-d₄)δ-77.10，-179.69--180.25(m)。

MS C₃₄H₅₂2F₄N₅O₉P[M-H⁺]；计算值：781.3，实测值：782.2。

实施例46.

合成前药的实验程序

将2-((氯(苯氧基)磷酰基)氨基)丙酸异丙酯(0.397g，1.300mmol)的无水THF(5ml)溶液加入在-78℃下搅拌的2′-脱氧-2′-氟代核苷(0.812mmol)和1-甲基-1H-咪唑(0.367ml，4.63mmol)的吡啶(10.00ml)溶液中。15分钟后，将反应升温至室温并再搅拌3小时。接下来，在减压下除去溶剂。将粗产物溶于120ml DCM中，用20ml 1N HCl溶液洗涤，然后用10ml水洗涤。将有机相用硫酸钠干燥，过滤并真空浓缩。使用5％MeOH的DCM溶液作为流动相，在硅胶柱上分离残余物(用TEA中和)，得到对应的产物，为非对映异构体。

实施例47.

N-叔丁氧羰基-植物鞘氨醇(174)

用二碳酸二叔丁酯(8.6mL，36.9mmol)逐滴处理植物鞘氨醇(10.6g，33.5mmol)和三乙胺(5.6ml，40.2mmol)的THF(250mL)悬浮液。在室温下12小时后，将混合物浓缩至干，所得白色固体用乙酸乙酯(80mL)重结晶，然后在35℃下高真空干燥12小时，得到174(10.5g，75％)。

¹H NMR(400MHz，Chloroform-d)δ5.31(d，J＝8.5Hz，1H)，3.89(d，J＝11.1Hz，1H)，3.83(s，2H)，3.74(dd，J＝11.1，5.2Hz，1H)，3.65(d，J＝8.3Hz，1H)，3.61(d，J＝3.9Hz，1H)，1.43(s，9H)，1.23(s，27H)，0.86(t，J＝6.4Hz，3H)。

实施例48.

2-O-叔丁基二苯基甲硅烷基-1-N-叔丁氧羰基-植物鞘氨醇(175)

用叔丁基氯二苯基硅烷(7mL，27.25mmol)逐滴处理N-叔丁氧羰基-植物鞘氨醇174(9.5g，22.65mmol)和三乙胺(3.8mL，27.2mmol)的无水二氯甲烷/DMF(120mL/10mL)溶液。在室温下18小时后，将混合物用二氯甲烷(200mL)稀释，并用0.2N HCl(100mL)洗涤，然后用盐水(100mL)洗涤。将有机相用硫酸钠干燥，过滤，然后浓缩，得到175(14.9g)，为油状物，其无需进一步纯化即可用于下一反应。

¹H NMR(400MHz，Chloroform-d)δ5.31(d，J＝8.5Hz，1H)，3.89(d，J＝11.1Hz，1H)，3.83(m，1H)，3.74(dd，J＝11.1，5.2Hz，1H)，3.65(d，J＝8.3Hz，1H)，3.61(d，J＝3.9Hz，1H)，1.43(s，9H)，1.23(s，27H)，0.86(t，J＝6.4Hz，3H)。

实施例49.

2-O-叔丁基二苯基甲硅烷基-1-N-叔丁氧羰基-3，4-O-亚异丙基-植物鞘氨醇(176)

用催化对甲苯磺酸(860mg，4.53mmol)处理2-O-叔丁基二苯基甲硅烷基-1-N-叔丁氧羰基-植物鞘氨醇(175，14.9g，22.65mmol)的1/1(v/v)THF/2，2-二甲氧基丙烷溶液。24小时后，将混合物用饱和碳酸氢钠溶液(50mL)淬灭。将混合物浓缩，然后溶于乙酸乙酯(200mL)中并用盐水(2×50mL)洗涤。将有机相用硫酸钠干燥，过滤并浓缩，得到176(15.7g)，为胶状物，其无需进一步纯化即可用于下一步骤。

¹H NMR(400MHz，Chloroform-d)δ7.66(m，4H)，7.51-7.27(m，6H)，4.78(d，J＝10.0Hz，1H)，4.18(dd，J＝9.3，5.5Hz，1H)，3.89(dd，J＝9.9，3.3Hz，1H)，3.80(d，J＝9.9Hz，1H)，3.72(d，J＝9.9Hz，1H)，1.45(s，9H)，1.42(s，3H)，1.35(s，3H)，1.25(s，27H)，1.05(s，9H)，0.87(t，J＝6.5Hz，3H)。

实施例50.

1-N-叔丁氧羰基-3，4-O-亚异丙基-植物鞘氨醇(177)

在20分钟内用四丁基氟化铵(1.0M的THF溶液，24.9mL，24.9mmol)溶液在0℃下逐滴处理2-O-叔丁基二苯基甲硅烷基-1-N-叔丁氧羰基-3，4-O-亚异丙基-植物鞘氨醇176(15.7g，22.6mmol)的THF溶液。在室温下16小时后，tlc(3∶1己烷∶乙酸乙酯)表明完全转化。将混合物浓缩至干，将所得残余物溶于乙酸乙酯(300mL)中并用水(3×100mL)洗涤。将有机相用硫酸钠干燥，过滤并浓缩。通过快速柱色谱法(35mm×180mm)，使用25至50％乙酸乙酯的己烷溶剂梯度纯化所得油状物，得到177(7.3g，71％，3个步骤)，为白色固体。

¹H NMR(400MHz，Chloroform-d)δ4.93(d，J＝9.1，1H)，4.16(q，J＝7.1，6.4Hz，1H)，4.07(t，J＝6.5Hz，1H)，3.83(dd，J＝11.1，2.4Hz，1H)，3.76(m，1H)，3.67(dd，J＝11.2，3.6Hz，1H)，1.43(s，3H)，1.42(s，9H)，1.32(s，3H)，1.23(s，27H)，0.86(t，J＝6.9Hz，3H)。

实施例51.

制备5′-氨基磷酸酯前药的一般程序

氯代氨基磷酸酯的合成：

将亚硫酰氯(80g，49.2mL，673mmol)在30分钟内逐滴加入L-丙氨酸(50g，561mmol)的异丙醇(500mL)悬浮液中。将混合物加热至温和回流5小时，然后通过旋转蒸发仪(浴温设定在60℃)浓缩。将所得浓胶状物用乙醚(150ml)研磨后进行固化。将白色粉末再次用乙醚(150mL)研磨，在氩气流下过滤收集，然后在高真空下干燥18小时，得到(S)-2-氨基丙酸异丙酯盐酸盐(88g，94％)。

¹H NMR(400MHz，DMSO-d₆)δ8.62(s，3H)，5.10-4.80(m，1H)，3.95(q，J＝7.2Hz，1H)，1.38(d，J＝7.2Hz，3H)，1.22(d，J＝4.6Hz，3H)，1.20(d，J＝4.6Hz，3H)。

实施例52.

将二氯磷酸苯酯(30.9g，146mmol)的二氯甲烷(450mL)溶液冷却至0℃，然后用(S)-2-氨基丙酸异丙酯盐酸盐(24.5g，146mmol)处理。将混合物进一步冷却至-78℃，然后在30分钟内用三乙胺(29.6g，40.8mL，293mmol)逐滴处理。将混合物在-78℃下继续再搅拌2小时，然后逐渐升温至室温。18小时后，将混合物浓缩至干，并将所得胶状物溶于无水乙醚(150mL)中。在氩气流下过滤浆液，并用少量无水乙醚(3×30mL)洗涤收集的固体。通过旋转蒸发仪将合并的滤液浓缩至干，得到磷酸氯化物(41.5g，93％)的1∶1非对映混合物，为浅黄色油状物。

¹H NMR(300MHz，Chloroform-d)δ7.43-7.14(m，5H)，5.06(m，1H)，4.55(dd，J＝14.9，7.0Hz，1H)，4.21-4.01(m，1H)，1.48(d，J＝7.0Hz，2H)，1.27(d，J＝6.2Hz，3H)，1.26(d，J＝5.8Hz，3H)。

³¹P NMR(121MHz，Chloroform-d)δ8.18 and 7.87。

实施例53.

2-氯-4-氨基磷酸硝基苯酯的合成：

将二氯磷酸苯酯(60g，42.5mL，284mmol)的二氯甲烷(300mL)溶液冷却至0℃，然后用(S)-2-氨基丙酸异丙酯盐酸盐(47.7g，284mmol)处理。将混合物进一步冷却至-78℃并在1小时内用三乙胺(57.6g，79mL，569mmol)的二氯甲烷(300mL)溶液逐滴处理。将反应混合物升温至0℃保持30分钟，然后在20分钟内用预先形成的2-氯-4-硝基苯酚(46.9g，270mmol)和三乙胺(28.8g，39.6mL，284mmol)在二氯甲烷(120mL)中的混合物处理。在0℃下2小时后，将混合物通过烧结漏斗过滤，并将收集的滤液浓缩至干。将粗制胶状物溶于MTBE(500mL)中并用0.2M K₂CO₃(2×100mL)洗涤，然后用10％盐水(3×75mL)洗涤。将有机相用硫酸钠干燥，过滤并通过旋转蒸发仪浓缩至干，得到非对映混合物(100g，93％)，为浅黄色油状物。

¹H NMR(400MHz，Chloroform-d)δ8.33(dd，J＝2.7，1.1Hz，1H，diastereomer 1)，8.31(dd，J＝2.7，1.1Hz，1H，diastereomer 2)，8.12(dd，J＝9.1，2.7Hz，1H)，7.72(dt，J＝9.1，1.1Hz，1H)，7.40-7.31(m，2H)，7.28-7.19(m，6H)，5.01(pd，J＝6.3，5.2Hz，1H)，4.22-4.08(m，1H)，3.96(td，J＝10.7，9.1，3.6Hz，1H)，1.43(dd，J＝7.0，0.6Hz，3H)，1.40(dd，J＝7.2，0.6Hz，3H，diastereomer 2)，1.25-1.20(m，9H)。

实施例54.

化合物253非对映体的分离：

将非对映混合物253(28g，63.2mmol)溶于2∶3乙酸乙酯∶己烷(100mL)中并冷却至-20℃。16小时后，过滤收集所得白色固体，并在高真空下干燥，得到16∶1 S_p∶R_p-非对映混合物(5.5g，19.6％)。浓缩母液，将所得残余物溶于2∶3乙酸乙酯∶己烷(50mL)中。在-10℃下16小时后，收集所得白色固体并在高真空下干燥，得到1∶6 S_p∶R_p-非对映混合物(4g，14％)。将16∶1 S_p∶R_p-非对映混合物(5.5g，12.4mmol)悬浮在热己烷(50mL)中，并用乙酸乙酯(大约10mL)缓慢处理直至完全溶解。冷却至0℃后，过滤收集所得白色固体，用己烷洗涤，并在高真空下干燥，得到254的S_p-非对映体(4.2g，76％)，为单一异构体。

¹H NMR(S_p-diastereomer，400MHz，Chloroform-d)δ8.33(dd，J＝2.7，1.1Hz，1H)，8.12(dd，J＝9.1，2.7Hz，1H)，7.71(dd，J＝9.1，1.2Hz，1H)，7.41-7.30(m，2H)，7.29-7.11(m，3H)，5.00(m，1H)，4.25-4.07(m，1H)，3.97(dd，J＝12.7，9.4Hz，1H)，1.43(d，J＝7.0Hz，3H)，1.23(d，J＝2.2Hz，3H)，1.21(d，J＝2.2Hz，3H)。

将1∶6 S_p∶R_p-非对映混合物(4g，12.4mmol)悬浮在热己烷(50mL)中，并用乙酸乙酯(大约5mL)缓慢处理直至完全溶解。冷却至0℃后，过滤收集所得白色固体，用己烷洗涤，并在高真空下干燥，得到255的R_p-非对映体(3.2g，80％)，为单一异构体。通过X射线分析证实绝对立体化学。

¹H NMR(R_p-diastereomer，400MHz，Chloroform-d)δ8.31(dd，J＝2.7，1.1Hz，1H)，8.11(dd，J＝9.1，2.7Hz，1H)，7.72(dd，J＝9.1，1.2Hz，1H)，7.42-7.30(m，2H)，7.31-7.14(m，3H)，5.01(p，J＝6.3Hz，1H)，4.15(tq，J＝9.0，7.0Hz，1H)，4.08-3.94(m，1H)，1.40(d，J＝7.0Hz，3H)，1.24(d，J＝3.5Hz，3H)，1.22(d，J＝3.5Hz，3H)。

实施例55.

形成氨基磷酸酯前药的一般程序：

在50℃下将要转化成其5′-氨基磷酸酯前药的所需核苷(1当量)在真空烘箱中干燥过夜。将干燥的核苷在惰性气氛下置于干燥烧瓶中，并悬浮在无水THF或无水DCM中以获得0.05M溶液。然后将烧瓶冷却至0℃，并将氯代氨基磷酸酯试剂(5当量)加入悬浮的核苷中。接下来，将1-甲基咪唑(8当量)逐滴加入反应混合物中。将反应物在室温下搅拌12至72小时。通过TLC判断反应完成后，将反应混合物用乙酸乙酯稀释。然后将稀释的反应混合物用饱和氯化铵水溶液洗涤。用乙酸乙酯再萃取水层。然后将合并的有机层用盐水洗涤，用MgSO₄干燥，过滤并浓缩。然后用DCM至5％MeOH的DCM溶液梯度洗脱，在二氧化硅上纯化浓缩的粗产物。

实施例56.

制备5′-三磷酸酯的一般程序：

将核苷类似物在50℃下高真空干燥18小时，然后溶于无水三甲基磷酸酯(0.3M)中。加入(1.5摩尔当量)后，将混合物冷却至0℃并在15分钟内通过微量注射器用磷酰氯(1.3摩尔当量)逐滴处理。将混合物在0℃下继续搅拌4至6小时，同时通过tlc(7∶2∶1异丙醇∶浓NH₄OH∶水)进行监测。一旦大于85％转化成单磷酸酯，用双(三正丁基焦磷酸铵)(3摩尔当量)和三丁胺(6摩尔当量)在无水DMF(1mL)中的混合物处理反应混合物。在0℃下通过tlc(11∶7∶2 NH₄OH∶异丙醇∶水)监测20分钟后，用20mL 100mM三乙基碳酸氢铵(TEAB)溶液处理混合物，在室温下搅拌1小时，然后用乙醚(3×15mL)萃取。然后通过DEAEA-25树脂(11×200mm)阴离子交换色谱法，使用50mM(400mL)至600mM(400mL)TEAB的缓冲液梯度纯化水相。通过tlc(11∶7∶2 NH₄OH∶异丙醇∶水)分析10mL级分。将含有三磷酸酯(用500mM TEAB洗脱的)的级分合并，并通过旋转蒸发仪(浴温＜25℃)浓缩。将所得固体在去离子水(10mL)中重构，并通过冷冻干燥浓缩。

实施例57.

使用制备5′-三磷酸酯的一般程序合成的5′-三磷酸盐：

实施例58.

(R)-2，2，2-三氟-N-(1-羟基十八烷-2-基)乙酰胺的合成

将植物鞘氨醇(15.75mmol)溶于EtOH(0.5M)中，逐滴加入三氟乙酸乙酯(15.75mmol)。加入NEt₃(24.41mmol)，接下来将反应混合物搅拌过夜。真空除去溶剂，将残余物溶于EtOAc和盐水中，洗涤，干燥并浓缩。为白色粉末的粗制物质足以无需进一步纯化即可用于下一步骤。表征匹配的文献：Synthesis，2011年，第867页。

实施例59.

将伯醇(15.75mmol)、DMAP(1.575mmol)和NEt₃(39.4mmol)溶于CH₂Cl₂和DMF(0.18M)混合物中并冷却至0℃。逐滴加入TBDPSCl(19.69mmol)，然后将溶液升温至室温并搅拌过夜。

加入NH₄Cl溶液进行淬灭。用EtOAc萃取反应混合物，并将合并的有机层用水(×2)洗涤以除去DMF。然后将其干燥并浓缩。以10-20％EtOAc/Hex运行柱以纯化混合物。表征匹配的文献：Synthesis，2011年，第867页。

实施例60.

将二醇(12.58mmol)、三苯基膦(50.3mmol)和咪唑(50.03mmol)溶于甲苯中并再加热至回流。然后缓慢加入碘(37.7mmol)并在回流下继续搅拌反应混合物。3小时后，将其冷却至室温，加入1当量的碘(12.58mmol)，然后加入8当量的1.5M NaOH(100.64mmol)。搅拌反应混合物直至所有固体溶解。在分液漏斗中除去水层，将有机层用Na₂S₂O₃溶液洗涤，然后用NaHCO₃溶液洗涤，然后用盐水洗涤。将其干燥并浓缩。以0-20％EtOAc/Hex运行柱以纯化混合物，得到顺式和反式的混合物，但继续进行到下一步。

δ¹H NMR(400MHz，Chloroform-d)δ7.64(ddt，J＝7.8，3.8，1.7Hz，4H)，7.51-7.35(m，6H)，6.68(dd，J＝16.0，8.2Hz，1H)，5.6-5.40(m，2H)，4.57-4.46(m，1H)，3.84-3.62(m，2H)，2.04(q，J＝7.0Hz，1H)，1.28-1.21(m，24H)，1.15-0.98(m，9H)，0.90(t，J＝6.8Hz，3H)。

HRMS：617.38759。

实施例61.

将烯烃(2.91mmol)溶于MeOH(0.1M)中并加入Pd(OH)₂/C(0.146mmol)。在40psi下使用Parr氢化器。小心地通过硅藻土过滤钯催化剂并用EtOAc冲洗。粗物质用于下一步骤并提供定量产率。

实施例62.

将甲硅烷基醚溶于THF中并冷却至0℃，然后逐滴加入TBAF。搅拌1小时后，将其升温至室温。2小时后，加入NH₄Cl溶液，将其用EtOAc萃取，用盐水洗涤，干燥并浓缩。以10-50％EtOAc/Hex运行柱。

¹H NMR(400MHz，Chloroform-d)δ7.60(tt，J＝7.0，1.5Hz，2H)，7.48-7.33(m，4H)，3.733.61(m，1H)，1.24(d，J＝3.5Hz，18H)，1.05(s，6H)，0.86(t，J＝6.8Hz，3H)。HRMS：381.28546。

实施例63.

向33.4g乙醇钠溶液(21重量％)的乙醇溶液中逐滴加入丙二酸二乙酯(15g)，然后逐滴加入1-溴十六烷(31.5g)。回流8小时后，真空蒸发乙醇。将剩余悬浮液与冰水(200ml)混合并用乙醚(3×200ml)萃取。将合并的有机层用MgSO₄干燥，过滤，并将滤液真空蒸发，得到粘性油状残余物。通过柱色谱法(二氧化硅：500g)，使用己烷/乙醚(12∶1)作为流动相纯化该残余物，得到主要化合物。

实施例64.

在250mL圆底烧瓶中加入氢化铝锂(2.503g，66.0mmol)的乙醚(90ml)溶液，得到悬浮液。向该悬浮液中逐滴加入2-十六烷基丙二酸二乙酯(18.12g，47.1mmol)并将反应物回流6小时。使用PMA和H₂SO₄作为干燥剂通过TLC跟踪反应。用200ml冰水破坏过量的氢化铝锂。加入150ml10％H₂SO₄以溶解氢氧化铝。用乙醚(100ml×3)萃取反应混合物。过滤包含未溶解产物的有机层。将收集的固体用乙酸乙酯洗涤。将滤液用MgSO₄干燥，过滤并减压浓缩。用己烷EtOAc(3∶1)至(1∶1)洗脱，在二氧化硅(100g)柱上纯化产物。

实施例65.

向2-十六烷基丙烷-1，3-二醇(7.04g，23.43mmol)的100ml DCM溶液中逐滴加入溶于20ml DCM中的三氯化磷(3.59g，23.43mmol)，然后逐滴加入三乙胺(6.53ml，46.9mmol)。将反应物回流一小时。TLC分析显示原料被消耗并形成两个新斑点。将混合物浓缩至干，溶于无水乙醚中并过滤。浓缩滤液，得到粗产物(8.85g)，其无需进一步纯化即可用于下一步骤。

实施例66.

5′-氘代核苷类似物的合成

将核苷悬浮在二氯甲烷(40mL，部分可溶)中。在室温下搅拌30分钟后，依次用PDC、乙酸酐和叔丁醇处理混合物。继续在室温下搅拌混合物。TLC(5％甲醇的DCM溶液)和LCMS表明在4小时时仅有少量剩余的原料。通过装入150mL烧结漏斗中的硅胶垫过滤混合物。用乙酸乙酯洗脱二氧化硅。将收集的滤液减压浓缩。用2∶1己烷∶乙酸乙酯至乙酸乙酯梯度，通过硅胶(25mm×175mm)色谱法纯化粗制深色油状物。收集纯级分并浓缩，得到白色胶状物。将该物质置于高真空下2天，其无需进一步纯化即可用于下一步骤。

将5′-受保护的核苷溶于200标准乙醇中，然后用固体硼氘化钠处理。混合物变得均匀，然后将其加热至80℃。12小时后，形成白色/浅黄色沉淀。将混合物冷却至室温。TLC(5％甲醇的二氯甲烷溶液)表明原料完全转化。用冰浴将混合物冷却至0℃，然后用乙酸(大约1mL)缓慢淬灭。将澄清溶液升温至室温，然后在乙酸乙酯(30mL)和盐水(3mL)之间分配。浓缩有机相，然后使用5％甲醇的二氯甲烷溶液作为流动相，通过硅胶(19mm×180mm)色谱法纯化该有机相。

实施例67.

将2′-脱氧-2′-氟尿苷(6g，24.37mmol)和4，4′-(氯(苯基)亚甲基)-双(甲氧基苯)(9.91g，29.2mmol)的吡啶(48.7ml)溶液在室温下搅拌16小时。将混合物用MeOH(20mL)处理，浓缩至干并在水(50mL)和EtOAc(250mL)之间分配。用EtOAc(50mL)反萃取水相，将合并的有机层用水(50mL)洗涤，并用Na₂SO₄干燥。浓缩溶液，得到2′-脱氧-2′-氟-5′-(4′，4′-二甲氧基三苯甲基)尿苷(14g，定量)，其无需进一步纯化即可使用。

向2′-脱氧-2′-氟-5′-(4′，4′-二甲氧基三苯甲基)尿苷(13.37g，24.37mmol)的二氯甲烷(30mL)溶液中加入1H-咪唑(2.48g，36.6mmol)和叔丁基氯二甲基硅烷(5.51g，36.6mmol)。将反应物搅拌16小时，然后用EtOAc(250mL)稀释。将混合物用饱和碳酸氢钠水溶液(50mL)和盐水(50mL)洗涤，用Na₂SO₄干燥，过滤并浓缩，得到2′-脱氧-2′-氟-3′-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-5′-(4′，4′-二甲氧基三苯甲基)尿苷(16g，99％)。该产物无需进一步纯化即可用于下一步骤。

向2′-脱氧-2′-氟-3′-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-5′-(4′，4′-二甲氧基三苯甲基)尿苷(13.37g，20.17mmol)的DCM(10mL)溶液中加入乙酸(20.19ml，353mmol)和水(5ml)。将反应物在室温下搅拌20小时，用EtOAc(250mL)稀释，用饱和NaHCO₃水溶液(2×100mL)和盐水(100mL)洗涤，干燥(硫酸钠)，过滤并浓缩。通过硅胶柱色谱法(1％MeOH的DCM溶液，2％MeOH的DCM溶液)纯化残余物，得到2′-脱氧-2′-氟-3′-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷(6.73g，产率为93％)，为黄色固体。

向PDC(14.05g，37.3mmol)的无水DCM(37.3ml)/DMF(9.34ml)悬浮液中依次加入2-甲基丙-2-醇(35.7ml，373mmol)、2′-脱氧-2′-氟-3′-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷(6.73g，18.67mmol)和乙酸酐(17.62ml，187mmol)。18小时后，将混合物用无水EtOH(5mL)淬灭，用EtOAc(15mL)稀释，用Na₂SO₄干燥，通过硅藻土过滤并浓缩。使用1％MeOH的DCM溶液，通过硅胶柱色谱法纯化粗制残余物，得到(2S，3R，4R，5R)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-4-氟四氢呋喃-2-羧酸叔丁酯(6.72g，83％)。

向(2S，3R，4R，5R)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-5-(2，4-二氧代-3，4-二氢嘧啶-1(2H)-基)-4-氟四氢呋喃-2-羧酸叔丁酯(3.29g，7.64mmol)中一次性加入硼氘化钠(1.422g，30.6mmol)。在密封管中将反应物在80℃下搅拌20小时。将混合物冷却至室温，然后用乙酸(6.99ml，122mmol)淬灭。将混合物用饱和碳酸氢钠水溶液中和，并用EtOAc萃取。浓缩后，通过硅胶柱色谱法(Rf＝0.5，己烷∶EtOAc为1∶1)纯化所得残余物，得到[5′-²H₂]-2′-脱氧-2′-氟-3′-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷(1g，36％)。

向[5′-²H₂]-2′-脱氧-2′-氟-3′-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷(200mg，0.552mmol)的MeOH(6mL)溶液中一次性加入Dowex 50WX8(H+形式)(6g)。将混合物搅拌72小时，过滤并浓缩，得到[5′-²H₂]-2′-脱氧-2′-氟尿苷(150mg，定量)。

在5℃下，在N₂下向磷酰三氯(1.69mL，18.13mmol)的磷酸三甲酯(2mL)溶液中分小份加入[5′-²H₂]-2′-脱氧-2′-氟尿苷(100mg，0.403mmol)。将溶液在5℃下剧烈搅拌2小时，然后通过逐滴加入去离子水(8mL)淬灭。用氯仿(2×10mL)萃取反应混合物，并将水相用NH₄OH浓缩至pH 6.5，同时将溶液保持在30℃以下。再次用氯仿(10mL)萃取水层，然后浓缩至干。将残余物悬浮在MeOH(15mL)中，过滤并浓缩。通过硅胶柱色谱法(7∶2∶1iPrOH∶浓NH₄OH∶H₂O，Rf＝0.2)纯化所得固体。通过DEAE柱色谱法，使用甲醇然后使用0至100mM碳酸氢铵水溶液的流动相梯度进一步纯化产物。将级分浓缩至干，溶于水中并冻干，得到[5′-²H₂]-2′-脱氧-2′-氟尿苷-5′-单磷酸酯(27mg，20％)，为无定形白色固体。

在10分钟内用3-((氯(二异丙基氨基)膦基)氧基)丙腈(3mL，13.45mmol)逐滴处理3-十六烷基氧基丙-1-醇(2.02g，6.72mmol)和DIPEA(4.7mL，26.9mmol)的无水二氯甲烷(45mL)悬浮液。在室温下18小时后，将混合物用饱和碳酸氢钠溶液(15mL)淬灭并用乙酸乙酯(2×100mL)萃取。将合并的有机相浓缩至干，并使用10至20％乙酸乙酯的己烷溶剂梯度，通过硅胶(25mm×140mm)色谱法纯化粗制残余物，得到十六烷氧基丙基-(2-氰基乙基)二异丙基亚磷酰胺(2.1g，65％)，为白色固体。

¹H NMR(400MHz，Chloroform-d)δ3.89-3.54(m，6H)，3.49(t，J＝6.3Hz，2H)，3.39(t，J＝6.7Hz，2H)，2.64(t，J＝6.6Hz，2H)，1.87(p，J＝6.3Hz，2H)，1.57(p，J＝6.3Hz，2H)，1.25(s，26H)，1.18(dd，J＝6.8，3.5Hz，12H)，0.87(t，J＝6.6Hz，3H)。

³¹P NMR(162MHz，Chloroform-d)δ147.40。

用1-H-四唑(14.7mL 0.45M乙腈溶液，6.62mmol)逐滴处理[5′-²H₂]-2′-脱氧-2-氟-3′-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)尿苷(600mg，1.65mmol)和十六烷氧基丙基-(2-氰基乙基)二异丙基亚磷酰胺(1.65g，3.31mmol)的无水THF(22mL)溶液。在室温下16小时后，用叔丁基氢过氧化物(1.5mL 5.5M壬烷溶液，8.28mmol)逐滴处理混合物，并在室温下搅拌1小时，然后用1.0M硫代硫酸钠水溶液(40mL)淬灭。30分钟后，用乙酸乙酯(2×80mL)萃取混合物。将合并的有机相用盐水(40mL)洗涤，用硫酸钠干燥，过滤并浓缩。用1％至5％甲醇的二氯甲烷溶液的流动相梯度，通过硅胶(40g)柱色谱法纯化所得残余物，得到磷酸氰乙酯中间体，其无需进一步纯化，将其溶于甲醇(30mL)中并用浓氢氧化铵(5mL，128mmol)处理。在室温下4小时后，将混合物浓缩至干。使用配备有40g硅胶柱的CombiFlash仪器，用5至25％甲醇的二氯甲烷溶剂梯度洗脱，通过硅胶柱色谱法纯化所得残余物，得到[5′-²H₂]-2′-脱氧-2′-氟-3′-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-5′-((十六烷氧基丙基)磷酸)尿苷(1g，82％)，为白色泡沫。

用乙酸(0.5g，8.28mmol)和三乙基氟化铵(1.2g，5.52mmol)处理[5′-²H₂]-2′-脱氧-2′-氟-3′-O-(叔丁基二甲基甲硅烷基)-5′-((十六烷氧基丙基)磷酸)尿苷(1g，1.38mmol)的THF(15mL)溶液。36小时后，浓缩混合物，并使用甲醇(120mL)作为流动相，通过Dowex 50WX8(H+形式)的短柱(11mm×90mm)洗脱所得残余物。使用0至25％甲醇的二氯甲烷以及2.5％(v/v)氢氧化铵的流动相梯度，通过硅胶(24g)柱色谱法进一步纯化产物。合并纯级分并浓缩。将所得固体与二氯甲烷(2×75mL)共蒸发，然后在高真空下干燥19小时，得到[5′-²H₂]-2′-脱氧-2′-氟-5′-((十六烷氧基丙基)磷酸)尿苷(455mg，54％)，为白色固体。

¹H NMR(400MHz，Chloroform-d4/Methanol-d₄)δ7.75(d，J＝8.1Hz，1H)，5.95(dd，J＝17.9，1.6Hz，1H)，5.70(d，J＝8.1Hz，1H)，5.01(ddd，J＝52.8，4.6，1.7Hz，1H)，4.30(ddd，J＝20.7，8.1，4.5Hz，1H)，4.16-4.07(m，3H)，3.51(t，J＝6.2Hz，2H)，3.41(t，J＝6.7Hz，2H)，1.92(p，J＝7.6Hz，2H)，1.53(p，J＝7.6Hz，2H)，1.25(s，26H)，0.87(d，J＝7.6Hz，3H)。

¹³C NMR(101MHz，Chloroform-d4/Methanol-d4)δ164.31，150.24，140.33，102.11，94.19，92.32，88.88，88.53，80.83，80.75，71.18，67.62，67.45，66.50，66.40，64.83，64.77，63.81，31.81，30.37，30.29，29.59，29.57，29.54，29.51，29.47，29.41，29.25，26.00，25.96，22.57，13.96。

³¹P NMR(162MHz，Chloroform-d4/Methanol-d4)δ-0.87。

HRMS C₂₈H₄₉D₂FN₂O₉P[M+H⁺]；计算值：611.34359，实测值：611.34363。

实施例68.

使用一般程序合成的氨基磷酸酯前药

实施例69.

测定方案

(1)DENV、JEV、POWV、WNV、YFV、PTV、RVFV、CHIKV、EEEV、VEEV、WEEV、TCRV、PCV、JUNV、MPRLV的筛查测定

原发性致细胞病变效应(CPE)降低测定。进行四个浓度的CPE抑制测定。在96孔一次性微孔板中制备汇合或接近汇合的细胞培养单层。根据每种细胞系的需要，将细胞维持在补充有FBS的MEM或DMEM中。对于抗病毒测定，使用相同的培养基，但将FBS降至2％或更低并补充50μg/ml庆大霉素。以四个log₁₀终浓度制备测试化合物，通常为0.1、1.0、10和100μg/ml或μM。每个微孔板上都有病毒对照孔和细胞对照孔。同时，使用与测试化合物相同的方法来测试已知的活性药物作为阳性对照药物。每次测试运行都测试阳性对照。通过首先从96孔细胞板中除去生长培养基来建立测定。然后以2×浓度将测试化合物以0.1ml体积施加到孔中。将通常在0.1ml体积中＜100 50％细胞培养感染剂量(CCID₅₀)的病毒置于指定用于病毒感染的那些孔中。将没有病毒的培养基置于毒性对照孔和细胞对照孔中。用病毒类似地处理病毒对照孔。将板在37℃和5％CO₂下温育，直至在病毒对照孔中观察到最大CPE。然后在37℃的5％CO₂培养箱中将板用0.011％中性红染色约2小时。通过完全抽吸除去中性红培养基，并用磷酸盐缓冲溶液(PBS)冲洗细胞1次以除去残留的染料。完全除去PBS，用50％Sorensen柠檬酸盐缓冲液/50％乙醇(pH 4.2)洗脱掺入的中性红至少30分钟。中性红色染料可以渗透到活细胞中，因此红色越强，孔中存在的活细胞数越多。使用96孔分光光度计在540nm波长下定量每个孔中的染料含量。使用基于Microsoft Excel计算机的电子表格将每组孔中的染料含量转换为未处理对照孔中存在的染料百分比。然后通过线性回归分析计算50％有效(EC₅₀，病毒抑制)浓度和50％细胞毒性(CC₅₀，细胞抑制)浓度。CC₅₀除以EC₅₀的商给出选择性指数(SI)值。

继发性CPE/病毒产量减少(VYR)测定。该测定涉及与在前面段落中描述的使用96孔细胞微孔板的方法类似。本节中注明了差异。测试八个半log₁₀浓度的抑制剂以分析抗病毒活性和细胞毒性。在发生足够的病毒复制后，从每个感染的孔中取出上清液样品(合并三个重复孔)并保留用于该测试的VYR部分(如果需要)。或者，可制备单独的板，并且可将板冷冻用于VYR测定。观察到最大CPE后，将活板用中性红染料染色。如上所述定量掺入的染料含量。从该部分测试产生的数据是中性红EC₅₀、CC₅₀和SI值。通过VYR测定进一步评估上文观察到活性的化合物。VYR测试直接测定测试化合物抑制病毒复制的程度。滴定在测试化合物存在下复制的病毒，并与来自未处理的感染对照的病毒进行比较。通过终点稀释进行合并的病毒样品(如上所述收集)的滴定。这是通过用终点稀释在新鲜单层细胞上使用每种稀释液的3或4个微孔来滴定病毒的log₁₀稀释液来实现的。在观察到不同的CPE(通过中性红摄取测量)后，对孔进行评分以确定是否存在病毒。绘制抑制剂浓度的log₁₀与每种浓度下产生的病毒的log₁₀的曲线，允许通过线性回归计算90％(一个log₁₀)有效浓度。EC₉₀除以在测定的第1部分中获得的CC₅₀，得到该测试的SI值。

实施例70.

(2)拉沙热病毒(LASV)的筛查测定

原发性拉沙热病毒测定。在12孔一次性细胞培养板中制备汇合或接近汇合的细胞培养单层。将细胞维持在补充有10％FBS的DMEM中。对于抗病毒测定，使用相同的培养基，但将FBS降至2％或更低并补充1％青霉素/链霉素。以四个log₁₀终浓度制备测试化合物，通常为0.1、1.0、10和100μg/ml或μM。病毒对照和细胞对照将与每个测试化合物同时运行。此外，使用与所述病毒和细胞对照相同的实验设置来测试已知的活性药物作为阳性对照药物。每次测试运行都测试阳性对照。通过首先从12孔细胞板中除去生长培养基，并用0.01MOI的LASV株Josiah感染细胞来建立测定。在以下条件下将细胞温育90分钟：500μl接种物/M12孔，37℃，5％CO₂，恒定温和摇动。将除去接种物并将细胞用培养基洗涤2次。然后将测试化合物施加到总体积为1ml的培养基中。将在适当的时间点收集组织培养上清液(TCS)。然后将TCS用于确定化合物对病毒复制的抑制作用。滴定在测试化合物存在下复制的病毒，并与来自未处理的感染对照的病毒进行比较。对于TCS的滴定，将制备连续的十倍稀释液并将其用于感染新鲜的细胞单层。将用1％琼脂糖(其以1∶1与补充有10％FBS和1％青霉素的2XMEM混合)覆盖细胞，并测定噬斑数。绘制抑制剂浓度的log₁₀与每种浓度下产生的病毒的log₁₀的曲线，允许通过线性回归计算90％(一个log₁₀)有效浓度。

继发性拉沙热病毒测定。继发性测定涉及与在前面段落中描述的使用12孔细胞板的方法类似。本节中注明了差异。如上所述感染细胞，但这次用来覆盖细胞的1％琼脂糖以1∶1用2X MEM稀释并补充有2％FBS和1％青霉素/链霉素，并且补充有相应的药物浓度。将细胞在37℃和5％CO₂下培养6天。然后除去覆盖层，并在室温下将板用0.05％结晶紫的10％缓冲福尔马林溶液染色约20分钟。然后洗涤板，干燥并对噬斑数进行计数。将每组化合物稀释液中的噬斑数转换为相对于未处理的病毒对照的百分数。然后通过线性回归分析计算50％有效(EC50，病毒抑制)浓度。

实施例71.

(3)埃博拉病毒(EBOV)和尼帕病毒(NIV)的筛查测定

原发性Ebola/Nipah病毒测定。进行四个浓度的噬斑减少测定。在12孔一次性细胞培养板中制备汇合或接近汇合的细胞培养单层。将细胞维持在补充有10％FBS的DMEM中。对于抗病毒测定，使用相同的培养基，但将FBS降至2％或更低并补充1％青霉素/链霉素。以四个log₁₀终浓度制备测试化合物，通常为0.1、1.0、10和100μg/ml或μM。病毒对照和细胞对照将与每个测试化合物同时运行。此外，使用与所述病毒和细胞对照相同的实验设置来测试已知的活性药物作为阳性对照药物。每次测试运行都测试阳性对照。通过首先从12孔细胞板中除去生长培养基来建立测定。然后以2×浓度将测试化合物以0.1ml体积施加到孔中。将通常在0.1ml体积中为约200噬斑形成单位的病毒置于指定用于病毒感染的那些孔中。将没有病毒的培养基置于毒性对照孔和细胞对照孔中。用病毒类似地处理病毒对照孔。将板在37℃和5％CO₂下温育1小时。将除去病毒-化合物接种物，洗涤细胞并用1.6％黄蓍胶覆盖，该黄蓍胶以1∶1用2X MEM稀释并补充有2％FBS和1％青霉素/链霉素，并且补充有相应的药物浓度。将细胞在37℃和5％CO₂下温育10天。然后除去覆盖层，并在室温下将板用0.05％结晶紫的10％缓冲福尔马林溶液染色约20分钟。然后洗涤板，干燥并对噬斑数进行计数。将每组化合物稀释液中的噬斑数转换为相对于未处理的病毒对照的百分数。然后通过线性回归分析计算50％有效(EC₅₀，病毒抑制)浓度。

用VYR组分进行继发性Ebola/NIpah病毒测定。继发性测定涉及与在前面段落中描述的使用12孔细胞板的方法类似。本节中注明了差异。测试八个半log₁₀浓度的抑制剂以分析抗病毒活性。每批评估的化合物都要测试一种阳性对照药物。对于该测定，用病毒感染细胞。如上所述感染细胞，但这次用补充有2％FBS和1％青霉素/链霉素并补充有相应的药物浓度的DMEM来温育细胞。将细胞在37℃和5％CO₂下温育10天，每天在显微镜下观察绿色荧光细胞的数量。每天从感染细胞取出上清液的等分试样，合并三个重复孔。然后将合并的上清液用于测定化合物对病毒复制的抑制作用。滴定在测试化合物存在下复制的病毒，并与来自未处理的感染对照的病毒进行比较。对于合并的病毒样品的滴定，将制备连续的十倍稀释液并将其用于感染新鲜的细胞单层。将用黄蓍胶覆盖细胞并测定噬斑数。绘制抑制剂浓度的log₁₀与每种浓度下产生的病毒的log₁₀的曲线，允许通过线性回归计算90％(一个log₁₀)有效浓度。

实施例72.

抗登革热病毒细胞保护测定：

细胞制备-将BHK21细胞(叙利亚金仓鼠肾细胞，ATCC目录号CCL-I0)、Vero细胞(非洲绿猴肾细胞，ATCC目录号CCL-81)或Huh-7细胞(人肝细胞癌)在T-75烧瓶中补充有10％FBS、2mM L-谷氨酰胺、100U/mL青霉素和100μg/mL链霉素的DMEM中传代，然后用于抗病毒测定。在测定前一天，将细胞以1∶2分开，以确保它们在感染时处于指数生长期。使用血细胞计数器和台盼蓝拒染法进行总细胞定量和活力定量。对于要在测定中使用的细胞，细胞活力大于95％。将细胞以每个孔3×10³(Vero细胞和Huh-7细胞为5×10⁵)个细胞重新悬浮于组织培养基中，并以100μL的体积加入平底微量滴定板中。将板在37℃/5％CO₂下温育过夜以使细胞粘附。观察到单层约70％汇合。

病毒制备-登革热病毒2型新几内亚C株从ATCC(目录号VR-1584)获得，并使其在LLC-MK2(恒河猴肾细胞，目录号CCL-7.1)细胞中生长以产生储用病毒库。从冰箱(-80℃)中取出在BHK21细胞中预滴定的等分病毒，并使其在生物安全柜中缓慢解冻至室温。将病毒重新悬浮并稀释到测定培养基(补充有2％热灭活FBS、2mM L-谷氨酰胺、100U/mL青霉素和100μg/mL链霉素的DMEM)中，使得以100μL的体积加入每个孔中的病毒量是确定在感染后6天产生85-95％细胞杀伤的量。

板布置-每个板包含细胞对照孔(只有细胞)、病毒对照孔(细胞加病毒)、每种化合物的一式三份药物毒性孔(只有细胞加药物)，以及一式三份实验孔(药物加细胞加病毒)。

功效和毒性XTT-在37℃、5％CO₂培养箱中温育后，将测试板用四唑鎓染料XTT(2，3-双(2-甲氧基-4-硝基-5-磺基苯基)-5-[(苯基氨基)羰基]-2H-氢氧化四唑鎓)染色。XTT-四唑鎓被代谢活性细胞的线粒体酶代谢成可溶性甲瓒产物，从而允许快速定量分析抗病毒测试物质对病毒诱导的细胞杀伤的抑制。每天制备XTT溶液，其为RPMI 1640中的1mg/mL储备液。在PBS中以0.15mg/mL制备吩嗪硫酸甲酯(PMS)溶液，并在-20℃下避光保存。在使用前立即通过向每ml XTT溶液中加入40μL PMS来制备XTT/PMS储备液。将50微升TXT/PMS加入板的每个孔中，并将板在37℃下再温育4小时。将板用胶板密封件密封，并轻轻摇动或倒置数次以混合可溶性甲瓒产物，用Molecular Devices Vmax酶标仪在450/650nm下采用分光光度法读板。

数据分析-从Softmax Pro 4.6软件收集原始数据并将其导入Microsoft Excel电子表格进行分析。计算每种化合物与未处理的病毒对照相比的病毒致细胞病变效应的降低百分比。将药物处理的未感染细胞与单独培养基中的未感染细胞进行比较，计算每种化合物的细胞百分比对照值。

实施例73.

抗RSV细胞保护测定：

细胞制备-将HEp2细胞(人上皮细胞，ATCC目录号CCL-23)在T-75烧瓶中补充有10％FBS、2mM L-谷氨酰胺、100U/mL青霉素、100μg/mL链霉素、1mM丙酮酸钠和0.1mM NEAA的DMEM中传代，然后用于抗病毒测定。在测定前一天，将细胞以1∶2分开，以确保它们在感染时处于指数生长期。使用血细胞计数器和台盼蓝拒染法进行总细胞定量和活力定量。对于要在测定中使用的细胞，细胞活力大于95％。将细胞以每个孔1×10⁴个细胞重新悬浮于组织培养基中，并以100μL的体积加入平底微量滴定板中。将板在37℃/5％CO₂下温育过夜以使细胞粘附。病毒制备-RSV株Long和RSV株9320从ATCC(目录号分别为VR-26和VR-955)获得，并使其在HEp2细胞中生长以产生储用病毒库。从冰箱(-80℃)中取出预滴定的等分病毒，并使其在生物安全柜中缓慢解冻至室温。将病毒重新悬浮并稀释到测定培养基(补充有2％热灭活FBS、2mM L-谷氨酰胺、100U/mL青霉素、100μg/mL链霉素、1mM丙酮酸钠和0.1mM NEAA的DMEM)中，使得以100μL的体积加入每个孔中的病毒量是确定在感染后6天产生85-95％细胞杀伤的量。功效和毒性XTT-如先前针对登革热细胞保护测定所述那样对板进行染色和分析。

实施例74.

抗流感病毒细胞保护测定：

细胞制备-将MOCK细胞(犬肾细胞，ATCC目录号CCL-34)在T-75烧瓶中补充有10％FBS、2mM L-谷氨酰胺、100U/mL青霉素、100μg/mL链霉素、1mM丙酮酸钠和0.1mM NEAA的DMEM中传代，然后用于抗病毒测定。在测定前一天，将细胞以1∶2分开，以确保它们在感染时处于指数生长期。使用血细胞计数器和台盼蓝拒染法进行总细胞定量和活力定量。对于要在测定中使用的细胞，细胞活力大于95％。将细胞以每个孔1×10⁴个细胞重新悬浮于组织培养基中，并以100μL的体积加入平底微量滴定板中。将板在37℃/5％CO₂下温育过夜以使细胞粘附。

病毒制备-流感A/PR/8/34(ATCC目录号VR-95)、A/CA/05/09(CDC)、A/NY/18/09(CDC)和A/NWS/33(ATCC目录号VR-219)株从ATCC或从疾病控制中心获得，并使其在MDCK细胞中生长以产生储用病毒库。从冰箱(-80℃)中取出预滴定的等分病毒，并使其在生物安全柜中缓慢解冻至室温。将病毒重新悬浮并稀释到测定培养基(补充有0.5％BSA、2mM L-谷氨酰胺、100U/mL青霉素、100μg/mL链霉素、1mM丙酮酸钠、0.1mM NEAA和1μg/ml TPCK处理的胰蛋白酶的DMEM)中，使得以100μL的体积加入每个孔中的病毒量是确定在感染后4天产生85-95％细胞杀伤的量。功效和毒性XTT-如先前针对登革热细胞保护测定所述那样对板进行染色和分析。

实施例75.

抗丙型肝炎病毒测定：

细胞培养-报告细胞系Huh-luc/neo-ET由ImQuest BioSciences通过特定许可协议从Ralf Bartenschlager博士(德国海德堡大学卫生研究所分子病毒学系)获得。该细胞系含有持续复制的I₃₈₉luc-ubi-neo/NS3-3′/ET复制子(其包含萤火虫荧光素酶基因-遍在蛋白-新霉素磷酸转移酶融合蛋白)和EMCV IRES驱动的NS3-5B HCV编码序列(其包含ET组织培养适应性突变(E1202G、Tl2081和K1846T))。通过在补充有10％FCS、2mM谷氨酰胺、青霉素(100μU/mL)/链霉素(100μg/mL)和1×非必需氨基酸以及1mg/mL G418的DMEM中培养扩增Huh-luc/neo-ET的储用培养物。将细胞以1∶4分开并在加入250μg/mL G418的相同培养基中培养两代。用胰蛋白酶处理细胞，并用台盼蓝染色计数，并且以每个孔7.5×10³个细胞的细胞培养密度接种到96孔组织培养板中，在37℃、5％CO₂下温育24小时。温育24小时后，除去培养基并用不含G418但加入测试化合物的相同培养基一式三份地替换。每个板中有六个孔只接受培养基作为未处理对照。将细胞在37℃、5％CO₂下再温育72小时，然后通过荧光素酶终点测量抗HCV活性。同时对重复板进行处理和温育，以通过XTT染色评估细胞毒性。

细胞活力-将来自处理细胞的细胞培养单层用四唑鎓染料XTT染色，以评估存在化合物时Huh-luc/neo-ET报告细胞系的细胞活力。

病毒复制的测量-根据制造商说明书(Perkin Elmer，Shelton，CT)，使用britelite plus发光报道基因试剂盒通过荧光素酶活性测量来自复制子测定系统的HCV复制。简而言之，将一小瓶的britelite plus冻干底物溶于10mL britelite重构缓冲液中并通过倒置轻轻混合。在室温下温育5分钟后，将britelite plus试剂以每孔100μL加入96孔板中。将板用胶膜密封，并在室温下温育约10分钟以裂解细胞。将孔内容物转移到白色96孔板中，并使用Wallac 1450Microbeta Trilux液体闪烁计数器在15分钟内测量发光。将数据导入定制的Microsoft Excel 2007电子表格以确定50％病毒抑制浓度(EC₅₀)。

实施例76.

抗副流感病毒3细胞保护测定：

细胞制备-将HEp2细胞(人上皮细胞，ATCC目录号CCL-23)在T-75烧瓶中补充有10％FBS、2mM L-谷氨酰胺、100U/mL青霉素、100μg/mL链霉素、1mM丙酮酸钠和0.1mM NEAA的DMEM中传代，然后用于抗病毒测定。在测定前一天，将细胞以1∶2分开，以确保它们在感染时处于指数生长期。使用血细胞计数器和台盼蓝拒染法进行总细胞定量和活力定量。对于要在测定中使用的细胞，细胞活力大于95％。将细胞以每个孔1×10⁴个细胞重新悬浮于组织培养基中，并以100μL的体积加入平底微量滴定板中。将板在37℃/5％CO₂下温育过夜以使细胞粘附。

病毒制备-副流感病毒3型SF4株从ATCC(目录号VR-281)获得，并使其在HEp2细胞中生长以产生储用病毒库。从冰箱(-80℃)中取出预滴定的等分病毒，并使其在生物安全柜中缓慢解冻至室温。将病毒重新悬浮并稀释到测定培养基(补充有2％热灭活FBS、2mM L-谷氨酰胺、100U/mL青霉素和100μg/mL链霉素的DMEM)中，使得以100μL的体积加入每个孔中的病毒量是确定在感染后6天产生85-95％细胞杀伤的量。

板布置-每个板包含细胞对照孔(只有细胞)、病毒对照孔(细胞加病毒)、每种化合物的一式三份药物毒性孔(只有细胞加药物)，以及一式三份实验孔(药物加细胞加病毒)。功效和毒性XTT-在37℃、5％CO₂培养箱中温育后，将测试板用四唑鎓染料XTT(2，3-双(2-甲氧基-4-硝基-5-磺基苯基)-5-[(苯基氨基)羰基]-2H-氢氧化四唑)染色。XTT-四唑鎓被代谢活性细胞的线粒体酶代谢成可溶性甲瓒产物，从而允许快速定量分析抗病毒测试物质对病毒诱导的细胞杀伤的抑制。每天制备XTT溶液，其为RPMI1640中的1mg/mL储备液。在PBS中以0.15mg/mL制备吩嗪硫酸甲酯(PMS)溶液，并在-20℃下避光保存。在使用前立即通过向每ml XTT溶液中加入40μL PMS来制备XTT/PMS储备液。将50微升XTT/PMS加入板的每个孔中，并将板在37℃下再温育4小时。将板用胶板密封件密封，并轻轻摇动或倒置数次以混合可溶性甲瓒产物，用Molecular Devices Vmax酶标仪在450/650nm下采用分光光度法读板。

实施例77.

流感聚合酶抑制测定：

病毒制备-纯化的流感病毒A/PR/8/34(1ml)从Advanced Biotechnologies，Inc.(Columbia，MD)获得，将其解冻并分配成5个等分试样，在-80℃下储存直至使用。在测定设置当天，将20μL 2.5％Triton N-101加入180μL纯化病毒中。将被破坏的病毒以1∶2在含有0.25％Triton和PBS的溶液中稀释。破坏作用提供了含有流感RNA依赖性RNA聚合酶和模板RNA的流感核糖核蛋白(RNP)的来源。将样品存储在冰上直至用于测定。

聚合酶反应-每个50μL聚合酶反应含有以下物质：5μL被破坏的RNP、100mM Tris-HCl(pH8.0)、100mM KCl、5mM MgCl₂、1mM二硫苏糖醇、0.25％Triton N-101，5μCi[α-³²P]GTP、100μM ATP、各50μM(CTP、UTP)、1μM GTP和200μM腺嘌呤(3′-5′)鸟苷。为了测试抑制剂，反应含有抑制剂，并且对含有阳性对照(2′-脱氧-2′-氟代鸟苷-5′-三磷酸酯)的反应也是一样。其他对照包括RNP+反应混合物和RNP+1％DMSO。将不含ApG引物和NTP的反应混合物在30℃下温育20分钟。一旦将ApG和NTP加入反应混合物中，将样品在30℃下温育1小时，然后立即将反应物转移到玻璃纤维滤板上，随后用10％三氯乙酸(TCA)沉淀。然后将板用5％TCA洗涤五次，然后用95％乙醇洗涤一次。过滤器干燥后，使用液体闪烁计数器(Micro beta)测量[α-³²P]GTP的掺入。

板布置-除了RNP+反应混合物(仅有RNP)、RNP+1％DMSO和单独的反应混合物(无RNP)的一式三份样品之外，每个测试板包含三种化合物(6种浓度)的一式三份样品。

数据分析-从Micro Beta闪烁计数器收集原始数据。放射性GTP的掺入直接与聚合酶活性水平相关。通过将每种测试化合物的平均值除以RNP+1％DMSO对照获得“抑制百分比值”。将在每种2DFGTP浓度下获得的平均值与RNP+反应对照进行比较。然后将数据导入Microsoft Excel电子表格，通过线性回归分析计算IC₅₀值。

实施例78.

HCV聚合酶抑制测定：

使用先前描述的方法评估化合物抑制HCV聚合酶的活性(Lam等人，2010年，“Antimicrobial Agents and Chemotherapy”，第54卷第8期，第3187-3196页)。HCV NS5B聚合酶测定在96孔反应板中以20μL体积进行。每个反应在50mM HEPES缓冲液(pH7.5)中含有40ng/μL纯化的重组NS5Bδ22基因型1b聚合酶、20ng/μL HCV基因型1b互补IRES模板、4种天然核糖核苷酸各1μM、1U/mL Optizyme RNAse抑制剂(Promega，Madison，WI)、1mM MgCl₂、0.75mM MnCl₂和2mM二硫苏糖醇(DTT)。将反应混合物分两步在冰上加入。第1步包括将除天然核苷酸和标记的UTP之外的所有反应组分混合在聚合酶反应混合物中。将10微升(10μL)聚合酶混合物在冰上分配到96孔反应板的各个孔中。不含NS5B聚合酶的聚合酶反应混合物作为无酶对照。在水中制备测试化合物和对照化合物即2′-O-甲基-CTP和2′-O-甲基-GTP(Trilink，San Diego，CA)的连续半对数稀释液，并且将5μL连续稀释的化合物或单独的水(无化合物对照)加入含有聚合酶混合物的孔中。然后将5微升核苷酸混合物(天然核苷酸和标记的UTP)加入反应板孔中，并将板在27℃下温育30分钟。加入80μL终止溶液(12.5mMEDTA、2.25M NaCl和225mM柠檬酸钠)淬灭反应，并使用斑点印迹装置在真空压力下将RNA产物施加到Hybond-N+膜(GE Healthcare，Piscataway，N.J)上。从斑点印迹装置中取出膜，用4×SSC(0.6M NaCl和60mM柠檬酸钠)洗涤4次，然后用水冲洗一次，用100％乙醇冲洗一次。将膜风干并暴露于磷光成像屏，并使用Typhoon 8600 Phospho成像仪捕获图像。捕获图像后，将膜与闪烁液一起置于Micro beta盒中，并在Micro beta 1450上对每个反应中的CPM进行计数。将CPM数据导入自定义Excel电子表格以确定化合物IC₅₀。

实施例79.

NS5B RNA依赖性RNA聚合酶反应条件

测定化合物对HCV GT-1b Con-1的NS5B-δ21的抑制作用。反应包括纯化的重组酶、1u/μL负链HCV IRES RNA模板以及1μM包括[³²P]-CTP或[³²P]-UTP的NTP底物。将测定板在27℃下温育1小时，然后淬灭。通过过滤器结合法评估[³²P]掺入大分子产物中的情况。

实施例80.

人DNA聚合酶抑制测定：

人DNA聚合酶α(目录号1075)、β(目录号1077)和γ(目录号1076)购自CHIMERx(Madison，WI)。在微量滴定板中在50uL反应混合物中测定β和γDNA聚合酶活性的抑制，所述反应混合物含有50mM Tris-HCl(pH8.7)、KCl(β为10mM，γ为100mM)、10mM MgCl₂、0.4mg/mL BSA、1mM DTT、15％甘油、0.05mM dCTP、dTTP和dATP、10uCi[³²P]-α-dGTP(800Ci/mmol)、20ug活化的小牛胸腺DNA和指定浓度的测试化合物。αDNA聚合酶反应混合物在每个样品的50uL体积中如下：20mM Tris-HCl(pH8)、5mM乙酸镁、0.3mg/mL BSA、1mM DTT、0.1mM精胺、0.05mM dCTP、dTTP和dATP、10uCi[³²P]-α-dGTP(800Ci/mmol)、20ug活化的小牛胸腺DNA和指定浓度的测试化合物。对于每个测定，使酶反应在37℃下进行30分钟，然后转移到玻璃纤维滤板上，随后用10％三氯乙酸(TCA)沉淀。然后将板用5％TCA洗涤，然后用95％乙醇洗涤一次。过滤器干燥后，使用液体闪烁计数器(Microbeta)测量放射性的掺入。

实施例81.

HIV感染的PBMC测定：

新鲜的人外周血单核细胞(PBMC)从商业来源(Biological Specialty)获得，并且其被确定为HIV和HBV血清阴性。根据所接受的供体血液的体积，用PBS洗涤带有白细胞的血细胞数次。洗涤后，将带有白细胞的血液以1∶1用Dulbecco磷酸盐缓冲盐水(PBS)稀释，并在50ml锥形离心管中用15mL Ficoll-Hypaque密度梯度分层。将这些管在600g下离心30分钟。从所得界面轻轻吸出带状PBMC，并用PBS洗涤三次。最后一次洗涤后，通过台盼蓝拒染法测定细胞数，并且将细胞以1×10^6个细胞/mL重悬于含有15％胎牛血清(FBS)、2mmol/L L-谷氨酰胺、2ug/mL PHA-P、100U/mL青霉素和100ug/mL链霉素的RPMI 1640中，并在37℃下温育48至72小时。温育后，将PBMC离心并重悬于组织培养基中。通过每3天用新鲜的含IL-2的组织培养基对半体积培养物进行更换，保持培养物直至使用。在PHA-P刺激后72小时用PBMC开始测定。

为了使供体可变性产生的影响最小化，测定中使用的PBMC是来自3个供体的细胞混合物。在即将使用之前，将靶细胞以1×10^6个细胞/mL重悬于新鲜组织培养基中，并以50uL/孔接种于96孔圆底微量滴定板的内孔中。然后，将100uL 2×浓度的含化合物的培养基转移到含50uL培养基中的细胞的96孔板中。AZT用作内部测定标准。

向孔中加入测试化合物后，加入50uL预定稀释度的HIV病毒(由4×最终所需孔内浓度制备)，并充分混合。对于感染，每个孔加入50-150TCID₅₀的每种病毒(最终MOI为约0.002)。将PBMC一式三份暴露于病毒，并在存在或不存在测试物质的情况下以不同浓度培养，如上文在96孔微量滴定板中所述。培养7天后，通过测量逆转录酶(RT)活性在组织培养上清液中定量HIV-1复制。细胞和病毒的孔仅作为病毒对照。对于药物细胞毒性研究，在没有病毒的情况下相同地制备单独的板。

逆转录酶活性测定-使用标准放射性掺入聚合测定法在无细胞上清液中测量逆转录酶活性。氚化胸苷三磷酸(TTP；New England Nuclear)以1Ci/mL购买，每次酶反应使用1uL。通过将0.5mg/mL聚rA和1.7U/mL oligo dT在蒸馏水中混合制备rAdT储备溶液，并将其储存在-20℃。每天新鲜制备RT反应缓冲液，其包括125uL 1mol/L EGTA、125uL dH₂O、125uL20％Triton X-100、50uL 1mol/L Tris(pH7.4)、50uL 1mol/L DTT和40uL 1mol/L MgCl₂。对于每个反应，将1uL TTP、4uL dH₂O、2.5uL rAdT和2.5uL反应缓冲液混合。将10微升该反应混合物置于圆底微量滴定板中，加入15uL含病毒的上清液并混合。将板在37℃下在潮湿的培养箱中温育90分钟。温育后，将10uL反应体积以适当的板布置点在DEAE滤垫上，用5％磷酸钠缓冲液洗涤5次(每次5分钟)，用蒸馏水洗涤2次(每次1分钟)，用70％乙醇洗涤2次(每次1分钟)，然后风干。将干燥的滤垫置于塑料套管中，并向套管中加入4mL Opti-FluorO。使用Wallac 1450 Microbeta Trilux液体闪烁计数器定量掺入的放射性。

实施例82.

HBV：

将含有10％胎牛血清的RPMI1640培养基中的HepG2.2.15细胞(100μL)以1×10⁴个细胞/孔的密度加入96孔板的所有孔中，并将板在37℃、5％CO₂的环境中温育24小时。温育后，将在含有10％胎牛血清的RPMI1640培养基中制备的六个10倍连续稀释度的测试化合物一式三份加入板的各个孔中。板中有六个孔只接受培养基作为仅有病毒的对照。将板在37℃、5％CO₂的环境中温育6天。在第3天用含有指定浓度的每种化合物的培养基更换培养基。从每个孔收集100微升上清液用于通过qPCR分析病毒DNA，并在第6天通过细胞培养单层的XTT染色评估细胞毒性。

将第6天收集的10微升细胞培养上清液在qPCR稀释缓冲液(40μg/mL剪切的鲑鱼精子DNA)中稀释并煮沸15分钟。使用Applied Biosystems 7900HT序列检测系统和支持SDS2.4软件在386孔板中进行定量实时PCR。使用Platinum Quantitative PCR SuperMix-UDG(Invitrogen)和特异DNA寡核苷酸引物(IDT，Coralville，ID)HBV-AD38-qF1(5′-CCG TCTGTG CCT TCT CAT CTG-3′)、HBV-AD38-qR1(5′-AGT CCA AGA GTY CTC TTA TRY AAG ACCTT-3′)和HBV-AD38-qP1(5′-FAM CCG TGT GCA/ZEN/CTT CGC TTC ACC TCT GC-3′BHQ1)对每个样品的5微升(5μL)煮沸DNA和定量DNA标准品的连续10倍稀释液进行实时Q-PCR，每个引物的最终浓度为0.2μM，总反应体积为15μL。通过SDS.24软件从标准曲线中插入每个样品中的HBV DNA拷贝数，并将数据导入Excel电子表格进行分析。

通过测量处理的组织培养板中四唑鎓染料XTT的减少来得到测试物质的50％细胞毒性浓度。XTT被线粒体酶NADPH氧化酶代谢成代谢活性细胞中的可溶性甲瓒产物。每天制备XTT溶液，其为PBS中的1mg/mL储备液。在PBS中以0.15mg/mL制备吩嗪硫酸甲酯(PMS)储备溶液，并在-20℃下避光保存。在使用前立即通过向每1mL XTT溶液中加入40μL PMS来制备XTT/PMS溶液。将50微升XTT/PMS加入板的每个孔中，并将板在37℃下温育2至4小时。根据经验确定2至4小时温育在XTT染料减少的线性响应范围内，每次测定指定了细胞数量。使用胶板密封件代替盖子，将密封的板倒置数次以混合可溶性甲瓒产物，并用Molecular DevicesSpectraMax Plus 384分光光度计在450nm(参考波长为650nm)下读板。通过Softmax 4.6软件收集数据，并将其导入Excel电子表格进行分析。

实施例83.

登革热RNA依赖性RNA聚合酶反应条件

在1.5ml管中使用100μl反应混合物在30℃下进行RNA聚合酶测定。最终反应条件为50mM Hepes(pH7.0)、2mM DTT、1mM MnCl₂、10mM KCl、100nM UTR-Poly A(自退火引物)、10μM UTP、26nM RdRp酶。将含有不同化合物(抑制剂)的反应混合物在30℃下温育1小时。为了评估聚合酶反应期间产生的焦磷酸盐的量，将30μl聚合酶反应混合物与荧光素酶偶联酶反应混合物(70μl)混合。荧光素酶反应的最终反应条件为5mMMgCl₂、50mM Tris-HCl(pH7.5)、150mM NaCl、200μU ATP硫酸化酶、5μM APS、10nM荧光素酶、100μM D-荧光素。将含有反应样品(100μl)的白色板立即转移到发光计Veritas(Turner Biosystems，CA)中检测光信号。

实施例84.

细胞培养和分析的程序

将Huh-7细胞以0.5×10^6个细胞/孔接种在12孔组织培养物处理的板中的1mL完全培养基中。使细胞在37℃/5％CO₂下粘附过夜。在100％DMSO中制备40μM测试物品的储备溶液。从40μM储备溶液中，制备测试物品在25ml完全DMEM培养基中的20μM溶液。对于化合物处理，从孔中吸出培养基，并将1mL 20μM溶液在完全DMEM培养基中加入适当的孔中。还制备了单独的“未”添加化合物的细胞板。将板在37℃/5％CO₂下温育以下时间：1、3、6和24小时。在温育所需时间后，将细胞用1mL DPBS洗涤2次。通过向用测试物品处理的每个孔中加入500μl加有内标的70％甲醇/30％水来提取细胞。用每孔500ul 70％甲醇/30％水萃取未处理的空白板。将样品在4℃下以16,000rpm离心10分钟。使用具有Hypercarb(PGC)柱的ABSCIEX 5500 QTRAP LC-MS/MS系统通过LC-MS/MS分析样品。

实施例85.

寨卡RNA依赖性RNA聚合酶反应条件

在1.5ml管中使用100μl反应混合物在30℃下进行RNA聚合酶测定。最终反应条件为50mM Hepes(pH 7.0)、2mM DTT、1mM MnCl₂、10mM KCl、100nM UTR-Poly A(自退火引物)、10μM UTP、26nM RdRp酶。将含有不同化合物(抑制剂)的反应混合物在30℃下温育1小时。为了评估聚合酶反应期间产生的焦磷酸盐的量，将30μl聚合酶反应混合物与荧光素酶偶联酶反应混合物(70μl)混合。荧光素酶反应的最终反应条件为5mM MgCl₂、50mM Tris-HCl(pH7.5)、150mM NaCl、200μU ATP硫酸化酶、5μM APS、10nM荧光素酶、100μM D-荧光素。将含有反应样品(100μl)的白色板立即转移到发光计Veritas(Turner Biosystems，CA)中检测光信号。

实施例86.

寨卡感染测定条件

将Vero细胞在T-75烧瓶中的DMEM培养基中传代，然后用于抗病毒测定。在测定前一天，将细胞以1∶2分开，以确保它们在感染时处于指数生长期。将细胞以每个孔5×10³个细胞重新悬浮于组织培养基中，并以100uL的体积加入平底微量滴定板中。将板在37℃/5％CO₂下温育过夜以使细胞粘附。另外，在LLCMK2细胞中滴定寨卡病毒以定义用于抗病毒测定的接种物。将病毒在DMEM培养基中稀释，使得以100mL的体积加入每个孔中的病毒量是确定在感染后5天达到85-95％细胞杀伤的量。温育后，将测试板用XTT染料染色。每天制备XTT溶液，其为RPMI1640中的1mg/mL储备溶液。在PBS中以0.15mg/mL制备PMS溶液，并在-20℃下避光保存。在使用前立即通过向每mL XTT溶液中加入40mL PMS来制备XTT/PMS储备液。将50微升XTT/PMS加入板的每个孔中，并将板在37℃下再温育4小时。将板用胶板密封件密封，并轻轻摇动以混合可溶性甲瓒产物，用Molecular Devices Vmax酶标仪在450/650nm下采用分光光度法读板。从Softmax Pro收集原始数据，并将其导入Microsoft Excel XLfit4电子表格，使用四参数曲线拟合计算进行分析。

实施例87.

线粒体RNA聚合酶测定

POLRMT酶纯化

从POLRMT cDNA质粒(登录号：BC098387，克隆号：5264127，Dharmacon，CO)扩增人POLRMT编码序列的变体，并在tac启动子的控制下将其克隆到pMal-c5X载体中。对于蛋白质表达，将质粒转化到Stellar感受态细胞(Clontech)中。表达载体pMal-c5X含有lacI基因，该基因允许在Stellar细胞中诱导表达POLRMT。使转化的细胞在35℃下在含有100μg/ml氨苄青霉素的LB培养基中生长至600nm下的光密度为1。将细胞在4℃冰箱中冷却1小时。加入MgCl₂至最终浓度为1mM。通过加入0.4mM IPTG在16℃下过夜诱导蛋白质表达。通过在4℃下以4000×g离心20分钟收获细胞。将细胞沉淀储存在-80℃直至进一步处理。对于蛋白质纯化，将细胞沉淀重悬于超声缓冲液(20mM Tris-HCl pH 7.5、10％甘油、500mM NaCl、0.5％Triton X-100、10mM DTT、10mM MgCl₂、30mM咪唑和1×蛋白酶抑制剂混合物)中。使用超声探针超声波仪在冰上破碎细胞10分钟。通过在4℃下以16,000×g离心20分钟澄清细胞提取物。将上清液与HisPur Ni-NTA琼脂糖树脂一起温育，在4℃下温和摇动15分钟。然后将树脂用10体积的含有30mM咪唑的洗涤缓冲液(20mM Tris-HCl pH 7.5、10％甘油、500mM NaCl、0.1％Triton X-100、1mM DTT、2mM MgCl₂)洗涤5次，然后用含有2M NaCl的洗涤缓冲液一次。用1体积的洗脱缓冲液(20mM Tris-HCl pH 7.5、10％甘油、50mM NaCl、0.5％Triton X-100、10mM DTT和300mM咪唑)从树脂上洗脱蛋白质。将洗脱的酶调节至50％甘油并在使用前储存在-80℃。通过质谱法进行蛋白质鉴定。使用BSA(Sigma，St.Louis，MO)作为标准，通过SDS-PAGE测量靶蛋白的浓度。

核糖核苷酸类似物掺入效率的测量

设计了不同的模板来测试各个类似物rNTP，见表1。在反应缓冲液(5mM Tris-HClpH 7.5、10mM DTT、20mM MgCl₂、0.5％X-100，10％甘油)中，将不同浓度的测试核糖核苷酸类似物加入含有10nM P/T和20nM POLRMT的反应混合物中引发反应。使反应在22℃下继续不同的时间，然后用淬灭缓冲液(8M尿素、90mM Tris碱、29mM牛磺酸、10mM EDTA、0.02％SDS和0.1％溴酚蓝)淬灭反应。将淬灭的样品在95℃下变性15分钟，并使用20％变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(尿素PAGE)在1×TTE缓冲液(90mM Tris碱、29mM牛磺酸和0.5mM EDTA)中分离引物延伸产物。电泳后，使用Odyssey红外成像系统扫描凝胶。使用Image Studio SoftwareLite 4.0版量化不同RNA条带的强度。通过测量K_1/2和相应的鉴别值(参考G Lu)评估不同rNTP类似物的掺入效率。

引物延伸聚合酶活性测定

使用荧光标记的RNA引物/DNA模板复合物在引物延伸反应中测定POLRMT聚合酶活性。典型的引物延伸反应在含有反应缓冲液(5mM Tris-HCl pH 7.5、10mM DTT、20mMMgCl₂、0.1％Triton X-100、0.01U RNasin、10％甘油)、10nM P/T复合物和20nM POLRMT的20μl反应混合物中进行。通过加入最终浓度为100μM的rNTP引发反应，然后在22℃下温育1小时。通过加入20μl淬灭缓冲液(8M尿素、90mM Tris碱、29mM牛磺酸、10mM EDTA、0.02％SDS和0.1％溴酚蓝)淬灭反应。将淬灭的样品在95℃下变性15分钟，并使用20％变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(尿素PAGE)在1×TTE缓冲液(90mM Tris碱、29mM牛磺酸和0.5mM EDTA)中分离引物延伸产物。电泳后，使用Odyssey红外成像系统(LI-COR Biosciences，Lincoln，NE)扫描凝胶。分析图像并使用Image Studio软件Lite 4.0版(LI-COR Biosciences，Lincoln，NE)定量合适的RNA条带。

实施例88.

ZIKV、DENV和POLRMT聚合酶测定结果

实施例89.

DENV测定结果

实施例90.

人鼻病毒测定结果

实施例91.

ZIKV测定结果

实施例92.

EIDD-02290的抗病毒测定结果

Claims

1.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R为OH、F、Cl、或NH₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

2.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R为OH、F、Cl、或NH₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

3.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R为OH、F、Cl、或NH₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

4.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

5.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

6.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

7.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

8.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

9.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

10.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

11.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

Y³为OH、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

12.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

13.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

14.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

15.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

R²为氢、甲基、氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、乙基、环丙基、氟、羟甲基、氨基甲基、乙烯基、或环丁基；R⁴为氢、甲基、乙基、异丙基、环戊基、环己基、新戊基、苄基、烷基、支链烷基、环烷基、或类脂；

16.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

Q为N或CR⁹；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

17.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe；

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

18.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

19.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

20.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

21.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

22.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

23.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

24.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

25.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

26.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

27.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

28.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

29.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

30.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

31.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe或OCH₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

32.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

33.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

34.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

35.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

36.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

37.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂或OCHMe；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

38.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

39.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

40.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

41.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

42.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

43.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

44.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

45.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

46.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

47.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

48.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

49.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

50.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

51.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

52.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂或OCHMe；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

53.一种选自以下的化合物：

54.一种选自以下的化合物：

55.一种选自以下的化合物：

56.一种选自以下的化合物：

57.一种选自以下的化合物：

58.一种选自以下的化合物：

59.一种选自以下的化合物：

60.一种选自以下的化合物：

61.一种选自以下的化合物：

62.一种选自以下的化合物：

63.一种选自以下的化合物：

64.一种选自以下的化合物：

65.一种选自以下的化合物：

66.一种选自以下的化合物：

67.一种选自以下的化合物：

68.一种选自以下的化合物：

69.一种选自以下的化合物：

70.一种选自以下的化合物：

71.一种选自以下的化合物：

72.一种选自以下的化合物：

73.一种选自以下的化合物：

74.一种选自以下的化合物：

75.一种选自以下的化合物：

76.一种选自以下的化合物：

77.一种选自以下的化合物：

78.一种选自以下的化合物：

79.一种选自以下的化合物：

80.一种选自以下的化合物：

81.一种选自以下的化合物：

82.一种选自以下的化合物：

83.一种选自以下的化合物：

84.一种选自以下的化合物：

85.一种选自以下的化合物：

86.一种选自以下的化合物：

87.一种选自以下的化合物：

88.一种选自以下的化合物：

89.一种选自以下的化合物：

90.一种选自以下的化合物：

91.一种选自以下的化合物：

92.一种选自以下的化合物：

93.一种选自以下的化合物：

94.一种选自以下的化合物：

95.一种选自以下的化合物：

96.一种选自以下的化合物：

97.一种选自以下的化合物：

98.一种选自以下的化合物：

99.一种选自以下的化合物：

100.一种选自以下的化合物：

101.一种选自以下的化合物：

102.一种选自以下的化合物：

103.一种选自以下的化合物：

104.一种选自以下的化合物：

105.一种选自以下的化合物：

106.一种选自以下的化合物：

107.一种选自以下的化合物：

108.一种选自以下的化合物：

109.一种选自以下的化合物：

110.一种选自以下的化合物：

111.一种选自以下的化合物：

112.一种选自以下的化合物：

113.一种选自以下的化合物：

114.一种选自以下的化合物：

115.一种选自以下的化合物：

116.一种选自以下的化合物：

117.一种选自以下的化合物：

118.一种选自以下的化合物：

119.一种选自以下的化合物：

120.一种选自以下的化合物：

121.一种选自以下的化合物：

122.一种选自以下的化合物：

123.一种选自以下的化合物：

124.一种选自以下的化合物：

125.一种选自以下的化合物：

126.一种选自以下的化合物：

127.一种选自以下的化合物：

128.一种选自以下的化合物：

129.一种选自以下的化合物：

130.一种选自以下的化合物：

131.一种选自以下的化合物：

132.一种选自以下的化合物：

133.一种选自以下的化合物：

134.一种选自以下的化合物：

135.一种选自以下的化合物：

136.一种选自以下的化合物：

137.一种选自以下的化合物：

138.一种选自以下的化合物：

139.一种选自以下的化合物：

140.一种选自以下的化合物：

141.一种选自以下的化合物：

142.一种选自以下的化合物：

143.一种选自以下的化合物：

144.一种选自以下的化合物：

145.一种选自以下的化合物：

146.一种选自以下的化合物：

147.一种选自以下的化合物：

148.一种选自以下的化合物：

149.一种选自以下的化合物：

150.一种选自以下的化合物：

151.一种选自以下的化合物：

152.一种选自以下的化合物：

153.一种选自以下的化合物：

154.一种选自以下的化合物：

155.一种选自以下的化合物：

156.一种选自以下的化合物：

157.一种选自以下的化合物：

158.一种选自以下的化合物：

159.一种选自以下的化合物：

160.一种选自以下的化合物：

161.一种选自以下的化合物：

162.一种选自以下的化合物：

163.一种选自以下的化合物：

164.一种选自以下的化合物：

165.一种选自以下的化合物：

166.一种选自以下的化合物：

167.一种选自以下的化合物：

168.一种选自以下的化合物：

169.一种选自以下的化合物：

170.一种选自以下的化合物：

171.一种选自以下的化合物：

172.一种选自以下的化合物：

173.一种选自以下的化合物：

174.一种选自以下的化合物：

175.一种选自以下的化合物：

176.一种选自以下的化合物：

177.一种选自以下的化合物：

178.一种选自以下的化合物：

179.一种选自以下的化合物：

180.一种选自以下的化合物：

181.一种选自以下的化合物：

182.一种选自以下的化合物：

183.一种选自以下的化合物：

184.一种选自以下的化合物：

185.一种选自以下的化合物：

186.一种选自以下的化合物：

187.一种选自以下的化合物：

188.一种选自以下的化合物：

189.一种选自以下的化合物：

190.一种选自以下的化合物：

191.一种选自以下的化合物：

192.一种选自以下的化合物：

193.一种选自以下的化合物：

194.一种选自以下的化合物：

195.一种选自以下的化合物：

196.一种选自以下的化合物：

197.一种药物组合物，所述药物组合物用于治疗或预防病毒感染，所述药物组合物包含根据权利要求1至196中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的载体。

198.根据权利要求197所述的药物组合物，其中所述病毒感染是由包含RNA病毒的感染剂引起的。

199.根据权利要求197所述的药物组合物，其中所述RNA病毒包括肝炎病毒。

200.根据权利要求197所述的药物组合物，其中所述RNA病毒包括黄病毒。

201.根据权利要求197所述的药物组合物，其中所述RNA病毒包括寨卡病毒。

202.一种脂质体组合物，所述脂质体组合物包含根据权利要求1至196中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的载体。

203.一种治疗或预防由RNA病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的根据权利要求1至196中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐。

204.根据权利要求203所述的方法，其中所述RNA病毒包括肝炎病毒。

205.根据权利要求203所述的方法，其中所述RNA病毒包括黄病毒。

206.根据权利要求203所述的方法，其中所述RNA病毒包括寨卡病毒。

207.根据权利要求203所述的方法，其中至少一种第二抗病毒剂选自ABT-450、ABT-267、ABT-333、ABT-493、ABT-530、阿巴卡韦、阿昔洛韦、阿昔洛韦、阿德福韦、金刚烷胺、安普那韦、安普利近、阿比朵尔、阿扎那韦、立普妥、博赛泼维、西多福韦、可比韦、达卡他韦、地瑞那韦、达塞布韦、地拉夫定、地达诺新、二十二烷醇、依度尿苷、依非韦伦、恩曲他滨、恩夫韦地、恩替卡韦、泛昔洛韦、福米韦生、夫沙那韦、膦甲酸、磷乙酸、更昔洛韦、伊巴他滨、异丙肌苷、疱疹净、咪喹莫特、茚地那韦、肌苷、III型干扰素、II型干扰素、I型干扰素、拉米夫定、雷迪帕韦、洛匹那韦、洛韦胺、马拉韦罗、吗啉胍、甲吲噻腙、奈非那韦、奈韦拉平、奈克沙韦、奥比他韦、奥司他韦、帕利瑞韦、聚乙二醇干扰素α-2a、喷昔洛韦、帕拉米韦、普拉康纳利、鬼臼毒素、雷特格韦、利巴韦林、金刚烷乙胺、利托那韦、嘧胺、沙奎那韦、西咪匹韦、索非布韦、司他夫定、特拉匹韦、替比夫定、替诺福韦、替诺福韦、替拉那韦、三氟尿苷、三协唯、曲金刚胺、特鲁瓦达、伐昔洛韦、缬更昔洛韦、维克韦罗、阿糖腺苷、维拉米定、扎西他滨、扎那米韦、或齐多夫定及其组合。

208.根据权利要求1至196所述的组合物，包含选自以下各项的至少一种第二抗病毒剂：ABT-450、ABT-267、ABT-333、ABT-493、ABT-530、阿巴卡韦、阿昔洛韦、阿昔洛韦、阿德福韦、金刚烷胺、安普那韦、安普利近、阿比朵尔、阿扎那韦、立普妥、博赛泼维、西多福韦、可比韦、达卡他韦、地瑞那韦、达塞布韦、地拉夫定、地达诺新、二十二烷醇、依度尿苷、依非韦伦、恩曲他滨、恩夫韦地、恩替卡韦、泛昔洛韦、福米韦生、夫沙那韦、膦甲酸、磷乙酸、更昔洛韦、伊巴他滨、异丙肌苷、疱疹净、咪喹莫特、茚地那韦、肌苷、III型干扰素、II型干扰素、I型干扰素、拉米夫定、雷迪帕韦、洛匹那韦、洛韦胺、马拉韦罗、吗啉胍、甲吲噻腙、奈非那韦、奈韦拉平、奈克沙韦、奥比他韦、奥司他韦、帕利瑞韦、聚乙二醇干扰素α-2a、喷昔洛韦、帕拉米韦、普拉康纳利、鬼臼毒素、雷特格韦、利巴韦林、金刚烷乙胺、利托那韦、嘧胺、沙奎那韦、西咪匹韦、索非布韦、司他夫定、特拉匹韦、替比夫定、替诺福韦、替诺福韦、替拉那韦、三氟尿苷、三协唯、曲金刚胺、特鲁瓦达、伐昔洛韦、缬更昔洛韦、维克韦罗、阿糖腺苷、维拉米定、扎西他滨、扎那米韦、或齐多夫定及其组合。

209.一种组合物，所述组合物包含根据权利要求1至196中任一项所述的化合物以及选自以下各项的至少一种第二抗病毒剂：ABT-450、ABT_-267、ABT-333、ABT-493、ABT-530、阿巴卡韦、阿昔洛韦、阿昔洛韦、阿德福韦、金刚烷胺、安普那韦、安普利近、阿比朵尔、阿扎那韦、立普妥、博赛泼维、西多福韦、可比韦、达卡他韦、地瑞那韦、达塞布韦、地拉夫定、地达诺新、二十二烷醇、依度尿苷、依非韦伦、恩曲他滨、恩夫韦地、恩替卡韦、泛昔洛韦、福米韦生、夫沙那韦、膦甲酸、磷乙酸、更昔洛韦、伊巴他滨、异丙肌苷、疱疹净、咪喹莫特、茚地那韦、肌苷、III型干扰素、II型干扰素、I型干扰素、拉米夫定、雷迪帕韦、洛匹那韦、洛韦胺、马拉韦罗、吗啉胍、甲吲噻腙、奈非那韦、奈韦拉平、奈克沙韦、奥比他韦、奥司他韦、帕利瑞韦、聚乙二醇干扰素α-2a、喷昔洛韦、帕拉米韦、普拉康纳利、鬼臼毒素、雷特格韦、利巴韦林、金刚烷乙胺、利托那韦、嘧胺、沙奎那韦、西咪匹韦、索非布韦、司他夫定、特拉匹韦、替比夫定、替诺福韦、替诺福韦、替拉那韦、三氟尿苷、三协唯、曲金刚胺、特鲁瓦达、伐昔洛韦、缬更昔洛韦、维克韦罗、阿糖腺苷、维拉米定、扎西他滨、扎那米韦、或齐多夫定及其组合。

210.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

211.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

212.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCH₂、OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

Z为N或CR⁸；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

213.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

214.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

215.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

216.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、或OCF₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

217.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或CD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

218.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

219.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

220.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

221.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

222.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

223.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

224.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

W为N或CR⁷；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

225.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

226.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

227.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

228.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

229.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

230.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

X为OCHMe、OCMe₂、OCHF、OCF₂、或OCD₂；

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

231.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

232.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

233.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

234.一种下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

235.一种治疗或预防由寨卡病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的选自下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

236.一种治疗或预防由寨卡病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的选自下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

237.一种治疗或预防由寨卡病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的选自下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

238.一种治疗或预防由寨卡病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的选自下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

239.一种治疗或预防由寨卡病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的选自下式的化合物：

或其药学上可接受的盐，其中：

R¹选自H或下式之一：

Y为O或S；

Y¹为OH、O芳基、O烷基、或BH₃ ^-M⁺；

Y²为OH或BH₃ ^-M⁺；

240.一种化合物，所述化合物具有以下结构：

241.一种治疗或预防由寨卡病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的具有以下结构的化合物：

242.一种治疗或预防由寨卡病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的选自下式的化合物：

243.一种治疗或预防由寨卡病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的选自下式的化合物：

244.一种治疗或预防由寨卡病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的选自下式的化合物：

245.一种治疗或预防由寨卡病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的选自下式的化合物：

246.一种治疗或预防由寨卡病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的选自下式的化合物：

247.一种治疗或预防由寨卡病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的选自下式的化合物：

248.一种药物组合物，所述药物组合物用于治疗或预防病毒感染，所述药物组合物包含根据权利要求210至234以及241中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的载体。

249.根据权利要求248所述的药物组合物，其中所述病毒感染是由包含RNA病毒的感染剂引起的。

250.根据权利要求248所述的药物组合物，其中所述RNA病毒包括肝炎病毒。

251.根据权利要求248所述的药物组合物，其中所述RNA病毒包括黄病毒。

252.根据权利要求248所述的药物组合物，其中所述RNA病毒包括寨卡病毒。

253.一种脂质体组合物，所述脂质体组合物包含根据权利要求210至234以及241中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的载体。

254.一种治疗或预防由RNA病毒引起的感染的方法，所述方法包括向需要的宿主施用有效量的根据权利要求210至234以及241中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐。

255.根据权利要求254所述的方法，其中所述RNA病毒包括肝炎病毒。

256.根据权利要求254所述的方法，其中所述RNA病毒包括黄病毒。

257.根据权利要求254所述的方法，其中所述RNA病毒包括寨卡病毒。