TWI353991B - Immunoglobulin chimeric monomer-dimer hybrids - Google Patents

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TWI353991B
TWI353991B TW093112725A TW93112725A TWI353991B TW I353991 B TWI353991 B TW I353991B TW 093112725 A TW093112725 A TW 093112725A TW 93112725 A TW93112725 A TW 93112725A TW I353991 B TWI353991 B TW I353991B
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chimeric protein
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binary
protein
immunoglobulin
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TW093112725A
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Daniel S Rivera
James Stattel
Robert T Peters
Adam R Mezo
Alan J Bitonti
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Syntonix Pharmaceuticals Inc
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Description

1353991 (1) 玖、發明說明 【發明所屬之技術領域】 本發明係關於包含二種多胜鏈的治療性嵌合型軍白質 ，其中第一鏈包含治療性的生物活性分子而第二鏈則不.包 含第一鏈中之治療性生物活性分子。更明確的說，本發明 係關於包含二種多胜鏈的嵌合型蛋白質；其中雙鏈均至少 包含一部分免疫球蛋白恒定區，其中第一鏈係經修飾而另. 外包含一個生物活性分子，而第二鏈則未經釦此之修飾。 因此不發明係關於一種嵌合型蛋白質，其係爲單元.體-二 元體之雜合體，即具有二元體特色以及單元體特.，色的舉合. 型蛋白質，其中此二元體的特色事實上係包含二種多胜鏈 ，各鏈均包含一部分免疫球蛋.白恒定區，其中此單、元體的. 特色是事實上二種鏈中僅有一者包含治療性的生物揷性分.. 子。圖1闡明·一個單元體-二元體雜合體之實施.例，其中此 生物活性分子是紅血球生成素（EPO)且此免疫球軍白恒定 區部分是免疫球蛋白G之F c區域。 【先前技術〕 免疫球.蛋白包含四個多胜鏈，二個重鏈以及二:個輕.鏈 ，其係經由雙硫鍵以形成四聚體。各鏈進一步包含.一.個變.. 異區以及一個恒定區。此變異區中介抗原的識別和結.合.， 而此恆定區，尤其是此重鏈恆定區，則中介各種效..應子功 能，例如：補體結合以及Fc受體結合（參閱例印..美國專利 第：6: 0 8 6 J 7 5 ; 5 : 6 2 4 : 8 2 1 ; 5 Π 6，9 6 4 號）。 (2) 1353991 此恒定區進一步包含之結構區稱爲CH(固定的重鏈） 結構區（CHI、CH2等）。視此同功型（即免疫球蛋白G、免 疫球蛋白 MI、免疫球蛋白 A、免疫球蛋白D、免疫球蛋 白E)而定，此恒定區可由三或四個CH結構區辑成。一些 同功型（例如免疫球蛋白G)恆定·.區亦含有一個樞紐區域 Janeway et at. 2 0.01,· immunobiology, Garland Publish.ing， N.Y_，N.Y。 .. 文獻報告中已提及製造包含與重要蛋白質或其片段聯 結之免疫球'蛋白恆定區的嵌合.型蛋白質（參閱例如美.國專 利第 5,480,98]以及 5,808,029 號；Gascoigne et at.1987, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84 ： 29 3 6 ； Capo.n e.t a]. 1 9 89, Nature 337 : 5 2 5 ； T r a u n e c k e r e.t al. 1 9 8 9, Nature 339 : 6 8 ;Zettmeiss]· et al.1990, DNA .Cell Biol.USA. 9 ·' 347.； B y r n et al.1 990. Nature 3 44 ： 667； Watson et at; 1 990，J. Cell. Biol.....1 10 :'222.1: Watson, et al.199], .Nat‘ure 349 ·· 164 ； Aruffo et al.1990. Cel] 61 · 1303.； Linsley et al.1991, J. Exp. Med. 173 ： 721 ； Linsley et a 1.199 1, J. Exp. Med . 174： 561 ； Stamenkovic et al. s 1991, Cell 66 : 113 3; Ashkenazi e t at. 1 9 91 , Proc. Natl. Acad. Sci. USA 8 8 : 1 0 5 3 5.； Le s si au er et at.1991. Eur. J.. Immunol.27 ： 2883 ； Peppel et at.1991, J. Exp. Med.174 ： 1483 ；
Bennett et at.1991, J. Bio]. Chem. 266 ： 2 ： 3060 ；
Kurschner et at. 1 99 2, J. Biol. Chem. .2 67 ： 93 5 4 ； C h a 1 u p n y ^ t a t. 1 9 9 2 . P r o c . N a t ]. Acad. Sci. USA 89：
-6 - (3) (3)1353991 10360 ; Ridgway and Gorman, '1991, J. Cell. Biol. 115; Abstract No. 1 448 ； Zheng et a ]. 1 9 9 5 , J. I m m u n . 1 5 4 ： 5 5 90)。此類分子通常擁有與所聯結的重要分子相關之生 物活性及效應子功能，或某些與此免疫球蛋白恒定區.（例 如生物的穩定性、細胞的分泌）相關之其它所要求的特性 〇 .
視此免疫球蛋白同功型而定，此F c部分免疫球蛋白 恒定區，可包含+CH2、CH3、以及CH4結構區.、與樞紐區 域。包含一個’F c部分免疫球蛋白的嵌合型蛋白質，在嵌 合型蛋白質上有許多令人滿意的性質，包括媢加穩定性、 增力口血淸半衰期（參閱 Capon et al_ 1 9 89，Nature 3 3 7 : 5 2 5) 以及可結合至Fc受體，例如新生兒·的Fc.受體（FcRn.)(美 國專利第 6,086,875， 6,485:726， 6,030,613 號 ；WO 03/077834 ; US 2003-0235536A])。 成年人之上皮組織內具有FcRn活性且在腸之內腔、 肺的氣道、鼻的表面、陰道的表面、大腸和直腸表面表現 FcRn(美國專利第6,4 8 5,72 6號）。由FcRn結合伴（例.如.lg(3 ' Fc片段）組成之嵌合型蛋白質可有效地利用FcRn穿—過 上皮障礙，如此可依非侵入性方法全身性投闬需要的治療 性分子。此外，由FcRn結合伴組成之嵌合型蛋白質可被 表現FcRn之細胞胞飮攝入。因爲不會被標記降解.，所以 lit類嵌合型蛋白質可再一次回收到循環中，因而增加此類 蛋白質在活體內之半衰期。 .... ... 免疫球蛋白恆定區之部份（例如FcRn結合伴.），.典型 (4) (4)1353991 地係經由雙硫鍵以及其它非專一性相互作用，相互形成二 元體及較高的多聚體。本發明有一部份是基於發現，.由 FcRn結合伴組成之嵌合型蛋白質其胞吞作用受到此嵌合 型蛋白質分子量之限制，分子量較高者運送效率較低。 一旦投用由生物活性分子組成之嵌合型蛋白質後，通 常將與目標分子或細胞交互反應。本發明有一部份係基於 硏究發現：具有一個·生物活性分.子及二個免疫球蛋白恒定 區（例如二個FcRn :結合伴·_)之單元體-二元體雜.合體有功.能. 且比起同源雙體（在此亦簡稱爲具有兩套或多套此生物活 性分子的’’二元體"或更高元之多聚體）更能有效的運送。.. 其中一部份係基於由雨種或多種生物活性分子組成之嵌合 型蛋白質係以二元體以及較高.元之多聚體的形式存在，.雖 然與巨：標分子或絀胞交互作用時會產生空間位阻1但由於 在近距離存在兩種或多種生物活性分子，且此生物活性分 子本身有高親和性，所以可克服位阻之障礙。· 據此，本發明特色之一係提供由生物活性分子組成之 嵌合型蛋白質，其可通過上皮障礙運送。.本發明其它特色 之一是提供由至少一個生物活性分子組成之嵌合型蛋.白質 ，其能和它的目標分子或細胞交互反應而無空間位阻或启 我凝集之現象。 本發明之特色提供嵌合·型蛋白質，其係由第.一及第二: 多胜鏈組成，第一鏈至少包含一部分免疫球蛋白恒定區， 其中此部分免疫球蛋白恒定區已經修飾而包.含一個生物活 性分子且第二鏈至少.包含一部分免疫球蛋白恒定區_，其中 -8- (5) 1353991 此部分免疫球蛋白恒定區未經修飾而未包含第一鏈之生物 活性分子。 【發明內容】 本發明槪要 .· ' 本發明係關於由一個生物活性分子以及二個至少一部 分免疫球蛋白值定區之分子組成的嵌合型蛋白質。此嵌合 型蛋白質能與目為.分子或細胞交互作用，其位阻小於由至 少二個生物活性分子以及至少部分二個免疫球蛋白恆定區 所組成之嵌合'型蛋白質。本發明亦關於由至少一個生物活 性分子以及二個至少部分免疫球蛋白恒定區分子組成之嵌 合型蛋白質，其能通過上皮障礙運送，比對應的同源二元. 體（.即其中兩鏈均是聯結至相同的生物活性.分子.)更有效率 。如此，本發明係關於由第一及第二多胜鏈共同聯結組成 的嵌合型蛋白質，其中該第一鏈包含一個生物活牲分子和 至少部分免疫球蛋白恒定區，而該第二鏈至少包含一部分 免疫球蛋白恒定區，·但無免疫球蛋白變異區及未附著任何 生物活性分子。 如此本發明係關於由第一及第二多胜鏈共同聯結組成 的嵌合型蛋白質，其中該第一鏈包含一個生物活性分子及 至少部分免疫球蛋白恒定區，而該第二鏈至少包含一部分 免疫球蛋白恒定區，但無堯疫球蛋白變異區且未附著任何 生物活性分子以友其中該第二鏈係非共價鍵地鍵結至任何 分子量大於]kD、2 kD、5 kD、]0 kD'或20,kD之分子。 -9 - (6) 1353991 在具體實施例之一中，第二鏈係非共價鍵地鍵結至任 子量大於0-2 kD之分子。在具體實施例之一中，第二 非共價鍵地鍵結至任何分子量大於5 - I 0 kD之分子.。 體實施例之一中，第二鏈係非共價鍵地鍵結至任何分 大於1 5-20 kD之分子。 本發明係關於由第一及第二多胜鏈共同聯結組成 合型蛋白質，其中該第一鏈包含一個生物活性分子及 部分免疫球蛋白恒定區，而該第二鏈包含竑非.以共價 結至任何其它除了該第一多胜鏈部分免疫球蛋白外之 的至少部分免疫球蛋白恒定區= ' 如此本發明係關於由第一及第二多胜鏈共同聯結 的嵌合型蛋白質，其中該第一鏈包含一個生物活性分 至少部分免疫球蛋白恒定區，而該第二鏈至少每含一 免.疫球蛋白恒定區以及可視需.要附加一個親和標記物 如此本發明係關於由第一及第二多胜鏈共同聯結 的嵌合型蛋白質'，其中該第一鏈包含一個生物活性分 至少部分免疫球蛋白恒定區，而該第二鏈本質上至少 一部分免疫球蛋白恒定區以及可視需要附加一個親和 物。 如此本發明係關於由第一及第二多胜鏈共同聯結 的嵌合型蛋白質，其中該第一鏈包含一個生.物活性分 至少部分免疫球蛋白恒定區，而該第二鏈至少包含一 免疫球蛋白恒定區，但無免疫球蛋白變異區且未附著 生物活性分子以及可視需要分子量小於】〇 kD、5 kD '
何分 鏈係 在具 子量 的嵌 至少 鍵聯 分子 組成 子及· 部分 〇 組成 子及 包含 標記 組成 子及 部分 任何 2kD -10- (7) (7)1353991 或1 kD之分子。具體實施例之一中，第二鏈包含之分子 少於15-20 kD。具體實施例之一中，第二鏈包含之分子少 於5 - 1 0 kD。具體實施例之一中，第二鏈包含之分子少於 1 -2 kD - 本發明係關於嵌合型蛋白質，其係由第一及第二多胜 鏈組成，其中該第十鏈包含一個生物活性分子、至少部分 免疫球蛋白恒定區、以及至少第一結構區，該第一結構區. 具有至少一個專一性結合伴.，以及其中該第二鏈至少包含 一·部分免疫球蛋白恒定區、以及至少第二結構區，其中該 第二結構區是該第·一結構區之專一性結合伴，而無任何免. 疫球蛋白變異區或一個生物活性分子。 本發明係關於製作由第一及第二多1生鏈組成，其中第· —多胜鏈與第二多胜鏈是不相同的嵌合型蛋白質之方法，’ 該方法包含以內含編碼第一多胜鏈、一個生物活性分子及 至少部分免疫球蛋白恒定區以及可視需要.連結子.之DN A · 分子的第一 DNA建構體，以及包含以內含編碼第二多胜 鏈、至少部分免疫球蛋白恒定區而無任何生物活性分子或 一個免疫球蛋白變異區、以及可視需要連結子之：DN A分 子的第二DNA建構體轉染細胞，在編碼第一.DNA建構體· 表現此多胜鏈以及在編碼第二DN A建構體表現此多胜鏈 的條件下培養細胞以及分離包含此編碼第一 _ DN A建構體 多胜鏈和編碼第二DNA建築體多胜鏈之單元體-二元體雜 合體。’ 本發明係關於製作嵌合型蛋白質之方法，該嵌合型蛋 -11 - (8) (8)1353991 白質由第一及第二多胜鏈組成，其中第一多胜鏈與第二多 胜鍵並不相同，以及其中該第一的多胜鏈包含一個生啤/活 性分子、至少部分免疫球蛋白恒定區、以及至少第一結構. 區，該第一結構區具有至少一個專一性結合伴，以及其中. 該第二多胜鏈至少包含一部分免疫球蛋白恒定區以及第二 結構區，其中該第二結構區是該第一結構.區之專一性結合·. 伴，而無任何生物活’[生分子或一個免疫球蛋白變異區，該 方法包含用包含DNA分子之編碼第一胜鏈第〜DNA建構·.. 體以及包含DN A分子之編碼第二胜鏈第二_ D.N A建構體轉 . 染細胞，在編碼第一DN A建構體表現龀多迸鏈以及在編 碼第二DN A建搆體表現此多胜鏈的條件下培養細胞以及_ _ 分離包含此編碼第一 DN A建構體多胜鏈和編碼第二DN A 建築體多胜鏈之單元體-二元體雜合體。 ： .. 本發明係關於製作本發明嵌合型蛋白質之方法該方 法包含用由編碼.第一多胜鏈DN A分子、一個生物活 '性分 子及至少部分免疫球蛋白恒定區以及可視需要的連結子組 成之第一DNA建築體轉染細胞，在編碼第一 DN A建售體 表現此多胜鏈的條侔下培養細胞、分離編碼第--DM A建.. 搆體之多胜鏈，以及用由編碼第二多胜鏈.. DNA分子、.至 . 少部分免疫球蛋白恒定區而無任何生物活性分子或免疫球 蛋白變異區組成之第二DNA建築體轉染細胞·，在編碼第. 二DNA建搆體表現此多胜鏈的條件下培養細胞、分離編 碼第二DN A建構體之多胜鏈，在形成編碼第:一DN A建構·，' 體多胜鏈和編碼第二DNA建搆體多胜鏈之單元體二元體 -12 - (9) 1353991 雜合體之條件下合倂編碼第一 DNA建構體胜鏈和編碼第 二DN A建構體多胜鏈，以及分離該單元體-二元體雜合體 〇 本發明係關於製作嵌合型蛋白質之方法，該嵌合型蛋 白質由第一及第二多胜鏈組成，其中第一多胜鏈與第二多 胜鏈並不相同，該方法包含周至少包含一部分免疫球蛋白 恒定區之包含編碼多胜鏈.的DN A_ .分子的DNA建構體轉染 細胞，在表現編碼此脫氧核糖之多胜鏈以及N端半脒胺 酸的核酸建'構體.形成此多胜鏈二元體之條俘下培.養細胞以. 及分離包含二套編碼' DNA建搆體之多胜鏈的二元體以及 使此分離之二元體與一個生物活性分子行化學反應，其中 該生物活性分子具有C端:硫.酯.，反應之條件是·此生物活性; 分子主要是:僅與此二元體之一個多胜鏈發生反應從而形成 單元體-二元體雜合體。’ ,.· ；.:， 本發明係關於製作嵌合型蛋白質之方法，該嵌合型軍 白質由第一及第二多胜鐽組成，其中第一多胜鏈與第二多 胜鐽並不相同，該方法包含用至.少包含一部分免疫球.蛋白 恒定區之包含可編碼多胜鏈之DNA分子的DN+A建構體轉 染細胞，在表現編碼.此脫.氧核糖之多胜鏈以及N竭半胱 胺酸的核酸建·構體形成此多胜鏈二元體之條件下培* .細胞 ，以及分離包含二套編碼DN A建構體之多胜鏈的二元體 ，以及使此分離之二元體與一個生物活性分子行化學反應 ，其中該生物活性分子具有C端硫酯，該生物活性分子是. 聯結至此二元體.之各鏈，使包含此部分免疫球蛋白二元體 -13 - (10) 1353991 變性聯結至此生物活性分子以形成單元體鏈，合倂此 體鏈與至少包含一部分免疫球蛋白恒定區而無聯結生 性分子之多胜鏈，以形成單元體-二元體雜合體，並 此單元體-二元體雜合體。 本發明係關於製作嵌合型蛋白質之方法，該嵌合 白質由第一及第=多胜鍵組成’其中第一多胜鏈與第 胜鏈並不相同，該方法.包含闬至少包含一部分免疫球 恒定區之包含編礁多胜鏈之D N A分子的D n A建構體 細胞，在表現編痛此脫氧核糖之二種多胜鏈混合物： 此混合物包含多肽和一個端的半胱胺酸，以及在 近端具有半胱胺酸多胜的條件下培養細胞，以及分離 編碼DN A ·建構體之多胜鏈混合物的二元_，以及使 離之二元體與一個生物活性分子行化學反應，其中該 活性分子具有硫酯，其中至少形成.一些單元體·_二元 合體以及從該混合物分離此單元體-二元體雜合體。 本發明係關於治療疾病或症狀之方法，包含投用 明之嵌合型蛋白質從而治療此疾病或症狀。 本發明的其它目標及’ί憂點將部份地描述於下，以 份地將從描述加以突顯，或可經本發明之操作而得知 發明之目標以及優點將由元件以及組合，尤其是在此 的申請專利範圍之內所指出者，加以認識及獲得。 前述的一般描述以及下列之詳細描述僅供作範例 解釋而不是限制本發明之申請專利範圍。 單元 物活 分離 型蛋 二多 蛋白 轉染. 其中 Ν端 包含 此分‘ 生物 體雜 本發 及部 • °本 附加 用以 -14 - (11) (11)1353991 描述之具體實施例 A.定義 本文之親和標記物意指附著至第二個重要分子的分子 ’能與專一性台伴交互作闬以分離或確認該第二個重要 的分子。 本文之鱼白質或肽類似物，或實質上與本發明之嵌合 型蛋白質相同’意指至少與給定的序列有、75 %、 80%、8”/。' 9〇%、95%、97%、98%、99%、或 相同 的相關胺基酸序列之蛋自質或者肽。例如’該序列可爲源 自各種不同物種的變異體或彼可爲源自給定的序列經截 斷 '刪除、胺基酸取代'或加入的變異體。二種胺基酸序列 間之相似百分比是經標準序列.對比演算法測定，例如 Banc Local A】ignment T〇〇l (BLas丁)描述於 Aitschu] et a'J · 1 99〇; J. Mot. Bio]，·’ 2 1 5 : 403-4 1 (),演算法 NeedU.man. et a,, i 97〇· ：[. Mot. Bi〇].; 4 8 :: 4 44_ 4 5 3 ;演算法 Meyers e:t at.l98S，Compu!. Appl. Bi〇sci : 4 : !】·]7 ;或 T?tus〇va et a 3.1 999, F£K4S Microbio]. Left·: 174 : 24 7 -25 0等。該.演算 法已倂 Λ BLASTN、BLAST}，以及"BLAST 2 Sequence.，程 式（參閱www』cbi.nim.nih.g0v/BLAST)。當使用:該程式時 可使用預設參數。例如’使吊"BLAST 2 Sequen:ces'，比對 核甘酸序列時其設定如下：程式BLASTN、匹配報酬2、 錯配處罰· 2、打開間隙以及延伸間隙處罰分別爲5以及2、 間隙X _遺失5 〇、期望値】〇、字彙大小n :過濾器。 例如’使用” B L A S T 2 S e q u e n c e s ’’比對胺基酸序列時其执 -15- (12) 1353991 定如下：程式BLASTP、矩陣BLOSUM62 ' .打開間隙以及 延仲間隙處罰分別爲Π以及1、間隙 x_遺失50，期望値 ! 〇 '字彙大小3、過濾.器ON。 本文之生物效性意指受質吸入活體系統或是提供生理. 活性位點Z程度以及速率。 本文之生物活性分子意指非免疫球蛋白分子或其片段 ，其能治療疾病或症狀或在生物中（例如生物體、.細胞、 或一個活體外模式之內）經進行功能或作用、或刺激或對 功能、作用或反應產生反應’使分子定位或導向身體疾病 :(·或症狀之部位。 本文之嵌合型蛋白質意指包含源自第一來源之第一胺 基酸序列，鍵結的、共價鍵地或非共價鍵地結合源自第二· % _ 「來源之第二胺基酸.序列.·（其中第一及第二來源是不相同）之. ί'任何蛋白質。第一來源以及第.二來源是不相同，可包含二 種不同生物的實體’或從相同生物實體、或生物的實體以 及非生物的實體的二種不同蛋白質。嵌合型蛋白質可包含 例如’源自.至少2種不同生物來源的蛋白質。生物的來源 可包含任何非合成製作的核酸或胺基酸序列（例如基因體 的或互補DN A .序列，質體或者病毒的載體、天然的病毒 顆粒或突變或.類似物’進一步的在此描述之任何之上述序 列）。合成的來源可包含化學以及不是經生物系統(.例如固 相合成之胺基酸序列）製作之蛋白質或者核酸序列。嵌合 型蛋白質亦可包含源自至少2不同合成的來源知蛋白質或 源自至少一個生物的來源以及至少一個合成來源的蛋白質 -16- (13) (13)1353991 本文之凝血因子意指天然或重組體製作於止血的病症 中防止或減低流血持續期間之任何分子、或其類似物。換 言之意指具有凝血活性之茌何分子。 本文之凝血活性意指參與形成血纖維凝塊及/或降低 出血嚴重性·、持續期或頻率的系列生化學反應之能力。 本文之二元體意‘指由第一及第二多胜鏈組成之嵌合型 蛋白質，其中第一及第二鐽均包含一個生物活性分子，以 及至少部分免疫球蛋白恒定區。同源二元體意指生物活性 分子均是相同的二元體。 本文之DNA建築體意指.DNA分子，或選殖之該分子. (單-或雙股），其可經由人顛介·入修飾成含.有非天然的合 倂之DNA片段。DNA.構築體含有表現重要的多胜肽之必 要的訊息。DNA構築體可包含啓動子、增強子以及轉錄 終止區。內含多肽分泌必要訊息的DNA構築體亦含有至 少一個分泌的信號序列。 本文之結搆區意指具有一些獨特的物理特色或功能包 括例如由一部分之多胜鏈組成之一個獨立折疊構.造之多肽 區域（包括.定義之蛋白質）。結構區可含有此多肽獨特的.物. 理特色之序列或它可含有一個保留它的結合.特性（即它可 結合至第二結構區）的物理特色之片段。結搆區可連結另 一結構區。.換言之第一結構區可當然地結合至第二結構區 〇 本文之片段意指一種肽或多肽，其包含一.個至少2個 -17 - (14) (14)1353991 鄰近的胺基酸殘基，至少5個鄰近的胺基酸殘基、至少1〇 個鄰近的胺基酸殘基、至少1 5個鄰近的胺基酸殘基、至少 20個鄰近的胺基酸殘基、至少25個鄰近的胺基酸殘基.、至 少40個鄰近的胺基酸殘基、至少50個鄰近的肢基酸殘基、 至少1 00個鄰近的胺基酸殘基 '或至少200個鄰近的胺棊酸 殘基或任何缺失或截斷之蛋白質、肽、或多肽之胺基酸序 列。 本文之止血意指此停止流血或出血；或停止經由尥.管 或身體部份之血流。. . 本文之止血病症意指遺傳的或後天的症狀；.，其特徵.在 於：經自發或創傷的結果，由於形咸血纖維血凝塊的能力 受損或缺乏而造成出血之傾向。 本文之聯結意指第一核酸序列共價鍵地聯結至第.二核 酸序列。第一核酸序列可直接相聯或並列.至第二核酸序列 或此外一個介於中間的序列可共價鍵地接合第一序列與第 二序列。本文之聯結亦可意指第一胺基酸序列共價鍵地， 非共價鍵地聯結至第二胺基酸序列。 ： 第一胺基酸序列可直接的相聯或並列至第二胺基.酸序 列或此外一個介於中間的序列可共價鍵地接合第一胺基酸 序列與第二胺基酸序'列。 本文之操作地聯結的意指第一核酸序列聯結至第二核 酸序列，使兩序列能表現生物活性的蛋白質或者肽。， 本文之多肽意指胺基酸之聚合物而不是指特定長度之 產物；因此·肽類 '寡肽、以及蛋白質包含在.此多肽之定義 -18 - (15) 1353991 內。此術語不排除後表現修飾作用，例如糖基化作用、乙 醯化、磷酸化、P E G化作用 '添加脂肪部分、或添加任何 有機或無機的分子之多肽。此定義之內包括，例如內含一 個或多個胺基酸類似物（包括例如非天然的胺基酸）之多胜 狀以及替代聯結，與其它技藝上已知的修飾作用（天然以 及非天然）之多胜肽。 本文之高嚴格包括經熟悉此技藝之專業人士基於例如 此DN A之長度立即測定之條件。一般而言，該條件定義 於 Sam brook et a],Molecular Cloning · A Laboratory Manual, 2 ed.-V〇]. l, p p . ] . 1 〇l -1 6 4 , Cold. Spring Harbor Labontory Press (] 989)，'以及I包含硝化纖維素濾之預淸 洗溶液爲5X SSC、0.5% SDS、1.0毫莫耳濃度乙二氨四醋 酸（酸鹼度+8 · 0 )、雜交條怦爲在4 2。(：下5 0 %甲醯胺' 6 X S S C (或者在42°C下其它相似的雜交溶液，例如..Stark’s溶液、 5 0 %甲醯胺）' 以及淸洗條件爲大約6 8 °C、0,2 X . S S . C、. 0.1 % SDS。熟悉此技藝之專業人士將認知溫度以.及洗滌溶 液之鹽濃度如必要的話可依據例如探針之長度測調整。.
本文之中度嚴格包含經平常熟悉此技藝的雩業人士基 於例如此DNA之長度立即測定之條件。該基本條件定義 於 Sambrook et al.Molecular Cloning : A Laboratory Manual, 2 ed. V〇], 1, pp.1.1 01-104, Cold Spring Harbor Laboratory Pr'es’s ( 1 9 89)，以及包含硝化纖維素據之預淸 洗溶液爲5X SSC、0.5% SDS、〗·0毫莫耳濃度乙二氨四醋 酸（酸鹼度8.0)、雜交條件爲在42°C下50%甲醯胺、6X SSC -19 - (16) (16)1353991 (或者在42 °C下其它相似的雜交溶液，例如Stark’s溶液、 5 0%甲醯胺）、以及淸洗條件爲大約60°C ' 0.5X SSC、 0 . 1 % S D S。 本文之小的無機分子意指不含碳原子以及不大於50 kD之分子。 本文之小的無機分子意指內含至少一個碳原子以及不 大於5 0 k Ό之分子_。 本文之治療意指下列：減少疾病或症狀之嚴重性；減 少疾病之持續期間；·此改善一種或多種相關疾病或症狀的 症狀；對有疾病或症狀之病入提供應有利的效應而未必 治癒此疾病或症狀，預防與疾病或症狀相關的一個或多個 症狀。 B.本發明某些具體實施例提供之改進 ：： ....，: 本發明提供由第一及第二多胜鏈共同聯結組成的嵌合 型蛋白質（單元體-二元體雜合體），其中該第一鏈包含一_ 個生物活性分子及至少部分免疫球蛋白恒定區，而該第二 鏈至少包含一部分免疫球蛋白恒定區，但無任何生物活性 分子或無免疫球蛋白變異區。圖1比對傳統融合型蛋白二 元體和本發明單元體-二元體雜合體之一個實施例。在此 實施例之內，此生物活性分子是EP 0以及部分免疫球蛋 白是免疫球蛋白G F c區域。 如同至少包含一部分免疫球蛋白恒定區之其它嵌合型 蛋白質，本發明提供了嵌合型蛋白質，相較於單獨之生物 -20- (17) (17)1353991 活性分子，其可增強此嵌合型蛋白質之穩定性以及增加此 嵌合型蛋白質之生物效性。此外地，然而因爲.二鏈中僅有 一鏈包含此生物活性分子，此嵌合型蛋白質之分子量低於 所有鏈中均包含一個生物活性分子的嵌合型蛋白質且不與 任何理論相結合，此可導致此嵌合型蛋白質更易通過上皮 障礙，例如經結合至FcRn受體·從而增加此嵌合型蛋白質. 之半生期。具體實施例之一中，如此本發明提供了 一個改 良之非侵入性方法（例如經過任何黏膜的表面，例如口昵 地、口頰的、舌下的、鼻腔的、直腸地··陰道的.、或經過 肺的或眼睛路徑）投用本發明之治療性的嵌合型蛋白質。 如此相較於先前描述之嵌'合型蛋白質（例如至少包含一部 分免疫球蛋白恒定區和生物活性分子之嵌合型蛋白質，其 中此嵌合型蛋白質之所有鏈包含一個生物活性分子），本 發明使用次數較少以及較低的劑量提供獲得本發明嵌.合型 蛋白質的治療含量之方法> 在另一具體實:施例之內，本發明提供侵入性的方法 例如皮下的、靜脈內地方法，投甩本發明之治療性的嵌合 型蛋白質。侵入牲的投用本發明之治療性的嵌合型蛋白質 可增加nt治療性的嵌合型蛋白質之半衰期，相較於之前描 述的嵌合'型蛋白“質（例如至少包含一部分免疫球蛋白恒定 區以及一個生物活性分子，其中此嵌合型蛋白質之所有鏈 均包含一個生物活性分子），導致使用次數較少以及較低 的劑量。 嵌合型蛋白質之另一優點，是其中僅有一.鏈包含一個 -21 - (18) (18)1353991 生物活性分子，相較於所有鏈是包含生物地活性分子之嵌 合型蛋白質，此可減低生物活性分子的位阻、減低疏水性 交互作用、減低離子相互作用、或減低分子量，增強嵌合 型蛋白質對於它標的細胞或分子之易接近性。 C.嵌合型蛋白質 本發明係關於包含一個生物活性分子、至少部分免疫 球蛋白恒定區、以及可視需要至少一個連結子之嵌合型蛋 白質。部分免疫球蛋白將'有N或胺基端，以及.C或羧基.· 端。此嵌合型蛋白質可帶有聯結至部分免疫球蛋白N端 之生物活性分子。lit外，此生物活性分子可聯結至此部分 免疫球蛋白之C端。具體實施例之一中，此聯結是共價鍵· 。另一具體實施例之一中，此聯結是非共價鍵。、 此嵌合型蛋白質可視需要包含至少一個連..結子.；因此 生物活性分子不必直接的聯結至此部分免疫球蛋白恒定區 。此連結子可插入此生物活性分子以及此部分免疫球蛋白· 恒定區之間。此連'結子可聯結至此部分免疫球蛋白恒定區〃 之Ν端，或此部分免疫球蛋白恒定區之C端。若此生物 活性分子是包含至少一個胺基酸，則此生物活性分子將有· 一個Ν端以及一個C端，以及此連結子可聯結至此生物 活性分子之Ν端，或此生物活性分子之C端.。 本發明係關於式X-La-F : F或F : F-La-X之嵌合型蛋 白質，其中X爲一個生物活性分子，L是任選的連結子， F是至少部分免疫球蛋白恒定區，a是任何之整數或零。 -22- (19) 1353991 本發明亦關於式Ta-X-La-F : F或Ta-F : F-L.a-X之嵌合型 蛋白質，其中X爲一個生物活性分子，L是任選的連結子 ，F是至少部分免疫球蛋白恒定區.，a是任何整數或零，T 是第二連結子或可用以協助純化此嵌合型蛋白質之標籤；，. 例如FLAG標籤、組胺酸標籤、GST標籤、麥芽.糖結合蛋 白質標籤以及（：）代表化學聯結，例如至少一個非肽鍵結 。在某些具體實施例中此化學聯結（：）即是共價鍵。在其· 它具體實施例之內，.此化學聯結（：）即是非共價型相互作 周，例如：離子相·互作用、.忌水性交互作用、親水的相互 作用、凡得瓦爾相互作芾、氫.鍵。熟悉此技藝之専業人士 將瞭解當；1等於零時，X將直接的聯結至F。因此 > 例如 a 可爲 0、]、2、3 _、4、5、·或大於 5。 具體實施例之一中，本發明之嵌合型蛋白質:包含.圖2 a .之胺基酸序列（序列確認號碼：6)。具體實施例之一中，. 本發明之嵌合型蛋白質包含圖2b之胺基酸序列.（序列確認 號碼：8 )。具體實施例之一中，本發明之嵌合型蛋白質包 含圖2c之胺基酸序列.（序列確認號碼：]0)。具體實施例之: 一中，本發.明之嵌合型·蛋.白質包.含圖2d之胺基酸序列（序 列確認號碼：1 2)。.具體實施例之一中，本發明之嵌合型 蛋白質包含圖2.e之胺基酸序列（序列確認號碼’··. 1 4) ·。具體 實施例之一中，本發明之嵌合型蛋白質包含圖2f之胺基 酸序列（序列確認號碼：]6)。具體實施例之一中.，，本發明 之嵌合型蛋白質包含圖2 g之胺基酸序列（序列確認號碼： 〗8 )。具體實施例之一中，’本發明之嵌合型蛋白質.包含圖 -23 - (20) (20)1353991 2h之胺基酸序列（序列確認號碼：20)。具體實施例之一中 ，本發明之嵌合型蛋白質包含圖2 i之胺基酸序列（序列確 認號碼：22)。具體實施例之一中》本發明之嵌合型蛋白 質包含圖2j之胺基酸序列（序列確認號碼·· 24)。 1.嵌合型蛋白質變異體 .. 本發明包括本發明之嵌合型蛋白質衍生物 '抗本發曰月 嵌合型蛋白質之抗·體以及對抗本發明嵌合型蛋白質之結合 伴之抗體，以及彼可’經序列取代、加入、及/或刪除/截斷 或引入化學修飾改變其胺基酸；產生等價功能的分子力口以 製造。熟悉此技藝的專業人士將瞭解任何蛋白質序列內之 某些胺基酸可經其_它胺基酸取代而未不利地影響此蛋白.質 之活惶。 .. 本發明嵌合型蛋白質之胺基酸序列或編碼DNA知序 列可經各種不同的改變而未明顯喪失其生物活性、功@、. 或用途。該改變產生的衍生物、類似物、或突變體，以及 該衍生物之用途是在本發明之範圍之內。在特定具體實施 例之內’此衍生物的功能是活化的，即能，展現=種或多種 與本發明之嵌合型蛋白·質相·關的活性，例如結合FcRn、 抑制病毒、止血 '產生紅血球。許多測定能測試每_含—個 技藝上已知的生物活性分子的嵌合型蛋白質之活性。H 物活性分子是HiV抑制劑時’可使用已知方法經測量反 轉錄酵素活性測試活性（參閱例如 Barre_Sin()Ussi et al.1983: Science 220 : 868 ; Gallo et al.1984，Science 2)4 -24 - (21) (21)1353991 :5 0 0)。此外，可經融合的活性測量活性（參閱例如 Nussbaum et a].1994，J_ Virol. 68(9): 54]1)。當生物活性 是止血時，可進行StaCLot FVl!a-rTF分析評估因子Vila 衍生物之活性（Johannessen e t a 1.2 0 0 0 . Blood Coagulation andFibrin olysisll:S159)。 此序列內胺基酸之取代物可選自其它胺基酸所屬分類 之成員（參閱表υ。 . 此外，不同胺基酸通常可被屮性胺基酸取代·.，例如：. 丙胺酸、白胺酸、異白胺酸、纈胺酸、脯胺酸、苯丙'胺酸 '色胺酸、以及甲硫胺酸（參厲例如 M a. c L_e η n a..n e ί _ a.i— 1 9 9 8. Acta Physiol. S c a n d . S u p p i. 64 3 ： 5 5 -67 ； Sasaki e t a t. 1 9 9 8, A d v. B i o p h y s . 3 5 ：】-2 4)。 -25- (22) (22)1353991 表1 原始殘基 取代範例 代表性取代物 Ala (A) Val, Leu, lie Val Arg (R) Lys, Gin, Asn Lys Asn (N) Gin Gin Asp (D) Glu Glu Cys (C) Ser, Ala Ser Gin (Q) Asn Asn Gly (G) Pro, Ala Ala · His (H) Asn, Gin, Lys, Arg Arg He(l) Leu, Vai, Met, Ala, Phe,正白胺酸 —— Leu Leu (L) 正白胺酸，！丨e, Val, Met, Ala, Phe lie Lys (K) Arg, 1,4-'二胺基-丙酸，. Gin, Asn Arg Met (M) Leu, Phe, !le Leu Phe (F) Leu, Val, lie. Ala, Tyr Leu Pro (P) Ala Gly Ser (S) Thr, Ala, Cys Thr Thr (T) Ser Ser Trp (W) Tyr, Phe Tyr Tyr (Y) Trp, Phe, Thr, Ser Phe Val (V) lie, Met, Leu, Phe, Ala, 正白胺酸 Leu 2.生物活性分子 本發明包含任何本發明治療分子之任何生物活性分子 的用途。此生物活性分子可爲多肽。此生物活性分子可爲 單一胺基酸。此生物活性分子可包含經修飾之多肽。 此生物活性分子可包含脂肪分子（例如類固醇或膽固 醇、脂肪酸、三醯基甘油、甘油基磷脂、.或鞘類磷脂）。 此生物活性分子可包含糖分子（例.如葡萄糖、蔗糖、'甘露 -26 - (23) (23)1353991 糖）。此生物活性分子可包含核酸分子（例如DN A、RN A) °此生物活性分子可包含小的有機分子或小的無機分子。 a.細胞激動素以及生長因子 具體實施例之一中，此生物活性分子是生長因子.·、激 素或細胞激動素或類似物或其片段。此生物活性分子可爲 任何能誘導細胞生長及增殖之藥劑。在特定具體實施例之 內’此生物活性分子是可誘發紅血球增生的任何藥劑.。因. 此’本發明生物活'丨生分子之一個實施例是EPO。此生物活 性分子亦可包括，但並非限制於，r A NT E S .、Μ1 P ] α、， Μ)ΡΙβ ' IL-2、IL-3 ' GM-CSF、生長激素、腫瘤壞:死因子（ 例如TNFa或β)。 此生物活性分子可包含合成的或重組製作的干擾素α ，包括（但非限於）約二十五種結構上地相關的次型中任何 之一種，例；如干擾素-a2a，目前市售作爲.臨庞.用途 (ROFEROTS®厂ROCHE)以及干擾素-a2b亦批準作爲臨床甩 途（IN T R Ο N ®，S c h e r i n g)與各種不同次型的遺傳工程構建 的版本’包括（但非限於）市售之共有序列干擾素 a (IN F E R G E N ®, Intermune ’ Amgen)以及共有序列之人類 白血球干擾素參閱例如，美國專利第號：4,.69.5,62 3 4，8 9 7，4 7】、干擾素β '表皮生長因子 '促性.腺激素釋放荷 爾蒙（GnRH)、亮丙瑞林、促卵泡激素、黃體酮、.雌激素 、或睪甾酮。 可使用在本發明之嵌合型蛋白質的細胞激動素及生長 -27- (24) (24)1353991 因子表列於前述文獻（參閱例如美國專利第6 : Ο 8 6 : 8 7 5、 6,485,726 ' 6,030,613 號；WO 03 /0 77834;美國專利第 2003-0235536Α1號）。 b .抗病毒劑 具體實施例之一中，此生物活性分子是抗病毒劑〖包 括其片段以及類似物。一値抗病-劑可包含抑制或防止病 毒複製，或抑制或防止病毒-入細胞、或抑.制或防止病毒 包裝籬開細胞的任何分子。具體實施例之一中此抗病毒 劑是融合拗制劑。在體實施例之一中，此抗病毒劑是抑制 病毒複製的細胞激動素。'在另一具體實施例之內、，此抗病 毒劑是千擾素α。 · 嵌合型蛋白質中使用的病毒融合抑制劑可爲任何能減 低或防止病毒穿透標的細胞之細胞膜的分子。此病毒融合 抑制劑可爲任何能減低或防止雨個易受影響的細胞形成融 合細胞的分子。此柄毒融合抑制劑可任何能減.低或防止真 核細胞脂肪雙層膜以及被:膜病毒脂肪雙層膜接合之分子。 被膜病毒之實i例包括（但非限於）：人類免疫不全病毒 、人類免疫不全病毒-2、‘ SIV '流行性感冒、副流行性感 冒、愛帕斯坦-巴爾氏病毒、CMV、單純庖疹-1、單純庖 疹-2以及呼吸融合病毒。· . · 此病毒融合的抑制劑可爲減低或防止病毒融合任何分 子，包括（但非限於）多肽、小的有機分子或小的無機·分子 。具體實施例之一中，此融合抑制劑是多肽。具體實施例 -28 - (25) (25)1353991 之一中’此病毒融合抑制劑是3 - 3 6個胺基酸之多肽。在另 —具體實施例之內，此病毒融合抑制劑是3 - 50個胺基酸、 1 〇 · 6 5個胺基酸、1 〇 - 7 5個胺基酸之多肽。此多肽可由天然 胺基酸序列（例如g p 4 I之片段）組成，包括其類似物以及突 變體或此多肽可由非天然胺基酸序列組成，只要此多肽展 現抑制病毒融合的活性。: . 具體實施例之一中，此病毒融合抑制劑是多肽其係 爲使用至少二個計算機演算法，例如 ALLM.OT.I5、 1〇7\175^4以及？]^1?確認'的病毒融合抑制劑（參閱例如美 國專利：第 6,0】3,2 63 ; 6:01 5,881 ; 6,01 7;5 3 6 ; 6,02 0,4 5.9, ;6,060,065 ； 6,068;973 ； 6,093,799 ；以及 6,228,983號）。 具體實施例之一中，此病毒融合抑制劑是人類免疫不 全病毒融合抑制劑。具體實施例之一中，人類免疫不.全病 毒是人類免疫不全病毒d。在另一具體實施例中；人類免 疫不全病毒是人類免疫不全病毒_2。具體實施例之一中， it匕人類免疫不全病毒融合抑制劑是包含人類免疫不全病 毒-1之gp41 .包膜蛋白好段之多肽。此人類免疫不全病毒 融合抑制劑可包含，例如.：Τ20.(序列確認號碼.：1 )或其類 似物、Τ2】（序列確認號碼：2)或其類似物、Tl 249(序列確 認號碼：3)或其類似.物、NCCegp41(Louis et al.200 〗，J. 131〇1(：}^111.2 76:(3 1 )2 94 8 5 )或其類似物.、或5螺旋（11〇(^ Η 12001’ Science 291 : 884)或其類似物。 技藝上已知的測定法可用以測驗多肽、小的有機分子 '或小的無機分子的病毒融合抑制活性。此類測定包含反 -29 - (26) (26)1353991 轉録酵素測定、P24測定、或病毒所造成的細胞間融合測 定（參閱例如美國專利第5,464,93 3號）。 可使用在本發明之嵌合型蛋白質的抗病毒劑表列於前. 述文獻（參閱例如美國專利第6 ; 0 8 6 J 7 $、6,4 8 5，7 2 6、 6,03 0,6 】3 號；W0 .03/07 7 8 3 4 ；美國專利第 2 03 3 - 0 2 3 5 5 3 6 A 1 號）。 c .止血劑 ' 具體實施例之·一中，此生物‘活性分子是凝血因子或其 它促進止血之藥劑，包括.其片段以及類似物。此凝血因子: 可包含有凝血活性之任何分子或活化凝血活性之分子。此' 凝血因子可由多肽組成。此凝血因子可爲例如（但非限於） 因子 Vm '因子IX、因子.XJ、因子XII、血纖維蛋白原 凝血原、因子V '因子VII、因·子 X '因子XI.l'I或.：νό’η Willebrand因子。具體實施例之一中，此凝血因子是因子 VII或因子V] la。此凝血因子可爲參與外在路徑的因子。 此凝血因子可爲參與內在路徑的因子。此外此凝血因子可 爲參與外在以及內在路徑的因子。 此凝血因子可爲人類凝血因子或非人類凝血因子，例 如源自非人類靈長類動物、豬或任何哺乳動.物。此凝血因 子可爲嵌合型凝血因子，例如此凝血因子可包含都分之人 類凝血因子以及部分之豬凝血因子或部分之第一'非人類凝 血因子以及部分之第二非人類凝血因子。.. : ' 此凝血因子可爲活化的凝血因子。此外，此凝血因子 -30- (27) (27)1353991 可爲無活性形式之凝血因子’例如酶原。此去活性的凝血. 因子可進行活化然後聯結至至少部分免疫球蛋白恒定區。 此去活性的凝血因子可活化後投用至病人，。此外，此去活 性的凝血因子可在.投用之前活化。 . - ' / d .其它生物活性的蛋白質分子 具體實施例之一中，此生物活性分子是受體或者是其 片段或類似物。此受體可表現在細胞表面上，·薄者此受體 可表現在細胞內部。此受.體可爲病毒的受體，.例如CD 4 ' CCR5、CXCR4 ' 1、CD46。此生物活性分.子可爲細 菌的受體。此生物活性分子可爲細菌的集群現象以及感染 之重要的細胞外基質蛋白質或者其片段或類似物\(參_例 如美國專利第：5，6 4 8，2 4 0 ; 5 :1 8 9，0 ] 5 ; 5 , 1 7 5，0 9々號）或粘 著以及感染重要的細菌表面.蛋白.質（參閱例如美國專利第 5:648,24〇號）。此生物活性分子可爲生長因子、.激.素或者 細胞激動素受體、或其片段或類似物，例如TNF、.a爱體、 紅血球生成溱受體、CD25、CD 122,或CD 132。.. 可使用在本發明之嵌合型蛋白質的其它蛋白質分子表 列於前述文獻.(參閱例如美國專利第6 5 0 8 6，8 7 5、6,4 8 5 5 7 2 6 、6,030,6 1 3.號；；^.〇..0 3/0 77 83 4;美國專利.第 2003 -0 2 3 5 5 3 6 A 1 號）。 e .核酸 具體實施例之一中，此生物活性分子是核酸，例如 -31 - (28) (28)1353991 DN A、RNA。在特定的具體實施例中，此生物活性分子是· 可用於RNA干涉（RNAi)之核酸。此核酸分子可爲例如（但 非限制）反義分子或核酶。 反義RNA以及DNA分子之作用可經雜交至目標傳訊 RNA而直接阻塞傳訊RNA之轉譯及預防·蛋白質轉譯。反 義方法包括設計互補至目標基因傳訊RN A之寡核苷酸。 此反義寡核苷酸將結合至此互補目標基因傳訊R: :N A轉錄 本以及防止轉譯。絕對的互補並不須要。’ · ' 本文中序列”互補"至部分之RN A，意指序列具有充分 的互補性能夠與RN A雜交，髟成穩定雙·股體；·於雙股的 反義核酸中，可測試雙股體DN A中的一股，·或可測試三: 股體之形成。雜交之能力將視'雨者'之互補程度及此反義翁 酸之長度而定。一般而言，雜交核酸越長，R.N A可含有 更多的鹽基配對錯誤仍能彤成穩定雙股體（或者三股:體）。 —熟悉此技藝的專業人士可使用標準之方法測定濰'交複合 體的熔點，確定配對錯·誤可容許的程度。 · 反義核酸之長度至少應有六個核酸，較佳之寡核苷酸 長度範圍是6至約50個核酸。在特定的特色之中·，此寡核 苷酸是至少]〇個核酸、至少1 7個核酸、至少2 5個核酸或至' 少5 0個核酸。 ' 龀寡核苷酸可爲單股或雙股的DNA或RNA或其嵌合 型混合物或衍生物或經修飾之版本。此寡核苷酸可在鹽基 部分、醣側鍵、或磷酸鹽主鏈經修飾以例如改良此分子之 穩定性、雜交作用等。此寡核苷酸可包含其它附加的基團 -32 - (29) (29)1353991 :例如多胜肽（例如在活體內導向宿主細胞受體），或促進 運送跨過細胞膜之藥劑（Letsinger et al.198夂Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86 ： 6 5 5 3 ； Lemaitre et al.1 9 8 7, Proc.
Nati· Acad. Sci· USA 84: 648; WC) 88/09810)或血腦屏 障之藥劑（參:閱例如WO 8 9/10134)，雜交啓動器之切割藥 ㈣（黎閱列如..Κ t,〇 i e t a. 1 9 8 8 ; B i ο T e c h n i q u e s - 6 : 9.5 8 )或插 入藥劑（參閱.例如2.Q.n〗98 8, Pharm. Res. 5 : 53$)。·此時寡 核甘酸可聯結至另一分子，例如：肽、雜交觸發之.交聯劑 、運輸劑.、或雜交觸發之切除劑等。 . 周於催化分解目標基因傳訊r N A轉錄本之核酶分子 亦可用以防.止目標基因傳訊rNa .之轉譯r及目標基因產. 物之表現。（參閱例如 WO 90/1 ] 3 64 ; Sarver et al. ] 9.90.5，·:
Science 2 47: .1 22 2-1 22 5.)。 核糖酶是醇素柱的RN A分子，能催化RNA之專一_性 切割。（參閱 R.O s s i ] 9 9 4」C u r r e Μ B i ο ] 〇 g y 4· : 4 6 9)。核.酶 作用之此機制包含此核酶分子與互補目標_.RNA序列_ 性之雜交’接著進行內細胞溶解的切割事件。核酶分子之· 組成成分必須包含與目標基因傳訊RN Α互補之一個或多 個序列，以及必須包含負責傳訊RN A切割熟知的傕化序. 列。此序列可參閱例如美國專利第5,093,246號。 具體實施例之.一中，在專一性識別序列位點分解傳訊. RNA之核糖.·酶可周以消滅目標基因傳訊。·在另二具 體實施例之內：可考慮使用錘頭狀核酶。錘頭狀核酶在與 目標傳訊RNA形成互補鹼基對之旁側區位置分解傳訊 -33- (30) (30)1353991
RNA。唯一的須求是此目標傳訊RNA有二個鹼基：5’-UG-3'之序列。構築以及生產錘頭狀核酶是已知的技藝以 及完整的描述在 Myers 1995，Molecular Biol0gy and Biotechnology : A Comprehensive Desk Reference. VCH
Publishers., New York, and in Haseloff and G e r 1 a c b 1 9 8 8. Nature. 3 3 4 ·； 5 8 5-. ° f.小分子 本發明亦打算使用任何治療性的小分子或藥物作爲本 發明嵌合型蛋白質之之生物活性分子。可使闬於本發明之 嵌合型蛋白質的小分子以及藥物已表列於前述之文獻.（參. 閱例如美國專利第 6S 086,8 75 號;'6,4 8 5,72ό 號；6,03.0/6 .1:.3..: 號；\^ 0 03/0773 3 4號；仍 2003-0235536八1號）。 2 免疫球蛋白.... 本發明之嵌合型胥白:質至少包含一部分免疫球蛋白恒 定區。免疫球蛋.白是包含四個以共價鍵鍵結之蛋白質鏈（ 一個重鍵以及二個輕.鍵）各鏈進一步地包含—個變異區 及一個恒定區。視免疫球蛋白之同功型而定，此重鏈恒定 區包含3或4個恒定區結構區（例如c η 1、CH 2、C Η 3、C .H 4 ) 。一些同功型進〜步包含樞紐區域。 此部分免.疫球蛋白恒定區可得自任何哺乳動物。此部 分免疫球蛋白恒定區可包含部分人類免疫球蛋白恒定區、 非人類靈長類動物的免疫球蛋白恒定區、牛的免疫球蛋白 -34- (31) (31)1353991 恒定區、豬的免疫球蛋白恒定區、海洋動用的免疫球蛋白 恒定區、綿羊的免疫球蛋白fe定區或老鼠的免疫球蛋白恒 定區。 此部分免疫球蛋白恒定區可以重組或合成的方法製作 。此免疫球蛋白可分離自互補DNA庫。此部分免疫球蛋 白恒定區可分離自噬菌體基因庫（參閱例如McCafferty et _ a 1. 1 9 9 Ο . Nature 3 4 8： 5 5 2, Kang e t a 1. 1 9 9 1 . P r o c . Nail. Acad. Sci. USA 88 ： 43 63 ； EP 0 5 8 9 8 7 7 B 1 )。此部分免:. 疫球蛋白恒定區可得自習··知的序列之基因置換（Mark et a]..]9,92，Bio/Techno].lC: 7 7 9 )。.此部分免疫球蛋白恒定'. · 區可分離自·生物體肉之重組（Waterhouse: ei al. 1 993, ’ N u c ] . A c i d R e s .1，： 2 2 6 5 ).。此免'疫'球蛋白·可爲人類'化'的免' 疫球蛋白（美國專利第5,5 8 5,0 8 9號、Jones et a] :1986， N a t υ r e 3 3 2 ： 3 2 3)° 此部分免疫球蛋白恒定區可包含部分免疫球蛋白G、’ 免疫球蛋白A、免疫球蛋白Μ '免疫球蛋白D·、或免疫球 蛋白Ε。具體實施例之-+·中，此免疫球蛋白是免疫球蛋白_ · _ G。在另一具體實施例之丙，此免疫球蛋白是免疫球蛋‘白· G】。在另一具體實施例之內，此免疫球蛋白是免疫球蛋ν · ' 白 G2 〇 . 此部分免疫球蛋白恒定區可包含此全部重'鏈恒定區， 或其片段或類似物。具體實施例之一中’重鏈恒定區可包 含C Η ]結構區、C Η 2結構區、C Η 3結構區 '及/或樞紐區域 。在另一具體實施例中，重鏈恒定區可包含CH]結構區'、 -35 - (32) (32)1353991 CH2結構區、CH3結構區、及/或CH4結構區。 此部分免疫球蛋白恒定區可包含一個Fc片段。Fc片 段可由免疫球蛋白之CH2以及CH3結構區和免疫球蛋白之 樞紐區域組成。此Fc片段可爲免疫球蛋白G1、免疫球蛋 白G2 '免疫ί求蛋白G3或免疫球蛋白G4之Fc片段。在特 定的具體實施例之內.，此部分免疫球蛋白恒定區是免疫球 蛋白G 1之.Fc片段。在另一具體實施例之內，此部分免疫 球蛋白恒定區是免疫球蛋.白G2之Fc片段。· 在另一具體實施例之內.，此部分免疫球蛋白恒定區是' 新生兒的受體Fc (FcRn)之結合伴。FcRn結合伴是任何可 與FcRn受體專一性結合、經FcRn受體之FcRn結合伴活 化主動運輸之分子。專一性結合意〜指在生理條件下二分子： 形成相對穩定的複合體。專一性結合之特徵在 '於高親和性· 以及低至中容量，不同於通常具有低親和性和中至高容量 的非特異性結合Λ弗型的專=性結合其親和性常數；KA高 於1.06 Μ·1，或更佳者髙於ΙΟ8 M:.1。如果必要的話，經各 種結合條件可降低.非專一性結合而實質上不影響專一性結 合。熟悉技藝的專業人士使甩常見技藝可篩選適當的結合 條件例如：分子之濃度、溶液之離子強度、溫度、結合時 間、封阻劑（例如血淸白蛋白、牛奶酪蛋白）之濃度等。’ 此FcRn.受體已分離自許多包括人類的哺乳動物物種 。人類FcRn'猴子FcRn'老鼠FcRn、以及小鼠之FcRn 序列是習知的序列（S t 〇 r y e t a j . 1 9 9 4，J . E X p . M e d · 1 8 0 : 2 3 7 7 )。在相對低酸鹸度下，此FcRn受體結合免疫球蛋白 -36 - (33) (33)1353991 G (但不是其它免疫球蛋白類，例如免疫球蛋白a、免疫球 蛋白Μ、免疫球蛋白D、以及免疫球蛋白E)，經細胞內 腔活化的運輸此免疫球蛋白G至血淸方向，以及然後在 組織液中相對地較高的酸鹼度下釋放此免疫球蛋白G。它： 是表現在成人’上皮的組織（美國專利.第6:48 5,7 26 .、 6;030;61 3、6,086,875 號；W0 03/077834 ; US: 20 03-: 0235 53 6Α】）’包括肺.及腸·上皮（Israe】et. al.1 9 5 75. Immunology 92 : 6 9)、腎的近端管狀上皮.（（K:〇bay.ashi. ei a 1 · 2 0 0 2 ; A m J . P h y s i 〇 】...R e r/a ] p h y s i ο 1.2 8 2 : F 3 5 8 )與鼻的： 上皮、陰道的表面.，以及膽汁.樹的.表面。 :；； 本發明之Fc,Rn結合伴包含任何可與FcRii受體專一 結合之分子，包括全部免疫球蛋白，此免疫球蛋白G之. F c片段，以及包含此完全結合區域之此F cR.n.受體的其.它 片，段。免疫球蛋白G之結·合至FcRn受體的；Fc部分的區 域已經藉由X射線結晶學詳加探討（B u r ra e i s t e r e t、a ] · 1 9 9 4， Nature 3 72 : 3 79)。Fc與 FcRn的主要接觸區域是接近 CH2以及CH3結構區之接合點。所有Fc-Fc之接觸是在單. —的Ig重+鏈之內。此FcRn結合伴包含全部免疫球蛋白G ' Fc片段之免疫球蛋白g.、以及包含FcRn完整的結合區 域之免疫球蛋白 G的其它片段。主要的，接觸位點'包含. CH2結構區之胺基酸殘基248、250-257、272、2 85、288 、2 9 0 - 2 9 1、3 0 8 - 3 1 ]、以及3丨4以及 C Η 3結構區之胺基酸 殘基3 8 5 - 3 8 7、4 2 8、以及4 3 3 - 4 3 6。所有免疫球蛋白或免 疫球蛋白片段、或區域之胺基酸編號是參考.K a b a t - e t -37 - (34) (34)1353991 al.l991; Sequences of Proteins of Immunological Interest, U.S. Department of Public Health, Bethesda, MD。
此免疫球蛋白G之F c區域可經確認方法修飾.，例如 位點定向誘變及其類似者，產生任意地經F c R η .結合的經 修飾之免疫球蛋白G或其Fc片段或部份。該修飾作用包 含修飾FcR,n接.觸位點遙遠的位點與修飾接觸.位點內之位 點’以保存或甚至增強與FcRn之結合。例如人類免疫球 蛋白G ] fc(FCyl)內之下列的單一胺基酸殘基可經取代而 未顯著的喪失F c與F cRn之結合:親和力：ρ·2 3 8 A、. S 2 3 9 A 、K 2. 4 6 A 、K 2 4 8 A 、D 2 4 9 A ' M2 5 2 A、 T2 5 <5 A ..、 E2 5 8 A. ' 丁 2 6 0 A D2 65 A 、 S267A ' H2 6 8.A、 E 2 6 9 A 、 D 2 7 0 A : ' E2 72 A 、 L274 A > . N 2 7 6 A、 Y27 3A ' D 2 8 0 A、 V282A 、 E.2 S 3 A ·· H 2 8 5 A N . N 2 8 6 A、 T289A 、 K 2 9 0 A ' R 2 9 2 A、 E 2 9 3 A > E2 9 1 - A 、 Q295A ' Y296F 、 N 2 9 7 A ' S298A 、 Y 3 0 0 F s R3：0 1 A 、 .V 3 03 A、 V 3 0 5 A ' T 3 0 7 A、 L309A 、 Q 3 Ϊ ] A D 3.1 2 A > N 3 1. 5 A '· K 3 1 7 A E 3 1 8 A、 K320A 、 K. 3 2 2 A > S 3 2 4 A . N K326A 、 A 3 2 7 Q ' P 3 29A A330Q 、 P 3 3 1 A 、 E3 3 3 A K.3 3 4A ' 丁 3 3 5 A、 S 3 3 7 A、. K 3 3 8 A、 K 3 4 0 A Q3 42A 、 R 3 4 4 A 、 E 3 4 5 A ' Q347A 、 R 3 5.5 A、 E3 5 6A \ M3 5 8A 、 T359A 、 K 3 6.0 A、 N 3 6 1 A. ' Q362A 、 Y 3 7 3 A > S 3 7 5 A 、. D376A 、 A378Q 、 E380A 、 E382A 、 S 3 8 3 A ，N384A 、 Q386A ' E3 E8A 、 N389A ' N390A 、 Y39 F、K392A ' L 3 9 8 A ' S400A ' D401 A、 D4 】3 A+、 K4 14 A ' R 4 】6 A Q4 1 8 A 、- Q419A 、 N4 21 A 、 V 4 2 2 A ' S424A ' -38- (35) (35)1353991 E430A 、 N434A 、 T437A 、 Q438A 、 K429A 、 S440A 、 S444A,以及K44 7A'其中例如p23 8a代表野生型脯胺酸 在位置編號2 3 8經丙胺酸取代。單—突變可爲引入F c得到 一百種以上之不同於天然F c的F c R η結合伴9此外，可共 同引入二、三、或更多個此類個別地突變之組合，得到一 百種以上之FcRn結合伴》 某些上述之突變可賦予FcRn結合伴新功能。例如， 在一個具體實施例中·引入' _N297A，可去除高度保留的.N-糖基化作用位點.。此突變之效應是減低產生免疫性從而 提高F cRxi結合伴的循環半衰期，.以及使F c Rn結合伴不 能結合至 FcyRI、FcyRIIA ' FcyRIIB ' 以及 FcyRIIlA，而 未累及 FcRn .之親和性（Routledge . et al · 1 995; Transplantation 60 ： .847 ； Friend e t a 1. 1 9 9 9,
Transplantation 68 1 63 2 ; Shields et aJ.1995, J. Bio.].
Chem. 2 76 : 659])。上述因突變產生新功能的其它實施爲. 在一些實例中增加F cRn·親和力使之超過野生型之親和.力' 。增加親和力可代表_增加”結合”速率，減低”離開”速率或 同時增加"結合"速率以及減低"離開”速率。相信包含 T256A、 T307A' E380A、以及 N434A 之突變可增力D FcRn 之親和力（Shields et al_200], J. Biol. Chem . 276 : 6591) ο [0] 2 9]此外，至少三種人類Fc γ受體可識別免疫球 蛋白 G內之較低樞紐區域（一般而言胺基酸2 34 _ 2 3 7)之結 合部位。因此，另一新功能以及可能減低產生免疫性之實 -39- (36) (36)1353991 施例是由此區域之突變引起’例如將人類免疫球蛋白G 1 -” ELLG "之胺基酸2 3 3 - 2 3 6經對應的免疫球蛋白G 2 " P V A，，序 列取代（刪除一個胺基酸）。據顯示FcyR】、FcyRII '以及 FeyRIII，其可中介各種不同的效應子功能，當引入該突 變後將不結合至免疫球蛋白G 1。 W ar d a.n d Gh eii e. 1 9 95 , Therapeutic Immunology 2 ·· 77 以及 Armour e t a 1. 1 9 9 9 , E u. J. Immunol. 29 ： 2613 c 具體實施例之一中，此 FcRn結合伴是包括序+列 PICNSSMISNTP (序列確認號碼 : ·2 6 )之多肽..以及可視.需要 進一步的包括，其係選自 HQSLGTQ(序列·.確認號碼：+.27) 、HQNLSDGK (序列確認號碼：2 8 ) H QN I S D G K (序列確 認號碼：2 9 ) '或V I S S H L G Q (序列確認號..碼·： .3 0)(美國專V 利第5;7 3 9:2 7 7號）之序列。 .. . 二個Fc.Rn受體可結合制單一的Fc分子。晶.體學資.料· 顯示各FcRn:·.分子結合Fc同源二元體的一個單二·多肽。·具 體實施例之'一中，此FcRn結合伴，例如免疫球蛋白G之 —個F c片段聯結至一個生物活性分子，提供口服地·、口 頰的、舌下的、直腸地、陰道的、氣溶膠鼻投用的或經由 肺的路徑、或經由眼睛的路徑運送此生物活性分子的方法 。在另—具體實施例之內，此嵌合型蛋白質可侵入性的’ 例如皮下的、靜脈內地投周。 熟悉此技藝之專業人士將瞭解本發明嵌合型蛋白質使 用的部份免疫球蛋白恒定區可包含突變體或其類似物，或 可包含經化學修飾之免疫球蛋白恆定區（例如聚乙二醇化 -40 - (37) (37)1353991 的），或其片段（參閱例如 Aslam and Dent 1998; Bioconjugation : Protein Coupling Techniques For the Biomedical Sciences Macmilan Reference. London) » 例如 突變可提供F.cRn之增強結合的FcRn結合伴。本發明之 嵌合型蛋白質亦可是至少部分免疫球蛋白恒定區之肽模仿 物’例如Fc片段..的模仿肽或..FcRn結合伴的肽模仿物。具' 體實施例之一中，此肽模仿物可使用噬菌體展示或經由化 學基因庫篩普檢確認（參.閱例如..McCafferty et al’/19.90; Nature 3 4 8 ： 5 52, Kang et al.1991, Proc. Natl. Acad. Sci. U S A 8 8 · 4 3 6 3 ; E P 0 5 8 9 8 .7 7 B 1)。 3.任選的連結子 . 本發明之嵌合型蛋白質可視需要包含至少一個連結子 分子。此連結子可由任何有機分子組成。具體實施例之一 中，此連結子是聚乙二醇（PEG)。在另一具體實施例之內 ，此連結子包含胺基酸。.此.連結子可包含1 -·5個胺基酸' 1-10個胺基酸、1-20個胺基酸、.1.0-50個胺基酸、50-100個’ 胺基酸、1 00-2.00胺基"酸。具體實施例之一中，'此連結子 是八個胺基酸連結子EFAGA AAV (序列確認號碼：3Ί ).‘。： 此連結子可包含此序列G η。此連結子可包含此序歹lj (GA)n (序歹IJ確認號碼：32)。此連結子可包含此序歹IJ' (GGS)n(序列確認號碼：33)。此連結子可包含此序列 (GGS)n(GGGGS)n (序歹U確認號碼：34)。此案例中* n'可 爲從]-1 〇 之整數’即].、.2、3、4、5、6、7、8 ' ·9、] 0。 -41 - (38) (38)1353991 連結子之實施例包括（但非限於）：GGG (序列確認號碼： 35)、SGGSGGS(序列確認號碼：36)、GGSGGSGGSGGSGG 克（序列確.認號碼：37)、GGSGGSGGGGSG.GGGSC序列確 認號碼：38)、GGSGGSGGSGGSGGSGGS(序歹IJ確認號碼： 3 9)=此連結子不會去除或者減低嵌合型蛋白質之.生物活 性。視需要，此連結子可提高嵌合型蛋白質之生物活性， 例如經進一步的縮減位阻效應以及使生物活.性的分.子可更. 親近其目標.結.合部位。. 在特定的具體實施例中，干擾素α之連結子的長度爲. 1 5 -2 5涸胺基:酸。在另一特定的具體實施例中，千擾素α 之連結子的長度爲1 5·· 20個胺基酸。在另一特定的具體實 施例中，干擾素α之連結子的長度爲！ 0-25個·胺基酸。在 另一特定的具體實施例中，干擾素之連結子的長度爲1: 5 個胺基酸。具體實施例之一中，千擾素α.之連結子：爲 (G G G G S ) η (序歹!j確認號碼：4 0 )，其中G代表甘胺酸，...S :代 表絲胺酸，η爲.1 - 1 0之整數。在特定的具體實施例中_ η爲-4 .用於專一性結合伴之嵌合型蛋白質二元化作用.. 具體實施例之一中，本發明之嵌合型蛋白質包含至少 由第一結構區組成之第一多胜鏈，該第一.結構區具有至少 一個專一性結合伴，以及至少由第二結構區組成之第二多 胜鏈，其中該第二結構區是該第一結構區之專一性結合伴 。如此嵌合型蛋白質包含由於第一結構區和第二結構區之 -42- (39) 1353991 元化之多肽。使用異I1 生結 藝上是已知的方法（美國 相互作用而能與另一多肽進行二 構區使抗體二元化之方法在本技 專利第 5,807,705以及 5,9l0.573f 虎
Kostel n.y et a 1, ] 9 9 2 . J. Immunol. 148(5) ： 1547)。 —兀化作用可經形成共價鍵而發生，或另外經非共價 鍵，例如：忌水性交互作箱、v.an der Waa】，s力:'兩性 類，例如（但非限..於 > 螺.旋、電價_電價相互作用的帶有相 反電價Z胺基酸，例如（但非限於）離胺酸以及天門冬胺酸 、fra胺酸以及Is胺酸之交錯結合而發生’.在—具體實施例 中，此結構區是包含螺旋、轉彎以及另一螺旋之螺旋束。 在另一具體實施例之內，此結搆區是具有數個重覆胺基酸 其中第七個胺基酸是白胺酸殘基，.之肽的白.胺酸拉鏈。具體. 實施例之一中，此專一性結合伴是f〇s/jun。（參閱
Brandon et al.199 1, Introduction To Protein Structure Garland P u b 1 i sh i n g, N e w Ύ 〇r ].:) 〇. .. 在另一具體賓施例之中’結合是經化學聯結調節（參 閱 Brennan et a 1. 1 985. Science 229: 8])。在此.具體實施 例中=其係經分解完整的免疫球蛋白 '或嵌合型蛋白質至 少包含一部分免疫球蛋白恒，定區產生重鏈片段。此類窗片 在二硫基複合劑亞砷酸鈉存在下還原，以穩定鄰接的二硫 基並預防分子間二硫化物之形成。然後將產生之斷片轉換 成硫硝基苯甲酸鹽（丁NB)衍生物。然後將其中一個TNB衍 生物用氫硫基乙胺還原再轉換成重鏈片段硫醇，以及與等 莫耳的量的其他TNB衍生物混合以形成嵌合型二元體。' -43- (40) 1353991 D.核酸 本發明係關於各自包含能編碼至少部分 蛋白質之核酸序列的第一核酸建構體和第二 具體實施例之一中，第一核酸建構體包含編 蛋白恒定區操作地聯結至編碼一個生物活性 DMA序列之.核.酸序列，，.以及該第二個DNA 碼一個免疫·球蛋白恒定:區而無編碼具生物活 個DNA序到的+DNA序列。.. 此生物活性分子可包括例如（但非限有 抑制劑、凝血因子〕生長因子或荷爾蒙、·或 上述分子的類似物、或片段。此核酸序列亦 技藝上已知的序列或元件.(例如：啓動子、 苷酸序列、親和標記物.）.。具體實施例之一 列之第二建構體可視需要包含編.碼置於編碼 子與部分之此免疫球蛋白恒定區的核酸序列 核酸序列。此核酸序列..之第二DNA建構體 置於編碼此生物活性分子及/或部分之此免 區的核酸序歹:!：!之前或者之後的連結子序列。 具體實施例之一中，此核酸建構體是由 另一具體實施例之一中，.此核酸建構體是由 此核酸建構體可爲載體，例如病毒的載體或 例之病毒的載體包括（但非限於）腺病毒載體 的載體或者鼠科動物白血病病毒載體。質體 (但非限於）pUC、pGEM以及pGEX。 本發明嵌合型 核酸建構體+。 碼部分免疫球 分子的第二個 建構體包含編 性分子之第二 ill ):病毒融合 受體、或任何 可包含額外的 增強子、聚腺 中，此核酸序 具生物活性分 間之連結子的 可視需要包含 疫球蛋白恒定 DNA組成。 RNA組成。 者質體。實施 、腺病毒相關 之實施例包含 -44 - (41) (41)1353991 具體實施例之一中，此核酸建構體包含圖3a之核酸 序列（序列確認號碼：7)。具體實施例之一中’此核.酸建 構體包含圖3 b之核酸序列（序列確認號碼：9)。具體實施 例之一中，此核酸建構體包含圖3 c之核酸序列（序列確認 號碼：〗1 )。具體實施例之一中，此核酸建構體包含圖3 d -之核酸序列（序列確認號碼^】3 )。具體實施例之一中0此 核酸建構體包含圖3 e之核酸序列（序列確認號碼：9具丨 體實施例之一中，此核酸建構體包含圖3f .之核酸序列.（序 列確認號碼：]7).。具體實施例之一中’此核酸建構體包 含圖3g之核酸序列（序列確認號碼：19)。具體實施例.之一 中，此核酸建搆體包含圖3 h之核酸序列（序列確認號碼: 2 1 )。具體實施例之·一中，此核·酸建棒體包含圖3 i之核酸‘· 序列（序列確認號碼：2 3 )。具體實施例之一中，此核.酸建： 構.體包含圖3j之核酸序列（序列確認號碼：.·25·)。 · 由於習知的遺傳密碼的退化現象，一種以上之密碼子' 可編碼相同胺基酸·. DNA序列可與序列確認號碼··'. 7、9 、：1 ] ' 13、15、】7、19、21、23或25相異以及仍編碼分別 對應至序列確認號碼：6、8、1 0 ' ] 2、】4.、1 6、：】8、2 0、 22或24的胺基酸序列之多肽。.該變異體DMA序列可爲沈. 默突變的結果（例如發生於PCR放大時），或可爲天然的.序 列誘變之產物。如此本發明提供編碼本發明多胜肽之分離·.’ 的DNA序列’其係選自：（a)包含序列確認號碼：7、9、 ]]、]3、1 5、] 7、1 9 ' 2 ] ' 2 3 或 2 5 之核苷酸序列的 D N A :(b)編碼序列確認號碼：6、8、1 0、] 2、] 4、】6. ' I 8、 -45 - (42) (42)1353991 20、22或24之多胜肽的DN A; (c)能在嚴格之條件下雜交 至（a)或（b) DNA之編碼本發明多胜肽之DMA; (d.)能在 高嚴格之條件下雜交至（a)或（b) DN A之編碼本發明多胜肽 之DNA ;以及（e)定義於（a) ' (b)、（c)、或（d)中編碼本發 明多胜肽之DNA經遺.傳密碼退化產生的DNA。.因此該 D N A序列編碼之多胜肽是包含於本發明。 在另一.具·.體實施例之內‘，包含編碼本發明嵌合型蛋白 質序列之核酸分子亦可由與天.然的序列至少是.8 〇 %相同之 核苷酸序列組成。具體實施例中，編碼本發明.嵌合型蛋白 質序列之核酸分子亦可由與天然的序列至少是9 0 %、至少 是9 5 °/〇、至少是9 8 % ·、至少是9 9 %相同之核苷酸序列組成. 。.天然的序列可·包含任何不是經‘人類改變之.D N A序列V 相同百分比可經目視檢驗以及數學上的計算測定·。此外二 種核酸序列之相同百分比可經使用描述於 Devereux et: a】.1984，IN1 ucl.Acids Res:12: 387，以及可得自 University of Wisconsin Genetics Computer Group (UWGCG)之 GAP 電腦程式版本6,0比較序列資料·加以測定。G AP程式較佳 的預設參數包括：（1 )核酸之單元比較基質.（其中內含數値 1表示相同以及〇表示不相同），以及G r i b s k ο V a n d B u r g e s s ]9865 Nuc】. Acids Res.】4: 6745之加權比較基質，如描述 於 Schwartz and Day hoff: eds.]9795 Atlas of Protein
Sequence and Structure, National Biomedical Research F o u n d a t i ο n : p p . 3 5 3 · 3 5 8 ; ( 2 )各間隙之處罰爲3 · 0以及各間. 隙符號有額外的〇. ] 〇處罰；以及（3)終點間隙無處罰。熟悉 -46 - (43) (43)1353991 此技藝的專業人士使用之其它序列比較程式亦可使用。 E.合成之嵌合型蛋白質 至少包含一部分免疫球蛋白恒定區以及一個生物活性 分子的嵌合型蛋白質可使用技藝上已知的技藝合成。例如 本發明之嵌合型蛋白質可重組的於細胞之內合成(參閱例 如 Sair»brook et a 1. 1 9 8 9 ； Molecular Cloning A L ab oratory1 Manual. Cold Spring Harbor Laboratory. N.Y. and A.usube.j e t a !. ], 9 8 9 . Current Protocols in Molecular Bioiogy.· Greene Publishing Associates and W i 】e y I n t e r s c i .e n c ε ; · N . Y .)。此外东發明之嵌合型蛋白質可使用習知的合成方 法例如固相合成法合成。合成的技藝是技藝.上已知的技藝、 (、参閱例如 M e r r i f i e Ϊ d . 1 9 73. Chemical Polypeptides*, (K a. t s o y a n ii i s and Panayotis e d s . ) pp. : 335.-.61 ；
Mi e r r i f i e ] d 1 9 6 3 : J Am. C h e m .. Soc. 85: ,2 14 9.; D a v i is e t a 1 .1 9 8 5, B i 〇 c hem. Inti . ]0 : 394 ； Finn et a 1 . 1 9 7 6, The Pr ο i e i n s (3d ed.) 2 ： 10 5 : Erikson < a].1 976, •The Pr o t e i n s (3d e d.) 2 ： 257 ；U . S . P at en t No 3 :94 1.:7 63 ) 。此 外 本發明 之嵌 合型蛋白質可使用組合之重 組 以及合成 的方 法 合成。 在某 些應用上， 可有利的使用重 組 方法或組 合之 重 組以及 合成 的方法。 編碼 -個 生物活性分子的核酸可使用 技 藝上已知 的重 組 技藝立 即合 成·。此外可化學合成此肽類 〇 本發明之 核酸 可 經技藝 上已 知的標準 方法合成，例如; 經‘ 陵用自動 化的 •47- (44) (44)1353991 δ 成(例如購自 Bi〇search: Applied Biosysteriis 等） E例如：硫代磷酸（酯）寡核苷酸可經S t e i n e.t a 1 · l 9 8 3 , NUel —AeidS Res·16: 3209之方法合成 '甲基膦酸酯寡核苷 酸可經使用可控孔度之坡璃聚合物支持物製備，如描述於 Sarin et a t. 1 9 8 8 : ρ Γ 〇 c . Natl. Acad. Sci. USA 85 ： 744 8 ° 核酸合成之其.他方法是技藝上已知的技藝。，（參閱例如美 國專.利第 6 : 0 1 5,8 81 6，2 8 ] 3 3.1 ; 6 :4 6 9:1 3 6 號）。 編碼免疫球蛋白恆定區.、或.其片段之DN A.序列可選 殖自技藝上已知的各種基因體或互補的D,N A基因庫.。使 用探針方法分離該PNA序列之技藝是習見的技藝以及是 熟悉此技藝的專業人士所熟贫i。分離該DN A序列之探針 可基於發表的DKA序列（參閱例如vHieter et ai. Γ9 8 0，Ce.U. 2 2 : 1 9 7 - 2 0 7)。可使用揭示於Mullis et a·】·（美國專利第 4:683,195號）以及Mu. 〗lis (美國專利第4,6 8 3,202號）之聚合 酶連鎖反應（PC.R)方法。分離DNA序列時，基因庫之選擇 以及探針之選擇爲平常的熟悉此技藝的專業人士所熟知。 此外，編碼免疫球蛋白或其片段之DNA序列可得自技藝 上已知含有免·疫球蛋白或其片段之載體。 . 爲了產生重組體.，將編碼部分本發明嵌合型蛋白質（ 例如部分免疫'球蛋白恒定區）之第一聚核苷酸序列以及編 碼部分本發明嵌合型蛋白質（例如部分免疫球蛋白恒定區 以及一個生物活性分子）之第二聚核苷酸序列插入到適當 的載體，即.含有插入編碼序列轉錄以及轉譯必要的元件， 或當爲RNA病毒的載體時食有複製以及轉譯必要的元 -48- (45) (45)1353991 件之載體。編碼此嵌合型蛋白質之核酸係插入的到此載體 適當的閱讀框架。 然後將此表現載體轉染或共轉染到適當的標的細胞， 彼將表現此多胜肽。轉染技藝是已知的技藝上包括（但非 限於）磷酸鹽沈澱（Wigler et al. 1 9 78，Cell 1 4 : 725)以及電 穿孔法（（Ν· e u ni a ·η n e.t a 丨..1 9 ..8 2，Ε Μ Β Ο，J · 1 : 8 4 .1); .、'以及基 於脂質體之試劑=可利用各種宿主表現載體系統表達此嵌 合型蛋白質，本文之描述包括原核的或真核細胞。此類細 胞包括（但非.限於）轉形內含適當的編碼序列之重組噬菌體 DNA或者質體DNA表現載體之微生物例如細菌（例如大腸 桿菌）；轉形內.含適當.的編碼序列之重組酵母菌或者真·菌 表現載體的酵母·菌或者絲狀真菌·； 感染內含適當·的編碼序' 列之重組病毒表現載.體（例如桿狀病毒）的昆蟲細胞系統； 感染內含適當的編碼序列之重組病毒表現載體（例如花椰 菜花葉病毒或菸草花葉病毒）或轉形重組質體表現載.體..(例 如Ή質體）的植物細胞系.統；.或動物細胞.系統，包括哺乳 動物的細胞（例如CHO、Cos、HeLa細胞）。.. 當本發明之嵌合型蛋白質是在原核細胞重組合成時， 它可令人滿意的再折疊此嵌合型蛋白質。此方法製作之嵌 合型蛋白質.可使用技藝上已知的條件，例如還原條件以及 然後用PBS緩慢的透析·，再折疊成生物活性的構像。 視使用之表現系統而定，然後用在此技藝中已爲大家 接受的方法.（例如親和層析法、大小排阻層析 '離子交換 色譜法）分離表現的嵌合型蛋白質。 -49 - (46) (46)1353991 此表現載體可編碼標記以容易的純化此重組製作之嵌 合型蛋白質。實施例包括（但非限於）：載體 p U R 2 7 8 ( R u t h e r et al.1983，EMBC)，其中在此描述之嵌合. 型蛋白質編碼序列可連結到此載體之Uc z編碼區的同框 架上，而製作雜合體蛋白質；可使用pGEX載體表達與谷 胱甘肽S-轉移酶（GST)標籤混合之本發明嵌合型蛋白質。·-此類蛋白質通常是可溶解的以及是可容易地經吸附至.谷胱 甘肽-瓊脂糖圓珠：接著在自由谷胱甘肽存在下溶析'，純-化自細胞。此載體包含切割位點（凝血酶或Xa :因子蛋白酶' 或者 P rescission Pretease rM (Pharmacia, Peapack.，N . .T.)) 可在純化之後容易的去除標籤〜 · - -爲了增加產率，可設計編碼多_·重單位之本發明嵌合型' 蛋白質之經酵素的切割位點分離的多苷核酸。產生的多· 可經分解（例如經適當的酵素處理）回復多肽單位—此可增 加經單一啓動于驅動之多胜肽的產率。當使.用適當的病毒 表現系統時，·係直接從轉錄產物的內部轉譯傳訊· RN A編 碼之各多肽；例如經內部的核糖體進入位點，IRES。因此 ，可使轉錄單一的、大的多順反子型傳訊RNA·之多順反'. 子型建構體，轉譯多重、個別地多胜肽。此解決方式去馀_ 產生以及多蛋白的酵素加工步驟以及可顯箸的增加經單一 啓動子驅動的多肽之產率。 ._ · 用於轉型之載體通常含有一個可選擇的標記，用以確 認轉形株。在細菌的系統中，其可包含一個抗生素，例如 氨比西林或卡那黴素之抗藥基因。用於培養哺乳動物細胞· -50 - (47) (47)1353991 時，可選擇標識包含抗藥基因，例如新黴素、潮黴素、以 及甲胺蝶呤之抗藥基因。可選擇的標記可爲一個可放大之 選擇性標記。可放大之選擇性標記之一是DHFR基因。另 一可放大之.選.擇性標記是DHFR互補DNA(Simons.en and Levinson 1 9.8 3 . P r o c . N a 11. Acad . S c i. USA 80: 2495)。可 選擇的榇識評估於..T hi.】】y.. (Mam+mali an Cell Technology， B u tter worth +P 口+b 1 i she.rs，.. S t,o‘n eh am , M A )以及選擇' 可選擇'的 標識是爲平常熟悉此技藝的專業人士所熟知。. 可選擇的標識可用分開的質體同時與重要的基因引入 細胞’或彼可在相同質體上引入細胞。若在相同質體上， 可選擇的標記以及重要的基因可受不同啓動子或相同啓動_ 子.的控制；捧一安排會產生雙順反·子型信息。此類型之構 築體是技藝上已知的類型（例如美國專利第4，7 1 3 : 3 3 9號）。’ · 表現系.統之表現元·件視其強度以及專一性而變化。 視使用之宿主/載體系統而定，+在表現載體之内可使用任 何數目之適當的轉錄以及轉譯元件，包括既存的以及可誘 發的啓動子·。.例如當選殖於細菌的系統之內，可使用可誘 發的啓動子例如.爲.嗤菌：體 Α之 pL、plac : ptrp'、 pi a c(ptrp-l a;c·.混合啓動子')及其類似者；當選殖在昆蟲細 胞系統之內’可使用之啓動子例如爲桿狀病毒多面體啓動 子；當選殖在植物細胞系統之內，可使用滬自植物細胞染 色體之啓動子（例如熱休克啓動子；小次單元體之 IUJBISCO啓動子；葉綠素a/b結合蛋白質’啓動子）或植物 病毒之啓動子（例如CaMV.之3 5S RNA啓動子；TMV之外 -51 - (48) (48)1353991 殼蛋白啓動子）；當選殖在哺乳動物的細胞系統之內，可 使用源自哺乳動物的細胞染色體之啓動子（例如金屬硫蛋 白啓動子）或哺乳動物病毒之啓動子（例如腺病毒後期的啓 動子；牛痘病毒7.5 K啓動子）；當產生之細胞株含有多套 之表現產物，可使用具有適當的選擇標記以的 SV40-、 BPV和EBV爲基.礎的載體。 .：. 在使用植物表現載體之案例中，表現編碼直線的，或·者 非環化形式之本發明嵌合型蛋白·質.之序列可經許多.啓動子 中任何之啓動子驅動。例如，可使闬的病毒啓.動子例如爲 C a IVi V 之 3 5 S R N A 以及】9 S R.N A 啓動子.(B r i s s ο n e t a】.〗9 8 4，Nature 3 1 Ο : 5 1 1-5 14)，或TMV之外殼蛋白啓.動 子（T a k a in a t s u e t . a ].. 1 9 8 7 ; Ε Μ Β· 0 J , 6 : 3 Ο 7 · 3 1 1 ) ;·此外可· 使闬之植物啓動子例如爲R UB I S C 0小次單元體之·啓動子 (Coruzzi et al.1984, EMBO J. 3 ： 1671-16 8 0 ί Broglie et a 1. 1 9 8 4，S c i enc e 2 2 4 : 8 : 3 8 - 8 4 3 )或熱休克啓動子，例如 大豆之 hsp】7.5-E S h.sp]7.3-B(GurIeyetal.] 986, Mo.]· Cell. Biel. 6 : 5 5 9-5 6 5 )。此類:構築體可使用ΤΓ質體' Ri 質體、植物病毒.載體、定向 DNA轉化、顯微注射.> 電穿 孔法等引入植物細胞。該技藝之評論可參閲例如
Weissbach & Weissbach 19 8 8, Methods for Plant Molecular Biology, Academic P r e s s 5 N Y ; Section VIII， p p . 4 2 1 - 4 6 3 ；以及 Grierson & Corey 1 98 8, Plant Molecular Biology. 2d Ed.. Blackie. London； Ch. 7-9 、〇 在產生本發明嵌合型蛋白.質之昆蟲表現系統之內，使 -52 - (49) (49)1353991 周苜蓿銀紋夜蛾核型多角體病毒（A cNPV)作爲載體表達此 外來基因。此病毒生長在草地黏蟲細胞之內.。編碼序列可 爲選殖入此病毒之非必要的區域（例如多面體基.因）以及在 A c N P V啓動子（例如多面體啓動子）的控制之下。成功的插 入編碼序列將·導致多面體基因去活化以及產生.非閉塞的重 組體病毒（即缺少此多面體基因編碼之蛋白質膜的病毒.）。 然後用此重組病毒感染草地黏蟲細胞以表現插.入的基因 (參閱例如：S m i t h . e t ’ a.】.】'9 8 3，J . V i r a ] · 4 6 : 5.S ;美.國專利 第4 5 2 ] 5，Ο 5 1 .號）。此.表現系統進一步的實.施例可參見 Α υ s u b e I fe t a i .. e d s . 1 9 8 9 . Current Protocols in Molecular. Biology. V 〇 1. ·. 2 . G r e e n e Publish. Assoc. & W .i! e y I n j e r s c i e n c e ° -., »· · - - 可用以表覌本發明嵌合型蛋白.質之另一系統是麩胺醯 胺酸合成基因表現系統，亦稱爲此” G S表現系.統”（.L〇.nza Biologies •PLL Berkshire UK)。此表現系統是詳細描述於 美國專利第5,+981:2〗6號。， .... 在哺乳動·物的.宿主細胞之內，可使用許多以病毒雳基 礎的表現系.統。在使用腺病毒作表現載體的案例肉·，編碼 序列可連結至腺.病'毒轉錄/轉.譯控制複合體，例如後期的 啓動子以及三方聯席前導:序列。然後此嵌合基因可經體外 或活體內之重組插入腺病毒染色體。插入病毒基因體非必 需的區域（例如區域E1或E 3 )將導致重組體病毒活化和能 在感染的宿主之內表現肽（參閱例如L 〇 g a η . & S h e n k . I 9 8 4 , P r o c . N a t ]. A c a d . s c i. U S A 8.1 : 3 6 5 5 )。此外，可使甩牛 -53 · (50) (50)1353991 !s7.5 K 啓動子（參閱例如 Mackett et al.1982，Proc..Natl. A c a d . S c i _ U S A 7 9 : 7 4 1 5 ; M a c k e 11 e t a 1.1 9 8 4 : J · "V i r 〇 l 49 ： 8 5 7 ； P an i cali et al.1 982, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 79 : 4927)。 在使用腺病毒作表現載體的案例內，編碼序列可連結 至腺病毒轉錄/轉譯控制複合體.，例如後期的啓動子以及. 三方聯席前導序列。然後此嵌合基因可經體外或活體內之 重組插入腺病毒染色體。.插入病毒基因體非必需的區.域..（ 例如區域E1或E3 )將導致重組體病毒活化和能在感染的 宿主心內表現(寥1閱例如 Log a.n & Shenk 1:9 84，Pr〇c. NaU· Acad. Sci. US A 8 1 : 3 65 5 )。此外，可使用牛痘 7.5 K 啓勤子（參閱例如..M a c k e 11 e t a 1. ] 9 8 2 , . P r o c,. N a 11.. A c a d.. Sci.. USA 79 ： 7415 ； Mackett et al.1 984, J. Virol. 49 ： 8 5 7 ; Pan i cali et al.1 9 8 2, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 79 ：4927)。 內含嵌合型蛋白質DNA構築體之宿主細胞是生長於 —個適當的生長培養液。本文術語之”適當的生長培養液，， 意指內含細胞生長須要之營養物的培養液。細胞生長須要 之營養物可包.含碳源 '氮源、必需胺基酸、維生素、礦物 質以及生長因子。.可視需要此培養液可含有小牛血淸或胎 牛血淸。具體實施例之一中，此培養液實質上不含有免疫 球蛋白G。：生長培養液一般而言可經DNA建構體上可選 擇的標記或者共轉染此DNA建築體，例如藥物選擇或缺 乏必需的營養物，選擇內含DNA建構體之細胞。培養的 -54 - (51) (51)1353991 晡乳動物細胞一般而言是生長於內含或不含血淸的培養液 (例如MEM、DMEM)。選擇特定的細胞株之適當的培養液 是平常熟悉此技藝的專業人士所熟知。 此重組製作之本發明嵌合型蛋白質可分離自細胞培養 液。從細胞材料中分離生長轉形或轉染的宿主細胞之適當 地培養液，以及顯示嵌合型蛋白質之存在。偵測嵌合型蛋 白質之方法之一.，例如是經結合嵌合型蛋白質或部份之嵌 合型蛋白質與識別本發明嵌合型蛋白質之專一性抗體。_ 抗··嵌合型蛋白質之抗體可爲此嵌合型蛋白質誘'發之:單株: 或多株抗體。例如嵌合型蛋白質.至少包含一部分免疫球蛋 白恒定區。識別許多免疫球蛋白恒定區之抗體是技藝上已 知的以及是可市售得之。.可使周抗體、進.行酵·素.聯結免疫抗. 體檢測法或西方轉漬法以偵測本發明嵌合型蛋白質之存在: 〇 本發明之嵌合型蛋白質可在導入外來基因的動物，例 如齧齒動物、牛、豬、羊、或山羊之內合成。本文術語之 基因轉殖動物意指基.因組中倂入外來基因之非人類動物 。因爲基因是存在於種系組織，它可從親代傳至後代：+。外 源基因是引入單一的胚胎細胞（Brinster et ai.】9 8 5, Proc. Nail. Acad. Sc i. USA 82: 4438)。產生基因轉殖動物之方 法是已知的技藝，包括轉基因產生免疫球蛋白分子 (Wagner et al.1981，Proc· Natl. Acad. Sci. USA 78 : 6376 ；Me Knight et al.1983. Cell 34 : 3 3 5 ； 1 B r i n s 1 e r e t a ] . 3 9 8 3 . Nature 306 - 332 ； Ritchie et al.198 4. Nature 312 -55- (52) (52)1353991 :517 ; Baldassarre et ai_2〇〇3: Theriogenology 5 9 : 8 3 1 ; R〇b! et al.2003, Th e r i 〇 g e η o 1 o gy 59： 107； Malassagne e] ，al.2003，Xenotransplantation ]〇(3) : 267)。 本發明之嵌合型蛋白質亦可經組合之合成化學以及重 組技藝製作。例如’此部分免疫球蛋白恒定區可如上述說 明般重組的表現.。此生物活.性分子可使用習知的化學合成 技藝（例如固祖合成）製作。. 部分免.疫.球蛋.白恒定·區可便用適當的聯接化學反應連 結至生物活性分子’然後與.未聯接生物活性分子的部分免. 疫球蛋白恒定區合倂以形成本發明之嵌合型蛋白質6具體 實施例之一中’此部分免疫球蛋白恒定區是：F c片段.。此 F C片段可重組製'作以形成c y s - F.C ..以及和表現硫醋的生物、 活性分子反應產生單元體-二元體雜合體。在另—.具體實 施例之內’是製造—個Fc-硫酯以及和表現N端半胱胺酸 的生物活性分子反應（圖.4)。.... 具體實施例之一中.，部分免疫球蛋白恒定區連結至生 物活性分子將形成同.源二元體。經暴露同源二元體至變性 以及還原條件（例如β-毓基乙醇以及8M尿.素）可破壞此同 源二元體，然後和未聯結至生物活性分子的部分免疫球蛋 白恒定區.合倂可.以形成單元體·二元體雜合體。然後經 P B S透析回復單元體-二元體雜合體之本性'及再折疊以及 分離（例如經大小排除或親和層析法）。 在另一具體實施例之內，部分免疫球蛋白恒定區在聯 .結至生物活性分子之前將形成同源二元體。在此具體實施 -56- (53) (53)1353991 例中，聯結生物活性分子至同源二元體之反應條件可經調 整使生物活性分子僅聯結至同源二元體的一個鏈（例如經 調整各反應物之莫耳當量）。 此生物活性分子可化學合成並具體N端的半胱胺酸· 。編碼部分免疫球蛋白恒定區序列可次選殖入聯結至幾丁. 質結合結構區編碼內含肽之載體（Invitrogen，Carlsbad；-C A )。此內含肽內可聯結至此部分免疫球蛋白恒定區之、C: 端。具體實施例之一中，免疫球蛋白和聯結至它的C端之 內含肽可在原核細胞之內表現。在另一具體實.施例之^：·中‘ =免疫球蛋白稆聯結至它的C端之內含肽可在真'核細胞之.· 內表現。聯結至內含肽之部分免疫球蛋白恒定區可和美司·’ 鈉反應。具體實施·例之一中·，聯·結至·內含肽之部分免疫球. - 蛋冶恒定區是結合至管柱，例如幾丁質管柱，然後用美司. 鈉溶析。生物活性分子以及部分免疫球蛋白可共同反應發：. 生親核的重排作甩以及此生物活性分子可經由醯'胺鍵結共· _ 價鍵地聯結·至部分免疫球蛋白。（Dawsen et a].· '2000: A η η u . R e ν . Β i ο c. h e m . 6 9 : 9 2 3 )。此方法合成之嵌合型蛋、· 白質可視需要於部分免疫球蛋白與生物活性分子之間包含 連結子肽。此連結子可（例如）合成在生物活性分子之Ν端. 上。連結子可包含肽類及/或有機的分子（例如聚乙二醇及/ 或短的胺基酸序列）t合併之重組以及化學合成允許快速 的篩檢生物活性分子以及連結子以最適化本發明嵌合型蛋’ 白質所要求的性質，例如病毒的抑制、止血、產生紅血球' 、生物半衰期、穩定性、結合至血淸蛋白質、或嵌合型蛋 -57 - (54) (54)1353991 白質之其它性質。此方法亦允許本發明之嵌合型蛋白質倂 入非天然的胺基酸’其可最適化的本發明之嵌合型蛋白質 所要求的性質。視需要此方法製作之嵌合.型蛋白質可使用 技藝上已知的條件，例如還原條件以及然後用.P B S緩慢 的透析：再折疊成生物活性的構像。 此外，N -端半胱胺酸可位於部分免疫球蛋白恒定區.，： 例如F c片段。利用天然的F c在.位置2 2 6具有半胱胺酸可 產生N - 具有半脱胺酸的F c片.段（參閱κ a b a t e t . a j . 1 9 9 l·，'
Sequences of Pfoteins of. Immunological Interest， U . S . D e p a r t ra e n t of Public Health. ： B e τ h e s d a . M D ) - 重組的表現F c片段可暴露末端的半胱胺酸.。具體實 施例之一中’此’Fc片段是表現在原核細·胞例如大腸桿菌. ... 之內。編碼Cys 226開頭之Fc部分的序列可置於編碼信號 的序列（例如OmpA、PhoA、STII)之後。此原核細胞.可... 經滲透休克釋放出此重組F c·片段。在另—具體.實施·例之 內，此Fc片段闬真核細胞（例如CHO細胞、βηκ細胞）製 作。編碼F c部分之序列可直接的置於編碼信號肽的.序列（ 例如小鼠IgK $至+鏈或’第一型MHC Kb信號序列之後，因… 此當此重組嵌_合型蛋白質經真核細胞合成時，此信號序列 將分解，造成N.端的半胱胺酸，其可分離以及與帶有硫· 酯之分子（例如C端的硫酯’若此分子是虫.胺基酸組:成）進 行化學反應。 亦可使用分解其N端反應基質之酵素（如因子X2、腸， 激酶）產生F c片段上N端的半胱胺酸，以.及將分離產物與 -58 - (55) (55)1353991 具體硫醋之分子反應。 此重組表現的Fc片段可用以製造同源二元體或單元 體-二元體雜合體。 在特定的具體實.施例之內，Fc片段是與鄰近226位置 C y s的人類α干擾素信號肽一起表現。 當編碼這個多肽之建構體在CHO細胞進行表現時， 此CHO細胞可在二個不同的位置在Cys 22.纟以及在Ν端 上游Va】2個胺基酸之信號肽內）分解信號肽。產生.二種F.c 片段之混合物（一.個有N -端V a 1以及一個有有N -端C y s)。. ' 因此產生二元體的混合，.物（芣端爲Val之同源二元體，末 端爲Cys之同源二元體和以及—鏈具有Cys末端以及另一 鏈具有V a 1端的雜二元體）。F c片段可和具有c端的硫酯.. 的生物活性分子反應以及從混合物中分離（例如經大小排 阻層析）產生的單元.-二元體雜合體。可·考慮其它信號肽序 列在CHO之內表.現Fc片段之混合物，將產生至少二，種不 同N -端之F c片段。 > . 在另一具體.實施例之內，重組製作之CyS-Fc可形成 同 '源11兀1體？：此同源二元體可和在C端上具有分支連結子 的狀反應=其中此分支的連結子有二個C端硫酯.，其可和 Cys-Fc S應。在另—具體實施例之內，此生物活性分子 具有單—的非端點硫酯，其可和C y s - F c反應。，此外.，此. 分支的連結子可有二個C端的半胱胺酸，其可和Fc硫酯 反應。在另一具體實施例之內，此分支的連結子有二個官 肯g基’其可和I Fc硫酯（例如2_氫硫基胺）反應。此生物活 -59- (56) (56)1353991 性分子可由胺基酸組成。此生物活性分子可包含小的有機 分子或小的無機分子。 F.使用嵌合型蛋白質之方法 熟悉此·技藝的專業人士將認知，本發明之·嵌合型蛋白 質有許多兩途，·包括（但非限於）治療病人疾病或症狀之方 法。此疾病或症狀可包括（但並非限於）：病毒感染.、止血 的病症、貧.虛、癌症/白血病、發炎性的症狀或自體.免疫 疾病（例妁關節炎 '牛皮癬、紅斑性狼瘡··多.發性硬化0 ' 或細菌感染症（參閱例如美國專利第6,0 8 6,875 ' 6,030:ι61 1 2 、6,4 8 5 : 7 2 6 號；WG 0 3 /0 7 7 8 3 4 ； 1J S 2 0 0 3 -02 3 5 5 3 6 A 1 )- . . 1 .治療病人紅血球缺失之方法 ， 本發明係關於治療紅並球缺失（例如貧Μ )病人之方法 ，包含投周有效治療量之至少一個嵌合型蛋白質其中嵌 合型蛋白質由第一及第二多胜鏈組成，其中第一鏈至少包 含一部分免疫球蛋白恒定區以及至少一·個能誘導紅血球增 殖之藥劑（例如ΕΡΟ)，以及第二多胜鏈至少包含”部分免 疫球蛋白而無第一鏈能誘導紅血球增殖之藥劑。： · -60- 1 .治療病入病毒感染之方法 2 本發明係關於治療病毒感染或暴露至病毒的病人之方 法，包含投用有效治療量之至少一個嵌合型蛋白質，其中 此嵌合型蛋白質由第一及第二多胜鏈組成，其中第一鏈至 (57) (57)1353991 少包含一部分免疫球蛋白恒定區以及至少一個抗病毒劑（ 例如融合抑制劑或干擾素α )以及第二多胜鏈至少包含一 部分免疫球蛋白而未無第一鏈之抗病毒劑。’具體實施例之 一中，病人是感染哪可用干擾素α治療性的病毒，例如C 型肝炎病毒。具體實施例之一中，病人是感染人類免疫不 全病毒，例如第一型人類免疫不全病毒或第二型人類.免疫 不全病毒。. 具體實施例之一中，本發明之嵌合型蛋白質可抑制病 毒的複.製。具體實施例之--中，.本發明之嵌合型'蛋白質可 防止或抑制病毒進入標的細胞.，從而停止、預防、或限制 病毒感染在病人體內之蔓延.以及降低感染的病人病毒的負 載。經聯結部分免疫球蛋白至病毒融合抑制劑，本發明提 供具有較大穩定性病毒融合抑制性活性以及相較於單獨的 病毒融合抑制劑（例如.Τ20、Τ2 1、Τ 1 249)具有較大生物效 性的嵌合型蛋白質。因此，具體實施例之一中，此病毒融 合抑制劑可減低或防止人類免疫不全病毒（例如第一型人 類免疫不全病毒）感染標的細胞。 … a.可治療的症狀. 本發明之嵌合型蛋白質可用以抑制或防止標細胞經肝 炎病毒（例如C型肝炎病毒）之感染。此嵌合型蛋白質可包 含一個抑制病毒複製的抗病毒藥劑。 具體實施例之一中=本發明之嵌合型蛋白質包含融合 抑制劑。本發明之嵌合型蛋白質可用以抑制或防止標的細 -61 - (58) (58)1353991 胞經任何病毒之感染（參閱例如美國專利第6,08 6;8 7 5、 6,0 3 0,6 1 3、6.4 8 5:7 26 號；WO 0 : 3/0 77 8 34 ; US 2 0 03 -0235536A1) ° 具體實施例之一中，此病毒是被膜病毒，例.如（但非 限於）人類免疫不全病毒、SIV '麻疹、流行.性感冒、愛帕 斯坦-巴爾氏病毒、呼吸融合病毒、或副流行性·感V冒..病毒 。在另一具體實施例之內，此病毒是非被膜病毒，例如； 鼻病毒或小兒麻捧症病'毒。 [本發明之嵌合型蛋白質可用於治療已感染病.毒.的病. 人。此病人可爲急性感染病毒的病人。此外病人可爲慢性 感染病毒的病人。本發明之嵌合型蛋白質.亦可用以預防上 地治療接觸病毒處於感染危險中·病人.，例.如與V已、知或相信... 與病毒緊密接觸之病人或相信感染或攜帶病毒.之病人·。本 發明之嵌合型蛋白質可用於治療何人已暴露至病毒但未經. 確定診斷之病人。 ：· 具體實施例之一中，本發明係關於治療感染.HCV的 病入之方法，包含對病人投周治療上有效量之嵌合型蛋白 質，其中此嵌合型蛋白質包含免疫球蛋白G之Fc片段以 及細胞激動素（例如干擾素α )。 具體實施例之一中，本發明係關於治療感染人類免疫 不全病毒的病人之方法，包含對病人投用治療上有效暈之 嵌合型蛋白質，其中此嵌合型蛋白質包含免疫球蛋白.G 之F c片段以及包含了2 0的病毒融合抑制劑。 -62 - (59) (59)1353991 3.治療止血病症的病人之方法 本發明係關於治療具有止血病症的病人之方法，包含 投用有效治療量之至少一個嵌合型蛋白質，其中此嵌合型 蛋白質包含第一及第二鏈，其中第一鏈包含至少一個凝血 因子以及至少部分免疫球蛋白恒足區，以及第二鏈至少包 含一部分之一·個免疫球蛋白恒定區。· 本發明之嵌合型蛋白質岢經促進形成血纖維血凝塊治 療或預防止血的病症•本發明之嵌合型蛋·白質可.活化凝血· 串聯反應中之任何成員。凝拖因子可參與外在的路徑 '，內 在的路徑或以上二路徑。具體實施例之—中，凝血因子是 因子VII或因子VHa'。因子Viia可活化因子X，其可和 因子Va交互作用，分解.凝血原''形·.成凝·血酶·，凝血酶可分… 解分解血纖維蛋白原形成血纖維。在另—具體實.施例之一 中，凝血因子是因子X或因子ί X a。在另--具體實施例. 之一中，凝血因子是因子VIII或因子Villa。在另了具體 實施洌之一中，凝血因子是w丨1】e b r a n d因子、因子XI、_ 因子XII、因子V、因子X或因子XIII。 a.可治療的症狀 · _ _ 本發明之嵌合型蛋白質可用於治療任何止血的病症。 本發明之嵌合型蛋白質可治療性的止血病症·包括（但非限 於）：血友病 A、血友病 B、W i 1 ] e b r a n d ' s、病、因子X I缺 失（P T A缺失）、因子X11缺失、與血纖維蛋白原、.凝血原 、因子V、因子VII、因子X、或因子XI】I缺乏或構造的 -63- (60) 1353991 異常。 具體實施例之一中，此止血的病症 體實施例之一中，病人患有血友病A， 包含因子 VIII或因子Ilia。在另一具 病人患有血友病A，以及嵌合型蛋白質 子Ha。在另二具體實施例之一中，病 以及嵌合型蛋白質包含因子IX或因子 實施例之一中·，病人患有血友病B，以 含因子 VII或因子Ila。在另一具體實 有因子VIII或因子Villa之抑制抗體以 包含因子VII··或因子Vila。在另一具體 人有因子IX或因子lX，a之抑制抗體以 包含因子VII或因子Vila。 本發明之嵌合型蛋白質可用於預防 病症的病人。本發明之嵌合型蛋白質可 症病人的急性流血事件。 具體實施例之一中，止血的病症| 如因子I X、因子V 111)之結果。在另一 止血的病症可爲缺乏凝血因子（例如V 〇 1 之結果。 在另一具體實施例之內，止血的病 。此後天的病症可爲續發性之疾病或症 狀可爲例如（但非限制）：癌症、自體免 此後天的病症可因老化或使用藥物另- 是遺傳的病症·。具 以及嵌合型蛋白質 體實施例之一中， 包含因子VII或因 人患有血友.·病B， IX a。在另一具體 及嵌合型蛋白質包 施.例之內，此病人 及此嵌合型蛋白質: 實施例之內.，·龀病 及此嵌合型蛋白質 上地治療具有止血 用於治療有止血病 b缺乏凝血因子（例 具體實施例之內， I W i 丨.1 e b r a n d 因子） 症可爲後天的病症 狀。此不相關的症 疫疾病、或懷孕。： -病症（例如癌症化 -64 - (61) (61)1353991 學治療）而產生。 4 .治療需要普通的止血劑的病人之方法 .· 本發明亦關於治療無止血的病症或續發性.疾病或症 狀造成止血病症的病人之方法。如此本發明係關於治療需 要普通的止血劑的病入之方法，包含投用有效治療#之_ 少一個嵌合型蛋白質，其中此嵌合型蛋白質由第.一及第二 多胜鏈組成，.其中第一多胜鏈至少包含一部分免疫球蛋白 恒定區以及至少一個凝血因子以及第二鏈至少包含一部分 免疫球蛋白恒定區而無第一多肽之凝盅因子。· a .可治療的症狀· ' 具體實施例之·一中：需要普通的止血劑的病Λ是進行 ，或是即將進行外科手術之病人。本發明之嵌合型蛋白質 可投周在外科手術之前或者之後作爲預防劑。本發明之嵌 合型蛋白質可於外科手術時或者之後投用以控制組急性的 傷血事件。此外科·手術可包括（但並非限制.於:）：肝臟移植 、肝臓切除或者幹細胞移植。· ...." . 本發明之嵌合型蛋白質可周於治療無止血病症病人的 急性流血事件。急性流血事件來自嚴重的創傷，例如外科 手術，汽車事故、創傷、槍傷、或任何其它無論控制流血 的創傷事件。 5 .治療法 -65- (62) (62)1353991 本發明之嵌合型蛋白質可靜脈內地、皮下的' 肌肉內 的、或經由任何黏膜的表面，例如：口服地、舌下的'口 頰的、舌下的、鼻的、直腸地、陰道的或經由肺的路徑投 用。嵌合型蛋白質可植入或聯結至生物聚合物固態支持物 ，允許在所要求的位點緩慢釋放出此嵌合型蛋白質：： 本發明嵌合型蛋白質之劑量變化視病人以及特定的投 用路徑而定劑量可介於〇:1至1 〇〇,〇〇〇微克/公斤體重。，具 體實施例之。-中，此投服範圍是0:1-1:000微克公斤。此 蛋白質可連續的投用或在特定的時間間隔投用。.可使用體 外測定，測定最佳的劑量範圍及/或投用時間表β技藝上 已知許多體外測定可測量病毒的感染性。例如反轉錄酵素 分析，或R Τ - P c R分析或分支.D Ν Α分析，.可用以測量人: 類免疫不全病毒濃度。Staciot分析可用以測量凝血活性 。此外，有效劑量可從得自動物模式之劑量反應曲線外插 得之。 本發明亦關於包含病毒融合抑制劑、至少部分免疫球 蛋白和醫藥學'上可接受的載體或賦形劑之藥學組成物.。醫 藥上的載體之適當的實施.例是描述於！Umi,ngt:〇n，s Pharmaceut ica 1 S.ci ence s b+y . E ..W:. M artin .。賦形劑.之實施. 例可包含澱粉、葡萄糖 '乳糖 '蔗糖、明膠 '麥芽.稻米 、麵粉、白堊、矽膠、硬脂酸鈉、甘油單硬脂酸鹽、滑石 粉、氯化鈉、乾燥脫脂牛奶、甘油、丙烯 '乙二醇、水、 乙醇等。此組成成分亦可含有酸鹼度緩衝劑、以及溼化劑 或乳化劑。 -66- (63) (63)1353991 口服的投用時，此藥學組成物可爲習見方法製備的藥 片或膠囊之髟式。此組成成分亦可製備成液體例如：糖漿 或懸浮液。此液體可包含懸浮劑（例如山梨糖醇糖漿、纖 維素衍生物或氫化的食用脂肪）、乳化劑（卵磷脂或阿拉伯 膠）' 非水溶·性載劑（例如杏仁油、油性酯類·、乙醇、.或.份 化的植物泊）、以及防腐劑（例如甲基或丙基-P-羥基苯甲酸· 鹽或山梨酸）。此製劑亦可包含橋味劑·、著色劑以及增甜._· 劑。此外，'此組成成分可爲與水·或另一適當的載劑重組之1.. 乾燥產物。. '.' 口頰以及舌下的投闱時，此組成成分可爲依據習見的 準則之藥片、錠劑或快速溶解薄膜的形式。. .' ，吸入投用時：，依據本發明之化合物可使用氣霧噴霧器Λ . 從加壓的洪應器或噴霧器（例如內含 P B S )以方便地運送形 式，適當的推進劑爲例如：二氟二氯甲烷、三氯氟甲烷 二氯四氟甲烷、二氧化碳或者其它適當的氣體。.當使甩加 壓的氣溶膠時，可提供劑量單位瓣膜測定運送的計量。應 吊於吸入器或吹藥器之膠囊及卡式管（例如·周明膠製成_)可. 調製成內含化合物以及適當的粉末例如乳糖或澱粉之粉末· 混合物。 此藥學組成物可調製爲經大量注射（即靜脈的或肌肉 內注射）之不經腸道的方法給藥之藥劑。往射調配物.可爲. 單位劑量髟式，例如於安瓿或多劑量容器中並添加防腐劑·… 。組成物可爲懸浮液、溶液或油性或水性載劑之乳狀液形 式，且可含有調配劑，例如：懸浮、安定及/或分散劑。. -67- (64) (64)1353991 此外，此有效成份可爲和適當的載劑，例如無熱原水，重 組之粉劑。 此藥學組成物亦可調製爲直腸投用時的栓劑或灌腸劑 ·-例如內含習見的栓劑，例如可可油或其它甘油酯。 6 .聯合治療 . 本發明之嵌合型蛋白質可結合至少一個其它習知的治 療疾病或症狀之藥劑：周於治療病人之疾病或症狀。.. /· 具體實施例之一中，本發明係關於治療感染入類免疫' 不全病毒病人之方法，包含投甩有效治療量之至少一個包 含第一及第二鏈的嵌合型蛋白質，其中第一鏈包含一個入. 類免疫不全病毒融合抑制劑以及·.至少部:分免疫球蛋白恒定.. 區以及第二鏈至少包·含一部分免疫球蛋白而無第一鐽之人. 類免疫不全病毒融合抑制劑，.以及結合至少一個其它抗 人類免疫不全病毒藥劑。其它抗-人類免疫不全病毒藥劑· 可爲任何抗人類免疫，不全病毒活性之治療劑。其它抗-人 類免疫不全病毒藥劑可包括例如（但非限制.）：.蛋白酶抑制. 劑（例如 A m p r e n a v i r ®、_C r i X i v a n ®、R i t ο n i v i r ®) '、反轉.錄· 酵素核苷類似物（例如 AZT、DD1、D4T、3TC、ZUgen®) 、非核苷類似物反轉錄酵素抑制劑（例如Sustiva®)、另一. HR/融合抑制劑·、人類.免疫不全病毒專一.性中和抗體.、 CD4專一性抗體、CD4模擬物，例如CD4-免疫球蛋白 G2 融合型蛋白（美國專利申請案〇9/912;82 4)或 CCR5、或 C X C R4專一性抗體、或C C R 5 '或C X C. R4之.專一:性結合伴 -68- (65) (65)1353991 在另一具體實施例之內’本發明係關於治療止血病症 的病人之方法，包含投用包含第一及第二鏈之有效治療量 之至少一個嵌合型蛋白質，其中第一鏈包含至少一個凝血 因子以及至少部分免疫球蛋白恒定區以及第二鏈包含在.最 少的部分免疫球蛋白恒定區而無第一鏈之凝血因子，.結合 至少一個其它凝血因子或促進止血之藥劑。該其它凝血因 子或促進止血之藥劑.可爲任何具體凝血活性的治療劑θ凝 血因子或止血.劑的實施例（但非限制）包括因子· V、因子 νπ '因子VII、因子IX、因子X、因子Χ:Ι、因子XII、 因子X π I、凝血原 '或血纖維蛋白原或上述的任.何藥劑之 活化的形式。凝血因子及止血劑.亦可包含抗-纖維蛋白水 解藥物，例如ε-胺基-己酸、氨甲.環酸。.. 7 ·抑制病毒融合標的細胞之方法 .. 本發明亦關於在體外抑制人類免疫不全病毒與哺乳動 物的細胞融合之.方法，包含合倂此哺乳動物的細胞與至少 —個嵌合型蛋白質.，其中此嵌合型蛋白質包含第一及第二 鐽’其中第一鏈至少包含一部分免疫球蛋白恒定區以及一 個人類免疫不全病毒抑制劑以及第二鏈至少包含—部分免 疫球蛋白恒定區而無第一鏈之人類免疫不全病毒抑制劑。 此哺乳動物的.細胞可包含任何可經人類免疫不全病毒感染 之細胞或者細胞株，包括（但非限於）初級人類C D 4 + Τ細 胞或巨噬細胞、MOLT -4細胞' CEM細胞、ΑΑ5細胞或在 -69- (66) (66)1353991 細胞表面上表現CD 4之HeLa細胞。 G.分離嵌合型蛋白質之方法 . 一般而言，當製作本發明之嵌合型蛋白質，其係數內 含其它分子例如其它蛋白質或蛋白質片段之混合物。如此 本發明提供從內含嵌合型蛋白質之混合物中分離任何上述 之此嵌合型蛋白質之方法。經測定本發明之嵌合型蛋白質 可在適當的條件下結合至染劑配體，而改變此條件.以.後可 破壞染劑配體與嵌合型蛋白質後續的結合；從.而提俟分離 此嵌合型蛋白質之方法。：某些具體實施例中·，此混合.物可 包含單元體-二元·體雜合體、二元體以及至少部分免疫球 蛋白恒定區，例妃.Fc雜合體。因此..，具體.實施例之一中 本發明提供分離單元體·二元體雜合體之方法。在另一具 體實施例之內本發明提供分離二元體之方法。· 據此具體實施例之一中，本發明提供從混合物分離單 元體-二元體雜合.體之方法，其中此混合物闺第一·及第'二 多胜鏈組成之單元體-二元體雜合體，其中第一鏈包含一 個生物活性分子及至少部分免疫球蛋白恒定區，.以及其中 第二鏈至少包含一部分免疫球蛋白恒定區·而無'生物活性分 子或免疫球蛋白變異區； 由第一及第二多胜鏈組成之二元體，其中第一及第二 鍵均包含生物活性分子，以及至少部分免疫球蛋白恒定區 ;以及 部分免疫球蛋白恒定區；該方法包含在使單元體-二 -70 - (67) (67)1353991 元體雜合體以及此二元體結合至染劑配體的適當條件下接 觸此混合物與聯結至固態支持物之染劑配體； 去除未結合的部分免疫球蛋白恒定區； ' 適當的改變1)之條件’中斷介於卓兀體· 一兀體雜合 體與聯結至固態支持物之染劑配體間之結合； 分離單元體二元體雜合體。 某些真體賨施例中’在接觸此混合物和染劑配體之前 :混合物先接觸色層分祈的物質，例如蛋白質A顰脂糖 等。此混合物可使用適當的溶析緩衝劑（例如低酸_度緩 衝劑）從色層分析的物質溶析的以及然後將內含混合;物之 溶桁物與染劑配體接觸。 - ，接觸混合物與染劑配體‘的適·當條件可包含緩衝劑以.保. 持混合物在適當的酸鹼度中。適當的酸鹼度零酸鹸度3 -1,〇 、4 - 9 · 5 - 8。具體實施例之一中此適當的酸鹼度是8.0。只... 要能維持此酸鹼度於適當的範圍，可使用任何技藝止:已知 的緩衝劑，.例如：三羥甲基胺基甲烷、H.EPES. ' PIPES、 MOPS。適當的條件亦可包含洗滌緩衝劑以從染劑;配體中 溶析未結合的物種。此洗滌緩衝劑可爲任何不破壞結合物. 種結合之緩衝劑。例如，此洗.條緩衝劑可爲用於接觸步.驟 之相同緩衝劑。 ―但嵌合型蛋白質結合至染劑配體，經改變此適當的 條件可分離嵌合型蛋白質。改變此適當的條件包含添加鹽 類至此緩衝劑。可使用任何鹽類例如：NaC卜KCI。此鹽 添加之濃度應高到足夠破壞染劑配體以及.此所要求的物種 -71 - (68) 1353991 (例如單元體-二元體雜合體）間之結合。 某些具體實施例中，此混合物包含Fc、單元體-二. 元體雜合體、以及二元體，據發現此Fc不結合至染劑配 體以及可從流通液中溶析出。此二元體結合至染劑配體比 單元體-二元體雜合體更緊密。因此相較於破壞染劑配體-與單元體間之鍵結，須要較高濃度之鹽以破壞二元輝與染..+ 劑配體間之鍵結（例如溶析）。·’ 某些具體實施.例中：可使用NaC】從混合物中純化單 元體-二元體雜合體。某些具體實施倒中，破壞二元體與· 染劑配體間之鍵結適當的鹽濃度是200-700毫莫耳濃度、.： 3 0 0 - 6 0 0毫莫耳濃度' 4 〇 〇 - 5 0 0毫.莫耳濃度。具體實施例之:… —中，須要破壞二元體與染劑配體'間之鍵·結之· NaCl濃度 是4 0 0毫莫耳濃度。 亦可使用N a CI從混合物中純化二元體。一般而言，. 在二元體化之前從混合物中分離.單元體-二元體雜合體έ 經添加適當之鹽濃度至此緩衝液，破壞染劑配體與二元體' 間之結合從而分離二元體。某些具體實施例中，破壞二元. 體與染劑配體間之鍵結之適當的鹽濃度是. 8 00毫莫耳濃度 至2莫耳濃度' 9 0 0毫莫耳濃度至1.5莫耳濃度、9.5 0_.毫莫耳.. 濃度至].2莫耳濃度。在特定的具體實施例.中，使用】莫耳 濃度破壞二元體與染劑配體間之鍵結。 ； 染劑配體可爲生物模仿物。生物模仿物是模倣天然物 知人工的物質、裝置、或系統。如此在某些具體實施例中 ，此染劑配體係模倣天然的配體分子。染劑配體可選自紅 -72- (69) (69)1353991 色]號TM模仿物、紅色2號TM模仿物、橙色】號TM模仿物 、橙色2號TM模仿物 '橙色3號TM模仿物、黃色1號TM模 仿物、黃色2號TM模仿物、綠色1號TM模仿物、藍色1號 ’「M模仿物、以及藍色2號TM模仿物（Prometic Bio.sciences (USA) Inc.. Wayne. NJ). in one specific embodiment the d y e ligand is M-i ni e t i c Red 2 T M (Prometic Bio.scjences. (USA) Inc.; Wayne: NJ)。在某些具體實施例中此染劑配 傾是聯結至固態支持物：例如紅.色1號A6XLTM .携仿物、 紅色2號A6XL τΜ .模仿物 '橙色號A6XL ΤΜ模仿物、，橙 色2號A 6 X L_ τ Μ .模仿物.、橙色3號.A 6 X L τ Μ .模访物.黃色] 號A6XL ΤΜ模仿物、黃色2號A6XL ΤΜ模仿物·'綠色]號 A6X.L ΤΜ模仿物·、藍色i號’ A6XL. τμ模仿物、以及藍:色2號. A 6 X .L Ί'莫伪物（p r 〇 m e t i c B i 〇 s c i e n c e s (USA). Inc.. Wayne·. N.1)。 此染劑配體可聯結至固態支持物。此固態支持物可爲. 技藝上已.知的任何.固態.支持物（參..閱.例.如 w w^^ejj^exajJ 〇 njN OW .com,)。固態支持物之實施例包含圓 珠、凝膨、.膜奈米顆粒或微球體。固態支持物包含任 何聯結染劑配體·的固.態支持物材料（例如瓊脂糖、.聚苯 乙錦、壞脂糖、葡聚糖凝膠）。固態支持物可包含任何合 成的有機聚合物’例如：聚丙烯酸、乙烯聚合物.、丙烯酸 _ '聚曱基丙烯酸、以及聚丙烯醯胺。固態支持物亦可包 含醒類聚合物.例如瓊脂糖、纖維素、或右旋聚醣。固態 支持物可包含無機氧化物，例如：矽土 '氧化锆' 二氧化 -73- (70) (70)1353991 钱、三氧化二鈽、氧化錦、氧化鎂（即氧化鎂）、或氧化錦 。固態支持物亦可包含某些上述支持物之組合，包括（但 非限於）右旋聚醣-丙烯醯胺。 【實施方式】 , 實施例 .· . . 實施例1 : 分’子量影響FcRn調節的胞呑轉運。： 實施例 1’： 包含各種不同的重要蛋白質以及免疫球蛋白G . Fc之: 嵌合型蛋白質是經重組製.作（Sambrook .et al... M. olecu.Iar Cloning : A Laboratory Manual., 2 ed.; Cold Spring Harbor
Laboratory Press，（ 1.9 8 9 ))，或當其爲接觸蛋白-Fc、MAB-β-ga](單株.抗體結合至β-gal之複合體）（Bi〇design:: 1 n t e Γ n a t i ο n a丨，S a c ο，Μ E)以及M A B - G Η (單株抗體與生長激 素之複合體）（Research Diagnostics，Inc. Flanders，NJ)時 則可市售地購買。簡言之’編碼此重要蛋白質的基因是經 P c R選殖’然.後次選殖入F C融合表達質體。將此質體轉 染到DG44 CH0細胞並用甲胺蝶呤選擇及放大穩定的轉染 株。嵌合型蛋白‘質同源二元體是以蛋白質A管柱純化。 經測試的蛋白質包括：干擾素α '生長激素、紅血球生成 素、促卵泡激素、凝血因子IX、β -半乳糖苷酶、接觸蛋 白 '以及因子.V Π丨。聯結此蛋白質至免疫球蛋白部份（包 括此F c R η受體結合伴），或使用市售之全部抗體包括此 F c Rn結合區域）-抗原複合物，可硏究胞呑轉運.·與分子量 -74- (71) 1353991 間之關係（參閱美國專利第6,03 0,6 1 3號）。此嵌合型蛋白質 是口服投用至老鼠，投用2-4小時後可使用重組製作嵌合 型ί蛋白質之酵素聯結免疫抗體檢測法以及市售得到之抗體 複合'物以及嵌合型蛋白質的西方轉漬法以及酵素聯結免疫 抗體檢測法測定血淸之含量。此外，所有此市售得到的蛋 白質或複合物與因子VIlI-Fc、凝血因子I.X...FC ,以及控制 組 Ερο-Fc 可使用 IODO :圓珠（Pierce, Pittsburgh.: PA)騎化 ε 口服投用嵌合型蛋白質至老鼠·· +，其結果指出血淸：.Fc以 及單株抗體之含量與蛋白質之大小直接的相關.。口服投用 k嵌合型蛋白質其視截斷點是介於2 00-2 8·5 k.D.之間·。（表 2)。 表2 蛋白質 大小(kD)_ 胞吞轉運 干擾素〇：-Fc 92 ++ + + GH-Fc 96 + + + Epo-Fc 120 + + + FSH-Fc 1 170 ++ + MAB:GH 172-194 + + + FIX-Fc 200 + MAB:/3Gal 285-420 - 接觸蛋白-Fc 300 - FVIIIA-Fc 380 " 實施例 2:選殖pcDNA3.〗-Flaq-Fc 將用以確認或純化蛋白質之共同的親和標記.物， FLAG 之序歹(j (Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp.-Asp-Lys)，選 殖入含有小鼠I gK信號序列接著聯接Fc片段之人類免疫 球蛋白GU胺基酸221-447，EU編號系統）的pcDNA3_]-Fc 質體。此建構是經使用下列引子之重疊p c R加以創造： -75- (72) (72)1353991
FlagFc-Fl ： 5'- GCTGGCTAGC C A C C A TG G A - 3，（序 列確認號碼：4 1 )
FlagFc-R] : 5'-CTTGTCATCG TCGTCCTTGT AGTCGTCA CCAGTGGAACCTGGAAC-3'(序歹 IJ 確認號碼：42)
FiagFc-F2 ： 5'-GACTACAAGG ACGACGATGA . CAAGGACAAA ACTCaGACAT GCCCACCGTG . CCCAGCTCCG GAACTCCd/C序歹[J.確認號碼：43).. ..
FlagFc-R2 : ^'-TAG^CGATCCT C AT T T A C C C G r 3 (序歹IJ 確認 號碼：44) 然後將pcDNA 3 . ] -Fc模版分別添加入二假PCR反應 中，反應體積爲5 0微升，內含5 0毫微莫耳各引·子對 (FlagFc-Fl/Rl 或.F】agFc-F2/R2).，使用 Pf.u Ultra :DNA 聚 合酶（S tr at.a g en e ; C A )依據製造者之標準方法在.M.j熱猸環 器之內使用以下週期：，9 5 °C 2分鐘；3 0個週期之（9 5 °C 3 0秒 、5 2 °C 3 0秒、7 2 °C 4 5秒），接著7 2 t： ] 〇分鐘進行.P C R反應 。然後在另一5 0微升.P C R反應體積中混合此二反應產物（ 各2微升）、5〇毫微莫耳之FiagFc-Fl以及FlagFc’R2引子’ 使用Pfu Ultra DNA聚合酶（Stratagene，CA)依據製造者之 檩準方法在M.T熱循環器之內使用以下週期：95°C 2分鐘
;3 0週期之（95t 30秒、52°C 30秒、72t： 45秒），接著 7_2°C ]〇分鐘進行PCR反應。產生的片段經凝膠純化、水解以_ 及插入的到pcDNA3_]-Fc質體之Nhel-Bam HI。產生的質 體含有小鼠IgK信號序列可產生FUgFc蛋白質。 -76- (73) (73)1353991 實施例 3 :選殖Fc-因子VII建築體 因子VII之編碼序列係經RT-PCR得自人類胎兒肝臟 RNA(Cl〇ntech，Pa】o Alto, CA)。此選殖的區域包含鹼基對 36至終止密碼子前之終止鹼基對1 4 3 0之互補DNA序列" 在端上引入Sbfl位點。在C-端上引入BspEI位點。此 建構體是使用以下引子： 下游：
S'GCTACCTGCAGGCCACCATGGTCTCCCAGGCCCTCAGG 3’（序列確認號碼：45) . 上游： 5 ! C A G TIC C G G A G C T G G G C A C G G C G G G C A C G T G T GA G T T T TGT.CGGGA.AAT GG 3’（序歹!_!確認.號碼：46) ' ..., 經PCR以及以下之條件選殖.· 95 t 5分鐘，接著30週 期之3 0秒' 55°C 3 0秒、72°C 1分鐘45秒，以及最終之 延侔週期72°C 10分鐘。 此片段周SbfI-BspE I水解以及插入的到編碼免疫球 蛋曰G]之Fc片段的pED.dC-Fc質體。 實施例 4 :選殖Fc-因子IX建築體 經RT-PCR使用下歹!J弓|子從成人肝臟RNA放大，得 到包括前原肽序列之人類凝血因子IX編碼序列：· natFIX-F ： 5'- TTACTGCAGAAGGTTATGCAGCGCGTGAACATG-3' F9-R ： 5'- -77- (74) (74)1353991 TTTTTCGAATTCAGTGAGCTTTGTTTTTTCCTTAATCC-3' 將20¾微克之成人肝臟 RNA(C丨ontech, .Palo.. Alto; CA)以及25微微莫耳各引子添加入使用Superscript TM的 RT-PCR反應中。依據製造者之實驗準則·.以單一步驟之 RT-PCR ’ PLATINUM® .Taq .系統（invitroge.n: Carlsbad. CA)進行放大。反應是在MJ熱循環器中進行，·使用下列. 週期：5 0°C 3 0分鐘；9 4 °C 2分鐘；3 5週期（9 4尤3 0秒、5 8 °C 3 0秒、7 2它1分鐘），以及最終之..7 2 °C 1 0分鐘。此片段是使 用 Qiagen Ge] Extraction Kit (Qiagen，Valencia.，CA)凝膠 純化，以及選殖對應酵素水解的pED.dC.XFcr質體。.. 實施例 5 :選殖.P A C E建築體 經RT-PCR得到人類內蛋白水解酶PACE (駢對的鹼 性胺基酸水解酵素）之編碼序列。使用下列引子：' PACE-F1 ： 5'- GGTAAGCTTGCCATGGAGCTGAGGCCCTGGTTGC-3’ ： PACE-R1 ： 5'-GTTTTC AATCTCTAGG ACCC ACTCGCC-3 ' PACE-F2 ： 5，-GCCAGGCCACATG ACTACTCCGC-3， PACE-R2 ： S'- GGTGAATTCTGACTCAGGCAGGTGTGAGGGC AG C - 3 ' 於PACE-Π引子之5’端PACE序列開頭之起始密碼子 前3個核酸加上Hindlll位點，於PACE-F1-R2引子終止密_ 碼子胺基酸7 1 5之後PACE最後之胞外域之終止密碼子·3.’ 端添加入EcoR]位點。將PACE-R1以及-F2引子分別在3' -78- (75) (75)1353991 以及5’側之內部的BamHI位點上進行徐冷。然後使用25微 莫耳各引子對之PACE-F1/R1或PACE-F2/R2和20毫微克之 成人肝臟 RNA (Clontech; Palo Alto, CA)在 50 微升 RT-PCR反應中使用Superscript TM設定二RT-PCR反應。依 據製造者之實驗準則，以單一步驟之 RT-PCR， PLATINUM® Taq. system (invitrogen, Ca.rlsbad, .CA).進行 放大。反應是在MJ熱循環器.中進行.，使用下列週期：5.0 °C 3 0分鐘；94°C 2分鐘；30週期（94°C 30秒、58°C 30秒' 7.2 t： 2分鐘），接著72 °C. 1.0分鐘。此類片段各自連結到載體 pGEM T-Easy (Promega; Madison，WI)以及完全定序。然 後將F2-R2片段使用BamHI/EcoRI位點次選殖入3D.cD.NA6 V5/His (Invitrogen，Carlsbad, CA)，然後將 F1-R1片段使 闬 Hindlll/BamHI位點選·殖入此建構體。最終之質體 pcDNA6-PACE可產生溶解形式之 PACE(胺基酸1 - 7.1.5)， 如此可刪除跨膜之區域。pcDNA6-PACE之 PACE序列基 本上如描..述於 HarHson et a 1. 1 9 9 8 , S e m,i n a r s . in HematoIogy35:4。 實施例 6:選殖干擾素α建築體 經PCR從人類基因體DNA，使用下列引子得到包括 信號序列之干擾素a 2b(h干擾素α )編碼序.列： IFNa + Sig-F ： 5'-
GCTACTGCAGCCACCATGGCCTTGACCTTTGCTTTAC-3' ifna-EcoR-R ： 5'-CGTTGAATTCTTCC T -79 - (76) (76)1353991 TACTTCTTAAACTTTCTTGC-3' 從3 7 3 MG人類星細胞瘤細胞系，依據標準方法 (Sambrook et a t. 1 9 8 9, Molecular Cloning · A Laboratory Manual. 2d ed.5 Cold Spring Harbor Laboratory Press)製 備基因體D N A。簡言之，離心大約2 x 1 05細胞，再懸浮 於100微升磷酸鹽緩衝生理食鹽水酸鹼度7.4，然後與等體 積之溶解緩衝劑（1 〇〇毫莫耳濃度三羥甲基胺基甲烷酸鹼度 8.0/200毫莫耳濃度^13(：丨/2%803/5毫莫耳濃度乙二氨四醋 酸）混合。加入蛋白酶K，最終濃度爲1 00毫克/毫升，以 及將樣本在3 7 °C下溫和的攪拌水解4小時。然後樣本用酚 :氯仿萃取兩次，經添加入乙酸鈉（酸鹼度7.0)至100毫莫 耳濃度以及添加入等體積之異丙醇以沈澱DNA，在室溫 下離心10分鐘。移除上淸液以及用冷卻之70%乙醇淸洗沉 澱物，經空氣乾燥後懸浮於TE( 1 0毫莫耳濃度三羥甲基胺 基甲烷酸鹼度8.0/]毫莫耳濃度乙二氨四醋酸）。 然後將100毫微克之基因體DNA與25微微莫耳之各引 子使用 Expand High Fidelity System (Boehringer Mannheim，Indianapolis, IN)依據製造者之標準方法，於 25毫升’在熱循環器中使用下列週期：94 t 2分鐘； 30週期（94°C 30秒、50°C 30秒、72°C 45秒），以及最後之72 °C】〇分鐘，進行PCR反應。預期大小之環帶（-5 5 0鹼基對） 是用凝膠萃取組套（Qiagen，Valencia, CA)凝膠純化， Pstl/EcoRI水解，再—次的以凝膠純化，以及選殖入含有 S胺基酸連結子（EFAGAAAV)接連Fc區域之人類免疫球蛋 -80- (77) (77)1353991 白 G1 之 pED.dC.XFc 的 Pstl/EcoRI 位點。 實施例7:選殖人類干擾素aFcA連結子之建築體 以1毫芜實施例6純化的pED.dC.天然的人類干擾素α Fc DNA作爲模版，在25毫升PCR反應中與25微微莫耳之 各引子IFNa + Sig-F以及下列引子進行反應： hi F N a 11 〇 L i.ivk F c - R ：
5!CAGTTCCGGAGCTGGGCACGGCGGG
C A C G T G T G. A GTTTTGTCTTCCTTACTTCTTAAACTTTTTGC AAGTTTG- 3' 使用 Expand High Fidelity System (Boeh ringer Mannheim, Indianapolis, IN)依據此製造者之標準方法以 RapidCylcle[熱循環器（Idaho Technology, Salt Lake City， U T)，9 4 °C變性2分鐘接著1 8週期之9 5 °C 1 5秒、5 5 °C 〇秒、 以及7 2 °C 1分鐘，斜率6，接著7 2 °C延伸1 〇分鐘，進行P C R 反應。使用* .p膠萃取組套（Q i a g e η ; V a 1 e n c i a, C A)凝膠純 化正確的（-525鹼基對）PCR產物，以PstI以及BspEI限制 酶水解，凝膠純化，以及次選殖入經修飾之pED.dC.XFc 的對應位點，其中Fc區域之胺基酸23 1 -2 3 3是使用遺傳密 碼退化現象改變以加入BspEl位點而維持野生型胺基酸之 序列。 實施例 8 :選殖人類干擾素a Fc GS ] 5連結子之建築體 使用含.Fc之△連結·子建構體（其中在5’端使用遺傳密 碼退化現象以內含BsPEI以及Rsr11位點，並保持胺基酸 -81 - (78) (78)1353991 序列）創造新主鏈載體，使用此DNA作爲模版與下列引子 進行PCR反應： 5' B2xGGGGS ： 5’ gtcaggatccggcggtggagggagcgacaaaactcacacglgccc 3' 3' GGGGS : 5' tgacgcggccgctcatttacccggagacaggg 3' PCR反應是以25微微莫耳之各引子使用Pfu Turbo酵 素（Stratagene, La Jolla，CA)依據製造者之標準方法在MJ 熱循環器中使用下列方法：95°C2分鐘：30週期（95°C30秒 、54°C 3 0秒、72°C 2分鐘），72°C 10分鐘進行。以凝膠萃取 組套（Qiagen, Valencia CA)凝膠純化預期環帶（-730驗基對 )，BamHI/Notl水解；再次的凝膠純化，以及選殖入 BamHI/Notl水解之載體pcDNA6 ID，其爲IRES序歹IJ以及 dhfr基因插_入Notl/Xbal位點之pcDNA6版本。 然後以5 00毫微克之純化的pED.dC.天然人類干擾素 aFc DNA作爲模版在25毫升PCR反應中與下列引子反應 5' IF N a for GGGGS : 5’ ccgctagcctgcaggccaccatggccttgacc 3 , 3' iFNa for GGGGS ： 5' ccggatccgccgccaccttcctttactacgtaaac 3’ PCR反應是以25微微莫耳之各引子使用Expand High Fidelity System (Boehringer Mannheim, Indianapolis, IN) &據製造者之標準方法在M J熱循環器中使用下列方法： 95 t 2分鐘：]4週期（95°C 30秒、48°C 3 0秒、72°C 】分鐘）， -82 - (79) (79)1353991 72 °C 1〇分鐘進行。以 Gel Extraction kit (Qiagen，Valencia 〇八）凝膠純化預期的環帶（-600鹼基對），：^61/83|1^1水解 ，再次的凝膠純化，以及選殖入上述pcDNA6 ID/Fc載體 之Nhel/BamHI位點，產生干擾素 aFc融合10個胺基酸 Gly/Ser 連結子（2xGGGGS)之載體 pcDNA6 ID/IFNa-GS10-F c 〇 然後使用500毫微克之 pcDNA6 ID/IFNa-GSlO-Fc和 下列引子進行PCR反應： 5' B3XGGGGS ： 5’gtcaggatccggtggaggcgggtccggcggtggagggagcgacaaaactcac acgtgccc 3' fcclv-R : 5' atagaagcctttgaccaggc 3' PCR反應是以25微微莫耳之各引子使用Expand High Fidelity System (Boehringer Mannheim, Indianapolis, IN) 依據製造者之標準方法在M ：[熱循環器中使用下列方法： 9 5 °C 2 分鐘：1 4 週期（9 5 °C 3 0 秒、4 8 °C 3 0 秒、7 2 °C 1 分鐘） ，72 °C 1〇 分鐘進行。以 Gel Extraction kit (Qiagen， Valencia C A)凝膠純化預期的環帶（504鹼基對）， B a m Η I / B s p E I水解，純化6 8鹼基對的環帶，以及選殖入上 述pcDNA6 ID/Fc載體之BamHI/BspEI位點，產生干擾素 a F c融合1 5個胺基酸G 1 y / S e r連結子（2 X. G G G G S )之載體 pcDNA6 lD/IFNa-GSl5-Fc。 實施例 9 :選殖鹼性肽的建築體 -83- (80) (80)1353991 以鹼性的肽（CCB)取代人類免疫球蛋白G1 Fc片段從 胺基酸221至22 9(Εϋ編號）之樞紐區域。 使用四個重疊之寡核苷酸（IDT, Coralvi丨丨e，ΙΑ): C C B - F c 正股 1 : 5’ GCC GGC GAA TTC GGT GGT GAG TAC CAG GCC CTG AAG AAG AAG GTG GCC CAG CTG AAG GCC AAG AAC CAG GCC CTG AAG AAG AAG 3' C C B - F c 正股 2 : 5’ GTG GCC CAG CTG AAG CAC AAG GGC GGC GGC CCC GCC CCA GAG CTC CTG GGC GGA CCG A 3' CCB-Fc反義股1 : 5' CGG TCC GCC CAG GAG CTC TGG GGC GGG GCC GCC GCC CTT GTG CTT CAG CTG GGC CAC CTT CTT CTT CAG GGC CTG GTT CTT G 3' CCB-Fc反義股2 : 5’ GCC TTC AGC TGG GCC ACC TTC TTC TTC AGG GCC TGG TAC TCA CCA CCG AAT TOG CCG GCA 3' 將寡核苷酸溶於dH20，濃度爲50毫莫耳。將5微升之 各寡核苷酸於薄壁的PCR試管、2.2微升之限制緩衝劑#2( 最終濃度爲10毫莫耳濃度三羥甲基胺基甲烷HC1酸鹼度 7.9，10毫莫耳濃度MgC]2，50毫莫耳濃度NaCl，.l毫莫耳 濃度一硫穌糖醇）（N e w E n g ] a n d B i ο 1 a b s，B e v e r ] y , Μ A)中 相互徐冷’以及加熱至95 °C 30秒，然後容許緩慢的徐冷2 小時至2 5 °C。將此5微微莫耳之徐+冷寡核苷酸依的說明直 -84 - (81) 1353991 接的連結到 pGEM T-Easy 載體。（Promega，Madison WI) ·將聯接反應混合物添加到5 〇微升冰冷之D Η 5 α勝任的 大腸桿菌細胞（Invitrogen，Carlsbad, CA)中反應2分鐘，於 3 7 t：下反應5分鐘’在冰上反應2分鐘，然後種植入 L B + 1 0 0 u g/L氨比西林瓊脂平皿以及置於3 7 °C下1 4小時。 用牙籤挑起個別地菌落，以及置於5毫升之LB + 100微克/ 升氨比西林以及容許生長]4小時。試管在2000xg、4 t下 離心15分鐘以及使用 Qiagen miniprep組套（Qiagen, Valencia，CA)依組套之說明分離載體DNA。以NgoM IV-Rsrll水解2微克之DNA。以Qiaquick，如組套指示之方 法feE膠純化此片段以及連結至 pED.dcEpoFc之 NgoM IV/Rsr II位點《將連接物轉形的到勝任的DH5 a大腸桿菌 細胞以及如描述於pGEM T-Easy載體般製備此DNA。 實施例選殖紅血球生成素-酸性肽Fc的建築體 以酸性的肽（CCA)取代EPO-Fc之內人類免疫球蛋白 G 1 Fc片段從胺基酸22 1至229(EU編號）之樞紐區域。使用 四個重疊之寡核苷酸（IDT，Coral ville; IA): ].Epo-CCA-Fc : 正股 1 : 5’ CCG GTG ACA GGG AAT TCG GTG GTG AGT ACC AGG CCC TGG AGA AGG AGG TGG COO AGC TGG AG 3' 2 . Epo-CCA-Fc 正股 2 :
5’ GCC GAG AAC CAG GCC CTG GAG AAG GAG GTG -85- (82) (82)1353991 GCC CAG CTG GAG CAC GAG GGT GGT GGT CCC GCT CCA GAG CTG CTG GGC GGA CA 3' 3. Epo-CCA-Fc 反義股 1 : 5' GTC CGC C ； CA GCA GCT CTG GAG CGG GAC CAC CAC CCT CGT GCT CCA GCT GGG CCA C 3' 4. Epo-CCA-Fc 反義股 2 : 5' CTC CTT CTC CAG GGC CTG GTT CTC GGC CTC CAG CTG GGC CAC CTC CTT CTC CAG GGC CTG GTA CTC ACC ACC GAA TTC CCT GTC ACC GGA 3' 以 dH20溶解寡核苷酸，濃度爲50毫莫耳。將5微升 之各寡核苷酸於薄壁的PCR試管、2.2微升之限制緩衝劑 #2( New England Biolabs, Beverly, MA)中相互退火，以及 加熱至9 5 t 3 0秒，然後容許緩慢的退火2小時至2 5 °C。將 此5微微莫耳之退火寡核苷酸依組套的說明直接的連結到 pGEM T-Easy 載體。（Promega，Madison, WI).將接合反 應混合物添加到50微升冰冷之DH5tx勝任的大腸桿菌細胞 (Invitrogen: Carlsbad，CA)反應 2 分鐘，37〇C 下反應 5 分鐘 ，在冰上反應2分鐘，然後種植入LB + I 00 ug/L氨比西林 瓊脂平皿以及置於3 7 °C下】4小時。用牙籤挑起個別地菌落 ，以及置於5毫升之LB + 1 00微克/升氨比西林以及容許生 長14小時。試管在2 000xg、4°C下離心]5分鐘以及使用 Qiagen miniprep 組套（Qiagen，Valencia: CA)依組套之說 明製備載體DNA"以 Age卜RsrII水解2微克之DNA。以 Qiaquick :如組套指示之方法凝膠純化此片段以及連結至 -86- (83) (83)1353991
pED.Epo Fc.l之Agel-Rsr II位點。將連接物轉形的到勝 任的DH 5 α大腸桿菌細胞以及如上述之方法般製備此DN A 實施例1 1 :選殖之Cys-Fc建築體 使用PCR以及標準分子生物學技藝（Sambrook et al.1 9 8 9. Molecular Cloning ： A Laboratory Manual, led., Cold Spring Harbor Laboratory Press)，產.生編碼人類千 擾素α信號肽直接於第一個半胱胺酸殘基（Cys 22 6，EU 編號）聯接編碼Fc序列之哺乳動物的表現建構體。一旦經 訊息胜肽酵素切割後，從哺乳動物的細胞分泌出N-端具 有半胱胺酸殘基之Fc蛋白質。簡言之，使用引子 lFNxx + Sig-F(IFNa + Sig-F : 5'-
GCTACTGCAGCCACCATGGCCTTGACCTTTGCTTTAC-3') 以及 Cys-Fc-R(5'-CAGTTCCGGAGCTGGGCACGGCGGA GAGCCCACAGAGCAGCTTG-3，）以PCR反應產生聯結此干 擾素a信號序列之N端從Cys 226開頭之Fc片段。將500 毫微克之pED.dC.天然的hIFNa △連結子添加入25微微莫 耳之各引子中以 Expand High Fidelity System (Boehringer Mannheim, Indianapolis，IN)依據製造者之標準方法進行 PCR反應。反應是在Μ】熱循環器中進行，使用下列週期 ：9 4。。2分鐘；3 0週期（94 t 3 0秒、5 0〇C 3 0秒、7 2〇C 45 秒） ，以及最終之 72 它 1 0分鐘。以 Gel Extraction kit (Qiagen， Valencia CA)凝膠純化預期之環帶（-1 ]2鹼基對），以PstI -87 - (84) (84)1353991 和BspEl限制酶水解，凝膠純化，以及次選殖入pED.dC. 天然的hIFNcx △連結子對應的位點產生pED.dC.Cys-Fc(圖 5)。
實施例 12 :表現蛋白質以及製備Fc-ME SNA 從內含Fc之質體.，使用標準條件以及試劑經PCR放 大得到Fc(人類免疫球蛋白G1之恒定區）編碼序列，接著 依製造者建議的步驟次選殖此Fc編碼序列至Ndel/Sapl。 簡言之，使用引子 5'- GTGGTCATAT GGGCATTGAA GGCAGAGGCG CCGCTGCGGT CG - 3'以及5'-GGTGGTTGCT CTTCCGCAAA AACCCGGAGA CAGGGAGAGA CTCTTCTGCG - 3·從 5 00 毫微克之質體 pED.dC.Epo-Fc 中使用 Expand High Fidelity System (‘Boeh ringer Mannheim, Basel Switzerland)、Rapid Cyic]er 熱循環器（Idaho Technology Salt Lake City, Utah) ，在9 5 °C變性2分鐘，接著1 8週期之9 5 °C 0秒、5 5 °C 0秒、 以及72°C 1分鐘、斜率4，接著72t延伸反應10分鐘放大 Fc序列。將PCR產物次選殖入中間選殖載體以及完全定 序，然後使用標準方法以Ndel以及SapI位點次選殖入 pTWINl載體。Sa m brook，J·，Fritsch，E.F. and Maniatis, T. 1989. Molecular Cloning ： A Laboratory Manual, 2d ed. Cold Spring Harbor. New York ： Cold Spring Harbor Laboratory Press•然後將此質體使用標準方法轉形 到 B L 2 1 (D E 3 ) p L y s S 細胞。 -88 - (85) (85)1353991 簡言之在3 7 °C下生長1公升培養之細胞至吸光讀數〇. 8 AU，以1毫莫耳濃度異丙基β-D-l -硫哌喃半乳糖苷誘發， 以及在2 5 °C下生長過夜。離心沉澱細胞，在4 t下溶解於 20毫莫耳濃度三羥甲基胺基甲烷8.8/1 % NP40/0.1毫莫耳濃 度苯基甲擴酿基氣化物/1微克/毫升Benzonase (Novagen Madison, WI)過夜’以及結合至幾丁質圓珠（New England Bio labs; Beverly，ΜΑ)。然後用數個管柱體積之20毫莫耳 濃度三羥甲基胺基甲烷8.5/500毫莫耳濃度NaC1/1毫莫耳 濃度乙二氨四醋酸淸洗圓珠，然後儲存在' -8 。此圓珠 經2 0毫莫耳濃度三羥甲基胺基甲烷8 . 5 / 5 0 0毫莫耳濃度 NaCl/Ι毫莫耳濃度乙二氨四醋酸/5〇0毫莫耳濃度2-氫硫基 乙烷磺酸（美司鈉）溶析蛋白質產生純化的Fc-NIE SNA，此 溶析物可直接的使用在以下之內耦合反應。 實施例 13 :表現以及純化因子VII-Fc單-二元體混合物 建立表現因子 VII-Fc之CHO DG-44細胞。在37t：、 5 % C Ο 2下將 C Η 0 D G -4 4細胞生長於加上核苷以及核糖核 以及補充5%加熱-去活化的胎牛血淸之MEM Alpha直.到轉 染爲止。 將D G 4 4細胞種植入1 〇公分之組織培養陪氏培養皿.以 及生長至50%- 60%滿。總共用1〇微克之DNA轉染10公分 之培養盤：7_5微克之 pED.ciC.FVII-Fc + 1.5徴克之 pcDNA3/Flag-Fc + ]微克之 pcDNA6-PACE。轉染細胞如 描述於S u p e】· f e c t轉染反應劑手冊（Q i a g e η，V a丨e n c i a 5 C A ) -89 - (86) (86)1353991 。轉染4 8小時之後移除培養液以及用無核苷加上5 %透析 的胎牛血淸以及微克/毫升之殺稻瘟菌素（Invitrogen， Carlsbad，CA)以及0.2毫克/毫升遺傳黴素（Invitr〇gen， Carlsbad，CA)之MEM Alpha取代。]0天之後，從平板以 〇 . 2 5 %胰蛋白酶釋出細胞以及轉移到τ 2 5組織培養燒瓶， 以及繼續選擇4天·直到細胞生長良好建立穩定的細胞 系。接著加入25毫微莫耳濃度甲氨喋昤放大表現蛋白質。 使用大約2 X 1 07細胞種入內含補充5微克/毫升維生素 K3(亞硫酸氫鈉甲萘醌）（Sigma5 St Louis, M)之300毫升生 長培養液之1700公分2轉動瓶（Corning, Corning，NY)進行 培養。轉動瓶在5% C〇2 ' 37°C下反應72小時。然後此生 長培養液用補充5微克/毫升維生素κ之300毫升不含血淸 的生產培養液（含5微克/毫升牛胰島素以及10微克/毫升慶 大黴素DMEM/F12)取代。每天收集生產培養液（條件培養 液）爲期1 〇天以及儲存在4 °C。 於各收集之後在轉動培養 瓶中加入新鮮的生產培養液以及將瓶子送回培養箱。集中 的培養液先使用S a η 〇 c 1 e a n玻璃纖維過濾器（3 · 〇微米+ 〇 . 2 微米）（SartoHous Corp. Gottingen, Germany)接著用 Aciopac.k 500 過濾器（0_8 微米 + 〇·2 微米）（Pall Corp·, East Hi丨1 ss NY)過濾。然後將澄淸的培養液使用 Pe】nc〇n B i 〇 m a X正切的流動過濾卡式盒（1 〇 k D a M W C 0) (M i 11 i ρ 〇 r e C o r p _，B i 11 e r i c a，M A)濃縮大約 2 0 倍。 然後將濃縮之培養液經蛋白質A瓊脂糖4快速流動管 柱（AP Biotech, Piscataway，NJ)收集 Fc 嵌合體。.於 5 X 5 -90 - (87) (87)1353991 公分（]00毫升）管柱中，每毫升管柱體積負何<5毫1克Fc蛋 白質，1 0 0公分/小時之線性流速率下達成駐留時間分鐘 。然後用>5倍管柱體積之IX DPBS淸洗管柱’去除非專~ 結合的蛋白質。結合的蛋白質是用100毫莫耳濃度甘胺酸 酸鹼度3.0溶析。然後在內含蛋白質吸收峰之溶析分層中 每1〇份加入1份之1 M Tris-HCl, pH 8中和。 從製備物中去除FLAG-Fc同源二元體（即’融合兩個 Fc分子表現的嵌合型Fc二元體與FLAG肽）’將蛋白質A 瓊脂糖4快速流動之集中分層通過Unosphere S陽離子交 換管柱（BioRad Corp.，Richmond, CA)。在此吕柱.操作條 件下，FLAG-Fc單元體-二元體雜合體是不帶電價（FLAG_ Fc之理論的pl = 6.19)可流過管柱，而hFVII-Fc構築體是 帶正電價，因此結合至管柱以及在較高的離子強度下可自 管柱中溶析出。此蛋白質A瓊脂糖4快速流動之集中分層 先用20毫莫耳濃度MES' 20毫莫耳濃度NaCl酸鹼度6.1透 析。然後將透析的材料以]5 0公分/小時之速度裝入I . 1 x 1 ]公分（9.9毫升）管柱。淸洗以及溶析期間’流速增加至 5〇〇公分/小時。管柱依序以8倍管柱體積之20毫莫耳濃度 MES' 20毫莫耳濃度NaCl，酸鹼度6·]以及8倍管柱體積之. 20毫莫耳濃度MES、4〇毫莫耳濃度NaC】，酸鹸度6.1淸洗 。結合的蛋白質用20毫莫耳濃度MES、750毫莫耳濃度 NaC1，酸鹼度6·]溶析。集中內含蛋白質吸收峰的溶析分 層以及經由0.2微米濾片無菌的過濾，儲藏在-80°C。 使用抗FLAG MAB親和管柱分離hFV]l融合至兩個 -91 - (88) (88)1353991
Fc分子之嵌合型Fc二元體和一個FLAG肽以及一個 hFVII之融合蛋白。集中之Unosphere S溶析物以20毫莫 耳濃度三羥甲基胺基甲烷、50毫莫耳濃度NaCl ' 5毫莫耳 濃度CaCl2(酸鹼度8)1 :]稀釋，以及以線性流速60公分/ 小時裝入1.6 X 5公分 M2抗-FLAG瓊脂糖管柱（Sigma Corp., St·.Louis: M0)。負荷量是<2.5毫克單元體-二元體 雜合體/毫升管柱體積。負荷後管柱是以5倍管柱體積20毫 莫耳濃度三羥甲基胺基甲烷、50毫莫耳濃度NaCl、5毫莫 耳濃度、CaC]2(酸鹼度8.0)淸洗，.然後用1〇〇毫莫耳濃度甘 胺酸（酸鹼度3.0)溶析單元體-二元體雜合體。然後在內含 蛋白質吸收峰之溶析分層中每]0份加入1份之]Μ T r i s -HC15 pH 8中和。將集中物儲存在-80〇C。 實施例 1 4 :表現和純化因子ix_Fc同源二元體以及單元 體-二元體雜合體 建立表現因子IX-Fc之CHO DG-44細胞。將DG44細 胞種植入1 〇公分之組織培養陪氏培養皿以及生長至50%-60%滿。使用總共10微克之DNA轉染10公分之培養盤： 轉染同源二元體，使用8微克之pED.dC.因子IX-Fc + 2微 克之pcDNA6-PACE ;轉染單元體-二元體雜合體’使用8 微克之pED.dC.因子】X-Fc + ]微克之pcDNA3-FlagFc+]微 克之pcDNA6-PACE。細胞之轉染如描述於Superfect轉染 反應劑手冊（Qiagen, Valencia, CA)。轉染48小時之後移除 if養液，及將轉染細胞換上無核苷加上5%透析的胎牛血 -92 - (89) (89)1353991 淸以及10微克/毫升之殺稻瘍菌素（Invitrogen，Carlsbad, CA)之MEM Alpha，而單元體-二元體雜合體轉染細胞是 換上補充0.2毫克/毫升遺傳黴素（Invitrogen, Carlsbad, CA)之MEM Alpha。3天之後，以0.25%胰蛋白酶從平板釋 出細胞以及轉移到T25組織培養瓶，以及繼續選擇10-14 天直到此細胞生長良好建立穩定的細胞株。接著分別地加 入]〇毫微莫耳濃度或100毫微莫耳濃度甲胺蝶呤放大表現 同源二元體或單元體-二元體雜合體蛋白質。 [0249]於此二細胞株，使用大約2 X 107細胞種入內 含補充5微克/毫升維生素K3(亞硫酸氫鈉甲萘醌HSigrna, St Louis，Μ)之3 00毫升生長培養液之1 700公分2轉動瓶 (Corning, Corning, ΝΥ)進行培養。轉動瓶在 5% C02、37 °C下反應大約72小時。此生長培養液用補充5微克/毫升維 生素K之3 00毫升不含血淸的生產培養液（含5微克/毫升牛 胰島素以及10微克/毫升慶大黴素 DMEM/F12)取代。每天 收集生產培養液（條件培養液）爲期1 0天以及儲存在4 °C。 各收集之後，於轉動培養瓶中加入新鮮的生產培養液以及 將瓶子送回培養箱。在色層分析法之前，使周S u ρ. 〇 r C a p -]00(0.8/0.2 微米）過濾器（Pal 丨 Gel man Sc i.e n. ces, .Ann Arbor: MI)過濾培養液。下列所有步驟是在4°C下進行。將 此澄淸的培養液施用至蛋白質A瓊脂糖，以5倍管柱體積 之IX PBS(]0毫莫耳濃度磷酸鹽，酸鹼度7.4' 2.7毫莫耳 濃度K C I、以及1 3 7毫莫耳濃度n a C 1)淸洗，0 . 1. Μ甘胺酸 酸鹼度2.7溶析，以及然後以】/ ] 〇體積之]Μ T r i s - H C】酸鹼 -93 - (90) (90)1353991 度9.0中和。然後用PBS透析蛋白質。
進一步的從內含 FIX-Fc: FIX-Fc同源二元體、FIX-Fc: Flag-Fc單元體·二元體雜合體、以及Flag-Fc: Flag-F c同源二元體之混合物中，純化單元體-二元體雜合體轉 染的蛋白質樣本。濃縮材料以及在流速毫升/分鐘（36公分/ 小時）下施用至2.6公分X 60公分（318毫升）Superdex 200 Prep Grade管柱’然後用3倍管柱體積之】X pBS溶析。 收集對應至U V檢測器上二個吸收峰之分層以及經s D S -PAGE分析。第一吸收峰分層內含FIX-Fc : FiX-Fc同源二 元體或FIX-Fc: FUgFc單元體-二元體雜合體，而第二吸 收峰內含FUgFc : FlagFc同源二元體。集中內含單元體-二元體雜合體但無FlagFc同源二元體所的有分層以及在 線性速率6 0公分/小時下直接施用至].6 X 5公分Μ 2抗 FLA’G 瓊脂糖管柱（Sigma Corp·，St. Louis, ΜΟ)。負荷後 ，用5倍管柱體積之p b S淸洗管柱。單元體-二元體雜合體 是用100毫莫耳濃度甘胺酸酸鹼度3.0溶析。然後在內含蛋 白質吸收峰.之溶析分層中加入1/10體積之1莫耳濃度 THsHC丨中和’以及經還原以及非還原SDS-PaG分析。分 層經P B S .透析’濃縮至I _ 5毫克/毫升，以及儲存在_ 8 〇 °C 實施例1 5 :表現和純化hIFNa同源二元體以及單元體-二元體雜合體 建立表現h I F Ν α之C Η Ο D G - 4 4細胞。將D G 4 4細胞種 -94 - (91) 1353991 植入1 0公分之組織培養陪氏培養皿以及生長至5 Ο % - 6 Ο %滿 。使用總共10微克之DN Α轉染10公分培養盤：轉染同源 二元體，10微克之hIFNaFc構築體；轉染單元體-二元體 雜合體，8微克之hIFNctFc構築體+ 2微克之pcDNA3-FlagFc。細胞之轉染如描述於Superfect轉染反應劑手冊 (Qiagen，vaiencia, CA)。轉染48小時之後移除培養液以及 用無核苷加上5%透析的胎牛血淸之MEM Alpha取代，而 轉染單元體-二元體雜合體，用補充〇·2毫克/毫升遺傳黴素 (Invitrogen，Carlsbad, CA)之 MEM Alpha 取代+。3天之後 ’以0 _ 2 5 %胰蛋白酶從平板釋出細胞以及轉移到T2 5組織 培養瓶，以及繼續選擇1 0-1 4天直到此細胞生長良好建立 穩定的細胞株。接著經由加入甲胺蝶呤：介於10至50毫微 莫耳濃度，放大表現的蛋白質》 於所有細胞株，使用大約2 X 1〇7細胞種入內含3 00毫 升生長培養液之1 7 00公分2 轉動瓶（Corning, Corning, N Y)培養。轉動瓶在5 °/。C Ο 2、3 7 °C下反應大約7 2小時。然 後將生長培養液以300毫升不含血淸的生產培養液（含5微 克/毫升牛胰島素以及10微克/毫升慶大黴素之DMEM/F12) 交換。每天收集生產培養液（條件培養液）爲期10天以及儲 存在4 °C。各收集之後轉動培養瓶中加入新鮮的生產培養 液以及將瓶子送回培養箱。在色層分析法之前，使用 SuporCap-I00(0.8/0*2微米）過減器（Pall Gel man Sciences. A η n A r b 〇 r, Μ I)過濾培養液。下列所有步驟是在4 °C下進行 ‘ 將此澄淸的培養液施用至蛋白質A瓊脂糖’以5倍管 -95 - (92) (92)1353991 柱體積之IX PBS(]0毫莫耳濃度磷酸鹽，酸鹼度74、27 毫莫耳濃度KCI、以及]37毫莫耳濃度NaCI)淸洗，〇 ]莫 耳濃度甘胺酸酸鹼度2 · 7溶析，以及然後以丨/丨0體積之1 M Tris-HCl酸驗度9.0中和。然後用PBS透析蛋白質。 然後將內含IFNaFc :〗FNaFc同源二元體、IFNaFc : FiagFc單元體-二元體雜合體、以及FiagFe: FiagFc同源 二元體（或者△連結子或GS1 5連結子）混合物之單元體-二 元體雜合體轉染蛋白質樣品作進一步的純化。濃縮材料以 及在流速毫升/分鐘（36公分/小時）下施用至2.6公分X 6〇公 分（3]8耄升）Superdex 2〇〇 Prep Grade管柱然後用3.倍.管 柱體積之1 X PB S溶析。收集對應至UV檢測器上二個吸. 收峰之分層以及經s D S - P A G E分析。第一吸收峰分層內含 IFN:.aFc : IFNaFc 同源二元體或 IF N a F c : F1 a g F c 單元體. 二元體雜合體’而第·二吸收峰內含FiagFc: FiagFc同源 二元體。集中內含單元體-二元體雜合體但無FiagFc同源 二元體所的有分層以及在線性速率60公分/小時下直接施 用至1.6 X 5公分M2抗FLAG瓊脂糖管柱（Sigma Corp.， St. Louis, MO)。負荷至管柱後用5倍管柱體積之PBS淸洗 ，然後用1〇〇毫莫耳濃度甘胺酸（鹼度3.0)析單元體·二元體 雜合體。然後在內含蛋白質吸收峰之溶析分層中加入]/1 〇 體積之1莫耳濃度TrisHCl中和’以及經還原以及非還原 SDS-PAG分析。分層經PBS透析，濃縮至I-5毫克/毫升 ，以及儲存在- 80°C。 -96- (93) (93)1353991 實施例】6:表現以及純化捲曲螺旋蛋白質 . 此質體，pED.dC Epo-CCA-Fc 以及 pED.dC CCB-Fc 將進行單獨轉染或以 1 : 1之比率共同轉染到CH Ο D G4 4 細胞。細胞之轉染如描述於 Superfect轉染反應劑手冊 (Qiagen，Valencia，CA)。48小時之後移除培養液以及用無 核苷加上5%透析的胎牛血淸MEM Alpha ·取代。使用蛋白 質 A管柱依據技藝上已知的方法經親和層析法完成純.化 。此外，可使用排阻層析達成純化。 實施例 ]7 :表現以及純化Cys-Fc 建立表現C y s - F c之C Η 0 D G - 4 4細胞。將含有小鼠二 氫葉酸還原酶（dhfr)基因之pED.dC.Cys-Fc表達質體使用 Su perfect反應劑（Qiage n; Valencia，CA)依據製造者之準 則轉染到CHO DG44(缺少dhfr)細胞，·接著在補充5%透析 的 FBS以及青霉素/鏈霉素抗菌素（In vitro'gen· Carlsbad, C A)之MEM(無核苷）組織培養液中培養10天選擇穩定轉染 株。然後將穩定轉染的集中細胞，用5 0毫微莫耳濃度甲胺 蝶呤放大以增加表現。使用大約2 X 1 07細胞種入內含3 00 毫升生長培養液之Γ7 00公分2轉動瓶（Corning, Corning, NY)培養。轉動瓶在5% C02、3 7t：下反應大約72小時》然 後將生長培養液以300毫升不含血淸的生產培養液（含5微 克/毫升牛胰島素以及10微克/毫升慶大黴素之DMEM/F12) 交換。每天收集生產培養液（條件培養液），爲期]〇天以及 儲存在 4 °C。各收集之後，於轉動培養瓶中加入新鮮的 -97 - (94) (94)1353991 生產培養液以及將瓶子送回培養箱。在色層分析法之前， 使用 SuporCap-] 00(0.8/0.2 微米）過濾器（Pall Gelman S c i e n c e s，A η n A r b ο ι_; Μ I)過濾培養液。下列所有步驟是在 4 °C下進行。將此澄淸的培養液施用至蛋白質A瓊脂糖， 以5倍管柱體積之IX PBS( 10毫莫耳濃度磷酸鹽，酸鹼度 7·4、2.7毫莫耳濃度KCI、以及13*7毫莫耳濃度NaCl)清洗 ’ 〇 · 1莫耳濃度甘胺酸酸鹼度2 · 7溶.析，以及然後以〗π 〇體 積之1莫耳濃度T r i s - H C· 1酸鹼度9.0中和.。蛋白質用.p b S 透析以及直接的用於接合反應。 實施例 1 8 :偶合Τ 2 0 -硫酯類至C y s - F c 將Cys-Fc(4毫克，最終濃度3·2毫克/毫升）以及T2〇_ 硫酯或 T20-PEG-硫酯（2毫克，大約5莫耳當量）在室溫下 與0.1 Μ三羥甲基胺基甲烷8/10毫莫耳濃度MESNA反應 ]6小時。經SDS-PAGE(Tris-Gly凝膠）使用還原樣本緩衝 液分析，指出存在一個新環帶大約比對照組Fc大5 kDa(>40-50%轉換至共軛物）。前述Cys-Fc之N -端定序以 及未反應的Cys-Fc指出分子信號肽之加工並不正確，留 下（Cys)-Fc之混合物’彼將經由天然的聯接反應與肽-硫 酯類反應，而（V a丨）·（ G1 y) - (C y s ) - F c則不會反應b當反應 條件不足以破壞 Cys-Fc分子之二元化作用時，反應會產 生T20-Cys-Fc之混合物：T20-Cys-Fc同源二元體、T2〇_
Cys-Fc : Fc單元體·二元體雜合體 '以及Cys-Fc : Cys-Fc Fc-二元體。使周上述之排阻層析純化蛋白質可分開此三 -98- (95) (95)1353991 種產物。在非還原條件下經S D S - P A G E分析可証實此結果 實施例〗9 :干擾素α活性的抗病毒分析 干擾素α融合型蛋白之抗病毒活性（IU/毫升）是使用 C Ρ Ε (細胞病變效應）分析測定。在 3 7 ° C、5 % C Ο 2下將 A 5 4 9細胞種植入內含生長培養液（RPΜI 1 6 4 0，：補充1 〇 %胎 牛血淸（FBS)以及2毫莫耳濃度L-麩胺醯胺酸）之96孔組織 培養盤內2小時。將干擾素α標準樣品以及千擾素α融合 型蛋白以生長培養液稀釋以及在37°C、5% (：02下三重覆 的添加入細胞中反應20小時。反應後，從培養孔移除所有 培養液，以生長培養液稀釋腦心肌炎病毒（EMC)病毒以及 除對照組外添加入各孔中（3000 pfu/孔）。平板是在37°C、 5% C02下反應28小時。用10%冷卻之三氯乙酸（TCA)固定 活著的細胞，然後以磺基羅丹明B(SRB)依據發表的實驗 準則染色（Rubinstein et al.1990，J.Natl. Cancer inst. 82, ]1] 3)。以10毫莫耳濃度三羥甲基胺基甲烷酸鹼度l〇.5溶 解S RB染料以及在4 9 0毫微米之分光光度計上讀取。從5 至 0·0]] IU/毫升活性，比較 World Health'Organization IFNa 2b International Standard之標準曲線分析樣品。結 果示於表3以及圖6，結果顯示單元體之-二元體雜合體可 增加抗病毒活性。 (96) (96)1353991 表3:同源二元體相較於單元體-二元體雜合體之干擾素抗 病毒的分析 蛋白質 抗病毒活性 (IU/毫微莫耳） 標準偏差 干擾素aFc 8aa連結子 同源二元體 0.45x105 0.29χ105 干擾素aFc 8aa連結子 :FlagFc單元體-二元 體雜合體 4.5x10s 1 ,2χ105 干擾素 aFc 連結子同 源二元體 0.22x105 0.07x105 干擾素aFc △連結子： FlagFc單元體-二元體 雜合體 2 ·4χ ] 05 0.0005 x 1 05 干擾素 a F c G S 1 5連結 子同源二元體 2.3χ105 1 . 0 χ 1 0 5 干擾素 aFc GS15連結 子單元體-二元體雜合 5 . 3χ105 0.15χ1 Ο5 實施例 20 : FVIIa凝血活性分析
StaClot FV〗Ia-rTF 分析組套是購自 Diagnost.ica Stago (P a r s j p p a n y 5 NJ)以及經 J o h a η n e s s e n e t a].2000， Blood Coagulation a n d F i b Η η o 】y s i s I 1 : S I 5 9 之描述修飾。標準· -100 - (97) (97)1353991 曲線是依 World Health Organization 標準 89/6.8 8 以 FVIla 製作。使用此分析比較單元體之·二元體雜合體與同源二 元體之凝血活性。結果顯示此單元體·二元體雜合體之凝 血活性是同源二元體之四倍（圖7)。 實施例 21 :對天大的老鼠口服的投用FVII-Fc 25克9天大新出生的 Sprague Dawley老鼠是購自 C h a r】e s R i v e r (w 1丨m i n g10 η : Μ A)以及使其適應新環境2 4小 時。老鼠口服投用FVIIaFc同源二元體、單元體·二元體 雜合體或5〇· 50混合Z此—混合物。以2(3 0微升體積之 FVIIaFc溶液投用1毫克/公斤之劑量。此溶液是由 Tris-HC]緩衝劑酸驗度7.4和5毫克/·毫升大豆胰蛋白抑制因子組 成。老鼠在許多時間點使用C〇2安樂死’用心臟針刺取得 2 00:微升之血液。經添加3·8%檸檬酸鈉溶液得到血漿以及 在室溫下以]268 x g之速度離心。血漿樣品是可新鮮的進 行測定或者冷凍在20 °C。口服投用單元體·二元體雜合髓 ，其血淸濃度比同源二元體的因子VII有顯著較高的最大 値（C m a X )(圖 8 )。 實施例 2 2 :新生的老鼠口服的投用F1X - F c。：. 對十天大的新生Sprague-Dawley老鼠經p:0.投用2〇〇 微升溶於內含5毫克/毫升大豆胰蛋白抑制因子以及〇. 9 % N a C】的〇 ·]莫耳濃度磷酸鈉緩衝液酸鹼度6·. 5，大約等莫耳 濃度之]〇毫微莫耳/公斤之FI X - F c同源二元體或FIX - F c : -101 - (98) (98)1353991
Flag Fc單元體.二元體雜合體。在注射之後1、2 ' 4、8、 24、48、以及72小時，將動物以C02安樂死，經心臟穿刺 放血，經添加3. 8%檸檬酸鈉溶液以及在室溫、1 26 8xg下 離心得到血漿。然後離心沉降樣品，收集血淸以及冷凍 在-2 0 °C直到以酵素聯結免疫抗體檢測法分析此融合型蛋 白爲止。 實施例 23 :因子IX-Fc之酵素聯結免疫.抗體檢測法 將 96 孑L Immulon 4HBX ELISA 平板（Thermo LabSystems, Vantaa, Finland)塗覆以50毫莫耳濃度碳酸鹽 緩衝液（酸鹼度9.6) 1 ·· 100稀釋之100微升/孔之山.羊抗-因 子 IX 免疫球蛋白 G (Affinity Biologicals, Ancaster, Canada) »平板在周圍溫度下反應2小時或以塑膠薄膜密封 、4°C下反應過夜。用3 0 0微升/孔之PBS丁使用TEC AN淸 洗器淸洗孔洞4次。孔洞用200微升/孔之PBST + 6% BSA 阻塞，以及在周圍溫度下反應90分鐘。用3 00微升/孔之 PBST使用TECAN淸洗器淸洗孔洞4次。添加入標準品以 及描述於實施例]8之老鼠血樣品（]0 0微升/ ) ’以及在周 圍溫度下反應90分鐘。樣品以及標準是以HBET緩衝液 ((HBET : 5.95 克 HEPES，]·46 克 NaCI，0.93 克 Na2 乙二氨 四醋酸，2.5克牛血淸白蛋白，Tween-20 0.25毫升，以 dH20調至25.0毫升，酸鹼度調整至7.2)稀釋。標.準曲線範 圍是介於2 0 〇毫微克/毫升至0.7 8毫微克/毫升之間’以2倍 稀釋進行。用3 00微升/孔之PBST使用TECAN淸洗器淸 -102 - (99) (99)1353991 洗孔洞4次。各孔中加入HbET 1:25,000稀釋之100微升/ 孔之共軛結合的山羊抗-人類免疫球蛋白G- Fc-HARP抗體 ipihce; Rockford，iL)。平板在周圍溫度下反應90分鐘。 用3〇〇微升/孔之PBST使用TECAN淸洗器淸洗孔洞4次。 + ί反中加入1 00微升/孔之四甲基聯苯胺過氧化酶反應基質 (TMB) (pierce, R〇ckf〇rd，IL)依據此製造者之說明顯影。 平板在黑暗中、周圍溫度下反應5分鐘或直到色彩顯影。 以】〇〇微升/孔之2莫耳濃度硫酸停止反應。在450 nm下以 Spectra M ax plusplate 計讀器（Mole, cular ..Devices, S u η n y v a i e , C A )讀取吸光率。4小時之血液經分析指出因子 ΙΧ-Fc單元體-二元體雜合體之血淸濃度是因子IX Fc.同源 二元體之10倍（圖9)。此結果指出因子IX-Fc .單元體-二元 體雜合體之含量高於因子IX-Fc同源二元體（圖1.0)。 實施例 2 4 :選殖Ε ρ 〇 - F c 從編碼此成熟的紅血球生成素編碼序列之質體（原本 經 RT-PCR 得自 Hep G2 mRNA)、以及以下之弓|子 h e ρ ο X b a - F以.及.h e ρ 〇 e c 〇 - R經P C R放大得到成熟的 £ p 〇 編碼區。引子hepoxba-F含有一個 Xbal位點，而引子 hepoeco-R含有一個 E c o RI位點。進行 P C R之.儀器是 Idaho Technology RapidCycler，使用 Vent 聚合酶，在 9 5 ° C變性]5秒，接著2 8週期坡度6.0之9 5 ° C 0秒:、5 5。c 〇 秒、以及72°C】分鐘20秒，接著在72 °C延伸3分鐘。凝膠 純化大約5 ] 4鹸基對的產物，Xbal以及EcoR]水解，再一 -103- (100) (100)1353991 次的凝膠純化以及定向次選殖入Xbal/EcoRI水解位點、 以凝膠純化上述的 pED.dC.XFc載體。此建.構體稱爲 pED . d C . EpoFc。 使用成人腎QUICK-株互補DNA製備物作模版以及如 下描述之引子 Epo + Pep-Sbf-F 以及 Epo + Pep-_Sbf-R 經 PCR 放大得到內含內生性信號 以及成熟序列的Epo序列。引 子Epo + Pep-Sbf-F在起始密碼子上游含有Sbfl位點，而 引子Epo + Pep-Sbf-R可退火至之Epo序列之內生性S.bfl 位點下游。進行 PCR 反應之儀器是 PTO-2 00 MJ Thermocyc]er，使用Expand聚合酶 '在94°C變性2.分鐘，. 接著3 2個循環之9 4 ° C 3 0秒，5 7 °C 3 0秒，7 2 °C 4 5秒.，接著 在7 2 °C.延伸1 〇分鐘。凝膠分離大約6 0 3鹸基對之產物以及 次選殖入pGEM-T Easy載體。經Sbfl水解切出正確的編 碼序列，凝膠純化，以及選殖入 P s 11 -水解、暇驗性憐醋 酶（S A P )-處理的 '凝膠純化的 p E D · d C . E p 〇 F c質體。經 Κρη]水解初步測定具有正確方向的插入體之質體。建構 體經XmnI以及PvuII水解並與pED.dC.EpoF.c相比較以及 証實正確的方向。測定序列以及此建'構是稱爲 pED.dC.natEpoFc。 PCR引子： hep〇xba-F (EPO-F) ： 5'- AATCTAGAGCCCCACCACGCCTCATCTGTGAC-3' hepoeco-R (EPO-R) ： 5'- 丁丁 GAATTCTCTGTCCCCTGTCCTGCAGGCC-S'Epo + Pep- -104 - (101) (101)1353991
Sbf-F ： 5'-GTACCTGCAGGCGGAGATGGGGGTGCA-3'
Epo + Pep-Sbf-R ： 5，- C C T G G T C A T C T G T C C C C T G T C C - 3 實施例 25 :選殖Epo-Fc 選殖EP〇-Fc之另一方法描述於此。放大包括此天·然 的信號序列之全長Epo編碼序列的引子是：
Epo-F : 5'-GTCGAACCTG CAGGAAGCTTG CCGCCACCAT GGGAGTGCAC GAATGTCCTG CCTGG- 3' Ep〇-R : 5'-GCCGAATTCA GTTTTGTCGA CCGCAGCGG CGCCGGCGAA CTCTCTGTCC CCTGTTCTGC AGGCCTCC-3' 正向引子在Kozak序列上游加上Sbfl以及Hindlll位 點’而在逆轉引子中移除內部的Sbfl位點，以及加上8個 胺基酸連結子（EFAGAAAV)與Sa]I以及EcoRI限制位點至 此編碼序列之3'端。然後從腎互補 DNA 庫（BD Biosciences Clontech，Palo Alto, CA)中放大 Epo 編碼序 列，其係使用2S微微莫耳之類引子在25微升之PCR反應 中’使用 Expand High Fidelity System (Boeh ringer Mannheim, I n d i a n ap o 1 i s, IN )，依據製造者之標準方法在 MJ熱循環器之內使用下列週期：94°C2分鐘；30週期（94 °C 3 0 秒 ’ 5 8 °C 3 0 秒 ’ 7 2 °C 4 5 秒），接著 7 2 °C 1 0 分鐘。以 Gel Extraction 組套（Qiagen，Valencia，CA)，凝膠.純化預 期的環帶（64]鹼基對）以及連結中間選殖載體pGEM τ„
Easy (Promega，Madison; Wl)，將 DNA 是轉形到 DH5a 細 -105- (102) (102)1353991 胞（Invitrogen，Carlsbad，CA)以及進行迷你製備培養生長 以及用 Plasmid Miniprep Kit (Qiagen，Valencia，CA)依據 製造者之標準程序純化。一旦証實序列，將插九體用 SbfI/EcoRI限制酶水解，凝膠純化，以及用相同方法選殖 入哺乳動物的表現載體pED.dC之Pstl/EcoRI位點·。 設計放大人類免疫球蛋白G ]恒定區（Fc區域，EU編 號 22 1 -4 4 7)編碼序列之引子如下：
Fc-F ： 5'-GCTGCGGTCG ACAAAACTCA CACATGCCCA CCGTGCCCAG CTCCGGAACT CCTGGGCGGA CCGTCAGTC- 3'
Fc-R 5，-ATTGGAATTC TCATTTACCC GGAGACAGGG AGAGGC- 3' 正向引子在連結子-Fc接合點加上Sal丨位點，並引入 Bsp/Ε]以及RsrII位點到Fc區域而不影響此編碼序列，而 逆轉引子則在終止密碼子之後加上一個EcoRI位點·。然後 從白血球互補 DNA 庫（BD Biosciences Clontech, Palo Alto，CA.)中放大Fc編碼序列，其係使用25微微莫耳之類 引子在25微升之PCR反應中，使用Expand High Fidelity System (Boehringer Mannheim. Indianapolis. IN)，.依'據'製 造者之標準方法在M J熱循環器之內使用下列週期：94 °C 2 分鐘；3 0 週期（9 4 °C 3 0 秒，5 8 eC 3 0 秒，7 2 °C 4 5 秒）， 接著 7 2 °C ] 〇 分鐘。以 Gel E X t r a c t i ο η .組套（Q i a g e η , Valencia: CA)凝膠純化預期的環帶（696鹼基對）·，以及連 結到中間選殖載體 P G E Μ 丁 - E a s >，（ P r 〇 m e g a: M a d i s ο η，W J) -106- (103) 1353991 。將 DNA 轉形到 DH5a 細胞（Invitrogen，Carlsbad，CA)以 及迷你製備培養生長以及用 Plasmid Miniprep Kit (Qiagen, Valencia，CA)依據製造者之標準程.序純化。一旦 証實序列，將插入體用Sal/EcoRI限制酶水解，凝膠純化 ，以及用相同方法選殖入載體pED.dC.Epo之 Sal/EcoRI 位點，產生哺乳動物的表現質體pED.dC.EpoFc。哺乳動 物的細胞之表現是描述於實施例2 6。具有八個胺基酸連結 子之EpoFc胺基酸序列如圖2j。進行替代之選殖方法時， 雖然保留精確的EpoFc胺基酸序列（圖2J)，在核酸等級上 則造成許多非編碼的改變（圖3J)。其爲G6A(在核酸6之G 改變至 A)(去除引子內可能的二級結構）、G5 6 7A(從Epo 移除內生性Sbfl位點）、A5 82G(從連結子移除EcoRI位點 )' A63 6T以及T63 9G(於Fc加上獨一無二的BspEl位點） '以及G65 1 C(於Fc加上獨一無二的RsrII位點）《圖3J 之核苷酸序列是實施例25製造的建構體，其係實施例24的 建構體中加入上述之差異。 實施例 26 :表現以及純化EPO-Fc單元體以及單元體-二 元體雜合體 將D G 4 4細胞種植入]0公分之組織培養陪氏培養皿以 及生長至50%-60%滿。總共使用1 0微克之 DNA轉染一個 I 〇公分之組織盤：轉染同源二元體’]0微克之 pED.dC.EPO-Fc ；轉染單元體-二元體雜合體，8微克之 pED.dC_EPO-Fc + 2微克之 pCDNA3-F]agFc。如描述於實 -107 - (104) (104)1353991 施例24，選殖此構築體。描述於實施例25之選殖方法亦可 用以取得應用於此實施例之構築體。轉染細胞如描述於 Superfect 轉染反應劑手冊（Qiagen; Valencia: CA)»·轉染 4 S小時之後移除培養液以及二轉染株用無核苷加上5 %透 析的胎牛血淸之MEM Alpha取代，而此單元體-二元體雜 合體轉染株中再補充0.2毫克/毫升遺傳黴素（Invitrogen, Carlsbad，CA)。3天之後，從平板以0.25%胰蛋白酶釋出細 胞以及轉移到T 2 5組織培養燒瓶，以及繼續選擇1 〇 ·] 4天 直到細胞生長良好建立穩定的細胞系。接著加入甲.胺蝶呤 放大表現蛋白質。 . 二細胞株鐘’使用大約2 X 1 〇 7細胞種入內含3 0 〇毫升 之生長培養液的1 7 0 0公分2之轉動瓶培養（C o r n i n g， C ο r.n i η g , Ν Υ )。此轉動瓶是在5 % C Ο 2、3 7 t下反應大約 72小時。將生長培養液用300毫升不含血淸的生產培養液 (DMEM/F12 ’ 5毫克/毫升牛胰島素以及10毫.克/毫升慶大 黴素）交換。每天收集生產培養液（條件培養液）爲期丨〇天. 以及儲存在4 °C。各收集之後，在轉動瓶中加入新鮮的生 產培養液以及將瓶子放回培養箱。在色層分析之前，使用
SuporCap-100(0.8/0.2 微米）濾膜（Pall Gelm an Sciences, A η η η η π A r b o r，Μ I)過濃器過濾培養液。所有步驟是在4 下進行。過據的培養液是施用至P r 〇 t e i n A S e p h a r 〇 s e，以 5倍管柱體積之IX PBS(l〇毫莫耳濃度磷酸鹽，酸鹼度7 4 、2.7毫莫耳濃度KC1、以及]37毫莫耳濃度NaCI)淸洗，' 〇 . 1莫耳濃度甘胺酸酸鹼度2 _溶析，以及然後用】/] 〇體稹之 -108- (105) (105)1353991 I莫耳濃度Tris-HCl酸鹼度9.0中和。然後用PBS .透析蛋 白質。 從內含 EPO-Fc: EPO-Fc 同源二元體、EPO，Fc: Flag-Fc單元體-二元體雜合體、以及 F]ag-Fc: FUg-Fc 同源二元體之·混合物，進一步的純化轉染單元體-二元體 雜合體之蛋白質樣本。濃縮材料以及在流速4毫升:/分鐘 (36 公分/小時）下施用至2.6公分 X 60 .公分（3 18毫升 )Superdex 200 Prep Grade管柱以及然後用3倍管柱體積之 1 X PBS溶析。收集在UV檢測器上對應至二吸.收峰之分 層以及經SDS-PAGE分析。第一吸收峰分層內含EPO-Fc :EPO-Fc同源二元體或EPO-Fc.: FlagFc單元體二元體 雜合體，而第二吸收峰內含FlagFc : FlagFc.同源二元體 。集中內含單元體-二元體雜合體但無FUgFc同源二元體 的所有分層以及在線性流速6 0公分/小時下直接施用至I - 6 X 5公分M2抗-FLAG瓊脂糖管柱（Sigma Corp·)。負荷後 ，管柱是用5倍管柱體積之PBS淸洗。然後單元體·二元體 雜合體是用1〇〇毫莫耳濃度甘胺酸酸鹼度3.0溶析。然後內 含蛋白質吸收峰之溶析分層經添加]/1 〇體積之1莫耳濃度 T r i s - H C】中和，以及經還原以及非還原S D S - P A G E分析。 分層經P B S透析，濃縮至1 - 5毫克/毫升，.以及儲存在-8 0 t。 此外，經S D S - P A GE分析S up er d eX 2 0 0的第一吸收峰 分層，以及集中內含多數之EpoFc單元體-二元體雜合體 及少數Ep 〇 F c同源二元體的分層。集中的分層，濃化.單元 -109- (106) (106)1353991 體-二元體雜合體，然後再施用至Superdex 2 00管柱，以 及然後集中僅內含EpoFc單元體-二元體雜合體的分層， 透析以及以純化的蛋白質儲存。·注意此替代之純化方法也 可用於純化非標記的單元體-二元體雜合體。 實施例 27:投用 EpoFc.二元體以及具有.8個胺基酸 連結子之單元體-二元體雜合體至獼猴屬猴子 肺部的投用時，用.Aeroneb ProTM (AeroGen, Mountain View, CA)噴霧器產生內含 EpoFc二元體或 EpoFc單元體-二元體雜合體蛋白質（兩者均有S個胺基酸連 結子）之PBS(酸鹼度7.4)之氣溶膠，和Bird Mark 7A呼吸 機同軸聯接，以及經由氣管內導管（約正常的呼吸）投用至 麻醉的獼猴。兩蛋白質亦經靜脈注投用至天真獼猴。各種 不同的時間點採樣，以及使用 Quantikine IVD人類Ep0 免疫測定（R&D Systems，Minneapolis, MN)定量血駿蛋白 質中Epo之含量。使用WinNonlin軟體計算藥物動力學參 數。表4是 EpoFc單元體-二元體雜合體或EpoFc二元體 處理的·獼猴之生物效性結果。 -110 - 1353991 屮磐削國枳.lisoD.3尚ΚΪ4Π蔻_圮!|- _呍酹S0d3眧¾: t，散 ti/2 avg (小時） (N κη (Ν 22.6 (N 14.6 t I /2 (小時） ΓΟ Γ'ϊ νΊ m 04 <N y〇 VO 卜 r~> ΓΟ CN ro cs m 卜 CN 0〇 口 〇\ o (N 〇\ <N IT) rn Ό m iN o 卜 CO oo ON c,… (fmol/毫升） 〇 703 16 84 1403 105 08 794 1 o 12 0 244 (N 143 302 4 1454 〇\ CN 3 0 5 3 3 4 73 79 5 0403 1 3 95 5 0 C m a \· (毫微克/毫升） 7 2.3 ο <Ti 120 100 749 566 _«n r- o 〇〇 <N ^r v〇 &c <N r- 3 7 01 3 6 80 2 726 4230 45 00 3 5 3 1 大約沈澱的劑 量穴微克/公斤） s ο (Ν cs m CN in >71 κη to 150 O 1 50 1 50 O 1 50 路徑 «t Q- r— Q. o. α. > > > D. P p D. S. P 二 a. > > > > > > 猴子編號 C06!8I C062 1 4 C07300 C07 332 C07285 C07288 ! C07343 DD026 DD062 DD046 DD0 1 5 D D 0 3 8 1 F492 9 6 V 0 0 2 1 I 1 26 1：CQ0 127-107 (N 1 00 〇 \o <N 蛋白質 E ;〕〇 F c 單 元體-二 蔻 藝 合體 J B p o F c 二 元體 111 (108) (108)1353991 使用下列公式計算肺劑量的生物效性百分比（F): F =(肺的AUC/肺的劑量）/(AUC IV /劑量IV)* 100 -112 - 1353991 qq农如迨锬晷胡Μ-Γ-Ι 二IfsMIlK.朗匠刼g锸莒難囊识!1謡議如蔻輩呍1|-調呍酹Qu-oda : ς锻 平均生物效性 3 4.9% i 0.0 % 生物效性2 (F) 2 5.2% 20.3 % 〇 m ·、〇 m 、〇 〇\ 〇〇 CN 勺. 〇1 A U C n g * 小時/毫升 〇 OC r·', 3 0 7 2 952 5 1 _ _ 里 . 4708 36 i 1 392 267 ' 647 2062 大約劑量1 (沈澱的） 2 0微克/公斤 2 0微克/公斤 20微克/公斤 2 0微克/公斤 15微克/公斤 15微克/公斤 ! 15微克/公斤： 1 5微克/公斤 35微克/公斤 猴子編號 C06 1 8 C062!4 C07300 C 0 7 3 3 2 1 DD026 DD062 DD046 DD0 1 5 DD038 蛋白質 E p 〇 F c單元體-二元體雜合體 Ε ρ 〇 F c二元體 1 ! 。也.<<5窭 0 S lBits 觀二屮磐»9 =.c)^s/ 凿七.？，£ 霆 s /. 9 60/.= 3 η V 珉&-^||1^1|30.00.3 Λ 1。.^^/踩窭 SCN喊 ¥®- ( i-磐戤 ε=5,νκ»ϋκ/*帜證螂 ε 16f =υην-ϋρίκ-·Ν_<ίπ韹一I1RU- _ 旧酹 3U-00.3 ΛΓ . W「& 11 ®ΠΝΦ 铝彝鹳fg%s 一&fl -抿 iils^sifE-v， -113- (110) (110)1353991 此具有8個胺基酸連結子之EpoFc投用至獼猴之藥物 動力學如圖Η。此圖爲單一的肺部劑量投用EpoFc二元體 和EpoFc單元體-二元體雜合體至猴子之後進行之比較。 基於莫耳濃度比較，單元體·二元體雜合體處理的猴子血 淸之含量顯著的比二元體處理的猴子高。 實施例 28 :皮下投用EPOFc單元體-二元體雜合體 皮下投用習知的紅血球生成素藥劑和EPOFc單元體-二元體雜合體、EPOFc單元體-二元體雜合體以及 Aranesp®(促紅血球生成素）（不是嵌合型融合型蛋白.）至不 同猴子以及在一段時間測.量血淸濃度，比較血淸之濃度。 將獼猴（每組η = 3)皮下注射0.025毫克/'公斤EpoFc單. 元體-二元體雜合體。收集注射前，以及注射後多至]4 4小 時之J&液樣本。從血液製備血淸以及冷凍儲存直到經酵素 聯結免疫抗體檢測法分析爲止（Human Epo Quant.iki.ne, Immunoassay) (R & D Systems, Minneapolis, MN)。使用. 认 i η N 〇 n L 】n a ® 軟體（P h a r s i g h ί，Μ o u n t a i n v i e w，C A)進行藥物 動力學參數之測定。 結果指出 EPOFc單元體-二元體雜合體以及 Al"aneSp®(促紅血球生成素）之血淸時間濃度是相等·，即使 投:用莫耳劑量之Aranesp®(促紅血球生成素）其血淸時間濃 度也只是:稍微地加大（表6 )(圖1 2 )。 -114 - (111)1353991 %生物效 性（F) 57 土 1 7 οο -Η m ΚΤ) I Τ,/2 (小時） 26土 5 22 士 2 卜 卜一 卜 -Η υ 義 #\ r\ 〇 m ο Os 5 ¥ . έ £ 爾 m 二 fi m -Η s 蘗 cn 〇〇 5 β + —> <4 〇 m Ο μ ίί 觀 β 〆漏、 、 <N Μ 成 飯 W 47") •Ul •IP •m Y- l1 酋 -¾ 呍 IS © -丨1 _ in O ο _ cz ω 義蔻 < -115 - (112) (112)1353991 實施例 29 :靜脈注射EP OF c單元體-二元體.雜合體 靜脈內投用習知的紅血球生成素藥劑和EP OFc單元 體-二元體雜合體' EPOFc單元體-二元體雜合體以及 A r a n e s p ® (促紅血球生成素）、Ε ρ 〇 g e η ® (阿法依伯汀）（二者 都不是嵌合型愚合型蛋白）至不同猴子以及在一段時間測 量血淸濃度，比較血淸之濃度。 . 將獼猴（每組η = 3 )靜脈內注射〇 . 〇 2 5毫克/公斤Ε ρ 〇 F c 單兀體-—.兀體雜合體。收集注射刖，以及·注射後多至‘_:]‘4 4 小時之血液樣本。從血液製備血淸以及冷凍儲存直到經酵 素锻Ρ結免疫抗體fe?測法分析爲止（Η u m a n ρ 〇 Q u a η ί i k j η έ Immunoassay) (R & D Systems. Minneapolis, MN)。使用 WinNonLina®軟體（Pharsight，Mountainview, CA)進行藥物. 動力學參數是測定。 結果指出即使投用臭耳劑量之Epogen® (阿法依伯汀·) 以及 Aranesp® (促紅血球生成素），EPOFc.單元體·二元體 雜合體之血淸時間濃度（A U C )是大於Ερ 〇 g e η ® (阿法依.伯汀 )或Aranesp®(促紅血球生成素）（表7)(圖]3)。 -116 - (113)1353991 \ -H i.i〆 Γ'ί 1=2 ί 3 i 23士 1 20士1 6.3 0.6 k ^ 〇〇 ON Ό m m 求 m CN «— <N -Η v〇 m 蠏 〇s Ο 〇〇 m Ch r -^. -H Ο -D .， '~~1 -Η (N 〇 rn ON < 七 /«^S >k Ο (N »—< 1 < oo -H Γ- _u -K CN 寸 S 窫 (Ν ν〇 ^T) s s /-N 寸 VO H Ο 〇 VO o m ^ 蘅β £ i? m (Ν _ 匿 S ST) <η <n JT> e e e 罃 簦 挡 ί=3 遙 鑒 ϊίϊτ^ KS ΪΓττ^ 识 襲 (5\ 鞞 旧 cx, -·,, ^ (Λ <υ Ο 〇 . <D CO CX) ο ω ϋ 惹 < Q- -117 - (114) (114)1353991 實施例 30:純化EpoFc單元體-二元體雜合體 將內含Fc、EpoFc單元體-二元體雜合體 '以及 EpoFc二元體混合物施用至蛋白質A瓊脂糖管柱。混合物 是依據製造者之說明溶析。將內含混合物之蛋白質A瓊 脂糖溶析物之緩衝液更換成5〇毫莫耳濃度丁1^-8(：1(酸鹼 度8.0)。將蛋白質混合物裝入50毫莫耳濃度Tris-HCl(酸驗 度 8.0)平衡的 8 毫升 Mimetic Red 2 XL 管柱（pr〇Metic Life Sciences, Inc” \Vayne; NJ)。然後以 50 毫.莫耳濃度 Tris-HCl (酸鹼度 8.0) ; 50毫莫 耳濃度 NaCl 淸洗 管柱。 這個步 驟移除大多數的此F c。從管柱中以5 0毫莫耳濃度T H s -KC】（酸鹼度8.0) ; 4〇〇毫莫耳濃度NaCM特別地.溶析出 EpoFc單元體·二元體雜合體。可溶析出ep〇Fc二元體以 及甩5倍管柱體積之1 M NaOH再生管柱。管柱的溶析.分.層. 疋經S D S - P A G E分析（圖i 4 )。 . 用於本說明書以及申請專利範圍中，所有表示成分之 ft、反應條件等等之數目，據瞭解可經本文術語之，，約，，修 飾n據此，除非另行指明，本說明書以及申請專利範圍中 的數値應是近似値’其將視本發明所要求的性質而定。不 7E試圖限㈣此申請專利範圍之用途，各參數的數値應能代 表有效數字以及平常捨入的數字。 所有引用之參考文獻全文在此倂入參考文獻，引用之 各個別地出版或專利或專利申請全文在此并入參考文獻.。 牴觸本說明書掲示之出版以及專利或專利申請案全文在此 并入參考文獻，本說明書超越任何以上相反的材料。 -118 - (115) (115)1353991 對熟悉此技藝的專業人士而言，本發明有許多修飾以 及變異而不脫離本發明之精髓以及範圍。在此描述的特定 具體實施例是例如僅用以試範以及不是限制本發明。本說 明書和實施例預期僅考慮作爲範例，本發明真正的範圍列 於下列之申請專.利範圍。 【圖式簡單說明】.. 圖1爲比較E P 0 - F c同源二元體、或二元體構造，以..， 及Epo-FC單元體-二元體雜合體構造之示意圖。 圖2A爲嵌合型蛋白質因子vn-Fc之胺基酸序列。.此 序列之內包括的是信號肽（劃底線），彼是經細胞分解且此 前肽（粗線）係經維生素 K-依存之 γ.羧化酶確認修飾因子. VII達成完整的活性。此序列其後經Pace分解而產生因 子 VII-Fe。 . ， 圖2b爲嵌合型蛋白質因子lx之胺基酸序列。.包 括在此序列之內的是信號肽（劃底線），彼是經細胞分解且 此前肽（粗線）係經維生素K-依存之γ羧化酶確認修飾因子. IX達成完整的活性。接著此序列經PACE分解產.生因.子· ΙΧ-Fc 。 圖2c爲嵌合型蛋白質因子IFNa-Fc之胺基酸序列。 包括在此序列之內的是信號肽（劃底線），彼是經細胞分解 產生成熟的干擾素Cl · F C。 圖2d爲嵌合型蛋白質IFNa-FC △連結子之胺基酸序 列。包括在此序列之內的是信號肽（劃底線），彼是經細胞 -119- (116) 1353991 分解產生成熟的干擾素α-Fc △連結子。 圖2e爲嵌合型蛋白質F】ag-Fc之胺基酸序列。包括在 此序列之內的是信號肽（劃底線），彼是經細胞分解產生成 熟的 Flag-Fc。 圖2f爲嵌合型蛋白質Epo-CCA-Fc之胺基酸序列。包 括在此序列之內的是信號肽（劃底線），彼是經細胞分解產 生成熟的Epo-CCA-Fc。粗線亦展示此酸性的捲曲螺旋結 構區。 圖2g爲嵌合型蛋白質CCB-Fc之胺基酸序列。包括在 此序列之內的是信號肽（劃底線），彼是經細胞分解產生成· 熟的C C B - F C。粗線亦展示此鹼性的捲曲螺旋結構區。 圖2，h爲嵌合型蛋白質Cys-Fc之胺基酸序列。包括在 此序列之內的是信號肽（劃底線），彼是經細胞分解產生成 熟的C y s · F c。當C Η 0細胞製作此序列時，一個百分比之 此分子未經此訊息胜肽切割酵素正確地分解，因此Ν端 留下二個額外的肢基酸，如此預防生物活性分子聯結C端 的硫酯（例如，經由天然的聯接反應）。當此類不正確地分 解種類和適當地分解之Cys-Fc二元化以及是接著和具有 C端硫酯類的生物活性分子反應，形成單元體·二元體雜 合體。 圖爲嵌合型.蛋白質IFNa-GS ] 5-Fc之胺基酸序列。 包括在此序列之內的是信號肽（劃底線），彼是經細胞分解 產生成熟的I F Ν a - G S ] 5 - F c。 圖2.丨爲嵌合型蛋白質Epo-Fc之胺基酸序列。包括在 -120-

Claims (1)

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:第0931 12725號申請專利範圍修正本 民國100年 7月21日修正 拾、申請專利範圍 1. 一種包含第一及第二多肽鏈之嵌合型蛋白質，其中 該第一鏈包含一種單一生物活性分子及含有FcRn結合部 位之免疫球蛋白恆定區的至少一部分，且其中該第二鏈包 含內含有FcRn結合部位之免疫球蛋白恆定區的至少一部 分且不含有生物活性分子或免疫球蛋白變異區，其中該第 一多肽鏈中該含有FcRn結合部位之免疫球蛋白恆定區的 部分係與該第二多肽鏈中含有FcRn結合部位之免疫球蛋 白恆定區的部分化學聯結。 2 .如申請專利範圍第1項之嵌合型蛋白質，其中第二 鏈進一步包含親和標記物。 3 .如申請專利範圍第2項之嵌合型蛋白質，其中親和 標記物是FLAG標籤。 4.如申請專利範圍第1項之嵌合型蛋白質’其中兔@ 球蛋白之部分是Fc片段。 5 .如申請專利範圍第1項之嵌合型蛋白質’其中资疾 球蛋白是IgG。 6. 如申請專利範圍第1項之嵌合型蛋白質，其中生物 活性分子是多肽。 7. 如申請專利範圍第5項之嵌合型蛋白質’其中 是 IgGl 或 IgG2。 8 ·如申請專利範圍第1項之嵌合型蛋白質’其中生物 1353991 « 活性分子是病毒融合抑制劑。 9. 如申請專利範圍第8項之嵌合型蛋白質，其中病毒 融合抑制劑是人免疫缺陷病毒（ΗI V )融合抑制劑。 10. 如申請專利範圍第9項之嵌合型蛋白質，其中 HIV 融合抑制劑是Τ 2 0 (序列確認號碼：1 )、T 2 1 (序列確認號碼 :2)或Τ 1 249(序列確認號碼：3)。 1 1 ·如申請專利範圍第1項之嵌合型蛋白質，其中生物 φ 活性分子是凝血因子。 1 2 ·如申請專利範圍第1 1項之嵌合型蛋白質，其中凝 血因子是因子VII或Vila。 1 3 .如申請專利範圍第1 1項之嵌合型蛋白質，其中凝 血因子是因子VIII。 1 4 .如申請專利範圍第1 1項之嵌合型蛋白質，其中凝 血因子是因子IX。 15. 如申請專利範圍第1項之嵌合型蛋白質，其中生物 Φ 活性分子是小分子。 16. 如申請專利範圍第15項之嵌合型蛋白質，其中生 物活性分子是売丙瑞林（leuprolide)。 17. 如申請專利範圍第1項之嵌合型蛋白質，其中生物 活性分子是干擾素。 18. 如申請專利範圍第17項之嵌合型蛋白質，其中生 物活性分子是干擾素α。 19. 如申請專利範圍第17項之嵌合型蛋白質，其中生 物活性分子是干擾素β。 S -2- I 1353991 20. 如申請專利範圍第17項之嵌合型蛋白質’其中干 擾素是千擾素α且具有15-25個胺基酸之連結子。 21. 如申請專利範圍第20項之嵌合型蛋白質’其中干 擾素α具有15-20個胺基酸之連結子。 22. 如申請專利範圍第21項之嵌合型蛋白質’其中該 連結子是（GGGGS)3。 2 3.如申請專利範圍第1項之嵌合型蛋白質，其中生物 活性分子是核酸。 φ 24. 如申請專利範圍第23項之嵌合型蛋白質’其中核 酸是DNA或RNA。 25. 如申請專利範圍第23項之嵌合型蛋白質，其中核 酸是反義分子。 2 6.如申請專利範圍第23項之嵌合型蛋白質，其中核 酸是催化性R N A ( r i b 〇 z y m e )。 2 7 .如申請專利範圍第1項之嵌合型蛋白質，其中生物 活性分子是生長因子。 φ 2 8 ·如申請專利範圍第2 7項之嵌合型蛋白質，其中生 長因子是紅血球生成素。 2 9 ·如申請專利範圍第1 5項之嵌合型蛋白質，其中小 分子是VLA4掊抗物。 3 0 . —種藥學組成物，其包含如申請專利範圍第1項之 嵌合型蛋白質及藥學上可接受的賦形劑。 31.—種包含第一及第二多肽鏈之嵌合型蛋白質’ a)其中該第一鏈包含一種單一生物活性分子、含有 -3- 1353991 FcRn結合部位之免疫球蛋白恆定區的至少一部分及具有 至少一個專一性結合伴之第一結構區，該專一性結合伴係 選自螺旋束、白胺酸拉鏈、福斯（fos)及瓊（jun);且 b)其中該第二鏈係由含有FcRn結合部位之免疫球蛋 白恆定區的至少一部分及該專一性結合伴之結合伴所構成 9 其中該第一鏈係與該第二鏈化學聯結。 φ 32.如申請專利範圍第31項之嵌合型蛋白質，其中第 二鏈進一步包含親和標記物。 3 3 ·如申請專利範圍第3 2項之嵌合型蛋白質，其中該 親和標記物是FLAG標籤。 34.—種製作如申請專利範圍第1項之嵌合型蛋白質之 方法，其包含： a) 利用編碼第一鏈之第一 DNA建構體轉染第一培養 之細胞，該第一 DNA建構體包含DNA分子，該DNA分 ® 子編碼與含有FcRn結合部位之免疫球蛋白恆定區的一部 分連接之生物活性分子； b) 利用編碼第二鏈之第二DNA建構體轉染第二培養 之細胞，該第二DNA建構體包含DNA分子，該DN A分 子編碼無生物活性分子或免疫球蛋白之變異區的含有 FcRn結合部位之免疫球蛋白恒定區的一部分； c) 在使經由該第一 DNA建構體和該第二DNA建構體 編碼之第一和第二鏈表現的條件下培養a)及b)之細胞； 及 S -4- 1353991 d)自該等經轉染之細胞分離由a)及b)之細胞所產製的 蛋白質之二元體。 3 5.如申請專利範圍第34項之方法，其中二元體是經 層析法分離。 36.如申請專利範圍第34項之方法，其中該第一和第 二培養之細胞是真核細胞。 3 7 .如申請專利範圍第3 6項之方法，其中真核細胞是 C Η 0細胞。 3 8 .如申請專利範圍第3 4項之方法，其中該第一和第 二培養之細胞是原核細胞。 3 9 .如申請專利範圍第3 8項之方法，其中原核細胞是 大腸桿菌。 4 0.如申請專利範圍第1項之嵌合型蛋白質，其包含下 式 X-La-F : F 或 F : F-La-X 其中X爲一種單一生物活性分子，L是連結子， F是含有FcRn結合部位之免疫球蛋白恆定區的至少一部 分，且a是任何整數或零。 41.如申請專利範圍第40項之嵌合型蛋白質，其中 FcRn是免疫球蛋白Fc片段之肽模仿物。 4 2.如申請專利範圍第40項之嵌合型蛋白質，其中每 個F是與其他F化學聯結。 43.如申請專利範圍第42項之嵌合型蛋白質，其中化 學聯結是非共價型相互作用 -5- 1353991 44. 如申請專利範圍第42項之嵌合型蛋白質，其中化 學鍵是共價鍵。 45. 如申請專利範圍第42項之嵌合型蛋白質，其中化 學鍵是雙硫鍵。 46. 如申請專利範圍第40項之嵌合型蛋白質，其中 F 是經非雙硫鍵之鍵與F連接。 47. 如申請專利範圍第40項之嵌合型蛋白質，其中 F 0 是IgG免疫球蛋白恆;定區。 48. 如申請專利範圍第40項之嵌合型蛋白質，其中 F 是 IgG 1。 49. 如申請專利範圍第40項之嵌合型蛋白質，其中F 是Fc片段。 50. 如申請專利範圍第40項之嵌合型蛋白質，其中 X 是多肽。 5 1.如申請專利範圍第40項之嵌合型蛋白質，其中 X 馨是亮丙瑞林（leuprolide )。 52.如申請專利範圍第40項之嵌合型蛋白質，其中 X 是小分子。 5 3 .如申請專利範圍第5 2項之嵌合型蛋白質，其中小 分子是VLA4拮抗物。 54. 如申請專利範圍第40項之嵌合型蛋白質，其中X 是病毒融合抑制劑。 55. 如申請專利範圍第54項之嵌合型蛋白質，其中病 毒融合抑制劑是人免疫缺陷病毒（HIV )融合抑制劑。 1353991 56. 如申請專利範圍第55項之嵌合型蛋白質，其中 HIV融合抑制劑是T20(序列確認號碼：1)、T21(序列確認 號碼：2)或Τ1 249(序列確認號碼：3)。 57. 如申請專利範圍第40項之嵌合型蛋白質，其中X 是凝血因子。 58. 如申請專利範圍第57項之嵌合型蛋白質，其中凝 血因子是因子VII或Vila » 5 9.如申請專利範圍第57項之嵌合型蛋白質，其中凝 血因子是因子VIII。 60. 如申請專利範圍第57項之嵌合型蛋白質，其中凝 血因子是因子IX。 61. 如申請專利範圍第40項之嵌合型蛋白質，其中X 是核酸。 62. 如申請專利範圍第61項之嵌合型蛋白質，其中核 酸是DNA或RNA分子。 63. 如申請專利範圍第40項之嵌合型蛋白質，其中X 是生長因子。 64. 如申請專利範圍第63項之嵌合型蛋白質，其中生 長因子是紅血球生成素。 6 5.—種如申請專利範圍第1或40項之嵌合型蛋白質於 製造供治療病患之藉由該生物活性分子可加以治療之疾病 或病症的藥物之用途，其中該疾病或病症係病毒感染、止 血性病症'貧血'癌症、白血病、發炎性症狀、選自關節 炎、牛皮癬、紅斑性狼瘡或多發性硬化之自體免疫疾病、 1353991 或細菌感染。 66. 如申請專利範圍第65項之用途，其中該疾病或病 症是病毒感染。 67. 如申請專利範圍第66項之用途，其中該病毒感染 是HIV感染。 68·如申請專利範圍第65項之用途，其中該疾病或病 症是出血性病症。 φ 69.如申請專利範圍第68項之用途，其中該出血性病 症是A型血友病。 70.如申請專利範圍第68項之用途，其中該出血性病 症是B型血友病。 71·如申請專利範圍第65項之用途，其中該疾病或病 症是貧血。 72. 如申請專利範圍第65項之用途，其中該嵌合型蛋 白質是經靜脈內、肌肉內、皮下、口服、頰、舌下、鼻、 鲁直腸、陰道、經由氣溶膠或經由肺路徑投服。 73. 如申請專利範圍第72項之用途，其中該嵌合型蛋 白質是經由肺路徑投服。 74. 如申請專利範圍第72項之用途，其中該嵌合型蛋 白質是經口投服。 75. —種製作如申請專利範圍第1或31項之嵌合型蛋白 質的第一鏈之方法，其包含： a)利用包含DNA序列之DNA分子轉染經培養之細胞 ，該DNA序列編碼與內含肽（intein)操作性連接之免疫球 1353991 蛋白恒定區（Fc); b) 於使該Fc和內含肽經表現爲融合蛋白之條件下培 養該細胞； c) 自該細胞分離該Fc-內含肽融合蛋白； d) 化學合成具有N端Cys的生物活性分子； e) 令c )經分離之Fc-內含肽融合蛋白與2-氫硫基乙烷 磺酸（ME SNA )反應以產生C端硫酯；及 f) 令d)之生物活性分子與e)之Fc反應以產生第一鏈 ，該第一鏈包含與生物活性分子連接之Fc。 7 6.—種製作如申請專利範圍第1或31項之嵌合型蛋白 質之方法，其包含： a) 利用包含DNA序列之DNA分子轉染經培養之細胞 ，該DNA序列編碼含有與信號肽操作性連接之FcRn結合 部位的免疫球蛋白恆定區（Fc)，其中該信號狀係毗鄰該 免疫球蛋白恆定區之半胱胺酸； b) 於使該Fc和信號肽經表現爲融合蛋白且該Fc在無 該信號肽但含有N端半胱胺酸之情況下自該細胞分泌之 條件下培養該細胞； c) 自該細胞分離該具有N端半胱胺酸之Fc的二元體 * d) 化學合成具有硫酯的生物活性分子；及 e) 令d)之生物活性分子與c)之Fc在使該生物活性分 子可聯結c)之二元體的一個鏈之條件下反應以產生包含與 生物活性分子連接之Fc的嵌合型蛋白質。 -9- 1353991 77. 如申請專利範圍第76項之方法，其中硫酯是C端 硫酯。 78. —種製作如申請專利範圍第1項之嵌合型蛋白質之 方法，其包含： a) 利用包含DNA序列之DNA分子轉染細胞’該DNA 序列編碼含有與信號肽操作性連接之FcRn結合部位的免 疫球蛋白恆定區（Fc)，其中該信號肽係毗鄰Fc半胱胺 • 酸； b) 在使經Fc和信號呔經表現呈彼此連接且該信號肽 經該細胞於毗鄰半胱胺酸之第一位置或毗鄰纈胺酸之第二 位置上與該Fc切割之條件下培養該細胞； c) 自該細胞分離具有二個N端半胱胺酸或二個N端 纈胺酸或一個N端半胱胺酸和一個N端纈胺酸之該Fc的 二元體； d) 化學合成具有硫酯的生物活性分子；及 φ e)令d)之生物活性分子與c)之二元體反應以製作嵌 合型蛋白質，該嵌合型蛋白質包含第一鏈和第二鏈，該第 一鏈包含與生物活性分子連接之Fc且該第二鏈包含不與 任何生物活性分子或免疫球蛋白之變異區連接之Fc。 7 9.如申請專利範圍第78項之方法，其中硫酯是C端 硫酯。 80. —種自混合物分離如申請專利範圍第1或40項之嵌 合型蛋白質之方法，其中該混合物包含： a)如申請專利範圍第1或40項之嵌合型蛋白質； -10- 1353991 b) 包含如申請專利範圍第1或40項所述之兩個第一鏈 之二元體：及 c) 包含如申請專利範圍第1或40項所述之兩個第二鏈 之二元體； 該方法包含： 1) 在使如申請專利範圍第1或40項之嵌合型蛋白質和 b)之二元體與染劑配體結合之適當條件下，令該混合物 與連接固體載體之該染劑配體接觸； 2) 去除未結合的c)之二元體； 3 )改變1 )之適當條件，使得如申請專利範圍第1或40 項之嵌合型蛋白質與連接固體載體之該染劑配體間的結合 遭破壞；及 4)分離如申請專利範圍第1或40項之嵌合型蛋白質。 8 1 ·如申請專利範圍第8 〇項之方法，其中染劑配體是 生物模仿物分子。 8 2 .如申請專利範圍第8 0項之方法，其中染劑配體係 選自：模仿物紅（Mimetic Red) ΓΜ、模仿物紅（Mimetic Red) 2TM、模仿物橙（Mimetic Orange) ΓΜ、模仿物橙 (Mimetic Orange) 2τμ、模仿物模（Mimetic Orange) 3τμ、 模仿物黃（Mimetic Yellow) 1TM、模仿物黃（Mimetic Yellow) 2TM、模仿物綠（Mimetic Green) ΓΜ、模仿物藍 (Mimetic Blue) 1ΤΜ 及模仿物藍（Mimetic Biue) 2τμ。 83 .如申請專利範圍第82項之方法，其中染劑配體是 模仿物紅（Mimetic Red) 2ΤΜ。 S -11 - 1353991 84 ·如申請專利範圍第8 2項之方法，其中染劑配體是 模仿物綠（Mimetic Green) 1TM。 ·： 85. 如申請專範圍第80項之方法，其中適當條件包 含pH介於4(含）至9(含）的緩衝液。 86. 如申請專利範圍第85項之方法，其中改變該適當 條件包含對該緩衝液添加至少一種鹽，該鹽之濃度係足以 破壞該嵌合型蛋白質與該染劑配體之結合，進而分離該嵌 φ 合型蛋白質。 8 7 .如申請專利範圍第8 6項之方法，其中至少一種鹽 是 NaCl。 8 8 ·如申請專利範圍第8 5項之方法，其中緩衝液之p Η 是8。 89. 如申請專利範圍第88項之方法，其中鹽濃度是 400mM ° 90. 如申請專利範圍第86項之方法，其進一步包含添 φ加與破壞該嵌合型蛋白質與該染劑配體之結合的鹽濃度相 比爲高之鹽濃度’使得該較高之鹽濃度破壞該嵌合型蛋白 質與染劑配體之結合，進而分離該嵌合型蛋白質。 S -12- 1353991
1353991 圖2A 1 MVSQALRLLC LLLGLQGCLA AVFVTQEEAH 6VLHRRRRAN AFLEELRB6S 51 LERECKEEQC SFEEAREIFK DAERTKLFWI SYSDGDQCAS SPCQNGGSCK 101 DQLQSYICFC LPAFEGRNCE THKDDQLICV NENGGCEQYC SDHTGTKRSC 151 RCHEGYSLLA DGVSCTPTVE YPCGKIPILE KRNASKPQGR IVGGKVCPKG 201 ECPWQVLLLV NGAQLCGGTL INTIPiWSAA HCFDKIKNWR NLIAVLGEHD 251 LSEHDGDEQS RRVAQVIIPS TYVPGTTNHD IALLRLHQPV \HJTDHWPLC 301 LPERTFSERT LAFVRFSLVS GWGQLLDRGA TALEIiMVLNV PRLMTQDCLQ 351 QSRKVGDSPN ITEYMFCAGY SDGSKDSCKG DSGGPHATHY RGTWYLTGIV
401 SWGQGCATVG HFGVYTRVSQ YIEWLQKLMR SEPRPGVLLR APFPDKTHTC 451 PPCPAPELLG GPSVFLFPPK PKDTLMISRT PEVTCVWDV SHEDPEVKFN 501 WYVDGVEVHN AKTKPREEQY NSTYRWSVL TVLHQDWLNG KEYKCKVSNK 551 ALPAPIEKTI SKAKGQPREP QVYTLPPSRD ELTKNQVSLT CLVKGFYPSD 601 IAVEWESNGQ PENNYKTTPP VLDSDGSFFL YSKLTVDKSR WQQGNVFSCS 651 VMHEALHNHY TQKSLSLSPG K 圖2B
1 MQRVNMIMRE SPGLITICLL GYLLSAECTV FLDHENAMKI LNRPKRYNSG 51 KLEEFVQGNL ERECMEEKCS FEEAREVFEN TERTTEFWKQ YVDGDQCESN 101 PCLNGGSCKD DINSYECWCP FGFEGKNCEL DVTCNIKNGR CEQFCKNSAD 151 NKWCSqTEG YRLAENQKSC EPAVPFPCGR VSVSQTSKLT RAETVFPDVD 201 YVNSTEAETI LDNITQSTQS FNDFTRWGG EDAKPGQFPW QWLNGKVDA 251 FCGGSIVNEK WIVTAAHCVE TGVKITWAG EHNIEETEHT EQKRNVIRII 301 PHHNYNAAIN KYNHDIALLE LDEPLVLNSY VTPICIADKE YTNIFLKFGS 351 GYVSGWGRVF HKGRSALVLQ YLRVPLVDRA TCLRSTKFTI YNNMFCAGFH 401 EGGRDSCQGD SGGPHVTEVB GTSFLTGIIS WGEECAMKGK YGIYTKVSRY 451 VNWIKEKTKL TEFAGAAAVD KTHTCPPCPA PELLGGPSVF LFPPKPKDTL 501 MISRTPEVTC VWDVSHEDP EVKFNWYVDG VEVHNAKTKP REEQYNSTYR 551 WSVLTVLHQ DWLNGKEYKC KVSNKALPAP IEKTISKAKG QPREPQVYTL 601 PPSRDELTKN QVSLTCLVKG FYPSDIAVEW ESNGQPENNY KTTPPVLDSD 651 GSFFLYSKLT VDKSRWQQGN VFSCSVMHEA LHNHYTQKSL SLSPGK
1353991 圖2C 1 MALTFALLVA LLVLSCKSSC SVQCDLPQTH SLGSRRTLML LAQMRRISLF 51 SCLKDRHDFG FPQEEFGNQF QKAETIPVLH EMIQQIFNLF STKDSSAAWD 101 ETLLDKFYTE LYQQLNDLEA CVIQGVGVTE TPLMKEDSIL AVRKYFQRIT 151 LYLKEKKYSP CAWEWRAEI MRSFSLSTNL QESLRSKEEF AGAAAVDKTH 201 TCPPCPAPEL LGGPSVFLFP PKPKDTLMIS RTPEVTCVW DVSHEDPEVK 251 FNWYVDGVEV HNAKTKPREE QYNSTYRWS VLTVLHQDWL NGKEYKCKVS 301 NKALPAPIEK TISKAKGQPR EPQVYTLPPS RDELTKNQVS LTCLVKGFYP 351 SDIAVEWESN GQPENNYKTT PPVLDSD0SF FLYSKLTVDK SRWQQGNVFS 401 CSVMHEALHN HYTQKSLSLS PGK 圖2D 1 MALTFALLVA LLVLSCKSSC SVGCDLPQTH SLGSRRTLML LAQMRRISLF 51 SCLKDRHDPG FPQEEFGNQF QKAETIPVLH EMIQQIFNLF STKDSSAAWD 1Ό1 ETLLDKFYTE LYQQLNDLEA CVIQGVGVTE TPLMKEDSIL AVRKYFQRIT 151 LYLKEKKYSP CAWEWRAEI MRSFSLSTNL QESLRSKEDK THTCPPCPAP 201 ELLGGPSVFL FPPKPKDTLM 工SRTPEVTCV WDVSHEDPE VKFNWYVDGV 251 EVHNAKTKPR EEQYNSTYRV VSVLTVLHQD WLNGKEYKCK VSNKALPAPI 301 EKTISKAKGQ PREPQVYTLP PSRDELTKNQ VSLTCLVKGF YPSDIAVEWE 351 SNGQPENNYK TTPPVLDSDG SFFLYSKLTV DKSRWQQGNV FSCSVMHEAL 401 HNHYTQKSLS LSPGK 圖2E 1 METDTLLLWV LLLWVPGSTG DDYKDDDDKD KTHTCPPCPA PELLGGPSVF 51 LFPPKPKDTL MISRTPEVTC VWDVSHEDP EVKFNWYVDG VEVHNAKTKP 101 REEQYNSTYR WSVLTVLHQ DWLNGKEYKC KVSNKALPAP IEKTISKAKG 151 QPREPQVYTL PPSRDELTKN QVSLTCLVKG FYPSDIAVEW ESNGQPENNY 201 KTTPPVLDSD GSFFLYSKLT VDKSRWQQGN VFSCSVMHEA LHNHYTQKSL 251 SLSPGK 1353991
11X111 5 0 5 0 5 112 2 圖2F 1 MVPCTLLLLL AAALAPTQTR AGSRAPPRLI CDSRVLQRYL LEAKEAENIT 51 TGCAEHCSLN ENITVPDTKV NFYAWKRMEV GQQAVEVWQG LALLSEAVLR 101 GQALLVNSSQ PWEPLQLHVD KAVSGLRSLT TLLRALGAQK EAISPPDAAS 151 AAPLRTITAD TFRKLFRVYS NFLRGKLKLY TGEACRTGDR EFGGEYQALE 201 KEVAQLEAEN QALEKEVAQL EHEGGGPAPE LLGGPSVFLF PPKPKDTLMI 251 SRTPEVTCW VDVSHEDPEV KFNWYVDGVE VHNJ^KTKPRE EQYNSTYRW 301 SVLTVLHQDW LNGKEYKCKV SNKALPAPIE KTISKAKGQP REPQVYTLPP 351 SRDELTKNQV SLTCLVKGFY PSDIAVEWES NGQPENNYKT TPPVLDSDGS 401 FFLYSKLTVD KSRWQQGNVF SCSVMHEALH NHYTQKSLSL SPGK 圖2G MVPCTLLLLL AAALAPTQTR AGEFGGEYQA LKKKVAQLKA KNQALKKRVA QLKHKGGGPA PELLGGPSVF LFPPKPKDTL MISRTPEVTC VWDVSHEDP EVKFNWYVDG VEVHNAKTKP REEQYNSTYR WSVLTVLHQ DWLNGKEYKC KVSNKALPAP IEKTISKAKG QPREPQVYTL PPSRDELTKN QVSLTCLVKG FYPSDIAVEW ESNGQPENNY KTTPPVLDSD GSFPLYSKLT VDKSRWQQGN VFSCSVMHEA LHNHYTQKSL SLSPGK 圖2H 1 MALTFALLVA LLVLSCKSSC SVGCPPCPAP ELLGGPSVFL· FPPKPKDTLM 51 ISRTPEVTCV WDVSHEDPE VKFNWYVDGV EVHNAKTKPR EEQYNSTYRV 101 VSVLTVLHQD WLNGKEYKCK VSNKALPAPI EKTISKAKGQ PREPQVYTLP 151 PSRDELTKNQ VSLTCLVKGF YPSDIAVEWE SNGQPENNYK TTPPVLDSDG 201 SFFLYSKLTV DKSRWQQGNV FSCSVMHEAL HNHYTQKSLS LSPGK 1353991 圖21 1 51 101 151 201 251 301 351 401 MALTFALLVA LLVLSCKSSC SVGCDLPQTH SLGSRRTLML LAQMRRISLF SCLKDRHDFG FPQEEFGNQF QKAETIPVLH EMIQQIFNLF STKDSSAAWD ETLLDKFYTE LYLKEKKYSP GGSDKTHTCP HEDPEVKFNW EYKCKVSNKA LVKGFYPSDI QQGNVFSCSV LYQQLNDLEA CAWEWRAEI PCPAPELLGG YVDGVEVHNA LPAPIEKTIS AVEWESNGQP MHEALHNHYT CVIQGVGVTE TPLMKEDSIL AVRKYFQRIT MRSFSLSTNL QESLRSKEGG GGSG6GGSGG PSVFLFPPKP KDTLMISRTP EVTCVWDVS KTKPREEQYN STYRWSVLT VLHQDWLNGK KAKGQPREPQ VYTLPPSRDE LTKNQVSLTC ENNYKTTPPV LDSDGSFFLY SKLTVDKSRW QKSLSLSPGK
圖2J 1 MGVHECPAWL WLLLSLLSLP LGLPVLGAPP RLIC3DSRVLE RYLLEAKEAE 51 NI.TTGCAEHC SLNENITVPD TKVNFYAWKR MEVGQQAVEV WQGLALLSEA 101 \TLRGQALLVN SSQPWEPLQL HVDKAVSGLR SLTTLLRALG AQKEAISPPD 151 AASAAPLRTI TADTFRKLFR VYSNFLRGKL KLYTGEACRT GDREFAGAAA 201 VDKTHTCPPC PAPELLGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCWVDVSHE 251 DPEVKFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQYNST YRWSVLTVL HQDWLNGKEY 301 KCKVSNKALP APIEKTISKA KGQPREPQVY TLPPSRDELT KNQVSLTCLV 351 KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPVLD SDGSFFLYSK LTVDKSRWQQ 401 GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSPGK
] 1353991 圖3A atggtctcccaggccctcaggctcctctgccttctgcttgggcttcagggctgcctggctgcag tcttcgtaacccaggaggaagcccacggcgtcctgcaccggcgccggcgcgccaacgcgttcct ggaggagctgcggccgggctccctggagagggagtgcaaggaggagcagtgctccttcgaggag gcccgggagatcttcaaggacgcggagaggacgaagctgttctggatttcttacagtgatgggg accagtgtgcctcaagtccatgccagaatgggggctcctgcaaggaccagctccagtcctatat ctgcttctgcctccctgccttcgagggccggaactgtgagacgcacaaggatgaccagctgatc tgtgtgaacgagaacggcggctgtgagcagtactgcagtgaccacacgggcaccaagcgctcct gtcggtgccacgaggggtactctctgctggcagacggggtgtcctgcacacccacagttgaata
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