JPH06506105A - 哺乳動物細胞における相同性組換え - Google Patents

哺乳動物細胞における相同性組換え

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JPH06506105A JP3517513A JP51751391A JPH06506105A JP H06506105 A JPH06506105 A JP H06506105A JP 3517513 A JP3517513 A JP 3517513A JP 51751391 A JP51751391 A JP 51751391A JP H06506105 A JPH06506105 A JP H06506105A
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 27、前記細胞が、内皮細胞、上皮細胞、筋芽細胞、肝細胞、白血球、造血幹細 胞、繊維芽細胞、BS細胞及び接合体より成る群から選ばれる、請求項26に記 載の方法。
28、前記細胞が接合体である、請求項26に記載の方法。
29、前記組換えDNAセグメントがタンパク質を特徴とする請求項26に記載 の方法。
30、前記タンパク質がhSAである、請求項29に記載の方法。
31、約50kbより長いトランス遺伝子を含んで成る遺伝子導入哺乳動物細胞 。
32、前記トランス遺伝子がタンパク質を特徴とする請求項31に記載の細胞。
33、トランス遺伝子を含む遺伝子導入非ヒト哺乳動物であって:第1と第2  DNAフラグメントの相同性組換えにより形成された組換えDNAセグメント( 各前記DNAフラグメントは5′及び3′配列部分を有しており;前記!lDN Aフラグメントの3′配列部分は、前記第2 DNAフラグメントの5′配列部 分と実質的に相同である)を含んで成る哺乳動物。
34、前記組換えDNAセグメントが少なくとも長さ50kbである、請求項3 3に記載の哺乳動物。
35、前記組換DNAセグメントがタンパク質を特徴とする請求項33に記載の 哺乳動物。
36、前記タンパク質がヒトイムノグロブリンである、請求項35に記載の哺乳 動物。
37、前記タンパク質がヒトラクトフェリンである、請求項35に記載の哺乳動 物。
38、前記哺乳動物がネズミの種の群から選ばれる、請求項33に記載の哺乳動 物。
39、前記哺乳動物がウシの種の群から選ばれる、請求項33に記載の哺乳動物 。
40、トランス遺伝子を含む遺伝子導入非ヒト哺乳動物であって:少なくとも第 11第2及び第3 DNAフラグメントの相同性組換えにより形成された組換え DNAセグメント(各前記DNAフラグメントは5′及び3′配列部分を有して おり;前記第1 DNAフラグメントの3′配列部分は前記第2 DNAフラグ メントの5′配列部分と実質的に相同であり、そしてこの第2フラグメントの3 ′配列部分は前記第3 DNAフラグメントの5′配列部分と実質的に相同であ る)を含んで成る哺乳動物。
41、前記組換えDNAセグメントがタンパク質を特徴とする請求項40に記載 の哺乳動物。
42、前記タンパク質がhSAである、請求項41に記載の哺乳動物。
43、前記哺乳動物がネズミの種の群より選ばれる、請求項40に記載の哺乳動 物。
44、前記哺乳動物がウシの種の群より選ばれる、請求項40に記載の哺乳動物 。
45、50kbより長いトランス遺伝子を含んで成る遺伝子導入非ヒト哺乳動物 。
46、前記哺乳動物がネズミの種の群より選ばれる、請求項45に記載の哺乳動 物。
47、前記哺乳動物がウシの種の群より選ばれる、請求項45に記載の哺乳動物 。
48、前記トランス遺伝子がタンパク質を特徴とする請求項45に記載の哺乳動 物。
明細書 哺乳動物細胞における相同性組換え 本出願は1990年8月29日に出願された米国特許出願第071574.74 7号の一部係属出願である。
発明の技術分野 本発明は小さめのDNAフラグメントの相同性組換えによりDNAセグメントを 細胞内で生産することによって遺伝子導入哺乳類細胞及び遺伝子導入非ヒト哺乳 動物を作製する方法、並びにかかる方法により生産される遺伝子導入細胞及び遺 伝子導入非ヒト哺乳動物に関する。
発明の背景 遺伝子導入細胞又は動物はそのゲノムの中に1又は複数のトランス遺伝子(導入 遺伝子)を含んでいる。トランス遺伝子はゲノムの遺伝子座に組込まれたDNA 配列であり、このトランス遺伝子のDNA配列はそのゲノムにおけるその遺伝子 座にて通常見い出されないものである。トランス遺伝子は外来DNA配列(他の 種のゲノムの中に通常見い出せる配列)より成るか、又は同族DNA配列(同じ 種のゲノムに由来する配列)より成りつる。遺伝子導入動物が報告されている。
例えば、米国特許第4.736.866号はc−myc癌遺伝子を含む遺伝子導 入マウスを開示している。遺伝子導入動物の他の報告には、PCT公開番号WO 32104443号(マウス接合体の前核に導入したウサギβ−グロブリン遺伝 子DNAフラグメント);EPO公開番号0.264.166号(哺乳動物組織 の特異的発現のための、乳漿酸性タンパク質プロモーターのコントロール下にあ るB型肝炎表層抗原及び組織プラスミノゲン活性剤遺伝子); EPO公開番号 第0.247.494号(種々の型のインスリンをコードする外来遺伝子を含む 遺伝子導入マウス)、PCT公開番号WO38100239号(乳漿タンパク質 プロモーターのコントロール下にある、■因子をコードするDNAの組織特異的 発現);PCT公開番号第WO38101648号(I11乳動物ラクトーゲン ー誘発性調節領域及び外来タンパク質をコードする構造領域を含んで成る組換え 発現系を含む哺乳動物分泌細胞を有する遺伝子導入哺乳動物);並びにEPO公 開番号第0.279.582号(遺伝子導入マウスにおける、ラットβ−カゼイ ンプロモーターのコントロール下にあるクロラムフェニコールアセチルトランス フェラーゼの組織特異的発現)が含まれる。
遺伝子導入植物も提供されている。例えばHiattらの米国特許第4、801 .540号は、発現にとって反対の方向に配向しているトマトのポリガラクツロ ナーゼ(PG)をコードするDNAを含む植物発現ベクターによる植物細胞の形 質転換を開示している。この遺伝子から発現されるアンチセンスRNAは、翻訳 を抑制するように内因性PGmRNAにハイブリダイズすることが可能であると 報告されている。
今迄に動物及び植物に導入されているトランス遺伝子は比較的短い長さである( 一般に約50kb以下)。しかしながら数多くの真核生物遺伝子は大きなゲノム DNA@域を有し、これは通常mRNAをコードするその配列領域(エキソン) の間に非常に多くの介在配列(イントロン)を有する。更に、数多くの真核細胞 遺伝子は調節配列、例えばエンハンサ−1組織特異的レギュレーター、シス作用 因子、及びこの構造遺伝子から時折り数千ヌクレオチド離れて位置していること のあるその他物理的に連結した調節因子と結合している。かかる真核生物遺伝子 の操作はそれらのサイズ及び複雑さにより妨げられている。障害には、大きなり NA分子の作製、安定性、パッケージング及び物理学的操作における困難性を含 む。
DNAをクローンするための媒体は、それらが収容できるDNAのサイズに基づ く固有の限界を育する。伝統的なウィルスベクター、例えばラムダファージ及び SV40はそれぞれが約50及び5kbの外来DNAをパッケージングする限界 を有している。より最近になって、F及びPlを基礎とするクローニング系、並 びに酵母人工染色体のクローニングの利用は、大きなりNAの連続断片の増殖を 可能にしている。
酵母人工染色体又はYACベクターは、酵母染色体に由来する配列をDNA断片 の末端にリゲートすることによって作られる。このような配列は動源体、2つの 末端小粒(各末端にて)、複製起点及び選択マーカーを含んでいる。末端小粒は クローンすべき特定のDNA断片の各末端にあり、動源体は一方の末端小粒とク ローンすべきDNAとの間に介在している。いくつかのグループが、このような YACベクターの中に50−200kbのヒトDNAを含んでいる酵母ライブラ リー5902) 、近年、酵母形質転換段階の最中にサイズの偏りを少なくする ポリアミン縮合を利用した酵母ライブラリーが報告されている(McCormi ckら著(1989) Proc、Natl、Acad、Sci、USA、 8 6.9991−9995)。
この方法により生産したライブラリーは410kbの平均インサートサイズを有 する。残念ながら、プラスミド又はウィルスベクターと比べてバルクで酵母染色 体を作ることはかなり難しく、且つより長い時間がかかる。更に、酵母細胞当り lコピーのYACベクターしがなく、形質転換又はトランスフェクションのため にはより大量の酵母クローンの増殖が必要となる。最後に、細菌コロニーと比べ て酵母コロニーはスクリーンするのにより大変であり、且つこのような大きなY AC由来線状DNAセグメントを細菌の中に形質転換させるためにそれらを環状 DNAの中にリゲートすることは現状可能ではない。
比較的大きなりNA分子を増殖させるその他の方法には、PIクローニング系の 利用を包含している。Sternberg、 N、 (1990)Proc、  Natl。
Acad、 Sci、 、 USA、 87.103−107゜この系のための ベクタープラスミドはP1パッケージング部位(匹ψを含み、これはベクタープ ラスミドをP1バクテリオファージ頭部の中にバックさせることを開始させるの に必要である。このベクタープラスミドはクローンされたインサートに並んでい る2つのP 11oxP組換え部位も含み、これはPI膿リすンビナーゼを含む 細胞のP1ファージ感染の後に、パッケージ化線状DNAを環化するのに必要で ある。この系の最大のインサートサイズは約100kbであると報告され、その 理由はPIファージ頭部は110−115kbのDNA Lか収容できないから である。
大きなりNA断片を作り、且つ増殖させるその他の近年開発された方法は、F因 子を基礎とするプラスミドの利用を包含している。報告されているこの方法は、 大きなプラスミドを連続的に組立てるための、E、 三lJ (E、 coli )における2つの閉環プラスミドの間での連続相同性組換え段階を利用している 。各組換えのラウンドはプラスミド中のDNAインサートのサイズを大きくする 。この技術を利用して、 l 50kbのインサートを含むいくつかのプラスミ ドが報告されている(0’ Cannerら著(1989)Science、  244.1307−1312) 、この手法の欠点は多段手順がめんどうであり 、且つ転位人工産物が導入されていないかを確認するために慎重なる分析を必要 とすることにある。
更に、この技術は対象の作製体を含んでいるスーパーコイルプラスミドの生産を 提供するが、にもかかわらずその中に含まれている大きいDNAインサートは切 り出しの際に機械的剪断を受ける。報告によるとこのようなインサートの切り出 しは必要であり、なぜならプラスミドの配列はトランス遺伝子の発現にとってネ ガティブな効果を有するからである(Brinsterら著(1985)Pro c、 Nat 1. Acad、 Sci、 USA。
大きなりNA断切を増殖させるためのこのような技術があるにもかかわらず、培 養哺乳動物細胞を形質転換させるのに、及び遺伝子導入動物を作るために比較的 小さいDNAインサート(例えば40−50kb)が使用され続けられている。
本発明は非常に簡単な方法で、相同性組換えを利用することによる上記及びその 他の規制(大きなりNA分子を作製することにおける困難性を含む)を解決する 。多大なる研究が相同性組換えにおいて行われているが、哺乳動物細胞形質転換 における上記の問題の解決はこのような研究からは明らかとなっていない。
遺伝子ターゲツティングとは、細胞の内因性染色体の特定の染色体遺伝子座の、 この特定の内因性配列と相同性を有する外因性DNA配列との相同性組換えによ る直接的な改質に関する。遺伝子ターゲツティングは内因性遺伝子の発現を高め る改質する及び崩壊するために利用される(Bollagら著、(1989)A nn、 Rev、 Genet、 、 23.199−225を参照のこと)。
哺乳動物細胞における効率的な遺伝子ターゲツティングの顕著なる障害は、これ らの細胞が、トランスフェクトされたDNAを非相同的に組込む能力を有するこ とにある(ROthとWi 1son著(1989)のrGenetic Re C0IDbinatiOnJ 、 KucherlapatiとSm1th編、 頁621−653. ワシントンD、 C,: Am、 Soc、 Micro biol、 ;Br1nsterら著(1985)、 Proc、Natl、A cad、Sci、USA、82.4438〜4442、を参照のこと)。
近年、相同性組換えによってゲノムの中にベクターが組込まれた細胞を選別する ための陽性−陰性選択ベクターが詳細されている(例染色体外相同性組換えとは 、2種類の外因性の、トランスフェクトされた、且つ少なくとも部分的に相同な りNA配列の間での、細胞内において起こる相同性組換えに関する。この現象は 報告によれば染色体外遺伝子又はウィルスの「レスキュー(救済)」実験を行う ことにより確認されている(van Zijlら著(1988)、J、Viro l、、 62゜2191−2195 ; MillerとTem1n(1983 )、 5cience、 220.606−609 ; WongとCapec chi(1987)、 Mo1.Ce11.Biol、、ヱ、 2294−22 95 、そして最近の論文に関しては、Bollagら著(1989)、 An n、Rev、Genet、、23.199−225を参照のこと)。これらの研 究において、重複したDNA断片(典型的には複合して機能的なウィルスを構成 するもの)を培養細胞に導入している。細胞内において、ウィルスのサブフラグ メントは活性ウィルス粒子を再構成するように相同組換えすると報告されている 。例えばvan Zijlらは、リン酸カルシウム沈殿を利用して、仮性狂犬病 ウィルスの5つの重複クローン化サブゲノムフラグメントを培養細胞の中にトラ ンスフェクトしている。報告によればいくつかのフラグメントは活性ウィルスを 形成するように組換えする。このような研究は主にライスルゲノムの操作、相同 性組換えのメカニズム並びに種々のめざましい効率性及び精度の解釈を目的とす る。
染色体外相同性組換えのその他の例には、細菌細胞培養物における、2種類の近 親であるが異なるポリペプチドをコードするDNAを含むプラスミドの導入が含 まれる。このような親に由来するポリペプチドをコードする遺伝子間の組換えは ハイブリドポリペプチドをコードするバイブリド遺伝子をもたらす。例えば5c hneider、 W、 P、ら著(1981)Proc、 Natl、 Ac ad、 Sci、 USA、 78.2169−2173 (tryl) A)  ; Web■■ とWeissmann著(1983)Nucl、 Ac1ds Res、 、  11.5661−5669 (アルファーインターフェロン) ;Gray、  G、 L、ら著(1986)J、 Bacteriol、、 166、635− 643(アルファーアミラーゼ);及び1987年1月14日に公開されたEP O公開番号第0.208.491号を参照のこと。
ある研究室は、マウス接合体における染色体外遺伝子レスキューを報告している (Palmiterら著(1985) : Genetic Manipula tion ofthe Early Mammalian Embryo、 C o1d Spring Harbour Laboratory。
頁123−132)。既に、これらの研究者はヒト成長ホルモン(hG)I)に 関する遺伝子にマウスメタロチオネイン−I (MT)プロモーターを融合して 、MT−hGf()ランス遺伝子を発現し、且つコントロールマウスよりも大き く成長する遺伝子導入マウスを作ったことを報告している。その後、これらの研 究者はMT−hGHDNA )ランス遺伝子の2種類の欠失突然変異体の作製を 報告している(Palmiterら著(1985)前述)。第1の突然変異体に おいては、MT−hGHDNAセグメントの5′部分が欠失している。第2の突 然変異体においては、MT −hGHDNAセグメントの3′側の部分が欠失し ている。報告によれば、これらの研究者はこの欠失突然変異を正常マウス受精卵 の中に、同時導入することにより、遺伝子レスキュー実験に対するコントロール 実験を行っている。得られるマウスの子供のいくつかは報告によれば完全MT  −HGH遺伝子に対応するmRNAを発現し、そしてこれらはその同腹の子より も大きく成長した。このレスキューのメカニズムは未だ不明である。
以上に説明してきた文献は本出願の出願日前に関するその開示内容を単に提供し たにすぎない。本発明者は先行発明又は1もしくは複数の先願に基づく優先権に よってかかる開示内容に先行する質格を有していない。
発明の概要 本発明の目的は遺伝子導入哺乳動物細胞及び遺伝子導入哺乳動物を作る方法の提 供にある。本発明の更なる目的は、上記の方法が50kbより長いトランス遺伝 子を作製することができることを提供することにある。更に、本発明の目的は上 記の方法により作った遺伝子導入哺乳動物細胞及び遺伝子導入哺乳動物を提供す ることにある。
上記の目的に関連して、本発明は哺乳動物細胞に少なくとも2種類のDNAフラ グメントを導入することによって遺伝子導入細胞を作る方法を含む。これらのD NAフラグメントは5′及び3′配列部分を育し、ここで第1フラグメントの3 ′配列部分は第27ラグメントの5′配列部分と実質的に相同である。細胞の中 でこれらのDNAフラグメントは相同組換えして少なくとも50kbの長さの組 換えDNAセグメントを形成し、これは細胞のゲノムの中に組込まれる。
更に本発明は、哺乳動物細胞に少なくとも第1、第2及び第3フラグメントを導 入することによって遺伝子導入細胞を作る方法も含む。各DNAフラグメントは 5′及び3′配列部分を有しており、ここでこの第1フラグメントの3′配列部 分はこの第2フラグメントの5′配列部分と実質的に相同である。更に、この$ 2フラグメントの3′配列部分はこの第3フラグメントの5′配列部と実質的に 相同である。細胞の中でこれらのDNAフラグメントは相同組換えして組換えD NAセグメントを形成し、これは細胞のゲノムの中に組込まれる。
本発明は、哺乳動物細胞のゲノムの中に組込まれる、長さにおいて一般的に50 kbより大きいDNA分子の複数のコピーを前記細胞の中に導入することによっ て遺伝子導入マウスを作る方法をも含む。
本発明は遺伝子導入哺乳動物を作る方法も含む。これらの実施態様は遺伝子導入 哺乳動物に関して詳細の通りに行われるが、ただしDNAフラグメント又は分子 を哺乳動物接合体又は多分化能性幹細胞、例えばES細胞に導入している。次に 遺伝子導入哺乳動物を作製するために、この接合体又は多分化能性幹細胞を常用 の方法によって利用する。
更に本発明は、本発明の上記の方法に従って作ったトランス遺伝子を含む遺伝子 導入哺乳動物細胞及び遺伝子導入哺乳動物を含む。
図面の簡単な説明 図1は2種類のDNAフラグメントの相同性組換えによるDNAセグメントの作 製を示す。
図2は3種類のDNAフラグメントの相同性組換えによるDNAセグメントの作 製を示す。
図3は2種類のDNAフラグメントの相同性組換えによるDNAセグメントの作 製を示し、その一方は相同の5′領域の末端に更なるフランキング領域を含んで いる。
図4は3種類のDNAフラグメントの相同性組換えの方法による陽性−陰性選択 ベクターの作製を示す。
図5は遺伝子導入マウスの中でヒト血清アルブミン遺伝子を作製するのに用いた DNAフラグメントを示す。
図6及び7は実施例1の遺伝子導入マウスに由来する染色体DNAのサザンプロ ットである。
図8は(消化した及び未消化の)増幅DNAを含む臭化エチジウム染色アガロー スゲルである。
図9は実施例1のhSA遺伝子導入マウスに由来する肝II RNAのノーザン プロットである。
図IOは実施例工のhSA遺伝子導入マウスにより生産されたhSAを特徴付け するRIAプロットである。
図11は実施例1のhSA遺伝子導入マウスにより生産されたhSAを特徴付け るウェスタンプロットである。
好ましい態様の詳細な説明 本発明者の発見によると、2種以上の重複DNAフラグメントを哺乳動物の接合 体のような組換えコンピテント細胞の中に導入すると、かかるDNAフラグメン トは相同的に組換えしてこの感受性細胞のゲノムの中に組込まれる。この発見は 遺伝子導入分野に限らず、一般的に哺乳動物細胞内での外因性DNAの操作にお いても広範囲の概念を有している。
本明細書に用いるr DNAフラグメント」なる語は、トランス遺伝子として哺 乳動物細胞のゲノムの中に組込まれるべきDNAセグメントの断片を称する。各 DNAフラグメントは、別のDNAフラグメントの配列部分と実質的に相同であ る少なくとも1つの配列部分を有し、従ってもし2種以上のこのDNAフラグメ ントを組換えコンピテント哩乳動物の中に同時導入すると、これらはそれらの相 同領域で相同的に組換えする。好ましくは、この配列相同はこのDNAフラグメ ントの末端又はその近くにある。更に各フラグメントは、それが組換えする他の DNAフラグメントの配列と相同でないDNA配列部分を含む。
本明細書で用いる、組換えしたr DNAセグメント」とは、2以上のDNAフ ラグメントの細胞内相同性組換えにより形成せしめたDNAに関する。このよう なフラグメントの組換えはインビボ相同性組換えによって、DNAセグメントを 形成するのに用いられるどのDNAフラグメントよりも大きな長さを有するDN Aセグメントをもたらす。
組換えDNAセグメントを形成せしめるために用いられる複数のDNAフラグメ ントは配列相同領域及び非相同領域を育する異なるDNAフラグメントであるた め、このようにして形成せしめた組換えDNAセグメントは、哺乳動物細胞の中 にDNAの多数のコピーを導入した場合のこの細胞の中で形成されるマルチコピ ーヘッド−ツーテール複合体とは異なる。Folger、に、R,ら著(198 2)Mo1. Ce11. Biol、 、 2.1372−1387゜ 2本のDNAフラグメントの組換えにより形成されたDNAセグメントを図1に 示す。この図は第1及び第2 DNAフラグメントを、この第1と第27ラグメ ントの組換えにより形成されたDNAセグメントと一緒に示す。ここで見い出せ る通り、第1及び第2フラグメントそれぞれは5′と3′配列部分を有している 。これらのDNAフラグメントの相同性組換えの後、第1 DNAフラグメント の5′配列部分は組換DNAセグメントの最も5′側の配列部分となる。同様に 、第2 DNAフラグメントの3′配列部分は最も3′側の配列部分となる。
この第1 DNAフラグメント3′配列部分と第2フラグメント5′配列部分は 実質的に相同であり、且つ図1に示すDNAセグメントの組換え領域に相当する 。これらのフラグメントそれぞれにおける残りのDNA配列は、このDNAフラ グメント間で相同でない。DNAフラグメントの選択は本明細書の開示内容及び 実施例に基づいてより明らかとなるであろう。
3本のDNAフラグメントの組換えより形成されたDNAセグメントを図2に示 す。ここでわかる通り、第1配列部分と第1組換え領域は図1の組換えセグメン トに対応する。第2 DNAフラグメントの3′配列部分及び第3フラグメント の5′配列部分は実質的に相同であり、且つ図2に示すDNAセグメントの第2 組換え領域に相当する。
ここで、第3 DNAフラグメントの3′配列部分は、組換DNAセグメントの 最も3′側の配列部分となる。図2において3種のDNAフラグメントしか示し ていないが、本発明の実施のうえで3種以上のDNAフラグメントを利用してよ い。
好ましい態様において、二本鎖DNAを利用する。このような場合、5′及び/ 又は3′の用語は、DNAフラグメントの相同性組換えにより形成される組換え DNAセグメントの一方の鎖に関する上記の配列の方向に関する。鎖の選択は自 由であるが、発現性遺伝子をコードするDNAセグメントを説明するのに用いる 場合、DNAセグメントの詳細はセンス鎖上で5′から3′へと読み取られるで あろう。
上記の詳細は、種々のDNAフラグメントの末端に位置している種々の相同配列 部分を記載しているが、これらの配列部分はそのように位置している必要がない ことが理解されるべきである。例えば、図3は図1と、2種のDNAフラグメン トが相同組換えして組換DNAセグメントを形成することにおいて類似する。し かしながら図3においては、第2 DNAフラグメントの5′配列部分(これは 第1 DNAフラグメントの3′配列部分と実質的に相同である)は第2 DN Aフラグメントの5′末端に位置していない。この5′配列部分はDNAフラグ メントでその3′配列部分に対して5′に並んでいるが、この5′配列部分に対 して更に5′側にある非相同配列がある。相同組換えの間、相同でないかかる5 ′ (又は3′)末端領域は切り出され、その結果、得られるDNAセグメント から除外される(図3参照)。
本発明は任意の「組換えコンピテント哺乳動物細胞」において実施できる。この ような細胞は、実質的に相同な領域を含むDNAフラグメントを相同的に組換え ることができるものとして機能的に規定されつる。このような細胞は内因性リコ ンビナーゼを含むものか、又はこのようなリコンビナーゼ及びDNA組換えを仲 介するのに必要なその他の必須成分を含むように遺伝子操作されたものである。
組換えコンピテント哺乳動物細胞の側には、内皮細胞、上皮細胞、胚芽細胞、肝 細胞、白血球、造血幹細胞、繊維芽細胞、通常の培養細胞、例えばHeLa細胞 及びチャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)、並びに胚種的細胞が含まれる 。
本明細書で用いる「胚種的細胞」とは、この胚種的細胞のゲノムにより哺乳動物 生殖系列を増殖させることができ、且つこの胚種的細胞を起源とするゲノム材料 をかかる哺乳動物の子孫へと伝搬することのできる任意の細胞として定義する。
胚種的細胞の例には、ウシ、ネズミ、ヒツジ、ブタ及び非人類霊長類、並びにラ ット、ウサギ及びギニアビッグに由来するような接合体が含まれる。特に好まし いのは、ネズミ、ウシ及びブタの種、好ましくはネズミ及びウシの種、そして最 も好ましくはネズミの種の接合体である。
本発明の実施において育用なその他の胚種的細胞には胚幹細胞(ES細胞)が含 まれる。BS細胞はインビトロで培養した着床前の胚Proc、 Nat 1.  Acad、 Sc i、 USA、 83.9065−9069 ;及びRo bertsonら著(1986)B Nature、322.445−448) 、このようなES細胞はウシ、ネズ ミ、ヒツジ、ブタ及び非人類霊長類の種、並びにラット、ウサギ及びギニアビッ グを含む数多くの任意の種に由来しうる。ES細胞は好ましくはマウス又はラッ ト起源、最も好ましくはマウス起源である。
組換えコンピテント哺乳動物へのDNAフラグメントの導入方法は、複数種のD NA分子の同時形質転換を満足せしめる任意の方法によるものでありうる。接合 体又はBS細胞へのDNAフラグメントの導入方法は、接合体(受精した卵母細 胞)の場合は前核、又はES細胞の場合は核へのマイクロインジェクションが好 ましい。他方、本発明のDNAセグメントはリン酸カルシウム仲介形質転換によ り適当なりNAフラグメントを導入することによってBS細胞の中で形成されう る。硫酸デキストラン仲介形質転換及び当業者に知られているその他の方法、例 えばエレクトロポレーションも利用できる。
一般に、遺伝子導入に関して接合体を標的とするとき、本明細書の方法に従って 得られる第1世代遺伝子導入哩乳動物はトランス遺伝子に関してヘテロ接合又は キメラであろう。従ってこのトランス遺伝子は一般にこの遺伝子導入哺乳動物の 全ての体細胞及びそれが提供する配偶子の半分において見い出せるであろう。従 って、本発明はトランス遺伝子に関してホモ接合である子孫、即ち、二倍体動物 細胞当り2コピーのトランス遺伝子が存在している子孫(一方は母性染色体内に 含まれ、そして他方は関連の父性由来染色体内に含まれている)を形成するよう 、2種類のこのようなヘテロ接合遺伝子導入動物を飼育することも提供する。こ の場合、このトランス遺伝子は、一般に提供される配偶千金てを含む、動物の全 ての有核細胞の中に見い出され、従ってその後の子孫に常に継代されるであろう 。この接合体より提供される第1世代動物がキメラ動物(即ち、その一部の細胞 のみがトランス遺伝子を含む)である可能性もある。
これは例えば、初期の胚細胞がそのトランス遺伝子を失った場合、又はマイクロ インジェクトされた接合体のゲノムがトランス遺伝子が組込まれる前に複製した 場合に起こりつる。遺伝子導入細胞の子孫が生殖系列の中で存在している限り、 このようなキメラ動物の子孫から遺伝子導入動物を得ることが可能である。
BS細胞の場合において、着床及び妊娠後に得られる動物は一般にキメラ(モザ イク)動物であり、このような動物に由来する細胞のサブ集団はこのDNAセグ メント(トランス遺伝子)を含む。このような動物は当業者によく知られた方法 によって交雑繁殖させて、動物の体細胞及び生殖系列細胞のそれぞれの中に該D NAセグメントを含む完全な遺伝子導入動物を形成せしめることができる。
組換えDNAセグメントは任意の特定のDNA配列に限定されない。
コード配列は全つくの合成起源であるか(あつらえの合成核酸を日常的に自動化 DNA合成装置により得るか、又は商業的に購入できつる)、又はmRNA配列 の逆転写に由来するか、もしくはゲノムDNA配列に直接由来しつる。遺伝子導 入細胞及び動物を作成するのに利用するDNAは好ましくは、cDNAよりもゲ ノムDNAを含んで成る。その理由は、トランス遺伝子の発現を組織特異的発現 及び時期特異的発現に限定することが好ましいからである。このトランス遺伝子 がゲノムDNAに由来するとき、重要なシス作用調節配列、例えばエンハンサ− 及びその他の調節因子が、イントロンの中であるか又はその構造遺伝子から離れ た領域の中で含まれていることができる。このような調節配列は転写及びRNA プロセシングの際に失われ、従ってcDN八由へトランス遺伝子からは一般に得 られない。
ゲノムDNAに由来する配列は一般に遺伝子の少なくとも一部をコードするだろ うが、しかし他方、非転写DNA領域をコードするか又は非組換え遺伝子座の領 域をコードすることができる。後者の例はイムノグロブリン及びT細胞抗原レセ プター遺伝子座が含まれる。
しかしながら一般に、該DNAセグメントはRNA転写体;好ましくはポリペプ チドをコードするmRNA転写体をコードする配列を含む。重要なポリペプチド の例には乳タンパク質、例えばラクトフェリン、リゾチーム、ラクトアルブミン 、胆汁酸塩−刺激化リパーゼ、分泌イムノグロブリン等:血清タンパク質、例え ばアルブミン、イムノグロブリン、■因子、■因子、組織プラスミノゲン活性剤 等:並びにその他のタンパク質、例えばシストロフィン、嚢胞性繊維症関連タン パク質及び工業的に重要な酵素が含まれる。工業的に重要な酵素の例には細菌及 び菌類のプロテアーゼ、リパーゼ、キチナーゼ及びリギナーゼが含まれる。
本発明のDNA分子及びセグメントは遺伝子治療のためにも利用されつる。例え ば、ある種の固体は有害な表現型を提供するI又は複数の欠陥遺伝子を有しうる 。このような場合において、特定の細胞の集団、例えば骨髄幹細胞、肺幹細胞等 をこの固体から抽出し、次いでこのような幹細胞の中に正常の野生型遺伝子を導 入する本明細書に記載の方法及び組成物によって改質して(ランダム組込み又は 遺伝子ターゲツティングのいづれかにより)この有害な表現型に関連する病因を 治す又は緩和することができる。このように改質せしめた細胞を次にこの固体に 再導入して、所望の遺伝子を有する成熟細胞のタイプの子孫を発生させる。この ような遺伝子治療の例には正常な嚢胞性繊維遺伝子、正常なヘモグロブリン遺伝 子等をコードする遺伝子セグメントの作製が含まれる。
トランス遺伝子をコードするポリペプチドが適切な調節配列をも含むとき、これ はポリペプチドの発現を及ぼす。一般に、組織特異的及び/又は時期特異的発現 をもたらすシス作用調節配列コントロール発現が選ばれる。更に、このようなポ リペプチドのある程度の分泌を所望するとき、組織特異的発現が生ずる特定の細 胞タイプにおいて機能する分泌シグナル配列をコードする適当なりNA配列を本 発明に従って形成せしめたDNAセグメントの中に含ませることもできる。組換 えDNAセグメントのためのDNA配列の選択は、特定のポリペプチド又は特定 の用途に従って、当業者により容易に明らかとなるであろう。
本発明のある態様において、該DNAフラグメントは[重複」遺伝子部分である 。しかしながら、本発明は非重複DNAフラグメントも含み、この場合、相同領 域は少なくとも一方のフラグメントの少なくとも一端にリゲートされたヌクレオ チド配列である。好ましい態様において、少なくとも2種類の異なるDNAフラ グメントはその5′及び3′末端それぞれにリゲートされた実質的に相同な合成 りNA配列を有する。
該DNAセグメントを組立てるのに必要とされるDNAフラグメントの種類の数 及び組換え作業の回数は相間領域の長さ、DNAフラグメントの長さ及び組換え DNAセグメントの長さに依存する。相同領域の長さは相同の程度になる程度依 存する。本明細書で用いる、2種類のDNA配列間の「実質的な相同」とは、こ れらの配列部分が十分に相同であり、これらのDNAフラグメントを組換えコン ピテント細胞の中に同特導入すると検出可能な組換えが促進されることを意味す る。2種類の配列部分は、もしそのヌクレオチド配列が他方のものと少なくとも 40%、好ましくは少なくとも60%、より好ましくは少なくとも80%、そし て最も好ましくは100%同一であるならば、実質的に相同である。この理由は 、相同性の値における低下は、対応する有効な相同性組換えの頻度の低下をもた らすからである。配列相同性に対する実際の低限界値は、相同の程度であって更 に下げることによって組換えコンピテント哺乳動物細胞におけるDNAフラグメ ントの検出可能な相同性組換えが仲介されなくなるような相同の値として機能的 に定義できる。
相同配列部分の間で非相同性が存在しているとき、この非相同性は相同配列部分 全体にわたって分布しているのではなく、むしろこの相同配列部分とは別の領域 にあることが好ましい。あらゆる場合において、相同性の程度が低いほど、相同 性組換えを促進するために相同領域を長くすべきである。哺乳動物細胞における 相同性組換えのためには14bpの100%相同ぐらいで十分であるが(Rub nitz、 J。
とSubramani、ら、(1984)、 Mo1. Ce1l、 Biol 、 、 4.2253−2258) 、各相同配列に関してより長い相同配列部 分、例えば500bp、より好ましくは1000bp、次に最も好ましくは約1 800bp、そして最も好ましくは1800bpが好ましい。
正しい遺伝子導入(正しい組換え及び完全なりNA上セグメント組込み)の頻度 は、DNAフラグメントの種類の数、種々の重複領域の相同性のサイズ及び程度 、並びに組換えたDNAセグメント及び宿主ゲノムにおける固有の性質に依存す る。いくつかの態様において、正しい遺伝子導入の頻度は選別を必要としないほ ど十分に高い。例えば接合体の場合において、相同性組換え及び組込みの頻度は 組換え体の選別のための手段を利用せずに大量の接合体をマイクロインジェクト することが不可能でないほどである。即ち、トランス遺伝子は、相同性組換えに 基づいて選択表現型を授ける陽性選択マーカーをコードする必要がない。しかし ながら、形質転換に基づいて選択表現型、例えばネオマイシン耐性を授ける遺伝 子、をコードするDNAは、該DNAフラグメントのいづれかに、このような選 択遺伝子を含ませることによって利用できる。
好ましくは、遺伝子導入動物を得るためにマイクロインジェクトするべき接合体 の数は1.000以下、より好ましくは200以下である。
動物へと発育するマイクロインジェクトせしめた接合体のパーセンテージは好ま しくは少なくとも1%、より好ましくは少なくとも5%、最も好ましくは少なく とも25%である。生まれた動物のうち、好ましくは少なくとも1%、より好ま しくは少なくとも10%が遺伝子導入型である。生まれた遺伝子導入動物のうち 、好ましくは少な(とも10%、より好ましくは少なくとも50%が完全な組換 えDNAセグメントのコピーを含む。
本発明の態様において、該DNAフラグメントは任意の実用的な長さである。そ の最小サイズは、相同性組換えを促進せしめるのに十分なる相同の長さの領域が あるとの要件のみにより規制される。各DNAフラグメントは好ましくは約50 kb、より好ましくは約100kbの長さを有する。しかしながらDNAフラグ メントは100kbより長くてもよい。たとえこのフラグメントの長さが、この ようなフラグメントの操作の際に実質的なサブフラグメンテーションを起こすよ うな長さであったとしても、このようなフラグメントを相同性組換えによるDN Aセグメントの形成に利用できる。その理由は、このようなサブフラグメントは 互いに組換えをしてフラグメントを再構成することができるからである。これは 、多数のフラグメントのコピーを利用し、且つフラグメンテーションパターンが ランダムであり、従ってサブフラグメントが重複した相同領域を育する場合に起 こる。
このような状況においては、該DNAフラグメントは以下に記載の通り、同−r  DNA分子」であると考えられることができる。
DNAセグメントは数百塩基対のcDNAクローンぐらいの小ささであるか、又 は組織特異性及び時期特異性を得るのに必要な調節領域を含む数メガの塩基の遺 伝子座ぐらいの大きさでありうる。好ましくは、組換えしたDNAセグメントは 3.5〜1000kb、好ましくは50〜500kb;より好ましくはioo〜 500kb 、そして最も好ましくは200〜500kbの長さを有する。しか しながら、このような組換えDNAフラグメントは1000kbより大きくてよ い。
本発明の更なる他の態様において、一般的に少なくとも約50kbの長さ、好ま しくは少なくとも75kbの長さ、より好ましくは少なくとも100kbの長さ 、そして最も好ましくは少なくとも200kbの長さの同−r DNANA分子 少なくとも2つ、組換えコンピテント哩乳動物細胞の中に直接導入する。機械剪 断がこのような大きなりNA分子を断片化することができるが、得られるフラグ メントはランダムなサイズとなる。更に、分子の多数のコピーを同時に導入する ため、機械剪断又はその他のプロセスは重複フラグメントのプールを提供する。
細胞の中で、重複フラグメントは次にその相同領域で組換えをする。十分な数の DNA分子を例えばマイクロインジェクションにより導入した場合、生ずる重複 フラグメントの数は、少なくともlっの完全組換え分子が少なくとも2本のフラ グメントの相同性組換えによって細胞の中で形成されるような数である。
マイクロインジェクションにより導入する場合、DNA分子のコピーの数はDN A分子のサイズにある程度依存するであろう。一般に、マイクロインジェクトす る溶液の容量が細胞のサイズにより規制され、且つ溶液の濃度がマイクロインジ ェクション操作の粘度規制によって記載されるため、少なめの数のコピーがマイ クロインジェクトされる。一般に、2〜1,000、好ましくは10〜200  、最も好ましくハ25〜100のDNA分子をマイクロインジェクトする。
YACベクター、PIを基礎とするベクター及びFを基礎とするプラスミドを含 む、このような大きなりNA分子をクローニングするための方法は報告されてお り、そして上記に説明した。マイクロインジェクションした分子のフラグメンテ ーションは、平行試験サンプルを同じ剪断力にかけることによって確認できる。
次に試験サンプルのフラグメンテーションを電気泳動技術、電子顕微鏡、勾配遠 心又はその他の当業者に知られている技術によって独立に決定する。
遺伝子導入動物のゲノムの中にランダムに組込まれつるDNAセグメントの形成 に加えて、本発明はES細胞を選別するのに用いることのできる陽性−陰性選択 ベクターに相当するDNAセグメントの作製を含む。ここでこのベクターはゲノ ムの中に特定部位にて組込まれ陽性−陰性選択ベクターに相当するDNAセグメ ントの作製は図4に示している。ここで示している通り、陰性選択ベクターはP NSベクター(r PNSセグメント」と呼ぶ)の3′末端に位置する。PNS ベクターのイントロン内にあるのは陽性選択マーカーである。図4のPNSベク ターにおいて2つの標的領域も示し、それぞれは導入すべきES細胞のゲノム内 の標的DNA配列と相同である。PNSベクターの非相同性ランダム組換えが起 こると、陰性選択マーカーは組込まれる。このようなPNSベクターを含む細胞 をその後選別する。PNSベクターが標的領域を介して相同性組換えによってゲ ノムの中に組込まれたなら、陰性選択マーカーは切り出され、従ってゲノムの中 に含まれなくなる。このような相同性組換えが起きた細胞は、イントロン内に含 まれている陽性選択マーカーに基づいて選別されつる。
本発明に従ってこのようなPNSベクターを作製するのに用いられるDNAフラ グメントも図4に示している。示している通り、重複領域を含む3種のDNAフ ラグメントを、ES細胞の核の中への同時マイクロインジェクションによるPN Sベクターの作製に用いている。異なるDNAフラグメント間の対応の重複領域 を示し、そしてPNSベクターにおいて示している組換え領域に対応させている 。相同性組換えによってDNAセグメントが組込まれたES細胞を選別し、その 後トランス遺伝子としてこのDNAセグメントを含むキメラ動物を得るために受 容雌動物の中に着床させる。
以下の実施例において、ヒト血清アルブミンをコードする組換えDNAセグメン トを適当なりNAフラグメントの同時導入によってマウス接合体の中で形成させ ている。これより得られる遺伝子導入マウスは、マウスの肝臓においてヒト血清 アルブミン含有遺伝子セグメントの組織特異的発現を示した。
実施例2及び3に更に示している通り、転位させていないヒトイムノグロブリン 遺伝子をコードするDNAフラグメントは、マウス接合体の前核の中にマイクロ インジェクトすると相同組換えする。実施例2において、2種類のYAC由来フ ラグメントをマイクロインジェクトして相同性組換えさせて、より大きな組換え DNAセグメントを作っている。実施例3においては、大きな非縮合YACDN A分子の複数のコピーをマイクロインジェクトしている。マイクロインジェクシ ョンに関するプロセスは、このような大きなりNA分子に機械剪断力をかけさせ つる。しかしながら、形成された場合に生ずるフラグメントは、マイクロインジ ェクトしたDNA分子と配列において相当する組換えDNAセグメントを再生す るように相同組換えすることができる。
特定の実施例は本発明にとっての最良の態様を開示しているが、本発明の範囲を 逸脱することなくあらゆる改良が本開示内容になされることが当業者にとって明 らかであろう。
実施例1 インビボ相同性組換えにより作製したヒト血清アルブミン(hSA)トランス遺 伝子を含む遺伝子導入マウス遺伝子導入マウスの中でhSA遺伝子を作製するた めに3種の重複ゲノムhSAクローンを利用した。3種のクローンはλHAL− HA 1 。
る。簡単に述べると、ゲノムライブラリーをヒト繊維芽細胞DNAのEcoR1 部分消化より作製した。クローンλHAL−3Wに関しては、このライブラリー の3!P−標識ヒトアルブミンゲノムクローンとの、3XのSSC及びIOXの デンハーヅ溶液の中でのプレハイブリダイゼーションの後の、IMのNaC1, 50mMのトリス−HCI(pH8,0) 、10mMのEDTA、0.1%の SDS、100μg /mlの剪断処理サケ精子DNA及びlOXのデンハーヅ 溶液の中での65゛Cに一夜のハイブリダイゼーションによってスクリーンした 。ハイブリダイゼーションの後、フィルターを0.2XのSSC及び0.1%の SOSの中で65℃で洗った。λHAL−)IAIクローンの単離方法は同じで あるが、ただしヒト繊維芽細胞ライブラリーをスクリーンするのにλI(AL− 3Wの5′末端に由来する0、9kbのBgl II−EcoR[フラグメント を用いた。クローンλHAL−H14は部分Hindu消化ヒト肝@ DNAに より作製したライブラリーから単離した。
これら3種のhSA)了−ジクローンを3種の重複線状DNAフラグメントを作 製するのに用い、これらは混成において完全hSA遺伝子及びフランキング領域 を構成する(図5参照)。最も5′側のフラグメントエは、λHAL−HA 1 より単離した17kbの部分EcoRI (図5の「R」)フラグメントであり 、13kbの5′フランキング配列及び3904bpの転写開始部位(+1)下 流部を含む。中央のフラグメント■はλHAL−3Wの13. lkbのAcy  I (=AhalI ;図中においては「A」)−SacI (rscJ ) フラグメントであり、そして+1405− +14546bl)までにわたって いる。最も3′側のフラグメント■はλHAL−H14の6、7kbのXhoI  (rXJ )−SalIフラグメント(図5)であり、そしてこれは+126 94−+19.斗kbにわたり、そして2.5kbの3′フランキング配列を含 む。重複領域は2.5kb(フラグメントIと■)及び1.85kb(フラグメ ント■と■)である。この両方の領域はエキソンとイントロンを含む。フラグメ ント1. I[及び■は、17. Okbの構造hSA遺伝子を含んで成る、3 3kbの領域に及ぶ。図5において、黒枠はエキソンを示し、白領域はイントロ ン及びフランキング配列を示す。相同性組換え現象の固有フラグメント診断を行 うために用いた制限部位をこの図の下方に示している。更にこの図において、A TGはhSAについての翻訳開始コドンを表わし、モしてTAAは翻訳終結コド ンを表わしている。
3種のフラグメント全てをサブクローンした。マイクロインジェクションの前に 、表示の制限酵素を用いてプラスミドの配列を完全に除去した。このフラグメン トは低融点アガロースから精製した。
はとんどの場合のように(表Iを参照)、このフラグメントをフレノウDNAポ リメラーゼによって処理して突き出し接着末端を補完した。生ずるプラント末端 化フラグメントを次に細菌性アルカリホスファターゼにより処理して5′リン酸 基を除去した。次にこの重複DNAフラグメントを濃縮し、そして公開された方 法(Hoganら著(1986)rManipulating the Mou se Embryo : A Laboratory Manual J Co ldSpring Harbor Laboratory)に従って、受精マウ ス卵の雄性前核の中に同時注入した。注入した分子の数は約25〜約100個/ 卵細胞で変え、個々のフラグメントの比は約1.1:1とした。Hoganら著 (前述)の方法に従って胚を疑似妊娠雌性マウスの子宮に着床させた。
3種の重複フラグメントの正しい相同性組換え及びマウスゲノムの中への新生ト ランス遺伝子の組込みをアッセイするため、新生児に由来するゲノムDNAを以 下の指定消化、次いでhSA cDNAプローブによるサザンハイプリダイゼー ションにかけた:Bst E It :正しい組換えが起きているなら、hSA 遺伝子領域の外側を切断して、1.8kbのバンドをもたらす(図5参照):N co I :正しい組換えが起きているなら、重複領域の外側も切断して、8. 1及び9.4kbのバンドをもたらす;Nco I +Hindll[:重複領 域の外側の数箇所を切断し、完全フラグメントの存在を指標する: HincI[:重複領域の中を切断し、これらの領域における正しい整列を指標 するいくつかのバンドをもたらす。
染色体DNAを生後3日のマウスの種々の器官(肝臓を含む)又は成マウスの尾 部のいづれかから単離した。全長hSA cDNAプローブを用いるサザンブロ ツテイングによって遺伝子導入動物を同定した。
17匹のマウスに関する結果を図6及び7に示す。これらのマウスに由来するD NA(10μg)をNco I (図6) ;Bst E II (図7):N eo r +HindllI(二重消化;データーは示していない);及びHi ncI[(データーは示していない)により消化し;0.6%のアガロースゲル に泳動し、ハイボンド−N(アマージャム社)に転写し、そして全長hSA c DNAプローブにハイブリダイズさせた。9,4及び8.1(Nco I消化) 又は18kb (Bst E II消化)のノλイブリダイズ用ノくンドは、同 時注入DNAフラグメントがフラグメントIと■、及び■と■それぞれに由来す る重複領域を含む場合にのみ存在している。この18kbのBst E IFフ ラグメントは両方の重複領域にまたがり、そして完全な17kbの構造hSA遺 伝子を含む。全部で20匹の遺伝子導入マウスが、全ての診断バンドの存在によ る判断に従い、完全hSA遺伝子座を含むことが明らかとなった。残りの7匹の マウスのうち、6匹はフラグメントIと■の組換えに由来する組込まれたDNA を有しく図6及び7のレーン番号23.25.29.31及び46)、1匹は■ と■の組換え生成物を含んでいた(図示せず)。完全遺伝子座を有する少なくと も4匹のマウス(22,53,63及び67)は、いくつかの組織に関してhS A DNAが存在していないこと、又は1個以下のコピー数による判定に従い、 モザイクであった(データ示さず)。
まとめると、これらのサザンプロットは、初期実験において、生まれた107匹 のマウスのうち、27匹が遺伝子導入体であり、その27匹の遺伝子導入動物の うちの20匹にこれら3種のフラグメントが正しく組換えられ、且つ組込まれて いたことを示した。
これらの結果を以下の表工にまとめる。
完全hSA座を有する 16/23 4/4 20/27遺伝子導入マウス hSAを発現するマウス 9/14° 4/ 4 13/ 18*:マイクロイ ンジェクションの前に、hSA DNAフラグメントをクレノウボリメラーゼ及 び細菌性アルカリホスファターゼ処理にかけて脱リン酸化プラント末端を生じせ しめた。
零*:5匹の非発現性マウスのうちの少なくとも3匹は完全hSA遺伝子に関し てモザイクであった。この分析に関して図2に示している非発現性マウスは22 (モザイク)、26及び33番である。
図6及び7において見い出せる通り、3種全ての重複DNAフラグメント間の相 同性組換えは優先的な組込みを提供し、そしてこれは74%の遺伝子導入マウス において検出された。更に、遺伝子導入マウスの全てが少なくとも2種の重複フ ラグメント間での相同性組換えに由来するhSAフラグメントを含んでいた。
完全なhSA )ランス遺伝子を含む20匹のマウスのうちの10匹を転写レベ ルで遺伝子の発現について分析した。既に記載されている通りに(Kawasa ki、日、S、のPCRプロトコール(Innis、M、ら纒);2l−27( Acad、 Press、 Inc、 、 San Diego、 1990) 、1μgの全肝臓DNAに基づいて、逆転写酵素(RT)反応に続いてポリメラ ーゼ連鎖反応(PCR)を行った。生ずるcDNAに由来する領域を、hSAエ キソン12及び14の部分に相補するプライマーを用いるPCRによって増幅さ せた。msA配列に対する低相同性及び増幅領域がゲノムフラグメント■と■の 間での重複部におけるだいたいの転写配列を含むように、PCRプライマーを選 んだ。Sac Iによる消化は181及び149bpのバンドをもたらし、Dd e Iによる消化は192及び138bpのバンドをもたらした。
コントロールマウスの肝臓RNAに基づ<RT−PCRは増幅を全つくもたらさ なかった(データーは示していない)。同様に、組換えhSAフラグメントは含 むが、完全hSA遺伝子座を含まない6匹のマウスに基づ< RT−PCRは増 幅をもたらさなかった。PCRは本質的にKawasakiら(前述)に記載の 通り、35周期の変性(92°Cで1分)、アニール(41″Cで1分)及び伸 長(72℃で2分)にわたって行った。
MgC1t濃度は2.5mMとした。前進プライマーの配列(エキラン12にお ける13853〜13878) ; 5 ’ −CAGATCACCAAATGCTAGCACAGA−3’ :リバ ースプライマ(エキラン14において15964〜15991) ;5 ’ − AGCTTAGACTTAGCAGCAACAAGTTTTTT−3’ :図8 において、レーンHはヒト肝臓RNAより増幅したDNAであり:レーン21. 44及び51はfiSA遺伝子導入マウスの肝臓RNAより増幅したDNAであ り;レーンSはSac Iにより消化した増幅DNAであり:レーンDはDde  Iにより切断した増幅DNAであり:そしてサイズマーカーはlkbのBDL ラダーである。サンプルは6%のアクリルアミドゲル上で分けた。
図9において、レーンHは全ヒト肝II RNAであり(1μg);レーンCは コントロールマウスのポリA十選別した肝臓RNAである20(μg);レーン 21は完全hSA遺伝子に関して遺伝子導入されたマウスのRNAであり(10 μgのポリA+RNA):レーン54は組換えhSADNAフラグメントIと■ に関して遺伝子導入されたマウス由来のRNAであり(10μgのポリA+RN A);レーン53はhSA遺伝子に関して遺伝子導入されたマウスのRNAであ り(20μgの全RNA) ;そしてCはコントロールマウスのRNAである( 20μgの全RNA)。結果は全てのマウスを代表している一マウス21及び5 3は比較的高い発現レベルをを示した。全及びポリA+RNA画分をMania tisら著のMolecularCloning : A Laborator y Manual (Cold Spring Harbor、New Yor k;Co1d Spring Harbor Press、 1982)の記載 に従ってマウスの肝臓から単離し:1%のホルアミドゲルに泳動し:ハイポンド −Nに転写し、そしてhSAのエキラン14に相補する末端標識化hSA特異的 合成プライマー(RT−PCRにおいても使用、上記参照)にハイブリダイズさ せた。図9において、rAIb JはhSA mRNAの位置を示している。1 8S及び28SリポソームRNAバンドが標識プライマーの特異的ハイブリダイ ゼーションによって識別できる。
まとめると、これらの実験が示すには、正しいサイズのバンドが完全hSA遺伝 子に関して遺伝子導入された10匹のマウスのうちの7匹のRNAサンプルから 増幅された。2種類の酵素を用いる制限分析は、hSAとしての増幅バンドの同 定を実証した。hSA特異的プローブを用いるノーザンプロットによる、各遺伝 子導入マウスに由来する全及びポリA十選択肝臓RNAの分析はこれらの発見を 実証し、且つhSA転写体が正しいサイズであることを実証した。異常な転写体 は観察されなかった。これらの10匹のマウスの中のヒト血清アルブミン転写体 はヒト肝臓におけるよりも10’〜10’分の1のレベルで検出された。
マウス血清におけるhSA (即ちタンパク質)の特異的検出のための定量ラジ オイムノアッセイ(RIA)を行った。セファローズ(Pharmacia社) に結合せしめたモノクローナル抗−hSA抗体(CL2513A ; Cede rlane Laboratories ; 0ntario、 Canada )の懸濁物を、hSAを10μg/mlまで加えた正常マウス血清(NMS)と (図10のべた塗り点);遺伝子導入マウスの血清と(マウス53番の血清の代 表カーブ;白抜き円);又はNSMのみと(大きいべた塗り点)インキュベート した。RIA手順は本質的に、Nui jens、 J、 H,ら著J、 Bi ol、 Chem、 264゜12941−12949に記載の通りである。セ ファローズ結合化hSAは125Iで標識したアフィニイティー精製抗−hSA ポリクローナルウサギ抗体(Sigma Chemica1社)とのインキュベ ーションにより定量した。
放射性ヨード化する前に、これらの精製抗体をNMS−セファローズとインキュ ベートしてマウス血清アルブミン交差反応性抗体を除去した。その後、セファロ ーズ−結合化放射活性を測定した。付加された標識抗体のパーセンテージとして 図10に結果を示す。血清の量を表示する(横座標)。遺伝子導入マウスの血清 中のhSAのレベルを平行の投与量一応答曲線より計算した。このRIAの低濃 度検出限界値は約5ngであった。HSAは完全hSAを含むマウス由来の血清 においてのみ検出された。
ウェスタンプロットに関して、手順は本質的にNuijens、J、H,ら著( 1990)J、 Cl1n、 Invest、 84.443−450に記載の 通りである。セファローズ結合化モノクローナル抗−ISA抗体により100μ mのサンプルからHSAを免疫沈殿させ、そして非還元5OS−サンプル緩衝液 lOμmの中で解離させた。5DS−PAGE (10−15%w/v)、それ に続くポリクローナルl!J−抗hSA抗体によるイムノブロッティングによっ て1μmのサンプルを分析した。図11において、レーンlは正常マウス血清、 レーン2はマウス53番血清(2,5μg/mlのhSAを含む)、レーン3は 250nHの精製hSAが加えられている正常マウス血清、レーン4は250n gの精製hSA、レーン6は250ngの精製mSA、そしてレーン5は25n gの精製hSAであって、SDS −PAGEに直接かけたものである。
これらの試験をまとめると、完全hSA遺伝子に関する遺伝子導入されたマウス 18匹のうち13匹がhSAを発現し、そしてこれらの13匹のhSA陽性マウ スは、RT−PCR(前記)によりhSA RNAを発現することが見い出せた 10匹のマウス全てを含んでいた。ウェスタンプロット分析(図11)は、RI Aにより最初に樹立された通り(図10) 、hSA遺伝子導入マウスによるh SA遺伝子の正しい翻訳を実証した。
実施例2 インビボ相同性組換えにより形成されるゲノム軽鎖ヒトIg)ラン以下は重複D NAフラグメントからのイムノグロブリントランス遺伝子のインビボ作製の代表 例である。
ヒトに軽鎖の地図はLorenz、 W、 ら著(1987)Nucl、 Ac 1ds Res、 15゜9667−9677に詳細されている。
全てのCに、3′エンハンサ−1全てのJセグメント及び少なくとも5つのVセ グメントを含む450kbのXho I〜NotIフラグメントを単離した。
簡潔に述べると、新鮮なヒト胎盤組織からMarzluff、 W、 F、ら著 (1985X rTranscription and Tran、5lati on : A Practical Approach」B、 D、 Hamm esとS、J、Higgins II、頁89−129. IRL Press 、0xford)に従って核を単離した。単離した核(又はPBS洗浄したヒト 精母細胞)を低融点アガロースマトリックスの中に包埋し、次いでEDTA及び プロテイナーゼKにより高分子量DNAが露出するまで溶解し、そして制限酵素 NotI及びXho Iによりこのアガロースの中で消化した。
これはM、 FinneyのrCurrent Protocols in M o1ecular Biology」に記載されている(F、Au5uberら 纒、John Wiley & 5ons、付録4.1988゜第2.5.1章 )。これにより消化せしめたDNAを次に、Anand、 R,ら著(1989 )Nucl、 Ac1ds Res、 、 17.3425−3433に記載の 通りに、パルス電場ゲル電気泳動により分画した。Not I / Xho I フラグメントに富む両分をサザンハイプリダイゼーシ3ンによりアッセイして、 このフラグメントによりコードされるl又は複数種の配列を検定した。このNo t I / Xho Iフラグメントを含むこれらの画分をプールし、そして酵 母細胞の中のベクターpYACNNの中にクローンした。pYACNNは、−3 ′の存在下におけるリゲーションによって作られる。
重鎖のNot I / Xho Iフラグメントを含むYACクローンを、した 。クローンしたインサートは、前述したM、 Finneyに詳細の通りにパル ス電場ゲル電気泳動によって高分子量酵母DNAから単離した。
上記のもの全てと少なくとも20個より多くのVセグメントを含む、750kb のMlu I 〜Not Iフラグメントを同様に単離し、そしてBs5HII により消化して約400kbのフラグメントを作った。
450kbのXho I −Not Iフラグメントと約400kbのMlu  I 〜Bs5HIIフラグメントは、Bs5HII及びXho I制限部位によ り規定される配列重複を有する。1mMのスペルミンの添加によりこれらのDN Aフラグメントを縮合させ、次いで先に記載した通りに単細胞の胚の核の中に直 接マイクロインジェクトさせて、各フラグメントの複数のコピーが各注入接合体 の中に存在するようにさせた。これらの2種のフラグメントのマウス接合体のマ イクロインジェクションに基づく相同性組換えは、この450kbのXho I  / Not Iフラグメントに見い出せるものの他に少なくとも更に15〜2 0のVセグメントを含むトランス遺伝子をもたらす。
実施例3 インビボ相同性組換えにより形成されるヒトラクトフェリントラ全体ゲノムクロ ーンを得るため、2つのヒトゲノムコスミドライブラリーを、プローブとしてh LF cDNAクローン(1991年6月に公開されたPCT公開番号第PCT /US90106874号に詳細)を用いてスクリーンした。単離した14のク ローンのうち、2クローン(13,1及び13.2と命名;それぞれ各ヒトコス ミドライブラリーに由来)は全体hLF遺伝子を含み、これは第1及び最後(1 7番目)のhLFエキソンラン異的なプライマーとのハイブリダイゼーション並 びにDNAシーケシングによって決定した。これらのコスミドベクーンは35− 40kbpのサイズの範囲にあった。クローン13.1は約4kbの付加された 3′フランキング配列;クローン13.2は付加された5′フランキング配列を 含んでいた。
最も5′側のApa I部位は、hLFシグナル配列におけるエキソンエに位置 している。エキソンエのすぐ5′側の4oobpの領域をシーケンス化した。こ の領域はhLF遺伝子の転写開始部位及びTATAボックスを含んでいた。この 領域はBamHI制限部位も含んでいた。
乳腺に特異的な発現ベクターを作製するには、16kbl)のαs!ウシカゼイ ンプロモーター領域をゲノムhLFクローンに融合させることが必要であった。
しかしながら、約60kbのこのような作製体の全体のサイズは(16kb ( プロモーター)+8kb(コスミドベクター)+ 35−40kb(hLFゲノ ムクローン) =59−64kb) 、常用のクローニングベクターの利用を難 しくする。従って、 16kbpのαslカゼインプロモーターを9kbの構造 hLF遺伝子領域の5′に融合し、そしてこのフラグメントを、クローン13. 1の最も3′側の30kbpを含む重複hLFフラグメントと一緒に同時導入し た。
クローン13.2に由来するBamHIフラグメント(エキランIを含む)をプ ラスミドpUc1 aにサブクローンした。このクローンより、Apa I(部 分消化)及び5alI消化によって8.9kbのApaI −Sal I 7ラ グメントを単離した。このフラグメントはhLFシグナル配列のほとんど及びh LFの5 ’ UTRの全体を欠いている。この欠失領域を有する配列は、5’ ApaI部位からhLF TATAボックスから下流の領域にまで及ぶ2種類の 相補DNA鎖(68−及び62−マー)を合成することによって得た。これらの プライマーをアニールさせた後、5’C1aI突き出し及び3’ ApaI突き 出しを有するDNAフラグメントが作られた。この合成C1a I −Apa  Iフラグメント及び前述した8、 9kbpのApa I −Sal Iフラグ メントをp−16kbのCSの中に、及び16kbのαslカゼインプロモータ ーの代わりに8 kbpを含む類似のプラスミドの中にリゲートさせた。このこ とは、hLFゲノム遺伝子の5′部(9kbp)に融合した16kbp又は8  kbpのウシαslカゼインプロモーターを含む2種類のプラスミドをもたらす 。これらのフラグメントを切断しく Notl −5all) 、モしてhLF コスニスクローン13.1に由来する3′側の30kbl)のC1alフラグメ ントと同時導入させた。
同時導入したフラグメントは2.7kbpの重複を育していた。
接合体のマイクロインジェクション及び遺伝子導入動物の作製は、遺伝子導入マ ウスに関する実施例1に記載の通り及び遺伝子導入ウシの種に関するPCT公開 番号第PCT/US90106874号に記載の通りに行った。
実施例4 インビボ相同性組換えにより形成されるゲノム軽鎖ヒト1gトランス遺伝子: 単独の大きなりNA上セグメントマイクロインジェクション以下は重複DNAフ ラグメントに由来するイムノグロブリントランス遺伝子のインビボ作製の他の実 施例である。
この実施例は実施例2と同じであるが、ただし750kbのMluI〜Not  I DNA分子の複数のコピーを、スペルミンにょる縮合を行うことなくマウス 接合体の核の中に直接マイクロインジェクトした。
遺伝子導入子孫に由来するDNAの分析は、動物のゲノムの中に組込まれた全長 750kb DNA トランス遺伝子の存在を実証した。
本発明の好ましい態様を詳細してきたが、本発明の範囲を逸脱することなく改良 がなされることを当業者は理解するであろう。
FIG、 5 8cal HC215453C” 0005 0.5 5 50 試験量μ1 国際調査報告 フロントページの続き (72)発明者 クリンペンフォルト、ボールオランダ国、エフエル−2333 ,セーアーライデン、二一ルス ポールベク 1l−13(72)発明者 ピー ペル、フランク オランダ国、エヌエル−2333,セーアーライデン、二一ルス ポールベク  1l−13(72)発明者 ストエイカー、ラインオランダ国、エヌエル−23 33,セーアーライデン、二一ルス ポールベク 11−13

Claims (48)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.細胞の中でDNAセグメントを作製するための方法であって、組換えコンピ テント哺乳動物細胞の中に少なくとも第1及び第2DNAフラグメントを導入す る段階を含んで成り、前記DNAフラグメントのそれぞれは5′及び3′配列部 分を有しており、前記第1DNAフラグメントの3′配列部分は前記第2DNA フラグメントの5′配列部分と実質的に相同であり、ここで前記の第1及び第2 DNAフラグメントは前記細胞の中で相同組換えして長さ50kb以上の組換え DNAセグメントを形成し、前記組換えDNAセグメントは前記細胞のゲノムの 中に組込まれる、方法。
  2. 2.前記細胞が、内皮細胞、上皮細胞、筋芽細胞、肝細胞、白血球、造血幹細胞 、繊維芽細胞、ES細胞及び接合体より成る群から選ばれる、請求項1に記載の 方法。
  3. 3.前記細胞が接合体である、請求項1に記載の方法。
  4. 4.前記の同時導入段階がマイクロインジェクションによって行われる、請求項 1に記載の方法。
  5. 5.前記組換えDNAセグメントがタンパク質をコードする、請求項1に記載の 方法。
  6. 6.前記タンパク質がヒトイムノグロブリンである、請求項6に記載の方法。
  7. 7.前記タンパク質がヒトラクトフェリンである、請求項6に記載の方法。
  8. 8.細胞の中でDNAセグメントを作製するための方法であって、組換えコンピ テント哺乳動物細胞の中に少なくとも第1及び第2DNAフラグメントを導入す る段階を含んで成り、前記DNAフラグメントのそれぞれは5′及び3′配列部 分を有しており、前記第1DNAフラグメントの3′配列部分は前記第2DNA フラグメントの5′配列部分と実質的に相同であり、ここで前記の第1及び第2 DNAフラグメントは前記細胞の中で相同組換えして、前記細胞のゲノムの中に 組込まれた組換えDNAセグメントを形成し、そして前記DNAセグメントは、 前記の第1と第2フラグメントとの間での相同性組換えを検出するのに用いるこ とができる陽性選択マーカーをコードしない、方法。
  9. 9.胚標的細胞の中でDNAセグメントを作製するための方法であって、哺乳動 物胚標的細胞の中に少なくとも第1及び第2DNAフラグメントを導入する段階 を含んで成り、前記DNAフラグメントのそれぞれは5′及び3′配列部分を有 しており、前記第1DNAフラグメントの3′配列部分は前記第2DNAフラグ メントの5′配列部分と実質的に相同であり、ここで前記の第1及び第2DNA フラグメントは前記胚標的細胞の中で相同組換えして組換えDNAセグメントを 形成し、前記組換えDNAセグメントは前記胚標的細胞のゲノムの中に組込まれ る、方法。
  10. 10.前記胚標的細胞が接合体である、請求項2に記載の方法。
  11. 11.細胞の中でDNAセグメントを作製するための方法であって、組換えコン ピテント哺乳動物細胞の中に少なくとも第1、第2及び第3DNAフラグメント を導入する段階を含んで成り、前記DNAフラグメントのそれぞれは5′及び3 ′配列部分を有しており、前記第1DNAフラグメントの3′配列部分は前記第 2DNAフラグメントの5′配列部分と実質的に相同であり、そして前記第2D NAフラグメントの3′配列部分は前記第3DNAフラグメントの5′配列部分 と実質的に相同であり、ここで前記の第1、第2及び第3DNAフラグメントは 前記細胞の中で相同値換えして組換えDNAセグメントを形成し、前記組換えD NAセグメントは前記細胞のゲノムの中に組込まれる、方法。
  12. 12.前記細胞が、内皮細胞、上皮細胞、筋芽細胞、肝細胞、白血球、造血幹細 胞、繊維芽細胞、ES細胞及び接合体より成る群から選ばれる、請求項11に記 載の方法。
  13. 13.前記細胞が接合体である、請求項11に記載の方法。
  14. 14.前記の導入段階をマイクロインジェクションによって行う、請求項11に 記載の方法。
  15. 15.前記組換えDNAセグメントが少なくとも50kbの長さである、請求項 11に記載の方法。
  16. 16.前記組換えDNAセグメントがタンパク質をコードする、請求項11に記 載の方法。
  17. 17.前記タンパク質がhSAである、請求項16に記載の方法。
  18. 18.細胞のゲノムの中に組込まれたトランス遺伝子を含む遺伝子導入哺乳動物 細胞を生産するための方法であって、組換えコンピテント哺乳動物細胞の中に同 一のDNA分子の複数のコピーをマイクロインジェクトする段階を含んで成り、 前記DNA分子はマイクロインジェクションに基づいてこのようなDNA分子の フラグメントの形成がもたらされるような長さを有し、前記フラグメントが生ず ると、それらは前記DNA分子を再生するように前記細胞の中で組換えをするこ とが可能である方法。
  19. 19.組換えコンピテント哺乳動物細胞の中に約50kbより長い同一のDNA 分子の複数のコピーを導入する段階を含んで成る、遺伝子導入細胞を生産するた めの方法。
  20. 20.トランス遺伝子を含む遺伝子導入非ヒト哺乳動物細胞であって:第1と第 2DNAフラグメントの相同性組換えにより形成された長さ50kb以上の組換 えDNAセグメント(各前記DNAフラグメントは5′及び3′配列部分を有し ており:前記第1DNAフラグメントの3′配列部分は、前記第2DNAフラグ メントの5′配列部分と実質的に相同である)を含んで成る細胞。
  21. 21.前記細胞が、内皮細胞、上皮細胞、筋芽細胞、肝細胞、白血球、造血幹細 胞、繊維芽細胞、ES細胞及び接合体より成る群から選ばれる、請求項20に記 載の方法。
  22. 22.前記細胞が接合体である、請求項20に記載の方法。
  23. 23.前記組換えDNAセグメントがタンパク質をコードする、請求項20に記 載の方法。
  24. 24.前記タンパク質がヒトイムノグロブリンである、請求項23に記載の方法 。
  25. 25.前記タンパク質がヒトラクトフェリンである、請求項23に記載の方法。
  26. 26.トランス遺伝子を含む遺伝子導入哺乳動物細胞であって:少なくとも第1 、第2及び第3DNAフラグメントの相同性組換えにより形成された組換えDM セグメント(各前記DNAフラグメントは5′及び3′配列部分を有しており; 前記第1DNAフラグメントの3′配列部分は前記第2DNAフラグメントの5 ′配列部分と実質的に相同であり、そしてこの第2フラグメントの3′配列部分 は前記第3DNAフラグメントの5′配列部分と実質的に相同である)を含んで 成る細胞。
  27. 27.前記細胞が、内皮細胞、上皮細胞、筋芽細胞、肝細胞、白血球、造血幹細 胞、繊維芽細胞、ES細胞及び接合体より成る群から選ばれる、請求項26に記 載の方法。
  28. 28.前記細胞が接合体である、請求項26に記載の方法。
  29. 29.前記組換えDNAセグメントがタンパク質をコードする、請求項26に記 載の方法。
  30. 30.前記タンパク質がhSAである、請求項29に記載の方法。
  31. 31.約50kbより長いトランス遺伝子を含んで成る遺伝子導入哺乳動物細胞 。
  32. 32.前記トランス遺伝子がタンパク質をコードする、請求項31に記載の細胞 。
  33. 33.トランス遺伝子を含む遺伝子導入非ヒト哺乳動物であって:第1と第2D NAフラグメントの相同性組換えにより形成された組換えDNAセグメント(各 前記DNAフラグメントは5′及び3′配列部分を有しており;前記第1DNA フラグメントの3′配列部分は、前記第2DNAフラグメントの5′配列部分と 実質的に相同である)を含んで成る哺乳動物。
  34. 34.前記組換えDNAセグメントが少なくとも長さ50kbである、請求項3 3に記載の哺乳動物。
  35. 35.前記組換DNAセグメントがタンパク質をコードする、請求項33に記載 の哺乳動物。
  36. 36.前記タンパク質がヒトイムノグロブリンである、請求項35に記載の哺乳 動物。
  37. 37.前記タンパク質がヒトラクトフェリンである、請求項35に記載の哺乳動 物。
  38. 38.前記哺乳動物がネズミの種の群から選ばれる、請求項33に記載の哺乳動 物。
  39. 39.前記哺乳動物がウシの種の群から選ばれる、請求項33に記載の哺乳動物 。
  40. 40.トランス遺伝子を含む遺伝子導入非ヒト哺乳動物であって:少なくとも第 1、第2及び第3DNAフラグメントの相同性組換えにより形成された組換えD NAセグメント(各前記DNAフラグメントは5′及び3′配列部分を有してお り;前記第1DNAフラグメントの3′配列部分は前記第2DNAフラグメント の5′配列部分と実質的に相同であり、そしてこの第2フラグメントの3′配列 部分は前記第3DNAフラグメントの5′配列部分と実質的に相同である)を含 んで成る哺乳動物。
  41. 41.前記組換えDNAセグメントがタンパク質をコードする、請求項40に記 載の哺乳動物。
  42. 42.前記タンパク質がhSAである、請求項41に記載の哺乳動物。
  43. 43.前記哺乳動物がネズミの種の群より選ばれる、請求項40に記載の哺乳動 物。
  44. 44.前記哺乳動物がウシの種の群より選ばれる、請求項40に記載の哺乳動物 。
  45. 45.50kbより長いトランス遺伝子を含んで成る遺伝子導入非ヒト哺乳動物 。
  46. 46.前記哺乳動物がネズミの種の群より選ばれる、請求項45に記載の哺乳動 物。
  47. 47.前記哺乳動物がウシの種の群より選ばれる、請求項45に記載の哺乳動物 。
  48. 48.前記トランス遺伝子がタンパク質をコードする、請求項45に記載の哺乳 動物。
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