JP7465272B2 - Csf1r/ccr2多特異性抗体 - Google Patents
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Description
本出願は、2018年9月27日出願の米国仮出願第62/737,742号、2018年10月24日出願の米国仮出願第62/750,163号、および2018年12月7日出願の米国仮出願第62/776,820号の優先権を主張し、当該出願の各々の全内容は、これにより参照により本明細書に組み込まれる。
本出願は、ASCII形式で電子的に提出され、その全体がこれにより参照により本明細書に組み込まれる配列リストを含有する。2019年9月27日に作出された前記ASCII複製は、E2070-7018WO_SL.txtと命名され、711,029バイトの大きさである。
(i)第1のTAM結合部分(例えば、第1のTAM抗原、例えば、CSF1R、CCR2またはCXCR2に結合する結合部分)は、第1および第2の非隣接ポリペプチドを含み、
(ii)第2のTAM結合部分(例えば、第2のTAM抗原、例えば、CSF1R、CCR2またはCXCR2に結合する結合部分)は、第3および第4の非隣接ポリペプチドを含み、
(a)第1のポリペプチドは、例えば、N~Cの向きで、第1のVH、第1のCH1、およびそれが、任意選択によりリンカーを介して、接続する、第1のポリペプチドと第3のポリペプチドとの間の会合を促進する第1のドメイン(例えば、第1のFc領域)を含み、
(b)第2のポリペプチドは、例えば、N~Cの向きで、第1のVLおよび第1のCLを含み、
(c)第3のポリペプチドは、例えば、N~Cの向きで、第2のVH、第2のCH1、およびそれが、任意選択によりリンカーを介して、接続する、第1のポリペプチドと第3のポリペプチドとの間の会合を促進する第2のドメイン(例えば、第2のFc領域)を含み、
(d)第4のポリペプチドは、例えば、N~Cの向きで、第2のVLおよび第2のCLを含む。一部の実施形態では、第1および第2のドメイン(例えば、第1および第2のFc領域)は、ホモまたはヘテロ二量体を形成する。
(i)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図1について実施例2で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、CSF1R陽性、CCR2陰性細胞、またはCSF1R陰性、CCR2陽性細胞と比較して、CSF1R陽性、CCR2陽性細胞に優先的に結合し、例えば、多特異性分子のCSF1R陽性、CCR2陽性細胞への結合が、多特異性分子のCSF1R陽性、CCR2陰性細胞、またはCSF1R陰性、CCR2陽性細胞への結合よりも少なくとも2、4、6、8、10、15、20または25倍強い;
(ii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図1について実施例2で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、CSF1R陽性、CCR2陰性細胞と比較して、CSF1R陽性、CCR2陽性細胞に優先的に結合し、例えば、多特異性分子のCSF1R陽性、CCR2陽性細胞への結合についてのEC50が、多特異性分子のCSF1R陽性、CCR2陰性細胞への結合についてのEC50の60、50、40、30、20または10%以下である;
(iii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図1について実施例2で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、CSF1R陰性、CCR2陽性細胞と比較して、CSF1R陽性、CCR2陽性細胞に優先的に結合し、例えば、多特異性分子のCSF1R陽性、CCR2陽性細胞への結合についてのEC50が、多特異性分子のCSF1R陰性、CCR2陽性細胞への結合についてのEC50の50、40、30、20、10または5%以下である;
(iv)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図5について実施例6で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、T細胞、NK細胞、好中球、組織常在性マクロファージ(例えば、クッパー細胞)またはランゲルハンス細胞と比較して、腫瘍関連マクロファージ(TAM)または骨髄系由来サプレッサー細胞(MDSC)に優先的に結合し、例えば、多特異性分子のTAMまたはMDSCへの結合が、多特異性分子のT細胞、NK細胞、好中球、組織常在性マクロファージ(例えば、クッパー細胞)またはランゲルハンス細胞への結合よりも少なくとも2、4、6、8、10、15、20または25倍強い;
(v)例えば、トランズウェルプレート遊走アッセイを使用して測定したとき、例えば、図2について実施例3で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、単球遊走、例えば単球走化性タンパク質1(MCP1)誘導単球遊走を阻害し、例えば、MCP1誘導単球遊走を少なくとも40、50、60または70%低減する;
(vi)例えば、細胞増殖MTTアッセイを使用して測定したとき、例えば、図3Bについて実施例4で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、マクロファージ、例えば、骨髄系由来マクロファージの増殖、例えば、骨髄系由来マクロファージのCSF-1誘導増殖を阻害し、例えば、骨髄系由来マクロファージのCSF-1誘導増殖を少なくとも50、60、70または80%低減する;
(vii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図4について実施例5で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、単球、例えば、骨髄系由来単球の分化、例えば、骨髄系由来単球のCSF-1誘導分化を阻害しないか、または実質的に阻害せず、例えば、骨髄系由来単球のCSF-1誘導分化を2、4、6、8または10%以下しか低減しない;
(viii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図6について実施例7で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、in vivoで、抑制性骨髄性細胞、例えば、TAMまたはMDSCを枯渇させ、例えば、抑制性骨髄性細胞、例えば、TAMまたはMDSCの数を少なくとも80、85、90、95、99または99.5%低減する;
(ix)例えば、免疫組織化学分析を使用して測定したとき、例えば、図7Bおよび7Dについて実施例8で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、in vivoで、組織常在性マクロファージ、例えば、クッパー細胞を枯渇させないか、または実質的に枯渇させず、例えば、組織常在性マクロファージ、例えば、クッパー細胞の数を4、6、8、10または15%以下しか低減しない;
(x)例えば、フローサイトメトリー分析または免疫組織化学分析を使用して測定したとき、例えば、図21について説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、TAM上でのCD86またはMHCクラスII発現を増大する;
(xi)例えば、細胞生存率MTTアッセイを使用して測定したとき、例えば、図8Aについて実施例9で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、CSF1R陽性、CCR2陰性細胞のCSF-1依存細胞生存を阻害しないか、または実質的に阻害せず、例えば、CSF1R陽性、CCR2陰性細胞のCSF-1依存細胞生存を5、10または15%以下しか低減しない;
(xii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図9について実施例10で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、in vivoでCD8+T細胞腫瘍浸潤を増大し、例えば、腫瘍におけるCD3+T細胞中のCD8+T細胞%を少なくとも1.5、2または2.5倍増大する;
(xiii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図10Aについて実施例11で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、in vivoで腫瘍におけるTreg頻度を低減し、例えば、腫瘍におけるTreg頻度を少なくとも15、20、25または30%低減する;
(xiv)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図10Bについて実施例11で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、in vivoで腫瘍におけるCD8+T細胞/Treg比を増大し、例えば、腫瘍におけるCD8+T細胞/Treg比を少なくとも2.5、3、3.5、4または4.5倍増大する;または
(xv)例えば、図11Aおよび11Bについて実施例12、または図23について実施例19で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、腫瘍成長を低減し、腫瘍保有動物の生存を増大し、かつ/または抗腫瘍免疫メモリーを向上させる
のうちの1つまたは複数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13個またはそれよりも多く)を有する。
(i)抗CSF1R抗体分子は、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、第1のポリペプチドは、第1の軽鎖可変領域(VL)および第1の軽鎖定常領域(CL)を含み、第2のポリペプチドは、第1の重鎖可変領域(VH)、第1の重鎖定常領域1(CH1)ならびに任意選択により、第1のCH2および第1のCH3を含み、
(ii)抗CCR2抗体分子は、第3のポリペプチドおよび第4のポリペプチドを含み、第3のポリペプチドは、第2のVLおよび第2のCLを含み、第4のポリペプチドは、第2のVH、第2のCH1ならびに任意選択により、第2のCH2および第2のCH3を含む。
(i)多特異性分子は、CCR2の存在下でCSF1Rを阻害し、任意選択により、細胞が、細胞表面上でCSF1RおよびCCR2の両方を発現する場合、多特異性分子は、細胞においてCSF1Rの活性(例えば、CSF1Rシグナル伝達、例えば、CSF-1誘導CSF1Rシグナル伝達)を、例えば、少なくとも40、50、60、70、80もしくは90%低減し、かつ/または
(ii)多特異性分子は、CCR2の非存在下でCSF1Rを阻害しないか、または実質的に阻害せず、任意選択により、細胞が、細胞表面上でCSF1Rを発現するが、CCR2を発現しない場合、多特異性分子は、CSF1Rの活性(例えば、CSF1Rシグナル伝達、例えば、CSF-1誘導CSF1Rシグナル伝達)を低減しないか、またはCSF1Rの活性を2、4、6、8、10もしくは15%以下しか低減しない。
(i)多特異性分子は、CSF1Rの存在下でCCR2を阻害し、任意選択により、細胞が、細胞表面上でCCR2およびCSF1Rの両方を発現する場合、多特異性分子は、細胞においてCCR2の活性を、例えば、少なくとも40、50、60、70、80もしくは90%低減し、かつ/または
(ii)多特異性分子は、CSF1Rの非存在下でCCR2を阻害しないか、または実質的に阻害せず、任意選択により、細胞が、細胞表面上でCCR2を発現するが、CSF1Rを発現しない場合、多特異性分子は、CCR2の活性を低減しないか、またはCCR2の活性を2、4、6、8、10もしくは15%以下しか低減しない。
(i)単球、例えば、炎症性単球、例えば、Ly6CHiCCR2+CX3CR1Lo炎症性単球の輸送を媒介する分子に結合する第1の結合部分であって、任意選択により、CCR2に結合する第1の結合部分;ならびに
(ii)炎症組織における単球および/またはマクロファージの成熟および/または生存を媒介する分子に結合する第2の結合部分であって、任意選択により、CSF1Rに結合する第2の結合部分
を含む単離された多特異性、例えば、二特異性分子を提供する。
(i)炎症性単球の腫瘍への動員を低減する第1の結合部分であって、任意選択により、CCR2に結合し、かつ/またはそれを阻害する第1の結合部分;ならびに
(ii)腫瘍微小環境における単球および/またはマクロファージの成熟および/または生存を低減する第2の結合部分であって、任意選択により、CSF1Rに結合し、かつ/またはそれを阻害する第2の結合部分
を含む単離された多特異性、例えば、二特異性分子を提供する。
(i)抗CSF1R結合部分(例えば、抗CSF1R抗体分子)と;
(ii)抗CCR2結合部分(例えば、抗CCR2抗体分子)と;
(iii)TGF-ベータ阻害剤;
(iv)抗PD-L1結合部分(例えば、抗PD-L1抗体分子);および
(v)サイトカイン分子、例えば、IL-2分子
のうちの1、2つまたはすべてと
を含む多特異性、例えば、二特異性分子が本明細書で提供される。
(i)VHが、配列番号480のアミノ酸配列を含まず、かつ/または
(ii)VLが、配列番号481のアミノ酸配列を含まない、
CCR2(例えば、ヒトCCR2)に結合する抗体分子(例えば、単離された抗体分子)が本明細書で提供される。
一態様では、(i)抗CSF1R結合部分(例えば、抗CSF1R抗体分子);(ii)抗CCR2結合部分(例えば、抗CCR2抗体分子);および(iii)TGF-ベータ阻害剤を含む多特異性分子が本明細書で開示される。一部の実施形態では、多特異性分子は、以下の特性:
(i)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図1について実施例2で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、CSF1R陽性、CCR2陰性細胞、またはCSF1R陰性、CCR2陽性細胞と比較して、CSF1R陽性、CCR2陽性細胞に優先的に結合し、例えば、多特異性分子のCSF1R陽性、CCR2陽性細胞への結合が、多特異性分子のCSF1R陽性、CCR2陰性細胞、またはCSF1R陰性、CCR2陽性細胞への結合よりも少なくとも2、4、6、8、10、15、20または25倍強い;
(ii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図1について実施例2で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、CSF1R陽性、CCR2陰性細胞と比較して、CSF1R陽性、CCR2陽性細胞に優先的に結合し、例えば、多特異性分子のCSF1R陽性、CCR2陽性細胞への結合についてのEC50が、多特異性分子のCSF1R陽性、CCR2陰性細胞への結合についてのEC50の60、50、40、30、20または10%以下である;
(iii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図1について実施例2で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、CSF1R陰性、CCR2陽性細胞と比較して、CSF1R陽性、CCR2陽性細胞に優先的に結合し、例えば、多特異性分子のCSF1R陽性、CCR2陽性細胞への結合についてのEC50が、多特異性分子のCSF1R陰性、CCR2陽性細胞への結合についてのEC50の50、40、30、20、10または5%以下である;
(iv)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図5について実施例6で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、T細胞、NK細胞、好中球、組織常在性マクロファージ(例えば、クッパー細胞)またはランゲルハンス細胞と比較して、腫瘍関連マクロファージ(TAM)または骨髄系由来サプレッサー細胞(MDSC)に優先的に結合し、例えば、多特異性分子のTAMまたはMDSCへの結合が、多特異性分子のT細胞、NK細胞、好中球、組織常在性マクロファージ(例えば、クッパー細胞)またはランゲルハンス細胞への結合よりも少なくとも2、4、6、8、10、15、20または25倍強い;
(v)例えば、トランズウェルプレート遊走アッセイを使用して測定したとき、例えば、図2について実施例3で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、単球遊走、例えば単球走化性タンパク質1(MCP1)誘導単球遊走を阻害し、例えば、MCP1誘導単球遊走を少なくとも40、50、60または70%低減する;
(vi)例えば、細胞増殖MTTアッセイを使用して測定したとき、例えば、図3Bについて実施例4で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、マクロファージ、例えば、骨髄系由来マクロファージの増殖、例えば、骨髄系由来マクロファージのCSF-1誘導増殖を阻害し、例えば、骨髄系由来マクロファージのCSF-1誘導増殖を少なくとも50、60、70または80%低減する;
(vii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図4について実施例5で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、単球、例えば、骨髄系由来単球の分化、例えば、骨髄系由来単球のCSF-1誘導分化を阻害しないか、または実質的に阻害せず、例えば、骨髄系由来単球のCSF-1誘導分化を2、4、6、8または10%以下しか低減しない;
(viii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図6について実施例7で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、in vivoで、抑制性骨髄性細胞、例えば、TAMまたはMDSCを枯渇させ、例えば、抑制性骨髄性細胞、例えば、TAMまたはMDSCの数を少なくとも80、85、90、95、99または99.5%低減する;
(ix)例えば、免疫組織化学分析を使用して測定したとき、例えば、図7Bおよび7Dについて実施例8で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、in vivoで、組織常在性マクロファージ、例えば、クッパー細胞を枯渇させないか、または実質的に枯渇させず、例えば、組織常在性マクロファージ、例えば、クッパー細胞の数を4、6、8、10または15%以下しか低減しない;
(x)例えば、フローサイトメトリー分析または免疫組織化学分析を使用して測定したとき、例えば、図21について説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、TAM上でのCD86またはMHCクラスII発現を増大する;
(xi)例えば、細胞生存率MTTアッセイを使用して測定したとき、例えば、図8Aについて実施例9で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、CSF1R陽性、CCR2陰性細胞のCSF-1依存細胞生存を阻害しないか、または実質的に阻害せず、例えば、CSF1R陽性、CCR2陰性細胞のCSF-1依存細胞生存を5、10または15%以下しか低減しない;
(xii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図9について実施例10で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、in vivoでCD8+T細胞腫瘍浸潤を増大し、例えば、腫瘍におけるCD3+T細胞中のCD8+T細胞%を少なくとも1.5、2または2.5倍増大する;
(xiii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図10Aについて実施例11で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、in vivoで腫瘍におけるTreg頻度を低減し、例えば、腫瘍におけるTreg頻度を少なくとも15、20、25または30%低減する;
(xiv)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図10Bについて実施例11で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、in vivoで腫瘍におけるCD8+T細胞/Treg比を増大し、例えば、腫瘍におけるCD8+T細胞/Treg比を少なくとも2.5、3、3.5、4または4.5倍増大する;
(xv)例えば、図11Aおよび11Bについて実施例12、または図23について実施例19で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、腫瘍成長を低減し、腫瘍保有動物の生存を増大し、かつ/または抗腫瘍免疫メモリーを向上する;
(xvi)例えば、図39Bおよび39Dについて実施例28で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、中間単球または非古典的単球と比較して、古典的単球に優先的に結合する;または
(xvii)例えば、図40A~40Fについて実施例28で説明される方法を使用して測定したとき、多特異性分子が、TGFβの活性を、例えば、少なくとも30、40、50、60、70、80または90%低減する
のうちの1つまたは複数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16個またはそれよりも多く)を有する。
一部の実施形態では、多特異性分子は、第1のFc領域(例えば、第1のCH1-Fc領域)および第2のFc領域(例えば、第2のCH1-Fc領域)を含む。一部の実施形態では、(i)第1のTGF-ベータ受容体ポリペプチドは、例えば、リンカーを介して、第1のFc領域(例えば、第1のCH1-Fc領域)、例えば、第1のFc領域(例えば、第1のCH1-Fc領域)のC末端に連結されており、かつ(ii)第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドは、例えば、リンカーを介して、第2のFc領域(例えば、第2のCH1-Fc領域)、例えば、第2のFc領域(例えば、第2のCH1-Fc領域)のC末端に連結されている。一部の実施形態では、第1のTGF-ベータ受容体ポリペプチドおよび第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドは、ホモ二量体またはヘテロ二量体、例えば、ホモ二量体を形成する。一部の実施形態では、第1または第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドは、TGFBR1、TGFBR2またはTGFBR3の細胞外ドメイン、例えば、TGFBR2の細胞外ドメインを含む。一部の実施形態では、多特異性分子は、図35Aまたは35Bの構成を有する。
一部の実施形態では、本明細書で開示される多特異性分子は、抗体依存性細胞傷害活性(ADCC)を誘導しない。
別の態様では、本明細書で説明される多特異性分子のいずれかをコードするヌクレオチド配列、またはそれと実質的に相同の(例えば、それと少なくとも95%~99.9%同一の)ヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子が本明細書で提供される。
別の態様では、本明細書で説明される核酸分子または本明細書で説明されるベクターを含む細胞、例えば、宿主細胞が本明細書で提供される。
別の態様では、過剰増殖性障害、がん、線維性障害もしくは状態、炎症性障害もしくは状態、または自己免疫障害を処置する方法が本明細書で提供される。一実施形態では、障害は、過剰増殖性障害、例えば、過剰増殖性結合組織障害(例えば、過剰増殖性線維性疾患)である。一実施形態では、線維性(例えば、過剰増殖性線維性)疾患は、多システム性または臓器特異性である。例示的な線維性疾患には、多システム性障害(例えば、全身性硬化症、多巣性線維性硬化症、骨髄移植レシピエントにおける強皮症性移植片対宿主病、腎性全身性線維症、強皮症)および臓器特異性障害(例えば、肺、肝臓、心臓、腎臓、膵臓、皮膚および他の臓器の線維症)が含まれるが、これらに限定されない。他の実施形態では、線維性疾患は、肝線維症(例えば、肝硬変、NASHおよび本明細書で説明される他の状態)、肺線維症(例えば、IPF)、腎線維症または骨髄の線維症(例えば、骨髄線維症)から選択される。
本特許または出願ファイルは、カラーで作成された少なくとも1つの図面を含有する。カラー図面を含む本特許または特許出願公開のコピーは、請求および必要な料金の支払いに応じて、特許庁により提供される。
本明細書で使用される場合、「トランスフォーミング増殖因子ベータ-1(TGF-ベータ1)」という用語は、ヒトにおいて、遺伝子TGFB1またはそのオルソログによってコードされるタンパク質を指す。スイスプロット受託番号P01137は、例示的ヒトTGF-ベータ1アミノ酸配列を提供する。例示的未熟ヒトTGF-ベータ1アミノ酸配列は、配列番号92で提供される。例示的成熟ヒトTGF-ベータ1アミノ酸配列は、配列番号117で提供される。
2つのアミノ酸配列の、または2つの核酸配列の同一性パーセントを決定するために、最適比較目的のために配列がアラインされる(例えば、最適アラインメントのために、第1および第2のアミノ酸または核酸配列の一方または両方にギャップが導入されてもよく、比較目的のために非相同配列が無視されてもよい)。好ましい実施形態では、比較目的のためにアラインされた参照配列の長さは、参照配列の長さの少なくとも30%、好ましくは、少なくとも40%、より好ましくは、少なくとも50%、60%、さらにより好ましくは、少なくとも70%、80%、90%、100%である。次いで、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置のアミノ酸残基またはヌクレオチドが比較される。第1の配列中の位置が、第2の配列中の対応する位置と同一のアミノ酸残基またはヌクレオチドによって占められる場合には、分子は、その位置で同一である(本明細書で使用される場合、アミノ酸または核酸「同一性」は、アミノ酸または核酸「相同性」と同等である)。
「アミノ酸」という用語は、天然であれ、合成であれ、アミノ官能性および酸官能性の両方を含み、天然に存在するアミノ酸のポリマー中に含まれることが可能なすべての分子を包含するものとする。例示的アミノ酸は、天然に存在するアミノ酸、そのアナログ、誘導体および同類物、バリアント側鎖を有するアミノ酸アナログ、ならびに前記のもののいずれかのすべての立体異性体を含む。本明細書で使用される場合、「アミノ酸」という用語は、D-またはL-光学異性体およびペプチド模倣物の両方を含む。
本明細書で使用される場合、「TAMを低減すること」という用語は、一般に、TAMの数を減少させることを指す。低減することは、腫瘍または腫瘍付近中のTAMの数を減少させること(例えば、本明細書において記載される多特異性分子の投与の前(例えば、本明細書において記載される多特異性分子の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10回またはそれより多い投与の前)のTAMの数と比較して)を含む。低減することは、任意の数のTAMを減少させること(例えば、1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、99%、100%、すべて、または実質的に)(例えば、本明細書において記載される多特異性分子の投与の前(例えば、本明細書において記載される多特異性分子の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10回またはそれより多い投与の前)のTAMの数と比較して)を含む。
抗原
本開示のTAM標的化抗原は、例えば、CSF1R、CCR2、CXCR2、CD68、CD163、CX3CR1、MARCO、CD204、CD52および葉酸受容体ベータを含む。TAM標的化抗原の例示的アミノ酸配列が、本明細書において提供される。
CSF1R(マクロファージコロニー刺激因子1受容体としても知られる)は、CSF1およびIL34の細胞表面受容体として作用し、造血前駆体細胞、特に、単核貪食細胞、例えば、マクロファージおよび単球の生存、増殖および分化の調節において必要不可欠な役割を果たすチロシン-タンパク質キナーゼである。CSF1Rは、IL34およびCSF1に応じて炎症性ケモカインの放出を促進し、それによって、自然免疫において、および炎症プロセスにおいて重要な役割を果たす。例示的CSF1R未熟アミノ酸配列は、配列番号87および88で提供される。
MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEWDGPPSPHWTLYSDGSSSILSTNNATFQNTGTYRCTEPGDPLGGSAAIHLYVKDPARPWNVLAQEVVVFEDQDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYSFSPWHGFTIHRAKFIQSQDYQCSALMGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSVDVNFDVFLQHNNTKLAIPQQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGKHSTSMFFRVVESAYLNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLGPFSDHQPEPKLANATTKDTYRHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRALTFELTLRYPPEVSVIWTFINGSGTLLCAASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFHKVTVQSLLTVETLEHNQTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMSIMALLLLLLLLLLYKYKQKPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGPSLSPGQDPEGGVDYKNIHLEKKYVRRDSGFSSQGVDTYVEMRPVSTSSNDSFSEQDLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHRPTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGSGSSSSELEEESSSEHLTCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC
配列番号87
CSF1R未熟アミノ酸配列アイソフォーム2(識別子:P07333-2):
MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEWDGPPSPHWTLYSDGSSSILSTNNATFQNTGTYRCTEPGDPLGGSAAIHLYVKDPARPWNVLAQEVVVFEDQDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYSFSPWHGFTIHRAKFIQSQDYQCSALMGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSVDVNFDVFLQHNNTKLAIPQQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGKHSTSMFFRVVGTPSPSLCPA
配列番号88
CCR2
CCR2(C-Cケモカイン受容体2型としても知られる)は、CCL2、CCL7およびCCL13ケモカインのGタンパク質共役受容体である。CCR2は、単球/マクロファージおよびT細胞の動員において機能することが知られている。CCR2は、単球およびT細胞の小さい亜集団で発現され、マウスおよびヒトにおいてほぼ同一の発現パターンを示す(MackらJ Immunol 2001年;166巻:4697~4704頁)。例示的CCR2アミノ酸配列は、配列番号89および90で提供される。
MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTKCQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRGKGKSIGRAPEASLQDKEGA
配列番号89
CCR2アミノ酸配列アイソフォームB(識別子:P41597-2):
MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTKCQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRRYLSVFFRKHITKRFCKQCPVFYRETVDGVTSTNTPSTGEQEVSAGL
配列番号90
CXCR2
CXCR2(インターロイキン-8受容体としても知られる)は、好中球走化因子であるIL8のGタンパク質共役受容体である。IL8の受容体への結合は、好中球の活性化を引き起こす。この応答は、ホスファチジルイノシトール-カルシウムセカンドメッセンジャー系を活性化するG-タンパク質によって媒介される。CXCR2は、IL-8に高親和性で結合し、CXCL3、GRO/MGSAおよびNAP-2にも高親和性で結合する。CXCR2は、循環好中球で高レベルで発現され、その遊走を炎症部位へ方向付けるために重要である(J Clin Invest. 2012年;122巻(9号):3127~3144頁)。例示的CXCR2アミノ酸配列は、配列番号91で提供される。
MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINKYFVVIIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLVKFICLSIWGLSLLLALPVLLFRRTVYSSNVSPACYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGFTLRTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRALDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSSGHTSTTL
配列番号91
例示的抗体
TAM抗原と結合する例示的抗体は、本明細書中および以下で提供される。例示的抗CSF1R抗体は、本明細書において、ならびにWO2009026303A1、WO2011123381A1、WO2016207312A1、WO2016106180A1、US20160220669A1、US20160326254A1、WO2013169264A1、WO2013087699A1、WO2011140249A2、WO2011131407A1、WO2011123381A1、WO2011107553A1およびWO2011070024A1に記載され、それらのすべては、その全文で参照により本明細書に組み込まれる。例示的CCR2抗体は、本明細書において、ならびにWO2013192596A2、WO2010021697A2、WO2001057226A1およびWO1997031949A1において記載され、それらのすべては、その全文で参照により本明細書に組み込まれる。例示的CXCR2抗体は、WO2014170317A1およびUS20160060347(例えば、a)配列番号14(軽鎖)および配列番号15(重鎖)、b)配列番号24(軽鎖)および配列番号25(重鎖)、c)配列番号34(軽鎖)および配列番号35(重鎖)、d)配列番号44(軽鎖)および配列番号45(重鎖)、e)配列番号54(軽鎖)および配列番号55(重鎖)、f)配列番号64(軽鎖)および配列番号65(重鎖)、g)配列番号74(軽鎖)および配列番号75(重鎖)、h)配列番号84(軽鎖)および配列番号85(重鎖)を参照されたい)において記載され、それらのすべては、その全文で参照により本明細書に組み込まれる。例示的抗CD163抗体は、その全文で参照により本明細書に組み込まれるUS20120258107(例えば、MAC2158、MAC2-48を参照されたい)において提供される。例示的抗CD52抗体は、その全文で参照により本明細書に組み込まれるUS20050152898において記載される。例示的抗葉酸抗体は、その全文で参照により本明細書に組み込まれるUS9522196において記載される。例示的抗CD52抗体は、その全文で参照により本明細書に組み込まれるUS20050152898において記載される。例示的抗MARCO抗体は、その全文で参照により本明細書に組み込まれるWO2016196612において記載される。
一実施形態では、多特異性分子は、第1の腫瘍関連マクロファージ(TAM)抗原に結合する抗体分子および第2のTAM抗原に結合する抗体分子を含む。一部の実施形態では、第1のおよび/または第2のTAM抗原は、例えば、哺乳動物、例えば、ヒトである。例えば、抗体分子は、TAM抗原上のエピトープ、例えば、線形またはコンフォメーションエピトープに特異的に結合する。
「モノクローナル抗体」または「モノクローナル抗体組成物」という用語は、本明細書で使用される場合、単一分子組成物の抗体分子の調製を指す。モノクローナル抗体組成物は、単一結合特異性および部分エピトープに対する親和性を示す。モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ技術によって、またはハイブリドーマ技術を使用しない方法(例えば、組換え法)によって作製され得る。
抗体を作製するためのファージディスプレイおよびコンビナトリアル法は、当技術分野で公知である(例えば、Ladnerら米国特許第5,223,409号、Kangら国際公開番号WO92/18619、Dowerら国際公開番号WO91/17271、Winterら国際公開公報WO92/20791、Marklandら国際公開番号WO92/15679、Breitlingら国際公開公報WO93/01288、McCaffertyら国際公開番号WO92/01047、Garrardら国際公開番号WO92/09690、Ladnerら国際公開番号WO90/02809、Fuchsら(1991年)Bio/Technology 9巻:1370~1372頁、Hayら(1992年)Hum Antibod Hybridomas 3巻:81~85頁、Huseら(1989年)Science 246巻:1275~1281頁、Griffthsら(1993年)EMBO J 12巻:725~734頁、Hawkinsら(1992年)J Mol Biol 226巻:889~896頁、Clacksonら(1991年)Nature 352巻:624~628頁、Gramら(1992年)PNAS 89巻:3576~3580頁、Garradら(1991年)Bio/Technology 9巻:1373~1377頁、Hoogenboomら(1991年)Nuc Acid Res 19巻:4133~4137頁およびBarbasら(1991年)PNAS 88巻:7978~7982頁に記載されるように、これらのすべての開示内容は、参照により本明細書に組み込まれる)。
一部の実施形態では、CSF1R、例えば、ヒトCSF1Rに結合する抗体分子(例えば、単一特異性または多特異性抗体分子)が、本明細書において提供される。
一部の実施形態では、CCR2、例えば、ヒトCCR2に結合する抗体分子(例えば、単一特異性または多特異性抗体分子)が、本明細書において提供される。
一部の実施形態では、PD-L1、例えば、ヒトPD-L1に結合する抗体分子(例えば、単一特異性または多特異性抗体分子)が、本明細書において提供される。
実施形態では、多特異性抗体分子は、1つより多い抗原結合部位を含む場合があり、異なる部位が異なる抗原に対して特異的である。実施形態では、多特異性抗体分子は、同一抗原上の1つより多い(例えば、2つまたはそれより多い)エピトープに結合できる。実施形態では、多特異性抗体分子は、標的細胞(例えば、がん細胞)に対する特異的な抗原結合部位および免疫エフェクター細胞に対する特異的な異なる抗原結合部位を含む。一実施形態では、多特異性抗体分子は、二特異性抗体分子である。二特異性抗体分子は、5つの異なる構造群:(i)二特異性免疫グロブリンG(BsIgG)、(ii)さらなる抗原結合部分が付加されたIgG、(iii)二特異性抗体断片、(iv)二特異性融合タンパク質および(v)二特異性抗体コンジュゲートに分類され得る。
一態様では、抗CSF1R結合部分を含む多特異性抗体分子が、本明細書において提供される。一実施形態では、抗CSF1R結合部分は、本明細書において開示される抗CSF1R抗体分子、例えば、副題「CSF1Rを標的とする抗体分子」を有する節において開示される抗CSF1R抗体分子を含む。一部の実施形態では、多特異性抗体分子は、抗CCR2結合部分(例えば、本明細書において開示される抗CCR2抗体分子)、抗PD-L1結合部分(例えば、本明細書において開示される抗PD-L1抗体分子)、TGFベータ阻害剤および/またはサイトカイン分子(例えば、IL-2分子)をさらに含む。
一態様では、CSF1R結合部分を含む多特異性抗体分子が、本明細書において開示される。一部の実施形態では、CSF1R結合部分は、抗CSF1R抗体分子を含む。例示的抗CSF1R抗体分子配列は、WO2009026303A1、WO2011123381A1、WO2016207312A1、WO2016106180A1、US20160220669A1、US20160326254A1、WO2013169264A1、WO2013087699A1、WO2011140249A2、WO2011131407A1、WO2011123381A1、WO2011107553A1およびWO2011070024A1に記載されており、そのすべては、その全文で参照により本明細書に組み込まれる。一部の実施形態では、CSF1R結合部分は、エマクツズマブのCDR(例えば、1、2、3、4、5もしくは6つすべてのCDR)、VH、VL、重鎖もしくは軽鎖配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも95%同一の、例えば、それと95%~99.9%同一の、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む。一部の実施形態では、CSF1R結合部分は、カビラリズマブのCDR(例えば、1、2、3、4、5もしくは6つすべてのCDR)、VH、VL、重鎖もしくは軽鎖配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも95%同一の、例えば、それと95%~99.9%同一の、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む。一部の実施形態では、CSF1R結合部分は、AMG820のCDR(例えば、1、2、3、4、5もしくは6つすべてのCDR)、VH、VL、重鎖もしくは軽鎖配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも95%同一の、例えば、それと95%~99.9%同一の、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む。一部の実施形態では、CSF1R結合部分は、IMC-CS4のCDR(例えば、1、2、3、4、5もしくは6つすべてのCDR)、VH、VL、重鎖もしくは軽鎖配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも95%同一の、例えば、それと95%~99.9%同一の、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む。一部の実施形態では、CSF1R結合部分は、表8において開示されるVHもしくはVLアミノ酸配列、表8において開示されるVHもしくはVLアミノ酸配列のCDRまたはそれと実質的に同一の配列を含む。
一態様では、CCR2結合部分を含む多特異性抗体分子が、本明細書において開示される。例示的CCR2抗体は、本明細書において、ならびにWO2013192596A2、WO2010021697A2、WO2001057226A1およびWO1997031949A1において記載され、それらのすべては、その全文で参照により本明細書に組み込まれる。一部の実施形態では、CCR2結合部分は、プロザリズマブのCDR(例えば、1、2、3、4、5もしくは6つすべてのCDR)、VH、VL、重鎖もしくは軽鎖配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと95%~99.9%同一の、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む。一部の実施形態では、CCR2結合部分は、表9において開示されるVHもしくはVLアミノ酸配列、表9において開示されるVHもしくはVLアミノ酸配列のCDRまたはそれと実質的に同一の配列を含む。
一態様では、PD-L1結合部分を含む多特異性抗体分子が、本明細書において開示される。一部の実施形態では、PD-L1結合部分は、抗PD-L1抗体分子を含む。例示的抗PD-L1抗体分子配列は、WO2013079174、WO2010077634、WO2007/005874およびUS20120039906に記載されており、それらのすべては、その全文で参照により本明細書に組み込まれる。一部の実施形態では、PD-L1結合部分は、デュルバルマブのCDR(例えば、1、2、3、4、5もしくは6つすべてのCDR)、VH、VL、重鎖もしくは軽鎖配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと95%~99.9%同一の、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む。一部の実施形態では、PD-L1結合部分は、アテゾリズマブのCDR(例えば、1、2、3、4、5もしくは6つすべてのCDR)、VH、VL、重鎖もしくは軽鎖配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも95%同一の、例えば、それと95%~99.9%同一の、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む。一部の実施形態では、PD-L1結合部分は、アベルマブのCDR(例えば、1、2、3、4、5もしくは6つすべてのCDR)、VH、VL、重鎖もしくは軽鎖配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも95%同一の、例えば、それと95%~99.9%同一の、もしくは少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む。一部の実施形態では、PD-L1結合部分は、表10において開示されるVHもしくはVLアミノ酸配列、表10において開示されるVHもしくはVLアミノ酸配列のCDRまたはそれと実質的に同一の配列を含む。
実施形態では、抗体分子は、CDRグラフト化スキャフォールドドメインである。実施形態では、スキャフォールドドメインは、フィブロネクチンドメイン、例えば、フィブロネクチンIII型ドメインに基づいている。フィブロネクチンIII型(Fn3)ドメインの全体的なフォールドは、最小機能的抗体断片、抗体重鎖の可変領域のものと密接に関連している。Fn3の末端に3つのループがあり、BC、DEおよびFGループの位置は、抗体のVHドメインのCDR1、2および3のものとほぼ対応する。Fn3は、ジスルフィド結合を有さず、したがって、Fn3は、抗体およびその断片とは異なり、還元条件下で安定である(例えば、WO98/56915、WO01/64942、WO00/34784を参照されたい)。Fn3ドメインは、例えば、本明細書において記載される抗原/マーカー/細胞に結合するドメインを選択するように改変され得る(例えば、本明細書において記載されるCDRもしくは超可変ループを使用して)または変更され得る。
ヘテロ二量体化二特異性抗体は、天然IgG構造に基づいており、2つの結合アームが異なる抗原を認識する。定義される一価の(および同時)抗原結合を可能にするIgG由来形式は、軽鎖誤対形成を最小にする技術(例えば、共通軽鎖)と組み合わされた、強制重鎖ヘテロ二量体化によって生成される。強制重鎖ヘテロ二量体化は、例えば、ノブ・イン・ホールOR鎖交換操作されたドメイン(SEED)を使用して得ることができる。
US5,731,116、US7,476,724およびRidgway, J.ら(1996年) Prot. Engineering 9巻(7号):617~621頁において記載されるノブ・イン・ホールは、概して、(1)抗体の一方または両方のCH3ドメインを突然変異して、ヘテロ二量体化を促進することおよび(2)突然変異された抗体をヘテロ二量体化を促進する条件下で組み合わせることを含む。「ノブ」または「突起」は、典型的には、Eu番号付けシステムに基づいて番号付けされた、親抗体中の小さいアミノ酸を、大きいアミノ酸で置き換えること(例えば、T366YまたはT366W)によって作出され、「ホール」または「空洞」は、親抗体中の大きい残基を、小さいアミノ酸で置き換えること(例えば、Y407T、T366S、L368Aおよび/またはY407V)によって作出される。
SEEDは、優先的にヘテロ二量体化する非同一鎖を作出するためのIgG1とIgAの間の配列交換に基づいている。SEED CH3ドメインにおいてヒトIgAおよびIgGから配列を変更することによって、AGおよびGAと名付けられる2つの非対称であるが相補的ドメインを生成する。SEED設計によって、AG/GAヘテロ二量体の効率的な生成が可能となるが、AGおよびGA SEED CH3ドメインのホモ二量体化は好ましくない。
二特異的IgGの均質な調製物を生成するには、軽鎖誤対形成は避けられなければならない。これを達成するための1つの方法は、共通軽鎖原理の使用、すなわち、1つの軽鎖を共有するが依然として別個の特異性を有する2つの結合剤を組み合わせることによる。別の選択肢として、二特異性抗体の2分の1のFabにおいてCH1およびCLドメインを交換することによって非特異的L鎖誤対形成を避けるCrossMab技術がある。このような乗換えバリアントは、結合特異性および親和性を保持するが、2つのアームをかなり異なるものにし、L鎖誤対形成が防がれる。
抗体のNまたはC末端に付着されたさらなる結合実体を含有する種々の形式が生成され得る。一本鎖またはジスルフィド安定化FvまたはFabとのこれらの融合は、各抗原に対して二価結合特異性を有する四価分子の生成をもたらす。scFvおよびscFabのIgGとの組合せによって、3つ以上の異なる抗原を認識できる分子の産生が可能となる。
抗体-Fab融合物は、第1の標的に対する伝統的な抗体、および抗体重鎖のC末端に融合された第2の標的に対するFabを含む二特異性抗体である。一般に、抗体およびFabは、共通軽鎖を有することとなる。抗体融合物は、(1)標的融合物のDNA配列を操作することおよび(2)標的DNAを適した宿主細胞にトランスフェクトして、融合タンパク質を発現させることによって産生され得る。Coloma, J.ら(1997年) Nature Biotech 15巻:159頁によって記載されるように、抗体-scFv融合物は、CH3ドメインのC末端とscFvのN末端の間で(Gly)-Serリンカーによって連結され得るようである。
抗体-scFv融合物は、伝統的な抗体、および抗体重鎖のC末端に融合された特有の特異性のscFvを含む二特異性抗体である。scFvは、scFvの重鎖によってC末端に、直接的にまたはリンカーペプチドを介してのいずれかで融合され得る。抗体融合物は、(1)標的融合物のDNA配列を操作することおよび(2)標的DNAを適した宿主細胞にトランスフェクトして、融合タンパク質を発現させることによって産生され得る。Coloma, J.ら(1997年) Nature Biotech 15巻:159頁によって記載されるように、抗体-scFv融合物は、CH3ドメインのC末端とscFvのN末端の間で(Gly)-Serリンカーによって連結され得るようである。
関連形式としては、二重可変ドメイン免疫グロブリン(DVD)があり、より短いリンカー配列によるVドメインのN末端の第2の特異性位置のVHおよびVLドメインから構成される。
ミニ抗体としても知られるFc含有実体は、scFvを、異なる特異性を有する抗体の定常重領域ドメイン3のC末端に(CH3-scFv)、および/またはヒンジ領域に(scFv-hinge-Fc)融合することによって生成され得る。IgGのCH3ドメインのC末端に融合されたジスルフィド安定化可変領域(ペプチドリンカーを有さない)を有する三価実体も作製され得る。
Fcのない二特異性は、一般に、Fc含有実体よりも小さい大きさを有することを特徴とする。このクラスの一般的な二特異性は、Fab-scFv2およびFab-scFv分子を含む。このクラスとしてまた、例えば、BiTE(二特異性T細胞エンゲージャー(bispecific T-cell engager)、ダイアボディ、TandAb(四価タンデム抗体)およびDART(二重親和性再標的化分子(dual affinity retargeting molecule))が挙げられる。BiTEは、2つのscFvを柔軟なリンカーペプチドによって融合することによって作出される。ダイアボディは、2つの異なる抗体に由来する2つのVHおよび2つのVLドメインからなる。ドメインを、VHおよびVLドメインとのみの対形成を可能にする短いリンカーペプチドを用いて付着させることによって、別の鎖上の相補的ドメインとのみ相互作用が達成される。第2の結合剤のVLに連結された第1の結合剤のVHは、第1の抗体のVLに連結された第2の抗体のVHと同時発現される。TandAb分子は、分子内対形成を妨げる配向にある4つの抗体可変H-およびL-鎖からなるタンパク質の機能的二量体化によって生成される。DARTは、ダイアボディのものと同様の設計概念を適用する、ジスルフィド結合によって安定化されている実体である。
ラムダ軽鎖ポリペプチドおよびカッパ軽鎖ポリペプチドを含む多特異性分子(例えば、多特異性抗体分子)は、ヘテロ二量体化を可能にするために使用され得る。ラムダ軽鎖ポリペプチドおよびカッパ軽鎖ポリペプチドを含む二特異性抗体分子を生成する方法は、その全文で参照により本明細書に組み込まれる、2017年9月22日に出願されたPCT/US2017/53053に開示されている。
第1のエピトープに対して特異的なラムダ軽鎖ポリペプチド1(LLCP1)、
第1のエピトープに対して特異的な重鎖ポリペプチド1(HCP1)、
第2のエピトープに対して特異的なカッパ軽鎖ポリペプチド2(KLCP2)、および
第2のエピトープに対して特異的な重鎖ポリペプチド2(HCP2)。
LLCP1は、HCP2に対してよりもHCP1に対してより高い親和性を有する、および/または
KLCP2は、HCP1に対してよりもHCP2に対してより高い親和性を有する。
HCP1は、HCP1の第2の分子に対してよりもHCP2に対してより大きい親和性を有する、および/または
HCP2は、HCP2の第2の分子に対してよりもHCP1に対してより大きい親和性を有する。
(i)~(iv)が関連する条件下で、
(i)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1の重鎖可変領域(第1のVH)、第1のCH1、第1の重鎖定常領域(例えば、第1のCH2、第1のCH3または両方)のうち1、2、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)を提供すること、
(ii)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2の重鎖可変領域(第2のVH)、第2のCH1、第2の重鎖定常領域(例えば、第2のCH2、第2のCH3または両方)のうち1、2、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)を提供すること、
(iii)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1のVH)と優先的に会合するラムダ鎖ポリペプチド(例えば、ラムダ軽可変領域(VLλ)、ラムダ軽定常鎖(VLλ)または両方)を提供すること、
(iv)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2のVH)と優先的に会合するカッパ鎖ポリペプチド(例えば、ラムダ軽可変領域(VLκ)、ラムダ軽定常鎖(VLκ)または両方)を提供すること
を含む。
実施形態では、(i)~(iv)(例えば、(i)~(iv)をコードする核酸)は、単一細胞、例えば、単一哺乳動物細胞、例えば、CHO細胞中に導入される。実施形態では、(i)~(iv)は、細胞において発現される。
(i)第1の重鎖ポリペプチド(HCP1)(例えば、第1の重鎖可変領域(第1のVH)、第1のCH1、第1の重鎖定常領域(例えば、第1のCH2、第1のCH3または両方)のうち1、2、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)であって、例えば、第1のエピトープに結合する、HCP1、
(ii)第2の重鎖ポリペプチド(HCP2)(例えば、第2の重鎖可変領域(第2のVH)、第2のCH1、第2の重鎖定常領域(例えば、第2のCH2、第2のCH3または両方)のうち1、2、3つまたはすべてを含む重鎖ポリペプチド)であって、例えば、第2のエピトープに結合する、HCP2、
(iii)第1の重鎖ポリペプチド(例えば、第1のVH)と優先的に会合するラムダ軽鎖ポリペプチド(LLCP1)(例えば、ラムダ軽可変領域(VLl)、ラムダ軽定常鎖(VLl)または両方)であって、例えば、第1のエピトープに結合する、LLCP1、
(iv)第2の重鎖ポリペプチド(例えば、第2のVH)と優先的に会合するカッパ軽鎖ポリペプチド(KLCP2)(例えば、ラムダ軽可変領域(VLk)、ラムダ軽定常鎖(VLk)または両方)であって、例えば、第2のエピトープに結合する、KLCP2
を含む。
一実施形態では、多特異性分子は、単一ポリペプチド鎖ではない。
一実施形態では、抗体分子は、2つの完全重鎖および2つの完全軽鎖を含む。一実施形態では、少なくとも2つまたは少なくとも3つの非連続ポリペプチド鎖を有する多特異性分子は、例えば、本明細書において記載されるように、少なくとも2つの非連続ポリペプチド鎖中に第1のおよび第2の重鎖定常領域(例えば、第1のおよび第2のFc領域)を含む。
(a)第1の重鎖定常領域(例えば、CH3領域に接続されたCH2)(例えば、第1のFc領域)に任意選択により、リンカーを介して接続された、第1の抗原、例えば、CSF1Rに結合する、第1の抗原ドメインの第1の部分、例えば、Fab分子の第1のVH-CH1、(b)第2の重鎖定常領域(例えば、CH3領域に接続されたCH2)(例えば、第1のFc領域)に任意選択により、リンカーを介して接続された、第2の抗原、例えば、CCR2またはCXCR2に結合する第2の抗原ドメインの第1の部分、例えば、Fab分子の第2のVH-CH1、(c)第3のポリペプチドは、NからCに以下の立体配置を有する:第1の抗原ドメインの第2の部分、例えば、VLがカッパサブタイプのものであり、第1の抗原、例えば、CSF1R(例えば、第1のVH-CH1が結合している同一抗原)に結合する、Fabの第1のVL-CL、(d)第4のポリペプチドは、NからCに以下の立体配置を有する:第2の抗原ドメインの第2の部分、例えば、VLがラムダサブタイプのものであり、第2の抗原、例えば、がん抗原、例えば、CCR2またはCXCR2(例えば、第2のVH-CH1が結合している同一抗原)に結合する、Fabの第2のVL-CL。
一態様では、TGF-ベータ阻害剤を含む多特異性抗体分子が、本明細書において提供される。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、TGF-ベータに結合し、阻害する、例えば、TGF-ベータの活性を低減する。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、TGF-ベータ1を阻害する(例えば、その活性を低減する)。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、TGF-ベータ2を阻害する(例えば、その活性を低減する)。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、TGF-ベータ3を阻害する(例えば、その活性を低減する)。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、TGF-ベータ1およびTGF-ベータ3を阻害する(例えば、それらの活性を低減する)。一部の実施形態では、TGF-ベータ阻害剤は、TGF-ベータ1、TGF-ベータ2およびTGF-ベータ3を阻害する(例えば、それらの活性を低減する)。
サイトカインは、一般に、例えば、シグナル伝達経路によって細胞性活性に影響を及ぼすポリペプチドである。したがって、多特異性または多機能性ポリペプチドのサイトカインは、有用であり、細胞膜の外側からシグナルを伝達し、細胞内の応答をモジュレートする受容体媒介性シグナル伝達と関連付けることができる。サイトカインは、免疫応答のメディエーターであるタンパク質性シグナル伝達化合物である。それらは、増殖、分化および細胞生存/アポトーシスを含む多数の異なる細胞性機能を管理する;サイトカインはまた、ウイルス感染および自己免疫疾患を含むいくつかの病態生理学的プロセスに関与する。サイトカインは、自然(単球、マクロファージ、樹状細胞)および適応(T細胞およびB細胞)免疫系両方の種々の細胞によって種々の刺激下で合成される。サイトカインは、2つの群に分類され得る:炎症促進性および抗炎症性。IFNγ、IL-1、IL-6およびTNF-アルファを含む炎症促進性サイトカインは、自然免疫細胞およびTh1細胞に主に由来する。IL-10、IL-4、IL-13およびIL-5を含む抗炎症性サイトカインは、Th2免疫細胞から合成される。
NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS(配列番号243)、その断片またはそれと実質的に同一のアミノ酸配列(例えば、それと95%~99.9%同一の、または配列番号243のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む)である。
MAPRRARGCRTLGLPALLLLLLLRPPATRGITCPPPMSVEHADIWVKSYSLYSRERYICNSGFKRKAGTSSLTECVL(配列番号244)、その断片またはそれと実質的に同一のアミノ酸配列(例えば、それと95%~99.9%同一の、または配列番号244のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む。一部の実施形態では、多特異性分子のサイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、例えば、リンカー(例えば、Gly-Serリンカー、例えば、アミノ酸配列SGGSGGGGSGGGSGGGGSLQ(配列番号245)を含むリンカー)を介して共有結合によって連結される。他の実施形態では、多特異性分子のサイトカイン分子(例えば、IL-15)および受容体二量体化ドメイン(例えば、IL15Rアルファ二量体化ドメイン)は、共有結合によって連結されない、例えば、非共有結合によって会合される。
APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号246)、その断片またはそれと実質的に同一のアミノ酸配列(例えば、それと95%~99.9%同一の、または配列番号246のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む)である。
YFGKLESKLSVIRNLNDQVLFIDQGNRPLFEDMTDSDCRDNAPRTIFIISMYKDSQPRGMAVTISVKCEKISTLSCENKIISFKEMNPPDNIKDTKSDIIFFQRSVPGHDNKMQFESSSYEGYFLACEKERDLFKLILKKEDELGDRSIMFTVQNED(配列番号247)、その断片またはそれと実質的に同一のアミノ酸配列(例えば、それと95%~99.9%同一の、または配列番号247のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む)である。
QGQDRHMIRMRQLIDIVDQLKNYVNDLVPEFLPAPEDVETNCEWSAFSCFQKAQLKSANTGNNERIINVSIKKLKRKPPSTNAGRRQKHRLTCPSCDSYEKKPPKEFLERFKSLLQKMIHQHLSSRTHGSEDS(配列番号248)、その断片またはそれと実質的に同一のアミノ酸配列(例えば、それと95%~99.9%同一の、または配列番号248のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む)である。
QDPYVKEAENLKKYFNAGHSDVADNGTLFLGILKNWKEESDRKIMQSQIVSFYFKLFKNFKDDQSIQKSVETIKEDMNVKFFNSNKKKRDDFEKLTNYSVTDLNVQRKAIHELIQVMAELSPAAKTGKRKRSQMLFRG(配列番号249)、その断片またはそれと実質的に同一のアミノ酸配列(例えば、それと95%~99.9%同一の、または配列番号249のアミノ酸配列に対して少なくとも1つのアミノ酸変更であるが、5、10もしくは15以下の変更(例えば、置換、欠失もしくは挿入、例えば、保存的置換)を有する)を含む)である。
本発明はまた、本明細書において記載されるような抗体分子の重鎖および軽鎖可変領域ならびにCDRまたは超可変ループをコードするヌクレオチド配列を含む核酸を特徴とする。例えば、本発明は、本明細書において開示される抗体分子のうち1つまたは複数から選択される抗体分子の、それぞれ重鎖および軽鎖可変領域をコードする第1のおよび第2の核酸を特徴とする。核酸は、本明細書における表中に示されるようなヌクレオチド配列またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも約85%、90%、95%、99%もしくはそれより高く同一の、または本明細書における表において示される配列から3、6、15、30もしくは45ヌクレオチド以下だけ異なる配列)を含み得る。
本明細書において記載される抗体分子をコードするヌクレオチド配列を含むベクターが、本明細書においてさらに提供される。一実施形態では、ベクターは、本明細書において記載される抗体分子をコードするヌクレオチドを含む。一実施形態では、ベクターは、本明細書において記載されるヌクレオチド配列を含む。ベクターは、それだけには限らないが、ウイルス、プラスミド、コスミド、ラムダファージまたは酵母人工染色体(YAC)を含む。
別の態様では、本出願は、本明細書において記載される核酸を含有する宿主細胞およびベクターを特徴とする。核酸は、単一ベクターまたは同一宿主細胞もしくは別個の宿主細胞中に存在する別個のベクター中に存在し得る。宿主細胞は、真核細胞、例えば、哺乳動物細胞、昆虫細胞、酵母細胞または原核細胞、例えば、大腸菌(E.coli)であり得る。例えば、哺乳動物細胞は、培養細胞または細胞系であり得る。例示的哺乳動物細胞として、リンパ球性細胞系(例えば、NSO)、チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)、COS細胞、卵母細胞およびトランスジェニック動物に由来する細胞、例えば、乳腺上皮細胞が挙げられる。
一実施形態では、宿主細胞は、抗体分子をコードする核酸を含むように遺伝子操作される。
細胞は、それだけには限らないが、真核細胞、細菌細胞、昆虫細胞またはヒト細胞であり得る。適した真核細胞として、それだけには限らないが、Vero細胞、HeLa細胞、COS細胞、CHO細胞、HEK293細胞、BHK細胞およびMDCKII細胞が挙げられる。適した昆虫細胞として、それだけには限らないが、Sf9細胞が挙げられる。
本明細書において記載される多特異性分子は、単独でまたは第2の療法もしくは第2の治療剤と組み合わせて、過剰増殖性障害、がんまたは線維性障害を処置するために使用され得る。
がん
本明細書において記載される方法は、本明細書において記載される多特異性分子を使用すること、例えば、本明細書において記載される医薬組成物を使用することによって対象においてがんを処置することを含む。また、対象においてがんの症状を低減または軽快させるための方法ならびにがんの成長を阻害するおよび/または1種もしくは複数のがん細胞を死滅させるための方法も提供される。実施形態では、本明細書において記載される方法は、本明細書において記載されるものまたは本明細書において記載される医薬組成物を投与された対象において、腫瘍の大きさを減少させる、および/またはがん細胞数を減少させる。
本発明はまた、本明細書において記載される多特異性分子または医薬組成物を使用して、肝臓状態または障害を処置する方法も提供する。
代謝障害もまた、肝臓にも影響を及ぼし、肝損傷を引き起こし得る。肝臓の、または肝臓に影響を及ぼす代謝障害の例として、ヘマクロマトーシス、糖尿病、肥満症、高血圧症、脂質代謝異常、ガラクトース血症およびグリコーゲン貯蔵疾患が挙げられる。
別の態様では、本発明は、対象において線維性状態または障害を処置または予防する方法を特徴とする。方法は、多特異性分子を単剤として、または別の薬剤もしくは治療様式と組み合わせて、それを必要とする対象に、対象において線維性状態を減少させる、または阻害するのに十分な量で投与することを含む。
ある特定の実施形態では、線維性状態は、骨髄の線維性状態である。ある特定の実施形態では、骨髄の線維性状態は、骨髄線維症(例えば、原発性骨髄線維症(PMF))、骨髄球性化生、慢性特発性骨髄線維症または原発性骨髄線維症である。他の実施形態では、骨髄線維症は、へアリー細胞白血病、リンパ腫または多発性骨髄腫のうち1つまたは複数から選択される血液系障害と関連している。
一部の実施形態では、線維性状態は、全身性である。一部の実施形態では、線維性状態は、全身性硬化症(例えば、限局性全身性硬化症、びまん性全身性硬化症または強皮症を伴わない全身性硬化症)、腎性全身性線維症、嚢胞性線維症、慢性移植片対宿主病またはアテローム性動脈硬化症である。
一部の実施形態では、線維性および/または炎症性状態は、骨髄炎、例えば、慢性骨髄炎である。
一部の実施形態では、本明細書において記載される1種または複数の組成物は、1種または複数の他の治療剤と組み合わせて投与される。例示的治療剤として、それだけには限らないが、抗線維化薬、副腎皮質ステロイド、抗炎症薬、免疫抑制薬、化学療法剤、代謝拮抗薬および免疫調節薬が挙げられる。
本明細書において開示される多特異性分子は、第2の治療剤または手順と組み合わせて使用され得る。
他の実施形態では、多特異性分子は、低または小分子量化学療法剤と組み合わせて投与される。例示的低または小分子量化学療法剤として、それだけには限らないが、13-シス-レチノイン酸(イソトレチノイン、ACCUTANE(登録商標))、2-CdA(2-クロロデオキシアデノシン、クラドリビン、LEUSTATIN(商標))、5-アザシチジン(アザシチジン、VIDAZA(登録商標))、5-フルオロウラシル(5-FU、フルオロウラシル、ADRUCIL(登録商標))、6-メルカプトプリン(6-MP、メルカプトプリン、PURINETHOL(登録商標))、6-TG(6-チオグアニン、チオグアニン、THIOGUANINE TABLOID(登録商標))、アブラキサン(パクリタキセルタンパク質結合型)、アクチノマイシン-D(ダクチノマイシン、COSMEGEN(登録商標))、アリトレチノイン(PANRETIN(登録商標))、オールトランスレチノイン酸(ATRA、トレチノイン、VESANOID(登録商標))、アルトレタミン(ヘキサメチルメラミン、HMM、HEXALEN(登録商標))、アメトプテリン(メトトレキサート、メトトレキサートナトリウム、MTX、TREXALL(商標)、RHEUMATREX(登録商標))、アミホスチン(ETHYOL(登録商標))、アラビノシルシトシン(Ara-C、シタラビン、CYTOSAR-U(登録商標))、ヒ素三酸化物(TRISENOX(登録商標))、アスパラギナーゼ(エルウィニアL-アスパラギナーゼ、L-アスパラギナーゼ、ELSPAR(登録商標)、KIDROLASE(登録商標))、BCNU(カルムスチン、BiCNU(登録商標))、ベンダムスチン(TREANDA(登録商標))、ベキサロテン(TARGRETIN(登録商標))、ブレオマイシン(BLENOXANE(登録商標))、ブスルファン(BUSULFEX(登録商標)、MYLERAN(登録商標))、カルシウムロイコボリン(シトロボラム因子、フォリン酸、ロイコボリン)、カンプトテシン-11(CPT-11、イリノテカン、CAMPTOSAR(登録商標))、カペシタビン(XELODA(登録商標))、カルボプラチン(PARAPLATIN(登録商標))、カルムスチンウエハー(カルムスチンインプラントを有するプロリフェプロスパン20、GLIADEL(登録商標)ウエハー)、CCI-779(テムシロリムス、TORISEL(登録商標))、CCNU(ロムスチン、CeeNU)、CDDP(シスプラチン、PLATINOL(登録商標)、PLATINOL-AQ(登録商標))、クロラムブシル(ロイケラン)、シクロホスファミド(CYTOXAN(登録商標)、NEOSAR(登録商標))、ダカルバジン(DIC、DTIC、イミダゾールカルボキサミド、DTIC-DOME(登録商標))、ダウノマイシン(ダウノルビシン、塩酸ダウノルビシン、塩酸ルビドマイシン、CERUBIDINE(登録商標))、デシタビン(DACOGEN(登録商標))、デクスラゾキサン(ZINECARD(登録商標))、DHAD(ミトキサントロン、NOVANTRONE(登録商標))、ドセタキセル(TAXOTERE(登録商標))、ドキソルビシン(ADRIAMYCIN(登録商標)、RUBEX(登録商標))、エピルビシン(ELLENCE(商標))、エストラムスチン(EMCYT(登録商標))、エトポシド(VP-16、エトポシドホスフェート、TOPOSAR(登録商標)、VEPESID(登録商標)、ETOPOPHOS(登録商標))、フロクスウリジン(FUDR(登録商標))、フルダラビン(FLUDARA(登録商標))、フルオロウラシル(クリーム)(CARAC(商標)、EFUDEX(登録商標)、FLUOROPLEX(登録商標))、ゲムシタビン(GEMZAR(登録商標))、ヒドロキシ尿素(HYDREA(登録商標)、DROXIA(商標)、MYLOCEL(商標))、イダルビシン(IDAMYCIN(登録商標))、イホスファミド(IFEX(登録商標))、イクサベピロン(IXEMPRA(商標))、LCR(ロイロクリスチン、ビンクリスチン、VCR、ONCOVIN(登録商標)、VINCASAR PFS(登録商標))、L-PAM(L-サルコリシン、メルファラン、フェニルアラニンマスタード、ALKERAN(登録商標))、メクロレタミン(塩酸メクロレタミン、ムスチン、ナイトロジェンマスタード、MUSTARGEN(登録商標))、メスナ(MESNEX(商標))、マイトマイシン(マイトマイシン-C、MTC、MUTAMYCIN(登録商標))、ネララビン(ARRANON(登録商標))、オキサリプラチン(エロキサチン(商標))、パクリタキセル(TAXOL(登録商標)、ONXAL(商標))、ペガスパルガーゼ(PEG-L-アスパラギナーゼ、ONCOSPAR(登録商標))、PEMETREXED(ALIMTA(登録商標))、ペントスタチン(NIPENT(登録商標))、プロカルバジン(MATULANE(登録商標))、ストレプトゾシン(ZANOSAR(登録商標))、テモゾロミド(TEMODAR(登録商標))、テニポシド(VM-26、VUMON(登録商標))、TESPA(チオホスホアミド、チオテパ、TSPA、THIOPLEX(登録商標))、トポテカン(HYCAMTIN(登録商標))、ビンブラスチン(ビンブラスチンスルフェート、ビンカロイコブラスチン、VLB、ALKABAN-AQ(登録商標)、VELBAN(登録商標))、ビノレルビン(ビノレルビンタルトレート、ナベルビン(登録商標))およびボリノスタット(ZOLINZA(登録商標))が挙げられる。
他の実施形態では、本明細書において記載される方法は、多特異性分子と組み合わせた免疫チェックポイント阻害剤の使用を含む。方法は、in vivoで治療プロトコールにおいて使用され得る。
実施例1
多数のαCCR2/αCSF1R二特異性抗体分子の生成
1.プラスミドの構築。
プラスミドをExpi293細胞(Life Technologies A14527)またはExpiCHO細胞(Life Technologies A29127)のいずれかに同時トランスフェクトした。トランスフェクションは、1:1のノブ対ホール重鎖比および3:2の軽鎖対重鎖比を有する多特異性構築物のために1mgの総DNAを使用して実施した。ビオチン化が必要とされた場合、多特異性構築物DNAに加えて1リットル当たり250μgのBirAを添加した。Expi293細胞におけるトランスフェクションは、25,000Daの直鎖状ポリエチレンイミン(PEI、Polysciences Inc 23966)を総DNAと3:1の比で使用して行った。DNAおよびPEIを各々50mLのOptiMem(Life Technologies 31985088)培地に添加し、滅菌濾過した。DNAおよびPEIを10分間組み合わせ、1.8~2.8×106細胞/mLの細胞密度および少なくとも95%の生存率のExpi293細胞に添加した。ExpiCHOトランスフェクションは、製造業者の使用説明書に従って実施した。Expi293細胞は、トランスフェクション後、37℃、8%CO2の加湿インキュベーター中で5~7日間成長させ、ExpiCHO細胞は、32℃、5%CO2で14日間成長させた。細胞を4500×gの遠心分離によってペレット化し、上清を0.2μm膜により濾過した。プロテインA樹脂(GE 17-1279-03)を、濾過した上清に添加し、室温で1~3時間インキュベートした。樹脂をカラムに詰め、3×10カラム容量のダルベッコリン酸緩衝食塩水(DPBS、Life Technologies 14190-144)を用いて洗浄した。結合タンパク質を、20mMクエン酸塩、100mM NaCl、pH2.9を用いてカラムから溶出した。必要な場合、タンパク質を、泳動用緩衝液としてDPBSを含むSuperdex200カラムでのリガンド親和性および/またはサイズ排除クロマトグラフィーを使用してさらに精製した。
mCCR2のみ、mCSF1Rのみ、またはmCCR2およびmCSF1Rの両方を発現する細胞へのUniTI-01結合
本実施例および次の少数の実施例では、表7で示される多特異性分子#1(UniTI-01とも称される)を特徴付けた。UniTI-01は抗CCR2/抗CSF1R二特異性抗体である。UniTI-01の可変領域および全長配列もまた表11で提供される。少数の実施例では、二特異性抗体UniTI-01を、抗CCR2二価単一特異性抗体または抗CSF1R二価単一特異性抗体に対して比較した。
UniTI-01はin vitroで骨髄系由来単球のMCP1誘導遊走を阻害する
マウス骨髄系細胞を健康なBalb/cマウスの大腿骨から単離し、mCSF1の存在下で4日間単球に分化させた。単球分化を、造血細胞上でのCCR2およびCSF1R発現のフローサイトメトリーによる分析によって評価した。分化細胞を計数し、それぞれ、異なる濃度のアイソタイプ(mIgG2a)、抗CCR2およびUniTI-01を用いて37℃で30分間培養した。その後、抗体処理細胞を、下部チャンバーにMCP1(CCL2)を含有するトランズウェル挿入プレートの上部チャンバーに添加した。MCP1誘導遊走を、トランズウェルプレートの下部チャンバーから培地を収集した後に評価し、細胞数の計算をフローサイトメトリーによる分析によって実施した。
UniTI-01はin vitroで骨髄系由来マクロファージのmCSF-1依存増殖を阻害する
マウス骨髄系細胞を健康なBalb/cマウスの大腿骨から単離し、mCSF1の存在下で4日間単球に分化させた。フローサイトメトリー分析は、骨髄系細胞が0日目にCCR2を明らかには発現しなかったことを示した(図3A;左のパネル)。しかしながら、mCSF1の存在下での細胞培養の4日後、著しい部分の骨髄系細胞が、CCR2およびCSF1R発現を示す単球に分化した(図3A;右のパネル)。単球を計数し、mCSF1の存在下で96ウェルプレートにプレーティングした。UniTI-01、抗CSF1RまたはmIgG2a抗体を、mCSF1を含有する細胞に添加した。37℃でのインキュベーションの72時間後、細胞増殖代謝活性を、MTTアッセイキットのための製造業者のプロトコールに従って、OD570での比色読取りによって評価した。
UniTI-01はin vitroでmCSF-1依存骨髄系由来単球分化を阻害しない
骨髄系細胞をナイーブ(非腫瘍保有)Balb/cマウスの大腿骨および脛骨の両方から摘出した。UniTI-01、抗CSF1RまたはmIgG2抗体を、新たに単離した骨髄系細胞と共に37℃で30分間プレインキュベートした後に、mCSF-1の添加を行い、単球分化を可能にした。37℃でのインキュベーションの4日後、細胞を、分化単球を同定するフローサイトメトリー染色のために収集した。細胞を、蛍光標識抗体を用いて4℃で15分間染色し、続いてフローサイトメトリー分析を行った。単球を、生細胞、CD45+細胞、CD11b+細胞、Ly6C+細胞、Ly6G-細胞としてゲーティングする。
UniTI-01はin vitroで初代腫瘍内M-MDSCおよびM2様マクロファージに特異的に結合する
B6アルビノマウスにおいて成長させたLLC腫瘍を、500~800mm3の体積で回収し、リベラーゼDL+Dnase Iを37℃で30分間、続いて解離プログラムm_imptumor_01をGentleMacs上で使用して解離させた。単一細胞懸濁液を70μm濾過器により濾過し、総細胞を、蛍光標識した抗体を用いて染色した。この結合研究のために、100μgのUniTI-01を、Alexa Fluor647抗体標識キット(ThermoFisher Scientific)を使用して標識し、標識した抗体の濃度をNanodropによって決定し、示された段階希釈液(5uM、1uM、0.1uM、0.01uM)をFacs緩衝液中で作製した。M-MDSCを、生CD45+CD11b+Ly6ChighLy6G-によってゲーティングし、M2マクロファージを、生CD45+CD11b+F4/80+CD206+によってゲーティングし、CD3+T細胞を、生CD45+CD3+によってゲーティングし、好中球を、生CD45+CD11b+Ly6G+によってゲーティングした。細胞を氷上、暗所で15分間染色し、生存率のためにzombie violetを用いて染色し、サイトメーター上で直ちに捉えた。
UniTI-01のM2マクロファージおよびM-MDSCへの濃度依存結合は図5で示される。
UniTI-01はin vivoでいくつかのマウスモデルにおける抑制性骨髄性細胞を枯渇させる
マウスにMC38結腸がん細胞系(B6アルビノマウス)またはEMT6乳がん細胞系(BALB/cマウス)のいずれかを注射し、腫瘍が150~200mm3の体積に達したら、同種マウスを無作為化して2つの群に群分けした。一方の群は、1、4、7および10日目にip経路を介して20mg/kgの用量の20mg/kg UniTI-01の処置を受け、他方は、同じ予定でPBS(ビヒクル)を受けた。4回目の用量の24時間後、腫瘍をフローサイトメトリー分析のために回収した。腫瘍を約2mm片に細断し、リベラーゼ+dnase Iを37℃で30分間用い、続いて1分間腫瘍混和プログラムをgentleMACs上で使用して解離させた。単一細胞懸濁液を、70μMフィルターにより濾過することによって作製し、計数した。次いで、細胞をフローサイトメトリー分析のために染色した。TAMを、生CD45+CD11b+Ly6G-Ly6C-F4/80+によってゲーティングし、M-MDSCを、生CD45+CD11b+Ly6G-Ly6Chighによってゲーティングした。各点は単一のマウスを表す。エラーバーは個々のマウスの平均および標準誤差を表す。統計量を、スチューデントのt検定を使用して算出した。
UniTI-01は腫瘍関連マクロファージを枯渇させるが、健康な組織マクロファージを存続させる
Balb/cマウスにEMT6同系乳房細胞系を注射し、腫瘍が150~200mm3の体積に達したら、無作為化して3つの群に群分けした。1、4、7および10日目に、1つの群はip経路を介して20mg/kgの用量の20mg/kg UniTI-01の処置を受け、第2の群は10mg/kg抗CSF1R抗体の処置を受け、第3の群はPBSを受けた。4回目の用量の24時間後、マウスを屠殺し、腫瘍および肝臓を回収してホルマリン固定パラフィン包埋した。肝臓および腫瘍におけるマクロファージ集団を検出するために、組織切片を、F4/80抗体(Cell Signaling)を用いて免疫組織化学染色し、Envisionシステムによって検出した。腫瘍または肝臓切片1つ当たりおよそ10の目的の領域をImageJソフトウェアによって分析した。
UniTI-01はin vitroでCCR2陰性NFS-60細胞におけるCSF-1依存細胞生存を阻害しない
CCR2陰性、CSF1R陽性NFS-60細胞を、UniTI-01、一価単一特異性抗CSF1R抗体、二価単一特異性抗CSF1R抗体またはmIgG2抗体の存在下のフェノールレッド不含培地中37℃で30分間培養し、続いて細胞生存のためにmCSF-1の添加を行った。37℃でのインキュベーションの48時間後、細胞生存率代謝活性を、MTTアッセイキットのための製造業者のプロトコールに従って、OD570での比色読取りによって評価した。
UniTI-01はin vivoでEMT6腫瘍へのCD8+T細胞浸潤を促進する
Balb/cマウスにEMT6同系乳房細胞系を注射し、腫瘍が150~200mm3の体積に達したら、無作為化して3つの群に群分けした。1、4、7および10日目に、1つの群はip経路を介して20mg/kgの用量の20mg/kg UniTI-01の処置を受け、第2の群は10mg/kg抗PD-L1の処置を受け、第3の群はPBSを受けた。4回目の用量の24時間後、マウスを屠殺し、腫瘍をフローサイトメトリー分析のために回収した。腫瘍を約2mm片に細断し、リベラーゼ+dnase Iを37℃で30分間用い、続いて1分間腫瘍混和プログラムをgentleMACS上で使用して解離させた。単一細胞懸濁液を、70μMフィルターにより濾過することによって作製し、計数した。次いで、細胞をフローサイトメトリー分析のために染色した。CD8T細胞を、CD45およびCD3を発現した生CD8細胞に対する染色によってゲーティングした。各点は単一のマウス腫瘍を表す。エラーバーは個々のマウスの平均および標準誤差を表す。統計量を、一元配置分散分析を使用して算出した。
実施例11
UniTI-01はin vivoでEMT6腫瘍におけるTreg頻度を低減し、CD8T細胞/Treg比を増大する
B6アルビノマウスにMC38同系結腸細胞系を注射し、腫瘍が150~200mm3の体積に達したら、無作為化して3つの群に群分けした。1、4、7および10日目に、1つの群はip経路を介して20mg/kgの用量の20mg/kg UniTI-01の処置を受け、第2の群は10mg/kg抗PD-L1の処置を受け、第3の群はPBSを受けた。4回目の用量の24時間後、マウスを屠殺し、腫瘍をフローサイトメトリーによる免疫プロファイリングのために回収した。腫瘍を約2mm片に細断し、リベラーゼ+dnase Iを37℃で30分間用い、続いて1分間腫瘍混和プログラムをgentleMACs上で使用して解離させた。単一細胞懸濁液を、70μMフィルターにより濾過することによって作製し、計数した。次いで、細胞をフローサイトメトリー分析のために染色した。制御性T細胞を、生CD4+Foxp3+T細胞に対するゲーティングによって分析した。加えて、CD8T細胞を、CD45およびCD3を発現した生CD8細胞に対する染色によってゲーティングした。各点は単一のマウス腫瘍を表す。エラーバーは個々のマウスの平均および標準誤差を表す。統計量を、一元配置分散分析を使用して算出した。
UniTI-01は、抗PD-L1抗体と組み合わせて使用した場合、抗腫瘍有効性、腫瘍縮小および向上した生存を示す
抗PD-L1抗体と組み合わせたUniTI-01の腫瘍成長阻害を皮下マウス同系EMT6乳がんモデルにおいて試験した。約8週齢雌BALB/c(Jackson Labs)を、研究の開始前に3日間馴化させた。マウスをケージ1つにつき5匹収容し、使い捨てケージをInnovive IVCマウスラックに入れた。マウス病原体を含まないことが以前に試験されたEMT6細胞(マウスCLEARパネル、Charles River Labs)を、0日目に0.5×106個の密度でBALB/cマウスの右側腹部に皮下移植した。腫瘍を、デジタルノギスを使用して週に2回二次元で測定および記録した。腫瘍体積(mm3)を、幅×幅×長さ×0.52の式を使用して算出した。移植後7日目の腫瘍体積測定後、マウスを無作為化して、77mm3の平均腫瘍体積に従って4つの群に群分けした。1つの群はPBSを用いて処置し、第2の群は10mg/kgの用量の抗PD-L1抗体を用いて処置し、第3の群は20mg/kgの用量のUniTI-01を用いて処置し、第4の群は抗PD-L1抗体およびUniTI-01の組合せを用いて処置した。すべての処置はip経路を介し、予定は週に2回、最大4週間の投薬であった。すべての薬剤はPBS中で新たに製剤化した後に投薬した。腫瘍体積測定は最大80日継続した。腫瘍体積データは平均±SEMとしてプロットする。加えて、生存を2000mm3のTVという研究のエンドポイントに達するまでの時間に基づいて記録し、カプラン・マイヤー曲線としてプロットする。統計量をログランク検定によって決定し、p値をプロットする。
MC38結腸マウスモデルを使用した別個の研究では、UniTI-01は抗CSF1R抗体よりも優れた抗PD-L1併用利益を示す(図11C)。
UniTI-01は、抗CSF1R処置と比べた場合、破骨細胞を存続させる
次の研究は、M-CSFおよびRANKLを有するマウス骨髄系細胞からの破骨細胞の6日間のin vitro分化と、それに続く固定およびTRAP染色とに関する。図14で示されるように、UniTI-01は、抗CSF1R二価単一特異性抗体と比較した場合、破骨細胞を存続させる。
UniTI-01は腫瘍においてM-MDSCおよびTAMの枯渇を駆動する
この研究では、EMT6、MC38またはLLC1腫瘍を保有するマウスは、抗PD-L1二価単一特異性抗体、抗CSF1R二価単一特異性抗体、抗CCR2二価単一特異性抗体またはUniTI-01を受けた。腫瘍1mg当たりのM-MDSC(図15A)またはTAM(図15B)の量を、フローサイトメトリー分析を使用して測定した。図15Aおよび15Bで示されるように、UniTI-01は、EMT6、MC38およびLLC1腫瘍においてM-MDSCおよびTAMの枯渇を駆動する。
UniTI-01は健康な組織よりもむしろ腫瘍内のマクロファージに優先的に結合する
この研究では、LLC1腫瘍を保有するマウスはUniTI-01処置を受けた。UniTI-01処置の24時間後、腫瘍、腸、腎臓、脾臓または肝臓からの組織を、抗ラットIgG抗体(UniTI-01を検出するため)ならびに抗F4/80抗体(マクロファージおよび単球を検出するため)を使用して免疫組織化学によって分析した。図16で示されるように、腫瘍保有マウスに投与されたUniTI-01は、腫瘍内のマクロファージに優先的に結合する。豊富なF4/80+細胞にもかかわらず、腸においても、腎臓においても、肝臓においても、脾臓においても、検出可能な抗ラットIgG抗体染色は存在しなかった。
EMT6腫瘍移植マウスにおけるUniTI-01の体内分布
VivoTag800蛍光色素標識UniTI-01をEMT6腫瘍移植マウスへ投与し、蛍光イメージング(未処理臓器蛍光に対して正規化したシグナル)によって検出した。投与の6時間、24時間または72時間後のUniTI-01の体内分布は図17で示される。
卵巣がん患者におけるM-MDSC細胞上でのCSF-1RおよびCCR2発現
腫瘍組織を4名の卵巣腫瘍患者から摘出し、CSF1RおよびCCR2発現に関して分析した。図18で示されるように、腫瘍M-MDSCはCSF1RおよびCCR2の共染色を示すが、腫瘍G-MDSCは示さない。CSF-1RおよびCCR2共発現はCD163+TAM上でも検出された(データは示していない)。
UniTI-01は腫瘍へのT細胞浸潤を増大する
この研究では、EMT6腫瘍を保有するマウスは、抗CSF1R二価単一特異性抗体、抗CCR2二価単一特異性抗体またはUniTI-01を受けた。腫瘍組織を、抗CD3抗体を使用して染色し、CD3陽性面積%を定量した。図19Aおよび19Bで示されるように、抗CSF1R二価単一特異性抗体と比較して、UniTI-01はEMT6腫瘍へのT細胞浸潤を増大する。
追加の免疫組織化学分析は、UniTI-01がEMT6、MC38およびLLC1腫瘍におけるCD8+T細胞/Treg比を増大することを明らかにする(図20)。
抗PD-L1抗体と組み合わせたUniTI-01を試験する追加のin vivo研究
いくつかのin vivo研究を行って、抗PD-L1抗体と組み合わせて使用したUniTI-01の効果を分析した。抗PD-L1抗体を単剤として使用することと比較して、UniTI-01および抗PD-L1抗体を組み合わせることは、単球系骨髄系由来サプレッサー細胞および腫瘍関連マクロファージの量を低減する(図22A)。
UniTI-102の特性分析
UniTI-01を、ヒトTGFβ R2/R2二量体を重鎖のC末端と融合させることによって改変した(図12Bおよび図26A)。この改変構築物をUniTI-102と命名する。初めに、UniTI-102のTGFβを中和する能力を試験した。図26Bで示されるように、UniTI-102はTGFβ/Smad活性化を効果的に中和するが、UniTI-01は中和しない。
抗CSF1R半アームFabの精製
2種のヒト抗ヒトCSF1R抗体BI117およびBI123を、酵母ディスプレイを使用して最適化した。抗体BI117は、表15で開示される配列番号323のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域(VH)と、配列番号341のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む。抗体BI123は、表15で開示される配列番号337のアミノ酸配列を含むVHと、配列番号342のアミノ酸配列を含むVLとを含む。酵母ディスプレイを使用した親和性成熟は、BI117のHCDR2およびHCDR3に改変を導入し、BI117のVHのバリアント(表15で示される配列番号324~336)を生成した。同様に、BI123のHCDR2およびHCDR3もまた突然変異させ、BI123のVHのバリアント(表15で示される配列番号338~340)を生じさせた。
精製抗CSF1R抗体のELISA結合
マイクロプレートを、100μL中2μg/mLのヒトまたはカニクイザルCSF1Rを用いて別個にコーティングし、2%BSAを用いてブロッキングした。未標識一価ヒト抗体の段階希釈液(11段階、3倍希釈、400nM~6.8pM)を、コーティングかつブロッキングしたプレートに75μL/ウェルで移し、室温で1時間インキュベートした。プレートを3回洗浄し、抗ヒトFc西洋ワサビペルオキシダーゼコンジュゲートと共に30分間インキュベートし、続いてHRPの基質であるTMBの添加を行った。プレートを5分間発色させ、1M HCLを用いて停止し、450nmの波長で読み取った。
精製抗ヒトCSF1R抗体の機能活性
損なわれていないCD14陽性ヒト単球を、磁気ビーズ分離を使用して、新たに単離したPBMCの負の選択から精製した。単球を、抗CSF1R遮断抗体およびhCSF-1の存在下の96ウェルプレート中37℃で24時間培養した。細胞培養上清を、CCL2(MCP-1)分泌を測定するために回収した。単球単独は、最小のMCP-1分泌として役立った。hCSF-1の存在下の単球は、最大のMCP-1分泌として役立った。MCP-1を、電気化学発光(Mesoscale Discovery)を使用して測定した。
精製抗CSF1R抗体の細胞結合
HEK-293T細胞にヒトCSF1Rをレンチウイルスにより形質導入し、安定細胞系を生成した。ほぼすべての形質導入した細胞は、高レベルのCSF1Rを発現した。細胞を、0.5%BSAおよび0.1%アジ化ナトリウムを含有するPBS(染色緩衝液)を用いて洗浄し、96ウェルV底プレートに100,000細胞/ウェルで添加した。ヒト抗CSF1R一価抗体を2.5倍の段階希釈で細胞に添加し、室温で2時間インキュベートした。プレートを、染色緩衝液を用いて2回洗浄した。APCにコンジュゲートしたヒトFcに対する二次抗体を1:200の希釈率(1.5mg/mlの原液)で添加し、細胞と共に4℃で1時間インキュベートし、続いて染色緩衝液を用いて洗浄した。その後、細胞を、生/死色素を用いて染色してあらゆる瀕死の細胞を排除し、4%パラホルムアルデヒドを用いて室温で10分間固定した。プレートをCytoFLEX LS(Beckman Coulter)上で読み取った。データを、APC陽性集団パーセントとして算出した。
図31で示されるように、試験したすべての抗CSF1R一価抗体は、ヒトCSF1Rを発現する細胞と結合することを示した。
選択二特異性CCR2×CSF1Rカッパ/ラムダ抗体の発現および精製
抗CCR2/抗CSF1R(「CCR2×CSF1R」)二特異性抗体BIM0204、BIM0205、BIM0206、BIM0207、BIM0208、BIM0209、BIM0210およびBIM0211を、下記のように生成した。これらの抗体の全長配列情報は表28で開示される。簡潔に述べると、これらの抗体は、抗CCR2アーム(表28においてHC1およびLC1と称される)ならびに抗CSF1Rアーム(表28においてHC2およびLC2と称される)を含む。これらの二特異性抗体に含有されるVH/VL対は、表32で要約される。抗CCR2結合アームは、カッパ軽鎖を含み、抗CSF1R結合アームは、ラムダ軽鎖を含む。
二特異性CCR2×CSF1R抗体の機能活性
Tango-CCR2 bla2 U2OS細胞(Invitrogen)は、リガンドCCL2に応答してベータ-ラクタマーゼレポーター遺伝子によって駆動される青色シグナル(460nmにおける)を発光するヒトCCR2を発現する。レポーター細胞を、CCL2の存在下の96ウェルプレート中37℃で16時間培養した後に、BLA基質の添加を行った。CCL2の非存在下では、基質の添加は緑色発光(約530nmにおける)をもたらす。
TGFβトラップを使用したTGFβシグナル伝達の阻害
この研究は、3種のTGFβトラップ構築物を、TGFβシグナル伝達を阻害する能力に関して検討する。図36で示される第1の構築物「単一TGFβ Fabトラップ」は2つの鎖を含み:第1の鎖は、N末端からC末端に向かって、第1のTGFBR2 ECD、第1のリンカーおよび重鎖定常領域1(CH1)を含み;第2の鎖は、N末端からC末端に向かって、第2のTGFBR2 ECD、第2のリンカーおよび軽鎖定常領域(CL)を含む。この構築物はいかなる標的ドメインも含まない。図36で示される第2の構築物「抗PD-L1×TGFβトラップ」は、2つのFc領域のC末端でTGFBR2 ECDホモ二量体と融合した抗PD-L1抗体を含む。図36で示される第3の構築物「UniTI-102(抗CCR2×抗CSF1R×TGFβトラップ)」は、2つのFc領域のC末端でTGFBR2 ECDホモ二量体と融合した抗CCR2×抗CSF1R二特異性抗体を含む。加えて、TGFβトラップを有しない抗CCR2×抗CSF1R二特異性抗体である、図36における第4の構築物「UniTI-01(抗CCR2×抗CSF1R)」を陰性対照として使用した。
UniTI-102構築物の特性分析
一部の実施形態では、図12Jまたは39Fで示される構成を有する多特異性分子が本明細書で提供される。一部の実施形態では、多特異性分子は、抗CSF1R結合部分(例えば、scFvとして)、抗CCR2結合部分(例えば、Fabとして)、およびFc領域のC末端と融合したTGFβトラップ(例えば、TGFβRIIホモ二量体)を含む。そのような分子はUniTI-102と称される。理論に拘束されるものではないが、UniTI-102は、CSF1R+CCR2+Mo-MDSCおよびTAMに優先的に結合すると同時に阻害機能を発揮し;新規MDSCおよびTAMの動員を妨げ;局所分泌されたTGFβを中和し間質を初期化して、T細胞浸潤を可能にし;かつ/または浸潤T細胞およびNK細胞の細胞傷害性機能を回復し得る。
BIM0648およびBIM0652の両方は、TGFβ誘導SMAD依存レポーター活性を阻害した(図40A)。
本明細書で言及されたすべての刊行物および特許は、個々の各刊行物または特許が参照により組み込まれることが具体的かつ個別的に指示されるように、それらの全体がこれにより参照により本明細書に組み込まれる。
[1](i)抗CSF1R結合部分(例えば、抗CSF1R抗体分子);
(ii)抗CCR2結合部分(例えば、抗CCR2抗体分子);および
(iii)TGF-ベータ阻害剤
を含む多特異性分子。
[2]以下の特性:
(i)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図1について実施例2で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、CSF1R陽性、CCR2陰性細胞、またはCSF1R陰性、CCR2陽性細胞と比較して、CSF1R陽性、CCR2陽性細胞に優先的に結合し、例えば、前記多特異性分子の前記CSF1R陽性、CCR2陽性細胞への結合が、前記多特異性分子の前記CSF1R陽性、CCR2陰性細胞、または前記CSF1R陰性、CCR2陽性細胞への結合よりも少なくとも2、4、6、8、10、15、20または25倍強い;
(ii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図1について実施例2で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、CSF1R陽性、CCR2陰性細胞と比較して、CSF1R陽性、CCR2陽性細胞に優先的に結合し、例えば、前記多特異性分子のCSF1R陽性、CCR2陽性細胞への結合についてのEC50が、前記多特異性分子のCSF1R陽性、CCR2陰性細胞への結合についてのEC50の60、50、40、30、20または10%以下である;
(iii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図1について実施例2で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、CSF1R陰性、CCR2陽性細胞と比較して、CSF1R陽性、CCR2陽性細胞に優先的に結合し、例えば、前記多特異性分子のCSF1R陽性、CCR2陽性細胞への結合についてのEC50が、前記多特異性分子のCSF1R陰性、CCR2陽性細胞への結合についてのEC50の50、40、30、20、10または5%以下である;
(iv)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図5について実施例6で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、T細胞、NK細胞、好中球、組織常在性マクロファージ(例えば、クッパー細胞)またはランゲルハンス細胞と比較して、腫瘍関連マクロファージ(TAM)または骨髄系由来サプレッサー細胞(MDSC)に優先的に結合し、例えば、前記多特異性分子のTAMまたはMDSCへの結合が、前記多特異性分子のT細胞、NK細胞、好中球、組織常在性マクロファージ(例えば、クッパー細胞)またはランゲルハンス細胞への結合よりも少なくとも2、4、6、8、10、15、20または25倍強い;
(v)例えば、トランズウェルプレート遊走アッセイを使用して測定したとき、例えば、図2について実施例3で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、単球遊走、例えば単球走化性タンパク質1(MCP1)誘導単球遊走を阻害し、例えば、MCP1誘導単球遊走を少なくとも40、50、60または70%低減する;
(vi)例えば、細胞増殖MTTアッセイを使用して測定したとき、例えば、図3Bについて実施例4で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、マクロファージ、例えば、骨髄系由来マクロファージの増殖、例えば、骨髄系由来マクロファージのCSF-1誘導増殖を阻害し、例えば、骨髄系由来マクロファージのCSF-1誘導増殖を少なくとも50、60、70または80%低減する;
(vii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図4について実施例5で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、単球、例えば、骨髄系由来単球の分化、例えば、骨髄系由来単球のCSF-1誘導分化を阻害しないか、または実質的に阻害せず、例えば、骨髄系由来単球のCSF-1誘導分化を2、4、6、8または10%以下しか低減しない;
(viii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図6について実施例7で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、in vivoで、抑制性骨髄性細胞、例えば、TAMまたはMDSCを枯渇させ、例えば、抑制性骨髄性細胞、例えば、TAMまたはMDSCの数を少なくとも80、85、90、95、99または99.5%低減する;
(ix)例えば、免疫組織化学分析を使用して測定したとき、例えば、図7Bおよび7Dについて実施例8で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、in vivoで、組織常在性マクロファージ、例えば、クッパー細胞を枯渇させないか、または実質的に枯渇させず、例えば、組織常在性マクロファージ、例えば、クッパー細胞の数を4、6、8、10または15%以下しか低減しない;
(x)例えば、フローサイトメトリー分析または免疫組織化学分析を使用して測定したとき、例えば、図21について説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、TAM上でのCD86またはMHCクラスII発現を増大する;
(xi)例えば、細胞生存率MTTアッセイを使用して測定したとき、例えば、図8Aについて実施例9で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、CSF1R陽性、CCR2陰性細胞のCSF-1依存細胞生存を阻害しないか、または実質的に阻害せず、例えば、CSF1R陽性、CCR2陰性細胞のCSF-1依存細胞生存を5、10または15%以下しか低減しない;
(xii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図9について実施例10で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、in vivoでCD8+T細胞腫瘍浸潤を増大し、例えば、腫瘍におけるCD3+T細胞中のCD8+T細胞%を少なくとも1.5、2または2.5倍増大する;
(xiii)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図10Aについて実施例11で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、in vivoで腫瘍におけるTreg頻度を低減し、例えば、腫瘍におけるTreg頻度を少なくとも15、20、25または30%低減する;
(xiv)例えば、フローサイトメトリー分析を使用して測定したとき、例えば、図10Bについて実施例11で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、in vivoで腫瘍におけるCD8+T細胞/Treg比を増大し、例えば、腫瘍におけるCD8+T細胞/Treg比を少なくとも2.5、3、3.5、4または4.5倍増大する;
(xv)例えば、図11Aおよび11Bについて実施例12、または図23について実施例19で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、腫瘍成長を低減し、腫瘍保有動物の生存を増大し、かつ/または抗腫瘍免疫メモリーを向上させる;
(xvi)例えば、図39Bおよび39Dについて実施例28で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、中間単球または非古典的単球と比較して、古典的単球に優先的に結合する;または
(xvii)例えば、図40A~40Fについて実施例28で説明される方法を使用して測定したとき、前記多特異性分子が、TGFβの活性を、例えば、少なくとも30、40、50、60、70、80または90%低減する
のうちの1つまたは複数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16個またはそれよりも多く)を有する、[1]に記載の多特異性分子。
[3]前記抗CSF1R結合部分が、重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2およびHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2およびLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、前記HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3が、それぞれ、配列番号402、474、475、432、434および436のアミノ酸配列を含む、[1]または[2]に記載の多特異性分子。
[4]前記HCDR1、HCDR2およびHCDR3が、それぞれ、配列番号402、476および477のアミノ酸配列を含む、[3]に記載の多特異性分子。
[5]前記HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3が、
それぞれ、配列番号402、405、413、432、434および436、
それぞれ、配列番号402、404、413、432、434および436、
それぞれ、配列番号402、406、413、432、434および436、
それぞれ、配列番号402、404、414、432、434および436、
それぞれ、配列番号402、407、413、432、434および436、
それぞれ、配列番号402、404、415、432、434および436、
それぞれ、配列番号402、408、413、432、434および436、
それぞれ、配列番号402、404、416、432、434および436、
それぞれ、配列番号402、404、417、432、434および436、
それぞれ、配列番号402、409、413、432、434および436、
それぞれ、配列番号402、404、418、432、434および436、
それぞれ、配列番号402、404、419、432、434および436、
それぞれ、配列番号402、404、420、432、434および436、または
それぞれ、配列番号402、404、421、432、434および436
のアミノ酸配列を含む、[3]または[4]に記載の多特異性分子。
[6]前記VHが、配列番号323~336のいずれかのアミノ酸配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、任意選択により、前記VHが、配列番号324のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、[3]~[5]のいずれかに記載の多特異性分子。
[7]前記VHが、配列番号129のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、[3]~[6]のいずれかに記載の多特異性分子。
[8]前記VLが、配列番号341のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、[3]~[7]のいずれかに記載の多特異性分子。
[9]前記VLが、配列番号130のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、[3]~[8]のいずれかに記載の多特異性分子。
[10]前記VHおよびVLが、
それぞれ、配列番号324および341、
それぞれ、配列番号323および341、
それぞれ、配列番号325および341、
それぞれ、配列番号326および341、
それぞれ、配列番号327および341、
それぞれ、配列番号328および341、
それぞれ、配列番号329および341、
それぞれ、配列番号330および341、
それぞれ、配列番号331および341、
それぞれ、配列番号332および341、
それぞれ、配列番号333および341、
それぞれ、配列番号334および341、
それぞれ、配列番号335および341、または
それぞれ、配列番号336および341
のアミノ酸配列を含む、[3]~[9]のいずれかに記載の多特異性分子。
[11]配列番号127のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、[3]~10]のいずれかに記載の多特異性分子。
[12]配列番号128のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、[3]~[11]のいずれかに記載の多特異性分子。
[13]前記抗CSF1R結合部分が、重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2およびHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2およびLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、前記HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3が、それぞれ、配列番号403、478、479、433、435および437のアミノ酸配列を含む、[1]または[2]に記載の多特異性分子。
[14]前記HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3が、
それぞれ、配列番号403、411、422、433、435および437、
それぞれ、配列番号403、410、422、433、435および437、
それぞれ、配列番号403、410、423、433、435および437、または
それぞれ、配列番号403、412、422、433、435および437
のアミノ酸配列を含む、[13]に記載の多特異性分子。
[15]前記VHが、配列番号337~340のいずれかのアミノ酸配列、またはそれと少なくとも90、92、94、96、98もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、任意選択により、前記VHが、配列番号339のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、[13]または[14]に記載の多特異性分子。
[16]前記VHが、配列番号138のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、[13]~[15]のいずれかに記載の多特異性分子。
[17]前記VLが、配列番号139もしくは342のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも90、92、94、96、98もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、任意選択により、前記VLが、配列番号139のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、[13]~[16]のいずれかに記載の多特異性分子。
[18]前記VLが、配列番号140のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、[13]~[17]のいずれかに記載の多特異性分子。
[19]前記VHおよびVLが、
それぞれ、配列番号339および139、
それぞれ、配列番号337および342、
それぞれ、配列番号338および342、
それぞれ、配列番号339および342、または
それぞれ、配列番号340および342
のアミノ酸配列を含む、[13]~[18]のいずれかに記載の多特異性分子。
[20]配列番号136のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、[13]~[19]のいずれかに記載の多特異性分子。
[21]配列番号137のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、[13]~[20]のいずれかに記載の多特異性分子。
[22]前記抗CCR2結合部分が、重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2およびHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2およびLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、前記HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3が、それぞれ、配列番号446、447、448、454、455および456のアミノ酸配列を含む、[1]~[21]のいずれかに記載の多特異性分子。
[23]前記VHが、配列番号480のアミノ酸配列を含まず、かつ/または前記VLが、配列番号481のアミノ酸配列を含まない、[1]~[22]のいずれかに記載の多特異性分子。
[24]前記VHが、配列番号343もしくは344のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも90、92、94、96、98もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、任意選択により、前記VHが、配列番号343のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも90、92、94、96、98もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、[1]~[23]のいずれかに記載の多特異性分子。
[25]前記VHが、配列番号133のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、[1]~[24]のいずれかに記載の多特異性分子。
[26]前記VLが、配列番号345のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも90、92、94、96、98もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、[1]~[25]のいずれかに記載の多特異性分子。
[27]前記VLが、配列番号272のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、[1]~[26]のいずれかに記載の多特異性分子。
[28]前記VHおよびVLが、
それぞれ、配列番号343および345、または
それぞれ、配列番号344および345
のアミノ酸配列を含む、[1]~[27]のいずれかに記載の多特異性分子。
[29]配列番号131のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは9
5%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、[1]~[28]のいずれかに記載の多特異性分子。
[30]配列番号132のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、[1]~[29]のいずれかに記載の多特異性分子。
[31]配列番号373のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、[1]~[30]のいずれかに記載の多特異性分子。
[32]配列番号134のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも80、85、90もしくは95%の同一性を有するヌクレオチド配列によってコードされるアミノ酸配列を含む、[1]~31]のいずれかに記載の多特異性分子。
[33]配列番号127のアミノ酸配列、配列番号131のアミノ酸配列、配列番号373のアミノ酸配列を含む、[1]~[32]のいずれかに記載の多特異性分子。
[34]配列番号136のアミノ酸配列、配列番号131のアミノ酸配列、配列番号373のアミノ酸配列を含む、[1]~[32]のいずれかに記載の多特異性分子。
[35](i)前記抗CSF1R抗体分子が、CSF1Rに一価性で結合し、かつ/または
(ii)前記抗CCR2抗体分子が、CCR2に一価性で結合し、
任意選択により、前記多特異性分子が、CSF1Rに一価性で結合し、かつCCR2に一価性で結合する、
[1]~[34]のいずれかに記載の多特異性分子。
[36](i)前記多特異性分子が、CCR2の存在下でCSF1Rを阻害し、任意選択により、細胞が、細胞表面上でCSF1RおよびCCR2の両方を発現する場合、前記多特異性分子が、前記細胞においてCSF1Rの活性(例えば、CSF1Rシグナル伝達、例えば、CSF-1誘導CSF1Rシグナル伝達)を、例えば、少なくとも40、50、60、70、80もしくは90%低減し、かつ/または
(ii)前記多特異性分子が、CCR2の非存在下でCSF1Rを阻害しないか、または実質的に阻害せず、任意選択により、細胞が、細胞表面上でCSF1Rを発現するが、CCR2を発現しない場合、前記多特異性分子が、CSF1Rの活性(例えば、CSF1Rシグナル伝達、例えば、CSF-1誘導CSF1Rシグナル伝達)を低減しないか、またはCSF1Rの活性を2、4、6、8、10もしくは15%以下しか低減しない、
[1]~[35]のいずれかに記載の多特異性分子。
[37](i)前記多特異性分子が、CSF1Rの存在下でCCR2を阻害し、任意選択により、細胞が、細胞表面上でCCR2およびCSF1Rの両方を発現する場合、前記多特異性分子が、前記細胞においてCCR2の活性を、例えば、少なくとも40、50、60、70、80もしくは90%低減し、かつ/または
(ii)前記多特異性分子が、CSF1Rの非存在下でCCR2を阻害しないか、または実質的に阻害せず、任意選択により、細胞が、細胞表面上でCCR2を発現するが、CSF1Rを発現しない場合、前記多特異性分子が、CCR2の活性を低減しないか、またはCCR2の活性を2、4、6、8、10もしくは15%以下しか低減しない、
[1]~[36]のいずれかに記載の多特異性分子。
[38]例えば、図26Bについて実施例20で説明される方法を使用して測定したとき、前記
TGF-ベータ阻害剤が、TGF-ベータ1、TGF-ベータ2、TGF-ベータ3、TGF-ベータ1およびTGF-ベータ3の両方、またはTGF-ベータ1、TGF-ベータ2およびTGF-ベータ3を阻害する、[1]~[37]のいずれかに記載の多特異性分子。
[39]前記TGF-ベータ阻害剤が、TGF-ベータ受容体ポリペプチド(例えば、TGF-ベータ受容体の細胞外ドメイン、またはその機能的バリアント)を含む、[1]~[38]のいずれかに記載の多特異性分子。
[40]前記TGF-ベータ阻害剤が、TGFBR1ポリペプチド(例えば、TGFBR1ポリペプチドのうちの1、2、3つまたはそれよりも多く)、TGFBR2ポリペプチド(例えば、TGFBR2ポリペプチドのうちの1、2、3つまたはそれよりも多く)またはTGFBR3ポリペプチド(例えば、TGFBR3ポリペプチドのうちの1、2、3つまたはそれよりも多く)のうちの1、2つまたはすべてを含む、[1]~[39]のいずれかに記載の多特異性分子。
[41]前記TGF-ベータ阻害剤が、TGFBR1ポリペプチドを含み、任意選択により、前記TGF-ベータ阻害剤が、
(i)TGFBR1の細胞外ドメインもしくはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%または95%同一の配列)、
(ii)配列番号95、96、97、120、121もしくは122の細胞外ドメイン、またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%または95%同一の配列)、または
(iii)配列番号104もしくは105のアミノ酸配列、またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%または95%同一の配列)
を含む、[1]~[40]のいずれかに記載の多特異性分子。
[42]前記TGF-ベータ阻害剤が、TGFBR2ポリペプチドを含み、任意選択により、前記TGF-ベータ阻害剤が、
(i)TGFBR2の細胞外ドメインもしくはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%または95%同一の配列)、
(ii)配列番号98、99、123もしくは124の細胞外ドメイン、またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%または95%同一の配列)、または
(iii)配列番号100、101、102および103からなる群から選択されるアミノ酸配列、もしくはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%または95%同一の配列)
を含む、[1]~[41]のいずれかに記載の多特異性分子。
[43]前記TGF-ベータ阻害剤が、TGFBR3ポリペプチドを含み、任意選択により、前記TGF-ベータ阻害剤が、
(i)TGFBR3の細胞外ドメインもしくはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%または95%同一の配列)、
(ii)配列番号106、107、125もしくは126の細胞外ドメイン、またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%または95%同一の配列)、または
(iii)配列番号108のアミノ酸配列もしくはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%または95%同一の配列)
を含む、[1]~[42]のいずれかに記載の多特異性分子。
[44]前記TGF-ベータ阻害剤が、ホモ二量体を形成する2つのTGF-ベータ受容体ポリペプチドを含み、任意選択により、前記TGF-ベータ阻害剤が、
(i)ホモ二量体を形成する2つのTGFBR1ポリペプチド、
(ii)ホモ二量体を形成する2つのTGFBR2ポリペプチド、または
(iii)ホモ二量体を形成する2つのTGFBR3ポリペプチド
を含む、[1]~[43]のいずれかに記載の多特異性分子。
[45]前記TGF-ベータ阻害剤が、ヘテロ二量体を形成する2つのTGF-ベータ受容体ポリペプチドを含み、任意選択により、前記TGF-ベータ阻害剤が、
(i)ヘテロ二量体を形成するTGFBR1ポリペプチドおよびTGFBR2ポリペプチド、
(ii)ヘテロ二量体を形成するTGFBR1ポリペプチドおよびTGFBR3ポリペプチド、または
(iii)ヘテロ二量体を形成するTGFBR2ポリペプチドおよびTGFBR3ポリペプチド
を含む、[1]~[44]のいずれかに記載の多特異性分子。
[46]前記TGF-ベータ阻害剤が、第1のTGF-ベータ受容体ポリペプチドおよび第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドを含む、[1]~[45]のいずれかに記載の多特異性分子。
[47]第1のFc領域(例えば、第1のCH1-Fc領域)および第2のFc領域(例えば、第2のCH1-Fc領域)を含み、任意選択により、
(i)前記第1のTGF-ベータ受容体ポリペプチドが、例えば、リンカーを介して、前記第1のFc領域(例えば、第1のCH1-Fc領域)、例えば、前記第1のFc領域(例えば、第1のCH1-Fc領域)のC末端に連結されており、かつ
(ii)前記第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドが、例えば、リンカーを介して、前記第2のFc領域(例えば、第2のCH1-Fc領域)、例えば、前記第2のFc領域(例えば、第2のCH1-Fc領域)のC末端に連結されており、任意選択により、
前記第1のTGF-ベータ受容体ポリペプチドおよび前記第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドが、ホモ二量体またはヘテロ二量体、例えば、ホモ二量体を形成し、任意選択により、
前記第1または第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドが、TGFBR1、TGFBR2またはTGFBR3の細胞外ドメイン、例えば、TGFBR2の細胞外ドメインを含み、任意選択により、
前記多特異性分子が、図35Aまたは35Bの構成を有する、
[46]に記載の多特異性分子。
[48](i)配列番号192のアミノ酸配列および配列番号193のアミノ酸配列、
(ii)配列番号192のアミノ酸配列および配列番号195のアミノ酸配列、
(iii)配列番号194のアミノ酸配列および配列番号193のアミノ酸配列、または
(iv)配列番号194のアミノ酸配列および配列番号195のアミノ酸配列
を含む、[47]に記載の多特異性分子。
[49]重鎖定常領域1(CH1)および軽鎖定常領域(CL)を含み、任意選択により、
(i)前記第1のTGF-ベータ受容体ポリペプチドが、例えば、リンカーを介して、前記CH1、例えば、前記CH1のN末端に連結されており、かつ
(ii)前記第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドが、例えば、リンカーを介して、前記CL、例えば、前記CLのN末端に連結されており、任意選択により、
前記第1のTGF-ベータ受容体ポリペプチドおよび前記第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドが、ホモ二量体またはヘテロ二量体、例えば、ホモ二量体を形成し、任意選択により、
前記第1または第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドが、TGFBR1、TGFBR2またはTGFBR3の細胞外ドメイン、例えば、TGFBR2の細胞外ドメインを含み、任意選択により、
前記多特異性分子が、図35Cまたは35Dの構成を有する、
[46]に記載の多特異性分子。
[50](i)配列番号196のアミノ酸配列および配列番号198のアミノ酸配列、
(ii)配列番号196のアミノ酸配列および配列番号199のアミノ酸配列、
(iii)配列番号197のアミノ酸配列および配列番号198のアミノ酸配列、または
(iv)配列番号197のアミノ酸配列および配列番号199のアミノ酸配列
を含む、[49]に記載の多特異性分子。
[51](i)TGF阻害剤が、例えば、リンカーを介して、前記抗CSF1R結合部分(例えば、抗CSF1R抗体分子)もしくは前記抗CCR2結合部分(例えば、抗CCR2抗体分子)に連結されているか;
(ii)前記抗CSF1R結合部分および/もしくは前記抗CCR2結合部分が、Fc領域を含み、前記TGF阻害剤が、例えば、リンカーを介して、前記Fc領域、例えば、前記Fc領域のC末端に連結されているか;
(iii)前記多特異性分子が、第1のTGF-ベータ阻害剤および第2のTGF-ベータ阻害剤を含み、前記第1のTGF-ベータ阻害剤が、例えば、リンカーを介して、前記抗CSF1R結合部分(例えば、抗CSF1R抗体分子)に連結されており、前記第2のTGF-ベータ阻害剤が、例えば、リンカーを介して、前記抗CCR2結合部分(例えば、抗CCR2抗体分子)に連結されているか;または
(iv)前記抗CSF1R結合部分が、第1のFc領域を含み、前記抗CCR2結合部分が、第2のFc領域を含み、前記多特異性分子が、第1のTGF-ベータ阻害剤および第2のTGF-ベータ阻害剤を含み、前記第1のTGF-ベータ阻害剤が、例えば、リンカーを介して、前記第1のFc領域、例えば、前記第1のFc領域のC末端に連結されており、前記第2のTGF-ベータ阻害剤が、例えば、リンカーを介して、前記第2のFc領域、例えば、前記第2のFc領域のC末端に連結されている、
[1]~[45]のいずれかに記載の多特異性分子。
[52](i)前記抗CSF1R結合部分が、第1の軽鎖および第1の重鎖を含み、前記第1の重鎖が、第1のFc領域を含み、前記第1のFc領域のC末端が、TGFBR2の細胞外ドメイン、またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%または95%同一の配列)に連結されており;かつ
(ii)前記抗CCR2結合部分が、第2の軽鎖および第2の重鎖を含み、前記第2の重鎖が、第2のFc領域を含み、前記第2のFc領域のC末端が、TGFBR2の細胞外ドメイン、またはそれと実質的に同一の配列(例えば、それと少なくとも80%、85%、90%または95%同一の配列)に連結されており、任意選択により、
前記多特異性分子が、図12Bで示される構成を有する、
[1]~[45]のいずれかに記載の多特異性分子。
[53]表34または表28で開示される分子を含む、[1]~[52]のいずれかに記載の多特異性分子。
[54]図39Fまたは12A~12Jのいずれかで示される構成を有する、[1]~[53]のいずれかに記載の多特異性分子。
[55]重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2およびHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2およびLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、
(i)前記HCDR1、HCDR2およびHCDR3が、それぞれ、配列番号402、474および475のアミノ酸配列を含み;かつ
(ii)前記LCDR1、LCDR2およびLCDR3が、それぞれ、配列番号432、434および436、またはそれぞれ、配列番号433、435および437のアミノ酸配列を含む、
CSF1Rに結合する抗体分子。
[56]前記HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3が、それぞれ、配列番号402、405、413、432、434および436のアミノ酸配列を含む、[55]に記載の抗体分子。
[57]前記VHおよびVLが、それぞれ、配列番号324および341のアミノ酸配列を含む、[55]または[56]に記載の抗体分子。
[58]重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2およびHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2およびLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、
(i)前記HCDR1、HCDR2およびHCDR3が、それぞれ、配列番号403、478および479のアミノ酸配列を含み;かつ
(ii)前記LCDR1、LCDR2およびLCDR3が、それぞれ、配列番号433、435および437、またはそれぞれ、配列番号432、434および436のアミノ酸配列を含む、
CSF1Rに結合する抗体分子。
[59]前記HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3が、それぞれ、配列番号403、411、422、433、435および437のアミノ酸配列を含む、[58]に記載の抗体分子。
[60]前記VHおよびVLが、それぞれ、配列番号339および139のアミノ酸配列を含む、[58]または[59]に記載の抗体分子。
[61]重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2およびHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2およびLCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含み、前記HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3が、それぞれ、配列番号446、447、448、454、455および456のアミノ酸配列を含み、
(i)前記VHが、配列番号480のアミノ酸配列を含まないか、または
(ii)前記VLが、配列番号481のアミノ酸配列を含まない、
CCR2に結合する抗体分子。
[62]前記VHおよびVLが、それぞれ、配列番号343および345のアミノ酸配列を含む、[61]に記載の抗体分子。
[63]重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2およびHCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2およびLCDR3を含
む軽鎖可変領域(VL)とを含み、前記HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3が、それぞれ、配列番号461、462、463、467、468および469のアミノ酸配列を含む、PD-L1に結合する抗体分子。
[64]前記VHが、配列番号346のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも90、92、94、96、98もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、[63]に記載の抗体分子。
[65]前記VLが、配列番号347のアミノ酸配列、またはそれと少なくとも90、92、94、96、98もしくは99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、[63]または[64]に記載の抗体分子。
[66]前記VHおよびVLが、それぞれ、配列番号346および347のアミノ酸配列を含む、[63]~[65]のいずれかに記載の抗体分子。
[67]抗CSF1R結合部分および抗CCR2結合部分を含む多特異性分子であって、前記抗CSF1R結合部分が、[55]~[60]のいずれかに記載の抗体分子を含む多特異性分子。
[68]抗CSF1R結合部分および抗CCR2結合部分を含む多特異性分子であって、前記抗CCR2結合部分が、[61]または[62]に記載の抗体分子を含む多特異性分子。
[69]前記抗CSF1R結合部分が、[55]~[60]のいずれかに記載の抗体分子を含み、前記抗CCR2結合部分が、[61または[62]に記載の抗体分子を含む、[67]または[68]に記載の多特異性分子。
[70][1]~[54]もしくは[67]~[69]のいずれかに記載の多特異性分子、または[55]~[66]のいずれかに記載の抗体分子をコードする単離された核酸分子。
[71][70]の核酸分子を含むベクター、例えば、発現ベクター。
[72][70]の核酸分子または[71]のベクターを含む細胞、例えば、宿主細胞。
[73][1]~[54]もしくは[67]~[69]のいずれかに記載の多特異性分子、または[55]~[66]のいずれかに記載の抗体分子を作製、例えば、産生する方法であって、[72]に記載の細胞、例えば、宿主細胞を好適な条件、例えば、遺伝子発現および/またはヘテロ二量体化に好適な条件下で培養するステップを含む方法。
[74][1]~[54]もしくは[67]~[69]のいずれかに記載の多特異性分子、または[55]~[66]のいずれかに記載の抗体分子、および薬学的に許容される担体、賦形剤または安定剤を含む医薬組成物。
[75]対象においてがんを処置する方法であって、それを必要とする前記対象に、[1]~[54]もしくは[67]~[69]のいずれかに記載の多特異性分子、[55]~[66]のいずれかに記載の抗体分子、または[74]に記載の医薬組成物を投与するステップを含み、前記多特異性分子、抗体分子または医薬組成物が、前記がんを処置するのに有効な量で投与される、方法。
[76]前記がんが、固形腫瘍がんまたは転移病変である、[75]に記載の方法。
[77]前記固形腫瘍がんが、膵がん(例えば、膵臓腺癌)、乳がん、結腸直腸がん、肺がん(例えば、小細胞または非小細胞肺がん)、皮膚がん(例えば、黒色腫)、卵巣がん、肝がん、脳がん(例えば、神経膠腫)、膀胱がん、子宮頸がん、頭頸部がん、腎がん、中皮がん、甲状腺がんまたは子宮がんのうちの1つまたは複数である、[76]に記載の方法。
[78]前記がんが、血液がんである、[77]に記載の方法。
[79]前記血液がんが、骨髄増殖性疾患、例えば、原発性もしくは特発性骨髄線維症(MF)、本態性血小板増加症(ET)、真性赤血球増加症(PV)または慢性骨髄性白血病(CML)である、[78]に記載の方法。
[80]第2の治療的処置を投与するステップをさらに含み、任意選択により、前記第2の治療的処置が、治療剤(例えば、化学療法剤、生物剤、ホルモン治療)、放射線照射または手術を含み、任意選択により、前記治療剤が、化学療法剤または生物剤から選択され、任意選択により、前記治療剤が、チェックポイント阻害剤である、[75]~[79]のいずれかに記載の方法。
[81]前記チェックポイント阻害剤が、抗CTLA4抗体、抗PD1抗体(例えば、ニボルマブ、ペンブロリズマブまたはピディリズマブ)、抗PD-L1抗体、抗PD-L2抗体、抗TIM3抗体、抗LAG3抗体、抗CD160抗体、抗2B4抗体、抗CD80抗体、抗CD86抗体、抗B7-H3(CD276)抗体、抗B7-H4(VTCN1)抗体、抗HVEM(TNFRSF14またはCD270)抗体、抗BTLA抗体、抗KIR抗体、抗MHCクラスI抗体、抗MHCクラスII抗体、抗GAL9抗体、抗VISTA抗体、抗BTLA抗体、抗TIGIT抗体、抗LAIR1抗体および抗A2aR抗体からなる群から選択され、任意選択により、前記チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体である、[80]に記載の方法。
均等物
当業者は、単に慣例的な実験を使用して、本明細書に記載される本発明の具体的な実施形態の多くの均等物を認識するかまたは確かめることができるだろう。そのような均等物は、以下の特許請求の範囲によって包含されることが意図される。
Claims (32)
- (a)抗CSF1R結合部分;および
(b)抗CCR2結合部分;
を含む多特異性分子であって、
(1)抗CSF1R結合部分が
(i)それぞれ配列番号402、474、および475、または配列番号402、476および477の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、重鎖相補性決定領域2(HCDR2)および重鎖相補性決定領域3(HCDR3)を含む重鎖可変領域(VH)、および
それぞれ配列番号432、434、および436の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、軽鎖相補性決定領域2(LCDR2)および軽鎖相補性決定領域3(LCDR3)を含む軽鎖可変領域(VL);または
(ii)それぞれ配列番号403、478、および479のHCDR1、HCDR2およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号433、435、および437のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL
を含む抗CSF1R抗体分子またはその抗原結合断片である;および
(2)抗CCR2結合部分が、それぞれ配列番号446、447、および448のHCDR1、HCDR2およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号454、455、および456のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVLを含む抗CCR2抗体分子またはその抗原結合断片であり、ここで
(i)抗CCR2結合部分が配列番号480のアミノ酸配列を含むVHを含まない、
(ii)抗CCR2結合部分が配列番号481のアミノ酸配列を含むVLを含まない、または
(iii)抗CCR2結合部分が配列番号480のアミノ酸配列を含むVHを含まず、かつない、抗CCR2結合部分が配列番号481のアミノ酸配列を含むVLを含まない;
前記多特異性分子。 - 多特異性分子が第1のポリペプチド鎖および第2のポリペプチド鎖を含み;
第1のポリペプチド鎖が第1の重鎖定常領域を含み、第2のポリペプチド鎖が第2の重鎖定常領域を含み;
第1の重鎖定常領域および第2の重鎖定常領域が独立に、IgG1またはその機能的断片、IgG2またはその機能的断片、IgG3またはその機能的断片、またはIgG4またはその機能的断片からなる群から選択され;および
抗CSF1R結合部分が第1の重鎖定常領域に連結されており、抗CCR2結合部分が第1の重鎖定常領域または第2の重鎖定常領域に連結されている、
請求項1に記載の多特異性分子。 - (i)抗CSF1R結合部分のVHが第1の重鎖定常領域に連結されており、多特異性分子がさらに第3のポリペプチド鎖を含み、第3のポリペプチド鎖が抗CSF1R結合部分のVLを含み、または
(ii)抗CCR2結合部分のVHが第1の重鎖定常領域または第2の重鎖定常領域に連結されており、多特異性分子がさらに第4のポリペプチド鎖を含み、第4のポリペプチド鎖が抗CCR2結合部分のVLを含む、
請求項1または2に記載の多特異性分子。 - 抗CSF1R結合部分が
(i)それぞれ配列番号402、405、および413のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(ii)それぞれ配列番号402,404,および413のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;、
(iii)それぞれ配列番号402,406,および413のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;、
(iv)それぞれ配列番号402、405、および414のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(v)それぞれ配列番号402、407、および413のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(vi)それぞれ配列番号402、404、および415のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(vii)それぞれ配列番号402、408、および413のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(viii)それぞれ配列番号402、404、および416のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(ix)それぞれ配列番号402、404、および417のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(x)それぞれ配列番号402、409、および413のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(xi)それぞれ配列番号402、404、および418のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(xii)それぞれ配列番号402、404、および419のHCDR1、HCDR2
、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(xiii)それぞれ配列番号402、404、および420のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(xiv)それぞれ配列番号402、404、および421のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号432、434および436のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(xv)それぞれ配列番号403、411、および422のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号433、435および437のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(xvi)それぞれ配列番号403、410、および422のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号433、435および437のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
(xvii)それぞれ配列番号403、410、および423のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号433、435および437のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;または
(xviii)それぞれ配列番号403、412、および422のHCDR1、HCDR2、およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号433、435および437のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVL;
を含む、請求項1~3のいずれか1項に記載の多特異性分子。 - 抗CSF1R結合部分が
(a)配列番号323~336、および339からなる群から選択されるいずれか1つの配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列、または配列番号337、338、および340からなる群から選択されるいずれか1つの配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH;
(b)配列番号341または配列番号139の配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列、または配列番号342の配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;または
(c)それらの組合せ
を含む、請求項1~4のいずれか1項に記載の多特異性分子。 - 抗CSF1R結合部分が
(a)配列番号323~340からなる群から選択されるいずれか1つの配列を含むVH;
(b)配列番号341、配列番号139、または配列番号342の配列有するアミノ酸配列を含むVL;または
(c)それらの組合せ
を含む、請求項1~5のいずれか1項に記載の多特異性分子。 - 抗CSF1R結合部分が
(i)それぞれ、配列番号323および341;
(ii)それぞれ、配列番号324および341;
(iii)それぞれ、配列番号325および341;
(iv)それぞれ、配列番号326および341;
(v)それぞれ、配列番号327および341;
(vi)それぞれ、配列番号328および341;
(vii)それぞれ、配列番号329および341;
(viii)それぞれ、配列番号330および341;
(ix)それぞれ、配列番号331および341;
(x)それぞれ、配列番号332および341;
(xi)それぞれ、配列番号333および341;
(xii)それぞれ、配列番号334および341;
(xiii)それぞれ、配列番号335および341;
(xiv)それぞれ、配列番号336および341;
(xv)それぞれ、配列番号337および342;
(xvi)それぞれ、配列番号338および342;
(xvii)それぞれ、配列番号339および139;
(xvi)それぞれ、配列番号339および342;
(xv)それぞれ、配列番号340および342;
(xvi)それぞれ、配列番号323および342;または
(xv)それぞれ、配列番号337および341
のアミノ酸配列を含むVHおよびVLを含む、請求項1~6のいずれか1項に記載の多特異性分子。 - 抗CCR2結合部分が
(i)配列番号343または配列番号344のアミノ酸配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH;
(ii)配列番号345のアミノ酸配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL;または
(iii)それらの組合せ
を含む、請求項1~7のいずれか1項に記載の多特異性分子。 - 抗CCR2結合部分が、それぞれ、配列番号343および345;またはそれぞれ、配列番号344および345のアミノ酸配列を含むVHおよびVLを含む、請求項1~8のいずれか1項に記載の多特異性分子。
- (i)配列番号386または配列番号387の配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む第1のポリペプチド鎖;
(ii)配列番号351~365からなる群から選択されるいずれか1つの配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む第1のポリペプチド鎖、および配列番号369の配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む第3のポリペプチド鎖;または
(iii)配列番号351、および365~368からなる群から選択されるいずれか1つの配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む第1のポリペプチド鎖、および配列番号370の配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む第3のポリペプチド鎖、
を含む、請求項2~9のいずれか1項に記載の多特異性分子。 - (i)配列番号386または配列番号387の配列を含む第1のポリペプチド鎖;
(ii)配列番号351~365からなる群から選択されるいずれか1つの配列を含む第1のポリペプチド鎖、および配列番号369の配列を含む第3のポリペプチド鎖;または
(iii)配列番号351、および365~368からなる群から選択されるいずれか1つの配列を含む第1のポリペプチド鎖、および配列番号370の配列を含む第3のポリペプチド鎖、
を含む、請求項2~10のいずれか1項に記載の多特異性分子。 - 配列番号371または配列番号372の配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む第1のポリペプチド鎖または第2のポリペプチド鎖、および配列番号373の配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む第4のポリペプチド鎖を含む、請求項3~11のいずれか1項に記載の多特異性分子。
- 配列番号371または配列番号372の配列を含む第1のポリペプチド鎖または第2のポリペプチド鎖、および配列番号373の配列を含む第4のポリペプチド鎖を含む、請求項3~12のいずれか1項に記載の多特異性分子。
- TGF-ベータ阻害剤、1つまたは複数のサイトカイン分子、抗PD-L1結合部分、またはその組合せをさらに含む、請求項1~13のいずれか1項に記載の多特異性分子。
- (i)TGF-ベータ阻害剤が、第1のTGF-ベータ受容体ポリペプチドおよび第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドを含み、第1のTGF-ベータ受容体ポリペプチドおよび第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドが:
(1)ホモ二量体を形成し、第1のTGF-ベータ受容体ポリペプチドおよび第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドが:
(a)ホモ二量体を形成する2つのTGFBR1ポリペプチド、
(b)ホモ二量体を形成する2つのTGFBR2ポリペプチド、または
(c)ホモ二量体を形成する2つのTGFBR3ポリペプチド
である、
(2)ヘテロ二量体を形成し、第1のTGF-ベータ受容体ポリペプチドおよび第2のTGF-ベータ受容体ポリペプチドが:
(a)ヘテロ二量体を形成するTGFBR1ポリペプチドおよびTGFBR2ポリペプチド、
(b)ヘテロ二量体を形成するTGFBR1ポリペプチドおよびTGFBR3ポリペプチド、または
(c)ヘテロ二量体を形成するTGFBR2ポリペプチドおよびTGFBR3ポリペプチド
である、または
(ii)1つまたは複数のサイトカイン分子が、インターロイキン-2(IL-2)、インターロイキン-12(IL-12)、インターロイキン-15(IL-15)、インターロイキン-18(IL-18)、インターロイキン-21(IL-21)、インターロイキン-7(IL-7)、インターフェロンガンマ、またはそれらのいずれかの組合せからなる群から選択される、
請求項14に記載の多特異性分子。 - (A)(a)TGFBR1ポリペプチドが:
(i)TGFBR1の細胞外ドメイン;
(ii)配列番号95、96、97、120、121、または122の細胞外ドメインと少なくとも90%の配列同一性を有する配列;
(iii)配列番号104または配列番号105の配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列;または
(iv)配列番号104または配列番号105の配列;
を含む;
(b)TGFBR2ポリペプチドが:
(i)TGFBR2の細胞外ドメイン;
(ii)配列番号98、99、123、または124の細胞外ドメインと少なくとも90%の配列同一性を有する配列;
(iii)配列番号100,101、102、および103の配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列;または
(iv)配列番号100,101、102、および103の配列;
を含む;
(c)TGFBR3ポリペプチドが:
(i)TGFBR3の細胞外ドメイン;
(ii)配列番号106、107、125、または126の細胞外ドメインと少なくとも90%の配列同一性を有する配列;
(iii)配列番号108の配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列;または
(iv)配列番号108の配列;
を含む;
(B)1つまたは複数のサイトカイン分子が、配列番号237~243および246~249からなる群から選択される配列を含む;または
(C)抗PD-L1結合部分が、それぞれ配列番号461、462、および463のHCDR1、HCDR2およびHCDR3を含むVH、およびそれぞれ配列番号467、468および469のLCDR1、LCDR2およびLCDR3を含むVLとを含む、抗PD-L1抗体分子またはその抗原結合性断片である、
請求項14または15に記載の多特異性分子。 - 抗PD-L1結合部分が、配列番号346の配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVH、配列番号347の配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含むVL、またはその組合せを含む抗PD-L1抗体分子またはその抗原結合性断片である、
請求項16に記載の多特異性分子。 - 抗PD-L1結合部分が、配列番号346の配列を含むVH、配列番号347の配列を含むVL、またはその組合せを含む抗PD-L1抗体分子またはその抗原結合性断片である、
請求項16または17に記載の多特異性分子。 - (a)(i)TGF阻害剤が、前記抗CSF1R結合部分または前記抗CCR2結合部分に連結されている;
(ii)多特異性分子が、第1のTGF-ベータ阻害剤および第2のTGF-ベータ阻害剤を含み、第1のTGF-ベータ阻害剤が抗CSF1R結合部分に連結されており、第2のTGF-ベータ阻害剤が抗CCR2結合部分に連結されている;
(iii)多特異性分子が、第1のTGF-ベータ阻害剤および第2のTGF-ベータ阻害剤を含み、第1のTGF-ベータ阻害剤が第1の重鎖定常領域に連結されており、第2のTGF-ベータ阻害剤が第2の重鎖定常領域に連結されている;
(iv)多特異性分子が、第1のTGF-ベータ阻害剤、第2のTGF-ベータ阻害剤、および第3のポリペプチド鎖を含み、第1のTGF-ベータ阻害剤が第1の重鎖定常領域または第2の重鎖定常領域に連結されており、第2のTGF-ベータ阻害剤が第3のポリペプチド鎖に連結されている;または
(iv)多特異性分子が、第1のTGF-ベータ阻害剤、第2のTGF-ベータ阻害剤、および第4のポリペプチド鎖を含み、第1のTGF-ベータ阻害剤が第1の重鎖定常領域または第2の重鎖定常領域に連結されており、第2のTGF-ベータ阻害剤が第4のポリペプチド鎖に連結されている;
(b)1つまたは複数のサイトカイン分子が、第1の重鎖定常領域、第2の重鎖定常領域、軽鎖定常領域、またはその組合せに連結されている;
(c)抗PD-L1結合部分が、第1の重鎖定常領域、または第2の重鎖定常領域に連結されている;または
(d)(a)~(b)のいずれかの組合せである、
請求項14~18のいずれか1項に記載の多特異性分子。 - (a)(i)配列番号192および配列番号193のアミノ酸配列、
(ii)配列番号192および配列番号195のアミノ酸配列、
(iii)配列番号194および配列番号193のアミノ酸配列、
(iv)配列番号194および配列番号195のアミノ酸配列
(b)(i)配列番号196および配列番号198のアミノ酸配列、
(ii)配列番号196および配列番号199のアミノ酸配列、
(iii)配列番号197および配列番号198のアミノ酸配列、または
(iv)配列番号197および配列番号199のアミノ酸配列
を含む、請求項14~19のいずれか1項に記載の多特異性分子。 - (i)配列番号127または配列番号136の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号131の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、および配列番号373の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列;
(ii)配列番号351の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号369の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号376の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、および配列番号373の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列;
(iii)配列番号365の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号370の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号376の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、および配列番号373の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列;
(iv)配列番号374の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号369の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号371の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、および配列番号373の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列;
(v)配列番号375の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号370の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号371の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、および配列番号373の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列;
(vi)配列番号351の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号377または配列番号378の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号371の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、および配列番号373の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列;
(vii)配列番号365の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号379または配列番号380の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号371の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、および配列番号373の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列;
(viii)配列番号351の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号369の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号371の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、および配列番号381の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列;
(ix)配列番号365の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号370の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号371の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、および配列番号382の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列;
(x)配列番号383の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号369または配列番号370の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号385の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、および配列番号373の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列;
(xi)配列番号388または配列番号389の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号385の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、および配列番号373の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列;
(xii)配列番号390の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号391の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、配列番号392または配列番号393の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列、および配列番号373の配列と少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列
を含む、請求項14~20のいずれか1項に記載の多特異性分子。 - (i)配列番号127または配列番号136の配列、配列番号131の配列、および配列番号373の配列;
(ii)配列番号351の配列、配列番号369の配列、配列番号376の配列、および配列番号373の配列;
(iii)配列番号365の配列、配列番号370の配列、配列番号376の配列、および配列番号373;
(iv)配列番号374の配列、配列番号369の配列、配列番号371の配列、および配列番号373の配列;
(v)配列番号375の配列、配列番号370の配列、配列番号371の配列、および配列番号373の配列;
(vi)配列番号351の配列、配列番号377または配列番号378の配列、配列番号371の配列、および配列番号373の配列;
(vii)配列番号365の配列、配列番号379または配列番号380の配列、配列番号371の配列、および配列番号373の配列;
(viii)配列番号351の配列、配列番号369の配列、配列番号371の配列、および配列番号381の配列;
(ix)配列番号365の配列、配列番号370の配列、配列番号371の配列、および配列番号382の配列;
(x)配列番号383の配列、配列番号369または配列番号370の配列、配列番号385の配列、および配列番号373の配列;
(xi)配列番号388または配列番号389の配列、配列番号385の配列、および配列番号373の配列;または
(xii)配列番号390の配列、配列番号391の配列、配列番号392または配列番号393の配列、および配列番号373の配列
を含む、請求項14~21のいずれか1項に記載の多特異性分子。 - 請求項1~22のいずれか1項に記載の多特異性分子をコードする配列を含む、組換えポリヌクレオチド。
- 請求項1~22のいずれか1項に記載の多特異性分子、および薬学的に許容される担体、賦形剤または安定剤を含む医薬組成物。
- 癌の処置を必要とする対象でのがんを処置する方法において使用するための、請求項1~22のいずれか1項に記載の多特異性分子を含む医薬組成物。
- がんが、固形腫瘍がん、血液がんまたは転移病変である、請求項25に記載の医薬組成物。
- (i)固形腫瘍がんが、膵がん、乳がん、結腸直腸がん、肺がん、皮膚がん、卵巣がん、肝がん、脳がん、膀胱がん、子宮頸がん、頭部がん、頸部がん、腎がん、中皮がん、甲状腺がんまたは子宮がんのうちの1つまたは複数である;または
(ii)血液のがんが骨髄増殖性腫瘍である、
請求項26に記載の医薬組成物。 - 骨髄増殖性腫瘍が、原発性もしくは特発性骨髄線維症(MF)、本態性血小板増加症(ET)、真性赤血球増加症(PV)または慢性骨髄性白血病(CML)である、請求項27に記載の医薬組成物。
- 第2の治療的処置と組み合わせて対象に投与される、請求項25~28のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 第2の治療的処置が、治療剤、放射線照射または手術を含み。治療剤が、化学療法剤、生物剤、ホルモン治療からなる群から選択される、請求項29に記載の医薬組成物。
- 治療剤がチェックポイント阻害剤である、請求項30に記載の医薬組成物。
- チェックポイント阻害剤が、抗CTLA4抗体、抗PD1抗体、抗PD-L1抗体、抗PD-L2抗体、抗TIM3抗体、抗LAG3抗体、抗CD160抗体、抗2B4抗体、抗CD80抗体、抗CD86抗体、抗B7-H3(CD276)抗体、抗B7-H4(VTCN1)抗体、抗HVEM(TNFRSF14またはCD270)抗体、抗BTLA抗体、抗KIR抗体、抗MHCクラスI抗体、抗MHCクラスII抗体、抗GAL9抗体、抗VISTA抗体、抗BTLA抗体、抗TIGIT抗体、抗LAIR1抗体および抗A2aR抗体からなる群から選択される。請求項31に記載の医薬組成物。
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