JP2004041242A - クローニング方法 - Google Patents

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Abstract

【課題】白血球増加剤および造血障害治療剤として有用なタンパク質の製造に使用できるDNAのクローニングを提供する。
【解決手段】ヒト多分化能性顆粒球コロニー刺激因子活性を有する蛋白質をコードするDNAをクローニングする方法。
【選択図】なし

Description

 本発明は、一般に、造血促進因子をコードするDNAをクローニングする方法に関する。詳しくは、造血促進因子は、哺乳動物の多分化能性コロニー刺激因子、特にヒト多分化能性顆粒球コロニー刺激因子(hpG‐CSF)、活性をもつポリペプチドである。
 ヒト血液生成(造血)系は、様々な白血球(好中球、マクロファージ及び好塩基球/肥満細胞を含む)、赤血球(エリスロサイト)及び凝血形成細胞(巨核球/血小板)を補充する。平均的ヒト男性の造血系は毎年 4.5×1011のオーダーの顆粒球及び赤血球を産生すると推測されていたが、これは1年間で全体重に相当する。デキスターら、バイオエッセイズ、第 2巻、第 154〜158 頁、1985年〔Dexter et al., BioEssays, 2, 154-158 (1985)〕。
 少量の特定の造血促進因子は、少数の前駆体“幹細胞”の各種血液細胞系への分化、これらの系の著しい増殖及びこれらの系からの成熟血液細胞の最終的分化の原因をなすと考えられている。造血促進因子は極端に少量で存在しているため、これら因子の検出及び同定は分析の仕方にかかっていたが、今までは人為的条件下での培養細胞に対する刺激効果に基づき様々な因子の中から区別できるにすぎなかった。その結果、多数の名称が極めて少数の因子を表示するために考え出されてきた。かかる混同が生じた例として、IL‐3,BPA、マルチ‐CSF、HCGF,MCGF及びPSFという語は、すべて現在では同一のマウス造血促進因子に該当すると考えられている頭字語である。メトカーフ、サイエンス、第 2 29巻、第16〜22頁、1985年〔Metcalf, Science, 229,16-22 (1985)〕。更に、各種マウスの成長調節糖タンパク質に関する、バージェスら、ジャーナル・オブ・バイオロジカル・ケミストリー、第 252巻、第1988頁、1977年〔Burgess, et al., J. Biol. Chem., 252, 1988 (1977)〕、ダスら、ブラッド、第58巻、第 600頁;1980年(Das, et al., Blood, 58, 600 (1980)〕;イーレら、ジャーナル・オブ・イムノロジー、第 129巻、第2431頁、1982年〔Ihle,et al., J. Immunol., 129,2431 (1982)〕、ニコラら、ジャーナル・オブ・バイオロジカル・ケミストリー、第 258巻、第9017頁、1983年〔Nicola, et al., J. Biol.Chem., 258, 9017 (1983)〕、メトカーフら、インターナショナル・ジャーナル・オブ・キャンサー、第30巻、第 773頁、1982年〔Metcalf, et al., Int. J. Cance r, 30, 773 (1982)〕;及び、バージェスら、インターナショナル・ジャーナル・オブ・キャンサー、第26巻、第 647頁、1980年〔Burgess, et al., Int. J. Cancer, 26, 647 (1980)〕参照。
 組換え遺伝子技術の利用はこの混乱の中から一定の秩序をもたらした。例えば、赤血球産生を促進するヒトエリスロポエチンのアミノ酸及びDNA配列が得られた〔1985年 6月20日に公開されたリン(Lin)のPCT出願公開第85/02610号明細書参照。〕。組換え方法は、ヒト顆粒球‐マクロファージコロニー刺激因子のcDNAの単離に関しても利用された。リーら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)第82巻、第4360〜4364頁、1985年〔Lee et al., Proc. Natl.Acad. Sci. (USA), 82, 4360-4364 (1985)〕及びウオンら、サイエンス、第 228巻、第 810〜814 頁、1985年〔Wong et al., Science, 228,810-814 (1985)〕。更に、マウス遺伝子のクローニングに関する、ヨコタら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第81巻、第1070頁、1984年〔Yokota,et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 81, 1070 (1984) 〕、ファングら、ネーチャー、第 307巻、第 233頁、1984年〔Fung, et al., 307, 233 (1984)〕及び、ゴーフら、ネーチャー、第 309巻、第 763頁、1984年〔Gough, et a l., Nature, 309 , 763(1984)〕、並びにヒトM‐CSFに関するカワサキら、サイエンス、第 230巻、第 291頁、1985年〔Kawasakiet al., Science, 230 ,291 (1985)〕参照。
 ヒト多分化能性コロニー刺激因子(hpCSF)又はプルリポエチンと称されるヒト造血促進因子は、ヒト膀胱癌細胞系の培養液中に存在していることが示された。この細胞系は5637と呼ばれて、米国菌寄託機関(American Type Culture Collection)、ロックビル、メリーランドにおいて制限条件付でATCC寄託番号第HTB‐9号として寄託されている。この細胞系から精製されたhpCSFは、ヒト骨髄前駆体細胞を用いた分析において、すべての主な血液細胞系の産生につながるような多分化能性前駆細胞の増殖及び分化を促進することが報告された。ウェルトら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第82巻、第1526〜1530頁、1985年〔Welte et al.,Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 82, 1526‐1530 (1985)〕。hpCSFの精製には、(NH42 SO4 沈降、陰イオン交換クロマトグラフィー(DEAEセルロース、DE52)、ゲル濾過(AcA54カラム)、及びC18逆相高性能液体クロマトグラフィーを利用していた。C18逆相HPLC画分において 2つの活性ピークの 2番目に溶出するhpCSFとして確認されたタンパク質は、銀染色を用いるドデシル硫酸ナトリウム(SDS)‐ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)での測定によれば、分子量(MW)18,000を有すると報告された。hpCSFは、等電点5.5 を有し〔ウェルトら、ジャーナル・オブ・セル・バイオケミストリー、増刊第9A号、第116 頁、1985年(Welte, et al., J. Cell Biochem., Supp 9A, 116 (1985))〕、マウス骨髄単球性白血病細胞系WEHI‐3B D+ に対して高分化能を有する〔ウェルトら、分子及び細胞生物学のUCLA討論会、ゲールら編集、ニューシリーズ、第28巻、1985年〔Welte, et al., UCLA Symposia on Molecular and Cellular Biology, Gale, et al., eds.,NewSeries, 28 (1985))〕ことが早期に報告された。予備研究では、hpCSFと確認された因子はヒトCFU‐GM分析において最初の 7日間に顕著な顆粒球コロニー刺激活性を有することを示している。
 ヒトCSF‐βと称されるもう1つの因子も、ヒト膀胱癌細胞系5637から単離されたが、未標識マウスG‐CSFの場合と同一の用量応答関係においてWEHI‐3B D+ 細胞との結合性に関しマウス 125I‐標識顆粒球コロニー刺激因子(G‐CSF)の競合体として記載されていた〔ニコラら、ネーチャー、第 314巻、第 625〜628 頁、1985年(Nicola, et al.,Nature, 314,625-628 (1985))〕。この用量応答関係は、以前、未標識マウスG‐CSFに独特であって、M‐CSF、GM‐CSF又はマルチ‐CSFのような因子には見られないと報告されていた〔ニコラら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第81巻、第3765〜3769頁、1984年(Nicola,et al.,Proc.Natl. Acad. Sci. (USA), 81, 3765‐3769 (1984))〕。CSF‐β及びG‐CSFはともに、それらがWEHI‐3B D+ 細胞の分化を誘導する高い能力を有している点において、CSF類の中では独特である(ニコラら、イムノロジー・トゥデー、第5巻、第76〜80頁、1984年〔Nicola, et al., Immunology Today, 5,76-80 (1984)〕)。高濃度でG‐CSFは混合顆粒球/マクロファージコロニー形成細胞を刺激するが(ニコラら、1984年、同上)、このことは、ヒト骨髄培養物及びhpCSFの14日間のインキュベート後に顆粒球性、単球性、混合顆粒球/単球性及び好酸球性のコロニー(CFU‐GEMM)の出現を示す予備実験結果と一致する。CSF‐βもマウス骨髄細胞使用分析において好中球性、顆粒球性のコロニー形成を促進すると記載されていたが、この性質は因子をG‐CSFとして同定するための基準とされた。これらの類似性から、ヒトCSF‐βはG‐CSF(顆粒球コロニー刺激因子)と同一視された(ニコラら、ネーチャー、第 314巻、第 625〜 628頁、1985年〔Nicola, et al., Nature, 314 , 625-628 (1985)〕)。
 これらの共通の性質に基づけば、ニコラら、同上のヒトCSF‐β及びウェルトら、同上のhpCSFは、適切にはヒト多分化能性顆粒球コロニー刺激因子(hpG‐CSF)と称される同一の因子であると思われる。hpG‐CSFの特徴づけ及び組換え産生は、イン・ビトロ WEHI‐3B D+ 白血病細胞数を“全く正常な濃度”で完全に抑制するマウスG‐CSFの報告されている能力、並びに、マウスで確立された移植骨髄白血病を抑制する粗製マウスG‐CSF注射製剤の報告されている能力からみて、特に望ましいであろう。メトカーフ、サイエンス、第229 巻、第 16〜22頁、1985年〔Metcalf, Science, 229, 16-22(1985)〕参照。更に、サックス、サイエンティフィック・アメリカン、第284 巻、第1号、第40〜47頁、1986年〔Sachs, Scientific American, 2848 (1), 40-47 (1986)〕参照。
 hpG‐CSFが治療上重要であるとわかり、したがって市販規模量の入手が必要となる限り、細胞培養物からの単離では、十分な物質源を提供することは困難である。たとえば、ウェルトら(1985年、同上)により天然hpCSF単離物源として報告されたヒト膀胱癌細胞系5637(ATCC HTB9)等のヒト腫瘍バンク細胞の商業的使用に対して制約が存在していることは、注目される。
Welte et al.,Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 82, 1526‐1530 (1985) Welte, et al., J. Cell Biochem., Supp 9A, 116 (1985) Gale, et al., eds.,NewSeries, 28(1985) Nicola, et al., Nature, 314 , 625-628 (1985) Nicola,et al.,Proc.Natl. Acad. Sci. (USA), 81, 3765‐3769 (1984) Nicola, et al., Immunology Today,5,76-80 (1984) Metcalf, Science, 229,16-22(1985) Sachs, Scientific American, 2848 (1), 40-47 (1986)
 本発明の目的は、造血促進因子をコードするDNA、詳しくは哺乳動物の多分化能性コロニー刺激因子、特にヒト多分化能性顆粒球コロニー刺激因子(hpG‐CSF)、活性をもつポリペプチドをコードするDNAをクローニングする方法を提供することである。
 本発明は、hpG−CSF活性を有する蛋白質をコードするDNAをクローニングする方法に関する。
 具体的には、本発明の蛋白質は、下記のアミノ酸配列(配列番号1参照):
Figure 2004041242
 (但し、nは0または1である。)
または該アミノ酸配列において第1位から第174位までのアミノ酸配列のうち1つ以上のアミノ酸残基が欠失、置換、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を有する。
 本発明のヒト多分化能性顆粒球コロニー刺激因子活性を有する蛋白質は造血障害等の治療に用いることができる。
 本発明によれば、hpG‐CSFの全部又は一部をコードするDNA配列が提供される。このような配列は、選択された非哺乳動物宿主による発現に“好ましい”コドンの組込み、制限エンドヌクレアーゼ酵素による切断部位の供与、及び、簡易的発現ベクターの組立てを容易にする前端、後端又は中間部へのDNA配列の付加的供与を含むことができる。本発明は更に、1以上のアミノ酸残基の同一性又は位置に関して天然型と異なり、しかも天然型の性質の一部又は全部を保有している、hpG‐CSFのポリペプチド類縁体又は誘導体(即ち、hpG‐CSFに特異的な残基のすべてまでは含有していない削除類縁体、1以上の特異的残基が他の残基で置換されている〔Ser17〕hpG‐CSFのような置換類縁体、及び、1以上のアミノ酸残基がポリペプチドの末端又は中間部分に付加している付加類縁体)の微生物発現をコードするDNA配列を提供する。
 本発明の新規DNA配列は、天然多分化能性顆粒球コロニー刺激因子における一次構造配列の少なくとも一部及び生物学的性質の1以上を有するポリペプチド産物の原核もしくは真核宿主細胞での発現を確実化するために使用される配列を含有している。本発明のDNA配列は、特に、 (a)表VII 及び表VIIIに示されたDNA配列又はそれらの相補鎖、 (b)表VII のDNA配列又はその断片と(本明細書記載のようなハイブリッド形成条件下又はより厳格な条件下で)ハイブリッド形成するDNA配列、又は (c)遺伝コードの縮重がなければ表VII のDNA配列とハイブリッド形成し得るDNA配列をも含むものである。特に (b)に包含されるものとしては、hpG‐CSFの対立変異型及び/又は他の哺乳動物種の多分化能性顆粒球コロニー刺激因子をコードするゲノムDNA配列がある。特に (c)に包含されるものとしては、hpG‐CSF、hpG‐CSFの断片及びhpG‐CSF類縁体をコードする人工DNA配列があるが、このDNA配列には微生物宿主でのメッセンジャーRNAの翻訳を促進するコドンを組込むことができる。このような人工配列は、アルトン(Alton)らのPCT出願公開第WO83/04053号の方法により容易に組立てることができる。
 本発明は、下記のアミノ酸配列(配列番号1参照):
Figure 2004041242
において1つ以上のアミノ酸残基が欠失、置換、付加及び/又は挿入されたアミノ酸配列を有し、且つヒト多分化能性顆粒球コロニー刺激因子活性を有するタンパク質の製造方法であって、該タンパク質をコードする塩基配列を含むDNAを含有する発現ベクターで形質転換された哺乳動物細胞を培養し、該タンパク質を分離精製することを特徴とする、前記製造方法を提供する。
 ここで、アミノ酸残基の欠失、置換、付加及び/又は挿入は、例えば、D.F. Mark等, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, Vol.81, p.5662-5666, 1984、S. Inouye等, Proc. Na tl. Acad. Sci. USA, Vol.79, p.3438-3441, 1982 、PCT WO85/00817, 1985 年2 月28日公開、R.P. Wharton 等, Nature, Vol.316, p.601-605, Aug.15,1985に記載されている本願優先権主張日前の周知技術である部位特定突然変異誘発法等により実施することができる。
 アミノ酸残基の欠失、置換、付加及び/又は挿入に関し、1つ以上のアミノ酸残基とは、該部位特定突然変異誘発法等により欠失、置換、付加及び/又は挿入できる程度の数のアミノ酸残基を意味する。
 更に本発明に包含されるものとしては、本明細書の表VII 又は表VIIIの上部鎖ヒトcDNA又はゲノムDNA配列に相補的なDNAの一部によりコードされたポリペプチド類、即ちトラモンタノら、ヌクレイック・アシッズ・リサーチ、第12巻、第5049〜5059頁、1984年〔Tramontano, et al., Nucleic Acids Res., 12, 5049-5059(1984)〕に記載された“相補的転化タンパク質”がある。
 本発明は、対立変異体を含む天然hpG‐CSFにおける一次構造配列(即ち、アミノ酸残基の連続配列)の一部もしくは全部、生物学的性質(例えば、免疫学的性質及びイン・ビトロ生物学的活性)の1以上、及び物性(例えば、分子量)を有する精製単離ポリペプチド産物を提供する。これらのポリペプチドは、化学合成操作又はゲノムもしくはcDNAのクローニングもしくは遺伝子合成により得られる外来性DNA配列の原核もしくは真核宿主発現(例えば、細菌、酵母菌、高等植物、昆虫及び哺乳動物細胞の培養による)の産物である、ということによっても特徴づけられる。典型的な酵母菌〔例えばサッカロマイセス・セレビシアエ(Saccharomyces cerevisiae)〕又は原核生物〔例えば、エシェリキア・コリ(Escherichia coli)〕宿主細胞の産物は、いずれの哺乳動物タンパク質とも会合していない。脊椎動物(例えば、非ヒト哺乳動物及び鳥類)細胞における微生物発現産物は、いずれのヒトタンパク質とも会合していない。用いられた宿主に応じて、本発明のポリペプチドは、哺乳動物その他の真核生物の炭水化物でグリコシル化していてもよいし、非グリコシル化のままでもよい。本発明のポリペプチドは、(-1位に)最初のメチオニンアミノ酸残基を有することもできる。
 更に本発明に包含されるものとしては、有効量の本発明のポリペプチド産物と一緒に適切な希釈剤、アジュバント及び/又は担体を含有する、hpG‐CSF療法に使用される医薬組成物がある。
 本発明のポリペプチド産物は、固体組織及び血液もしくは尿等の液体試料中におけるヒトhpG‐CSFの検出及び定量に使用される試薬を提供するために、検出可能なマーカー物質と結合させることにより“標識”する(例えば、 125Iで放射線標識する)ことができる。
 本発明のDNA産物は、検出可能なマーカー(例えば、放射線標識及びビオチンのような非アイソトープ標識)で標識することもでき、しかも染色体地図上のヒトhpG‐CSF遺伝子の位置及び/又はその関連遺伝子群の位置をつきとめるためのDNAハイブリッド形成操作に用いることができる。それらはDNAレベルでのヒトhpG‐CSF遺伝子の異常を確認するためにも使用され、隣接遺伝子及びそれらの異常を確認するための遺伝子マーカーとして使用することもできる。
 本発明のポリペプチド産物は、再生不良性貧血のような造血障害の治療のために、単独で又は他の造血因子もしくは薬物と一緒に使用される。それらは化学療法又は放射線療法による造血障害の治療にも使用される。骨髄移植の成功率は、例えばhpG‐CSFの使用により高められるであろう。創傷治癒熱傷治療及び細菌性炎症治療にもhpG‐CSFが有効である。更に、hpG‐CSFは、白血病細胞を分化させると報告されている能力に基づき、白血病の治療にも使用される。ウェルトら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第82巻、第1526〜1530頁、1985年〔Welte, et al.,Proc. Natl. Acad. Sci.(USA),82, 1526-1530 (1985)〕及びサックス(Sachs)、同上参照。
 本発明の多数の側面及び長所は、現在の好ましい態様たる本発明の実例について説明した以下の詳細な説明を斟酌することにより、当業者であれば明らかになるであろう。
 以下に本発明をさらに詳細に説明する。
 本発明によって、hpG‐CSFのポリペプチド配列の一部又は全部をコードするDNA配列が単離されかつ特徴づけられた。
 下記の諸例は本発明の説明のために示されたものであって、特に、hpG‐CSF cDNA及びゲノムクローンの同定に先立ち行なわれる操作、かかる同定方法、並びに、配列決定、cDNA、ゲノム及び人工遺伝子に基づく発現系の開発、及びかかる系での発現hpG‐CSF及び類縁体産物の同定に関する。
 更に詳しくは、例1はhpG‐CSFのアミノ酸配列決定に関する。例2はコロニーハイブリッド形成スクリーニング用cDNAライブラリーの製造に関する。例3はハイブリッド形成プローブの組立てに関する。例4は、ハイブリッド形成スクリーニング、陽性クローンの同定、陽性cDNAクローンのDNA配列決定及びポリペプチド一次構造配列(アミノ酸配列)情報の作成に関する。例5はhpG‐CSFをコードするゲノムクローンの同定及び配列決定に関する。例6は、大腸菌優先(preference)コドンが用いられたhpG‐CSFをコードする人工遺伝子の組立てに関する。
 例7は、hpG‐CSFをコードするDNAを組込んだ大腸菌形質転換ベクターの組立て方法、hpG‐CSFの原核生物発現におけるベクターの使用、及び本発明の組換え産物の特性分析に関する。例8は、システイン残基がhpG‐CSFをコードするDNAでの変異誘発により別の適切なアミノ酸残基で置換されたhpG‐CSF類縁体の産生方法に関する。例9は、陽性cDNAクローンから得たhpG‐CSF類縁体をコードするDNAを組込んだベクターの組立て方法、COS‐1細胞形質転換のためのベクターの使用、及び形質転換細胞の培養増殖に関する。例10は、本発明の組換えポリペプチド産物の物理的及び生物学的性質に関する。
例 1
(A) 文献記載方法により得られた物質の配列決定
hpG‐CSF試料(3〜4 μg、SDS銀染色‐PAGE純度85〜90%)は、ウェルトら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第82巻、第1526〜1530頁、1985年〔Welte, et al., Proc.Natl. Acad. Sci. (USA), 82, 1526‐1530 (1985)〕に従い単離精製したものと同様であって、スローン・ケタリング・インスティテュート(Sloan Kettering Institute)、ニューヨーク、ニューヨーク州から入手した。
 このhpG‐CSF試料のN末端アミノ酸配列を、AB 407A気相分析装置〔アプライド・バイオシステムズ(Applied Biosystems)、フォスター市、カリフォルニア〕を用いたミクロ配列分析により1号操作(Run #1)で決定し、下記表Iに掲示された配列情報を得た。表I‐IVでは、単一文字コードが用いられており、“X”は明確に決定されなかった残基を示し、括弧内の残基は単に択一的又は推定的に示されたものである。
Figure 2004041242


 高いバックグランドが操作サイクル毎に存在したが、その結果は表Iに報告されており、このことは試料がおそらく精製時の化学的残留物たる多くの汚染成分を有することを示していた。配列を単に参照用として保存した。
 2号操作(Run #2)では、第2試料(5〜6 μg、純度95%以下)は 1号操作と同様にスローン・ケタリングから入手し、配列決定操作は 1号操作と同様にして実施した。この試料は、ウェルトら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第82巻、第1526〜1530頁、1985年の図4を作成するために用いられた物質の同一ロットから得たものである。結果は、表IIに示されている。
Figure 2004041242


 更に多くの残基が同定されたが、 2号操作では、適当数のプローブをhpG‐CSF DNA調査用に組立て得るほど十分に長い明確な配列は得られなかった。表IIの配列に基づきcDNAの単離を行なうためには、少なくとも1536種類のプローブが必要であろうと計算された。再度、試料の汚染が問題視された。
 このため、第3試料( 3〜5 μg、純度40%以下)を上記のようにスローン・ケタリングから入手した。この調製物は、更に精製するために、SDS‐PAGEによる分離後、電気ブロット(electroblot)に付した。この試料の配列分析ではデータが得られなかった。
(B) 修正方法により得られた物質の配列決定
十分量の純粋物質を得て適切な最終的アミノ酸配列分析を実施するため、スローン・ケタリングで産生されるものと同様の膀胱癌細胞系5637の細胞(サブクローンIA6)をイー・プラッツァー博士(Dr.E. Platzer)から入手した。細胞を最初にフラスコ中のアイコブ(Iscove′s)培地〔ギブコ(GIBCO)、グランドアイランド、ニューヨーク〕で培養し、集密化させた。集密化時、培養物をトリプシン処理し、ローラーボトル中に播種したが(1.5フラスコ/ボトル)、各ボトルは 5%CO2 下で予め条件が整えられたアイコブ培地25mlを含有していた。細胞を37℃,0.3rpmで一夜増殖させた。
 サイトデックス‐1(Cytodex‐1)ビーズ〔ファルマシア(Pharmacia)、ウプサラ、スウェーデン〕を洗浄し、下記操作により滅菌した。ビーズ 8gをボトルに加え、PBS 400mlを加えた。ビーズを3時間静かに攪拌して懸濁させた。ビーズを静置させた後、PBSを排出し、ビーズをPBSで洗浄し、新鮮PBSを加えた。ビーズを15分間オートクレーブで処理した。使用前に、ビーズを、新鮮培地+10%牛胎児血清(FCS)添加前にアイコブ培地+10%FCS中で洗浄し、処理ビーズを得た。
 各ローラーボトルから30mlを除くすべての培地を除去した後、新鮮培地+10%FCS30ml及び処理ビーズ40mlをボトルに加えた。ボトルを 5%CO2 処理し、すべての泡を吸引除去した。ボトルを、速度0.3rpmに低下させる前、ローラー台に3rpmで 0.5時間載置した。3時間後、別のフラスコ内容物をトリプシン処理し、ビーズ含有の各ローラーボトルに加えた。
 集密度40〜50%の時点でローラーボトル培養物をPBS50mlで洗浄し、PBS除去前10分間回転させた。細胞を培地A〔 0.2%FCS、10-8Mヒドロコルチゾン、 2mMグルタミン、 100単位/mlペニシリン及び 100μg/mlストレプトマイシン含有アイコブ培地〕中で48時間培養した。次いで、培養上澄を3000rpm で15分間遠心分離して集め、−70℃で貯蔵した。培養物に10%FCS含有培地Aを再度加え、48時間培養した。培地を捨てた後、細胞を上記のようにPBSで洗浄し、培地A中で48時間培養した。上澄を再度集め、上記のように処理した。
 IA6細胞の培養培地約30リットルを、10,000M. W. 遮断装置をもつ2個のカセットを備えたミリポア・ペリコン(Millipore Pellicon)ユニットにより、濾過速度約 200ml/min 及び保持速度約1000ml/minで約 2リットルまで濃縮した。濃縮物を同一装置及び同一流速により50mMトリス(pH7.8)約10リットルで透析濾過した。透析濾過濃縮物を50mMトリス(pH7.8)で平衡化された1リットルDEセルロースカラムに40ml/minで添加した。添加後、カラムを50mMトリス(pH7.8)1リットル、次いで50mM NaCl含有50mMトリス(pH7.8)2リットルにより同一速度で洗浄した。カラムを次いでNaCl濃度が75mM,100mM, 125mM, 150mM, 200mM及び300mM の6種の50mMトリス(pH7.5)1リットルで連続的に溶出させた。画分(50ml)を集め、活性画分をプールし、YM5膜装備アミコン(Amicon)限外濾過攪拌セルユニットで65mlに濃縮した。この濃縮物をPBSで平衡化された2リットルのAcA54ゲル濾過カラムに添加した。カラムを80ml/hrで操作し、10ml画分を集めた。活性画分をプールし、C4高性能液体クロマトグラフィー(HPLC)カラムに直接添加した。
 容量125〜850mlで、タンパク質1〜8mgを含有し、その約10%がhpG‐CSFである試料を、流速1〜4ml/minでカラムに添加した。添加後、流速1ml/minで80%2‐プロパノール中の0.1M酢酸アンモニウム(pH 6.0〜7.0)により洗浄した。1ml画分を集め、タンパク質について220nm、260nm 及び280nmでモニターした。
 精製した結果、hpG‐CSF含有画分を他のタンパク質含有画分から(80の画分中72及び73番目の画分として)明確に分離した。hpG‐CSFは純度約80± 5%及び収率約50%で単離された(150〜300 μg)。この精製物質 9μgを 4号操作(Run #4)アミノ酸配列分析に使用し、タンパク質試料を非ポリブレンTFA活性ガラス繊維板に付着させた。配列分析は、ヘウィックら、ジャーナル・オブ・バイオロジカル・ケミストリー、第 256巻、第7990〜7997頁、1981年〔Hewick,et al., J. Biol. Chem., 256, 7990-7997 (1981)〕及びライ、アナリティカ・キミカ・アクタ、第 163巻、第 243〜 248頁、1984年〔Lai,Anal.
Chim. Acta, 163 , 243-248 (1984)〕の方法に従い、AB 470A分析装置で実施した。4号操作の結果は表III に示されている。
Figure 2004041242


 4号操作では、(表III の残基31に相当する)第31サイクルより先において、更に重要な配列情報は得られなかった。長い明確な配列を得るために、5号操作(Run #5)においては、条件調整培地から精製されたhpG‐CSF14μgを45℃で1時間β‐メルカプトエタノール10mlで還元し、次いで減圧下で完全に乾燥した。タンパク質残基を次いで、ポリブレン化ガラス繊維板に付着させる前に 5%ギ酸に再溶解した。配列分析は上記 4号操作と同様にして実施した。 5号操作の結果は表IVに示されている。
Figure 2004041242


 表IVのアミノ酸配列は、下記hpG‐CSF cDNAを得るためのプローブを組立てる上で、十分に長く(44残基)かつ明確であった。

例 2
 目的のcDNA配列を単離するための標準的操作の中には、標的遺伝子の発現に基づき選択されたドナー細胞中に豊富に存在するmRNAの逆転写から得られるプラスミド担持cDNA“ライブラリー”の調製が含まれる。ポリペプチドのアミノ酸配列の実質的部分が公知である場合には、“標的”cDNA中での存在が推定される配列を複製した標識一重鎖DNAプローブ配列が、一重鎖型に変性されたcDNAのクローンコピーに対して実施されるDNA/DNAハイブリッド形成操作において使用され得る。ワイスマン(Weissman)ら、米国特許第 4,394,443号明細書、ウォレスら、ヌクレイック・アシッズ・リサーチ、第6巻、第3543〜3557頁、1979年〔Wallace,et al., Nucleic Acids Res., 6, 3543‐3557 (1979)〕、レイスら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第79巻、第3270〜3274頁、1982年〔Reyes, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 79, 3270-3274 (1982)〕、及びジェイ(Jaye)ら、ヌクレイック・アシッズ・リサーサ、第11巻、第2325〜2335、1983年参照。更に、診断実施時におけるDNA/DNAハイブリッド形成操作に関するファルコー(Falkow)らの米国特許第 4,358,535号明細書、及びコロニー及びプラークハイブリッド形成技術に関するデービスら、“遺伝子工学、高等細菌遺伝学のマニュアル”、コールド・スプリング・ハーバー・ラボラトリー〔Davis, et al., “A Manual for Genetic Engineering, Advanced BacterialGenetics ”,Cold Spring Harbor Laboratory 〕・コールド・スプリング・ハーバー、ニューヨーク、1980年、第55〜58頁及び第 174〜176 頁参照。
 完全RNAの定量的単離のためのグアニジニウムチオシアネート操作〔チャーグウィンら、バイオケミストリー、第18巻、第5294〜5299頁、1979年(Chirgwin, et al., Biochemistry , 18,5294-5299 (1979))〕により、全RNAを膀胱癌細胞系5637(IA6)細胞約1gから抽出した。 無菌RNA水溶液はIA6細胞由来の全RNAを含有していた。全RNA溶液からメッセンジャーRNAのみを得るため、溶液をオリゴデオキシチミジレート〔オリゴ(dT)〕〔コラボレーティブ・リサーチ社(Collaborative Research, Inc.)、ウォルサム、マサチューセッツ〕含有カラムに通した。メッセンジャーRNAに特有のポリアデニル化(ポリA+ )尾部はカラムに付着するが、リボソームRNAは溶出する。かかる操作の結果、ポリアデニル化メッセンジャーRNA(ポリA+mRNA)約90μgを単離した。単離されたポリA+ メッセンジャーRNAを、cDNA反応で使用する前に、最終濃度4mMで 5分間室温で水酸化メチル水銀〔アルファ・ベントロン(Alpha Ventron)、デンバーズ、マサチューセッツ〕により前処理した。水酸化メチル水銀処理は、翻訳を阻害するメッセンジャーRNA自体の相互反応及びそれと汚染分子との相互反応を抑制させた。ペイバーら、ジャーナル・オブ・バイオロジカル・ケミストリー、第 258巻、第7636〜7642頁、1979年〔Payvar, et al., J. Biol.Chem., 258, 7636-7642 (1979)〕参照。
 オカヤマ操作法〔オカヤマら、モレキュラー・アンド・セルラー・バイオロジー、第2巻、第161〜170 頁、1982年(Okayama, et al., Molcular & Cellular Biology, 2, 161-170 (1982))〕に従い、cDNAバンクをIA6細胞から得たmRNAにより調製した。cDNAを次いでインキュベートして増幅用宿主微生物大腸菌K‐12株HB 101に組込んだ。

例 3
 表IVのhpG‐CSFアミノ末端配列に基づき考え出されたハイブリッド形成プローブは、各々が長さ23塩基で 3個のイノシン残基を有する24組のオリゴヌクレオチドから構成されていた。プローブオリゴヌクレオチドをカルザースら、ジェネティック・エンジニアリング、第 4巻、第 1〜18頁、1982年〔(Caruthers, et al., Genetic Engineering, 4, 1-18(1982)〕の操作に従い製造し、ポリヌクレオチドキナーゼでリン酸化(Kinasing)することによりγ‐32P ATPで標識した。表IVの配列中残基23〜30のメッセンジャーRNAに対応するプローブオリゴヌクレオチドは、表Vに示されている。
Figure 2004041242


 中立性をIに付与したのは、タカハシら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第82巻、第1931〜1935頁、1985年〔Takahashi, et al., Proc.Natl. Acad. Sci. (USA), 82, 1931‐1935 (1985)〕及びオーツカら、ジャーナル・オブ・バイオロジカル・ケミストリー、第 260巻、第2605〜2608頁、1985年〔Ohtsuka, et al.,J. Biol. Chem., 260, 2605-2608 (1985)〕の研究公表に基づいていた。しかしながら、イノシンはG又はTと塩基対形成した場合には脱安定化効果を有する。タカハシらの場合では、イノシンは、それらが一群として平均化してほぼ中立化するに到ることから、中立効果を有するようである(例えば、 3個はCと好ましく対形成したが、2個はTと対形成し好ましくなかった)。
 GとのI塩基対形成効果を試験するため、コントロール実験をN‐myc 遺伝子配列及びクローンを用いて計画した。N‐myc 遺伝子から得た配列は、hpG‐CSFプローブで規定されたものと同一の全体的G及びC含有率を、各コドンの最初の2つの位置で有していた。したがって、N‐myc 試験プローブは、hpG‐CSFプローブと比較し、同一の長さであり、同一の相対的位置にIを含有し、しかも潜在的に同一の平均Tm(62〜66℃、 3又は 4個のイノシン残基を含有しているためではない)を有していた。
 2組のN‐myc 試験プローブを前記カルザースらの操作に従い組立てた。表VIに示された第1組は、以下のものを含んでいた; 1. 完全対合体の23量体; 2. 3個の3位Cが、Iを加えた場合に最悪のケースを生じるようにIで置換されている; 3. 4個の3位がIで置換されている。第2組の試験プローブは、全体的な中立的塩基対形成効果を与え得るイノシン塩基対のよりランダムな配置を表わすために考え出された。表VIに示された第2組は以下のものを含んでいた; 4. Cと塩基対形成する2個のI及びG塩基対形成する1個のIを有する; 5. I:G塩基対たるもう1個のIを有する 4と同一である。
Figure 2004041242


 N‐myc DNA配列及びニワトリ成長ホルモンDNA配列(陰性コントロール)を含有する5個のレプリカフィルターを、ハイブリッド形成前に、減圧オーブン中80℃で2時間焼いた。すべてのフィルターは、ハイブリッド形成時間が6時間のみであること以外、hpG‐CSFプローブに関して例4で記載されたように、ハイブリッド形成した。フィルターを室温で3回しかる後45℃で1回各々10分間洗浄した。フィルターをガイガーカウンターでモニターした。
 N‐myc プローブ3のフィルターは他の4個のプローブフィルターと比較して非常に弱いシグナルを発したため、それ以上洗浄しなかった。50℃で10分間洗浄後、ガイガーカウンターは、プローブ 1を 100%標準として、下記%シグナルを表示した:プローブ 2、20%;プロープ 3(45℃)、2 %;プローブ4、92%;及びプローブ5 、75%。55℃での洗浄後は、%が:プローブ 2、16%;プローブ4、 100%;及びプローブ 5、80%であった。60℃での最終洗浄では下記%を表示した:プローブ 2、1.6 %;プローブ 4、90%;及びプローブ 5、70%。
 このように、プローブ 2及び 4のように3個のIが存在する場合では、シグナルにおいて60倍までの差違が、理論的Tm(Iは計算に含まれていない)は〔最悪のI塩基対形成例(プローブ2)及び比較的中立なI塩基対形成例(プローブ4)に関して〕近いにもかかわらず観察される。
 N‐myc 試験ハイブリッド形成により得られた標準化情報は、より厳格でない洗浄による結果が許容され得る信頼度を測定するために、下記のように洗浄及びhpG‐CSFハイブリッド形成のモニターに際して利用された。

例 4
 ハナハンら、ジャーナル・オブ・モレキュラー・バイオロジー、第 166巻、第557〜580 頁、1983年〔Hanahan, et al., J. Mol. Biol.,166 , 557-580 (1983)〕の操作に従い、例2で産生されたcDNAインサート(insert)との組換え体を含む細菌を、寒天プレート上に載置された24個のニトロセルロースフィルター〔ミリポア(Millipore)、ベッドフォード、マサチューセッツ〕に拡散した。プレートを次いでインキュベートして約 150,000個のコロニーを得たが、これを24個の他のニトロセルロースフィルターに移してレプリカ培養した。レプリカを明瞭なコロニーが出現するまでインキュベートした。フィルター上の細菌を、10分間水酸化ナトリウム(0.5M)でわずかに飽和され、しかる後2分間トリス(1M)でブロットされ、次いで10分間NaCl(1.5M)含有トリス(0.5M)でブロットされたワットマン3MM 紙上で溶菌させた。フィルターがほぼ乾燥した後、それらを核酸ハイブリッド形成前に減圧オーブン中80℃で2時間焼いた。ウァールら、プロシーディングス・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第76巻、第3683〜3687頁、1979年〔Wahl, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 76, 3683‐3687(1979)〕、及びマニアティスら、セル、第81巻、第 163〜182 頁、1976年〔Maniatis, et al.,Cell, 81, 163-182 (1976)〕。
 フィルターを10×デンハード (Denhardt) 0.2%SDS及び6×SSC 750ml中65℃で2時間、前ハイブリッド形成させた。フィルターを6×SSCで洗浄し、次いで4つをバッグに入れ、6×SSC及び10×デンハード中で14時間ハイブリッド形成させた。50×106cpm の32P‐標識プローブ(オリゴヌクレオチド)を有するバッグ当たり、溶液約15mlが入っていた。
 ハイブリッド形成後、フィルターを6×SSC(1リットル/洗浄)中で3回室温で各々10分間洗浄した。フィルターを次いで6×SSC1リットルにより、45℃15分間で1回洗浄した。フィルターを増強スクリーン及びコダックXAR‐2フィルムにより−70℃で2時間オートラジオグラフィーに付した。このオートラジオグラフでは、5個の非常に強いシグナルを含む40〜50個の陽性シグナルが検出された。
 最強の5個のシグナル及び別の5個の陽性シグナルを含む領域をマスタープレートからこすり落とし、同一条件下同一プローブ混合物を用いて二次スクリーニングに移した。洗浄操作は、高温洗浄が55℃15分間で各々2回、及びしかる後の60℃15分間で1回からなる点で異なっていた。例3のN‐myc プローブ研究に基づき、二次スクリーニングでの最終洗浄温度を上げたが、24個の23量体に関する凝集融解温度がN‐myc プローブの温度に近似した60〜68℃であったためである。2回目の55℃での洗浄後、フィルターを湿潤させたままにし、オートラジオグラフィーに付した。このオートラジオグラフィーと、60℃での最終洗浄後同じ時間をかけた2回目のオートラジオグラフィーとの比較では、10個の被試クローンのうち2個だけが55℃〜60℃以上に昇温させた場合にシグナルの実質的損失をうけないことが明らかになった。これら2個のクローンは、ほぼ同一の長さ及び制限エンドヌクレアーゼパターンであることが後に示された。Ppo2と称される1個のクローンを配列決定のため選択した。
 上記操作で得られた組換えhpG‐CSF cDNAクローンのPpo2の配列決定は、サンガーら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第74巻、第5463〜5467頁、1977年〔Sanger, et al.,Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 74,5463-5467 (1977)〕のジデオキシ法により達成された。一重鎖DNAファージM‐13は、二重鎖cDNAクローンの一重鎖DNA鋳型を供給するためのクローニングベクターとして使用した。サンガーらの方法により、表VII に示されているようなアミノ酸翻訳を伴う配列及びポリペプチドコード領域の相補鎖が明らかとなった(配列番号2参照)。
Figure 2004041242

Figure 2004041242

Figure 2004041242


 表VII の下記特徴は顕著である。配列の5′末端には、ポリGcDNAリンカー配列に相当する塩基が示されている。次いで約5個の塩基(“N”と表示されている)が存在するが、その配列は前にある多数のGのためにサンガーらの方法によっては容易に明確に決定することができなかった。その後の配列は、ポリペプチドのリーダー配列と推定される部分をコードする12個のコドンを表わす。例1に記載されたhpG‐CSF天然単離物のアミノ末端配列との対応により、hpG‐CSFの推定的“成熟”型における最初のスレオニン残基は+1で示されている。成熟hpG‐CSFは、示された如く 174個の残基を有することがその後示された。“停止”コドン(OPコドン、TGA)の後に、約 856塩基の非翻訳3′配列及びポリA“尾部”の多数のAが続く。唯一のHgiAI及びApaI制限エンドヌクレアーゼ認識部位、並びに2つのStuI部位(原核及び真核細胞発現系の組立てに関して以下で説明されている)も表VII に示されている。ポリペプチド中におけるアスパラギン残基の欠損のため、N‐グリコシル化のための明確な部位は存在しない。3′非翻訳配列末端近くで下線が引かれた6個の塩基は、潜在的ポリアデニル化部位を表わす。
 合計 450,000個のクローンの中から上記ハイブリッド形成操作により同定された2つの他のcDNAクローンの各々が、転写開始部位以降の全リーダー配列をコードするDNAを含有していなかったことは、注目に値する。なるほど、3つすべてのhpG‐CSFクローンは正確に同一部位の5′領域で集結しており、このことは転写されたmRNAの二次構造がこの部位より先のcDNA形成を著しく阻害することを示唆している。実際には、したがって、オカヤマら、モレキュラー・アンド・セルラー・バイオロジー、第3巻、第 280〜289 頁、1983年〔Okayama,et al.,Mol. and Cell. Biol., 3, 280-289 (1983)〕に記載され、しかもウォンら、サイエンス、第228 巻、第 810〜814 頁、1985年〔Wong, et al., Science, 228, 810-814 (1985)〕においてGM‐CSFを単離するために現実に利用されたcDNA発現スクリーニングは、hpG‐CSF DNAの単離に簡単に利用することができなかったが、その理由は、かかる単離系が通常被験クローン中における全長のcDNA転写体の存否に依存しているからである。
 上記配列は、微生物宿主におけるhpG‐CSFの直接的発現を確実化するには、困難である。かかる発現を確実にするためhpG‐CSFコード領域には開始ATGコドンを加えるべきであり、しかもその配列は適切なプロモーター/レギュレーターDNA配列の制御下にある部位で形質転換ベクター中に挿入されるべきである。

例 5
 この例では、前記例で単離されるようなhpG‐CSFコードcDNAを用いてゲノムクローンをスクリーニングした。λファージヒト胎児肝ゲノムライブラリー〔ローンら、セル、第15巻、第1157〜1174頁、1978年(Lawn , et al., Cell,15, 1157-1174 (1978))の操作に従い製造され、ティー・マニアティス(T. Maniatis)から入手した〕を、HgiAI及びStuIで切断単離された2つのhpG‐CSF cDNA断片(HgiAI〜StuI、 649塩基対;StuI〜StuI、 639塩基対)からなるニック(nick)翻訳プローブを用いてスクリーニングした。合計約 500,000個のファージを12個のペトリ皿(15cm)で培養し、プラークを取出し、ベントン/デビソン(Benton /Davi son)操作法〔ベントンら、サイエンス、第196 巻、第 180頁、1977年(Benton, et al.,Science, 196, 180 (1977))〕によりプローブとハイブリッド形成させた。合計12個の陽性クローンが観察された。二次スクリーニングにおけるオートラジオグラフィーで最強シグナルを生じた3個のクローン(1〜3)を、 1リットル培地中で増殖させ、放射線標識24量体オリゴヌクレオチド(γ‐32P ATPでキナーゼ処理されている)5′CTGCACTGTCCAGAGTGCACTGTG3′を用いて制限酵素切断及びサザーンブロット法(Southern blotting)により遺伝子地図を作成した。地図作成結果は、単離体1 及び3 が同一であって、単離体2 がhpG‐CSF遺伝子の5′に付加した2000個の塩基を含有することを示していた。したがって、クローン2 を更に特徴づけるために使用した。クローン2 のDNAをEcoRIで切断して8500塩基対のhpG‐CSF含有断片を得、これを次いでpBR322 に組込んでサブクローニングし、更に制限エンドヌクレアーゼ切断、サザーンブロット法、M13サブクローニング及び配列決定により遺伝子地図を作成した。得られた配列は表VIIIに示されたとおりである(配列番号3参照)。
Figure 2004041242

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Figure 2004041242

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 hpG‐CSF遺伝子を含有するゲノムDNAの制限エンドヌクレアーゼ地図(約 3.4キロ塩基対)は図1で詳細に記されている。図1で示された制限エンドヌクレアーゼは、NcoI,N;PstI,P;BamHI,B;ApaI,A;XhoI,X;及びKpnI,Kである。図の下方の矢印は、ゲノム配列を得るために利用される配列決定方法を示す。ボックス領域はcDNAクローン中の領域であり、点線の端部ボックスはcDNAクローン中に存在しないもののmRNAブロット法により同定された配列を表わす。エキソン配列たるコード配列の同定をノーザン(Northern)ブロット法により実施した。エキソン1 及び2 における推定的スプライス部位にまたがる24量体オリゴヌクレオチドプローブ、5′CAGCAGCTGCAGGGCCATCAGCTT3′を、ノーザンブロット法でhpG‐CSF mRNAとハイブリッド形成させた。得たブロットは、エキソン2 のオリゴヌクレオチドプローブの場合と同様のサイズ(1650塩基対以下)のmRNAを示す。このデータは、表VIIIで示されるMet開始コドンを用いたpSV/ghG−CSFベクター(例9)によるhpG‐CSFの直接的発現能と一緒に考え合わされた場合に、エキソン1 に含有されるコード配列を規定する。エキソン 2〜5 は、hpG‐CSF遺伝子(表VII )のcDNAクローン(Ppo2)において得られるコード配列により規定される。

例 6
この例は、hpG‐CSFをコードしかつ大腸菌優先コドンを含有する人工遺伝子の製造に関する。
 簡潔に述べると、用いられたプロトコールは、全般的に、参考のため本明細書に包含される共有権者アルトン(Alton)らのPCT公開第WO83/04053 号明細書の開示に示されているとおりであった。遺伝子は、成分オリゴヌクレオチドが多数の二重鎖にまず集合するように考えられ、二重鎖は次いで3つの別個のセクションにまとめられた。これらセクションは簡易な増幅用として考えられ、増幅系から除去された後に、適切な発現ベクター中に連続的に又は多数の断片結合を介してまとめることができた。
 セクションI,II及びIII の構造は表IX〜XIV に示されている。表IX及びXに示されたセクションIの構造において、オリゴヌクレオチド 1〜14は7本の二重鎖(1及び8 ; 2及び9 ; 3及び10; 4及び11;5及び12; 6及び13; 7及び14)にまとめられた。7本の二重鎖を次いで結合し、表Xに示されるセクションIを形成した。表Xにおいて、セクションIは増幅・発現ベクターとの結合及びセクションIIとの結合のために用いられる上流XbaI付着端及び下流BamHI付着端を含有することにも着目されるであろう。
Figure 2004041242

Figure 2004041242


 表XI及びXII に示されるセクションIIの構造において、オリゴヌクレオチド15〜30は8本の二重鎖(15及び23;16及び24;17及び25;18及び26;19及び27;20及び28;21及び29;22及び30)にまとめられた。これら8本の二重鎖を次いで結合し、表XII に示されるセクションIIを形成した。表XII で更に示されるように、セクションIIは増幅ベクターとの結合及びセクションIとの結合のために用いられる上流BamHI付着端及び下流EcoRI付着端を有する。その下流端部近くでは、セクションIIは最後の結合セクションII及びIII に用いられる下流SstI部位も有している。
Figure 2004041242

Figure 2004041242


 最後に、セクションIII は表XIII及びXIV に示されているように組立てられた。この組立てのために、オリゴヌクレオチド31〜42は6本の二重鎖(31及び37;32及び38;33及び39;34及び40;35及び41;36及び42)にまとめられた。6本の二重鎖を次いで結合し、表XIV に示されるセクションIII を形成した。表XIV でも示されているように、セクションIII は、増幅ベクター、及び少なくともEcoRI末端の場合には発現ベクターとの結合のために用いられる上流BamHI付着端及び下流EcoRI付着端を含有する。しかもセクションIII は、セクションII及びIII の最終的結合に用いられる上流SstI部位を有している。
Figure 2004041242

Figure 2004041242


 セクションIで形成されたXbaI〜BamHI断片を、XbaI及びBamHIで開環されたM13mp11ファージベクターに結合する。ベクターを次いでBamHI及びEcoRIで切断することにより再開環し、次いでセクションIIで形成されたBamHI〜EcoRI断片と結合する。この段階で、セクションI及びIIは適切な方向で結合された。次いで別のM13mp11ベクターをBamHI〜EcoRI切断で開環し、しかる後セクションIII で形成されたBamHI〜EcoRI断片と結合した。
 セクションI及びII含有ベクターをXbaI及びSstIで切断する。同様に、セクションIII 含有ベクターをSstI及びEcoRIで切断する。各々の切断で得る2つの断片のうち小断片の両方を、事前にXbaI及びEcoRIで開環されたプラスミドpCFM1156に結合する。この反応の生成物は表XVに示される連続DNA配列含有の発現プラスミドであって、そのDNA配列は大腸菌翻訳開始用のアミノ末端メチオニンコドン(ATG)をもつ完全hpG‐CSFポリペプチドをコードしている(配列番号1参照)。
Figure 2004041242

Figure 2004041242


 いずれの適切なベクターもこのDNA発現のために使用することができるが、発現プラスミドpCFM1156はプラスミドpCFM836 から容易に組立てることができ、その構造は公開欧州特許出願第 136,490号明細書に記載されているpCFM836 をまずNdeIで切断し、次いで両方に存在するNdeI部位が破壊されるようにPolIでブラント末端化する。次いで、ベクターをClaI及びSacIIで切断して、存在するポリリンカーを除去し、しかる後表XVI に示される代替ポリリンカーに結合する。この代替ポリリンカーは、前記アルトンらの操作に従い組立てることができる。なお、プラスミドpCFM836 は、pCFM736 (後述)をBamHIで切断し、下記の断片を挿入することによって得られる。
Figure 2004041242


 発現pCFM1156プラスミドにおける発現制御はλPL プロモーターによるが、これ自体が(大腸菌株K12ΔHtrp から得られるような)CI857リプレッサー遺伝子の制御下にある。
Figure 2004041242


例 7
 この例は、〔Met-1〕hpG‐CSFコードDNA配列によるhpG‐CSFポリペプチドの大腸菌発現に関する。使用された配列は、部分的に合成で、部分的にcDNA由来であった。使用された合成配列は大腸菌優先コドンであった。
 表VII に示されたhpG‐CSF遺伝子含有プラスミドPpo2をHgiAI及びStuIで切断して、約 645塩基対の断片を得たが、この断片は5′末端の7個のリーダー配列残基コドン及び3′非コード領域の約 100塩基対をもつ(表VII に示されるような)成熟hpG‐CSF遺伝子を含有していた。HgiAI切断ではPstI切断の場合と同一の5′の 4塩基付着端を残し、StuIではブラント末端を残す。これにより、PstI及びブラント末端形成制限酵素HincIIで切断されたM13mp8 (Rf)に断片を容易に挿入することができる。M13中で増幅させた後、hpG‐CSF DNAをApaI及びBamHIで切断することにより摘出したが、これはそれぞれhpG‐CSFにおける+3〜+5残基コドン間にまたがるApaI部位、及びM13mp8 制限ポリリンカーにおけるHincII部位の“下流”のBamHI部位において切断されたものである。hpG‐CSFポリペプチドの大腸菌発現を可能にするため、合成断片を下記表XVIIに示されるように製造した。
Figure 2004041242


 表XVIIの分析から調べ得るように、リンカーは、ApaI付着端、hpG‐CSFアミノ末端の最初の 3個の残基を特定するコドン(上記M13DNAのApaI消化で削除されたThr1 ,Pro2 ,Leu3指定コドンを回復させ、かつ大腸菌中で優先的に発現するコドンを採用)、翻訳開始ATG、リボソーム結合部位を付与する24塩基対配列、及びXbaI付着端を有している。
 大腸菌発現用に使用される発現ベクターは、1985年 4月10日に公開されたモリス(Morris )の欧州特許出願第136,490 号明細書においてpCFM536 として記載されたベクターである(更に、pCFM536 含有の大腸菌JM 103,ブタペスト条約に基づく寄託における受託番号、ATCC39934 参照)。簡単にいえば、まずプラスミドpCFM536 をXbaI及びBamHIで切断した。上記hpG‐CSF断片(ApaI/BamHI)及びリンカー(XbaI/ApaI)を次いでそれに結合し、プラスミドp536 Ppo2を形成した。 プラスミドp536 Ppo2を、CI857遺伝子含有プラスミドpMW1(ブタペスト条約に基づく寄託における受託番号、ATCC No.39933)で予め形質転換された大腸菌AM 7株のファージ耐性変異体に組込んだ。形質転換は、pCFM536 前駆体プラスミドに担持された抗生物質(amp)耐性マーカー遺伝子に基づき確認した。LBブロス(アンピシリン50μg/ml)中での細胞培養物を28℃に維持し、A600=0.5 の培養細胞増殖時において培養物を温度42℃に3時間上げて、hpG‐CSF発現を誘導した。培養物の最終ODはA600 =1.2 であった。
 形質転換細胞によるhpG‐CSF発現レベルは、クマシーブル一色素で染色されたSDSポリアクリルアミドゲルにより、総細胞タンパク質 3〜5 %と評価された。
 細胞をJS‐4.2 ローター中3500×gで10分間遠心分離して回収した。水中25%(w/v) の細胞をフレンチ・プレッシャー・セル(French Pressure Cell)に10,000psi (700kg/cm2 )で3回通して破壊した。破壊細胞懸濁液をJA‐20ローター中10,000×gで15分間遠心分離した。ペレットを水に再懸濁し、pH8.7 の1%ラウリン酸50mMトリス中に総タンパク質濃度約 5mg/mlで溶解させた。溶解ペレット物質を15,000×gで10分間遠心分離し、上澄にCuSO4を20mMまで加えた。1時間後、この試料を、例1(B) の操作に従い精製するため、容量及び濃度を調整して、C4HPLCカラムに充填した。
 非有機物含有緩衝液中で調製された更に多量のhpG‐CSFを得るために第二の精製法が開発された。この物質はイン・ビボ研究に適する。細胞ペースト 150gを 1mM DTT約 600mlに再懸濁し、約7000psi (490kg/cm2 )でマントン・グアリン(Manton Gualin)ホモジナイザーに 4回通した。破壊細胞懸濁液を10,000×gで30分間遠心分離し、ペレットを 1%デオキシコール酸、 5mMEDTA、5mM DTT及び 50mM トリスのpH 9の400 mlに再懸濁した。この懸濁液を室温で30分間混合し、10,000×gで30分間遠心分離した。ペレットを水約 400mlに再懸濁し、10,000×gで30分間遠心分離した。ペレットを 2%ザルコシル及び50mMトリスpH8 の 100mlに溶解した。CuSO4 を20μM まで加え、混合物を室温で16時間撹拌し、しかる後、20,000×gで30分間遠心分離した。上澄にアセトン300mlを加えた。この混合物を氷上に20分間おき、しかる後5000×gで30分間遠心分離した。ペレットをpH4 の 6Mグアニジン及び40mM酢酸ナトリウムの 250mlに溶解し、平衡化された1200mlのG‐25カラムに充填し、pH5.4 の20mM酢酸ナトリウムで操作した。hpG‐CSFピーク(約 400ml)をプールし、pH5.4 の20mM酢酸ナトリウムで平衡化された15mlのCMセルロースカラムに加えた。充填後、カラムを60mlのpH5.4 の20mM酢酸ナトリウム及び25mM塩化ナトリウムで洗浄し、しかる後カラムを 200mlのpH5.4 の20mM酢酸ナトリウム及び37mM塩化ナトリウムで溶出させた。この溶出液 150mlを10mlに濃縮し、平衡化された 300mlのG‐75カラムに充填し、pH5.4 の20mM酢酸ナトリウム及び 100mM塩化ナトリウムで操作した。ピーク画分35mlをプールし、フィルター滅菌した。hpG‐CSFの最終濃度は 1.5mg/mlであったが、ゲル分析で測定した場合純度95%以上であり、hpG‐CSF 0.5mgにつき発熱性物質を 0.5ng以下で含有していた。発熱性物質レベルは、カブトガニ遊走細胞溶離物(LAL)試験キット〔エム・エー・バイオプロダクツ(M.A. Bioproducts)、ウォーカースビル、メリーランド〕により測定した。

例 8
 この例は、17,36,42,64及び74位に存在するシステイン残基が各々適切なアミノ酸残基で置換されたhpG‐CSF類縁体を産生する組換え方法の利用に関する。
 1985年 2月28日に公開されたスーザ(Souza)らの公開PCT出願第WO85/00817号明細書の特定部位突然変異誘発は、下記表XVIII に示された大きさが20〜23塩基の合成オリゴヌクレオチドを用いて、下記プラスミドp536 Ppo2の〔Met-1〕コードDNA上で行なわれた。オリゴヌクレオチド1 は〔Ser17〕hpG‐CSFコード遺伝子の形成が可能で、オリゴヌクレオチド2は〔Ser36〕hpG‐CSFの形成が可能であった。
Figure 2004041242


 CysからSerへの限定的突然変異誘発は、鋳型としてp536 Ppo2から単離されたXbaI‐BamHI hpG‐CSF断片含有のM13mp10を用いて実施した。Cys‐Ser置換体含有の各M13mp10由来のDNAをXbaI及びBamHIで処理した。得た断片を発現ベクターpCFM746 に組込んでクローニングし、発現産物を例7のように単離した。
 プラスミドpCFM746 は、1985年 2月28日に公開されたモリス(Morris)の公開PCT出願第WO85/00829号明細書に記載されているように、ClaI及びBamHIでプラスミドpCFM736 を切断し、存在するポリリンカーを除去し、下記ポリリンカーで置換することにより組立てることができる。
Figure 2004041242


 なお、pCFM736 は、pCFM536(ATCC39934)から、次の手順によりpCFM636 を経由し、組立てることができる。まず、pCFM536 をEcoRI部分的切断及びSstI切断することにより、アンピシリン耐性遺伝子配列及び安定化配列(par)を欠失させた後、EcoRI部位は、リンカーによってAatII部位に変換する。一方、プラスミドTn5 (Beck等のGene, 19, p 327-336 (1982)あるいはAuerswald 等の Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.,45 p107-113 (1981)に全塩基配列が示されている。)から、カナマイシン耐性遺伝子配列を含むSmaI/HindIII 断片領域を、SstIリンカーをSmaI粘着末端に、且つNdeIリンカーをHindIII 粘着末端に付加することにより、SstI/NdeI断片として得る。また、pSC101 (受託番号、ATCC 37032)から、par 遺伝子を含むHincII/AvaI断片領域を、HincII部位は最初にSalIリンカーで次いでAatIIリンカーで処理し、また、AvaI部位は最初にBamHIリンカーで次いでNdeIリンカーで処理し、AatII/NdeI断片として得る。
 pCFM536 の大きな断片(AatII/SstI)、カナマイシン耐性遺伝子の断片(SstI/NdeI)およびpar 遺伝子断片(AatII/NdeI)を混ぜ合わせて結合し、pCFM636 が得られる。
 pCFM636 をAatII及びXbaIにより切断後、下記のAatIIからXbaIまでの断片を挿入し、pCFM736 を得る。
Figure 2004041242


 本発明のCys‐Ser(CysからSerへの)類縁体の精製操作において、細胞ペースト約10〜15gを1mMDTT40mlに再懸濁し、フレンチ・プレッシャー・セルに10,000psi (700kg/cm2 )で3回通した。破壊細胞懸濁液を1000×gで30分間遠心分離した。ペレットをpH9 の 1%DOC, 5mMEDTA, 5mM DTT,50mMトリスに再懸濁し、室温で30分間混合した。混合物を10,000×gで30分間遠心分離し、H2 O 40mlに再懸濁し、10,000×gで30分間再遠心分離した。ペレットをpH8 の 2%ザルコシル、50mM DTT,50mMトリスの10mlに溶解した。1時間混合後、混合物を20,000×gで30分間遠心分離して清澄化し、しかる後平衡化された 300mlのG‐75カラムに充填し、pH8 の 1%ザルコシル、50mMトリスで操作した。類縁体含有画分をプールし、少なくとも1日間空気にさらして空気酸化させた。最終濃度は 0.5〜5mg/mlの範囲であった。

例 9
 この例において、哺乳動物細胞発現系は、hpG‐CSF DNAの活性ポリペプチド産物が哺乳動物細胞(COS‐1,ATCC CRL‐1650)中で発現されかつそこから分泌されるか否かを確認するために、工夫された。この系は、ウォンら、サイエンス、第228 巻、第 810〜815 頁、1985年〔Wong,et al., Science, 228, 810-8 15 (1985)〕及びリーら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第82巻、第4360〜4364頁、1985年〔Lee, et al., Proc. Natl. Acad. Sci.(USA),82, 4360‐4364(1985)〕におけるヒトGM‐CSFに属する残基配列を有したリーダーポリペプチドの後に位置して〔Ala1〕hpG‐CSFをコードする、部分的合成部分的cDNA由来構造体の発現分泌プロセッシングを介して、hpG‐CSFポリペプチド類縁体を分泌させるように考え出された。
 本発明のポリペプチド産物の予備的発現研究のために使用される発現ベクターは、ウィルス性プロモーター/レギュレーターDNA配列の制御下で挿入外来性DNAを哺乳動物細胞発現すると共に哺乳動物細胞及び大腸菌の双方において自律複製するように考え出されたpBR322 及びSV40DNAの双方を組込んでいる“シャトル(shuttle)”ベクターであった。大腸菌HB101 に担持されたこのベクターpSVDM‐19は1985年 8月23日にアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション、123 01 パークローン・ドライブ、ロックビル、メリーランドにブタペスト条約に基づいて寄託され、受託番号ATCC第53241 号が付された。
 発現ベクター組立てに必要な具体的操作は下記のとおりであった。リーダーコードDNA配列を下記表XXに示したように合成した。
Figure 2004041242


 表XXに示されているように、配列は、HindIII 及びApaI付着端、及びヒトGM‐CSFの“リーダー”に属する17個のアミノ酸残基のコドンを有している。アラニン残基、プロリン残基及びロイシン残基を特定するコドンが続いている。プロリン及びロイシン残基はhpG‐CSFの+2及び+3位に存在するアミノ酸の複製で、一方アラニン残基はhpG‐CSF以外のGM‐CSFの開始アミノ末端(+1)残基の複製である。スレオニンのアラニンによる置換は、GM‐CSF分泌プロセッシングに通常伴う細胞メカニズムによるGM‐CSFリーダーの適切な宿主細胞“プロセッシング・オフ(processing off)”を促進させるために考え出された。
 プラスミドpSVDM‐19をKpnIで切断し、その部位をクレノウ酵素でブラント末端化した。次いでDNAをHindIII で切断した。得られる大断片を表VII に示されるHindIII /PvuII断片(HindIII 断片及びPvuIIでの部分的切断から得るhpG−CSFコード領域を完全に含む2番目に大きな断片としてプラスミドPpo2から単離された)と混合して結合し、プラスミドpSV‐Ppo1を形成した。表XXの人工GM‐CSFリーダー配列断片を次いで(HindIII 及びApaIで切断後の)pSV‐Ppo1に結合し、プラスミドpSVGM‐Ppo1を得た。
 プラスミドpSVGM‐Ppo1DNAのリン酸カルシウム沈降物( 1〜5 μg)を、ウィグラーら、セル、第14巻、第 725〜731 頁、1978年〔Wigler, et al.,Cell, 14, 725-731 (1978)〕に実質的に記載されているようなCOS‐1細胞の2個の60mmプレートに組込んだ。コントロールとして、プラスミドpSVDM‐19もCOS‐1細胞に組込んだ。組織培養上澄を形質転換後5日目に回収し、hpG‐CSF活性について試験した。培養上澄からの〔Ala1〕hpG‐CSF収量は、1〜2.5 μg/mlであった。
 COS‐1細胞における〔Ala1〕hpG‐CSF産物コードプラスミドpSVGM‐Ppo1の上首尾な発現の後、ヒトGM‐CSFリーダー配列を含む一方で、スレオニン残基(hpG‐CSFの1位に元来存在する)のコドンをその位置のアラニンのコドンに代わって有する他のベクターを組立てた。簡単に言えば、オリゴヌクレオチドが特定部位の突然変異誘発(SDM)用に合成された(5′CAGCATCTCTACACCTCTGGG)。pSVGM‐Ppo1におけるHindIII ‐BamHI hpG‐CSF断片をSDM用にM13mp10と結合した。1位にThrコドンを有する新規合成hpG‐CSF遺伝子をHindIII 及びEcoRIで切断して単離した。断片を次いで、同一の2つの制限エンドヌクレアーゼによる切断から得られたpSVDM‐19に組込んで複製した。得られるベクターpSVGM‐Ppo(Thr)をCOS細胞に組込んで形質転換したが、培養上澄中で測定されるhpG‐CSFの収量は 1〜5 μg/mlの範囲であった。
 最後に、単離法が例5に記載されているゲノム配列を用いて、hpG‐CSFの哺乳動物細胞発現用の発現ベクターを形成した。更に詳しくは、pSVDM‐1 9をKpnI及びHindIII で切断し、大断片を表XXI に示されるHincIII 及びNcoI粘着端含有合成リンカーとの四者結合に使用した。エキソン1含有NcoI‐BamHI断片はpBR322(8500hpG‐CSFゲノムサブクローン)から単離し、エキソン 2〜5 含有BamHI‐KpnI断片はプラスミドpBR322(8500hpG‐CSFゲノムサブクローン)から単離した。得られる哺乳動物発現ベクターpSV/ghG‐CSFは形質転換COS細胞から 1〜2.5 μg/mlのhpG‐CSFを産生した。
Figure 2004041242


例 10
 この例は、本発明の組換えポリペプチド産物の物理的及び生物学的性質に関する。
1.分子量
 例7における大腸菌発現の組換えhpG‐CSF産物は(表VII の演繹的アミノ酸分析から予測されるように)還元SDS‐PAGEで測定した場合の見掛分子量が18.8キロダルトンであったが、一方例1で記載したようにして精製された天然単離体は見掛の分子量が19.6キロダルトンであった。天然単離体と会合したN‐グリカン類の存在は、表VII のhpG‐CSF一次配列中にアスパラギン残基が欠損していることから、実際上無視することができ、したがって、操作はO‐グリカン類が天然単離体及び非グリコシド組換え産物間の分子量差の原因であるか否かを調べられるように工夫した。天然単離物質約5μgをノイラミニダーゼ〔カルビオケム(Calbiochem )、ラホラ、カリフォルニア〕で処理し、試料0.5 μgを取出し、残留物質をO‐グリカナーゼ〔エンド‐x‐n‐アセチルガラクトースアミニダーゼ、ジェンザイム(Genzyme)、ボストン、マサチューセッツ〕4mU と37℃でインキュベートした。一部をインキュベートの 0.5,2及び4時間後に取出した。これら試料を大腸菌由来組換え物質と並べてSDS‐PAGEに付した。ノイラミニダーゼ処理後、単離体の見掛分子量は19.6キロダルトンから19.2キロダルトンに変わったが、このことはシアル酸残基の離脱を示唆する。O‐グリカナーゼ処理の2時間後、分子量は18.8キロダルトンに変わったが、これは大腸菌由来物質の見掛分子量と一致する。ノイラミニダーゼ及びO‐グリカナーゼに対する炭水化物構造体の感受性から判断すると炭水化物成分として下記構造体が示唆される:N‐アセチルノイラミン酸‐α(2-6) ガラクトースβ(1-3) N‐アセチルガラクトサミン‐R(Rはセリン又はスレオニンである)。
2. 3 H‐チミジン取込み
 ヒト骨髄細胞の増殖誘導を3H‐チミジンの取込み増加に基づき分析した。健康ドナー者のヒト骨髄をフィコール‐ハイパック(Ficoll ‐Hypaque)(1.077g/ml、ファルマシア)による密度分離に付し、低密度細胞を10%牛胎児血清及びグルタミンペニシリン・ストレプトマイシン含有のイスコブ培地〔Gibco(ギブコ)〕に懸濁した。次いで、ヒト骨髄細胞 2×104 個を96個の平底ウェルプレート中コントロール培地又は例7の組換え大腸菌物質と一緒に37℃空気中 5%CO2で2日間インキュベートした。試料を重複して分析したが、濃度は10,000倍以上異なっていた。培養物に次いで 3H‐チミジン〔ニュー・イングランド・ヌクレア(New England Nuclear)、ボスマン、マサチューセッツ〕 0.5μCi /ウェルを加えた。 3H‐チミジン取込み量をベンチュアら、ブラッド、第61巻、第 781頁、1983年〔Ventua, et al., Blood, 61, 7 81 (1983)〕に記載されているように測定した。この分析において、ヒトhpG‐CSF単離体は、コントロール上澄よりも約 4〜10倍高いレベルで、ヒト骨髄細胞中に3H‐チミジンを取込ませることができる。例7の大腸菌由来のhpG‐CSF物質も同様の性質を有していた。
 2回目のヒト骨髄細胞増殖研究は、例9で製造された形質転換COS‐1細胞の培養培地を用いて実施され、同様の結果を与えたが、このことはコードされたポリペプチド産物が活性物質として培地中に実際に分泌されることを意味する。
3.WEHI‐3B D + 分化誘導
 マウス骨髄単球性白血病細胞WEHI‐3BD+ の分化を誘導する組換え大腸菌由来物質の能力を、メトカーフ、インターナショナル・ジャーナル・オブ・キャンサー、第25巻、第 225巻、1980年〔Metcalf, Int. J.Cancer, 25,225 (1980)〕に記載されているように、半固体寒天培地中で分析した。組換えhpG‐CSF産物及び培地コントロールを30℃空気中 5%CO2 で7日間60個以下のWEHI‐3B D+ 細胞/ウェルと一緒にインキュベートした。試料を24個の平底ウェルプレート中でインキュベートしたが、濃度は2000倍以上異なっていた。コロニーを未分化、部分的分化又は全部分化のコロニーに分類し、コロニー数を顕微鏡で計測した。大腸菌組換え物質は分化を誘導することが判明した。
4.CFU‐GM,BFU‐E及びCFU‐GEMM分析
 多分化能性ヒトG‐CSF(hpG‐CSF)の天然単離体及び組換え多分化能性ヒトG‐CSF(hpG‐CSF)は、ヒト骨髄細胞を増殖かつ分化させることが判明した。これらの活性は、CFU‐GM〔ブロックスマイヤーら、エクスペリメンタル・ヘマトロジー、第 5巻、第87頁、1971年(Broxmeyer, et al., Exp. Hematol., 5, 87 (1971))〕、BFU‐E及びCFU‐GEMM試験法〔ルーら、ブラッド、第61巻、第250 頁、1983年(Lu, et al., Blood, 61, 250 (1983))〕により、健康ヒトボランティアの低密度非付着性骨髄細胞を用いて測定した。各々500 単位のhpG‐CSF又はrhpG‐CSFを用いたCFU‐GM,BFU‐E及びCFU‐GEMM生物学的活性の比較は、下記表XXIIに示されている。
 すべてのコロニー分析は、低密度非付着性骨髄細胞を用いて実施した。ヒト骨髄細胞をフィコールハイパック(密度 1.077g/cm3 、ファルマシア)による密度分離に付した。低密度細胞を次いで牛胎児血清含有のイスコブ修正ダルベッコ(Dulbecco)培地に再懸濁し、ファルコン組織培養皿〔No.3003 、ベクトン・ディケンソン(Becton Dikenson)コッキーズビル、メリーランド〕上に付着させるために37℃で 1.5時間入れておいた。
Figure 2004041242


 培地コントロールは、10%FCS、 0.2mMヘミン及び組換えエリスロポエチン1単位含有イスコブ修正ダルベッコ培地であった。
 CFU‐GM分析の場合では、標的細胞は、補充マッコイ(McCoy) 5A培地及び10%熱不活化牛胎児血清を含有する 0.3%寒天培地 1ml中 1×105 個で培養した。培養7日目、培養物のコロニー(凝集物当たり細胞数40以上)について計数し、形態を観察した。コロニー数は、4個の同一プレートから測定される平均±SEMとして示されている。
 BFU‐E及びCFU‐GEMM分析の場合では、細胞(1×105)をイスコブ修正ダルベッコ培地〔ギブコ(Gibco)〕、 0.8%メチルセルロース、30%牛胎児血清、0.05nM2‐メルカプトエタノール、 0.2mMヘミン及び組換えエリスロポエチン 1単位の混合物 1mlに加えた。皿を 5%CO2 及び 5%O2 湿気雰囲気中でインキュベートした。レミング・バイオインスツルメンツ(Reming Bioinstruments)〔シラキュース(Syraccuse)、ニューヨーク〕の酸素減少器により低酸素圧にした。コロニーをインキュベート14日後に計測した。コロニー数は、2個の同一プレートから測定される平均±SEMとして示されている。
 CFU‐GM分析で形成されたコロニーは、すべて、クロロアセテートエステラーゼ陽性でかつ非特異的エステラーゼ(α‐ナフチルアセテートエステラーゼ)陰性であることが判明し、顆粒球型のコロニーと一致した。天然hpG‐CSF及びrhpG‐CSFは双方とも、CFU‐GM分析における連続希釈により分析した場合、約1×108 U/mg純粋タンパク質の特異的活性を有することが判明した。表XXIIのBFU‐E及びCFU‐GEMMデータは、3つの別個の実験を表示しており、天然hpG‐CSFに関し過去に報告されたデータと類似する。rhpG‐CSFが大腸菌中で産生されていることから、極めて純粋でありかつ他の潜在的哺乳動物成長因子を含有しないことに注目することは重要である。このように、rhpG‐CSFは、組換えエリスロポエチンの存在下で加えられた場合に、混合コロニー形成(CFU‐GEMM)及びBFU‐Eを補助することができる。
5.細胞結合試験
 WEHI‐3B(D+ )細胞及び新たに診断された白血病患者のヒト白血球は
125I‐標識マウスG‐CSFに結合するが、この結合は未標識G‐CSF又はヒトCSF‐βの添加により競合させることができる、と過去に報告された。ヒト及びマウスの白血球に対して 125I‐hpG‐CSFの結合に競合する天然hpG‐CSF及びrhpG‐CSFの能力に関し試験した。高度に精製された天然hpG‐CSF(純度95%以上、1μg)がヨウ素化〔デジェドーら、アナリティカル・バイオケミストリー、第 127巻、第 143頁、1982年(Tejedor, et al., Anal. Biochem., 127, 143 (1982))〕され、ゲル濾過及びイオン交換クロマトグラフィーにより反応物から分離された。天然 125I‐hpG‐CSFの比活性は約 100μCi /μgタンパク質であった。マウスWEHI‐3B(D+ )及び2種のヒト未梢血骨髄白血病細胞(ANLL、1つはM4、他はM5Bとして分類される)を125I‐hpG‐CSFとの結合能について試験した。
 マウス及び新しく得たヒトの未梢血骨髄白血病細胞をPBS/ 1%BSAで3回洗浄した。WEHI‐3B(D+ )細胞(5×106 個)又は新鮮白血病細胞(3×106 個)を、各種濃度(容量:10μl )の未標識hpG‐CSF,rhpG‐CSF又はGM‐CSFの存在又は非存在下、及び 125I‐hpG‐CSF(約100,000cpm又は1ng)の存在下、PBS/ 1%BSA(100μl )中0 ℃90分間 2連でインキュベートした(総容量:120 μl )。細胞を次いで 350μl プラスチック製遠心管中の氷冷FCS 200μl に再懸濁して積層し、遠心分離(1000×g;1分間)した。ペレットを管端部切断により集め、ペレット及び上澄を別々にガンマカウンター〔パッカード(Packard)〕で計測した。
 特異的結合量(cpm)は、競合物の非存在下における総結合量(2連の平均)‐100 倍過剰の未標識hpG‐CSFの存在下における結合量(非特異結合量)(cpm)として計算した。非特異的結合量は、最大で、WEHI‐3B(D+)細胞の場合が2503cpm ,ANLL(M4)の細胞の場合が1072cpm ,ANLL(M5B)細胞の場合が1125cpm であった。実験1及び2は同一の 125I‐hpG‐CSF調製物を用いて異なる日に実施したが、hpG‐CSF2000単位の場合の阻害率においては内部的一貫性を示す。得られたデータは下記表XXIII に示されている。
Figure 2004041242


 表XXIII で示されているように、 125I‐hpG‐CSFはWEHI‐3B(D+)白血病細胞との結合性を示した。結合は、GM‐CSFではなく未標識天然hpG‐CSF又はrhpG‐CSFにより用量依存的に阻害された。しかも、ヒト骨髄単球性白血病細胞(ANLL,M4)に対する天然hpG‐CSFの結合も観察された。これら細胞への結合性は、液体培養物中の天然hpG‐CSFに応じて、形態学的に判断されるマクロファージへの分化と比較される。別の患者の単球性白血病細胞(ANLL,M5B)との天然 125I‐hpG‐CSFの結合性の欠如は、特定の白血病が特異的に発現したか、又はhpG‐CSFに対するレセプターを欠くことを示唆する。天然hpG‐CSFと同様に天然 125I‐標識‐hpG‐CSFの結合に対して競合するrhpG‐CSFの能力は、レセプターが十分等しく両型を認識することを示唆する。
 白血病細胞との天然 125I‐標識hpG‐CSFの結合性を証明するこれらの研究は、培養物中で急性前骨髄性白血病(M3)の第1患者及び急性骨髄芽球性白血病(M2)の第2患者から得た低密度骨髄球の顆粒球及び単球への分化を誘導する天然hpG‐CSFの能力と対比される。各患者からの細胞を、培地単独で又はrhpG‐CSF 1×105 単位存在下で、4日間培養した。培地単独でインキュベートされたM3コントロール培養物からの細胞は前骨髄球のままであったが、一方rhpG‐CSFの存在下で培養された細胞は、後骨髄球、巨大杆状核型‐分葉核型好中球及び単球からなる骨髄型成熟細胞を示した。この患者での現実の分化は、 100個の細胞について、コントロールの場合が 100%前骨髄球であり、rhpG‐CSF処理細胞の場合が22%芽球+前骨髄球、 7%骨髄球、35%後骨髄球、20%杆状核型+分葉核型好中球、14%単球及び 2%マクロファージであった。注目されるのは、多形核顆粒球の1つが顕著なアウエル小体をまだ有していたという事実であるが、このことは少なくともこの細胞が白血病系のクローンに属する分化細胞であることを示唆する。骨髄芽球性白血病(M2)の第2患者からの細胞もrhpG‐CSFの存在又は非存在下で4日間培養した。培地単独で培養されたM2細胞の視覚分析では、大きな“芽球様”細胞を示したが、そのうちのいくつかは核小体を有していた。M2細胞のいくつかは、rhpG‐CSFで処理した場合に、好中球の中心にアウエル小体が残った成熟分葉核型好中球に分化したが、このことは白血病系のクローンに属する細胞で生じる分化を示唆した。形態学的に評価された細胞100 個の実際の分化では、コントロール細胞は100 %芽球からなることが示された。rhpG‐CSF処理細胞は、43%芽球、 1%骨髄球、15%後骨髄球、28%杆状核型+分葉核型好中球、 2%前単球及び11%単球からなっていた。白血病細胞が、また 4つの異なる濃度(5×103 , 1×104 、 2.5×104 及び 5×104 U/ml、データ示さず)のrhpG‐CSF存在下で分化に関して試験された。試験されたrhpG‐CSFの最低濃度(5×103U/ml)の場合であっても、M3(50%)及びM2(37%)白血病細胞の著しい分化が生じた(細胞は骨髄球以上に分化した)。
6.免疫試験
 免疫試験用のポリクローナル抗体を産生するために使用された抗原は、例1(B) で調製されたようにしてヒト膀胱癌細胞系5637(IA6)から精製された多分化能性G‐CSFであった。この物質は、ポリアクリルアミドゲルの硝酸銀染色に基づき、純度85%と判定された。 6週令Balb /Cマウスを抗原の多部位注射により免疫した。抗原をPBSに再懸濁し、等量のフロイント(Freund)完全アジュバントで乳化させた。投与量は抗原 5〜7 μg/マウス/注射であった。追加免疫注射は、等量のフロイント不完全アジュバントで乳化された同量の抗原で18日後に投与した。 4日後、マウス血清を採取し、ヒト多分化能性G‐CSFに特異的な抗体について試験した。
 ホルダー中のダイナテック・イムロンII・リムーバウェル(Dynatech ImmulonII Removawell)ストリップ〔ダイナテック・ラボラトリー社(Dynateck Lab., Inc.)、アレクサンドリア、バージニア〕をpH9.2 の50mM炭酸‐重炭酸緩衝液中のhpG‐CSF 5μg/mlで被覆した。ウェルを容量50μl 中の0.25μgで被覆した。抗原被覆プレートを室温で2時間及び 4℃で一夜インキュベートした。溶液を捨て、プレートを 5%BSA含有PBS中で30分間インキュベートして、反応表面を保護した。この溶液を捨て、希釈された免疫前血清又は試験血清をウェルに加え、室温で2時間インキュベートした。血清は 1%BSA含有のpH7.0 のPBSで希釈した。血清溶液を捨て、プレートをワッシュ・ソルーション(Wash Solution)(KPL、ゲイザースブルグ、メリーランド)で3回洗浄した。pH7.0 の 1%BSA含有PBS50μl 中の放射性ヨウ素化ウサギ抗マウスIgG(NEN、ボストン、マサチューセッツ)約200,000 cpm を各々のウェルに加えた。室温で 1.5時間インキュベートした後、溶液を捨て、プレートをワッシュ・ソルーションで5回洗浄した。ウェルをホルダーから取外し、ベックマン5500ガンマカウンターで計測した。高力価マウス血清は、 1:100 希釈時において、相当する免疫前血清よりも12倍以上高い反応性を示した。
 大腸菌由来hpG‐CSFの免疫学的性質は、哺乳動物細胞由来hpG‐CSFに特異的な高力価マウス血清に対する反応性により測定した。純度90%の大腸菌由来タンパク質0.25μgを容量50μl のイムロンIIリムーバウェルに被覆し、マウス血清を上記のように分析した。
 高力価マウス血清は、 1:100 希釈時において、相当する免疫前血清よりも24倍高い反応性を大腸菌由来物質に対して示した。
7.セリン類縁体生物学的試験
 例8で製造された〔Ser17〕hpG‐CSF,〔Ser36〕hpG‐CSF,〔Ser42〕hpG‐CSF,〔Ser64〕hpG‐CSF及び〔Ser74〕hpG‐CSF産物を、 3H‐チミジン取込み、CFU‐GM及びWEHI‐3B D+ 分析によりhpG‐CSF活性に関し分析した。各分析において、〔Ser17〕類縁体は天然構造組換え分子の活性に匹敵する活性を有していた。他の類縁体は、 3H‐チミジン取込み分析では 1/100 の活性、CFU‐GM分析では 1/250 の活性、及びWEHI‐3B D+分析では 1/500 の活性を有していた。このデータは、36,42,64及び74位のシステインが十分な生物学的活性のために必要であるという考え方を支持する。
8.イン・ビボ生物学的試験
 アルゼット(AlzetR )浸透圧ポンプ〔アルゼット社(Alzet Corp.) パロ・アルト(Palo Alto)、カリフォルニア;モデル2001〕を内在型右頚静脈血管カテーテルに連結し、7匹の雄性シリアンゴールデンハムスターの皮下に植込んだ。4つのポンプは緩衝液〔20mM酢酸ナトリウム(pH5.4 )及び37mM塩化ナトリウム〕及び大腸菌由来hpG‐CSF 1.5mg/mlを含有し、3つは緩衝液のみを含有していた。浸透圧ポンプに必要な排出速度は、7日目まで 1μl /hrであった。ポンプ植込み後3日目において、4匹の処理ハムスターの平均顆粒球数は3匹の(緩衝液)コントロールの場合より6倍高く、顆粒球数増加は総白血球が4倍増加したことに反映されていた。赤血球数は処理により変化しなかった。これらの結果は、組換え物質が哺乳動物において顆粒球の産生及び/又は放出を特異的に高めることを示している。
 hpG‐CSFの天然対立型に加え、本発明ではhpG‐CSFのポリペプチド類縁体及びhpG‐CSF断片のような他のhpG‐CSF産物も包含する。上記アルトンらの出願公開(WO/83/04053)の操作に従い、1以上の残基の同一性又は位置に関し本明細書で記載されたものとは異なる(例えば、置換、端部及び中間部付加、並びに削除)一次構造をもつポリペプチドの微生物での発現をコードする遺伝子を容易に考えかつ製造することができる。一方、cDNA及びゲノム遺伝子の修正は、周知の特定部位突然変異誘発法によって容易に実施することができ、しかもそれらの類縁体及び誘導体を産生するために利用することができる。このような産物はhpG‐CSFの生物学的性質のうち少なくとも1つを有するが、他の点では異なる可能性がある。例えば、考えられる本発明の産物としては、例えば削除により短縮された産物、加水分解に対しより安定な産物(したがって、天然体よりも顕著な又は持続性の効果を有する可能性がある)、1以上の潜在的O‐グリコシル化部位を削除して修正された産物(酵母菌産生産物に関しより高い活性を有するようになる)、1以上のシステイン残基が削除され又はアラニンもしくはセリン残基等で置換され、しかも微生物系から活性型でより容易に単離され得る産物、又は、1以上のチロシン残基がフェニルアラニンで置換され、しかも標的細胞上のhpG‐CSFレセプターにいくぶん容易に結合し得る産物がある。更には、hpG‐CSFの連続アミノ酸配列又は二次構造の一部のみを複製したポリペプチド断片も包含されるが、この断片は1つの活性(例えば、レセプター結合性)を有するが、他の活性(例えば、コロニー増殖刺激活性)を有しない可能性がある。本発明のいずれの1以上の産物が、治療的効用〔ウァイラントら、ブルート、第44巻、第 173〜175 頁、1982年(Weiland, et al., Blut, 44, 173-175 (1982))参照〕又はhpG‐CSF拮抗作用分析のような他の関連における効用をもつために、活性が必ずしも必要とされないことは注目に値する。競合的拮抗剤は、例えばhpG‐CSFの過剰産生時に非常に有用である可能性がある。
 本発明の他の側面によれば、hpG‐CSFポリペプチドをコードする本明細書に記載されたDNA配列は、天然産物単離体の分析的プロセッシングにもかかわらず今まで得られていなかったこの哺乳動物タンパク質のアミノ酸配列に関して、それが情報を提供することから、価値がある。DNA配列は、様々な組換え技術によるhpG‐CSFの大規模な微生物での合成を実施するために使用される産物としても著しい価値がある。その他に、本発明により提供されるDNA配列は、新規かつ有用なウイルス性または環状プラスミドDNAベクター、新規かつ有用な形質転換された及びトランスフェクトされた(transfected) 微生物原核及び真核及び真核宿主細胞(細菌、酵母菌細胞及び哺乳動物の培養細胞を含む)、hpG‐CSF及びその関連産物の発現が可能なかかる微生物宿主細胞の新規かつ有用な培養増殖方法を開発するために使用される。本発明のDNA配列は、hpG‐CSF及び関連タンパク質をコードするヒトゲノムDNA並びに他の哺乳動物種のcDNA及びゲノムDNA配列を単離するための標識プローブとして使用される、極めて適切な物質でもある。DNA配列は、(例えば、昆虫細胞中での)タンパク質合成の様々な代替的方法又はヒト及び他の哺乳動物における遺伝子療法にも使用することができる。本発明のDNA配列は、hpG‐CSF及びhpG‐CSF産物の大規模産生用の真核細胞“宿主”として機能し得る遺伝子転換哺乳動物種を開発するためにも使用し得る、と期待されている。一般的には、パルミターら、サイエンス、第 222巻、第4625号、第 809〜814 頁、1983年〔Palmiter, et al., Science, 222(4625), 809-814 (1983)〕参照。
 本発明のhpG‐CSF断片及びポリペプチド類縁体の応用例の中には、天然タンパク質、糖タンパク質及び核タンパク質中に存在するアミノ酸配列を実質的に複製した合成ペプチドの免疫学的活性に関する報告がある。更に詳しくは、比較的低分子量のポリペプチドは、ウィルス抗原、ポリペプチドホルモンその他のような生理学的に重要なタンパク質の免疫反応と時間及び程度が類似した免疫反応に関係することが示された。このようなポリペプチドの免疫反応の中には、免疫学的に活性な動物における特異的抗体産生の賦活化が含まれる。例えば、レーナーら、セル、第23巻、第 309〜310 頁、1981年〔Lerner, et al., Cel l,23, 309-310 (1981)〕、ロスら、ネーチャー、第 294巻、第 654〜656 頁、1981年〔Ross, et al.,Nature, 294, 654‐656 (1981)〕、ワルターら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第77巻、第5197〜5200頁、1980年〔Walter, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 77 , 5197-5200 (1980) 〕、ラーナーら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第78巻、第3403〜3407頁、1981年、ワルターら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第78巻、第4882〜4886頁、1981年;ウォン(Wong)ら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第78巻、第7412〜7416頁、1981年;グリーン(Green)ら、セル、第28巻、第 477〜487 頁、1982年;ニッグ(Nigg)ら、プロシーディングス・オブ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンス(USA)、第79巻、第5322〜5326頁、1982年;バロン(Baron) ら、セル、第28巻、第395〜404 頁、1982年;ドリーズマン(Dreesman)ら、ネーチャー、第 295巻、第 185〜160 頁、1982年;及びラーナー、サイエンティフィック・アメリカン、第248 巻、第 2号、第66〜74頁、1983年〔Lerner, Scintific American, 248, No.2, 66-74(1983) 〕参照。更に、ペプチドホルモンの二次構造をほぼ有するもののそれらの一次構造配列を有していない合成ペプチドの生物学的及び免疫学的活性に関する、カイザーら、サイエンス、第 223巻、第 249〜255 頁、1984年〔Kaiser, et al., Science,223, 249-255 (1984)〕参照。
hpG‐CSF遺伝子の部分的な制限エンドヌクレアーゼ地図である。
 配列番号1:Xaaは非存在またはMetを表す。

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