CN101293920B - 脑膜炎奈瑟球菌抗原和组合物 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了脑膜炎奈瑟球菌的蛋白质,包括氨基酸序列和相应的核苷酸序列。这些蛋白质预计可用作疫苗和/或诊断的抗原。
Description
本申请是申请日为1999年4月30日、申请号为200510072807.7、发明名称为“脑膜炎奈瑟球菌抗原和组合物”的中国专利申请的分案申请,该申请是申请日为1999年4月30日、申请号为99808145.0、发明名称为“脑膜炎奈瑟球菌抗原和组合物”的中国专利申请的分案申请。
本申请是下列美国临时专利申请的部分续展申请,要求其中每件专利申请的优先权,并且每件专利申请都全部引入本文作为参考:60/083,758(1998年5月1日提交)、60/094,869(1998年7月31日提交)、60/098,994(1998年9月2日提交)、60/099,062(1998年9月2日提交)、60/103,749(1998年10月9日提交)、60/103,794(1998年10月9日提交)、60/103,796(1998年10月9日提交)、和60/121,528(1999年2月25日提交)。
技术领域
本发明涉及下列细菌菌种的抗原:脑膜炎奈瑟球菌(Neisseria meningitidis)和淋病奈瑟球菌(Neisseria gonorrhoeae)。本发明涉及脑膜炎奈瑟球菌抗原和组合物。
背景技术
脑膜炎奈瑟球菌(Neisseria meningitidis)是不能动的、对人有致病性的革兰阴性双球菌。脑膜炎奈瑟球菌聚居在咽喉处,引起脑膜炎,而且偶尔不引起脑膜炎而引起败血病。脑膜炎奈瑟球菌与淋病奈瑟球菌密切相关,然而脑膜炎球菌与淋球菌明显不同的一个特征是,所有病原性脑膜炎双球菌中存在多糖荚膜。
脑膜炎奈瑟球菌会引起地方性和流行性疾病。在美国,其发病率为每年每100000人有0.6-1人,爆发时可以高得多(见Lieberman等人,(1996)″血清型A/C脑膜炎奈瑟球菌寡糖-蛋白偶联疫苗在幼儿中的安全性和免疫原性″,JAMA 275(19):1499-1503;Schuchat等人(1997)“1995年美国的细菌性脑膜炎”,新英格兰医学杂志(N.Engl.J.Med.)337(14):970-976)。在发展中国家,地方性疾病发病率要高得多,在流行时,发病率可高达每年每100000人500起。该病的死亡率在美国很高,为10-20%,在发展中国家则要高得多。在引入了抗流感嗜血杆菌(haemophilus influenzae)偶联疫苗后,脑膜炎奈瑟球菌是引起美国所有年龄人群中细菌性脑膜炎的主要原因(Schuchat等人(1997)同上)。
根据该菌的荚膜多糖,已经鉴定出12种脑膜炎奈瑟球菌的血清型。A型是亚撒哈拉-非洲地区流行病中最常见的病原体。B型和C型血清型菌是导致美国以及大多数发达国家内大多数病例的原因。W135和Y型血清型菌是导致美国和发达国家的其余病例的原因。目前使用的脑膜炎球菌疫苗是由血清型A、C、Y和W135组成的四价多糖疫苗。尽管其在青年和成人中有效,但是它诱导了的免疫应答和短期的保护作用,并且不能用于婴儿[例如,见发病率和死亡率每周报道,46卷,PR-5(1997)]。这是因为多糖是T细胞非依赖型抗原,其诱导的弱免疫应答不能通过重复免疫来加强。在流感嗜血杆菌疫苗接种成功后,已经开发出了针对血清型A和C的偶联疫苗,现在是临床测试的最终阶段(Zollinger WD″新的和改进的抗脑膜炎球菌病疫苗″,在:New GenerationVaccines中,同上,469-488页;Lieberman等人(1996)同上;Costantino等人(1992)“抗脑膜炎球菌A和C的偶联疫苗的开发和I期临床测试”,Vaccine,10:691-698)。
然而,脑膜炎球菌B(menB)仍是一个问题。此血清型目前在美国、欧洲和南美州引起的病例约占总脑膜炎的50%。不能采用多糖方法,因为menB荚膜多糖是α(2-8)-相连的N-乙酰基神经氨酸的聚合物,它也存在于哺乳动物组织中。这导致了对抗原的耐受;实际上,如果引发免疫应答,则该免疫应答是抗自身的,因此是不希望的。为了避免引起自身免疫力并诱导保护性免疫应答,已经对该荚膜多糖进行化学修饰,例如用N-丙酰基代替N-乙酰基,而不改变特异性抗原性(Romero和Outschoorn(1994)″B型脑膜炎球菌候选疫苗的目前状况:荚膜或非荚膜?″Clin Microbiol Rev 7(4):595-575)。
menB疫苗的另一种方法采用外膜蛋白(OMP)的复合混合物,它只含有OMP、或富集在膜孔蛋白中的OMP,或缺失4类OMP(认为它诱导了封闭杀菌活性的抗体)。该方法产生的疫苗的性质还未经完全地分析。它们能保护机体抵抗同源的菌株,但是当存在外膜蛋白的许多抗原性变异株时一般无效。为了克服抗原性变异,已经构建了含有高达9种不同膜孔蛋白的多价疫苗(例如,Poolman JT(1992)“脑膜炎球菌疫苗的发展”Infect.Agents Dis.4:13-28)。用于外膜疫苗的其它蛋白是opa和opc蛋白,但是这些方法均不能克服抗原性变异(例如Ala′Aldeen和Borriello(1996)″脑膜炎球菌运铁蛋白结合蛋白1和2均是外露的,并产生能杀伤同源和异源菌株的杀菌性抗体″Vaccine 14(1):49-53)。
已可得到脑膜炎球菌和淋球菌的基因和蛋白的一定数量的序列信息(例如EP-A-0467714,WO96/29412),但这决不完全。其他menB蛋白包括那些在WO/28273、WO96/29412、WO 95/03413、US5,439,808和US5,879,686中所列出的蛋白。
提供进一步的序列,就有机会能鉴定出估计是免疫系统靶标且没有抗原性变异的分泌性或外露的蛋白。例如,一些已鉴定的蛋白可作为抗脑膜炎球菌B的有效疫苗成分,一些可作为抗所有脑膜炎球菌血清型的疫苗成分,其它可作为抗所有病原性奈瑟球菌(包括脑膜炎奈瑟球菌和淋病奈瑟球菌)的疫苗成分。这些对脑膜炎奈瑟球菌或淋病奈瑟球菌特异的且更高度保守的序列,是更优选的序列。
因此,本发明的一个目的是提供奈瑟球菌的DNA序列,这些DNA序列编码具有抗原性或免疫原性的蛋白。
发明内容
本发明提供了一些蛋白,这些蛋白含有公开在实施例中的脑膜炎奈瑟球菌氨基酸序列和淋病奈瑟球菌氨基酸序列。
本发明还提供了含有与实施例所公开的脑膜炎奈瑟球菌氨基酸序列同源(即具有序列相同性)的序列的蛋白。根据具体的序列,同源性(即序列相同性)的程度宜大于50%(例如60%、70%、80%、90%、95%、99%或更高)。这些蛋白包括实施例中公开的序列的突变体和等位基因变体。通常,认为两种蛋白之间有50%或更高的相同性表明功能等价。蛋白之间的相同性宜用Smith-Watemen同源性搜寻算法来确定,例如在MRSRCH程序(Oxford Molecular)中采用仿射缺口搜寻,其中参数“缺口罚分(gappenalty)”为12,“缺口延伸罚分(gap extension penalty)”为1。
本发明还提供了包含实施例所公开的脑膜炎奈瑟球菌氨基酸序列和淋病奈瑟球菌氨基酸序列片段的蛋白。这些片段应包含诸序列中至少n个连续的氨基酸,并且根据具体的序列,n为7或更高(例如,8、10、12、14、16、18、20或更高)。诸片段宜包含该序列的一个表位。
本发明的蛋白当然可用各种方法(例如重组表达、从细胞培养中纯化、化学合成等)制成各种形式(例如天然的、融合蛋白等)。它们宜制成基本上纯的或分离的形式(即基本上不含其它脑膜炎奈瑟球菌或淋病奈瑟球菌宿主细胞蛋白)。
另一方面,本发明提供了结合这些蛋白的抗体。它们可能是多克隆的或单克隆的,可用任何合适的方法制得。
另一方面,本发明提供了包含实施例所公开的脑膜炎奈瑟球菌核苷酸序列和淋病奈瑟球菌核苷酸序列的核酸。
另一方面,本发明包括与本文提供的核酸序列有50%以上(如60%、70%、80%、90%、95%、99%或更高)序列相同性的核酸。序列相同性如上述那样确定。
另一方面,本发明包括能与本文提供的序列杂交的核酸。杂交条件如本文所述。
本发明还提供了包含这些序列之片段的核酸。这些核酸应包含脑膜炎奈瑟球菌序列或淋病奈瑟球菌序列的至少n个连续的核苷酸,并且根据具体的序列,n为10或更高(例如,12、14、15、18、20、25、30、35、40或更高)。
另一方面,本发明提供了编码本发明的蛋白和蛋白片段的核酸。
也应理解,本发明提供的核酸包含与上述那些序列互补的序列(例如用于反义或探针目的)。
当然,本发明的核酸可用许多方式制得(例如部分或全部化学合成,从基因组或cDNA文库、或从生物体本身制得等),并可采用各种形式(例如单链、双链、载体、探针等)。
另外,术语“核酸”包括DNA和RNA,以及它们的类似物,如含有修饰骨架的那些类似物,还包括肽核酸(PNA)等。
另一方面,本发明提供了含有本发明的核苷酸序列的载体(如表达载体)以及转化了这些载体的宿主细胞。
另一方面,本发明提供了包含本发明的蛋白、抗体和/核酸的组合物。例如,这些组合物适合用作疫苗,或作为诊断性试剂,或作为免疫原性组合物。
本发明还提供了本发明的核酸、蛋白或抗体用作药剂(例如作为疫苗)或作为诊断性试剂。本发明还提供了本发明的核酸、蛋白或抗体在生产下列物质中的应用:(i)用于治疗或预防奈瑟球菌感染的药剂;(ii)用于检测奈瑟球菌或检测抗奈瑟球菌抗体是否存在的诊断性试剂;或(iii)用于产生抗体。所述奈瑟球菌可以是任菌种或菌株(例如淋病奈瑟球菌),但优选地是脑膜炎奈瑟球菌,尤其是脑膜炎奈瑟球菌菌株B或菌株C。
本发明还提供了一种治疗患者的方法,该方法包括给予患者治疗有效量的本发明的核酸、蛋白和/或抗体。
另一方面,本发明提供了各种方法。
提供了一种生产本发明的蛋白的方法,该方法包括步骤:在诱导蛋白表达的条件下,培育本发明的宿主细胞。
提供了一种检测本发明的多核苷酸的方法,该方法包括下列步骤:(a)在杂交条件下使本发明的核酸探针与生物样品接触,形成双链体;和(b)检测所述双链体。
提供了一种检测本发明的蛋白质的方法,该方法包括下列步骤:(a)在适合形成抗体-抗原复合物的条件下使本发明的抗体和生物样品接触;和(b)检测所述复合物。
在现已概述了本发明之后,通过参考下列实施例可以更容易地理解本发明。下列实施例是以阐述方式提供的,并不意味限制本发明,除非指明。
附图简述
图1显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF279的蛋白质表达产物和纯化。
图2显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF576-1的蛋白质表达产物和纯化。
图3显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF519-1的蛋白质表达产物和纯化。
图4显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF121-1的蛋白质表达产物和纯化。
图5显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF128-1的蛋白质表达产物和纯化。
图6显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF206的蛋白质表达产物和纯化。
图7显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF287的蛋白质表达产物和纯化。
图8显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF406的蛋白质表达产物和纯化。
图9显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF919的蛋白质表达产物的亲水性图、抗原指数和AMPHI区域。
图10显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF279的蛋白质表达产物的亲水性图、抗原指数和AMPHI区域。
图11显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF576-1的蛋白质表达产物的亲水性图、抗原指数和AMPHI区域。
图12显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF519-1的蛋白质表达产物的亲水性图、抗原指数和AMPHI区域。
图13显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF121-1的蛋白质表达产物的亲水性图、抗原指数和AMPHI区域。
图14显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF128-1的蛋白质表达产物的亲水性图、抗原指数和AMPHI区域。
图15显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF206的蛋白质表达产物的亲水性图、抗原指数和AMPHI区域。
图16显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF287的蛋白质表达产物的亲水性图、抗原指数和AMPHI区域。
图17显示了在大肠杆菌中克隆和表达的预期ORF406的蛋白质表达产物的亲水性图、抗原指数和AMPHI区域。
图18(A至C)显示了奈瑟球菌的数种菌株的ORF225的氨基酸序列的排列比较。黑色阴影代表同源区,灰色阴影表示具有相似特性的保守氨基酸。该图显示出在不同菌株之间有高度的保守性,进而证实了其作为疫苗和诊断的抗原的用途。
图19(A至B)显示了奈瑟球菌的数种菌株的ORF235的氨基酸序列的排列比较。黑色阴影代表同源区,灰色阴影表示具有相似特性的保守氨基酸。该图显示出在不同菌株之间有高度的保守性,进而证实了其作为疫苗和诊断的抗原的用途。
图20(A至B)显示了奈瑟球菌的数种菌株的ORF287的氨基酸序列的排列比较。黑色阴影代表同源区,灰色阴影表示具有相似特性的保守氨基酸。该图显示出在不同菌株之间有高度的保守性,进而证实了其作为疫苗和诊断的抗原的用途。
图21(A至B)显示了奈瑟球菌的数种菌株的ORF519的氨基酸序列的排列比较。黑色阴影代表同源区,灰色阴影表示具有相似特性的保守氨基酸。该图显示出在不同菌株之间有高度的保守性,进而证实了其作为疫苗和诊断的抗原的用途。
图22(A至D)显示了奈瑟球菌的数种菌株的ORF919的氨基酸序列的排列比较。黑色阴影代表同源区,灰色阴影表示具有相似特性的保守氨基酸。该图显示出在不同菌株之间有高度的保守性,进而证实了其作为疫苗和诊断的抗原的用途。
具体实施方式
方法学-标准程序和技术的概述
综述
本发明提供了脑膜炎奈瑟球菌menB核苷酸序列、和其所编码的氨基酸序列。利用这些所公开的序列,可以产生核酸探针试验和表达盒及载体。表达载体可以转入宿主细胞以产生蛋白。纯化或分离的多肽(多肽也可化学合成),可用于产生抗体以检测menB蛋白。而且,宿主细胞或提取物可用于生物试验以分离促效剂和拮抗剂。此外,利用这些序列,人们可检索以鉴定开放读框(ORF)和鉴定氨基酸序列。蛋白质还可用于免疫原性组合物、抗原组合物以及用作疫苗组份。
除非另有描述,本发明的实施将采用分子生物学、微生物学、重组DNA和免疫学的常规技术,这些均是本领域技术人员所知的。这些技术在下列文献中有完整的描述:例如,Sambrook《分子克隆实验指南》第2版(1989);《DNA克隆》第I和II卷(D.N.Glover编1985);《寡核苷酸合成》(M.J.Gait编,1984);《核酸杂交》(B.D.Hames和S.J.Higgins编.1984);《转录和翻译》(B.D.Hames和S.J.Higgins编,1984);《动物细胞培养》(R.I.Freshney编,1986);《固定化细胞和酶》(IRL出版社,1986);B.Perbal,《分子克隆实用指南》(1984);《酶学方法》系列丛书(Academic Press,Inc.),尤其是154和155卷;《哺乳动物细胞的基因转移载体》(J.H.Miller和M.P.Calos编,1987,Cold SpringHarbor Laboratory);Mayer和Walker编(1987),《细胞和分子生物学的免疫化学方法》(Academic Press,London);Scopes,(1987)《蛋白质纯化:原理和实践》第2版(Springer-Verlag,N.Y.),以及《实验免疫学手册》I-IV卷(D.C.Weir和C.C.Blackwell编1986)。
在本说明书中采用了核苷酸和氨基酸的标准缩写。
本文引用的所有出版物、专利和专利申请均全部纳入本文作参考。
表达系统
奈瑟球菌menB核苷酸序列可在各种不同的表达系统中表达;例如与哺乳动物细胞、植物细胞、杆状病毒、细菌和酵母一起使用的那些系统。
i.哺乳动物系统
哺乳动物表达系统是本领域中已知的。哺乳动物启动子是能结合哺乳动物RNA聚合酶并启动下游(3′)编码序列(如结构基因)转录成mRNA的任何DNA序列。启动子具有一个转录起始区,其通常邻近编码序列的5′端,还具有一个TATA盒,其通常位于转录起始位点上游25-30个碱基对(bp)处。认为TATA盒指导RNA聚合酶II在正确位点开始RNA合成。哺乳动物启动子还含有一个上游启动子元件,其通常位于TATA盒上游100至200bp内。该上游启动子元件决定了转录启动的速度,并可在两个方向之一上起作用[Sambrook等人(1989)“克隆基因在哺乳动物细胞中的表达”《分子克隆:实验手册》,第2版]。
哺乳动物病毒基因通常是高表达的,具有宽的宿主范围;因此,编码哺乳动物病毒基因的序列提供了特别有用的启动子序列。例子包括SV40早期启动子、小鼠乳房肿瘤病毒LTR启动子、腺病毒主要晚期启动子(Ad MLP)以及单纯疱疹病毒启动子。另外,从非病毒基因(如鼠金属硫蛋白基因)衍生的序列也提供了有用的启动子序列。表达可以是组成型的或受调控的(诱导型)。根据所选用的启动子,许多启动子可用已知的底物进行诱导,例如使用带糖皮质素反应元件(GRE)的小鼠乳腺瘤病毒(MMTV)启动子,该启动子可在激素反应性转化细胞中用促糖皮质激素加以诱导(参见例如美国专利5,783,681)。
增强元件(增强子)的存在,联合上述启动子元件通常会提高表达水平。增强子是这样一种调控性DNA序列,当其与同源或异源启动子相连,合成在正常的RNA起始位点开始时,它能刺激转录提高1000倍。当增强子位于转录起始位点的上游或下游,处于正常或翻转方向,或距离启动子1000个核苷酸以上的距离时,它均具有活性[Maniatis等人(1987)Science 236:1237;Alberts等人(1989)《细胞分子生物学》,第2版]。从病毒衍生获得的增强子元件可能是特别有用的,因为它们通常具有较宽的宿主范围。例子包括SV40早期基因增强子[Dijkema等人(1985)EMBO J.4:761]以及衍生自Rous肉瘤病毒的长末端重复序列(LTR)的增强子/启动子[Gorman等人(1982b)Proc.Natl.Acad.Sci.79:6777]以及来自人巨细胞病毒的增强子/启动子[Boshart等人(1985)Cell 41:521]。另外,一些增强子仅仅在诱导物(例如激素或金属离子)的存在下是可调节的并具有活性[Sassone-Corsi和Borelli(1986)Trends Genet.2:215;Maniatis等人(1987)Science236:1237]。
DNA分子可在哺乳动物细胞中胞内表达。启动子序列可以和DNA分子直接相连,在这种情况下,重组蛋白的N端第一个氨基酸始终是甲硫氨酸,其由ATG起始密码子编码。如果需要,可通过和溴化氰体外培育来从蛋白上切下此N端。
另外,外来蛋白也可从细胞中分泌到生长培养基中,方法是产生嵌合的DNA分子,该DNA分子编码的融合蛋白包括一前导序列片段,该片段在哺乳动物细胞中提供了外源蛋白的分泌。较佳的,在前导序列片段和外源基因之间可以有能在体内或体外断裂的加工位点。前导序列片段通常编码一种信号肽,该信号肽由引导蛋白分泌出细胞的疏水性氨基酸组成。腺病毒三联前导序列是哺乳动物细胞中分泌外来蛋白的一个前导序列的例子。
通常,哺乳动物细胞识别的转录终止和聚腺苷酸化序列是位于翻译终止密码子3′的调控区域,因此它和启动子元件一起连接在编码序列的侧面。成熟mRNA的3′端由定点的转录后断裂和聚腺苷酸化形成[Birnstiel等人(1985)Cell 41:349;Proudfoot和Whitelaw(1988)″真核RNA的终端和3′端加工″《转录和剪接》(B.D.Hames和D.M.Glover编);Proudfoot(1989)Trends Biochem.Sci.14:105]。这些序列指导mRNA的转录,mRNA能被翻译成该DNA编码的多肽。转录终止子/聚腺苷酸化信号的例子包括从SV40衍生的那些[Sambrook等人(1989)“克隆基因在培养的哺乳动物细胞中的表达”《分子克隆实验指南》]。
通常,上述组件,包括启动子、聚腺苷酸化信号以及转录终止序列被一起放在表达构建物中。如果需要,表达构建物中还包括增强子、具有功能性剪接供体和受体位点的内含子以及前导序列。表达构建物通常以复制子形式维持,例如是能在宿主(如哺乳动物细胞或细菌)中稳定维持的染色体外元件(如质粒)。哺乳动物复制系统包括从动物病毒衍生的那些系统,其需要反式作用因子来进行复制。例如,含有乳多空病毒复制系统的质粒,如SV40[Gluzman(1981)Cell 23:175]或多瘤病毒,在合适的病毒T抗原存在下复制出极高的拷贝数。哺乳动物复制子的其它例子包括衍生自牛乳头瘤病毒和EB病毒的复制子。另外,复制子可以有两个复制系统,从而使其能维持在例如哺乳动物细胞中进行表达并能在原核宿主中克隆和扩增。这些哺乳动物细菌穿梭载体的例子包括pMT2[Kaufman等人(1989)Mol.Cell.Biol.9:946]和pHEBO[Shimizu等人(1986)Mol.Cell.Biol.6:1074]。
所用的转化程序取决于待转化的宿主。将异源多核苷酸导入哺乳动物细胞中的方法是本领域所知的,其包括葡聚糖介导的转染、磷酸钙沉淀、Polybrene(1,5-二甲基-1,5-二氮十一亚甲基聚甲溴化物)介导的转染、原生质体融合、电穿孔、将多核苷酸包裹在脂质体中以及将DNA直接显微注射到胞核中。
可作为宿主进行表达的哺乳动物细胞系是本领域中已知的,其包括许多从美国典型培养物保藏中心(ATCC)获得的无限增殖细胞系,包括但不局限于,中国仓鼠卵巢(CHO)细胞、海拉细胞、乳仓鼠肾(BHK)细胞、猴肾细胞(COS)、人肝细胞癌细胞(如HepG2)和其它许多细胞系。
ii.植物细胞表达系统
本领域已知有许多植物细胞培养系统和全植物遗传表达系统。典型的植物细胞基因表达系统包括在以下专利中描述的那些,例如:US 5,693,506;US 5,659,122;和US5,608,143。Zenk,Phytochemistry 30:3861-3863(1991)中描述了在植物细胞培养物中遗传表达的其它例子。除上述参考文献外,关于植物蛋白信号肽的描述还可在下列文献中找到:Vaulcombe等人,Mol.Gen.Genet.209:33-40(1987);Chandler等人,Plant MolecularBiology 3:407-418(1984);Rogers,J.Biol.Chem.260:3731-3738(1985);Rothstein等人,Gene 55:353-356(1987);Whittier等人,Nucleic Acids Research 15:2515-2535(1987);Wirsel等人,Molecular Microbiology 3:3-14(1989);Yu等人,Gene 122:247-253(1992)。关于用植物激素、赤霉素酸和赤霉素酸诱导分泌的酶调节植物基因表达的描述可在R.L.Jones和J.MacMillin,Gibberellins,《植物生理学进展》,Malcolm B.Wilkins编辑,1984 Pitman Publishing Limited,London,21-52页中找到。描述其它调节代谢的基因的参考文献参见:Sheen,Plant Cell,2:1027-1038(1990);Maas等人,欧洲分子生物学协会杂志(EMBO J.)9:3447-3452(1990);Benkel和Hickey,美国科学院院报(Proc.Natl.Acad.Sci.).84:1337-1339(1987)。
通常,利用本领域已知的技术,将所需的多核苷酸序列插入一表达盒中,该表达盒含有为在植物中操作而设计的基因调控元件。将该表达盒插入所需的表达载体中,表达盒的上游和下游有适合在植物宿主中表达的伴随序列。这些伴随序列可来自质粒或病毒,并为载体提供所需的性能,以允许载体将DNA从起初的克隆宿主(如细菌)中移动到所需植物宿主中。基础的细菌/植物载体构建物最好能提供宽的宿主范围原核复制起点;原核可选择标记;以及,对于农杆菌转化而言,宜提供T DNA序列用于农杆菌介导的转移至植物染色体。当异源基因不易检测时,该构建物最好还具有一个适用于确定植物细胞是否已经转化的可选择标记基因。关于合适标记(例如对于禾草类家族成员)的综述可在Wilmink和Dons,1993,Plant Mol.Biol.Reptr,11(2):165-185中找到。
还建议采用适合将异源序列整合到植物基因组中的序列。这些序列可能包括用于同源重组的转座子序列以及允许将异源表达盒随机插入植物基因组中的Ti序列。合适的原核可选择标记包括抗生素(如氨苄青霉素或四环素)抗性标记。编码其它功能的其它DNA序列也可存在于载体中,这是本领域所知的。
本发明的核酸分子可包括在一个表达盒中来表达感兴趣的蛋白质。通常只要一个表达盒,但是两个或多个表达盒也是可行的。除了编码异源蛋白的序列外,重组表达盒还含有下列元件:启动子区域、植物5′非翻译序列、起始密码子(根据结构基因原来是否具有而定)、以及转录和翻译终止序列。表达盒5′和3′端的独特限制性酶位点能使表达盒方便地插入预先存在的载体中。
异源编码序列可以用于任何与本发明有关的蛋白。编码感兴趣的蛋白的序列将编码出一个信号肽,该信号肽能适当地加工和转运蛋白质,并且通常缺少可能会导致本发明的所需蛋白与膜结合的序列。由于对于大部分来说,转录起始区将针对发芽期间表达和转运的基因,采用提供转运的信号肽,也可提供转运感兴趣的蛋白质。通过这种方式,感兴趣的蛋白将从表达该蛋白的细胞中转运出来,并能被有效地收获。通常,种子中的分泌是通过糊粉或小盾体上皮层进入种子的胚乳。尽管不需要使蛋白从产生该蛋白的细胞中分泌出来,但是这种分泌有利于重组蛋白的分离和纯化。
由于所需基因产物的最终表达将在真核细胞中进行,因此需要确定克隆的基因部分是否含有作为内含子被宿主剪接体机制加工的序列。如果是这样,需要对“内含子”区进行定点诱变,以防止一部分遗传信息作为错误的内含子密码而丧失,Reed和Maniatis,Cell 41:95-105,1985。
可用微量移液管以机械方式转移重组DNA,将载体直接显微注射到植物细胞中。Crossway,Mol.Gen.Genet,202:179-185。还可用聚乙二醇将遗传物质转移到植物细胞中,Krens等人,Nature,296,72-74,1982。导入核酸片段的另一种方法是用小颗粒进行高速弹道贯穿,在这些小珠或颗粒的基质中或表面上带有核酸,Klein等人,Nature,327,70-73,1987,Knudsen和Muller,1991,Planta,185:330-336提出用颗粒轰击大麦胚乳以产生转基因大麦。还有一种导入方法是使原生质体和其它实体(微细胞(minicell)、细胞、溶酶体或其它可融合的脂质表面体)融合,Fraley等人,美国科学院院报(Proc.Natl.Acad.Sci.USA),79,1859-1863,1982。
载体也可通过电穿孔导入植物细胞中。(Fromm等人,PNAS 82:5824,1958)。在该技术中,在含有基因构建物的质粒存在下电穿孔植物原生质体。高电场强度的电脉冲使生物膜可逆地被通透,从而允许导入质粒。电穿孔的植物原生质体改造了细胞壁,分裂并形成植物胼胝体。
能分离出原生质体并能培育成全再生植物的所有植物,都能用本发明进行转化,从而回收得到含有转基因的全植物。已经知道实际上可以从培育的细胞或组织再生所有的植物,其包括但不局限于,甘蔗、甜菜、棉花、果实和其它树、豆科植物和蔬菜的所有主要种类。一些合适的植物包括,例如,草莓属、莲花属、苜蓿属、驴食豆属、三叶草属、胡卢巴属、豇豆属、柑橘属、亚麻属、老鹳草属、Manihot、Daucus、鼠耳芥属、芸苔属、萝卜属、白芥属、颠茄属、辣椒属、曼陀罗属、天仙子属、番茄属、烟草属、茄属、碧冬茄属、毛地黄属、Majorana、菊苣属、向日葵属、莴苣属、雀麦属、天门冬属、金鱼草属、龙骨角属、Nemesia、天竺葵属、稷属、狼尾草属、毛莨属、千里光属、Salpiglossis、香瓜属、Browaalia、大豆属、黑麦草属、玉蜀黍属、小麦、蜀黍属和曼陀罗属各种类。
再生方式随各种植物而有所不同,但是通常是首先提供含有异源基因拷贝的转化的原生质体悬液。形成胼胝体组织,从胼胝体中诱生出枝条,随后是根。另外,从原生质体悬液可以诱生形成胚胎。这些胚胎象天然的胚胎那样发芽形成植物。培养基通常含有各种氨基酸和激素,如植物生长素和细胞分裂素。尤其是对于玉米和苜蓿属来说,在培养基中加入谷氨酸和脯氨酸也是很有利的。枝条和根通常同时发育。有效的再生取决于培养基、基因型以及培养史。如果控制了这三个变量,那么再生能完全再现和重复。
在一些植物细胞培养系统中,本发明所需的蛋白可能被排泄出来,或者蛋白可从全植物中提取出来。当本发明所需的蛋白被分泌到培养基中后,就可进行收集。或者,可以用机械方式破碎胚以及无胚-半种子或其它植物组织,以释放出分泌到细胞和组织之间的蛋白。将该混合物悬于缓冲液中,以收回可溶性蛋白。然后用常规的蛋白分离和纯化方法纯化重组蛋白。用常规方法调节时间、温度、pH、氧和体积等参数,以优化异源蛋白的表达和回收。
iii.杆状病毒系统
也可将编码蛋白质的多核苷酸插入合适的昆虫表达载体中,并与该载体中的控制元件操作性相连。载体构建采用本领域已知的技术。总地来说,表达系统的组分包括一种转移载体,通常是细菌质粒,其含有杆状病毒基因组片段以及便于插入待表达异源基因的限制性位点;野生型杆状病毒,其序列与转移载体中的杆状病毒特异性片段同源(这使得异源基因能同源重组到杆状病毒基因组中);以及合适的昆虫宿主细胞和生长培养基。
将编码蛋白质的DNA序列插入转移载体中后,将载体和野生型病毒基因组转染到昆虫宿主细胞中,使载体和病毒基因组重组。表达包装的重组病毒,鉴定并纯化重组噬斑。杆状病毒/昆虫细胞表达系统材料及其方法,除别的以外,可以试剂盒形式购自Invitrogen,San Diego CA(″MaxBac″试剂盒)。这些技术通常是本领域技术人员所知的,在Summers和Smith的Texas Agricultural Experiment Station Bulletin No.1555(1987)(后称“Summer和Smith的文章”)中有充分描述。
在将编码蛋白质的DNA序列插入杆状病毒基因组之前,通常将上述组件,包括启动子、前导序列(如果需要)、感兴趣的编码序列以及转录终止序列装配在中间置换型构建物(转移载体)中。该构建物可含有单个基因以及操作性相连的调控元件;多个基因,每个基因有其自己的一套操作性相连调控元件;或是由同一组调控元件调控的多个基因。中间置换型构建物通常保持在一个复制子中,例如能在宿主(如细菌)内稳定保持的染色体外元件(如质粒)。复制子将具有一个复制系统,从而使其能保持在合适的宿主中进行克隆和扩增。
目前,用来将外源基因导入AcNPV的最常用的转移载体是pAc373。还可设计本领域技术人员已知的其它许多载体。这些载体例如包括,pVL985(其将多角体蛋白的起始密码子从ATG变为ATT,在ATT下游32个碱基对处引入一个BamHI克隆位点;见Luckow和Summers,Virology(1989)17:31)。
质粒通常还含有多角体蛋白聚腺苷酸化信号(Miller等人(1988)Ann.Rev.Microbiol.,42:177)以及用来在大肠杆菌中选择和繁殖的原核氨苄青霉素抗性(amp)基因和复制起点。
杆状病毒转移载体通常含有杆状病毒启动子。杆状病毒启动子是能结合杆状病毒RNA聚合酶并启动下游(5′到3′)编码序列(如结构基因)转录成mRNA的DNA序列。启动子具有一个转录起始区,该区通常邻近编码序列的5′端。该转录起始区通常包括一个RNA聚合酶结合位点以及一个转录起始位点。杆状病毒转移载体还可能具有称为增强子的第二区,如果该区域存在,它通常远离结构基因。表达可以是调控型或组成型的。
在病毒感染周期晚期大量转录的结构基因提供了特别有用的启动子序列。例子包括从编码病毒多角体蛋白的基因衍生获得的序列,Friesen等人(1986)“杆状病毒基因表达的调控”《杆状病毒分子生物学》(Walter Doerfler编辑);EPO公开号127 839和155476;以及编码p10蛋白的基因,Vlak等人(1988),J.Gen.Virol.69:765。
编码合适的信号序列的DNA可以衍生自分泌的昆虫或杆状病毒蛋白(如杆状病毒多角体蛋白基因)的基因(Carbonell等人,(1988)Gene,73:409)。另外,由于哺乳动物细胞翻译后修饰的信号(如信号肽断裂、蛋白水解断裂和磷酸化)看来可被昆虫细胞识别,且分泌和胞核积累所需的信号看来在非脊椎动物细胞和脊椎动物细胞之间是保守的,因此也可用非昆虫来源的前导序列来提供昆虫中的分泌,这些前导序列例如是从编码人α-干扰素(Maeda等人(1985),Nature 315:592)、人胃泌素释放的肽(Lebacq-Verheyden等人(1988),Molec.Cell.Biol.8:3129)、人IL-2(Smith等人(1985)PNAS,82:8404)、小鼠IL-3(Miyajima等人(1987)Gene 58:273)和人葡糖脑苷脂酶(Martin等人(1988)DNA,7:99)的基因衍生获得的。
重组多肽或聚蛋白可以在胞内表达,或如果它用合适的调控序列表达,它可被分泌。非融合的外源蛋白的良好胞内表达理想的通常需要具有短前导序列的异源基因在ATG起始信号前有合适的翻译起始信号。如果需要,可通过和溴化氰体外培育来从成熟蛋白上切下N端甲硫氨酸。
另外,可通过产生嵌合的DNA分子将非天然分泌的重组聚蛋白或蛋白从昆虫细胞中分泌出来,该嵌合的DNA分子所编码的融合蛋白包含一前导序列片段,该片段提供了昆虫中分泌外源蛋白的作用。该前导序列片段通常编码一种信号肽,该信号肽包含的疏水性氨基酸引导蛋白质转移到内质网中。
在插入了编码该蛋白表达产物前体的DNA序列和/或基因后,用转移载体的异源DNA和野生型杆状病毒的基因组DNA共同转化(通常是共转染)昆虫细胞宿主。构建物的启动子和转录终止序列通常包含2-5kb的杆状病毒基因组片段。将异源DNA引入杆状病毒中所需位点内的方法是本领域所知的。(见Summers和Smith的文章,同上;Ju等人(1987);Smith等人,Mol.Cell.Biol.(1983)3:2156;和Luckow和Summers(1989))。例如,插入可以是通过同源双交换重组来插入一个基因如多角体蛋白基因中;插入还可以是插入工程改造入所需杆状病毒基因内的限制性酶切位点中。Miller等人(1989),Bioessays 4:91。当DNA序列被克隆在表达载体多角体蛋白基因位置中时,其5′和3′均侧接了多角体蛋白特异性序列,并位于多角体蛋白启动子的下游。
随后将新形成的杆状病毒表达载体包装到感染性重组杆状病毒中。发生同源重组的频率很低(在约1%和5%之间);因此,共转染后产生的大多数病毒仍是野生型病毒。因此,需要用一种方法来鉴别重组病毒。该表达系统的一个优点是肉眼筛选能区分重组病毒。在病毒感染后期,天然病毒产生的多角体蛋白在受其感染细胞的胞核中产生的水平非常高。累积的多角体蛋白形成的包涵体还含有包埋颗粒。这些包涵体的大小为15微米,它们具有高度的折光性,从而使它们呈现明亮的发光外观,在光学显微镜下很容易观察。感染了重组病毒的细胞缺少包涵体。为了区分重组病毒和野生型病毒,用本领域已知的技术将转染上清接种到单层昆虫细胞上形成噬斑。即,在光学显微镜下筛选存在(表明是野生型病毒)或不存在(表明是重组病毒)包涵体的噬斑。“当代微生物学方法”第2卷(Ausubel等人编辑),16.8(增补10,1990);Summers和Smith,同上;Miller等人(1989)。
已经开发出感染进入几种昆虫细胞的重组杆状病毒表达载体。例如,已经开发出用于感染以下昆虫细胞的重组杆状病毒:埃及伊蚊、苜蓿丫纹夜蛾、家蚕、黑尾果蝇、草地夜蛾和粉纹夜蛾(PCT出版物WO 89/046699;Carbonell等人(1985)J.Virol.56:153;Wright(1986)Nature 321:718;Smith等人(1983)Mol.Cell.Biol.3:2156;综述见Fraser等人(1989)In Vitro Cell.Dev.Biol.25:225)。
可以购得细胞和细胞培养基用于在杆状病毒/表达系统中直接表达和融合表达异源多肽;细胞培养技术是本领域技术人员通常所知的。例如见Summers和Smith,同上。
然后,经修饰的昆虫细胞可以生长在合适的营养培养基中,该培养基能稳定地保持该质粒于修饰的昆虫宿主中。当表达产物的基因处于可诱导的控制下时,可以使宿主生长至高密度,并诱导表达。另外,当表达是组成型表达时,产物将被连续表达到培养基中,营养性培养基必需不断循环,取出感兴趣的产物同时补充消耗的营养物。产物可用以下这些技术来纯化:例如层析,如HPLC、亲和层析、离子交换层析等;电泳;密度梯度离心;溶剂抽提等。产物可按需作进一步纯化,以基本上除去所有也分泌到培养基中或由昆虫细胞裂解而产生的昆虫蛋白,以提供一种至少基本上不含宿主碎片如蛋白质、脂质和多糖的产物。
为了进行蛋白质表达,将从转化子衍生获得的重组宿主细胞培育在允许重组蛋白的编码序列表达的条件下。这些条件将随所选定的宿主细胞而变。然而,本领域技术人员容易根据本领域已知的知识来确定该条件。
iv.细菌系统
细菌表达技术是本领域已知的。细菌启动子是能结合细菌RNA聚合酶并启动下游(3′)编码序列(如结构基因)转录成mRNA的DNA序列。启动子具有一个转录起始区,其通常位于编码序列的5′端附近。该转录起始区通常包括RNA聚合酶结合位点以及一个转录起始位点。细菌启动子可能还有第二个功能区域称为操纵子,它可能与毗邻的RNA合成开始的RNA聚合酶结合位点重叠。该操纵子允许(可诱导)对转录的负调节,因为基因阻遏蛋白可能结合操纵子并因而抑制特定基因的转录。在负调节元件(如操纵子)不存在时,可能发生组成型表达。另外,正调节可通过基因激活蛋白结合序列来实现,如果有的话,该结合序列通常邻近RNA聚合酶结合序列的(5′)。基因激活蛋白的例子是分解代谢物激活剂蛋白(CAP),它帮助启动大肠杆菌(E.coli)中的lac操纵子的转录[Raibaud等人(1984)Annu.Rev.Genet.18:173]。因此,表达的调控可能是正作用或负作用,从而增强或减弱转录。
编码代谢途径中的酶的序列提供了特别有用的启动子序列。例子包括衍生自糖(如半乳糖、乳糖(lac)[Chang等人(1977)Nature 198:1056]和麦芽糖)代谢酶的启动子序列。其它例子包括衍生自生物合成酶(如色氨酸(trp))[Goeddel等人(1980)Nuc.Acids Res.8:4057;Yelverton等人(1981)Nucl.Acids Res.9:731;美国专利4,738,921;EPO出版物No.036 776和121 775]的启动子序列。β-内酰胺酶(bla)启动子系统[Weissmann(1981)″干扰素的克隆和其它错误″《干扰素3》(I.Gresser编辑)],λ嗜菌体PL[Shimatake等人(1981)Nature 292:128]和T5[美国专利4,689,406]启动子系统也提供了有用的启动子序列。
另外,非天然存在的合成的启动子也可象细菌启动子一样起作用。例如,一种细菌或嗜菌体启动子的转录激活序列可以和另一种细菌或嗜菌体启动子的操纵子序列连接在一起,形成合成的杂交启动子[美国专利4,551,433]。例如,tac启动子是杂合的trp-lac启动子,它由trp启动子以及受lac阻遏蛋白调节的lac操纵子序列组成[Amann等人(1983)Gene 25:167;de Boer等人,(1983)Proc.Natl.Acad.Sci.80:21]。另外,细菌启动子可包括非细菌来源但能结合细菌RNA聚合酶并启动转录的天然存在的启动子。天然存在的非细菌来源的启动子还能和相容的RNA聚合酶偶联在一起,从而在原核细胞中高水平地表达某些基因[Studier等人(1986)J.Mol.Biol.189:113;Tabor等人(1985)Proc.Natl.Acad.Sci.82:1074]。另外,杂合的启动子还可由嗜菌体启动子以及大肠杆菌操纵子区域组成(EPO出版物No.267 851)。
除了有功能的启动子序列外,有效的核糖体结合位点对于外来基因在原核细胞中的表达也是有用的。在大肠杆菌中,核糖体结合位点称为Shine-Dalgarno(SD)序列,其包括起始密码子(ATG)以及在起始密码子上游3-11个核苷酸处的长度为3-9个核苷酸的序列[Shine等人(1975)Nature 254:34]。认为SD序列是通过SD序列和大肠杆菌16SrRNA的3′端之间碱基配对来促进mRNA与核糖体结合的[Steitz等人(1979)″信使RNA中的遗传信号和核苷酸序列″生物学调节和发育:基因表达″(编者R.F.Goldberger)]。为了表达具有弱的核糖体结合位点的原核基因和真核基因,通常需要优化SD序列与真核基因的ATG之间的距离[Sambrook等人(1989)″克隆基因在大肠杆菌中的表达″《分子克隆实验手册》]。
DNA分子可以在胞内表达。启动子序列可以直接与DNA分子相连,在这种情况下,N端的第一个氨基酸始终是甲硫氨酸,其由ATG起始密码子编码。如果需要,可通过和溴化氰体外培育或通过和细菌甲硫氨酸N-端肽酶体内或体外培育,将N端的甲硫氨酸从蛋白质上切下(EPO出版物No.219237)。
融合蛋白为直接表达提供了另一种方法。通常,将编码内源细菌蛋白或其它稳定的蛋白之N端部分的DNA序列与异源编码序列的5′端融合。在表达时,该构建物将提供这两个氨基酸序列的融合物。例如,λ噬菌体细胞基因可以和外源基因的5′端相连并在细菌中表达。所得融合蛋白宜保留一个酶(因子Xa)加工位点,以便将噬菌体蛋白与外源基因切开[Nagai等人(1984)Nature 309:810]。融合蛋白也可用lacZ[Jia等人(1987)Gene 60:197],trpE[Allen等人(1987)J.Biotechnol.5:93;Makoff等人(1989),J.Gen.Microbiol.135:11]以及Chey[EPO出版物No.324647]基因的序列组成。两个氨基酸序列连接处的DNA序列可以编码或不编码一可切割的位点。另一个例子是遍在蛋白融合蛋白。这种融合蛋白由遍在蛋白区域组成,该区域宜保留一个酶(例如遍在蛋白特异性加工蛋白酶)加工位点,以便将外源蛋白和遍在蛋白切开。通过这种方法,可以分离获得天然的外源蛋白[Miller等人(1989)Bio/Technology 7:698]。
另外,还可通过产生嵌合的DNA分子来将外源蛋白分泌出细胞,该嵌合的DNA分子编码的融合蛋白含有一个信号肽序列片段,该序列片段能使细菌中的外源蛋白分泌出来[美国专利4,336,336]。信号序列片段通常编码一个信号肽,该信号肽含有疏水性氨基酸,能指引蛋白分泌出细胞。蛋白质被分泌到生长培养基(革兰阳性菌)中或细胞内膜和外膜之间的周质间隙内(革兰阴性菌)。在编码的信号肽片段和外源基因之间宜具有能在体内或体外切割的加工位点。
编码合适信号序列的DNA可以从分泌性细菌蛋白的基因衍生获得,这些基因例如是大肠杆菌外膜蛋白基因(ompA)[Masui等人(1983),《基因表达的实验操作》;Ghrayeb等人(1984)EMBO J.3:2437]以及大肠杆菌碱性磷酸酶信号序列(phoA)[Oka等人(1985)Proc.Natl.Acad.Sci.82:7212]。另一个例子是,可采用各种芽孢杆菌菌株的α淀粉酶基因的信号序列将异源蛋白分泌出枯草芽孢杆菌[Palva等人(1982)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 79:5582;EPO出版物No.244042]。
通常,细菌所识别的转录终止序列是位于翻译终止密码子3′的调控区,它和启动子一起侧接在编码序列的两侧。这些序列指导mRNA的转录,而mRNA能被翻译成该DNA所编码的多肽。转录终止序列通常包括约50个核苷酸的DNA序列,该序列能形成帮助终止转录的茎环结构。例子包括衍生自具有强启动子的基因(如大肠杆菌中的trp基因以及其它生物合成的基因)的转录终止序列。
上述组件,包括启动子、信号序列(如果需要的)、感兴趣的编码序列以及转录终止序列通常一起被放在表达构建物中。表达构建物通常以复制子的形式维持,例如能在宿主(如细菌)中稳定维持的染色体外元件(如质粒)。复制子具有一个复制系统,从而允许其维持在原核宿主中或进行表达或进行克隆和扩增。另外,复制子可以是高拷贝数或低拷贝数的质粒。高拷贝数质粒的拷贝数大致在约5至200之间,通常在约10至150之间。含有高拷贝数质粒的宿主宜含有至少约10个质粒,更佳的含有至少约20个质粒。根据载体以及外源蛋白对宿主的影响,可以选择高拷贝数或低拷贝数的载体。
另外,表达构建物可以和一个整合载体一起整合入细菌基因组中。整合载体通常含有至少一个序列与细菌染色体同源,从而允许该载体整合。整合看来是载体和细菌染色体中的同源DNA之间重组的结果。例如,用不同芽孢杆菌菌株的DNA构建的整合载体整合到芽孢杆菌染色体中(EPO出版物No.127 328)。整合载体还可包含噬菌体或转座子序列。
通常,染色体外构建物以及整合的表达构建物可含有可选择的标记,以便选择已经转化的菌株。可选择标记可在细菌宿主中表达,其包括赋予细菌对药物(如氨苄青霉素、氯霉素、红霉素、卡那霉素(新霉素)和四环素)抗性的基因[Davies等人(1978)Annu.Rev.Microbiol.32:469]。可选择标记还可包括生物合成性基因,如在组氨酸、色氨酸以及亮氨酸生物合成途径中的那些基因。
另外,上述某些组件可以一起放在转化载体中。转化载体通常包含一个可选择标记,如上所述,该载体以复制子形式维持或发展成一个整合载体。
已经开发出了用于转化到许多细菌中的表达和转化载体(无论是染色体外复制子还是整合载体)。例如,已经开发出了用于下列细菌的表达载体:枯草芽孢杆菌[Palva等人,(1982)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 79:5582;EPO出版物No.036 259和063 953;PCT出版物WO 84/04541],大肠杆菌[Shimatake等人,(1981)Nature 292:128;Amann等人,(1985)Gene 40:183;Studier等人,(1986)J.Mol.Biol.189:113;EPO出版物No.036776、136 829和136 907],酪链球菌[Powell等人,(1988)Appl.Environ.Microbiol.54:655];浅青紫链球菌[Powell等人,(1988)Appl.Environ.Microbiol.54:655],浅青紫链霉菌[US patent 4,745,056].
将外源DNA导入细菌宿主的方法是本领域熟知的,通常包括用氯化钙或其它试剂(如二价阳离子和DMSO)处理对细菌进行转化。DNA还可通过电穿孔方法导入细菌细胞。转化程序通常因待转化的细菌种类而不同。[参见,例如使用杆菌:Masson等人,(1989)FEMS Microbiol.Lett.60:273;Palva等人,(1982)Proc.Natl.Acad.Sci.USA79:5582;EPO出版物No.036 259和063 953;PCT出版物WO 84/04541;使用弯曲杆菌:Miller等人,(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.85:856;和Wang等人,(1990)J.Bacteriol.172:949;使用埃希氏大肠杆菌:Cohen等人,(1973)Proc.Natl.Acad.Sci.69:2110;Dower等人,(1988)Nucleic Acias Res.16:6127;Kushner(1978)″用ColE1-衍生质粒转化大肠杆菌的改进方法″Genetic Engineering.Proceedings of the International Symposium onGenetic Engineering(H.W.Boyer和S.Nicosia编辑);Mandel等人,(1970)J.Mol.Biol.53:159;Taketo(1988)Biochim Biophys.Acta 949:318;使用乳酸杆菌:Chassy等人,(1987)FEMS Microbiol.Lett.44:173;使用假单胞菌:Fiedler等人,(1988)Anal.Biochem 170:38;使用葡萄球菌:Augustin等人,(1990)FEMS Microbiol.Lett.66:203;使用链球菌:Barany等人,(1980)J.Bacteriol.144:698;Harlander(1987)″用电穿孔转化链球菌产乳酸微生物″Streptococcal Genetics(J.Ferretti和R.Curtiss III编辑);Perry等人,(1981)Infect.Immun.32:1295;Powell等人,(1988)Appl.Environ.Microbiol.54:655;Somkuti等人,(1987)Proc.4th Evr.Cong.Biotechnology 1:412]。
v.酵母表达
酵母表达系统也是本领域技术人员所知的。酵母启动子是能结合酵母RNA聚合酶并启动下游(3′)编码序列(如结构基因)转录成mRNA的DNA序列。启动子具有一个转录起始区,它通常位于编码序列的5′端附近。该转录起始区通常包括RNA聚合酶结合位点(″TATA″盒)以及一个转录起始位点。酵母启动子可能还有第二个功能区域称为上游激活序列(UAS),如果存在的话,它通常远离结构基因。UAS能调节表达(可诱导)。在UAS不存在时,发生组成型表达。表达的调控可能是正作用或负作用的,从而增强或减弱转录。
酵母是一种发酵生物体,具有活泼的代谢途径,因此编码代谢途径中的酶的序列提供了特别有用的启动子序列。例子包括醇脱氢酶(ADH)(EPO出版物No.284 044)、烯醇酶、葡萄糖激酶、葡萄糖-6-磷酸异构酶、甘油醛-3-磷酸-脱氢酶(GAP或GAPDH)、己糖激酶、磷酸果糖激酶、3-磷酸甘油酸变位酶、以及丙酮酸激酶(PyK)(EPO出版物No.329 203)。编码酸性磷酸酶的酵母PHO5基因也提供了有用的启动子序列[Myanohara等人(1983)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 80:1]。
另外,非天然存在的合成的启动子也可象酵母启动子一样起作用。例如,一种酵母启动子的UAS序列可以和另一种酵母启动子的转录激活区连接在一起,形成合成的杂合启动子。这种杂合启动子的例子包括与GAP转录激活区相连的ADH调控序列(美国专利No.4,876,197和4,880,734)。杂合启动子的其它例子包括由ADH2、GAL4、GAL10或PHO5基因的调控序列组成的启动子与糖酵解酶基因如GAP或PyK的转录激活区的组合(EPO出版物No.164 556)。另外,酵母启动子可包括非酵母来源但能结合酵母RNA聚合酶并启动转录的天然存在的启动子。这些启动子的例子包括,尤其是,[Cohen等人,(1980)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:1078;Henikoff等人,(1981)Nature 283:835;Hollenberg等人,(1981)Curr.Topics Microbiol.Immunol.96:119;Hollenberg等人,(1979)″细菌抗生素抗性基因在酿酒酵母中的表达″Plasmids of Medical,Environmentaland Commercial Importance(K.N.Timmis和A.Puhler编辑);Mercerau-Puigalon等人,(1980)Gene 11:163;Panthier等人,(1980)Curr.Genet.2:109]。
DNA分子可以在酵母菌胞内表达。启动子序列可以直接与DNA分子相连,在这种情况下,重组蛋白N端的第一个氨基酸始终是甲硫氨酸,其由ATG起始密码子编码。如果需要,可通过和溴化氰体外培育将N端的甲硫氨酸从蛋白质上切下。
象在哺乳动物、植物、杆状病毒以及细菌表达系统中一样,融合蛋白为酵母表达系统提供了另一种方法。通常,将编码内源酵母蛋白或其它稳定的蛋白之N端部分的DNA序列与异源编码序列的5′端融合。在表达时,该构建物将提供这两个氨基酸序列的融合物。例如,酵母或人超氧化物歧化酶(SOD)基因可以和外源基因5′端相连并在酵母中表达。两个氨基酸序列连接处的DNA序列可以编码或不编码可切割的位点。例如参见EPO出版物No.196 056。另一个例子是遍在蛋白融合蛋白。这种融合蛋白由遍在蛋白区域组成,该区域宜保留一个酶(例如遍在蛋白特异性加工蛋白酶)加工位点,以便将外源蛋白和遍在蛋白切开。因此,通过这种方法,可以分离获得天然的外源蛋白(例如WO88/024066)。
另外,还可通过产生嵌合的DNA分子来将外源蛋白从细胞分泌到生长培养基中,该嵌合的DNA分子编码的融合蛋白含有一个前导序列片段,该前导序列片段能使酵母中的外源蛋白分泌出来。较佳的,在编码的前导片段和外来基因之间宜具有能在体内或体外切割的加工位点。该前导序列片段通常编码了含有疏水性氨基酸的信号肽,其引导蛋白从细胞分泌出来。
编码合适信号序列的DNA可以从分泌性酵母蛋白的基因衍生获得,这些基因例如有酵母转化酶基因(EPO出版物No.012 873;JPO出版物.62:096,086)以及A-因子基因(美国专利4,588,684)。另外,非酵母来源的前导序列(如干扰素前导序列)的存在也能提供分泌出酵母的作用(EPO出版物No.060 057)。
较佳的一类分泌前导序列采用了酵母α-因子基因的片段,其含有″pre″信号序列和″pro″区。可采用的α因子片段的类型包括全长pre-proα因子前导序列(约83个氨基酸残基)以及截短的α-因子前导序列(通常约25至50个氨基酸残基)(美国专利4,546,083和4,870,008;EPO出版物No.324 274)。采用α-因子前导片段提供分泌作用的其它前导序列包括杂合的α-因子前导序列,其由第一个酵母的pre序列以及第二个酵母α因子的pro区域组成(例如见PCT出版物WO 89/02463)。
通常,酵母识别的转录终止序列是位于翻译终止密码子3′的调控区,其和启动子一起侧接在编码序列的两侧。这些序列指导mRNA的转录,而mRNA能被翻译成该DNA所编码的多肽。转录终止序列和其它酵母识别的终止序列的例子是编码糖酵解酶的那些转录终止序列。
上述组件,包括启动子、前导序列(如果需要的)、感兴趣的编码序列以及转录终止序列,通常被一起放在表达构建物中。表达构建物通常以复制子的形式保持,例如能在宿主(如酵母或细菌)中稳定保持的染色体外元件(如质粒)。复制子可能具有两个复制系统,从而允许其能维持在例如酵母中进行表达,并能维持在原核宿主进行克隆和扩增。这些酵母-细菌穿梭载体的例子包括YEp24[Botstein等人(1979)Gene 8:17-24],pCL/1[Brake等人,(1984)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:4642-4646]和YRp17[Stinchcomb等人(1982)J.Mol.Biol.158:157]。另外,复制子可以是高拷贝数或低拷贝数的质粒。高拷贝数质粒的拷贝数大致在约5至200之间,通常在约10至150之间。含有高拷贝数质粒的宿主宜含有至少约10个质粒,更佳的含有至少约20个质粒。根据载体以及外源蛋白对宿主的影响,可以选择高拷贝数或低拷贝数的载体。例如参见Brake等人,同上。
另外,表达构建物可以和一个整合载体一起整合入酵母基因组中。整合载体通常含有至少一个序列与酵母染色体同源,从而允许该载体整合,最好含有两个同源序列侧接该表达构建物。整合看来是载体和酵母染色体中同源DNA之间重组的结果[Orr-Weaver等人(1983)Methods in Enzymol.101:228-245]。通过选择合适的同源序列插入载体中,可将整合载体导入酵母中某一特定的基因座。见Orr-Weaver等人,同上。可以整合入一个或多个表达构建物,这可能会影响重组蛋白产生的水平[Rine等人(1983)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 80:6750]。载体中的染色体序列可以载体中的单个片段形式存在(从而导致整个载体的整合),或是与染色体中的相邻片段同源的两个片段,这两个片段在载体中侧接在表达构建物两侧,从而可导致仅表达构建物的稳定性整合。
通常,染色体外构建物以及整合的表达可建物均含有可选择的标记,以便选择已经转化的酵母菌株。可选择标记可包括能在酵母宿主中表达的生物合成基因(如ADE2、HIS4、LEU2、TRP1和ALG7以及G418抗性基因),这些基因分别赋予酵母细胞对衣霉素以及G418的抗性。另外,合适的可选择标记还可能为酵母在毒性化合物(如金属)存在下提供生长能力。例如,CUP1的存在使酵母能在铜离子存在下生长[Butt等人,(1987)Microbiol,Rev.51:351]。
另外,上述某些组件可以一起放在转化载体中。转化载体通常包含一个可选择标记,如上所述,该载体以复制子形式维持或发展成一个整合载体。
已经开发出了用于转化入许多酵母中的表达和转化载体(无论是染色体外复制子还是整合载体)。例如,已经开发出用于下列酵母菌的表达载体和将外源DNA导入酵母宿主的方法:白色念珠菌[Kurtz,等人,(1986)Mol.Cell.Biol.6:142],麦芽糖念珠菌[Kunze,等人,(1985)J.Basic Microbiol.25:141],多形汉逊酵母[Gleeson,等人,(1986)J.Gen.Microbiol.132:3459;Roggenkamp等人,(1986)Mol.Gen.Genet.202:302],脆壁克鲁维酵母[Das,等人,(1984)J.Bacteriol.158:1165],乳酸克鲁维酵母[DeLouvencourt等人,(1983)J.Bacteriol.154:737;Van den Berg等人,(1990)Bio/Technology 8:135],季也蒙毕赤酵母[Kunze等人,(1985)J.Basic Microbiol.25:141],巴斯德毕酵母[Cregg,等人,(1985)Mol.Cell.Biol.5:3376;美国专利No.4,837,148和4,929,555],酿酒酵母[Hinnen等人,(1978)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 75:1929;Ito等人,(1983)J.Bacteriol.153:163],栗酒裂植酵母[Beach和Nurse(1981)Nature 300:706],以及Yarrowia lipolytica[Davidow,等人,(1985)Curr.Genet.10:380471 Gaillardin,等人,(1985)Curr.Genet.10:49]。
将外源DNA导入酵母宿主的方法是本领域熟知的,通常包括用碱阳离子处理转化原生质球或完整酵母细胞。转化程序通常因待转化的酵母种类而不同。例如参见,[Kurtz等人,(1986)Mol.Cell.Biol.6:142;Kunze等人,(1985)J.Basic Microbiol.25:141;念珠菌];[Gleeson等人,(1986)J.Gen.Microbiol.132:3459;Roggenkamp等人,(1986)Mol.Gen.Genet.202:302;汉逊酵母];[Das等人,(1984)J.Bacteriol.158:1165;DeLouvencourt等人,(1983)J.Bacteriol.154:1165;Van den Berg等人,(1990)Bio/Technology 8:135;克鲁维酵母];[Cregg等人,(1985)Mol.Cell.Biol.5:3376;Kunze等人,(1985)J.Basic Microbiol.25:141;美国专利No.4,837,148和4,929,555;毕赤酵母];[Hinnen等人,(1978)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 75;1929;Ito等人,(1983)J.Bacteriol.153:163酿酒酵母];[Beach和Nurse(1981)Nature 300:706;裂殖酵母];[Davidow等人,(1985)Curr.Genet.10:39;Gaillardin等人,(1985)Curr.Genet.10:49;Yarrowia]。
定义
当组合物中总X+Y重量的至少85%是X时,则称含有X的组合物“基本上没有Y”。较佳的,X占组合物中X+Y总重量的至少约90%,更佳至少约95%或者甚至99%(重量)。
“保守的”奈瑟球菌氨基酸片段或蛋白质是在至少x%奈瑟球菌中的特定蛋白质中存在的片段或蛋白质。x的值可以为50%或更高,例如66%、75%、80%、90%、95%、或甚至100%(即该氨基酸在所有有关的奈瑟球菌的蛋白质中都存在)。为了确定某氨基酸在某一特定奈瑟球菌蛋白质中是否是“保守的”,需比较多种不同奈瑟球菌(参照群体)的有关蛋白质序列中的氨基酸残基。参照群体可包括多种不同的奈瑟球菌菌种,也可包括一种菌种。参照群体可包括某一菌种的多种不同的血清型(serogroup),也可包括一个血清型。优选的参照群体由5种最常见的奈瑟球菌菌株构成。
术语“异源”指在自然界中发现不在一起的两种生物学组分。此组分可以是宿主细胞、基因、或调控区如启动子。尽管异源组分在自然界中发现不在一起,但是它们能一起起作用,例如当与某基因异源的一种启动子与该基因操作性相连时。另一个例子是奈瑟球菌序列与小鼠宿主细胞异源。
“表位”指抗原决定蔟,它可引发细胞和/或体液应答反应。
“高度严紧”条件是65℃,在0.1×SSC,0.5%SDS溶液中。
“复制起点”是启动和调节多核苷酸(例如表达载体)复制的一种多核苷酸序列。复制起点可作为细胞内多核苷酸复制的自主性单位,能在其自身的控制下进行复制。复制起点是载体在特定宿主细胞中复制所需要的。有了某一复制起点,表达载体就能在细胞中合适蛋白的存在下高拷贝数的复制。复制起点的例子是在酵母中有效的自主复制序列;以及在COS-7细胞中有效的病毒性T-抗原。
“突变体”序列定义为与天然或公开的序列不同但具有同源性的DNA、RNA或氨基酸序列。根据具体的序列,天然或公开的序列与突变体序列之间的同源性(序列相同性)程度宜大于50%(例如60%、70%、80%、90%、95%、99%或更高),其中同源性用上述方法计算出。如本文所述,本文提供的核酸序列的核酸分子或区域的“等位基因变体”是在另一或第二个分离物的基因组中基本上相同的基因座上的核酸分子或区域,由于诸如突变或重组引起的自然变异,它们具有相似但不相同的核酸序列。编码区等位基因变体通常编码的蛋白具有与其比较基因所编码蛋白相似的活性。等位基因变体还可包含基因5′或3′非翻译区中的变化,例如在调节控制区中的变化(例如见美国专利5,753,235)。
抗体
本文所用的术语“抗体”指由至少一个抗体结合位点组成的一个或一组多肽。“抗体结合位点”是一个三维结合空间,其内表面形状和电荷分布与抗原表位的特征互补,从而使抗体与抗原结合。“抗体”例如包括,脊椎动物抗体、杂合抗体、嵌合抗体、人源化抗体、经修饰的抗体、单价抗体、Fab蛋白以及单结构域抗体。
针对本发明蛋白的抗体可用于亲和层析、免疫试验以及区别/鉴定奈瑟球菌menB蛋白。所引发的针对本发明蛋白的抗体,可结合于存在的且与脑膜炎奈瑟球菌menB菌株特异性相关的抗原性多肽或蛋白质或蛋白片段。在某些情况下,这些抗原与特定的菌株相关,例如那些menB菌株特有的抗原。本发明的抗体可以固定于基质并用于免疫试验,或者固定在亲和层析柱上以检测和/或分离多肽、蛋白或蛋白片段,或者含所述多肽、蛋白或蛋白片段的细胞。或者,所述多肽、蛋白或蛋白片段可以被固定化,以检测能与其特异性结合的抗体。
针对本发明蛋白的多克隆和单克隆抗体可用常规方法制得。通常,首先用蛋白来免疫合适的动物,较佳的是小鼠、大鼠、家兔或山羊。由于可获得的血清体积多,能获得标记的抗家兔和抗山羊抗体,因此对于制备多克隆抗血清来说,家兔和山羊是较佳的。免疫通常这样进行:将蛋白以盐水(较佳的以佐剂如Freund氏完全佐剂)混合或乳化,然后肠胃外(通常是皮下或肌内)注射该混合物或乳剂。每次注射50-200微克的剂量就足够了。2-6周后用盐水(较佳的是用Freund氏不完全佐剂)配的蛋白质注射一次或多次以强化免疫。另外可以用本领域已知的方法进行体外免疫来产生抗体,从本发明的目的来看,认为其与体内免疫等效。将免疫后的动物血液抽取到玻璃或塑料容器中,25℃培育该血液1小时,然后4℃培育2-18小时,获得多克隆抗血清。离心(例如1000g 10分钟)回收血清。家兔每次取血可获得约20-50毫升。
用Kohler和Milstein的标准方法[Nature(1975)256:495-96]或其改进方法制得单克隆抗体。通常,如上所述对小鼠或大鼠免疫。然而,并非是对动物取血然后抽提血清,而是取出脾脏(以及任选地取出几个大的淋巴结),将其分离成单细胞。如果需要,可将细胞悬液(在除去非特异性粘附的细胞后)加入包被了蛋白质抗原的板或孔中,对脾细胞进行筛选。表达抗原特异性的膜结合免疫球蛋白的B细胞结合到板上,不象悬液其它物质那样被洗去。然后使所得B细胞或所有解离的脾细胞与骨髓瘤细胞融合形成杂交瘤,培养在选择性培养基(如次黄嘌呤、氨基蝶呤胸苷培养基,“HAT”)中。通过有限稀释接种所得杂交瘤,并测定特异性结合免疫抗原(且不结合无关抗原)的抗体的产生。然后,体外(例如在组织培养瓶或中空纤维反应器中)或体内(如小鼠腹水中)培养所选的分泌单克隆抗体的杂交瘤。
如果需要,抗体(无论是多克隆还是单克隆抗体)可用常规技术来标记。合适的标记包括荧光团、发色团、放射活性原子(具体是32P和125I)、密电子试剂、酶、以及具有特异性结合配偶的配体。酶通常靠其活性来检测。例如,辣根过氧化物酶通常是检测其将3,3′,5,5′-四甲基联苯胺(TMB)转变成蓝色的能力,可用分光光度计定量测定。“特异性结合配偶”指能以高特异性结合配体分子的蛋白质,例如抗原以及对其有特异性的单克隆抗体。其它特异性结合配偶包括生物素和亲和素或链亲和素,IgG和蛋白A,以及本领域已知的许多受体-配体对。应理解,上述内容并非要将各种标记分成不同的类,因为同一标记可在几种不同的模型中起作用。例如,125I可作为放射活性标记,或作为密电子试剂。HRP可作为酶或单抗的抗原。另外,一种物质可以和各种标记组合以获得所需的效果。例如,在实施本发明中,单抗和亲和素也需要标记,因此,可以用生物素标记单抗,并用标记了125I的亲和素检测其存在,或用标记HRP的抗生物素单抗检测其存在。其它替换和可能性对于本领域普通技术人员来说是显而易见的,所以应认作等价物属于本发明的范围。
本发明的抗原、免疫原、多肽、蛋白或蛋白片段可引发形成特异结合配对(partner)抗体。本发明的这些抗原、免疫原、多肽、蛋白或蛋白片段包括本发明的免疫原性组合物。这些免疫原性组合物还可包括或含有佐剂、载体、或其他促进或增强或稳定本发明抗原、多肽、蛋白或蛋白片段的组份。这些佐剂和载体对本领域一般技术人员而言是很显而易见的。
药物组合物
药物组合物可包含(含有)本发明的多肽、抗体或核酸。该药物组合物将包含治疗有效量的本发明的多肽、抗体或多核苷酸。
本文所用的术语“治疗有效量”指治疗剂治疗、缓解或预防目标疾病或状况的量,或是表现出可检测的治疗或预防效果的量。该效果例如可通过化学标记或抗原水平来检测。治疗效果也包括生理性症状的减少,例如对发热病人给药时导致体温降低。对于某一对象的精确有效量取决于该对象的体型和健康状况、病症的性质和程度、以及选择给予的治疗剂和/或治疗剂的组合。因此,预先指定准确的有效量是没用的。然而,对于某给定的状况而言,可以用常规实验来确定该有效量,临床医师是能够判断出来的。
为了本发明的目的,有效的剂量为给予个体约0.01毫克/千克至50毫克/千克或0.05毫克/千克至10毫克/千克的DNA构建物。
药物组合物还可含有药学上可接受的载体。术语“药学上可接受的载体”指用于治疗剂(例如抗体、多肽、基因或其它治疗剂)给药的载体。该术语指这样一些药剂载体:它们本身不诱导产生对接受该组合物的个体有害的抗体,且给药后没有过分的毒性。合适的载体可能是大的、代谢缓慢的大分子,如蛋白质、多糖、聚乳酸(polylactic acid)、聚乙醇酸、氨基酸聚合物、氨基酸共聚物以及无活性的病毒颗粒。这些载体是本领域普通技术人员所熟知的。
本文可用的药学上可接受的盐例如有:无机酸盐,如盐酸盐、氢溴酸盐、磷酸盐、硫酸盐等;以及有机酸盐,如乙酸盐、丙酸盐、丙二酸盐、苯甲酸盐等。在Remington′sPharmaceutical Sciences(Mack Pub.Co.,N.J.1991)中可找到关于药学上可接受的赋形剂的充分讨论。
治疗性组合物中药学上可接受的载体可含有液体,如水、盐水、甘油和乙醇。另外,这些载体中还可能存在辅助性的物质,如润湿剂或乳化剂、pH缓冲物质等。通常,可将治疗性组合物制成可注射剂,例如液体溶液或悬液;还可制成在注射前适合配入溶液或悬液中、液体载体的固体形式。脂质体也包括在药学上可接受的载体的定义中。
输药方法
一旦配成本发明的组合物,可将其直接给予对象。待治疗的对象可以是动物;尤其可以治疗人对象。
直接输送该组合物通常可通过皮下、腹膜内、静脉内或肌内注射或输送至组织间隙来实现。组合物也可输送至病灶区。其它给药方式包括口服和肺给药、栓剂和透皮或经皮肤施用、用针、基因枪或手持喷雾器(hypospray)。治疗剂量方案可以是单剂方案或多剂方案。
疫苗
本发明的疫苗可以是预防性的(即预防感染)或治疗性的(即在感染后治疗疾病)。
这些疫苗包含免疫性抗原或免疫原、免疫原性多肽、蛋白或蛋白片段、或核酸(如核糖核酸或脱氧核糖核酸),通常与“药学上可接受的载体”组合,这些载体包括本身不诱导产生对接受该组合物的个体有害的抗体的任何载体。合适的载体通常是大的、代谢缓慢的大分子,如蛋白质、多糖、聚乳酸、聚乙醇酸、氨基酸聚合物、氨基酸共聚物、脂质凝集物(如油滴或脂质体)以及无活性的病毒颗粒。这些载体是本领域普通技术人员所熟知的。另外,这些载体可起免疫刺激剂(“佐剂”)作用。另外,抗原或免疫原可以和细菌类毒素(如白喉、破伤风、霍乱、幽门螺杆菌等病原体的类毒素)偶联。
增强组合物效果的较佳的佐剂包括但不局限于:(1)铝盐(alum),如氢氧化铝、磷酸铝、硫酸铝等;(2)水包油型乳剂配方(有或没有其它特异性的免疫刺激剂,如胞壁酰肽(见下文)或细菌细胞壁成分),例如,(a)MF59(PCT出版物No.WO 90/14837),其含有5%鲨烯、0.5%吐温80和0.5%Span 85(任选地含有不同量的MTP-PE(见下文),虽然并不需要),用微量流化器(如110Y型微量流化器(Microfluidics,Newton,MA))制成亚微米级颗粒;(b)SAF,其含有10%鲨烯、0.4%吐温80、5%普卢兰尼克(pluronic)嵌段聚合物L121以及thr-MDP(见下文),微量流化成亚微米级乳剂或涡流振荡产生粒径较大的乳剂,和(c)RibiTM佐剂系统(RAS)(Ribi Immunochem,Hamilton,MT),其含有2%鲨烯、0.2%吐温80以及取自单磷酰脂A(MPL)、二霉菌酸海藻糖酯(TDM)、和细胞壁骨架(CWS)的一种或多种细菌细胞壁组分,较佳的是MPL+CWS(DetoxTM);(3)皂素佐剂,例如可采用StimulonTM(Cambridge Bioscience,Worcester,MA)或从其产生的颗粒,如ISCOM(免疫刺激性复合物);(4)Freund完全佐剂(CFA)和Freund不完全佐剂(IFA);(5)细胞因子,如白介素(如IL-1、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-12等)、干扰素(如γ干扰素)、巨噬细胞集落刺激因子(M-CFS)、肿瘤坏死因子(TNF)等;(6)细菌ADP-核糖基化毒素(如霍乱毒素CT,百日咳毒素PT或大肠杆菌热不稳定毒素LT)的脱毒变异体,尤其是LT-K63、LT-R72,CT-S109、PT-K9/G129;参见例如WO93/13302和WO92/19265;以及(7)作为免疫刺激剂来增强组合物效果的其它物质。Alum和MF59是较佳的。
如上所述,胞壁酰肽包括但不局限于,N-乙酰-胞壁酰-L-苏氨酰-D-异谷氨酰胺(thr-MDP)、N-乙酰-去胞壁酰-L-丙氨酰-D-异谷氨酰胺(nor-MDP)、N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酰-D-异谷氨酰氨酰基-L-丙氨酸-2-(1′-2′-二棕榈酰-sn-甘油-3-羟基磷酰氧)-乙胺(MTP-PE)等。
包括免疫原性组合物在内的疫苗组合物(如可包括抗原,药学上可接受的载体以及佐剂),通常含有稀释剂,如水,盐水,甘油,乙醇等。另外,辅助性物质,如润湿剂或乳化剂、pH缓冲物质等可存在于这类运载体中。此外,包括免疫原性组合物在内的疫苗组合物可含有在药学上可接受载体中的抗原、多肽、蛋白、蛋白片段或核酸。
更具体地,包括免疫原性组合物在内的疫苗,包含免疫学有效量的免疫原性多肽,以及上述其它所需的组分。“免疫学有效量”指以单剂或连续剂一部分给予个体的量对治疗或预防是有效的。该用量根据所治疗个体的健康状况和生理状况、所治疗个体的类别(如非人灵长类等)、个体免疫系统合成抗体的能力、所需的保护程度、疫苗的配制、治疗医师对医疗状况的评估、及其它的相关因素而定。预计该用量将在相对较宽的范围内,可通过常规实验来确定。
通常,可将疫苗组合物或免疫原性组合物制成可注射剂,例如液体溶液或悬液;还可制成在注射前适合配入溶液或悬液、液体赋形剂的固体形式。该制剂还可乳化或包封在脂质体中,在上述药学上可接受的载体下增强佐剂效果。
常规方法是从肠胃外(皮下或肌内)途径通过注射给予免疫原性组合物。适合其它给药方式的其它配方包括口服和肺制剂、栓剂和透皮应用。治疗剂量可以是单剂方案或多剂方案。疫苗可以结合其它免疫调节剂一起给予。
作为以蛋白质为基础的疫苗的一种替代方案是,可以采用DNA疫苗接种[例如,Robinson和Torres(1997)Seminars in Immunology 9:271-283;Donnelly等人(1997)AnnuRev.Immunol 15:617-648;见下文]。
基因输送载体
用于输送构建物的基因治疗载体可以口服或全身性给予,其中所述构建物包括本发明治疗剂的编码序列,将其输送至哺乳动物以便在哺乳动物体内表达。这些构建物可利用体内或活体外方式中的病毒或非病毒载体方法。这些编码序列的表达可用内源哺乳动物启动子或异源启动子诱导。编码序列的体内表达可以是组成型的或受调控的。
本发明包括能表达所涉及的核酸序列的基因输送运载体。基因输送运载体宜为病毒载体,更佳的是逆转录病毒、腺病毒、腺伴随病毒(AAV)、疱疹病毒或甲病毒载体。病毒载体还可以是星状病毒、冠状病毒、正粘病毒、乳多空病毒、副粘病毒、细小病毒、小核糖核酸病毒、痘病毒或披膜病毒的病毒载体。通常参见Jolly(1994)Cancer GeneTherapy 1:51-64;Kimura(1994)Human Gene Therapy 5:845-852;Connelly(1995)HumanGene Therapy 6:185-193;以及Kaplitt(1994)Nature Genetics 6:148-153。
逆转录病毒载体是本领域中熟知的,包括B、C和D型逆转录病毒、异嗜性逆转录病毒(例如NZB-X1、NZB-X2和NZB9-1(见O′Neill(1985)J.Virol.53:160)广食性逆转录病毒如MCF和MCF-MLV(见Kelly(1983)J.Virol 45:291)、泡沫病毒和慢病毒。见《RNA肿瘤病毒》第2版,Cold Spring Harbor Laboratory,1985。
逆转录病毒基因治疗载体的诸部分可从不同逆转录病毒衍生获得。例如,逆转录载体LTR可以从小鼠肉瘤病毒衍生获得,tRNA结合位点可以从Rous肉瘤病毒衍生获得,包装信号从小鼠白血病病毒获得,第二链的合成起点从禽类白血病病毒获得。
可将这些重组逆转录病毒载体导入合适的包装细胞系,用来产生转导感受态逆转录病毒载体颗粒(见美国专利5,591,624)。通过将嵌合性整合酶掺入逆转录病毒颗粒,构建逆转录病毒载体,以便将其定点整合到宿主细胞DNA中(见WO96/37626)。较佳的重组病毒载体是复制缺陷型重组病毒。
适合与上述逆转录病毒载体一起使用的包装细胞系是本领域熟知的,很容易制得(见WO95/30763和WO92/05266),并能用来产生能生产重组载体颗粒的生产型细胞系(也称为载体细胞系或“VCL”)。包装细胞系宜从人亲代细胞(如HT1080细胞)或貂亲代细胞系制取,以便消除人血清的灭活作用。
用来构建逆转录病毒基因治疗载体的较佳的逆转录病毒,包括禽类白血病病毒、牛白血病病毒、鼠白血病病毒、水貂细胞灶诱导病毒、鼠肉瘤病毒、网状内皮组织增殖病毒和Rous肉瘤病毒。特别佳的鼠白血病病毒包括4070A和1504A(Hartley和Rowe(1976)J Virol 19:19-25),Abelson(ATCC No.VR-999),Friend(ATCC No.VR-245),Graffi,Gross(ATCC Nol VR-590),Kirsten,Harvey肉瘤病毒和Rauscher(ATCC No.VR-998)以及莫洛尼鼠白血病病毒(ATCC No.VR-190)。这些逆转录病毒可以从保藏机构或保藏中心如Rockville,Maryland的美国典型培养物保藏中心(ATCC)获得,或用常用的技术从已知来源分离获得。
可用于本发明的典型的已知逆转录病毒基因治疗载体包括在以下专利申请中描述的那些载体:GB2200651,EP0415731,EP0345242,EP0334301,WO89/02468;WO89/05349,WO89/09271,WO90/02806,WO90/07936,WO94/03622,WO93/25698,WO93/25234,WO93/11230,WO93/10218,WO91/02805,WO91/02825,WO95/07994,US 5,219,740,US 4,405,712,US 4,861,719,US 4,980,289,US 4,777,127,US 5,591,624.另见Vile(1993)Cancer Res 53:3860-3864;Vile(1993)Cancer Res 53:962-967;Ram(1993)Cancer Res 53(1993)83-88;Takamiya(1992)J Neurosci Res 33:493-503;Baba(1993)J Neurosurg 79:729-735;Mann(1983)Cell 33:153;Cane(1984)Proc Natl Acad Sci81:6349;以及Miller(1990)Human Gene Therapy 1。
人腺病毒基因治疗载体也是本领域中已知的,并可用于本发明。例如参见Berkner(1988)Biotechniques 6:616和Rosenfeld(1991)Science 252:431,以及WO93/07283,WO93/06223和WO93/07282。用于本发明的典型的已知的腺病毒基因治疗载体包括在上述文献以及下述专利中描述的那些例子:WO94/12649,WO93/03769,WO93/19191,WO94/28938,WO95/11984,WO95/00655,WO95/27071,WO95/29993,WO95/34671,WO96/05320,WO94/08026,WO94/11506,WO93/06223,WO94/24299,WO95/14102,WO95/24297,WO95/02697,WO94/28152,WO94/24299,WO95/09241,WO95/25807,WO95/05835,WO94/18922和WO95/09654。另外,可以采用Curiel(1992)Hum.Gene Ther.3:147-154中描述的给予和已杀死腺病毒相连的DNA的方法。本发明的基因输递载体还包括腺病毒伴随病毒(AAV)载体。用于本发明的这种载体的主要且较佳的例子是Srivastava,WO93/09239中公开的AAV-2为基础的载体。最佳的AAV载体包含两个AAV反向末端重复序列,其中通过替换核苷酸对天然D-序列进行修饰,使至少5-18个天然的核苷酸(较佳的至少10-18个天然核苷酸,最佳的10个天然核苷酸)被保留下来,而D-序列其余的核苷酸缺失或用非天然核苷酸取代。AAV反向末端重复序列的天然D-序列是每个AAV反向末端重复序列中不参与HP形成的20个串联核苷酸的序列(即每一端有一个序列)。非天然的替换核苷酸可以是天然D-序列该位置中所见核苷酸以外的任何核苷酸。其它可采用的典型AAV载体是pWP-19、pWN-1,两者均公开在Nahreini(1993)Gene 124:257-262中。这样的AAV的另一个例子是psub201(见Samulski(1987)J.Virol.61:3096)。另一个典型的AAV载体是Double-D ITR载体。Double-D ITR载体的构建方案公开在美国专利5,478,745中。还有其它的载体是公开在Carter的美国专利4,797,368和Muzyczka的美国专利5,139,941、Chartejee的美国专利5,474,935和Kotin的WO94/288157中的载体。可用于本发明的另一个AAV载体例子是SSV9AFABTKneo,它含有AFP增强子和白蛋白启动子,并且主要指导肝内表达。其结构和构建方案公开在Su(1996)Human Gene Therapy 7:463-470中。其它的AAV基因治疗载体在美国专利5,354,678,5,173,414,5,139,941,5,252,479中有所描述。
包含本发明序列的基因治疗载体还包括疱疹载体。主要且较佳的例子是含有编码胸苷激酶多肽的序列的单纯疱疹病毒载体,如公开在US5,288,641和EP0176170(Roizman)中的那些。其它典型的单纯疱疹病毒载体包括WO95/04139中公开的HFEM/ICP6-LacZ(Wistar Institute)、Geller(1988)Science 241:1667-1669以及WO90/09441和WO92/07945中公开的pHSVlac、Fink(1992)Human Gene Therapy 3:11-19中描述的HSV Us3::pgC-lacZ、EP 0453242(Breakefield)中描述的HSV 7134、2RH 105和GAL4以及保藏于ATCC、保藏号为ATCC VR-977和ATCC VR-260的那些病毒。
还考虑到甲病毒基因基因治疗载体也可用于本发明。较佳的甲病毒载体是新培斯病毒载体。披膜病毒、Semliki Forest病毒(ATCC VR-67;ATCC VR-1247)、Middleberg病毒(ATCC VR-370)、Ross River病毒(ATCC VR-373;ATCC VR-1246)、委内瑞拉马脑炎病毒(ATCC VR923;ATCC VR-1250;ATCC VR-1249;ATCC VR-532)、以及在美国专利5,091,309,5,217,879以及WO92/10578中描述的那些。更具体地说,可以采用1995年3月15日提交的美国申请08/405,627、WO94/21792、WO92/10578、WO95/07994、US 5,091,309和US 5,217,879中描述的那些甲病毒载体。这些甲病毒可以从保藏机构或保藏中心如Rockville,Maryland的美国典型培养物保藏中心(ATCC)获得,或用常用的技术从已知来源分离获得。较佳的是,采用细胞毒性降低的甲病毒载体(见USSN08/679640)。
DNA载体系统,如真核分层的(layered)表达系统也可用于表达本发明的核酸。关于真核分层的表达系统详见WO95/07994。较佳的,本发明的真核分层表达系统宜从甲病毒载体衍生获得,更佳的从新培斯病毒载体衍生获得。
适用于本发明的其它病毒载体包括:从脊髓灰质炎病毒衍生的载体,例如ATCCVR-58以及在Evans,Nature 339(1989)385和Sabin(1973)J.Biol.Standardization 1:115中描述的那些;鼻病毒,例如ATCC VR-1110以及在Arnold(1990)J Cell Biochem L401中描述的那些;痘病毒,如金黄色痘病毒或牛痘病毒,例如ATCC VR-111和ATCCVR-2010,以及在Fisher-Hoch(1989)Proc Natl Acad Sci 86:317;Flexner(1989)Ann NYAcad Sci 569:86,Flexner(1990)Vaccine 8:17;US 4,603,112,US 4,769,330以及WO89/01973中描述的那些;SV40病毒,例如ATCC VR-305以及在Mulligan(1979)Nature 277:108和Madzak(1992)J Gen Virol 73:1533中描述的那些;流感病毒,例如ATCC VR-797以及用例如US 5,166,057和Enami(1990)Proc Natl Acad Sci87:3802-3805;Enami和Palese(1991)J Virol 65:2711-2713;Luytjes(1989)Cell 59:110中所述的反基因技术制得的重组流感病毒(另见McMichael(1983)NEJ Med 309:13,Yap(1978)Nature 273:238以及Nature(1979)277:108);EP-0386882和Buchschacher(1992)J.Virol.66:2731中描述的人免疫缺陷病毒;麻疹病毒,例如ATCC VR-67和VR-1247,以及EP-0440219中描述的那些;奥拉病毒,例如ATCC VR-368;Bebaru病毒,例如ATCC VR-600和ATCC VR-1240;Cabassou病毒,例如ATCC VR-922;屈曲病毒,例如ATCC VR-64和ATCC VR-1241;Fort Morgan病毒,例如ATCC VR-924;Getah病毒,例如ATCC VR-369和ATCC VR-1243;Kyzylagach病毒,例如ATCC VR-927;Mayaro病毒,例如ATCC VR-66;Mucambo病毒,例如ATCC VR-580和ATCC VR-1244;Ndumu病毒,例如ATCC VR-371;Pixuna病毒,例如ATCC VR-372和ATCC VR-1245;Tonate病毒,例如ATCC VR-925;Triniti病毒,例如ATCC VR-469;Una病毒,例如ATCC VR-374;Whataroa病毒,例如ATCC VR-926;Y-62-33病毒,例如ATCC VR-375;O′Nyong病毒,东部脑炎病毒,例如ATCC VR-65和ATCC VR-1242;西部脑炎病毒,例如ATCC VR-70,ATCC VR-1251,ATCC VR-622和ATCC VR-1252;和冠状病毒,例如ATCC VR-740和在Hamre(1966)Proc Soc Exp Biol Med 121:190中描述的那些。
将本发明的组合物输送至细胞内并不局限于上述病毒载体。还可采用其它输送方法和介质,例如核酸表达载体、与已被杀死的腺病毒相连或不相连的单独的聚阳离子凝缩的DNA(例如参见1994年12月30日美国申请No.08/366,787和Curiel(1992)HumGene Ther 3:147-154)、配体连接的DNA(例如参见Wu(1989)J.Biol.Chem.264:16985-16987)、真核细胞输送载体细胞(例如参见1994年5月9日提交的美国申请No.08/240,030以及美国申请No.08/404,796)、光聚合水凝胶材料的沉淀、手提式基因转移颗粒枪(如美国专利5,149,655所述)、电离辐射(如US5,206,152和WO92/11033所述)、核电荷中和或与细胞膜融合。其它方法在Philip(1994)Mol Cell Biol 14:2411-2418以及Woffendin(1994)Proc.Natl.Acad.Sci.91:1581-1585中有所描述。
可以采用颗粒介导的基因转移,例如参见美国申请No.60/023,867。简言之,可将序列插入含有控制高水平表达的常规序列的常规载体中,然后和合成性基因转移分子一起培育,这些基因转移分子例如是聚合性DNA-结合阳离子(如聚赖氨酸、鱼精蛋白和白蛋白),其与细胞寻靶配体(如脱唾液酸血清类粘蛋白(如Wu和Wu(1987)J.Biol.Chem.262:4429-4432所述)、胰岛素(如Hucked(1990)Biochem Pharmacol 40:253-263所述)、半乳糖(如Plank(1992)Bioconjugate Chem 3:533-539所述)、乳糖或运铁蛋白)相连。
裸DNA也可用于转化宿主细胞。典型的裸DNA导入方法在WO 90/11902和US5,580,859中有所描述。用可生物降解的乳胶珠可以改善摄取效果。在对珠粒的胞吞作用开始后,DNA包被的乳胶珠粒被有效地运输到细胞中。通过处理珠粒以提高其疏水性可进一步改进该方法,从而促进核内体的破坏和将DNA释放到细胞质中。
可作为基因输送运载体的脂质体在US 5,422,120,WO95/13796,WO94/23697,WO91/14445和EP-524,968中有所描述。如USSN 60/023,867中所描述的,在非病毒输送时,可将编码多肽的核酸序列插入含有控制高水平表达的常规序列的常规载体中,然后和合成性基因转移分子一起培育,这些基因转移分子例如是聚合性DNA-结合阳离子(如聚赖氨酸、鱼精蛋白和白蛋白),其与细胞寻靶配体(如脱唾液酸血清类粘蛋白、胰岛素、半乳糖、乳糖或运铁蛋白)相连。其它输送系统包括采用脂质体来包裹DNA,该DNA所含基因在各种组织特异性或活性普遍存在的启动子控制下。适用的其它非病毒输送系统包括机械输送系统,如Woffendin等人(1994)Proc.Natl.Acad.Sci.USA91(24):11581-11585中描述的方法。另外,该系统的编码序列和表达产物可以通过光聚合的水凝胶材料的沉淀来输送。可用来输送编码序列的其它基因输送常规方法例如包括,用手提式基因转移颗粒枪(如美国专利5,149,655所述);用电离辐射来激活转移的基因(如US 5,206,152和WO92/11033所述)。
典型的脂质体和聚阳离子基因输送载体在下列文献中有所描述:US 5,422,120和4,762,915;WO 95/13796;WO94/23697;WO91/14445;EP-0524968;Stryer,Biochemistry,236-240页(1975)W.H.Freeman,San Francisco;Szoka(1980)Biochem Biophys Acta600:1;Bayer(1979)Biochem Biophys Acta 550:464;Rivnay(1987)Meth Enzymol 149:119;Wang(1987)Proc Natl Acad Sci 84:7851;Plant(1989)Anal Biochem 176:420。
多核苷酸组合物可包含治疗有效量的基因治疗运载体,其定义如上所述。出于本发明的目的,有效的剂量是给予个体约0.01毫克/千克至50毫克/千克或0.05毫克/千克至10毫克/千克的DNA构建物。
输送方法
一旦配制后,本发明的多核苷酸组合物可以以下三种方式给予:(1)直接给予对象;(2)活体外输送给对象衍生的细胞;或(3)体外表达重组蛋白。待处理的对象可以是哺乳动物或鸟类。另外,也可对人进行治疗。
直接输送该组合物通常可通过皮下、腹膜内、静脉内或肌内注射或输送至组织间隙来实现。该组合物也可输送至肿瘤或病损部位。其它给药方式包括口服和肺给药、栓剂和透皮或经皮肤应用、用针、基因枪或手持喷雾器(hypospray)。治疗剂量方案可以是单剂方案或多剂方案。
活体外输送以及将转化的细胞重新植入对象体内的方法是本领域所熟知的,在例如WO93/14778中有所描述。用于活体外应用的细胞例子包括例如干细胞、尤其是造血细胞、淋巴细胞、巨噬细胞、树突细胞或肿瘤细胞。
通常,对于活体外和体外应用,核酸的输送可通过以下步骤来实现,例如葡聚糖介导的转染、磷酸钙沉淀、Polybrene介导的转染、原生质体融合、电穿孔、将多核苷酸包裹在脂质体中以及将DNA直接显微注射到胞核中,所有这些均是本领域所熟知的。
多核苷酸和多肽药物组合物
除了上述的药学上可接受的载体和盐外,多核苷酸和多肽组合物中还可采用下列附加试剂。
A.多肽
一个例子是多肽,其包括但不局限于:脱唾液酸血清类粘蛋白(ASOR);运铁蛋白;脱唾液酸糖蛋白;抗体;抗体片段;铁蛋白;白介素;干扰素;粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF);粒细胞集落刺激因子(G-CSF)、巨噬细胞集落刺激因子(M-CSF)、干细胞因子和促红细胞生成素。还可使用病毒抗原,如包膜蛋白。另外,可用来自其它侵袭性生物的蛋白,例如疟原虫恶性疟疾的环孢子蛋白的17个氨基酸的肽(称为RII)。
B.激素,维生素等
其它可包括的种类例如是:激素、类固醇、雄激素、雌激素、甲状腺激素或维生素、叶酸。
C.聚亚烷基、多糖等
另外,聚(亚烷基)二醇可以和所需的多核苷酸或多肽组合在一起。在一个较佳的实施方案中,聚(亚烷基)二醇是聚乙二醇。另外,可以加入单糖、二糖或多糖。在此方面的一个较佳实施方案中,多糖是葡聚糖或DEAE-葡聚糖。另外有脱乙酰壳多糖和聚交酯-聚乙醇酸内酯共聚物。
D.脂质和脂质体
所需的多核苷酸或多肽还可在输送给对象或对象衍生的细胞之前包裹在脂质中或包裹在脂质体中。
脂质包裹通常用能稳定结合或捕获并保留核酸的脂质体来实现。浓缩的多核苷酸或多肽与脂质制剂之比可以不同,但是通常在约1∶1(毫克DNA∶微摩尔脂质)之间,或脂质更多。关于脂质体作为输送核酸的载体的综述参见Hug和Sleight(1991)Biochim.Biophys.Acta.1097:1-17;Straubinger(1983)Meth.Enzymol.101:512-527。
用于本发明的脂质体制剂包括阳离子(带正电荷)、阴离子(带负电荷)和中性制剂。阳离子脂质体已经显示出能以有功能的形式介导质粒DNA的胞内输送(Felgner(1987)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 84:7413-7416);mRNA(Malone(1989)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:6077-6081);和纯化的转录因子的胞内输送(Debs(1990)J.Biol.Chem.265:10189-10192)。
阳离子脂质体很容易购得。例如,N[1-2,3-二油烯基氧)丙基]-N,N,N-三乙铵(DOTMA)脂质体可以以Lipofectin的商标从GIBCO BRL,Grand Island,NY购得。(另见Felgner,同上)。其它商品脂质体包括transfectace(DDAB/DOPE)和DOTAP/DOPE(Boerhinger)。其它阳离子脂质体可用本领域熟知的方法从易购得的材料制得。例如参见,Szoka(1978)PNAS 75:4194-4198;WO90/11092关于DOTAP(1,2-二(油酰基氧)-3-(三甲基铵溶)丙烷)脂质体合成的描述。
同样,阴离子和中性脂质体也是容易获得的,例如购自Avanti PolarLipids(birmingham,AL),或容易用易购得的材料制得。这种材料包括磷脂酰胆碱、胆固醇、磷脂酰乙醇胺、二油酰基磷脂酰胆碱(DOPC)、二油酰基磷脂酰甘油(DOPG)、二油酰基磷脂酰乙醇胺(DOPE)。这些材料还能以合适比例与DOTMA和DOTAP原料混合。用这些材料制备脂质体的方法是本领域熟知的。
脂质体可包含多层脂质体(MLV),小的单层脂质体(SUV)、或大的单层脂质体(LUV)。各种脂质体-核酸复合物可用本领域已知的方法制得。例如参见Straubinger(1983)Meth.Immunol.101:512-527;Szoka(1978)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 75:4194-4198;Papahadjopoulos(1975)Biochim.Biophys.Acta 394:483;Wilson(1979)Cell 17:77);Deamer和Bangham(1976)Biochim.Biophys.Acta 443:629;Ostro(1977)Biochem.Biophys.Res.Commun.76:836;Fraley(1979)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 76:3348);Enoch和Strittmatter(1979)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 76:145;Fraley(1980)J.Biol.Chem.(1980)255:10431;Szoka和Papahadjopoulos(1978)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 75:145;以及Schaefer-Ridder(1982)Science 215:166。
E.脂蛋白
另外,脂蛋白也可加入待输送的多核苷酸或多肽中。采用的脂蛋白的例子包括:乳糜微粒、HDL、IDL、LDL和VLDL。还可采用这些蛋白的突变体、片段或融合蛋白。另外,可采用天然存在的脂蛋白的修饰物,例如乙酰化的LDL。这些脂蛋白能使多核苷酸的输送指向表达脂蛋白受体的细胞。较佳的,如果待输送的多核苷酸中加入了脂蛋白,则组合物中不加入其它寻靶的配体。
天然存在的脂蛋白包含脂质和蛋白部分。蛋白部分称为脱辅基蛋白。目前,已经分离并鉴定出了脱辅基蛋白A、B、C、D和E。其中至少有两个含有几种蛋白,用罗马数字AI、AII、AIV;CI、CII、CIII命名。
脂蛋白可包含多个脱辅基蛋白。例如,天然存在的乳糜微粒包含A、B、C和E,随着时间的推移,这些脂蛋白失去A,得到C和E脱辅基蛋白。VLDL包含A、B、C、和E脱辅基蛋白,LDL包含脱辅基蛋白B;HDL包含脱辅基蛋白A、C和E。
这些脱辅基蛋白的氨基酸是已知的,并且在下列文献中有所描述:Breslow(1985)Annu Rev.Biochem 54:699;Law(1986)Adv.Exp Med.Biol.151:162;Chen(1986)J BiolChem 261:12918;Kane(1980)Proc Natl Acad Sci USA 77:2465;and Utermann(1984)Hum Genet 65:232。
脂蛋白含有各种脂质,包括甘油三酯、胆固醇(游离的和酯型)以及磷脂。天然存在的脂蛋白中脂质的组成是不同的。例如,乳糜微粒主要含甘油三酯。关于天然存在的脂蛋白的脂质含量更详细的描述可在例如Meth.Enzymol.128(1986)中找到。选择脂质的组成,以使脱辅基蛋白的构型有利于受体结合活性。还可选择脂质的组成,以促进与多核苷酸结合分子中的疏水性相互作用和结合。
天然存在的脂蛋白可以用诸如超离心方法从血清中分离出来。这些方法在Meth.Enzymol.(同上);Pitas(1980)J.Bio Chem.255:5454-5460以及Mahey(1979)J Clin.Invest64:743-750中有所描述。
脂蛋白还可在体外产生,或通过在所需宿主细胞中表达脱辅基蛋白基因的重组方法产生。例如参见Atkinson(1986)Annu Rev Biophys Chem 15:403和Radding(1958)Biochim Biophys Acta 30:443。
脂蛋白也可购自商业供应商,如Biomedical Techniologies,Inc.,Stoughton,Massachusetts,USA。
关于脂蛋白的进一步描述可在Zuckermann等人的PCT/US97/14465中找到。
F.聚阳离子试剂
聚阳离子试剂可以与或不与脂蛋白一起包括在含所需待输送多核苷酸或多肽的组合物中。
聚阳离子试剂通常在生理性相关的pH下表现出净的正电荷,并能中和核酸的电荷,而有助于输送至所需位置。这些试剂具有体外、活体外和体内的用途。聚阳离子试剂可用来将核酸通过肌内或皮下等输送至活的对象。
下面是用作聚阳离子试剂的多肽例子:聚赖氨酸、聚精氨酸、聚鸟氨酸和鱼精蛋白。其它例子包括组蛋白、鱼精蛋白、人血清白蛋白、DNA结合蛋白、非组蛋白染色体蛋白、DNA病毒的外壳蛋白,如(X174,转录因子还含有结合DNA的结构域,因此可用作核酸凝聚剂。简言之,转录因子如C/CEBP、c-jun、c-fos、AP-1、AP-2、AP-3、CPF、Prot-1、Sp-1、Oct-1、Oct-2、CREP、和TFIID含有结合DNA序列的基本结构域。
聚阳离子有机试剂包括:精胺、亚精胺和腐胺。
从上面的清单可以推出聚阳离子试剂的尺寸和生理性能,以构建其它多肽聚阳离子试剂或产生合成的聚阳离子试剂。
合成的聚阳离子试剂
有用的合成聚阳离子试剂例如包括,DEAE-葡聚糖、polybrene。LipofectinTM和lipofectAMINETM是与多核苷酸/多肽组合时形成聚阳离子复合物的单体。
免疫诊断试验
本发明的奈瑟球菌抗原可用于免疫试验来检测抗体水平(或相反,可用抗奈瑟球菌抗体来检测抗原水平)。根据明确的免疫试验,可以开发重组抗原,以代替侵入性诊断方法。可检测生物学样品(例如包括血液或血清样品)中的抗奈瑟球菌蛋白的抗体。免疫试验的设计可作很大变化,其各种方案均是本领域中已知的。免疫试验的方案可采取例如竞争性、或直接反应或夹心型试验。方案例如还可采用固体支持物,或可以采用免疫沉淀法。大多数试验涉及采用有标记的抗体或多肽;该标记例如可以是荧光标记、化学发光标记、放射活性标记或染料分子。扩增探针信号的试验也是已知的;其例子是采用生物素和亲和素的试验,酶标记的和介导的免疫试验,如ELISA试验。
将合适的材料(包括本发明的组合物)以及进行试验所需的其它试剂和材料(例如合适的缓冲液、盐溶液等)和合适的试验说明书包装到合适的容器中,构成适用于免疫诊断且含有适当标记的试剂的试剂盒。
核酸杂交
“杂交”指两个核酸序列相互之间通过氢键而结合。通常,一个序列固定于固体载体,另一个将游离于溶液内。然后,在有利于形成氢键的条件下使两个序列相互接触。影响这种结合的因素包括:溶剂的类型和体积;反应温度;杂交时间;搅拌;封闭液相序列与固体载体非特异性结合的试剂(Denhardt′s试剂或BLOTTO);各序列的浓度;是否使用化合物来增加序列结合的速度(硫酸葡聚糖或聚乙二醇);以及杂交后洗涤条件的严谨程度。见Sambrook等人[同上]第2卷,第9章,9.47至9.57页。
“严谨性”指有利于非常相似的序列结合而不利于不同序列结合的杂交反应条件。例如,应选择温度和盐浓度的组合,使温度比所研究的杂交的Tm计算值低大约120至200℃。温度和盐浓度常可在前期初步实验中通过经验来确定,在初步实验中,固定在滤膜上的基因组DNA样品与感兴趣的序列杂交,然后在不同的严谨度条件下洗涤。见Sambrook等人第9.50页。
在进行例如Southern印迹时,要考虑的参数是(1)待印迹的DNA的复杂性以及(2)探针与受检测序列之间的同源性。对于高度复杂的真核基因组中的单拷贝基因,待研究片段的总量可以在10的一个数量级范围内变化,质粒为0.1至1微克,或将噬菌体消化至10-9至10-8克。对于复杂性较低的多核苷酸,可以采用实际上更短的印迹、杂交以及接触时间,更少量的起始多核苷酸,以及比活更低的探针。例如,从1微克酵母DNA开始,用仅仅1小时的接触时间,印迹2小时,然后和108cpm/μg的探针杂交4-8小时,就可以检测单拷贝酵母基因。对于单拷贝哺乳动物基因而言,一种保守的方法是从10微克DNA开始,印迹过夜,在10%硫酸葡聚糖存在下用108cpm/μg以上的探针杂交过夜,导致接触时间约为24小时。
有几个因素可能会影响探针与感兴趣片段之间的DNA-DNA杂交物的解链温度(Tm),因而影响杂交和洗涤的合适条件。在许多情况下,探针并非与片段100%同源。其它常常遇到的变量包括杂交序列的长度和G+C总含量,以及杂交缓冲液的离子强度和甲酰胺含量。所有这些因素的作用可近似表示成一个方程式:
Tm=81+16.6(log10Ci)+0.4[%(G+C)]-0.6(%甲酰胺)-600/n-1.5(%错配)
具中Ci是盐浓度(单价离子),n是杂交物碱基对的长度(对Meinkoth和Wahl(1984)Anal.Biochem.138:267-284中的稍稍作了修改)。
在设计杂交实验时,影响核酸杂交的一些因素可以方便地予以改变。杂交和洗涤时的温度以及洗涤时的盐浓度的调节最为简单。随着杂交温度(即严谨度)的升高,不同源的链之间发生杂交的可能性变得更少,结果背景值降低。如果放射性标记的探针并非与固定的片段完全同源(这在基因家族和种间杂交实验中是常见的),则必须降低杂交温度,而背景值将会增加。洗涤温度以类似的方式影响杂交带的强度和背景值的程度。洗涤的严谨性也随盐浓度的降低而升高。
通常,在50%甲酰胺存在下的方便的杂交温度是:对于靶片段同源性达95%至100%的探针而言,是42℃;对于同源性为90%至95%的探针,为37℃;对于同源性为85%和90%的探针,为32℃。对于较低的同源性,应用上述方程式应相应地降低甲酰胺含量和调节温度。如果探针和靶片段之间的同源性是未知的,则最简单的方法是从非严谨的杂交和洗涤条件开始。如果在放射自显影后发现了非特异性的条带或高背景值,则可在高严谨性下洗涤滤膜,并重新曝光。如果曝光所需时间使得该方法不切实际,则应平行测试几种杂交和/或洗涤严谨性。
核酸探针试验
采用本发明的核酸探针的方法(如PCR、分支DNA探针试验或印迹技术)能确定cDNA或mRNA的存在。如果探针和本发明的序列能形成稳定地足以被检测到的双链体或双链复合物,则称探针与本发明的序列“杂交”。
核酸探针将与本发明的奈瑟球菌核苷酸序列(包括有义和反义链)杂交。尽管有许多不同的核苷酸序列编码该氨基酸序列,但是天然的奈瑟球菌序列是较佳的,因为它是实际存在于细胞中的序列。mRNA代表一种编码序列,因此探针应与该编码序列互补;单链cDNA与mRNA互补,因此cDNA探针应与非编码序列互补。
探针序列无需和奈瑟球菌序列(或其互补体)相同,序列以及长度的一些差异能增加试验的灵敏度,如果核酸探针能和靶核苷酸形成能被检测的双链体的话。另外,核酸探针可包括其它核苷酸,以使形成的双链体稳定。其它奈瑟球菌序列也是有帮助的,可作为检测形成的双链体的标记。例如,非互补的核苷酸序列可以和探针的5′端相连,探针序列的其余部分与奈瑟球菌序列互补。或者,可将非互补的碱基或较长的序列散布到探针中,只要探针序列与奈瑟球菌序列有足够的互补性以便与其杂交从而形成能被检测的双链体。
探针的确切长度和序列将取决于杂交条件,如温度、盐浓度等。例如,对于诊断应用,根据分析物序列的复杂程度,核酸探针通常含有至少10-20个核苷酸,较佳的15-25个,更佳的至少30个核苷酸,但是也可短于该长度。短的引物通常需要较低温度,以便和模板形成足够稳定的杂交复合物。
探针可用合成方法产生,例如Matteucci等人[J.Am.Chem.Soc.(1981)103:3185]的方法或Urdea等人[Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1983)80:7461]的方法,或用市售的自动寡核苷酸合成仪合成。
可以根据偏好选择探针的化学特征。对于某些应用,DNA或RNA是合适的。对于其它的应用,可以加入修饰,例如骨架修饰,如硫代磷酸酯或甲基磷酸酯,可用来增加体内半衰期,改变RNA亲和力,增加核酸酶抗性等[例如参见Agrawal和Iyer(1995)Curr Opin Biotechnol 6:12-19;Agrawal(1996)TIBTECH 14:376-387];还可采用类似物如肽核酸[例如参见Corey(1997)TIBTECH 15:224-229;Buchardt等人(1993)TIBTECH11:384-386]。
一种核苷酸杂交试验的例子由Urdea等人描述于国际专利申请WO 92/02526[还可参见美国专利5,124,246]。
另外,聚合酶链反应(PCR)是另一个熟知的检测少量靶核酸的手段。该试验在Mullis等人[Meth.Enzymol.(1987)155:335-350];美国专利4,683,195和4,683,202中有所描述。用两个“引物”核苷酸与靶核酸杂交,并用来引导反应。引物可包含不与扩增靶序列(或其互补序列)杂交的序列,以帮助双链体的稳定性,或例如可插入一个简便的限制性位点。这些序列通常侧接所需的奈瑟球菌序列。
利用最初的靶核酸作为模板,热稳定的聚合酶能从引物产生靶核酸的拷贝。在聚合酶产生临界量的靶核酸后,它们可用较传统的方法(如Southern印迹)来检测。当采用Southern印迹方法后,标记的探针将与奈瑟球菌序列(如其互补序列)杂交。
另外,mRNA或cDNA也可用Sambrook等人[同上]中描述的传统印迹技术来检测。用凝胶电泳可纯化并分离利用聚合酶从mRNA产生的mRNA或cDNA。然后,将凝胶上的核酸印迹到固体载体如硝酸纤维素上。使固体载体与标记的探针接触,然后洗涤除去所有未杂交的探针。然后,检测含有标记探针的双链体。该探针通常用放射活性物质作标记。
实施例
下列实施例描述已经在脑膜炎奈瑟球菌和淋病奈瑟球菌中鉴定的核酸序列及其分别推定的翻译产物。并非所有的核酸序列都是完整的,即它们编码比全长短的野生型蛋白。
实施例总体上采用下列形式:
●在脑膜炎奈瑟球菌中已经鉴定的核苷酸序列
●所述脑膜炎奈瑟球菌序列的推定翻译产物
●根据数据库比较用计算机分析所述翻译产物
●在淋病奈瑟球菌中鉴定出的对应核苷酸序列
●所述淋病奈瑟球菌序列的推定翻译产物
●对脑膜炎奈瑟球菌序列和淋病奈瑟球菌序列的翻译产物之间相同性百分比的比较
●从脑膜炎奈瑟球菌A菌株中鉴定出的对应核苷酸序列
●所述脑膜炎奈瑟球菌A菌株序列的推定的翻译产物
●对脑膜炎奈瑟球菌序列和淋病奈瑟球菌序列的翻译产物之间相同性百分比的比较
●对可能具有适当抗原性或免疫原性的蛋白的特性描述
在NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)用BLAST、BLAST2、BLASTn、BLASTp、tBLASTn、BLASTx、和tBLASTx算法进行序列比较[例如参见Altschul等人(1997)″Gapped BLAST和PSI-BLAST:新一代的蛋白数据库搜索程序″Nucleic Acids Research25:2289-3402]。对下列数据库进行搜索:非冗余的GenBank+EMBL+DDBJ+PDB序列和非冗余的GenBank CDS翻译+PDB+SwissProt+SPupdate+PIR序列。
核苷酸序列中的点代表为了维持读码框而任意导入的核苷酸。同样,带双划线的核苷酸被去除。小写字母代表在独立测序反应的序列对比时出现了多义性(实施例中的一些核苷酸序列是通过合并两个或多个实验的结果而获得的)。
用根据Esposti等人[″膜蛋白亲水性的关键评价″(1990)Eur J Biochem 190:207-219]的统计研究的算法,扫描所有6种读码框中的核苷酸序列,以预测疏水性区域的存在。这些结构域代表潜在的跨膜区域或疏水性前导序列。
用ORFFINDER程序(NCBI)从片段化的核苷酸序列预测开放读框。
有下划线的氨基酸序列代表用PSORT算法(http://www.psort.nibb.ac.jp)估测出的ORF中可能的跨膜区域或前导序列。还用MOTIFS程序(GCG Wisconsin和PROSITE)预测了功能性结构域。
对于下列每一实施例:根据淋球菌蛋白中推定的前导序列和/或数个推定的跨膜区域(单下划线),预测脑膜炎奈瑟球菌和淋病奈瑟球菌的蛋白质以及它们各自的表位,可能是疫苗或诊断的有用抗原或免疫原。
可用于实施本发明(例如将所公开的序列用于疫苗接种或诊断目的)的标准技术和程序,在上文中已概述。该概述不是对本发明的限制,相反给出了可以使用但并不是必需使用的例子。
具体地说,采用下列方法来表达、纯化和分析本发明蛋白的生物化学特性。
染色体DNA制备
使脑膜炎奈瑟球菌2996菌株在100毫升GC培养基中生长至指数期,离心收获,重悬于5毫升缓冲液(20%(w/v)蔗糖、50毫摩尔Tris-HCl、50毫摩尔EDTA、pH 8)中。冰上培育10分钟后,加入10毫升裂解溶液(50毫摩尔NaCl,1%Na-十二烷基肌氨酸钠,50微克/毫升蛋白酶K)裂解该细菌,37℃培育悬液2小时。用苯酚抽提两次(平衡至pH8),用三氯甲烷/异戊醇(24∶1)抽提一次。加入0.3M乙酸钠和2体积乙醇,使DNA沉淀,离心收集。用70%乙醇洗涤沉淀一次,重新溶解在4.0毫升TE缓冲液(10毫摩尔Tris-HCl,1毫摩尔EDTA,pH 8)中。通过读取260纳米处的OD值而测定DNA浓度。
寡核苷酸设计
用(a)脑膜炎球菌B的序列(当能获得时),或(b)淋球菌/脑膜炎球菌A的序列(按需要根据脑膜炎球菌密码子偏好利用率进行调整),根据各ORF的编码序列,设计合成的寡核苷酸引物。设计针对紧靠预计的前导序列的下游序列的5′端引物,从而忽略任何预计的信号肽。
对于大多数ORF,5′引物包括两个限制性酶识别位点(BamHI-NdeI,BamHI-NheI、EcoRI-NdeI或EcoRI-NheI),这取决于感兴趣基因的限制图谱。3′引物包括XhoI或HindIII限制性位点(表1)。建立该步骤是为了指导将各扩增产物(对应于各ORF)克隆到以下两个不同的表达系统中:pGEX-KG(用BamHI-XhoI、BamHI-HindIII、EcoRI-XhoI或EcoRI-HindIII),以及pET21b+(用NdeI-XhoI、NheI-XhoI、NdeI-HindIII或NheI-HindIII)。
5′-端引物尾序列:CGCGGATCCCATATG(BamHI-NdeI)
CGCGGATCCGCTAGC(BamHI-NheI)
CCGGAATTCTACATATG(BamHI-NheI)
CCGGAATTCTAGCTAGC(EcoRI-NheI)
3′-端引物尾序列:CCCGCTCGAG(XhoI)
CCCGCTCGAG(HindIII)
为了将ORF克隆入pGEX-His载体,5′和3′引物只含有一个限制性酶切位点(对于5′引物是EcoRI、KpnI或SalI,对于3′引物是PstI、XbaI、SphI或SalI)。同样,限制性酶切位点的选择是根据该基因的限制性酶切图谱加以选择的(表1)。
5′-端引物尾序列: (AAA)AAAGAATTC(EcoRI)
(AAA)AAAGGTACC(KpnI)
3′-端引物尾序列: (AAA)AAACTGCAG(PstI)
(AAA)AAATCTAGA(XbaI)
AAAGCATGC(SphI)
5′或3′-端引物尾序列:AAAAAAGTCGAC(SalI)
引物不仅含有限制性酶识别序列,而且还包括能与待扩增序列杂交的核苷酸。解链温度取决于整个引物中杂交核苷酸的数目和类型,并且对于各引物可用下式确定:
Tm=4(G+C)+2(A+T) (排除尾部)
Tm=64.9+0.41(%GC)-600/N (整个引物)
对于整个寡核苷酸来说,所选寡核苷酸的解链温度通常为65-70℃,对于单单杂交区来说,解链温度为50-55℃。
表1显示了用于各扩增反应的正向和反向引物。在某些情况下,引物序列并不完全与预计ORF的序列精确匹配。这是因为在进行最初的扩增时,并不知道一些脑膜炎球菌B的ORF的完整5′和/或3′序列。然而,已经鉴定了淋球菌或脑膜炎球菌A中的对应序列。因此,当脑膜炎球菌B序列是不完整或不确定时,可使用淋球菌或脑膜炎球菌A的序列作为引物设计的基础。根据密码子偏好性对这些序列作了改动。可理解,一旦鉴定出了完整的序列,就不再需要该方法了。
用Perkin Elmer 394 DNA/RNA合成仪合成寡核苷酸,用2.0毫升氢氧化铵从柱上洗脱下,56℃培育5小时去保护。加入0.3M乙酸钠和2体积乙醇,使寡核苷酸沉淀。然后离心样品,将沉淀重悬于100微升或1.0毫升水中。用Perkin ElmerλBio分光光度计测定OD260,测得浓度,调节至2-10pmol/微升。
扩增
标准的PCR程序如下:在20-40微摩尔各寡核苷酸引物、400-800微摩尔dNTP溶液、1x PCR缓冲液(包括1.5毫摩尔氯化镁)、2.5单位TaqI DNA聚合酶(用Perkin-ElmerAmpliTaQ,GIBCO Platinum,Pwo DNA聚合酶或Tahara Shuzo Taq聚合酶)存在下,用50-200ng基因组DNA作为模板。在一些例子中,通过加入10微升DMSO或50微升2M甜菜碱来优化PCR。
在加热开始后(95℃初步培育整个混合物3分钟期间加入聚合酶),每个样品经历两步扩增:前5个循环的进行使用排除引物限制性酶尾部的杂交温度(见上文)。随后进行的30循环使用全长寡核苷酸的杂交温度。72℃延伸10分钟结束循环。
标准循环如下:
变性 | 杂交 | 延伸 | |
前5循环 | 30秒95℃ | 30秒50-55℃ | 30-60秒72℃ |
后30循环 | 30秒95℃ | 30秒65-70℃ | 30-60秒72℃ |
延伸时间随待扩增ORF的长度而不同。扩增用9600或2400 Perkin Elmer GeneAmpPCR系统进行。为了检查结果,将1/10的扩增体积加到1-1.5%(w/v)琼脂糖凝胶上,将各扩增片段的大小与DNA分子标记作比较。
将扩增的DNA直接上样到1%琼脂糖凝胶上,或是先用乙醇沉淀,然后重悬于合适的体积中,上样到1.0%琼脂糖凝胶上。然后用Qiagen凝胶抽提试剂盒,按照生产商说明,从凝胶中纯化获得对应于大小正确条带的DNA片段。在30微升或50微升的中的DNA片段,用水或10mM Tris,pH 8.5洗脱。
PCR片段的消化
将对应于扩增片段的纯化DNA用适当的限制酶进行双重消化,然后,克隆入pET-21b+并以C-末端His尾的融合蛋白形式表达蛋白;克隆入pGEX-KG并以N末端GST融合形式表达蛋白;克隆入pGEX-His并以N末端GST-His尾融合蛋白形式表达蛋白。
在合适的消化缓冲液存在下,使各纯化的DNA片段与20单位的适当限制性酶(New England Biolabs)在30或40微升体积中37℃培育3小时至过夜。然后用QIAquickPCR纯化试剂盒,按照生产商说明书纯化消化的片段,以30微升或50微升体积用水或10mM Tris-HCl(pH 8.5)洗脱。在已滴定的分子量标记存在下,通过定量琼脂糖凝胶电泳(1.0%凝胶)测定DNA浓度。
克隆载体(pET22B,pGEX-KG,pTRC-His A、pET21b+、pGEX-KG和pGEX-His)的消化
pGEX-His载体是经修饰的pGEX-2T载体,其在凝血酶断裂位点上游携带有一个编码6个组氨酸残基的区域,而且还含有载体pTRC99(Pharmacia)的多个克隆位点。在合适的缓冲液存在下,在200微升反应体积中用50单位的各限制性酶对10微克质粒进行双消化37℃培育过夜。将全部消化物上样到1%琼脂糖凝胶上后,用Qiagen QIAquick凝胶抽提试剂盒从凝胶中纯化对应于消化载体的条带,将DNA洗脱到50微升10毫摩尔Tris-HCl,pH 8.5中。测定样品的OD260评价其DNA浓度,并将浓度调节至50微克/微升。每个克隆步骤使用1微升质粒。
用合适的缓冲液,在200微升反应体积中用50单位的各限制性酶对10微克质粒进行双消化37℃培育过夜。将全部消化物上样到1.0%琼脂糖凝胶上后,用QiagenQIAquick凝胶抽提试剂盒从凝胶中纯化对应于消化载体的条带,将DNA洗脱到50微升10毫摩尔Tris-HCl,pH 8.5中。测定样品的OD260nm而评价其DNA浓度,并将浓度调节至50微克/微升。每个克隆步骤使用1微升质粒。
克隆
对于某些ORF,将预先消化和纯化的、对应于各ORF的片段连接到pET22b和pGEX-KG中。在20微升的最终体积,在生产商提供的缓冲液存在下,用0.5微升NEBT4DNA连接酶(400单位/微升)连接摩尔比为3∶1的片段/载体。室温培育反应3小时。在一些实验中,用Boheringer的″快速连接试剂盒″按照生产商说明书进行连接。
为了将重组质粒导入合适的菌株内,使100微升大肠杆菌DH5感受态细胞与连接酶反应溶液于冰上培育40分钟,然后37℃3分钟,然后加入800微升LB肉汤后,再37℃培育20分钟。然后在Eppendorf微量离心机(microfuge)中以最大速度离心细胞,重悬于约200微升上清液中。然后将悬液接种到LB氨苄青霉素(100毫克/毫升)平板上。
使5个随机选择的菌落在2毫升(pGEX或pTC克隆)或5毫升(pET克隆)LB肉汤+100微克/毫升氨苄青霉素中37℃生长过夜,对重组克隆进行筛选。然后,使细胞沉淀,用Qiagen QIAprep旋转微量制备试剂盒,按照生产商说明书,将DNA抽提到最终体积为30微升。用NdeI/XhoI或BamHI/XhoI消化5微升各个微量制备物(约1微克),将整个消化物上样到1-1.5%琼脂糖凝胶上(取决于预计的插入片段大小),与分子量标记(1KbDNA梯序列,GIBCO)平行。根据正确的插入片段大小筛选阳性克隆。
对于某些ORF,将预先消化和纯化的、对应于各ORF的片段连接到pET21b+和pGEX-KG中。在20微升最终体积(含有生产商提供的缓冲液和0.5微升T4 DNA连接酶(400单位/微升,NEB))中,使用摩尔比为3∶1的片段/载体。反应在室温下进行3小时。在一些实验中,用Boheringer的″快速连接试剂盒″按照生产商说明书进行连接。
通过将连接酶反应溶液与细菌于冰上培育40分钟,然后37℃3分钟,而将重组质粒转入100微升感受态的大肠杆菌DH5或HB101。然后,在加入800微升LB肉汤后,在37℃培育20分钟。然后在Eppendorf微量离心机(microfuge)中以最大速度离心细胞,重悬于约200微升上清液中,然后接种到LB氨苄青霉素(100毫克/毫升)琼脂平板上。
使5个随机选择的菌落在2.0毫升(pGEX-KG克隆)或5.0毫升(pET克隆)LB肉汤+100微克/毫升氨苄青霉素中37℃生长过夜,对重组克隆进行筛选。然后,使细胞沉淀,用Qiagen QIAprep旋转微量制备试剂盒,按照生产商说明书抽提质粒DNA。用合适的限制酶消化约1微升各种微量制备物,将整个消化物上样到1-1.5%琼脂糖凝胶上(取决于预计的插入片段大小),与分子量标记(1Kb DNA梯序列,GIBCO)平行。根据正确的插入片段大小筛选阳性克隆。
通过对PCR产物双消化并连入类似消化的载体中,将ORF克隆入pGEX-His。克隆后,将重组质粒转入大肠杆菌W3110宿主中。各克隆在含50微升/毫升氨苄青霉素的L-肉汤中37℃生长过夜。
通过使用EcoRI-PstI克隆位点、或EcoRI-SalI、或SalI-PstI位点将某些ORF克隆入pGEX-His载体中。克隆后,可将重组质粒导入大肠杆菌W3110宿主中。
表达
然后,将克隆到表达载体中的每个ORF转化入适合表达重组蛋白产物的菌株中。用1微升各构建物转化上述30微升大肠杆菌BL21(pGEX载体)、大肠杆菌TOP10(pTRC载体)或大肠杆菌BL21-DE3(pET载体)。在pGEX-His载体例子中,用相同的大肠杆菌菌株(W3110)进行最初的克隆和表达。将单个重组菌落接种到2毫升LB+Amp(100微克/毫升)中,37℃培育过夜,然后1∶30稀释在100毫升瓶中的20毫升LB+Amp(100微克/毫升)中,确保OD600在0.1至0.15之间。将瓶培育在30℃的回转水浴摇床中,直至OD表明达到适合诱导表达的指数生长(pET和pTRC载体的OD为0.4-0.8;pGEX和pGEX-His载体的OD为0.8-1)。对于pET,pTRC和pGEX-His载体,加入1毫摩尔IPTG,诱导蛋白质表达,而在pGEX系统情况下,IPTG的最终浓度为0.2毫摩尔。30℃培育3小时后,测OD检查样品的最终浓度。为了检查表达,取出各样品1毫升,在微量离心机中离心,将沉淀重悬于PBS中,用12%SDS-PAGE和考马斯蓝染色分析。6000g离心整个样品,将沉淀重悬于PBS中待用。
GST-融合蛋白的大规模纯化
对于某些ORF,使单菌落在LB+Amp琼脂板上37℃培育过夜。将细菌接种到20毫升LB+Amp培养液中,水浴摇床上生长过夜。将细菌1∶30稀释到600毫升新鲜培养基中,使其在最适温度(20-37℃)下生长至OD550为0.8-1。用0.2毫摩尔IPTG诱导蛋白质表达,培育3小时。4℃、8000rpm离心培养物。弃去上清液,将细菌沉淀重悬于7.5毫升冷的PBS中。用40W的Brason超声波仪B-15在冰上超声破碎细胞30秒种,冻融2次,再次离心。收集上清液,与150微升谷胱苷肽-Sepharose 4B树脂(Pharmacia)(先用PBS洗涤)混合,室温下培育30分钟。4℃、700g离心样品5分钟。用10毫升冷的PBS洗涤树脂2次10分钟,重悬于1毫升冷的PBS中,上样于一次性柱中。用2毫升冷PBS洗柱2次,直至流穿液OD280达到0.02-0.06。加入700微升冷的谷胱苷肽洗脱缓冲液(10毫摩尔还原的谷胱苷肽,50毫摩尔Tris-HCl),洗脱GST-融合蛋白,收集各组分直至OD280为0.1。将各组分21微升上样于12%SDS凝胶上,凝胶采用BioradSDS-PAGE分子量标准宽范围(M1)(200,116.25,97.4,66.2,45,31,21.5,14.4,6.5kDa)或Amersham Rainbow标记(M″)(220,66,46,30,21.5,14.3kDa)作为标准。因为GST的MW为26kDa,因此该值必须加到各GST-融合蛋白的MW中。
对于其他ORF,对于以GST-融合蛋白形式纯化的各克隆,对单菌落进行划线然后在LB/Amp(100微克/毫升)琼脂平板上37℃培育过夜。将自该平板分离的菌落接种于20毫升LB/Amp(100微克/毫升)培养液中,37℃摇动生长过夜。将过夜培养物以1∶30稀释到600毫升LB/Amp(100微克/毫升)培养液中,使其在最适温度(20-37℃)下生长至OD550m为0.6-0.8。加入IPTG(终浓度为0.2毫摩尔)诱导重组蛋白质的表达,然后培养物再培育3小时。4℃、8000g离心15分钟收集培养物。
将细菌沉淀重悬于7.5毫升冷PBS中。用40W的Brason超声波仪450在冰上超声破碎细胞30秒种4次,然后4℃,13000xg离心30分钟。收集上清液,与150微升谷胱苷肽-Sepharose 4B树脂(Pharmacia)(预先用PBS平衡)混合,室温下轻柔搅拌培育30分钟。将分批的制备物4℃,700g离心5分钟,然后弃去上清液。树脂用10毫升冷的PBS(分批地)洗涤2次10分钟,再重悬于1毫升冷的PBS中,然后上样于一次性柱中。继续用冷PBS洗涤树脂,直至流穿液OD280nm达到0.02-0.01。加入700微升冷的谷胱苷肽洗脱缓冲液(10毫摩尔还原的谷胱苷肽,50毫摩尔Tris-HCl),洗脱GST-融合蛋白,收集各组分直至洗脱液的OD280nm表明已获得所有的重组蛋白。将各洗脱组分的20微升样品用12%凝胶进行SDS-PAGE分析。采用Bio-Rad大范围分子量标准物(M1)(200,116.25,97.4,66.2,45.0,31.0,21.5,14.4,6.5kDa)或Amersham Rainbow标记(M2)(220,66.2,46.0,30.0,21.5,14.3kDa)作为标准。GST-融合蛋白的分子量是26kDa GST蛋白与其融合伙伴(partner)的分子量之和。蛋白质浓度用Bradford测试法估测。
可溶性His-融合蛋白的大规模纯化
对于某些ORF,使单菌落在LB+Amp琼脂板上37℃培育过夜。将细菌接种到20毫升LB+Amp培养液中,并在水浴摇床上生长过夜。将细菌1∶30稀释到600毫升新鲜培养基中,使其在最适温度(20-37℃)下生长至OD550为0.6-0.8。加入1毫摩尔IPTG诱导蛋白质表达,培养物再培育3小时。4℃8000rpm离心培养物。弃去上清液,将细菌沉淀重悬于7.5毫升冷的10mM咪唑缓冲液中(300mM Nacl,50mM磷酸缓冲液,10mM咪唑pH8)。用40W的Brason超声波仪B-15在冰上超声破碎细胞30秒种,冻融2次,然后再次离心。收集上清液,与150微升Ni2+-树脂(Pharmacia)(预先用10mM咪唑缓冲液洗涤)混合,室温轻柔搅拌培育30分钟。4℃,700g离心样品5分钟。树脂用10毫升冷的10mM咪唑缓冲液洗涤二次,各10分钟,然后重悬于1毫升冷的10mM咪唑缓冲液中,上样于一次性柱中。4℃,用2毫升冷的10mM咪唑缓冲液洗涤树脂,直至流穿液OD280达到0.02-0.06。用2毫升冷的20mM咪唑缓冲液(300mM NaCl,50mM磷酸盐缓冲液,20mM咪唑,pH 8)洗涤树脂,直至流穿液OD280达到0.02-0.06。加入700微升冷的250mM咪唑缓冲液(300mM NaCl,50mM磷酸盐缓冲液,250mM咪唑,pH 8),洗脱His-融合蛋白,并收集各组分直至OD280为0.1。将各组分21微升上样于12%SDS凝胶上。
不溶性His融合蛋白大规模纯化
使单菌落在LB+Amp琼脂板上37℃培育过夜。将细菌接种到20毫升LB+Amp培养液中,在水浴摇床中培育过夜。将细菌1∶30稀释到600毫升新鲜培养基中,使其在最适温度(37℃)下生长至OD550为0.6-0.8。加入1毫摩尔IPTG诱导蛋白质表达,继续培育该培养物3小时。4℃、8000rpm离心培养物,弃去上清液,将细菌沉淀重悬于7.5毫升缓冲液B中(尿素8M,10毫摩尔Tris-HCl,100毫摩尔磷酸缓冲液,pH 8.8)。用Brason超声波仪B-15于40W在冰上超声破碎细胞30秒种,冻融2次,然后再次离心。上清液保存在-20℃,而沉淀重悬于2毫升胍缓冲液(6M盐酸胍,100毫摩尔磷酸缓冲液,10毫摩尔Tris-HCl,pH 7.5)中,在匀化器中处理10个循环。13000rpm离心产物40分钟。将上清液与150微升Ni2+-树脂(Pharmacia)(先用缓冲液B洗涤),混合室温轻微搅动培育30分钟。样品4℃,700g离心5分钟。树脂用10毫升缓冲液B洗涤二次10分钟,然后重悬于1毫升缓冲液B中,上样于一次性柱中。树脂用2毫升缓冲液B室温洗涤,直至流穿液OD280达到0.02-0.06。树脂用2毫升缓冲液C(尿素8M,10毫摩尔Tris-HCl,100毫摩尔磷酸缓冲液,pH 6.3)洗涤,直至流穿液OD280达到0.02-0.06。加入700微升洗脱缓冲液(尿素8M,10毫摩尔Tris-HCl,100毫摩尔磷酸缓冲液,pH 4.5)洗脱His-融合蛋白,收集各组分直至OD280为0.1。将各组分的21微升上样于12%SDS凝胶。
His融合蛋白的纯化
对于以His-融合蛋白形式纯化的各克隆,划线单菌落在LB/Amp(100微克/毫升)琼脂平板上37℃培育过夜。将自该平板分离的菌落接种于20毫升LB/Amp(100微克/毫升)培养液中,37℃摇动生长过夜。将过夜培养液以1∶30稀释到600毫升LB/Amp(100微克/毫升)培养液中,使其在最适温度(20-37℃)下生长至OD550nm为0.6-0.8。加入IPTG(终浓度为1.0毫摩尔)诱导重组蛋白质的表达,培养物再培育3小时。4℃、8000g离心15分钟收集细菌。
将细菌沉淀重悬于7.5毫升(i)冷的、用于可溶性蛋白的缓冲液A中(300mM氯化钠,50毫摩尔磷酸缓冲液,10毫摩尔咪唑,pH 8),或(ii)用于不溶性蛋白的缓冲液B中(尿素8M,10毫摩尔Tris-HCl,100毫摩尔磷酸缓冲液,pH 8.8)。用Brason超声波仪450于40W在冰上超声破碎细胞30秒种4次,4℃,13000×g离心30分钟。对于不溶性蛋白,将沉淀重悬于2.0毫升缓冲液C(6M盐酸胍,100毫摩尔磷酸缓冲液,10毫摩尔Tris-HCl,pH 7.5)中,用Dounce匀化器处理10个循环。匀浆在13000×g离心40分钟,保留上清液。
将可溶性和不溶性制备物的上清液,与150微升Ni2+-树脂(先用合适的缓冲液A或缓冲液B平衡)混合,室温下轻微搅动培育30分钟。该树脂是Chelating Sepharose FastFlow(Pharmacia),根据制造商的说明书制备的。将分批制备物4℃,700g离心5分钟,弃去上清液。树脂用10毫升缓冲液A或B(分批地)洗涤二次,10分钟,然后重悬于1.0毫升缓冲液A或B中,再上样于一次性柱中。树脂继续(i)在4℃用缓冲液A,或(ii)在室温下用缓冲液B洗涤,直至流穿液OD280nm达到0.02-0.01。进一步用以下缓冲液洗涤树脂:(i)冷的缓冲液C(300毫摩尔氯化钠,50毫摩尔磷酸缓冲液,20毫摩尔咪唑,pH 8.0)或(ii)缓冲液D(尿素8M,10毫摩尔Tris-HCl,100毫摩尔磷酸缓冲液,pH 6.3),直至流穿液OD280nm达到0.02-0.01。加入700微升的(i)冷的洗脱缓冲液A(300毫摩尔氯化钠,50毫摩尔磷酸缓冲液,250毫摩尔咪唑,pH8.0)或(ii)洗脱缓冲液B(尿素8M,10毫摩尔Tris-HCl,100毫摩尔磷酸缓冲液,pH 4.5),洗脱His-融合蛋白,收集各组分直至OD280nm表明已收集了所有的重组蛋白。将各洗脱组分20微升等份样品用12%凝胶进行SDS-PAGE分析。蛋白质浓度用Bradford试验估测。
His-融合蛋白复性
在需要对可溶性蛋白进行变性的情况下,则在免疫之前采用复性步骤。将甘油加入变性的、上述获得的组份,使其终浓度为10%(v/v)。用透析缓冲液I(10%(v/v)甘油,0.5M精氨酸,50毫摩尔磷酸缓冲液,5.0毫摩尔还原的谷胱苷肽,0.5毫摩尔氧化的谷胱苷肽,2.0M尿素,pH 8.8)将蛋白质稀释至200微克/毫升,用相同的缓冲液4℃透析12-14小时。用缓冲液II(10%(v/v)甘油,0.5M精氨酸,50mM磷酸缓冲液,5.0毫摩尔还原的谷胱苷肽,0.5毫摩尔氧化的谷胱苷肽,pH 8.8)进一步4℃透析蛋白质12-14小时。
或者,在变性的蛋白中加入10%甘油。然后用透析缓冲液I(10%甘油,0.5M精氨酸,50毫摩尔磷酸缓冲液,5毫摩尔还原的谷胱苷肽,0.5毫摩尔氧化的谷胱苷肽,2M尿素,pH 8.8)将蛋白质稀释至20微克/毫升,用相同的缓冲液4℃透析12-14小时。用透析缓冲液II(10%甘油,0.5M精氨酸,50mM磷酸缓冲液,5毫摩尔还原的谷胱苷肽,0.5毫摩尔氧化的谷胱苷肽,pH 8.8)进一步4℃透析蛋白质12-14小时。
用下式评价蛋白浓度:
蛋白质(毫克/毫升)=(1.55×OD280)-(0.76×OD260)
蛋白质纯化
为了分析溶解度,将从3.0毫升培养物得到的沉淀重悬于500微升缓冲液M1[PBS,pH 7.2]中。加入25微升溶菌酶(10毫克/毫升),4℃培育细菌15分钟。用Branson超声仪450在40W下超声破碎细胞30秒4次。13000g离心30分钟4℃收集上清液,并将沉淀重悬于缓冲液M2[8M尿素,0.5M氯化钠,20毫摩尔咪唑和0.1M磷酸二氢钠]中,4℃培育3-4小时。离心后,收集上清液,并将沉淀重悬于缓冲液M3[6M盐酸胍,0.5M氯化钠,20毫摩尔咪唑和0.1M磷酸二氢钠]中,4℃过夜。用SDS-PAGE分析所有步骤的上清液。发现某些蛋白质在PBS中可溶,而另一些蛋白的溶解需要尿素或盐酸胍。
为了制备性大规模纯化,用上述步骤诱导500毫升培养物,并将融合蛋白溶于缓冲液M1、M2或M3中。将细菌粗提物上样于Ni-NTA超流(superflow)柱(Quiagen),该柱已根据所采用的溶解缓冲液用M1、M2或M3预先平衡。用相同缓冲液洗柱而洗脱掉未结合的物质。用含有500毫摩尔咪唑的相应缓冲液洗脱重组融合蛋白,然后用不含咪唑的同一缓冲液透析。
小鼠免疫
用各纯化蛋白20微克腹膜内免疫小鼠。对于某些ORF,用氢氧化铝作为佐剂,在第1、21和42天免疫Balb-C小鼠,检测第56天所取样品中的免疫应答。对于其他ORF,可用相同方案免疫CD 1小鼠。对于ORF 25和40,用Freund佐剂免疫CD1小鼠,采用相同的免疫方案,只是在第42天而非56天测定免疫应答。同样,对于另一些ORF,用Freund佐剂免疫CD1小鼠,但是在第49天测定免疫应答。或者,将20微克每种纯化的蛋白与Freund佐剂混合,然后用于腹膜内免疫CD1小鼠。对于大多数蛋白质,免疫在第1、21和35天进行,并在第34和49天取样品测定免疫应答。对于一些蛋白质,在第28天(而不是第35天)进行第三次免疫,并在第20和42天(而不是第34和49天)测定免疫应答。
ELISA试验(血清分析)
将无荚膜MenB M7菌株接种到巧克力琼脂板上,37℃培育过夜。用无菌挑菌拭子收集琼脂板的细菌菌落,接种到7毫升含0.25%葡萄糖的Mueller-Hinton肉汤(Difco)中。跟踪OD260每30分钟监测细菌生长。使细菌长至OD达到0.3-0.4。10000rpm离心培养物10分钟。弃去上清液,用PBS洗涤细菌1次,重悬于含0.025%甲醛的PBS中,室温培育2小时,然后4℃搅拌过夜。在96孔Greiner板的每个孔中加入100微升细菌细胞,4℃培育过夜。然后用PBT洗涤缓冲液(0.1%吐温-20,PBS配)洗涤孔三次。每孔中加入200微升饱和缓冲液(含2.7%聚乙烯吡咯烷酮10的水),37℃培育平板2小时。用PBT洗涤各孔3次。每孔中加入200微升稀释的血清(稀释缓冲液:1%BSA,0.1%吐温-20,0.1%叠氮钠,PBS配),37℃培育平板90分钟。用PBT洗孔三次。每孔中加入100微升以稀释缓冲液1∶2000稀释的HRP-偶联的家兔抗小鼠(Dako)血清,37℃培育平板90分钟。用PBT缓冲液洗涤孔三次。每孔中加入100微升HRP的底物缓冲液(25毫升柠檬酸缓冲液pH 5,10毫克邻苯二胺和10微升双氧水),平板室温放置20分钟。每孔中加入100微升硫酸,并跟踪OD490。当OD490为各自免疫前血清OD值的2.5倍时,认为ELISA呈阳性。
或者,将无荚膜MenB M7菌株接种到巧克力琼脂板上,37℃培育过夜。用无菌挑菌拭子收集琼脂板的细菌菌落,接种到7毫升含0.25%葡萄糖的Mueller-Hinton肉汤(Difco)中。跟踪OD260每30分钟监测细菌生长。使细菌长至OD达到0.3-0.4。10000rpm离心培养物10分钟。弃去上清液,用PBS洗涤细菌1次,重悬于含0.025%甲醛的PBS中,37℃培育1小时,然后4℃搅拌过夜。在96孔Greiner板的每孔中加入100微升细菌细胞,4℃培育过夜。然后用PBT洗涤缓冲液(0.1%吐温-20,PBS配)洗涤孔三次。每孔中加入200微升饱和缓冲液(含2.7%聚乙烯吡咯烷酮10的水),37℃培育平板2小时。用PBT洗涤各孔3次。每孔中加入200微升稀释的血清(稀释缓冲液:1%BSA,0.1%吐温-20,0.1%叠氮钠,PBS配),37℃培育平板2小时。用PBT洗孔三次。在每孔中加入100微升以稀释缓冲液1∶2000稀释的HRP-偶联的家兔抗小鼠(Dako)血清,37℃培育平板90分钟。用PBT缓冲液洗涤孔三次。在每孔中加入100微升HRP的底物缓冲液(25毫升柠檬酸缓冲液pH 5,10毫克邻苯二胺和10微升双氧水),平板室温放置20分钟。每孔中加入100微升硫酸,并跟踪OD490。计算ELISA效价,以产生OD490值比免疫前血清水平高0.4的血清稀释倍数表示。当OD490值为0.4的血清稀释倍数大于1∶400时,认为ELISA呈阳性。
FACScan细菌结合试验程序
将无荚膜MenB M7菌株接种到巧克力琼脂板上,37℃培育过夜。用无菌挑菌拭子收集琼脂板上的细菌菌落,接种到8毫升含0.25%葡萄糖的Mueller-Hinton肉汤(Difco)的4个试管中。跟踪OD260,每30分钟监测细菌生长。使细菌长至OD达到0.35-0.5。4000rpm离心培养物10分钟。弃去上清液,将沉淀重悬于封闭缓冲液(1%BSA,PSB配0.4%叠氮钠)中,4000rpm离心5分钟。将细胞重悬于封闭缓冲液中,至OD620为0.07。在Costar 96孔板的每孔中加入100微升细菌细胞。在每孔中加入100微升稀释的(1∶100、1∶200、1∶400)血清(封闭缓冲液配),4℃培育平板2小时。4000rpm离心细胞5分钟,吸出上清液,每个孔中加入200微升封闭缓冲液,洗涤细胞。在每个孔中加入1∶100稀释的R-Phicoerytrin偶联的F(ab)2山羊抗小鼠抗体,4℃培育平板1小时。4000rpm离心5分钟,使细胞旋转沉淀,在每个孔中加入200微升封闭缓冲液进行洗涤。吸出上清液,将细胞重悬于每孔200微升PBS和0.25%甲醛中。将样品转移到FACScan管中读数。FACScan(激光功率15mV)设置条件为:FL2开;FSC-H临界值:92;FSC PMT电压:E01;SSC PMT:474;Amp.Gains 6.1;FL-2 PMT:586;补偿值:0。
OMV制备
使细菌在5GC平板上生长过夜,用挑菌环收获,重悬于10毫升20毫摩尔Tris-HCl中。56℃热灭活30分钟,在冰上超声破碎该细菌10分钟(50%负载循环,50%输出)。5000g离心10分钟,除去未破碎的细胞,4℃、50000g离心75分钟,回收全部细胞包膜组分。为了从粗制的外膜中抽提出细胞质膜蛋白,将全部组分重悬于2%十二烷基肌氨酸钠(Sigma)中,室温培育20分钟。10000g离心该悬浮液10分钟,除去凝聚物,对上清液进一步50000g超离心75分钟,使外膜沉淀。将外膜重悬于10毫摩尔Tris-HCl,pH 8,用BioRad蛋白质试验以BSA为标准品测定蛋白浓度。
全抽提物制备
使细菌在GC板上生长过夜,用挑菌环收获,重悬于1毫升20毫摩尔Tris-HCl中。56℃热灭活30分钟。
Western印迹
将MenB菌株2996的纯化蛋白(每条泳道500ng)、外膜囊泡(5微克)和全细胞抽提物(25微克)上样于12%SDS-聚丙烯酰胺凝胶,然后转移到硝酸纤维素膜上。转移使用转移缓冲液(0.3%Tris碱,1.44%甘氨酸,20%(v/v)甲醇),在4℃和150mA下进行2小时。在饱和缓冲液(10%脱脂乳、0.1%Triton X100,PBS配)中4℃培育过夜,使该膜饱和。用洗涤缓冲液(3%脱脂乳,0.1%Triton X 100,PBS配)洗涤该膜两次,并与洗涤缓冲液1∶200稀释的小鼠血清37℃培育2小时。洗涤该膜两次,和稀释度为1∶2000的辣根过氧化物酶标记的抗小鼠Ig培育90分钟。用含0.1%Triton X100的PBS洗涤该膜两次,用Opti-4CN底物试剂盒(Bio-Rad)显影。加入水,终止反应。
杀菌试验
使MC58和2996菌株在巧克力琼脂板上37℃生长过夜。收集5-7个菌落,用于接种7毫升Mueller-Hinton肉汤。在震动器上37℃培育该悬浮液,使其生长,至OD620为0.5-0.8。将培养液等分到1.5毫升无菌Eppendorf管中,在微量离心机中以最大速度离心20分钟。以Gey′s缓冲液(Gibco)洗涤沉淀一次,重悬于相同缓冲液中,至OD620为0.5,以Gey′s缓冲液1∶20000稀释,25℃保藏。
在96孔组织培养板的每孔中加入50微升Gey′s缓冲液/1%BSA。在每个孔中加入25微升稀释(1∶100)的小鼠血清(稀释缓冲液:Gey′s缓冲液/0.2%BSA中),4℃培育平板。将25微升前述细菌悬浮液加入每个孔中。每个孔中加入25微升热灭活(56℃水浴30分钟)或正常的幼兔补体。在加入幼兔补体后,立即将每个孔中22微升的样品接种到Mueller-Hinton琼脂板(时间0)上。37℃转动培育96孔板1小时,然后将每个孔内22微升的样品接种到Mueller-Hinton琼脂板(时间1)上。过夜培育后,计数对应于时间0和时间1小时的菌落数。
基因变异性
ORF4和919基因是通过PCR,在不同奈瑟球菌(参见菌株清单)抽提的染色体DNA上扩增出的。用作PCR引物的下列寡核苷酸被设计在该两基因的上游和下游区域:
orf 4.1(正向) CGAATCCGGACGGCAGGACTC
orf 4.3(反向) GGCAGGGAATGGCGGATTAAAG
919.1 (正向) AAAATGCCTCTCCACGGCTG或
CTGCGCCCTGTGTTAAAATCCCCT
919.6 (反向) CAAATAAGAAAGGAATTTTG或
GGTATCGCAAAACTTCGCCTTAATGCG
PCR循环条件是:
1个循环 94℃2分钟
30个循环 94℃30秒
约54℃或约60℃(根据引物的Tm)30秒
72℃40秒
1个循环 72℃7分钟
从1%琼脂糖凝胶中纯化出PCR产物,并用下列引物测序:
orf 4.1 (正向) CGAATCCGGACGGCAGGACTC
orf 4.2 (正向) CGACCGCGCCTTTGGGACTG
orf 4.3 (反向) GGCAGGGAATGGCGGATTAAAG
orf 4.4 (反向) TCTTTGAGTTTGATCCAACC
919.1 (正向) AAAATGCCTCTCCACGGCTG或
CTGCGCCCTGTGTTAAAATCCCCT
919.2 (正向) ATCCTTCCGCCTCGGCTGCG
919.3 (正向) AAAACAGCGGCACAATCGAC
919.4 (正向) ATAAGGGCTACCTCAAACTC
919.5 (正向) GCGCGTGGATTATTTTTGGG
919.6 (反向) CAAATAAGAAAGGAATTTTG或
GGTATCGCAAAACTTCGCCTTAATGCG
919.7 (反向) CCCAAGGTAATGTAGTGCCG
919.8 (反向) TAAAAAAAAGTTCGACAGGG
919.9 (反向) CCGTCCGCCTGTCGTCGCCC
919.10 (反向) TCGTTCCGGCGGGGTCGGGG
本文提及的所有文献都全部以参考形式纳入本文。
给出下列实施例用于说明本发明而不是限制本发明。
实施例1
使用上述程序,在聚合酶链反应(PCR)试验中采用下列寡核苷酸引物,以克隆所示ORF:
表1用于实施例2-10的PCR中的寡核苷酸
ORF的定位
下列DNA和氨基酸序列用下列形式的标题加以限定:[g,m,或a][#].[seq或pep],其中“g”表示序列来自淋病奈瑟球菌,“m”表示序列来自脑膜炎奈瑟球菌B,而“a”表示序列来自脑膜炎奈瑟球菌A;“#”表示序列编号;“seq”表示DNA序列,而“pep”表示氨基酸序列。例如,“g001.seq”指编号为1的淋病奈瑟球菌DNA序列。当这些序列存在后缀“-1”时,表示对于同一ORF发现的额外序列,因此,无后缀和有后缀的序列命名的ORF数据适用于两种如此命名的序列。此外,开放阅读框以“ORF#”表示,其中“#”指ORF的编号,对应于编码ORF的序列的编号。此外,ORF命名可有后缀“ng”或“a”,分别表示该ORF对应于淋病奈瑟球菌序列或脑膜炎奈瑟球菌A序列。在序列前面的词语“部分”表示该序列可能是部分或完整的ORF。用计算机分析了“g”、“m”和“a”肽序列之间的比较。在本文中,“pep”后缀暗示那里没有明确地说明。此外,如果位于被比较序列之前并描述该序列的文本与被比较的指定序列发生冲突时,以指定的序列为准并且指定序列是实际比较的序列。
ORF: 毗连群:
279 gnm4.seq
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3039>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3040;ORF 279>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3041>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3042;ORF 279.ng>:
ORF 279与淋病奈瑟球菌中预计的ORF(ORF 279.ng)在152个氨基酸的重迭区有89.5%相同性:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3043>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3044;ORF 279.a>:
m279/a279 ORFs 279和279.a在152个氨基酸的重迭区有88.2%相同性。
519和519-1 gnm7.seq
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3045>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3046;ORF 519>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3047>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3048;ORF 519.ng>:
ORF 519与N.Gonorrhoeae中预计的ORF(ORF 519.ng)在200个氨基酸的重迭区有87.5%相同性:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3049>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3050;ORF 519.a>:
m519/a519 ORFs 519和519.a具有99.5%相同性(在199个氨基酸的重迭区)
进一步的工作揭示了在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的DNA序列<SEQ ID 3051>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3052;ORF 519-1>:
下列DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3053>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3054;ORF 519-1.ng>:
m519-1/g519-1 ORFs 519-1和519-1.ng具有99.0%相同性(在315个氨基酸的重迭区)
下列DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3055>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3056;ORF 519-1.a>:
m519-1/a519-1 ORFs 519-1和519-1.a具有99.0%相同性(在315个氨基酸的重迭区)
576和576-1 gnm22.seq
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3057>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3058;ORF 576>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3059>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3060;ORF 576.ng>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m576/g576 ORFs 576和576.ng具有97.2%相同性(在215个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3061>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3062;ORF 576.a>:
m576/a576 ORFs 576和576.a具有99.5%相同性(在222个氨基酸的重迭区)
进一步的工作揭示了脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的DNA序列<SEQ ID 3063>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3064;ORF 576-1>:
下列DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3065>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3066;ORF 576-1.ng>:
g576-1/m576-1 ORFs 576-1和576-1.ng具有97.8%相同性(在272个氨基酸的重迭区)
下列DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3067>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3068;ORF 576-1.a>:
a576-1/m576-1 ORFs 576-1和576-1.a具有99.6%相同性(在272个氨基酸的重迭区)
919 gnm43.seq
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3069>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3070;ORF 919>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3071>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3072;ORF 919.ng>:
ORF 919与淋病奈瑟球菌中预计的ORF(ORF 919.ng)有95.9%相同性(在441个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3073>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3074;ORF 919.a>:
m919/a919 ORFs 919和919.a具有98.6%相同性(在441个氨基酸的重迭区)
121和121-1
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3075>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3076;ORF 121>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3077>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3078;ORF 121.ng>:
ORF 121与淋病奈瑟球菌的预计的ORF(ORF121.ng)有73.5%相同性(在366个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3079>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3080;ORF 121.a>:
m121/a121 ORFs 121和121.a具有74.0%相同性(在366个氨基酸的重迭区)
进一步的工作揭示了在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的DNA序列<SEQ ID 3081>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3082;ORF 121-1>:
m121-1/g121 ORFs 121-1和121.ng具有95.6%相同性(在366个氨基酸的重迭区)
下列DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3083>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3084;ORF 121-1.a>:
m121-1/a121-1 ORFs 121-1和121-1.a具有96.4%相同性(在366个氨基酸的重迭区)
128和128-1
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3085>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3086;ORF 128>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3087>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3088;ORF 128.ng>:
ORF 128与淋病奈瑟球菌的预计的ORF(ORF 128.ng)有91.7%相同性(在475个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3089>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3090;ORF 128.a>:
m128/a128 ORFs 128和128.a具有66.0%相同性(在677个氨基酸的重迭区)
进一步的工作揭示了在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的DNA序列<SEQ ID 3091>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3092;ORF 128-1>:
下列DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3093>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3094;ORF 128-1.ng>:
m128-1/g128-1 ORFs 128-1和128-1.ng具有94.5%相同性(在491个氨基酸的重迭区)
下列DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3095>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3096;ORF 128-1.a>:
m128-1/a128-1 ORFs 128-1和128-1.a具有97.8%相同性(在677个氨基酸的重迭区)
206
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3097>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3098;ORF 206>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3099>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3100;ORF 206.ng>:
ORF 206与淋病奈瑟球菌的预计的ORF(ORF 206.ng)有96.0%相同性(在177个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3101>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3102;ORF 206.a>:
m206/a206 ORFs 206和206.a具有99.4%相同性(在177个氨基酸的重迭区)
287
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3103>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3104;ORF 287>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3105>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3106;ORF 287.ng>:
m287/g287 ORFs 287和287.ng具有70.1%相同性(在499个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3107>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3108;ORF 287.a>:
m287/a287 ORFs 287和287.a具有77.2%相同性(在501个氨基酸的重迭区)
406
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3109>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3110;ORF 406>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3111>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3112;ORF 406>:
ORF 406与淋病奈瑟球菌的预计的ORF(ORF406.a)有98.8%相同性(在320个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3113>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3114;ORF 406.a>:
m406/a406 ORFs 406和406.a具有98.8%相同性(在320个氨基酸的重迭区)
实施例2
ORF 919的表达
使用表1中所述的用于ORF 919的引物来定位和克隆ORF 919。预计的基因919被克隆在pET载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白表达产物和纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对919-His融合蛋白纯化的分析。用纯化的919-His免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FACS(C图),杀菌性测试(D图)和ELISA分析(E图)。符号:M1,分子量标记物;PP,纯化的蛋白;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。这些试验证实了919是一种暴露在表面的蛋白,并且是一种有用的免疫原。ORF 919的疏水性图、抗原指数、和两亲区域在图10中提供。使用AMPHI程序来预测推定的T细胞表位(Gao et al 1989,J.Immunol 143:3007;Robertset al.1996,AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyi et al.1992,Scand J Immunol Suppl11:9)。ORF 919的核酸序列及其编码的氨基酸序列在实施例1中提供。
实施例3
ORF 279的表达
使用表1中所述的用于ORF 279的引物来定位和克隆ORF 279。预计的基因279被克隆在pGex载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白表达产物和纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对279-GST融合蛋白纯化的分析。用纯化的279-GST免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FACS(C图),杀菌性测试(D图)和ELISA分析(E图)。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。这些试验证实了279是一种暴露在表面的蛋白,并且是一种有用的免疫原。ORF 279的疏水性图、抗原指数、和两亲区域在图11中提供。使用AMPHI程序来预测推定的T细胞表位(Gao et al 1989,J.Immunol 143:3007;Roberts et al.1996,AIDSRes Human Retroviruses 12:593;Quakyi et al.1992,Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 279的核酸序列及其编码的氨基酸序列在实施例1中提供。
实施例4
ORF 576和576-1的表达
使用表1中所述的用于ORF 576的引物来定位和克隆ORF 576。预计的基因576被克隆在pGex载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对576-GST融合蛋白纯化的分析。用纯化的576-GST免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FACS(C图),杀菌性测试(D图)和ELISA分析(E图)。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。这些试验证实了576是一种暴露在表面的蛋白,并且是一种有用的免疫原。ORF 576的疏水性图、抗原指数、和两亲区域在图12中提供。使用AMPHI程序来预测推定的T细胞表位(Gao et al 1989,J.Immunol 143:3007;Roberts et al.1996,AIDS ResHuman Retroviruses 12:593;Quakyi et al.1992,Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 576的核酸序列及其编码的氨基酸序列在实施例1中提供。
实施例5
ORF 519和519-1的表达
使用表1中所述的用于ORF 519的引物来定位和克隆ORF 519。预计的基因519被克隆在pET载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对519-His融合蛋白纯化的分析。用纯化的519-His免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FACS(C图),杀菌性测试(D图)和ELISA分析(E图)。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。这些试验证实了519是一种暴露在表面的蛋白,并且是一种有用的免疫原。ORF 519的疏水性图、抗原指数、和两亲区域在图13中提供。使用AMPHI程序来预测推定的T细胞表位(Gao et al 1989,J.Immunol 143:3007;Roberts et al.1996,AIDS ResHuman Retroviruses 12:593;Quakyi et al.1992,Scand J Inmunol Suppl 11:9)。ORF 519的核酸序列及其编码的氨基酸序列在实施例1中提供。
实施例6
ORF 121和121-1的表达
使用表1中所述的用于ORF 121的引物来定位和克隆ORF 121。预计的基因121被克隆在pET载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对121-His融合蛋白纯化的分析。用纯化的121-His免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FACS(C图),杀菌性测试(D图)和ELISA分析(E图)。结果显示121是一种暴露在表面的蛋白。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。这些试验证实了121是一种暴露在表面的蛋白,并且是一种有用的免疫原。ORF 121的疏水性图、抗原指数、和两亲区域在图14中提供。使用AMPHI程序来预测推定的T细胞表位(Gao et al 1989,J.Immunol 143:3007;Roberts et al.1996,AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyi et al.1992,Scand J ImmunolSuppl 11:9)。ORF 121的核酸序列及其编码的氨基酸序列在实施例1中提供。
实施例7
ORF 128和128-1的表达
使用表1中所述的用于ORF 128的引物来定位和克隆ORF 128。预计的基因128被克隆在pET载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对128-His融合蛋白纯化的分析。用纯化的128-His免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FACS(C图),杀菌性测试(D图)和ELISA分析(E图)。结果显示128是暴露在表面的蛋白。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。这些试验证实了128是一种暴露在表面的蛋白,并且是一种有用的免疫原。ORF 128的疏水性图、抗原指数、和两亲区域在图15中提供。使用AMPHI程序来预测推定的T细胞表位(Gao et al 1989,J.Immunol 143:3007;Roberts et al.1996,AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyi et al.1992,Scand J ImmunolSuppl 11:9)。ORF 128的核酸序列及其编码的氨基酸序列在实施例1中提供。
实施例8
ORF 206的表达
使用表1中所述的用于ORF 206的引物来定位和克隆ORF 206。预计的基因206被克隆在pET载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白表达产物和纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对206-His融合蛋白纯化的分析。用纯化的206-His免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图)。值得注意的是,在脑膜炎球菌的蛋白质提取物中的免疫反应性条带是38kDa而不是17kDa(图A)。为了获得与该抗体染色的本质有关的信息,我们在大肠杆菌中以没有His-标志但包含预计的前导肽的形式表达ORF 206。对表达这种天然形式206蛋白的大肠杆菌总蛋白提取物的Western印迹分析表明,在38kDa处有一反应性条带,这与脑膜炎球菌中所观察的一样。我们得出结论,在图B)中的38kDa条带是特异性的,而且抗206抗体可能识别多聚体的蛋白复合体。在图C中显示了FACS分析,在图D中显示了杀菌性测试,并在图E中显示了ELISA分析。结果显示296是一种暴露在表面的蛋白。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。这些试验证实了206是一种暴露在表面的蛋白,并且是一种有用的免疫原。ORF 206的疏水性图、抗原指数、和两亲区域在图16中提供。使用AMPHI程序来预测推定的T细胞表位(Gao et al 1989,J.Immunol 143:3007;Roberts et al.1996,AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyi et al.1992,Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 206的核酸序列及其编码的氨基酸序列在实施例1中提供。
实施例9
ORF 287的表达
使用表1中所述的用于ORF 287的引物来定位和克隆ORF 287。预计的基因287被克隆在pGex载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对287-GST融合蛋白纯化的分析。用纯化的287-GST免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FACS(C图),杀菌性测试(D图)和ELISA分析(E图)。结果显示287是暴露在表面的蛋白。符号:M1,分子量标记物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)。这些试验证实了287是一种暴露在表面的蛋白,并且是一种有用的免疫原。ORF 287的疏水性图、抗原指数、和两亲区域在图17中提供。使用AMPHI程序来预测推定的T细胞表位(Gao et al 1989,J.Immunol 143:3007;Roberts et al.1996,AIDS Res HumanRetroviruses 12:593;Quakyi et al.1992,Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 287的核酸序列及其编码的氨基酸序列在实施例1中提供。
实施例10
ORF 406的表达
使用表1中所述的用于ORF 406的引物来定位和克隆ORF 406。预计的基因406被克隆在pET载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对406-His融合蛋白纯化的分析。用纯化的406-His免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FACS(C图),杀菌性测试(D图)和ELISA分析(E图)。结果显示406是暴露在表面的蛋白。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。这些试验证实了406是一种暴露在表面的蛋白,并且是一种有用的免疫原。ORF 406的疏水性图、抗原指数、和两亲区域在图13中提供。使用AMPHI程序来预测推定的T细胞表位(Gao et al 1989,J.Immunol 143:3007;Roberts et al.1996,AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyi et al.1992,Scand J ImmunolSuppl 11:9)。ORF 406的核酸序列及其编码的氨基酸序列在实施例1中提供。
实施例11
表2列出了数种奈瑟球菌菌株,它们被用于评估不同菌株中ORF225序列的保守性。
表2
每种所列菌株的氨基酸序列如下:
图19显示了对每种这些菌株的序列进行对齐排列的结果。黑色阴影表示同源区域,而灰色阴影表示具有相似特性的保守氨基酸。可以轻易看出,在不同菌株的ORF225之间有显著的保守性,这进一步证实了其作为疫苗和诊断的抗原的用途。
实施例12
表3列出了数种奈瑟球菌菌株,它们被用于评估不同菌株中ORF235序列的保守性。
表3
每种所列菌株的氨基酸序列如下:
图20显示了对每种这些菌株的序列进行对齐排列的结果。黑色阴影表示同源区域,而灰色阴影表示具有相似特性的保守氨基酸。可以轻易看出,在不同菌株的ORF235之间有显著的保守性,这进一步证实了其作为疫苗和诊断的抗原的用途。
实施例13
表4列出了数种奈瑟球菌菌株,它们被用于评估不同菌株中ORF 287序列的保守性。
表4
每种所列菌株的氨基酸序列如下:
图21显示了对每种这些菌株的序列进行对齐排列的结果。黑色阴影表示同源区域,而灰色阴影表示具有相似特性的保守氨基酸。可以轻易看出,在不同菌株的ORF287之间有显著的保守性,这进一步证实了其作为疫苗和诊断的抗原的用途。
实施例14
表5列出了数种奈瑟球菌菌株,它们被用于评估不同菌株中ORF 519序列的保守性。
表5
每种所列菌株的氨基酸序列如下:
图22显示了对每种这些菌株的序列进行对齐排列的结果。黑色阴影表示同源区域,而灰色阴影表示具有相似特性的保守氨基酸。可以轻易看出,在不同菌株的ORF 519之间有显著的保守性,这进一步证实了其作为疫苗和诊断的抗原的用途。
实施例15
表6列出了数种奈瑟球菌菌株,它们被用于评估不同菌株中ORF 919序列的保守性。
表6
每种所列菌株的氨基酸序列如下:
图23显示了对每种这些菌株的序列进行对齐排列的结果。黑色阴影表示同源区域,而灰色阴影表示具有相似特性的保守氨基酸。可以轻易看出,在不同菌株的ORF 919之间有显著的保守性,这进一步证实了其作为疫苗和诊断的抗原的用途。
实施例16
使用上述程序,在聚合酶链反应(PCR)中采用下列寡核苷酸引物,从而克隆所示的ORF:
表7:用于扩增全长或部分ORF的PCR的寡核苷酸
带下划线的序列表示限制性识别位点。
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2;ORF 001.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 4;ORF 001>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 5>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 6;ORF 001.a>:
m001/a001 96.2%相同性(在131个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 001与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 001.ng)有89.3%相同性(在131个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 7>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 8;ORF 003.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 9>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 10;ORF 003>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 11>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 12;ORF 003.a>:
m003/a003 95.9%相同性(在220个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 003与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 003.ng)有88.6%相同性(在219个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 13>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 14;ORF 004.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 15>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 16;ORF 004>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 17>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 18;ORF 004.a>:
m004/a004 94.9%相同性(在257个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 004与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 004.ng)有93.4%相同性(在258个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 19>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 20;ORF 005.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 21>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 22;ORF 005>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 23>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 24;ORF 005.a>:
m005/a005 79.2%相同性(在366个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 005与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 005.ng)有77.0%相同性(在366个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 25>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 26;ORF 006.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 27>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 28;ORF 006>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 29>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 30;ORF 006.a>:
m006/a006 96.7%相同性(在153个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 006与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 006)有95.4%相同性(在153个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 31>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 32;ORF 006-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 33>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 34;ORF 006-1>:
m006-1/g006-1 95.5%相同性(在288个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 35>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 36;ORF 006-1.a>:
a006-1/m006-1 95.7%相同性(在280个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 37>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 38;ORF 007.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 39>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 40;ORF 007>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 41>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 42;ORF 007.a>:
m007/a007 97.3%相同性(在113个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 007与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 007.ng)有86.7%相同性(在113个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 43>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 44;ORF 007-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 45>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 46;ORF 007-1>
m007-1/g007-1 91.7%相同性(在133个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 47>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 48;ORF 007-1.a>:
m007-1/a007-1 98.5%相同性(在132个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 49>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 50;ORF 008.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 51>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 52;ORF 008>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 53>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 54;ORF 008.a>:
m008/a008 97.6%相同性(在164个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 008与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 008.ng)有92.7%相同性(在164个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 55>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 56;ORF 009.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 57>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 58;ORF 009>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 009与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 009.ng)有97.7%相同性(在86个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 59>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 60;ORF 009.a>:
m009/a009 97.7%相同性(在86个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 61>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 62;ORF 010.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 63>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 64;ORF 010>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 65>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 66;ORF 010.a>:
m010/a010 98.7%相同性(在231个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 010与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 010.ng)有98.7%相同性(在231个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 67>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 68;ORF 010-1.ng>:
g010-1/P10444
sp|P10444|DHSA ECOLI琥珀酸脱氢酶 黄素蛋白亚基
gnl|PID|d1015210(D90711)琥珀酸脱氢酶,黄素蛋白 [大肠杆菌] gi|1786942 (AE000175) 琥珀酸脱氢酶 黄素蛋白亚基 [大肠杆菌] 长度=588
分值=1073(495.6bits),预计值=6.7e-169,总和P(2)=6.7e-169
相同性=191/303(63%),相似性=238/303(78%)
分值=249(115.0bits),预计值=6.7e-169,总和P(2)=6.7e-169
相同性=53/102(51%),相似性=62/102(60%)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 69>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 70;ORF 010-1>:
m010-1/g010-1 99.5%相同性(在410个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 71>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 72;ORF 010-1.a>:
m010-1/a010-1 99.3%相同性(在587个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 73>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 74;ORF 011.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 75>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 76;ORF 011>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 011与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 011.ng)有95.8%相同性(在165个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 77>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 78;ORF 012.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 79>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 80;ORF 012>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 81>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 82;ORF 012.a>:
m012/a012 64.2%相同性(在218个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 012与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 012.ng)有58.7%相同性(在218个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 83>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 84;ORF 012-1>:
m012-1/g012 91.7%相同性(在218个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 85>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 86;ORF 012-1.a>:
a012-1/m012-1 97.2%相同性(在218个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 87>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 88;ORF 013.ng:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 89>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 90;ORF 013>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 91>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 92;ORF 013.a>:
m013/a013 97.0%相同性(在101个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 013与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 013.ng)有73.3%相同性(在101个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 93>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 94;ORF 015.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 95>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 96;ORF 015>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 97>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 98;ORF 015.a>:
m015/a015 96.7%相同性(在91个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 015与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 015.ng)有94.5%相同性(在91个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 99>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID100;ORF 018.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 101>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 102;ORF 018>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 103>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 104;ORF 018.a>:
m018/a018 86.4%相同性(在103个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 018与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 018.ng)有84.5%相同性(在103个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 105>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 106;ORF 019.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 107>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 108;ORF 019>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 109>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 11O;ORF 019.a>:
m019/a019 88.9%相同性(在524个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 019与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 019.ng)有95.5%相同性(在89个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 111>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 112;ORF 023.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 113>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 114;ORF 023>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 115>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 116;ORF 023.a>:
m023/a023 96.5%相同性(在113个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 023与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 023.ng)有97.3%相同性(在113个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 117>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 118;ORF 025.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 119>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 110;ORF 025>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 111>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 112;ORF 025.a>:
m025/a025 97.4%相同性(在351个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 025与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 025.ng)有75.6%相同性(在353个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 113>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 114;ORF 031.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 115>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 116;ORF 031>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 117>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 118;ORF 031.a>:
m031/a031 100.0%相同性(在71个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 031与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 031.ng)有60.0%相同性(在85个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 119>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 110;ORF 032.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 111>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 112;ORF 032>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 113>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 114;ORF 032.a>:
m032/a032 88.1%相同性(在176个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 032与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 032.ng)有86.4%相同性(在176个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 115>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 116;ORF 033.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 117>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 118;ORF 033>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 119>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 120;ORF 033.a>:
m033/a033 98.4%相同性(在509个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 033与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 033.ng)有98.4%相同性(在509个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 121>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 122;ORF 034.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 123>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 124;ORF 034>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 125>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 126;ORF 034.a>:
m034/a034 96.9%相同性(在257个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 034与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 034.ng)有96.5%相同性(在257个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 127>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 128;ORF 036.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 129>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 130;ORF 036>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 131>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 132;ORF 036.a>:
m036/a036 85.6%相同性(在270个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 036与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 0.36.ng)有74.9%相同性(在271个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 133>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 134;ORF 0036-1>:
m036-1/g036 76.8%相同性(在228个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 135>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 136;ORF 038.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 137>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 138;ORF 038>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 139>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 140;ORF 038.a>:
m038/a038 100.0%相同性(在213个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 038与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 038.ng)有98.1%相同性(在213个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 141>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 142;ORF 039.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 143>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 144;ORF 039>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 145>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 146;ORF 039.a>:
m039/a039 79.4%相同性(在170个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 039与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 039.ng)有60.8%相同性(在171个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 147>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 148;ORF 040.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 149>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 150;ORF 040>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 151>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 152;ORF 040.a>:
m040/a040 91.5%相同性(在436个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 040与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 040.ng)有88.3%相同性(在436个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 153>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 154;ORF 041.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 155>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 156;ORF 041>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 157>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 158;ORF 041.a>:
m041/a041 98.7%相同性(在154个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 041与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 041.ng)有96.8%相同性(在154个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 159>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 160;ORF 041-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 161>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 162;ORF 041-1>:
m041-1/g041-1 94.6%相同性(在671个氨基酸的重迭区)
m041-1/P55577
sp|P55577|Y4NA_RHISN可能的肽酶Y4NA>gi|2182536(AE000086)Y4nA[Rhizobium sp.NGR234]长度=726
分值=370bits(940),预计值=e-101
相同性=217/682(31%),相似性=331/682(47%),缺口=22/682(3%)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 163>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 164;ORF 041-1.a>:
a041-1/m041-1 97.9%相同性(在671个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 165>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 166;ORF 042.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 167>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 168;ORF 042>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 169>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 170;ORF 042.a>:
m042/a042 99.0%相同性(在201个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 042与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 042.ng)有93.0%相同性(在201个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 171>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 172;ORF 042-1>:
m042-1/g042 95.4%相同性(在173个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 173>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 174;ORF 042-1.a>:
m042-1/a042-1 100.0%相同性(在173个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 175>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 176;ORF 043.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 177>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 178;ORF 043>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 043与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 043.ng)有89.8%相同性(在128个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 179>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 180;ORF 043.a>:
m043/a043 100.0%相同性(在129个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 181>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 182;ORF 044.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 183>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 184;ORF 044>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 185>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 186;ORF 044.a>:
m044/a044 91.0%相同性(在89个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 044与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 044.ng)有86.5%相同性(在89个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 187>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 188;ORF 046.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 189>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 190;ORF 046>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 191>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 192;ORF 046.a>:
m046/a046 98.4%相同性(在186个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 046与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 046.ng)有97.3%相同性(在185个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 193>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 194;ORF 047.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 195>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 196;ORF 047>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 197>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 198;ORF 047.a>:
m047/a047 96.5%相同性(在312个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 047与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 047.ng)有96.2%相同性(在312个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 199>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 200;ORF 048.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 201>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 202;ORF 048>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 203>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 204;ORF 048.a>:
m048/a048 96.0%相同性(在150个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 048与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 048.ng)有96.4%相同性(在150个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 205>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 206;ORF 049.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 207>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 208;ORF 049>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 209>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 210;ORF 049.a>:
m049/a049 90.6%相同性(在139个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 049与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 049.ng)有86.3%相同性(在139个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 211>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 212;ORF 050.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 213>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 214;ORF 050>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 215>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 216;ORF 050.a>:
m050/a050 97.7%相同性(在129个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 050与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 050.ng)有98.4%相同性(在127个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 217>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 218;ORF 050-1.ng>:
g050-1/p14407
sp|p14407|FUMB_ECOLI I类 延胡索酸水合酶,厌氧的(延胡索酸酶)>gi|280063|pir||B44511延胡索酸水合酶(EC 4.2.1.2)fumB,铁依赖型-大肠杆菌>gi|146048(M27058)厌氧的I类延胡索酸酶(EC 4.2.1.2)[大肠杆菌]长度=548
分值=172bits(432),预计值=4e-42
相同性=138/488(28%),相似性=216/488(43%),缺口=22/488(4%)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 219>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 220;ORF 050-1>:
m050-1/g050-1 98.2%相同性(在507个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 221>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 222;ORF 050-1.a>:
a050-1/m050-1 98.4%相同性(在507个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 223>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 224;ORF 052.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 225>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 226;ORF 052>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 227>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 228;ORF 052.a>:
m052/a052 95.8%相同性(在119个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 052与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 052.ng)有95.8%相同性(在119个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 229>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 230;ORF 073.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 231>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 232;ORF 073>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 233>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 234;ORF 073.a>:
m073/a073 92.3%相同性(在130个氨基酸的重迭区)
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 073与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 073.ng)有87.0%相同性(在131个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 235>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 236;ORF 075.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 237>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 238;ORF 075>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 075与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 075.ng)有65.7%相同性(在137个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 239>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 240;ORF 075.a>:
m075/a075 98.5%相同性(在136个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 241>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 242;ORF 080.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 243>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 244;ORF 080>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 080与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 080.ng)有97.9%相同性(在242个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 245>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 246;ORF 080.a>:
m080/a080 99.2%相同性(在242个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 247>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 248;ORF 081.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 249>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 250;ORF 081>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 081与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 081.ng)有94.1%相同性(在455个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 251>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 252;ORF 081.a>:
m081/a081 96.7%相同性(在455个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 253>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 254;ORF 082.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 255>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 256;ORF 082>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 082与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 082.ng)有92.7%相同性(在247个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 257>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 258;ORF 082.a>:
m082/a082 95.5%相同性(在247个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 259>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 260;ORF 084.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 261>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 262;ORF 084>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 084与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 084.ng)有90.5%相同性(在231个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 263>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 264;ORF 084.a>:
m084/a084 92.2%相同性(在231个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 265>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 266;ORF 085.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 267>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 268;ORF 085>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 085与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 085.ng)有94.7%相同性(在94个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 269>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 270;ORF 085.a>:
m085/a085 94.7%相同性(在94个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 271>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 272;ORF 086.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 273>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 274;ORF 086>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 086与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 086.ng)有96.7%相同性(在396个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 275>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 276;ORF 086.a>:
m086/a086 98.0%相同性(在396个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 277>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 278;ORF 087.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 279>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 280;ORF 087>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 087与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 087.ng)有83.9%相同性(在355个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 281>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 282;ORF 087.a>:
m087/a087 85.4%相同性(在355个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 283>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 284;ORF 088.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 285>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 286;ORF 088>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 088与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 088.ng)有91.7%相同性(在205个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 287>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 288;ORF 088.a>:
m088/a088 99.5%相同性(在205个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 289>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 290;ORF 089.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 291>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 292;ORF 089>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 089与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 089.ng)有88.6%相同性(在149个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 293>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 294;ORF 089.a>:
m089/a089 91.9%相同性(在149个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 295>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 296;ORF 090.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 297>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 298;ORF 090>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 090与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 090.ng)有83.9%相同性(在118个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 299>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 300;ORF 090.a>:
m09/a090 91.5%相同性(在117个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的
g090-1.seq 该序列含有多个终止密码子。(未示出)
这对应于氨基酸序列<ORF 090-1.ng>:
g090-1.pep (未示出)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3;ORF 090-1>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 303>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 304;ORF 091.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 305>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 306;ORF 091>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 091与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 091.ng)有84.2%相同性(在101个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 307>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 308;ORF 091.a>:
m091/a091 93.8%相同性(在96个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 309>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 310;ORF 092.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 311>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 312;ORF 092>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 092与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 092.ng)有96.6%相同性(在506个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 313>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 314;ORF 092.a>:
m092/a092 99.4%相同性(在506个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 315>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 316;ORF 093.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 317>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 318;ORF 093>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 093与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 093.ng)有96.7%相同性(在276个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 319>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 320;ORF 093.a>:
m093/a093 95.7%相同性(在276个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 321>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 322;ORF 094.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 323>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 324;ORF 094>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 094与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 094.ng)有95.1%相同性(在103个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 325>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 326;ORF 094.a>:
m094/a094 100.0%相同性(在103个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 327>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 328;ORF 095.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 329>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 330;ORF 095>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 095与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 095.ng)有97.6%相同性(在124个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 331>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 332;ORF 095.a>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 333>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 334;ORF 096ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 335>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 336;ORF 096>:
m096/g096 96.0%相同性(在124个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 337>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 338;ORF 096.ng>:
m096/a096 92.7%相同性(在124个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 339>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 340;ORF 097.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 341>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 342;ORF 097>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 097与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 097.ng)有96.3%相同性(在436个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 343>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 344;ORF 097.a>:
m097/a097 99.3%相同性(在436个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 345>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 346;ORF 098.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 347>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 348;ORF 098>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 098与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 098.ng)有89.6%相同性(在125个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 349>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 350;ORF 098.a>:
m098/a098 100.0%相同性(在125个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 351>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 352;ORF 099.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 353>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 354;ORF 099>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 099与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 099.ng)有96.2%相同性(在639个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 355>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 356;ORF 099.a>:
m099/a099 97.5%相同性(在639个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 357>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 358;ORF 102.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 359>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 360;ORF 102>:
m102/g102 86.0%相同性(在415个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 361>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 362;ORF 102.a>:
m102/a102 95.9%相同性(在413个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 363>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 364;ORF 105.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 365>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 366;ORF 105>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 105与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 105.ng)有79.9%相同性(在289个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 367>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 368;ORF 105.a>:
m105/a105 96.5%相同性(在289个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 369>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 370;ORF 105-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 371>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 372;ORF 105-1>:
m105-1/g105-1 96.9%相同性(在289个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 373>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 374;ORF 105-1.a>:
a105-1/m105-1 99.0%相同性(在289个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 375>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 376;ORF 107.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 377>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 378;ORF 107>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 107与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 170.ng)有89.4%相同性(在170个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 379>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 380;ORF 107.a>:
m107/a107 94.8%相同性(在154个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 381>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 382;ORF 108.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 383>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 384;ORF 108>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 108与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 108.ng)有89.6%相同性(在173个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 385>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 386;ORF 108.a>:
m108/a108 96.5%相同性(在173个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 387>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 388;ORF 109.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 389>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 4;ORF 109>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 109与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 109.ng)有92.9%相同性(在126个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 391>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 392;ORF 109>:
m109/a109 97.6%相同性(在126个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 393>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 394;ORF 111.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 395>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 396;ORF 111>:
ORF 111与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 111.ng)有88.7%相同性(在97个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 397>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 398;ORF 111.a>:
m111/a111 97.7%相同性(在351个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 399>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 400;ORF 111-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 401>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 402;ORF 111-1>:
m111-1/g111-1 96.6%相同性(在351个氨基酸的重迭区)
g111-1/p44550
sp|P44550|YOJL_HAEIN假想的脂蛋白HI0172前体>gi|1074292|pir||C64144hypothetical protein HI0172-流感嗜血杆菌(strain Rd KW20)>gi|1573128(U32702)脂蛋白,假想的[流感嗜血杆菌Rd]长度=346
分值=349bits(885),预计值=2e-95
相同性=177/328(53%),相似性=240/328(72%),缺口=4/328(1%)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 403>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 404;ORF 111-1.a>:
a111-1/m111-1 98.9%相同性(在351个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 405>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 406;ORF 114.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 407>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 408;ORF 114>:
m114/g114 90.0%相同性(在140个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 409>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 410;ORF 114.a>:
m114/a114 92.9%相同性(在140个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 411>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 412;ORF 117.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 413>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 414;ORF 117>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 117与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 117.ng)有97.6%相同性(在490个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 415>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 416;ORF 117.a>:
m117/a117 98.0%相同性(在490个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 417>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 418;ORF 117-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 419>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 420;ORF 117-1>:
m117-1/g117-1 98.2%相同性(在737个氨基酸的重迭区)
m117-1/RelA
sp|P55133|RELA_VIBSS GTP焦磷酸激酶(ATP:GTP 3′-焦磷酸转移酶)(PPGPP合成酶I)>gi|537617(U13769)ppGpp合成酶I[Vibrio sp.]长度=744
分值=536bits(1366),预计值=e-151
相同性=288/685(42%),相似性=432/685(63%),缺口=31/685(4%)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 421>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 422;ORF 117-1.a>:
a117-1/m117-1 97.7%相同性(在737个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 423>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 424;ORF 118.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 425>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 426;ORF 118>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 118与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 118.ng)有92.8%相同性(在125个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 427>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 428;ORF 118.a>:
m118/a118 93.6%相同性(在125个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 429>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 430;ORF 120.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 431>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 432;ORF 120>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 120与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 120.ng)有97.3%相同性(在223个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 433>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 434;ORF 120.a>:
m120/a120 99.6%相同性(在223个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 435>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 436;ORF 121.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 437>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 438;ORF 121>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 121与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 121.ng)有73.5%相同性(在366个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 439>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 440;ORF 121.a>:
m121/a121 74.0%相同性(在366个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 441>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 442;ORF 121-1>:
m121-1/g121 95.6%相同性(在366个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 443>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 444;ORF 121-1.a>:
m121-1/a121-1 96.4%相同性(在366个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 445>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 446;ORF 122.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 447>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 448;ORF 122>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 122与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 122.ng)有47.2%相同性(在246个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 449>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 450;ORF 122.a>:
m122/a122 96.0%相同性(在253个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 451>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 452;ORF 122-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 453>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 454;ORF 122-1>:
m122-1/g122-1 94.8%相同性(在251个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 455>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 456;ORF 122-1.a>:
a122-1/m122-1 97.2%相同性(在251个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 457>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 458;ORF 125.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 459>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 460;ORF 125>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 125与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 125.ng)有92.1%相同性(在343个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 461>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 462;ORF 125.a>:
m125/a125 95.6%相同性(在342个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 463>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 464;ORF 126.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 465>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 466;ORF 126>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 126与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 126.ng)有95.9%相同性(在269个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 467>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 468;ORF 126.a>:
m126/a126 98.1%相同性(在269个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 469>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 470;ORF 126-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 471>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 5;ORF 126-1>:
m126-1/g126-1 96.9%相同性(在262个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 473>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 474;ORF 126-1.a>:
a126-1/m126-1 98.1%相同性(在262个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 475>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 476;ORF 127.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 477>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 478;ORF 127>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 127与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 127.ng)有97.9%相同性(在290个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 479>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 480;ORF 127.a>:
m127/a127 98.6%相同性(在290个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 481>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 482;ORF 128.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 483>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 484;ORF 128>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 128与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 128.ng)有91.7%相同性(在475个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 485>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 486;ORF 128.a>:
m128/a128 66.0%相同性(在677个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 487>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 488;ORF 128-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 489>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 490;ORF 128-1>:
m128-1/g128-1 94.5%相同性(在491个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 491>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 492;ORF 128-1.a>:
m128-1/a128-1 97.8%相同性(在677个氨基酸的重迭区)
a128-1/P44573
sp|P44573|OPDA_HAEIN寡肽酶A>gi|1075082|pir||C64055寡肽酶(oligopeptidase)A(prlc)同源物-流感嗜血杆菌(菌株Rd KW20)>gi|1573174(U32706)寡肽酶A(prlc)[流感嗜血杆菌Rd]长度=681
分值=591bits(1507),预计值=e-168
相同性=309/677(45%),相似性=415/677(60%),缺口=4/677(0%)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 493>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 494;ORF 129.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 495>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 496;ORF 129>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 129与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 129.ng)有79.1%相同性(在110个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 497>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 498;ORF 129.a>:
m129/a129 98.2%相同性(在110个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 499>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 500;ORF 130.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 501>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 502;ORF 130>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 130与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 130.ng)有98.1%相同性(在206个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 503>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 504;ORF 130.a>:
m130/a130 97.6%相同性(在206个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 505>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 506;ORF 132.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 507>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 508;ORF 132>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 509>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 510;ORF 132.a>:
m132/a132 92.1%相同性(在38个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 511>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 512;ORF 134.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 513>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 514;ORF 134>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 134与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 134.ng)有98.7%相同性(在531个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 515>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 516;ORF 134.a>:
m134/a134 98.9%相同性(在531个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 517>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 518;ORF 135.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 519>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 520;ORF 135>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 135与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 135.ng)有97.6%相同性(在294个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 521>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 522;ORF 135.a>:
m135/a135 98.4%相同性(在369个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 523>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 524;ORF 136.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 525>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 526;ORF 136>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 136与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 136.ng)有85.6%相同性(在209个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 527>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 528;ORF 136.a>:
m136/a136 98.3%相同性(在238个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 529>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 530;ORF 137.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 531>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 532;ORF 137>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 137与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 137.ng)有95.4%相同性(在283个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 533>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 534;ORF 137.a>:
m137/a137 98.2%相同性(在283个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 535>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 536;ORF 138.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 537>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 538;ORF 138>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 138与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 138.ng)有98.0%相同性(在298个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 539>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 540;ORF 138.a>:
m138/a138 99.7%相同性(在298个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 541>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 542;ORF 138.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 543>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 544;ORF 138>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 138与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 138.ng)有92.2%相同性(在179个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 545>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 546;ORF 139.a>:
m139/a139 97.1%相同性(在175个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 547>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 548;ORF 140.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 549>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 550;ORF 140>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 140与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 140.ng)有94.5%相同性(在454个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 551>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 552;ORF 140.a>:
m140/a140 98.2%相同性(在454个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 553>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 554;ORF 141.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 555>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 556;ORF 141>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 141与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 141.ng)有97.5%相同性(在558个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 557>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 558;ORF 141.a>:
m141/a141 99.5%相同性(在558个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 559>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 560;ORF 142.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 561>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 562;ORF 142>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 142与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 142.ng)有93.7%相同性(在158个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 563>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 564;ORF 142.a>:
m142/a142 96.1%相同性(在153个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 565>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 566;ORF 143.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 567>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 568;ORF 143>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m143/g143 93.9%相同性(在429个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 569>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 570;ORF 143.a>:
m143/a143 99.5%相同性(在429个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 571>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 572;ORF 144.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 573>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 574;ORF 144>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m144/g144 91.3%相同性(在218个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 575>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 576;ORF 144.a>:
m144/a144 99.1%相同性(在218个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 577>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 578;ORF 146.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 579>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 580;ORF 146>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m146/g146 90.1%相同性(在212个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 581>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 582;ORF 146.a>:
m146/a146 90.6%相同性(在212个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 583>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 584;ORF 147.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 585>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 586;ORF 147>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m147/g147 92.3%相同性(在142个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 587>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 588;ORF 147.a>:
m147/a147 98.1%相同性(在734个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 589>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 590;ORF 148.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 591>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 592;ORF 148>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m148/g148 99.0%相同性(在199个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 593>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 594;ORF 148.a>:
m148/a148 99.5%相同性(在199个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 595>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 596;ORF 149.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 597>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 598;ORF 149>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 149与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 149.ng)有95.9%相同性(在339个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 599>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 600;ORF 149.a>:
m149/a149 98.8%相同性(在339个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 601>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 602;ORF 149-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 603>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 604;ORF 149-1>:
m149-1/g149-1 96.2%相同性(在758个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 605>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 606;ORF 149-1.a>:
a149-1/m149-1 98.0%相同性(在758个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 607>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 608;ORF 150.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 609>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 610;ORF 150>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 150与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 150.ng)有91.3%相同性(在369个氨基酸的重迭区/:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 611>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 612;ORF 150.a>:
m150/a150 94.8%相同性(在599个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 613>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 614;ORF 151.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 615>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 616;ORF 151>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 151与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 151.ng)有99.2%相同性(在603个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 617>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 618;ORF 151.a>:
m151/a151 99.8%相同性(在603个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 619>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 620;ORF 152.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 621>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 622;ORF 152>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 152与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 152.ng)有95.4%相同性(在218个氨基酸的重迭区/:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 623>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 624;ORF 152.a>:
m152/a152 94.0%相同性(在218个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 625>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 626;ORF 153.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 627>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 628;ORF 153>:
m153/g153 96.1%相同性(在358个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 629>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 630;ORF 153.a>:
m153/a153 99.7%相同性(在358个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 631>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 632;ORF 154.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 633>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 634 ORF 154.a>:
m154/g154 97.8%相同性(在553个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 635>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 636;ORF 154.a>:
m154/a154 100.0%相同性(在553个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 637>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 638;ORF 155.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 639>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 640;ORF 155>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 155与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 155.ng)有97.9%相同性(在513个氨基酸的重迭区):
m155/g155 97.9%相同性(在513个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 641>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 642;ORF 155.a>:
m155/a155 95.3%相同性(在513个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 643>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 644;ORF 156.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 645>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 646;ORF 156>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 647>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 648;ORF 156.a>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 649>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 650;ORF 157.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 651>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 652;ORF 157>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m157/g157 88.1%相同性(在193个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 653>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 654;ORF 157.a>:
m157/a157 82.4%相同性(在193个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 655>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 656;ORF 158.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 657>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 658;ORF 158>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m158/g158 94.3%相同性(在297个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 659>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 660;ORF 158.a>:
m158/a158 99.0%相同性(在299个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 661>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 662;ORF 160.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 663>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 664;ORF 160>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m160/g160 93.4%相同性(在301个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 665>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 666;ORF 160.a>:
m160/a160 100.0%相同性(在301个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 667>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 668;ORF 161.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 669>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 670;ORF 161>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m161/g161 97.0%相同性(在300个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 671>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 672;ORF 161.a>:
m161/a161 99.3%相同性(在300个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 673>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 674;ORF 163.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 675>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 676;ORF 163>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m163/g163 98.6%相同性(在660个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 677>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 678;ORF 163.a>:
m163/a163 99.4%相同性(在660个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 679>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 680;ORF 164.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 681>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 682;ORF 164>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m164/g164 98.6%相同性(在432个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 683>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 684;ORF 164.a>:
m164/a164 98.3%相同性(在517个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 685>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 686;ORF 165.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 687>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 688;ORF 165>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m165/g165 97.2%相同性(在356个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 689>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 690;ORF 165.a>:
m165/a165 99.7%相同性(在356个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 691>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 692;ORF 165-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 693>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 694;ORF 165-1>:
m165-1/g165-1 89.7%相同性(在428个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 695>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 696;ORF 165-1.a>:
a165-1/m165-1 99.4%相同性(在488个氨基酸的重迭区)
a165-1/p33940
sp|P33940|YOJH_ECOLI假想的60.2KD蛋白,在ECO-ALKB基因间区域>gi|1736851|gnl|PID|d1016718(D90850)ORF_ID:o372#5;类似于[SwissProt Accession Number P33940][大肠杆菌]>gi|1788539(AE000310)f548;该548个氨基酸的ORF与YOJH_ECOLI(SW:P33940(492aa))的490个残基100%相同,但是含有额外的56个N端氨基;与GB:ECOHU49_33 ACCESSION:U00008(490aa)100%相同,但是含有额外的58个N端氨基酸...长度=548
分值=458bits(1167),预计值=e-128
相同性=233/490(47%),相似性=303/490(61%),缺口=5/490(1%)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 697>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 698;ORF 204.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 699>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 700;ORF 204>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 204与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 204.ng)有82.0%相同性(在250个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 701>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 702;ORF 204.a>:
m204/a204 54.5%相同性(在246个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 703>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 704;ORF 205.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 705>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 706;ORF 205>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 205与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 205.ng)有88.4%相同性(在181个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 707>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 708;ORF 205.a>:
m205/a205 88.3%相同性(在111个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 709>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 710;ORF 205-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 711>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 712;ORF 205-1>:
m205-1/g205-1 92.0%相同性(在174个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 713>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 714;ORF 205-1.a>:
m205-1/a205-1 89.0%相同性(在109个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 715>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 716;ORF 206.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 717>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 718;ORF 206>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 206与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 206.ng)有96.0%相同性(在177个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 719>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 720;ORF 206.a>:
m206/a206 99.4%相同性(在177个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 721>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 722;ORF 209.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 723>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 724;ORF 209>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 209与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 209.ng)有88.5%相同性(在253个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 725>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 726;ORF 209.a>:
m209/a209 95.6%相同性(在341个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 727>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 728;ORF 211.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 729>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 730;ORF 211>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 211与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 211.ng)有89.1%相同性(在174个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 731>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 732;ORF 211.a>:
m211/a211 99.4%相同性(在174个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 733>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 734;ORF 212.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 735>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 736;ORF 212>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 212与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 212.ng)有92.9%相同性(在421个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 737>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 738;ORF 212.a>:
m212/a212 93.7%相同性(在539个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 739>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 740;ORF 214.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 741>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 742;ORF 214>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 214与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 214.ng)有80.3%相同性(在152个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 743>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 744;ORF 214.a>:
m214/a214 99.3%相同性(在152个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 745>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 746;ORF 214-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 747>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 748;ORF 214-1>:
m214-1/g214-1 93.8%相同性(在176个氨基酸的重迭区)
g214-1/p38685
sp|P38685|YHBN_ECOLI 17.3KD蛋白,在MURA-RPON基因间区域的前体(ORF185)>gi|551336(U12684)orf185[大肠杆菌]>gi|606139(U18997)ORF_o185[大肠杆菌]>gi|1789592(AE000399)orf,假想的蛋白[大肠杆菌]长度=185
分值=97.1bits(238),预计值=6e-20
相同性=57/126(45%),相似性=74/126(58%),缺口=3/126(2%)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 749>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 750;ORF 214-1.a>:
a214-1/m214-1 100.0%相同性(在176个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 751>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 752;ORF 215.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 753>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 754;ORF 215>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 215与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 215.ng)有96.0%相同性(在173个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 755>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 756;ORF 215.a>:
m215/a215 98.3%相同性(在173个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 757>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 758;ORF 216.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 759>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 760;ORF 216>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 216与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 216.ng)有91.8%相同性(在147个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 761>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 762;ORF 216.a>:
m216/a216 97.2%相同性(在326个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 763>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 764;ORF 217.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 765>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 766;ORF 217>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 217与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 217.ng)有80.5%相同性(在226个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 767>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 768;ORF 217.a>:
m217/a217 90.3%相同性(在226个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 769>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 770;ORF 218.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 771>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 772;ORF 218>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 218与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 218.ng)有87.2%相同性(在218个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 773>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 774;ORF 218.a>:
m218/a218 95.9%相同性(在218个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 775>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 776;ORF 219.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 777>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 778;ORF 219>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 219与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 219.ng)有86.9%相同性(在213个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 779>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 780;ORF 219.a>:
m219/a219 94.8%相同性(在213个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 781>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 782;ORF 221.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 783>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 784;ORF 221>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
ORF 221与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 221.ng)有87.6%相同性(在170个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 785>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 786;ORF 221.a>:
m221/a221 95.5%相同性(在177个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 787>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 788;ORF 223.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 789>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 790;ORF 223>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 223与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 223.ng)有80.7%相同性(在119个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 791>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 792;ORF 223.a>:
m223/a223 95.8%相同性(在119个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 793>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 794;ORF 225.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 795>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 796;ORF 225>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 225与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 225.ng)有83.5%相同性(在248个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 797>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 798;ORF 225.a>:
m225/a225 87.4%相同性(在277个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 799>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 800;ORF 225-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 801>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 802;ORF 217>:
m225-1/g225-1 84.9%相同性(在251个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 803>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 804;ORF 225-1.a>:
a225-1/m225-1 88.6%相同性(在280个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 805>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 806;ORF 226.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 807>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 808;ORF 226>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 226与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 226.ng)有94.2%相同性(在121个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 809>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 810;ORF 226.a>:
m226/a226 99.6%相同性(在230个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 811>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 812;ORF 227.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 813>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 814;ORF 227>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 227与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 227.ng)有95.5%相同性(在66个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 815>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 816;ORF 227.a>:
m227/a227 95.5%相同性(在66个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 817>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 818;ORF 228>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 819>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 820;ORF 228.a>:
m228/a228 100.0%相同性(在107个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 821>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 822;ORF 229.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 823>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 824;ORF 229>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 229与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 229.ng)有80.5%相同性(在169个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 825>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 826;ORF 229.a>:
m229/a229 85.6%相同性(在167个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 827>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 828;ORF 230.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 829>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 830;ORF 230>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 230与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 230.ng)有95.9%相同性(在386个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 831>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 832;ORF 230.a>:
m230/a230 99.2%相同性(在386个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 833>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 834;ORF 230-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 835>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 836;ORF 230-1>:
m230-1/g230-1 96.3%相同性(在512个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 837>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 838;ORF 230-1.a>:
a230-1/m230-1 99.8%相同性(在512个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 839>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 840;ORF 231.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 841>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 842;ORF 231>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 231与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 231.ng)有98.6%相同性(在73个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 843>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 844;ORF 217.a>:
m231/a231 98.6%相同性(在73个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 845>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 846;ORF 231-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 847>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 848;ORF 231-1>:
g231-1/m231-1 87.0%相同性(在262个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 849>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 850;ORF 231-1.a>:
a231-1/m231-1 99.0%相同性(在309个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 851>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 852;ORF 232.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 853>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 854;ORF 232>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 232与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 232.ng)有94.1%相同性(在290个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 855>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 856;ORF 232.a>:
m232/a232 95.9%相同性(在290个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 857>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 858;ORF 233.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 859>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 860;ORF 233>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 233与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 233.ng)有93.4%相同性(在152个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 861>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 862;ORF 233.a>:
m233/a233 99.3%相同性(在152个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 863>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 864;ORF 234.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 865>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 866;ORF 234>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 234与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 234.ng)有94.4%相同性(在54个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 867>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 868;ORF 234.a>:
m234/a234 100.0%相同性(在54个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 869>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 870;ORF 235.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 871>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 872;ORF 235>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 235与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 235.ng)有96.7%相同性(在215个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 873>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 874;ORF 235.a>:
m235/a235 100.0%相同性(在215个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 875>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 876;ORF 236.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 877>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 878;ORF 236>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 236与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 236.ng)有82.9%相同性(在258个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 879>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 880;ORF 236.a>:
m236/a236 81.0%相同性(在258个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 881>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 882;ORF 237.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 883>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 884;ORF 237>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 237与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 237.ng)有86.1%相同性(在382个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 885>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 886;ORF 237.a>:
m237/a237 85.6%相同性(在382个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 887>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 888;ORF 238.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 889>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 890;ORF 238>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 238与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 238.ng)有86.0%相同性(在401个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 891>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 892;ORF 238.a>:
m238/a238 91.9%相同性(在385个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 893>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 894;ORF 239.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 895>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 896;ORF 239>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 239与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 239.ng)有93.7%相同性(在255个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 897>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 898;ORF 239.a>:
m239/a239 97.3%相同性(在255个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 899>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 900;ORF 240.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 901>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 902;ORF 240>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 240与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 240.ng)有94.5%相同性(在220个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 903>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 904;ORF 240.a>:
m240/a240 99.1%相同性(在219个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 905>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 906;ORF 241.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 907>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 908;ORF 241>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 241与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 241.ng)有91.5%相同性(在177个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 909>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 910;ORF 241.a>:
m241/a241 96.0%相同性(在177个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 911>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 912;ORF 241-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 913>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 914;ORF 241-1>:
m241-1/g241-1 93.3%相同性(在267个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 915>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 916;ORF 241-1.a>:
m241-1/a241-1 95.1%相同性(在267个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 917>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 918;ORF 242.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 919>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 920;ORF 242>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 242与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 242.ng)有90.3%相同性(在289个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 921>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 922;ORF 242.a>:
m242/a242 95.2%相同性(在289个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 923>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 924;ORF 243.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 925>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 926;ORF 243>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 243与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 243.ng)有92.7%相同性(在110个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 927>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 928;ORF 243.a>:
m243/a243 92.7%相同性(在110个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 929>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 930;ORF 244.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 931>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 932;ORF 244>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 244与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 244.ng)有86.3%相同性(在277个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 933>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 934;ORF 244.a>:
m244/a244 96.8%相同性(在277个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 935>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 936;ORF 244-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 937>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 938;ORF 244-1>:
m244-1/G244-1 86.3%相同性(在277个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 939>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 940;ORF 244-1.a>:
m244-1/a244-1 96.8%相同性(在274个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 941>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 942;ORF 246.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 943>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 944;ORF 246>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 246与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 246.ng)有80.0%相同性(在150个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 945>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 946;ORF 246.a>:
m246/a246 88.0%相同性(在150个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 947>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 948;ORF 247.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 949>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 950;ORF 247>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 247与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 247.ng)有69.3%相同性(在238个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 951>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 952;ORF 247.a>:
m247/a247 70.9%相同性(在244个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 953>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 954;ORF 247-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 955>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 956;ORF 247-1>:
m247-1/g247-1 72.1%相同性(在222个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 957>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 958;ORF 247-1.a>:
m247-1/a247-1 80.6%相同性(在206个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 959>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 960;ORF 248.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 961>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 962;ORF 248>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 248与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 248.ng)有81.1%相同性(在185个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 963>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 964;ORF 248.a>:
m248/a248 89.4%相同性(在180个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 965>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 966;ORF 248-1>:
m248-1/g248 89.1%相同性(在202个氨基酸的重迭区)
m248-1/a248 97.0%相同性(在197个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 967>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 968;ORF 249.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 969>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 970;ORF 249>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 249与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 249.ng)有81.3%相同性(在203个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 971>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 972;ORF 249.a>:
m249/a249 81.9%相同性(在204个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 973>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 974;ORF 249-1>:
m249-1/g249 90.1%相同性(在203个氨基酸的重迭区)
a249/L36117
gi|643582(L36117)前菌毛蛋白,需要切去前导序列来激活[pseudomonas aeruginosa]>gi|1161222(L48934)在4型菌毛生物合成中涉及;含有类似前菌毛蛋白的前导序列[Pseudomonas aeruginosa]>gi|1246299(L76605)参考号L36117,L48934[Pseudomonas aeruginosa]长度=185
分值=50.4bits(118),预计值=9e-06
相同性=45/183(24%),相似性=84/183(45%),缺口=26/183(14%)
m249-1/a249 90.7%相同性(在204个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 975>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 976;ORF 250.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 977>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 978;ORF 250>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 250与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 250.ng)有91.0%相同性(在111个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 979>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 980;ORF 250.a>:
m250/a250 94.6%相同性(在111个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 981>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 982;ORF 251.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 983>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 984;ORF 251>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 251与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 251.ng)有85.2%相同性(在243个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 985>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 986;ORF 251.a>:
m251/a251 88.5%相同性(在304个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 987>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 988;ORF 253.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 989>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 990;ORF 253>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 253与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 253.ng)有94.7%相同性(在397个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 991>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 992;ORF 253.a>:
m253/a253 97.2%相同性(在395个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 993>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 994;ORF 254.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 995>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 996;ORF 254>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 254与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 254.ng)有97.6%相同性(在167个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 997>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 998;ORF 254.a>:
m254/a254 97.6%相同性(在167个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 999>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1000;ORF 255.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1001>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1002;ORF 255>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 255与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 255.ng)有88.8%相同性(在188个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1003>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1004;ORF 255.a>:
m255/a255 93.1%相同性(在188个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1005>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1006;ORF 256.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1007>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1008;ORF 256>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 256与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 256.ng)有92.9%相同性(在239个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1009>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1010;ORF 256.a>:
m256/a256 95.4%相同性(在239个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1011>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1012;ORF 256-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1013>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1014;ORF 256-1>:
m256-1/g256-1 93.1%相同性(在319个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1015>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1016;ORF 256-1.a>:
a256-1/m256-1 95.6%相同性(在318个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1017>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1018;ORF 257.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1019>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1020;ORF 257>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 257与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 257.ng)有88.0%相同性(在125个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1021>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1022;ORF 257.a>:
m257/a257 92.0%相同性(在125个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1023>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1024;ORF 258.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1025>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1026;ORF 258>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 258与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 258.ng)有90.9%相同性(在386个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1027>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1028;ORF 258.a>:
m258/a258 99.0%相同性(在584个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1029>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1030;ORF 259.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1031>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1032;ORF 259>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 259与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 259.ng)有94.3%相同性(在212个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1033>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1034;ORF 259.a>:
m259/a259 98.1%相同性(在213个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1035>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1036;ORF 259-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1037>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1038;ORF 259-1>:
g259-1/m259-1 98.8%相同性(在169个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1039>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1040;ORF 259-1.a>:
a259-1/m259-1 99.5%相同性(在221个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1041>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1042;ORF 260.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1043>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1044;ORF 260>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 260与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 260.ng)有89.5%相同性(在171个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1045>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1046;ORF 260.a>:
m260/a260 97.1%相同性(在171个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1047>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1048;ORF 261.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1049>:
这对应于氨基酸序列<SEQ 1D 1050;ORF 261>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 261与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 261.ng)有79.7%相同性(在237个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1051>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1052;ORF 261.a>:
m261/a261 97.8%相同性(在232个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1053>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1054;ORF 263.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1055>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1056;ORF 263>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 263与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 263.ng)有85.7%相同性(在77个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1057>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1058;ORF 263.a>:
m263/a263 97.4%相同性(在77个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1059>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1060;ORF 264.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1061>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1062;ORF 264>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 264与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 264.ng)有91.6%相同性(在239个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1063>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1064;ORF 264.a>:
m264/a264 96.2%相同性(在239个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1065>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1066;ORF 265>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 265与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 265.ng)有88.6%相同性(在123个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1067>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1068;ORF 265.a>:
m265/a265 79.7%相同性(在123个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1069>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1070;ORF 266.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1071>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1072;ORF 266>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 266与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 266.ng)有92.1%相同性(在114个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1073>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1074;ORF 266.a>:
m266/a266 91.7%相同性(在120个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1075>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1076;ORF 267.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1077>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1078;ORF 267>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 267与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 267.ng)有82.7%相同性(在127个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1079>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1080;ORF 267.a>:
m267/a267 82.7%相同性(在127个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1081>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1082;ORF 268.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1083>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1084;ORF 268>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 268与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 268.ng)有86.0%相同性(在150个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1085>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1086;ORF 268.a>:
m268/a268 91.4%相同性(在140个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1087>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1088;ORF 268-1>:
m268-1/g268 82.3%相同性(在164个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1089>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1090;ORF 268-1.a>:
a268-1/m268-1 95.6%相同性(在158个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1091>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1092;ORF 269.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1093>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1094;ORF 269>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 269与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 269.ng)有87.6%相同性(在121个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1095>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1096;ORF 269.a>:
m269/a269 90.1%相同性(在121个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1097>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1098;ORF 270.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1099>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1100;ORF 270>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 270与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 270.ng)有96.4%相同性(在140个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1101>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1102;ORF 270.a>:
m270/a270 99.3%相同性(在140个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1103:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1104;ORF 271.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1105>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1106;ORF 271>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 271与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 271.ng)有95.2%相同性(在189个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1107>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1108;ORF 271.a>:
m271/a271 96.3%相同性(在189个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1109>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1110;ORF 272.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1111>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1112;ORF 272>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 272与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 272.ng)有97.6%相同性(在370个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1113>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1114;ORF 272.a>:
m272/a272 97.6%相同性(在370个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1115>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1116;ORF 273.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1117>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1118;ORF 273>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 273与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 273.ng)有86.0%相同性(在171个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1119>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1120;ORF 273.a>:
m273/a273 80.1%相同性(在171个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1121>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1122;ORF 274.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1123>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1124;ORF 274>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 274与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 274.ng)有97.5%相同性(在163个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1125>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1126;ORF 274.a>:
m274/a274 100.0%相同性(在163个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1127>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1128;ORF 276.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1129>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1130;ORF 276>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 276与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 276.ng)有96.8%相同性(在278个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1131>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1132;ORF 276.a>:
m276/a276 98.2%相同性(在278个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1133>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1134;ORF 277.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1135>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1136;ORF 277>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 277与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 277.ng)有90.0%相同性(在221个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1137>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1138;ORF 277.a>:
m277/a277 92.5%相同性(在252个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1139>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1140;ORF 278.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1141>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1142;ORF 278>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 278与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 278.ng)有95.9%相同性(在170个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1143>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1144;ORF 278.a>:
m278/a278 98.2%相同性(在219个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1145>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1146;ORF 279.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1147>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1148;ORF 279>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 279与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 279.ng)有89.5%相同性(在152个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1149>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1150;ORF 279.a>:
m279/a279 88.2%相同性(在152个氨基酸的重迭区)
ORF 279的表达
使用表1中所述的用于ORF 279的引物来定位和克隆ORF 279。如上所述,ORF 279被克隆在pET和pGex载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白表达产物和纯化产物用SDS-PAGE分析。图2A显示了亲和纯化的结果,图2B显示了在大肠杆菌中的表达。用纯化的GST-融合蛋白免疫小鼠,并用小鼠血清进行ELISA分析(阳性),FACS(图2C),Western印迹分析(图2D)。这些试验证实了279是一种暴露在表面的蛋白,并且是一种有用的免疫原。ORF 279的疏水性图、抗原指数、和两亲区域在图6中提供。使用AMPHI程序来预测推定的T细胞表位(Gao et al 1989,J.Immunol 143:3007;Roberts et al.1996,AIDS Res HumanRetroviruses 12:593;Quakyi et al.1992,Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 279的核酸序列及其编码的氨基酸序列在此提供。
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1151>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1152;ORF 280.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1153>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1154;ORF 280>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 280与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 280.ng)有93.8%相同性(在308个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1155>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1156;ORF 280.a>:
m280/a280 96.4%相同性(在308个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1157>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1158;ORF 281.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1159>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1160;ORF 281>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 281与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 281.ng)有93.5%相同性(在263个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1161>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1162;ORF 281.a>:
m281/a281 99.2%相同性(在264个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1163:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1164;ORF 282.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1165>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1166;ORF 282.ng>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 282与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 282.ng)有98.6%相同性(在217个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1167>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1168;ORF 282.a>:
m282/a282 99.1%相同性(在217个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1169>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1170;ORF 283.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1171>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1172;ORF 283>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m283/g283 86.1%相同性(在144个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1173>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1174;ORF 283.a>:
m283/a283 100.0%相同性(在144个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1175>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1176;ORF 284.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1177>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1178;ORF 284>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m284/g284 92.3%相同性(在298个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1179>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1180;ORF 284.a>:
m284/a284 94.8%相同性(在424个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1181>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1182;ORF 285.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1183>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1184;ORF 285>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m285/g285 96.5%相同性(在1389个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1185>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1186;ORF 285.a>:
m285/a285 99.4%相同性(在1389个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1187>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1188;ORF 285-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1189>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1190;ORF 285-1>:
g285-1/m285-1 96.5%相同性(在1354个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1191>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1192;ORF 285-1.a>:
a285-1/m285-1 99.3%相同性(在1354个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1193>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1194;ORF 286.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1195>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1196;ORF 286>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m286/g286 95.9%相同性(在293个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1197>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1198;ORF 286.a>:
m286/a286 98.7%相同性(在615个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1199>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1200;ORF 287.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1201>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1202;ORF 287>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m287/g287 70.1%相同性(在499个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1203>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1204;ORF 287.a>:
m287/a287 77.2%相同性(在501个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1205>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1206;ORF 288.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1207>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1208;ORF 288>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m288/g288 97.8%相同性(在181个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1209>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1210;ORF 288.a>:
m288/a288 97.2%相同性(在181个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1211>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1212;ORF 290.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1213>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1214;ORF 290>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m290/g290 96.1%相同性(在334个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1215>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1216;ORF 290.a>:
m290/a290 98.2%相同性(在334个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1217>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1218;ORF 292.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1219>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1220;ORF 292>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m292/g292 98.7%相同性(在238个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1221>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1222;ORF 292.a>:
m292/a292 100.0%相同性(在260个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1223>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1224;ORF 294.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1225>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1226;ORF 294>:
g294/m294 92.3%相同性(在196个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1227>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1228;ORF 294.a>:
m294/a294 94.9%相同性(在277个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1229>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1230;ORF 295.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1231>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1232;ORF 295>:
m295/g295 93.9%相同性(在294个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1233>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1234;ORF 295.a>:
m295/a295 93.2%相同性(在294个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1235>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1236;ORF 297.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1237>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1238;ORF 297>:
m297/g297 97.9%相同性(在430个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1239>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1240;ORF 297.a>:
m297/a297 99.3%相同性(在430个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1241>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1242;ORF 298.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1243>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1244;ORF 298>:
m298/g298 94.8%相同性(在327个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1245>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1246;ORF 298.a>:
m298/a298 96.3%相同性(在327个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1247>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1248;ORF 299.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1249>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1250;ORF 299>:
m299/g299 95.5%相同性(在397个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1251>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1252;ORF 299.a>:
m299/a299 98.0%相同性(在397个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1253>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1254;ORF 302.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1255>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1256;ORF 302>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 302与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 302.ng)有94.0%相同性(在533个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1257>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1258;ORF 302.a>:
m302/a302 96.1%相同性(在533个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1259>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1260;ORF 305.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1261>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1262;ORF 305>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 305与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 305.ng)有96.7%相同性(在243个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1263>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1264;ORF 305.a>:
m305/a305 96.3%相同性(在243个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1265>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1266;ORF 306.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1267>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1268;ORF 306>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 306与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 306.ng)有88.9%相同性(在253个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1269>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1270;ORF 306.a>:
m306/a306 93.7%相同性(在252个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1271>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1272;ORF 307.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1273>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1274;ORF 307>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 307与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 307.ng)有97.4%相同性(在38个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1275>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1276;ORF 307.a>:
m307/a307 100.0%相同性(在38个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1277>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1278;ORF 308.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1279>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1280;ORF 308>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 308与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 308.ng)有96.5%相同性(在231个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1281>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1282;ORF 308.a>:
m308/a308 95.7%相同性(在231个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1283>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1284;ORF 308-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1285>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1286;ORF 308-1>:
m308-1/g308-1 97.0%相同性(在232个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1287>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1288;ORF 308-1.a>:
a308-1/m308-1 96.1%相同性(在232个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1289>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1290;ORF 311.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1291>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1292;ORF 311>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 311与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 311.ng)有78.5%相同性(在455个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1293>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1294;ORF 311.a>:
m311/a311 81.3%相同性(在455个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1295>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1296;ORF 311-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1297>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1298;ORF 311-1>:
m311-1/g311-1 93.9%相同性(在591个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1299>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1300;ORF 311-1.a>:
a311-1/m311-1 98.5%相同性(在591个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1301>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1302;ORF 312.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1303>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1304;ORF 312>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 312与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 312.ng)有95.6%相同性(在451个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1305>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1306;ORF 312.a>:
m312/a312 96.7%相同性(在451个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1307>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1308;ORF 313.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1309>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1310;ORF 313>;
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 313与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 313.ng)有90.2%相同性(在173个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1311>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1312;ORF 313.a>:
m313/a313 90.8%相同性(在173个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1313>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1314;ORF 401.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1315>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1316;ORF 401>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 401与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 401.ng)有100.0%相同性(在203个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1317>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1318;ORF 401.a>:
m401/a401 99.5%相同性(在203个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1319>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1320;ORF 402.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1321>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1322;ORF 402>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 402与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 402.ng)有97.0%相同性(在497个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1323>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1324;ORF 402.a>:
m402/a402 99.0%相同性(在497个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1325>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1326;ORF 406>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1327>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1328;ORF 406>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 406与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 406.ng)有98.8%相同性(在320个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1329>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1330;ORF 406.a>:
m406/a406 98.8%相同性(在320个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1331>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1332;ORF 501.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1333>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1334;ORF 501>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 501与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 501.ng)有86.2%相同性(在558个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1335>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1336;ORF 501.a>:
m501/a501 90.3%相同性(在557个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1337>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1338;ORF 502.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1339>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1340;ORF 502.ng>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 502与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 502.ng)有95.8%相同性(在168个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1341>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1342;502 217.a>:
m502/a502 95.2%相同性(在167个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1343>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1344;ORF 502-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1345>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1346;ORF 502-1>:
m502-1/g502-1 99.0%相同性(在207个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1347>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1348;ORF 502-1.a>:
a502-1/m502-1 98.6%相同性(在207个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1349>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1350;ORF 503.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1351>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1352;ORF 503>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 503与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 503.ng)有91.2%相同性(在68个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1353>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1354;ORF 503.a>:
m503/a503 100.0%相同性(在68个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1355>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1356;ORF 214.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1357>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1358;ORF 503-1>:
g503-1/m503-1 89.9%相同性(在119个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1359>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1360;ORF 503-1.a>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1361>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1362;ORF 504.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1363>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1364;ORF 504>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 504与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 504.ng)有96.7%相同性(在425个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1365>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1366;ORF 504.a>:
m504/a504 99.8%相同性(在425个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1367>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1368;ORF 505.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1369>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1370;ORF 505>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 505与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 505.ng)有93.7%相同性(在287个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1371>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1372;ORF 505.a>:
m505/a505 99.0%相同性(在287个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1373>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1374;ORF 505-1>:
m505-1/g505 94.3%相同性(在298个氨基酸的重迭区)
m505-1/a505 99.7%相同性(在298个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1375>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1376;ORF 506.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1377>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1378;ORF 506>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 506与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 506.ng)有89.2%相同性(在520个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1379>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1380;ORF 506.a>:
m506/a506 94.8%相同性(在520个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1381>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1382;ORF 507.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1383>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1384;ORF 507>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 507与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 507.ng)有87.0%相同性(在185个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1385>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1386;ORF 507.a>:
m507/a507 89.7%相同性(在185个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1387>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1388;ORF 508.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1389>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1390;ORF 508.ng>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 508与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 508.ng)有86.8%相同性(在167个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1391>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1392;ORF 508.a>:
m508/a508 88.6%相同性(在167个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1393>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1394;ORF 509.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1395>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1396;ORF 509>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 509与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 509.ng)有87.8%相同性(在575个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1397>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1398;ORF 509.a>:
m509/a509 93.0%相同性(在575个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1399>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1400;ORF 510.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1401>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1402;ORF 510>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 510与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 510.ng)有96.2%相同性(在132个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1403>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1404;ORF 510.a>:
m510/a510 97.0%相同性(在132个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1405>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1406;ORF 512.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1407>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1408;ORF 512>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 512与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 512.ng)有93.4%相同性(在122个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1409>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1410;ORF 512.a>:
m512/a512 95.9%相同性(在122个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1411>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1412;ORF 513.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1413>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1414;ORF 513>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 513与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 513.ng)有99.5%相同性(在191个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1415>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1416;ORF 513.a>:
m513/a513 100.0%相同性(在191个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1417>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1418;ORF 515.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1419>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1420;ORF 515>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 515与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 515.ng)有85.9%相同性(在304个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1421>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1422;ORF 515.a>:
m515/a515 92.1%相同性(在304个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1423>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1424;ORF 515-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1425>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1426;ORF 515-1>:
m515-1/g515-1 91.7%相同性(在312个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1427>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1428;ORF 515-1.a>:
m515-1/a515-1 94.9%相同性(在312个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1429>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1430;ORF 516.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1431>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1432;ORF 516>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 516与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 516.ng)有90.0%相同性(在231个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1433>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1434;ORF 516.a>:
m516/a516 86.1%相同性(在238个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1435>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1436;ORF 517.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1437>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1438;ORF 517>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 517与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 517.ng)有92.7%相同性(在164个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1439>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1440;ORF 517.a>:
m517/a517 93.4%相同性(在167个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1441>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1442;ORF 518.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1443>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1444;ORF 518>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 518与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 518.ng)有74.1%相同性(在135个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1445>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1446;ORF 518.a>:
m518/a518 79.9%相同性(在134个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1447>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1448;ORF 519.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1449>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1450;ORF 519>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 519与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 519.ng)有87.5%相同性(在200个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1451>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1452;ORF 519.a>:
m519/a519 99.5%相同性(在199个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1453>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1454;ORF 519-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1455>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1456;ORF 519-1>:
m519-1/g519-1 99.0%相同性(在315个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1457>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1458;ORF 519-1.a>:
m519-1/a519-1 99.0%相同性(在315个氨基酸的重迭区)
ORF 519的表达
使用表1中所述的用于ORF 519的引物来定位和克隆ORF 519。如上所述,ORF 519被克隆在pET和pGex载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白表达产物和纯化产物用SDS-PAGE分析。图4A显示了亲和纯化的结果,图4B显示了在大肠杆菌中的表达。用纯化的His-融合蛋白免疫小鼠,并用小鼠血清进行ELISA分析(阳性结果),FACS(图4C),Western印迹分析(图4E)和杀菌性测试(图4D)。这些试验证实了519是一种暴露在表面的蛋白,并且是一种有用的免疫原。ORF 519的疏水性图、抗原指数、和两亲区域在图8中提供。使用AMPHI程序来预测推定的T细胞表位(Gao et al 1989,J.Immunol 143:3007;Robertset al.1996,AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyi et al.1992,Scand J Immunol Suppl11:9)。ORF 519的核酸序列及其编码的氨基酸序列在此提供。
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1459>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1460;ORF 520.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1461>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1462;ORF 520>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 520与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 520.ng)有87.3%相同性(在197个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1463>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1464;ORF 520.a>:
m520/a520 98.0%相同性(在197个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1465>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1466;ORF 520-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1467>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1468;ORF 520-1>:
g520-1/m520-1 97.1%相同性(在173个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1469>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1470;ORF 520-1.a>:
m520-1/a520-1 100.0%相同性(在173个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1471>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1472;ORF 521.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1473>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1474;ORF 521>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 521与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 521.ng)有90.6%相同性(在171个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1475>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1476;ORF 521.a>:
m521/a521 94.2%相同性(在171个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1477>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1478;ORF 522.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1479>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1480;ORF 522>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 522与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 522.ng)有91.0%相同性(在144个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1481>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1482;ORF 522.a>:
m522/a522 95.8%相同性(在144个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1483>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1484;ORF 523.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1485>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1486;ORF 523>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 523与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 523.ng)有91.3%相同性(在126个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1487>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1488;ORF 523.a>:
m523/a523 94.4%相同性(在126个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1489>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1490;ORF 525.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1491>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1492;ORF 525>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 525与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 525.ng)有94.1%相同性(在186个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1493>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1494;ORF 525.a>:
m525/a525 90.8%相同性(在185个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1495>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1496;ORF 525-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1497>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1498;ORF 525-1>:
m525-1/g525-1 97.6%同性(在251个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1499>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1500;ORF 525-1.a>:
m525-1/a525-1 97.2%相同性(在251个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1501>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1502;ORF 527.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1503>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1504;ORF 527>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 527与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 527.ng)有90.0%相同性(在150个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1505>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1506;ORF 527.a>:
m527/a527 93.3%相同性(在150个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1507>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1508;ORF 528.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1509>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1510;ORF 528>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 528与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 528.ng)有89.3%相同性(在121个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1511>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1512;ORF 528.a>:
m528/a528 95.0%相同性(在121个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1513>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1514;ORF 528-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1515>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1516;ORF 528-1>:
g528-1/m528-1 92.6%相同性(在135个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1517>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1518;ORF 528-1.a>:
a528-1/m528-1 97.0%相同性(在135个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1519>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1520;ORF 529.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1521>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1522;ORF 529>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 529与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 529.ng)有83.5%相同性(在115个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1523>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1524;ORF 529.a>:
m529/a529 99.2%相同性(在375个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1525>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1526;ORF 530.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1527>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1528;ORF 530>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 530与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 530.ng)有88.8%相同性(在98个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1529>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1530;ORF 530.a>:
m530/a530 93.9%相同性(在98个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1531>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1532;ORF 531.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1533>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1534;ORF 531>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 531与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 531.ng)有94.4%相同性(在162个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1535>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1536;ORF 531.a>:
m531/a531 96.9%相同性(在162个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1537>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1538;ORF 532.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1539>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1540;ORF 532>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 532与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 532.ng)有91.4%相同性(在93个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1541>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1542;ORF 532.a>:
m532/a532 100.0%相同性(在463个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1543>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1544;ORF 535.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1545>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1546;ORF 535>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 535与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 535.ng)有80.9%相同性(在262个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1547>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1548;ORF 535.a>:
m535/a535 88.7%相同性(在256个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1549>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1550;ORF 537.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1551>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1552;ORF 537>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 537与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 537.ng)有95.7%相同性(在164个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1553>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1554;ORF 537.a>:
m537/a537 98.2%相同性(在164个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1555>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1556;ORF 538.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1557>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1558;ORF 538>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 538与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 538.ng)有92.1%相同性(在392个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1559>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1560;ORF 538.a>:
m538/a538 94.6%相同性(在392个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1561>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1562;ORF 539.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1563>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1564;ORF 539>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计GRF的同源性
ORF 539与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 539.ng)有89%相同性(在345个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1565>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1566;ORF 539.a>:
m539/a539 97.1%相同性(在345个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1567>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1568;ORF 540.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1569>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1570;ORF 540>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 540与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 540.ng)有85.7%相同性(在112个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1571>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1572;ORF 540.a>:
m540/a540 92.8%相同性(在111个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1573>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1574;ORF 542.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1575>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1576;ORF 542>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 542与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 542.ng)有93.7%相同性(在111个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1577>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1578;ORF 542.a>:
m542/a542 94.6%相同性(在111个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1579>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1580;ORF 543.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1581>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1582;ORF 543>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 543与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 543.ng)有84.2%相同性(在379个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1583>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1584;ORF 543.a>:
m543/a543 96.0%相同性(在378个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1585>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1586;ORF 544.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1587>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1588;ORF 544>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 544与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 544.ng)有90.7%相同性(在162个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1589>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1590;ORF 544.a>:
m544/a544 88.9%相同性(在162个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1591>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1592;ORF 547.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1593>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1594;ORF 547>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 547与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 547.ng)有97.2%相同性(在142个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1595>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1596;ORF 547.a>:
m547/a547 97.6%相同性(在127个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1597>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1598;ORF 548.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1599>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1600;ORF 548>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 548与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 548.ng)有95.9%相同性(在217个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1601>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1602;ORF 548.a>:
m548/a548 97.7%相同性(在217个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1603>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1604;ORF 550.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1605>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1606;ORF 550>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 550与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 550.ng)有_%相同性(在_个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1607>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1608;ORF 550.a>:
m550/a550 97.2%相同性(在106个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1609>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1610;ORF552.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1611>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1612;ORF 552>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 552与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 552.ng)有97.1%相同性(在174个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1613>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1614;ORF 552.a>:
m552/a552 100.0%相同性(在193个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1615>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1616;ORF 552-1>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1617>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1618;ORF 552-1.a>:
a552-1/m552-1 100.0%相同性(在195个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1619>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1620;ORF 553.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1621>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1622;ORF 553>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 553与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 553.ng)有65.5%相同性(在185个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1623>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1624;ORF 553.a>:
m553/a553 62.7%相同性(在51个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1625>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1626;ORF 554.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1627>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1628;ORF 554>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 554与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 554.ng)有96.1%相同性(在389个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1629>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1630;ORF 554.a>:
m554/a554 99.2%相同性(在389个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1631>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1632;ORF 556.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1633>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1634;ORF 556>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 556与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 556.ng)有100.0%相同性(在139个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1635>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1636;ORF 556.a>:
m556/a556 100.0%相同性(在139个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1637>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1638;ORF 557.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1639>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1640;ORF 557>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 557与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 557.ng)有94.3%相同性(在159个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1641>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1642;ORF 557.a>:
m557/a557 99.4%相同性(在159个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1643>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1644;ORF 558.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1645>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1646;ORF 558>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 558与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 558.ng)有92.5%相同性(在106个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1647>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1648;ORF 558.a>:
m558/a558 70.2%相同性(在141个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1649>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID1650;ORF 560.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1651>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1652;ORF 560>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 560与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 560.ng)有97.2%相同性(在246个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1653>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1654;ORF 560.a>:
m560/a560 98.4%相同性(在247个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1655>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1656;ORF 561>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m561/g561 89.7%相同性(在223个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1657>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1658;ORF 561.a>:
m561/a561 96.9%相同性(在590个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1659>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1660;ORF 562.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1661>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1662;ORF 562>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m562/g562 99.0%相同性(在208个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1663>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1664;ORF 562.a>:
m562/a562 96.6%相同性(在208个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1665>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1666;ORF 563.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1667>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1668;ORF 563>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 563与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 563.ng)有79.1%相同性(在2316个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1669>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1670;ORF 564>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与fha的同源性
m564/fha
ID FHAB_BORPE 标准; PRT;3591 AA
AC P12255;
DT 01-OCT-1989(REL.12,创制)
DT 01-FEB-1996(REL.33,最后的序列更新)
DT 01-FEB-1996(REL.33,最后的命名更新)
DE FILAMENTOUS HEMAGGLUTININ. . . .
分值 Initl:190 Initn: 524 Opt: 594
Smith-Waterman分值:866; 21.7%相同性(在2427个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1671>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1672;ORF 565.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1673>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1674;ORF 565>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m565/g565 100.0%相同性(在67个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1675>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1676;ORF 565.a>:
m565/a565 99.5%相同性(在209个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1677>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1678;ORF 566.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1679>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1680;ORF 566>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m566/g566 93.1%相同性(在116个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1681>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1682;ORF 566.a>:
m566/a566 94.0%相同性(在116个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1683>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1684;ORF 567.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1685>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1686;ORF 567>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m567/g567 98.2%相同性(在168个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1687>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1688;ORF 567.a>:
m567/a567 97.7%相同性(在257个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1689>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1690;ORF 568.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1691>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1692;ORF 568>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m568/g568 94.8%相同性(在154个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1693>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1694;ORF 568.a>:
m568/a568 98.1%相同性(在257个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1695>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1696;ORF 569.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1697>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1698;ORF 569>:
m569/g569 95.3%相同性(在127个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1699>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1700;ORF 569.a>:
m569/a569 99.6%相同性(在265个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1701>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1702;ORF 570.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1703>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1704;ORF 570>:
m570/g570 94.6%相同性(在166个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1705>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1706;ORF 570.a>:
m570/a570 97.6%相同性(在166个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1707>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1708;ORF 571.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1709>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1710;ORF 571>:
m571/g571 93.1%相同性(在102个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1711>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1712;ORF 571.a>:
m571/a571 98.1%相同性(在160个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1713>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1714;ORF 572.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1715>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1716;ORF 572>:
m572/g572 92.9%相同性(在295个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1717>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1718;ORF 572.a>:
m572/a572 98.3%相同性(在295个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1719>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1720;ORF 573.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1721>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1722;ORF 573>:
m573/g573 95.9%相同性(在364个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1723>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1724;ORF 573.a>:
m573/a573 98.6%相同性(在364个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1725>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1726;ORF 574.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1727>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1728;ORF 574>:
m573/g573 97.8%相同性(在402个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1729>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1730;ORF 574.a>:
m574/a574 97.5%相同性(在402个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1731>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1732;ORF 575.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1733>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1734;ORF 575>:
m575/g575 70.2%相同性(在114个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1735>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1736;ORF 575.a>:
m575/a575 98.8%相同性(在344个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1737>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1738;ORF 576.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1739>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1740;ORF 576>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m576/g576 97.2%相同性(在215个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1741>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1742;ORF 576.a>:
m576/a576 99.5%相同性(在222个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1743>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1744;ORF 576-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1745>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1746;ORF 576-1>:
g576-1/m576-1 97.8%相同性(在272个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1747>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1748;ORF 576-1.a>:
a576-1/m576-1 99.6%相同性(在272个氨基酸的重迭区)
ORF 576的表达
使用表1中所述的用于ORF 576的引物来定位和克隆ORF 576。如上所述,ORF 576被克隆在pET和pGex载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白表达产物和纯化产物用SDS-PAGE分析。图3A显示了亲和纯化的结果,图3B显示了在大肠杆菌中的表达。用纯化的His-融合蛋白免疫小鼠,并用小鼠血清进行ELISA分析(阳性结果),FACS(图3C),Western印迹分析(图3D)。这些试验证实了576是一种暴露在表面的蛋白,并且是一种有用的免疫原。ORF 576的疏水性图、抗原指数、和两亲区域在图7中提供。使用AMPHI程序来预测推定的T细胞表位(Gao et al 1989,J.Immunol 143:3007;Roberts et al.1996,AIDS ResHuman Retroviruses 12:593;Quakyi et al.1992,Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 576的核酸序列及其编码的氨基酸序列在实施例1中提供。
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1749>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1750;ORF 577.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1751>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1752;ORF 577>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m577/g577 88.1%相同性(在160个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1753>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1754;ORF 577.a>:
m577/a577 98.1%相同性(在160个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1755>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1756;ORF 578.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1757>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1758;ORF 578>:
m578/g578 87.7%相同性(在106个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1759>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1760;ORF 578.a>:
m578/a578 91.5%相同性(在106个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1761>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1762;ORF 579.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1763>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1764;ORF 579>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m579/g579 98.7%相同性(在231个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1765>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1766;ORF 579.a>:
m579/a579 100.0%相同性(在231个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1767>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1768;ORF 008.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1769>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1770;ORF 579-1>:
m579-1/g579-1 98.6%相同性(在282个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1771>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1772;ORF 579-1.a>:
a579-1/m579-1 99.6%相同性(在282个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1773>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1774;ORF 580.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1775>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1776;ORF 580>:
m580/g580 97.0%相同性(在100个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1777>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1778;ORF 580.a>:
m580/a580 98.0%相同性(在100个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1779>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1780;ORF 581.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1781>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1782;ORF 581>:
m581/g581 93.8%相同性(在113个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1783>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1784;ORF 581.a>:
m581/a581 98.2%相同性(在113个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1785>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1786;ORF 582.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1787>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1788;ORF 582>:
m582/g582 98.6%相同性(在370个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1789>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1790;ORF 582.a>:
m582/a582 100.0%相同性(在370个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1791>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1792;ORF 583.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1793>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1794;ORF 583>:
m583/g583 98.5%相同性(在202个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1795>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1796;ORF 583.a>:
m583/a583 99.0%相同性(在202个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1797>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1798;ORF 584.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1799>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1800;ORF 584>:
m584/g584 89.7%相同性(在234个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1801>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1802;ORF 584.a>:
m584/a584 88.9%相同性(在234个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1803>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1804;ORF 585.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1805>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1806;ORF 585>:
m585/g585 88.3%相同性(在231个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1807>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1808;ORF 585.a>:
m585/a585 99.8%相同性(在468个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1809>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1810;ORF 586.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1811>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1812;ORF 586>:
m586/g 586 97.1%相同性(在209个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1813>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1814;ORF 586.a>:
m586/a586 97.6%相同性(在209个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1815>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1816;ORF 587.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1817>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1818;ORF 587>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m587/g587 95.0%相同性(在161个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1819>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1820;ORF 587.a>:
m587/a587 95.2%相同性(在289个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1821>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1822;ORF 588.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1823>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1824;ORF 588>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m588/g588 82.5%相同性(在120个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1825>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1826;ORF 588.a>:
m588/a588 96.4%相同性(在138个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1827>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1828;ORF 589.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1829>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1830;ORF 589>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m589/g589 94.2%相同性(在725个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1831>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1832;ORF 589.a>:
m589/a589 94.9%相同性(在725个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1833>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1834;ORF 590.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1835>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1836;ORF 590>:
m590/g590 93.1%相同性(在462个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1837>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1838;ORF 590.a>:
m590/a590 97.8%相同性(在462个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1839>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1840;ORF 590-1>:
m590-1/g590 93.6%相同性(在516个氨基酸的重迭区)
a590/m590-1 98.3%相同性(在516个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1841>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1842;ORF 591.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1843>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1844;ORF 591>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m591/g591 97.3%相同性(在446个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1845>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1846;ORF 591.a>:
m591/a591 99.6%相同性(在446个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1847>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1848;ORF 592.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1849>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1850;ORF 592>:
m592/g592 100.0%相同性(在237个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1851>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1852;ORF 592.a>:
m592/a592 100.0%相同性(在237个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1853>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1854;ORF 593.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1855>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1856;ORF 593>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m593/g593 83.4%相同性(在313个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1857>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1858;ORF 593.a>:
m593/a593 92.9%相同性(在312个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1859>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1860;ORF 594.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1861>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1862;ORF 594>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m594/g594 98.1%相同性(在158个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1863>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1864;ORF 594.a>:
m594/a594 100.0%相同性(在158个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1865>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1866;ORF 595.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1867>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1868;ORF 595>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m595/g595 95.4%相同性(在388个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1869>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1870;ORF 595.a>:
m595/a595 99.7%相同性(在388个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1871>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1872;ORF 596.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1873>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1874;ORF 596>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m596 g596 98.4%相同性(在373个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1875>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1876;ORF 596.a>:
m596/a596 99.3%相同性(在558个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1877>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1878;ORF 597>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1879>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1880;ORF 597>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 597与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 597.ng)有96.1%相同性(在389个氨基酸的重迭区):
m597/g597 96.1%相同性(在389个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1881>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1882;ORF 597.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 597与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 597)有98.5%相同性(在389个氨基酸的重迭区):
m597/a597 98.5%相同性(在389个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1883>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1884;ORF 601.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1885>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1886;ORF 601>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 601与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 601.ng)有94.1%相同性(在205个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1887>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1888;ORF 601.a>:
m601/a601 100.0%相同性(在205个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1889>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1890;ORF 602.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1891>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1892;ORF 602>:
m602/g602 65.2%相同性(在115个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1893>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1894;ORF 602.a>:
m602/a602 95.5%相同性(在111个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1895>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1896;ORF 603.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1897>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1898;ORF 603>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 603与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 603.ng)有91.6%相同性(在450个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1899>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1900;ORF 603.a>:
m603/a603 96.7%相同性(在450个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1901>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1902;ORF 604.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1903>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1904;ORF 604>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 604与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 604.ng)有83.4%相同性(在169个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1905>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1906;ORF 604.a>:
m604/a604 97.0%相同性(在169个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1907>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1908;ORF 605.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1909>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1910;ORF 605>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 605与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 605.ng)有97.9%相同性(在513个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1911>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1912;ORF 605.a>:
m605/a605 98.1%相同性(在514个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1913>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1914;ORF606.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1915>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1916;ORF 606>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 606与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 606.ng)有100.0%相同性(在225个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1917>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1918;ORF 606.a>:
m606/a606 100.0%相同性(在226个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1919>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1920;ORF 607.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1921>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1922;ORF 607>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 607与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 607.ng)有94.8%相同性(在459个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1923>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1924;ORF 607.a>:
m607/a607 98.9%相同性(在459个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1925>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1926;ORF 608.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1927>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1928;ORF 608>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 608与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 608.ng)有95.2%相同性(在188个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1929>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1930;ORF 608.a>:
m608/a608 98.9%相同性(在188个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1931>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1932;ORF 609.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1933>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1934;ORF 609>:
m609/g609 93.1%相同性(在131个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1935>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1936;ORF 609.a>:
m609/a609 96.9%相同性(在131个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1937>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1938;ORF 610.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1939>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1940;ORF 610>:
m610/g610 98.5%同性(在338个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1941>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1942;ORF 610.a>:
m610/a610 99.4%相同性(在338个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1943>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1944;ORF 611.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1945>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1946;ORF 611>:
m611/g611 96.1%相同性(在180个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1947>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1948;ORF 611.a>:
m611/a611 98.9%相同性(在180个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1949>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1950;ORF 612.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1951>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1952;ORF 612>:
m612/g612 96.0%相同性(在124个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1953>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1954;ORF 612.a>:
m612/a612 96.0%相同性(在124个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1955>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1956;ORF 613.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1957>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1958;ORF 613>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m613/g613 94.6%相同性(在204个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1959>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1960;ORF 613.a>:
m613/a613 98.0%相同性(在204个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1961>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1962;ORF 614.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1963>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1964;ORF 614>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m614/g614 98.0%相同性(在391个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1965>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1966;ORF 614.a>:
m614/a614 99.7%相同性(在391个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1967>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1968;ORF 615.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1969>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1970;ORF 615>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m615/g615 86.8%相同性(在371个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1971>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1972;ORF 615.a>:
m615/a615 90.3%相同性(在371个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1973>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1974;ORF 616.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1975>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1976;ORF 616>:
m616/g616 86.0%相同性(在401个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1977>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1978;ORF 616.a>:
m616/a616 90.0%相同性(在401个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1979>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1980;ORF 619.a>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1981>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1982;ORF 619>:
m619/g619 95.1%相同性(在324个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1983>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1984;ORF 619.a>:
m619/a619 97.2%相同性(在324个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1985>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1986;ORF 620.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1987>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1988;ORF 620>:
m620/g620 97.0%相同性(在164个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1989>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1990;ORF 620.a>:
m620/a620 100.0%相同性(在164个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1991>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1992;ORF 622.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1993>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1994;ORF 622>:
m622/g622 98.8%相同性(在415个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1995>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1996;ORF 622.a>:
m622/a622 98.1%相同性(在415个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1997>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 1998;ORF 624.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 1999>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2000;ORF 624>:
m624/g624 91.6%相同性(在119个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2001>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2002;ORF 624.a>:
m624/a624 99.2%相同性(在119个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2003>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2004>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2005;ORF 625.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2006>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2007;ORF 625>:
m625/g625 98.3%相同性(在117个氨基酸的重迭区)
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2008;ORF 625.a>:
m625/a625 100.0%相同性(在117个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2009>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2010;ORF 627.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2011>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2012;ORF 627>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m627/g627 97.6%相同性(在210个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2013>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2014;ORF 627.a>:
m627/a627 99.5%相同性(在210个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2015>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2016;ORF 628.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2017>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2018;ORF 628>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m628/g628 93.3%相同性(在119个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2019>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2020;ORF 628.a>:
m628/a628 95.0%相同性(在120个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2021>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2022;ORF 629.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2023>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2024;ORF 629>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m629/g629 95.7%相同性(在322个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2025>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2026;ORF 629.a>:
m629/a629 95.7%相同性(在322个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2027>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2028;ORF 630.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2029>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2030;ORF 630>:
m630/g630 93.5%相同性(在275个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2031>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2032;ORF 630.a>:
m630/a630 98.3%相同性(在355个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2033>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2034;ORF 635.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2035>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2036;ORF 635>:
m635/g635 80.0%相同性(在130个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2037>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2038;ORF 635.a>:
m635/a635 95.4%相同性(在131个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2039>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2040;ORF 638.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2041>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2042;ORF 638>:
m638/g638 88.2%相同性(在254个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2043>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2044;ORF 638.a>:
m638/a638 91.3%相同性(在264个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2045>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2046;ORF 639-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2047>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2048;ORF 639-1>:
g639-1/m639-1 95.9%相同性(在344个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2049>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2050;ORF 639-1.a>:
a639-1/m639-1 98.8%相同性(在344个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2051>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2052;ORF 640.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2053>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2054;ORF 640>:
m640/g640 96.5%相同性(在143个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2055>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2056;ORF 640.a>:
m640/a640 96.5%相同性(在143个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2057>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2058;ORF 642.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2059>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2060;ORF 642>:
m642/g642 90.4%相同性(在407个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2061>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2062;ORF 642.a>:
m642/a642 95.8%相同性(在407个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2063>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2064;ORF 643>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2065>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2066;ORF 643>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 643与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 643.ng)有94.9%相同性(在136个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2067>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2068;ORF 643.a>:
m643/a643 97.1%相同性(在136个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2069>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2070;ORF 644.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2071>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2072;ORF 644>:
m644/g644 94.6%相同性(在517个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2073>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2074;ORF 644.a>:
m644/a644 97.3%相同性(在517个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2075>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2076;ORF 645.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2077>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2078;ORF 645>:
m645/g645 93.7%相同性(在286个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2079>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2080;ORF 645.a>:
m645/a645 96.9%相同性(在286个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2081>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2082;ORF 647.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2083>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2084;ORF 647>:
m647/g647 91.3%相同性(在103个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2085>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2086;ORF 647.a>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2087>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2088;ORF 648.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2089>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2090;ORF 648>:
m648/g648 91.5%相同性(在211个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2091>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2092;ORF 648.a>:
m648/a648 93.8%相同性(在211个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2093>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2094;ORF 649.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2095>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2096;ORF 649>:
m649/g649 96.1%相同性(在103个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2097>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2098;ORF 649.a>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2099>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2100;ORF 650.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2101>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2102;ORF 650>:
m650/g650 96.1%相同性(在465个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2103>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2104;ORF 650.a>:
m650/a650 99.1%相同性(在465个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2105>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2106;ORF 652.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2107>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2108;ORF 652>:
m552/g652 98.2%相同性(在335个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2109>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2110;ORF 652.a>:
m652/a652 99.7%相同性(在335个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2111>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2112;ORF 652-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2113>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2114;ORF 652-1>:
m652-1/g652-1 98.6%相同性(在428个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2115>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2116;ORF 652-1.a>:
m652-1/a652-1 99.8%相同性(在428个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2117>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2118;ORF 653.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2119>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2120;ORF 653>:
m653/g653 96.9%相同性(在163个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2121>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2122;ORF 653.a>:
m653/a653 100.0%相同性(在163个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2123>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2124;ORF 656.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2125>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2126;ORF 656>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2127>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2128;ORF 656.a>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2129>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2130;ORF 657.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2131>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2132;ORF 657>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m657/g657 93.9%相同性(在378个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2133>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2134;ORF 657.a>:
m657/a657 94.2%相同性(在378个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2135>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2136;ORF 658.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2137>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2138;ORF 658>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m658/g658 82.2%相同性(在259个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2139>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2140;ORF 658.a>:
m658/a658 75.3%相同性(在259个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2141>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2142;ORF 661.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2143>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2144;ORF 661>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m661/g661 88.5%相同性(在295个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2145>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2146;ORF 661.a>:
m661/a661 94.6%相同性(在298个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2147>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2148;ORF 663.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2149>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2150;ORF 663>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m663/g663 94.9%相同性(在293个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2151>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2152;ORF 663.a>:
m663/a663 96.2%相同性(在293个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2153>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2154;ORF 664.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2155>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2156;ORF 664>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m664/g664 91.8%相同性(在183个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2157>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2158;ORF 664.a>:
m664/a664 92.9%相同性(在183个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2159>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2160;ORF 665.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2161>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2162;ORF 665>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m665/g665 96.1%相同性(在637个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2163>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2164;ORF 665.a>:
m665/a665 97.3%相同性(在638个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2165>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2166;ORF 665-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2167>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2168;ORF 665-1>:
m665-1/g665-1 96.1%相同性(在866个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2169>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2170;ORF 665-1.a>:
a665-1/m665-1 97.2%相同性(在867个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2171>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2172;ORF 666.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2173>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2174;ORF 666>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m666/g666 93.9%相同性(在181个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2175>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2176;ORF 666.a>:
m666/a666 100.0%相同性(在181个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2177>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2178;ORF 667.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2179>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2180;ORF 667>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m667/g667 75.0%相同性(在224个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2181>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2182;ORF 667.a>:
m667/a667 79.0%相同性(在224个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2183>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2184;ORF 669.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2185>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2186;ORF 669>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m669/g669 96.2%相同性(在106个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2187>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2188;ORF 669.a>:
m669/a669 98.1%相同性(在106个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2189>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2190;ORF 670.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2191>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2192;ORF 670>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m670/g670 98.0%相同性(在151个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2193>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2194;ORF 670.a>:
m670/a670 98.0%相同性(在151个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2195>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2196;ORF 671.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2197>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2198;ORF 671>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m671/g671 91.9%相同性(在148个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2199>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2200;ORF 671.a>:
m671/a671 93.9%相同性(在148个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2201>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2202;ORF 672.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2203>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2204;ORF 672>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m672/g672 91.3%相同性(在208个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2205>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2206;ORF 672.a>:
m672/a672 91.8%相同性(在208个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2207>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2208;ORF 673.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2209>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2210;ORF 673>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m673/g673 98.4%相同性(在307个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2211>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2212;ORF 673.a>:
m673/a673 99.7%相同性(在307个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2213>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2214;ORF 674.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2215>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2216;ORF 674>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m674/g674 97.9%相同性(在141个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2217>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2218;ORF 674.a>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2219>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2220;ORF 675.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2221>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2222;ORF 675>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m675/g675 96.8%相同性(在158个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2223>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2224;ORF 675.a>:
m675/a675 100.0%相同性(在158个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2225>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2226;ORF 677.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2227>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2228;ORF 677>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m677/g677 94.9%相同性(在198个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2229>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2230;ORF 677.a>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2231>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2232;ORF 678.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2233>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2234;ORF 678>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m678/g678 89.7%相同性(在165个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2235>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2236;ORF 678.a>:
m678/a678 93.9%相同性(在165个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2237>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2238;ORF 680.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2239>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2240;ORF 680>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m680/g680 90.9%相同性(在220个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2241>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2242;ORF 680.a>:
m680/a680 98.6%相同性(在220个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2243>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2244;ORF 681>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2245>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2246;ORF 681>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 681与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 681.ng)有94.6%相同性(在261个氨基酸的重迭区):
列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2247>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2248;ORF 681.a>:
m681/a681 90.8%相同性(在260个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2249>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2250;ORF 682>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2251>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2252;ORF 682>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 682与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 682.ng)有88.1%相同性(在134个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2253>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2254;ORF 682.a>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2255>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2256;ORF 683>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2257>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2258;ORF 683>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 683与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 683.ng)有99.3%相同性(在146个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2259>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2260;ORF 683.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 683与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 683)有97.9%相同性(在146个氨基酸的重迭区):
m683/a683 97.9%相同性(在146个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2261>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2262;ORF 684>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2263>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2264;ORF 684>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 684与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 684.ng)有97.7%相同性(在172个氨基酸的重迭区):
m684/g684 97.7%相同性(在172个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2265>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2266;ORF 684.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 684与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 684)有99.4%相同性(在172个氨基酸的重迭区):
m684/a684 99.4%相同性(在172个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2267>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2268;ORF 685>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2269>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2270;ORF 685>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 685与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 685.ng)有94.4%相同性(在356个氨基酸的重迭区):
m685/g685 94.4%相同性(在356个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2271>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2272;ORF 685.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 685与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 685)有98.9%相同性(在355个氨基酸的重迭区):
m685/a685 98.9%相同性(在355个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2273>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2274;ORF 686>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2275>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2276;ORF 686>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 686与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 686.ng)有95.4%相同性(在131个氨基酸的重迭区):
g686/m686 95.4%相同性(在131个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2277>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2278;ORF 686.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 686与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 686)有96.2%相同性(在131个氨基酸的重迭
区):
m686/a686 96.2%相同性(在131个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2279>
这对应于氨基酸序列<2280 ID 724;ORF 687>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2281>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2282;ORF 687>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 687与淋病奈瑟球菌预计的ORF(ORF 687)有97.0%相同性(在234个氨基酸的重迭区):
m687/g687 97.0%相同性(在234个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2283>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2284;ORF 687.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 687与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 687)有98.7%相同性(在232个氨基酸的重迭区):
m687/a687 98.7%相同性(在232个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2285>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2286;ORF 688>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2287>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2288;ORF 688>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 688与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 688.ng)有90.6%相同性(在138个氨基酸的重迭区):
m688/g688 90.6%相同性(在138个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2289>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2290;ORF 688.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 688与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 688)有93.5%相同性(在138个氨基酸的重迭区):
m688/a688 93.5%相同性(在138个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2291>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2292;ORF 689>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2293>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2294;ORF 689>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 689与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 689.ng)有88.0%相同性(在408个氨基酸的重迭区):
m689/a689 88.0%相同性(在408个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2295>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2296;ORF 689.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 689与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 689)有99.1%相同性(在459个氨基酸的重迭区):
m689/a689 99.1%相同性(在459个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2297>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2298;ORF 690>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2299>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2300;ORF 690>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 690与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 690.ng)有89.3%相同性(在408个氨基酸的重迭区):
m690/g690 89.3%相同性(在408个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2301>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2302;ORF 690.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 690与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 690)有93.9%相同性(在280个氨基酸的重迭区):
m690/a690 93.9%相同性(在280个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2303>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2304;ORF 691>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2305>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2306;ORF 691>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 691与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 691.ng)有97.2%相同性(在144个氨基酸的重迭区):
m691/g691 97.2%相同性(在144个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2307>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2308;ORF 691.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 691与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 691)有97.2%相同性(在144个氨基酸的重迭区):
m691/a691 97.2%相同性(在144个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2309>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2310;ORF 692>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2311>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2312;ORF 692>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 692与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 692.ng)有91.1%相同性(在338个氨基酸的重迭区):
m692/g692 91.1%相同性(在338个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2313>
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2314;ORF 692.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 692与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 692)有98.8%相同性(在336个氨基酸的重迭区):
m692/a692 98.8%相同性(在336个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2315>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2316;ORF 694>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2317>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2318;ORF 694>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 694与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 694.ng)有86.8%相同性(在372个氨基酸的重迭区):
m694/g694 86.8%相同性(在372个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2319>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2320;ORF 694.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 694与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 694)有100%相同性(在385个氨基酸的重迭区):
m694/a694 100.0%相同性(在385个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2321>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2322;ORF 695>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2323>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2324;ORF 695>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 694与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 694.ng)有90.8%相同性(在305个氨基酸的重迭区):
m695/g695 90.8%相同性(在305个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2325>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2326;ORF 695.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 695与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 695)有88.3%相同性(在308个氨基酸的重迭区):
m695/a695 88.3%相同性(在308个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的
g696.seq:未找到
这对应于氨基酸序列<ORF 696.ng>:
g696.pep:未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2327>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2328;ORF 696>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2329>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2330;ORF 696.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 696与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 696.a)有100.0%相同性(在120个氨基酸的重迭区):
m696/a695 1000%相同性(在120个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2331>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2332;ORF 700>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2333>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2334;ORF 700>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性with menB
ORF 700与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 700.ng)有94.7%相同性(在300个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2335>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2336;ORF 700.a>:
m700/a700 97.0%相同性(在300个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2337>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2338;ORF 701>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2339>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2340;ORF 701>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌和menB的预计ORF的同源性
ORF 701与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 701.ng)有92.2%相同性(在128个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2341>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2342;ORF 701.a>:
m701/a701 92.2%相同性(在128个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2343>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2344;ORF 702>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2345>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2346;ORF 702>:
ORF 702与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 702.ng)有91.9%相同性(在124个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2347>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2348;ORF 702.a>:
m702/a702 100.0%相同性(在143个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2349>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2350;ORF 703>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2351>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2352;ORF 703>:
ORF 703与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 703.ng)有98.3%相同性(在288个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2353>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2354;ORF 703.a>:
m703/a703 100.0%相同性(在288个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2355>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2356;ORF 703>:
m704/a704 99.8%相同性(在823个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2357>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2358;ORF 705>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2359>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2360;ORF 705>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 705与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 705.ng)有95.0%相同性(在238个氨基酸的重迭区):
m705/g705 95.0%相同性(在238个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2361>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2362;ORF 705.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 705与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 705)有100.0%相同性(在238个氨基酸的重迭区):
a705/m705 100.0%相同性(在238个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2363>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2364;ORF 706.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2365>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2366;ORF 706>:
m706/g706 96.5%相同性(在375个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2367>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2368;ORF 706.a>:
a706/m706 99.5%相同性(在374个氨基酸的重迭区)
g707.seq未找到
g707.pep未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2369>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2370;ORF 707>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2371>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2372;ORF 707.a>:
a707/m707 95.3%相同性(在486个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2373>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2374;ORF 708.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2375>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2376;ORF 708>:
m708/g708 99.2%相同性(在253个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2377>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2378;ORF 708.a>:
a708/m708 98.0%相同性(在253个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2379>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2380;ORF 709.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2381>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2382;ORF 709>:
m709/g709 96.9%相同性(在459个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2383>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2384;ORF 709.a>:
a709/m709 91.1%相同性(在459个氨基酸的重迭区)
g710.seq未找到
g710.pep未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2385>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2386;ORF 710>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2387>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2388;ORF 710.a>:
a710/m710 85.7%相同性(在126个氨基酸的重迭区)
g711.seq未找到
g711.pep未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2389>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2390;ORF 711>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2391>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2392;ORF 711.a>:
a711/m711 99.8%相同性(在431个氨基酸的重迭区)
g712.seq还未找到
g712.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2393>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2394;ORF 712>:
a712.seq还未找到
a712.pep还未找到
g713.seq还未找到
g713.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2395>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2396;ORF 713>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2397>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2398;ORF 713.a>:
a713/m713 98.4%相同性(在381个氨基酸的重迭区)
g714.seq还未找到
g714.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2399>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2400;ORF 714>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2401>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2402;ORF 714.a>:
a714/m71498.9%相同性(在186个氨基酸的重迭区)
g715.seq还未找到
g715.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2403>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2404;ORF 715>:
:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2405>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2406;ORF 715.a>
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2407>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2408;ORF 716.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2409>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2410;ORF 716>:
m716/g716 86.6%相同性(在112个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2411>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2412.a>:
a716/m716 100.0%相同性(在102个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2413>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2414;ORF 717.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2415>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2416;ORF 717>:
m717/g717 96.4%相同性(在473个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2417>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2418;ORF 717.a>:
a717/m717 97.9%相同性(在473个氨基酸的重迭区)
g718.seq还未找到
g718.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2419>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2420;ORF 718>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2421>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2422;ORF 718.a>:
a718/m718 98.4%相同性(在380个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2423>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2424;ORF 718-1>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2425>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2426;ORF 718-1.a>:
a718/m718-1 99.0%相同性(在526个氨基酸的重迭区)
g719.seq还未找到
g719.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2427>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2428;ORF 719>:
a719.seq还未找到
a719.pep还未找到
g720.seq还未找到
g720.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2429>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2430;ORF 720>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2431>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2432;ORF 720.a>:
m720/a720 100.0%相同性(在169个氨基酸的重迭区)
g721.seq未找到
g721.pep未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2433>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2434;ORF 721>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2435>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2436;ORF 721.a>:
a721/m721 99.2%相同性(在353个氨基酸的重迭区)
g722.seq还未找到
g722.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2437>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2438;ORF 722>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2439>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2440;ORF 722.a>:
g723.seq还未找到
g723.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2441>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2442;ORF 723>:
a723.seq还未找到
a723.pep还未找到
g724.seq还未找到
g724.pep还未找到
下列部分DNA序列及其编码的氨基酸序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2443>:
可以切割的酶:无
不能切割的酶:BamHI BglII EcoRI HindIII KpnI NdeI NheI PstI SacI SalI SmaI SphIxbaI xhoI
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2444;ORF 724>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2445>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2446;ORF 724.a>:
a724/m724 100.0%相同性(在222个氨基酸的重迭区)
g725.seq还未找到
g725.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2447>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2448;ORF 725>:
a725.seq还未找到
a725.pep还未找到
g726.seq还未找到
g726.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2449>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2450;ORF 726>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2451>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2452;ORF 726.a>:
a726/m72695.5%相同性(在201个氨基酸的重迭区)
g727.seq还未找到
g727.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2453>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2454;ORF 727>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2455>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2456;ORF 727.a>:
a727/m727 83.2%相同性(在119个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2457>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2458;ORF 728>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2459>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2460;ORF 728>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 728与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 728.a)有96.3%相同性(在377个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2461>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2462;ORF 728.a>:
a728/m728 96.3%相同性(在377个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2463>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2464;ORF 729>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2465>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2466;ORF 729>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 729与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 729.a)有95.7%相同性(在467个氨基酸的重迭区):
m729/g729 95.7%相同性(在467个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2467>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2468;ORF 729.a>:
a729/m729 98.1%相同性(在467个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2469>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2470;ORF 730.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2471>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2472;ORF 730>:
g730/m730 93.0%相同性(在344个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2473>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2474;ORF 730.a>:
a730/m730 88.6%相同性(在376个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2475>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2476;ORF 731.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2477>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2478;ORF 731>:
g731/m731 95.2%相同性(在84个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2479>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2480;ORF 731.a>:
a731/m731 94.4%相同性(在126个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2481>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2482;ORF 732>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2483>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2484;ORF 732>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 732与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 732.a)有98.2%相同性(在491个氨基酸的重迭区):
m732/g732 98.2%相同性(在491个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2485>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2486;ORF 732.a>:
a732/m732 99.6%相同性(在494个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2487>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2488;ORF 733>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2489>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2490;ORF 733>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 733与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 733.a)有94.3%相同性(在123个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2491>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2492;ORF 733.a>:
a733/m733 100.0%相同性(在123个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2493>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2494;ORF 734.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2495>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2496;ORF 734>:
m734/g734 92.4%相同性(在92个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2497>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2498;ORF 734.a>:
a734/g734 95.6%相同性(在160个氨基酸的重迭区)
g735.seq还未找到
g735.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2499>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2500;ORF 735>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2501>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2502;ORF 735.a>:
a735/m735 95.7%相同性(在139个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2503>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2504;ORF 736>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2505>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2506;ORF 736>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 736与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 736.ng)有97.7%相同性(在258个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2507>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2508;ORF 736.a>:
a736/m736 100.0%相同性(在258个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2509>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2510;ORF 737>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2511>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2512;ORF 737>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 737与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 737.a)有95.4%相同性(在108个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2513>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2514;ORF 737.a>:
a737/m737 94.4%相同性(在108个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2515>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2516;ORF 738>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2517>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2518;ORF 738>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 738与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 738.a)有95.0%相同性(在604个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2519>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2520;ORF 738.a>:
a738/m738 98.3%相同性(在604个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2521>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2522;ORF 739>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2523>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2524;ORF 739>:
对氨基酸序列进行的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌menA和menB的预计ORF的同源性
ORF 739与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 739.a)有86.3%相同性(在197个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2525>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2526;ORF 739.a>:
a739/m739 93.9%相同性(在197个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2527>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2528;ORF 740.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2529>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2530;ORF 740>:
m740/g740 93.5%相同性(在92个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2531>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2532;ORF 740.a>:
a740/m740 97.8%相同性(在92个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2533>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2534;ORF 741.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2535>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2536;ORF 741>:
m741/g741 61.4%相同性(在280个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2537>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2538;ORF 741.a>:
a741/m741 95.6%相同性(在274个氨基酸的重迭区)
g742.seq还未找到
g742.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2539>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2540;ORF 742>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2541>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2542;ORF 742.a>:
a742/m742 98.5%相同性(在783个氨基酸的重迭区)
a742/p25184
sp|P25184|PUPA_PSEPU铁-假单胞菌素(FERRIC-PSEUDOBACTIN)358受体前体>gi|94923|pir||S15169铁-假单胞菌素受体前体-Pseudomonas putida>gi|45723(X56605)假单胞菌素摄入蛋白[Pseudomonas putida]长度=819
分值=152bits(381),预计值=6e-36
相同性=110/356(30%),相似性=170/356(46%),缺口=55/356(15%)
g743.seq还未找到
g743.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2543>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2544;ORF 743>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2545>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2546;ORF 743.a>:
a743/m743 98.9%相同性(在187个氨基酸的重迭区)
g744.seq还未找到
g744.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2547>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2548;ORF 744>:
g745.seq还未找到
g745.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2549>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2550;ORF 745>:
a745.seq还未找到
a745.pep还未找到
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2551>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2552;ORF 746.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2553>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2554;ORF 746>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 746与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 746)有89.9%相同性(在346个氨基酸的重迭区):
m746/g746 89.9%相同性(在346个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2555>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2556;ORF 746.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 746与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 746)有99.7%相同性(在332个氨基酸的重迭区):
a746/m746;99.7%相同性(在332个氨基酸的重迭区)
g747.seq还未找到
g747.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2557>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2558;ORF 747>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2559>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2560;ORF 747.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 747与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 747)有97.1%相同性(在102个氨基酸的重迭区):
a747/m747 97.1%相同性(在102个氨基酸的重迭区)
a747/m80195
gi|150271(M80195)外膜蛋白[脑膜炎奈瑟球菌]长度=272
分值=59.3bits(141),预计值=6e-09
相同性=29/99(29%),相似性=51/99(51%),缺口=4/99(4%)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2561>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2562;ORF 748.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2563>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2564;ORF 748>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 748与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 748.ng)有95.0%相同性(在421个氨基酸的重迭区):
m748/g748 95.0%相同性(在421个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2565>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2566;ORF 748.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 748与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 748)有99.0%相同性(在421个氨基酸的重迭区):
a748/m748 99.0%相同性(在421个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2567>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2568;ORF 749.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2569>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2570;ORF 749>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 749与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 749.ng)有96.1%相同性(在388个氨基酸的重迭区):
m749/g749 96.1%相同性(在388个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2571>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2572;ORF 749.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 749与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 749)有99.7%相同性(在388个氨基酸的重迭区):
a749/m749 99.7%相同性(在388个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2573>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2574;ORF 750.ng>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 750与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 750)有93.8%相同性(在322个氨基酸的重迭区):
m750/g750 93.8%相同性(在322个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2577>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2578;ORF 750.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 750与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 750)有98.8%相同性(在321个氨基酸的重迭区):
a750/m750 98.8%相同性(在321个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2579>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2580;ORF 751>:
a751.seq还未找到
a751.pep还未找到
g752.seq还未找到
g752.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2581>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2582;ORF 752>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2583>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2584;ORF 752-1>:
a752.seq还未找到
a752.pep还未找到
g753.seq还未找到
g753.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2585>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2586;ORF 753>:
a753.seq还未找到
a753.pep还未找到
g754.seq还未找到
g754.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2587>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2588;ORF 754>:
a754.seq还未找到
a754.pep还未找到
g755.seq还未找到
g755.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2589>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2590;ORF 755>:
a755.seq还未找到
a755.pep还未找到
g756.seq还未找到
g756.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2591>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2592;ORF 756>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2593>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2594;ORF 756.a>:
m756/a756 99.5%相同性(在186个氨基酸的重迭区)
g757.seq还未找到
g757.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2595>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2596;ORF 757>:
a757.seq还未找到
a757.pep还未找到
g758.seq还未找到
g758.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2597>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2598;ORF 758>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2599>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2600;ORF 758.a>:
m758/a758 100.0%相同性(在167个氨基酸的重迭区)
g759.seq还未找到
g759.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2601>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2602;ORF 759>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2603>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2604;ORF 760.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2605>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2606;ORF 760>:
m760/g760 91.6%相同性(在154个氨基酸的重迭区)
g761.seq还未找到
g761.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2607>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2608;ORF 761>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2609>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2610;ORF 761.a>:
m761/a761 99.6%相同性(在703个氨基酸的重迭区)
g762.seq还未找到
g762.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2611>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2612;ORF 762>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2613>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2614;ORF 762.a>:
m762/a762 100.0%相同性(在147个氨基酸的重迭区)
g763.seq还未找到
g763.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2615>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2616;ORF 763>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2617>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2618;ORF 763.a>:
m763/a763 99.8%相同性(在467个氨基酸的重迭区)
g764.seq还未找到
g764.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2619>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2620;ORF 764>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2621>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2622;ORF 764.a>:
m764/a764 99.3%相同性(在435个氨基酸的重迭区)
g765.seq还未找到
g765.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2623>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2624;ORF 765>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2625>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2626;ORF 765.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 765与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 765)有96.18%相同性(在309个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2627>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2628;ORF 767.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2629>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2630;ORF 767>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 767与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 767)有95.8%相同性(在214个氨基酸的重迭区):
m767/g767 95.8%相同性(在214个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2631>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2632;ORF 767.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 767与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 767)有96.7%相同性(在214个氨基酸的重迭区):
m767/a767 96.7%相同性(在214个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2633>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2634;ORF 768.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2635>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2636;ORF 768>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 768与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 768)有96.6%相同性(在119个氨基酸的重迭区):
m768/g768 96.6%相同性(在119个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2637>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2638;ORF 768.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 768与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 768)有99.2%相同性(在119个氨基酸的重迭区):
m768/a768 99.2%相同性(在119个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2639>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2640;ORF 769.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2641>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2642;ORF 769>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 769与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 769)有95.1%相同性(在492个氨基酸的重迭区):
m769/g769 95.1%相同性(在492个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2643>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2644;ORF 769.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 769与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 769)有99.8%相同性(在490个氨基酸的重迭区):
m769/a769 99.8%相同性(在490个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2645>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2646;ORF 770.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2647>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2648;ORF 770>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 770与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 770)有93.5%相同性(在186个氨基酸的重迭区):
m770/g770 93.5%相同性(在186个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2649>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2650;ORF 770.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 770与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 770)有99.5%相同性(在186个氨基酸的重迭区):
m770/a770 99.5%相同性(在186个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2651>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2652;ORF 771.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2653>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2654;ORF 771>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 771与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 771)有90.3%相同性(在704个氨基酸的重迭区):
m771/g771 90.3%相同性(在704个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2655>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2656;ORF 771.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 771与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 771)有98.9%相同性(在704个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2657>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2658;ORF 772.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2659>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2660;ORF 772>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 772与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 772)有85.2%相同性(在298个氨基酸的重迭区):
m772/g772 85.2%相同性(在298个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2661>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2662;ORF 772.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 772与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 772)有95.6%相同性(在298个氨基酸的重迭区):
m772/a772 95.6%相同性(在298个氨基酸的重迭区)
g773.seq还未找到
g773.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2663>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2664;ORF 773>:
a773.seq还未找到
a773.pep还未找到
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2665>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2666;ORF 774.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2667>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2668;ORF 774>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 774与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 774)有92.8%相同性(在237个氨基酸的重迭区):
m774/g774 92.8%相同性(在237个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2669>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2670;ORF 774.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 774与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 774)有89.5%相同性(在238个氨基酸的重迭区):
m774/a774 89.5%相同性(在238个氨基酸的重迭区)
g790.seq还未找到
g790.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2671>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2672;ORF 790>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2673>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2674;ORF 790.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 790与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 790)有98.2%相同性(在342个氨基酸的重迭区):
a790/m790 98.2%相同性(在342个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2675>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2676;ORF 791.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2677>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2678;ORF 791>:
g791/m791 97.3%相同性(在805个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2679>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2680;ORF 791.a>:
a791/m791 99.9%相同性(在805个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2681>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2682;ORF 792.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2683>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2684;ORF 792>:
g792/m792 90.4%相同性(在230个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2685>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2686;ORF 792.a>:
m792/a792 99.6%相同性(在233个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2687>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2688;ORF 793.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2689>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2690;ORF 793>:
g793/m793 98.5%相同性(在582个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2691>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2692;ORF 793.a>:
a793/m793 100.0%相同性(在581个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2693>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2694;ORF 794.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2695>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2696;ORF 794>:
g794/m794 95.5%相同性(在515个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2697>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2698;ORF 794.a>:
a794/m794 98.6%相同性(在515个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2699>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2700;ORF 900.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2701>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2702;ORF 900>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 900与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 900.ng)有87.0%相同性(在386个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2703>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2704;ORF 900.a>:
m900/a900 88.4%相同性(在378个氨基酸的重迭区)
g901.seq还未找到
g901.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2705>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2706;ORF 901>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2707>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2708;ORF 901.a>:
m901/a901 98.9%相同性(在269个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2709>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2710;ORF 902.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2711>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2712;ORF 902>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 902与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 902.ng)有80.9%相同性(在345个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2713>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2714;ORF 902.a>:
m902/a902 94.7%相同性(在360个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2715>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2716;ORF 903.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2717>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2718;ORF 903>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 903与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 903.ng)有48.9%相同性(在519个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2719>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2720;ORF 903.a>:
m903/a903 98.4%相同性(在547个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2721>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2722;ORF 904.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2723>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2724;ORF 904>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 904与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 904.ng)有90.4%相同性(在436个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2725>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2726;ORF 904.a>:
m904/a904 91.3%相同性(在436个氨基酸的重迭区)
g 906.seq还未找到
g906.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2727>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2728;ORF 906>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2729>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2730;ORF 907.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2731>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2732;ORF 907>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 907与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 907.ng)有92.9%相同性(在126个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2733>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2734;ORF 907.a>:
mg07/a907 97.6%相同性(在207个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2735>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2736;ORF 908.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2737>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2738;ORF 908>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 908与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 908.ng)有93.4%相同性(在166个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2739>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2740;ORF 908.a>:
m908/a908 98.2%相同性(在166个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2741>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2742;ORF 909.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2743>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2744;ORF 909>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 909与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 909.ng)有53.3%相同性(在90个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2745>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2746;ORF 909.a>:
m909/a909 96.7%相同性(在90个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2747>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2748;ORF 910.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2749>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2750;ORF 910>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 910与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 910.ng)有96.8%相同性(在94个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2751>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2752;ORF 910.a>:
m910/a910 95.7%相同性(在94个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2753>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2754;ORF 911.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2755>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2756;ORF 911>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 911与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 911.ng)有99.4%相同性(在164个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2757>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2758;ORF 911.a>:
m911/a911 100.0%相同性(在164个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2759>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2760;ORF 912.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2761>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2762;ORF 912>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 912与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 912.ng)有91.8%相同性(在196个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2763>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2764;ORF 912.a>:
m912/a912 98.0%相同性(在196个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2765>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2766;ORF 913.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2767>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2768;ORF 913>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 913与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 913.ng)有94.9%相同性(在277个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2769>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2770;ORF 913.a>:
m913/a913 100.0%相同性(在275个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2771>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2772;ORF 914.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2773>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2774;ORF 914>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 914与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 914.ng)有96.7%相同性(在244个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2775>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2776;ORF 914.a>:
m914/a914 98.4%相同性(在244个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2777>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2778;ORF 915.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2779>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2780;ORF 915>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 915与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 915.ng)有97.0%相同性(在164个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2781>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2782;ORF 915.a>:
m915/a915 99.4%相同性(在164个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2783>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2784;ORF 917.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2785>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2786;ORF 917>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 917与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 917.ng)有97.6%相同性(在376个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2787>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2788;ORF 917.a>:
m917/a917 99.7%相同性(在376个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2789>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2790;ORF 919.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2791>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2792;ORF 919>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 919与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 919.ng)有95.9%相同性(在441个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2793>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2794;ORF 919.a>:
m919/a919 98.6%相同性(在441个氨基酸的重迭区)
ORF 919的表达
使用实施例1中所述的用于ORF 919的引物来定位和克隆ORF 919。该序列被纯化并在大肠杆菌中表达,如图1#所示。ORF 919的疏水性图、抗原指数、和两亲区域在图5#中提供。使用AMPHI程序来预测推定的T细胞表位(Gao et al 1989,J.Immunol 143:3007;Roberts et al.1996,AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyi et al.1992,Scand J ImmunolSuppl 11:9)。ORF 919的核酸序列在展示(Exhibit)C#中提供。
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2795>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2796;ORF 920.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2797>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2798;ORF 920>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 920与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 920.ng)有91.3%相同性(在207个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2799>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2800;ORF 920.a>:
m920/a920 97.0%相同性(在267个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2801>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2802;ORF 920-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2803>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2804;ORF 920-1>:
m920-1/g920-1 96.3%相同性(在268个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2805>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2806;ORF 920-1.a>:
m920-1/a920 98.9%相同性(在267个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2807>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2808;ORF 921.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2809>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2810;ORF 921>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 921与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 921.ng)有95.7%相同性(在162个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2811>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2812;ORF 921.a>:
m921/a921 99.4%相同性(在162个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2813>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2814;ORF 922.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2815>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2816;ORF 922>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 922与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 922.ng)有95.9%相同性(在369个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2817>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2818;ORF 922.a>:
m922/a922 98.9%相同性(在369个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2819>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2820;ORF 923.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2821>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2822;ORF 923>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 923与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 923.ng)有68.8%相同性(在157个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2823>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2824;ORF 923.a>:
m923/a923 84.6%相同性(在175个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2825>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2826;ORF 925.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2827>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2828;ORF 925>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 925与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 925.ng)有94.0%相同性(在50个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2829>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2830;ORF 925-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2831>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2832;ORF 925-1>:
m925/g925 92.5%相同性(在173个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2833>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2834;ORF 925-1.a>:
a925-1/m925-1 92.7%相同性(在123个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2835>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2836;ORF 926.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2837>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2838;ORF 926>:
g926/m926 91.6%相同性(在155个氨基酸的重迭区)
m926/a926 96.9%相同性(在191个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2839>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2840;ORF 927.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2841>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2842;ORF 927>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 927与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 927.ng)有94.2%相同性(在243个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2843>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2844;ORF 927.a>:
m927/a927 99.2%相同性(在242个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2845>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2846;ORF 929.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2847>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2848;ORF 929>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 929与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 929.ng)有98.8%相同性(在487个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2849>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2850;ORF 929.a>:
m929/a929 99.6%相同性(在487个氨基酸的重迭区)
g930.seq还未找到
g930.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2851>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2852;ORF 930>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2853>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2854;ORF 930-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2855>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2856;ORF 930-1>:
m930-1/g930-1 95.4%相同性(在478个氨基酸的重迭区)
a930-1.seq还未找到
a930-1.pep还未找到
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2857>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2858;ORF 931.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2859>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2860;ORF 931>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 931与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 931.ng)有91.9%相同性(在185个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2861>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2862;ORF 931.a>:
m931/a93194.6%相同性(在185个氨基酸的重迭区)
g932.seq还未找到
g932.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2863>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2864;ORF 932>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 932与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 932.ng)有_%相同性(在_个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2865>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2866;ORF 934.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2867>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2868;ORF 934>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 934与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 934.ng)有91.7%相同性(在205个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2869>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2870;ORF 934.a>:
m934/a934 94.1%相同性(在205个氨基酸的重迭区)
g935.seq还未找到
g935.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2871>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2872;ORF 935>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2873>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2874;ORF 935.a>:
m935/a935 98.8%相同性(在505个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2875>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2876;ORF 936.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2877>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2878;ORF 936>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 936与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 936.ng)有93.8%相同性(在128个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2879>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2880;ORF 936.a>:
m936/a936 95.3%相同性(在128个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2881>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2882;ORF 936-1.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2883>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2884;ORF 936-1>:
m936-1/g936-1 95.5%相同性(在202个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2885>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2886;ORF 936-1.a>:
a936-1/m936-1 97.0%相同性(在202个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2887>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2888;ORF 937.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2889>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2890;ORF 937>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 937与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 937.ng)有86.9%相同性(在289个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2891>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2892;ORF 937.a>:
m937/a93795.2%相同性(在289个氨基酸的重迭区)
g939.seq还未找到
g939.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2893>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2894;ORF 939>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2895>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2896;ORF 939.a>:
m939/a939 100.0%相同性(在70个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2897>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2898;ORF 950.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2899>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2900;ORF 950>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 950与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 950.ng)有86.6%相同性(在112个氨基酸的重迭区):
m950/g950 86.6%相同性(在112个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2901>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2902;ORF 950.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 950与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 950)有100.0%相同性(在102个氨基酸的重迭区):
a950/m950 100.0%相同性(在102个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2903>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2904;ORF 951.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2905>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2906;ORF 791>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 951与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 951)有88.6%相同性(在616个氨基酸的重迭区):
m951/g951 88.6%相同性(在616个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2907>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2908;ORF 951.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 951与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 951)有96.4%相同性(在614个氨基酸的重迭区):
a951/m951 96.4%相同性(在614个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2909>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2910;ORF 952.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2911>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2912;ORF 952>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 952与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 952)有92.5%相同性(在201个氨基酸的重迭区):
g952/m952; 92.5%相同性(在201个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2913>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2914;ORF 952.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 952与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 952)有97.7%相同性(在218个氨基酸的重迭区):
a952/m952 97.7%相同性(在218个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2915>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2916;ORF 953.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2917>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2918;ORF 953>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 953与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 953)有93.0%相同性(在187个氨基酸的重迭区):
m953/g953 93.0%相同性(在187个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2919>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2920;ORF 953.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 953与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 953)有97.3%相同性(在187个氨基酸的重迭区):
a953/m953 97.3%相同性(在187个氨基酸的重迭区)
g954.seq还未找到
g954.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2921>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2922;ORF 954>:
a954.geq还未找到
a954.pep还未找到
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2923>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2924;ORF 957.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2925>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2926;ORF 957>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 957与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 957)有95.2%相同性(在331个氨基酸的重迭区):
g957/m957 95.2%相同性(在331个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2927>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2928;ORF 957.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 957与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 957)有96.3%相同性(在377个氨基酸的重迭区):
a957/m957 96.3%相同性(在377个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2929>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2930;ORF 958.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2931>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2932;ORF 958>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 958与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 958)有89.3%相同性(在802个氨基酸的重迭区):
m958/g958 89.3%相同性(在802个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2933>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2934;ORF 958.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 957与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 957)有96.3%相同性(在377个氨基酸的重迭区):
a958/m958 98.1%相同性(在802个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2935>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2936;ORF 959.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2937>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2938;ORF 959>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 959与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 959)有95.4%相同性(在108个氨基酸的重迭区):
m959/g959 95.4%相同性(在108个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2939>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2940;ORF 959.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 959与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 959)有94.4%相同性(在108个氨基酸的重迭区):
a959/m959 94.4%相同性(在108个氨基酸的重迭区)
g960.seq还未找到
g960.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2941>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2942;ORF 960>:
a960.seq还未找到
a960.pep还未找到
g961.seq还未找到
g961.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2943>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 940;ORF 2944>:
a961.seq还未找到
a961.pep还未找到
g972.seq还未找到
g972.pep还未找到
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2945>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2946;ORF 972>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2947>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2948;ORF 972.a>:
m972/a972 99.3%相同性(在422个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2949>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2950;ORF 973.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2951>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2952;ORF 973>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 973与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 973.ng)有95.6%相同性(在274个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2953>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2954;ORF 973.a>:
m973/a973 97.8%相同性(在274个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2955>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2956;ORF 981.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2957>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2958;ORF 981>:
m981/g981 98.1%相同性(在266个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2959>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2960;ORF 981.a>:
m981/a981 98.5%相同性(在266个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2961>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2962;ORF 982.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2963>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2964;ORF 982>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m982/g982 95.8%相同性(在544个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2965>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2966;ORF 982.a>:
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2967>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2968;ORF 986.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2969>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2970;ORF 986>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m986/g986 97.0%相同性(在499个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2971>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2972;ORF 986.a>:
m986/a986 98.2%相同性(在499个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2973>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2974;ORF 987.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2975>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2976;ORF 987>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m987/g987 97.8%相同性(在508个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2977>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 550;ORF 2978.a>:
m987/a987 98.8%相同性(在508个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2979>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2980;ORF 988.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2981>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2982;ORF 988>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
m988/g988 94.2%相同性(在642个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2983>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2984;ORF 988.a>:
m988/a988 97.0%相同性(在641个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2985>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2986;ORF 989.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2987>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2988;ORF 989>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
g989/m989 90.0%相同性(在468个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2989>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2990;ORF 989.a>:
m989/a989 93.1%相同性(在467个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2991>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2992;ORF 990>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2993>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2994;ORF 990.a>:
m990/a990 96.0%相同性(在619个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2995>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2996 ORF 992.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2997>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 2998;ORF 992>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 992与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 992)有96.1%相同性(在233个氨基酸的重迭区):
m992/g992 96.1%相同性(在233个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 2999>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3000;ORF 992.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 992与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 992)有100.0%相同性(在233个氨基酸的重迭区):
a992/m992 100.0%相同性(在233个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3001>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3002 ORF 993.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3003>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3004;ORF 993>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 993与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 993)有93.1%相同性(在248个氨基酸的重迭区):
m993/g993 93.1%相同性(在248个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3005>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3006;ORF 993.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 993与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 993)有97.6%相同性(在248个氨基酸的重迭区):
a993/m993 97.6%相同性(在248个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3007>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3008 ORF 996.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3009>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3010;ORF 996>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 996与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 996)有98.1%相同性(在207个氨基酸的重迭区):
m996/g996 98.1%相同性(在207个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3011>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3012;ORF 996.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 996与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 996)有100.0%相同性(在207个氨基酸的重迭区):
下列部分DNA序列是在淋病奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3013>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3014 ORF 997.ng>:
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3015>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3016;ORF 997>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与淋病奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 997与淋病奈瑟球菌的预计ORF(ORF 997.ng)有96.0%相同性(在351个氨基酸的重迭区):
g997/m997 96.0%相同性(在351个氨基酸的重迭区)
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3017>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3018;ORF 997.a>:
对该序列的计算机分析给出如下结果:
与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF的同源性
ORF 997与脑膜炎奈瑟球菌的预计ORF(ORF 997)有98.2%相同性(在437个氨基酸的重迭区):
g999.seq还未发现
g999.pep还未发现
下列部分DNA序列是在脑膜炎奈瑟球菌中鉴别出的<SEQ ID 3019>:
这对应于氨基酸序列<SEQ ID 3020;ORF 999>:
a999.seq还未发现
a999.pep还未发现
上述实施例用于说明本发明,而不是用于限制本发明。
附图的补充说明
图1中,预计的基因279被克隆在pGex载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白表达产物和纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对279-GST融合蛋白纯化的分析。用纯化的279-GST免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FASC(C图),杀菌试验(D图)和ELISA分析(E图)。结果显示279蛋白是一种暴露在表面的蛋白。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。
图2中,预计的基因576被克隆在pGex载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白表达产物和纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对576-GST融合蛋白纯化的分析。用纯化的576-GST免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FASC(C图),杀菌试验(D图)和ELISA分析(E图)。结果显示576蛋白是一种暴露在表面的蛋白。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。
图3中,预计的基因519被克隆在pET载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对519-His融合蛋白纯化的分析。用纯化的519-His免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FASC(C图),杀菌试验(D图)和ELISA分析(E图)。结果显示519蛋白是一种暴露在表面的蛋白。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。
图4中,预计的基因121被克隆在pET载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对121-His融合蛋白纯化的分析。用纯化的121-His免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FASC(C图),杀菌试验(D图)和ELISA分析(E图)。结果显示121是一种暴露在表面的蛋白。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。
图5中,预计的基因128被克隆在pET载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对128-His融合蛋白纯化的分析。用纯化的128-His免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FASC(C图),杀菌试验(D图)和ELISA分析(E图)。结果显示128是一种暴露在表面的蛋白。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。
图6中,预计的基因206被克隆在pET载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白表达产物和纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对206-His纯化的分析。用纯化的206-His免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图)。值得注意的是,在脑膜炎球菌的蛋白质提取物中的免疫反应性条带是38kDa而不是17kDa(图A)。为了获得与该抗体染色性质有关的信息,我们在大肠杆菌中以没有His-标志但包含预计的前导肽的形式表达ORF 206对表达这种天然形式206蛋白的大肠杆菌总蛋白提取物的Western印迹分析表明,在38kDa处有一反应性条带,这与脑膜炎球菌中所观察的一样。我们得出结论,在图B)中的38kDa条带是特异性的,而且抗-206抗体可能识别多聚体的蛋白复合体。在图C中显示了FACS分析,在图D中显示了杀菌试验,并在图E中显示了ELISA分析。结果显示296是一种暴露在表面的蛋白。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。
图7中,预计的基因287被克隆在pGex载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对287-GST融合蛋白纯化的分析。用纯化的287-GST免疫小鼠,并用血清进行FASC(B图),杀菌试验(C图)和ELISA分析(D图)。结果显示287是一种暴露在表面的蛋白。符号:M1,分子量标记物;箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)。
图8中,预计的基因406被克隆在pET载体中并在大肠杆菌中表达。蛋白纯化产物用SDS-PAGE分析。在A)图中,显示了对406-His融合蛋白纯化的分析。用纯化的406-His免疫小鼠,并用血清进行Western印迹分析(B图),FASC(C图),杀菌试验(D图)和ELISA分析(E图)。结果显示406是一种暴露在表面的蛋白。符号:M1,分子量标记物;TP,脑膜炎奈瑟球菌总蛋白提取物;OMV,脑膜炎奈瑟球菌外膜小泡(vesicle)制备物。箭头指出了主要的重组蛋白产物的位置(A)和脑膜炎奈瑟球菌的免疫原反应性条带(B)。
Claims (8)
1.一种蛋白质,其特征在于,它是SEQ ID NO:2534、2536和2538中任一项所述的氨基酸序列。
2.一种抗体,其特征在于,它结合于权利要求1所述的蛋白质。
3.如权利要求2所述的抗体,其特征在于,所述抗体是单克隆抗体。
4.一种核酸,其特征在于,它编码权利要求1所述的蛋白质。
5.如权利要求4所述的核酸,其特征在于,所述核酸是SEQ ID NO:2533、2535和2537中任一项所述的核苷酸序列。
6.一种核酸,其特征在于,它是与权利要求4或5所述的核酸序列互补的核苷酸序列。
7.一种组合物,其特征在于,它包含权利要求1所述的蛋白质、权利要求4-6中任一项所述的核酸、或者权利要求2或3所述的抗体。
8.如权利要求7所述的组合物,其特征在于,它是疫苗组合物或诊断组合物。
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