JP2004500801A - 髄膜炎菌抗原および組成物 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、以下の米国特許仮出願の一部継続中のものであり、それぞれ優先権が主張され、そしてその全体において参考として援用される:60/083,758(1998年5月1日出願);60/094,869(1998年7月31日出願);60/098,994(1998年9月2日出願);60/099,062(1998年9月2日出願);60/103,749(1998年10月9日出願);60/103,794(1998年10月9日出願);60/103,796(1998年10月9日出願);および60/121,528(1999年2月25日出願)。
【0002】
本発明は細菌種:Neisseria meningitidisおよびNeisseria gonorrhoeae由来の抗原に関する。
【0003】
(背景)
Neisseria meningitidisは、非運動性のグラム陰性双球菌ヒト病原体である。これは、咽頭にコロニー形成をし、髄膜炎(および、時折、髄膜炎のない敗血症)を引き起こす。これは、N.gonorrhoeaに密接に関連しているが、髄膜炎菌が淋病菌と明らかに異なる1つの特徴は、全ての病原性髄膜炎菌に存在する多糖類性被膜の存在である。
【0004】
N.meningitidisは、風土病および伝染病をともに引き起こす。米国において、発病率は1年間に100,000人中0.6〜1人の割合であり、そして大発生によりずっと大きくなり得る(Liebermanら(1996)Safety and Immunogenicity of a Serogroups A/C Neisseria meningitidis Oligosaccharide−Protein Conjugate Vaccine in Young Children.JAMA 275(19):1499−1503;Schuchatら(1997)Bacterial Meningitis in the United States in 1995,N Engl J Med 377(14):970−976)。発展途上国では、風土病の割合は、よりずっと大きくそして伝染病発生率は1年間あたり100,000人あたり500件に達し得る。死亡率は極めて高く、米国では10〜20%、そして発展途上国においてはよりずっと高い。Haemophilus influenzaeに対する共役ワクチンの導入の結果、N.meningitidisは、米国において全ての年齢における細菌性髄膜炎の主な原因である(Schuchat(1997)前出)。
【0005】
生物の被膜多糖類に基づいて、N.meningitidisの12血清群が同定されている。A群はサハラアフリカ周縁での伝染病において最も頻繁に関与している病原体である。血清型B群および血清型C群は、米国および大部分の先進国における症例の大部分の原因である。血清型W135およびYは、米国および先進国における症例の残りの原因である。現在使用される髄膜炎ワクチンは、血清型A、C、Y、およびW135で構成される4価の多糖類ワクチンである。これは、青年および成人には効果があるが、弱い免疫応答および短い保護持続期間を誘導し、そして乳児には使用され得ない(例えば、Morbidity and Mortality weekly report,46巻,No.PR−5(1997))。これは、多糖類が、繰り返し免疫処置により増強され得ない弱い免疫応答を誘導するT細胞独立性抗原であるからである。H.influenzaに対するワクチン接種の成功に続き、血清型Aおよび血清型Cに対する共役ワクチンが開発されており、そして臨床試験の最終段階である(Zollinger WD「New and Improved Vaccines Against Meningococcal Disease」New Generation Vaccines,上記,469−488頁;Liebermanら(1996)上記;Costantinoら(1992)Development and phease I clinical testing of a conjugate vaccine against meningococus AおよびC.Vaccine 10:691−698)。
【0006】
しかし、髄膜炎菌B(menB)は問題を残したままである。この血清型は現在、米国、欧州、および南アメリカにおける全髄膜炎のおおよそ50%の原因である。この多糖類アプローチは使用され得ない。なぜならばmenB被膜多糖類は、哺乳動物組織にもまた存在するα(2−8)−連結N−アセチルノイラミン酸のポリマーであるからである。これは抗原に対する寛容性を生ずる;実際、免疫応答が惹起された場合、それは抗−自己であり、それ故、所望されない。自己免疫の誘導を回避しそして保護的免疫応答を誘導するために、この被膜性多糖類は、例えば、N−アセチル基をN−プロピオニル基と置換して化学的に改変されるが、特異的抗原性は不変のままである(RomeroおよびOutschoorn(1994)Current Status of Meningococcal group B vaccine candidates:capsular or non−capsular? Clin Microbiol Rev 7(4):559−575)。
【0007】
menBワクチンに対する代替のアプローチは、外膜タンパク質(OMP)の複合体混合物(OMPのみを含むかまたはポーリンに富むOMPのいずれかを含む)を使用するか、または細菌活性をブロックする抗体を誘導すると考えられるクラス4OMPを欠失した。このアプローチは、十分に特徴付けられていないワクチンを産生する。それらワクチンは、相同な菌株に対して保護し得えるが、外膜タンパク質の多くの抗原性改変体が多く存在する場合、全体として効果がない。抗原変異性を克服するために、9つまでの異なるポーリンを含む多価ワクチンが構築されている(例えば、Poolman JT(1992)Development of a meningococcal vaccine.Infect.Agents Dis.4:13−28)。外膜ワクチンで使用されるさらなるタンパク質は、opaおよびopcタンパク質であるが、これらのアプローチは抗原変異性を克服し得ない(例えば、Ala’AldeenおよびBorriello(1996)The meningococcal tranferrin−binding proteins 1 and 2 are both surface exposed and generate bactericidal antibodies capable of killing homologous and heterologous strains.Vaccine 14(1):49−53)。
【0008】
特定の量の配列データは、髄膜炎菌および淋病菌の遺伝子およびタンパク質(例えば、EP−A−0467714,WO96/29412)について利用可能であるが、これは決して完全ではない。他のmenBタンパク質としては、WO97/28273、WO96/29412、WO95/03413、US5,439,808、およびUS5,879,686に列挙されるものが挙げられ得る。
【0009】
さらなる配列の供給は、免疫系に対する標的と推測され、そして抗原的に変異し得ることのない分泌タンパク質または表面露出タンパク質を同定するための機会を提供し得た。例えば、同定されたタンパク質のいくつかは、髄膜炎菌Bに対して効果のあるワクチンの成分であり、いくつかは全ての髄膜炎菌血清型に対するワクチンの成分であり、そして他は全ての病原性Neisseriae(Neisseria meningitidisまたはNesseria gonorrhoeaeを含む)に対するワクチンの成分であり得た。より高度に保存されるN.meningitidisまたはN.gonorrhoeaeに特異的なsoれらの配列は、さらに好ましい配列である。
【0010】
従って、本発明の目的は、抗原性または免疫原性のタンパク質をコードするナイセリアDNA配列を提供することである。
(本発明)
本発明は、本実施例で開示されたN.meningitidisアミノ酸配列およびN.gonorrhoeaeアミノ酸配列を含むタンパク質を提供する。
【0011】
これはまた、本実施例で開示されるN.meningitidisアミノ酸配列と相同な(すなわち、配列同一性を有する)配列を含むタンパク質を提供する。この特定の配列に依存して、相同性の程度(配列同一性)は、好ましくは50%よりも大きい(例えば、60%、70%、80%、90%、95%、99%以上)。これらのタンパク質は、本実施例で開示される配列の変異体および対立遺伝子改変体を含む。代表的には、2つのタンパク質の間の50%以上の同一性は、機能的に等価であることの表示であると考えられる。タンパク質間の同一性は、好ましくは、パラメーター(gap penalty 12,gap extention penalty 1)でのaffine gap検索を使用して、MPSRCHプログラム(Oxford Molecular)において実行されるようなSmith−Waterman相同性検索アルゴリズムによって決定される。
【0012】
本発明はさらに、本実施例で開示されるN.meningitidisアミノ酸配列およびN.gonorrhoeaeアミノ酸配列のフラグメントを含むタンパク質を提供する。このフラグメントは、その配列由来の少なくともn個の連続したアミノ酸を含むべきであり、そしてその特定の配列に依存して、nは7以上(例えば8、10、12、14、16、18、20以上)である。好ましくはこのフラグメントは、その配列に由来するエピトープを含む。
【0013】
本発明のタンパク質は、もちろん、種々の手段(例えば、組換え発現、細胞培養物からの精製、化学合成など)によって、および種々の型で(例えば、天然型、融合型など)調製され得る。これらは、好ましくは実質的に純粋または単離された型で調製される(すなわち、他のN.meningitidisまたはN.gonorrhoeae宿主細胞タンパク質を実質的に含まない)。
【0014】
さらなる局面に従って、本発明は、これらのタンパク質に結合する抗体を提供する。これらは、ポリクローナルまたはモノクローナルであり得、そして任意の適切な手段により産生され得る。
【0015】
さらなる局面に従って、本発明は、本実施例で開示されるN.meningitidisヌクレオチド配列およびN.gonorrhoeaeヌクレオチド配列を含む核酸を提供する。
【0016】
さらなる局面に従って、本発明は、本明細書中の核酸配列に対して50%より高い(例えば、60%、70%、80%、90%、95%、99%またはそれ以上)配列同一性を有する核酸を含む。配列同一性は、上記に議論されるように決定される。
【0017】
さらなる局面に従って、本発明は、本明細書中に提供される配列にハイブリダイズする核酸を含む。ハイブリダイゼーションの条件は、本明細書中に示される。
【0018】
これらの配列のフラグメントを含む核酸もまた、提供される。これらは、N.meningitidis配列またはN.gonorrhoeae配列由来の少なくともn個の連続するヌクレオチドを含有すべきであり、そして特定の配列に依存して、nは10またはそれ以上(例えば、12、14、15、18、20、25、30、35、40またはそれ以上)である。
【0019】
さらなる局面に従って、本発明は、本発明のタンパク質およびタンパク質フラグメントをコードする核酸を提供する。
【0020】
本発明が上記に記載される配列と相補的な配列を含む核酸を提供することもまた、認識されるべきである(例えば、アンチセンスの目的またはプロービングの目的のために)。
【0021】
本発明に従う核酸は、もちろん、多くの様式(例えば、化学合成により、部分的または全体的に、ゲノムライブラリーまたはcDNAライブラリーから、生物自体からなど)で調製され得、そして種々の型(例えば、一本鎖、二本鎖、ベクター、プローブなど)をとり得る。
【0022】
さらに、用語「核酸」は、DNAおよびRNA、および、それらのアナログ(例えば、改変された骨格を含むDNAおよびRNA)もまた、そしてタンパク質核酸(PNA)などもまた含む。
【0023】
さらなる局面に従って、本発明は、本発明のヌクレオチド配列を含むベクター(例えば、発現ベクター)およびそのようなベクターで形質転換された宿主細胞を提供する。
【0024】
さらなる局面に従って、本発明は、本発明に従うタンパク質、抗体および/または核酸を含む組成物を提供する。これらの組成物は、例えば、ワクチンとして、または診断用試薬として、または免疫原性組成物として適切であり得る。
【0025】
本発明はまた、医薬品として(例えば、ワクチンとして)または診断用試薬として使用するための、本発明に従う核酸、タンパク質、または抗体を提供する。また、以下の製造における、本発明に従う核酸、タンパク質、または抗体の使用を提供する:(i)ナイセリア細菌に起因する感染の処置または予防のための医薬品;(ii)ナイセリア細菌またはナイセリア細菌に対して惹起された抗体の存在を検出するための診断用試薬;あるいは(iii)抗体を惹起し得る試薬。上記のナイセリア細菌は任意の種または株(例えば、N.gonorrhoeae)であり得るが、好ましくは、N.meningitidis(特に、B株またはC株)である。
【0026】
本発明はまた、治療的有効量の、本発明に従う核酸、タンパク質、および/または抗体を患者に投与する工程を包含する、患者の処置の方法を提供する。
【0027】
さらなる局面に従って、本発明は、種々のプロセスを提供する。
【0028】
本発明のタンパク質または核酸を産生するためのプロセスであって、ここでそのタンパク質または核酸は、化学的手段を使用して、一部または全体が合成されるプロセスが提供される。
【0029】
本発明のポリヌクレオチドを検出するためのプロセスであって、(a)本発明に従う核プローブを、二重鎖を形成するハイブリダイズの条件下で生物学的サンプルと接触させる工程;および(b)上記の二重鎖を検出する工程を包含する、プロセスが提供される。
【0030】
本発明のタンパク質を検出するためのプロセスであって、(a)本発明に従う抗体を、抗体−抗原複合体の形成に適した条件下で生物学的サンプルと接触させる工程;および(b)上記の複合体を検出する工程を包含する、プロセスが提供される。
【0031】
ここで、本発明を一般的に記載してきたが、同じことが、例示目的で提供され、そして明記しない限り、本発明を限定することを意図されない、以下の実施例を参照することによって、より容易に理解され得る。
【0032】
(方法論−標準的な手段および技術の要約)
(一般)
本発明は、Neisseria meningitidis menBヌクレオチド配列、そこにコードされるアミノ酸配列を提供する。これらの開示される配列を用いて、核酸プローブアッセイ、ならびに発現カセットおよび発現ベクターが産生され得る。発現ベクターは、タンパク質を産生するために宿主細胞内に形質転換され得る。精製された、または単離されたポリペプチド(これもまた、化学的に合成され得る)は、menBタンパク質を検出するための抗体を産生するために使用され得る。また、宿主細胞または抽出物は、アゴニストまたはアンタゴニストを単離するための生物学的アッセイに利用され得る。さらに、これらの配列を用いて、オープンリーディングフレームを同定して、そしてアミノ酸配列を同定するために検索し得る。タンパク質はまた、免疫原性組成物、抗原性組成物中で、およびワクチン成分として利用され得る。
【0033】
本発明の実施は、他に示されなければ、分子生物学、微生物学、組換えDNA、および免疫学の慣習的な技術を使用し、これらは当該分野の技術の範囲内である。このような技術は以下の文献で十分説明されている(例えば、Sambrook Molecular Cloning:A Laboratory Manual 第2版(1989);DNA Cloning,第I巻および第II巻(D.N Glover編 1985);Oligonucleotide Synthesis(M.J.Gait編 1984);Nucleic Acid Hybridization(B.D.HamesおよびS.J.Higgins編 1984);Transcription and Translation(B.D.HamesおよびS.J.Higgins編 1984);Animal Cell Culture(R.I.Freshney編 1986);Immobilized Cells and Enzymes(IRL Press,1986);B.Perbal,A Practical Guide to Molecular Cloning(1984);the Methods in Enzymologyシリーズ(Academic Press,Inc.),特に154巻および155巻;Gene Transfer Vector for Mammalian Cells(J.H.MillerおよびM.P.Calos編1987,Cold Spring Harbor Laboratory);MayerおよびWalker,編(1987),Immunochemical Methods in Cell and Molecular Biology(Academic Press,London);Scopes,(1987)Protein Purification:Principles and Practice,第2版(Springer−Verlag,N.Y.)、およびHandbook of Experimental Immunology,第I巻−第IV巻(D.M.WeirおよびC.C.Blackwell編 1986)。
【0034】
ヌクレオチドおよびアミノ酸についての標準的な略語が、本明細書において使用される。
【0035】
本明細書中で引用される全ての刊行物、特許、および特許出願は参考としてその全体が援用される。
【0036】
(発現系)
Neisseria menBヌクレオチド配列は、種々の異なる発現系;例えば、哺乳動物細胞、植物細胞、バキュロウイルス、細菌、および酵母と共に使用される発現系において発現され得る。
【0037】
(i.哺乳動物系)
哺乳動物発現系は当該分野において公知である。哺乳動物プロモーターは、哺乳動物RNAポリメラーゼを結合し、コード配列(例えば、構造遺伝子)のmRNAへの下流(3’)転写を開始し得る任意のDNA配列である。プロモーターは、転写開始領域(これはコード配列の5’末端の近位に通常位置する)およびTATAボックス(転写開始部位の25〜30塩基対(bp)上流に通常位置する)を有する。TATAボックスは、その正しい部位においてRNAポリメラーゼIIにRNA合成を開始させるよう指示すると考えられている。哺乳動物プロモーターはまた、TATAボックスの100〜200bp上流以内に通常位置する上流プロモーターエレメントを含む。上流プロモーターエレメントは、転写が開始され、そしていずれかの方向において作用し得る速度を決定する(Sambrookら(1989)「Expression of Cloned Genes in Mammalian Cells」 Molecular Cloning:A Laboratory Manual、第2版)。
【0038】
哺乳動物ウイルス遺伝子は、しばしば高度に発現され、そして広い宿主範囲を有する;従って、哺乳動物ウイルス遺伝子をコードする配列は、特に有用なプロモーター配列を提供する。例は、SV40初期プロモーター、マウス乳腺癌ウイルスLTRプロモーター、アデノウイルス主要後期プロモーター(Ad MLP)、および単純疱疹ウイルスプロモーターを含む。さらに、マウスのメタロチオネイン遺伝子のような非ウイルス性遺伝子に由来する配列もまた、有用なプロモーター配列を提供する。発現は、構成性であるかまたは調節される(誘導可能)かのいずれかであり得る。選択されるプロモーターに依存して、多くのプロモーターは、公知の基質を使用して誘導可能であり得る(例えば、マウス乳腺癌ウイルス(MMTV)プロモーターのグルココルチコイド応答性エレメント(GRE)との使用(このプロモーターは、ホルモン応答性形質転換細胞においてグルココルチコイドにより誘導される))。例えば、米国特許第5,783,681号を参照のこと。
【0039】
上記に記載されるプロモーターエレメントと組み合わされるエンハンサーエレメント(エンハンサー)の存在は、通常発現レベルを増大させる。エンハンサーは、同種プロモーターまたは異種プロモーターに連結される場合、転写を1000倍まで刺激し得る調節DNA配列であり、合成は、通常のRNA開始部位で開始する。エンハンサーはまた、それらが、通常方向もしくは逆の(flipped)方向のいずれかで転写開始部位より上流または下流に、もしくはプロモーターから1000ヌクレオチドを超える距離で位置される場合、活性である(Maniatisら(1987) Science 236:1237;Albertsら(1989)Molecular Biology of the Cell,第2版)。ウイルス由来のエンハンサーエレメントは、それらは通常、より広い宿主範囲を有するため、特に有用であり得る。例は、SV40初期遺伝子エンハンサー(Dijkemaら(1985)EMBO J.4:761)およびラウス肉腫ウイルスの長末端反復(LTR)に由来するエンハンサー/プロモーター(Gormanら(1982b)Proc.Natl.Acad.Sci.79:6777)およびヒトサイトメガウイルスに由来するエンハンサー/プロモーター(Boshartら(1985)Cell 41:521)を包含する。さらに、いくつかのエンハンサーは調節可能であり、そしてホルモンまたは金属イオンのような誘導因子の存在下のみで活性になる(Sassone−CorsiおよびBorelli(1986)Trends Genet.2:215;Maniatisら(1987)Science 236:1237)。
【0040】
DNA分子は、哺乳動物細胞において細胞内で発現され得る。プロモーター配列は、組換えタンパク質のN末端における最初のアミノ酸が常にATG開始コドンによりコードされるメチオニンである場合、DNA分子と直接連結され得る。所望される場合、N末端は、臭化シアンとのインビトロでのインキュベーションによりタンパク質から切断され得る。
【0041】
あるいは、外来タンパク質もまた、哺乳動物細胞において外来タンパク質の分泌を提供するリーダー配列フラグメントで構成される融合タンパク質をコードするキメラDNA分子を作製することにより、細胞から増殖培地へ分泌され得る。好ましくは、インビボまたはインビトロのいずれかにおいて切断され得る、リーダーフラグメントおよび外来遺伝子との間にコードされるプロセシング部位が存在する。リーダー配列フラグメントは通常、細胞からのタンパク質の分泌を指示する疎水性アミノ酸で構成される単一のペプチドをコードする。アデノウイルス3分割(tripartite)リーダーは、哺乳動物細胞における外来タンパク質の分泌を提供するリーダー配列の例である。
【0042】
通常、哺乳動物細胞によって認識される転写終結配列およびポリアデニル化配列は、翻訳終止コドンの3’側に位置する調節領域であり、従って、プロモーターエレメントと共に、コード配列に隣接する。成熟mRNAの3’末端は、部位特異的転写後切断およびポリアデニル化により形成される(Birnstielら.(1985)Cell 41:349;ProudfootおよびWhitelaw(1988)「Termination and 3’end processing of eukaryotic RNA.」Transcription and splicing(B.D.HamesおよびD.M.Glover編);Proudfoot(1989)Trends Biochem.Sci.14:105)。これらの配列は、mRNAの転写を方向づけ、そのmRNAは、そのDNAにコードされるポリペプチドに翻訳され得る。転写ターミネーター/ポリアデニル化シグナルの例としては、SV40由来のシグナルが挙げられる(Sambrookら(1989)「Expression of cloned genes in cultured mammalian cells.」Molecular Cloning:A Laboratory Manual)。
【0043】
通常、プロモーター、ポリアデニル化シグナル、および転写終結配列を含む上記の構成要素は、発現構築物内に共に導入される。エンハンサー、機能的なスプライスドナー部位およびアクセプター部位を有するイントロン、ならびにリーダー配列もまた、所望される場合、発現構築物内に含まれ得る。発現構築物はしばしば、哺乳動物細胞または細菌のような宿主内で安定的に維持し得る染色体外エレメント(例えば、プラスミド)のような、レプリコン内で維持される。哺乳動物複製系としては、複製にトランス作用性の因子を必要とする、動物ウイルス由来の複製系が挙げられる。例えば、SV40(Gluzmam(1981)Cell 23:175)、あるいはポリオーマウイルスのようなパポバウイルスの複製系を含むプラスミドは、適切なウイルスのT抗原の存在下で極めて高いコピー数で複製する。哺乳動物レプリコンのさらなる例としては、ウシパピローマウイルスおよびエプスタイン−バーウイルス由来のレプリコンが挙げられる。さらに、このレプリコンは、二つの複製系を有し得、従って、例えば、発現用の哺乳動物細胞内で、ならびにクローニングおよび増幅用の原核生物の宿主内で、そのレプリコンは維持することが可能である。このような哺乳類−細菌シャトルベクターの例としては、pMT2(Kaufmanら、(1989)Mol.Cell.Biol.9:946)およびpHEBO(Shimizuら、(1986)Mol.Cell.Biol.6:1074)が挙げられる。
【0044】
使用される形質転換の手順は、形質転換される宿主に依存する。異種のポリヌクレオチドの哺乳動物細胞への導入方法は、当該分野で公知であり、その方法としては、デキストラン媒介トランスフェクション、リン酸カルシウム沈殿、ポリブレン媒介トランスフェクション、プロトプラスト融合、エレクトロポレーション、リポソーム内でのポリヌクレオチドの封入、およびDNAの核内への直接微量注入が挙げられる。
【0045】
発現用宿主として利用可能な哺乳動物細胞株は、当該分野で公知であり、そのような細胞株としては、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、HeLa細胞、乳仔ハムスター腎臓(BHK)細胞、サル腎臓細胞(COS)、ヒト肝細胞癌細胞(例えば、Hep G2)および多くの他の細胞株を含むが、これらに限定されない、American Type Culture Collection(ATCC)から入手可能な多くの不死化細胞株が含まれる。
【0046】
(ii 植物細胞発現系)
当該分野で公知の多くの植物細胞培養および全植物遺伝子発現系が存在する。例示的な植物細胞遺伝子発現系としては、米国特許第5,693,506号;米国特許第5,659,122号;および米国特許第5,608,143号のような特許文献に記載されるものが挙げられる。植物細胞培養における遺伝子発現のさらなる例は、Zenk,Phytochemistry 30:3861−3863(1991)に記載されている。植物タンパク質のシグナルペプチドの記載は、上記の参考文献に加えて、以下の文献においても見出され得る;Vaulcombeら,Mol.Gen.Genet.209:33−40(1987);Chandlerら,Plant Molecular Biology 3:407−418(1984);Rogers,J.Biol.Chem.260:3731−3738(1985);Rothsteinら,Gene 55:353−356(1987);Whittierら,Nucleic Acids Research 15:2515−2535(1987);Wirselら,Molecular Microbiology 3:3−14(1989);Yuら,Gene 122:247−253(1992)。植物ホルモンであるジベレリン酸、およびジベレリン酸により誘導される分泌酵素による植物遺伝子発現の調節の記載は、R.L.JonesおよびJ.MacMillin,Gibberellins:Advanced Plant Physiology,Malcolm B.Wilkins編,1984 Pitman Publishing Limited,London,21−52頁に見出され得る。他の代謝調節遺伝子が記載される参考文献;Sheen,Plant Cell,2:1027−1038(1990);Maasら,EMBO J.9:3447−3452(1990);BenkelおよびHickey,Proc.Natl.Acad.Sci.84:1337−1339(1987)。
【0047】
代表的には、当該分野で公知の技術を使用して、所望のポリヌクレオチド配列を、植物内で操作するために設計された遺伝子調節エレメントを含む発現カセット中に挿入する。その発現カセットは、植物宿主内での発現に適切な発現カセットの上流および下流にコンパニオン配列を有する望ましい発現ベクター中に挿入される。そのコンパニオン配列は、プラスミド起源またはウイルス起源でのものあり、そしてそのベクターが、細菌のような本来のクローニング宿主から所望の植物宿主へDNAが移動することを可能にするために必要とされる特徴をベクターに提供する。基本的な細菌/植物ベクター構築物は、好ましくは、広範な宿主範囲の原核生物の複製起点;原核生物の選択マーカー;および、Agrobacteriumの形質転換についてAgrobacterium媒介転位のためのT DNA配列、を植物染色体に提供する。異種遺伝子が検出に容易に反応しない場合は、好ましくは、その構築物はまた、植物細胞が形質転換されたか否かの決定に適した選択マーカー遺伝子も有する。適切なマーカーの一般的な総説は、例えば、イネ科のメンバーについては、WilminkおよびDons,1993,Plant Mol.Biol.Reptr,11(2):165−185に見出される。
【0048】
植物ゲノムへの異種配列の組込みを可能にするために適した配列もまた、推奨される。これらは、植物ゲノム内へ異種発現カセットのランダム挿入を可能にする相同組換えのためのトランスポゾン配列など、およびTi配列を含み得る。適切な原核生物選択マーカーとしては、アンピシリンまたはテトラサイクリンのような抗生物質に対する耐性が挙げられる。当該分野で公知であるように、さらなる機能をコードする他のDNA配列もまた、そのベクター中に存在し得る。
【0049】
本発明の核酸分子はまた、目的のタンパク質の発現のための発現カセット中に含まれ得る。2つ以上の発現カセットも可能であるが、通常は一つのみの発現カセットである。組換え発現カセットは、異種タンパク質のコード配列に加えて、以下のエレメントを含む;プロモーター領域、植物5’非翻訳配列、開始コドン(構造遺伝子が開始コドンを備えているか否かに依存する)、ならびに転写配列および翻訳終結配列。そのカセットの5’末端および3’末端の独特な制限酵素部位は、既存のベクター内への容易な挿入を可能にする。
【0050】
異種のコード配列は、本発明に関連する任意のタンパク質についての配列であり得る。目的のタンパクをコードする配列は、適切に、そのタンパク質のプロセッシングおよび輸送を可能にするシグナルペプチドをコードし、そして通常、本発明の所望のタンパク質の膜への結合を生じ得る任意の配列を欠く。転写開始領域は、大部分は、発芽中に発現および輸送される遺伝子のためのものであるから、輸送を規定するシグナルペプチドを使用することにより、それはまた、目的のタンパク質の輸送を提供し得る。この方法で、目的のタンパク質は、それらが発現される細胞から輸送され、そして効率的に回収され得る。代表的には、種子における分泌は、種子の胚乳へ、アリューロン層または胚盤上皮層を通過する。タンパク質が産生された細胞から分泌される必要がない一方で、これは組換えタンパク質の単離および精製を容易にする。
【0051】
所望の遺伝子産物の最終的な発現は、真核生物中であるため、クローン化した遺伝子の任意の部分が、イントロンのように宿主のスプライセオソーム(splicosome)機構によってプロセシングされる配列を含むか否かを決定することが望ましい。そのような場合、「イントロン」領域の部位特異的変異誘発は、偽イントロンコード(false intron code)として遺伝的情報の一部を欠失することを防ぐように実施され得る(ReedおよびManiatis、Cell 41:95−105(1985))。
【0052】
ベクターは、組換えDNAを機械的に転移するためのマイクロピペットを用いることによって、植物細胞内に直接的に微量注入され得る。Crossway、Mol.Gen.Genet,202:179−185、1985。遺伝物質はまた、ポリエチレングリコールを用いて植物細胞内に転移され得る(Krensら、Nature、296、72−74、1982)。核酸部分の導入の別の方法は、小さいビーズまたは微粒子のいずれかのマトリックスの内部に、あるいは表面に核酸を有する小さな微粒子による高速バリスティック(ballistic)穿通法である(Kleinら,Nature,327,70−73,1987ならびにKnudsenおよびMuller,1991,Planta,185:330−336は、大麦胚乳の粒子の照射(bombardment)によりトランスジェニック大麦を作製することを示している)。さらに別の導入方法は、他の物体、いずれかのミニ細胞、細胞、リソソームあるいは他の易融な脂肪表面体とのプロトプラストの融合である(Fraleyら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA,79,1859−1863,1982)。
【0053】
ベクターはまた、エレクトロポレーションにより植物細胞内に導入され得る(Frommら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:5824,1985)。この技術において、植物プロトプラストは、遺伝子構築物を含むプラスミドの存在下でエレクトロポレートされる。高い電界の強さの電気衝撃により、生体膜を可逆的に通過できるようにして、プラスミドの導入を可能にする。エレクトロポレートされた植物プロトプラストは細胞壁を再形成し、分裂して、そして植物カルス形成する。
【0054】
プロトプラストを単離し得、そして培養して完全な再生植物を提供し得る全ての植物は、本発明により形質転換され得、転移された遺伝子を保持する完全な植物が再生される。実際に、全ての植物は、培養細胞あるいは組織(さとうきび、甜菜、綿、果実および他の樹木、マメ科植物および野菜の全ての主要な種を含むがそれらに限定されない)から再生され得る。いくつかの適した植物としては、例えば、以下の属由来の種が挙げられる;Fragaria,Lotus,Medicago,Onobrychis,Trifolium,Trigonella,Vigna,Citrus,Linum,Geranium,Manihot,Daucus,Arabidopsis,Brassica,Raphanus,Sinapis,Atropa,Capsicum,Datura,Hyoscyamus,Lycopersion,Nicotiana,Solanum,Petunia,Digitalis,Majorana,Cichorium,Helianthus,Lactuca,Bromus,Asparagus,Antirrhinum,Hererocallis,Nemesia,Pelargonium,Panicum,Pennisetum,Ranunculus,Senecio,Salpiglossis,Cucumis,Browaalia,Glycine,Lolium,Zea,Triticum,Sorghum,およびDatura。
【0055】
再生のための手法は、植物の種によって変化するが、一般に異種遺伝子のコピーを含む形質転換されたプロトプラストの懸濁液が最初に提供される。カルス組織が形成され、そしてシュートがカルスから誘導され、続いて発根される。あるいは、胚形成がプロトプラスト懸濁液から誘導され得る。これらの胚は、天然の胚として発芽し、植物を形成する。培養培地は、一般に、種々のアミノ酸、ならびにオーキシンおよびサイトカイニンのようなホルモンを含有する。またグルタミン酸およびプロリンを培地に添加することは、特に、コーンおよびアルファルファのような種にとって有用である。シュートおよび根は、通常、同時に発生する。効果的な再生は、培地、遺伝子型、および培養遍歴に依存する。これらの3つの変数が制御されるならば、再生は十分に再現性がありそして繰り返し可能である。
【0056】
いくつかの植物細胞培養系において、本発明の所望のタンパク質は排出されるか、またはこのタンパク質は植物全体から抽出され得る。本発明の所望のタンパク質が培地内に分泌される場合、これを回収し得る。あるいは、胚および胚を有さない不完全な種子または他の植物組織を機械的に破壊して、細胞と組織と間の任意の分泌タンパク質を放出させ得る。その混合物を緩衝液に懸濁して、可溶性タンパク質を回収し得る。次いで、慣用的なタンパク質の単離方法および精製方法を使用して、組換えタンパク質を精製する。時間、温度、pH、酸素、および容量のパラメーターを慣用的な方法により調整して、異種タンパク質の適切な発現および回収を最適化する。
【0057】
(iii バキュロウイルス系)
タンパク質をコードするポリヌクレオチドはまた、適切な昆虫の発現ベクター内に挿入され得、そしてそのベクター内で、制御エレメントに作動可能に連結される。ベクターの構築には、当該分野で公知の技術を使用する。一般に、その発現系の構成要素として、以下のものが挙げられる:バキュロウイルスゲノムのフラグメント、および発現させる異種遺伝子の挿入のための簡便な制限部位の両方を有する転移ベクター(通常は細菌プラスミド);転移ベクター内のバキュロウイルス特異的フラグメントに対して配列相同性を有する野生型バキュロウイルス(これは、バキュロウイルスゲノム内への異種遺伝子の相同組換えを可能にする);ならびに適切な昆虫宿主細胞および増殖培地。
【0058】
転移ベクターにタンパク質をコードするDNA配列を挿入した後、そのベクターおよび野生型ウイルスゲノムを、昆虫宿主細胞にトランスフェクトし、そこでベクターとウイルスゲノムを組換え可能にする。パッケージングされた組換えウイルスは発現され、そして組換えプラークが同定されそして精製される。バキュロウイルス/昆虫細胞発現系の材料および方法は、特に、Invitrogen、San Diego CAからキット形態(「MaxBac」キット)で市販される。これらの技術は、一般に当業者に公知であり、そしてSummersおよびSmith、Texas Agricultural Experiment Station Bulletin No.1555(1987)(以下、「Summers and Smith」)に十分に記載されている。
【0059】
タンパク質をコードするDNA配列をバキュロウイルスゲノムに挿入する前に、プロモーター配列、リーダー配列(所望される場合は)、目的のコード配列、および転写終結配列を含む上記の構成要素を、通常、中間転移構築物(転移ベクター)に構築する。この構築物は、単一の遺伝子および作動可能に連結された調節エレメント;作動可能に連結された調節エレメントのセットを各々が所有する複数の遺伝子;あるいは同じ調節エレメントのセットにより調節される複数の遺伝子、を含み得る。中間転移構築物は、しばしば、細菌のような宿主内で安定的に維持し得る染色体外エレメント(例えば、プラスミド)のような、レプリコン内で維持される。レプリコンは、複製系を有しており、従って、それはクローニングおよび増幅に適切な宿主内で維持され得る。
【0060】
現在、外来遺伝子をAcNPVへ導入するために、最も一般に使用される転移ベクターは、pAc373である。当業者に公知の多くの他のベクターもまた設計される。これらには、例えば、pVL985(ポリへドリンの開始コドンをATGからATTに変化させ、そしてそのATTから32塩基対下流に、BamHIクローニング部位を導入する;LuckowおよびSummers,Virology(1989)17:31を参照のこと)が挙げられる。
【0061】
そのプラスミドはまた、通常、ポリへドリンポリアデニル化シグナル(Millerら、(1988)Ann.Rev.Microbiol.,42:177)、および原核生物のアンピシリン耐性(amp)遺伝子、およびE.coliでの選択および増殖のための複製起点を有する。
【0062】
バキュロウイルス転移ベクターは、通常、バキュロウイルスプロモーターを含む。バキュロウイルスプロモーターは、バキュロウイルスRNAポリメラーゼを結合し、そしてコード配列(例えば、構造遺伝子)のmRNAへの下流(5’から3’)方向の転写を開始し得る任意のDNA配列である。プロモーターは、通常、コード配列の5’末端に近接して存在する転写開始領域を有している。この転写開始領域は、通常、RNAポリメラーゼ結合部位および転写開始点を含む。バキュロウイルス転移ベクターはまた、エンハンサーと呼ばれる第二のドメインを有し得、存在する場合には、通常、構造遺伝子に対して遠位にある。発現は調節的または構成的のいずれかであり得る。
【0063】
ウイルスの感染周期の後期で大量に転写される構造遺伝子は、特に有用なプロモーター配列を提供する。例としては、ウイルス多面体タンパク質をコードする遺伝子(Friesenら、(1986)「The Regulation of Baculovirus Gene Expression,」:The Molecular Biology of Baculoviruses(Walter Doerfler編);EPO公開第127839号および同第155476号;およびp10タンパク質をコードする遺伝子(Vlakら,(1988),J.Gen.Virol.69:765)由来の配列が挙げられる。
【0064】
適切なシグナル配列をコードするDNAは、分泌される昆虫タンパク質、あるいはバキュロウイルスポリへドリン遺伝子(Carbonellら,(1998)Gene,73:409)のようなバキュロウイルスタンパク質の遺伝子に由来し得る。あるいは、哺乳動物細胞の翻訳後修飾(シグナルペプチド切断、タンパク質分解切断、およびリン酸化のような)のシグナルは、昆虫細胞に認識されるようであり、ならびに分泌および核蓄積に必要なシグナルはまた、無脊椎動物細胞と脊椎動物細胞との間で保存されているようであるため、ヒトインターフェロンα(Maedaら(1985)Nature 315:592);ヒトガストリン放出ペプチド(Lebacq−Verheydenら(1988)Molec.Cell.Biol.8:3129);ヒトIL−2(Smithら(1985)Proc.Nat’l Acad.Sci.USA、82:8404);マウスIL−3(Miyajimaら(1987)Gene 58:273);およびヒトグルコセレブロシダーゼ(Martinら(1988)DNA、7:99)をコードする遺伝子に由来のような、非昆虫起源のリーダーもまた使用して、昆虫での分泌を提供し得る。
【0065】
組換えポリペプチドまたは組換えポリタンパク質は細胞内に発現され得るか、あるいは適切な調節配列と共に発現される場合には、分泌され得る。非融合の外来タンパク質の優れた細胞内発現には通常、ATG開始シグナルに先行する適切な翻訳開始シグナルを含む短いリーダー配列を理想的には有する異種遺伝子が必要である。所望であれば、N末端のメチオニンは、臭化シアンとのインビトロインキュベーションにより、成熟タンパク質から切断され得る。
【0066】
あるいは、自然に分泌されない組換えポリタンパク質あるいは組換えタンパク質は、昆虫において外来タンパク質の分泌を与えるリーダー配列フラグメントを含む、融合タンパク質をコードするキメラDNA分子を作製することにより、昆虫細胞から分泌され得る。リーダー配列フラグメントは通常、タンパク質の小胞体内への輸送を指向する疎水性アミノ酸を含むシグナルペプチドをコードする。
【0067】
タンパク質の発現産物の前駆体をコードするDNA配列および/または遺伝子の挿入後、昆虫細胞宿主に、転移ベクターの異種DNAおよび野生型バキュロウイルスのゲノムDNAを同時形質転換(通常は、同時トランスフェクションによって)する。構築物のプロモーターおよび転写終結配列は、通常バキュロウイルスゲノムの2〜5kbの区域を含む。バキュロウイルスウイルスの望ましい部位に異種DNAを導入する方法は、当該分野で公知である(SummersおよびSmith、前出;Juら(1987);Smithら,Mol.Cell.Biol.(1983)3:2156;ならびにLuckowおよびSummers(1989)を参照のこと)。例えば、その挿入は、相同二重交差組換え(homologous double crossover recombination)により、ポリへドリン遺伝子のような遺伝子内であり得る;挿入はまた、所望のバキュロウイルス遺伝子に設計された制限酵素部位内であり得る。Millerら、(1989)、Bioessays 4;91。発現ベクター内のポリへドリン遺伝子の代わりにクローン化される場合のDNA配列は、ポリへドリン特異的配列に5’および3’の両側で隣接され、そしてポリへドリンプロモーターの下流に位置される。
【0068】
新規に形成されたバキュロウイルス発現ベクターは続いて、感染性の組換えバキュロウイルス内にパッケージされる。相同組換えは、低い頻度で起こる(約1%〜約5%の間);それゆえ、同時トランスフェクション後に産生されるウイルスの大半は、なお野生型ウイルスである。従って、組換えウイルスを同定するための方法が必要である。その発現系の利点は、組換えウイルスを区別させ得る可視的スクリーニングである。天然のウイルスにより産生されるポリへドリンタンパク質は、ウイルス感染後の後期で、その感染された細胞の核内で非常に高いレベルで産生される。蓄積されたポリへドリンタンパク質は、閉塞体を形成し、それはまた包埋された粒子を含む。これらの閉塞体は、最大15μmの大きさで、高度に屈折し、明るく輝く外見を与え、容易に光学顕微鏡下で可視化される。組換えウイルスに感染された細胞は、閉塞体を欠く。組換えウイルスと野生型ウイルスを区別するために、トランスフェクションの上清を、当業者に公知の技術により昆虫細胞の単層にプラーク形成させた。すなわち、プラークを、光学顕微鏡下で、閉塞体の存在(野生型ウイルスを示す)または非存在(組換えウイルスを示す)についてスクリーニングする。「Current Protocols in Microbiology」、第2巻(Ausubelら編)16.8(増補10、1990);SummersおよびSmith、前出;Millerら(1989)。
【0069】
組換えバキュロウイルス発現ベクターは、いくつかの昆虫細胞への感染用に開発された。例えば、組換えバキュロウイルスは、特に以下に示すもののために開発された:Aedes aegypti、Autographa californica、Bombyx mori、Drosophila melanogaster、Spodoptera frugiperda、およびTrichoplusia ni(PCT公開番号WO89/046699;Carbonellら,(1985)J.Virol.56:153;Wright(1986)Nature 321:718;Smithら,(1983)Mol.Cell.Biol.3:2156;および一般には、Fraserら,(1989)In Vitro Cell.Dev.Biol.25:225を参照のこと)。
【0070】
細胞および細胞培養培地は、バキュロウイルス/発現系における異種ポリペプチドの直接発現および融合発現の両方のために市販される;細胞培養技術は、一般に当業者に公知である。例えば、前出のSummersおよびSmithを参照のこと。
【0071】
次いで、改変した昆虫細胞を、改変した昆虫宿主内で存在するプラスミドの安定的維持を可能にする適切な栄養培地で増殖し得る。発現産物の遺伝子が、誘導性の制御下にある場合、宿主は高密度で増殖され得、そして発現は誘導され得る。あるいは、発現が構成的である場合、その産物は培地中に連続的に発現され、そして栄養培地を連続的に循環させる一方で、目的産物を取り出し、そして枯渇した栄養を増大させる必要がある。その産物は、クロマトグラフィー(例えば、HPLC、アフィニティークロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィーなど);電気泳動;密度勾配遠心;溶媒抽出などのような技術により精製され得る。適切には、必要ならば、その産物をさらに精製して、培地中にも分泌されたか、または昆虫細胞の溶解から生じる任意の昆虫タンパク質を実質的に除去し、宿主細片(例えば、タンパク質、脂質および多糖類)を少なくとも実質的に含まない産物を供給する。
【0072】
タンパク質の発現を得るために、形質転換体に由来する組換え宿主細胞は、組換えタンパク質をコードする配列の発現を可能にする条件下でインキュベートされる。これらの条件は、選択された宿主細胞に依存して変動する。しかし、その条件は、当該分野で公知の条件に基づいて、当業者に容易に確かめられる。
【0073】
(iv.細菌系)
細菌の発現技術は、当該分野で公知である。細菌のプロモーターは、細菌のRNAポリメラーゼに結合し得、そしてコード配列(例えば、構造遺伝子)の下流方向(3’方向)へのmRNAへの転写を開始し得る任意のDNA配列である。プロモーターは、通常、コード配列の5’末端に近接して配置される転写開始領域を有する。この転写開始領域は、通常、RNAポリメラーゼ結合部位および転写開始部位を含む。細菌のプロモーターはまた、オペレーターと呼ばれる第二のドメインを有し、これはRNA合成が始まる近接のRNAポリメラーゼ結合部位と重複し得る。オペレーターは、遺伝子リプレッサータンパク質が、オペレーターに結合し、そのため特定の遺伝子の転写を阻害し得るような、負の調節された(誘導性の)転写を可能にする。構成的発現は、オペレーターのような負の調節エレメントの非存在下で起こり得る。さらに、正の調節は、遺伝子アクチベータータンパク質結合配列により達成され得、その配列は、存在する場合には通常、RNAポリメラーゼ結合配列の(5’)側に近接している。遺伝子アクチベータータンパク質の例としては、カタボライト活性化タンパク質(CAP)があり、それはEscherichia coli(E.coli)におけるlacオペロンの転写の開始を補助する(Raibaudら(1984)Annu.Rev.Genet.18:173)。従って、調節される発現は、正または負のいずれかであり、それによって転写を増強するかまたは低下し得る。
【0074】
代謝経路の酵素をコードする配列は、特に有用なプロモーター配列を提供する。例としては、ガラクトース、ラクトース(lac)(Changら.(1997)Nature 198:1056)、およびマルトースのような糖代謝の酵素由来のプロモーター配列が挙げられる。さらなる例としては、トリプトファン(trp)(Goeddelら(1980)Nuc.Acids Res.8:4057;Yelvertonら(1981)Nucl.Acids Res.9:731;米国特許第4,738,921号;EPO公開番号036 776および121 775)のような生合成酵素由来のプロモーター配列が挙げられる。β−ラクタマーゼ(bla)プロモーター系(Weissmann(1981)「The cloning of interferon and other mistakes.」Interferon 3(I.Gresser編))、バクテリオファージλPL(Shimatakeら(1981)Nature 292:128)およびT5(米国特許第4,689,406号)プロモーター系もまた有用なプロモーター配列を提供する。
【0075】
さらに、天然に存在しない合成プロモーターもまた、細菌のプロモーターとして機能する。例えば、ある細菌あるいはバクテリオファージプロモーターの転写活性化配列は、別の細菌あるいはバクテリオファージプロモーターのオペロン配列と結合し得、合成ハイブリッドプロモーターを作製する(米国特許第4,551,433号)。例えば、tacプロモーターは、trpプロモーター配列およびlacリプレッサーにより調節されるlacオペロン配列の両方から構成される、ハイブリッドtrp−lacプロモーターである(Amannら(1983)Gene 25:167;de Boerら(1983)Proc.Natl.Acad.Sci.80:21)。さらに、細菌のプロモーターは、細菌のRNAポリメラーゼに結合し、そして転写を開始させる能力を有する非細菌起源の天然に存在するプロモーターを含み得る。非細菌起源の天然に存在するプロモーターはまた、原核生物内でいくつかの遺伝子の高いレベルでの発現を生じるために、適合性のあるRNAポリメラーゼと結合され得る。バクテリオファージT7 RNAポリメラーゼ/プロモーター系は、連結したプロモーター系の例である(Studierら(1986)J.Mol.Biol.189:113;Taborら(1985)Proc Natl.Acad.Sci.82:1074)。さらに、ハイブリッドプロモーターはまた、バクテリオファージプロモーターおよびE.coliオペレーター領域から構成され得る(EPO公開番号267 851)。
【0076】
機能性のプロモーター配列に加え、効果的なリボソーム結合部位はまた、原核生物における外来遺伝子の発現に有用である。E.coliにおいて、リボソーム結合部位は、シャイン−ダルガルノ(SD)配列と呼ばれ、そして開始コドン(ATG)および開始コドンの3〜11ヌクレオチド上流に位置する長さ3〜9ヌクレオチドの配列を含む(Shineら(1975)Nature 254:34)。SD配列は、SD配列とE.coliの16S rRNAの3’末端との間の塩基対形成によりリボソームへのmRNAの結合を促進すると考えられている(Steitzら(1979)「Genetic signals and nucleotide sequences in messenger RNA.」Biological Regulation and Development:Gene Expression(R.F.Goldberger編))。弱いリボソーム結合部位を有する真核生物遺伝子および原核生物遺伝子の発現のためには、SD配列と真核生物遺伝子のATGとの間の距離を最適化することが、しばしば必要とされる(Sambrookら(1989)「Expression of cloned genes in Escherichia coli.」Molecular Cloning:A Laboratory Manual)。
【0077】
DNA分子は、細胞内で発現され得る。プロモーター配列は、直接的にそのDNA分子と連結され得、この場合、N末端の最初のアミノ酸は、常に、ATG開始コドンによりコードされるメチオニンである。所望される場合、N末端のメチオニンは、臭化シアンとのインビトロインキュベーション、あるいは細菌のメチオニンN末端ペプチダーゼとのインビボまたはインビトロのインキュベーションのいずれかによりタンパク質から切断され得る(EPO公開番号219 237)。
【0078】
融合タンパク質は、直接的発現に対する代替物を提供する。通常、内在性の細菌のタンパク質、あるいは他の安定なタンパク質のN末端部分をコードするDNA配列は、異種のコード配列の5’末端と融合される。発現の際に、この構築物は、2つのアミノ酸配列の融合を提供する。例えば、バクテリオファージλ細胞遺伝子は、外来遺伝子の5’末端と連結し得、そして細菌において発現され得る。生じた融合タンパク質は、好ましくは、外来遺伝子由来のバクテリオファージタンパク質を切断するためのプロセシング酵素(Xa因子)用の部位を保持する(Nagaiら(1984)Nature 309:810)。融合タンパク質はまた、lacZ(Jiaら(1987)Gene 60:197)、trpE(Allenら(1987)J.Biotechnol.5:93;Makoffら(1989)J.Gen.Microbiol.135:11)、およびChey(EPO公開番号324 647)遺伝子由来の配列を用いて作製され得る。2つのアミノ酸配列の接合部でのDNA配列は、切断部位をコードしてもよいし、あるいはコードしなくてもよい。別の例は、ユビキチン融合タンパク質である。そのような融合タンパク質は、好ましくは、外来タンパク質からユビキチンを切断するためのプロセシング酵素(例えば、ユビキチン特異的プロセシングプロテアーゼ)用の部位を保持するユビキチン領域と共に作製され得る。この方法を通して、天然の外来タンパク質は分離され得る(Millerら(1989)Bio/Technology 7:698)。
【0079】
あるいは、外来タンパク質はまた、細菌における外来タンパク質の分泌を提供するシグナルペプチド配列フラグメントから構成される、融合タンパク質をコードするキメラDNA分子を作製することによって、細胞から分泌され得る(米国特許第4,336,336号)。シグナル配列フラグメントは、通常、細胞からのタンパク質の分泌を指向する、疎水性アミノ酸から構成されるシグナルペプチドをコードする。このタンパク質は、増殖培地(グラム陽性細菌)、または細胞の内膜と外膜との間に位置するペリプラズム腔(グラム陰性細菌)のいずれかへ分泌される。好ましくは、インビボまたはインビトロのいずれかで切断され得る、このシグナルペプチドフラグメントと外来遺伝子との間にコードされるプロセシング部位がある。
【0080】
適切なシグナル配列をコードするDNAは、E.coli外膜タンパク質遺伝子(ompA)(Masuiら(1983)、Experimetal Manipulation of Gene Expression;Ghrayebら、(1984)EMBO J.3:2437)およびE.coliアルカリホスファターゼシグナル配列(phoA)(Okaら(1985)Proc.Natl.Acad.Sci.82:7212)のような、分泌性細菌タンパク質についての遺伝子に由来し得る。さらなる例として、種々のBacillus株由来のα−アミラーゼ遺伝子のシグナル配列は、B.subtilis由来の異種タンパク質を分泌するために使用され得る(Palvaら(1982)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 79:5582;EPO公開番号244 042)。
【0081】
通常、細菌によって認識される転写終結配列は、翻訳終止コドンの3’側に位置する調節領域であり、そして従って、プロモーターとともに、コード配列に隣接する。これらの配列は、そのDNAによってコードされるポリペプチドへと翻訳され得るmRNAの転写を指向する。転写終結配列は、しばしば、転写の終結を補助するステムループ構造を形成し得る、約50ヌクレオチドのDNA配列を含む。例としては、強力なプロモーターを有する遺伝子(例えば、E.coliのtrp遺伝子および他の生合成遺伝子)由来の転写終結配列が挙げられる。
【0082】
通常、上記の成分(プロモーター、シグナル配列(もし所望ならば)、目的のコード配列、および転写終結配列を含む)は、組み立てられて発現構築物となる。発現構築物は、しばしば、宿主(例えば細菌)において安定に保持し得る染色体外エレメント(例えばプラスミド)のような、レプリコンに維持される。このレプリコンは複製系を有し、従って、発現またはクローニングおよび増幅のいずれかのために、レプリコンが原核生物宿主において保持されることを可能にする。さらに、レプリコンは、高コピー数プラスミドまたは低コピー数プラスミドのいずれかであり得る。高コピー数プラスミドは、一般に約5〜約200、そして通常約10〜約150の範囲のコピー数を有する。高コピー数プラスミドを含む宿主は、好ましくは少なくとも約10個、そしてより好ましくは少なくとも約20個のプラスミドを含む。高コピー数ベクターまたは低コピー数ベクターのいずれかが選択され得、それは、宿主に対するベクターおよび外来タンパク質の効果に依存する。
【0083】
あるいは、発現構築物は、組み込みベクターを用いて、細菌のゲノムへ組み込まれ得る。組み込みベクターは、通常、ベクターが組み込むのを可能にする、細菌の染色体と相同な少なくとも1つの配列を含む。組み込みは、ベクターにおける相同なDNAと細菌の染色体との間の組換えから生じるようである。例えば、種々のBacillus株からのDNAによって構築される組み込みベクターは、Bacillus染色体に組み込まれる(EPO公開番号 127 328)。組み込みベクターはまた、バクテリオファージまたはトランスポゾン配列から構成され得る。
【0084】
通常、染色体外発現構築物および組み込み発現構築物は、選択マーカーを含んで、形質転換された細菌株の選択を可能にし得る。選択マーカーは、細菌宿主において発現され得、そして細菌が薬物(例えば、アンピシリン、クロラムフェニコール、エリスロマイシン、カナマイシン(ネオマイシン)、およびテトラサイクリン)に耐性になるようにする遺伝子を含み得る(Daviesら(1978)Annu.Rev.Microbiol.32:469)。選択マーカーはまた、ヒスチジン、トリプトファン、およびロイシンの生合成経路における生合成遺伝子のような、生合成遺伝子を含み得る。
【0085】
あるいは、上記の成分のいくつかは、形質転換ベクターにおいて組み立てられ得る。形質転換ベクターは、通常、上記のように、レプリコンにおいて保持されるか、または組み込みベクターへと開発されるかのいずれかの選択マーカー(market)から構成され得る。
【0086】
発現ベクターおよび形質転換ベクター(染色体外レプリコンまたは組み込みベクターのいずれか)は、多くの細菌へ形質転換のために開発されてきた。例えば、発現ベクターは、とりわけ、以下の細菌のために開発されてきた:Bacillus subtilis(Palvaら(1982)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 79:5582;EPO公開番号036 259および063 953;PCT公開番号 WO84/04541)、Escherichia coli(Shimatakeら(1981)Nature 292:128;Amannら(1985)Gene 40:183;Studierら(1986)J.MOl.Biol.189:113;EPO公開番号036 776号、同第136 829号、同第136 907号)、Streptococcus cremoris(Powellら(1988)Appl.Environ.Microbiol.54:655);Streptococcus lividans(Powellら(1988)Appl.Environ.Microbiol.54:655)、Streptomyces lividans(米国特許第4,745,056号)。
【0087】
細菌宿主への外来性DNA導入の方法は、当該分野で周知であり、そして、通常、CaCl2または他の因子(例えば、二価陽イオンおよびDMSO)のいずれかで処理された細菌の形質転換を含む。DNAはまた、エレクトロポレーションにより細菌細胞に導入され得る。形質転換の手順は、通常、形質転換されるべき細菌の種で変化する。(例えば、以下を参照のこと:Bacillusの使用:Massonら(1989)FEMS Microbiol.Lett.60:273;Palvaら(1982)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 79:5582;EPO公開番号036 259号および同第063 953号;PCT公開番号WO84/04541;Campylobacterの使用:Millerら(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.85:856;およびWangら(1990)J.Bacteriol.172:949;Escherichia coli:Cohenら(1973)Proc.Natl.Acad.Sci.69:2110;Dowerら(1988)Nucleic Acids Res.16:6127;Kushner(1978)「An improved method for transfsormation of Escherichia coli with ColE1−derived plasmids」Genetic Enginerring:Proceedings of International Symposium on Genetic Engineering(H.W.BoyerおよびS.Nicosia編);Mandelら(1970)J.Mol.Biol.53:159;Taketo(1988)Biochim.Biophys.Acta 949:318;Lactobacillusの使用:Chassyら(1987)FEMS Microbiol.Lett.44:173;Pseudomonasの使用:Fiedlrら(1988)Anal.Biochem 170:38;Staphylococcusの使用:Augustinら(1990)FEMS Microbiol.Lett.66:203;Streptococcusの使用:Baranyら(1980)J.Bacteriol.144:698;Harlander(1987)「Transformation of Streptococcus lactis by electroporation」:Streptococcal Genetics(J.FerrettiおよびR.CurtissIII編);Perryら(1981)Infect.Immun.32:1295;Powellら(1988)Appl.Environ.Microbiol.54:655;Somkutiら(1987)Proc.4th Evr.Cong.Biotechnology 1:412。
【0088】
(v.酵母発現)
酵母発現系もまた、当業者に公知である。酵母プロモーターは、酵母RNAポリメラーゼに結合可能であり、そしてコード配列(例えば、構造遺伝子)からmRNAへの下流の(3’側の)転写を開始し得る、任意のDNA配列である。プロモーターは、通常、コード配列の5’末端の近位に位置する転写開始領域を有する。この転写開始領域は、通常、RNAポリメラーゼ結合部位(「TATAボックス」)および転写開始部位を含む。酵母プロモーターはまた、上流アクチベーター配列(UAS)と呼ばれる第2のドメインを有し得、これは、もし存在するならば、通常、構造遺伝子とは遠位である。このUASは、調節される(誘導できる)発現を可能にする。構成的発現は、UASの非存在下で生じる。調節される発現は、正または負のいずれかであり得、それによって転写を増加させるかまたは減少させるかのいずれかであり得る。
【0089】
酵母は、活性な代謝経路を有する発酵性微生物であり、従って、代謝経路における酵素をコードする配列は、特に有用なプロモーター配列を提供する。例としては、以下が挙げられる:アルコールデヒドロゲナーゼ(ADH)(EPO公開第284 044号)、エノラーゼ、グルコキナーゼ、グルコース−6−リン酸イソメラーゼ、グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ(GAPまたはGAPDH)、ヘキソキナーゼ、ホスホフルクトキナーゼ、3−ホスホグリセリン酸ムターゼ、およびピルビン酸キナーゼ(PyK)(EPO公開第329 203号)。酸性ホスファターゼをコードする酵母PHO5遺伝子はまた、有用なプロモーター配列を提供する(Myanoharaら(1983)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 80:1)。
【0090】
さらに、天然には生じない合成プロモーターもまた、酵母のプロモーターとして機能する。例えば、ある1つの酵母プロモーターのUAS配列は、別の酵母プロモーターの転写活性化領域と連結され得、合成ハイブリッドプロモーターを生成し得る。このようなハイブリッドプロモーターの例は、GAP転写活性化領域と連結されるADH調節配列(米国特許第4,876,197号および同第4,880,734号)を含む。ハイブリッドプロモーターの他の例は、ADH2、GAL4、GAL10、またはPHO5遺伝子のいずれかの調節配列からなり、GAPまたはPyK(EPO公開第164 556号)のような解糖酵素遺伝子の転写活性化領域に結合されているプロモーターを含む。さらに、酵母プロモーターは、酵母RNAポリメラーゼと結合し、そして転写を開始する能力を有する、天然に存在する非酵母起源のプロモーターを含み得る。このようなプロモーターの例としては、とりわけ、以下が挙げられる:(Cohenら、(1980)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 77:1078;Henikoffら(1981)Nature 283:835;Hollenbergら(1981)Curr.Topics Microbiol.Immunol.96:119;Hollenbergら(1979)「The Expression of Bacterial Antibiotic Resistance Gene in the Yeast Saccharomyces cervisiae」、Plasmids of Medical,Environmental and Commercial Importance(K.N.TimmisおよびA.Puhler編);Mercerau−Puigalonら(1980)Gene 11:163;Panthierら(1980)Curr.Genet.2:109;)。
【0091】
DNA分子は、酵母において、細胞内で発現され得る。プロモーター配列は、DNA分子と直接連結され得、その場合、組換えタンパク質のN末端にある最初のアミノ酸は常にATG開始コドンによってコードされるメチオニンである。もし所望ならば、N末端のメチオニンは、臭化シアンとのインビトロインキュベーションによって、タンパク質から切断され得る。
【0092】
融合タンパク質は、酵母発現系について、ならびに哺乳動物、植物バキュロウイルス、および細菌の発現系において、代替物を提供する。通常、内因性酵母タンパク質、または他の安定なタンパク質のN末端部分をコードするDNA配列は、異種コード配列の5’末端に融合される。発現において、この構築物は、2つのアミノ酸配列の融合物を提供する。例えば、酵母またはヒトのスーパーオキシドジスムターゼ(SOD)遺伝子は、外来遺伝子の5’末端に連結され得、そして酵母において発現され得る。2つのアミノ酸配列の連結部にあるDNA配列は、切断部位をコードしてもよいし、コードしなくてもよい。例えば、EPO公開番号196 056号を参照のこと。別の例はユビキチン融合タンパク質である。このような融合タンパク質は、外来タンパク質からユビキチンを切断するプロセシング酵素(例えば、ユビキチン特異的プロセシングプロテアーゼ)のための部位を好ましくは保持する、ユビキチン領域を伴って作製される。従って、この方法を通じて、ネイティブな外来タンパク質は、単離され得る(例えば、WO88/024066)。
【0093】
あるいは、外来タンパク質はまた、酵母における外来タンパク質の分泌を提供する、リーダー配列フラグメントから構成される融合タンパク質をコードする、キメラDNA分子を作製することによって、細胞から増殖培地へ分泌され得る。好ましくは、インビボまたはインビトロのいずれかで切断され得る、リーダーフラグメントと外来遺伝子との間にコードされるプロセシング部位が存在する。リーダー配列フラグメントは、細胞からのタンパク質の分泌を指向する、疎水性アミノ酸から構成されるシグナルペプチドを、通常コードする。
【0094】
適切なシグナル配列をコードするDNAは、分泌性酵母タンパク質に関する遺伝子由来であり得、その遺伝子は例えば、酵母インベルターゼ遺伝子(EPO公開番号012 873;JPO公開番号62:096,086)およびA因子遺伝子(米国特許第4,588,684号)である。あるいは、インターフェロンリーダーのような、酵母における分泌も提供する、非酵母起源のリーダーが存在する(EPO公開番号第060 057号)。
【0095】
好ましいクラスの分泌リーダーは、酵母α因子遺伝子のフラグメントを使用するリーダーであり、これは「プレ」シグナル配列、および「プロ」領域の両方を含む。用いられ得るこの型のα因子フラグメントは、完全長の、プレ−プロα因子リーダー(約83アミノ酸残基)および短縮されたα因子リーダー(通常約25〜約50アミノ酸残基)を含む(米国特許第4,546,083号および同第4,870,008号;EPO公開番号第324 274号)。分泌を提供するα因子リーダーフラグメントを使用するさらなるリーダーは、第1の酵母のプレ配列を有するが、第2の酵母α因子からのプロ領域を有しないで作製される、ハイブリッドα因子リーダーを含む(例えば、PCT公開番号WO89/02463を参照のこと)。
【0096】
通常、酵母に認識される転写終結配列は、翻訳終止コドンの3’側に位置する調節領域であり、そして従って、プロモーターと共にコード配列に隣接する。これらの配列は、そのDNAにコードされるポリペプチドへと翻訳され得る、mRNAの転写を指向する。転写終結配列および他の酵母に認識される終結配列の例は、例えば、解糖酵素をコードする転写終結配列である。
【0097】
通常、上記の成分(プロモーター、リーダー(もし所望ならば)、目的のコード配列、および転写終結配列を含む)は、組み立てられて発現構築物になる。発現構築物は、宿主(例えば、酵母または細菌)において安定に保持され得る染色体外エレメント(例えば、プラスミド)のような、レプリコンにおいてしばしば保持される。このレプリコンは、2つの複製系を有し得、従って、このことが、例えば、酵母において発現のために、ならびに原核生物宿主においてクローニングおよび増幅のために保持されることを可能にする。このような酵母−細菌シャトルベクターの例としては、以下が挙げられる:YEp24(Botsteinら(1979)Gene 8:17〜24)、pCl/1(Brakeら(1984)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:4642〜4646)、およびYRp17(Stinchcombら(1982)J.Mol.Biol.158:157)。さらに、レプリコンは、高コピー数プラスミドまたは低コピー数プラスミドのいずれかであり得る。高コピー数プラスミドは、一般に約5〜約200、そして通常約10〜約150の範囲のコピー数を有する。高コピー数プラスミドを含む宿主は、好ましくは少なくとも約10個、そしてより好ましくは少なくとも約20個を有する。高コピー数ベクターまたは低コピー数ベクターのいずれかが選択され得、それは、宿主に対するベクターおよび外来タンパク質の効果に依存する。例えば、Brakeら、前出を参照のこと。
【0098】
あるいは、発現構築物は、組み込みベクターを用いて、酵母のゲノムへ組み込まれ得る。組み込みベクターは、通常、ベクターが組み込むのを可能にする、酵母の染色体と相同な少なくとも1つの配列を含み、そして好ましくは、発現構築物に隣接する2つの相同配列を含む。組み込みは、ベクターにおける相同なDNAと酵母の染色体との間の組換えから生じるようである(Orr−Weaverら(1983)Methods in Enzymol.101:228〜245)。組み込みベクターは、そのベクター中に含有するために適切な相同配列を選択することによって、酵母における特定の遺伝子座を指向され得る。Orr−Weaverら、前出を参照のこと。1つ以上の発現構築物が組み込まれ得、おそらく産生される組換えタンパク質のレベルに影響を与え得る(Rineら(1983)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 80:6750)。ベクターに含まれる染色体配列は、ベクターにおける単一セグメント(ベクター全体の組み込みを生じる)、または染色体における隣接セグメントに相同でかつベクターにおける発現構築物に隣接する2つのセグメント(発現構築物のみの安定した組み込みを生じ得る)のいずれかとして生じ得る。
【0099】
通常、染色体外発現構築物および組み込み発現構築物は、選択マーカーを含み得、形質転換された酵母株の選択を可能にする。選択マーカーは、酵母宿主において発現され得る生合成遺伝子を含み得、それは例えば、ADE2、HIS4、LEU2、TRP1、およびALG7、ならびにG418耐性遺伝子であり、それぞれ、酵母細胞がツニカマイシンおよびG418に耐性になるようにする。さらに、適切な選択マーカーはまた、金属のような毒性化合物の存在下において増殖する能力を、酵母に提供し得る。例えば、CUP1の存在は、酵母が、銅イオンの存在下において増殖することを可能にする(Buttら(1987)Microbiol.Rev.51:351)。
【0100】
あるいは、上記成分のうちのいくつかは、組み立てられて形質転換ベクターになり得る。形質転換ベクターは、通常、上記のように、レプリコンにおいて保持されるか、または組み込みベクターに開発されるかのいずれかである、選択マーカーから構成される。
【0101】
発現ベクターおよび形質転換ベクターは、染色体外レプリコンまたは組み込みベクターのいずれかであり、多くの酵母への形質転換のために開発されてきた。例えば、酵母宿主に外来DNAを導入する発現ベクターおよび方法は、とりわけ、以下の酵母のために開発されてきた:Candida albicans(Kurtzら(1986)Mol.Cell.Biol.6:142)、Candida maltosa(Kunzeら(1985)J.Basic Microbiol.25:141);Hansenula polymorpha(Gleesonら(1986)J.Gen.Microbiol.132:3459;Roggenkampら(1986)Mol.Gen.Genet.202:302)、Kluyveromyces fragilis(Dasら(1984)J.Bacteriol.158:1165)、Kluyveromyces lactis(De Louvencourtら(1983)J.Bacteriol.154:737;Van den Bergら(1990)Bio/Technology 8:135)、Pichia guillerimondii(Kunzeら(1985)J.Basic Microbiol.25:141)、Pichia pastoris(Creggら(1985)Mol.Cell.Biol.5:3376;米国特許第4,837,148号および同第4,929,555号)、Saccharomyces cerevisiae(Hinnenら(1978)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 75:1929;Itoら(1983)J.Bacteriol.153:163);Schizosaccharomyces pombe(BeachおよびNurse(1981)Nature 300:706)、およびYarrowia lipolytica(Davidowら(1985)Curr.Genet.10:380471;Gaillardinら(1985)Curr.Genet.10:49)。
【0102】
外来DNAを酵母宿主へ導入する方法は、当該分野において周知であり、そして通常、スフェロプラストの、またはアルカリ陽イオンで処置された無傷の酵母細胞のいずれかの形質転換を含む。形質転換の手順は、通常、形質転換される酵母の種によって変化する。例えば以下を参照のこと:(Kurtzら(1986)Mol.Cell.Biol.6:142;Kunzeら(1985)J.Basic Microbiol.25:141;Candida);(Gleesonら(1986)J.Gen.Microbiol.132:3459;Roggenkampら(1986)Mol.Gen.Genet.202:302;Hansenula);[Dasら(1984)J.Bacteriol.158:1165;De Louvencourtら(1983)J.Bacteriol.154:1165;Van den Bergら(1990)Bio/Technology 8:135;Kluyveromyces];[Creggら(1985)Mol.Cell.Biol.5:3376;Kunzeら(1985)J.Basic Microbiol.25:141;米国特許第4,837,148号および同第4,929,555号;Pichia];[Hinnenら(1978)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 75:1929;Itoら(1983)J.Bacteriol.153:163 Saccharomyces];[BeachおよびNurse(1981)Nature 300:706;Schizosaccharomyces];[Davidowら(1985)Curr.Genet.10:39;Gaillardinら(1985)Curr.Genet.10:49;Yarrowia]。
【0103】
(定義)
Xを含む組成物は、組成物中の全X+Yの少なくとも85重量%がXであるとき、Yを「実質的に含まない」。好ましくは、Xは、組成物中の全X+Yの少なくとも約90重量%を、さらに好ましくは少なくとも約95重量%または99重量%さえをも含む。
【0104】
「保存された」Neisseriaのアミノ酸フラグメントまたはタンパク質は、少なくともx%のNeisseriaで、特定のナイセリアのタンパク質中に存在するものである。このxの値は、50%以上(例えば、66%、75%、80%、90%、95%または100%でさえ(すなわち、アミノ酸は、全てのNeisseriaにおいて該当するタンパク質中に見出される))であり得る。アミノ酸が、特定のナイセリアのタンパク質において「保存されて」いるか否かを決定するために、複数の異なるNeisseria(参照集団)由来の該当するタンパク質の配列中のアミノ酸残基を比較する必要がある。この参照集団は、多数の異なるNeisseria種を含み得るか、または単一種を含み得る。この参照集団は、特定の種の多数の異なる血清型または単一の血清型を含み得る。好ましい参照集団は、5つの最も一般的なNeisseria株からなる。
【0105】
用語「異種」とは、天然では共に見られない2つの生物学的成分をいう。この成分は、宿主細胞、遺伝子、または調節領域(例えば、プロモーター)であり得る。異種成分は天然では共に見られないが、遺伝子に対して異種のプロモーターがその遺伝子に作動可能に連結される場合、それらは共に機能し得る。別の例は、ナイセリア配列がマウス宿主細胞に対して異種であることである。
【0106】
「エピトープ」は、抗原性決定基を意味し、そして細胞性応答および/または体液性応答を誘発し得る。
【0107】
「高ストリンジェンシー」な条件は、0.1×SSC、0.5%SDS溶液中65℃である。
【0108】
「複製起点」とは、発現ベクターのような、ポリヌクレオチドの複製を開始および調節するポリヌクレオチド配列である。複製起点は、細胞内でのポリヌクレオチド複製の自律性ユニットとして振る舞い、それ自体の制御下で複製し得る。複製起点は、ベクターが特定の宿主細胞において複製するために必要であり得る。特定の複製起点を有せば、発現ベクターは、細胞内の適切なタンパク質の存在下で高いコピー数で再生され得る。起点の例は、酵母において有効な自律性複製配列;およびCOS−7細胞で有効であるウイルスT抗原である。
【0109】
「変異」配列は、天然の配列または開示された配列とは異なるが相同性を有するDNA配列、RNA配列またはアミノ酸配列として規定される。特定の配列に依存して、天然の配列または開示された配列と変異配列との間の相同性(配列同一性)の程度は、上記のように算出して、好ましくは50%より大きい(例えば、60%、70%、80%、90%、95%、99%またはそれ以上)。本明細書中で使用される場合、本明細書で核酸配列が提供される核酸分子、または領域の「対立遺伝子改変体」は、別のもしくは2番目の単離体のゲノム中の同じ遺伝子座で本質的に生ずる核酸分子または領域であり、そしてこれは、例えば、変異または組換えにより生ずる天然変化に起因して、類似するが、しかし同一でない核酸配列を有する。コード領域の対立遺伝子改変体は、代表的には、比較される遺伝子によってコードされるタンパク質の活性と類似した活性を有するタンパク質をコードする。対立遺伝子改変体はまた、遺伝子の5’または3’非翻訳領域(例えば、調節制御領域)での変化を含み得る(例えば、米国特許第5,753,235号を参照のこと)。
【0110】
(抗体)
本明細書中で使用される場合、用語「抗体」とは、少なくとも1つの抗体結合部位から構成されるポリペプチドまたはポリペプチド群をいう。「抗体結合部位」は、内部表面形状および抗原のエピトープの特徴に相補的な電荷分布を有する、3次元結合空間であり、これが、抗体と抗原の結合を可能にする。「抗体」は、例えば、脊椎動物抗体、ハイブリッド抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、変化された抗体、一価抗体、Fabタンパク質、および単一ドメイン抗体を含む。
【0111】
本発明のタンパク質に対する抗体は、親和性クロマトグラフィー、免疫アッセイ、およびNeisseriaのmenBタンパク質の識別/同定に有用である。
本発明のタンパク質に対して惹起された抗体は、Neisseria meningitidis menBの株に存在および特異的に関連する抗原性のポリペプチドまたはタンパク質もしくはタンパク質フラグメントに結合する。いくつかの例では、これらの抗原は、特定の株(例えば、これらの抗原はmenB株に特異的である)に関連し得る。本発明の抗体は、マトリックスに固定され得、そして免疫アッセイまたは親和性カラムクロマトグラフィーカラムに利用され得、ポリペプチド、タンパク質、またはタンパク質フラグメント、あるいはこのようなポリペプチド、タンパク質、またはタンパク質フラグメントを含む細胞の検出および/または分離を可能にする。あるいは、このようなポリペプチド、タンパク質、またはタンパク質フラグメントは、それらに特異的に結合し得る抗体を検出するために固定され得る。
【0112】
本発明のタンパク質に対する抗体(ポリクローナルおよびモノクローナルの両方)は、従来の方法によって調製され得る。一般に、タンパク質は、最初に、適切な動物、好ましくはマウス、ラット、ウサギ、またはヤギを免疫するために使用される。ウサギおよびヤギは、得られ得る血清の容量、および標識された抗ウサギ抗体および抗ヤギ抗体の入手可能性に起因して、ポリクローナル血清の調製のために好ましい。免疫は、一般的に、タンパク質を生理食塩水(好ましくはフロイント完全アジュバントのようなアジュバント)に混合または乳化し、そしてその混合物または乳化物を非経口的に(一般的に皮下、または筋肉内に)注射することによって行われる。50〜200μg/注射の用量が、代表的に充分である。免疫は、一般的に、2〜6週後に生理食塩水を使用する(好ましくはフロイント不完全アジュバント)のタンパク質の1回以上の注射でブーストされる。あるいは、当該分野において公知の方法を使用するインビトロ免疫によって抗体を産生し得、これは、本発明の目的にとっては、インビボ免疫に等しいと考えられる。ポリクローナル抗血清は、免疫された動物からガラスまたはプラスチック製容器へ採血し、その血液を25℃で1時間インキュベートし、その後4℃で2〜18時間インキュベートすることによって得られる。この血清は、遠心分離(例えば1,000g、10分間)によって回収される。ウサギから、採血につき約20〜50mlが得られ得る。
【0113】
モノクローナル抗体は、KohlerおよびMilstein(Nature(1975)256:495〜96)の標準的方法、またはその改変版を使用して調製される。代表的には、マウスまたはラットが、上記のように免疫される。しかし、血清を抽出するために動物から採血するよりも、脾臓(および必要に応じていくつかの大きなリンパ節)が取り出され、そして単細胞へ解離される。もし所望ならば、脾臓細胞は、(非特異的付着細胞の回収後)細胞懸濁液をタンパク質抗原でコーティングされたプレートまたはウェルへアプライすることによって、スクリーニングされ得る。この抗原に特異的な膜結合免疫グロブリンを発現するB細胞は、このプレートに結合し、そして残りの懸濁液によって、洗い落とされない。生じるB細胞、または全ての解離された脾臓細胞は、次に骨髄腫細胞と融合するように誘導されてハイブリドーマを形成し、そして選択培地(例えばヒポキサンチン、アミノプテリン、チミジン培地、「HAT」)において培養される。生じるハイブリドーマは、限界希釈によってプレーティングされ、そして免疫する抗原に対して特異的に結合する(かつ関連しない抗原に結合しない)抗体の産生についてアッセイされる。選択されるMAb分泌ハイブリドーマは、次にインビトロ(例えば、組織培養瓶または中空繊維リアクター中で)、またはインビボ(マウスにおける腹水として)のいずれかで培養される。
【0114】
もし所望ならば、抗体は(ポリクローナルまたはモノクローナルいずれであっても)、従来技術を使用して標識され得る。適切な標識としては、以下が挙げられる:発蛍光団、発色団、放射性原子(特に32Pおよび125I)、電子密度試薬、酵素、および特異的結合パートナーを有するリガンド。酵素は、代表的に、その活性によって検出される。例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼは、通常、3,3’,5,5’−テトラメチルベンジジン(TMB)を青い色素(分光光度計を用いて定量可能)へ変換するその能力によって、検出される。「特異的結合パートナー」とは、高い特異性でリガンド分子に結合し得るタンパク質をいい、例えば抗原およびそれに特異的なモノクローナル抗体の場合である。他の特異的結合パートナーは、ビオチンおよびアビジンまたはストレプトアビジン、IgGおよびプロテインA、ならびに当該分野において公知の多くのレセプター−リガンド対を含む。同じ標識がいくつかの異なる様式で働き得るので、以上の記載が、種々の標識を別個のクラスへ分類することを意味しないことは、理解されるべきである。例えば、125Iは、放射性標識として、または電子密度試薬として働き得る。HRPは、酵素として、またはMAbについての抗原として働き得る。さらに、所望の効果のために、種々の標識を組合せ得る。例えば、MAbおよびアビジンはまた、本発明の実施において、標識を必要とする。従って、MAbをビオチンで標識して、そして125Iで標識したアビジン、またはHRPで標識した抗ビオチンMAbで、その存在を検出し得る。他の置換および可能性は、当業者に容易に明らかであり、そして本発明の範囲内に等しいと考えられる。
【0115】
本発明の抗原、免疫原、ポリペプチド、タンパク質、またはタンパク質フラグメントは、特定の結合パートナー抗体の形成を誘発する。本発明のこれらの抗原、免疫原、ポリペプチド、タンパク質、またはタンパク質フラグメントは、本発明の免疫原性組成物を含む。このような免疫原性組成物は、本発明の抗原、免疫原、ポリペプチド、タンパク質、またはタンパク質フラグメントを、促進または増強もしくは安定化するアジュバント、キャリア、または他の組成物をさらに含み得る(comprise or include)。このようなアジュバントおよびキャリアは、当業者に容易に理解され得る。
【0116】
(薬学的組成物)
薬学的組成物は、本発明のポリペプチド、抗体または核酸のいずれかを含み得る。この薬学的組成物は、治療上有効な量の、本願発明のポリペプチド、抗体、またはポリヌクレオチドのいずれかを含む。
【0117】
本明細書において使用される用語「治療上有効な量」とは、所望の疾患または状態を処置、改善、または予防するための治療薬剤の量、または、検出可能な治療効果または予防効果を示すための治療薬剤の量をいう。この効果は、例えば、キメラマーカーまたは抗原レベルによって検出され得る。治療効果はまた、熱病の患者に与えた場合に、体温低下のような、身体の症状における減少を含む。被験体に関する正確な有効量は、被験体の大きさおよび健康、状態の性質および程度、ならびに投与のために選択される治療または治療の組合せに依存する。従って、あらかじめ正確な有効量を特定することは有用ではない。しかし、所定状況のための有効量は、慣用的な実験によって決定され得、そして臨床医の判断内である。
【0118】
本発明の目的のために、有効な用量は、DNA構築物が投与される個体において、DNA構築物の約0.01mg/kg〜50mg/kgまたは0.05mg/kg〜約10mg/kgである。
【0119】
薬学的組成物はまた、薬学的に受容可能なキャリアを含み得る。用語「薬学的に受容可能なキャリア」とは、抗体またはポリペプチド、遺伝子、および他の治療薬剤のような、治療薬剤の投与のためのキャリアをいう。この用語は、この組成物を受け取る個体に有害な抗体の産生をそれ自体誘導しない、任意の薬学的キャリアをいい、そして、過度の毒性を伴わずに投与され得る。適切なキャリアは、タンパク質、多糖、ポリ乳酸、ポリグリコール酸、重合アミノ酸、アミノ酸コポリマー、および不活性ウイルス粒子のように、大きく、緩徐に代謝される高分子であり得る。このようなキャリアは、当業者に周知である。
【0120】
薬学的に受容可能な塩が、その中で使用され得る。例えば、塩酸塩、臭化水素塩、リン酸塩、硫酸塩などのような鉱酸塩;および酢酸塩、プロピオン酸塩、マロン酸塩、安息香酸塩などのような有機酸の塩である。薬学的に受容可能な賦形剤の徹底的な議論は、Remington’s Pharmaceutical Sciences(Mack Pub.Co.、N.J.1991)にて利用可能である。
【0121】
治療組成物における薬学的に受容可能なキャリアは、水、生理的食塩水、グリセロールおよびエタノールのような液体を含み得る。さらに、湿潤剤または乳化剤、pH緩衝物質などのような補助物質が、このようなビヒクルに存在し得る。代表的には、治療組成物は、液体溶液または懸濁液のいずれかの、注射可能物質として調製される;注射前に液体ビヒクルに溶解または懸濁するのに適切な固体形態もまた、調製され得る。リポソームは、薬学的に受容可能なキャリアの定義中に含まれる。
【0122】
(送達方法)
一旦処方されると、本発明の組成物は、その被験体へ直接投与され得る。処置される被験体は、動物であり得;特に、ヒト被験体が処置され得る。
【0123】
その組成物の直接送達は、一般的に、皮下的に、腹腔内に、静脈内に、または筋肉内のいずれかでの注入によって達成されるか、あるいは、組織の間質空間へ送達される。この組成物はまた、病巣へ投与され得る。他の投与様式には、経口投与、および肺投与、坐剤、および経皮(transdermal)適用ならびに経皮(transcutaneous)適用、針、および遺伝子銃またはハイポスプレー(hypospray)が含まれる。投薬処置は、単回用量スケジュール、または多数回用量スケジュールであり得る。
【0124】
(ワクチン)
本発明に従うワクチンは、予防的(すなわち、感染を予防するため)または治療(すなわち、感染後の疾患を処置するため)のいずれかであり得る。
【0125】
このようなワクチンは、免疫抗原、免疫原、免疫原性ポリペプチド、タンパク質もしくはタンパク質フラグメント、または核酸(例えば、リボ核酸またはデオキシリボ核酸)を、通常「薬学的に受容可能なキャリア」とともに含み、このキャリア自体は、その組成物を受ける個体に有害である抗体の産生を誘発しない任意のキャリアを含む。適切なキャリアは、代表的に、大きく、ゆっくり代謝される高分子(例えば、タンパク質、ポリサッカリド、ポリ乳酸、ポリグリコール酸、ポリマー性アミノ酸、アミノ酸コポリマー、脂質凝集物(例えば、油小滴またはリポソーム)、および不活性ウイルス粒子である。このようなキャリアは、当業者に周知である。さらに、これらのキャリアは免疫刺激薬剤(「アジュバント」)として機能し得る。さらに、この免疫原または抗原は、細菌毒素(例えば、ジフテリア、破傷風、コレラ、H.pyloriなどの病原由来の毒素)と結合体化され得る。
【0126】
この組成物の効力を増強するために好ましいアジュバントは、(1)アルミニウム塩(「明礬」)(例えば、水酸化アルミニウム、リン酸アルミニウム、硫酸アルミニウムなど);(2)水中油型乳濁液濁処方物(他の特定の免疫刺激薬剤(例えば、ムラミルペプチド(以下を参照のこと)または細菌細胞壁成分)を伴うか伴わない)を包含するが、それらに限定されず、例えば、以下:(a)5%スクアレン、0.5% Tween 80、および0.5% Span85(必要に応じて、種々の量のMTP−PE(以下を参照のこと)を含有するが、必要ではない)を含み、モデル110Y微小流体化器(Microfluidics、Newton、MA)のような微小流体化器を用いてμ未満の粒子へと処方されたMF59(PCT出願WO90/14837);(b)μ未満のエマルジョンへと微小流体化されたか、またはボルテックスして、より大きな粒子径エマルジョンを生成したかのいずれかである、10%スクアレン、0.4%Tween80、5%プルロニックブロックポリマーL121、およびthr−MDP(以下を参照のこと)を含有するSAF、ならびに(c)2%スクアレン、0.2%Tween80、およびモノホスホリピドA(MPL)、トレハロースジミコレート(TDM)、および細胞壁骨格(CWS)好ましくはMPLおよびCWS(DetoxTM)からなる群由来の1つ以上の細菌細胞壁成分を含むRibiTMアジュバント系(RAS)、(Ribi Immunochem、Hamilton、MT);(3)サポニンアジュバント(例えば、StimulonTM)(Cambridge Bioscience、Worcester、MA)を使用し得るか、またはそれから粒子(例えば、ISCOM(免疫刺激性複合体)を生成し得る;(4)完全フロイントアジュバント(CFA)および不完全フロイントアジュバント(IFA);(5)サイトカイン(例えば、インターロイキン(例えば、IL−1、IL−2、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−12など)、インターフェロン(例えば、γインターフェロン)、マクロファージコロニー刺激因子(M−CSF)、腫瘍壊死因子(TNF)など;(6)コレラ毒素(CT)、百日咳毒素(PT)、またはE.coli熱不安定性毒素(LT)(詳細には、LT−K63、LT−R72、CT−S109、PT−K9/G129)のような細菌ADP−リボース化毒素の無毒化変異体;例えば、WO93/13302およびWO92/19265を参照のこと;および(7)その組成物の効力を強化するための免疫刺激因子として作用する他の物質を包含するがそれらに限定されない。ミョウバンおよびMF59が好ましい。
【0127】
上記で言及したように、ムラミルペプチドは、N−アセチル−ムラミル−L−スレオニル−D−イソグルタミン(thr−MDP)、N−アセチル−ノルムラミル−L−アラニル−D−イソグルタミン(nor−MDP)、N−アセチルムラミル−L−アラニル−D−イソグルタミニル−L−アラニン−2−(1’−2’−ジパルミトイル−sn−グリセロ−3−ヒドロキシホスホリルオキシ)−エチルアミン(MTP−PE)などを包含するがそれらに限定されない。
【0128】
免疫原性組成物(例えば、抗原、薬学的に受容可能なキャリア、およびアジュバントを含み得る)を含むワクチン組成物は、代表的に、希釈剤(例えば、水、生理食塩水、グリセロール、エタノールなど)を含有する。さらに、補助物質(例えば、湿潤剤または乳化剤、pH緩衝物質など)が、このようなビヒクルに存在し得る。あるいは、免疫原組成物を含むワクチン組成物は、薬学的に受容可能なキャリア中に、抗原、ポリペプチド、タンパク質、タンパク質フラグメント、または核酸を含み得る。
【0129】
より詳細には、免疫原組成物を含むワクチンは、免疫学的に有効な量の免疫原性ポリペプチド、ならびに、必要な場合、任意の他の上記の成分を含む。「免疫学的に有効な量」とは、単回用量または一連の一部のいずれかでの個体へのその量の投与が、処置または予防に有効であることを意味する。この量は、処置される個体の健康状態および身体状態、処置される個体の分類上のグループ(例えば、ヒト以外の霊長類、霊長類など)、抗体を合成するための個体の免疫系の能力、所望される防御の程度、ワクチンの処方、医療状況の処置医の判断、および他の関連因子に依存して変化する。この量は、慣用的な治験を通して決定され得る比較的広範な範囲に入ることが予想される。
【0130】
代表的に、ワクチン組成物または免疫原性組成物は、液体溶液または懸濁物のいずれかとして、注射可能なように調製され;注射前に液体ビヒクルにおける溶液または懸濁物として適切な固体形態もまた調製され得る。この調製物はまた、薬学的に受容可能なキャリアの下で、上記に記載のように、アジュバント効果の強化のために乳化され得るかまたはリポソーム中にカプセル化され得る。
【0131】
免疫原組成物は、従来のように、非経口的(例えば、皮下、または筋肉内のいずれかでの注射による)に投与される。他の投与様式に適切なさらなる処方物は、経口処方物および肺処方物、坐剤、および経皮(transdermalおよびtranscutaneous)適用を含む。投薬処置は、単回用量スケジュールまたは多数回用量スケジュールであり得る。ワクチンは、他の免疫調節剤とともに投与され得る。
【0132】
タンパク質ベースのワクチンの代替として、DNAワクチン接種を使用し得る(例えば、RobinsonおよびTorres(1997)Seminars in Immunology 9:271−283;Donnellyら(1997)Annu Rev Immunol 15:617−648)。
【0133】
(遺伝子送達ビヒクル)
本発明の治療剤のコード配列を含む、哺乳動物における発現のためにその哺乳動物へ送達される構築物の送達のための遺伝子治療ビヒクルは、局所または全身的のいずれかで投与され得る。これらの構築物は、ウイルスベクターアプローチまたは非ウイルスベクターアプローチを、インビボまたはエキソビボの様式で利用し得る。このようなコード配列の発現は、内在性哺乳動物プロモーターまたは外来性プロモーターを用いて誘導され得る。このコード配列のインビボでの発現は、構成性または調節性のいずれかであり得る。
【0134】
本発明は、意図された核酸配列を発現し得る遺伝子送達ビヒクルを含む。この遺伝子送達ビヒクルは、好ましくは、ウイルスベクター、およびより好ましくはレトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルス(AAV)ベクター、ヘルペスウイルスベクター、またはαウイルスベクターである。このウイルスベクターはまた、アストロウイルスベクター、コロナウイルスベクター、オルトミクソウイルスベクター、パポバウイルスベクター、パラミクソウイルスベクター、パルボウイルスベクター、ピコルナウイルスベクター、ポックスウイルスベクター、またはトガウイルスベクターであり得る。一般的には、Jolly(1994)Cancer Gene Therapy 1:51−64;Kimura(1994)Human Gene Therapy 5:845−852;Connelly(1995)Human Gene Therapy 6:185−193;およびKaplitt(1994)Nature Genetics 6:148−153を参照のこと。
【0135】
レトロウイルスベクターは、当該分野で周知であり、これには、B型、C型およびD型のレトロウイルス、異種栄養性ウイルス(例えば、NZB−X1、NZB−X2およびNZB9−1(O’Neill(1985)J.Virol.53:160を参照のこと)多向性レトロウイルス(例えば、MCFおよびMCF−MLV(Kelly(1983)J.Virol.45:291を参照のこと)、スプマウイルスおよびレンチウイルスが含まれる。RNA Tumor Viruses、第2版、Cold Spring Harbor Laboratory、1985を参照のこと。
【0136】
レトロウイルス遺伝子治療ベクターの部分は、異なるレトロウイルスに由来し得る。例えば、レトロウイルスLTRは、マウス肉腫ウイルスに由来し得、tRNA結合部位はラウス肉腫ウイルスに由来し得、パッケージングシグナルはマウス白血病ウイルスに由来し得、そして第二の鎖合成の起源はトリ白血病ウイルスに由来し得る。
【0137】
これらの組換えレトロウイルスベクターを使用して、適切なパッケージング細胞株へそれらを導入することによって形質導入受容性レトロウイルスベクター粒子を生成し得る(米国特許第5,591,624号を参照のこと)。レトロウイルスベクターは、レトロウイルス粒子へのキメラインテグラーゼ酵素の組込みによって宿主細胞DNAへの部位特異的組込みについて構築され得る(WO96/37626号を参照のこと)。この組換えウイルスベクターは複製欠損組換えウイルスであることが好ましい。
【0138】
上記に記載のレトロウイルスベクターを伴う使用について適切なパッケージング細胞株は、当該分野で周知であり、容易に調製され(WO95/30763号およびWO92/05266号を参照のこと)、そしてこれを使用して、組換えベクター粒子の生産のためのプロデューサー細胞株(これは、ベクター細胞株または「VCL」とも称される)を作製し得る。好ましくは、このパッケージング細胞株は、ヒトの親細胞(例えば、HT1080細胞)またはミンク親細胞株から作製され、これは、ヒト血清における不活化を除去する。
【0139】
レトロウイルス遺伝子治療ベクターの構築のために好ましいレトロウイルスは、トリ白血病ウイルス、ウシ白血病ウイルス、マウス白血病ウイルス、ミンク細胞フォーカス形成ウイルス(Mink−Cell Focus−Inducing Virus)、マウス肉腫ウイルス、細網内皮症ウイルス、およびラウス肉腫ウイルスを含む。特に好ましいマウス白血病ウイルスは、4070Aおよび1504A(HartleyおよびRowe(1976)J.Virol.19:19−25)、Abelson(ATCC番号VR−999)、Friend(ATCC番号VR−245)、Graffi、Gross(ATCC番号VR−590)、Kirsten、Harvey肉腫ウイルスおよびRauscher(ATCC番号VR−998)およびモロニーマウス白血病ウイルス(ATCC番号VR−190)を含む。このようなレトロウイルスは、寄託機関または収集機関(例えば、アメリカンタイプカルチャーコレクション(「ATCC」)、Rockville、Maryland)から入手し得るか、または一般に利用可能な技術を用いて公知の供給源から単離され得る。
【0140】
本発明において使用可能な例示的な公知のレトロウイルス遺伝子治療ベクターは、特許出願GB2200651、EP0415731、EP0345242、EP0334301、WO89/02468;WO89/05349、WO89/09271.WO90/02806、WO90/07936、WO94/03622、WO93/25698、WO93/25234、WO93/11230、WO93/10218、WO91/02805、WO91/02825、WO95/07994、米国特許第5,219,740号、同4,405,712号、同4,861,719号、同4,980,289号、同4,777,127号、同5,591,624号に記載されるものを含む。Vile(1993)Cancer Res 53:3860−3864;Vile(1993)Cancer Res.53:962−967;Ram(1993)Cancer Res 53(1993)83−88;Takamiya(1992)J Neurosci Res 33:493−503;Baba(1993)J Neurosurg 79:729−735;Mann(1983)Cell 33:153;Cane(1984)Proc Natl Acad Sci 81;6349;およびMiller(1990)Human Gene Therapy 1もまた参照のこと。
【0141】
ヒトアデノウイルス遺伝子治療ベクターもまた当該分野で公知であり、そして本発明において使用可能である。例えば、Berkner(1988)Biotechniques 6:616およびRosenfeld(1991)Science 252:431;ならびにWO93/07283、WO93/06223、およびWO93/07282を参照のこと。本発明において使用可能な例示的な公知のアデノウイルス遺伝子治療ベクターは、上記に参照される文書およびWO94/12649、WO93/03769、WO93/19191、WO94/28938、WO95/11984、WO95/00655、WO95/27071、WO95/29993、WO95/34671、WO96/05320、WO94/08026、WO94/11506、WO93/06223、WO94/24299、WO95/14102、WO95/24297、WO95/02697、WO94/28152、WO94/24299、WO95/09241,WO95/25807、WO95/05835、WO94/18922およびWO95/09654において記載されるものを含む。あるいは、Curiel(1992)Hum.Gene Ther.3:147−154に記載されるような殺傷したアデノウイルスに連結したDNAの投与が使用され得る。本発明の遺伝子送達ビヒクルはまた、アデノウイルス随伴ウイルス(AAV)ベクターを含む。本発明における使用のためのこのようなベクターの主要なおよび好ましい例は、Srivastava WO93/09239に開示されるAAV−2ベースのベクターである。最も好ましいAAVベクターは、2つのAAV逆方向末端反復を含む。ここで、ネイティブD配列は、ヌクレオチドの置換によって改変され、その結果、少なくとも5つのネイティブなヌクレオチドおよび18までのネイティブヌクレオチド、好ましくは少なくとも10のネイティブヌクレオチドから18までのネイティブヌクレオチド、最も好ましくは10のネイティブヌクレオチドが維持され、そしてD配列の残りのヌクレオチドが欠失またはネイティブでないヌクレオチドで置換されている。AAV逆方向末端反復のネイティブなD配列は、各AAV逆方向末端反復において(すなわち、各末端に1つの配列が存在する)20の連続するヌクレオチドの配列であって、これは、HP形成に関与しない。ネイティブでない置換ヌクレオチドは、同じ位置でのネイティブなD配列に見出されるヌクレオチド以外の任意のヌクレオチドであり得る。他の使用可能な例示的なAAVベクターは、pWP−19、pWN−1であり、これらは両方ともNahreini(1993)Gene 124:257−262に開示される。このようなAAVベクターの別の例は、psub201(Samulski(1987)J.Virol.61:3096を参照のこと)である。別の例示的なAAVベクターは、Double−D ITRベクターである。Double−D ITRベクターの構築は、米国特許第5,478,745号に開示される。なお他のベクターは、Carterの米国特許第4,797,368号およびMuzyczkaの米国特許第5,139,941号、Chartejeeの米国特許第5,474,935号ならびにKotinのWO94/288157に開示されるものである。本発明において使用可能なAAVベクターのなおさらなる例は、SSV9AFABTKneoであり、これは、AFPエンハンサーおよびアルブミンプロモーターを含み、そして肝臓において優性に発現を指向する。その構造および構築は、Su(1996)Human Gene Therapy 7:463−470に開示される。さらなるAAV遺伝子治療ベクターは、米国特許第5,354,678号、同5,173,414号、同5,139,941号、および同5,252,479号に開示される。
【0142】
本発明の配列を含む遺伝子治療ベクターはまた、ヘルペスウイルスベクターを含む。主要なおよび好ましい例は、チミジンキナーゼポリペプチドをコードする配列を含む単純ヘルペスウイルスベクター(例えば、米国特許第5,288,641号、およびEP0176170(Roizman)に開示されるもの)である。さらなる例示的な単純ヘルペスウイルスベクターは、WO95/04139(Wistar Institute)に開示されるHFEM/ICP6−LacZ、Geller(1988)Science 241:1667−1669ならびにWO90/09441およびWO92/07945に記載されるpHSVlac、Fink(1992)Human Gene Therapy 3:11−19に記載されるHSV Us3::pgC−lacZ、ならびにEP0453242(Breakefield)に記載されるHSV 7134、2RH 105およびGAL4、ならびにATCCに受託番号ATCC VR−977およびATCC VR−260として寄託されたものを含む。
【0143】
本発明において使用され得るαウイルス遺伝子治療ベクターもまた意図される。好ましいαウイルスベクターは、シンドビスウイルスベクターである。トガウイルス、セムリキ森林ウイルス(ATCC VR−67;ATCC VR−1247)、Middlebergウイルス(ATCC VR−370)、ロスリバーウイルス(ATCC VR−373;ATCC VR−1246)、ベネズエラウマ脳脊髄炎ウイルス(ATCC VR−923;ATCC VR−1250;ATCC VR−1249;ATCC VR−532)および米国特許第5,0091,309号、同5,217,879号、およびWO92/10578に記載されるもの。より詳細には、米国特許出願第08/405,627号(1995年3月15日出願)、WO94/21792号、WO92/10578号、WO95/07994号、米国特許第5,091,309号、および米国特許第5,217,879号に記載されるαウイルスベクターが使用可能である。このようなαウイルスは、ATCC、Rockville、Marylandのような寄託機関または収集機関から入手し得るか、または一般的に利用可能な技術を用いて公知の供給源から単離され得る。好ましくは、細胞傷害性を減少させたαウイルスベクターを使用する(米国特許出願番号08/679640号を参照のこと)。
【0144】
DNAベクター系(例えば、真核生物層状発現系)もまた、本発明の核酸の発現に有用である。真核生物層状発現系の詳細な説明についてはWO95/07994を参照のこと。好ましくは、本発明の真核生物層状発現系はαウイルスベクターに由来し、そして最も好ましくはシンドビスウイルスベクターに由来する。
【0145】
本発明における使用に適切な他のウイルスベクターは、以下に由来するものが挙げられる:ポリオウイルス(例えば、ATCC VR−58およびEvans、Nature 339(1989)385およびSabin(1973)J.Biol.Standardization 1:115に記載されるもの);リノウイルス(例えば、ATCC VR−1110およびArnold(1990)J Cell Biochem L401に記載されるもの);ポックスウイルス(例えば、カナリアポックスルウイルスまたはワクシニアウイルス(例えば、ATCC VR−111およびATCC VR−2010ならびにFisher−Hoch(1989)Proc Natl Acad Sci 86:317;Flexner(1989)Ann NY Acad Sci 569:86、Flexner(1990)Vaccine 8:17;米国特許第4,603,112号および同4,769,330号ならびにWO89/01973号に記載されるもの);SV40ウイルス(例えば、ATCC VR−305およびMulligan(1979)Nature 277:108およびMadzak(1992)J Gen Virol 73:1533に記載されるもの);インフルエンザウイルス(例えば、ATCC VR−797および米国特許第5,166,057号およびEnami(1990)Proc Natl Acad Sci 87:3802−3805;EnamiおよびPalese(1991)J Virol 65:2711−2713およびLuytjes(1989)Cell 59:110(McMichael(1983)NEJ Med 309:13ならびにYap(1978)Nature 273:238およびNature(1979)277:108もまた参照のこと)に記載されるような逆遺伝子技術を使用して作製した組換えインフルエンザウイルス);EP−0386882およびBuchschacher(1992)J.Virol.66:2731に記載されるようなヒト免疫不全ウイルス;麻疹ウイルス(例えば、ATCC VR−67およびVR−1247ならびにEP−0440219に記載されるもの);アウラ(Aura)ウイルス(例えば、ATCC VR−368);ベバル(Bebaru)ウイルス(例えば、ATCC VR−600およびATCC VR−1240);カバス(Cabassou)ウイルス(例えば、ATCC VR−922);チクングニヤウイルス(例えば、ATCC VR−64およびATCC VR−1241);フォートモーガン(Fort Morgan)ウイルス(例えば、ATCC VR−924);ゲタウイルス(例えば、ATCC VR−369およびATCC VR−1243);キジラガハ(Kyzylagach)ウイルス(例えば、ATCC VR−927);マヤロウイルス(例えば、ATCC VR−66);ムカン(Mucambo)ウイルス(例えば、ATCC VR−580およびATCC VR−1244);ヌヅム(Ndumu)ウイルス(例えば、ATCC VR−371);ピクスナ(Pixuna)ウイルス(例えば、ATCC VR−372およびATCC VR−1245);トナテ(Tonate)ウイルス(例えば、ATCC VR−925);トリニティ(Trinity)ウイルス(例えば、ATCC VR−469);ユナ(Una)ウイルス(例えば、ATCC VR−374);ワタロア(Whataroa)ウイルス(例えば、ATCC VR−926);Y−62−33ウイルス(例えば、ATCC VR−375);オニョンニョンウイルス、東部脳脊髄炎ウイルス(例えば、ATCC VR−65およびATCC VR−1242);西部脳脊髄炎ウイルス(例えば、ATCC VR−70、ATCC VR−1251、ATCC VR−622およびATCC VR−1252);ならびにコロナウイルス(例えば、ATCC VR−740)およびHamre(1966)Proc Soc Exp Biol Med 121:190に記載のもの。
【0146】
本発明の組成物の細胞への送達は、上記に言及したウイルスベクターに限定されない。他の送達方法および媒体が使用され得る(例えば、核酸発現ベクター、殺傷したアデノウイルスに連結したポリカチオン性縮合DNAかまたは連結してないポリカチオン性縮合DNA単独(例えば、米国特許出願番号08/366,787(1994年12月30日出願)およびCuriel(1992)Hum Gene Ther 3:147−154を参照のこと)、リガンド連結DNA(例えば、Wu(1989)J Biol Chem 264:16985−16987を参照のこと)、真核生物細胞送達ビヒクル細胞(例えば、米国特許出願番号08/240,030(1994年5月9日出願)および米国特許出願番号08/404,796を参照のこと)、光重合化ヒドロゲル物質の沈着、手動の遺伝子送達粒子銃(米国特許第5,149,655号に記載されるような)、米国特許第5,206,152およびWO92/11033に記載されるような電離放射線、核電荷中和または細胞膜との融合)。さらなるアプローチは、Philip(1994)Mol Cell Biol 14:2411−2418およびWoffendin(1994)Proc Natl Acad Sci 91:1581−1585に記載される。
【0147】
粒子媒介遺伝子移入が使用され得る(例えば、米国特許出願60/023,867号を参照のこと)。手短には、配列を、高レベル発現のための従来の制御配列を含む従来のベクターに挿入し得、次いで細胞標的化リガンド(例えば、アシアロオロソムコイド(WuおよびWu(1987)J.Biol.Chem.262:4429−4432に記載されるような)、Hucked(1990)Biochem Pharmacol 40:253−263に記載されるようなインスリン、Plank(1992)Bioconjugate Chem 3:533−539に記載されるようなガラクトース、ラクトースまたはトランスフェリン)に連結された合成遺伝子移入分子(例えば、ポリリジン、プロタミンおよびアルブミン、のような重合DNA結合カチオン)とともにインキュベートされ得る。
【0148】
裸のDNAもまた、宿主細胞を形質転換するために使用され得る。例示的な裸のDNA導入方法は、WO90/11092および米国特許第5,580,859号に記載される。取り込み効率は、生分解性のラテックスビーズを用いて改良され得る。DNAコートラテックスビーズは、ビーズによるエンドサイトーシス開始の後に効率よく細胞へと輸送される。この方法は、ビーズを処理して疎水性を高め、それによってエンドソームの破壊および細胞質へのDNAの放出を容易にすることによってさらに改良され得る。
【0149】
遺伝子送達ビヒクルとして作用し得るリポソームは、米国特許第5,422,120号、WO95/13796、WO94/23697、WO91/14445、およびEP524,968に記載される。米国特許出願60/023,867に記載されるように、非ウイルス性送達において、ポリペプチドをコードする核酸配列は、高レベル発現のための従来の制御配列を含む従来のベクターへと挿入され得、次いで細胞標的化リガンド(例えば、アシアロオロソムコイド、インスリン、ガラクトース、ラクトースまたはトランスフェリン)に連結された、重合性DNA結合カチオン(例えば、ポリリジン、プロタミン、およびアルブミン)のような合成遺伝子移入分子とともにインキュベートされ得る。他の送達系は、種々の組織特異的または普遍的作用性のプロモーターの制御下に遺伝子を含むDNAをカプセル化するためのリポソームの使用を含む。さらに、使用に適切な非ウイルス送達は、機械的送達系(例えば、Woffendinら(1994)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91(24):11581−11585に記載されるアプローチを含む。さらに、コード配列およびそのようなものの発現産物は、光重合化ヒドロゲル物質の沈着を介して送達され得る。コード配列の送達について使用され得る、遺伝子送達のための他の従来の方法は、例えば、手動の遺伝子移入粒子銃(米国特許第5,149,655号に記載されるような);移入された遺伝子を活性化するための電離放射線の使用(米国特許第5,206,152号およびWO92/11033に記載されるような)を含む。
【0150】
例示的なリポソームおよびポリカチオン性遺伝子送達ビヒクルは、米国特許第5,422,120号および同4,762,915号;WO95/13796;WO94/23697;およびWO91/14445;EP−0524968;およびStryer、Biochemistry、236−240頁(1975)、W.H.Freeman、San Francisco;Szoka(1980)Biochem Biophys Acta 600:1;Bayer(1979) Biochem Biophys Acta 550:464;Rivnay(1987)Meth Enzymol 149:119;Wang(1987)Proc Natl Acad Sci 84:7851;Plant(1989)Anal Biochem 176:420に記載されるものである。
【0151】
ポリヌクレオチド組成物は、治療有効量の遺伝子治療ビヒクル(この用語は上記に定義されるとおりである)を含み得る。本発明の目的のために、有効用量は、投与される個体において、約0.01mg/kg〜50mg/kgまたは0.05mg/kg〜約10mg/kgのDNA構築物である。
【0152】
(送達方法)
一旦処方されると、本発明のポリヌクレオチド組成物は、(1)被験体に直接);(2)エキソビボで被験体由来の細胞に送達されて;または(3)組換えタンパク質の発現のためにインビトロで、投与され得る。処置される被験体は、哺乳動物または鳥類であり得る。ヒト被験体もまた処置され得る。
【0153】
この組成物の直接送達は、皮下、腹腔内、静脈内、または筋肉内の注射によって、または組織の間質空間への送達のいずれかによって一般的に達成される。この組成物はまた、腫瘍または病巣へ投与され得る。他の投与様式は、経口投与または肺投与、坐剤、および経皮適用、針、および遺伝子銃またはハイポスプレーを含む。投薬治療は、単回用量スケジュールまたは多数回用量スケジュールであり得る。
【0154】
エキソビボ送達および被験体への形質転換細胞の再移植のための方法は、当該分野で公知であり、そして例えばWO93/14778に記載されている。エキソビボ適用に有用である細胞の例は、例えば、幹細胞、特に、造血細胞、リンパ細胞、マクロファージ、樹状細胞または腫瘍細胞を含む。
【0155】
一般的に、エキソビボ適用およびインビトロ適用の両方のための核酸の送達は、以下の手順:例えば、デキストラン媒介トランスフェクション、リン酸カルシウム沈降、ポリブレン媒介トランスフェクション、原形質融合、エレクトロポレーション、ポリヌクレオチドのリポソーム内へのカプセル化、およびDNAの核への直接の微量注入(これらはすべて当該分野で周知である)で達成され得る。
【0156】
(ポリヌクレオチドおよびポリペプチドの薬学的組成物)
上記に記載の薬学的に受容可能なキャリアおよび塩に加えて、以下のさらなる薬剤がポリヌクレオチド組成物および/またはポリペプチド組成物とともに使用され得る。
【0157】
(A.ポリペプチド)
1つの例は、限定することなく以下を包含するポリペプチドである:アシアロオロソムコイド(ASOR);トランスフェリン;アシアロ糖タンパク質;抗体;抗体フラグメント;フェリチン;インターロイキン;インターフェロン;顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、顆粒球コロニー刺激因子(G−CSF)、マクロファージコロニー刺激因子(M−CSF)、幹細胞因子およびエリスロポエチン。ウイルス抗原(例えば、エンベロープタンパク質)もまた、使用され得る。また、他の侵襲性生物由来のタンパク質(例えば、RIIとして知られるPlasmodium falciparumの環境スポロゾイト(circumsporozoite)タンパク質由来の17アミノ酸ペプチド)。
【0158】
(B.ホルモン、ビタミンなど)
包含され得る他の群は、例えば、ホルモン、ステロイド、アンドロゲン、エストロゲン、甲状腺ホルモン、またはビタミン、葉酸である。
【0159】
(C.ポリアルキレン、ポリサッカリドなど)
また、ポリアルキレングリコールが、所望のポリヌクレオチドまたはポリペプチドとともに含有され得る。好ましい実施態様において、ポリアルキレングリコールは、ポリエチレングリコールである。さらに、モノサッカリド、ジサッカリド、またはポリサッカリドが含有され得る。この局面の好ましい実施態様において、このポリサッカリドは、デキストランまたはDEAEデキストランである。また、キトサンおよびポリ(乳酸−コ−グリコリド)である。
【0160】
(D.脂質およびリポソーム)
所望のポリヌクレオチドまたはポリペプチドはまた、被験体またはそれに由来する細胞への送達の前に、脂質中にカプセル化され得るか、またはリポソーム中にパッケージングされ得る。
【0161】
脂質カプセル化は、一般的に核酸に安定に結合し得るか、または核酸を捕捉および維持し得るリポソームを用いて達成される。縮合ポリヌクレオチドまたは縮合ポリペプチドの脂質調製物に対する比は、変動し得るが、一般的に約1:1(mgDNA:マイクロモル脂質)であるか、またはより多くの脂質である。核酸の送達のためのキャリアとしてのリポソーム使用の概説については、HugおよびSleight(1991)Biochim.Biophys.Acta.1097:1−17;Straubinger(1983)Meth.Enzymol.101:512−527を参照のこと。
【0162】
本発明における使用のためのリポソーム調製物は、カチオン性(正に荷電した)アニオン性(負に荷電した)および中性の調製物を包含する。カチオン性リポソームは、機能的な形態で、プラスミドDNA(Felgner(1987)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 84:7413−7416);mRNA(Malone(1989)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:6077−6081;および精製した転写因子(Debs(1990)J.Biol.Chem.265:10189−10192)の細胞内送達を媒介することが示されている。
【0163】
カチオン性リポソームは容易に入手可能である。例えば、N[1−2,3−ジオレイルオキシ)プロピル]−N,N,N−トリエチルアンモニウム(DOTMA)リポソームは、GIBCO BRL、Grand Island、NYから商標リポフェクチン(Lipofectin)の下で入手可能である(Felgner前出もまた参照のこと)。他の市販されているリポソームは、トランスフェクテース(transfectace)(DDAB/DOPE)およびDOTAP/DOPE(Boerhinger)を含む。他のカチオン性リポソームは、当該分野で周知の技法を使用する容易に利用可能な物質から調製され得る。例えば、DOTAP(1,2−ビス(オレイルオキシ)−3−(トリメチルアンモニオ)プロパン)リポソームの合成の記載について、Szoka(1978)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 75:4194−4198;WO90/11092を参照のこと。
【0164】
同様に、アニオン性および中性リポソームは、例えば、Avanti Polar Lipids(Birmingham,AL)から容易に入手可能であるか、または容易に入手可能な物質を使用して容易に調製され得る。このような物質には、とりわけ、ホスファチジルコリン、コレステロール、ホスファチジルエタノールアミン、ジオレオイルホスファチジルコリン(DOPC)、ジオレオイルホスファチジルグリセロール(DOPG)、ジオレオイルホスファチジルエタノールアミン(DOPE)が含まれる。これらの物質はまた、適切な比率のDOTMAおよびDOTAPの出発物質と混合される。これらの物質を使用してリポソームを作製する方法は、当該分野で周知である。
【0165】
このリポソームは、多重膜のベシクル(MLV)、小さな単一膜ベシクル(SUV)、または大きな単一膜のベシクル(LUV)を含み得る。種々のリポソーム−核酸複合体は当該分野で公知の方法を使用して調製され得る。例えば、Straubinger(1983)Meth.Immunol.101:512−527;Szoka(1978)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 75:4194−4198;Papahadjopoulos(1975)Biochim.Biophys.Acta 394:483;Wilson(1979)Cell 17:77;DeamerおよびBangham(1976)Biochim.Biophys.Acta 443:629;Ostro(1977)Biochem.Biophys.Res.Commun.76:836;Fraley(1979)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 76:3348;EnochおよびStrittmatter(1979)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 76:145;Fraley(1980)J.Biol.Chem.(1980)255:10431;SzokaおよびPapahadjopoulos(1978)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 75:145;ならびにSchaefer−Ridder(1982)Science 215:166を参照のこと。
【0166】
(E.リポタンパク質)
さらに、リポタンパク質が、送達されるポリヌクレオチドまたはポリペプチドとともに含まれ得る。利用されるリポタンパク質の例は、キロミクロン、HDL、IDL、LDL、およびVLDLを含む。これらのタンパク質の変異体、フラグメント、または融合物もまた、使用され得る。また、天然に存在するリポタンパク質の改変体(例えば、アセチル化されたLDL)が使用され得る。これらのリポタンパク質は、リポタンパク質レセプターを発現する細胞へのポリヌクレオチドの送達を標的化し得る。好ましくは、リポタンパク質が、送達されるポリヌクレオチドとともに含まれる場合、他の標的化リガンドはその組成物中には含まれない。
【0167】
天然に存在するリポタンパク質は、脂質およびタンパク質部分を含む。このタンパク質部分は、アポタンパク質として知られる。現在では、アポタンパク質A、B、C、D、およびEが単離および同定されている。これらの少なくとも2つはいくつかのタンパク質を含み、ローマ数字、AI、AII、AIV;CI、CII、CIIIによって命名されている。
【0168】
1つのリポタンパク質は、1を超えるアポタンパク質を含み得る。例えば、天然に存在するキロミクロンは、A、B、C、およびEからなり、そして時間がたてばこれらのリポタンパク質はAを欠失し、そしてCおよびEアポタンパク質を獲得する。VLDLは、A、B、C、およびEアポタンパク質を含み、LDLはアポタンパク質Bを含み;そしてHDLは、アポタンパク質A、C、およびEを含む。
【0169】
これらのアポタンパク質のアミノ酸は公知であり、そして例えば、Breslow(1985)Annu Rev.Biochem 54:699;Law(1986)Adv.Exp Med.Biol.151:162;Chen(1986)J Biol Chem 261:12918;Kane(1980)Proc Natl Acad Sci USA 77:2465;およびUtermann(1984)Hum Genet 65:232に記載されている。
【0170】
リポタンパク質は、トリグリセリド、コレステロール(遊離およびエステル)、およびリン脂質を含む、種々の脂質を含む。この脂質の組成は、天然に存在するリポタンパク質において変化する。例えば、キロミクロンは、主としてトリグリセリドを含む。天然に存在するリポタンパク質の脂質含有物のより詳細な記載は、例えば、Meth.Enzymol.128(1986)に見いだされ得る。この脂質の組成は、レセプター結合活性についてアポタンパク質の立体構造において補助するために選択される。脂質の組成はまた、ポリヌクレオチド結合分子との疎水性相互作用および会合を容易にするように選択され得る。
【0171】
天然に存在するリポタンパク質は、例えば、血清から超遠心分離によって単離され得る。そのような方法は、Meth.Enzymol.(前出);Pitas(1980)J.Biochem.255:5454−5460およびMahey(1979)J Clin.Invest 64:743−750に記載される。
【0172】
リポタンパク質はまた、インビトロまたは所望の宿主細胞中のアポタンパク質遺伝子の発現による組換え方法によって産生され得る。例えば、Atkinson(1986)Annu Rev Biophys Chem 15:403およびRadding(1958)Biochim Biophys Acta 30:443を参照のこと。
【0173】
リポタンパク質はまた、Biomedical Techniologies,Inc.,Stoughton,Massachusetts,USAのような商業的な供給者から購入され得る。
【0174】
さらなるリポタンパク質の記載は、Zuckermannら、PCT/US97/14465に見い出され得る。
【0175】
(F.ポリカチオン性薬剤)
ポリカチオン性薬剤は、送達される所望のポリヌクレオチドまたはポリペプチドを有する組成物中に、リポタンパク質を伴って、またはリポタンパク質を伴わずに含まれ得る。
【0176】
ポリカチオン性薬剤は、代表的には、生理的に適切なpHにおいて正味の正電荷を示し、そして所望の位置への送達を容易にするための核酸の電荷を中和し得る。これらの薬剤は、インビトロ、エキソビボ、およびインビボ適用のいずれもを有する。ポリカチオン性薬剤は、生きている被験体に、筋肉内、皮下などのいずれかで核酸を送達するために使用され得る。
【0177】
以下は、ポリカチオン性薬剤としての有用なポリペプチドの例である:ポリリジン、ポリアルギニン、ポリオルニチン、およびプロタミン。他の例は、ヒストン、プロタミン、ヒト血清アルブミン、DNA結合タンパク質、非ヒストン染色体タンパク質、DNAウイルス由来のコートタンパク質(例えば、X174)を含む。転写因子もまた、DNAに結合するドメインを含み、従って核酸縮合薬剤として有用であり得る。手短に言えば、転写因子(例えば、C/CEBP、c−jun、c−fos、AP−1、AP−2、AP−3、CPF、Prot−1、Sp−1、Oct−1、Oct−2、CREP、およびTFIID)は、DNA配列に結合する塩基性ドメインを含む。
【0178】
有機ポリカチオン性薬剤は、スペルミン、スペルミジン、およびプトレシン(purtrescine)を含む。
【0179】
ポリカチオン性薬剤の大きさおよびその物理的特性は、上記のリストから外挿されて、他のポリペプチドのポリカチオン性薬剤が構築され得るか、または合成ポリカチオン性薬剤が産生され得る。
【0180】
(合成ポリカチオン性薬剤)
有用な合成ポリカチオン性薬剤は、例えば、DEAE−デキストラン、ポリブレンを含む。LipofectinTM、およびlipofectAMINETMは、ポリヌクレオチドまたはポリペプチドと組み合わせた場合に、ポリカチオン性複合体を形成するモノマーである。
【0181】
(免疫診断アッセイ)
本発明のNeisserial抗原は、抗体レベルを検出するためのイムノアッセイにおいて使用され得る(または、逆に抗Neisserial抗体は、抗原レベルを検出するために使用され得る)。充分に規定された組換え抗原に基づくイムノアッセイは、侵襲性の診断方法と置き換えるために開発され得る。生物学的サンプル(例えば、血液サンプルまたは血清サンプルを含む)内のNeisserialタンパク質に対する抗体が検出され得る。このイムノアッセイの設計は、多くのバリエーションの対象であり、そして種々のこれらは当該分野で公知である。イムノアッセイのプロトコルは、例えば、競合アッセイ、または直接反応アッセイ、またはサンドイッチ型アッセイに基づき得る。プロトコルはまた、例えば、固体支持体を使用し得るか、または免疫沈降によってなされ得る。ほとんどのアッセイは、標識された抗体またはポリペプチドの使用を含む;その標識は、例えば、蛍光分子、化学発光分子、放射性分子、または色素分子であり得る。プローブからのシグナルを増幅するアッセイもまた公知である;これらの例は、ビオチンおよびアビジンを利用するアッセイ、ならびに酵素標識および酵素媒介イムノアッセイ(例えば、ELISAアッセイ)である。
【0182】
免疫診断に適切でありそして適切な標識試薬を備えるキットは、適切な容器中に、アッセイの実行に必要とされる残りの試薬および物質(例えば、適切な緩衝液、塩溶液など)ならびに適切なアッセイの説明書のセットと共に、本発明の組成物を含む適切な物質をパッケージすることによって構築される。
【0183】
(核酸ハイブリダイゼーション)
「ハイブリダイゼーション」とは、水素結合による2つの核酸配列の互いの会合をいう。代表的には、1つの配列は、固体支持体に固定され、そして他方は溶液中で遊離している。次いで、2つの配列は水素結合に好ましい条件下で互いに接触される。この結合に影響を与える因子は以下を含む:溶媒のタイプおよび容量;反応温度;ハイブリダイゼーションの時間;撹拌;液体相の配列の固体支持体への非特異的な付着をブロックする薬剤(Denhardt’s試薬またはBLOTTO);配列の濃度;配列の会合の速度を増大させる化合物(硫酸デキストランまたはポリエチレングリコール)の使用;およびハイブリダイゼーション後の洗浄条件のストリンジェンシー。Sambrookら(前出)第2巻、第9章、9.47〜9.57頁を参照のこと。
【0184】
「ストリンジェンシー」とは、異なる配列よりも非常に類似する配列の会合に好ましいハイブリダイゼーション反応における条件をいう。例えば、研究中のハイブリッドの計算されたTmより約120〜200℃低い温度および塩濃度の組み合わせが選択されるべきである。温度および塩条件はしばしば、フィルターに固定したゲノムDNAのサンプルが目的の配列にハイブリダイズし、次いで異なるストリンジェンシーの条件下で洗浄される、予備的な実験において経験的に決定され得る。Sambrookら、9.50頁を参照のこと。
【0185】
例えば、サザンブロットを行う場合、考慮する変数は、(1)ブロットされるDNAの複雑さ、および(2)プローブと検出される配列との間の相同性である。研究されるフラグメント全量は、プラスミドまたはファージ消化物については0.1〜1μg、非常に複雑な真核生物ゲノム中の単一コピーについては10−9〜10−8gまで、10倍変化し得る。より低い複雑さのポリヌクレオチドについては、実質的により短いブロッティング、ハイブリダイゼーション、および曝露回数、より少量の出発ポリヌクレオチド、ならびにより低い非活性のプローブが使用され得る。例えば、単一コピーの酵母遺伝子は、1μgの酵母DNAで開始し、2時間ブロットし、そして4〜8時間108cpm/μgのプローブを用いてハイブリダイズして、わずか1時間の曝露時間を用いて検出され得る。単一コピーの哺乳動物遺伝子について、保存性のアプローチは、10μgのDNAで開始し、一晩ブロットし、そして108cpm/μgより多いプローブを用いて10%硫酸デキストランの存在下で一晩ハイブリダイズし、約24時間の曝露時間を生じる。
【0186】
いくつかの因子が、プローブと目的のフラグメントとの間のDNA−DNAハイブリッドの融解温度(Tm)、ならびに、結果として、ハイブリダイゼーションおよび洗浄についての適切な条件に影響を与え得る。多くの場合において、そのプローブはフラグメントに対して100%相同なわけではない。他の共通して直面する変化には、長さ、およびハイブリダイズする配列の全G+C含量、ならびにイオン強度およびハイブリダイゼーション緩衝液のホルムアミド含量が含まれる。これらのすべての因子の効果は、一つの式によって近似され得る:
Tm=81+16.6(log10Ci)+0.4[%(G+C)]−0.6(%ホルムアミド)−600/n−1.5(%ミスマッチ)。
ここでCiは塩濃度(一価イオン)であり、そしてnは塩基対内のハイブリッドの長さである(MeinkothおよびWahl(1984)Anal.Biochem.138:267−284からわずかに改変した)。
【0187】
ハイブリダイゼーション実験の設計において、核酸ハイブリダイゼーションに影響を与えるいくつかの因子が簡便に変更され得る。ハイブリダイゼーションおよび洗浄の温度ならびに洗浄時の塩濃度を調整するのが最も単純である。ハイブリダイゼーション温度(すなわち、ストリンジェンシー)が上昇するにつれて、非相同的な鎖の間で起こるハイブリダイゼーションは起こりにくくなるようであり、結果として、バックグラウンドが減少する。放射標識したプローブが固定化されたフラグメントと完全に相同ではない場合(遺伝子ファミリーおよび種間のハイブリダイゼーション実験における場合で頻繁であるように)、ハイブリダイゼーション温度は低下されなければならず、そしてバックグラウンドが増大する。洗浄の温度は、類似の様式で、ハイブリダイゼーションバンドの強度、およびバックグラウンドの程度に影響を与える。洗浄のストリンジェンシーはまた、塩濃度の減少とともに増大する。
【0188】
一般的に、50%ホルミアミドの存在下で都合よいハイブリダイゼーション温度は、標的フラグメントに95%〜100%相同であるプローブについて42℃、90%〜95%の相同性では37℃、そして85%〜90%の相同性については32℃である。より低い相同性については、上記の式を用いて、適宜にホルムアミド含量が低くされ、そして温度が調整されるべきである。プローブと標的フラグメントとの間の相同性が未知である場合、最も単純なアプローチは、ストリンジェントではないハイブリダイゼーション条件および洗浄条件の両方で開始することである。オートラジオグラフィー後に非特異的バンドまたは高いバックグラウンドが観察される場合、フィルターは高ストリンジェンシーで洗浄され得、そして再び露光され得る。露光のために必要な時間がこのアプローチを非実用的にする場合、いくつかのハイブリダイゼーションおよび/または洗浄ストリンジェンシーが並行して試験されるべきである。
【0189】
(核酸プローブアッセイ)
本発明に従う核酸プローブを利用する、PCR、分枝DNAプローブアッセイ、またはブロッティング技術のような方法は、cDNAまたはmRNAの存在を決定し得る。プローブは、検出されるに十分に安定な、二重鎖または二本鎖複合体を形成し得る場合に、本発明の配列に「ハイブリダイズする」といわれる。
【0190】
核酸プローブは、本発明のNeisserialヌクレオチド配列(センス鎖およびアンチセンス鎖の両方を含む)にハイブリダイズする。多くの異なるヌクレオチド配列がアミノ酸配列をコードするが、ネイティブなNeisserial配列は、細胞に存在する実際の配列であるので、好ましい。mRNAは、コード配列を表し、従ってプローブはコード配列に相補的であるべきであり、一本鎖cDNAはmRNAに相補的であり、従ってcDNAプローブは非コード配列に相補的であるべきである。
【0191】
プローブ配列はNeisseria配列(またはその相補物)に同一である必要はない。核酸プローブが標的ヌクレオチドと検出され得る二重鎖を形成し得る場合、配列および長さのいくらかの変動は、アッセイの感受性の増加をもたらし得る。また、核酸プローブは、形成された二重鎖を安定化するためにさらなるヌクレオチドを含み得る。さらなるNeisseria配列もまた、形成された二重鎖を検出するための標識としての一助となり得る。例えば、非相補的ヌクレオチド配列が、そのプローブの5’末端に付着され得、ここでそのプローブ配列の残りはNeisseria配列に相補的である。あるいは、プローブ配列が、それとハイブリダイズし、そしてそれによって検出され得る二重鎖を形成するためにNeisseria配列との十分な相補性を有する場合、非相補的塩基またはより長い配列が、プローブ中に分散され得る。
【0192】
プローブの正確な長さおよび配列は、ハイブリダイゼーション条件(例えば、温度、塩条件など)に依存する。例えば、診断的適用については、分析物の配列の複雑さに依存して、核酸プローブは、代表的には、少なくとも10〜20ヌクレオチド、好ましくは15〜25、そしてより好ましくは少なくとも30ヌクレオチドを含むが、これよりも短くもあり得る。短いプライマーは、一般的には、鋳型との十分に安定なハイブリッド複合体を形成するのにより低い温度を必要とする。
【0193】
プローブは、合成的手順(例えば、Matteucciらのトリエステル法(J.Am.Chem.Soc.(1981)103:3185))、またはUrdeaら(Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1983)80:7461)に従って、または市販の自動オリゴヌクレオチド合成機を使用して、産生され得る。
【0194】
プローブの化学的性質は、優先度に従って選択され得る。特定の適用については、DNAまたはRNAが適切である。他の適用については、改変(例えば、ホスホロチオエートまたはメチルホスホネートのようなバックボーンの改変)が組み込まれ得、インビボの半減期を増大させ、RNA親和性を変化させ、ヌクレアーゼ耐性を増大させるためなどに使用され得(例えば、AgrawalおよびIyer(1995)Curr Opin Biotechnol 6:12−19;Agrawal(1996)TIBTECH 14:376−387を参照のこと);ペプチド核酸のようなアナログもまた使用され得る(例えば、Corey(1997)TIBTECH 15 224−229;Buchardtら(1993)TIBTECH 11:384−386を参照のこと)。
【0195】
ヌクレオチドハイブリダイゼーションアッセイの一例は、Urdeaら、国際特許出願 WO92/02526によって記載される(米国特許第5,124,246号もまた参照のこと)。
【0196】
あるいは、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)は、少量の標的核酸を検出する別の周知の手段である。そのアッセイは、Mullisら(Meth.Enzymol.(1987)155:335−350);米国特許第4,683,195号および同第4,683,202号に記載されている。2つの「プライマー」ヌクレオチドは、標的核酸とハイブリダイズし、そして反応を開始するために使用される。このプライマーは、二重鎖の安定性を補助するために、または、例えば、都合のよい制限部位を組み込むために、増幅標的(またはその相補物)の配列にハイブリダイズしない配列を含み得る。代表的には、このような配列は、所望のNeisseria配列に隣接する。
【0197】
熱安定性のポリメラーゼは、もともとの標的核酸を鋳型として使用して、プライマーから標的核酸のコピーを作製する。閾値量の標的核酸がポリメラーゼによって産生された後、それらはより従来的な方法(例えば、サザンブロット)によって検出され得る。サザンブロット法を使用する場合、標識されたプローブは、Neisseria配列(またはその相補物)にハイブリダイズする。
【0198】
また、mRNAまたはcDNAは、Sambrookら(前出)に記載される、従来的なブロッティング技術によって検出され得る。mRNA、またはmRNAからポリメラーゼ酵素を使用して生成されたcDNAは、ゲル電気泳動を使用して精製および分離され得る。次いで、ゲル上のこの核酸は、ニトロセルロースのような固体支持体上にブロットされる。この固体支持体は、標識されたプローブに曝露され、次いですべてのハイブリダイズしていないプローブを洗浄して除去する。次に、標識プローブを含む二重鎖を検出する。代表的には、そのプローブは、放射活性部分で標識される。
【0199】
(実施例)
本実施例は、N.meningitidisで同定された核酸配列を、推定の翻訳産物と共に記載し、そしてまたN.gonorrhoeaeで同定された核酸配列を、推定の翻訳産物と共に記載する。すべての核酸配列が完全なわけではなく、すなわち、それらは、全長の野生型タンパク質より短い配列をコードする。
【0200】
本実施例は一般的には以下の様式である:
・N.meningitidisにおいて同定されたヌクレオチド配列
・このN.meningitidis配列の推定の翻訳産物
・データベースの比較に基づくこの翻訳産物のコンピューター分析
・N.gonorrhoeaeから同定される、対応するヌクレオチド配
・このN.gonorrhoeae配列の推定の翻訳産物
・N.meningitidis配列の翻訳産物とN.gonorrhoeae配列の翻訳産物との間の同一性のパーセンテージの比較
・N.meningitidisのA株から同定された、対応するヌクレオチド配列
・このN.meningitidis A株の配列の推定の翻訳産物
・N.meningitidis配列の翻訳産物とN.gonorrhoeae配列の翻訳産物との間の同一性のパーセンテージの比較
・適切に抗原性または免疫原性であり得ることを示すタンパク質の特徴の記載。
【0201】
配列比較を、BLAST、BLAST2、BLASTn、BLASTp、tBLASTn、BLASTx、およびtBLASTxのアルゴリズム(例えば、Altschulら(1997)Gapped BLAST and PSI−BLAST:a new generation of protein database search programs.Nucleic Acids Resaerch 25:2289−3402もまた参照のこと)を使用して、NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov)で行った。検索を、以下のデータベースに対して行った:縮重しないGenBank+EMBL+DDBJ+PDB配列および縮重しないGenBank CDS 翻訳物+PDB+SwissProt+SPupdate+PIR配列。
【0202】
ヌクレオチド配列中のドットは、リーディングフレームを維持するために自由裁量によって導入されたヌクレオチドを示す。同様に、二重下線を付したヌクレオチドを取り除いた。小文字は、独立した配列決定反応のアラインメントの間に生じたあいまいさを示す(本実施例におけるヌクレオチド配列のいくつかは2つ以上の実験の結果を合わせて得られる)。
【0203】
ヌクレオチド配列を全部で6つのリーディングフレームで走査して、Espostiら(Critical evaluation of the hydropathy of membrane proteins(1990)Eur J Biochem 190:207−219)の統計学的な研究に基づくアルゴリズムを用いて、疎水性ドメインの存在を予測した。これらのドメインは、潜在的な膜貫通領域または疎水性リーダー配列を表す。
【0204】
オープンリーディングフレームを、プログラムORFFINDER(NCBI)を使用して、フラグメント化されたヌクレオチド配列から予測した。
【0205】
下線を付したアミノ酸配列は、PSORTアルゴリズム(http://www.psort.nibb.ac.jp)によって予測される、ORF中の潜在的な膜貫通ドメインまたはリーダー配列を示す。機能的なドメインもまた、MOTIFSプログラム(GCG WisconsinおよびPROSITE)を使用して予測した。
【0206】
以下の実施例の各々について:淋菌タンパク質中の推定のリーダー配列および/またはいくらかの推定の膜貫通ドメイン(一本下線)の存在に基づいて、N.meningitidisおよびN.gonorrhoeaeからのタンパク質およびそれらのそれぞれのエピトープは、ワクチンまたは診断剤のために有用な抗原または免疫原性組成物であり得ることが予測される。
【0207】
本発明を実施するために(例えば、ワクチン接種または診断目的のために、開示された配列を使用するために)使用され得る標準的な施術および手順が、上記に要約された。この要旨は、本発明に対する限定ではなく、むしろ、使用され得るが必要ではない例を与える。
【0208】
特に、以下の方法を使用して、本発明のタンパク質を発現、精製し、そして生化学的特徴付けを行った。
【0209】
(染色体DNA調製)
N.meningitidis株2996を、100mlのGC培地中で対数増殖期まで増殖させ、遠心分離によって収集し、そして5ml緩衝液(20%(w/v)スクロース、50mM Tris−HCl、50mM EDTA、pH8)に再懸濁した。氷上で10分間のインキュベーション後、その細菌を、10mlの溶解溶液(50mM NaCl、1% Na−サルコシル、50μg/ml プロテイナーゼK)の添加によって溶解し、そしてその懸濁液を37℃で2時間インキュベートした。2回のフェノール抽出(pH8に平衡化)および1回のCHCl3/イソアミルアルコール(24:1)抽出を行った。DNAを、0.3M 酢酸ナトリウムおよび2容量のエタノールの添加によって沈殿させ、そして遠心分離によって収集した。ペレットを、70%(v/v)エタノールで1回洗浄し、そして4.0ml TE緩衝液(10mM Tris−HCl、1mM EDTA、pH8)に再溶解した。DNA濃度を、260nmにおけるODを読みとることによって測定した。
【0210】
(オリゴヌクレオチド設計)
合成オリゴヌクレオチドプライマーを、(a)利用可能な場合にはmeningococcus B配列、または(b)gonococcus/meningococcus A配列を使用して、必要に応じて、meningococcusの好ましいコドン使用法に適合させて、各々のORFのコード配列に基づいて設計した。予測されるリーダー配列のすぐ下流の配列に対して、5’プライマーを設計することによって、いかなる予測されるシグナルペプチドをも除外した。
【0211】
大部分のORFについて、5’プライマーは、目的の遺伝子の制限パターンに依存して、2つの制限酵素部位(BamHI−NdeI、BamHI−NheI、EcoRI−NdeIまたはEcoRI−NheI)を含んだ。3’プライマーは、XhoI制限部位またはHindIII制限部位を含んだ(表1)。この手順を、各々の増幅産物(各々のORFに一致する)のクローニングを2つの異なる発現系:pGEX−KG(BamHI−XhoI、BamHI−HindIII、EcoRI−XhoIまたはEcoRI−HindIIIを使用する)、およびpET21b+(NdeI−XhoI、NheI−XhoI、NdeI−HindIIIまたはNheI−HindIIIを使用する)に指向させるように確立した。
【0212】
【数1】
ORFをpGEX−Hisベクターへクローニングするために、5’プライマーおよび3’プライマーは、ただ1つの制限酵素部位(5’プライマーについてEcoRI、KpnIまたはSalIおよび3’プライマーについてPstI、XbaI、SphIまたはSalI)を含んだ。また、制限部位を、遺伝子の特定の制限パターンに従って選択した(表1)。
【0213】
【数2】
制限酵素認識配列を含むのと同様に、プライマーは、増幅されるべき配列にハイブリダイズするヌクレオチドを含んだ。融解温度は、プライマー全体においてハイブリダイズするヌクレオチドの数および型に依存し、そして各々のプライマーについて、以下の式を使用して決定した:
Tm=4(G+C)+2(A+T) (テイルを除外)
Tm=64.9+0.41(%GC)−600/N (プライマー全体) 選択したオリゴヌクレオチドの融解温度は、オリゴ全体について通常65〜70℃であり、そしてハイブリダイズする領域単独では50〜55℃であった。
【0214】
表1は、各増幅のために使用される順方向および逆方向のプライマーを示す。特定の場合において、プライマーの配列は、予測されるORFの配列に正確には一致しない。これは、初期の増幅を行った時、いくつかのmeningococcas B ORFについて、完全な5’および/または3’配列は、公知ではなかったからである。しかし、対応する配列は、GonococcusまたはMeningoccus Aにおいて同定されていた。従って、Meningoccus B配列が不完全または不確かであった場合、Gonococcus配列またはMeningococcus A配列を、プライマー設計のための基礎として使用した。これらの配列を、コドンの優先性を考慮して変更した。一旦完全な配列が同定されると、このアプローチがもはや必要でないことが理解され得る。
【0215】
Perkin Elmer 394 DNA/RNA合成機を使用してオリゴヌクレオチドを合成し、2.0mlのNH4OH中でカラムから溶出し、そして56℃での5時間のインキュベーションにより脱保護した。このオリゴを0.3M 酢酸ナトリウムおよび2容量のエタノールの添加によって沈殿させた。このサンプルを遠心分離し、そしてそのペレットを100μlまたは1.0mlいずれかの水に再懸濁した。OD260を、Perkin Elmer Lambda Bio分光光度計を使用して決定し、濃度を2〜10pmol/μlに調整した。
【0216】
(増幅)
標準PCRプロトコールは、以下のとおりであった:50〜200ngのゲノムDNAを、20〜40μMの各オリゴヌクレオチドプライマー、400〜800μMのdNTP溶液、1×PCR緩衝液(1.5mM MgCl2を含む)、2.5単位のTaqI DNAポリメラーゼ(Perkin−Elmer AmpliTaQ、GIBCO Platinum、Pwo DNAポリメラーゼ、またはTakara Shuzo Taqポリメラーゼを使用する)の存在下でテンプレートとして使用した。いくつかの場合において、PCRを10μlのDMSOまたは50μlの2Mベタインの添加によって最適化(otpimse)した。
【0217】
ホットスタート(全混合物を95℃で予め3分間インキュベーションしている間にポリメラーゼを添加する)の後に、各サンプルに二工程増幅を行った:最初の5サイクルを、プライマーの制限酵素のテールを除くハイブリダイゼーション温度を使用して行った(上記を参照のこと)。これに続いて、次に全長オリゴについて算出されたハイブリダイゼーション温度を用いて30サイクルを行った。このサイクルは、72℃での10分間の伸長によって完了した。標準サイクルは、以下のとおりであった:
【0218】
【表8】
伸長時間は、増幅されるべきORFの長さに従って変化した。増幅を、9600または2400のいずれかのPerkin Elmer GeneAmp PCRシステムを使用して行った。結果を確認するために、増幅容量の1/10を、1〜1.5%(w/v)アガロースゲルにロードし、そして各増幅フラグメントのサイズをDNA分子量マーカーと比較した。
【0219】
増幅したDNAは、1%アガロースゲルに直接ロードしたか、またはまずエタノール沈殿をして、1.0%アガロースゲルにロードするために適切な容量中に再懸濁したかのいずれかであった。正確なサイズのバンドに対応するDNAフラグメントを、Qiagen Gel Extraction Kitを使用して、製造業者のプロトコルに従って精製した。DNAフラグメントを、H2Oまたは10mM Tris、pH8.5のいずれかで、30μlまたは50μlの容量で溶出させた。
【0220】
(PCRフラグメントの切断)
増幅フラグメントに対応する精製DNAを、以下のために適切な制限酵素を用いて2重に消化した:pET−21b+へのクローニング、およびC末端Hisタグ化融合物としてのタンパク質の発現、pGEX−KGへのクローニング、およびN末端GST融合物としてのタンパク質の発現、ならびにpGEX−Hisへのクローニング、およびN末端GST−Hisタグ化融合物としてのタンパク質の発現。
【0221】
各精製DNAフラグメントを、30μlまたは40μlのいずれかの容量中で、適切な消化緩衝液の存在下で適切な制限酵素(New England Biolabs)20単位を用いて、37℃で3時間から一晩、インキュベートした。消化フラグメントをQIAquick PCR精製キットを(製造業者の指示に従って)使用して精製し、そして、H2Oまたは10mM Tris(pH8.5)のいずれかの30μlまたは50μlの容量中で溶出した。DNA濃度を、適定された分子量マーカーの存在下での定量的アガロースゲル電気泳動(1.0%ゲル)によって決定した。
【0222】
(クローニングベクター(pET22B、pGEX−KG、pTRC−HisA、pET21b+、pGEX−KGおよびpGEX−His)の消化)
ベクターpGEX−Hisは、トロンビン切断部位の上流に6つのヒスチジン残基をコードする領域を保有し、ベクターpTRC99(Pharmacia)のマルチプルクローニング部位を含む、改変されたpGEX−2Tベクターである。10μgのプラスミドを、適切な緩衝液の存在下で、200μlの反応容量中で、50単位の各制限酵素を用いて、37℃での一晩のインキュベーションで2重に消化した。消化物全体を1%アガロースゲルにロードした後に、消化したベクターに対応するバンドを、Qiagen QIAquick Gel Extraction Kitを使用してゲルから精製し、そしてそのDNAを50μlの10mM Tris−HCl(pH8.5)中に溶出した。DNA濃度を、サンプルのOD260を測定することにより評価し、そして50μg/μlに調整した。1μlのプラスミドを、各クローニング手順に使用した。
【0223】
10μgのプラスミドベクターを、適切な緩衝液の200μlの容量中で、50単位の各制限酵素を用いて、37℃での一晩のインキュベーションで2重に消化した。消化物を1.0%アガロースゲルにロードし、そしてQiagen QIAquick Gel Extraction Kitを使用して精製した消化したベクターに対応するバンドを、50μlの10mM Tris−HCl(pH8.5)中に溶出させた。DNA濃度を、OD260を測定することにより評価し、そして濃度を50μg/μlに調整した。1μlのプラスミドを、各クローニング手順に使用した。
【0224】
(クローニング)
いくつかのORFについて、予め消化して精製した各ORFに対応するフラグメントを、pET22bおよびpGEX−KGの両方に連結した。最終容量20μl中で、モル比3:1のフラグメント/ベクターを、0.5μlのNEB T4 DNAリガーゼ(400単位/μl)を使用して、製造業者から供給された緩衝液の存在下で連結した。この反応物を、室温で3時間インキュベートした。いくつかの実験において、連結を、Boheringerの「Rapid Ligation Kit」を使用して、製造業者の指示に従って行った。
【0225】
適切な株に組換えプラスミドを導入するために、100μlのE.coli DH5コンピテント細胞を、リガーゼ反応溶液とともに、40分間氷上でインキュベートし、次に、37℃で3分間インキュベートし、次に、800μlのLBブロスを添加した後、再度37℃で20分間インキュベートした。次に細胞を、Eppendorfの微量遠心機において最大速度で遠心分離し、そして約200μlの上清に再懸濁した。次に、その懸濁物をLBアンピシリン(100mg/ml)上にプレーティングした。
【0226】
組換えクローンのスクリーニングを、無作為に選択した5つのコロニーを、100μg/mlのアンピシリンを加えた2ml(pGEXまたはpTCクローン)または5ml(pETクローン)のLBブロスのいずれかにおいて37℃で一晩増殖させて行った。次に、細胞をペレットにして、Qiagen QIAprep Spin Miniprep Kitを使用して、製造業者の指示に従って、DNAを最終容量30μlに抽出した。各々個々のミニプレップ(約1g)の5μlを、NdeI/XhoIまたはBamHI/XhoIのいずれかを用いて消化し、そして全消化物を、1〜1.5%アガロースゲル(予想されるインサートサイズに依存する)に、分子量マーカー(1Kb DNA Ladder、GIBCO)と並行してロードした。陽性クローンのスクリーニングを、正確なインサートサイズに基づいて行った。
【0227】
他のORFについては、予め消化および精製した、各ORFに対応するフラグメントを、pET21b+およびpGEX−KGの両方の中に連結した。3:1のモル比のフラグメント/ベクターを、0.5μlのT4 DNAリガーゼ(400単位/μl、NEB)および製造業者によって供給される連結緩衝液を含む20μlの最終容量において用いた。反応を、室温にて3時間行った。いくつかの実験では、Boheringerの「Rapid Ligation Kit」および製造業者のプロトコルを用いて連結を行った。
【0228】
組換えプラスミドを、100μlのコンピテントなE.coli DH5またはHB101中に、連結反応溶液および細菌を氷上で40分間インキュベートし、次いで37℃にて3分間インキュベートすることによって、形質転換した。これに続いて、800μlのLBブロスを添加し、そして37℃にて20分間インキュベーションした。細胞を、Eppendorfの微量遠心機において最大速度で遠心分離し、約200μlの上清に再懸濁し、そしてLBアンピシリン(100mg/ml)寒天上にプレーティングした。
【0229】
組換えクローンのスクリーニングを、無作為に選択した5つのコロニーを、100μg/mlのアンピシリンを加えた2.0ml(pGEX−KGクローン)または5.0ml(pETクローン)のLBブロスのいずれかにおいて37℃で一晩増殖させて行った。細胞をペレットにし、そしてQiagen QIAprep Spin Miniprep Kitを使用して、製造業者の指示に従って、プラスミドDNAを抽出した。約1μgの各々個々のミニプレップを、適切な制限酵素を用いて消化し、そして消化物を、1〜1.5%アガロースゲル(予想されるインサートサイズに依存する)に、分子量マーカー(1kb DNA Ladder、GIBCO)と並行してロードした。陽性クローンを、インサートのサイズに基づいて選択した。
【0230】
ORFを、PCR産物を二重に消化し、そして同様に消化したベクター中に連結することによって、PGEX−His中にクローニングした。クローニングの後、組換えプラスミドを、E.coli宿主W3110中に形質転換した。個々のクローンを、個々のクローンを50μg/mlアンピシリンを含むLBブロス中で37℃で、一晩で増殖させた。
【0231】
特定のORFを、EcoRI−PstIクローニング部位、またはEcoRI−SalI、またはSalI−PstIを用いてpGEX−HISベクター中にクローニングし得る。クローニングの後、組換えプラスミドを、E.coli宿主W3110に導入し得る。
【0232】
(発現)
次いで、発現ベクター中にクローニングされた各ORFを、組換えタンパク質産物の発現に適切な株中に形質転換し得る。各構築物の1μlを使用して、30μlのE.coli BL21(pGEXベクター)、E.coli TOP10(pTRCベクター)またはE.coli BL21−DE3(pETベクター)を、上記のように形質転換した。pGEX−Hisベクターの場合、同一のE.coli株(W3110)を初期のクローニングおよび発現のために使用した。単一の組換えコロニーを、Amp(100μg/ml)を加えた2mlのLBに接種し、37℃で一晩でインキュベートし、次に、100mlのフラスコ中でAmp(100μg/ml)を加えた20mlのLB中に1:30で希釈し、OD600の範囲が0.1と0.15との間であることを確実にした。このフラスコを、ODが発現の誘導に適切な指数増殖を示すまで(pETおよびpTRCベクターについて、0.4〜0.8 OD;pGEXおよびpGEX−Hisベクターについて0.8〜1 OD)、回転型水浴振とう機中で30℃でインキュベートした。pET、pTRCおよびpGEX−Hisベクターについて、タンパク質の発現を1mM IPTGの添加によって誘導し、一方、pGEX系の場合、IPTGの最終濃度は、0.2mMであった。30℃での3時間のインキュベーションの後、サンプルの最終濃度を、ODによって確認した。発現を確認するために、1mlの各サンプルを取り出し、微量遠心機で遠心分離し、ペレットをPBS中で再懸濁し、そしてクマシーブルー染色を用いる12% SDS−PAGEによって分析した。サンプル全体を6000gで遠心分離し、そしてペレットをさらなる使用のためにPBS中に再懸濁した。
【0233】
(GST融合タンパク質の大規模精製)
いくつかのORFについて、単一のコロニーを、Ampを加えたLB寒天プレート上で37℃で一晩で増殖させた。細菌を、水浴振とう機中のアンピシリンを加えた20mlのLB液体培養物中に接種し、そして一晩増殖させた。細菌を、600mlの新鮮な培地中に1:30に希釈し、最適な温度(20〜37℃)でOD550が0.8〜1になるまで増殖させた。タンパク質の発現を0.2mMのIPTGを用いて誘導し、続いて、3時間インキュベートした。培養物を8000rpmで4℃で遠心分離した。上清を捨て、そして細菌のペレットを7.5mlの冷PBS中に懸濁した。この細胞を、Branson sonifier B−15を使用して、氷上で、30秒間、40Wで超音波処理することにより破砕し、2回凍結融解し、そして再度遠心分離した。この上清を回収し、150μlのグルタチオン−Sepharose 4B樹脂(Pharmacia)(前もってPBSで洗浄)と混合し、そして室温で30分間インキュベートした。このサンプルを700gで5分間4℃で遠心分離した。この樹脂を10mlの冷PBSを用いて、10分間、2回洗浄し、1mlの冷PBSに再懸濁し、そして使い捨てカラムにロードした。この樹脂を素通り画分が0.02〜0.06のOD280に到達するまで2mlの冷PBSで2回洗浄した。GST融合タンパク質を、700μlの冷グルタチオン溶出緩衝液(10mM 還元型グルタチオン、50mM Tris−HCl)の添加によって溶出し、そして画分をOD280が0.1になるまで回収した。各画分の21μlを、Biorad SDS−PAGE Molecular weight standard broad range(M1)(200、116.25、97.4、66.2、45、31、21.5、14.4、6.5kDa)またはAmersham Rainbow Marker(M”)(220、66、46、30、21.5、14.3kDa)のいずれかを標準として使用して、12% SDSゲル上にロードした。GSTの分子量が26kDaであるので、この値を各GST融合タンパク質の分子量に添加しなければならない。
【0234】
他のORFについて、GST融合物として精製されるべき各クローンについては、単一コロニーを画線し、そしてLB/Amp(100μg/ml)寒天プレート上で37℃にて一晩増殖させた。このプレートからの単離されたコロニーを、20mlのLB/Amp(100μg/ml)液体培地中に接種し、そして振盪しながら一晩増殖させた。一晩の培養物を、600mlのLB/Amp(100μg/ml)液体培地中に1:30に希釈し、そして最適な温度(20〜37℃)でOD550が0.6〜0.8になるまで増殖させた。組換えタンパク質の発現をIPTG(最終濃度0.2mM)の添加によって誘導し、そして培養物をさらに3時間インキュベートした。細菌を、4℃にて8000×gにて15分間遠心分離することによって収集した。
【0235】
細菌のペレットを7.5mlの冷PBS中に再懸濁した。細胞を、Branson sonifier 450を使用して、氷上で、30秒間、40Wで4回超音波処理することにより破砕し、そして13000×gにて30分間、4℃にて遠心分離した。この上清を回収し、150μlのグルタチオン−Sepharose 4B樹脂(Pharmacia)(前もってPBSで平衡化)と混合し、そして穏やかに攪拌しながら室温で30分間インキュベートした。バッチ様式の調製物を、700×gにて5分間、4℃にて遠心分離し、そして上清を捨てた。この樹脂を10mlの冷PBSを用いて、10分間、2回洗浄し(バッチ様式で)、1mlの冷PBSに再懸濁し、そして使い捨てカラムにロードした。この樹脂を素通り画分が0.02〜0.01のOD280nmに到達するまで冷PBSで洗浄し続けた。GST融合タンパク質を、700μlの冷グルタチオン溶出緩衝液(10mM 還元型グルタチオン、50mM Tris−HCl、pH8.0)の添加によって溶出し、そして画分を、溶出物のOD280nmによって全ての組換えタンパク質が得られたことが示されるまで回収した。各溶出画分の20μlのアリコートを、12%ゲルを用いてSDS−PAGEによって分析した。精製タンパク質の分子量を、Bio−Rad broad range molecular weight standard(M1)(200、116、97.4、66.2、45.0、31.0、21.5、14.4、6.5kDa)またはAmersham Rainbow Marker(M2)(220、66.2、46.0、30.0、21.5、14.3kDa)のいずれかを使用して決定した。GST融合タンパク質の分子量は、26kDa GSTタンパク質とその融合パートナーとの組合せである。タンパク質濃度を、Bradfordアッセイを用いて評価した。
【0236】
(His融合可溶性タンパク質の大規模精製)
いくつかのORFについて、単一のコロニーをLB+Ampアガープレート上で37℃で一晩増殖させた。細菌を、20mlのLB+Amp液体培養物中に接種し、水浴振とう機中で一晩インキュベートした。細菌を、600mlの新鮮な培地中に1:30に希釈し、最適な温度(20〜37℃)でOD550が0.6〜0.8になるまで増殖させた。タンパク質の発現を1mMのIPTGの添加によって誘導し、そして、培養物をさらに3時間インキュベートした。培養物を8000rpmで4℃で遠心分離した。上清を捨て、そして細菌のペレットを7.5mlの冷10mMイミダゾール緩衝液(300mM NaCl、50mM リン酸緩衝液、10mM イミダゾール、pH8)中に再懸濁した。この細胞を、Branson sonifier B−15を使用し、氷上で、30秒間、40Wで超音波処理によって破砕し、2回凍結融解して、そして再度遠心分離した。上清を収集し、150μlのNi2+樹脂(Pharmacia)(10mMイミダゾール緩衝液で予め洗浄する)と混合し、30分間、穏やかな撹拌をしながら、室温でインキュベートした。このサンプルを700gで5分間4℃で遠心分離した。この樹脂を10mlの冷10mMイミダゾール緩衝液を用いて10分間、2回洗浄し、1mlの冷10mMイミダゾール緩衝液に再懸濁し、そして使い捨てカラムにロードした。この樹脂を、2mlの冷10mMイミダゾール緩衝液を用いて4℃で、素通り画分が0.02〜0.06のO.D280に達するまで洗浄した。この樹脂を、2mlの冷20mMイミダゾール緩衝液(300mM NaCl、50mM リン酸緩衝液、20mM イミダゾール、pH8)で素通り画分が0.02〜0.06のO.D280に達するまで洗浄した。このHis融合タンパク質を、700μlの冷250mMイミダゾール緩衝液(300mM NaCl、50mM リン酸緩衝液、250mM イミダゾール、pH8)の添加によって溶出し、O.D280が0.1になるまで、画分を収集した。21μlの各画分を、12%SDSゲルにロードした。
【0237】
(His融合不溶性タンパク質の大規模精製)
単一のコロニーをLB+Ampアガープレート上で37℃で一晩で増殖させた。細菌を、水浴振とう機中の20mlのLB+Amp液体培養物中に接種し、そして一晩増殖させた。細菌を、600mlの新鮮な培地中に1:30に希釈し、最適な温度(37℃)でO.D550が0.6〜0.8になるまで増殖させた。タンパク質の発現を1mM IPTGの添加によって誘導し、そして、培養物をさらに3時間インキュベートした。培養物を8000rpmで4℃で遠心分離した。上清を捨て、そして細菌のペレットを7.5mlの緩衝液B(尿素8M、10mM Tris−HCl、100mM リン酸緩衝液、pH8.8)中に再懸濁した。この細胞を、Branson sonifier B−15を使用し、氷上で、30秒間、40Wでの超音波処理により破砕し、2回凍結融解して、そして再度遠心分離した。上清を−20℃に保存し、一方、ペレットを2mlのグアニジン緩衝液(6M 塩酸グアニジン、100mM リン酸緩衝液、10mM Tris―HCl、pH7.5)に再懸濁し、そしてホモジナイザー中で10サイクル処理した。この産物を13000rpmで40分間遠心分離した。上清を150μlのNi2+−樹脂(Pharmacia)(緩衝液Bで予め洗浄する)と混合し、そして30分間穏やかな撹拌をしながら、室温でインキュベートした。このサンプルを700gで5分間4℃で遠心分離した。この樹脂を10mlの緩衝液Bを用いて10分間、2回洗浄し、1mlの緩衝液B中に再懸濁し、そして使い捨てカラムにロードした。この樹脂を、2mlの緩衝液Bを用いて室温で、素通り画分が0.02〜0.06のOD280に達するまで洗浄した。この樹脂を、2mlの緩衝液C(尿素8M、10mM Tris−HCl、100mM リン酸緩衝液、pH6.3)で、素通り画分が0.02〜0.06のO.D280に達するまで洗浄した。このHis融合タンパク質を、700μlの溶出緩衝液(尿素8M、10mM Tris−HCl、100mM リン酸緩衝液、pH4.5)の添加によって溶出し、そしてOD280が0.1になるまで、画分を回収した。21μlの各画分を、12%SDSゲルにロードした。
【0238】
(His融合タンパク質の精製)
His融合物として精製されるべき各クローンについて、単一のコロニーをストリークし、そしてLB/Amp(100μg/ml)アガープレート上で37℃にて一晩増殖させた。このプレートから単離されたコロニーを、20mlのLB/Amp(100μg/ml)液体培地中に接種し、攪拌しながら37℃で一晩増殖させた。この一晩の培養物を、600mlのLB/Amp(100μg/ml)液体培地中に1:30で希釈し、そしてOD550nmが0.6〜0.8に達するまで最適な温度(20〜37℃)で増殖させた。組換えタンパク質の発現をIPTGの添加(最終濃度1.0mM)によって誘導し、そして培養物をさらに3時間インキュベートした。細菌を8000×gで15分間4℃で遠心分離することによって回収した。
【0239】
細菌のペレットを、(i)可溶性タンパク質については、冷緩衝液A(300mM NaCl、50mM リン酸緩衝液、10mM イミダゾール、pH8.0)、または(ii)不溶性タンパク質については、緩衝液B(8M尿素、10mM Tris−HCl、100mM リン酸緩衝液、pH8.8)のいずれか7.5ml中に再懸濁した。細胞を、Branson sonifier 450を40Wで使用し、氷上で、30秒間づつ4回超音波処理することによって破砕し、そして13000×gで30分間、4℃で遠心分離した。不溶性タンパク質については、ペレットを2.0mlの緩衝液C(6M 塩酸グアニジン、100mM リン酸緩衝液、10mM Tris―HCl、pH7.5)に再懸濁し、そしてDounceホモジナイザー中で10サイクル処理した。このホモジネートを13000×gで40分間遠心分離し、そしてこの上清を保持した。
【0240】
可溶性調製物および不溶性調製物の両方の上清を、150μlのNi2+樹脂(適切なように、緩衝液Aまたは緩衝液Bのいずれかで予め平衡化する)と混合し、30分間、穏やかに撹拌しながら、室温でインキュベートした。この樹脂は、製造業者のプロトコルに従って調製された、Chelating Sepharose Fast Flow(Pharmacia)であった。このバッチ様式の(batch wise)調製物を700×gで5分間4℃で遠心分離し、そしてこの上清を捨てた。この樹脂を10mlの緩衝液AまたはBを用いて10分間、2回洗浄(バッチ様式)で、1.0mlの緩衝液AまたはB中に再懸濁し、そして使い捨てカラムにロードした。この樹脂を、(i)緩衝液Aを用いて4℃で、または(ii)緩衝液Bを用いて室温でのいずれかで、素通り画分のOD280nmが0.02〜0.01に達するまで洗浄し続けた。この樹脂を、(i)冷緩衝液C(300mM NaCl、50mM リン酸緩衝液、20mM イミダゾール、pH8)、または(ii)緩衝液D(8M尿素、10mM Tris−HCl、100mM リン酸緩衝液、pH6.3)のいずれかで、素通り画分のOD280nmが0.02〜0.01に達するまでさらに洗浄した。このHis融合タンパク質を、700μlの(i)冷溶出緩衝液A(300mM NaCl、50mM リン酸緩衝液、250mM イミダゾール、pH8)、または(ii)溶出緩衝液B(8M尿素、10mM Tris−HCl、100mM リン酸緩衝液、pH4.5)のいずれかの添加によって溶出し、そしてO.D280nmが全ての組換えタンパク質が得られたことを示すまで、画分を収集した。各溶出画分の20μlのアリコートを、12%ゲルを使用してSDS−PAGEによって分析した。タンパク質濃度をBradfordアッセイを使用して評価した。
【0241】
(His融合タンパク質の再生)
タンパク質を可溶化するために変性が必要とされる場合、免疫の前に再生の工程を用いた。グリセロールを、上記で得られた変性した画分に添加し、10%(v/v)の最終濃度を得た。このタンパク質を透析緩衝液I(10%(v/v)グリセロール、0.5M アルギニン、50mM リン酸緩衝液、5.0mM 還元型グルタチオン、0.5mM 酸化型グルタチオン、2.0M 尿素、pH8.8)を使用して200μg/mlになるまで希釈し、そして同じ緩衝液に対して、4℃で12〜14時間透析した。さらなる透析を、透析緩衝液II(10%(v/v)グリセロール、0.5M アルギニン、50mM リン酸緩衝液、5.0mM 還元型グルタチオン、0.5mM 酸化型グルタチオン、pH8.8)を用いて4℃で12〜14時間実行した。
【0242】
あるいは、10%グリセロールを、変性タンパク質に添加した。次にこのタンパク質を透析緩衝液I(10%グリセロール、0.5M アルギニン、50mM リン酸緩衝液、5mM 還元型グルタチオン、0.5mM 酸化型グルタチオン、2M 尿素、pH8.8)を使用して20μg/mlになるまで希釈し、同じ緩衝液に対して、4℃で12〜14時間透析した。このタンパク質をさらに透析緩衝液II(10%グリセロール、0.5M アルギニン、50mM リン酸緩衝液、5mM 還元型グルタチオン、0.5mM 酸化型グルタチオン、pH8.8)に対して4℃で12〜14時間透析した。
【0243】
タンパク質濃度を、以下の式を用いて評価した:
タンパク質(mg/ml)=(1.55×OD280)−(0.76×OD260)。
【0244】
(タンパク質の精製)
可溶性を分析するために、3.0mlの培養物から得られたペレットを、500μlの緩衝液M1(PBS pH7.2)中に再懸濁した。25μlのリゾチーム(10mg/ml)を添加し、そしてこの細菌を15分間4℃でインキュベートした。細胞を、Branson sonifier 450を40Wで使用して30秒間4回氷上で超音波破砕することにより破壊し、そして13000×gで30分間4℃にて遠心分離した。この上清を収集し、そしてこのペレットを、緩衝液M2(8M尿素、0.5M NaCl、20mMイミダゾールおよび0.1M NaH2PO4)中に再懸濁し、そして4℃で3〜4時間インキュベートした。遠心分離後、この上清を収集し、そしてこのペレットを、緩衝液M3(6MグアニジニウムHCl、0.5M NaCl、20mM イミダゾールおよび0.1M NaH2PO4)中に4℃にて一晩再懸濁した。全ての工程からの上清を、SDS−PAGEにより分析した。いくつかのタンパク質は、PBS中で可溶性であることが見出され、他のタンパク質は、可溶化のために尿素またはグアニジウムHClを必要とした。
【0245】
調製的な規模の精製については、500mlの培養物を誘導し、そして融合タンパク質を、上記の手順を使用して、緩衝液M1、M2またはM3のいずれかにおいて可溶化した。粗抽出物を、用いた可溶化緩衝液に依存して、緩衝液M1、M2またはM3を用いて平衡化したNi−NTAスーパーフローカラム(Quiagen)上にロードした。非結合物質を、カラムを同一の緩衝液で洗浄することにより溶出した。500mMのイミダゾールを含有する対応する緩衝液を用いて、組換え融合タンパク質を溶出し、次いでイミダゾールの非存在下で同じ緩衝液に対して透析した。
【0246】
(マウスの免疫化)
20μgの各精製タンパク質を使用して、マウスの腹腔内で免疫した。いくつかのORFの場合、Balb−Cマウスを、Al(OH)3をアジュバントとして用いて、1、21および42日目に免疫し、そして56日目に採取したサンプルにおける免疫応答をモニターした。他のORFについては、CD1マウスを、同じプロトコルを用いて免疫し得た。ORF25および40については、CD1マウスを、フロイントアジュバントを用いて免疫し、そして免疫応答を56日目ではなく42日目に測定したことを除いて、同じ免疫プロトコルを使用した。同様に、なお他のORFについては、CD1マウスをフロイントアジュバントを用いて免疫したが、免疫応答を49日目に測定した。あるいは、20μgの各精製タンパク質をフロイントアジュバントと混合し、そしてCD1マウスに腹腔内で免疫するために使用した。多くのタンパク質については、この免疫化を、1、21および35日目に実行し、そして免疫応答を、34および49日目に採取されたサンプルにおいてモニターした。いくつかのタンパク質については、第3の免疫化を、35日目ではなく28日目に実行し、この免疫応答を、34および49日目ではなく、20および42日目に測定した。
【0247】
(ELISAアッセイ(血清分析))
無莢膜のMenB M7株を、チョコレートアガープレート上にプレートし、そして37℃で一晩インキュベートした。細菌のコロニーをアガープレートから滅菌ドラコン(dracon)スワブを使用して収集し、そして0.25%グルコースを含有する7mlのMueller−Hintonブロス(Difco)中に接種した。細菌の増殖を30分毎に、OD620を追跡することによりモニターした。細菌をODが0.3〜0.4の値に達するまで増殖させた。培養物を10分間10000rpmで遠心分離した。上清を捨て、そして細菌をPBSで1回洗浄し、0.025%のホルムアルデヒドを含有するPBS中に再懸濁し、そして室温で2時間インキュベートし、次いで4℃で一晩で攪拌しながらインキュベートした。100μlの細菌細胞を、96ウェルGreinerプレートの各ウェルに添加し、そして4℃で一晩でインキュベートした。次いでそのウェルをPBT洗浄緩衝液(PBS中の0.1% Tween−20)を用いて3回洗浄した。200μlの飽和緩衝液(水中の2.7%のポリビニルピロリドン 10)を各ウェルに添加し、そしてプレートを37℃で2時間インキュベートした。ウェルをPBTで3回洗浄した。200μlの希釈血清(希釈緩衝液:PBS中に1% BSA、0.1% Tween−20、0.1% NaN3)を各ウェルに添加し、そしてそのプレートを37℃で90分間インキュベートした。ウェルをPBTで3回洗浄した。希釈緩衝液中に1:2000に希釈した100μlのHRP−結合体化ウサギ抗マウス(Dako)血清を、各ウェルに添加し、そしてこのプレートを37℃で90分間インキュベートした。ウェルを、PBT緩衝液で3回洗浄した。100μlのHRPに対する基質緩衝液(25mlのクエン酸緩衝液、pH5、10mgのO−フェニルジアミンおよび10μlのH2O2)を各ウェルに添加し、そしてこのプレートを室温で20分間放置した。100μlのH2SO4を各ウェルに添加し、そしてOD490を追跡した。OD490がそれぞれの免疫前血清の2.5倍である場合、ELISAが陽性であるとみなした。
【0248】
あるいは、無莢膜のMenB M7株を、チョコレートアガープレート上にプレートし、そして37℃で一晩インキュベートした。細菌のコロニーをアガープレートから滅菌ドラコンスワブを使用して収集し、そして0.25%グルコースを含有する7mlのMueller−Hintonブロス(Difco)中に接種した。細菌の増殖を30分毎に、OD620を追跡することによりモニターした。細菌をODが0.3〜0.4の値に達するまで増殖させた。培養物を10分間10000rpmで遠心分離した。上清を捨て、そして細菌をPBSで1回洗浄し、0.025%のホルムアルデヒドを含有するPBS中に再懸濁し、そして37℃で1時間インキュベートし、次いで4℃で一晩で攪拌しながらインキュベートした。100μlの細菌細胞を、96ウェルGreinerプレートの各ウェルに添加し、そして4℃で一晩でインキュベートした。次いでこのウェルをPBT洗浄緩衝液(PBS中の0.1% Tween−20)を用いて3回洗浄した。200μlの飽和緩衝液(水中の2.7%のポリビニルピロリドン 10)を各ウェルに添加し、そしてプレートを37℃で2時間インキュベートした。ウェルをPBTで3回洗浄した。200μlの希釈血清(希釈緩衝液:PBS中に1% BSA、0.1% Tween−20、0.1% NaN3)を各ウェルに添加し、そしてそのプレートを37℃で2時間インキュベートした。ウェルをPBTで3回洗浄した。希釈緩衝液中に1:2000に希釈した100μlのHRP−結合体化ウサギ抗マウス(Dako)血清を、各ウェルに添加し、そしてこのプレートを37℃で90分間インキュベートした。ウェルを、PBT緩衝液で3回洗浄した。100μlのHRPに対する基質緩衝液(25mlのクエン酸緩衝液、pH5、10mgのO−フェニルジアミンおよび10μlのH2O2)を各ウェルに添加し、そしてこのプレートを室温で20分間放置した。100μlの12.5% H2SO4を各ウェルに添加し、そしてOD490を追跡した。ELISA力価を、免疫前血清レベルを超える0.4のOD490値を与える血清の希釈として任意(abitrarely)算定した。0.4のOD490での血清の希釈が1:400を超える場合、ELISAを陽性であるとみなした。
【0249】
(FACScan細菌結合アッセイ手順)
無莢膜MenB M7株をチョコレートアガープレートにプレートし、37℃でオーバーナイトでインキュベートした。細菌のコロニーをアガープレートから滅菌ドラコン(dracon)スワブを使用して回収し、各々0.25%グルコースを含有する8mlのMueller−Hintonブロス(Difco)を含む4本のチューブに中に接種した。細菌の増殖を30分毎に、OD620を追跡することによりモニターした。細菌を、ODが0.35〜0.5の値に達するまで増殖させた。培養物を10分間4000rpmで遠心分離した。上清を捨て、ペレットをブロッキング緩衝液(PBS中1% BSA、0.4% NaN3)中に再懸濁し、5分間4000rpmで遠心分離した。細胞をOD62 0が0.07に達するようにブロッキング緩衝液に再懸濁した。100μlの細菌細胞を、Coster96ウェルプレートの各ウェルに添加した。100μlの希釈(1:100、1:200、1:400)血清(ブロッキング緩衝液中)を各ウェルに添加し、そしてそのプレートを4℃で2時間インキュベートした。細胞を5分間4000rpmで遠心分離し、その上清を吸引し、各ウェルに200μl/ウェルのブロッキング緩衝液を添加することにより、細胞を洗浄した。100μlのR−フィコエリトリン結合体化F(ab)2ヤギ抗マウス(1:100希釈)を各ウェルに添加し、そしてプレートを1時間4℃でインキュベートした。細胞を、4000rpm5分間の遠心分離によって遠心沈殿し、200μl/ウェルのブロッキング緩衝液を添加することにより、洗浄した。その上清を吸引し、そして細胞を200μl/ウェルのPBS、0.25%のホルムアルデヒドに再懸濁した。そのサンプルをFACScanチューブに移して、読み取った。FACScan(Laser Power 15mW)設定の状態は、以下のとおりである:FL2 オン、FSC−H閾値:92;FSC PMT電圧:E 01;SSC PMT:474;増幅利得 6.1:FL−2 PMT:586;補償値:0。
【0250】
(OMV調製)
細菌を5GCプレート上でオーバーナイトで増殖させ、ループを用いて収穫し、そして10mlの20mM Tris−HClに再懸濁した。56℃、30分の熱不活化を行い、そして細菌を10分間氷上で超音波処理することにより破壊した(50% 衝撃係数、50% 出力)。未破壊細胞を5000g、10分間の遠心分離によって除去し、そして全細胞エンベロープ画分を50000g、4℃、75分間の遠心分離によって回収した。細胞質膜タンパク質を粗外膜から抽出するために、全画分を2%サルコシル(Sigma)中に再懸濁し、そして室温で20分間インキュベートした。この懸濁液を、10000gで10分間遠心し、凝集物を除去し、そしてこの上清をさらに50000gで75分間、超遠心分離して、外膜をペレット化した。この外膜を、10mM Tris−HCl(pH8)に再懸濁し、そしてそのタンパク質濃度をBio−Rad Proteinアッセイによって、BSAを標準として測定した。
【0251】
(全抽出物の調製)
細菌をGCプレート上でオーバーナイトで増殖させ、ループを用いて収穫し、そして1mlの20mM Tris−HClに再懸濁した。56℃、30分の熱不活化を行った。
【0252】
(ウェスタンブロッティング)
MenB株2996由来の精製タンパク質(500ng/レーン)、外膜ベシクル(5μg)および全細胞抽出物(25μg)を、12%SDS−PAGE上にロードし、ニトロセルロース膜上に転写した。この転写を、2時間、150mA、4℃、転写緩衝液(0.3% Tris Base、1.44% グリシン、20%(v/v)メタノール)を使用して行った。この膜を飽和緩衝液(PBS中の10% スキムミルク、0.1% Triton X100)中での4℃のオーバーナイトのインキュベートにより飽和させた。この膜を洗浄緩衝液(PBS中の3% スキムミルク、0.1% Triton X100)を用いて2回洗浄し、洗浄緩衝液中に1:200に希釈したマウス血清とともに、2時間37℃でインキュベートした。この膜を2回洗浄し、1:2000希釈の西洋わさびペルオキシダーゼ標識化抗マウスIgとともに90分間インキュベートした。この膜をPBS中の0.1% Triton X100を用いて2回洗浄し、Opti−4CN基質キット(Bio−Rad)を用いて、発色させた。この反応を水を添加して停止した。
【0253】
(殺菌性アッセイ)
MC58株および2966株をチョコレートアガープレート上で、37℃でオーバーナイトで増殖させた。5〜7のコロニーを回収し、そして7mlのMueller−Hintonブロスに接種するために使用した。この懸濁液を、旋回装置上で37℃でインキュベートし、OD620が0.5〜0.8の間になるまで増殖させた。この培養物を滅菌1.5mlエッペンドルフチューブに分取し、微量遠心機中で最大速度で20分間遠心分離した。このペレットをGey緩衝液(Gibco)中で1回洗浄し、そして同一の緩衝液中でOD620が0.5になるように再懸濁し、Gey緩衝液中に1:20000に希釈し、25℃で保存した。
【0254】
50μlのGey緩衝液/1% BSAを96ウェル組織培養プレートの各ウェルに添加した。25μlの希釈(1:100)マウス血清(希釈緩衝液:Gey緩衝液/0.2% BSA)を各ウェルに添加し、そのプレートを4℃でインキュベートした。上記記載の細菌懸濁液の25μlを各ウェルに添加した。熱非働化(56℃水浴中に30分)または正常乳仔ウサギ補体のいずれかの25μlを各ウェルに添加した。乳仔ウサギ補体の添加の直後に、1ウェルあたり22μlの各サンプルをMueller−Hintonアガープレート上にプレートした(時間0)。この96ウェルプレートを、1時間37℃で回転しながらインキュベートし、次に、1ウェルあたり22μlの各サンプルをMueller−Hintonアガープレート上にプレートした(時間1)。オーバーナイトのインキュベートの後、時間0および時間1に対応するコロニーを計数した。
【0255】
(遺伝子の可変性)
ORF4遺伝子および919遺伝子は、種々のNeisseria株(株の表を参照のこと)から抽出された染色体DNA上でPCRによって増幅された。PCRプライマーとして使用された以下のオリゴヌクレオチドは、遺伝子の上流および下流領域において設計された。
【0256】
【数3】
。
【0257】
PCRサイクル条件は以下であった:
1サイクル 94℃、2分間
30サイクル 94℃、30秒間
約54℃または約60℃(プライマーのTmに従って)、30秒間 72℃、40秒間
1サイクル 72℃、7分間。
【0258】
PCR産物は、1%アガロースゲルから精製され、そして以下のプライマーを用いて配列決定された:
(実施例2〜10のPCRに使用されるオリゴヌクレオチド)
【0259】
【数4】
。
【0260】
本明細書中で引用されたすべての資料は、その全体が参考として援用される。
【0261】
以下の実施例は例示のために提供され、本発明を限定するためではない。
【0262】
(実施例1)
上記の手順を用いて、以下のオリゴヌクレオチドプライマーを、示されるようなORFをクローニングするために、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)アッセイにおいて利用した:
【0263】
【表1】
(ORFの位置決め)
以下のDNAおよびアミノ酸配列は、以下の形式のタイトルによって同定される:[g、m、またはa][#].[seqまたはpep]。ここで「g」は、N.gonorrhoeae由来の配列を意味し、「m」は、N.meningitidis B由来の配列を意味し、そして「a」は、N.meningitidis A由来の配列を意味する;「#」は、配列番号を意味する;「seq」はDNA配列を意味し、そして「pep」はアミノ酸配列を意味する。例えば、「g001.seq」は、N.gonorrohoeae DNA配列、番号1をいう。これらの配列への添字「−1」の存在は、同じORFについて見出されたさらなる配列を示し、従って、添字を有さない配列の指定および添字を有する配列の指定の両方を有するORFについてのデータが、このような指定された配列の両方に適用する。さらに、オープンリーディングフレームは、ORF#として同定され、ここで「#」はORFの番号を意味し、これはORFをコードする配列の番号に対応し、そしてORFの指定は「.ng」または「.a」の添字を付けられ得、このことは、そのORFがそれぞれ、N.gonorrhoeae配列またはN.meningitidis A配列に対応することを意味する。配列の前の語「部分的」は、その配列が部分ORFであるかまたは完全ORFであり得ることを示す。コンピューター分析が、「g」、「m」、および「a」ペプチド配列の間を理解する比較のために行われた;そしてその中で添字「pep」は、はっきりと言及されていない場合に暗示される。さらに、すぐ前に先行するテキストと、どの配列が比較されるかの記載との間に矛盾がある場合、そして指定された配列が比較された場合、指定された配列は、実際の比較される配列を制御し、そして実際の比較される配列である。
ORF: コンティーグ:
279 gnm4.seq
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3039):
【化1】
これは、アミノ酸配列(配列番号3040;ORF 279)に対応する:
【化2】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号3041):
【化3】
これは、アミノ酸配列(配列番号3042;ORF 279.ng)に対応する:
【化4】
ORF 279は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 279.ng)と152アミノ酸重複にわたって89.5%の同一性を示す。
【化5】
【化6】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3043):
【化7】
これは、アミノ酸配列(配列番号3044;ORF 279.a)に対応する:
【化8】
519および519−1 gnm7.seq
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3045):
【化9】
【化10】
これは、アミノ酸配列(配列番号3046;ORF 519)に対応する:
【化11】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号3047):
【化12】
これは、アミノ酸配列(配列番号3048;ORF 519.ng)に対応する:
【化13】
ORF 519は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 519.ng)と200アミノ酸重複にわたって、87.5%の同一性を示す。
【化14】
【化15】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3049):
【化16】
これは、アミノ酸配列(配列番号3050;ORF 519.a)に対応する:
【化17】
【化18】
さらなる研究は、N.meningitidisにおいて同定されたDNA配列を明らかにした(配列番号3051):
【化19】
これは、アミノ酸配列(配列番号3052;ORF 519−1)に対応する:
【化20】
以下のDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号3053):
【化21】
【化22】
これは、アミノ酸配列(配列番号3054;ORF 519−1.ng)に対応する:
【化23】
以下のDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3055):
【化24】
【化25】
これは、アミノ酸配列(配列番号3056;ORF 519−1.a)に対応する:
【化26】
【化27】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3057):
【化28】
これは、アミノ酸配列(配列番号3058;ORF 576)に対応する:
【化29】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号3059):
【化30】
これは、アミノ酸配列(配列番号3060;ORF 576.ng)に対応する:
【化31】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化32】
【化33】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3061):
【化34】
これは、アミノ酸配列(配列番号3062;ORF 576.a)に対応する:
【化35】
【化36】
さらなる研究は、N.meningitidisにおいて同定されたDNA配列を明らかにした(配列番号3063):
【化37】
これは、アミノ酸配列(配列番号3064;ORF 576−1)に対応する:
【化38】
以下のDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号3065):
【化39】
【化40】
これは、アミノ酸配列(配列番号3066;ORF 576−1.ng)に対応する:
【化41】
以下のDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3067):
【化42】
【化43】
これは、アミノ酸配列(配列番号3068;ORF 576−1.a)に対応する:
【化44】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3069):
【化45】
【化46】
これは、アミノ酸配列(配列番号3070;ORF 919)に対応する:
【化47】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号3071):
【化48】
これは、アミノ酸配列(配列番号3072;ORF 919.ng)に対応する:
【化49】
ORF 919は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 919.ng)と441アミノ酸重複にわたって95.9%の同一性を示す:
【化50】
【化51】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3073):
【化52】
これは、アミノ酸配列(配列番号3074;ORF 919.a)に対応する:
【化53】
m919/a919 ORF919および919.aは、441アミノ酸重複にわたって98.6%の同一性を示した。
【化54】
【化55】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3075):
【化56】
【化57】
これは、アミノ酸配列(配列番号3076;ORF 121)に対応する:
【化58】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号3077):
【化59】
これは、アミノ酸配列(配列番号3078;ORF 121.ng)に対応する:
【化60】
ORF 121は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF121.ng)と366アミノ酸重複にわたって73.5%の同一性を示す:
【化61】
【化62】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3079):
【化63】
これは、アミノ酸配列(配列番号3080;ORF 121.a)に対応する:
【化64】
【化65】
さらなる研究は、N.meningitidisにおいて同定されたDNA配列を明らかにした(配列番号3081):
【化66】
【化67】
これは、アミノ酸配列(配列番号3082;ORF 121−1)に対応する:
【化68】
以下のDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3083):
【化69】
【化70】
これは、アミノ酸配列(配列番号3084;ORF 121−1.a)に対応する:
【化71】
【化72】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3085):
【化73】
これは、アミノ酸配列(配列番号3086;ORF 128)に対応する:
【化74】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号3087):
【化75】
これは、アミノ酸配列(配列番号3088;ORF 128.ng)に対応する:
【化76】
【化77】
ORF 128は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF128.ng)と475アミノ酸重複にわたって91.7%の同一性を示す:
【化78】
【化79】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3089):
【化80】
これは、アミノ酸配列(配列番号3090;ORF 128.a)に対応する:
【化81】
【化82】
【化83】
【化84】
さらなる研究は、N.meningitidisにおいて同定されたDNA配列を明らかにした(配列番号3091):
【化85】
これは、アミノ酸配列(配列番号3092;ORF 128−1)に対応する:
【化86】
【化87】
以下のDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号3093):
【化88】
これは、アミノ酸配列(配列番号3094;ORF 128−1.ng)に対応する:
【化89】
【化90】
以下のDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3095):
【化91】
【化92】
これは、アミノ酸配列(配列番号3096;ORF 128−1.a)に対応する:
【化93】
m128−1/a128−1 ORF128−1および128−1.aは、677アミノ酸重複において97.8%の同一性を示した。
【化94】
【化95】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3097):
【化96】
【化97】
これは、アミノ酸配列(配列番号3098;ORF 206)に対応する:
【化98】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号3099):
【化99】
これは、アミノ酸配列(配列番号3100;ORF 206.ng)に対応する:
【化100】
ORF 206は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF206.ng)と177アミノ酸重複にわたって96.0%の同一性を示す:
【化101】
【化102】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3101):
【化103】
これは、アミノ酸配列(配列番号3102;ORF 206.a)に対応する:
【化104】
m206/206a ORF206および206a.は、117アミノ酸重複において99.4%の同一性を示した。
【化105】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3103):
【化106】
【化107】
これは、アミノ酸配列(配列番号3104;ORF 287)に対応する:
【化108】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号3105):
【化109】
これは、アミノ酸配列(配列番号3106;ORF 287.ng)に対応する:
【化110】
【化111】
m287/g287 ORF287および287.ngは、499アミノ酸重複において70.1%の同一性を示した。
【化112】
【化113】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3107):
【化114】
これは、アミノ酸配列(配列番号3108;ORF 287.a)に対応する:
【化115】
【化116】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3109):
【化117】
【化118】
これは、アミノ酸配列(配列番号3110;ORF 406)に対応する:
【化119】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号3111):
【化120】
これは、アミノ酸配列(配列番号3112;ORF 406)に対応する:
【化121】
ORF 406は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF406.a)と320アミノ酸重複にわたって98.8%の同一性を示す:
【化122】
【化123】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3113):
【化124】
これは、アミノ酸配列(配列番号3114;ORF 406.a)に対応する:
【化125】
【化126】
(実施例2)
(ORF 919の発現)
表1中に記載されるORF 919についてのプライマーを使用して、ORF 919を位置付けそしてクローン化した。推定遺伝子919をpETベクター中にクローン化し、そしてE.coli中で発現させた。このタンパク質発現および精製産物を、SDS−PAGEにより分析した。パネルA)は、919−His融合タンパク質精製分析を示す。マウスを精製された919−Hisで免疫し、そして血清をウェスタンブロット(パネルB)、FACS分析(パネルC)、殺菌アッセイ(パネルD)、およびELISAアッセイ(パネルE)に使用した。記号:M1、分子量マーカー;PP、精製タンパク質、TP、N.meningitidis総タンパク質抽出物;OMV、N.meningitidis外膜小胞調製物。矢印は、主な組換えタンパク質産物(A)およびN.meningitidis免疫反応性バンド(B)の位置を示す。これらの実験は、919は、表面露出タンパク質であり、有用な免疫源であることを確かめる。ORF 919の親水性プロット、抗原性指数、および両親媒性領域を図10に提供する。AMPHIプログラムを使用して、推定T細胞エピトープを予測する(Gaoら、1989、J.Immunol 143:3007;Robertsら、1996、AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyiら、1992、Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 919の核酸配列およびそれによってコードされるアミノ酸配列を実施例1に提供する。
(実施例3)
(ORF 279の発現)
表1中に記載されるORF 279についてのプライマーを使用して、ORF 279を位置付けそしてクローン化した。推定遺伝子279をpGexベクター中にクローン化し、そしてE.coli中で発現させた。このタンパク質発現および精製産物を、SDS−PAGEにより分析した。パネルA)は、279−GST精製分析を示す。マウスを精製された279−GSTで免疫し、そして血清をウェスタンブロット分析(パネルB)、FACS分析(パネルC)、殺菌アッセイ(パネルD)、およびELISAアッセイ(パネルE)に使用した。記号:M1、分子量マーカー;TP、N.meningitidis総タンパク質抽出物;OMV、N.meningitidis外膜小胞調製物。矢印は、主な組換えタンパク質産物(A)およびN.meningitidis免疫反応性バンド(B)の位置を示す。これらの実験は、279は、表面露出タンパク質であり、有用な免疫源であることを確かめる。ORF 279の親水性プロット、抗原性指数、および両親媒性領域を図11に提供する。AMPHIプログラムを使用して、推定T細胞エピトープを予測する(Gaoら、1989、J.Immunol 143:3007;Robertsら、1996、AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyiら、1992、Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 279の核酸配列およびそれによってコードされるアミノ酸配列を実施例1に提供する。
(実施例4)
(ORF 576および576−1の発現)
表1中に記載されるORF 576についてのプライマーを使用して、ORF 576を位置付けそしてクローン化した。推定遺伝子576をpGexベクター中にクローン化し、そしてE.coli中で発現させた。このタンパク質精製産物を、SDS−PAGEにより分析した。パネルA)は、576−GST融合タンパク質精製分析を示す。マウスを精製された576−GSTで免疫し、そして血清をウェスタンブロット(パネルB)、FACS分析(パネルC)、殺菌アッセイ(パネルD)、およびELISAアッセイ(パネルE)に使用した。記号:M1、分子量マーカー;TP、N.meningitidis総タンパク質抽出物;OMV、N.meningitidis外膜小胞調製物。矢印は、主な組換えタンパク質産物(A)およびN.meningitidis免疫反応性バンド(B)の位置を示す。これらの実験は、ORF 576は、表面露出タンパク質であり、有用な免疫源であることを確かめる。ORF 576の親水性プロット、抗原性指数、および両親媒性領域を図12に提供する。AMPHIプログラムを使用して、推定T細胞エピトープを予測する(Gaoら、1989、J.Immunol 143:3007;Robertsら、1996、AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyiら、1992、Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 576の核酸配列およびそれによってコードされるアミノ酸配列を実施例1に提供する。
(実施例5)
(ORF 519および519−1の発現)
表1中に記載されるORF 519についてのプライマーを使用して、ORF 519を位置付けそしてクローン化した。推定遺伝子519をpETベクター中にクローン化し、そしてE.coli中で発現させた。このタンパク質精製産物を、SDS−PAGEにより分析した。パネルA)は、519−His融合タンパク質精製分析を示す。マウスを精製された519−Hisで免疫し、そして血清をウェスタンブロット(パネルB)、FACS分析(パネルC)、殺菌アッセイ(パネルD)、およびELISAアッセイ(パネルE)に使用した。記号:M1、分子量マーカー;TP、N.meningitidis総タンパク質抽出物;OMV、N.meningitidis外膜小胞調製物。矢印は、主な組換えタンパク質産物(A)およびN.meningitidis免疫反応性バンド(B)の位置を示す。これらの実験は、519は、表面露出タンパク質であり、有用な免疫源であることを確かめる。ORF 519の親水性プロット、抗原性指数、および両親媒性領域を図13に提供する。AMPHIプログラムを使用して、推定T細胞エピトープを予測する(Gaoら、1989、J.Immunol 143:3007;Robertsら、1996、AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyiら、1992、Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 519の核酸配列およびそれによってコードされるアミノ酸配列を実施例1に提供する。
(実施例6)
(ORF 121および121−1の発現)
表1中に記載されるORF 121についてのプライマーを使用して、ORF 121を位置付けそしてクローン化した。推定遺伝子121をpETベクター中にクローン化し、そしてE.coli中で発現させた。このタンパク質精製産物を、SDS−PAGEにより分析した。パネルA)は、121−His融合タンパク質精製分析を示す。マウスを精製された121−Hisで免疫し、そして血清をウェスタンブロット分析(パネルB)、FACS分析(パネルC)、殺菌アッセイ(パネルD)、およびELISAアッセイ(パネルE)に使用した。結果は、121が表面露出タンパク質であることを示す。記号:M1、分子量マーカー;TP、N.meningitidis総タンパク質抽出物;OMV、N.meningitidis外膜小胞調製物。矢印は、主な組換えタンパク質産物(A)およびN.meningitidis免疫反応性バンド(B)の位置を示す。これらの実験は、121は、表面露出タンパク質であり、有用な免疫源であることを確かめる。ORF 121の親水性プロット、抗原性指数、および両親媒性領域を図14に提供する。AMPHIプログラムを使用して、推定T細胞エピトープを予測する(Gaoら、1989、J.Immunol 143:3007;Robertsら、1996、AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyiら、1992、Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 121の核酸配列およびそれによってコードされるアミノ酸配列を実施例1に提供する。
(実施例7)
(ORF 128および128−1の発現)
表1中に記載されるORF 128についてのプライマーを使用して、ORF 128を位置付けそしてクローン化した。推定遺伝子128をpETベクター中にクローン化し、そしてE.coli中で発現させた。このタンパク質精製産物を、SDS−PAGEにより分析した。パネルA)は、128−His精製分析を示す。マウスを精製された128−Hisで免疫し、そして血清をウェスタンブロット分析(パネルB)、FACS分析(パネルC)、殺菌アッセイ(パネルD)、およびELISAアッセイ(パネルE)に使用した。結果は、128が表面露出タンパク質であることを示す。記号:M1、分子量マーカー;TP、N.meningitidis総タンパク質抽出物;OMV、N.meningitidis外膜小胞調製物。矢印は、主な組換えタンパク質産物(A)およびN.meningitidis免疫反応性バンド(B)の位置を示す。これらの実験は、128は、表面露出タンパク質であり、有用な免疫源であることを確かめる。ORF 128の親水性プロット、抗原性指数、および両親媒性領域を図15に提供する。AMPHIプログラムを使用して、推定T細胞エピトープを予測する(Gaoら、1989、J.Immunol 143:3007;Robertsら、1996、AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyiら、1992、Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 128の核酸配列およびそれによってコードされるアミノ酸配列を実施例1に提供する。
(実施例8)
(ORF 206の発現)
表1中に記載されるORF 206についてのプライマーを使用して、ORF 206を位置付けそしてクローン化した。推定遺伝子206をpETベクター中にクローン化し、そしてE.coli中で発現させた。このタンパク質精製産物を、SDS−PAGEにより分析した。パネルA)は、206−His精製分析を示す。マウスを精製された206−Hisで免疫し、そして血清をウェスタンブロット分析(パネルB)に使用した。髄膜炎菌由来のタンパク質抽出物における免疫反応性バンドが、17kDaの代わりに38kDaであることは、価値ある知見である(パネルA)。この抗体染色の性質の情報を得るために、本発明者らは、His−tagを含まずかつ推定リーダーペプチドを含むE.coliにおいてORF 206を発現させた。この206タンパク質のネイティブな形態を発現しているE.coli由来の、総タンパク質抽出物についてのウェスタンブロット分析は、髄膜炎菌において観察されるように、38kDaの位置に反応性バンドを示した。本発明者らは、パネルB)における38kDaバンドは特異的であり、そして抗206抗体は多量体タンパク質複合体を認識するようであると結論する。パネルCはFACS分析を示し、パネルDは殺菌アッセイを示し、そしてパネルEはELISAアッセイを示す。結果は、206が表面露出タンパク質であることを示す。記号:M1、分子量マーカー;TP、N.meningitidis総タンパク質抽出物;OMV、N.meningitidis外膜小胞調製物。矢印は、主な組換えタンパク質産物(A)およびN.meningitidis免疫反応性バンド(B)の位置を示す。これらの実験は、206は、表面露出タンパク質であり、有用な免疫源であることを確かめる。ORF 519の親水性プロット、抗原性指数、および両親媒性領域を図16に提供する。AMPHIプログラムを使用して、推定T細胞エピトープを予測する(Gaoら、1989、J.Immunol 143:3007;Robertsら、1996、AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyiら、1992、Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 206の核酸配列およびそれによってコードされるアミノ酸配列を実施例1に提供する。
(実施例9)
(ORF 287の発現)
表1中に記載されるORF 287についてのプライマーを使用して、ORF 287を位置付けそしてクローン化した。推定遺伝子287をpGexベクター中にクローン化し、そしてE.coli中で発現させた。タンパク質精製産物を、SDS−PAGEにより分析した。パネルA)は、287−GST融合タンパク質精製分析を示す。マウスを精製された287−GSTで免疫し、そして血清をFACS分析(パネルB)、殺菌アッセイ(パネルC)、およびELISAアッセイ(パネルD)に使用した。結果は、287が表面露出タンパク質であることを示す。記号:M1、分子量マーカー。矢印は、主な組換えタンパク質産物(A)の位置を示す。これらの実験は、287は、表面露出タンパク質であり、有用な免疫源であることを確かめる。ORF 287の親水性プロット、抗原性指数、および両親媒性領域を図17に提供する。AMPHIプログラムを使用して、推定T細胞エピトープを予測する(Gaoら、1989、J.Immunol 143:3007;Robertsら、1996、AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyiら、1992、Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 287の核酸配列およびそれによってコードされるアミノ酸配列を実施例1に提供する。
(実施例10)
(ORF 406の発現)
表1中に記載されるORF 406についてのプライマーを使用して、ORF 406を位置付けそしてクローン化した。推定遺伝子406をpETベクター中にクローン化し、そしてE.coli中で発現させた。このタンパク質精製産物を、SDS−PAGEにより分析した。パネルA)は、406−His融合タンパク質精製分析を示す。マウスを精製された406−Hisで免疫し、そして血清をウェスタンブロット分析(パネルB)、FACS分析(パネルC)、殺菌アッセイ(パネルD)、およびELISAアッセイ(パネルE)に使用した。結果は、406が表面露出タンパク質であることを示す。記号:M1、分子量マーカー;TP、N.meningitidis総タンパク質抽出物;OMV、N.meningitidis外膜小胞調製物。矢印は、主な組換えタンパク質産物(A)およびN.meningitidis免疫反応性バンド(B)の位置を示す。これらの実験は、406は、表面露出タンパク質であり、有用な免疫源であることを確かめる。ORF 406の親水性プロット、抗原性指数、および両親媒性領域を図18に提供する。AMPHIプログラムを使用して、推定T細胞エピトープを予測する(Gaoら、1989、J.Immunol 143:3007;Robertsら、1996、AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyiら、1992、Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 406の核酸配列およびそれによってコードされるアミノ酸配列を実施例1に提供する。
(実施例11)
表2は、異なる株間でのORF 225の配列保存を評価するために使用した、いくつかのNeisseria株を列挙する。
【表2】
列挙された各株のアミノ酸配列は以下の通りである:
【化127】
【化128】
【化129】
【化130】
【化131】
図19は、これらの各株の配列整列化の結果を示す。暗い影は相同性領域を示し、そして灰色の影は類似した特徴を有するアミノ酸の保存を示す。容易に識別可能である場合、ORF 225の種々の株間で有意な保存が存在し、このことはさらに、ワクチンおよび診断の両方のための抗原としての有用性を確認する。 (実施例12)
表3は、異なる株間でのORF 235の配列保存を評価するために使用した、いくつかのNeisseria株を列挙する。
【表3】
列挙された各株のアミノ酸配列は以下の通りである:
【化132】
【化133】
【化134】
【化135】
図20は、これらの各株の配列整列化の結果を示す。暗い影は相同な領域を示し、そして灰色の影は類似した特徴を有するアミノ酸の保存を示す。容易に識別可能である場合、ORF 235の種々の株間で有意な保存が存在し、このことはさらに、ワクチンおよび診断の両方のための抗原としての有用性を確認する。 (実施例13)
表4は、異なる株間でのORF 287の配列保存を評価するために使用した、いくつかのNeisseria株を列挙する。
【表4】
列挙された各株のアミノ酸配列は以下の通りである:
【化136】
【化137】
図21は、これらの各株の配列整列化の結果を示す。暗い影は相同な領域を示し、そして灰色の影は類似した特徴を有するアミノ酸の保存を示す。容易に識別可能である場合、ORF 287の種々の株間で有意な保存が存在し、このことはさらに、ワクチンおよび診断の両方のための抗原としての有用性を確認する。 (実施例14)
表5は、異なる株間でのORF 519の配列保存を評価するために使用した、いくつかのNeisseria株を列挙する。
【表5】
列挙された各株のアミノ酸配列は以下の通りである:
【化138】
【化139】
【化140】
【化141】
図22は、これらの各株の配列整列化の結果を示す。暗い影は相同な領域を示し、そして灰色の影は類似した特徴を有するアミノ酸の保存を示す。容易に識別可能である場合、ORF 519の種々の株間で有意な保存が存在し、このことはさらに、ワクチンおよび診断の両方のための抗原としての有用性を確認する。 (実施例15)
表6は、異なる株間でのORF 919の配列保存を評価するために使用した、いくつかのNeisseria株を列挙する。
【表6】
列挙された各株のアミノ酸配列は以下の通りである:
【化142】
【化143】
【化144】
【化145】
【化146】
【化147】
図23は、これらの各株の配列整列化の結果を示す。暗い影は相同な領域を示し、そして灰色の影は類似した特徴を有するアミノ酸の保存を示す。容易に識別可能である場合、ORF 919の種々の株間で有意な保存が存在し、このことはさらに、ワクチンおよび診断の両方のための抗原としての有用性を確認する。 (実施例16)
上記の手順により、以下のオリゴヌクレオチドプライマーをポリメラーゼ連鎖反応(PCR)アッセイにおいて使用して、示されるようにORFをクローン化した:
表7:完全ORFまたは部分的ORFを増幅するために、PCRに使用されたオリゴヌクレオチド
【表7】
下線を付した配列は、制限認識部位を示す。
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1):
【化148】
これは、アミノ酸配列(配列番号2;ORF 001.ng)に対応する:
【化149】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号3):
【化150】
これは、アミノ酸配列(配列番号4;ORF 001)に対応する:
【化151】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号5):
【化152】
これは、アミノ酸配列(配列番号6;ORF 001.a)に対応する:
【化153】
【化154】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF 001は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 001.ng)と131アミノ酸重複にわたって、89.3%の同一性を示す。
【化155】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号7):
【化156】
これは、アミノ酸配列(配列番号8;ORF 003.ng)に対応する:
【化157】
【化158】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号9):
【化159】
これは、アミノ酸配列(配列番号10;ORF 003)に対応する:
【化160】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号11):
【化161】
これは、アミノ酸配列(配列番号12;ORF 003.a)に対応する:
【化162】
【化163】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF 003は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 003.ng)と219アミノ酸重複にわたって、88.6%の同一性を示す。
【化164】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号13):
【化165】
【化166】
これは、アミノ酸配列(配列番号14;ORF 004.ng)に対応する:
【化167】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号15):
【化168】
これは、アミノ酸配列(配列番号16;ORF 004)に対応する:
【化169】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号17):
【化170】
これは、アミノ酸配列(配列番号18;ORF004.a)に対応する:
【化171】
【化172】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF004は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF004.ng)との258アミノ酸重複にわたって93.4%の同一性を示す:
【化173】
【化174】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号19):
【化175】
これは、アミノ酸配列(配列番号20;ORF005.ng)に対応する:
【化176】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号21):
【化177】
【化178】
これは、アミノ酸配列(配列番号22;ORF005)に対応する:
【化179】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号23):
【化180】
これは、アミノ酸配列(配列番号24;ORF005.a)に対応する:
【化181】
【化182】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF005は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF005.ng)との366アミノ酸重複にわたって77.0%の同一性を示す:
【化183】
【化184】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号25):
【化185】
これは、アミノ酸配列(配列番号26;ORF006.ng)に対応する:
【化186】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号27):
【化187】
【化188】
これは、アミノ酸配列(配列番号28;ORF006)に対応する:
【化189】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号29):
【化190】
これは、アミノ酸配列(配列番号30;ORF006.a)に対応する:
【化191】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF006は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF006.ng)との153アミノ酸重複にわたって95.4%の同一性を示す:
【化192】
【化193】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号31):
【化194】
これは、アミノ酸配列(配列番号32;ORF006−1.ng)に対応する:
【化195】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号33):
【化196】
【化197】
これは、アミノ酸配列(配列番号34;ORF006−1)に対応する:
【化198】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号35):
【化199】
【化200】
これは、アミノ酸配列(配列番号36;ORF006−1.a)に対応する:
【化201】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号37):
【化202】
これは、アミノ酸配列(配列番号38;ORF007.ng)に対応する:
【化203】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号39):
【化204】
これは、アミノ酸配列(配列番号40;ORF007)に対応する:
【化205】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号41):
【化206】
これは、アミノ酸配列(配列番号42;ORF007.a)に対応する:
【化207】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF007は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF007.ng)との113アミノ酸重複にわたって86.7%の同一性を示す:
【化208】
【化209】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号43):
【化210】
これは、アミノ酸配列(配列番号44;ORF007−1.ng)に対応する:
【化211】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号45):
【化212】
これは、アミノ酸配列(配列番号46;ORF007−1)に対応する:
【化213】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号47):
【化214】
【化215】
これは、アミノ酸配列(配列番号48;ORF007−1.a)に対応する:
【化216】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号49):
【化217】
これは、アミノ酸配列(配列番号50;ORF008.ng)に対応する:
【化218】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号51):
【化219】
【化220】
これは、アミノ酸配列(配列番号52;ORF008)に対応する:
【化221】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号53):
【化222】
これは、アミノ酸配列(配列番号54;ORF008.a)に対応する:
【化223】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF008は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF008.ng)との164アミノ酸重複にわたって92.7%の同一性を示す:
【化224】
【化225】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号55):
【化226】
これは、アミノ酸配列(配列番号56;ORF009.ng)に対応する:
【化227】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号57):
【化228】
これは、アミノ酸配列(配列番号58;ORF009)に対応する:
【化229】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF009は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF009.ng)との86アミノ酸重複にわたって97.7%の同一性を示す:
【化230】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号59):
【化231】
これは、アミノ酸配列(配列番号60;ORF009.a)に対応する:
【化232】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号61):
【化233】
これは、アミノ酸配列(配列番号62;ORF010.ng)に対応する:
【化234】
【化235】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号63):
【化236】
これは、アミノ酸配列(配列番号64;ORF010)に対応する:
【化237】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号65):
【化238】
【化239】
これは、アミノ酸配列(配列番号66;ORF010.a)に対応する:
【化240】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF010は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF010.ng)との231アミノ酸重複にわたって98.7%の同一性を示す:
【化241】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号67):
【化242】
【化243】
これは、アミノ酸配列(配列番号68;ORF010−1.ng)に対応する:
【化244】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号69):
【化245】
【化246】
これは、アミノ酸配列(配列番号70;ORF010−1)に対応する:
【化247】
【化248】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号71):
【化249】
これは、アミノ酸配列(配列番号72;ORF010−1.a)に対応する:
【化250】
【化251】
【化252】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号73):
【化253】
これは、アミノ酸配列(配列番号74;ORF011.ng)に対応する:
【化254】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号75):
【化255】
これは、アミノ酸配列(配列番号76;ORF011)に対応する:
【化256】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF011は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF011.ng)との165アミノ酸重複にわたって95.8%の同一性を示す:
【化257】
【化258】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号77):
【化259】
これは、アミノ酸配列(配列番号78;ORF012.ng)に対応する:
【化260】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号79):
【化261】
これは、アミノ酸配列(配列番号80;ORF012)に対応する:
【化262】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号81):
【化263】
これは、アミノ酸配列(配列番号82;ORF012.a)に対応する:
【化264】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF012は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF012.ng)との218アミノ酸重複にわたって58.7%の同一性を示す:
【化265】
【化266】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号83):
【化267】
これは、アミノ酸配列(配列番号84;ORF012−1)に対応する:
【化268】
【化269】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号85):
【化270】
これは、アミノ酸配列(配列番号86;ORF012−1.a)に対応する:
【化271】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号87):
【化272】
【化273】
これは、アミノ酸配列(配列番号88;ORF013.ng)に対応する:
【化274】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号89):
【化275】
これは、アミノ酸配列(配列番号90;ORF013)に対応する:
【化276】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号91):
【化277】
これは、アミノ酸配列(配列番号92;ORF013.a)に対応する:
【化278】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF013は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF013.ng)との101アミノ酸重複にわたって73.3%の同一性を示す:
【化279】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号93):
【化280】
これは、アミノ酸配列(配列番号94;ORF015.ng)に対応する:
【化281】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号95):
【化282】
これは、アミノ酸配列(配列番号96;ORF015)に対応する:
【化283】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号97):
【化284】
これは、アミノ酸配列(配列番号98;ORF015.a)に対応する:
【化285】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF015は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF015.ng)との91アミノ酸重複にわたって94.5%の同一性を示す:
【化286】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号99):
【化287】
これは、アミノ酸配列(配列番号100;ORF018.ng)に対応する:
【化288】
【化289】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号101):
【化290】
これは、アミノ酸配列(配列番号102;ORF018)に対応する:
【化291】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号103):
【化292】
これは、アミノ酸配列(配列番号104;ORF018.a)に対応する:
【化293】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF018は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF018.ng)との103アミノ酸重複にわたって84.5%の同一性を示す:
【化294】
【化295】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号105):
【化296】
これは、アミノ酸配列(配列番号106;ORF019.ng)に対応する:
【化297】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号107):
【化298】
これは、アミノ酸配列(配列番号108;ORF019)に対応する:
【化299】
【化300】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号109):
【化301】
これは、アミノ酸配列(配列番号110;ORF019.a)に対応する:
【化302】
【化303】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF019は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF019.ng)との89アミノ酸重複にわたって95.5%の同一性を示す:
【化304】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号111):
【化305】
これは、アミノ酸配列(配列番号112;ORF023.ng)に対応する:
【化306】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号113):
【化307】
これは、アミノ酸配列(配列番号114;ORF023)に対応する:
【化308】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号115):
【化309】
【化310】
これは、アミノ酸配列(配列番号116;ORF023.a)に対応する:
【化311】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF023は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF023.ng)との113アミノ酸重複にわたって97.3%の同一性を示す:
【化312】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号117):
【化313】
【化314】
これは、アミノ酸配列(配列番号118;ORF025.ng)に対応する:
【化315】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号119):
【化316】
これは、アミノ酸配列(配列番号110;ORF025)に対応する:
【化317】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号111):
【化318】
【化319】
これは、アミノ酸配列(配列番号112;ORF025.a)に対応する:
【化320】
【化321】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF025は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF025.ng)との353アミノ酸重複にわたって75.6%の同一性を示す:
【化322】
【化323】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号113):
【化324】
これは、アミノ酸配列(配列番号114;ORF031.ng)に対応する:
【化325】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号115):
【化326】
これは、アミノ酸配列(配列番号116;ORF031)に対応する:
【化327】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号117):
【化328】
これは、アミノ酸配列(配列番号118;ORF031.a)に対応する:
【化329】
【化330】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF031は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF031.ng)との85アミノ酸重複にわたって60.0%の同一性を示す:
【化331】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号119):
【化332】
これは、アミノ酸配列(配列番号110;ORF032.ng)に対応する:
【化333】
【化334】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号111):
【化335】
これは、アミノ酸配列(配列番号112;ORF032)に対応する:
【化336】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号113):
【化337】
これは、アミノ酸配列(配列番号114;ORF032.a)に対応する:
【化338】
【化339】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF032は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF032.ng)との176アミノ酸重複にわたって86.4%の同一性を示す:
【化340】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号115):
【化341】
【化342】
これは、アミノ酸配列(配列番号116;ORF033.ng)に対応する:
【化343】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号117):
【化344】
【化345】
これは、アミノ酸配列(配列番号118;ORF033)に対応する:
【化346】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号119):
【化347】
これは、アミノ酸配列(配列番号120;ORF033.a)に対応する:
【化348】
【化349】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF033は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF033.ng)との509アミノ酸重複にわたって98.4%の同一性を示す:
【化350】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号121):
【化351】
【化352】
これは、アミノ酸配列(配列番号122;ORF034.ng)に対応する:
【化353】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号123):
【化354】
これは、アミノ酸配列(配列番号124;ORF034)に対応する:
【化355】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号125):
【化356】
【化357】
これは、アミノ酸配列(配列番号126;ORF034.a)に対応する:
【化358】
【化359】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF034は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF034.ng)との257アミノ酸重複にわたって96.5%の同一性を示す:
【化360】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号127):
【化361】
これは、アミノ酸配列(配列番号128;ORF036.ng)に対応する:
【化362】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号129):
【化363】
【化364】
これは、アミノ酸配列(配列番号130;ORF036)に対応する:
【化365】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号131):
【化366】
これは、アミノ酸配列(配列番号132;ORF036.a)に対応する:
【化367】
【化368】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF036は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF036.ng)との271アミノ酸重複にわたって74.9%の同一性を示す:
【化369】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号133):
【化370】
【化371】
これは、アミノ酸配列(配列番号134;ORF0036−1)に対応する:
【化372】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号135):
【化373】
これは、アミノ酸配列(配列番号136;ORF038.ng)に対応する:
【化374】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号137):
【化375】
これは、アミノ酸配列(配列番号138;ORF038)に対応する:
【化376】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号139):
【化377】
これは、アミノ酸配列(配列番号140;ORF038.a)に対応する:
【化378】
【化379】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF038は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF038.ng)との213アミノ酸重複にわたって98.1%の同一性を示す:
【化380】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号141):
【化381】
【化382】
これは、アミノ酸配列(配列番号142;ORF039.ng)に対応する:
【化383】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号143):
【化384】
これは、アミノ酸配列(配列番号144;ORF039)に対応する:
【化385】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号145):
【化386】
これは、アミノ酸配列(配列番号146;ORF039.a)に対応する:
【化387】
【化388】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF039は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF039.ng)との171アミノ酸重複にわたって60.8%の同一性を示す:
【化389】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号147):
【化390】
【化391】
これは、アミノ酸配列(配列番号148;ORF040.ng)に対応する:
【化392】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号149):
【化393】
これは、アミノ酸配列(配列番号150;ORF040)に対応する:
【化394】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号151):
【化395】
【化396】
これは、アミノ酸配列(配列番号152;ORF040.a)に対応する:
【化397】
【化398】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF040は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF040.ng)との436アミノ酸重複にわたって88.3%の同一性を示す:
【化399】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号153):
【化400】
これは、アミノ酸配列(配列番号154;ORF041.ng)に対応する:
【化401】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号155):
【化402】
これは、アミノ酸配列(配列番号156;ORF041)に対応する:
【化403】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号157):
【化404】
これは、アミノ酸配列(配列番号158;ORF041.a)に対応する:
【化405】
【化406】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF041は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF041.ng)との154アミノ酸重複にわたって96.8%の同一性を示す:
【化407】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号159):
【化408】
【化409】
これは、アミノ酸配列(配列番号160;ORF041−1.ng)に対応する:
【化410】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号161):
【化411】
【化412】
これは、アミノ酸配列(配列番号162;ORF041−1)に対応する:
【化413】
【化414】
【化415】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号163):
【化416】
【化417】
これは、アミノ酸配列(配列番号164;ORF041−1.a)に対応する:
【化418】
【化419】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号165):
【化420】
これは、アミノ酸配列(配列番号166;ORF042.ng)に対応する:
【化421】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号167):
【化422】
これは、アミノ酸配列(配列番号168;ORF042)に対応する:
【化423】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号169):
【化424】
これは、アミノ酸配列(配列番号170;ORF042.a)に対応する:
【化425】
【化426】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF042は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF042.ng)との201アミノ酸重複にわたって93.0%の同一性を示す:
【化427】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号171):
【化428】
これは、アミノ酸配列(配列番号172;ORF042−1)に対応する:
【化429】
【化430】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号173):
【化431】
これは、アミノ酸配列(配列番号174;ORF042−1.a)に対応する:
【化432】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号175):
【化433】
これは、アミノ酸配列(配列番号176;ORF043.ng)に対応する:
【化434】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号177):
【化435】
これは、アミノ酸配列(配列番号178;ORF043)に対応する:
【化436】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.meningitidis menA由来の推定ORFと、menBとの相同性)
ORF043は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF043.a)との128アミノ酸重複にわたって89.8%の同一性を示す:
【化437】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号179):
【化438】
【化439】
これは、アミノ酸配列(配列番号180;ORF043.a)に対応する:
【化440】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号181):
【化441】
これは、アミノ酸配列(配列番号182;ORF044.ng)に対応する:
【化442】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号183):
【化443】
これは、アミノ酸配列(配列番号184;ORF044)に対応する:
【化444】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号185):
【化445】
これは、アミノ酸配列(配列番号186;ORF044.a)に対応する:
【化446】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF044は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF044.ng)との89アミノ酸重複にわたって86.5%の同一性を示す:
【化447】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号187):
【化448】
【化449】
これは、アミノ酸配列(配列番号188;ORF046.ng)に対応する:
【化450】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号189):
【化451】
これは、アミノ酸配列(配列番号190;ORF046)に対応する:
【化452】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号191):
【化453】
これは、アミノ酸配列(配列番号192;ORF046.a)に対応する:
【化454】
【化455】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF046は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF046.ng)との185アミノ酸重複にわたって97.3%の同一性を示す:
【化456】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号193):
【化457】
【化458】
これは、アミノ酸配列(配列番号194;ORF047.ng)に対応する:
【化459】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号195):
【化460】
これは、アミノ酸配列(配列番号196;ORF047)に対応する:
【化461】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号197):
【化462】
【化463】
これは、アミノ酸配列(配列番号198;ORF047.a)に対応する:
【化464】
【化465】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF047は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF047.ng)との312アミノ酸重複にわたって96.2%の同一性を示す:
【化466】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号199):
【化467】
これは、アミノ酸配列(配列番号200;ORF048.ng)に対応する:
【化468】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号201):
【化469】
【化470】
これは、アミノ酸配列(配列番号202;ORF048)に対応する:
【化471】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号203):
【化472】
これは、アミノ酸配列(配列番号204;ORF048.a)に対応する:
【化473】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF048は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF048.ng)との150アミノ酸重複にわたって96.4%の同一性を示す:
【化474】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号205):
【化475】
これは、アミノ酸配列(配列番号206;ORF049.ng)に対応する:
【化476】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号207):
【化477】
これは、アミノ酸配列(配列番号208;ORF049)に対応する:
【化478】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号209):
【化479】
【化480】
これは、アミノ酸配列(配列番号210;ORF049.a)に対応する:
【化481】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF049は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF049.ng)との139アミノ酸重複にわたって86.3%の同一性を示す:
【化482】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号211):
【化483】
これは、アミノ酸配列(配列番号212;ORF050.ng)に対応する:
【化484】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号213):
【化485】
これは、アミノ酸配列(配列番号214;ORF050)に対応する:
【化486】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号215):
【化487】
これは、アミノ酸配列(配列番号216;ORF050.a)に対応する:
【化488】
【化489】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF050は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF050.ng)との127アミノ酸重複にわたって98.4%の同一性を示す:
【化490】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号217):
【化491】
【化492】
これは、アミノ酸配列(配列番号218;ORF050−1.ng)に対応する:
【化493】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号219):
【化494】
【化495】
これは、アミノ酸配列(配列番号220;ORF050−1)に対応する:
【化496】
【化497】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号221):
【化498】
これは、アミノ酸配列(配列番号222;ORF050−1.a)に対応する:
【化499】
【化500】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号223):
【化501】
これは、アミノ酸配列(配列番号224;ORF052.ng)に対応する:
【化502】
【化503】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号225):
【化504】
これは、アミノ酸配列(配列番号226;ORF052)に対応する:
【化505】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号227):
【化506】
これは、アミノ酸配列(配列番号228;ORF052.a)に対応する:
【化507】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF052は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF052.ng)との119アミノ酸重複にわたって95.8%の同一性を示す:
【化508】
【化509】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号229):
【化510】
これは、アミノ酸配列(配列番号230;ORF073.ng)に対応する:
【化511】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号231):
【化512】
これは、アミノ酸配列(配列番号232;ORF073)に対応する:
【化513】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号233):
【化514】
これは、アミノ酸配列(配列番号234;ORF073.a)に対応する:
【化515】
【化516】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF073は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF073.ng)との131アミノ酸重複にわたって87.0%の同一性を示す:
【化517】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号235):
【化518】
これは、アミノ酸配列(配列番号236;ORF075.ng)に対応する:
【化519】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号237):
【化520】
これは、アミノ酸配列(配列番号238;ORF075)に対応する:
【化521】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF075は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF075.ng)との137アミノ酸重複にわたって65.7%の同一性を示す:
【化522】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号239):
【化523】
これは、アミノ酸配列(配列番号240;ORF075.a)に対応する:
【化524】
【化525】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号241):
【化526】
これは、アミノ酸配列(配列番号242;ORF080.ng)に対応する:
【化527】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号243):
【化528】
【化529】
これは、アミノ酸配列(配列番号2441;ORF080)に対応する:
【化529a】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF080は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF080.ng)との242アミノ酸重複にわたって97.9%の同一性を示す:
【化530】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号245):
【化531】
【化532】
これは、アミノ酸配列(配列番号246;ORF080.a)に対応する:
【化533】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号247):
【化534】
【化535】
これは、アミノ酸配列(配列番号248;ORF081.ng)に対応する:
【化536】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号249):
【化537】
これは、アミノ酸配列(配列番号250;ORF081)に対応する:
【化538】
【化539】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF081は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF081.ng)との455アミノ酸重複にわたって94.1%の同一性を示す:
【化540】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号251):
【化541】
これは、アミノ酸配列(配列番号252;ORF081.a)に対応する:
【化542】
【化543】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号253):
【化544】
これはアミノ酸配列(配列番号254;ORF082.ng)に対応する:
【化545】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号255):
【化546】
【化547】
これはアミノ酸配列(配列番号256;ORF082)に対応する:
【化548】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF082は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF082.ng)と247アミノ酸重複にわたって92.7%の同一性を示す:
【化549】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号257):
【化550】
【化551】
これはアミノ酸配列(配列番号258;ORF082.a)に対応する:
【化552】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号259):
【化553】
【化554】
これはアミノ酸配列(配列番号260;ORF084.ng)に対応する:
【化555】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号261):
【化556】
これはアミノ酸配列(配列番号262;ORF084)に対応する:
【化557】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF084は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF084.ng)と231アミノ酸重複にわたって90.5%の同一性を示す:
【化558】
【化559】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号263):
【化560】
これはアミノ酸配列(配列番号264;ORF084.a)に対応する:
【化561】
【化562】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号265):
【化563】
【化564】
これはアミノ酸配列(配列番号266;ORF085.ng)に対応する:
【化565】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号267):
【化566】
これはアミノ酸配列(配列番号268;ORF085)に対応する:
【化567】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF085は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF085.ng)と94アミノ酸重複にわたって94.7%の同一性を示す:
【化568】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号269):
【化569】
これはアミノ酸配列(配列番号270;ORF085.a)に対応する:
【化560a】
【化561a】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号271):
【化562a】
これはアミノ酸配列(配列番号272;ORF086.ng)に対応する:
【化563a】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号273):
【化564a】
【化565a】
これはアミノ酸配列(配列番号274;ORF086)に対応する:
【化566a】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF086は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF086.ng)と396アミノ酸重複にわたって96.7%の同一性を示す:
【化567a】
【化568a】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号275):
【化569a】
これはアミノ酸配列(配列番号276;ORF086.a)に対応する:
【化570】
【化571】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号277):
【化572】
これはアミノ酸配列(配列番号278;ORF087.ng)に対応する:
【化573】
【化574】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号279):
【化575】
これはアミノ酸配列(配列番号280;ORF087)に対応する:
【化576】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF087は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF087.ng)と355アミノ酸重複にわたって83.9%の同一性を示す:
【化577】
【化578】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号281):
【化579】
これはアミノ酸配列(配列番号282;ORF087.a)に対応する:
【化580】
【化581】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号283):
【化582】
これはアミノ酸配列(配列番号284;ORF088.ng)に対応する:
【化583】
【化584】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号285):
【化585】
これはアミノ酸配列(配列番号286;ORF088)に対応する:
【化586】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF088は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF0888.ng)と205アミノ酸重複にわたって91.7%の同一性を示す:
【化587】
【化588】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号287):
【化589】
これはアミノ酸配列(配列番号288;ORF088.a)に対応する:
【化590】
【化591】
【化592】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号289):
【化593】
これはアミノ酸配列(配列番号290;ORF089.ng)に対応する:
【化594】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号291):
【化595】
これはアミノ酸配列(配列番号292;ORF089)に対応する:
【化596】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF089は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF089.ng)と149アミノ酸重複にわたって88.6%の同一性を示す:
【化597】
【化598】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号293):
【化599】
これはアミノ酸配列(配列番号294;ORF089.a)に対応する:
【化600】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号295):
【化601】
【化602】
これはアミノ酸配列(配列番号296;ORF090.ng)に対応する:
【化603】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号297):
【化604】
これはアミノ酸配列(配列番号298;ORF090)に対応する:
【化605】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF090は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF090.ng)と118アミノ酸重複にわたって83.9%の同一性を示す:
【化606】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号299):
【化607】
これはアミノ酸配列(配列番号300;ORF090.a)に対応する:
【化608】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された
【化609】
これはアミノ酸配列(ORF090−1.ng)に対応する:
【化610】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2):
【化611】
これはアミノ酸配列(配列番号3;ORF090−1)に対応する:
【化612】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号303):
【化613】
これはアミノ酸配列(配列番号304;ORF091.ng)に対応する:
【化614】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号305):
【化615】
これはアミノ酸配列(配列番号306;ORF091)に対応する:
【化616】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF091は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF091.ng)と101アミノ酸重複にわたって84.2%の同一性を示す:
【化617】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号307):
【化618】
これはアミノ酸配列(配列番号308;ORF091.a)に対応する:
【化619】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号309):
【化620】
これはアミノ酸配列(配列番号310;ORF092.ng)に対応する:
【化621】
【化622】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号311):
【化623】
これはアミノ酸配列(配列番号312;ORF092)に対応する:
【化624】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF092は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF092.ng)と506アミノ酸重複にわたって96.6%の同一性を示す:
【化625】
【化626】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号313):
【化627】
【化628】
これはアミノ酸配列(配列番号314;ORF092.a)に対応する:
【化629】
【化630】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号315):
【化631】
これはアミノ酸配列(配列番号316;ORF093.ng)に対応する:
【化632】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号317):
【化633】
【化634】
これはアミノ酸配列(配列番号318;ORF093)に対応する:
【化635】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF093は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF093.ng)と276アミノ酸重複にわたって96.7%の同一性を示す:
【化636】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号319):
【化637】
これはアミノ酸配列(配列番号320;ORF093.a)に対応する:
【化638】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号321):
【化639】
これはアミノ酸配列(配列番号322;ORF094.ng)に対応する:
【化640】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号323):
【化641】
これはアミノ酸配列(配列番号324;ORF094)に対応する:
【化642】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF094は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF094.ng)と103アミノ酸重複にわたって95.1%の同一性を示す:
【化643】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号325):
【化644】
これはアミノ酸配列(配列番号326;ORF094.a)に対応する:
【化645】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号327):
【化646】
これはアミノ酸配列(配列番号328;ORF095.ng)に対応する:
【化647】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号329):
【化648】
これはアミノ酸配列(配列番号330;ORF095)に対応する:
【化649】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF095は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF095.ng)と124アミノ酸重複にわたって97.6%の同一性を示す:
【化650】
【化651】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号331):
【化652】
これはアミノ酸配列(配列番号332;ORF095.a)に対応する:
【化653】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号333):
【化654】
【化655】
これはアミノ酸配列(配列番号334;ORF096.ng)に対応する:
【化656】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号335):
【化657】
これはアミノ酸配列(配列番号336;ORF096)に対応する:
【化658】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号337):
【化659】
これはアミノ酸配列(配列番号338;ORF096.ng)に対応する:
【化660】
【化661】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号339):
【化662】
これはアミノ酸配列(配列番号340;ORF097.ng)に対応する:
【化663】
【化664】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号341):
【化665】
これはアミノ酸配列(配列番号342;ORF097)に対応する:
【化666】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF097は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF097.ng)と436アミノ酸重複にわたって96.3%の同一性を示す:
【化667】
【化668】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号343):
【化669】
【化670】
これはアミノ酸配列(配列番号344;ORF097.a)に対応する:
【化671】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号345):
【化672】
これはアミノ酸配列(配列番号346;ORF098.ng)に対応する:
【化673】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号347):
【化674】
これはアミノ酸配列(配列番号348;ORF098)に対応する:
【化675】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF098は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF098.ng)と125アミノ酸重複にわたって89.6%の同一性を示す:
【化676】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号349):
【化677】
【化678】
これはアミノ酸配列(配列番号350;ORF098.a)に対応する:
【化679】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号351):
【化680】
【化681】
これはアミノ酸配列(配列番号352;ORF099.ng)に対応する:
【化682】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号353):
【化683】
【化684】
これはアミノ酸配列(配列番号354;ORF099)に対応する:
【化685】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF099は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF099.ng)と639アミノ酸重複にわたって96.2%の同一性を示す:
【化686】
【化687】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号355):
【化688】
【化689】
これはアミノ酸配列(配列番号356;ORF099.a)に対応する:
【化690】
【化691】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号357):
【化692】
これはアミノ酸配列(配列番号358;ORF102.ng)に対応する:
【化693】
【化694】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号359):
【化695】
これはアミノ酸配列(配列番号360;ORF102)に対応する:
【化696】
【化697】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号361):
【化698】
これはアミノ酸配列(配列番号362;ORF102.a)に対応する:
【化699】
【化700】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号363):
【化701】
これはアミノ酸配列(配列番号364;ORF105.a)に対応する:
【化702】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号365):
【化703】
これはアミノ酸配列(配列番号366;ORF105)に対応する:
【化704】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF0105は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF105.ng)と289アミノ酸重複にわたって79.9%の同一性を示す:
【化705】
【化706】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号367):
【化707】
これはアミノ酸配列(配列番号368;ORF105.a)に対応する:
【化708】
【化709】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号369):
【化710】
これはアミノ酸配列(配列番号370;ORF105−1.ng)に対応する:
【化711】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号371):
【化712】
これはアミノ酸配列(配列番号372;ORF105−1)に対応する:
【化713】
【化714】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号373):
【化715】
これはアミノ酸配列(配列番号374;ORF105−1.a)に対応する:
【化716】
【化717】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号375):
【化718】
これはアミノ酸配列(配列番号376;ORF107.ng)に対応する:
【化719】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号377):
【化720】
これはアミノ酸配列(配列番号378;ORF107)に対応する:
【化721】
【化722】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF107は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF107.ng)と170アミノ酸重複にわたって89.4%の同一性を示す:
【化723】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号379):
【化724】
これはアミノ酸配列(配列番号380;ORF107.a)に対応する:
【化725】
【化726】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号381):
【化727】
これはアミノ酸配列(配列番号382;ORF108.ng)に対応する:
【化728】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号383):
【化729】
これはアミノ酸配列(配列番号384;ORF108)に対応する:
【化730】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF108は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF108.ng)と173アミノ酸重複にわたって89.6%の同一性を示す:
【化731】
【化732】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号385):
【化733】
これはアミノ酸配列(配列番号386;ORF108.a)に対応する:
【化734】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号387):
【化735】
これはアミノ酸配列(配列番号388;ORF109.ng)に対応する:
【化736】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号389):
【化737】
これはアミノ酸配列(配列番号4;ORF109)に対応する:
【化738】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF109は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF109.ng)と126アミノ酸重複にわたって92.9%の同一性を示す:
【化739】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号391):
【化740】
【化741】
これはアミノ酸配列(配列番号392;ORF109)に対応する:
【化742】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号393):
【化743】
これはアミノ酸配列(配列番号394;ORF111.ng)に対応する:
【化744】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号395):
【化745】
【化746】
これはアミノ酸配列(配列番号396;ORF111)に対応する:
【化747】
ORF111は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF111.ng)と97アミノ酸重複にわたって88.7%の同一性を示す:
【化748】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号397):
【化749】
【化750】
これはアミノ酸配列(配列番号398;ORF111.a)に対応する:
【化751】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号399):
【化752】
【化753】
これはアミノ酸配列(配列番号400;ORF111−1.ng)に対応する:
【化754】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号401):
【化755】
これはアミノ酸配列(配列番号402;ORF111−1)に対応する:
【化756】
【化757】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号403):
【化758】
【化759】
これはアミノ酸配列(配列番号404;ORF111−1.a)に対応する:
【化760】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号405):
【化761】
【化762】
これはアミノ酸配列(配列番号406;ORF114.ng)に対応する:
【化763】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号407):
【化764】
これはアミノ酸配列(配列番号408;ORF114)に対応する:
【化765】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号409):
【化766】
これはアミノ酸配列(配列番号410;ORF114.a)に対応する:
【化767】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号411):
【化768】
【化769】
これはアミノ酸配列(配列番号412;ORF117.ng)に対応する:
【化770】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号413):
【化771】
これはアミノ酸配列(配列番号414;ORF117)に対応する:
【化772】
【化773】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF117は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF117.ng)と490アミノ酸重複にわたって97.6%の同一性を示す:
【化774】
【化775】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号415):
【化776】
これはアミノ酸配列(配列番号416;ORF117.a)に対応する:
【化777】
【化778】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号417):
【化779】
これはアミノ酸配列(配列番号418;ORF117−1.ng)に対応する:
【化780】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号419):
【化781】
【化782】
これはアミノ酸配列(配列番号420;ORF117−1)に対応する:
【化783】
【化784】
【化785】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号421):
【化786】
【化787】
これはアミノ酸配列(配列番号422;ORF117−1.a)に対応する:
【化788】
【化789】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号423):
【化790】
これはアミノ酸配列(配列番号424;ORF118.ng)に対応する:
【化791】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号425):
【化792】
これはアミノ酸配列(配列番号426;ORF118)に対応する:
【化793】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF118は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF118.ng)と125アミノ酸重複にわたって92.8%の同一性を示す:
【化794】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号427):
【化795】
これはアミノ酸配列(配列番号428;ORF118.a)に対応する:
【化796】
【化797】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号429):
【化798】
これはアミノ酸配列(配列番号430;ORF120.ng)に対応する:
【化799】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号431):
【化800】
これはアミノ酸配列(配列番号432;ORF120)に対応する:
【化801】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF120は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF120.ng)と223アミノ酸重複にわたって97.3%の同一性を示す:
【化802】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号433):
【化803】
これはアミノ酸配列(配列番号434;ORF120.a)に対応する:
【化804】
【化805】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号435):
【化806】
これはアミノ酸配列(配列番号436;ORF121.ng)に対応する:
【化807】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号437):
【化808】
【化809】
これはアミノ酸配列(配列番号438;ORF121)に対応する:
【化810】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF121は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF121.ng)と336アミノ酸重複にわたって73.5%の同一性を示す:
【化811】
【化812】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号439):
【化813】
これはアミノ酸配列(配列番号440;ORF121.a)に対応する:
【化814】
【化815】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号441):
【化816】
これはアミノ酸配列(配列番号442;ORF121−1)に対応する:
【化817】
【化818】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号443):
【化819】
これはアミノ酸配列(配列番号444;ORF121−1.a)に対応する:
【化820】
【化821】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号445):
【化822】
これはアミノ酸配列(配列番号446;ORF122.ng)に対応する:
【化823】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号447):
【化824】
これはアミノ酸配列(配列番号448;ORF122)に対応する:
【化825】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF122は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF122.ng)と246アミノ酸重複にわたって47.2%の同一性を示す:
【化826】
【化827】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号449):
【化828】
これはアミノ酸配列(配列番号450;ORF122.a)に対応する:
【化829】
【化830】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号451):
【化831】
これはアミノ酸配列(配列番号452;ORF122−1.ng)に対応する:
【化832】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号453):
【化833】
これはアミノ酸配列(配列番号454;ORF122−1)に対応する:
【化834】
【化835】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号455):
【化836】
これはアミノ酸配列(配列番号456;ORF122−1.a)に対応する:
【化837】
【化838】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号457):
【化839】
これはアミノ酸配列(配列番号458;ORF125.ng)に対応する:
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号459):
【化840】
【化841】
これはアミノ酸配列(配列番号460;ORF125)に対応する:
【化842】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF125は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF125.ng)と343アミノ酸重複にわたって92.1%の同一性を示す:
【化843】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号461):
【化844】
【化845】
これはアミノ酸配列(配列番号462;ORF125.a)に対応する:
【化846】
【化847】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号463):
【化848】
これはアミノ酸配列(配列番号464;ORF126.ng)に対応する:
【化849】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号465):
【化850】
これはアミノ酸配列(配列番号446;ORF126)に対応する:
【化851】
【化852】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF126は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF126.ng)と269アミノ酸重複にわたって95.9%の同一性を示す:
【化853】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号467):
【化854】
これはアミノ酸配列(配列番号468;ORF126.a)に対応する:
【化855】
【化856】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号469):
【化857】
これはアミノ酸配列(配列番号470;ORF126−1.ng)に対応する:
【化858】
【化859】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号471):
【化860】
これはアミノ酸配列(配列番号5;ORF126−1)に対応する:
【化861】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号473):
【化862】
【化863】
これはアミノ酸配列(配列番号474;ORF126−1.a)に対応する:
【化864】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号475):
【化865】
【化866】
これはアミノ酸配列(配列番号476;ORF127.ng)に対応する:
【化867】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号477):
【化868】
これはアミノ酸配列(配列番号478;ORF127)に対応する:
【化869】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF127は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF127.ng)と290アミノ酸重複にわたって97.9%の同一性を示す:
【化870】
【化871】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号479):
【化872】
これはアミノ酸配列(配列番号480;ORF127.a)に対応する:
【化873】
【化874】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号481):
【化875】
【化876】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号482;ORF 128.ng)に対応する:
【化877】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号483):
【化878】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号484;ORF128)に対応する:
【化879】
【化880】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF128は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF128.ng)と475アミノ酸の重複にわたって91.7%の同一性を示す:
【化881】
【化882】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号485):
【化883】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号486;ORF128.a)に対応する:
【化884】
【化885】
【化886】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号487):
【化887】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号488;ORF128−1.ng)に対応する:
【化888】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号489):
【化889】
【化890】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号490;ORF128−1)に対応する:
【化891】
【化892】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号491):
【化893】
【化894】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号492;ORF128−1.a)に対応する:
【化895】
【化896】
【化897】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号493):
【化898】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号494;ORF129.ng)に対応する:
【化899】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号495):
【化900】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号496;ORF129)に対応する:
【化901】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF129は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF129.ng)と110アミノ酸の重複にわたって79.1%の同一性を示す:
【化902】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号497):
【化903】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号498;ORF129.a)に対応する:
【化904】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号499):
【化905】
【化906】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号500;ORF130.ng)に対応する:
【化907】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号501):
【化908】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号502;ORF130)に対応する:
【化909】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF130は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF130.ng)と206アミノ酸の重複にわたって98.1%の同一性を示す:
【化910】
【化911】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号503):
【化912】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号504;ORF130.a)に対応する:
【化913】
【化914】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号505):
【化915】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号506;ORF132.ng)に対応する:
【化916】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号507):
【化917】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号508;ORF132)に対応する:
【化918】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF132は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF132.ng)と38アミノ酸の重複にわたって89.5%の同一性を示す:
【化919】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号509):
【化920】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号510;ORF132.a)に対応する:
【化921】
【化922】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号511):
【化923】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号512;ORF134.ng)に対応する:
【化924】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号513):
【化925】
【化926】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号514;ORF134)に対応する:
【化927】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF134は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF134.ng)と531アミノ酸の重複にわたって98.7%の同一性を示す:
【化928】
【化929】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号515):
【化930】
【化931】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号516;ORF134.a)に対応する:
【化932】
【化933】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号517):
【化934】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号518;ORF135.ng)に対応する:
【化935】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号519):
【化936】
【化937】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号520;ORF135)に対応する:
【化938】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF135は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF135.ng)と294アミノ酸の重複にわたって97.6%の同一性を示す:
【化939】
【化940】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号521):
【化941】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号522;ORF135.a)に対応する:
【化942】
【化943】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号523):
【化944】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号524;ORF136.ng)に対応する:
【化945】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号525):
【化946】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号526;ORF136)に対応する:
【化947】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF136は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF136.ng)と209アミノ酸の重複にわたって85.6%の同一性を示す:
【化948】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号527):
【化949】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号528;ORF136.a)に対応する:
【化950】
【化951】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号529):
【化952】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号530;ORF137.ng)に対応する:
【化953】
【化954】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号531):
【化955】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号532;ORF137)に対応する:
【化956】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF137は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF137.ng)と283アミノ酸の重複にわたって95.4%の同一性を示す:
【化957】
【化958】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号533):
【化959】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号534;ORF137.a)に対応する:
【化960】
【化961】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号535):
【化962】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号536;ORF138.ng)に対応する:
【化963】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号537):
【化964】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号538;ORF138)に対応する:
【化965】
【化966】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF138は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF138.ng)と298アミノ酸の重複にわたって98.0%の同一性を示す:
【化967】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号539):
【化968】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号540;ORF138.a)に対応する:
【化969】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号541):
【化970】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号542;ORF138.ng)に対応する:
【化971】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号543):
【化972】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号544;ORF138)に対応する:
【化973】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF138は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF138.ng)と179アミノ酸の重複にわたって92.2%の同一性を示す:
【化974】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号545):
【化975】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号546;ORF139.a)に対応する:
【化976】
【化977】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号547):
【化978】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号548;ORF140.ng)に対応する:
【化979】
【化980】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号549):
【化981】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号550;ORF140)に対応する:
【化982】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF140は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF140.ng)と454アミノ酸の重複にわたって94.5%の同一性を示す:
【化983】
【化984】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号551):
【化985】
【化986】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号552;ORF140.a)に対応する:
【化987】
【化988】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号553):
【化989】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号554;ORF141.ng)に対応する:
【化990】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号555):
【化991】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号556;ORF141)に対応する:
【化992】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF141は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF141.ng)と558アミノ酸の重複にわたって97.5%の同一性を示す:
【化993】
【化994】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号557):
【化995】
【化996】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号558;ORF141.a)に対応する:
【化997】
【化998】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号559):
【化999】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号560;ORF142.ng)に対応する:
【化1000】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号561):
【化1001】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号562;ORF142)に対応する:
【化1002】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF142は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF142.ng)と158アミノ酸の重複にわたって93.7%の同一性を示す:
【化1003】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号563):
【化1004】
【化1005】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号564;ORF142.a)に対応する:
【化1006】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号565):
【化1007】
【化1008】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号566;ORF143.ng)に対応する:
【化1009】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号567):
【化1010】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号568;ORF143)に対応する:
【化1011】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化1012】
【化1013】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号569):
【化1014】
【化1015】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号570;ORF143.a)に対応する:
【化1016】
【化1017】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号571):
【化1018】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号572;ORF144.ng)に対応する:
【化1019】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号573):
【化1020】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号574;ORF144)に対応する:
【化1021】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化1022】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号575):
【化1023】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号576;ORF144.a)に対応する:
【化1024】
【化1025】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号577):
【化1026】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号578 ;ORF146.ng)に対応する:
【化1027】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号579):
【化1028】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号580;ORF146)に対応する:
【化1029】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化1030】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号581):
【化1031】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号582;ORF146.a)に対応する:
【化1032】
【化1033】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号583):
【化1034】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号584;ORF147.ng)に対応する:
【化1035】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号585):
【化1036】
【化1037】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号586;ORF147)に対応する:
【化1038】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化1039】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号587):
【化1040】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号588;ORF147.a)に対応する:
【化1041】
【化1042】
【化1043】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号589):
【化1044】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号590;ORF148.ng)に対応する:
【化1045】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号591):
【化1046】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号592;ORF148)に対応する:
【化1047】
【化1048】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化1049】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号593):
【化1050】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号594;ORF148.a)に対応する:
【化1051】
【化1052】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号595):
【化1053】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号596;ORF149.ng)に対応する:
【化1054】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号597):
【化1055】
【化1056】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号598;ORF149)に対応する:
【化1057】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF149は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF149.ng)と339アミノ酸の重複にわたって95.9%の同一性を示す:
【化1058】
【化1059】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号599):
【化1059a】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号600;ORF149.a)に対応する:
【化1060】
【化1061】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号601):
【化1062】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号602;ORF149−1.ng)に対応する:
【化1063】
【化1064】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号603):
【化1065】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号604;ORF149−1)に対応する:
【化1066】
【化1067】
【化1068】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号605):
【化1069】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号606;ORF149−1.a)に対応する:
【化1070】
【化1071】
【化1072】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号607):
【化1073】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号608;ORF150.ng)に対応する:
【化1074】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号609):
【化1075】
【化1076】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号610;ORF150)に対応する:
【化1077】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF150は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF150.ng)と369アミノ酸の重複にわたって91.3%の同一性を示す:
【化1078】
【化1079】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号611):
【化1080】
【化1081】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号612;ORF150.a)に対応する:
【化1082】
【化1083】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号613):
【化1084】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号614;ORF151.ng)に対応する:
【化1085】
【化1086】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号615):
【化1087】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号616;ORF151)に対応する:
【化1088】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF151は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF151.ng)と603アミノ酸の重複にわたって99.2%の同一性を示す:
【化1089】
【化1090】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号617):
【化1091】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号618;ORF151.a)に対応する:
【化1092】
【化1093】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号619):
【化1094】
【化1095】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号620;ORF152.ng)に対応する:
【化1096】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号621):
【化1097】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号622;ORF152)に対応する:
【化1098】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF152は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF152.ng)と218アミノ酸の重複にわたって95.4%の同一性を示す:
【化1099】
【化2000】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号623):
【化2001】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号624;ORF152.a)に対応する:
【化2002】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号625):
【化2003】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号626;ORF153.ng)に対応する:
【化2004】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号627):
【化2005】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号628;ORF153)に対応する:
【化2006】
【化2007】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号629):
【化2008】
【化2009】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号630;ORF153.a)に対応する:
【化2010】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号631):
【化2011】
【化2012】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号632;ORF154.ng)に対応する:
【化2013】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号633):
【化2014】
【化2015】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号634;ORF154.a)に対応する:
【化2016】
【化2017】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号635):
【化2018】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号636;ORF154.a)に対応する:
【化2019】
【化2020】
【化2021】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号637):
【化2022】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号638;ORF155.ng)に対応する:
【化2023】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号639):
【化2024】
【化2025】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号640;ORF155)に対応する:
【化2026】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF155は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF155.ng)と513アミノ酸の重複にわたって97.9%の同一性を示す:
【化2027】
【化2028】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号641):
【化2029】
【化2030】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号642;ORF155.a)に対応する:
【化2031】
【化2032】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号643):
【化2033】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号644;ORF156.ng)に対応する:
【化2034】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号645):
【化2035】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号646;ORF156)に対応する:
【化2036】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2037】
【化2038】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号647):
【化2039】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号648;ORF156.a)に対応する:
【化2040】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号649):
【化2041】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号650;ORF157.ng)に対応する:
【化2042】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号651):
【化2043】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号652;ORF157)に対応する:
【化2044】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2045】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号653):
【化2046】
【化2047】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号654;ORF157.a)に対応する:
【化2048】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号655):
【化2049】
【化2050】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号656;ORF158.ng)に対応する:
【化2051】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号657):
【化2052】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号658;ORF158)に対応する:
【化2053】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2054】
【化2055】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号659):
【化2056】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号660;ORF158.a)に対応する:
【化2057】
【化2058】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号661):
【化2059】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号662;ORF160.ng)に対応する:
【化2060】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号663):
【化2061】
【化2062】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号664;ORF160)に対応する:
【化2063】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2064】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号665):
【化2065】
【化2066】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号666;ORF160.a)に対応する:
【化2067】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号667):
【化2068】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号668;ORF161.ng)に対応する:
【化2069】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号669):
【化2070】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号670;ORF161)に対応する:
【化2071】
【化2072】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2073】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号671):
【化2074】
【化2075】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号672;ORF161.a)に対応する:
【化2076】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号673):
【化2077】
【化2078】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号674;ORF.ng)に対応する:
【化2079】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号675):
【化2080】
【化2081】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号676;ORF 163)に対応する:
【化2082】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2083】
【化2084】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号677):
【化2085】
【化2086】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号678;ORF 163.a)に対応する:
【化2087】
【化2088】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号679):
【化2089】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号680;ORF 164.ng)に対応する:
【化2090】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号681):
【化2091】
【化2092】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号682;ORF 164)に対応する:
【化2093】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORF)
m164/gp164
432アミノ酸重複中で98.6%の同一性
【化2094】
【化2095】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号683):
【化2096】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号684;ORF 164.a)に対応する:
【化2097】
【化2098】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号685):
【化2099】
【化2100】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号686;ORF 165.ng)に対応する:
【化2101】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号687):
【化2102】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号688;ORF 165)に対応する:
【化2103】
【化2104】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2105】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号689):
【化2106】
【化2107】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号690;ORF 165.a)に対応する:
【化2108】
【化2109】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号691):
【化2110】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号692;ORF 165−1.ng)に対応する:
【化2111】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号693):
【化2112】
【化2113】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号694;ORF 165−1)に対応する:
【化2114】
【化2115】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号695):
【化2116】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号696;ORF 165−1.a)に対応する:
【化2117】
【化2118】
【化2119】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号697):
【化2120】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号698;ORF 204.ng)に対応する:
【化2121】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号699):
【化2122】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号700;ORF 204)に対応する:
【化2123】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFと相同性)
ORF204は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 204.ng)と250アミノ酸にわたって82.0%の同一性を示す:
【化2124】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号701):
【化2125】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号702;ORF 204.a)に対応する:
【化2126】
【化2127】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号703):
【化2128】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号704;ORF 205.ng)に対応する:
【化2129】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号705):
【化2130】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号706;ORF 205)に対応する:
【化2131】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF205は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 205.ng)と181アミノ酸にわたって88.4%の同一性を示す:
【化2132】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号707):
【化2133】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号708;ORF 205.a)に対応する:
【化2134】
【化2135】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号709):
【化2136】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号710;ORF 205−1.ng)に対応する:
【化2137】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号711):
【化2138】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号712;ORF 205−1)に対応する:
【化2139】
【化2140】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号713):
【化2141】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号714;ORF 205−1.a)に対応する:
【化2142】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号715):
【化2143】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号716;ORF 206.ng)に対応する:
【化2144】
【化2145】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号717):
【化2146】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号718;ORF 206)に対応する:
【化2147】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF206は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 206.ng)と177アミノ酸にわたって96.0%の同一性を示す:
【化2148】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号719):
【化2149】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号720;ORF 206.a)に対応する:
【化2150】
【化2151】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号721):
【化2152】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号722;ORF 209.ng)に対応する:
【化2153】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号723):
【化2154】
【化2155】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号724;ORF 209)に対応する:
【化2156】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF209は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 209.ng)と253アミノ酸にわたって88.5%の同一性を示す:
【化2157】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号725):
【化2158】
【化2159】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号726;ORF 209.a)に対応する:
【化2160】
【化2161】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号727):
【化2162】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号728;ORF 211.ng)に対応する:
【化2163】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号729):
【化2164】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号730;ORF 211)に対応する:
【化2165】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF211は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 211.ng)と174アミノ酸にわたって89.1%の同一性を示す:
【化2166】
【化2167】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号731):
【化2168】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号732;ORF 211.a)に対応する:
【化2169】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号733):
【化2170】
【化2171】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号734;ORF 212.ng)に対応する:
【化2172】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号735):
【化2173】
【化2174】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号736;ORF 212)に対応する:
【化2175】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF212は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 212.ng)と421アミノ酸にわたって92.9%の同一性を示す:
【化2176】
【化2177】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号737):
【化2178】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号738;ORF 212.a)に対応する:
【化2179】
【化2180】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号739):
【化2181】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号740;ORF 214.ng)に対応する:
【化2182】
【化2183】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号741):
【化2184】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号412;ORF 214)に対応する:
【化2185】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)ORF214は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF214.ng)と152アミノ酸にわたって80.3%の同一性を示す:
【化2186】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号743):
【化2187】
【化2188】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号744;ORF 214.a)に対応する:
【化2189】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号745):
【化2190】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号746;ORF 214−1.ng)に対応する:
【化2191】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号747):
【化2192】
【化2193】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号748;ORF 214−1)に対応する:
【化2194】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号749):
【化2195】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号750;ORF 214−1.a)に対応する:
【化2196】
【化2197】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号751):
【化2198】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号752;ORF 215.ng)に対応する:
【化2199】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号753):
【化2200】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号754;ORF 215)に対応する:
【化2201】
【化2202】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF215は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF215.ng)と173アミノ酸にわたって96.0%の同一性を示す:
【化2203】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号755):
【化2204】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号756;ORF 215.a)に対応する:
【化2205】
【化2206】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号757):
【化2207】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号758;ORF 216.ng)に対応する:
【化2208】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号759):
【化2209】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号760;ORF 216)に対応する:
【化2210】
【化2211】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF216は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF216.ng)と147アミノ酸にわたって91.8%の同一性を示す:
【化2212】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号761):
【化2213】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号762;ORF 216.a)に対応する:
【化2214】
【化2215】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号763):
【化2216】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号764;ORF 217.ng)に対応する:
【化2217】
【化2218】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号765):
【化2219】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号766;ORF 217)に対応する:
【化2220】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF217は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF217.ng)と226アミノ酸重複にわたって80.5%の同一性を示す:
【化2221】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号767):
【化2222】
【化2223】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号768;ORF 217.a)に対応する:
【化2224】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号769):
【化2225】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号770;ORF 218.ng)に対応する:
【化2226】
【化2227】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号771):
【化2228】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号772;ORF 218)に対応する:
【化2229】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF218は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF218.ng)と218アミノ酸にわたって87.2%の同一性を示す:
【化2230】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号773):
【化2231】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号774;ORF 218.a)に対応する:
【化2232】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号775):
【化2233】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号776;ORF 219.ng)に対応する:
【化2234】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号777):
【化2235】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号778;ORF 219)に対応する:
【化2236】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFと相同性)
ORF219は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 219.ng)と213アミノ酸にわたって86.9%の同一性を示す:
【化2237】
【化2238】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号779):
【化2239】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号780;ORF 219.a)に対応する:
【化2240】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号781):
【化2241】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号782;ORF 221.ng)に対応する:
【化2242】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号783):
【化2243】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号784;ORF 221)に対応する:
【化2244】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF221は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 221.ng)と170アミノ酸にわたって87.6%の同一性を示す:
【化2245】
【化2246】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号785):
【化2247】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号786;ORF 221.a)に対応する:
【化2248】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号787):
【化2249】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号788;ORF 223.ng)に対応する:
【化2250】
【化2251】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号789):
【化2252】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号790;ORF 223)に対応する:
【化2253】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF223は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF223.ng)と119アミノ酸にわたって80.7%の同一性を示す:
【化2254】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号791):
【化2255】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号792;ORF 223.a)に対応する:
【化2256】
【化2257】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号793):
【化2258】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号794;ORF 225.ng)に対応する:
【化2259】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号795):
【化2260】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号796;ORF 225)に対応する:
【化2261】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF225は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 22.5.ng)と248アミノ酸重複にわたって83.5%の同一性を示す:
【化2262】
【化2263】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号797):
【化2264】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号798;ORF 225.a)に対応する:
【化2265】
【化2266】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号799):
【化2267】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号800;ORF 225−1.ng)に対応する:
【化2268】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号801):
【化2269】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号802;ORF 217)に対応する:
【化2270】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号803):
【化2271】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号804;ORF 225−1.a)に対応する:
【化2272】
【化2273】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号805):
【化2274】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号806;ORF 226.ng)に対応する:
【化2275】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号807):
【化2276】
【化2277】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号808;ORF 226)に対応する:
【化2278】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF226は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 226.ng)と121アミノ酸重複にわたって94.2%の同一性を示す:
【化2279】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号809):
【化2280】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号810;ORF 226.a)に対応する:
【化2281】
【化2282】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号811):
【化2283】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号812;ORF 227.ng)に対応する:
【化2284】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号813):
【化2285】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号814;ORF 227)に対応する:
【化2286】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF227は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 227.ng)と66アミノ酸にわたって95.5%の同一性を示す:
【化2287】
【化2288】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号815):
【化2289】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号816;ORF 227.a)に対応する:
【化2290】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号817):
【化2291】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号818;ORF 228)に対応する:
【化2292】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号819):
【化2293】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号820;ORF 228.a)に対応する:
【化2294】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号821):
【化2295】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号822;ORF 229.ng)に対応する:
【化2296】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号823):
【化2297】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号824;ORF 229)に対応する:
【化2298】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF229は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF229.ng)と169アミノ酸にわたって80.5%の同一性を示す:
【化2299】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号825):
【化2300】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号826;ORF 229.a)に対応する:
【化2301】
【化2302】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号827):
【化2303】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号828;ORF 230.ng)に対応する:
【化2304】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号829):
【化2305】
【化2306】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号830;ORF 230)に対応する:
【化2307】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF221は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 230.ng)と386アミノ酸にわたって95.9%の同一性を示す:
【化2308】
【化2309】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号831):
【化2310】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号832;ORF 230.a)に対応する:
【化2311】
【化2312】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号833):
【化2313】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号834;ORF 230.1.ng)に対応する:
【化2314】
【化2315】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号835):
【化2316】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号836;ORF 230−1)に対応する:
【化2317】
【化2318】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号837):
【化2319】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号838;ORF 230−1.a)に対応する:
【化2320】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号839):
【化2321】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号840;ORF 231.ng)に対応する:
【化2322】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号841):
【化2323】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号842;ORF 231)に対応する:
【化2324】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF231は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 231.ng)と73アミノ酸重複にわたって98.6%の同一性を示す:
【化2325】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号843):
【化2326】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号844;ORF 217.a)に対応する:
【化2327】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号845):
【化2328】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号846;ORF 231−1.ng)に対応する:
【化2329】
【化2330】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号847):
【化2331】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号848;ORF 231−1)に対応する:
【化2332】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号849):
【化2333】
【化2334】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号850;ORF 231−1.a)に対応する:
【化2335】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号851):
【化2336】
【化2337】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号852;ORF 232.ng)に対応する:
【化2338】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号853):
【化2339】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号854;ORF 232)に対応する:
【化2340】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF232は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 232.ng)と290アミノ酸重複にわたって94.1%の同一性を示す:
【化2341】
【化2342】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号855):
【化2343】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号856;ORF 232.a)に対応する:
【化2344】
【化2345】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号857):
【化2346】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号858;ORF 233.ng)に対応する:
【化2347】
【化2348】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号859):
【化2349】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号860;ORF 233)に対応する:
【化2350】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF233は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 233.ng)と152アミノ酸にわたって93.4%の同一性を示す:
【化2351】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号861):
【化2352】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号862;ORF 233.a)に対応する:
【化2353】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号863):
【化2354】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号864;ORF 234.ng)に対応する:
【化2355】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号865):
【化2356】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号866;ORF 234)に対応する:
【化2357】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF234は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF234.ng)と54アミノ酸にわたって94.4%の同一性を示す:
【化2358】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号867):
【化2359】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号868;ORF 234.a)に対応する:
【化2360】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号869):
【化2361】
【化2362】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号870;ORF 235.ng)に対応する:
【化2363】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号871)
【化2364】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号872;ORF 235)に対応する:
【化2365】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFと相同性)
ORF235は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 235.ng)と215アミノ酸にわたって96.7%の同一性を示す:
【化2366】
【化2367】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号873):
【化2368】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号874;ORF 235.a)に対応する:
【化2369】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号875):
【化2370】
【化2371】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号876;ORF 236.ng)に対応する:
【化2372】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号877):
【化2373】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号878;ORF 236)に対応する:
【化2374】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF236は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF236.ng)と258アミノ酸にわたって82.9%の同一性を示す:
【化2375】
【化2376】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号879):
【化2377】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号880;ORF 236.a)に対応する:
【化2378】
【化2379】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号881):
【化2380】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号882;ORF 237.ng)に対応する:
【化2381】
【化2382】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号883):
【化2383】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号884;ORF 237)に対応する:
【化2384】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF237は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 237.ng)と382アミノ酸重複にわたって86.1%の同一性を示す:
【化2385】
【化2386】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号885):
【化2387】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号886;ORF 237.a)に対応する:
【化2388】
【化2389】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号887):
【化2390】
【化2391】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号888;ORF 238.ng)に対応する:
【化2392】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号889):
【化2393】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号890;ORF 238)に対応する:
【化2394】
【化2395】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF238は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 238.ng)と401アミノ酸重複にわたって86.0%の同一性を示す:
【化2396】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号891):
【化2397】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号892;ORF 238.a)に対応する:
【化2398】
【化2399】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号893):
【化2400】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号894;ORF 239.ng)に対応する:
【化2401】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号895):
【化2402】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号896;ORF 239)に対応する:
【化2403】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF239は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 239.ng)と255アミノ酸にわたって93.7%の同一性を示す:
【化2404】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号897):
【化2405】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号898;ORF 239.a)に対応する:
【化2406】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号899):
【化2407】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号900;ORF 240.ng)に対応する:
【化2408】
【化2409】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号901):
【化2410】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号902;ORF 240)に対応する:
【化2411】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF240は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF240.ng)と220アミノ酸にわたって94.5%の同一性を示す:
【化2412】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号903):
【化2413】
【化2414】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号904;ORF 240.a)に対応する:
【化2415】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号905):
【化2416】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号906;ORF 241.ng)に対応する:
【化2417】
【化2418】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号907):
【化2419】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号908;ORF 241)に対応する:
【化2420】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF241は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 241.ng)と177アミノ酸にわたって91.5%の同一性を示す:
【化2421】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号909):
【化2422】
【化2423】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号910;ORF 241.a)に対応する:
【化2424】
以下の部分的なDNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号911):
【化2425】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号912;ORF 241−1.ng)に対応する:
【化2426】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号913):
【化2427】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号914;ORF 241−1)に対応する:
【化2428】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号915):
【化2429】
【化2430】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号916;ORF 241−1.a)に対応する:
【化2431】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号917):
【化2432】
【化2433】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号918;ORF 242.ng)に対応する:
【化2434】
以下の部分的なDNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号919):
【化2435】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号920;ORF 242)に対応する:
【化2436】
このアミノ酸配列のコンピューター分析により、以下の結果を得た:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF242は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF 242.ng)と289アミノ酸重複にわたって90.3%の同一性を示す:
【化2437】
【化2438】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号921):
【化2439】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号922;ORF242.a)に対応する:
【化2440】
【化2441】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号923):
【化2442】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号924;ORF243.ng)に対応する:
【化2443】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号925):
【化2444】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号926;ORF243)に対応する:
【化2445】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF243は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF243.ng)との110アミノ酸にわたる重複において92.7%の同一性を示す:
【化2446】
【化2446a】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号927):
【化2447】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号928;ORF243.a)に対応する:
【化2448】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号929):
【化2449】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号930;ORF244.ng)に対応する:
【化2450】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号931):
【化2451】
【化2452】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号932;ORF244)に対応する:
【化2453】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF244は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF244.ng)との277アミノ酸にわたる重複において86.3%の同一性を示す:
【化2454】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号933):
【化2455】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号934;ORF244.a)に対応する:
【化2456】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号935):
【化2457】
【化2458】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号936;ORF244−1.ng)に対応する:
【化2459】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号937):
【化2460】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号938;ORF244−1)に対応する:
【化2461】
【化2462】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号939):
【化2463】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号940;ORF244−1.a)に対応する:
【化2464】
【化2465】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号941):
【化2466】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号942;ORF246.ng)に対応する:
【化2467】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号943):
【化2468】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号944;ORF246)に対応する:
【化2469】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF246は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF246.ng)との150アミノ酸にわたる重複において80.0%の同一性を示す:
【化2470】
【化2471】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号945):
【化2472】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号946;ORF246.a)に対応する:
【化2473】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号947):
【化2474】
【化2475】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号948;ORF247.ng)に対応する:
【化2476】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号949):
【化2477】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号950;ORF247)に対応する:
【化2478】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF247は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF247.ng)との238アミノ酸にわたる重複において69.3%の同一性を示す:
【化2479】
【化2480】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号951):
【化2481】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号952;ORF247.a)に対応する:
【化2482】
【化2483】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号953):
【化2484】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号954;ORF247−1.ng)に対応する:
【化2485】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号955):
【化2486】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号956;ORF247−1)に対応する:
【化2487】
【化2488】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号957):
【化2489】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号958;ORF247−1.a)に対応する:
【化2490】
【化2491】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号959):
【化2492】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号960;ORF248.ng)に対応する:
【化2493】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号961):
【化2494】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号962;ORF248)に対応する:
【化2495】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF248は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF248.ng)との185アミノ酸にわたる重複において81.1%の同一性を示す:
【化2496】
【化2497】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号963):
【化2498】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号964;ORF248.a)に対応する:
【化2499】
【化2500】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号965):
【化2501】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号966;ORF248−1)に対応する:
【化2502】
【化2503】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号967):
【化2504】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号968;ORF249.ng)に対応する:
【化2505】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号969):
【化2506】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号970;ORF249)に対応する:
【化2507】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF249は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF249.ng)との203アミノ酸にわたる重複において81.3%の同一性を示す:
【化2508】
【化2509】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号971):
【化2510】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号972;ORF249.a)に対応する:
【化2511】
【化2512】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号973):
【化2513】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号974;ORF249−1)に対応する:
【化2414】
【化2515】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号975):
【化2516】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号976;ORF250.ng)に対応する:
【化2517】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号977):
【化2518】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号978;ORF250)に対応する:
【化2519】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF250は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF250.ng)との111アミノ酸にわたる重複において91.0%の同一性を示す:
【化2520】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号979):
【化2521】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号980;ORF250.a)に対応する:
【化2522】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号981):
【化2523】
【化2524】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号982;ORF251.ng)に対応する:
【化2525】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号983):
【化2526】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号984;ORF251)に対応する:
【化2527】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF251は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF251.ng)との243アミノ酸にわたる重複において85.2%の同一性を示す:
【化2528】
【化2529】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号985):
【化2530】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号986;ORF251.a)に対応する:
【化2531】
【化2532】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号987):
【化2533】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号988;ORF253.ng)に対応する:
【化2534】
【化2535】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号989):
【化2536】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号990;ORF253)に対応する:
【化2537】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF253は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF253.ng)との397アミノ酸にわたる重複において94.7%の同一性を示す:
【化2538】
【化2539】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号991):
【化2540】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号992;ORF253.a)に対応する:
【化2541】
【化2542】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号993):
【化2543】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号994;ORF254.ng)に対応する:
【化2544】
【化2545】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号995):
【化2546】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号996;ORF254)に対応する:
【化2547】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF254は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF254.ng)との167アミノ酸にわたる重複において97.6%の同一性を示す:
【化2548】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号997):
【化2549】
【化2550】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号998;ORF254.a)に対応する:
【化2551】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号999):
【化2552】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1000;ORF255.ng)に対応する:
【化2553】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1001):
【化2554】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号91002;ORF255)に対応する:
【化2555】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF255は、由来の推定ORF(ORF255.ng)との188アミノ酸にわたる重複において88.8%の同一性を示す:
【化2556】
【化2557】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1003):
【化2558】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1004;ORF255.a)に対応する:
【化2559】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1005):
【化2560】
【化2561】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1006;ORF256.ng)に対応する:
【化2562】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1007):
【化2563】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1008;ORF256)に対応する:
【化2564】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF256は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF256.ng)と239のアミノ酸にわたる重複において92.9%の同一性を示す:
【化2565】
【化2566】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1009):
【化2567】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号110;ORF256.a)に対応する:
【化2568】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1011):
【化2569】
【化2570】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1012;ORF256−1.ng)に対応する:
【化2571】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1013):
【化2572】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1014;ORF256−1)に対応する:
【化2573】
【化2574】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1015):
【化2575】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1016;ORF256−1.a)に対応する:
【化2576】
【化2577】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1017):
【化2578】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1018;ORF257.ng)に対応する:
【化2579】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1019):
【化2580】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1020;ORF257)に対応する:
【化2581】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF257は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF257.ng)と125のアミノ酸にわたる重複において88.0%の同一性を示す:
【化2582】
【化2583】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1021):
【化2584】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1022;ORF257.a)に対応する:
【化2585】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1023):
【化2586】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1024;ORF258.ng)に対応する:
【化2587】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1025):
【化2588】
【化2589】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1026;ORF258)に対応する:
【化2590】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF258は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF258.ng)と386のアミノ酸にわたる重複において90.9%の同一性を示す:
【化2591】
【化2592】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1027):
【化2593】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1028;ORF258.a)に対応する:
【化2594】
【化2595】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1029):
【化2596】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1030;ORF259.a)に対応する:
【化2597】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1031):
【化2598】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1032;ORF259)に対応する:
【化2599】
【化2600】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF259は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF259.ng)と212のアミノ酸にわたる重複において94.3%の同一性を示す:
【化2601】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1033):
【化2602】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1034;ORF259.a)に対応する:
【化2603】
【化2604】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1035):
【化2605】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1036;ORF259−1.ng)に対応する:
【化2606】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1037):
【化2607】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1038;ORF259−1)に対応する:
【化2608】
【化2609】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1039):
【化2610】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1040;ORF259−1.a)に対応する:
【化2611】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1041):
【化2612】
【化2613】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1042;ORF260.ng)に対応する:
【化2614】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1043):
【化2615】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1044;ORF260)に対応する:
【化2616】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF260は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF260.ng)と171のアミノ酸にわたる重複において89.5%の同一性を示す:
【化2617】
【化2618】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1045):
【化2619】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1046;ORF260.a)に対応する:
【化2620】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1047):
【化2621】
【化2622】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1048;ORF261.ng)に対応する:
【化2623】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1049):
【化2624】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1050;ORF261)に対応する:
【化2625】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF261は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF261.ng)と237のアミノ酸にわたる重複において79.7%の同一性を示す:
【化2626】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1051):
【化2627】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1052;ORF261.a)に対応する:
【化2628】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1053):
【化2629】
【化2630】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1054;ORF264.ng)に対応する:
【化2631】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1055):
【化2632】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1056;ORF263)に対応する:
【化2633】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF263は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF263.ng)と77のアミノ酸にわたる重複において85.7%の同一性を示す:
【化2634】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1057):
【化2635】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1058;ORF263.a)に対応する:
【化2636】
【化2637】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1059):
【化2638】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1060;ORF263.ng)に対応する:
【化2639】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1061):
【化2640】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1062;ORF264)に対応する:
【化2641】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF264は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF264.ng)と239のアミノ酸にわたる重複において91.6%の同一性を示す:
【化2642】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1063):
【化2643】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1064;ORF264.a)に対応する:
【化2644】
【化2645】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1065):
【化2646】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1066;ORF265)に対応する:
【化2647】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF265は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF265.ng)と123のアミノ酸にわたる重複において88.6%の同一性を示す:
【化2648】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1067):
【化2649】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1068;ORF265.a)に対応する:
【化2650】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1069):
【化2651】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1070;ORF266.ng)に対応する:
【化2652】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1071):
【化2653】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1072;ORF266)に対応する:
【化2654】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF266は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF266.ng)と114のアミノ酸にわたる重複において92.1%の同一性を示す:
【化2655】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1073):
【化2656】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1074;ORF266.a)に対応する:
【化2657】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1075):
【化2658】
【化2659】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1076;ORF267.ng)に対応する:
【化2660】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1077):
【化2661】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1078;ORF267)に対応する:
【化2662】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF267は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF267.ng)と127のアミノ酸にわたる重複において82.7%の同一性を示す:
【化2663】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1079):
【化2664】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1080;ORF267.a)に対応する:
【化2665】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1081):
【化2666】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1082;ORF268.ng)に対応する:
【化2667】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1083):
【化2668】
【化2669】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1084;ORF268)に対応する:
【化2670】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF268は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF268.ng)と150のアミノ酸にわたる重複において86.0%の同一性を示す:
【化2671】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1085):
【化2672】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1086;ORF268.a)に対応する:
【化2673】
【化2674】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1087):
【化2675】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1088;ORF268−1)に対応する:
【化2676】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1089):
【化2677】
【化2678】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1090;ORF268−1.a)に対応する:
【化2679】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1091):
【化2680】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1092;ORF269.ng)に対応する:
【化2681】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1093):
【化2682】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1094;ORF269)に対応する:
【化2683】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF269は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF269.ng)と121のアミノ酸にわたる重複において87.6%の同一性を示す:
【化2684】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1095):
【化2685】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1096;ORF269.a)に対応する:
【化2686】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1097):
【化2687】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1098;ORF270.ng)に対応する:
【化2688】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1099):
【化2689】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1110;ORF270)に対応する:
【化2690】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF270は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF270.ng)と140のアミノ酸にわたる重複において96.4%の同一性を示す:
【化2691】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1101):
【化2692】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1102;ORF270.a)に対応する:
【化2693】
【化2694】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1103):
【化2695】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1104;ORF271.ng)に対応する:
【化2696】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1105):
【化2697】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1106;ORF271)に対応する:
【化2698】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF271は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF271.ng)と189のアミノ酸にわたる重複において95.2%の同一性を示す:
【化2699】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1107):
【化2700】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1108;ORF271.a)に対応する:
【化2701】
【化2702】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1109):
【化2703】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1110;ORF272.ng)に対応する:
【化2704】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1111):
【化2705】
【化2706】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1112;ORF272)に対応する:
【化2707】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF272は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF272.ng)と370のアミノ酸にわたる重複において97.6%の同一性を示す:
【化2708】
【化2709】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1113):
【化2710】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1114;ORF272.a)に対応する:
【化2711】
【化2712】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1115):
【化2713】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1116;ORF273.ng)に対応する:
【化2714】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1117):
【化2715】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1118;ORF273)に対応する:
【化2716】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF273は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF273.ng)と171のアミノ酸にわたる重複において86.0%の同一性を示す:
【化2717】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1119):
【化2718】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1120;ORF273.a)に対応する:
【化2719】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1121):
【化2720】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1122;ORF274.ng)に対応する:
【化2721】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1123):
【化2722】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1124;ORF274)に対応する:
【化2723】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF274は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF274.ng)と163のアミノ酸にわたる重複において97.5%の同一性を示す:
【化2724】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1125):
【化2725】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1126;ORF274.a)に対応する:
【化2726】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1127):
【化2727】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1128;ORF276.ng)に対応する:
【化2728】
【化2729】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1129):
【化2730】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1130;ORF276)に対応する:
【化2731】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF276は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF276.ng)と278のアミノ酸にわたる重複において96.8%の同一性を示す:
【化2732】
【化2733】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1131):
【化2734】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1132;ORF276.a)に対応する:
【化2735】
【化2736】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1133):
【化2737】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1134;ORF277.ng)に対応する:
【化2738】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1135):
【化2739】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1136;ORF277)に対応する:
【化2740】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF277は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF277.ng)と221のアミノ酸にわたる重複において90.0%の同一性を示す:
【化2741】
【化2742】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1137):
【化2743】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1138;ORF277.a)に対応する:
【化2744】
【化2745】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1139):
【化2746】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1140;ORF278.ng)に対応する:
【化2747】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1141):
【化2748】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1142;ORF278)に対応する:
【化2749】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF278は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF278.ng)と170のアミノ酸にわたる重複において95.9%の同一性を示す:
【化2750】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1143):
【化2751】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1144;ORF278.a)に対応する:
【化2752】
【化2753】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1145):
【化2754】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1146;ORF279.ng)に対応する:
【化2755】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1147):
【化2756】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1148;ORF279)に対応する:
【化2757】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF279は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF279.ng)と152のアミノ酸にわたる重複において89.5%の同一性を示す:
【化2758】
【化2759】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1149):
【化2760】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1150;ORF279.a)に対応する:
【化2761】
(ORF279の発現)
ORF279についての表1に記載されるプライマーを使用して、そしてORF279を位置付けしクローニングした。ORF279を、上記のように、pETベクターおよびpGexベクターにクローニングし、そしてE.coliにおける発現させた。タンパク質発現産物および精製物を、SDS−PAGEにより分析した。図2Aは、アフィニティー精製の結果を示し、そして図2Bは、E.coliにおける発現を示す。精製したHis融合タンパク質を使用して、マウスを免疫化し、その血清をELISA(陽性結果)、FACS分析(図2C)、ウエスタンブロット(図2D)のために使用した。これらの実験は、ORF279が、表面露出タンパク質であり、有用な免疫原であることを確証する。ORF279の親水性プロット、抗原インデックス、および両親媒性領域を図6に提供する。推定T細胞エピトープを推測するために、AMPHIプログラムを使用する(Gaoら、1989、J.Immunol 143:3007;Robertsら、1996,AIDS Res Human Retrovirues 12:593;Quakyiら、1992,Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF279の核酸配列およびそれによりコードされるアミノ酸配列を、本明細書中に提供する。
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1151):
【化2762】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1152;ORF280.ng)に対応する:
【化2763】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1153):
【化2764】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1154;ORF280)に対応する:
【化2765】
【化2766】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF280は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF280.ng)と308のアミノ酸にわたる重複において93.8%の同一性を示す:
【化2767】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1155):
【化2768】
【化2769】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1156;ORF280.a)に対応する:
【化2770】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1157):
【化2771】
【化2772】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1158;ORF281.ng)に対応する:
【化2773】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1159):
【化2774】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1160;ORF281)に対応する:
【化2775】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF281は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF281.ng)と263のアミノ酸にわたる重複において93.5%の同一性を示す:
【化2776】
【化2777】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1161):
【化2778】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1162;ORF281.a)に対応する:
【化2779】
【化2780】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1163):
【化2781】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1164;ORF282.ng)に対応する:
【化2782】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1165):
【化2783】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1166;ORF282.ng)に対応する:
【化2784】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF282は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF282.ng)と217のアミノ酸にわたる重複において98.6%の同一性を示す:
【化2785】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1167):
【化2786】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1168;ORF282.a)に対応する:
【化2787】
【化2788】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1169):
【化2789】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1170;ORF283.ng)に対応する:
【化2790】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1171):
【化2791】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1172;ORF283)に対応する:
【化2792】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2793】
【化2794】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1173):
【化2795】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1174;ORF283.a)に対応する:
【化2796】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1175):
【化2797】
【化2798】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1176;ORF284.ng)に対応する:
【化2799】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1177):
【化2800】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1178;ORF284)に対応する:
【化2801】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2802】
【化2803】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1179):
【化2804】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1180;ORF284.a)に対応する:
【化2805】
【化2806】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号1181):
【化2807】
【化2808】
【化2809】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1182;ORF285.ng)に対応する:
【化2810】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号1183):
【化2811】
【化2812】
【化2813】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1184;ORF285)に対応する:
【化2814】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2815】
【化2816】
【化2817】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1185):
【化2818】
【化2819】
【化2820】
これはアミノ酸配列(配列番号1186;ORF285.a)に対応する:
【化2821】
【化2822】
【化2823】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1187):
【化2824】
【化2825】
これはアミノ酸配列(配列番号1188;ORF285−1.ng)に対応する:
【化2826】
【化2827】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1189):
【化2828】
【化2829】
これはアミノ酸配列(配列番号1190;ORF285−1)に対応する:
【化2830】
【化2831】
【化2832】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1191):
【化2833】
【化2834】
これはアミノ酸配列(配列番号1192;ORF285−1.a)に対応する:
【化2835】
【化2836】
【化2837】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1193):
【化2838】
これはアミノ酸配列(配列番号1194;ORF286.ng)に対応する:
【化2839】
【化2840】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1195):
【化2841】
これはアミノ酸配列(配列番号1196;ORF286)に対応する:
【化2842】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2843】
【化2844】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1197):
【化2845】
【化2846】
これはアミノ酸配列(配列番号1198;ORF286.a)に対応する:
【化2847】
【化2848】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1199):
【化2849】
これはアミノ酸配列(配列番号1200;ORF287.ng)に対応する:
【化2850】
【化2851】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1201):
【化2852】
これはアミノ酸配列(配列番号1202;ORF287)に対応する:
【化2853】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2854】
【化2855】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1203):
【化2856】
【化2857】
これはアミノ酸配列(配列番号1204;ORF287.a)に対応する:
【化2858】
【化2859】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1205):
【化2860】
これはアミノ酸配列(配列番号1206;ORF288.ng
)に対応する:
【化2861】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1207):
【化2862】
これはアミノ酸配列(配列番号1208;ORF288)に対応する:
【化2863】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2864】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1209):
【化2865】
これはアミノ酸配列(配列番号1210;ORF288.a)に対応する:
【化2866】
【化2867】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1211):
【化2868】
これはアミノ酸配列(配列番号1212;ORF290.ng)に対応する:
【化2869】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1213):
【化2870】
【化2871】
これはアミノ酸配列(配列番号1214;ORF290)に対応する:
【化2872】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2873】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1215):
【化2874】
これはアミノ酸配列(配列番号1216;ORF290.a)に対応する:
【化2875】
【化2876】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1217):
【化2877】
これはアミノ酸配列(配列番号1218;ORF292.ng)に対応する:
【化2878】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1219):
【化2879】
これはアミノ酸配列(配列番号1220;ORF292)に対応する:
【化2880】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化2881】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1221):
【化2882】
これはアミノ酸配列(配列番号1222;ORF292.a)に対応する:
【化2883】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1223):
【化2884】
これはアミノ酸配列(配列番号1224;ORF294.ng)に対応する:
【化2885】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1225):
【化2886】
これはアミノ酸配列(配列番号1226;ORF294)に対応する:
【化2887】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1227):
【化2888】
【化2889】
これはアミノ酸配列(配列番号1228;ORF294.a)に対応する:
【化2890】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1229):
【化2891】
これはアミノ酸配列(配列番号1230;ORF295.ng)に対応する:
【化2892】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1231):
【化2893】
これはアミノ酸配列(配列番号1232;ORF295)に対応する:
【化2894】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1233):
【化2895】
これはアミノ酸配列(配列番号1234;ORF295.a)に対応する:
【化2896】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1235):
【化2897】
【化2898】
これはアミノ酸配列(配列番号1236;ORF297.ng)に対応する:
【化2899】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1237):
【化2900】
これはアミノ酸配列(配列番号1238;ORF297)に対応する:
【化2901】
【化2902】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1239):
【化2903】
【化2904】
これはアミノ酸配列(配列番号1240;ORF297.a)に対応する:
【化2905】
【化2906】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1241):
【化2907】
これはアミノ酸配列(配列番号1242;ORF298.ng)に対応する:
【化2908】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1243):
【化2909】
これはアミノ酸配列(配列番号1244;ORF298)に対応する:
【化2910】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1245):
【化2911】
【化2912】
これはアミノ酸配列(配列番号1246;ORF298.a)に対応する:
【化2913】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1247):
【化2914】
これはアミノ酸配列(配列番号1248;ORF299.ng)に対応する:
【化2915】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1249):
【化2916】
これはアミノ酸配列(配列番号1250;ORF299)に対応する:
【化2917】
【化2918】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1251):
【化2919】
これはアミノ酸配列(配列番号1252;ORF299.a)に対応する:
【化2920】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1253):
【化2921】
【化2922】
これはアミノ酸配列(配列番号1254;ORF302.ng)に対応する:
【化2923】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1255):
【化2924】
【化2925】
これはアミノ酸配列(配列番号1256;ORF302)に対応する:
【化2926】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF302は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF302.ng)との533アミノ酸の重複にわたって、94.0%の同一性を示す:
【化2927】
【化2928】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1257):
【化2929】
これはアミノ酸配列(配列番号1258;ORF302.a)に対応する:
【化2930】
【化2931】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1259):
【化2932】
これはアミノ酸配列(配列番号1260;ORF305.ng)に対応する:
【化2933】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1261):
【化2934】
これはアミノ酸配列(配列番号1262;ORF305)に対応する:
【化2935】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF305は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF305.ng)との243アミノ酸の重複にわたって、96.7%の同一性を示す:
【化2936】
【化2937】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1263):
【化2938】
これはアミノ酸配列(配列番号1264;ORF305.a)に対応する:
【化2939】
【化2940】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1265):
【化2941】
これはアミノ酸配列(配列番号1266;ORF306.ng)に対応する:
【化2942】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1267):
【化2943】
【化2944】
これはアミノ酸配列(配列番号1268;ORF306)に対応する:
【化2945】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF306は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF306.ng)との253アミノ酸の重複にわたって、88.9%の同一性を示す:
【化2946】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1269):
【化2947】
【化2948】
これはアミノ酸配列(配列番号1270;ORF306.a)に対応する:
【化2949】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1271):
【化2950】
【化2951】
これはアミノ酸配列(配列番号1272;ORF307.ng)に対応する:
【化2952】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1273):
【化2953】
これはアミノ酸配列(配列番号1274;ORF307)に対応する:
【化2954】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF307は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF307.ng)との38アミノ酸の重複にわたって、97.4%の同一性を示す:
【化2955】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1275):
【化2956】
これはアミノ酸配列(配列番号1276;ORF307.a)に対応する:
【化2957】
【化2958】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1277):
【化2959】
これはアミノ酸配列(配列番号1278;ORF308.ng)に対応する:
【化2960】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1279):
【化2961】
これはアミノ酸配列(配列番号1280;ORF308)に対応する:
【化2962】
【化2963】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF308は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF308.ng)との231アミノ酸の重複にわたって、96.5%の同一性を示す:
【化2964】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1281):
【化2965】
これはアミノ酸配列(配列番号1282;ORF308.a)に対応する:
【化2966】
【化2967】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1283):
【化2968】
これはアミノ酸配列(配列番号1284;ORF308−1.ng)に対応する:
【化2969】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1285):
【化2970】
これはアミノ酸配列(配列番号1286;ORF308−1)に対応する:
【化2971】
【化2972】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1287):
【化2973】
これはアミノ酸配列(配列番号1288;ORF301−8.a)に対応する:
【化2974】
【化2975】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1289):
【化2976】
これはアミノ酸配列(配列番号1290;ORF311.ng)に対応する:
【化2977】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1291):
【化2978】
【化2979】
これはアミノ酸配列(配列番号1292;ORF311)に対応する:
【化2980】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF311は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF311.ng)との455アミノ酸の重複にわたって、78.5%の同一性を示す:
【化2981】
【化2982】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1293):
【化2983】
これはアミノ酸配列(配列番号1294;ORF311.a)に対応する:
【化2984】
【化2985】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1295):
【化2986】
【化2987】
これはアミノ酸配列(配列番号1296;ORF311−1.ng)に対応する:
【化2988】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1297):
【化2989】
【化2990】
これはアミノ酸配列(配列番号1298;ORF311−1)に対応する:
【化2991】
【化2992】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1299):
【化2993】
これはアミノ酸配列(配列番号1300;ORF311−1.a)に対応する:
【化2994】
【化2995】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1301):
【化2996】
【化2997】
これはアミノ酸配列(配列番号1302;ORF312.ng)に対応する:
【化2998】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1303):
【化2999】
これはアミノ酸配列(配列番号1304;ORF312)に対応する:
【化3000】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF312は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF312.ng)との451アミノ酸の重複にわたって、95.6%の同一性を示す:
【化3001】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1305):
【化3002】
【化3003】
これはアミノ酸配列(配列番号1306;ORF312.a)に対応する:
【化3004】
【化3005】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1307):
【化3006】
これはアミノ酸配列(配列番号1308;ORF313.ng)に対応する:
【化3007】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1309):
【化3008】
これはアミノ酸配列(配列番号1310;ORF313)に対応する:
【化3009】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF313は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF313.ng)との173アミノ酸の重複にわたって、90.2%の同一性を示す:
【化3010】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1311):
【化3011】
これはアミノ酸配列(配列番号1312;ORF313.a)に対応する:
【化3012】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1313):
【化3013】
これはアミノ酸配列(配列番号1314;ORF401.ng)に対応する:
【化3014】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1315):
【化3015】
これはアミノ酸配列(配列番号1316;ORF401)に対応する:
【化3016】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF401は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF401.ng)との203アミノ酸の重複にわたって、100.0%の同一性を示す:
【化3017】
【化3018】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1317):
【化3019】
これはアミノ酸配列(配列番号1318;ORF401.a)に対応する:
【化3020】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1319):
【化3021】
これはアミノ酸配列(配列番号1320;ORF402.ng)に対応する:
【化3022】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1321):
【化3023】
【化3024】
これはアミノ酸配列(配列番号1322;ORF402)に対応する:
【化3025】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF402は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF402.ng)との497アミノ酸の重複にわたって、97.0%の同一性を示す:
【化3026】
【化3027】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1323):
【化3028】
これはアミノ酸配列(配列番号1324;ORF402.a)に対応する:
【化3029】
【化3030】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1325):
【化3031】
これはアミノ酸配列(配列番号1326;ORF406)に対応する:
【化3032】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1327):
【化3033】
これはアミノ酸配列(配列番号1328;ORF406)に対応する:
【化3034】
【化3035】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF406は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF406.a)との320アミノ酸の重複にわたって、98.8%の同一性を示す:
【化3036】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1329):
【化3037】
【化3038】
これはアミノ酸配列(配列番号1330;ORF406.a)に対応する:
【化3039】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1331):
【化3040】
【化3041】
これはアミノ酸配列(配列番号1332;ORF501.ng)に対応する:
【化3042】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1333):
【化3043】
【化3044】
これはアミノ酸配列(配列番号1334;ORF501)に対応する:
【化3045】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF501は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF501.ng)との558アミノ酸の重複にわたって、86.2%の同一性を示す:
【化3046】
【化3047】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1335):
【化3048】
【化3049】
これはアミノ酸配列(配列番号1336;ORF501.a)に対応する:
【化3050】
【化3051】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1337):
【化3052】
これはアミノ酸配列(配列番号1338;ORF502.ng)に対応する:
【化3053】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1339):
【化3054】
これはアミノ酸配列(配列番号1340;ORF502.ng)に対応する:
【化3055】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF502は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF502.ng)との168アミノ酸の重複にわたって、95.8%の同一性を示す:
【化3056】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1341):
【化3057】
これはアミノ酸配列(配列番号1342;502 217.a)に対応する:
【化3058】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1343):
【化3059】
これはアミノ酸配列(配列番号1344;ORF502−1.ng)に対応する:
【化3060】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1345):
【化3061】
これはアミノ酸配列(配列番号1346;ORF502−1)に対応する:
【化3062】
【化3063】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1347):
【化3064】
これはアミノ酸配列(配列番号1348;ORF502−1.a)に対応する:
【化3065】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1349):
【化3066】
これはアミノ酸配列(配列番号1350;ORF503.ng)に対応する:
【化3067】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1351):
【化3068】
これはアミノ酸配列(配列番号1352;ORF503)に対応する:
【化3069】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF503は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF503.ng)との68アミノ酸の重複にわたって、91.2%の同一性を示す:
【化3070】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis)において同定した(配列番号1353:
【化3071】
これはアミノ酸配列(配列番号1354;ORF503.a)に対応する:
【化3072】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1355):
【化3073】
これはアミノ酸配列(配列番号1356;ORF214.ng)に対応する:
【化3074】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1357):
【化3075】
これはアミノ酸配列(配列番号1358;ORF503−1)に対応する:
【化3076】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1359):
【化3077】
これはアミノ酸配列(配列番号1360;ORF503−1.a)に対応する:
【化3078】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1361):
【化3079】
これはアミノ酸配列(配列番号1362;ORF504.ng)に対応する:
【化3080】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1363):
【化3081】
【化3082】
これはアミノ酸配列(配列番号1364;ORF504)に対応する:
【化3083】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF504は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF504.ng)との425アミノ酸の重複にわたって、96.7%の同一性を示す:
【化3084】
【化3085】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1365):
【化3086】
これはアミノ酸配列(配列番号1366;ORF504.a)に対応する:
【化3087】
【化3088】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1367):
【化3089】
これはアミノ酸配列(配列番号1368;ORF505.ng)に対応する:
【化3090】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1369):
【化3091】
これはアミノ酸配列(配列番号1370;ORF505)に対応する:
【化3092】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF505は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF505.ng)との287アミノ酸の重複にわたって、93.7%の同一性を示す:
【化3093】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1371):
【化3094】
これはアミノ酸配列(配列番号1372;ORF505.a)に対応する:
【化3095】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1373):
【化3096】
これはアミノ酸配列(配列番号1374;ORF505−1)に対応する:
【化3097】
【化3098】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeaeにおいて同定した(配列番号1375):
【化3099】
これはアミノ酸配列(配列番号1376;ORF506.ng)に対応する:
【化3100】
【化3101】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1377):
【化3102】
これはアミノ酸配列(配列番号1378;ORF506)に対応する:
【化3103】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF506は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF506.ng)との520アミノ酸の重複にわたって、89.2%の同一性を示す:
【化3104】
【化3105】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidisにおいて同定した(配列番号1379):
【化3106】
【化3107】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1380;ORF 506.a>に対応する:
【化3108】
【化3109】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1381>:
【化3110】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1382;ORF 507.ng>に対応する:
【化3111】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1383>:
【化3112】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1384;ORF 507>に対応する:
【化3113】
【化3114】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 507は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 507.ng)との185アミノ酸重複に対して87.0%同一性を示す:
【化3115】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1385>:
【化3116】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1386;ORF 507.a>に対応する:
【化3117】
【化3118】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1387>:
【化3119】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1388;ORF 508.ng>に対応する:
【化3120】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1389>:
【化3121】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1390;ORF 508.ng>に対応する:
【化3122】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 508は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 508.ng)との167アミノ酸重複に対して86.8%同一性を示す:
【化3123】
【化3124】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1391>:
【化3125】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1392;ORF 508.a>に対応する:
【化3126】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1393>:
【化3127】
【化3128】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1394;ORF 509.ng>に対応する:
【化3129】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1395>:
【化3130】
【化3131】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1396;ORF 509>に対応する:
【化3132】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 509は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 509.ng)との575アミノ酸重複に対して87.8%同一性を示す:
【化3133】
【化3134】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1397>:
【化3135】
【化3136】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1398;ORF 509.a>に対応する:
【化3137】
【化3138】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1399>:
【化3139】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1400;ORF 510.ng>に対応する:
【化3140】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1401>:
【化3141】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1402;ORF 510>に対応する:
【化3142】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 510は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 510.ng)との132アミノ酸重複に対して96.2%同一性を示す:
【化3143】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1403>:
【化3144】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1404;ORF 510.a>に対応する:
【化3145】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1405>:
【化3146】
【化3147】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1406;ORF 512.ng>に対応する:
【化3148】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1407>:
【化3149】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1408;ORF 512>に対応する:
【化3150】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 512は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 512.ng)との122アミノ酸重複に対して93.4%同一性を示す:
【化3151】
【化3152】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1409>:
【化3152a】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1410;ORF 512.a>に対応する:
【化3153】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1411>:
【化3154】
【化3155】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1412;ORF 513.ng>に対応する:
【化3156】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1413>:
【化3157】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1414;ORF 513.ng>に対応する:
【化3158】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 513は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 513)との191アミノ酸重複に対して99.5%同一性を示す:
【化3159】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1415>:
【化3160】
【化3161】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1416;ORF 513.a>に対応する:
【化3162】
【化3163】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1417>:
【化3164】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1418;ORF 515.ng>に対応する:
【化3165】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1419>:
【化3166】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1420;ORF 515>に対応する:
【化3167】
【化3168】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 515は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 515.ng)との304アミノ酸重複に対して85.9%同一性を示す:
【化3169】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1421>:
【化3170】
【化3171】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1422;ORF 515.a>に対応する:
【化3172】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1423>:
【化3173】
【化3174】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1424;ORF 515−1.ng>に対応する:
【化3175】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1425>:
【化3176】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1426;ORF 515−1>に対応する:
【化3177】
【化3178】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1427>:
【化3179】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1428;ORF 515−1.a>に対応する:
【化3180】
【化3181】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1429>:
【化3182】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1430;ORF 516.ng>に対応する:
【化3183】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1431>:
【化3184】
【化3185】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1432;ORF 516>に対応する:
【化3186】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 516は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 516.ng)との231アミノ酸重複に対して90.0%同一性を示す:
【化3187】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1433>:
【化3188】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1434;ORF 516.a>に対応する:
【化3189】
【化3190】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1435>:
【化3191】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1436;ORF 517.ng>に対応する:
【化3192】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1437>:
【化3193】
【化3194】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1438;ORF 517.ng>に対応する:
【化3195】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 517は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 508.ng)との164アミノ酸重複に対して92.7%同一性を示す:
【化3196】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1439>:
【化3197】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1440;ORF 517.a>に対応する:
【化3198】
【化3199】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1441>:
【化3200】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1442;ORF 518.ng>に対応する:
【化3201】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1443>:
【化3202】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1444;ORF 518>に対応する:
【化3203】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 518は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 518.ng)との135アミノ酸重複に対して74.1%同一性を示す:
【化3204】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1445>:
【化3205】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1446;ORF 518.a>に対応する:
【化3206】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1447>:
【化3207】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1448;ORF 519.ng>に対応する:
【化3208】
【化3209】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1449>:
【化3210】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1450;ORF 519>に対応する:
【化3211】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 519は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 519.ng)との200アミノ酸重複に対して87.5%同一性を示す:
【化3212】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1451>:
【化3213】
【化3214】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1452;ORF 519.a>に対応する:
【化3215】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1453>:
【化3216】
【化3217】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1454;ORF 519−1.ng>に対応する:
【化3218】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1455>:
【化3219】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1456;ORF 519−1>に対応する:
【化3220】
【化3221】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1457>:
【化3222】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1458;ORF 519−1.a>に対応する:
【化3223】
【化3224】
(ORF 519の発現)
表1に記載されるORF519についてのプライマーを使用して、ORF 519を位置決定およびクローニングした。ORF 519を、上記のようにpETベクターおよびpGexベクターにクローニングし、そしてE.coli中で発現させた。タンパク質発現産物および精製物を、SDS−PAGEにより分析した。図4Aは、アフィニティー精製の結果を示し、そして図4Bは、E.coliにおける発現を示す。精製したNis融合タンパク質を使用してマウスを免疫し、その血清をELISA(陽性の結果)、FACS分析(図4C)、ウェスタンブロット(図1E)、および殺菌アッセイ(図4D)に使用した。これらの実験により、519が表面に露出されたタンパク質であること、およびこれが有用な免疫原であることが確認される。ORF 519の親水性プロット、抗原性指標、および両親媒性領域を、図8に提供する。AMPHIプログラムを使用して、推定T細胞エピトープを推測する(Gaoら、1989、J.Immunol 143:3007;Robertsら、1996、AIDS Res Human Retrovirus 12:593;Quakyiら、1992、Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF 519核酸配列およびこれによりコードされるアミノ酸配列は、本明細書中に提供されるものである。
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1459>:
【化3225】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1460;ORF 520.ng>に対応する:
【化3226】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1461>:
【化3227】
【化3228】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1462;ORF 520>に対応する:
【化3229】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 520は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 520.ng)との197アミノ酸重複に対して87.3%同一性を示す:
【化3230】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1463>:
【化3231】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1464;ORF 520.a>に対応する:
【化3232】
【化3233】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1465>:
【化3234】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1466;ORF 520−1.ng>に対応する:
【化3235】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1467>:
【化3236】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1468;ORF 520−1>に対応する:
【化3237】
【化3238】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1469>:
【化3239】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1470;ORF 520−1.a>に対応する:
【化3240】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1471>:
【化3241】
【化3242】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1472;ORF 521.ng>に対応する:
【化3243】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1473>:
【化3244】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1474;ORF 521>に対応する:
【化3245】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 521は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 521.ng)との171アミノ酸重複に対して90.6%同一性を示す:
【化3246】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1475>:
【化3247】
【化3248】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1476;ORF 521.a>に対応する:
【化3249】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1477>:
【化3250】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1478;ORF 522.ng>に対応する:
【化3251】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1479>:
【化3252】
【化3253】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1480;ORF 522>に対応する:
【化3254】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 522は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 522.ng)との144アミノ酸重複に対して91.0%同一性を示す:
【化3255】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1481>:
【化3256】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1482;ORF 522.a>に対応する:
【化3257】
【化3258】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1483>:
【化3259】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1484;ORF 523.ng>に対応する:
【化3260】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1485>:
【化3261】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1486;ORF 523>に対応する:
【化3262】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 523は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 523.ng)との126アミノ酸重複に対して91.3%同一性を示す:
【化3263】
【化3264】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1487>:
【化3265】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1488;ORF 523.a>に対応する:
【化3266】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1489>:
【化3267】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1490;ORF 525.ng>に対応する:
【化3268】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1491>:
【化3269】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1492;ORF 525>に対応する:
【化3270】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 525は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 525.ng)との186アミノ酸重複に対して94.1%同一性を示す:
【化3271】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1493>:
【化3272】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1494;ORF 525.a>に対応する:
【化3273】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1495>:
【化3274】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1496;ORF 525−1.ng>に対応する:
【化3275】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1497>:
【化3276】
【化3277】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1498;ORF 525−1.ng>に対応する:
【化3278】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1499>:
【化3279】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1500;ORF 525−1.a>に対応する:
【化3280】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1501>:
【化3281】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1502;ORF 527.ng>に対応する:
【化3282】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1503>:
【化3283】
【化3284】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1504;ORF 527>に対応する:
【化3285】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 527は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 527.ng)との150アミノ酸重複に対して90.0%同一性を示す:
【化3286】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1505>:
【化3287】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1506;ORF 527.a>に対応する:
【化3288】
【化3289】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1507>:
【化3290】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1508;ORF 528.ng>に対応する:
【化3291】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1509>:
【化3292】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1510;ORF 528>に対応する:
【化3293】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 528は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 528.ng)との121アミノ酸重複に対して89.3%同一性を示す:
【化3294】
【化3295】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1511>:
【化3296】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1512;ORF 528.a>に対応する:
【化3297】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1513>:
【化3298】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1514;ORF 528−1.ng>に対応する:
【化3299】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1515>:
【化3300】
【化3301】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1516;ORF 528−1>に対応する:
【化3302】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1517>:
【化3303】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1518;ORF 528−1.a>に対応する:
【化3304】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1519>:
【化3305】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1520;ORF 529.ng>に対応する:
【化3306】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1521>:
【化3307】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1522;ORF 529>に対応する:
【化3308】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 529は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 529.ng)との115アミノ酸重複に対して83.5%同一性を示す:
【化3309】
【化3310】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1523>:
【化3311】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1524;ORF 529.a>に対応する:
【化3312】
【化3313】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1525>:
【化3314】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1526;ORF 530.ng>に対応する:
【化3315】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1527>:
【化3316】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1528;ORF 530>に対応する:
【化3317】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 530は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 530.ng)との98アミノ酸重複に対して88.8%同一性を示す:
【化3318】
【化3319】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1529>:
【化3320】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1530;ORF 530.a>に対応する:
【化3321】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1531>:
【化3322】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1532;ORF 531.ng>に対応する:
【化3323】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1533>:
【化3324】
【化3325】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1534;ORF 531>に対応する:
【化3326】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 531は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 531.ng)との162アミノ酸重複に対して94.4%同一性を示す:
【化3327】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1535>:
【化3328】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1536;ORF 531.a>に対応する:
【化3329】
【化3330】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1537>:
【化3331】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1538;ORF 532.ng>に対応する:
【化3332】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1539>:
【化3333】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1540;ORF 532>に対応する:
【化3334】
【化3335】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 532は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 532.ng)との93アミノ酸重複に対して91.4%同一性を示す:
【化3336】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1541>:
【化3337】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1542;ORF 532.a>に対応する:
【化3338】
【化3339】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1543>:
【化3340】
【化3341】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1544;ORF 535.ng>に対応する:
【化3342】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1545>:
【化3343】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1546;ORF 535>に対応する:
【化3344】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 535は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 535.ng)との262アミノ酸重複に対して80.9%同一性を示す:
【化3345】
【化3346】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1547>:
【化3347】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1548;ORF 535.a>に対応する:
【化3348】
【化3349】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1549>:
【化3350】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1550;ORF 537.ng>に対応する:
【化3351】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1551>:
【化3352】
【化3353】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1552;ORF 537>に対応する:
【化3354】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 537は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 537.ng)との164アミノ酸重複に対して95.7%同一性を示す:
【化3355】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1553>:
【化3356】
【化3357】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1554;ORF 537.a>に対応する:
【化3358】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1555>:
【化3359】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1556;ORF 538.ng>に対応する:
【化3360】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1557>:
【化3361】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1558;ORF 538>に対応する:
【化3362】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 538は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 538.ng)との392アミノ酸重複に対して92.1%同一性を示す:
【化3363】
【化3364】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1559>:
【化3365】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1560;ORF 538.a>に対応する:
【化3366】
【化3367】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1561>:
【化3368】
【化3369】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1562;ORF 539.ng>に対応する:
【化3370】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1563>:
【化3371】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1564;ORF 539>に対応する:
【化3372】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 539は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 539.ng)との345アミノ酸重複に対して89%同一性を示す:
【化3373】
【化3374】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1565>:
【化3375】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1566;ORF 539.a>に対応する:
【化3376】
【化3377】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1567>:
【化3378】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1568;ORF 540.ng>に対応する:
【化3379】
【化3380】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1569>:
【化3381】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1570;ORF 540>に対応する:
【化3382】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 540は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 540.ng)との112アミノ酸重複に対して85.7%同一性を示す:
【化3383】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1571>:
【化3384】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1572;ORF 540.a>に対応する:
【化3385】
【化3386】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1573>:
【化3387】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1574;ORF 542.ng>に対応する:
【化3388】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1575>:
【化3389】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1576;ORF 542>に対応する:
【化3390】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 542は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 542.ng)との111アミノ酸重複に対して93.7%同一性を示す:
【化3391】
【化3392】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1577>:
【化3393】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1578;ORF 542.a>に対応する:
【化3394】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1579>:
【化3395】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1580;ORF 543.ng>に対応する:
【化3396】
【化3397】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1581>:
【化3398】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1582;ORF 543>に対応する:
【化3399】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
ORF 543は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 543.ng)との379アミノ酸重複に対して84.2%同一性を示す:
【化3400】
【化3401】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1583>:
【化3402】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1584;ORF 543.a>に対応する:
【化3403】
【化3404】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1585>:
【化3405】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1586;ORF 544.ng>に対応する:
【化3406】
【化3407】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1587>:
【化3408】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1588;ORF 544>に対応する:
【化3409】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 544は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 544.ng)との162アミノ酸重複に対して90.7%同一性を示す:
【化3410】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1589>:
【化3411】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1590;ORF 544.a>に対応する:
【化3412】
【化3413】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1591>:
【化3414】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1592;ORF 547.ng>に対応する:
【化3415】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1593>:
【化3416】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1594;ORF 547>に対応する:
【化3417】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 547は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 547.ng)との142アミノ酸重複に対して97.2%同一性を示す:
【化3418】
【化3419】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1595>:
【化3420】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1596;ORF 547.a>に対応する:
【化3421】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1597>:
【化3422】
【化3423】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1598;ORF 548.ng>に対応する:
【化3424】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1599>:
【化3425】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1600;ORF 548>に対応する:
【化3426】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 548は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 548.ng)との217アミノ酸重複に対して95.9%同一性を示す:
【化3427】
【化3428】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1601>:
【化3429】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1602;ORF 548.a>に対応する:
【化3430】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1603>:
【化3431】
【化3432】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1604;ORF 550.ng>に対応する:
【化3433】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1605>:
【化3434】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1606;ORF 550>に対応する:
【化3435】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 550は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 550.ng)とのアミノ酸重複に対して%同一性を示す:
【化3436】
【化3437】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1607>:
【化3438】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1608;ORF 550.a>に対応する:
【化3439】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1609>:
【化3440】
【化3441】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1610;ORF 552.ng>に対応する:
【化3442】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1611>:
【化3443】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1612;ORF 552>に対応する:
【化3444】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 552は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 552.ng)との174アミノ酸重複に対して97.1%同一性を示す:
【化3445】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1613>:
【化3446】
【化3447】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1614;ORF 552.a>に対応する:
【化3448】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1615>:
【化3449】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1616;ORF 552−1>に対応する:
【化3450】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1617>:
【化3451】
【化3452】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1618;ORF 552−1.a>に対応する:
【化3453】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1619>:
【化3454】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1620;ORF 553.ng>に対応する:
【化3455】
【化3456】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1621>:
【化3457】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1622;ORF 553>に対応する:
【化3458】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 553は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 553.ng)との185アミノ酸重複に対して65.5%同一性を示す:
【化3459】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1623>:
【化3460】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1624;ORF 553.a>に対応する:
【化3461】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1625>:
【化3462】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1626;ORF 554.ng>に対応する:
【化3463】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1627>:
【化3464】
【化3465】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1628;ORF 554>に対応する:
【化3466】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 554は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 554.ng)との389アミノ酸重複に対して96.1%同一性を示す:
【化3467】
【化3468】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1629>:
【化3469】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1630;ORF 554.a>に対応する:
【化3470】
【化3471】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1631>:
【化3472】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1632;ORF 556.ng>に対応する:
【化3473】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1633>:
【化3474】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1634;ORF 556>に対応する:
【化3475】
【化3476】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 556は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 556.ng)との139アミノ酸重複に対して100.0%同一性を示す:
【化3477】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1635>:
【化3478】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1636;ORF 556.a>に対応する:
【化3479】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1637>:
【化3480】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1638;ORF 557.ng>に対応する:
【化3481】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1639>:
【化3482】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1640;ORF 557.ng>に対応する:
【化3483】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 557は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 557.ng)との159アミノ酸重複に対して94.3%同一性を示す:
【化3484】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1641>:
【化3485】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1642;ORF 557.ng>に対応する:
【化3486】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1643>:
【化3487】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1644;ORF 558.ng>に対応する:
【化3488】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1645>:
【化3489】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1646;ORF 558>に対応する:
【化3490】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 558は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 558.ng)との106アミノ酸重複に対して92.5%同一性を示す:
【化3491】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1647>:
【化3492】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1648;ORF 558.a>に対応する:
【化3493】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された<配列番号1649>:
【化3494】
【化3495】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1650;ORF 560.ng>に対応する:
【化3496】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1651>:
【化3497】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1652;ORF 560>に対応する:
【化3498】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
ORF 560は、N.gonorrhoeae由来の予想されるORF(ORF 560.ng)との246アミノ酸重複に対して97.2%同一性を示す:
【化3499】
【化3500】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1653>:
【化3501】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1654;ORF 560.a>に対応する:
【化3502】
【化3503】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1655>:
【化3504】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1656;ORF 561>に対応する:
【化3505】
【化3506】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の予想されるORFとの相同性)
【化3507】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された<配列番号1657>:
【化3508】
【化3509】
これは、このアミノ酸配列<配列番号1658;ORF 561.a>に対応する:
【化3510】
【化3511】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1659):
【化3512】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1660;ORF562.ng)に対応する:
【化3513】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1661):
【化3514】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1662;ORF562)に対応する:
【化3515】
【化3516】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeaeからの推定ORFとの相同性)
【化3517】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1663):
【化3518】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1664;ORF562.a)に対応する:
【化3519】
【化3520】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1665):
【化3521】
【化3522】
【化3523】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1666;ORF563.ng)に対応する:
【化3524】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1667):
【化3525】
【化3526】
【化3527】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1668;ORF563)に対応する:
【化3528】
【化3529】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeaeからの推定ORFとの相同性)
ORF563は、N.gonorrhoeaeからの推定ORF(ORF563.ng)との2316aa重複部分にわたって79.1%の相同性を示す。
【化3530】
【化3531】
【化3532】
【化3533】
【化3534】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1669):
【化3535】
【化3536】
【化3537】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1670;ORF564)に対応する:
【化3538】
【化3539】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(fhaとの相同性)
【化3540】
【化3541】
【化3542】
【化3543】
【化3544】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1671):
【化3545】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1672;ORF565.ng)に対応する:
【化3546】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1673):
【化3547】
【化3548】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1674;ORF565)に対応する:
【化3549】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeaeからの推定ORFとの相同性)
【化3550】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1675):
【化3551】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1676;ORF565.a)に対応する:
【化3552】
【化3553】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1677):
【化3554】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1678;ORF566.ng)に対応する:
【化3555】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1679):
【化3556】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1680;ORF566)に対応する:
【化3557】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeaeからの推定ORFとの相同性)
【化3558】
【化3559】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1681):
【化3560】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1682;ORF566.a)に対応する:
【化3561】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1683):
【化3562】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1684;ORF567.ng)に対応する:
【化3563】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1685):
【化3564】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1686;ORF567)に対応する:
【化3565】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を示した:
(N.gonorrhoeaeからの推定ORFとの相同性)
【化3566】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1687):
【化3567】
【化3568】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1688;ORF567.a)に対応する:
【化3569】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1689):
【化3570】
【化3571】
これはアミノ酸配列(配列番号1690;ORF568.ng)に対応する:
【化3572】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1691)において同定した:
【化3573】
これはアミノ酸配列(配列番号1692;ORF568)に対応する:
【化3574】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3575】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1693)において同定した:
【化3576】
これはアミノ酸配列(配列番号1694;ORF568.a)に対応する:
【化3577】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1695)において同定した:
【化3578】
【化3579】
これはアミノ酸配列(配列番号1696;ORF569.ng)に対応する:
【化3580】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1697)において同定した:
【化3581】
これはアミノ酸配列(配列番号1698;ORF569)に対応する:
【化3582】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1699)において同定した:
【化3583】
【化3584】
これはアミノ酸配列(配列番号1700;ORF569.a)に対応する:
【化3585】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1701)において同定した:
【化3586】
【化3587】
これはアミノ酸配列(配列番号1702;ORF570.ng)に対応する:
【化3588】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1703)において同定した:
【化3589】
これはアミノ酸配列(配列番号1704;ORF570)に対応する:
【化3590】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1705)において同定した:
【化3591】
【化3592】
これはアミノ酸配列(配列番号1706;ORF570.a)に対応する:
【化3593】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1707)において同定した:
【化3594】
これはアミノ酸配列(配列番号1708;ORF571.ng)に対応する:
【化3595】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1709)において同定した:
【化3596】
これはアミノ酸配列(配列番号1710;ORF571)に対応する:
【化3597】
【化3598】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1711)において同定した:
【化3599】
これはアミノ酸配列(配列番号1712;ORF571.a)に対応する:
【化3600】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1713)において同定した:
【化3601】
【化3602】
これはアミノ酸配列(配列番号1714;ORF572.ng)に対応する:
【化3603】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1715)において同定した:
【化3604】
これはアミノ酸配列(配列番号1716;ORF572)に対応する:
【化3605】
【化3606】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1717)において同定した:
【化3607】
これはアミノ酸配列(配列番号1718;ORF572.a)に対応する:
【化3608】
【化3609】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1719)において同定した:
【化3610】
これはアミノ酸配列(配列番号1720;ORF573.ng)に対応する:
【化3611】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1721)において同定した:
【化3612】
【化3613】
これはアミノ酸配列(配列番号1722;ORF573)に対応する:
【化3614】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1723)において同定した:
【化3615】
これはアミノ酸配列(配列番号1724;ORF573.a)に対応する:
【化3616】
【化3617】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1725)において同定した:
【化3618】
これはアミノ酸配列(配列番号1726;ORF574.ng)に対応する:
【化3619】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1727)において同定した:
【化3620】
【化3621】
これはアミノ酸配列(配列番号1728;ORF574)に対応する:
【化3622】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1729)において同定した:
【化3623】
これはアミノ酸配列(配列番号1730;ORF574.a)に対応する:
【化3624】
【化3625】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1731)において同定した:
【化3626】
これはアミノ酸配列(配列番号1732;ORF575.ng)に対応する:
【化3627】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1733)において同定した:
【化3628】
これはアミノ酸配列(配列番号1734;ORF575)に対応する:
【化3629】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1735)において同定した:
【化3630】
これはアミノ酸配列(配列番号1736;ORF575.a)に対応する:
【化3631】
【化3632】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1737)において同定した:
【化3633】
これはアミノ酸配列(配列番号1738;ORF576.ng)に対応する:
【化3634】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1739)において同定した:
【化3635】
【化3636】
これはアミノ酸配列(配列番号1740;ORF576)に対応する:
【化3637】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3638】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1741)において同定した:
【化3639】
【化3640】
これはアミノ酸配列(配列番号1742;ORF576.a)に対応する:
【化3641】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1743)において同定した:
【化3642】
これはアミノ酸配列(配列番号1744;ORF576−1.ng)に対応する:
【化3643】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1745)において同定した:
【化3644】
これはアミノ酸配列(配列番号1746;ORF576−1)に対応する:
【化3645】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1747)において同定した:
【化3646】
【化3647】
これはアミノ酸配列(配列番号1748;ORF576−1.a)に対応する:
【化3648】
(ORF576の発現)
ORF576についての表1に記載されるプライマーを使用して、ORF576を位置付けし、そしてクローニングした。ORF576を、上記のように、pETベクターおよびpGexベクターにクローニングし、そしてE.coliにおいて発現させた。タンパク質発現産物および精製物を、SDS−PAGEにより分析した。図3Aは、アフィニティー精製の結果を示し、そして図3Bは、E.coliにおける発現を示す。精製したHis融合タンパク質を使用して、マウスを免疫化し、その血清をELISA(陽性結果)、FACS分析(図3C)、ウエスタンブロット(図3D)のために使用した。これらの実験は、ORF576が、表面露出タンパク質であり、有用な免疫原であることを確証する。ORF576の親水性プロット、抗原インデックス、および両親媒性領域を図7に提供する。推定T細胞エピトープを推測するために、AMPHIプログラムを使用する(Gaoら、1989、J.Immunol 143:3007;Robertsら、1996,AIDS Res Human Retrovirues 12:593;Quakyiら、1992,Scand J Immunol Suppl 11:9)。ORF576の核酸配列およびそれによりコードされるアミノ酸配列を、実施例1に提供する。
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1749)において同定した:
【化3649】
これはアミノ酸配列(配列番号1750;ORF577.ng)に対応する:
【化3650】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1751)において同定した:
【化3651】
これはアミノ酸配列(配列番号1752;ORF577)に対応する:
【化3652】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3653】
【化3654】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1753)において同定した:
【化3655】
これはアミノ酸配列(配列番号1754;ORF577.a)に対応する:
【化3656】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1755)において同定した:
【化3657】
これはアミノ酸配列(配列番号1756;ORF578.ng)に対応する:
【化3658】
【化3659】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1757)において同定した:
【化3660】
これはアミノ酸配列(配列番号1758;ORF578)に対応する:
【化3661】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1759)において同定した:
【化3662】
これはアミノ酸配列(配列番号1760;ORF578.a)に対応する:
【化3663】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1761)において同定した:
【化3664】
【化3665】
これはアミノ酸配列(配列番号1762;ORF579.ng)に対応する:
【化3666】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1763)において同定した:
【化3667】
これはアミノ酸配列(配列番号1764;ORF579)に対応する:
【化3668】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3669】
【化3670】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1765)において同定した:
【化3671】
これはアミノ酸配列(配列番号1766;ORF579.a)に対応する:
【化3672】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1767)において同定した:
【化3673】
【化3674】
これはアミノ酸配列(配列番号1768;ORF008.ng)に対応する:
【化3675】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1769)において同定した:
【化3676】
これはアミノ酸配列(配列番号1770;ORF579−1)に対応する:
【化3677】
【化3678】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1771)において同定した:
【化3679】
これはアミノ酸配列(配列番号1772;ORF579−1.a)に対応する:
【化3680】
【化3681】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1773)において同定した:
【化3682】
これはアミノ酸配列(配列番号1774;ORF580.ng)に対応する:
【化3683】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1775)において同定した:
【化3684】
これはアミノ酸配列(配列番号1776;ORF580)に対応する:
【化3685】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1777)において同定した:
【化3686】
これはアミノ酸配列(配列番号1778;ORF580.a)に対応する:
【化3687】
【化3688】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1779)において同定した:
【化3689】
これはアミノ酸配列(配列番号1780;ORF581.ng)に対応する:
【化3690】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1781)において同定した:
【化3691】
これはアミノ酸配列(配列番号1782;ORF581)に対応する:
【化3692】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1783)において同定した:
【化3693】
これはアミノ酸配列(配列番号1784;ORF581.a)に対応する:
【化3694】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1785)において同定した:
【化3695】
これはアミノ酸配列(配列番号1786;ORF582.ng)に対応する:
【化3696】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1787)において同定した:
【化3697】
これはアミノ酸配列(配列番号1788;ORF582)に対応する:
【化3698】
【化3699】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1789)において同定した:
【化3700】
これはアミノ酸配列(配列番号1790;ORF582.a)に対応する:
【化3701】
【化3702】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1791)において同定した:
【化3703】
これはアミノ酸配列(配列番号1792;ORF583.ng)に対応する:
【化3704】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1793)において同定した:
【化3705】
【化3706】
これはアミノ酸配列(配列番号1794;ORF583)に対応する:
【化3707】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1795)において同定した:
【化3708】
これはアミノ酸配列(配列番号1796;ORF583.a)に対応する:
【化3709】
【化3710】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1797)において同定した:
【化3711】
これはアミノ酸配列(配列番号1798;ORF584.ng)に対応する:
【化3712】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1799)において同定した:
【化3713】
これはアミノ酸配列(配列番号1800;ORF584)に対応する:
【化3714】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1801)において同定した:
【化3715】
これはアミノ酸配列(配列番号1802;ORF584.a)に対応する:
【化3716】
【化3717】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1803)において同定した:
【化3718】
これはアミノ酸配列(配列番号1804;ORF585.ng)に対応する:
【化3719】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1805)において同定した:
【化3720】
【化3721】
これはアミノ酸配列(配列番号1806;ORF585)に対応する:
【化3722】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1807)において同定した:
【化3723】
【化3724】
これはアミノ酸配列(配列番号1808;ORF585.a)に対応する:
【化3725】
【化3726】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1809)において同定した:
【化3727】
これはアミノ酸配列(配列番号1810;ORF586.ng)に対応する:
【化3728】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1811)において同定した:
【化3729】
これはアミノ酸配列(配列番号1812;ORF586)に対応する:
【化3730】
【化3731】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1813)において同定した:
【化3732】
これはアミノ酸配列(配列番号1814;ORF586.a)に対応する:
【化3733】
【化3734】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1815)において同定した:
【化3735】
これはアミノ酸配列(配列番号1816;ORF587.ng)に対応する:
【化3736】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1817)において同定した:
【化3737】
これはアミノ酸配列(配列番号1818;ORF587)に対応する:
【化3738】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3739】
【化3740】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1819)において同定した:
【化3741】
これはアミノ酸配列(配列番号1820;ORF587.a)に対応する:
【化3742】
【化3743】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1821)において同定した:
【化3744】
これはアミノ酸配列(配列番号1822;ORF588.ng)に対応する:
【化3745】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1823)において同定した:
【化3746】
これはアミノ酸配列(配列番号1824;ORF588)に対応する:
【化3747】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3748】
【化3749】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1825)において同定した:
【化3750】
これはアミノ酸配列(配列番号1826;ORF588.a)に対応する:
【化3751】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1827)において同定した:
【化3752】
【化3753】
これはアミノ酸配列(配列番号1828;ORF589.ng)に対応する:
【化3754】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1829)において同定した:
【化3755】
【化3756】
これはアミノ酸配列(配列番号1830;ORF589)に対応する:
【化3757】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3758】
【化3759】
【化3760】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1831)において同定した:
【化3761】
【化3762】
これはアミノ酸配列(配列番号1832;ORF589.a)に対応する:
【化3763】
【化3764】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1833)において同定した:
【化3765】
【化3766】
これはアミノ酸配列(配列番号1834;ORF590.ng)に対応する:
【化3767】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1835)において同定した:
【化3768】
これはアミノ酸配列(配列番号1836;ORF590)に対応する:
【化3769】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1837)において同定した:
【化3770】
これはアミノ酸配列(配列番号1838;ORF590.a)に対応する:
【化3771】
【化3772】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1839)において同定した:
【化3773】
【化3774】
これはアミノ酸配列(配列番号1840;ORF590−1)に対応する:
【化3775】
【化3776】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1841)において同定した:
【化3777】
【化3778】
これはアミノ酸配列(配列番号1842;ORF591.ng)に対応する:
【化3779】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1843)において同定した:
【化3780】
これはアミノ酸配列(配列番号1844;ORF591)に対応する:
【化3781】
【化3782】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3783】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1845)において同定した:
【化3784】
【化3785】
これはアミノ酸配列(配列番号1846;ORF591.a)に対応する:
【化3786】
【化3787】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1847)において同定した:
【化3788】
これはアミノ酸配列(配列番号1848;ORF592.ng)に対応する:
【化3789】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1849)において同定した:
【化3790】
【化3791】
これはアミノ酸配列(配列番号1850;ORF592)に対応する:
【化3792】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1851)において同定した:
【化3793】
これはアミノ酸配列(配列番号1852;ORF592.a)に対応する:
【化3794】
【化3795】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1853)において同定した:
【化3796】
これはアミノ酸配列(配列番号1854;ORF593.ng)に対応する:
【化3797】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1855)において同定した:
【化3798】
【化3799】
これはアミノ酸配列(配列番号1856;ORF593)に対応する:
【化3800】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3801】
【化3802】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1857)において同定した:
【化3803】
これはアミノ酸配列(配列番号1858;ORF593.a)に対応する:
【化3804】
【化3805】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1859)において同定した:
【化3806】
これはアミノ酸配列(配列番号1860;ORF594.ng)に対応する:
【化3807】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1861)において同定した:
【化3808】
これはアミノ酸配列(配列番号1862;ORF594)に対応する:
【化3809】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3810】
【化3811】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1863)において同定した:
【化3812】
これはアミノ酸配列(配列番号1864;ORF594.a)に対応する:
【化3813】
以下の部分DNA配列を、N.gonorrhoeae(配列番号1865)において同定した:
【化3814】
【化3815】
【化3816】
これはアミノ酸配列(配列番号1866;ORF595.ng)に対応する:
【化3817】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1867)において同定した:
【化3818】
これはアミノ酸配列(配列番号1868;ORF595)に対応する:
【化3819】
このアミノ酸配列のコンピューター分析は以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3820】
【化3821】
以下の部分DNA配列を、N.meningitidis(配列番号1869)において同定した:
【化3822】
これはアミノ酸配列(配列番号1870;ORF595.a)に対応する:
【化3823】
【化3824】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1871):
【化3825】
【化3826】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1872;ORF 596.ng)に対応する:
【化3827】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1873):
【化3828】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1874;ORF 596)に対応する:
【化3829】
【化3830】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3831】
【化3832】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1875):
【化3833】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1876;ORF 596.a)に対応する:
【化3834】
【化3835】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1877):
【化3836】
【化3837】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1878;ORF 597)に対応する:
【化3838】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1879):
【化3839】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1880;ORF 597)に対応する:
【化3840】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF597は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF597)との389アミノ酸にわたる重複で96.1%の同一性を示す:
【化3841】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1881):
【化3842】
【化3843】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1882;ORF597.a)に対応する:
【化3844】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性)
ORF597は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF597)との389アミノ酸にわたる重複で98.5%の同一性を示す:
【化3845】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1883):
【化3846】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1884;ORF601.ng)に対応する:
【化3847】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1885):
【化3848】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1886;ORF601)に対応する:
【化3849】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF601は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF601.ng)との205アミノ酸にわたる重複で94.1%の同一性を示す:
【化3850】
【化3851】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1887):
【化3852】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1888;ORF601.a)に対応する:
【化3853】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1889):
【化3854】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1890;ORF602.ng)に対応する:
【化3855】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1891):
【化3856】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1892;ORF602)に対応する:
【化3857】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1893):
【化3858】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1894;ORF602.a)に対応する:
【化3859】
【化3860】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1895):
【化3861】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1896;ORF603.ng)に対応する:
【化3862】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1897):
【化3863】
【化3864】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1898;ORF603)に対応する:
【化3865】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF603は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF603.ng)との450アミノ酸にわたる重複で91.6%の同一性を示す:
【化3866】
【化3867】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1899):
【化3868】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1900;ORF603.a)に対応する:
【化3869】
【化3870】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1901):
【化3871】
【化3872】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1902;ORF604.ng)に対応する:
【化3873】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1903):
【化3874】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1904;ORF604)に対応する:
【化3875】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF604は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF604.ng)との169アミノ酸にわたる重複で83.4%の同一性を示す:
【化3876】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1905):
【化3877】
【化3878】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1906;ORF604.a)に対応する:
【化3879】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1907):
【化3880】
【化3881】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1908;ORF605.ng)に対応する:
【化3882】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1909):
【化3883】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1910;ORF605)に対応する:
【化3884】
【化3885】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF605は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF605.ng)との513アミノ酸にわたる重複で97.9%の同一性を示す:
【化3886】
【化3887】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1911):
【化3888】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1912;ORF605.a)に対応する:
【化3889】
【化3890】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1913):
【化3891】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1914;ORF606.ng)に対応する:
【化3892】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1915):
【化3893】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1916;ORF606)に対応する:
【化3894】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF606は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF606.ng)との225アミノ酸にわたる重複で100.0%の同一性を示す:
【化3895】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1917):
【化3896】
【化3897】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1918;ORF606.a)に対応する:
【化3898】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1919):
【化3899】
【化3900】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1920;ORF607.ng)に対応する:
【化3901】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1921):
【化3902】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1922;ORF607)に対応する:
【化3903】
【化3904】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF607は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF607.ng)との459アミノ酸にわたる重複で94.8%の同一性を示す:
【化3905】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1923):
【化3906】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1924;ORF607.a)に対応する:
【化3907】
【化3908】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1925):
【化3909】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1926;ORF608.ng)に対応する:
【化3910】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1927):
【化3911】
【化3912】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1928;ORF608)に対応する:
【化3913】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF608は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF608.ng)との188アミノ酸にわたる重複で95.2%の同一性を示す:
【化3914】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1929):
【化3915】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1930;ORF608.a)に対応する:
【化3916】
【化3917】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1931):
【化3918】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1932;ORF609.ng)に対応する:
【化3919】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1933):
【化3920】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1934;ORF609)に対応する:
【化3921】
【化3922】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1935):
【化3923】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1936;ORF609.a)に対応する:
【化3924】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1937):
【化3925】
【化3926】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1938;ORF610.ng)に対応する:
【化3927】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1939):
【化3928】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1940;ORF610)に対応する:
【化3929】
【化3930】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1941):
【化3931】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1942;ORF610.a)に対応する:
【化3932】
【化3933】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1943):
【化3934】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1944;ORF611.ng)に対応する:
【化3935】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1945):
【化3936】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1946;ORF611)に対応する:
【化3937】
【化3938】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1947):
【化3939】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1948;ORF611.a)に対応する:
【化3940】
【化3941】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1949):
【化3942】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1950;ORF612.ng)に対応する:
【化3943】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1951):
【化3944】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1952;ORF612)に対応する:
【化3945】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1953):
【化3946】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1954;ORF612.a)に対応する:
【化3947】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1955):
【化3948】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1956;ORF613.ng)に対応する:
【化3949】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1957):
【化3950】
【化3951】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1958;ORF613)に対応する:
【化3952】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3953】
【化3954】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1959):
【化3955】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1960;ORF613.a)に対応する:
【化3956】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1961):
【化3957】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1962;ORF614.ng)に対応する:
【化3958】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1963):
【化3959】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1964;ORF614)に対応する:
【化3960】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3961】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1965):
【化3962】
【化3963】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1996;ORF614.a)に対応する:
【化3964】
【化3965】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1967):
【化3966】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1968;ORF615.ng)に対応する:
【化3967】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1969):
【化3968】
【化3969】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1970;ORF615)に対応する:
【化3970】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化3971】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1971):
【化3972】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1972;ORF615.a)に対応する:
【化3973】
【化3974】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1973):
【化3975】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1974;ORF616.ng)に対応する:
【化3976】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1975):
【化3977】
【化3978】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1976;ORF616)に対応する:
【化3979】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1977):
【化3980】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1978;ORF616.a)に対応する:
【化3981】
【化3982】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1979):
【化3983】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1980;ORF619.a)に対応する:
【化3984】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1981):
【化3985】
【化3986】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1982;ORF619)に対応する:
【化3987】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1983):
【化3988】
【化3989】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1984;ORF619.a)に対応する:
【化3990】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1985):
【化3991】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1986;ORF620.ng)に対応する:
【化3992】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1987):
【化3993】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1988;ORF620)に対応する:
【化3994】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1989):
【化3995】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1990;ORF620.a)に対応する:
【化3996】
【化3997】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1991):
【化3998】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1992;ORF622.ng)に対応する:
【化3999】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1993):
【化4000】
【化4001】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1994;ORF622)に対応する:
【化4002】
【化4003】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1995):
【化4004】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1996;ORF622.a)に対応する:
【化4005】
【化4006】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号1997):
【化4007】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号1998;ORF624.ng)に対応する:
【化4008】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号1999):
【化4009】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2000;ORF624)に対応する:
【化4010】
【化4011】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2001):
【化4012】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2002;ORF624.a)に対応する:
【化4013】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2003):
【化4014】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2004):
【化4015】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2005;ORF625.ng)に対応する:
【化4016】
【化4017】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2006):
【化4018】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2007;ORF625)に対応する:
【化4019】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2008;ORF625.a)に対応する:
【化4020】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2009):
【化4021】
【化4022】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2010;ORF627.ng)に対応する:
【化4023】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2011):
【化4024】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2012;ORF627)に対応する:
【化4025】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化4026】
【化4027】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2013):
【化4028】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2014;ORF627.a)に対応する:
【化4029】
【化4030】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2015):
【化4031】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2016;ORF628.ng)に対応する:
【化4032】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2017):
【化4033】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2018;ORF628)に対応する:
【化4034】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化4035】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2019):
【化4036】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2020;ORF628.a)に対応する:
【化4037】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2021):
【化4038】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2022;ORF629.ng)に対応する:
【化4039】
【化4040】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2023):
【化4041】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2024;ORF629)に対応する:
【化4042】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化4043】
【化4044】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2025):
【化4045】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2026;ORF629.a)に対応する:
【化4046】
【化4047】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2027):
【化4048】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2028;ORF630.ng)に対応する:
【化4049】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2029):
【化4050】
【化4051】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2030;ORF630)に対応する:
【化4052】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2031):
【化4053】
【化4054】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2032;ORF630.a)に対応する:
【化4055】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2033):
【化4056】
【化4057】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2034;ORF635.ng)に対応する:
【化4058】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2035):
【化4059】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2036;ORF635)に対応する:
【化4060】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2037):
【化4061】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2038;ORF635.a)に対応する:
【化4062】
【化4063】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2039):
【化4064】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2040;ORF638.ng)に対応する:
【化4065】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2041):
【化4066】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2042;ORF638)に対応する:
【化4067】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2043):
【化4068】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2044;ORF638.a)に対応する:
【化4069】
【化4070】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2045):
【化4071】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2046;ORF639−1.ng)に対応する:
【化4072】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2047):
【化4073】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2048;ORF639−1)に対応する:
【化4074】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2049):
【化4075】
【化4076】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2050;ORF639−1.a)に対応する:
【化4077】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2051):
【化4078】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2052;ORF640.ng)に対応する:
【化4079】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2053):
【化4080】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2054;ORF640)に対応する:
【化4081】
【化4082】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2055):
【化4083】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2056;ORF640.a)に対応する:
【化4084】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2057):
【化4085】
【化4086】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2058;ORF642.ng)に対応する:
【化4087】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2059):
【化4088】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2060;ORF642)に対応する:
【化4089】
【化4090】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2061):
【化4091】
【化4092】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2062;ORF642.a)に対応する:
【化4093】
【化4094】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2063):
【化4095】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2064;ORF643)に対応する:
【化4096】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2065):
【化4097】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2066;ORF643)に対応する:
【化4098】
このアミノ酸配列に関するコンピューター分析は、以下の結果を与えた:
(N.meningitidis menAとmenB由来の推定ORFとの相同性)
ORF643は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF643.a)との136アミノ酸にわたる重複で94.9%の同一性を示す:
【化4099】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2067):
【化4100】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2068;ORF643.a)に対応する:
【化4101】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2069):
【化4102】
【化4103】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2070;ORF644.ng)に対応する:
【化4104】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2071):
【化4105】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2072;ORF644)に対応する:
【化4106】
【化4107】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2073):
【化4108】
【化4109】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2074;ORF644.a)に対応する:
【化4110】
【化4111】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2075):
【化4112】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2076;ORF645.ng)に対応する:
【化4113】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2077):
【化4114】
【化4115】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2078;ORF645)に対応する:
【化4116】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2079):
【化4117】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2080;ORF645.a)に対応する:
【化4118】
【化4119】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2081):
【化4120】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2082;ORF647.ng)に対応する:
【化4121】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2083):
【化4122】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2084;ORF647)に対応する:
【化4123】
【化4124】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2085):
【化4125】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2086;ORF647.a)に対応する:
【化4126】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2087):
【化4127】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2088;ORF648.ng)に対応する:
【化4128】
【化4129】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2089):
【化4130】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2090;ORF648)に対応する:
【化4131】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2091):
【化4132】
【化4133】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2092;ORF648.a)に対応する:
【化4134】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2093):
【化4135】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2094;ORF649.ng)に対応する:
【化4136】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2095):
【化4137】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2096;ORF649)に対応する:
【化4138】
【化4139】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2097):
【化4140】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2098;ORF649.a)に対応する:
【化4141】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2099):
【化4142】
【化4143】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2100;ORF650.ng)に対応する:
【化4144】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2101):
【化4145】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2102;ORF650)に対応する:
【化4146】
【化4147】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2103):
【化4148】
【化4149】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2104;ORF650.a)に対応する:
【化4150】
【化4151】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2105):
【化4152】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2106;ORF652.ng)に対応する:
【化4153】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2107):
【化4154】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2108;ORF652)に対応する:
【化4155】
【化4156】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2109):
【化4157】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2110;ORF652.a)に対応する:
【化4158】
【化4159】
以下の部分DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2111):
【化4160】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2112;ORF652−1.ng)に対応する:
【化4161】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2113):
【化4162】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2114;ORF652−1)に対応する:
【化4163】
【化4164】
以下の部分DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2115):
【化4165】
これは、以下のアミノ酸配列(配列番号2116;ORF652−1.a)に対応する:
【化4166】
【化4167】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2117):
【化4168】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2118;ORF 653.ng):
【化4169】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2119):
【化4170】
【化4171】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2120;ORF 653):
【化4172】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2121):
【化4173】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2122;ORF 653.a):
【化4174】
【化4175】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2123):
【化4176】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2124;ORF 656.ng):
【化4177】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2125):
【化4178】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2126;ORF 656):
【化4179】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4180】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2127):
【化4181】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2128;ORF 656.a):
【化4182】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2129):
【化4183】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2130;ORF 657.ng):
【化4184】
【化4185】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2131):
【化4186】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2132;ORF 657):
【化4187】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4188】
【化4189】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2133):
【化4190】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2134;ORF 657.a):
【化4191】
【化4192】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2135):
【化4193】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2136;ORF 658.ng):
【化4194】
【化4195】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2137):
【化4196】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2138;ORF 658):
【化4197】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4198】
【化4199】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2139):
【化4200】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2140;ORF 658.a):
【化4201】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2141):
【化4202】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2142;ORF 661.ng):
【化4203】
以下の部分的4DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2143):
【化4204】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2144;ORF 661):
【化4205】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4206】
【化4207】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2145):
【化4208】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2146;ORF 661.a):
【化4209】
【化4210】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2147):
【化4211】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2148;ORF 663.ng):
【化4212】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2149):
【化4213】
【化4214】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2150;ORF 663):
【化4215】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4216】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2151):
【化4217】
【化4218】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2152;ORF 663.a):
【化4219】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2153):
【化4220】
【化4221】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2154;ORF 664.ng):
【化4222】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2155):
【化4223】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2156;ORF 664):
【化4224】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4225】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2157):
【化4226】
【化4227】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2158;ORF 664.a):
【化4228】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2159):
【化4229】
【化4230】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2160;ORF 665.ng):
【化4231】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2161):
【化4232】
【化4233】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2162;ORF 665):
【化4234】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4235】
【化4236】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2163):
【化4237】
【化4238】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2164;ORF 665.a):
【化4239】
【化4240】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2165):
【化4241】
【化4242】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2166;ORF 665−1.ng):
【化4243】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2167):
【化4244】
【化4245】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2168;ORF 665−1):
【化4246】
【化4247】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2169):
【化4248】
【化4249】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2170;ORF 665−1.a):
【化4250】
【化4251】
【化4252】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2171):
【化4253】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2172;ORF 666.ng):
【化4254】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2173):
【化4255】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2174;ORF 666):
【化4256】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4257】
【化4258】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2175):
【化4259】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2176;ORF 666.a):
【化4260】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2177):
【化4261】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2178;ORF 667.ng):
【化4262】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2179):
【化4263】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2180;ORF 667):
【化4264】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4265】
【化4266】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2181):
【化4267】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2182;ORF 667.a):
【化4268】
【化4269】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2183):
【化4270】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2184;ORF 669.ng):
【化4271】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2185):
【化4272】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2186;ORF 669):
【化4273】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4274】
【化4275】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2187):
【化4276】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2188;ORF 669.a):
【化4277】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2189):
【化4278】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2190;ORF 670.ng):
【化4279】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2191):
【化4280】
【化4281】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2192;ORF 670):
【化4282】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4283】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2193):
【化4284】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2194;ORF 670.a):
【化4285】
【化4286】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2195):
【化4287】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2196;ORF 671.ng):
【化4288】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2197):
【化4289】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2198;ORF 671):
【化4290】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4291】
【化4292】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2199):
【化4293】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2200;ORF 671.a):
【化4294】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2201):
【化4295】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2202;ORF 672.ng):
【化4296】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2203):
【化4297】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2204;ORF 672):
【化4298】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4299】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2205):
【化4300】
【化4301】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2206;ORF 672.a):
【化4302】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2207):
【化4303】
【化4304】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2208;ORF 673.ng):
【化4305】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2209):
【化4306】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2210;ORF 673):
【化4307】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4308】
【化4309】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2211):
【化4310】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2212;ORF 673.a):
【化4311】
【化4312】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2213):
【化4313】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2214;ORF 674.ng):
【化4314】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2215):
【化4315】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2216;ORF 674):
【化4316】
【化4317】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4318】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2217):
【化4319】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2218;ORF 674.a):
【化4320】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2219):
【化4321】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2220;ORF 675.ng):
【化4322】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2221):
【化4323】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2222;ORF 675):
【化4324】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4325】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2223):
【化4326】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2224;ORF 675.a):
【化4327】
【化4328】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2225):
【化4329】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2226;ORF 677.ng):
【化4330】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2227):
【化4331】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2228;ORF 677):
【化4332】
【化4333】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4334】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2229):
【化4335】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2230;ORF 677.a):
【化4336】
【化4337】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2231):
【化4338】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2232;ORF 678.ng):
【化4339】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2233):
【化4340】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2234;ORF 678):
【化4341】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4342】
【化4343】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2235):
【化4344】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2236;ORF 678.a):
【化4345】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2237):
【化4346】
【化4347】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2238;ORF 680.ng):
【化4348】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2239):
【化4349】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2240;ORF 680):
【化4350】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
【化4351】
【化4352】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2241):
【化4353】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2242;ORF 680.a):
【化4354】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2243):
【化4355】
【化4356】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2244;ORF 681):
【化4357】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2245):
【化4358】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2246;ORF 681):
【化4359】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis menA由来の推定ORFと、N.meningitidis menB由来の推定ORFとの相同性
ORF681は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF681.a)と、261アミノ酸の重複にわたって94.6%の同一性を示す。
【化4360】
【化4361】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2247):
【化4362】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2248;ORF 681.a):
【化4363】
【化4364】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2249):
【化4365】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2250;ORF 682):
【化4366】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2251):
【化4367】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2252;ORF 682):
【化4368】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis menA由来の推定ORFと、N.meningitidis menB由来の推定ORFとの相同性
ORF682は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF682.a)と、134アミノ酸の重複にわたって88.1%の同一性を示す。
【化4369】
【化4370】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2253):
【化4371】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2254;ORF 682.a):
【化4372】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2255):
【化4373】
【化4374】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2256;ORF 683):
【化4375】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2257):
【化4376】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2258;ORF 683):
【化4377】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF683は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF683)と、146アミノ酸の重複にわたって99.3%の同一性を示す。
【化4378】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2259):
【化4379】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2260;ORF 683.a):
【化4380】
【化4381】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF683は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF683)と、146アミノ酸の重複にわたって97.9%の同一性を示す。
【化4382】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2261):
【化4383】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2262;ORF 684):
【化4384】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2263):
【化4385】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2264;ORF 684):
【化4386】
【化4387】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF684は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF684)と、172アミノ酸の重複にわたって97.7%の同一性を示す。
【化4388】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2265):
【化4389】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2266;ORF 684.a):
【化4390】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF684は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF684)と、172アミノ酸の重複にわたって99.4%の同一性を示す。
【化4391】
【化4392】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2267):
【化4393】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2268;ORF 685):
【化4394】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2269):
【化4395】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2270;ORF 685):
【化4396】
【化4397】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF685は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF685)と、356アミノ酸の重複にわたって94.4%の同一性を示す。
【化4398】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2271):
【化4399】
【化4400】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2272;ORF 685.a):
【化4401】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF685は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF685)と、355アミノ酸の重複にわたって98.9%の同一性を示す。
【化4402】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2273):
【化4403】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2274;ORF 686):
【化4404】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2275):
【化4405】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2276;ORF 686):
【化4406】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF686は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF686)と、131アミノ酸の重複にわたって95.4%の同一性を示す。
【化4407】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2277):
【化4408】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2278;ORF 686.a):
【化4409】
【化4410】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF686は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF686)と、131アミノ酸の重複にわたって96.2%の同一性を示す。
【化4411】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2279):
【化4412】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2280;ORF 687):
【化4413】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2281):
【化4414】
【化4415】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2282;ORF 687):
【化4416】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF687は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF687)と、234アミノ酸の重複にわたって97.0%の同一性を示す。
【化4417】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2283):
【化4418】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2284;ORF 687.a):
【化4419】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF687は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF687)と、232アミノ酸の重複にわたって98.7%の同一性を示す。
【化4420】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2285):
【化4421】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2286;ORF 688):
【化4422】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2287):
【化4423】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2288;ORF 688):
【化4424】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF688は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF688)と、138アミノ酸の重複にわたって90.6%の同一性を示す。
【化4425】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2289):
【化4426】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2290;ORF 688.a):
【化4427】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF688は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF688)と、138アミノ酸の重複にわたって93.5%の同一性を示す。
【化4428】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2291):
【化4429】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2292;ORF 689):
【化4430】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2293):
【化4431】
【化4432】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2294;ORF 689):
【化4433】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF689は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF689)と、408アミノ酸の重複にわたって88.0%の同一性を示す。
【化4434】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2295):
【化4435】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2296;ORF 689.a):
【化4436】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF689は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF689)と、459アミノ酸の重複にわたって99.1%の同一性を示す。
【化4437】
【化4438】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2297):
【化4439】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2298;ORF 690):
【化4440】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2299):
【化4441】
【化4442】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2300;ORF 690):
【化4443】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF690は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF690)と、408アミノ酸の重複にわたって89.3%の同一性を示す。
【化4444】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2301):
【化4445】
【化4446】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2302;ORF 690.a):
【化4447】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF690は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF690)と、280アミノ酸の重複にわたって93.9%の同一性を示す。
【化4448】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2303):
【化4449】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2304;ORF 691):
【化4450】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2305):
【化4451】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2306;ORF 691):
【化4452】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF691は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF691)と、144アミノ酸の重複にわたって97.2%の同一性を示す。
【化4453】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2307):
【化4454】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2308;ORF 691.a):
【化4455】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF691は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF691)と、144アミノ酸の重複にわたって97.2%の同一性を示す。
【化4456】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2309):
【化4457】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2310;ORF 692):
【化4458】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2311):
【化4459】
【化4460】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2312;ORF 692):
【化4461】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF692は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF692)と、338アミノ酸の重複にわたって91.1%の同一性を示す。
【化4462】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2313):
【化4463】
【化4464】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2314;ORF 692.a):
【化4465】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF692は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF692)と、336アミノ酸の重複にわたって98.8%の同一性を示す。
【化4466】
【化4467】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2315):
【化4468】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2316;ORF 694):
【化4469】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2317):
【化4470】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2318;ORF 694):
【化4471】
【化4472】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF694は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF694)と、372アミノ酸の重複にわたって86.8%の同一性を示す。
【化4473】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2319):
【化4474】
【化4475】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2320;ORF 694.a):
【化4476】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF694は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF694)と、385アミノ酸の重複にわたって100%の同一性を示す。
【化4477】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2321):
【化4478】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2322;ORF 695):
【化4479】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2323):
【化4480】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2324;ORF 695):
【化4481】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF694は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF695)と、305アミノ酸の重複にわたって90.8%の同一性を示す。
【化4482】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2325):
【化4483】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2326;ORF 695.a):
【化4484】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF695は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF695)と、308アミノ酸の重複にわたって88.3%の同一性を示す。
【化4485】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された:
【化4486】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(ORF 696.ng):
【化4487】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2327):
【化4488】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2328;ORF 696):
【化4489】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2329):
【化4490】
【化4491】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2330;ORF 696.a):
【化4492】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF696は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF696.a)と、120アミノ酸の重複にわたって100.0%の同一性を示す。
【化4493】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2331):
【化4494】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2332;ORF 700):
【化4495】
【化4496】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2333):
【化4497】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2334;ORF 700):
【化4498】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFと、menBとの相同性
ORF700は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF700)と、300アミノ酸の重複にわたって94.7%の同一性を示す。
【化4499】
【化4500】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2335):
【化4501】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2336;ORF 700.a):
【化4502】
【化4503】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2337):
【化4504】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2338;ORF 701):
【化4505】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2339):
【化4506】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2340;ORF 701):
【化4507】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFと、menBとの相同性
ORF701は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF701.ng)と、128アミノ酸の重複にわたって92.2%の同一性を示す。
【化4508】
【化4509】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2341):
【化4510】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2342;ORF 701.a):
【化4511】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2343):
【化4512】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2344;ORF 702):
【化4513】
【化4514】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2345):
【化4515】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2346;ORF 702):
【化4516】
ORF702は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF702.ng)と、124アミノ酸の重複にわたって91.9%の同一性を示す。
【化4517】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2347):
【化4518】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2348;ORF 702.a):
【化4519】
【化4520】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2349):
【化4521】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2350;ORF 703):
【化4522】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2351):
【化4523】
【化4524】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2352;ORF 703):
【化4525】
ORF703は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF703.ng)と、288アミノ酸の重複にわたって98.3%の同一性を示す。
【化4526】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2353):
【化4527】
【化4528】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2354;ORF 703.a):
【化4529】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2355):
【化4530】
【化4531】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2356;ORF 703):
【化4532】
【化4533】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2357):
【化4534】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2358;ORF 705):
【化4535】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2359):
【化4536】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2360;ORF 705):
【化4537】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF705は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF705)と、238アミノ酸の重複にわたって95.0%の同一性を示す。
【化4538】
【化4539】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2361):
【化4540】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2362;ORF 705.a):
【化4541】
このアミノ酸配列のコンピュータ解析により、以下の結果が得られた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF705は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF705)と、238アミノ酸の重複にわたって100.0%の同一性を示す。
【化4542】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeaeにおいて同定された(配列番号2363):
【化4543】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2364;ORF 706.ng):
【化4544】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2365):
【化4545】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2366;ORF 706):
【化4546】
【化4547】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2367):
【化4548】
【化4549】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2368;ORF 706.a):
【化4550】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2369):
【化4551】
これは、以下のアミノ酸配列に対応する(配列番号2370;ORF 707):
【化4552】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidisにおいて同定された(配列番号2371):
【化4553】
【化4554】
これは、アミノ酸配列(配列番号2372;ORF707.a)に対応する:
【化4555】
【化4556】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2373):
【化4557】
これは、アミノ酸配列(配列番号2374;ORF708.ng)に対応する:
【化4558】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2375):
【化4559】
これは、アミノ酸配列(配列番号2376;ORF708)に対応する:
【化4560】
【化4561】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2377):
【化4562】
これは、アミノ酸配列(配列番号2378;ORF708.a)に対応する:
【化4563】
【化4564】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2363):
【化4565】
これは、アミノ酸配列(配列番号2380;ORF709.ng)に対応する:
【化4566】
【化4567】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2381):
【化4568】
これは、アミノ酸配列(配列番号2382;ORF709)に対応する:
【化4569】
【化4570】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2383):
【化4571】
これは、アミノ酸配列(配列番号2384;ORF709.a)に対応する:
【化4572】
【化4573】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2385):
【化4574】
【化4575】
これは、アミノ酸配列(配列番号2386;ORF710)に対応する:
【化4576】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2387):
【化4577】
これは、アミノ酸配列(配列番号2388;ORF710.a)に対応する:
【化4578】
【化4579】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2389):
【化4580】
これは、アミノ酸配列(配列番号2390;ORF711)に対応する:
【化4581】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2391):
【化4582】
【化4583】
これは、アミノ酸配列(配列番号2392;ORF711.a)に対応する:
【化4584】
【化4585】
【化4586】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2393):
【化4587】
これは、アミノ酸配列(配列番号2394;ORF712)に対応する:
【化4588】
【化4589】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2395):
【化4590】
これは、アミノ酸配列(配列番号2396;ORF713)に対応する:
【化4591】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2397):
【化4592】
【化4593】
これは、アミノ酸配列(配列番号2398;ORF713.a)に対応する:
【化4594】
【化4595】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2399):
【化4596】
これは、アミノ酸配列(配列番号2400;ORF714)に対応する:
【化4597】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2401):
【化4598】
これは、アミノ酸配列(配列番号2402;ORF714.a)に対応する:
【化4599】
【化4600】
N.meningitidisにおいて、以下部分DNA配列を同定した(配列番号2403):
【化4601】
これは、アミノ酸配列(配列番号2404;ORF715)に対応する:
【化4602】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2405):
【化4603】
これは、アミノ酸配列(配列番号2406;ORF715.a)に対応する:
【化4604】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2407):
【化4605】
これは、アミノ酸配列(配列番号2408;ORF716.ng)に対応する:
【化4606】
【化4607】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2409):
【化4608】
これは、アミノ酸配列(配列番号2410;ORF716)に対応する:
【化4609】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2411):
【化4610】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2412.a):
【化4611】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2413):
【化4612】
【化4613】
これは、アミノ酸配列(配列番号2414;ORF717.ng)に対応する:
【化4614】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2415):
【化4615】
これは、アミノ酸配列(配列番号2416;ORF717)に対応する:
【化4616】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2417):
【化4617】
【化4618】
これは、アミノ酸配列(配列番号2418;ORF717.a)に対応する:
【化4619】
【化4620】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2419):
【化4621】
これは、アミノ酸配列(配列番号2420;ORF718)に対応する:
【化4622】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2421):
【化4623】
これは、アミノ酸配列(配列番号2422;ORF718.a)に対応する:
【化4624】
【化4625】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2423):
【化4626】
これは、アミノ酸配列(配列番号2424;ORF718−1)に対応する:
【化4627】
【化4628】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2425):
【化4629】
これは、アミノ酸配列(配列番号2426;ORF718−1.a)に対応する:
【化4630】
【化4631】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2427):
【化4632】
【化4633】
これは、アミノ酸配列(配列番号2428;ORF719)に対応する:
【化4634】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2429):
【化4635】
【化4636】
これは、アミノ酸配列(配列番号2430;ORF720)に対応する:
【化4637】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2431):
【化4638】
これは、アミノ酸配列(配列番号2432;ORF720.a)に対応する:
【化4639】
【化4640】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2433):
【化4641】
これは、アミノ酸配列(配列番号2434;ORF721)に対応する:
【化4642】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2435):
【化4643】
【化4644】
これは、アミノ酸配列(配列番号2436;ORF721.a)に対応する:
【化4645】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2437):
【化4646】
【化4647】
これは、アミノ酸配列(配列番号2438;ORF722)に対応する:
【化4648】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2439):
【化4649】
これは、アミノ酸配列(配列番号2440;ORF722.a)に対応する:
【化4650】
【化4651】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2441):
【化4652】
これは、アミノ酸配列(配列番号2442;ORF723)に対応する:
【化4653】
N.meningitidisにおいて、そのコードされるアミノ酸配列とともに示される、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2443):
【化4654】
【化4655】
これは、アミノ酸配列(配列番号2444;ORF724)に対応する:
【化4656】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2445):
【化4657】
【化4658】
これは、アミノ酸配列(配列番号2446;ORF724.a)に対応する:
【化4659】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2447):
【化4660】
これは、アミノ酸配列(配列番号2448;ORF725)に対応する:
【化4661】
【化4662】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2449):
【化4663】
これは、アミノ酸配列(配列番号2450;ORF726)に対応する:
【化4664】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2451):
【化4665】
これは、アミノ酸配列(配列番号2452;ORF726.a)に対応する:
【化4666】
【化4667】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2453):
【化4668】
これは、アミノ酸配列(配列番号2454;ORF727)に対応する:
【化4669】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2455):
【化4670】
これは、アミノ酸配列(配列番号2456;ORF727.a)に対応する:
【化4671】
【化4672】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2457):
【化4673】
これは、アミノ酸配列(配列番号2458;ORF728)に対応する(配列番号2458;ORF728):
【化4674】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2459):
【化4675】
【化4676】
これは、アミノ酸配列(配列番号2460;ORF728)に対応する:
【化4677】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.meningitidis menA with menB由来の推定ORFとの相同性
ORF728は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF728.a)との377アミノ酸の重複にわたって、96.3%の同一性を示す:
【化4678】
【化4679】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2461):
【化4680】
これは、アミノ酸配列(配列番号2462;ORF728.a)に対応する:
【化4681】
【化4682】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2463):
【化4683】
これは、アミノ酸配列(配列番号2464;ORF729)に対応する:
【化4684】
【化4685】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2465):
【化4686】
これは、アミノ酸配列(配列番号2466;ORF729)に対応する:
【化4687】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.meningitidis menA with menB由来の推定ORFとの相同性
ORF729は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF729.a)との467アミノ酸の重複にわたって、95.7%の同一性を示す:
【化4688】
【化4689】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2467):
【化4690】
【化4691】
これは、アミノ酸配列(配列番号2468;ORF729.a)に対応する:
【化4692】
【化4693】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2469):
【化4694】
これは、アミノ酸配列(配列番号2470;ORF730.ng)に対応する:
【化4695】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2471):
【化4696】
【化4697】
これは、アミノ酸配列(配列番号2472;ORF730)に対応する:
【化4698】
【化4699】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2473):
【化4700】
これは、アミノ酸配列(配列番号2474;ORF730.a)に対応する:
【化4701】
【化4702】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2475):
【化4703】
これは、アミノ酸配列(配列番号2476;ORF731,ng)に対応する:
【化4704】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2477):
【化4705】
【化4706】
これは、アミノ酸配列(配列番号2478;ORF731)に対応する:
【化4707】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2479):
【化4708】
これは、アミノ酸配列(配列番号2480;ORF731.a)に対応する:
【化4709】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2481):
【化4710】
【化4711】
これは、アミノ酸配列(配列番号2482;ORF732)に対応する:
【化4712】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2483):
【化4713】
【化4714】
これは、アミノ酸配列(配列番号2484;ORF732)に対応する:
【化4715】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.meningitidis menA with menB由来の推定ORFとの相同性
ORF732は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF732.a)と491アミノ酸の重複にわたって、98.2%の同一性を示す:
【化4716】
【化4717】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2485):
【化4718】
これは、アミノ酸配列(配列番号2486;ORF732.a)に対応する:
【化4719】
【化4720】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2487):
【化4721】
【化4722】
これは、アミノ酸配列(配列番号2488;ORF733)に対応する:
【化4723】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2489):
【化4724】
これは、アミノ酸配列(配列番号2490;ORF733)に対応する:
【化4725】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.meningitidis menA with menB由来の推定ORFとの相同性
ORF733は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF733.a)との123アミノ酸の重複にわたって、94.3%の同一性を示す:
【化4726】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2491):
【化4727】
これは、アミノ酸配列(配列番号2492;ORF733.a)に対応する:
【化4728】
【化4729】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2493):
【化4730】
これは、アミノ酸配列(配列番号2494;ORF734.ng)に対応する:
【化4731】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2495):
【化4732】
これは、アミノ酸配列(配列番号2496;ORF734)に対応する:
【化4733】
【化4734】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2497):
【化4735】
これは、アミノ酸配列(配列番号2498;ORF734.a)に対応する:
【化4736】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2499):
【化4737】
【化4738】
これは、アミノ酸配列(配列番号2500;ORF735)に対応する:
【化4739】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2501):
【化4740】
これは、アミノ酸配列(配列番号2502;ORF735.a)に対応する:
【化4741】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2503):
【化4742】
【化4743】
これは、アミノ酸配列(配列番号2504;ORF736)に対応する:
【化4744】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2505):
【化4745】
これは、アミノ酸配列(配列番号2506;ORF736)に対応する:
【化4746】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.meningitidis menA with menB由来の推定ORFとの相同性
ORF736は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF736.ng)との258アミノ酸の重複にわたって、97.7%の同一性を示す:
【化4747】
【化4748】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2507):
【化4749】
これは、アミノ酸配列(配列番号2508;ORF736.a)に対応する:
【化4750】
【化4751】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2509):
【化4752】
これは、アミノ酸配列(配列番号2510;ORF737)に対応する:
【化4753】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2511):
【化4754】
これは、アミノ酸配列(配列番号2512;ORF737)に対応する:
【化4755】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.meningitidis menA with menB由来の推定ORFとの相同性
ORF737は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF737.a)との108アミノ酸の重複にわたって、95.4%の同一性を示す:
【化4756】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2513):
【化4757】
これは、アミノ酸配列(配列番号2514;ORF737.a)に対応する:
【化4758】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2515):
【化4759】
【化4760】
これは、アミノ酸配列(配列番号2516;ORF738)に対応する:
【化4761】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2517):
【化4762】
これは、アミノ酸配列(配列番号2518;ORF738)に対応する:
【化4763】
【化4764】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.meningitidis menA with menB由来の推定ORFとの相同性
ORF738は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF738.a)との604アミノ酸の重複にわたって、95.0%の同一性を示す:
【化4765】
【化4766】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2519):
【化4767】
これは、アミノ酸配列(配列番号2520;ORF738.a)に対応する:
【化4768】
【化4769】
【化4770】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2521):
【化4771】
これは、アミノ酸配列(配列番号2522;ORF739)に対応する:
【化4772】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2523):
【化4773】
これは、アミノ酸配列(配列番号2524;ORF739)に対応する:
【化4774】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.meningitidis menA with menB由来の推定ORFとの相同性
ORF739は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF739.a)との197アミノ酸の重複にわたって、86.3%の同一性を示す:
【化4775】
【化4776】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2525):
【化4777】
これは、アミノ酸配列(配列番号2526;ORF739.a)に対応する:
【化4778】
【化4779】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2527):
【化4780】
これは、アミノ酸配列(配列番号2528;ORF740.ng)に対応する:
【化4781】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2529):
【化4782】
これは、アミノ酸配列(配列番号2530;ORF740)に対応する:
【化4783】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2531):
【化4784】
これは、アミノ酸配列(配列番号2532;ORF740.a)に対応する:
【化4785】
【化4786】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2533):
【化4787】
これは、アミノ酸配列(配列番号2534;ORF741.ng)に対応する:
【化4788】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2535):
【化4789】
これは、アミノ酸配列(配列番号2536;ORF741)に対応する:
【化4790】
【化4791】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2537):
【化4792】
これは、アミノ酸配列(配列番号2538;ORF741.a)に対応する:
【化4793】
【化4794】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2539):
【化4795】
【化4796】
これは、アミノ酸配列(配列番号2540;ORF742)に対応する:
【化4797】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2541):
【化4798】
【化4799】
これは、アミノ酸配列(配列番号2542;ORF742.a)に対応する:
【化4800】
【化4801】
【化4802】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2543):
【化4803】
これは、アミノ酸配列(配列番号2544;ORF743)に対応する:
【化4804】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2545):
【化4805】
【化4806】
これは、アミノ酸配列(配列番号2546;ORF743.a)に対応する:
【化4807】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2547):
【化4808】
【化4809】
これは、アミノ酸配列(配列番号2548;ORF744)に対応する:
【化4810】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2549):
【化4811】
これは、アミノ酸配列(配列番号2550;ORF745)に対応する:
【化4812】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2551):
【化4813】
【化4814】
これは、アミノ酸配列(配列番号2552;ORF746.ng)に対応する:
【化4815】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2553):
【化4816】
これは、アミノ酸配列(配列番号2554;ORF746)に対応する:
【化4817】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF746は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF746)との346アミノ酸の重複にわたって、89.9%の同一性を示す:
【化4818】
【化4819】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2555):
【化4820】
これは、アミノ酸配列(配列番号2556;ORF746.a)に対応する:
【化4821】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF746は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF746)との332アミノ酸の重複にわたって、99.7%の同一性を示す:
【化4822】
【化4823】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2557):
【化4824】
これは、アミノ酸配列(配列番号2558;ORF747)に対応する:
【化4825】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2559):
【化4826】
これは、アミノ酸配列(配列番号2560;ORF747.a)に対応する:
【化4827】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF747は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF746)との102アミノ酸の重複にわたって、97.1%の同一性を示す:
【化4828】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2561):
【化4829】
これは、アミノ酸配列(配列番号2562;ORF748.ng)に対応する:
【化4830】
【化4831】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2563):
【化4832】
これは、アミノ酸配列(配列番号2564;ORF748)に対応する:
【化4833】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF748は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF748)との421アミノ酸の重複にわたって、95.0%の同一性を示す:
【化4834】
【化4835】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2565):
【化4836】
これは、アミノ酸配列(配列番号2566;ORF748.a)に対応する;
【化4837】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF748は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF748)との421アミノ酸の重複にわたって、99.0%の同一性を示す:
【化4838】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2567):
【化4839】
【化4840】
これは、アミノ酸配列(配列番号2568;ORF749.ng)に対応する:
【化4841】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2569);
【化4842】
これは、アミノ酸配列(配列番号2570;ORF749)に対応する:
【化4843】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF749は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF749)との388アミノ酸の重複にわたって、96.1%の同一性を示す:
【化4844】
【化4845】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2571):
【化4846】
これは、アミノ酸配列(配列番号2572;ORF749.a)に対応する:
【化4847】
【化4848】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF749は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF749)との388アミノ酸の重複にわたって、99.7%の同一性を示す:
【化4849】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2573):
【化4850】
【化4851】
これは、アミノ酸配列(配列番号2574;ORF750.ng)に対応する:
【化4852】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2575):
【化4853】
これは、アミノ酸配列(配列番号2576;ORF750)に対応する:
【化4854】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性
ORF750は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF750)との322アミノ酸の重複にわたって、93.8%の同一性を示す:
【化4855】
【化4856】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2577):
【化4857】
これは、アミノ酸配列(配列番号2578;ORF750.a)に対応する:
【化4858】
このアミノ酸配列のコンピュータ分析は、以下の結果を導いた:
N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性
ORF750は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF750)との321アミノ酸の重複にわたって、98.8%の同一性を示す:
【化4859】
【化4860】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2579):
【化4861】
これは、アミノ酸配列(配列番号2580;ORF751)に対応する:
【化4862】
【化4863】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2581):
【化4864】
これは、アミノ酸配列(配列番号2582;ORF752)に対応する:
【化4865】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2583):
【化4866】
【化4867】
これは、アミノ酸配列(配列番号2584;ORF752−1)に対応する:
【化4868】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2585):
【化4869】
これは、アミノ酸配列(配列番号2586;ORF753)に対応する:
【化4870】
【化4871】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2587):
【化4872】
これは、アミノ酸配列(配列番号2588;ORF754)に対応する:
【化4873】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2589):
【化4874】
これは、アミノ酸配列(配列番号2590;ORF755)に対応する:
【化4875】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2591):
【化4876】
これは、アミノ酸配列(配列番号2592;ORF756)に対応する:
【化4877】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2593):
【化4878】
これは、アミノ酸配列(配列番号2594;ORF756.a)に対応する:
【化4879】
【化4880】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2595):
【化4881】
これは、アミノ酸配列(配列番号2596;ORF757)に対応する:
【化4882】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2597):
【化4883】
これは、アミノ酸配列(配列番号2598;ORF758)に対応する:
【化4884】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2599):
【化4885】
これは、アミノ酸配列(配列番号2600;ORF758.a)に対応する:
【化4886】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2601):
【化4887】
【化4888】
【化4889】
これは、アミノ酸配列(配列番号2602;ORF759)に対応する:
【化4890】
N.gonorrhoeaeにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2603):
【化4891】
これは、アミノ酸配列(配列番号2604;ORF760.ng)に対応する:
【化4892】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2605):
【化4893】
これは、アミノ酸配列(配列番号2606;ORF760)に対応する:
【化4894】
【化4895】
N.meningitidisにおいて、以下の部分DNA配列を同定した(配列番号2607):
【化4896】
【化4897】
これは、アミノ酸配列(配列番号2608;ORF761)に対応する:
【化4898】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2609):
【化4899】
【化4900】
これは、アミノ酸配列(配列番号2610;ORF761.a)に対応する:
【化4901】
【化4902】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2611):
【化4903】
これは、アミノ酸配列(配列番号2612;ORF762)に対応する:
【化4904】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2613):
【化4905】
【化4906】
これは、アミノ酸配列(配列番号2614;ORF762.a)に対応する:
【化4907】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2615):
【化4908】
これは、アミノ酸配列(配列番号2616;ORF763)に対応する:
【化4909】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2617):
【化4910】
これは、アミノ酸配列(配列番号2618;ORF763.a)に対応する:
【化4911】
【化4912】
【化4913】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2619):
【化4914】
これは、アミノ酸配列(配列番号2620;ORF764)に対応する:
【化4915】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2621):
【化4916】
【化4917】
これは、アミノ酸配列(配列番号2622;ORF764.a)に対応する:
【化4918】
【化4919】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2623):
【化4919a】
これは、アミノ酸配列(配列番号2624;ORF765)に対応する:
【化1920】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2625):
【化4921】
これは、アミノ酸配列(配列番号2626;ORF765.a)に対応する:
【化4922】
【化4923】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.meningitidis由来の予測されるORFとの相同性
ORF765は、N.meningitidis由来のORF(ORF765)と309アミノ酸のオーバーラップにわたって、96.18%の同一性を示す:
【化4924】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2627):
【化4925】
これは、アミノ酸配列(配列番号2628;ORF767.ng)に対応する:
【化4926】
【化4927】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2629):
【化4928】
これは、アミノ酸配列(配列番号2630;ORF767)に対応する:
【化4929】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF767は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF767)と214アミノ酸のオーバーラップにわたって、95.8%の同一性を示す:
【化4930】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2631):
【化4931】
【化4932】
これは、アミノ酸配列(配列番号2632;ORF767.a)に対応する:
【化4933】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.meningitidis由来の予測されるORFとの相同性
ORF767は、N.meningitidis由来のORF(ORF767)と214アミノ酸のオーバーラップにわたって、96.7%の同一性を示す:
【化4934】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2633):
【化4935】
これは、アミノ酸配列(配列番号2634;ORF768.ng)に対応する:
【化4936】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2635):
【化4937】
【化4938】
これは、アミノ酸配列(配列番号2636;ORF768)に対応する:
【化4939】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF768は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF768)と119アミノ酸のオーバーラップにわたって、96.6%の同一性を示す:
【化4940】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2637):
【化4941】
これは、アミノ酸配列(配列番号2638;ORF768.a)に対応する:
【化4942】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.meningitidis由来の予測されるORFとの相同性
ORF768は、N.meningitidis由来のORF(ORF768)と119アミノ酸のオーバーラップにわたって、99.2%の同一性を示す:
【化4943】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2639):
【化4944】
これは、アミノ酸配列(配列番号2640;ORF769.ng)に対応する:
【化4945】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2641):
【化4946】
【化4947】
これは、アミノ酸配列(配列番号2642;ORF769)に対応する:
【化4948】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF769は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF769)と429アミノ酸のオーバーラップにわたって、95.1%の同一性を示す:
【化4949】
【化4950】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2643):
【化4951】
これは、アミノ酸配列(配列番号2644;ORF769.a)に対応する:
【化4952】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.meningitidis由来の予測されるORFとの相同性
ORF769は、N.meningitidis由来のORF(ORF769)と490アミノ酸のオーバーラップにわたって、99.8%の同一性を示す:
【化4953】
【化4954】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2645):
【化4955】
これは、アミノ酸配列(配列番号2646;ORF770.ng)に対応する:
【化4956】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2647):
【化4957】
【化4958】
これは、アミノ酸配列(配列番号2648;ORF770)に対応する:
【化4959】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF770は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF770)と186アミノ酸のオーバーラップにわたって、93.5%の同一性を示す:
【化4960】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2649):
【化4961】
これは、アミノ酸配列(配列番号2650;ORF770.a)に対応する:
【化4962】
【化4963】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.meningitidis由来の予測されるORFとの相同性
ORF770は、N.meningitidis由来のORF(ORF770)と186アミノ酸のオーバーラップにわたって、99.5%の同一性を示す:
【化4964】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2651):
【化4965】
【化4966】
これは、アミノ酸配列(配列番号2652;ORF771.ng)に対応する:
【化4967】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2653):
【化4968】
これは、アミノ酸配列(配列番号2654;ORF771)に対応する:
【化4969】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF771は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF771)と704アミノ酸のオーバーラップにわたって、90.3%の同一性を示す:
【化4970】
【化4971】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2655):
【化4972】
これは、アミノ酸配列(配列番号2656;ORF771.a)に対応する:
【化4973】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.meningitidis由来の予測されるORFとの相同性
ORF771は、N.meningitidis由来のORF(ORF771)と704アミノ酸のオーバーラップにわたって、98.9%の同一性を示す:
【化4974】
【化4975】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2657):
【化4976】
これは、アミノ酸配列(配列番号2658;ORF772.ng)に対応する:
【化4977】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2659):
【化4978】
【化4979】
これは、アミノ酸配列(配列番号2660;ORF772)に対応する:
【化4980】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF772は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF772)と298アミノ酸のオーバーラップにわたって、85.2%の同一性を示す:
【化4981】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2661):
【化4982】
これは、アミノ酸配列(配列番号2662;ORF772.a)に対応する:
【化4983】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.meningitidis由来の予測されるORFとの相同性
ORF772は、N.meningitidis由来のORF(ORF772)と298アミノ酸のオーバーラップにわたって、95.6%の同一性を示す:
【化4984】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2663):
【化4985】
これは、アミノ酸配列(配列番号2664;ORF773)に対応する:
【化4986】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2665):
【化4987】
これは、アミノ酸配列(配列番号2666;ORF774.ng)に対応する:
【化4988】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2667):
【化4989】
これは、アミノ酸配列(配列番号2668;ORF774)に対応する:
【化4990】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF774は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF774)と237アミノ酸のオーバーラップにわたって、92.8%の同一性を示す:
【化4991】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2669):
【化4992】
これは、アミノ酸配列(配列番号2670;ORF774.a)に対応する:
【化4993】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.meningitidis由来の予測されるORFとの相同性
ORF774は、N.meningitidis由来のORF(ORF774)と238アミノ酸のオーバーラップにわたって、89.5%の同一性を示す:
【化4994】
【化4995】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2671):
【化4996】
これは、アミノ酸配列(配列番号2672;ORF790)に対応する:
【化4997】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2673):
【化4998】
【化4999】
これは、アミノ酸配列(配列番号2674;ORF790.a)に対応する:
【化5000】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.meningitidis由来の予測されるORFとの相同性
ORF790は、N.meningitidis由来のORF(ORF790)と342アミノ酸のオーバーラップにわたって、98.2%の同一性を示す:
【化5001】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2675):
【化5002】
【化5003】
これは、アミノ酸配列(配列番号2676;ORF791.ng)に対応する:
【化5004】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2677):
【化5005】
【化5006】
これは、アミノ酸配列(配列番号2678;ORF791)に対応する:
【化5007】
【化5008】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2679):
【化5009】
これは、アミノ酸配列(配列番号2680;ORF791.a)に対応する:
【化5010】
【化5011】
【化5012】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2681):
【化5013】
これは、アミノ酸配列(配列番号2682;ORF792.ng)に対応する:
【化5014】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2683):
【化5015】
これは、アミノ酸配列(配列番号2684;ORF792)に対応する:
【化5016】
【化5017】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2685):
【化5018】
これは、アミノ酸配列(配列番号2686;ORF792.a)に対応する:
【化5019】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2687):
【化5019a】
【化5020】
これは、アミノ酸配列(配列番号2688;ORF793.ng)に対応する:
【化5021】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2689):
【化5022】
【化5023】
これは、アミノ酸配列(配列番号2690;ORF793)に対応する:
【化5024】
【化5025】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2691):
【化5026】
これは、アミノ酸配列(配列番号2692;ORF793.a)に対応する:
【化5027】
【化5028】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2693):
【化5029】
【化5030】
これは、アミノ酸配列(配列番号2694;ORF794.ng)に対応する:
【化5031】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2695):
【化5032】
これは、アミノ酸配列(配列番号2696;ORF794)に対応する:
【化5033】
【化5034】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2697):
【化5035】
【化5036】
これは、アミノ酸配列(配列番号2698;ORF794.a)に対応する:
【化5037】
【化5038】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2699):
【化5039】
これは、アミノ酸配列(配列番号2700;ORF900.ng)に対応する:
【化5040】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2701):
【化5041】
【化5042】
これは、アミノ酸配列(配列番号2702;ORF900)に対応する:
【化5043】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF900は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF900)と386アミノ酸のオーバーラップにわたって、87.0%の同一性を示す:
【化5044】
【化5045】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2703):
【化5046】
これは、アミノ酸配列(配列番号2704;ORF900.a)に対応する:
【化5047】
【化5048】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2705):
【化5049】
これは、アミノ酸配列(配列番号2706;ORF901)に対応する:
【化5050】
【化5051】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2707):
【化5052】
これは、アミノ酸配列(配列番号2708;ORF901.a)に対応する:
【化5053】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2709):
【化5054】
これは、アミノ酸配列(配列番号2710;ORF902.ng)に対応する:
【化5055】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2711):
【化5056】
これは、アミノ酸配列(配列番号2712;ORF902)に対応する:
【化5057】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF902は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF902.ng)と345アミノ酸のオーバーラップにわたって、80.9%の同一性を示す:
【化5058】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2713):
【化5059】
【化5060】
これは、アミノ酸配列(配列番号2714;ORF902.a)に対応する:
【化5061】
【化5062】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2715):
【化5063】
これは、アミノ酸配列(配列番号2716;ORF903.ng)に対応する:
【化5064】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2717):
【化5065】
【化5066】
これは、アミノ酸配列(配列番号2718;ORF903)に対応する:
【化5067】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF903は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF903.ng)と519アミノ酸のオーバーラップにわたって、48.9%の同一性を示す:
【化5068】
【化5069】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2719):
【化5070】
【化5071】
これは、アミノ酸配列(配列番号2720;ORF903.a)に対応する:
【化5072】
【化5073】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2721):
【化5074】
これは、アミノ酸配列(配列番号2722;ORF904.ng)に対応する:
【化5075】
【化5076】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2723):
【化5077】
これは、アミノ酸配列(配列番号2724;ORF904)に対応する:
【化5078】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF904は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF904.ng)と436アミノ酸のオーバーラップにわたって、90.4%の同一性を示す:
【化5079】
【化5080】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2725):
【化5081】
【化5082】
これは、アミノ酸配列(配列番号2726;ORF904.a)に対応する:
【化5083】
【化5084】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2727):
【化5085】
これは、アミノ酸配列(配列番号2728;ORF906)に対応する:
【化5086】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2729):
【化5087】
これは、アミノ酸配列(配列番号2730;ORF907.ng)に対応する:
【化5088】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2731):
【化5089】
これは、アミノ酸配列(配列番号2732;ORF907)に対応する:
【化5090】
【化5091】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF907は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF907.ng)と126アミノ酸のオーバーラップにわたって、92.9%の同一性を示す:
【化5092】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2733):
【化5093】
これは、アミノ酸配列(配列番号2734;ORF907.a)に対応する:
【化5094】
【化5095】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2735):
【化5096】
これは、アミノ酸配列(配列番号2736;ORF908.ng)に対応する:
【化5097】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2737):
【化5098】
これは、アミノ酸配列(配列番号2738;ORF908)に対応する:
【化5099】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF908は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF908.ng)と166アミノ酸のオーバーラップにわたって、93.4%の同一性を示す:
【化5100】
【化5101】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2739):
【化5102】
これは、アミノ酸配列(配列番号2740;ORF908.a)に対応する:
【化5103】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2741):
【化5104】
【化5105】
これは、アミノ酸配列(配列番号2742;ORF909.ng)に対応する:
【化5106】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2743):
【化5107】
これは、アミノ酸配列(配列番号2744;ORF909)に対応する:
【化5108】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF909は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF909.ng)と90アミノ酸のオーバーラップにわたって、53.3%の同一性を示す:
【化5109】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2745):
【化5110】
これは、アミノ酸配列(配列番号2746;ORF909.a)に対応する:
【化5111】
【化5112】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2747):
【化5113】
これは、アミノ酸配列(配列番号2748;ORF910.ng)に対応する:
【化5114】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2749):
【化5115】
これは、アミノ酸配列(配列番号2750;ORF910)に対応する:
【化5116】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF910は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF910.ng)と94アミノ酸のオーバーラップにわたって、96.8%の同一性を示す:
【化5117】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2751):
【化5118】
これは、アミノ酸配列(配列番号2752;ORF910.a)に対応する:
【化5119】
【化5120】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2753):
【化5121】
これは、アミノ酸配列(配列番号2754;ORF911.ng)に対応する:
【化5122】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2755):
【化5123】
これは、アミノ酸配列(配列番号2756;ORF911)に対応する:
【化5124】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF911は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF911.ng)と164アミノ酸のオーバーラップにわたって、99.4%の同一性を示す:
【化5125】
【化5126】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2757):
【化5127】
これは、アミノ酸配列(配列番号2758;ORF911.a)に対応する:
【化5128】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2759):
【化5129】
【化5130】
これは、アミノ酸配列(配列番号2760;ORF912.ng)に対応する:
【化5131】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2761):
【化5132】
これは、アミノ酸配列(配列番号2762;ORF912)に対応する:
【化5133】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF912は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF912.ng)と196アミノ酸のオーバーラップにわたって、91.8%の同一性を示す:
【化5134】
【化5135】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2763):
【化5136】
これは、アミノ酸配列(配列番号2764;ORF912.a)に対応する:
【化5137】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2765):
【化5138】
【化5139】
これは、アミノ酸配列(配列番号2766;ORF913.ng)に対応する:
【化5140】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2767):
【化5141】
これは、アミノ酸配列(配列番号2768;ORF913)に対応する:
【化5142】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF913は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF913.ng)と277アミノ酸のオーバーラップにわたって、94.9%の同一性を示す:
【化5143】
【化5144】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2769):
【化5145】
これは、アミノ酸配列(配列番号2770;ORF913.a)に対応する:
【化5146】
【化5147】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2771):
【化5148】
これは、アミノ酸配列(配列番号2772;ORF914.ng)に対応する:
【化5149】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2773):
【化5150】
これは、アミノ酸配列(配列番号2774;ORF914)に対応する:
【化5151】
【化5152】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF914は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF914.ng)と244アミノ酸のオーバーラップにわたって、96.7%の同一性を示す:
【化5153】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2775):
【化5154】
これは、アミノ酸配列(配列番号2776;ORF914.a)に対応する:
【化5155】
【化5156】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2777):
【化5157】
これは、アミノ酸配列(配列番号2778;ORF915.ng)に対応する:
【化5158】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2779):
【化5159】
【化5160】
これは、アミノ酸配列(配列番号2780;ORF915)に対応する:
【化5161】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF915は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF915.ng)と164アミノ酸のオーバーラップにわたって、97.0%の同一性を示す:
【化5162】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2781):
【化5163】
これは、アミノ酸配列(配列番号2782;ORF915.a)に対応する:
【化5164】
【化5165】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2783):
【化5166】
これは、アミノ酸配列(配列番号2784;ORF917.ng)に対応する:
【化5167】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2785):
【化5168】
【化5169】
これは、アミノ酸配列(配列番号2786;ORF917)に対応する:
【化5170】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF917は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF917.ng)と376アミノ酸のオーバーラップにわたって、97.6%の同一性を示す:
【化5171】
【化5172】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2787):
【化5173】
これは、アミノ酸配列(配列番号2788;ORF917.a)に対応する:
【化5174】
【化5175】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2789):
【化5176】
これは、アミノ酸配列(配列番号2790;ORF919.ng)に対応する:
【化5177】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2791):
【化5178】
これは、アミノ酸配列(配列番号2792;ORF919)に対応する:
【化5179】
【化5180】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2793):
【化5181】
【化5182】
これは、アミノ酸配列(配列番号2794;ORF919.a)に対応する:
【化5183】
(ORF919の発現)
実施例1に記載されたORF919についてのプライマーを使用して、ORFを位置付けし、そしてクローニングした。この配列は、図1#において提供されるように、精製され、そしてE.coli中で発現された。ORF919の親水性プロット、抗原性指数、および両親媒性領域を、図5#中に提供する。AMPHIプログラムは、推定のT細胞エピトープを予測するために使用されている(Gaoら(1989)J.Immunol.143:3007;Robertsら(1996)AIDS Res Human Retroviruses 12:593;Quakyiら(1992)Scand J Immunol 補遺 11:9)。ORF919の核酸配列は、提示C#において提供される。
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2795):
【化5184】
これは、アミノ酸配列(配列番号2796;ORF920.ng)に対応する:
【化5185】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2797):
【化5186】
これは、アミノ酸配列(配列番号2798;ORF920)に対応する:
【化5187】
【化5188】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF920は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF920.ng)と207アミノ酸のオーバーラップにわたって、91.3%の同一性を示す:
【化5189】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2799):
【化5190】
これは、アミノ酸配列(配列番号2800;ORF920.a)に対応する:
【化5191】
【化5192】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2801):
【化5193】
これは、アミノ酸配列(配列番号2802;ORF920−1.ng)に対応する:
【化5194】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2803):
【化5195】
【化5196】
これは、アミノ酸配列(配列番号2804;ORF920−1)に対応する:
【化5197】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2805):
【化5198】
これは、アミノ酸配列(配列番号2806;ORF920−1.a)に対応する:
【化5199】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2807):
【化5200】
これは、アミノ酸配列(配列番号2808;ORF921.ng)に対応する:
【化5200a】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2809):
【化5200b】
【化5201】
これは、アミノ酸配列(配列番号2810;ORF921)に対応する:
【化5202】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF921は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF921.ng)と162アミノ酸のオーバーラップにわたって、95.7%の同一性を示す:
【化5203】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2811):
【化5204】
これは、アミノ酸配列(配列番号2812;ORF921.a)に対応する:
【化5205】
【化5206】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2813):
【化5207】
これは、アミノ酸配列(配列番号2814;ORF922.ng)に対応する:
【化5208】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2815):
【化5209】
【化5210】
これは、アミノ酸配列(配列番号2816;ORF922)に対応する:
【化5211】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF922は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF922.ng)と369アミノ酸のオーバーラップにわたって、95.9%の同一性を示す:
【化5212】
【化5213】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2817):
【化5214】
これは、アミノ酸配列(配列番号2818;ORF922.a)に対応する:
【化5215】
【化5216】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2819):
【化5217】
これは、アミノ酸配列(配列番号2820;ORF923.ng)に対応する:
【化5218】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2821):
【化5219】
これは、アミノ酸配列(配列番号2822;ORF923)に対応する:
【化5220】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF923は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF923.ng)と157アミノ酸のオーバーラップにわたって、68.8%の同一性を示す:
【化5221】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2823):
【化5222】
これは、アミノ酸配列(配列番号2824;ORF923.a)に対応する:
【化5223】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2825):
【化5224】
これは、アミノ酸配列(配列番号2826;ORF925.ng)に対応する:
【化5225】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2827):
【化5226】
これは、アミノ酸配列(配列番号2828;ORF925)に対応する:
【化5227】
このアミノ酸のコンピュータ解析の結果を以下に示す:
N.gonorrhoeae由来の予測されるORFとの相同性
ORF925は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF925.ng)と50アミノ酸のオーバーラップにわたって、94.0%の同一性を示す:
【化5228】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2829):
【化5229】
これは、アミノ酸配列(配列番号2830;ORF925−1.ng)に対応する:
【化5230】
【化5231】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2831):
【化5232】
これは、アミノ酸配列(配列番号2832;ORF925−1)に対応する:
【化5233】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2833):
【化5234】
これは、アミノ酸配列(配列番号2834;ORF925−1.a)に対応する:
【化5235】
【化5236】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2835):
【化5237】
これは、アミノ酸配列(配列番号2836;ORF926.ng)に対応する:
【化5238】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2837):
【化5239】
これは、アミノ酸配列(配列番号2838;ORF926)に対応する:
【化5240】
【化5241】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2839):
【化5242】
【化5243】
これは、アミノ酸配列(配列番号2840;ORF927.ng)に対応する:
【化5244】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2841):
【化5245】
これは、アミノ酸配列(配列番号2842;ORF927)に対応する:
【化5246】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF927は、N.gonorrhoeae由来のORF(ORF927.ng)と243アミノ酸重複にわたって94.2%の同一性を示す:
【化5247】
【化5248】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2843):
【化5249】
これは、アミノ酸配列(配列番号2844;ORF927.a)に対応する:
【化5250】
【化5251】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2845):
【化5252】
これは、アミノ酸配列(配列番号2846;ORF929.ng)に対応する:
【化5253】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2847):
【化5254】
【化5255】
これは、アミノ酸配列(配列番号2848;ORF929)に対応する:
【化5256】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF929は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF929.ng)と487アミノ酸重複にわたって98.8%の同一性を示す:
【化5257】
【化5258】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2849):
【化5259】
これは、アミノ酸配列(配列番号2850;ORF929.a)に対応する:
【化5260】
【化5261】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2851):
【化5262】
これは、アミノ酸配列(配列番号2852;ORF930)に対応する:
【化5263】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2853):
【化5264】
これは、アミノ酸配列(配列番号2854;ORF930−1.ng)に対応する:
【化5265】
【化5266】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2855):
【化5267】
これは、アミノ酸配列(配列番号2856;ORF930−1)に対応する:
【化5268】
【化5269】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2857):
【化5270】
これは、アミノ酸配列(配列番号2858;ORF931.ng)に対応する:
【化5271】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2859):
【化5272】
これは、アミノ酸配列(配列番号2860;ORF931)に対応する:
【化5273】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF931は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF931.ng)と185アミノ酸重複にわたって91.9%の同一性を示す:
【化5274】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2861):
【化5275】
【化5276】
これは、アミノ酸配列(配列番号2862;ORF931.a)に対応する:
【化5277】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2863):
【化5278】
これは、アミノ酸配列(配列番号2864;ORF932)に対応する:
【化5279】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF932は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF932.ng)と アミノ酸重複にわたって %の同一性を示す:
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2865):
【化5280】
【化5281】
これは、アミノ酸配列(配列番号2866;ORF934.ng)に対応する:
【化5282】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2867):
【化5283】
これは、アミノ酸配列(配列番号2868;ORF934)に対応する:
【化5284】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF934は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF934.ng)と205アミノ酸重複にわたって91.7%の同一性を示す:
【化5285】
【化5286】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2869):
【化5287】
これは、アミノ酸配列(配列番号2870;ORF934.a)に対応する:
【化5288】
【化5289】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2871):
【化5290】
これは、アミノ酸配列(配列番号2872;ORF935)に対応する:
【化5291】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2873):
【化5292】
【化5293】
これは、アミノ酸配列(配列番号2874;ORF935.a)に対応する:
【化5294】
【化5295】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2875):
【化5296】
これは、アミノ酸配列(配列番号2876;ORF936.ng)に対応する:
【化5297】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2877):
【化5298】
これは、アミノ酸配列(配列番号2878;ORF936)に対応する:
【化5299】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF936は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF936.ng)と128アミノ酸重複にわたって93.8%の同一性を示す:
【化5300】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2879):
【化5301】
これは、アミノ酸配列(配列番号2880;ORF936.a)に対応する:
【化5302】
【化5303】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2881):
【化5304】
これは、アミノ酸配列(配列番号2882;ORF936−1.ng)に対応する:
【化5305】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2883):
【化5306】
これは、アミノ酸配列(配列番号2884;ORF936−1)に対応する:
【化5307】
【化5308】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2885):
【化5309】
これは、アミノ酸配列(配列番号2886;ORF936−1.a)に対応する:
【化5310】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2887):
【化5311】
【化5312】
これは、アミノ酸配列(配列番号2888;ORF937.ng)に対応する:
【化5313】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2889):
【化5314】
これは、アミノ酸配列(配列番号2890;ORF937)に対応する:
【化5315】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF937は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF937.ng)と289アミノ酸重複にわたって86.9%の同一性を示す:
【化5316】
【化5317】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2891):
【化5318】
これは、アミノ酸配列(配列番号2892;ORF937.a)に対応する:
【化5319】
【化5320】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2893):
【化5321】
これは、アミノ酸配列(配列番号2894;ORF939)に対応する:
【化5322】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2895):
【化5323】
これは、アミノ酸配列(配列番号2896;ORF939.a)に対応する:
【化5324】
【化5325】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2897):
【化5326】
これは、アミノ酸配列(配列番号2898;ORF950.ng)に対応する:
【化5327】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2899):
【化5328】
これは、アミノ酸配列(配列番号2900;ORF950)に対応する:
【化5329】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF950は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF950)と112アミノ酸重複にわたって86.6%の同一性を示す:
【化5330】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2901):
【化5331】
これは、アミノ酸配列(配列番号2902;ORF950.a)に対応する:
【化5332】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性)
ORF950は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF950)と102アミノ酸重複にわたって100.0%の同一性を示す:
【化5333】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2903):
【化5334】
これは、アミノ酸配列(配列番号2904;ORF951.ng)に対応する:
【化5335】
【化5336】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2905):
【化5337】
これは、アミノ酸配列(配列番号2906;ORF791)に対応する:
【化5338】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF951は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF951)と616アミノ酸重複にわたって88.6%の同一性を示す:
【化5339】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2907):
【化5340】
これは、アミノ酸配列(配列番号2908;ORF951.a)に対応する:
【化5341】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF951は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF951)と614アミノ酸重複にわたって96.4%の同一性を示す:
【化5342】
【化5343】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2909):
【化5344】
【化5345】
これは、アミノ酸配列(配列番号2910;ORF952.ng)に対応する:
【化5346】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2911):
【化5347】
これは、アミノ酸配列(配列番号2912;ORF952)に対応する:
【化5348】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF952は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF952)と201アミノ酸重複にわたって92.5%の同一性を示す:
【化5349】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2913):
【化5350】
【化5351】
これは、アミノ酸配列(配列番号2914;ORF952.a)に対応する:
【化5352】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性)
ORF952は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF952)と218アミノ酸重複にわたって97.7%の同一性を示す:
【化5353】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2915):
【化5354】
これは、アミノ酸配列(配列番号2916;ORF953.ng)に対応する:
【化5355】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2917):
【化5356】
これは、アミノ酸配列(配列番号2918;ORF953)に対応する:
【化5357】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF953は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF953)と187アミノ酸重複にわたって93.0%の同一性を示す:
【化5358】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2919):
【化5359】
【化5360】
これは、アミノ酸配列(配列番号2920;ORF953.a)に対応する:
【化5361】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性)
ORF953は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF953)と187アミノ酸重複にわたって97.3%の同一性を示す:
【化5362】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2921):
【化5363】
これは、アミノ酸配列(配列番号2922;ORF954)に対応する:
【化5364】
【化5365】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2923):
【化5366】
これは、アミノ酸配列(配列番号2924;ORF957.ng)に対応する:
【化5367】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2925):
【化5368】
これは、アミノ酸配列(配列番号2926;ORF957)に対応する:
【化5369】
【化5370】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF957は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF957)と331アミノ酸重複にわたって95.2%の同一性を示す:
【化5371】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2927):
【化5372】
【化5373】
これは、アミノ酸配列(配列番号2928;ORF957.a)に対応する:
【化5374】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性)
ORF957は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF957)と377アミノ酸重複にわたって96.3%の同一性を示す:
【化5375】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2929):
【化5376】
【化5377】
これは、アミノ酸配列(配列番号2930;ORF958.ng)に対応する:
【化5378】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2931):
【化5379】
【化5380】
これは、アミノ酸配列(配列番号2932;ORF958)に対応する:
【化5381】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF958は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF958)と802アミノ酸重複にわたって89.3%の同一性を示す:
【化5382】
【化5383】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2933):
【化5384】
これは、アミノ酸配列(配列番号2934;ORF958,a)に対応する:
【化5385】
【化5386】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性)
ORF957は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF957)と377アミノ酸重複にわたって96.3%の同一性を示す:
【化5387】
【化5388】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2935):
【化5389】
これは、アミノ酸配列(配列番号2936;ORF959.ng)に対応する:
【化5390】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2937):
【化5391】
これは、アミノ酸配列(配列番号2938;ORF959)に対応する:
【化5392】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF959は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF959)と108アミノ酸重複にわたって95.4%の同一性を示す:
【化5393】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2939):
【化5394】
これは、アミノ酸配列(配列番号2940;ORF959.a)に対応する:
【化5395】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性)
ORF959は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF959)と108アミノ酸重複にわたって94.4%の同一性を示す:
【化5396】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2941):
【化5397】
【化5398】
これは、アミノ酸配列(配列番号2942;ORF960)に対応する:
【化5399】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2943):
【化5400】
これは、アミノ酸配列(配列番号940;ORF2944)に対応する:
【化5401】
【化5402】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2945):
【化5403】
これは、アミノ酸配列(配列番号2946;ORF972)に対応する:
【化5404】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2947):
【化5405】
【化5406】
これは、アミノ酸配列(配列番号2948;ORF972.a)に対応する:
【化5407】
【化5408】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2949):
【化5409】
これは、アミノ酸配列(配列番号2950;ORF973.ng)に対応する:
【化5410】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2951):
【化5411】
【化5412】
これは、アミノ酸配列(配列番号2952;ORF973)に対応する:
【化5413】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF973は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF973.ng)と274アミノ酸重複にわたって95.6%の同一性を示す:
【化5414】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2953):
【化5415】
【化5416】
これは、アミノ酸配列(配列番号2954;ORF973.a)に対応する:
【化5417】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2955):
【化5418】
これは、アミノ酸配列(配列番号2956;ORF981.ng)に対応する:
【化5419】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2957):
【化5420】
これは、アミノ酸配列(配列番号2958;ORF981)に対応する:
【化5421】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2959):
【化5422】
これは、アミノ酸配列(配列番号2960;ORF981.a)に対応する:
【化5423】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2961):
【化5424】
これは、アミノ酸配列(配列番号2962;ORF982.ng)に対応する:
【化5425】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2963):
【化5426】
【化5427】
これは、アミノ酸配列(配列番号2964;ORF982)に対応する:
【化5428】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化5429】
【化5430】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2965):
【化5431】
【化5432】
これは、アミノ酸配列(配列番号2966;ORF982.a)に対応する:
【化5433】
【化5434】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2967):
【化5435】
【化5436】
これは、アミノ酸配列(配列番号2968;ORF986.ng)に対応する:
【化5437】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2969):
【化5438】
これは、アミノ酸配列(配列番号2970;ORF986)に対応する:
【化5439】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化5440】
【化5441】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2971):
【化5442】
これは、アミノ酸配列(配列番号2972;ORF986.a)に対応する:
【化5443】
【化5444】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2973):
【化5445】
【化5446】
これは、アミノ酸配列(配列番号2974;ORF987.ng)に対応する:
【化5447】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2975):
【化5448】
【化5449】
これは、アミノ酸配列(配列番号2976;ORF987)に対応する:
【化5450】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化5451】
【化5452】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2977):
【化5453】
これは、アミノ酸配列(配列番号550;ORF2978.a)に対応する:
【化5454】
【化5455】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2979):
【化5456】
【化5457】
これは、アミノ酸配列(配列番号2980;ORF988.ng)に対応する:
【化5458】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2981):
【化5459】
【化5460】
これは、アミノ酸配列(配列番号2982;ORF988)に対応する:
【化5461】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化5462】
【化5463】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2983):
【化5464】
【化5465】
これは、アミノ酸配列(配列番号2984;ORF988.a)に対応する:
【化5466】
【化5467】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2985):
【化5468】
【化5469】
これは、アミノ酸配列(配列番号2986;ORF989.ng)に対応する:
【化5470】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2987):
【化5471】
これは、アミノ酸配列(配列番号2988;ORF989)に対応する:
【化5472】
【化5473】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
【化5474】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2989):
【化5475】
【化5476】
これは、アミノ酸配列(配列番号2990;ORF989.a)に対応する:
【化5477】
【化5478】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2991):
【化5479】
これは、アミノ酸配列(配列番号2992;ORF990)に対応する:
【化5480】
【化5481】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2993):
【化5482】
これは、アミノ酸配列(配列番号2994;ORF990.a)に対応する:
【化5483】
【化5484】
【化5485】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号2995):
【化5486】
これは、アミノ酸配列(配列番号2996;ORF992.ng)に対応する:
【化5487】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2997):
【化5488】
これは、アミノ酸配列(配列番号2998;ORF992)に対応する:
【化5489】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF992は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF992)と233アミノ酸重複にわたって96.1%の同一性を示す:
【化5490】
【化5491】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号2999):
【化5492】
これは、アミノ酸配列(配列番号3000;ORF992.a)に対応する:
【化5493】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性)
ORF992は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF992)と233アミノ酸重複にわたって100.0%の同一性を示す:
【化5494】
【化5495】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号3001):
【化5496】
これは、アミノ酸配列(配列番号3002;ORF993.ng)に対応する:
【化5497】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号3003):
【化5498】
これは、アミノ酸配列(配列番号3004;ORF993)に対応する:
【化5499】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF993は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF993)と248アミノ酸重複にわたって93.1%の同一性を示す:
【化5500】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号3005):
【化5501】
これは、アミノ酸配列(配列番号3006;ORF993.a)に対応する:
【化5502】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性)
ORF993は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF993)と248アミノ酸重複にわたって97.6%の同一性を示す:
【化5503】
【化5504】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号3007):
【化5505】
これは、アミノ酸配列(配列番号3008;ORF996.ng)に対応する:
【化5506】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号3009):
【化5507】
これは、アミノ酸配列(配列番号3010;ORF996)に対応する:
【化5508】
【化5509】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF996は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF996)と207アミノ酸重複にわたって98.1%の同一性を示す:
【化5510】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号3011):
【化5511】
これは、アミノ酸配列(配列番号3012;ORF996.a)に対応する:
【化5512】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性)
ORF996は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF996)と207アミノ酸重複にわたって100.0%の同一性を示す:
【化5513】
【化5514】
以下の部分的DNA配列は、N.gonorrhoeae中で同定された(配列番号3013):
【化5515】
これは、アミノ酸配列(配列番号3014;ORF997.ng)に対応する:
【化5516】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号3015):
【化5517】
【化5518】
これは、アミノ酸配列(配列番号3016;ORF997)に対応する:
【化5519】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.gonorrhoeae由来の推定ORFとの相同性)
ORF997は、N.gonorrhoeae由来の推定ORF(ORF997)と351アミノ酸重複にわたって96.0%の同一性を示す:
【化5520】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号3017):
【化5521】
これは、アミノ酸配列(配列番号3018;ORF997.a)に対応する:
【化5522】
このアミノ酸配列のコンピューター解析は、以下の結果を与えた:
(N.meningitidis由来の推定ORFとの相同性)
ORF997は、N.meningitidis由来の推定ORF(ORF997)と437アミノ酸重複にわたって98.2%の同一性を示す:
【化5523】
【化5524】
以下の部分的DNA配列は、N.meningitidis中で同定された(配列番号3019):
【化5525】
これは、アミノ酸配列(配列番号3020;ORF999)に対応する:
【化5526】
前述の実施例は、本発明を例示することが意図され、本発明を限定することは意図されない。
【図面の簡単な説明】
【図1】
図1は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF919のタンパク質発現および精製産物を示す。
【図2】
図2は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF279のタンパク質発現および精製産物を示す。
【図3】
図3は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF576−1のタンパク質発現および精製産物を示す。
【図4】
図4は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF519−1のタンパク質発現および精製産物を示す。
【図5】
図5は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF121−1のタンパク質発現および精製産物を示す。
【図6】
図6は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF128−1のタンパク質発現および精製産物を示す。
【図7】
図7は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF206のタンパク質発現および精製産物を示す。
【図8】
図8は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF287のタンパク質発現および精製産物を示す。
【図9】
図9は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF406のタンパク質発現および精製産物を示す。
【図10】
図10は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF919のタンパク質発現産物の親水性プロット、抗原性指数、およびAMPHI領域を示す。
【図11】
図11は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF279のタンパク質発現産物の親水性プロット、抗原性指数、およびAMPHI領域を示す。
【図12】
図12は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF576−1のタンパク質発現産物の親水性プロット、抗原性指数、およびAMPHI領域を示す。
【図13】
図13は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF519−1のタンパク質発現産物の親水性プロット、抗原性指数、およびAMPHI領域を示す。
【図14】
図14は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF121−1のタンパク質発現産物の親水性プロット、抗原性指数、およびAMPHI領域を示す。
【図15】
図15は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF128−1のタンパク質発現産物の親水性プロット、抗原性指数、およびAMPHI領域を示す。
【図16】
図16は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF206のタンパク質発現産物の親水性プロット、抗原性指数、およびAMPHI領域を示す。
【図17】
図17は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF287のタンパク質発現産物の親水性プロット、抗原性指数、およびAMPHI領域を示す。
【図18】
図18は、クローン化されそしてE.coli中で発現される、推定ORF406のタンパク質発現産物の親水性プロット、抗原性指数、およびAMPHI領域を示す。
【図19】
図19は、ORF225とNeisseriaのいくつかの株のアミノ酸配列のアラインメントの比較を示す。黒い影は相同な領域を示し、そして灰色の影は、類似した特徴を有するアミノ酸の保存を示す。この図は、さらにワクチンおよび診断の両方のための抗原としてその有効性が確認される、種々の株間での高度な保存を示す。
【図20】
図20は、ORF235とNeisseriaのいくつかの株のアミノ酸配列のアラインメントの比較を示す。黒い影は相同な領域を示し、そして灰色の影は、類似した特徴を有するアミノ酸の保存を示す。この図は、さらにワクチンおよび診断の両方のための抗原としてその有効性が確認される、種々の株間での高度な保存を示す。
【図21】
図21は、ORF287とNeisseriaのいくつかの株のアミノ酸配列のアラインメントの比較を示す。黒い影は相同な領域を示し、そして灰色の影は、類似した特徴を有するアミノ酸の保存を示す。この図は、さらにワクチンおよび診断の両方のための抗原としてその利用が確認される、種々の株間での高度な保存を示す。
【図22】
図22は、ORF519とNeisseriaのいくつかの株のアミノ酸配列のアラインメントの比較を示す。黒い影は相同な領域を示し、そして灰色の影は、類似した特徴を有するアミノ酸の保存を示す。この図は、さらにワクチンおよび診断の両方のための抗原としてその有効性が確認される、種々の株間での高度な保存を示す。
【図23】
図23は、ORF919とNeisseriaのいくつかの株のアミノ酸配列のアラインメントの比較を示す。黒い影は相同な領域を示し、そして灰色の影は、類似した特徴を有するアミノ酸の保存を示す。この図は、さらにワクチンおよび診断の両方のための抗原としてその有効性が確認される、種々の株間での高度な保存を示す。
Claims (18)
- 配列番号2790からのアミノ酸配列のフラグメントを含むタンパク質であって、ここで該フラグメントが、該配列からの少なくとも7アミノ酸を含む、タンパク質。
- 配列番号2〜配列番号3020の偶数の配列番号からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、タンパク質。
- 請求項1に記載のタンパク質に対して50%以上の相同性を有する、タンパク質。
- 配列番号2〜配列番号3020の偶数の配列番号からなる群より選択されるアミノ酸配列のフラグメントを含むタンパク質であって、ここで該フラグメントが、該配列からの14以上の連続するアミノ酸を含む、タンパク質。
- 請求項1〜3のいずれか1項に記載のタンパク質に特異的に結合する、抗体。
- 請求項1〜3のいずれか1項に記載のタンパク質をコードする、核酸分子。
- 配列番号1〜配列番号3019の奇数の配列番号からなる群より選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項5に記載の核酸分子。
- 配列番号1〜配列番号3019の奇数の配列番号からなる群より選択されるヌクレオチド配列のフラグメントを含む核酸分子であって、ここで該フラグメントが、該配列からの40以上の連続するヌクレオチドを含む、核酸分子。
- 請求項6に記載の核酸分子に相補的なヌクレオチド配列を含む、核酸分子。
- 請求項7に記載の核酸分子に相補的なヌクレオチド配列を含む、核酸分子。
- 請求項8に記載の核酸分子に相補的なヌクレオチド配列を含む、核酸分子。
- 請求項1〜12のいずれかに記載のタンパク質、核酸、または抗体を含む、組成物。
- ワクチン組成物または診断用組成物である、請求項12に記載の組成物。
- 医薬品として使用するための、請求項12に記載の組成物。
- 髄膜炎菌に起因する感染の処置または予防のための医薬の製造における、請求項12に記載の組成物の、使用。
- 請求項1に記載のタンパク質を含む組成物であって、該組成物が免疫原性である、組成物。
- 請求項2に記載のタンパク質を含む組成物であって、該組成物が免疫原性である、組成物。
- 請求項3に記載のタンパク質を含む組成物であって、該組成物が免疫原性である、組成物。
Applications Claiming Priority (17)
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