CN101203529A - 来自脑膜炎/脓毒症相关性大肠杆菌的蛋白质和核酸 - Google Patents

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Abstract

本文公开了引起新生儿脑膜炎(MNEC)的大肠杆菌菌株的各种开放阅读框,以及在制备能引起对MNEC感染的免疫力的组合物中特别感兴趣的它们的子集。

Description

来自脑膜炎/脓毒症相关性大肠杆菌的蛋白质和核酸
本文引用的所有文献均以其全文纳入本文中作为参考。
相关申请
本申请要求于2005年2月18日提交的美国临时申请号60/654,632和2005年8月29日提交的美国临时申请号60/712,720的优先权,以其全文纳入本文中作为参考。
技术领域
本发明属于大肠杆菌(E.coli)生物学领域,具体涉及能引起对肠外病原性大肠杆菌(ExPEC)菌株产生免疫的免疫原。
背景技术
很少有微生物具有如大肠杆菌般的多用途。同时作为哺乳动物正常肠道微生物区系的重要成员,其已被广泛用作重组DNA技术的宿主。然而,大肠杆菌也可能成为致命病原体。
大肠杆菌菌株通常被分为共生性或病原性,病原性菌株再分成肠内或肠外菌株。也可根据‘K’抗原分类。研究得最透彻的‘K’抗原是‘K1’,认为它是引起新生儿脑膜炎的大肠杆菌菌株中毒力的主要决定因素。K1抗原是α-2,8-连接的唾液酸的均聚物,如脑膜炎球菌血清组B的荚膜糖。更新的分类技术如多基因座酶电泳法(MLEE)将大肠杆菌分为5类系统发生组(A、B1、B2、D和E),这些分组与传统的分类不匹配。例如MLEE B1组包括共生性和病原性菌株,D组包括肠内和肠外菌株。
大肠杆菌的肠外病原性菌株(或’ExPEC’菌株[1])属于MLEE B2组和D组,包括尿路病原性(UPEC)菌株和脑膜炎/脓毒症相关性(MNEC)菌株。UPEC菌株引起尿路感染(UTI),为膀胱炎的常见原因。它们还引起肾盂肾炎(及其并发症如脓毒症)和尿导管相关感染。MNEC菌株引起病例致死率范围在25%-40%的新生儿脑膜炎(每1000个活新生儿中出现0.1例),还引起大约1/6的脓毒症病例。
最早的ExPEC疫苗基于细胞裂解物或细胞结构。SOLCOUROVACTM包括10种不同的热杀细菌,包括6种ExPEC菌株,参考文献2中报道了成功的II期临床实验。URO-VAXOMTM是一种含有18种选择的大肠杆菌菌株的冻干细菌裂解物的口服片剂疫苗[3]。Baxter Vaccines研制出一种基于6-10种不同菌株来源的菌毛的UTI疫苗,但该产品已被放弃。MedImmune研制出的一种基于FimH粘附素复合物的名为MEDI516的产品显示效力不够。而且,这种疫苗存在影响正常肠道菌丛中的非病原性FimH+ve菌株的风险,同时,由于其膀胱特异性粘附机制,预计这种疫苗仅对UPEC菌株有效,而其它ExPEC菌株不受它的控制。
因此,需要一种改良的ExPEC疫苗,这包括需要从天然细胞裂解物转移到更明确的分子,以及需要鉴定适于包含入疫苗的其它抗原,尤其是那些在临床ExPEC菌株中很普遍、而在共生性菌株中不存在的抗原。在ExPEC群体中,特别需要鉴定出适用于引起对MNEC菌株产生免疫的抗原。
参考文献5报道了满足上述需要的一种方法,其发明人寻找在MLEE B2类型和D类型的基因组中存在但在MLEE A类型和B1类型中不存在的基因。基于扣除杂交的其它比较方法参见参考文献6和7。参考文献8中也鉴定了ExPEC菌株的毒力基因。参考文献9分析了UPEC大肠杆菌菌株536中的四个毒力岛(pathogenicity island)。
参考文献10采用UPEC(O6:K2:H1)菌株CFT073的基因组序列[11,12]来鉴定在非病原性大肠杆菌菌株中不存在的序列。参考文献13比较了大肠杆菌人肾盂肾炎分离物536(O6:K15:H31)(一种UPEC)的基因组序列与菌株CFT073(UPEC)、EDL933(肠出血性)和MG1655(非病原性实验菌株)的序列数据。病原性菌株的基因组序列获自数据库中的登录号AE005174、BA000007和NC-004431。非病原性菌株的序列获自登录号U00096。
本发明的目的是提供用于引起对病原性大肠杆菌菌株、具体是ExPEC菌株、更具体是MNEC菌株产生免疫的其它抗原。
发明概述
本发明者从引起新生儿脑膜炎(MNEC)的大肠杆菌中鉴定了各种开放阅读框,并且鉴定了在制备能引起对MNEC感染产生免疫的组合物中特别感兴趣的它们的子集。
本发明一方面涉及一种多肽,其包含:(a)选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO706、2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、522、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、548、550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、650、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678、680、682、684、686、688、690、692、694、696、698、700、702、704、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、754、756、758、760、762、764、766、768、770、772、774、776、778、780、782、784、786、788、790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、846、848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、872、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、898、900、902、904、906、908、910、912、914、916、918、920、922、924、926、928、930、932、934、936、938、940、942、944、946、948、950、952、954、956、958、960、962、964、966、968、970、972、974、976、978、980、982、984、986、988、990、992、994、996、998、1000、1002、1004、1006、1008、1010、1012、1014、1016、1018、1020、1022、1024、1026、1028、1030、1032、1034、1036、1038、1040、1042、1044、1046、1048、1050、1052、1054、1056、1058、1060、1062、1064、1066、1068、1070、1072、1074、1076、1078、1080、1082、1084、1086、1088、1090、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142、1144、1146、1148、1150、1152、1154、1156、1158、1160、1162、1164、1166、1168、1170、1172、1174、1176、1178、1180、1182、1184、1186、1188、1190、1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、1220、1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、1288、1290、1292、1294、1296、1298、1300、1302、1304、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390、1392、1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564、1566、1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、1598、1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770、1772、1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、1820、1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982、1984、1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、2190、2192、2194、2196、2198、2200、2202、2204、22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在第二个方面,本发明涉及一种多肽,其包含:(a)选自下组的氨基酸序列:SEQID NO 512、2454、2456、2678、2692、4596、4748、7004、7052、8168、4628和5700;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的氨基酸序列;(c)作为氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列;或(d)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列。在一个具体实施方式中,本发明这方面的多肽包含含有至少一个(a)的B细胞表位的片段。
另一方面,本发明涉及一种多肽,其包含:(a)选自下组的氨基酸序列:SEQ IDNO 8564、2728、9872、4672、5680、534、3222、3226和7004;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的氨基酸序列;(c)作为氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列;或(d)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列。在一个具体实施方式中,本发明这方面的多肽包含含有至少一个(a)的B细胞表位的片段。
本发明也涉及一种核酸,其包含:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO 705、1、3、5、7、9、11、1、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、287、289、291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、319、321、323、325、327、329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、363、365、367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513、515、517、519、521、523、525、527、529、531、533、535、537、539、541、543、545、547、549、551、553、555、557、559、561、563、565、567、569、571、573、575、577、579、581、583、585、587、589、591、593、595、597、599、601、603、605、607、609、611、613、615、617、619、621、623、625、627、629、631、633、635、637、639、641、643、645、647、649、651、653、655、657、659、661、663、665、667、669、671、673、675、677、679、681、683、685、687、689、691、693、695、697、699、701、703、707、709、711、713、715、717、719、721、723、725、727、729、731、733、735、737、739、741、743、745、747、749、751、753、755、757、759、761、763、765、767、769、771、773、775、777、779、781、783、785、787、789、791、793、795、797、799、801、803、805、807、809、811、813、815、817、819、821、823、825、827、829、831、833、835、837、839、841、843、845、847、849、851、853、855、857、859、861、863、865、867、869、871、873、875、877、879、881、883、885、887、889、891、893、895、897、899、901、903、905、907、909、911、913、915、917、919、921、923、925、927、929、931、933、935、937、939、941、943、945、947、949、951、953、955、957、959、961、963、965、967、969、971、973、975、977、979、981、983、985、987、989、991、993、995、997、999、1001、1003、1005、1007、1009、1011、1013、1015、1017、1019、1021、1023、1025、1027、1029、1031、1033、1035、1037、1039、1041、1043、1045、1047、1049、1051、1053、1055、1057、1059、1061、1063、1065、1067、1069、1071、1073、1075、1077、1079、1081、1083、1085、1087、1089、1091、1093、1095、1097、1099、1101、1103、1105、1107、1109、1111、1113、1115、1117、1119、1121、1123、1125、1127、1129、1131、1133、1135、1137、1139、1141、1143、1145、1147、1149、1151、1153、1155、1157、1159、1161、1163、1165、1167、1169、1171、1173、1175、1177、1179、1181、1183、1185、1187、1189、1191、1193、1195、1197、1199、1201、1203、1205、1207、1209、1211、1213、1215、1217、1219、1221、1223、1225、1227、1229、1231、1233、1235、1237、1239、1241、1243、1245、1247、1249、1251、1253、1255、1257、1259、1261、1263、1265、1267、1269、1271、1273、1275、1277、1279、1281、1283、1285、1287、1289、1291、1293、1295、1297、1299、1301、1303、1305、1307、1309、1311、1313、1315、1317、1319、1321、1323、1325、1327、1329、1331、1333、1335、1337、1339、1341、1343、1345、1347、1349、1351、1353、1355、1357、1359、1361、1363、1365、1367、1369、1371、1373、1375、1377、1379、1381、1383、1385、1387、1389、1391、1393、1395、1397、1399、1401、1403、1405、1407、1409、1411、1413、1415、1417、1419、1421、1423、1425、1427、1429、1431、1433、1435、1437、1439、1441、1443、1445、1447、1449、1451、1453、1455、1457、1459、1461、1463、1465、1467、1469、1471、1473、1475、1477、1479、1481、1483、1485、1487、1489、1491、1493、1495、1497、1499、1501、1503、1505、1507、1509、1511、1513、1515、1517、1519、1521、1523、1525、1527、1529、1531、1533、1535、1537、1539、1541、1543、1545、1547、1549、1551、1553、1555、1557、1559、1561、1563、1565、1567、1569、1571、1573、1575、1577、1579、1581、1583、1585、1587、1589、1591、1593、1595、1597、1599、1601、1603、1605、1607、1609、1611、1613、1615、1617、1619、1621、1623、1625、1627、1629、1631、1633、1635、1637、1639、1641、1643、1645、1647、1649、1651、1653、1655、1657、1659、1661、1663、1665、1667、1669、1671、1673、1675、1677、1679、1681、1683、1685、1687、1689、1691、1693、1695、1697、1699、1701、1703、1705、1707、1709、1711、1713、1715、1717、1719、1721、1723、1725、1727、1729、1731、1733、1735、1737、1739、1741、1743、1745、1747、1749、1751、1753、1755、1757、1759、1761、1763、1765、1767、1769、1771、1773、1775、1777、1779、1781、1783、1785、1787、1789、1791、1793、1795、1797、1799、1801、1803、1805、1807、1809、1811、1813、1815、1817、1819、1821、1823、1825、1827、1829、1831、1833、1835、1837、1839、1841、1843、1845、1847、1849、1851、1853、1855、1857、1859、1861、1863、1865、1867、1869、1871、1873、1875、1877、1879、1881、1883、1885、1887、1889、1891、1893、1895、1897、1899、1901、1903、1905、1907、1909、1911、1913、1915、1917、1919、1921、1923、1925、1927、1929、1931、1933、1935、1937、1939、1941、1943、1945、1947、1949、1951、1953、1955、1957、1959、1961、1963、1965、1967、1969、1971、1973、1975、1977、1979、1981、1983、1985、1987、1989、1991、1993、1995、1997、1999、2001、2003、2005、2007、2009、2011、2013、2015、2017、2019、2021、2023、2025、2027、2029、2031、2033、2035、2037、2039、2041、2043、2045、2047、2049、2051、2053、2055、2057、2059、2061、2063、2065、2067、2069、2071、2073、2075、2077、2079、2081、2083、2085、2087、2089、2091、2093、2095、2097、2099、2101、2103、2105、2107、2109、2111、2113、2115、2117、2119、2121、2123、2125、2127、2129、2131、2133、2135、2137、2139、2141、2143、2145、2147、2149、2151、2153、2155、2157、2159、2161、2163、2165、2167、2169、2171、2173、2175、2177、2179、2181、2183、2185、2187、2189、2191、2193、2195、2197、2199、2201、2203、2205、22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07、8209、8211、8213、8215、8217、8219、8221、8223、8225、8227、8229、8231、8233、8235、8237、8239、8241、8243、8245、8247、8249、8251、8253、8255、8257、8259、8261、8263、8265、8267、8269、8271、8273、8275、8277、8279、8281、8283、8285、8287、8289、8291、8293、8295、8297、8299、8301、8303、8305、8307、8309、8311、8313、8315、8317、8319、8321、8323、8325、8327、8329、8331、8333、8335、8337、8339、8341、8343、8345、8347、8349、8351、8353、8355、8357、8359、8361、8363、8365、8367、8369、8371、8373、8375、8377、8379、8381、8383、8385、8387、8389、8391、8393、8395、8397、8399、8401、8403、8405、8407、8409、8411、8413、8415、8417、8419、8421、8423、8425、8427、8429、8431、8433、8435、8437、8439、8441、8443、8445、8447、8449、8451、8453、8455、8457、8459、8461、8463、8465、8467、8469、8471、8473、8475、8477、8479、8481、8483、8485、8487、8489、8491、8493、8495、8497、8499、8501、8503、8505、8507、8509、8511、8513、8515、8517、8519、8521、8523、8525、8527、8529、8531、8533、8535、8537、8539、8541、8543、8545、8547、8549、8551、8553、8555、8557、8559、8561、8563、8565、8567、8569、8571、8573、8575、8577、8579、8581、8583、8585、8587、8589、8591、8593、8595、8597、8599、8601、8603、8605、8607、8609、8611、8613、8615、8617、8619、8621、8623、8625、8627、8629、8631、8633、8635、8637、8639、8641、8643、8645、8647、8649、8651、8653、8655、8657、8659、8661、8663、8665、8667、8669、8671、8673、8675、8677、8679、8681、8683、8685、8687、8689、8691、8693、8695、8697、8699、8701、8703、8705、8707、8709、8711、8713、8715、8717、8719、8721、8723、8725、8727、8729、8731、8733、8735、8737、8739、8741、8743、8745、8747、8749、8751、8753、8755、8757、8759、8761、8763、8765、8767、8769、8771、8773、8775、8777、8779、8781、8783、8785、8787、8789、8791、8793、8795、8797、8799、8801、8803、8805、8807、8809、8811、8813、8815、8817、8819、8821、8823、8825、8827、8829、8831、8833、8835、8837、8839、8841、8843、8845、8847、8849、8851、8853、8855、8857、8859、8861、8863、8865、8867、8869、8871、8873、8875、8877、8879、8881、8883、8885、8887、8889、8891、8893、8895、8897、8899、8901、8903、8905、8907、8909、8911、8913、8915、8917、8919、8921、8923、8925、8927、8929、8931、8933、8935、8937、8939、8941、8943、8945、8947、8949、8951、8953、8955、8957、8959、8961、8963、8965、8967、8969、8971、8973、8975、8977、8979、8981、8983、8985、8987、8989、8991、8993、8995、8997、8999、9001、9003、9005、9007、9009、9011、9013、9015、9017、9019、9021、9023、9025、9027、9029、9031、9033、9035、9037、9039、9041、9043、9045、9047、9049、9051、9053、9055、9057、9059、9061、9063、9065、9067、9069、9071、9073、9075、9077、9079、9081、9083、9085、9087、9089、9091、9093、9095、9097、9099、9101、9103、9105、9107、9109、9111、9113、9115、9117、9119、9121、9123、9125、9127、9129、9131、9133、9135、9137、9139、9141、9143、9145、9147、9149、9151、9153、9155、9157、9159、9161、9163、9165、9167、9169、9171、9173、9175、9177、9179、9181、9183、9185、9187、9189、9191、9193、9195、9197、9199、9201、9203、9205、9207、9209、9211、9213、9215、9217、9219、9221、9223、9225、9227、9229、9231、9233、9235、9237、9239、9241、9243、9245、9247、9249、9251、9253、9255、9257、9259、9261、9263、9265、9267、9269、9271、9273、9275、9277、9279、9281、9283、9285、9287、9289、9291、9293、9295、9297、9299、9301、9303、9305、9307、9309、9311、9313、9315、9317、9319、9321、9323、9325、9327、9329、9331、9333、9335、9337、9339、9341、9343、9345、9347、9349、9351、9353、9355、9357、9359、9361、9363、9365、9367、9369、9371、9373、9375、9377、9379、9381、9383、9385、9387、9389、9391、9393、9395、9397、9399、9401、9403、9405、9407、9409、9411、9413、9415、9417、9419、9421、9423、9425、9427、9429、9431、9433、9435、9437、9439、9441、9443、9445、9447、9449、9451、9453、9455、9457、9459、9461、9463、9465、9467、9469、9471、9473、9475、9477、9479、9481、9483、9485、9487、9489、9491、9493、9495、9497、9499、9501、9503、9505、9507、9509、9511、9513、9515、9517、9519、9521、9523、9525、9527、9529、9531、9533、9535、9537、9539、9541、9543、9545、9547、9549、9551、9553、9555、9557、9559、9561、9563、9565、9567、9569、9571、9573、9575、9577、9579、9581、9583、9585、9587、9589、9591、9593、9595、9597、9599、9601、9603、9605、9607、9609、9611、9613、9615、9617、9619、9621、9623、9625、9627、9629、9631、9633、9635、9637、9639、9641、9643、9645、9647、9649、9651、9653、9655、9657、9659、9661、9663、9665、9667、9669、9671、9673、9675、9677、9679、9681、9683、9685、9687、9689、9691、9693、9695、9697、9699、9701、9703、9705、9707、9709、9711、9713、9715、9717、9719、9721、9723、9725、9727、9729、9731、9733、9735、9737、9739、9741、9743、9745、9747、9749、9751、9753、9755、9757、9759、9761、9763、9765、9767、9769、9771、9773、9775、9777、9779、9781、9783、9785、9787、9789、9791、9793、9795、9797、9799、9801、9803、9805、9807、9809、9811、9813、9815、9817、9819、9821、9823、9825、9827、9829、9831、9833、9835、9837、9839、9841、9843、9845、9847、9849、9851、9853、9855、9857、9859、9861、9863、9865、9867、9869、9871、9873、9875、9877、9879、9881、9883、9885、9887、9889、9891、9893、9895、9897、9899、9901、9903、9905、9907、9909、9911、9913、9915、9917、9919、9921、9923、9925、9927、9929、9931、9933、9935、9937、9939、9941、9943、9945、9947、9949、9951、9953、9955、9957、9959、9961、9963、9965、9967、9969、9971、9973、9975、9977、9979、9981、9983、9985、9987、9989;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%、并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
另一方面,本发明涉及一种核酸,其包含:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ IDNO 511、2453、2455、2677、2691、4595、4747、7003、7051、8167、4627和5699;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%、并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
另一方面,本发明涉及一种核酸,其包含:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ IDNO 8563、2727、9871、4671、5679、533、3221、3225和7003,(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%、并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
本发明也涉及编码本发明多肽的本发明核酸,还涉及本发明多肽的特异性单克隆抗体。
本发明多肽、核酸和抗体可用于药物和用于制造在患者中产生免疫应答的药物。
本发明也涉及含有与药学上可接受的载体混合的本发明多肽、核酸或抗体的药物组合物。本发明还涉及含有与药学上可接受的载体混合的两种或多种本发明多肽的药物组合物。在一个具体实施方式中,本发明药物组合物还含有疫苗佐剂。本发明还涉及含有表达或过度表达下组编码的一种或多种多肽的一种或多种外膜泡(OMV)的免疫原性组合物:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO 511、2453、2455、2677、2691、4595、4747、7003、7051、8167、4627和5699;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%、并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
本发明也涉及含有表达或过度表达下组编码的一种或多种多肽的一种或多种OMV的免疫原性组合物:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO 8563、2727、9871、4671、5679、533、3221、3225和7003;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%、并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
本发明也涉及在患者中产生免疫应答的方法,所述方法包括给予所述患者本发明药物组合物或免疫原性组合物的步骤。在一个具体实施方式中,所述免疫反应是保护性抵抗ExPEC感染,具体抵抗MNEC感染。本发明的其它方面描述如下。
附图简要说明
图1显示了用热灭活IHE3034或对照(′fisiol′)免疫后,用IHE3034刺激后随时间变化的小鼠存活率%,以及24小时后的菌血症水平(cfu/ml)。
图2显示了用热灭活细菌(上图)或ΔtolR突变体的小泡(下图)免疫后,用IHE3034刺激后的小鼠存活率%。从IHE3034菌株或对照菌株(DH5)制备免疫原。
图3显示了用IroN或对照(上图)和血清抗-IroN Ig效价(下图)免疫后,用IHE3034刺激后的小鼠存活率%。
图4类似于图3,但采用IbeA而非IroN。
发明详述
本发明者从K1/B2 MNEC菌株鉴定了4995种开放阅读框,并鉴定了在制备抵抗MNEC菌株的免疫原性组合物中特别感兴趣的它们的子集。
多肽
本发明提供了含有实施例中所述氨基酸序列的多肽。这些序列是序列表SEQ IDNO 2-9990中偶数编号的序列。
SEQ ID NO 2-9990中的优选氨基酸序列见表2。其它优选氨基酸序列是现有技术中未鉴定的序列,如参考文献5、6、7、8、9、10、11和13中未鉴定的序列。
本发明也提供了核酸序列SEQ ID NO 9991-10273中任一种或SEQ ID NO:10274内编码的多肽。核酸中的编码序列优选开始于起始密码子,终止于终止密码子。优选的多肽是现有技术中未鉴定的序列,如参考文献5、6、8、10和11中未鉴定的序列。
本发明还提供包含与实施例中公开的氨基酸序列具有序列相同性的氨基酸序列的多肽。相似地,本发明提供了含有与SEQ ID NO 9991-10273或SEQ ID NO:10274内编码的氨基酸序列有序列相同性的氨基酸序列的多肽。针对特定序列,序列相同性程度优选大于50%(如60%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高)。这些多肽包括同源物、直向同源物、等位基因变体和突变体。一般地,两种多肽序列之间相同性为50%或更高被认为是功能等效的标志。优选用MPSRCH程序(Oxford Molecular)中运行的Smith-Waterman同源性检索算法来确定多肽间的相同性,其采用带有参数缺口开放罚分=12和缺口延伸罚分=1的仿射缺口检索来进行。
与实施例的序列相比,这些多肽可包含一个或多个(如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10等)保守的氨基酸取代,即用具有相关侧链的另一种氨基酸取代原有氨基酸。遗传编码氨基酸通常分成4种家族:(1)酸性,即天冬氨酸、谷氨酸;(2)碱性,即赖氨酸、精氨酸、组氨酸;(3)非极性,即丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸;和(4)不带电荷的极性氨基酸,即甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、半胱氨酸、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸。有时将苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸一起称为芳族氨基酸。通常,这些家族中的单个氨基酸的替换不会对生物活性产生重要影响。而且,相对于参比序列,所述多肽可以有一个或多个(如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10等)单个氨基酸的缺失。而且,相对于参比序列,所述多肽可包含一个或多个(如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10等)插入(如1、2、3、4或5个氨基酸)。
优选的多肽包含那些脂质化的、位于外膜中的、位于内膜中的、或位于周质中的多肽。尤其优选的多肽是同时属于这些范畴中1种以上的多肽,如位于外膜中的脂质化多肽。翻译后加工信号肽后脂蛋白的N端半胱氨酸共价连接于脂质。
可以进行脂质化的多肽包括:SEQ ID NO:620、630、660、724、946、1196、1304、1510、1530、1548、1600、1700、1958、2030、2396、2610、3040、3364、3414、3422、3554、3678、3824、4072、4116、4178、4240、4374、4412、4462、4576、4664、4856、5178、5286、5362、5662、5682、5984、6018、6132、6256、6286、6532、6714、6754、6764、6790、6938、7144、7442、7674、7872、8278、8498、8564、8782、8784、9276和9580。SEQ ID NO 5662(ORF02831)和8564(ORF04282)是优选的脂蛋白。
优选的多肽见表2。
本发明还提供包含实施例中公开的氨基酸序列的片段的多肽。相似地,本发明提供了含有SEQ ID NO 9991-10273或SEQ ID NO:10274内编码的氨基酸序列的片段的多肽。所述片段包含该序列中至少n个连续氨基酸,针对特定序列,n为7或更大(如8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100或更大)。所述片段可包含该序列的至少一个T细胞表位,或优选地,B细胞表位。T细胞表位和B细胞表位可凭经验鉴定(如采用PEPSCAN[14、15]或类似方法)或预测(如采用Jameson-Wolf抗原性指数[16]、矩阵基方法[17]、TEPITOPE[18]、神经网络[19]、OptiMer&EpiMer[20、21]、ADEPT[22]、Tsites[23]、亲水性[24]、抗原性指数[25]或参考文献26公开的方法等)。其它优选片段为(a)本发明多肽的N端信号肽、(b)不具有N端信号肽的本发明多肽、(c)不具有1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个N端氨基酸残基的本发明多肽。
其它优选的片段为以可能的起始密码子(ATG、GTG、TTG)编码的氨基酸开始的那些片段。从所示起始密码子下游的起始密码子编码的甲硫氨酸处开始的片段为本发明多肽。
其它优选的片段为那些与本发明多肽以及与由参考文献5、6、8、10和11中的任一篇鉴定的多肽相同的片段。
本发明多肽可以许多方式制备,如化学合成(全部或部分)、用蛋白酶消化较长多肽、对RNA进行翻译、从细胞培养物(如重组表达的细胞培养物)或生物体本身(如经过细菌培养或直接来自患者的生物体)进行纯化等。制备长度<40个氨基酸的多肽的优选方法包括体外化学合成[27、28]。尤其优选固相的肽合成,如基于tBoc或Fmoc[29]化学的方法。也可部分或全部采用酶合成[30]。作为对化学合成的替代方法,还可采用生物合成,例如可以通过翻译来制备多肽。这可在体外或体内进行。生物学方法通常限于制备L氨基酸多肽,然而操控翻译机器(如氨酰基tRNA分子)可用于引入D氨基酸(或其它非天然氨基酸,如碘化酪氨酸或甲基苯丙氨酸、叠氮高丙氨酸等)[31]。然而,含有D氨基酸时,优选采用化学合成方法。可在C末端和/或N末端对本发明多肽进行共价修饰。
本发明多肽可采取各种形式(如天然、融合、糖基化、非糖基化、脂质化、非脂质化、磷酸化、非磷酸化、十四烷基化、非十四烷基化、单体、多聚体、颗粒、变性等)。
优选提供纯化或基本纯化形式,即基本上不含其它多肽(如不含天然产生的多肽),尤其是不含其它ExPEC或宿主细胞多肽的本发明多肽,通常至少约50%纯(重量),通常至少约90%纯,即其它表达多肽占该组合物的约50%以下,更优选约10%以下(如5%或更少)。本发明多肽优选为ExPEC多肽,更优选MNEC多肽。
本发明多肽可连接于固相载体。本发明多肽可包含检测标记(如放射性或荧光标记或生物素标记)。
术语“多肽”指任何长度的氨基酸聚合物。所述聚合物可以是直链或支链,它可包含修饰氨基酸,并且可被非氨基酸所中断。所述术语还涵盖经天然修饰或介入(intervention)修饰的氨基酸聚合物;例如,二硫键形成、糖基化、脂质化、乙酰化、磷酸化或任何其它操控或修饰,如与标记组分偶联。该定义还包括(例如)含有一个或多个氨基酸类似物(包括(如)非天然氨基酸等)以及其它本领域公知修饰的多肽。多肽可以单链或结合链的形式存在。本发明多肽可以是天然或人工糖基化的多肽(即所述多肽的糖基化模式与在相应的天然产生多肽中发现的糖基化模式不同)。
本发明多肽的长度可以是至少40个氨基酸(如至少40、50、60、70、80、90、100、120、140、160、180、200、220、240、260、280、300、350、400、450、500或更多)。本发明多肽可短于500个氨基酸(如不超过40、50、60、70、80、90、100、120、140、160、180、200、220、240、260、280、300、350、400或450个氨基酸)。
本发明提供的多肽包含序列-X-Y-或-Y-X-,其中:-X-为上述定义的氨基酸序列,-Y-并非上述定义的序列,即本发明提供融合蛋白。当多肽编码序列的N末端密码子并非ATG时,所述密码子将会按照该密码子的标准氨基酸进行翻译而不是翻译成Met,这种情况发生在该密码子翻译成起始密码子时。
本发明提供一种制备本发明多肽的方法,包括在诱导多肽表达的条件下培养本发明的宿主细胞的步骤。
本发明提供一种制备本发明多肽的方法,其中所述多肽部分或完全用化学方法合成。
本发明提供一种含有两种或多种(如2、3、4、5、6或更多种)本发明多肽的组合物。可选择不同多肽,以使它们参与不同的细菌代谢和/或信号转导途径,如从2、3、4、5、6或更多种以下分类中选择:粘附素;自体转运蛋白;毒素;摄铁蛋白(ironacquisitions protein);和膜结合蛋白,具体包括完整的外膜蛋白。这种抗原组合可靶向对抗细菌生活周期的不同方面的免疫应答,产生更有效的免疫应答。
本发明还提供一种以通式NH2-A-[-X-L-]n-B-COOH表示的杂交多肽,其中X为上述定义的本发明多肽,L为任选的接头氨基酸序列,A为任选的N末端氨基酸序列,B为任选的C末端氨基酸序列,n为大于1的整数。n值在2和x之间,x值一般为3、4、5、6、7、8、9或10。优选地,n为2、3或4;更优选地为2或3;最优选地,n=2。在每种n的例子中,-X-可以相同或不同。在[-X-L-]的每种n的例子中,接头氨基酸序列-L-可有或无。例如,当n=2时,该杂交体可以是NH2-X1-L1-X2-L2-COOH、NH2-X1-X2-COOH、NH2-X1-L1-X2-COOH、NH2-X1-X2-L2-COOH等。接头氨基酸序列-L-一般为短序列(如20个或更少氨基酸,即19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1个)。例子包括有助于克隆的短肽序列、聚甘氨酸接头(即Glyn,其中n=2、3、4、5、6、7、8、9、10或更大)、和组氨酸标签(即Hisn,其中n=3、4、5、6、7、8、9、10或更大)。其它合适的接头氨基酸序列对本领域技术人员而言是显而易见的。-A-和-B-为任选序列,一般为短序列(如40个或更少氨基酸,即39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1个)。例子包括指导多肽运输的前导序列,或有助于克隆或纯化的短肽序列(如组氨酸标签,即Hisn,其中n=3、4、5、6、7、8、9、10或更大)。其它合适的N末端和C末端氨基酸序列对本领域技术人员而言是显而易见的。
可采用各种试验来评估本发明多肽的体内免疫原性。例如,多肽可重组表达并通过免疫印迹法用来筛选患者血清。多肽和患者血清之间发生阳性反应说明患者以前对所研究蛋白产生了免疫应答,即该蛋白为免疫原。这种方法还可用来鉴定优势免疫蛋白。
抗体
本发明提供与本发明多肽结合的抗体。它们可以是多克隆或单克隆抗体,并可由任何合适方法制备(如通过重组表达)。为了增加其与人免疫系统的相容性,所述抗体可以是嵌合抗体或人源化抗体[如,参考文献32和33],或可采用完全人抗。所述抗体可以包含检测标记(如用于诊断试验)。本发明抗体可以连接于固相载体。本发明抗体优选为中和抗体。
单克隆抗体对鉴定和纯化与之结合的单独多肽尤其有用。本发明的单克隆抗体也可以用作免疫测定、放射性免疫试验(RIA)或酶联免疫吸附试验(ELISA)等的试剂。在这些应用中,可用分析检测试剂如放射性同位素、荧光分子或酶标记抗体。以上述方法制备的单克隆抗体还可用于本发明多肽的分子鉴定或表征(表位作图)。
本发明抗体优选对大肠杆菌的ExPEC菌株具有特异性,即,相对于其它细菌(如,相对于非ExPEC大肠杆菌和相对于非大肠杆菌细菌),它们优选地与ExPEC大肠杆菌结合。更优选地,所述抗体对MNEC菌株具有特异性,即相对于其它细菌,包括相对于其它ExPEC大肠杆菌,它们优选地与MNEC细菌结合。
本发明抗体优选地以纯化或基本纯化形式提供。一般地,抗体存在于基本上不含其它多肽的组合物中,如组合物中其它多肽少于90%(重量),通常少于60%,更通常少于50%。
本发明抗体可以是任何同种型(如IgA、IgG、IgM,即α、γ或μ重链),然而通常为IgG。在IgG同种型中,抗体可以是IgG1、IgG2、IgG3、IgG4亚类。本发明抗体可具有κ或λ轻链。
本发明抗体可具有各种形式,包括完整抗体,抗体片段如F(ab’)2和F(ab)片段、Fv片段(非共价异二聚体)、单链抗体(如单链Fv分子(scFv))、小抗体、寡抗体(oligobody)等。术语“抗体”不暗指任何特定来源,并包括由非常规方法(如噬菌体呈现)所获得的抗体。
本发明提供一种检测本发明多肽的方法,包括如下步骤:(a)在适于形成抗体-抗原复合物的条件下将生物样品与本发明抗体接触;和(b)检测所述复合物。
本发明提供一种检测本发明抗体的方法,包括如下步骤:(a)在适于形成抗体-抗原复合物的条件下将生物样品(如血液或血清样品)与本发明多肽接触;和(b)检测所述复合物。
优选抗体与本发明多肽结合的亲和力明显大于本领域公知抗体。优选地,该亲和力至少比本领域公知抗体强1.5倍、2倍、5倍、10倍、100倍、103倍、104倍、105倍、106倍等。
核酸
本发明还提供包含编码本发明多肽的核苷酸序列的核酸(如SEQ ID NO:1-9989的奇数编码)。本发明也提供含有SEQ ID NO 9991-10273中任一项的核酸。本发明还提供包含与所述核苷酸序列有序列相同性的核苷酸序列的核酸。序列之间的相同性优选用上述Smith-Waterman同源检索算法确定。对于具体序列,序列相同性程度优选大于50%(如60%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高)。
本发明还提供可与这些核酸杂交的核酸。杂交反应可以在不同“严格”条件下进行。本领域众所周知并公开了提高杂交严格性的条件[如参考文献34第7.52页]。相关条件的例子包括(以严格性递增的顺序):培育温度:25℃、37℃、50℃、55℃和68℃;缓冲液浓度:10×SSC、6×SSC、1×SSC、0.1×SSC(其中SSC为0.15M NaCl和15mM柠檬酸盐的缓冲液)及采用其它缓冲体系的等效物;甲酰胺浓度:0%、25%、50%和75%;培育时间从5分钟到24小时;1次、2次或更多次洗涤步骤;1分钟、2分钟或15分钟的洗涤培育时间;洗涤溶液:6×SSC、1×SSC、0.1×SSC或去离子水。杂交技术及其优化为本领域公知[如见参考文献34-37等]。
一些实施方式中,本发明核酸在低严格条件下与靶点杂交;在其它实施方式中它在中等严格条件下杂交;优选实施方式中,它在高度严格条件下杂交。低严格杂交条件的示例性参数组为50℃和10×SSC。中等严格杂交条件的示例性参数组为55℃和1×SSC。高度严格杂交条件的示例性参数组为68℃和0.1×SSC。
还提供了包含这些序列片段的核酸。它们应该包含序列中的至少n个连续核苷酸,根据特定序列,n为10或更多(如12、14、15、18、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90、100、150、200或更多)。优选的片段为与本发明核酸序列和参考文献5、6、8、10和11中任一篇所鉴定的核苷酸序列相同的那些片段。
本发明提供通式5′-X-Y-Z-3′的核酸,其中:-X-为由x个核苷酸组成的核苷酸序列;-Z-为z个核苷酸组成的核苷酸序列;-Y-为由以下片段组成的核苷酸序列:(a)选自SEQ ID NO:1-9989中奇数编码的核酸序列的片段;或(b)SEQ ID NO 9991-10273中任一项的片段;(c)SEQ ID NO:10274的片段;或(d)(a)或(b)或(c)的互补物;所述核酸5′-X-Y-Z-3′不是(i)SEQ ID NO:1-9989中奇数编码的核酸或SEQ ID NO9991-10273或SEQ ID NO:10274的片段,也不是(ii)(i)的互补物。-X-和/或-Z-部分可包含启动子序列(或其互补物)。
本发明也提供了含有SEQ ID 10274的至少n个连续核苷酸的片段的核酸,其中n为10或更大,如12、14、15、18、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90、100、150、200、250、300、350、400、450、500、600、700、800、900、1000、1500、2000、3000、4000、5000、10000、100000、1000000或更大。此核酸可以是单链(至少为部分单链),以便用作杂交探针和/或扩增引物。在一些实施方式中,该片段不是、或不包含现有ExPEC序列的片段,如不是参考文献5、6、7、8、9、10、11和13中任一篇特别公开的核酸序列的片段。在其它实施方式中,该片段也是现有ExPEC序列的片段,如与参考文献5、6、7、8、9、10、11和13中任一篇特别公开的核酸序列的片段相同。
本发明包括含有与这些序列互补的序列的核酸(如作为反义链或探针,或用作引物)。
本发明核酸可用于杂交反应(如Northern杂交或Southern印迹、或用于核酸微阵列或‘基因芯片’)、扩增反应(如PCR、SDA、SSSR、LCR、TMA、NASBA等)和其它核苷酸技术。
本发明核酸可具有各种形式(如单链、双链、载体、引物、探针、标记等)。本发明核酸可以是环状或支链,然而通常为直链。除非另有限定或要求,采用核酸的本发明任何实施方式均可采用双链形式和组成该双链形式的两条互补的单链形式。引物和探针通常为单链,反义核苷酸通常也是单链。
优选以纯化或基本纯化的形式,即基本上不含其它核酸(如不含天然产生的核酸)、尤其不含其它ExPEC或宿主细胞核酸的形式提供本发明核酸,通常为至少约50%纯(重量),通常至少约90%纯。本发明核酸优选地为ExPEC核酸。
本发明核酸可以多种方式制备,如完全或部分采用化学合成(如DNA的亚磷酰胺合成),用核酸酶消化较长核酸(如限制性酶),连接基因组或cDNA文库中的较短核酸或核苷酸(如采用连接酶或聚合酶)等。
本发明核酸可以连接于固相载体(如珠子、平板、滤纸、膜、玻片、微阵列载体、树脂等)。可用(如)放射性标记或荧光标记、或生物素标记标记本发明核酸。当该核酸用于检测技术,如该核酸是引物或探针时,标记特别有用。
术语“核酸”通常包括任何长度的核苷酸的聚合形式,其包含脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸和/或其类似物。它包括DNA、RNA、DNA/RNA杂交体。它还包括DNA或RNA类似物,如含有修饰主链(如肽核酸(PNA)或硫代磷酸酯)或修饰碱基的类似物。因此本发明包括mRNA、tRNA、rRNA、核酶、DNA、cDNA、重组核酸、支链核酸、质粒、载体、探针、引物等。当本发明的核酸采用RNA形式时,它可能或可能不带有5′帽。
本发明核酸包含序列,然而它们还可以包含非ExPEC序列(如上述通式5′-X-Y-Z-3′的核酸)。这对探针而言尤其适用,从而可使探针包含与靶核酸互补的第一序列和不与靶核酸互补的第二序列。引物中的任何此类非互补序列优选位于互补序列的5′。典型的非互补序列包含限制性位点或启动子序列。
本发明的核酸可用许多方法制备,如化学合成(至少一部分),用核酸酶(如限制性酶)消化较长核酸,连接基因组或cDNA文库中的较短核酸(如采用连接酶或聚合酶)等。
本发明核酸可以是载体的一部分,即设计用于转导/转染一种或多种细胞类型的核酸构建物的一部分。载体可以是,例如,设计用来分离、增殖和复制插入核苷酸的“克隆载体”,设计用来在宿主细胞中表达核苷酸序列的“表达载体”,设计用来生产重组病毒或病毒样颗粒的“病毒载体”,或包括超过一种类型的载体的属性的“穿梭载体”。优选的载体为质粒。“宿主细胞”包括单个细胞或细胞培养物,其可以作为或已经作为外源核酸的受体。宿主细胞包括单个宿主细胞的后代,并且由于天然、偶然或有意的突变和/或改变,所述后代不一定与原始亲代细胞完全相同(形态方面或总DNA互补物(complement)方面)。宿主细胞包括用本发明核酸在体内或体外转染或感染的细胞。
当核酸为DNA时,应理解,RNA序列中的“U”会被DNA中的“T”取代。相似地,当核酸为RNA时,应理解,DNA序列中的“T”会被RNA中的“U”取代。
当术语“互补物”或“互补”用于核酸时,指Watson-Crick碱基配对。因此C的互补物为G,G的互补物为C,A的互补物为T(或U),T(或U)的互补物为A。还可能使用如I(嘌呤肌苷)这样的碱基,与嘧啶(C或T)互补。所述术语还暗示了方向,即5′-ACAGT-3′的互补物为5′-ACTGT-3′而不是5′-TGTCA-3′。
本发明核酸可用于,如:制备多肽;作为在生物样品中检测核酸的杂交探针;产生核酸的额外拷贝;产生核酶或反义寡核苷酸;作为单链DNA引物或探针;或作为三链形式寡核苷酸。
本发明提供一种制备本发明核酸的方法,其中所述核酸为部分或全部采用化学方法合成的。
本发明提供包含本发明核苷酸序列的载体(如,克隆或表达载体)和转染有所述载体的宿主细胞。
本发明还提供包含用于扩增ExPEC核酸序列内所含模板序列的引物(如PCR引物)的试剂盒,所述试剂盒包括第一引物和第二引物,其中所述第一引物与所述模板序列基本互补,所述第二引物与所述模板序列的互补物基本互补,其中基本互补的所述引物部分确定了待扩增模板序列的末端。所述第一引物和/或第二引物可包括可检测标记(如荧光标记)。
本发明还提供一种试剂盒,其包括第一和第二单链寡核苷酸,其可以扩增单链或双链核酸(或其混合物)内所含的ExPEC模板核酸序列,其中:(a)所述第一寡核苷酸包含与所述模板核酸序列基本互补的引物序列;(b)所述第二寡核苷酸包含与所述模板核酸序列的互补物基本互补的引物序列;(c)所述第一寡核苷酸和/或所述第二寡核苷酸包含不与所述模板核酸互补的序列;和(d)所述引物序列确定了待扩增模板序列的末端。所述特征(c)的非互补序列优选位于所述引物序列的上游(即其5′方向)。(c)序列中一种或两种可包含限制性位点[如参考文献38]或启动子序列[如39]。第一寡核苷酸和/或第二寡核苷酸可包括可检测标记(如荧光标记)。
所述模板序列可以是基因组序列的任何部分(如SEQ ID NO:10274)。例如,可以是rRNA基因(如Turenne等(2000)J. Clin.Microbiol.38:513-520)或蛋白编码基因。所述模板序列优选为ExPEC特异性,更优选为MNEC特异性序列。
本发明也提供了计算机可读介质(如软盘、硬盘、CD-ROM、DVD等)和/或含有序列表中一个或多个序列的计算机数据库。该介质优选含有SEQ ID NO:10274。
本发明提供了检测本发明核酸的方法,所述方法包括以下步骤:(a)在杂交条件下将生物样品与本发明核酸探针接触以形成双链体;和(b)检测所述双链体。
本发明提供检测生物样品(如血液)的方法,包括如下步骤:在杂交条件下将生物样品与本发明核酸接触。所述方法可以包括核酸扩增(如,PCR、SDA、SSSR、LCR、TMA、NASBA等)或杂交(如微阵列、印迹、在溶液中与探针杂交等)。已经报道过用PCR检测临床样品中的ExPEC[如,见参考文献40]。在参考文献41中总体描述了基于核酸的临床试验。
本发明提供一种制备靶序列片段的方法,其中通过延伸核酸引物制备所述片段。所述靶序列和/或引物为本发明的核酸。所述引物延伸反应可包括核酸扩增(如,PCR、SDA、SSSR、LCR、TMA、NASBA等)。
本发明的核酸扩增可以是定量和/或实时扩增。
就本发明的某些实施方式而言,核酸长度优选为至少7个核苷酸(如8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、45、50、55、60、65、70、75、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、225、250、275、300个核苷酸或更长)。
就本发明的某些实施方式而言,核酸长度优选为至多500个核苷酸(如450、400、350、300、250、200、150、140、130、120、110、100、90、80、75、70、65、60、55、50、45、40、39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15个核苷酸或更短)。
本发明的引物和探针,以及其它用于杂交的核酸的长度优选为10-30个核苷酸(如10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30个核苷酸)。
突变细菌
本发明提供了本文所鉴定的一种或多种基因的表达已被敲除的大肠杆菌。基因敲除技术是本领域熟知的,以前报道了大肠杆菌的敲除突变体。
优选用编码区的等基因缺失进行敲除,但可采用任何其它合适技术,如启动子的缺失或突变、起始密码子的缺失或突变、反义抑制、抑制性RNA等。然而,在获得的细菌中,编码该基因产物的mRNA不存在和/或其翻译被抑制(如至野生型水平的1%以下)。
该细菌可用标记物基因取代敲除基因,如抗生素抗性标记物。
小泡
参考文献42描述了通过敲除mltA(胞壁质溶解性糖基转移酶)或大肠杆菌Tol-Pal复合物的一种或多种组分(如tolA、tolQ、tolB、pal和/或tolR)从MNEC菌株中制备小泡的方法。可以对细菌染色体进行一个或多个遗传改变或插入″特别的″附加型元件(如表达载体)来增加小泡表面保护性抗原的量和/或免疫可及性″接触″,从而改进小泡。
获得此类改进的一种方法是上调本发明多肽保护性抗原的表达。本领域熟知增加靶蛋白表达的多种不同遗传方案,它们可以分成两大类:一类依赖对染色体的修饰(如用较强的启动子替换野生型启动子、使天然抑制基因失活等)以增加内源性基因的表达,另一类则基于附加型元件(如高拷贝数质粒、携带工程改造的靶基因的载体等)或染色体中整合外源性保护性靶基因进行的重组表达。这些方法的实施例可以在参考文献44-50中找到。
提高小泡免疫原性和选择性的另一种方法是下调免疫优势非保护性抗原的表达或下调与共生菌株中找到的蛋白同源的蛋白。可以通过对LPS的脂质A部分进行脱毒降低小泡的可能毒性,从而获得进一步改进。先前描述了相似的改变,以从其它革兰阴性病原体中产生改进小泡(参见参考文献51和52)。
所有上述方案均可单独使用或联用以获得用于免疫原性组合物的改进小泡。本发明提供一种敲除了mltA和/或其Tol-Pal复合物的组分和下组中一种或多种的病原性大肠杆菌(尤其是MNEC):(i)在一种与编码本发明多肽的基因天然相连的启动子相比使本发明多肽表达水平升高的启动子的控制下编码本发明多肽的染色体基因;(ii)编码本发明多肽的自主复制的染色体外元件;和/或(iii)相对于野生型LPS减弱大肠杆菌LPS的脂质A部分毒性的遗传修饰。
本发明还提供可通过培育此类细菌获得的小泡,例如在细菌培养时,释放入培养基中的小泡。
药物组合物
本发明提供的组合物含有:(a)本发明的多肽、抗体、小泡和/或核酸;和(b)药学上可接受的载体。这些组合物可能适合用作免疫原性组合物,例如,或者用作诊断试剂,或者用作疫苗。本发明的疫苗可以是预防性疫苗或治疗性疫苗,但一般是预防性疫苗。
在一个具体方面,本发明提供了含有表达或过度表达下组编码的一种或多种多肽的一种或多种外膜泡(OMV)的免疫原性组合物:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ IDNO 511、2453、2455、2677、2691、4595、4747、7003、7051、8167、4627和5699;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%,并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
另一方面,本发明提供了含有表达或过度表达下组编码的一种或多种多肽的一种或多种外膜泡(OMV)的免疫原性组合物:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO8563、2727、9871、4671、5679、533、3221、3225和7003;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%,并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
“药学上可接受的载体”包括自身不诱导产生对接受该组合物的个体有害的抗体的任何载体。合适的载体一般为大的、代谢缓慢的大分子如蛋白质、多糖、聚乳酸、聚乙醇酸、多聚氨基酸、氨基酸共聚物、蔗糖、海藻糖、乳糖和脂质聚集体(如油滴或脂质体)。此类载体对本领域技术人员为公知技术。所述疫苗还可包含稀释剂,如水、盐水、甘油等。此外,可存在助剂,如湿润剂或乳化剂、pH缓冲物质等。无菌无热原的磷酸盐缓冲生理盐水是典型的载体。对药学上可接受赋形剂的详细讨论参见参考文献289。
本发明的组合物可包含抗微生物剂、尤其是以多剂量形式包装时。
本发明的组合物可包含去污剂,如吐温(聚山梨醇酯),例如吐温80。去污剂的含量通常很低,如<0.01%。
本发明的组合物可包含钠盐(如氯化钠)以提供涨度(tonicity)。NaCl浓度一般为10±2mg/ml。
本发明的组合物通常包含缓冲液。一般为磷酸盐缓冲液。
本发明的组合物,尤其是当其将被冻干或当它们包含由冻干材料重建获得的物质时,可包含(如)约15-50mg/ml(如25mg/ml)的糖醇(如甘露醇)或二糖(如蔗糖或海藻糖)。在冻干前可将用于冻干的组合物的pH调整为约6.1。
本发明的多肽可与其它免疫调节剂一起给药。具体说,组合物通常包含疫苗佐剂。所述佐剂可选自TH1佐剂和TH2佐剂中的一种或多种,下面进行进一步论述。可用于本发明组合物的佐剂包括,但不限于:
A.含矿物质的组合物
适合用作本发明佐剂的含矿物质的组合物包括无机盐、如铝盐和钙盐。本发明包括无机盐,如氢氧化物(例如羟基氧化物)、磷酸盐(例如羟磷酸盐、正磷酸盐)、硫酸盐等[例如参见参考文献53的第8和9章]或不同无机化合物的混合物(如,磷酸盐和氢氧化物佐剂的混合物,任选地磷酸盐过量),该化合物采用任何合适的形式(例如凝胶、晶体、无定形等),优选吸附于盐。含矿物质的组合物制成金属盐颗粒[54]。
本发明疫苗中可含有铝盐,使Al3+剂量为每剂0.2-1.0mg。
在另一实施方式中,本发明佐剂含有磷酸铝和氢氧化铝。在一个更具体的实施方式中,该佐剂中磷酸铝的含量大于氢氧化铝,如磷酸铝与氢氧化铝的重量比为2∶1、3∶1、4∶1、5∶1、6∶1、7∶1、8∶1、9∶1或大于9∶1。更具体说,疫苗中的铝盐含量为每个疫苗剂量中0.4-1.0mg,或每个疫苗剂量中0.4-0.8mg,或每个疫苗剂量中0.5-0.7mg,或每个疫苗剂量中约0.6mg。
通常,通过优化分子之间的静电吸引选择优选的铝系佐剂或多种铝系佐剂如磷酸铝与氢氧化铝的比例,以便在所需pH下该抗原携带的电荷与所述佐剂相反。例如,在pH 7.4时pI~4的磷酸铝佐剂静电吸附溶菌酶,而非白蛋白。如果白蛋白是靶点,则应选择氢氧化铝佐剂(如pH 11.4)。或者,用磷酸盐预处理氢氧化铝能降低其pI,使其成为更多碱性抗原优选的佐剂。
典型的磷酸铝佐剂为无定形羟基磷酸铝,其PO4/Al摩尔比为0.84-0.92,包括约0.6mg Al3+/ml。可以采用低剂量磷酸铝进行吸附,如每剂量每个偶联物采用50-100μg Al3+。当采用磷酸铝并且不希望使抗原吸附于佐剂时,宜在溶液中包含游离磷酸根离子(如通过采用磷酸盐缓冲液)。
B.油乳剂
适合用作本发明佐剂的油乳剂组合物包括鲨烯-水乳剂,如MF59(采用微流化机将5%鲨烯、0.5%吐温80和0.5%Span 85制成亚微米颗粒)[参考文献53的第10章;还参见参考文献55-57,参考文献58的第12章]。MF59用作FLUADTM流感病毒三价亚基疫苗的佐剂。所述乳剂宜包含柠檬酸根离子,如10mM柠檬酸钠缓冲液。
用于该组合物中的尤其优选佐剂为亚微米水包油乳剂。本发明采用的优选的亚微米水包油乳剂为鲨烯/水乳剂,任选地包含不同量的MTP-PE,如含有4-5%(重量/体积)鲨烯、0.25-1.0%(重量/体积)吐温80(聚氧乙烯山梨糖醇单油酸酯)、和/或0.25-1.0%的Span85(山梨聚糖三油酸酯)以及任选的N-乙酰胞壁酰基-L-丙氨酰基-D-异谷氨酰氨酰基-L-丙氨酸-2-(1′-2′-二棕榈酰基-sn-甘油-3-羟基磷酰氧基)-乙胺(MTP-PE)的亚微米水包油乳剂。参考文献55和59-60中详细描述了用于组合物的亚微米水包油乳剂、其制备方法和免疫刺激剂如胞壁酰肽。
可以采用鲨烯、生育酚和吐温80的乳剂。所述乳剂可包含磷酸盐缓冲盐水。还可包含Span85(如1%)和/或卵磷脂。这些乳剂可含有2-10%的鲨烯、2-10%的生育酚和0.3-3%的吐温80,并且鲨烯:生育酚的重量比优选≤1,以提供更稳定的乳剂。此类乳剂中的一种可以通过以下方法制备:将吐温80溶于PBS以获得2%溶液,然后将90ml所述溶液与5g DL-α-生育酚和5ml鲨烯的混合物混合,然后微流化所述混合物。得到的乳剂可含有(如)平均直径为100-250nm,优选约180nm的亚微米油滴。
可以采用鲨烯、生育酚和Triton去污剂(如Triton X-100)的乳剂。
可以采用鲨烯、聚山梨醇80和泊洛沙姆401(“PluronicTML121”)的乳剂。可用磷酸盐缓冲盐水,pH7.4配制所述乳剂。所述乳剂可用作胞壁酰二肽的递送载体,并与苏氨酰-MDP一起用于“SAF-1”佐剂[61](0.05-1%Thr-MDP、5%鲨烯、2.5%普朗尼克(Pluronic)L121和0.2%聚山梨醇80)。它还可以在没有苏氨酰-MDP的情况下用作“AF”佐剂[62](5%鲨烯、1.25%普朗尼克(Pluronic)L121和0.2%聚山梨醇80)。优选进行微流化。
还可将完全弗氏佐剂(CFA)和不完全弗氏佐剂(IFA)用作本发明佐剂。
C.皂苷制剂[参考文献53第22章]
皂苷制剂也可用作本发明的佐剂。皂苷为甾醇糖苷和三萜糖苷的异种组,其发现于广泛的植物种类的树皮、叶、茎、根甚至花中。分离自皂树(QuillaiaSaponaria,Molina)树皮的皂苷作为佐剂已广泛研究。在商业上,皂苷还可获自丽花菝葜(Smilax ornata)(墨西哥菝葜)、满天星(Gypsophillapaniculata)(婚纱花)和肥皂草(Saponaria officianalis)(皂根)。皂苷佐剂制剂包括纯化制剂如QS21和脂质制剂如ISCOM。
皂苷组合物采用HPLC和RP-HPLC纯化。已鉴定出采用这些技术特别纯化的部分,包括:QS7、QS17、QS18、QS21、QH-A、QH-B和QH-C。优选地,皂苷为QS21。制备QS21的一种方法示于参考文献63。皂苷制剂还可包含甾醇,如胆固醇[64]。
皂苷和胆固醇的组合可用于形成免疫刺激复合物(ISCOM)的独特颗粒[参考文献53第23章]。ISCOM通常也包含磷脂,如磷脂酰乙醇胺或磷脂酰胆碱。任何已知皂苷均可用于ISCOM。优选地,ISCOM包含一种或多种QuilA、QHA和QHC。ISCOM在参考文献64-66中进一步描述。任选地,ISCOM不含另外的去污剂[67]。
有关皂苷基佐剂的进展的综述可见参考文献68和69。
D.病毒体或病毒样颗粒
病毒体和病毒样颗粒(VLP)也可用作本发明的佐剂。这些结构通常包含一种或多种来自病毒的蛋白,所述病毒任选结合磷脂或用磷脂配制。它们通常为不致病、不复制且通常不含有任何天然病毒基因组。所述病毒蛋白可由重组方法制备或从完整病毒中分离。这些适用于病毒体或VLP的病毒蛋白包括由如下病毒衍生的蛋白:流感病毒(如HA或NA)、乙肝病毒(如核心蛋白或衣壳蛋白)、戊肝病毒、麻疹病毒、辛德比斯病毒(Sindbis)、轮状病毒、口蹄疫病毒、反转录病毒、诺沃克病毒(Norwalk)、人乳头状瘤病毒、HIV、RNA噬菌体、Qβ噬菌体(如外被蛋白)、GA噬菌体、fr噬菌体、AP205噬菌体、和Ty(如反转录转座子Ty蛋白p1)。VLP在参考文献70-75中进一步讨论。病毒体在参考文献76中进一步讨论。
E.细菌或微生物衍生物
适用于本发明的佐剂包括细菌或微生物衍生物,如肠细菌脂多糖(LPS)的非毒性衍生物、脂质A衍生物、免疫刺激性寡核苷酸和ADP核糖基化毒素及其脱毒衍生物。
LPS的非毒性衍生物包括单磷酰脂质A(MPL)和3-O-脱酰化MPL(3dMPL)。3dMPL为带有4、5或6条酰化链的3脱-O-酰化单磷酰脂质A的混合物。优选的“小颗粒”形式的3脱-O-酰化单磷酰脂质A在参考文献77中公开。此类3dMPL“小颗粒”足够小,能通过0.22μm膜进行无菌过滤[77]。其它非毒性LPS衍生物包括单磷酰脂质A模拟物,如氨烷基氨基葡糖苷磷酸衍生物,如RC529[78、79]。
脂质A衍生物包括大肠杆菌来源的脂质A的衍生物,如OM174。OM174在参考文献80和81中进行了描述。
适合用作本发明佐剂的免疫刺激性寡核苷酸包括含有CpG基序(含有通过磷酸键与鸟嘌呤连接的未甲基化胞嘧啶的二核苷酸序列)的核苷酸序列。含有回文或聚(dG)序列的双链RNA和寡核苷酸也显现出免疫刺激性。
CpG可包括核苷酸修饰/类似物,如硫代磷酸修饰并可为双链或单链。参考文献82、83和84公开了可能的类似物取代,如用2′-脱氧-7-脱氮鸟苷代替鸟苷。CpG寡核苷酸的佐剂效果在参考文献85-90中进一步讨论。
CpG序列可指向TLR9,如基序GTCGTT或TTCGTT[91]。CpG序列可特异性诱导Th1免疫应答,如CpG-A ODN,或可更特异性地诱导B细胞应答,如CpG-B ODN。CpG-A和CpG-B ODN在参考文献92-94中讨论。优选的CpG为CpG-A ODN。
优选地,构建CpG寡核苷酸使5′端能进行受体识别。可选地,两种CpG寡核苷酸以其3′端相连以形成“免疫聚体(immunomers)”。参见例如,参考文献91和95-97。
其它免疫刺激性寡核苷酸包括双链RNA、或含有回文序列的寡核苷酸、或含有聚(dG)序列的寡核苷酸。
细菌ADP-核糖基化毒素及其脱毒衍生物可用作本发明的佐剂。优选地,蛋白获自大肠杆菌(大肠杆菌热不稳定肠毒素“LT”)、霍乱(“CT”)或百日咳(“PT”)。采用脱毒ADP-核糖基化毒素作为粘膜佐剂在参考文献98中描述,作为肠道外佐剂在参考文献99中描述。毒素或类毒素优选为包含A和B亚基的全毒素形式。优选地,A亚基包含脱毒突变;B亚基优选不突变。优选地,佐剂为脱毒LT突变体,如LT-K63、LT-R72和LT-G192。采用ADP-核糖基化毒素及其脱毒衍生物,尤其是LT-K63和LT-R72作为佐剂可参见参考文献100-107。氨基酸取代的参比数字优选根据参考文献108(特别纳入本文作参考)中所列的ADP-核糖基化毒素的A和B亚基的比对得到。
式I、II或III化合物或其盐也可以用作佐剂:
I    II    III
Figure S2006800123787D00461
如参考文献109所述,如‘ER803058’、‘ER803732’、‘ER804053’、‘ER804058’、‘ER804059’、‘ER804442’、‘ER804680’、‘ER804764’、‘ER803022’或‘ER804057’例如:
Figure S2006800123787D00462
F.人免疫调制剂
适合用作本发明佐剂的人免疫调制剂包括细胞因子如白介素(如IL-1、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-12[110]等)[111]、干扰素(如干扰素γ)、巨噬细胞集落刺激因子、肿瘤坏死因子和巨噬细胞炎性蛋白-1α(MIP-1α)和MIP-1β[112]。
G.生物粘合剂和粘膜粘合剂
生物粘合剂和粘膜粘合剂也可用作本发明的佐剂。合适的生物粘合剂包括酯化透明质酸微球体[113]或粘膜粘合剂如聚(丙烯酸)、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、多糖和羧甲基纤维素的交联衍生物。壳聚糖及其衍生物也可用作本发明的佐剂[114]。
H.微粒
微粒也可用作本发明的佐剂。优选为可生物降解及无毒性物质(如聚(α羟酸)、聚羟基丁酸、聚原酸酯、聚酐、聚己酸内酯等)材料形成的颗粒(即直径在~100nm-~150μm的颗粒,更优选直径在~200nm-30μm,最优选直径在~500nm-~10μm),优选具有丙交酯乙交酯共聚物,任选处理以具有带负电表面(如用SDS处理)或带正电表面(例如用阳离子去污剂如CTAB处理)。
I.脂质体(参考文献53第13和14章)
适合用作佐剂的脂质体制剂的例子如参考文献115-117中所述。
J.聚氧乙烯醚和聚氧乙烯酯制剂
适用于本发明的佐剂包括聚氧乙烯醚和聚氧乙烯酯[118]。此类制剂进一步包括结合有辛苯昔醇的聚氧乙烯山梨聚糖酯表面活性剂[119]和结合有至少一种其它非离子表面活性剂如辛苯昔醇的聚氧乙烯烷基醚或酯表面活性剂[120]。优选的聚氧乙烯醚选自:聚氧乙烯-9-月桂基醚(laureth 9)、聚氧乙烯-9-硬脂酰醚、聚氧乙烯-8-硬脂酰醚、聚氧乙烯-4-月桂基醚、聚氧乙烯-35-月桂基醚和聚氧乙烯-23-月桂基醚。
K.磷腈如PCPP
磷腈佐剂包括参考文献121和122中所述的聚[二(羧基苯氧基)磷腈](poly[di(carboxylatophenoxy)phosphazene],“PCPP”)。
L.胞壁酰肽
适合用作本发明佐剂的胞壁酰肽的例子包括N-乙酰-胞壁酰-L-苏氨酰-D-异谷氨酰胺(thr-MDP)、N-乙酰-去甲胞壁酰-L-丙氨酰-D-异谷氨酰胺(去甲MDP)和N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酰-D-异谷氨酰胺酰-L-丙氨酸-2-(1′-2′-二棕榈酰-sn-甘油-3-羟基磷酰氧基)-乙胺(MTP-PE)。
M.咪唑并喹啉(imidazoquinolone)化合物
咪唑并喹啉佐剂包括咪喹莫特(“R-837”)[123、124]、雷西莫特(“R-848”)[125]及其类似物;和它们的盐(如盐酸盐)。关于免疫刺激性咪唑并喹啉的进一步细节可以在参考文献126-130中找到。
N.硫代缩氨基脲化合物
硫代缩氨基脲化合物的例子以及适合用作本发明佐剂的化合物的配制方法、制备方法和筛选方法包括如参考文献131所述的内容。所述硫代缩氨基脲对刺激人外周血单核细胞产生细胞因子(如TNF-α)特别有效。
O.色胺酮化合物
色胺酮化合物的例子以及适合用作本发明佐剂的化合物的配制方法、制备方法和筛选方法包括如参考文献132所述的内容。所述色胺酮化合物对刺激人外周血单核细胞产生细胞因子(如TNF-α)特别有效。
P.核苷类似物
各种核苷类似物可用作佐剂,如(a)Isatorabine(ANA-245;7-硫杂-8-氧代鸟苷)及其前药:
Figure S2006800123787D00481
(b)ANA975;(c)ANA-025-1;(d)ANA380;(e)如参考文献133-135公开的化合物;(f)具有下式的化合物:
Figure S2006800123787D00482
式中:
R1和R2各自独立地是H、卤素、-NRaRb、-OH、C1-6烷氧基、取代C1-6烷氧基、杂环基、取代杂环基、C6-10芳基、取代C6-10芳基、C1-6烷基或取代C1-6烷基;
R3不存在,或者是H、C1-6烷基、取代C1-6烷基、C6-10芳基、取代C6-10芳基、杂环基或取代杂环基;
R4和R5各自独立地是H、卤素、杂环基、取代杂环基、-C(O)-Rd、C1-6烷基、取代C1-6烷基、或结合在一起形成如R4-5所示的5元环:
Figure S2006800123787D00491
表示的化学键处实现结合
X1和X2各自独立地是N、C、O或S;
R8为H、卤素、-OH、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、-OH、-NRaRb、-(CH2)n-O-Rc、-O-(C1-6烷基)、-S(O)pRe或-C(O)-Rd
R9为H、C1-6烷基、取代C1-6烷基、杂环基、取代杂环基或R9a,其中
R9a为:
Figure S2006800123787D00493
Figure S2006800123787D00494
表示的化学键处实现结合
R10和R11各自独立地是H、卤素、C1-6烷氧基、取代C1-6烷氧基、-NRaRb或-OH;
Ra和Rb各自独立地是H、C1-6烷基、取代C1-6烷基、-C(O)Rd、C6-10芳基;
Rc各自独立地是H、磷酸、二磷酸、三磷酸、C1-6烷基或取代C1-6烷基;
Rd各自独立地是H、卤素、C1-6烷基、取代C1-6烷基、C1-6烷氧基、取代C1-6烷氧基、-NH2、-NH(C1-6烷基)、-NH(取代C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-N(取代C1-6烷基)2、C6-10芳基或杂环基;
Re各自独立地是H、C1-6烷基、取代C1-6烷基、C6-10芳基、取代C6-10芳基、杂环基或取代杂环基;
Rf各自独立地是H、C1-6烷基、取代C1-6烷基、-C(O)Rd、磷酸、二磷酸或三磷酸;
n各自独立地是0、1、2或3;
p各自独立地是0、1或2;或
或(g)(a)-(f)中任一项的药学上可接受的盐、(a)-(b)中任一项的互变异构体、或所述互变异构体的药学上可接受的盐。
Q.连到含磷酸无环主链上的脂质
包含连接于含磷酸无环主链的脂质的佐剂包括TLR4拮抗剂E5564[136、137]:
Figure S2006800123787D00501
R.小分子免疫增强剂(SMIP)
SMIP包括:
·N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2,N2-二甲基-1-(2-甲基丙基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-乙基-N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-N2-丙基-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·1-(2-甲基丙基)-N2-丙基-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-丁基-1-(2-甲基丙基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-丁基-N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-N2-戊基-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-N2-丙-2-烯基-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·1-(2-甲基丙基)-2-[(苯基甲基)硫]-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-4-胺;
·1-(2-甲基丙基)-2-(丙硫基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-4-胺;
·2-[[4-氨基-1-(2-甲基丙基)1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2基](甲基)氨基]乙醇;
·乙酸2-[[4-氨基-1-(2-甲基丙基)1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2基](甲基)氨基]乙酯;
·4-氨基-1-(2-甲基丙基)-1,3-二氢-2H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2-酮;
·N2-丁基-1-(2-甲基丙基)-N4,N4-双(苯基甲基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-丁基-N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-N4,N4-双(苯基甲基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-N4,N4-双(苯基甲基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2,N2-二甲基-1-(2-甲基丙基)-N4,N4-双(苯基甲基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·1-{4-氨基-2-[甲基(丙基)氨基]-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-1基}-2-甲基丙-2醇;
·1-[4-氨基-2-(丙基氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-1基]-2-甲基丙-2醇;
·N4,N4-二苄基-1-(2-甲氧基-2-甲基丙基)-N2-丙基-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺。
S.蛋白体
一种佐剂为由第一种革兰阴性菌制备的外膜蛋白蛋白体制备物和由第二种革兰阴性菌制备的脂糖类(liposaccharide)制备物的组合,其中所述外膜蛋白蛋白体和脂糖类制备物形成稳定的非共价佐剂复合物。此类复合物包括“IVX-908”,它是由脑膜炎奈瑟球菌(Neisseria meningitidis)外膜和脂多糖组成的复合物。它们已被用作流感疫苗的佐剂[138]。
T.其它佐剂
作为免疫刺激剂的其它物质公开于参考文献53的第7章、参考文献53和58。有用的佐剂物质还包括:
·甲基肌苷5′单磷酸(“MIMP”)[139]。
·一种多羟基化的吡咯烷士定化合物[140],如下式化合物:
Figure S2006800123787D00511
式中R选自:氢,直链或支链的、未取代或取代的、饱和或不饱和的酰基、烷基(如环烷基)、烯基、炔基或芳基、或者其药学上可接受的盐或衍生物。例子包括,但不限于:木麻黄素(casuarine)、木麻黄素-6-α-D-吡喃葡萄糖、3-表-木麻黄素、7-表-木麻黄素、3,7-二表-木麻黄素等。
·γ菊糖[141]或其衍生物,如algammulin。
·参考文献142中公开的化合物。
·参考文献143中公开的化合物,包括:酰基哌嗪化合物、吲哚二酮化合物、四氢异喹啉(tetrahydraisoquinoline,THIQ)化合物、苯并环二酮化合物、氨基氮杂乙烯基化合物、氨基苯并咪唑喹啉酮(ABIQ)化合物[144、145]、氢化邻苯二甲酰胺(hydrapthalamide)化合物、二苯甲酮化合物、异唑化合物、甾醇化合物、喹唑啉酮化合物、吡咯化合物[146]、蒽醌化合物、喹啉化合物、三嗪化合物、吡唑并嘧啶(Pyrazalopyrimidine)化合物和吲哚化合物[147]。
·罗唑利宾(7-烯丙基-8-氧代鸟苷)[148]。
·阳离子脂类和(通常为中性的)共脂如氨基丙基-二甲基-肉豆蔻酰氧基-溴化丙铵-二植烷酰基磷脂酰基-乙醇胺(“VaxfectinTM”)或氨基丙基-二甲基-双-十二烷氧基-溴化丙铵-二油酰基磷脂酰基-乙醇胺(“GAP-DLRIE:DOPE”)的制剂。优选含有(±)-N-(3-氨基丙基)-N,N-二甲基-2,3-双(顺式-9-四癸烯氧基)-1-丙铵盐的制剂。
本发明还包含上述一种或多种佐剂的组合。例如,以下组合物可用作本发明佐剂组合物:(1)皂苷和水包油乳剂[150];(2)皂苷(如QS21)+非毒性LPS衍生物(如3dMPL)[151];(3)皂苷(如QS21)+无毒性LPS衍生物(如3dMPL)+胆固醇;(4)皂苷(如QS21)+3dMPL+IL-12(可选地+甾醇)[152];(5)3dMPL与QS21和/或水包油乳剂的组合[153];(6)SAF,含有10%角鲨烷、0.4%吐温80TM、5%普朗尼克嵌段聚合物L121和thr-MDP,经微流化形成亚微米乳剂或经涡旋形成较大粒度的乳剂。(7)RibiTM佐剂体系(RAS)(Ribi免疫化学),其含有2%角鲨烯、0.2%吐温80TM和选自下组的一种或多种细菌细胞壁组分:单磷酰基脂质A(MPL)、二霉菌酸海藻糖酯(TDM)和细胞壁骨架(CWS),优选为MPL+CWS(DetoxTM);(8)一种或多种无机盐(如铝盐)+无毒性LPS衍生物(如3dMPL);和(9)一种或多种无机盐(如铝盐)+免疫刺激性寡核苷酸(如包含CpG基序的核苷酸序列)。
本发明的组合物优选地引起细胞介导免疫应答和体液免疫应答以有效地应对尿路病原性感染。所述免疫应答优选地诱导出长效(如中和)抗体和细胞介导的免疫力从而在遇到MNEC-相关抗原时能够快速应答。
通常认为两类T细胞CD4和CD8细胞是启动和/或增强细胞介导免疫和体液免疫必需的。CD8 T细胞能够表达CD8共受体,通常被称为细胞毒性T淋巴细胞(CTL)。CD8细胞能够识别MHC I类分子呈现的抗原或与之相互作用。CD4T细胞可表达CD4共受体,通常被称为T辅助细胞,CD4细胞能够识别与MHC II类分子结合的抗原性肽。通过与MHC II类分子相互作用,CD4细胞可分泌诸如细胞因子这样的因子。这些分泌的细胞因子可激活B细胞、细胞毒性T细胞、巨噬细胞和参与免疫应答的其它细胞。辅助T细胞或CD4+细胞可进一步分成两种功能不同的亚组:TH1表型和TH2表型,其不同之处在于细胞因子和效应器功能。
活化的TH1细胞增强细胞免疫(包括增加抗原特异性CTL的产量)并因此对细胞内感染的应答具有特殊价值。活化的TH1细胞可以分泌IL-2、IFN-γ和TNF-β中的一种或多种。TH1免疫应答可通过激活巨噬细胞、NK(自然杀伤)细胞和CD8细胞毒性T细胞(CTL)而导致局部炎性反应。TH1免疫应答还可通过以IL-12来刺激B细胞和T细胞的生长,从而扩展免疫应答。经TH1刺激的B细胞可分泌IgG2a。
活化的TH2细胞增加抗体产生并因此对细胞外感染的应答具有特殊价值。活化的TH2细胞可分泌IL-4、IL-5、IL-6和IL-10中的一种或多种。TH2免疫应答会导致产生IgG1、IgE、IgA和记忆B细胞,用于将来的防卫。
增强的免疫应答可包括增强的TH1免疫应答和TH2免疫应答中的一种或多种。增强的TH1免疫应答可包括CTL增加,一种或多种TH1免疫应答相关性细胞因子(如IL-2、IFN-γ和TNF-β)的增加、活化巨噬细胞的增加、NK活性的增加或IgG2a产量的增加中的一种或多种反应。优选地,增强的TH1免疫应答包括IgG2a产量的增加。增强的TH2免疫应答可包括一种或多种TH2免疫应答相关性细胞因子(如IL-4、IL-5、IL-6和IL-10)的增加、或IgG1、IgE、IgA和记忆B细胞的产量的增加中的一种或多种反应。优选地,增强的TH2免疫应答包括IgG1产量的增加。
采用TH1佐剂会引起TH1免疫应答。TH1佐剂通常引起IgG2a产量相对于无佐剂抗原免疫增加。适用于本发明的TH1佐剂可包括例如皂苷制剂、病毒体和病毒样颗粒、肠杆菌脂多糖(LPS)的无毒衍生物、免疫刺激性寡核苷酸。免疫刺激性寡核苷酸,如含有CpG基序的寡核苷酸,为优选的用于本发明的TH1佐剂。
采用TH2佐剂会引起TH2免疫应答。TH2佐剂通常引起IgG1产量相对于无佐剂抗原免疫增加。适用于本发明的TH2佐剂包括例如含矿物质的组合物、油乳剂和ADP核糖基化毒素及其脱毒衍生物。含矿物质的组合物,如铝盐为优选的适用于本发明的TH2佐剂。
优选地,本发明包括含有TH1佐剂和TH2佐剂的组合的组合物。优选地,此类组合物引起增强的TH1和增强的TH2应答,即相对于无佐剂免疫,IgG1和IgG2a的产量均有增加。更优选地,包含TH1和TH2佐剂组合的所述组合物相对于单佐剂免疫(即相对于单以TH1佐剂或单以TH2佐剂进行免疫)引起增强的TH1和/或增强的TH2免疫应答。
所述免疫应答可以是TH1免疫应答和TH2免疫应答中的一种或两种。优选地,免疫应答为增强的TH1应答和增强的TH2应答中的一种或两种。
所述增强的免疫应答可以是全身性和粘膜性免疫应答中的一种或两种。优选地,所述免疫应答为增强的全身性和增强的粘膜性免疫应答中的一种或两种。优选地,粘膜性免疫应答为TH2免疫应答。优选地,粘膜性免疫应答包括IgA产量的增加。
尤其优选采用氢氧化铝或磷酸铝佐剂,抗原通常吸附于此类盐。磷酸钙为另一种优选佐剂。
本发明的组合物的pH优选在6-8之间,优选地为大约7。采用缓冲液维持pH的稳定。当组合物包含氢氧化铝盐时,优选采用组氨酸缓冲液[154]。组合物可以是无菌和/或无热原的。本发明的组合物可与人体等渗。
所述组合物可装在小瓶中,或者它们可装在预填充的注射器中。所述注射器可以带有或不带有针头。注射器包括单剂量的组合物,而小瓶可包括单剂量或多剂量。可注射组合物通常为液体溶液或悬液。或者,其可以固态形态存在(如冻干),在注射前用液态载体溶解或悬浮。
本发明的组合物可以单位剂量形式或以多剂量形式包装。就多剂量形式而言,小瓶优于预填充注射器。可以常规方法得到有效剂量体积,但注射用组合物的人体剂量一般为0.5ml。
当本发明的组合物需要在临用前临时制备(如一组分以冻干形式存放)并以药盒形式存放时,所述药盒可包括两个小瓶,或者可包括一个预填充的注射器和一个小瓶,注射之前用注射器中的内容物将小瓶中的内容物再激活。
因此本发明提供一种试剂盒,包括第一组分和第二组分,其中:所述第一组分包含一种或多种本发明的多肽、抗体、小泡和/或核酸;所述第二组分包含下组中的一种或多种:将组合物给予患者的说明书、注射器或其它递送装置、佐剂和/或药学上可接受的配制溶液。
本发明还提供一种预填充有本发明的免疫原性组合物的递送装置(如注射器)。
用作疫苗的免疫原性组合物包括免疫学有效量的抗原、和其它任何所需组分。‘免疫学有效量’指将所述量(以单剂量给药或作为连续剂量的一部分给药)给予个体能有效治疗或预防。所述量取决于待治疗个体的健康和身体状况、年龄、待治疗个体的分类组(如非人灵长类、灵长类等)、个体免疫系统合成抗体的能力、所需保护程度、疫苗的剂型、治疗医生对医学状况的评估和其它相关因素。预计所述量将落入可通过常规试验确定的相对宽的范围内,每个剂量中每种脑膜炎球菌糖抗原的含量一般为每抗原1μg-10mg。
药物应用
本发明还提供一种治疗患者的方法,包括给予患者治疗有效量的本发明组合物。患者可能自身处于患该病的风险中或可能为孕妇(‘母体免疫’[155])。
本发明提供用作药剂(如作为免疫原性组合物或作为疫苗)或用作诊断试剂的本发明的核酸、多肽、小泡或抗体。它还提供使用本发明的核酸、多肽、小泡或抗体来制造:(i)治疗或预防由ExPEC细菌引起的疾病和/或感染的药剂;(ii)检测针对ExPEC细菌的抗体是否存在的诊断试剂;和/或(iii)能产生针对ExPEC细菌的抗体的试剂。所述ExPEC细菌可以是任何血清型或菌株,但优选为MNEC菌株,如K1血清型和/或B2MLEE型。
本发明可用于预防和/或治疗疾病如菌血症、脑膜炎、尿路感染、肾盂肾炎和/或膀胱炎。本发明尤其可用于治疗脓毒症和/或脑膜炎。
患者优选为人。人可以是儿童(如年龄为0-18岁或0-5岁),可以是青少年(如年龄为15-19岁)、成年人(如年龄为19-54岁),或者可以是老年人(如年龄为55岁或更大年纪)。女性青少年和成年人是优选的患者。打算施用于儿童或青少年的疫苗也可给予成人,(例如)以评估其安全性、剂量、免疫原性等。
其它可能的动物患者包括犬,其可能为ExPEC携带者[156、157]。
一种检验治疗性治疗效果的方法包括在给予本发明组合物之后监控感染情况。一种检验预防治疗效果的方法包括在给药后监控针对给予的多肽的免疫应答情况。本发明的组合物的免疫原性可通过如下方法确定:将它们给予测试对象(如12-16个月大的儿童、或动物模型如小鼠模型),然后确定包括ELISA效价(GMT)在内的IgG的标准参数。通常在给予该组合物大约4周后测定这些免疫应答情况,并与给予组合物之前测定的值进行比较。当给予一个以上剂量的组合物时,可进行一次以上的给药后测定。也可以用脓毒症的成年小鼠模型、UTI的小鼠模型和新生大鼠中脑膜炎的被动保护评价效力。
给予多肽抗原为一种优选的诱导免疫的治疗方式。
给予本发明的抗体为另一种优选的治疗方式。这种被动免疫方式尤其适用于新生婴儿或怀孕妇女。这一方法一般采用单克隆抗体,如人源化抗体或完整的人抗体。
本发明的组合物通常直接给予患者。直接递送可通过如下方式实现:胃肠道外注射(如皮下、腹膜内、静脉内、肌肉内或组织间隙)、直肠施用、口服(如片剂、喷雾剂)、阴道施用、局部施用、经皮施用、经皮肤施用、鼻内施用、舌下施用、眼部施用、耳部施用、肺部施用或其它粘膜施用。优选肌肉内施用到大腿或上臂。注射可通过针头(如皮下注射针头)实现,然而还可使用无针注射。典型的肌肉内剂量为0.5ml。
本发明可用于引起全身性和/或粘膜性免疫。优选地,所述全身性和/或粘膜性免疫表现为增强的TH1和/或TH2免疫应答。优选地,增强的免疫应答包括IgG1和/或IgG2a和/或IgA的产量增加。
剂量治疗可以是单剂量方案或多剂量方案。多剂量可用于初次免疫方案和/或用于加强免疫方案。加强剂量方案可接在初次剂量方案之后。在多剂量方案中,可采用同样或不同的途径,如胃肠道外初次免疫和粘膜加强免疫、粘膜初次免疫和胃肠道外加强免疫等给予各种剂量。初次剂量之间的合适间隔(如4-16周)、以及初次和加强免疫之间的合适间隔可用常规方法确定。例如,疫苗接种的初次疗程包括1-10个单独剂量,之后以维持和/或加强免疫应答所必需的时间间隔给予其它剂量,例如,第二剂在1-4个月时给予,当需要时,几个月后给予后续剂量。
细菌感染影响身体的各个部分,因此组合物可以制备成各种形式。例如,组合物可以制备为液体溶液或悬液形式的注射剂。还可制备适于在注射前溶解或悬浮于液体载体中的固体形式(如冻干或喷雾冷冻干燥的组合物)。该组合物可制备成局部给药剂型,如软膏剂、乳膏剂或粉末剂。该组合物可制备成口服给药剂型,如片剂或胶囊、喷雾剂或糖浆(任选地进行调味)。所述组合物可制备成肺部给药剂型,如使用细粉或喷雾的吸入器。所述组合物可制备成栓剂或阴道栓剂。所述组合物可制备成鼻、耳或眼给药剂型,如喷雾剂、滴剂、凝胶或粉末[如参考文献158和159]。所述组合物可以为药盒形式,设计成临近给予患者前重建成混合的组合物。此类药盒可包括一种或多种液体形式的抗原和一种或多种冻干抗原。
本发明的组合物可以在与其它疫苗基本上相同的时间(如在相同的医疗咨询或问诊期间)给予患者,如基本上与下述疫苗相同的时间:麻疹疫苗、腮腺炎疫苗、风疹疫苗、MMR疫苗、水痘疫苗、MMRV疫苗、白喉疫苗、破伤风疫苗、百日咳疫苗、DTP疫苗、偶联的b型流感嗜血杆菌(H.influenzae)疫苗、人乳头瘤病毒疫苗、灭活脊髓灰质炎病毒疫苗、乙肝病毒疫苗、肺炎球菌偶联疫苗、脑膜炎球菌偶联疫苗等。类似地,它们可在与抗生素,尤其是对MNEC有活性的抗生素化合物基本上相同的时间(如在相同的医疗咨询或问诊期间)给予患者。
本发明组合物的其它抗原组分
本发明还提供一种包含本发明多肽和一种或多种下述其它抗原的组合物:
-脑膜炎奈瑟球菌(N.meningitides)血清组A、C、W135和/或Y(优选所有四种)的糖抗原,如在参考文献160中公开的血清组C的寡糖[还参见参考文献161]或参考文献162中的寡糖。
-脑膜炎奈瑟球菌血清组B的抗原,如参考文献163-171等公开的抗原。
-肺炎链球菌(Streptococcuspneumoniae)的糖抗原[如172、173、174]。
-甲肝病毒抗原,如灭活病毒[如175、176]。
-乙肝病毒抗原,如表面抗原和/或核心抗原[如176、177]。
-白喉抗原,如白喉类毒素[如参考文献178第3章]如CRM197突变体。
-丙肝病毒的抗原[如180]。
-HIV抗原[181]。
-破伤风抗原,如破伤风类毒素[如参考文献178第4章]。
-百日咳博德特菌(Bordetella pertussis)的抗原,如百日咳博德特菌的百日咳全毒素(PT)和丝状血凝素(FHA),任选地还与百日咳杆菌黏附素(pertactin)和/或凝集原2和3混合[如参考文献182和183]。
-流感嗜血杆菌B(Haemophilus influenzae B)的糖抗原[如161]。
-骨髓灰质炎抗原[如184、185]如IPV。
-麻疹、腮腺炎和/或风疹抗原[如参考文献178第9、10和11章]。
-水痘抗原。
-流感抗原[如参考文献178第19章],如血凝素和/或神经氨酸酶表面蛋白。流感抗原可衍生自大规模流行性(每年)流感毒株。流感抗原可衍生自有可能引起大规模爆发的毒株(即与目前循环毒株的血凝素相比具有新的血凝素的流感毒株,或者对家禽具有病原性并且有可能横向传播给人群的流感毒株,或对人具有病原性的流感毒株)。流感抗原可衍生自在鸡蛋或细胞培养物中生长出来的病毒。
-卡他莫拉菌(Moraxella catarrhalis)的抗原[如186]。
-无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)(B型链球菌)的糖抗原。
-无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)(B型链球菌)的蛋白抗原[如187、188]。
-淋病奈瑟球菌(N.gonorrhoeae)的抗原[如189-192]。
-肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)的抗原[如参考文献193-199]或来自肺炎衣原体的抗原的组合[如200]。
-沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis)的抗原,或来自沙眼衣原体的抗原的组合[如201]。
-牙龈炎卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis)的抗原[如202]。
-狂犬病抗原[如203],如冻干的灭活病毒[如204,RabAvertTM]。
-副粘病毒如呼吸道合胞病毒(RSV[205、206])和/或副流感病毒(PIV3[207])的抗原。
-炭疽杆菌(Bacillus anthracis)抗原[如208、209、210]。
-酿脓链球菌(Streptococcus pyogenes)(A型链球菌)的抗原[如188、211、212]。
-金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的抗原[如213]。
-黄病毒属病毒的抗原,如黄热病病毒、日本脑炎病毒、登格热病毒的四种血清型、蜱传播性脑炎病毒、西尼罗河病毒的抗原。
-瘟病毒抗原,如经典猪热病病毒、牛病毒性腹泻病毒和/或边界病病毒的抗原。
-细小病毒,如细小病毒B19的抗原。
-人乳头瘤病毒(HPV)抗原[214]。
本组合物可包含一种或多种这些其它抗原。
优选的淋球菌抗原包括ngs13(OmpA)、OmpH、ngs576(肽基脯氨酰顺/反异构酶(PPI酶)蛋白)、ngs41和ngs117中的一种或多种。
优选的HPV抗原包括HPV16、HPV18、HPV6和HPV11中的一种或多种。
优选的沙眼衣原体抗原包括下组的一种或多种:CT045、CT089、CT242、CT316、CT381。CT396、CT398、CT444、CT467、CT547、CT587、CT823、CT761和这些抗原的特定组合,其公开于WO 05/002619。
优选的肺炎衣原体抗原包括下组的一种或多种:CPn0324、Cpn0301、Cpn0482、Cpn0503、Cpn0525、Cpn0558、Cpn0584、Cpn0800、Cpn0979、Cpn0498、Cpn0300、Cpn0042、Cpn0013、Cpn450、Cpn0661、Cpn0557、Cpn0904、Clpn0795、Cpn0186和Cpn0604以及这些抗原的特定组合,其公开于WO05/084306。
优选的GBS抗原包括GBS80、GBS104、GBS59、GBS67、GBS322和GBS276中的一种或多种。
在另一个实施方式中,将本发明抗原与适用于经设计能保护女性不得泌尿系统和/或性传播疾病的疫苗中的一种或多种其它非大肠杆菌抗原混合。例如,所述抗原可与衍生自下组的抗原混合:无乳链球菌、沙眼衣原体、淋病奈瑟球菌、乳头瘤病毒和单纯疱疹病毒。使用人乳头状瘤病毒抗原时,它们可能来自HPV16、HPV18、HPV6和/或HPV11中的一种或多种。
在另一个实施方式中,本发明的抗原组合与适用于经设计能保护老年人或免疫削弱个体的疫苗中的一种或多种其它非大肠杆菌抗原混合。例如,所述抗原组合可与衍生自下组的抗原混合:粪肠球菌(Enterococcus faecalis)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermis)、铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)、嗜肺军团菌(Legionella pneumophila)、单核细胞增生利斯特菌(Listeria monocytogenes)、脑膜炎奈瑟球菌(Neisseria meningitidies)、流感病毒和副流感病毒(‘PIV’)。
在需要时可对毒性蛋白抗原进行脱毒(如通过化学和/或遗传方法对百日咳毒素进行脱毒[183])。
该组合物中含有白喉抗原时,优选还包含破伤风抗原和百日咳抗原。类似地,在包含破伤风抗原的情况下,优选还包含白喉抗原和百日咳抗原。类似地,在包含百日咳抗原的情况下,优选还包含白喉抗原和破伤风抗原。因此优选DTP组合物。
糖抗原优选为偶联物形式。偶联物的载体蛋白包括细菌毒素(例如白喉类毒素或破伤风类毒素)、脑膜炎奈瑟球菌外膜蛋白[215]、合成肽[216、217]、热激蛋白[218、219]、百日咳蛋白[220、221]、来自流感嗜血杆菌的蛋白D[222、223]、细胞因子[224]、淋巴因子[224]、流感嗜血杆菌蛋白、激素[224]、生长因子[224]、来自艰难梭菌(C.difficile)的毒素A或毒素B[225]、摄铁蛋白[226]、含有各种病原体衍生抗原的多个人CD4+T细胞表位的人工蛋白[227]例如N19蛋白[228]、肺炎球菌表面蛋白PspA[229]、肺炎球菌溶血素[230]等。优选的载体蛋白为CRM197蛋白[231]。
该组合物中各抗原的浓度一般为至少1μg/ml。总体而言,任何给定抗原的浓度都足以引起针对该抗原的免疫应答。
优选地,抗原吸附于铝盐。
核酸免疫
上述免疫原性组合物包括来自MNEC的多肽抗原。作为将蛋白抗原用于本发明免疫原性组合物的替代方法,可以采用编码该抗原的核酸(优选为DNA,如质粒形式),以提供基于核酸免疫的组合物、方法和用途。目前核酸免疫已经是一个成熟的领域(如,参考文献232-239等),已应用于许多疫苗。
编码免疫原的核酸在被递送到患者体内后进行体内表达,表达的免疫原进而刺激免疫系统。活性成分通常采用包含以下组件的核酸载体形式:(i)启动子;(ii)编码免疫原的序列,其操作性连接于所述启动子;和任选的(iii)选择性标记。优选的载体还可包含(iv)复制起点;和(v)位于(ii)下游并与之操作性连接的转录终止子。通常,(i)和(v)为真核来源,而(iii)和(iv)为原核来源。
优选的启动子为病毒启动子,如巨细胞病毒(CMV)的启动子。除了启动子外,该载体还可包括转录调控序列(如增强子),其在功能上与启动子相互作用。优选的载体包括立即早期CMV增强子/启动子,更优选的载体还包括CMV内含子A。启动子操作性连接于编码免疫原的下游序列,从而对免疫原编码序列的表达进行控制。
使用标记时,其优选在微生物宿主中(如在原核生物中、在细菌中、在酵母中)起作用。所述标记优选为原核选择性标记(如在原核启动子的控制下转录)。方便起见,标记一般为抗生素抗性基因。
本发明的载体优选为自主复制附加型载体或自主复制染色体外载体,如质粒。
本发明的载体优选包含复制起点。优选地,所述复制起点在原核生物中有活性而在真核生物中无活性。
因此,优选的载体包括用于选择该载体的原核标记、原核性复制起点,还包括用于驱动免疫原编码序列转录的真核启动子。因此所述载体(a)在原核宿主中扩增并选择而不表达多肽,但(b)在真核宿主中表达而不扩增。这种安排对核酸免疫载体很理想。
本发明的载体可包含位于编码序列下游的真核转录终止子序列。这将提高转录水平。当编码序列自身不具有聚腺苷酸化序列时,本发明的载体优选具有该序列。优选的聚腺苷酸化序列来自牛生长激素。
本发明的载体可包含多克隆位点。
除了编码免疫原和标记的序列外,该载体可包含第二真核编码序列。所述载体在所述第二序列的上游还可包含IRES,以便从与免疫原相同的转录物翻译出第二真核多肽。或者,所述免疫原编码序列可以在IRES下游。
本发明的载体可包含未甲基化CpG基序,如未甲基化DNA序列,它们的共同之处在于胞嘧啶后接鸟苷、侧接两个5′嘌呤和两个3′嘧啶。这些DNA基序的非甲基化形式被证明为几种类型的免疫细胞的有效刺激物。
可以靶向方式递送载体。受体介导的DNA治疗技术描述于(如)参考文献240-245中。在基因治疗方法中,以约100ng-200mg的DNA量给予含有核酸的治疗组合物,以进行局部给药。在基因治疗方法中,DNA浓度范围还可以是约500ng-50mg、约1μg-2mg、约5μg-500μg和约20μg-100μg。各种因素如作用方式(如提高或抑制编码基因产物的水平)以及转化和表达效力均被认为会影响达到最终效力所需的剂量。当需要在较大组织面积上表达得更多时,为了达到阳性治疗结果,可能需要施用更大量的载体、或通过连续给药方式再次施用同样量载体、或多次施用于邻近或附近组织部位。所有这些情况中,临床试验中的常规试验可以确定达到最优疗效所需的特定范围。
可通过基因递送载体进行递送载体。所述基因递送载体可以是病毒或非病毒来源(大致参见参考文献246-249)。
用于递送所需核酸并在所需细胞中的表达的病毒载体为本领域公知。示例性病毒载体包括但不限于:重组逆转录病毒(如参考文献250-260)、α病毒载体(如辛德比斯病毒载体、塞姆利基森林病毒(ATCC VR-67;ATCC VR-1247)、罗斯河病毒(ATCCVR-373;ATCC VR-1246)和委内瑞拉马脑炎病毒(ATCC VR-923;ATCCVR-1250;ATCC VR-1249;ATCC VR-532);还可采用这些病毒的杂交体或嵌合体)、痘病毒载体(如牛痘病毒、禽痘病毒、金丝雀痘病毒、修饰的安卡拉牛痘病毒等)、腺病毒载体、和腺伴随病毒(AAV)载体(如见参考文献261-266)。还可采用与杀死的腺病毒相连的DNA进行给药[267]。
还可采用非病毒递送载体和方法,包括但不限于,单独与杀死的腺病毒连接或不连接的聚阳离子凝聚DNA[如267]、配体连接的DNA[268]、真核细胞递送载体细胞[如,参考文献269-273]和核电荷(nucleic charge)中和或与细胞膜发生融合。还可使用裸露DNA。示例性裸露DNA引入方式描述于参考文献274和275中。可作为基因递送载体的脂质体(如免疫脂质体)描述于参考文献276-280中。其它方式描述于参考文献281和282中。
适用于本发明的其它非病毒递送包括机械递送系统,如描述于参考文献282中的方式。而且,所述编码序列及其表达产物可通过光聚合水凝胶物质的沉积或采用电离辐射进行递送[如参考文献283和284]。可用于递送编码序列的其它基因递送常规方法包括,例如,采用手持式基因转移颗粒枪[285]或采用电离辐射以激活转移基因[283和286]。
采用PLG(丙交酯-乙交酯共聚物)微粒递送DNA为尤其优选的方法,如,通过将DNA吸附到经任选处理以具有负电荷表面(如用SDS处理)或正电荷表面(如用阳离子去污剂如CATB)的微粒上。
概述
所述术语“包含”涵盖“包括”及“由...组成”,如“包含”X的组合物可仅由X组成或可包括其它附加物,如X+Y。
涉及数值x的术语“约”指(例如)x±10%。
所述术语“基本上”并不排除“完全地”,如“基本上不含”Y的组合物可以是完全不含Y。在需要时,术语“基本上”可从本发明的定义中省略。
序列表中的氨基酸序列的N端残基通常为由对应核苷酸序列的第一个密码子编码的氨基酸。当第一密码子不是ATG时(如SEQ ID NO:1、7、19、39、43、49、51、55、63、73、119、127、129、137、143、145、147、149、155、159、165、173、181、183、205、209、219、221、229、235、247、263、269、271、297、303、325、327、341、345、359、363、373、395、401、413、443、447、453、459、463、465、469、473、477、479、495、505、507、517、527、533、535、537、539、549、569、575、579、581、583、587、591、593、599、613、621、635、637、643、655、661、665、669、671、681、683、687、693、707、709、721、723、729、743、757、763、765、769、781、791、793、813、817、823、837、839、855、861、865、881、885、897、907、909、911、917、921、941、949、957、965、975、977、979、981、983、989、993、997、1001、1005、1011、1015、1017、1019、1027、1029、1033、1037、1043、1051、1053、1073、1087、1097、1101、1103、1107、1113、1115、1117、1121、1123、1135、1143、1147、1149、1175、1181、1227、1263、1271、1287、1295、1305、1307、1311、1317、1323、1331、1341、1345、1349、1351、1355、1359、1363、1373、1375、1383、1399、1411、1415、1417、1423、1433、1451、1477、1483、1485、1493、1495、1501、1503、1511、1519、1521、1525、1529、1553、1559、1579、1585、1603、1609、1611、1619、1621、1623、1629、1631、1643、1653、1669、1675、1677、1687、1693、1705、1713、1717、1727、1739、1751、1763、1769、1785、1789、1799、1801、1817、1819、1825、1827、1829、1831、1833、1839、1857、1867、1911、1919、1925、1929、1939、1947、1955、1957、1979、1981、1985、1989、1993、1995、2003、2005、2009、2027、2035、2037、2047、2049、2059、2063、2079、2093、2123、2135、2139、2141、2163、2165、2173、2177、2189、2195、2197、2203、2209、2211、2241、2247、2275、2291、2321、2327、2357、2361、2373、2377、2379、2397、2399、2405、2433、2437、2443、2447、2451、2455、2457、2487、2491、2503、2505、2507、2513、2515、2521、2541、2545、2549、2553、2565、2577、2579、2591、2613、2623、2629、2631、2633、2635、2639、2641、2649、2657、2659、2661、2663、2665、2667、2669、2671、2681、2687、2689、2699、2701、2705、2713、2719、2721、2729、2735、2743、2745、2759、2781、2785、2787、2789、2795、2801、2809、2813、2815、2823、2825、2845、2847、2869、2885、2891、2897、2905、2907、2911、2913、2915、2925、2939、2945、2947、2975、2993、3015、3043、3055、3061、3063、3075、3107、3117、3127、3131、3175、3179、3191、3193、3207、3209、3213、3221、3229、3243、3253、3259、3261、3267、3283、3289、3307、3313、3331、3337、3339、3353、3357、3361、3367、3379、3381、3383、3411、3419、3429、3433、3435、3437、3445、3449、3453、3471、3491、3501、3507、3515、3559、3563、3571、3573、3577、3579、3583、3595、3607、3619、3621、3623、3625、3629、3633、3635、3637、3663、3671、3679、3685、3687、3699、3701、3707、3713、3721、3723、3739、3741、3743、3759、3763、3777、3797、3807、3811、3821、3829、3833、3855、3857、3863、3865、3867、3869、3873、3881、3891、3893、3901、3919、3925、3931、3937、3949、3951、3955、3959、3969、3973、3981、3991、4003、4013、4029、4033、4049、4057、4069、4071、4077、4081、4089、4107、4131、4139、4171、4193、4195、4199、4201、4223、4225、4245、4249、4273、4279、4281、4287、4293、4301、4319、4321、4327、4337、4351、4353、4361、4363、4365、4369、4377、4379、4387、4395、4403、4411、4417、4423、4429、4443、4463、4479、4483、4485、4493、4495、4523、4527、4529、4541、4549、4553、4563、4577、4583、4585、4595、4619、4635、4651、4677、4683、4685、4699、4703、4709、4711、4719、4751、4753、4761、4789、4803、4805、4819、4829、4833、4837、4839、4847、4851、4857、4863、4869、4887、4891、4893、4909、4925、4927、4931、4935、4939、4943、4949、4957、4963、4965、4973、5019、5033、5063、5073、5081、5083、5085、5089、5093、5113、5167、5179、5183、5193、5209、5211、5213、5227、5231、5237、5245、5273、5281、5283、5297、5299、5301、5305、5309、5329、5333、5347、5353、5365、5367、5369、5385、5389、5401、5435、5437、5439、5453、5465、5475、5515、5517、5525、5543、5545、5559、5571、5605、5611、5619、5639、5651、5655、5665、5685、5701、5715、5761、5769、5771、5775、5781、5793、5795、5801、5817、5819、5831、5855、5861、5865、5873、5887、5889、5909、5911、5927、5945、5949、5957、5959、5965、5973、5987、5997、6003、6013、6015、6023、6025、6027、6037、6063、6091、6093、6095、6097、6111、6117、6119、6135、6143、6147、6165、6177、6187、6189、6191、6195、6197、6199、6203、6223、6227、6229、6237、6245、6247、6249、6253、6255、6259、6267、6297、6305、6311、6317、6345、6361、6389、6419、6421、6435、6457、6461、6463、6467、6471、6487、6499、6535、6553、6559、6561、6565、6617、6631、6633、6643、6677、6699、6707、6733、6745、6781、6783、6789、6799、6813、6843、6847、6851、6861、6941、6943、6957、6961、6967、6973、6985、6993、6995、7021、7023、7045、7047、7051、7063、7065、7069、7077、7085、7089、7091、7097、7099、7107、7113、7123、7129、7131、7167、7191、7199、7219、7223、7241、7247、7263、7277、7289、7309、7339、7345、7383、7401、7409、7411、7413、7429、7439、7443、7455、7459、7461、7465、7477、7489、7497、7499、7513、7523、7525、7527、7533、7549、7555、7557、7567、7581、7601、7611、7615、7617、7623、7633、7641、7651、7653、7659、7665、7687、7693、7701、7709、7723、7727、7779、7789、7797、7809、7849、7859、7869、7877、7885、7891、7893、7905、7907、7917、7929、7933、7937、7943、7945、7951、7953、7969、7971、8015、8017、8027、8055、8059、8061、8069、8107、8137、8145、8149、8151、8153、8171、8179、8217、8219、8231、8239、8245、8247、8261、8269、8301、8313、8341、8365、8371、8381、8387、8393、8421、8447、8453、8455、8457、8461、8465、8471、8493、8501、8505、8515、8523、8531、8545、8575、8579、8581、8617、8645、8647、8655、8667、8677、8679、8683、8689、8691、8697、8709、8715、8721、8727、8731、8739、8745、8775、8793、8797、8807、8815、8823、8827、8833、8859、8863、8869、8889、8899、8901、8909、8913、8915、8929、8933、8935、8949、8951、8955、8967、8993、8995、8997、9003、9009、9013、9019、9033、9037、9061、9065、9067、9079、9101、9103、9123、9153、9157、9163、9185、9189、9197、9201、9223、9225、9227、9241、9243、9247、9273、9275、9281、9297、9313、9321、9331、9339、9369、9383、9385、9387、9409、9413、9435、9449、9469、9471、9491、9495、9497、9499、9503、9527、9529、9545、9547、9557、9559、9565、9577、9589、9599、9601、9603、9605、9607、9621、9633、9635、9653、9655、9663、9681、9701、9705、9717、9731、9747、9765、9797、9807、9809、9811、9831、9851、9853、9855、9875、9899、9915、9929、9931、9939、9941、9945、9949、9953、9959、9989),应该理解为当密码子用作起始密码子时应该翻译成甲硫氨酸,而当该序列位于融合伙伴的C端时应该翻译为所示的非甲硫氨酸氨基酸。本发明特别公开并涵盖序列表中每一种以N端甲硫氨酸残基(如甲酰-甲硫氨酸残基)代替任何所示非甲硫氨酸残基的氨基酸序列(如SEQ ID NO:236、662、758、770、782、792、838、918、1182、1312、1374、1632、2064、2378、2400、2456、2516、2636、2670、2682、2688、2744、3384、3702、37 14、4058、4678、4704、4804、4806、4848、6026、6112、7022、7242、7710、8582、9682)。它还特别公开并涵盖序列表中每一种从序列内部的任何甲硫氨酸残基开始的氨基酸序列。
如上所述,本发明的核酸和多肽可包括如下序列:
(a)与序列表中公开的序列相同(即100%相同)的序列;
(b)与序列表中公开的序列有序列相同性的序列;
(c)与序列(a)或(b)相比,具有分离或连续的1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个单核苷酸或氨基酸改变(缺失、插入、取代)的序列;和
(d)当采用逐对比对算法与序列表的特定序列进行比对时,x个单体(氨基酸或核苷酸)的移动窗口从起点(N端或5′)移到终点(3′C端),从而对延长至p个单体(p>x)的比对而言,有p-x+1个此类窗口,每个窗口有至少x·y个相同的比对单体,其中:x选自20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、150、200;y选自0.50、0.60、0.70、0.75、0.80、0.85、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96、0.97、0.98、0.99;并且当x·y不是整数时四舍五入为整数。优选的逐对比对算法为Needleman-Wunsch全局比对算法[287],采用默认参数(如开口开放罚分=10.0,开口延伸罚分=0.5,采用EBLOSUM62评分距阵)的。用EMBOSS软件包中的Needle工具很方便地实施该算法[288]。
本发明的核酸和多肽还可能在序列(a)-(d)的N端/5′和/或C端/3′处连有其它序列。
除非另有说明,本发明的实施将采用本领域技术人员能够实施的常规的化学方法、生物化学方法、分子生物学方法、免疫学方法和药理学方法。此类技术已在参考文献中得到充分阐述。见,如,参考文献289-296等。
实验
下面是实施本发明的具体实施方式的例子。所述例子仅为说明性使用,而不以任何方式限制本发明的范围。
我们努力保证所用数值(如量、温度等)的精确性,然而还是应该允许一些实验性误差和偏差。
实施本发明的方式
MNEC菌株IHE3034
IHE3034是已知的MNEC致病型大肠杆菌菌株。参考文献297的表1报道,IHE3034分为O18:K1:H7/9血清型,属于ECOR B2类。已知水平转移的DNA元件上的毒力相关性基因是sfaII、ibeA、iro、kps(II型)、fyuA和malX。它还携带编码细胞致死性膨胀毒素的cdt基因簇。
对大肠杆菌K1菌株IHE3034测序产生283个毗连序列群。它们是SEQ ID NO9991-10273,以长度递减的顺序排列。
通过分析大肠杆菌K1菌株IHE3034的基因组序列,鉴定了4995种开放阅读框(ORF),将它们命名为ORFnnnnn,其中nnnnn是00001-04995的数字。这些ORF的序列为SEQ ID NO:1-9990,奇数SEQ ID NO为DNA序列,偶数ID为氨基酸序列。可按下述方法将此nnnnn编号转变为序列表的SEQ ID NO编号:就氨基酸序列而言,SEQ IDNO:=nnnnn x 2;就核苷酸序列而言,SEQ ID NO:=[nnnnn x 2]-1。因此,可以在SEQ ID NO:2467和2468处找到ORF01234,如表1所示。
表1中给出了4995种ORF的初步功能注释。
表3显示了与共生菌株ORF同源性低的ORF(共计1194个)。优选这些ORF的原因是,在核酸测试和免疫交叉反应性方面,它们相对于共生菌株、对病原性大肠杆菌特异。潜在致病性岛(island)位于ORF00028-70、ORF000330-353、ORF00655-687、ORF00883-910、ORF01031-1058、ORF1078-1119、ORF1186-1228、ORF01313-1376、ORF01479-1514、ORF01523-1543、ORF01550-1578、ORF01810-1865、ORF02295-02315、ORF02351-2375、ORF02382-2405、ORF02436-2472、ORF02788-02816、ORF02844-2891、ORF03011-3056、ORF03340-3365、ORF03499-3522、ORF04416-4439、ORF04661-4679、ORF04915-4930和ORF04946-4966.
根据本发明者采用的不同标准,选择4995种ORF中的142种(2.8%)进行免疫应用。这142种ORF见表2。选择这些ORF的标准包括但不限于:与共生性大肠杆菌菌株的ORF的同源性低;长度>100aa;并且有合适的细胞定位(见表2下部)。
克隆编码这142种蛋白质的基因,在细菌中(例如在非病原性实验室大肠杆菌宿主中或在芽孢杆菌如枯草芽孢杆菌(B.subtilis)或巨大芽孢杆菌(B.megaterium)中)表达,纯化,然后用于免疫受试动物(如小鼠)。然后,用Western印迹、ELISA和FACS试验分析小鼠中产生的血清,并在体外和体内实验中进一步检测。合适的体外试验包括检测抗体诱导补体介导的细菌杀伤的能力和/或调理吞噬作用的活性、阻断MNEC菌株(或纯化抗原)与人上皮细胞或其它细胞系结合的能力、和/或抑制大肠杆菌(如K1菌株)粘附/侵入脑微血管内皮细胞(BMEC)的能力。检测对菌血症和脑膜炎的效力的合适的体内试验包括在用大肠杆菌K1菌株刺激的5日龄大鼠中进行主动或被动全身性免疫和刺激以及用MNEC菌株免疫和腹膜内感染成年小鼠。
所述蛋白对细菌生活周期的重要性可通过建立等基因敲除突变体来进行检验。所述突变体还可用于确保抗原产生的血清对该抗原的特异性。采用微阵列研究表达模式。通过对来自多种不同ExPEC菌株的序列进行测序来评估保守和变异。
进行试验以选出预测的表面暴露蛋白,其对MNEC菌株具有特异性并在非病原性菌株(共生菌株和试验菌株)中不存在。一旦选中,即表达并纯化这些蛋白,并用于免疫小鼠。
从参考文献43中可知,大肠杆菌任一tol-pal基因的突变都会导致含有天然外膜蛋白的小泡的形成。通过比较MNEC菌株和非病原性菌株的小泡中存在的蛋白,可能选出一小组可用作潜在抗原的蛋白。
共生和病原性大肠杆菌中的λ红介导的基因操作
本方法为基于PCR的快速方法,用于使野生型大肠杆菌菌株中的tolR基因失活[298]。简单地说,步骤1由独立扩增靶基因(tolR)的上游和下游区域以及抗性标记盒组成。将步骤1得到的两种PCR产物与等摩尔浓度的AB盒的扩增机器混合并进行第二轮PCR(三元PCR),以产生其上游和下游侧接的500bp(或更长)部分与靶基因同源的抗性标记盒。在步骤3中,将大量(1μg)所需直链DNA电穿孔到λ红感受态细胞中。
小泡制备
1.通过TCA沉淀制备小泡
用平板上培养的细菌接种LB培养基,在轻柔振摇下37℃过夜培养。用该培养物接种200ml LB使OD600=0.1。细菌生长到OD600 0.4(或按规定)。培养物以4000×g离心10分钟,上清液通过0.22mm滤器过滤以除去残留细菌。
在限铁条件下往LB培养基中添加二吡啶基(Dipyridyl)(0.25mM)以进行同样的实验。
通过往培养物上清液中添加终浓度为10%的100%(重量/体积)TCA、0.4%(重量/体积)脱氧胆酸盐来进行沉淀。所述沉淀过程在4℃下进行30分钟。通过在4℃以20000×g离心10分钟回收沉淀。该沉淀以10%TCA(重量/体积)洗涤一次并用纯乙醇洗涤两次。所述沉淀用SpeedVac干燥并保存于-20℃。
对野生型和突变型菌株进行SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳,从中可以观察到突变型菌株上清液中产生的条带远远多于野生型菌株。随机选择的条带证实上清液中的所有蛋白均为膜蛋白。
2.通过超速离心以制备小泡
培养物的上清液在4℃以200000×g超速离心2小时。沉淀以PBS洗涤,重悬于PBS并保存于-20℃。
3.小泡的胍盐变性
在进行胍盐变性前,小泡用乙醇沉淀。通过加入冷的纯乙醇到终浓度为90%沉淀PBS溶液中的10μg OMV。沉淀过程在-20℃下进行20分钟。通过13000×g离心10分钟回收沉淀。将该沉淀重悬于50ml 6M胍盐、15mM DTT、200mM Tris-HCl,pH8.0。变性过程在60℃下进行60分钟。消化之前,溶液用1.5M Tris pH8.0溶液1/8稀释并往所述稀释溶液中添加5mg胰蛋白酶。消化过程在37℃过夜。通过添加终浓度为0.1%的甲酸终止反应。用Oasis抽提试剂盒(cartridge)对肽进行抽提。通过LC耦连MS-MS分析肽。
4.表面消化
将5mg胰蛋白酶加入10mg小泡的PBS溶液中,并在37℃孵育3小时。添加0.1%终浓度的甲酸终止反应。通过30Kda截断滤器过滤回收肽,用Oasis抽提试剂盒进行抽提。通过LC耦连MS-MS分析肽。
小泡分析
蛋白定量
用Bradford法、以BSA作为标准品进行蛋白定量。
SDS-PAGE
采用十二烷基硫酸钠(SDS)4-12%聚丙烯酰胺凝胶和Mini-protean II电泳装置分析样品。将样品悬浮于SDS样品缓冲液中(0.06M Tris-HCl pH6.8、10%(体积/体积)甘油、2%(重量/体积)SDS、5%(体积/体积)2-巯基乙醇、10mg/ml溴酚蓝)并加热到100℃5分钟,然后进行SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。电泳后,凝胶用考马斯蓝染色。
MALDI-TOF质谱测定
从凝胶中将蛋白条带和蛋白点切下,用50mM碳酸氢铵/乙腈(50/50,体积/体积)洗涤,并用SpeedVac离心(Savant)干燥。加入7-10ml含有5mM碳酸氢铵、0.012mg测序级胰蛋白酶的溶液于37℃消化干燥的蛋白点2小时。消化后,吸取0.6ml加到预点阵列靶(matrix pre-spotted target)上并空气干燥。蛋白点用0.6ml含有70%乙醇、0.1%三氟醋酸的溶液洗涤。从超挠性(ultraflex)MALDI-TOF质谱仪上获得质谱信息。谱型信息采用靶上预点的标准品组合进行外部校准。采用Mascot程序对质量范围在700-3,000Da内的试验生成的肽的同位素单峰与计算机生成的指纹进行自动或手工比较以鉴定蛋白。
二维电泳
将200mg小泡重悬于Immobiline再溶胀溶液(7M尿素、2M硫脲、2%(重量/体积)CHAPS、(2%重量/体积)ASB14、2%(体积/体积)IPG缓冲液pH 3-10NL、2mM TBP、65mM DTT),并过夜吸附于7厘米的Immobiline DryStrip(pH3-10NL)柱。然后经2维电泳分离蛋白。第一维电泳的进行采用IPGphor等电位聚焦单位,连续施加150伏电压35分钟、500伏35分钟、1,000伏30分钟、2,600伏10分钟、3,500伏15分钟、4,200伏15分钟,最后施加5,000伏至10kVh。对于第二维电泳,条带在4M尿素、2M硫脲、30%甘油、2%SDS、5mM TBP、50mM Tris HCl pH8.8、2.5%丙烯酰胺、0.2%溴酚蓝中孵育2次10分钟以平衡。然后,在线性4-12%预制聚丙烯酰胺凝胶上分离蛋白。
凝胶用胶质考马斯蓝染色,并用个人光密度计SI扫描。图像用Image Master 2DElite软件进行分析。
纳米-LC/MS/MS
肽由连接于装有纳米喷射源的Q-ToF Micro ESI质谱仪的CapLC HPLC系统上的纳米LC进行分离。通过一个C18收集柱(300μm i.d.×5mm)将样品装入Atlantis C18NanoEase柱(100μm i.d.×100mm)。50分钟内以400nl/分钟的流速用2%-60%的溶于0.1%甲酸溶液的95%ACN的梯度进行洗脱。经洗提的肽采用MassLynx软件(4.0版)进行自动的数据依赖型采集程序,其中用MS测量扫描在400-2,000的m/z范围内自动选择多电荷肽以进行进一步的MS/MS片段化。最多有3种不同组分同时进行MS/MS片段化。采集到数据之后,用MassLynx对单个MS/MS谱型数据进行组合、校平和确定质心。通过MASCOT的授权版本的批量模式对肽进行检索和鉴定。所述MASCOT检索参数为:(1)种:ExPEC;(2)允许的切割失败数目(仅针对胰蛋白酶水解):6;(3)可变的翻译后修饰:甲硫氨酸氧化;(4)肽容限:±500ppm;(5)MS/MS容限:±0.3Da和(6):肽电荷:从+1到+4。就前述平台而言,仅考虑由MASCOT概率分析确定的显著命中。接受至少一种肽的蛋白测定结果的分数阈值由MASCOT设定,胰蛋白酶消化的阈值为18,蛋白酶K消化的阈值为36。
结果
上述分析的结果为,鉴定了10种优选抗原。即:orf03526(SEQ ID No:7051+7052)、orf01339(SEQ ID No:2677+2678)、orf00256(SEQ ID No:511+512)、orf01346(SEQ ID No:2691+2692)、orf04084(SEQ ID No:8167+8168)、orf02374(SEQID No:4747+4748)、orf03 502(SEQ ID No:7003+7004)、orf02298(SEQ ID No:4595+4596)、orf01228(SEQ ID No:2455+2456)、orf01227(SEQ ID No:2453+2454)、orf02314(SEQ ID NO:4627+4628)和orf02850(SEQ ID NO:5699+5700)。见表4,其中也给出了这些蛋白与UPEC菌株CFT073中的蛋白的相同性。其它优选抗原是与用上述相同方法鉴定的CFT073菌株的优选抗原的相同性大于60%的抗原。这些优选抗原是orf04282(SEQ ID No:8563+8564)、orf01364(SEQ ID No:2727+2728)、orf04936(SEQ ID No:9871+9872)、orf02336(SEQ ID No:4671+4672)、orf02840(SEQ ID No:5679+5680)、orf00267(SEQ ID No:533+534)、orf01611(SEQ ID No:3221+3222)、orf01613(SEQ ID No:3225+3226)和orf03502(SEQ ID No:7003+7004)。
抗原分析
全身感染的小鼠模型
为了筛选由对病原性和非病原性大肠杆菌菌株进行的比较基因组分析所选出来的大量抗原,建立了基于经典毒力试验的保护模型。
实验模型(免疫和感染)采用5周龄的CD1远交小鼠,采用腹膜内接种有毒力的IHE3034大肠杆菌菌株进行刺激。刺激剂量通过试验确定为能够在72小时内杀死80%成年小鼠的细菌量,对IHE3034菌株而言,该剂量对应为1×107cfu/只小鼠。
将称为毒力因子和潜在保护性抗原的两种蛋白用作阳性对照。这些蛋白是IbeA[299]和IroN(SEQ ID No:2691、2692和参考文献300、301)。表达重组蛋白,并用于免疫实验。
免疫方法
通过皮下注射150μl使用弗氏佐剂的蛋白溶液免疫小鼠3次,如下表所示:
  对照小鼠 免疫小鼠
第0天   75μl盐水溶液75μl完全弗氏佐剂 75μl蛋白溶液(20μg)75μl完全弗氏佐剂
第21天   75μl盐水溶液75μl不完全弗氏佐剂 75μl蛋白溶液(20μg)75μl不完全弗氏佐剂
第35天   75μl盐水溶液75μl不完全弗氏佐剂 75μl蛋白溶液(20μg)75μl不完全弗氏佐剂
在第一次免疫前一天(免疫前血清)、第34天和第48天(刺激前一天)收集血样,用western印迹和ELISA试验检测免疫小鼠的血清以测定抗体效价。
刺激
在第48天,用大肠杆菌IHE3034的冻存液在LB琼脂平板上划线,在培养箱中于37℃培养过夜(ON)。在第49天用所述ON平板-培养物接种50ml LB培养基,直到O.D.600=0.1,并在37℃振摇培养1.5小时,直到细菌培养物达到O.D.600=0.6,其对应为5×108cfu/ml的IHE3034菌株。用生理溶液稀释该培养物,直到细菌浓度为1×108/ml (一般用8ml生理溶液稀释2ml细菌培养物),并用标准的平板计数法铺板,以核实接种物。用1ml注射器将含有1×107IHE3034细菌的100μl细胞悬液注射到对照和免疫小鼠的腹膜内。记录感染24、48和72小时后各动物组的死亡数。
通过比较刺激72小时后小鼠疫苗接种组中的存活率和对照组中的存活率,来评估由于接种疫苗所获得的保护。由下式计算相对于对照的存活率百分比:
Figure S2006800123787D00711
结果
如上所述用阳性对照IroN和IbeA进行免疫。如图3和4所示,用IroN或IbeA免疫后,再用IHE3034刺激的%小鼠存活率升高。
用热灭活的IHE3034进行免疫。如图1所示,用热灭活的IHE3034免疫后,再用IHE3034刺激的%小鼠存活率升高。
也用IHE3034ΔTol-R的小泡进行免疫。如图2所示,用IHE3034ΔTol-R免疫后,再用IHE3034刺激的%小鼠存活率升高。
免疫研究
选择抗原组合得到本发明组合物。BALB/c小鼠被分成9组并按照如下方式进行免疫:
    组     免疫组合物     给药途径
    1     抗原混合物(各10-20μg蛋白)+CFA(完全弗氏佐剂)     腹膜内或鼻内或皮下
    2     抗原混合物(各5μg蛋白)+氢氧化铝(200μg)     腹膜内或鼻内或皮下
    3     抗原混合物(各10-20μg蛋白)+CpG(10μg)     腹膜内或鼻内或皮下
    4     抗原混合物(各10-20μg蛋白)+氢氧化铝(200μg)+CpG(10μg)     腹膜内或鼻内或皮下
    5     CFA     腹膜内或鼻内或皮下
    6     抗原混合物(各10-20μg蛋白)+LTK63(5μg)     腹膜内或鼻内或皮下
    7     氢氧化铝(200μg)+CpG(10μg)     腹膜内或鼻内或皮下
    8     CpG(10μg)     腹膜内或鼻内或皮下
    9     LTK63(5μg)     腹膜内或鼻内或皮下
以2周间隔免疫小鼠。最后一次免疫后2-3周,用合适的MNEC菌株刺激所有小鼠。当采用粘膜免疫(如鼻内)时,也以粘膜方式刺激动物模型以测试粘膜免疫原的保护效果。临近刺激前,对小鼠采血以检测针对所给予抗原的抗体的效价。
就小鼠刺激而言,有毒力的细菌要在合适的培养基中生长。通过离心收获细菌,重悬,连续稀释成刺激接种物。对BALB/c小鼠进行刺激并在接触后30天内每天观察。
可以采用完整细菌和纯化重组蛋白的ELISA试验来测定不同免疫方案产生的小鼠血清中的总IgG和IgG1/IgG2A亚型。而且,可通过多参数FACS分析评价分离自免疫接种小鼠的脾细胞和/或PBMC中的抗原特异性CD4+和CD8+Th细胞,以评估抗原特异性T细胞的细胞因子表达情况。具体地,IFN-γ和IL-5的产量可在用纯化抗原体外刺激T细胞之后进行测量。此外,用各抗原/疫苗制剂免疫的小鼠的脾细胞和/或PBMC可以在最后一次免疫剂量后10-12天收集,并用MNEC细菌来刺激。经过4小时的刺激之后,往后的12个小时内往细胞中加入布雷菲德菌素A以阻断细胞因子分泌。然后,固定细胞并用抗体染色,以检测表达IFN-γ和IL-5的MNEC特异性T细胞。
可以通过本领域技术人员了解的各种方法从外周血淋巴细胞(PBL)中分离T细胞。例如,可以通过去除辅助细胞和B细胞从PBL群中“富集”T细胞群。具体地,可使用抗MHC II类单克隆抗体清除非T细胞来富集T细胞。类似地,其它抗体可用于消耗特定的非T细胞群。例如,抗Ig抗体分子可用于消耗B细胞,抗MacI抗体分子可用于消耗巨噬细胞。
还可用本领域技术人员已知技术将T细胞分成许多不同的亚群。两类主要的亚群可以基于其细胞表面标记CD4和CD8的表达差异进行分离。例如,在上述T细胞富集之后,可采用对CD4特异性的抗体富集CD4+细胞。所述抗体可以偶联于固体支持物如磁珠上。相反地,CD8+细胞可使用对CD4特异性的抗体进行富集(去除CD4+细胞),或可使用偶联于固体支持物的CD8抗体进行分离。在转导之前或之后,可以离体扩增感染MNEC的患者的CD4淋巴细胞。
T细胞纯化之后,纯化的T细胞用各种细胞因子(包括但不限于rIL-2、IL-10、IL-12和IL-15)进行预刺激,以促进淋巴细胞的生长和活化。
可以用上述免疫原性多肽进行活化MNEC特异性T细胞。MNEC特异性T细胞可以是CD8+或CD4+。MNEC特异性CD8+T细胞可以是细胞毒性T淋巴细胞(CTL),其能杀死呈现与MHC I类分子复合的任何上述多肽或其片段的MNEC感染细胞。衣原体特异性CD8+T细胞可以通过如51Cr释放试验进行检测。51Cr释放试验检测MNEC特异性CD8+T细胞裂解呈现一种或多种这些表位的靶细胞的能力。本发明还考虑了表达抗病毒物质如IFNγ的MNEC特异性CD8+T细胞,它们也可通过免疫学方法进行检测,优选用一种或多种上述MNEC多肽进行体外刺激后对IFNγ或类似细胞因子进行细胞内染色来检测。MNEC特异性CD4+T细胞可以通过淋巴增殖试验进行检测。淋巴增殖试验检测MNEC特异性CD4+T细胞对一种或多种上述多肽应答而增殖的能力。
应该理解,本发明仅通过实施例的方式进行描述,可以在本发明的范围和精神内进行改变。
表1-ORF00001-ORF04995的注释
 ORFnnnnn  SEQ ID NO 注释
 ORF00001  1和2 磷酸甘油转移酶I
 ORF00002  3和4 引发体操纵子17.5K蛋白(mdob-dnac基因间区)
 ORF00003  5和6 DNA复制蛋白dnaC
 ORF00004  7和8 引发体蛋白I
 ORF00005  9和10 可能的完整膜蛋白Cj1 165c,推定
 ORF00006  11和12 可能的完整膜蛋白Cj1 166c,推定
 ORF00007  13和14 转录调节蛋白,LuxR家族结构域蛋白
 ORF00008  15和16 转录激活物蛋白bqIJ
 ORF00009  17和18 三价铁还原酶蛋白fhuF[1.6.99.-]
 ORF00010  19和20 功能未知的蛋白质(DUF1435)家族
 ORF00011  21和22 保守性假拟蛋白
 ORF00012  23和24 核糖体RNA小亚基甲基转移酶C(AE005668)[2.1.1.52]
 ORF00013  25和26 DNA聚合酶III,psi亚基(holD)[2.7.7.7]
 ORF00014  27和28 核糖体-蛋白-丙氨酸乙酰基转移酶(riml) [2.3.1.128]
 ORF00015  29和30  HAD超家族(亚家族IA)水解酶,TIGR02254
 ORF00016  31和32 位点特异性重组酶,噬菌体整合酶家族
 ORF00017  33和34 假拟蛋白
 ORF00018  35和36 保守性假拟蛋白
 ORF00019  37和38 假拟nin区域蛋白(cvsD)
 ORF00020  39和40 假拟蛋白
 ORF00021  41和42 保守性假拟蛋白
 ORF00022  43和44 Sb36
 ORF00023  45和46 Sb36
 ORF00024  47和48 假拟蛋白
 ORF00025  49和50 假拟蛋白
 ORF00026  51和52 保守性假拟蛋白
 ORF00027  53和54 阻抑物
 ORF00028  55和56 Sb40
 ORF00029  57和58 免疫性区域
 ORF00030  59和60 保守性假拟蛋白
 ORF00031  61和62 复制蛋白
 ORF00032  63和64 假拟蛋白
 ORF00033  65和66 噬菌体N-6-腺嘌呤-甲基转移酶[2.1.1.72]
 ORF00034  67和68 LexA阻抑物
 ORF00035  69和70 交叉连接内切脱氧核糖核酸酶[3.1.22.-]
 ORF00036  71和72 Sb46
 ORF00037  73和74 功能未知的蛋白质(DUF1277)超家族
 ORF00038  75和76 λ原噬菌体的抗终止蛋白Q同源物
 ORF00039  77和78 裂解蛋白S.b1556
 ORF00040  79和80 细胞内溶素(溶酶体)[3.2.1.17]
 ORF00041  81和82 噬菌体裂解蛋白
 ORF00042  83和84 假拟蛋白
 ORF00043  85和86 Gifsy-2原噬菌体蛋白
 ORF00044  87和88 噬菌体末端酶大亚基(GpA)
 ORF00045  89和90 保守性假拟蛋白
 ORF00046  91和92 噬菌体门蛋白,λ家族
 ORF00047  93和94 Gifsy-2原噬菌体类似Clp蛋白酶
 ORF00048  95和96 保守性假拟蛋白
 ORF00049  97和98 Gifsy-2原噬菌体ATP-结合糖转运蛋白样蛋白
ORF00050  99和100 Gifsy-1原噬菌体:类似于小尾蛋白Z
ORF00051  101和102 噬菌体小尾蛋白U
ORF00052  103和104 原噬菌体CP-933K的推定尾组件
ORF00053  105和106 噬菌体小尾蛋白G
ORF00054  107和108 噬菌体尾装配蛋白T
ORF00055  109和110 Gifsy-1原噬菌体蛋白
ORF00056  111和112 噬菌体小尾蛋白
ORF00057  113和114 噬菌体小尾蛋白L
ORF00058  115和116 原噬菌体的推定尾丝组件K
ORF00059  117和118 原噬菌体的推定尾丝组件K
ORF00060  119和120 Gifsy-1原噬菌体蛋白
ORF00061  121和122 Gifsy-1原噬菌体蛋白
ORF00062  123和124 宿主特异性蛋白(部分)
ORF00063  125和126 Lom
ORF00064  127和128 保守性假拟蛋白
ORF00065  129和130 假拟蛋白
ORF00066  131和132 保守性假拟蛋白
ORF00067  133和134 保守性假拟蛋白
ORF00068  135和136 保守性假拟蛋白
ORF00069  137和138 成熟酶相关蛋白
ORF00070  139和140 DinI样蛋白Z3916-ECs3483(AF175466)
ORF00071  141和142 肽链释放因子3(prfC)
ORF00072  143和144 渗透压诱导型蛋白Y前体
ORF00073  145和146 功能未知的蛋白质(DUF1328)家族
ORF00074  147和148 未命名蛋白产物
ORF00075  149和150 Mg-依赖性DNA酶
ORF00076  151和152 丙酮酸盐甲酸盐裂合酶活化酶(act)[1.97.1.4]
ORF00077  153和154 蛋白
ORF00078  155和156 保守性假拟蛋白
ORF00079  157和158 脱氧核糖-磷酸醛缩酶(deoC)[4.1.2.4]
ORF00080  159和160 胸腺嘧啶磷酸化酶(TDRPASE)
ORF00081  161和162 磷酸五碳糖变位酶(phosphopento变位酶)(deoB)[5.4.2.7]
ORF00082  163和164 嘌啉核苷磷酸化酶(deoD)[2.4.2.1]
ORF00083  165和166 保守性假拟蛋白
ORF00084  167和168 硫辛酸-蛋白连接酶A[6.3.4.-]
ORF00085  169和170 smp蛋白前体
ORF00086  171和172 磷酸丝氨酸磷酸酶(serB)[3.1.3.3]
ORF00087  173和174 DNA修复蛋白RadA(radA)
ORF00088  175和176 烟酰胺-核苷酸腺苷酰基转移酶[2.7.7.1]
ORF00089  177和178 保守性假拟蛋白
ORF00090  179和180 螺旋-转角-螺旋基序
ORF00091  181和182 ABC转运蛋白ATP结合蛋白yjjK(atp结合)
ORF00092  183和184 可溶性裂解胞壁质转糖基酶[3.2.1.-]
ORF00093  185和186 trp操纵子阻抑物(trpR)
ORF00094  187和188 保守性假拟蛋白TIGR00258
ORF00095  189和190 磷酸甘油酸变位酶家族蛋白,推定[5.4.2.1]
ORF00096  191和192 右侧来源(right origin)-结合蛋白
ORF00097  193和194 CreA蛋白
ORF00098  195和196 转录调节蛋白creB
ORF00099  197和198 传感蛋白creC[2.7.3.-]
ORF00100  199和200 内膜蛋白creD(AE005671)
ORF00101  201和202 需氧呼吸控制蛋白arcA(染料抗性蛋白)(arcA)
 ORF00102  203和204 RNA甲基转移酶,TrmH家族,1型
 ORF00103  205和206 天冬氨酸激酶I,高丝氨酸脱氢酶I
 ORF00104  207和208 高丝氨酸激酶(thrB)[2.7.1 39]
 ORF00105  209和210 苏氨酸合酶(thrC)[4.2.3.1]
 ORF00106  211和212 未命名蛋白产物:ORF ID:o101#5
 ORF00107  213和214 保守性假拟蛋白
 ORF00108  215和216 UPF0246蛋白vaaA
 ORF00109  217和218 未命名蛋白产物(ORF8)
 ORF00110  219和220 转醛酶(tal)[2.2.12]
 ORF00111  221和222 钼蝶呤生物合成mog蛋白
 ORF00112  223和224 gpr1-fun34-vaaH家族蛋白
 ORF00113  225和226 未命名蛋白产物:ORF4
 ORF00114  227和228 保守性假拟蛋白
 ORF00115  229和230 假拟蛋白
 ORF00116  231和232 侣伴蛋白DnaK(dnaK)
 ORF00117  233和234 侣伴蛋白DnaJ(dnaJ)
 ORF00118  235和236 gef蛋白相关蛋白
 ORF00119  237和238 推定的保守性蛋白
 ORF00120  239和240 硫酸酯酶,推定
 ORF00121  241和242 保守性假拟蛋白
 ORF00122  243和244 Na+-H+反向转运蛋白NhaA(nhaA)
 ORF00123  245和246 转录激活蛋白nhaR
 ORF00124  247和248 核黄素生物合成蛋白RibF(ribF)[2.7.1.26 2.7.7.2]
 ORF00125  249和250 异亮氨酰-tRNA合成酶(ileS) [6.1.1.5]
 ORF00126  251和252 脂蛋白信号肽酶(IspA)[3.4.23.36]
 ORF00127  253和254 5.2.1.8[5.2.1.8]
 ORF00128  255和256 二磷酸4-羟基-3-甲基丁-2-烯酯还原酶(ispH)[1.17.1.2]
 ORF00129  257和258 肌苷-尿苷优选核苷水解酶[3.2.-.-]
 ORF00130  259和260 假拟蛋白DUF805
 ORF00131  261和262 二氢二皮考啉酸酯还原酶(dapB)[1.3.1.26]
 ORF00132  263和264 氨基甲酰基-磷酸酯合酶,小亚基(carA)[6.3.5.5]
 ORF00133  265和266 氨基甲酰基-磷酸酯合酶,大亚基(carB)[6.3.5.5]
 ORF00134  267和268 转座酶
 ORF00135  269和270 转录激活蛋白v蛋白caiF
 ORF00136  271和272 肉碱操纵子蛋白caiE
 ORF00137  273和274 echA1[5.-.-.-]
 ORF00138  275和276 caiC(fadD)[6.3.2.-]
 ORF00139  277和278 CAIB-BAIF家族蛋白,推定[2.8.3.-]
 ORF00140  279和280 巴豆酰甜菜碱(Crotonobetainyl)-CoA脱氢酶(巴豆酰甜菜碱-CoA还原酶)(acd)
 ORF00141  281和282 L-肉碱-γ-丁基甜菜碱反向转运蛋白
 ORF00142  283和284 电子转移黄素蛋白,β亚基,推定
 ORF00143  285和286 电子转移黄素蛋白,α亚基,推定
 ORF00144  287和288 FixC蛋白[1.5.5.-]
 ORF00145  289和290 铁氧还蛋白样蛋白
 ORF00146  291和292 糖转运蛋白,推定
 ORF00147  293和294 谷胱甘肽-调节的钾外流系统辅助蛋白kefF(OUINONE)
 ORF00148  295和296 谷胱甘肽-调节的钾外流系统蛋白kefC(K(+)-H(+)反向转运蛋白)
 ORF00149  297和298 二氢叶酸还原酶ffolA)[1.5.1.3]
 ORF00150  299和300 CcdB解毒剂CcdA
 ORF00151  301和302 CcdB样蛋白
 ORF00152  303和304 CcB样蛋白
 ORF00153  305和306 双(5′-核酸基)-四磷酸酯酶(对称)[3.6.1.4.1]
 ORF00154  307和308 蛋白apaG (AJ012295)
 ORF00155  309和310 二甲基腺苷转移酶(ksqA)[2.1.1.-]
 ORF00156  311和312 4-羟基苏氯酸-4-磷酸脱氢酶(pdxA)[1.1.1.262]
 ORF00157  313和314 存活蛋白surA前体(肽基-脯氨酰基顺反异构酶surA)(PPI酶)
 ORF00158  315和316 有机溶剂耐受蛋白前体
 ORF00159  317和318 有机溶剂耐受蛋白前体
 ORF00160  319和320 DnaJ样蛋白dilA (AE005182)
 ORF00161  321和322 核糖体大亚基假尿苷合酶A
 ORF00162  323和324 RNA聚合酶相关蛋白(hepA)[3.6.1.-]
 ORF00163  325和326 假拟蛋白
 ORF00164  327和328 DNA聚合酶II
 ORF00165  329和330 L-核酮糖-5-磷酸4-差向异构酶(araD)[5.1.3.4]
 ORF00166  331和332 L-阿拉伯糖异构酶(araA)[5.3.1.4]
 ORF00167  333和334 L-核酮糖激酶(araB)[2.7.1.16]
 ORF00168  335和336 转录调节蛋白,AraC家族
 ORF00169  337和338 保守性假拟蛋白
 ORF00170  339和340 DedA家族内膜蛋白
 ORF00171  341和342 硫胺ABC转运蛋白。ATP-结合蛋白
 ORF00172  343和344 硫胺-硫胺焦磷酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白(thiP)
 ORF00173  345和346 硫胺-硫胺焦磷酸ABC转运蛋白,硫胺-硫胺焦磷酸-结合蛋白(thiB)
 ORF00174  347和348 细菌胞外溶质-结合蛋白,家族5家族
 ORF00175  349和350 3-异丙基苹果酸酯脱水酶,小亚基(leuD)[4.2.1.33]
 ORF00176  351和352 3-异丙基苹果酸酯脱水酶,大亚基(leuC) [4.2.1.33]
 ORF00177  353和354 3-异丙基苹果酸酯脱氢酶(leuB)[1.1.1.85]
 ORF00178  355和356 2-异丙基苹果酸酯合酶(leuA) [2.3.3.13]
 ORF00179  357和358 LeuO蛋白。
 ORF00180  359和360 乙酰乳酸合酶,大亚基,生物合成类型(ilvB)[2.2.1.6]
 ORF00181  361和362 乙酰乳酸合酶,小亚基(ilvN)[2.2.1.6]
 ORF00182  363和364 fru操纵子等的转录阻抑物
 ORF00183  365和366 mraZ蛋白(mraZ)
 ORF00184  367和368 S-腺苷-甲基转移酶MraW(mraW)[2.1.1.-]
 ORF00185  369和370 细胞分裂蛋白fisL
 ORF00186  371和372 肽聚糖合成酶ftsl前体(PBP)[2.4.1.129]
 ORF00187  373和374 UDP-N-乙酰胞壁酰丙氨酰-D-谷氨酸--2,6-二氨基庚二酸连接酶
 ORF00188  375和376 UDP-N-乙酰胞壁酰丙氨酰-D-谷氨酰-2,6-二氨基庚二酸-D-丙氨酰-D-丙氨酰连
 ORF00189  377和378 磷酸-N-乙酰基胞壁酰基-五肽-转移酶(mraY)[2.7.8.13]
 ORF00190  379和380 UDP-乙酰基胞壁酰基丙氨酸-D-谷氨酸连接酶(murD)[6.3.2.9]
 ORF00191  381和382 细胞分裂蛋白ftsW
 ORF00192  383和384 十一碳异戊二烯基-二磷酸-胞壁酰基五肽β-N-乙酰基葡糖胺基转移酶(murG)
 ORF00193  385和386 UDP-N-乙酰基胞壁酸-丙氨酸连接酶(murC)[6.3.2.8]
 ORF00194  387和388 D-丙氨酸--D-丙氨酸连接酶B(ddlB)[6.3.2.4]
 ORF00195  389和390 乙酰乳酸合酶同功酶III大亚基[4.1.3.18]
 ORF00196  391和392 乙酰乳酸合酶,小亚基(ilvN) [2.2.1.6]
 ORF00197  393和394 果糖阻抑物(分解代谢物阻抑物-激活物)
 ORF00198  395和396 果糖阻抑物(分解代谢物阻抑物-激活物)
 ORF00199  397和398 乙酰乳酸合酶同功酶III大亚基[4.1.3.18]
 ORF00200  399和400 乙酰乳酸合酶,小亚基(ilvN) [2.2,1.6]
 ORF00201  401和402 果糖阻抑物(分解代谢物阻抑物-激活物)
 ORF00202  403和404 D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶B (ddlB)[6.3,2.4]
 ORF00203  405和406 细胞分裂蛋白ftsO
 ORF00204  407和408 细胞分裂蛋白FtsA (ffsA)
 ORF00205  409和410 细胞分裂蛋白ftsZ
 ORF00206  411和412 UDP-3-O-酰基N-乙酰基葡糖胺脱乙酰酶(lpxC)[3.5.1.-]
 ORF00207  413和414 分泌监测物前体
 ORF00208  415和416 secA蛋白
 ORF00209  417和418 前蛋白转位酶,SecA亚基(secA)
 ORF00210  419和420 突变基因mutT蛋白(mutT)[3.6.1.-]
 ORF00211  421和422 UPF0243锌结合蛋白yacG-相关蛋白
 ORF00212  423和424 假拟UPF0289蛋白vacF
 ORF00213  425和426 脱磷酸-CoA激酶(coaE)[2.7.1.24]
 ORF00214  427和428 鸟苷单磷酸还原酶(guaC)[1.7.1.7]
 ORF00215  429和430 蛋白转运蛋白hofC(MTB)
 ORF00216  431和432 蛋白转运蛋白hofB(MTB)
 ORF00217  433和434 前菌毛蛋白肽酶依赖性蛋白D前体
 ORF00218  435和436 盐酸-核苷酸焦磷酸化酶(nadC)[2.4.2.19]
 ORF00219  437和438 AmpD蛋白(ampD)
 ORF00220  439和440 调节ampC
 ORF00221  441和442 芳族氨基酸转运蛋白aroP(通用芳族氨基酸通透酶)
 ORF00222  443和444 尿路病原性特定蛋白
 ORF00223  445和446 未命名蛋白产物:在OrfU2的3′缺失9 bp
 ORF00224  447和448 尿路病原性特定蛋白(部分)[3.1.-.-]
 ORF00225  449和450 未命名蛋白产物:OrfU3
 ORF00226  451和452 未命名蛋白产物;OrfU1
 ORF00227  453和454 丙酮酸脱氢酶复合物阻抑物
 ORF00228  455和456 丙酮酸脱氢酶E1组件(aceE)[1.2.4.1]
 ORF00229  457和458 丙酮酸脱氢酶复合物二氢硫辛酰胺乙酰基转移酶(aceF)
 ORF00230  459和460 二氢硫辛酰胺脱氢酶(lpdA)[1.8.1.4]
 ORF00231  461和462 保守性假拟蛋白
 ORF00232  463和464 假拟蛋白
 ORF00233  465和466 假拟蛋白
 ORF00234  467和468 顺乌头酸水合酶2(acnB)[4.2.13]
 ORF00235  469和470 S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶酶原
 ORF00236  471和472 亚精胺合酶(speE)[2.5.1.16]
 ORF00237  473和474 vacC
 ORF00238  475和476 蓝铜氧化酶cueO前体
 ORF00239  477和478 葡萄糖脱氢酶
 ORF00240  479和480 次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶(hpt)[2.4,2.8]
 ORF00241  481和482 蛋白yadF[4.2.1.1]
 ORF00242  483和484 ABC转运蛋白ATP-结合蛋白
 ORF00243  485和486 ABC转运蛋白完整膜蛋白STY0195(膜)
 ORF00244  487和488 果糖特异性磷酸转移酶系统组件同源物(PTS)[2.7.1.69]
 ORF00245  489和490 多糖脱乙酰酶结构域蛋白
 ORF00246  491和492 天冬氨酸1-脱羧酶(panD)[4.1.1.11]
 ORF00247  493和494 转座酶
 ORF00248  495和496 泛解酸-β-丙氨酸连接酶(panC)[6.3.2.1]
 ORF00249  497和498 3-甲基-2-氧代丁酸羟甲基转移酶(panB) [2.1.2.11]
 ORF00250  499和500 假拟的菌毛样蛋白yadC前体
 ORF00251  501和502 蛋白质
 ORF00252  503和504 菌毛蛋白超家族
 ORF00253  505和506 假拟蛋白
 ORF00254  507和508 外膜传达蛋白htrE前体
 ORF00255  509和510 侣伴蛋白ecpD前体
 ORF00256  511和512 菌毛蛋白侣伴蛋白ecpD2
 ORF00257  513和514 2-氨基-4-羟基-6-羟甲基二氢蝶啶焦磷酸激酶(folK)2.7.6.3
 ORF00258  515和516 聚(A)聚合酶(PAP)(质粒拷贝数蛋白)(PAP)[2.7.7.19]
 ORF00259  517和518 聚(A)聚合酶(PAP)
 ORF00260  519和520 谷氨酸-tRNA连接酶同源物yadB
 ORF00261  521和522 dnaK抑制蛋白
 ORF00262  523和524 糖发酵刺激蛋白(sfsA)
 ORF00263  525和526 2-5 RNA连接酶
 ORF00264  527和528 ATP-依赖性螺旋酶HrpB(hrpB)
 ORF00265  529和530 肽聚糖合成酶青霉素-结合蛋白1B
 ORF00266  531和532 青霉素-结合蛋白1B(mrcB)
 ORF00267  533和534 铁色素-铁受体前体(异羟肟酸铁摄取)(异羟肟酸铁受体)
 ORF00268  535和536 铁色素转运ATP结合蛋白fhuC
 ORF00269  537和538 铁色素结合性周质蛋白前体
 ORF00270  539和540 铁色素转运系统通透酶蛋白fhuB(膜)
 ORF00271  541和542 谷氨酸-1-半醛-2,1-氨基变位酶(hemL)[5.4.3.8]
 ORF00272  543和544 H(+)-Cl(-)交换转运蛋白clcA
 ORF00273  545和546 HesB家族蛋白
 ORF00274  547和548 预计的膜蛋白
 ORF00275  549和550 维生素B12转运蛋白btuF前体(PBP)
 ORF00276  551和552 MTA-SAH核苷酶
 ORF00277  553和554 脱氧鸟苷三磷酸三磷酸水解酶,推定亚家族[3.1.5.1]
 ORF00278  555和556 htrA产物[3.4.21.-]
 ORF00279  557和558 糖二酸调节蛋白
 ORF00280  559和560 假拟UPFO325蛋白yaeH
 ORF00281  561和562 2,3,4,5-四氢吡啶-2,6-二羧酸N-琥珀酰转移酶(dapD)[2.3.1.117]
 ORF00282  563和564 蛋白-P-II尿苷酰基转移酶(glnD)[2.7.7.59]
 ORF00283  565和566 1型甲硫氨酸氨基肽酶(map)[3.4.11.18]
 ORF00284  567和568 保守性假拟蛋白
 ORF00285  569和570 30S核糖体蛋白S2
 ORF00286  571和572 翻译延长因子Ts(tsf)
 ORF00287  573和574 尿苷酸激酶(pyrH)[2.7.4.-]
 ORF00288  575和576 核糖体回收因子(frr)
 ORF00289  577和578 1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶(dxr)[1.1.1.267]
 ORF00290  579和580 十一异戊二烯基二磷酸合酶(uppS)[2.5.1.31]
 ORF00291  581和582 磷脂酸胞苷酰基转移酶(cdsA)[2.7.7.41
 ORF00292  583和584 推定的膜结合锌金属蛋白酶
 ORF00293  585和586 外膜蛋白前体yaeT(D15)
 ORF00294  587和588 位于外膜中的组蛋白样蛋白或
 ORF00295  589和590 UDP-3-O-[3-羟基十四酰]葡糖胺N-酰基转移酶(lpxD)[2.3.1.-]
 ORF00296  591和592 (3R)-羟基十四酰酰基载体蛋白脱水酶[4.2.1.-]
 ORF00297  593和594 酰基-[酰基-载体-蛋白质]-UDP-N-乙酰基葡糖胺O-酰基转移酶(lpxA)[2.3.1.129]
 ORF00298  595和596  脂质A-二糖合酶(lpxB)[2.4.1.182]
 ORF00299  597和598  核糖核酸酶HII (mhB)[3.1 26.4]
 ORF00300  599和600  DNA聚合酶III α亚基(dnaE)[2.7.7.7]
 ORF00301  601和602  乙酰基-CoA羧化酶,羧基转移酶,α亚基(accA) [6.4.1.2]
 ORF00302  603和604  赖氨酸脱羧酶,组成性(Idc)[4.11.18]
 ORF00303  605和606  赖氨酸脱羧酶,组成性(Idc)[4.1.1.18]
 ORF00304  607和608  乳酰谷胱甘肽裂合酶
 ORF00305  609和610  细胞周期蛋白(IIe)
 ORF00306  611和612  Rof蛋白
 ORF00307  613和614  推定的胞质蛋白
 ORF00308  615和616  YaeQ蛋白
 ORF00309  617和618  推定的肽酰基-tRNA水解酶结构域
 ORF00310  619和620  铜内稳态蛋白cutF前体(脂蛋白)
 ORF00311  621和622  yaeF蛋白
 ORF00312  623和624  脯氨酰-tRNA合成酶(proS)[6.1.1.15]
 ORF00313  625和626  UPF0066蛋白rcsF (orf3)
 ORF00314  627和628  蛋白rcsF
 ORF00315  629和630  D-甲硫氨酸-结合性脂蛋白metQ前体(hlpA)
 ORF00316  631和632  D-甲硫氨酸转运系统通透酶蛋白metl(膜)
 ORF00317  633和634  D-甲硫氨酸ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(metN)
 ORF00318  635和636  未命名蛋白产物
 ORF00319  637和638  假拟蛋白
 ORF00320  639和640  2.5-二酮-D-葡糖酸还原酶B(orf267)[1.11.274]
 ORF00321  641和642  未命名蛋白产物;与LysR-家族转录调节物高度相似,大肠杆菌的YafC蛋白
 ORF00322  643和644  未命名蛋白产物
 ORF00323  645和646  甲基转移酶,UbiE-COQ5家族
 ORF00324  647和648  结合于膜的裂解性胞壁质转糖基酶D前体(胞壁质水解酶D)
 ORF00325  649和650  羟基酰基谷胱甘肽水解酶[3.12.6]
 ORF00326  651和652  假拟蛋白
 ORF00327  653和654  保守性假拟蛋白
 ORF00328  655和656  RNA酶HI,降解DNA-RNA杂交体的RNA
 ORF00329  657和658  DNA聚合酶III,ε亚基(dnaQ)[2.7.7.7]
 ORF00330  659和660  假拟脂蛋白yafT前体
 ORF00331  661和662  Aec32
 ORF00332  663和664  Aec31
 ORF00333  665和666  Aec30
 ORF00334  667和668  Aec29
 ORF00335  669和670  假拟蛋白
 ORF00336  671和672  Aec28
 ORF00337  673和674  Aec27
 ORF00338  675和676  Aec26
 ORF00339  677和678  Aec25
 ORF00340  679和680  Aec24
 ORF00341  681和682  Aec23
 ORF00342  683和684  假拟蛋白
 ORF00343  685和686  Aec22
 ORF00344  687和688  Aec20
 ORF00345  689和690  Aec19
 ORF00346  691和692  Aec18
 ORF00347  693和694  Aec17
 ORF00348  695和696  Aec16
 ORF00349  697和698  Aec15(AF044503)
 ORF00350  699和700  Aec14
 ORF00351  701和702  Aec13
 ORF00352  703和704  转座酶(IS4家族)
 ORF00353  705和706  Aec7
 ORF00354  707和708  可能的水解酶
 ORF00355  709和710  假拟蛋白
 ORF00356  711和712  脊椎动物溶酶体前体的抑制物
 ORF00357  713和714  酰基-CoA脱氢酶(EC 1.3.99.-)[1.3.99.-]
 ORF00358  715和716  磷酸庚糖异构酶(gmhA)[5.-.-.-]
 ORF00359  717和718  功能未知的细菌蛋白(DUF949)超家族
 ORF00360  719和720  预测的谷胺酰胺酰胺基转移酶
 ORF00361  721和722  保守性假拟蛋白
 ORF00362  723和724  假拟脂蛋白yafL前体
 ORF00363  725和726  功能未知的蛋白质(DUF1568)结构域蛋白
 ORF00364  727和728  FhiA蛋白
 ORF00365  729和730  MbhA蛋白
 ORF00366  731和732  DNA聚合酶IV(PolIV)[2.7.7.7]
 ORF00367  733和734  防止-宿主-死亡家族蛋白
 ORF00368  735和736  未命名蛋白产物
 ORF00369  737和738  假拟的乙酰基转移酶yafP[2.3.1.-]
 ORF00370  739和740  未表征的保守性蛋白,RtcB-UPF0027家族CAC3383
 ORF00371  741和742  肽链释放因子同源物(RF)
 ORF00372  743和744  氨基酰基-组氨酸二肽酶PepD
 ORF00373  745和746  黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶(XGPRT)[2.4.2.22]
 ORF00374  747和748  α-β超家族的水解酶
 ORF00375  749和750  Curlin基因转录激活蛋白
 ORF00376  751和752  外膜孔蛋白E前体
 ORF00377  753和754  谷氨酸5-激酶(proB) [2.7.2.11]
 ORF00378  755和756  γ-谷氨酰磷酸还原酶(proA)[1.2.1.41]
 ORF00379  757和758  HTH型转录调节物prsX
 ORF00380  759和760  血红蛋白酶
 ORF00381  761和762  InsA
 ORF00382  763和764  InsB
 ORF00383  765和766  保守性假拟蛋白
 ORF00384  767和768  YagU
 ORF00385  769和770  未表征的蛋白家族(UPF0153)超家族
 ORF00386  771和772  保守性假拟蛋白
 ORF00387  773和774  保守性假拟蛋白
 ORF00388  775和776  保守性假拟蛋白
 ORF00389  777和778  保守性假拟蛋白
 ORF00390  779和780  MatB前体
 ORF00391  781和782  转录调节物,LuxR家族结构域蛋白
 ORF00392  783和784  核糖体蛋白L36(rPmJ)
 ORF00393  785和786  尾蛋白
 ORF00394  787和788  Sb24
 ORF00395  789和790  尾丝装配蛋白
 ORF00396  791和792  T4-排除蛋白gpIBEGd
 ORF00397  793和794  假拟蛋白
 ORF00398  795和796  假拟蛋白
 ORF00399  797和798  NADH-依赖性黄素氧化还原酶,Oye家族[1.-.-.-]
 ORF00400  799和800 二烯内酯水解酶结构域蛋白(AE000230)
 ORF00401  801和802 转录调节物,LysR家族Atu5241
 ORF00402  803和804 转录调节物(LysR家族)
 ORF00403  805和806 氧化还原酶,醛-酮还原酶家族
 ORF00404  807和808 2,5-二酮-D-葡糖酸还原酶A [1.1.1.-]
 ORF00405  809和810 推定粘附素
 ORF00406  811和812 假拟转录调节物ykgA
 ORF00407  813和814 2,5-二酮-D-葡糖酸还原酶A
 ORF00408  815和816 MC21
 ORF00409  817和818 功能未知的蛋白质(DUF1471)超家族
 ORF00410  819和820 吡啶核苷酸-二硫化物氧化还原酶[1.16.1.1]
 ORF00411  821和822 假拟转录调节物vkgD
 ORF00412  823和824 富半胱氨酸结构域蛋白
 ORF00413  825和826 铁-硫簇结合
 ORF00414  827和828 未表征的ACR,YkgG家族COG1556家族
 ORF00415  829和830 假拟蛋白
 ORF00416  831和832 外膜自体转运蛋白圆筒结构域蛋白
 ORF00417  833和834 保守性假拟蛋白
 ORF00418  835和836 保守性假拟蛋白
 ORF00419  837和838 1型菌毛调节蛋白fimB
 ORF00420  839和840 胆碱脱氢酶(β)[1.1.99.1]
 ORF00421  841和842 甜菜碱醛脱氢酶(betB)[1.2.1.8]
 ORF00422  843和844 调节蛋白betl(U73857)
 ORF00423  845和846 高亲和胆碱转运蛋白
 ORF00424  847和848 EAL结构域蛋白
 ORF00425  849和850 allS
 ORF00426  851和852 谷胱甘肽-调节的钾外流系统蛋白
 ORF00427  853和854 锚蛋白重复结构域蛋白
 ORF00428  855和856 保守性假拟蛋白
 ORF00429  857和858 YahF-FdrA样蛋白
 ORF00430  859和860 YahG-YIbE样蛋白
 ORF00431  861和862 氨基甲酸酯激酶样蛋白yahl[2.7.2.2]
 ORF00432  863和864 胞嘧啶脱氨酶
 ORF00433  865和866 功能未知的蛋白质(DUF984)超家族
 ORF00434  867和868 ABC转运蛋白,底物结合蛋白[sugar](AE005211)
 ORF00435  869和870 核糖ABC转运蛋白(ATP-结合蛋白)
 ORF00436  871和872 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白,推定
 ORF00437  873和874 ABC糖转运蛋白,通透酶亚基(通透酶)
 ORF00438  875和876 氧化还原酶,锌结合[1.1.1.2]
 ORF00439  877和878 RhtC样转运蛋白STY0397 (RhtC)
 ORF00440  879和880 功能未知的蛋白质(DUF1471)超家族
 ORF00441  881和882 丙酸代谢操纵子调节蛋白PrpR(prpR)
 ORF00442  883和884 假拟蛋白
 ORF00443  885和886 prp操纵子的调节物
 ORF00444  887和888 假拟蛋白
 ORF00445  889和890 甲基异柠檬酸裂合酶(prpB) [4.1.3.30]
 ORF00446  891和892 2-甲基柠檬酸裂合酶(甲基柠檬酸裂合酶)(柠檬酸裂合酶2)[2.3.3.5]
 ORF00447  893和894 2-甲基柠檬酸脱水酶(prpD)[4.2.1.79]
 ORF00448  895和896 丙酸-CoA连接酶(prpE)[6.2.1.17]
 ORF00449  897和898 推定的胞嘧啶转运蛋白
 ORF00450  899和900 胞嘧啶脱氨酶
 ORF00451  901和902 半乳糖苷O-乙酰基转移酶[2.3.1.18]
ORF00452  903和904 乳糖通透酶(乳糖-质子-同向转运)
ORF00453  905和906 β-半乳糖苷酶(lacZ)[3.2.1.23]
ORF00454  907和908 转录调节物,lacI家族结构域蛋白,推定
ORF00455  909和910 Arac家族转录调节物
ORF00456  911和912 核蛋白-多核苷酸-相关酶
ORF00457  913和914 羧酸酯酶
ORF00458  915和916 醇脱氢酶[相似性](adhC)[1.-.-.-]
ORF00459  917和918 推定的α螺旋链
ORF00460  919和920 保守性假拟蛋白
ORF00461  921和922 糖磷酸酯核苷酰基转移酶
ORF00462  923和924 葡糖胺基转移酶
ORF00463  925和926 推定的保守蛋白
ORF00464  927和928 牛磺酸ABC转运蛋白,周质结合蛋白(tauA)
ORF00465  929和930 牛磺酸ABC转运蛋白,ATP结合蛋白(cmpC)
ORF00466  931和932 牛磺酸转运系统通透酶蛋白tauC
ORF00467  933和934 α-酮戊二酸-依赖性牛磺酸双加氧酶[1.-.-.-]
ORF00468  935和936 6-氨基乙酰丙酸脱水酶(hemB)[4.2.1.24]
ORF00469  937和938 推定的自体转运蛋白-毒力因子STY0405(部分)
ORF00470  939和940 保守性假拟蛋白
ORF00471  941和942 β-内酰胺酶
ORF00472  943和944 SbmA蛋白
ORF00473  945和946 推定的脂蛋白
ORF00474  947和948 保守性假拟蛋白
ORF00475  949和950 保守性假拟蛋白
ORF00476  951和952 D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶A(D-丙氨酰丙氨酸合成酶A)(D-Ala-D-Ala连接酶A)
ORF00477  953和954 保守性假拟蛋白
ORF00478  955和956 LD01705p
ORF00479  957和958 碱性磷酸酶前体
ORF00480  959和960 由磷酸饥饿诱导
ORF00481  961和962 AdrA蛋白(GGDEF)
ORF00482  963和964 吡咯啉-5-羧酸酯还原酶(proC)[1.5.1.2]
ORF00483  965和966 Yail-YqxD家族蛋白家族
ORF00484  967和968 莽草酸激酶(aroK)[2.7.1.71]
ORF00485  969和970 保守性假拟蛋白
ORF00486  971和972 AroM蛋白
ORF00487  973和974 在细菌中保守的未表征的蛋白
ORF00488  975和976 保守性假拟蛋白
ORF00489  977和978 保守性假拟蛋白
ORF00490  979和980 重组相关蛋白rdgC
ORF00491  981和982 可能的NAGC样转录调节物
ORF00492  983和984 主要易化家族转运蛋白
ORF00493  985和986 外切核酸酶sbcC(p-环)[3.1.15.-]
ORF00494  987和988 外切核酸酶sbcD(sbcD)[3.1.-.-]
ORF00495  989和990 保守性假拟蛋白
ORF00496  991和992 磷酸调节子转录调节蛋白PhoB(phoB)
ORF00497  993和994 磷酸调节子传感蛋白phoR
ORF00498  995和996 假拟蛋白
ORF00499  997和998 保守性假拟蛋白
ORF00500  999和1000 支链氨基酸转运系统II载体蛋白(brnQ)
ORF00501  1001和1002 脯氨酸-特异性通透酶proY
ORF00502  1003和1004 麦芽糖糊精葡糖苷酶[3.2.1.20]
ORF00503  1005和1006 功能未知的蛋白,DUF479超家族
ORF00504  1007和1008 S-腺苷甲硫氨酸:tRNA核糖基转移酶
ORF00505  1009和1010 queuine tRNA-核糖基转移酶(tgt)[2.4.2.29]
ORF00506  1011和1012 前蛋白移位酶,YajC亚基,推定
ORF00507  1013和1014 蛋白输出膜蛋白secD
ORF00508  1015和1016 蛋白输出膜蛋白secF
ORF00509  1017和1018 HNH内切核酸酶结构域蛋白
ORF00510  1019和1020 核苷特异性通道形成蛋白tsx前体
ORF00511  1021和1022 yajl蛋白
ORF00512  1023和1024 保守性假拟蛋白TIGR00244
ORF00513  1025和1026 核黄素生物合成蛋白RibD(ribD)[3.5.4.26 1.1.1.193]
ORF00514  1027和1028 6,7-二甲基-8-核糖基二氧四氢蝶啶合酶
ORF00515  1029和1030 转录抗终止因子NusB(nusB)
ORF00516  1031和1032 硫胺-单磷酸激酶(thiL)[2.7.4.16]
ORF00517  1033和1034 磷脂酰甘油磷酸酶A
ORF00518  1035和1036 可能的氧化还原酶YajO[1.-.-.-]
ORF00519  1037和1038 -脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(dxs)[2.2.1.7]
ORF00520  1039和1040 牻牛儿基转移酶(法尼基-二磷酸合酶)(FPP合酶)(ispA)[2.5.1.10]
ORF00521  1041和1042 外切脱氧核糖核酸酶VII,小亚基(xseB)[3.1.11.6]
ORF00522  1043和1044 假拟蛋白
ORF00523  1045和1046 硫胺生物合成蛋白thil(thil)
ORF00524  1047和1048 4-甲基-5(B-羟乙基)-噻唑单磷酸生物合成酶(ThiJ)
ORF00525  1049和1050 2-脱氢泛解酸酯2-还原酶(panE)[1.1.1.169]
ORF00526  1051和1052 蛋白yajQ
ORF00527  1053和1054 假拟转运蛋白yajR
ORF00528  1055和1056 血红素IX法尼基转移酶(cyoE)[2.5.1.-]
ORF00529  1057和1058 细胞色素o泛醇氧化酶C亚基[1.10.3.-]
ORF00530  1059和1060 细胞色素c氧化酶亚基III
ORF00531  1061和1062 泛醇氧化酶多肽I(细胞色素o亚基1)(氧化酶BO(3)亚基1)(细胞色素o泛醇氧化酶
ORF00532  1063和1064 泛醇氧化酶多肽II前体(细胞色素o亚基2)(氧化酶BO(3)亚基2)(细胞色素o泛醇
ORF00533  1065和1066 β-内酰胺酶诱导信号转导物AmpG
ORF00534  1067和1068 AmpG-信号转导物
ORF00535  1069和1070 推定的多肽酶-蛋白酶
ORF00536  1071和1072 BolA蛋白
ORF00537  1073和1074 保守性假拟蛋白
ORF00538  1075和1076 引发蛋白(TF)(tig)
ORF00539  1077和1078 保守性假拟蛋白
ORF00540  1079和1080 引发蛋白(tig)[5.2.1.8]
ORF00541  1081和1082 ATP依赖性Clp蛋白酶,蛋白水解亚基ClpP(clpP)[3.4.21.92]
ORF00542  1083和1084 ATP依赖性Clp蛋白酶,ATP结合亚基ClpX(clpX)
ORF00543  1085和1086 ATP依赖性Clp蛋白酶La(Ion)[3.4.21.53]
ORF00544  1087和1088 DNA结合蛋白HU-β,NS1(HU)
ORF00545  1089和1090 肽基-脯氨酰顺反异构酶D(PPI酶D)(旋转异构酶D)[5.2.1.8]
ORF00546  1091和1092 DNA摄取蛋白
ORF00547  1093和1094 预测的硫酯酶
ORF00548  1095和1096 exsB蛋白
ORF00549  1097和1098 保守性假拟蛋白
ORF00550  1099和1100 Cof蛋白
ORF00551  1101和1102 转录调节物,AsnC家族
ORF00552  1103和1104 多药耐药样ATP-结合蛋白mdlA(atp)
ORF00553  1105和1106 多药耐药样ATP-结合蛋白Mdl
ORF00554  1107和1108 谷氨酰胺合成酶活性调节蛋白
ORF00555  1109和1110 铵转运蛋白(amt)
ORF00556  1111和1112 酰基-CoA硫酯酶II(tesB)[3.1.2.-]
ORF00557  1113和1114 假拟蛋白
ORF00558  1115和1116 糖蛋白-多糖代谢
ORF00559  1117和1118 预测的甲基化DNA-蛋白半胱氨酸甲基转移酶
ORF00560  1119和1120 功能未知的蛋白质(DUF1428)超家族
ORF00561  1121和1122 EAL结构域蛋白
ORF00562  1123和1124 保守性假拟蛋白
ORF00563  1125和1126 麦芽糖O-乙酰基转移酶[2.3.1.79]
ORF00564  1127和1128 假拟蛋白
ORF00565  1129和1130 Hha蛋白
ORF00566  1131和1132 YmoB
ORF00567  1133和1134 吖啶黄素抗性蛋白B
ORF00568  1135和1136 吖啶黄素抗性蛋白A前体
ORF00569  1137和1138 HTH-型转录调节物acrR(可能的acrAB操纵子阻抑物)(acrEF)
ORF00570  1139和1140 钾外流系统kefA
ORF00571  1141和1142 保守性假拟蛋白
ORF00572  1143和1144 引发体复制蛋白N
ORF00573  1145和1146 功能未知的蛋白质(DUF454)家族
ORF00574  1147和1148 假拟蛋白
ORF00575  1149和1150 腺嘌呤磷酸核糖基转移酶(apt)[2.4.2.7]
ORF00576  1151和1152 DNA聚合酶III,γ和τ亚基,程序性(dnaX)[2.7.7.7]
ORF00577  1153和1154 保守性假拟蛋白TIGR00103
ORF00578  1155和1156 重组蛋白RecR(recR)
ORF00579  1157和1158 侣伴蛋白htpG (热激蛋白htpG) (高温蛋白G)(热激蛋白C62.5) (htpG)
ORF00580  1159和1160 腺苷酸激酶
ORF00581  1161和1162 亚铁螯合酶(hemH)[4.99.1.1]
ORF00582  1163和1164 乙酰酯酶[3.1.1.-]
ORF00583  1165和1166 肌苷-鸟苷激酶[2.7.1.73]
ORF00584  1167和1168 RosB
ORF00585  1169和1170 马薄荷油抗性蛋白(CAMP)
ORF00586  1171和1172 蛋白ushA前体[白金:UDP-糖水解酶(UDP-糖二磷酸酶)
ORF00587  1173和1174 假拟蛋白
ORF00588  1175和1176 假拟蛋白
ORF00589  1177和1178 ybaK-ebsC蛋白(ybaK)
ORF00590  1179和1180 GumN蛋白超家族
ORF00591  1181和1182 可能的杀伤蛋白VCA0391
ORF00592  1183和1184 未命名蛋白产物;与毒力相关蛋白A(vapA)有些相似
ORF00593  1185和1186 铜-转运P-型ATP酶[3.6.1.-]
ORF00594  1187和1188 K-3型谷氨酰胺酶[3.5.1.2]
ORF00595  1189和1190 推定的氨基酸通透酶家族蛋白
ORF00596  1191和1192 Cu(I)-反应性转录调节物(cueR)
ORF00597  1193和1194 假拟蛋白
ORF00598  1195和1196 推定的脂蛋白
ORF00599  1197和1198 粘附素-侵袭素-样蛋白
ORF00600  1199和1200 保守性假拟蛋白
ORF00601  1201和1202 膜蛋白
ORF00602  1203和1204 条带7-Mec-2家族蛋白
ORF00603  1205和1206 ABC转运蛋白,ATP结合蛋白
ORF00604  1207和1208 推定的膜蛋白
ORF00605  1209和1210 ybbN蛋白
ORF00606  1211和1212 氧化还原酶,短链脱氢酶-还原酶家族(SDR)[1.-.-.-]
ORF00607  1213和1214 酰基-coA硫酯酶前体[3.1.2.-]
ORF00608  1215和1216 ABC转运蛋白,ATP结合蛋白
ORF00609  1217和1218 通透酶,推定的结构域蛋白
ORF00610  1219和1220 YbbB
ORF00611  1221和1222 allS
ORF00612  1223和1224 脲基乙醇酸水解酶(allA)[3.5.3.19]
ORF00613  1225和1226 尿囊素的负调节蛋白和乙醛酸利用操纵子(转录调节蛋白allR)
ORF00614  1227和1228 乙醛酸聚醛酶(gcl)[4.1.1.47]
ORF00615  1229和1230 羟基丙酮酸异构酶[5.3.1.22]
ORF00616  1231和1232 2-羟基-3-氧代丙酸还原酶[1.1.1.60]
ORF00617  1233和1234 推定的胞嘧啶-嘌啉-尿嘧啶-硫胺-尿囊素通透酶家族蛋白
ORF00618  1235和1236 尿囊素酶[3.5.2.5]
ORF00619  1237和1238 推定的嘌啉通透酶ybbY
ORF00620  1239和1240 甘油酸激酶1
ORF00621  1241和1242 GlxB6
ORF00622  1243和1244 尿囊酸酰胺水解酶(部分)
ORF00623  1245和1246 脲基乙醇酸脱氢酶[1.1.1.154]
ORF00624  1247和1248 蛋白fdrA
ORF00625  1249和1250 保守性假拟蛋白
ORF00626  1251和1252 功能未知的蛋白(DUF1116)超家族
ORF00627  1253和1254 保守性假拟蛋白
ORF00628  1255和1256 氨基甲酸激酶(arcC)[2.7.2.2]
ORF00629  1257和1258 磷酸核糖基氨基咪唑羧化酶,ATP酶亚基(purK)[4.1.1.21]
ORF00630  1259和1260 磷酸核糖基氨基咪唑羧化酶,催化亚基(purE)[4.1.1.21]
ORF00631  1261和1262 保守性假拟蛋白
ORF00632  1263和1264 UDP-2,3-二酰基葡糖胺水解酶(IpxH)[3.6.1.-]
ORF00633  1265和1266 肽基-脯氨酰顺反异构酶B(ppiB)
ORF00634  1267和1268 半胱胺酰-tRNA合成酶(cysS)[6.1.1.16]
ORF00635  1269和1270 预测的膜结合金属依赖性水解酶(DUF457)家族
ORF00636  1271和1272 未表征的ACR相关蛋白
ORF00637  1273和1274 5,10-亚甲基-四氢叶酸脱氢酶(folD)[1.5.1.5]
ORF00638  1275和1276 原噬菌体DLP12整合酶(原始菌体QSR’整合酶)
ORF00639  1277和1278 保守性假拟蛋白
ORF00640  1279和1280 Gp37
ORF00641  1281和1282 保守性假拟蛋白
ORF00642  1283和1284 Sb36
ORF00643  1285和1286 保守性假拟蛋白
ORF00644  1287和1288 由原噬菌体CP-933N编码的未知蛋白
ORF00645  1289和1290 抗终止蛋白Q
ORF00646  1291和1292 由原噬菌体CP-933O编码的未知蛋白
ORF00647  1293和1294 DNA腺嘌啉-甲基化酶
ORF00648 1295和1296 裂解蛋白
ORF00649 1297和1298 保守性假拟蛋白
ORF00650 1299和1300 功能未知的蛋白质(DUF1327)超家族
ORF00651 1301和1302 溶酶体(裂解蛋白)(胞壁酸酶)(内溶素)[3.2.1.17]
ORF00652 1303和1304 脂蛋白Rzl前体-相关蛋白
ORF00653 1305和1306 噬菌体裂解蛋白
ORF00654 1307和1308 λ原噬菌体的DLP12的Bor蛋白同源物
ORF00655 1309和1310 假拟蛋白
ORF00656 1311和1312 原噬菌体内编码的部分tonB样膜蛋白
ORF00657 1313和1314 保守性假拟蛋白
ORF00658 1315和1316 末端酶小亚基(DNA包装蛋白NUI)(片段)
ORF00659 1317和1318 噬菌体末端酶大亚基(GpA)
ORF00660 1319和1320 gpW
ORF00661 1321和1322 噬菌体门蛋白,λ家族
ORF00662 1323和1324 头-尾预连接蛋白GP5
ORF00663 1325和1326 噬菌体λ头装饰蛋白D
ORF00664 1327和1328 噬菌体主要衣壳蛋白E
ORF00665 1329和1330 DNA包装蛋白FI
ORF00666 1331和1332 噬菌体头尾连接
ORF00667 1333和1334 原噬菌体小尾蛋白Z(GPZ)
ORF00668 1335和1336 噬菌体小尾蛋白U
ORF00669 1337和1338 主要尾蛋白V
ORF00670 1339和1340 噬菌体小尾蛋白G
ORF00671 1341和1342 小尾蛋白
ORF00672 1343和1344 尾长卷尺蛋白前体
ORF00673 1345和1346 噬菌体尾卷尺蛋白,λ家族
ORF00674 1347和1348 噬菌体小尾蛋白L
ORF00675 1349和1350 原噬菌体的推定尾丝组件K
ORF00676 1351和1352 噬菌体λ尾装配蛋白I
ORF00677 1353和1354 宿主特异性蛋白(部分)
ORF00678 1355和1356 宿主特异性蛋白(部分)
ORF00679 1357和1358 Lom
ORF00680 1359和1360 保守性假拟蛋白
ORF00681 1361和1362 保守性假拟蛋白
ORF00682 1363和1364 保守性假拟蛋白
ORF00683 1365和1366 保守性假拟蛋白
ORF00684 1367和1368 λ原噬菌体的尾丝装配蛋白同源物
ORF00685 1369和1370 推定的蛋白酶
ORF00686 1371和1372 蛋白酶VII前体(Omptin)(外膜蛋白3 B)(蛋白酶A) (SopA)
ORF00687 1373和1374 原噬菌体DLP12整合酶(原噬菌体QSR′整合酶)
ORF00688 1375和1376 λ(噬菌体)的尾丝装配蛋白同源物
ORF00689 1377和1378 蛋白酶VII前体(Omptin)(外膜蛋白3B) (蛋白酶A) (SopA)
ORF00690 1379和1380 保守性假拟蛋白
ORF00691 1381和1382 噬菌体N4吸附蛋白A前体
ORF00692 1383和1384 噬菌体N4吸附蛋白NfrB
ORF00693 1385和1386 假拟蛋白
ORF00694 1387和1388 传感蛋白激酶cusS E.7.3.-]
ORF00695 1389和1390 转录调节蛋白cusR
ORF00696 1391和1392 阳离子外流系统蛋白cusC前体
ORF00697 1393和1394 阳离子外流系统蛋白cusF前体
ORF00698  1395和1396 阳离子外流系统蛋白cusB前体
ORF00699  1397和1398 阳离子外流系统蛋白cusA(CzcA)
ORF00700  1399和1400 苯丙氨酸-特异性通透酶
ORF00701  1401和1402 推定转运
ORF00702  1403和1404 对氧气不敏感的NAD(P)H硝基还原酶[1.-.-.-]
ORF00703  1405和1406 细菌中的未表征的蛋白保守性
ORF00704  1407和1408 功能未知的蛋白质(DUF1158)超家族
ORF00705  1409和1410 推定的谷氨酸-半胱氨酸连接酶家族2
ORF00706  1411和1412 4-磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶entD
ORF00707  1413和1414 铁肠菌素受体前体
ORF00708  1415和1416 保守性假拟蛋白
ORF00709  1417和1418 肠原体酯酶
ORF00710  1419和1420 mbtH蛋白相关蛋白
ORF00711  1421和1422 肠菌素合成酶组件F[2.7.7.-]
ORF00712  1423和1424 铁肠菌素转运蛋白fepE(肠原体)
ORF00713  1425和1426 铁exochelin摄取(fxuB)
ORF00714  1427和1428 铁exochelin摄取(fxuA)
ORF00715  1429和1430 铁exochelin摄取(fxuC)
ORF00716  1431和1432 推定的膜蛋白
ORF00717  1433和1434 铁肠菌素(肠原体)结合蛋白;周质组件
ORF00718  1435和1436 异分支酸合酶[5.4.99.6]
ORF00719  1437和1438 2,3-二氢水杨酸-AMP连接酶[2.7.7.58]
ORF00720  1439和1440 异分支酸酶(异分支酸裂合酶)(2,3-二氢-2,3-二氢水杨酸合酶)
ORF00721  1441和1442 氧化还原酶,短链脱氢酶-还原酶家族[1.3.1.28]
ORF00722  1443和1444 假拟UPF0152蛋白ybdB (p15)
ORF00723  1445和1446 碳饥饿蛋白A
ORF00724  1447和1448 未表征的小蛋白
ORF00725  1449和1450 甘油脱氢酶[1.1.-.-]
ORF00726  1451和1452 I类氨基转移酶[2.6.1.-]
ORF00727  1453和1454 未命名蛋白产物;ORF ID:o166#4
ORF00728  1455和1456 保守性假拟蛋白
ORF00729  1457和1458 假拟转录调节物ybdO(orf2)
ORF00730  1459和1460 巯基:二硫键交换蛋白dsbG前体
ORF00731  1461和1462 烷基氢过氧化物还原酶c22蛋白[1.6.4.-]
ORF00732  1463和1464 烷基氢过氧化物还原酶F52A蛋白[1.6.4.-]
ORF00733  1465和1466 通用应激蛋白G
ORF00734  1467和1468 核苷二磷酸激酶的调节物
ORF00735  1469和1470 核糖核酸酶I前体[3.1.27.6]
ORF00736  1471和1472 柠檬酸载体-转运蛋白(反向转运)
ORF00737  1473和1474 三磷酸核糖基-脱磷酸-CoA合酶(citG)[2.7.8.25]
ORF00738  1475和1476 Apo-柠檬酸裂合酶磷酸核糖基-脱磷酸-CoA转移酶(citX)[2.7.7.-]
ORF00739  1477和1478 柠檬酸裂合酶,α亚基(citF)[2.8.3.10]
ORF00740  1479和1480 柠檬酸裂合酶,β亚基(citE)[4.1.3.6]
ORF00741  1481和1482 柠檬酸裂合酶酰基载体蛋白(citD)
ORF00742  1483和1484 柠檬酸裂合酶连接酶(citC)[6.2.1.221
ORF00743  1485和1486 传感蛋白激酶dpiB
ORF00744  1487和1488 转录调节蛋白dpiA (质粒遗传的去稳定剂)
ORF00745  1489和1490 转运二羧酸
ORF00746  1491和1492 CrcA蛋白
ORF00747  1493和1494 冷激样蛋白cspE
 ORF00748  1495和1496 crcB蛋白(crcB)
 ORF00749  1497和1498 腈水解酶
 ORF00750  1499和1500 Sec-非依赖型蛋白转位酶蛋白tarA (YIGT)
 ORF00751  1501和1502 硫辛酸合成酶(lipA)
 ORF00752  1503和1504 硫辛酸-蛋白连接酶B (lipB)
 ORF00753  1505和1506 UPF0250蛋白
 ORF00754  1507和1508 青霉素-结合蛋白5 (PBP)[3.4.16.4]
 ORF00755  1509和1510 稀有脂蛋白A前体(rlpA)
 ORF00756  1511和1512 保守性假拟蛋白
 ORF00757  1513和1514 杆形-决定蛋白RodA(rodA)
 ORF00758  1515和1516 青霉素-结合蛋白2(PBP-2)(PBP)
 ORF00759  1517和1518 青霉素-结合蛋白2(PBP-2)(PBP)
 ORF00760  1519和1520 保守性假拟蛋白TIGR00246
 ORF00761  1521和1522 未命名蛋白产物
 ORF00762  1523和1524 推定的磷酸甘油酸变位酶家族蛋白[3.1.3.73]
 ORF00763  1525和1526 烟酸(烟酰胺)核苷酸腺苷酰基转移酶(nadD)[2.7.7.18]
 ORF00764  1527和1528 DNA聚合酶III,δ亚基(holA)[2.7.7.7]
 ORF00765  1529和1530 小脂蛋白
 ORF00766  1531和1532 亮氨酰-tRNA合成酶(leuS)[6.1.1.4]
 ORF00767  1533和1534 接受甲基的趋化性蛋白
 ORF00768  1535和1536 肌苷-尿苷核苷N-核糖水解酶(AL355920)
 ORF00769  1537和1538 谷氨酸-天冬氨酸转运ATP结合蛋白gltL
 ORF00770  1539和1540 谷氨酸-天冬氨酸转运系统gltK(膜)
 ORF00771  1541和1542 谷氨酸-天冬氨酸转运系统gltJ
 ORF00772  1543和1544 谷氨酸-天冬氨酸ABC转运蛋白,周质谷氨酸-天冬氨酸结合蛋白,截短
 ORF00773  1545和1546 菱形家族
 ORF00774  1547和1548 载脂蛋白N-酰基转移酶(ALP N-酰基转移酶)(铜内稳态蛋白cutE)[2.3.1.-]
 ORF00775  1549和1550 镁和钴外流蛋白corC(tlyC)
 ORF00776  1551和1552 预测的金属依赖性水解酶
 ORF00777  1553和1554 PhoH样蛋白
 ORF00778  1555和1556 tRNA-i(6)A37硫转移酶MiaB(miaB)
 ORF00779  1557和1558 2-八异戊二烯基-3-甲基-6-甲氧基-1,4-苯并醌醇羟化酶
 ORF00780  1559和1560 天冬酰胺合成酶B[谷氨酰胺-水解]
 ORF00781  1561和1562 nagD蛋白,简并
 ORF00782  1563和1564 N-胰腺葡糖胺阻抑物
 ORF00783  1565和1566 N-乙酰葡糖胺-6-磷酸脱乙酰酶(nagA)[3.5.1.25]
 ORF00784  1567和1568 葡糖胺-6磷酸异构酶(nagB)[3.5.99.6]
 ORF00785  1569和1570 PTS系统,N-乙酰基葡糖胺-特异性IIABC组件F(EII-Nag)[2.7.1.69]
 ORF00786  1571和1572 推定的膜蛋白
 ORF00787  1573和1574 假拟蛋白
 ORF00788  1575和1576 假拟蛋白
 ORF00789  1577和1578 假拟蛋白
 ORF00790  1579和1580 TerC蛋白
 ORF00791  1581和1582 TerC蛋白
 ORF00792  1583和1584 二氢皮考啉酸合酶(AE004999)[42.1.52]
 ORF00793  1585和1586 推定的醇脱氢酶(U59485)
 ORF00794  1587和1588 推定的内膜蛋白
 ORF00795  1589和1590 4-羟基苏氨酸-4-磷酸脱氢酶(pdxA)[1.1.1.262]
 ORF00796  1591和1592 推定的糖代谢的转录调节物
 ORF00797  1593和1594 谷氨酰胺酰-tRNA合成酶(glnS)[6.1.1.18]
 ORF00798  1595和1596 假拟蛋白
 ORF00799  1597和1598 未命名蛋白产物;ORFID:o172#6
 ORF00800  1599和1600 假拟脂蛋白ybfN前体
 ORF00801  1601和1602 摄铁调节蛋白(摄铁调节物)
 ORF00802  1603和1604 黄素氧还蛋白1
 ORF00803  1605和1606 脲酰胺裂合酶相关蛋白
 ORF00804  1607和1608 脲酰胺裂合酶相关蛋白
 ORF00805  1609和1610 SeqA蛋白
 ORF00806  1611和1612 磷酸葡糖变位酶,α-D-葡萄糖磷酸特异性(pgm)[5.4.2.2]
 ORF00807  1613和1614 腐胺-鸟氨酸反向转运蛋白(腐胺转运蛋白) (potE)
 ORF00808  1615和1616 诱导型鸟氨酸脱羧酶(speF)[4.1.1.17]
 ORF00809  1617和1618 保守性假拟蛋白
 ORF00810  1619和1620 假拟蛋白
 ORF00811  1621和1622 kdpE
 ORF00812  1623和1624 推定的传感蛋白组氨酸激酶KdpD
 ORF00813  1625和1626 K+-转运ATP酶,C亚基(kdpC)[3.6.3.12]
 ORF00814  1627和1628 K+-转运ATP酶,B亚基(kdpB) [3.6.3.12]
 ORF00815  1629和1630 K+-转运ATP酶,A亚基(kdpA)[3.6.3.12]
 ORF00816  1631和1632 K+-转运ATP酶,F亚基(kdpF)[3.6.3.12]
 ORF00817  1633和1634 保守性假拟蛋白
 ORF00818  1635和1636 未表征的保守蛋白(orf169)
 ORF00819  1637和1638 脱氧核糖二嘧啶光裂合酶[4.1.99.3]
 ORF00820  1639和1640 PTR2-家族转运蛋白STY0750
 ORF00821  1641和1642 保守性假拟蛋白TIGR00486
 ORF00822  1643和1644 保守性假拟蛋白TIGR00370
 ORF00823  1645和1646 脲酰胺裂合酶相关蛋白
 ORF00824  1647和1648 LamB-YcsF家族蛋白(lamB)
 ORF00825  t649和1650 推定的甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶[3.2.-.-]
 ORF00826  1651和1652 推定的膜蛋白
 ORF00827  1653和1654 ybgO蛋白
 ORF00828  1655和1656 柠檬酸合酶I(gltA)[2.3.3.1]
 ORF00829  1657和1658 琥珀酸脱氢酶细胞色素b-556亚基(AF007569)
 ORF00830  1659和1660 琥珀酸脱氢酶疏水性膜锚定蛋白(sdhD)[1.3.99.1]
 ORF00831  1661和1662 琥珀酸脱氢酶,黄素蛋白亚基(sdhA)
 ORF00832  1663和1664 琥珀酸脱氢酶,铁硫蛋白[1.3.99.1]
 ORF00833  1665和1666 2-酮戊二酸脱氢酶,E1组件(sucA)[1.2.4.2]
 ORF00834  1667和1668 2-酮戊二酸脱氢酶,E2组件,二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶(sucR)[2.3.1.61]
 ORF00835  1669和1670 2-酮戊二酸脱氢酶复合物的二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶组件[2.3.1.61]
 ORF00836  1671和1672 琥珀酰-CoA合成酶,β链(SCS-β)(sucC)[6.2.1.5]
 ORF00837  1673和1674 琥珀酰-CoA合成酶,α亚基(sucD)[6.2.1.5]
 ORF00838  1675和1676 未表征的蛋白,可能位于表面
 ORF00839  1677和1678 假拟蛋白
 ORF00840  1679和1680 细胞色素d泛醇氧化酶链I[相似性][1.10.3.-]
 ORF00841  1681和1682 细胞色素d泛醇氧化酶,亚基II(cydB)[1.10.3.-]
 ORF00842  1683和1684 cyd操纵子蛋白YbgT相关蛋白
 ORF00843  1685和1686 cyd操纵子蛋白YbgE
 ORF00844  1687和1688 预测的硫酯酶
 ORF00845  1689和1690 TolQ蛋白
 ORF00846  1691和1692 TolR蛋白(tolR)
 ORF00847  1693和1694 TolA蛋白
ORF00848  1695和1696 TolA蛋白
ORF00849  1697和1698 TolB(tolB)
ORF00850  1699和1700 肽聚糖-相关性脂蛋白前体
ORF00851  1701和1702 YboF蛋白
ORF00852  1703和1704 喹啉酸合成酶复合物,A亚基(nadA)
ORF00853  1705和1706 蛋白pnuC
ORF00854  1707和1708 阳离子外流家族蛋白(外流)
ORF00855  1709和1710 保守性假拟蛋白
ORF00856  1711和1712 磷酸-脱氢-脱氧庚酸醛缩酶[2.5.1.54]
ORF00857  1713和1714 假拟蛋白
ORF00858  1715和1716 磷酸甘油酸变位酶1
ORF00859  1717和1718 醛糖1-差向异构酶
ORF00860  1719和1720 半乳糖激酶(qalK)[2.7.1.61
ORF00861  1721和1722 半乳糖-1-磷酸尿苷酰转移酶(gaiT)[2.7.7.10]
ORF00862  1723和1724 UDP-葡萄糖4-差向异构酶(galE) [5.1.3.2]
ORF00863  1725和1726 钼酸转运系统的ATP结合组件(atp结合)
ORF00864  1727和1728 假拟蛋白
ORF00865  1729和1730 转录调节五modE(modE)
ORF00866  1731和1732 保守性假拟蛋白
ORF00867  1733和1734 钼酸ABC转运蛋白,周质钼酸-结合蛋白(modA)
ORF00868  1735和1736 钼酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白(modB)
ORF00869  1737和1738 钼酸ABC转运蛋白,ATP结合蛋白(modC)[3.6.3.29]
ORF00870  1739和1740 推定的磷酸酶
ORF00871  1741和1742 保守性假拟蛋白
ORF00872  1743和1744 vbhD蛋白
ORF00873  1745和1746 FIdA蛋白
ORF00874  1747和1748 2-酮戊二酸-苹果酸转运蛋白同源物yflS(SODiT1)
ORF00875  1749和1750 推定的顺乌头酸水合酶
ORF00876  1751和1752 可能的果胶酯酶前体
ORF00877  1753和1754 保守性假拟蛋白TIGR00481
ORF00878  1755和1756 腺苷甲硫氨酸-8-氨基-7-氧代壬酸氨基转移酶(bioA)[2.6.1.62]
ORF00879  1757和1758 生物素合酶(bioB/[2.8.1.61
ORF00880  1759和1760 8-氨基-7-氧代壬酸合酶(bioF)[2.3.1.47]
ORF00881  1761和1762 生物素生物合成蛋白BioC(bioC)
ORF00882  1763和1764 脱硫生物素合成酶(DTBS)
ORF00883  1765和1766 噬菌体小尾蛋白
ORF00884  1767和1768 噬菌体小尾蛋白L
ORF00885  1769和1770 推定的原噬菌体尾丝组件K
ORF00886  1771和1772 小尾蛋白前体H
ORF00887  1773和1774 噬菌体小尾蛋白
ORF00888  1775和1776 噬菌体小尾蛋白L
ORF00889  1777和1778 推定的噬菌体尾组件
ORF00890  1779和1780 噬菌体小尾蛋白L
ORF00891  1781和1782 推定的噬菌体尾组件
ORF00892  1783和1784 噬菌体小尾蛋白L
ORF00893  1785和1786 推定的原噬菌体尾丝组件K
ORF00894  1787和1788 推定的原噬菌体尾丝组件K
ORF00895  1789和1790 λ噬菌体尾装配蛋白I
ORF00896  1791和1792 宿主特异性蛋白(部分)
ORF00897  1793和1794 尾装配蛋白
ORF00898  1795和1796 噬菌体λ尾装配蛋白I
ORF00899  1797和1798 宿主特异性蛋白(部分)
ORF00900   1799和1800 推定的噬菌体尾组件(部分)
ORF00901   1801和1802 假拟蛋白
ORF00902   1803和1804 保守性假拟蛋白
ORF00903   1805和1806 保守性假拟蛋白
ORF00904   1807和1808 保守性假拟蛋白
ORF00905   1809和1810 SitD蛋白(AF128999)
ORF00906   1811和1812 SitC蛋白(AF128999)
ORF00907   1813和1814 SitB蛋白(AF128999)
ORF00908   1815和1816 周质结合蛋白(螯合)
ORF00909   1817和1818 推定的转座酶
ORF00910   1819和1820 保守性假拟蛋白
ORF00911   1821和1822 异柠檬酸脱氢酶[1.1.1.42]
ORF00912   1823和1824 ydfO蛋白
ORF00913   1825和1826 假拟的转录调节蛋白ycgE
ORF00914   1827和1828 保守性假拟蛋白
ORF00915   1829和1830 采用FAD家族的蓝光传感蛋白
ORF00916   1831和1832 可能的膜蛋白b1168(o528)
ORF00917   1833和1834 保守性假拟蛋白
ORF00918   1835和1836 保守性假拟蛋白
ORF00919   1837和1838 保守性假拟蛋白
ORF00920   1839和1840 保守性假拟蛋白
ORF00921   1841和1842 推定的转运系统ATP结合组件
ORF00922   1843和1844 细胞分裂拓扑特异性因子MinE(minE)
ORF00923   1845和1846 细胞分裂抑制物MinD
ORF00924   1847和1848 尾装配蛋白
ORF00925   1849和1850 宿主特异性蛋白J(部分)
ORF00926   1851和1852 宿主特异性蛋白(部分)
ORF00927   1853和1854 外切核酸酶ABC,B亚基(uvrB)
ORF00928   1855和1856 未表征的保守的膜结合蛋白
ORF00929   1857和1858 钼辅因子生物合成蛋白A
ORF00930   1859和1860 钼辅因子生物合成蛋白B
ORF00931   1861和1862 钼辅因子生物合成蛋白C(moaC)
ORF00932   1863和1864 钼蝶呤转化因子亚基1(MPT)
ORF00933   1865和1866 钼蝶呤转化因子亚基2
ORF00934   1867和1868 保守性假拟蛋白
ORF00935   1869和1870 膜蛋白(SAD)
ORF00936   1871和1872 假拟蛋白
ORF00937   1873和1874 推定的未表征的蛋白家族UPF0005
ORF00938   1875和1876 推定的膜蛋白
ORF00939   1877和1878 磷脂酶家族蛋白[2.7.8.-]
ORF00940   1879和1880 内切核酸酶-外切核酸酶-磷酸酶家族蛋白
ORF00941   1881和1882 ABC转运蛋白,通透酶蛋白,推定
ORF00942   1883和1884 保守性假拟蛋白
ORF00943   1885和1886 ElsD(膜)
ORF00944   1887和1888 ABC转运蛋白,ATP结合性-通透酶蛋白
ORF00945   1889和1890 假拟膜蛋白ybhG
ORF00946   1891和1892 可能的转录调节蛋白ybiH
ORF00947   1893和1894 超家族II DNA和RNA解旋酶
ORF00948   1895和1896 GTP环化水解酶II(F160)
ORF00949   1897和1898 可能的ATP依赖性解旋酶
ORF00950   1899和1900 糖基转移酶家族蛋白(o320)[2.4.2.18]
ORF00951   1901和1902 YbiC(o361)[1.1.1.-]
ORF00952  1903和1904 功能未知的蛋白质(DUF1471)超家族
ORF00953  1905和1906 TmR
ORF00954  1907和1908 铁调性外膜蛋白
ORF00955  1909和1910 用于铁转运的TonB-依赖性受体XF0599(III)
ORF00956  1911和1912 假拟蛋白
ORF00957  1913和1914 功能未知的蛋白质(DUF1471)家族
ORF00958  1915和1916 功能未知的蛋白质(DUF890)超家族
ORF00959  1917和1918 推定转运蛋白
ORF00960  1919和1920 谷氨酰胺高亲和转运系统的ATP-结合细件(atp结合)
ORF00961  1921和1922 氨基酸ABC转运蛋白,氨基酸-结合-通透酶蛋白
ORF00962  1923和1924 氨基酸ABC转运蛋白,氨基酸-结合-通透酶蛋白(GlnH)
ORF00963  1925和1926 全局调节物,饥饿条件
ORF00964  1927和1928 转运蛋白,EamA家族
ORF00965  1929和1930 外膜蛋白X
ORF00966  1931和1932 Dca
ORF00967  1933和1934 转录调节物mntR(锰转运调节蛋白)
ORF00968  1935和1936 转运蛋白,NadC-P-Pho87家族,推定
ORF00969  1937和1938 蛋白ybiS前体
ORF00970  1939和1940 ABC转运蛋白ATP-结合蛋白
ORF00971  1941和1942 水解酶,卤代酸脱卤酶样家族
ORF00972  1943和1944 丙酮酸甲酸-裂合酶[2.3.1.54]
ORF00973  1945和1946 铁依赖性丙酮酸盐甲酸-裂合酶-活化酶(pflC)[1.97.1.4]
ORF00974  1947和1948 推定的转醛酶
ORF00975  1949和1950 钼蝶呤合酶磺酰基酶MoeB(moeB)
ORF00976  1951和1952 钼蝶呤生物合成蛋白moeA (moeA)
ORF00977  1953和1954 天冬酰胺酶[3.5.1.1]
ORF00978  1955和1956 bcr 5′区中假拟的ABC转运蛋白ATP结合蛋白。(D90720)
ORF00979  1957和1958 血红素-结合蛋白前体(高铁血红素-结合脂蛋白)。
ORF00980  1959和1960 ABC转运蛋白通透酶蛋白(通透酶)
ORF00981  1961和1962 肽ABC转运蛋白,通透酶蛋白
ORF00982  1963和1964 EAL结构域蛋白
ORF00983  1965和1966 假拟膜蛋白yliF
ORF00984  1967和1968 MiaB样tRNA修饰酶YliG,TIGR01125
ORF00985  1969和1970 保守性假拟蛋白
ORF00986  1971和1972 lppZ
ORF00987  1973和1974 谷胱甘肽S-转移酶
ORF00988  1975和1976 青霉素-结合蛋白6前体(PBP)[3.4.16.4]
ORF00989  1977和1978 脱氧核糖操纵子阻抑物(AE006172)
ORF00990  1979和1980 未命名蛋白产物
ORF00991  1981和1982 假拟蛋白
ORF00992  1983和1984 多药转位酶mdfA
ORF00993  1985和1986 保守性假拟蛋白
ORF00994  1987和1988 水解酶,卤代酸脱卤酶样家族
ORF00995  1989和1990 主要易化超家族亚家族
ORF00996  1991和1992 推定的转录调节物,TetR家族
ORF00997  1993和1994 TrkA,钾通道-家族蛋白
ORF00998  1995和1996 保守性假拟蛋白
ORF00999  1997和1998 谷氨酸氧化还原酶(谷氧还蛋白),GrxA家族(grxA)
ORF01000  1999和2000 功能未知的蛋白质(DUF1418)超家族
ORF01001  2001和2002 对氧气不敏感的NADPH硝基还原酶[1.-.-.-]
ORF01002  2003和2004 核糖体蛋白$6 modifi阳离子蛋白
ORF01003  2005和2006 推定传感转导调节物
ORF01004  2007和2008 腐胺结合性周质蛋白前体
ORF01005  2009和2010 腐胺转运ATP-结合蛋白potG(atp结合)
ORF01006  2011和2012 腐胺ABC转运蛋白,通透酶蛋白(膜)
ORF01007  2013和2014 腐胺转运系统通透酶蛋白potl
ORF01008  2015和2016 保守性假拟蛋白
ORF01009  2017和2018 23S rRNA(尿嘧啶-5-)-甲基转移酶RumB (rumB)[2.1.1.-]
ORF01010  2019和2020 精氨酸-结合性周质蛋白2前体
ORF01011  2021和2022 精氨酸转运系统通透酶蛋白artM (膜)
ORF01012  2023和2024 精氨酸转运系统通透酶蛋白artQ(artQ)
ORF01013  2025和2026 精氨酸-结合性周质蛋白1前体
ORF01014  2027和2028 精氨酸转运ATP-结合蛋白artP
ORF01015  2029和2030 推定的脂蛋白ybjP前体
ORF01016  2031和2032 保守性蛋白
ORF01017  2033和2034 N-乙酰基胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶结构域蛋白[3.5.1.28]
ORF01018  2035和2036 保守性假拟蛋白
ORF01019  2037和2038 COG0702:预测的核苷-二磷酸-糖差向异构酶,推定
ORF01020  2039和2040 低特异性L-苏氨酸醛缩酶[4.1.2.5]
ORF01021  2041和2042 丙酮酸盐脱氢酶[1.2.2.2]
ORF01022  2043和2044 铁硫簇结合蛋白
ORF01023  2045和2046 杂交簇蛋白
ORF01024  2047和2048 推定的表面蛋白
ORF01025  2049和2050 水通道蛋白Z
ORF01026  2051和2052 与RecF蛋白同源
ORF01027  2053和2054 SomA(VirG)
ORF01028  2055和2056 大环内酯特异性外流蛋白macA前体
ORF01029  2057和2058 大环内酯特异性ABC型外流载体(外流)
ORF01030  2059和2060 冷激样蛋白cspD
ORF01031  2061和2062 位点特异性重组酶,噬菌体整合酶家族,截短
ORF01032  2063和2064 可能的DNA结合蛋白相关蛋白
ORF01033  2065和2066 假拟蛋白
ORF01034  2067和2068 保守性假拟蛋白
ORF01035  2069和2070 保守性假拟蛋白
ORF01036  2071和2072 假拟噬菌体蛋白
ORF01037  2073和2074 噬菌体P4 DNA引发酶
ORF01038  2075和2076 原噬菌体编码的未知蛋白
ORF01039  2077和2078 单链结合蛋白(SSB) (螺旋去稳定蛋白) (ssb)
ORF01040  2079和2080 假拟蛋白
ORF01041  2081和2082 保守性假拟蛋白
ORF01042  2083和2084 Gifsy-1原噬菌体蛋白
ORF01043  2085和2086 头装饰蛋白(头蛋白GPSHP)
ORF01044  2087和2088 假拟蛋白
ORF01045  2089和2090 头尾预连接蛋白GP5
ORF01046  2091和2092 gpl
ORF01047  2093和2094 原噬菌体编码的未知蛋白
ORF01048  2095和2096 原噬菌体编码的未知蛋白
ORF01049  2097和2098 ATP依赖性Clp蛋白酶衔接子蛋白clpS
ORF01050  2099和2100 丝氨酸蛋白酶的ATP结合组件
ORF01051  2101和2102 ATP依赖性clp蛋白酶ATP结合亚基clpA
ORF01052  2103和2104 CRISPR相关蛋白Cas1(cas1)
ORF01053  2105和2106 未命名蛋白产物;与未知蛋白相似
ORF01054  2107和2108 保守性假拟蛋白
ORF01055  2109和2110 保守性假拟蛋白
 ORF01056  2111和2112 保守性假拟蛋白
 ORF01057  2113和2114 保守性假拟蛋白
 ORF01058  2115和2116 保守性假拟蛋白
 ORF01059  2117和2118 翻译启动因子IF-1(infA)
 ORF01060  2119和2120 亮氨酰-苯基丙氨酰-tRNA-蛋白转移酶(aat)[2.3.2.-]
 ORF01061  2121和2122 转运ATP-结合蛋白cydC
 ORF01062  2123和2124 转运ATP-结合蛋白cydD
 ORF01063  2125和2126 抗限制性蛋白家族
 ORF01064  2127和2128 YeeS蛋白(o160)
 ORF01065  2129和2130 转运ATP-结合蛋白cydD
 ORF01066  2131和2132 硫氧还蛋白-二硫还原酶(trxB)[1.8.1.9]
 ORF01067  2133和2134 亮氨酸-反应性调节蛋白
 ORF01068  2135和2136 细胞分裂蛋白ftsK
 ORF01069  2137和2138 外膜脂蛋白载体蛋白LolA(lolA)
 ORF01070  2139和2140 未命名蛋白产物
 ORF01071  2141和2142 丝氨酰-tRNA合成酶(serS)[6.1.1.11]
 ORF01072  2143和2144 厌氧性二甲亚砜还原酶A链前体(dmsA)[1.8.99.-]
 ORF01073  2145和2146 厌氧性二甲亚砜还原酶B链(dmsB)[1.-.-.-]
 ORF01074  2147和2148 DMSO还原酶锚定亚基(DmsC)(dmsC)[1.8.99.-]
 ORF01075  2149和2150 蛋白ycaC
 ORF01076  2151和2152 假拟MFS-性转运蛋白ycaD
 ORF01077  2153和2154 丙酮酸甲酸裂合酶活化酶1[1.97.1.4]
 ORF01078  2155和2156 噬菌体整合酶
 ORF01079  2157和2158 噬菌体调节蛋白
 ORF01080  2159和2160 gpB
 ORF01081  2161和2162 gp80-相关蛋白
 ORF01082  2163和2164 InsAB′蛋白
 ORF01083  2165和2166 InsA蛋白
 ORF01084  2167和2168 gp81
 ORF01085  2169和2170 TraR蛋白
 ORF01086  2171和2172 gp83
 ORF01087  2173和2174 复制基因A蛋白(GPA)
 ORF01088  2175和2176 gp91
 ORF01089  2177和2178 保守性假拟蛋白
 ORF01090  2179和2180 假拟蛋白
 ORF01091  2181和2182 假拟蛋白
 ORF01092  2183和2184 噬菌体门蛋白,PBSX家族
 ORF01093  2185和2186 推定的末端酶ATP酶亚基(gpP样)
 ORF01094  2187和2188 噬菌体衣壳支架蛋白(GPO)
 ORF01095  2189和2190 衣壳支架蛋白
 ORF01096  2191和2192 噬菌体主要衣壳蛋白,P2家族
 ORF01097  2193和2194 噬菌体小末端酶亚基
 ORF01098  2195和2196 噬菌体头完成蛋白(GPL)
 ORF01099  2197和2198 尾蛋白X(GPX)相关蛋白
 ORF01100  2199和2200 噬菌体穴蛋白家族2
 ORF01101  2201和2202 溶酶体(裂解蛋白)(胞壁酸酶)(内溶素)(蛋白gpK)[3.2.1.17]
 ORF01102  2203和2204 假拟蛋白
 ORF01103  2205和2206 蛋白lvsA
 ORF01104  2207和2208 蛋白lysB(AB008550)
 ORF01105  2209和2210 LysC
 ORF01106  2211和2212 尾完成蛋白R(GPR)
 ORF01107  2213和2214 噬菌体病毒粒体形态发生蛋白
ORF01108  2215和2216 gpV(gpV)
ORF01109  2217和2218 基板装配蛋白W(GPW)IqpW)
ORF01110  2219和2220 基板J样蛋白
0RF01111  2221和2222 gpI(gpI)
ORF01112  2223和2224 gpH
ORF01113  2225和2226 gpG(gpG)
ORF01114  2227和2228 假拟蛋白
ORF01115  2229和2230 噬菌体尾鞘蛋白
ORF01116  2231和2232 噬菌体主要尾管蛋白
ORF01117  2233和2234 噬菌体尾蛋白E
ORF01118  2235和2236 噬菌体尾卷尺蛋白,TP901家族,推定
ORF01119  2237和2238 gpU(gpU)
ORF01120  2239和2240 基因D蛋白(GPD)
ORF01121  2241和2242 Ogr
ORF01122  2243和2244 甲酸乙酰基转移酶(pflB)[2.3.1.54]
ORF01123  2245和2246 可能的甲酸转运蛋白1
0RF01124  2247和2248 未命名蛋白产物
ORF01125  2249和2250 功能未知的蛋白质(DUF421)家族
ORF01126  2251和2252 磷酸丝氨酸氨基转移酶(serC)[2.6.1.52]
ORF01127  2253和2254 3-磷酸莽草酸1-羧基乙烯基转移酶(aroA)[2.5.1.19]
ORF01128  2255和2256 cmk蛋白前体[3.4.24.-]
ORF01129  2257和2258 胞苷酸激酶(cmk)[2.7.4.14]
ORF01130  2259和2260 核糖体蛋白S1/rpsA
ORF01131  2261和2262 相互作用宿主因子,β亚基(ihfB)
ORF01132  2263和2264 DNA内化相关感受态蛋白ComEC-Rec2
ORF01133  2265和2266 脂质A输出ATP结合性通透酶蛋白MsbA(msbA)
ORF01134  2267和2268 四酰基二糖4′-激酶(lpxK)[2.7.1.130]
ORF01135  2269和2270 功能未知的蛋白质(DUF1006)超家族
ORF01136  2271和2272 四酰基二糖-1-P 4′-激酶
ORF01137  2273和2274 3-脱氧-D-甘露糖-辛酮糖酸胞苷酰转移酶(kdsB)[2.7.7.38]
ORF01138  2275和2276 未表征的ACR,COG1434家族
ORF01139  2277和2278 mukF蛋白(杀伤因子KicB)
ORF01140  2279和2280 保守性假拟蛋白
ORF01141  2281和2282 蛋白smtA
ORF01142  2283和2284 染色体分隔蛋白mukF(kicB)
ORF01143  2285和2286 染色体分隔蛋白mukE
ORF01144  2287和2288 细胞分裂蛋白mukB(mukB)
ORF01145  2289和2290 保守性假拟蛋白
ORF01146  2291和2292 功能未知的细菌蛋白(DUF882)超家族
ORF01147  2293和2294 金属-β-内酰胺酶超家族蛋白[3.-.-.-]
ORF01148  2295和2296 天冬氨酸氨基转移酶(aspC)[2.6.1.1]
ORF01149  2297和2298 外膜蛋白F前体(GBP)
ORF01150  2299和2300 天冬酰胺酰-tRNA合成酶(asnS)[6.1.1.221
ORF01151  2301和2302 烟酸磷酸核糖基转移酶(pncB)[2.4.2.11]
ORF01152  2303和2304 氨基肽酶N(peoN)[3.4.11.2]
ORF01153  2305和2306 磺酸ABC转运蛋白,ATP结合亚基SsuB(AF075709)
ORF01154  2307和2308 磺酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白SsuC
ORF01155  2309和2310 烷基磺酸加单氧酶[1.14.14.5]
ORF01156  2311和2312 假拟蛋白
ORF01157  2313和2314 ABC转运蛋白,脂族磺酸结合蛋白
ORF01158  2315和2316 FMN还原酶[1.5.1.29]
 ORF01159  2317和2318 二氢乳清酸氧化酶(pyrD)[1.3.3.1]
 ORF01160  2319和2320 功能未知的蛋白质(DUF1379)超家族
 ORF01161  2321和2322 黄素氧还蛋白还原酶(铁氧还蛋白-NADPH还原酶)家族1
 ORF01162  2323和2324 预测的N6-腺嘌呤特异性DNA甲基化酶
 ORF01163  2325和2326 ABC转运蛋白ATP结合蛋白uup
 ORF01164  2327和2328 假拟蛋白
 ORF01165  2329和2330 对草快-诱导性蛋白A
 ORF01166  2331和2332 对草快-诱导性蛋白B
 ORF01167  2333和2334 功能未知的蛋白质(DUF330)超家族
 ORF01168  2335和2336 核糖体调节因子(蛋白E)相关蛋白
 ORF01169  2337和2338 β-羟基酰基-(酰基-载体-蛋白)脱水酶FabA(fabA)[4.2.1.-]
 ORF01170  2339和2340 未命名蛋白产物
 ORF01171  2341和2342 外膜蛋白A前体
 ORF01172  2343和2344 细胞分裂抑制剂
 ORF01173  2345和2346 假拟膜蛋白TIGR01666(yccS)
 ORF01174  2347和2348 感受态特异性基因的调节蛋白
 ORF01175  2349和2350 功能未知的结构域
 ORF01176  2351和2352 DNA解旋酶IV[3.6.1.-]
 ORF01177  2353和2354 甲基乙二醛合酶(mgsA)[4.2.3.3]
 ORF01178  2355和2356 假拟UPF0319蛋白yccT前体
 ORF01179  2357和2358 蛋白yccU
 ORF01180  2359和2360 半甲基化的DNA结合结构域,推定
 ORF01181  2361和2362 预测的SAM依赖性甲基转移酶
 ORF01182  2363和2364 酰基磷酸酶
 ORF01183  2365和2366 可能的亚硫酸还原酶γ链[1.8.-.-]
 ORF01184  2367和2368 完整的膜蛋白
 ORF01185  2369和2370 氢化酶-1短链前体
 0RF01186  2371和2372 保守性假拟蛋白
 ORF01187  2373和2374 原噬菌体内编码的未知蛋白
 ORF01188  2375和2376 未表征的BCR,COG1636家族
 ORF01189  2377和2378 推定的原噬菌体细胞杀伤蛋白(gef)
 ORF01190  2379和2380 功能未知的蛋白质(DUF1277)超家族
 ORF01191  2381和2382 内切脱氧核糖核酸酶RUS(Holliday连接解离酶) [3.1.22.-]
 ORF01192  2383和2384 隐蔽原噬菌体的抗终止蛋白Q同源物
 ORF01193  2385和2386 假拟蛋白
 ORF01194  2387和2388 未命名蛋白产物;ORF137,长度
 ORF01195  2389和2390 裂解蛋白S.b1556
 ORF01196  2391和2392 假拟噬菌体蛋白
 ORF01197  2393和2394 溶酶体(裂解蛋白)(胞壁酸酶)
 IRF01198  2395和2396 脂蛋白Rz1前体-相关蛋白
 ORF01199  2397和2398 噬菌体裂解蛋白
 ORF01200  2399和2400 Sb56
 ORF01201  2401和2402 噬菌体末端酶,小亚基,推定,P27家族,推定
 ORF01202  2403和2404 噬菌体末端酶,大亚基,推定
 ORF01203  2405和2406 假拟蛋白
 ORF01204  2407和2408 噬菌体门蛋白,HK97家族
 ORF01205  2409和2410 Caudo病毒(caudovirus)前头蛋白酶
 ORF01206  2411和2412 噬菌体主要衣壳蛋白,HK97家族
 ORF01207  2413和2414 来表征的噬菌体蛋白(可能的DNA包装)
 ORF01208  2415和2416 噬菌体头-尾衔接子,推定
 ORF01209  2417和2418 噬菌体蛋白,HK97gp10家族
 ORF01210  2419和2420 Cp11
 ORF0121t  2421和2422 主要尾亚基
 ORF01212  2423和2424 噬菌体尾装配侣伴蛋白
 ORF01213  2425和2426 Gp14
 ORF01214  2427和2428 尾长卷尺蛋白
 ORF01215  2429和2430 噬菌体小尾蛋白L
 ORF01216  2431和2432 推定的原噬菌体尾丝组件K
 ORF01217  2433-和2434 λ噬菌体尾装配蛋白I
 ORF01218  2435和2436 宿主特异性蛋白J(部分)
 ORF01219  2437和2438 宿主特异性蛋白J(部分)
 ORF01220  2439和2440 宿主特异性蛋白(部分)
 ORF01221  2441和2442 Lom
 ORF01222  2443和2444 保守性假拟蛋白
 ORF01223  2445和2446 保守性假拟蛋白
 ORF01224  2447和2448 保守性假拟蛋白
 ORF01225  2449和2450 保守性假拟蛋白
 ORF01226  2451和2452 CdtA
 ORF01227  2453和2454 CdtB
 ORF01228  2455和2456 CdtC
 ORF01229  2457和2458 周质溶质结合蛋白家族
 ORF01230  2459和2460 膜蛋白
 ORF01231  2461和2462 假拟UPF0190蛋白yedY(AE005419)
 ORF01232  2463和2464 运甲状腺素蛋白家族蛋白
 ORF01233  2465和2466 转录激活蛋白CopR,
 ORF01234  2467和2468 组氨酸激酶[2.7.3.-]
 ORF01235  2469和2470 H-NS-阻抑蛋白,30K(Hsp31)
 ORF01236  2471和2472 外膜蛋白N前体(OmpF)
 ORF01237  2473和2474 HD结构域蛋白
 ORF01238  2475和2476 DNA-胞嘧啶甲基转移酶(M,EcoDcm)[2.1.1.37]
 ORF01239  2477和2478 完整的膜蛋白
 ORF01240  2479和2480 斑块(patch)修复蛋白[3.1.-.-]
 ORF01241  2481和2482 功能未知的蛋白
 ORF01242  2483和2484 保守性假拟蛋白
 ORF01243  2485和2486 保守性假拟蛋白
 ORF01244  2487和2488 二鸟苷酸环化酶(GGDEF)结构域蛋白
 ORF01245  2489和2490 甘露糖基-3-磷酸甘油酸磷酸酶相关蛋白[3.1.3.-]
 ORF01246  2491和2492 保守性假拟蛋白
 ORF01247  2493和2494 保守性假拟蛋白
 ORF01248  2495和2496 肠菌酸荚膜生物合成活化蛋白A
 ORF01249  2497和2498 鞭毛生物合成蛋白FliR(fliR)
 ORF01250  2499和2500 鞭毛生物合成蛋白FliQ(fliQ)
 ORF01251  2501和2502 鞭毛生物合成蛋白FliP(fliP)
 ORF01252  2503和2504 末端酶大亚基
 ORF01253  2505和2506 噬菌体末端酶家族蛋白,推定
 ORF01254  2507和2508 假拟蛋白
 ORF01255  2509和2510 Gp45
 ORF01256  2511和2512 保守性假拟蛋白
 ORF01257  2513和2514 Cl蛋白
 ORF01258  2515和2516 转录调节物,Cro-Cl家族相关蛋白
 ORF01259  2517和2518 阻抑物(cll)
 ORF01260  2519和2520 O(DNA复制;299)
 ORF01261  2521和2522 P蛋白
 ORF01262  2523和2524 氢化酶
 ORF01263  2525和2526 氢化酶-1长链(NiFe氢化酶)(膜-结合性氢化酶1大亚基)(HYD1)(hyaB)[1.12.99.6]
 ORF01264  2527和2528 Ni-Fe-氢化酶,b-型细胞色素亚基(CybH)
 ORF01265  2529和2530 氢化酶-1成熟蛋白酶[3.4.24.-]
 ORF01266  2531和2532 氢化酶-1操纵子蛋白hyaE
 ORF01267  2533和2534 氢化酶-1操纵子蛋白hyaF
 ORF01268  2535和2536 细胞色素d泛醇氧化酶,亚基I
 ORF01269  2537和2538 细胞色素d泛醇氧化酶,亚基II(cydB)[1.10.3.-]
 ORF01270  2539和2540 保守性假拟蛋白
 ORF01271  2541和2542 冷激样蛋白
 ORF01272  2543和2544 周质appA蛋白前体(agp)[3.1.3.2]
 ORF01273  2545和2546 假拟蛋白
 ORF01274  2547和2548 冷激样蛋白
 ORF01275  2549和2550 GnsB蛋白
 ORF01276  2551和2552 推定的电子传递蛋白vccM
 ORF01277  2553和2554 2.7.3.-[2.7.3.-]
 ORF01278  2555和2556 TorCAD操纵子转录调节蛋白torR
 ORF01279  2557和2558 周质蛋白torT前体
 ORF01280  2559和2560 三甲基胺-N-氧化物还原酶c-型细胞色素TorC(torC)
 ORF01281  2561和2562 三甲基胺-N-氧化物还原酶TorA(torA)[1.7.2.3]
 ORF01282  2563和2564 侣伴蛋白torD
 ORF01283  2565和2566 保守性假拟蛋白
 ORF01284  2567和2568 保守性假拟蛋白
 ORF01285  2569和2570 dnaJ蛋白
 ORF01286  2571和2572 周质葡萄糖-1-磷酸酶
 ORF01287  2573和2574 保守性假拟蛋白
 ORF01288  2575和2576 trp阻抑物-结合蛋白
 ORF01289  2577和2578 保守性假拟蛋白
 ORF01290  2579和2580 尿嘧啶-黄嘌呤通透酶
 ORF01291  2581和2582 保守性假拟蛋白
 ORF01292  2583和2584 尿嘧啶-黄嘌呤通透酶
 ORF01293  2585和2586 4-羟基苯基乙酸3-加单氧酶(EC 1.14.13.3)短链[1.14.13.3]
 ORF01294  2587和2588 推定硝基还原酶(AE005300)[1.-.-.-]
 ORF01295  2589和2590 推定的3-氧代己二酸烯醇-内酯水解酶-4-羧基粘康酸内酯脱羧酶
 ORF01296  2591和2592 假拟蛋白
 ORF01297  2593和2594 推定的内切核糖核酸酶L-PSP
 ORF01298  2595和2596 假拟异分支酸酶家族蛋白ycdL
 ORF01299  2597和2598 推定的细菌荧光素酶家族蛋白
 ORF01300  2599和2600 转录调节物,TetR家族
 ORF01301  2601和12602 脯氨酸脱氢酶-δ-1-吡咯啉-5-羧酸脱氢酶
 ORF01302  2603和2604 保守性假拟蛋白
 ORF01303  2605和2606 钠-脯氨酸同向转运蛋白(putP)
 ORF01304  2607和2608 推定的膜蛋白
 ORF01305  2609和2610 推定的脂蛋白
 ORF01306  2611和2612 Tat-移位的酶
 ORF01307  2613和2614 PhoH家族蛋白
 ORF01308  2615和2616 保守性假拟蛋白
 ORF01309  2617和2618 高铁血红素存储系统,HmsR蛋白(lgtD)
 ORF01310  2619和2620 HmsF(HmsF)
 ORF01311  2621和2622 高铁血红素存储系统,HmsH蛋白
 ORF01312  2623和2624 GGDEF结构域蛋白
 ORF01313  2625和2626 整合酶
 ORF01314  2627和2628 可能的膜蛋白
 ORF01315  2629和2630 INSA
 ORF01316  2631和2632 转座酶
 ORF01317  2633和2634 假拟蛋白
 ORF01318  2635和2636 原噬菌体CP4-57调节蛋白alpA
 ORF01319  2637和2638 保守性假拟蛋白
 ORF01320  2639和2640 预测的甲基转移酶
 ORF01321  2641和2642 预测的甲基转移酶
 ORF01322  2643和2644 肠毒素
 ORF01323  2645和2646 推定的II型氨基转移酶
 ORF01324  2647和2648 KbaY[4.1.2.-]
 ORF01325  2649和2650 推定的塔格糖6-磷酸激酶蛋白
 ORF01326  2651和2652 DeoR-家族调节蛋白
 ORF01327  2653和2654 糖代谢的转录调节物
 ORF01328  2655和2656 D-粘酸脱水酶[4.2.1.42]
 ORF01329  2657和2658 D-粘酸脱水酶[4.2.1.7]
 ORF01330  2659和2660 推定水解酶
 ORF01331  2661和2662 粘酸脱氢酶[4.2.1.42]
 ORF01332  2663和2664 假拟蛋白
 ORF01333  2665和2666 保守性假拟蛋白
 ORF01334  2667和2668 推定的F1C和S菌毛交换调节
 ORF01335  2669和2670 SfaB蛋白
 ORF01336  2671和2672 假拟蛋白
 ORF01337  2673和2674 SfaD蛋白
 ORF01338  2675和2676 SfaE蛋白
 ORF01339  2677和2678 F1C菌毛传达物
 ORF01340  2679和2680 S菌毛粘附素小亚基SfaG
 ORF01341  2681和2682 S菌毛粘附素小亚基SfaS(菌毛蛋白)
 ORF01342  2683和2684 S菌毛粘附素小亚基SfaH
 ORF01343  2685和2686 推定的EAL结构域
 ORF01344  2687和2688 PapX蛋白
 ORF01345  2689和2690 假拟蛋白
 ORF01346  2691和2692 IroN蛋白
 ORF01347  2693和2694 IroE
 ORF01348  2695和2696 IroD蛋白(Fes)
 ORF01349  2697和2698 IroC(ABC)
 ORF01350  2699和2700 推定的葡糖基转移酶
 ORF01351  2701和2702 保守性假拟蛋白
 ORF01352  2703和2704 保守性假拟蛋白
 ORF01353  2705和2706 未命名蛋白产物;ORF94,长度(ISPlu9-p)
 ORF01354  2707和2708 转座酶,IS4家族
 ORF01355  2709和2710 tonB依赖性外膜高铁血红素受体,hmuR(Y08983)
 ORF01356  2711和2712 保守性假拟蛋白
 ORF01357  2713和2714 推定的钴胺素合成蛋白
 ORF01358  2715和2716 ECs1339
 ORF0t359  2717和2718 保守性假拟蛋白
 ORF01360  2719和2720 假拟蛋白
 tRF01361  2721和2722 复制蛋白(Rep)
 ORF01362  2723和2724 假拟蛋白
 ORF01363  2725和2726 YeeP蛋白
ORF01364  2727和2728 抗原43蛋白直向同源物
ORF01365  2729和2730 保守性假拟蛋白
ORF01366  2731和2732 Z1215蛋白(o273)
ORF01367  2733和2734 保守性假拟蛋白
ORF01368  2735和2736 抗限制性蛋白家族
ORF01369  2737和2738 YeeS蛋白(o160)
ORF01370  2739和2740 基因间区蛋白相关蛋白
ORF01371  2741和2742 保守性假拟蛋白
ORF01372  2743和2744 基因间区蛋白
ORF01373  2745和2746 YeeV蛋白
ORF01374  2747和2748 L0008样蛋白
ORF01375  2749和2750 Z1225蛋白(AF071034)
ORF01376  2751和2752 Z1226蛋白
ORF01377  2753和2754 推定的脱氢酶(AE005314)
ORF01378  2755和2756 PHP家族蛋白
ORF01379  2757和2758 TorD蛋白
ORF01380  2759和2760 功能未知的蛋白质(DUF1097)超家族
ORF01381  2761和2762 Curli生产的装配-转运组件CsgG前体
ORF01382  2763和2764 Curli生产的装配-转运组件csqF前体
ORF01383  2765和2766 Curli生产的装配-转运组件csgE前体
ORF01384  2767和2768 转录调节蛋白,LuxR家族
ORF01385  2769和2770 curli纤维主要亚基CsqA,简并
ORF01386  2771和2772 curli纤维主要亚基CsaA,简并,推定
ORF01387  2773和2774 保守性假拟蛋白
ORF01388  2775和2776 Appr-1-p加工酶家族蛋白
ORF01389  2777和2778 心磷脂合酶
ORF01390  2779和2780 葡聚糖生物合成蛋白C[2.1.-.-1
ORF01391  2781和2782 保守性假拟蛋白
ORF01392  2783和2784 周质葡聚糖生物合成蛋白mdoG前体
ORF01393  2785和2786 周质葡聚糖生物合成蛋白mdoH
ORF01394  2787和2788 保守性假拟蛋白
ORF01395  2789和2790 功能未知的蛋白质(DUF1375)超家族
ORF01396  2791和2792 酸性蛋白msvB
ORF01397  2793和2794 主要易化家族转运蛋白
ORF01398  2795和2796 脂质A生物合成十二烷酰酰基转移酶
ORF01399  2797和2798 推定的硫氰酸生成酶样结构域蛋白
ORF01400  2799和2800 蛋白ycel前体
ORF01401  2801和2802 细胞色素b561同源物2
ORF01402  2803和2804 保守性假拟蛋白
ORF01403  2805和2806 N-甲基-L-色氨酸氧化酶(MTOX)[1.5.3.-]
ORF01404  2807和2808 未命名蛋白产物;ORF ID:o233#8
ORF01405  2809和2810 未命名蛋白产物;ORF ID:o233#9
ORF01406  2811和28t2 二氢乳清酸酶,同源二聚体型(pyrC)[3.5.2.3]
ORF01407  2813和2814 功能未知的蛋白质(DUF1439)超家族
ORF01408  2815和2816 谷氨酸氧化还原酶,GrxB家族(grxB)
ORF01409  2817和2818 主要易化超家族亚家族
ORF01410  2819和2820 核糖体-蛋白-丙氨酸乙酰基转移酶[2.3.1.128]
ORF01411  2821和2822 g20.3
ORF01412  2823和2824 推定毒力因子
ORF01413  2825和2826 完整的膜蛋白MviN(mviN)
ORF01414  2827和2828 鞭毛合成蛋白figN
ORF01415  2829和2830 鞭毛蛋白合成的负调节物(抗-σ-28因子)
ORF01416  2831和2832 鞭毛基体P环蛋白FlgA前体
ORF01417  2833和2834 鞭毛基体杆蛋白FlgB(flgB)
ORF01418  2835和2836 鞭毛基体杆蛋白FlgC(flgC)
ORF01419  2837和2838 鞭毛生物合成,钩形鞘蛋白
ORF01420  2839和2840 鞭毛生物合成,钩形鞘蛋白
ORF01421  2841和2842 鞭毛基体杆蛋白flgF
ORF01422  2843和2844 鞭毛基体杆蛋白flgG(远端杆蛋白)
ORF01423  2845和2846 鞭毛L-环蛋白FigH(flgH)
ORF01424  2847和2848 鞭毛P-环蛋白FlgI(FlgI)
ORF01425  2849和2850 肽聚糖水解酶flgJ[3.2.1.-]
ORF01426  2851和2852 鞭毛钩形鞘-结合蛋白1(hap1)
ORF01427  2853和2854 鞭毛钩形鞘-结合蛋白3(hap3)
ORF01428  2855和2856 核糖核酸酶E(RNA酶E)(rne)[3.1.4.-]
ORF01429  2857和2858 假拟蛋白
ORF01430  2859和2860 核糖体大亚基假尿苷合酶C(orfx)[4.2.1.70]
ORF01431  2861和2862 核糖体大亚基假尿苷合酶C(orfx)[4.2.1.70]
ORF01432  2863和2864 maf蛋白(maf)
ORF01433  2865和2866 未表征的ACR,COG1399
ORF01434  2867和2868 核糖体蛋白L32 (rpmF)
ORF01435  2869和2870 3-氧代酰基-[酰基-载体-蛋白]合酶II
ORF01436  2871和2872 氨基脱氧分支酸裂合酶(4-氨基-4-脱氧分支酸裂合酶)(ADC裂合酶)(ADCL)
ORF01437  2873和2874 保守性假拟蛋白TIGR00247
ORF01438  2875和2876 胸苷酸激酶(tmk)[2.7.4.9]
ORF01439  2877和2878 DNA聚合酶III,δ亚基[2.7.7.7]
ORF01440  2879和2880 推定的脱氧核糖核酸酶ycfH
ORF01441  2881和2882 PTS系统,葡萄糖-特异性IIBC组件(ptsG)[2.7.1.69]
ORF01442  2883和2884 FhuE受体前体(III)
ORF01443  2885和2886 HIT样蛋白ycfF(Ap4A)
ORF01444  2887和2888 功能未知的蛋白质(DUF1425)超家族
ORF01445  2889和2890 纤连蛋白-结合蛋白B
ORF01446  2891和2892 未命名蛋白产物[3.2.1.21]
ORF01447  2893和2894 B-氨基己糖苷酶
ORF01448  2895和2896 ycfP蛋白
ORF01449  2897和2898 NADH脱氢酶
ORF01450  2899和2900 保守性假拟蛋白
ORF01451  2901和2902 转录调节蛋白,TetR家族
ORF01452  2903和2904 功能未知的蛋白质(DUF1471)超家族
ORF01453  2905和2906 ErfK-YbiS-YcfS-YnhG家族
ORF01454  2907和2908 转录-修复偶联因子突变频率下降
ORF01455  2909和2910 推定酰基转移酶家族
ORF01456  2911和2912 假拟蛋白
ORF01457  2913和2914 ABC转运蛋白,完整的膜蛋白
ORF01458  2915和2916 脂蛋白释放系统,ATP结合蛋白(lolD)
ORF01459  2917和2918 脂蛋白释放系统,跨膜蛋白LolE(lolE)
ORF01460  2919和2920 ROK家族蛋白
ORF01461  2921和2922 NAD依赖性脱乙酰酶(调节蛋白SIR2同源物)(DMB)[3.5.1.-]
ORF01462  2923和2924 保守性假拟蛋白
ORF01463  2925和2926 保守性假拟蛋白
ORF01464  2927和2928 亚精胺-腐胺-结合周质蛋白前体(potD)
ORF01465  2929和2930 亚精胺-腐胺转运系统通透酶蛋白potC(potC)
ORF01466  2931和2932 亚精胺-腐胺转运系统通透酶
ORF01467  2933和2934 ABC转运蛋白,聚胺转运蛋白,ATP结合蛋白(atp结合)
ORF01468  2935和2936 肽酶T(pepT)[3.4.11.14]
ORF01469  2937和2938 ycfD蛋白
ORF01470  2939和2940 传感蛋白phoQ[2.7.3.-]
ORF01471  2941和2942 转录调节蛋白
ORF01472  2943和2944 腺嘌呤琥珀酸裂合酶(purB)[4.3.2.2]
ORF01473  2945和2946 参与嘌呤代谢的未表征的蛋白
ORF01474  2947和2948 tRNA(5-甲基氨基甲基-2-硫尿苷酸)-甲基转移酶(trmU)[2.1.1.61]
ORF01475  2949和2950 未命名蛋白产物[3.6.-.-]
ORF01476  2951和2952 RNA假尿苷酸合酶家族蛋白[4.2.1.70]
ORF01477  2953和2954 保守性假拟蛋白
ORF01478  2955和2956 异柠檬酸脱氢酶,NADP依赖性(icd)[1.11.42]
ORF01479  2957和2958 λ噬菌体整合酶
ORF01480  2959和2960 保守性假拟蛋白
ORF01481  2961和2962 未命名蛋白产物;与噬菌体蛋白有些相似
ORF01482  2963和2964 外切核酸酶Z0951[相似性][3.1.11.3]
ORF01483  2965和2966 重组蛋白Bet
ORF01484  2967和2968 宿主-核酸酶抑制剂蛋白Gam
ORF01485  2969和2970 Kil蛋白
ORF01486  2971和2972 λ调节蛋白CIII相关蛋白
ORF01487  2973和2974 Ea10基因蛋白
ORF01488  2975和2976 保守性假拟蛋白
ORF01489  2977和2978 抗终止蛋白Q
ORF01490  2979和2980 溶菌酶[3.2.1.17]
ORF01491  2981和2982 噬菌体裂解蛋白
ORF01492  2983和2984 假拟蛋白
ORF01493  2985和2986 原噬菌体L54a,HNH内切核酸酶家族蛋白
ORF01494  2987和2988 小末端酶亚基
ORF01495  2989和2990 噬菌体末端酶,大亚基,推定
ORF01496  2991和2992 保守性假拟蛋白
ORF01497  2993和2994 噬菌体门蛋白,HK97家族
ORF01498  2995和2996 Sb5(AF181080)
ORF01499  2997和2998 噬菌体主要衣壳蛋白,HK97家族
ORF01500  2999和3000 Sb7相关蛋白
ORF01501  3001和3002 Sb8
ORF0t502  3003和3004 Sb9
ORF01503  3005和3006 假拟蛋白
ORF01504  3007和3008 Sb11
ORF01505  3009和3010 保守性假拟蛋白
ORF01506  3011和3012 噬菌体Mu尾鞘蛋白(GpL)
ORF01507  3013和3014 Sb14
ORF01508  3015和3016 假拟蛋白
ORF01509  3017和3018 Sb15
ORF01510  3019和3020 尾蛋白
ORF01511  3021和3022 尾-DNA循环蛋白(muN)
ORF01512  3023和3024 噬菌体Mu P蛋白
ORF01513  3025和3026 噬菌体Mu GD45蛋白
ORF01514  3027和3028 噬菌体蛋白GP46
ORF01515  3029和3030 尾蛋白
ORF01516  3031和3032 尾蛋白
ORF01517  3033和3034 ycfE蛋白(片段)
ORF01518  3035和3036 功能来知的结构域DUF144超家族
ORF01519  3037和3038 未命名蛋白产物;未鉴定的阅读框P-293
ORF01520  3039和3040 脂蛋白Rzl前体相关蛋白
ORF01521  3041和3042 噬菌体裂解蛋白
ORF01522  3043和3044 λ原噬菌体的Bor蛋白同源物DLP12
ORF01523  3045和3046 假拟蛋白
ORF01524  3047和3048 保守性假拟蛋白
ORF01525  3049和3050 λ噬菌体头装饰蛋白D
ORF01526  3051和3052 噬菌体主要衣壳蛋白E
ORF01527  3053和3054 保守性假拟蛋白
ORF01528  3055和3056 噬菌体头尾连接
ORF01529  3057和3058 原噬菌体小尾蛋白Z(GPZ)
ORF01530  3059和3060 小尾蛋白U
ORF01531  3061和3062 假拟蛋白
ORF01532  3063和3064 小尾蛋白Z(GPZ)
ORF01533  3065和3066 噬菌体小尾蛋白U
ORF01534  3067和3068 小尾蛋白
ORF01535  3069和3070 噬菌体小尾蛋白U
ORF01536  3071和3072 主要尾蛋白
ORF01537  3073和3074 噬菌体小尾蛋白G
ORF01538  3075和3076 小尾蛋白
ORF01539  3077和3078 小尾蛋白
ORF01540  3079和3080 尾长卷尺蛋白前体
ORF01541  3081和3082 小尾蛋白
ORF01542  3083和3084 小尾蛋白前体H
ORF01543  3085和3086 小尾蛋白前体H
ORF01544  3087和3088 假拟噬菌体蛋白
ORF01545  3089和3090 未命名蛋白产物;类似于尾丝装配蛋白
ORF01546  3091和3092 蛋白酶VII前体(Omptin)(外膜蛋白3B)(蛋白酶A)(SopA)[3.4.21.87]
ORF01547  3093和3094 蛋白酶VII前体(Omptin)(外膜蛋白3B)(蛋白酶A)(SopA)[3.4.21.87]
ORF01548  3095和3096 蛋白酶VII前体(Omptin)(外膜蛋白3B)(蛋白酶A)(SopA)[3.4.21.87]
ORF01549  3097和3098 vdfE蛋白(35kD)
ORF01550  3099和3100 噬菌体末端酶大亚基(GpA)
ORF01551  3101和3102 噬菌体末端酶大亚基(GpA)
ORF01552  3103和3104 噬菌体末端酶大亚基(GpA)
ORF01553  3105和3106 门蛋白(头蛋白GP4)
ORF01554  3107和3108 头尾预连接蛋白GP5
ORF01555  3109和3110 头尾预连接蛋白GP5[含有:支架蛋白GP6(头蛋白GP6)]
ORF01556  3111和3112 噬菌体λ头装饰蛋白D
ORF01557  3113和3114 噬菌体主要衣壳蛋白E
ORF01558  3115和3116 保守性假拟蛋白
ORF01559  3117和3118 噬菌体头尾连接
ORF01560  3119和3120 原噬菌体小尾蛋白Z(GPZ)
ORF01561  3121和3122 噬菌体小尾蛋白U
ORF01562  3123和3124 主要尾蛋白
 ORF01563  3125和3126 噬菌体小尾蛋白G
 ORF0t564  3127和3128 小尾蛋白
 ORF01565  3129和3130 门蛋白(头蛋白GP4)
 ORF01566  3131和3132 头尾预连接蛋白GP5
 ORF01567  3133和3134 头尾预连接蛋白GP5[含有:支架蛋白GP6(头蛋白GP6)]
 ORF01568  3135和3136 头尾预连接蛋白GP5[含有:支架蛋白GP6(头蛋白GP6)]
 ORF01569  3137和3138 λ噬菌体头装饰蛋白D
 ORF01570  3139和3140 噬菌体尾卷尺蛋白,λ家族
 ORF01571  3141和3142 噬菌体小尾蛋白
 ORF01572  3143和3144 小尾蛋白
 ORF01573  3145和3146 推定的原噬菌体尾组件
 ORF01574  3147和3148 噬菌体小尾蛋白
 ORF01575  3149和3150 噬菌体小尾蛋白L
 ORF01576  3151和3152 推定的原噬菌体尾组件
 ORF01577  3153和3154 噬菌体小尾蛋白
 ORF01578  3155和3156 噬菌体小尾蛋白L
 ORF01579  3157和3158 转录调节物,GntR家族
 ORF01580  3159和3160 可能的氧化还原酶ydfG
 ORF01581  3161和3162 肽基-二肽酶Dcp,推定
 ORF01582  3163和3164 肽基-二肽酶Dcp
 ORF01583  3165和3166 假拟蛋白
 ORF01584  3167和3168 GGDEF结构域蛋白
 ORF01585  3169和3170 假拟蛋白
 ORF01586  3171和3172 主要易化超家族亚家族
 ORF01587  3173和3174 YdeD
 ORF01588  3175和3176 推定的保守性蛋白
 ORF01589  3177和3178 PTS系统,纤维二糖-特异性IIB组件(PTS)[2.7.1.69]
 ORF01590  3179和3180 推定的保守性蛋白
 ORF01591  3181和3182 PTR系统,纤维二糖-特异性IIA组件
 ORF01592  3183和3184 f538
 ORF01593  3185和3186 6-磷酸-β-葡糖苷酶
 ORF01594  3187和3188 多种抗生素抗性蛋白marB相关蛋白
 ORF01595  3189和3190 多种抗生素抗性蛋白MarA
 ORF01596  3191和3192 多种抗生素抗性蛋白marR(AL359989)
 ORF01597  3193和3194 保守性假拟蛋白TIGR00427
 ORF01598  3195和3196 糖外流转运蛋白
 ORF01599  3197和3198 转录调节物,LysR家族
 ORF01600  3199和3200 醛-脱氢酶样蛋白ynel(SSDH)[1.2.1.-]
 ORF01601  3201和3202 谷氨酰胺酶家族蛋白,中断-N
 ORF01602  3203和3204 保守性假拟蛋白
 ORF01603  3205和3206 GGDEF结构域蛋白
 ORF01604  3207和3208 阿卓糖酸氧化还原酶
 ORF01605  3209和3210 未表征的蛋白家族(UPF0187)超家族
 ORF01606  3211和3212 转-顺乌头酸甲基转移酶[2.1.1.144]
 ORF01607  3213和3214 蛋白hipB
 ORF01608  3215和3216 蛋白hipA
 ORF01609  3217和3218 保守性假拟蛋白
 ORF01610  3219和3220 短链脱氢酶
 ORF01611  3221和3222 I型菌毛蛋白,A链前体
 ORF01612  3223和3224 侣伴蛋白fimC前体
ORF01613  3225和3226 外膜传达蛋白fimD前体
ORF01614  3227和3228 菌毛形态
ORF01615  3229和3230 假拟菌毛样蛋白ydeQ前体
ORF01616  3231和3232 氧化还原酶α(钼蝶呤)亚基
ORF01617  3233和3234 HTH-型转录调节物ydeO
ORF01618  3235和3236 酰基硫酸酯酶B(GALNS)
ORF01619  3237和3238 基团状SAM结构域蛋白
ORF01620  3239和3240 ABC外流转运蛋白,通透酶-ATP结合蛋白,推定
ORF01621  3241和3242 cds103
ORF01622  3243和3244 cds103
ORF01623  3245和3246 肽酶,M16家族,推定[3.4.99.4
ORF01624  3247和3248 谷氨酸脱羧酶[4.1.1.15]
ORF01625  3249和3250 氨基酸反向转运蛋白
ORF01626  3251和3252 yngK蛋白
ORF01627  3253和3254 推定的保守性蛋白相关蛋白
ORF01628  3255和3256 传感蛋白FixL(EC 2.7.3.-).(nifL)[2.7.3.-]
ORF01629  3257和3258 渗透压诱导性蛋白C
ORF01630  3259和3260 假拟蛋白
ORF01631  3261和3262 保守性假拟蛋白
ORF01632  3263和3264 保守性假拟蛋白
ORF01633  3265和3266 30S核糖体蛋白S22(稳定期-诱导的核糖体结合蛋白)
ORF01634  3267和3268 假拟蛋白
ORF01635  3269和3270 NAD连接的苹果酸脱氢酶(苹果酸酶)
ORF01636  3271和3272 醇脱氢酶,优选丙醇(adhA)[1.-.-.-]
ORF01637  3273和3274 蛋白杀伤抑制蛋白higA
ORF01638  3275和3276 保守性假拟蛋白
ORF01639  3277和3278 蛋白杀伤活性蛋白higB
ORF01640  3279和3280 甲酸脱氢酶,γ亚基[1.2.1.2]
ORF01641  3281和3282 甲酸脱氢酶,β亚基(FdxH)[1.2.1.2]
ORF01642  3283和3284 甲酸脱氢酶,α亚基,含有硒代半胱氨酸[1.2.1.2]
ORF01643  3285和3286 甲酸脱氢酶,α亚基,含有硒代半胱氨酸[1.2.1.2]
ORF01644  3287和3288 甲酸脱氢酶,α亚基,含有硒代半胱氨酸[1.2.1.2]
ORF01645  3289和3290 假拟蛋白
ORF01646  3291和3292 膜蛋白yddG
ORF01647  3293和3294 亚硝酸挤出蛋白2
ORF01648  3295和3296 硝酸还原酶,α亚基[1.7.99.4]
ORF01649  3297和3298 硝酸还原酶,β亚基(narH)[1.7.99.4]
ORF01650  3299和3300 呼吸作用硝酸还原酶2,δ链[1.7.99.4]
ORF01651  3301和3302 呼吸作用硝酸还原酶,γ亚基(narl)[1.7.99.4]
ORF01652  3303和3304 吩嗪生物合成蛋白PhzF家族亚家族
ORF01653  3305和3306 链D,M,Smegmatis芳胺N-乙酰基转移酶[2.3.1.118]
ORF01654  3307和3308 黄素还原酶样结构域蛋白
ORF01655  3309和3310 H重复结合蛋白(ORF-H)
ORF01656  3311和3312 保守性假拟蛋白
ORF01657  3313和3314 保守性假拟蛋白
ORF01658  3315和3316 Aec15(AF044503)
ORF01659  3317和3318 未表征的保守性蛋白
ORF01660  3319和3320 可能的转移酶(U59485)
ORF01661  3321和3322 谷胱甘肽S-转移酶gst
ORF01662  3323和3324 L-天冬酰胺通透酶(516aa)
ORF01663  3325和3326 保守性假拟蛋白
ORF01664  3327和3328 TonB依赖性受体蛋白
ORF01665  3329和3330 推定的保守性蛋白相关蛋白
ORF01666  3331和3332 乙酰基转移酶,GNAT家族[2.3.1.-]
ORF01667  3333和3334 功能未知的蛋白,DUF606超家族
ORF01668  3335和3336 保守性假拟蛋白
ORF01669  3337和3338 保守性假拟蛋白
ORF01670  3339和3340 假拟蛋白
ORF01671  3341和3342 醛脱氢酶家族蛋白(BADH)[1.2.1.8]
ORF01672  3343和3344 聚胺ABC转运蛋白,通透酶蛋白
ORF01673  3345和3346 聚胺ABC转运蛋白,通透酶蛋白
ORF01674  3347和3348 聚胺ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白
ORF01675  3349和3350 聚胺ABC转运蛋白,周质聚胺-结合蛋白
ORF01676  3351和3352 未命名蛋白产物(TAT)[2.6.1.5]
ORF01677  3353和3354 未命名蛋白产物
ORF01678  3355和3356 保守性假拟蛋白
ORF01679  3357和3358 肽酶,U32家族
ORF01680  3359和3360 转录调节蛋白,Cro-Cl家族,推定
ORF01681  3361和3362 类似于苯甲酸转运蛋白
ORF01682  3363和3364 假拟脂蛋白ydcL前体
ORF01683  3365和3366 亚碲酸抗性蛋白TehB(tehB)
ORF01684  3367和3368 亚碲酸抗性蛋白tehA
ORF01685  3369和3370 推定的核糖体-蛋白-丝氨酸乙酰基转移酶
ORF01686  3371和3372 保守性假拟蛋白
ORF01687  3373和3374 功能未知的蛋白质(DUF465)家族
ORF01688  3375和3376 葡聚糖生物合成蛋白D前体
ORF01689  3377和3378 功能未知的蛋白质(DUF1338)家族
ORF01690  3379和3380 转录调节蛋白PcaQ
ORF01691  3381和3382 接受甲基的趋化性蛋白II,天冬氨酸传感蛋白受体
ORF01692  3383和3384 Hok蛋白相关蛋白
ORF01693  3385和3386 保守性假拟蛋白
ORF01694  3387和3388 细胞色素b561(561)
ORF01695  3389和3390 I型甘油醛-3-磷酸脱氢酶(gap)[1.2.1.-]
ORF01696  3391和3392 醛脱氢酶A(NAD)[1.2.122]
ORF01697  3393和3394 蛋白ydcF
ORF01698  3395和3396 ATP-依赖性解旋酶HrDA(hrpA)
ORF01699  3397和3398 [酰基-载体-蛋白]磷酸二酯酶acpD(片段) [3.1.4.14]
ORF01700  3399和3400 双特异性磷酸酶,催化结构域蛋白
ORF01701  3401和3402 溶血磷脂酶
ORF01702  3403和3404 磷脂酸胞苷酰转移酶(cdsA)[2.7.7.41]
ORF01703  3405和3406 CDP-醇磷脂酰转移酶家族
ORF01704  3407和3408 氧化还原酶,醛酮还原酶家族[1.-.-.-]
ORF01705  3409和3410 分离orf
ORF01706  3411和3412 功能未知的蛋白质IDUF1318)家族
ORF01707  3413和3414 推定的脂蛋白
ORF01708  3415和3416 未命名蛋白产物;类似于大肠杆菌的膜蛋白YbdH
ORF01709  3417和3418 发酵的D-乳酸脱氢酶(D-LDH)[1.1.1.28]
ORF01710  3419和3420 热激蛋白hslJ
ORF01711  3421和3422 推定的脂蛋白
ORF01712  3423和3424 丙酮酸盐:铁氧还蛋白(黄素氧还蛋白)氧化还原酶(nifJ)[1.2.7.1]
ORF01713  3425和3426 外膜蛋白N前体(Ibc)
ORF01714  3427和3428 推定的丝状蛋白
ORF01715  3429和3430 噬菌体BP-933W的整合酶
ORF01716  3431和3432 YdaO蛋白
ORF01717  3433和3434 ATP依赖性RNA解旋酶dbpA
ORF01718  3435和3436 假拟蛋白
ORF01719  3437和3438 CorA样Mg2+转运蛋白
ORF01720  3439和3440 二鸟苷酸环化酶-磷酸二酯酶结构域1(GGDEF)
ORF01721  3441和3442 Smr结构域蛋白
ORF01722  3443和3444 耐药性转运蛋白,Bcr-CflA家族(emrB)
ORF01723  3445和3446 HlyD家族分泌蛋白
ORF01724  3447和3448 转录调节物,AraC家族
ORF01725  3449和3450 保守性假拟蛋白
ORF01726  3451和3452 甲基化-DNA-蛋白-半胱氨酸甲基转移酶(6-O-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶)
ORF01727  3453和3454 延胡索酸和硝酸还原调节蛋白
ORF01728  3455和3456 通用应激蛋白家族结构域蛋白
ORF01729  3457和3458 保守性假拟蛋白
ORF01730  3459和3460 小电导率机械敏感性通道
ORF01731  3461和3462 周质胞壁质肽-结合蛋白前体
ORF01732  3463和3464 黄嘌呤核苷操纵子调节蛋白。
ORF01733  3465和3466 二烯内酯水解酶结构域蛋白
ORF01734  3467和3468 保守性假拟蛋白
ORF01735  3469和3470 扁桃酸消旋酶-粘康酸内酯化酶,C-末端结构域蛋白
ORF01736  3471和3472 Ycjl
ORF01737  3473和3474 硫醇过氧化物酶(P20)[1.11.1.-]
ORF01738  3475和3476 转录调节蛋白tyrR
ORF01739  3477和3478 保守性假拟蛋白TIGR01620
ORF01740  3479和3480 YcjX(AY008264)
ORF01741  3481和3482 转录调节物同源物lin2974
ORF01742  3483和3484 外膜蛋白G前体
ORF01743  3485和3486 ABC转运蛋白结构域蛋白
ORF01744  3487和3488 β-磷酸葡糖变位酶(pgmB)[5.4.2.6]
ORF01745  3489和3490 麦芽糖磷酸化酶同源物tin2966(磷酸化酶)[3.2.1.-]
ORF01746  3491和3492 氧化还原酶,Gfo-ldh-MocA家族
ORF01747  3493和3494 大肠杆菌蛋白同源物lin2968 [5.3.1.-]
ORF01748  3495和3496 醇脱氢酶(EC 1.1.1.),[1.1.1.-]
ORF01749  3497和3498 ABC转运蛋白,通透酶蛋白(AF175299)
ORF01750  3499和3500 Sn-甘油-3-磷酸转运系统通透酶蛋白UgpA。(AF307052)
ORF01751  3501和3502 ABC转运蛋白,底物结合蛋白
ORF01752  3503和3504 推定的右旋糖苷蔗糖酶(EC 2.4.1.5),[2.4.1.5]
ORF01753  3505和3506 硫氰酸生成酶样结构域蛋白
ORF01754  3507和3508 噬菌体休克蛋白相关蛋白
ORF01755  3509和3510 噬菌体休克蛋白C
ORF01756  3511和3512 噬菌体休克蛋白B
ORF01757  3513和3514 噬菌体休克蛋白A
ORF01758  3515和3516 Psp操纵子转录激活蛋白
ORF01759  3517和3518 可能的氨基酸通透酶yciJ
ORF01760  3519和3520 保守性假拟蛋白
ORF01761  3521和3522 肽转运周质蛋白sapA前体
ORF01762  3523和3524 肽转运系统通透酶蛋白sapB
ORF01763  3525和3526 肽转运系统通透酶蛋白sapC(sapC)
ORF01764  3527和3528 肽转运系统ATP结合蛋白sapD
ORF01765  3529和3530 肽转运系统ATP结合蛋白sapF
ORF01766  3531和3532 耐药性转运蛋白,Bcr-CflA家族蛋白
ORF01767  3533和3534 EefC外膜蛋白
ORF01768  3535和3536 吖啶黄素抗性蛋白B
ORF01769  3537和3538 吖啶黄素抗性蛋白A前体(MFP)
ORF01770  3539和3540 转录调节物,TetR家族
ORF01771  3541和3542 烯酰基-[酰基-载体-蛋白]还原酶ECs1861 (NADH)[1.3.1.9]
ORF01772  3543和3544 保守性假拟蛋白
ORF01773  3545和3546 外切核糖核酸酶II(rnb)[3.1.13.1]
ORF01774  3547和3548 传感框蛋白
ORF01775  3549和3550 保守性假拟蛋白
ORF01776  3551和3552 推定的甘油-3-磷酸调节子阻抑物
ORF01777  3553和3554 渗透压诱导性脂蛋白B前体相关蛋白
ORF01778  3555和3556 翻译启动因子SUI1,推定
ORF01779  3557和3558 乳清苷5′-磷酸脱羧酶(pyrF)[4.1.1 23]
ORF01780  3559和3560 假拟蛋白
ORF0t781  3561和3562 预测的N-乙酰基葡糖胺基转移酶
ORF01782  3563和3564 未命名蛋白产物
ORF01783  3565和3566 磷脂酰甘油磷酸酶B(pgpB)[3.1.3.27]
ORF01784  3567和3568 GTP环式水解酶II(ribA)[3.5.4.25]
ORF01785  3569和3570 顺乌头酸水合酶1(acnA) M.2.1.3]
ORF01786  3571和3572 保守性假拟蛋白
ORF01787  3573和3574 保守性假拟蛋白
ORF01788  3575和3576 HTH型转录调节物cysB(Cys调节子转录激活物)
ORF01789  3577和3578 DNA拓扑异构酶I
ORF01790  3579和3580 假拟蛋白
ORF01791  3581和3582 蛋白yciN
ORF01792  3583和3584 可能的蛋白酶sohB
ORF01793  3585和3586 氧化还原酶[1.-.-.-]
ORF01794  3587和3588 钴胺素腺苷转移酶(cobO)[2.5.1.17]
ORF01795  3589和3590 RNA假尿苷酸合酶家族蛋白[4.2.1.70]
ORF01796  3591和3592 保守性假拟蛋白
ORF01797  3593和3594 Sua5-YciO-YrdC-YwlC家族蛋白
ORF01798  3595和3596 蛋白trpH
ORF01799  3597和3598 邻氨基苯甲酸合酶组件I(trpE)[4.1.3.27]
ORF01800  3599和3600 邻氨基苯甲酸合酶组件II[4.1.3.27]
ORF01801  3601和3602 邻氨基苯甲酸异构酶(PRAI)[4.1.1.48]
ORF01802  3603和3604 色氨酸合酶,β亚基(trpB)[4.2.1.20]
ORF01803  3605和3606 色氨酸合酶,α亚基(trpA)[4.2.1.20]
ORF01804  3607和3608 保守性假拟蛋白
ORF01805  3609和3610 蛋白yciF
ORF01806  3611和3612 yciE
ORF01807  3613和3614 外膜蛋白W前体
ORF01808  3615和3616 λ原噬菌体的尾丝装配蛋白同源物
ORF01809  3617和3618 λ原噬菌体的尾丝装配蛋白同源物Oin
ORF01810  3619和3620 可能的原噬菌体膜蛋白CP-933X Z1918
ORF01811  3621和3622 可能的原噬菌体膜蛋白CP-933X Z1918
ORF01812  3623和3624 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933X
ORF01813  3625和3626 假拟蛋白
ORF01814  3627和3628 Lom
ORF01815  3629和3630 宿主特异性蛋白(部分)
ORF01816  3631和3632 宿主特异性蛋白J(部分)
ORF01817  3633和3634 噬菌体λ尾装配蛋白I
ORF01818  3635和3636 推定的原噬菌体的尾丝组件K
ORF01819  3637和3638 小尾蛋白
ORF01820  3639和3640 小尾蛋白
ORF0182t  3641和3642 噬菌体小尾蛋白
ORF01822  3643和3644 小尾蛋白前体H
ORF01823  3645和3646 小尾蛋白
ORF01824  3647和3648 噬菌体小尾蛋白G
0RF01825  3649和3650 细菌Ig样结构域(2类)家族
0RF0t826  3651和3652 噬菌体小尾蛋白U
ORF01827  3653和3654 原噬菌体小尾蛋白Z(GPZ)
ORF01828  3655和3656 噬菌体头-尾连接
ORF01829  3657和3658 保守性假拟蛋白
ORF01830  3659和3660 噬菌体主要衣壳蛋白E
ORF01831  3661和3662 λ噬菌体头装饰蛋白D
ORF01832  3663和3664 头尾连接蛋白GP5
ORF01833  3665和3666 噬菌体门蛋白,λ家族
ORF01834  3667和3668 gpW
ORF01835  3669和3670 噬菌体末端酶大亚基(GpA)
ORF01836  3671和3672 末端酶小亚基(GP1)(片段)
ORF01837  3673和3674 假拟蛋白
ORF01838  3675和3676 噬菌体裂解蛋白
ORF01839  3677和3678 脂蛋白Rzl前体相关蛋白
ORF01840  3679和3680 推定噬菌体蛋白
ORF01841  3681和3682 溶酶体(裂解蛋白)(胞壁酸酶) (内溶素)[3.2.1.17]
ORF01842  3683和3684 功能未知的蛋白质(DUF1327)超家族
ORF01843  3685和3686 λ原噬菌体的裂解蛋白S同源物
ORF01844  3687和3688 未命名蛋白产物;ORF616
ORF01845  3689和3690 未命名蛋白产物;ORF616
ORF01846  3691和3692 DNA腺嘌呤-甲基化酶
ORF01847  3693和3694 原噬菌体编码的未知蛋白CP-9330
ORF01848  3695和3696 隐藏原噬菌体的抗终止蛋白Q同源物
ORF01849  3697和3698 内切脱氧核糖核酸酶RUS(Holliday连接解离酶)[3.1.22.-]
ORF01850  3699和3700 功能未知的蛋白质(DUF1277)超家族
ORF01851  3701和3702 原噬菌体维持蛋白[相似性]相关蛋白
ORF01852  3703和3704 假拟蛋白
ORF01853  3705和3706 保守性假拟蛋白
ORF01854  3707和3708 原噬菌体内编码的未知蛋白
ORF01855  3709和3710 保守性假拟蛋白
ORF01856  3711和3712 隐藏原噬菌体编码的未知蛋白
ORF01857  3713和3714 推定的肽酶S24样结构域
ORF01858  3715和3716 功能未知的蛋白质(DUF1391)家族
ORF01859  3717和3718 ydfB蛋白相关蛋白
ORF01860  3719和3720 保守性假拟蛋白
ORF01861  3721和3722 假拟蛋白
ORF01862  3723和3724 分裂抑制蛋白dicB
ORF01863  3725和3726 原噬菌体编码的未知蛋白CP-9330相关蛋白
ORF01864  3727和3728 外切脱氧核糖核酸酶VIII (35kD)[3.1,11.-]
ORF01865  3729和3730 整合酶
ORF01866  3731和3732 外膜蛋白W前体
ORF01867  3733和3734 yciC
ORF01868  3735和3736 胞内分隔蛋白A(ispZ)
ORF01869  3737和3738 酰基-CoA水解酶[3.1.2.-]
ORF01870  3739和3740 TonB蛋白
ORF01871  3741和3742 ycil蛋白
ORF01872  3743和3744 推定钾通道蛋白
ORF01873  3745和3746 心磷脂合成酶(心磷脂合酶)(CL合酶)[2.7.8.-]
ORF01874  3747和3748 功能未知的蛋白,DUF440超家族
ORF01875  3749和3750 肽ABC转运蛋白,ATP结合蛋白(AA1)
ORF01876  3751和3752 寡肽ABC转运蛋白,ATP结合蛋白(AA1)
ORF01877  3753和3754 寡肽ABC转运蛋白,通透酶蛋白(AA1)
ORF01878  3755和3756 寡肽转运系统通透酶蛋白oppB(AA1)
ORF01879  3757和3758 周质寡肽-结合蛋白前体
ORF01880  3759和3760 推定的膜蛋白
ORF01881  3761和3762 乙醛脱氢酶(乙酰化)-醇脱氢酶(EC 1.1.1.1)
ORF01882  3763和3764 用于插入序列元件IS4的转座酶insG
ORF01883  3765和3766 胸苷激酶[2,7,1.21]
ORF01884  3767和3768 保守性假拟蛋白
ORF01885  3769和3770 DNA-结合蛋白H-NS同源物virR
ORF01886  3771和3772 UTP-葡糖-1-磷酸尿苷酰转移酶(galU)[2.7.7,9]
ORF01887  3773和3774 Hnr蛋白
ORF01888  3775和3776 药物转运蛋白
ORF01889  3777和3778 未命名蛋白产物
ORF01890  3779和3780 甲酰四氢叶酸去甲酰酶(purU)[3.5.1.10]
ORF01891  3781和3782 Tun1330蛋白
ORF01892  3783和3784 呼吸作用硝酸还原酶,γ亚基(narl)[1.7.99.4]
ORF01893  3785和3786 呼吸作用硝酸还原酶1,δ链[1.7.99.4]
ORF01894  3787和3788 硝酸还原酶,β亚基(narH)[1.7.99.4]
ORF01895  3789和3790 硝酸还原酶,α亚基[1.7.99.4]
ORF01896  3791和3792 亚硝酸挤出蛋白1
ORF01897  3793和3794 硝酸-亚硝酸传感蛋白narX[2.7.3.-]
ORF01898  3795和3796 narL
ORF01899  3797和3798 保守性假拟蛋白
ORF01900  3799和3800 YchN蛋白
ORF01901  3801和3802 阳离子转运蛋白chaC
ORF01902  3803和3804 阳离子转运调节物chaB相关蛋白
ORF01903  3805和3806 钙-质子反向转运蛋白
ORF01904  3807和3808 保守性假拟蛋白
ORF01905  3809和3810 3-脱氧-8-磷酸辛酮酸合酶(kdsA)[2.5.1.55]
ORF01906  3811和3812 蛋白sirB1
ORF01907  3813和3814 蛋白sirB1
ORF01908  3815和3816 蛋白sirB2
ORF01909  3817和3818 蛋白甲基转移酶hemK(hemK)[2.1.1.-]
ORF01910  3819和3820 肽链释放因子1(prfA)
ORF01911  3821和3822 谷氨酰-tRNA还原酶(hemA)[1.2.1.-]
ORF01912  3823和3824 外膜脂蛋白LolB(IolB)
ORF01913  3825和3826 4-二磷酸胞苷-2C-甲基-D-赤藓醇激酶(ispE)[2.7:1.148]
ORF01914  3827和3828 核糖-磷酸焦磷酸激酶
ORF01915  3829和3830 硫酸通透酶家族蛋白
ORF01916  3831和3832 保守性假拟蛋白
ORF01917  3833和3834 肽基-tRNA水解酶(pth)[3.1.1,29]
ORF01918  3835和3836 GTP-结合蛋白YchF (ychF)
ORF01919  3837和3838 甘油代谢操纵子调节蛋白
ORF01920  3839和3840 二羟基丙酮激酶,DhaK亚基(dhaK)[2.7.1.-]
ORF01921  3841和3842 二羟丙酮激酶,L亚基[2.7.1.-]
ORF01922  3843和3844 磷酸烯醇式丙酮酸-蛋白磷酸转移酶.EI-HPr-EIIA组件
ORF01923  3845和3846 假拟蛋白
ORF01924  3847和3848 保守性假拟蛋白
ORF01925  3849和3850 海藻糖酶[3.2.1.28]
ORF01926  3851和3852 周质结合蛋白家族
ORF01927  3853和3854 铁(III)
ORF01928  3855和3856 保守性假拟蛋白
ORF01929  3857和3858 可能的ABC-型铁载体转运系统ATP结合蛋白(111)
ORF01930  3859和3860 保守性假拟蛋白
ORF01931  3861和3862 modD蛋白(modD)
ORF01932  3863和3864 推定的外膜受体,可能是tonB依赖性
ORF01933  3865和3866 糖基转移酶相关蛋白
ORF01934  3867和3868 YcoR蛋白超家族
ORF01935  3869和3870 胞壁质糖基转移酶E
ORF01936  3871和3872 胞壁酰四肽羧肽酶(LD-羧肽酶A)[3.4.17.13]
ORF01937  3873和3874 Na+-H+反向转运蛋白
ORF01938  3875和3876 丙氨酸消旋酶(alr)[5.1.1.1]
ORF01939  3877和3878 D-氨基酸脱氢酶小亚基
ORF01940  3879和3880 未鉴定的蛋白
ORF01941  3881和3882 fad调节子的负调节物,和正调节物
ORF01942  3883和3884 Na+-H+反向转运蛋白NhaB(nhaB)
ORF01943  3885和3886 二硫键形成蛋白B[1.8.4.-]
ORF01944  3887和3888 UmuC蛋白
ORF01945  3889和3890 UmuD蛋白(R391)[3.4.21.-]
ORF01946  3891和3892 溶细胞素A
ORF01947  3893和3894 功能未知的细菌蛋白(DUF838)超家族
ORF01948  3895和3896 蛋白vcaM(FAA)
ORF01949  3897和3898 蛋白vcaL
ORF01950  3899和3900 Fels-1原噬菌体蛋白样家族
ORF01951  3901和3902 隔膜部位-决定蛋白MinC(minC)
ORF01952  3903和3904 Lom
ORF01953  3905和3906 推定的原噬菌体尾组件(部分)
ORF01954  3907和3908 Lom
ORF01955  3909和3910 推定的原噬菌体尾组件(部分)
ORF01956  3911和3912 假拟蛋白
ORF01957  3913和3914 GntR-家族转录调节蛋白
ORF01958  3915和3916 保守性假拟蛋白
ORF01959  3917和3918 果糖酮酸还原酶[1.-.-.4
ORF01960  3919和3920 代谢物-质子同向转运蛋白(PPII)
ORF01961  3921和3922 L-艾杜醇2-脱氢酶
ORF01962  3923和3924 饥饿感受蛋白rspA
ORF01963  3925和3926 未表征的BCR,YnfA-UPF0060家族超家族
ORF01964  3927和3928 功能未知的蛋白质(DUF1283)超家族
ORF01965  3929和3930 精胺N(1)-乙酰基转移酶(SAT)[23.1.57]
ORF01966  3931和3932 ynfC蛋白
ORF01967  3933和3934 功能未知的蛋白质(DUF1161)家族
ORF01968  3935和3936 DmsA[1.8.99.-1
ORF01969  3937和3938 DmsA[1.8.99.-1
ORF01970  3939和3940 二甲亚砜还原酶A2链前体,厌氧[1.8.-.-]
ORF01971  3941和3942 厌氧性二甲亚砜还原酶B链(dmsB)[1.8.-.-]
ORF01972  3943和3944 DMSO还原酶锚定亚基(DmsC)(dmsC)[1.8.99.-]
ORF01973  3945和3946 TorD蛋白
ORF01974  3947和3948 脱硫生物素合成酶(DTBS)
ORF01975  3949和3950 推定的氯通道蛋白eriC样
ORF01976  3951和3952 Mlc蛋白
ORF01977  3953和3954 转录调节物,LysR家族
ORF01978  3955和3956 未命名蛋白产物
ORF01979  3957和3958 酸休克蛋白重复家族
ORF01980  3959和3960 谷氨酰内肽酶[3.4.21.-]
ORF01981  3961和3962 可能的侣伴蛋白
ORF01982  3963和3964 DMT超家族药物外流泵
ORF01983  3965和3966 推定的功能未知的结构域
ORF01984  3967和3968 NAD(P)转氢酶,β亚基(pntB)[1.6.1.2]
ORF01985  3969和3970 NAD(P)转氢酶,α亚基(pntA)[1.6.1.1]
ORF01986  3971和3972 蛋白ydgH前体
ORF01987  3973和3974 假拟蛋白
ORF01988  3975和3976 未命名蛋白产物
ORF01989  3977和3978 推定的fabG5[1.-.-.-]
ORF01990  3979和3980 膜蛋白glpM
ORF01991  3981和3982 转录调节蛋白rstA
ORF01992  3983和3984 传感蛋白rstB[2.7.3.-]
ORF01993  3985和3986 DNA复制末端位点结合蛋白
ORF01994  3987和3988 II类延胡索酸水合酶(fumC)[4.2.1.2]
ORF01995  3989和3990 I类延胡索酸水合酶,厌氧性[4.2.1.2]
ORF01996  3991和3992 I类甘露糖-6-磷酸异构酶(manA)[5.3.1.8]
ORF01997  3993和3994 功能未知的细菌蛋白(DUF945)超家族
ORF01998  3995和3996 膜结合蛋白
ORF01999  3997和3998 葡糖苷酸载体蛋白
ORF02000  3999和4000 B-葡糖醛酸糖苷酶(GUS)[3.2.131]
ORF02001  4001和4002 转录调节物,TetR家族结构域蛋白,推定
ORF02002  4003和4004 7-α-羟基类固醇脱氢酶
ORF02003  4005和4006 麦芽糖调节子调节蛋白mall
ORF02004  4007和4008 PTS系统,麦芽糖和葡萄糖特异性IIBC组件(malX)[2.7.1.69]
ORF02005  4009和4010 推定的II类氨基转移酶[4.4.1.8]
ORF02006  4011和4012 腺苷脱氨酶(add)[3.5.4.4]
ORF02007  4013和4014 预测的脱氢酶
ORF02008  4015和4016 Hha蛋白
ORF02009  4017和4018 保守性假拟蛋白
ORF02010  4019和4020 电子传递复合物蛋白rnfA
ORF02011  4021和4022 电子传递复合物蛋白rnfB
ORF02012  4023和4024 电子传递复合物蛋白rnfC
ORF02013  4025和4026 电子传递复合物蛋白rnfD
ORF02014  4027和4028 电子传递复合物蛋白rnfG(rnfG)
ORF02015  4029和4030 电子传递复合物蛋白rnfE
ORF02016  4031和4032 内切核酸酶III(nth)[4.2.99.18[
ORF02017  4033和4034 假拟的转运蛋白ydclR
ORF02018  4035和4036 谷胱甘肽S-转移酶[2.5.1.18]
ORF02019  4037和4038 吡哆醛激酶[2.7.1.35]
ORF02020  4039和4040 酪氨酰-tRNA合成酶(tyrS)[6.1.1.1]
ORF02021  4041和4042 吡哆胺5′-磷酸氧化酶(pdxH)[1.4.3.5]
ORF02022  4043和4044 ydhA蛋白
ORF02023  4045和4046 假拟UPF0075蛋白ydhH
ORF02024  4047和4048 SlyA
ORF02025  4049和4050 镰刀菌酸抗性蛋白FusE
ORF02026  4051和4052 镰刀菌酸抗性蛋白保守区域家族
ORF02027  4053和4054 铜-锌超氧化物岐化酶(sodC)
ORF02028  4055和4056 氧化还原酶,醛酮还原酶家族[1.-.-.-]
ORF02029  4057和4058 未命名蛋白产物
ORF02030  4059和4060 转录调节蛋白
ORF02031  4061和4062 N-乙基马来酰亚胺还原酶(Y13942)[1.-.-.-]
ORF02032  4063和4064 乳酰谷胱甘肽裂合酶(qloA)[4.4.1.5]
ORF02033  4065和4066 核糖核酸酶T(rnt)[3.1.13.-]
ORF02034  4067和4068 谷氨酸氧化还原酶相关蛋白
ORF02035  4069和4070 假拟蛋白
IRF02036  4071和4072 推定的脂蛋白
ORF02037  4073和4074 超氧化物歧化酶,铁[1.15.1.1]
ORF02038  4075和4076 主要易化家族转运蛋白(AL136500)
ORF02039  4077和4078 假拟蛋白
ORF02040  4079和4080 嘌呤核苷酸合成阻抑物(purR)
ORF02041  4081和4082 cyn操纵子转录激活蛋白
ORF02042  4083和4084 双环霉素抗性蛋白(磺酰胺抗性蛋白)
ORF02043  4085和4086 环丙烷-脂酰基-磷脂合酶[2.1.1.79]
ORF02044  4087和4088 核黄素合酶,α亚基(ribE)[2.5.1.9]
ORF02045  4089和4090 多药耐药蛋白norM
ORF02046  4091和4092 可能的酶
ORF02047  4093和4094 蛋白ydhR前体
ORF02048  4095和4096 保守性假拟蛋白
ORF02049  4097和4098 保守性假拟蛋白
ORF02050  4099和4100 PhsC蛋白同源物[2.8.1.5]
ORF02051  4101和4102 nrfC蛋白同源物b1671(nrfC)[2.8.1.5]
ORF02052  4103和4104 保守性假拟蛋白
ORF02053  4105和4106 醛-铁氧还蛋白氧化还原酶PH0892(apt)[1.-.-.-]
ORF02054  4107和4108 醛氧化还原酶(aor)[1.-.-.-]
ORF02055  4109和4110 铁硫簇-b结合蛋白[2.8.1.5]
ORF02056  4111和4112 保守性假拟蛋白
ORF02057  4113和4114 丙酮酸激酶(pyk)[2.7.1.40]
ORF02058  4115和4116 主要外膜脂蛋白
ORF02059  4117和4118 ErfK-Ybis-YcfS-YnhG家族
ORF02060  4119和4120 SufE蛋白(orf5)
ORF02061  4121和4122 V类氨基转移酶[4.4.1.16]
ORF02062  4123和4124 Fes组装蛋白SufD(sufD)
ORF02063  4125和4126 Fes组装ATP酶SufC(sufC)
ORF02064  4127和4138 Fes组装蛋白SufB(sufB)
ORF02065  4129和4130 Fes组装支架SufA(sufA)
ORF02066  4131和4132 未命名的蛋白质产物
ORF02067  4133和4134 推定的未表征的结构域1
ORF02068  4135和4136 推定的氧化还原酶,结合FAD
ORF02069  4137和4138 假拟的UPF0118蛋白ydiK
ORF02070  4139和4140 保守性假拟蛋白
ORF02071  4141和4142 转运系统通透酶蛋白同源物lin2340
ORF02072  4143和4144 假拟的转运蛋白ydiN
ORF02073  4145和4146 莽草酸5-脱氢酶[1.1.1.-]
ORF02074  4147和4148 I型3-脱氢奎尼酸脱水酶,(aroD)[4.2.1.10]
ORF02075  4149和4150 推定的乙酰-CoA-转移酶亚基[2.8.3.-]
ORF02076  4151和4152 推定的酰基-CoA脱氢酶家族蛋白[1.3.99.-]
ORF02077  4153和4154 假拟的转录调节物ydiP
ORF02078  4155和4156 FixA蛋白
ORF02079  4157和4158 电子转移黄素蛋白,α亚基,推定
ORF02080  4159和4160 黄素蛋白,可能用于电子传递[1.5.5.-]
ORF02081  4161和4162 铁氧还蛋白样蛋白ydiT
ORF02082  4163和4164 推定的底物-CoA连接酶[6.2.1.-]
ORF02083  4165和4166 磷酸烯醇式丙酮酸合酶(ppsA)[2.7.9.2]
ORF02084  4167和4168 假拟UPF0085蛋白ydiA
ORF02085  4169和4170 磷酸-2-脱氢-3-脱氧庚酮酸醛缩酶[2.5.1.54]
ORF02086  4171和4172 保守性假拟蛋白
ORF02087  4173和4174 假拟UPF0061蛋白ydiU(AP001520)
ORF02088  4175和4176 保守性假拟蛋白
ORF02089  4177和4178 脂蛋白(ORF)
ORF02090  4179和4180 维生素B12转运ATP结合蛋白btuD(维生素B12-转运ATP酶)[3.6.3.33]
ORF02091  4181和4182 谷胱甘肽过氧化物酶
ORF02092  4183和4184 维生素B12转运系统通透酶蛋白btuC(膜)
ORF02093  4185和4186 整合宿主因子,α亚基(ihfA)
ORF02094  4187和4188 苯丙氨酰基-tRNA合成酶,β亚基(pheT)[6.1.1.20]
ORF02095  4189和4190 苯丙氨酰基-tRNA合成酶,α亚基(pheS)[6.1.1.20]
ORF02096  4191和4192 核糖体蛋白L20(rplT)
ORF02097  4193和4194 核糖体蛋白L35(rpml)
ORF02098  4195和4196 翻译启动因子IF-3(infC)
ORF02099  4197和4198 苏氨酰-tRNA合成酶(thrS)[6.1.1.3]
ORF02100  4199和4200 InsAB′蛋白
ORF02101  4201和4202 InsA蛋白
ORF02102  4203和4204 假拟蛋白
ORF02103  4205和4206 功能未知的蛋白,DUF481超家族
ORF02104  4207和4208 pfkB(pfkB)[2.7.1.111
ORF02105  4209和4210 保守性假拟蛋白
ORF02106  4211和4212 果糖胺激酶亚家族
ORF02107  4213和4214 保守性假拟蛋白
ORF02108  4215和4216 蛋白vniC(YniC)[3.1.3.18]
ORF02109  4217和4218 预测的膜结合-金属依赖性水解酶(DUF457)家族
ORF02110  4219和4220 钠:二羧酸同向转运蛋白家族蛋白
ORF02111  4221和4222 细胞分裂激活物cedA
ORF02112  4223和4224 保守性假拟蛋白
ORF02113  4225和4226 过氧化氢酶HPII(111)[1.11.1.6]
ORF02114  4227和4228 未命名蛋白产物;ORF 28.5
ORF02115  4229和4230 6-磷酸-β-葡糖苷酶[3.2.1.86]
ORF02116  4231和4232 Cel操纵子阻抑物
ORF02117  4233和4234 纤维二糖、熊果苷和水扬苷的PEP依赖性磷酸转移酶酶III(PTS)[2.7.1.69)
ORF02118  4235和4236 PTR系统,纤维二糖特异性IIC组件(celR)
ORF02119  4237和4238 PTS系统,N,N′-二乙酰基壳二糖特异性IIB组件(FIIB-Chb)(N,N′-二乙酰基壳二糖
ORF02120  4239和4240 渗透压诱导型脂蛋白E前体
ORF02121  4241和4242 NAD+合成酶(nadE)[6.3.1.5]
ORF02122  4243和4244 功能未知的细菌蛋白(DUF886)超家族
ORF02123  4245和4246 外切核酸酶ABC亚基C同源物
ORF02124  4247和4248 原生质蛋白Y前体
ORF02125  4249和4250 保守的假拟蛋白
ORF02126  4251和4252 琥珀酰谷氨酸脱琥珀酰酶[3.1.-.-]
ORF02127  4253和4254 琥珀酰精氨酸双水解酶(astB)
ORF02128  4255和4256 琥珀酸半醛脱氢酶(EC 1.2.1.24)(NAD(+)依赖性琥珀酸半醛脱氢酶).(视黄醇)
ORF02129  4257和4258 精氨酸N-琥珀酰转移酶β亚基(astA)[2.3.1.109]
ORF02130  4259和4260 琥珀酰鸟氨酸转氨酶(琥珀酰鸟氨酸氨基转移酶)(ACOAT)[2.6.1.-]
ORF0213t  4261和4262 外切脱氧核糖核酸酶III(xth)[3.1.11.2]
ORF02132  4263和4264 可能的推定的膜蛋白
ORF02133  4265和4266 保守性假拟蛋白
ORF02134  4267和4268 DedA家族
ORF02135  4269和4270 截短的IS110家族转座酶,推定
ORF02136  4271和4272 蛋白ynjB
ORF02137  4273和4274 假拟的ABC转运蛋白通透酶蛋白yNjC
ORF02138  4275和4276 内膜蛋白MalK(P-1oop)
ORF02139  4277和4278 2.8.1.1 1[2.8.1.1]
ORF02140  4279和4280 磷脂酰甘油磷酸合酶
ORF02141  4281和4282 功能未知的蛋白质(DUF1496)超家族
ORF02142  4283和4284 mutT2[3.6.1.-]
ORF02143  4285和4286 NADP-特异性谷氨酸脱氢酶(NADP-GDH)[1.1.4]
ORF02144  4287和4288 DNA拓扑异构酶III
ORF02145  4289和4290 硒化物,水二激酶(selD)[2.7.9.3]
ORF02146  4291和4292 蛋白ydjA
ORF02147  4293和4294 假拟蛋白
ORF02148  4295和4296 信号肽肽酶SppA,67K型(sppA)[3.4.-.-]
ORF02149  4297和4298 L-天冬酰胺酶(ansA) [3.5.1.1]
ORF02150  4299和4300 吡嗪酰胺酶-烟酰胺酶(PZASE)[3.5.1.-]
ORF02151  4301和4302 推定转运蛋白
ORF02152  4303和4304 类似于转录调节物DeoR家族
ORF02153  4305和4306 醛酮还原酶Atu3 877 (ggsp69)[1.-.-.-]
ORF02154  4307和4308 推定的激酶
ORF02155  4309和4310 果糖-塔格糖二磷酸醛缩酶[4.1.2.-]
ORF02156  4311和4312 山梨糖醇脱氢酶(EC 1.1.1.14) (L-艾杜醇2-脱氢酶),(山梨糖醇)[1.1.1.14]
ORF02157  4313和4314 膜转运蛋白D1。
ORF02158  4315和4316 推定的山梨糖醇脱氢酶[1.1.1.-]
ORF02159  4317和4318 功能未知的蛋白质(DUF1315)超家族
ORF02160  4319和4320 甲硫氨酸-R-亚砜原酶(msrB)[1.8.4.6]
ORF02161  4321和4322 甘油醛-3-磷酸脱氢酶,I型(gap)[1.2.1.-]
ORF02162  4323和4324 转糖酶(片段)
ORF02163  4325和4326 吗啡6-脱氢酶(EC 1.1.1.218)(纳洛酮还原酶),(PA0804)[1.1.1.-]
ORF02164  4327和4328 MltA-相互作用蛋白前体
ORF02165  4329和4330 假拟蛋白
ORF02166  4331和4332 蛋白激酶
ORF02167  4333和4334 假拟UPF0229蛋白yeaH
ORF02168  4335和4336 GGDEF结构域蛋白
ORF02169  4337和4338 GGDEF结构域蛋白
ORF02170  4339和4340 未命名蛋白产物
ORF02171  4341和4342 转录调节物araC家族
ORF02172  4343和4344 功能未知的蛋白质(DUF441)超家族
ORF02173  4345和4346 氰酸MFS转运蛋白(通透酶)
ORF02174  4347和4348 功能未知的蛋白,DUF488超家族
ORF02175  4349和4350 溶血素VCA0594
ORF02176  4351和4352 GGDEF结构域蛋白
ORF02177  4353和4354 假拟蛋白
ORF02178  4355和4356 糖基转移酶结合蛋白
ORF02179  4357和4358 保守性假拟蛋白
ORF02180  4359和4360 推定的亚碲酸抗性蛋白TehB
ORF02181  4361和4362 假拟蛋白
ORF02182  4363和4364 转运蛋白,LvsE家族超家族
ORF02183  4365和4366 保守性假拟蛋白
ORF02184  4367和4368 酒石酸脱氢酶(3-1PM-DH)[1.1.1.93]
ORF02185  4369和4370 核糖核酸酶D(rnd)[3.1.26.3]
ORF02186  4371和4372 长链脂肪酸-CoA连接酶
ORF02187  4373和4374 外膜脂蛋白
ORF02188  4375和4376 假拟的M22肽酶同源物yeaZ[3.4.24.57]
ORF02189  4377和4378 未命名蛋白产物
ORF02190  4379和4380 内切核糖核酸酶L-PSP超家族
ORF02191  4381和4382 保守性假拟蛋白
ORF02192  4383和4384 假拟UPF0181蛋白yoaH相关蛋白
ORF02193  4385和4386 对氨基苯甲酸合酶组件I [6.3.5.8]
ORF02194  4387和4388 MutT-家族蛋白
ORF02195  4389和4390 L-丝氨酸氨-裂合酶(sdaA)[4.3.1.17]
ORF02196  4391和4392 EAL结构域蛋白
ORF02197  4393和4394 可能的Mg+2-Co+2-重金属外流泵的CorC-HlyC家族
ORF02198  4395和4396 PTS酶IIAB,甘露糖特异性(EIII-MAN)
ORF02199  4397和4398 PTS系统,甘露糖特异性IIC组件
ORF02200  4399和4400 PTS系统,甘露糖特异性IID组件
ORF02201  4401和4402 假拟UPF0266蛋白yobD
ORF02202  4403和4404 功能未知的DUF家族的结构域
ORF02203  4405和4406 推定的23S rRNA mlG745甲基转移酶[2.1.1.51]
ORF02204  4407和4408 冷激样蛋白cspE
ORF02205  4409和4410 保守性假拟蛋白
ORF02206  4411和4412 推定的脂蛋白
ORF02207  4413和4414 保守性假拟蛋白
ORF02208  4415和4416 转录调节物kdgR
ORF02209  4417和4418 多药耐药蛋白B
ORF02210  4419和4420 热激蛋白,完整的膜蛋白(htpX)[3.4.24.-]
ORF02211  4421和4422 尾特异性蛋白酶前体[3.4.21.102]
ORF02212  4423和4424 青霉素-结合蛋白3羧基末端蛋白酶
ORF02213  4425和4426 Prop效应蛋白
ORF02214  4427和4428 GAF结构域蛋白
ORF02215  4429和4430 PqiA蛋白
ORF02216  4431和4432 PqiA蛋白
ORF02217  4433和4434 mce相关蛋白家族
ORF02218  4435和4436 Sun-核仁蛋白家族蛋白
ORF02219  4437和4438 功能未知的蛋白质(DUF1480)超家族
ORF02220  4439和4440 功能未知的蛋白质(DUF1482)家族
ORF02221  4441和4442 丝氨酸-苏氨酸蛋白磷酸酶1
ORF02222  4443和4444 保守性假拟蛋白
ORF02223  4445和4446 未命名蛋白产物
ORF02224  4447和4448 推定的铜抗性蛋白D家族
ORF02225  4449和4450 蛋白yobA前体
ORF02226  4451和4452 DNA聚合酶III,θ亚基[2.7.7.7]
ORF02227  4453和4454 水解酶,碳-氮家族
ORF02228  4455和4456 DNA聚合酶III,α亚基,革兰阳性,推定
ORF02229  4457和4458 蛋白酶II(AB004795)[3.4.21.83]
ORF02230  445 9和4460 未鉴定的阅读框
ORF02231  4461和4462 未命名蛋白产物;类似于大肠杆菌的脂蛋白YebF前体
ORF02232  4463和4464 假拟蛋白
ORF02233  4465和4466 SOS调节子中的DNA损伤-诱导基因,取决于环化AMP和H-NS
ORF02234  4467和4468 磷酸核糖基甘氨酰胺甲酰基转移酶2 (purT)[2.1.2.-]
ORF02235  4469和4470 2-脱氢-3-脱氧磷酸葡糖酸醛缩酶-4-羟基-2-酮戊二酸醛缩酶(eda)[4.1 3.16]
ORF02236  4471和4472 磷酸葡糖酸脱水酶(edd)[4.2.1.12]
ORF02237  4473和4474 葡萄糖-6-磷酸1-脱氢酶(zwf)[1.1.1.49]
ORF02238  4475和4476 保守性假拟蛋白
ORF02239  4477和4478 Hex调节子阻抑物
ORF02240  4479和4480 丙酮酸激酶(pyk)[2.7.1.40]
ORF02241  4481和4482 脂质A生物合成(KDO)2-(月桂酰)-脂质IVA酰基转移酶(msbB)[2.3.1.-]
ORF02242  4483和4484 细胞包膜
ORF02243  4485和4486 高亲和摄锌系统蛋白znuA前体(AE005408)
ORF02244  4487和4488 ABC超家族高亲和Zn转运蛋白(atp结合)
ORF02245  4489和4490 高亲和摄锌系统膜蛋白znuB(atp结合)
ORF02246  4491和4492 Holliday连接DNA解旋酶RuvB (ruvB)
ORF02247  4493和4494 Holliday连接DNA解旋酶RuvA (ruvA)
ORF02248  4495和4496 功能未知的蛋白质(DUF1105)超家族
ORF02249  4497和4498 交叉连接内切脱氧核糖核酸酶RuvC (ruvC)[3.1.22.4]
ORF02250  4499和4500 保守性假拟蛋白TIGR01 033
ORF02251  4501和4502 dATP焦磷酸水解酶
ORF02252  4503和4504 天冬氨酰-tRNA合成酶(aspS)[6.1.1.12]
ORF02253  4505和4506 假拟异分支酸酶家族蛋白yecD
ORF02254  4507和4508 功能未知的蛋白质超家族
ORF02255  4509和4510 保守性假拟蛋白
ORF02256  4511和4512 推定的甲基转移酶
ORF02257  4513和4514 推定的甲基转移酶
ORF02258  4515和4516 三甲基胺-N-氧化物还原酶2前体
ORF02259  4517和4518 细胞色素c-型蛋白torY
ORF02260  4519和4520 铜内稳态蛋白VC0730
ORF02261  4521和4522 蛋白yecM
ORF02262  4523和4524 精氨酰-tRNA合成酶(argS) [6.1.1.19]
ORF02263  4525和4526 鞭毛蛋白flhE前体
ORF02264  4527和4528 鞭毛生物合成蛋白FlhA(flhA)
ORF02265  4529和4530 鞭毛生物合成蛋白FlhB(flhB)
ORF02266  4531和4532 保守性假拟蛋白
ORF02267  4533和4534 趋化性蛋白cheZ
ORF02268  4535和4536 趋化性蛋白cheY
ORF02269  4537和4538 趋化性反应调节蛋白-谷氨酸甲基酯酶(EC 3.1.1.61)[3.1.1.61]
ORF02270  4539和4540 趋化性蛋白甲基转移酶[2.1.1.80]
ORF02271  4541和4542 接受甲基的趋化性蛋白IV,肽传感蛋白受体
ORF02272  4543和4544 保守性假拟蛋白
ORF02273  4545和4546 接受甲基的趋化性蛋白II
ORF02274  4547和4548 趋化性蛋白cheW
ORF02275  4549和4550 趋化性蛋白cheA
ORF02276  4551和4552 趋化性motB蛋白
ORF02277  4553和4554 趋化性motA蛋白
ORF02278  4555和4556 鞭毛转录激活蛋白flhC
ORF02279  4557和4558 鞭毛生物合成调节蛋白,对2类操纵子起作用;转录启动因子
ORF02280  4559和4560 通用应激蛋白C (UspA)
ORF02281  4561和4562 α,α-海藻糖-磷酸合酶[UDP-形成](otsA)[2.4.1.15]
ORF02282  4563和4564 海藻糖-磷酸酶(otsB)[3.1.3.12]
ORF02283  4565和4566 L-阿拉伯糖转运系统通透酶蛋白araH
ORF02284  4567和4568 L-阿拉伯糖转运性ATP结合蛋白araG
ORF02285  4569和4570 L-阿拉伯糖-结合性周质蛋白前体(PBP)
ORF02286  4571和4572 铁蛋白样蛋白2
ORF02287  4573和4574 保守性假拟蛋白
ORF02288  4575和4576 推定的脂蛋白
ORF02289  4577和4578 保守性假拟蛋白
ORF02290  4579和4580 胞质铁蛋白(储铁蛋白)
ORF02291  4581和4582 保守性假拟蛋白
ORF02292  4583和4584 酪氨酸-特异性转运蛋白
ORF02293  4585和4586 前蛋白转位酶,SecA亚基
ORF02294  4587和4588 保守性假拟蛋白
ORF02295  4589和4590 Fels-2原噬菌体:类似于E的逆转录子(retron)
ORF02296  4591和4592 ParA
ORF02297  4593和4594 Sb32
ORF02298  4595和4596 假拟蛋白
ORF02299  4597和4598 噬菌体门蛋白,PBSX家族
ORF02300  4599和4600 推定的末端酶ATP酶亚基(gpP样)
ORF02301  4601和4602 噬菌体衣壳支架蛋白(GPO)
ORF02302  4603和4604 噬菌体主要衣壳蛋白,P2家族
ORF02303  4605和4606 噬菌体小末端酶亚基
ORF02304  4607和4608 头完成-稳定蛋白L
ORF02305  4609和4610 噬菌体尾蛋白X
ORF02306  4611和4612 Bbp2
ORF02307  4613和4614 保守性假拟蛋白
ORF02308  4615和4616 噬菌体尾完成蛋白R
ORF02309  4617和4618 Fels-2原噬菌体:类似于用于完成的gpS
ORF02310  4619和4620 基板装配蛋白V(gpV)
ORF02311  4621和4622 噬菌体基板装配蛋白W(gpW)
ORF02312  4623和4624 基板J样蛋白
ORF02313  4625和4626 gpl(gpl)
ORF02314  4627和4628 gpH(gpH)
ORF02315  4629和4630 gpU引发(gpG)
ORF02316  4631和4632 CDP-二酰甘油--甘油-3-磷酸3-磷脂酰转移酶(pgsA)
ORF02317  4633和4634 外切核酸酶ABC,C亚基(uvrC)
ORF02318  4635和4636 反应调节蛋白
ORF02319  4637和4638 保守性假拟蛋白
ORF02320  4639和4640 调节蛋白sdiA
ORF02321  4641和4642 氨基酸ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白
ORF02322  4643和4644 氨基酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白(通透酶)
ORF02323  4645和4646 4.4.1.15[3.5.99.7]
ORF02324  4647和4648 半胱氨酸-结合性周质蛋白前体
ORF02325  4649和4650 FliZ蛋白
ORF02326  4651和4652 转录启动因子替代物σ因子28(o)
ORF02327  4653和4654 FliC
ORF02328  4655和4656 鞭毛钩形鞘-结合蛋白2(HAP2)
ORF02329  4657和4658 鞭毛蛋白FliS(fliS)
ORF02330  4659和4660 鞭毛蛋白FliT
ORF02331  4661和4662 胞质α-淀粉酶[3.2.1.1]
ORF02332  4663和4664 假拟脂蛋白vedD前体
ORF02333  4665和4666 YeeE-YedE家族蛋白家族
ORF02334  4667和4668 假拟UPF0033蛋白yedF相关蛋白
ORF02335  4669和4670 未表征的ACR,COG2135超家族
ORF02336  4671和4672 外膜孔蛋白nmpC前体
ORF02337  4673和4674 假拟转录调节物ybcM
ORF02338  4675和4676 保守性假拟蛋白
ORF02339  4677和4678 EmrE蛋白
ORF02340  4679和4680 鞭毛钩形鞘-基体复合物蛋白(FliE)(fliE)
ORF02341  4681和4682 鞭毛M-环蛋白FliF(fliF)
ORF02342  4683和4684 鞭毛动力蛋白开关蛋白FliG(fliG)
ORF02343  4685和4686 鞭毛装配蛋白FliH(flH)
ORF02344  4687和4688 鞭毛特异性ATP合酶
ORF02345  4689和4690 鞭毛输出蛋白F1iJ(fliJ)
ORF02346  4691和4692 鞭毛钩形鞘-长度控制蛋白
ORF02347  4693和4694 鞭毛基体-结合蛋白FliL(fliL)
ORF02348  4695和4696 鞭毛动力蛋白开关蛋白FliM(filM)
ORF02349  4697和4698 鞭毛动力蛋白开关蛋白fliN
ORF02350  4699和4700 鞭毛蛋白fliO
ORF02351  4701和4702 隐藏原噬菌体编码的未知蛋白
ORF02352  4703和4704 螺旋-转角-螺旋结构域蛋白
ORF02353  4705和4706 稳定性决定簇
ORF02354  4707和4708 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933N相关蛋白
ORF02355  4709和4710 分裂抑制蛋白dicB
ORF02356  4711和4712 保守性假拟蛋白
ORF02357  4713和4714 外切脱氧核糖核酸酶VIII(35kD)[3.1.11.-]
ORF02358  4715和4716 保守性假拟蛋白
ORF02359  47t7和4718 Sb28(AE005423)
ORF02360  4719和4720 功能未知的蛋白质(DUF980)超家族
ORF02361  4721和4722 假拟蛋白
ORF02362  4723和4724 整合酶
ORF02363  4725和4726 trpE2
ORF02364  4727和4728 推定的胞质跨膜蛋白
ORF02365  4729和4730 推定的ABC转运蛋白,ATP-结合性-通透酶蛋白
ORF02366  4731和4732 EF0101
ORF02367  4733和4734 假拟蛋白
ORF02368  4735和4736 推定的AraC型调节蛋白
ORF02369  4737和4738 二氢酚噻唑酸合成酶
ORF02370  4739和4740 耶尔森菌菌素生物合成蛋白
ORF02371  4741和4742 耶尔森菌菌素生物合成蛋白YbtU
ORF02372  4743和4744 耶尔森菌菌素生物合成蛋白YbtT
ORF02373  4745和4746 mbtA[6.2.1.-]
ORF02374  4747和4748 OMR家族鼠疫菌素-耶尔森菌菌素受体蛋白(IRPC)
ORF02375  4749和4750 保守性假拟蛋白
ORF02376  4751和4752 推定因子
ORF02377  4753和4754 推定因子
ORF02378  4755和4756 保守性假拟蛋白
ORF02379  4757和4758 主要易化家族转运蛋白(PPII)
ORF02380  4759和4760 AMP核苷酶(amn)[3.2.2.4]
ORF02381  4761和4762 推定的功能未知的结构域
ORF02382  4763和4764 MelD蛋白
ORF02383  4765和4766 推定的酰胺酶家族蛋白
ORF02384  4767和4768 MATE外流家族蛋白亚家族
ORF02385  4769和4770 推定的肽合成酶
ORF02386  4771和4772 NosB(AF183408)
ORF02387  4773和4774 推定的fmtA样蛋白
ORF02388  4775和4776 硫酯酶
ORF02389  4777和4778 原噬菌体P4整合酶
ORF02390  4779和4780 假拟蛋白
ORF02391  4781和4782 MATE外流家族蛋白亚家族
ORF02392  4783和4784 TubD蛋白[6.3.2.-]
ORF02393  4785和4786 BarG
ORF02394  4787和4788 NosB
ORF02395  4789和4790 AMP结合性酶结构域蛋白
0RF02396  4791和4792 [酰基-载体-蛋白] S-丙二酰转移酶[2.3.1.39]
ORF02397  4793和4794 推定的酰基-CoA脱氢酶
ORF02398  4795和4796 酰基载体蛋白
ORF02399  4797和4798 3-羟基酰基CoA脱氢酶(BHBD)[1.1.1.157]
ORF02400  4799和4800 JamP
ORF02401  4801和4802 氧化还原酶,锌结合性脱氢酶家族
ORF02402  4803和4804 可能的DNA-结合反应调节蛋白
ORF02403  4805和4806 EntD-Gsp-HetI-Sfp家族蛋白[2.7.8.-]
ORF02404  4807和4808 转座酶
ORF02405  4809和4810 ISSo2,转座酶OrfB,截短
ORF02406  4811和4812 蛋白erfK-srfK前体
ORF02407  4813和4814 烟酸-核苷酸--二甲基苯并咪唑磷酸核糖基转移酶(EC
ORF02408  4815和4816 钴胺素5′-磷酸合酶(cobS) [2.7.8.26]
ORF02409  4817和4818 钴胺素生物合成蛋白cobU[2.7.1.156]
ORF02410  4819和4820 保守性假拟蛋白
ORF02411  4821和4822 保守性假拟蛋白
ORF02412  4823和4824 推定的TonB依赖性受体
ORF02413  4825和4826 保守性假拟蛋白
ORF02414  4827和4828 Z1204蛋白
ORF02415  4829和4830 保守性假拟蛋白
ORF02416  4831和4832 葡糖胺基转移酶
ORF02417  4833和4834 糖磷酸核苷酸转移酶
ORF02418  4835和4836 保守性假拟蛋白
ORF02419  4837和4838 宿主特异性蛋白J,截短,推定
ORF02420  4839和4840 宿主特异性蛋白(部分)
ORF02421  4841和4842 宿主特异性蛋白(部分)
ORF02422  4843和4844 末端酶小亚基(GP1) (片段)
ORF02423  4845和4846 保守性假拟蛋白
ORF02424  4847和4848 原噬菌体内编码的部分tonB样膜蛋白
ORF02425  4849和4850 假拟蛋白
ORF02426  4851和4852 λ原噬菌体的Bor蛋白同源物DLP12
ORF02427  4853和4854 噬菌体裂解蛋白
ORF02428  4855和4856 脂蛋白Rz1前体相关蛋白
ORF02429  4857和4858 假拟蛋白
ORF02430  4859和4860 溶酶体(裂解蛋白)(胞壁酸酶)(内溶素)(溶酶体)[3.2.1.17]
ORF02431  4861和4862 裂解蛋白S.b1556
ORF02432  4863和4864 假拟蛋白
ORF02433  4865和4866 外膜孔蛋白nmpC前体(Ibc)
ORF02434  4867和4868 λ原噬菌体的抗终止蛋白O同源物
ORF02435  4869和4870 内切脱氧核糖核酸酶RUS(Hollidav连接解离酶)
ORF02436  4871和4872 蛋白ninE相关蛋白
ORF02437  4873和4874 噬菌体N-6-腺嘌呤-甲基转移酶[2.1.1.72]
ORF02438  4875和4876 蛋白ninB
ORF02439  4877和4878 复制蛋白P
ORF02440  4879和4880 转座酶
ORF02441  4881和4882 ECs1339
ORF02442  4883和4884 核糖激酶
ORF02443  4885和4886 功能未知的蛋白质(DUF1355)超家族
ORF02444  4887和4888 推定膜蛋白
ORF02445  4889和4890 推定的磷酸三酯酶(PTE)[3.1.8.1]
ORF02446  4891和4892 γ-谷氨酰转肽酶
ORF02447  4893和4894 γ-谷氨酰转肽酶
ORF02448  4895和4896 ST55蛋白
ORF02449  4897和4898 保守性假拟蛋白
ORF02450  4899和4900 保守性假拟蛋白
ORF02451  4901和4902 ISBma3,转座酶,截短
ORF02452  4903和4904 原噬菌体CP4-57调节蛋白(AIpA)家族
ORF02453  4905和4906 假拟蛋白
ORF02454  4907和4908 保守性假拟蛋白
ORF02455  4909和4910 假拟蛋白
ORF02456  4911和4912 插入序列ATP-结合蛋白
ORF02457  4913和4914 转座酶
ORF02458  4915和4916 保守性假拟蛋白
ORF02459  4917和4918 铁-肠菌素-转运蛋白(111)
ORF02460  4919和4920 ABC转运蛋白通透酶STY0802(FecCD家族)
ORF02461  4921和4922 周质结合蛋白(111)
ORF02462  4923和4924 TonB依赖性受体
ORF02463  4925和4926 YeeP蛋白
ORF02464  4927和4928 保守性假拟蛋白
ORF02465  4929和4930 保守性假拟蛋白
ORF02466  4931和4932 保守性假拟蛋白
ORF02467  4933和4934 Patatin样磷脂酶家族
ORF02468  4935和4936 保守性假拟蛋白
ORF02469  4937和4938 保守性假拟蛋白
ORF02470  4939和4940 保守性假拟蛋白
ORF02471  4941和4942 Z1215蛋白(0273)
ORF02472  4943和4944 抗限制性蛋白家族
ORF02473  4945和4946 YeeS蛋白(o160)
ORF02474  4947和4948 功能未知的蛋白质(DUF987)超家族
ORF02475  4949和4950 YeeU蛋白
ORF02476  4951和4952 L0007样蛋白
ORF02477  4953和4954 YeeW蛋白
ORF02478  4955和4956 功能未知的蛋白质(DUF496)超家族
ORF02479  4957和4958 保守性假拟蛋白
ORF02480  4959和4960 DNA促旋酶抑制蛋白
ORF02481  4961和4962 青霉素-结合蛋白6B前体(PBP)
ORF02482  4963和4964 青霉素结合蛋白6b
ORF02483  4965和4966 外切脱氧核糖核酸酶I
ORF02484  4967和4968 氨基酸通透酶
ORF02485  4969和4970 转录调节物,LysR家族
ORF02486  4971和4972 蛋白yeeZ前体
ORF02487  4973和4974 成瘾模块毒素,Txe-YoeB家族
ORF02488  4975和4976 yefM蛋白
ORF02489  4977和4978 ATP磷酸核糖基转移酶(h isG)[2.4.2.17]
ORF02490  4979和4980 组氨醇脱氢酶(hisD)[1.1.1.23]
ORF02491  4981和4982 组氨醇-磷酸氨基转移酶(hisC)[2.6.1.9]
ORF02492  4983和4984 组氨酸生物合成双功能蛋白hisB
ORF02493  4985和4986 咪唑甘油磷酸合酶亚基hisH(IGP合酶谷胺酰胺酰胺基转移酶亚基)(IGP合酶亚
ORF02494  4987和4988 咪唑甘油磷酸合酶,谷胺酰胺酰胺基转移酶亚基(hisH)[2.4.2.-]
ORF02495  4989和4990 磷酸核糖基亚胺甲基-5-氨基咪唑羧酰胺核醣酸异构酶(hisA)[5.3.1.16]
ORF02496  4991和4992 咪唑甘油磷酸合酶,环化酶亚基(hisF)
ORF02497  4993和4994 组氨酸生物合成双功能蛋白hislE[包括:磷酸核糖基-AMP环式水解酶
ORF02498  4995和4996 链长决定簇蛋白
ORF02499  4997和4998 UDP-葡萄糖6-脱氢酶(UDPGDH)[1.1.1.22]
ORF02500  4999和5000 6-磷酸葡糖酸脱氢酶,脱羧性(gnd)[1.1.1.44]
ORF02501  5001和5002 WbnE[2.4.1.-]
ORF02502  5003和5004 推定的糖基转移酶[2.4.1.-]
ORF02503  5005和5006 糖基转移酶CpsO
ORF02504  5007和5008 鼠李糖基转移酶Cps6bS
ORF02505  5009和5010 O-抗原修饰蛋白
ORF02506  5011和5012 rfbX蛋白
ORF02507  5013和5014 dTDP-4-脱氢鼠李糖3,5-差向异构酶(rfbC)[5.1.3.13]
ORF02508  5015和5016 葡萄糖-1-磷酸胸苷酰转移酶(rfbA)[2.7.7.24]
ORF02509  5017和5018 dTDP-4-脱氢鼠李糖还原酶(rfbD)[1.1.1.133]
ORF02510  5019和5020 dTDP-葡萄糖4,6-脱水酶(rfb B) [4.2.1.46]
ORF02511  5021和5022 调节蛋白GalF(galF)
ORF02512  5023和5024 肠菌酸生物合成蛋白wcaM
ORF02513  5025和5026 Amylovoran生物合成糖基转移酶amsK[2.-.-.-]
ORF02514  5027和5028 肠菌酸生物合成蛋白wcaK [2.-.-.-]
ORF02515  5029和5030 脂多糖生物合成蛋白wzxC
ORF02516  5031和5032 糖基转移酶(WcaJ)[2.7.-.-]
ORF02517  5033和5034 磷酸甘露糖变位酶
ORF02518  5035和5036 甘露糖-1-磷酸鸟苷酰转移酶-甘露糖-6-磷酸异构酶
ORF02519  5037和5038 推定的脂多糖生物合成蛋白
ORF02520  5039和5040 GDP-甘露糖甘露糖基水解酶[3.6.1.-]
ORF02521  5041和5042 GDP-岩藻糖合成酶A链(GER1)[1.1.1.271]
ORF02522  5043和5044 GDP-甘露糖4,6-脱水酶(gmd)[4.2.1.47]
ORF02523  5045和5046 推定的乙酰基转移酶,CysE-LacA-LpxA-NodL家族[2.3.1.-]
ORF02524  5047和5048 糖基转移酶,2类家族蛋白,推定
ORF02525  5049和5050 推定肠菌酸聚合酶
ORF02526  5051和5052 可能的糖基转移酶
ORF02527  5053和5054 丝氨酸乙酰基转移酶[2.3.1.-]
ORF02528  5055和5056 可能的糖基转移酶
ORF02529  5057和5058 酪氨酸-蛋白激酶wzc
ORF02530  5059和5060 低分子量蛋白-酪氨酸-磷酸酶wzb[3.1.3.48]
ORF02531  5061和5062 膜蛋白
ORF02532  5063和5064 推定转运蛋白
ORF02533  5065和5066 未命名蛋白产物
ORF02534  5067和5068 PHIKZ114
ORF02535  5069和5070 蛋白asmA前体
ORF02536  5071和5072 脱氧胞嘧啶三磷酸脱氨酶(dcd)[3.5.4.13]
ORF02537  5073和5074 尿苷激酶(udk)[2.7.1.48]
ORF02538  5075和5076 MASE1结构域家族
ORF02539  5077和5078 推定的Ada调节蛋白[3.2,2.21]
ORF02540  5079和5080 假拟蛋白
ORF02541  5081和5082 分子侣伴蛋白
ORF02542  5083和5084 保守性假拟蛋白
ORF02543  5085和5086 保守性假拟蛋白
ORF02544  5087和5088 yon Willebrand因子A型结构域蛋白
ORF02545  5089和5090 推定的膜蛋白
ORF02546  5091和5092 AcrB-AcrD-AcrF(HAE 1)
ORF02547  5093和5094 AcrB-AcrD-AcrF家族膜蛋白
ORF02548  5095和5096 MFS超家族药物外流泵
ORF02549  5097和5098 推定的传感蛋白组氨酸激酶SrrB[2.7.3.-]
ORF02550  5099和5100 转录调节蛋白baeR (ResD)
ORF02551  5101和5102 功能未知的结构域(DUF1508)家族
ORF02552  5103和5104 保守性假拟蛋白
ORF02553  5105和5106 保守性假拟蛋白
ORF02554  5107和5108 保守性假拟蛋白
ORF02555  5109和5110 保守性假拟蛋白
ORF02556  5111和5112 YeqQ[3.4.-.-]
ORF02557  5113和5114 保守性假拟蛋白TIGR00147
ORF02558  5115和5116 半乳糖醇利用操纵子阻抑物(片段)
ORF02559  5117和5118 己糖醇脱氢酶[1.1.1.251]
ORF02560  5119和5120 PTS系统,山梨糖醇特异性IIC组件(EIIC-GAT)
ORF02561  5121和5122 PTS系统,半乳糖醇特异性IIB组件(EIIB-Gat)(乳糖醇(galacticol)-通透酶IIB组
ORF02562  5123和5124 PTS系统,半乳糖醇特异性IIA组件(EIIA-Gat) (乳糖醇(galactico1)-通透酶IIA组件)
ORF02563  5125和5126 推定的塔格糖6-磷酸激酶蛋白[2.7.1.144]
ORF02564  5127和5128 II类醛缩酶,塔格糖二磷酸家族[4.1.2.-]
ORF02565  5129和5130 脱水蛋白[4.1.2.13]
ORF02566  5131和5132 推定的核苷通透酶NupG
ORF02567  5133和5134 推定的ADP-核糖基糖水解酶
ORF02568  5135和5136 推定的转录调节物,GntR家族
ORF02569  5137和5138 核糖激酶(EC 2.7.1.151。[2.7.1.15]
ORF02570  5139和5140 糖基水解酶,家族25[3.2.1.17]
ORF02571  5141和5142 磷酸甲基嘧啶激酶(thiD) [2.7.4.7]
ORF02572  5143和5144 羟乙基噻唑激酶(thiM) [2.7.1,50]
ORF02573  5145和5146 未表征的BCR,COG1937家族
ORF02574  5147和5148 NirC
ORF02575  5149和5150 保守性假拟蛋白
ORF02576  5151和5152 保守性假拟蛋白
ORF02577  5153和5154 假拟外膜传达蛋白yehB前体
ORF02578  5155和5156 假拟菌毛侣伴蛋白yehC前体
ORF02579  5157和5158 菌毛蛋白亚家族
ORF02580  5159和5160 Mrp蛋白(mrp)
ORF02581  5161和5162 甲硫氨酰基-tRNA合成酶(metG)[6.1.1.10]
ORF02582  5163和5164 钼酸代谢调节蛋白,第二片段2(片段)
ORF02583  5165和5166 yehl(片段)
ORF02584  5167和5168 yehl(片段)
ORF02585  5169和5170 保守性假拟蛋白
ORF02586  5171和5172 保守性假拟蛋白
ORF02587  5173和5174 含有VWA结构域的CoxE样蛋白家族
ORF02588  5175和5176 yehO基因产物
ORF02589  5177和5178 假拟脂蛋白yehR前体
ORF02590  5179和5180 在细菌中保守的未表征蛋白
ORF02591  5181和5182 未命名蛋白产物
ORF02592  5183和5184 推定的2-组件传感蛋白
ORF02593  5185和5186 MerR样调节蛋白A
ORF02594  5187和5188 甘氨酸甜菜碱-1-脯氨酸转运系统通透酶蛋白prow (AE005444)
ORF02595  5189和5190 推定的膜蛋白
ORF02596  5191和5192 氨基酸ABC转运蛋白,ATP结合蛋白(AE005444)
ORF02597  5193和5194 ABC转运蛋白,通透酶蛋白(AE005444)
ORF02598  5195和5196 甘氨酸甜菜碱-L-脯氨酸ABC转运蛋白,周质底物-结合蛋白,推定
ORF02599  5197和5198 yohA(STI)[3.2.1 21]
ORF02600  5199和5200 D-乳酸脱氢酶
ORF02601  5201和5202 β-内酰胺酶
ORF02602  5203和5204 功能未知的蛋白质(DUF1282)超家族
ORF02603  5205和5206 DedA家族蛋白
ORF02604  5207和5208 yohF[1.-.-.-]
ORF02605  5209和5210 推定的通道纤维蛋白
ORF02606  5211和5212 二氢尿苷合酶(Dus)超家族
ORF02607  5213和5214 推定的LrgA家族亚家族
ORF02608  5215和5216 推定的膜蛋白
ORF02609  5217和5218 胞嘧啶脱氨酶(cdd) [3.5.4.5]
ORF02610  5219和5220 SanA蛋白
ORF02611  5221和5222 保守性假拟蛋白
ORF02612  5223和5224 谷氨酸合酶,小亚基(NADPH)
ORF02613  5225和5226 二氢乳清酸酶脱氢酶(pyrD)
ORF02614  5227和5228 保守性假拟蛋白
ORF02615  5229和5230 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白(膜)
ORF02616  5231和5232 半乳糖苷转运ATP-结合蛋白mglA(atp结合)
ORF02617  5233和5234 D-半乳糖-结合性周质蛋白前体(GBP)(D-半乳糖-D-葡萄糖结合蛋白)(GGBP)
ORF02618  5235和5236 Mgl阻抑物和半乳糖超诱导因子
ORF02619  5237和5238 未命名蛋白产物
ORF02620  5239和5240 保守性假拟蛋白
ORF02621  5241和5242 GTP环式水解酶I(folE)[3.5.4.16]
ORF02622  5243和5244 羧基酯酶[3.1.1.-]
ORF02623  5245和5246 大肠杆菌素I受体前体
ORF02624  5247和5248 赖氨酸-特异性通透酶
ORF02625  5249和5250 转录调节物,LysR家族
ORF02626  5251和5252 推定的膜蛋白
ORF02627  5253和5254 内切核酸酶IV(内切脱氧核糖核酸酶IV)[3.1.21.2]
ORF02628  5255和5256 yeil
ORF02629  5257和5258 肌苷-尿苷优选核苷水解酶(AL355920)
ORF02630  5259和5260 调节蛋白nsr
ORF02631  5261和5262 核苷转运蛋白
ORF02632  5263和5264 参与色素生物合成的未表征的酶
ORF02633  5265和5266 yeil
ORF02634  5267和5268 PTS系统,果糖特异性IIBC组件[2.7.1.69]
ORF02635  5269和5270 1-磷酸果糖激酶(果糖1-磷酸激酶)(fruK)[2.7.1.56]
ORF02636  5271和5272 PTS系统,果糖特异性IIA-FPr组件(EIIA-Fru) (果糖-通透酶IIA-FPr组件)(磷酸转
ORF02637  5273和5274 保守性假拟蛋白
ORF02638  5275和5276 糖外流转运蛋白B(orfl04)
ORF02639  5277和5278 翻译延伸因子EF-P(EF-P)
ORF02640  5279和5280 D-甘露糖酸氧化还原酶
ORF02641  5281和5282 CobW-P47K家族蛋白结构域蛋白
ORF02642  5283和5284 PAP2超家族结构域蛋白
ORF02643  5285和5286 脂蛋白spr前体(spr)
ORF02644  5287和5288 Rtn蛋白
ORF02645  5289和5290 ABC转运蛋白底物结合蛋白
ORF02646  5291和5292 肽ABC转运蛋白,通透酶蛋白
ORF02647  5293和5294 ABC转运蛋白,通透酶蛋白
ORF02648  5295和5296 ABC转运蛋白,核苷酸结合性-ATP酶蛋白[肽]
ORF02649  5297和5298 未命名蛋白产物
ORF02650  5299和5300 双环霉素抗性蛋白
ORF02651  5301和5302 核糖体小亚基假尿苷合酶A
ORF02652  5303和5304 yejH
ORF02653  5305和5306 50S核糖体蛋白L25
ORF02654  5307和5308 拟核-结合蛋白
ORF02655  5309和5310 假拟蛋白
ORF02656  53t1和5312 功能未知的蛋白质(DUF1414)超家族
ORF02657  5313和5314 预测的碱性磷酸酶超家族的水解酶
ORF02658  5315和5316 yejO
ORF02659  5317和5318 硝酸-亚硝酸反应调节蛋白narP
ORF02660  5319和5320 细胞色素c型生源蛋白ccmH前体(nrfF)
ORF02661  5321和5322 巯基:二硫键交换蛋白dsbE(细胞色素c生源蛋白ccmG)(dsbE)
ORF02662  5323和5324 细胞色素c型生源蛋白ccmF(ccmF)
ORF02663  5325和5326 细胞色素c型生源蛋白ccmE
ORF02664  5327和5328 血红素输出蛋白D (细胞色素c型生源蛋白ccmD)-相关蛋白
ORF02665  5329和5330 血红素输出蛋白C
ORF02666  5331和5332 血红素输出蛋白CcmB (ccmB)
ORF02667  5333和5334 血红素输出蛋白CcmA (ccmA)
ORF02668  5335和5336 细胞色素c型蛋白napC
ORF02669  5337和5338 周质硝酸还原酶,二血红素细胞色素c亚基(napB)
ORF02670  5339和5340 铁氧还蛋白-型蛋白napH(napH)
ORF02671  5341和5342 铁氧还蛋白-型蛋白napG(napG)
ORF02672  5343和5344 周质硝酸还原酶,大亚基(napA)[1.7.99.4]
ORF02673  5345和5346 NapD蛋白(napD)
ORF02674  5347和5348 铁氧还蛋白-型蛋白NapF(napF)
ORF02675  5349和5350 Ecotin
ORF02676  5351和5352 苹果酸:醌-氧化还原酶(mqo)[1.1.99.16]
ORF02677  5353和5354 假拟蛋白
ORF02678  5355和5356 MdlB蛋白
ORF02679  5357和5358 烷基化的DNA修复蛋白alkB(alkB)
ORF02680  5359和5360 O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶;转录激活物-阻抑物
ORF02681  5361和5362 推定的硫胺生物合成脂蛋白ApbE
ORF02682  5363和5364 外膜蛋白C前体(孔蛋白ompC)(外膜蛋白1B)(Ibc)
ORF02683  5365和5366 YoiQ[2.7.3.-]
ORF02684  5367和5368 肠菌酸荚膜生物合成的阳性反应调节物
ORF02685  5369和5370 传感蛋白rcsC
ORF02686  5371和5372 传感蛋白atoS
ORF02687  5373和5374 乙酰乙酸代谢调节蛋白atoC(atoC)
ORF02688  5375和5376 乙酸CoA-转移酶α亚基[2.8.3.8]
ORF02689  5377和5378 乙酸CoA-转移酶β亚基(atoA)[2.8.3.8]
ORF02690  5379和5380 推定的膜蛋白
ORF02691  5381和5382 乙酰-CoA乙酰基转移酶(atoB)[2.3.1.9]
ORF02692  5383和5384 保守性假拟蛋白
ORF02693  5385和5386 保守性假拟蛋白
ORF02694  5387和5388 α-2-巨球蛋白家族N末端区家族
ORF02695  5389和5390 功能未知的蛋白质(DUF1175)超家族
ORF02696  5391和5392 保守性假拟蛋白
ORF02697  5393和5394 DNA促旋酶,A亚基(gyrA)[5.99.1.3]
ORF02698  5395和5396 泛醌生物合成O-甲基转移酶(ubiG)[2.11.-]
ORF02699  5397和5398 类似于[SwissProt登录号P45508]
ORF02700  5399和5400 核糖核苷二磷酸还原酶1,α亚基,B1(nrdA)[1.17.4.1]
ORF02701  5401和5402 核糖核苷二磷酸还原酶1,β亚基,B2
ORF0272  5403和5404 皮质铁氧还蛋白家族铁氧还蛋白
ORF02703  5405和5406 蛋白inaA
ORF02704  5407和5408 甘油磷酸二酯磷酸二酯酶,周质
ORF02705  5409和5410 甘油-3-磷酸转运蛋白(glpT)
ORF02706  5411和5412 推定glpD2[1.1.99.5]
ORF02707  5413和5414 厌氧性甘油-3-磷酸脱氢酶亚基B
ORF02708  5415和5416 厌氧性甘油-3-磷酸脱氢酶亚基C[1.1.99.5]
ORF02709  5417和5418 保守性假拟蛋白
ORF02710  5419和5420 转座酶
ORF02711  5421和5422 转座酶
ORF02712  5423和5424 类似于[SwissProt登录号P23522]
ORF02713  5425和5426 主要易化家族转运蛋白
ORF02714  5427和5428 扁桃酸消旋酶-粘康酸内酯化酶,C末端结构域蛋白
ORF02715  5429和5430 推定的转录调节蛋白,lclR家族
ORF02716  5431和5432 CinA样蛋白
ORF02717  5433和5434 YfaZ前体超家族
ORF02718  5435和5436 水解酶,NUDIX家族,推定
ORF02719  5437和5438 铝诱导的蛋白
ORF02720  5439和5440 脂多糖生物合成蛋白
ORF02721  5441和5442 糖基转移酶arnC(Ara4N转移酶)(多粘菌素抗性蛋白pmrF)[2.-.-.-]
ORF02722  5443和5444 甲酰基转移酶,C-末端结构域蛋白
ORF02723  5445和5446 PbgP4蛋白
ORF02724  5447和5448 蜂毒肽抗性蛋白PqaB
ORF02725  5449和5450 蔗糖-6磷酸水解酶
ORF02726  5451和5452 保守性假拟蛋白
ORF02727  5453和5454 多粘菌素B抗性蛋白pmrD
ORF02728  5455和5456 O-琥珀酰苯甲酸-CoA连接酶(menE)[6.2.1.26]
ORF02729  5457和5458 O-琥珀酰苯甲酸(OSB)合成酶(menC)[4.2.1.-]
ORF02730  5459和5460 萘甲酸合酶(menB)[4.1.3.36]
ORF02731  5461和5462 水解酶,α-β水解酶折叠家族,推定
ORF02732  5463和5464 2-琥珀酰-6-羟基-2,4-环己二烯-1-羧酸合酶-2-酮戊二酸
ORF02733  5465和5466 甲基萘醌特异性异分支酸合酶
ORF02734  5467和5468 ElaB蛋白
ORF02735  5469和5470 elaA蛋白VC2565(推定)
ORF02736  5471和5472 金属-β-内酰胺酶超家族蛋白[3.1.26.11]
ORF02737  5473和5474 yon Willebrand因子A型结构域蛋白
ORF02738  5475和5476 推定的氨基肽酶
ORF02739  5477和5478 保守性假拟蛋白
ORF02740  5479和5480 NADH脱氢酶I,N链(NUO14)[1.6.99.5]
ORF02741  5481和5482 NADH脱氢酶I,M链(NUO13][1.6.99.5]
ORF02742  5483和5484 NADH脱氢酶I,L链ECs3162(NUO12)[1.6.99.5]
ORF02743  5485和5486 NADH脱氢酶I,L链ECs3162(NUO12)[1.6.99.5]
ORF02744  5487和5488 NADH脱氢酶I,K亚基(NUO11)[1.6.5.3]
ORF02745  5489和5490 NADH-醌氧化还原酶J链(NADH脱氢酶I,J链)(NDH-1,J链)(NUO10)[1.6.99.5]
ORF02746  5491和5492 NADH脱氢酶I,I链(EC 1.6.5.3)(NADH-泛醌氧化还原酶链7)(NUO7)(片
ORF02747  5493和5494 NADH脱氢酶I,H链(NUO8)[1.6.99.5]
ORF02748  5495和5496 NADH脱氢酶I,G链(EC 1.6.5.3)(NADH-泛醌氧化还原酶链7)(NUO7)(片
ORF02749  5497和5498 NADH-醌氧化还原酶,F亚基(nuoF)
ORF02750  5499和5500 NADH-醌氧化还原酶,E链(NADH脱氢酶I,E链)(NDH-1,E链)(NUO5)[1.6.99.5]
ORF02751  5501和5502 NADH脱氢酶I,C-D链(NUO4)[1.6.99.5]
ORF02752  5503和5504 NADH-醌氧化还原酶,B链(NADH脱氢酶I,B链)(NDH-1,B链)(NUO2)[1.6.99.5]
ORF02753  5505和5506 NADH-醌氧化还原酶,A链(NADH脱氢酶I,A链)(NDH-1,A链)(NUO1)[1.6.99.5]
ORF02754  5507和5508 LysR家族NADH脱氢酶转录调节蛋白(RssB)
ORF02755  5509和5510 假拟蛋白
ORF02756  5511和5512 I和II类氨基转移酶(ASPAT)[2.6.1.-]
ORF02757  5513和5514 b2291
ORF02758  5515和5516 未命名蛋白产物
ORF02759  5517和5518 水解酶,卤代酸脱卤酶样家族[3.1.3.-]
ORF02760  5519和5520 蛋白yfbU
ORF02761  5521和5522 假拟UPF0208蛋白yfbV
ORF02762  5523和5524 乙酸激酶(ackA)[2.7.2.1]
ORF02763  5525和5526 磷酸乙酰基转移酶
ORF02764  5527和5528 预测的膜蛋白
ORF02765  5529和5530 1型IPP异构酶家族蛋白,推定[3.6.-.-]
ORF02766  5531和5532 磷酸酯酶,推定亚家族
ORF02767  5533和5534 谷胱甘肽S-转移酶,N末端结构域蛋白
ORF02768  5535和5536 推定的谷胱甘肽S-转移酶
ORF02769  5537和5538 二氢新蝶呤醛缩酶(folB)[4.1.2.25]
ORF02770  5539和5540 保守性假拟蛋白TIGR01777
ORF02771  5541和5542 保守性假拟蛋白亚家族
ORF02772  5543和5544 组氨酸转运ECs3190的ATP结合组件
ORF02773  5545和5546 组氨酸转运系统膜蛋白M(膜)
ORF02774  5547和5548 氨基酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白
ORF02775  5549和5550 组氨酸-结合性周质蛋白前体(HBP)
ORF02776  5551和5552 赖氨酸-精氨酸-鸟氨酸结合性周质蛋白前体(LAO-结合蛋白)
ORF02777  5553和5554 3-八异戊二烯基-4-羟基苯甲酸羧基-裂合酶(聚异戊二烯基对羟基苯甲酸脱羧
ORF02778  5555和5556 酰氨基磷酸核糖基转移酶(purF)[2.4.2.14]
ORF02779  5557和5558 CvpA家族蛋白(cvpA)
ORF02780  5559和5560 DedD蛋白
ORF02781  5561和5562 FolC双功能蛋白[6.3.2.17]
ORF02782  5563和5564 乙酰-CoA羧化酶,羧基转移酶,β亚基(accD)[6.4.1.2]
ORF02783  5565和5566 DedA蛋白
ORF02784  5567和5568 tRNA假尿苷合酶A(truA)[4.2.1.70]
ORF02785  5569和5570 USG-1蛋白[1.2.1.-]
ORF02786  5571和5572 赤酮酸-4-磷酸脱氢酶[1.1.1.-]
ORF02787  5573和5574 假拟蛋白
ORF02788  5575和5576 Int
ORF02789  5577和5578 调节蛋白cox
ORF02790  5579和5580 假拟蛋白
ORF02791  5581和5582 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933T
ORF02792  5583和5584 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933T
ORF02793  5585和5586 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933T
ORF02794  5587和5588 假拟蛋白
ORF02795  5589和5590 保守性假拟蛋白
ORF02796  5591和5592 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933T
ORF02797  5593和5594 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933T相关蛋白
ORF02798  5595和5596 保守性假拟蛋白
ORF02799  5597和5598 Fels-2原噬菌体蛋白
ORF02800  5599和5600 gpH
ORF02801  5601和5602 gpU(gpG)
ORF02802  5603和5604 GpU引发(gpG)
ORF02803  5605和5606 DNA-转化酶(pin)
ORF02804  5607和5608 Fels-2原噬菌体蛋白(gpU)
ORF02805  5609和5610 噬菌体尾卷尺蛋白,TP901家族,推定
ORF02806  561 1和5612 可能的噬菌体尾蛋白相关蛋白
ORF02807  5613和5614 可能的尾蛋白(gpE)
ORF02808  5615和5616 噬菌体主要尾管蛋白
ORF02809  5617和5618 噬菌体尾鞘蛋白
ORF02810  5619和5620 假拟蛋白
ORF02811  5621和5622 噬菌体晚期基因控制蛋白D
ORF02812  5623和5624 假拟蛋白
ORF02813  5625和5626 噬菌体转录激活蛋白,Oqr-δ
ORF02814  5627和5628 保守的假拟蛋白
ORF02815  5629和5630 假拟蛋白
ORF02816  5631和5632 假拟蛋白
ORF02817  5633和5634 DIV蛋白(片段)
ORF02818  5635和5636 假拟UPF0226蛋白vfcJ
ORF02819  5637和5638 3-氧代酰基-[酰基-载体-蛋白]合酶I(β-酮酰基-ACP合酶I)(KAS I)[2.3.1.41]
ORF02820  5639和5640 甘氨酸-D-氨基酸氧化酶(脱氨基)
ORF02821  5641和5642 保守的假拟蛋白
ORF02822  5643和5644 类似于[SwissProt登录号P44255]
ORF02823  5645和5646 预测的通透酶(ORF9)
ORF02824  5647和5648 对青霉素不敏感的胞壁质内肽酶前体[3.4.99.-]
ORF02825  5649和5650 分支酸合酶(aroC)[4.2,3.5]
ORF02826  5651和5652 预测的rRNA或tRNA甲基化酶[2.1.1.72]
ORF02827  5653和5654 Smr结构域蛋白
ORF02828  5655和5656 保守性假拟蛋白
ORF02829  5657和5658 小菌毛亚基StfG
ORF02830  5659和5660 小菌毛亚基StfF
ORF02831  5661和5662 菌毛亚基
ORF02832  5663和5664 周质菌毛侣伴蛋白StfD
ORF02833  5665和5666 外膜传达蛋白StfC
ORF02834  5667和5668 主要菌毛亚基StfA
ORF02835  5669和5670 假拟蛋白
ORF02836  5671和5672 磷酸组氨酸磷酸酶SixA(sixA)[3.1.3.-]
ORF02837  5673和5674 脂肪酸氧化复合物,α亚基FadJ(fadJ)[4.2.1.17 1.1.1.35 5.1.2.3]
ORF02838  5675和5676 乙酰-CoA C-酰基转移酶FadI(fadI)[2.3,1.16]
ORF02839  5677和5678 保守性假拟蛋白超家族
ORF02840  5679和5680 长链脂肪酸转运蛋白前体(外膜fadL蛋白)(外膜flp蛋白)
ORF02841  5681和5682 VACJ脂蛋白前体(vacJ)
ORF02842  5683和5684 可能的转运yfdC
ORF02843  5685和5686 推定的原噬菌体整合酶
ORF02844  5687和5688 假拟蛋白
ORF02845  5689和5690 内-α-唾液酸酶[3.2.1.129]
ORF02846  5691和5692 假拟蛋白
ORF02847  5693和5694 内-α-唾液酸酶[3.2.1.129]
ORF02848  5695和5696 抗阻抑物蛋白ant
ORF02849  5697和5698 未命名蛋白产物;pot.mnt-基因产物(aa 1-83)
ORF02850  5699和5700 DNA转移蛋白
ORF02851  5701和5702 假拟蛋白
ORF02852  5703和5704 DNA转移蛋白
ORF02853  5705和5706 DNA转移蛋白gp7
ORF02854  5707和5708 头装配蛋白
ORF02855  5709和5710 DNA稳定蛋白
ORF02856  5711和5712 DNA稳定蛋白
ORF02857  5713和5714 基因7蛋白
ORF02858  5715和5716 假拟蛋白
ORF02859  5717和5718 推定的外被蛋白
ORF02860  5719和5720 推定的P23
ORF02861  5721和5722 门蛋白
ORF02862  5723和5724 噬菌体末端酶,大亚基,PBSX家族
ORF02863  5725和5726 保守性假拟蛋白
ORF02864  5727和5728 基因67蛋白
ORF02865  5729和5730 在bp 59处交替启动;ORF
ORF02866  5731和5732 噬菌体裂解蛋白
ORF02867  5733和5734 溶菌酶[3.2.1.17]
ORF02868  5735和5736 噬菌体穴蛋白,λ家族
ORF02869  5737和5738 基因59蛋白
ORF02870  5739和5740 噬菌体NinH蛋白超家族
ORF02871  5741和5742 holiday-连接解离酶[3.1.22.-]
ORF02872  5743和5744 GD66
ORF02873  5745和5746 DNA-结合蛋白Roi(Antl)
ORF02874  5747和5748 NinF蛋白超家族
ORF02875  5749和5750 NinX
ORF02876  5751和5752 蛋白ninE相关蛋白
ORF02877  5753和5754 蛋白ninB
ORF02878  5755和5756 DnaB类似物[3.6.1.-1
ORF02879  5757和5758 GO54
ORF02880  5759和5760 调节蛋白CII (cll)
ORF02881  5761和5762 假拟蛋白
ORF02882  5763和5764 基因33蛋白
ORF02883  5765和5766 基因33蛋白
ORF02884  5767和5768 Kil蛋白相关蛋白
ORF02885  5769和5770 Gp42.1
ORF02886  5771和5772 Gp40
ORF02887  5773和5774 基因25蛋白
ORF02888  5775和5776 假拟蛋白
ORF02889  5777和5778 Gp37
ORF02890  5779和5780 功能未知的蛋白质(DUF551)家族
ORF02891  5781和5782 保守性假拟蛋白
ORF02892  5783和5784 基因18蛋白相关蛋白
ORF02893  5785和5786 D-丝氨酸脱氨酶转录激活蛋白(dsdC)
ORF02894  5787和5788 DsdX通透酶
ORF02895  5789和5790 D-丝氨酸氨-裂合酶(dsdA)[4.3.1.18]
ORF02896  5791和5792 多药耐药蛋白Y
ORF02897  5793和5794 多药耐药蛋白K
ORF02898  5795和5796 保守性假拟蛋白
ORF02899  5797和5798 阳性转录调节蛋白evgA
ORF02900  5799和5800 传感蛋白evgS前体[2.7.3.-]
ORF02901  5801和5802 CAIB-BAIF家族蛋白
ORF02902  5803和5804 类似于[SwissProt登录号P45869]
ORF02903  5805和5806 oxcA[4.1.1,81
ORF02904  5807和5808 CAIB-BAIF家族蛋白[2.8.3.161
ORF02905  5809和5810 YfdX蛋白前体
ORF02906  5811和5812 保守性假拟蛋白
ORF02907  5813和5814 DDG蛋白
ORF02908  5815和5816 转氨酶[相似性] (ASPAT)[2.6.1.-]
ORF02909  5817和5818 组氨酸激酶家族
ORF029t0  5819和5820 自溶素反应调节物
ORF02911  5821和5822′ 转录调节物VC1825
ORF02912  5823和5824 磷酸烯醇式内酮酸-蛋白磷酸转移酶ptsA(磷酸转移酶系统,酶I)(酶I-Ani) [2.7.3.9]
ORF02913  5825和5826 frv操纵子蛋白
ORF02914  5827和5828 脯氨酸二肽酶[3.4.-.-]
ORF02915  5829和5830 PTS系统,果糖特异性IIABC组件,推定[2.7.1.69]
ORF02916  5831和5832 PTS系统,果糖样-2 IIB组件1 (磷酸转移酶)
ORF02917  5833和5834 葡萄糖激酶(qlk)[2.7.121
ORF02918  5835和5836 推定的离子-转运蛋白yfeO
ORF02919  5837和5838 保守性假拟蛋白
ORF02920  5839和5840 转运蛋白,NRAMP家族
ORF02921  5841和5842 核苷通透酶nupC
ORF02922  5843和5844 核苷通透酶nupC
ORF02923  5845和5846 类似于[SwissProt登录号P23842]仍未鉴定到起始密码子
ORF02924  5847和5848 类似于[SwissProt登录号P27239]仍未鉴定到起始密码子
ORF02925  5849和5850 类似于[SwissProt登录号P27239]仍未鉴定到起始密码子
ORF02926  5851和5852 谷氨酰-tRNA合成酶(gltX) [6.1.1.171
ORF02927  5853和5854 转录调节蛋白,LysR家族,推定
ORF02928  5855和5856 保守性假拟蛋白
ORF02929  5857和5858 核苷通透酶NupG
ORF02930  5859和5860 黄嘌呤核苷磷酸化酶(xapA)[2.4.2.1]
ORF02931  5861和5862 假拟蛋白
ORF02932  5863和5864 功能未知的蛋白质(DUF1384)超家族
ORF02933  5865和5866 OsmT蛋白
ORF02934  5867和5868 类似于[SwissProt登录号P39836]仍未鉴定到起始密码子
ORF02935  5869和5870 保守性假拟蛋白
ORF02936  5871和5872 DNA连接酶,NAD依赖性(li.qA)[6.5.1.2]
ORF02937  5873和5874 细胞分裂蛋白ZipA (zipA)
ORF02938  5875和5876 CysZ蛋白
ORF02939  5877和5878 半胱氨酸合酶A(cysK)[2.5.1.47]
ORF02940  5879和5880 磷酸载体蛋白HPr (含组氨酸的蛋白)(ptsH)[2.7.1.69]
ORF02941  5881和5882 磷酸烯醇式丙酮酸-蛋白磷酸转移酶(ptsI)[2.7.3.9]
ORF02942  5883和5884 磷酸转移酶系统酶II,葡萄糖-特异性,因子III(crr)[2.7.1.69]
ORF02943  5885和5886 吡哆醛激酶[2.7.1.35]
ORF02944  5887和5888 保守性假拟蛋白
ORF02945  5889和5890 半胱氨酸合酶B (cysM)[2.5.1.47]
ORF02946  5891和5892 硫酸-硫代硫酸输入ATP结合蛋白cysA(硫酸-转运ATP酶)
ORF02947  5893和5894 硫酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白CysW(cysW)
ORF02948  5895和5896 硫酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白CysT(cysT)
0RF02949  5897和5898 硫代硫酸结合蛋白
ORF02950  5899和5900 3-氧代酰基-(酰基-载体-蛋白)还原酶
ORF02951  5901和5902 葡糖激酶调节相关蛋白
ORF02952  5903和5904 PTS系统,蔗糖特异性IIBC组件(EIIBC-Scr) (蔗糖-通透酶IIBC组件)(磷酸转移酶
ORF02953  5905和5906 tyrA蛋白VC2145
ORF02954  5907和5908 功能未知的蛋白质(DUF1131)超家族
ORF02955  5909和5910 保守性假拟蛋白
ORF02956  5911和5912 乙酰基转移酶,GNAT家族
ORF02957  5913和5914 N-乙酰基胞壁酰-1-丙氨酸酰胺酶I[3.5.1.28]
ORF02958  5915和5916 粪卟林原III氧化酶,好氧(hemF)[1.3.3.3]
ORF02959  5917和5918 乙醇胺操纵子调节蛋白
ORF02960  5919和5920 乙醇胺利用蛋白eutK前体
0RF02961  5921和5922 乙醇胺利用蛋白eutL(eutL)
ORF02962  5923和5924 乙醇胺氨-裂合酶,小亚基,推定[4.3.1.7]
ORF02963  5925和5926 乙醇胺氨-裂合酶,大亚基(eutB)[4.3.1.7]
ORF02964  5927和5928 乙醇胺利用蛋白eutA
ORF02965  5929和5930 乙醇胺利用蛋白eutH
ORF02966  5931和5932 乙醇胺利用蛋白eutG
ORF02967  5933和5934 乙醇胺利用蛋白eutJ (EutJ)
ORF02968  5935和5936 醛-醇脱氢酶(EutE)
ORF02969  5937和5938 二氧化碳浓缩机制蛋白CcmL,推定
0RF02970  5939和5940 解毒蛋白(EutM)
ORF02971  5941和5942 磷酸乙酰基转移酶(pta)[2.3.1.81
ORF02972  5943和5944 乙醇胺利用钴胺素腺苷转移酶[2.5.1.17]
ORF02973  5945和5946 乙醇胺利用蛋白eutQ
ORF02974  5947和5948 乙醇胺利用蛋白eutP
ORF02975  5949和5950 乙醇胺利用蛋白eutS
ORF02976  5951和5952 NADP-依赖性苹果酸酶(NADP-ME)[1.1.1.40]
ORF02977  5953和5954 转醛酶(tal)[2.2.1.2]
ORF02978  5955和5956 酮糖转移酶(tkt)[2.2.1.1]
ORF02979  5957和5958 功能未知的蛋白质(DUF1176)超家族
ORF02980  5959和5960 保守性假拟蛋白
ORF02981  5961和5962 保守性假拟蛋白TIGR00052
ORF02982  5963和5964 类似于[SwissProt登录号P37127]仍未鉴定到起始密码子(GltD)[1.4.1.13]
ORF02983  5965和5966 硝酸-亚硝酸传感蛋白narO
ORF02984  5967和5968 1037个氨基酸,113 kDa蛋白
ORF02985  5969和5970 蛋白yffB[1.-.-.-1
ORF02986  5971和5972 琥珀酰-二氨基庚二酸脱琥珀酰酶(dapE)[3.5.1.18]
ORF02987  5973和5974 保守性假拟蛋白
ORF02988  5975和5976 3.1.-.-[3.1.-.-]
ORF02989  5977和5978 类似于[SwissProt登录号P44140]
ORF02990  5979和5980 金属肽酶,锌结合性[3.4.-.-]
ORF02991  5981和5982 磷酸核糖基氨基咪唑-琥珀酸羧酰胺合酶(purC)[6.3.2.6]
ORF02992  5983和5984 脂蛋白-34前体
ORF02993  5985和5986 二氢二皮考啉酸合酶(daDA)[4.2.1.52]
ORF02994  5987和5988 gcv操纵子的转录调节
ORF02995  5989和5990 bcp[1.11.1.-]
ORF02996  5991和5992 预测的通透酶
ORF02997  5993和5994 肽酶家族M48家族[3.4.-.-]
ORF02998  5995和5996 砷酸还原酶(arsC)[1.20.4.1]
ORF02999  5997和5998 参与DNA复制启动的ATP酶
ORF03000  5999和6000 尿嘧啶通透酶
ORF03001  6001和6002 尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(upp)[2.4.2.9]
ORF03002  6003和6004 磷酸核糖基甲酰基甘氨脒环-连接酶(purM)[6.3.3.1]
ORF03003  6005和6006 磷酸核糖基甘氨脒甲酰基转移酶(purN)[2.1.2.2]
ORF03004  6007和6008 磷酸激酶(DDk)[2.7.4.1]
ORF03005  6009和6010 外切聚磷酸酶[3.6.1.11]
ORF03006  6011和6012 MASE1结构域家族
ORF03007  6013和6014 保守性假拟蛋白
ORF03008  6015和6016 假拟蛋白
ORF03009  6017和6018 推定的外膜脂蛋白
ORF03010  6019和6020 可能的膜蛋白Z3770
ORF03011  6021和6022 推定Rz样蛋白
ORF03012  6023和6024 细胞内溶素
ORF03013  6025和6026 穴蛋白
ORF03014  6027和6028 内-α-唾液酸酶
ORF03015  6029和6030 假拟蛋白
ORF03016  6031和6032 内-α-唾液酸酶[3.2.1.129]
ORF03017  6033和6034 假拟蛋白
ORF03018  6035和6036 GD27
ORF03019  6037和6038 假拟蛋白
ORF03020  6039和6040 假拟蛋白
ORF03021  6041和6042 假拟蛋白
ORF03022  6043和6044 保守性假拟蛋白
ORF03023  6045和6046 保守性假拟蛋白
ORF03024  6047和6048 假拟蛋白
ORF03025  6049和6050 Bbp13
ORF03026  6051和6052 gp11
ORF03027  6053和6054 Bbp20
ORF03028  6055和6056 保守性假拟蛋白
ORF03029  6057和6058 Bbp16
ORF03030  6059和6060 aP08
ORF03031  6061和6062 Bbp18
ORF03032  6063和6064 假拟蛋白
ORF03033  6065和6066 Bbp19
ORF03034  6067和6068 Bbp21
ORF03035  6069和6070 保守性假拟蛋白
ORF03036  6071和6072 假拟蛋白
ORF03037  6073和6074 假拟蛋白
ORF03038  6075和6076 末端酶大亚基
ORF03039  6077和6078 保守性假拟蛋白
ORF03040  6079和6080 推定阻抑物
ORF03041  6081和6082 保守性假拟蛋白
ORF03042  6083和6084 保守性假拟蛋白
ORF03043  6085和6086 外切核酸酶VIII RecE [3.1.11.-]
ORF03044  6087和6088 肠溶血素1
ORF03045  6089和6090 原噬菌体CP4-57调节蛋白(AIpA)家族
ORF03046  6091和6092 保守性假拟蛋白
ORF03047  6093和6094 腺嘌呤甲基化酶
ORF03048  6095和6096 腺嘌呤甲基化酶
ORF03049  6097和6098 整合酶
ORF03050  6099和6100 GMP合酶[谷胺酰胺-水解性](谷胺酰胺酰胺基转移酶)(GMP合成酶)(谷氨酰
ORF03051  6101和6102 肌苷-5′-单磷酸脱氢酶(fluaB)[1.1.1.205]
ORF03052  6103和6104 外切脱氧核糖核酸酶VII,大亚基(xseA)[3.1.11.6]
ORF03053  6105和6106 Aec4前体
ORF03054  6107和6108 Sinl同源物
ORF03055  6109和6110 Aecl前体
ORF03056  6111和6112 功能未知的蛋白质(DUF1407)超家族
ORF03057  6113和61t4 预测的GTP-结合蛋白
ORF03058  6115和6116 PQQ酶重复结构域蛋白[2.7.1.-]
ORF03059  6117和6118 未命名蛋白产物
ORF03060  6119和6120 组氨酰-tRNA合成酶(hisS)[6.1.1.2 1]
ORF03061  6121和6122 4-羟基-3-甲基丁-2-烯-1-基二磷酸合酶(ispG)[1.17.4.3]
ORF03062  6123和6124 类似于[SwissProt登录号P27434]
ORF03063  6125和6126 基团SAM酶,Cfr家族
ORF03064  6127和6128 核苷二磷酸激酶(ndk) [2.7.4.6]
ORF03065  6129和6130 青霉素-结合性蛋白1C (pbpC)
ORF03066  6131和6132 假拟脂蛋白yfhM前体
ORF03067  6133和6134 3-巯基内酮酸硫转移酶(AF109156) [2.8.1.1]
ORF03068  6135和6136 丝氨酸敏感性提高
ORF03069  6137和6138 胞浆氨基肽酶家族,催化结构域家族
ORF03070  6139和6140 功能未知的蛋白质(DUF528)超家族
ORF03071  6141和6142 铁氧还蛋白,2Fe-2S型,ISC系统(fdx)
ORF03072  6143和6144 Fe-S蛋白装配侣伴蛋白HscA (hscA)
ORF03073  6145和6146 Fe-S蛋白装配辅助侣伴蛋白HscB (hscB)
ORF03074  6147和6148 铁硫簇装配蛋白IscA (iscA)
ORF03075  6149和6150 FeS簇装配支架IscU(isscU)
ORI03076  6151和6152 半胱氨酸脱硫酶IscS (iscS)[4.4.1.-]
ORF03077  6153和6154 铁硫簇装配转录因子IscR (iscR)
ORF03078  6155和6156 RNA甲基转移酶,TrmH家族,1类
ORF03079  6157和6158 肌醇-1-单磷酸酶(IMP酶) (肌醇-1-磷酸酶) (I-1-P酶) (I-1-P酶)[3.1.3.25]
ORF03080  6159和6160 保守性假拟蛋白
ORF03081  6161和6162 MFS(主要易化超家族)转运蛋白
ORF03082  6163和6164 csiE
ORF03083  6165和6166 推定的DoxX亚家族
ORF03084  6167和6168 醛糖1-差向异构酶超家族
ORF03085  6169和6170 氧化还原酶,锌结合性脱氢酶家族超家族[1.1.1.14]
ORF03086  6171和6172 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白
ORF03087  6173和6174 D-木糖ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白
ORF03088  6175和6176 核糖ABC转运蛋白,周质核糖结合蛋白,推定
ORF03089  6177和6178 TPR结构域结构域蛋白
ORF03090  6179和6180 ROK家族蛋白结构域蛋白
ORF03091  6181和6182 丝氨酸羟甲基转移酶(qlyA)[2.1.2.1]
ORF03092  6183和6184 二氢蝶啶还原酶(NOD)[1.5.134]
ORF03093  6185和6186 氮调节蛋白P-II
ORF03094  6187和6188 转录调节蛋白
ORF03095  6189和6190 未命名蛋白产物
ORF03096  6191和6192 双组件系统传感蛋白激酶
ORF03097  6193和6194 磷酸核糖基甲酰基甘氨脒合酶(purL)[6.3.5.3]
ORF03098  6195和6196 糖基转移酶,Slt家族
ORF03099  6197和6198 tRNA-特异性腺苷脱氨酶[3.5.4.-]
ORF03100  6199和6200 HAD超家族(亚家族IF)水解酶,YfhB (yfhb)
ORF03101  6201和6202 转录调节蛋白(膜)
ORF03102  6203和6204 NapF蛋白(fdx)
ORF03103  6205和6206 全-(酰基-载体-蛋白)合酶(acpS) [2.7.8.7]
ORF03104  6207和6208 吡哆醛磷酸生物合成蛋白PdxJ (pdxJ)
ORF03105  6209和6210 DNA修复蛋白RecO (recO)
ORF03106  6211和6212 GTP结合蛋白Era (era)
ORF03107  6213和6214 核糖核酸酶III (mc) [3.1 26.3]
ORF03108  6215和6216 信号肽酶I[相似性](lep)[3.4.21.89]
ORF03109  6217和6218 GTP结合蛋白LeoA (lepA)
ORF03110  6219和6220 σ-E因子调节蛋白rseC
ORF03111  6221和6222 σ-E因子调节蛋白rseB前体(rseB)
ORF03112  6223和6224 σ-E因子,负调节蛋白
ORF03113  6225和6226 RNA聚合酶σ E(SIGMA)
ORF03114  6227和6228 假拟蛋白
ORF03115  6229和6230 未命名蛋白产物
ORF03116  6231和6232 L-天冬氨酸氧化酶(nadB)[1.4.3.16]
 ORF03117  6233和6234 ATP依赖性RNA解旋酶(srmB)
 ORF03118  6235和6236 类似于[SwissProt登录号P33634]
 ORF03119  6237和6238 转运蛋白,LysE家族超家族
 ORF03120  6239和6240 蛋白yfiD
 ORF03121  6241和6242 尿嘧啶-DNA糖基化酶(ung)[3.2.2.-]
 ORF03122  6243和6244 类似于[SwissProt登录号P33635]仍未鉴定到起始密码子
 ORF03123  6245和6246 假拟蛋白
 ORF03124  6247和6248 硫氧还蛋白(trx)
 ORF03125  6249和6250 DTW结构域蛋白
 ORF03126  6251和6252 酰基-CoA合成酶(NDP形成性)
 ORF03127  6253和6254 CDP-二酰甘油-丝氨酸O-磷脂酰转移酶(EC 2.7.8.8)(磷脂酰丝氨酸合酶)[2.7.8.8]
 ORF03128  6255和6256 推定的脂蛋白
 ORF03129  6257和6258 α-酮戊二酸通透酶
 ORF03130  6259和6260 转座酶
 ORF03131  6261和6262 转座酶
 ORF03132  6263和6264 转座酶
 ORF03133  6265和6266 假拟的
 ORF03134  6267和6268 假拟蛋白
 ORF03135  6269和6270 热激蛋白[3.4.21.-]
 ORF03136  6271和6272 保守性假拟蛋白TIGR00726
 ORF03137  6273和6274 核糖体大亚基假尿苷合酶D (sfhB)[4.2.1.70]
 ORF03138  6275和6276 未知
 ORF03139  6277和6278 核糖体亚基界面蛋白(yfiA)
 ORF03140  6279和6280 P-蛋白(PDT)[5.4.99,5]
 ORF03141  6281和6282 T-蛋白(PDH)[5.4.99.5]
 ORF03142  6283和6284 磷酸-2-脱氢-3-脱氧庚糖酸醛缩酶[2.5.1.54]
 ORF03143  6285和6286 推定的脂蛋白
 ORF03144  6287和6288 保守性假拟蛋白
 ORF03145  6289和6290 类似于[SwissProt登录号P46139]
 ORF03146  6291和6292 未命名蛋白产物;未鉴定的阅读框(16K多肽) (aa 1-127)
 ORF03147  6293和6294 核糖体蛋白L19(rplS)
 ORF03148  6295和6296 tRNA (鸟嘌呤-N1)-甲基转移酶(trmD)[2.1.1.31]
 ORF03149  6297和6298 16S rRNA加工蛋白RimM (rimM)
 ORF03150  6299和6300 30S核糖体蛋白S16 (rpS16)
 ORF03151  6301和6302 信号识别颗粒蛋白(ffh)
 ORF03152  6303和6304 CorE
 ORF03153  6305和6306 未命名蛋白产物
 ORF03154  6307和6308 辅助-侣伴蛋白GrpE (grpE)
 ORF03155  6309和6310 NAD+激酶[2.7.1.23]
 ORF03156  6311和6312 假拟蛋白
 ORF03157  6313和6314 DNA修复蛋白RecN (recN)
 ORF03158  6315和6316 小蛋白A前体
 ORF03159  6317和6318 蛋白yfiF
 ORF03160  6319和6320 链丝菌环化酶-脱水酶家族
 ORF03161  6321和6322 SsrA-结合蛋白(smpB)
 ORF03162  6323和6324 假拟蛋白
 ORF03163  6325和6326 保守性假拟蛋白
 ORF03164  6327和6328 Dinl样蛋白Z3916-ECs3483 (AF175466)
 ORF03165  6329和6330 T4-排斥蛋白刺激物gIBEG
 ORF03166  6331和6332 ycfE蛋白(片段)
 ORF03167  6333和6334 未命名的蛋白产物;未鉴定的阅读框P-293
 ORF03168  6335和6336 热激蛋白[3.4.21.-]
 ORF03169  6337和6338 热激蛋白[3.4.21.-]
 ORF03170  6339和6340 保守性假拟蛋白
 ORF03171  6341和6342 Sb36
 ORF03172  6343和6344 保守性假拟蛋白
 ORF03173  6345和6346 假拟蛋白
 ORF03174  6347和6348 保守性假拟蛋白
 ORF03175  6349和6350 未命名蛋白产物
 ORF03176  6351和6352 假拟蛋白
 ORF03177  6353和6354 gab蛋白
 ORF03178  6355和6356 预测的脱氢酶
 ORF03179  6357和6358 琥珀酸-半醛脱氢酶[NADP+][1.2.1.16]
 ORF03180  6359和6360 4-氨基丁酸转氨酶(gabT)[2.6,1.19]
 ORF03181  6361和6362 GABA通透酶(gabP)
 ORF03182  6363和6364 转录调节蛋白,GntR家族,推定
 ORF03183  6365和6366 推定的磷脂结合结构域家族
 ORF03184  6367和6368 假拟的UPF0057蛋白yqaE相关蛋白
 ORF03185  6369和6370 转录调节蛋白,ArsR家族(AJ001934)
 ORF03186  6371和6372 推定的硫氰酸生成酶家族蛋白
 ORF03187  6373和6374 DNA-结合蛋白stpA
 ORF03188  6375和6376 功能未知的蛋白质(DUF1144)超家族
 ORF03189  6377和6378 类似于[SwissProt登录号P36931]仍未鉴定到起始密码子
 ORF03190  6379和6380 未命名蛋白产物;ORFA
 ORF03191  6381和6382 GntR-家族转录调节物(X78503)
 ORF03192  6383和6384 未表征的ACR
 ORF03193  6385和6386 nrdH相关蛋白
 ORF03194  6387和6388 nrdl蛋白(nrdl)
 ORF03195  6389和6390 核糖核苷-二磷酸还原酶α链
 ORF03196  6391和6392 核糖核苷-二磷酸还原酶,β亚基[1.17.4.1]
 ORF03197  6393和6394 甘氨酸、甜菜碱和脯氨酸的转运系统的ATP-结合组件(atp结合)
 ORF03198  6395和6396 甘氨酸甜菜碱-L-脯氨酸转运系统通透酶蛋白proW(膜)
 ORF03199  6397和6398 高亲和甘氨酸甜菜碱-脯氨酸转运系统
 ORF03200  6399和6400 主要易化家族转运蛋白(通透酶)
 ORF03201  6401和6402 推定的AzlC家族蛋白
 ORF03202  6403和6404 YgaH蛋白
 ORF03203  6405和6406 转录阻抑物mprA(EmrR蛋白)
 ORF03204  6407和6408 多药耐药蛋白A
 ORF03205  6409和6410 多药耐药蛋白B
 ORF03206  6411和6412 保守性假拟蛋白
 ORF03207  6413和6414 保守性假拟蛋白
 ORF03208  6415和6416 自体诱导物-2产生蛋白LuxS (luxS)
 ORF03209  6417和6418 谷氨酸-半胱氨酸连接酶(gshA)[6.3.2.2]
 ORF03210  6419和6420 γ-谷氨酸-半胱氨酸连接酶(GCS)
 ORF03211  6421和6422 保守性假拟蛋白
 ORF03212  6423和6424 CbbY家族蛋白VCA0662(pgp)
 ORF03213  6425和6426 储碳调节蛋白(csrA)
 ORF03214  6427和6428 丙氨酰基-tRNA合成酶(alaS)[6.1.1.71
 ORF03215  6429和6430 调节蛋白recX(oraA蛋白) (recX)
 ORF03216  6431和6432 recA蛋白(recA)
 ORF03217  6433和6434 蛋白ygaD
 ORF03218  6435和6436 膜-结合性裂解胞壁质转糖基酶B前体
ORF03219  6437和6438 PTS系统,葡糖醇-山梨糖醇特异性IIBC组件(EIIBC-GUT)(葡糖醇-山梨糖醇-通透
ORF03220  6439和6440 PTS系统,葡糖醇-山梨糖醇特异性IIBC组件(EIIBC-GUT)(葡糖醇-山梨糖醇-通透
ORF03221  6441和6442 PTS酶III葡糖醇[2.7.1.69]
ORF03222  6443和6444 3-氧代酰基-(酰基-载体-蛋白)还原酶(山梨糖醇)[1.1.1.140]
ORF03223  6445和6446 葡糖醇操纵子激活蛋白(gutM)
ORF03224  6447和6448 葡糖醇操纵子阻抑物(srl)
ORF03225  6449和6450 GutQ蛋白
ORF03226  6451和6452 ygaA蛋白(fhlA)
ORF03227  6453和6454 厌氧性一氧化氮还原酶黄素红氧还蛋白(FIRd)(黄素Rb) (fprA)[1.-.-.-]
ORF03228  6455和6456 一氧化氮还原酶FIRd-NAD(+)还原酶(黄素红氧还蛋白还原酶)(FIRd-还原酶)(黄
ORF03229  6457和6458 [NiFe]氢化酶成熟蛋白HypF (hypF)
ORF03230  6459和6460 电子传递蛋白hvdN
ORF03231  6461和6462 假拟蛋白
ORF03232  6463和6464 ascBF操纵子阻抑物
ORF03233  6465和6466 PTS系统酶II ABC (asc)[2.7.1.69]
ORF03234  6467和6468 6-磷酸-β-葡糖苷酶[3.2.1.86]
ORF03235  6469和6470 未命名蛋白产物
ORF03236  6471和6472 保守性假拟蛋白
ORF03237  6473和6474 氢化酶成熟蛋白酶Hycl
ORF03238  6475和6476 甲酸氢化酶成熟蛋白hycH (HycE)[1.-.-.-]
ORF03239  6477和6478 甲酸氢化酶亚基7[1.18.99.1]
ORF03240  6479和6480 甲酸氢化酶亚基6[1.18.99.1]
ORF03241  6481和6482 氢化酶3大亚基[1.18.99.1]
ORF03242  6483和6484 甲酸氢化酶亚基4 (hycD)[1.18.99.1]
ORF03243  6485和6486 甲酸氢裂合酶亚基3 (FHL亚基3) (氢化酶-3组件C)[1.18.99.1]
ORF03244  6487和6488 甲酸氢化酶亚基-7组件B (FHL)
ORF03245  6489和6490 甲酸氢化酶调节蛋白hycA
ORF03246  6491和6492 氢化酶镍插入蛋白HyDA (hypA)
ORF03247  6493和6494 氢化酶辅助蛋白HypB
ORF03248  6495和6496 氢化酶装配侣伴蛋白HypC-HupF (hypC)
ORF03249  6497和6498 氢化酶表达-形成蛋白HypD (hypD)
ORF03250  6499和6500 氢化酶表达-形成蛋白HypE (hypE)
ORF03251  6501和6502 甲酸氢化酶转录激活蛋白
ORF03252  6503和6504 可能的钼蝶呤结合蛋白
ORF03253  6505和6506 保守性假拟蛋白
ORF03254  6507和6508 DNA错配修复蛋白MutS (mutS)
ORF03255  6509和6510 丝氨酸-苏氨酸蛋白磷酸酶2[3.1.3.16]
ORF03256  6511和6512 糖代谢的转录调节蛋白
ORF03257  6513和6514 3-羟基异丁酸脱氢酶[1.1.-.-]
ORF03258  6515和6516 tRNA合酶样蛋白
ORF03259  6517和6518 L-墨角藻糖-1-磷酸醛缩酶样蛋白(fucA)[4.1.2.17]
ORF03260  6519和6520 Hfi蛋白[5.3.1.22]
ORF03261  6521和6522 葡糖酸通透酶
ORF03262  6523和6524 金属-β-内酰胺酶超家族结构域蛋白
 ORF03263  6525和6526 色氨酸阻抑物结合蛋白
 ORF03264  6527和6528 σ因子RpoS (σ38)
 ORF03265  6529和6530 σ因子RpoS(σ38)
 ORF03266  6531和6532 脂蛋白nlpD前体
 ORF03267  6533和6534 蛋白-L-异天冬氨酸O-甲基转移酶(pcm)[2.1.1.77]
 ORF03268  6535和6536 酸性磷酸酶SurE (surE)[3.1.3.2]
 ORF03269  6537和6538 保守性假拟蛋白TIGR00094
 ORF03270  6539和6540 2C-甲基-D-赤藓醇2.4-环二磷酸合酶(ispF)[4.6.1.12]
 ORF03271  6541和6542 2-C-甲基-D-赤藓醇4-磷酸胞苷酰转移酶(ispD)[2.7.7.60]
 ORF03272  6543和6544 细胞分裂蛋白ftsB
 ORF03273  6545和6546 YgbE
 ORF03274  6547和6548 腺苷酰基硫酸激酶(cysC)[2.7.1.25]
 ORF03275  6549和6550 硫酸腺苷酰基转移酶亚基1 (硫酸腺苷酸转移酶) (SAT) (ATP-硫酸化酶大亚基)
 ORF03276  6551和6552 硫酸腺苷酰基转移酶亚基2 (硫酸腺苷酸转移酶) (SAT) (ATP-硫酸化酶小亚基)
 ORF03277  6553和6554 假拟蛋白
 ORF03278  6555和6556 碱性磷酸酶同功酶转化蛋白前体[3.4.11.-]
 ORF03279  6557和6558 Hok-qef家族超家族
 ORF03280  6559和6560 3-磷酸腺苷5-磷酸硫酸还原酶
 ORF03281  6561和6562 亚硫酸还原酶(NADPH)血红素蛋白,β亚基(cysl)[1.8.1.2]
 ORF03282  6563和6564 亚硫酸还原酶[NADPH]黄素蛋白,α链[1.8.1.2]
 ORF03283  6565和6566 6-丙酮酰-四氢蝶呤合酶
 ORF03284  6567和6568 可能的电子转移黄素蛋白-醌氧化还原酶ygcN
 ORF03285  6569和6570 铁氧还蛋白样蛋白ygcO
 ORF03286  6571和6572 推定的甘油摄取操纵子抗终止调节蛋白
 ORF03287  6573和6574 电子转移黄素蛋白,α亚基亚家族(etfA)
 ORF03288  6575和6576 推定转运蛋白
 ORF03289  6577和6578 糖转运蛋白,推定
 ORF03290  6579和6580 推定的烷基-二羟基丙酮磷酸合酶
 ORF03291  6581和6582 1.-.-.-[1.1.1.-]
 ORF03292  6583和6584 主要易化超家族亚家族
 ORF03293  6585和6586 糖激酶,FGGY家族,推定[2.7.1.17]
 ORF03294  6587和6588 基团活化酶
 ORF03295  6589和6590 基团活化酶
 ORF03296  6591和6592 LemA家族超家族
 ORF03297  6593和6594 富甘氨酸蛋白
 ORF03298  6595和6596 保守性假拟蛋白
 ORF03299  6597和6598 功能未知的结构域(DUF477)家族
 ORF03300  6599和6600 富甘氨酸蛋白
 ORF03301  6601和6602 烯醇酶(eno)[4.2.1.11 1
 ORF03302  6603和6604 CTP合酶(pyrG)[6.3.4.2]
 ORF03303  6605和6606 MazG蛋白(mazG)
 ORF03304  6607和6608 PemK样蛋白1(MazF蛋白) (AF027767)
 ORF03305  6609和6610 PemI样蛋白1(MazE蛋白)
 ORF03306  6611和6612 GTP焦磷酸激酶(ATP:GTP 3′-焦磷酸转移酶)(ppGpp合成酶I) ((p)ppGpp合成酶)
 ORF03307  6613和6614 23S rRNA (尿嘧啶-5-)-甲基转移酶RumA (rumA)[2.1.1.-]
 ORF03308  6615和6616 传感蛋白barA[2.7.3.-]
 ORF03309  6617和6618 假拟蛋白
 ORF03310  6619和6620 葡糖二酸脱水酶[4.2.1.40]
 ORF03311  6621和6622 葡糖二酸脱水酶[4.2.1.-]
ORF03312  6623和6624 MFS转运蛋白,邻苯二甲酸通透酶家族
ORF03313  6625和6626 外酶调节调节子(mioC)
ORF03314  6627和6628 RNA假尿苷酸合酶家族蛋白[4.2.1.70]
ORF03315  6629和6630 tRNA假尿苷合酶C(假尿苷酸合酶)(尿嘧啶氢裂合酶)
ORF03316  6631和6632 与secY相互作用
ORF03317  6633和6634 假拟蛋白
ORF03318  6635和6636 GTP环式水解酶I样蛋白
ORF03319  6637和6638 预测的Rossmann折叠核苷酸-结合蛋白
ORF03320  6639和6640 丝氨酸转运蛋白
ORF03321  6641和6642 L-丝氨酸氨-裂合酶(sdaA)[4.3.1.17]
ORF03322  6643和6644 外切脱氧核糖核酸酶IX
ORF03323  6645和6646 乳醛还原酶[1.1.1.77]
ORF03324  6647和6648 L-墨角藻糖磷酸醛缩酶(fucA)[4.1.2.17]
ORF03325  6649和6650 保守性假拟蛋白
ORF03326  6651和6652 L-岩藻糖通透酶(NcP)
ORF03327  6653和6654 L-岩藻糖异构酶(fucl)[5.3.1.25]
ORF03328  6655和6656 L-墨角藻糖激酶(L-墨角藻糖激酶) (fucK)[2.7.1.51]
ORF03329  6657和6658 岩藻糖操纵子fucU蛋白(fucU)
ORF03330  6659和6660 假拟蛋白
ORF03331  6661和6662 L-岩藻糖操纵子激活蛋白
ORF03332  6663和6664 SAM依赖性甲基转移酶样蛋白
ORF03333  6665和6666 未表征的小膜蛋白
ORF03334  6667和6668 转录调节物,LysR家族(gcvA)
ORF03335  6669和6670 功能未知的细菌蛋白(DUF903)超家族
ORF03336  6671和6672 半胱氨酸亚磺酸脱亚磺酸酶
ORF03337  6673和6674 Fe-S代谢相关结构域亚家族
ORF03338  6675和6676 参与钼蝶呤和硫胺生物合成的二核苷酸-利用酶家族1
ORF03339  6677和6678 膜-结合性裂解胞壁质糖基转移酶A前体
ORF03340  6679和6680 功能未知的蛋白质(DUF770)超家族
ORF03341  6681和6682 Aec18
ORF03342  6683和6684 功能未知的细菌蛋白(DUF876)超家族
ORF03343  6685和6686 可能保守的膜蛋白
ORF03344  6687和6688 未命名蛋白产物
ORF03345  6689和6690 分泌蛋白Hcp
ORF03346  6691和6692 C1DB蛋白
ORF03347  6693和6694 推定的Rhs元件Vgr蛋白亚家族
ORF03348  6695和6696 未命名蛋白产物;类似于未知蛋白
ORF03349  6697和6698 未命名蛋白产物;高度类似于发光杆菌的未知蛋白,推定的分泌蛋白,推定
ORF03350  6699和6700 未命名蛋白产物
ORF03351  6701和6702 未命名蛋白产物
ORF03352  6703和6704 ImpA相关性N-末端家族
ORF03353  6705和6706 保守性假拟蛋白
ORF03354  6707和6708 假拟蛋白
ORF03355  6709和6710 功能未知的细菌蛋白(DUF879)超家族
ORF03356  6711和6712 功能未知的蛋白质(DUF1305)超家族
ORF03357  6713和6714 推定的脂蛋白
ORF03358  6715和6716 功能未知的蛋白质(DUF1316)亚家族
ORF03359  6717和6718 保守性假拟蛋白
ORF03360  6719和6720 ImpA相关性N-末端家族
ORF03361  6721和6722 2-羟酸脱氢酶(serA)
ORF03362  6723和6724 磷酸糖异构酶
ORF03363  6725和6726 β-胱硫醚酶
ORF03364  6727和6728 PTS系统,IIBC组件,推定[2.7.1.69]
ORF03365  6729和6730 抗终止子
ORF03366  6731和6732 N-乙酰基胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶amiC前体[3.5.1.28]
ORF03367。  6733和6734 氨基酸N-乙酰基转移酶(areA)[2.3.1.1]
ORF03368  6735和6736 外切脱氧核糖核酸酶V,α亚基(recD)[3.1.11,5]
ORF03369  6737和6738 外切脱氧核糖核酸酶V,β亚基(recB)[3.1.11.5]
ORF03370  6739和6740 蛋白酶I前体(Pitrilysin) (蛋白酶pi) (pitrilysin)[3.4.24.55]
ORF03371  6741和6742 外切脱氧核糖核酸酶V,γ亚基(recC)[3.1.t 1.5]
ORF03372  6743和6744 前菌毛蛋白肽酶依赖性蛋白C前体
ORF03373  6745和6746 保守性假拟蛋白
ORF03374  6747和6748 未命名蛋白产物;URF1(aa 1-267)
ORF03375  6749和6750 前菌毛蛋白肽酶依赖性蛋白A前体
ORF03376  6751和6752 胸苷酸合酶(thyA)[2.1.1.45]
ORF03377  6753和6754 前脂蛋白二酰基甘油基转移酶(Igt)[2.4.99.-]
ORF03378  6755和6756 磷酸烯醇式丙酮酸-蛋白磷酸转移酶ptsP (Ntr)[2.7.3.9]
ORF03379  6757和6758 NTP焦磷酸水解酶,包括氧化损伤修复酶
ORF03380  6759和6760 DNA错配修复内切核酸酶mutH(mutH)
ORF03381  6761和6762 TerC蛋白
ORF03382  6763和6764 脂蛋白
ORF03383  6765和6766 Tas蛋白
ORF03384  6767和6768 未命名蛋白产物
ORF03385  6769和6770 AAS双功能蛋白
ORF03386  6771和6772 半乳糖操纵子阻抑物
ORF03387  6773和6774 二氨基庚二酸脱羧酶(lysA)[4.1.1.20]
ORF03388  6775和6776 天冬氨酸消旋酶亚家族[5.1.1.13]
ORF03389  6777和6778 转录激活蛋白lysR
ORF03390  6779和6780 阿拉伯糖-质子同向转运蛋白
ORF03391  6781和6782 2-脱氧-D-葡糖酸3-脱氢酶(kduD)[1.1.1.1 25]
ORF03392  6783和6784 4-脱氧-L-苏氨-5-hexosulose-糖醛酸酮醇-异构酶
ORF03393  6785和6786 可能的乙酰-CoA乙酰基转移酶
ORF03394  6787和6788 丝氨酸反向转运蛋白
ORF03395  6789和6790 可能的脂蛋白
ORF03396  6791和6792 推定醛氧化还原酶[1.1.1 204]
ORF03397  6793和6794 黄嘌呤脱氢酶,FAD结合亚基(cutB)[1.11.204]
ORF03398  6795和6796 短链CO脱氢酶(cutC)
ORF03399  6797和6798 信号转导和转录控制蛋白
ORF03400  6799和6800 假拟蛋白
ORF03401  6801和6802 天冬氨酸-鸟氨酸氨甲酰基转移酶,Asp-Orn结合结构域家族
ORF03402  6803和6804 苏氨酸脱水酶生物合成[4.3.1.15]
ORF03403  6805和6806 推定乙酰基鸟氨酸脱乙酰酶
ORF03404  6807和6808 二氢嘧啶酶(hydA)[3.5.2.2]
ORF03405  6809和6810 氨基甲酸酯激酶(arcC)[2.7.2.2]
ORF03406  6811和6812 黄嘌呤脱氢酶辅助因子,推定亚家族,推定
ORF03407  6813和6814 保守性假拟蛋白
ORF03408  6815和6816 假拟的ygfJ
ORF03409  6817和6818 氧化还原酶,吡啶核苷酸-二硫家族
ORF03410  6819和6820 推定氯水解酶家族蛋白
ORF03411  6821和6822 钼蝶呤脱氢酶蛋白中的FAD结合结构域
ORF03412  6823和6824 推定醛氧化还原酶[1.-.-.-]
ORF03413  6825和6826 黄嘌呤-尿嘧啶通透酶通透酶家族蛋白
ORF03414  6827和6828 鸟嘌呤脱氨酶
ORF03415  6829和6830 黄嘌呤-尿嘧啶通透酶家族蛋白
ORF03416  6831和6832 电子传递蛋白hydN
ORF03417  6833和6834 无氧表达的氧化还原酶(OItD)[1.4.1.13]
ORF03418  6835和6836 黄嘌呤通透酶
ORF03419  6837和6838 异戊烯基-二磷酸δ-异构酶,1型(idi)[5.3.3.2]
ORF03420  6839和6840 赖氨酰基-tRNA合成酶(IvsS/[6.11.6]
ORF03421  6841和6842 肽链释放因子2 (prfB)
ORF03422  6843和6844 单链-DNA特异性外切核酸酶RecJ (recJ)[3.1.-.-]
ORF03423  6845和6846 巯基:二硫键交换蛋白dsbC前体(DsbC)[5.3.4.1]
ORF03424  6847和6848 酪氨酸重组酶XerD (xerD)
ORF03425  6849和6850 黄素氧还蛋白
ORF03426  6851和6852 未命名蛋白产物
ORF03427  6853和6854 未表征的保守性蛋白
ORF03428  6855和6856 预测的氨基甲基转移酶
ORF03429  6857和6858 类似于溶血素III同源物
ORF03430  6859和6860 UPF0267蛋白
ORF03431  6861和6862 6-磷酸-β-葡糖苷酶
ORF03432  6863和6864 甘氨酸脱氢酶(acvP)[1.4.4.2]
ORF03433  6865和6866 甘氨酸切割系统H蛋白(gcvH)
ORF03434  6867和6868 甘氨酸切割系统T蛋白(gcvT)[2.1.2.10]
ORF03435  6869和6870 蛋白visC [1.-.-.-]
ORF03436  6871和6872 2-聚异戊二烯基-6-甲氧基苯酚4-羟化酶(ubiH)[1.14.13.-]
ORF03437  6873和6874 Xaa-Pro氨基肽酶(APP-II)[3.4.11.9]
ORF03438  6875和6876 yecA家族蛋白亚家族
ORF03439  6877和6878 功能未知的家族(DUF710)超家族
ORF03440  6879和6880 5-甲酰基四氢叶酸环-连接酶家族蛋白,推定
ORF03441  6881和6882 D-3-磷酸甘油酸脱氢酶[1.1.1.95]
ORF03442  6883和6884 核糖5-磷酸异构酶A(rpiA)[5.3.1.6]
ORF03443  6885和6886 保守性假拟蛋白
ORF03444  6887和6888 染色体启动抑制剂
ORF03445  6889和6890 未命名蛋白产物;sbm orf(MCM)
ORF03446  6891和6892 推定转录调节蛋白LYSR-型
ORF03447  6893和6894 IpqG,推定
ORF03448  6895和6896 可能的膜转运蛋白
ORF03449  6897和6898 小电导率机械敏感性通道
ORF03450  6899和6900 果糖-双磷酸醛缩酶,II类(fbaA)[4.1.2.13]
ORF03451  6901和6902 磷酸甘油酸激酶(pgk)[2.7.2.3]
ORF03452  6903和6904 D-赤藓糖-4-磷酸脱氢酶(epd)[1.2.1.-]
ORF03453  6905和6906 假拟蛋白
ORF03454  6907和6908 功能未知的结构域(DUF296)家族
ORF03455  6909和6910 保守性假拟蛋白
ORF03456  6911和6912 保守性假拟蛋白
ORF03457  6913和6914 ABC转运蛋白,ATP结合蛋白
ORF03458  6915和6916 激酶相关蛋白
ORF03459  6917和6918 钴转运ATP结合蛋白cbiO
ORF03460  6919和6920 未命名蛋白产物:ORF2 (AA 1-133)
ORF03461  6921和6922 果糖-1,6-双磷酸酶,II型
ORF03462  6923和6924 推定的氧化还原酶
ORF03463  6925和6926 PTS系统,甘露醇(隐藏) [2.7.1.69]
 ORF03464  6927和6928 PTS系统,甘露醇(隐藏)特异性IIA组件(EIIA-(C)Mtl)(甘露醇(隐藏)-通透酶IIA
 ORF03465  6929和6930 推定的丝氨酸蛋白酶
 ORF03466  6931和6932 酮糖转移酶(tkt)[2.2.1.11
 ORF03467  6933和6934 推定的金属蛋白酶G
 ORF03468  6935和6936 推定的胍丁胺酶(agmatinase)[3.5.3.11]
 ORF03469  6937和6938 推定的脂蛋白
 ORF03470  6939和6940 精氨酸脱羧酶(speA)[4.1.1.191
 ORF03471  6941和6942 保守性假拟蛋白
 ORF03472  6943和6944 保守性假拟蛋白
 ORF03473  6945和6946 S-腺苷甲硫氨酸合成酶(metK)[2.5.1.6]
 ORF03474  6947和6948 半乳糖-质子同向转运蛋白
 ORF03475  6949和6950 蛋白sprT
 ORF03476  6951和6952 内切核酸酶I前体
 ORF03477  6953和6954 保守性假拟蛋白TIGR00046
 ORF03478  6955和6956 谷胱甘肽合酶(qshB)[6.3.2.3]
 ORF03479  6957和6958 未表征的ACR,COG1678
 ORF03480  6959和6960 保守性假拟蛋白TIGR00250
 ORF03481  6961和6962 预测的参与菌毛生物合成的ATP酶,PiIT同源物
 ORF03482  6963和6964 保守性假拟蛋白TIGR00044
 ORF03483  6965和6966 预测的内膜蛋白
 ORF03484  6967和6968 保守性假拟蛋白TIGR00251
 ORF03485  6969和6970 非经典嘌呤NTP焦磷酸酶,rdgB-HAM1家族(rdgB)
 ORF03486  6971和6972 推定的氧非依赖型粪卟啉原III氧化酶
 ORF03487  6973和6974 功能未知的蛋白质(DUF1202)超家族
 ORF03488  6975和6976 L-天冬酰胺酶II (ansB)[3.5.1.1]
 ORF03489  6977和6978 保守性假拟蛋白
 ORF03490  6979和6980 保守性假拟蛋白
 ORF03491  6981和6982 蛋白
 ORF03492  6983和6984 tRNA (鸟嘌呤-N(7)-)-甲基转移酶(tRNA(m7G46)-甲基转移酶)[2.1.1.33]
 ORF03493  6985和6986 A-G特异性腺嘌呤糖基化酶
 ORF03494  6987和6988 蛋白yggX
 ORF03495  6989和6990 yggZ蛋白(mltC)[3.2.1.-]
 ORF03496  6991和6992 核苷通透酶NupG
 ORF03497  6993和6994 鸟氨酸脱羧酶同功酶(speC)[4.1.1.17]
 ORF03498  6995和6996 完整的膜蛋白
 ORF03499  6997和6998 截短的转座酶
 ORF03500  6999和7000 KpsF
 ORF03501  7001和7002 荚膜多糖输出内膜蛋白kpsE
 ORF03502  7003和7004 推定的多糖生物合成蛋白
 ORF03503  7005和7006 3-脱氧-D-甘露糖-辛酮糖酸胞苷酰转移酶(kdsB)[2.7.7.38]
 ORF03504  7007和7008 荚膜多糖输出蛋白KpsC
 ORF03505  7009和7010 KpsS蛋白
 ORF03506  7011和7012 聚唾液酸荚膜生物合成蛋白SiaD,截短;被外来的ermC破坏,推定[2.4.-.-]
 ORF03507  7013和7014 NeuE蛋白
 ORF03508  7015和7016 UDP-N-乙酰基葡糖胺2-差向异构酶[5.1.3.14]
 ORF03509  7017和7018 推定的酰基神经氨酸胞苷酰转移酶[2.7.7.43]
 ORF03510  7019和7020 neuB蛋白[4.1,3,-1
 ORF03511  7021和7022 聚唾液酸转运ATP结合蛋白kpsT[3.6.3.38]
 ORF03512  7023和7024 聚唾液酸转运蛋白kpsM
 ORF03513  7025和7026 推定的通用分泌通路蛋白M-型yghD
 ORF03514  7027和7028 通用分泌通路蛋白L (gspL)
 ORF03515  7029和7030 通用分泌通路蛋白K (gspK)
 ORF03516  7031和7032 通用分泌通路蛋白J(gspJ)
 ORF03517  7033和7034 通用分泌通路蛋白I(gspI)
 ORF03518  7035和7036 GsDH,假拟II型分泌蛋白
 ORF03519  7037和7038 通用分泌通路蛋白G (qspG)
 ORF03520  7039和7040 通用分泌通路蛋白F (qspF)
 ORF03521  7041和7042 通用分泌通路蛋白E (GSP)
 ORF03522  7043和7044 II型分泌通路,组件EpsD
 ORF03523  7045和7046 通用分泌通路蛋白C (gspC)
 ORF03524  7047和7048 YghG蛋白
 ORF03525  7049和7050 分泌蛋白b2972 [3.4.23.43]
 ORF03526  7051和7052 辅助集落化因子AcfD前体
 ORF03527  7053和7054 乙醇酸通透酶glcA
 ORF03528  7055和7056 苹果酸合酶G (alcB)[2.3.3.9]
 ORF03529  7057和7058 glcG蛋白
 ORF03530  7059和7060 乙醇酸氧化酶亚基GlcE和GlcF (Fe-S)[1.1.3.15]
 ORF03531  7061和7062 乙醇酸氧化酶亚基GlcE和GlcF
 ORF03532  7063和7064 乙醇酸氧化酶,亚基GlcD (glcD)
 ORF03533  7065和7066 Glc操纵子转录激活蛋白
 ORF03534  7067和7068 保守性假拟蛋白
 ORF03535  7069和7070 酰基-CoA合酶
 ORF03536  7071和7072 保守性假拟蛋白
 ORF03537  7073和7074 磷酸泛酰巯基乙胺连接位点(ACP)
 ORF03538  7075和7076 8-氨基-7-氧代壬酸合酶
 ORF03539  7077和7078 预测的通透酶YigP-YigQ家族超家族
 ORF03540  7079和7080 预测的通透酶YigP-YigQ家族超家族
 ORF03541  7081和7082 保守性假拟蛋白YtfJ-家族,TIGR01626
 ORF03542  7083和7084 保守性假拟蛋白
 ORF03543  7085和7086 多糖生物合成蛋白结构域蛋白
 ORF03544  7087和7088 假拟ATP-结合蛋白yghR
 ORF03545  7089和7090 假拟的ATP-结合蛋白yghS
 ORF03546  7091和7092 假拟蛋白
 ORF03547  7093和7094 假拟的ATP-结合蛋白yghT
 ORF03548  7095和7096 低亲和力磷酸转运蛋白
 ORF03549  7097和7098 谷胱甘肽精胺合酶
 ORF03550  7099和7100 假拟GST样蛋白yghU
 ORF03551  7101和7102 氢化酶装配侣伴蛋白HypC-HupF(hypC)
 ORF03552  71 03和7104 氢化酶镍插入蛋白HypA (hypA)
 ORF03553  7105和7106 氢化酶-2操纵子蛋白hybE
 ORF03554  7107和7108 氢化酶表达-形成蛋白
 ORF03555  7109和7t10 氢化酶-2大亚基HybC[1.18.99.1]
 ORF03556  7111和7112 氢化酶-2的细胞色素Ni-Fe组件
 ORF03557  7113和7114 氢化酶-2操纵子蛋白hybA前体
 ORF03558  7115和7116 氢化酶-2短链前体(NiFe氢化酶)(膜结合性氢化酶2小亚
 ORF03559  7117和7118 保守性假拟蛋白
 ORF03560  7119和7120 二烯内酯水解酶家族蛋白
 ORF03561  7121和7122 氧化还原酶,醛酮还原酶家族
 ORF03562  7123和7124 保守性假拟蛋白TIGR00645
ORF03563   7125和7126 氧化还原酶,短链脱氢酶-还原酶家族[1.-.-.-]
ORF03564   7127和7128 生物聚合物转运exbD蛋白
ORF03565   7129和7130 生物聚合物转运exbB蛋白(摄取)
ORF03566   7131和7132 胱硫醚β-裂合酶(metC)[4.4.1.8]
ORF03567   7133和7134 未命名的蛋白产物;类似于大肠杆菌的DedA-家族完整膜蛋白YghB
ORF03568   7135和7136 转录调节蛋白,AraC家族
ORF03569   7137和7138 未表征的氧化还原酶
ORF03570   7139和7140 氧化还原酶,醛酮还原酶家族[1.1.1.274]
ORF03571   7141和7142 保守性假拟蛋白
ORF03572   7143和7144 主要外膜脂蛋白
ORF03573   7145和7146 基团SAM结构域蛋白
ORF03574   7147和7148 xux操纵子的调节蛋白
ORF03575   7149和7150 假拟的氧化还原酶ydfl
ORF03576   7151和7152 推定的2,3-丁二醇脱氢酶[1.1.1.14]
ORF03577   7153和7154 脲基乙醇酸脱氢酶[1.1.1.-]
ORF03578   7155和7156 TRAP型C4-二羧酸转运系统,周质组件(AP00l509)
ORF03579   7157和7158 未命名蛋白产物
ORF03580   7159和7160 TRAP二羧酸转运蛋白,DctM亚基
ORF03581   7161和7162 ftsl的抑制物
ORF03582   7163和7164 1-酰基-sn-甘油-3-磷酸酰基转移酶(LPAAT)[2.3.1.51]
ORF03583   7165和7166 DNA拓扑异构酶IV,A亚基(parC)[5.99.1.-]
ORF03584   7167和7168 ABC超家族(周质),寡肽转运蛋白
ORF03585   7169和7170 转录调节蛋白,AraC家族
ORF03586   7171和7172 保守的假拟蛋白TIGR00156
ORF03587   7173和7174 转录调节蛋白qseB
ORF03588   7175和7176 传感蛋白qseC[2.7.3.-]
ORF03589   7177和7178 未命名的蛋白产物:类似于Hcp蛋白
ORF03590   7179和7180 推定的NAD(P)H醌氧化还原酶
ORF03591   7181和7182 蛋白ygiN
ORF03592   7183和7184 SIS结构域蛋白
ORF03593   7185和7186 推定的ABC转运蛋白的铁化合物-结合蛋白
ORF03594   7187和7188 铁化合物ABC转运蛋白,通透酶蛋白(III)
ORF03595   7189和7190 铁exochelin摄取(fxuC)
ORF03596   7191和7192 铁exochelin摄取(fxuB)
ORF03597   7193和7194 推定的铁化合物受体
ORF03598   7195和7196 DNA拓扑异构酶IV,B亚基(parE)[5.99.1.-]
ORF03599   7197和7198 预测的酯酶
ORF03600   7199和7200 cc蛋白
ORF03601   7201和7202 功能未知的蛋白(DUF1249)超家族
ORF03602   7203和7204 保守性假拟蛋白TIGR00052
ORF03603   7205和7206 对大肠杆菌素特异性耐受的外膜通道
ORF03604   7207和7208 保守性假拟蛋白
ORF03605   7209和7210 谷胱甘肽精胺合酶(O386)
ORF03606   7211和7212 酰基硫酸磺基转移酶
ORF03607   7213和7214 巯基:二硫键交换蛋白dsbA样前体[5.3.4.1]
ORF03608   7215和7216 二硫键形成蛋白B(dsbB)[1.8.4.-]
ORF03609   7217和7218 芳环-开环加双氧酶超家族的催化LigB亚基
ORF03610   7219和7220 假拟蛋白
ORF03611   7221和7222 锌转运蛋白zupT
ORF03612   7223和7224 保守性假拟蛋白
ORF03613   7225和7226 菌毛蛋白
ORF03614  7227和7228 外膜菌毛传达蛋白孔蛋白
ORF03615  7229和7230 外膜传达蛋白PMFC前体。
ORF03616  7231和7232 假拟的菌毛侣伴蛋白yqiH前体
ORF03617  7233和7234 ybgO蛋白
ORF03618  7235和7236 3.4-二羟基-2-丁酮4-磷酸合酶(ribB)
ORF03619  7237和7238 功能未知的蛋白质(DUF526)家族
ORF03620  7239和7240 糖换生物合成,rpoS依赖性相关蛋白
ORF03621  7241和7242 YgiJ
ORF03622  7243和7244 未表征的BCR,推定
ORF03623  7245和7246 ADP-庚糖合酶[2.7.-.-]
ORF03624  7247和7248 谷氨酸-氨连接酶腺苷酰转移酶
ORF03625  7249和7250 推定的腺苷酸环化酶
ORF03626  7251和7252 保守性假拟蛋白
ORF03627  7253和7254 tRNA核苷酸转移酶
ORF03628  z255和7256 推定的十一异戊二烯醇激酶[2.7.1.66]
ORF03629  7257和7258 二氢新蝶呤醛缩酶(folB)[4.1.2.25]
ORF03630  7259和7260 保守性假拟蛋白TIGR00023
ORF03631  7261和7262 LysR家族调节蛋白
ORF03632  7263和7264 假拟蛋白
ORF03633  7265和7266 延胡索酸酶(延胡索酸酶)[4.2,132]
ORF03634  7267和7268 推定的I类延胡索酸水合酶[4.2.1.32]
ORF03635  7269和7270 DASS家族,柠檬酸:琥珀酸转运(反向转运)
ORF03636  7271和7272 O-唾液酸糖蛋白内肽酶(.qcp)[3.4.24.57]
ORF03637  7273和7274 30S核糖体蛋白S21相关蛋白
ORF03638  7275和7276 DNA引发酶[2.7.7.-]
ORF03639  7277和7278 RNA聚合酶的σD因子
ORF03640  7279和7280 RNA聚合酶的σD因子
ORF03641  7281和7282 G-U错配特异性DNA糖基化酶(错配特异性尿嘧啶DNA-糖基化酶)(UDG)[3.2.2.-]
ORF03642  7283和7284 铁螯合物利用蛋白
ORF03643  7285和7286 转录调节物,PadR家族
ORF03644  7287和7288 趋氧性受体
ORF03645  7289和7290 鸟氨酸氨基转移酶(rocD)[2.6.1.13]
ORF03646  7291和7292 tRNA-结合蛋白ygiH(mets)[6.1.1.10]
ORF03647  7293和7294 半乳糖操纵子阻抑物galR
ORF03648  7295和7296 引发的β-半乳糖苷酶α-亚基
ORF03649  7297和7298 EGB酶β亚基[3.2.1.23]
ORF03650  7299和7300 可能的氧化还原酶ygil
ORF03651  7301和7302 保守性假拟蛋白
ORF03652  7303和7304 保守性假拟蛋白
ORF03653  7305和7306 2,4-二烯酰基-coA还原酶[1.-.-.-]
ORF03654  7307和7308 2.1.1.52[2.1.1.52]
ORF03655  7309和7310 保守性假拟蛋白
ORF03656  7311和7312 sanA蛋白
ORF03657  7313和7314 氧化还原酶[1.-.-.-1
ORF03658  7315和7316 Alx蛋白
ORF03659  7317和7318 钠:二羧酸同向转运蛋白家族超家族
ORF03660  7319和7320 保守性假拟蛋白
ORF03661  7321和7322 阿卓糖酸水解酶[4.2.1.7]
ORF03662  7323和7324 葡糖醛酸异构酶(uxaC)[5.3.1.12]
ORF03663  7325和7326 推定的主要易化家族转运蛋白
ORF03664  7327和7328 Exu调节子转录调节物
ORF03665  7329和7330 未命名的蛋白产物;类似于大肠杆菌的DedA-家族完整膜蛋白YghB
ORF03666  7331和7332 保守性假拟蛋白
ORF03667  7333和7334 蛋白yqjC前体[3.4.24.13]
ORF03668  7335和7336 功能未知的细菌蛋白(DUF883)超家族
ORF03669  7337和7338 保守性假拟蛋白
ORF03670  7339和7340 保守性假拟蛋白
ORF03671  7341和7342 预测的膜蛋白
ORF03672  7343和7344 谷胱甘肽S-转移酶C末端(O328)
ORF03673  7345和7346 功能未知的蛋白质(DUF805)超家族
ORF03674  7347和7348 lysR-家族转录调节蛋白YPO3545
ORF03675  7349和7350 未表征的BCR,YhhW家族COG1741家族
ORF03676  7351和7352 保守性假拟蛋白
ORF03677  7353和7354 功能未知的蛋白质(DUF1063)超家族
ORF03678  7355和7356 推定的转运系统通透酶蛋白
ORF03679  7357和7358 L-丝氨酸氨-裂合酶(sdaA)[4.3.1.17]
ORF03680  7359和7360 推定的内切核糖核酸酶L-PSP
ORF03681  7361和7362 甲酸乙酰基转移酶(pflB)[2.3.1.54]
ORF03682  7363和7364 乙酸激酶(ackA)[2.7.2.1]
ORF03683  7365和7366 苏氨酸-丝氨酸转运蛋白
ORF03684  7367和7368 苏氨酸脱水酶,易化(苏氨酸脱氨酶) (tdcB)[4.3.1.19]
ORF03685  7369和7370 推定的转录调节蛋白,LysR家族[4.2.1.16]
ORF03686  7371和7372 甘油酸激酶2
ORF03687  7373和7374 2-羟基-3-氧代丙酸还原酶[1.1.1.60]
ORF03688  7375和7376 2-脱氢-3-脱氧葡糖二酸醛缩酶(ptpA)[4.1.2.20]
ORF03689  7377和7378 MFS转运蛋白,邻苯二甲酸通透酶家族
ORF03690  7379和7380 D-粘酸脱水酶(GalcD)[4.2.1.42]
ORF03691  7381和7382 DeoR-家族调节蛋白(srl)
ORF03692  7383和7384 推定的塔格糖6-磷酸激酶蛋白
ORF03693  7385和7386 N-乙酰半乳糖胺特异性PTS系统酶IIB组件(EIIB-AGA)[2.7.1.69]
ORF03694  7387和7388 N-乙酰半乳糖胺特异性IIC组件2
ORF03695  7389和7390 PTS系统,N-乙酰半乳糖胺特异性IID组件
ORF03696  7391和7392 AgaF[2.7.1.69]
ORF03697  7393和7394 N-乙酰葡糖胺-6-磷酸脱乙酰酶(nagA)[3.5.1.25]
ORF03698  7395和7396 糖异构酶结构域蛋白AgaS[5.-.-.-]
ORF03699  7397和7398 II类醛缩酶,塔格糖双磷酸家族[4.1.2.-]
ORF03700  7399和7400 PTS系统,N-乙酰半乳糖胺特异性IIB组件1(EIIB-Aga)(N-乙酰半乳糖胺-通透酶
ORF03701  7401和7402 PTS系统,N-乙酰半乳糖胺特异性IIC组件1(EIIC-Aga)(N-乙酰半乳糖胺-通透酶
ORF03702  7403和7404 PTS系统,N-乙酰半乳糖胺特异性IID组件(EIID-AGA)
ORF03703  7405和7406 推定的葡糖胺-6-磷酸异构酶[5.3.1.-]
ORF03704  7407和7408 保守性假拟蛋白TIGR00096
ORF03705  7409和7410 LppC
ORF03706  7411和7412 保守性假拟蛋白TIGR00252
ORF03707  7413和7414 磷酸庚糖异构酶(.qmhA)
ORF03708  7415和7416 推定的磷脂结合结构域家族
ORF03709  7417和7418 预测的通透酶超家族
ORF03710  7419和7420 保守性假拟蛋白
ORF03711  7421和7422 未命名蛋白产物
ORF03712  7423和7424 蛋白酶I
ORF03713  7425和7426 乙酰基转移酶[2.3.1.-]
ORF03714  7427和7428 预测的内切核酸酶
ORF03715  7429和7430 SCP-2固醇转移家族
ORF03716  7431和7432 胶原酶
ORF03717  7433和7434 肽酶,U32家族[3.4.-.-]
ORF03718  7435和7436 黄素依赖性氧化还原酶
ORF03719  7437和7438 色氨酸特异性转运蛋白
ORF03720  7439和7440 ATP依赖性RNA解旋酶DeaD
ORF03721  7441和7442 脂蛋白nlpI前体
ORF03722  7443和7444 多核糖核苷酸核苷酸转移酶(CAP87K)
ORF03723  7445和7446 核糖体蛋白S15(rpsO)
ORF03724  7447和7448 tRNA假尿苷合酶B[4.2.1.70]
ORF03725  7449和7450 核糖体结合因子A(rbfA)
ORF03726  7451和7452 翻译启动因子IF-2
ORF03727  7453和7454 转录延长蛋白nusA(N利用物质蛋白A)(L因子)(nusA)
ORF03728  7455和7456 YhbC样蛋白
ORF03729  7457和7458 精氨琥珀酸合酶(argG)[6.3.4.5]
ORF03730  7459和7460 外膜蛋白yhbX前体
ORF03731  7461和7462 蛋白-输出膜蛋白secG
ORF03732  7463和7464 磷酸葡糖胺变位酶(glmM)[5.4.2.-]
ORF03733  7465和7466 二氢蝶酸合酶(folP)[2.5.1.15]
ORF03734  7467和7468 ATP-结合蛋白[3.4.24.-]
ORF03735  7469和7470 核糖体RNA大亚基甲基转移酶J(rrmJ)[2.1.1.-]
ORF03736  7471和7472 保守性假拟蛋白TIGR00253
ORF03737  7473和7474 转录延长因子greA(转录物切割因子greA)(greA)
ORF03738  7475和7476 D-丙氨酰-D-丙氨酸羧肽酶-D-丙氨酰-D-丙氨酸-内肽酶(dacB)[3.4.16.4]
ORF03739  7477和7478 Obg蛋白(Obg)
ORF03740  7479和7480 Obg蛋白(F390)
ORF03741  7481和7482 RhaT蛋白
ORF03742  7483和7484 RhaT蛋白
ORF03743  7485和7486 核糖体蛋白L27(rpmA)
ORF03744  7487和7488 50S核糖体蛋白L21
ORF03745  7489和7490 保守性假拟蛋白
ORF03746  7491和7492 RhaT蛋白
ORF03747  7493和7494 核糖体蛋白L27(rpmA)
ORF03748  7495和7496 50S核糖体蛋白L21
ORF03749  7497和7498 核糖体蛋白L21(rplU)
ORF03750  7499和7500 保守性假拟蛋白
ORF03751  7501和7502 八异戊二烯基-二磷酸合酶(八异戊二烯基焦磷酸合成酶)(OPP合成酶)[2.5.1-]
ORF03752  7503和7504 糖发酵刺激蛋白B(Ner样蛋白)
ORF03753  7505和7506 UDP-N-乙酰葡糖胺1-羧基乙烯基转移酶(murA)[2.5.1.7]
ORF03754  7507和7508 BolA样蛋白
ORF03755  7509和7510 保守性假拟蛋白
ORF03756  7511和7512 蛋白yrbC前体(Ttg2D)
ORF03757  7513和7514 保守性假拟蛋白
ORF03758  7515和7516 VpsC
ORF03759  7517和7518 未命名的蛋白产物;高度类似于大肠杆菌的ABC转运蛋白,通透酶蛋白YrbE
ORF03760  7519和7520 ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(atp结合)
ORF03761  7521和7522 K+依赖性Na+-Ca+交换蛋白相关蛋白
ORF03762  7523和7524 假拟蛋白
ORF03763  7525和7526 保守性假拟蛋白
ORF03764  7527和7528 推定的异构酶
ORF03765  7529和7530 3-脱氧-D-甘露糖-辛酮糖酸8-磷酸磷酸酶(KDO 8-P磷酸酶)[3.1.3.45]
ORF03766  7531和7532 未命名的蛋白产物;类似于大肠杆菌的YrbK前体蛋白
ORF03767  7533和7534 OstA样蛋白家族
ORF03768  7535和7536 ABC转运蛋白,ATP结合组件
ORF03769  7537和7538 RNA聚合酶σ-54因子(rpoN)
ORF03770  7539和7540 核糖体亚基界面蛋白(yfiA)
ORF03771  7541和7542 PTS IIA样氮调节性蛋白PtsN(ptsN)
ORF03772  7543和7544 未命名的蛋白产物;ORF193肽片段(AA 1-192)(1524是密码子中的第二个碱基)
ORF03773  7545和7546 磷酸载体蛋白(NPr)
ORF03774  7547和7548 保守性假拟蛋白
ORF03775  7549和7550 单功能生物合成肽聚糖糖基转移酶(mtgA)[2.4.2.-]
ORF03776  7551和7552 σ交叉反应蛋白27A(SCRP-27A)
ORF03777  7553和7554 需氧呼吸控制传感蛋白arcB[2.7.3.-]
ORF03778  7555和7556 基团SAM蛋白,TIGR01212家族
ORF03779  7557和7558 假拟蛋白
ORF03780  7559和7560 谷氨酸合酶[NADPH]长链前体[1.4.1.13]
ORF03781  7561和7562 谷氨酸合酶(NADPH)短链(NADPH)[1.4.1.13]
ORF03782  7563和7564 保守性假拟蛋白亚家族
ORF03783  7565和7566 推定的ROK家族蛋白结构域蛋白
ORF03784  7567和7568 N-乙酰甘露糖胺-6-磷酸2-差向异构酶-N-乙酰甘露糖胺激酶
ORF03785  7569和7570 推定的顺,顺-粘康酸转运蛋白MucK
ORF03786  7571和7572 N-乙酰神经氨酸裂合酶(nanA)[4.1.3.3]
ORF03787  7573和7574 推定的转录调节蛋白,GntR家族
ORF03788  7575和7576 严格性饥饿蛋白B(sspB)
ORF03789  7577和7578 严格性饥饿蛋白A(Ssp)
ORF03790  7579和7580 核糖体蛋白S9(rpsI)
ORF03791  7581和7582 核糖体蛋白L13(rplM)
ORF03792  7583和7584 预测的ATP酶
ORF03793  7585和7586 功能未知的蛋白(DUF1043)超家族
ORF03794  7587和7588 蛋白酶degQ前体
ORF03795  7589和7590 周质丝氨酸蛋白酶DegS(degS)[3.4.21.-]
ORF03796  7591和7592 苹果酸脱氢酶,NAD依赖性(mdh)[1.1.1.37]
ORF03797  7593和7594 精氨酸阻抑物(argR)
ORF03798  7595和7596 功能未知的蛋白(DUF1471)超家族
ORF03799  7597和7598 未命名的蛋白产物;类似于核糖核酸酶抑制物(barstar)
ORF03800  7599和7600 萎蔫酸抗性蛋白保守区家族
ORF03801  7601和7602 萎蔫酸抗性蛋白
ORF03802  7603和7604 保守性假拟蛋白
ORF03803  7605和7606 保守性假拟蛋白
ORF03804  7607和7608 转录调节蛋白
ORF03805  7609和7610 TldD蛋白(CSRA)
ORF03806  7611和7612 保守性假拟蛋白TIGR02099
ORF03807  7613和7614 胞浆纤丝束
ORF03808  7615和7616 maf蛋白(maf)
ORF03809  7617和7618 杆形-决定蛋白MreD(mreD)
ORF03810  7619和7620 杆形-决定蛋白mreC(mreC)
ORF03811  7621和7622 杆形-决定蛋白mreC(mreC)
ORF03812  7623和7624 ftsI的调节蛋白
ORF03813  7625和7626 EAL结构域蛋白
ORF03814  7627和7628 蛋白yhdH
ORF03815  7629和7630 乙酰-CoA羧化酶,生物素羧基载体蛋白(accB)
ORF03816  7631和7632 乙酰-CoA羧化酶,生物素羧化酶(accC)[6.4.1.2]
ORF03817  7633和7634 保守性假拟蛋白
ORF03818  7635和7636 保守性假拟蛋白
ORF03819  7637和7638 果糖激酶(AB010074)[2.7.1.-]
ORF03820  7639和7640 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白(通透酶)
ORF03821  7641和7642 核糖转运ATP-结合蛋白rbsA(醛糖)
ORF03822  7643和7644 周质核糖结合蛋白
ORF03823  7645和7646 II类醛缩酶,塔格糖双磷酸家族[4.1.2.-]
ORF03824  7647和7648 保守性假拟蛋白
ORF03825  7649和7650 aga操纵子转录阻抑物(DeoR家族)
ORF03826  7651和7652 果糖激酶(AB010074)[2.7.1.-]
ORF03827  7653和7654 功能未知的蛋白(DUF997)超家族
ORF03828  7655和7656 钠-泛酸同向转运蛋白(panF)
ORF03829  7657和7658 核糖体蛋白L11甲基转移酶(prmA)[2.1.1.-]
ORF03830  7659和7660 tRNA-二氢尿苷合酶B[1.-.-.-]
ORF03831  7661和7662 DNA-结合蛋白fis(倒位刺激因子蛋白)(HIN重组增强蛋白结合蛋白)(fis)
ORF03832  7663和7664 ADENINE特异性METHYL转移酶
ORF03833  7665和7666 保守性假拟蛋白
ORF03834  7667和7668 可能的acrEF-envCD操纵子阻抑物(acrEF)
ORF03835  7669和7670 吖啶黄抗性蛋白E前体
ORF03836  7671和7672 吖啶黄抗性蛋白F
ORF03837  7673和7674 推定的脂蛋白
ORF03838  7675和7676 氨基酸ABC转运蛋白,周质氨基酸-结合蛋白
ORF03839  7677和7678 L-氨基酸ABC转运蛋白通透酶蛋白
ORF03840  7679和7680 L-氨基酸ABC转运蛋白通透酶蛋白
ORF03841  7681和7682 L-氨基酸ABC转运蛋白ATP-结合蛋白
ORF03842  7683和7684 谷氨酸脱羧酶[4.1.1.15]
ORF03843  7685和7686 谷氨酸脱羧酶[4.1.1.15]
ORF03844  7687和7688 未命名的蛋白产物
ORF03845  7689和7690 蛋白yrdA
ORF03846  7691和7692 莽草酸5-脱氢酶(aroE)[1.1.1.25]
ORF03847  7693和7694 蛋白yrdC
ORF03848  7695和7696 蛋白smg
ORF03849  7697和7698 预测的参与DNA的Rossmann-折叠核苷酸-结合蛋白
ORF03850  7699和7700 肽脱甲基酶(def)[3.5.1.88]
ORF03851  7701和7702 甲硫氨酰基-tRNA甲酰基转移酶(fmt)[2.1.2.9]
ORF03852  7703和7704 sun蛋白(sun)[2.1.1.-]
ORF03853  7705和7706 Trk系统摄钾蛋白trkA(K(+)-摄取蛋白trkA)(trkA)
ORF03854  7707和7708 大电导率机械敏感性通道蛋白(mscL)
ORF03855  7709和7710 细菌中保守的未表征蛋白
ORF03856  7711和7712 Zn(II)-反应性转录调节蛋白(zntR)
ORF03857  7713和7714 保守性假拟蛋白
ORF03858  7715和7716 核糖体蛋白L17(rplQ)
ORF03859  7717和7718 以DNA为指导的RNA聚合酶,α亚基(rpoA)[2.7.7.6]
ORF03860  7719和7720 核糖体蛋白S4(rpsD)
ORF03861  7721和7722 核糖体蛋白S11(rpsK)
ORF03862  7723和7724 核糖体蛋白S13p-S18e(rpsM)
ORF03863  7725和7726 核糖体蛋白L36(rpmJ)
ORF03864  7727和7728 前蛋白转位酶,SecY亚基
ORF03865  7729和7730 前蛋白转位酶secY亚基(secY)
ORF03866  7731和7732 核糖体蛋白L15(rplO)
ORF03867  7733和7734 核糖体蛋白L30(rpmD)
ORF03868  7735和7736 核糖体蛋白S5(rpsE)
ORF03869  7737和7738 核糖体蛋白L18(rplR)
ORF03870  7739和7740 50S核糖体亚基蛋白L6(rplF)
ORF03871  7741和7742 保守性假拟蛋白
ORF03872  7743和7744 核糖体蛋白S8(rpsH)
ORF03873  7745和7746 核糖体蛋白S14p-S29e(rpsN)
ORF03874  7747和7748 50S核糖体亚基蛋白L5(rpL5)
ORF03875  7749和7750 核糖体蛋白L24(rplX)
ORF03876  7751和7752 核糖体蛋白L14(rplN)
ORF03877  7753和7754 核糖体蛋白S17(rpsQ)
ORF03878  7755和7756 核糖体蛋白L29(rpmC)
ORF03879  7757和7758 核糖体蛋白L16(rplp)
ORF03880  7759和7760 核糖体蛋白S3(rpsC)
ORF03881  7761和7762 核糖体蛋白L22(rplV)
ORF03882  7763和7764 核糖体蛋白S19(rpsS)
ORF03883  7765和7766 核糖体蛋白L2(rplB)
ORF03884  7767和7768 核糖体蛋白L23(rplW)
ORF03885  7769和7770 核糖体蛋白L4-L1家族(rplD)
ORF03886  7771和7772 核糖体蛋白L3(rplC)
ORF03887  7773和7774 核糖体蛋白S10(rpsJ)
ORF03888  7775和7776 PioO蛋白(PinO蛋白)
ORF03889  7777和7778 可能的通用分泌通路蛋白A(GSP)
ORF03890  7779和7780 通用分泌通路蛋白C(gspC)
ORF03891  7781和7782 通用分泌通路蛋白D前体(支链淀粉酶分泌包膜pulD)(GSP)
ORF03892  7783和7784 通用分泌通路蛋白E(II型运输管理ATP酶)(霍乱毒素分泌蛋白epsE)(GSP)
ORF03893  7785和7786 通用分泌通路蛋白F(gspF)
ORF03894  7787和7788 通用分泌通路蛋白G(gspG)
ORF03895  7789和7790 通用分泌通路蛋白H前体(支链淀粉酶分泌蛋白pulH)(GSP)
ORF03896  7791和7792 外膜分泌蛋白V(GSP)
ORF03897  7793和7794 通用分泌通路蛋白J(gspJ)
ORF03898  7795和7796 通用分泌通路蛋白K(gspK)
ORF03899  7797和7798 通用分泌通路蛋白L(gspL)
ORF03900  7799和7800 推定的通用分泌通路蛋白M(GSP)
ORF03901  7801和7802 4型前菌毛蛋白样蛋白前导肽加工酶(GSP)[3.4.23.43]
ORF03902  7803和7804 细菌铁蛋白(bfr)
ORF03903  7805和7806 细菌铁蛋白-结合性铁氧还蛋白相关蛋白
ORF03904  7807和7808 几丁质酶[3.2.1.14]
ORF03905  7809和7810 翻译延长因子Tu(tuf)
ORF03906  7811和7812 翻译延长因子G(fusA)
ORF03907  7813和7814 核糖体蛋白S7(rpsG)
ORF03908  7815和7816 核糖体蛋白S12(rpsL)
ORF03909  7817和7818 DsrH蛋白
ORF03910  7819和7820 参与氧化的未表征蛋白
ORF03911  7821和7822 参与胞内硫的未表征保守蛋白
ORF03912  7823和7824 保守性假拟蛋白
ORF03913  7825和7826 FKBP-型肽基-脯氨酰顺反异构酶fkpA前体(EC 5.2.1.8)(PPI酶)(旋转异构酶)(旋
ORF03914  7827和7828 SlyX蛋白(slyX)
ORF03915  7829和7830 FKBP型肽基-脯氨酰顺反异构酶slyD(PPI酶)(旋转异构酶)(富组氨酸蛋白)
ORF03916  7831和7832 保守性假拟蛋白
ORF03917  7833和7834 谷胱甘肽-调节的钾外流系统蛋白kefB(K(+)-H(+)反向转运蛋白)(NEM-激活性
ORF03918  7835和7836 谷胱甘肽-调节的钾外流系统辅助蛋白kefG[1.6.99.2]
ORF03919  7837和7838 ABC转运蛋白ATP-结合蛋白
ORF03920  7839和7840 预测的α-β-水解酶折叠的水解酶
ORF03921  7841和7842 假拟的UPF0270蛋白yheU相关蛋白
ORF03922  7843和7844 磷酸核酮糖激酶[2.7.1.19]
ORF03923  7845和7846 无已知功能
ORF03924  7847和7848 代谢产物基因激活物(cAMP受体蛋白)(cAMP调节蛋白)(crp)
ORF03925  7849和7850 完整的膜蛋白,YccS-YhfK家族亚家族
ORF03926  7851和7852 乙酰鸟氨酸氨基转移酶(argD)[2.6.1.11]
ORF03927  7853和7854 对氨基苯甲酸合酶谷氨酰胺酰胺基转移酶组件II[6.3.5.8]
ORF03928  7855和7856 推定的fic
ORF03929  7857和7858 肽基-脯氨酰顺反异构酶A前体(PPI酶A)(旋转异构酶A)(亲环蛋白A)(utu)
ORF03930  7859和7860 假拟蛋白
ORF03931  7861和7862 TsgA蛋白
ORF03932  7863和7864 亚硝酸还原酶[NAD(P)H],大亚基(nirB)[1.7.1.4]
ORF03933  7865和7866 亚硝酸还原酶[NAD(P)H],小亚基(nirD)[1.7.1.4]
ORF03934  7867和7868 可能的亚硝酸转运蛋白(甲酸)
ORF03935  7869和7870 亚硝酸还原酶(Siroheme)合酶
ORF03936  7871和7872 推定脂蛋白
ORF03937  7873和7874 未命名的蛋白产物
ORF03938  7875和7876 推定膜蛋白
ORF03939  7877和7878 保守性假拟蛋白
ORF03940  7879和7880 推定的对硫磷水解酶
ORF03941  7881和7882 磷酸戊糖变位酶(phosphopentomutase)
ORF03942  7883和7884 丙氨酸消旋酶,N-末端结构域家族
ORF03943  7885和7886 未命名的蛋白产物
ORF03944  7887和7888 保守性假拟蛋白
ORF03945  7889和7890 色氨酰-tRNA合成酶(trpS)[6.1.1.2]
ORF03946  7891和7892 磷酸乙醇酸磷酸酶,细菌(gph)[3.1.3.18]
ORF03947  7893和7894 假拟蛋白
ORF03948  7895和7896 磷酸乙醇酸磷酸酶(PGP)[3.1.3.18]
ORF03949  7897和7898 核酮糖-磷酸3-差向异构酶(rpe)[5.1.3.1]
ORF03950  7899和7900 DNA腺嘌呤甲基化酶(dam)[2.1.1.72]
ORF03951  7901和7902 DamX蛋白(1989)
ORF03952  7903和7904 3-脱氢奎尼酸合酶(aroB)[4.2.3.4]
ORF03953  7905和7906 莽草酸激酶I
ORF03954  7907和7908 蛋白转运蛋白hofQ前体(Tfp)
ORF03955  7909和7910 保守性假拟蛋白
ORF03956  7911和7912 保守性假拟蛋白
ORF03957  7913和7914 菌毛装配蛋白(PilN)超家族
ORF03958  7915和7916 保守性假拟蛋白
ORF03959  7917和7918 青霉素-结合蛋白1A(PBPla)[2.4.2.-]
ORF03960  7919和7920 ADP化合物水解酶nudE [3.6.1.-]
ORF03961  7921和7922 胞内生长弱化子蛋白igaA
ORF03962  7923和7924 HAD-超家族水解酶,亚家族IA,变体3蛋白家族
ORF03963  7925和7926 热激蛋白15(HSP15)(HSP15)
ORF03964  7927和7928 33 kDa侣伴蛋白(热激蛋白33)(HSP33)(HSP33)
ORF03965  7929和7930 推定膜蛋白
ORF03966  7931和7932 磷酸烯醇式丙酮酸羧基激酶(ATP)(pckA)[4.1.1.49]
ORF03967  7933和7934 渗透压传感蛋白envZ[2.7.3.-]
ORF03968  7935和7936 影响ompC和ompF转录的反应调节蛋白(传感蛋白,EnvZ):外膜蛋白合成
ORF03969  7937和7938 转录延长因子GreB(greB)
ORF03970  7939和7940 蛋白yhgF
ORF03971  7941和7942 亚铁转运蛋白B
ORF03972  7943和7944 亚铁转运蛋白B(feoB)
ORF03973  7945和7946 保守性假拟蛋白
ORF03974  7947和7948 转座酶
ORF03975  7949和7950 假拟蛋白
ORF03976  7951和7952 bioH蛋白(bioH)
ORF03977  7953和7954 假拟蛋白
ORF03978  7955和7956 预测的酰氨基磷酸核糖基转移酶
ORF03979  7957和7958 蛋白yhgI
ORF03980  7959和7960 高亲和葡糖酸转运蛋白(葡糖酸通透酶)(Gnt-Isystem)
ORF0398 1  7961和7962 4-α-葡聚糖转移酶(malQ)[2.4.1.25]
ORF03982  7963和7964 麦芽糖糊精磷酸化酶[2.4.1.1]
ORF03983  7965和7966 推定的转录调节蛋白,LuxR家族
ORF03984  7967和7968 RNA 3′-末端磷酸环化酶(rtcA)[6.5.1.4]
ORF03985  7969和7970 蛋白rtcB
ORF03986  7971和7972 甘油-3-磷酸调节子阻抑物
ORF03987  7973和7974 转录调节蛋白y蛋白rtcR
ORF03988  7975和7976 推定的λ家族蛋白
ORF03989  7977和7978 未命名的蛋白产物;glpE多肽(AA1-131)
ORF03990  7979和7980 需氧性甘油-3-磷酸脱氢酶(需氧)
ORF03991  7981和7982 保守性假拟蛋白
ORF03992  7983和7984 保守性假拟蛋白
ORF03993  7985和7986 保守性假拟蛋白
ORF03994  7987和7988 甘露糖结合蛋白FimH前体
ORF03995  7989和7990 菌毛侣伴蛋白
ORF03996  7991和7992 推定的小菌毛亚基前体
ORF03997  7993和7994 推定的小菌毛亚基前体
ORF03998  7995和7996 FlC菌毛传达蛋白
ORF03999  7997和7998 侣伴蛋白蛋白fimC前体
ORF04000  7999和8000 长极性菌毛蛋白A前体(菌毛蛋白)
ORF04001  8001和8002 糖元磷酸化酶[2.4.1.1]
ORF04002  8003和8004 糖元合酶(淀粉[细菌糖原]合酶)[2.4.1.21]
ORF04003  8005和8006 葡萄糖-1-磷酸腺苷酰转移酶(glgC)[2.7.7.27]
ORF04004  8007和8008 糖元脱支酶GlgX(glgX)[3.2.1.-]
ORF04005  8009和8010 1,4-α-葡聚糖分支酶(glgB)[2.4.1.18]
ORF04006  8011和8012 天冬氨酸-半醛脱氢酶(asd)[1.2.1.11]
ORF04007  8013和8014 推定的膜蛋白
ORF04008  8015和8016 推定的葡糖酸通透酶
ORF04009  8017和8018 耐热葡糖酸激酶(葡糖酸激酶2)
ORF04010  8019和8020 HTH型转录调节蛋白gntR(葡糖酸利用系统GNT-I转录阻抑物)(gnt)
ORF04011  8021和8022 蛋白yhhW
ORF04012  8023和8024 推定的氧化还原酶yhhX[1.-.-.-]
ORF04013  8025和8026 保守性假拟蛋白
ORF04014  8027和8028 推定的乙酰基转移酶,GNAT家族[2.3.1.-]
ORF04015  8029和8030 未命名的蛋白产物;类似于Hcp蛋白
ORF04016  8031和8032 保守性假拟蛋白
ORF04017  8033和8034 γ-谷氨酰转移酶(ggt)[2.3.2.2]
ORF04018  8035和8036 甘油磷酸二酯磷酸二酯酶[3.1.4.46]
ORF040l9  8037和8038 CG9973-PA
ORF04020  8039和8040 SN-甘油-3-磷酸转运ATP-结合蛋白ugpC
ORF04021  8041和8042 SN-甘油-3-磷酸转运系统通透酶蛋白ugpE(膜)
ORF04022  8043和8044 甘油-3-磷酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白(膜)
ORF04023  8045和8046 甘油-3-磷酸-结合性周质蛋白前体
ORF04024  8047和8048 ABC转运蛋白结构域蛋白
ORF04025  8049和8050 高亲和支链氨基酸转运ATP-结合蛋白livG(LIV-I蛋白G)(AJ272047)
ORF04026  8051和8052 高亲和支链氨基酸转运系统通透酶蛋白livM(LIV-I蛋白M)
ORF04027  8053和8054 高亲和支链氨基酸转运系统通透酶蛋白livH
ORF04028  8055和8056 亮氨酸特异性结合蛋白前体
ORF04029  8057和8058 乙酰基转移酶,GNAT家族
ORF04030  8059和8060 Leu-Ile-Val-结合蛋白前体
ORF04031  8061和8062 PTS系统,甘露糖特异性酶II,AB组件(EIII-MAN)[2.7.1.69]
ORF04032  8063和8064 PTS系统,甘露糖特异性IIAB组件,推定[2.7.1.69]
ORF04033  8065和8066 PTS系统,IIC组件(PTS)
ORF04034  8067和8068 甘露糖特异性PTS酶IID
ORF04035  8069和8070 D-3-磷酸甘油酸脱氢酶(serA)[1.1.1.95]
ORF04036  8071和8072 二氢二皮考啉酸合酶(dapA)[4.2.1.52]
ORF04037  8073和8074 另一种σ因子RpoH(rpoH)
ORF04038  8075和8076 推定的蛋白插入通透酶FtsX(ftsX)
ORF04039  8077和8078 细胞分裂ATP-结合蛋白ftsE
ORF04040  8079和8080 细胞分裂蛋白ftsY
ORF04041  8081和8082 推定的甲基转移酶
ORF04042  8083和8084 与前一ORF重叠,可能采用下游启动
ORF04043  8085和8086 保守性假拟蛋白
ORF04044  8087和8088 推定膜蛋白
ORF04045  8089和8090 铅、镉、锌和汞转运ATP酶[3.6.3.3]
ORF04046  8091和8092 SirA蛋白
ORF04047  8093和8094 膜蛋白(o221)
ORF04048  8095和8096 DcrB蛋白前体
ORF04049  8097和8098 假拟的UPF0226蛋白yhhS
ORF04050  8099和8100 推定的功能未知的结构域
ORF04051  8101和8102 4′-磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶acpT[2.7.8.-]
ORF04052  8103和8104 镍ABC转运蛋白,周质镍-结合蛋白(nikA)
ORF04053  8105和8106 镍转运系统通透酶蛋白nikB(通透酶)
ORF04054  8107和8108 推定的二肽ABC转运蛋白,通透酶蛋白
ORF04055  8109和8110 镍转运ATP-结合蛋白nikD
ORF04056  8111和8112 镍转运ATP-结合蛋白nikE
ORF04057  8113和8114 镍反应性调节蛋白
ORF04058  8115和8116 推定的转录调节蛋白,GntR家族
ORF04059  8117和8118 PTS系统IIA组件,可能的,推定的
ORF04060  8119和8120 PTS系统,半乳糖醇特异性酶II,B组件[2.7.1.69]
ORF04061  8121和8122 PTS系统,山梨糖醇特异性IIC组件
ORF04062  8123和8124 可能的木酮糖激酶Z4878[2.7.1.30]
ORF04063  8125和8126 磷酸转移酶系统HPr酶(PTS)
ORF04064  8127和8128 塔格糖-双磷酸醛缩酶GatY [4.1.2.-]
ORF04065  8129和8130 ABC-2型转运蛋白家族
ORF04066  8131和8132 核糖体结合性ATP酶,ATP结合结构域(N-末端)
ORF04067  8133和8134 I型抗冻蛋白:HlyD家族分泌蛋白
ORF04068  8135和8136 推定膜蛋白
ORF04069  8137和8138 保守性假拟蛋白TIGR00275
ORF04070  8139和8140 低亲和无机磷酸转运蛋白1
ORF04071  8141和8142 通用的应激蛋白B
ORF04072  8143和8144 通用的应激蛋白A(UspA)
ORF04073  8145和8146 假拟蛋白
ORF04074  8147和8148 假拟的转运蛋白yhiP
ORF04075  8149和8150 gtg启动,可能交替启动
ORF04076  8151和8152 寡肽酶A
ORF04077  8153和8154 功能未知的蛋白(DUF519)超家族
ORF04078  8155和8156 谷胱甘肽-二硫还原酶(gor)[1.8.1.7]
ORF04079  8157和8158 保守性假拟蛋白
ORF04080  8159和8160 砷酸还原酶[1.20.4.1]
ORF04081  8161和8162 碳饥饿诱导的外膜蛋白
ORF04082  8163和8164 假拟的转录调节蛋白yhiF
ORF04083  8165和8166 高铁血红素转运蛋白hmuS
ORF04084  8167和8168 外膜高铁血红素受体ChuA
ORF04085  8169和8170 保守性假拟蛋白
ORF04086  8171和8172 推定的周质结合蛋白
ORF04087  8173和8174 HugW
ORF04088  8175和8176 HuvX蛋白(片段)
ORF04089  8177和8178 保守性假拟蛋白
ORF04090  8179和8180 高铁血红素ABC转运蛋白通透酶蛋白
ORF04091  8181和8182 高铁血红素转运系统ATP-结合蛋白
ORF04092  8183和8184 阳离子转运ATP酶yqgG
ORF04093  8185和8186 蛋白hdeB前体
ORF04094  8187和8188 推定的蛋白hdeA前体
ORF04095  8189和8190 HdeD蛋白
ORF04096  8191和8192 保守性假拟蛋白
ORF04097  8193和8194 多药外流泵SdeX
ORF04098  8195和8196 RND家族,吖啶-多药外流泵
ORF04099  8197和8198 HTH型转录调节蛋白appY(M5多肽)
ORF04100  8199和8200 转录调节蛋白gadX
ORF04101  8201和8202 谷氨酸脱羧酶[4.1.1.15]
ORF04102  8203和8204 细胞色素c551过氧化物酶
ORF04103  8205和8206 海藻糖酶[3.2.1.28]
ORF04104  8207和8208 毒力调节蛋白
ORF04105  8209和8210 转录调节蛋白
ORF04106  8211和8212 核糖核酸酶,推定的
ORF04107  8213和8214 代谢物-质子同向转运蛋白
ORF04108  8215和8216 参与外膜生物合成的未表征蛋白
ORF04109  8217和8218 推定的EAL结构域
ORF04110  8219和8220 2-脱氢-3-脱氧葡糖酸激酶
ORF04111  8221和8222 蛋白yhjJ前体[3.4.99.-]
ORF04112  8223和8224 需氧C4-二羧酸转运蛋白
ORF04113  8225和8226 蛋白yhjK
ORF04114  8227和8228 纤维素合酶操纵子蛋白C
ORF04115  8229和8230 Endo葡聚糖酶前体
ORF04116  8231和8232 环式二-GMP结合蛋白前体
ORF04117  8233和8234 纤维素合酶催化亚基[UDP形成]
ORF04118  8235和8236 YhjQ蛋白家族
ORF04119  8237和8238 保守性假拟蛋白
ORF04120  8239和8240 保守性假拟蛋白
ORF04121  8241和8242 保守性假拟蛋白
ORF04122  8243和8244 保守性假拟蛋白
ORF04123  8245和8246 保守性假拟蛋白
ORF04124  8247和8248 假拟的转运蛋白yhjV
ORF04125  8249和8250 肽ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(atp结合)
ORF04126  8251和8252 二肽转运ATP-结合蛋白dppD(atp结合)
ORF04127  8253和8254 二肽转运系统通透酶蛋白dppC(膜)
ORF04128  8255和8256 二肽转运系统通透酶蛋白dppB(通透酶)
ORF04129  8257和8258 周质二肽转运蛋白前体(DBP)
ORF04130  8259和8260 保守性假拟蛋白
ORF04131  8261和8262 膜-蛋白yhjW
ORF04132  8263和8264 推定的抗性蛋白
ORF04133  8265和8266 保守性假拟蛋白
ORF04134  8267和8268 DNA-3-甲基腺嘌呤糖基化酶I[3.2.2.20]
ORF04135  8269和8270 生物素亚砜还原酶
ORF04136  8271和8272 假拟的乙酰基转移酶yiaC(GNAT)[2.3.1.-]
ORF04137  8273和8274 可能的外膜蛋白yiaD
ORF04138  8275和8276 2-酮葡糖酸还原酶[1.1.1.215]
ORF04139  8277和8278 推定脂蛋白
ORF04140  8279和8280 推定的HTH型转录调节蛋白yiaG
ORF04141  8281和8282 冷激样蛋白
ORF04142  8283和8284 可能的膜通透性改变蛋白Z4982相关蛋白
ORF04143  8285和8286 甘氨酰-tRNA合成酶,β亚基(glyS)[6.1.1.14]
ORF04144  8287和8288 甘氨酰-tRNA合成酶,α亚基(glyQ)[6.1.1.14]
ORF04145  8289和8290 保守性假拟蛋白
ORF04146  8291和8292 酰基转移酶家族,推定的
ORF04147  8293和8294 yiaA-B二螺旋结构域家族
ORF04148  8295和8296 yiaA-B二螺旋结构域家族
ORF04149  8297和8298 木酮糖激酶(xylB)[2.7.1.17]
ORF04150  8299和8300 木糖异构酶(xylA)[5.3.1.5]
ORF04151  8301和8302 D-木糖ABC转运蛋白,周质-D木糖结合蛋白
ORF04152  8303和8304 糖ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(xylG)
ORF04153  8305和8306 糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白
ORF04154  8307和8308 木糖操纵子调节蛋白(xylR)
ORF04155  8309和8310 BAX蛋白
ORF04156  8311和8312 A-淀粉酶前体[3.2.1.1]
ORF04157  8313和8314 缬氨酸-丙酮酸氨基转移酶
ORF04158  8315和8316 电子传递蛋白hydN
ORF04159  8317和8318 IclR家族转录阻抑物
ORF04160  8319和8320 2-酮还原酶[1.1.1.-]
ORF04161  8321和8322 YiaL
ORF04162  8323和8324 YiaX1
ORF04163  8325和8326 TRAP转运蛋白,DctQ样膜蛋白超家族
ORF04164  8327和8328 C4-二羧酸转运系统通透酶大蛋白(DctM)
ORF04165  8329和8330 DctP蛋白(AP001509)
ORF04166  8331和8332 推定的糖激酶,FGGY家族[2.7.1.53]
ORF04167  8333和8334 己酮糖-6-磷酸合酶(humps)[4.1.2.-]
ORF04168  8335和8336 推定的己酮糖-6-磷酸异构酶
ORF04169  8337和8338 L-核酮糖-5-磷酸4-差向异构酶(araD)[5.1.3.4]
ORF04170  8339和8340 醛脱氢酶家族蛋白(AF029733)
ORF04171  8341和8342 Fic蛋白家族
ORF04172  8343和8344 醇脱氢酶,IV类[1.1.1.1]
ORF04173  8345和8346 硒代半胱氨酸特异性翻译延长因子(selB)
ORF04174  8347和8348 L-丝氨酰-tRNA硒转移酶(selA)[2.9.1.1]
ORF04175  8349和8350 假拟的GST样蛋白yibF
ORF04176  8351和8352 多药耐药外流泵
ORF04177  8353和8354 GTP酶
ORF04178  8355和8356 PTS系统,甘露醇特异性酶IIABC组件[2.7.1.69]
ORF04179  8357和8358 甘露醇-1-磷酸5-脱氢酶[1.1.1.17]
ORF04180  8359和8360 甘露醇操纵子阻抑物(甘露醇阻抑物蛋白)
ORF04181  8361和8362 保守性假拟蛋白
ORF04182  8363和8364 保守性假拟蛋白
ORF04183  8365和8366 保守性假拟蛋白
ORF04184  8367和8368 表面蛋白(partial)
ORF04185  8369和8370 L-乳酸通透酶
ORF04186  8371和8372 转录调节蛋白
ORF04187  8373和8374 L-乳酸脱氢酶(1ctD)[1.1.2.3]
ORF04188  8375和8376 RNA甲基转移酶,TrmH家族,2类
ORF04189  8377和8378 丝氨酸乙酰基转移酶(SAT)(SAT)[2.3.1.30]
ORF04190  8379和8380 甘油-3-磷酸脱氢酶[NAD(P)+](NAD(P)H依赖性甘油-3-磷酸脱氢酶)(gpsA)
ORF04191  8381和8382 蛋白-输出蛋白SecB(secB)
ORF04192  8383和8384 谷氧还蛋白3(grxC)
ORF04193  8385和8386 硫氰酸生成酶样结构域蛋白
ORF04194  8387和8388 2,3-双磷酸甘油酸非依赖型磷酸甘油酸变位酶(gpmI)[5.4.2.1]
ORF04195  8389和8390 膜-结合性金属肽酶
ORF04196  8391和8392 推定的糖基转移酶,2类家族蛋白[2.-.-.-]
ORF04197  8393和8394 yibQ基因产物
ORF04198  8395和8396 L-苏氨酸3-脱氢酶(tdh)[1.1.1.103]
ORF04199  8397和8398 2-氨基-3-酮丁酸辅酶A连接酶(kbl)[2.3.1.29]
ORF04200  8399和8400 ADP-L-甘油-D-甘露糖-庚糖-6-差向异构酶(rfaD)[5.1.3.20]
ORF04201  8401和8402 脂多糖庚糖基转移酶II(rfaF)
ORF04202  8403和8404 脂多糖庚糖基转移酶I(rfaC)[2.-.-.-]
ORF04203  8405和8406 脂质A-核心,表面聚合物连接酶
ORF04204  8407和8408 β-1,3-糖基转移酶[2.4.1.166]
ORF04205  8409和8410 UDP-半乳糖:(半乳糖基)LPS α-1,2-半乳糖基转移酶(糖基)[2.4.1.58]
ORF04206  8411和8412 庚糖基-II-激酶
ORF04207  8413和8414 UDP-半乳糖:(糖基)[2.4.1.58]
ORF04208  8415和8416 UDP-葡萄糖:(糖基)[2.4.1.44]
ORF04209  8417和8418 脂多糖核心生物合成蛋白rfaP
ORF04210  8419和8420 UDP-葡萄糖:(庚糖基)[2.4.1.-]
ORF04211  8421和8422 推定的脂多糖庚糖基转移酶III
ORF04212  8423和8424 3-脱氧-D-甘露糖-辛酮糖酸转移酶(KDO转移酶)(KDO)[2.-.-.-]
ORF04213  8425和8426 泛酰巯基乙胺-磷酸腺苷酰转移酶(coaD)[2.7.7.3]
ORF04214  8427和8428 甲酰胺基嘧啶-DNA糖基化酶(mutM)[3.2.2.23]
ORF04215  8429和8430 核糖体蛋白L33(rpmG)
ORF04216  8431和8432 RpmB蛋白(rpL28)
ORF04217  8433和8434 DNA修复蛋白
ORF04218  8435和8436 磷酸泛酰半胱氨酸脱羧酶-磷酸泛酸-半胱氨酸连接酶(coaBC)[4.1.1.36 6.3.2.5]
ORF04219  8437和8438 脱氧尿苷5′-三磷酸核苷酸水解酶(dut)[3.6.1.23]
ORF04220  8439和8440 Ttk蛋白
ORF04221  8441和8442 乳清酸磷酸核糖基转移酶(pyrE)[2.4.2.10]
ORF04222  8443和8444 核糖核酸酶PH(rph)[2.7.7.56]
ORF04223  8445和8446 保守性假拟蛋白TIGR00255
ORF04224  8447和8448 假拟蛋白
ORF04225  8449和8450 DNA损伤-诱导蛋白D
ORF04226  8451和8452 预测的膜蛋白
ORF04227  8453和8454 假拟的DNA连接酶样蛋白yicF
ORF04228  8455和8456 保守性假拟蛋白
ORF04229  8457和8458 鸟苷酸激酶
ORF04230  8459和8460 以DNA为指导的RNA聚合酶ω链(RNAPω亚基)(转录酶ω链)(RNA聚合酶ω亚
ORF04231  8461和8462 鸟苷-3,5-双(二磷酸)3-焦磷酸水解酶(ppGpp)
ORF04232  8463和8464 tRNA(鸟苷-2′-O-)-甲基转移酶(Gm18)[2.1.1.34]
ORF04233  8465和8466  ATP依赖性DNA解旋酶RecG(recG)[3.6.1.-]
ORF04234  8467和8468 钠-谷氨酸同向转运蛋白(gltS)
ORF04235  8469和8470 黄嘌呤-尿嘧啶通透酶家族蛋白
ORF04236  8471和8472 可能的输出蛋白
ORF04237  8473和8474 功能未知的蛋白(DUF1498)超家族
ORF04238  8475和8476 可能的NAGC样转录调节蛋白
ORF04239  8477和8478 果糖-双磷酸醛缩酶,II类家族[4.1.2.13]
ORF04240  8479和8480 果糖-双磷酸醛缩酶,II类家族[4.1.2.-]
ORF04241  8481和8482 PTS系统,IIbc组件(PTS)[2.7.1.69]
ORF04242  8483和8484 PTS系统,果糖-样-2 IIB组件1
ORF04243  8485和8486 PTS系统,EIIa组件(PTS)[2.7.1.69]
ORF04244  8487和8488 推定的转录抗终止蛋白BglG家族蛋白
ORF04245  8489和8490 f772[3.2.1.20]
ORF04246  8491和8492 类似于蜜二糖载体蛋白
ORF04247  8493和8494 RhuM(部分)
ORF04248  8495和8496 膜蛋白
ORF04249  8497和8498 脂蛋白-28前体(hlpA)
ORF04250  8499和8500 保守性假拟蛋白
ORF04251  8501和8502 推定的转运蛋白
ORF04252  8503和8504 功能未知的蛋白(DUF1198)超家族
ORF04253  8505和8506 黄嘌呤-尿嘧啶通透酶家族蛋白亚家族
ORF04254  8507和8508 腺嘌啉脱氨酶(ade)[3.5.4.2]
ORF04255  8509和8510 己醣磷酸转运蛋白
ORF04256  8511和8512 调节蛋白uhpC
ORF04257  8513和8514 传感蛋白uhpB
ORF04258  8515和8516 假拟蛋白
ORF04259  8517和8518 反应调节蛋白,uhpT转录的正激活物
ORF04260  8519和8520 推定的乙酰乳酸合酶,小亚基[2.2.1.6]
ORF04261  8521和8522 乙酰乳酸合酶,大亚基,生物合成类型(ilvB)[2.2.1.6]
ORF04262  8523和8524 多药耐药蛋白D
ORF04263  8525和8526 f165[1.-.-.-]
ORF04264  8527和8528 保守性假拟蛋白
ORF04265  8529和8530 预测的膜蛋白
ORF04266  8531和8532 可能的硫酸酯酶yidJ [3.1.6.-]
ORF04267  8533和8534 推定的硫酸酯酶yidJ[3.1.6.-]
ORF04268  8535和8536 Na+-肌醇共同转运蛋白
ORF04269  8537和8538 推定的msm操纵子调节蛋白
ORF04270  8539和8540 推定的摄钾蛋白TrkA
ORF04271  8541和8542 热激蛋白
ORF04272  8543和8544 热激蛋白
ORF04273  8545和8546 假拟蛋白
ORF04274  8547和8548 o135蛋白
ORF04275  8549和8550 f416
ORF04276  8551和8552 MFS转运蛋白,邻苯二甲酸通透酶家族
ORF04277  8553和8554 保守性假拟蛋白
ORF04278  8555和8556 扁桃酸消旋酶-粘康酸内酯化酶家族蛋白(partial)[4.2.1.6]
ORF04279  8557和8558 4-羟基-2-酮戊二酸醛缩酶-2-脱氢-3-脱氧磷酸葡糖酸[4.1.2.21]
ORF04280  8559和8560 2-脱氢-3-脱氧半乳糖酸激酶[2.7.1.58]
ORF04281  8561和8562 半乳糖酸利用的转录阻抑物(GntR家族)(AF096293)
ORF04282  8563和8564 可能的复制酶Z5187
ORF04283  8565和8566 Cof家族蛋白
ORF04284  8567和8568 功能未知的细菌蛋白(DUF937)家族
ORF04285  8569和8570 DNA促旋酶,B亚基(gyrB)[5.99.1.3]
ORF04286  8571和8572 DNA复制和修复蛋白recF[相似性]
ORF04287  8573和8574 DNA聚合酶III,β亚基(dnaN)[2.7.7.7]
ORF04288  8575和8576 染色体复制启动蛋白DnaA(dnaA)
ORF04289  8577和8578 核糖体蛋白L34(rpmH)
ORF04290  8579和8580 核糖核酸酶P蛋白组件(rnpA)[3.1.26.5]
ORF04291  8581和8582 保守性假拟蛋白TIGR00278
ORF04292  8583和8584 内膜蛋白oxaA(IMP)
ORF04293  8585和8586 tRNA修饰GTP酶TrmE(trmE)
ORF04294  8587和8588 色氨酸酶(TN酶)[4.1.99.1]
ORF04295  8589和8590 低亲和色氨酸通透酶
ORF04296  8591和8592 类似于耐药性转位酶
ORF04297  8593和8594 转录调节蛋白,LysR家族
ORF04298  8595和8596 假拟蛋白
ORF04299  8597和8598 o252
ORF04300  8599和8600 YieF(推定)
ORF04301  8601和8602 f445
ORF04302  8603和8604 推定的卤代酸脱卤酶样水解酶
ORF04303  8605和8606 保守性假拟蛋白
ORF04304  8607和8608 嘧啶特异性核苷水解酶[3.5.99.6]
ORF04305  8609和8610 推定的酯酶家族,推定
ORF04306  8611和8612 推定的木聚糖酶
ORF04307  8613和8614 f538
ORF04308  8615和8616 6-磷酸-β-葡糖苷酶bglB[3.2.1.86]
ORF04309  8617和8618 PTS系统,β-葡糖苷特异性IIABC组件
ORF04310  8619和8620 隐藏β-葡糖苷bgl操纵子抗终止蛋白
ORF04311  8621和8622 磷酸转运系统调节蛋白PhoU(phoU)
ORF04312  8623和8624 磷酸ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(pstB)[3.6.3.27]
ORF04313  8625和8626 磷酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白PstA(pstA)
ORF04314  8627和8628 磷酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白PstC(pstC)
ORF04315  8629和8630 磷酸ABC转运蛋白,磷酸-结合蛋白(pstS)
ORF04316  8631和8632 葡糖胺-果糖-6-磷酸氨基转移酶,异构化(glmS)[2.6.1.16]
ORF04317  8633和8634 UDP-N-乙酰葡糖胺焦磷酸化酶(glmU)[2.7.7.23]
ORF04318  8635和8636 ATP合酶F1,ε亚基(atpC) [3.63.14]
ORF04319  8637和8638 ATP合酶F1,β亚基(atpD)[3.6.3.14]
ORF04320  8639和8640 ATP合酶F1,γ亚基(atpG)[3.6.3.14]
ORF04321  8641和8642 ATP合酶F1,α亚基(atpA)[3.6.3.14]
ORF04322  8643和8644 ATP合酶F1,δ亚基(atpH)[3.6.3.14]
ORF04323  8645和8646 ATP合酶F0,B亚基(atpF)[3.6.3.14]
ORF04324  8647和8648 保守性假拟蛋白
ORF04325  8649和8650 ATP合酶F0,C亚基[3.6.3.14]
ORF04326  8651和8652 ATP合酶F0,A亚基(atpB)[3.6.3.14]
ORF04327  8653和8654 ATP合酶F0,I亚基(atpI)[3.6.3.14]
ORF04328  8655和8656 甲基转移酶GidB (gidB)[2.1.-.-]
ORF04329  8657和8658 葡萄糖-抑制性分裂蛋白A(gidA)
ORF04330  8659和8660 蛋白mioC(mioC)
ORF04331  8661和8662 转录调节蛋白,AsnC家族(asnC)
ORF04332  8663和8664 天冬氨酸-氨连接酶(asnA)[6.3.1.1]
ORF04333  8665和8666 保守性假拟蛋白
ORF04334  8667和8668 未命名的蛋白产物
ORF04335  8669和8670 摄钾蛋白(kup)
ORF04336  8671和8672 高亲和核糖转运蛋白rbsD
ORF04337  8673和8674 核糖ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(atp结合)
ORF04338  8675和8676 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白(rbsC)
ORF04339  8677和8678 核糖ABC转运蛋白,周质D-核糖结合蛋白
ORF04340  8679和8680 核糖激酶(rbsK)[2.7.1.15]
ORF04341  8681和8682 耐药性转运蛋白,EmrB-QacA家族
ORF04342  8683和8684 rbs操纵子的调节蛋白
ORF04343  8685和8686 ProP蛋白
ORF04344  8687和8688 yieP基因产物(AF096293)
ORF04345  8689和8690 假拟蛋白
ORF04346  8691和8692 转录调节蛋白
ORF04347  8693和8694 o137(Y1FE)
ORF04348  8695和8696 Mg螯合酶-相关蛋白
ORF04349  8697和8698 假拟蛋白
ORF04350  8699和8700 乙酰乳酸合酶,大亚基,生物合成类型(i1vB)[2.2.1.6]
ORF04351  8701和8702 乙酰乳酸合酶II短链(ALS-II)[4.1.3.18]
ORF04352  8703和8704 支链氨基酸氨基转移酶(ilvE)[2.6.1.42]
ORF04353  8705和8706 二羟酸脱水酶(ilvD)[4.2.1.9]
ORF04354  8707和8708 苏氨酸氨-裂合酶,生物合成(ilvA)[4.3.1.19]
ORF04355  8709和8710 推定的转录调节蛋白,LysR家族
ORF04356  8711和8712 酮醇-酸还原异构酶(ILVC)[1.1.1.86]
ORF04357  8713和8714 肽基脯氨酰异构酶(SPP39159)[5.2.1.8]
ORF04358  8715和8716 ATP依赖性DNA解旋酶Rep(rep)[3.6.1.-]
ORF04359  8717和8718 鸟苷-5′-三磷酸,3′-二磷酸焦磷酸酶[3.6.1.40]
ORF04360  8719和8720 rhlB蛋白(RHLB)[3.6.1.-]
ORF04361  8721和8722 硫氧还蛋白1
ORF04362  8723和8724 转录终止因子Rho(rho)
ORF04363  8725和8726 保守性假拟蛋白
ORF04364  8727和8728 十一异戊二烯基-磷酸α-N-乙酰氨基葡萄糖基1-磷酸转移酶(wecA)[2.7.8.-]
ORF04365  8729和8730 脂多糖生物合成蛋白wzzE
ORF04366  8731和8732 UDP-N-乙酰葡糖胺2-差向异构酶[5.1.3.14]
ORF04367  8733和8734 UDP-N-乙酰基-D-甘露糖胺脱氢酶(ECA)[1.1.1.-]
ORF04368  8735和8736 dTDP-葡萄糖4,6-脱水酶(rfbB)[4.2.1.46]
ORF04369  8737和8738 葡萄糖-1-磷酸胸苷酰转移酶(rfbA)[2.7.7.24]
ORF04370  8739和8740 TDP-D-墨角藻糖胺乙酰基转移酶(wecD)
ORF04371  8741和8742 脂多糖生物合成蛋白rffA(WECE)[4.2.1.-]
ORF04372  8743和8744 WzxE蛋白(WZXE)
ORF04373  8745和8746 TDP-Fuc4NAc:脂质II Fuc4Nac转移酶(wecF)[2.4.1.-]
ORF04374  8747和8748 ECA生物合成蛋白WzyE(wzyE)
ORF04375  8749和8750 可能是rffM (ECA)[2.4.1.-]
ORF04376  8751和8752 假拟蛋白
ORF04377  8753和8754 类似于几种氨基酸转运蛋白(o461)
ORF04378  8755和8756 酪氨酸重组酶XerC(xerC)
ORF04379  8757和8758 o238(YIGB)
ORF04380  8759和8760 酪氨酸重组酶XerC(xerC)
ORF04381  8761和8762 o238(YIGB)
ORF04382  8763和8764 芳基硫酸酯酶调节蛋白
ORF04383  8765和8766 芳基硫酸酯酶[3.1.6.1]
ORF04384  8767和8768 hemY蛋白(hemY)
ORF04385  8769和8770 尿卟啉原III甲基化酶(HEMX)[2.1.1.107]
ORF04386  8771和8772 尿卟啉原-III合酶(hemD)[4.2.1.75]
ORF04387  8773和8774 胆色素原脱氨酶(hemC)[2.5.1.61]
ORF04388  8775和8776 腺苷酸环化酶,I类(cyaA)[4.6.1.1]
ORF04389  8777和8778 CyaY蛋白(CYAY)
ORF04390  8779和8780 可能的输出蛋白
ORF04391  8781和8782 推定脂蛋白
ORF04392  8783和8784 假拟的脂蛋白yifL前体相关蛋白
ORF04393  8785和8786 二氨基庚二酸差向异构酶(dapF)[5.1.1.7]
ORF04394  8787和8788 功能未知的蛋白,DUF484超家族
ORF04395  8789和8790 酪氨酸重组酶XerC(xerC)
ORF04396  8791和8792 o238(YIGB)
ORF04397  8793和8794 DNA解旋酶11 (uvrD)[3.6.1.-]
ORF04398  8795和8796 功能未知的蛋白超家族
ORF04399  8797和8798 yigE蛋白
ORF04400  8799和8800 假拟蛋白
ORF04401  8801和8802 酶和钴转运蛋白CorA(corA)
ORF04402  8803和8804 肠细菌推定的膜蛋白(DUF943)超家族
ORF04403  8805和8806 保守性假拟蛋白
ORF04404  8807和8808 假拟蛋白
ORF04405  8809和8810 rarD蛋白(rarD)
ORF04406  8811和8812 f161(YIGI)
ORF04407  8813和8814 磷酸脂酶A1家族蛋白,中断[3.1.1.32]
ORF04408  8815和8816 ATP依赖性DNA解旋酶RecQ (recQ)[3.6.1.-]
ORF04409  8817和8818 苏氨酸外流蛋白
ORF04410  8819和8820 转运蛋白,LysE家族
ORF04411  8821和8822 溶血磷脂酶L2(卵磷脂酶B)(PLDB)[3.1.1.5]
ORF04412  8823和8824 Cof蛋白
ORF04413  8825和8826 HTH型转录调节蛋白metR (METR)
ORF04414  8827和8828 假拟的膜蛋白yigM
ORF04415  8829和8830 5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸-高半胱氨酸S-甲基转移酶(metE)[2.1.1.14]
ORF04416  8831和8832 保守性假拟蛋白
ORF04417  8833和8834 保守性假拟蛋白
ORF04418  8835和8836 6-磷酸-3-己酮糖异构酶(PHI)
ORF04419  8837和8838 PTS系统,葡萄糖特异性IIBC组件(ptsG)[2.7.1.69]
ORF04420  8839和8840 酮糖转移酶(tkt)[2.2.1.1]
ORF04421  8841和8842 转录调节蛋白,rpiR家族结构域蛋白
ORF04422  8843和8844 转录调节蛋白,LysR家族
ORF04423  8845和8846 推定的胞嘧啶转运蛋白
ORF04424  8847和8848 推定的酰胺酶家族蛋白
ORF04425  8849和8850 氨基甲酸激酶样蛋白yahI[2.7.2.2]
ORF04426  8851和8852 YahG-YlbE样蛋白
ORF04427  8853和8854 YahF-FdrA样蛋白
ORF04428  8855和8856 保守性假拟蛋白
ORF04429  8857和8858 异分支酸酶家族蛋白
ORF04430  8859和8860 假拟蛋白
ORF04431  8861和8862 推定的羧基亚甲基丁烯醇酶
ORF04432  8863和8864 保守性假拟蛋白
ORF04433  8865和8866 尿苷磷酸化酶(udp)[2.4.2.3]
ORF04434  8867和8868 推定的三羧酸转运蛋白TctA
ORF04435  8869和8870 保守性假拟蛋白
ORF04436  8871和8872 博尔德杆菌摄取基因(bug)产物超家族
ORF04437  8873和8874 4-羟基-2-酮戊二酸醛缩酶-2-脱氢-3-脱氧磷酸葡糖酸
ORF04438  8875和8876 2-脱氢-3-脱氧半乳糖酸激酶
ORF04439  8877和8878 转录调节蛋白,IclR家族
ORF04440  8879和8880 DNA重组蛋白rmuC
ORF04441  8881和8882 泛醌-甲基萘醌生物合成甲基转移酶ubiE(EC 2.1.1.-)(UBIE)[2.1.1.-]
ORF04442  8883和8884 未命名的蛋白产物
ORF04443  8885和8886 2-多异戊二烯基苯酚6-羟化酶(ubiB)[1.14.13.-]
ORF04444  8887和8888 o261(YIGT)
ORF04445  8889和8890 o261
ORF04446  8891和8892 Sec-非依赖型蛋白转位酶TatC(tatC)
ORF04447  8893和8894 tatD基因产物(YIGW)[3.1.21.-]
ORF04448  8895和8896 转录激活蛋白RfaH(rfaH)
ORF04449  8897和8898 3-八异戊二烯基-4-羟基苯甲酸羧基-裂合酶(名异戊二烯基对羟基苯甲酸脱羧酶)
ORF04450  8899和8900 NAD(P)H-黄素还原酶
ORF04451  8901和8902 保守性假拟蛋白
ORF04452  8903和8904 乙酰-CoAC-酰基转移酶FadA(fadA)[2.3.1.16]
ORF04453  8905和8906 脂肪酸氧化复合物,α亚基FadB(fadB)[4.2.1.17 5.3.3.8 1.1.1.35 5.1.2.3]
ORF04454  8907和8908 未命名的蛋白产物;pepQ产物,脯氨酸二肽酶(PEPQ)[3.4.13.9]
ORF04455  8909和8910 保守性假拟蛋白TIGR00257
ORF04456  8911和8912 双(5′-核苷基)-四磷酸酶,对称的-Trk系统摄钾蛋白TrkG,融合
ORF04457  8913和8914 原卟啉氧化酶
ORF04458  8915和8916 假拟蛋白
ORF04459  8917和8918 钼蝶呤-鸟嘌呤二核苷酸生物合成蛋白R(mobR)
ORF04460  8919和8920 钼蝶呤-鸟嘌呤二核苷酸生物合成蛋白A
ORF04461  8921和8922 蛋白yihD
ORF04462  8923和8924 YihE
ORF04463  8925和8926 巯基:二硫键交换蛋白dsbA前体(por)[5.3.4.1]
ORF04464  8927和8928 功能未知的细菌蛋白(DUF945)超家族
ORF04465  8929和8930 酰基转移酶结构域蛋白
ORF04466  8931和8932 DNA聚合酶I(POL I)(polA)[2.7.7.7]
ORF04467  8933和8934 细胞周期必需的GTP酶
ORF04468  8935和8936 嗜中性粒细胞蛋白
ORF04469  8937和8938 假拟蛋白
ORF04470  8939和8940 氧非依赖型粪卟啉原III氧化酶(hemN)
ORF04471  8941和8942 假拟蛋白
ORF04472  8943和8944 氮调节蛋白NR(I)(ntrC)
ORF04473  8945和8946 氮调节蛋白NR(II)[2.7.3.-]
ORF04474  8947和8948 谷氨酰胺合成酶,I型(glnA)[6.3.1.2]
ORF04475  8949和8950 A型GTP-结合蛋白(typA)
ORF04476  8951和8952 假拟蛋白
ORF04477  8953和8954 甘油-3-磷酸调节子阻抑物
ORF04478  8955和8956 假拟的糖激酶yihV
ORF04479  8957和8958 3-羟基异丁酸脱氢酶
ORF04480  8959和8960 塔格糖1,6-二磷酸醛缩酶2(塔格糖-双磷酸醛缩酶2)(D-塔格糖-1,6-双磷酸醛缩
ORF04481  8961和8962 推定的2,3-丁二醇脱氢酶
ORF04482  8963和8964 推定的主要易化蛋白家族转运蛋白,截短
ORF04483  8965和8966 主要易化蛋白家族转运蛋白
ORF04484  8967和8968 醛糖1-差向异构酶超家族
ORF04485  8969和8970 推定的卤代酸脱卤酶样水解酶
ORF04486  8971和8972 推定的核糖核酸酶BN[3.1.-.-]
ORF04487  8973和8974 D-酪氨酰-tRNA(Tyr)脱酰酶(dtd)[3.1.-.-]
ORF04488  8975和8976 保守的膜蛋白[2.3.1.18]
ORF04489  8977和8978 脂酶,GDXG家族VCA0490
ORF04490  8979和8980 转录调节蛋白,Cro-CI家族
ORF04491  8981和8982 带-螺旋-螺旋蛋白,copG家族结构域蛋白
ORF04492  8983和8984 甲酸脱氢酶辅助蛋白FdhE(fdhE)
ORF04493  8985和8986 甲酸脱氢酶,γ亚基[1.2.1.2]
ORF04494  8987和8988 甲酸脱氢酶,β亚基(FdxH)[1.2.1.2]
ORF04495  8989和8990 甲酸脱氢酶,α亚基[1.2.1.2]
ORF04496  8991和8992 甲酸脱氢酶,α亚基,含有硒代半胱氨酸[1.2.1.2]
ORF04497  8993和8994 甲酸脱氢酶家族辅助蛋白FdhD(fdhD)
ORF04498  8995和8996 保守性假拟蛋白
ORF04499  8997和8998 保守性假拟蛋白
ORF04500  8999和9000 推定的血型糖蛋白
ORF04501  9001和9002 推定的枯草杆菌(B.subtilis)YulD蛋白同源物lin2978
ORF04502  9003和9004 鼠李树胶糖-1-磷酸醛缩酶
ORF04503  9005和9006 L-鼠李糖异构酶(rhaA)[5.3.1.14]
ORF04504  9007和9008 糖激酶[2.7.1.5]
ORF04505  9009和9010 假拟蛋白
ORF04506  9011和9012 L-鼠李糖操纵子调节蛋白rhaS
ORF04507  9013和9014 rhaRS操纵子的正调节物
ORF04508  9015和9016 L-鼠李糖-质子同向转运
ORF04509  9017和9018 超氧化物岐化酶[Mn](sodA)[1.15.1.1]
ORF04510  9019和9020 保守性假拟蛋白
ORF04511  9021和9022 2-酮-3-脱氧葡糖酸转运蛋白(kdgT)
ORF04512  9023和9024 MOSC结构域蛋白
ORF04513  9025和9026 传感蛋白cpxA [2.7.3.-]
ORF04514  9027和9028 转录调节蛋白y蛋白cpxR
ORF04515  9029和9030 周质蛋白cpxP前体
ORF04516  9031和9032 蛋白p34
ORF04517  9033和9034 6-磷酸果糖激酶I
ORF04518  9035和9036 硫酸-结合蛋白前体
ORF04519  9037和9038 CDP-二酰基甘油焦磷酸酶
ORF04520  9039和9040 丙糖磷酸异构酶(tpiA)[5.3.1.1]
ORF04521  9041和9042 功能未知的蛋白(DUF1454)超家族
ORF04522  9043和9044 保守性膜蛋白
ORF04523  9045和9046 保守性假拟蛋白超家族
ORF04524  9047和9048 通用应激蛋白D(UspA)
ORF04525  9049和9050 铁氧还蛋白-NADP还原酶(DA1)[1.18.1.2]
ORF04526  9051和9052 果糖-1,6-双磷酸酶,II类(glpX)[3.1.3.11]
ORF04527  9053和9054 甘油激酶(glpK)[2.7.1.30]
ORF04528  9055和9056 甘油摄取易化蛋白(Aquaglyceroporin)(glpF)
ORF04529  9057和9058 功能未知的蛋白(DUF904)超家族
ORF04530  9059和9060 核糖核酸酶活性调节物A(rraA)
ORF04531  9061和9062 1,4-二羟基-2-萘甲酸八异戊二烯基转移酶(men A)[2.5.-.-]
ORF04532  9063和9064 热激蛋白HslVU,ATP酶亚基HslU(hslU)
ORF04533  9065和9066 HslUV蛋白酶的肽酶组件
ORF04534  9067和9068 细胞分裂蛋白FtsN(ftsN)
ORF04535  9069和9070 deo操纵子的调节蛋白,udp,cdd,tsx
ORF04536  9071和9072 引发体蛋白N′
ORF04537  9073和9074 核糖体蛋白L31rpmE)
ORF04538  9075和9076 功能未知的蛋白(DUF1105)超家族
ORF04539  9077和9078 Met阻抑物
ORF04540  9079和9080 O-琥珀酰高丝氨酸(硫醇)-裂合酶(metR)[2.5.1.48]
ORF04541  9081和9082 AKII-HDII蛋白[2.7.2.4]
ORF04542  9083和9084 核苷特异性通道形成蛋白tsx前体
ORF04543  9085和9086 推定的5-核苷酸酶家族蛋白
ORF04544  9087和9088 5′-核苷酸酶,C-末端结构域蛋白
ORF04545  9089和9090 推定的5-核苷酸酶
ORF04546  9091和9092 保守性假拟蛋白
ORF04547  9093和9094 推定的5-核苷酸酶家族蛋白
ORF04548  9095和9096 5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(metF)[1.7.99.5]
ORF04549  9097和9098 过氧化氢酶-过氧化物酶HPI(katG)[1.11.1.6]
ORF04550  9099和9100 假拟的转运蛋白yijE
ORF04551  9101和9102 功能未知的蛋白(DUF1287)超家族
ORF04552  9103和9104 保守性假拟蛋白
ORF04553  9105和9106 甘油脱氢酶(NAD)[1.1.1.6]
ORF04554  9107和9108 推定的转醛醇酶
ORF04555  9109和9110 磷酸烯醇式丙酮酸-蛋白磷酸转移酶ptsA[2.7.3.9]
ORF04556  9111和9112 PTS系统,果糖特异性IIABC组件
ORF04557  9113和9114 PTS系统,果糖-样-2 IIB组件1(磷酸转移酶II,B组件)[2.7.1.69]
ORF04558  9115和9116 丙酮酸甲酸-裂合酶[2.3.1.54]
ORF04559  9117和9118 类似于大肠杆菌丙酮酸甲酸-裂合酶活化酶
ORF04560  9119和9120 含有AraC型DNA结合域的蛋白
ORF04561  9121和9122 PTS系统果糖样IIB组件2(磷酸转移)[2.7.1.69]
ORF04562  9123和9124 完整的推定膜蛋白
ORF04563  9125和9126 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(ppc)[4.1.1.31]
ORF04564  9127和9128 乙酰鸟氨酸脱乙酰酶(ArgE)(argE)[3.5.1.16]
ORF04565  9129和9130 N-乙酰基-γ-谷氨酰胺酰-磷酸还原酶(argC)[1.2.1.38]
ORF04566  9131和9132 乙酰基谷氨酸激酶(argB)[2.7.2.8]
ORF04567  9133和9134 精氨琥珀酸裂合酶(argH)[4.3.2.1]
ORF04568  9135和9136 饥饿感受蛋白rspA
ORF04569  9137和9138 主要易化蛋白家族转运蛋白
ORF04570  9139和9140 可溶性吡啶核苷酸转氢酶(STH)[1.6.1.1]
ORF04571  9141和9142 过氧化氢-诱导基因激活物(oxyR)
ORF04572  9143和9144 马尿酸水解酶
ORF04573  9145和9146 主要易化蛋白家族转运蛋白
ORF04574  9147和9148 转录调节蛋白,TetR家族
ORF04575  9149和9150 AAA+类型的ATP酶
ORF04576  9151和9152 tRNA(尿嘧啶-5-)-甲基转移酶(trmA)[2.1.1.35]
ORF04577  9153和9154 TonB依赖性维生素B12受体(btuB)
ORF04578  9155和9156 谷氨酸消旋酶(murI)[5.1.1.3]
ORF04579  9157和9158 假拟蛋白
ORF04580  9159和9160 UDP-N-乙酰基烯醇式丙酮酰葡糖胺还原酶(murB)[1.1.1.158]
ORF04581  9161和9162 BirA双功能蛋白(BIRA)[6.3.4.15]
ORF04582  9163和9164 泛酸激酶(coaA)[2.7.1.33]
ORF04583  9165和9166 翻译延长因子EF-Tu.B
ORF04584  9167和9168 翻译延长因子EF-Tu.B
ORF04585  9169和9170 蛋白链延长因子EF-Tu
ORF04586  9171和9172 前蛋白转位酶SecE亚基(SecE)
ORF04587  9173和9174 转录终止-抗终止因子NusG(nusG)
ORF04588  9175和9176 核糖体蛋白L11(rplK)
ORF04589  9177和9178 核糖体蛋白L1(rplA)
ORF04590  9179和9180 50S核糖体亚基蛋白L10(RPLJ)
ORF04591  9181和9182 核糖体蛋白L7-L12(rplL)
ORF04592  9183和9184 以DNA-为指导的RNA聚合酶,β亚基(rpoB)[2.7.7.6]
ORF04593  9185和9186 以DNA-为指导的RNA聚合酶,β′亚基(rpoC)[2.7.7.6]
ORF04594  9187和9188 噻唑生物合成蛋白ThiH(thiH)
ORF04595  9189和9190 4-甲基-5-(β-羟乙基)噻唑单磷酸合成蛋白ThiG
ORF04596  9191和9192 硫胺生物合成蛋白ThiS(thiS)
ORF04597  9193和9194 噻唑生物合成腺苷酰转移酶ThiF(thiF)
ORF04598  9195和9196 硫胺-磷酸焦磷酸化酶(thiE)[2.5.1.3]
ORF04599  9197和9198 硫胺生物合成蛋白thiC
ORF04600  9199和9200 σD的调节蛋白
ORF04601  9201和9202 MutT-nudix家族蛋白[3.6.1.-]
ORF04602  9203和9204 尿卟啉原脱羧酶(hemE)[4.1.1.37]
ORF04603  9205和9206 内切核酸酶V(脱氧肌苷3核酸内切酶)
ORF04604  9207和9208 功能未知的蛋白,DUF超家族
ORF04605  9209和9210 DNA-结合蛋白HU-α(NS2)(HU-2)(HU)
ORF04606  9211和9212 未命名的蛋白产物
ORF04607  9213和9214 锌耐受性相关蛋白前体
ORF04608  9215和9216 HydG的传感蛋白激酶,氢化酶3活性[2.7.3.-]
ORF04609  9217和9218 转录调节蛋白zraR(σ54)
ORF04610  9219和9220 磷酸核糖基胺-甘氨酸连接酶(purD)[6.3.4.13]
ORF04611  9221和9222 双功能嘌啉生物合成蛋白PurH(purH)
ORF04612  9223和9224 保守性假拟蛋白
ORF04613  9225和9226 假拟蛋白
ORF04614  9227和9228 保守性假拟蛋白
ORF04615  9229和9230 乙酰基转移酶,GNAT家族(推定的)[2.3.1.-]
ORF04616  9231和9232 高丝氨酸O-琥珀酰转移酶(metA)[2.3.1.46]
ORF04617  9233和9234 苹果酸合酶A(aceB)[2.3.3.9]
ORF04618  9235和9236 异柠檬酸裂合酶(aceA)[4.1.3.1]
ORF04619  9237和9238 异柠檬酸脱氢酶激酶-磷酸酶(EC 3.1.3.-)(IDH激酶-磷酸酶)(IDHK-P)[2.7.1.116]
ORF04620  9239和9240 推定的转录调节蛋白
ORF04621  9241和9242 假拟蛋白
ORF04622  9243和9244 5-甲基四氢叶酸-高半胱氨酸甲基转移酶(metH)[2.1.1.13]
ORF04623  9245和9246 保守性假拟蛋白
ORF04624  9247和9248 推定的Na-Pi-共同转运蛋白II-相关蛋白
ORF04625  9249和9250 肽酶E(α-天冬氨酰二肽酶)(Asp特异性二肽酶)(二肽酶E)(α)[3.4.13.21]
ORF04626  9251和9252 L-山梨糖1-磷酸还原酶[1.1.1.-]
ORF04627  9253和9254 PTS系统,甘露糖特异性IID组件
ORF04628  9255和9256 PTS系统,甘露糖特异性IIC组件[2.7.1.69]
ORF04629  9257和9258 山梨糖-通透酶PTS系统IIB组件(EIII-MAN)[2.7.1.69]
ORF04630  9259和9260 PTS系统,山梨糖特异性IIA组件(EIIA-Sor)(山梨糖-通透酶IIA组件)(磷酸转移
ORF04631  9261和9262 D-葡糖醇-6-磷酸脱氢酶[1.1.1.140]
ORF04632  9263和9264 推定的山梨糖摄取的转录调节蛋白
ORF04633  9265和9266 RNA假尿苷酸合酶家族蛋白[4.2.1.70]
ORF04634  9267和9268 保守性假拟蛋白
ORF04635  9269和9270 天冬氨酸激酶,单功能类型[2.7.2.4]
ORF04636  9271和9272 葡萄糖-6-磷酸异构酶(pgi)[5.3.1.9]
ORF04637  9273和9274 保守性假拟蛋白
ORF04638  9275和9276 推定脂蛋白
ORF04639  9277和9278 功能未知的蛋白(DUF1017)超家族
ORF04640  9279和9280 otnG蛋白(o698)
ORF04641  9281和9282 保守性假拟蛋白
ORF04642  9283和9284 PsiE蛋白同源物
ORF04643  9285和9286 麦芽糖转运系统通透酶蛋白malG(malG)
ORF04644  9287和9288 麦芽糖转运系统通透酶蛋白malF(膜)
ORF04645  9289和9290 麦芽糖-结合性周质蛋白前体
ORF04646  9291和9292 麦芽糖-麦芽糖糊精转运ATP-结合蛋白malK
ORF04647  9293和9294 麦芽糖孔蛋白前体(麦芽糖诱导性孔蛋白)(malL)
ORF04648  9295和9296 麦芽糖操纵子周质蛋白前体(MalM)超家族
ORF04649  9297和9298 保守性假拟蛋白
ORF04650  9299和9300 分支酸裂合酶[4.-.-.-]
ORF04651  9301和9302 4-羟基苯甲酸名异戊二烯基转移酶(ubiA)[2.5.1.-]
ORF04652  9303和9304 甘油-3-磷酸O-酰基转移酶[2.3.1.15]
ORF04653  9305和9306 二酰基甘油激酶(DGK)[2.7.1.107]
ORF04654  9307和9308 LexA阻抑物(1exA)[3.4.21.88]
ORF04655  9309和9310 DNA损伤-诱导蛋白F,截短
ORF04656  9311和9312 蛋白yjbJ-相关蛋白
ORF04657  9313和9314 摄锌调节蛋白
ORF04658  9315和9316 tRNA-二氢尿苷合酶A[1.-.-.-]
ORF04659  9317和9318 保守性假拟蛋白
ORF04660  9319和9320 醌氧化还原酶
ORF04661  9321和9322 推定的氧化还原酶
ORF04662  9323和9324 代谢物-质子同向转运蛋白
ORF04663  9325和9326 烯酰基-CoA水合酶-异构酶家族蛋白
ORF04664  9327和9328 推定的乙酰-CoA-转移酶亚基[2.8.3.-]
ORF04665  9329和9330 LACI-家族转录调节蛋白
ORF04666  9331和9332 复制性DNA解旋酶(dnaB)[3.6.1.-]
ORF04667  9333和9334 丙氨酸消旋酶(alr)[5.1.1.1]
ORF04668  9335和9336 推定的转运蛋白
ORF04669  9337和9338 NadR同源物
ORF04670  9339和9340 芳族-氨基酸氨基转移酶
ORF04671  9341和9342 2-酮戊二酸脱氢酶,E1组件(sucA)[1.2.4.2]
ORF04672  9343和9344 2-酮戊二酸脱氢酶,E2组件,二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶(sucB)[2.3.1.61]
ORF04673  9345和9346 二氢硫辛酰胺脱氢酶(lpdA)[1.8.1.4]
ORF04674  9347和9348 琥珀酰-CoA合成酶β链(AF326913)[6.2.1.5]
ORF04675  9349和9350 琥珀酰-CoA合成酶α链[6.2.1.5]
ORF04676  9351和9352 阴离子转运蛋白家族蛋白
ORF04677  9353和9354 双组件反应调节蛋白
ORF04678  9355和9356 推定的乳酸脱氢酶
ORF04679  9357和9358 推定的转运传感蛋白
ORF04680  9359和9360 HAD超家族(亚家族IIIB)磷酸酶,TIGR01672(AphA)[3.1.3.-]
ORF04681  9361和9362 保守性假拟蛋白TIGR00149
ORF04682  9363和9364 蛋白yjbR
ORF04683  9365和9366 外切核酸酶ABC,A亚基(uvrA)
ORF04684  9367和9368 ssDNA-结合蛋白
ORF04685  9369和9370 保守性假拟蛋白
ORF04686  9371和9372 EAL结构域蛋白
ORF04687  9373和9374 调节蛋白soxS
ORF04688  9375和9376 氧化还原-敏感性转录激活物SoxR(soxR)
ORF04689  9377和9378 黄嘌呤-尿嘧啶通透酶家族蛋白
ORF04690  9379和9380 Na+-H+反向转运蛋白
ORF04691  9381和9382 转录调节蛋白,LysR家族,推定的
ORF04692  9383和9384 保守性假拟蛋白
ORF04693  9385和9386 胞壁质水解酶输出蛋白
ORF04694  9387和9388 LrgB-样家族超家族
ORF04695  9389和9390 钠、溶质同向转运蛋白家族蛋白(PutP)
ORF04696  9391和9392 功能未知的蛋白,DUF485超家族
ORF04697  9393和9394 乙酸-CoA连接酶(acsA)[6.2.1.1]
ORF04698  9395和9396 亚硝酸还原酶(细胞色素;氨形成性)(nrfA)[1.7.2.2]
ORF04699  9397和9398 甲酸依赖性亚硝酸还原酶NrfB
ORF04700  9399和9400 NrfC蛋白(NrfC)[1.-.-.-]
ORF04701  9401和9402 NrfD蛋白(NrfD)[1.-.-.-]
ORF04702  9403和9404 细胞色素c型生物合成蛋白CcmF(ccmF)
ORF04703  9405和9406 甲酸依赖性亚硝酸还原酶
ORF04704  9407和9408 甲酸依赖性亚硝酸还原酶复合物nrfG亚基(nrfF)
ORF04705  9409和9410 保守性假拟蛋白
ORF04706  9411和9412 谷氨酸-天冬氨酸同向转运蛋白(gltP)
ORF04707  9413和9414 保守性假拟蛋白
ORF04708  9415和9416 ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白
ORF04709  9417和9418 ABC转运蛋白,核苷酸结合性-ATP酶蛋白[dipeptide]
ORF04710  9419和9420 ABC转运蛋白,通透酶蛋白(AE006058)
ORF04711  9421和9422 ABC转运蛋白通透酶蛋白(AE005357)
ORF04712  9423和9424 ABC转运蛋白,周质寡-二肽-镍结合蛋白(AE005357)
ORF04713  9425和9426 甲酸脱氢酶,α亚基[1.2.1.2]
ORF04714  9427和9428 推定的甲酸脱氢酶,α亚基[1.2.1.2]
ORF04715  9429和9430 匹配PS00443:谷氨酰胺酰胺基转移酶IJ类活化位点;类似于洋葱假单胞菌
ORF04716  9431和9432 萎蔫酸抗性蛋白保守区家族
ORF04717  9433和9434 推定的HlyD家族分泌蛋白
ORF04718  9435和9436 保守性假拟蛋白
ORF04719  9437和9438 金属-β-内酰胺酶超家族蛋白
ORF04720  9439和9440 推定的葡糖激酶(EC 2.7.1.2)[2.7.1.2]
ORF04721  9441和9442 核酮糖-磷酸3-差向异构酶(rpe)[5.1.3.1]
ORF04722  9443和9444 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白(通透酶)
ORF04723  9445和9446 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白(ECOWU89)
ORF04724  9447和9448 D-阿洛糖转运ATP-结合蛋白alsA(醛糖)
ORF04725  9449和9450 假拟蛋白
ORF04726  9451和9452 D-阿洛糖-结合性周质蛋白前体(ALBP)
ORF04727  9453和9454 推定的转录调节蛋白
ORF04728  9455和9456 假拟蛋白
ORF04729  9457和9458 核糖5-磷酸异构酶B(rpiB)[5.3.1.6]
ORF04730  9459和9460 保守性假拟蛋白
ORF04731  9461和9462 PhnP蛋白(phnp)
ORF04732  9463和9464 PhnO蛋白
ORF04733  9465和9466 膦酸代谢蛋白-1,5-双磷酸激酶(PRPP-形成)PhnN(phnN)
ORF04734  9467和9468 膦酸代谢蛋白PhnM(phnM)
ORF04735  9469和9470 膦酸C-P裂合酶系统蛋白PhnL(phnL)
ORF04736  9471和9472 膦酸C-P裂合酶系统蛋白PhnK(phnK)
ORF04737  9473和9474 膦酸代谢蛋白PhnJ
ORF04738  9475和9476 细菌膦酸代谢蛋白(PhnI)
ORF04739  9477和9478 细菌膦酸代谢蛋白(PhnH)
ORF04740  9479和9480 PhnG蛋白
ORF04741  9481和9482 膦酸代谢转录调节蛋白PhnF(phnF)
ORF04742  9483和9484 Pn转运蛋白的膜通道蛋白组件
ORF04743  9485和9486 推定的膦酸ABC转运蛋白,底物-结合蛋白
ORF04744  9487和9488 膦酸ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(phnC)
ORF04745  9489和9490 PhnB蛋白
ORF04746  9491和9492 烷基膦酸利用操纵子蛋白PhnA
ORF04747  9493和9494 保守性假拟蛋白
ORF04748  9495和9496 保守性假拟蛋白
ORF04749  9497和9498 氨基酸MFS转运蛋白(PPII)
ORF04750  9499和9500 传感蛋白basS-pmrB
ORF04751  9501和9502 转录调节蛋白basR-pmrA
ORF04752  9503和9504 预测的膜-结合性,金属依赖性水解酶
ORF04753  9505和9506 精氨酸-鲱精胺反向转运蛋白
ORF04754  9507和9508 HTH型转录调节蛋白adiY
ORF04755  9509和9510 精氨酸脱羧酶[4.1.1.19]
ORF04756  9511和9512 精氨酸脱羧酶adi,生物降解性(ldc)[4.1.1.19]
ORF04757  9513和9514 蜜二糖操纵子调节蛋白(AF049243)
ORF04758  9515和9516 推定的糖基水解酶,家族4[3.2.1.22]
ORF04759  9517和9518 推定膜蛋白
ORF04760  9519和9520 I类延胡索酸水合酶,厌氧性[4.2.1.2]
ORF04761  9521和9522 厌氧性C4-二羧酸膜转运蛋白
ORF04762  9523和9524 保守性假拟蛋白
ORF04763  9525和9526 反应调节蛋白VC1604(部分)
ORF04764  9527和9528 传感蛋白dcuS[2.7.3.-]
ORF04765  9529和9530 假拟蛋白
ORF04766  9531和9532 YjdI样蛋白
ORF04767  9533和9534 乙酰基转移酶,GNAT家族(GNAT)
ORF04768  9535和9536 酪氨酰-tRNA合成酶(1ysS)[6.1.1.6]
ORF04769  9537和9538 PTR2-家族转运蛋白STY0750(POT)
ORF04770  9539和9540 CadA(1dc)[4.1.1.18]
ORF04771  9541和9542 赖氨酸-尸胺的转运
ORF04772  9543和9544 转录激活物
ORF04773  9545和9546 假拟蛋白
ORF04774  9547和9548 推定的转录调节蛋白,TetR家族结构域蛋白
ORF04775  9549和9550 巯基:二硫键交换蛋白dsbD前体(dsbD)[1.8.1.8]
ORF04776  9551和9552 二甲阳离子耐受蛋白细胞色素c生物合成
ORF04777  9553和9554 厌氢性C4-二羧酸转运蛋白dcuA(DcuA)
ORF04778  9555和9556 天冬氨酸氨-裂合酶(aspA)[4.3.1.1]
ORF04779  9557和9558 噬菌体T7的F排除的抑制蛋白
ORF04780  9559和9560 氨基酸通透酶超家族
ORF04781  9561和9562 侣伴蛋白,10 kDa(groES)
ORF04782  9563和9564 侣伴蛋白GroEL(groL)
ORF04783  9565和9566 保守性假拟蛋白
ORF04784  9567和9568 保守性假拟蛋白
ORF04785  9569和9570 赖氨酸2;3-氨基变位酶
ORF04786  9571和9572 翻译延长因子P(efp)
ORF04787  9573和9574 Entericidin B前体相关蛋白
ORF04788  9575和9576 Entericidin B前体相关蛋白
ORF04789  9577和9578 SugEL
ORF04790  9579和9580 外膜脂蛋白blc前体
ORF04791  9581和9582 β-内酰胺酶
ORF04792  9583和9584 延胡索酸还原酶,厌氧性,膜锚定多肽
ORF04793  9585和9586 延胡索酸还原酶亚基C(延胡索酸还原酶15 kDa疏水性蛋白)(frdC)[1.3.99.1]
ORF04794  9587和9588 延胡索酸还原酶,厌氧性,铁硫蛋白亚基
ORF04795  9589和9590 延胡索酸还原酶,黄蛋白亚基(frdA)[1.3.99.1]
ORF04796  9591和9592 酪氨酰-tRNA合成酶相关蛋白GenX
ORF04797  9593和9594 氨基酸通透酶
ORF04798  9595和9596 保守性假拟蛋白
ORF04799  9597和9598 保守性假拟蛋白
ORF04800  9599和9600 未命名的蛋白产物
ORF04801  9601和9602 磷脂酰丝氨酸脱羧酶磷酸脂质合成
ORF04802  9603和9604 预测的GTP酶
ORF04803  9605和9606 寡核糖核酸酶
ORF04804  9607和9608 未命名的蛋白产物
ORF04805  9609和9610 预测的糖激酶
ORF04806  9611和9612 保守性假拟蛋白TIGR00150
ORF04807  9613和9614 N-乙酰胞壁酰-1-丙氨酸酰胺酶II胞壁质水解酶
ORF04808  9615和9616 DNA错配修复蛋白mutL
ORF04809  9617和9618 tRNAδ(2)-异戊烯基焦磷酸转移酶(miaA)[2.5.1.8]
ORF04810  9619和9620 宿主因子I(HF-I)
ORF04811  9621和9622 GTP-结合蛋白hflX
ORF04812  9623和9624 HflK蛋白(hflK)[3.4.-.-]
ORF04813  9625和9626 HflC蛋白(hflC)
ORF04814  9627和9628 假拟蛋白
ORF04815  9629和9630 保守性假拟蛋白
ORF04816  9631和9632 假拟蛋白
ORF04817  9633和9634 腺苷酸基琥珀酸合成酶(purA)[6.3.4.4]
ORF04818  9635和9636 预测的转录调节蛋白
ORF04819  9637和9638 核糖核酸酶R(rnr)[3.1.-.-]
ORF04820  9639和9640 RNA甲基转移酶,TrmH家族,3类
ORF04821  9641和9642 保守性假拟蛋白
ORF04822  9643和9644 PspA-IM30家族蛋白
ORF04823  9645和9646 保守性假拟蛋白
ORF04824  9647和9648 预测的膜蛋白(o132)
ORF04825  9649和9650 功能未知的蛋白(DUF1190)超家族
ORF04826  9651和9652 谷胱甘肽基精胺合酶(O386)
ORF04827  9653和9654 fadE8
ORF04828  9655和9656 功能未知的蛋白(DUF1471)超家族
ORF04829  9657和9658 功能未知的蛋白(DUF1471)家族
ORF04830  9659和9660 α-β超家族的水解酶(推定的)
ORF04831  9661和9662 推定的转录调节蛋白,DeoR家族
ORF04832  9663和9664 预测的β-内酰胺酶折叠的Zn依赖性水解酶
ORF04833  9665和9666 推定的糖特异性通透酶,SgaT-UlaA超家族,推定
ORF04834  9667和9668 推定的PTS系统的IIB蛋白
ORF04835  9669和9670 蛋白-Npi-磷酸组氨酸-糖磷酸转移酶(Ntr-type)[2.7.1.69]
ORF04836  9671和9672 己酮糖-6-磷酸合酶(humps)
ORF04837  9673和9674 己酮糖-6-磷酸异构酶,推定的
ORF04838  9675和9676 AraD
ORF04839  9677和9678 功能未知的蛋白(DUF1471)超家族
ORF04840  9679和9680 30S核糖体蛋白(rpS6)
ORF04841  9681和9682 单链结合蛋白家族
ORF04842  9683和9684 核糖体蛋白S18(rpsR)
ORF04843  9685和9686 核糖体蛋白L9(rplI)
ORF04844  9687和9688 保守性假拟蛋白
ORF04845  9689和9690 推定的MFS转运蛋白,邻苯二甲酸通透酶家族
ORF04846  9691和9692 推定的氧化还原酶
ORF04847  9693和9694 推定的乙酰-CoA-转移酶亚基
ORF04848  9695和9696 推定的烯酰基-CoA水合酶-异构酶FadB1x[4.2.1.55]
ORF04849  9697和9698 3-脱氢莽草酸脱水酶
ORF04850  9699和9700 保守性假拟蛋白
ORF04851  9701和9702 3-氧代酰基-(酰基-载体-蛋白)还原酶
ORF04852  9703和9704 不透明性相关蛋白A超家族
ORF04853  9705和9706 推定的保守蛋白
ORF04854  9707和9708 FKBP型22 kDa肽基脯氨酰顺反异构酶(旋转异构酶)[5.2.1.8]
ORF04855  9709和9710 D-丝氨酸-D-丙氨酸-甘氨酸转运蛋白
ORF04856  9711和9712 推定的ScdA蛋白
ORF04857  9713和9714 完整的膜蛋白(f324)
ORF04858  9715和9716 保守性假拟蛋白
ORF04859  9717和9718 预测的转录调节蛋白s
ORF04860  9719和9720 2′,3′-环-核苷酸2′-磷酸二酯酶(cpdB)[3.1.4.16]
ORF04861  9721和9722 保守性假拟蛋白YtfJ-家族,TIGR01626
ORF04862  9723和9724 3′(2′),5′-双磷酸核苷酸酶(cysQ)[3.1.3.7]
ORF04863  9725和9726 功能未知的蛋白(DUF1107)超家族
ORF04864  9727和9728 假拟的UPF0053蛋白ytfL
ORF04865  9729和9730 肽甲硫氨酸亚砜还原酶
ORF04866  9731和9732 未命名的蛋白产物
ORF04867  9733和9734 功能未知的家族(DUF490)家族
ORF04868  9735和9736 假拟的UPF0131蛋白ytfP
ORF04869  9737和9738 无机焦磷酸酶(ppa)[3.6.1.1]
ORF04870  9739和9740 周质核糖结合蛋白
ORF04871  9741和9742 ABC转运蛋白的ATP结合蛋白
ORF04872  9743和9744 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白VCA0129
ORF04873  9745和9746 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白
ORF04874  9747和9748 果糖-1,6-双磷酸酶(fbp)[3.1.3.11]
ORF04875  9749和9750 保守性假拟蛋白
ORF04876  9751和9752 UDP-N-乙酰基胞壁酸:L-丙氨酰-γ-D-谷氨酰胺酰-间-二氨基庚二酸连接酶(mpl)
ORF04877  9753和9754 假拟的UPF0307蛋白yjgA(x96蛋白)
ORF04878  9755和9756 PmbA蛋白(pmbA)
ORF04879  9757和9758 可溶性细胞色素b562前体(562)
ORF04880  9759和9760 厌氧性核糖核苷-三磷酸还原酶活化蛋白(EC 1.97.1.4)(III类厌氧性核糖核苷酸
ORF04881  9761和9762 厌氧性核糖核苷-三磷酸还原酶[1.17.4.2]
ORF04882  9763和9764 假拟蛋白
ORF04883  9765和9766 α,α-磷酸海藻糖酶(treC)[3.2.1.93]
ORF04884  9767和9768 PTS系统,海藻糖特异性IIBC组件(trep)[2.7.1.69]
ORF04885  9769和9770 海藻糖操纵子阻抑物(treR)
ORF04886  9771和9772 镁-转位P型ATP酶(mgtA)[3.6.3.2]
ORF04887  9773和9774 推定的内切核糖核酸酶L-PSP
ORF04888  9775和9776 天冬氨酸氨基甲酰转移酶,调节亚基(pyrI)
ORF04889  9777和9778 天冬氨酸氨基甲酰转移酶(pyrB)[2.1.3.2]
ORF04890  9779和9780 精氨酸阻抑物
ORF04891  9781和9782 推定膜蛋白
ORF04892  9783和9784 鸟氨酸氨基甲酰转移酶(argF)[2.1.3.3]
ORF04893  9785和9786 氨基甲酸激酶(arcC)[2.7.2.2]
ORF04894  9787和9788 精氨酸脱亚胺酶(arcA)[3.5.3.6]
ORF04895  9789和9790 蛋白yjgK
ORF04896  9791和9792 鸟氨酸氨基甲酰转移酶(argF)[2.1.3.3]
ORF04897  9793和9794 蛋白
ORF04898  9795和9796 假拟蛋白
ORF04899  9797和9798 乙酰基转移酶,GNAT家族
ORF04900  9799和9800 可能的内膜蛋白STY4813
ORF04901  9801和9802 缬氨酰-tRNA合成酶(valS)[6.1.1.9]
ORF04902  9803和9804 DNA聚合酶III,chi亚基[2.7.7.7]
ORF04903  9805和9806 胞浆氨基肽酶(亮氨酸氨基肽酶)(LAP)(亮氨酰氨基肽酶)(氨基肽酶A-I)(LAP)
ORF04904  9807和9808 保守性假拟蛋白
ORF04905  9809和9810 未命名的蛋白产物
ORF04906  9811和9812 假拟蛋白
ORF04907  9813和9814 预测的通透酶
ORF04908  9815和9816 保守性ATP-结合蛋白
ORF04909  9817和9818 L-艾杜糖酸调节蛋白(gnt)
ORF04910  9819和9820 Gnt-II系统L-艾杜糖酸转运蛋白
ORF04911  9821和9822 可能的葡糖酸5-脱氢酶氧化还原酶蛋白[1.1.1.69]
ORF04912  9823和9824 2,3-丁二醇脱氢酶[1.1.1.264]
ORF04913  9825和9826 耐热性葡糖酸激酶[2.7.1.12]
ORF04914  9827和9828 NADP依赖性醇脱氢酶[1.1.1.-]
ORF04915  9829和9830 整合酶
ORF04916  9831和9832 CJJ蛋白
ORF04917  9833和9834 β蛋白
ORF04918  9835和9836 极性抑制蛋白(琥珀突变抑制蛋白)
ORF04919  9837和9838 转移活化蛋白
ORF04920  9839和9840 糖蛋白3(荚膜尺寸决定蛋白)
ORF04921  9841和9842 噬菌体DNA结合蛋白
ORF04922  9843和9844 未命名的蛋白产物;cI基因产物(AA 1-137)
ORF04923  9845和9846 保守性假拟蛋白
ORF04924  9847和9848 保守性假拟蛋白
ORF04925  9849和9850 噬菌体P4 DNA引发酶[2.7.7.-]
ORF04926  9851和9852 假拟蛋白
ORF04927  9853和9854 假拟蛋白
ORF04928  9855和9856 ATP依赖性蛋白酶La
ORF04929  9857和9858 保守性假拟蛋白
ORF04930  9859和9860 保守性假拟蛋白
ORF04931  9861和9862 未命名的蛋白产物;ORF616
ORF04932  9863和9864 Kelch基序结构域蛋白
ORF04933  9865和9866 寡半乳糖醛酸特异性孔蛋白(KdgM)超家族
ORF04934  9867和9868 FimB蛋白
ORF04935  9869和9870 参与相变异调节物的重组酶
ORF04936  9871和9872 1型菌毛蛋白fimA前体
ORF04937  9873和9874 菌毛蛋白
ORF04938  9875和9876 侣伴蛋白蛋白fimC前体
ORF04939  9877和9878 外膜传达蛋白fimD前体
ORF04940  9879和9880 FimF蛋白前体
ORF04941  9881和9882 菌毛形态
ORF04942  9883和9884 FimH
ORF04943  9885和9886 甘露糖酸脱水酶(uxuA)[4.2.1.8]
ORF04944  9887和9888 D-甘露糖酸氧化还原酶[1.1.1.57]
ORF04945  9889和9890 uxu操纵子的调节蛋白
ORF04946  9891和9892 功能未知的蛋白(DUF1316)亚家族
ORF04947  9893和9894 磷酸烯醇式丙酮酸-蛋白磷酸转移酶,EI-HPr-EIIA组件
ORF04948  9895和9896 二羟丙酮激酶,L亚基[2.7.1.-]
ORF04949  9897和9898 二羟丙酮激酶,DhaK亚基(dhaK)[2.7.1.-]
ORF04950  9899和9900 假拟蛋白
ORF04951  9901和9902 甘油脱氢酶CgrD(NAD)[1.1.1.6]
ORF04952  9903和9904 推定的转运蛋白CgxT
ORF04953  9905和9906 侵袭蛋白IbeA
ORF04954  9907和9908 胆碱-甘氨酸甜菜碱转运蛋白
ORF04955  9909和9910 甘油酸激酶[2.7.1.31]
ORF04956  9911和9912 2-羟基-3-氧代丙酸还原酶[1.1.1.60]
ORF04957  9913和9914 羟基丙酮酸异构酶[5.3.1.22]
ORF04958  9915和9916 假拟蛋白
ORF04959  9917和9918 乙醛酸聚醛酶[4.1.1.47]
ORF04960  9919和9920 乙醛酸聚醛酶[4.1.1.47]
ORF04961  9921和9922 NtrC家族转录调节蛋白,ATP酶结构域
ORF04962  9923和9924 侵袭蛋白IbeA
ORF04963  9925和9926 假拟蛋白
ORF04964  9927和9928 Na+-H+反向转运蛋白NhaC(nhaC)
ORF04965  9929和9930 假拟的转录调节蛋白yjiE
ORF04966  9931和9932  假拟蛋白
ORF04967  9933和9934  异天冬氨酰二肽酶(iadA)[3.4.19.-]
ORF04968  9935和9936  未表征的膜蛋白
ORF04969  9937和9938  核苷识别结构域蛋白
ORF04970  9939和9940  RNA 2′-磷酸转移酶,Tptl-KptA家族结构域蛋白
ORF04971  9941和9942  保守性假拟蛋白
ORF04972  9943和9944  推定膜蛋白
ORF04973  9945和9946  SrgB
ORF04974  9947和9948  保守性假拟蛋白
ORF04975  9949和9950  2-羟基戊二酰基-CoA脱水酶的激活物(HSP70-类ATP酶结构域)
ORF04976  9951和9952  2-羟基戊二酰基-CoA脱水酶亚基β同源物
ORF04977  9953和9954  功能未知的蛋白(DUF445)超家族
ORF04978  9955和9956  转座酶
ORF04979  9957和9958  保守性蛋白
ORF04980  9959和9960  保守性假拟蛋白
ORF04981  9961和9962  I型限制性酶EcoKI特异性蛋白(S蛋白)(S.EcoKI)[3.1.21.3]
ORF04982  9963和9964  I型限制性酶EcoKI M蛋白(M.EcoKI)[2.1.1.72]
ORF04983  9965和9966  I型限制性酶EcoKI R蛋白(R.EcoKI)[3.1.21.3]
ORF04984  9967和9968  Mrr限制性系统蛋白(EcoKMrr)
ORF04985  9969和9970  CobW-P47K家族蛋白结构域蛋白
ORF04986  9971和9972  未表征的小蛋白
ORF04987  9973和9974  YjiY
ORF04988  9975和9976  接受甲基的趋化性蛋白I(MCP-I)(丝氨酸化学受体蛋白)(MCP-I)
ORF04989  9977和9978  C4-二羧酸转运蛋白大亚基(DctM)
ORF04990  9979和9980  TRAP转运蛋白,DctQ样膜蛋白超家族
ORF04991  9981和9982  DctP蛋白
ORF04992  9983和9984  Na+-H+反向转运蛋白
ORF04993  9985和9986  yjjM基因产物
ORF04994  9987和9988  推定的山梨糖醇脱氢酶[1.1.1.14]
ORF04995  9989和9990  假拟蛋白
表2-142种优选抗原
ORF00010    ORF00017    ORF00029    ORF00041    ORF00130    ORF00250
ORF00251    ORF00252    ORF00332    ORF00333    ORF00342    ORF00353
ORF00394    ORF00405    ORF00469    ORF00631    ORF00773    ORF00905
ORF00908    ORF01034    ORF01037    ORF01056    ORF01090    ORF01103
ORF01104    ORF01108    ORF01115    ORF01118    ORF01119    ORF01194
ORF01202    ORF01207    ORF01208    ORF01214    ORF01228    ORF01236
ORF01337    ORF01338    ORF01339    ORF01340    ORF01341    ORF01342
ORF01344    ORF01348    ORF01349    ORF01350    ORF01351    ORF01365
ORF01371    ORF01462    ORF01477    ORF01491    ORF01503    ORF01506
ORF01589    ORF01590    ORF01592    ORF01656    ORF01660    ORF01705
ORF01722    ORF01723    ORF01855    ORF01932    ORF02307    ORF02314
ORF02392    ORF02412    ORF02424    ORF02470    ORF02554    ORF02735
ORF02816    ORF02828    ORF02829    ORF02830    ORF02831    ORF02832
ORF02833    ORF02834    ORF02847    ORF02866    ORF02868    ORF02878
ORF02888    ORF03011    ORF03020    ORF03021    ORF03025    ORF03044
ORF03166    ORF03174    ORF03176    ORF03235    ORF03252    ORF03262
ORF03300    ORF03348    ORF03349    ORF03364    ORF03459    ORF03501
ORF03504    ORF03507    ORF03512    ORF03515    ORF03516    ORF03517
ORF03518    ORF03519    ORF03520    ORF03522    ORF03535    ORF03539
ORF03540    ORF03541    ORF03542    ORF03575    ORF03576    ORF03579
ORF03580    ORF03613    ORF04162    ORF04163    ORF04184    ORF04203
ORF04204    ORF04282    ORF04390    ORF04391    ORF04402    ORF04477
ORF04608    ORF04693    ORF04694    ORF04844    ORF04845    ORF04849
ORF04851    ORF04922    ORF04924    ORF04925
胞质定位:ORF00252、ORF01056、ORF01337、ORF01341、ORF01344、ORF01348、ORF01371、
ORF01477、ORF02424、ORF02833、ORF03348、ORF03504、ORF03542、ORF04162、ORF04844.
内膜定位:ORF00010、ORF00017、ORF00029、ORF00041、ORF00130、ORF00332、ORF00333、
ORF00342、ORF00353、ORF00394、ORF00405、ORF00631、ORF00773、ORF00905、ORF01034、
ORF01037、ORF01090、ORF01103、ORF01104、ORF01108、ORF01115、ORF01118、ORF01119、
ORF01194、ORF01202、ORF01207、ORF01208、ORF01214、ORF01338、ORF01339、ORF01349、
ORF01350、ORF01365、ORF01462、ORF01491、ORF01503、ORF01506、ORF01590、ORF01705、
ORF01722、ORF01723、ORF01855、ORF01932、ORF02314、ORF02392、ORF02412、ORF02470、
ORF02554、ORF02735、ORF02847、ORF02868、ORF02878、ORF02888、ORF03020、ORF03021、
ORF03025、ORF03044、ORF03174、ORF03176、ORF03235、ORF03300、ORF03349、ORF03364、
ORF03459、ORF03501、ORF03507、ORF03512、ORF03519、ORF03520、ORF03535、ORF03539、
ORF03540、ORF03575、ORF03576、ORF03579、ORF03580、ORF04163、ORF04184、ORF04203、
ORF04204、ORF04402、ORF04477、ORF04608、ORF04693、ORF04694、ORF04845、ORF04849、
ORF04851、ORF04922、ORF04924、ORF04925.
外膜定位:ORF00250、ORF00251、ORF00469、ORF01228、ORF01236、ORF01340、ORF01342、
ORF01351、ORF01592、ORF01656、ORF02829、ORF02831、ORF02834、ORF03166、ORF03517、
ORF03613、ORF04282.
周质定位:ORF00908、ORF01589、ORF01660、ORF02307、ORF02816、ORF02828、ORF02830、
ORF02832、ORF02866、ORF03011、ORF03252、ORF03262、ORF03515、ORF03516、ORF03518、
ORF03522、ORF03541、ORF04390、ORF04391
表3-与共生菌株同源性低
ORF00010、ORF00016、ORF00017、ORF00018、ORF00019、ORF00020、ORF00025、
ORF00028、ORF00029、ORF00030、ORF00031、ORF00032、ORF00034、ORF00035、
ORF00036、ORF00037、ORF00041、ORF00042、ORF00043、ORF00044、ORF00045、
ORF00046、ORF00047、ORF00048、ORF00049、ORF00050、ORF00051、ORF00052、
ORF00053、ORF00054、ORFO0055、ORF00056、ORF00057、ORF00058、ORF00059、
ORF00060、ORF00061、ORF00062、ORF00064、ORF00065、ORF00066、ORF00067、
ORF00068、ORF00069、ORF00070、ORF00089、ORF00090、ORF00106、ORF00107、
ORF00119、ORF00120、ORF00121、ORF00130、ORF00134、ORF00150、ORF00151、
ORF00152、ORF00163、ORF00169、ORF00198、ORF00222、ORF00223、ORF00224、
ORF00225、ORF00226、ORF00231、ORF00232、ORF00233、ORF00250、ORF00251、
ORF00252、ORF00253、ORF00254、ORF00255、ORF00256、ORF00257、ORF00330、
ORF00331、ORF00332、ORF00333、ORF00334、ORF00335、ORF00336、ORF00337、
ORF00338、ORF00339、ORF00340、ORF00341、ORF00342、ORF00343、ORF00344、
ORF00345、ORF00346、ORF00347、ORF00348、ORF00349、ORF00350、ORF00351、
ORF00352、ORF00353、ORF00361、ORF00379、ORF00380、ORF00381、ORF00382、
ORF00383、ORF00394、ORF00395、ORF00396、ORF00397、ORF00399、ORF00400、
ORF00401、ORF00402、ORF00403、ORF00404、ORF00407、ORF00415、ORF00416、
ORF00417、ORF00418、ORF00419、ORF00433、ORF00434、ORF00435、ORF00436、
ORF00437、ORF00442、ORF00444、ORF00455、ORF00587、ORF00588、ORF00591、
ORF00597、ORF00598、ORF00599、ORF00600、ORF00631、ORF00644、ORF00646、
ORF00647、ORF00648、ORF00649、ORF00650、ORF00655、ORF00656、ORF00657、
ORF00659、ORF00660、ORF00661、ORF00662、ORF00663、ORF00664、ORF00665、
ORF00666、ORF00667、ORF00668、ORF00669、ORF00670、ORF00671、ORF00672、
ORF00673、ORF00674、ORF00675、ORF00676、ORF00677、ORF00678、ORF00680、
ORF00681、ORF00682、ORF00683、ORF00685、ORF00687、ORF00773、ORF00786、
ORF00787、ORF00788、ORF00789、ORF00790、ORF00791、ORF00792、ORF00793、
ORF00794、ORF00795、ORF00796、ORF00798、ORF00803、ORF00804、ORF00809、
ORF00810、ORF00838、ORF00839、ORF00857、ORF00864、ORF00883、ORF00884、
ORF00885、ORF00886、ORF00887、ORF00888、ORF00889、ORF00890、ORF00891、
ORF00892、ORF00893、ORF00894、ORF00895、ORF00896、ORF00897、ORF00898、
ORF00899、ORF00900、ORF00901、ORF00902、ORF00903、ORF00904、ORF00905、
ORF00906、ORF00907、ORF00908、ORF00909、ORF00910、ORF00924、ORF00925、
ORF00926、ORF00948、ORF00956、ORF01031、ORF01032、ORF01033、ORF01034、
ORF01035、ORF01036、ORF01037、ORF01038、ORF01039、ORF01040、ORF01041、
ORF01042、ORF01043、ORF01044、ORF01045、ORF01046、ORF01047、ORF01048、
ORF01052、ORF01053、ORF01054、ORF01055、ORF01056、ORF01057、ORF01058、
ORF01063、ORF01078、ORF01079、ORF01080、ORF01081、ORF01084、ORF01085、
ORF01086、ORF01087、ORF01088、ORF01089、ORF01090、ORF01091、ORF01092、
ORF01093、ORF01094、ORF01095、ORF01096、ORF01097、ORF01098、ORF01099、
ORF01100、ORF01101、ORF01102、ORF01103、ORF01104、ORF01105、ORF01106、
ORF01107、ORF01108、ORF01109、ORF01110、ORF01111、ORF01112、ORF01113、
ORF01114、ORF01115、ORF01116、ORF01117、ORF01118、ORF01119、ORF01156、
ORF01186、ORF01187、ORF01188、ORF01190、ORF01191、ORF01192、ORF01193、
ORF01194、ORF01195、ORF01196、ORF01199、ORF01200、ORF01201、ORF01202、
ORF01203、ORF01204、ORF01205、ORF01206、ORF01207、ORF01208、ORF01209、
ORF01210、ORF01211、ORF01212、ORF01213、ORF01214、ORF01215、ORF01216、
ORF01217、ORF01218、ORF01219、ORF01220、ORF01222、ORF01223、ORF01224、
ORF01225、ORF01226、ORF01227、ORF01228、ORF01236、ORF01252、ORF01253、
ORF01254、ORF01255、ORF01256、ORF01257、ORF01258、ORF01259、ORF01260、
ORF01261、ORF01283、ORF01313、ORF01314、ORF01315、ORF01316、ORF01317、
ORF01318、ORF01319、ORF01320、ORF01321、ORF01322、ORF01323、ORF01325、
ORF01330、ORF01331、ORF01332、ORF01333、ORF01334、ORF01335、ORF01336、
ORF01337、ORF01338、ORF01339、ORF01340、ORF01341、ORF01342、ORF01343、
ORF01344、ORF01345、ORF01346、ORF01347、ORF01348、ORF01349、ORF01350、
ORF01351、ORF01352、ORF01353、ORF01354、ORF01355、ORF01356、ORF01357、
ORF01359、ORF01360、ORF01361、ORF01365、ORF01366、ORF01367、ORF01368、
ORF01371、ORF01373、ORF01374、ORF01375、ORF01376、ORF01394、ORF01456、
ORF01462、ORF01477、ORF01479、ORF01480、ORF01483、ORF01484、ORF01485、
ORF01486、ORF01487、ORF01488、ORF01490、ORF01491、ORF01492、ORF01493、
ORF01494、ORF01498、ORF01499、ORF01500、ORF01501、ORF01502、ORF01503、
ORF01504、ORF01505、ORF01506、ORF01507、ORF01508、ORF01509、ORF01510、
ORF01511、ORF01512、ORF01513、ORF01514、ORF01518、ORF01523、ORF01524、
ORF01525、ORF01526、ORF01527、ORF01528、ORF01529、ORF01530、ORF01531、
ORF01532、ORF01533、ORF01534、ORF01535、ORF01536、ORF01537、ORF01538、
ORF01539、ORF01540、ORF01541、ORF01542、ORF01543、ORF01550、ORF01551、
ORF01552、ORF01553、ORF01554、ORF01555、ORF01556、ORF01557、ORF01558、
ORF01559、ORF01560、ORF01561、ORF01562、ORF01563、ORF01564、ORF01565、
ORF01566、ORF01567、ORF01568、ORF01569、ORF01570、ORF01571、ORF01572、
ORF01573、ORF01574、ORF01575、ORF01576、ORF01577、ORF01578、ORF01583、
ORF01588、ORF01589、ORF01590、ORF01591、ORF01592、ORF01593、ORF01609、
ORF01610、ORF01611、ORF01612、ORF01613、ORF01630、ORF01631、ORF01637、
ORF01651、ORF01655、ORF01656、ORF01657、ORF01658、ORF01659、ORF01660、
ORF01665、ORF01705、ORF01722、ORF01723、ORF01724、ORF01725、ORF01766、
ORF01767、ORF01768、ORF01769、ORF01770、ORF01790、ORF01810、ORF01812、
ORF01813、ORF01815、ORF01816、ORF01817、ORF01818、ORF01819、ORF01820、
ORF01821、ORF01822、ORF01823、ORF01824、ORF01825、ORF01826、ORF01827、
ORF01828、ORF01829、ORF01830、ORF01831、ORF01832、ORF01833、ORF01834、
ORF01835、ORF01836、ORF01837、ORF01838、ORF01840、ORF01842、ORF01843、
ORF01844、ORF01845、ORF01846、ORF01847、ORF01848、ORF01849、ORF01850、
ORF01852、ORF01853、ORF01854、ORF01855、ORF01856、ORF01857、ORF01861、
ORF01862、ORF01865、ORF01891、ORF01923、ORF01926、ORF01927、ORF01928、
ORF01929、ORF01930、ORF01931、ORF01932、ORF01946、ORF01953、ORF01955、
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ORF03027、ORF03028、ORF03029、ORF03030、ORF03031、ORF03032、ORF03033、
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ORF03048、ORF03049、ORF03053、ORF03054、ORF03055、ORF03056、ORF03114、
ORF03130、ORF03131、ORF03132、ORF03133、ORF03162、ORF03163、ORF03164、
ORF03165、ORF03166、ORF03167、ORF03173、ORF03174、ORF03175、ORF03176、
ORF03191、ORF03192、ORF03206、ORF03207、ORF03235、ORF03236、ORF03252、
ORF03262、ORF03263、ORF03279、ORF03296、ORF03297、ORF03298、ORF03299、
ORF03300、ORF03325、ORF03340、ORF03341、ORF03342、ORF03343、ORF03344、
ORF03345、ORF03346、ORF03347、ORF03348、ORF03349、ORF03350、ORF03351、
ORF03352、ORF03353、ORF03354、ORF03355、ORF03356、ORF03357、ORF03358、
ORF03359、ORF03360、ORF03361、ORF03362、ORF03363、ORF03364、ORF03365、
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ORF03458、ORF03459、ORF03465、ORF03469、ORF03499、ORF03500、ORF03501、
ORF03502、ORF03503、ORF03504、ORF03505、ORF03506、ORF03507、ORF03508、
ORF03509、ORF03510、ORF03511、ORF03512、ORF03515、ORF03516、ORF03517、
ORF03518、ORF03519、ORF03520、ORF03521、ORF03522、ORF03526、ORF03535、
ORF03536、ORF03537、ORF03538、ORF03539、ORF03540、ORF03541、ORF03542、
ORF03574、ORF03575、ORF03576、ORF03577、ORF03578、ORF03579、ORF03580、
ORF03589、ORF03592、ORF03593、ORF03594、ORF03595、ORF03596、ORF03597、
ORF03606、ORF03607、ORF03608、ORF03610、ORF03612、ORF03613、ORF03614、
ORF03615、ORF03616、ORF03617、ORF03619、ORF03695、ORF03696、ORF03817、
ORF03818、ORF03819、ORF03820、ORF03821、ORF03822、ORF03823、ORF03824、
ORF03825、ORF03826、ORF03975、ORF03991、ORF03992、ORF03993、ORF03994、
ORF03995、ORF03996、ORF03997、ORF03998、ORF03999、ORF04000、ORF04031、
ORF04032、ORF04033、ORF04034、ORF04035、ORF04036、ORF04058、ORF04059、
ORF04060、ORF04061、ORF04062、ORF04063、ORF04064、ORF04073、ORF04083、
ORF04084、ORF04085、ORF04086、ORF04087、ORF04088、ORF04089、ORF04090、
ORF04091、ORF04130、ORF04162、ORF04163、ORF04164、ORF04171、ORF04183、
ORF04184、ORF04203、ORF04204、ORF04205、ORF04206、ORF04207、ORF04208、
ORF04209、ORF04211、ORF04224、ORF04225、ORF04237、ORF04238、ORF04239、
ORF04240、ORF04241、ORF04242、ORF04243、ORF04244、ORF04247、ORF04250、
ORF04282、ORF04302、ORF04390、ORF04391、ORF04398、ORF04402、ORF04403、
ORF04404、ORF04416、ORF04417、ORF04418、ORF04419、ORF04420、ORF04421、
ORF04422、ORF04423、ORF04424、ORF04425、ORF04426、ORF04427、ORF04428、
ORF04429、ORF04430、ORF04434、ORF04435、ORF04436、ORF04437、ORF04438、
ORF04439、ORF04451、ORF04476、ORF04477、ORF04478、ORF04479、ORF04480、
ORF04481、ORF04482、ORF04483、ORF04484、ORF04489、ORF04490、ORF04500、
ORF04542、ORF04543、ORF04544、ORF04545、ORF04546、ORF04547、ORF04552、
ORF04569、ORF04572、ORF04573、ORF04608、ORF04612、ORF04623、ORF04626、
ORF04627、ORF04628、ORF04629、ORF04630、ORF04631、ORF04632、ORF04661、
ORF04662、ORF04663、ORF04664、ORF04665、ORF04668、ORF04669、ORF04671、
ORF04672、ORF04673、ORF04674、ORF04675、ORF04676、ORF04677、ORF04678、
ORF04679、ORF04691、ORF04692、ORF04693、ORF04694、ORF04708、ORF04709、
ORF04710、ORF04711、ORF04712、ORF04728、ORF04844、ORF04845、ORF04846、
ORF04847、ORF04848、ORF04849、ORF04850、ORF04851、ORF04882、ORF04890、
ORF04891、ORF04892、ORF04893、ORF04894、ORF04895、ORF04898、ORF04900、
ORF04915、ORF04916、ORF04917、ORF04918、ORF04919、ORF04920、ORF04921、
ORF04922、ORF04923、ORF04924、ORF04925、ORF04926、ORF04927、ORF04928、
ORF04929、ORF04930、ORF04946、ORF04947、ORF04948、ORF04949、ORF04950、
ORF04951、ORF04952、ORF04953、ORF04954、ORF04955、ORF04956、ORF04957、
ORF04958、ORF04959、ORF04960、ORF04961、ORF04962、ORF04963、ORF04964、
ORF04966、ORF04974、ORF04978、ORF04979、ORF04981、ORF04989、ORF04990、
ORF04991、ORF04992、ORF04993、ORF04995
表4
 蛋白   SEQ ID 注释  Psort    TMD   CFT073  %ID
 ORF03526   7051+7052 辅助集落化因子AcfD前体  I    0   upec-2704  45.3
 ORF01339   2677+2678 FlC菌毛传达蛋白  I    1   upec-1199  99.4
 ORF00256   511+512 菌毛蛋白侣伴蛋白ecpD2  I    1   upec-0166  100
 ORF01346   2691+2692 IroN蛋白  O    0   upec-1207  99.3
 ORF04084   8167+8168 外膜高铁血红素受体ChuA  O    0   upec-4213  99.7
ORF02374 4747+4748 OMR家族鼠疫菌素-耶尔森菌菌素受体蛋白(IRPC) O 0 upec-2371 100
 ORF03502   7003+7004 推定的多糖生物合成蛋白  O    0   upec-3606  99.5
 ORF02298   4595+4596 假拟蛋白  C    0   upec-5009  30
 ORF01228   2455+2456 CdtC  O    0   upec-1086  30.3
 ORF01227   2453+2454 CdtB  I    1   upec-0679  31.9
 ORF02314   4627+4628 gpH  I    1   upec-0941  48.8
 ORF02850   5699+5700 DNA转移蛋白  C    0   upec-4881  21.2
栏:
·PSORT:由PSORT算法得到的预测位点;I=内膜;O=外膜;P=周质
·TMD:跨膜结构域的个数
·%ID:比对长度上相同残基的百分数
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[301]Russo等(2002)Infect Immun 71:7164-7169。

Claims (19)

1.一种多肽,其包含:(a)选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO 706、2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、522、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、548、550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、650、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678、680、682、684、686、688、690、692、694、696、698、700、702、704、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、754、756、758、760、762、764、766、768、770、772、774、776、778、780、782、784、786、788、790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、846、848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、872、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、898、900、902、904、906、908、910、912、914、916、918、920、922、924、926、928、930、932、934、936、938、940、942、944、946、948、950、952、954、956、958、960、962、964、966、968、970、972、974、976、978、980、982、984、986、988、990、992、994、996、998、1000、1002、1004、1006、1008、1010、1012、1014、1016、1018、1020、1022、1024、1026、1028、1030、1032、1034、1036、1038、1040、1042、1044、1046、1048、1050、1052、1054、1056、1058、1060、1062、1064、1066、1068、1070、1072、1074、1076、1078、1080、1082、1084、1086、1088、1090、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142、1144、1146、1148、1150、1152、1154、1156、1158、1160、1162、1164、1166、1168、1170、1172、1174、1176、1178、1180、1182、1184、1186、1188、1190、1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、1220、1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、1288、1290、1292、1294、1296、1298、1300、1302、1304、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390、1392、1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564、1566、1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、1598、1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770、1772、1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、1820、1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982、1984、1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、2190、2192、2194、2196、2198、2200、2202、2204、2206、22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2.如权利要求1所述的多肽,其包含:(a)选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO512、2454、2456、2678、2692、4596、4748、7004、7052、8168、4628和5700;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的氨基酸序列;(c)作为氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列;或(d)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列。
3.如权利要求1所述的多肽,其包含:(a)选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO8564、2728、9872、4672、5680、534、3222、3226和7004;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的氨基酸序列;(c)作为氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列;或(d)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列。
4.如权利要求1-3中任一项所述的多肽,其特征在于,所述片段包含至少一个(a)的B细胞表位。
5.如权利要求1-4中任一项所述的多肽,所述多肽用于药物。
6.一种核酸,其包含:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO 705、1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、287、289、291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、319、321、323、325、327、329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、363、365、367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513、515、517、519、521、523、525、527、529、531、533、535、537、539、541、543、545、547、549、551、553、555、557、559、561、563、565、567、569、571、573、575、577、579、581、583、585、587、589、591、593、595、597、599、601、603、605、607、609、611、613、615、617、619、621、623、625、627、629、631、633、635、637、639、641、643、645、647、649、651、653、655、657、659、661、663、665、667、669、671、673、675、677、679、681、683、685、687、689、691、693、695、697、699、701、703、707、709、711、713、715、717、719、721、723、725、727、729、731、733、735、737、739、741、743、745、747、749、751、753、755、757、759、761、763、765、767、769、771、773、775、777、779、781、783、785、787、789、791、793、795、797、799、801、803、805、807、809、811、813、815、817、819、821、823、825、827、829、831、833、835、837、839、841、843、845、847、849、851、853、855、857、859、861、863、865、867、869、871、873、875、877、879、881、883、885、887、889、891、893、895、897、899、901、903、905、907、909、911、913、915、917、919、921、923、925、927、929、931、933、935、937、939、941、943、945、947、949、951、953、955、957、959、961、963、965、967、969、971、973、975、977、979、981、983、985、987、989、991、993、995、997、999、1001、1003、1005、1007、1009、1011、1013、1015、1017、1019、1021、1023、1025、1027、1029、1031、1033、1035、1037、1039、1041、1043、1045、1047、1049、1051、1053、1055、1057、1059、1061、1063、1065、1067、1069、1071、1073、1075、1077、1079、1081、1083、1085、1087、1089、1091、1093、1095、1097、1099、1101、1103、1105、1107、1109、1111、1113、1115、1117、1119、1121、1123、1125、1127、1129、1131、1133、1135、1137、1139、1141、1143、1145、1147、1149、1151、1153、1155、1157、1159、1161、1163、1165、1167、1169、1171、1173、1175、1177、1179、1181、1183、1185、1187、1189、1191、1193、1195、1197、1199、1201、1203、1205、1207、1209、1211、1213、1215、1217、1219、1221、1223、1225、1227、1229、1231、1233、1235、1237、1239、1241、1243、1245、1247、1249、1251、1253、1255、1257、1259、1261、1263、1265、1267、1269、1271、1273、1275、1277、1279、1281、1283、1285、1287、1289、1291、1293、1295、1297、1299、1301、1303、1305、1307、1309、1311、1313、1315、1317、1319、1321、1323、1325、1327、1329、1331、1333、1335、1337、1339、1341、1343、1345、1347、1349、1351、1353、1355、1357、1359、1361、1363、1365、1367、1369、1371、1373、1375、1377、1379、1381、1383、1385、1387、1389、1391、1393、1395、1397、1399、1401、1403、1405、1407、1409、1411、1413、1415、1417、1419、1421、1423、1425、1427、1429、1431、1433、1435、1437、1439、1441、1443、1445、1447、1449、1451、1453、1455、1457、1459、1461、1463、1465、1467、1469、1471、1473、1475、1477、1479、1481、1483、1485、1487、1489、1491、1493、1495、1497、1499、1501、1503、1505、1507、1509、1511、1513、1515、1517、1519、1521、1523、1525、1527、1529、1531、1533、1535、1537、1539、1541、1543、1545、1547、1549、1551、1553、1555、1557、1559、1561、1563、1565、1567、1569、1571、1573、1575、1577、1579、1581、1583、1585、1587、1589、1591、1593、1595、1597、1599、1601、1603、1605、1607、1609、1611、1613、1615、1617、1619、1621、1623、1625、1627、1629、1631、1633、1635、1637、1639、1641、1643、1645、1647、1649、1651、1653、1655、1657、1659、1661、1663、1665、1667、1669、1671、1673、1675、1677、1679、1681、1683、1685、1687、1689、1691、1693、1695、1697、1699、1701、1703、1705、1707、1709、1711、1713、1715、1717、1719、1721、1723、1725、1727、1729、1731、1733、1735、1737、1739、1741、1743、1745、1747、1749、1751、1753、1755、1757、1759、1761、1763、1765、1767、1769、1771、1773、1775、1777、1779、1781、1783、1785、1787、1789、1791、1793、1795、1797、1799、1801、1803、1805、1807、1809、1811、1813、1815、1817、1819、1821、1823、1825、1827、1829、1831、1833、1835、1837、1839、1841、1843、1845、1847、1849、1851、1853、1855、1857、1859、1861、1863、1865、1867、1869、1871、1873、1875、1877、1879、1881、1883、1885、1887、1889、1891、1893、1895、1897、1899、1901、1903、1905、1907、1909、1911、1913、1915、1917、1919、1921、1923、1925、1927、1929、1931、1933、1935、1937、1939、1941、1943、1945、1947、1949、1951、1953、1955、1957、1959、1961、1963、1965、1967、1969、1971、1973、1975、1977、1979、1981、1983、1985、1987、1989、1991、1993、1995、1997、1999、2001、2003、2005、2007、2009、2011、2013、2015、2017、2019、2021、2023、2025、2027、2029、2031、2033、2035、2037、2039、2041、2043、2045、2047、2049、2051、2053、2055、2057、2059、2061、2063、2065、2067、2069、2071、2073、2075、2077、2079、2081、2083、2085、2087、2089、2091、2093、2095、2097、2099、2101、2103、2105、2107、2109、2111、2113、2115、2117、2119、2121、2123、2125、2127、2129、2131、2133、2135、2137、2139、2141、2143、2145、2147、2149、2151、2153、2155、2157、2159、2161、2163、2165、2167、2169、2171、2173、2175、2177、2179、2181、2183、2185、2187、2189、2191、2193、2195、2197、2199、2201、2203、2205、2207、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8209、8211、8213、8215、8217、8219、8221、8223、8225、8227、8229、8231、8233、8235、8237、8239、8241、8243、8245、8247、8249、8251、8253、8255、8257、8259、8261、8263、8265、8267、8269、8271、8273、8275、8277、8279、8281、8283、8285、8287、8289、8291、8293、8295、8297、8299、8301、8303、8305、8307、8309、8311、8313、8315、8317、8319、8321、8323、8325、8327、8329、8331、8333、8335、8337、8339、8341、8343、8345、8347、8349、8351、8353、8355、8357、8359、8361、8363、8365、8367、8369、8371、8373、8375、8377、8379、8381、8383、8385、8387、8389、8391、8393、8395、8397、8399、8401、8403、8405、8407、8409、8411、8413、8415、8417、8419、8421、8423、8425、8427、8429、8431、8433、8435、8437、8439、8441、8443、8445、8447、8449、8451、8453、8455、8457、8459、8461、8463、8465、8467、8469、8471、8473、8475、8477、8479、8481、8483、8485、8487、8489、8491、8493、8495、8497、8499、8501、8503、8505、8507、8509、8511、8513、8515、8517、8519、8521、8523、8525、8527、8529、8531、8533、8535、8537、8539、8541、8543、8545、8547、8549、8551、8553、8555、8557、8559、8561、8563、8565、8567、8569、8571、8573、8575、8577、8579、8581、8583、8585、8587、8589、8591、8593、8595、8597、8599、8601、8603、8605、8607、8609、8611、8613、8615、8617、8619、8621、8623、8625、8627、8629、8631、8633、8635、8637、8639、8641、8643、8645、8647、8649、8651、8653、8655、8657、8659、8661、8663、8665、8667、8669、8671、8673、8675、8677、8679、8681、8683、8685、8687、8689、8691、8693、8695、8697、8699、8701、8703、8705、8707、8709、8711、8713、8715、8717、8719、8721、8723、8725、8727、8729、8731、8733、8735、8737、8739、8741、8743、8745、8747、8749、8751、8753、8755、8757、8759、8761、8763、8765、8767、8769、8771、8773、8775、8777、8779、8781、8783、8785、8787、8789、8791、8793、8795、8797、8799、8801、8803、8805、8807、8809、8811、8813、8815、8817、8819、8821、8823、8825、8827、8829、8831、8833、8835、8837、8839、8841、8843、8845、8847、8849、8851、8853、8855、8857、8859、8861、8863、8865、8867、8869、8871、8873、8875、8877、8879、8881、8883、8885、8887、8889、8891、8893、8895、8897、8899、8901、8903、8905、8907、8909、8911、8913、8915、8917、8919、8921、8923、8925、8927、8929、8931、8933、8935、8937、8939、8941、8943、8945、8947、8949、8951、8953、8955、8957、8959、8961、8963、8965、8967、8969、8971、8973、8975、8977、8979、8981、8983、8985、8987、8989、8991、8993、8995、8997、8999、9001、9003、9005、9007、9009、9011、9013、9015、9017、9019、9021、9023、9025、9027、9029、9031、9033、9035、9037、9039、9041、9043、9045、9047、9049、9051、9053、9055、9057、9059、9061、9063、9065、9067、9069、9071、9073、9075、9077、9079、9081、9083、9085、9087、9089、9091、9093、9095、9097、9099、9101、9103、9105、9107、9109、9111、9113、9115、9117、9119、9121、9123、9125、9127、9129、9131、9133、9135、9137、9139、9141、9143、9145、9147、9149、9151、9153、9155、9157、9159、9161、9163、9165、9167、9169、9171、9173、9175、9177、9179、9181、9183、9185、9187、9189、9191、9193、9195、9197、9199、9201、9203、9205、9207、9209、9211、9213、9215、9217、9219、9221、9223、9225、9227、9229、9231、9233、9235、9237、9239、9241、9243、9245、9247、9249、9251、9253、9255、9257、9259、9261、9263、9265、9267、9269、9271、9273、9275、9277、9279、9281、9283、9285、9287、9289、9291、9293、9295、9297、9299、9301、9303、9305、9307、9309、9311、9313、9315、9317、9319、9321、9323、9325、9327、9329、9331、9333、9335、9337、9339、9341、9343、9345、9347、9349、9351、9353、9355、9357、9359、9361、9363、9365、9367、9369、9371、9373、9375、9377、9379、9381、9383、9385、9387、9389、9391、9393、9395、9397、9399、9401、9403、9405、9407、9409、9411、9413、9415、9417、9419、9421、9423、9425、9427、9429、9431、9433、9435、9437、9439、9441、9443、9445、9447、9449、9451、9453、9455、9457、9459、9461、9463、9465、9467、9469、9471、9473、9475、9477、9479、9481、9483、9485、9487、9489、9491、9493、9495、9497、9499、9501、9503、9505、9507、9509、9511、9513、9515、9517、9519、9521、9523、9525、9527、9529、9531、9533、9535、9537、9539、9541、9543、9545、9547、9549、9551、9553、9555、9557、9559、9561、9563、9565、9567、9569、9571、9573、9575、9577、9579、9581、9583、9585、9587、9589、9591、9593、9595、9597、9599、9601、9603、9605、9607、9609、9611、9613、9615、9617、9619、9621、9623、9625、9627、9629、9631、9633、9635、9637、9639、9641、9643、9645、9647、9649、9651、9653、9655、9657、9659、9661、9663、9665、9667、9669、9671、9673、9675、9677、9679、9681、9683、9685、9687、9689、9691、9693、9695、9697、9699、9701、9703、9705、9707、9709、9711、9713、9715、9717、9719、9721、9723、9725、9727、9729、9731、9733、9735、9737、9739、9741、9743、9745、9747、9749、9751、9753、9755、9757、9759、9761、9763、9765、9767、9769、9771、9773、9775、9777、9779、9781、9783、9785、9787、9789、9791、9793、9795、9797、9799、9801、9803、9805、9807、9809、9811、9813、9815、9817、9819、9821、9823、9825、9827、9829、9831、9833、9835、9837、9839、9841、9843、9845、9847、9849、9851、9853、9855、9857、9859、9861、9863、9865、9867、9869、9871、9873、9875、9877、9879、9881、9883、9885、9887、9889、989 1、9893、9895、9897、9899、9901、9903、9905、9907、9909、9911、9913、9915、9917、9919、9921、9923、9925、9927、9929、9931、9933、9935、9937、9939、9941、9943、9945、9947、9949、9951、9953、9955、9957、9959、9961、9963、9965、9967、9969、9971、9973、9975、9977、9979、9981、9983、9985、9987和9989;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
7.如权利要求6所述的核酸,其包含:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO511、2453、2455、2677、2691、4595、4747、7003、7051、8167、4627和5699;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
8.如权利要求6所述的核酸,其包含:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO8563、2727、9871、4671、5679、533、3221、3225和7003;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
9.如权利要求6-8中任一项所述的核酸,其编码权利要求1、2、3或4所述的多肽。
10.如权利要求1-4中任一项所述的多肽的特异性单克隆抗体。
11.一种药物组合物,其包含与药学上可接受的载体混合的权利要求1-4中任一项所述的多肽、权利要求1-9中任一项所述的核酸或权利要求10所述的抗体。
12.一种药物组合物,其包含与药学上可接受的载体混合的权利要求1-4中所述的两种或多种多肽。
13.如权利要求10或11所述的组合物,还包含疫苗佐剂。
14.一种免疫原性组合物,其包含表达或过度表达下组编码的一种或多种多肽的一种或多种外膜泡(OMV):(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO 511、2453、2455、2677、2691、4595、4747、7003、7051、8167、4627和5699;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
15.一种免疫原性组合物,其包含表达或过度表达下组编码的一种或多种多肽的一种或多种外膜泡(OMV):(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO 8563、2727、9871、4671、5679、533、3221、3225和7003;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
16.如权利要求14或15所述的免疫原性组合物,其特征在于,所述片段包含至少一个(a)的B细胞表位。
17.如权利要求1-4中任一项所述的多肽,或如权利要求6-9中任一项所述的核酸,或如权利要求10所述的抗体,或如权利要求14-16中任一项所述的免疫原性组合物在制备用于在患者中产生免疫应答的药物中的应用。
18.一种在患者中产生免疫应答的方法,所述方法包括给予所述患者如权利要求10-12中任一项所述的药物组合物或者如权利要求14-16中任一项所述的免疫原性组合物的步骤。
19.如权利要求17所述的应用,或如权利要求18所述的方法,其特征在于,所述免疫应答保护个体免受ExPEC感染,尤其免受MNEC感染。
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