CN101203529A - 来自脑膜炎/脓毒症相关性大肠杆菌的蛋白质和核酸 - Google Patents
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Abstract
本文公开了引起新生儿脑膜炎(MNEC)的大肠杆菌菌株的各种开放阅读框,以及在制备能引起对MNEC感染的免疫力的组合物中特别感兴趣的它们的子集。
Description
本文引用的所有文献均以其全文纳入本文中作为参考。
相关申请
本申请要求于2005年2月18日提交的美国临时申请号60/654,632和2005年8月29日提交的美国临时申请号60/712,720的优先权,以其全文纳入本文中作为参考。
技术领域
本发明属于大肠杆菌(E.coli)生物学领域,具体涉及能引起对肠外病原性大肠杆菌(ExPEC)菌株产生免疫的免疫原。
背景技术
很少有微生物具有如大肠杆菌般的多用途。同时作为哺乳动物正常肠道微生物区系的重要成员,其已被广泛用作重组DNA技术的宿主。然而,大肠杆菌也可能成为致命病原体。
大肠杆菌菌株通常被分为共生性或病原性,病原性菌株再分成肠内或肠外菌株。也可根据‘K’抗原分类。研究得最透彻的‘K’抗原是‘K1’,认为它是引起新生儿脑膜炎的大肠杆菌菌株中毒力的主要决定因素。K1抗原是α-2,8-连接的唾液酸的均聚物,如脑膜炎球菌血清组B的荚膜糖。更新的分类技术如多基因座酶电泳法(MLEE)将大肠杆菌分为5类系统发生组(A、B1、B2、D和E),这些分组与传统的分类不匹配。例如MLEE B1组包括共生性和病原性菌株,D组包括肠内和肠外菌株。
大肠杆菌的肠外病原性菌株(或’ExPEC’菌株[1])属于MLEE B2组和D组,包括尿路病原性(UPEC)菌株和脑膜炎/脓毒症相关性(MNEC)菌株。UPEC菌株引起尿路感染(UTI),为膀胱炎的常见原因。它们还引起肾盂肾炎(及其并发症如脓毒症)和尿导管相关感染。MNEC菌株引起病例致死率范围在25%-40%的新生儿脑膜炎(每1000个活新生儿中出现0.1例),还引起大约1/6的脓毒症病例。
最早的ExPEC疫苗基于细胞裂解物或细胞结构。SOLCOUROVACTM包括10种不同的热杀细菌,包括6种ExPEC菌株,参考文献2中报道了成功的II期临床实验。URO-VAXOMTM是一种含有18种选择的大肠杆菌菌株的冻干细菌裂解物的口服片剂疫苗[3]。Baxter Vaccines研制出一种基于6-10种不同菌株来源的菌毛的UTI疫苗,但该产品已被放弃。MedImmune研制出的一种基于FimH粘附素复合物的名为MEDI516的产品显示效力不够。而且,这种疫苗存在影响正常肠道菌丛中的非病原性FimH+ve菌株的风险,同时,由于其膀胱特异性粘附机制,预计这种疫苗仅对UPEC菌株有效,而其它ExPEC菌株不受它的控制。
因此,需要一种改良的ExPEC疫苗,这包括需要从天然细胞裂解物转移到更明确的分子,以及需要鉴定适于包含入疫苗的其它抗原,尤其是那些在临床ExPEC菌株中很普遍、而在共生性菌株中不存在的抗原。在ExPEC群体中,特别需要鉴定出适用于引起对MNEC菌株产生免疫的抗原。
参考文献5报道了满足上述需要的一种方法,其发明人寻找在MLEE B2类型和D类型的基因组中存在但在MLEE A类型和B1类型中不存在的基因。基于扣除杂交的其它比较方法参见参考文献6和7。参考文献8中也鉴定了ExPEC菌株的毒力基因。参考文献9分析了UPEC大肠杆菌菌株536中的四个毒力岛(pathogenicity island)。
参考文献10采用UPEC(O6:K2:H1)菌株CFT073的基因组序列[11,12]来鉴定在非病原性大肠杆菌菌株中不存在的序列。参考文献13比较了大肠杆菌人肾盂肾炎分离物536(O6:K15:H31)(一种UPEC)的基因组序列与菌株CFT073(UPEC)、EDL933(肠出血性)和MG1655(非病原性实验菌株)的序列数据。病原性菌株的基因组序列获自数据库中的登录号AE005174、BA000007和NC-004431。非病原性菌株的序列获自登录号U00096。
本发明的目的是提供用于引起对病原性大肠杆菌菌株、具体是ExPEC菌株、更具体是MNEC菌株产生免疫的其它抗原。
发明概述
本发明者从引起新生儿脑膜炎(MNEC)的大肠杆菌中鉴定了各种开放阅读框,并且鉴定了在制备能引起对MNEC感染产生免疫的组合物中特别感兴趣的它们的子集。
本发明一方面涉及一种多肽,其包含:(a)选自下组的氨基酸序列:SEQ ID 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8222、8224、8226、8228、8230、8232、8234、8236、8238、8240、8242、8244、8246、8248、8250、8252、8254、8256、8258、8260、8262、8264、8266、8268、8270、8272、8274、8276、8278、8280、8282、8284、8286、8288、8290、8292、8294、8296、8298、8300、8302、8304、8306、8308、8310、8312、8314、8316、8318、8320、8322、8324、8326、8328、8330、8332、8334、8336、8338、8340、8342、8344、8346、8348、8350、8352、8354、8356、8358、8360、8362、8364、8366、8368、8370、8372、8374、8376、8378、8380、8382、8384、8386、8388、8390、8392、8394、8396、8398、8400、8402、8404、8406、8408、8410、8412、8414、8416、8418、8420、8422、8424、8426、8428、8430、8432、8434、8436、8438、8440、8442、8444、8446、8448、8450、8452、8454、8456、8458、8460、8462、8464、8466、8468、8470、8472、8474、8476、8478、8480、8482、8484、8486、8488、8490、8492、8494、8496、8498、8500、8502、8504、8506、8508、8510、8512、8514、8516、8518、8520、8522、8524、8526、8528、8530、8532、8534、8536、8538、8540、8542、8544、8546、8548、8550、8552、8554、8556、8558、8560、8562、8564、8566、8568、8570、8572、8574、8576、8578、8580、8582、8584、8586、8588、8590、8592、8594、8596、8598、8600、8602、8604、8606、8608、8610、8612、8614、8616、8618、8620、8622、8624、8626、8628、8630、8632、8634、8636、8638、8640、8642、8644、8646、8648、8650、8652、8654、8656、8658、8660、8662、8664、8666、8668、8670、8672、8674、8676、8678、8680、8682、8684、8686、8688、8690、8692、8694、8696、8698、8700、8702、8704、8706、8708、8710、8712、8714、8716、8718、8720、8722、8724、8726、8728、8730、8732、8734、8736、8738、8740、8742、8744、8746、8748、8750、8752、8754、8756、8758、8760、8762、8764、8766、8768、8770、8772、8774、8776、8778、8780、8782、8784、8786、8788、8790、8792、8794、8796、8798、8800、8802、8804、8806、8808、8810、8812、8814、8816、8818、8820、8822、8824、8826、8828、8830、8832、8834、8836、8838、8840、8842、8844、8846、8848、8850、8852、8854、8856、8858、8860、8862、8864、8866、8868、8870、8872、8874、8876、8878、8880、8882、8884、8886、8888、8890、8892、8894、8896、8898、8900、8902、8904、8906、8908、8910、8912、8914、8916、8918、8920、8922、8924、8926、8928、8930、8932、8934、8936、8938、8940、8942、8944、8946、8948、8950、8952、8954、8956、8958、8960、8962、8964、8966、8968、8970、8972、8974、8976、8978、8980、8982、8984、8986、8988、8990、8992、8994、8996、8998、9000、9002、9004、9006、9008、9010、9012、9014、9016、9018、9020、9022、9024、9026、9028、9030、9032、9034、9036、9038、9040、9042、9044、9046、9048、9050、9052、9054、9056、9058、9060、9062、9064、9066、9068、9070、9072、9074、9076、9078、9080、9082、9084、9086、9088、9090、9092、9094、9096、9098、9100、9102、9104、9106、9108、9110、9112、9114、9116、9118、9120、9122、9124、9126、9128、9130、9132、9134、9136、9138、9140、9142、9144、9146、9148、9150、9152、9154、9156、9158、9160、9162、9164、9166、9168、9170、9172、9174、9176、9178、9180、9182、9184、9186、9188、9190、9192、9194、9196、9198、9200、9202、9204、9206、9208、9210、9212、9214、9216、9218、9220、9222、9224、9226、9228、9230、9232、9234、9236、9238、9240、9242、9244、9246、9248、9250、9252、9254、9256、9258、9260、9262、9264、9266、9268、9270、9272、9274、9276、9278、9280、9282、9284、9286、9288、9290、9292、9294、9296、9298、9300、9302、9304、9306、9308、9310、9312、9314、9316、9318、9320、9322、9324、9326、9328、9330、9332、9334、9336、9338、9340、9342、9344、9346、9348、9350、9352、9354、9356、9358、9360、9362、9364、9366、9368、9370、9372、9374、9376、9378、9380、9382、9384、9386、9388、9390、9392、9394、9396、9398、9400、9402、9404、9406、9408、9410、9412、9414、9416、9418、9420、9422、9424、9426、9428、9430、9432、9434、9436、9438、9440、9442、9444、9446、9448、9450、9452、9454、9456、9458、9460、9462、9464、9466、9468、9470、9472、9474、9476、9478、9480、9482、9484、9486、9488、9490、9492、9494、9496、9498、9500、9502、9504、9506、9508、9510、9512、9514、9516、9518、9520、9522、9524、9526、9528、9530、9532、9534、9536、9538、9540、9542、9544、9546、9548、9550、9552、9554、9556、9558、9560、9562、9564、9566、9568、9570、9572、9574、9576、9578、9580、9582、9584、9586、9588、9590、9592、9594、9596、9598、9600、9602、9604、9606、9608、9610、9612、9614、9616、9618、9620、9622、9624、9626、9628、9630、9632、9634、9636、9638、9640、9642、9644、9646、9648、9650、9652、9654、9656、9658、9660、9662、9664、9666、9668、9670、9672、9674、9676、9678、9680、9682、9684、9686、9688、9690、9692、9694、9696、9698、9700、9702、9704、9706、9708、9710、9712、9714、9716、9718、9720、9722、9724、9726、9728、9730、9732、9734、9736、9738、9740、9742、9744、9746、9748、9750、9752、9754、9756、9758、9760、9762、9764、9766、9768、9770、9772、9774、9776、9778、9780、9782、9784、9786、9788、9790、9792、9794、9796、9798、9800、9802、9804、9806、9808、9810、9812、9814、9816、9818、9820、9822、9824、9826、9828、9830、9832、9834、9836、9838、9840、9842、9844、9846、9848、9850、9852、9854、9856、9858、9860、9862、9864、9866、9868、9870、9872、9874、9876、9878、9880、9882、9884、9886、9888、9890、9892、9894、9896、9898、9900、9902、9904、9906、9908、9910、9912、9914、9916、9918、9920、9922、9924、9926、9928、9930、9932、9934、9936、9938、9940、9942、9944、9946、9948、9950、9952、9954、9956、9958、9960、9962、9964、9966、9968、9970、9972、9974、9976、9978、9980、9982、9984、9986、9988、9990;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的氨基酸序列;(c)作为氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列;或(d)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列。在一个具体实施方式中,本发明这方面的多肽包含含有至少一个(a)的B细胞表位的片段。
在第二个方面,本发明涉及一种多肽,其包含:(a)选自下组的氨基酸序列:SEQID NO 512、2454、2456、2678、2692、4596、4748、7004、7052、8168、4628和5700;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的氨基酸序列;(c)作为氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列;或(d)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列。在一个具体实施方式中,本发明这方面的多肽包含含有至少一个(a)的B细胞表位的片段。
另一方面,本发明涉及一种多肽,其包含:(a)选自下组的氨基酸序列:SEQ IDNO 8564、2728、9872、4672、5680、534、3222、3226和7004;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的氨基酸序列;(c)作为氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列;或(d)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列。在一个具体实施方式中,本发明这方面的多肽包含含有至少一个(a)的B细胞表位的片段。
本发明也涉及一种核酸,其包含:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO 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223、8225、8227、8229、8231、8233、8235、8237、8239、8241、8243、8245、8247、8249、8251、8253、8255、8257、8259、8261、8263、8265、8267、8269、8271、8273、8275、8277、8279、8281、8283、8285、8287、8289、8291、8293、8295、8297、8299、8301、8303、8305、8307、8309、8311、8313、8315、8317、8319、8321、8323、8325、8327、8329、8331、8333、8335、8337、8339、8341、8343、8345、8347、8349、8351、8353、8355、8357、8359、8361、8363、8365、8367、8369、8371、8373、8375、8377、8379、8381、8383、8385、8387、8389、8391、8393、8395、8397、8399、8401、8403、8405、8407、8409、8411、8413、8415、8417、8419、8421、8423、8425、8427、8429、8431、8433、8435、8437、8439、8441、8443、8445、8447、8449、8451、8453、8455、8457、8459、8461、8463、8465、8467、8469、8471、8473、8475、8477、8479、8481、8483、8485、8487、8489、8491、8493、8495、8497、8499、8501、8503、8505、8507、8509、8511、8513、8515、8517、8519、8521、8523、8525、8527、8529、8531、8533、8535、8537、8539、8541、8543、8545、8547、8549、8551、8553、8555、8557、8559、8561、8563、8565、8567、8569、8571、8573、8575、8577、8579、8581、8583、8585、8587、8589、8591、8593、8595、8597、8599、8601、8603、8605、8607、8609、8611、8613、8615、8617、8619、8621、8623、8625、8627、8629、8631、8633、8635、8637、8639、8641、8643、8645、8647、8649、8651、8653、8655、8657、8659、8661、8663、8665、8667、8669、8671、8673、8675、8677、8679、8681、8683、8685、8687、8689、8691、8693、8695、8697、8699、8701、8703、8705、8707、8709、8711、8713、8715、8717、8719、8721、8723、8725、8727、8729、8731、8733、8735、8737、8739、8741、8743、8745、8747、8749、8751、8753、8755、8757、8759、8761、8763、8765、8767、8769、8771、8773、8775、8777、8779、8781、8783、8785、8787、8789、8791、8793、8795、8797、8799、8801、8803、8805、8807、8809、8811、8813、8815、8817、8819、8821、8823、8825、8827、8829、8831、8833、8835、8837、8839、8841、8843、8845、8847、8849、8851、8853、8855、8857、8859、8861、8863、8865、8867、8869、8871、8873、8875、8877、8879、8881、8883、8885、8887、8889、8891、8893、8895、8897、8899、8901、8903、8905、8907、8909、8911、8913、8915、8917、8919、8921、8923、8925、8927、8929、8931、8933、8935、8937、8939、8941、8943、8945、8947、8949、8951、8953、8955、8957、8959、8961、8963、8965、8967、8969、8971、8973、8975、8977、8979、8981、8983、8985、8987、8989、8991、8993、8995、8997、8999、9001、9003、9005、9007、9009、9011、9013、9015、9017、9019、9021、9023、9025、9027、9029、9031、9033、9035、9037、9039、9041、9043、9045、9047、9049、9051、9053、9055、9057、9059、9061、9063、9065、9067、9069、9071、9073、9075、9077、9079、9081、9083、9085、9087、9089、9091、9093、9095、9097、9099、9101、9103、9105、9107、9109、9111、9113、9115、9117、9119、9121、9123、9125、9127、9129、9131、9133、9135、9137、9139、9141、9143、9145、9147、9149、9151、9153、9155、9157、9159、9161、9163、9165、9167、9169、9171、9173、9175、9177、9179、9181、9183、9185、9187、9189、9191、9193、9195、9197、9199、9201、9203、9205、9207、9209、9211、9213、9215、9217、9219、9221、9223、9225、9227、9229、9231、9233、9235、9237、9239、9241、9243、9245、9247、9249、9251、9253、9255、9257、9259、9261、9263、9265、9267、9269、9271、9273、9275、9277、9279、9281、9283、9285、9287、9289、9291、9293、9295、9297、9299、9301、9303、9305、9307、9309、9311、9313、9315、9317、9319、9321、9323、9325、9327、9329、9331、9333、9335、9337、9339、9341、9343、9345、9347、9349、9351、9353、9355、9357、9359、9361、9363、9365、9367、9369、9371、9373、9375、9377、9379、9381、9383、9385、9387、9389、9391、9393、9395、9397、9399、9401、9403、9405、9407、9409、9411、9413、9415、9417、9419、9421、9423、9425、9427、9429、9431、9433、9435、9437、9439、9441、9443、9445、9447、9449、9451、9453、9455、9457、9459、9461、9463、9465、9467、9469、9471、9473、9475、9477、9479、9481、9483、9485、9487、9489、9491、9493、9495、9497、9499、9501、9503、9505、9507、9509、9511、9513、9515、9517、9519、9521、9523、9525、9527、9529、9531、9533、9535、9537、9539、9541、9543、9545、9547、9549、9551、9553、9555、9557、9559、9561、9563、9565、9567、9569、9571、9573、9575、9577、9579、9581、9583、9585、9587、9589、9591、9593、9595、9597、9599、9601、9603、9605、9607、9609、9611、9613、9615、9617、9619、9621、9623、9625、9627、9629、9631、9633、9635、9637、9639、9641、9643、9645、9647、9649、9651、9653、9655、9657、9659、9661、9663、9665、9667、9669、9671、9673、9675、9677、9679、9681、9683、9685、9687、9689、9691、9693、9695、9697、9699、9701、9703、9705、9707、9709、9711、9713、9715、9717、9719、9721、9723、9725、9727、9729、9731、9733、9735、9737、9739、9741、9743、9745、9747、9749、9751、9753、9755、9757、9759、9761、9763、9765、9767、9769、9771、9773、9775、9777、9779、9781、9783、9785、9787、9789、9791、9793、9795、9797、9799、9801、9803、9805、9807、9809、9811、9813、9815、9817、9819、9821、9823、9825、9827、9829、9831、9833、9835、9837、9839、9841、9843、9845、9847、9849、9851、9853、9855、9857、9859、9861、9863、9865、9867、9869、9871、9873、9875、9877、9879、9881、9883、9885、9887、9889、9891、9893、9895、9897、9899、9901、9903、9905、9907、9909、9911、9913、9915、9917、9919、9921、9923、9925、9927、9929、9931、9933、9935、9937、9939、9941、9943、9945、9947、9949、9951、9953、9955、9957、9959、9961、9963、9965、9967、9969、9971、9973、9975、9977、9979、9981、9983、9985、9987、9989;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%、并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
另一方面,本发明涉及一种核酸,其包含:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ IDNO 511、2453、2455、2677、2691、4595、4747、7003、7051、8167、4627和5699;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%、并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
另一方面,本发明涉及一种核酸,其包含:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ IDNO 8563、2727、9871、4671、5679、533、3221、3225和7003,(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%、并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
本发明也涉及编码本发明多肽的本发明核酸,还涉及本发明多肽的特异性单克隆抗体。
本发明多肽、核酸和抗体可用于药物和用于制造在患者中产生免疫应答的药物。
本发明也涉及含有与药学上可接受的载体混合的本发明多肽、核酸或抗体的药物组合物。本发明还涉及含有与药学上可接受的载体混合的两种或多种本发明多肽的药物组合物。在一个具体实施方式中,本发明药物组合物还含有疫苗佐剂。本发明还涉及含有表达或过度表达下组编码的一种或多种多肽的一种或多种外膜泡(OMV)的免疫原性组合物:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO 511、2453、2455、2677、2691、4595、4747、7003、7051、8167、4627和5699;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%、并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
本发明也涉及含有表达或过度表达下组编码的一种或多种多肽的一种或多种OMV的免疫原性组合物:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO 8563、2727、9871、4671、5679、533、3221、3225和7003;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%、并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
本发明也涉及在患者中产生免疫应答的方法,所述方法包括给予所述患者本发明药物组合物或免疫原性组合物的步骤。在一个具体实施方式中,所述免疫反应是保护性抵抗ExPEC感染,具体抵抗MNEC感染。本发明的其它方面描述如下。
附图简要说明
图1显示了用热灭活IHE3034或对照(′fisiol′)免疫后,用IHE3034刺激后随时间变化的小鼠存活率%,以及24小时后的菌血症水平(cfu/ml)。
图2显示了用热灭活细菌(上图)或ΔtolR突变体的小泡(下图)免疫后,用IHE3034刺激后的小鼠存活率%。从IHE3034菌株或对照菌株(DH5)制备免疫原。
图3显示了用IroN或对照(上图)和血清抗-IroN Ig效价(下图)免疫后,用IHE3034刺激后的小鼠存活率%。
图4类似于图3,但采用IbeA而非IroN。
发明详述
本发明者从K1/B2 MNEC菌株鉴定了4995种开放阅读框,并鉴定了在制备抵抗MNEC菌株的免疫原性组合物中特别感兴趣的它们的子集。
多肽
本发明提供了含有实施例中所述氨基酸序列的多肽。这些序列是序列表SEQ IDNO 2-9990中偶数编号的序列。
SEQ ID NO 2-9990中的优选氨基酸序列见表2。其它优选氨基酸序列是现有技术中未鉴定的序列,如参考文献5、6、7、8、9、10、11和13中未鉴定的序列。
本发明也提供了核酸序列SEQ ID NO 9991-10273中任一种或SEQ ID NO:10274内编码的多肽。核酸中的编码序列优选开始于起始密码子,终止于终止密码子。优选的多肽是现有技术中未鉴定的序列,如参考文献5、6、8、10和11中未鉴定的序列。
本发明还提供包含与实施例中公开的氨基酸序列具有序列相同性的氨基酸序列的多肽。相似地,本发明提供了含有与SEQ ID NO 9991-10273或SEQ ID NO:10274内编码的氨基酸序列有序列相同性的氨基酸序列的多肽。针对特定序列,序列相同性程度优选大于50%(如60%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高)。这些多肽包括同源物、直向同源物、等位基因变体和突变体。一般地,两种多肽序列之间相同性为50%或更高被认为是功能等效的标志。优选用MPSRCH程序(Oxford Molecular)中运行的Smith-Waterman同源性检索算法来确定多肽间的相同性,其采用带有参数缺口开放罚分=12和缺口延伸罚分=1的仿射缺口检索来进行。
与实施例的序列相比,这些多肽可包含一个或多个(如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10等)保守的氨基酸取代,即用具有相关侧链的另一种氨基酸取代原有氨基酸。遗传编码氨基酸通常分成4种家族:(1)酸性,即天冬氨酸、谷氨酸;(2)碱性,即赖氨酸、精氨酸、组氨酸;(3)非极性,即丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸;和(4)不带电荷的极性氨基酸,即甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、半胱氨酸、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸。有时将苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸一起称为芳族氨基酸。通常,这些家族中的单个氨基酸的替换不会对生物活性产生重要影响。而且,相对于参比序列,所述多肽可以有一个或多个(如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10等)单个氨基酸的缺失。而且,相对于参比序列,所述多肽可包含一个或多个(如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10等)插入(如1、2、3、4或5个氨基酸)。
优选的多肽包含那些脂质化的、位于外膜中的、位于内膜中的、或位于周质中的多肽。尤其优选的多肽是同时属于这些范畴中1种以上的多肽,如位于外膜中的脂质化多肽。翻译后加工信号肽后脂蛋白的N端半胱氨酸共价连接于脂质。
可以进行脂质化的多肽包括:SEQ ID NO:620、630、660、724、946、1196、1304、1510、1530、1548、1600、1700、1958、2030、2396、2610、3040、3364、3414、3422、3554、3678、3824、4072、4116、4178、4240、4374、4412、4462、4576、4664、4856、5178、5286、5362、5662、5682、5984、6018、6132、6256、6286、6532、6714、6754、6764、6790、6938、7144、7442、7674、7872、8278、8498、8564、8782、8784、9276和9580。SEQ ID NO 5662(ORF02831)和8564(ORF04282)是优选的脂蛋白。
优选的多肽见表2。
本发明还提供包含实施例中公开的氨基酸序列的片段的多肽。相似地,本发明提供了含有SEQ ID NO 9991-10273或SEQ ID NO:10274内编码的氨基酸序列的片段的多肽。所述片段包含该序列中至少n个连续氨基酸,针对特定序列,n为7或更大(如8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100或更大)。所述片段可包含该序列的至少一个T细胞表位,或优选地,B细胞表位。T细胞表位和B细胞表位可凭经验鉴定(如采用PEPSCAN[14、15]或类似方法)或预测(如采用Jameson-Wolf抗原性指数[16]、矩阵基方法[17]、TEPITOPE[18]、神经网络[19]、OptiMer&EpiMer[20、21]、ADEPT[22]、Tsites[23]、亲水性[24]、抗原性指数[25]或参考文献26公开的方法等)。其它优选片段为(a)本发明多肽的N端信号肽、(b)不具有N端信号肽的本发明多肽、(c)不具有1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个N端氨基酸残基的本发明多肽。
其它优选的片段为以可能的起始密码子(ATG、GTG、TTG)编码的氨基酸开始的那些片段。从所示起始密码子下游的起始密码子编码的甲硫氨酸处开始的片段为本发明多肽。
其它优选的片段为那些与本发明多肽以及与由参考文献5、6、8、10和11中的任一篇鉴定的多肽相同的片段。
本发明多肽可以许多方式制备,如化学合成(全部或部分)、用蛋白酶消化较长多肽、对RNA进行翻译、从细胞培养物(如重组表达的细胞培养物)或生物体本身(如经过细菌培养或直接来自患者的生物体)进行纯化等。制备长度<40个氨基酸的多肽的优选方法包括体外化学合成[27、28]。尤其优选固相的肽合成,如基于tBoc或Fmoc[29]化学的方法。也可部分或全部采用酶合成[30]。作为对化学合成的替代方法,还可采用生物合成,例如可以通过翻译来制备多肽。这可在体外或体内进行。生物学方法通常限于制备L氨基酸多肽,然而操控翻译机器(如氨酰基tRNA分子)可用于引入D氨基酸(或其它非天然氨基酸,如碘化酪氨酸或甲基苯丙氨酸、叠氮高丙氨酸等)[31]。然而,含有D氨基酸时,优选采用化学合成方法。可在C末端和/或N末端对本发明多肽进行共价修饰。
本发明多肽可采取各种形式(如天然、融合、糖基化、非糖基化、脂质化、非脂质化、磷酸化、非磷酸化、十四烷基化、非十四烷基化、单体、多聚体、颗粒、变性等)。
优选提供纯化或基本纯化形式,即基本上不含其它多肽(如不含天然产生的多肽),尤其是不含其它ExPEC或宿主细胞多肽的本发明多肽,通常至少约50%纯(重量),通常至少约90%纯,即其它表达多肽占该组合物的约50%以下,更优选约10%以下(如5%或更少)。本发明多肽优选为ExPEC多肽,更优选MNEC多肽。
本发明多肽可连接于固相载体。本发明多肽可包含检测标记(如放射性或荧光标记或生物素标记)。
术语“多肽”指任何长度的氨基酸聚合物。所述聚合物可以是直链或支链,它可包含修饰氨基酸,并且可被非氨基酸所中断。所述术语还涵盖经天然修饰或介入(intervention)修饰的氨基酸聚合物;例如,二硫键形成、糖基化、脂质化、乙酰化、磷酸化或任何其它操控或修饰,如与标记组分偶联。该定义还包括(例如)含有一个或多个氨基酸类似物(包括(如)非天然氨基酸等)以及其它本领域公知修饰的多肽。多肽可以单链或结合链的形式存在。本发明多肽可以是天然或人工糖基化的多肽(即所述多肽的糖基化模式与在相应的天然产生多肽中发现的糖基化模式不同)。
本发明多肽的长度可以是至少40个氨基酸(如至少40、50、60、70、80、90、100、120、140、160、180、200、220、240、260、280、300、350、400、450、500或更多)。本发明多肽可短于500个氨基酸(如不超过40、50、60、70、80、90、100、120、140、160、180、200、220、240、260、280、300、350、400或450个氨基酸)。
本发明提供的多肽包含序列-X-Y-或-Y-X-,其中:-X-为上述定义的氨基酸序列,-Y-并非上述定义的序列,即本发明提供融合蛋白。当多肽编码序列的N末端密码子并非ATG时,所述密码子将会按照该密码子的标准氨基酸进行翻译而不是翻译成Met,这种情况发生在该密码子翻译成起始密码子时。
本发明提供一种制备本发明多肽的方法,包括在诱导多肽表达的条件下培养本发明的宿主细胞的步骤。
本发明提供一种制备本发明多肽的方法,其中所述多肽部分或完全用化学方法合成。
本发明提供一种含有两种或多种(如2、3、4、5、6或更多种)本发明多肽的组合物。可选择不同多肽,以使它们参与不同的细菌代谢和/或信号转导途径,如从2、3、4、5、6或更多种以下分类中选择:粘附素;自体转运蛋白;毒素;摄铁蛋白(ironacquisitions protein);和膜结合蛋白,具体包括完整的外膜蛋白。这种抗原组合可靶向对抗细菌生活周期的不同方面的免疫应答,产生更有效的免疫应答。
本发明还提供一种以通式NH2-A-[-X-L-]n-B-COOH表示的杂交多肽,其中X为上述定义的本发明多肽,L为任选的接头氨基酸序列,A为任选的N末端氨基酸序列,B为任选的C末端氨基酸序列,n为大于1的整数。n值在2和x之间,x值一般为3、4、5、6、7、8、9或10。优选地,n为2、3或4;更优选地为2或3;最优选地,n=2。在每种n的例子中,-X-可以相同或不同。在[-X-L-]的每种n的例子中,接头氨基酸序列-L-可有或无。例如,当n=2时,该杂交体可以是NH2-X1-L1-X2-L2-COOH、NH2-X1-X2-COOH、NH2-X1-L1-X2-COOH、NH2-X1-X2-L2-COOH等。接头氨基酸序列-L-一般为短序列(如20个或更少氨基酸,即19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1个)。例子包括有助于克隆的短肽序列、聚甘氨酸接头(即Glyn,其中n=2、3、4、5、6、7、8、9、10或更大)、和组氨酸标签(即Hisn,其中n=3、4、5、6、7、8、9、10或更大)。其它合适的接头氨基酸序列对本领域技术人员而言是显而易见的。-A-和-B-为任选序列,一般为短序列(如40个或更少氨基酸,即39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1个)。例子包括指导多肽运输的前导序列,或有助于克隆或纯化的短肽序列(如组氨酸标签,即Hisn,其中n=3、4、5、6、7、8、9、10或更大)。其它合适的N末端和C末端氨基酸序列对本领域技术人员而言是显而易见的。
可采用各种试验来评估本发明多肽的体内免疫原性。例如,多肽可重组表达并通过免疫印迹法用来筛选患者血清。多肽和患者血清之间发生阳性反应说明患者以前对所研究蛋白产生了免疫应答,即该蛋白为免疫原。这种方法还可用来鉴定优势免疫蛋白。
抗体
本发明提供与本发明多肽结合的抗体。它们可以是多克隆或单克隆抗体,并可由任何合适方法制备(如通过重组表达)。为了增加其与人免疫系统的相容性,所述抗体可以是嵌合抗体或人源化抗体[如,参考文献32和33],或可采用完全人抗。所述抗体可以包含检测标记(如用于诊断试验)。本发明抗体可以连接于固相载体。本发明抗体优选为中和抗体。
单克隆抗体对鉴定和纯化与之结合的单独多肽尤其有用。本发明的单克隆抗体也可以用作免疫测定、放射性免疫试验(RIA)或酶联免疫吸附试验(ELISA)等的试剂。在这些应用中,可用分析检测试剂如放射性同位素、荧光分子或酶标记抗体。以上述方法制备的单克隆抗体还可用于本发明多肽的分子鉴定或表征(表位作图)。
本发明抗体优选对大肠杆菌的ExPEC菌株具有特异性,即,相对于其它细菌(如,相对于非ExPEC大肠杆菌和相对于非大肠杆菌细菌),它们优选地与ExPEC大肠杆菌结合。更优选地,所述抗体对MNEC菌株具有特异性,即相对于其它细菌,包括相对于其它ExPEC大肠杆菌,它们优选地与MNEC细菌结合。
本发明抗体优选地以纯化或基本纯化形式提供。一般地,抗体存在于基本上不含其它多肽的组合物中,如组合物中其它多肽少于90%(重量),通常少于60%,更通常少于50%。
本发明抗体可以是任何同种型(如IgA、IgG、IgM,即α、γ或μ重链),然而通常为IgG。在IgG同种型中,抗体可以是IgG1、IgG2、IgG3、IgG4亚类。本发明抗体可具有κ或λ轻链。
本发明抗体可具有各种形式,包括完整抗体,抗体片段如F(ab’)2和F(ab)片段、Fv片段(非共价异二聚体)、单链抗体(如单链Fv分子(scFv))、小抗体、寡抗体(oligobody)等。术语“抗体”不暗指任何特定来源,并包括由非常规方法(如噬菌体呈现)所获得的抗体。
本发明提供一种检测本发明多肽的方法,包括如下步骤:(a)在适于形成抗体-抗原复合物的条件下将生物样品与本发明抗体接触;和(b)检测所述复合物。
本发明提供一种检测本发明抗体的方法,包括如下步骤:(a)在适于形成抗体-抗原复合物的条件下将生物样品(如血液或血清样品)与本发明多肽接触;和(b)检测所述复合物。
优选抗体与本发明多肽结合的亲和力明显大于本领域公知抗体。优选地,该亲和力至少比本领域公知抗体强1.5倍、2倍、5倍、10倍、100倍、103倍、104倍、105倍、106倍等。
核酸
本发明还提供包含编码本发明多肽的核苷酸序列的核酸(如SEQ ID NO:1-9989的奇数编码)。本发明也提供含有SEQ ID NO 9991-10273中任一项的核酸。本发明还提供包含与所述核苷酸序列有序列相同性的核苷酸序列的核酸。序列之间的相同性优选用上述Smith-Waterman同源检索算法确定。对于具体序列,序列相同性程度优选大于50%(如60%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更高)。
本发明还提供可与这些核酸杂交的核酸。杂交反应可以在不同“严格”条件下进行。本领域众所周知并公开了提高杂交严格性的条件[如参考文献34第7.52页]。相关条件的例子包括(以严格性递增的顺序):培育温度:25℃、37℃、50℃、55℃和68℃;缓冲液浓度:10×SSC、6×SSC、1×SSC、0.1×SSC(其中SSC为0.15M NaCl和15mM柠檬酸盐的缓冲液)及采用其它缓冲体系的等效物;甲酰胺浓度:0%、25%、50%和75%;培育时间从5分钟到24小时;1次、2次或更多次洗涤步骤;1分钟、2分钟或15分钟的洗涤培育时间;洗涤溶液:6×SSC、1×SSC、0.1×SSC或去离子水。杂交技术及其优化为本领域公知[如见参考文献34-37等]。
一些实施方式中,本发明核酸在低严格条件下与靶点杂交;在其它实施方式中它在中等严格条件下杂交;优选实施方式中,它在高度严格条件下杂交。低严格杂交条件的示例性参数组为50℃和10×SSC。中等严格杂交条件的示例性参数组为55℃和1×SSC。高度严格杂交条件的示例性参数组为68℃和0.1×SSC。
还提供了包含这些序列片段的核酸。它们应该包含序列中的至少n个连续核苷酸,根据特定序列,n为10或更多(如12、14、15、18、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90、100、150、200或更多)。优选的片段为与本发明核酸序列和参考文献5、6、8、10和11中任一篇所鉴定的核苷酸序列相同的那些片段。
本发明提供通式5′-X-Y-Z-3′的核酸,其中:-X-为由x个核苷酸组成的核苷酸序列;-Z-为z个核苷酸组成的核苷酸序列;-Y-为由以下片段组成的核苷酸序列:(a)选自SEQ ID NO:1-9989中奇数编码的核酸序列的片段;或(b)SEQ ID NO 9991-10273中任一项的片段;(c)SEQ ID NO:10274的片段;或(d)(a)或(b)或(c)的互补物;所述核酸5′-X-Y-Z-3′不是(i)SEQ ID NO:1-9989中奇数编码的核酸或SEQ ID NO9991-10273或SEQ ID NO:10274的片段,也不是(ii)(i)的互补物。-X-和/或-Z-部分可包含启动子序列(或其互补物)。
本发明也提供了含有SEQ ID 10274的至少n个连续核苷酸的片段的核酸,其中n为10或更大,如12、14、15、18、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90、100、150、200、250、300、350、400、450、500、600、700、800、900、1000、1500、2000、3000、4000、5000、10000、100000、1000000或更大。此核酸可以是单链(至少为部分单链),以便用作杂交探针和/或扩增引物。在一些实施方式中,该片段不是、或不包含现有ExPEC序列的片段,如不是参考文献5、6、7、8、9、10、11和13中任一篇特别公开的核酸序列的片段。在其它实施方式中,该片段也是现有ExPEC序列的片段,如与参考文献5、6、7、8、9、10、11和13中任一篇特别公开的核酸序列的片段相同。
本发明包括含有与这些序列互补的序列的核酸(如作为反义链或探针,或用作引物)。
本发明核酸可用于杂交反应(如Northern杂交或Southern印迹、或用于核酸微阵列或‘基因芯片’)、扩增反应(如PCR、SDA、SSSR、LCR、TMA、NASBA等)和其它核苷酸技术。
本发明核酸可具有各种形式(如单链、双链、载体、引物、探针、标记等)。本发明核酸可以是环状或支链,然而通常为直链。除非另有限定或要求,采用核酸的本发明任何实施方式均可采用双链形式和组成该双链形式的两条互补的单链形式。引物和探针通常为单链,反义核苷酸通常也是单链。
优选以纯化或基本纯化的形式,即基本上不含其它核酸(如不含天然产生的核酸)、尤其不含其它ExPEC或宿主细胞核酸的形式提供本发明核酸,通常为至少约50%纯(重量),通常至少约90%纯。本发明核酸优选地为ExPEC核酸。
本发明核酸可以多种方式制备,如完全或部分采用化学合成(如DNA的亚磷酰胺合成),用核酸酶消化较长核酸(如限制性酶),连接基因组或cDNA文库中的较短核酸或核苷酸(如采用连接酶或聚合酶)等。
本发明核酸可以连接于固相载体(如珠子、平板、滤纸、膜、玻片、微阵列载体、树脂等)。可用(如)放射性标记或荧光标记、或生物素标记标记本发明核酸。当该核酸用于检测技术,如该核酸是引物或探针时,标记特别有用。
术语“核酸”通常包括任何长度的核苷酸的聚合形式,其包含脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸和/或其类似物。它包括DNA、RNA、DNA/RNA杂交体。它还包括DNA或RNA类似物,如含有修饰主链(如肽核酸(PNA)或硫代磷酸酯)或修饰碱基的类似物。因此本发明包括mRNA、tRNA、rRNA、核酶、DNA、cDNA、重组核酸、支链核酸、质粒、载体、探针、引物等。当本发明的核酸采用RNA形式时,它可能或可能不带有5′帽。
本发明核酸包含序列,然而它们还可以包含非ExPEC序列(如上述通式5′-X-Y-Z-3′的核酸)。这对探针而言尤其适用,从而可使探针包含与靶核酸互补的第一序列和不与靶核酸互补的第二序列。引物中的任何此类非互补序列优选位于互补序列的5′。典型的非互补序列包含限制性位点或启动子序列。
本发明的核酸可用许多方法制备,如化学合成(至少一部分),用核酸酶(如限制性酶)消化较长核酸,连接基因组或cDNA文库中的较短核酸(如采用连接酶或聚合酶)等。
本发明核酸可以是载体的一部分,即设计用于转导/转染一种或多种细胞类型的核酸构建物的一部分。载体可以是,例如,设计用来分离、增殖和复制插入核苷酸的“克隆载体”,设计用来在宿主细胞中表达核苷酸序列的“表达载体”,设计用来生产重组病毒或病毒样颗粒的“病毒载体”,或包括超过一种类型的载体的属性的“穿梭载体”。优选的载体为质粒。“宿主细胞”包括单个细胞或细胞培养物,其可以作为或已经作为外源核酸的受体。宿主细胞包括单个宿主细胞的后代,并且由于天然、偶然或有意的突变和/或改变,所述后代不一定与原始亲代细胞完全相同(形态方面或总DNA互补物(complement)方面)。宿主细胞包括用本发明核酸在体内或体外转染或感染的细胞。
当核酸为DNA时,应理解,RNA序列中的“U”会被DNA中的“T”取代。相似地,当核酸为RNA时,应理解,DNA序列中的“T”会被RNA中的“U”取代。
当术语“互补物”或“互补”用于核酸时,指Watson-Crick碱基配对。因此C的互补物为G,G的互补物为C,A的互补物为T(或U),T(或U)的互补物为A。还可能使用如I(嘌呤肌苷)这样的碱基,与嘧啶(C或T)互补。所述术语还暗示了方向,即5′-ACAGT-3′的互补物为5′-ACTGT-3′而不是5′-TGTCA-3′。
本发明核酸可用于,如:制备多肽;作为在生物样品中检测核酸的杂交探针;产生核酸的额外拷贝;产生核酶或反义寡核苷酸;作为单链DNA引物或探针;或作为三链形式寡核苷酸。
本发明提供一种制备本发明核酸的方法,其中所述核酸为部分或全部采用化学方法合成的。
本发明提供包含本发明核苷酸序列的载体(如,克隆或表达载体)和转染有所述载体的宿主细胞。
本发明还提供包含用于扩增ExPEC核酸序列内所含模板序列的引物(如PCR引物)的试剂盒,所述试剂盒包括第一引物和第二引物,其中所述第一引物与所述模板序列基本互补,所述第二引物与所述模板序列的互补物基本互补,其中基本互补的所述引物部分确定了待扩增模板序列的末端。所述第一引物和/或第二引物可包括可检测标记(如荧光标记)。
本发明还提供一种试剂盒,其包括第一和第二单链寡核苷酸,其可以扩增单链或双链核酸(或其混合物)内所含的ExPEC模板核酸序列,其中:(a)所述第一寡核苷酸包含与所述模板核酸序列基本互补的引物序列;(b)所述第二寡核苷酸包含与所述模板核酸序列的互补物基本互补的引物序列;(c)所述第一寡核苷酸和/或所述第二寡核苷酸包含不与所述模板核酸互补的序列;和(d)所述引物序列确定了待扩增模板序列的末端。所述特征(c)的非互补序列优选位于所述引物序列的上游(即其5′方向)。(c)序列中一种或两种可包含限制性位点[如参考文献38]或启动子序列[如39]。第一寡核苷酸和/或第二寡核苷酸可包括可检测标记(如荧光标记)。
所述模板序列可以是基因组序列的任何部分(如SEQ ID NO:10274)。例如,可以是rRNA基因(如Turenne等(2000)J. Clin.Microbiol.38:513-520)或蛋白编码基因。所述模板序列优选为ExPEC特异性,更优选为MNEC特异性序列。
本发明也提供了计算机可读介质(如软盘、硬盘、CD-ROM、DVD等)和/或含有序列表中一个或多个序列的计算机数据库。该介质优选含有SEQ ID NO:10274。
本发明提供了检测本发明核酸的方法,所述方法包括以下步骤:(a)在杂交条件下将生物样品与本发明核酸探针接触以形成双链体;和(b)检测所述双链体。
本发明提供检测生物样品(如血液)的方法,包括如下步骤:在杂交条件下将生物样品与本发明核酸接触。所述方法可以包括核酸扩增(如,PCR、SDA、SSSR、LCR、TMA、NASBA等)或杂交(如微阵列、印迹、在溶液中与探针杂交等)。已经报道过用PCR检测临床样品中的ExPEC[如,见参考文献40]。在参考文献41中总体描述了基于核酸的临床试验。
本发明提供一种制备靶序列片段的方法,其中通过延伸核酸引物制备所述片段。所述靶序列和/或引物为本发明的核酸。所述引物延伸反应可包括核酸扩增(如,PCR、SDA、SSSR、LCR、TMA、NASBA等)。
本发明的核酸扩增可以是定量和/或实时扩增。
就本发明的某些实施方式而言,核酸长度优选为至少7个核苷酸(如8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、45、50、55、60、65、70、75、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、225、250、275、300个核苷酸或更长)。
就本发明的某些实施方式而言,核酸长度优选为至多500个核苷酸(如450、400、350、300、250、200、150、140、130、120、110、100、90、80、75、70、65、60、55、50、45、40、39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15个核苷酸或更短)。
本发明的引物和探针,以及其它用于杂交的核酸的长度优选为10-30个核苷酸(如10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30个核苷酸)。
突变细菌
本发明提供了本文所鉴定的一种或多种基因的表达已被敲除的大肠杆菌。基因敲除技术是本领域熟知的,以前报道了大肠杆菌的敲除突变体。
优选用编码区的等基因缺失进行敲除,但可采用任何其它合适技术,如启动子的缺失或突变、起始密码子的缺失或突变、反义抑制、抑制性RNA等。然而,在获得的细菌中,编码该基因产物的mRNA不存在和/或其翻译被抑制(如至野生型水平的1%以下)。
该细菌可用标记物基因取代敲除基因,如抗生素抗性标记物。
小泡
参考文献42描述了通过敲除mltA(胞壁质溶解性糖基转移酶)或大肠杆菌Tol-Pal复合物的一种或多种组分(如tolA、tolQ、tolB、pal和/或tolR)从MNEC菌株中制备小泡的方法。可以对细菌染色体进行一个或多个遗传改变或插入″特别的″附加型元件(如表达载体)来增加小泡表面保护性抗原的量和/或免疫可及性″接触″,从而改进小泡。
获得此类改进的一种方法是上调本发明多肽保护性抗原的表达。本领域熟知增加靶蛋白表达的多种不同遗传方案,它们可以分成两大类:一类依赖对染色体的修饰(如用较强的启动子替换野生型启动子、使天然抑制基因失活等)以增加内源性基因的表达,另一类则基于附加型元件(如高拷贝数质粒、携带工程改造的靶基因的载体等)或染色体中整合外源性保护性靶基因进行的重组表达。这些方法的实施例可以在参考文献44-50中找到。
提高小泡免疫原性和选择性的另一种方法是下调免疫优势非保护性抗原的表达或下调与共生菌株中找到的蛋白同源的蛋白。可以通过对LPS的脂质A部分进行脱毒降低小泡的可能毒性,从而获得进一步改进。先前描述了相似的改变,以从其它革兰阴性病原体中产生改进小泡(参见参考文献51和52)。
所有上述方案均可单独使用或联用以获得用于免疫原性组合物的改进小泡。本发明提供一种敲除了mltA和/或其Tol-Pal复合物的组分和下组中一种或多种的病原性大肠杆菌(尤其是MNEC):(i)在一种与编码本发明多肽的基因天然相连的启动子相比使本发明多肽表达水平升高的启动子的控制下编码本发明多肽的染色体基因;(ii)编码本发明多肽的自主复制的染色体外元件;和/或(iii)相对于野生型LPS减弱大肠杆菌LPS的脂质A部分毒性的遗传修饰。
本发明还提供可通过培育此类细菌获得的小泡,例如在细菌培养时,释放入培养基中的小泡。
药物组合物
本发明提供的组合物含有:(a)本发明的多肽、抗体、小泡和/或核酸;和(b)药学上可接受的载体。这些组合物可能适合用作免疫原性组合物,例如,或者用作诊断试剂,或者用作疫苗。本发明的疫苗可以是预防性疫苗或治疗性疫苗,但一般是预防性疫苗。
在一个具体方面,本发明提供了含有表达或过度表达下组编码的一种或多种多肽的一种或多种外膜泡(OMV)的免疫原性组合物:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ IDNO 511、2453、2455、2677、2691、4595、4747、7003、7051、8167、4627和5699;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%,并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
另一方面,本发明提供了含有表达或过度表达下组编码的一种或多种多肽的一种或多种外膜泡(OMV)的免疫原性组合物:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO8563、2727、9871、4671、5679、533、3221、3225和7003;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为来自核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%,并包含核苷酸序列(a)的至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
“药学上可接受的载体”包括自身不诱导产生对接受该组合物的个体有害的抗体的任何载体。合适的载体一般为大的、代谢缓慢的大分子如蛋白质、多糖、聚乳酸、聚乙醇酸、多聚氨基酸、氨基酸共聚物、蔗糖、海藻糖、乳糖和脂质聚集体(如油滴或脂质体)。此类载体对本领域技术人员为公知技术。所述疫苗还可包含稀释剂,如水、盐水、甘油等。此外,可存在助剂,如湿润剂或乳化剂、pH缓冲物质等。无菌无热原的磷酸盐缓冲生理盐水是典型的载体。对药学上可接受赋形剂的详细讨论参见参考文献289。
本发明的组合物可包含抗微生物剂、尤其是以多剂量形式包装时。
本发明的组合物可包含去污剂,如吐温(聚山梨醇酯),例如吐温80。去污剂的含量通常很低,如<0.01%。
本发明的组合物可包含钠盐(如氯化钠)以提供涨度(tonicity)。NaCl浓度一般为10±2mg/ml。
本发明的组合物通常包含缓冲液。一般为磷酸盐缓冲液。
本发明的组合物,尤其是当其将被冻干或当它们包含由冻干材料重建获得的物质时,可包含(如)约15-50mg/ml(如25mg/ml)的糖醇(如甘露醇)或二糖(如蔗糖或海藻糖)。在冻干前可将用于冻干的组合物的pH调整为约6.1。
本发明的多肽可与其它免疫调节剂一起给药。具体说,组合物通常包含疫苗佐剂。所述佐剂可选自TH1佐剂和TH2佐剂中的一种或多种,下面进行进一步论述。可用于本发明组合物的佐剂包括,但不限于:
A.含矿物质的组合物
适合用作本发明佐剂的含矿物质的组合物包括无机盐、如铝盐和钙盐。本发明包括无机盐,如氢氧化物(例如羟基氧化物)、磷酸盐(例如羟磷酸盐、正磷酸盐)、硫酸盐等[例如参见参考文献53的第8和9章]或不同无机化合物的混合物(如,磷酸盐和氢氧化物佐剂的混合物,任选地磷酸盐过量),该化合物采用任何合适的形式(例如凝胶、晶体、无定形等),优选吸附于盐。含矿物质的组合物制成金属盐颗粒[54]。
本发明疫苗中可含有铝盐,使Al3+剂量为每剂0.2-1.0mg。
在另一实施方式中,本发明佐剂含有磷酸铝和氢氧化铝。在一个更具体的实施方式中,该佐剂中磷酸铝的含量大于氢氧化铝,如磷酸铝与氢氧化铝的重量比为2∶1、3∶1、4∶1、5∶1、6∶1、7∶1、8∶1、9∶1或大于9∶1。更具体说,疫苗中的铝盐含量为每个疫苗剂量中0.4-1.0mg,或每个疫苗剂量中0.4-0.8mg,或每个疫苗剂量中0.5-0.7mg,或每个疫苗剂量中约0.6mg。
通常,通过优化分子之间的静电吸引选择优选的铝系佐剂或多种铝系佐剂如磷酸铝与氢氧化铝的比例,以便在所需pH下该抗原携带的电荷与所述佐剂相反。例如,在pH 7.4时pI~4的磷酸铝佐剂静电吸附溶菌酶,而非白蛋白。如果白蛋白是靶点,则应选择氢氧化铝佐剂(如pH 11.4)。或者,用磷酸盐预处理氢氧化铝能降低其pI,使其成为更多碱性抗原优选的佐剂。
典型的磷酸铝佐剂为无定形羟基磷酸铝,其PO4/Al摩尔比为0.84-0.92,包括约0.6mg Al3+/ml。可以采用低剂量磷酸铝进行吸附,如每剂量每个偶联物采用50-100μg Al3+。当采用磷酸铝并且不希望使抗原吸附于佐剂时,宜在溶液中包含游离磷酸根离子(如通过采用磷酸盐缓冲液)。
B.油乳剂
适合用作本发明佐剂的油乳剂组合物包括鲨烯-水乳剂,如MF59(采用微流化机将5%鲨烯、0.5%吐温80和0.5%Span 85制成亚微米颗粒)[参考文献53的第10章;还参见参考文献55-57,参考文献58的第12章]。MF59用作FLUADTM流感病毒三价亚基疫苗的佐剂。所述乳剂宜包含柠檬酸根离子,如10mM柠檬酸钠缓冲液。
用于该组合物中的尤其优选佐剂为亚微米水包油乳剂。本发明采用的优选的亚微米水包油乳剂为鲨烯/水乳剂,任选地包含不同量的MTP-PE,如含有4-5%(重量/体积)鲨烯、0.25-1.0%(重量/体积)吐温80(聚氧乙烯山梨糖醇单油酸酯)、和/或0.25-1.0%的Span85(山梨聚糖三油酸酯)以及任选的N-乙酰胞壁酰基-L-丙氨酰基-D-异谷氨酰氨酰基-L-丙氨酸-2-(1′-2′-二棕榈酰基-sn-甘油-3-羟基磷酰氧基)-乙胺(MTP-PE)的亚微米水包油乳剂。参考文献55和59-60中详细描述了用于组合物的亚微米水包油乳剂、其制备方法和免疫刺激剂如胞壁酰肽。
可以采用鲨烯、生育酚和吐温80的乳剂。所述乳剂可包含磷酸盐缓冲盐水。还可包含Span85(如1%)和/或卵磷脂。这些乳剂可含有2-10%的鲨烯、2-10%的生育酚和0.3-3%的吐温80,并且鲨烯:生育酚的重量比优选≤1,以提供更稳定的乳剂。此类乳剂中的一种可以通过以下方法制备:将吐温80溶于PBS以获得2%溶液,然后将90ml所述溶液与5g DL-α-生育酚和5ml鲨烯的混合物混合,然后微流化所述混合物。得到的乳剂可含有(如)平均直径为100-250nm,优选约180nm的亚微米油滴。
可以采用鲨烯、生育酚和Triton去污剂(如Triton X-100)的乳剂。
可以采用鲨烯、聚山梨醇80和泊洛沙姆401(“PluronicTML121”)的乳剂。可用磷酸盐缓冲盐水,pH7.4配制所述乳剂。所述乳剂可用作胞壁酰二肽的递送载体,并与苏氨酰-MDP一起用于“SAF-1”佐剂[61](0.05-1%Thr-MDP、5%鲨烯、2.5%普朗尼克(Pluronic)L121和0.2%聚山梨醇80)。它还可以在没有苏氨酰-MDP的情况下用作“AF”佐剂[62](5%鲨烯、1.25%普朗尼克(Pluronic)L121和0.2%聚山梨醇80)。优选进行微流化。
还可将完全弗氏佐剂(CFA)和不完全弗氏佐剂(IFA)用作本发明佐剂。
C.皂苷制剂[参考文献53第22章]
皂苷制剂也可用作本发明的佐剂。皂苷为甾醇糖苷和三萜糖苷的异种组,其发现于广泛的植物种类的树皮、叶、茎、根甚至花中。分离自皂树(QuillaiaSaponaria,Molina)树皮的皂苷作为佐剂已广泛研究。在商业上,皂苷还可获自丽花菝葜(Smilax ornata)(墨西哥菝葜)、满天星(Gypsophillapaniculata)(婚纱花)和肥皂草(Saponaria officianalis)(皂根)。皂苷佐剂制剂包括纯化制剂如QS21和脂质制剂如ISCOM。
皂苷组合物采用HPLC和RP-HPLC纯化。已鉴定出采用这些技术特别纯化的部分,包括:QS7、QS17、QS18、QS21、QH-A、QH-B和QH-C。优选地,皂苷为QS21。制备QS21的一种方法示于参考文献63。皂苷制剂还可包含甾醇,如胆固醇[64]。
皂苷和胆固醇的组合可用于形成免疫刺激复合物(ISCOM)的独特颗粒[参考文献53第23章]。ISCOM通常也包含磷脂,如磷脂酰乙醇胺或磷脂酰胆碱。任何已知皂苷均可用于ISCOM。优选地,ISCOM包含一种或多种QuilA、QHA和QHC。ISCOM在参考文献64-66中进一步描述。任选地,ISCOM不含另外的去污剂[67]。
有关皂苷基佐剂的进展的综述可见参考文献68和69。
D.病毒体或病毒样颗粒
病毒体和病毒样颗粒(VLP)也可用作本发明的佐剂。这些结构通常包含一种或多种来自病毒的蛋白,所述病毒任选结合磷脂或用磷脂配制。它们通常为不致病、不复制且通常不含有任何天然病毒基因组。所述病毒蛋白可由重组方法制备或从完整病毒中分离。这些适用于病毒体或VLP的病毒蛋白包括由如下病毒衍生的蛋白:流感病毒(如HA或NA)、乙肝病毒(如核心蛋白或衣壳蛋白)、戊肝病毒、麻疹病毒、辛德比斯病毒(Sindbis)、轮状病毒、口蹄疫病毒、反转录病毒、诺沃克病毒(Norwalk)、人乳头状瘤病毒、HIV、RNA噬菌体、Qβ噬菌体(如外被蛋白)、GA噬菌体、fr噬菌体、AP205噬菌体、和Ty(如反转录转座子Ty蛋白p1)。VLP在参考文献70-75中进一步讨论。病毒体在参考文献76中进一步讨论。
E.细菌或微生物衍生物
适用于本发明的佐剂包括细菌或微生物衍生物,如肠细菌脂多糖(LPS)的非毒性衍生物、脂质A衍生物、免疫刺激性寡核苷酸和ADP核糖基化毒素及其脱毒衍生物。
LPS的非毒性衍生物包括单磷酰脂质A(MPL)和3-O-脱酰化MPL(3dMPL)。3dMPL为带有4、5或6条酰化链的3脱-O-酰化单磷酰脂质A的混合物。优选的“小颗粒”形式的3脱-O-酰化单磷酰脂质A在参考文献77中公开。此类3dMPL“小颗粒”足够小,能通过0.22μm膜进行无菌过滤[77]。其它非毒性LPS衍生物包括单磷酰脂质A模拟物,如氨烷基氨基葡糖苷磷酸衍生物,如RC529[78、79]。
脂质A衍生物包括大肠杆菌来源的脂质A的衍生物,如OM174。OM174在参考文献80和81中进行了描述。
适合用作本发明佐剂的免疫刺激性寡核苷酸包括含有CpG基序(含有通过磷酸键与鸟嘌呤连接的未甲基化胞嘧啶的二核苷酸序列)的核苷酸序列。含有回文或聚(dG)序列的双链RNA和寡核苷酸也显现出免疫刺激性。
CpG可包括核苷酸修饰/类似物,如硫代磷酸修饰并可为双链或单链。参考文献82、83和84公开了可能的类似物取代,如用2′-脱氧-7-脱氮鸟苷代替鸟苷。CpG寡核苷酸的佐剂效果在参考文献85-90中进一步讨论。
CpG序列可指向TLR9,如基序GTCGTT或TTCGTT[91]。CpG序列可特异性诱导Th1免疫应答,如CpG-A ODN,或可更特异性地诱导B细胞应答,如CpG-B ODN。CpG-A和CpG-B ODN在参考文献92-94中讨论。优选的CpG为CpG-A ODN。
优选地,构建CpG寡核苷酸使5′端能进行受体识别。可选地,两种CpG寡核苷酸以其3′端相连以形成“免疫聚体(immunomers)”。参见例如,参考文献91和95-97。
其它免疫刺激性寡核苷酸包括双链RNA、或含有回文序列的寡核苷酸、或含有聚(dG)序列的寡核苷酸。
细菌ADP-核糖基化毒素及其脱毒衍生物可用作本发明的佐剂。优选地,蛋白获自大肠杆菌(大肠杆菌热不稳定肠毒素“LT”)、霍乱(“CT”)或百日咳(“PT”)。采用脱毒ADP-核糖基化毒素作为粘膜佐剂在参考文献98中描述,作为肠道外佐剂在参考文献99中描述。毒素或类毒素优选为包含A和B亚基的全毒素形式。优选地,A亚基包含脱毒突变;B亚基优选不突变。优选地,佐剂为脱毒LT突变体,如LT-K63、LT-R72和LT-G192。采用ADP-核糖基化毒素及其脱毒衍生物,尤其是LT-K63和LT-R72作为佐剂可参见参考文献100-107。氨基酸取代的参比数字优选根据参考文献108(特别纳入本文作参考)中所列的ADP-核糖基化毒素的A和B亚基的比对得到。
式I、II或III化合物或其盐也可以用作佐剂:
I II III
如参考文献109所述,如‘ER803058’、‘ER803732’、‘ER804053’、‘ER804058’、‘ER804059’、‘ER804442’、‘ER804680’、‘ER804764’、‘ER803022’或‘ER804057’例如:
F.人免疫调制剂
适合用作本发明佐剂的人免疫调制剂包括细胞因子如白介素(如IL-1、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-12[110]等)[111]、干扰素(如干扰素γ)、巨噬细胞集落刺激因子、肿瘤坏死因子和巨噬细胞炎性蛋白-1α(MIP-1α)和MIP-1β[112]。
G.生物粘合剂和粘膜粘合剂
生物粘合剂和粘膜粘合剂也可用作本发明的佐剂。合适的生物粘合剂包括酯化透明质酸微球体[113]或粘膜粘合剂如聚(丙烯酸)、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、多糖和羧甲基纤维素的交联衍生物。壳聚糖及其衍生物也可用作本发明的佐剂[114]。
H.微粒
微粒也可用作本发明的佐剂。优选为可生物降解及无毒性物质(如聚(α羟酸)、聚羟基丁酸、聚原酸酯、聚酐、聚己酸内酯等)材料形成的颗粒(即直径在~100nm-~150μm的颗粒,更优选直径在~200nm-30μm,最优选直径在~500nm-~10μm),优选具有丙交酯乙交酯共聚物,任选处理以具有带负电表面(如用SDS处理)或带正电表面(例如用阳离子去污剂如CTAB处理)。
I.脂质体(参考文献53第13和14章)
适合用作佐剂的脂质体制剂的例子如参考文献115-117中所述。
J.聚氧乙烯醚和聚氧乙烯酯制剂
适用于本发明的佐剂包括聚氧乙烯醚和聚氧乙烯酯[118]。此类制剂进一步包括结合有辛苯昔醇的聚氧乙烯山梨聚糖酯表面活性剂[119]和结合有至少一种其它非离子表面活性剂如辛苯昔醇的聚氧乙烯烷基醚或酯表面活性剂[120]。优选的聚氧乙烯醚选自:聚氧乙烯-9-月桂基醚(laureth 9)、聚氧乙烯-9-硬脂酰醚、聚氧乙烯-8-硬脂酰醚、聚氧乙烯-4-月桂基醚、聚氧乙烯-35-月桂基醚和聚氧乙烯-23-月桂基醚。
K.磷腈如PCPP
磷腈佐剂包括参考文献121和122中所述的聚[二(羧基苯氧基)磷腈](poly[di(carboxylatophenoxy)phosphazene],“PCPP”)。
L.胞壁酰肽
适合用作本发明佐剂的胞壁酰肽的例子包括N-乙酰-胞壁酰-L-苏氨酰-D-异谷氨酰胺(thr-MDP)、N-乙酰-去甲胞壁酰-L-丙氨酰-D-异谷氨酰胺(去甲MDP)和N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酰-D-异谷氨酰胺酰-L-丙氨酸-2-(1′-2′-二棕榈酰-sn-甘油-3-羟基磷酰氧基)-乙胺(MTP-PE)。
M.咪唑并喹啉(imidazoquinolone)化合物
咪唑并喹啉佐剂包括咪喹莫特(“R-837”)[123、124]、雷西莫特(“R-848”)[125]及其类似物;和它们的盐(如盐酸盐)。关于免疫刺激性咪唑并喹啉的进一步细节可以在参考文献126-130中找到。
N.硫代缩氨基脲化合物
硫代缩氨基脲化合物的例子以及适合用作本发明佐剂的化合物的配制方法、制备方法和筛选方法包括如参考文献131所述的内容。所述硫代缩氨基脲对刺激人外周血单核细胞产生细胞因子(如TNF-α)特别有效。
O.色胺酮化合物
色胺酮化合物的例子以及适合用作本发明佐剂的化合物的配制方法、制备方法和筛选方法包括如参考文献132所述的内容。所述色胺酮化合物对刺激人外周血单核细胞产生细胞因子(如TNF-α)特别有效。
P.核苷类似物
各种核苷类似物可用作佐剂,如(a)Isatorabine(ANA-245;7-硫杂-8-氧代鸟苷)及其前药:
(b)ANA975;(c)ANA-025-1;(d)ANA380;(e)如参考文献133-135公开的化合物;(f)具有下式的化合物:
式中:
R1和R2各自独立地是H、卤素、-NRaRb、-OH、C1-6烷氧基、取代C1-6烷氧基、杂环基、取代杂环基、C6-10芳基、取代C6-10芳基、C1-6烷基或取代C1-6烷基;
R3不存在,或者是H、C1-6烷基、取代C1-6烷基、C6-10芳基、取代C6-10芳基、杂环基或取代杂环基;
R4和R5各自独立地是H、卤素、杂环基、取代杂环基、-C(O)-Rd、C1-6烷基、取代C1-6烷基、或结合在一起形成如R4-5所示的5元环:
在表示的化学键处实现结合
X1和X2各自独立地是N、C、O或S;
R8为H、卤素、-OH、C1-6烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、-OH、-NRaRb、-(CH2)n-O-Rc、-O-(C1-6烷基)、-S(O)pRe或-C(O)-Rd;
R9为H、C1-6烷基、取代C1-6烷基、杂环基、取代杂环基或R9a,其中
R9a为:
R10和R11各自独立地是H、卤素、C1-6烷氧基、取代C1-6烷氧基、-NRaRb或-OH;
Ra和Rb各自独立地是H、C1-6烷基、取代C1-6烷基、-C(O)Rd、C6-10芳基;
Rc各自独立地是H、磷酸、二磷酸、三磷酸、C1-6烷基或取代C1-6烷基;
Rd各自独立地是H、卤素、C1-6烷基、取代C1-6烷基、C1-6烷氧基、取代C1-6烷氧基、-NH2、-NH(C1-6烷基)、-NH(取代C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)2、-N(取代C1-6烷基)2、C6-10芳基或杂环基;
Re各自独立地是H、C1-6烷基、取代C1-6烷基、C6-10芳基、取代C6-10芳基、杂环基或取代杂环基;
Rf各自独立地是H、C1-6烷基、取代C1-6烷基、-C(O)Rd、磷酸、二磷酸或三磷酸;
n各自独立地是0、1、2或3;
p各自独立地是0、1或2;或
或(g)(a)-(f)中任一项的药学上可接受的盐、(a)-(b)中任一项的互变异构体、或所述互变异构体的药学上可接受的盐。
Q.连到含磷酸无环主链上的脂质
包含连接于含磷酸无环主链的脂质的佐剂包括TLR4拮抗剂E5564[136、137]:
R.小分子免疫增强剂(SMIP)
SMIP包括:
·N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2,N2-二甲基-1-(2-甲基丙基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-乙基-N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-N2-丙基-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·1-(2-甲基丙基)-N2-丙基-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-丁基-1-(2-甲基丙基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-丁基-N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-N2-戊基-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-N2-丙-2-烯基-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·1-(2-甲基丙基)-2-[(苯基甲基)硫]-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-4-胺;
·1-(2-甲基丙基)-2-(丙硫基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-4-胺;
·2-[[4-氨基-1-(2-甲基丙基)1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2基](甲基)氨基]乙醇;
·乙酸2-[[4-氨基-1-(2-甲基丙基)1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2基](甲基)氨基]乙酯;
·4-氨基-1-(2-甲基丙基)-1,3-二氢-2H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2-酮;
·N2-丁基-1-(2-甲基丙基)-N4,N4-双(苯基甲基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-丁基-N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-N4,N4-双(苯基甲基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2-甲基-1-(2-甲基丙基)-N4,N4-双(苯基甲基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·N2,N2-二甲基-1-(2-甲基丙基)-N4,N4-双(苯基甲基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺;
·1-{4-氨基-2-[甲基(丙基)氨基]-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-1基}-2-甲基丙-2醇;
·1-[4-氨基-2-(丙基氨基)-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-1基]-2-甲基丙-2醇;
·N4,N4-二苄基-1-(2-甲氧基-2-甲基丙基)-N2-丙基-1H-咪唑并[4,5-c]喹啉-2,4-二胺。
S.蛋白体
一种佐剂为由第一种革兰阴性菌制备的外膜蛋白蛋白体制备物和由第二种革兰阴性菌制备的脂糖类(liposaccharide)制备物的组合,其中所述外膜蛋白蛋白体和脂糖类制备物形成稳定的非共价佐剂复合物。此类复合物包括“IVX-908”,它是由脑膜炎奈瑟球菌(Neisseria meningitidis)外膜和脂多糖组成的复合物。它们已被用作流感疫苗的佐剂[138]。
T.其它佐剂
作为免疫刺激剂的其它物质公开于参考文献53的第7章、参考文献53和58。有用的佐剂物质还包括:
·甲基肌苷5′单磷酸(“MIMP”)[139]。
·一种多羟基化的吡咯烷士定化合物[140],如下式化合物:
式中R选自:氢,直链或支链的、未取代或取代的、饱和或不饱和的酰基、烷基(如环烷基)、烯基、炔基或芳基、或者其药学上可接受的盐或衍生物。例子包括,但不限于:木麻黄素(casuarine)、木麻黄素-6-α-D-吡喃葡萄糖、3-表-木麻黄素、7-表-木麻黄素、3,7-二表-木麻黄素等。
·γ菊糖[141]或其衍生物,如algammulin。
·参考文献142中公开的化合物。
·参考文献143中公开的化合物,包括:酰基哌嗪化合物、吲哚二酮化合物、四氢异喹啉(tetrahydraisoquinoline,THIQ)化合物、苯并环二酮化合物、氨基氮杂乙烯基化合物、氨基苯并咪唑喹啉酮(ABIQ)化合物[144、145]、氢化邻苯二甲酰胺(hydrapthalamide)化合物、二苯甲酮化合物、异唑化合物、甾醇化合物、喹唑啉酮化合物、吡咯化合物[146]、蒽醌化合物、喹啉化合物、三嗪化合物、吡唑并嘧啶(Pyrazalopyrimidine)化合物和吲哚化合物[147]。
·罗唑利宾(7-烯丙基-8-氧代鸟苷)[148]。
·阳离子脂类和(通常为中性的)共脂如氨基丙基-二甲基-肉豆蔻酰氧基-溴化丙铵-二植烷酰基磷脂酰基-乙醇胺(“VaxfectinTM”)或氨基丙基-二甲基-双-十二烷氧基-溴化丙铵-二油酰基磷脂酰基-乙醇胺(“GAP-DLRIE:DOPE”)的制剂。优选含有(±)-N-(3-氨基丙基)-N,N-二甲基-2,3-双(顺式-9-四癸烯氧基)-1-丙铵盐的制剂。
本发明还包含上述一种或多种佐剂的组合。例如,以下组合物可用作本发明佐剂组合物:(1)皂苷和水包油乳剂[150];(2)皂苷(如QS21)+非毒性LPS衍生物(如3dMPL)[151];(3)皂苷(如QS21)+无毒性LPS衍生物(如3dMPL)+胆固醇;(4)皂苷(如QS21)+3dMPL+IL-12(可选地+甾醇)[152];(5)3dMPL与QS21和/或水包油乳剂的组合[153];(6)SAF,含有10%角鲨烷、0.4%吐温80TM、5%普朗尼克嵌段聚合物L121和thr-MDP,经微流化形成亚微米乳剂或经涡旋形成较大粒度的乳剂。(7)RibiTM佐剂体系(RAS)(Ribi免疫化学),其含有2%角鲨烯、0.2%吐温80TM和选自下组的一种或多种细菌细胞壁组分:单磷酰基脂质A(MPL)、二霉菌酸海藻糖酯(TDM)和细胞壁骨架(CWS),优选为MPL+CWS(DetoxTM);(8)一种或多种无机盐(如铝盐)+无毒性LPS衍生物(如3dMPL);和(9)一种或多种无机盐(如铝盐)+免疫刺激性寡核苷酸(如包含CpG基序的核苷酸序列)。
本发明的组合物优选地引起细胞介导免疫应答和体液免疫应答以有效地应对尿路病原性感染。所述免疫应答优选地诱导出长效(如中和)抗体和细胞介导的免疫力从而在遇到MNEC-相关抗原时能够快速应答。
通常认为两类T细胞CD4和CD8细胞是启动和/或增强细胞介导免疫和体液免疫必需的。CD8 T细胞能够表达CD8共受体,通常被称为细胞毒性T淋巴细胞(CTL)。CD8细胞能够识别MHC I类分子呈现的抗原或与之相互作用。CD4T细胞可表达CD4共受体,通常被称为T辅助细胞,CD4细胞能够识别与MHC II类分子结合的抗原性肽。通过与MHC II类分子相互作用,CD4细胞可分泌诸如细胞因子这样的因子。这些分泌的细胞因子可激活B细胞、细胞毒性T细胞、巨噬细胞和参与免疫应答的其它细胞。辅助T细胞或CD4+细胞可进一步分成两种功能不同的亚组:TH1表型和TH2表型,其不同之处在于细胞因子和效应器功能。
活化的TH1细胞增强细胞免疫(包括增加抗原特异性CTL的产量)并因此对细胞内感染的应答具有特殊价值。活化的TH1细胞可以分泌IL-2、IFN-γ和TNF-β中的一种或多种。TH1免疫应答可通过激活巨噬细胞、NK(自然杀伤)细胞和CD8细胞毒性T细胞(CTL)而导致局部炎性反应。TH1免疫应答还可通过以IL-12来刺激B细胞和T细胞的生长,从而扩展免疫应答。经TH1刺激的B细胞可分泌IgG2a。
活化的TH2细胞增加抗体产生并因此对细胞外感染的应答具有特殊价值。活化的TH2细胞可分泌IL-4、IL-5、IL-6和IL-10中的一种或多种。TH2免疫应答会导致产生IgG1、IgE、IgA和记忆B细胞,用于将来的防卫。
增强的免疫应答可包括增强的TH1免疫应答和TH2免疫应答中的一种或多种。增强的TH1免疫应答可包括CTL增加,一种或多种TH1免疫应答相关性细胞因子(如IL-2、IFN-γ和TNF-β)的增加、活化巨噬细胞的增加、NK活性的增加或IgG2a产量的增加中的一种或多种反应。优选地,增强的TH1免疫应答包括IgG2a产量的增加。增强的TH2免疫应答可包括一种或多种TH2免疫应答相关性细胞因子(如IL-4、IL-5、IL-6和IL-10)的增加、或IgG1、IgE、IgA和记忆B细胞的产量的增加中的一种或多种反应。优选地,增强的TH2免疫应答包括IgG1产量的增加。
采用TH1佐剂会引起TH1免疫应答。TH1佐剂通常引起IgG2a产量相对于无佐剂抗原免疫增加。适用于本发明的TH1佐剂可包括例如皂苷制剂、病毒体和病毒样颗粒、肠杆菌脂多糖(LPS)的无毒衍生物、免疫刺激性寡核苷酸。免疫刺激性寡核苷酸,如含有CpG基序的寡核苷酸,为优选的用于本发明的TH1佐剂。
采用TH2佐剂会引起TH2免疫应答。TH2佐剂通常引起IgG1产量相对于无佐剂抗原免疫增加。适用于本发明的TH2佐剂包括例如含矿物质的组合物、油乳剂和ADP核糖基化毒素及其脱毒衍生物。含矿物质的组合物,如铝盐为优选的适用于本发明的TH2佐剂。
优选地,本发明包括含有TH1佐剂和TH2佐剂的组合的组合物。优选地,此类组合物引起增强的TH1和增强的TH2应答,即相对于无佐剂免疫,IgG1和IgG2a的产量均有增加。更优选地,包含TH1和TH2佐剂组合的所述组合物相对于单佐剂免疫(即相对于单以TH1佐剂或单以TH2佐剂进行免疫)引起增强的TH1和/或增强的TH2免疫应答。
所述免疫应答可以是TH1免疫应答和TH2免疫应答中的一种或两种。优选地,免疫应答为增强的TH1应答和增强的TH2应答中的一种或两种。
所述增强的免疫应答可以是全身性和粘膜性免疫应答中的一种或两种。优选地,所述免疫应答为增强的全身性和增强的粘膜性免疫应答中的一种或两种。优选地,粘膜性免疫应答为TH2免疫应答。优选地,粘膜性免疫应答包括IgA产量的增加。
尤其优选采用氢氧化铝或磷酸铝佐剂,抗原通常吸附于此类盐。磷酸钙为另一种优选佐剂。
本发明的组合物的pH优选在6-8之间,优选地为大约7。采用缓冲液维持pH的稳定。当组合物包含氢氧化铝盐时,优选采用组氨酸缓冲液[154]。组合物可以是无菌和/或无热原的。本发明的组合物可与人体等渗。
所述组合物可装在小瓶中,或者它们可装在预填充的注射器中。所述注射器可以带有或不带有针头。注射器包括单剂量的组合物,而小瓶可包括单剂量或多剂量。可注射组合物通常为液体溶液或悬液。或者,其可以固态形态存在(如冻干),在注射前用液态载体溶解或悬浮。
本发明的组合物可以单位剂量形式或以多剂量形式包装。就多剂量形式而言,小瓶优于预填充注射器。可以常规方法得到有效剂量体积,但注射用组合物的人体剂量一般为0.5ml。
当本发明的组合物需要在临用前临时制备(如一组分以冻干形式存放)并以药盒形式存放时,所述药盒可包括两个小瓶,或者可包括一个预填充的注射器和一个小瓶,注射之前用注射器中的内容物将小瓶中的内容物再激活。
因此本发明提供一种试剂盒,包括第一组分和第二组分,其中:所述第一组分包含一种或多种本发明的多肽、抗体、小泡和/或核酸;所述第二组分包含下组中的一种或多种:将组合物给予患者的说明书、注射器或其它递送装置、佐剂和/或药学上可接受的配制溶液。
本发明还提供一种预填充有本发明的免疫原性组合物的递送装置(如注射器)。
用作疫苗的免疫原性组合物包括免疫学有效量的抗原、和其它任何所需组分。‘免疫学有效量’指将所述量(以单剂量给药或作为连续剂量的一部分给药)给予个体能有效治疗或预防。所述量取决于待治疗个体的健康和身体状况、年龄、待治疗个体的分类组(如非人灵长类、灵长类等)、个体免疫系统合成抗体的能力、所需保护程度、疫苗的剂型、治疗医生对医学状况的评估和其它相关因素。预计所述量将落入可通过常规试验确定的相对宽的范围内,每个剂量中每种脑膜炎球菌糖抗原的含量一般为每抗原1μg-10mg。
药物应用
本发明还提供一种治疗患者的方法,包括给予患者治疗有效量的本发明组合物。患者可能自身处于患该病的风险中或可能为孕妇(‘母体免疫’[155])。
本发明提供用作药剂(如作为免疫原性组合物或作为疫苗)或用作诊断试剂的本发明的核酸、多肽、小泡或抗体。它还提供使用本发明的核酸、多肽、小泡或抗体来制造:(i)治疗或预防由ExPEC细菌引起的疾病和/或感染的药剂;(ii)检测针对ExPEC细菌的抗体是否存在的诊断试剂;和/或(iii)能产生针对ExPEC细菌的抗体的试剂。所述ExPEC细菌可以是任何血清型或菌株,但优选为MNEC菌株,如K1血清型和/或B2MLEE型。
本发明可用于预防和/或治疗疾病如菌血症、脑膜炎、尿路感染、肾盂肾炎和/或膀胱炎。本发明尤其可用于治疗脓毒症和/或脑膜炎。
患者优选为人。人可以是儿童(如年龄为0-18岁或0-5岁),可以是青少年(如年龄为15-19岁)、成年人(如年龄为19-54岁),或者可以是老年人(如年龄为55岁或更大年纪)。女性青少年和成年人是优选的患者。打算施用于儿童或青少年的疫苗也可给予成人,(例如)以评估其安全性、剂量、免疫原性等。
其它可能的动物患者包括犬,其可能为ExPEC携带者[156、157]。
一种检验治疗性治疗效果的方法包括在给予本发明组合物之后监控感染情况。一种检验预防治疗效果的方法包括在给药后监控针对给予的多肽的免疫应答情况。本发明的组合物的免疫原性可通过如下方法确定:将它们给予测试对象(如12-16个月大的儿童、或动物模型如小鼠模型),然后确定包括ELISA效价(GMT)在内的IgG的标准参数。通常在给予该组合物大约4周后测定这些免疫应答情况,并与给予组合物之前测定的值进行比较。当给予一个以上剂量的组合物时,可进行一次以上的给药后测定。也可以用脓毒症的成年小鼠模型、UTI的小鼠模型和新生大鼠中脑膜炎的被动保护评价效力。
给予多肽抗原为一种优选的诱导免疫的治疗方式。
给予本发明的抗体为另一种优选的治疗方式。这种被动免疫方式尤其适用于新生婴儿或怀孕妇女。这一方法一般采用单克隆抗体,如人源化抗体或完整的人抗体。
本发明的组合物通常直接给予患者。直接递送可通过如下方式实现:胃肠道外注射(如皮下、腹膜内、静脉内、肌肉内或组织间隙)、直肠施用、口服(如片剂、喷雾剂)、阴道施用、局部施用、经皮施用、经皮肤施用、鼻内施用、舌下施用、眼部施用、耳部施用、肺部施用或其它粘膜施用。优选肌肉内施用到大腿或上臂。注射可通过针头(如皮下注射针头)实现,然而还可使用无针注射。典型的肌肉内剂量为0.5ml。
本发明可用于引起全身性和/或粘膜性免疫。优选地,所述全身性和/或粘膜性免疫表现为增强的TH1和/或TH2免疫应答。优选地,增强的免疫应答包括IgG1和/或IgG2a和/或IgA的产量增加。
剂量治疗可以是单剂量方案或多剂量方案。多剂量可用于初次免疫方案和/或用于加强免疫方案。加强剂量方案可接在初次剂量方案之后。在多剂量方案中,可采用同样或不同的途径,如胃肠道外初次免疫和粘膜加强免疫、粘膜初次免疫和胃肠道外加强免疫等给予各种剂量。初次剂量之间的合适间隔(如4-16周)、以及初次和加强免疫之间的合适间隔可用常规方法确定。例如,疫苗接种的初次疗程包括1-10个单独剂量,之后以维持和/或加强免疫应答所必需的时间间隔给予其它剂量,例如,第二剂在1-4个月时给予,当需要时,几个月后给予后续剂量。
细菌感染影响身体的各个部分,因此组合物可以制备成各种形式。例如,组合物可以制备为液体溶液或悬液形式的注射剂。还可制备适于在注射前溶解或悬浮于液体载体中的固体形式(如冻干或喷雾冷冻干燥的组合物)。该组合物可制备成局部给药剂型,如软膏剂、乳膏剂或粉末剂。该组合物可制备成口服给药剂型,如片剂或胶囊、喷雾剂或糖浆(任选地进行调味)。所述组合物可制备成肺部给药剂型,如使用细粉或喷雾的吸入器。所述组合物可制备成栓剂或阴道栓剂。所述组合物可制备成鼻、耳或眼给药剂型,如喷雾剂、滴剂、凝胶或粉末[如参考文献158和159]。所述组合物可以为药盒形式,设计成临近给予患者前重建成混合的组合物。此类药盒可包括一种或多种液体形式的抗原和一种或多种冻干抗原。
本发明的组合物可以在与其它疫苗基本上相同的时间(如在相同的医疗咨询或问诊期间)给予患者,如基本上与下述疫苗相同的时间:麻疹疫苗、腮腺炎疫苗、风疹疫苗、MMR疫苗、水痘疫苗、MMRV疫苗、白喉疫苗、破伤风疫苗、百日咳疫苗、DTP疫苗、偶联的b型流感嗜血杆菌(H.influenzae)疫苗、人乳头瘤病毒疫苗、灭活脊髓灰质炎病毒疫苗、乙肝病毒疫苗、肺炎球菌偶联疫苗、脑膜炎球菌偶联疫苗等。类似地,它们可在与抗生素,尤其是对MNEC有活性的抗生素化合物基本上相同的时间(如在相同的医疗咨询或问诊期间)给予患者。
本发明组合物的其它抗原组分
本发明还提供一种包含本发明多肽和一种或多种下述其它抗原的组合物:
-脑膜炎奈瑟球菌(N.meningitides)血清组A、C、W135和/或Y(优选所有四种)的糖抗原,如在参考文献160中公开的血清组C的寡糖[还参见参考文献161]或参考文献162中的寡糖。
-脑膜炎奈瑟球菌血清组B的抗原,如参考文献163-171等公开的抗原。
-肺炎链球菌(Streptococcuspneumoniae)的糖抗原[如172、173、174]。
-甲肝病毒抗原,如灭活病毒[如175、176]。
-乙肝病毒抗原,如表面抗原和/或核心抗原[如176、177]。
-白喉抗原,如白喉类毒素[如参考文献178第3章]如CRM197突变体。
-丙肝病毒的抗原[如180]。
-HIV抗原[181]。
-破伤风抗原,如破伤风类毒素[如参考文献178第4章]。
-百日咳博德特菌(Bordetella pertussis)的抗原,如百日咳博德特菌的百日咳全毒素(PT)和丝状血凝素(FHA),任选地还与百日咳杆菌黏附素(pertactin)和/或凝集原2和3混合[如参考文献182和183]。
-流感嗜血杆菌B(Haemophilus influenzae B)的糖抗原[如161]。
-骨髓灰质炎抗原[如184、185]如IPV。
-麻疹、腮腺炎和/或风疹抗原[如参考文献178第9、10和11章]。
-水痘抗原。
-流感抗原[如参考文献178第19章],如血凝素和/或神经氨酸酶表面蛋白。流感抗原可衍生自大规模流行性(每年)流感毒株。流感抗原可衍生自有可能引起大规模爆发的毒株(即与目前循环毒株的血凝素相比具有新的血凝素的流感毒株,或者对家禽具有病原性并且有可能横向传播给人群的流感毒株,或对人具有病原性的流感毒株)。流感抗原可衍生自在鸡蛋或细胞培养物中生长出来的病毒。
-卡他莫拉菌(Moraxella catarrhalis)的抗原[如186]。
-无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)(B型链球菌)的糖抗原。
-无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)(B型链球菌)的蛋白抗原[如187、188]。
-淋病奈瑟球菌(N.gonorrhoeae)的抗原[如189-192]。
-肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)的抗原[如参考文献193-199]或来自肺炎衣原体的抗原的组合[如200]。
-沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis)的抗原,或来自沙眼衣原体的抗原的组合[如201]。
-牙龈炎卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis)的抗原[如202]。
-狂犬病抗原[如203],如冻干的灭活病毒[如204,RabAvertTM]。
-副粘病毒如呼吸道合胞病毒(RSV[205、206])和/或副流感病毒(PIV3[207])的抗原。
-炭疽杆菌(Bacillus anthracis)抗原[如208、209、210]。
-酿脓链球菌(Streptococcus pyogenes)(A型链球菌)的抗原[如188、211、212]。
-金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的抗原[如213]。
-黄病毒属病毒的抗原,如黄热病病毒、日本脑炎病毒、登格热病毒的四种血清型、蜱传播性脑炎病毒、西尼罗河病毒的抗原。
-瘟病毒抗原,如经典猪热病病毒、牛病毒性腹泻病毒和/或边界病病毒的抗原。
-细小病毒,如细小病毒B19的抗原。
-人乳头瘤病毒(HPV)抗原[214]。
本组合物可包含一种或多种这些其它抗原。
优选的淋球菌抗原包括ngs13(OmpA)、OmpH、ngs576(肽基脯氨酰顺/反异构酶(PPI酶)蛋白)、ngs41和ngs117中的一种或多种。
优选的HPV抗原包括HPV16、HPV18、HPV6和HPV11中的一种或多种。
优选的沙眼衣原体抗原包括下组的一种或多种:CT045、CT089、CT242、CT316、CT381。CT396、CT398、CT444、CT467、CT547、CT587、CT823、CT761和这些抗原的特定组合,其公开于WO 05/002619。
优选的肺炎衣原体抗原包括下组的一种或多种:CPn0324、Cpn0301、Cpn0482、Cpn0503、Cpn0525、Cpn0558、Cpn0584、Cpn0800、Cpn0979、Cpn0498、Cpn0300、Cpn0042、Cpn0013、Cpn450、Cpn0661、Cpn0557、Cpn0904、Clpn0795、Cpn0186和Cpn0604以及这些抗原的特定组合,其公开于WO05/084306。
优选的GBS抗原包括GBS80、GBS104、GBS59、GBS67、GBS322和GBS276中的一种或多种。
在另一个实施方式中,将本发明抗原与适用于经设计能保护女性不得泌尿系统和/或性传播疾病的疫苗中的一种或多种其它非大肠杆菌抗原混合。例如,所述抗原可与衍生自下组的抗原混合:无乳链球菌、沙眼衣原体、淋病奈瑟球菌、乳头瘤病毒和单纯疱疹病毒。使用人乳头状瘤病毒抗原时,它们可能来自HPV16、HPV18、HPV6和/或HPV11中的一种或多种。
在另一个实施方式中,本发明的抗原组合与适用于经设计能保护老年人或免疫削弱个体的疫苗中的一种或多种其它非大肠杆菌抗原混合。例如,所述抗原组合可与衍生自下组的抗原混合:粪肠球菌(Enterococcus faecalis)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermis)、铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)、嗜肺军团菌(Legionella pneumophila)、单核细胞增生利斯特菌(Listeria monocytogenes)、脑膜炎奈瑟球菌(Neisseria meningitidies)、流感病毒和副流感病毒(‘PIV’)。
在需要时可对毒性蛋白抗原进行脱毒(如通过化学和/或遗传方法对百日咳毒素进行脱毒[183])。
该组合物中含有白喉抗原时,优选还包含破伤风抗原和百日咳抗原。类似地,在包含破伤风抗原的情况下,优选还包含白喉抗原和百日咳抗原。类似地,在包含百日咳抗原的情况下,优选还包含白喉抗原和破伤风抗原。因此优选DTP组合物。
糖抗原优选为偶联物形式。偶联物的载体蛋白包括细菌毒素(例如白喉类毒素或破伤风类毒素)、脑膜炎奈瑟球菌外膜蛋白[215]、合成肽[216、217]、热激蛋白[218、219]、百日咳蛋白[220、221]、来自流感嗜血杆菌的蛋白D[222、223]、细胞因子[224]、淋巴因子[224]、流感嗜血杆菌蛋白、激素[224]、生长因子[224]、来自艰难梭菌(C.difficile)的毒素A或毒素B[225]、摄铁蛋白[226]、含有各种病原体衍生抗原的多个人CD4+T细胞表位的人工蛋白[227]例如N19蛋白[228]、肺炎球菌表面蛋白PspA[229]、肺炎球菌溶血素[230]等。优选的载体蛋白为CRM197蛋白[231]。
该组合物中各抗原的浓度一般为至少1μg/ml。总体而言,任何给定抗原的浓度都足以引起针对该抗原的免疫应答。
优选地,抗原吸附于铝盐。
核酸免疫
上述免疫原性组合物包括来自MNEC的多肽抗原。作为将蛋白抗原用于本发明免疫原性组合物的替代方法,可以采用编码该抗原的核酸(优选为DNA,如质粒形式),以提供基于核酸免疫的组合物、方法和用途。目前核酸免疫已经是一个成熟的领域(如,参考文献232-239等),已应用于许多疫苗。
编码免疫原的核酸在被递送到患者体内后进行体内表达,表达的免疫原进而刺激免疫系统。活性成分通常采用包含以下组件的核酸载体形式:(i)启动子;(ii)编码免疫原的序列,其操作性连接于所述启动子;和任选的(iii)选择性标记。优选的载体还可包含(iv)复制起点;和(v)位于(ii)下游并与之操作性连接的转录终止子。通常,(i)和(v)为真核来源,而(iii)和(iv)为原核来源。
优选的启动子为病毒启动子,如巨细胞病毒(CMV)的启动子。除了启动子外,该载体还可包括转录调控序列(如增强子),其在功能上与启动子相互作用。优选的载体包括立即早期CMV增强子/启动子,更优选的载体还包括CMV内含子A。启动子操作性连接于编码免疫原的下游序列,从而对免疫原编码序列的表达进行控制。
使用标记时,其优选在微生物宿主中(如在原核生物中、在细菌中、在酵母中)起作用。所述标记优选为原核选择性标记(如在原核启动子的控制下转录)。方便起见,标记一般为抗生素抗性基因。
本发明的载体优选为自主复制附加型载体或自主复制染色体外载体,如质粒。
本发明的载体优选包含复制起点。优选地,所述复制起点在原核生物中有活性而在真核生物中无活性。
因此,优选的载体包括用于选择该载体的原核标记、原核性复制起点,还包括用于驱动免疫原编码序列转录的真核启动子。因此所述载体(a)在原核宿主中扩增并选择而不表达多肽,但(b)在真核宿主中表达而不扩增。这种安排对核酸免疫载体很理想。
本发明的载体可包含位于编码序列下游的真核转录终止子序列。这将提高转录水平。当编码序列自身不具有聚腺苷酸化序列时,本发明的载体优选具有该序列。优选的聚腺苷酸化序列来自牛生长激素。
本发明的载体可包含多克隆位点。
除了编码免疫原和标记的序列外,该载体可包含第二真核编码序列。所述载体在所述第二序列的上游还可包含IRES,以便从与免疫原相同的转录物翻译出第二真核多肽。或者,所述免疫原编码序列可以在IRES下游。
本发明的载体可包含未甲基化CpG基序,如未甲基化DNA序列,它们的共同之处在于胞嘧啶后接鸟苷、侧接两个5′嘌呤和两个3′嘧啶。这些DNA基序的非甲基化形式被证明为几种类型的免疫细胞的有效刺激物。
可以靶向方式递送载体。受体介导的DNA治疗技术描述于(如)参考文献240-245中。在基因治疗方法中,以约100ng-200mg的DNA量给予含有核酸的治疗组合物,以进行局部给药。在基因治疗方法中,DNA浓度范围还可以是约500ng-50mg、约1μg-2mg、约5μg-500μg和约20μg-100μg。各种因素如作用方式(如提高或抑制编码基因产物的水平)以及转化和表达效力均被认为会影响达到最终效力所需的剂量。当需要在较大组织面积上表达得更多时,为了达到阳性治疗结果,可能需要施用更大量的载体、或通过连续给药方式再次施用同样量载体、或多次施用于邻近或附近组织部位。所有这些情况中,临床试验中的常规试验可以确定达到最优疗效所需的特定范围。
可通过基因递送载体进行递送载体。所述基因递送载体可以是病毒或非病毒来源(大致参见参考文献246-249)。
用于递送所需核酸并在所需细胞中的表达的病毒载体为本领域公知。示例性病毒载体包括但不限于:重组逆转录病毒(如参考文献250-260)、α病毒载体(如辛德比斯病毒载体、塞姆利基森林病毒(ATCC VR-67;ATCC VR-1247)、罗斯河病毒(ATCCVR-373;ATCC VR-1246)和委内瑞拉马脑炎病毒(ATCC VR-923;ATCCVR-1250;ATCC VR-1249;ATCC VR-532);还可采用这些病毒的杂交体或嵌合体)、痘病毒载体(如牛痘病毒、禽痘病毒、金丝雀痘病毒、修饰的安卡拉牛痘病毒等)、腺病毒载体、和腺伴随病毒(AAV)载体(如见参考文献261-266)。还可采用与杀死的腺病毒相连的DNA进行给药[267]。
还可采用非病毒递送载体和方法,包括但不限于,单独与杀死的腺病毒连接或不连接的聚阳离子凝聚DNA[如267]、配体连接的DNA[268]、真核细胞递送载体细胞[如,参考文献269-273]和核电荷(nucleic charge)中和或与细胞膜发生融合。还可使用裸露DNA。示例性裸露DNA引入方式描述于参考文献274和275中。可作为基因递送载体的脂质体(如免疫脂质体)描述于参考文献276-280中。其它方式描述于参考文献281和282中。
适用于本发明的其它非病毒递送包括机械递送系统,如描述于参考文献282中的方式。而且,所述编码序列及其表达产物可通过光聚合水凝胶物质的沉积或采用电离辐射进行递送[如参考文献283和284]。可用于递送编码序列的其它基因递送常规方法包括,例如,采用手持式基因转移颗粒枪[285]或采用电离辐射以激活转移基因[283和286]。
采用PLG(丙交酯-乙交酯共聚物)微粒递送DNA为尤其优选的方法,如,通过将DNA吸附到经任选处理以具有负电荷表面(如用SDS处理)或正电荷表面(如用阳离子去污剂如CATB)的微粒上。
概述
所述术语“包含”涵盖“包括”及“由...组成”,如“包含”X的组合物可仅由X组成或可包括其它附加物,如X+Y。
涉及数值x的术语“约”指(例如)x±10%。
所述术语“基本上”并不排除“完全地”,如“基本上不含”Y的组合物可以是完全不含Y。在需要时,术语“基本上”可从本发明的定义中省略。
序列表中的氨基酸序列的N端残基通常为由对应核苷酸序列的第一个密码子编码的氨基酸。当第一密码子不是ATG时(如SEQ ID NO:1、7、19、39、43、49、51、55、63、73、119、127、129、137、143、145、147、149、155、159、165、173、181、183、205、209、219、221、229、235、247、263、269、271、297、303、325、327、341、345、359、363、373、395、401、413、443、447、453、459、463、465、469、473、477、479、495、505、507、517、527、533、535、537、539、549、569、575、579、581、583、587、591、593、599、613、621、635、637、643、655、661、665、669、671、681、683、687、693、707、709、721、723、729、743、757、763、765、769、781、791、793、813、817、823、837、839、855、861、865、881、885、897、907、909、911、917、921、941、949、957、965、975、977、979、981、983、989、993、997、1001、1005、1011、1015、1017、1019、1027、1029、1033、1037、1043、1051、1053、1073、1087、1097、1101、1103、1107、1113、1115、1117、1121、1123、1135、1143、1147、1149、1175、1181、1227、1263、1271、1287、1295、1305、1307、1311、1317、1323、1331、1341、1345、1349、1351、1355、1359、1363、1373、1375、1383、1399、1411、1415、1417、1423、1433、1451、1477、1483、1485、1493、1495、1501、1503、1511、1519、1521、1525、1529、1553、1559、1579、1585、1603、1609、1611、1619、1621、1623、1629、1631、1643、1653、1669、1675、1677、1687、1693、1705、1713、1717、1727、1739、1751、1763、1769、1785、1789、1799、1801、1817、1819、1825、1827、1829、1831、1833、1839、1857、1867、1911、1919、1925、1929、1939、1947、1955、1957、1979、1981、1985、1989、1993、1995、2003、2005、2009、2027、2035、2037、2047、2049、2059、2063、2079、2093、2123、2135、2139、2141、2163、2165、2173、2177、2189、2195、2197、2203、2209、2211、2241、2247、2275、2291、2321、2327、2357、2361、2373、2377、2379、2397、2399、2405、2433、2437、2443、2447、2451、2455、2457、2487、2491、2503、2505、2507、2513、2515、2521、2541、2545、2549、2553、2565、2577、2579、2591、2613、2623、2629、2631、2633、2635、2639、2641、2649、2657、2659、2661、2663、2665、2667、2669、2671、2681、2687、2689、2699、2701、2705、2713、2719、2721、2729、2735、2743、2745、2759、2781、2785、2787、2789、2795、2801、2809、2813、2815、2823、2825、2845、2847、2869、2885、2891、2897、2905、2907、2911、2913、2915、2925、2939、2945、2947、2975、2993、3015、3043、3055、3061、3063、3075、3107、3117、3127、3131、3175、3179、3191、3193、3207、3209、3213、3221、3229、3243、3253、3259、3261、3267、3283、3289、3307、3313、3331、3337、3339、3353、3357、3361、3367、3379、3381、3383、3411、3419、3429、3433、3435、3437、3445、3449、3453、3471、3491、3501、3507、3515、3559、3563、3571、3573、3577、3579、3583、3595、3607、3619、3621、3623、3625、3629、3633、3635、3637、3663、3671、3679、3685、3687、3699、3701、3707、3713、3721、3723、3739、3741、3743、3759、3763、3777、3797、3807、3811、3821、3829、3833、3855、3857、3863、3865、3867、3869、3873、3881、3891、3893、3901、3919、3925、3931、3937、3949、3951、3955、3959、3969、3973、3981、3991、4003、4013、4029、4033、4049、4057、4069、4071、4077、4081、4089、4107、4131、4139、4171、4193、4195、4199、4201、4223、4225、4245、4249、4273、4279、4281、4287、4293、4301、4319、4321、4327、4337、4351、4353、4361、4363、4365、4369、4377、4379、4387、4395、4403、4411、4417、4423、4429、4443、4463、4479、4483、4485、4493、4495、4523、4527、4529、4541、4549、4553、4563、4577、4583、4585、4595、4619、4635、4651、4677、4683、4685、4699、4703、4709、4711、4719、4751、4753、4761、4789、4803、4805、4819、4829、4833、4837、4839、4847、4851、4857、4863、4869、4887、4891、4893、4909、4925、4927、4931、4935、4939、4943、4949、4957、4963、4965、4973、5019、5033、5063、5073、5081、5083、5085、5089、5093、5113、5167、5179、5183、5193、5209、5211、5213、5227、5231、5237、5245、5273、5281、5283、5297、5299、5301、5305、5309、5329、5333、5347、5353、5365、5367、5369、5385、5389、5401、5435、5437、5439、5453、5465、5475、5515、5517、5525、5543、5545、5559、5571、5605、5611、5619、5639、5651、5655、5665、5685、5701、5715、5761、5769、5771、5775、5781、5793、5795、5801、5817、5819、5831、5855、5861、5865、5873、5887、5889、5909、5911、5927、5945、5949、5957、5959、5965、5973、5987、5997、6003、6013、6015、6023、6025、6027、6037、6063、6091、6093、6095、6097、6111、6117、6119、6135、6143、6147、6165、6177、6187、6189、6191、6195、6197、6199、6203、6223、6227、6229、6237、6245、6247、6249、6253、6255、6259、6267、6297、6305、6311、6317、6345、6361、6389、6419、6421、6435、6457、6461、6463、6467、6471、6487、6499、6535、6553、6559、6561、6565、6617、6631、6633、6643、6677、6699、6707、6733、6745、6781、6783、6789、6799、6813、6843、6847、6851、6861、6941、6943、6957、6961、6967、6973、6985、6993、6995、7021、7023、7045、7047、7051、7063、7065、7069、7077、7085、7089、7091、7097、7099、7107、7113、7123、7129、7131、7167、7191、7199、7219、7223、7241、7247、7263、7277、7289、7309、7339、7345、7383、7401、7409、7411、7413、7429、7439、7443、7455、7459、7461、7465、7477、7489、7497、7499、7513、7523、7525、7527、7533、7549、7555、7557、7567、7581、7601、7611、7615、7617、7623、7633、7641、7651、7653、7659、7665、7687、7693、7701、7709、7723、7727、7779、7789、7797、7809、7849、7859、7869、7877、7885、7891、7893、7905、7907、7917、7929、7933、7937、7943、7945、7951、7953、7969、7971、8015、8017、8027、8055、8059、8061、8069、8107、8137、8145、8149、8151、8153、8171、8179、8217、8219、8231、8239、8245、8247、8261、8269、8301、8313、8341、8365、8371、8381、8387、8393、8421、8447、8453、8455、8457、8461、8465、8471、8493、8501、8505、8515、8523、8531、8545、8575、8579、8581、8617、8645、8647、8655、8667、8677、8679、8683、8689、8691、8697、8709、8715、8721、8727、8731、8739、8745、8775、8793、8797、8807、8815、8823、8827、8833、8859、8863、8869、8889、8899、8901、8909、8913、8915、8929、8933、8935、8949、8951、8955、8967、8993、8995、8997、9003、9009、9013、9019、9033、9037、9061、9065、9067、9079、9101、9103、9123、9153、9157、9163、9185、9189、9197、9201、9223、9225、9227、9241、9243、9247、9273、9275、9281、9297、9313、9321、9331、9339、9369、9383、9385、9387、9409、9413、9435、9449、9469、9471、9491、9495、9497、9499、9503、9527、9529、9545、9547、9557、9559、9565、9577、9589、9599、9601、9603、9605、9607、9621、9633、9635、9653、9655、9663、9681、9701、9705、9717、9731、9747、9765、9797、9807、9809、9811、9831、9851、9853、9855、9875、9899、9915、9929、9931、9939、9941、9945、9949、9953、9959、9989),应该理解为当密码子用作起始密码子时应该翻译成甲硫氨酸,而当该序列位于融合伙伴的C端时应该翻译为所示的非甲硫氨酸氨基酸。本发明特别公开并涵盖序列表中每一种以N端甲硫氨酸残基(如甲酰-甲硫氨酸残基)代替任何所示非甲硫氨酸残基的氨基酸序列(如SEQ ID NO:236、662、758、770、782、792、838、918、1182、1312、1374、1632、2064、2378、2400、2456、2516、2636、2670、2682、2688、2744、3384、3702、37 14、4058、4678、4704、4804、4806、4848、6026、6112、7022、7242、7710、8582、9682)。它还特别公开并涵盖序列表中每一种从序列内部的任何甲硫氨酸残基开始的氨基酸序列。
如上所述,本发明的核酸和多肽可包括如下序列:
(a)与序列表中公开的序列相同(即100%相同)的序列;
(b)与序列表中公开的序列有序列相同性的序列;
(c)与序列(a)或(b)相比,具有分离或连续的1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个单核苷酸或氨基酸改变(缺失、插入、取代)的序列;和
(d)当采用逐对比对算法与序列表的特定序列进行比对时,x个单体(氨基酸或核苷酸)的移动窗口从起点(N端或5′)移到终点(3′C端),从而对延长至p个单体(p>x)的比对而言,有p-x+1个此类窗口,每个窗口有至少x·y个相同的比对单体,其中:x选自20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、150、200;y选自0.50、0.60、0.70、0.75、0.80、0.85、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96、0.97、0.98、0.99;并且当x·y不是整数时四舍五入为整数。优选的逐对比对算法为Needleman-Wunsch全局比对算法[287],采用默认参数(如开口开放罚分=10.0,开口延伸罚分=0.5,采用EBLOSUM62评分距阵)的。用EMBOSS软件包中的Needle工具很方便地实施该算法[288]。
本发明的核酸和多肽还可能在序列(a)-(d)的N端/5′和/或C端/3′处连有其它序列。
除非另有说明,本发明的实施将采用本领域技术人员能够实施的常规的化学方法、生物化学方法、分子生物学方法、免疫学方法和药理学方法。此类技术已在参考文献中得到充分阐述。见,如,参考文献289-296等。
实验
下面是实施本发明的具体实施方式的例子。所述例子仅为说明性使用,而不以任何方式限制本发明的范围。
我们努力保证所用数值(如量、温度等)的精确性,然而还是应该允许一些实验性误差和偏差。
实施本发明的方式
MNEC菌株IHE3034
IHE3034是已知的MNEC致病型大肠杆菌菌株。参考文献297的表1报道,IHE3034分为O18:K1:H7/9血清型,属于ECOR B2类。已知水平转移的DNA元件上的毒力相关性基因是sfaII、ibeA、iro、kps(II型)、fyuA和malX。它还携带编码细胞致死性膨胀毒素的cdt基因簇。
对大肠杆菌K1菌株IHE3034测序产生283个毗连序列群。它们是SEQ ID NO9991-10273,以长度递减的顺序排列。
通过分析大肠杆菌K1菌株IHE3034的基因组序列,鉴定了4995种开放阅读框(ORF),将它们命名为ORFnnnnn,其中nnnnn是00001-04995的数字。这些ORF的序列为SEQ ID NO:1-9990,奇数SEQ ID NO为DNA序列,偶数ID为氨基酸序列。可按下述方法将此nnnnn编号转变为序列表的SEQ ID NO编号:就氨基酸序列而言,SEQ IDNO:=nnnnn x 2;就核苷酸序列而言,SEQ ID NO:=[nnnnn x 2]-1。因此,可以在SEQ ID NO:2467和2468处找到ORF01234,如表1所示。
表1中给出了4995种ORF的初步功能注释。
表3显示了与共生菌株ORF同源性低的ORF(共计1194个)。优选这些ORF的原因是,在核酸测试和免疫交叉反应性方面,它们相对于共生菌株、对病原性大肠杆菌特异。潜在致病性岛(island)位于ORF00028-70、ORF000330-353、ORF00655-687、ORF00883-910、ORF01031-1058、ORF1078-1119、ORF1186-1228、ORF01313-1376、ORF01479-1514、ORF01523-1543、ORF01550-1578、ORF01810-1865、ORF02295-02315、ORF02351-2375、ORF02382-2405、ORF02436-2472、ORF02788-02816、ORF02844-2891、ORF03011-3056、ORF03340-3365、ORF03499-3522、ORF04416-4439、ORF04661-4679、ORF04915-4930和ORF04946-4966.
根据本发明者采用的不同标准,选择4995种ORF中的142种(2.8%)进行免疫应用。这142种ORF见表2。选择这些ORF的标准包括但不限于:与共生性大肠杆菌菌株的ORF的同源性低;长度>100aa;并且有合适的细胞定位(见表2下部)。
克隆编码这142种蛋白质的基因,在细菌中(例如在非病原性实验室大肠杆菌宿主中或在芽孢杆菌如枯草芽孢杆菌(B.subtilis)或巨大芽孢杆菌(B.megaterium)中)表达,纯化,然后用于免疫受试动物(如小鼠)。然后,用Western印迹、ELISA和FACS试验分析小鼠中产生的血清,并在体外和体内实验中进一步检测。合适的体外试验包括检测抗体诱导补体介导的细菌杀伤的能力和/或调理吞噬作用的活性、阻断MNEC菌株(或纯化抗原)与人上皮细胞或其它细胞系结合的能力、和/或抑制大肠杆菌(如K1菌株)粘附/侵入脑微血管内皮细胞(BMEC)的能力。检测对菌血症和脑膜炎的效力的合适的体内试验包括在用大肠杆菌K1菌株刺激的5日龄大鼠中进行主动或被动全身性免疫和刺激以及用MNEC菌株免疫和腹膜内感染成年小鼠。
所述蛋白对细菌生活周期的重要性可通过建立等基因敲除突变体来进行检验。所述突变体还可用于确保抗原产生的血清对该抗原的特异性。采用微阵列研究表达模式。通过对来自多种不同ExPEC菌株的序列进行测序来评估保守和变异。
进行试验以选出预测的表面暴露蛋白,其对MNEC菌株具有特异性并在非病原性菌株(共生菌株和试验菌株)中不存在。一旦选中,即表达并纯化这些蛋白,并用于免疫小鼠。
从参考文献43中可知,大肠杆菌任一tol-pal基因的突变都会导致含有天然外膜蛋白的小泡的形成。通过比较MNEC菌株和非病原性菌株的小泡中存在的蛋白,可能选出一小组可用作潜在抗原的蛋白。
共生和病原性大肠杆菌中的λ红介导的基因操作
本方法为基于PCR的快速方法,用于使野生型大肠杆菌菌株中的tolR基因失活[298]。简单地说,步骤1由独立扩增靶基因(tolR)的上游和下游区域以及抗性标记盒组成。将步骤1得到的两种PCR产物与等摩尔浓度的AB盒的扩增机器混合并进行第二轮PCR(三元PCR),以产生其上游和下游侧接的500bp(或更长)部分与靶基因同源的抗性标记盒。在步骤3中,将大量(1μg)所需直链DNA电穿孔到λ红感受态细胞中。
小泡制备
1.通过TCA沉淀制备小泡
用平板上培养的细菌接种LB培养基,在轻柔振摇下37℃过夜培养。用该培养物接种200ml LB使OD600=0.1。细菌生长到OD600 0.4(或按规定)。培养物以4000×g离心10分钟,上清液通过0.22mm滤器过滤以除去残留细菌。
在限铁条件下往LB培养基中添加二吡啶基(Dipyridyl)(0.25mM)以进行同样的实验。
通过往培养物上清液中添加终浓度为10%的100%(重量/体积)TCA、0.4%(重量/体积)脱氧胆酸盐来进行沉淀。所述沉淀过程在4℃下进行30分钟。通过在4℃以20000×g离心10分钟回收沉淀。该沉淀以10%TCA(重量/体积)洗涤一次并用纯乙醇洗涤两次。所述沉淀用SpeedVac干燥并保存于-20℃。
对野生型和突变型菌株进行SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳,从中可以观察到突变型菌株上清液中产生的条带远远多于野生型菌株。随机选择的条带证实上清液中的所有蛋白均为膜蛋白。
2.通过超速离心以制备小泡
培养物的上清液在4℃以200000×g超速离心2小时。沉淀以PBS洗涤,重悬于PBS并保存于-20℃。
3.小泡的胍盐变性
在进行胍盐变性前,小泡用乙醇沉淀。通过加入冷的纯乙醇到终浓度为90%沉淀PBS溶液中的10μg OMV。沉淀过程在-20℃下进行20分钟。通过13000×g离心10分钟回收沉淀。将该沉淀重悬于50ml 6M胍盐、15mM DTT、200mM Tris-HCl,pH8.0。变性过程在60℃下进行60分钟。消化之前,溶液用1.5M Tris pH8.0溶液1/8稀释并往所述稀释溶液中添加5mg胰蛋白酶。消化过程在37℃过夜。通过添加终浓度为0.1%的甲酸终止反应。用Oasis抽提试剂盒(cartridge)对肽进行抽提。通过LC耦连MS-MS分析肽。
4.表面消化
将5mg胰蛋白酶加入10mg小泡的PBS溶液中,并在37℃孵育3小时。添加0.1%终浓度的甲酸终止反应。通过30Kda截断滤器过滤回收肽,用Oasis抽提试剂盒进行抽提。通过LC耦连MS-MS分析肽。
小泡分析
蛋白定量
用Bradford法、以BSA作为标准品进行蛋白定量。
SDS-PAGE
采用十二烷基硫酸钠(SDS)4-12%聚丙烯酰胺凝胶和Mini-protean II电泳装置分析样品。将样品悬浮于SDS样品缓冲液中(0.06M Tris-HCl pH6.8、10%(体积/体积)甘油、2%(重量/体积)SDS、5%(体积/体积)2-巯基乙醇、10mg/ml溴酚蓝)并加热到100℃5分钟,然后进行SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。电泳后,凝胶用考马斯蓝染色。
MALDI-TOF质谱测定
从凝胶中将蛋白条带和蛋白点切下,用50mM碳酸氢铵/乙腈(50/50,体积/体积)洗涤,并用SpeedVac离心(Savant)干燥。加入7-10ml含有5mM碳酸氢铵、0.012mg测序级胰蛋白酶的溶液于37℃消化干燥的蛋白点2小时。消化后,吸取0.6ml加到预点阵列靶(matrix pre-spotted target)上并空气干燥。蛋白点用0.6ml含有70%乙醇、0.1%三氟醋酸的溶液洗涤。从超挠性(ultraflex)MALDI-TOF质谱仪上获得质谱信息。谱型信息采用靶上预点的标准品组合进行外部校准。采用Mascot程序对质量范围在700-3,000Da内的试验生成的肽的同位素单峰与计算机生成的指纹进行自动或手工比较以鉴定蛋白。
二维电泳
将200mg小泡重悬于Immobiline再溶胀溶液(7M尿素、2M硫脲、2%(重量/体积)CHAPS、(2%重量/体积)ASB14、2%(体积/体积)IPG缓冲液pH 3-10NL、2mM TBP、65mM DTT),并过夜吸附于7厘米的Immobiline DryStrip(pH3-10NL)柱。然后经2维电泳分离蛋白。第一维电泳的进行采用IPGphor等电位聚焦单位,连续施加150伏电压35分钟、500伏35分钟、1,000伏30分钟、2,600伏10分钟、3,500伏15分钟、4,200伏15分钟,最后施加5,000伏至10kVh。对于第二维电泳,条带在4M尿素、2M硫脲、30%甘油、2%SDS、5mM TBP、50mM Tris HCl pH8.8、2.5%丙烯酰胺、0.2%溴酚蓝中孵育2次10分钟以平衡。然后,在线性4-12%预制聚丙烯酰胺凝胶上分离蛋白。
凝胶用胶质考马斯蓝染色,并用个人光密度计SI扫描。图像用Image Master 2DElite软件进行分析。
纳米-LC/MS/MS
肽由连接于装有纳米喷射源的Q-ToF Micro ESI质谱仪的CapLC HPLC系统上的纳米LC进行分离。通过一个C18收集柱(300μm i.d.×5mm)将样品装入Atlantis C18NanoEase柱(100μm i.d.×100mm)。50分钟内以400nl/分钟的流速用2%-60%的溶于0.1%甲酸溶液的95%ACN的梯度进行洗脱。经洗提的肽采用MassLynx软件(4.0版)进行自动的数据依赖型采集程序,其中用MS测量扫描在400-2,000的m/z范围内自动选择多电荷肽以进行进一步的MS/MS片段化。最多有3种不同组分同时进行MS/MS片段化。采集到数据之后,用MassLynx对单个MS/MS谱型数据进行组合、校平和确定质心。通过MASCOT的授权版本的批量模式对肽进行检索和鉴定。所述MASCOT检索参数为:(1)种:ExPEC;(2)允许的切割失败数目(仅针对胰蛋白酶水解):6;(3)可变的翻译后修饰:甲硫氨酸氧化;(4)肽容限:±500ppm;(5)MS/MS容限:±0.3Da和(6):肽电荷:从+1到+4。就前述平台而言,仅考虑由MASCOT概率分析确定的显著命中。接受至少一种肽的蛋白测定结果的分数阈值由MASCOT设定,胰蛋白酶消化的阈值为18,蛋白酶K消化的阈值为36。
结果
上述分析的结果为,鉴定了10种优选抗原。即:orf03526(SEQ ID No:7051+7052)、orf01339(SEQ ID No:2677+2678)、orf00256(SEQ ID No:511+512)、orf01346(SEQ ID No:2691+2692)、orf04084(SEQ ID No:8167+8168)、orf02374(SEQID No:4747+4748)、orf03 502(SEQ ID No:7003+7004)、orf02298(SEQ ID No:4595+4596)、orf01228(SEQ ID No:2455+2456)、orf01227(SEQ ID No:2453+2454)、orf02314(SEQ ID NO:4627+4628)和orf02850(SEQ ID NO:5699+5700)。见表4,其中也给出了这些蛋白与UPEC菌株CFT073中的蛋白的相同性。其它优选抗原是与用上述相同方法鉴定的CFT073菌株的优选抗原的相同性大于60%的抗原。这些优选抗原是orf04282(SEQ ID No:8563+8564)、orf01364(SEQ ID No:2727+2728)、orf04936(SEQ ID No:9871+9872)、orf02336(SEQ ID No:4671+4672)、orf02840(SEQ ID No:5679+5680)、orf00267(SEQ ID No:533+534)、orf01611(SEQ ID No:3221+3222)、orf01613(SEQ ID No:3225+3226)和orf03502(SEQ ID No:7003+7004)。
抗原分析
全身感染的小鼠模型
为了筛选由对病原性和非病原性大肠杆菌菌株进行的比较基因组分析所选出来的大量抗原,建立了基于经典毒力试验的保护模型。
实验模型(免疫和感染)采用5周龄的CD1远交小鼠,采用腹膜内接种有毒力的IHE3034大肠杆菌菌株进行刺激。刺激剂量通过试验确定为能够在72小时内杀死80%成年小鼠的细菌量,对IHE3034菌株而言,该剂量对应为1×107cfu/只小鼠。
将称为毒力因子和潜在保护性抗原的两种蛋白用作阳性对照。这些蛋白是IbeA[299]和IroN(SEQ ID No:2691、2692和参考文献300、301)。表达重组蛋白,并用于免疫实验。
免疫方法
通过皮下注射150μl使用弗氏佐剂的蛋白溶液免疫小鼠3次,如下表所示:
对照小鼠 | 免疫小鼠 | |
第0天 | 75μl盐水溶液75μl完全弗氏佐剂 | 75μl蛋白溶液(20μg)75μl完全弗氏佐剂 |
第21天 | 75μl盐水溶液75μl不完全弗氏佐剂 | 75μl蛋白溶液(20μg)75μl不完全弗氏佐剂 |
第35天 | 75μl盐水溶液75μl不完全弗氏佐剂 | 75μl蛋白溶液(20μg)75μl不完全弗氏佐剂 |
在第一次免疫前一天(免疫前血清)、第34天和第48天(刺激前一天)收集血样,用western印迹和ELISA试验检测免疫小鼠的血清以测定抗体效价。
刺激
在第48天,用大肠杆菌IHE3034的冻存液在LB琼脂平板上划线,在培养箱中于37℃培养过夜(ON)。在第49天用所述ON平板-培养物接种50ml LB培养基,直到O.D.600=0.1,并在37℃振摇培养1.5小时,直到细菌培养物达到O.D.600=0.6,其对应为5×108cfu/ml的IHE3034菌株。用生理溶液稀释该培养物,直到细菌浓度为1×108/ml (一般用8ml生理溶液稀释2ml细菌培养物),并用标准的平板计数法铺板,以核实接种物。用1ml注射器将含有1×107IHE3034细菌的100μl细胞悬液注射到对照和免疫小鼠的腹膜内。记录感染24、48和72小时后各动物组的死亡数。
通过比较刺激72小时后小鼠疫苗接种组中的存活率和对照组中的存活率,来评估由于接种疫苗所获得的保护。由下式计算相对于对照的存活率百分比:
结果
如上所述用阳性对照IroN和IbeA进行免疫。如图3和4所示,用IroN或IbeA免疫后,再用IHE3034刺激的%小鼠存活率升高。
用热灭活的IHE3034进行免疫。如图1所示,用热灭活的IHE3034免疫后,再用IHE3034刺激的%小鼠存活率升高。
也用IHE3034ΔTol-R的小泡进行免疫。如图2所示,用IHE3034ΔTol-R免疫后,再用IHE3034刺激的%小鼠存活率升高。
免疫研究
选择抗原组合得到本发明组合物。BALB/c小鼠被分成9组并按照如下方式进行免疫:
组 | 免疫组合物 | 给药途径 |
1 | 抗原混合物(各10-20μg蛋白)+CFA(完全弗氏佐剂) | 腹膜内或鼻内或皮下 |
2 | 抗原混合物(各5μg蛋白)+氢氧化铝(200μg) | 腹膜内或鼻内或皮下 |
3 | 抗原混合物(各10-20μg蛋白)+CpG(10μg) | 腹膜内或鼻内或皮下 |
4 | 抗原混合物(各10-20μg蛋白)+氢氧化铝(200μg)+CpG(10μg) | 腹膜内或鼻内或皮下 |
5 | CFA | 腹膜内或鼻内或皮下 |
6 | 抗原混合物(各10-20μg蛋白)+LTK63(5μg) | 腹膜内或鼻内或皮下 |
7 | 氢氧化铝(200μg)+CpG(10μg) | 腹膜内或鼻内或皮下 |
8 | CpG(10μg) | 腹膜内或鼻内或皮下 |
9 | LTK63(5μg) | 腹膜内或鼻内或皮下 |
以2周间隔免疫小鼠。最后一次免疫后2-3周,用合适的MNEC菌株刺激所有小鼠。当采用粘膜免疫(如鼻内)时,也以粘膜方式刺激动物模型以测试粘膜免疫原的保护效果。临近刺激前,对小鼠采血以检测针对所给予抗原的抗体的效价。
就小鼠刺激而言,有毒力的细菌要在合适的培养基中生长。通过离心收获细菌,重悬,连续稀释成刺激接种物。对BALB/c小鼠进行刺激并在接触后30天内每天观察。
可以采用完整细菌和纯化重组蛋白的ELISA试验来测定不同免疫方案产生的小鼠血清中的总IgG和IgG1/IgG2A亚型。而且,可通过多参数FACS分析评价分离自免疫接种小鼠的脾细胞和/或PBMC中的抗原特异性CD4+和CD8+Th细胞,以评估抗原特异性T细胞的细胞因子表达情况。具体地,IFN-γ和IL-5的产量可在用纯化抗原体外刺激T细胞之后进行测量。此外,用各抗原/疫苗制剂免疫的小鼠的脾细胞和/或PBMC可以在最后一次免疫剂量后10-12天收集,并用MNEC细菌来刺激。经过4小时的刺激之后,往后的12个小时内往细胞中加入布雷菲德菌素A以阻断细胞因子分泌。然后,固定细胞并用抗体染色,以检测表达IFN-γ和IL-5的MNEC特异性T细胞。
可以通过本领域技术人员了解的各种方法从外周血淋巴细胞(PBL)中分离T细胞。例如,可以通过去除辅助细胞和B细胞从PBL群中“富集”T细胞群。具体地,可使用抗MHC II类单克隆抗体清除非T细胞来富集T细胞。类似地,其它抗体可用于消耗特定的非T细胞群。例如,抗Ig抗体分子可用于消耗B细胞,抗MacI抗体分子可用于消耗巨噬细胞。
还可用本领域技术人员已知技术将T细胞分成许多不同的亚群。两类主要的亚群可以基于其细胞表面标记CD4和CD8的表达差异进行分离。例如,在上述T细胞富集之后,可采用对CD4特异性的抗体富集CD4+细胞。所述抗体可以偶联于固体支持物如磁珠上。相反地,CD8+细胞可使用对CD4特异性的抗体进行富集(去除CD4+细胞),或可使用偶联于固体支持物的CD8抗体进行分离。在转导之前或之后,可以离体扩增感染MNEC的患者的CD4淋巴细胞。
T细胞纯化之后,纯化的T细胞用各种细胞因子(包括但不限于rIL-2、IL-10、IL-12和IL-15)进行预刺激,以促进淋巴细胞的生长和活化。
可以用上述免疫原性多肽进行活化MNEC特异性T细胞。MNEC特异性T细胞可以是CD8+或CD4+。MNEC特异性CD8+T细胞可以是细胞毒性T淋巴细胞(CTL),其能杀死呈现与MHC I类分子复合的任何上述多肽或其片段的MNEC感染细胞。衣原体特异性CD8+T细胞可以通过如51Cr释放试验进行检测。51Cr释放试验检测MNEC特异性CD8+T细胞裂解呈现一种或多种这些表位的靶细胞的能力。本发明还考虑了表达抗病毒物质如IFNγ的MNEC特异性CD8+T细胞,它们也可通过免疫学方法进行检测,优选用一种或多种上述MNEC多肽进行体外刺激后对IFNγ或类似细胞因子进行细胞内染色来检测。MNEC特异性CD4+T细胞可以通过淋巴增殖试验进行检测。淋巴增殖试验检测MNEC特异性CD4+T细胞对一种或多种上述多肽应答而增殖的能力。
应该理解,本发明仅通过实施例的方式进行描述,可以在本发明的范围和精神内进行改变。
表1-ORF00001-ORF04995的注释
ORFnnnnn | SEQ ID NO | 注释 |
ORF00001 | 1和2 | 磷酸甘油转移酶I |
ORF00002 | 3和4 | 引发体操纵子17.5K蛋白(mdob-dnac基因间区) |
ORF00003 | 5和6 | DNA复制蛋白dnaC |
ORF00004 | 7和8 | 引发体蛋白I |
ORF00005 | 9和10 | 可能的完整膜蛋白Cj1 165c,推定 |
ORF00006 | 11和12 | 可能的完整膜蛋白Cj1 166c,推定 |
ORF00007 | 13和14 | 转录调节蛋白,LuxR家族结构域蛋白 |
ORF00008 | 15和16 | 转录激活物蛋白bqIJ |
ORF00009 | 17和18 | 三价铁还原酶蛋白fhuF[1.6.99.-] |
ORF00010 | 19和20 | 功能未知的蛋白质(DUF1435)家族 |
ORF00011 | 21和22 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00012 | 23和24 | 核糖体RNA小亚基甲基转移酶C(AE005668)[2.1.1.52] |
ORF00013 | 25和26 | DNA聚合酶III,psi亚基(holD)[2.7.7.7] |
ORF00014 | 27和28 | 核糖体-蛋白-丙氨酸乙酰基转移酶(riml) [2.3.1.128] |
ORF00015 | 29和30 | HAD超家族(亚家族IA)水解酶,TIGR02254 |
ORF00016 | 31和32 | 位点特异性重组酶,噬菌体整合酶家族 |
ORF00017 | 33和34 | 假拟蛋白 |
ORF00018 | 35和36 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00019 | 37和38 | 假拟nin区域蛋白(cvsD) |
ORF00020 | 39和40 | 假拟蛋白 |
ORF00021 | 41和42 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00022 | 43和44 | Sb36 |
ORF00023 | 45和46 | Sb36 |
ORF00024 | 47和48 | 假拟蛋白 |
ORF00025 | 49和50 | 假拟蛋白 |
ORF00026 | 51和52 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00027 | 53和54 | 阻抑物 |
ORF00028 | 55和56 | Sb40 |
ORF00029 | 57和58 | 免疫性区域 |
ORF00030 | 59和60 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00031 | 61和62 | 复制蛋白 |
ORF00032 | 63和64 | 假拟蛋白 |
ORF00033 | 65和66 | 噬菌体N-6-腺嘌呤-甲基转移酶[2.1.1.72] |
ORF00034 | 67和68 | LexA阻抑物 |
ORF00035 | 69和70 | 交叉连接内切脱氧核糖核酸酶[3.1.22.-] |
ORF00036 | 71和72 | Sb46 |
ORF00037 | 73和74 | 功能未知的蛋白质(DUF1277)超家族 |
ORF00038 | 75和76 | λ原噬菌体的抗终止蛋白Q同源物 |
ORF00039 | 77和78 | 裂解蛋白S.b1556 |
ORF00040 | 79和80 | 细胞内溶素(溶酶体)[3.2.1.17] |
ORF00041 | 81和82 | 噬菌体裂解蛋白 |
ORF00042 | 83和84 | 假拟蛋白 |
ORF00043 | 85和86 | Gifsy-2原噬菌体蛋白 |
ORF00044 | 87和88 | 噬菌体末端酶大亚基(GpA) |
ORF00045 | 89和90 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00046 | 91和92 | 噬菌体门蛋白,λ家族 |
ORF00047 | 93和94 | Gifsy-2原噬菌体类似Clp蛋白酶 |
ORF00048 | 95和96 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00049 | 97和98 | Gifsy-2原噬菌体ATP-结合糖转运蛋白样蛋白 |
ORF00050 | 99和100 | Gifsy-1原噬菌体:类似于小尾蛋白Z |
ORF00051 | 101和102 | 噬菌体小尾蛋白U |
ORF00052 | 103和104 | 原噬菌体CP-933K的推定尾组件 |
ORF00053 | 105和106 | 噬菌体小尾蛋白G |
ORF00054 | 107和108 | 噬菌体尾装配蛋白T |
ORF00055 | 109和110 | Gifsy-1原噬菌体蛋白 |
ORF00056 | 111和112 | 噬菌体小尾蛋白 |
ORF00057 | 113和114 | 噬菌体小尾蛋白L |
ORF00058 | 115和116 | 原噬菌体的推定尾丝组件K |
ORF00059 | 117和118 | 原噬菌体的推定尾丝组件K |
ORF00060 | 119和120 | Gifsy-1原噬菌体蛋白 |
ORF00061 | 121和122 | Gifsy-1原噬菌体蛋白 |
ORF00062 | 123和124 | 宿主特异性蛋白(部分) |
ORF00063 | 125和126 | Lom |
ORF00064 | 127和128 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00065 | 129和130 | 假拟蛋白 |
ORF00066 | 131和132 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00067 | 133和134 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00068 | 135和136 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00069 | 137和138 | 成熟酶相关蛋白 |
ORF00070 | 139和140 | DinI样蛋白Z3916-ECs3483(AF175466) |
ORF00071 | 141和142 | 肽链释放因子3(prfC) |
ORF00072 | 143和144 | 渗透压诱导型蛋白Y前体 |
ORF00073 | 145和146 | 功能未知的蛋白质(DUF1328)家族 |
ORF00074 | 147和148 | 未命名蛋白产物 |
ORF00075 | 149和150 | Mg-依赖性DNA酶 |
ORF00076 | 151和152 | 丙酮酸盐甲酸盐裂合酶活化酶(act)[1.97.1.4] |
ORF00077 | 153和154 | 蛋白 |
ORF00078 | 155和156 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00079 | 157和158 | 脱氧核糖-磷酸醛缩酶(deoC)[4.1.2.4] |
ORF00080 | 159和160 | 胸腺嘧啶磷酸化酶(TDRPASE) |
ORF00081 | 161和162 | 磷酸五碳糖变位酶(phosphopento变位酶)(deoB)[5.4.2.7] |
ORF00082 | 163和164 | 嘌啉核苷磷酸化酶(deoD)[2.4.2.1] |
ORF00083 | 165和166 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00084 | 167和168 | 硫辛酸-蛋白连接酶A[6.3.4.-] |
ORF00085 | 169和170 | smp蛋白前体 |
ORF00086 | 171和172 | 磷酸丝氨酸磷酸酶(serB)[3.1.3.3] |
ORF00087 | 173和174 | DNA修复蛋白RadA(radA) |
ORF00088 | 175和176 | 烟酰胺-核苷酸腺苷酰基转移酶[2.7.7.1] |
ORF00089 | 177和178 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00090 | 179和180 | 螺旋-转角-螺旋基序 |
ORF00091 | 181和182 | ABC转运蛋白ATP结合蛋白yjjK(atp结合) |
ORF00092 | 183和184 | 可溶性裂解胞壁质转糖基酶[3.2.1.-] |
ORF00093 | 185和186 | trp操纵子阻抑物(trpR) |
ORF00094 | 187和188 | 保守性假拟蛋白TIGR00258 |
ORF00095 | 189和190 | 磷酸甘油酸变位酶家族蛋白,推定[5.4.2.1] |
ORF00096 | 191和192 | 右侧来源(right origin)-结合蛋白 |
ORF00097 | 193和194 | CreA蛋白 |
ORF00098 | 195和196 | 转录调节蛋白creB |
ORF00099 | 197和198 | 传感蛋白creC[2.7.3.-] |
ORF00100 | 199和200 | 内膜蛋白creD(AE005671) |
ORF00101 | 201和202 | 需氧呼吸控制蛋白arcA(染料抗性蛋白)(arcA) |
ORF00102 | 203和204 | RNA甲基转移酶,TrmH家族,1型 |
ORF00103 | 205和206 | 天冬氨酸激酶I,高丝氨酸脱氢酶I |
ORF00104 | 207和208 | 高丝氨酸激酶(thrB)[2.7.1 39] |
ORF00105 | 209和210 | 苏氨酸合酶(thrC)[4.2.3.1] |
ORF00106 | 211和212 | 未命名蛋白产物:ORF ID:o101#5 |
ORF00107 | 213和214 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00108 | 215和216 | UPF0246蛋白vaaA |
ORF00109 | 217和218 | 未命名蛋白产物(ORF8) |
ORF00110 | 219和220 | 转醛酶(tal)[2.2.12] |
ORF00111 | 221和222 | 钼蝶呤生物合成mog蛋白 |
ORF00112 | 223和224 | gpr1-fun34-vaaH家族蛋白 |
ORF00113 | 225和226 | 未命名蛋白产物:ORF4 |
ORF00114 | 227和228 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00115 | 229和230 | 假拟蛋白 |
ORF00116 | 231和232 | 侣伴蛋白DnaK(dnaK) |
ORF00117 | 233和234 | 侣伴蛋白DnaJ(dnaJ) |
ORF00118 | 235和236 | gef蛋白相关蛋白 |
ORF00119 | 237和238 | 推定的保守性蛋白 |
ORF00120 | 239和240 | 硫酸酯酶,推定 |
ORF00121 | 241和242 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00122 | 243和244 | Na+-H+反向转运蛋白NhaA(nhaA) |
ORF00123 | 245和246 | 转录激活蛋白nhaR |
ORF00124 | 247和248 | 核黄素生物合成蛋白RibF(ribF)[2.7.1.26 2.7.7.2] |
ORF00125 | 249和250 | 异亮氨酰-tRNA合成酶(ileS) [6.1.1.5] |
ORF00126 | 251和252 | 脂蛋白信号肽酶(IspA)[3.4.23.36] |
ORF00127 | 253和254 | 5.2.1.8[5.2.1.8] |
ORF00128 | 255和256 | 二磷酸4-羟基-3-甲基丁-2-烯酯还原酶(ispH)[1.17.1.2] |
ORF00129 | 257和258 | 肌苷-尿苷优选核苷水解酶[3.2.-.-] |
ORF00130 | 259和260 | 假拟蛋白DUF805 |
ORF00131 | 261和262 | 二氢二皮考啉酸酯还原酶(dapB)[1.3.1.26] |
ORF00132 | 263和264 | 氨基甲酰基-磷酸酯合酶,小亚基(carA)[6.3.5.5] |
ORF00133 | 265和266 | 氨基甲酰基-磷酸酯合酶,大亚基(carB)[6.3.5.5] |
ORF00134 | 267和268 | 转座酶 |
ORF00135 | 269和270 | 转录激活蛋白v蛋白caiF |
ORF00136 | 271和272 | 肉碱操纵子蛋白caiE |
ORF00137 | 273和274 | echA1[5.-.-.-] |
ORF00138 | 275和276 | caiC(fadD)[6.3.2.-] |
ORF00139 | 277和278 | CAIB-BAIF家族蛋白,推定[2.8.3.-] |
ORF00140 | 279和280 | 巴豆酰甜菜碱(Crotonobetainyl)-CoA脱氢酶(巴豆酰甜菜碱-CoA还原酶)(acd) |
ORF00141 | 281和282 | L-肉碱-γ-丁基甜菜碱反向转运蛋白 |
ORF00142 | 283和284 | 电子转移黄素蛋白,β亚基,推定 |
ORF00143 | 285和286 | 电子转移黄素蛋白,α亚基,推定 |
ORF00144 | 287和288 | FixC蛋白[1.5.5.-] |
ORF00145 | 289和290 | 铁氧还蛋白样蛋白 |
ORF00146 | 291和292 | 糖转运蛋白,推定 |
ORF00147 | 293和294 | 谷胱甘肽-调节的钾外流系统辅助蛋白kefF(OUINONE) |
ORF00148 | 295和296 | 谷胱甘肽-调节的钾外流系统蛋白kefC(K(+)-H(+)反向转运蛋白) |
ORF00149 | 297和298 | 二氢叶酸还原酶ffolA)[1.5.1.3] |
ORF00150 | 299和300 | CcdB解毒剂CcdA |
ORF00151 | 301和302 | CcdB样蛋白 |
ORF00152 | 303和304 | CcB样蛋白 |
ORF00153 | 305和306 | 双(5′-核酸基)-四磷酸酯酶(对称)[3.6.1.4.1] |
ORF00154 | 307和308 | 蛋白apaG (AJ012295) |
ORF00155 | 309和310 | 二甲基腺苷转移酶(ksqA)[2.1.1.-] |
ORF00156 | 311和312 | 4-羟基苏氯酸-4-磷酸脱氢酶(pdxA)[1.1.1.262] |
ORF00157 | 313和314 | 存活蛋白surA前体(肽基-脯氨酰基顺反异构酶surA)(PPI酶) |
ORF00158 | 315和316 | 有机溶剂耐受蛋白前体 |
ORF00159 | 317和318 | 有机溶剂耐受蛋白前体 |
ORF00160 | 319和320 | DnaJ样蛋白dilA (AE005182) |
ORF00161 | 321和322 | 核糖体大亚基假尿苷合酶A |
ORF00162 | 323和324 | RNA聚合酶相关蛋白(hepA)[3.6.1.-] |
ORF00163 | 325和326 | 假拟蛋白 |
ORF00164 | 327和328 | DNA聚合酶II |
ORF00165 | 329和330 | L-核酮糖-5-磷酸4-差向异构酶(araD)[5.1.3.4] |
ORF00166 | 331和332 | L-阿拉伯糖异构酶(araA)[5.3.1.4] |
ORF00167 | 333和334 | L-核酮糖激酶(araB)[2.7.1.16] |
ORF00168 | 335和336 | 转录调节蛋白,AraC家族 |
ORF00169 | 337和338 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00170 | 339和340 | DedA家族内膜蛋白 |
ORF00171 | 341和342 | 硫胺ABC转运蛋白。ATP-结合蛋白 |
ORF00172 | 343和344 | 硫胺-硫胺焦磷酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白(thiP) |
ORF00173 | 345和346 | 硫胺-硫胺焦磷酸ABC转运蛋白,硫胺-硫胺焦磷酸-结合蛋白(thiB) |
ORF00174 | 347和348 | 细菌胞外溶质-结合蛋白,家族5家族 |
ORF00175 | 349和350 | 3-异丙基苹果酸酯脱水酶,小亚基(leuD)[4.2.1.33] |
ORF00176 | 351和352 | 3-异丙基苹果酸酯脱水酶,大亚基(leuC) [4.2.1.33] |
ORF00177 | 353和354 | 3-异丙基苹果酸酯脱氢酶(leuB)[1.1.1.85] |
ORF00178 | 355和356 | 2-异丙基苹果酸酯合酶(leuA) [2.3.3.13] |
ORF00179 | 357和358 | LeuO蛋白。 |
ORF00180 | 359和360 | 乙酰乳酸合酶,大亚基,生物合成类型(ilvB)[2.2.1.6] |
ORF00181 | 361和362 | 乙酰乳酸合酶,小亚基(ilvN)[2.2.1.6] |
ORF00182 | 363和364 | fru操纵子等的转录阻抑物 |
ORF00183 | 365和366 | mraZ蛋白(mraZ) |
ORF00184 | 367和368 | S-腺苷-甲基转移酶MraW(mraW)[2.1.1.-] |
ORF00185 | 369和370 | 细胞分裂蛋白fisL |
ORF00186 | 371和372 | 肽聚糖合成酶ftsl前体(PBP)[2.4.1.129] |
ORF00187 | 373和374 | UDP-N-乙酰胞壁酰丙氨酰-D-谷氨酸--2,6-二氨基庚二酸连接酶 |
ORF00188 | 375和376 | UDP-N-乙酰胞壁酰丙氨酰-D-谷氨酰-2,6-二氨基庚二酸-D-丙氨酰-D-丙氨酰连 |
ORF00189 | 377和378 | 磷酸-N-乙酰基胞壁酰基-五肽-转移酶(mraY)[2.7.8.13] |
ORF00190 | 379和380 | UDP-乙酰基胞壁酰基丙氨酸-D-谷氨酸连接酶(murD)[6.3.2.9] |
ORF00191 | 381和382 | 细胞分裂蛋白ftsW |
ORF00192 | 383和384 | 十一碳异戊二烯基-二磷酸-胞壁酰基五肽β-N-乙酰基葡糖胺基转移酶(murG) |
ORF00193 | 385和386 | UDP-N-乙酰基胞壁酸-丙氨酸连接酶(murC)[6.3.2.8] |
ORF00194 | 387和388 | D-丙氨酸--D-丙氨酸连接酶B(ddlB)[6.3.2.4] |
ORF00195 | 389和390 | 乙酰乳酸合酶同功酶III大亚基[4.1.3.18] |
ORF00196 | 391和392 | 乙酰乳酸合酶,小亚基(ilvN) [2.2.1.6] |
ORF00197 | 393和394 | 果糖阻抑物(分解代谢物阻抑物-激活物) |
ORF00198 | 395和396 | 果糖阻抑物(分解代谢物阻抑物-激活物) |
ORF00199 | 397和398 | 乙酰乳酸合酶同功酶III大亚基[4.1.3.18] |
ORF00200 | 399和400 | 乙酰乳酸合酶,小亚基(ilvN) [2.2,1.6] |
ORF00201 | 401和402 | 果糖阻抑物(分解代谢物阻抑物-激活物) |
ORF00202 | 403和404 | D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶B (ddlB)[6.3,2.4] |
ORF00203 | 405和406 | 细胞分裂蛋白ftsO |
ORF00204 | 407和408 | 细胞分裂蛋白FtsA (ffsA) |
ORF00205 | 409和410 | 细胞分裂蛋白ftsZ |
ORF00206 | 411和412 | UDP-3-O-酰基N-乙酰基葡糖胺脱乙酰酶(lpxC)[3.5.1.-] |
ORF00207 | 413和414 | 分泌监测物前体 |
ORF00208 | 415和416 | secA蛋白 |
ORF00209 | 417和418 | 前蛋白转位酶,SecA亚基(secA) |
ORF00210 | 419和420 | 突变基因mutT蛋白(mutT)[3.6.1.-] |
ORF00211 | 421和422 | UPF0243锌结合蛋白yacG-相关蛋白 |
ORF00212 | 423和424 | 假拟UPF0289蛋白vacF |
ORF00213 | 425和426 | 脱磷酸-CoA激酶(coaE)[2.7.1.24] |
ORF00214 | 427和428 | 鸟苷单磷酸还原酶(guaC)[1.7.1.7] |
ORF00215 | 429和430 | 蛋白转运蛋白hofC(MTB) |
ORF00216 | 431和432 | 蛋白转运蛋白hofB(MTB) |
ORF00217 | 433和434 | 前菌毛蛋白肽酶依赖性蛋白D前体 |
ORF00218 | 435和436 | 盐酸-核苷酸焦磷酸化酶(nadC)[2.4.2.19] |
ORF00219 | 437和438 | AmpD蛋白(ampD) |
ORF00220 | 439和440 | 调节ampC |
ORF00221 | 441和442 | 芳族氨基酸转运蛋白aroP(通用芳族氨基酸通透酶) |
ORF00222 | 443和444 | 尿路病原性特定蛋白 |
ORF00223 | 445和446 | 未命名蛋白产物:在OrfU2的3′缺失9 bp |
ORF00224 | 447和448 | 尿路病原性特定蛋白(部分)[3.1.-.-] |
ORF00225 | 449和450 | 未命名蛋白产物:OrfU3 |
ORF00226 | 451和452 | 未命名蛋白产物;OrfU1 |
ORF00227 | 453和454 | 丙酮酸脱氢酶复合物阻抑物 |
ORF00228 | 455和456 | 丙酮酸脱氢酶E1组件(aceE)[1.2.4.1] |
ORF00229 | 457和458 | 丙酮酸脱氢酶复合物二氢硫辛酰胺乙酰基转移酶(aceF) |
ORF00230 | 459和460 | 二氢硫辛酰胺脱氢酶(lpdA)[1.8.1.4] |
ORF00231 | 461和462 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00232 | 463和464 | 假拟蛋白 |
ORF00233 | 465和466 | 假拟蛋白 |
ORF00234 | 467和468 | 顺乌头酸水合酶2(acnB)[4.2.13] |
ORF00235 | 469和470 | S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶酶原 |
ORF00236 | 471和472 | 亚精胺合酶(speE)[2.5.1.16] |
ORF00237 | 473和474 | vacC |
ORF00238 | 475和476 | 蓝铜氧化酶cueO前体 |
ORF00239 | 477和478 | 葡萄糖脱氢酶 |
ORF00240 | 479和480 | 次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶(hpt)[2.4,2.8] |
ORF00241 | 481和482 | 蛋白yadF[4.2.1.1] |
ORF00242 | 483和484 | ABC转运蛋白ATP-结合蛋白 |
ORF00243 | 485和486 | ABC转运蛋白完整膜蛋白STY0195(膜) |
ORF00244 | 487和488 | 果糖特异性磷酸转移酶系统组件同源物(PTS)[2.7.1.69] |
ORF00245 | 489和490 | 多糖脱乙酰酶结构域蛋白 |
ORF00246 | 491和492 | 天冬氨酸1-脱羧酶(panD)[4.1.1.11] |
ORF00247 | 493和494 | 转座酶 |
ORF00248 | 495和496 | 泛解酸-β-丙氨酸连接酶(panC)[6.3.2.1] |
ORF00249 | 497和498 | 3-甲基-2-氧代丁酸羟甲基转移酶(panB) [2.1.2.11] |
ORF00250 | 499和500 | 假拟的菌毛样蛋白yadC前体 |
ORF00251 | 501和502 | 蛋白质 |
ORF00252 | 503和504 | 菌毛蛋白超家族 |
ORF00253 | 505和506 | 假拟蛋白 |
ORF00254 | 507和508 | 外膜传达蛋白htrE前体 |
ORF00255 | 509和510 | 侣伴蛋白ecpD前体 |
ORF00256 | 511和512 | 菌毛蛋白侣伴蛋白ecpD2 |
ORF00257 | 513和514 | 2-氨基-4-羟基-6-羟甲基二氢蝶啶焦磷酸激酶(folK)2.7.6.3 |
ORF00258 | 515和516 | 聚(A)聚合酶(PAP)(质粒拷贝数蛋白)(PAP)[2.7.7.19] |
ORF00259 | 517和518 | 聚(A)聚合酶(PAP) |
ORF00260 | 519和520 | 谷氨酸-tRNA连接酶同源物yadB |
ORF00261 | 521和522 | dnaK抑制蛋白 |
ORF00262 | 523和524 | 糖发酵刺激蛋白(sfsA) |
ORF00263 | 525和526 | 2-5 RNA连接酶 |
ORF00264 | 527和528 | ATP-依赖性螺旋酶HrpB(hrpB) |
ORF00265 | 529和530 | 肽聚糖合成酶青霉素-结合蛋白1B |
ORF00266 | 531和532 | 青霉素-结合蛋白1B(mrcB) |
ORF00267 | 533和534 | 铁色素-铁受体前体(异羟肟酸铁摄取)(异羟肟酸铁受体) |
ORF00268 | 535和536 | 铁色素转运ATP结合蛋白fhuC |
ORF00269 | 537和538 | 铁色素结合性周质蛋白前体 |
ORF00270 | 539和540 | 铁色素转运系统通透酶蛋白fhuB(膜) |
ORF00271 | 541和542 | 谷氨酸-1-半醛-2,1-氨基变位酶(hemL)[5.4.3.8] |
ORF00272 | 543和544 | H(+)-Cl(-)交换转运蛋白clcA |
ORF00273 | 545和546 | HesB家族蛋白 |
ORF00274 | 547和548 | 预计的膜蛋白 |
ORF00275 | 549和550 | 维生素B12转运蛋白btuF前体(PBP) |
ORF00276 | 551和552 | MTA-SAH核苷酶 |
ORF00277 | 553和554 | 脱氧鸟苷三磷酸三磷酸水解酶,推定亚家族[3.1.5.1] |
ORF00278 | 555和556 | htrA产物[3.4.21.-] |
ORF00279 | 557和558 | 糖二酸调节蛋白 |
ORF00280 | 559和560 | 假拟UPFO325蛋白yaeH |
ORF00281 | 561和562 | 2,3,4,5-四氢吡啶-2,6-二羧酸N-琥珀酰转移酶(dapD)[2.3.1.117] |
ORF00282 | 563和564 | 蛋白-P-II尿苷酰基转移酶(glnD)[2.7.7.59] |
ORF00283 | 565和566 | 1型甲硫氨酸氨基肽酶(map)[3.4.11.18] |
ORF00284 | 567和568 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00285 | 569和570 | 30S核糖体蛋白S2 |
ORF00286 | 571和572 | 翻译延长因子Ts(tsf) |
ORF00287 | 573和574 | 尿苷酸激酶(pyrH)[2.7.4.-] |
ORF00288 | 575和576 | 核糖体回收因子(frr) |
ORF00289 | 577和578 | 1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶(dxr)[1.1.1.267] |
ORF00290 | 579和580 | 十一异戊二烯基二磷酸合酶(uppS)[2.5.1.31] |
ORF00291 | 581和582 | 磷脂酸胞苷酰基转移酶(cdsA)[2.7.7.41 |
ORF00292 | 583和584 | 推定的膜结合锌金属蛋白酶 |
ORF00293 | 585和586 | 外膜蛋白前体yaeT(D15) |
ORF00294 | 587和588 | 位于外膜中的组蛋白样蛋白或 |
ORF00295 | 589和590 | UDP-3-O-[3-羟基十四酰]葡糖胺N-酰基转移酶(lpxD)[2.3.1.-] |
ORF00296 | 591和592 | (3R)-羟基十四酰酰基载体蛋白脱水酶[4.2.1.-] |
ORF00297 | 593和594 | 酰基-[酰基-载体-蛋白质]-UDP-N-乙酰基葡糖胺O-酰基转移酶(lpxA)[2.3.1.129] |
ORF00298 | 595和596 | 脂质A-二糖合酶(lpxB)[2.4.1.182] |
ORF00299 | 597和598 | 核糖核酸酶HII (mhB)[3.1 26.4] |
ORF00300 | 599和600 | DNA聚合酶III α亚基(dnaE)[2.7.7.7] |
ORF00301 | 601和602 | 乙酰基-CoA羧化酶,羧基转移酶,α亚基(accA) [6.4.1.2] |
ORF00302 | 603和604 | 赖氨酸脱羧酶,组成性(Idc)[4.11.18] |
ORF00303 | 605和606 | 赖氨酸脱羧酶,组成性(Idc)[4.1.1.18] |
ORF00304 | 607和608 | 乳酰谷胱甘肽裂合酶 |
ORF00305 | 609和610 | 细胞周期蛋白(IIe) |
ORF00306 | 611和612 | Rof蛋白 |
ORF00307 | 613和614 | 推定的胞质蛋白 |
ORF00308 | 615和616 | YaeQ蛋白 |
ORF00309 | 617和618 | 推定的肽酰基-tRNA水解酶结构域 |
ORF00310 | 619和620 | 铜内稳态蛋白cutF前体(脂蛋白) |
ORF00311 | 621和622 | yaeF蛋白 |
ORF00312 | 623和624 | 脯氨酰-tRNA合成酶(proS)[6.1.1.15] |
ORF00313 | 625和626 | UPF0066蛋白rcsF (orf3) |
ORF00314 | 627和628 | 蛋白rcsF |
ORF00315 | 629和630 | D-甲硫氨酸-结合性脂蛋白metQ前体(hlpA) |
ORF00316 | 631和632 | D-甲硫氨酸转运系统通透酶蛋白metl(膜) |
ORF00317 | 633和634 | D-甲硫氨酸ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(metN) |
ORF00318 | 635和636 | 未命名蛋白产物 |
ORF00319 | 637和638 | 假拟蛋白 |
ORF00320 | 639和640 | 2.5-二酮-D-葡糖酸还原酶B(orf267)[1.11.274] |
ORF00321 | 641和642 | 未命名蛋白产物;与LysR-家族转录调节物高度相似,大肠杆菌的YafC蛋白 |
ORF00322 | 643和644 | 未命名蛋白产物 |
ORF00323 | 645和646 | 甲基转移酶,UbiE-COQ5家族 |
ORF00324 | 647和648 | 结合于膜的裂解性胞壁质转糖基酶D前体(胞壁质水解酶D) |
ORF00325 | 649和650 | 羟基酰基谷胱甘肽水解酶[3.12.6] |
ORF00326 | 651和652 | 假拟蛋白 |
ORF00327 | 653和654 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00328 | 655和656 | RNA酶HI,降解DNA-RNA杂交体的RNA |
ORF00329 | 657和658 | DNA聚合酶III,ε亚基(dnaQ)[2.7.7.7] |
ORF00330 | 659和660 | 假拟脂蛋白yafT前体 |
ORF00331 | 661和662 | Aec32 |
ORF00332 | 663和664 | Aec31 |
ORF00333 | 665和666 | Aec30 |
ORF00334 | 667和668 | Aec29 |
ORF00335 | 669和670 | 假拟蛋白 |
ORF00336 | 671和672 | Aec28 |
ORF00337 | 673和674 | Aec27 |
ORF00338 | 675和676 | Aec26 |
ORF00339 | 677和678 | Aec25 |
ORF00340 | 679和680 | Aec24 |
ORF00341 | 681和682 | Aec23 |
ORF00342 | 683和684 | 假拟蛋白 |
ORF00343 | 685和686 | Aec22 |
ORF00344 | 687和688 | Aec20 |
ORF00345 | 689和690 | Aec19 |
ORF00346 | 691和692 | Aec18 |
ORF00347 | 693和694 | Aec17 |
ORF00348 | 695和696 | Aec16 |
ORF00349 | 697和698 | Aec15(AF044503) |
ORF00350 | 699和700 | Aec14 |
ORF00351 | 701和702 | Aec13 |
ORF00352 | 703和704 | 转座酶(IS4家族) |
ORF00353 | 705和706 | Aec7 |
ORF00354 | 707和708 | 可能的水解酶 |
ORF00355 | 709和710 | 假拟蛋白 |
ORF00356 | 711和712 | 脊椎动物溶酶体前体的抑制物 |
ORF00357 | 713和714 | 酰基-CoA脱氢酶(EC 1.3.99.-)[1.3.99.-] |
ORF00358 | 715和716 | 磷酸庚糖异构酶(gmhA)[5.-.-.-] |
ORF00359 | 717和718 | 功能未知的细菌蛋白(DUF949)超家族 |
ORF00360 | 719和720 | 预测的谷胺酰胺酰胺基转移酶 |
ORF00361 | 721和722 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00362 | 723和724 | 假拟脂蛋白yafL前体 |
ORF00363 | 725和726 | 功能未知的蛋白质(DUF1568)结构域蛋白 |
ORF00364 | 727和728 | FhiA蛋白 |
ORF00365 | 729和730 | MbhA蛋白 |
ORF00366 | 731和732 | DNA聚合酶IV(PolIV)[2.7.7.7] |
ORF00367 | 733和734 | 防止-宿主-死亡家族蛋白 |
ORF00368 | 735和736 | 未命名蛋白产物 |
ORF00369 | 737和738 | 假拟的乙酰基转移酶yafP[2.3.1.-] |
ORF00370 | 739和740 | 未表征的保守性蛋白,RtcB-UPF0027家族CAC3383 |
ORF00371 | 741和742 | 肽链释放因子同源物(RF) |
ORF00372 | 743和744 | 氨基酰基-组氨酸二肽酶PepD |
ORF00373 | 745和746 | 黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶(XGPRT)[2.4.2.22] |
ORF00374 | 747和748 | α-β超家族的水解酶 |
ORF00375 | 749和750 | Curlin基因转录激活蛋白 |
ORF00376 | 751和752 | 外膜孔蛋白E前体 |
ORF00377 | 753和754 | 谷氨酸5-激酶(proB) [2.7.2.11] |
ORF00378 | 755和756 | γ-谷氨酰磷酸还原酶(proA)[1.2.1.41] |
ORF00379 | 757和758 | HTH型转录调节物prsX |
ORF00380 | 759和760 | 血红蛋白酶 |
ORF00381 | 761和762 | InsA |
ORF00382 | 763和764 | InsB |
ORF00383 | 765和766 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00384 | 767和768 | YagU |
ORF00385 | 769和770 | 未表征的蛋白家族(UPF0153)超家族 |
ORF00386 | 771和772 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00387 | 773和774 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00388 | 775和776 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00389 | 777和778 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00390 | 779和780 | MatB前体 |
ORF00391 | 781和782 | 转录调节物,LuxR家族结构域蛋白 |
ORF00392 | 783和784 | 核糖体蛋白L36(rPmJ) |
ORF00393 | 785和786 | 尾蛋白 |
ORF00394 | 787和788 | Sb24 |
ORF00395 | 789和790 | 尾丝装配蛋白 |
ORF00396 | 791和792 | T4-排除蛋白gpIBEGd |
ORF00397 | 793和794 | 假拟蛋白 |
ORF00398 | 795和796 | 假拟蛋白 |
ORF00399 | 797和798 | NADH-依赖性黄素氧化还原酶,Oye家族[1.-.-.-] |
ORF00400 | 799和800 | 二烯内酯水解酶结构域蛋白(AE000230) |
ORF00401 | 801和802 | 转录调节物,LysR家族Atu5241 |
ORF00402 | 803和804 | 转录调节物(LysR家族) |
ORF00403 | 805和806 | 氧化还原酶,醛-酮还原酶家族 |
ORF00404 | 807和808 | 2,5-二酮-D-葡糖酸还原酶A [1.1.1.-] |
ORF00405 | 809和810 | 推定粘附素 |
ORF00406 | 811和812 | 假拟转录调节物ykgA |
ORF00407 | 813和814 | 2,5-二酮-D-葡糖酸还原酶A |
ORF00408 | 815和816 | MC21 |
ORF00409 | 817和818 | 功能未知的蛋白质(DUF1471)超家族 |
ORF00410 | 819和820 | 吡啶核苷酸-二硫化物氧化还原酶[1.16.1.1] |
ORF00411 | 821和822 | 假拟转录调节物vkgD |
ORF00412 | 823和824 | 富半胱氨酸结构域蛋白 |
ORF00413 | 825和826 | 铁-硫簇结合 |
ORF00414 | 827和828 | 未表征的ACR,YkgG家族COG1556家族 |
ORF00415 | 829和830 | 假拟蛋白 |
ORF00416 | 831和832 | 外膜自体转运蛋白圆筒结构域蛋白 |
ORF00417 | 833和834 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00418 | 835和836 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00419 | 837和838 | 1型菌毛调节蛋白fimB |
ORF00420 | 839和840 | 胆碱脱氢酶(β)[1.1.99.1] |
ORF00421 | 841和842 | 甜菜碱醛脱氢酶(betB)[1.2.1.8] |
ORF00422 | 843和844 | 调节蛋白betl(U73857) |
ORF00423 | 845和846 | 高亲和胆碱转运蛋白 |
ORF00424 | 847和848 | EAL结构域蛋白 |
ORF00425 | 849和850 | allS |
ORF00426 | 851和852 | 谷胱甘肽-调节的钾外流系统蛋白 |
ORF00427 | 853和854 | 锚蛋白重复结构域蛋白 |
ORF00428 | 855和856 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00429 | 857和858 | YahF-FdrA样蛋白 |
ORF00430 | 859和860 | YahG-YIbE样蛋白 |
ORF00431 | 861和862 | 氨基甲酸酯激酶样蛋白yahl[2.7.2.2] |
ORF00432 | 863和864 | 胞嘧啶脱氨酶 |
ORF00433 | 865和866 | 功能未知的蛋白质(DUF984)超家族 |
ORF00434 | 867和868 | ABC转运蛋白,底物结合蛋白[sugar](AE005211) |
ORF00435 | 869和870 | 核糖ABC转运蛋白(ATP-结合蛋白) |
ORF00436 | 871和872 | 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白,推定 |
ORF00437 | 873和874 | ABC糖转运蛋白,通透酶亚基(通透酶) |
ORF00438 | 875和876 | 氧化还原酶,锌结合[1.1.1.2] |
ORF00439 | 877和878 | RhtC样转运蛋白STY0397 (RhtC) |
ORF00440 | 879和880 | 功能未知的蛋白质(DUF1471)超家族 |
ORF00441 | 881和882 | 丙酸代谢操纵子调节蛋白PrpR(prpR) |
ORF00442 | 883和884 | 假拟蛋白 |
ORF00443 | 885和886 | prp操纵子的调节物 |
ORF00444 | 887和888 | 假拟蛋白 |
ORF00445 | 889和890 | 甲基异柠檬酸裂合酶(prpB) [4.1.3.30] |
ORF00446 | 891和892 | 2-甲基柠檬酸裂合酶(甲基柠檬酸裂合酶)(柠檬酸裂合酶2)[2.3.3.5] |
ORF00447 | 893和894 | 2-甲基柠檬酸脱水酶(prpD)[4.2.1.79] |
ORF00448 | 895和896 | 丙酸-CoA连接酶(prpE)[6.2.1.17] |
ORF00449 | 897和898 | 推定的胞嘧啶转运蛋白 |
ORF00450 | 899和900 | 胞嘧啶脱氨酶 |
ORF00451 | 901和902 | 半乳糖苷O-乙酰基转移酶[2.3.1.18] |
ORF00452 | 903和904 | 乳糖通透酶(乳糖-质子-同向转运) |
ORF00453 | 905和906 | β-半乳糖苷酶(lacZ)[3.2.1.23] |
ORF00454 | 907和908 | 转录调节物,lacI家族结构域蛋白,推定 |
ORF00455 | 909和910 | Arac家族转录调节物 |
ORF00456 | 911和912 | 核蛋白-多核苷酸-相关酶 |
ORF00457 | 913和914 | 羧酸酯酶 |
ORF00458 | 915和916 | 醇脱氢酶[相似性](adhC)[1.-.-.-] |
ORF00459 | 917和918 | 推定的α螺旋链 |
ORF00460 | 919和920 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00461 | 921和922 | 糖磷酸酯核苷酰基转移酶 |
ORF00462 | 923和924 | 葡糖胺基转移酶 |
ORF00463 | 925和926 | 推定的保守蛋白 |
ORF00464 | 927和928 | 牛磺酸ABC转运蛋白,周质结合蛋白(tauA) |
ORF00465 | 929和930 | 牛磺酸ABC转运蛋白,ATP结合蛋白(cmpC) |
ORF00466 | 931和932 | 牛磺酸转运系统通透酶蛋白tauC |
ORF00467 | 933和934 | α-酮戊二酸-依赖性牛磺酸双加氧酶[1.-.-.-] |
ORF00468 | 935和936 | 6-氨基乙酰丙酸脱水酶(hemB)[4.2.1.24] |
ORF00469 | 937和938 | 推定的自体转运蛋白-毒力因子STY0405(部分) |
ORF00470 | 939和940 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00471 | 941和942 | β-内酰胺酶 |
ORF00472 | 943和944 | SbmA蛋白 |
ORF00473 | 945和946 | 推定的脂蛋白 |
ORF00474 | 947和948 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00475 | 949和950 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00476 | 951和952 | D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶A(D-丙氨酰丙氨酸合成酶A)(D-Ala-D-Ala连接酶A) |
ORF00477 | 953和954 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00478 | 955和956 | LD01705p |
ORF00479 | 957和958 | 碱性磷酸酶前体 |
ORF00480 | 959和960 | 由磷酸饥饿诱导 |
ORF00481 | 961和962 | AdrA蛋白(GGDEF) |
ORF00482 | 963和964 | 吡咯啉-5-羧酸酯还原酶(proC)[1.5.1.2] |
ORF00483 | 965和966 | Yail-YqxD家族蛋白家族 |
ORF00484 | 967和968 | 莽草酸激酶(aroK)[2.7.1.71] |
ORF00485 | 969和970 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00486 | 971和972 | AroM蛋白 |
ORF00487 | 973和974 | 在细菌中保守的未表征的蛋白 |
ORF00488 | 975和976 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00489 | 977和978 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00490 | 979和980 | 重组相关蛋白rdgC |
ORF00491 | 981和982 | 可能的NAGC样转录调节物 |
ORF00492 | 983和984 | 主要易化家族转运蛋白 |
ORF00493 | 985和986 | 外切核酸酶sbcC(p-环)[3.1.15.-] |
ORF00494 | 987和988 | 外切核酸酶sbcD(sbcD)[3.1.-.-] |
ORF00495 | 989和990 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00496 | 991和992 | 磷酸调节子转录调节蛋白PhoB(phoB) |
ORF00497 | 993和994 | 磷酸调节子传感蛋白phoR |
ORF00498 | 995和996 | 假拟蛋白 |
ORF00499 | 997和998 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00500 | 999和1000 | 支链氨基酸转运系统II载体蛋白(brnQ) |
ORF00501 | 1001和1002 | 脯氨酸-特异性通透酶proY |
ORF00502 | 1003和1004 | 麦芽糖糊精葡糖苷酶[3.2.1.20] |
ORF00503 | 1005和1006 | 功能未知的蛋白,DUF479超家族 |
ORF00504 | 1007和1008 | S-腺苷甲硫氨酸:tRNA核糖基转移酶 |
ORF00505 | 1009和1010 | queuine tRNA-核糖基转移酶(tgt)[2.4.2.29] |
ORF00506 | 1011和1012 | 前蛋白移位酶,YajC亚基,推定 |
ORF00507 | 1013和1014 | 蛋白输出膜蛋白secD |
ORF00508 | 1015和1016 | 蛋白输出膜蛋白secF |
ORF00509 | 1017和1018 | HNH内切核酸酶结构域蛋白 |
ORF00510 | 1019和1020 | 核苷特异性通道形成蛋白tsx前体 |
ORF00511 | 1021和1022 | yajl蛋白 |
ORF00512 | 1023和1024 | 保守性假拟蛋白TIGR00244 |
ORF00513 | 1025和1026 | 核黄素生物合成蛋白RibD(ribD)[3.5.4.26 1.1.1.193] |
ORF00514 | 1027和1028 | 6,7-二甲基-8-核糖基二氧四氢蝶啶合酶 |
ORF00515 | 1029和1030 | 转录抗终止因子NusB(nusB) |
ORF00516 | 1031和1032 | 硫胺-单磷酸激酶(thiL)[2.7.4.16] |
ORF00517 | 1033和1034 | 磷脂酰甘油磷酸酶A |
ORF00518 | 1035和1036 | 可能的氧化还原酶YajO[1.-.-.-] |
ORF00519 | 1037和1038 | -脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶(dxs)[2.2.1.7] |
ORF00520 | 1039和1040 | 牻牛儿基转移酶(法尼基-二磷酸合酶)(FPP合酶)(ispA)[2.5.1.10] |
ORF00521 | 1041和1042 | 外切脱氧核糖核酸酶VII,小亚基(xseB)[3.1.11.6] |
ORF00522 | 1043和1044 | 假拟蛋白 |
ORF00523 | 1045和1046 | 硫胺生物合成蛋白thil(thil) |
ORF00524 | 1047和1048 | 4-甲基-5(B-羟乙基)-噻唑单磷酸生物合成酶(ThiJ) |
ORF00525 | 1049和1050 | 2-脱氢泛解酸酯2-还原酶(panE)[1.1.1.169] |
ORF00526 | 1051和1052 | 蛋白yajQ |
ORF00527 | 1053和1054 | 假拟转运蛋白yajR |
ORF00528 | 1055和1056 | 血红素IX法尼基转移酶(cyoE)[2.5.1.-] |
ORF00529 | 1057和1058 | 细胞色素o泛醇氧化酶C亚基[1.10.3.-] |
ORF00530 | 1059和1060 | 细胞色素c氧化酶亚基III |
ORF00531 | 1061和1062 | 泛醇氧化酶多肽I(细胞色素o亚基1)(氧化酶BO(3)亚基1)(细胞色素o泛醇氧化酶 |
ORF00532 | 1063和1064 | 泛醇氧化酶多肽II前体(细胞色素o亚基2)(氧化酶BO(3)亚基2)(细胞色素o泛醇 |
ORF00533 | 1065和1066 | β-内酰胺酶诱导信号转导物AmpG |
ORF00534 | 1067和1068 | AmpG-信号转导物 |
ORF00535 | 1069和1070 | 推定的多肽酶-蛋白酶 |
ORF00536 | 1071和1072 | BolA蛋白 |
ORF00537 | 1073和1074 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00538 | 1075和1076 | 引发蛋白(TF)(tig) |
ORF00539 | 1077和1078 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00540 | 1079和1080 | 引发蛋白(tig)[5.2.1.8] |
ORF00541 | 1081和1082 | ATP依赖性Clp蛋白酶,蛋白水解亚基ClpP(clpP)[3.4.21.92] |
ORF00542 | 1083和1084 | ATP依赖性Clp蛋白酶,ATP结合亚基ClpX(clpX) |
ORF00543 | 1085和1086 | ATP依赖性Clp蛋白酶La(Ion)[3.4.21.53] |
ORF00544 | 1087和1088 | DNA结合蛋白HU-β,NS1(HU) |
ORF00545 | 1089和1090 | 肽基-脯氨酰顺反异构酶D(PPI酶D)(旋转异构酶D)[5.2.1.8] |
ORF00546 | 1091和1092 | DNA摄取蛋白 |
ORF00547 | 1093和1094 | 预测的硫酯酶 |
ORF00548 | 1095和1096 | exsB蛋白 |
ORF00549 | 1097和1098 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00550 | 1099和1100 | Cof蛋白 |
ORF00551 | 1101和1102 | 转录调节物,AsnC家族 |
ORF00552 | 1103和1104 | 多药耐药样ATP-结合蛋白mdlA(atp) |
ORF00553 | 1105和1106 | 多药耐药样ATP-结合蛋白Mdl |
ORF00554 | 1107和1108 | 谷氨酰胺合成酶活性调节蛋白 |
ORF00555 | 1109和1110 | 铵转运蛋白(amt) |
ORF00556 | 1111和1112 | 酰基-CoA硫酯酶II(tesB)[3.1.2.-] |
ORF00557 | 1113和1114 | 假拟蛋白 |
ORF00558 | 1115和1116 | 糖蛋白-多糖代谢 |
ORF00559 | 1117和1118 | 预测的甲基化DNA-蛋白半胱氨酸甲基转移酶 |
ORF00560 | 1119和1120 | 功能未知的蛋白质(DUF1428)超家族 |
ORF00561 | 1121和1122 | EAL结构域蛋白 |
ORF00562 | 1123和1124 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00563 | 1125和1126 | 麦芽糖O-乙酰基转移酶[2.3.1.79] |
ORF00564 | 1127和1128 | 假拟蛋白 |
ORF00565 | 1129和1130 | Hha蛋白 |
ORF00566 | 1131和1132 | YmoB |
ORF00567 | 1133和1134 | 吖啶黄素抗性蛋白B |
ORF00568 | 1135和1136 | 吖啶黄素抗性蛋白A前体 |
ORF00569 | 1137和1138 | HTH-型转录调节物acrR(可能的acrAB操纵子阻抑物)(acrEF) |
ORF00570 | 1139和1140 | 钾外流系统kefA |
ORF00571 | 1141和1142 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00572 | 1143和1144 | 引发体复制蛋白N |
ORF00573 | 1145和1146 | 功能未知的蛋白质(DUF454)家族 |
ORF00574 | 1147和1148 | 假拟蛋白 |
ORF00575 | 1149和1150 | 腺嘌呤磷酸核糖基转移酶(apt)[2.4.2.7] |
ORF00576 | 1151和1152 | DNA聚合酶III,γ和τ亚基,程序性(dnaX)[2.7.7.7] |
ORF00577 | 1153和1154 | 保守性假拟蛋白TIGR00103 |
ORF00578 | 1155和1156 | 重组蛋白RecR(recR) |
ORF00579 | 1157和1158 | 侣伴蛋白htpG (热激蛋白htpG) (高温蛋白G)(热激蛋白C62.5) (htpG) |
ORF00580 | 1159和1160 | 腺苷酸激酶 |
ORF00581 | 1161和1162 | 亚铁螯合酶(hemH)[4.99.1.1] |
ORF00582 | 1163和1164 | 乙酰酯酶[3.1.1.-] |
ORF00583 | 1165和1166 | 肌苷-鸟苷激酶[2.7.1.73] |
ORF00584 | 1167和1168 | RosB |
ORF00585 | 1169和1170 | 马薄荷油抗性蛋白(CAMP) |
ORF00586 | 1171和1172 | 蛋白ushA前体[白金:UDP-糖水解酶(UDP-糖二磷酸酶) |
ORF00587 | 1173和1174 | 假拟蛋白 |
ORF00588 | 1175和1176 | 假拟蛋白 |
ORF00589 | 1177和1178 | ybaK-ebsC蛋白(ybaK) |
ORF00590 | 1179和1180 | GumN蛋白超家族 |
ORF00591 | 1181和1182 | 可能的杀伤蛋白VCA0391 |
ORF00592 | 1183和1184 | 未命名蛋白产物;与毒力相关蛋白A(vapA)有些相似 |
ORF00593 | 1185和1186 | 铜-转运P-型ATP酶[3.6.1.-] |
ORF00594 | 1187和1188 | K-3型谷氨酰胺酶[3.5.1.2] |
ORF00595 | 1189和1190 | 推定的氨基酸通透酶家族蛋白 |
ORF00596 | 1191和1192 | Cu(I)-反应性转录调节物(cueR) |
ORF00597 | 1193和1194 | 假拟蛋白 |
ORF00598 | 1195和1196 | 推定的脂蛋白 |
ORF00599 | 1197和1198 | 粘附素-侵袭素-样蛋白 |
ORF00600 | 1199和1200 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00601 | 1201和1202 | 膜蛋白 |
ORF00602 | 1203和1204 | 条带7-Mec-2家族蛋白 |
ORF00603 | 1205和1206 | ABC转运蛋白,ATP结合蛋白 |
ORF00604 | 1207和1208 | 推定的膜蛋白 |
ORF00605 | 1209和1210 | ybbN蛋白 |
ORF00606 | 1211和1212 | 氧化还原酶,短链脱氢酶-还原酶家族(SDR)[1.-.-.-] |
ORF00607 | 1213和1214 | 酰基-coA硫酯酶前体[3.1.2.-] |
ORF00608 | 1215和1216 | ABC转运蛋白,ATP结合蛋白 |
ORF00609 | 1217和1218 | 通透酶,推定的结构域蛋白 |
ORF00610 | 1219和1220 | YbbB |
ORF00611 | 1221和1222 | allS |
ORF00612 | 1223和1224 | 脲基乙醇酸水解酶(allA)[3.5.3.19] |
ORF00613 | 1225和1226 | 尿囊素的负调节蛋白和乙醛酸利用操纵子(转录调节蛋白allR) |
ORF00614 | 1227和1228 | 乙醛酸聚醛酶(gcl)[4.1.1.47] |
ORF00615 | 1229和1230 | 羟基丙酮酸异构酶[5.3.1.22] |
ORF00616 | 1231和1232 | 2-羟基-3-氧代丙酸还原酶[1.1.1.60] |
ORF00617 | 1233和1234 | 推定的胞嘧啶-嘌啉-尿嘧啶-硫胺-尿囊素通透酶家族蛋白 |
ORF00618 | 1235和1236 | 尿囊素酶[3.5.2.5] |
ORF00619 | 1237和1238 | 推定的嘌啉通透酶ybbY |
ORF00620 | 1239和1240 | 甘油酸激酶1 |
ORF00621 | 1241和1242 | GlxB6 |
ORF00622 | 1243和1244 | 尿囊酸酰胺水解酶(部分) |
ORF00623 | 1245和1246 | 脲基乙醇酸脱氢酶[1.1.1.154] |
ORF00624 | 1247和1248 | 蛋白fdrA |
ORF00625 | 1249和1250 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00626 | 1251和1252 | 功能未知的蛋白(DUF1116)超家族 |
ORF00627 | 1253和1254 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00628 | 1255和1256 | 氨基甲酸激酶(arcC)[2.7.2.2] |
ORF00629 | 1257和1258 | 磷酸核糖基氨基咪唑羧化酶,ATP酶亚基(purK)[4.1.1.21] |
ORF00630 | 1259和1260 | 磷酸核糖基氨基咪唑羧化酶,催化亚基(purE)[4.1.1.21] |
ORF00631 | 1261和1262 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00632 | 1263和1264 | UDP-2,3-二酰基葡糖胺水解酶(IpxH)[3.6.1.-] |
ORF00633 | 1265和1266 | 肽基-脯氨酰顺反异构酶B(ppiB) |
ORF00634 | 1267和1268 | 半胱胺酰-tRNA合成酶(cysS)[6.1.1.16] |
ORF00635 | 1269和1270 | 预测的膜结合金属依赖性水解酶(DUF457)家族 |
ORF00636 | 1271和1272 | 未表征的ACR相关蛋白 |
ORF00637 | 1273和1274 | 5,10-亚甲基-四氢叶酸脱氢酶(folD)[1.5.1.5] |
ORF00638 | 1275和1276 | 原噬菌体DLP12整合酶(原始菌体QSR’整合酶) |
ORF00639 | 1277和1278 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00640 | 1279和1280 | Gp37 |
ORF00641 | 1281和1282 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00642 | 1283和1284 | Sb36 |
ORF00643 | 1285和1286 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00644 | 1287和1288 | 由原噬菌体CP-933N编码的未知蛋白 |
ORF00645 | 1289和1290 | 抗终止蛋白Q |
ORF00646 | 1291和1292 | 由原噬菌体CP-933O编码的未知蛋白 |
ORF00647 | 1293和1294 | DNA腺嘌啉-甲基化酶 |
ORF00648 | 1295和1296 | 裂解蛋白 |
ORF00649 | 1297和1298 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00650 | 1299和1300 | 功能未知的蛋白质(DUF1327)超家族 |
ORF00651 | 1301和1302 | 溶酶体(裂解蛋白)(胞壁酸酶)(内溶素)[3.2.1.17] |
ORF00652 | 1303和1304 | 脂蛋白Rzl前体-相关蛋白 |
ORF00653 | 1305和1306 | 噬菌体裂解蛋白 |
ORF00654 | 1307和1308 | λ原噬菌体的DLP12的Bor蛋白同源物 |
ORF00655 | 1309和1310 | 假拟蛋白 |
ORF00656 | 1311和1312 | 原噬菌体内编码的部分tonB样膜蛋白 |
ORF00657 | 1313和1314 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00658 | 1315和1316 | 末端酶小亚基(DNA包装蛋白NUI)(片段) |
ORF00659 | 1317和1318 | 噬菌体末端酶大亚基(GpA) |
ORF00660 | 1319和1320 | gpW |
ORF00661 | 1321和1322 | 噬菌体门蛋白,λ家族 |
ORF00662 | 1323和1324 | 头-尾预连接蛋白GP5 |
ORF00663 | 1325和1326 | 噬菌体λ头装饰蛋白D |
ORF00664 | 1327和1328 | 噬菌体主要衣壳蛋白E |
ORF00665 | 1329和1330 | DNA包装蛋白FI |
ORF00666 | 1331和1332 | 噬菌体头尾连接 |
ORF00667 | 1333和1334 | 原噬菌体小尾蛋白Z(GPZ) |
ORF00668 | 1335和1336 | 噬菌体小尾蛋白U |
ORF00669 | 1337和1338 | 主要尾蛋白V |
ORF00670 | 1339和1340 | 噬菌体小尾蛋白G |
ORF00671 | 1341和1342 | 小尾蛋白 |
ORF00672 | 1343和1344 | 尾长卷尺蛋白前体 |
ORF00673 | 1345和1346 | 噬菌体尾卷尺蛋白,λ家族 |
ORF00674 | 1347和1348 | 噬菌体小尾蛋白L |
ORF00675 | 1349和1350 | 原噬菌体的推定尾丝组件K |
ORF00676 | 1351和1352 | 噬菌体λ尾装配蛋白I |
ORF00677 | 1353和1354 | 宿主特异性蛋白(部分) |
ORF00678 | 1355和1356 | 宿主特异性蛋白(部分) |
ORF00679 | 1357和1358 | Lom |
ORF00680 | 1359和1360 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00681 | 1361和1362 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00682 | 1363和1364 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00683 | 1365和1366 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00684 | 1367和1368 | λ原噬菌体的尾丝装配蛋白同源物 |
ORF00685 | 1369和1370 | 推定的蛋白酶 |
ORF00686 | 1371和1372 | 蛋白酶VII前体(Omptin)(外膜蛋白3 B)(蛋白酶A) (SopA) |
ORF00687 | 1373和1374 | 原噬菌体DLP12整合酶(原噬菌体QSR′整合酶) |
ORF00688 | 1375和1376 | λ(噬菌体)的尾丝装配蛋白同源物 |
ORF00689 | 1377和1378 | 蛋白酶VII前体(Omptin)(外膜蛋白3B) (蛋白酶A) (SopA) |
ORF00690 | 1379和1380 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00691 | 1381和1382 | 噬菌体N4吸附蛋白A前体 |
ORF00692 | 1383和1384 | 噬菌体N4吸附蛋白NfrB |
ORF00693 | 1385和1386 | 假拟蛋白 |
ORF00694 | 1387和1388 | 传感蛋白激酶cusS E.7.3.-] |
ORF00695 | 1389和1390 | 转录调节蛋白cusR |
ORF00696 | 1391和1392 | 阳离子外流系统蛋白cusC前体 |
ORF00697 | 1393和1394 | 阳离子外流系统蛋白cusF前体 |
ORF00698 | 1395和1396 | 阳离子外流系统蛋白cusB前体 |
ORF00699 | 1397和1398 | 阳离子外流系统蛋白cusA(CzcA) |
ORF00700 | 1399和1400 | 苯丙氨酸-特异性通透酶 |
ORF00701 | 1401和1402 | 推定转运 |
ORF00702 | 1403和1404 | 对氧气不敏感的NAD(P)H硝基还原酶[1.-.-.-] |
ORF00703 | 1405和1406 | 细菌中的未表征的蛋白保守性 |
ORF00704 | 1407和1408 | 功能未知的蛋白质(DUF1158)超家族 |
ORF00705 | 1409和1410 | 推定的谷氨酸-半胱氨酸连接酶家族2 |
ORF00706 | 1411和1412 | 4-磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶entD |
ORF00707 | 1413和1414 | 铁肠菌素受体前体 |
ORF00708 | 1415和1416 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00709 | 1417和1418 | 肠原体酯酶 |
ORF00710 | 1419和1420 | mbtH蛋白相关蛋白 |
ORF00711 | 1421和1422 | 肠菌素合成酶组件F[2.7.7.-] |
ORF00712 | 1423和1424 | 铁肠菌素转运蛋白fepE(肠原体) |
ORF00713 | 1425和1426 | 铁exochelin摄取(fxuB) |
ORF00714 | 1427和1428 | 铁exochelin摄取(fxuA) |
ORF00715 | 1429和1430 | 铁exochelin摄取(fxuC) |
ORF00716 | 1431和1432 | 推定的膜蛋白 |
ORF00717 | 1433和1434 | 铁肠菌素(肠原体)结合蛋白;周质组件 |
ORF00718 | 1435和1436 | 异分支酸合酶[5.4.99.6] |
ORF00719 | 1437和1438 | 2,3-二氢水杨酸-AMP连接酶[2.7.7.58] |
ORF00720 | 1439和1440 | 异分支酸酶(异分支酸裂合酶)(2,3-二氢-2,3-二氢水杨酸合酶) |
ORF00721 | 1441和1442 | 氧化还原酶,短链脱氢酶-还原酶家族[1.3.1.28] |
ORF00722 | 1443和1444 | 假拟UPF0152蛋白ybdB (p15) |
ORF00723 | 1445和1446 | 碳饥饿蛋白A |
ORF00724 | 1447和1448 | 未表征的小蛋白 |
ORF00725 | 1449和1450 | 甘油脱氢酶[1.1.-.-] |
ORF00726 | 1451和1452 | I类氨基转移酶[2.6.1.-] |
ORF00727 | 1453和1454 | 未命名蛋白产物;ORF ID:o166#4 |
ORF00728 | 1455和1456 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00729 | 1457和1458 | 假拟转录调节物ybdO(orf2) |
ORF00730 | 1459和1460 | 巯基:二硫键交换蛋白dsbG前体 |
ORF00731 | 1461和1462 | 烷基氢过氧化物还原酶c22蛋白[1.6.4.-] |
ORF00732 | 1463和1464 | 烷基氢过氧化物还原酶F52A蛋白[1.6.4.-] |
ORF00733 | 1465和1466 | 通用应激蛋白G |
ORF00734 | 1467和1468 | 核苷二磷酸激酶的调节物 |
ORF00735 | 1469和1470 | 核糖核酸酶I前体[3.1.27.6] |
ORF00736 | 1471和1472 | 柠檬酸载体-转运蛋白(反向转运) |
ORF00737 | 1473和1474 | 三磷酸核糖基-脱磷酸-CoA合酶(citG)[2.7.8.25] |
ORF00738 | 1475和1476 | Apo-柠檬酸裂合酶磷酸核糖基-脱磷酸-CoA转移酶(citX)[2.7.7.-] |
ORF00739 | 1477和1478 | 柠檬酸裂合酶,α亚基(citF)[2.8.3.10] |
ORF00740 | 1479和1480 | 柠檬酸裂合酶,β亚基(citE)[4.1.3.6] |
ORF00741 | 1481和1482 | 柠檬酸裂合酶酰基载体蛋白(citD) |
ORF00742 | 1483和1484 | 柠檬酸裂合酶连接酶(citC)[6.2.1.221 |
ORF00743 | 1485和1486 | 传感蛋白激酶dpiB |
ORF00744 | 1487和1488 | 转录调节蛋白dpiA (质粒遗传的去稳定剂) |
ORF00745 | 1489和1490 | 转运二羧酸 |
ORF00746 | 1491和1492 | CrcA蛋白 |
ORF00747 | 1493和1494 | 冷激样蛋白cspE |
ORF00748 | 1495和1496 | crcB蛋白(crcB) |
ORF00749 | 1497和1498 | 腈水解酶 |
ORF00750 | 1499和1500 | Sec-非依赖型蛋白转位酶蛋白tarA (YIGT) |
ORF00751 | 1501和1502 | 硫辛酸合成酶(lipA) |
ORF00752 | 1503和1504 | 硫辛酸-蛋白连接酶B (lipB) |
ORF00753 | 1505和1506 | UPF0250蛋白 |
ORF00754 | 1507和1508 | 青霉素-结合蛋白5 (PBP)[3.4.16.4] |
ORF00755 | 1509和1510 | 稀有脂蛋白A前体(rlpA) |
ORF00756 | 1511和1512 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00757 | 1513和1514 | 杆形-决定蛋白RodA(rodA) |
ORF00758 | 1515和1516 | 青霉素-结合蛋白2(PBP-2)(PBP) |
ORF00759 | 1517和1518 | 青霉素-结合蛋白2(PBP-2)(PBP) |
ORF00760 | 1519和1520 | 保守性假拟蛋白TIGR00246 |
ORF00761 | 1521和1522 | 未命名蛋白产物 |
ORF00762 | 1523和1524 | 推定的磷酸甘油酸变位酶家族蛋白[3.1.3.73] |
ORF00763 | 1525和1526 | 烟酸(烟酰胺)核苷酸腺苷酰基转移酶(nadD)[2.7.7.18] |
ORF00764 | 1527和1528 | DNA聚合酶III,δ亚基(holA)[2.7.7.7] |
ORF00765 | 1529和1530 | 小脂蛋白 |
ORF00766 | 1531和1532 | 亮氨酰-tRNA合成酶(leuS)[6.1.1.4] |
ORF00767 | 1533和1534 | 接受甲基的趋化性蛋白 |
ORF00768 | 1535和1536 | 肌苷-尿苷核苷N-核糖水解酶(AL355920) |
ORF00769 | 1537和1538 | 谷氨酸-天冬氨酸转运ATP结合蛋白gltL |
ORF00770 | 1539和1540 | 谷氨酸-天冬氨酸转运系统gltK(膜) |
ORF00771 | 1541和1542 | 谷氨酸-天冬氨酸转运系统gltJ |
ORF00772 | 1543和1544 | 谷氨酸-天冬氨酸ABC转运蛋白,周质谷氨酸-天冬氨酸结合蛋白,截短 |
ORF00773 | 1545和1546 | 菱形家族 |
ORF00774 | 1547和1548 | 载脂蛋白N-酰基转移酶(ALP N-酰基转移酶)(铜内稳态蛋白cutE)[2.3.1.-] |
ORF00775 | 1549和1550 | 镁和钴外流蛋白corC(tlyC) |
ORF00776 | 1551和1552 | 预测的金属依赖性水解酶 |
ORF00777 | 1553和1554 | PhoH样蛋白 |
ORF00778 | 1555和1556 | tRNA-i(6)A37硫转移酶MiaB(miaB) |
ORF00779 | 1557和1558 | 2-八异戊二烯基-3-甲基-6-甲氧基-1,4-苯并醌醇羟化酶 |
ORF00780 | 1559和1560 | 天冬酰胺合成酶B[谷氨酰胺-水解] |
ORF00781 | 1561和1562 | nagD蛋白,简并 |
ORF00782 | 1563和1564 | N-胰腺葡糖胺阻抑物 |
ORF00783 | 1565和1566 | N-乙酰葡糖胺-6-磷酸脱乙酰酶(nagA)[3.5.1.25] |
ORF00784 | 1567和1568 | 葡糖胺-6磷酸异构酶(nagB)[3.5.99.6] |
ORF00785 | 1569和1570 | PTS系统,N-乙酰基葡糖胺-特异性IIABC组件F(EII-Nag)[2.7.1.69] |
ORF00786 | 1571和1572 | 推定的膜蛋白 |
ORF00787 | 1573和1574 | 假拟蛋白 |
ORF00788 | 1575和1576 | 假拟蛋白 |
ORF00789 | 1577和1578 | 假拟蛋白 |
ORF00790 | 1579和1580 | TerC蛋白 |
ORF00791 | 1581和1582 | TerC蛋白 |
ORF00792 | 1583和1584 | 二氢皮考啉酸合酶(AE004999)[42.1.52] |
ORF00793 | 1585和1586 | 推定的醇脱氢酶(U59485) |
ORF00794 | 1587和1588 | 推定的内膜蛋白 |
ORF00795 | 1589和1590 | 4-羟基苏氨酸-4-磷酸脱氢酶(pdxA)[1.1.1.262] |
ORF00796 | 1591和1592 | 推定的糖代谢的转录调节物 |
ORF00797 | 1593和1594 | 谷氨酰胺酰-tRNA合成酶(glnS)[6.1.1.18] |
ORF00798 | 1595和1596 | 假拟蛋白 |
ORF00799 | 1597和1598 | 未命名蛋白产物;ORFID:o172#6 |
ORF00800 | 1599和1600 | 假拟脂蛋白ybfN前体 |
ORF00801 | 1601和1602 | 摄铁调节蛋白(摄铁调节物) |
ORF00802 | 1603和1604 | 黄素氧还蛋白1 |
ORF00803 | 1605和1606 | 脲酰胺裂合酶相关蛋白 |
ORF00804 | 1607和1608 | 脲酰胺裂合酶相关蛋白 |
ORF00805 | 1609和1610 | SeqA蛋白 |
ORF00806 | 1611和1612 | 磷酸葡糖变位酶,α-D-葡萄糖磷酸特异性(pgm)[5.4.2.2] |
ORF00807 | 1613和1614 | 腐胺-鸟氨酸反向转运蛋白(腐胺转运蛋白) (potE) |
ORF00808 | 1615和1616 | 诱导型鸟氨酸脱羧酶(speF)[4.1.1.17] |
ORF00809 | 1617和1618 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00810 | 1619和1620 | 假拟蛋白 |
ORF00811 | 1621和1622 | kdpE |
ORF00812 | 1623和1624 | 推定的传感蛋白组氨酸激酶KdpD |
ORF00813 | 1625和1626 | K+-转运ATP酶,C亚基(kdpC)[3.6.3.12] |
ORF00814 | 1627和1628 | K+-转运ATP酶,B亚基(kdpB) [3.6.3.12] |
ORF00815 | 1629和1630 | K+-转运ATP酶,A亚基(kdpA)[3.6.3.12] |
ORF00816 | 1631和1632 | K+-转运ATP酶,F亚基(kdpF)[3.6.3.12] |
ORF00817 | 1633和1634 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00818 | 1635和1636 | 未表征的保守蛋白(orf169) |
ORF00819 | 1637和1638 | 脱氧核糖二嘧啶光裂合酶[4.1.99.3] |
ORF00820 | 1639和1640 | PTR2-家族转运蛋白STY0750 |
ORF00821 | 1641和1642 | 保守性假拟蛋白TIGR00486 |
ORF00822 | 1643和1644 | 保守性假拟蛋白TIGR00370 |
ORF00823 | 1645和1646 | 脲酰胺裂合酶相关蛋白 |
ORF00824 | 1647和1648 | LamB-YcsF家族蛋白(lamB) |
ORF00825 | t649和1650 | 推定的甲酰胺嘧啶-DNA糖基化酶[3.2.-.-] |
ORF00826 | 1651和1652 | 推定的膜蛋白 |
ORF00827 | 1653和1654 | ybgO蛋白 |
ORF00828 | 1655和1656 | 柠檬酸合酶I(gltA)[2.3.3.1] |
ORF00829 | 1657和1658 | 琥珀酸脱氢酶细胞色素b-556亚基(AF007569) |
ORF00830 | 1659和1660 | 琥珀酸脱氢酶疏水性膜锚定蛋白(sdhD)[1.3.99.1] |
ORF00831 | 1661和1662 | 琥珀酸脱氢酶,黄素蛋白亚基(sdhA) |
ORF00832 | 1663和1664 | 琥珀酸脱氢酶,铁硫蛋白[1.3.99.1] |
ORF00833 | 1665和1666 | 2-酮戊二酸脱氢酶,E1组件(sucA)[1.2.4.2] |
ORF00834 | 1667和1668 | 2-酮戊二酸脱氢酶,E2组件,二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶(sucR)[2.3.1.61] |
ORF00835 | 1669和1670 | 2-酮戊二酸脱氢酶复合物的二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶组件[2.3.1.61] |
ORF00836 | 1671和1672 | 琥珀酰-CoA合成酶,β链(SCS-β)(sucC)[6.2.1.5] |
ORF00837 | 1673和1674 | 琥珀酰-CoA合成酶,α亚基(sucD)[6.2.1.5] |
ORF00838 | 1675和1676 | 未表征的蛋白,可能位于表面 |
ORF00839 | 1677和1678 | 假拟蛋白 |
ORF00840 | 1679和1680 | 细胞色素d泛醇氧化酶链I[相似性][1.10.3.-] |
ORF00841 | 1681和1682 | 细胞色素d泛醇氧化酶,亚基II(cydB)[1.10.3.-] |
ORF00842 | 1683和1684 | cyd操纵子蛋白YbgT相关蛋白 |
ORF00843 | 1685和1686 | cyd操纵子蛋白YbgE |
ORF00844 | 1687和1688 | 预测的硫酯酶 |
ORF00845 | 1689和1690 | TolQ蛋白 |
ORF00846 | 1691和1692 | TolR蛋白(tolR) |
ORF00847 | 1693和1694 | TolA蛋白 |
ORF00848 | 1695和1696 | TolA蛋白 |
ORF00849 | 1697和1698 | TolB(tolB) |
ORF00850 | 1699和1700 | 肽聚糖-相关性脂蛋白前体 |
ORF00851 | 1701和1702 | YboF蛋白 |
ORF00852 | 1703和1704 | 喹啉酸合成酶复合物,A亚基(nadA) |
ORF00853 | 1705和1706 | 蛋白pnuC |
ORF00854 | 1707和1708 | 阳离子外流家族蛋白(外流) |
ORF00855 | 1709和1710 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00856 | 1711和1712 | 磷酸-脱氢-脱氧庚酸醛缩酶[2.5.1.54] |
ORF00857 | 1713和1714 | 假拟蛋白 |
ORF00858 | 1715和1716 | 磷酸甘油酸变位酶1 |
ORF00859 | 1717和1718 | 醛糖1-差向异构酶 |
ORF00860 | 1719和1720 | 半乳糖激酶(qalK)[2.7.1.61 |
ORF00861 | 1721和1722 | 半乳糖-1-磷酸尿苷酰转移酶(gaiT)[2.7.7.10] |
ORF00862 | 1723和1724 | UDP-葡萄糖4-差向异构酶(galE) [5.1.3.2] |
ORF00863 | 1725和1726 | 钼酸转运系统的ATP结合组件(atp结合) |
ORF00864 | 1727和1728 | 假拟蛋白 |
ORF00865 | 1729和1730 | 转录调节五modE(modE) |
ORF00866 | 1731和1732 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00867 | 1733和1734 | 钼酸ABC转运蛋白,周质钼酸-结合蛋白(modA) |
ORF00868 | 1735和1736 | 钼酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白(modB) |
ORF00869 | 1737和1738 | 钼酸ABC转运蛋白,ATP结合蛋白(modC)[3.6.3.29] |
ORF00870 | 1739和1740 | 推定的磷酸酶 |
ORF00871 | 1741和1742 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00872 | 1743和1744 | vbhD蛋白 |
ORF00873 | 1745和1746 | FIdA蛋白 |
ORF00874 | 1747和1748 | 2-酮戊二酸-苹果酸转运蛋白同源物yflS(SODiT1) |
ORF00875 | 1749和1750 | 推定的顺乌头酸水合酶 |
ORF00876 | 1751和1752 | 可能的果胶酯酶前体 |
ORF00877 | 1753和1754 | 保守性假拟蛋白TIGR00481 |
ORF00878 | 1755和1756 | 腺苷甲硫氨酸-8-氨基-7-氧代壬酸氨基转移酶(bioA)[2.6.1.62] |
ORF00879 | 1757和1758 | 生物素合酶(bioB/[2.8.1.61 |
ORF00880 | 1759和1760 | 8-氨基-7-氧代壬酸合酶(bioF)[2.3.1.47] |
ORF00881 | 1761和1762 | 生物素生物合成蛋白BioC(bioC) |
ORF00882 | 1763和1764 | 脱硫生物素合成酶(DTBS) |
ORF00883 | 1765和1766 | 噬菌体小尾蛋白 |
ORF00884 | 1767和1768 | 噬菌体小尾蛋白L |
ORF00885 | 1769和1770 | 推定的原噬菌体尾丝组件K |
ORF00886 | 1771和1772 | 小尾蛋白前体H |
ORF00887 | 1773和1774 | 噬菌体小尾蛋白 |
ORF00888 | 1775和1776 | 噬菌体小尾蛋白L |
ORF00889 | 1777和1778 | 推定的噬菌体尾组件 |
ORF00890 | 1779和1780 | 噬菌体小尾蛋白L |
ORF00891 | 1781和1782 | 推定的噬菌体尾组件 |
ORF00892 | 1783和1784 | 噬菌体小尾蛋白L |
ORF00893 | 1785和1786 | 推定的原噬菌体尾丝组件K |
ORF00894 | 1787和1788 | 推定的原噬菌体尾丝组件K |
ORF00895 | 1789和1790 | λ噬菌体尾装配蛋白I |
ORF00896 | 1791和1792 | 宿主特异性蛋白(部分) |
ORF00897 | 1793和1794 | 尾装配蛋白 |
ORF00898 | 1795和1796 | 噬菌体λ尾装配蛋白I |
ORF00899 | 1797和1798 | 宿主特异性蛋白(部分) |
ORF00900 | 1799和1800 | 推定的噬菌体尾组件(部分) |
ORF00901 | 1801和1802 | 假拟蛋白 |
ORF00902 | 1803和1804 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00903 | 1805和1806 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00904 | 1807和1808 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00905 | 1809和1810 | SitD蛋白(AF128999) |
ORF00906 | 1811和1812 | SitC蛋白(AF128999) |
ORF00907 | 1813和1814 | SitB蛋白(AF128999) |
ORF00908 | 1815和1816 | 周质结合蛋白(螯合) |
ORF00909 | 1817和1818 | 推定的转座酶 |
ORF00910 | 1819和1820 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00911 | 1821和1822 | 异柠檬酸脱氢酶[1.1.1.42] |
ORF00912 | 1823和1824 | ydfO蛋白 |
ORF00913 | 1825和1826 | 假拟的转录调节蛋白ycgE |
ORF00914 | 1827和1828 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00915 | 1829和1830 | 采用FAD家族的蓝光传感蛋白 |
ORF00916 | 1831和1832 | 可能的膜蛋白b1168(o528) |
ORF00917 | 1833和1834 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00918 | 1835和1836 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00919 | 1837和1838 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00920 | 1839和1840 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00921 | 1841和1842 | 推定的转运系统ATP结合组件 |
ORF00922 | 1843和1844 | 细胞分裂拓扑特异性因子MinE(minE) |
ORF00923 | 1845和1846 | 细胞分裂抑制物MinD |
ORF00924 | 1847和1848 | 尾装配蛋白 |
ORF00925 | 1849和1850 | 宿主特异性蛋白J(部分) |
ORF00926 | 1851和1852 | 宿主特异性蛋白(部分) |
ORF00927 | 1853和1854 | 外切核酸酶ABC,B亚基(uvrB) |
ORF00928 | 1855和1856 | 未表征的保守的膜结合蛋白 |
ORF00929 | 1857和1858 | 钼辅因子生物合成蛋白A |
ORF00930 | 1859和1860 | 钼辅因子生物合成蛋白B |
ORF00931 | 1861和1862 | 钼辅因子生物合成蛋白C(moaC) |
ORF00932 | 1863和1864 | 钼蝶呤转化因子亚基1(MPT) |
ORF00933 | 1865和1866 | 钼蝶呤转化因子亚基2 |
ORF00934 | 1867和1868 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00935 | 1869和1870 | 膜蛋白(SAD) |
ORF00936 | 1871和1872 | 假拟蛋白 |
ORF00937 | 1873和1874 | 推定的未表征的蛋白家族UPF0005 |
ORF00938 | 1875和1876 | 推定的膜蛋白 |
ORF00939 | 1877和1878 | 磷脂酶家族蛋白[2.7.8.-] |
ORF00940 | 1879和1880 | 内切核酸酶-外切核酸酶-磷酸酶家族蛋白 |
ORF00941 | 1881和1882 | ABC转运蛋白,通透酶蛋白,推定 |
ORF00942 | 1883和1884 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00943 | 1885和1886 | ElsD(膜) |
ORF00944 | 1887和1888 | ABC转运蛋白,ATP结合性-通透酶蛋白 |
ORF00945 | 1889和1890 | 假拟膜蛋白ybhG |
ORF00946 | 1891和1892 | 可能的转录调节蛋白ybiH |
ORF00947 | 1893和1894 | 超家族II DNA和RNA解旋酶 |
ORF00948 | 1895和1896 | GTP环化水解酶II(F160) |
ORF00949 | 1897和1898 | 可能的ATP依赖性解旋酶 |
ORF00950 | 1899和1900 | 糖基转移酶家族蛋白(o320)[2.4.2.18] |
ORF00951 | 1901和1902 | YbiC(o361)[1.1.1.-] |
ORF00952 | 1903和1904 | 功能未知的蛋白质(DUF1471)超家族 |
ORF00953 | 1905和1906 | TmR |
ORF00954 | 1907和1908 | 铁调性外膜蛋白 |
ORF00955 | 1909和1910 | 用于铁转运的TonB-依赖性受体XF0599(III) |
ORF00956 | 1911和1912 | 假拟蛋白 |
ORF00957 | 1913和1914 | 功能未知的蛋白质(DUF1471)家族 |
ORF00958 | 1915和1916 | 功能未知的蛋白质(DUF890)超家族 |
ORF00959 | 1917和1918 | 推定转运蛋白 |
ORF00960 | 1919和1920 | 谷氨酰胺高亲和转运系统的ATP-结合细件(atp结合) |
ORF00961 | 1921和1922 | 氨基酸ABC转运蛋白,氨基酸-结合-通透酶蛋白 |
ORF00962 | 1923和1924 | 氨基酸ABC转运蛋白,氨基酸-结合-通透酶蛋白(GlnH) |
ORF00963 | 1925和1926 | 全局调节物,饥饿条件 |
ORF00964 | 1927和1928 | 转运蛋白,EamA家族 |
ORF00965 | 1929和1930 | 外膜蛋白X |
ORF00966 | 1931和1932 | Dca |
ORF00967 | 1933和1934 | 转录调节物mntR(锰转运调节蛋白) |
ORF00968 | 1935和1936 | 转运蛋白,NadC-P-Pho87家族,推定 |
ORF00969 | 1937和1938 | 蛋白ybiS前体 |
ORF00970 | 1939和1940 | ABC转运蛋白ATP-结合蛋白 |
ORF00971 | 1941和1942 | 水解酶,卤代酸脱卤酶样家族 |
ORF00972 | 1943和1944 | 丙酮酸甲酸-裂合酶[2.3.1.54] |
ORF00973 | 1945和1946 | 铁依赖性丙酮酸盐甲酸-裂合酶-活化酶(pflC)[1.97.1.4] |
ORF00974 | 1947和1948 | 推定的转醛酶 |
ORF00975 | 1949和1950 | 钼蝶呤合酶磺酰基酶MoeB(moeB) |
ORF00976 | 1951和1952 | 钼蝶呤生物合成蛋白moeA (moeA) |
ORF00977 | 1953和1954 | 天冬酰胺酶[3.5.1.1] |
ORF00978 | 1955和1956 | bcr 5′区中假拟的ABC转运蛋白ATP结合蛋白。(D90720) |
ORF00979 | 1957和1958 | 血红素-结合蛋白前体(高铁血红素-结合脂蛋白)。 |
ORF00980 | 1959和1960 | ABC转运蛋白通透酶蛋白(通透酶) |
ORF00981 | 1961和1962 | 肽ABC转运蛋白,通透酶蛋白 |
ORF00982 | 1963和1964 | EAL结构域蛋白 |
ORF00983 | 1965和1966 | 假拟膜蛋白yliF |
ORF00984 | 1967和1968 | MiaB样tRNA修饰酶YliG,TIGR01125 |
ORF00985 | 1969和1970 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00986 | 1971和1972 | lppZ |
ORF00987 | 1973和1974 | 谷胱甘肽S-转移酶 |
ORF00988 | 1975和1976 | 青霉素-结合蛋白6前体(PBP)[3.4.16.4] |
ORF00989 | 1977和1978 | 脱氧核糖操纵子阻抑物(AE006172) |
ORF00990 | 1979和1980 | 未命名蛋白产物 |
ORF00991 | 1981和1982 | 假拟蛋白 |
ORF00992 | 1983和1984 | 多药转位酶mdfA |
ORF00993 | 1985和1986 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00994 | 1987和1988 | 水解酶,卤代酸脱卤酶样家族 |
ORF00995 | 1989和1990 | 主要易化超家族亚家族 |
ORF00996 | 1991和1992 | 推定的转录调节物,TetR家族 |
ORF00997 | 1993和1994 | TrkA,钾通道-家族蛋白 |
ORF00998 | 1995和1996 | 保守性假拟蛋白 |
ORF00999 | 1997和1998 | 谷氨酸氧化还原酶(谷氧还蛋白),GrxA家族(grxA) |
ORF01000 | 1999和2000 | 功能未知的蛋白质(DUF1418)超家族 |
ORF01001 | 2001和2002 | 对氧气不敏感的NADPH硝基还原酶[1.-.-.-] |
ORF01002 | 2003和2004 | 核糖体蛋白$6 modifi阳离子蛋白 |
ORF01003 | 2005和2006 | 推定传感转导调节物 |
ORF01004 | 2007和2008 | 腐胺结合性周质蛋白前体 |
ORF01005 | 2009和2010 | 腐胺转运ATP-结合蛋白potG(atp结合) |
ORF01006 | 2011和2012 | 腐胺ABC转运蛋白,通透酶蛋白(膜) |
ORF01007 | 2013和2014 | 腐胺转运系统通透酶蛋白potl |
ORF01008 | 2015和2016 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01009 | 2017和2018 | 23S rRNA(尿嘧啶-5-)-甲基转移酶RumB (rumB)[2.1.1.-] |
ORF01010 | 2019和2020 | 精氨酸-结合性周质蛋白2前体 |
ORF01011 | 2021和2022 | 精氨酸转运系统通透酶蛋白artM (膜) |
ORF01012 | 2023和2024 | 精氨酸转运系统通透酶蛋白artQ(artQ) |
ORF01013 | 2025和2026 | 精氨酸-结合性周质蛋白1前体 |
ORF01014 | 2027和2028 | 精氨酸转运ATP-结合蛋白artP |
ORF01015 | 2029和2030 | 推定的脂蛋白ybjP前体 |
ORF01016 | 2031和2032 | 保守性蛋白 |
ORF01017 | 2033和2034 | N-乙酰基胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶结构域蛋白[3.5.1.28] |
ORF01018 | 2035和2036 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01019 | 2037和2038 | COG0702:预测的核苷-二磷酸-糖差向异构酶,推定 |
ORF01020 | 2039和2040 | 低特异性L-苏氨酸醛缩酶[4.1.2.5] |
ORF01021 | 2041和2042 | 丙酮酸盐脱氢酶[1.2.2.2] |
ORF01022 | 2043和2044 | 铁硫簇结合蛋白 |
ORF01023 | 2045和2046 | 杂交簇蛋白 |
ORF01024 | 2047和2048 | 推定的表面蛋白 |
ORF01025 | 2049和2050 | 水通道蛋白Z |
ORF01026 | 2051和2052 | 与RecF蛋白同源 |
ORF01027 | 2053和2054 | SomA(VirG) |
ORF01028 | 2055和2056 | 大环内酯特异性外流蛋白macA前体 |
ORF01029 | 2057和2058 | 大环内酯特异性ABC型外流载体(外流) |
ORF01030 | 2059和2060 | 冷激样蛋白cspD |
ORF01031 | 2061和2062 | 位点特异性重组酶,噬菌体整合酶家族,截短 |
ORF01032 | 2063和2064 | 可能的DNA结合蛋白相关蛋白 |
ORF01033 | 2065和2066 | 假拟蛋白 |
ORF01034 | 2067和2068 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01035 | 2069和2070 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01036 | 2071和2072 | 假拟噬菌体蛋白 |
ORF01037 | 2073和2074 | 噬菌体P4 DNA引发酶 |
ORF01038 | 2075和2076 | 原噬菌体编码的未知蛋白 |
ORF01039 | 2077和2078 | 单链结合蛋白(SSB) (螺旋去稳定蛋白) (ssb) |
ORF01040 | 2079和2080 | 假拟蛋白 |
ORF01041 | 2081和2082 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01042 | 2083和2084 | Gifsy-1原噬菌体蛋白 |
ORF01043 | 2085和2086 | 头装饰蛋白(头蛋白GPSHP) |
ORF01044 | 2087和2088 | 假拟蛋白 |
ORF01045 | 2089和2090 | 头尾预连接蛋白GP5 |
ORF01046 | 2091和2092 | gpl |
ORF01047 | 2093和2094 | 原噬菌体编码的未知蛋白 |
ORF01048 | 2095和2096 | 原噬菌体编码的未知蛋白 |
ORF01049 | 2097和2098 | ATP依赖性Clp蛋白酶衔接子蛋白clpS |
ORF01050 | 2099和2100 | 丝氨酸蛋白酶的ATP结合组件 |
ORF01051 | 2101和2102 | ATP依赖性clp蛋白酶ATP结合亚基clpA |
ORF01052 | 2103和2104 | CRISPR相关蛋白Cas1(cas1) |
ORF01053 | 2105和2106 | 未命名蛋白产物;与未知蛋白相似 |
ORF01054 | 2107和2108 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01055 | 2109和2110 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01056 | 2111和2112 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01057 | 2113和2114 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01058 | 2115和2116 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01059 | 2117和2118 | 翻译启动因子IF-1(infA) |
ORF01060 | 2119和2120 | 亮氨酰-苯基丙氨酰-tRNA-蛋白转移酶(aat)[2.3.2.-] |
ORF01061 | 2121和2122 | 转运ATP-结合蛋白cydC |
ORF01062 | 2123和2124 | 转运ATP-结合蛋白cydD |
ORF01063 | 2125和2126 | 抗限制性蛋白家族 |
ORF01064 | 2127和2128 | YeeS蛋白(o160) |
ORF01065 | 2129和2130 | 转运ATP-结合蛋白cydD |
ORF01066 | 2131和2132 | 硫氧还蛋白-二硫还原酶(trxB)[1.8.1.9] |
ORF01067 | 2133和2134 | 亮氨酸-反应性调节蛋白 |
ORF01068 | 2135和2136 | 细胞分裂蛋白ftsK |
ORF01069 | 2137和2138 | 外膜脂蛋白载体蛋白LolA(lolA) |
ORF01070 | 2139和2140 | 未命名蛋白产物 |
ORF01071 | 2141和2142 | 丝氨酰-tRNA合成酶(serS)[6.1.1.11] |
ORF01072 | 2143和2144 | 厌氧性二甲亚砜还原酶A链前体(dmsA)[1.8.99.-] |
ORF01073 | 2145和2146 | 厌氧性二甲亚砜还原酶B链(dmsB)[1.-.-.-] |
ORF01074 | 2147和2148 | DMSO还原酶锚定亚基(DmsC)(dmsC)[1.8.99.-] |
ORF01075 | 2149和2150 | 蛋白ycaC |
ORF01076 | 2151和2152 | 假拟MFS-性转运蛋白ycaD |
ORF01077 | 2153和2154 | 丙酮酸甲酸裂合酶活化酶1[1.97.1.4] |
ORF01078 | 2155和2156 | 噬菌体整合酶 |
ORF01079 | 2157和2158 | 噬菌体调节蛋白 |
ORF01080 | 2159和2160 | gpB |
ORF01081 | 2161和2162 | gp80-相关蛋白 |
ORF01082 | 2163和2164 | InsAB′蛋白 |
ORF01083 | 2165和2166 | InsA蛋白 |
ORF01084 | 2167和2168 | gp81 |
ORF01085 | 2169和2170 | TraR蛋白 |
ORF01086 | 2171和2172 | gp83 |
ORF01087 | 2173和2174 | 复制基因A蛋白(GPA) |
ORF01088 | 2175和2176 | gp91 |
ORF01089 | 2177和2178 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01090 | 2179和2180 | 假拟蛋白 |
ORF01091 | 2181和2182 | 假拟蛋白 |
ORF01092 | 2183和2184 | 噬菌体门蛋白,PBSX家族 |
ORF01093 | 2185和2186 | 推定的末端酶ATP酶亚基(gpP样) |
ORF01094 | 2187和2188 | 噬菌体衣壳支架蛋白(GPO) |
ORF01095 | 2189和2190 | 衣壳支架蛋白 |
ORF01096 | 2191和2192 | 噬菌体主要衣壳蛋白,P2家族 |
ORF01097 | 2193和2194 | 噬菌体小末端酶亚基 |
ORF01098 | 2195和2196 | 噬菌体头完成蛋白(GPL) |
ORF01099 | 2197和2198 | 尾蛋白X(GPX)相关蛋白 |
ORF01100 | 2199和2200 | 噬菌体穴蛋白家族2 |
ORF01101 | 2201和2202 | 溶酶体(裂解蛋白)(胞壁酸酶)(内溶素)(蛋白gpK)[3.2.1.17] |
ORF01102 | 2203和2204 | 假拟蛋白 |
ORF01103 | 2205和2206 | 蛋白lvsA |
ORF01104 | 2207和2208 | 蛋白lysB(AB008550) |
ORF01105 | 2209和2210 | LysC |
ORF01106 | 2211和2212 | 尾完成蛋白R(GPR) |
ORF01107 | 2213和2214 | 噬菌体病毒粒体形态发生蛋白 |
ORF01108 | 2215和2216 | gpV(gpV) |
ORF01109 | 2217和2218 | 基板装配蛋白W(GPW)IqpW) |
ORF01110 | 2219和2220 | 基板J样蛋白 |
0RF01111 | 2221和2222 | gpI(gpI) |
ORF01112 | 2223和2224 | gpH |
ORF01113 | 2225和2226 | gpG(gpG) |
ORF01114 | 2227和2228 | 假拟蛋白 |
ORF01115 | 2229和2230 | 噬菌体尾鞘蛋白 |
ORF01116 | 2231和2232 | 噬菌体主要尾管蛋白 |
ORF01117 | 2233和2234 | 噬菌体尾蛋白E |
ORF01118 | 2235和2236 | 噬菌体尾卷尺蛋白,TP901家族,推定 |
ORF01119 | 2237和2238 | gpU(gpU) |
ORF01120 | 2239和2240 | 基因D蛋白(GPD) |
ORF01121 | 2241和2242 | Ogr |
ORF01122 | 2243和2244 | 甲酸乙酰基转移酶(pflB)[2.3.1.54] |
ORF01123 | 2245和2246 | 可能的甲酸转运蛋白1 |
0RF01124 | 2247和2248 | 未命名蛋白产物 |
ORF01125 | 2249和2250 | 功能未知的蛋白质(DUF421)家族 |
ORF01126 | 2251和2252 | 磷酸丝氨酸氨基转移酶(serC)[2.6.1.52] |
ORF01127 | 2253和2254 | 3-磷酸莽草酸1-羧基乙烯基转移酶(aroA)[2.5.1.19] |
ORF01128 | 2255和2256 | cmk蛋白前体[3.4.24.-] |
ORF01129 | 2257和2258 | 胞苷酸激酶(cmk)[2.7.4.14] |
ORF01130 | 2259和2260 | 核糖体蛋白S1/rpsA |
ORF01131 | 2261和2262 | 相互作用宿主因子,β亚基(ihfB) |
ORF01132 | 2263和2264 | DNA内化相关感受态蛋白ComEC-Rec2 |
ORF01133 | 2265和2266 | 脂质A输出ATP结合性通透酶蛋白MsbA(msbA) |
ORF01134 | 2267和2268 | 四酰基二糖4′-激酶(lpxK)[2.7.1.130] |
ORF01135 | 2269和2270 | 功能未知的蛋白质(DUF1006)超家族 |
ORF01136 | 2271和2272 | 四酰基二糖-1-P 4′-激酶 |
ORF01137 | 2273和2274 | 3-脱氧-D-甘露糖-辛酮糖酸胞苷酰转移酶(kdsB)[2.7.7.38] |
ORF01138 | 2275和2276 | 未表征的ACR,COG1434家族 |
ORF01139 | 2277和2278 | mukF蛋白(杀伤因子KicB) |
ORF01140 | 2279和2280 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01141 | 2281和2282 | 蛋白smtA |
ORF01142 | 2283和2284 | 染色体分隔蛋白mukF(kicB) |
ORF01143 | 2285和2286 | 染色体分隔蛋白mukE |
ORF01144 | 2287和2288 | 细胞分裂蛋白mukB(mukB) |
ORF01145 | 2289和2290 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01146 | 2291和2292 | 功能未知的细菌蛋白(DUF882)超家族 |
ORF01147 | 2293和2294 | 金属-β-内酰胺酶超家族蛋白[3.-.-.-] |
ORF01148 | 2295和2296 | 天冬氨酸氨基转移酶(aspC)[2.6.1.1] |
ORF01149 | 2297和2298 | 外膜蛋白F前体(GBP) |
ORF01150 | 2299和2300 | 天冬酰胺酰-tRNA合成酶(asnS)[6.1.1.221 |
ORF01151 | 2301和2302 | 烟酸磷酸核糖基转移酶(pncB)[2.4.2.11] |
ORF01152 | 2303和2304 | 氨基肽酶N(peoN)[3.4.11.2] |
ORF01153 | 2305和2306 | 磺酸ABC转运蛋白,ATP结合亚基SsuB(AF075709) |
ORF01154 | 2307和2308 | 磺酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白SsuC |
ORF01155 | 2309和2310 | 烷基磺酸加单氧酶[1.14.14.5] |
ORF01156 | 2311和2312 | 假拟蛋白 |
ORF01157 | 2313和2314 | ABC转运蛋白,脂族磺酸结合蛋白 |
ORF01158 | 2315和2316 | FMN还原酶[1.5.1.29] |
ORF01159 | 2317和2318 | 二氢乳清酸氧化酶(pyrD)[1.3.3.1] |
ORF01160 | 2319和2320 | 功能未知的蛋白质(DUF1379)超家族 |
ORF01161 | 2321和2322 | 黄素氧还蛋白还原酶(铁氧还蛋白-NADPH还原酶)家族1 |
ORF01162 | 2323和2324 | 预测的N6-腺嘌呤特异性DNA甲基化酶 |
ORF01163 | 2325和2326 | ABC转运蛋白ATP结合蛋白uup |
ORF01164 | 2327和2328 | 假拟蛋白 |
ORF01165 | 2329和2330 | 对草快-诱导性蛋白A |
ORF01166 | 2331和2332 | 对草快-诱导性蛋白B |
ORF01167 | 2333和2334 | 功能未知的蛋白质(DUF330)超家族 |
ORF01168 | 2335和2336 | 核糖体调节因子(蛋白E)相关蛋白 |
ORF01169 | 2337和2338 | β-羟基酰基-(酰基-载体-蛋白)脱水酶FabA(fabA)[4.2.1.-] |
ORF01170 | 2339和2340 | 未命名蛋白产物 |
ORF01171 | 2341和2342 | 外膜蛋白A前体 |
ORF01172 | 2343和2344 | 细胞分裂抑制剂 |
ORF01173 | 2345和2346 | 假拟膜蛋白TIGR01666(yccS) |
ORF01174 | 2347和2348 | 感受态特异性基因的调节蛋白 |
ORF01175 | 2349和2350 | 功能未知的结构域 |
ORF01176 | 2351和2352 | DNA解旋酶IV[3.6.1.-] |
ORF01177 | 2353和2354 | 甲基乙二醛合酶(mgsA)[4.2.3.3] |
ORF01178 | 2355和2356 | 假拟UPF0319蛋白yccT前体 |
ORF01179 | 2357和2358 | 蛋白yccU |
ORF01180 | 2359和2360 | 半甲基化的DNA结合结构域,推定 |
ORF01181 | 2361和2362 | 预测的SAM依赖性甲基转移酶 |
ORF01182 | 2363和2364 | 酰基磷酸酶 |
ORF01183 | 2365和2366 | 可能的亚硫酸还原酶γ链[1.8.-.-] |
ORF01184 | 2367和2368 | 完整的膜蛋白 |
ORF01185 | 2369和2370 | 氢化酶-1短链前体 |
0RF01186 | 2371和2372 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01187 | 2373和2374 | 原噬菌体内编码的未知蛋白 |
ORF01188 | 2375和2376 | 未表征的BCR,COG1636家族 |
ORF01189 | 2377和2378 | 推定的原噬菌体细胞杀伤蛋白(gef) |
ORF01190 | 2379和2380 | 功能未知的蛋白质(DUF1277)超家族 |
ORF01191 | 2381和2382 | 内切脱氧核糖核酸酶RUS(Holliday连接解离酶) [3.1.22.-] |
ORF01192 | 2383和2384 | 隐蔽原噬菌体的抗终止蛋白Q同源物 |
ORF01193 | 2385和2386 | 假拟蛋白 |
ORF01194 | 2387和2388 | 未命名蛋白产物;ORF137,长度 |
ORF01195 | 2389和2390 | 裂解蛋白S.b1556 |
ORF01196 | 2391和2392 | 假拟噬菌体蛋白 |
ORF01197 | 2393和2394 | 溶酶体(裂解蛋白)(胞壁酸酶) |
IRF01198 | 2395和2396 | 脂蛋白Rz1前体-相关蛋白 |
ORF01199 | 2397和2398 | 噬菌体裂解蛋白 |
ORF01200 | 2399和2400 | Sb56 |
ORF01201 | 2401和2402 | 噬菌体末端酶,小亚基,推定,P27家族,推定 |
ORF01202 | 2403和2404 | 噬菌体末端酶,大亚基,推定 |
ORF01203 | 2405和2406 | 假拟蛋白 |
ORF01204 | 2407和2408 | 噬菌体门蛋白,HK97家族 |
ORF01205 | 2409和2410 | Caudo病毒(caudovirus)前头蛋白酶 |
ORF01206 | 2411和2412 | 噬菌体主要衣壳蛋白,HK97家族 |
ORF01207 | 2413和2414 | 来表征的噬菌体蛋白(可能的DNA包装) |
ORF01208 | 2415和2416 | 噬菌体头-尾衔接子,推定 |
ORF01209 | 2417和2418 | 噬菌体蛋白,HK97gp10家族 |
ORF01210 | 2419和2420 | Cp11 |
ORF0121t | 2421和2422 | 主要尾亚基 |
ORF01212 | 2423和2424 | 噬菌体尾装配侣伴蛋白 |
ORF01213 | 2425和2426 | Gp14 |
ORF01214 | 2427和2428 | 尾长卷尺蛋白 |
ORF01215 | 2429和2430 | 噬菌体小尾蛋白L |
ORF01216 | 2431和2432 | 推定的原噬菌体尾丝组件K |
ORF01217 | 2433-和2434 | λ噬菌体尾装配蛋白I |
ORF01218 | 2435和2436 | 宿主特异性蛋白J(部分) |
ORF01219 | 2437和2438 | 宿主特异性蛋白J(部分) |
ORF01220 | 2439和2440 | 宿主特异性蛋白(部分) |
ORF01221 | 2441和2442 | Lom |
ORF01222 | 2443和2444 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01223 | 2445和2446 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01224 | 2447和2448 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01225 | 2449和2450 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01226 | 2451和2452 | CdtA |
ORF01227 | 2453和2454 | CdtB |
ORF01228 | 2455和2456 | CdtC |
ORF01229 | 2457和2458 | 周质溶质结合蛋白家族 |
ORF01230 | 2459和2460 | 膜蛋白 |
ORF01231 | 2461和2462 | 假拟UPF0190蛋白yedY(AE005419) |
ORF01232 | 2463和2464 | 运甲状腺素蛋白家族蛋白 |
ORF01233 | 2465和2466 | 转录激活蛋白CopR, |
ORF01234 | 2467和2468 | 组氨酸激酶[2.7.3.-] |
ORF01235 | 2469和2470 | H-NS-阻抑蛋白,30K(Hsp31) |
ORF01236 | 2471和2472 | 外膜蛋白N前体(OmpF) |
ORF01237 | 2473和2474 | HD结构域蛋白 |
ORF01238 | 2475和2476 | DNA-胞嘧啶甲基转移酶(M,EcoDcm)[2.1.1.37] |
ORF01239 | 2477和2478 | 完整的膜蛋白 |
ORF01240 | 2479和2480 | 斑块(patch)修复蛋白[3.1.-.-] |
ORF01241 | 2481和2482 | 功能未知的蛋白 |
ORF01242 | 2483和2484 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01243 | 2485和2486 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01244 | 2487和2488 | 二鸟苷酸环化酶(GGDEF)结构域蛋白 |
ORF01245 | 2489和2490 | 甘露糖基-3-磷酸甘油酸磷酸酶相关蛋白[3.1.3.-] |
ORF01246 | 2491和2492 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01247 | 2493和2494 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01248 | 2495和2496 | 肠菌酸荚膜生物合成活化蛋白A |
ORF01249 | 2497和2498 | 鞭毛生物合成蛋白FliR(fliR) |
ORF01250 | 2499和2500 | 鞭毛生物合成蛋白FliQ(fliQ) |
ORF01251 | 2501和2502 | 鞭毛生物合成蛋白FliP(fliP) |
ORF01252 | 2503和2504 | 末端酶大亚基 |
ORF01253 | 2505和2506 | 噬菌体末端酶家族蛋白,推定 |
ORF01254 | 2507和2508 | 假拟蛋白 |
ORF01255 | 2509和2510 | Gp45 |
ORF01256 | 2511和2512 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01257 | 2513和2514 | Cl蛋白 |
ORF01258 | 2515和2516 | 转录调节物,Cro-Cl家族相关蛋白 |
ORF01259 | 2517和2518 | 阻抑物(cll) |
ORF01260 | 2519和2520 | O(DNA复制;299) |
ORF01261 | 2521和2522 | P蛋白 |
ORF01262 | 2523和2524 | 氢化酶 |
ORF01263 | 2525和2526 | 氢化酶-1长链(NiFe氢化酶)(膜-结合性氢化酶1大亚基)(HYD1)(hyaB)[1.12.99.6] |
ORF01264 | 2527和2528 | Ni-Fe-氢化酶,b-型细胞色素亚基(CybH) |
ORF01265 | 2529和2530 | 氢化酶-1成熟蛋白酶[3.4.24.-] |
ORF01266 | 2531和2532 | 氢化酶-1操纵子蛋白hyaE |
ORF01267 | 2533和2534 | 氢化酶-1操纵子蛋白hyaF |
ORF01268 | 2535和2536 | 细胞色素d泛醇氧化酶,亚基I |
ORF01269 | 2537和2538 | 细胞色素d泛醇氧化酶,亚基II(cydB)[1.10.3.-] |
ORF01270 | 2539和2540 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01271 | 2541和2542 | 冷激样蛋白 |
ORF01272 | 2543和2544 | 周质appA蛋白前体(agp)[3.1.3.2] |
ORF01273 | 2545和2546 | 假拟蛋白 |
ORF01274 | 2547和2548 | 冷激样蛋白 |
ORF01275 | 2549和2550 | GnsB蛋白 |
ORF01276 | 2551和2552 | 推定的电子传递蛋白vccM |
ORF01277 | 2553和2554 | 2.7.3.-[2.7.3.-] |
ORF01278 | 2555和2556 | TorCAD操纵子转录调节蛋白torR |
ORF01279 | 2557和2558 | 周质蛋白torT前体 |
ORF01280 | 2559和2560 | 三甲基胺-N-氧化物还原酶c-型细胞色素TorC(torC) |
ORF01281 | 2561和2562 | 三甲基胺-N-氧化物还原酶TorA(torA)[1.7.2.3] |
ORF01282 | 2563和2564 | 侣伴蛋白torD |
ORF01283 | 2565和2566 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01284 | 2567和2568 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01285 | 2569和2570 | dnaJ蛋白 |
ORF01286 | 2571和2572 | 周质葡萄糖-1-磷酸酶 |
ORF01287 | 2573和2574 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01288 | 2575和2576 | trp阻抑物-结合蛋白 |
ORF01289 | 2577和2578 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01290 | 2579和2580 | 尿嘧啶-黄嘌呤通透酶 |
ORF01291 | 2581和2582 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01292 | 2583和2584 | 尿嘧啶-黄嘌呤通透酶 |
ORF01293 | 2585和2586 | 4-羟基苯基乙酸3-加单氧酶(EC 1.14.13.3)短链[1.14.13.3] |
ORF01294 | 2587和2588 | 推定硝基还原酶(AE005300)[1.-.-.-] |
ORF01295 | 2589和2590 | 推定的3-氧代己二酸烯醇-内酯水解酶-4-羧基粘康酸内酯脱羧酶 |
ORF01296 | 2591和2592 | 假拟蛋白 |
ORF01297 | 2593和2594 | 推定的内切核糖核酸酶L-PSP |
ORF01298 | 2595和2596 | 假拟异分支酸酶家族蛋白ycdL |
ORF01299 | 2597和2598 | 推定的细菌荧光素酶家族蛋白 |
ORF01300 | 2599和2600 | 转录调节物,TetR家族 |
ORF01301 | 2601和12602 | 脯氨酸脱氢酶-δ-1-吡咯啉-5-羧酸脱氢酶 |
ORF01302 | 2603和2604 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01303 | 2605和2606 | 钠-脯氨酸同向转运蛋白(putP) |
ORF01304 | 2607和2608 | 推定的膜蛋白 |
ORF01305 | 2609和2610 | 推定的脂蛋白 |
ORF01306 | 2611和2612 | Tat-移位的酶 |
ORF01307 | 2613和2614 | PhoH家族蛋白 |
ORF01308 | 2615和2616 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01309 | 2617和2618 | 高铁血红素存储系统,HmsR蛋白(lgtD) |
ORF01310 | 2619和2620 | HmsF(HmsF) |
ORF01311 | 2621和2622 | 高铁血红素存储系统,HmsH蛋白 |
ORF01312 | 2623和2624 | GGDEF结构域蛋白 |
ORF01313 | 2625和2626 | 整合酶 |
ORF01314 | 2627和2628 | 可能的膜蛋白 |
ORF01315 | 2629和2630 | INSA |
ORF01316 | 2631和2632 | 转座酶 |
ORF01317 | 2633和2634 | 假拟蛋白 |
ORF01318 | 2635和2636 | 原噬菌体CP4-57调节蛋白alpA |
ORF01319 | 2637和2638 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01320 | 2639和2640 | 预测的甲基转移酶 |
ORF01321 | 2641和2642 | 预测的甲基转移酶 |
ORF01322 | 2643和2644 | 肠毒素 |
ORF01323 | 2645和2646 | 推定的II型氨基转移酶 |
ORF01324 | 2647和2648 | KbaY[4.1.2.-] |
ORF01325 | 2649和2650 | 推定的塔格糖6-磷酸激酶蛋白 |
ORF01326 | 2651和2652 | DeoR-家族调节蛋白 |
ORF01327 | 2653和2654 | 糖代谢的转录调节物 |
ORF01328 | 2655和2656 | D-粘酸脱水酶[4.2.1.42] |
ORF01329 | 2657和2658 | D-粘酸脱水酶[4.2.1.7] |
ORF01330 | 2659和2660 | 推定水解酶 |
ORF01331 | 2661和2662 | 粘酸脱氢酶[4.2.1.42] |
ORF01332 | 2663和2664 | 假拟蛋白 |
ORF01333 | 2665和2666 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01334 | 2667和2668 | 推定的F1C和S菌毛交换调节 |
ORF01335 | 2669和2670 | SfaB蛋白 |
ORF01336 | 2671和2672 | 假拟蛋白 |
ORF01337 | 2673和2674 | SfaD蛋白 |
ORF01338 | 2675和2676 | SfaE蛋白 |
ORF01339 | 2677和2678 | F1C菌毛传达物 |
ORF01340 | 2679和2680 | S菌毛粘附素小亚基SfaG |
ORF01341 | 2681和2682 | S菌毛粘附素小亚基SfaS(菌毛蛋白) |
ORF01342 | 2683和2684 | S菌毛粘附素小亚基SfaH |
ORF01343 | 2685和2686 | 推定的EAL结构域 |
ORF01344 | 2687和2688 | PapX蛋白 |
ORF01345 | 2689和2690 | 假拟蛋白 |
ORF01346 | 2691和2692 | IroN蛋白 |
ORF01347 | 2693和2694 | IroE |
ORF01348 | 2695和2696 | IroD蛋白(Fes) |
ORF01349 | 2697和2698 | IroC(ABC) |
ORF01350 | 2699和2700 | 推定的葡糖基转移酶 |
ORF01351 | 2701和2702 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01352 | 2703和2704 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01353 | 2705和2706 | 未命名蛋白产物;ORF94,长度(ISPlu9-p) |
ORF01354 | 2707和2708 | 转座酶,IS4家族 |
ORF01355 | 2709和2710 | tonB依赖性外膜高铁血红素受体,hmuR(Y08983) |
ORF01356 | 2711和2712 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01357 | 2713和2714 | 推定的钴胺素合成蛋白 |
ORF01358 | 2715和2716 | ECs1339 |
ORF0t359 | 2717和2718 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01360 | 2719和2720 | 假拟蛋白 |
tRF01361 | 2721和2722 | 复制蛋白(Rep) |
ORF01362 | 2723和2724 | 假拟蛋白 |
ORF01363 | 2725和2726 | YeeP蛋白 |
ORF01364 | 2727和2728 | 抗原43蛋白直向同源物 |
ORF01365 | 2729和2730 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01366 | 2731和2732 | Z1215蛋白(o273) |
ORF01367 | 2733和2734 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01368 | 2735和2736 | 抗限制性蛋白家族 |
ORF01369 | 2737和2738 | YeeS蛋白(o160) |
ORF01370 | 2739和2740 | 基因间区蛋白相关蛋白 |
ORF01371 | 2741和2742 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01372 | 2743和2744 | 基因间区蛋白 |
ORF01373 | 2745和2746 | YeeV蛋白 |
ORF01374 | 2747和2748 | L0008样蛋白 |
ORF01375 | 2749和2750 | Z1225蛋白(AF071034) |
ORF01376 | 2751和2752 | Z1226蛋白 |
ORF01377 | 2753和2754 | 推定的脱氢酶(AE005314) |
ORF01378 | 2755和2756 | PHP家族蛋白 |
ORF01379 | 2757和2758 | TorD蛋白 |
ORF01380 | 2759和2760 | 功能未知的蛋白质(DUF1097)超家族 |
ORF01381 | 2761和2762 | Curli生产的装配-转运组件CsgG前体 |
ORF01382 | 2763和2764 | Curli生产的装配-转运组件csqF前体 |
ORF01383 | 2765和2766 | Curli生产的装配-转运组件csgE前体 |
ORF01384 | 2767和2768 | 转录调节蛋白,LuxR家族 |
ORF01385 | 2769和2770 | curli纤维主要亚基CsqA,简并 |
ORF01386 | 2771和2772 | curli纤维主要亚基CsaA,简并,推定 |
ORF01387 | 2773和2774 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01388 | 2775和2776 | Appr-1-p加工酶家族蛋白 |
ORF01389 | 2777和2778 | 心磷脂合酶 |
ORF01390 | 2779和2780 | 葡聚糖生物合成蛋白C[2.1.-.-1 |
ORF01391 | 2781和2782 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01392 | 2783和2784 | 周质葡聚糖生物合成蛋白mdoG前体 |
ORF01393 | 2785和2786 | 周质葡聚糖生物合成蛋白mdoH |
ORF01394 | 2787和2788 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01395 | 2789和2790 | 功能未知的蛋白质(DUF1375)超家族 |
ORF01396 | 2791和2792 | 酸性蛋白msvB |
ORF01397 | 2793和2794 | 主要易化家族转运蛋白 |
ORF01398 | 2795和2796 | 脂质A生物合成十二烷酰酰基转移酶 |
ORF01399 | 2797和2798 | 推定的硫氰酸生成酶样结构域蛋白 |
ORF01400 | 2799和2800 | 蛋白ycel前体 |
ORF01401 | 2801和2802 | 细胞色素b561同源物2 |
ORF01402 | 2803和2804 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01403 | 2805和2806 | N-甲基-L-色氨酸氧化酶(MTOX)[1.5.3.-] |
ORF01404 | 2807和2808 | 未命名蛋白产物;ORF ID:o233#8 |
ORF01405 | 2809和2810 | 未命名蛋白产物;ORF ID:o233#9 |
ORF01406 | 2811和28t2 | 二氢乳清酸酶,同源二聚体型(pyrC)[3.5.2.3] |
ORF01407 | 2813和2814 | 功能未知的蛋白质(DUF1439)超家族 |
ORF01408 | 2815和2816 | 谷氨酸氧化还原酶,GrxB家族(grxB) |
ORF01409 | 2817和2818 | 主要易化超家族亚家族 |
ORF01410 | 2819和2820 | 核糖体-蛋白-丙氨酸乙酰基转移酶[2.3.1.128] |
ORF01411 | 2821和2822 | g20.3 |
ORF01412 | 2823和2824 | 推定毒力因子 |
ORF01413 | 2825和2826 | 完整的膜蛋白MviN(mviN) |
ORF01414 | 2827和2828 | 鞭毛合成蛋白figN |
ORF01415 | 2829和2830 | 鞭毛蛋白合成的负调节物(抗-σ-28因子) |
ORF01416 | 2831和2832 | 鞭毛基体P环蛋白FlgA前体 |
ORF01417 | 2833和2834 | 鞭毛基体杆蛋白FlgB(flgB) |
ORF01418 | 2835和2836 | 鞭毛基体杆蛋白FlgC(flgC) |
ORF01419 | 2837和2838 | 鞭毛生物合成,钩形鞘蛋白 |
ORF01420 | 2839和2840 | 鞭毛生物合成,钩形鞘蛋白 |
ORF01421 | 2841和2842 | 鞭毛基体杆蛋白flgF |
ORF01422 | 2843和2844 | 鞭毛基体杆蛋白flgG(远端杆蛋白) |
ORF01423 | 2845和2846 | 鞭毛L-环蛋白FigH(flgH) |
ORF01424 | 2847和2848 | 鞭毛P-环蛋白FlgI(FlgI) |
ORF01425 | 2849和2850 | 肽聚糖水解酶flgJ[3.2.1.-] |
ORF01426 | 2851和2852 | 鞭毛钩形鞘-结合蛋白1(hap1) |
ORF01427 | 2853和2854 | 鞭毛钩形鞘-结合蛋白3(hap3) |
ORF01428 | 2855和2856 | 核糖核酸酶E(RNA酶E)(rne)[3.1.4.-] |
ORF01429 | 2857和2858 | 假拟蛋白 |
ORF01430 | 2859和2860 | 核糖体大亚基假尿苷合酶C(orfx)[4.2.1.70] |
ORF01431 | 2861和2862 | 核糖体大亚基假尿苷合酶C(orfx)[4.2.1.70] |
ORF01432 | 2863和2864 | maf蛋白(maf) |
ORF01433 | 2865和2866 | 未表征的ACR,COG1399 |
ORF01434 | 2867和2868 | 核糖体蛋白L32 (rpmF) |
ORF01435 | 2869和2870 | 3-氧代酰基-[酰基-载体-蛋白]合酶II |
ORF01436 | 2871和2872 | 氨基脱氧分支酸裂合酶(4-氨基-4-脱氧分支酸裂合酶)(ADC裂合酶)(ADCL) |
ORF01437 | 2873和2874 | 保守性假拟蛋白TIGR00247 |
ORF01438 | 2875和2876 | 胸苷酸激酶(tmk)[2.7.4.9] |
ORF01439 | 2877和2878 | DNA聚合酶III,δ亚基[2.7.7.7] |
ORF01440 | 2879和2880 | 推定的脱氧核糖核酸酶ycfH |
ORF01441 | 2881和2882 | PTS系统,葡萄糖-特异性IIBC组件(ptsG)[2.7.1.69] |
ORF01442 | 2883和2884 | FhuE受体前体(III) |
ORF01443 | 2885和2886 | HIT样蛋白ycfF(Ap4A) |
ORF01444 | 2887和2888 | 功能未知的蛋白质(DUF1425)超家族 |
ORF01445 | 2889和2890 | 纤连蛋白-结合蛋白B |
ORF01446 | 2891和2892 | 未命名蛋白产物[3.2.1.21] |
ORF01447 | 2893和2894 | B-氨基己糖苷酶 |
ORF01448 | 2895和2896 | ycfP蛋白 |
ORF01449 | 2897和2898 | NADH脱氢酶 |
ORF01450 | 2899和2900 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01451 | 2901和2902 | 转录调节蛋白,TetR家族 |
ORF01452 | 2903和2904 | 功能未知的蛋白质(DUF1471)超家族 |
ORF01453 | 2905和2906 | ErfK-YbiS-YcfS-YnhG家族 |
ORF01454 | 2907和2908 | 转录-修复偶联因子突变频率下降 |
ORF01455 | 2909和2910 | 推定酰基转移酶家族 |
ORF01456 | 2911和2912 | 假拟蛋白 |
ORF01457 | 2913和2914 | ABC转运蛋白,完整的膜蛋白 |
ORF01458 | 2915和2916 | 脂蛋白释放系统,ATP结合蛋白(lolD) |
ORF01459 | 2917和2918 | 脂蛋白释放系统,跨膜蛋白LolE(lolE) |
ORF01460 | 2919和2920 | ROK家族蛋白 |
ORF01461 | 2921和2922 | NAD依赖性脱乙酰酶(调节蛋白SIR2同源物)(DMB)[3.5.1.-] |
ORF01462 | 2923和2924 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01463 | 2925和2926 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01464 | 2927和2928 | 亚精胺-腐胺-结合周质蛋白前体(potD) |
ORF01465 | 2929和2930 | 亚精胺-腐胺转运系统通透酶蛋白potC(potC) |
ORF01466 | 2931和2932 | 亚精胺-腐胺转运系统通透酶 |
ORF01467 | 2933和2934 | ABC转运蛋白,聚胺转运蛋白,ATP结合蛋白(atp结合) |
ORF01468 | 2935和2936 | 肽酶T(pepT)[3.4.11.14] |
ORF01469 | 2937和2938 | ycfD蛋白 |
ORF01470 | 2939和2940 | 传感蛋白phoQ[2.7.3.-] |
ORF01471 | 2941和2942 | 转录调节蛋白 |
ORF01472 | 2943和2944 | 腺嘌呤琥珀酸裂合酶(purB)[4.3.2.2] |
ORF01473 | 2945和2946 | 参与嘌呤代谢的未表征的蛋白 |
ORF01474 | 2947和2948 | tRNA(5-甲基氨基甲基-2-硫尿苷酸)-甲基转移酶(trmU)[2.1.1.61] |
ORF01475 | 2949和2950 | 未命名蛋白产物[3.6.-.-] |
ORF01476 | 2951和2952 | RNA假尿苷酸合酶家族蛋白[4.2.1.70] |
ORF01477 | 2953和2954 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01478 | 2955和2956 | 异柠檬酸脱氢酶,NADP依赖性(icd)[1.11.42] |
ORF01479 | 2957和2958 | λ噬菌体整合酶 |
ORF01480 | 2959和2960 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01481 | 2961和2962 | 未命名蛋白产物;与噬菌体蛋白有些相似 |
ORF01482 | 2963和2964 | 外切核酸酶Z0951[相似性][3.1.11.3] |
ORF01483 | 2965和2966 | 重组蛋白Bet |
ORF01484 | 2967和2968 | 宿主-核酸酶抑制剂蛋白Gam |
ORF01485 | 2969和2970 | Kil蛋白 |
ORF01486 | 2971和2972 | λ调节蛋白CIII相关蛋白 |
ORF01487 | 2973和2974 | Ea10基因蛋白 |
ORF01488 | 2975和2976 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01489 | 2977和2978 | 抗终止蛋白Q |
ORF01490 | 2979和2980 | 溶菌酶[3.2.1.17] |
ORF01491 | 2981和2982 | 噬菌体裂解蛋白 |
ORF01492 | 2983和2984 | 假拟蛋白 |
ORF01493 | 2985和2986 | 原噬菌体L54a,HNH内切核酸酶家族蛋白 |
ORF01494 | 2987和2988 | 小末端酶亚基 |
ORF01495 | 2989和2990 | 噬菌体末端酶,大亚基,推定 |
ORF01496 | 2991和2992 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01497 | 2993和2994 | 噬菌体门蛋白,HK97家族 |
ORF01498 | 2995和2996 | Sb5(AF181080) |
ORF01499 | 2997和2998 | 噬菌体主要衣壳蛋白,HK97家族 |
ORF01500 | 2999和3000 | Sb7相关蛋白 |
ORF01501 | 3001和3002 | Sb8 |
ORF0t502 | 3003和3004 | Sb9 |
ORF01503 | 3005和3006 | 假拟蛋白 |
ORF01504 | 3007和3008 | Sb11 |
ORF01505 | 3009和3010 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01506 | 3011和3012 | 噬菌体Mu尾鞘蛋白(GpL) |
ORF01507 | 3013和3014 | Sb14 |
ORF01508 | 3015和3016 | 假拟蛋白 |
ORF01509 | 3017和3018 | Sb15 |
ORF01510 | 3019和3020 | 尾蛋白 |
ORF01511 | 3021和3022 | 尾-DNA循环蛋白(muN) |
ORF01512 | 3023和3024 | 噬菌体Mu P蛋白 |
ORF01513 | 3025和3026 | 噬菌体Mu GD45蛋白 |
ORF01514 | 3027和3028 | 噬菌体蛋白GP46 |
ORF01515 | 3029和3030 | 尾蛋白 |
ORF01516 | 3031和3032 | 尾蛋白 |
ORF01517 | 3033和3034 | ycfE蛋白(片段) |
ORF01518 | 3035和3036 | 功能来知的结构域DUF144超家族 |
ORF01519 | 3037和3038 | 未命名蛋白产物;未鉴定的阅读框P-293 |
ORF01520 | 3039和3040 | 脂蛋白Rzl前体相关蛋白 |
ORF01521 | 3041和3042 | 噬菌体裂解蛋白 |
ORF01522 | 3043和3044 | λ原噬菌体的Bor蛋白同源物DLP12 |
ORF01523 | 3045和3046 | 假拟蛋白 |
ORF01524 | 3047和3048 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01525 | 3049和3050 | λ噬菌体头装饰蛋白D |
ORF01526 | 3051和3052 | 噬菌体主要衣壳蛋白E |
ORF01527 | 3053和3054 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01528 | 3055和3056 | 噬菌体头尾连接 |
ORF01529 | 3057和3058 | 原噬菌体小尾蛋白Z(GPZ) |
ORF01530 | 3059和3060 | 小尾蛋白U |
ORF01531 | 3061和3062 | 假拟蛋白 |
ORF01532 | 3063和3064 | 小尾蛋白Z(GPZ) |
ORF01533 | 3065和3066 | 噬菌体小尾蛋白U |
ORF01534 | 3067和3068 | 小尾蛋白 |
ORF01535 | 3069和3070 | 噬菌体小尾蛋白U |
ORF01536 | 3071和3072 | 主要尾蛋白 |
ORF01537 | 3073和3074 | 噬菌体小尾蛋白G |
ORF01538 | 3075和3076 | 小尾蛋白 |
ORF01539 | 3077和3078 | 小尾蛋白 |
ORF01540 | 3079和3080 | 尾长卷尺蛋白前体 |
ORF01541 | 3081和3082 | 小尾蛋白 |
ORF01542 | 3083和3084 | 小尾蛋白前体H |
ORF01543 | 3085和3086 | 小尾蛋白前体H |
ORF01544 | 3087和3088 | 假拟噬菌体蛋白 |
ORF01545 | 3089和3090 | 未命名蛋白产物;类似于尾丝装配蛋白 |
ORF01546 | 3091和3092 | 蛋白酶VII前体(Omptin)(外膜蛋白3B)(蛋白酶A)(SopA)[3.4.21.87] |
ORF01547 | 3093和3094 | 蛋白酶VII前体(Omptin)(外膜蛋白3B)(蛋白酶A)(SopA)[3.4.21.87] |
ORF01548 | 3095和3096 | 蛋白酶VII前体(Omptin)(外膜蛋白3B)(蛋白酶A)(SopA)[3.4.21.87] |
ORF01549 | 3097和3098 | vdfE蛋白(35kD) |
ORF01550 | 3099和3100 | 噬菌体末端酶大亚基(GpA) |
ORF01551 | 3101和3102 | 噬菌体末端酶大亚基(GpA) |
ORF01552 | 3103和3104 | 噬菌体末端酶大亚基(GpA) |
ORF01553 | 3105和3106 | 门蛋白(头蛋白GP4) |
ORF01554 | 3107和3108 | 头尾预连接蛋白GP5 |
ORF01555 | 3109和3110 | 头尾预连接蛋白GP5[含有:支架蛋白GP6(头蛋白GP6)] |
ORF01556 | 3111和3112 | 噬菌体λ头装饰蛋白D |
ORF01557 | 3113和3114 | 噬菌体主要衣壳蛋白E |
ORF01558 | 3115和3116 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01559 | 3117和3118 | 噬菌体头尾连接 |
ORF01560 | 3119和3120 | 原噬菌体小尾蛋白Z(GPZ) |
ORF01561 | 3121和3122 | 噬菌体小尾蛋白U |
ORF01562 | 3123和3124 | 主要尾蛋白 |
ORF01563 | 3125和3126 | 噬菌体小尾蛋白G |
ORF0t564 | 3127和3128 | 小尾蛋白 |
ORF01565 | 3129和3130 | 门蛋白(头蛋白GP4) |
ORF01566 | 3131和3132 | 头尾预连接蛋白GP5 |
ORF01567 | 3133和3134 | 头尾预连接蛋白GP5[含有:支架蛋白GP6(头蛋白GP6)] |
ORF01568 | 3135和3136 | 头尾预连接蛋白GP5[含有:支架蛋白GP6(头蛋白GP6)] |
ORF01569 | 3137和3138 | λ噬菌体头装饰蛋白D |
ORF01570 | 3139和3140 | 噬菌体尾卷尺蛋白,λ家族 |
ORF01571 | 3141和3142 | 噬菌体小尾蛋白 |
ORF01572 | 3143和3144 | 小尾蛋白 |
ORF01573 | 3145和3146 | 推定的原噬菌体尾组件 |
ORF01574 | 3147和3148 | 噬菌体小尾蛋白 |
ORF01575 | 3149和3150 | 噬菌体小尾蛋白L |
ORF01576 | 3151和3152 | 推定的原噬菌体尾组件 |
ORF01577 | 3153和3154 | 噬菌体小尾蛋白 |
ORF01578 | 3155和3156 | 噬菌体小尾蛋白L |
ORF01579 | 3157和3158 | 转录调节物,GntR家族 |
ORF01580 | 3159和3160 | 可能的氧化还原酶ydfG |
ORF01581 | 3161和3162 | 肽基-二肽酶Dcp,推定 |
ORF01582 | 3163和3164 | 肽基-二肽酶Dcp |
ORF01583 | 3165和3166 | 假拟蛋白 |
ORF01584 | 3167和3168 | GGDEF结构域蛋白 |
ORF01585 | 3169和3170 | 假拟蛋白 |
ORF01586 | 3171和3172 | 主要易化超家族亚家族 |
ORF01587 | 3173和3174 | YdeD |
ORF01588 | 3175和3176 | 推定的保守性蛋白 |
ORF01589 | 3177和3178 | PTS系统,纤维二糖-特异性IIB组件(PTS)[2.7.1.69] |
ORF01590 | 3179和3180 | 推定的保守性蛋白 |
ORF01591 | 3181和3182 | PTR系统,纤维二糖-特异性IIA组件 |
ORF01592 | 3183和3184 | f538 |
ORF01593 | 3185和3186 | 6-磷酸-β-葡糖苷酶 |
ORF01594 | 3187和3188 | 多种抗生素抗性蛋白marB相关蛋白 |
ORF01595 | 3189和3190 | 多种抗生素抗性蛋白MarA |
ORF01596 | 3191和3192 | 多种抗生素抗性蛋白marR(AL359989) |
ORF01597 | 3193和3194 | 保守性假拟蛋白TIGR00427 |
ORF01598 | 3195和3196 | 糖外流转运蛋白 |
ORF01599 | 3197和3198 | 转录调节物,LysR家族 |
ORF01600 | 3199和3200 | 醛-脱氢酶样蛋白ynel(SSDH)[1.2.1.-] |
ORF01601 | 3201和3202 | 谷氨酰胺酶家族蛋白,中断-N |
ORF01602 | 3203和3204 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01603 | 3205和3206 | GGDEF结构域蛋白 |
ORF01604 | 3207和3208 | 阿卓糖酸氧化还原酶 |
ORF01605 | 3209和3210 | 未表征的蛋白家族(UPF0187)超家族 |
ORF01606 | 3211和3212 | 转-顺乌头酸甲基转移酶[2.1.1.144] |
ORF01607 | 3213和3214 | 蛋白hipB |
ORF01608 | 3215和3216 | 蛋白hipA |
ORF01609 | 3217和3218 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01610 | 3219和3220 | 短链脱氢酶 |
ORF01611 | 3221和3222 | I型菌毛蛋白,A链前体 |
ORF01612 | 3223和3224 | 侣伴蛋白fimC前体 |
ORF01613 | 3225和3226 | 外膜传达蛋白fimD前体 |
ORF01614 | 3227和3228 | 菌毛形态 |
ORF01615 | 3229和3230 | 假拟菌毛样蛋白ydeQ前体 |
ORF01616 | 3231和3232 | 氧化还原酶α(钼蝶呤)亚基 |
ORF01617 | 3233和3234 | HTH-型转录调节物ydeO |
ORF01618 | 3235和3236 | 酰基硫酸酯酶B(GALNS) |
ORF01619 | 3237和3238 | 基团状SAM结构域蛋白 |
ORF01620 | 3239和3240 | ABC外流转运蛋白,通透酶-ATP结合蛋白,推定 |
ORF01621 | 3241和3242 | cds103 |
ORF01622 | 3243和3244 | cds103 |
ORF01623 | 3245和3246 | 肽酶,M16家族,推定[3.4.99.4 |
ORF01624 | 3247和3248 | 谷氨酸脱羧酶[4.1.1.15] |
ORF01625 | 3249和3250 | 氨基酸反向转运蛋白 |
ORF01626 | 3251和3252 | yngK蛋白 |
ORF01627 | 3253和3254 | 推定的保守性蛋白相关蛋白 |
ORF01628 | 3255和3256 | 传感蛋白FixL(EC 2.7.3.-).(nifL)[2.7.3.-] |
ORF01629 | 3257和3258 | 渗透压诱导性蛋白C |
ORF01630 | 3259和3260 | 假拟蛋白 |
ORF01631 | 3261和3262 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01632 | 3263和3264 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01633 | 3265和3266 | 30S核糖体蛋白S22(稳定期-诱导的核糖体结合蛋白) |
ORF01634 | 3267和3268 | 假拟蛋白 |
ORF01635 | 3269和3270 | NAD连接的苹果酸脱氢酶(苹果酸酶) |
ORF01636 | 3271和3272 | 醇脱氢酶,优选丙醇(adhA)[1.-.-.-] |
ORF01637 | 3273和3274 | 蛋白杀伤抑制蛋白higA |
ORF01638 | 3275和3276 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01639 | 3277和3278 | 蛋白杀伤活性蛋白higB |
ORF01640 | 3279和3280 | 甲酸脱氢酶,γ亚基[1.2.1.2] |
ORF01641 | 3281和3282 | 甲酸脱氢酶,β亚基(FdxH)[1.2.1.2] |
ORF01642 | 3283和3284 | 甲酸脱氢酶,α亚基,含有硒代半胱氨酸[1.2.1.2] |
ORF01643 | 3285和3286 | 甲酸脱氢酶,α亚基,含有硒代半胱氨酸[1.2.1.2] |
ORF01644 | 3287和3288 | 甲酸脱氢酶,α亚基,含有硒代半胱氨酸[1.2.1.2] |
ORF01645 | 3289和3290 | 假拟蛋白 |
ORF01646 | 3291和3292 | 膜蛋白yddG |
ORF01647 | 3293和3294 | 亚硝酸挤出蛋白2 |
ORF01648 | 3295和3296 | 硝酸还原酶,α亚基[1.7.99.4] |
ORF01649 | 3297和3298 | 硝酸还原酶,β亚基(narH)[1.7.99.4] |
ORF01650 | 3299和3300 | 呼吸作用硝酸还原酶2,δ链[1.7.99.4] |
ORF01651 | 3301和3302 | 呼吸作用硝酸还原酶,γ亚基(narl)[1.7.99.4] |
ORF01652 | 3303和3304 | 吩嗪生物合成蛋白PhzF家族亚家族 |
ORF01653 | 3305和3306 | 链D,M,Smegmatis芳胺N-乙酰基转移酶[2.3.1.118] |
ORF01654 | 3307和3308 | 黄素还原酶样结构域蛋白 |
ORF01655 | 3309和3310 | H重复结合蛋白(ORF-H) |
ORF01656 | 3311和3312 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01657 | 3313和3314 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01658 | 3315和3316 | Aec15(AF044503) |
ORF01659 | 3317和3318 | 未表征的保守性蛋白 |
ORF01660 | 3319和3320 | 可能的转移酶(U59485) |
ORF01661 | 3321和3322 | 谷胱甘肽S-转移酶gst |
ORF01662 | 3323和3324 | L-天冬酰胺通透酶(516aa) |
ORF01663 | 3325和3326 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01664 | 3327和3328 | TonB依赖性受体蛋白 |
ORF01665 | 3329和3330 | 推定的保守性蛋白相关蛋白 |
ORF01666 | 3331和3332 | 乙酰基转移酶,GNAT家族[2.3.1.-] |
ORF01667 | 3333和3334 | 功能未知的蛋白,DUF606超家族 |
ORF01668 | 3335和3336 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01669 | 3337和3338 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01670 | 3339和3340 | 假拟蛋白 |
ORF01671 | 3341和3342 | 醛脱氢酶家族蛋白(BADH)[1.2.1.8] |
ORF01672 | 3343和3344 | 聚胺ABC转运蛋白,通透酶蛋白 |
ORF01673 | 3345和3346 | 聚胺ABC转运蛋白,通透酶蛋白 |
ORF01674 | 3347和3348 | 聚胺ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白 |
ORF01675 | 3349和3350 | 聚胺ABC转运蛋白,周质聚胺-结合蛋白 |
ORF01676 | 3351和3352 | 未命名蛋白产物(TAT)[2.6.1.5] |
ORF01677 | 3353和3354 | 未命名蛋白产物 |
ORF01678 | 3355和3356 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01679 | 3357和3358 | 肽酶,U32家族 |
ORF01680 | 3359和3360 | 转录调节蛋白,Cro-Cl家族,推定 |
ORF01681 | 3361和3362 | 类似于苯甲酸转运蛋白 |
ORF01682 | 3363和3364 | 假拟脂蛋白ydcL前体 |
ORF01683 | 3365和3366 | 亚碲酸抗性蛋白TehB(tehB) |
ORF01684 | 3367和3368 | 亚碲酸抗性蛋白tehA |
ORF01685 | 3369和3370 | 推定的核糖体-蛋白-丝氨酸乙酰基转移酶 |
ORF01686 | 3371和3372 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01687 | 3373和3374 | 功能未知的蛋白质(DUF465)家族 |
ORF01688 | 3375和3376 | 葡聚糖生物合成蛋白D前体 |
ORF01689 | 3377和3378 | 功能未知的蛋白质(DUF1338)家族 |
ORF01690 | 3379和3380 | 转录调节蛋白PcaQ |
ORF01691 | 3381和3382 | 接受甲基的趋化性蛋白II,天冬氨酸传感蛋白受体 |
ORF01692 | 3383和3384 | Hok蛋白相关蛋白 |
ORF01693 | 3385和3386 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01694 | 3387和3388 | 细胞色素b561(561) |
ORF01695 | 3389和3390 | I型甘油醛-3-磷酸脱氢酶(gap)[1.2.1.-] |
ORF01696 | 3391和3392 | 醛脱氢酶A(NAD)[1.2.122] |
ORF01697 | 3393和3394 | 蛋白ydcF |
ORF01698 | 3395和3396 | ATP-依赖性解旋酶HrDA(hrpA) |
ORF01699 | 3397和3398 | [酰基-载体-蛋白]磷酸二酯酶acpD(片段) [3.1.4.14] |
ORF01700 | 3399和3400 | 双特异性磷酸酶,催化结构域蛋白 |
ORF01701 | 3401和3402 | 溶血磷脂酶 |
ORF01702 | 3403和3404 | 磷脂酸胞苷酰转移酶(cdsA)[2.7.7.41] |
ORF01703 | 3405和3406 | CDP-醇磷脂酰转移酶家族 |
ORF01704 | 3407和3408 | 氧化还原酶,醛酮还原酶家族[1.-.-.-] |
ORF01705 | 3409和3410 | 分离orf |
ORF01706 | 3411和3412 | 功能未知的蛋白质IDUF1318)家族 |
ORF01707 | 3413和3414 | 推定的脂蛋白 |
ORF01708 | 3415和3416 | 未命名蛋白产物;类似于大肠杆菌的膜蛋白YbdH |
ORF01709 | 3417和3418 | 发酵的D-乳酸脱氢酶(D-LDH)[1.1.1.28] |
ORF01710 | 3419和3420 | 热激蛋白hslJ |
ORF01711 | 3421和3422 | 推定的脂蛋白 |
ORF01712 | 3423和3424 | 丙酮酸盐:铁氧还蛋白(黄素氧还蛋白)氧化还原酶(nifJ)[1.2.7.1] |
ORF01713 | 3425和3426 | 外膜蛋白N前体(Ibc) |
ORF01714 | 3427和3428 | 推定的丝状蛋白 |
ORF01715 | 3429和3430 | 噬菌体BP-933W的整合酶 |
ORF01716 | 3431和3432 | YdaO蛋白 |
ORF01717 | 3433和3434 | ATP依赖性RNA解旋酶dbpA |
ORF01718 | 3435和3436 | 假拟蛋白 |
ORF01719 | 3437和3438 | CorA样Mg2+转运蛋白 |
ORF01720 | 3439和3440 | 二鸟苷酸环化酶-磷酸二酯酶结构域1(GGDEF) |
ORF01721 | 3441和3442 | Smr结构域蛋白 |
ORF01722 | 3443和3444 | 耐药性转运蛋白,Bcr-CflA家族(emrB) |
ORF01723 | 3445和3446 | HlyD家族分泌蛋白 |
ORF01724 | 3447和3448 | 转录调节物,AraC家族 |
ORF01725 | 3449和3450 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01726 | 3451和3452 | 甲基化-DNA-蛋白-半胱氨酸甲基转移酶(6-O-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶) |
ORF01727 | 3453和3454 | 延胡索酸和硝酸还原调节蛋白 |
ORF01728 | 3455和3456 | 通用应激蛋白家族结构域蛋白 |
ORF01729 | 3457和3458 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01730 | 3459和3460 | 小电导率机械敏感性通道 |
ORF01731 | 3461和3462 | 周质胞壁质肽-结合蛋白前体 |
ORF01732 | 3463和3464 | 黄嘌呤核苷操纵子调节蛋白。 |
ORF01733 | 3465和3466 | 二烯内酯水解酶结构域蛋白 |
ORF01734 | 3467和3468 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01735 | 3469和3470 | 扁桃酸消旋酶-粘康酸内酯化酶,C-末端结构域蛋白 |
ORF01736 | 3471和3472 | Ycjl |
ORF01737 | 3473和3474 | 硫醇过氧化物酶(P20)[1.11.1.-] |
ORF01738 | 3475和3476 | 转录调节蛋白tyrR |
ORF01739 | 3477和3478 | 保守性假拟蛋白TIGR01620 |
ORF01740 | 3479和3480 | YcjX(AY008264) |
ORF01741 | 3481和3482 | 转录调节物同源物lin2974 |
ORF01742 | 3483和3484 | 外膜蛋白G前体 |
ORF01743 | 3485和3486 | ABC转运蛋白结构域蛋白 |
ORF01744 | 3487和3488 | β-磷酸葡糖变位酶(pgmB)[5.4.2.6] |
ORF01745 | 3489和3490 | 麦芽糖磷酸化酶同源物tin2966(磷酸化酶)[3.2.1.-] |
ORF01746 | 3491和3492 | 氧化还原酶,Gfo-ldh-MocA家族 |
ORF01747 | 3493和3494 | 大肠杆菌蛋白同源物lin2968 [5.3.1.-] |
ORF01748 | 3495和3496 | 醇脱氢酶(EC 1.1.1.),[1.1.1.-] |
ORF01749 | 3497和3498 | ABC转运蛋白,通透酶蛋白(AF175299) |
ORF01750 | 3499和3500 | Sn-甘油-3-磷酸转运系统通透酶蛋白UgpA。(AF307052) |
ORF01751 | 3501和3502 | ABC转运蛋白,底物结合蛋白 |
ORF01752 | 3503和3504 | 推定的右旋糖苷蔗糖酶(EC 2.4.1.5),[2.4.1.5] |
ORF01753 | 3505和3506 | 硫氰酸生成酶样结构域蛋白 |
ORF01754 | 3507和3508 | 噬菌体休克蛋白相关蛋白 |
ORF01755 | 3509和3510 | 噬菌体休克蛋白C |
ORF01756 | 3511和3512 | 噬菌体休克蛋白B |
ORF01757 | 3513和3514 | 噬菌体休克蛋白A |
ORF01758 | 3515和3516 | Psp操纵子转录激活蛋白 |
ORF01759 | 3517和3518 | 可能的氨基酸通透酶yciJ |
ORF01760 | 3519和3520 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01761 | 3521和3522 | 肽转运周质蛋白sapA前体 |
ORF01762 | 3523和3524 | 肽转运系统通透酶蛋白sapB |
ORF01763 | 3525和3526 | 肽转运系统通透酶蛋白sapC(sapC) |
ORF01764 | 3527和3528 | 肽转运系统ATP结合蛋白sapD |
ORF01765 | 3529和3530 | 肽转运系统ATP结合蛋白sapF |
ORF01766 | 3531和3532 | 耐药性转运蛋白,Bcr-CflA家族蛋白 |
ORF01767 | 3533和3534 | EefC外膜蛋白 |
ORF01768 | 3535和3536 | 吖啶黄素抗性蛋白B |
ORF01769 | 3537和3538 | 吖啶黄素抗性蛋白A前体(MFP) |
ORF01770 | 3539和3540 | 转录调节物,TetR家族 |
ORF01771 | 3541和3542 | 烯酰基-[酰基-载体-蛋白]还原酶ECs1861 (NADH)[1.3.1.9] |
ORF01772 | 3543和3544 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01773 | 3545和3546 | 外切核糖核酸酶II(rnb)[3.1.13.1] |
ORF01774 | 3547和3548 | 传感框蛋白 |
ORF01775 | 3549和3550 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01776 | 3551和3552 | 推定的甘油-3-磷酸调节子阻抑物 |
ORF01777 | 3553和3554 | 渗透压诱导性脂蛋白B前体相关蛋白 |
ORF01778 | 3555和3556 | 翻译启动因子SUI1,推定 |
ORF01779 | 3557和3558 | 乳清苷5′-磷酸脱羧酶(pyrF)[4.1.1 23] |
ORF01780 | 3559和3560 | 假拟蛋白 |
ORF0t781 | 3561和3562 | 预测的N-乙酰基葡糖胺基转移酶 |
ORF01782 | 3563和3564 | 未命名蛋白产物 |
ORF01783 | 3565和3566 | 磷脂酰甘油磷酸酶B(pgpB)[3.1.3.27] |
ORF01784 | 3567和3568 | GTP环式水解酶II(ribA)[3.5.4.25] |
ORF01785 | 3569和3570 | 顺乌头酸水合酶1(acnA) M.2.1.3] |
ORF01786 | 3571和3572 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01787 | 3573和3574 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01788 | 3575和3576 | HTH型转录调节物cysB(Cys调节子转录激活物) |
ORF01789 | 3577和3578 | DNA拓扑异构酶I |
ORF01790 | 3579和3580 | 假拟蛋白 |
ORF01791 | 3581和3582 | 蛋白yciN |
ORF01792 | 3583和3584 | 可能的蛋白酶sohB |
ORF01793 | 3585和3586 | 氧化还原酶[1.-.-.-] |
ORF01794 | 3587和3588 | 钴胺素腺苷转移酶(cobO)[2.5.1.17] |
ORF01795 | 3589和3590 | RNA假尿苷酸合酶家族蛋白[4.2.1.70] |
ORF01796 | 3591和3592 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01797 | 3593和3594 | Sua5-YciO-YrdC-YwlC家族蛋白 |
ORF01798 | 3595和3596 | 蛋白trpH |
ORF01799 | 3597和3598 | 邻氨基苯甲酸合酶组件I(trpE)[4.1.3.27] |
ORF01800 | 3599和3600 | 邻氨基苯甲酸合酶组件II[4.1.3.27] |
ORF01801 | 3601和3602 | 邻氨基苯甲酸异构酶(PRAI)[4.1.1.48] |
ORF01802 | 3603和3604 | 色氨酸合酶,β亚基(trpB)[4.2.1.20] |
ORF01803 | 3605和3606 | 色氨酸合酶,α亚基(trpA)[4.2.1.20] |
ORF01804 | 3607和3608 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01805 | 3609和3610 | 蛋白yciF |
ORF01806 | 3611和3612 | yciE |
ORF01807 | 3613和3614 | 外膜蛋白W前体 |
ORF01808 | 3615和3616 | λ原噬菌体的尾丝装配蛋白同源物 |
ORF01809 | 3617和3618 | λ原噬菌体的尾丝装配蛋白同源物Oin |
ORF01810 | 3619和3620 | 可能的原噬菌体膜蛋白CP-933X Z1918 |
ORF01811 | 3621和3622 | 可能的原噬菌体膜蛋白CP-933X Z1918 |
ORF01812 | 3623和3624 | 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933X |
ORF01813 | 3625和3626 | 假拟蛋白 |
ORF01814 | 3627和3628 | Lom |
ORF01815 | 3629和3630 | 宿主特异性蛋白(部分) |
ORF01816 | 3631和3632 | 宿主特异性蛋白J(部分) |
ORF01817 | 3633和3634 | 噬菌体λ尾装配蛋白I |
ORF01818 | 3635和3636 | 推定的原噬菌体的尾丝组件K |
ORF01819 | 3637和3638 | 小尾蛋白 |
ORF01820 | 3639和3640 | 小尾蛋白 |
ORF0182t | 3641和3642 | 噬菌体小尾蛋白 |
ORF01822 | 3643和3644 | 小尾蛋白前体H |
ORF01823 | 3645和3646 | 小尾蛋白 |
ORF01824 | 3647和3648 | 噬菌体小尾蛋白G |
0RF01825 | 3649和3650 | 细菌Ig样结构域(2类)家族 |
0RF0t826 | 3651和3652 | 噬菌体小尾蛋白U |
ORF01827 | 3653和3654 | 原噬菌体小尾蛋白Z(GPZ) |
ORF01828 | 3655和3656 | 噬菌体头-尾连接 |
ORF01829 | 3657和3658 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01830 | 3659和3660 | 噬菌体主要衣壳蛋白E |
ORF01831 | 3661和3662 | λ噬菌体头装饰蛋白D |
ORF01832 | 3663和3664 | 头尾连接蛋白GP5 |
ORF01833 | 3665和3666 | 噬菌体门蛋白,λ家族 |
ORF01834 | 3667和3668 | gpW |
ORF01835 | 3669和3670 | 噬菌体末端酶大亚基(GpA) |
ORF01836 | 3671和3672 | 末端酶小亚基(GP1)(片段) |
ORF01837 | 3673和3674 | 假拟蛋白 |
ORF01838 | 3675和3676 | 噬菌体裂解蛋白 |
ORF01839 | 3677和3678 | 脂蛋白Rzl前体相关蛋白 |
ORF01840 | 3679和3680 | 推定噬菌体蛋白 |
ORF01841 | 3681和3682 | 溶酶体(裂解蛋白)(胞壁酸酶) (内溶素)[3.2.1.17] |
ORF01842 | 3683和3684 | 功能未知的蛋白质(DUF1327)超家族 |
ORF01843 | 3685和3686 | λ原噬菌体的裂解蛋白S同源物 |
ORF01844 | 3687和3688 | 未命名蛋白产物;ORF616 |
ORF01845 | 3689和3690 | 未命名蛋白产物;ORF616 |
ORF01846 | 3691和3692 | DNA腺嘌呤-甲基化酶 |
ORF01847 | 3693和3694 | 原噬菌体编码的未知蛋白CP-9330 |
ORF01848 | 3695和3696 | 隐藏原噬菌体的抗终止蛋白Q同源物 |
ORF01849 | 3697和3698 | 内切脱氧核糖核酸酶RUS(Holliday连接解离酶)[3.1.22.-] |
ORF01850 | 3699和3700 | 功能未知的蛋白质(DUF1277)超家族 |
ORF01851 | 3701和3702 | 原噬菌体维持蛋白[相似性]相关蛋白 |
ORF01852 | 3703和3704 | 假拟蛋白 |
ORF01853 | 3705和3706 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01854 | 3707和3708 | 原噬菌体内编码的未知蛋白 |
ORF01855 | 3709和3710 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01856 | 3711和3712 | 隐藏原噬菌体编码的未知蛋白 |
ORF01857 | 3713和3714 | 推定的肽酶S24样结构域 |
ORF01858 | 3715和3716 | 功能未知的蛋白质(DUF1391)家族 |
ORF01859 | 3717和3718 | ydfB蛋白相关蛋白 |
ORF01860 | 3719和3720 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01861 | 3721和3722 | 假拟蛋白 |
ORF01862 | 3723和3724 | 分裂抑制蛋白dicB |
ORF01863 | 3725和3726 | 原噬菌体编码的未知蛋白CP-9330相关蛋白 |
ORF01864 | 3727和3728 | 外切脱氧核糖核酸酶VIII (35kD)[3.1,11.-] |
ORF01865 | 3729和3730 | 整合酶 |
ORF01866 | 3731和3732 | 外膜蛋白W前体 |
ORF01867 | 3733和3734 | yciC |
ORF01868 | 3735和3736 | 胞内分隔蛋白A(ispZ) |
ORF01869 | 3737和3738 | 酰基-CoA水解酶[3.1.2.-] |
ORF01870 | 3739和3740 | TonB蛋白 |
ORF01871 | 3741和3742 | ycil蛋白 |
ORF01872 | 3743和3744 | 推定钾通道蛋白 |
ORF01873 | 3745和3746 | 心磷脂合成酶(心磷脂合酶)(CL合酶)[2.7.8.-] |
ORF01874 | 3747和3748 | 功能未知的蛋白,DUF440超家族 |
ORF01875 | 3749和3750 | 肽ABC转运蛋白,ATP结合蛋白(AA1) |
ORF01876 | 3751和3752 | 寡肽ABC转运蛋白,ATP结合蛋白(AA1) |
ORF01877 | 3753和3754 | 寡肽ABC转运蛋白,通透酶蛋白(AA1) |
ORF01878 | 3755和3756 | 寡肽转运系统通透酶蛋白oppB(AA1) |
ORF01879 | 3757和3758 | 周质寡肽-结合蛋白前体 |
ORF01880 | 3759和3760 | 推定的膜蛋白 |
ORF01881 | 3761和3762 | 乙醛脱氢酶(乙酰化)-醇脱氢酶(EC 1.1.1.1) |
ORF01882 | 3763和3764 | 用于插入序列元件IS4的转座酶insG |
ORF01883 | 3765和3766 | 胸苷激酶[2,7,1.21] |
ORF01884 | 3767和3768 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01885 | 3769和3770 | DNA-结合蛋白H-NS同源物virR |
ORF01886 | 3771和3772 | UTP-葡糖-1-磷酸尿苷酰转移酶(galU)[2.7.7,9] |
ORF01887 | 3773和3774 | Hnr蛋白 |
ORF01888 | 3775和3776 | 药物转运蛋白 |
ORF01889 | 3777和3778 | 未命名蛋白产物 |
ORF01890 | 3779和3780 | 甲酰四氢叶酸去甲酰酶(purU)[3.5.1.10] |
ORF01891 | 3781和3782 | Tun1330蛋白 |
ORF01892 | 3783和3784 | 呼吸作用硝酸还原酶,γ亚基(narl)[1.7.99.4] |
ORF01893 | 3785和3786 | 呼吸作用硝酸还原酶1,δ链[1.7.99.4] |
ORF01894 | 3787和3788 | 硝酸还原酶,β亚基(narH)[1.7.99.4] |
ORF01895 | 3789和3790 | 硝酸还原酶,α亚基[1.7.99.4] |
ORF01896 | 3791和3792 | 亚硝酸挤出蛋白1 |
ORF01897 | 3793和3794 | 硝酸-亚硝酸传感蛋白narX[2.7.3.-] |
ORF01898 | 3795和3796 | narL |
ORF01899 | 3797和3798 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01900 | 3799和3800 | YchN蛋白 |
ORF01901 | 3801和3802 | 阳离子转运蛋白chaC |
ORF01902 | 3803和3804 | 阳离子转运调节物chaB相关蛋白 |
ORF01903 | 3805和3806 | 钙-质子反向转运蛋白 |
ORF01904 | 3807和3808 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01905 | 3809和3810 | 3-脱氧-8-磷酸辛酮酸合酶(kdsA)[2.5.1.55] |
ORF01906 | 3811和3812 | 蛋白sirB1 |
ORF01907 | 3813和3814 | 蛋白sirB1 |
ORF01908 | 3815和3816 | 蛋白sirB2 |
ORF01909 | 3817和3818 | 蛋白甲基转移酶hemK(hemK)[2.1.1.-] |
ORF01910 | 3819和3820 | 肽链释放因子1(prfA) |
ORF01911 | 3821和3822 | 谷氨酰-tRNA还原酶(hemA)[1.2.1.-] |
ORF01912 | 3823和3824 | 外膜脂蛋白LolB(IolB) |
ORF01913 | 3825和3826 | 4-二磷酸胞苷-2C-甲基-D-赤藓醇激酶(ispE)[2.7:1.148] |
ORF01914 | 3827和3828 | 核糖-磷酸焦磷酸激酶 |
ORF01915 | 3829和3830 | 硫酸通透酶家族蛋白 |
ORF01916 | 3831和3832 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01917 | 3833和3834 | 肽基-tRNA水解酶(pth)[3.1.1,29] |
ORF01918 | 3835和3836 | GTP-结合蛋白YchF (ychF) |
ORF01919 | 3837和3838 | 甘油代谢操纵子调节蛋白 |
ORF01920 | 3839和3840 | 二羟基丙酮激酶,DhaK亚基(dhaK)[2.7.1.-] |
ORF01921 | 3841和3842 | 二羟丙酮激酶,L亚基[2.7.1.-] |
ORF01922 | 3843和3844 | 磷酸烯醇式丙酮酸-蛋白磷酸转移酶.EI-HPr-EIIA组件 |
ORF01923 | 3845和3846 | 假拟蛋白 |
ORF01924 | 3847和3848 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01925 | 3849和3850 | 海藻糖酶[3.2.1.28] |
ORF01926 | 3851和3852 | 周质结合蛋白家族 |
ORF01927 | 3853和3854 | 铁(III) |
ORF01928 | 3855和3856 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01929 | 3857和3858 | 可能的ABC-型铁载体转运系统ATP结合蛋白(111) |
ORF01930 | 3859和3860 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01931 | 3861和3862 | modD蛋白(modD) |
ORF01932 | 3863和3864 | 推定的外膜受体,可能是tonB依赖性 |
ORF01933 | 3865和3866 | 糖基转移酶相关蛋白 |
ORF01934 | 3867和3868 | YcoR蛋白超家族 |
ORF01935 | 3869和3870 | 胞壁质糖基转移酶E |
ORF01936 | 3871和3872 | 胞壁酰四肽羧肽酶(LD-羧肽酶A)[3.4.17.13] |
ORF01937 | 3873和3874 | Na+-H+反向转运蛋白 |
ORF01938 | 3875和3876 | 丙氨酸消旋酶(alr)[5.1.1.1] |
ORF01939 | 3877和3878 | D-氨基酸脱氢酶小亚基 |
ORF01940 | 3879和3880 | 未鉴定的蛋白 |
ORF01941 | 3881和3882 | fad调节子的负调节物,和正调节物 |
ORF01942 | 3883和3884 | Na+-H+反向转运蛋白NhaB(nhaB) |
ORF01943 | 3885和3886 | 二硫键形成蛋白B[1.8.4.-] |
ORF01944 | 3887和3888 | UmuC蛋白 |
ORF01945 | 3889和3890 | UmuD蛋白(R391)[3.4.21.-] |
ORF01946 | 3891和3892 | 溶细胞素A |
ORF01947 | 3893和3894 | 功能未知的细菌蛋白(DUF838)超家族 |
ORF01948 | 3895和3896 | 蛋白vcaM(FAA) |
ORF01949 | 3897和3898 | 蛋白vcaL |
ORF01950 | 3899和3900 | Fels-1原噬菌体蛋白样家族 |
ORF01951 | 3901和3902 | 隔膜部位-决定蛋白MinC(minC) |
ORF01952 | 3903和3904 | Lom |
ORF01953 | 3905和3906 | 推定的原噬菌体尾组件(部分) |
ORF01954 | 3907和3908 | Lom |
ORF01955 | 3909和3910 | 推定的原噬菌体尾组件(部分) |
ORF01956 | 3911和3912 | 假拟蛋白 |
ORF01957 | 3913和3914 | GntR-家族转录调节蛋白 |
ORF01958 | 3915和3916 | 保守性假拟蛋白 |
ORF01959 | 3917和3918 | 果糖酮酸还原酶[1.-.-.4 |
ORF01960 | 3919和3920 | 代谢物-质子同向转运蛋白(PPII) |
ORF01961 | 3921和3922 | L-艾杜醇2-脱氢酶 |
ORF01962 | 3923和3924 | 饥饿感受蛋白rspA |
ORF01963 | 3925和3926 | 未表征的BCR,YnfA-UPF0060家族超家族 |
ORF01964 | 3927和3928 | 功能未知的蛋白质(DUF1283)超家族 |
ORF01965 | 3929和3930 | 精胺N(1)-乙酰基转移酶(SAT)[23.1.57] |
ORF01966 | 3931和3932 | ynfC蛋白 |
ORF01967 | 3933和3934 | 功能未知的蛋白质(DUF1161)家族 |
ORF01968 | 3935和3936 | DmsA[1.8.99.-1 |
ORF01969 | 3937和3938 | DmsA[1.8.99.-1 |
ORF01970 | 3939和3940 | 二甲亚砜还原酶A2链前体,厌氧[1.8.-.-] |
ORF01971 | 3941和3942 | 厌氧性二甲亚砜还原酶B链(dmsB)[1.8.-.-] |
ORF01972 | 3943和3944 | DMSO还原酶锚定亚基(DmsC)(dmsC)[1.8.99.-] |
ORF01973 | 3945和3946 | TorD蛋白 |
ORF01974 | 3947和3948 | 脱硫生物素合成酶(DTBS) |
ORF01975 | 3949和3950 | 推定的氯通道蛋白eriC样 |
ORF01976 | 3951和3952 | Mlc蛋白 |
ORF01977 | 3953和3954 | 转录调节物,LysR家族 |
ORF01978 | 3955和3956 | 未命名蛋白产物 |
ORF01979 | 3957和3958 | 酸休克蛋白重复家族 |
ORF01980 | 3959和3960 | 谷氨酰内肽酶[3.4.21.-] |
ORF01981 | 3961和3962 | 可能的侣伴蛋白 |
ORF01982 | 3963和3964 | DMT超家族药物外流泵 |
ORF01983 | 3965和3966 | 推定的功能未知的结构域 |
ORF01984 | 3967和3968 | NAD(P)转氢酶,β亚基(pntB)[1.6.1.2] |
ORF01985 | 3969和3970 | NAD(P)转氢酶,α亚基(pntA)[1.6.1.1] |
ORF01986 | 3971和3972 | 蛋白ydgH前体 |
ORF01987 | 3973和3974 | 假拟蛋白 |
ORF01988 | 3975和3976 | 未命名蛋白产物 |
ORF01989 | 3977和3978 | 推定的fabG5[1.-.-.-] |
ORF01990 | 3979和3980 | 膜蛋白glpM |
ORF01991 | 3981和3982 | 转录调节蛋白rstA |
ORF01992 | 3983和3984 | 传感蛋白rstB[2.7.3.-] |
ORF01993 | 3985和3986 | DNA复制末端位点结合蛋白 |
ORF01994 | 3987和3988 | II类延胡索酸水合酶(fumC)[4.2.1.2] |
ORF01995 | 3989和3990 | I类延胡索酸水合酶,厌氧性[4.2.1.2] |
ORF01996 | 3991和3992 | I类甘露糖-6-磷酸异构酶(manA)[5.3.1.8] |
ORF01997 | 3993和3994 | 功能未知的细菌蛋白(DUF945)超家族 |
ORF01998 | 3995和3996 | 膜结合蛋白 |
ORF01999 | 3997和3998 | 葡糖苷酸载体蛋白 |
ORF02000 | 3999和4000 | B-葡糖醛酸糖苷酶(GUS)[3.2.131] |
ORF02001 | 4001和4002 | 转录调节物,TetR家族结构域蛋白,推定 |
ORF02002 | 4003和4004 | 7-α-羟基类固醇脱氢酶 |
ORF02003 | 4005和4006 | 麦芽糖调节子调节蛋白mall |
ORF02004 | 4007和4008 | PTS系统,麦芽糖和葡萄糖特异性IIBC组件(malX)[2.7.1.69] |
ORF02005 | 4009和4010 | 推定的II类氨基转移酶[4.4.1.8] |
ORF02006 | 4011和4012 | 腺苷脱氨酶(add)[3.5.4.4] |
ORF02007 | 4013和4014 | 预测的脱氢酶 |
ORF02008 | 4015和4016 | Hha蛋白 |
ORF02009 | 4017和4018 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02010 | 4019和4020 | 电子传递复合物蛋白rnfA |
ORF02011 | 4021和4022 | 电子传递复合物蛋白rnfB |
ORF02012 | 4023和4024 | 电子传递复合物蛋白rnfC |
ORF02013 | 4025和4026 | 电子传递复合物蛋白rnfD |
ORF02014 | 4027和4028 | 电子传递复合物蛋白rnfG(rnfG) |
ORF02015 | 4029和4030 | 电子传递复合物蛋白rnfE |
ORF02016 | 4031和4032 | 内切核酸酶III(nth)[4.2.99.18[ |
ORF02017 | 4033和4034 | 假拟的转运蛋白ydclR |
ORF02018 | 4035和4036 | 谷胱甘肽S-转移酶[2.5.1.18] |
ORF02019 | 4037和4038 | 吡哆醛激酶[2.7.1.35] |
ORF02020 | 4039和4040 | 酪氨酰-tRNA合成酶(tyrS)[6.1.1.1] |
ORF02021 | 4041和4042 | 吡哆胺5′-磷酸氧化酶(pdxH)[1.4.3.5] |
ORF02022 | 4043和4044 | ydhA蛋白 |
ORF02023 | 4045和4046 | 假拟UPF0075蛋白ydhH |
ORF02024 | 4047和4048 | SlyA |
ORF02025 | 4049和4050 | 镰刀菌酸抗性蛋白FusE |
ORF02026 | 4051和4052 | 镰刀菌酸抗性蛋白保守区域家族 |
ORF02027 | 4053和4054 | 铜-锌超氧化物岐化酶(sodC) |
ORF02028 | 4055和4056 | 氧化还原酶,醛酮还原酶家族[1.-.-.-] |
ORF02029 | 4057和4058 | 未命名蛋白产物 |
ORF02030 | 4059和4060 | 转录调节蛋白 |
ORF02031 | 4061和4062 | N-乙基马来酰亚胺还原酶(Y13942)[1.-.-.-] |
ORF02032 | 4063和4064 | 乳酰谷胱甘肽裂合酶(qloA)[4.4.1.5] |
ORF02033 | 4065和4066 | 核糖核酸酶T(rnt)[3.1.13.-] |
ORF02034 | 4067和4068 | 谷氨酸氧化还原酶相关蛋白 |
ORF02035 | 4069和4070 | 假拟蛋白 |
IRF02036 | 4071和4072 | 推定的脂蛋白 |
ORF02037 | 4073和4074 | 超氧化物歧化酶,铁[1.15.1.1] |
ORF02038 | 4075和4076 | 主要易化家族转运蛋白(AL136500) |
ORF02039 | 4077和4078 | 假拟蛋白 |
ORF02040 | 4079和4080 | 嘌呤核苷酸合成阻抑物(purR) |
ORF02041 | 4081和4082 | cyn操纵子转录激活蛋白 |
ORF02042 | 4083和4084 | 双环霉素抗性蛋白(磺酰胺抗性蛋白) |
ORF02043 | 4085和4086 | 环丙烷-脂酰基-磷脂合酶[2.1.1.79] |
ORF02044 | 4087和4088 | 核黄素合酶,α亚基(ribE)[2.5.1.9] |
ORF02045 | 4089和4090 | 多药耐药蛋白norM |
ORF02046 | 4091和4092 | 可能的酶 |
ORF02047 | 4093和4094 | 蛋白ydhR前体 |
ORF02048 | 4095和4096 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02049 | 4097和4098 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02050 | 4099和4100 | PhsC蛋白同源物[2.8.1.5] |
ORF02051 | 4101和4102 | nrfC蛋白同源物b1671(nrfC)[2.8.1.5] |
ORF02052 | 4103和4104 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02053 | 4105和4106 | 醛-铁氧还蛋白氧化还原酶PH0892(apt)[1.-.-.-] |
ORF02054 | 4107和4108 | 醛氧化还原酶(aor)[1.-.-.-] |
ORF02055 | 4109和4110 | 铁硫簇-b结合蛋白[2.8.1.5] |
ORF02056 | 4111和4112 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02057 | 4113和4114 | 丙酮酸激酶(pyk)[2.7.1.40] |
ORF02058 | 4115和4116 | 主要外膜脂蛋白 |
ORF02059 | 4117和4118 | ErfK-Ybis-YcfS-YnhG家族 |
ORF02060 | 4119和4120 | SufE蛋白(orf5) |
ORF02061 | 4121和4122 | V类氨基转移酶[4.4.1.16] |
ORF02062 | 4123和4124 | Fes组装蛋白SufD(sufD) |
ORF02063 | 4125和4126 | Fes组装ATP酶SufC(sufC) |
ORF02064 | 4127和4138 | Fes组装蛋白SufB(sufB) |
ORF02065 | 4129和4130 | Fes组装支架SufA(sufA) |
ORF02066 | 4131和4132 | 未命名的蛋白质产物 |
ORF02067 | 4133和4134 | 推定的未表征的结构域1 |
ORF02068 | 4135和4136 | 推定的氧化还原酶,结合FAD |
ORF02069 | 4137和4138 | 假拟的UPF0118蛋白ydiK |
ORF02070 | 4139和4140 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02071 | 4141和4142 | 转运系统通透酶蛋白同源物lin2340 |
ORF02072 | 4143和4144 | 假拟的转运蛋白ydiN |
ORF02073 | 4145和4146 | 莽草酸5-脱氢酶[1.1.1.-] |
ORF02074 | 4147和4148 | I型3-脱氢奎尼酸脱水酶,(aroD)[4.2.1.10] |
ORF02075 | 4149和4150 | 推定的乙酰-CoA-转移酶亚基[2.8.3.-] |
ORF02076 | 4151和4152 | 推定的酰基-CoA脱氢酶家族蛋白[1.3.99.-] |
ORF02077 | 4153和4154 | 假拟的转录调节物ydiP |
ORF02078 | 4155和4156 | FixA蛋白 |
ORF02079 | 4157和4158 | 电子转移黄素蛋白,α亚基,推定 |
ORF02080 | 4159和4160 | 黄素蛋白,可能用于电子传递[1.5.5.-] |
ORF02081 | 4161和4162 | 铁氧还蛋白样蛋白ydiT |
ORF02082 | 4163和4164 | 推定的底物-CoA连接酶[6.2.1.-] |
ORF02083 | 4165和4166 | 磷酸烯醇式丙酮酸合酶(ppsA)[2.7.9.2] |
ORF02084 | 4167和4168 | 假拟UPF0085蛋白ydiA |
ORF02085 | 4169和4170 | 磷酸-2-脱氢-3-脱氧庚酮酸醛缩酶[2.5.1.54] |
ORF02086 | 4171和4172 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02087 | 4173和4174 | 假拟UPF0061蛋白ydiU(AP001520) |
ORF02088 | 4175和4176 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02089 | 4177和4178 | 脂蛋白(ORF) |
ORF02090 | 4179和4180 | 维生素B12转运ATP结合蛋白btuD(维生素B12-转运ATP酶)[3.6.3.33] |
ORF02091 | 4181和4182 | 谷胱甘肽过氧化物酶 |
ORF02092 | 4183和4184 | 维生素B12转运系统通透酶蛋白btuC(膜) |
ORF02093 | 4185和4186 | 整合宿主因子,α亚基(ihfA) |
ORF02094 | 4187和4188 | 苯丙氨酰基-tRNA合成酶,β亚基(pheT)[6.1.1.20] |
ORF02095 | 4189和4190 | 苯丙氨酰基-tRNA合成酶,α亚基(pheS)[6.1.1.20] |
ORF02096 | 4191和4192 | 核糖体蛋白L20(rplT) |
ORF02097 | 4193和4194 | 核糖体蛋白L35(rpml) |
ORF02098 | 4195和4196 | 翻译启动因子IF-3(infC) |
ORF02099 | 4197和4198 | 苏氨酰-tRNA合成酶(thrS)[6.1.1.3] |
ORF02100 | 4199和4200 | InsAB′蛋白 |
ORF02101 | 4201和4202 | InsA蛋白 |
ORF02102 | 4203和4204 | 假拟蛋白 |
ORF02103 | 4205和4206 | 功能未知的蛋白,DUF481超家族 |
ORF02104 | 4207和4208 | pfkB(pfkB)[2.7.1.111 |
ORF02105 | 4209和4210 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02106 | 4211和4212 | 果糖胺激酶亚家族 |
ORF02107 | 4213和4214 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02108 | 4215和4216 | 蛋白vniC(YniC)[3.1.3.18] |
ORF02109 | 4217和4218 | 预测的膜结合-金属依赖性水解酶(DUF457)家族 |
ORF02110 | 4219和4220 | 钠:二羧酸同向转运蛋白家族蛋白 |
ORF02111 | 4221和4222 | 细胞分裂激活物cedA |
ORF02112 | 4223和4224 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02113 | 4225和4226 | 过氧化氢酶HPII(111)[1.11.1.6] |
ORF02114 | 4227和4228 | 未命名蛋白产物;ORF 28.5 |
ORF02115 | 4229和4230 | 6-磷酸-β-葡糖苷酶[3.2.1.86] |
ORF02116 | 4231和4232 | Cel操纵子阻抑物 |
ORF02117 | 4233和4234 | 纤维二糖、熊果苷和水扬苷的PEP依赖性磷酸转移酶酶III(PTS)[2.7.1.69) |
ORF02118 | 4235和4236 | PTR系统,纤维二糖特异性IIC组件(celR) |
ORF02119 | 4237和4238 | PTS系统,N,N′-二乙酰基壳二糖特异性IIB组件(FIIB-Chb)(N,N′-二乙酰基壳二糖 |
ORF02120 | 4239和4240 | 渗透压诱导型脂蛋白E前体 |
ORF02121 | 4241和4242 | NAD+合成酶(nadE)[6.3.1.5] |
ORF02122 | 4243和4244 | 功能未知的细菌蛋白(DUF886)超家族 |
ORF02123 | 4245和4246 | 外切核酸酶ABC亚基C同源物 |
ORF02124 | 4247和4248 | 原生质蛋白Y前体 |
ORF02125 | 4249和4250 | 保守的假拟蛋白 |
ORF02126 | 4251和4252 | 琥珀酰谷氨酸脱琥珀酰酶[3.1.-.-] |
ORF02127 | 4253和4254 | 琥珀酰精氨酸双水解酶(astB) |
ORF02128 | 4255和4256 | 琥珀酸半醛脱氢酶(EC 1.2.1.24)(NAD(+)依赖性琥珀酸半醛脱氢酶).(视黄醇) |
ORF02129 | 4257和4258 | 精氨酸N-琥珀酰转移酶β亚基(astA)[2.3.1.109] |
ORF02130 | 4259和4260 | 琥珀酰鸟氨酸转氨酶(琥珀酰鸟氨酸氨基转移酶)(ACOAT)[2.6.1.-] |
ORF0213t | 4261和4262 | 外切脱氧核糖核酸酶III(xth)[3.1.11.2] |
ORF02132 | 4263和4264 | 可能的推定的膜蛋白 |
ORF02133 | 4265和4266 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02134 | 4267和4268 | DedA家族 |
ORF02135 | 4269和4270 | 截短的IS110家族转座酶,推定 |
ORF02136 | 4271和4272 | 蛋白ynjB |
ORF02137 | 4273和4274 | 假拟的ABC转运蛋白通透酶蛋白yNjC |
ORF02138 | 4275和4276 | 内膜蛋白MalK(P-1oop) |
ORF02139 | 4277和4278 | 2.8.1.1 1[2.8.1.1] |
ORF02140 | 4279和4280 | 磷脂酰甘油磷酸合酶 |
ORF02141 | 4281和4282 | 功能未知的蛋白质(DUF1496)超家族 |
ORF02142 | 4283和4284 | mutT2[3.6.1.-] |
ORF02143 | 4285和4286 | NADP-特异性谷氨酸脱氢酶(NADP-GDH)[1.1.4] |
ORF02144 | 4287和4288 | DNA拓扑异构酶III |
ORF02145 | 4289和4290 | 硒化物,水二激酶(selD)[2.7.9.3] |
ORF02146 | 4291和4292 | 蛋白ydjA |
ORF02147 | 4293和4294 | 假拟蛋白 |
ORF02148 | 4295和4296 | 信号肽肽酶SppA,67K型(sppA)[3.4.-.-] |
ORF02149 | 4297和4298 | L-天冬酰胺酶(ansA) [3.5.1.1] |
ORF02150 | 4299和4300 | 吡嗪酰胺酶-烟酰胺酶(PZASE)[3.5.1.-] |
ORF02151 | 4301和4302 | 推定转运蛋白 |
ORF02152 | 4303和4304 | 类似于转录调节物DeoR家族 |
ORF02153 | 4305和4306 | 醛酮还原酶Atu3 877 (ggsp69)[1.-.-.-] |
ORF02154 | 4307和4308 | 推定的激酶 |
ORF02155 | 4309和4310 | 果糖-塔格糖二磷酸醛缩酶[4.1.2.-] |
ORF02156 | 4311和4312 | 山梨糖醇脱氢酶(EC 1.1.1.14) (L-艾杜醇2-脱氢酶),(山梨糖醇)[1.1.1.14] |
ORF02157 | 4313和4314 | 膜转运蛋白D1。 |
ORF02158 | 4315和4316 | 推定的山梨糖醇脱氢酶[1.1.1.-] |
ORF02159 | 4317和4318 | 功能未知的蛋白质(DUF1315)超家族 |
ORF02160 | 4319和4320 | 甲硫氨酸-R-亚砜原酶(msrB)[1.8.4.6] |
ORF02161 | 4321和4322 | 甘油醛-3-磷酸脱氢酶,I型(gap)[1.2.1.-] |
ORF02162 | 4323和4324 | 转糖酶(片段) |
ORF02163 | 4325和4326 | 吗啡6-脱氢酶(EC 1.1.1.218)(纳洛酮还原酶),(PA0804)[1.1.1.-] |
ORF02164 | 4327和4328 | MltA-相互作用蛋白前体 |
ORF02165 | 4329和4330 | 假拟蛋白 |
ORF02166 | 4331和4332 | 蛋白激酶 |
ORF02167 | 4333和4334 | 假拟UPF0229蛋白yeaH |
ORF02168 | 4335和4336 | GGDEF结构域蛋白 |
ORF02169 | 4337和4338 | GGDEF结构域蛋白 |
ORF02170 | 4339和4340 | 未命名蛋白产物 |
ORF02171 | 4341和4342 | 转录调节物araC家族 |
ORF02172 | 4343和4344 | 功能未知的蛋白质(DUF441)超家族 |
ORF02173 | 4345和4346 | 氰酸MFS转运蛋白(通透酶) |
ORF02174 | 4347和4348 | 功能未知的蛋白,DUF488超家族 |
ORF02175 | 4349和4350 | 溶血素VCA0594 |
ORF02176 | 4351和4352 | GGDEF结构域蛋白 |
ORF02177 | 4353和4354 | 假拟蛋白 |
ORF02178 | 4355和4356 | 糖基转移酶结合蛋白 |
ORF02179 | 4357和4358 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02180 | 4359和4360 | 推定的亚碲酸抗性蛋白TehB |
ORF02181 | 4361和4362 | 假拟蛋白 |
ORF02182 | 4363和4364 | 转运蛋白,LvsE家族超家族 |
ORF02183 | 4365和4366 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02184 | 4367和4368 | 酒石酸脱氢酶(3-1PM-DH)[1.1.1.93] |
ORF02185 | 4369和4370 | 核糖核酸酶D(rnd)[3.1.26.3] |
ORF02186 | 4371和4372 | 长链脂肪酸-CoA连接酶 |
ORF02187 | 4373和4374 | 外膜脂蛋白 |
ORF02188 | 4375和4376 | 假拟的M22肽酶同源物yeaZ[3.4.24.57] |
ORF02189 | 4377和4378 | 未命名蛋白产物 |
ORF02190 | 4379和4380 | 内切核糖核酸酶L-PSP超家族 |
ORF02191 | 4381和4382 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02192 | 4383和4384 | 假拟UPF0181蛋白yoaH相关蛋白 |
ORF02193 | 4385和4386 | 对氨基苯甲酸合酶组件I [6.3.5.8] |
ORF02194 | 4387和4388 | MutT-家族蛋白 |
ORF02195 | 4389和4390 | L-丝氨酸氨-裂合酶(sdaA)[4.3.1.17] |
ORF02196 | 4391和4392 | EAL结构域蛋白 |
ORF02197 | 4393和4394 | 可能的Mg+2-Co+2-重金属外流泵的CorC-HlyC家族 |
ORF02198 | 4395和4396 | PTS酶IIAB,甘露糖特异性(EIII-MAN) |
ORF02199 | 4397和4398 | PTS系统,甘露糖特异性IIC组件 |
ORF02200 | 4399和4400 | PTS系统,甘露糖特异性IID组件 |
ORF02201 | 4401和4402 | 假拟UPF0266蛋白yobD |
ORF02202 | 4403和4404 | 功能未知的DUF家族的结构域 |
ORF02203 | 4405和4406 | 推定的23S rRNA mlG745甲基转移酶[2.1.1.51] |
ORF02204 | 4407和4408 | 冷激样蛋白cspE |
ORF02205 | 4409和4410 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02206 | 4411和4412 | 推定的脂蛋白 |
ORF02207 | 4413和4414 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02208 | 4415和4416 | 转录调节物kdgR |
ORF02209 | 4417和4418 | 多药耐药蛋白B |
ORF02210 | 4419和4420 | 热激蛋白,完整的膜蛋白(htpX)[3.4.24.-] |
ORF02211 | 4421和4422 | 尾特异性蛋白酶前体[3.4.21.102] |
ORF02212 | 4423和4424 | 青霉素-结合蛋白3羧基末端蛋白酶 |
ORF02213 | 4425和4426 | Prop效应蛋白 |
ORF02214 | 4427和4428 | GAF结构域蛋白 |
ORF02215 | 4429和4430 | PqiA蛋白 |
ORF02216 | 4431和4432 | PqiA蛋白 |
ORF02217 | 4433和4434 | mce相关蛋白家族 |
ORF02218 | 4435和4436 | Sun-核仁蛋白家族蛋白 |
ORF02219 | 4437和4438 | 功能未知的蛋白质(DUF1480)超家族 |
ORF02220 | 4439和4440 | 功能未知的蛋白质(DUF1482)家族 |
ORF02221 | 4441和4442 | 丝氨酸-苏氨酸蛋白磷酸酶1 |
ORF02222 | 4443和4444 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02223 | 4445和4446 | 未命名蛋白产物 |
ORF02224 | 4447和4448 | 推定的铜抗性蛋白D家族 |
ORF02225 | 4449和4450 | 蛋白yobA前体 |
ORF02226 | 4451和4452 | DNA聚合酶III,θ亚基[2.7.7.7] |
ORF02227 | 4453和4454 | 水解酶,碳-氮家族 |
ORF02228 | 4455和4456 | DNA聚合酶III,α亚基,革兰阳性,推定 |
ORF02229 | 4457和4458 | 蛋白酶II(AB004795)[3.4.21.83] |
ORF02230 | 445 9和4460 | 未鉴定的阅读框 |
ORF02231 | 4461和4462 | 未命名蛋白产物;类似于大肠杆菌的脂蛋白YebF前体 |
ORF02232 | 4463和4464 | 假拟蛋白 |
ORF02233 | 4465和4466 | SOS调节子中的DNA损伤-诱导基因,取决于环化AMP和H-NS |
ORF02234 | 4467和4468 | 磷酸核糖基甘氨酰胺甲酰基转移酶2 (purT)[2.1.2.-] |
ORF02235 | 4469和4470 | 2-脱氢-3-脱氧磷酸葡糖酸醛缩酶-4-羟基-2-酮戊二酸醛缩酶(eda)[4.1 3.16] |
ORF02236 | 4471和4472 | 磷酸葡糖酸脱水酶(edd)[4.2.1.12] |
ORF02237 | 4473和4474 | 葡萄糖-6-磷酸1-脱氢酶(zwf)[1.1.1.49] |
ORF02238 | 4475和4476 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02239 | 4477和4478 | Hex调节子阻抑物 |
ORF02240 | 4479和4480 | 丙酮酸激酶(pyk)[2.7.1.40] |
ORF02241 | 4481和4482 | 脂质A生物合成(KDO)2-(月桂酰)-脂质IVA酰基转移酶(msbB)[2.3.1.-] |
ORF02242 | 4483和4484 | 细胞包膜 |
ORF02243 | 4485和4486 | 高亲和摄锌系统蛋白znuA前体(AE005408) |
ORF02244 | 4487和4488 | ABC超家族高亲和Zn转运蛋白(atp结合) |
ORF02245 | 4489和4490 | 高亲和摄锌系统膜蛋白znuB(atp结合) |
ORF02246 | 4491和4492 | Holliday连接DNA解旋酶RuvB (ruvB) |
ORF02247 | 4493和4494 | Holliday连接DNA解旋酶RuvA (ruvA) |
ORF02248 | 4495和4496 | 功能未知的蛋白质(DUF1105)超家族 |
ORF02249 | 4497和4498 | 交叉连接内切脱氧核糖核酸酶RuvC (ruvC)[3.1.22.4] |
ORF02250 | 4499和4500 | 保守性假拟蛋白TIGR01 033 |
ORF02251 | 4501和4502 | dATP焦磷酸水解酶 |
ORF02252 | 4503和4504 | 天冬氨酰-tRNA合成酶(aspS)[6.1.1.12] |
ORF02253 | 4505和4506 | 假拟异分支酸酶家族蛋白yecD |
ORF02254 | 4507和4508 | 功能未知的蛋白质超家族 |
ORF02255 | 4509和4510 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02256 | 4511和4512 | 推定的甲基转移酶 |
ORF02257 | 4513和4514 | 推定的甲基转移酶 |
ORF02258 | 4515和4516 | 三甲基胺-N-氧化物还原酶2前体 |
ORF02259 | 4517和4518 | 细胞色素c-型蛋白torY |
ORF02260 | 4519和4520 | 铜内稳态蛋白VC0730 |
ORF02261 | 4521和4522 | 蛋白yecM |
ORF02262 | 4523和4524 | 精氨酰-tRNA合成酶(argS) [6.1.1.19] |
ORF02263 | 4525和4526 | 鞭毛蛋白flhE前体 |
ORF02264 | 4527和4528 | 鞭毛生物合成蛋白FlhA(flhA) |
ORF02265 | 4529和4530 | 鞭毛生物合成蛋白FlhB(flhB) |
ORF02266 | 4531和4532 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02267 | 4533和4534 | 趋化性蛋白cheZ |
ORF02268 | 4535和4536 | 趋化性蛋白cheY |
ORF02269 | 4537和4538 | 趋化性反应调节蛋白-谷氨酸甲基酯酶(EC 3.1.1.61)[3.1.1.61] |
ORF02270 | 4539和4540 | 趋化性蛋白甲基转移酶[2.1.1.80] |
ORF02271 | 4541和4542 | 接受甲基的趋化性蛋白IV,肽传感蛋白受体 |
ORF02272 | 4543和4544 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02273 | 4545和4546 | 接受甲基的趋化性蛋白II |
ORF02274 | 4547和4548 | 趋化性蛋白cheW |
ORF02275 | 4549和4550 | 趋化性蛋白cheA |
ORF02276 | 4551和4552 | 趋化性motB蛋白 |
ORF02277 | 4553和4554 | 趋化性motA蛋白 |
ORF02278 | 4555和4556 | 鞭毛转录激活蛋白flhC |
ORF02279 | 4557和4558 | 鞭毛生物合成调节蛋白,对2类操纵子起作用;转录启动因子 |
ORF02280 | 4559和4560 | 通用应激蛋白C (UspA) |
ORF02281 | 4561和4562 | α,α-海藻糖-磷酸合酶[UDP-形成](otsA)[2.4.1.15] |
ORF02282 | 4563和4564 | 海藻糖-磷酸酶(otsB)[3.1.3.12] |
ORF02283 | 4565和4566 | L-阿拉伯糖转运系统通透酶蛋白araH |
ORF02284 | 4567和4568 | L-阿拉伯糖转运性ATP结合蛋白araG |
ORF02285 | 4569和4570 | L-阿拉伯糖-结合性周质蛋白前体(PBP) |
ORF02286 | 4571和4572 | 铁蛋白样蛋白2 |
ORF02287 | 4573和4574 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02288 | 4575和4576 | 推定的脂蛋白 |
ORF02289 | 4577和4578 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02290 | 4579和4580 | 胞质铁蛋白(储铁蛋白) |
ORF02291 | 4581和4582 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02292 | 4583和4584 | 酪氨酸-特异性转运蛋白 |
ORF02293 | 4585和4586 | 前蛋白转位酶,SecA亚基 |
ORF02294 | 4587和4588 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02295 | 4589和4590 | Fels-2原噬菌体:类似于E的逆转录子(retron) |
ORF02296 | 4591和4592 | ParA |
ORF02297 | 4593和4594 | Sb32 |
ORF02298 | 4595和4596 | 假拟蛋白 |
ORF02299 | 4597和4598 | 噬菌体门蛋白,PBSX家族 |
ORF02300 | 4599和4600 | 推定的末端酶ATP酶亚基(gpP样) |
ORF02301 | 4601和4602 | 噬菌体衣壳支架蛋白(GPO) |
ORF02302 | 4603和4604 | 噬菌体主要衣壳蛋白,P2家族 |
ORF02303 | 4605和4606 | 噬菌体小末端酶亚基 |
ORF02304 | 4607和4608 | 头完成-稳定蛋白L |
ORF02305 | 4609和4610 | 噬菌体尾蛋白X |
ORF02306 | 4611和4612 | Bbp2 |
ORF02307 | 4613和4614 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02308 | 4615和4616 | 噬菌体尾完成蛋白R |
ORF02309 | 4617和4618 | Fels-2原噬菌体:类似于用于完成的gpS |
ORF02310 | 4619和4620 | 基板装配蛋白V(gpV) |
ORF02311 | 4621和4622 | 噬菌体基板装配蛋白W(gpW) |
ORF02312 | 4623和4624 | 基板J样蛋白 |
ORF02313 | 4625和4626 | gpl(gpl) |
ORF02314 | 4627和4628 | gpH(gpH) |
ORF02315 | 4629和4630 | gpU引发(gpG) |
ORF02316 | 4631和4632 | CDP-二酰甘油--甘油-3-磷酸3-磷脂酰转移酶(pgsA) |
ORF02317 | 4633和4634 | 外切核酸酶ABC,C亚基(uvrC) |
ORF02318 | 4635和4636 | 反应调节蛋白 |
ORF02319 | 4637和4638 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02320 | 4639和4640 | 调节蛋白sdiA |
ORF02321 | 4641和4642 | 氨基酸ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白 |
ORF02322 | 4643和4644 | 氨基酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白(通透酶) |
ORF02323 | 4645和4646 | 4.4.1.15[3.5.99.7] |
ORF02324 | 4647和4648 | 半胱氨酸-结合性周质蛋白前体 |
ORF02325 | 4649和4650 | FliZ蛋白 |
ORF02326 | 4651和4652 | 转录启动因子替代物σ因子28(o) |
ORF02327 | 4653和4654 | FliC |
ORF02328 | 4655和4656 | 鞭毛钩形鞘-结合蛋白2(HAP2) |
ORF02329 | 4657和4658 | 鞭毛蛋白FliS(fliS) |
ORF02330 | 4659和4660 | 鞭毛蛋白FliT |
ORF02331 | 4661和4662 | 胞质α-淀粉酶[3.2.1.1] |
ORF02332 | 4663和4664 | 假拟脂蛋白vedD前体 |
ORF02333 | 4665和4666 | YeeE-YedE家族蛋白家族 |
ORF02334 | 4667和4668 | 假拟UPF0033蛋白yedF相关蛋白 |
ORF02335 | 4669和4670 | 未表征的ACR,COG2135超家族 |
ORF02336 | 4671和4672 | 外膜孔蛋白nmpC前体 |
ORF02337 | 4673和4674 | 假拟转录调节物ybcM |
ORF02338 | 4675和4676 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02339 | 4677和4678 | EmrE蛋白 |
ORF02340 | 4679和4680 | 鞭毛钩形鞘-基体复合物蛋白(FliE)(fliE) |
ORF02341 | 4681和4682 | 鞭毛M-环蛋白FliF(fliF) |
ORF02342 | 4683和4684 | 鞭毛动力蛋白开关蛋白FliG(fliG) |
ORF02343 | 4685和4686 | 鞭毛装配蛋白FliH(flH) |
ORF02344 | 4687和4688 | 鞭毛特异性ATP合酶 |
ORF02345 | 4689和4690 | 鞭毛输出蛋白F1iJ(fliJ) |
ORF02346 | 4691和4692 | 鞭毛钩形鞘-长度控制蛋白 |
ORF02347 | 4693和4694 | 鞭毛基体-结合蛋白FliL(fliL) |
ORF02348 | 4695和4696 | 鞭毛动力蛋白开关蛋白FliM(filM) |
ORF02349 | 4697和4698 | 鞭毛动力蛋白开关蛋白fliN |
ORF02350 | 4699和4700 | 鞭毛蛋白fliO |
ORF02351 | 4701和4702 | 隐藏原噬菌体编码的未知蛋白 |
ORF02352 | 4703和4704 | 螺旋-转角-螺旋结构域蛋白 |
ORF02353 | 4705和4706 | 稳定性决定簇 |
ORF02354 | 4707和4708 | 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933N相关蛋白 |
ORF02355 | 4709和4710 | 分裂抑制蛋白dicB |
ORF02356 | 4711和4712 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02357 | 4713和4714 | 外切脱氧核糖核酸酶VIII(35kD)[3.1.11.-] |
ORF02358 | 4715和4716 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02359 | 47t7和4718 | Sb28(AE005423) |
ORF02360 | 4719和4720 | 功能未知的蛋白质(DUF980)超家族 |
ORF02361 | 4721和4722 | 假拟蛋白 |
ORF02362 | 4723和4724 | 整合酶 |
ORF02363 | 4725和4726 | trpE2 |
ORF02364 | 4727和4728 | 推定的胞质跨膜蛋白 |
ORF02365 | 4729和4730 | 推定的ABC转运蛋白,ATP-结合性-通透酶蛋白 |
ORF02366 | 4731和4732 | EF0101 |
ORF02367 | 4733和4734 | 假拟蛋白 |
ORF02368 | 4735和4736 | 推定的AraC型调节蛋白 |
ORF02369 | 4737和4738 | 二氢酚噻唑酸合成酶 |
ORF02370 | 4739和4740 | 耶尔森菌菌素生物合成蛋白 |
ORF02371 | 4741和4742 | 耶尔森菌菌素生物合成蛋白YbtU |
ORF02372 | 4743和4744 | 耶尔森菌菌素生物合成蛋白YbtT |
ORF02373 | 4745和4746 | mbtA[6.2.1.-] |
ORF02374 | 4747和4748 | OMR家族鼠疫菌素-耶尔森菌菌素受体蛋白(IRPC) |
ORF02375 | 4749和4750 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02376 | 4751和4752 | 推定因子 |
ORF02377 | 4753和4754 | 推定因子 |
ORF02378 | 4755和4756 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02379 | 4757和4758 | 主要易化家族转运蛋白(PPII) |
ORF02380 | 4759和4760 | AMP核苷酶(amn)[3.2.2.4] |
ORF02381 | 4761和4762 | 推定的功能未知的结构域 |
ORF02382 | 4763和4764 | MelD蛋白 |
ORF02383 | 4765和4766 | 推定的酰胺酶家族蛋白 |
ORF02384 | 4767和4768 | MATE外流家族蛋白亚家族 |
ORF02385 | 4769和4770 | 推定的肽合成酶 |
ORF02386 | 4771和4772 | NosB(AF183408) |
ORF02387 | 4773和4774 | 推定的fmtA样蛋白 |
ORF02388 | 4775和4776 | 硫酯酶 |
ORF02389 | 4777和4778 | 原噬菌体P4整合酶 |
ORF02390 | 4779和4780 | 假拟蛋白 |
ORF02391 | 4781和4782 | MATE外流家族蛋白亚家族 |
ORF02392 | 4783和4784 | TubD蛋白[6.3.2.-] |
ORF02393 | 4785和4786 | BarG |
ORF02394 | 4787和4788 | NosB |
ORF02395 | 4789和4790 | AMP结合性酶结构域蛋白 |
0RF02396 | 4791和4792 | [酰基-载体-蛋白] S-丙二酰转移酶[2.3.1.39] |
ORF02397 | 4793和4794 | 推定的酰基-CoA脱氢酶 |
ORF02398 | 4795和4796 | 酰基载体蛋白 |
ORF02399 | 4797和4798 | 3-羟基酰基CoA脱氢酶(BHBD)[1.1.1.157] |
ORF02400 | 4799和4800 | JamP |
ORF02401 | 4801和4802 | 氧化还原酶,锌结合性脱氢酶家族 |
ORF02402 | 4803和4804 | 可能的DNA-结合反应调节蛋白 |
ORF02403 | 4805和4806 | EntD-Gsp-HetI-Sfp家族蛋白[2.7.8.-] |
ORF02404 | 4807和4808 | 转座酶 |
ORF02405 | 4809和4810 | ISSo2,转座酶OrfB,截短 |
ORF02406 | 4811和4812 | 蛋白erfK-srfK前体 |
ORF02407 | 4813和4814 | 烟酸-核苷酸--二甲基苯并咪唑磷酸核糖基转移酶(EC |
ORF02408 | 4815和4816 | 钴胺素5′-磷酸合酶(cobS) [2.7.8.26] |
ORF02409 | 4817和4818 | 钴胺素生物合成蛋白cobU[2.7.1.156] |
ORF02410 | 4819和4820 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02411 | 4821和4822 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02412 | 4823和4824 | 推定的TonB依赖性受体 |
ORF02413 | 4825和4826 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02414 | 4827和4828 | Z1204蛋白 |
ORF02415 | 4829和4830 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02416 | 4831和4832 | 葡糖胺基转移酶 |
ORF02417 | 4833和4834 | 糖磷酸核苷酸转移酶 |
ORF02418 | 4835和4836 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02419 | 4837和4838 | 宿主特异性蛋白J,截短,推定 |
ORF02420 | 4839和4840 | 宿主特异性蛋白(部分) |
ORF02421 | 4841和4842 | 宿主特异性蛋白(部分) |
ORF02422 | 4843和4844 | 末端酶小亚基(GP1) (片段) |
ORF02423 | 4845和4846 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02424 | 4847和4848 | 原噬菌体内编码的部分tonB样膜蛋白 |
ORF02425 | 4849和4850 | 假拟蛋白 |
ORF02426 | 4851和4852 | λ原噬菌体的Bor蛋白同源物DLP12 |
ORF02427 | 4853和4854 | 噬菌体裂解蛋白 |
ORF02428 | 4855和4856 | 脂蛋白Rz1前体相关蛋白 |
ORF02429 | 4857和4858 | 假拟蛋白 |
ORF02430 | 4859和4860 | 溶酶体(裂解蛋白)(胞壁酸酶)(内溶素)(溶酶体)[3.2.1.17] |
ORF02431 | 4861和4862 | 裂解蛋白S.b1556 |
ORF02432 | 4863和4864 | 假拟蛋白 |
ORF02433 | 4865和4866 | 外膜孔蛋白nmpC前体(Ibc) |
ORF02434 | 4867和4868 | λ原噬菌体的抗终止蛋白O同源物 |
ORF02435 | 4869和4870 | 内切脱氧核糖核酸酶RUS(Hollidav连接解离酶) |
ORF02436 | 4871和4872 | 蛋白ninE相关蛋白 |
ORF02437 | 4873和4874 | 噬菌体N-6-腺嘌呤-甲基转移酶[2.1.1.72] |
ORF02438 | 4875和4876 | 蛋白ninB |
ORF02439 | 4877和4878 | 复制蛋白P |
ORF02440 | 4879和4880 | 转座酶 |
ORF02441 | 4881和4882 | ECs1339 |
ORF02442 | 4883和4884 | 核糖激酶 |
ORF02443 | 4885和4886 | 功能未知的蛋白质(DUF1355)超家族 |
ORF02444 | 4887和4888 | 推定膜蛋白 |
ORF02445 | 4889和4890 | 推定的磷酸三酯酶(PTE)[3.1.8.1] |
ORF02446 | 4891和4892 | γ-谷氨酰转肽酶 |
ORF02447 | 4893和4894 | γ-谷氨酰转肽酶 |
ORF02448 | 4895和4896 | ST55蛋白 |
ORF02449 | 4897和4898 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02450 | 4899和4900 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02451 | 4901和4902 | ISBma3,转座酶,截短 |
ORF02452 | 4903和4904 | 原噬菌体CP4-57调节蛋白(AIpA)家族 |
ORF02453 | 4905和4906 | 假拟蛋白 |
ORF02454 | 4907和4908 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02455 | 4909和4910 | 假拟蛋白 |
ORF02456 | 4911和4912 | 插入序列ATP-结合蛋白 |
ORF02457 | 4913和4914 | 转座酶 |
ORF02458 | 4915和4916 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02459 | 4917和4918 | 铁-肠菌素-转运蛋白(111) |
ORF02460 | 4919和4920 | ABC转运蛋白通透酶STY0802(FecCD家族) |
ORF02461 | 4921和4922 | 周质结合蛋白(111) |
ORF02462 | 4923和4924 | TonB依赖性受体 |
ORF02463 | 4925和4926 | YeeP蛋白 |
ORF02464 | 4927和4928 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02465 | 4929和4930 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02466 | 4931和4932 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02467 | 4933和4934 | Patatin样磷脂酶家族 |
ORF02468 | 4935和4936 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02469 | 4937和4938 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02470 | 4939和4940 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02471 | 4941和4942 | Z1215蛋白(0273) |
ORF02472 | 4943和4944 | 抗限制性蛋白家族 |
ORF02473 | 4945和4946 | YeeS蛋白(o160) |
ORF02474 | 4947和4948 | 功能未知的蛋白质(DUF987)超家族 |
ORF02475 | 4949和4950 | YeeU蛋白 |
ORF02476 | 4951和4952 | L0007样蛋白 |
ORF02477 | 4953和4954 | YeeW蛋白 |
ORF02478 | 4955和4956 | 功能未知的蛋白质(DUF496)超家族 |
ORF02479 | 4957和4958 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02480 | 4959和4960 | DNA促旋酶抑制蛋白 |
ORF02481 | 4961和4962 | 青霉素-结合蛋白6B前体(PBP) |
ORF02482 | 4963和4964 | 青霉素结合蛋白6b |
ORF02483 | 4965和4966 | 外切脱氧核糖核酸酶I |
ORF02484 | 4967和4968 | 氨基酸通透酶 |
ORF02485 | 4969和4970 | 转录调节物,LysR家族 |
ORF02486 | 4971和4972 | 蛋白yeeZ前体 |
ORF02487 | 4973和4974 | 成瘾模块毒素,Txe-YoeB家族 |
ORF02488 | 4975和4976 | yefM蛋白 |
ORF02489 | 4977和4978 | ATP磷酸核糖基转移酶(h isG)[2.4.2.17] |
ORF02490 | 4979和4980 | 组氨醇脱氢酶(hisD)[1.1.1.23] |
ORF02491 | 4981和4982 | 组氨醇-磷酸氨基转移酶(hisC)[2.6.1.9] |
ORF02492 | 4983和4984 | 组氨酸生物合成双功能蛋白hisB |
ORF02493 | 4985和4986 | 咪唑甘油磷酸合酶亚基hisH(IGP合酶谷胺酰胺酰胺基转移酶亚基)(IGP合酶亚 |
ORF02494 | 4987和4988 | 咪唑甘油磷酸合酶,谷胺酰胺酰胺基转移酶亚基(hisH)[2.4.2.-] |
ORF02495 | 4989和4990 | 磷酸核糖基亚胺甲基-5-氨基咪唑羧酰胺核醣酸异构酶(hisA)[5.3.1.16] |
ORF02496 | 4991和4992 | 咪唑甘油磷酸合酶,环化酶亚基(hisF) |
ORF02497 | 4993和4994 | 组氨酸生物合成双功能蛋白hislE[包括:磷酸核糖基-AMP环式水解酶 |
ORF02498 | 4995和4996 | 链长决定簇蛋白 |
ORF02499 | 4997和4998 | UDP-葡萄糖6-脱氢酶(UDPGDH)[1.1.1.22] |
ORF02500 | 4999和5000 | 6-磷酸葡糖酸脱氢酶,脱羧性(gnd)[1.1.1.44] |
ORF02501 | 5001和5002 | WbnE[2.4.1.-] |
ORF02502 | 5003和5004 | 推定的糖基转移酶[2.4.1.-] |
ORF02503 | 5005和5006 | 糖基转移酶CpsO |
ORF02504 | 5007和5008 | 鼠李糖基转移酶Cps6bS |
ORF02505 | 5009和5010 | O-抗原修饰蛋白 |
ORF02506 | 5011和5012 | rfbX蛋白 |
ORF02507 | 5013和5014 | dTDP-4-脱氢鼠李糖3,5-差向异构酶(rfbC)[5.1.3.13] |
ORF02508 | 5015和5016 | 葡萄糖-1-磷酸胸苷酰转移酶(rfbA)[2.7.7.24] |
ORF02509 | 5017和5018 | dTDP-4-脱氢鼠李糖还原酶(rfbD)[1.1.1.133] |
ORF02510 | 5019和5020 | dTDP-葡萄糖4,6-脱水酶(rfb B) [4.2.1.46] |
ORF02511 | 5021和5022 | 调节蛋白GalF(galF) |
ORF02512 | 5023和5024 | 肠菌酸生物合成蛋白wcaM |
ORF02513 | 5025和5026 | Amylovoran生物合成糖基转移酶amsK[2.-.-.-] |
ORF02514 | 5027和5028 | 肠菌酸生物合成蛋白wcaK [2.-.-.-] |
ORF02515 | 5029和5030 | 脂多糖生物合成蛋白wzxC |
ORF02516 | 5031和5032 | 糖基转移酶(WcaJ)[2.7.-.-] |
ORF02517 | 5033和5034 | 磷酸甘露糖变位酶 |
ORF02518 | 5035和5036 | 甘露糖-1-磷酸鸟苷酰转移酶-甘露糖-6-磷酸异构酶 |
ORF02519 | 5037和5038 | 推定的脂多糖生物合成蛋白 |
ORF02520 | 5039和5040 | GDP-甘露糖甘露糖基水解酶[3.6.1.-] |
ORF02521 | 5041和5042 | GDP-岩藻糖合成酶A链(GER1)[1.1.1.271] |
ORF02522 | 5043和5044 | GDP-甘露糖4,6-脱水酶(gmd)[4.2.1.47] |
ORF02523 | 5045和5046 | 推定的乙酰基转移酶,CysE-LacA-LpxA-NodL家族[2.3.1.-] |
ORF02524 | 5047和5048 | 糖基转移酶,2类家族蛋白,推定 |
ORF02525 | 5049和5050 | 推定肠菌酸聚合酶 |
ORF02526 | 5051和5052 | 可能的糖基转移酶 |
ORF02527 | 5053和5054 | 丝氨酸乙酰基转移酶[2.3.1.-] |
ORF02528 | 5055和5056 | 可能的糖基转移酶 |
ORF02529 | 5057和5058 | 酪氨酸-蛋白激酶wzc |
ORF02530 | 5059和5060 | 低分子量蛋白-酪氨酸-磷酸酶wzb[3.1.3.48] |
ORF02531 | 5061和5062 | 膜蛋白 |
ORF02532 | 5063和5064 | 推定转运蛋白 |
ORF02533 | 5065和5066 | 未命名蛋白产物 |
ORF02534 | 5067和5068 | PHIKZ114 |
ORF02535 | 5069和5070 | 蛋白asmA前体 |
ORF02536 | 5071和5072 | 脱氧胞嘧啶三磷酸脱氨酶(dcd)[3.5.4.13] |
ORF02537 | 5073和5074 | 尿苷激酶(udk)[2.7.1.48] |
ORF02538 | 5075和5076 | MASE1结构域家族 |
ORF02539 | 5077和5078 | 推定的Ada调节蛋白[3.2,2.21] |
ORF02540 | 5079和5080 | 假拟蛋白 |
ORF02541 | 5081和5082 | 分子侣伴蛋白 |
ORF02542 | 5083和5084 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02543 | 5085和5086 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02544 | 5087和5088 | yon Willebrand因子A型结构域蛋白 |
ORF02545 | 5089和5090 | 推定的膜蛋白 |
ORF02546 | 5091和5092 | AcrB-AcrD-AcrF(HAE 1) |
ORF02547 | 5093和5094 | AcrB-AcrD-AcrF家族膜蛋白 |
ORF02548 | 5095和5096 | MFS超家族药物外流泵 |
ORF02549 | 5097和5098 | 推定的传感蛋白组氨酸激酶SrrB[2.7.3.-] |
ORF02550 | 5099和5100 | 转录调节蛋白baeR (ResD) |
ORF02551 | 5101和5102 | 功能未知的结构域(DUF1508)家族 |
ORF02552 | 5103和5104 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02553 | 5105和5106 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02554 | 5107和5108 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02555 | 5109和5110 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02556 | 5111和5112 | YeqQ[3.4.-.-] |
ORF02557 | 5113和5114 | 保守性假拟蛋白TIGR00147 |
ORF02558 | 5115和5116 | 半乳糖醇利用操纵子阻抑物(片段) |
ORF02559 | 5117和5118 | 己糖醇脱氢酶[1.1.1.251] |
ORF02560 | 5119和5120 | PTS系统,山梨糖醇特异性IIC组件(EIIC-GAT) |
ORF02561 | 5121和5122 | PTS系统,半乳糖醇特异性IIB组件(EIIB-Gat)(乳糖醇(galacticol)-通透酶IIB组 |
ORF02562 | 5123和5124 | PTS系统,半乳糖醇特异性IIA组件(EIIA-Gat) (乳糖醇(galactico1)-通透酶IIA组件) |
ORF02563 | 5125和5126 | 推定的塔格糖6-磷酸激酶蛋白[2.7.1.144] |
ORF02564 | 5127和5128 | II类醛缩酶,塔格糖二磷酸家族[4.1.2.-] |
ORF02565 | 5129和5130 | 脱水蛋白[4.1.2.13] |
ORF02566 | 5131和5132 | 推定的核苷通透酶NupG |
ORF02567 | 5133和5134 | 推定的ADP-核糖基糖水解酶 |
ORF02568 | 5135和5136 | 推定的转录调节物,GntR家族 |
ORF02569 | 5137和5138 | 核糖激酶(EC 2.7.1.151。[2.7.1.15] |
ORF02570 | 5139和5140 | 糖基水解酶,家族25[3.2.1.17] |
ORF02571 | 5141和5142 | 磷酸甲基嘧啶激酶(thiD) [2.7.4.7] |
ORF02572 | 5143和5144 | 羟乙基噻唑激酶(thiM) [2.7.1,50] |
ORF02573 | 5145和5146 | 未表征的BCR,COG1937家族 |
ORF02574 | 5147和5148 | NirC |
ORF02575 | 5149和5150 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02576 | 5151和5152 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02577 | 5153和5154 | 假拟外膜传达蛋白yehB前体 |
ORF02578 | 5155和5156 | 假拟菌毛侣伴蛋白yehC前体 |
ORF02579 | 5157和5158 | 菌毛蛋白亚家族 |
ORF02580 | 5159和5160 | Mrp蛋白(mrp) |
ORF02581 | 5161和5162 | 甲硫氨酰基-tRNA合成酶(metG)[6.1.1.10] |
ORF02582 | 5163和5164 | 钼酸代谢调节蛋白,第二片段2(片段) |
ORF02583 | 5165和5166 | yehl(片段) |
ORF02584 | 5167和5168 | yehl(片段) |
ORF02585 | 5169和5170 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02586 | 5171和5172 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02587 | 5173和5174 | 含有VWA结构域的CoxE样蛋白家族 |
ORF02588 | 5175和5176 | yehO基因产物 |
ORF02589 | 5177和5178 | 假拟脂蛋白yehR前体 |
ORF02590 | 5179和5180 | 在细菌中保守的未表征蛋白 |
ORF02591 | 5181和5182 | 未命名蛋白产物 |
ORF02592 | 5183和5184 | 推定的2-组件传感蛋白 |
ORF02593 | 5185和5186 | MerR样调节蛋白A |
ORF02594 | 5187和5188 | 甘氨酸甜菜碱-1-脯氨酸转运系统通透酶蛋白prow (AE005444) |
ORF02595 | 5189和5190 | 推定的膜蛋白 |
ORF02596 | 5191和5192 | 氨基酸ABC转运蛋白,ATP结合蛋白(AE005444) |
ORF02597 | 5193和5194 | ABC转运蛋白,通透酶蛋白(AE005444) |
ORF02598 | 5195和5196 | 甘氨酸甜菜碱-L-脯氨酸ABC转运蛋白,周质底物-结合蛋白,推定 |
ORF02599 | 5197和5198 | yohA(STI)[3.2.1 21] |
ORF02600 | 5199和5200 | D-乳酸脱氢酶 |
ORF02601 | 5201和5202 | β-内酰胺酶 |
ORF02602 | 5203和5204 | 功能未知的蛋白质(DUF1282)超家族 |
ORF02603 | 5205和5206 | DedA家族蛋白 |
ORF02604 | 5207和5208 | yohF[1.-.-.-] |
ORF02605 | 5209和5210 | 推定的通道纤维蛋白 |
ORF02606 | 5211和5212 | 二氢尿苷合酶(Dus)超家族 |
ORF02607 | 5213和5214 | 推定的LrgA家族亚家族 |
ORF02608 | 5215和5216 | 推定的膜蛋白 |
ORF02609 | 5217和5218 | 胞嘧啶脱氨酶(cdd) [3.5.4.5] |
ORF02610 | 5219和5220 | SanA蛋白 |
ORF02611 | 5221和5222 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02612 | 5223和5224 | 谷氨酸合酶,小亚基(NADPH) |
ORF02613 | 5225和5226 | 二氢乳清酸酶脱氢酶(pyrD) |
ORF02614 | 5227和5228 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02615 | 5229和5230 | 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白(膜) |
ORF02616 | 5231和5232 | 半乳糖苷转运ATP-结合蛋白mglA(atp结合) |
ORF02617 | 5233和5234 | D-半乳糖-结合性周质蛋白前体(GBP)(D-半乳糖-D-葡萄糖结合蛋白)(GGBP) |
ORF02618 | 5235和5236 | Mgl阻抑物和半乳糖超诱导因子 |
ORF02619 | 5237和5238 | 未命名蛋白产物 |
ORF02620 | 5239和5240 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02621 | 5241和5242 | GTP环式水解酶I(folE)[3.5.4.16] |
ORF02622 | 5243和5244 | 羧基酯酶[3.1.1.-] |
ORF02623 | 5245和5246 | 大肠杆菌素I受体前体 |
ORF02624 | 5247和5248 | 赖氨酸-特异性通透酶 |
ORF02625 | 5249和5250 | 转录调节物,LysR家族 |
ORF02626 | 5251和5252 | 推定的膜蛋白 |
ORF02627 | 5253和5254 | 内切核酸酶IV(内切脱氧核糖核酸酶IV)[3.1.21.2] |
ORF02628 | 5255和5256 | yeil |
ORF02629 | 5257和5258 | 肌苷-尿苷优选核苷水解酶(AL355920) |
ORF02630 | 5259和5260 | 调节蛋白nsr |
ORF02631 | 5261和5262 | 核苷转运蛋白 |
ORF02632 | 5263和5264 | 参与色素生物合成的未表征的酶 |
ORF02633 | 5265和5266 | yeil |
ORF02634 | 5267和5268 | PTS系统,果糖特异性IIBC组件[2.7.1.69] |
ORF02635 | 5269和5270 | 1-磷酸果糖激酶(果糖1-磷酸激酶)(fruK)[2.7.1.56] |
ORF02636 | 5271和5272 | PTS系统,果糖特异性IIA-FPr组件(EIIA-Fru) (果糖-通透酶IIA-FPr组件)(磷酸转 |
ORF02637 | 5273和5274 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02638 | 5275和5276 | 糖外流转运蛋白B(orfl04) |
ORF02639 | 5277和5278 | 翻译延伸因子EF-P(EF-P) |
ORF02640 | 5279和5280 | D-甘露糖酸氧化还原酶 |
ORF02641 | 5281和5282 | CobW-P47K家族蛋白结构域蛋白 |
ORF02642 | 5283和5284 | PAP2超家族结构域蛋白 |
ORF02643 | 5285和5286 | 脂蛋白spr前体(spr) |
ORF02644 | 5287和5288 | Rtn蛋白 |
ORF02645 | 5289和5290 | ABC转运蛋白底物结合蛋白 |
ORF02646 | 5291和5292 | 肽ABC转运蛋白,通透酶蛋白 |
ORF02647 | 5293和5294 | ABC转运蛋白,通透酶蛋白 |
ORF02648 | 5295和5296 | ABC转运蛋白,核苷酸结合性-ATP酶蛋白[肽] |
ORF02649 | 5297和5298 | 未命名蛋白产物 |
ORF02650 | 5299和5300 | 双环霉素抗性蛋白 |
ORF02651 | 5301和5302 | 核糖体小亚基假尿苷合酶A |
ORF02652 | 5303和5304 | yejH |
ORF02653 | 5305和5306 | 50S核糖体蛋白L25 |
ORF02654 | 5307和5308 | 拟核-结合蛋白 |
ORF02655 | 5309和5310 | 假拟蛋白 |
ORF02656 | 53t1和5312 | 功能未知的蛋白质(DUF1414)超家族 |
ORF02657 | 5313和5314 | 预测的碱性磷酸酶超家族的水解酶 |
ORF02658 | 5315和5316 | yejO |
ORF02659 | 5317和5318 | 硝酸-亚硝酸反应调节蛋白narP |
ORF02660 | 5319和5320 | 细胞色素c型生源蛋白ccmH前体(nrfF) |
ORF02661 | 5321和5322 | 巯基:二硫键交换蛋白dsbE(细胞色素c生源蛋白ccmG)(dsbE) |
ORF02662 | 5323和5324 | 细胞色素c型生源蛋白ccmF(ccmF) |
ORF02663 | 5325和5326 | 细胞色素c型生源蛋白ccmE |
ORF02664 | 5327和5328 | 血红素输出蛋白D (细胞色素c型生源蛋白ccmD)-相关蛋白 |
ORF02665 | 5329和5330 | 血红素输出蛋白C |
ORF02666 | 5331和5332 | 血红素输出蛋白CcmB (ccmB) |
ORF02667 | 5333和5334 | 血红素输出蛋白CcmA (ccmA) |
ORF02668 | 5335和5336 | 细胞色素c型蛋白napC |
ORF02669 | 5337和5338 | 周质硝酸还原酶,二血红素细胞色素c亚基(napB) |
ORF02670 | 5339和5340 | 铁氧还蛋白-型蛋白napH(napH) |
ORF02671 | 5341和5342 | 铁氧还蛋白-型蛋白napG(napG) |
ORF02672 | 5343和5344 | 周质硝酸还原酶,大亚基(napA)[1.7.99.4] |
ORF02673 | 5345和5346 | NapD蛋白(napD) |
ORF02674 | 5347和5348 | 铁氧还蛋白-型蛋白NapF(napF) |
ORF02675 | 5349和5350 | Ecotin |
ORF02676 | 5351和5352 | 苹果酸:醌-氧化还原酶(mqo)[1.1.99.16] |
ORF02677 | 5353和5354 | 假拟蛋白 |
ORF02678 | 5355和5356 | MdlB蛋白 |
ORF02679 | 5357和5358 | 烷基化的DNA修复蛋白alkB(alkB) |
ORF02680 | 5359和5360 | O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶;转录激活物-阻抑物 |
ORF02681 | 5361和5362 | 推定的硫胺生物合成脂蛋白ApbE |
ORF02682 | 5363和5364 | 外膜蛋白C前体(孔蛋白ompC)(外膜蛋白1B)(Ibc) |
ORF02683 | 5365和5366 | YoiQ[2.7.3.-] |
ORF02684 | 5367和5368 | 肠菌酸荚膜生物合成的阳性反应调节物 |
ORF02685 | 5369和5370 | 传感蛋白rcsC |
ORF02686 | 5371和5372 | 传感蛋白atoS |
ORF02687 | 5373和5374 | 乙酰乙酸代谢调节蛋白atoC(atoC) |
ORF02688 | 5375和5376 | 乙酸CoA-转移酶α亚基[2.8.3.8] |
ORF02689 | 5377和5378 | 乙酸CoA-转移酶β亚基(atoA)[2.8.3.8] |
ORF02690 | 5379和5380 | 推定的膜蛋白 |
ORF02691 | 5381和5382 | 乙酰-CoA乙酰基转移酶(atoB)[2.3.1.9] |
ORF02692 | 5383和5384 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02693 | 5385和5386 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02694 | 5387和5388 | α-2-巨球蛋白家族N末端区家族 |
ORF02695 | 5389和5390 | 功能未知的蛋白质(DUF1175)超家族 |
ORF02696 | 5391和5392 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02697 | 5393和5394 | DNA促旋酶,A亚基(gyrA)[5.99.1.3] |
ORF02698 | 5395和5396 | 泛醌生物合成O-甲基转移酶(ubiG)[2.11.-] |
ORF02699 | 5397和5398 | 类似于[SwissProt登录号P45508] |
ORF02700 | 5399和5400 | 核糖核苷二磷酸还原酶1,α亚基,B1(nrdA)[1.17.4.1] |
ORF02701 | 5401和5402 | 核糖核苷二磷酸还原酶1,β亚基,B2 |
ORF0272 | 5403和5404 | 皮质铁氧还蛋白家族铁氧还蛋白 |
ORF02703 | 5405和5406 | 蛋白inaA |
ORF02704 | 5407和5408 | 甘油磷酸二酯磷酸二酯酶,周质 |
ORF02705 | 5409和5410 | 甘油-3-磷酸转运蛋白(glpT) |
ORF02706 | 5411和5412 | 推定glpD2[1.1.99.5] |
ORF02707 | 5413和5414 | 厌氧性甘油-3-磷酸脱氢酶亚基B |
ORF02708 | 5415和5416 | 厌氧性甘油-3-磷酸脱氢酶亚基C[1.1.99.5] |
ORF02709 | 5417和5418 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02710 | 5419和5420 | 转座酶 |
ORF02711 | 5421和5422 | 转座酶 |
ORF02712 | 5423和5424 | 类似于[SwissProt登录号P23522] |
ORF02713 | 5425和5426 | 主要易化家族转运蛋白 |
ORF02714 | 5427和5428 | 扁桃酸消旋酶-粘康酸内酯化酶,C末端结构域蛋白 |
ORF02715 | 5429和5430 | 推定的转录调节蛋白,lclR家族 |
ORF02716 | 5431和5432 | CinA样蛋白 |
ORF02717 | 5433和5434 | YfaZ前体超家族 |
ORF02718 | 5435和5436 | 水解酶,NUDIX家族,推定 |
ORF02719 | 5437和5438 | 铝诱导的蛋白 |
ORF02720 | 5439和5440 | 脂多糖生物合成蛋白 |
ORF02721 | 5441和5442 | 糖基转移酶arnC(Ara4N转移酶)(多粘菌素抗性蛋白pmrF)[2.-.-.-] |
ORF02722 | 5443和5444 | 甲酰基转移酶,C-末端结构域蛋白 |
ORF02723 | 5445和5446 | PbgP4蛋白 |
ORF02724 | 5447和5448 | 蜂毒肽抗性蛋白PqaB |
ORF02725 | 5449和5450 | 蔗糖-6磷酸水解酶 |
ORF02726 | 5451和5452 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02727 | 5453和5454 | 多粘菌素B抗性蛋白pmrD |
ORF02728 | 5455和5456 | O-琥珀酰苯甲酸-CoA连接酶(menE)[6.2.1.26] |
ORF02729 | 5457和5458 | O-琥珀酰苯甲酸(OSB)合成酶(menC)[4.2.1.-] |
ORF02730 | 5459和5460 | 萘甲酸合酶(menB)[4.1.3.36] |
ORF02731 | 5461和5462 | 水解酶,α-β水解酶折叠家族,推定 |
ORF02732 | 5463和5464 | 2-琥珀酰-6-羟基-2,4-环己二烯-1-羧酸合酶-2-酮戊二酸 |
ORF02733 | 5465和5466 | 甲基萘醌特异性异分支酸合酶 |
ORF02734 | 5467和5468 | ElaB蛋白 |
ORF02735 | 5469和5470 | elaA蛋白VC2565(推定) |
ORF02736 | 5471和5472 | 金属-β-内酰胺酶超家族蛋白[3.1.26.11] |
ORF02737 | 5473和5474 | yon Willebrand因子A型结构域蛋白 |
ORF02738 | 5475和5476 | 推定的氨基肽酶 |
ORF02739 | 5477和5478 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02740 | 5479和5480 | NADH脱氢酶I,N链(NUO14)[1.6.99.5] |
ORF02741 | 5481和5482 | NADH脱氢酶I,M链(NUO13][1.6.99.5] |
ORF02742 | 5483和5484 | NADH脱氢酶I,L链ECs3162(NUO12)[1.6.99.5] |
ORF02743 | 5485和5486 | NADH脱氢酶I,L链ECs3162(NUO12)[1.6.99.5] |
ORF02744 | 5487和5488 | NADH脱氢酶I,K亚基(NUO11)[1.6.5.3] |
ORF02745 | 5489和5490 | NADH-醌氧化还原酶J链(NADH脱氢酶I,J链)(NDH-1,J链)(NUO10)[1.6.99.5] |
ORF02746 | 5491和5492 | NADH脱氢酶I,I链(EC 1.6.5.3)(NADH-泛醌氧化还原酶链7)(NUO7)(片 |
ORF02747 | 5493和5494 | NADH脱氢酶I,H链(NUO8)[1.6.99.5] |
ORF02748 | 5495和5496 | NADH脱氢酶I,G链(EC 1.6.5.3)(NADH-泛醌氧化还原酶链7)(NUO7)(片 |
ORF02749 | 5497和5498 | NADH-醌氧化还原酶,F亚基(nuoF) |
ORF02750 | 5499和5500 | NADH-醌氧化还原酶,E链(NADH脱氢酶I,E链)(NDH-1,E链)(NUO5)[1.6.99.5] |
ORF02751 | 5501和5502 | NADH脱氢酶I,C-D链(NUO4)[1.6.99.5] |
ORF02752 | 5503和5504 | NADH-醌氧化还原酶,B链(NADH脱氢酶I,B链)(NDH-1,B链)(NUO2)[1.6.99.5] |
ORF02753 | 5505和5506 | NADH-醌氧化还原酶,A链(NADH脱氢酶I,A链)(NDH-1,A链)(NUO1)[1.6.99.5] |
ORF02754 | 5507和5508 | LysR家族NADH脱氢酶转录调节蛋白(RssB) |
ORF02755 | 5509和5510 | 假拟蛋白 |
ORF02756 | 5511和5512 | I和II类氨基转移酶(ASPAT)[2.6.1.-] |
ORF02757 | 5513和5514 | b2291 |
ORF02758 | 5515和5516 | 未命名蛋白产物 |
ORF02759 | 5517和5518 | 水解酶,卤代酸脱卤酶样家族[3.1.3.-] |
ORF02760 | 5519和5520 | 蛋白yfbU |
ORF02761 | 5521和5522 | 假拟UPF0208蛋白yfbV |
ORF02762 | 5523和5524 | 乙酸激酶(ackA)[2.7.2.1] |
ORF02763 | 5525和5526 | 磷酸乙酰基转移酶 |
ORF02764 | 5527和5528 | 预测的膜蛋白 |
ORF02765 | 5529和5530 | 1型IPP异构酶家族蛋白,推定[3.6.-.-] |
ORF02766 | 5531和5532 | 磷酸酯酶,推定亚家族 |
ORF02767 | 5533和5534 | 谷胱甘肽S-转移酶,N末端结构域蛋白 |
ORF02768 | 5535和5536 | 推定的谷胱甘肽S-转移酶 |
ORF02769 | 5537和5538 | 二氢新蝶呤醛缩酶(folB)[4.1.2.25] |
ORF02770 | 5539和5540 | 保守性假拟蛋白TIGR01777 |
ORF02771 | 5541和5542 | 保守性假拟蛋白亚家族 |
ORF02772 | 5543和5544 | 组氨酸转运ECs3190的ATP结合组件 |
ORF02773 | 5545和5546 | 组氨酸转运系统膜蛋白M(膜) |
ORF02774 | 5547和5548 | 氨基酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白 |
ORF02775 | 5549和5550 | 组氨酸-结合性周质蛋白前体(HBP) |
ORF02776 | 5551和5552 | 赖氨酸-精氨酸-鸟氨酸结合性周质蛋白前体(LAO-结合蛋白) |
ORF02777 | 5553和5554 | 3-八异戊二烯基-4-羟基苯甲酸羧基-裂合酶(聚异戊二烯基对羟基苯甲酸脱羧 |
ORF02778 | 5555和5556 | 酰氨基磷酸核糖基转移酶(purF)[2.4.2.14] |
ORF02779 | 5557和5558 | CvpA家族蛋白(cvpA) |
ORF02780 | 5559和5560 | DedD蛋白 |
ORF02781 | 5561和5562 | FolC双功能蛋白[6.3.2.17] |
ORF02782 | 5563和5564 | 乙酰-CoA羧化酶,羧基转移酶,β亚基(accD)[6.4.1.2] |
ORF02783 | 5565和5566 | DedA蛋白 |
ORF02784 | 5567和5568 | tRNA假尿苷合酶A(truA)[4.2.1.70] |
ORF02785 | 5569和5570 | USG-1蛋白[1.2.1.-] |
ORF02786 | 5571和5572 | 赤酮酸-4-磷酸脱氢酶[1.1.1.-] |
ORF02787 | 5573和5574 | 假拟蛋白 |
ORF02788 | 5575和5576 | Int |
ORF02789 | 5577和5578 | 调节蛋白cox |
ORF02790 | 5579和5580 | 假拟蛋白 |
ORF02791 | 5581和5582 | 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933T |
ORF02792 | 5583和5584 | 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933T |
ORF02793 | 5585和5586 | 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933T |
ORF02794 | 5587和5588 | 假拟蛋白 |
ORF02795 | 5589和5590 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02796 | 5591和5592 | 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933T |
ORF02797 | 5593和5594 | 原噬菌体编码的未知蛋白CP-933T相关蛋白 |
ORF02798 | 5595和5596 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02799 | 5597和5598 | Fels-2原噬菌体蛋白 |
ORF02800 | 5599和5600 | gpH |
ORF02801 | 5601和5602 | gpU(gpG) |
ORF02802 | 5603和5604 | GpU引发(gpG) |
ORF02803 | 5605和5606 | DNA-转化酶(pin) |
ORF02804 | 5607和5608 | Fels-2原噬菌体蛋白(gpU) |
ORF02805 | 5609和5610 | 噬菌体尾卷尺蛋白,TP901家族,推定 |
ORF02806 | 561 1和5612 | 可能的噬菌体尾蛋白相关蛋白 |
ORF02807 | 5613和5614 | 可能的尾蛋白(gpE) |
ORF02808 | 5615和5616 | 噬菌体主要尾管蛋白 |
ORF02809 | 5617和5618 | 噬菌体尾鞘蛋白 |
ORF02810 | 5619和5620 | 假拟蛋白 |
ORF02811 | 5621和5622 | 噬菌体晚期基因控制蛋白D |
ORF02812 | 5623和5624 | 假拟蛋白 |
ORF02813 | 5625和5626 | 噬菌体转录激活蛋白,Oqr-δ |
ORF02814 | 5627和5628 | 保守的假拟蛋白 |
ORF02815 | 5629和5630 | 假拟蛋白 |
ORF02816 | 5631和5632 | 假拟蛋白 |
ORF02817 | 5633和5634 | DIV蛋白(片段) |
ORF02818 | 5635和5636 | 假拟UPF0226蛋白vfcJ |
ORF02819 | 5637和5638 | 3-氧代酰基-[酰基-载体-蛋白]合酶I(β-酮酰基-ACP合酶I)(KAS I)[2.3.1.41] |
ORF02820 | 5639和5640 | 甘氨酸-D-氨基酸氧化酶(脱氨基) |
ORF02821 | 5641和5642 | 保守的假拟蛋白 |
ORF02822 | 5643和5644 | 类似于[SwissProt登录号P44255] |
ORF02823 | 5645和5646 | 预测的通透酶(ORF9) |
ORF02824 | 5647和5648 | 对青霉素不敏感的胞壁质内肽酶前体[3.4.99.-] |
ORF02825 | 5649和5650 | 分支酸合酶(aroC)[4.2,3.5] |
ORF02826 | 5651和5652 | 预测的rRNA或tRNA甲基化酶[2.1.1.72] |
ORF02827 | 5653和5654 | Smr结构域蛋白 |
ORF02828 | 5655和5656 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02829 | 5657和5658 | 小菌毛亚基StfG |
ORF02830 | 5659和5660 | 小菌毛亚基StfF |
ORF02831 | 5661和5662 | 菌毛亚基 |
ORF02832 | 5663和5664 | 周质菌毛侣伴蛋白StfD |
ORF02833 | 5665和5666 | 外膜传达蛋白StfC |
ORF02834 | 5667和5668 | 主要菌毛亚基StfA |
ORF02835 | 5669和5670 | 假拟蛋白 |
ORF02836 | 5671和5672 | 磷酸组氨酸磷酸酶SixA(sixA)[3.1.3.-] |
ORF02837 | 5673和5674 | 脂肪酸氧化复合物,α亚基FadJ(fadJ)[4.2.1.17 1.1.1.35 5.1.2.3] |
ORF02838 | 5675和5676 | 乙酰-CoA C-酰基转移酶FadI(fadI)[2.3,1.16] |
ORF02839 | 5677和5678 | 保守性假拟蛋白超家族 |
ORF02840 | 5679和5680 | 长链脂肪酸转运蛋白前体(外膜fadL蛋白)(外膜flp蛋白) |
ORF02841 | 5681和5682 | VACJ脂蛋白前体(vacJ) |
ORF02842 | 5683和5684 | 可能的转运yfdC |
ORF02843 | 5685和5686 | 推定的原噬菌体整合酶 |
ORF02844 | 5687和5688 | 假拟蛋白 |
ORF02845 | 5689和5690 | 内-α-唾液酸酶[3.2.1.129] |
ORF02846 | 5691和5692 | 假拟蛋白 |
ORF02847 | 5693和5694 | 内-α-唾液酸酶[3.2.1.129] |
ORF02848 | 5695和5696 | 抗阻抑物蛋白ant |
ORF02849 | 5697和5698 | 未命名蛋白产物;pot.mnt-基因产物(aa 1-83) |
ORF02850 | 5699和5700 | DNA转移蛋白 |
ORF02851 | 5701和5702 | 假拟蛋白 |
ORF02852 | 5703和5704 | DNA转移蛋白 |
ORF02853 | 5705和5706 | DNA转移蛋白gp7 |
ORF02854 | 5707和5708 | 头装配蛋白 |
ORF02855 | 5709和5710 | DNA稳定蛋白 |
ORF02856 | 5711和5712 | DNA稳定蛋白 |
ORF02857 | 5713和5714 | 基因7蛋白 |
ORF02858 | 5715和5716 | 假拟蛋白 |
ORF02859 | 5717和5718 | 推定的外被蛋白 |
ORF02860 | 5719和5720 | 推定的P23 |
ORF02861 | 5721和5722 | 门蛋白 |
ORF02862 | 5723和5724 | 噬菌体末端酶,大亚基,PBSX家族 |
ORF02863 | 5725和5726 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02864 | 5727和5728 | 基因67蛋白 |
ORF02865 | 5729和5730 | 在bp 59处交替启动;ORF |
ORF02866 | 5731和5732 | 噬菌体裂解蛋白 |
ORF02867 | 5733和5734 | 溶菌酶[3.2.1.17] |
ORF02868 | 5735和5736 | 噬菌体穴蛋白,λ家族 |
ORF02869 | 5737和5738 | 基因59蛋白 |
ORF02870 | 5739和5740 | 噬菌体NinH蛋白超家族 |
ORF02871 | 5741和5742 | holiday-连接解离酶[3.1.22.-] |
ORF02872 | 5743和5744 | GD66 |
ORF02873 | 5745和5746 | DNA-结合蛋白Roi(Antl) |
ORF02874 | 5747和5748 | NinF蛋白超家族 |
ORF02875 | 5749和5750 | NinX |
ORF02876 | 5751和5752 | 蛋白ninE相关蛋白 |
ORF02877 | 5753和5754 | 蛋白ninB |
ORF02878 | 5755和5756 | DnaB类似物[3.6.1.-1 |
ORF02879 | 5757和5758 | GO54 |
ORF02880 | 5759和5760 | 调节蛋白CII (cll) |
ORF02881 | 5761和5762 | 假拟蛋白 |
ORF02882 | 5763和5764 | 基因33蛋白 |
ORF02883 | 5765和5766 | 基因33蛋白 |
ORF02884 | 5767和5768 | Kil蛋白相关蛋白 |
ORF02885 | 5769和5770 | Gp42.1 |
ORF02886 | 5771和5772 | Gp40 |
ORF02887 | 5773和5774 | 基因25蛋白 |
ORF02888 | 5775和5776 | 假拟蛋白 |
ORF02889 | 5777和5778 | Gp37 |
ORF02890 | 5779和5780 | 功能未知的蛋白质(DUF551)家族 |
ORF02891 | 5781和5782 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02892 | 5783和5784 | 基因18蛋白相关蛋白 |
ORF02893 | 5785和5786 | D-丝氨酸脱氨酶转录激活蛋白(dsdC) |
ORF02894 | 5787和5788 | DsdX通透酶 |
ORF02895 | 5789和5790 | D-丝氨酸氨-裂合酶(dsdA)[4.3.1.18] |
ORF02896 | 5791和5792 | 多药耐药蛋白Y |
ORF02897 | 5793和5794 | 多药耐药蛋白K |
ORF02898 | 5795和5796 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02899 | 5797和5798 | 阳性转录调节蛋白evgA |
ORF02900 | 5799和5800 | 传感蛋白evgS前体[2.7.3.-] |
ORF02901 | 5801和5802 | CAIB-BAIF家族蛋白 |
ORF02902 | 5803和5804 | 类似于[SwissProt登录号P45869] |
ORF02903 | 5805和5806 | oxcA[4.1.1,81 |
ORF02904 | 5807和5808 | CAIB-BAIF家族蛋白[2.8.3.161 |
ORF02905 | 5809和5810 | YfdX蛋白前体 |
ORF02906 | 5811和5812 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02907 | 5813和5814 | DDG蛋白 |
ORF02908 | 5815和5816 | 转氨酶[相似性] (ASPAT)[2.6.1.-] |
ORF02909 | 5817和5818 | 组氨酸激酶家族 |
ORF029t0 | 5819和5820 | 自溶素反应调节物 |
ORF02911 | 5821和5822′ | 转录调节物VC1825 |
ORF02912 | 5823和5824 | 磷酸烯醇式内酮酸-蛋白磷酸转移酶ptsA(磷酸转移酶系统,酶I)(酶I-Ani) [2.7.3.9] |
ORF02913 | 5825和5826 | frv操纵子蛋白 |
ORF02914 | 5827和5828 | 脯氨酸二肽酶[3.4.-.-] |
ORF02915 | 5829和5830 | PTS系统,果糖特异性IIABC组件,推定[2.7.1.69] |
ORF02916 | 5831和5832 | PTS系统,果糖样-2 IIB组件1 (磷酸转移酶) |
ORF02917 | 5833和5834 | 葡萄糖激酶(qlk)[2.7.121 |
ORF02918 | 5835和5836 | 推定的离子-转运蛋白yfeO |
ORF02919 | 5837和5838 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02920 | 5839和5840 | 转运蛋白,NRAMP家族 |
ORF02921 | 5841和5842 | 核苷通透酶nupC |
ORF02922 | 5843和5844 | 核苷通透酶nupC |
ORF02923 | 5845和5846 | 类似于[SwissProt登录号P23842]仍未鉴定到起始密码子 |
ORF02924 | 5847和5848 | 类似于[SwissProt登录号P27239]仍未鉴定到起始密码子 |
ORF02925 | 5849和5850 | 类似于[SwissProt登录号P27239]仍未鉴定到起始密码子 |
ORF02926 | 5851和5852 | 谷氨酰-tRNA合成酶(gltX) [6.1.1.171 |
ORF02927 | 5853和5854 | 转录调节蛋白,LysR家族,推定 |
ORF02928 | 5855和5856 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02929 | 5857和5858 | 核苷通透酶NupG |
ORF02930 | 5859和5860 | 黄嘌呤核苷磷酸化酶(xapA)[2.4.2.1] |
ORF02931 | 5861和5862 | 假拟蛋白 |
ORF02932 | 5863和5864 | 功能未知的蛋白质(DUF1384)超家族 |
ORF02933 | 5865和5866 | OsmT蛋白 |
ORF02934 | 5867和5868 | 类似于[SwissProt登录号P39836]仍未鉴定到起始密码子 |
ORF02935 | 5869和5870 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02936 | 5871和5872 | DNA连接酶,NAD依赖性(li.qA)[6.5.1.2] |
ORF02937 | 5873和5874 | 细胞分裂蛋白ZipA (zipA) |
ORF02938 | 5875和5876 | CysZ蛋白 |
ORF02939 | 5877和5878 | 半胱氨酸合酶A(cysK)[2.5.1.47] |
ORF02940 | 5879和5880 | 磷酸载体蛋白HPr (含组氨酸的蛋白)(ptsH)[2.7.1.69] |
ORF02941 | 5881和5882 | 磷酸烯醇式丙酮酸-蛋白磷酸转移酶(ptsI)[2.7.3.9] |
ORF02942 | 5883和5884 | 磷酸转移酶系统酶II,葡萄糖-特异性,因子III(crr)[2.7.1.69] |
ORF02943 | 5885和5886 | 吡哆醛激酶[2.7.1.35] |
ORF02944 | 5887和5888 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02945 | 5889和5890 | 半胱氨酸合酶B (cysM)[2.5.1.47] |
ORF02946 | 5891和5892 | 硫酸-硫代硫酸输入ATP结合蛋白cysA(硫酸-转运ATP酶) |
ORF02947 | 5893和5894 | 硫酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白CysW(cysW) |
ORF02948 | 5895和5896 | 硫酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白CysT(cysT) |
0RF02949 | 5897和5898 | 硫代硫酸结合蛋白 |
ORF02950 | 5899和5900 | 3-氧代酰基-(酰基-载体-蛋白)还原酶 |
ORF02951 | 5901和5902 | 葡糖激酶调节相关蛋白 |
ORF02952 | 5903和5904 | PTS系统,蔗糖特异性IIBC组件(EIIBC-Scr) (蔗糖-通透酶IIBC组件)(磷酸转移酶 |
ORF02953 | 5905和5906 | tyrA蛋白VC2145 |
ORF02954 | 5907和5908 | 功能未知的蛋白质(DUF1131)超家族 |
ORF02955 | 5909和5910 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02956 | 5911和5912 | 乙酰基转移酶,GNAT家族 |
ORF02957 | 5913和5914 | N-乙酰基胞壁酰-1-丙氨酸酰胺酶I[3.5.1.28] |
ORF02958 | 5915和5916 | 粪卟林原III氧化酶,好氧(hemF)[1.3.3.3] |
ORF02959 | 5917和5918 | 乙醇胺操纵子调节蛋白 |
ORF02960 | 5919和5920 | 乙醇胺利用蛋白eutK前体 |
0RF02961 | 5921和5922 | 乙醇胺利用蛋白eutL(eutL) |
ORF02962 | 5923和5924 | 乙醇胺氨-裂合酶,小亚基,推定[4.3.1.7] |
ORF02963 | 5925和5926 | 乙醇胺氨-裂合酶,大亚基(eutB)[4.3.1.7] |
ORF02964 | 5927和5928 | 乙醇胺利用蛋白eutA |
ORF02965 | 5929和5930 | 乙醇胺利用蛋白eutH |
ORF02966 | 5931和5932 | 乙醇胺利用蛋白eutG |
ORF02967 | 5933和5934 | 乙醇胺利用蛋白eutJ (EutJ) |
ORF02968 | 5935和5936 | 醛-醇脱氢酶(EutE) |
ORF02969 | 5937和5938 | 二氧化碳浓缩机制蛋白CcmL,推定 |
0RF02970 | 5939和5940 | 解毒蛋白(EutM) |
ORF02971 | 5941和5942 | 磷酸乙酰基转移酶(pta)[2.3.1.81 |
ORF02972 | 5943和5944 | 乙醇胺利用钴胺素腺苷转移酶[2.5.1.17] |
ORF02973 | 5945和5946 | 乙醇胺利用蛋白eutQ |
ORF02974 | 5947和5948 | 乙醇胺利用蛋白eutP |
ORF02975 | 5949和5950 | 乙醇胺利用蛋白eutS |
ORF02976 | 5951和5952 | NADP-依赖性苹果酸酶(NADP-ME)[1.1.1.40] |
ORF02977 | 5953和5954 | 转醛酶(tal)[2.2.1.2] |
ORF02978 | 5955和5956 | 酮糖转移酶(tkt)[2.2.1.1] |
ORF02979 | 5957和5958 | 功能未知的蛋白质(DUF1176)超家族 |
ORF02980 | 5959和5960 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02981 | 5961和5962 | 保守性假拟蛋白TIGR00052 |
ORF02982 | 5963和5964 | 类似于[SwissProt登录号P37127]仍未鉴定到起始密码子(GltD)[1.4.1.13] |
ORF02983 | 5965和5966 | 硝酸-亚硝酸传感蛋白narO |
ORF02984 | 5967和5968 | 1037个氨基酸,113 kDa蛋白 |
ORF02985 | 5969和5970 | 蛋白yffB[1.-.-.-1 |
ORF02986 | 5971和5972 | 琥珀酰-二氨基庚二酸脱琥珀酰酶(dapE)[3.5.1.18] |
ORF02987 | 5973和5974 | 保守性假拟蛋白 |
ORF02988 | 5975和5976 | 3.1.-.-[3.1.-.-] |
ORF02989 | 5977和5978 | 类似于[SwissProt登录号P44140] |
ORF02990 | 5979和5980 | 金属肽酶,锌结合性[3.4.-.-] |
ORF02991 | 5981和5982 | 磷酸核糖基氨基咪唑-琥珀酸羧酰胺合酶(purC)[6.3.2.6] |
ORF02992 | 5983和5984 | 脂蛋白-34前体 |
ORF02993 | 5985和5986 | 二氢二皮考啉酸合酶(daDA)[4.2.1.52] |
ORF02994 | 5987和5988 | gcv操纵子的转录调节 |
ORF02995 | 5989和5990 | bcp[1.11.1.-] |
ORF02996 | 5991和5992 | 预测的通透酶 |
ORF02997 | 5993和5994 | 肽酶家族M48家族[3.4.-.-] |
ORF02998 | 5995和5996 | 砷酸还原酶(arsC)[1.20.4.1] |
ORF02999 | 5997和5998 | 参与DNA复制启动的ATP酶 |
ORF03000 | 5999和6000 | 尿嘧啶通透酶 |
ORF03001 | 6001和6002 | 尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(upp)[2.4.2.9] |
ORF03002 | 6003和6004 | 磷酸核糖基甲酰基甘氨脒环-连接酶(purM)[6.3.3.1] |
ORF03003 | 6005和6006 | 磷酸核糖基甘氨脒甲酰基转移酶(purN)[2.1.2.2] |
ORF03004 | 6007和6008 | 磷酸激酶(DDk)[2.7.4.1] |
ORF03005 | 6009和6010 | 外切聚磷酸酶[3.6.1.11] |
ORF03006 | 6011和6012 | MASE1结构域家族 |
ORF03007 | 6013和6014 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03008 | 6015和6016 | 假拟蛋白 |
ORF03009 | 6017和6018 | 推定的外膜脂蛋白 |
ORF03010 | 6019和6020 | 可能的膜蛋白Z3770 |
ORF03011 | 6021和6022 | 推定Rz样蛋白 |
ORF03012 | 6023和6024 | 细胞内溶素 |
ORF03013 | 6025和6026 | 穴蛋白 |
ORF03014 | 6027和6028 | 内-α-唾液酸酶 |
ORF03015 | 6029和6030 | 假拟蛋白 |
ORF03016 | 6031和6032 | 内-α-唾液酸酶[3.2.1.129] |
ORF03017 | 6033和6034 | 假拟蛋白 |
ORF03018 | 6035和6036 | GD27 |
ORF03019 | 6037和6038 | 假拟蛋白 |
ORF03020 | 6039和6040 | 假拟蛋白 |
ORF03021 | 6041和6042 | 假拟蛋白 |
ORF03022 | 6043和6044 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03023 | 6045和6046 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03024 | 6047和6048 | 假拟蛋白 |
ORF03025 | 6049和6050 | Bbp13 |
ORF03026 | 6051和6052 | gp11 |
ORF03027 | 6053和6054 | Bbp20 |
ORF03028 | 6055和6056 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03029 | 6057和6058 | Bbp16 |
ORF03030 | 6059和6060 | aP08 |
ORF03031 | 6061和6062 | Bbp18 |
ORF03032 | 6063和6064 | 假拟蛋白 |
ORF03033 | 6065和6066 | Bbp19 |
ORF03034 | 6067和6068 | Bbp21 |
ORF03035 | 6069和6070 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03036 | 6071和6072 | 假拟蛋白 |
ORF03037 | 6073和6074 | 假拟蛋白 |
ORF03038 | 6075和6076 | 末端酶大亚基 |
ORF03039 | 6077和6078 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03040 | 6079和6080 | 推定阻抑物 |
ORF03041 | 6081和6082 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03042 | 6083和6084 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03043 | 6085和6086 | 外切核酸酶VIII RecE [3.1.11.-] |
ORF03044 | 6087和6088 | 肠溶血素1 |
ORF03045 | 6089和6090 | 原噬菌体CP4-57调节蛋白(AIpA)家族 |
ORF03046 | 6091和6092 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03047 | 6093和6094 | 腺嘌呤甲基化酶 |
ORF03048 | 6095和6096 | 腺嘌呤甲基化酶 |
ORF03049 | 6097和6098 | 整合酶 |
ORF03050 | 6099和6100 | GMP合酶[谷胺酰胺-水解性](谷胺酰胺酰胺基转移酶)(GMP合成酶)(谷氨酰 |
ORF03051 | 6101和6102 | 肌苷-5′-单磷酸脱氢酶(fluaB)[1.1.1.205] |
ORF03052 | 6103和6104 | 外切脱氧核糖核酸酶VII,大亚基(xseA)[3.1.11.6] |
ORF03053 | 6105和6106 | Aec4前体 |
ORF03054 | 6107和6108 | Sinl同源物 |
ORF03055 | 6109和6110 | Aecl前体 |
ORF03056 | 6111和6112 | 功能未知的蛋白质(DUF1407)超家族 |
ORF03057 | 6113和61t4 | 预测的GTP-结合蛋白 |
ORF03058 | 6115和6116 | PQQ酶重复结构域蛋白[2.7.1.-] |
ORF03059 | 6117和6118 | 未命名蛋白产物 |
ORF03060 | 6119和6120 | 组氨酰-tRNA合成酶(hisS)[6.1.1.2 1] |
ORF03061 | 6121和6122 | 4-羟基-3-甲基丁-2-烯-1-基二磷酸合酶(ispG)[1.17.4.3] |
ORF03062 | 6123和6124 | 类似于[SwissProt登录号P27434] |
ORF03063 | 6125和6126 | 基团SAM酶,Cfr家族 |
ORF03064 | 6127和6128 | 核苷二磷酸激酶(ndk) [2.7.4.6] |
ORF03065 | 6129和6130 | 青霉素-结合性蛋白1C (pbpC) |
ORF03066 | 6131和6132 | 假拟脂蛋白yfhM前体 |
ORF03067 | 6133和6134 | 3-巯基内酮酸硫转移酶(AF109156) [2.8.1.1] |
ORF03068 | 6135和6136 | 丝氨酸敏感性提高 |
ORF03069 | 6137和6138 | 胞浆氨基肽酶家族,催化结构域家族 |
ORF03070 | 6139和6140 | 功能未知的蛋白质(DUF528)超家族 |
ORF03071 | 6141和6142 | 铁氧还蛋白,2Fe-2S型,ISC系统(fdx) |
ORF03072 | 6143和6144 | Fe-S蛋白装配侣伴蛋白HscA (hscA) |
ORF03073 | 6145和6146 | Fe-S蛋白装配辅助侣伴蛋白HscB (hscB) |
ORF03074 | 6147和6148 | 铁硫簇装配蛋白IscA (iscA) |
ORF03075 | 6149和6150 | FeS簇装配支架IscU(isscU) |
ORI03076 | 6151和6152 | 半胱氨酸脱硫酶IscS (iscS)[4.4.1.-] |
ORF03077 | 6153和6154 | 铁硫簇装配转录因子IscR (iscR) |
ORF03078 | 6155和6156 | RNA甲基转移酶,TrmH家族,1类 |
ORF03079 | 6157和6158 | 肌醇-1-单磷酸酶(IMP酶) (肌醇-1-磷酸酶) (I-1-P酶) (I-1-P酶)[3.1.3.25] |
ORF03080 | 6159和6160 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03081 | 6161和6162 | MFS(主要易化超家族)转运蛋白 |
ORF03082 | 6163和6164 | csiE |
ORF03083 | 6165和6166 | 推定的DoxX亚家族 |
ORF03084 | 6167和6168 | 醛糖1-差向异构酶超家族 |
ORF03085 | 6169和6170 | 氧化还原酶,锌结合性脱氢酶家族超家族[1.1.1.14] |
ORF03086 | 6171和6172 | 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白 |
ORF03087 | 6173和6174 | D-木糖ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白 |
ORF03088 | 6175和6176 | 核糖ABC转运蛋白,周质核糖结合蛋白,推定 |
ORF03089 | 6177和6178 | TPR结构域结构域蛋白 |
ORF03090 | 6179和6180 | ROK家族蛋白结构域蛋白 |
ORF03091 | 6181和6182 | 丝氨酸羟甲基转移酶(qlyA)[2.1.2.1] |
ORF03092 | 6183和6184 | 二氢蝶啶还原酶(NOD)[1.5.134] |
ORF03093 | 6185和6186 | 氮调节蛋白P-II |
ORF03094 | 6187和6188 | 转录调节蛋白 |
ORF03095 | 6189和6190 | 未命名蛋白产物 |
ORF03096 | 6191和6192 | 双组件系统传感蛋白激酶 |
ORF03097 | 6193和6194 | 磷酸核糖基甲酰基甘氨脒合酶(purL)[6.3.5.3] |
ORF03098 | 6195和6196 | 糖基转移酶,Slt家族 |
ORF03099 | 6197和6198 | tRNA-特异性腺苷脱氨酶[3.5.4.-] |
ORF03100 | 6199和6200 | HAD超家族(亚家族IF)水解酶,YfhB (yfhb) |
ORF03101 | 6201和6202 | 转录调节蛋白(膜) |
ORF03102 | 6203和6204 | NapF蛋白(fdx) |
ORF03103 | 6205和6206 | 全-(酰基-载体-蛋白)合酶(acpS) [2.7.8.7] |
ORF03104 | 6207和6208 | 吡哆醛磷酸生物合成蛋白PdxJ (pdxJ) |
ORF03105 | 6209和6210 | DNA修复蛋白RecO (recO) |
ORF03106 | 6211和6212 | GTP结合蛋白Era (era) |
ORF03107 | 6213和6214 | 核糖核酸酶III (mc) [3.1 26.3] |
ORF03108 | 6215和6216 | 信号肽酶I[相似性](lep)[3.4.21.89] |
ORF03109 | 6217和6218 | GTP结合蛋白LeoA (lepA) |
ORF03110 | 6219和6220 | σ-E因子调节蛋白rseC |
ORF03111 | 6221和6222 | σ-E因子调节蛋白rseB前体(rseB) |
ORF03112 | 6223和6224 | σ-E因子,负调节蛋白 |
ORF03113 | 6225和6226 | RNA聚合酶σ E(SIGMA) |
ORF03114 | 6227和6228 | 假拟蛋白 |
ORF03115 | 6229和6230 | 未命名蛋白产物 |
ORF03116 | 6231和6232 | L-天冬氨酸氧化酶(nadB)[1.4.3.16] |
ORF03117 | 6233和6234 | ATP依赖性RNA解旋酶(srmB) |
ORF03118 | 6235和6236 | 类似于[SwissProt登录号P33634] |
ORF03119 | 6237和6238 | 转运蛋白,LysE家族超家族 |
ORF03120 | 6239和6240 | 蛋白yfiD |
ORF03121 | 6241和6242 | 尿嘧啶-DNA糖基化酶(ung)[3.2.2.-] |
ORF03122 | 6243和6244 | 类似于[SwissProt登录号P33635]仍未鉴定到起始密码子 |
ORF03123 | 6245和6246 | 假拟蛋白 |
ORF03124 | 6247和6248 | 硫氧还蛋白(trx) |
ORF03125 | 6249和6250 | DTW结构域蛋白 |
ORF03126 | 6251和6252 | 酰基-CoA合成酶(NDP形成性) |
ORF03127 | 6253和6254 | CDP-二酰甘油-丝氨酸O-磷脂酰转移酶(EC 2.7.8.8)(磷脂酰丝氨酸合酶)[2.7.8.8] |
ORF03128 | 6255和6256 | 推定的脂蛋白 |
ORF03129 | 6257和6258 | α-酮戊二酸通透酶 |
ORF03130 | 6259和6260 | 转座酶 |
ORF03131 | 6261和6262 | 转座酶 |
ORF03132 | 6263和6264 | 转座酶 |
ORF03133 | 6265和6266 | 假拟的 |
ORF03134 | 6267和6268 | 假拟蛋白 |
ORF03135 | 6269和6270 | 热激蛋白[3.4.21.-] |
ORF03136 | 6271和6272 | 保守性假拟蛋白TIGR00726 |
ORF03137 | 6273和6274 | 核糖体大亚基假尿苷合酶D (sfhB)[4.2.1.70] |
ORF03138 | 6275和6276 | 未知 |
ORF03139 | 6277和6278 | 核糖体亚基界面蛋白(yfiA) |
ORF03140 | 6279和6280 | P-蛋白(PDT)[5.4.99,5] |
ORF03141 | 6281和6282 | T-蛋白(PDH)[5.4.99.5] |
ORF03142 | 6283和6284 | 磷酸-2-脱氢-3-脱氧庚糖酸醛缩酶[2.5.1.54] |
ORF03143 | 6285和6286 | 推定的脂蛋白 |
ORF03144 | 6287和6288 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03145 | 6289和6290 | 类似于[SwissProt登录号P46139] |
ORF03146 | 6291和6292 | 未命名蛋白产物;未鉴定的阅读框(16K多肽) (aa 1-127) |
ORF03147 | 6293和6294 | 核糖体蛋白L19(rplS) |
ORF03148 | 6295和6296 | tRNA (鸟嘌呤-N1)-甲基转移酶(trmD)[2.1.1.31] |
ORF03149 | 6297和6298 | 16S rRNA加工蛋白RimM (rimM) |
ORF03150 | 6299和6300 | 30S核糖体蛋白S16 (rpS16) |
ORF03151 | 6301和6302 | 信号识别颗粒蛋白(ffh) |
ORF03152 | 6303和6304 | CorE |
ORF03153 | 6305和6306 | 未命名蛋白产物 |
ORF03154 | 6307和6308 | 辅助-侣伴蛋白GrpE (grpE) |
ORF03155 | 6309和6310 | NAD+激酶[2.7.1.23] |
ORF03156 | 6311和6312 | 假拟蛋白 |
ORF03157 | 6313和6314 | DNA修复蛋白RecN (recN) |
ORF03158 | 6315和6316 | 小蛋白A前体 |
ORF03159 | 6317和6318 | 蛋白yfiF |
ORF03160 | 6319和6320 | 链丝菌环化酶-脱水酶家族 |
ORF03161 | 6321和6322 | SsrA-结合蛋白(smpB) |
ORF03162 | 6323和6324 | 假拟蛋白 |
ORF03163 | 6325和6326 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03164 | 6327和6328 | Dinl样蛋白Z3916-ECs3483 (AF175466) |
ORF03165 | 6329和6330 | T4-排斥蛋白刺激物gIBEG |
ORF03166 | 6331和6332 | ycfE蛋白(片段) |
ORF03167 | 6333和6334 | 未命名的蛋白产物;未鉴定的阅读框P-293 |
ORF03168 | 6335和6336 | 热激蛋白[3.4.21.-] |
ORF03169 | 6337和6338 | 热激蛋白[3.4.21.-] |
ORF03170 | 6339和6340 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03171 | 6341和6342 | Sb36 |
ORF03172 | 6343和6344 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03173 | 6345和6346 | 假拟蛋白 |
ORF03174 | 6347和6348 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03175 | 6349和6350 | 未命名蛋白产物 |
ORF03176 | 6351和6352 | 假拟蛋白 |
ORF03177 | 6353和6354 | gab蛋白 |
ORF03178 | 6355和6356 | 预测的脱氢酶 |
ORF03179 | 6357和6358 | 琥珀酸-半醛脱氢酶[NADP+][1.2.1.16] |
ORF03180 | 6359和6360 | 4-氨基丁酸转氨酶(gabT)[2.6,1.19] |
ORF03181 | 6361和6362 | GABA通透酶(gabP) |
ORF03182 | 6363和6364 | 转录调节蛋白,GntR家族,推定 |
ORF03183 | 6365和6366 | 推定的磷脂结合结构域家族 |
ORF03184 | 6367和6368 | 假拟的UPF0057蛋白yqaE相关蛋白 |
ORF03185 | 6369和6370 | 转录调节蛋白,ArsR家族(AJ001934) |
ORF03186 | 6371和6372 | 推定的硫氰酸生成酶家族蛋白 |
ORF03187 | 6373和6374 | DNA-结合蛋白stpA |
ORF03188 | 6375和6376 | 功能未知的蛋白质(DUF1144)超家族 |
ORF03189 | 6377和6378 | 类似于[SwissProt登录号P36931]仍未鉴定到起始密码子 |
ORF03190 | 6379和6380 | 未命名蛋白产物;ORFA |
ORF03191 | 6381和6382 | GntR-家族转录调节物(X78503) |
ORF03192 | 6383和6384 | 未表征的ACR |
ORF03193 | 6385和6386 | nrdH相关蛋白 |
ORF03194 | 6387和6388 | nrdl蛋白(nrdl) |
ORF03195 | 6389和6390 | 核糖核苷-二磷酸还原酶α链 |
ORF03196 | 6391和6392 | 核糖核苷-二磷酸还原酶,β亚基[1.17.4.1] |
ORF03197 | 6393和6394 | 甘氨酸、甜菜碱和脯氨酸的转运系统的ATP-结合组件(atp结合) |
ORF03198 | 6395和6396 | 甘氨酸甜菜碱-L-脯氨酸转运系统通透酶蛋白proW(膜) |
ORF03199 | 6397和6398 | 高亲和甘氨酸甜菜碱-脯氨酸转运系统 |
ORF03200 | 6399和6400 | 主要易化家族转运蛋白(通透酶) |
ORF03201 | 6401和6402 | 推定的AzlC家族蛋白 |
ORF03202 | 6403和6404 | YgaH蛋白 |
ORF03203 | 6405和6406 | 转录阻抑物mprA(EmrR蛋白) |
ORF03204 | 6407和6408 | 多药耐药蛋白A |
ORF03205 | 6409和6410 | 多药耐药蛋白B |
ORF03206 | 6411和6412 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03207 | 6413和6414 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03208 | 6415和6416 | 自体诱导物-2产生蛋白LuxS (luxS) |
ORF03209 | 6417和6418 | 谷氨酸-半胱氨酸连接酶(gshA)[6.3.2.2] |
ORF03210 | 6419和6420 | γ-谷氨酸-半胱氨酸连接酶(GCS) |
ORF03211 | 6421和6422 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03212 | 6423和6424 | CbbY家族蛋白VCA0662(pgp) |
ORF03213 | 6425和6426 | 储碳调节蛋白(csrA) |
ORF03214 | 6427和6428 | 丙氨酰基-tRNA合成酶(alaS)[6.1.1.71 |
ORF03215 | 6429和6430 | 调节蛋白recX(oraA蛋白) (recX) |
ORF03216 | 6431和6432 | recA蛋白(recA) |
ORF03217 | 6433和6434 | 蛋白ygaD |
ORF03218 | 6435和6436 | 膜-结合性裂解胞壁质转糖基酶B前体 |
ORF03219 | 6437和6438 | PTS系统,葡糖醇-山梨糖醇特异性IIBC组件(EIIBC-GUT)(葡糖醇-山梨糖醇-通透 |
ORF03220 | 6439和6440 | PTS系统,葡糖醇-山梨糖醇特异性IIBC组件(EIIBC-GUT)(葡糖醇-山梨糖醇-通透 |
ORF03221 | 6441和6442 | PTS酶III葡糖醇[2.7.1.69] |
ORF03222 | 6443和6444 | 3-氧代酰基-(酰基-载体-蛋白)还原酶(山梨糖醇)[1.1.1.140] |
ORF03223 | 6445和6446 | 葡糖醇操纵子激活蛋白(gutM) |
ORF03224 | 6447和6448 | 葡糖醇操纵子阻抑物(srl) |
ORF03225 | 6449和6450 | GutQ蛋白 |
ORF03226 | 6451和6452 | ygaA蛋白(fhlA) |
ORF03227 | 6453和6454 | 厌氧性一氧化氮还原酶黄素红氧还蛋白(FIRd)(黄素Rb) (fprA)[1.-.-.-] |
ORF03228 | 6455和6456 | 一氧化氮还原酶FIRd-NAD(+)还原酶(黄素红氧还蛋白还原酶)(FIRd-还原酶)(黄 |
ORF03229 | 6457和6458 | [NiFe]氢化酶成熟蛋白HypF (hypF) |
ORF03230 | 6459和6460 | 电子传递蛋白hvdN |
ORF03231 | 6461和6462 | 假拟蛋白 |
ORF03232 | 6463和6464 | ascBF操纵子阻抑物 |
ORF03233 | 6465和6466 | PTS系统酶II ABC (asc)[2.7.1.69] |
ORF03234 | 6467和6468 | 6-磷酸-β-葡糖苷酶[3.2.1.86] |
ORF03235 | 6469和6470 | 未命名蛋白产物 |
ORF03236 | 6471和6472 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03237 | 6473和6474 | 氢化酶成熟蛋白酶Hycl |
ORF03238 | 6475和6476 | 甲酸氢化酶成熟蛋白hycH (HycE)[1.-.-.-] |
ORF03239 | 6477和6478 | 甲酸氢化酶亚基7[1.18.99.1] |
ORF03240 | 6479和6480 | 甲酸氢化酶亚基6[1.18.99.1] |
ORF03241 | 6481和6482 | 氢化酶3大亚基[1.18.99.1] |
ORF03242 | 6483和6484 | 甲酸氢化酶亚基4 (hycD)[1.18.99.1] |
ORF03243 | 6485和6486 | 甲酸氢裂合酶亚基3 (FHL亚基3) (氢化酶-3组件C)[1.18.99.1] |
ORF03244 | 6487和6488 | 甲酸氢化酶亚基-7组件B (FHL) |
ORF03245 | 6489和6490 | 甲酸氢化酶调节蛋白hycA |
ORF03246 | 6491和6492 | 氢化酶镍插入蛋白HyDA (hypA) |
ORF03247 | 6493和6494 | 氢化酶辅助蛋白HypB |
ORF03248 | 6495和6496 | 氢化酶装配侣伴蛋白HypC-HupF (hypC) |
ORF03249 | 6497和6498 | 氢化酶表达-形成蛋白HypD (hypD) |
ORF03250 | 6499和6500 | 氢化酶表达-形成蛋白HypE (hypE) |
ORF03251 | 6501和6502 | 甲酸氢化酶转录激活蛋白 |
ORF03252 | 6503和6504 | 可能的钼蝶呤结合蛋白 |
ORF03253 | 6505和6506 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03254 | 6507和6508 | DNA错配修复蛋白MutS (mutS) |
ORF03255 | 6509和6510 | 丝氨酸-苏氨酸蛋白磷酸酶2[3.1.3.16] |
ORF03256 | 6511和6512 | 糖代谢的转录调节蛋白 |
ORF03257 | 6513和6514 | 3-羟基异丁酸脱氢酶[1.1.-.-] |
ORF03258 | 6515和6516 | tRNA合酶样蛋白 |
ORF03259 | 6517和6518 | L-墨角藻糖-1-磷酸醛缩酶样蛋白(fucA)[4.1.2.17] |
ORF03260 | 6519和6520 | Hfi蛋白[5.3.1.22] |
ORF03261 | 6521和6522 | 葡糖酸通透酶 |
ORF03262 | 6523和6524 | 金属-β-内酰胺酶超家族结构域蛋白 |
ORF03263 | 6525和6526 | 色氨酸阻抑物结合蛋白 |
ORF03264 | 6527和6528 | σ因子RpoS (σ38) |
ORF03265 | 6529和6530 | σ因子RpoS(σ38) |
ORF03266 | 6531和6532 | 脂蛋白nlpD前体 |
ORF03267 | 6533和6534 | 蛋白-L-异天冬氨酸O-甲基转移酶(pcm)[2.1.1.77] |
ORF03268 | 6535和6536 | 酸性磷酸酶SurE (surE)[3.1.3.2] |
ORF03269 | 6537和6538 | 保守性假拟蛋白TIGR00094 |
ORF03270 | 6539和6540 | 2C-甲基-D-赤藓醇2.4-环二磷酸合酶(ispF)[4.6.1.12] |
ORF03271 | 6541和6542 | 2-C-甲基-D-赤藓醇4-磷酸胞苷酰转移酶(ispD)[2.7.7.60] |
ORF03272 | 6543和6544 | 细胞分裂蛋白ftsB |
ORF03273 | 6545和6546 | YgbE |
ORF03274 | 6547和6548 | 腺苷酰基硫酸激酶(cysC)[2.7.1.25] |
ORF03275 | 6549和6550 | 硫酸腺苷酰基转移酶亚基1 (硫酸腺苷酸转移酶) (SAT) (ATP-硫酸化酶大亚基) |
ORF03276 | 6551和6552 | 硫酸腺苷酰基转移酶亚基2 (硫酸腺苷酸转移酶) (SAT) (ATP-硫酸化酶小亚基) |
ORF03277 | 6553和6554 | 假拟蛋白 |
ORF03278 | 6555和6556 | 碱性磷酸酶同功酶转化蛋白前体[3.4.11.-] |
ORF03279 | 6557和6558 | Hok-qef家族超家族 |
ORF03280 | 6559和6560 | 3-磷酸腺苷5-磷酸硫酸还原酶 |
ORF03281 | 6561和6562 | 亚硫酸还原酶(NADPH)血红素蛋白,β亚基(cysl)[1.8.1.2] |
ORF03282 | 6563和6564 | 亚硫酸还原酶[NADPH]黄素蛋白,α链[1.8.1.2] |
ORF03283 | 6565和6566 | 6-丙酮酰-四氢蝶呤合酶 |
ORF03284 | 6567和6568 | 可能的电子转移黄素蛋白-醌氧化还原酶ygcN |
ORF03285 | 6569和6570 | 铁氧还蛋白样蛋白ygcO |
ORF03286 | 6571和6572 | 推定的甘油摄取操纵子抗终止调节蛋白 |
ORF03287 | 6573和6574 | 电子转移黄素蛋白,α亚基亚家族(etfA) |
ORF03288 | 6575和6576 | 推定转运蛋白 |
ORF03289 | 6577和6578 | 糖转运蛋白,推定 |
ORF03290 | 6579和6580 | 推定的烷基-二羟基丙酮磷酸合酶 |
ORF03291 | 6581和6582 | 1.-.-.-[1.1.1.-] |
ORF03292 | 6583和6584 | 主要易化超家族亚家族 |
ORF03293 | 6585和6586 | 糖激酶,FGGY家族,推定[2.7.1.17] |
ORF03294 | 6587和6588 | 基团活化酶 |
ORF03295 | 6589和6590 | 基团活化酶 |
ORF03296 | 6591和6592 | LemA家族超家族 |
ORF03297 | 6593和6594 | 富甘氨酸蛋白 |
ORF03298 | 6595和6596 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03299 | 6597和6598 | 功能未知的结构域(DUF477)家族 |
ORF03300 | 6599和6600 | 富甘氨酸蛋白 |
ORF03301 | 6601和6602 | 烯醇酶(eno)[4.2.1.11 1 |
ORF03302 | 6603和6604 | CTP合酶(pyrG)[6.3.4.2] |
ORF03303 | 6605和6606 | MazG蛋白(mazG) |
ORF03304 | 6607和6608 | PemK样蛋白1(MazF蛋白) (AF027767) |
ORF03305 | 6609和6610 | PemI样蛋白1(MazE蛋白) |
ORF03306 | 6611和6612 | GTP焦磷酸激酶(ATP:GTP 3′-焦磷酸转移酶)(ppGpp合成酶I) ((p)ppGpp合成酶) |
ORF03307 | 6613和6614 | 23S rRNA (尿嘧啶-5-)-甲基转移酶RumA (rumA)[2.1.1.-] |
ORF03308 | 6615和6616 | 传感蛋白barA[2.7.3.-] |
ORF03309 | 6617和6618 | 假拟蛋白 |
ORF03310 | 6619和6620 | 葡糖二酸脱水酶[4.2.1.40] |
ORF03311 | 6621和6622 | 葡糖二酸脱水酶[4.2.1.-] |
ORF03312 | 6623和6624 | MFS转运蛋白,邻苯二甲酸通透酶家族 |
ORF03313 | 6625和6626 | 外酶调节调节子(mioC) |
ORF03314 | 6627和6628 | RNA假尿苷酸合酶家族蛋白[4.2.1.70] |
ORF03315 | 6629和6630 | tRNA假尿苷合酶C(假尿苷酸合酶)(尿嘧啶氢裂合酶) |
ORF03316 | 6631和6632 | 与secY相互作用 |
ORF03317 | 6633和6634 | 假拟蛋白 |
ORF03318 | 6635和6636 | GTP环式水解酶I样蛋白 |
ORF03319 | 6637和6638 | 预测的Rossmann折叠核苷酸-结合蛋白 |
ORF03320 | 6639和6640 | 丝氨酸转运蛋白 |
ORF03321 | 6641和6642 | L-丝氨酸氨-裂合酶(sdaA)[4.3.1.17] |
ORF03322 | 6643和6644 | 外切脱氧核糖核酸酶IX |
ORF03323 | 6645和6646 | 乳醛还原酶[1.1.1.77] |
ORF03324 | 6647和6648 | L-墨角藻糖磷酸醛缩酶(fucA)[4.1.2.17] |
ORF03325 | 6649和6650 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03326 | 6651和6652 | L-岩藻糖通透酶(NcP) |
ORF03327 | 6653和6654 | L-岩藻糖异构酶(fucl)[5.3.1.25] |
ORF03328 | 6655和6656 | L-墨角藻糖激酶(L-墨角藻糖激酶) (fucK)[2.7.1.51] |
ORF03329 | 6657和6658 | 岩藻糖操纵子fucU蛋白(fucU) |
ORF03330 | 6659和6660 | 假拟蛋白 |
ORF03331 | 6661和6662 | L-岩藻糖操纵子激活蛋白 |
ORF03332 | 6663和6664 | SAM依赖性甲基转移酶样蛋白 |
ORF03333 | 6665和6666 | 未表征的小膜蛋白 |
ORF03334 | 6667和6668 | 转录调节物,LysR家族(gcvA) |
ORF03335 | 6669和6670 | 功能未知的细菌蛋白(DUF903)超家族 |
ORF03336 | 6671和6672 | 半胱氨酸亚磺酸脱亚磺酸酶 |
ORF03337 | 6673和6674 | Fe-S代谢相关结构域亚家族 |
ORF03338 | 6675和6676 | 参与钼蝶呤和硫胺生物合成的二核苷酸-利用酶家族1 |
ORF03339 | 6677和6678 | 膜-结合性裂解胞壁质糖基转移酶A前体 |
ORF03340 | 6679和6680 | 功能未知的蛋白质(DUF770)超家族 |
ORF03341 | 6681和6682 | Aec18 |
ORF03342 | 6683和6684 | 功能未知的细菌蛋白(DUF876)超家族 |
ORF03343 | 6685和6686 | 可能保守的膜蛋白 |
ORF03344 | 6687和6688 | 未命名蛋白产物 |
ORF03345 | 6689和6690 | 分泌蛋白Hcp |
ORF03346 | 6691和6692 | C1DB蛋白 |
ORF03347 | 6693和6694 | 推定的Rhs元件Vgr蛋白亚家族 |
ORF03348 | 6695和6696 | 未命名蛋白产物;类似于未知蛋白 |
ORF03349 | 6697和6698 | 未命名蛋白产物;高度类似于发光杆菌的未知蛋白,推定的分泌蛋白,推定 |
ORF03350 | 6699和6700 | 未命名蛋白产物 |
ORF03351 | 6701和6702 | 未命名蛋白产物 |
ORF03352 | 6703和6704 | ImpA相关性N-末端家族 |
ORF03353 | 6705和6706 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03354 | 6707和6708 | 假拟蛋白 |
ORF03355 | 6709和6710 | 功能未知的细菌蛋白(DUF879)超家族 |
ORF03356 | 6711和6712 | 功能未知的蛋白质(DUF1305)超家族 |
ORF03357 | 6713和6714 | 推定的脂蛋白 |
ORF03358 | 6715和6716 | 功能未知的蛋白质(DUF1316)亚家族 |
ORF03359 | 6717和6718 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03360 | 6719和6720 | ImpA相关性N-末端家族 |
ORF03361 | 6721和6722 | 2-羟酸脱氢酶(serA) |
ORF03362 | 6723和6724 | 磷酸糖异构酶 |
ORF03363 | 6725和6726 | β-胱硫醚酶 |
ORF03364 | 6727和6728 | PTS系统,IIBC组件,推定[2.7.1.69] |
ORF03365 | 6729和6730 | 抗终止子 |
ORF03366 | 6731和6732 | N-乙酰基胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶amiC前体[3.5.1.28] |
ORF03367。 | 6733和6734 | 氨基酸N-乙酰基转移酶(areA)[2.3.1.1] |
ORF03368 | 6735和6736 | 外切脱氧核糖核酸酶V,α亚基(recD)[3.1.11,5] |
ORF03369 | 6737和6738 | 外切脱氧核糖核酸酶V,β亚基(recB)[3.1.11.5] |
ORF03370 | 6739和6740 | 蛋白酶I前体(Pitrilysin) (蛋白酶pi) (pitrilysin)[3.4.24.55] |
ORF03371 | 6741和6742 | 外切脱氧核糖核酸酶V,γ亚基(recC)[3.1.t 1.5] |
ORF03372 | 6743和6744 | 前菌毛蛋白肽酶依赖性蛋白C前体 |
ORF03373 | 6745和6746 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03374 | 6747和6748 | 未命名蛋白产物;URF1(aa 1-267) |
ORF03375 | 6749和6750 | 前菌毛蛋白肽酶依赖性蛋白A前体 |
ORF03376 | 6751和6752 | 胸苷酸合酶(thyA)[2.1.1.45] |
ORF03377 | 6753和6754 | 前脂蛋白二酰基甘油基转移酶(Igt)[2.4.99.-] |
ORF03378 | 6755和6756 | 磷酸烯醇式丙酮酸-蛋白磷酸转移酶ptsP (Ntr)[2.7.3.9] |
ORF03379 | 6757和6758 | NTP焦磷酸水解酶,包括氧化损伤修复酶 |
ORF03380 | 6759和6760 | DNA错配修复内切核酸酶mutH(mutH) |
ORF03381 | 6761和6762 | TerC蛋白 |
ORF03382 | 6763和6764 | 脂蛋白 |
ORF03383 | 6765和6766 | Tas蛋白 |
ORF03384 | 6767和6768 | 未命名蛋白产物 |
ORF03385 | 6769和6770 | AAS双功能蛋白 |
ORF03386 | 6771和6772 | 半乳糖操纵子阻抑物 |
ORF03387 | 6773和6774 | 二氨基庚二酸脱羧酶(lysA)[4.1.1.20] |
ORF03388 | 6775和6776 | 天冬氨酸消旋酶亚家族[5.1.1.13] |
ORF03389 | 6777和6778 | 转录激活蛋白lysR |
ORF03390 | 6779和6780 | 阿拉伯糖-质子同向转运蛋白 |
ORF03391 | 6781和6782 | 2-脱氧-D-葡糖酸3-脱氢酶(kduD)[1.1.1.1 25] |
ORF03392 | 6783和6784 | 4-脱氧-L-苏氨-5-hexosulose-糖醛酸酮醇-异构酶 |
ORF03393 | 6785和6786 | 可能的乙酰-CoA乙酰基转移酶 |
ORF03394 | 6787和6788 | 丝氨酸反向转运蛋白 |
ORF03395 | 6789和6790 | 可能的脂蛋白 |
ORF03396 | 6791和6792 | 推定醛氧化还原酶[1.1.1 204] |
ORF03397 | 6793和6794 | 黄嘌呤脱氢酶,FAD结合亚基(cutB)[1.11.204] |
ORF03398 | 6795和6796 | 短链CO脱氢酶(cutC) |
ORF03399 | 6797和6798 | 信号转导和转录控制蛋白 |
ORF03400 | 6799和6800 | 假拟蛋白 |
ORF03401 | 6801和6802 | 天冬氨酸-鸟氨酸氨甲酰基转移酶,Asp-Orn结合结构域家族 |
ORF03402 | 6803和6804 | 苏氨酸脱水酶生物合成[4.3.1.15] |
ORF03403 | 6805和6806 | 推定乙酰基鸟氨酸脱乙酰酶 |
ORF03404 | 6807和6808 | 二氢嘧啶酶(hydA)[3.5.2.2] |
ORF03405 | 6809和6810 | 氨基甲酸酯激酶(arcC)[2.7.2.2] |
ORF03406 | 6811和6812 | 黄嘌呤脱氢酶辅助因子,推定亚家族,推定 |
ORF03407 | 6813和6814 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03408 | 6815和6816 | 假拟的ygfJ |
ORF03409 | 6817和6818 | 氧化还原酶,吡啶核苷酸-二硫家族 |
ORF03410 | 6819和6820 | 推定氯水解酶家族蛋白 |
ORF03411 | 6821和6822 | 钼蝶呤脱氢酶蛋白中的FAD结合结构域 |
ORF03412 | 6823和6824 | 推定醛氧化还原酶[1.-.-.-] |
ORF03413 | 6825和6826 | 黄嘌呤-尿嘧啶通透酶通透酶家族蛋白 |
ORF03414 | 6827和6828 | 鸟嘌呤脱氨酶 |
ORF03415 | 6829和6830 | 黄嘌呤-尿嘧啶通透酶家族蛋白 |
ORF03416 | 6831和6832 | 电子传递蛋白hydN |
ORF03417 | 6833和6834 | 无氧表达的氧化还原酶(OItD)[1.4.1.13] |
ORF03418 | 6835和6836 | 黄嘌呤通透酶 |
ORF03419 | 6837和6838 | 异戊烯基-二磷酸δ-异构酶,1型(idi)[5.3.3.2] |
ORF03420 | 6839和6840 | 赖氨酰基-tRNA合成酶(IvsS/[6.11.6] |
ORF03421 | 6841和6842 | 肽链释放因子2 (prfB) |
ORF03422 | 6843和6844 | 单链-DNA特异性外切核酸酶RecJ (recJ)[3.1.-.-] |
ORF03423 | 6845和6846 | 巯基:二硫键交换蛋白dsbC前体(DsbC)[5.3.4.1] |
ORF03424 | 6847和6848 | 酪氨酸重组酶XerD (xerD) |
ORF03425 | 6849和6850 | 黄素氧还蛋白 |
ORF03426 | 6851和6852 | 未命名蛋白产物 |
ORF03427 | 6853和6854 | 未表征的保守性蛋白 |
ORF03428 | 6855和6856 | 预测的氨基甲基转移酶 |
ORF03429 | 6857和6858 | 类似于溶血素III同源物 |
ORF03430 | 6859和6860 | UPF0267蛋白 |
ORF03431 | 6861和6862 | 6-磷酸-β-葡糖苷酶 |
ORF03432 | 6863和6864 | 甘氨酸脱氢酶(acvP)[1.4.4.2] |
ORF03433 | 6865和6866 | 甘氨酸切割系统H蛋白(gcvH) |
ORF03434 | 6867和6868 | 甘氨酸切割系统T蛋白(gcvT)[2.1.2.10] |
ORF03435 | 6869和6870 | 蛋白visC [1.-.-.-] |
ORF03436 | 6871和6872 | 2-聚异戊二烯基-6-甲氧基苯酚4-羟化酶(ubiH)[1.14.13.-] |
ORF03437 | 6873和6874 | Xaa-Pro氨基肽酶(APP-II)[3.4.11.9] |
ORF03438 | 6875和6876 | yecA家族蛋白亚家族 |
ORF03439 | 6877和6878 | 功能未知的家族(DUF710)超家族 |
ORF03440 | 6879和6880 | 5-甲酰基四氢叶酸环-连接酶家族蛋白,推定 |
ORF03441 | 6881和6882 | D-3-磷酸甘油酸脱氢酶[1.1.1.95] |
ORF03442 | 6883和6884 | 核糖5-磷酸异构酶A(rpiA)[5.3.1.6] |
ORF03443 | 6885和6886 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03444 | 6887和6888 | 染色体启动抑制剂 |
ORF03445 | 6889和6890 | 未命名蛋白产物;sbm orf(MCM) |
ORF03446 | 6891和6892 | 推定转录调节蛋白LYSR-型 |
ORF03447 | 6893和6894 | IpqG,推定 |
ORF03448 | 6895和6896 | 可能的膜转运蛋白 |
ORF03449 | 6897和6898 | 小电导率机械敏感性通道 |
ORF03450 | 6899和6900 | 果糖-双磷酸醛缩酶,II类(fbaA)[4.1.2.13] |
ORF03451 | 6901和6902 | 磷酸甘油酸激酶(pgk)[2.7.2.3] |
ORF03452 | 6903和6904 | D-赤藓糖-4-磷酸脱氢酶(epd)[1.2.1.-] |
ORF03453 | 6905和6906 | 假拟蛋白 |
ORF03454 | 6907和6908 | 功能未知的结构域(DUF296)家族 |
ORF03455 | 6909和6910 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03456 | 6911和6912 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03457 | 6913和6914 | ABC转运蛋白,ATP结合蛋白 |
ORF03458 | 6915和6916 | 激酶相关蛋白 |
ORF03459 | 6917和6918 | 钴转运ATP结合蛋白cbiO |
ORF03460 | 6919和6920 | 未命名蛋白产物:ORF2 (AA 1-133) |
ORF03461 | 6921和6922 | 果糖-1,6-双磷酸酶,II型 |
ORF03462 | 6923和6924 | 推定的氧化还原酶 |
ORF03463 | 6925和6926 | PTS系统,甘露醇(隐藏) [2.7.1.69] |
ORF03464 | 6927和6928 | PTS系统,甘露醇(隐藏)特异性IIA组件(EIIA-(C)Mtl)(甘露醇(隐藏)-通透酶IIA |
ORF03465 | 6929和6930 | 推定的丝氨酸蛋白酶 |
ORF03466 | 6931和6932 | 酮糖转移酶(tkt)[2.2.1.11 |
ORF03467 | 6933和6934 | 推定的金属蛋白酶G |
ORF03468 | 6935和6936 | 推定的胍丁胺酶(agmatinase)[3.5.3.11] |
ORF03469 | 6937和6938 | 推定的脂蛋白 |
ORF03470 | 6939和6940 | 精氨酸脱羧酶(speA)[4.1.1.191 |
ORF03471 | 6941和6942 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03472 | 6943和6944 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03473 | 6945和6946 | S-腺苷甲硫氨酸合成酶(metK)[2.5.1.6] |
ORF03474 | 6947和6948 | 半乳糖-质子同向转运蛋白 |
ORF03475 | 6949和6950 | 蛋白sprT |
ORF03476 | 6951和6952 | 内切核酸酶I前体 |
ORF03477 | 6953和6954 | 保守性假拟蛋白TIGR00046 |
ORF03478 | 6955和6956 | 谷胱甘肽合酶(qshB)[6.3.2.3] |
ORF03479 | 6957和6958 | 未表征的ACR,COG1678 |
ORF03480 | 6959和6960 | 保守性假拟蛋白TIGR00250 |
ORF03481 | 6961和6962 | 预测的参与菌毛生物合成的ATP酶,PiIT同源物 |
ORF03482 | 6963和6964 | 保守性假拟蛋白TIGR00044 |
ORF03483 | 6965和6966 | 预测的内膜蛋白 |
ORF03484 | 6967和6968 | 保守性假拟蛋白TIGR00251 |
ORF03485 | 6969和6970 | 非经典嘌呤NTP焦磷酸酶,rdgB-HAM1家族(rdgB) |
ORF03486 | 6971和6972 | 推定的氧非依赖型粪卟啉原III氧化酶 |
ORF03487 | 6973和6974 | 功能未知的蛋白质(DUF1202)超家族 |
ORF03488 | 6975和6976 | L-天冬酰胺酶II (ansB)[3.5.1.1] |
ORF03489 | 6977和6978 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03490 | 6979和6980 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03491 | 6981和6982 | 蛋白 |
ORF03492 | 6983和6984 | tRNA (鸟嘌呤-N(7)-)-甲基转移酶(tRNA(m7G46)-甲基转移酶)[2.1.1.33] |
ORF03493 | 6985和6986 | A-G特异性腺嘌呤糖基化酶 |
ORF03494 | 6987和6988 | 蛋白yggX |
ORF03495 | 6989和6990 | yggZ蛋白(mltC)[3.2.1.-] |
ORF03496 | 6991和6992 | 核苷通透酶NupG |
ORF03497 | 6993和6994 | 鸟氨酸脱羧酶同功酶(speC)[4.1.1.17] |
ORF03498 | 6995和6996 | 完整的膜蛋白 |
ORF03499 | 6997和6998 | 截短的转座酶 |
ORF03500 | 6999和7000 | KpsF |
ORF03501 | 7001和7002 | 荚膜多糖输出内膜蛋白kpsE |
ORF03502 | 7003和7004 | 推定的多糖生物合成蛋白 |
ORF03503 | 7005和7006 | 3-脱氧-D-甘露糖-辛酮糖酸胞苷酰转移酶(kdsB)[2.7.7.38] |
ORF03504 | 7007和7008 | 荚膜多糖输出蛋白KpsC |
ORF03505 | 7009和7010 | KpsS蛋白 |
ORF03506 | 7011和7012 | 聚唾液酸荚膜生物合成蛋白SiaD,截短;被外来的ermC破坏,推定[2.4.-.-] |
ORF03507 | 7013和7014 | NeuE蛋白 |
ORF03508 | 7015和7016 | UDP-N-乙酰基葡糖胺2-差向异构酶[5.1.3.14] |
ORF03509 | 7017和7018 | 推定的酰基神经氨酸胞苷酰转移酶[2.7.7.43] |
ORF03510 | 7019和7020 | neuB蛋白[4.1,3,-1 |
ORF03511 | 7021和7022 | 聚唾液酸转运ATP结合蛋白kpsT[3.6.3.38] |
ORF03512 | 7023和7024 | 聚唾液酸转运蛋白kpsM |
ORF03513 | 7025和7026 | 推定的通用分泌通路蛋白M-型yghD |
ORF03514 | 7027和7028 | 通用分泌通路蛋白L (gspL) |
ORF03515 | 7029和7030 | 通用分泌通路蛋白K (gspK) |
ORF03516 | 7031和7032 | 通用分泌通路蛋白J(gspJ) |
ORF03517 | 7033和7034 | 通用分泌通路蛋白I(gspI) |
ORF03518 | 7035和7036 | GsDH,假拟II型分泌蛋白 |
ORF03519 | 7037和7038 | 通用分泌通路蛋白G (qspG) |
ORF03520 | 7039和7040 | 通用分泌通路蛋白F (qspF) |
ORF03521 | 7041和7042 | 通用分泌通路蛋白E (GSP) |
ORF03522 | 7043和7044 | II型分泌通路,组件EpsD |
ORF03523 | 7045和7046 | 通用分泌通路蛋白C (gspC) |
ORF03524 | 7047和7048 | YghG蛋白 |
ORF03525 | 7049和7050 | 分泌蛋白b2972 [3.4.23.43] |
ORF03526 | 7051和7052 | 辅助集落化因子AcfD前体 |
ORF03527 | 7053和7054 | 乙醇酸通透酶glcA |
ORF03528 | 7055和7056 | 苹果酸合酶G (alcB)[2.3.3.9] |
ORF03529 | 7057和7058 | glcG蛋白 |
ORF03530 | 7059和7060 | 乙醇酸氧化酶亚基GlcE和GlcF (Fe-S)[1.1.3.15] |
ORF03531 | 7061和7062 | 乙醇酸氧化酶亚基GlcE和GlcF |
ORF03532 | 7063和7064 | 乙醇酸氧化酶,亚基GlcD (glcD) |
ORF03533 | 7065和7066 | Glc操纵子转录激活蛋白 |
ORF03534 | 7067和7068 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03535 | 7069和7070 | 酰基-CoA合酶 |
ORF03536 | 7071和7072 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03537 | 7073和7074 | 磷酸泛酰巯基乙胺连接位点(ACP) |
ORF03538 | 7075和7076 | 8-氨基-7-氧代壬酸合酶 |
ORF03539 | 7077和7078 | 预测的通透酶YigP-YigQ家族超家族 |
ORF03540 | 7079和7080 | 预测的通透酶YigP-YigQ家族超家族 |
ORF03541 | 7081和7082 | 保守性假拟蛋白YtfJ-家族,TIGR01626 |
ORF03542 | 7083和7084 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03543 | 7085和7086 | 多糖生物合成蛋白结构域蛋白 |
ORF03544 | 7087和7088 | 假拟ATP-结合蛋白yghR |
ORF03545 | 7089和7090 | 假拟的ATP-结合蛋白yghS |
ORF03546 | 7091和7092 | 假拟蛋白 |
ORF03547 | 7093和7094 | 假拟的ATP-结合蛋白yghT |
ORF03548 | 7095和7096 | 低亲和力磷酸转运蛋白 |
ORF03549 | 7097和7098 | 谷胱甘肽精胺合酶 |
ORF03550 | 7099和7100 | 假拟GST样蛋白yghU |
ORF03551 | 7101和7102 | 氢化酶装配侣伴蛋白HypC-HupF(hypC) |
ORF03552 | 71 03和7104 | 氢化酶镍插入蛋白HypA (hypA) |
ORF03553 | 7105和7106 | 氢化酶-2操纵子蛋白hybE |
ORF03554 | 7107和7108 | 氢化酶表达-形成蛋白 |
ORF03555 | 7109和7t10 | 氢化酶-2大亚基HybC[1.18.99.1] |
ORF03556 | 7111和7112 | 氢化酶-2的细胞色素Ni-Fe组件 |
ORF03557 | 7113和7114 | 氢化酶-2操纵子蛋白hybA前体 |
ORF03558 | 7115和7116 | 氢化酶-2短链前体(NiFe氢化酶)(膜结合性氢化酶2小亚 |
ORF03559 | 7117和7118 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03560 | 7119和7120 | 二烯内酯水解酶家族蛋白 |
ORF03561 | 7121和7122 | 氧化还原酶,醛酮还原酶家族 |
ORF03562 | 7123和7124 | 保守性假拟蛋白TIGR00645 |
ORF03563 | 7125和7126 | 氧化还原酶,短链脱氢酶-还原酶家族[1.-.-.-] |
ORF03564 | 7127和7128 | 生物聚合物转运exbD蛋白 |
ORF03565 | 7129和7130 | 生物聚合物转运exbB蛋白(摄取) |
ORF03566 | 7131和7132 | 胱硫醚β-裂合酶(metC)[4.4.1.8] |
ORF03567 | 7133和7134 | 未命名的蛋白产物;类似于大肠杆菌的DedA-家族完整膜蛋白YghB |
ORF03568 | 7135和7136 | 转录调节蛋白,AraC家族 |
ORF03569 | 7137和7138 | 未表征的氧化还原酶 |
ORF03570 | 7139和7140 | 氧化还原酶,醛酮还原酶家族[1.1.1.274] |
ORF03571 | 7141和7142 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03572 | 7143和7144 | 主要外膜脂蛋白 |
ORF03573 | 7145和7146 | 基团SAM结构域蛋白 |
ORF03574 | 7147和7148 | xux操纵子的调节蛋白 |
ORF03575 | 7149和7150 | 假拟的氧化还原酶ydfl |
ORF03576 | 7151和7152 | 推定的2,3-丁二醇脱氢酶[1.1.1.14] |
ORF03577 | 7153和7154 | 脲基乙醇酸脱氢酶[1.1.1.-] |
ORF03578 | 7155和7156 | TRAP型C4-二羧酸转运系统,周质组件(AP00l509) |
ORF03579 | 7157和7158 | 未命名蛋白产物 |
ORF03580 | 7159和7160 | TRAP二羧酸转运蛋白,DctM亚基 |
ORF03581 | 7161和7162 | ftsl的抑制物 |
ORF03582 | 7163和7164 | 1-酰基-sn-甘油-3-磷酸酰基转移酶(LPAAT)[2.3.1.51] |
ORF03583 | 7165和7166 | DNA拓扑异构酶IV,A亚基(parC)[5.99.1.-] |
ORF03584 | 7167和7168 | ABC超家族(周质),寡肽转运蛋白 |
ORF03585 | 7169和7170 | 转录调节蛋白,AraC家族 |
ORF03586 | 7171和7172 | 保守的假拟蛋白TIGR00156 |
ORF03587 | 7173和7174 | 转录调节蛋白qseB |
ORF03588 | 7175和7176 | 传感蛋白qseC[2.7.3.-] |
ORF03589 | 7177和7178 | 未命名的蛋白产物:类似于Hcp蛋白 |
ORF03590 | 7179和7180 | 推定的NAD(P)H醌氧化还原酶 |
ORF03591 | 7181和7182 | 蛋白ygiN |
ORF03592 | 7183和7184 | SIS结构域蛋白 |
ORF03593 | 7185和7186 | 推定的ABC转运蛋白的铁化合物-结合蛋白 |
ORF03594 | 7187和7188 | 铁化合物ABC转运蛋白,通透酶蛋白(III) |
ORF03595 | 7189和7190 | 铁exochelin摄取(fxuC) |
ORF03596 | 7191和7192 | 铁exochelin摄取(fxuB) |
ORF03597 | 7193和7194 | 推定的铁化合物受体 |
ORF03598 | 7195和7196 | DNA拓扑异构酶IV,B亚基(parE)[5.99.1.-] |
ORF03599 | 7197和7198 | 预测的酯酶 |
ORF03600 | 7199和7200 | cc蛋白 |
ORF03601 | 7201和7202 | 功能未知的蛋白(DUF1249)超家族 |
ORF03602 | 7203和7204 | 保守性假拟蛋白TIGR00052 |
ORF03603 | 7205和7206 | 对大肠杆菌素特异性耐受的外膜通道 |
ORF03604 | 7207和7208 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03605 | 7209和7210 | 谷胱甘肽精胺合酶(O386) |
ORF03606 | 7211和7212 | 酰基硫酸磺基转移酶 |
ORF03607 | 7213和7214 | 巯基:二硫键交换蛋白dsbA样前体[5.3.4.1] |
ORF03608 | 7215和7216 | 二硫键形成蛋白B(dsbB)[1.8.4.-] |
ORF03609 | 7217和7218 | 芳环-开环加双氧酶超家族的催化LigB亚基 |
ORF03610 | 7219和7220 | 假拟蛋白 |
ORF03611 | 7221和7222 | 锌转运蛋白zupT |
ORF03612 | 7223和7224 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03613 | 7225和7226 | 菌毛蛋白 |
ORF03614 | 7227和7228 | 外膜菌毛传达蛋白孔蛋白 |
ORF03615 | 7229和7230 | 外膜传达蛋白PMFC前体。 |
ORF03616 | 7231和7232 | 假拟的菌毛侣伴蛋白yqiH前体 |
ORF03617 | 7233和7234 | ybgO蛋白 |
ORF03618 | 7235和7236 | 3.4-二羟基-2-丁酮4-磷酸合酶(ribB) |
ORF03619 | 7237和7238 | 功能未知的蛋白质(DUF526)家族 |
ORF03620 | 7239和7240 | 糖换生物合成,rpoS依赖性相关蛋白 |
ORF03621 | 7241和7242 | YgiJ |
ORF03622 | 7243和7244 | 未表征的BCR,推定 |
ORF03623 | 7245和7246 | ADP-庚糖合酶[2.7.-.-] |
ORF03624 | 7247和7248 | 谷氨酸-氨连接酶腺苷酰转移酶 |
ORF03625 | 7249和7250 | 推定的腺苷酸环化酶 |
ORF03626 | 7251和7252 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03627 | 7253和7254 | tRNA核苷酸转移酶 |
ORF03628 | z255和7256 | 推定的十一异戊二烯醇激酶[2.7.1.66] |
ORF03629 | 7257和7258 | 二氢新蝶呤醛缩酶(folB)[4.1.2.25] |
ORF03630 | 7259和7260 | 保守性假拟蛋白TIGR00023 |
ORF03631 | 7261和7262 | LysR家族调节蛋白 |
ORF03632 | 7263和7264 | 假拟蛋白 |
ORF03633 | 7265和7266 | 延胡索酸酶(延胡索酸酶)[4.2,132] |
ORF03634 | 7267和7268 | 推定的I类延胡索酸水合酶[4.2.1.32] |
ORF03635 | 7269和7270 | DASS家族,柠檬酸:琥珀酸转运(反向转运) |
ORF03636 | 7271和7272 | O-唾液酸糖蛋白内肽酶(.qcp)[3.4.24.57] |
ORF03637 | 7273和7274 | 30S核糖体蛋白S21相关蛋白 |
ORF03638 | 7275和7276 | DNA引发酶[2.7.7.-] |
ORF03639 | 7277和7278 | RNA聚合酶的σD因子 |
ORF03640 | 7279和7280 | RNA聚合酶的σD因子 |
ORF03641 | 7281和7282 | G-U错配特异性DNA糖基化酶(错配特异性尿嘧啶DNA-糖基化酶)(UDG)[3.2.2.-] |
ORF03642 | 7283和7284 | 铁螯合物利用蛋白 |
ORF03643 | 7285和7286 | 转录调节物,PadR家族 |
ORF03644 | 7287和7288 | 趋氧性受体 |
ORF03645 | 7289和7290 | 鸟氨酸氨基转移酶(rocD)[2.6.1.13] |
ORF03646 | 7291和7292 | tRNA-结合蛋白ygiH(mets)[6.1.1.10] |
ORF03647 | 7293和7294 | 半乳糖操纵子阻抑物galR |
ORF03648 | 7295和7296 | 引发的β-半乳糖苷酶α-亚基 |
ORF03649 | 7297和7298 | EGB酶β亚基[3.2.1.23] |
ORF03650 | 7299和7300 | 可能的氧化还原酶ygil |
ORF03651 | 7301和7302 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03652 | 7303和7304 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03653 | 7305和7306 | 2,4-二烯酰基-coA还原酶[1.-.-.-] |
ORF03654 | 7307和7308 | 2.1.1.52[2.1.1.52] |
ORF03655 | 7309和7310 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03656 | 7311和7312 | sanA蛋白 |
ORF03657 | 7313和7314 | 氧化还原酶[1.-.-.-1 |
ORF03658 | 7315和7316 | Alx蛋白 |
ORF03659 | 7317和7318 | 钠:二羧酸同向转运蛋白家族超家族 |
ORF03660 | 7319和7320 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03661 | 7321和7322 | 阿卓糖酸水解酶[4.2.1.7] |
ORF03662 | 7323和7324 | 葡糖醛酸异构酶(uxaC)[5.3.1.12] |
ORF03663 | 7325和7326 | 推定的主要易化家族转运蛋白 |
ORF03664 | 7327和7328 | Exu调节子转录调节物 |
ORF03665 | 7329和7330 | 未命名的蛋白产物;类似于大肠杆菌的DedA-家族完整膜蛋白YghB |
ORF03666 | 7331和7332 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03667 | 7333和7334 | 蛋白yqjC前体[3.4.24.13] |
ORF03668 | 7335和7336 | 功能未知的细菌蛋白(DUF883)超家族 |
ORF03669 | 7337和7338 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03670 | 7339和7340 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03671 | 7341和7342 | 预测的膜蛋白 |
ORF03672 | 7343和7344 | 谷胱甘肽S-转移酶C末端(O328) |
ORF03673 | 7345和7346 | 功能未知的蛋白质(DUF805)超家族 |
ORF03674 | 7347和7348 | lysR-家族转录调节蛋白YPO3545 |
ORF03675 | 7349和7350 | 未表征的BCR,YhhW家族COG1741家族 |
ORF03676 | 7351和7352 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03677 | 7353和7354 | 功能未知的蛋白质(DUF1063)超家族 |
ORF03678 | 7355和7356 | 推定的转运系统通透酶蛋白 |
ORF03679 | 7357和7358 | L-丝氨酸氨-裂合酶(sdaA)[4.3.1.17] |
ORF03680 | 7359和7360 | 推定的内切核糖核酸酶L-PSP |
ORF03681 | 7361和7362 | 甲酸乙酰基转移酶(pflB)[2.3.1.54] |
ORF03682 | 7363和7364 | 乙酸激酶(ackA)[2.7.2.1] |
ORF03683 | 7365和7366 | 苏氨酸-丝氨酸转运蛋白 |
ORF03684 | 7367和7368 | 苏氨酸脱水酶,易化(苏氨酸脱氨酶) (tdcB)[4.3.1.19] |
ORF03685 | 7369和7370 | 推定的转录调节蛋白,LysR家族[4.2.1.16] |
ORF03686 | 7371和7372 | 甘油酸激酶2 |
ORF03687 | 7373和7374 | 2-羟基-3-氧代丙酸还原酶[1.1.1.60] |
ORF03688 | 7375和7376 | 2-脱氢-3-脱氧葡糖二酸醛缩酶(ptpA)[4.1.2.20] |
ORF03689 | 7377和7378 | MFS转运蛋白,邻苯二甲酸通透酶家族 |
ORF03690 | 7379和7380 | D-粘酸脱水酶(GalcD)[4.2.1.42] |
ORF03691 | 7381和7382 | DeoR-家族调节蛋白(srl) |
ORF03692 | 7383和7384 | 推定的塔格糖6-磷酸激酶蛋白 |
ORF03693 | 7385和7386 | N-乙酰半乳糖胺特异性PTS系统酶IIB组件(EIIB-AGA)[2.7.1.69] |
ORF03694 | 7387和7388 | N-乙酰半乳糖胺特异性IIC组件2 |
ORF03695 | 7389和7390 | PTS系统,N-乙酰半乳糖胺特异性IID组件 |
ORF03696 | 7391和7392 | AgaF[2.7.1.69] |
ORF03697 | 7393和7394 | N-乙酰葡糖胺-6-磷酸脱乙酰酶(nagA)[3.5.1.25] |
ORF03698 | 7395和7396 | 糖异构酶结构域蛋白AgaS[5.-.-.-] |
ORF03699 | 7397和7398 | II类醛缩酶,塔格糖双磷酸家族[4.1.2.-] |
ORF03700 | 7399和7400 | PTS系统,N-乙酰半乳糖胺特异性IIB组件1(EIIB-Aga)(N-乙酰半乳糖胺-通透酶 |
ORF03701 | 7401和7402 | PTS系统,N-乙酰半乳糖胺特异性IIC组件1(EIIC-Aga)(N-乙酰半乳糖胺-通透酶 |
ORF03702 | 7403和7404 | PTS系统,N-乙酰半乳糖胺特异性IID组件(EIID-AGA) |
ORF03703 | 7405和7406 | 推定的葡糖胺-6-磷酸异构酶[5.3.1.-] |
ORF03704 | 7407和7408 | 保守性假拟蛋白TIGR00096 |
ORF03705 | 7409和7410 | LppC |
ORF03706 | 7411和7412 | 保守性假拟蛋白TIGR00252 |
ORF03707 | 7413和7414 | 磷酸庚糖异构酶(.qmhA) |
ORF03708 | 7415和7416 | 推定的磷脂结合结构域家族 |
ORF03709 | 7417和7418 | 预测的通透酶超家族 |
ORF03710 | 7419和7420 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03711 | 7421和7422 | 未命名蛋白产物 |
ORF03712 | 7423和7424 | 蛋白酶I |
ORF03713 | 7425和7426 | 乙酰基转移酶[2.3.1.-] |
ORF03714 | 7427和7428 | 预测的内切核酸酶 |
ORF03715 | 7429和7430 | SCP-2固醇转移家族 |
ORF03716 | 7431和7432 | 胶原酶 |
ORF03717 | 7433和7434 | 肽酶,U32家族[3.4.-.-] |
ORF03718 | 7435和7436 | 黄素依赖性氧化还原酶 |
ORF03719 | 7437和7438 | 色氨酸特异性转运蛋白 |
ORF03720 | 7439和7440 | ATP依赖性RNA解旋酶DeaD |
ORF03721 | 7441和7442 | 脂蛋白nlpI前体 |
ORF03722 | 7443和7444 | 多核糖核苷酸核苷酸转移酶(CAP87K) |
ORF03723 | 7445和7446 | 核糖体蛋白S15(rpsO) |
ORF03724 | 7447和7448 | tRNA假尿苷合酶B[4.2.1.70] |
ORF03725 | 7449和7450 | 核糖体结合因子A(rbfA) |
ORF03726 | 7451和7452 | 翻译启动因子IF-2 |
ORF03727 | 7453和7454 | 转录延长蛋白nusA(N利用物质蛋白A)(L因子)(nusA) |
ORF03728 | 7455和7456 | YhbC样蛋白 |
ORF03729 | 7457和7458 | 精氨琥珀酸合酶(argG)[6.3.4.5] |
ORF03730 | 7459和7460 | 外膜蛋白yhbX前体 |
ORF03731 | 7461和7462 | 蛋白-输出膜蛋白secG |
ORF03732 | 7463和7464 | 磷酸葡糖胺变位酶(glmM)[5.4.2.-] |
ORF03733 | 7465和7466 | 二氢蝶酸合酶(folP)[2.5.1.15] |
ORF03734 | 7467和7468 | ATP-结合蛋白[3.4.24.-] |
ORF03735 | 7469和7470 | 核糖体RNA大亚基甲基转移酶J(rrmJ)[2.1.1.-] |
ORF03736 | 7471和7472 | 保守性假拟蛋白TIGR00253 |
ORF03737 | 7473和7474 | 转录延长因子greA(转录物切割因子greA)(greA) |
ORF03738 | 7475和7476 | D-丙氨酰-D-丙氨酸羧肽酶-D-丙氨酰-D-丙氨酸-内肽酶(dacB)[3.4.16.4] |
ORF03739 | 7477和7478 | Obg蛋白(Obg) |
ORF03740 | 7479和7480 | Obg蛋白(F390) |
ORF03741 | 7481和7482 | RhaT蛋白 |
ORF03742 | 7483和7484 | RhaT蛋白 |
ORF03743 | 7485和7486 | 核糖体蛋白L27(rpmA) |
ORF03744 | 7487和7488 | 50S核糖体蛋白L21 |
ORF03745 | 7489和7490 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03746 | 7491和7492 | RhaT蛋白 |
ORF03747 | 7493和7494 | 核糖体蛋白L27(rpmA) |
ORF03748 | 7495和7496 | 50S核糖体蛋白L21 |
ORF03749 | 7497和7498 | 核糖体蛋白L21(rplU) |
ORF03750 | 7499和7500 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03751 | 7501和7502 | 八异戊二烯基-二磷酸合酶(八异戊二烯基焦磷酸合成酶)(OPP合成酶)[2.5.1-] |
ORF03752 | 7503和7504 | 糖发酵刺激蛋白B(Ner样蛋白) |
ORF03753 | 7505和7506 | UDP-N-乙酰葡糖胺1-羧基乙烯基转移酶(murA)[2.5.1.7] |
ORF03754 | 7507和7508 | BolA样蛋白 |
ORF03755 | 7509和7510 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03756 | 7511和7512 | 蛋白yrbC前体(Ttg2D) |
ORF03757 | 7513和7514 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03758 | 7515和7516 | VpsC |
ORF03759 | 7517和7518 | 未命名的蛋白产物;高度类似于大肠杆菌的ABC转运蛋白,通透酶蛋白YrbE |
ORF03760 | 7519和7520 | ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(atp结合) |
ORF03761 | 7521和7522 | K+依赖性Na+-Ca+交换蛋白相关蛋白 |
ORF03762 | 7523和7524 | 假拟蛋白 |
ORF03763 | 7525和7526 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03764 | 7527和7528 | 推定的异构酶 |
ORF03765 | 7529和7530 | 3-脱氧-D-甘露糖-辛酮糖酸8-磷酸磷酸酶(KDO 8-P磷酸酶)[3.1.3.45] |
ORF03766 | 7531和7532 | 未命名的蛋白产物;类似于大肠杆菌的YrbK前体蛋白 |
ORF03767 | 7533和7534 | OstA样蛋白家族 |
ORF03768 | 7535和7536 | ABC转运蛋白,ATP结合组件 |
ORF03769 | 7537和7538 | RNA聚合酶σ-54因子(rpoN) |
ORF03770 | 7539和7540 | 核糖体亚基界面蛋白(yfiA) |
ORF03771 | 7541和7542 | PTS IIA样氮调节性蛋白PtsN(ptsN) |
ORF03772 | 7543和7544 | 未命名的蛋白产物;ORF193肽片段(AA 1-192)(1524是密码子中的第二个碱基) |
ORF03773 | 7545和7546 | 磷酸载体蛋白(NPr) |
ORF03774 | 7547和7548 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03775 | 7549和7550 | 单功能生物合成肽聚糖糖基转移酶(mtgA)[2.4.2.-] |
ORF03776 | 7551和7552 | σ交叉反应蛋白27A(SCRP-27A) |
ORF03777 | 7553和7554 | 需氧呼吸控制传感蛋白arcB[2.7.3.-] |
ORF03778 | 7555和7556 | 基团SAM蛋白,TIGR01212家族 |
ORF03779 | 7557和7558 | 假拟蛋白 |
ORF03780 | 7559和7560 | 谷氨酸合酶[NADPH]长链前体[1.4.1.13] |
ORF03781 | 7561和7562 | 谷氨酸合酶(NADPH)短链(NADPH)[1.4.1.13] |
ORF03782 | 7563和7564 | 保守性假拟蛋白亚家族 |
ORF03783 | 7565和7566 | 推定的ROK家族蛋白结构域蛋白 |
ORF03784 | 7567和7568 | N-乙酰甘露糖胺-6-磷酸2-差向异构酶-N-乙酰甘露糖胺激酶 |
ORF03785 | 7569和7570 | 推定的顺,顺-粘康酸转运蛋白MucK |
ORF03786 | 7571和7572 | N-乙酰神经氨酸裂合酶(nanA)[4.1.3.3] |
ORF03787 | 7573和7574 | 推定的转录调节蛋白,GntR家族 |
ORF03788 | 7575和7576 | 严格性饥饿蛋白B(sspB) |
ORF03789 | 7577和7578 | 严格性饥饿蛋白A(Ssp) |
ORF03790 | 7579和7580 | 核糖体蛋白S9(rpsI) |
ORF03791 | 7581和7582 | 核糖体蛋白L13(rplM) |
ORF03792 | 7583和7584 | 预测的ATP酶 |
ORF03793 | 7585和7586 | 功能未知的蛋白(DUF1043)超家族 |
ORF03794 | 7587和7588 | 蛋白酶degQ前体 |
ORF03795 | 7589和7590 | 周质丝氨酸蛋白酶DegS(degS)[3.4.21.-] |
ORF03796 | 7591和7592 | 苹果酸脱氢酶,NAD依赖性(mdh)[1.1.1.37] |
ORF03797 | 7593和7594 | 精氨酸阻抑物(argR) |
ORF03798 | 7595和7596 | 功能未知的蛋白(DUF1471)超家族 |
ORF03799 | 7597和7598 | 未命名的蛋白产物;类似于核糖核酸酶抑制物(barstar) |
ORF03800 | 7599和7600 | 萎蔫酸抗性蛋白保守区家族 |
ORF03801 | 7601和7602 | 萎蔫酸抗性蛋白 |
ORF03802 | 7603和7604 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03803 | 7605和7606 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03804 | 7607和7608 | 转录调节蛋白 |
ORF03805 | 7609和7610 | TldD蛋白(CSRA) |
ORF03806 | 7611和7612 | 保守性假拟蛋白TIGR02099 |
ORF03807 | 7613和7614 | 胞浆纤丝束 |
ORF03808 | 7615和7616 | maf蛋白(maf) |
ORF03809 | 7617和7618 | 杆形-决定蛋白MreD(mreD) |
ORF03810 | 7619和7620 | 杆形-决定蛋白mreC(mreC) |
ORF03811 | 7621和7622 | 杆形-决定蛋白mreC(mreC) |
ORF03812 | 7623和7624 | ftsI的调节蛋白 |
ORF03813 | 7625和7626 | EAL结构域蛋白 |
ORF03814 | 7627和7628 | 蛋白yhdH |
ORF03815 | 7629和7630 | 乙酰-CoA羧化酶,生物素羧基载体蛋白(accB) |
ORF03816 | 7631和7632 | 乙酰-CoA羧化酶,生物素羧化酶(accC)[6.4.1.2] |
ORF03817 | 7633和7634 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03818 | 7635和7636 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03819 | 7637和7638 | 果糖激酶(AB010074)[2.7.1.-] |
ORF03820 | 7639和7640 | 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白(通透酶) |
ORF03821 | 7641和7642 | 核糖转运ATP-结合蛋白rbsA(醛糖) |
ORF03822 | 7643和7644 | 周质核糖结合蛋白 |
ORF03823 | 7645和7646 | II类醛缩酶,塔格糖双磷酸家族[4.1.2.-] |
ORF03824 | 7647和7648 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03825 | 7649和7650 | aga操纵子转录阻抑物(DeoR家族) |
ORF03826 | 7651和7652 | 果糖激酶(AB010074)[2.7.1.-] |
ORF03827 | 7653和7654 | 功能未知的蛋白(DUF997)超家族 |
ORF03828 | 7655和7656 | 钠-泛酸同向转运蛋白(panF) |
ORF03829 | 7657和7658 | 核糖体蛋白L11甲基转移酶(prmA)[2.1.1.-] |
ORF03830 | 7659和7660 | tRNA-二氢尿苷合酶B[1.-.-.-] |
ORF03831 | 7661和7662 | DNA-结合蛋白fis(倒位刺激因子蛋白)(HIN重组增强蛋白结合蛋白)(fis) |
ORF03832 | 7663和7664 | ADENINE特异性METHYL转移酶 |
ORF03833 | 7665和7666 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03834 | 7667和7668 | 可能的acrEF-envCD操纵子阻抑物(acrEF) |
ORF03835 | 7669和7670 | 吖啶黄抗性蛋白E前体 |
ORF03836 | 7671和7672 | 吖啶黄抗性蛋白F |
ORF03837 | 7673和7674 | 推定的脂蛋白 |
ORF03838 | 7675和7676 | 氨基酸ABC转运蛋白,周质氨基酸-结合蛋白 |
ORF03839 | 7677和7678 | L-氨基酸ABC转运蛋白通透酶蛋白 |
ORF03840 | 7679和7680 | L-氨基酸ABC转运蛋白通透酶蛋白 |
ORF03841 | 7681和7682 | L-氨基酸ABC转运蛋白ATP-结合蛋白 |
ORF03842 | 7683和7684 | 谷氨酸脱羧酶[4.1.1.15] |
ORF03843 | 7685和7686 | 谷氨酸脱羧酶[4.1.1.15] |
ORF03844 | 7687和7688 | 未命名的蛋白产物 |
ORF03845 | 7689和7690 | 蛋白yrdA |
ORF03846 | 7691和7692 | 莽草酸5-脱氢酶(aroE)[1.1.1.25] |
ORF03847 | 7693和7694 | 蛋白yrdC |
ORF03848 | 7695和7696 | 蛋白smg |
ORF03849 | 7697和7698 | 预测的参与DNA的Rossmann-折叠核苷酸-结合蛋白 |
ORF03850 | 7699和7700 | 肽脱甲基酶(def)[3.5.1.88] |
ORF03851 | 7701和7702 | 甲硫氨酰基-tRNA甲酰基转移酶(fmt)[2.1.2.9] |
ORF03852 | 7703和7704 | sun蛋白(sun)[2.1.1.-] |
ORF03853 | 7705和7706 | Trk系统摄钾蛋白trkA(K(+)-摄取蛋白trkA)(trkA) |
ORF03854 | 7707和7708 | 大电导率机械敏感性通道蛋白(mscL) |
ORF03855 | 7709和7710 | 细菌中保守的未表征蛋白 |
ORF03856 | 7711和7712 | Zn(II)-反应性转录调节蛋白(zntR) |
ORF03857 | 7713和7714 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03858 | 7715和7716 | 核糖体蛋白L17(rplQ) |
ORF03859 | 7717和7718 | 以DNA为指导的RNA聚合酶,α亚基(rpoA)[2.7.7.6] |
ORF03860 | 7719和7720 | 核糖体蛋白S4(rpsD) |
ORF03861 | 7721和7722 | 核糖体蛋白S11(rpsK) |
ORF03862 | 7723和7724 | 核糖体蛋白S13p-S18e(rpsM) |
ORF03863 | 7725和7726 | 核糖体蛋白L36(rpmJ) |
ORF03864 | 7727和7728 | 前蛋白转位酶,SecY亚基 |
ORF03865 | 7729和7730 | 前蛋白转位酶secY亚基(secY) |
ORF03866 | 7731和7732 | 核糖体蛋白L15(rplO) |
ORF03867 | 7733和7734 | 核糖体蛋白L30(rpmD) |
ORF03868 | 7735和7736 | 核糖体蛋白S5(rpsE) |
ORF03869 | 7737和7738 | 核糖体蛋白L18(rplR) |
ORF03870 | 7739和7740 | 50S核糖体亚基蛋白L6(rplF) |
ORF03871 | 7741和7742 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03872 | 7743和7744 | 核糖体蛋白S8(rpsH) |
ORF03873 | 7745和7746 | 核糖体蛋白S14p-S29e(rpsN) |
ORF03874 | 7747和7748 | 50S核糖体亚基蛋白L5(rpL5) |
ORF03875 | 7749和7750 | 核糖体蛋白L24(rplX) |
ORF03876 | 7751和7752 | 核糖体蛋白L14(rplN) |
ORF03877 | 7753和7754 | 核糖体蛋白S17(rpsQ) |
ORF03878 | 7755和7756 | 核糖体蛋白L29(rpmC) |
ORF03879 | 7757和7758 | 核糖体蛋白L16(rplp) |
ORF03880 | 7759和7760 | 核糖体蛋白S3(rpsC) |
ORF03881 | 7761和7762 | 核糖体蛋白L22(rplV) |
ORF03882 | 7763和7764 | 核糖体蛋白S19(rpsS) |
ORF03883 | 7765和7766 | 核糖体蛋白L2(rplB) |
ORF03884 | 7767和7768 | 核糖体蛋白L23(rplW) |
ORF03885 | 7769和7770 | 核糖体蛋白L4-L1家族(rplD) |
ORF03886 | 7771和7772 | 核糖体蛋白L3(rplC) |
ORF03887 | 7773和7774 | 核糖体蛋白S10(rpsJ) |
ORF03888 | 7775和7776 | PioO蛋白(PinO蛋白) |
ORF03889 | 7777和7778 | 可能的通用分泌通路蛋白A(GSP) |
ORF03890 | 7779和7780 | 通用分泌通路蛋白C(gspC) |
ORF03891 | 7781和7782 | 通用分泌通路蛋白D前体(支链淀粉酶分泌包膜pulD)(GSP) |
ORF03892 | 7783和7784 | 通用分泌通路蛋白E(II型运输管理ATP酶)(霍乱毒素分泌蛋白epsE)(GSP) |
ORF03893 | 7785和7786 | 通用分泌通路蛋白F(gspF) |
ORF03894 | 7787和7788 | 通用分泌通路蛋白G(gspG) |
ORF03895 | 7789和7790 | 通用分泌通路蛋白H前体(支链淀粉酶分泌蛋白pulH)(GSP) |
ORF03896 | 7791和7792 | 外膜分泌蛋白V(GSP) |
ORF03897 | 7793和7794 | 通用分泌通路蛋白J(gspJ) |
ORF03898 | 7795和7796 | 通用分泌通路蛋白K(gspK) |
ORF03899 | 7797和7798 | 通用分泌通路蛋白L(gspL) |
ORF03900 | 7799和7800 | 推定的通用分泌通路蛋白M(GSP) |
ORF03901 | 7801和7802 | 4型前菌毛蛋白样蛋白前导肽加工酶(GSP)[3.4.23.43] |
ORF03902 | 7803和7804 | 细菌铁蛋白(bfr) |
ORF03903 | 7805和7806 | 细菌铁蛋白-结合性铁氧还蛋白相关蛋白 |
ORF03904 | 7807和7808 | 几丁质酶[3.2.1.14] |
ORF03905 | 7809和7810 | 翻译延长因子Tu(tuf) |
ORF03906 | 7811和7812 | 翻译延长因子G(fusA) |
ORF03907 | 7813和7814 | 核糖体蛋白S7(rpsG) |
ORF03908 | 7815和7816 | 核糖体蛋白S12(rpsL) |
ORF03909 | 7817和7818 | DsrH蛋白 |
ORF03910 | 7819和7820 | 参与氧化的未表征蛋白 |
ORF03911 | 7821和7822 | 参与胞内硫的未表征保守蛋白 |
ORF03912 | 7823和7824 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03913 | 7825和7826 | FKBP-型肽基-脯氨酰顺反异构酶fkpA前体(EC 5.2.1.8)(PPI酶)(旋转异构酶)(旋 |
ORF03914 | 7827和7828 | SlyX蛋白(slyX) |
ORF03915 | 7829和7830 | FKBP型肽基-脯氨酰顺反异构酶slyD(PPI酶)(旋转异构酶)(富组氨酸蛋白) |
ORF03916 | 7831和7832 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03917 | 7833和7834 | 谷胱甘肽-调节的钾外流系统蛋白kefB(K(+)-H(+)反向转运蛋白)(NEM-激活性 |
ORF03918 | 7835和7836 | 谷胱甘肽-调节的钾外流系统辅助蛋白kefG[1.6.99.2] |
ORF03919 | 7837和7838 | ABC转运蛋白ATP-结合蛋白 |
ORF03920 | 7839和7840 | 预测的α-β-水解酶折叠的水解酶 |
ORF03921 | 7841和7842 | 假拟的UPF0270蛋白yheU相关蛋白 |
ORF03922 | 7843和7844 | 磷酸核酮糖激酶[2.7.1.19] |
ORF03923 | 7845和7846 | 无已知功能 |
ORF03924 | 7847和7848 | 代谢产物基因激活物(cAMP受体蛋白)(cAMP调节蛋白)(crp) |
ORF03925 | 7849和7850 | 完整的膜蛋白,YccS-YhfK家族亚家族 |
ORF03926 | 7851和7852 | 乙酰鸟氨酸氨基转移酶(argD)[2.6.1.11] |
ORF03927 | 7853和7854 | 对氨基苯甲酸合酶谷氨酰胺酰胺基转移酶组件II[6.3.5.8] |
ORF03928 | 7855和7856 | 推定的fic |
ORF03929 | 7857和7858 | 肽基-脯氨酰顺反异构酶A前体(PPI酶A)(旋转异构酶A)(亲环蛋白A)(utu) |
ORF03930 | 7859和7860 | 假拟蛋白 |
ORF03931 | 7861和7862 | TsgA蛋白 |
ORF03932 | 7863和7864 | 亚硝酸还原酶[NAD(P)H],大亚基(nirB)[1.7.1.4] |
ORF03933 | 7865和7866 | 亚硝酸还原酶[NAD(P)H],小亚基(nirD)[1.7.1.4] |
ORF03934 | 7867和7868 | 可能的亚硝酸转运蛋白(甲酸) |
ORF03935 | 7869和7870 | 亚硝酸还原酶(Siroheme)合酶 |
ORF03936 | 7871和7872 | 推定脂蛋白 |
ORF03937 | 7873和7874 | 未命名的蛋白产物 |
ORF03938 | 7875和7876 | 推定膜蛋白 |
ORF03939 | 7877和7878 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03940 | 7879和7880 | 推定的对硫磷水解酶 |
ORF03941 | 7881和7882 | 磷酸戊糖变位酶(phosphopentomutase) |
ORF03942 | 7883和7884 | 丙氨酸消旋酶,N-末端结构域家族 |
ORF03943 | 7885和7886 | 未命名的蛋白产物 |
ORF03944 | 7887和7888 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03945 | 7889和7890 | 色氨酰-tRNA合成酶(trpS)[6.1.1.2] |
ORF03946 | 7891和7892 | 磷酸乙醇酸磷酸酶,细菌(gph)[3.1.3.18] |
ORF03947 | 7893和7894 | 假拟蛋白 |
ORF03948 | 7895和7896 | 磷酸乙醇酸磷酸酶(PGP)[3.1.3.18] |
ORF03949 | 7897和7898 | 核酮糖-磷酸3-差向异构酶(rpe)[5.1.3.1] |
ORF03950 | 7899和7900 | DNA腺嘌呤甲基化酶(dam)[2.1.1.72] |
ORF03951 | 7901和7902 | DamX蛋白(1989) |
ORF03952 | 7903和7904 | 3-脱氢奎尼酸合酶(aroB)[4.2.3.4] |
ORF03953 | 7905和7906 | 莽草酸激酶I |
ORF03954 | 7907和7908 | 蛋白转运蛋白hofQ前体(Tfp) |
ORF03955 | 7909和7910 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03956 | 7911和7912 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03957 | 7913和7914 | 菌毛装配蛋白(PilN)超家族 |
ORF03958 | 7915和7916 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03959 | 7917和7918 | 青霉素-结合蛋白1A(PBPla)[2.4.2.-] |
ORF03960 | 7919和7920 | ADP化合物水解酶nudE [3.6.1.-] |
ORF03961 | 7921和7922 | 胞内生长弱化子蛋白igaA |
ORF03962 | 7923和7924 | HAD-超家族水解酶,亚家族IA,变体3蛋白家族 |
ORF03963 | 7925和7926 | 热激蛋白15(HSP15)(HSP15) |
ORF03964 | 7927和7928 | 33 kDa侣伴蛋白(热激蛋白33)(HSP33)(HSP33) |
ORF03965 | 7929和7930 | 推定膜蛋白 |
ORF03966 | 7931和7932 | 磷酸烯醇式丙酮酸羧基激酶(ATP)(pckA)[4.1.1.49] |
ORF03967 | 7933和7934 | 渗透压传感蛋白envZ[2.7.3.-] |
ORF03968 | 7935和7936 | 影响ompC和ompF转录的反应调节蛋白(传感蛋白,EnvZ):外膜蛋白合成 |
ORF03969 | 7937和7938 | 转录延长因子GreB(greB) |
ORF03970 | 7939和7940 | 蛋白yhgF |
ORF03971 | 7941和7942 | 亚铁转运蛋白B |
ORF03972 | 7943和7944 | 亚铁转运蛋白B(feoB) |
ORF03973 | 7945和7946 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03974 | 7947和7948 | 转座酶 |
ORF03975 | 7949和7950 | 假拟蛋白 |
ORF03976 | 7951和7952 | bioH蛋白(bioH) |
ORF03977 | 7953和7954 | 假拟蛋白 |
ORF03978 | 7955和7956 | 预测的酰氨基磷酸核糖基转移酶 |
ORF03979 | 7957和7958 | 蛋白yhgI |
ORF03980 | 7959和7960 | 高亲和葡糖酸转运蛋白(葡糖酸通透酶)(Gnt-Isystem) |
ORF0398 1 | 7961和7962 | 4-α-葡聚糖转移酶(malQ)[2.4.1.25] |
ORF03982 | 7963和7964 | 麦芽糖糊精磷酸化酶[2.4.1.1] |
ORF03983 | 7965和7966 | 推定的转录调节蛋白,LuxR家族 |
ORF03984 | 7967和7968 | RNA 3′-末端磷酸环化酶(rtcA)[6.5.1.4] |
ORF03985 | 7969和7970 | 蛋白rtcB |
ORF03986 | 7971和7972 | 甘油-3-磷酸调节子阻抑物 |
ORF03987 | 7973和7974 | 转录调节蛋白y蛋白rtcR |
ORF03988 | 7975和7976 | 推定的λ家族蛋白 |
ORF03989 | 7977和7978 | 未命名的蛋白产物;glpE多肽(AA1-131) |
ORF03990 | 7979和7980 | 需氧性甘油-3-磷酸脱氢酶(需氧) |
ORF03991 | 7981和7982 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03992 | 7983和7984 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03993 | 7985和7986 | 保守性假拟蛋白 |
ORF03994 | 7987和7988 | 甘露糖结合蛋白FimH前体 |
ORF03995 | 7989和7990 | 菌毛侣伴蛋白 |
ORF03996 | 7991和7992 | 推定的小菌毛亚基前体 |
ORF03997 | 7993和7994 | 推定的小菌毛亚基前体 |
ORF03998 | 7995和7996 | FlC菌毛传达蛋白 |
ORF03999 | 7997和7998 | 侣伴蛋白蛋白fimC前体 |
ORF04000 | 7999和8000 | 长极性菌毛蛋白A前体(菌毛蛋白) |
ORF04001 | 8001和8002 | 糖元磷酸化酶[2.4.1.1] |
ORF04002 | 8003和8004 | 糖元合酶(淀粉[细菌糖原]合酶)[2.4.1.21] |
ORF04003 | 8005和8006 | 葡萄糖-1-磷酸腺苷酰转移酶(glgC)[2.7.7.27] |
ORF04004 | 8007和8008 | 糖元脱支酶GlgX(glgX)[3.2.1.-] |
ORF04005 | 8009和8010 | 1,4-α-葡聚糖分支酶(glgB)[2.4.1.18] |
ORF04006 | 8011和8012 | 天冬氨酸-半醛脱氢酶(asd)[1.2.1.11] |
ORF04007 | 8013和8014 | 推定的膜蛋白 |
ORF04008 | 8015和8016 | 推定的葡糖酸通透酶 |
ORF04009 | 8017和8018 | 耐热葡糖酸激酶(葡糖酸激酶2) |
ORF04010 | 8019和8020 | HTH型转录调节蛋白gntR(葡糖酸利用系统GNT-I转录阻抑物)(gnt) |
ORF04011 | 8021和8022 | 蛋白yhhW |
ORF04012 | 8023和8024 | 推定的氧化还原酶yhhX[1.-.-.-] |
ORF04013 | 8025和8026 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04014 | 8027和8028 | 推定的乙酰基转移酶,GNAT家族[2.3.1.-] |
ORF04015 | 8029和8030 | 未命名的蛋白产物;类似于Hcp蛋白 |
ORF04016 | 8031和8032 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04017 | 8033和8034 | γ-谷氨酰转移酶(ggt)[2.3.2.2] |
ORF04018 | 8035和8036 | 甘油磷酸二酯磷酸二酯酶[3.1.4.46] |
ORF040l9 | 8037和8038 | CG9973-PA |
ORF04020 | 8039和8040 | SN-甘油-3-磷酸转运ATP-结合蛋白ugpC |
ORF04021 | 8041和8042 | SN-甘油-3-磷酸转运系统通透酶蛋白ugpE(膜) |
ORF04022 | 8043和8044 | 甘油-3-磷酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白(膜) |
ORF04023 | 8045和8046 | 甘油-3-磷酸-结合性周质蛋白前体 |
ORF04024 | 8047和8048 | ABC转运蛋白结构域蛋白 |
ORF04025 | 8049和8050 | 高亲和支链氨基酸转运ATP-结合蛋白livG(LIV-I蛋白G)(AJ272047) |
ORF04026 | 8051和8052 | 高亲和支链氨基酸转运系统通透酶蛋白livM(LIV-I蛋白M) |
ORF04027 | 8053和8054 | 高亲和支链氨基酸转运系统通透酶蛋白livH |
ORF04028 | 8055和8056 | 亮氨酸特异性结合蛋白前体 |
ORF04029 | 8057和8058 | 乙酰基转移酶,GNAT家族 |
ORF04030 | 8059和8060 | Leu-Ile-Val-结合蛋白前体 |
ORF04031 | 8061和8062 | PTS系统,甘露糖特异性酶II,AB组件(EIII-MAN)[2.7.1.69] |
ORF04032 | 8063和8064 | PTS系统,甘露糖特异性IIAB组件,推定[2.7.1.69] |
ORF04033 | 8065和8066 | PTS系统,IIC组件(PTS) |
ORF04034 | 8067和8068 | 甘露糖特异性PTS酶IID |
ORF04035 | 8069和8070 | D-3-磷酸甘油酸脱氢酶(serA)[1.1.1.95] |
ORF04036 | 8071和8072 | 二氢二皮考啉酸合酶(dapA)[4.2.1.52] |
ORF04037 | 8073和8074 | 另一种σ因子RpoH(rpoH) |
ORF04038 | 8075和8076 | 推定的蛋白插入通透酶FtsX(ftsX) |
ORF04039 | 8077和8078 | 细胞分裂ATP-结合蛋白ftsE |
ORF04040 | 8079和8080 | 细胞分裂蛋白ftsY |
ORF04041 | 8081和8082 | 推定的甲基转移酶 |
ORF04042 | 8083和8084 | 与前一ORF重叠,可能采用下游启动 |
ORF04043 | 8085和8086 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04044 | 8087和8088 | 推定膜蛋白 |
ORF04045 | 8089和8090 | 铅、镉、锌和汞转运ATP酶[3.6.3.3] |
ORF04046 | 8091和8092 | SirA蛋白 |
ORF04047 | 8093和8094 | 膜蛋白(o221) |
ORF04048 | 8095和8096 | DcrB蛋白前体 |
ORF04049 | 8097和8098 | 假拟的UPF0226蛋白yhhS |
ORF04050 | 8099和8100 | 推定的功能未知的结构域 |
ORF04051 | 8101和8102 | 4′-磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶acpT[2.7.8.-] |
ORF04052 | 8103和8104 | 镍ABC转运蛋白,周质镍-结合蛋白(nikA) |
ORF04053 | 8105和8106 | 镍转运系统通透酶蛋白nikB(通透酶) |
ORF04054 | 8107和8108 | 推定的二肽ABC转运蛋白,通透酶蛋白 |
ORF04055 | 8109和8110 | 镍转运ATP-结合蛋白nikD |
ORF04056 | 8111和8112 | 镍转运ATP-结合蛋白nikE |
ORF04057 | 8113和8114 | 镍反应性调节蛋白 |
ORF04058 | 8115和8116 | 推定的转录调节蛋白,GntR家族 |
ORF04059 | 8117和8118 | PTS系统IIA组件,可能的,推定的 |
ORF04060 | 8119和8120 | PTS系统,半乳糖醇特异性酶II,B组件[2.7.1.69] |
ORF04061 | 8121和8122 | PTS系统,山梨糖醇特异性IIC组件 |
ORF04062 | 8123和8124 | 可能的木酮糖激酶Z4878[2.7.1.30] |
ORF04063 | 8125和8126 | 磷酸转移酶系统HPr酶(PTS) |
ORF04064 | 8127和8128 | 塔格糖-双磷酸醛缩酶GatY [4.1.2.-] |
ORF04065 | 8129和8130 | ABC-2型转运蛋白家族 |
ORF04066 | 8131和8132 | 核糖体结合性ATP酶,ATP结合结构域(N-末端) |
ORF04067 | 8133和8134 | I型抗冻蛋白:HlyD家族分泌蛋白 |
ORF04068 | 8135和8136 | 推定膜蛋白 |
ORF04069 | 8137和8138 | 保守性假拟蛋白TIGR00275 |
ORF04070 | 8139和8140 | 低亲和无机磷酸转运蛋白1 |
ORF04071 | 8141和8142 | 通用的应激蛋白B |
ORF04072 | 8143和8144 | 通用的应激蛋白A(UspA) |
ORF04073 | 8145和8146 | 假拟蛋白 |
ORF04074 | 8147和8148 | 假拟的转运蛋白yhiP |
ORF04075 | 8149和8150 | gtg启动,可能交替启动 |
ORF04076 | 8151和8152 | 寡肽酶A |
ORF04077 | 8153和8154 | 功能未知的蛋白(DUF519)超家族 |
ORF04078 | 8155和8156 | 谷胱甘肽-二硫还原酶(gor)[1.8.1.7] |
ORF04079 | 8157和8158 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04080 | 8159和8160 | 砷酸还原酶[1.20.4.1] |
ORF04081 | 8161和8162 | 碳饥饿诱导的外膜蛋白 |
ORF04082 | 8163和8164 | 假拟的转录调节蛋白yhiF |
ORF04083 | 8165和8166 | 高铁血红素转运蛋白hmuS |
ORF04084 | 8167和8168 | 外膜高铁血红素受体ChuA |
ORF04085 | 8169和8170 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04086 | 8171和8172 | 推定的周质结合蛋白 |
ORF04087 | 8173和8174 | HugW |
ORF04088 | 8175和8176 | HuvX蛋白(片段) |
ORF04089 | 8177和8178 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04090 | 8179和8180 | 高铁血红素ABC转运蛋白通透酶蛋白 |
ORF04091 | 8181和8182 | 高铁血红素转运系统ATP-结合蛋白 |
ORF04092 | 8183和8184 | 阳离子转运ATP酶yqgG |
ORF04093 | 8185和8186 | 蛋白hdeB前体 |
ORF04094 | 8187和8188 | 推定的蛋白hdeA前体 |
ORF04095 | 8189和8190 | HdeD蛋白 |
ORF04096 | 8191和8192 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04097 | 8193和8194 | 多药外流泵SdeX |
ORF04098 | 8195和8196 | RND家族,吖啶-多药外流泵 |
ORF04099 | 8197和8198 | HTH型转录调节蛋白appY(M5多肽) |
ORF04100 | 8199和8200 | 转录调节蛋白gadX |
ORF04101 | 8201和8202 | 谷氨酸脱羧酶[4.1.1.15] |
ORF04102 | 8203和8204 | 细胞色素c551过氧化物酶 |
ORF04103 | 8205和8206 | 海藻糖酶[3.2.1.28] |
ORF04104 | 8207和8208 | 毒力调节蛋白 |
ORF04105 | 8209和8210 | 转录调节蛋白 |
ORF04106 | 8211和8212 | 核糖核酸酶,推定的 |
ORF04107 | 8213和8214 | 代谢物-质子同向转运蛋白 |
ORF04108 | 8215和8216 | 参与外膜生物合成的未表征蛋白 |
ORF04109 | 8217和8218 | 推定的EAL结构域 |
ORF04110 | 8219和8220 | 2-脱氢-3-脱氧葡糖酸激酶 |
ORF04111 | 8221和8222 | 蛋白yhjJ前体[3.4.99.-] |
ORF04112 | 8223和8224 | 需氧C4-二羧酸转运蛋白 |
ORF04113 | 8225和8226 | 蛋白yhjK |
ORF04114 | 8227和8228 | 纤维素合酶操纵子蛋白C |
ORF04115 | 8229和8230 | Endo葡聚糖酶前体 |
ORF04116 | 8231和8232 | 环式二-GMP结合蛋白前体 |
ORF04117 | 8233和8234 | 纤维素合酶催化亚基[UDP形成] |
ORF04118 | 8235和8236 | YhjQ蛋白家族 |
ORF04119 | 8237和8238 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04120 | 8239和8240 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04121 | 8241和8242 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04122 | 8243和8244 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04123 | 8245和8246 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04124 | 8247和8248 | 假拟的转运蛋白yhjV |
ORF04125 | 8249和8250 | 肽ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(atp结合) |
ORF04126 | 8251和8252 | 二肽转运ATP-结合蛋白dppD(atp结合) |
ORF04127 | 8253和8254 | 二肽转运系统通透酶蛋白dppC(膜) |
ORF04128 | 8255和8256 | 二肽转运系统通透酶蛋白dppB(通透酶) |
ORF04129 | 8257和8258 | 周质二肽转运蛋白前体(DBP) |
ORF04130 | 8259和8260 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04131 | 8261和8262 | 膜-蛋白yhjW |
ORF04132 | 8263和8264 | 推定的抗性蛋白 |
ORF04133 | 8265和8266 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04134 | 8267和8268 | DNA-3-甲基腺嘌呤糖基化酶I[3.2.2.20] |
ORF04135 | 8269和8270 | 生物素亚砜还原酶 |
ORF04136 | 8271和8272 | 假拟的乙酰基转移酶yiaC(GNAT)[2.3.1.-] |
ORF04137 | 8273和8274 | 可能的外膜蛋白yiaD |
ORF04138 | 8275和8276 | 2-酮葡糖酸还原酶[1.1.1.215] |
ORF04139 | 8277和8278 | 推定脂蛋白 |
ORF04140 | 8279和8280 | 推定的HTH型转录调节蛋白yiaG |
ORF04141 | 8281和8282 | 冷激样蛋白 |
ORF04142 | 8283和8284 | 可能的膜通透性改变蛋白Z4982相关蛋白 |
ORF04143 | 8285和8286 | 甘氨酰-tRNA合成酶,β亚基(glyS)[6.1.1.14] |
ORF04144 | 8287和8288 | 甘氨酰-tRNA合成酶,α亚基(glyQ)[6.1.1.14] |
ORF04145 | 8289和8290 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04146 | 8291和8292 | 酰基转移酶家族,推定的 |
ORF04147 | 8293和8294 | yiaA-B二螺旋结构域家族 |
ORF04148 | 8295和8296 | yiaA-B二螺旋结构域家族 |
ORF04149 | 8297和8298 | 木酮糖激酶(xylB)[2.7.1.17] |
ORF04150 | 8299和8300 | 木糖异构酶(xylA)[5.3.1.5] |
ORF04151 | 8301和8302 | D-木糖ABC转运蛋白,周质-D木糖结合蛋白 |
ORF04152 | 8303和8304 | 糖ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(xylG) |
ORF04153 | 8305和8306 | 糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白 |
ORF04154 | 8307和8308 | 木糖操纵子调节蛋白(xylR) |
ORF04155 | 8309和8310 | BAX蛋白 |
ORF04156 | 8311和8312 | A-淀粉酶前体[3.2.1.1] |
ORF04157 | 8313和8314 | 缬氨酸-丙酮酸氨基转移酶 |
ORF04158 | 8315和8316 | 电子传递蛋白hydN |
ORF04159 | 8317和8318 | IclR家族转录阻抑物 |
ORF04160 | 8319和8320 | 2-酮还原酶[1.1.1.-] |
ORF04161 | 8321和8322 | YiaL |
ORF04162 | 8323和8324 | YiaX1 |
ORF04163 | 8325和8326 | TRAP转运蛋白,DctQ样膜蛋白超家族 |
ORF04164 | 8327和8328 | C4-二羧酸转运系统通透酶大蛋白(DctM) |
ORF04165 | 8329和8330 | DctP蛋白(AP001509) |
ORF04166 | 8331和8332 | 推定的糖激酶,FGGY家族[2.7.1.53] |
ORF04167 | 8333和8334 | 己酮糖-6-磷酸合酶(humps)[4.1.2.-] |
ORF04168 | 8335和8336 | 推定的己酮糖-6-磷酸异构酶 |
ORF04169 | 8337和8338 | L-核酮糖-5-磷酸4-差向异构酶(araD)[5.1.3.4] |
ORF04170 | 8339和8340 | 醛脱氢酶家族蛋白(AF029733) |
ORF04171 | 8341和8342 | Fic蛋白家族 |
ORF04172 | 8343和8344 | 醇脱氢酶,IV类[1.1.1.1] |
ORF04173 | 8345和8346 | 硒代半胱氨酸特异性翻译延长因子(selB) |
ORF04174 | 8347和8348 | L-丝氨酰-tRNA硒转移酶(selA)[2.9.1.1] |
ORF04175 | 8349和8350 | 假拟的GST样蛋白yibF |
ORF04176 | 8351和8352 | 多药耐药外流泵 |
ORF04177 | 8353和8354 | GTP酶 |
ORF04178 | 8355和8356 | PTS系统,甘露醇特异性酶IIABC组件[2.7.1.69] |
ORF04179 | 8357和8358 | 甘露醇-1-磷酸5-脱氢酶[1.1.1.17] |
ORF04180 | 8359和8360 | 甘露醇操纵子阻抑物(甘露醇阻抑物蛋白) |
ORF04181 | 8361和8362 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04182 | 8363和8364 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04183 | 8365和8366 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04184 | 8367和8368 | 表面蛋白(partial) |
ORF04185 | 8369和8370 | L-乳酸通透酶 |
ORF04186 | 8371和8372 | 转录调节蛋白 |
ORF04187 | 8373和8374 | L-乳酸脱氢酶(1ctD)[1.1.2.3] |
ORF04188 | 8375和8376 | RNA甲基转移酶,TrmH家族,2类 |
ORF04189 | 8377和8378 | 丝氨酸乙酰基转移酶(SAT)(SAT)[2.3.1.30] |
ORF04190 | 8379和8380 | 甘油-3-磷酸脱氢酶[NAD(P)+](NAD(P)H依赖性甘油-3-磷酸脱氢酶)(gpsA) |
ORF04191 | 8381和8382 | 蛋白-输出蛋白SecB(secB) |
ORF04192 | 8383和8384 | 谷氧还蛋白3(grxC) |
ORF04193 | 8385和8386 | 硫氰酸生成酶样结构域蛋白 |
ORF04194 | 8387和8388 | 2,3-双磷酸甘油酸非依赖型磷酸甘油酸变位酶(gpmI)[5.4.2.1] |
ORF04195 | 8389和8390 | 膜-结合性金属肽酶 |
ORF04196 | 8391和8392 | 推定的糖基转移酶,2类家族蛋白[2.-.-.-] |
ORF04197 | 8393和8394 | yibQ基因产物 |
ORF04198 | 8395和8396 | L-苏氨酸3-脱氢酶(tdh)[1.1.1.103] |
ORF04199 | 8397和8398 | 2-氨基-3-酮丁酸辅酶A连接酶(kbl)[2.3.1.29] |
ORF04200 | 8399和8400 | ADP-L-甘油-D-甘露糖-庚糖-6-差向异构酶(rfaD)[5.1.3.20] |
ORF04201 | 8401和8402 | 脂多糖庚糖基转移酶II(rfaF) |
ORF04202 | 8403和8404 | 脂多糖庚糖基转移酶I(rfaC)[2.-.-.-] |
ORF04203 | 8405和8406 | 脂质A-核心,表面聚合物连接酶 |
ORF04204 | 8407和8408 | β-1,3-糖基转移酶[2.4.1.166] |
ORF04205 | 8409和8410 | UDP-半乳糖:(半乳糖基)LPS α-1,2-半乳糖基转移酶(糖基)[2.4.1.58] |
ORF04206 | 8411和8412 | 庚糖基-II-激酶 |
ORF04207 | 8413和8414 | UDP-半乳糖:(糖基)[2.4.1.58] |
ORF04208 | 8415和8416 | UDP-葡萄糖:(糖基)[2.4.1.44] |
ORF04209 | 8417和8418 | 脂多糖核心生物合成蛋白rfaP |
ORF04210 | 8419和8420 | UDP-葡萄糖:(庚糖基)[2.4.1.-] |
ORF04211 | 8421和8422 | 推定的脂多糖庚糖基转移酶III |
ORF04212 | 8423和8424 | 3-脱氧-D-甘露糖-辛酮糖酸转移酶(KDO转移酶)(KDO)[2.-.-.-] |
ORF04213 | 8425和8426 | 泛酰巯基乙胺-磷酸腺苷酰转移酶(coaD)[2.7.7.3] |
ORF04214 | 8427和8428 | 甲酰胺基嘧啶-DNA糖基化酶(mutM)[3.2.2.23] |
ORF04215 | 8429和8430 | 核糖体蛋白L33(rpmG) |
ORF04216 | 8431和8432 | RpmB蛋白(rpL28) |
ORF04217 | 8433和8434 | DNA修复蛋白 |
ORF04218 | 8435和8436 | 磷酸泛酰半胱氨酸脱羧酶-磷酸泛酸-半胱氨酸连接酶(coaBC)[4.1.1.36 6.3.2.5] |
ORF04219 | 8437和8438 | 脱氧尿苷5′-三磷酸核苷酸水解酶(dut)[3.6.1.23] |
ORF04220 | 8439和8440 | Ttk蛋白 |
ORF04221 | 8441和8442 | 乳清酸磷酸核糖基转移酶(pyrE)[2.4.2.10] |
ORF04222 | 8443和8444 | 核糖核酸酶PH(rph)[2.7.7.56] |
ORF04223 | 8445和8446 | 保守性假拟蛋白TIGR00255 |
ORF04224 | 8447和8448 | 假拟蛋白 |
ORF04225 | 8449和8450 | DNA损伤-诱导蛋白D |
ORF04226 | 8451和8452 | 预测的膜蛋白 |
ORF04227 | 8453和8454 | 假拟的DNA连接酶样蛋白yicF |
ORF04228 | 8455和8456 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04229 | 8457和8458 | 鸟苷酸激酶 |
ORF04230 | 8459和8460 | 以DNA为指导的RNA聚合酶ω链(RNAPω亚基)(转录酶ω链)(RNA聚合酶ω亚 |
ORF04231 | 8461和8462 | 鸟苷-3,5-双(二磷酸)3-焦磷酸水解酶(ppGpp) |
ORF04232 | 8463和8464 | tRNA(鸟苷-2′-O-)-甲基转移酶(Gm18)[2.1.1.34] |
ORF04233 | 8465和8466 | ATP依赖性DNA解旋酶RecG(recG)[3.6.1.-] |
ORF04234 | 8467和8468 | 钠-谷氨酸同向转运蛋白(gltS) |
ORF04235 | 8469和8470 | 黄嘌呤-尿嘧啶通透酶家族蛋白 |
ORF04236 | 8471和8472 | 可能的输出蛋白 |
ORF04237 | 8473和8474 | 功能未知的蛋白(DUF1498)超家族 |
ORF04238 | 8475和8476 | 可能的NAGC样转录调节蛋白 |
ORF04239 | 8477和8478 | 果糖-双磷酸醛缩酶,II类家族[4.1.2.13] |
ORF04240 | 8479和8480 | 果糖-双磷酸醛缩酶,II类家族[4.1.2.-] |
ORF04241 | 8481和8482 | PTS系统,IIbc组件(PTS)[2.7.1.69] |
ORF04242 | 8483和8484 | PTS系统,果糖-样-2 IIB组件1 |
ORF04243 | 8485和8486 | PTS系统,EIIa组件(PTS)[2.7.1.69] |
ORF04244 | 8487和8488 | 推定的转录抗终止蛋白BglG家族蛋白 |
ORF04245 | 8489和8490 | f772[3.2.1.20] |
ORF04246 | 8491和8492 | 类似于蜜二糖载体蛋白 |
ORF04247 | 8493和8494 | RhuM(部分) |
ORF04248 | 8495和8496 | 膜蛋白 |
ORF04249 | 8497和8498 | 脂蛋白-28前体(hlpA) |
ORF04250 | 8499和8500 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04251 | 8501和8502 | 推定的转运蛋白 |
ORF04252 | 8503和8504 | 功能未知的蛋白(DUF1198)超家族 |
ORF04253 | 8505和8506 | 黄嘌呤-尿嘧啶通透酶家族蛋白亚家族 |
ORF04254 | 8507和8508 | 腺嘌啉脱氨酶(ade)[3.5.4.2] |
ORF04255 | 8509和8510 | 己醣磷酸转运蛋白 |
ORF04256 | 8511和8512 | 调节蛋白uhpC |
ORF04257 | 8513和8514 | 传感蛋白uhpB |
ORF04258 | 8515和8516 | 假拟蛋白 |
ORF04259 | 8517和8518 | 反应调节蛋白,uhpT转录的正激活物 |
ORF04260 | 8519和8520 | 推定的乙酰乳酸合酶,小亚基[2.2.1.6] |
ORF04261 | 8521和8522 | 乙酰乳酸合酶,大亚基,生物合成类型(ilvB)[2.2.1.6] |
ORF04262 | 8523和8524 | 多药耐药蛋白D |
ORF04263 | 8525和8526 | f165[1.-.-.-] |
ORF04264 | 8527和8528 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04265 | 8529和8530 | 预测的膜蛋白 |
ORF04266 | 8531和8532 | 可能的硫酸酯酶yidJ [3.1.6.-] |
ORF04267 | 8533和8534 | 推定的硫酸酯酶yidJ[3.1.6.-] |
ORF04268 | 8535和8536 | Na+-肌醇共同转运蛋白 |
ORF04269 | 8537和8538 | 推定的msm操纵子调节蛋白 |
ORF04270 | 8539和8540 | 推定的摄钾蛋白TrkA |
ORF04271 | 8541和8542 | 热激蛋白 |
ORF04272 | 8543和8544 | 热激蛋白 |
ORF04273 | 8545和8546 | 假拟蛋白 |
ORF04274 | 8547和8548 | o135蛋白 |
ORF04275 | 8549和8550 | f416 |
ORF04276 | 8551和8552 | MFS转运蛋白,邻苯二甲酸通透酶家族 |
ORF04277 | 8553和8554 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04278 | 8555和8556 | 扁桃酸消旋酶-粘康酸内酯化酶家族蛋白(partial)[4.2.1.6] |
ORF04279 | 8557和8558 | 4-羟基-2-酮戊二酸醛缩酶-2-脱氢-3-脱氧磷酸葡糖酸[4.1.2.21] |
ORF04280 | 8559和8560 | 2-脱氢-3-脱氧半乳糖酸激酶[2.7.1.58] |
ORF04281 | 8561和8562 | 半乳糖酸利用的转录阻抑物(GntR家族)(AF096293) |
ORF04282 | 8563和8564 | 可能的复制酶Z5187 |
ORF04283 | 8565和8566 | Cof家族蛋白 |
ORF04284 | 8567和8568 | 功能未知的细菌蛋白(DUF937)家族 |
ORF04285 | 8569和8570 | DNA促旋酶,B亚基(gyrB)[5.99.1.3] |
ORF04286 | 8571和8572 | DNA复制和修复蛋白recF[相似性] |
ORF04287 | 8573和8574 | DNA聚合酶III,β亚基(dnaN)[2.7.7.7] |
ORF04288 | 8575和8576 | 染色体复制启动蛋白DnaA(dnaA) |
ORF04289 | 8577和8578 | 核糖体蛋白L34(rpmH) |
ORF04290 | 8579和8580 | 核糖核酸酶P蛋白组件(rnpA)[3.1.26.5] |
ORF04291 | 8581和8582 | 保守性假拟蛋白TIGR00278 |
ORF04292 | 8583和8584 | 内膜蛋白oxaA(IMP) |
ORF04293 | 8585和8586 | tRNA修饰GTP酶TrmE(trmE) |
ORF04294 | 8587和8588 | 色氨酸酶(TN酶)[4.1.99.1] |
ORF04295 | 8589和8590 | 低亲和色氨酸通透酶 |
ORF04296 | 8591和8592 | 类似于耐药性转位酶 |
ORF04297 | 8593和8594 | 转录调节蛋白,LysR家族 |
ORF04298 | 8595和8596 | 假拟蛋白 |
ORF04299 | 8597和8598 | o252 |
ORF04300 | 8599和8600 | YieF(推定) |
ORF04301 | 8601和8602 | f445 |
ORF04302 | 8603和8604 | 推定的卤代酸脱卤酶样水解酶 |
ORF04303 | 8605和8606 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04304 | 8607和8608 | 嘧啶特异性核苷水解酶[3.5.99.6] |
ORF04305 | 8609和8610 | 推定的酯酶家族,推定 |
ORF04306 | 8611和8612 | 推定的木聚糖酶 |
ORF04307 | 8613和8614 | f538 |
ORF04308 | 8615和8616 | 6-磷酸-β-葡糖苷酶bglB[3.2.1.86] |
ORF04309 | 8617和8618 | PTS系统,β-葡糖苷特异性IIABC组件 |
ORF04310 | 8619和8620 | 隐藏β-葡糖苷bgl操纵子抗终止蛋白 |
ORF04311 | 8621和8622 | 磷酸转运系统调节蛋白PhoU(phoU) |
ORF04312 | 8623和8624 | 磷酸ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(pstB)[3.6.3.27] |
ORF04313 | 8625和8626 | 磷酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白PstA(pstA) |
ORF04314 | 8627和8628 | 磷酸ABC转运蛋白,通透酶蛋白PstC(pstC) |
ORF04315 | 8629和8630 | 磷酸ABC转运蛋白,磷酸-结合蛋白(pstS) |
ORF04316 | 8631和8632 | 葡糖胺-果糖-6-磷酸氨基转移酶,异构化(glmS)[2.6.1.16] |
ORF04317 | 8633和8634 | UDP-N-乙酰葡糖胺焦磷酸化酶(glmU)[2.7.7.23] |
ORF04318 | 8635和8636 | ATP合酶F1,ε亚基(atpC) [3.63.14] |
ORF04319 | 8637和8638 | ATP合酶F1,β亚基(atpD)[3.6.3.14] |
ORF04320 | 8639和8640 | ATP合酶F1,γ亚基(atpG)[3.6.3.14] |
ORF04321 | 8641和8642 | ATP合酶F1,α亚基(atpA)[3.6.3.14] |
ORF04322 | 8643和8644 | ATP合酶F1,δ亚基(atpH)[3.6.3.14] |
ORF04323 | 8645和8646 | ATP合酶F0,B亚基(atpF)[3.6.3.14] |
ORF04324 | 8647和8648 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04325 | 8649和8650 | ATP合酶F0,C亚基[3.6.3.14] |
ORF04326 | 8651和8652 | ATP合酶F0,A亚基(atpB)[3.6.3.14] |
ORF04327 | 8653和8654 | ATP合酶F0,I亚基(atpI)[3.6.3.14] |
ORF04328 | 8655和8656 | 甲基转移酶GidB (gidB)[2.1.-.-] |
ORF04329 | 8657和8658 | 葡萄糖-抑制性分裂蛋白A(gidA) |
ORF04330 | 8659和8660 | 蛋白mioC(mioC) |
ORF04331 | 8661和8662 | 转录调节蛋白,AsnC家族(asnC) |
ORF04332 | 8663和8664 | 天冬氨酸-氨连接酶(asnA)[6.3.1.1] |
ORF04333 | 8665和8666 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04334 | 8667和8668 | 未命名的蛋白产物 |
ORF04335 | 8669和8670 | 摄钾蛋白(kup) |
ORF04336 | 8671和8672 | 高亲和核糖转运蛋白rbsD |
ORF04337 | 8673和8674 | 核糖ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(atp结合) |
ORF04338 | 8675和8676 | 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白(rbsC) |
ORF04339 | 8677和8678 | 核糖ABC转运蛋白,周质D-核糖结合蛋白 |
ORF04340 | 8679和8680 | 核糖激酶(rbsK)[2.7.1.15] |
ORF04341 | 8681和8682 | 耐药性转运蛋白,EmrB-QacA家族 |
ORF04342 | 8683和8684 | rbs操纵子的调节蛋白 |
ORF04343 | 8685和8686 | ProP蛋白 |
ORF04344 | 8687和8688 | yieP基因产物(AF096293) |
ORF04345 | 8689和8690 | 假拟蛋白 |
ORF04346 | 8691和8692 | 转录调节蛋白 |
ORF04347 | 8693和8694 | o137(Y1FE) |
ORF04348 | 8695和8696 | Mg螯合酶-相关蛋白 |
ORF04349 | 8697和8698 | 假拟蛋白 |
ORF04350 | 8699和8700 | 乙酰乳酸合酶,大亚基,生物合成类型(i1vB)[2.2.1.6] |
ORF04351 | 8701和8702 | 乙酰乳酸合酶II短链(ALS-II)[4.1.3.18] |
ORF04352 | 8703和8704 | 支链氨基酸氨基转移酶(ilvE)[2.6.1.42] |
ORF04353 | 8705和8706 | 二羟酸脱水酶(ilvD)[4.2.1.9] |
ORF04354 | 8707和8708 | 苏氨酸氨-裂合酶,生物合成(ilvA)[4.3.1.19] |
ORF04355 | 8709和8710 | 推定的转录调节蛋白,LysR家族 |
ORF04356 | 8711和8712 | 酮醇-酸还原异构酶(ILVC)[1.1.1.86] |
ORF04357 | 8713和8714 | 肽基脯氨酰异构酶(SPP39159)[5.2.1.8] |
ORF04358 | 8715和8716 | ATP依赖性DNA解旋酶Rep(rep)[3.6.1.-] |
ORF04359 | 8717和8718 | 鸟苷-5′-三磷酸,3′-二磷酸焦磷酸酶[3.6.1.40] |
ORF04360 | 8719和8720 | rhlB蛋白(RHLB)[3.6.1.-] |
ORF04361 | 8721和8722 | 硫氧还蛋白1 |
ORF04362 | 8723和8724 | 转录终止因子Rho(rho) |
ORF04363 | 8725和8726 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04364 | 8727和8728 | 十一异戊二烯基-磷酸α-N-乙酰氨基葡萄糖基1-磷酸转移酶(wecA)[2.7.8.-] |
ORF04365 | 8729和8730 | 脂多糖生物合成蛋白wzzE |
ORF04366 | 8731和8732 | UDP-N-乙酰葡糖胺2-差向异构酶[5.1.3.14] |
ORF04367 | 8733和8734 | UDP-N-乙酰基-D-甘露糖胺脱氢酶(ECA)[1.1.1.-] |
ORF04368 | 8735和8736 | dTDP-葡萄糖4,6-脱水酶(rfbB)[4.2.1.46] |
ORF04369 | 8737和8738 | 葡萄糖-1-磷酸胸苷酰转移酶(rfbA)[2.7.7.24] |
ORF04370 | 8739和8740 | TDP-D-墨角藻糖胺乙酰基转移酶(wecD) |
ORF04371 | 8741和8742 | 脂多糖生物合成蛋白rffA(WECE)[4.2.1.-] |
ORF04372 | 8743和8744 | WzxE蛋白(WZXE) |
ORF04373 | 8745和8746 | TDP-Fuc4NAc:脂质II Fuc4Nac转移酶(wecF)[2.4.1.-] |
ORF04374 | 8747和8748 | ECA生物合成蛋白WzyE(wzyE) |
ORF04375 | 8749和8750 | 可能是rffM (ECA)[2.4.1.-] |
ORF04376 | 8751和8752 | 假拟蛋白 |
ORF04377 | 8753和8754 | 类似于几种氨基酸转运蛋白(o461) |
ORF04378 | 8755和8756 | 酪氨酸重组酶XerC(xerC) |
ORF04379 | 8757和8758 | o238(YIGB) |
ORF04380 | 8759和8760 | 酪氨酸重组酶XerC(xerC) |
ORF04381 | 8761和8762 | o238(YIGB) |
ORF04382 | 8763和8764 | 芳基硫酸酯酶调节蛋白 |
ORF04383 | 8765和8766 | 芳基硫酸酯酶[3.1.6.1] |
ORF04384 | 8767和8768 | hemY蛋白(hemY) |
ORF04385 | 8769和8770 | 尿卟啉原III甲基化酶(HEMX)[2.1.1.107] |
ORF04386 | 8771和8772 | 尿卟啉原-III合酶(hemD)[4.2.1.75] |
ORF04387 | 8773和8774 | 胆色素原脱氨酶(hemC)[2.5.1.61] |
ORF04388 | 8775和8776 | 腺苷酸环化酶,I类(cyaA)[4.6.1.1] |
ORF04389 | 8777和8778 | CyaY蛋白(CYAY) |
ORF04390 | 8779和8780 | 可能的输出蛋白 |
ORF04391 | 8781和8782 | 推定脂蛋白 |
ORF04392 | 8783和8784 | 假拟的脂蛋白yifL前体相关蛋白 |
ORF04393 | 8785和8786 | 二氨基庚二酸差向异构酶(dapF)[5.1.1.7] |
ORF04394 | 8787和8788 | 功能未知的蛋白,DUF484超家族 |
ORF04395 | 8789和8790 | 酪氨酸重组酶XerC(xerC) |
ORF04396 | 8791和8792 | o238(YIGB) |
ORF04397 | 8793和8794 | DNA解旋酶11 (uvrD)[3.6.1.-] |
ORF04398 | 8795和8796 | 功能未知的蛋白超家族 |
ORF04399 | 8797和8798 | yigE蛋白 |
ORF04400 | 8799和8800 | 假拟蛋白 |
ORF04401 | 8801和8802 | 酶和钴转运蛋白CorA(corA) |
ORF04402 | 8803和8804 | 肠细菌推定的膜蛋白(DUF943)超家族 |
ORF04403 | 8805和8806 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04404 | 8807和8808 | 假拟蛋白 |
ORF04405 | 8809和8810 | rarD蛋白(rarD) |
ORF04406 | 8811和8812 | f161(YIGI) |
ORF04407 | 8813和8814 | 磷酸脂酶A1家族蛋白,中断[3.1.1.32] |
ORF04408 | 8815和8816 | ATP依赖性DNA解旋酶RecQ (recQ)[3.6.1.-] |
ORF04409 | 8817和8818 | 苏氨酸外流蛋白 |
ORF04410 | 8819和8820 | 转运蛋白,LysE家族 |
ORF04411 | 8821和8822 | 溶血磷脂酶L2(卵磷脂酶B)(PLDB)[3.1.1.5] |
ORF04412 | 8823和8824 | Cof蛋白 |
ORF04413 | 8825和8826 | HTH型转录调节蛋白metR (METR) |
ORF04414 | 8827和8828 | 假拟的膜蛋白yigM |
ORF04415 | 8829和8830 | 5-甲基四氢蝶酰三谷氨酸-高半胱氨酸S-甲基转移酶(metE)[2.1.1.14] |
ORF04416 | 8831和8832 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04417 | 8833和8834 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04418 | 8835和8836 | 6-磷酸-3-己酮糖异构酶(PHI) |
ORF04419 | 8837和8838 | PTS系统,葡萄糖特异性IIBC组件(ptsG)[2.7.1.69] |
ORF04420 | 8839和8840 | 酮糖转移酶(tkt)[2.2.1.1] |
ORF04421 | 8841和8842 | 转录调节蛋白,rpiR家族结构域蛋白 |
ORF04422 | 8843和8844 | 转录调节蛋白,LysR家族 |
ORF04423 | 8845和8846 | 推定的胞嘧啶转运蛋白 |
ORF04424 | 8847和8848 | 推定的酰胺酶家族蛋白 |
ORF04425 | 8849和8850 | 氨基甲酸激酶样蛋白yahI[2.7.2.2] |
ORF04426 | 8851和8852 | YahG-YlbE样蛋白 |
ORF04427 | 8853和8854 | YahF-FdrA样蛋白 |
ORF04428 | 8855和8856 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04429 | 8857和8858 | 异分支酸酶家族蛋白 |
ORF04430 | 8859和8860 | 假拟蛋白 |
ORF04431 | 8861和8862 | 推定的羧基亚甲基丁烯醇酶 |
ORF04432 | 8863和8864 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04433 | 8865和8866 | 尿苷磷酸化酶(udp)[2.4.2.3] |
ORF04434 | 8867和8868 | 推定的三羧酸转运蛋白TctA |
ORF04435 | 8869和8870 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04436 | 8871和8872 | 博尔德杆菌摄取基因(bug)产物超家族 |
ORF04437 | 8873和8874 | 4-羟基-2-酮戊二酸醛缩酶-2-脱氢-3-脱氧磷酸葡糖酸 |
ORF04438 | 8875和8876 | 2-脱氢-3-脱氧半乳糖酸激酶 |
ORF04439 | 8877和8878 | 转录调节蛋白,IclR家族 |
ORF04440 | 8879和8880 | DNA重组蛋白rmuC |
ORF04441 | 8881和8882 | 泛醌-甲基萘醌生物合成甲基转移酶ubiE(EC 2.1.1.-)(UBIE)[2.1.1.-] |
ORF04442 | 8883和8884 | 未命名的蛋白产物 |
ORF04443 | 8885和8886 | 2-多异戊二烯基苯酚6-羟化酶(ubiB)[1.14.13.-] |
ORF04444 | 8887和8888 | o261(YIGT) |
ORF04445 | 8889和8890 | o261 |
ORF04446 | 8891和8892 | Sec-非依赖型蛋白转位酶TatC(tatC) |
ORF04447 | 8893和8894 | tatD基因产物(YIGW)[3.1.21.-] |
ORF04448 | 8895和8896 | 转录激活蛋白RfaH(rfaH) |
ORF04449 | 8897和8898 | 3-八异戊二烯基-4-羟基苯甲酸羧基-裂合酶(名异戊二烯基对羟基苯甲酸脱羧酶) |
ORF04450 | 8899和8900 | NAD(P)H-黄素还原酶 |
ORF04451 | 8901和8902 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04452 | 8903和8904 | 乙酰-CoAC-酰基转移酶FadA(fadA)[2.3.1.16] |
ORF04453 | 8905和8906 | 脂肪酸氧化复合物,α亚基FadB(fadB)[4.2.1.17 5.3.3.8 1.1.1.35 5.1.2.3] |
ORF04454 | 8907和8908 | 未命名的蛋白产物;pepQ产物,脯氨酸二肽酶(PEPQ)[3.4.13.9] |
ORF04455 | 8909和8910 | 保守性假拟蛋白TIGR00257 |
ORF04456 | 8911和8912 | 双(5′-核苷基)-四磷酸酶,对称的-Trk系统摄钾蛋白TrkG,融合 |
ORF04457 | 8913和8914 | 原卟啉氧化酶 |
ORF04458 | 8915和8916 | 假拟蛋白 |
ORF04459 | 8917和8918 | 钼蝶呤-鸟嘌呤二核苷酸生物合成蛋白R(mobR) |
ORF04460 | 8919和8920 | 钼蝶呤-鸟嘌呤二核苷酸生物合成蛋白A |
ORF04461 | 8921和8922 | 蛋白yihD |
ORF04462 | 8923和8924 | YihE |
ORF04463 | 8925和8926 | 巯基:二硫键交换蛋白dsbA前体(por)[5.3.4.1] |
ORF04464 | 8927和8928 | 功能未知的细菌蛋白(DUF945)超家族 |
ORF04465 | 8929和8930 | 酰基转移酶结构域蛋白 |
ORF04466 | 8931和8932 | DNA聚合酶I(POL I)(polA)[2.7.7.7] |
ORF04467 | 8933和8934 | 细胞周期必需的GTP酶 |
ORF04468 | 8935和8936 | 嗜中性粒细胞蛋白 |
ORF04469 | 8937和8938 | 假拟蛋白 |
ORF04470 | 8939和8940 | 氧非依赖型粪卟啉原III氧化酶(hemN) |
ORF04471 | 8941和8942 | 假拟蛋白 |
ORF04472 | 8943和8944 | 氮调节蛋白NR(I)(ntrC) |
ORF04473 | 8945和8946 | 氮调节蛋白NR(II)[2.7.3.-] |
ORF04474 | 8947和8948 | 谷氨酰胺合成酶,I型(glnA)[6.3.1.2] |
ORF04475 | 8949和8950 | A型GTP-结合蛋白(typA) |
ORF04476 | 8951和8952 | 假拟蛋白 |
ORF04477 | 8953和8954 | 甘油-3-磷酸调节子阻抑物 |
ORF04478 | 8955和8956 | 假拟的糖激酶yihV |
ORF04479 | 8957和8958 | 3-羟基异丁酸脱氢酶 |
ORF04480 | 8959和8960 | 塔格糖1,6-二磷酸醛缩酶2(塔格糖-双磷酸醛缩酶2)(D-塔格糖-1,6-双磷酸醛缩 |
ORF04481 | 8961和8962 | 推定的2,3-丁二醇脱氢酶 |
ORF04482 | 8963和8964 | 推定的主要易化蛋白家族转运蛋白,截短 |
ORF04483 | 8965和8966 | 主要易化蛋白家族转运蛋白 |
ORF04484 | 8967和8968 | 醛糖1-差向异构酶超家族 |
ORF04485 | 8969和8970 | 推定的卤代酸脱卤酶样水解酶 |
ORF04486 | 8971和8972 | 推定的核糖核酸酶BN[3.1.-.-] |
ORF04487 | 8973和8974 | D-酪氨酰-tRNA(Tyr)脱酰酶(dtd)[3.1.-.-] |
ORF04488 | 8975和8976 | 保守的膜蛋白[2.3.1.18] |
ORF04489 | 8977和8978 | 脂酶,GDXG家族VCA0490 |
ORF04490 | 8979和8980 | 转录调节蛋白,Cro-CI家族 |
ORF04491 | 8981和8982 | 带-螺旋-螺旋蛋白,copG家族结构域蛋白 |
ORF04492 | 8983和8984 | 甲酸脱氢酶辅助蛋白FdhE(fdhE) |
ORF04493 | 8985和8986 | 甲酸脱氢酶,γ亚基[1.2.1.2] |
ORF04494 | 8987和8988 | 甲酸脱氢酶,β亚基(FdxH)[1.2.1.2] |
ORF04495 | 8989和8990 | 甲酸脱氢酶,α亚基[1.2.1.2] |
ORF04496 | 8991和8992 | 甲酸脱氢酶,α亚基,含有硒代半胱氨酸[1.2.1.2] |
ORF04497 | 8993和8994 | 甲酸脱氢酶家族辅助蛋白FdhD(fdhD) |
ORF04498 | 8995和8996 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04499 | 8997和8998 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04500 | 8999和9000 | 推定的血型糖蛋白 |
ORF04501 | 9001和9002 | 推定的枯草杆菌(B.subtilis)YulD蛋白同源物lin2978 |
ORF04502 | 9003和9004 | 鼠李树胶糖-1-磷酸醛缩酶 |
ORF04503 | 9005和9006 | L-鼠李糖异构酶(rhaA)[5.3.1.14] |
ORF04504 | 9007和9008 | 糖激酶[2.7.1.5] |
ORF04505 | 9009和9010 | 假拟蛋白 |
ORF04506 | 9011和9012 | L-鼠李糖操纵子调节蛋白rhaS |
ORF04507 | 9013和9014 | rhaRS操纵子的正调节物 |
ORF04508 | 9015和9016 | L-鼠李糖-质子同向转运 |
ORF04509 | 9017和9018 | 超氧化物岐化酶[Mn](sodA)[1.15.1.1] |
ORF04510 | 9019和9020 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04511 | 9021和9022 | 2-酮-3-脱氧葡糖酸转运蛋白(kdgT) |
ORF04512 | 9023和9024 | MOSC结构域蛋白 |
ORF04513 | 9025和9026 | 传感蛋白cpxA [2.7.3.-] |
ORF04514 | 9027和9028 | 转录调节蛋白y蛋白cpxR |
ORF04515 | 9029和9030 | 周质蛋白cpxP前体 |
ORF04516 | 9031和9032 | 蛋白p34 |
ORF04517 | 9033和9034 | 6-磷酸果糖激酶I |
ORF04518 | 9035和9036 | 硫酸-结合蛋白前体 |
ORF04519 | 9037和9038 | CDP-二酰基甘油焦磷酸酶 |
ORF04520 | 9039和9040 | 丙糖磷酸异构酶(tpiA)[5.3.1.1] |
ORF04521 | 9041和9042 | 功能未知的蛋白(DUF1454)超家族 |
ORF04522 | 9043和9044 | 保守性膜蛋白 |
ORF04523 | 9045和9046 | 保守性假拟蛋白超家族 |
ORF04524 | 9047和9048 | 通用应激蛋白D(UspA) |
ORF04525 | 9049和9050 | 铁氧还蛋白-NADP还原酶(DA1)[1.18.1.2] |
ORF04526 | 9051和9052 | 果糖-1,6-双磷酸酶,II类(glpX)[3.1.3.11] |
ORF04527 | 9053和9054 | 甘油激酶(glpK)[2.7.1.30] |
ORF04528 | 9055和9056 | 甘油摄取易化蛋白(Aquaglyceroporin)(glpF) |
ORF04529 | 9057和9058 | 功能未知的蛋白(DUF904)超家族 |
ORF04530 | 9059和9060 | 核糖核酸酶活性调节物A(rraA) |
ORF04531 | 9061和9062 | 1,4-二羟基-2-萘甲酸八异戊二烯基转移酶(men A)[2.5.-.-] |
ORF04532 | 9063和9064 | 热激蛋白HslVU,ATP酶亚基HslU(hslU) |
ORF04533 | 9065和9066 | HslUV蛋白酶的肽酶组件 |
ORF04534 | 9067和9068 | 细胞分裂蛋白FtsN(ftsN) |
ORF04535 | 9069和9070 | deo操纵子的调节蛋白,udp,cdd,tsx |
ORF04536 | 9071和9072 | 引发体蛋白N′ |
ORF04537 | 9073和9074 | 核糖体蛋白L31rpmE) |
ORF04538 | 9075和9076 | 功能未知的蛋白(DUF1105)超家族 |
ORF04539 | 9077和9078 | Met阻抑物 |
ORF04540 | 9079和9080 | O-琥珀酰高丝氨酸(硫醇)-裂合酶(metR)[2.5.1.48] |
ORF04541 | 9081和9082 | AKII-HDII蛋白[2.7.2.4] |
ORF04542 | 9083和9084 | 核苷特异性通道形成蛋白tsx前体 |
ORF04543 | 9085和9086 | 推定的5-核苷酸酶家族蛋白 |
ORF04544 | 9087和9088 | 5′-核苷酸酶,C-末端结构域蛋白 |
ORF04545 | 9089和9090 | 推定的5-核苷酸酶 |
ORF04546 | 9091和9092 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04547 | 9093和9094 | 推定的5-核苷酸酶家族蛋白 |
ORF04548 | 9095和9096 | 5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(metF)[1.7.99.5] |
ORF04549 | 9097和9098 | 过氧化氢酶-过氧化物酶HPI(katG)[1.11.1.6] |
ORF04550 | 9099和9100 | 假拟的转运蛋白yijE |
ORF04551 | 9101和9102 | 功能未知的蛋白(DUF1287)超家族 |
ORF04552 | 9103和9104 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04553 | 9105和9106 | 甘油脱氢酶(NAD)[1.1.1.6] |
ORF04554 | 9107和9108 | 推定的转醛醇酶 |
ORF04555 | 9109和9110 | 磷酸烯醇式丙酮酸-蛋白磷酸转移酶ptsA[2.7.3.9] |
ORF04556 | 9111和9112 | PTS系统,果糖特异性IIABC组件 |
ORF04557 | 9113和9114 | PTS系统,果糖-样-2 IIB组件1(磷酸转移酶II,B组件)[2.7.1.69] |
ORF04558 | 9115和9116 | 丙酮酸甲酸-裂合酶[2.3.1.54] |
ORF04559 | 9117和9118 | 类似于大肠杆菌丙酮酸甲酸-裂合酶活化酶 |
ORF04560 | 9119和9120 | 含有AraC型DNA结合域的蛋白 |
ORF04561 | 9121和9122 | PTS系统果糖样IIB组件2(磷酸转移)[2.7.1.69] |
ORF04562 | 9123和9124 | 完整的推定膜蛋白 |
ORF04563 | 9125和9126 | 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(ppc)[4.1.1.31] |
ORF04564 | 9127和9128 | 乙酰鸟氨酸脱乙酰酶(ArgE)(argE)[3.5.1.16] |
ORF04565 | 9129和9130 | N-乙酰基-γ-谷氨酰胺酰-磷酸还原酶(argC)[1.2.1.38] |
ORF04566 | 9131和9132 | 乙酰基谷氨酸激酶(argB)[2.7.2.8] |
ORF04567 | 9133和9134 | 精氨琥珀酸裂合酶(argH)[4.3.2.1] |
ORF04568 | 9135和9136 | 饥饿感受蛋白rspA |
ORF04569 | 9137和9138 | 主要易化蛋白家族转运蛋白 |
ORF04570 | 9139和9140 | 可溶性吡啶核苷酸转氢酶(STH)[1.6.1.1] |
ORF04571 | 9141和9142 | 过氧化氢-诱导基因激活物(oxyR) |
ORF04572 | 9143和9144 | 马尿酸水解酶 |
ORF04573 | 9145和9146 | 主要易化蛋白家族转运蛋白 |
ORF04574 | 9147和9148 | 转录调节蛋白,TetR家族 |
ORF04575 | 9149和9150 | AAA+类型的ATP酶 |
ORF04576 | 9151和9152 | tRNA(尿嘧啶-5-)-甲基转移酶(trmA)[2.1.1.35] |
ORF04577 | 9153和9154 | TonB依赖性维生素B12受体(btuB) |
ORF04578 | 9155和9156 | 谷氨酸消旋酶(murI)[5.1.1.3] |
ORF04579 | 9157和9158 | 假拟蛋白 |
ORF04580 | 9159和9160 | UDP-N-乙酰基烯醇式丙酮酰葡糖胺还原酶(murB)[1.1.1.158] |
ORF04581 | 9161和9162 | BirA双功能蛋白(BIRA)[6.3.4.15] |
ORF04582 | 9163和9164 | 泛酸激酶(coaA)[2.7.1.33] |
ORF04583 | 9165和9166 | 翻译延长因子EF-Tu.B |
ORF04584 | 9167和9168 | 翻译延长因子EF-Tu.B |
ORF04585 | 9169和9170 | 蛋白链延长因子EF-Tu |
ORF04586 | 9171和9172 | 前蛋白转位酶SecE亚基(SecE) |
ORF04587 | 9173和9174 | 转录终止-抗终止因子NusG(nusG) |
ORF04588 | 9175和9176 | 核糖体蛋白L11(rplK) |
ORF04589 | 9177和9178 | 核糖体蛋白L1(rplA) |
ORF04590 | 9179和9180 | 50S核糖体亚基蛋白L10(RPLJ) |
ORF04591 | 9181和9182 | 核糖体蛋白L7-L12(rplL) |
ORF04592 | 9183和9184 | 以DNA-为指导的RNA聚合酶,β亚基(rpoB)[2.7.7.6] |
ORF04593 | 9185和9186 | 以DNA-为指导的RNA聚合酶,β′亚基(rpoC)[2.7.7.6] |
ORF04594 | 9187和9188 | 噻唑生物合成蛋白ThiH(thiH) |
ORF04595 | 9189和9190 | 4-甲基-5-(β-羟乙基)噻唑单磷酸合成蛋白ThiG |
ORF04596 | 9191和9192 | 硫胺生物合成蛋白ThiS(thiS) |
ORF04597 | 9193和9194 | 噻唑生物合成腺苷酰转移酶ThiF(thiF) |
ORF04598 | 9195和9196 | 硫胺-磷酸焦磷酸化酶(thiE)[2.5.1.3] |
ORF04599 | 9197和9198 | 硫胺生物合成蛋白thiC |
ORF04600 | 9199和9200 | σD的调节蛋白 |
ORF04601 | 9201和9202 | MutT-nudix家族蛋白[3.6.1.-] |
ORF04602 | 9203和9204 | 尿卟啉原脱羧酶(hemE)[4.1.1.37] |
ORF04603 | 9205和9206 | 内切核酸酶V(脱氧肌苷3核酸内切酶) |
ORF04604 | 9207和9208 | 功能未知的蛋白,DUF超家族 |
ORF04605 | 9209和9210 | DNA-结合蛋白HU-α(NS2)(HU-2)(HU) |
ORF04606 | 9211和9212 | 未命名的蛋白产物 |
ORF04607 | 9213和9214 | 锌耐受性相关蛋白前体 |
ORF04608 | 9215和9216 | HydG的传感蛋白激酶,氢化酶3活性[2.7.3.-] |
ORF04609 | 9217和9218 | 转录调节蛋白zraR(σ54) |
ORF04610 | 9219和9220 | 磷酸核糖基胺-甘氨酸连接酶(purD)[6.3.4.13] |
ORF04611 | 9221和9222 | 双功能嘌啉生物合成蛋白PurH(purH) |
ORF04612 | 9223和9224 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04613 | 9225和9226 | 假拟蛋白 |
ORF04614 | 9227和9228 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04615 | 9229和9230 | 乙酰基转移酶,GNAT家族(推定的)[2.3.1.-] |
ORF04616 | 9231和9232 | 高丝氨酸O-琥珀酰转移酶(metA)[2.3.1.46] |
ORF04617 | 9233和9234 | 苹果酸合酶A(aceB)[2.3.3.9] |
ORF04618 | 9235和9236 | 异柠檬酸裂合酶(aceA)[4.1.3.1] |
ORF04619 | 9237和9238 | 异柠檬酸脱氢酶激酶-磷酸酶(EC 3.1.3.-)(IDH激酶-磷酸酶)(IDHK-P)[2.7.1.116] |
ORF04620 | 9239和9240 | 推定的转录调节蛋白 |
ORF04621 | 9241和9242 | 假拟蛋白 |
ORF04622 | 9243和9244 | 5-甲基四氢叶酸-高半胱氨酸甲基转移酶(metH)[2.1.1.13] |
ORF04623 | 9245和9246 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04624 | 9247和9248 | 推定的Na-Pi-共同转运蛋白II-相关蛋白 |
ORF04625 | 9249和9250 | 肽酶E(α-天冬氨酰二肽酶)(Asp特异性二肽酶)(二肽酶E)(α)[3.4.13.21] |
ORF04626 | 9251和9252 | L-山梨糖1-磷酸还原酶[1.1.1.-] |
ORF04627 | 9253和9254 | PTS系统,甘露糖特异性IID组件 |
ORF04628 | 9255和9256 | PTS系统,甘露糖特异性IIC组件[2.7.1.69] |
ORF04629 | 9257和9258 | 山梨糖-通透酶PTS系统IIB组件(EIII-MAN)[2.7.1.69] |
ORF04630 | 9259和9260 | PTS系统,山梨糖特异性IIA组件(EIIA-Sor)(山梨糖-通透酶IIA组件)(磷酸转移 |
ORF04631 | 9261和9262 | D-葡糖醇-6-磷酸脱氢酶[1.1.1.140] |
ORF04632 | 9263和9264 | 推定的山梨糖摄取的转录调节蛋白 |
ORF04633 | 9265和9266 | RNA假尿苷酸合酶家族蛋白[4.2.1.70] |
ORF04634 | 9267和9268 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04635 | 9269和9270 | 天冬氨酸激酶,单功能类型[2.7.2.4] |
ORF04636 | 9271和9272 | 葡萄糖-6-磷酸异构酶(pgi)[5.3.1.9] |
ORF04637 | 9273和9274 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04638 | 9275和9276 | 推定脂蛋白 |
ORF04639 | 9277和9278 | 功能未知的蛋白(DUF1017)超家族 |
ORF04640 | 9279和9280 | otnG蛋白(o698) |
ORF04641 | 9281和9282 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04642 | 9283和9284 | PsiE蛋白同源物 |
ORF04643 | 9285和9286 | 麦芽糖转运系统通透酶蛋白malG(malG) |
ORF04644 | 9287和9288 | 麦芽糖转运系统通透酶蛋白malF(膜) |
ORF04645 | 9289和9290 | 麦芽糖-结合性周质蛋白前体 |
ORF04646 | 9291和9292 | 麦芽糖-麦芽糖糊精转运ATP-结合蛋白malK |
ORF04647 | 9293和9294 | 麦芽糖孔蛋白前体(麦芽糖诱导性孔蛋白)(malL) |
ORF04648 | 9295和9296 | 麦芽糖操纵子周质蛋白前体(MalM)超家族 |
ORF04649 | 9297和9298 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04650 | 9299和9300 | 分支酸裂合酶[4.-.-.-] |
ORF04651 | 9301和9302 | 4-羟基苯甲酸名异戊二烯基转移酶(ubiA)[2.5.1.-] |
ORF04652 | 9303和9304 | 甘油-3-磷酸O-酰基转移酶[2.3.1.15] |
ORF04653 | 9305和9306 | 二酰基甘油激酶(DGK)[2.7.1.107] |
ORF04654 | 9307和9308 | LexA阻抑物(1exA)[3.4.21.88] |
ORF04655 | 9309和9310 | DNA损伤-诱导蛋白F,截短 |
ORF04656 | 9311和9312 | 蛋白yjbJ-相关蛋白 |
ORF04657 | 9313和9314 | 摄锌调节蛋白 |
ORF04658 | 9315和9316 | tRNA-二氢尿苷合酶A[1.-.-.-] |
ORF04659 | 9317和9318 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04660 | 9319和9320 | 醌氧化还原酶 |
ORF04661 | 9321和9322 | 推定的氧化还原酶 |
ORF04662 | 9323和9324 | 代谢物-质子同向转运蛋白 |
ORF04663 | 9325和9326 | 烯酰基-CoA水合酶-异构酶家族蛋白 |
ORF04664 | 9327和9328 | 推定的乙酰-CoA-转移酶亚基[2.8.3.-] |
ORF04665 | 9329和9330 | LACI-家族转录调节蛋白 |
ORF04666 | 9331和9332 | 复制性DNA解旋酶(dnaB)[3.6.1.-] |
ORF04667 | 9333和9334 | 丙氨酸消旋酶(alr)[5.1.1.1] |
ORF04668 | 9335和9336 | 推定的转运蛋白 |
ORF04669 | 9337和9338 | NadR同源物 |
ORF04670 | 9339和9340 | 芳族-氨基酸氨基转移酶 |
ORF04671 | 9341和9342 | 2-酮戊二酸脱氢酶,E1组件(sucA)[1.2.4.2] |
ORF04672 | 9343和9344 | 2-酮戊二酸脱氢酶,E2组件,二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶(sucB)[2.3.1.61] |
ORF04673 | 9345和9346 | 二氢硫辛酰胺脱氢酶(lpdA)[1.8.1.4] |
ORF04674 | 9347和9348 | 琥珀酰-CoA合成酶β链(AF326913)[6.2.1.5] |
ORF04675 | 9349和9350 | 琥珀酰-CoA合成酶α链[6.2.1.5] |
ORF04676 | 9351和9352 | 阴离子转运蛋白家族蛋白 |
ORF04677 | 9353和9354 | 双组件反应调节蛋白 |
ORF04678 | 9355和9356 | 推定的乳酸脱氢酶 |
ORF04679 | 9357和9358 | 推定的转运传感蛋白 |
ORF04680 | 9359和9360 | HAD超家族(亚家族IIIB)磷酸酶,TIGR01672(AphA)[3.1.3.-] |
ORF04681 | 9361和9362 | 保守性假拟蛋白TIGR00149 |
ORF04682 | 9363和9364 | 蛋白yjbR |
ORF04683 | 9365和9366 | 外切核酸酶ABC,A亚基(uvrA) |
ORF04684 | 9367和9368 | ssDNA-结合蛋白 |
ORF04685 | 9369和9370 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04686 | 9371和9372 | EAL结构域蛋白 |
ORF04687 | 9373和9374 | 调节蛋白soxS |
ORF04688 | 9375和9376 | 氧化还原-敏感性转录激活物SoxR(soxR) |
ORF04689 | 9377和9378 | 黄嘌呤-尿嘧啶通透酶家族蛋白 |
ORF04690 | 9379和9380 | Na+-H+反向转运蛋白 |
ORF04691 | 9381和9382 | 转录调节蛋白,LysR家族,推定的 |
ORF04692 | 9383和9384 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04693 | 9385和9386 | 胞壁质水解酶输出蛋白 |
ORF04694 | 9387和9388 | LrgB-样家族超家族 |
ORF04695 | 9389和9390 | 钠、溶质同向转运蛋白家族蛋白(PutP) |
ORF04696 | 9391和9392 | 功能未知的蛋白,DUF485超家族 |
ORF04697 | 9393和9394 | 乙酸-CoA连接酶(acsA)[6.2.1.1] |
ORF04698 | 9395和9396 | 亚硝酸还原酶(细胞色素;氨形成性)(nrfA)[1.7.2.2] |
ORF04699 | 9397和9398 | 甲酸依赖性亚硝酸还原酶NrfB |
ORF04700 | 9399和9400 | NrfC蛋白(NrfC)[1.-.-.-] |
ORF04701 | 9401和9402 | NrfD蛋白(NrfD)[1.-.-.-] |
ORF04702 | 9403和9404 | 细胞色素c型生物合成蛋白CcmF(ccmF) |
ORF04703 | 9405和9406 | 甲酸依赖性亚硝酸还原酶 |
ORF04704 | 9407和9408 | 甲酸依赖性亚硝酸还原酶复合物nrfG亚基(nrfF) |
ORF04705 | 9409和9410 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04706 | 9411和9412 | 谷氨酸-天冬氨酸同向转运蛋白(gltP) |
ORF04707 | 9413和9414 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04708 | 9415和9416 | ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白 |
ORF04709 | 9417和9418 | ABC转运蛋白,核苷酸结合性-ATP酶蛋白[dipeptide] |
ORF04710 | 9419和9420 | ABC转运蛋白,通透酶蛋白(AE006058) |
ORF04711 | 9421和9422 | ABC转运蛋白通透酶蛋白(AE005357) |
ORF04712 | 9423和9424 | ABC转运蛋白,周质寡-二肽-镍结合蛋白(AE005357) |
ORF04713 | 9425和9426 | 甲酸脱氢酶,α亚基[1.2.1.2] |
ORF04714 | 9427和9428 | 推定的甲酸脱氢酶,α亚基[1.2.1.2] |
ORF04715 | 9429和9430 | 匹配PS00443:谷氨酰胺酰胺基转移酶IJ类活化位点;类似于洋葱假单胞菌 |
ORF04716 | 9431和9432 | 萎蔫酸抗性蛋白保守区家族 |
ORF04717 | 9433和9434 | 推定的HlyD家族分泌蛋白 |
ORF04718 | 9435和9436 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04719 | 9437和9438 | 金属-β-内酰胺酶超家族蛋白 |
ORF04720 | 9439和9440 | 推定的葡糖激酶(EC 2.7.1.2)[2.7.1.2] |
ORF04721 | 9441和9442 | 核酮糖-磷酸3-差向异构酶(rpe)[5.1.3.1] |
ORF04722 | 9443和9444 | 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白(通透酶) |
ORF04723 | 9445和9446 | 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白(ECOWU89) |
ORF04724 | 9447和9448 | D-阿洛糖转运ATP-结合蛋白alsA(醛糖) |
ORF04725 | 9449和9450 | 假拟蛋白 |
ORF04726 | 9451和9452 | D-阿洛糖-结合性周质蛋白前体(ALBP) |
ORF04727 | 9453和9454 | 推定的转录调节蛋白 |
ORF04728 | 9455和9456 | 假拟蛋白 |
ORF04729 | 9457和9458 | 核糖5-磷酸异构酶B(rpiB)[5.3.1.6] |
ORF04730 | 9459和9460 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04731 | 9461和9462 | PhnP蛋白(phnp) |
ORF04732 | 9463和9464 | PhnO蛋白 |
ORF04733 | 9465和9466 | 膦酸代谢蛋白-1,5-双磷酸激酶(PRPP-形成)PhnN(phnN) |
ORF04734 | 9467和9468 | 膦酸代谢蛋白PhnM(phnM) |
ORF04735 | 9469和9470 | 膦酸C-P裂合酶系统蛋白PhnL(phnL) |
ORF04736 | 9471和9472 | 膦酸C-P裂合酶系统蛋白PhnK(phnK) |
ORF04737 | 9473和9474 | 膦酸代谢蛋白PhnJ |
ORF04738 | 9475和9476 | 细菌膦酸代谢蛋白(PhnI) |
ORF04739 | 9477和9478 | 细菌膦酸代谢蛋白(PhnH) |
ORF04740 | 9479和9480 | PhnG蛋白 |
ORF04741 | 9481和9482 | 膦酸代谢转录调节蛋白PhnF(phnF) |
ORF04742 | 9483和9484 | Pn转运蛋白的膜通道蛋白组件 |
ORF04743 | 9485和9486 | 推定的膦酸ABC转运蛋白,底物-结合蛋白 |
ORF04744 | 9487和9488 | 膦酸ABC转运蛋白,ATP-结合蛋白(phnC) |
ORF04745 | 9489和9490 | PhnB蛋白 |
ORF04746 | 9491和9492 | 烷基膦酸利用操纵子蛋白PhnA |
ORF04747 | 9493和9494 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04748 | 9495和9496 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04749 | 9497和9498 | 氨基酸MFS转运蛋白(PPII) |
ORF04750 | 9499和9500 | 传感蛋白basS-pmrB |
ORF04751 | 9501和9502 | 转录调节蛋白basR-pmrA |
ORF04752 | 9503和9504 | 预测的膜-结合性,金属依赖性水解酶 |
ORF04753 | 9505和9506 | 精氨酸-鲱精胺反向转运蛋白 |
ORF04754 | 9507和9508 | HTH型转录调节蛋白adiY |
ORF04755 | 9509和9510 | 精氨酸脱羧酶[4.1.1.19] |
ORF04756 | 9511和9512 | 精氨酸脱羧酶adi,生物降解性(ldc)[4.1.1.19] |
ORF04757 | 9513和9514 | 蜜二糖操纵子调节蛋白(AF049243) |
ORF04758 | 9515和9516 | 推定的糖基水解酶,家族4[3.2.1.22] |
ORF04759 | 9517和9518 | 推定膜蛋白 |
ORF04760 | 9519和9520 | I类延胡索酸水合酶,厌氧性[4.2.1.2] |
ORF04761 | 9521和9522 | 厌氧性C4-二羧酸膜转运蛋白 |
ORF04762 | 9523和9524 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04763 | 9525和9526 | 反应调节蛋白VC1604(部分) |
ORF04764 | 9527和9528 | 传感蛋白dcuS[2.7.3.-] |
ORF04765 | 9529和9530 | 假拟蛋白 |
ORF04766 | 9531和9532 | YjdI样蛋白 |
ORF04767 | 9533和9534 | 乙酰基转移酶,GNAT家族(GNAT) |
ORF04768 | 9535和9536 | 酪氨酰-tRNA合成酶(1ysS)[6.1.1.6] |
ORF04769 | 9537和9538 | PTR2-家族转运蛋白STY0750(POT) |
ORF04770 | 9539和9540 | CadA(1dc)[4.1.1.18] |
ORF04771 | 9541和9542 | 赖氨酸-尸胺的转运 |
ORF04772 | 9543和9544 | 转录激活物 |
ORF04773 | 9545和9546 | 假拟蛋白 |
ORF04774 | 9547和9548 | 推定的转录调节蛋白,TetR家族结构域蛋白 |
ORF04775 | 9549和9550 | 巯基:二硫键交换蛋白dsbD前体(dsbD)[1.8.1.8] |
ORF04776 | 9551和9552 | 二甲阳离子耐受蛋白细胞色素c生物合成 |
ORF04777 | 9553和9554 | 厌氢性C4-二羧酸转运蛋白dcuA(DcuA) |
ORF04778 | 9555和9556 | 天冬氨酸氨-裂合酶(aspA)[4.3.1.1] |
ORF04779 | 9557和9558 | 噬菌体T7的F排除的抑制蛋白 |
ORF04780 | 9559和9560 | 氨基酸通透酶超家族 |
ORF04781 | 9561和9562 | 侣伴蛋白,10 kDa(groES) |
ORF04782 | 9563和9564 | 侣伴蛋白GroEL(groL) |
ORF04783 | 9565和9566 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04784 | 9567和9568 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04785 | 9569和9570 | 赖氨酸2;3-氨基变位酶 |
ORF04786 | 9571和9572 | 翻译延长因子P(efp) |
ORF04787 | 9573和9574 | Entericidin B前体相关蛋白 |
ORF04788 | 9575和9576 | Entericidin B前体相关蛋白 |
ORF04789 | 9577和9578 | SugEL |
ORF04790 | 9579和9580 | 外膜脂蛋白blc前体 |
ORF04791 | 9581和9582 | β-内酰胺酶 |
ORF04792 | 9583和9584 | 延胡索酸还原酶,厌氧性,膜锚定多肽 |
ORF04793 | 9585和9586 | 延胡索酸还原酶亚基C(延胡索酸还原酶15 kDa疏水性蛋白)(frdC)[1.3.99.1] |
ORF04794 | 9587和9588 | 延胡索酸还原酶,厌氧性,铁硫蛋白亚基 |
ORF04795 | 9589和9590 | 延胡索酸还原酶,黄蛋白亚基(frdA)[1.3.99.1] |
ORF04796 | 9591和9592 | 酪氨酰-tRNA合成酶相关蛋白GenX |
ORF04797 | 9593和9594 | 氨基酸通透酶 |
ORF04798 | 9595和9596 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04799 | 9597和9598 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04800 | 9599和9600 | 未命名的蛋白产物 |
ORF04801 | 9601和9602 | 磷脂酰丝氨酸脱羧酶磷酸脂质合成 |
ORF04802 | 9603和9604 | 预测的GTP酶 |
ORF04803 | 9605和9606 | 寡核糖核酸酶 |
ORF04804 | 9607和9608 | 未命名的蛋白产物 |
ORF04805 | 9609和9610 | 预测的糖激酶 |
ORF04806 | 9611和9612 | 保守性假拟蛋白TIGR00150 |
ORF04807 | 9613和9614 | N-乙酰胞壁酰-1-丙氨酸酰胺酶II胞壁质水解酶 |
ORF04808 | 9615和9616 | DNA错配修复蛋白mutL |
ORF04809 | 9617和9618 | tRNAδ(2)-异戊烯基焦磷酸转移酶(miaA)[2.5.1.8] |
ORF04810 | 9619和9620 | 宿主因子I(HF-I) |
ORF04811 | 9621和9622 | GTP-结合蛋白hflX |
ORF04812 | 9623和9624 | HflK蛋白(hflK)[3.4.-.-] |
ORF04813 | 9625和9626 | HflC蛋白(hflC) |
ORF04814 | 9627和9628 | 假拟蛋白 |
ORF04815 | 9629和9630 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04816 | 9631和9632 | 假拟蛋白 |
ORF04817 | 9633和9634 | 腺苷酸基琥珀酸合成酶(purA)[6.3.4.4] |
ORF04818 | 9635和9636 | 预测的转录调节蛋白 |
ORF04819 | 9637和9638 | 核糖核酸酶R(rnr)[3.1.-.-] |
ORF04820 | 9639和9640 | RNA甲基转移酶,TrmH家族,3类 |
ORF04821 | 9641和9642 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04822 | 9643和9644 | PspA-IM30家族蛋白 |
ORF04823 | 9645和9646 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04824 | 9647和9648 | 预测的膜蛋白(o132) |
ORF04825 | 9649和9650 | 功能未知的蛋白(DUF1190)超家族 |
ORF04826 | 9651和9652 | 谷胱甘肽基精胺合酶(O386) |
ORF04827 | 9653和9654 | fadE8 |
ORF04828 | 9655和9656 | 功能未知的蛋白(DUF1471)超家族 |
ORF04829 | 9657和9658 | 功能未知的蛋白(DUF1471)家族 |
ORF04830 | 9659和9660 | α-β超家族的水解酶(推定的) |
ORF04831 | 9661和9662 | 推定的转录调节蛋白,DeoR家族 |
ORF04832 | 9663和9664 | 预测的β-内酰胺酶折叠的Zn依赖性水解酶 |
ORF04833 | 9665和9666 | 推定的糖特异性通透酶,SgaT-UlaA超家族,推定 |
ORF04834 | 9667和9668 | 推定的PTS系统的IIB蛋白 |
ORF04835 | 9669和9670 | 蛋白-Npi-磷酸组氨酸-糖磷酸转移酶(Ntr-type)[2.7.1.69] |
ORF04836 | 9671和9672 | 己酮糖-6-磷酸合酶(humps) |
ORF04837 | 9673和9674 | 己酮糖-6-磷酸异构酶,推定的 |
ORF04838 | 9675和9676 | AraD |
ORF04839 | 9677和9678 | 功能未知的蛋白(DUF1471)超家族 |
ORF04840 | 9679和9680 | 30S核糖体蛋白(rpS6) |
ORF04841 | 9681和9682 | 单链结合蛋白家族 |
ORF04842 | 9683和9684 | 核糖体蛋白S18(rpsR) |
ORF04843 | 9685和9686 | 核糖体蛋白L9(rplI) |
ORF04844 | 9687和9688 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04845 | 9689和9690 | 推定的MFS转运蛋白,邻苯二甲酸通透酶家族 |
ORF04846 | 9691和9692 | 推定的氧化还原酶 |
ORF04847 | 9693和9694 | 推定的乙酰-CoA-转移酶亚基 |
ORF04848 | 9695和9696 | 推定的烯酰基-CoA水合酶-异构酶FadB1x[4.2.1.55] |
ORF04849 | 9697和9698 | 3-脱氢莽草酸脱水酶 |
ORF04850 | 9699和9700 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04851 | 9701和9702 | 3-氧代酰基-(酰基-载体-蛋白)还原酶 |
ORF04852 | 9703和9704 | 不透明性相关蛋白A超家族 |
ORF04853 | 9705和9706 | 推定的保守蛋白 |
ORF04854 | 9707和9708 | FKBP型22 kDa肽基脯氨酰顺反异构酶(旋转异构酶)[5.2.1.8] |
ORF04855 | 9709和9710 | D-丝氨酸-D-丙氨酸-甘氨酸转运蛋白 |
ORF04856 | 9711和9712 | 推定的ScdA蛋白 |
ORF04857 | 9713和9714 | 完整的膜蛋白(f324) |
ORF04858 | 9715和9716 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04859 | 9717和9718 | 预测的转录调节蛋白s |
ORF04860 | 9719和9720 | 2′,3′-环-核苷酸2′-磷酸二酯酶(cpdB)[3.1.4.16] |
ORF04861 | 9721和9722 | 保守性假拟蛋白YtfJ-家族,TIGR01626 |
ORF04862 | 9723和9724 | 3′(2′),5′-双磷酸核苷酸酶(cysQ)[3.1.3.7] |
ORF04863 | 9725和9726 | 功能未知的蛋白(DUF1107)超家族 |
ORF04864 | 9727和9728 | 假拟的UPF0053蛋白ytfL |
ORF04865 | 9729和9730 | 肽甲硫氨酸亚砜还原酶 |
ORF04866 | 9731和9732 | 未命名的蛋白产物 |
ORF04867 | 9733和9734 | 功能未知的家族(DUF490)家族 |
ORF04868 | 9735和9736 | 假拟的UPF0131蛋白ytfP |
ORF04869 | 9737和9738 | 无机焦磷酸酶(ppa)[3.6.1.1] |
ORF04870 | 9739和9740 | 周质核糖结合蛋白 |
ORF04871 | 9741和9742 | ABC转运蛋白的ATP结合蛋白 |
ORF04872 | 9743和9744 | 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白VCA0129 |
ORF04873 | 9745和9746 | 核糖ABC转运蛋白,通透酶蛋白 |
ORF04874 | 9747和9748 | 果糖-1,6-双磷酸酶(fbp)[3.1.3.11] |
ORF04875 | 9749和9750 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04876 | 9751和9752 | UDP-N-乙酰基胞壁酸:L-丙氨酰-γ-D-谷氨酰胺酰-间-二氨基庚二酸连接酶(mpl) |
ORF04877 | 9753和9754 | 假拟的UPF0307蛋白yjgA(x96蛋白) |
ORF04878 | 9755和9756 | PmbA蛋白(pmbA) |
ORF04879 | 9757和9758 | 可溶性细胞色素b562前体(562) |
ORF04880 | 9759和9760 | 厌氧性核糖核苷-三磷酸还原酶活化蛋白(EC 1.97.1.4)(III类厌氧性核糖核苷酸 |
ORF04881 | 9761和9762 | 厌氧性核糖核苷-三磷酸还原酶[1.17.4.2] |
ORF04882 | 9763和9764 | 假拟蛋白 |
ORF04883 | 9765和9766 | α,α-磷酸海藻糖酶(treC)[3.2.1.93] |
ORF04884 | 9767和9768 | PTS系统,海藻糖特异性IIBC组件(trep)[2.7.1.69] |
ORF04885 | 9769和9770 | 海藻糖操纵子阻抑物(treR) |
ORF04886 | 9771和9772 | 镁-转位P型ATP酶(mgtA)[3.6.3.2] |
ORF04887 | 9773和9774 | 推定的内切核糖核酸酶L-PSP |
ORF04888 | 9775和9776 | 天冬氨酸氨基甲酰转移酶,调节亚基(pyrI) |
ORF04889 | 9777和9778 | 天冬氨酸氨基甲酰转移酶(pyrB)[2.1.3.2] |
ORF04890 | 9779和9780 | 精氨酸阻抑物 |
ORF04891 | 9781和9782 | 推定膜蛋白 |
ORF04892 | 9783和9784 | 鸟氨酸氨基甲酰转移酶(argF)[2.1.3.3] |
ORF04893 | 9785和9786 | 氨基甲酸激酶(arcC)[2.7.2.2] |
ORF04894 | 9787和9788 | 精氨酸脱亚胺酶(arcA)[3.5.3.6] |
ORF04895 | 9789和9790 | 蛋白yjgK |
ORF04896 | 9791和9792 | 鸟氨酸氨基甲酰转移酶(argF)[2.1.3.3] |
ORF04897 | 9793和9794 | 蛋白 |
ORF04898 | 9795和9796 | 假拟蛋白 |
ORF04899 | 9797和9798 | 乙酰基转移酶,GNAT家族 |
ORF04900 | 9799和9800 | 可能的内膜蛋白STY4813 |
ORF04901 | 9801和9802 | 缬氨酰-tRNA合成酶(valS)[6.1.1.9] |
ORF04902 | 9803和9804 | DNA聚合酶III,chi亚基[2.7.7.7] |
ORF04903 | 9805和9806 | 胞浆氨基肽酶(亮氨酸氨基肽酶)(LAP)(亮氨酰氨基肽酶)(氨基肽酶A-I)(LAP) |
ORF04904 | 9807和9808 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04905 | 9809和9810 | 未命名的蛋白产物 |
ORF04906 | 9811和9812 | 假拟蛋白 |
ORF04907 | 9813和9814 | 预测的通透酶 |
ORF04908 | 9815和9816 | 保守性ATP-结合蛋白 |
ORF04909 | 9817和9818 | L-艾杜糖酸调节蛋白(gnt) |
ORF04910 | 9819和9820 | Gnt-II系统L-艾杜糖酸转运蛋白 |
ORF04911 | 9821和9822 | 可能的葡糖酸5-脱氢酶氧化还原酶蛋白[1.1.1.69] |
ORF04912 | 9823和9824 | 2,3-丁二醇脱氢酶[1.1.1.264] |
ORF04913 | 9825和9826 | 耐热性葡糖酸激酶[2.7.1.12] |
ORF04914 | 9827和9828 | NADP依赖性醇脱氢酶[1.1.1.-] |
ORF04915 | 9829和9830 | 整合酶 |
ORF04916 | 9831和9832 | CJJ蛋白 |
ORF04917 | 9833和9834 | β蛋白 |
ORF04918 | 9835和9836 | 极性抑制蛋白(琥珀突变抑制蛋白) |
ORF04919 | 9837和9838 | 转移活化蛋白 |
ORF04920 | 9839和9840 | 糖蛋白3(荚膜尺寸决定蛋白) |
ORF04921 | 9841和9842 | 噬菌体DNA结合蛋白 |
ORF04922 | 9843和9844 | 未命名的蛋白产物;cI基因产物(AA 1-137) |
ORF04923 | 9845和9846 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04924 | 9847和9848 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04925 | 9849和9850 | 噬菌体P4 DNA引发酶[2.7.7.-] |
ORF04926 | 9851和9852 | 假拟蛋白 |
ORF04927 | 9853和9854 | 假拟蛋白 |
ORF04928 | 9855和9856 | ATP依赖性蛋白酶La |
ORF04929 | 9857和9858 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04930 | 9859和9860 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04931 | 9861和9862 | 未命名的蛋白产物;ORF616 |
ORF04932 | 9863和9864 | Kelch基序结构域蛋白 |
ORF04933 | 9865和9866 | 寡半乳糖醛酸特异性孔蛋白(KdgM)超家族 |
ORF04934 | 9867和9868 | FimB蛋白 |
ORF04935 | 9869和9870 | 参与相变异调节物的重组酶 |
ORF04936 | 9871和9872 | 1型菌毛蛋白fimA前体 |
ORF04937 | 9873和9874 | 菌毛蛋白 |
ORF04938 | 9875和9876 | 侣伴蛋白蛋白fimC前体 |
ORF04939 | 9877和9878 | 外膜传达蛋白fimD前体 |
ORF04940 | 9879和9880 | FimF蛋白前体 |
ORF04941 | 9881和9882 | 菌毛形态 |
ORF04942 | 9883和9884 | FimH |
ORF04943 | 9885和9886 | 甘露糖酸脱水酶(uxuA)[4.2.1.8] |
ORF04944 | 9887和9888 | D-甘露糖酸氧化还原酶[1.1.1.57] |
ORF04945 | 9889和9890 | uxu操纵子的调节蛋白 |
ORF04946 | 9891和9892 | 功能未知的蛋白(DUF1316)亚家族 |
ORF04947 | 9893和9894 | 磷酸烯醇式丙酮酸-蛋白磷酸转移酶,EI-HPr-EIIA组件 |
ORF04948 | 9895和9896 | 二羟丙酮激酶,L亚基[2.7.1.-] |
ORF04949 | 9897和9898 | 二羟丙酮激酶,DhaK亚基(dhaK)[2.7.1.-] |
ORF04950 | 9899和9900 | 假拟蛋白 |
ORF04951 | 9901和9902 | 甘油脱氢酶CgrD(NAD)[1.1.1.6] |
ORF04952 | 9903和9904 | 推定的转运蛋白CgxT |
ORF04953 | 9905和9906 | 侵袭蛋白IbeA |
ORF04954 | 9907和9908 | 胆碱-甘氨酸甜菜碱转运蛋白 |
ORF04955 | 9909和9910 | 甘油酸激酶[2.7.1.31] |
ORF04956 | 9911和9912 | 2-羟基-3-氧代丙酸还原酶[1.1.1.60] |
ORF04957 | 9913和9914 | 羟基丙酮酸异构酶[5.3.1.22] |
ORF04958 | 9915和9916 | 假拟蛋白 |
ORF04959 | 9917和9918 | 乙醛酸聚醛酶[4.1.1.47] |
ORF04960 | 9919和9920 | 乙醛酸聚醛酶[4.1.1.47] |
ORF04961 | 9921和9922 | NtrC家族转录调节蛋白,ATP酶结构域 |
ORF04962 | 9923和9924 | 侵袭蛋白IbeA |
ORF04963 | 9925和9926 | 假拟蛋白 |
ORF04964 | 9927和9928 | Na+-H+反向转运蛋白NhaC(nhaC) |
ORF04965 | 9929和9930 | 假拟的转录调节蛋白yjiE |
ORF04966 | 9931和9932 | 假拟蛋白 |
ORF04967 | 9933和9934 | 异天冬氨酰二肽酶(iadA)[3.4.19.-] |
ORF04968 | 9935和9936 | 未表征的膜蛋白 |
ORF04969 | 9937和9938 | 核苷识别结构域蛋白 |
ORF04970 | 9939和9940 | RNA 2′-磷酸转移酶,Tptl-KptA家族结构域蛋白 |
ORF04971 | 9941和9942 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04972 | 9943和9944 | 推定膜蛋白 |
ORF04973 | 9945和9946 | SrgB |
ORF04974 | 9947和9948 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04975 | 9949和9950 | 2-羟基戊二酰基-CoA脱水酶的激活物(HSP70-类ATP酶结构域) |
ORF04976 | 9951和9952 | 2-羟基戊二酰基-CoA脱水酶亚基β同源物 |
ORF04977 | 9953和9954 | 功能未知的蛋白(DUF445)超家族 |
ORF04978 | 9955和9956 | 转座酶 |
ORF04979 | 9957和9958 | 保守性蛋白 |
ORF04980 | 9959和9960 | 保守性假拟蛋白 |
ORF04981 | 9961和9962 | I型限制性酶EcoKI特异性蛋白(S蛋白)(S.EcoKI)[3.1.21.3] |
ORF04982 | 9963和9964 | I型限制性酶EcoKI M蛋白(M.EcoKI)[2.1.1.72] |
ORF04983 | 9965和9966 | I型限制性酶EcoKI R蛋白(R.EcoKI)[3.1.21.3] |
ORF04984 | 9967和9968 | Mrr限制性系统蛋白(EcoKMrr) |
ORF04985 | 9969和9970 | CobW-P47K家族蛋白结构域蛋白 |
ORF04986 | 9971和9972 | 未表征的小蛋白 |
ORF04987 | 9973和9974 | YjiY |
ORF04988 | 9975和9976 | 接受甲基的趋化性蛋白I(MCP-I)(丝氨酸化学受体蛋白)(MCP-I) |
ORF04989 | 9977和9978 | C4-二羧酸转运蛋白大亚基(DctM) |
ORF04990 | 9979和9980 | TRAP转运蛋白,DctQ样膜蛋白超家族 |
ORF04991 | 9981和9982 | DctP蛋白 |
ORF04992 | 9983和9984 | Na+-H+反向转运蛋白 |
ORF04993 | 9985和9986 | yjjM基因产物 |
ORF04994 | 9987和9988 | 推定的山梨糖醇脱氢酶[1.1.1.14] |
ORF04995 | 9989和9990 | 假拟蛋白 |
表2-142种优选抗原
ORF00010 ORF00017 ORF00029 ORF00041 ORF00130 ORF00250
ORF00251 ORF00252 ORF00332 ORF00333 ORF00342 ORF00353
ORF00394 ORF00405 ORF00469 ORF00631 ORF00773 ORF00905
ORF00908 ORF01034 ORF01037 ORF01056 ORF01090 ORF01103
ORF01104 ORF01108 ORF01115 ORF01118 ORF01119 ORF01194
ORF01202 ORF01207 ORF01208 ORF01214 ORF01228 ORF01236
ORF01337 ORF01338 ORF01339 ORF01340 ORF01341 ORF01342
ORF01344 ORF01348 ORF01349 ORF01350 ORF01351 ORF01365
ORF01371 ORF01462 ORF01477 ORF01491 ORF01503 ORF01506
ORF01589 ORF01590 ORF01592 ORF01656 ORF01660 ORF01705
ORF01722 ORF01723 ORF01855 ORF01932 ORF02307 ORF02314
ORF02392 ORF02412 ORF02424 ORF02470 ORF02554 ORF02735
ORF02816 ORF02828 ORF02829 ORF02830 ORF02831 ORF02832
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ORF02888 ORF03011 ORF03020 ORF03021 ORF03025 ORF03044
ORF03166 ORF03174 ORF03176 ORF03235 ORF03252 ORF03262
ORF03300 ORF03348 ORF03349 ORF03364 ORF03459 ORF03501
ORF03504 ORF03507 ORF03512 ORF03515 ORF03516 ORF03517
ORF03518 ORF03519 ORF03520 ORF03522 ORF03535 ORF03539
ORF03540 ORF03541 ORF03542 ORF03575 ORF03576 ORF03579
ORF03580 ORF03613 ORF04162 ORF04163 ORF04184 ORF04203
ORF04204 ORF04282 ORF04390 ORF04391 ORF04402 ORF04477
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表3-与共生菌株同源性低
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ORF03359、ORF03360、ORF03361、ORF03362、ORF03363、ORF03364、ORF03365、
ORF03400、ORF03415、ORF03453、ORF03454、ORF03455、ORF03456、ORF03457、
ORF03458、ORF03459、ORF03465、ORF03469、ORF03499、ORF03500、ORF03501、
ORF03502、ORF03503、ORF03504、ORF03505、ORF03506、ORF03507、ORF03508、
ORF03509、ORF03510、ORF03511、ORF03512、ORF03515、ORF03516、ORF03517、
ORF03518、ORF03519、ORF03520、ORF03521、ORF03522、ORF03526、ORF03535、
ORF03536、ORF03537、ORF03538、ORF03539、ORF03540、ORF03541、ORF03542、
ORF03574、ORF03575、ORF03576、ORF03577、ORF03578、ORF03579、ORF03580、
ORF03589、ORF03592、ORF03593、ORF03594、ORF03595、ORF03596、ORF03597、
ORF03606、ORF03607、ORF03608、ORF03610、ORF03612、ORF03613、ORF03614、
ORF03615、ORF03616、ORF03617、ORF03619、ORF03695、ORF03696、ORF03817、
ORF03818、ORF03819、ORF03820、ORF03821、ORF03822、ORF03823、ORF03824、
ORF03825、ORF03826、ORF03975、ORF03991、ORF03992、ORF03993、ORF03994、
ORF03995、ORF03996、ORF03997、ORF03998、ORF03999、ORF04000、ORF04031、
ORF04032、ORF04033、ORF04034、ORF04035、ORF04036、ORF04058、ORF04059、
ORF04060、ORF04061、ORF04062、ORF04063、ORF04064、ORF04073、ORF04083、
ORF04084、ORF04085、ORF04086、ORF04087、ORF04088、ORF04089、ORF04090、
ORF04091、ORF04130、ORF04162、ORF04163、ORF04164、ORF04171、ORF04183、
ORF04184、ORF04203、ORF04204、ORF04205、ORF04206、ORF04207、ORF04208、
ORF04209、ORF04211、ORF04224、ORF04225、ORF04237、ORF04238、ORF04239、
ORF04240、ORF04241、ORF04242、ORF04243、ORF04244、ORF04247、ORF04250、
ORF04282、ORF04302、ORF04390、ORF04391、ORF04398、ORF04402、ORF04403、
ORF04404、ORF04416、ORF04417、ORF04418、ORF04419、ORF04420、ORF04421、
ORF04422、ORF04423、ORF04424、ORF04425、ORF04426、ORF04427、ORF04428、
ORF04429、ORF04430、ORF04434、ORF04435、ORF04436、ORF04437、ORF04438、
ORF04439、ORF04451、ORF04476、ORF04477、ORF04478、ORF04479、ORF04480、
ORF04481、ORF04482、ORF04483、ORF04484、ORF04489、ORF04490、ORF04500、
ORF04542、ORF04543、ORF04544、ORF04545、ORF04546、ORF04547、ORF04552、
ORF04569、ORF04572、ORF04573、ORF04608、ORF04612、ORF04623、ORF04626、
ORF04627、ORF04628、ORF04629、ORF04630、ORF04631、ORF04632、ORF04661、
ORF04662、ORF04663、ORF04664、ORF04665、ORF04668、ORF04669、ORF04671、
ORF04672、ORF04673、ORF04674、ORF04675、ORF04676、ORF04677、ORF04678、
ORF04679、ORF04691、ORF04692、ORF04693、ORF04694、ORF04708、ORF04709、
ORF04710、ORF04711、ORF04712、ORF04728、ORF04844、ORF04845、ORF04846、
ORF04847、ORF04848、ORF04849、ORF04850、ORF04851、ORF04882、ORF04890、
ORF04891、ORF04892、ORF04893、ORF04894、ORF04895、ORF04898、ORF04900、
ORF04915、ORF04916、ORF04917、ORF04918、ORF04919、ORF04920、ORF04921、
ORF04922、ORF04923、ORF04924、ORF04925、ORF04926、ORF04927、ORF04928、
ORF04929、ORF04930、ORF04946、ORF04947、ORF04948、ORF04949、ORF04950、
ORF04951、ORF04952、ORF04953、ORF04954、ORF04955、ORF04956、ORF04957、
ORF04958、ORF04959、ORF04960、ORF04961、ORF04962、ORF04963、ORF04964、
ORF04966、ORF04974、ORF04978、ORF04979、ORF04981、ORF04989、ORF04990、
ORF04991、ORF04992、ORF04993、ORF04995
表4
蛋白 | SEQ ID | 注释 | Psort | TMD | CFT073 | %ID |
ORF03526 | 7051+7052 | 辅助集落化因子AcfD前体 | I | 0 | upec-2704 | 45.3 |
ORF01339 | 2677+2678 | FlC菌毛传达蛋白 | I | 1 | upec-1199 | 99.4 |
ORF00256 | 511+512 | 菌毛蛋白侣伴蛋白ecpD2 | I | 1 | upec-0166 | 100 |
ORF01346 | 2691+2692 | IroN蛋白 | O | 0 | upec-1207 | 99.3 |
ORF04084 | 8167+8168 | 外膜高铁血红素受体ChuA | O | 0 | upec-4213 | 99.7 |
ORF02374 | 4747+4748 | OMR家族鼠疫菌素-耶尔森菌菌素受体蛋白(IRPC) | O | 0 | upec-2371 | 100 |
ORF03502 | 7003+7004 | 推定的多糖生物合成蛋白 | O | 0 | upec-3606 | 99.5 |
ORF02298 | 4595+4596 | 假拟蛋白 | C | 0 | upec-5009 | 30 |
ORF01228 | 2455+2456 | CdtC | O | 0 | upec-1086 | 30.3 |
ORF01227 | 2453+2454 | CdtB | I | 1 | upec-0679 | 31.9 |
ORF02314 | 4627+4628 | gpH | I | 1 | upec-0941 | 48.8 |
ORF02850 | 5699+5700 | DNA转移蛋白 | C | 0 | upec-4881 | 21.2 |
栏:
·PSORT:由PSORT算法得到的预测位点;I=内膜;O=外膜;P=周质
·TMD:跨膜结构域的个数
·%ID:比对长度上相同残基的百分数
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Claims (19)
1.一种多肽,其包含:(a)选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO 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22、8224、8226、8228、8230、8232、8234、8236、8238、8240、8242、8244、8246、8248、8250、8252、8254、8256、8258、8260、8262、8264、8266、8268、8270、8272、8274、8276、8278、8280、8282、8284、8286、8288、8290、8292、8294、8296、8298、8300、8302、8304、8306、8308、8310、8312、8314、8316、8318、8320、8322、8324、8326、8328、8330、8332、8334、8336、8338、8340、8342、8344、8346、8348、8350、8352、8354、8356、8358、8360、8362、8364、8366、8368、8370、8372、8374、8376、8378、8380、8382、8384、8386、8388、8390、8392、8394、8396、8398、8400、8402、8404、8406、8408、8410、8412、8414、8416、8418、8420、8422、8424、8426、8428、8430、8432、8434、8436、8438、8440、8442、8444、8446、8448、8450、8452、8454、8456、8458、8460、8462、8464、8466、8468、8470、8472、8474、8476、8478、8480、8482、8484、8486、8488、8490、8492、8494、8496、8498、8500、8502、8504、8506、8508、8510、8512、8514、8516、8518、8520、8522、8524、8526、8528、8530、8532、8534、8536、8538、8540、8542、8544、8546、8548、8550、8552、8554、8556、8558、8560、8562、8564、8566、8568、8570、8572、8574、8576、8578、8580、8582、8584、8586、8588、8590、8592、8594、8596、8598、8600、8602、8604、8606、8608、8610、8612、8614、8616、8618、8620、8622、8624、8626、8628、8630、8632、8634、8636、8638、8640、8642、8644、8646、8648、8650、8652、8654、8656、8658、8660、8662、8664、8666、8668、8670、8672、8674、8676、8678、8680、8682、8684、8686、8688、8690、8692、8694、8696、8698、8700、8702、8704、8706、8708、8710、8712、8714、8716、8718、8720、8722、8724、8726、8728、8730、8732、8734、8736、8738、8740、8742、8744、8746、8748、8750、8752、8754、8756、8758、8760、8762、8764、8766、8768、8770、8772、8774、8776、8778、8780、8782、8784、8786、8788、8790、8792、8794、8796、8798、8800、8802、8804、8806、8808、8810、8812、8814、8816、8818、8820、8822、8824、8826、8828、8830、8832、8834、8836、8838、8840、8842、8844、8846、8848、8850、8852、8854、8856、8858、8860、8862、8864、8866、8868、8870、8872、8874、8876、8878、8880、8882、8884、8886、8888、8890、8892、8894、8896、8898、8900、8902、8904、8906、8908、8910、8912、8914、8916、8918、8920、8922、8924、8926、8928、8930、8932、8934、8936、8938、8940、8942、8944、8946、8948、8950、8952、8954、8956、8958、8960、8962、8964、8966、8968、8970、8972、8974、8976、8978、8980、8982、8984、8986、8988、8990、8992、8994、8996、8998、9000、9002、9004、9006、9008、9010、9012、9014、9016、9018、9020、9022、9024、9026、9028、9030、9032、9034、9036、9038、9040、9042、9044、9046、9048、9050、9052、9054、9056、9058、9060、9062、9064、9066、9068、9070、9072、9074、9076、9078、9080、9082、9084、9086、9088、9090、9092、9094、9096、9098、9100、9102、9104、9106、9108、9110、9112、9114、9116、9118、9120、9122、9124、9126、9128、9130、9132、9134、9136、9138、9140、9142、9144、9146、9148、9150、9152、9154、9156、9158、9160、9162、9164、9166、9168、9170、9172、9174、9176、9178、9180、9182、9184、9186、9188、9190、9192、9194、9196、9198、9200、9202、9204、9206、9208、9210、9212、9214、9216、9218、9220、9222、9224、9226、9228、9230、9232、9234、9236、9238、9240、9242、9244、9246、9248、9250、9252、9254、9256、9258、9260、9262、9264、9266、9268、9270、9272、9274、9276、9278、9280、9282、9284、9286、9288、9290、9292、9294、9296、9298、9300、9302、9304、9306、9308、9310、9312、9314、9316、9318、9320、9322、9324、9326、9328、9330、9332、9334、9336、9338、9340、9342、9344、9346、9348、9350、9352、9354、9356、9358、9360、9362、9364、9366、9368、9370、9372、9374、9376、9378、9380、9382、9384、9386、9388、9390、9392、9394、9396、9398、9400、9402、9404、9406、9408、9410、9412、9414、9416、9418、9420、9422、9424、9426、9428、9430、9432、9434、9436、9438、9440、9442、9444、9446、9448、9450、9452、9454、9456、9458、9460、9462、9464、9466、9468、9470、9472、9474、9476、9478、9480、9482、9484、9486、9488、9490、9492、9494、9496、9498、9500、9502、9504、9506、9508、9510、9512、9514、9516、9518、9520、9522、9524、9526、9528、9530、9532、9534、9536、9538、9540、9542、9544、9546、9548、9550、9552、9554、9556、9558、9560、9562、9564、9566、9568、9570、9572、9574、9576、9578、9580、9582、9584、9586、9588、9590、9592、9594、9596、9598、9600、9602、9604、9606、9608、9610、9612、9614、9616、9618、9620、9622、9624、9626、9628、9630、9632、9634、9636、9638、9640、9642、9644、9646、9648、9650、9652、9654、9656、9658、9660、9662、9664、9666、9668、9670、9672、9674、9676、9678、9680、9682、9684、9686、9688、9690、9692、9694、9696、9698、9700、9702、9704、9706、9708、9710、9712、9714、9716、9718、9720、9722、9724、9726、9728、9730、9732、9734、9736、9738、9740、9742、9744、9746、9748、9750、9752、9754、9756、9758、9760、9762、9764、9766、9768、9770、9772、9774、9776、9778、9780、9782、9784、9786、9788、9790、9792、9794、9796、9798、9800、9802、9804、9806、9808、9810、9812、9814、9816、9818、9820、9822、9824、9826、9828、9830、9832、9834、9836、9838、9840、9842、9844、9846、9848、9850、9852、9854、9856、9858、9860、9862、9864、9866、9868、9870、9872、9874、9876、9878、9880、9882、9884、9886、9888、9890、9892、9894、9896、9898、9900、9902、9904、9906、9908、9910、9912、9914、9916、9918、9920、9922、9924、9926、9928、9930、9932、9934、9936、9938、9940、9942、9944、9946、9948、9950、9952、9954、9956、9958、9960、9962、9964、9966、9968、9970、9972、9974、9976、9978、9980、9982、9984、9986、9988和9990;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的氨基酸序列;(c)作为氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列;或(d)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列。
2.如权利要求1所述的多肽,其包含:(a)选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO512、2454、2456、2678、2692、4596、4748、7004、7052、8168、4628和5700;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的氨基酸序列;(c)作为氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列;或(d)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列。
3.如权利要求1所述的多肽,其包含:(a)选自下组的氨基酸序列:SEQ ID NO8564、2728、9872、4672、5680、534、3222、3226和7004;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的氨基酸序列;(c)作为氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列;或(d)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含氨基酸序列(a)中至少10个连续氨基酸的片段的氨基酸序列。
4.如权利要求1-3中任一项所述的多肽,其特征在于,所述片段包含至少一个(a)的B细胞表位。
5.如权利要求1-4中任一项所述的多肽,所述多肽用于药物。
6.一种核酸,其包含:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO 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8223、8225、8227、8229、8231、8233、8235、8237、8239、8241、8243、8245、8247、8249、8251、8253、8255、8257、8259、8261、8263、8265、8267、8269、8271、8273、8275、8277、8279、8281、8283、8285、8287、8289、8291、8293、8295、8297、8299、8301、8303、8305、8307、8309、8311、8313、8315、8317、8319、8321、8323、8325、8327、8329、8331、8333、8335、8337、8339、8341、8343、8345、8347、8349、8351、8353、8355、8357、8359、8361、8363、8365、8367、8369、8371、8373、8375、8377、8379、8381、8383、8385、8387、8389、8391、8393、8395、8397、8399、8401、8403、8405、8407、8409、8411、8413、8415、8417、8419、8421、8423、8425、8427、8429、8431、8433、8435、8437、8439、8441、8443、8445、8447、8449、8451、8453、8455、8457、8459、8461、8463、8465、8467、8469、8471、8473、8475、8477、8479、8481、8483、8485、8487、8489、8491、8493、8495、8497、8499、8501、8503、8505、8507、8509、8511、8513、8515、8517、8519、8521、8523、8525、8527、8529、8531、8533、8535、8537、8539、8541、8543、8545、8547、8549、8551、8553、8555、8557、8559、8561、8563、8565、8567、8569、8571、8573、8575、8577、8579、8581、8583、8585、8587、8589、8591、8593、8595、8597、8599、8601、8603、8605、8607、8609、8611、8613、8615、8617、8619、8621、8623、8625、8627、8629、8631、8633、8635、8637、8639、8641、8643、8645、8647、8649、8651、8653、8655、8657、8659、8661、8663、8665、8667、8669、8671、8673、8675、8677、8679、8681、8683、8685、8687、8689、8691、8693、8695、8697、8699、8701、8703、8705、8707、8709、8711、8713、8715、8717、8719、8721、8723、8725、8727、8729、8731、8733、8735、8737、8739、8741、8743、8745、8747、8749、8751、8753、8755、8757、8759、8761、8763、8765、8767、8769、8771、8773、8775、8777、8779、8781、8783、8785、8787、8789、8791、8793、8795、8797、8799、8801、8803、8805、8807、8809、8811、8813、8815、8817、8819、8821、8823、8825、8827、8829、8831、8833、8835、8837、8839、8841、8843、8845、8847、8849、8851、8853、8855、8857、8859、8861、8863、8865、8867、8869、8871、8873、8875、8877、8879、8881、8883、8885、8887、8889、8891、8893、8895、8897、8899、8901、8903、8905、8907、8909、8911、8913、8915、8917、8919、8921、8923、8925、8927、8929、8931、8933、8935、8937、8939、8941、8943、8945、8947、8949、8951、8953、8955、8957、8959、8961、8963、8965、8967、8969、8971、8973、8975、8977、8979、8981、8983、8985、8987、8989、8991、8993、8995、8997、8999、9001、9003、9005、9007、9009、9011、9013、9015、9017、9019、9021、9023、9025、9027、9029、9031、9033、9035、9037、9039、9041、9043、9045、9047、9049、9051、9053、9055、9057、9059、9061、9063、9065、9067、9069、9071、9073、9075、9077、9079、9081、9083、9085、9087、9089、9091、9093、9095、9097、9099、9101、9103、9105、9107、9109、9111、9113、9115、9117、9119、9121、9123、9125、9127、9129、9131、9133、9135、9137、9139、9141、9143、9145、9147、9149、9151、9153、9155、9157、9159、9161、9163、9165、9167、9169、9171、9173、9175、9177、9179、9181、9183、9185、9187、9189、9191、9193、9195、9197、9199、9201、9203、9205、9207、9209、9211、9213、9215、9217、9219、9221、9223、9225、9227、9229、9231、9233、9235、9237、9239、9241、9243、9245、9247、9249、9251、9253、9255、9257、9259、9261、9263、9265、9267、9269、9271、9273、9275、9277、9279、9281、9283、9285、9287、9289、9291、9293、9295、9297、9299、9301、9303、9305、9307、9309、9311、9313、9315、9317、9319、9321、9323、9325、9327、9329、9331、9333、9335、9337、9339、9341、9343、9345、9347、9349、9351、9353、9355、9357、9359、9361、9363、9365、9367、9369、9371、9373、9375、9377、9379、9381、9383、9385、9387、9389、9391、9393、9395、9397、9399、9401、9403、9405、9407、9409、9411、9413、9415、9417、9419、9421、9423、9425、9427、9429、9431、9433、9435、9437、9439、9441、9443、9445、9447、9449、9451、9453、9455、9457、9459、9461、9463、9465、9467、9469、9471、9473、9475、9477、9479、9481、9483、9485、9487、9489、9491、9493、9495、9497、9499、9501、9503、9505、9507、9509、9511、9513、9515、9517、9519、9521、9523、9525、9527、9529、9531、9533、9535、9537、9539、9541、9543、9545、9547、9549、9551、9553、9555、9557、9559、9561、9563、9565、9567、9569、9571、9573、9575、9577、9579、9581、9583、9585、9587、9589、9591、9593、9595、9597、9599、9601、9603、9605、9607、9609、9611、9613、9615、9617、9619、9621、9623、9625、9627、9629、9631、9633、9635、9637、9639、9641、9643、9645、9647、9649、9651、9653、9655、9657、9659、9661、9663、9665、9667、9669、9671、9673、9675、9677、9679、9681、9683、9685、9687、9689、9691、9693、9695、9697、9699、9701、9703、9705、9707、9709、9711、9713、9715、9717、9719、9721、9723、9725、9727、9729、9731、9733、9735、9737、9739、9741、9743、9745、9747、9749、9751、9753、9755、9757、9759、9761、9763、9765、9767、9769、9771、9773、9775、9777、9779、9781、9783、9785、9787、9789、9791、9793、9795、9797、9799、9801、9803、9805、9807、9809、9811、9813、9815、9817、9819、9821、9823、9825、9827、9829、9831、9833、9835、9837、9839、9841、9843、9845、9847、9849、9851、9853、9855、9857、9859、9861、9863、9865、9867、9869、9871、9873、9875、9877、9879、9881、9883、9885、9887、9889、989 1、9893、9895、9897、9899、9901、9903、9905、9907、9909、9911、9913、9915、9917、9919、9921、9923、9925、9927、9929、9931、9933、9935、9937、9939、9941、9943、9945、9947、9949、9951、9953、9955、9957、9959、9961、9963、9965、9967、9969、9971、9973、9975、9977、9979、9981、9983、9985、9987和9989;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
7.如权利要求6所述的核酸,其包含:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO511、2453、2455、2677、2691、4595、4747、7003、7051、8167、4627和5699;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
8.如权利要求6所述的核酸,其包含:(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO8563、2727、9871、4671、5679、533、3221、3225和7003;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
9.如权利要求6-8中任一项所述的核酸,其编码权利要求1、2、3或4所述的多肽。
10.如权利要求1-4中任一项所述的多肽的特异性单克隆抗体。
11.一种药物组合物,其包含与药学上可接受的载体混合的权利要求1-4中任一项所述的多肽、权利要求1-9中任一项所述的核酸或权利要求10所述的抗体。
12.一种药物组合物,其包含与药学上可接受的载体混合的权利要求1-4中所述的两种或多种多肽。
13.如权利要求10或11所述的组合物,还包含疫苗佐剂。
14.一种免疫原性组合物,其包含表达或过度表达下组编码的一种或多种多肽的一种或多种外膜泡(OMV):(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO 511、2453、2455、2677、2691、4595、4747、7003、7051、8167、4627和5699;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
15.一种免疫原性组合物,其包含表达或过度表达下组编码的一种或多种多肽的一种或多种外膜泡(OMV):(a)选自下组的核苷酸序列:SEQ ID NO 8563、2727、9871、4671、5679、533、3221、3225和7003;(b)与氨基酸序列(a)的序列相同性至少为80%的核苷酸序列;(c)作为核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列;或(d)与核苷酸序列(a)的序列相同性至少为80%并包含核苷酸序列(a)中至少10个连续核苷酸的片段的核苷酸序列。
16.如权利要求14或15所述的免疫原性组合物,其特征在于,所述片段包含至少一个(a)的B细胞表位。
17.如权利要求1-4中任一项所述的多肽,或如权利要求6-9中任一项所述的核酸,或如权利要求10所述的抗体,或如权利要求14-16中任一项所述的免疫原性组合物在制备用于在患者中产生免疫应答的药物中的应用。
18.一种在患者中产生免疫应答的方法,所述方法包括给予所述患者如权利要求10-12中任一项所述的药物组合物或者如权利要求14-16中任一项所述的免疫原性组合物的步骤。
19.如权利要求17所述的应用,或如权利要求18所述的方法,其特征在于,所述免疫应答保护个体免受ExPEC感染,尤其免受MNEC感染。
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SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
C12 | Rejection of a patent application after its publication | ||
RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |
Application publication date: 20080618 |