TWI586806B - 異多聚體蛋白質之製造 - Google Patents

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Description

異多聚體蛋白質之製造
本發明係關於製造異多聚體蛋白質之方法。
本申請案主張2010年4月23日申請之題為「Production of Heteromultimeric Proteins」之美國臨時專利申請案第61/327,302號之優先權，該案之全部內容以引用的方式併入本文中。
IgG型單株抗體含有兩個相同抗原結合臂及一個恆定域(Fc)。結合臂特異性不同之抗體通常不存在於自然界中，因此，必須藉助於化學工程改造(例如化學交聯等)、重組DNA及/或細胞融合技術精巧地製作。
雙特異性抗體可同時結合兩種不同抗原。此特性允許開發用習知單株抗體不可能進行之治療策略。一大組已開發之想像雙特異性抗體形式反映出對此等分子之強烈關注。參見Berg J,Lotscher E,Steimer KS等人，「Bispecific antibodies that mediate killing of cells infected with human immunodeficiency virus of any strain」，Proc Natl Acad Sci USA(1991) 88(11): 4723-4727及Fischer N及Leger O.,「Biospecific Antibodies: Molecules That Enable Novel Therapeutic Strategies」，Pathobiology(2007) 74:3-14。
另一類多特異性分子為重組融合蛋白。重組融合蛋白由免疫調節蛋白質之細胞外域及免疫球蛋白(Ig)之恆定(Fc)域組成，其代表一類發展中之人類治療劑。免疫黏附素將具有所要特異性之蛋白質序列之結合區與抗體之效應域組合。免疫黏附素具有兩個對於其作為治療劑之潛能而言有意義之重要特性：標靶特異性及藥物動力學穩定性(活體內半衰期，與抗體之活體內半衰期相當)。免疫黏附素可用作拮抗劑以抑制或阻斷有害相互作用或用作促效劑以模擬或增強生理學反應。參見Chamow SM,Zhang DZ,Tan XY等人，「A humanized,bispecific immunoadhesin-antibody that retargets CD3+ effectors to kill HIV-1-infected cells」，J Hematother 1995;4(5): 439-446。
別處已論述其他多特異性分子。實例包括(但不限於)Fisher等人，Pathobiology(2007) 74:3-14(各種雙特異性形式之評述)；2003年12月9日頒予Feige等人之美國專利第6,660,843號(肽體)；2002年1月10日公開之美國專利公開案第2002-004587號(多特異性抗體)；2009年11月3日頒予Wu等人之美國專利第7612181號(雙重可變域形式)；美國專利第6,534,628號，Nord K等人，Prot Eng(1995) 8:601-608，Nord K等人，Nat Biotech(1997) 15:772-777及Grnwall等人，Biotechnol Appl Biochem.(2008)6月；50(第2部分)：97-112(親和抗體)；Martens等人，Clin Cancer Res(2006),12: 6144-6152及Jin等人，Cancer Res(2008) 68(11):4360-4368(一臂抗體)；Bostrom等人，Science(2009) 323:1610-1614(雙重作用Fab、aka混合價抗體)。其他形式為熟習此項技術者已知。
對於上述多特異性分子，製造臨床級物質仍具挑戰性。如上所述，有多種途徑製造具有混合結合臂(亦即彼此不一致之結合臂)之分子。此等方法每一者均具有其缺陷。
化學交聯為勞動密集的，因為相關物質可能仍需要自均二聚體及其他不適宜副產物純化。另外，化學修飾步驟可改變蛋白質之完整性，從而造成穩定性差。因此，此方法通常低效且可導致抗體活性喪失。
細胞融合技術(例如雜交融合瘤)表現兩條重鏈及兩條輕鏈，該等重鏈及輕鏈隨機組裝，產生10種抗體組合。所要異多聚體抗體僅為由此製造之抗體的一小部分。純化所要異多聚體蛋白質會顯著降低製造產量且增加製造成本。
已使用重組DNA技術產生不包含Fc域之各種異多聚體形式，例如單鏈Fv、雙功能抗體等。此類型抗體分子之主要缺陷為缺乏Fc域，從而缺乏抗體引發效應功能(例如補體活化、Fc-受體結合等)之能力。因此，需要一種包含功能性Fc域之雙特異性抗體。
亦可使用重組DNA技術產生『杵臼結構』雙特異性抗體。參見美國專利申請案20030078385(Arathoon等人-Genentech)。此策略之一限制性為兩個親本抗體之輕鏈必須一致以防止錯配及因在同一細胞中表現而形成不適宜及/或無活性分子。
因此，仍需要製造異多聚體蛋白質之替代性方法。本文所述之發明提供該等方法。本發明之此等及其他態樣及優點將由本文所提供之發明的描述而顯而易知。
使用當前技術製造異多聚體蛋白質(例如多特異性抗體)存在缺陷，包括尤其產生產物混合物、產量降低及效應功能降低/消除。因此，需要有效且以高水準製造異多聚體蛋白質。
一般已充分瞭解用各種方式製造抗體分子。舉例而言，美國專利6331415(Cabilly等人)描述一種重組製造免疫球蛋白之方法，其中重鏈及輕鏈同時由單一載體或單一細胞中之兩個各別載體表現。Wibbenmeyer等人(1999,Biochim Biophys Acta 1430(2): 191-202)及Lee及Kwak(2003,J. Biotechnology 101: 189-198)描述由使用在各別大腸桿菌培養物中表現之質體各別製造之重鏈及輕鏈製造單株抗體。與製造抗體有關之各種其他技術描述於例如Harlow等人，ANTIBODIES: A LABORATORY MANUAL,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.,(1988)及WO 2006028936中。然而其各具有缺陷，諸如產量低，使用化學物質。
本發明之方法提供在不添加還原劑之情況下含鉸鏈異多聚體蛋白質之各組分(例如抗體之一臂)於各別宿主細胞中之表現及含鉸鏈異多聚體蛋白質(例如多特異性抗體)之組裝。
本發明提供一種簡單且有效之製造製程/方法，其允許經濟地製造異多聚體蛋白質(例如多特異性抗體)。
本發明提供有效且新穎之製造多特異性免疫球蛋白複合物(例如多特異性抗體)及其他多聚體蛋白質(在本文中統稱作異多聚體蛋白質)之方法，其克服傳統方法之限制性。根據本發明之方法，異多聚體蛋白質(諸如雙特異性抗體)可以高度均質異之多聚體多肽形式提供。另外，本文所提供之方法不依賴於添加還原劑來實現異多聚體蛋白質中之至少一個、至少兩個、至少三個、至少四個鏈間二硫鍵的形成。
在第一態樣中，本文所述之方法允許製備包含具有第一異二聚域之第一含鉸鏈多肽及具有第二異二聚域之第二含鉸鏈多肽的異多聚體蛋白質，其中第二異二聚域與第一異二聚域相互作用，且其中第一及第二含鉸鏈多肽藉由至少一個鏈間二硫鍵連接，該方法包含以下步驟：
(a)在表現第一含鉸鏈多肽之條件下培養包含編碼該含鉸鏈多肽之第一核酸的第一宿主細胞；
(b)在表現第二含鉸鏈多肽之條件下培養包含編碼該含鉸鏈多肽之核酸的第二宿主細胞；
(c)破壞細胞膜，使得第一及第二含鉸鏈多肽釋放於細胞外環境中，其中第一及第二宿主細胞在單一懸浮液中組合在一起；及
(d)回收異多聚體蛋白質，
其中該方法無需添加還原劑。
在第二態樣中，提供製備異多聚體蛋白質之方法，該異多聚體蛋白質包含具有第一異二聚域之第一含鉸鏈多肽及具有第二異二聚域之第二含鉸鏈多肽，其中第二異二聚域與第一異二聚域相互作用，且其中第一及第二含鉸鏈多肽藉由至少一個鏈間二硫鍵連接，該方法包含以下步驟：
(a)提供具有第一異二聚域之經純化第一含鉸鏈多肽；
(b)提供具有第二異二聚域之經純化第二含鉸鏈多肽；
(c)將第一及第二含鉸鏈多肽組合；
(d)將第一含鉸鏈多肽及第二含鉸鏈多肽再摺疊；及
(e)回收異多聚體蛋白質複合物。
在第三態樣中，本文提供之方法係關於一種製備異多聚體蛋白質之方法，其包含在允許第一對免疫球蛋白重鏈與輕鏈多肽及第二對免疫球蛋白重鏈與輕鏈多肽多聚以形成實質上均質之抗體群之條件下培育該第一及第二對多肽，其中該等條件不包含添加還原劑；其中第一對多肽能夠結合第一標靶；其中第二對多肽能夠結合第二標靶分子；且其中第一重鏈多肽之Fc多肽與第二重鏈多肽之Fc多肽在界面處會合，且第二Fc多肽之界面包含突起，其可置於第一Fc多肽界面之空腔中。
在第四態樣中，提供一種產生異多聚體蛋白質組合庫之方法，該方法包含具有第一異二聚域之第一含鉸鏈多肽及具有第二異二聚域之第二含鉸鏈多肽，其中第二異二聚域與第一異二聚域相互作用，且其中第一及第二含鉸鏈多肽藉由至少一個鏈間二硫鍵連接，該方法包含以下步驟：
(a)培養第一宿主細胞及至少兩種其他宿主細胞，其中
a.該第一宿主細胞包含編碼含第一異二聚域之多肽的第一核酸；及
b.該等其他宿主細胞包含構成含第二異二聚域之多肽的核酸，
(b)將第一及至少兩種其他宿主細胞組合；
(c)處理該等細胞，以使第一及第二含異二聚域之多肽釋放於細胞外環境中；及
(d)回收異多聚體蛋白質，
其中該方法無需添加還原劑。
在第五態樣中，提供藉由本文所述之方法製造之異多聚體蛋白質。
應瞭解，本發明之方法可包括其他步驟，該等步驟一般為顯然用於起始及/或完成本文所述之本發明方法所涵蓋之製程的常規步驟。舉例而言，在一實施例中，本發明方法之步驟(a)前有如下步驟，其中將編碼第一含鉸鏈多肽之核酸引入第一宿主細胞中，且將編碼第二含鉸鏈多肽之核酸引入第二宿主細胞中。在一實施例中，本發明之方法進一步包含純化對至少兩種不同標靶具有結合特異性之異多聚體蛋白質的步驟。在一實施例中，在純化異多聚體蛋白質之步驟之前，不超過約10%、15%或20%之經分離多肽以單體或重鏈-輕鏈二聚體形式存在。
在一實施例中，第一及/或第二含鉸鏈多肽為抗體重鏈。在另一實施例中，抗體重鏈與抗體輕鏈配對以提供重鏈-輕鏈對。在一些實施例中，重鏈-輕鏈對共價連接。在另一實施例中，重鏈-輕鏈對界定標靶結合臂。在一些實施例中，標靶結合臂一致。在一些實施例中，標靶結合臂各自識別兩種不同標靶。
在一些實施例中，第一及/或第二含鉸鏈多肽包含Fc區。在另一實施例中，第一及/或第二含鉸鏈多肽包含至少一個恆定重鏈域。在另一實施例中，第一及/或第二含鉸鏈多肽包含可變重鏈域。在另一實施例中，第一及/或第二含鉸鏈多肽包含受體結合域。在一些實施例中，第一及/或第二含鉸鏈多肽實質上一致(亦即異二聚域可能不一致，而異二聚域外之區域一致)。在一些實施例中，第一及/或第二含鉸鏈多肽不一致。
在一些實施例中，異多聚體蛋白質係選自由以下組成之群：抗體、雙特異性抗體、多特異性抗體、一臂抗體、單特異性單價抗體、多特異性單價抗體、雙特異性最大抗體、單抗體、免疫黏附素、肽體、雙特異性肽體、單價肽體、親和抗體及受體融合蛋白。
在一些實施例中，該等異多聚體蛋白質包含鉸鏈區，其具有至少一個、至少兩個、至少三個、至少四個或任何整數個至所有半胱胺酸殘基，該等殘基通常能夠形成重鏈間二硫鍵聯(linkage)。在一些實施例中，將其他半胱胺酸引入鉸鏈區中。
本發明之異多聚體蛋白質亦可為抗體片段，諸如Fc或Fc融合多肽，只要其包含免疫球蛋白之鉸鏈區即可。Fc融合多肽一般包含融合於異源多肽序列(諸如抗原結合域)之Fc多肽(或其片段)，諸如融合於免疫球蛋白Fc多肽之受體細胞外域(ECD)(例如融合於IgG2 Fc之Flt受體ECD)。舉例而言，在一實施例中，Fc融合多肽包含VEGF結合域，其可為包括flt、flk等之VEGF受體。本發明之異多聚體蛋白質一般包含重鏈恆定域及輕鏈恆定域。在一實施例中，本發明之異多聚體蛋白質包含修飾(例如(但不限於)插入一或多個胺基酸以例如形成二聚序列(諸如白胺酸拉鏈))以形成重鏈間二聚或多聚。在一些實施例中，本發明之異多聚體中缺少Fc多肽之一部分(而非全部)，只要其保留免疫球蛋白之鉸鏈區即可。在一些此等實施例中，Fc多肽之缺少序列為CH2及/或CH3域之一部分或全部。在一些此等實施例中，異多聚體蛋白質包含例如融合於重鏈片段之C端的二聚域(諸如白胺酸拉鏈序列)。在一些此等實施例中，異多聚體蛋白質包含含突變之二聚域以提供「杵臼結構」二聚域(如下文進一步定義)。
在本發明之方法及異多聚體蛋白質的一些實施例中，含鉸鏈多肽包含至少一個促進第一及第二含鉸鏈多肽之異二聚而使均二聚最小之特徵(例如在重鏈之Fc多肽之間)。該(等)特徵改良藉由本文所述之本發明方法可獲得的異多聚體蛋白質群之產量及/或純度及/或均質性。在一實施例中，第一含鉸鏈多肽及第二含鉸鏈多肽之Fc多肽在界面處會合/相互作用。在第一及第二含鉸鏈多肽之Fc多肽在界面處會合的一些實施例中，第二Fc多肽之界面包含突起，其可置於第一Fc多肽界面之空腔中。在一實施例中，第一Fc多肽已自模板/初始多肽改變以編碼空腔，或第二Fc多肽已自模板/初始多肽改變以編碼突起，或編碼空腔與突起。在一實施例中，第一Fc多肽已自模板/初始多肽改變以編碼空腔，且第二Fc多肽已自模板/初始多肽改變以編碼突起，或編碼空腔與突起。在一實施例中，第二Fc多肽之界面包含突起，其可置於第一Fc多肽界面之空腔中，其中分別將空腔或突起或兩者引入第一及第二Fc多肽之界面中。在第一及第二Fc多肽在界面處會合的一些實施例中，第一Fc多肽之界面包含突起，其可置於第二Fc多肽界面之空腔中。在一實施例中，第二Fc多肽已自模板/初始多肽改變以編碼空腔，或第一Fc多肽已自模板/初始多肽改變以編碼突起，或編碼空腔與突起。在一實施例中，第二Fc多肽已自模板/初始多肽改變以編碼空腔，且第一Fc多肽已自模板/初始多肽改變以編碼突起，或編碼空腔與突起。在一實施例中，第一Fc多肽之界面包含突起，其可置於第二Fc多肽界面之空腔中，其中分別將突起或空腔或兩者引入第一及第二Fc多肽之界面中。
在一實施例中，突起及空腔各自包含天然存在之胺基酸殘基。在一實施例中，包含突起之Fc多肽係藉由用側鏈體積大於模板/初始多肽界面之初始殘基的輸入殘基置換該初始殘基產生。在一實施例中，包含突起之Fc多肽係藉由包含如下步驟之方法產生，其中編碼該多肽界面之初始殘基的核酸經編碼側鏈體積大於該初始殘基之輸入殘基的核酸置換。在一實施例中，初始殘基為蘇胺酸。在一實施例中，輸入殘基為精胺酸。在一實施例中，輸入殘基為苯丙胺酸(F)。在一實施例中，輸入殘基為酪胺酸(Y)。在一實施例中，輸入殘基為色胺酸(W)。在一實施例中，輸入殘基為R、F、Y或W。在一實施例中，突起係藉由置換模板/初始多肽中之兩個或兩個以上殘基產生。在一實施例中，包含突起之Fc多肽包含用色胺酸置換位置366之蘇胺酸，胺基酸編號係根據Kabat等人(第688-696頁，Sequences of proteins of immunological interest，第5版，第1卷(1991;NIH,Bethesda,MD))之EU編號方案。
在一些實施例中，包含空腔之Fc多肽係藉由用側鏈體積小於模板/初始多肽界面中之初始殘基之輸入殘基置換該初始殘基產生。舉例而言，包含空腔之Fc多肽可藉由包含如下步驟之方法產生，其中編碼該多肽界面之初始殘基的核酸經編碼側鏈體積小於初始殘基之輸入殘基的核酸置換。在一實施例中，初始殘基為蘇胺酸。在一實施例中，初始殘基為白胺酸。在一實施例中，初始殘基為酪胺酸。在一實施例中，輸入殘基不為半胱胺酸(C)。在一實施例中，輸入殘基為丙胺酸(A)。在一實施例中，輸入殘基為絲胺酸(S)。在一實施例中，輸入殘基為蘇胺酸(T)。在一實施例中，輸入殘基為纈胺酸(V)。空腔可藉由置換模板/初始多肽之一或多個初始殘基產生。舉例而言，在一實施例中，包含空腔之Fc多肽包含置換兩個或兩個以上選自由蘇胺酸、白胺酸及酪胺酸組成之群的初始胺基酸。在一實施例中，包含空腔之Fc多肽包含兩個或兩個以上選自由丙胺酸、絲胺酸、蘇胺酸及纈胺酸組成之群的輸入殘基。在一些實施例中，包含空腔之Fc多肽包含置換兩個或兩個以上選自由蘇胺酸、白胺酸及酪胺酸組成之群的初始胺基酸，且其中該等初始胺基酸經選自由丙胺酸、絲胺酸、蘇胺酸及纈胺酸組成之群的輸入殘基置換。在一實施例中，包含空腔之Fc多肽包含用絲胺酸置換位置366之蘇胺酸，胺基酸編號係根據前述Kabat等人之EU編號方案。在一實施例中，包含空腔之Fc多肽包含用丙胺酸置換位置368之白胺酸，胺基酸編號係根據前述Kabat等人之EU編號方案。在一實施例中，包含空腔之Fc多肽包含用纈胺酸置換位置407之酪胺酸，胺基酸編號係根據前述Kabat等人之EU編號方案。在一實施例中，包含空腔之Fc多肽包含兩個或兩個以上選自由T366S、L368A及Y407V組成之群的胺基酸置換，胺基酸編號係根據前述Kabat等人之EU編號方案。在此等抗體片段之一些實施例中，包含突起之Fc多肽包含用色胺酸置換位置366之蘇胺酸，胺基酸編號係根據前述Kabat等人之EU編號方案。
在各種實施例中，第一及第二重鏈多肽之Fc多肽可能一致或不一致，只要其能夠二聚形成Fc區(如本文所定義)即可。第一Fc多肽一般相鄰連接於單一多肽中免疫球蛋白重鏈之一或多個域，例如與鉸鏈、恆定及/或可變域序列連接。在一實施例中，第一Fc多肽包含鉸鏈序列之至少一部分(包括全部)、CH2域之至少一部分(包括全部)及/或CH3域之至少一部分(包括全部)。在一實施例中，第一Fc多肽包含免疫球蛋白之鉸鏈序列及CH2及CH3域。在一實施例中，第二Fc多肽包含鉸鏈序列之至少一部分(包括全部)、CH2域之至少一部分(包括全部)及/或CH3域之至少一部分(包括全部)。在一實施例中，第二Fc多肽包含免疫球蛋白之鉸鏈序列及CH2及CH3域。在一實施例中，本發明之抗體包含第一及第二Fc多肽，其各自包含至少一個抗體恆定域之至少一部分。在一實施例中，抗體恆定域為CH2及/或CH3域。在包含恆定域之本發明抗體之任何實施例中，抗體恆定域可來自任何免疫球蛋白類型，例如IgG。免疫球蛋白來源可為任何適合之物種來源(例如IgG可為人類IgG1)或為合成形式。
在一實施例中，本發明抗體之第一及第二標靶分子結合臂各別之第一輕鏈多肽及第二輕鏈多肽包含不同/相異抗原結合決定子(例如不同/獨特可變域序列)。在一實施例中，本發明抗體之第一及第二標靶分子結合臂各別之第一輕鏈多肽及第二輕鏈多肽包含相同(亦即共同)抗原結合決定子(例如相同可變域序列)。
本發明之方法能夠產生高均質性異多聚體分子。因此，本發明提供如下方法，其中至少約40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%多肽在包含第一重鏈與輕鏈多肽對及第二重鏈與輕鏈多肽對之複合物中。在一實施例中，本發明提供如下方法，其中約60%至99%、70%至98%、75%至97%、80%至96%、85%至96%或90%至95%多肽在包含第一重鏈與輕鏈多肽對及第二重鏈與輕鏈多肽對之複合物中。
在一實施例中，本發明之抗體係選自由IgG、IgE、IgA、IgM及IgD組成之群。在一些實施例中，本發明抗體之鉸鏈區較佳係來自選自由IgG、IgA及IgD組成之群的免疫球蛋白。舉例而言，在一些實施例中，抗體或抗體之鉸鏈區係來自IgG，在一些實施例中為IgG1或IgG2(例如IgG2a或IgG2b)。在一些實施例中，本發明之抗體係選自由IgG、IgA及IgD組成之群。在一實施例中，抗體來自人類、人類化、嵌合或非人類(例如鼠類)來源。
本發明之異多聚體蛋白質一般能夠結合、較佳特異性結合於抗原。該等抗原包括例如腫瘤抗原、細胞存活調節因子、細胞增殖調節因子、與組織發育或分化有關(例如已知或懷疑在功能上促進組織發育或分化)之分子、細胞表面分子、淋巴激素、細胞激素、參與細胞週期調節之分子、參與血小管生成之分子及與血管生成有關(例如已知或懷疑在功能上促進血管生成)之分子。本發明之異多聚體蛋白質能夠結合之抗原可為上述類別之子集的成員，其中該類別之其他子集包含具有相異特徵(相對於相關抗原)之其他分子/抗原。相關抗原亦可視為屬於兩個或兩個以上類別。在一實施例中，本發明提供結合、較佳特異性結合不為細胞表面分子之腫瘤抗原的異多聚體蛋白質。在一實施例中，腫瘤抗原為細胞表面分子，諸如受體多肽。在另一實例中，在一些實施例中，本發明之異多聚體蛋白質結合、較佳特異性結合不為集群(cluster)分化因子之腫瘤抗原。在另一實例中，本發明之異多聚體蛋白質能夠結合、較佳特異性結合於集群分化因子，在一些實施例中，該因子不為例如CD3或CD4。在一些實施例中，本發明之異多聚體蛋白質為抗VEGF抗體。在一些實施例中，本發明之異多聚體蛋白質為選自由以下組成之群的雙特異性抗體：IL-1α/IL-1β、IL-12/IL-18；IL-13/IL-9；IL-13/IL-4；IL-13/IL-5；IL-5/IL-4；IL-13/IL-1β；IL-13/IL-25；IL-13/TARC；IL-13/MDC；IL-13/MEF；IL-13/TGF-β；IL-13/LHR促效劑；IL-12/TWEAK、IL-13/CL25；IL-13/SPRR2a；IL-13/SPRR2b；IL-13/ADAM8、IL-13/PED2、IL17A/IL17F、CD3/CD19、CD138/CD20；CD138/CD40；CD19/CD20；CD20/CD3；CD38/CD138；CD38/CD20；CD38/CD40；CD40/CD20；CD-8/IL-6；CD20/BR3、TNFα/TGF-β、TNFα/IL-1β；TNFα/IL-2、TNFα/IL-3、TNFα/IL-4、TNFα/IL-5、TNFα/IL6、TNFα/IL8、TNFα/IL-9、TNFα/IL-10、TNFα/IL-11、TNFα/IL-12、TNFα/IL-13、TNFα/IL-14、TNFα/IL-15、TNFα/IL-16、TNFα/IL-17、TNFα/IL-18、TNFα/IL-19、TNFα/IL-20、TNFα/IL-23、TNFα/IFNα、TNFα/CD4、TNFα/VEGF、TNFα/MIF、TNFα/ICA M-1、TNFα/PGE4、TNFα/PEG2、TNFα/RANK配位體、TNFα/Te38；TNFα/BAFF；TNFα/CD22；TNFα/CTLA-4；TNFα/GP130；TNFα/IL-12p40；VEGF/HER2、VEGF-A/HER2、VEGF-A/PDGF、HER1/HER2、VEGF-A/VEGF-C、VEGF-C/VEGF-D、HER2/DR5、VEGF/IL-8、VEGF/MET、VEGFR/MET受體、VEGFR/EGFR、HER2/CD64、HER2/CD3、HER2/CD16、HER2/HER3；EGFR/HER2、EGFR/HER3、EGFR/HER4、IL-13/CD40L、IL4/CD40L、TNFR1/IL-1R、TNFR1/IL-6R、TNFR1/IL-18R、EpCAM/CD3、MAPG/CD28、EGFR/CD64、CSPG/RGMA；CTLA-4/BTNO2；IGF1/IGF2；IGF1/2/Erb2B；MAG/RGM A；NgR/RGM A；NogoA/RGM A；OMGp/RGM A；PDL-I/CTLA-4；及RGM A/RGM B、IL1β/IL18、NRP1/VEGFA、VEGFA/NRP2、cMET/EGFR、ALK1/BMP9、VEGFA/α5β1、HER1/HER3-BU及CMV。在一些實施例中，本發明之異多聚體蛋白質結合於至少兩種選自由以下組成之群的標靶分子：α5β1、ALK1、BMP9、IL-1α、IL-1β、TARC、MDC、MEF、TGF-β、LHR促效劑、TWEAK、CL25、SPRR2a、SPRR2b、ADAM8、PED2、CD3、CD4、CD16、CD19、CD20、CD22、CD28、CD40、CD38、CD64、CD138、CD-8、BR3、TNFα、TGF-β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-10、IL-11、IL-12、IL-13、IL-14、IL-15、IL-16、IL-17、IL-17A、IL-17F、IL-18、IL-19、IL-20、IL-23、IL-25、IFNα、MIF、ICAM-1、PGE4、PEG2、RANK配位體、Te38、BAFF、CTLA-4、GP130、IL-12p40、VEGF、VEGF-A、PDGF、HER1、HER2、HER3、HER3-BU、HER4、VEGF-C、VEGF-D、DR5、cMET、MET、MET受體、VEGFR、EGFR、CD40L、TNFR1、IL-1R、IL-6R、IL-18R、EpCAM、MAPG、CSPG、BTNO2、IGF1、IGF2、IGF1/2、Erb2B、MAG、NgR、NogoA、NRP1、NRP2、OMGp、PDL-I、RGM A及RGM B。在一些實施例中，本發明之異多聚體蛋白質結合於CD3及至少一種選自以下之其他標靶分子：BLR1、BR3、CD19、CD20、CD22、CD72、CD79A、CD79B、CD180(RP105)、CR2、FcRH1、FcRH2、FcRH5、FCER2、FCRL4、HLA-DOB及NAG14。
本發明方法中之第一及第二宿主細胞可在允許表現及分離相關多肽之任何環境中培養。舉例而言，在一實施例中，本發明方法中之第一宿主細胞及第二宿主細胞以各別細胞培養物形式生長。在另一實施例中，本發明方法中之第一宿主細胞及第二宿主細胞以包含兩種宿主細胞之混合培養物形式生長。
在一些實施例中，至少一種、至少兩種、至少三種或三種以上表現其他含鉸鏈多肽之宿主細胞可在與含第一及/或第二鉸鏈宿主細胞相同或分開之培養物中生長。在一些實施例中，其他含鉸鏈多肽包含與第一含鉸鏈多肽相同之異二聚域。在一些實施例中，其他含鉸鏈多肽包含與第二含鉸鏈多肽相同之異二聚域。
異多聚體蛋白質可經修飾以增強及/或添加其他所要特徵。該等特徵包括生物學功能，諸如免疫效應功能、所需活體內半衰期/清除率、生物可用性、生物分佈或其他藥物動力學特徵。該等修飾為此項技術所熟知且亦可憑經驗確定，且可包括由可能基於肽或不基於肽之部分進行之修飾。舉例而言，抗體可經糖基化或去糖基化，一般至少部分視宿主細胞之性質而定。本發明之抗體較佳經去糖基化。藉由本發明方法製造之去糖基化抗體可隨後藉由例如使用此項技術中熟知之活體外糖基化方法來糖基化。如上文及本文所述，本發明之異多聚體蛋白質可在原核細胞(諸如大腸桿菌)中製造。大腸桿菌製造之異多聚體蛋白質一般進行去糖基化且缺乏通常與在哺乳動物宿主細胞(例如CHO)製造之異多聚體蛋白質中發現之糖基化特徵有關的生物學功能。
本發明亦提供免疫結合物，其包含本發明之異多聚體蛋白質與異源部分結合。任何異源部分均適合，只要其與抗體之結合不會實質上減少抗體之所要功能及/或特徵即可。舉例而言，在一些實施例中，免疫結合物包含作為細胞毒性劑之異源部分。在一些實施例中，該細胞毒性劑係選自由放射性同位素、化學治療劑及毒素組成之群。在一些實施例中，該毒素係選自由加里剎黴素(calichemicin)、美登素(maytansine)及單端孢黴烯(trichothene)組成之群。在一些實施例中，免疫結合物包含作為可偵測標記物之異源部分。在一些實施例中，該可偵測標記物係選自由以下組成之群：放射性同位素、配位體-受體對之成員、酶-受質對之成員及螢光共振能量傳遞對之成員。
在一態樣中，本發明提供組合物，其包含本發明之異多聚體蛋白質及載劑，在一些實施例中，該載劑為醫藥學上可接受之載劑。
在另一態樣中，本發明提供組合物，其包含本文所述之免疫結合物及載劑，在一些實施例中，該載劑為醫藥學上可接受之載劑。
在一態樣中，本發明提供包含本發明之多特異性異多聚體蛋白質群的組合物。如熟習此項技術者所顯而易見，一般而言，此類組合物不完全(亦即100%)均質。然而，如本文所述，本發明之方法能夠製造實質上均質之多特異性異多聚體蛋白質群。舉例而言，本發明提供包含異多聚體蛋白質之組合物，其中該等異多聚體蛋白質之至少40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%為本文所述之本發明多特異性抗體(例如雙特異性抗體等)。
在一態樣中，本發明提供包含第一宿主細胞與第二宿主細胞之混合物的細胞培養物，其中第一宿主細胞包含編碼第一含鉸鏈多肽之核酸，且第二宿主細胞包含編碼第二含鉸鏈多肽之核酸，且其中該兩對具有不同標靶結合特異性。在一態樣中，本發明提供包含第一宿主細胞與第二宿主細胞之混合物的細胞培養物，其中第一宿主細胞表現第一對重鏈與輕鏈多肽，且第二宿主細胞表現第二對重鏈與輕鏈多肽，且其中該兩對具有不同標靶結合特異性。
在另一態樣中，本發明提供如下製品，其包含容器及其中所含之組合物，其中組合物包含本發明之異多聚體蛋白質(例如抗體)。在另一態樣中，本發明提供如下製品，其包含容器及其中所含之組合物，其中組合物包含本文所述之免疫結合物。在一些實施例中，此等製品進一步包含該組合物之使用說明。
在另一態樣中，本發明提供編碼本發明之異多聚體蛋白質的聚核苷酸。在另一態樣中，本發明提供編碼本文所述之免疫結合物的聚核苷酸。
在一態樣中，本發明提供表現本發明之分子(例如抗體)的重組載體。在另一態樣中，本發明提供表現本發明之免疫結合物的重組載體。
多種宿主細胞中之任一者均可用於本發明之方法。該等細胞為此項技術中已知(其中一些描述於本文中)或可使用此項技術中已知之常規技術關於對用於本發明方法之適合性憑經驗確定。在一實施例中，宿主細胞為原核細胞。在一些實施例中，宿主細胞為革蘭氏陰性細菌細胞(gram-negative bacterial cell)。在一實施例中，宿主細胞為大腸桿菌。在一些實施例中，大腸桿菌為缺乏脂蛋白之菌株(Δlpp)。在一些實施例中，大腸桿菌宿主細胞之基因型缺乏degP及prc基因且具有突變spr基因。在一實施例中，宿主細胞為哺乳動物細胞，例如中國倉鼠卵巢(CHO)細胞。
在一態樣中，本發明提供包含本發明之聚核苷酸或重組載體之宿主細胞。在一實施例中，宿主細胞為哺乳動物細胞，例如中國倉鼠卵巢(CHO)細胞。在一實施例中，宿主細胞為原核細胞。在一些實施例中，宿主細胞為革蘭氏陰性細菌細胞，在一些實施例中，其為大腸桿菌。本發明之宿主細胞可進一步包含編碼在宿主細胞中之表現可提高本發明方法中異多聚體蛋白質之產量之分子的聚核苷酸或重組載體。舉例而言，該分子可為伴隨蛋白。在一實施例中，該分子為選自由DsbA、DsbC、DsbG及FkpA組成之群的原核多肽。在一些實施例中，該聚核苷酸或重組載體編碼DsbA與DsbC。在一些實施例中，大腸桿菌宿主細胞為缺乏內源蛋白酶活性之菌株。在一些實施例中，大腸桿菌宿主細胞之基因型為缺乏degP及prc基因且具有突變spr基因之大腸桿菌菌株之基因型。在一些實施例中，大腸桿菌宿主細胞之基因型為Δ1pp。
本發明之異多聚體蛋白質可廣泛應用於多種環境中。在一實例中，本發明之異多聚體蛋白質為治療抗體。在另一實例中，本發明之異多聚體蛋白質為促效抗體。在另一實例中，本發明之異多聚體蛋白質為拮抗抗體。本發明之異多聚體蛋白質亦可為診斷抗體。在另一實例中，本發明之異多聚體蛋白質為阻斷抗體。在另一實例中，本發明之異多聚體蛋白質為中和抗體。
在一態樣中，本發明提供治療或延緩個體之疾病的方法，該等方法包含投與該個體本發明之異多聚體蛋白質。在一實施例中，該疾病為癌症。在另一實施例中，疾病與血管生成失調有關。在另一實施例中，疾病為免疫病症，諸如類風濕性關節炎、免疫血小板減少性紫癜、全身性紅斑狼瘡等。
在一態樣中，本發明提供本發明之異多聚體蛋白質(例如抗體)之用途，其係用於製備供治療性及/或預防性處理疾病(諸如癌症、腫瘤、細胞增殖病、免疫(諸如自體免疫)病症及/或血管生成相關病症)之藥物。
在一態樣中，本發明提供本發明之核酸之用途，其係用於製備供治療性及/或預防性處理疾病(諸如癌症、腫瘤、細胞增殖病、免疫(諸如自體免疫)病症及/或血管生成相關病症)之藥物。
在一態樣中，本發明提供本發明之表現載體之用途，其係用於製備供治療性及/或預防性處理疾病(諸如癌症、腫瘤、細胞增殖病、免疫(諸如自體免疫)病症及/或血管生成相關病症)之藥物。
在一態樣中，本發明提供本發明之宿主細胞之用途，其係用於製備供治療性及/或預防性處理疾病(諸如癌症、腫瘤、細胞增殖病、免疫(諸如自體免疫)病症及/或血管生成相關病症)之藥物。
在一態樣中，本發明提供本發明之製品之用途，其係用於製備供治療性及/或預防性處理疾病(諸如癌症、腫瘤、細胞增殖病、免疫(諸如自體免疫)病症及/或血管生成相關病症)之藥物。
在一態樣中，本發明提供本發明之套組之用途，其係用於製備供治療性及/或預防性處理疾病(諸如癌症、腫瘤、細胞增殖病、免疫(諸如自體免疫)病症及/或血管生成相關病症)之藥物。
本發明之其他目的、特徵及優點將由以下詳細描述顯而易知。然而，應瞭解，詳細描述及特定實例儘管表明本發明之較佳實施例，但僅以說明之方式提供，因為熟習此項技術者由此詳細描述將顯而易知屬於本發明之範疇及精神內之各種變化及修改。
 縮寫
ADCC=抗體依賴性細胞介導之細胞毒性
API=抗病原體免疫黏附素
BPI=殺菌/通透性增加蛋白
C1q=補體因子1q
CD=分化集群
CDC=補體依賴性細胞毒性
CH1或CH1=重鏈第一恆定域
CH2或CH2=重鏈第二恆定域
CH3或CH3=重鏈第三恆定域
CH4或CH4=重鏈第四恆定域
CL或CL=輕鏈恆定域
CTLA=細胞毒性T淋巴細胞締合分子
Fc=可結晶片段
FcγR=IgG之Fc部分的受體γ
HIV=人類免疫缺乏病毒
ICAM=細胞間黏著分子
BsAb=雙特異性抗體
BsDb=雙特異性雙功能抗體
dsFv=二硫基穩定之Fv
Fc=抗體之恆定片段
Fd=抗體之VH+CH1
FcR=Fc受體
Fv=抗體之可變片段
IgG=免疫球蛋白G
mAb=單株抗體
PBL=周邊血液淋巴細胞
scDb=單鏈雙功能抗體
scFv=單鏈Fv
(scFv)2=scFv-scFv串聯體
Tandab=串聯雙功能抗體
VH或VH=抗體重鏈之可變域
VL或VL=抗體輕鏈之可變域
現僅使用以下定義及實例以參考之方式詳細描述本發明。本文提及之所有專利及公開案(包括該等專利及公開案中所揭示之所有序列)均以引用的方式明確併入本文中。
除非本文中另外定義，否則本文所用之所有技術及科學術語均具有與一般熟習本發明所屬技術者通常所瞭解之含義相同的含義。Singleton等人，DICTIONARY OF MICROBIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY，第2版，John Wiley and Sons,New York(1994)及Hale及Marham,THE HARPER COLLINS DICTIONARY OF BIOLOGY,Harper Perennial,NY(1991)為熟習此項技術者提供本發明中所用之許多術語的通用詞典。儘管可使用任何與本文中所述之方法及材料相似或等效的方法及材料來實踐或測試本發明，但描述較佳方法及材料。數值範圍包括界定範圍之數值。除非另外指明，否則分別地，核酸以自左至右為5'至3'取向來書寫；胺基酸序列以自左至右為胺基至羧基取向來書寫。關於此項技術之定義及術語，從業人士尤其受教於Sambrook等人，1989及Ausubel FM等人，1993。應瞭解，本發明並不限於所述特定方法、方案及試劑，因為其可變化。
數值範圍包括界定範圍之數值。
除非另外指明，否則分別地，核酸以自左至右為5'至3'取向來書寫；胺基酸序列以自左至右為胺基至羧基取向來書寫。
本文所提供之標題並不限制本發明之各種態樣或實施例，其可藉由在整體上查閱本說明書來瞭解。相應地，下文緊接著定義之術語藉由在整體上查閱本說明書而更全面地定義。
I.　定義
「異多聚體」、「異多聚體複合物」或「異多聚體蛋白質」係指包含至少第一含鉸鏈多肽及第二含鉸鏈多肽之分子，其中第二含鉸鏈多肽與第一含鉸鏈多肽的胺基酸序列有至少一個胺基酸殘基不同。異多聚體可包含由第一及第二含鉸鏈多肽形成之「異二聚體」，或可形成高級三級結構，其中存在除第一及第二含鉸鏈多肽以外之多肽。異多聚體之多肽可藉由非肽共價鍵(例如二硫鍵)及/或非共價相互作用(例如氫鍵、離子鍵、凡得瓦爾力(van der Waals force)及/或疏水性相互作用)而彼此相互作用。
如本文所用之「異多聚域」係指對生物分子之變化或添加以促進異多聚體形成及阻礙均多聚體形成。相較於均二聚體高度優先形成異二聚體之任何異二聚域屬於本發明之範疇內。說明性實例包括(但不限於)例如美國專利申請案20030078385(Arathoon等人-Genentech；描述杵臼結構)；WO 2007147901(Kjærgaard等人-Novo Nordisk：描述離子相互作用)；WO 2009089004(Kannan等人-Amgen：描述靜電牽引作用)；美國臨時專利申請案61/243,105(Christensen等人-Genentech；描述捲曲螺旋)。亦參見例如描述白胺酸拉鏈之Pack,P.及Plückthun,A.,Biochemistry 31,1579-1584(1992)或描述螺旋-轉角-螺旋基元之Pack等人，Bio/Technology 11,1271-1277(1993)。短語「異多聚域」及「異二聚域」在本文中可互換使用。
如本文所用之短語「含鉸鏈多肽」係指包含對應於如此項技術中所瞭解之免疫球蛋白之鉸鏈區的區域(例如重鏈之CH1與CH2域之間的區域)之多肽。如本文所用之「鉸鏈區」、「鉸鏈序列」及其變化形式包括此項技術中已知之含義，其於例如Janeway's Immunobiology,(Garland Science,Taylor & Francis Group,LLC,NY)(第7版，2008)；Bloom等人，Protein Science(1997),6：407-415；Humphreys等人，J.Immunol.Methods(1997),209：193-202中說明。亦參見例如Burton,Molec.Immunol.22：161-206(1985)及Papadea,C.及I. J. Check(1989)「Human immunoglobulin G and immunoglobulin G subclasses: biochemical,genetic,and clinical aspects.」，Crit Rev Clin Lab Sci 27(1): 27-58。熟習此項技術者應瞭解胺基酸之數目以及可用於鏈間二硫鍵形成之半胱胺酸殘基之數目在免疫球蛋白之類別及同型之間變化。所有該等鉸鏈區可在含鉸鏈多肽中且屬於本發明之範疇內。
本文之術語「抗體」以最廣泛意義使用且係指包含兩條重鏈及兩條輕鏈之任何免疫球蛋白(Ig)分子，及其任何片段、突變體、變異體或衍生物，只要該等片段、突變體、變異體或衍生物展現所要生物活性(例如抗原決定基結合活性)即可。抗體之實例包括單株抗體、多株抗體、多特異性抗體(例如雙特異性抗體)及本文所述之抗體片段。抗體可為人類抗體、人類化抗體及/或親和力成熟抗體。
作為參考座標，如本文所用，抗體係指免疫球蛋白G(IgG)之結構。然而，熟習此項技術者應瞭解/認識到任何免疫球蛋白類別之抗體可用於本文所述之本發明方法中。為清晰起見，IgG分子含有一對一致重鏈(HC)及一對一致輕鏈(LC)。各LC具有一可變域(VL)及一恆定域(CL)，而各HC具有一可變域(VH)及三個恆定域(CH1、CH2及CH3)。CH1及CH2域由鉸鏈區連接。此結構為此項技術所熟知。參考圖1B。
如本文所用之「半抗體」係指一免疫球蛋白重鏈與一免疫球蛋白輕鏈締合。一例示性半抗體描述於圖1A中。熟習此項技術者易瞭解，半抗體亦可具有由單一可變域組成之抗原結合域。
術語「最大抗體」係指包含scFv融合於Fc多肽之融合蛋白。參考WO 2009089004之圖8a。對於雙特異性最大抗體，參考WO 2009089004之圖2。
術語人類IgG Fc區之「CH2域」通常根據EU編號系統自IgG之約殘基231延伸至約340。CH2域獨特之處在於其不與另一域緊密配對。相反，兩條N連接之分支碳水化合物鏈插入完整天然IgG分子之兩個CH2域之間。據推測，碳水化合物可替代域-域配對且幫助穩定CH2域。Burton,Molec. Immunol. 22:161-206(1985)。
術語「CH3域」包含Fc區中C端殘基至CH2域之延伸序列(亦即根據EU編號系統，IgG之約胺基酸殘基341至約胺基酸殘基447)。
如本文所用之術語「Fc區」一般係指包含免疫球蛋白重鏈之C端多肽序列的二聚體複合物，其中C端多肽序列為可藉由木瓜蛋白酶消化完整抗體而獲得之序列。Fc區可包含天然或變異Fc序列。儘管免疫球蛋白重鏈之Fc序列的邊界可改變，但人類IgG重鏈Fc序列通常定義為自約位置Cys226處之胺基酸殘基或自約位置Pro230處之胺基酸殘基延伸至Fc序列之羧基端。除非本文中另外規定，否則Fc區或恆定區中胺基酸殘基之編號係根據EU編號系統(亦稱作EU索引)，如Kabat等人，Sequences of Proteins of Immunological Interest，第5版，Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD,1991中所述。免疫球蛋白之Fc序列一般包含兩個恆定域：CH2域及CH3域，且視情況包含CH4域。本文之「Fc多肽」意謂構成Fc區之多肽之一，例如單體Fc。可自任何適合免疫球蛋白(諸如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4亞型、IgA、IgE、IgD或IgM)獲得Fc多肽。Fc區包含由二硫基結合在一起之兩條H鏈之羧基端部分。抗體之效應功能由Fc區中之序列決定；此區亦為由存在於特定細胞類型上之Fc受體(FcR)識別之部分。在一些實施例中，Fc多肽包含野生型鉸鏈序列之部分或全部(通常在其N端)。在一些實施例中，Fc多肽不包含功能性或野生型鉸鏈序列。
「功能性Fc區」具有天然序列Fc區之「效應功能」。例示性「效應功能」包括Clq結合；CDC；Fc受體結合；ADCC；吞噬作用；細胞表面受體(例如B細胞受體；BCR)下調等。該等效應功能一般需要Fc區與結合域(例如抗體可變域)組合，且可使用例如本文定義中所揭示之各種檢定來評定。
「天然序列Fc區」包含與自然界中發現之Fc區之胺基酸序列一致的胺基酸序列。天然序列人類Fc區包括天然序列人類IgG1 Fc區(非A及A異型)；天然序列人類IgG2 Fc區；天然序列人類IgG3 Fc區；及天然序列人類IgG4 Fc區以及其天然存在之變異體。
「變異Fc區」包含因至少一個胺基酸修飾、較佳一或多個胺基酸取代而不同於天然序列Fc區之胺基酸序列的胺基酸序列。較佳地，變異Fc區相較於天然序列Fc區或親本多肽之Fc區具有至少一個胺基酸取代，例如在天然序列Fc區中或在親本多肽之Fc區中具有約一至約十個胺基酸取代，且較佳約一至約五個胺基酸取代。本文之變異Fc區較佳與天然序列Fc區及/或與親本多肽之Fc區具有至少約80%同源性，且最佳與其具有至少約90%同源性，更佳與其具有至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%同源性。
如本文所用之「Fc組分」係指Fc區之鉸鏈區、CH2域或CH3域。
在某些實施例中，含鉸鏈多肽包含較佳衍生自野生型人類IgG Fc區之IgG Fc區。「野生型」人類IgG Fc意謂天然存在於人類群體內之胺基酸序列。當然，正如個體之間Fc序列可略微變化，野生型序列可進行一或多個變化且仍然屬於本發明之範疇內。舉例而言，Fc區可含有與本發明無關之其他變化，諸如糖基化位點突變或包括非天然胺基酸。
術語「可變區」或「可變域」係指抗體重鏈或輕鏈中參與抗體結合於抗原之域。天然抗體之重鏈及輕鏈的可變域(分別為VH及VL)一般具有類似結構，其中各域包含四個保守構架區(FR)及三個高變區(HVR)。(參見例如Kindt等人Kuby Immunology，第6版，W.H. Freeman and Co.，第91頁(2007))。單一VH或VL域可足以賦予抗原結合特異性。此外，結合特定抗原之抗體可使用結合該抗原之抗體的VH或VL域分別篩選互補VL或VH域之庫來分離。參見例如Portolano等人，J.Immunol.150：880-887(1993)；Clackson等人，Nature 352：624-628(1991)。
如本文所用之術語「Fab」係指抗體之抗原結合片段。如上所述，可使用木瓜蛋白酶消化完整抗體。木瓜蛋白酶消化抗體可產生兩個一致抗原結合片段(亦即「Fab」片段)及殘餘「Fc」片段(亦即前述Fc區)。Fab片段由完整L鏈以及H鏈可變區域(VH)及一條重鏈之第一恆定域(CH1)組成。
如本文所用之短語「抗原結合臂」、「標靶分子結合臂」、「標靶結合臂」及其變化形式係指本發明之異多聚體蛋白質中能夠特異性結合相關標靶的組成部分。一般而言且較佳地，抗原結合臂為免疫球蛋白多肽序列(例如CDR及/或免疫球蛋白輕鏈及重鏈之可變域序列)之複合物。
「標靶」或「標靶分子」係指由異多聚體蛋白質之結合臂識別之部分。舉例而言，若異多聚體蛋白質為抗體，則標靶可為單一分子或不同分子上之抗原決定基，或病原體或腫瘤細胞，視情形而定。類似地，若異多聚體蛋白質為受體-Fc融合蛋白，則標靶將為受體之同源結合搭配物。熟習此項技術者應瞭解，標靶由標靶結合臂之結合特異性決定且不同標靶結合臂可識別不同標靶。標靶較佳以高於1μM Kd之親和力結合於本發明之異多聚體蛋白質(根據斯卡查德分析(scatchard analysis))。標靶分子之實例包括(但不限於)血清可溶性蛋白及/或其受體，諸如細胞激素及/或細胞激素受體、黏附素、生長因子及/或其受體、激素、病毒粒子(例如RSV F蛋白、CMV、StaphA、流行性感冒、C型肝炎病毒)、微生物(例如細菌細胞蛋白質、真菌細胞)、黏附素、CD蛋白及其受體。
「完整」或「全長」抗體之一實例為包含抗原結合臂以及CL及至少重鏈恆定域CH1、CH2及CH3之抗體。恆定域可為天然序列恆定域(例如人類天然序列恆定域)或其胺基酸序列變異體。
如本文所用之術語「偶合」係指將第一與第二含鉸鏈多肽彼此連接所需之步驟，例如形成共價鍵。該等步驟包含將第一及第二含鉸鏈多肽中之半胱胺酸殘基還原、退火及/或氧化，形成鏈間二硫鍵。偶合可藉由化學交聯或使用氧化還原系統達成。參見例如Humphreys等人，J. Immunol. Methods(1998) 217:1-10及Zhu等人，Cancer Lett.,(1994) 86: 127-134。
術語「多特異性抗體」以最廣泛意義使用且特別涵蓋具有多抗原決定基特異性之抗體。該等多特異性抗體包括(但不限於)包含重鏈可變域(VH)及輕鏈可變域(VL)之抗體，其中VHVL單元具有多抗原決定基特異性；具有兩個或兩個以上VL及VH域之抗體，其中各VHVL單元結合於不同抗原決定基；具有兩個或兩個以上單一可變域之抗體，其中各單一可變域結合於不同抗原決定基；全長抗體；抗體片段，諸如Fab、Fv、dsFv、scFv、雙特異性雙功能抗體及三功能抗體、共價或非共價連接之抗體片段。「多抗原決定基特異性」係指特異性結合於相同或不同標靶上之兩種或兩種以上不同抗原決定基之能力。「單特異性」係指僅結合一種抗原決定基之能力。根據一實施例，多特異性抗體為以5 μM至0.001 pM、3 μM至0.001 pM、1 μM至0.001 pM、0.5 μM至0.001 pM或0.1 μM至0.001 pM之親和力結合於各抗原決定基之IgG抗體。雙特異性抗體之示意圖提供於圖1B中。
「抗體片段」包含完整抗體之一部分，較佳完整抗體之抗原結合區或可變區。抗體片段之實例包括Fab、Fab'、F(ab')2及Fv片段；雙功能抗體(Db)；串聯雙功能抗體(taDb)、線性抗體(例如美國專利第5,641,870號；Zapata等人，Protein Eng. 8(10):1057-1062(1995))；一臂抗體、單可變域抗體、微型抗體、單鏈抗體分子；及由抗體片段形成之多特異性抗體(例如包括(但不限於)Db-Fc、taDb-Fc、taDb-CH3及(scFV)4-Fc)。
表述「單域抗體」(sdAb)或「單可變域(SVD)抗體」一般係指單可變域(VH或VL)可賦予抗原結合之抗體。換言之，單可變域無需為識別標靶抗原而與另一可變域相互作用。單域抗體由各抗原結合臂上之單一單體可變抗體域(VH或VL)組成。單域抗體之實例包括衍生自駱駝科(駝馬及駱駝)及軟骨魚(例如護士鯊)之抗體及由重組方法衍生自人類及小鼠抗體之抗體(Ward等人，Nature(1989)341:544-546；Dooley及Flajnik,Dev Comp Immunol(2006) 30:43-56；Muyldermans等人，Trend Biochem Sci(2001) 26:230-235；Holt等人，Trends Biotechnol(2003):21:484-490；WO 2005/035572；WO 03/035694；Davies及Riechmann,Febs Lett(1994)339:285-290；WO 00/29004；WO 02/051870)。單可變域抗體可以含其他可變區或可變域之抗原結合臂(例如均或異多聚體)形式存在，在該情況下其不為單域抗體。
表述「線性抗體」一般係指Zapata等人，Protein Eng. 8(10):1057-1062(1995)中所述之抗體。簡言之，此等抗體包含一對串聯Fd區段(VH-CH1-VH-CH1)，其連同互補輕鏈多肽一起形成一對抗原結合區。線性抗體可為雙特異性或單特異性抗體。
本文提及之術語「杵臼結構」或「KnH」技術係指在活體外或活體內藉由在多肽相互作用之界面處向一多肽中引入突起(杵)且向另一多肽中引入空腔(臼)來指導兩個多肽配對在一起的技術。舉例而言，已在抗體之Fc：Fc結合界面、CL：CH1界面或VH/VL界面中引入KnH(例如US 2007/0178552、WO 96/027011、WO 98/050431及Zhu等人，(1997)Protein Science 6:781-788)。此尤其適用於在製造多特異性抗體期間推動兩個不同重鏈配對在一起。舉例而言，Fc區中具有KnH之多特異性抗體可進一步包含單一可變域連接於各Fc區，或進一步包含不同重鏈可變域與類似或不同輕鏈可變域配對。KnH技術亦可用於使兩個不同受體細胞外域或包含不同標靶識別序列之任何其他多肽序列(例如包括親和抗體、肽體及其他Fc融合物)配對在一起。
「Fv」由一個重鏈可變區域與一個輕鏈可變區域緊密非共價締合而成之二聚體組成。此兩個域摺疊產生六個高變環(H鏈及L鏈各3個環)，其提供用於抗原結合之胺基酸殘基，且賦予抗體抗原結合特異性。然而，即使單一可變域(或僅包含三個對抗原具有特異性之CDR的半個Fv)亦具有識別及結合抗原之能力，但通常親和力比完整結合位點低。
「單鏈Fv」(亦簡寫為「sFv」或「scFv」)為包含VH及VL抗體域連接於單一多肽鏈中之抗體片段。sFv多肽較佳在VH與VL域之間進一步包含使sFv能夠形成抗原結合所要結構之多肽連接子。關於sFv之評述，參見Pluckthun,The Pharmacology of Monoclonal Antibodies，第113卷，Rosenburg及Moore編，Springer-Verlag,New York，第269-315頁(1994)；Malmborg等人，J.Immunol.Methods 183：7-13,1995。
術語「雙功能抗體」係指藉由在VH與VL域之間用短連接子(約5-10個殘基)構築sFv片段(參見前段)，以達成V域之鏈間而非鏈內配對，從而得到二價片段(亦即具有兩個抗原結合位點之片段)而製備的小抗體片段。雙特異性雙功能抗體為兩個「交叉」sFv片段之異二聚體，其中兩個抗體之VH域及VL域存在於不同多肽鏈上。雙功能抗體更詳細地描述於例如EP 404,097、WO 93/11161及Holliger等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA,90：6444-6448(1993)中。
術語「一臂抗體」係指包含以下之抗體：(1)藉由肽鍵接合於包含CH2域、CH3域或CH2-CH3域之多肽的可變域；及(2)第二CH2、CH3或CH2-CH3域，其中可變域未藉由肽鍵接合於包含第二CH2、CH3或CH2-CH3域之多肽。在一實施例中，一臂抗體包含3種多肽：(1)包含可變域(例如VH)、CH1、CH2及CH3之第一多肽，(2)包含可變域(例如VL)及CL域之第二多肽，及(3)包含CH2及CH3域之第三多肽。在另一實施例中，一臂抗體具有含兩個半胱胺酸殘基之部分鉸鏈區，該兩個半胱胺酸殘基形成連接恆定重鏈之二硫鍵。在一實施例中，一臂抗體之可變域形成抗原結合區。在另一實施例中，一臂抗體之可變域為單一可變域，其中各單一可變域為抗原結合區。在一實施例中，一臂抗體為單可變域抗體。
本發明之抗體可為「嵌合」抗體，其中重鏈及/或輕鏈之一部分與源自特定物種或屬於特定抗體類別或亞類之抗體的相應序列一致或同源，而該(等)鏈之其餘部分與源自另一物種或屬於另一抗體類別或亞類之抗體的相應序列一致或同源；以及該等抗體之片段，只要其展現出所要生物活性即可(美國專利第4,816,567號；及Morrison等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81:6851-6855(1984))。本文之相關嵌合抗體包括「靈長類化」抗體，其包含源自非人類靈長類動物(例如舊大陸猴(Old World Monkey)、猿等)之可變域抗原結合序列及人類恆定區序列。
非人類(例如齧齒動物)抗體之「人類化」形式為含有源自非人類抗體之最小序列的嵌合抗體。在大多數情況下，人類化抗體為如下人類免疫球蛋白(接受者抗體)，其中接受者高變區之殘基置換為具有所要抗體特異性、親和力及能力之非人類物種(諸如小鼠、大鼠、兔或非人類靈長類動物)(供者抗體)高變區之殘基。在一些情況下，人類免疫球蛋白之構架區(FR)殘基經相應非人類殘基置換。此外，人類化抗體可包含接受者抗體或供者抗體中未發現之殘基。可進行此等修飾以進一步改善抗體效能。一般而言，人類化抗體包含至少一個且通常兩個可變域之實質上全部，其中所有或實質上所有高變環對應於非人類免疫球蛋白之高變環，且所有或實質上所有FR為人類免疫球蛋白序列之FR。人類化抗體視情況亦包含免疫球蛋白恆定區(Fc)之至少一部分，通常為人類免疫球蛋白恆定區之至少一部分。關於其他詳情，參見Jones等人，Nature 321：522-525(1986)；Riechmann等人，Nature 332：323-327(1988)；及Presta，Curr.Op.Struct.Biol.2：593-596(1992)。
「肽體」係指隨機產生之肽與Fc域之融合物。參見2003年12月9日頒予Feige等人之美國專利第6,660,843號(以全文引用的方式併入本文中)。其包括一或多種肽連接於N端、C端、胺基酸側鏈或一個以上此等位點。肽體技術使設計併入靶向一或多種配位體或受體之肽、腫瘤導向肽、膜輸送肽及其類似物的治療劑成為功能。肽體技術已證明適用於設計多種該等分子，包括線性及二硫基限制肽、「串聯肽多聚體」(亦即Fc域單鏈上之一個以上肽)。參見例如美國專利第6,660,843號；2003年10月16日公開之美國專利申請案第2003/0195156號(對應於2002年11月21日公開之WO 02/092620)；2003年9月18日公開之美國專利申請案第2003/0176352號(對應於2003年4月17日公開之WO 03/031589)；1999年10月22日申請之美國第09/422,838號(對應於2000年5月4日公開之WO 00/24770)；2003年12月11日公開之美國專利申請案第2003/0229023號；2003年7月17日公開之WO 03/057134；2003年12月25日公開之美國專利申請案第2003/0236193號(對應於2004年4月8日申請之PCT/US04/010989)；2003年9月18日申請之美國第10/666,480號(對應於2004年4月1日公開之WO 04/026329)，其各以全文引用的方式併入本文中。
「親和抗體」係指使用藉由肽鍵連接於Fc區之蛋白質，其中該蛋白質用作提供標靶分子之結合表面的骨架。該蛋白質通常為天然存在之蛋白質，諸如葡萄球菌蛋白A(staphylococcal protein A)或IgG結合B域或衍生自其之Z蛋白(參見Nilsson等人，(1987),Prot Eng 1,107-113及美國專利第5,143,844號)或其片段或衍生物。舉例而言，親和抗體可由對標靶分子之結合親和力改變之Z蛋白變異體產生，其中Z蛋白之區段已藉由隨機突變誘發而突變，產生能夠結合標靶分子之變異體之庫。親和抗體之實例包括美國專利第6,534,628號；Nord K等人，Prot Eng 8：601-608(1995)；及Nord K等人，Nat Biotech 15：772-777(1997)；Biotechnol Appl Biochem.2008年6月；50(第2部分)：97-112。
如本文所用之術語「免疫黏附素」表示組合異源蛋白質(「黏附素」)之結合特異性與免疫球蛋白恆定域之效應功能的分子。在結構上，免疫黏附素包含具有所要結合特異性之胺基酸序列(該胺基酸序列不為抗體之抗原識別及結合位點，亦即相較於抗體之恆定區為「異源」)與免疫球蛋白恆定域序列(例如IgG之CH2及/或CH3序列)之融合物。例示性黏附素序列包括包含結合於相關蛋白質之受體或配位體之一部分的相鄰胺基酸序列。黏附素序列亦可為結合相關蛋白質但不為受體或配位體序列的序列(例如肽體中之黏附素序列)。該等多肽序列可藉由各種方法選擇或鑑別，包括噬菌體呈現技術及高通量分選方法。免疫黏附素中之免疫球蛋白恆定域序列可獲自任何免疫球蛋白，諸如IgG1、IgG2、IgG3或IgG4亞型、IgA(包括IgA1及IgA2)、IgE、IgD或IgM。
如本文所用之「複合」係指兩個或兩個以上分子彼此經由非肽鍵之鍵及/或力(例如凡得瓦爾力、疏水性力、親水性力)相互作用而締合。在一實施例中，複合為異多聚。應瞭解，如本文所用之術語「蛋白質複合物」或「多肽複合物」包括蛋白質複合物中具有非蛋白質實體(例如包括(但不限於)化學分子，諸如毒素或偵測劑)結合於蛋白質的複合物。
結合相關抗原之本發明異多聚體蛋白質為以足以使得異多聚體蛋白質適用作靶向表現標靶之蛋白質或細胞或組織之診斷及/或治療劑的親和力結合標靶且不與其他蛋白質顯著交叉反應的蛋白質。在該等實施例中，如螢光活化細胞分選(FACS)分析或放射免疫沈澱(RIA)或ELISA所測定，異多聚體蛋白質結合於「非標靶」蛋白質之程度應小於抗體結合於其特定標靶蛋白質的約10%。關於異多聚體蛋白質結合於標靶分子，術語「特異性結合」或「特異性結合於」或「特異性針對」特定多肽或特定多肽標靶上之抗原決定基意謂顯著不同於非特異性相互作用(例如非特異性相互作用可為結合於牛血清白蛋白或酪蛋白)之結合。特異性結合可例如藉由測定分子之結合，與對照分子之結合相比較來量測。舉例而言，特異性結合可藉由與類似於標靶之對照分子(例如過量未標記標靶)競爭來測定。在此情況下，若經標記標靶與探針之結合受過量未標記標靶競爭性抑制，則表明特異性結合。如本文所用之術語「特異性結合」或「特異性結合於」或「特異性針對」特定多肽或特定多肽標靶上之抗原決定基可例如由對標靶之Kd值為至少約200 nM、或者至少約150 nM、或者至少約100 nM、或者至少約60 nM、或者至少約50 nM、或者至少約40 nM、或者至少約30 nM、或者至少約20 nM、或者至少約10 nM、或者至少約8 nM、或者至少約6 nM、或者至少約4 nM、或者至少約2 nM、或者至少約1 nM或更大的分子展現。在一實施例中，術語「特異性結合」係指如下結合，其中異多聚體蛋白質結合於特定多肽或特定多肽上之抗原決定基而不會實質上結合於任何其他多肽或多肽抗原決定基。
「結合親和力」一般係指分子(例如抗體)之單一結合位點與其結合搭配物(例如抗原)之間的非共價相互作用的總強度。除非另外指明，否則如本文所用之「結合親和力」係指反映結合對(例如抗體與抗原)成員之間1:1相互作用之固有結合親和力。分子X對其搭配物Y之親和力一般可由解離常數(Kd)表示。舉例而言，Kd值可為約200 nM、150 nM、100 nM、60 nM、50 nM、40 nM、30 nM、20 nM、10 nM、8 nM、6 nM、4 nM、2 nM、1 nM或更強。可藉由此項技術中已知之通用方法(包括本文所述之方法)量測親和力。低親和力抗體一般緩慢地結合抗原且傾向於容易解離，而高親和力抗體一般較快地結合抗原且傾向於保持較長時間結合。此項技術中已知多種量測結合親和力之方法，任一方法均可用於達成本發明之目的。
在一實施例中，藉由在25℃下，用約10個反應單位(RU)之固定標靶(例如抗原)CM5晶片，使用BIAcoreTM-2000或BIAcoreTM-3000(BIAcore,Inc.,Piscataway,NJ)，使用表面電漿子共振檢定來量測根據本發明之「Kd」或「Kd值」。簡言之，根據供應商之說明，用N-乙基-N'-(3-二甲基胺基丙基)-碳化二亞胺鹽酸鹽(EDC)及N-羥基丁二醯亞胺(NHS)活化羧甲基化聚葡萄糖生物感測器晶片(CM5,BIAcore Inc.)。用10 mM乙酸鈉(pH 4.8)稀釋抗原至5 μg/ml(約0.2 μM)，隨後以5 μl/min之流速注射，獲得約10個反應單位(RU)之偶合蛋白質。注射抗原後，注射1 M乙醇胺以阻斷未反應之基團。為進行動力學量測，在25℃下以約25 μl/min之流速注射Fab於含0.05% Tween 20之PBS(PBST)中之兩倍連續稀釋液(例如0.78 nM至500 nM)。使用簡單一對一朗繆爾結合模型(one-to-one Langmuir binding model)(BIAcore評估軟體3.2版)，藉由同時擬合締合與解離感測器圖譜來計算締合速率(kon)及解離速率(koff)。平衡解離常數(Kd)計算為比率koff/kon。參見例如Chen等人，J. Mol. Biol. 293:865-881(1999)。若藉由上述表面電漿子共振檢定，締合速率超過106 M-1 S-1，則締合速率可藉由使用螢光淬滅技術量測，該技術係在25℃下，在濃度增大之抗原存在下，如光譜儀(諸如具有攪拌式比色管之停流裝備型分光光度計(Aviv Instruments)或8000-系列SLM-Aminco分光光度計(ThermoSpectronic))中所量測，量測PBS(pH 7.2)中之20 nM抗抗原抗體(Fab形式)之螢光發射強度(激發=295 nm；發射=340 nm，16 nm帶通)之增加或減少。
除非另外規定，否則有關本發明異多聚體蛋白質(諸如抗體、片段或其衍生物)之「生物學活性」及「生物特徵」意謂具有結合於生物分子之能力。
「經分離」在用於描述各種異多聚體多肽時意謂已自表現其之細胞或細胞培養物分離及/或回收之異多聚體。其天然環境之污染組分為將干擾異多聚體之診斷或治療用途之物質，且可包括酶、激素及其他蛋白質或非蛋白質溶質。在某些實施例中，異多聚體(1)如藉由勞立法(Lowry method)所測定，純化至大於95重量%，且最佳大於99重量%蛋白質；(2)純化至足以藉由使用旋杯式定序儀獲得N端或內部胺基酸序列之至少15個殘基的程度；或(3)純化至藉由SDS-PAGE在還原或非還原條件下使用考馬斯藍(Coomassie blue)或較佳銀染色法得知之均質性。然而，通常經分離多肽藉由至少一個純化步驟製備。
本發明之異多聚體一般純化至實質上均質。短語「實質上均質」、「實質上均質形式」及「實質上均質性」用於指示產物實質上不含源自不需多肽組合(例如均多聚體)之副產物。
在純度方面表述之實質上均質性意謂副產物之量不超過10重量%、9重量%、8重量%、7重量%、6重量%、4重量%、3重量%、2重量%或1重量%或小於1重量%。在一實施例中，副產物少於5%。
「生物分子」係指核酸、蛋白質、碳水化合物、脂質及其組合。在一實施例中，生物分子存在於自然界中。
如本文所用之「連接」意謂第一與第二胺基酸序列之間的直接肽鍵鍵聯，或涉及第三胺基酸序列之鍵聯，該第三胺基酸序列以肽鍵鍵結於第一及第二胺基酸序列且鍵結於第一與第二胺基酸序列之間。舉例而言，連接子以肽鍵鍵結於一胺基酸序列之C端且鍵結於另一胺基酸序列之N端。
如本文所用之「連接子」意謂長度為兩個或兩個以上胺基酸之胺基酸序列。連接子可由中性極性或非極性胺基酸組成。連接子長度可為例如2至100個胺基酸，諸如長度為2至50個胺基酸，例如長度為3、5、10、15、20、25、30、35、40、45或50個胺基酸。連接子可為「可裂解的」，例如藉由自裂解或酶法或化學裂解。胺基酸序列中之裂解位點及在該等位點處裂解之酶及化學物質為此項技術所熟知且亦描述於本文中。
如本文所用之「繫栓」意謂接合兩個其他胺基酸序列之胺基酸連接子。本文所述之繫栓可連接免疫球蛋白重鏈可變域之N端與免疫球蛋白輕鏈恆定域之C端。在特定實施例中，繫栓長度為約15至50個胺基酸，例如長度為20至26個胺基酸(例如長度為20、21、22、23、24、25或26個胺基酸)。繫栓可為「可裂解的」，例如藉由自裂解或使用此項技術中之標準方法及試劑酶法或化學裂解。
「連接子」或「繫栓」之酶法裂解可涉及使用內肽酶，諸如Lys-C、Asp-N、Arg-C、V8、Glu-C、胰凝乳蛋白酶、胰蛋白酶、胃蛋白酶、木瓜蛋白酶、凝血酶、Genenase、因子Xa、TEV(菸草蝕刻病毒半胱胺酸蛋白酶)、腸激酶、HRV C3(人類鼻病毒C3蛋白酶)、激肽原酶以及枯草桿菌蛋白酶樣原蛋白轉化酶(例如弗林蛋白酶(PC1)、PC2或PC3)或N-精胺酸二元轉化酶。化學裂解可涉及使用例如羥基胺、N-氯丁二醯亞胺、N-溴丁二醯亞胺或溴化氰。
如本文所用之「Lys-C內肽酶裂解位點」為胺基酸序列中可藉由Lys-C內肽酶在C端側裂解之離胺酸殘基。Lys-C內肽酶在離胺酸殘基之C端側裂解。
「離液劑」意謂藉由干擾穩定分子內相互作用(例如氫鍵、凡得瓦爾力或疏水性作用)而破壞蛋白質(例如抗體)之三維結構的水溶性物質。例示性離液劑包括(但不限於)尿素、鹽酸胍、過氯酸鋰、組胺酸及精胺酸。
「溫和清潔劑」意謂藉由干擾穩定分子內相互作用(例如氫鍵、凡得瓦爾力或疏水性作用)而破壞蛋白質(例如抗體)之三維結構，但不會永久破壞蛋白質結構而造成生物活性喪失(亦即不會使蛋白質變性)的水溶性物質。例示性溫和清潔劑包括(但不限於)Tween(例如Tween-20)、Triton(例如Triton X-100)、NP-40(壬基苯氧基聚乙氧基乙醇)、Nonidet P-40(辛基苯氧基聚乙氧基乙醇)及十二烷基硫酸鈉(SDS)。
抗體「效應功能」係指可歸因於抗體之Fc區(天然序列Fc區或胺基酸序列變異體Fc區)的生物活性，且其隨抗體同型而變化。抗體效應功能之實例包括：Clq結合及補體依賴性細胞毒性；Fc受體結合；抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)；吞噬作用；細胞表面受體(例如B細胞受體)下調；及B細胞活化。
「抗體依賴性細胞介導之細胞毒性」或「ADCC」係指如下細胞毒性形式，其中結合於某些細胞毒性細胞(例如自然殺手(NK)細胞、嗜中性白血球及巨噬細胞)上所存在之Fc受體(FcR)的分泌型Ig使此等細胞毒性效應細胞能夠特異性結合於帶有抗原之標靶細胞且隨後用細胞毒性劑殺死標靶細胞。抗體「裝備」該等細胞毒性細胞且為該殺死絕對需要。用於介導ADCC之初級細胞NK細胞僅表現FcγRIII，而單核細胞表現FcγRI、FcγRII及FcγRIII。FcR在造血細胞上之表現概括於Ravetch及Kinet,Annu. Rev. Immunol. 9:457-92(1991)第464頁表3中。為評定相關分子之ADCC活性，可執行活體外ADCC檢定，諸如美國專利第5,500,362號或第5,821,337號中所述之檢定。適用於該等檢定之效應細胞包括周邊血液單核細胞(PBMC)及自然殺手(NK)細胞。或者或另外，可例如在動物模型(諸如Clynes等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:652-656(1998)中所揭示之動物模型)中活體內評定相關分子之ADCC活性。
「Fc受體」或「FcR」描述結合於抗體Fc區之受體。較佳FcR為人類FcR。此外，較佳FcR為結合IgG抗體之FcR(γ受體)且包括FcγRI、FcγRII及FcγRIII亞類之受體，包括此等受體之對偶基因變異體及替代性拼接形式。FcγRII受體包括FcγRIIA(「活化受體」)及FcγRIIB(「抑制受體」)，兩者具有類似胺基酸序列，主要不同之處在其細胞質域。活化受體FcγRIIA在其細胞質域中含有基於免疫受體酪胺酸之活化基元(ITAM)。抑制受體FcγRIIB在其細胞質域中含有基於免疫受體酪胺酸之抑制基元(ITIM)(參見評述M. Daron,Annu. Rev. Immunol. 15:203-234(1997))。FcR評述於Ravetch及Kinet,Annu. Rev. Immunol 9:457-492(1991)；Capel等人，Immunomethods 4:25-34(1994)；及de Haas等人，J. Lab. Clin. Med. 126:330-41(1995)。本文之術語「FcR」涵蓋其他FcR，包括將來待鑑別之FcR。該術語亦包括新生兒受體FcRn，其負責將母體IgG轉移至胎兒(Guyer等人，J.Immunol.117：587(1976)及Kim等人，European J.Immunol.24：2429-2434(1994))。
「人類效應細胞」為表現一或多種FcR且執行效應功能之白血球。該等細胞較佳至少表現FcγRIII且執行ADCC效應功能。介導ADCC之人類白血球之實例包括周邊血液單核細胞(PBMC)、自然殺手(NK)細胞、單核細胞、細胞毒性T細胞及嗜中性白血球；其中PBMC及NK細胞為較佳。效應細胞可自天然來源(例如血液)分離。
「補體依賴性細胞毒性」或「CDC」係指在補體存在下標靶細胞之溶解。經典補體路徑之活化係由補體系統之第一組分(C1q)結合於與其同源抗原結合之(適當亞類)抗體而開始。為評定補體活化，可執行CDC檢定，例如Gazzano-Santoro等人，J.Immunol.Methods 202：163(1996)中所述。
術語「治療有效量」係指抗體、抗體片段或衍生物治療個體之疾病或病症的量。在腫瘤(例如癌性腫瘤)之情況下，治療有效量之抗體或抗體片段(例如多特異性抗體或抗體片段)可減少癌細胞之數目；減小原發性腫瘤尺寸；抑制(亦即在某種程度上減緩且較佳停止)癌細胞向周邊器官浸潤；抑制(亦即在某種程度上減緩且較佳停止)腫瘤轉移；在某種程度上抑制腫瘤生長；及/或在某種程度上緩解與病症有關之一或多種症狀。在抗體或抗體片段可阻止生長及/或殺死所存在之癌細胞的程度上，該抗體或抗體片段可具有細胞生長抑制性及/或細胞毒性。對於癌症療法，可例如藉由評定存活持續時間、疾病進展時間(TTP)、反應率(RR)、反應持續時間及/或生活品質來量測活體內功效。
「減小或抑制」意謂能夠引起整體降低較佳20%或20%以上，更佳50%或50%以上且最佳75%、85%、90%、95%或95%以上。減小或抑制可指所治療病症之症狀、轉移之存在或尺寸、原發性腫瘤之尺寸或血管生成病症中血管之尺寸或數目。
術語「癌症」及「癌性」係指或描述哺乳動物中通常特徵為不受調控之細胞生長/增殖的生理病狀。此定義包括良性及惡性癌症。癌症之實例包括(但不限於)：癌瘤、淋巴瘤、母細胞瘤、肉瘤及白血病。該等癌症之更特定實例包括鱗狀細胞癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、肺鱗癌、腹膜癌、肝細胞癌、胃癌(包括胃腸癌)、胰臟癌、膠質母細胞瘤、神經膠質瘤、子宮頸癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、肝腫瘤、乳癌、結腸癌、結腸直腸癌、子宮內膜癌或子宮癌、唾液腺癌、腎癌(例如腎細胞癌)、肝癌、前列腺癌、陰門癌、甲狀腺癌、肝癌瘤、肛門癌、陰莖癌、黑色素瘤及各類型頭頸癌。「早期癌症」意謂非侵襲性或轉移性或歸屬於0、I或II期癌症的癌症。術語「癌症前期」係指通常在癌症之前或發展成癌症之病狀或生長。「非轉移性」意謂癌症為良性的或保持在原發性位點且尚未滲透至淋巴或血管系統中或除原發性位點以外之組織中。非轉移性癌症一般為0、I或II期癌症且有時III期癌症之任何癌症。
本文之「過敏或發炎病症」為由個體之免疫系統過度活化而引起之疾病或病症。例示性過敏或發炎病症包括(但不限於)哮喘、牛皮癬、類風濕性關節炎、異位性皮膚炎、多發性硬化症、全身性紅斑狼瘡、濕疹、器官移植、年齡相關之黃斑變性、克羅恩氏病(Crohn's disease)、潰瘍性結腸炎、嗜伊紅血球性食道炎及與發炎有關之自體免疫疾病。
本文之「自體免疫疾病」為由個體自身組織引起且針對個體自身組織的疾病或病症或其共分離或表現形式或由其所引起之病狀。自體免疫疾病或病症之實例包括(但不限於)關節炎(類風濕性關節炎，諸如急性關節炎、慢性類風濕性關節炎、痛風性關節炎、急性痛風性關節炎、慢性發炎性關節炎、退化性關節炎、傳染性關節炎、萊姆關節炎(Lyme arthritis)、增生性關節炎、牛皮癬性關節炎、脊椎關節炎及幼年發作型類風濕性關節炎、骨關節炎、慢性漸進性關節炎、變形性關節炎、慢性原發性多發性關節炎、反應性關節炎及僵直性脊椎炎)、發炎性過度增殖皮膚病、牛皮癬(諸如斑塊狀牛皮癬、滴狀牛皮癬、膿皰型牛皮癬及指甲牛皮癬)、皮膚炎(包括接觸性皮膚炎、慢性接觸性皮膚炎、過敏性皮膚炎、過敏性接觸性皮膚炎、疱疹樣皮膚炎及異位性皮膚炎)、x連鎖高IgM症候群、蕁麻疹(諸如慢性過敏性蕁麻疹及慢性特發性蕁麻疹，包括慢性自體免疫性蕁麻疹)、多發性肌炎/皮肌炎、青少年皮肌炎、中毒性表皮壞死溶解、硬皮病(包括全身性硬皮病)、硬化症(諸如全身性硬化症、多發性硬化症(MS)(諸如脊髓-眼MS、原發性進行性MS(PPMS)及復發緩解性MS(RRMS))、進行性全身性硬化症、動脈粥樣硬化、動脈硬化、播散性硬化及共濟失調硬化)、發炎性腸道疾病(IBD)(例如克羅恩氏病、自體免疫介導之胃腸病、結腸炎(諸如潰瘍性結腸炎、顯微鏡下結腸炎、膠原性結腸炎、息肉狀結腸炎、壞死性小腸結腸炎及透壁性結腸炎)及自體免疫性發炎性腸道疾病)、壞疽性膿皮病、結節性紅斑、原發性硬化性膽管炎、上鞏膜炎、呼吸窘迫症候群(包括成人或急性呼吸窘迫症候群(ARDS))、腦膜炎、葡萄膜全部或部分發炎、虹膜炎、脈絡膜炎、自體免疫性血液病症、類風濕性脊椎炎、突發性耳聾、IgE介導之疾病(諸如全身性過敏反應及過敏性及異位性鼻炎)、腦炎(諸如拉氏腦炎(Rasmussen's encephalitis)及邊緣葉腦炎及/或腦幹腦炎)、葡萄膜炎(諸如前葡萄膜炎、急性前葡萄膜炎、肉芽腫性葡萄膜炎、非肉芽腫性葡萄膜炎、晶狀體抗原性葡萄膜炎、後葡萄膜炎或自體免疫性葡萄膜炎)、有或無腎病症候群之腎小球腎炎(GN)(諸如慢性或急性腎小球腎炎，諸如原發性GN、免疫介導之GN、膜性GN(膜性腎病)、特發性膜性GN或特發性膜性腎病、膜或膜性增生性GN(MPGN)(包括I型及II型)及快速進行性GN)、過敏性病狀、過敏反應、濕疹(包括過敏性或異位性濕疹)、哮喘(諸如支氣管哮喘及自體免疫性哮喘)、涉及T細胞浸潤及慢性發炎反應之病狀、慢性肺部發炎疾病、自體免疫性心肌炎、白血球黏著缺陷病、全身性紅斑狼瘡(SLE)(諸如皮膚SLE)、亞急性皮膚紅斑狼瘡、新生兒狼瘡症候群(NLE)、播散性紅斑狼瘡、狼瘡(包括狼瘡性腎炎、狼瘡性大腦炎、兒童狼瘡、非腎狼瘡、腎外狼瘡、盤狀狼瘡、狼瘡脫髮)、青少年發作型(I型)糖尿病(包括兒童胰島素依賴型糖尿病(IDDM))、成年發作型糖尿病(II型糖尿病)、自體免疫性糖尿病、特發性尿崩症、與由細胞激素及T淋巴細胞介導之急性及遲發性過敏反應有關的免疫反應、結核病、類肉瘤病、肉芽腫(包括淋巴瘤樣肉芽腫、韋格納氏肉芽腫(Wegener's granulomatosis))、顆粒性球缺乏症、血管炎病(包括血管炎，包括大血管血管炎(包括風濕性多肌痛及巨細胞(高安氏(Takayasu's))動脈炎)、中等血管血管炎(包括川崎氏病(Kawasaki's disease)及結節性多動脈炎)、顯微鏡下多動脈炎、CNS血管炎、壞死性血管炎、皮膚血管炎或過敏性血管炎、全身性壞死性血管炎及ANCA相關之血管炎(諸如丘格-斯特勞斯血管炎(Churg-Strauss vasculitis)或丘格-斯特勞斯症候群(CSS)))、顳動脈炎、再生障礙性貧血、自體免疫性再生障礙性貧血、庫姆陽性貧血(Coombs positive anemia)、戴-布二氏貧血(Diamond Blackfan anemia)、溶血性貧血或免疫性溶血性貧血(包括自體免疫性溶血性貧血(AIHA))、惡性貧血、愛迪森氏病(Addison's disease)、純紅血球貧血或發育不全(PRCA)、因子VIII缺陷病、A型血友病、自體免疫性嗜中性白血球減少症、全部血球減少症、白血球減少症、涉及白血球滲出之疾病、CNS發炎病症、多發性器官損傷症候群(諸如因敗血病、創傷或出血繼發之多發性器官損傷症候群)、抗原-抗體複合物介導之疾病、抗腎小球基底膜病、抗磷脂抗體症候群、過敏性神經炎、白塞氏病(Bechet's/Behcet's disease)、卡氏症候群(Castleman's syndrome)、古柏氏症候群(Goodpasture's syndrome)、雷諾氏症候群(Reynaud's syndrome)、休格連氏症候群(Sjogren's syndrome)、史蒂芬-強森症候群(Stevens-Johnson syndrome)、類天疱瘡(諸如大皰性類天疱瘡及皮膚類天疱瘡)、天疱瘡(包括尋常天疱瘡、落葉狀天疱瘡、天疱瘡黏膜類天疱瘡及紅斑性天疱瘡)、自體免疫性多內分泌病、雷特氏病(Reiter's disease)或雷特氏症候群、免疫複合物性腎炎、抗體介導之腎炎、視神經脊髓炎、多發性神經病、慢性神經病(諸如IgM多發性神經病或IgM介導之神經病)、血小板減少症(如例如心肌梗塞患者發展之血小板減少症，包括血栓性血小板減少性紫癜(TTP)及自體免疫或免疫介導之血小板減少症(諸如特發性血小板減少性紫癜(ITP)，包括慢性或急性ITP))、睪丸及卵巢之自體免疫疾病(包括自體免疫性睪丸炎及卵巢炎)、原發性甲狀腺功能低下、副甲狀腺機能減退症、自體免疫內分泌疾病(包括甲狀腺炎，諸如自體免疫性甲狀腺炎、橋本氏病(Hashimoto's disease)、慢性甲狀腺炎(橋本氏甲狀腺炎)或亞急性甲狀腺炎)、自體免疫性甲狀腺病、特發性甲狀腺功能低下、格雷夫斯氏病(Grave's disease)、多腺症候群(諸如自體免疫性多腺症候群(或多腺內分泌病症候群))、副腫瘤症候群(包括神經性副腫瘤症候群，諸如朗伯-伊頓肌無力症候群(Lambert-Eaton myasthenic syndrome)或伊頓-朗伯症候群)、僵人症候群、腦脊髓炎(諸如過敏性腦脊髓炎及實驗性過敏性腦脊髓炎(EAE))、重症肌無力(諸如胸腺瘤相關之重症肌無力)、小腦退化、神經性肌強直、斜視眼陣攣或斜視眼陣攣性肌陣攣症候群(OMS)及感覺神經病、多灶性運動神經病、席漢氏症候群(Sheehan's syndrome)、自體免疫性肝炎、慢性肝炎、狼瘡樣肝炎、巨細胞性肝炎、慢性活動性肝炎或自體免疫性慢性活動性肝炎、淋巴間質性肺炎、阻塞性細支氣管炎(非移植)伴有NSIP、格林-巴利症候群(Guillain-Barrsyndrome)、伯傑氏病(Berger's disease)(IgA腎病)、特發性IgA腎病、線狀IgA皮膚病、原發性膽汁性肝硬化、肺硬化、自體免疫性腸病症候群、乳糜病、乳糜瀉、口炎性腹瀉(麩質腸病)、難治性脂肪瀉、特發性脂肪瀉、冷球蛋白血症、肌肉萎縮性側索硬化(ALS；盧格里格氏病(Lou Gehrig's disease))、冠狀動脈病、自體免疫性耳病(諸如自體免疫性內耳病(AIED))、自體免疫性耳聾、斜視眼陣攣性肌陣攣症候群(OMS)、多軟骨炎(諸如難治性或復發性多軟骨炎)、肺泡性蛋白沈積症、澱粉樣變性、鞏膜炎、非癌性淋巴細胞增多、原發性淋巴細胞增多(其包括單株B細胞淋巴細胞增多(例如良性單株球蛋白症及意義未明之單株球蛋白症(MGUS)))、周邊神經病、副腫瘤症候群、通道病變(諸如癲癇、偏頭痛、心律不整、肌肉性病症、聾、盲、週期性麻痺及CNS之通道病變)、自閉、發炎性肌病、局部節段性腎小球硬化(FSGS)、內分泌眼病、葡萄膜視網膜炎、脈絡膜視網膜炎、自體免疫性肝臟病症、肌肉纖維疼痛、多發性內分泌失調、施密特氏症候群(Schmidt's syndrome)、腎上腺炎、胃萎縮、早老性癡呆、脫髓鞘疾病(諸如自體免疫性脫髓鞘疾病)、糖尿病性腎病、德雷斯勒氏症候群(Dressler's syndrome)、斑形脫髮、CREST症候群(鈣質沈積症、雷諾現象(Raynaud's phenomenon)、食道蠕動異常、指硬皮病及毛細血管擴張)、男性及女性自體免疫性不孕症、混合型結締組織疾病、卡格氏病(Chagas'disease)、風濕熱、反覆流產、農民肺(farmer's lung)、多形性紅斑、心臟切開術後症候群、庫欣氏症候群(Cushing's syndrome)、飼鳥者肺(bird-fancier's lung)、過敏性肉芽腫性血管炎、良性淋巴細胞性血管炎、阿爾波特氏症候群(Alport's syndrome)、肺泡炎(諸如過敏性肺泡炎及纖維化肺泡炎)、間質性肺病、輸血反應、麻風、瘧疾、利什曼體病(leishmaniasis)、錐蟲病、血吸蟲病、蛔蟲病、麯黴病、森普特氏症候群(Sampter's syndrome)、卡潘氏症候群(Caplan's syndrome)、登革熱、心內膜炎、心內膜心肌纖維化、彌漫性間質性肺纖維化、肺間質纖維化、特發性肺纖維化、囊腫性纖維化、內眼炎、持久性隆起性紅斑、胎兒紅血球母細胞增多症、嗜伊紅血球筋膜炎、舒爾曼氏症候群(Shulman's syndrome)、費爾提氏症候群(Felty's syndrome)、絲蟲病、睫狀體炎(諸如慢性睫狀體炎、異色性睫狀體炎、虹膜睫狀體炎或福斯氏睫狀體炎(Fuch's cyclitis))、亨諾-許蘭紫癜(Henoch-Schonlein purpura)、人類免疫缺乏病毒(HIV)感染、埃可病毒感染、心肌病、阿茲海默氏病(Alzheimer's disease)、小病毒感染、風疹病毒感染、疫苗接種後症候群、先天性風疹感染、愛巴病毒感染(Epstein-Barr virus infection)、腮腺炎、埃文氏症候群(Evan's syndrome)、自體免疫性生殖腺失調、西氏舞蹈病(Sydenham's chorea)、鏈球菌感染後腎炎、閉塞性血栓性血管炎、甲狀腺毒症、脊髓癆、脈絡膜炎、巨細胞多肌痛、內分泌眼病、慢性過敏性肺炎、乾燥性角膜結膜炎、流行性角膜結膜炎、特發性腎炎症候群、微小病變性腎病、良性家族性及缺血再灌注損傷、視網膜自體免疫、關節發炎、支氣管炎、慢性阻塞性氣管病、矽沉著病、口瘡、口瘡性口炎、動脈硬化症、不形成精子症、自體免疫性溶血、伯克氏病(Boeck's disease)、冷球蛋白血症、杜氏攣縮(Dupuytren's contracture)、晶狀體過敏性眼內炎、過敏性腸炎、麻風結節性紅斑、特發性面神經麻痺、慢性疲勞症候群、風濕熱、哈曼-里奇氏病(Hamman-Rich's disease)、感音神經性聽力損失、陣發性血紅素尿、性腺低能症、區域性迴腸炎、白血球減少症、傳染性單核細胞增多症、橫貫性脊髓炎、原發性特發性黏液水腫、腎炎、交感性眼炎、肉芽腫性睪丸炎、胰腺炎、急性多神經根炎、壞疽性膿皮病、魁文氏甲狀腺炎(Quervain's thyreoiditis)、後天性脾萎縮、由抗精細胞抗體所致之不孕症、非惡性胸腺瘤、白斑症、SCID及愛巴病毒相關疾病、後天性免疫缺乏症候群(AIDS)、寄生性疾病(諸如利什曼原蟲病)、中毒性休克症候群、食物中毒、涉及T細胞浸潤之病狀、白血球黏著缺陷病、與由細胞激素及T淋巴細胞介導之急性及遲發性過敏反應有關的免疫反應、涉及白血球滲出之疾病、多發性器官損傷症候群、抗原-抗體複合物介導之疾病、抗腎小球基底膜病、過敏性神經炎、自體免疫性多內分泌病、卵巢炎、原發性黏液水腫、自體免疫性萎縮性胃炎、交感性眼炎、風濕性疾病、混合型結締組織疾病、腎病症候群、胰島炎、多內分泌腺失調、周邊神經病、自體免疫性多腺症候群I型、成年發作型特發性副甲狀腺機能減退症(AOIH)、全禿、擴張型心肌病、後天性大皰性表皮鬆懈(EBA)、血色素沉著症、心肌炎、腎病症候群、原發性硬化性膽管炎、化膿性或非化膿性竇炎、急性或慢性竇炎、篩竇炎、額竇炎、上頜竇炎或蝶竇炎、嗜伊紅血球相關病症(諸如嗜伊紅血球過多、肺部浸潤性嗜伊紅血球過多、嗜伊紅血球過多-肌痛症候群、呂弗勒氏症候群(Loffler's syndrome)、慢性嗜伊紅血球肺炎、熱帶肺嗜伊紅血球過多、支氣管肺麯黴病、麯黴腫或含有嗜伊紅血球之肉芽瘤)、全身性過敏反應、血清陰性脊椎關節炎、多內分泌腺自體免疫疾病、硬化性膽管炎、鞏膜、上鞏膜、慢性皮膚黏膜念珠菌病、布魯頓氏症候群(Bruton's syndrome)、嬰兒暫時性低γ球蛋白血症、威斯科特-奧爾德里奇症候群(Wiskott-Aldrich syndrome)、共濟失調毛細血管擴張、與膠原性疾病有關之自體免疫病症、風濕病、神經病、缺血再灌注病症、血壓反應降低、血管功能障礙、血管擴張、組織損傷、心血管缺血、痛覺過敏、大腦缺血及伴有血管生成之疾病、過敏症、腎小球腎炎、再灌注損傷、心肌或其他組織之再灌注損傷、含急性發炎組分之皮膚病、急性化膿性腦膜炎或其他中樞神經系統發炎性病症、眼睛及眼眶發炎性病症、顆粒球輸注相關症候群、細胞激素誘發之毒性、急性嚴重性發炎、慢性難治性發炎、腎盂炎、肺硬化、糖尿病性視網膜病、糖尿病性大動脈病症、動脈內膜過度增生、消化性潰瘍、瓣膜炎及子宮內膜異位。
如本文所用之術語「細胞毒性劑」係指一種抑制或阻止細胞之功能及/或引起細胞破壞的物質。該術語意欲包括放射性同位素(例如At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、Ra223、P32及Lu之放射性同位素)、化學治療劑(例如甲胺喋呤(methotrexate)、阿黴素(adriamicin)、長春花生物鹼(vincaalkaloid)(長春新鹼(vincristine)、長春鹼(vinblastine)、依託泊苷(etoposide))、小紅莓(doxorubicin)、美法侖(melphalan)、絲裂黴素C(mitomycinC)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)、道諾黴素(daunorubicin))或其他插入劑、酶及其片段(諸如核分解酶)、抗生素及毒素(諸如小分子毒素或細菌、真菌、植物或動物來源之酶活性毒素，包括其片段及/或變異體)及本文所揭示之各種抗腫瘤、抗癌及化學治療劑。其他細胞毒性劑描述於本文中。殺腫瘤劑可引起腫瘤細胞破壞。
「化學治療劑」為適用於治療癌症之化合物。化學療劑之實例包括烷化劑，諸如噻替派(thiotepa)及CYTOXAN環磷醯胺(cyclosphosphamide)；磺酸烷酯，諸如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)及哌泊舒凡(piposulfan)；氮丙啶，諸如苯佐多巴(benzodopa)、卡波醌(carboquone)、米特多巴(meturedopa)及尤利多巴(uredopa)；伸乙基亞胺及甲基三聚氰胺，包括六甲蜜胺(altretamine)、三伸乙基三聚氰胺、三伸乙基磷醯胺、三伸乙基硫代磷醯胺及三羥甲基三聚氰胺；乙醯精寧(acetogenin)(尤其為布拉他辛(bullatacin)及布拉他辛酮(bullatacinone))；δ-9-四氫大麻酚(屈大麻酚(dronabinol)，MARINOL)；β-拉帕酮(beta-lapachone)；拉帕醇(lapachol)；秋水仙鹼(colchicine)；樺木酸(betulinic acid)；喜樹鹼(camptothecin)(包括合成類似物拓朴替康(topotecan)(HYCAMTIN)、CPT-11(伊立替康(irinotecan)，CAMPTOSAR)、乙醯喜樹鹼(acetylcamptothecin)、斯考普萊汀(scopolectin)及9-胺基喜樹鹼)；苔蘚蟲素(bryostatin)；卡利他汀(callystatin)；CC-1065(包括其阿多來新(adozelesin)、卡折來新(carzelesin)及比折來新(bizelesin)合成類似物)；鬼臼毒素(podophyllotoxin)；鬼臼毒素酸(podophyllinic acid)；替尼泊苷(teniposide)；念(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮基-5-側氧基-L-正白胺酸、ADRIAMYCIN小紅莓(包括N-嗎啉基-小紅莓、氰基(N-嗎啉基)-小紅莓、2-N-吡咯基-小紅莓及去氧小紅莓)、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、依達比星(idarubicin)、麻西羅黴素(marcellomycin)、絲裂黴素(mitomycin)(諸如絲裂黴素C)、黴酚酸、諾拉黴素(nogalamycin)、橄欖黴素(olivomycins)、培洛黴素(peplomycin)、泊非黴素(potfiromycin)、嘌黴素(puromycin)、三鐵阿黴素(quelamycin)、羅多比星(rodorubicin)、鏈黑黴素(streptonigrin)、鏈佐星(streptozocin)、殺結核菌素(tubercidin)、烏苯美司(ubenimex)、淨司他汀(zinostatin)、左柔比星(zorubicin)；抗代謝劑，諸如甲胺喋呤及5-氟尿嘧啶(5-fluorouracil，5-FU)；葉酸類似物，諸如迪諾特寧(denopterin)、甲胺喋呤、喋羅呤(pteropterin)、三甲曲沙(trimetrexate)；嘌呤類似物，諸如氟達拉濱(fludarabine)、6-巰基嘌呤(mercaptopurine)、噻咪嘌呤(thiamiprine)、硫鳥嘌呤(thioguanine)；嘧啶類似物，諸如安西他濱(ancitabine)、阿紮胞苷(azacitidine)、6-氮尿苷(azauridine)、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、雙去氧尿苷(dideoxyuridine)、去氧氟尿苷(doxifluridine)、依諾他濱(enocitabine)、氟尿苷(floxuridine)；雄激素，諸如卡普睪酮(calusterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、環硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷珠藻環肽(cryptophycins)(尤其為念珠藻環肽1及念珠藻環肽8)；海兔毒素(dolastatin)；多卡米辛(duocarmycin)(包括合成類似物KW-2189及CB1-TM1)；艾榴素(eleutherobin)；水鬼蕉鹼(pancratistatin)；沙考的汀(sarcodictyin)；海綿他汀(spongistatin)；氮芥，諸如苯丁酸氮芥、萘氮芥、氯磷醯胺、雌莫司汀(estramustine)、異環磷醯胺(ifosfamide)、二氯甲基二乙胺(mechlorethamine)、鹽酸氧化二氯甲基二乙胺、美法侖、新恩比興(novembichin)、苯芥膽甾醇(phenesterine)、潑尼莫司汀(prednimustine)、曲洛磷胺(trofosfamide)、尿嘧啶氮芥(uracil mustard)；亞硝基脲，諸如卡莫司汀(carmustine)、氯脲黴素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)及拉甯司汀(ranimnustine)；抗生素，諸如烯二炔抗生素(例如刺孢黴素(calicheamicin)，尤其為刺孢黴素γI(參見例如Agnew,Chem Intl. Ed. Engl. 33: 183-186(1994))；達內黴素(dynemicin)，包括達內黴素A；埃斯培拉黴素(esperamicin)；以及新制癌菌素發色團及相關色蛋白烯二炔抗生素發色團)、阿克拉黴素(aclacinomysin)、放線菌素(actinomycin)、安麯黴素(authramycin)、偶氮絲胺酸(azaserine)、博萊黴素(bleomycins)、放線菌素C(cactinomycin)、卡拉比星(carabicin)、洋紅黴素(carminomycin)、嗜癌菌素(carzinophilin)、色黴素(chromomycinis)、放線菌素D(dactinomycin)、道諾黴素(mepitiostane)、睪內酯酮(testolactone)；抗腎上腺素，諸如胺魯米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane)；葉酸補充物，諸如夫羅林酸(frolinic acid)；醋葡醛內酯(aceglatone)；醛磷醯胺糖苷(aldophosphamide glycoside)；胺基乙醯丙酸(aminolevulinic acid)；恩尿嘧啶(eniluracil)；安吖啶(amsacrine)；貝司他布(bestrabucil)；比生群(bisantrene)；埃達曲卡(edatraxate)；得弗伐胺(defofamine)；秋水仙胺(demecolcine)；地吖醌(diaziquone)；伊弗尼辛(elfornithine)；依利醋銨(elliptinium acetate)；埃坡黴素(epothilone)；依託格魯(etoglucid)；硝酸鎵；羥基脲；香菇多糖(lentinan)；羅尼達寧(lonidainine)；類美登素(maytansinoid)，諸如美登素(maytansine)及美登木素(ansamitocins)；米托胍腙(mitoguazone)；米托蒽醌(mitoxantrone)；莫比達摩(mopidanmol)；硝爾靈(nitraerine)；噴司他汀(pentostatin)；蛋胺氮芥(phenamet)；吡柔比星(pirarubicin)；洛索蒽醌(losoxantrone)；2-乙基醯肼；丙卡巴肼(procarbazine)；PSK多醣複合物(JHS Natural Products,Eugene,OR)；雷佐生(razoxane)；根瘤菌素(rhizoxin)；西佐喃(sizofiran)；鍺螺胺(spirogermanium)；細交鏈孢菌酮酸(tenuazonic acid)；三亞胺醌(triaziquone)；2,2',2"-三氯三乙胺；新月毒素(trichothecenes)(尤其為T-2毒素、韋拉庫林A(verracurin A)、桿孢菌素A(roridin A)及安奎定(anguidine))；烏拉坦(urethan)；長春地辛(vindesine)(ELDISINE、FILDESIN)；達卡巴嗪(dacarbazine)；甘露莫司汀(mannomustine)；二溴甘露醇(mitobronitol)；二溴衛矛醇(mitolactol)；哌泊溴烷(pipobroman)；伽托辛(gacytosine)；阿拉伯糖苷(arabinoside)(「Ara-C」)；噻替派；紫杉醇，例如TAXOL太平洋紫杉醇(paclitaxel)(Bristol-Myers Squibb Oncology,Princeton,N.J.)、ABRAXANETM無十六醇聚氧乙烯醚且經白蛋白工程改造之太平洋紫杉醇之奈米粒子調配物(American Pharmaceutical Partners,Schaumberg,IL)及TAXOTERE多西他賽(doxetaxel)(Rhne-Poulenc Rorer,Antony,France)；苯丁酸氮芥(chloranbucil)；吉西他濱(GEMZAR)；6-硫鳥嘌呤；巰基嘌呤；甲胺喋呤；鉑類似物，諸如順鉑(cisplatin)及卡鉑(carboplatin)；長春鹼(VELBAN)；鉑；依託泊苷(VP-16)；異環磷醯胺；米托蒽醌；長春新鹼(ONCOVIN)；奧賽力鉑(oxaliplatin)；甲醯四氫葉酸(leucovovin)；長春瑞濱(vinorelbine)(NAVELBINE)；諾凡特龍(novantrone)；依達曲沙(edatrexate)；道諾黴素；胺基喋呤(aminopterin)；伊班膦酸鹽(ibandronate)；拓撲異構酶抑制劑RFS 2000；二氟甲基鳥胺酸(DMFO)；類視黃素，諸如視黃酸；卡培他濱(capecitabine)(XELODA)；上述任一者之醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物；以及以上兩者或兩者以上之組合，諸如CHOP(環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松龍(prednisolone)之組合療法的縮寫)及FOLFOX(使用奧賽力鉑(ELOXATINTM)與5-FU及甲醯四氫葉酸之組合的治療方案的縮寫)。
此定義中亦包括用於調節、減少、阻斷或抑制可促進癌症生長之激素的作用且通常呈全身性或全身治療形式的抗激素劑。其可為激素本身。實例包括抗雌激素及選擇性雌激素受體調節劑(SERM)，包括例如他莫昔芬(tamoxifen)(包括NOLVADEX他莫昔芬)、EVISTA雷洛昔芬(raloxifene)、曲洛昔芬(droloxifene)、4-羥基他莫昔芬(4-hydroxytamoxifen)、曲沃昔芬(trioxifene)、雷洛昔芬鹽酸鹽(keoxifene)、LY117018、奧那司酮(onapristone)及FARESTON托瑞米芬(toremifene)；抗孕酮；雌激素受體下調劑(ERD)；用於抑制或封阻卵巢之藥劑，例如黃體生成激素釋放激素(LHRH)促效劑，諸如LUPRON及ELIGARD乙酸亮丙瑞林(leuprolide acetate)、乙酸戈舍瑞林(goserelin acetate)、乙酸布舍瑞林(buserelin acetate)及曲特瑞林(tripterelin)；其他抗雄激素，諸如氟他胺(flutamide)、尼魯胺(nilutamide)及比卡魯胺(bicalutamide)；及抑制調節腎上腺中之雌激素產生之芳香酶的芳香酶抑制劑，諸如4(5)-咪唑、胺魯米特、MEGASE乙酸甲地孕酮(megestrol acetate)、AROMASIN依西美坦(exemestane)、弗米斯坦(formestanie)、法屈唑(fadrozole)、RIVISOR伏羅唑(vorozole)、FEMARA來曲唑(letrozole)及ARIMIDEX阿那曲唑(anastrozole)。另外，化學治療劑之該定義包括雙膦酸鹽，諸如氯屈膦酸鹽(clodronate)(例如BONEFOS或OSTAC)、DIDROCAL依替膦酸鹽(etidronate)、NE-58095、ZOMETA唑來膦酸(zoledronic acid)/唑來膦酸鹽(zoledronate)、FOSAMAX阿侖膦酸鹽(alendronate)、AREDIA帕米膦酸鹽(pamidronate)、SKELID替魯膦酸鹽(tiludronate)或ACTONEL利塞膦酸鹽(risedronate)；以及曲沙他濱(troxacitabine)(1,3-二氧雜環戊烷核苷胞嘧啶類似物)；反義寡核苷酸，尤其抑制與異常細胞增殖相關之信號傳導路徑中之基因表現的反義寡核苷酸，諸如PKC-α、Raf、H-Ras及表皮生長因子受體(EGF-R)；疫苗，諸如THERATOPE疫苗及基因療法疫苗，例如ALLOVECTIN疫苗、LEUVECTIN疫苗及VAXID疫苗；LURTOTECAN拓撲異構酶1抑制劑；ABARELIX rmRH；拉帕替尼二甲苯磺酸鹽(lapatinib ditosylate)(ErbB-2與EGFR雙重酪胺酸激酶小分子抑制劑，亦稱GW572016)；及上述任一者之醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物。
「生長抑制劑」在用於本文中時係指活體外或活體內抑制細胞生長之化合物或組合物。因此，生長抑制劑可為顯著降低S期細胞百分率之生長抑制劑。生長抑制劑之實例包括阻斷細胞週期進程(除S期外之其他位置)之藥劑，諸如誘導G1停滯及M期停滯之藥劑。經典M期阻斷劑包括長春花類(例如長春新鹼及長春鹼)、紫杉烷及拓撲異構酶II抑制劑(諸如小紅莓、表柔比星、道諾黴素、依託泊苷及博萊黴素)。能使G1停滯之藥劑亦擴大到能使S期停滯，例如DNA烷化劑，諸如他莫昔芬、潑尼松(prednisone)、達卡巴嗪、二氯甲基二乙胺、順鉑、甲胺喋呤、5-氟尿嘧啶及阿拉伯糖苷(ara-C)。其他資訊可見於The Molecular Basis of Cancer,Mendelsohn及Israel編，第1章，Murakami等人之題為「Cell cycle regulation,oncogenes,and antineoplastic drugs」(W.B. Saunders: Philadelphia,1995),尤其第13頁中。紫杉烷(太平洋紫杉醇及多西他賽)為衍生自紫杉樹之抗癌藥。源自歐洲紫杉之多西他賽(TAXOTERE,Rhone-Poulenc Rorer)為太平洋紫杉醇(TAXOL,Bristol-Myers Squibb)之半合成類似物。太平洋紫杉醇及多西他賽促進自微管蛋白二聚體組裝微管且藉由防止解聚作用而使微管穩定，從而抑制細胞中之有絲分裂。
如本文所用之「抗癌療法」係指減少或抑制個體之癌症的療法。抗癌療法之實例包括細胞毒性放射療法以及投與個體治療有效量之細胞毒性劑、化學治療劑、生長抑制劑、癌症疫苗、血管生成抑制劑、前藥、細胞激素、細胞激素拮抗劑、皮質類固醇、免疫抑制劑、抗嘔吐劑、抗體或抗體片段或止痛劑。
本申請案中所用之術語「前藥」係指醫藥活性物質之前驅物或衍生形式，其對腫瘤細胞的細胞毒性小於母體藥物且能夠以酶法活化或轉化為較具活性之母體形式。參見例如Wilman,「Prodrugs in Cancer Chemotherapy」，Biochemical Society Transactions,14，第375-382頁，615th Meeting Belfast(1986)及Stella等人，「Prodrugs: AChemical Approach to Targeted Drug Delivery」，Directed Drug Delivery,Borchardt等人(編)，第247-267頁，Humana Press(1985)。前藥包括(但不限於)：含磷酸鹽之前藥、含硫代磷酸鹽之前藥、含硫酸鹽之前藥、含肽之前藥、經D-胺基酸修飾之前藥、糖基化前藥、含β-內醯胺之前藥、含視需要經取代之苯氧基乙醯胺之前藥或含視情況經取代之苯基乙醯胺之前藥、可轉化為更具活性之無細胞毒性藥物的5-氟胞嘧啶及其他5-氟尿苷前藥。可衍生成用於本發明之前藥形式的細胞毒性藥物之實例包括(但不限於)上述彼等化學治療劑。
術語「細胞激素」為由一細胞群體釋放，作為細胞間介體作用於另一細胞的蛋白質之通用術語。該等細胞激素之實例為淋巴激素、單核球激素及傳統多肽激素。細胞激素包括生長激素，諸如人類生長激素(HGH)、N-甲硫胺醯基人類生長激素及牛生長激素；副甲狀腺激素；甲狀腺素；胰島素；前胰島素；鬆弛素；前鬆弛素；醣蛋白激素，諸如促濾泡激素(FSH)、促甲狀腺激素(TSH)及促黃體激素(LH)；表皮生長因子(EGF)；肝臟生長因子；纖維母細胞生長因子(FGF)；促乳素；胎盤生乳素；腫瘤壞死因子α及β；苗勒抑制物質；小鼠促性腺激素相關肽；抑制素；活化素；血管內皮生長因子；整合素；血小板生成素(TPO)；神經生長因子，諸如NGF-α；血小板生長因子；轉型生長因子(TGF)，諸如TGF-α及TGF-β；胰島素樣生長因子I及II；紅血球生成素(EPO)；骨誘導因子；干擾素，諸如干擾素α、β及γ；群落刺激因子(CSF)，諸如巨噬細胞-CSF(M-CSF)；顆粒球-巨噬細胞-CSF(GM-CSF)；及顆粒球-CSF(G-CSF)；介白素(IL)，諸如IL-1、IL-1α、IL-1β、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-9、IL-10、IL-11、IL-12、IL-18；腫瘤壞死因子，諸如TNF-α或TNF-β；及其他多肽因子，包括LIF及kit配位體(KL)。如本文所用之術語細胞激素包括來自天然來源或來自重組細胞培養物之蛋白質及天然序列細胞激素之生物活性等效物。
「細胞激素拮抗劑」意謂部分或完全阻斷、抑制或中和至少一種細胞激素之生物活性的分子。舉例而言，細胞激素拮抗劑可藉由抑制細胞激素表現及/或分泌或藉由結合於細胞激素或細胞激素受體而抑制細胞激素活性。細胞激素拮抗劑包括結合於細胞激素或細胞激素受體之抗體、合成或自然序列肽、免疫黏附素及小分子拮抗劑。細胞激素拮抗劑視情況與細胞毒性劑結合或融合。例示性TNF拮抗劑為依那西普(etanercept)(ENBREL)、英利昔單抗(infliximab)(REMICADE)及阿達木單抗(adalimumab)(HUMIRATM)。
如本文所用之術語「免疫抑制劑」係指用於抑制或遮蔽所治療個體之免疫系統的物質。其包括抑制細胞激素產生、下調或抑制自體抗原表現或遮蔽MHC抗原之物質。免疫抑制劑之實例包括2-胺基-6-芳基-5-取代之嘧啶(參見美國專利第4,665,077號)；黴酚酸嗎啉乙酯(mycophenolate mofetil)，諸如CELLCEPT；硫唑嘌呤(IMURAN，AZASAN/6-巰基嘌呤)；溴隱定(bromocryptine)；達那唑(danazol)；胺苯碸(dapsone)；戊二醛(glutaraldehyde)(其遮蔽MHC抗原，如美國專利第4,120,649號中所述)；MHC抗原及MHC片段之抗個體基因型抗體；環孢素A；類固醇，諸如皮質類固醇及糖皮質類固醇，例如潑尼松、潑尼松龍，諸如PEDTAPRED(潑尼松龍磷酸鈉)或ORAPRED(潑尼松龍磷酸鈉口服溶液)、甲潑尼龍(methylprednisolone)及地塞米松(dexamethasone)；甲胺喋呤(經口或皮下)(RHEUMATREX、TREXALLTM)；羥基氯喹(hydroxycloroquine)/氯喹(chloroquine)；柳氮磺吡啶(sulfasalazine)；來氟米特(leflunomide)；細胞激素或細胞激素受體拮抗劑，包括抗干擾素γ、β或α抗體、抗腫瘤壞死因子α抗體(英利昔單抗或阿達木單抗)、抗TNFα免疫黏附素(ENBREL，依那西普)、抗腫瘤壞死因子β抗體、抗介白素2抗體及抗IL-2受體抗體；抗LFA-1抗體，包括抗CD11a及抗CD18抗體；抗L3T4抗體；異源抗淋巴細胞球蛋白；多株或泛T抗體，或單株抗CD3或抗CD4/CD4a抗體；含LFA-3結合域之可溶性肽(WO90/08187)；鏈球菌激酶；TGF-β；鏈球菌去氧核糖核酸酶；宿主之RNA或DNA；FK506；RS-61443；去氧史帕胍淋(deoxyspergualin)；雷帕黴素(rapamycin)；T細胞受體(Cohen等人，美國專利第5,114,721號)；T細胞受體片段(Offner等人，Science 251: 430-432(1991)；WO 90/11294；Ianeway,Nature 341: 482(1989)；及WO 91/01133)；T細胞受體抗體(EP 340,109)，諸如T10B9；環磷醯胺(CYTOXAN)；胺苯碸；青黴胺(penicillamine)(CUPRIMINE)；血漿交換；或靜脈內免疫球蛋白(IVIG)。此等免疫抑制劑可單獨使用或彼此組合使用，尤其類固醇與另一免疫抑制劑組合，或該等組合後為維持劑量的非類固醇藥劑以減少對類固醇之需要。
「止痛劑」係指用於抑制或抑止個體疼痛的藥物。例示性止痛劑包括非類固醇消炎藥(NSAIDs)，包括布洛芬(ibuprofen)(MOTRIN)、萘普生(naproxen)NAPROSYN)、乙醯水楊酸(acetylsalicylic acid)、吲哚美辛(indomethacin)、舒林酸(sulindac)及托美丁(tolmetin)，包括其鹽及衍生物，以及各種用於降低可能發生之刺痛的其他藥物，包括抗驚厥劑(加巴噴丁(gabapentin)、苯妥英(phenyloin)、卡馬西平(carba-mazepine))或三環抗抑鬱劑。特定實例包括乙醯胺酚(acetaminophen)、阿司匹林(aspirin)、阿米替林(amitriptyline)(ELAVIL)、卡馬西平(TEGRETOL)、苯妥英(phenyltoin)(DILANTIN)、加巴噴丁(NEURONTIN)、(E)-N-香草基-8-甲基-6-壬醯胺(CAPSAICIN)或神經阻斷劑。
「皮質類固醇」係指模擬或加強天然存在之皮質類固醇作用之具有類固醇通用化學結構的數種合成或天然存在物質之任一者。合成皮質類固醇之實例包括潑尼松、潑尼松龍(包括甲潑尼龍)、地塞米松、曲安西龍(triamcino-lone)及倍他米松(betamethasone)。
如本文所用，「癌症疫苗」為刺激個體對癌症之免疫反應的組合物。癌症疫苗通常由個體自體(來自自身)或同種異體(來自他者)的癌症相關物質或細胞來源(抗原)連同進一步刺激及加強針對抗原之免疫反應的其他組分(例如佐劑)一起組成。癌症疫苗可刺激個體之免疫系統對一或數種特異性抗原產生抗體及/或產生殺手T細胞以襲擊具有此等抗原之癌細胞。
如本文所用，術語「細胞毒性放射療法」係指抑制或阻止細胞之功能及/或引起細胞破壞的放射療法。放射療法可包括例如體外光束照射或用放射性標記藥劑(諸如抗體)治療。該術語意欲包括使用放射性同位素(例如At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、Ra223、P32，及Lu之放射性同位素)。
「個體」為脊椎動物，諸如哺乳動物，例如人類。哺乳動物包括(但不限於)家畜(諸如母牛)、競技動物(sport animals)、寵物(諸如貓、狗及馬)、靈長類動物、小鼠及大鼠。
除非另外指明，否則術語「第一」多肽及「第二」多肽及其變化形式僅為一般標識符，不應視為鑑別本發明抗體之特定或特別多肽或組分。
除非另外指明，否則實例中所提及之市售試劑係根據製造商之說明書使用。以下實例及說明書通篇中由ATCC寄存編號標識的彼等細胞之來源為美國菌種保存中心(American Type Culture Collection,Manassas,VA)。除非另外說明，否則本發明使用重組DNA技術之標準程序，諸如上文及以下教科書中所述之標準程序：上述Sambrook等人；Ausubel等人，Current Protocols in Molecular Biology(Green Publishing Associates and Wiley Interscience,NY,1989)；Innis等人，PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications(Academic Press,Inc.,NY,1990)；Harlow等人，Antibodies: A Laboratory Manual(Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,1988)；Gait,Oligonucleotide Synthesis(IRL Press,OXford,1984)；Freshney,Animal Cell Culture,1987；Coligan等人，Current Protocols in Immunology,1991。
在本說明書及申請專利範圍中，詞語「包含」應理解為意味包括所述整數或整數組但不排除任何其他整數或整數組。
II.　構築異多聚體蛋白質
通常，本文所述之異多聚體蛋白質包含抗體Fc區之重要部分。然而，在其他態樣中，重鏈僅包含CH1、CH2及/或CH3域之一部分。
異多聚域
異多聚體蛋白質包含異多聚域。為產生實質上均質之異二聚體分子群，異二聚域必須高度優先形成異二聚體，勝過均二聚體。儘管本文例示之異多聚體蛋白質使用杵臼結構技術來促進異多聚，但熟習此項技術者應瞭解其他異多聚域亦適用於本發明。
杵臼結構
使用杵臼結構作為製造多特異性抗體之方法為此項技術所熟知。參見1998年3月24日頒予且受讓於Genentech之美國專利第5,731,168號、2009年7月16日公開且受讓於Amgen之PCT公開案第WO 2009089004號及2009年7月16日公開且受讓於Novo Nordisk A/S之美國專利公開案第20090182127號。亦參見Marvin及Zhu,Acta Pharmacologica Sincia(2005)26(6)：649-658及Kontermann(2005)Acta Pharmacol.Sin.,26：1-9。本文提供簡要論述。
「突起」係指如下至少一個胺基酸側鏈，其自第一多肽之界面突出，因此可置於相鄰界面(亦即第二多肽之界面)之補償性空腔中以穩定異多聚體，從而例如相較於均多聚體形成，更有利於異多聚體形成。突起可存在於初始界面中或可以合成方式(例如藉由改變編碼界面之核酸)引入。通常，改變編碼第一多肽之界面的核酸以編碼突起。為達成此目的，將編碼第一多肽界面中之至少一個「初始」胺基酸殘基的核酸置換為編碼至少一個側鏈體積大於初始胺基酸殘基之「輸入」胺基酸殘基的核酸。應瞭解，可存在一個以上初始殘基及相應輸入殘基。可置換之初始殘基數目之上限為第一多肽界面中之殘基總數。各種胺基殘基之側鏈體積展示於下表中。
a胺基酸分子量減去水之分子量。值來自Handbook of Chemistry and Physics，第43版，Cleveland,Chemical Rubber Publishing Co.,1961。
b值來自A.A. Zamyatnin,Prog. Biophys. Mol. Biol. 24:107-123,1972。
c值來自C. Chothia,J. Mol. Biol. 105:1-14,1975。可及表面積在此參考文獻之圖6-20中定義。
形成突起之較佳輸入殘基一般為天然存在之胺基酸殘基，且較佳選自精胺酸(R)、苯丙胺酸(F)、酪胺酸(Y)及色胺酸(W)。最佳為色胺酸及酪胺酸。在一實施例中，形成突起之初始殘基具有小側鏈體積，諸如丙胺酸、天冬醯胺、天冬胺酸、甘胺酸、絲胺酸、蘇胺酸或纈胺酸。
「空腔」係指如下至少一胺基酸側鏈，其自第二多肽之界面凹陷，因此可容納第一多肽相鄰界面上之相應突起。空腔可存在於初始界面中或可以合成方式(例如藉由改變編碼界面之核酸)引入。通常，改變編碼第二多肽之界面的核酸以編碼空腔。為達成此目的，將編碼第二多肽界面中之至少一個「初始」胺基酸殘基的核酸置換為編碼至少一個側鏈體積小於初始胺基酸殘基之「輸入」胺基酸殘基的DNA。應瞭解，可存在一個以上初始殘基及相應輸入殘基。可置換之初始殘基數目之上限為第二多肽界面中之殘基總數。各種胺基殘基之側鏈體積展示於上表1中。形成空腔之較佳輸入殘基通常為天然存在之胺基酸殘基，且較佳選自丙胺酸(A)、絲胺酸(S)、蘇胺酸(T)及纈胺酸(V)。最佳為絲胺酸、丙胺酸或蘇胺酸。在一實施例中，形成空腔之初始殘基具有大側鏈體積，諸如酪胺酸、精胺酸、苯丙胺酸或色胺酸。
「初始」胺基酸殘基為經側鏈體積小於或大於初始殘基之「輸入」殘基置換的胺基酸殘基。輸入胺基酸殘基可為天然存在或非天然存在之胺基酸殘基，但較佳為前者。「天然存在」之胺基酸殘基為由遺傳密碼編碼且列於上表1中之彼等殘基。「非天然存在」之胺基酸殘基意謂並非由遺傳密碼子編碼但能夠共價結合多肽鏈中之相鄰胺基酸殘基的殘基。非天然存在之胺基酸殘基的實例為正白胺酸、鳥胺酸、正纈胺酸、高絲胺酸及諸如Ellman等人，Meth. Enzym. 202:301-336(1991)中所述之其他胺基酸殘基類似物。為產生該等非天然存在之胺基酸殘基，可使用Noren等人，Science 244: 182(1989)及前述Ellman等人之程序。簡言之，此包含用非天然存在之胺基酸殘基以化學方式活化抑制tRNA，繼而活體外轉錄及轉譯RNA。本發明之方法包含置換至少一個初始胺基酸殘基，但亦可置換一個以上初始殘基。通常，置換之初始胺基酸殘基不超過第一或第二多肽界面中之全部殘基。通常，將用於置換之初始殘基「埋藏」。「埋藏」意謂使殘基基本上不可接近溶劑。一般而言，輸入殘基不為半胱胺酸以防止二硫鍵可能氧化或錯配。
突起「可置於」空腔中，此意謂分別在第一多肽及第二多肽之界面上之突起及空腔的空間位置及突起及空腔之尺寸使得突起可位於空腔中而不會顯著干擾第一及第二多肽在界面處之正常結合。因為突起(諸如Tyr、Phe及Trp)通常不自界面之軸垂直延伸且具有較佳構形，所以突起與相應空腔之對準依靠基於三維結構(諸如藉由X射線結晶法或核磁共振(NMR)獲得之三維結構)模製突起/空腔對。此可使用此項技術中普遍接受之技術達成。
「初始或模板核酸」意謂編碼相關多肽之核酸，其可經「改變」(亦即遺傳工程改造或突變)以編碼突起或空腔。初始或起始核酸可為天然存在之核酸或可包含已進行預先改變之核酸(例如人類化抗體片段)。「改變」核酸意謂初始核酸藉由插入、缺失或置換至少一個編碼相關胺基酸殘基之密碼子而突變。通常，將編碼初始殘基之密碼子置換為編碼輸入殘基之密碼子。以此方式遺傳修飾DNA之技術已評述於Mutagenesis: a Practical Approach,M.J. McPherson編，(IRL Press,Oxford,UK.(1991)中，且包括例如定點突變誘發、盒式突變誘發及聚合酶鏈反應(PCR)突變誘發。藉由使初始/模板核酸突變，由初始/模板核酸編碼之初始/模板多肽由此相應地改變。
突起或空腔可藉由合成方式，例如藉由重組技術、活體外肽合成、引入前述非天然存在之胺基酸殘基的技術、藉由肽之酶法或化學偶合或此等技術之一些組合來「引入」第一或第二多肽之界面中。因此，所「引入」之突起或空腔為「非天然存在」或「非天然」的，此意謂其不存在於自然界中或初始多肽(例如人類化單株抗體)中。
一般而言，形成突起之輸入胺基酸殘基具有相對小數目之「旋轉異構體」(例如約3-6個)。「旋轉異構物」為胺基酸側鏈之能量有利構形。各種胺基酸殘基之旋轉異構體數回顧於Ponders及Richards,J. Mol. Biol. 193: 775-791(1987)中。
III.　載體、宿主細胞及重組方法
為重組製造本發明之異多聚體蛋白質(例如抗體)，將編碼其之核酸分離且插入可複製載體中以進一步選殖(擴增DNA)或表現。易於分離編碼抗體之DNA且使用習知程序(例如藉由使用能夠特異性結合於編碼抗體重鏈及輕鏈之基因的寡核苷酸探針)測序。可利用多種載體。載體之選擇部分取決於所用宿主細胞。一般而言，較佳宿主細胞具有原核或真核(一般為哺乳動物，但亦包括真菌(例如酵母)、昆蟲、植物及來自其他多細胞生物體之有核細胞)來源。應瞭解，任何同型之恆定區可用於達成此目的，包括IgG、IgM、IgA、IgD及IgE恆定區，且該等恆定區可由任何人類或動物物種獲得。
a.　使用原核宿主細胞產生異多聚體蛋白質
i.　載體構築
可使用標準重組技術獲得編碼本發明異多聚體蛋白質(例如抗體)之多肽組分的聚核苷酸序列。所要聚核苷酸序列可自例如抗體產生細胞(諸如融合瘤細胞)分離且測序。或者，可使用核苷酸合成儀或PCR技術合成聚核苷酸。在獲得編碼多肽之序列後，將其插入能夠在原核宿主中複製且表現異源聚核苷酸之重組載體中。可獲得且為此項技術中已知之多種載體可用於達成本發明之目的。適當載體之選擇主要視欲插入載體中之核酸的尺寸及欲用載體轉型之特定宿主細胞而定。每一載體均含有多種組分，視其功能(擴增或表現異源聚核苷酸或兩者)及其與其所處之特定宿主細胞的相容性而定。載體組分一般包括(但不限於)複製起點、選擇標記基因、啟動子、核糖體結合位點(RBS)、信號序列、異源核酸插入物及轉錄終止序列。
一般而言，衍生自與宿主細胞相容之物種的含有複製子及控制序列之質體載體與此等宿主結合使用。載體通常具有複製位點以及能夠於經轉型細胞中提供表型選擇之標記序列。舉例而言，大腸桿菌通常使用衍生自大腸桿菌物種之質體pBR322轉型。pBR322含有編碼胺苄西林(ampicillin，Amp)及四環素(tetracycline，Tet)抗性之基因，因此提供容易地鑑別經轉型細胞之方式。pBR322、其衍生物或其他微生物質體或噬菌體亦可含有或經修飾以含有可由微生物使用以表現內源蛋白質之啟動子。用於表現特定抗體之pBR322衍生物之實例詳細描述於Carter等人，美國專利第5,648,237號中。
另外，與宿主微生物相容之含有複製子及控制序列的噬菌體載體可作為轉型載體結合此等宿主使用。舉例而言，可利用諸如λGEM.TM.-11之噬菌體製備可用於轉型易感宿主細胞(諸如大腸桿菌LE392)的重組載體。
本發明之表現載體可包含兩個或兩個以上啟動子-順反子對，編碼各多肽組分。啟動子為位於調節其表現之順反子上游(5')之非轉譯調節序列。原核啟動子通常分成兩類：誘導型與組成型。誘導型啟動子為在其控制下響應於培養條件之變化(例如營養物之存在或不存在或溫度變化)，起始順反子轉錄水準增加的啟動子。
大量由多種潛在宿主細胞識別之啟動子為吾人所熟知。可藉由經由限制酶消化將所選啟動子自來源DNA移出且將所分離之啟動子序列插入本發明之載體中，使該啟動子可操作地連接於編碼例如輕鏈或重鏈之順反子DNA。可使用天然啟動子序列與多種異源啟動子指導標靶基因之擴增及/或表現。在一些實施例中，使用異源啟動子，因為其相較於天然標靶多肽啟動子，一般可使所表現之標靶基因轉錄更多且產率更高。
適用於原核宿主之啟動子包括PhoA啟動子、β-半乳糖酶及乳糖啟動子系統、色胺酸(trp)啟動子系統及雜合啟動子(諸如tac或trc啟動子)。然而，在細菌中具有功能性之其他啟動子(諸如其他已知之細菌或噬菌體啟動子)亦適用。其核苷酸序列已公開，從而使得熟習此項技術者能夠使用連接子或接附子提供任何所要限制位點將其可操作地接合於編碼異多聚體蛋白質(例如標靶輕鏈及重鏈)之基因的順反子(Siebenlist等人，(1980) Cell 20: 269)。
在本發明之一態樣中，重組載體內之各順反子包含指導所表現之多肽跨膜易位之分泌信號序列組分。一般而言，信號序列可為載體之組分，或其可為插入載體中之標靶多肽DNA之一部分。出於本發明之目的而選擇之信號序列應為可由宿主細胞識別及加工(亦即由信號肽酶裂解)之信號序列。對於不識別及加工異源多肽之天然信號序列的原核宿主細胞，信號序列經例如選自由以下組成之群的原核信號序列取代：鹼性磷酸酶、青黴素酶、Ipp或熱穩定性腸毒素II(STII)前導序列、LamB、PhoE、PelB、OmpA及MBP。在本發明之一實施例中，表現系統之兩種順反子中所用之信號序列為STII信號序列或其變異體。
在另一態樣中，本發明之免疫球蛋白可在宿主細胞之細胞質中產生，因此無需各順反子內存在分泌信號序列。就此而言，免疫球蛋白之輕鏈及重鏈在細胞質內表現、摺疊且組裝形成功能性免疫球蛋白。某些宿主菌株(例如大腸桿菌trxB -菌株)提供有利於二硫鍵形成之細胞質條件，從而允許適當摺疊及組裝所表現之蛋白質次單元。參見Proba及Pluckthun Gene,159:203(1995)。
適用於表現本發明之異多聚體蛋白質(例如抗體)的原核宿主細胞包括古細菌(Archaebacteria)及真細菌(Eubacteria)，諸如革蘭氏陰性或革蘭氏陽性生物體。適用細菌之實例包括埃希氏桿菌(Escherichia)(例如大腸桿菌)、桿菌(Bacilli)(例如枯草桿菌(B. subtilis))、腸細菌、假單胞菌(Pseudomonas)屬(例如綠膿桿菌(P. aeruginosa))、鼠傷寒沙門氏菌(Salmonella typhimurium)、黏質沙雷氏菌(Serratia marcescans)、克雷伯氏桿菌(Klebsiella)、變形桿菌(Proteus)、志賀氏菌(Shigella)、根瘤菌(Rhizobia)、透明顫菌(Vitreoscilla)或副球菌(Paracoccus)。在一實施例中，使用革蘭氏陰性細胞。在一實施例中，使用大腸桿菌細胞作為本發明之宿主。大腸桿菌菌株之實例包括菌株W3110(Bachmann,Cellular and Molecular Biology，第2卷(Washington,D.C.: American Society for Microbiology,1987)，第1190-1219頁；ATCC寄存編號27,325)及其衍生物，包括具有基因型W3110 ΔfhuA(ΔtonA) ptr3 lac Iq lacL8 ΔompTΔ(nmpc-fepE) degP41 kan R 之菌株33D3(美國專利第5,639,635號)。其他菌株及其衍生物(諸如大腸桿菌294(ATCC 31,446)、大腸桿菌B、大腸桿菌λ1776(ATCC 31,537)及大腸桿菌RV308(ATCC 31,608))亦適合。在一實施例中，大腸桿菌Δlpp尤其適用。此等實例為說明性而非限制性的。具有指定基因型之任何上述細菌之衍生物的構築方法為此項技術中已知且描述於例如Bass等人，Proteins,8:309-314(1990)中。一般需要考慮複製子在細菌細胞中之可複製性來選擇適當細菌。舉例而言，當使用熟知之質體(諸如pBR322、pBR325、pACYC177或pKN410)提供複製子時，大腸桿菌、沙雷氏菌(Serratia)或沙門氏菌(Salmonella)屬可適用作宿主。宿主細胞通常應分泌最少量之蛋白水解酶，且其他蛋白酶抑制劑可適宜地併入細胞培養物中。
ii.　多肽製造
用上述表現載體將宿主細胞轉型，且培養於視需要改良之習知營養培養基中以誘導啟動子、選擇轉型體或擴增編碼所要序列之基因。
轉型意謂將DNA引入原核宿主中使得DNA可作為染色體外元件或藉由染色體組成部分複製。視所用宿主細胞而定，使用適合於該等細胞之標準技術進行轉型。使用氯化鈣進行鈣處理一般用於含有實質細胞壁障壁之細菌細胞。另一轉型方法採用聚乙二醇/DMSO。所用之另一技術為電穿孔。
用於製造本發明多肽之原核細胞於此項技術中已知且適於培養所選宿主細胞之培養基中生長。適當培養基之實例包括加有必需營養補充物之魯利亞培養液(Luria broth，LB)。在一些實施例中，培養基亦含有基於構築表現載體而選擇之選擇試劑，以選擇性允許含有表現載體之原核細胞生長。舉例而言，將胺苄西林添加至培養基中以使表現胺苄西林抗性基因之細胞生長。
亦可包括除碳、氮及無機磷酸鹽來源以外之任何必需補充物，其單獨或以與另一補充物或培養基(諸如複合氮源)之混合物形式以適當濃度引入。視情況，培養基可含有一或多種選自由以下組成之群的還原劑：麩胱甘肽、半胱胺酸、胱胺、巰基乙酸鹽、二硫赤蘚糖醇及二硫蘇糖醇。
在適合溫度下培養原核宿主細胞。為使大腸桿菌生長，舉例而言，較佳溫度範圍為約20℃至約39℃，更佳為約25℃至約37℃，甚至更佳為約30℃。培養基之pH值可為範圍在約5至約9之任何pH值，主要視宿主生物體而定。對於大腸桿菌，pH值較佳為約6.8至約7.4，且更佳為約7.0。
若本發明之表現載體中使用誘導型啟動子，則在適於活化該啟動子之條件下誘導蛋白質表現。在本發明之一態樣中，PhoA啟動子用於控制多肽轉錄。因此，於磷酸鹽限制性培養基中培養經轉型宿主細胞以進行誘導。磷酸鹽限制性培養基較佳為C.R.A.P培養基(參見例如，Simmons等人，J. Immunol. Methods(2002),263:133-147)。如此項技術中已知，可根據所用載體構築體使用多種其他誘導劑。
在一實施例中，各別培養第一及第二含鉸鏈宿主細胞，且所表現之本發明多肽各別分泌於宿主細胞之周質中且自周質回收。在第二實施例中，各別培養第一及第二含鉸鏈宿主細胞，且在分離含鉸鏈多肽之前，將兩種宿主細胞培養物混合在一起且將細胞粒化。在第三實施例中，各別培養第一及第二含鉸鏈宿主細胞，離心且各別再懸浮，隨後混合在一起，接著分離含鉸鏈多肽。在第四實施例中，將第一及第二含鉸鏈宿主細胞一起於同一培養容器中培養。蛋白質回收通常包含一般藉由諸如滲壓衝擊、音波處理或溶解之方式破壞微生物細胞膜。細胞破壞之後，可藉由離心或過濾移除細胞碎片或全細胞。蛋白質可例如藉由親和樹脂層析進一步純化。或者，可將蛋白質輸送至培養基中且在其中進行分離。可自培養物移除細胞，過濾培養物上清液且濃縮以進一步純化所產生之蛋白質。可使用諸如聚丙烯醯胺凝膠電泳(PAGE)及西方墨點檢定之通常已知之方法進一步分離且鑑別所表現之多肽。所分離之多肽將用於製造異多聚體蛋白質。
在本發明之一態樣中，異多聚體蛋白質(例如抗體)製造藉由醱酵製程大量進行。可利用各種大規模饋料-分批醱酵程序來製造重組蛋白質。大規模醱酵具有至少1,000公升之容量，較佳為約1,000至100,000公升之容量。此等醱酵罐使用攪拌器葉輪來分配氧氣及營養物，尤其葡萄糖(較佳碳源/能源)。小規模醱酵一般係指在容量不超過約100公升且範圍可為約1公升至約100公升之醱酵罐中醱酵。
在醱酵製程中，通常在細胞已於適合條件下生長至所要密度(例如OD550為約180-220，在此階段細胞處於穩定期早期)後起始誘導蛋白質表現。如此項技術中已知且如上文所述，可根據所用載體構築體使用各種誘導劑。可在誘導之前使細胞生長較短時期。通常誘導細胞約12-50小時，但亦可使用更長或更短之誘導時間。
為改良本發明多肽之製造產率及品質，可改良各種醱酵條件。舉例而言，為改良所分泌之異多聚體蛋白質(例如抗體)之適當組裝及摺疊，可使用過度表現伴隨蛋白(諸如Dsb蛋白(DsbA、DsbB、DsbC、DsbD及或DsbG)或FkpA(一種具有伴隨蛋白活性之肽基脯胺醯基順，反-異構酶))之其他載體將宿主原核細胞共轉型。已證實伴隨蛋白促進細菌宿主細胞中所產生之異源蛋白質之適當摺疊及可溶性。Chen等人，(1999) J Bio Chem 274:19601-19605；Georgiou等人，美國專利第6,083,715號；Georgiou等人，美國專利第6,027,888號；Bothmann及Pluckthun(2000) J. Biol. Chem. 275:17100-17105；Ramm及Pluckthun(2000) J. Biol. Chem. 275:17106-17113；Arie等人(2001) Mol. Microbiol. 39:199-210。
為使所表現之異源蛋白質(尤其對蛋白水解敏感之蛋白質)之蛋白水解達最小，某些缺乏蛋白水解酶之宿主菌株可用於本發明。舉例而言，宿主細胞菌株可經修飾以實現編碼已知之細菌蛋白酶之基因(諸如蛋白酶III、OmpT、DegP、Tsp、蛋白酶I、蛋白酶Mi、蛋白酶V、蛋白酶VI及其組合)的遺傳突變。可利用一些缺乏大腸桿菌蛋白酶之菌株且其描述於例如Joly等人(1998),Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:2773-2777；Georgiou等人，美國專利第5,264,365號；Georgiou等人，美國專利第5,508,192號；Hara等人，Microbial Drug Resistance,2:63-72(1996)中。
在一實施例中，缺乏蛋白水解酶且用過度表現一或多種伴隨蛋白之質體轉型的大腸桿菌菌株用作本發明表現系統中之宿主細胞。在第二實施例中，大腸桿菌菌株缺乏外膜之脂蛋白(Δ1pp)。
iii.　異多聚體蛋白質純化
在一實施例中，本文製造之異多聚體蛋白質可進一步純化以獲得實質上均質之製劑供其他檢定及用途使用。可使用此項技術中已知之標準蛋白質純化方法。以下程序為例示性適合純化程序：免疫親和管柱或離子交換管柱分級分離、乙醇沈澱、逆相HPLC、二氧化矽或陽離子交換樹脂(諸如DEAE)層析、層析聚焦、SDS-PAGE、硫酸銨沈澱及使用例如Sephadex G-75之凝膠過濾。
在一態樣中，固定於固相上之蛋白A用於免疫親和純化例如本發明之全長抗體產物。蛋白A為來自金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)之41 kD細胞壁蛋白質，其以高親和力結合於抗體之Fc區。Lindmark等人(1983)J. Immunol. Meth. 62:1-13。固定蛋白A之固相較佳為包含玻璃或二氧化矽表面之管柱，更佳為可控孔隙玻璃管柱或矽酸管柱。在一些應用中，管柱塗佈有諸如甘油之試劑以防止污染物之非特異性黏著。
作為純化之第一步驟，將上述源自細胞培養物之製劑塗覆於固定蛋白A之固相上以使相關抗體特異性結合於蛋白A。接著洗滌固相以移除非特異性結合於固相之污染物。藉由溶離自固相回收異多聚體蛋白質(例如抗體)。
b.　使用真核宿立細胞產生異多聚體蛋白質：
載體組分一般包括(但不限於)以下一或多者：信號序列、複製起點、一或多個標記基因、強化子元件、啟動子及轉錄終止序列。
i.　信號序列組分
用於真核宿主細胞之載體亦可含有信號序列或在相關成熟蛋白質或多肽之N端具有特異性裂解位點的其他多肽。所選異源信號序列較佳為可由宿主細胞識別及加工(亦即由信號肽酶裂解)之信號序列。在哺乳動物細胞表現中，可利用哺乳動物信號序列以及病毒分泌型前導序列(例如單純疱疹gD信號)。該前驅區域之DNA在閱讀框架中接合於編碼所要異多聚體蛋白質(例如抗體)之DNA。
ii.　複製起點
一般而言，哺乳動物表現載體無需複製起點組分。舉例而言，通常可使用SV40起點，但僅係因為其含有早期啟動子。
iii.　選擇基因組分
表現及選殖載體可含有選擇基因，亦稱作可選標記物。典型選擇基因編碼如下蛋白質：(a)賦予對抗生素或其他毒素(例如胺苄西林、新黴素(neomycin)、甲胺喋呤或四環素)之抗性的蛋白質；(b)補充營養缺陷(適當時)之蛋白質；或(c)提供不能自複合培養基獲得之關鍵營養物的蛋白質。
選擇方案之一實例利用藥物使宿主細胞之生長停滯。用異源基因成功轉型之彼等細胞產生賦予抗藥性之蛋白質且因此在選擇方案中存活。該顯性選擇之實例使用藥物新黴素、黴酚酸及潮黴素(hygromycin)。
適用於哺乳動物細胞之可選標記物的另一實例為能夠鑑別可接納抗體核酸之細胞的可選標記物，諸如DHFR、胸苷激酶、金屬硫蛋白I及II(較佳為靈長類動物金屬硫蛋白基因)、腺苷去胺酶、鳥胺酸去羧酶等。
舉例而言，首先藉由在含有甲胺喋呤(Mtx)(DHFR之競爭性拮抗劑)之培養基中培養所有轉型體來鑑別用DHFR選擇基因轉型的細胞。當使用野生型DHFR時適當之宿主細胞為缺乏DHFR活性的中國倉鼠卵巢(CHO)細胞株(例如ATCC CRL-9096)。
或者，用編碼抗體、野生型DHFR蛋白及另一可選標記物(諸如胺基糖苷3'-磷酸轉移酶(APH))之DNA序列轉型或共轉型之宿主細胞(尤其為含有內源DHFR之野生型宿主)可藉由在含有針對該可選標記物之選擇試劑(諸如胺基糖苷抗生素，例如卡那黴素(kanamycin)、新黴素或G418)的培養基中進行細胞生長來選擇。參見例如美國專利第4,965,199號。
iv.　啟動子組分
表現及選殖載體通常含有由宿主生物體識別且可操作地連接於所要含鉸鏈多肽(例如抗體)核酸的啟動子。已知用於真核生物之啟動子序列。實際上所有真核基因均具有位於轉錄起始位點上游大約25至30個鹼基處之富AT區。發現於多種基因轉錄起點上游70至80個鹼基處的另一序列為CNCAAT區，其中N可為任何核苷酸。大部分真核基因的3'端處為AATAAA序列，該序列可為編碼序列之3'端增加polyA尾的信號。所有此等序列均適於插入真核表現載體中。
哺乳動物宿主細胞中所要含鉸鏈多肽(例如抗體)自載體轉錄例如由獲自以下之啟動子來控制：病毒基因組，該等病毒例如多瘤病毒、禽痘病毒、腺病毒(諸如腺病毒2)、牛乳突狀瘤病毒、禽類肉瘤病毒、巨細胞病毒、反轉錄病毒、B型肝炎病毒及猿猴病毒40(SV40)；異源哺乳動物啟動子，例如肌動蛋白啟動子或免疫球蛋白啟動子；或熱休克啟動子，只要該等啟動子與宿主細胞系統相容即可。
便利地獲得SV40病毒之早期及晚期啟動子，其為亦含有SV40病毒複製起點之SV40限制片段。便利地獲得人類巨細胞病毒之即刻早期啟動子，其為HindIII E限制片段。美國專利第4,419,446號中揭示一種使用牛乳突狀瘤病毒作為載體在哺乳動物宿主中表現DNA之系統。美國專利第4,601,978號中描述此系統之改良。關於在單純疱疹病毒之胸苷激酶啟動子控制下在小鼠細胞中表現人類β-干擾素cDNA，亦參見Reyes等人，Nature 297:598-601(1982)。或者，可使用勞斯肉瘤病毒(Rous Sarcoma Virus)之長末端重複序列作為啟動子。
v.　強化子元件組分
由高等真核生物轉錄編碼所要含鉸鏈多肽(例如抗體)之DNA可藉由將強化子序列插入載體中加強。現已知多種來自哺乳動物基因(例如血球蛋白、彈性蛋白酶、白蛋白、α-胎蛋白及胰島素基因)之強化子序列。亦可使用來自真核細胞病毒之強化子。實例包括複製起點(bp 100-270)後側之SV40強化子、巨細胞病毒早期啟動子強化子、複製起點後側之多瘤病毒強化子及腺病毒強化子。關於用於強化真核生物啟動子活化之元件的描述，亦參見Yaniv,Nature 297:17-18(1982)。強化子可在抗體多肽編碼序列之位置5'或3'處拼接於載體中，其限制條件為實現強化，但一般位於啟動子之5'位點處。
vi.　轉錄終止組分
用於真核宿主細胞之表現載體通常亦含有終止轉錄及穩定mRNA所需之序列。此等序列通常可獲自真核生物或病毒DNA或cDNA之5'及有時3'非轉譯區。此等區域含有轉錄為編碼抗體之mRNA之非轉譯部分中的聚腺苷酸化片段之核苷酸區段。一種適用之轉錄終止組分為牛生長激素聚腺苷酸化區。參見WO94/11026及其中所揭示之表現載體。
vii.　宿主細胞之選擇及轉型
適用於選殖或表現本文載體中之DNA的宿主細胞包括本文所述之高等真核生物細胞，包括脊椎動物宿主細胞。在培養物(組織培養物)中繁殖脊椎動物細胞已成為常規程序。適用哺乳動物宿主細胞株之實例為由SV40轉型之猴腎CV1細胞株(COS-7，ATCC CRL 1651)；人類胚腎細胞株(293細胞或經次選殖以在懸浮培養物中生長之293細胞，Graham等人，J. Gen virol. 36:59(1977))；幼倉鼠腎細胞(BHK，ATCC CCL 10)；中國倉鼠卵巢細胞/-DHFR(CHO，Urlaub等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4216(1980))；小鼠足細胞(TM4，Mather,Biol. Reprod. 23:243-251(1980))；猴腎細胞(CV1 ATCC CCL 70)；非洲綠猴腎細胞(VERO-76，ATCC CRL-1587)；人類子宮頸癌細胞(HELA，ATCC CCL2)；犬腎細胞(MDCK，ATCC CCL 34)；布法羅大鼠肝細胞(buffalo rat liver cell)(BRL 3A，ATCC CRL 1442)；人類肺細胞(W138，ATCC CCL 75)；人類肝細胞(Hep G2，HB 8065)；小鼠乳房腫瘤(MMT 060562，ATCC CCL51)；TRI細胞(Mather等人，Annals N.Y. Acad. Sci. 383:44-68(1982))；MRC 5細胞；FS4細胞；及人類肝腫瘤細胞株(Hep G2)。
將宿主細胞用上述用於製造所要含鉸鏈多肽(例如抗體)之表現或選殖載體轉型，且培養於視需要經改良之習知營養培養基中以誘導啟動子、選擇轉型體或擴增編碼所要序列之基因。
viii.　培養宿主細胞
用於製造本發明之含鉸鏈多肽(例如抗體)之宿主細胞可培養於多種培養基中。諸如哈姆氏F10(Ham's F10)(Sigma)、最低必需培養基(MEM)(Sigma)、RPMI-1640(Sigma)及杜爾貝科氏改良伊格爾氏培養基(Dulbecco's Modified Eagle's Medium，DMEM)(Sigma)之市售培養基適於培養宿主細胞。另外，以下中所述之任何培養基均可用作宿主細胞之培養基：Ham等人，Meth. Enz. 58:44(1979)；Barnes等人，Anal. Biochem.102:255(1980)；美國專利第4,767,704號；第4,657,866號；第4,927,762號；第4,560,655號；或第5,122,469號；WO 90/03430；WO 87/00195；或美國專利Re.30,985。任何此等培養基均可視需要補充激素及/或其他生長因子(諸如胰島素、轉鐵蛋白或表皮生長因子)、鹽(諸如氯化鈉、鈣、鎂及磷酸鹽)、緩衝液(諸如HEPES)、核苷酸(諸如腺苷及胸苷)、抗生素(諸如GENTAMYCINTM藥物)、痕量元素(定義為通常以在微莫耳濃度範圍內之最終濃度存在之無機化合物)及葡萄糖或等效能源。亦可包括熟習此項技術者已知之適當濃度的任何其他必需補充物。培養條件(諸如溫度、pH值及其類似條件)為選擇用於表現之宿主細胞先前所用的條件，且為一般技術者所瞭解。
ix.　純化異多聚體蛋白質
當使用重組技術時，含鉸鏈多肽可於細胞內產生，或直接分泌於培養基中。若含鉸鏈多肽於細胞內產生，則作為第一步驟，例如藉由離心或超濾移除微粒碎片(宿主細胞或溶解片段)。若含鉸鏈多肽分泌於培養基中，則一般首先使用市售蛋白質濃縮過濾器(例如Amicon或Millipore Pellicon超濾單元)濃縮該等表現系統之上清液。在任何先前步驟中可包括諸如PMSF之蛋白酶抑制劑以抑制蛋白水解，且可包括抗生素以防止外來污染物生長。
由該等細胞製備之異多聚體組合物可使用例如羥磷灰石層析、凝膠電泳、透析及親和層析來純化，其中親和層析為較佳純化技術。蛋白A作為親和配位體之適用性取決於物種及存在於抗體中之任何免疫球蛋白Fc域的同型。蛋白A可用於純化基於人類γ1、γ2或γ4重鏈的抗體(Lindmark等人，J.Immunol.Meth.62：1-13(1983))。蛋白G推薦用於所有小鼠同型及人類γ3(Guss等人，EMBO J.5：1567-1575(1986))。雖然親和配位體所連接之基質最常為瓊脂糖，但亦可利用其他基質。與用瓊脂糖所達成之流速及加工時間相比，機械穩定性基質(諸如可控孔徑玻璃或聚(苯乙烯二乙烯基)苯)允許流速更快且加工時間更短。當抗體包含CH3結構域時，Bakerbond ABXTM樹脂(J.T.Baker,Phillipsburg,NJ)適用於純化。視欲回收抗體而定，亦可利用其他用於蛋白質純化之技術，諸如離子交換管柱分級分離、乙醇沈澱、逆相HPLC、二氧化矽層析、肝素SEPHAROSETM層析、陰離子或陽離子交換樹脂(諸如聚天冬胺酸管柱)層析、層析聚焦、SDS-PAGE及硫酸銨沈澱。
繼任何初步純化步驟之後，可使用pH值為約2.5-4.5的溶離緩衝液對包含相關抗體及污染物之混合物進行低pH值疏水性相互作用層析，且較佳在低鹽濃度(例如約0-0.25M鹽)下進行。異多聚體蛋白質之製造可或者或另外(對於任何上述特定方法)包含透析包含多肽混合物之溶液。
x.　使用桿狀病毒製造抗體
重組桿狀病毒可藉由使用例如脂質體(可購自GIBCO-BRL)將編碼抗體或抗體片段之質體及BaculoGoldTM病毒DNA(Pharmingen)共轉染於昆蟲細胞(諸如草地夜蛾(Spodoptera frugiperda)細胞(例如Sf9細胞；ATCC CRL 1711)或黑腹果蠅(Drosophila melanogaster)S2細胞)中而產生。在一特定實例中，將抗體序列融合於桿狀病毒表現載體內所含之抗原決定基標記的上游。該等抗原決定基標記包括poly-His標記。可採用多種質體，包括來源於市售質體(諸如pVL1393(Novagen)或pAcGP67B(Pharmingen))之質體。簡言之，編碼抗體或其片段之序列可藉由PCR用與5'及3'區互補之引子擴增。5'引子可併入側面(所選)限制酶位點。產物可隨後用所選限制酶消化且次選殖於表現載體中。
用表現載體轉染之後，在28℃下培育宿主細胞(例如Sf9細胞)4-5天，且收集所釋放之病毒並用於進一步擴增。病毒感染及蛋白質表現可如例如O'Reilley等人(Baculovirus expression vectors: A Laboratory Manual. Oxford: Oxford University Press(1994))所述執行。
隨後可例如藉由Ni2+螯合親和層析如下純化所表現之經poly-His標記之抗體。可如Rupert等人(Nature 362:175-179(1993))所述由重組病毒感染之Sf9細胞製備提取物。簡言之，洗滌Sf9細胞，再懸浮於音波處理緩衝液(25 mL HEPES(pH 7.9)；12.5 mM MgCl2；0.1 mM EDTA；10%甘油；0.1% NP-40；0.4 M KCl)中，且於冰上音波處理兩次，歷時20秒。藉由離心淨化音波處理物，且用負載緩衝液(50 mM磷酸鹽；300 mM NaCl；10%甘油，pH 7.8)50倍稀釋上清液且經由0.45 μm過濾器過濾。製備床體積為5 mL之Ni2+-NTA瓊脂糖管柱(可購自Qiagen)，用25 mL水洗滌且用25 mL負載緩衝液平衡。將經過濾之細胞提取物以0.5 mL/min負載於管柱上。用負載緩衝液洗滌管柱至基線A280，此時開始收集溶離份。隨後，用第二洗滌緩衝液(50 mM磷酸鹽；300 mM NaCl；10%甘油，pH 6.0)洗滌管柱，此溶離出非特異性結合之蛋白質。再次達成A280基線之後，用第二洗滌緩衝液中0至500 mM咪唑梯度發展管柱。收集1 mL溶離份，且藉由SDS-PAGE及銀染色或西方墨點法用結合於鹼性磷酸酶之Ni2+-NTA(Qiagen)分析。彙集含所溶離之經His10標記之抗體的溶離份且針對負載緩衝液透析。
或者，抗體純化可使用已知之層析技術(包括例如蛋白A或蛋白G管柱層析)執行。在一實施例中，相關抗體可藉由用含離液劑或溫和清潔劑之溶液溶離自管柱固相回收。例示性離液劑及溫和清潔劑包括(但不限於)鹽酸胍、尿素、過氯酸鋰、精胺酸、組胺酸、SDS(十二烷基硫酸鈉)、Tween、Triton及NP-40，均可購得。
IV.　異多聚體蛋白質形成/組裝
形成完整異多聚體蛋白質包含藉由形成二硫鍵再組裝第一與第二含鉸鏈多肽，此在本發明中稱作再摺疊。再摺疊包括第一含鉸鏈多肽與第二含鉸鏈多肽締合及形成鏈間二硫鍵。在本發明中，再摺疊(亦稱作複性)在活體外在不添加還原劑下進行。
宿主細胞可使用上述方法以各別培養物或單一培養物形式培養。在一方法中，第一宿主細胞及第二宿主細胞在同一培養容器中生長(在本文中有時稱作共培養或混合培養物)。在另一方法中，第一及第二宿主細胞在各別培養容器中生長。在一方法中，各別加工各別培養物，隨後混合/組合，接著破壞細胞膜。在另一方法中，混合各別培養物，隨後加工，接著破壞細胞膜。在一方法中，混合各別培養物，不進行進一步加工，接著破壞細胞膜。在一方法中，在破壞細胞膜之前，加工包含第一及第二宿主細胞之單一培養物。在另一方法中，在破壞細胞膜之前，不加工共培養之細胞。細胞之加工包含離心及再懸浮於適當緩衝液(例如提取緩衝液)中。
提取緩衝液為此項技術中已知，且熟習此項技術者應能夠不經過度實驗而確定使用何種緩衝液。
宿主細胞膜可使用此項技術中已知之方法破壞。該等方法包括細胞膜滲透及細胞膜崩解。細胞膜滲透係指在不破壞膜整體完整性以使細胞仍有活力下例如藉由引入孔使膜「滲漏」。換言之，滲透使大分子跨細胞膜移動且保留足以允許細胞活力延續之細胞結構。相比之下，細胞膜崩解使細胞內含物釋放至細胞外環境中且造成細胞死亡。
破壞細胞膜之方法包括(但不限於)：酶法溶解、音波處理、滲壓衝擊、通過微流化機、添加EDTA、使用各種清潔劑、溶劑(諸如甲苯、二甲亞碸等)、界面活性劑(諸如Triton-X 100、Tween 20等)、低滲透壓緩衝液、使用冷凍/解凍技術、電穿孔及通過不鏽鋼球均質機。
含鉸鏈多肽自細胞釋放(藉由滲透或崩解)之後，異多聚域將驅使異多聚體蛋白質締合。在不添加還原劑下，締合之含鉸鏈多肽形成鏈間二硫基。隨後純化所得經二硫基連接之異多聚體蛋白質。視情況，其可經調配以用於研究、診斷、治療或其他目的。
V.　標靶分子
可由本發明異多聚體蛋白質靶向之分子之實例包括(但不限於)可溶性血清蛋白及其受體及其他膜結合蛋白質(例如黏附素)。
在另一實施例中，本發明之異多聚體蛋白質能夠結合一種、兩種或兩種以上選自由以下組成之群的細胞激素、細胞激素相關蛋白及細胞激素受體：BMP1、BMP2、BMP3B(GDF10)、BMP4、BMP6、BMP8、CSF1(M-CSF)、CSF2(GM-CSF)、CSF3(G-CSF)、EPO、FGF1(aFGF)、FGF2(bFGF)、FGF3(int-2)、FGF4(HST)、FGF5、FGF6(HST-2)、FGF7(KGF)、FGF9、FGF10、FGF11、FGF12、FGF12B、FGF14、FGF16、FGF17、FGF19、FGF20、FGF21、FGF23、IGF1、IGF2、IFNA1、IFNA2、IFNA4、IFNA5、IFNA6、IFNA7、IFNB1、IFNG、IFNW1、FEL1、FEL1(ε)、FEL1(ζ)、IL1A、IL1B、IL2、IL3、IL4、IL5、IL6、IL7、IL8、IL9、IL10、IL11、IL12A、IL12B、IL13、IL14、IL15、IL16、IL17、IL17B、IL18、IL19、IL20、IL22、IL23、IL24、IL25、IL26、IL27、IL28A、IL28B、IL29、IL30、PDGFA、PDGFB、TGFA、TGFB1、TGFB2、TGFB3、LTA(TNF-b)、LTB、TNF(TNF-a)、TNFSF4(OX40配位體)、TNFSF5(CD40配位體)、TNFSF6(FasL)、TNFSF7(CD27配位體)、TNFSF8(CD30配位體)、TNFSF9(4-1BB配位體)、TNFSF10(TRAIL)、TNFSF11(TRANCE)、TNFSF12(APO3L)、TNFSF13(April)、TNFSF13B、TNFSF14(HVEM-L)、TNFSF15(VEGI)、TNFSF18、HGF(VEGFD)、VEGF、VEGFB、VEGFC、IL1R1、IL1R2、IL1RL1、LL1RL2、IL2RA、IL2RB、IL2RG、IL3RA、IL4R、IL5RA、IL6R、IL7R、IL8RA、IL8RB、IL9R、IL10RA、IL10RB、IL11RA、IL12RB1、IL12RB2、IL13RA1、IL13RA2、IL15RA、IL17R、IL18R1、IL20RA、IL21R、IL22R、IL1HY1、IL1RAP、IL1RAPL1、IL1RAPL2、IL1RN、IL6ST、IL18BP、IL18RAP、IL22RA2、AIF1、HGF、LEP(瘦素)、PTN及THPO。
在另一實施例中，標靶分子為選自由以下組成之群的趨化因子、趨化因子受體或趨化因子相關蛋白：CCL1(I-309)、CCL2(MCP-1/MCAF)、CCL3(MIP-1a)、CCL4(MIP-1b)、CCL5(RANTES)、CCL7(MCP-3)、CCL8(mcp-2)、CCLH(嗜酸性粒細胞趨化因子)、CCL13(MCP-4)、CCL15(MIP-1d)、CCL16(HCC-4)、CCL17(TARC)、CCL18(PARC)、CCL19(MDP-3b)、CCL20(MIP-3a)、CCL21(SLC/次級非淋巴組織趨化因子-2)、CCL22(MDC/STC-1)、CCL23(MPIF-1)、CCL24(MPIF-2/嗜酸性粒細胞趨化因子-2)、CCL25(TECK)、CCL26(嗜酸性粒細胞趨化因子-3)、CCL27(CTACK/ILC)、CCL28、CXCL1(GR01)、CXCL2(GR02)、CXCL3(GR03)、CXCL5(ENA-78)、CXCL6(GCP-2)、CXCL9(MIG)、CXCL10(IP10)、CXCL11(I-TAC)、CXCL12(SDF1)、CXCL13、CXCL14、CXCL16、PF4(CXCL4)、PPBP(CXCL7)、CX3CL1(SCYD1)、SCYE1、XCL1(淋巴細胞趨化因子)、XCL2(SCM-1b)、BLR1(MDR15)、CCBP2(D6/JAB61)、CCR1(CKR1/HM145)、CCR2(mcp-IRB/RA)、CCR3(CKR3/CMKBR3)、CCR4、CCR5(CMKBR5/ChemR13)、CCR6(CMKBR6/CKR-L3/STRL22/DRY6)、CCR7(CKR7/EB11)、CCR8(CMKBR8/TER1/CKR-L1)、CCR9(GPR-9-6)、CCRL1(VSHK1)、CCRL2(L-CCR)、XCR1(GPR5/CCXCR1)、CMKLR1、CMKOR1(RDC1)、CX3CR1(V28)、CXCR4、GPR2(CCR10)、GPR31、GPR81(FKSG80)、CXCR3(GPR9/CKR-L2)、CXCR6(TYMSTR/STRL33/Bonzo)、HM74、IL8RA(IL8Ra)、IL8RB(IL8Rb)、LTB4R(GPR16)、TCP10、CKLFSF2、CKLFSF3、CKLFSF4、CKLFSF5、CKLFSF6、CKLFSF7、CKLFSF8、BDNF、C5R1、CSF3、GRCC10(C10)、EPO、FY(DARC)、GDF5、HDF1A、DL8、PRL、RGS3、RGS13、SDF2、SLIT2、TLR2、TLR4、TREM1、TREM2及VHL。
在另一實施例中，本發明之異多聚體蛋白質能夠結合一或多種選自由以下組成之群的標靶：ABCF1；ACVR1；ACVR1B；ACVR2；ACVR2B；ACVRL1；AD0RA2A；聚蛋白聚糖；AGR2；AICDA；AIF1；AIG1；AKAP1；AKAP2；AMH；AMHR2；ANGPT1；ANGPT2；ANGPTL3；ANGPTL4；ANPEP；APC；APOC1；AR；AZGP1(鋅-a-醣蛋白)；B7.1；B7.2；BAD；BAFF(BLys)；BAG1；BAI1；BCL2；BCL6；BDNF；BLNK；BLR1(MDR15)；BMP1；BMP2；BMP3B(GDF10)；BMP4；BMP6；BMP8；BMPR1A；BMPR1B；BMPR2；BPAG1(網蛋白)；BRCA1；C19orf10(IL27W)；C3；C4A；C5；C5R1；CANT1；CASP1；CASP4；CAV1；CCBP2(D6/JAB61)；CCL1(1-309)；CCL11(嗜酸性粒細胞趨化因子)；CCL13(MCP-4)；CCL15(MIP-1d)；CCL16(HCC-4)；CCL17(TARC)；CCL18(PARC)；CCL19(MIP-3b)；CCL2(MCP-1)；MCAF；CCL20(MIP-3a)；CCL21(MTP-2)；SLC；次級非淋巴組織趨化因子-2；CCL22(MDC/STC-1)；CCL23(MPIF-1)；CCL24(MPIF-2/嗜酸性粒細胞趨化因子-2)；CCL25(TECK)；CCL26(嗜酸性粒細胞趨化因子-3)；CCL27(CTACK/ILC)；CCL28；CCL3(MTP-1a)；CCL4(MDP-1b)；CCL5(RANTES)；CCL7(MCP-3)；CCL8(mcp-2)；CCNA1；CCNA2；CCND1；CCNE1；CCNE2；CCR1(CKR1/HM145)；CCR2(mcp-1RB/RA)；CCR3(CKR3/CMKBR3)；CCR4；CCR5(CMKBR5/ChemR13)；CCR6(CMKBR6/CKR-L3/STRL22/DRY6)；CCR7(CKR7/EBI1)；CCR8(CMKBR8/TER1/CKR-L1)；CCR9(GPR-9-6)；CCRL1(VSHK1)；CCRL2(L-CCR)；CD164；CD19；CD1C；CD20；CD200；CD22；CD24；CD28；CD3；CD37；CD38；CD3E；CD3G；CD3Z；CD4；CD40；CD40L；CD44；CD45RB；CD52；CD69；CD72；CD74；CD79A；CD79B；CD8；CD80；CD81；CD83；CD86；CDH1(E-鈣黏素)；CDH10；CDH12；CDH13；CDH18；CDH19；CDH20；CDH5；CDH7；CDH8；CDH9；CDK2；CDK3；CDK4；CDK5；CDK6；CDK7；CDK9；CDKN1A(p21Wap1/Cip1)；CDKN1B(p27Kip1)；CDKN1C；CDKN2A(P16INK4a)；CDKN2B；CDKN2C；CDKN3；CEBPB；CER1；CHGA；CHGB；殼質酶；CHST10；CKLFSF2；CKLFSF3；CKLFSF4；CKLFSF5；CKLFSF6；CKLFSF7；CKLFSF8；CLDN3；CLDN7(緊密連接蛋白-7)；CLN3；CLU(簇蛋白)；CMKLR1；CMKOR1(RDC1)；CNR1；COL18A1；COLIA1；COL4A3；COL6A1；CR2；CRP；CSF1(M-CSF)；CSF2(GM-CSF)；CSF3(GCSF)；CTLA4；CTNNB1(b-連環素)；CTSB(組織蛋白酶B)；CX3CL1(SCYD1)；CX3CR1(V28)；CXCL1(GRO1)；CXCL10(IP-10)；CXCL11(I-TAC/IP-9)；CXCL12(SDF1)；CXCL13；CXCL14；CXCL16；CXCL2(GRO2)；CXCL3(GRO3)；CXCL5(ENA-78/LIX)；CXCL6(GCP-2)；CXCL9(MIG)；CXCR3(GPR9/CKR-L2)；CXCR4；CXCR6(TYMSTR/STRL33/Bonzo)；CYB5；CYC1；CYSLTR1；DAB2IP；DES；DKFZp451J0118；DNCL1；DPP4；E2F1；ECGF1；EDG1；EFNA1；EFNA3；EFNB2；EGF；EGFR；ELAC2；ENG；ENO1；ENO2；ENO3；EPHB4；EPO；ERBB2(Her-2)；EREG；ERK8；ESR1；ESR2；F3(TF)；FADD；FasL；FASN；FCER1A；FCER2；FCGR3A；FGF；FGF1(aFGF)；FGF10；FGF11；FGF12；FGF12B；FGF13；FGF14；FGF16；FGF17；FGF18；FGF19；FGF2(bFGF)；FGF20；FGF21；FGF22；FGF23；FGF3(int-2)；FGF4(HST)；FGF5；FGF6(HST-2)；FGF7(KGF)；FGF8；FGF9；FGFR3；FIGF(VEGFD)；FEL1(ε)；FIL1(ζ)；FLJ12584；FLJ25530；FLRT1(纖維結合蛋白)；FLT1；FOS；FOSL1(FRA-1)；FY(DARC)；GABRP(GABAa)；GAGEB1；GAGEC1；GALNAC4S-6ST；GATA3；GDF5；GFI1；GGT1；GM-CSF；GNAS1；GNRH1；GPR2(CCR10)；GPR31；GPR44；GPR81(FKSG80)；GRCC10(C10)；GRP；GSN(膠溶素)；GSTP1；HAVCR2；HDAC4；HDAC5；HDAC7A；HDAC9；HGF；HIF1A；HDP1；組胺及組胺受體；HLA-A；HLA-DRA；HM74；HMOX1；HUMCYT2A；ICEBERG；ICOSL；ID2；IFN-a；IFNA1；IFNA2；IFNA4；IFNA5；IFNA6；IFNA7；IFNB1；IFNγ；DFNW1；IGBP1；IGF1；IGF1R；IGF2；IGFBP2；IGFBP3；IGFBP6；IL-I；IL10；IL10RA；IL10RB；IL11；IL11RA；IL-12；IL12A；IL12B；IL12RB1；IL12RB2；IL13；IL13RA1；IL13RA2；IL14；IL15；IL15RA；IL16；IL17；IL17B；IL17C；IL17R；IL18；IL18BP；IL18R1；IL18RAP；IL19；IL1A；IL1B；IL1F10；IL1F5；IL1F6；IL1F7；IL1F8；IL1F9；IL1HY1；IL1R1；IL1R2；IL1RAP；IL1RAPL1；IL1RAPL2；IL1RL1；IL1RL2、IL1RN；IL2；IL20；IL20RA；IL21R；IL22；IL22R；IL22RA2；IL23；IL24；IL25；IL26；IL27；IL28A；IL28B；IL29；IL2RA；IL2RB；IL2RG；IL3；IL30；IL3RA；IL4；IL4R；IL5；IL5RA；IL6；IL6R；IL6ST(醣蛋白130)；EL7；EL7R；EL8；IL8RA；DL8RB；IL8RB；DL9；DL9R；DLK；INHA；INHBA；INSL3；INSL4；IRAKI；ERAK2；ITGA1；ITGA2；ITGA3；ITGA6(a6整合素)；ITGAV；ITGB3；ITGB4(b4整合素)；JAG1；JAK1；JAK3；JUN；K6HF；KAI1；KDR；KITLG；KLF5(GC Box BP)；KLF6；KLK10；KLK12；KLK13；KLK14；KLK15；KLK3；KLK4；KLK5；KLK6；KLK9；KRT1；KRT19(角蛋白19)；KRT2A；KHTHB6(毛髮特異性H型角蛋白)；LAMAS；LEP(瘦素)；Lingo-p75；Lingo-Troy；LPS；LTA(TNF-b)；LTB；LTB4R(GPR16)；LTB4R2；LTBR；MACMARCKS；MAG或Omgp；MAP2K7(c-Jun)；MDK；MIB1；中期因子；MEF；MIP-2；MKI67；(Ki-67)；MMP2；MMP9；MS4A1；MSMB；MT3(金屬硫結合蛋白-III(metallothionectin-III))；MTSS1；MUC1(黏蛋白)；MYC；MYD88；NCK2；神經黏蛋白；NFKB1；NFKB2；NGFB(NGF)；NGFR；NgR-Lingo；NgR-Nogo66(Nogo)；NgR-p75；NgR-Troy；NME1(NM23A)；N0X5；NPPB；NR0B1；NR0B2；NR1D1；NR1D2；NR1H2；NR1H3；NR1H4；NR1I2；NR1I3；NR2C1；NR2C2；NR2E1；NR2E3；NR2F1；NR2F2；NR2F6；NR3C1；NR3C2；NR4A1；NR4A2；NR4A3；NR5A1；NR5A2；NR6A1；NRP1；NRP2；NT5E；NTN4；ODZ1；OPRD1；P2RX7；PAP；PART1；PATE；PAWR；PCA3；PCNA；PDGFA；PDGFB；PECAM1；PF4(CXCL4)；PGF；PGR；磷酸蛋白聚糖；PIAS2；PIK3CG；PLAU(uPA)；PLG；PLXDC1；PPBP(CXCL7)；PPID；PR1；PRKCQ；PRKD1；PRL；PROC；PROK2；PSAP；PSCA；PTAFR；PTEN；PTGS2(COX-2)；PTN；RAC2(p21Rac2)；RARB；RGS1；RGS13；RGS3；RNF110(ZNF144)；ROBO2；S100A2；SCGB1D2(親脂蛋白B)；SCGB2A1(乳腺珠蛋白2)；SCGB2A2(乳腺珠蛋白1)；SCYE1(內皮單核細胞活化細胞激素)；SDF2；SERPINA1；SERPINA3；SERP1NB5(乳腺絲氨酸蛋白酶抑制劑)；SERPINE1(PAI-I)；SERPDMF1；SHBG；SLA2；SLC2A2；SLC33A1；SLC43A1；SLIT2；SPP1；SPRR1B(Spr1)；ST6GAL1；STAB1；STAT6；STEAP；STEAP2；TB4R2；TBX21；TCP10；TDGF1；TEK；TGFA；TGFB1；TGFB111；TGFB2；TGFB3；TGFBI；TGFBR1；TGFBR2；TGFBR3；TH1L；THBS1(血小板反應蛋白-1)；THBS2；THBS4；THPO；TIE(Tie-1)；TMP3；組織因子；TLR10；TLR2；TLR3；TLR4；TLR5；TLR6；TLR7；TLR8；TLR9；TNF；TNF-a；TNFAEP2(B94)；TNFAIP3；TNFRSF11A；TNFRSF1A；TNFRSF1B；TNFRSF21；TNFRSF5；TNFRSF6(Fas)；TNFRSF7；TNFRSF8；TNFRSF9；TNFSF10(TRAIL)；TNFSF11(TRANCE)；TNFSF12(APO3L)；TNFSF13(April)；TNFSF13B；TNFSF14(HVEM-L)；TNFSF15(VEGI)；TNFSF18；TNFSF4(OX40配位體)；TNFSF5(CD40配位體)；TNFSF6(FasL)；TNFSF7(CD27配位體)；TNFSF8(CD30配位體)；TNFSF9(4-1BB配位體)；TOLLIP；Toll樣受體；TOP2A(拓撲異構酶Ea)；TP53；TPM1；TPM2；TRADD；TRAF1；TRAF2；TRAF3；TRAF4；TRAF5；TRAF6；TREM1；TREM2；TRPC6；TSLP；TWEAK；VEGF；VEGFB；VEGFC；多功能蛋白聚糖；VHLC5；VLA-4；XCL1(淋巴細胞趨化因子)；XCL2(SCM-Ib)；XCR1(GPR5/CCXCR1)；YY1；及ZFPM2。
本發明涵蓋之抗體的較佳分子標靶分子包括CD蛋白，諸如CD3、CD4、CD8、CD16、CD19、CD20、CD34、CD64、CD200；ErbB受體家族之成員，諸如EGF受體、HER2、HER3或HER4受體；細胞黏著分子，諸如LFA-1、Mac1、p150.95、VLA-4、ICAM-1、VCAM、α4/β7整合素及αv/β3整合素，包括其α或 β次單元(例如抗CD11a、抗CD18或抗CD11b抗體)；生長因子，諸如VEGF-A、VEGF-C；組織因子(TF)；α干擾素(「αIFN」)；TNFα；介白素，諸如IL-1β、IL-3、IL-4、IL-5、IL-8、IL-9、IL-13、IL17A/F、IL-18、IL13Rα1、IL13Rα2、IL-4R、IL-5R、IL-9R；IgE；血型抗原；flk2/flt3受體；肥胖(O B)受體；mp1受體；CTLA-4；RANKL、RANK、RSVF蛋白、蛋白C等。
在一實施例中，本發明之異多聚體蛋白質結合低密度脂蛋白受體相關蛋白(LRP)-1或LRP-8或轉鐵蛋白受體，及至少一種選自由以下組成之群的標靶：1)β-分泌酶(BACE1或BACE2)、2)α-分泌酶、3)γ-分泌酶、4)τ-分泌酶、5)澱粉樣前驅蛋白(APP)、6)死亡受體6(DR6)、7)澱粉樣β肽、8)α-突觸核蛋白(alpha-synuclein)、9)帕金蛋白(Parkin)、10)亨廷頓蛋白(Huntingtin)、11)p75 NTR及12)卡斯蛋白酶-6。
在一實施例中，本發明之異多聚體蛋白質結合於至少兩種選自由以下組成之群的標靶分子：IL-1α及IL-1β、IL-12及IL-18；IL-13及IL-9；IL-13及IL-4；IL-13及IL-5；IL-5及IL-4；IL-13及IL-1β；IL-13及IL-25；IL-13及TARC；IL-13及MDC；IL-13及MEF；IL-13及TGF-β；IL-13及LHR促效劑；IL-12及TWEAK、IL-13及CL25；IL-13及SPRR2a；IL-13及SPRR2b；IL-13及ADAM8、IL-13及PED2、IL17A及IL17F、CD3及CD19、CD138及CD20；CD138及CD40；CD19及CD20；CD20及CD3；CD38及CD138；CD38及CD20；CD38及CD40；CD40及CD20；CD-8及IL-6；CD20及BR3、TNFα及TGF-β、TNFα及IL-1β；TNFα及IL-2、TNFα及IL-3、TNFα及IL-4、TNFα及IL-5、TNFα及IL6、TNFα及IL8、TNFα及IL-9、TNFα及IL-10、TNFα及IL-11、TNFα及IL-12、TNFα及IL-13、TNFα及IL-14、TNFα及IL-15、TNFα及IL-16、TNFα及IL-17、TNFα及IL-18、TNFα及IL-19、TNFα及IL-20、TNFα及IL-23、TNFα及IFNα、TNFα及CD4、TNFα及VEGF、TNFα及MIF、TNFα及ICAM-1、TNFα及PGE4、TNFα及PEG2、TNFα及RANK配位體、TNFα及Te38；TNFα及BAFF；TNFα及CD22；TNFα及CTLA-4；TNFα及GP130；TNFα及IL-12p40；VEGF及HER2、VEGF-A及HER2、VEGF-A及PDGF、HER1及HER2、VEGF-A及VEGF-C、VEGF-C及VEGF-D、HER2及DR5、VEGF及IL-8、VEGF及MET、VEGFR及MET受體、VEGFR及EGFR、HER2及CD64、HER2及CD3、HER2及CD16、HER2及HER3；EGFR(HER1)及HER2、EGFR及HER3、EGFR及HER4、IL-13及CD40L、IL4及CD40L、TNFR1及IL-1R、TNFR1及IL-6R及TNFR1及IL-18R、EpCAM及CD3、MAPG及CD28、EGFR及CD64、CSPGs及RGM A；CTLA-4及BTNO2；IGF1及IGF2；IGF1/2及Erb2B；MAG及RGM A；NgR及RGM A；NogoA及RGM A；OMGp及RGM A；PDL-I及CTLA-4；及RGM A及RGM B。
視情況結合於其他分子之可溶抗原或其片段可用作產生抗體之免疫原。對於跨膜分子，諸如受體，其片段(例如受體之細胞外域)可用作免疫原。或者，表現跨膜分子之細胞可用作免疫原。該等細胞可源自天然來源(例如癌細胞株)或可為藉由重組技術轉型以表現跨膜分子之細胞。適用於製備抗體之其他抗原及其形式為熟習此項技術者將顯而易知。
VI.　活性檢定
本發明之異多聚體蛋白質的物理/化學特性及生物學功能可藉由此項技術中已知之各種檢定表徵。
可藉由一系列檢定進一步表徵經純化之異多聚體蛋白質，包括(但不限於)N端測序、胺基酸分析、非變性尺寸排阻高壓液相層析(HPLC)、質譜分析、離子交換層析及木瓜蛋白酶消化。
在本發明之某些實施例中，分析本文所製造之免疫球蛋白之生物活性。在一些實施例中，測試本發明免疫球蛋白之抗原結合活性。此項技術中已知且可用於本文中之抗原結合檢定包括(但不限於)使用諸如西方墨點法、放射免疫檢定、ELISA(酶聯免疫吸附檢定)、「夾心」免疫檢定、免疫沈澱檢定、螢光免疫檢定及蛋白A免疫檢定之技術的任何直接或競爭性結合檢定。下文在實例部分提供說明性抗原結合檢定。
在一實施例中，本發明涵蓋具有一些而非所有效應功能的經改變抗體，此使該抗體成為諸多應用之適宜候選者，在該等應用中活體內抗體之半衰期很重要，但某些效應功能(諸如補體及ADCC)為不必要或有害的。在某些實施例中，量測所製造之異多聚體蛋白質之Fc活性以確保僅維持所要特性。可進行活體外及/或活體內細胞毒性檢定以證實CDC及/或ADCC活性減少/去除。舉例而言，可進行Fc受體(FcR)結合檢定以確保異多聚體蛋白質缺乏FcγR結合能力(從而可能缺乏ADCC活性)，但保留FcRn結合能力。介導ADCC之初級細胞NK細胞僅表現FcγRIII，而單核細胞表現FcγRI、FcγRII及FcγRIII。FcR在造血細胞上之表現概述於Ravetch及Kinet,Annu. Rev. Immunol 9:457-92(1991)第464頁表3中。評定相關分子之ADCC活性之活體外檢定的一實例描述於美國專利第5,500,362號或第5,821,337號中。適用於該等檢定之效應細胞包括周邊血液單核細胞(PBMC)及自然殺手(NK)細胞。或者或另外，例如可在動物模型(諸如Clynes等人PNAS(USA) 95:652-656(1998)中所揭示之動物模型)中活體內評定相關分子之ADCC活性。亦可進行C1q結合檢定以確認抗體不能結合C1q且因此缺乏CDC活性。為評定補體活化，可執行CDC檢定，例如Gazzano-Santoro等人，J. Immunol. Methods 202:163(1996)中所述。亦可使用此項技術中已知之方法進行FcRn結合及活體內清除率/半衰期測定。
VII.　結合之蛋白質
本發明亦提供包含本文所述之異多聚體蛋白質(例如根據本文所述之方法製得之抗體)的結合之蛋白質，諸如結合之抗體或免疫結合物(例如「抗體-藥物結合物」或「ADC」)，其中輕鏈或重鏈之恆定區之一結合於化學分子，諸如染料或細胞毒性劑，諸如化學治療劑、藥物、生長抑制劑、毒素(例如細菌、真菌、植物或動物來源之酶活性毒素或其片段)或放射性同位素(亦即放射性結合物)。詳言之，如本文所述，使用異多聚域能夠構築含有兩條不同重鏈(HC1及HC2)以及兩條不同輕鏈(LC1及LC2)之抗體。使用本文所述之方法構築的免疫結合物可含有細胞毒性劑結合於僅一條重鏈(HC1或HC2)或僅一條輕鏈(LC1或LC2)之恆定區。此外，因為免疫結合物可具有細胞毒性劑連接於僅一條重鏈或輕鏈，所以投與個體之細胞毒性劑之量相對於投與細胞毒性劑連接於兩條重鏈或輕鏈之抗體減少。減少投與個體之細胞毒性劑之量可限制與細胞毒性劑有關之不良副作用。
在治療癌症時使用抗體-藥物結合物局部傳遞細胞毒性劑或細胞生長抑制劑(亦即殺死或抑制腫瘤細胞之藥物)(Syrigos及Epenetos,Anticancer Research 19:605-614(1999)；Niculescu-Duvaz及Springer,Adv. Drg. Del. Rev. 26:151-172(1997)；美國專利第4,975,278號)允許藥物部分靶向腫瘤傳遞且在其中進行細胞內累積，其中全身性投與此等未結合之藥劑可能對正常細胞以及設法去除之腫瘤細胞造成不可接受之毒性程度(Baldwin等人，Lancet(1986年3月15日)：603-605(1986)；Thorpe,(1985)「Antibody Carriers Of Cytotoxic Agents In Cancer Therapy: A Review」，Monoclonal Antibodies '84: Biological And Clinical Applications,A. Pinchera等人(編)，第475-506頁)。因此設法使功效最大而毒性最小。已報導多株抗體與單株抗體均適用於此等策略(Rowland等人，Cancer Immunol. Immunother. 21:183-187(1986))。此等方法中所用之藥物包括道諾黴素、小紅莓、甲胺喋呤及長春地辛(前述Rowland等人，(1986))。抗體-毒素結合物中所用之毒素包括細菌毒素，諸如白喉毒素；植物毒素，諸如蓖麻毒素；小分子毒素，諸如格爾德黴素(geldanamycin)(Mandler等人，Jour. of the Nat. Cancer Inst. 92(19):1573-1581(2000)；Mandler等人，Bioorganic & Med. Chem. Letters 10:1025-1028(2000)；Mandler等人，Bioconjugate Chem. 13:786-791(2002))、類美登素(EP 1391213；Liu等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:8618-8623(1996))及刺孢黴素(Lode等人，Cancer Res. 58:2928(1998)；Hinman等人，Cancer Res.53:3336-3342(1993))。該等毒素可藉由包括微管蛋白結合、DNA結合或拓撲異構酶抑制之機制來實現其細胞毒性及細胞生長抑制作用。一些細胞毒性藥物在與大抗體或蛋白質受體配位體結合時趨向於無活性或活性降低。
適用於產生免疫結合物之化學治療劑描述於本文(例如上文)中。可使用之酶活性毒素及其片段包括：白喉A鏈、白喉毒素之非結合活性片段、外毒素A鏈(來自綠膿桿菌(Pseudomonas aeruginosa))、篦麻毒素A鏈、相思子毒素A鏈、莫迪素A鏈、α-帚麴菌素、油桐(Aleurites fordii)蛋白、康乃馨蛋白、美洲商陸(Phytolaca americana)蛋白(PAPI、PAPII及PAP-S)、苦瓜(momordica charantia)抑制劑、麻瘋樹毒蛋白、巴豆毒素、肥皂草(sapaonaria officinalis)抑制劑、白樹素、有絲分裂素、侷限麴菌素(restrictocin)、酚黴素、伊諾黴素(enomycin)及黴菌毒素(tricothecene)。參見例如1993年10月28日公開之WO 93/21232。多種放射性核素可用於製造放射性結合之抗體。實例包括212Bi、131I、131In、90Y及186Re。抗體與細胞毒性劑之結合物可使用多種雙官能蛋白質偶合劑製得，該等蛋白質偶合劑諸如N-丁二醯亞胺基-3-(2-吡啶基二硫氫)丙酸酯(SPDP)、亞胺基硫雜環戊烷(IT)、醯亞胺酯之雙官能衍生物(諸如二亞胺代己二酸二甲酯鹽酸鹽)、活性酯(諸如辛二酸二丁二醯亞胺酯)、醛(諸如戊二醛)、雙疊氮基化合物(諸如雙(對疊氮基苯甲醯基)己二胺)、雙重氮鎓衍生物(諸如雙(對重氮鎓苯甲醯基)-乙二胺)、二異氰酸酯(諸如甲苯2,6-二異氰酸酯)及雙活性氟化合物(諸如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。舉例而言，蓖麻毒素免疫毒素可如Vitetta等人，Science,238:1098(1987)中所述來製備。碳14標記之1-異硫氰基苯甲基-3-甲基二伸乙三胺五乙酸(MX-DTPA)為一種用於使放射性核苷酸與抗體結合之例示性螯合劑。參見例如WO 94/11026。
本文亦涵蓋抗體與一或多種小分子毒素(諸如刺胞黴素、類美登素、海兔毒素、奧瑞他汀(aurostatin)、新月毒素及CC1065及此等毒素之具有毒素活性之衍生物)的結合物。
i.　美登素及類美登素
在一些實施例中，免疫結合物包含本發明之抗體(全長或片段)結合於一或多個類美登素分子。
類美登素為藉由抑制微管蛋白聚合發揮作用之有絲分裂抑制劑。美登素最先自東非灌木齒葉美登木(Maytenus serrata)分離(美國專利第3,896,111號)。隨後，發現某些微生物亦產生類美登素，諸如美登醇及C-3美登醇酯(美國專利第4,151,042號)。合成美登醇及其衍生物及類似物揭示於例如美國專利第4,137,230號；第4,248,870號；第4,256,746號；第4,260,608號；第4,265,814號；第4,294,757號；第4,307,016號；第4,308,268號；第4,308,269號；第4,309,428號；第4,313,946號；第4,315,929號；第4,317,821號；第4,322,348號；第4,331,598號；第4,361,650號；第4,364,866號；第4,424,219號；第4,450,254號；第4,362,663號；及第4,371,533中。
類美登素藥物部分在抗體-藥物結合物中為具吸引力之藥物部分，因為其：(i)相對易於藉由醱酵或醱酵產物之化學改質、衍生而獲得；(ii)易於用適於經由非二硫基連接子結合於抗體的官能基衍生；(iii)在血漿中穩定；及(iv)有效針對多種腫瘤細胞株。
含有類美登素之免疫結合物、其製備方法及其治療用途揭示於例如美國專利第5,208,020號、第5,416,064號及歐洲專利EP 0 425 235 B1中，該等專利之揭示內容以引用的方式明確併入本文中。Liu等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:8618-8623(1996)描述包含命名為DM1之類美登素連接於針對人類結腸直腸癌之單株抗體C242的免疫結合物。發現該結合物對所培養之結腸癌細胞具有高細胞毒性且在活體內腫瘤生長檢定中展示抗腫瘤活性。Chari等人，Cancer Research 52:127-131(1992)描述如下免疫結合物，其中類美登素經由二硫基連接子與結合於人類結腸癌細胞株上之抗原的鼠類抗體A7結合，或與結合HER-2/neu致癌基因之另一鼠類單株抗體TA.1結合。在活體外，於每個細胞表現3×105個HER-2表面抗原之人類乳癌細胞株SK-BR-3上測試TA.1-類美登素結合物之細胞毒性。該藥物結合物所達成之細胞毒性程度與游離類美登素藥物類似，可藉由增加每個抗體分子之類美登素分子數目而提高。A7-類美登素結合物在小鼠中展示低全身細胞毒性。
可藉由在不顯著降低抗體或類美登素分子之生物活性的情況下將抗體化學連接於類美登素分子來製備抗體-類美登素結合物。參見例如美國專利第5,208,020號(其揭示內容以引用之方式明確併入本文中)。平均每個抗體分子結合3-4個類美登素分子已展示增強標靶細胞之細胞毒性的功效且不會負面影響抗體之功能或溶解性，但預期甚至每個抗體1個毒素分子相較於使用裸抗體亦可增強細胞毒性。類美登素為此項技術中所熟知，且可藉由已知之技術合成或自天然來源分離。適合之類美登素揭示於例如美國專利第5,208,020號及上文提及之其他專利及非專利公開案中。較佳之類美登素為美登醇及在美登醇分子之芳環中或其他位置處改質之美登醇類似物(諸如各種美登醇酯)。
此項技術中已知多種連接基團可用於製備抗體-類美登素結合物，包括例如美國專利第5,208,020號或歐洲專利0 425 235 B1；Chari等人，Cancer Research 52:127-131(1992)及美國專利申請公開案第2005/0169933號中所揭示之連接基團，該等參考文獻之揭示內容以引用的方式明確併入本文中。包含連接子組分SMCC之抗體-類美登素結合物可如美國專利申請公開案第2005/0169933號中所揭示而製備。連接基團包括如上文所確定之專利中所揭示之二硫基、硫醚基、酸不穩定基團、光不穩定基團、肽酶不穩定基團或酯酶不穩定基團，二硫基及硫醚基為較佳。本文中描述且例示其他連接基團。
抗體與類美登素之結合物可使用多種雙官能蛋白質偶合劑製得，該等蛋白質偶合劑諸如N-丁二醯亞胺基-3-(2-吡啶基二硫基)丙酸酯(SPDP)、丁二醯亞胺基-4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)環己烷-1-甲酸酯(SMCC)、亞胺基硫雜環戊烷(IT)、醯亞胺酯之雙官能衍生物(諸如二亞胺代己二酸二甲酯鹽酸鹽)、活性酯(諸如辛二酸二丁二醯亞胺酯)、醛(諸如戊二醛)、雙疊氮基化合物(諸如雙(對疊氮基苯甲醯基)己二胺)、雙重氮衍生物(諸如雙(對重氮鎓苯甲醯基)-乙二胺)、二異氰酸酯(諸如2,6-二異氰酸甲苯酯)及雙活性氟化合物(諸如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。特別較佳之偶合劑包括提供二硫鍵聯之N-丁二醯亞胺基-3-(2-吡啶基二硫基)丙酸酯(SPDP)(Carlsson等人，Biochem. J. 173:723-737(1978))及N-丁二醯亞胺基-4-(2-吡啶基硫基)戊酸酯(SPP)。
連接子可連接於類美登素分子之各個位置，視連接類型而定。舉例而言，可藉由使用習知偶合技術與羥基反應形成酯鍵。反應可發生於具有羥基之C-3位置、經羥基甲基修飾之C-14位置、經羥基修飾之C-15位置及具有羥基之C-20位置。在一較佳實施例中，在美登醇或美登醇類似物之C-3位置處形成鍵聯。
ii.　奧瑞他汀及海兔毒素
在一些實施例中，免疫結合物包含本發明抗體結合於海兔毒素或海兔毒素之肽類似物及衍生物奧瑞他汀(美國專利第5,635,483號及第5,780,588號)。已展示海兔毒素及奧瑞他汀干擾微管動力學、GTP水解及核及細胞分裂(Woyke等人，Antimicrob. Agents and Chemother. 45(12):3580-3584(2001))且具有抗癌活性(美國專利第5,663,149號)及抗真菌活性(Pettit等人，Antimicrob. Agents Chemother. 42:2961-2965(1998))。海兔毒素或奧瑞他汀藥物部分可經由該肽藥物部分之N(胺基)端或C(羧基)端連接於抗體(WO 02/088172)。
例示性奧瑞他汀實施例包括「Monomethylvaline Compounds Capable of Conjugation to Ligands」，美國申請公開案第2005/0238649號(其揭示內容以全文引用的方式明確併入本文中)中所揭示的N端連接之單甲基奧瑞他汀藥物部分DE及DF。
通常，基於肽之藥物部分可藉由在兩個或兩個以上胺基酸及/或肽片段之間形成肽鍵而製備。該等肽鍵可例如根據肽化學領域中熟知之液相合成法(參見E. Schrder及K. Lbke,「The Peptides」，第1卷，第76-136頁，1965,Academic Press)製備。奧瑞他汀/海兔毒素藥物部分可根據以下中之方法製備：美國專利第5,635,483號及第5,780,588號；Pettit等人，J. Nat. Prod. 44:482-485(1981)；Pettit等人，Anti-Cancer Drug Design 13:47-66(1998)；Poncet,Curr. Pharm. Des. 5:139-162(1999)；及Pettit,Fortschr. Chem. Org. Naturst. 70:1-79(1997)。亦參見Doronina,Nat. Biotechnol. 21(7):778-784(2003)；及「Monomethylvaline Compounds Capable of Conjugation to Ligands」，美國申請公開案第2005/0238649號(以全文引用的方式併入本文中)(揭示例如製備單甲基纈胺酸化合物(諸如結合於連接子之MMAE及MMAF)之連接子及方法)。
iii.　刺孢黴素
在其他實施例中，免疫結合物包含本發明抗體結合於一或多個刺孢黴素分子。刺孢黴素家族之抗生素能夠在低於皮莫耳濃度下產生雙股DNA斷裂。關於刺孢黴素家族之結合物之製備，參見美國專利第5,712,374、第5,714,586號、第5,739,116號、第5,767,285號、第5,770,701號、第5,770,710號、第5,773,001號及第5,877,296號(均屬於American Cyanamid Company)。可使用之刺胞黴素之結構類似物包括(但不限於)γ1 I、α2 I、α3 I、N-乙醯基-γ1 I、PSAG及θI 1(Hinman等人，Cancer Research 53:3336-3342(1993)；Lode等人，Cancer Research 58:2925-2928(1998)及上述屬於American Cyanamid之美國專利)。可與抗體結合之另一抗腫瘤藥物為QFA，其為抗葉酸藥。刺胞黴素與QFA均具有細胞內作用位點且不易於跨過質膜。因此，經由抗體介導之內化作用，細胞吸收此等藥劑，從而大大增強其細胞毒性作用。
iv.　其他細胞毒性劑
可結合於本發明或根據本文所述之方法製得之抗體的其他抗腫瘤劑包括BCNU、鏈佐星、長春新鹼及5-氟尿嘧啶、美國專利第5,053,394號及第5,770,710號中所述之統稱為LL-E33288複合物的藥劑家族以及埃斯培拉黴素(美國專利第5,877,296號)。
可用酶活性毒素及其片段包括：白喉A鏈、白喉毒素之非結合活性片段、外毒素A鏈(來自綠膿桿菌)、篦麻毒素A鏈、相思子毒素A鏈、莫迪素A鏈、α-帚麴菌素、油桐蛋白、康乃馨蛋白、美洲商陸蛋白(PAPI、PAPII及PAP-S)、苦瓜抑制劑、麻瘋樹毒蛋白、巴豆毒素、肥皂草抑制劑、白樹素、有絲分裂素、侷限麴菌素、酚黴素、伊諾黴素及黴菌毒素(參見例如1993年10月28日公開之WO 93/21232)。
本發明進一步涵蓋抗體與具有核分解活性之化合物(例如核糖核酸酶或DNA核酸內切酶，諸如去氧核糖核酸酶；DNA酶)之間所形成的免疫結合物。
為選擇性破壞腫瘤，抗體可包含高度放射性原子。可利用多種放射性同位素產生放射性結合抗體。實例包括At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212及Lu之放射性同位素。當使用結合物進行偵測時，其可包含用於閃爍攝影研究之放射性原子，例如tc99m或I123；或用於核磁共振(NMR)成像(亦稱為磁共振成像，mri)之自旋標記，諸如碘-123(再次)及碘-131、銦-111、氟-19、碳-13、氮-15、氧-17、釓、錳或鐵。
可以已知之方式將放射性標記或其他標記併入結合物中。舉例而言，肽可生物合成，或可藉由使用包含例如氟-19替代氫之適合胺基酸前驅物進行化學胺基酸合成來合成。標記(諸如tc99m或I123、Re186、Re188及In111)可經由肽中之半胱胺酸殘基連接。釔-90可經由離胺酸殘基連接。IODOGEN法(Fraker等人，Biochem. Biophys. Res. Commun. 80:49-57(1978))可用於併入碘-123。「Monoclonal Antibodies in Immunoscintigraphy」(Chatal,CRC Press 1989)詳細描述其他方法。
抗體與細胞毒性劑之結合物可使用多種雙官能蛋白質偶合劑製得，該等蛋白質偶合劑諸如N-丁二醯亞胺基-3-(2-吡啶基二硫基)丙酸酯(SPDP)、丁二醯亞胺基-4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)環己烷-1-甲酸酯(SMCC)、亞胺基硫雜環戊烷(IT)、醯亞胺酯之雙官能衍生物(諸如二亞胺代己二酸二甲酯鹽酸鹽)、活性酯(諸如辛二酸二丁二醯亞胺酯)、醛(諸如戊二醛)、雙疊氮基化合物(諸如雙(對疊氮基苯甲醯基)己二胺)、雙重氮衍生物(諸如雙(對重氮鎓苯甲醯基)-乙二胺)、二異氰酸酯(諸如2,6-二異氰酸甲苯酯)及雙活性氟化合物(諸如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。舉例而言，蓖麻毒素免疫毒素可如Vitetta等人，Science,238:1098(1987)中所述來製備。碳14標記之1-異硫氰基苯甲基-3-甲基二伸乙三胺五乙酸(MX-DTPA)為一種用於使放射性核苷酸與抗體結合之例示性螯合劑。參見例如WO 94/11026。該連接子可為促進細胞中細胞毒性藥物釋放之「可裂解連接子」。舉例而言，可使用酸不穩定連接子、肽酶敏感性連接子、光不穩定連接子、二甲基連接子或含二硫基連接子(Chari等人，Cancer Research 52:127-131(1992)；美國專利第5,208,020號)。
本發明之化合物特別涵蓋(但不限於)用如下交聯試劑製備之ADC：BMPS、EMCS、GMBS、HBVS、LC-SMCC、MBS、MPBH、SBAP、SIA、SIAB、SMCC、SMPB、SMPH、磺酸基-EMCS、磺酸基-GMBS、磺酸基-KMUS、磺酸基-MBS、磺酸基-SIAB、磺酸基-SMCC及磺酸基-SMPB及SVSB(丁二醯亞胺基-(4-乙烯基碸)苯甲酸酯)，該等交聯試劑可購得(例如購自Pierce Biotechnology,Inc.,Rockford,IL.,U.S.A)。參見2003-2004 Applications Handbook and Catalog第467-498頁。
v.　製備結合之抗體
在本發明之結合之抗體中，抗體視情況經由連接子結合於一或多個部分(例如藥物部分)，例如每個抗體結合約1至約20個部分。結合之抗體可藉由數種途徑使用熟習此項技術者已知之有機化學反應、條件及試劑製備，包括：(1)使抗體之親核基團與二價連接子試劑經由共價鍵反應，繼而與相關部分反應；及(2)使部分之親核基團與二價連接子試劑經由共價鍵反應，繼而與抗體之親核基團反應。製備結合之抗體的其他方法描述於本文中。
連接子試劑可由一或多個連接子組分構成。例示性連接子組分包括6-順丁烯二醯亞胺基己醯基(「MC」)、順丁烯二醯亞胺基丙醯基(「MP」)、纈胺酸-瓜胺酸(「val-cit」)、丙胺酸-苯丙胺酸(「ala-phe」)、對胺基苯甲氧基羰基(「PAB」)、4-(2-吡啶基硫基)戊酸N-丁二醯亞胺酯(「SPP」)、4-(N-順丁烯二醯亞胺基甲基)環己烷-1-甲酸N-丁二醯亞胺酯(「SMCC」)及(4-碘-乙醯基)胺基苯甲酸N-丁二醯亞胺酯(「SIAB」)。其他連接子組分為此項技術中已知且一些描述於本文中。亦參見「Monomethylvaline Compounds Capable of Conjugation to Ligands」，美國申請公開案第2005/0238649號，其內容以全文引用的方式併入本文中。
在一些實施例中，連接子可包含胺基酸殘基。例示性胺基酸連接子組分包括二肽、三肽、四肽或五肽。例示性二肽包括纈胺酸-瓜胺酸(vc或val-cit)、丙胺酸-苯丙胺酸(af或ala-phe)。例示性三肽包括甘胺酸-纈胺酸-瓜胺酸(gly-val-cit)及甘胺酸-甘胺酸-甘胺酸(gly-gly-gly)。包含胺基酸連接子組分之胺基酸殘基包括天然存在之胺基酸以及次要胺基酸及非天然存在之胺基酸類似物，諸如瓜胺酸。可在胺基酸連接子組分對由特定酶(例如腫瘤相關蛋白酶、組織蛋白酶B、C及D或纖維蛋白溶酶蛋白酶)酶法裂解的選擇性方面對胺基酸連接子組分進行設計及最佳化。
抗體上之親核基團包括(但不限於)：(i)N端胺基；(ii)側鏈胺基，例如離胺酸；(iii)側鏈硫氫基，例如半胱胺酸；及(iv)糖羥基或胺基，其中抗體經糖基化。胺基、硫氫基及羥基具有親核性且能夠與連接子部分及連接子試劑上之親電子基團反應形成共價鍵，該等親電子基團包括：(i)活性酯，諸如NHS酯、HOBt酯、鹵基甲酸酯及酸鹵化物；(ii)烷基及苯甲基鹵化物，諸如鹵基乙醯胺；(iii)醛、酮、羧基及順丁烯二醯亞胺基。某些抗體具有可還原之鏈間二硫基，亦即半胱胺酸橋。抗體可藉由用諸如DTT(二硫蘇糖醇)之還原劑處理而具有與連接子試劑結合之反應性。因此，理論上各半胱胺酸橋將形成兩個反應性硫氫基親核體。可經由離胺酸與2-亞胺基硫雜環戊烷(喬特試劑(Traut's reagent))反應使胺轉化為硫氫基，將其他親核基團引入抗體中。可藉由引入一個、兩個、三個、四個或四個以上半胱胺酸殘基(例如製備包含一或多個非天然半胱胺酸胺基酸殘基之突變抗體)而將反應性硫氫基引入抗體(或其片段)中。
本發明之結合之抗體亦可藉由修飾抗體，引入可與連接子試劑或藥物或其他部分上之親核取代基反應之親電子部分來製造。糖基化抗體之糖可例如用過碘酸鹽氧化劑氧化，形成可與連接子試劑或藥物或其他部分之胺基反應的醛基或酮基。所得亞胺席夫鹼(Schiff base)基團可形成穩定鍵聯，或可例如經硼氫化物試劑還原，形成穩定胺鍵聯。在一實施例中，糖基化抗體之碳水化合物部分與半乳糖氧化酶或偏過碘酸鈉之反應可於蛋白質中產生可與藥物或其他部分上之適當基團反應的羰基(醛基及酮基)(Hermanson,Bioconjugate Techniques)。在另一實施例中，含有N端絲胺酸或蘇胺酸殘基之蛋白質可與偏過碘酸鈉反應，得到醛而非第一胺基酸(Geoghegan及Stroh,Bioconjugate Chem. 3:138-146(1992)；美國專利第5,362,852號)。該醛可與藥物部分或連接子親核體反應。
同樣，部分(諸如藥物部分)上之親核基團包括(但不限於)：能夠與連接子部分及連接子試劑上之親電子基團反應形成共價鍵之胺、硫氫基、羥基、醯肼、肟、肼、硫縮胺基脲、羧酸肼及芳肼基團，該等親電子基團包括：(i)活性酯，諸如NHS酯、HOBt酯、鹵基甲酸酯及酸鹵化物；(ii)烷基及苯甲基鹵化物，諸如鹵基乙醯胺；及(iii)醛、酮、羧基及順丁烯二醯亞胺基。
或者，可例如藉由重組技術或肽合成製得包含抗體及細胞毒性劑之融合蛋白。DNA之長度可包含編碼結合物之兩個部分的各別區域，該等區域可彼此相鄰或由編碼不破壞結合物所要特性之連接子肽之區域分隔。在另一實施例中，抗體可結合於「受體」(諸如抗生蛋白鏈菌素)以用於腫瘤預靶向，其中投與個體抗體-受體結合物，繼而使用清除劑自循環中移除未結合之結合物，隨後投與結合於細胞毒性劑(例如放射性核苷酸)之「配位體」(例如抗生物素蛋白)。
VIII.　效用
本文提供之本發明方法在工業上適用於製造異多聚體蛋白質。本發明之方法減少兩個各別醱酵及分離中所涉及之工作量，且減少兩個各別醱酵中所固有之技術困難。此外，去除先前方法程序中之退火及氧化還原步驟可提高產量且降低加工複雜性及成本。
本文所述之異多聚體蛋白質可用於例如活體外、離體及活體內治療方法。本發明提供各種基於使用一或多個此等分子之方法。在某些病理病狀中，必需及/或需要利用異多聚體蛋白質(例如多特異性抗體)。本發明提供此等異多聚體蛋白質，其可用於達成多種目的，例如作為治療劑、預防劑及診斷劑。舉例而言，本發明提供治療疾病之方法，該等方法包含投與需要治療之個體本發明之異多聚體蛋白質，從而治療疾病。本文所述之任何本發明異多聚體蛋白質可用於本文所述之治療(或預防或診斷)方法。
舉例而言，當異多聚體蛋白質為多價時，重要益處為其對抗原之結合力(avidity)增強。除基於結合單元(亦即Fab)對抗原具有固有高親和力以外，正常IgG抗體亦由於對標靶二價結合而利用該結合力作用來提高其與抗原之結合。
針對同一抗原分子上之兩各別抗原決定基的異多聚體蛋白質不僅可提供增強結合力(binding avidity)之益處(由於二價結合)，而且亦可獲得與任一親本抗體無關之新穎特性。因此，本發明之異多聚體蛋白質可用於例如阻斷受體-配位體相互作用。
本文所述之異多聚體蛋白質亦可用於以一個分子同時阻斷兩個標靶之信號傳導路徑的應用。
IX.　治療用途
本文所述之異多聚體蛋白質(諸如抗體及抗體片段)(例如根據本文所述方法製得之抗體及/或其片段)可用於治療應用。舉例而言，該等異多聚體蛋白質可用於治療腫瘤，包括癌前、非轉移性、轉移性及癌性腫瘤(例如早期癌症)，用於治療過敏或發炎病症，或用於治療自體免疫疾病，或用於治療有發生癌症(例如乳癌、結腸直腸癌、肺癌、腎細胞癌、神經膠質瘤或卵巢癌)、過敏或發炎病症或自體免疫疾病風險的個體。
術語癌症涵蓋多種增生性病症，包括(但不限於)癌前生長、良性腫瘤及惡性腫瘤。良性腫瘤保持位於起始位點且不能浸潤、侵襲或轉移至遠端位點。惡性腫瘤會侵襲且破壞周圍的其他組織。其亦能夠脫離起始位置，且通常經由血流或經由淋巴結所在之淋巴系統，擴散至身體其他部分(轉移)。原發性腫瘤係由發生之組織類型分類；轉移性腫瘤係由癌細胞來源之組織類型分類。惡性腫瘤之細胞隨時間變得愈異常且顯得愈不像正常細胞。此癌細胞外觀之改變稱作腫瘤等級，且癌細胞描述為良好分化、中等分化、不良分化或未分化。良好分化之細胞外觀相當正常且類似於來源之正常細胞。未分化細胞為已變得異常以致不再能夠確定細胞來源之細胞。
腫瘤可為實體腫瘤或非實體腫瘤或軟組織腫瘤。軟組織腫瘤之實例包括白血病(例如慢性骨髓性白血病、急性骨髓性白血病、成人急性淋巴母細胞性白血病、急性骨髓性白血病、成熟B細胞急性淋巴母細胞性白血病、慢性淋巴細胞性白血病、幼淋巴細胞性白血病或毛細胞白血病)或淋巴瘤(例如非霍奇金氏淋巴瘤(non-Hodgkin's lymphoma)、皮膚T細胞淋巴瘤或霍奇金氏病)。實體腫瘤包括除血液、骨髓或淋巴系統以外的身體組織之任何癌症。實體腫瘤可進一步分為上皮細胞來源之腫瘤及非上皮細胞來源之腫瘤。上皮細胞實體腫瘤之實例包括胃腸道、結腸、乳房、前列腺、肺、腎臟、肝臟、胰臟、卵巢、頭頸、口腔、胃、十二指腸、小腸、大腸、肛門、膽囊、唇、鼻咽、皮膚、子宮、男性生殖器、泌尿器官、膀胱及皮膚之腫瘤。非上皮來源之實體腫瘤包括肉瘤、腦腫瘤及骨腫瘤。
上皮癌一般自良性腫瘤發展為侵襲前階段(例如原位癌)、穿透基底膜且侵襲上皮下基質之惡性癌症。
多特異性蛋白質複合物亦可用於此等治療應用，且結合HER2之抗體尤其可用於治療乳癌、結腸直腸癌、肺癌、腎細胞癌、神經膠質瘤或卵巢癌。
作為接受本發明組合物之候選者的其他個體患有如下疾病或具有出現如下疾病之風險：纖維小管組織異常增生、痤瘡、後天性免疫缺乏症候群、動脈閉塞、異位性角膜炎、細菌性潰瘍、白塞氏病、血源性腫瘤、頸動脈阻塞性疾病、脈絡膜新血管生成、慢性發炎、慢性視網膜脫離、慢性葡萄膜炎、慢性玻璃體炎、隱形眼鏡超戴症、角膜移植排斥反應、角膜新血管生成、角膜移植物新血管生成、克羅恩氏病、伊爾斯氏病(Eales disease)、流行性角膜結膜炎、真菌性潰瘍、單純疱疹感染、帶狀疱疹感染、高黏滯症候群、卡波西氏肉瘤(Kaposi's sarcoma)、白血病、脂質變性、萊姆氏病、邊緣角質層分離、木雷潰瘍(Mooren ulcer)、非麻風性分枝桿菌感染(Mycobacteria infection other than leprosy)、近視、眼部新生血管疾病、視盤小凹、奧斯勒-韋伯症候群(Osler-Weber syndrome)(奧斯勒-韋伯-朗迪(Osler-Weber-Rendu))、骨關節炎、佩吉特氏病(Paget's disease)、平坦部炎、類天疱瘡、泡性角結膜炎、多動脈炎、雷射後併發症、原蟲感染、彈性假黃瘤、翼狀胬肉乾性角膜炎、放射狀角膜切開術、視網膜新血管生成、早產兒視網膜病、晶狀體後纖維組織增生、類肉瘤、鞏膜炎、鐮狀細胞貧血、休格連氏症候群(Sogren's syndrome)、實體腫瘤、斯特格氏病(Stargart's disease)、史蒂芬強森病、上緣角膜炎、梅毒、全身性狼瘡、特芮安氏角膜邊緣變性(Terrien's marginal degeneration)、弓蟲病、尤文氏肉瘤(Ewing sarcoma)之腫瘤、神經母細胞瘤之腫瘤、骨肉瘤之腫瘤、視網膜母細胞瘤之腫瘤、橫紋肌肉瘤之腫瘤、潰瘍性結腸炎、靜脈閉塞、維生素A缺乏症、韋格納氏類肉瘤病(Wegener's sarcoidosis)、與糖尿病有關之不良血管生成、寄生性疾病、異常創口癒合、外科手術後肥大、損傷或創傷(例如急性肺損傷/ARDS)、抑制毛髮生長、抑制排卵及黃體形成、抑制植入及抑制子宮中之胚胎發育。
可使用根據本文所述方法製得之抗體治療的過敏或發炎病症或自體免疫疾病或病症之實例包括(但不限於)關節炎(類風濕性關節炎、諸如急性關節炎、慢性類風濕性關節炎、痛風性關節炎、急性痛風性關節炎、慢性發炎性關節炎、退化性關節炎、傳染性關節炎、萊姆關節炎、增生性關節炎、牛皮癬性關節炎、脊椎關節炎及幼年發作型類風濕性關節炎、骨關節炎、慢性漸進性關節炎、變形性關節炎、慢性原發性多發性關節炎、反應性關節炎及僵直性脊椎炎)、發炎性過度增殖皮膚病、牛皮癬(諸如斑塊狀牛皮癬、滴狀牛皮癬、膿皰型牛皮癬及指甲牛皮癬)、皮膚炎(包括接觸性皮膚炎、慢性接觸性皮膚炎、過敏性皮膚炎、過敏性接觸性皮膚炎、疱疹樣皮膚炎及異位性皮膚炎)、x連鎖高IgM症候群、蕁麻疹(諸如慢性過敏性蕁麻疹及慢性特發性蕁麻疹，包括慢性自體免疫性蕁麻疹)、多發性肌炎/皮肌炎、青少年皮肌炎、中毒性表皮壞死溶解、硬皮病(包括全身性硬皮病)、硬化症(諸如全身性硬化症、多發性硬化症(MS)(諸如脊髓-眼MS、原發性進行性MS(PPMS)及復發緩解性MS(RRMS))、進行性全身性硬化症、動脈粥樣硬化、動脈硬化、播散性硬化及共濟失調硬化)、發炎性腸道疾病(IBD)(例如克羅恩氏病、自體免疫介導之胃腸病、結腸炎(諸如潰瘍性結腸炎、顯微鏡下結腸炎、膠原性結腸炎、息肉狀結腸炎、壞死性小腸結腸炎及透壁性結腸炎)及自體免疫性發炎性腸道疾病)、壞疽性膿皮病、結節性紅斑、原發性硬化性膽管炎、上鞏膜炎、呼吸窘迫症候群(包括成人或急性呼吸窘迫症候群(ARDS))、腦膜炎、葡萄膜全部或部分發炎、虹膜炎、脈絡膜炎、自體免疫性血液病症、類風濕性脊椎炎、突發性耳聾、IgE介導之疾病(諸如全身性過敏反應及過敏性及異位性鼻炎)、腦炎(諸如拉氏腦炎及邊緣葉腦炎及/或腦幹腦炎)、葡萄膜炎(諸如前葡萄膜炎、急性前葡萄膜炎、肉芽腫性葡萄膜炎、非肉芽腫性葡萄膜炎、晶狀體抗原性葡萄膜炎、後葡萄膜炎或自體免疫性葡萄膜炎)、有或無腎病症候群之腎小球腎炎(GN)(諸如慢性或急性腎小球腎炎，諸如原發性GN、免疫介導之GN、膜性GN(膜性腎病)、特發性膜性GN或特發性膜性腎病、膜或膜性增生性GN(MPGN)(包括I型及II型)及快速進行性GN)、過敏性病狀、過敏反應、濕疹(包括過敏性或異位性濕疹)、哮喘(諸如支氣管哮喘及自體免疫性哮喘)、涉及T細胞浸潤及慢性發炎反應之病狀、慢性肺部發炎疾病、自體免疫性心肌炎、白血球黏著缺陷病、全身性紅斑狼瘡(SLE)(諸如皮膚SLE)、亞急性皮膚紅斑狼瘡、新生兒狼瘡症候群(NLE)、播散性紅斑狼瘡、狼瘡(包括狼瘡性腎炎、狼瘡性大腦炎、兒童狼瘡、非腎狼瘡、腎外狼瘡、盤狀狼瘡、狼瘡脫髮)、青少年發作型(I型)糖尿病(包括兒童胰島素依賴型糖尿病(IDDM))、成年發作型糖尿病(II型糖尿病)、自體免疫性糖尿病、特發性尿崩症、與由細胞激素及T淋巴細胞介導之急性及遲發性過敏反應有關的免疫反應、結核病、類肉瘤病、肉芽腫(包括淋巴瘤樣肉芽腫、韋格納氏肉芽腫)、顆粒性球缺乏症、脈管炎(包括血管炎，包括大血管血管炎(包括風濕性多肌痛及巨細胞(高安氏)動脈炎)、中等血管血管炎(包括川崎氏病及結節性多動脈炎)、顯微鏡下多動脈炎、CNS血管炎、壞死性血管炎、皮膚血管炎或過敏性血管炎、全身性壞死性血管炎及ANCA相關之血管炎(諸如丘格-斯特勞斯血管炎或丘格-斯特勞斯症候群(CSS)))、顳動脈炎、再生障礙性貧血、自體免疫性再生障礙性貧血、庫姆陽性貧血、戴-布二氏貧血、溶血性貧血或免疫性溶血性貧血(包括自體免疫性溶血性貧血(AIHA))、惡性貧血、愛迪森氏病、純紅血球貧血或發育不全(PRCA)、因子VIII缺陷病、A型血友病、自體免疫性嗜中性白血球減少症、全部血球減少症、白血球減少症、涉及白血球滲出之疾病、CNS發炎病症、多發性器官損傷症候群(諸如因敗血病、創傷或出血繼發之多發性器官損傷症候群)、抗原-抗體複合物介導之疾病、抗腎小球基底膜病、抗磷脂抗體症候群、過敏性神經炎、白塞氏病、卡氏症候群、古柏氏症候群、雷諾氏症候群、休格連氏症候群、史蒂芬-強森症候群、類天疱瘡(諸如大皰性類天疱瘡及皮膚類天疱瘡)、天疱瘡(包括尋常天疱瘡、落葉狀天疱瘡、天疱瘡黏膜類天疱瘡及紅斑性天疱瘡)、自體免疫性多內分泌病、雷特氏病或雷特氏症候群、免疫複合物性腎炎、抗體介導之腎炎、視神經脊髓炎、多發性神經病、慢性神經病(諸如IgM多發性神經病或IgM介導之神經病)、血小板減少症(如例如心肌梗塞患者發展之血小板減少症，包括血栓性血小板減少性紫癜(TTP)及自體免疫或免疫介導之血小板減少症(諸如特發性血小板減少性紫癜(ITP)，包括慢性或急性ITP))、睪丸及卵巢之自體免疫疾病(包括自體免疫性睪丸炎及卵巢炎)、原發性甲狀腺功能低下、副甲狀腺機能減退症、自體免疫內分泌疾病(包括甲狀腺炎，諸如自體免疫性甲狀腺炎、橋本氏病、慢性甲狀腺炎(橋本氏甲狀腺炎)或亞急性甲狀腺炎)、自體免疫性甲狀腺病、特發性甲狀腺功能低下、格雷夫斯氏病、多腺症候群(諸如自體免疫性多腺症候群(或多腺內分泌病症候群))、副腫瘤症候群(包括神經性副腫瘤症候群，諸如朗伯-伊頓肌無力症候群或伊頓-朗伯症候群)、僵人症候群、腦脊髓炎(諸如過敏性腦脊髓炎及實驗性過敏性腦脊髓炎(EAE))、重症肌無力(諸如胸腺瘤相關之重症肌無力)、小腦退化、神經性肌強直、斜視眼陣攣或斜視眼陣攣性肌陣攣症候群(OMS)及感覺神經病、多灶性運動神經病、席漢氏症候群、自體免疫性肝炎、慢性肝炎、狼瘡樣肝炎、巨細胞性肝炎、慢性活動性肝炎或自體免疫性慢性活動性肝炎、淋巴間質性肺炎、阻塞性細支氣管炎(非移植)伴有NSIP、格林-巴利症候群、伯傑氏病(IgA腎病)、特發性IgA腎病、線狀IgA皮膚病、原發性膽汁性肝硬化、肺硬化、自體免疫性腸病症候群、乳糜病、乳糜瀉、口炎性腹瀉(麩質腸病)、難治性脂肪瀉、特發性脂肪瀉、冷球蛋白血症、肌肉萎縮性側索硬化(ALS；盧格里格氏病)、冠狀動脈病、自體免疫性耳病(諸如自體免疫性內耳病(AIED))、自體免疫性耳聾、斜視眼陣攣性肌陣攣症候群(OMS)、多軟骨炎(諸如難治性或復發性多軟骨炎)、肺泡性蛋白沈積症、澱粉樣變性、鞏膜炎、非癌性淋巴細胞增多、原發性淋巴細胞增多(其包括單株B細胞淋巴細胞增多(例如良性單株球蛋白症及意義未明之單株球蛋白症(MGUS)))、周邊神經病、副腫瘤症候群、通道病變(諸如癲癇、偏頭痛、心律不整、肌肉性病症、聾、盲、週期性麻痺及CNS之通道病變)、自閉、發炎性肌病、局部節段性腎小球硬化(FSGS)、內分泌眼病、葡萄膜視網膜炎、脈絡膜視網膜炎、自體免疫性肝臟病症、肌肉纖維疼痛、多發性內分泌失調、施密特氏症候群、腎上腺炎、胃萎縮、早老性癡呆、脫髓鞘疾病(諸如自體免疫性脫髓鞘疾病)、糖尿病性腎病、德雷斯勒氏症候群、斑形脫髮、CREST症候群(鈣質沈積症、雷諾現象、食道蠕動異常、指硬皮病及毛細血管擴張)、男性及女性自體免疫性不孕症、混合型結締組織疾病、卡格氏病、風濕熱、反覆流產、農民肺、多形性紅斑、心臟切開術後症候群、庫欣氏症候群、飼鳥者肺、過敏性肉芽腫性血管炎、良性淋巴細胞性血管炎、阿爾波特氏症候群、肺泡炎(諸如過敏性肺泡炎及纖維化肺泡炎)、間質性肺病、輸血反應、麻風、瘧疾、利什曼體病、錐蟲病、血吸蟲病、蛔蟲病、麯黴病、森普特氏症候群、卡潘氏症候群、登革熱、心內膜炎、心內膜心肌纖維化、彌漫性間質性肺纖維化、肺間質纖維化、特發性肺纖維化、囊腫性纖維化、內眼炎、持久性隆起性紅斑、胎兒紅血球母細胞增多症、嗜伊紅血球筋膜炎、舒爾曼氏症候群、費爾提氏症候群、絲蟲病、睫狀體炎(諸如慢性睫狀體炎、異色性睫狀體炎、虹膜睫狀體炎或福斯氏睫狀體炎)、亨諾-許蘭紫癜、人類免疫缺乏病毒(HIV)感染、埃可病毒感染、心肌病、阿茲海默氏病、小病毒感染、風疹病毒感染、疫苗接種後症候群、先天性風疹感染、愛巴病毒感染、腮腺炎、埃文氏症候群、自體免疫性生殖腺失調、西氏舞蹈病、鏈球菌感染後腎炎、閉塞性血栓性血管炎、甲狀腺毒症、脊髓癆、脈絡膜炎、巨細胞多肌痛、內分泌眼病、慢性過敏性肺炎、乾燥性角膜結膜炎、流行性角膜結膜炎、特發性腎炎症候群、微小病變性腎病、良性家族性及缺血再灌注損傷、視網膜自體免疫、關節發炎、支氣管炎、慢性阻塞性氣管病、矽沉著病、口瘡、口瘡性口炎、動脈硬化症、不形成精子症、自體免疫性溶血、伯克氏病、冷球蛋白血症、杜氏攣縮、晶狀體過敏性眼內炎、過敏性腸炎、麻風結節性紅斑、特發性面神經麻痺、慢性疲勞症候群、風濕熱、哈曼-里奇氏病、感音神經性聽力損失、陣發性血紅素尿、性腺低能症、區域性迴腸炎、白血球減少症、傳染性單核細胞增多症、橫貫性脊髓炎、原發性特發性黏液水腫、腎炎、交感性眼炎、肉芽腫性睪丸炎、胰腺炎、急性多神經根炎、壞疽性膿皮病、魁文氏甲狀腺炎、後天性脾萎縮、由抗精細胞抗體所致之不孕症、非惡性胸腺瘤、白斑症、SCID及愛巴病毒相關疾病、後天性免疫缺乏症候群(AIDS)、寄生性疾病(諸如利什曼原蟲病)、中毒性休克症候群、食物中毒、涉及T細胞浸潤之病狀、白血球黏著缺陷病、與由細胞激素及T淋巴細胞介導之急性及遲發性過敏反應有關的免疫反應、涉及白血球滲出之疾病、多發性器官損傷症候群、抗原-抗體複合物介導之疾病、抗腎小球基底膜病、過敏性神經炎、自體免疫性多內分泌病、卵巢炎、原發性黏液水腫、自體免疫性萎縮性胃炎、交感性眼炎、風濕性疾病、混合型結締組織疾病、腎病症候群、胰島炎、多內分泌腺失調、周邊神經病、自體免疫性多腺症候群I型、成年發作型特發性副甲狀腺機能減退症(AOIH)、全禿、擴張型心肌病、後天性大皰性表皮鬆懈(EBA)、血色素沉著症、心肌炎、腎病症候群、原發性硬化性膽管炎、化膿性或非化膿性竇炎、急性或慢性竇炎、篩竇炎、額竇炎、上頜竇炎或蝶竇炎、嗜伊紅血球相關病症(諸如嗜伊紅血球過多、肺部浸潤性嗜伊紅血球過多、嗜伊紅血球過多-肌痛症候群、呂弗勒氏症候群、慢性嗜伊紅血球肺炎、熱帶肺嗜伊紅血球過多、支氣管肺麯黴病、麯黴腫或含有嗜伊紅血球之肉芽瘤)、全身性過敏反應、血清陰性脊椎關節炎、多內分泌腺自體免疫疾病、硬化性膽管炎、鞏膜、上鞏膜、慢性皮膚黏膜念珠菌病、布魯頓氏症候群、嬰兒暫時性低γ球蛋白血症、威斯科特-奧爾德里奇症候群、共濟失調毛細血管擴張、與膠原性疾病有關之自體免疫病症、風濕病、神經病、缺血再灌注病症、血壓反應降低、血管功能障礙、血管擴張、組織損傷、心血管缺血、痛覺過敏、大腦缺血及伴有血管生成之疾病、過敏症、腎小球腎炎、再灌注損傷、心肌或其他組織之再灌注損傷、含急性發炎組分之皮膚病、急性化膿性腦膜炎或其他中樞神經系統發炎性病症、眼睛及眼眶發炎性病症、顆粒球輸注相關症候群、細胞激素誘發之毒性、急性嚴重性發炎、慢性難治性發炎、腎盂炎、肺硬化、糖尿病性視網膜病、糖尿病性大動脈病症、動脈內膜過度增生、消化性潰瘍、瓣膜炎及子宮內膜異位。
除治療用途以外，本發明之抗體可用於達成其他目的，包括診斷方法，諸如本文所述之疾病及病狀的診斷方法。
X.　劑量、調配物及持續時間
本發明之蛋白質將以與良好醫療實踐一致之方式調配、給與及投與。在此情形中所考慮之因素包括所治療之特定病症、所治療之特定哺乳動物、個別個體之臨床狀況、病症之原因、藥劑傳遞位點、投藥方法、投藥時程及開業醫師已知之其他因素。欲投與之蛋白質的「治療有效量」應受該等考慮因素控制，且為預防、改善或治療特定病症(例如癌症、過敏或發炎病症或自體免疫病症)所必需之最小量。蛋白質無需但視情況可與一或多種當前用於預防或治療該病症之藥劑一起調配。該等其他藥劑之有效量視存在於調配物中之蛋白質之量、病症或治療之類型及上述其他因素而定。其一般以與上文所用相同之劑量及投藥途徑使用或以迄今所用劑量之約1%至99%使用。一般而言，減輕或治療癌症包含減輕一或多個與癌症有關之症狀或醫學問題。治療有效量之藥物可實現以下之一或組合：減少癌細胞之數目(至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%或100%以上)；減少或抑制腫瘤尺寸或腫瘤負荷；抑制(亦即在某種程度上減少及/或停止)癌細胞向周邊器官浸潤；在腺瘤之情況下減少激素分泌；降低血管密度；抑制腫瘤轉移；減弱或抑制腫瘤生長；及/或在某種程度上緩解一或多種與癌症有關之症狀。在一些實施例中，蛋白質用於預防個體之癌症或自體免疫病症發生或復發。
在一實施例中，本發明可用於延長易患或經診斷患有癌症或自體免疫病症之人類個體的存活持續時間。存活持續時間定義為自首次投與藥物至死亡之時間。存活持續時間亦可藉由治療組相對於對照組之分層風險比(HR)量測，該風險比表示治療期間個體死亡之風險。
在另一實施例中，本發明之治療顯著提高易患或經診斷患有癌症且用各種抗癌症療法治療之人類個體組的反應速率。反應速率定義為經治療個體中對治療起反應之百分比。在一態樣中，相較於用外科手術、輻射療法或化學療法單獨治療之組，使用本發明之蛋白質與外科手術、輻射療法或一或多種化學治療劑的本發明組合治療顯著提高經治療個體組之反應速率，該提高之卡方p值(Chi-square p-value)小於0.005。癌症治療中治療功效之其他量度描述於美國專利申請公開案第20050186208號中。
使用此項技術中已知之標準方法，藉由混合具有所要純度之活性成分與視情況選用之生理學上可接受之載劑、賦形劑或穩定劑來製備治療調配物(Remington's Pharmaceutical Sciences(第20版)，A. Gennaro編，2000,Lippincott,Williams & Wilkins,Philadelphia,PA)。可接受之載劑包括生理食鹽水，或緩衝液，諸如磷酸鹽、檸檬酸鹽及其他有機酸；抗氧化劑，包括抗壞血酸；低分子量(小於約10個殘基)多肽；蛋白質，諸如血清白蛋白、明膠或免疫球蛋白；親水性聚合物，諸如聚乙烯吡咯啶酮；胺基酸，諸如甘胺酸、麩醯胺酸、天冬醯胺、精胺酸或離胺酸；單醣、二醣及其他碳水化合物，包括葡萄糖、甘露糖或糊精；螯合劑，諸如EDTA；糖醇，諸如甘露糖醇或山梨糖醇；成鹽相對離子，諸如鈉；及/或非離子型界面活性劑，諸如TWEENTM、PLURONICSTM或PEG。
視情況但較佳地，該調配物含有醫藥學上可接受之鹽，較佳為氯化鈉，且在約生理學濃度下。視情況，本發明之調配物可含有醫藥學上可接受之防腐劑。在某些實施例中，防腐劑濃度範圍為0.1%至2.0%(通常v/v)。適合防腐劑包括醫藥技術中已知之防腐劑。苯甲醇、苯酚、間甲酚、對羥基苯甲酸甲酯及對羥基苯甲酸丙酯為較佳防腐劑。視情況，本發明之調配物可包括濃度為0.005%至0.02%之醫藥學上可接受之界面活性劑。
如所治療之特定適應症所需，本文之調配物亦可含有一種以上活性化合物，較佳為具有互補活性且不會不利地彼此影響的活性化合物。該等分子適合以有效達成預期目的之量組合存在。
活性成分亦可包埋於例如藉由凝聚技術或藉由界面聚合製備之微膠囊(分別例如羥甲基纖維素微膠囊或明膠微膠囊及聚-(甲基丙烯酸甲酯)微膠囊)中；包埋於膠態藥物傳遞系統(例如脂質體、白蛋白微球體、微乳液、奈米粒子及奈米膠囊)中；或包埋於巨乳液中。前述Remington's Pharmaceutical Sciences中揭示該等技術。
可製備持續釋放製劑。持續釋放製劑之適合實例包括含有異多聚體蛋白質之固體疏水性聚合物的半滲透性基質，該等基質呈成型物品(例如薄膜或微膠囊)之形式。持續釋放基質之實例包括聚酯、水凝膠(例如聚(2-羥基乙基-甲基丙烯酸酯)或聚(乙烯醇))、聚丙交酯(美國專利第3,773,919號)、L-麩胺酸與γ乙基-L-麩胺酸酯之共聚物、不可降解之乙烯-乙酸乙烯酯、可降解之乳酸-乙醇酸共聚物(諸如LUPRON DEPOTTM(由乳酸-乙醇酸共聚物及乙酸亮丙瑞林構成的可注射微球體))及聚-D-(-)-3-羥基丁酸。儘管聚合物(諸如乙烯-乙酸乙烯酯及乳酸-乙醇酸)能夠釋放分子超過100天，但某些水凝膠釋放蛋白質時間較短。當囊封之異多聚體蛋白質長時間保留於體內時，其可能會因在37℃下暴露於水分而變性或凝集，從而導致生物活性喪失及免疫原性可能改變。視所涉及之機制而定，可設計合理的穩定策略。舉例而言，若發現凝集機制為經由硫基-二硫基互換(thio-disulfide interchange)形成分子間S-S鍵，則可藉由修飾氫硫基殘基、自酸性溶液凍乾、控制水分含量、使用適當添加劑及開發特定聚合物基質組合物來實現穩定。
本文所述之蛋白質(例如異多聚體蛋白質，諸如根據本文所述之方法製得之多特異性抗體)可根據已知之方法投與人類個體，諸如以快速注射形式或藉由經一段時間連續輸注靜脈內投與，藉由肌肉內、腹膜內、脳脊髄內、皮下、關節內、滑膜內、鞘內、經口、局部或吸入途徑投與。若廣泛副作用或毒性伴隨對蛋白質所識別之標靶分子的拮抗作用，則可能尤其適宜局部投藥。離體策略亦可用於治療應用。離體策略包含用編碼本發明蛋白質之聚核苷酸轉染或轉導獲自個體之細胞。隨後，經轉染或轉導之細胞返回個體。該等細胞可為包括(但不限於)造血細胞(例如骨髓細胞、巨噬細胞、單核細胞、樹突狀細胞、T細胞或B細胞)、纖維母細胞、上皮細胞、內皮細胞、角質細胞或肌細胞之多種類型中之任一種。
在一實例中，當病症或腫瘤位置允許時，蛋白質複合物(例如異多聚體蛋白質，諸如根據本文所述方法製得之多特異性抗體)可例如藉由直接注射來局部投與，且該注射可週期性重複。在手術切除腫瘤之後，蛋白質複合物亦可向個體全身傳遞或直接傳遞至腫瘤細胞(例如腫瘤或腫瘤床)以預防或減少局部復發或轉移。
XI.　製品
本發明之另一實施例為含有一或多種本文所述之蛋白質複合物及適用於治療或診斷病症(例如自體免疫疾病或癌症)之物質的製品。該製品包含容器及在該容器上或與該容器相連之標籤或藥品說明書。適合容器包括例如瓶子、小瓶、注射器等。容器可由諸如玻璃或塑膠之多種材料形成。該容器容納有效治療病狀之組合物，且可具有無菌入孔(例如容器可為具有皮下注射針可刺穿之塞子的靜脈內溶液袋或小瓶)。組合物中之至少一種活性劑為本發明之異多聚體蛋白質(例如抗體或抗體片段)。標籤或藥品說明書指示該組合物係用於治療特定病狀。標籤或藥品說明書進一步包含關於向個體投與異多聚體蛋白質組合物之說明書。亦涵蓋包含本文所述之組合療法的製品及套組。
藥品說明書係指通常包括在治療產品之商業包裝中的說明書，其含有關於適應症、用法、劑量、投藥、禁忌症及/或有關使用該等治療產品之警告的資訊。在某些實施例中，藥品說明書指示該組合物係用於治療乳癌、結腸直腸癌、肺癌、腎細胞癌、神經膠質瘤或卵巢癌。
此外，製品可進一步包含第二容器，該容器包含醫藥學上可接受之緩衝液，諸如抑菌性注射用水(BWFI)、磷酸鹽緩衝鹽水、林格氏溶液(Ringer's solution)及右旋糖溶液。其可進一步包括由商業及使用者觀點考慮之其他物質，包括其他緩衝液、稀釋液、過濾器、針及注射器。
亦提供適用於各種目的之套組，例如用於抗原(例如HER2或EGFR)自細胞純化或免疫沈澱。為分離及純化抗原(例如HER2或EGFR)，套組可含有異多聚體蛋白質(例如EGFR/HER2)偶合於珠粒(例如瓊脂糖珠粒)。可提供如下套組，其含有用於例如在ELISA或西方墨點法中活體外偵測及定量抗原的異多聚體蛋白質。如製品般，套組包含容器及在該容器上或與該容器相連之標籤或藥品說明書。該容器容納包含至少一種本發明異多聚體蛋白質(例如多特異性抗體或抗體片段)之組合物。可包括含有例如稀釋液及緩衝液或對照抗體之其他容器。標籤或藥品說明書可提供組合物之描述以及用於所欲活體外或診斷用途之說明書。
認為上述書面描述足以使得熟習此項技術者能夠實施本發明。以下實例僅出於說明之目的而提供，且不欲以任何方式限制本發明之範疇。實際上，熟習此項技術者由上述描述顯而易知除本文所示及所述以外的本發明之各種修改且該等修改屬於隨附申請專利範圍之範疇內。
在以下實驗揭示內容中，以下縮寫適用：eq(當量)；M(莫耳濃度)；μM(微莫耳濃度)；N(當量濃度)；mol(莫耳)；mmol(毫莫耳)；μmol(微莫耳)；nmol(奈莫耳)；g(公克)；mg(毫克)；kg(公斤)；μg(微克)；L(公升)；ml(毫升)；μl(微升)；cm(公分)；mm(毫米)；μm(微米)；nm(奈米)；℃(攝氏度)；h(小時)；min(分鐘)；sec(秒)；msec(毫秒)；ADCC(抗體依賴性細胞毒性)；BsAb(雙特異性抗體)；CL(輕鏈之恆定域)；CH(重鏈之恆定域)；CMC(補體介導之細胞毒性)；Fab(抗原結合片段)；Fc(結晶片段)；Fv(可變片段(VL+VH))；EGFR(表皮生長因子受體)；HC(重鏈)；IGFR(胰島素樣生長因子受體)；LC(輕鏈)；scFv(單鏈可變片段(由胺基酸連接子繫栓之VL與VH))；VEGF(血管內皮生長因子)；VEGFR2(血管內皮生長因子受體2)；VH(可變重鏈域)；VL(可變輕鏈域)。
實例
在以下實例中進一步詳細說明本發明，該等實例不欲以任何方式限制所主張之本發明範疇。附圖意欲視為本發明之說明及描述的組成部分。所引用之所有參考文獻中所述的全部內容以引用的方式特別地併入本文中。提供以下實例說明而非限制所主張之本發明。
實例1 構築表現載體
此實例說明用於使宿主細胞轉型之核酸構築體。
一般而言，重鏈與輕鏈DNA編碼序列均選殖於表現質體中，該表現質體含有用於各序列之各別啟動子元件及用於選擇含有表現質體之細菌細胞的抗生素抗性。載體構築體亦編碼熱穩定性腸毒素II(STII)分泌信號(Picken等人，1983,Infect. Immun. 42:269-275及Lee等人，1983,Infect. Immun. 42:264-268)以將抗體多肽輸出至細菌細胞之周質空間中。各鏈之轉錄由phoA啟動子控制(Kikuchi等人，1981,Nucleic Acids Res.,9:5671-5678)，且先前所述之具有所量測之相對轉譯強度的STII信號序列變異體提供轉譯控制，該等STII信號序列變異體在轉譯起始區(TIR)含有沉默密碼子變化(Simmons及Yansura,1996,Nature Biotechnol. 14:629-634及Simmons等人，2002,J. Immunol Methods,263:133-147)。圖2A及2B分別展示杵及臼質體之示意圖。
儘管本發明不依賴於特異性抗體結合序列且適用於任何半抗體組合，但本文之實例係關於針對c-met、EGFR、IL-4及IL-13之異多聚體抗體。美國專利第7,472,724號及美國專利第7,498,420號中給出抗c-met抗體之實例。美國臨時申請案61/210,562(2009年3月20日申請)、美國專利申請公開案第20080274114號(2008年11月6日公開)及美國專利第5,844,093號(1998年12月1日頒予)中給出抗EGFR抗體。美國專利第7,501,121號(2009年3月10日頒予)、美國專利第7,615,213號(2009年11月10日頒予)、WO 2006/085938(2006年8月17日公開)、美國專利申請公開案第20,090,214,523號(2009年8月27日公開)及美國專利第7,674,459號(2010年3月9日頒予)中描述抗IL-13抗體之實例。美國專利申請公開案第US 20080241160號(2008年10月2日公開)及美國專利第6,358,509號(2002年3月19日頒予)中描述抗IL-4抗體之實例。
各半抗體具有經工程改造於重鏈中之杵(突起)或臼(空腔)，如美國專利第7,642,228號中所述。簡言之，首先產生CH3杵突變體。隨後藉由隨機化接近搭配物CH3域上之杵的殘基366、368及407產生CH3臼突變體之庫。在以下實例中，在IgG1骨架中，杵突變為T366W，且臼具有突變T366S、L368A及Y407V。熟習此項技術者容易確定其他免疫球蛋白同型中之同等突變。此外，熟習此項技術者應易瞭解，用於雙特異性抗體之兩個半抗體較佳為相同同型。可使用不同同型之半抗體，但可能需要其他突變。
儘管此實例中所述之載體係用於抗c-Met或抗EGFR半抗體，但熟習此項技術者應易瞭解質體中可編碼任何抗體。本文所用之所有構築體的起始質體為先前所述之抗組織因子各別順反子質體paTF50，其中重鏈之相對TIR為1且輕鏈之相對TIR為1(Simmons等人，2002,J. Immunol Methods,263:133-147及美國專利第6,979,556號)。相對TIR強度增加用於提高此等半抗體之表現力價。
實例2 使用各別細胞培養物製造異多聚體蛋白質
以下實例展示當表現單體組分之細胞在各別培養物中生長時異多聚體蛋白質之製造。在此方法中，細胞在各別培養物中生長且誘導其表現半抗體。在一方法中，可在蛋白質純化之前組合宿主細胞培養物。在另一方法中，可首先純化組分，隨後組合形成異多聚體蛋白質。
在兩種方法中，將編碼第一含鉸鏈多肽(例如半抗體(杵))之核酸引入第一宿主細胞中，且將編碼第二含鉸鏈多肽(例如半抗體(臼))之核酸引入第二宿主細胞中。儘管此實例說明BsAb之形成，但熟習此項技術者應易瞭解所述方法適用於包含鉸鏈區之任何異多聚體蛋白質(例如親和抗體等)。
方法#1-在各別培養物中獨立製造杵半抗體及臼半抗體，各別純化該等半抗體，混合且氧化還原形成完整BsAb
藉由使用實例1中所述之構築體在細菌宿主細胞(例如大腸桿菌)中表現重鏈及輕鏈而在各別培養物中產生含有杵或臼突變之半抗體。參見圖3B及4A。在此方法#1中，杵半抗體為抗EGFR且臼半抗體為抗c-met。將實例1之表現質體引入大腸桿菌宿主菌株33D3(Ridgway等人，Cancer Res,59(11)：2718(1999))或64B4(W3110 △fhuA △phoA ilvG+ △prc spr43H1 △degP △manA lacI q △ompT)中，且於含羧苄西林(carbenicillin)之LB平板上選擇轉型體。隨後使用轉型體接種含羧苄西林之LB起始培養物，且使其在30℃下在震盪下生長隔夜。用含羧苄西林之磷酸鹽限制培養基C.R.A.P.(Simmons等人，2002,J.Immunol Methods,263：133-147)稀釋起始培養物100倍，且使其在30℃下在震盪下生長24小時。將培養物離心，且冷凍細胞小球，直至開始抗體純化。使小球解凍，且再懸浮於含有25 mM經鹽酸調節至pH 7.5之Tris鹼、125 mM NaCl及5 mM EDTA的提取緩衝液(TEB或Tris提取緩衝液)(其中體積與重量比為每5公克細胞小球100 mL TEB)中，且藉由使用微流化技術，使再懸浮混合物三次通過Microfluidics Corporation 110F型微流化機(Newton,MA)破壞細胞來提取。隨後藉由在15,000×g下離心20分鐘來淨化細菌細胞提取物，且收集上清液並經由0.22微米乙酸酯過濾器過濾，隨後進行純化。
分別藉由蛋白A捕捉，繼而陽離子交換層析來純化各半抗體。將杵半抗體之經淨化細胞提取物以2 mL/min負載於1 mL來自GE Healthcare(Pistcataway,NJ)之HiTrap MabSelect SURE管柱上。負載之後，用10管柱體積(CV)40 mM檸檬酸鈉(pH 6.0)、125 mM氯化鈉及5 mM EDTA，繼而5管柱體積20 mM檸檬酸鈉(pH 6.0)洗滌管柱，以促進陽離子交換管柱捕捉。用10管柱體積(CV)0.2 mM乙酸(pH 2-3)溶離親和力捕捉之半抗體，且直接捕捉於1 mL來自GE Healthcare之HiTrap SP-HP強陽離子交換管柱上。用10 CV含25 mM 2-(N-嗎啉基)乙烷磺酸(MES)(pH 5.8)之緩衝液A洗滌管柱。用0-50%緩衝液B(25 mM MES(pH 5.8)及1 M氯化鈉(NaCl))之線性梯度溶離半抗體。兩種蛋白質均在20%-40% B之間溶離，且藉由280 nm下之UV吸光度及藉由非還原性SDS-PAGE分析所收集之溶離份而確定的溶離峰分別作為杵或臼半抗體彙集。兩種蛋白質一般展現主溶離峰，且含有經氧化連接於彼此之重鏈及輕鏈物質的所有溶離份均包括於彙集物中。藉由還原性及非還原性SDS-PAGE對經純化半抗體之分析展示於圖4B中。結果表明，大多數所表現且捕捉之蛋白質的大小為75 kD。藉由圖4C中所示之ESI-TOF質譜分析證實此。半抗體之質量為預期質量，表明任何半胱胺酸(包括鉸鏈區中之兩個半胱胺酸殘基)上均不存在二硫基加合物。為判定鉸鏈半胱胺酸是否經還原而展現反應性游離硫氫基，使蛋白質在中性pH值下與1 mM N-乙基順丁烯二醯亞胺(NEM)反應1小時，隨後藉由質譜分析進行分析。蛋白質之質量不變，表明鉸鏈半胱胺酸很可能以鏈內二硫基(例如環狀二硫基)之形式經氧化連接於彼此。為使用此兩個半抗體(杵及臼)組裝完整雙特異性抗體，需要首先還原鉸鏈區之鏈內二硫基以釋放半胱胺酸游離硫氫基，以使其可隨後經氧化連接於另一重鏈而形成150 kD雙特異性抗體。
為實現兩個形成完整雙特異性分子之互補半抗體之退火、還原及再氧化，研發出以下程序。獨立分離之後，在程序(圖5A中所示)之彙集步驟中將經純化蛋白質以等質量合併在一起，藉由添加1/10體積之1 M Tris(pH 7.5)調節彙集物之pH值至7.5，且在室溫下用0.5 mM Tris[2-羧基乙基]膦(TCEP)還原蛋白質。還原2小時之後，使用5 mL Zeba去鹽離心管柱(Pierce,Rockford,IL)將所彙集之蛋白質緩衝液更換成25 mM Tris(pH 7.5)及125 mM NaCl，得到約4 mL體積之濃度為1 mg/mL之蛋白質。隨後藉由加熱混合物至52℃，維持25分鐘，繼而冷卻至室溫(約20℃)，使蛋白質退火。使用10 kD MW截留離心濃縮器將經退火之抗體濃縮至0.5 mL體積之濃度為約8 mg/mL之蛋白質，且藉由向反應混合物添加300微莫耳濃度來自100 mM DHAA溶解於二甲亞碸中之儲備溶液的去氫抗壞血酸(DHAA)來氧化。添加用於氧化之DHAA之量約10倍過量於蛋白質莫耳濃度。在室溫下氧化隔夜之後，將經氧化物質於S-200凝膠過濾管柱(22 mL S200 Tricorn，來自GE Healthcare)上於含25 mM MES(pH 6.0)及300 mM NaCl之緩衝液中操作。彙集完整抗體且用水稀釋10倍。隨後藉由弱陽離子交換層析，使用羧甲基(CM)樹脂(1 mL HiTrap CM-FF，GE Healthcare)，用4.5至9.2之pH梯度溶離來純化BsAb蛋白質。緩衝液A及B組合物由20 mM檸檬酸鈉、30 mM MES、20 mM HEPES、20 mM咪唑、20 mM Tris、20 mM CAPS及25 mM NaCl組成，其中A緩衝液用HCl調節至pH 4.2，且B緩衝液使用NaOH調節至pH 9.2(或10.4)。藉由質譜分析來分析在CM層析之後獲得之經純化物質，以確定精確分子組成(圖4D)。質譜分析表明，唯一可偵測完整抗體產物之MW為146,051.89，其與理論MW為145,051.75之異二聚體杵-臼物質抗EGFR/抗c-met幾乎完全匹配。以約2 mg杵及2 mg臼開始之此程序的產量為約0.5-1 mg。
為大規模製造抗體以供活體內實驗(諸如測定於非人類靈長類動物中之藥物動力學特性)，需要100 mg至公克規模數量之抗體。如圖5A中所示，研發出針對各半抗體使用各別獨立培養物之程序以製造此等數量之完整雙特異性抗體。為進行此等製備，需要10公升醱酵以產生具有足夠數量抗體之細胞小球或全培養液(Simmons等人，2002. J. Immunol. Methods,263:133-147及美國專利第6,979,556號)。在實驗過程中，細胞小球或細菌全培養液用於含有所表現半抗體之生物質。在一些情況下，大部分抗體漏至培養基中，其中全培養液提供較高產量。對於細胞小球，將物質再懸浮於含有25 mM Tris(pH 7.5)、5 mM EDTA及125 mM NaCl之提取緩衝液中，且藉由使用來自Microfluidics(Newton,MA)之HC80003A型微流化機進行微流化來溶解。全培養液無需添加添加劑即可直接微流化。在兩種情況下，使物質通過儀器三次。在此實例中，製備500 mg兩種形式之靶向細胞激素介白素-4(杵)及介白素-13(臼)之雙特異性抗體。
第一形式之雙特異性抗體含有人類IgG1a Fc，其僅具有杵及臼突變，而第二形式含有進一步修飾之Fc，其具有兩種突變T307Q及N434A，該等突變使得其對新生兒Fc受體(FcRn)具有更大親和力。預期第二形式賦予抗體較慢之清除率及較長之半衰期。兩種形式之Fc(前者為WT-Fc，後者為FcRn變異體)的臼抗體(靶向IL-4)與杵抗體(靶向IL-13)分別以10公升醱酵生長，且將含有生長培養基及細菌細胞之全培養液均質化且獨立純化。全培養液微流化之後，用相同體積之0.4%聚伸乙基亞胺(PEI)(pH 9.0)處理提取物以製備供離心淨化用之提取物。在室溫下攪拌混合物3小時或在4℃下隔夜。PEI造成提取物大量沈澱，藉由在15,000×g下離心45分鐘淨化。隨後藉由0.22微米過濾器過濾上清液，接著負載於100 mL Mab Select SURE蛋白A捕捉管柱上。以20 ml/min負載提取物，且用40 mM檸檬酸鈉(pH 6.0)及100 mM NaCl洗滌，直至280下之UV吸光度達到穩定基線，一般為約10管柱體積(CV)。將洗滌緩衝液更換為20 mM檸檬酸鈉(pH 6.0)且用約2 CV洗滌。使用0.2 M乙酸溶離捕捉之半抗體。藉由蛋白A分離之後，藉由陽離子交換層析使用S-FF樹脂(GE Healthcare)或凝膠過濾層析使用S200樹脂(GE Healthcare)移除雜質及凝集物來純化抗體。如圖5B所示，經純化半抗體大部分為約75 kD之物質。第二分離步驟之後，將500 mg 1 mg/mL濃度之各半抗體彙集在一起且使用1 M Tris(pH 7.5)調節pH值至7.5。於培育箱中加熱混合物至37℃，且藉由凝膠過濾監視150 kD抗體物質之出現。2小時後，完成退火，展示完全轉化為二聚150 kD物質，且混合物冷卻至室溫。藉由在24℃下經2小時添加2 mM DTT來還原蛋白質，隨後使用10 kD截留離心過濾器濃縮至20 mg/mL。藉由於僅含25 mM Tris(8.0)之緩衝液中透析隔夜來氧化經濃縮之溶液。隨後分析經氧化物質之純度及凝集情況。藉由質譜分析確定完整抗體物質為完整的完全氧化之異二聚體雙特異性分子，然而，凝膠過濾及SDS-PAGE分析表明存在大量凝集物，其中一些顯然為二硫基連接之多聚體之結果(資料未示)。為進一步純化雙特異性抗體以供活體內實驗，經S-200凝膠過濾管柱於Tris(pH 7.5)及125 mM NaCl中分離抗體。經純化物質展現歸因於移除所引入之凝集物的超過30%之物質損失。對於製備之最後階段，將蛋白質黏著於陽離子交換管柱，用含0.1%TX114之50 mM乙酸鈉(pH 5.0)洗滌以移除污染性內毒素，且用含50 mM Tris(pH 8.0)之高pH值緩衝液溶離。隨後藉由於適於活體內實驗之緩衝液中透析來調配經溶離蛋白質，且儲存在4℃下。藉由SDS-PAGE、質譜分析、測定污染性內毒素含量之LAL檢定及凝膠過濾分析來分析由WT-Fc及FcRn變異體組成之最終物質。SDS-PAGE之結果展示於圖5C中，且表明主要物質為150 kD之完整雙特異性抗體。圖6A展示測試細胞激素IL-4及IL-13之中和的TF-2細胞增殖檢定中抗體之生物活性。對於該檢定，使用起始濃度為25 μg/ml之抗IL-4/IL-13雙特異性抗體、抗IL-4及抗IL-13抗體，且於96孔培養板(Falcon，目錄號353072)中用檢定培養基(無rhGM-CSF之培養基)或含有0.4 ng/ml人類IL-4(R&D Systems，目錄號204-IL)以及20 ng/ml人類IL-13(Genentech Inc.)之檢定培養基連續稀釋10倍至0.025 pg/ml之最終濃度，最終體積為每孔50 μl。在37℃下預培育經稀釋抗體30分鐘。
預培育之後，用檢定培養基洗滌於RPMI 1640(Genentech,Inc.)、10%胎牛血清(HyClone，目錄號SH300071.03)、2 mM L-麩醯胺酸、100單位/毫升青黴素(Penicillin)、100 μg/mL鏈黴素(Streptomycin)(Gibco，目錄號10378)及2 ng/mL rhGM-CSF(R&D Systems，目錄號215-GM)中培養之TF-1細胞2次，且再懸浮於檢定培養基中，獲得每毫升2×105個細胞之最終濃度。將50 μl細胞添加至含有經稀釋抗體、加有IL-4及IL-13細胞激素之檢定培養基(最大增殖對照組)或單獨檢定培養基(本底對照組)的各孔中。所有樣品均一式兩份接種。在37℃、5% CO2下培育板4天。在最後4小時培育期間，將1 μCi 3H胸苷(Perkin Elmer，目錄號NET027005MC)添加至各孔中。使用Packard Filtermate將培養板收集於Unifilter-96 GF/C(Perkin Elmer，目錄號6005174)上，使用TopCount NXT(Perkin Elmer)量測3H胸苷併入。使用KaleidaGraph將數據繪製成曲線。結果表明，在中和IL-4及IL-13活性方面，WT抗IL-4/抗IL-13雙特異性抗體與IL-4與IL-13之IgG抗體組合同等有效。
隨後測試兩種抗體(WT抗IL-4/抗IL-13及FcRn變異體抗IL-4/抗IL-13)於石蟹獼猴(cynomologous monkey)中之藥物動力學(PK)特性。使用單次劑量注射，藉由靜脈內注射投與於20 mM組胺酸-乙酸鹽(pH 5.5)、240 mM蔗糖及0.02% Tween 20中調配之10.8 mg/mL及1 mg/mL WT分子，以及於20 mM磷酸鈉(pH 7.5)、240 mM蔗糖及0.02% Tween 20中調配之10.5 mg/mL FcRn變異體。對於兩種WT濃度，劑量為20 mg/kg及2 mg/kg，且對於FcRn變異體，劑量為20 mg/kg。經42天之時程，自注射該三種治療之兩隻雌猴及兩隻雄猴週期性採集血清樣品。藉由ELISA檢定血清樣品中之完整雙特異性抗體，其中將IL-4或IL-13之一種抗原塗佈於培養板上，且隨後自血清捕捉抗體。藉由用第二生物素標記配位體IL-13或IL-4(任何一個未塗佈於培養板上之配位體)及酶偶合之抗生蛋白鏈菌素偵測來測定存在的本發明之所捕捉雙特異性抗體之量。圖6B之結果展示三個樣品之預期二室清除。兩種不同形式之抗體相較於源自CHO產生宿主且含有Fc糖基化之兩種其他抗體(阿瓦斯汀(Avastin)及赫賽汀(Herceptin))的PK特性展示於表2中。顯然，大腸桿菌產生之雙特異性抗體類似於標準方法之源自CHO之抗體，且FcRn變異體具有較長半衰期。
方法#2-在不添加還原劑下，於各別(亦即獨立)培養物中製造杵半抗體及臼半抗體，混合全培養液，接著純化半抗體且溶解，形成完整BsAb
此方法嘗試藉由同時純化杵與臼半抗體來減少製程中之步驟數目。因此，混合醱酵液，隨後粒化及再懸浮於提取緩衝液中。認為在細胞膜破壞之後各宿主細胞將釋放其所表現之鉸鏈區內含有環狀二硫基之半抗體至提取緩衝液中。隨後，可同時進行兩種半抗體之純化，繼而進行氧化還原-退火步驟以形成完整BsAb。意外地發現杵-臼抗體獨自異二聚且氧化，形成全長抗體(約150 kD)，該全長抗體超過完整抗體與半抗體(約75 kD)合併總數之20%(參見表3)。
使用前述方法#1中所述之製程，使表現杵半抗體及臼半抗體之宿主細胞生長於各別培養物中且誘導。將各培養物之全細胞醱酵液與另一培養物之全細胞醱酵液以三種不同體積比混合，隨後離心形成單細胞小球。將全細胞醱酵液以1:1、2:1或1:2之(抗c-met):(抗EGFR)比率混合在一起以使最終體積為500 mL，意欲匹配兩種抗體以相對同等之豐度回收，且瞭解，在相同條件下抗EGFR半抗體類似於cMet抗體表現。將各細胞小球再懸浮於提取緩衝液中且溶解。提取蛋白質且藉由蛋白A層析繼而陽離子交換層析來純化，如實例2方法1中所述。提取緩衝液含有25 mM Tris(pH 7.5)、125 mM NaCl及5 mM EDTA。在分別純化時，各杵半抗體及臼半抗體在鉸鏈區內形成環狀二硫基，亦即鏈內二硫基，從而防止杵與臼重鏈共價締合。然而，發現當在共培養之後或在混合全醱酵液之後且在離心之前第一及第二宿主細胞在一起溶解時，存在一定程度之完整抗體物質組裝。圖7展示三種比率下觀察到之完整抗體物質。此表明對程序之修改可能引起自發性形成完整雙特異性抗體，此實質上可排除對其他化學步驟之需要。
藉由用SDS-PAGE使用Novex 4-20% Tris-甘胺酸凝膠(Invitrogen,Carlsbad CA)分離5微克蛋白質來定量兩種蛋白質物質。電泳之後，使用含有150 mM硫酸銨、1.74 M乙酸、10%甲醇及0.4 g/L庫馬斯染料(Coomassie Dye)R250於水中之膠態庫馬斯染色劑(Coomassie stain)對凝膠染色。用10%乙酸水溶液將凝膠脫色，隨後於Gel-Dry乾燥溶液(Invitrogen)中平衡且在兩片塞璐芬(cellophane)之間乾燥。凝膠乾燥之後，藉由Odyssey IR成像系統(LI-COR Biosciences,Lincoln,NE)在700 nm下定量蛋白質條帶。
方法#3-在不添加還原劑下，於獨立培養物中製造杵半抗體及臼半抗體，獨立離心，混合小球且再懸浮，繼而溶解，且純化BsAb。
此方法嘗試藉由同時純化杵與臼來減少製程中之步驟數目。
將細胞獨立培養且藉由離心粒化。混合小球且一起再懸浮於提取緩衝液中。咸信半抗體將在破壞細胞膜後釋放至提取緩衝液中，且將看到類似於上述方法#2之產物概況。
實例3 使用單一混合之細胞培養物製造異多聚體蛋白質
此實例說明由包含兩種宿主細胞群體之培養物形成異多聚體蛋白質，其中在該製程中不添加還原劑。
方法#4-在不添加還原劑下，於同一培養物中由不同細胞群體製造杵半抗體及臼半抗體，形成完整BsAb
首先於0.5公升搖瓶中用含有杵半抗體或臼半抗體之兩種不同大腸桿菌轉型體執行共培養實驗。對於此實驗，藉由在30℃下於含LB培養基(100 μg/ml羧苄西林)之5 mL培養物中隔夜培養產生杵(抗EGFR)半抗體與臼(抗cMet)半抗體之起始培養物。使用OD600相等之隔夜培養物以三種不同比率(抗EGFR：抗cMet：1.5:1、1:1及1:1.5)接種500 ml完全CRAP培養基(100 μg/ml羧苄西林)，保持總接種量為培養物之1/100。使細胞在30℃、200 rpm下生長24小時。隨後藉由離心(6750×g，10分鐘，4℃)將細胞粒化且用於純化。
將細胞以每10 g細胞小球100 mL之比率再懸浮於含有25 mM Tris(pH 7.5)、5 mM EDTA及125 mM NaCl之提取緩衝液中。如實例2中所述藉由微流化提取且製備用於層析之後，三種不同比率之細胞提取物藉由首先於Mab Select SURE 1 mL HiTrap管柱(GE Healthcare,S. San Francisco,CA)上捕捉雙特異性抗體來純化，且管柱洗滌緩衝液僅含有40 mM檸檬酸鈉(pH 6.0)。如實例2中所述洗滌且溶離之後，將蛋白A捕捉彙集物負載於SP-HP陽離子交換管柱上且如實例2中所述純化。藉由陽離子交換分離之後，彙集三種純化物各自之層析峰且濃縮至約50-100微升之體積，且蛋白質濃度為約15 mg/mL。初始接種比率似乎使最終完整抗體之量產生差異，且相較於在37℃下隔夜培養之後將細胞小球混合在一起時所觀察到之結果，此得到完整雙特異性抗體與較低分子量形式之較高比例。參見表4。
為判定共培養是否可擴展為10公升醱酵規模(此對於擴大程序很關鍵)，可用抗EGFR及抗cMet半抗體進行若干實驗。對於10公升醱酵，使用含有1:1抗EGFR與抗cMet細胞比之接種起始培養物。使10公升共培養物在如實例2中所述之單一半抗體培養物的相同條件下生長。亦如上所述，使用細胞小球或全培養液進行抗體物質之提取及分離。為自細胞小球提取物質，由一次10公升醱酵產生約2.5 kg糊狀物。將細胞小球再懸浮於5公升含有25 mM Tris(pH 7.5)及125 mM NaCl之緩衝液中。用polytron混合器處理小球2分鐘，隨後使小球再懸浮，接著微流化、淨化且製備以供蛋白A捕捉，如實例2中所述。再重複醱酵實驗兩次，且來自10公升醱酵罐之共培養分離之結果展示於圖8C中。使用質譜分析表徵約150 kD蛋白質及約75 kD蛋白質以確定分子組分。出乎意料地，主要的較高MW蛋白質為雙特異性抗體，且約75 kD蛋白質主要為cMet半抗體，此歸因為其差異之表現概況。此表明無需其他化學步驟即可完整形成雙特異性抗體。因為雙特異性抗體為杵與臼半抗體之1:1化學計量組合，所以僅存在75 kD蛋白質表明大部分限制性半抗體已自發地併入完整雙特異性抗體中。
由此觀察結果可開發出如圖8D中所示之簡化之表現及純化流程。蛋白A捕捉之後，用含有1.5 M硫酸銨及25 mM磷酸鈉(pH 6.5)之緩衝液1:1稀釋抗體，且負載於疏水性相互作用管柱(HIC)Dionex Pro Pac HIC-10 4.6 mm×100 mm(Sunnyvale,CA)上。梯度為30%-60% B，其中A緩衝液由25 mM磷酸鈉(pH 6.95)及1.5 M硫酸銨構成，且B緩衝液由25 mM磷酸鈉(pH 6.95)及25%異丙醇構成。用15 CV梯度分離蛋白質。蛋白質分離為兩大物質，一種含有完整雙特異性抗體，且另一種含有過量抗EGFR半抗體。層析分離之結果展示於圖8E中。彙集含有完整抗體之溶離份且藉由黏著於S-FF管柱25 mM乙酸鈉緩衝液(pH 5.0)中，用含0.1% Triton X114之相同乙酸鹽緩衝液洗滌，隨後藉由用起始乙酸鹽緩衝液洗滌移除清潔劑而進行處理，以移除任何剩餘之污染性內毒素。由S-FF管柱使用25 mM Tris(pH 8.0)溶離蛋白質，彙集且藉由SDS-PAGE、質譜分析及針對內毒素之LAL檢定分析。在最終製劑中，蛋白質含有0.076 EU/mg內毒素，表明其適於活體內應用。圖8F中展示最終表徵結果。SDS-PAGE分析展示大多數蛋白質為最終完整雙特異性抗體，且質譜分析展示雙特異性抗體之預期分子量，且無任何污染性物質，尤其可能存在之均二聚體形式。圖8G中展示使用共培養之修改程序相較於需要退火及氧化還原化學之程序的比較結果。
方法#5-使用不同杵：臼比率，於同一培養物中製造杵半抗體及臼半抗體，形成完整BsAb
此實例展示使用類似表現構築體(不同之處僅為欲表現之半抗體)之宿主細胞不會生長超過彼此，且可產生完整BsAb。
實驗證實控制任一鏈之比率易於藉由在擴增及表現之前調節接種比率而進行。兩種菌株不會生長超過彼此。
為判定接種比率在共培養物之醱酵期間是否保持，進行實驗以測定含不同細胞比率之共培養物24小時醱酵結束時所存在的杵或臼重鏈之量。具有杵(抗EGFR)或臼(抗c-Met)質體之細胞分別在30℃下於LB培養基(100 μg/ml羧苄西林)中生長隔夜。使用含不同比率之隔夜培養物的起始培養物接種完全CRAP培養基(100 μg/ml羧苄西林)，保持合併之接種體積為最終培養物之1:100。測試之抗EGFR：抗c-Met之比率為10:1、5:1、2:1、1:1、1:2、1:5及1:10。在30℃下培養24小時之後，獲得細胞樣品，且藉由非還原性SDS-PAGE(12% Tris甘胺酸)，繼而西方墨點法用山羊抗人類IgG-Fc抗體HRP結合物(Bethyl Laboratories,Inc.,Montgomery,TX)來分析。兩種物質之重鏈藉由SDS-PAGE解析且結果展示於圖8B中。各半抗體之量與共培養物之接種比率相關，表明具有編碼不同半抗體之質體的細胞在共培養物中不會生長超過彼此。
方法#6-於同一培養物中製造杵半抗體及臼半抗體，形成完整BsAb-膜滲透
此實例展示膜滲透使半抗體釋放至培養基中，且隨後無需其他化學作用(例如氧化還原或偶合)即可形成完整BsAb。
已知導致脂蛋白合成喪失之突變可改變大腸桿菌之細胞膜，使周質蛋白質漏至培養基中，且亦使大腸桿菌對EDTA高度敏感(Hirota,Y.等人，PNAS 74:1417-1420(1977))。比較在添加及不添加EDTA之情況下所表現之抗體自菌株65G4(W3110 ΔfhuA ΔphoA ilvG+ Δprc spr43H1 ΔdegP ΔmanA lacI q ΔompT Δlpp)的釋放。如方法#4中所述，以1:1比率共培養表現α-IL-4(臼)或α-IL-13(杵)之細胞，且在30℃下在200 rpm下於培育震盪器中生長20小時。在培育結束時，將培養物分成三等份。一個樣品充當對照組，其中不添加EDTA。向其他兩個樣品中添加EDTA(pH 8.0)至10 mM最終濃度。所有樣品繼續培育30分鐘，之後向EDTA處理樣品之一中添加MgCl2至20 mM最終濃度。再於培育震盪器中培育所有樣品30分鐘，隨後藉由離心(9200×g，20分鐘，4℃)移除細胞，且經由GF/F過濾器(Whatman,Piscataway,NJ)及0.2 μm PES過濾器(Nalgene,Rochester,NY)過濾上清液。可添加牛胰臟DNA酶I(Sigma,St. Louis,MO)至4 mg/l來改良過濾。
隨後如先前所述直接將經過濾之上清液負載於1 mL蛋白A MabSelect SURE HiTrap管柱(GE Healthcare)上。如上所述用乙酸溶離所捕捉之蛋白質，且圖9A中可見蛋白質之峰回收。結果展示在EDTA處理樣品中整個UV吸光度提高。此吸光度為完整雙特異性抗體及過量半抗體。參見圖9B及9C。
在各別實驗中，分別表現或以65G4細胞之1:1共培養物之形式表現抗IL-4及抗IL-13半抗體。如上所述(方法#4)培養細胞，其中例外為向完全CRAP培養基補充聚矽氧消泡劑(Fluka,Buchs,Switzerland)至0.02%(v/v)。在30℃及200 rpm下於培育震盪器中培養細胞24小時之後，添加EDTA(pH 8.0)至10 mM最終濃度且繼續培育1小時，隨後添加MgCl2至20 mM。藉由離心(6750×g，10分鐘，4℃)收集細胞，過濾(0.2 μ PES,Nalgene,Rochester,NY)上清液，且如上所述藉由蛋白A捕捉抗體，且藉由SDS-PAGE及質譜分析來分析。圖9D所示之結果表明僅在雙特異性抗體之兩種半抗體存在下觀察到完整雙特異性抗體形成。另外，大部分抗IL-13抗體併入雙特異性抗體中而無任何其他氧化還原化學，因為質譜分析表明75 kD蛋白質條帶主要為抗IL-4半抗體。用硫酸銨緩衝液1:1稀釋經蛋白A純化之雙特異性抗體，且使用與實例3中所述相同之程序用7.5 mm×150 mm ProPac HIC-10管柱(Dionex,Sunnyvale,CA)進一步純化。發現完整雙特異性抗體在99.68之滯留時間時溶離。彙集此峰，且藉由SDS-PAGE在非還原性條件下分析，且發現幾乎完全由完整抗體物質構成。為證實此蛋白質為純異二聚體雙特異性分子，藉由ESI-TOF LC/MS分析該蛋白質。將約10微克雙特異性抗體注射於PLRP-S 300 A 3微米50×2.1 mm逆相管柱(Polymer Laboratories)上，且藉由4.3分鐘34%-45% 0.05% TFA及乙腈之梯度，使用Agilent 1200系列HPLC及0.5 mL/min之流速及80℃下之管柱加熱器分離。藉由Agilent 6210 TOF分析自LC溶離之蛋白質。觀察到含單峰之蛋白質，且使用Agilent Mass Hunter軟體B.02.00版，使用50,000-160,000之質量範圍、1.0 Da步長、30.0 S/N臨限值、90之平均質量、未限制之質量範圍及設定為自動之同位素寬度對此峰反卷積。大部分信號呈現出雙特異性分子之預期質量。由胺基酸序列計算出之完整異二聚體雙特異性抗體之質量為144,044，其在量測質量之1-2道爾頓範圍內，而可能之均二聚體蛋白質之計算質量對於抗IL-4為144,954.6且對於抗IL-13為145,133.4。
測試不同接種比率在此組抗體以及65G4缺失lpp之情形下培養期間是否會再次持續。使用OD600相等之含有抗IL-4(臼)或抗IL-13(knob)的種子培養物以2:1及1:2之比率接種500 ml CRAP培養基，培養且在醱酵結束時滲透，如先前所述(參見方法#6)。如上所述，藉由蛋白A捕捉，繼而HIC分離來純化兩種不同培養基製劑，其中例外為HIC A及B緩衝液之pH值降至6.5。兩種不同起始培養物比率之結果展示於圖9E中。觀察到大部分蛋白質為完整雙特異性抗體。其他峰藉由質譜分析表徵且在圖9E上標記。偵測到極少抗IL-13半抗體，且可見大量抗IL-4。在抗IL-4與抗IL-13之比率為33/66時，觀察到較多抗IL-13，且剩餘少量抗IL-4。此處可見，在培養期間可維持接種比率，且製程之最佳化可藉由經由操縱起始培養物比率，平衡所表現之半抗體之比率來達成。
繼續用多種不同抗體變異體測試Δlpp細胞中之此共培養表現過程。圖9F展示在數種例示性半抗體HIC層析後進行調配之後，最終經純化之蛋白質。
實例4 異多聚體蛋白質庫
此實例說明異多聚體蛋白質庫之構築。
可使用某些方法篩選雙特異性抗體之混合物或利用所述方法快速產生大量雙特異性抗體。
方法#7
在一些情況下，所選雙特異性抗體未知，但可為多種不同半抗體組合之結果。或者，可能需要特異性標靶組合，例如抗IL-4/抗IL-13，但可選自多種候選半抗體。發現產生最佳結合或功效之特異性半抗體組合可藉由以矩陣格式組合半抗體來實現，從而可快速產生多種雙特異性抗體變異體。對於此實驗，可以超過需要篩選之抗體之量約10倍(或10倍以上)製造一種抗體(諸如抗CD3)。此分子可隨後使用實例#1中所述之程序退火及氧化。如圖10所繪，可使用約1/10總量之第一抗體與等量之約10個靶向不同抗原之半抗體(諸如抗CD19、抗CD20等)組合。若需要另一第一半抗體與第二半抗體譜系組合，則此可進行以產生一組篩選分子。
在該方法之第二修改形式中，第一抗體(諸如抗CD3)可以使用「正常」大腸桿菌宿主細胞或具有非功能性脂蛋白表型之突變株的共培養物形式生長。此半抗體可隨後系統地添加至各可變半抗體中，得到一系列雙特異性分子，均含有第一靶向半抗體。
方法#8
第一半抗體可與大量替代性搭配半抗體以由製造足夠數量之此半抗體以與欲組合之所有其他抗體半抗體組合組成之方式組合。可隨後在單一反應中執行整體退火，使得第一半抗體為杵或臼型之重鏈，且第二靶向半抗體組為互補突變體。在此情形下，可製造抗體之複合混合物，其可組合用於治療疾病。
或者，可使用利用上述實例中所述之方法的共培養方法來製造含一組第一半抗體及可變第二半抗體之雙特異性抗體之複合混合物。該混合物可隨後成批分離且用作篩選物質，使得雙特異性變異體彙集物中之陽性結果可隨後反卷積以確定活性雙特異性抗體物質，或組合之混合物可用作更有效之治療性混合物。
實例5 活體外活性
此實例說明本文所述之雙特異性抗體在活體外系統中具有活性。兩種細胞株用於此實例5及以下實例6中。在此等實驗中，KP4(胰臟導管癌細胞株)與A431(表皮樣癌細胞株)均分別由Met或EGFR強力驅動，因此此等細胞株為獨立探查bsAb針對各標靶之功效的優良細胞株及腫瘤異種移植物。
KP4細胞株獲自理研生物資源中心細胞庫(Riken BioResource Center Cell Bank)(細胞株編號：RCB1005；3-1-1 Koyadai,Tuskuba-shi,Ibaraki 305-0074 Japan)。A431細胞株(CRL-1555)獲自美國菌種保存中心(ATCC,Manassas,VA)。
用PBS洗滌癌細胞A431一次，再懸浮於無血清培養基中，計數，隨後添加至96孔板中(每孔2500個細胞)。隨後用人類HGF(0.5 nM)及TGFα(0.05 nM)單獨處理細胞或連同一定劑量範圍之以下處理：(1)抗EGFR、(2)抗c-met抗體(「一臂」c-met)、(3)抗EGFR與抗c-met抗體之組合或(4)雙特異性抗EGFR/抗c-met抗體。根據製造商之建議執行三天AlamarBlueTM檢定(BioSource International;Camarillo,CA)。藉由非線性回歸分析用四參數模型(KaleidaGraph 3.6版，Synergy Software；Reading,PA)測定IC50值。
在活體外及活體內具有Met依賴性之KP4細胞檢定中，藉由用TGF-α及HGF處理刺激之生長可由抗c-met抗體、抗c-met抗體與抗EGFR之組合及雙特異性抗體抑制。用抗EGFR處理展示單一藥劑在此等細胞中之活性有限。然而，雙特異性抗體在KP4細胞中達成之抑制比單獨抗c-met或分別添加之抗c-met加上抗EGFR Ab有效。在主要由EGFR驅動之A431細胞中，單獨抗EGFR抗體與單獨抗c-met抗體均不能顯著抑制細胞增殖。兩種分子之組合展示對細胞增殖之一定程度之抑制，然而，相同濃度下之雙特異性抗體展現更高活性。除抗增殖以外，細胞亦展現出細胞凋亡。
在此等檢定中，雙特異性抗體展示相對於單獨其他抗體或分別添加之抗Met與抗EGFR抗體組合改良之效能。此等資料表明，抗Met抗體與抗EGFR抗體一起於一個抗體上之配置使得雙特異性抗體優良。結果展示於圖11中。
實例6 活體內活性
此實例證實本文所述之雙特異性抗體在活體內模型中具有活性。
自Charles River Laboratories,Inc.(Hollister,CA)獲得6-8週齡且重22-30 g之雌性裸小鼠。將小鼠置於Genentech標準齧齒動物微型隔離籠中，且使其適應研究條件至少3天，隨後植入腫瘤細胞。僅看似健康且無明顯異常之動物用於研究。所有實驗程序均遵循美國生理學協會(American Physiology Society)之指導性原則，且經Genentech的實驗動物護理及使用委員會(Institutional Animal Care and Use Committee)批准。用人類KP4胰臟癌細胞(每隻小鼠用含5百萬個細胞之漢克氏平衡鹽溶液(Hank's Balanced Salt Solution，HBSS)加基質膠(BD Biosciences))或人類A431表皮樣癌細胞(每隻小鼠用含5百萬個細胞之HBSS加基質膠)皮下注射小鼠。當腫瘤達約150 mm3時，將小鼠隨機化且用媒劑或雙特異性EGFR/c-met(bsEGFR/c-met)(50 mg/kg，腹膜內，每週1次)處理2週。
使用Ultra Cal-IV測徑規(54-10-111型；Fred V. Fowler Co.;Newton,MA)以兩個尺寸(長度及寬度)量測腫瘤體積，且使用Excel 11.2版(Microsoft Corporation;Redmond WA)分析。使用KaleidaGraph 3.6版(Synergy Software; Reading,PA)繪製腫瘤抑制曲線。腫瘤體積用下式計算：
腫瘤尺寸(mm3)=(較長量測值×較短量測值2)×0.5。
資料藉由下述混合模型化方法分析。此處，不計算嚴格平均偏差及標準偏差。使用信賴區間而非提供標準偏差來說明可變性。信賴區間在表格中緊靠每天AUC(% TGI)以括號中上限及下限形式報導。使用Adventura Pro AV812天平(Ohaus Corporation;Pine Brook,NJ)量測動物體重。使用KaleidaGraph 3.6版產生圖。使用下式計算重量變化%：組重量變化%=(新重量-初始重量)/初始重量×100。
為適當地分析同一動物之腫瘤體積隨時間之重複量測，使用混合模型化方法(Pinheiro等人，Linear and Nonlinear Mixed Effects Models.(2008) R套裝3.1-89版)。此方法解決了重複量測與歸因於研究結束之前任何非處理相關動物死亡之適度中途退出的問題。
使用三次回歸樣條擬合各劑量下log2腫瘤體積對時程之非線性曲線。此等非線性曲線隨後與混合模型內之劑量相關。呈媒劑百分比形式之腫瘤生長抑制(%TGI)使用下式計算為每天各別給藥組之擬合曲線下面積(AUC)相對於媒劑組之百分比：
%TGI=100×(1-AUC給藥/AUC媒劑)。
為確定%TGI之不定區間(UI)，使用擬合曲線及擬合協方差矩陣產生近似%TGI分佈之隨機樣本。隨機樣本由擬合-混合模型之1000個模擬實現構成，其中針對各次實現，再計算%TGI。報導之UI為95%時間下%TGI之再計算值落在給定擬合模型下之此區域中的值。使用模擬分佈之2.5及97.5百分位數作為上限及下限UI。
繪製曲線且使用R 2.8.1版(R Development Core Team 2008;R Foundation for Statistical Computing;Vienna,Austria)及Excel 12.0.1版(Microsoft Corporation)產生。使用R 2.8.1版分析資料，且在R內使用nlme套裝3.1-89版(Pinheiro等人，2008)擬合混合模型。
圖12及13分別展示抗EGFR/c-met雙特異性抗體在KP4胰臟異種移植模型及A431表皮樣癌異種移植模型中之活體內活性。相較於僅接受媒劑作為處理之對照動物，雙特異性抗體能夠抑制兩種模型的活體內腫瘤生長。該等圖表明腫瘤體積因投與雙特異性抗體而減小，其中線性混合效應(Linear Mixed Effect，LME)擬合之腫瘤體積在KP4異種移植物中在處理後20天時為505 mm3，相較之下僅接受媒劑組為1710 mm3，且在A431異種移植物中在20天後為328 mm3，相較之下僅接受媒劑對照組為495 mm3。整體而言，以%TGI表示之每天AUC存在顯著變化。對於雙特異性抗體處理，在KP4異種移植中存在85%腫瘤生長抑制(TGI)，且在A431異種移植模型中存在68% TGI。
實例7 使用CHO細胞培養物製造異多聚體蛋白質
此實例說明自包含兩種宿主CHO細胞群體之培養物形成異多聚體蛋白質。
在各別培養物中藉由使用此項技術中熟知之構築體及技術短暫表現重鏈及輕鏈來產生含有杵或臼突變之半抗體。(參見例如Ye等人，Biotechnol Bioeng. 2009年6月15日；103(3):542-51)。在1公升培養基(參見例如Wong等人，J. Biol. Chem. 2007 282(31):22953-22963)中培養細胞且在14天後收集。
於5 mL MabSURE SELECT管柱上捕捉各半抗體。隨後用10管柱體積(CV)平衡緩衝液、繼而10 CV檸檬酸鈉低電導緩衝液洗滌管柱(平衡緩衝液由50 mM TRIS(pH 8.0)、150 mM NaCl、0.05% Triton X-100、0.05% Triton X-114組成；低電導洗滌緩衝液由25 mM檸檬酸鈉(pH 6.0)組成)。用0.15 M乙酸鈉(pH 2.7)溶離各組。
將各半抗體以1:300之比率於50 mM TRIS(pH 8.0)、150 mM NaCl、1 mM EDTA中透析隔夜。隨後離心各組，使用0.22微米乙酸纖維素過濾器過濾且以1:1之比率將兩組混合在一起(總濃度小於2 mg/mL)。隨後以如下兩種方式之一處理該混合物：
氧化還原(有水浴)：隨後在水浴中37℃下加熱混合物。1小時後，自水浴移除氧化還原混合物且靜置，冷卻至室溫。混合物達到室溫後，添加新鮮製備之還原劑二硫蘇糖醇(DTT)，使DTT之最終濃度達2 mM。混合物置於室溫下2小時，隨後使用Amicon Ultracell離心過濾器(10K)濃縮至11 mg/mL，且於50 mM TRIS(pH 8.0)、150 mL NaCl中透析(1:300)隔夜。
氧化還原(無水浴)：混合物置於室溫下3小時，之後添加新鮮製備之還原劑二硫蘇糖醇(DTT)，使DTT之最終濃度達2 mM。混合物置於室溫下2小時，使用Amicon Ultracell離心過濾器(10K)濃縮至11 mg/mL，且於50 mM TRIS(pH 8.0)、150 mL NaCl中透析(1:300)隔夜。
氧化還原後，於15 mL HIC ProPac 10管柱上使用20 CV梯度類似於先前部分純化所組裝之物質。操作緩衝液為25 mM磷酸鉀、0.7 M硫酸銨(pH 6.5)，且溶離緩衝液為25 mM磷酸鉀(pH 6.5)、25%異丙醇。收集1 mL溶離份且藉由4%-20% Tris-甘胺酸SDS PAGE分離峰溶離份以分析純度，且相應地彙集。隨後使用Amicon Ultracell離心過濾器(10K)濃縮彙集物至約1.5 mg/mL，且於50 mM TRIS(pH 8.0)、150 mM NaCl中透析並進行0.22 μm過濾。
藉由質譜分析證實各組裝之雙特異性抗體的身分。藉由4%-20% Tris-甘胺酸SDS PAGE凝膠及生物分析儀分析純度。藉由SEC-MALS測定凝集物含量。
結果展示於圖14-19中。此實例證實雙特異性抗體可使用CHO宿主細胞製造。熟習此項技術者應認識到該方法可用於製造其他異多聚體蛋白質。
圖1A說明完全氧化之半抗體。未展示「杵」或「臼」或其他異二聚域。此圖中所描繪之半抗體為IgG1同型。熟習此項技術者應瞭解，其他免疫球蛋白同型可視為具有相應鏈間及鏈內鍵之半抗體。在完整Ab中，鉸鏈半胱胺酸將形成鏈間二硫鍵；圖1B說明全長雙特異性抗體。未描繪鉸鏈區中之重鏈間二硫鍵；圖2A及2B分別說明編碼杵及臼半抗體之質體；圖3A說明使用通用輕鏈法製造異多聚體蛋白質(例如雙特異性抗體)。所製造之BsAb具有兩條不同重鏈，各與一通用輕鏈配對；圖3B說明使用分別工程改造及表現之半抗體製造異多聚體蛋白質(例如雙特異性抗體)。所製造之BsAb通常具有兩條不同重鏈，各與其同源輕鏈配對。在此方法中，對於各半抗體，各輕鏈不必相同；圖4A為使用分別工程改造及表現之半抗體製造雙特異性抗體之流程圖。在此方法中，使用氧化還原化學；圖4B展示庫馬斯染色之凝膠。藉由SDS-PAGE在還原性及非還原性條件下分析兩種半抗體。在非還原性條件下，各半抗體之主要溶離份為75 kD輕鏈-重鏈對。在還原性條件(例如用DTT處理)下，各鏈以各別條帶可見；圖4C展示經或未經1 mM N-乙基順丁烯二醯亞胺(NEM)處理之半抗體的ESI-TOF質譜分析結果。在用NEM處理後觀察到半抗體之質量不變，表明所有半胱胺酸均完全氧化。在所描繪之胺基酸序列中，經氧化之鉸鏈半胱胺酸表示為環狀二硫基。半抗體之預期質量為72,548道爾頓，此為質譜分析所觀察到之結果，表明無共價加合物；圖4D展示關於製造抗EGFR/抗c-met雙特異性抗體之羧甲基(CM)層析圖、SDS-PAGE凝膠像片及反卷積質量。CM層析得到單峰，隨後由SDS-PAGE分析。凝膠上之主要條帶為全長(亦即完整)雙特異性抗體。在75 kD範圍亦可見次要條帶。隨後藉由質譜分析來分析主要條帶，且表明唯一可偵測之完整抗體產物與抗EGFR/抗c-met雙特異性抗體之理論MW一致；圖5A為使用分別工程改造及表現之半抗體大規模製造雙特異性抗體之流程圖；圖5B為凝膠之像片，其展示在非還原性條件下經純化之半抗體主要為約75 kD物質。在還原性條件(例如用DTT處理)下，各鏈以各別條帶可見；圖5C展示移除凝集物之後，經純化雙特異性抗體之SDS-PAGE分析結果，表明主要物質為150 kD之完整雙特異性抗體。亦展示還原性條件下之相同樣品，表明所有經分離產物為輕鏈或重鏈抗體鏈；圖6A為展示測試細胞激素IL-4及IL-13之中和的TF-2細胞增殖檢定中抗體之生物活性的圖。該圖展示雙特異性抗體具有類似於兩種哺乳動物產生之全長抗體加在一起或各別之活性；圖6B為一組三張圖，其展示野生型Fc及突變Fc之抗IL-4/抗IL-13雙特異性抗體在石蟹獼猴中之藥物動力學(PK)特性，如ELISA所測定。第一張圖展示野生型Fc在2 mg/kg劑量下之PK特性。中間一張圖展示野生型Fc又在20 mg/kg劑量下之PK特性。最後一張圖展示突變Fc在20 mg/kg劑量下之PK特性。在測試之動物中雙特異性抗體展現預期二室清除。雌性動物由閉合符號表示且雄性動物由開放符號表示。在三種動物中，如第21天血清中量測之抗體急劇減少所示，可見抗治療反應；圖7為聚丙烯醯胺凝膠之像片。以不同比率混合全醱酵液，隨後溶解。溶解之後提取蛋白質且在非還原性條件下負載於凝膠上。此程序期間所形成之經純化雙特異性抗體以凝膠頂部條帶可見；圖8A為兩種聚丙烯醯胺凝膠之像片，其比較細胞分別培養時之雙特異性抗體製造與共培養表現半抗體之細胞時之雙特異性抗體製造。在共培養條件下形成之完整雙特異性抗體含量高得多。當獨立表現半抗體且純化、隨後混合時，半抗體形成少於5%之完整雙特異性抗體。在共培養條件下，超過40%為完整雙特異性抗體，如使用Li-Core蛋白質測定由150 kD/(150 kD+75 kD)所確定；圖8B為改變初始接種之細胞群體的共培養實驗之示意圖。所用比率及全長雙特異性抗體之相對量展示於該圖之底部；圖8C為抗EGFR與抗c-Met之細胞比率為1:1的三個各別10公升醱酵操作的凝膠像片。各操作產生全長雙特異性抗體作為主產物，表明該製程之再現性；圖8D為製造異多聚體蛋白質(例如雙特異性抗體)之共培養製程之流程圖；圖8E為280nm下之UV吸光度之層析圖，其在滯留時間91.79及102.35鑑別出兩個主峰。隨後藉由質譜分析來分析，指示完整雙特異性抗體與過量半抗體有效分離；圖8F展示藉由SDS-PAGE及質譜分析來分析圖8E之峰91.79。將質譜分析資料反卷積，得到146,051.89道爾頓之單峰，其與雙特異性抗體之預期質量一致。未偵測到污染性均二聚體物質；圖8G為獨立製造與共培養製造異多聚體蛋白質之工作流程的比較；圖9A展示三個層析圖。頂部層析圖展示無EDTA之樣品溶離期間無吸收峰。中間層析圖展示含EDTA之樣品具有獨特溶離峰，由此溶離峰回收約1.5mg蛋白質。下部層析圖展示用EDTA及Mg處理之樣品亦展示類似溶離峰，由此溶離峰回收1.1mg蛋白質。在還原性及非還原性條件下藉由SDS-PAGE分析來自EDTA樣品、EDTA加Mg樣品及未處理EDTA樣品中相同滯留時間之溶離份彙集物的回收蛋白質；圖9B為圖9A中所述之SDS-PAGE凝膠之像片。用EDTA處理之樣品產生完整雙特異性抗體，其已釋放於培養基中；泳道1)具有-lpp突變之共培養物溶離36.6-37.6分鐘的彙集物，泳道2)具有-lpp突變及EDTA之共培養物溶離36.6-37.6分鐘的彙集物，泳道3)具有-lpp突變及EDTA及Mg2+之共培養物溶離36.6-37.6分鐘的彙集物；圖9C-1至9C-3展示圖9A中回收且描述之樣品的質譜分析層析圖。含EDTA之樣品展示雙特異性抗體之預期質量及過量半抗體之質量；泳道1)具有-lpp突變之IL-4/IL-13共培 養物溶離36.6-37.6分鐘的彙集物，泳道2)具有-lpp突變及EDTA之IL-4/IL-13共培養物溶離36.6-37.6分鐘的彙集物，泳道3)具有-lpp突變及EDTA及Mg2+之IL-4/IL-13共培養物溶離36.6-37.6分鐘的彙集物。
圖9D為SDS-PAGE凝膠之像片及所示條帶之質量層析圖。泳道1為MW標記物，泳道2為獨立表現之抗IL-13，泳道3為獨立表現之抗IL-4且泳道4為兩種細胞之共培養物。所有三種樣品之質譜分析均展示共培養物產生完整雙特異性抗體及一種過量半抗體-抗IL-4。此表明抗IL-13半抗體為化學計量有限的。當獨立地表現且純化半抗體、隨後混合時，半抗體形成約2%(抗IL-13)及3%(抗IL-4)完整雙特異性抗體。在共培養條件下，約60%為完整雙特異性抗體，如使用Li-Core蛋白質測定由150kD/(150kD+75kD)所確定；圖9E-1及9E-2展示如所示初始醱酵接種物中具有不同細胞比率之兩種共培養物的兩個HIC層析圖。觀察到反映初始接種物比率之產物明顯差異。使用此方法顯而易見，可改變初始接種物比率以獲得最佳製造異多聚體蛋白質；圖9F為展示在還原性及非還原性條件下由本文所述之共培養製程製造之八種不同雙特異性抗體之SDS-PAGE分析的一組四個像片。抗CD3/抗CD19異多聚體蛋白質之非還原性凝膠未展示。箭頭指示完整雙特異性抗體；圖10為篩選異多聚體蛋白質之矩陣方法的示意圖；實例：細胞毒性T細胞及腫瘤抗原標靶；圖11展示使用本文所述之方法製造之雙特異性抗體的活體外活性之兩張圖； 圖12為展示抗EGFR/抗c-met雙特異性抗體在KP4胰臟異種移植活體內模型中具有抗腫瘤活性的圖；圖13為展示抗EGFR/抗c-met雙特異性抗體在A431表皮樣癌異種移植活體內模型中具有抗腫瘤活性的圖；圖14展示A)組裝前之杵的HIC、B)組裝前之臼的HIC、C)組裝後之雙特異性抗體的HIC。圖14D為組裝前各組之凝膠；泳道1：杵，泳道2：臼，泳道3：標記12 MW標記物，泳道4：杵+20mM DTT，泳道5：臼+20mM DTT；圖15展示經組裝物質之電泳圖，其表明86%之物質完全氧化；圖16：經組裝雙特異性抗體之表徵：A)經退火雙特異性抗體之HIC層析圖表明該物質中超過90.5%為雙特異性抗體，B)經純化物質之凝膠，C)最終樣品之質譜分析反卷積，及D)理論質量表；圖16C的泳道說明：泳道1：最終物質，泳道2：標記12，泳道3：最終物質+20mM DTT；圖17為氧化還原程序(加熱)之示意圖：a)加熱樣品1小時以使二硫鍵環化，b)隨後冷卻，且使用2mM DTT還原半胱胺酸，歷時2小時，及c)隨後濃縮，且藉由在室溫下透析使半胱胺酸經空氣氧化；圖18為氧化還原程序(不加熱)之示意圖：a)混合樣品2小時，b)使用2mM DTT還原半胱胺酸，歷時2小時，及c)隨後濃縮，且藉由在室溫下透析使半胱胺酸經空氣氧化，同時移除EDTA；及圖19：分析經組裝之雙特異性抗體：A)使用具有加熱步驟之氧化還原程序之HIC層析圖，B)使用無加熱步驟之氧化還原程序之HIC層析圖。
(無元件符號說明)

Claims (64)

  1. 一種製備異多聚體蛋白質之方法，該異多聚體蛋白質包含第一抗體重鏈及第二抗體重鏈，其中該第一抗體重鏈與該第二抗體重鏈由至少一個在鉸鏈區之間的鏈間二硫鍵連接，該方法包含以下步驟：(a)包含編碼該第一抗體重鏈之第一核酸的第一宿主細胞在表現該第一抗體重鏈之條件下培養；(b)包含編碼該第二抗體重鏈之第二核酸的第二宿主細胞在表現該第二抗體重鏈之條件下培養；及(c)將該第一宿主細胞與該第二宿主細胞組合，以產生包含該第一宿主細胞與該第二宿主細胞的組合培養物；(d)破壞該第一宿主細胞及該第二宿主細胞之細胞膜，使第一抗體重鏈與第二抗體重鏈自宿主細胞釋出以形成該異多聚體蛋白質，其中該異多聚體蛋白質在該組合培養物中形成。
  2. 一種製備異多聚體蛋白質之方法，該異多聚體蛋白質包含第一抗體重鏈及第二抗體重鏈，且其中該第一抗體重鏈與該第二抗體重鏈由至少一個在鉸鏈區之間的鏈間二硫鍵連接，該方法包含以下步驟：(a)包含編碼該第一抗體重鏈之第一核酸的第一宿主細胞在表現及分泌該第一抗體重鏈之條件下培養；(b)包含編碼該第二抗體重鏈之第二核酸的第二宿主細胞在表現及分泌該第二抗體重鏈之條件下培養；及 (c)將該第一宿主細胞與該第二宿主細胞的培養物組合，以產生包含該第一宿主細胞與該第二宿主細胞的組合培養物；及(d)在該組合培養物中形成該異多聚體蛋白質。
  3. 一種製備異多聚體蛋白質之方法，該異多聚體蛋白質包含第一抗體重鏈及第二抗體重鏈，其中該第一抗體重鏈與該第二抗體重鏈由至少一個在鉸鏈區之間的鏈間二硫鍵連接，該方法包含以下步驟：(a)將包含編碼該第一抗體重鏈之第一核酸的第一宿主細胞以及包含編碼該第二抗體重鏈之第二核酸的第二宿主細胞在表現及分泌該第一抗體重鏈與該第二抗體重鏈之條件下，培養於組合培養物，該組合培養物包含該第一宿主細胞與該第二宿主細胞；及(b)在該組合培養物中形成該異多聚體蛋白質。
  4. 如請求項1-3中任一項之方法，其進一步包含回收該異多聚體蛋白質複合物之步驟。
  5. 如請求項1-3中任一項之方法，其中該第一抗體重鏈包含第一Fc區或其變異體，且其中該第二抗體重鏈包含第二Fc區或其變異體。
  6. 如請求項5之方法，其中該第一抗體重鏈包含第一變異Fc區且該第二抗體重鏈包含第二變異Fc區，其中該第一變異Fc區與該第二變異Fc區在界面會合(meet)，且其中該第二變異Fc區之界面部分包含突起(杵)，該突起可置於該第一變異Fc區之界面部分的空腔(臼)中。
  7. 如請求項5之方法，其中該第一抗體重鏈包含第一變異Fc區且第二抗體重鏈包含第二變異Fc區，其中該第一變異Fc區與該第二變異Fc區在界面會合，且其中該第一變異Fc區之界面部分包含突起(杵)，該突起可置於該第二變異Fc區之界面部分的空腔(臼)中。
  8. 如請求項1-3中任一項之方法，其中該第一抗體重鏈及第二抗體重鏈已經修飾以包含白胺酸拉鏈或捲曲螺旋。
  9. 如請求項1-3中任一項之方法，其中該第一抗體重鏈及第二抗體重鏈各包含人類CH2及/或CH3域之至少一部分。
  10. 如請求項1-3中任一項之方法，其中該第一抗體重鏈與第一抗體輕鏈配對以形成第一標靶結合臂。
  11. 如請求項10之方法，其中該第二抗體重鏈與第二抗體輕鏈配對以形成第二標靶結合臂。
  12. 如請求項11之方法，其中該第一標靶結合臂及第二標靶結合臂各自辨識相同抗原。
  13. 如請求項11之方法，其中該第一標靶結合臂及第二標靶結合臂各自辨識不同抗原。
  14. 如請求項11之方法，其中該第一抗體輕鏈及第二抗體輕鏈包含不同可變域序列。
  15. 如請求項11之方法，其中該第一抗體重鏈及第一抗體輕鏈經人類化。
  16. 如請求項15之方法，其中該第二抗體重鏈及第二抗體輕鏈經人類化。
  17. 如請求項11之方法，其中該第一抗體重鏈及第一抗體輕 鏈編碼在各別表現質體。
  18. 如請求項11之方法，其中該第二抗體重鏈及第二抗體輕鏈編碼在各別表現質體。
  19. 如請求項11之方法，其中該第一抗體重鏈及第一抗體輕鏈編碼在同一表現質體。
  20. 如請求項11之方法，其中該第二抗體重鏈及第二抗體輕鏈編碼在同一表現質體。
  21. 如請求項1-3中任一項之方法，其中該宿主細胞係選自由原核細胞及真核細胞組成之群。
  22. 如請求項21之方法，其中該宿主細胞為真核細胞，且其中該真核細胞為植物細胞或哺乳動物細胞。
  23. 如請求項22之方法，其中該真核細胞為哺乳動物細胞，且其中該哺乳動物細胞為CHO細胞。
  24. 如請求項21之方法，其中該宿主細胞為原核細胞，且其中該原核細胞為大腸桿菌(E.coli)細胞。
  25. 如請求項1之方法，其中該第一宿主細胞及該第二宿主細胞係：(i)組合、離心且再懸浮於緩衝液中，隨後破壞該細胞膜，或(ii)離心且再懸浮於緩衝液中，隨後組合，接著破壞該細胞膜。
  26. 如請求項1之方法，其中破壞該細胞膜係選自下列群組：滲透該細胞膜、細胞膜崩解、細胞溶解、音波處理、滲壓衝擊(shock)、通過微流體儀，添加EDTA、添 加清潔劑、添加溶劑、添加界面活性劑、添加低滲透壓緩衝液，使用冷凍/解凍技術、電穿孔，及通過不鏽鋼球均質機。
  27. 如請求項26之方法，其中該溶劑選自由甲苯及二甲亞碸所組成的群組。
  28. 如請求項26之方法，其中該界面活性劑選自由Triton-X 100及Tween 20所組成的群組。
  29. 如請求項4之方法，其中該回收步驟進一步包含至少一個純化步驟。
  30. 如請求項1至3中任一項之方法，其進一步包含以下步驟：(a)該抗體捕捉於包含蛋白A之管柱上，(b)自該管柱溶離該抗體，及(c)該溶離抗體稀釋於含有離液劑(chaotropic agent)或溫和清潔劑之溶液中。
  31. 如請求項1-3中任一項之方法，其中該異多聚體蛋白質係選自由以下組成之群：抗體、單抗體(monobody)、Fc融合多肽及親和抗體(affibody)。
  32. 如請求項31之方法，其中該異多聚體蛋白質為抗體，且其中該抗體為雙特異性抗體、多特異性抗體、一臂抗體或多特異性單價抗體。
  33. 如請求項31之方法，其中該異多聚體蛋白質為Fc融合蛋白，且其中該Fc融合蛋白為最大抗體(maxibody)、免疫黏附素或肽體(peptibodv)。
  34. 如請求項33之方法，其中該Fc融合蛋白為肽體，且其中該肽體為雙特異性肽體或單價肽體。
  35. 如請求項33之方法，其中該Fc融合蛋白為最大抗體，且其中該最大抗體為雙特異性最大抗體。
  36. 如請求項32之方法，其中該抗體為雙特異性抗體，其包含：與第一抗體重鏈配對以形成第一標靶結合臂的第一抗體輕鏈；以及與第二抗體重鏈配對以形成第二標靶結合臂的第二抗體輕鏈。
  37. 如請求項31之方法，其中該異多聚體蛋白質為抗體，且其中該抗體包含重鏈恆定域及輕鏈恆定域。
  38. 如請求項31之方法，其中該異多聚體蛋白質為抗體，且其中該抗體為人類化抗體或人類抗體。
  39. 如請求項31之方法，其中該異多聚體蛋白質為抗體，且其中該抗體為全長抗體。
  40. 如請求項31之方法，其中該異多聚體蛋白質為抗體片段。
  41. 如請求項40之方法，其中該抗體片段包含人類CH2及/或CH3域之至少一部分。
  42. 如請求項31之方法，其中該異多聚體蛋白質為抗體，且其中該抗體為IgG抗體、IgA抗體或IgD抗體。
  43. 如請求項42之方法，其中該抗體為IgG抗體，且其中該IgG抗體為IgG1抗體或IgG2抗體。
  44. 如請求項31之方法，其中該異多聚體蛋白質為抗體，且其中該抗體為治療抗體或診斷抗體。
  45. 如請求項44之方法，其中該抗體為治療抗體，且其中該治療抗體為促效(agonist)抗體、拮抗抗體、阻斷抗體或中和抗體。
  46. 如請求項44之方法，其中該抗體為治療抗體，且其中該治療抗體為能夠結合於腫瘤抗原的抗體、能夠結合於集群(cluster)分化因子的抗體、能夠結合於細胞存活調節因子的抗體、能夠特異性結合於細胞增殖調節因子的抗體、能夠結合於與組織發育或分化有關之分子的抗體、能夠結合於細胞表面分子的抗體或能夠結合於淋巴激素的抗體。
  47. 如請求項46之方法，其中該抗體為能夠結合於腫瘤抗原的治療抗體，且其中：(i)該腫瘤抗原不為細胞表面分子，或(ii)該腫瘤抗原不為集群分化因子。
  48. 如請求項11之方法，其中該第一抗體重鏈與該第一抗體輕鏈為人類多肽。
  49. 如請求項11之方法，其中該第二抗體重鏈與第二抗體輕鏈為人類多肽。
  50. 如請求項36之方法，其中該第一抗體重鏈、第一抗體輕鏈、第二抗體重鏈及第二抗體輕鏈為人類多肽。
  51. 如請求項36之方法，其中該第一抗體輕鏈及該第二抗體輕鏈包含不同可變域序列。
  52. 如請求項13之方法，其中該異多聚體蛋白質為雙特異性抗體，且其中該第一標靶結合臂及第二標靶結合臂之至 少40%形成該雙特異性抗體。
  53. 如請求項36之方法，其中該雙特異性抗體能夠特異性結合兩種不同標靶分子。
  54. 如請求項36之方法，其中該第一標靶結合臂及第二標靶結合臂之至少40%形成該雙特異性抗體。
  55. 如請求項13之方法，其中該異多聚體蛋白質為雙特異性抗體，且其中在純化該雙特異性抗體後，該第一標靶結合臂及該第二標靶結合臂之不超過10%以均二聚體(homodimer)存在。
  56. 如請求項36之方法，其中在純化該雙特異性抗體後，該第一標靶結合臂及該第二標靶結合臂之不超過10%以均二聚體存在。
  57. 如請求項11之方法，其中該第一抗體重鏈及該第一抗體輕鏈經由二硫基連接。
  58. 如請求項11之方法，其中該第二抗體重鏈及該第二抗體輕鏈經由二硫基連接。
  59. 如請求項36之方法，其中該第一抗體重鏈及該第一抗體輕鏈經由二硫基連接。
  60. 如請求項58之方法，其中該第二抗體重鏈及該第二抗體輕鏈經由二硫基連接。
  61. 如請求項11之方法，其中該第一標靶結合臂與該第二標靶結合臂之間的pI值差異為至少0.5。
  62. 如請求項36之方法，其中該第一標靶結合臂與該第二標靶結合臂之間的pI值差異為至少0.5。
  63. 一種產生組合異多聚體蛋白質庫之方法，該庫包含第一抗體重鏈及第二抗體重鏈，其中該第一抗體重鏈與該第二抗體重鏈由至少一個在鉸鏈區之間的鏈間二硫鍵連接，該方法包含以下步驟：(a)培養第一宿主細胞及至少兩種其他宿主細胞，其中i.該第一宿主細胞包含編碼第一抗體重鏈的第一核酸；及ii.該等至少兩種其他宿主細胞各自包含編碼至少兩種其他抗體重鏈的至少兩種其他核酸，(b)將該第一宿主細胞與至少兩種其他宿主細胞組合，以產生包含該第一宿主細胞及至少兩種其他宿主細胞的組合培養物；(c)破壞該第一宿主細胞及至少兩種其他宿主細胞之細胞膜，以使該第一抗體重鏈及該至少兩種其他抗體重鏈之一釋放於細胞外環境中，其中未經事先純化步驟下，異多聚體蛋白質複合物在該組合培養物中形成；及(d)回收該等異多聚體蛋白質複合物。
  64. 一種產生組合異多聚體蛋白質庫之方法，該庫包含第一抗體重鏈及第二抗體重鏈，其中該第一抗體重鏈與該第二抗體重鏈由至少一個在鉸鏈區之間的鏈間二硫鍵連接，該方法包含以下步驟：(a)在表現及分泌該第一抗體重鏈與至少兩種其他抗體重鏈之條件下，培養第一宿主細胞及至少兩種其他 宿主細胞，其中i.該第一宿主細胞包含編碼第一抗體重鏈的第一核酸；及ii.該等至少兩種其他宿主細胞包含編碼至少兩種其他抗體重鏈的至少兩種其他核酸，(b)將該第一宿主細胞與至少兩種其他宿主細胞培養物組合，以產生包含該第一宿主細胞及至少兩種其他宿主細胞的組合培養物，其中未經事先純化步驟下，異多聚體蛋白質複合物在該組合培養物中形成；及(c)自該組合培養物分離該異多聚體蛋白質複合物。
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