CN101802015A - 双特异性抗体及其制造方法 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及产生双特异性抗体的体外方法,包括如下步骤:a)提供具有第一结合特异性的第一抗体,其中所述第一抗体包含IgG4-样CH3区,b)提供具有不同于所述第一结合特异性的第二结合特异性的第二抗体,其中所述第二抗体包含IgG4-样CH3区,c)在允许核心铰链区的半胱氨酸发生二硫键异构化的还原条件下共同温育所述第一和第二抗体,和d)获得双特异性抗体。本发明进一步涉及通过本发明的方法获得的双特异性抗体。

Description

双特异性抗体及其制造方法
发明领域
本发明涉及产生双特异性抗体的新方法,并涉及可以通过这些方法获得的双特异性抗体。
发明背景
人免疫球蛋白G(IgG)抗体存在4种具有不同结构和功能性质的亚型。IgG包括两个重链-轻链对(半分子),它们通过位于铰链区中的重链间二硫键连接。人IgG4分子存在多种分子形式,它们的区别在于位于铰链区中的重链间二硫键的有无。IgG4分子以两个重链间二硫键均已形成或者均未形成的形式存在(6,7)。然而,不论是否存在这些链间二硫键(6,8),人IgG4在溶液中均以由两个Ig重链和两个轻链组成的四聚体形式存在,这是免疫球蛋白G分子的共同性质,因为在CH3结构域之间和在CH1和CH2结构域之间存在相对强的非共价相互作用(4)。只有在非还原条件下发生变性时,两个非共价关联的半分子才会解离,如大小测定分析(size-determinationanalysis)例如SDS-PAGE所表现的(6,9)。
几年来人们已经知道,人IgG4分子与其它的IgG亚类不同,以单价分子形式与抗原相互作用。已经发现,血清来源的人IgG4不能沉淀纯化的抗原,因为它不能交联。虽然这种血清来源的IgG4在功能上是单价的(1,2),但与之形成对照的是,重组产生的IgG4在与抗原相互作用中的行为表现为二价(3)。根据这些观察结果,有人提出,血清中的IgG4分子能够交换半分子(即,由一个重链和一个轻链构成的分子),结果产生双特异性分子,这样的分子不能交联相同的抗原(3-5)。这种半分子交换过程在本文也被称作“Fab臂交换”。
双特异性抗体作为治疗药物的潜力是令人感兴趣的,因为它们可以用作例如调节物,使效应物机制重新靶向于疾病相关的位点。然而,开发双特异性抗体的其中一个主要的障碍就是通过传统的技术,例如杂交瘤和化学偶联方法,难以产生足够量和品质的材料(10)。
WO 2005/062916介绍了用于在小鼠体内基于IgG4形成多聚分子的方法。此外,WO 2005/062916还介绍,在盐缓冲液中体外共同温育两种具有不同抗原结合特异性的IgG4抗体可形成能够同时与两种抗原反应的产物。然而,WO 2005/062916中没有证明,这些产物是聚集体还是双特异性的抗体,并且反应的产出在所用条件下较低。
发明概要
现在人们惊奇地发现,在还原条件下,两种具有不同抗原结合特异性的IgG4-或IgG4-样抗体能够进行高效的半分子交换,从而形成双特异性抗体,而不会伴随形成聚集体(aggregates)。
因此,在第一个主要方面中,本发明涉及一种用于产生双特异性抗体的体外方法,所述方法包括如下步骤:
a)提供具有第一结合特异性的第一抗体,其中所述第一抗体包含IgG4-样CH3区,
b)提供具有不同于所述第一结合特异性的第二结合特异性的第二抗体,其中所述第二抗体包含IgG4-样CH3区,
c)在允许核心铰链区的半胱氨酸发生二硫键异构化的还原条件下共同温育所述第一和第二抗体,和
d)获得双特异性抗体。
不受限于任何具体的理论,我们认为抗体的两个区域对其进行半分子交换的能力具有重要的影响。
首先,半分子交换的能力可能受到分子的核心铰链区中的序列差异的影响,因为在核心铰链区中具有CPSC序列的抗体,例如IgG4,比具有CPPC核心铰链序列的抗体,例如IgG1,更容易交换。不受限于任何理论,提出这样的假设,即CPSC序列导致核心铰链(core-hinge)更有柔性(flexible),并使链内二硫键的形成成为可能。值得一提的是,核心铰链的结构与蛋白质-二硫化物-异构酶(PDI)的活性结构域CXXC相似。不同同种型的PDI的这些CXXC基序催化蛋白质中二硫键的形成、还原和重排。因此,不受限于任何具体的理论,认为具有IgG4-样核心铰链序列的抗体可能具有内在的重排二硫键的活性,这种活性被本发明方法中所用的条件所激发。
第二,同样不受限于任何理论,结果显示为了允许交换反应发生,CH3区的序列应当是IgG4-样,即使得不会形成强的半分子间相互作用。
在另一个主要方面中,本发明涉及通过本发明的方法获得的或者可以通过本发明的方法获得的分离的双特异性抗体,并涉及包含这样的抗体的药物组合物。
在进一步的方面中,本发明涉及一种包含两个IgG4-样CH3区的分离的双特异性抗体,并涉及包含这样的抗体的药物组合物。
在更进一步的方面中,本发明涉及一种用于选择具有期望性质的双特异性抗体的方法,所述方法包括如下步骤:
a)提供一系列抗体,其中每种抗体具有不同的靶标特异性,并且其中每种抗体包含IgG4-样CH3区,
b)在还原条件下将所述系列中的每种抗体与所述系列中的另一种抗体进行温育,从而产生一系列的抗体混合物,其中每种混合物包含不同的双特异性抗体(a different bispecific antibody),
c)测定所得的一系列抗体混合物的给定的期望性质,和
d)选择具有期望性质的双特异性抗体混合物。
附图简述
图1.经纯化的重组IgG1和IgG4的SDS-PAGE分析。纯化之后,将Betv1和Feld1,IgG1和IgG4抗体在非还原SDS-PAGE上进行分析。
图2.nu/nu Balb/c小鼠体内,在不同时间点上双特异性IgG的水平。将异源交联测定确定的双特异性IgG的量对Betv1结合测定确定的Betv1特异性IgG的量进行作图。含IgG1血浆样品和含IgG4血浆样品的数据分别用空心和实心符号表示。虚线代表在IgG半分子交换是随机且完全的条件下双特异性IgG的计算量。
图3.在体内产生双特异性人IgG4分子。(A)各组SCID小鼠(n=5)注射嵌合抗体混合物:100μg IgG1-Betv1/100μgIgG1-Feld1(正方形),100μgIgG4-Betv1/100μg IgG4-Feld1(圆形),或3)100μg IgG4-Betv1/100μgIgG4-Feld1+2,000μg无关重组IgG4(IgG4-EGFR;三角形)。通过评估血浆中针对Betv1和Feld1的双特异性活性来随时间追踪双特异性抗体的产生。双特异性IgG相对于总IgG-Betv1浓度的分数用百分比表示。带星号的箭头指示在过量的无关IgG4的存在下接受IgG4-Betv1/IgG4-Feld1的小鼠体内预期的双特异反应性水平(4%),不带星号的箭头指示接受IgG4-Betv1/IgG4-Feld1混合物的小鼠体内预期的双特异反应性水平(50%)。误差棒代表SEM。(B)通过评估小鼠血浆中放射性标记的Feld1与Feld1偶联Sepharose的交联来测试单特异交联活性。单特异反应性表示为通过交联结合的放射性标记Feld1的量与总IgG-Feld1的比值,以便校正IgG的清除。误差棒表示SEM。
图4.小鼠血浆中双特异活性的SEC分析。
将在t=24h时从给予了一种IgG4混合物的小鼠获得的血浆(10μl)在Superdex200柱上进行分离。小鼠被给予了含有300μgBetv1结合性IgG4和300μgFeld1结合性IgG4的混合物。在级分中Feld1特异性IgG(■)的浓度在抗原结合试验中测量,双特异性IgG Betv1-Feld1(·)的浓度在Betv1-Feld1交联测定中确定。用IVIg对柱进行校准,结果显示单体、双体和聚集型IgG分别在12.9,11.0和8.4ml洗脱(数据未显示)。
图5.IgG在全血组分中的交换
是将嵌合IgG混合物在37℃的全血、血细胞、血浆和血清中温育24h,之后在异源交联测定(Feld1-Betv1)中测量双特异活性,来评估IgG4和IgG1的交换。血液从两个供体获得:A(黑色条形)和B(灰色条形)。确定在添加了嵌合IgG4(图A)、嵌合IgG1(图B)或者没有添加IgG(图C)的混合物中的双特异性活性。所有提供的数据均是在37℃温育24h后测量的。
图6.人血细胞的IgG交换
在37℃将嵌合IgG混合物与单个核细胞(MNC)、血小板(Thr)和红细胞(Ery)温育48h,之后在异源交联测定(Feld1-Betv1)中测量双特异活性,来评估IgG4(黑色条形)和IgG1(灰色条形)的交换。作为对照,还在无血清培养基(SFC)中温育抗体混合物。双特异性表示为被结合的125I-Betv1相对于总添加量的百分比。
图7.HEK和小鼠细胞系的IgG4交换
在37℃将嵌合IgG混合物与HEK细胞、小鼠B细胞(J558)或杂交瘤细胞温育,来评估IgG4半分子的交换。在异源交联测定(Feld1-Betv1)中对分别在t=0h(灰色条形)和t=24h(黑色条形)获取的1μl样品中的双特异活性进行测量。双特异性表示为被结合的125I-Betv1与总添加量的百分比。
图8.红细胞介导的IgG4交换
将IgG4-Betv1/IgG4-Feld1混合物与新鲜纯化的红细胞(ery,实心符号)温育产生了双特异性抗体,而对于IgG1同种型的混合物没有观察到双特异性。作为对照,将抗体混合物在无红细胞的PBS中温育(空心符号)。箭头指示双特异性IgG的最大预期百分比(50%)。误差棒表示重复测量结果的范围。
图9.IgG4在PBS中的交换
通过测量双特异活性(图A)、二价性和抗原结合来评估IgG1(白柱),IgG4(灰色条形)和IgG4在过量的无关IgG4(黑色条形)存在下在PBS中的交换。图A中IgG半分子的交换是从双特异IgG的浓度(在异源交联测定中确定)和假设IgG半分子的交换是随机且完全的情况下双特异IgG的最大预期浓度计算而得的。交换表示为占最大交换的百分比,最大交换为100%。在图B中描绘了随时间变化的Feld1二价性,其是在同源交联测定中测得的。将t=0时的二价IgG的浓度设定为100%,将二价IgG的浓度标准化。
图10.红细胞裂解物的IgG4交换
在来自红细胞的裂解物中37℃温育嵌合IgG4混合物来评估IgG4半分子的交换。将IgG4与递增稀释度的裂解物一起温育。在异源交联测定中对在所示时间点获取的样品进行双特异活性(Betv1-Feld1)测量。双特异性表达为被结合的125I-Betv1相对于添加量的百分比。
图11.受红细胞裂解物诱导的双特异活性的SEC分析
将IgG4与新鲜制备的红细胞裂解物在37℃温育24h,随后在Superdex200柱上进行分级。Superdex200柱在
Figure G2008800182801D00051
HPLC单元(AmershamBiosciences,Uppsala,Sweden)上以0.5ml/min运行。级分中Betv1特异性IgG(■)的浓度在抗原结合测定中进行测量,双特异性IgG Feld1-Betv1(·)的浓度在Betv1-Feld1交联测定中加以确定。对该柱进行校准,结果显示单体、双体和聚集型IgG分别在12.1,10.3和8.3ml洗脱(数据未显示)。
图12.GSH介导的IgG4交换
通过在PBS/叠氮化物(Azide)中递增浓度GSH的存在下温育IgG4来评估GSH介导的IgG4半分子交换。在所示的时间点采取样品,测量其中的抗原结合和双特异活性。IgG4半分子的交换是从双特异性IgG的测得浓度(在异源交联测定中确定)以及假定IgG4半分子的交换是随机且完全的情况下双特异性IgG4的最大预期浓度计算而得的。交换表示为占最大交换的百分比,最大交换设定为100%。
图13.GSH介导的IgG4半分子交换的SEC
IgG4与GSH(0.5mM)温育,随后在Superdex200柱上进行分离。Superdex200柱在
Figure G2008800182801D00061
HPLC单元(Amersham Biosciences,Uppsala,Sweden)上以0.5ml/min运行。级分中Betv1特异IgG(■)的浓度在抗原结合测定中进行测量,双特异性IgG Feld1-Betv1(·)的浓度在Betv1-Feld1交联测定中加以确定。对该柱进行校准,结果显示单体、双体和聚集型IgG分别在12.1,10.3和8.3m1洗脱(数据未显示)。
图14.GSH介导的IgG4交换的温度依赖性
将IgG4-Betv1及IgG4-Feld1混合物在示明的温度下在PBS中与GSH温育。在t=0h(灰色条形)和t=24h(黑色条形),对双特异性IgG4的浓度进行评估。由这些数据计算双特异性IgG相对于IgG4Betv1浓度的分数,并表示为百分比。误差棒表示重复测量的范围。
图15.由一组还原剂介导的IgG4交换
将PBS中的IgG4-Betv1和IgG4-Feld1在不同作用剂(全部为还原性,GSSG除外)的存在下在37℃温育24h。Betv1特异性IgG的浓度在Betv1结合测定中进行测量,双特异性IgG的浓度在异源交联测定(Feld1-Betv1)中进行测量。计算双特异性IgG相对于IgG-Betv1浓度的百分比。标准误差棒表示从三次测量计算出的SEM。
图16.使用GSH的完全人类IgG4抗体的交换
(A)将IgG4-CD20/IgG4-EGFr或IgG1-CD20/IgG1-EGFr混合物在有或者没有0.5mM GSH的条件下在37℃进行温育。在示明的时间点采取样品。在夹心式ELISA中测量双特异性抗体的形成。Y轴表示405nm的光密度,作为双特异性CD20/EGFR抗体形成的量度。
(B)GSH剂量依赖性的IgG4交换。将IgG4-CD20和IgG4-EGFr的混合物与所示浓度的GSH 37℃温育24h。双特异性抗体的形成在夹心式ELISA中测量。在Y轴上绘制405nm的光密度,作为双特异性CD20/EGFR抗体形成的量度。
(C)GSH-介导的IgG4半分子交换受到反应中所用成分的影响,并且在较低GSH浓度的培养基(Freestyle 293)中发生。
(D)GSH-介导的IgG4半分子交换在0.5mM GSH比在5mM GSH更高。
(E/F)通过ESI-TOF质谱检测IgG4-EGFR和IgG4-CD20之间的Fab臂交换。IgG4混合物在不存在(E)或存在(F)0.5mM GSH的条件下温育24小时,之后用PNGase F使抗体去糖基化,并通过ESI-TOF质谱确定所得抗体的分子量。图中显示的是经去卷积(deconvoluted)ESI-TOF质谱。数据代表2次实验的结果。
图17.猕猴IVIg参与重组人IgG4抗体的Fab臂交换
A)将两种重组人IgG4抗体(IgG4-CD20和IgG4-EGFr)的混合物在存在或不存在纯化猕猴免疫球蛋白或人IVIg的条件下在37℃与GSH温育24h。双特异性抗体通过Fab臂交换的形成在夹心式ELISA.中进行测量。
B)将两种重组人IgG4抗体(IgG4-CD20和IgG4-EGFr)的混合物在存在或不存在过量(圆括号内所示)的来自数种动物(来源也示于圆括号中)的纯化猕猴免疫球蛋白或人IVIg的条件下在37℃与GSH温育24h。在夹心式ELISA.中测量双特异性抗体通过Fab臂交换的形成。
C)将两种重组人IgG4抗体(IgG4-CD20和IgG4-EGFr)的混合物在存在或不存在过量(圆括号内所示)的经纯化的黑猩猩、狒狒、食蟹猴(cynomolgousmonkey)、马和猪免疫球蛋白(圆括号内也指示了来源)或人IVIg的条件下在37℃与GSH温育24h。在夹心式ELISA中测量双特异性抗体通过Fab臂交换的形成。
图18.恒定区序列下划线的序列代表CH3区
图19.IgG1突变体的GSH介导的半分子交换
(A)用0、0.1、1和10mM GSH测试GSH浓度对不同IgG1突变体的半分子交换的影响。交换的测试使用如下的混合物:
-IgG4a-feld1 wt和IgG4 a-betv1 wt(图中表示为IgG4 wt)
-IgG1 a-feld1 wt和IgG4a-betv1 wt(表示为IgG1 wt)
-IgG1a-feld1 CPSC和IgG1a-betv1 CPSC(表示为IgG1-CPSC)
-IgG1a-feld1 CH3(IgG4)和IgG1a-betv1CH3(IgG4)(表示为IgG1-CH3(IgG4))
-IgG1a-feld1 CPSC-CH3(IgG4)和a-betv1 IgG1CPSC-CH3(IgG4))(表示
为IgG1-CPSC-CH3(IgG4))
(B)用0.5和5mM GSH测试GSH浓度对不同IgG1突变体与野生型IgG4(IgG4 wt)分子的半分子交换的影响。交换的测试使用如下的混合物:
-IgG1a-feld1 wt和IgG4a-betv1 wt(表示为IgG1)
-IgG1a-feld1 CPSC和IgG4a-betv1 wt(表示为IgG1-CPSC)
-IgG1a-feld1 CH3(IgG4)和IgG4a-betv1 wt(表示为IgG1-CH3(IgG4))
-IgG1a-feld1 CPSC-CH3(IgG4)和IgG4a-betv1 wt(表示为IgG1-CPSC-CH3(G4))
-IgG1a-feld1 R238Q和IgG4a-betv1 wt(表示为IgG1-R238Q)
-IgG1a-feld1 K292R和IgG4a-betv1 wt(表示为IgG1-K292R)
-IgG1a-feld1 Q302E和IgG4a-betv1 wt(表示为IgG1-Q302E)
-IgG1a-feld1 P328L和IgG4a-betv1 wt(表示为IgG1-P328L)
-IgG1a-feld1 CPSC-K292R和IgG4 a-betv1 wt(表示为IgG1-CPSC-K292R)
-IgG4a-feld1 wt和IgG4a-betv1 wt(表示为IgG4)
(C)用0.5和5mM GSH测试GSH浓度对不同IgG1突变体的半分子交换的影响。交换的测试使用如下的混合物:
-IgG1a-feld1 wt和IgG1a-betv1 wt(表示为IgG1)
-IgG1a-feld1 CPSC和IgG1a-betv1 CPSC(表示为IgG1-CPSC)
-IgG1a-feld1 CH3(IgG4)和IgG1a-betv1 CH3(IgG4)(表示为IgG1-CH3(IgG4))
-IgG1a-feld1 CPSC-CH3(IgG4)和IgG1a-betv1 CPSC-CH3(IgG4)(表示为IgG1-CPSC-CH3(IgG4))
-IgG1a-feld1 R238Q和IgG1a-betv1 R238Q(表示为IgG1-R238Q)
-IgG1a-feld1 K292R和IgG1a-betv1 K292R(表示为IgG1-K292R)
-IgG1a-feld1 Q302E和IgG1a-betv1 Q302E(表示为IgG1-Q302E)
-IgG1a-feld1 P328L和IgG1a-betv1 P328L(表示为IgG1-P328L)
-IgG1a-feld1 CPSC-K292R和IgG1a-betv1 CPSC-K292R(表示为IgG1-CPSC-K292R)
-IgG4a-feld1 wt和IgG4a-betv1 wt(表示为IgG4)
图20.在0.5mM GSH下,具有野生型(IgG4)核心铰链的IgG4分子参与重组人IgG4抗体的Fab臂交换,而具有IgG1核心铰链的分子不参与。(A)两种重组人IgG4抗体(IgG4-CD20和IgG4-EGFr,如上文说明的)的混合物在存在或不存在过量(50和100微克/ml)的那他珠单抗(Tysabri)的条件下在37℃与0.5mM GSH温育24h。在夹心式ELISA中测量双特异性抗体通过Fab臂交换的形成。(B)将两种重组人IgG4抗体(IgG4-CD20和IgG4-EGFr,如上所述)的混合物在存在或不存在等摩尔量(10微克/ml)的那他珠单抗(Tysabri)或吉妥单抗(Mylotarg)的条件下在37℃与0.5mM GSH温育24h。在夹心式ELISA中测量双特异性抗体通过Fab臂交换的形成。
图21.在292位点具有额外突变的IgG1-CPSC构建体的半分子交换。用0.5mM GSH测试不同IgG1突变体的半分子交换。交换的测试使用如下的混合物:
-IgG1-2F8 wt和IgG1-7D8 wt(表示为IgG1)
-IgG1-2F8-CPSC和IgG1-7D8-CPSC(表示为IgG1-CPSC)
-IgG1-2F8-CH3(IgG4)和IgG1-7D8-CH3(IgG4)(表示为IgG1-CH3(IgG4))
-IgG1-2F8-CPSC-CH3(IgG4)和IgG1-7D8-CPSC-CH3(IgG4)(表示为IgG1-CPSC-CH3(IgG4))
-IgG1-2F8-CPSC-R238Q和IgG1-7D8-CPSC-R238Q(表示为IgG1-CPSC-R238Q)
-IgG1-2F8-CPSC-K292R和IgG1-7D8-CPSC-K292R(表示为IgG1-CPSC-K292R)
-IgG1-2F8-CPSC-K292Y和IgG1-7D8-CPSC-K292Y(表示为IgG1-CPSC-K292Y)
-IgG1-2F8-CPSC-K292F和IgG1-7D8-CPSC-K292F(表示为IgG1-CPSC-K292F)
-IgG1-2F8-CPSC-K292W和IgG1-7D8-CPSC-K292W(表示为IgG1-CPSC-K292W)
-IgG1-2F8-CPSC-Q302E和IgG1-7D8-CPSC-Q302E(表示为IgG1-CPSC-Q302E)
-IgG1-2F8-CPSC-P328L和IgG1-7D8-CPSC-P328L(表示为IgG1-CPSC-P328L)
-IgG4-2F8 wt和IgG4-7D8 wt(表示为IgG4)
在夹心式ELISA中测量双特异性抗体通过Fab臂交换的形成。
图22.核心铰链的稳定化可在体内保护IgG4抗体治疗剂免于遭受Fab臂交换。
(A)通过ESI-TOF质谱检测IgG4-EGFR-CPPC和IgG4-CD20之间的Fab臂交换。将IgG4-EGFR-CPPC/IgG4-CD20混合物在5mM GSH的存在下(F)温育24小时,之后用PNGase F使抗体去糖基化,并通过ESI-TOF质谱确定所得抗体的分子量。图中显示了去卷积后的ESI-TOF谱。在使用5mM GSH时可以检测到双特异性EGFR/CD20抗体(在没有GSH或0.5mM GSH的条件下温育未产生双特异性抗体(数据未显示))。
(B)将数组(n=4)SCID小鼠用IgG4-CD20/IgG4-EGFR(空心圆)、IgG4-CD20/IgG1-EGFR和IgG4-CD20/IgG4-EGFR-CPPC等抗体混合物(每种300μg)进行注射。通过ELISA对双特异性抗体的产生进行经时追踪和定量。双特异性抗体的定量使用体外交换的抗体混合物作为对照。数据点代表4只小鼠的在不同的实验中至少测量2次的平均值±SEM。在IgG4-CD20/IgG1-EGFR和IgG4-CD20/IgG4-EGFR-CPPC混合物中未能检测到双特异性抗体。示明了测定的检测限(虚线),代表2000ng/ml的血清水平。
图23.CXXC-突变体的经时Fab臂交换
将CXXC-突变抗体的混合物在37℃与0.5mM GSH温育。在示明的时间点采取样品。测量双特异性抗体的形成。交换的测试使用如下的混合物:
-IgG1a-feld1 wt和IgG1a-betv1 wt(表示为IgG1)
-IgG4a-feld1 wt和IgG4a-betv1 wt(表示为IgG4)
-IgG4a-feld1 CGHC和IgG4a-betv1 CGHC(表示为CGHC)
-IgG4a-feld1 CGC和IgG4a-betv1 CGC(表示为CGC)
-IgG4a-feld1 CPRC和IgG4a-betv1 CPRC(表示为CPRC)
-IgG4a-feld1 CPHC和IgG4a-betv1 CPHC(表示为CPHC)
图24:CXXC突变体的GSH介导的Fab臂交换
用1-20,000μM GSH测试GSH浓度对CXXC突变体的Fab臂交换的影响。交换的测试使用如下的混合物:
-IgG1a-feld1 wt和IgG1a-betv1 wt(表示为IgG1)
-IgG4a-feld1 wt和IgG4a-betv1 wt(表示为IgG4)
-IgG4a-feld1 CGHC和IgG4a-betv1 CGHC(表示为CGHC)
-IgG4a-feld1 CGC和IgG4a-betv1 CGC(表示为CGC)
-IgG4a-feld1 CPRC和IgG4a-betv1 CPRC(表示为CPRC)
-IgG4a-feld1 CPHC和IgG4a-betv1 CPHC(表示为CPHC)
发明详细说明
定义
术语“免疫球蛋白”是指一类结构相关的糖蛋白,由两对多肽链,一对低分子量轻链(L)和一对重链(H)所构成,所有4条链均通过二硫键相互连接。免疫球蛋白的结构已经得到了详尽的表征。见例如《FundamentalImmunology》第七章(Paul,W.,ed.,2nd ed.Raven Press,N.Y.(1989))(11)。简而言之,每条重链典型地由一个重链可变区(本文缩写为VH或VH)和一个重链恒定区构成。重链恒定区通常由三个结构域构成:CH1、CH2和CH3。每条轻链典型地由一个轻链可变区(本文缩写为VL或VL)和一个轻链恒定区构成。轻链恒定区通常由一个结构域CL构成。VH和VL区可以进一步分为高可变性区(或高变区,其在序列和/或结构限定的环的形式上具有高度可变性),也称作补体决定区(CDR),它们之间散布着更加保守的区,称作框架区(FRs)。每个VH和VL通常由三个CDR和4个FR构成,从氨基端向羧基端的排列顺序是:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4(另见(12))。典型地,该区中氨基酸残基用Kabat(13)所述的方法进行编号。使用该编号系统,肽的实际线性氨基酸序列可以包含更少或更多的氨基酸,相应于可变结构域的FR或CDR的缩短或插入。例如,重链可变结构域可以在VHCDR2的52位残基之后包含单氨基酸插入(依照Kabat的残基52a),和在重链FR的82位残基之后插入残基(例如依照Kabat的残基82a,82b和82c等)。对于给定的抗体,可以通过将该抗体序列与一条“标准的”Kabat编号序列在同源区域处进行比对,来确定其残基的Kabat编号。
在本发明语境中,术语“抗体(Ab)”是指这样的免疫球蛋白分子,免疫球蛋白分子的片段,或两者之任一的衍生物,其能够在典型的生理条件下以相当长时间的半衰期特异性结合抗原,例如至少大约30分钟,至少大约45分钟,至少大约1小时,至少大约2小时,至少大约4小时,至少大约8小时,至少大约12小时,大约24小时或者更长,大约48小时或者更长,大约3、4、5、6或更多天等,或者其它任何相关的功能上定义的时间段(例如足以诱导、促进、提高和/或调节与抗体结合抗原相关联的生理响应的时间,和/或足以供抗体招募Fc介导的效应物活性的时间)。免疫球蛋白分子的重链和轻链可变区包含可以和抗原相互作用的结合结构域。抗体(Abs)的恒定区可以介导免疫球蛋白结合宿主组织或因子,包括免疫系统的各种细胞(例如效应细胞),和补体系统的成分,例如C1q,经典补体激活途径的第一个成分。如上文指出的,除非在另外指出或明显与上下文矛盾,本文中的术语“抗体“包括含有突变的或野生型的核心铰链区并保留特异性结合抗原的能力的抗体片段。
已经显示,抗体的抗原结合功能可以由全长抗体的片段来实施。术语“抗体”中涵盖的结合性片段的实例包括例如F(ab′)2片段,它们是二价片段,包括两条Fab片段,这两条片段通过位于铰链区的一个二硫键相连。尽管这些片段一般包含在抗体的含义之内,但是它们作为总体以及各个独立的个体都是本发明的独特特征,展示不同的生物性质和效用。还应当理解,除非另外具体指出,术语“抗体”还包括通过任何已知的技术,例如酶切、肽合成和重组技术,所提供的多克隆抗体、单克隆抗体(mAbs)、类抗体多肽例如嵌合抗体和人源化抗体,以及保留特异性结合抗原能力的抗体片段(抗体结合片段)。所产生的抗体可以具有任何同种型。
如本文所使用的,术语“人抗体”或“人类抗体”意图包括具有来源于人种系免疫球蛋白序列的可变和恒定区的抗体。本发明的人抗体可以包括不是由人种系免疫球蛋白序列编码的氨基酸残基(例如由于体外随机或定点突变或由于体内体细胞突变引入的突变)。然而,如本文所使用的,术语“人抗体”或“人类抗体”不意图包括如下的抗体,其中来自另一哺乳动物物种(例如小鼠)的种系的CDR序列被移植到人类框架序列上。
如本文所使用的,“分离的抗体”意图指示如下的抗体,其基本上不含其它具有不同抗原特异性的抗体。然而,特异性结合某种特定人靶抗原的表位、同种型或变异体的分离抗体可能具有与其它相关抗原(例如来源于其它物种的抗原(例如物种同源物))的交叉反应性。而且,分离的抗体可以基本不含其它的细胞材料和/或化学品。在本发明的一个实施方案中,将一组具有不同特异性的“分离”单克隆抗体组合在明确限定的组合物中。
如本文所使用的,术语“单克隆抗体”或“单克隆抗体组合物”是指抗体分子单一分子组合物的制备物。单克隆抗体组合物显示针对特定表位的单一结合特异性和亲和性。因此,术语“人单克隆抗体”是指显示单一结合特异性、且具有来源于人种系免疫球蛋白序列的可变和恒定区的抗体。人单克隆抗体可以由杂交瘤产生,杂交瘤包括相互融合的B细胞和永生化细胞,其中B细胞是从基因组中包含人重链转基因和轻链转基因的转基因或转染色体非人动物(例如转基因小鼠)获得的。
如本文使用的,术语“结合”在某一抗体结合预定抗原的语境中通常是亲和力相当于KD为大约10-7M或者更低,例如大约10-8M或者更低,例如大约10-9M或者更低,大约10-10M或者更低,或者大约10-11M或者更低的结合,所述KD例如使用BIAcore 3000设备,以抗原作为配体,并以抗体作为分析物,通过表面等离子体共振(SPR)技术来加以确定;其结合预定抗原的亲和力,相当于比其针对除该预定抗原或紧密相关抗原之外的非特异抗原(例如BSA、酪蛋白)的结合亲和力的KD至少低10倍,例如至少低100倍,例如至少低1000倍,例如至少低10,000倍,例如至少低100,000倍的KD。亲和力相差的量取决于抗体的KD,从而当抗体KD非常低(即抗体特异性很高)时,针对抗原的亲和力较针对非特异抗原的亲和力相差的量可以是至少10,000倍。
如本文所使用的,术语“kd”(sec-1)是指特定抗体-抗原相互作用的解离速度常数。该值又称为koff值。
如本文所使用的,术语“ka”(M-1x sec-1)是指特定抗体-抗原相互作用的结合速度常数。
如本文所使用的,术语“KD”(M)是指特定抗体-抗原相互作用的解离平衡常数。
如本文所使用的,术语“KA”(M-1)是指特定抗体-抗原相互作用的结合平衡常数,是通过ka除以kd获得的。
如本文所使用的,“同种型”是指由重链恒定区基因编码的免疫球蛋白类型(例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgD、IgA、IgE或IgM)。
术语“表位”是指能够特异结合抗体的蛋白决定簇。表位通常由表面分子集团(surface groupings of molecules)构成,例如氨基酸或糖侧链,并且通常具有特异的三维结构特征,以及特异的电荷特征。构象性和非构象性表位的区别在于,在变性溶剂的存在下,与前者的结合会丧失,而后者不会。表位可以包括直接参与结合的氨基酸残基(也称作表位的免疫显性组分)和不直接参与结合的其它氨基酸残基,例如被特异性抗原结合肽有效封闭的氨基酸残基(换言之,该氨基酸残基位于特异抗原结合肽的足迹(footprint)内)。
如本文所使用的,人抗体如果满足下述条件,则是“来源于”或“衍生自”(derive from)特定的种系序列的:该抗体是从使用人免疫球蛋白序列的系统获得的,例如通过免疫携带人免疫球蛋白基因的转基因小鼠或通过筛选人免疫球蛋白基因库,且其中所选择的人抗体的氨基酸序列与由该种系免疫球蛋白基因编码的氨基酸序列具有至少90%,例如至少95%,例如至少96%,例如至少97%,例如至少98%,或者例如至少99%的同一性。典型地,在重链CD3之外,来源于特定人种系序列的人抗体将显示与由该种系免疫球蛋白基因编码的氨基酸序列不超过20个氨基酸的差异,例如不超过10个氨基酸的差异,例如不超过5个,例如不超过4、3、2或1个氨基酸的差异。
术语“双特异性抗体”意图包括任何具有两种不同的结合特异性的抗体,即该抗体结合两种不同的表位,这两种表位可以位于相同的靶抗原上,或者更一般地,位于不同的靶抗原上。
如本文所使用的,术语“效应细胞”是指免疫响应效应期中,而不是免疫响应的识别期和激活期中所涉及的免疫细胞。免疫细胞的实例包括骨髓或淋巴来源的细胞,例如淋巴细胞(例如B细胞和T细胞,包括溶细胞性T细胞(CTL))、杀伤细胞、天然杀伤细胞、巨噬细胞、单核细胞、嗜酸性粒细胞、多形核细胞,例如嗜中性粒细胞、粒细胞、肥大细胞和嗜碱细胞。一些效应细胞表达特异的Fc受体,并执行特异的免疫功能。在一些实施方案中,效应细胞能够诱导抗体依赖的细胞毒性(ADCC),例如自然杀伤细胞能够诱导ADCC。例如,表达FcR的单核细胞、巨噬细胞参与特异杀伤靶细胞、将抗原呈递给免疫系统的其它成分、或结合呈递抗原的细胞等作用。在一些实施方案中,效应细胞可以吞噬靶抗原或靶细胞。特定FcR在效应细胞上的表达可以被体液因子例如细胞因子所调节。例如,已经发现,FcγRI的表达被干扰素γ(IFN-γ)和/或G-CSF上调。这种提高的表达可增加带有FcγRI的细胞对靶标的细胞毒活性。效应细胞可以吞噬或裂解靶抗原或靶细胞。
“治疗”是指以缓解、减轻、阻止或根除(治愈)症状或疾病状态为目的施用有效量的本发明治疗活性化合物。
“有效量”是指在必要的给药剂量(dosage)或时程下,可有效获得期望的治疗结果的量。抗体的治疗有效量可随多种因素变化,例如个体的疾病状态、年龄、性别和体重,和抗体在个体内引发期望的响应的能力。治疗有效量同时还指抗体或抗体部分的治疗有益效应超过任何毒性或有害效应。术语“IgG4-样核心铰链区”是指如下的核心铰链区,其中半胱氨酸残基与抗体分子中其它半胱氨酸/二硫桥相比显著地更容易被还原和/或二硫键异构体化。因此,对于具有IgG4-样核心铰链区的抗体,可以找到这样的还原性条件,在该条件下核心区的半胱氨酸残基/二硫桥可以被还原,继而与另一个半分子中的核心铰链半胱氨酸形成二硫桥,而同时抗体内的其它二硫桥以及抗体的整体结构仍保持完整。例如,IgG4-样核心铰链区可以是IgG4核心铰链区,或者是另一种同种型抗体的核心铰链序列,其中核心区CPPC序列的其中一个脯氨酸被突变,例如突变成丝氨酸,如CPPC突变成CPSC。
在本专利申请的语境中,术语“IgG4-样CH3区”是指与IgG4(例如人IgG4)的CH3相同的CH3区,或者在功能上与IgG4CH3区等价的CH3区。在此语境中,“功能上等价”的意思是所述CH3区与IgG4的CH3区相似,不形成稳定的半分子间相互作用。给定的CH3区的稳定的半分子间相互作用的形成,可以通过用该CH3区替换IgG4的CH3,然后在实施例31或32给定的条件下进行交换测试来加以检验。如果观察到交换,则没有形成稳定的半分子间相互作用。例如,IgG4-样CH3区可以是这样的CH3区,其容许半分子交换的效率与来自IgG4的CH3区相当。由此,IgG4-样CH3区可以在结构上与IgG4的CH3区相似,例如与IgG4的CH3区的序列有超过75%,例如超过90%的相似性。然而,作为附加条件或者替代条件,在此语境下IgG4-样CH3区可以是这样的CH3区,它在结构上与IgG4的CH3区不相近,但具有相似的功能特征,即它不含任何参与和其它包含相同的CH3区氨基酸序列的肽形成二硫键或共价或稳定非共价重链间键(例如盐桥)的氨基酸残基。例如,IgG4-样CH3区可以是突变的IgG1CH3区,其中可参与半分子间CH3-CH3相互作用的一个或多个氨基酸残基已被改变或删除。
术语“还原性条件”或“还原性环境”是指如下的条件或环境,其中底物,在这里是抗体核心区中的半胱氨酸残基,更可能被还原而不是被氧化。
术语“还原剂”是指这样的化合物,它还原它的环境中的分子,即改变其环境中的分子,使之更加被还原(more reduced)或者更具有还原性(morereducing)。还原剂通过提供电子发挥作用,这样其自身在还原了底物之后被氧化。因此,还原剂是提供电子的作用剂。还原剂的实例包括二硫苏糖醇(DTT)、巯基乙醇、半胱氨酸、巯基乙醇酸盐(或酯)、半胱胺(cysteamine)、谷胱甘肽和硼氢化钠。在一个实施方案中,还原剂不包括酶。
“二硫键形成”是指在一个或两个多肽内存在的两个半胱氨酸之间形成共价键的过程,其可图示为″-S--S-″。
“二硫键还原”是指断裂二硫键,从而形成两个巯基(-SH基团)的过程。
术语“二硫键异构化”是指不同半胱氨酸之间二硫键的交换,即二硫键改组(shuffling)。
“蛋白质二硫键异构酶”是指催化蛋白质中二硫键的异构化的酶。
在二硫桥还原的语境中使用的“无显著还原”一般是指,在溶液中发生还原的所述二硫桥少于10%,例如少于5%,例如少于2%,或者少于1%。
发明的各方面和实施方案
如上文所述,在第一个主要方面中,本发明涉及一种用于产生双特异性抗体的体外方法,所述方法包括如下步骤:
a)提供具有第一结合特异性的第一抗体,其中所述第一抗体包含IgG4-样CH3区,
b)提供具有不同于所述第一结合特异性的第二结合特异性的第二抗体,其中所述第二抗体包含IgG4-样CH3区,
c)在允许核心铰链区的半胱氨酸发生二硫键异构化的还原条件下共同温育所述第一和第二抗体,和
d)获得双特异性抗体。
在优选实施方案中,本发明方法中使用的第一和第二抗体是单克隆抗体。单克隆抗体可以,例如,通过首先由Kohler et al.(14)描述的杂交瘤方法产生,或者可以通过重组DNA方法产生。单克隆抗体还可以用例如Clackson等(15)和Marks等(16)介绍的技术从噬菌体抗体文库中分离。单克隆抗体可以从任何合适的来源获得。因此,例如,可以用感兴趣的抗原,例如以在表面上表达该抗原的细胞或者编码感兴趣的抗原的核酸的形式,免疫小鼠,从该小鼠获得脾B细胞,从该小鼠脾B细胞制备杂交瘤,从该杂交瘤获得单克隆抗体。还可以从来自经过免疫的人或非人哺乳动物(例如大鼠、狗、灵长动物等)的抗体表达性细胞衍生的杂交瘤获得单克隆抗体。
在一个实施方案中,本发明的抗体是人抗体。指定的人单克隆抗体可用携带部分人免疫系统而非小鼠系统的转基因或转染色体小鼠产生。这些转基因和转染色体小鼠包括在本文中分别被称作HuMAb小鼠和KM小鼠的小鼠,并在本文中统称为“转基因小鼠”。
HuMAb小鼠含有人免疫球蛋白基因迷你座位(miniloci),其编码未重排的人重链(μ和γ)和κ轻链免疫球蛋白序列,以及使内源μ和κ链座位失活的靶定突变(targeted mutations)(17)。因此,所述小鼠表现出小鼠IgM或κ表达降低,在应答于免疫时,被引入的人重链和轻链转基因经历类别转换和体细胞突变而产生高亲和性的人IgG,κ单克隆抗体(17-20)。HuMAb小鼠的制备在参考文献21-25中有详细介绍。另见US 5,545,806、US 5,569,825、US 5,625,126、US 5,633,425、US 5,789,650、US 5,877,397、US 5,661,016、US 5,814,318、US 5,874,299、US 5,770,429、US 5,545,807、WO 98/24884、WO 94/25585、WO 93/1227、WO 92/22645、WO 92/03918和WO 01/09187。
HCo7小鼠在它们的内源轻链(kappa)基因中有一个JKD中断(disruption)(如Chen等(26)所述),在它们的内源重链基因中有一个CMD中断(如WO 01/14424的实施例1所述),一个KCo5人kappa轻链转基因(如Fishwild等(25)所述),和一个HCo7人重链转基因(如US 5,770,429所述)。
HCo12小鼠在其内源轻链(kappa)基因中有一个JKD中断(如Chen等(26)所述),在其内源重链基因中有一个CMD中断(如WO 01/14424的实施例1所述),一个KCo5人kappa轻链转基因(如Fishwild等(25)所述),和一个HCol2人重链转基因(如WO 01/14424的实施例2所述)。
在KM小鼠品系中,内源小鼠kappa轻链基因如Chen等(26)所述的那样被纯合地中断,并且内源小鼠重链基因如WO 01/09187的实施例1所述那样被纯合地中断。这种小鼠品系携带一个人kappa轻链转基因,KCo5,如Fishwild等(25)所述。该小鼠种系还携带一个人重链转染色体,其包括染色体14的片段hCF(SC20),如WO 02/43478所述。
来自这些转基因小鼠的脾细胞可用于根据众所周知的技术产生分泌人单克隆抗体的杂交瘤。这些转基因非人类动物、包含编码表达本发明所用抗体的可操作核酸序列的非人类动物、用一个或多个编码靶标的核酸序列稳定转染的非人类动物等,是本发明的额外特征。
本发明使用的人单克隆或多克隆抗体或者本发明使用的来源于其它物种的抗体,还可以用转基因方式来产生,其是通过产生另一种用目的免疫球蛋白重链和轻链序列转基因的非人类哺乳动物或植物,并由所述动物或植物生产可回收的形式的抗体。就哺乳动物中的转基因生产而言,抗体可以在山羊、牛或其他哺乳动物的奶中产生并回收。见例如US 5,827,690、US 5,756,687、US 5,750,172和US 5,741,957。
进一步,本发明使用的人类或其它抗体可以通过展示型(display-type)技术产生,这类技术包括但不限于噬菌体展示、逆转录病毒展示、核糖体展示和其它技术,使用本领域众所周知的技术,并且可以对所得的分子进行额外的突变,例如亲和性突变,因为这些技术是本领域熟知的(见例如参考文献27,28和30(噬菌体展示),29(核糖体展示),31-35和US 5,733,743)。如果使用展示技术产生非人类抗体,则这些抗体可以被人源化。
如上文解释的,在一些实施方案中,本发明方法中使用的第一和/或第二抗体是IgG4抗体。然而,本发明使用的抗体理论上可以是任何同种型,只要CH3区中的序列允许半分子交换即可。例如,本发明方法中使用或获得的抗体可以包括在SEQ ID NO:19-22中显示的任何恒定区序列(在任何指明的突变位置之外)。
因此,在本发明的一个实施方案中,第一和/或第二抗体在核心铰链区中包含CPPC序列。在另一个实施方案中,第一和/或第二抗体包含IgG4-样核心铰链区。例如,在一些实施方案中,所述第一和/或第二抗体是在核心铰链区中包含CX1X2C序列的抗体,其中X1和X2可以是任何氨基酸,但X1和X2不能都是脯氨酸。在另一个实施方案中,所述第一和/或第二抗体是在核心铰链区中包含CX3PC或CPX3C序列的抗体,其中X3可以是除脯氨酸之外的任何氨基酸。在进一步的实施方案中,所述第一和/或第二抗体是在核心铰链区中包含CSPC、CPSC、CRPC、CPRC、CGHC或CPHC序列的抗体。上述突变可以通过例如本领域众所周知的定点突变来引入。
同种型的选择通常由期望的效应功能(例如CDC诱导作用或ADCC中的活性)来指导。同种型的实例包括IgG1、IgG2、IgG3和IgG4(见例如SEQID NO:19-22)。可以使用人轻链恒定区kappa或lambda中的任何一种。如果希望的话,本发明使用的抗体类型可以通过已知的方法加以转换。例如,本发明使用的原本为IgM、IgG1或IgG2的抗体可以被类型转换为本发明的IgG4抗体。因此,本发明抗体的效应物功能可以通过同种型转换而变为例如IgG1,IgG2,IgG3,IgG4,IgD,IgA,IgE或IgM抗体,用于各种治疗用途。
在一个实施方案中,本发明使用的第一和/或第二抗体是全长抗体。在另一个实施方案中,本发明使用的第一和/或第二抗体是抗体片段。
在本发明的方法的一个实施方案中,第一和/或第二抗体包含IgG4CH3区,例如具有图18所示序列(SEQ ID NO:22)的IgG4CH3区。
然而,在本发明的方法的另一个实施方案中,第一和/或第二抗体包含非IgG4同种型的CH3区,其中该CH3区不包含,或者经过了修饰而不包含任何这样的氨基酸残基:所述氨基酸残基可以参与和包含相同的CH3区氨基酸序列的其它肽形成二硫键或者共价的或稳定非共价的重链间键。
例如,在此处的一个进一步的实施方案中,第一和/或第二抗体包含具有图18所示序列(SEQ ID NO:19)的CH3区,其中该CH3区已被修饰从而发生了一种或多种如下的氨基酸替换:238位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;239位的Asp(D)已被Glu(E)取代;292位的Lys(K)已被Arg(R)取代;302位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;和328位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
在一个优选实施方案中,第一和/或第二抗体包含具有如图18所示序列(SEQ ID NO:19)的CH3区,其中292位的Lys(K)已被Arg(R)取代。
在另一个实施方案中,第一和/或第二抗体包含具有如图18所示序列(SEQ ID NO:19)的CH3区,但是其中292位的Lys(K)已被Tyr(W)或Phe(F)取代。
在另一个进一步的实施方案中,第一和/或第二抗体包含具有如图18所示序列(SEQ ID NO:20)的CH3区,其中CH3区已被修饰从而发生了下列氨基酸替换中的一种或多种或者全部5种:234位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;276位的Met(M)已被Val(V)取代;288位的Lys(K)已被Arg(R)取代;298位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;和324位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
在一个优选的实施方案中,第一和/或第二抗体包含具有如图18所示序列(SEQ ID NO:20)的CH3区,其中234位的Arg(R)已被Gln(Q)取代。
在一个进一步优选的实施方案中,第一和/或第二抗体包含具有如图18所示序列(SEQ ID NO:20)的CH3区,其中234位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;且324位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
在另一个进一步的实施方案中,第一和/或第二抗体包含具有如图18所示序列(SEQ ID NO:21)的CH3区,其中CH3区已被修饰从而发生了下列氨基酸替换中的一种或多种或全部10种:285位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;314位的Ser(S)已被Asn(N)取代;322位的Asn(N)已被Lys(K)取代;327位的Met(M)已被Val(V)取代;339位的Lys(K)已被Arg(R)取代;349位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;352位的Ile(I)已被Val(V)取代;365位的Arg(R)已被His(H)取代;366位的Phe(F)已被Tyr(Y)取代;和375位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
在一个优选实施方案中,第一和/或第二抗体包含具有如图18所示序列(SEQ ID NO:21)的CH3区,其中285位的Arg(R)已被Gln(Q)取代。
在一个优选的实施方案中,第一和/或第二抗体包含具有如图18所示序列(SEQ ID NO:21)的CH3区,其中285位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;且375位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
在本发明方法的一个进一步的实施方案中,所述第一抗体在核心铰链区中包含CPPC并包含IgG4-样CH3区,且其中所述第二抗体在核心铰链区中包含CPPC并包含IgG4-样CH3区。
如上文解释的,在一个主要方面中,本发明涉及一种用于产生双特异性抗体的体外方法,所述方法包括如下步骤:
a)提供具有第一结合特异性的第一抗体,其中所述第一抗体包含IgG4-样CH3区,
b)提供具有不同于所述第一结合特异性的第二结合特异性的第二抗体,其中所述第二抗体包含IgG4-样CH3区,
c)在允许核心铰链区中的半胱氨酸发生二硫键异构化的还原条件下共同温育所述第一和第二抗体,和
d)获得双特异性抗体。
在本发明方法的一个实施方案中,选择步骤c)中的条件,使得核心铰链区之外不发生显著的二硫桥还原或异构化。
在另一个实施方案中,步骤c)中的还原条件是这样的条件:所述条件刺激核心铰链区的进行二硫键交换的内在活性。
在本发明进一步的实施方案中,步骤c)包括还原剂的添加。在进一步的实施方案中,步骤c)包括添加一种从下组选出的作用剂:谷胱甘肽、L-半胱氨酸、二硫苏糖醇、β-巯基乙醇和半胱胺(cysteamine)。
在本发明的方法的一个实施方案中,所述作用剂的浓度使得步骤c)中产生的溶液的氧化还原势等于(equal to)或者还原性更高于(more reducingthan)在实施例31所述的条件下由1μM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于在实施例31所述的条件下由10μM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由50μM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由0.1mM谷胱甘肽产生的氧化还原势。
在进一步的实施方案中,所述作用剂的浓度使得步骤c)中产生的溶液的氧化还原势
-等于或者还原性更高于在实施例31所述的条件下由1μM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于在实施例31所述的条件下由10μM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由50μM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由0.1mM谷胱甘肽产生的氧化还原势。且
-等于或者还原性低于(less reducing than)在实施例31所述的条件下由1M谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性低于由100mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,等于或者还原性低于由15mM谷胱甘肽产生的氧化还原势。
在一个实施方案中,其中第一抗体在核心铰链区中具有CPPC序列且/或第二抗体在核心铰链区中具有CPPC序列,优选的是,在步骤c)中产生的溶液的氧化还原势等于或者还原性更高于在实施例35所述的条件下由1mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由2mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由4mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由6mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由8mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由10mM谷胱甘肽产生的氧化还原势。
在进一步的实施方案中,所述还原剂的浓度使得步骤c)中产生的溶液的氧化还原势
-等于或者还原性更高于在实施例35所述的条件下由1mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由2mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由4mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由6mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由8mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由10mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,且
-等于或者还原性更低于于由1M谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性低于由100mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,等于或者还原性低于由15mM谷胱甘肽产生的氧化还原势。
在本发明方法的一个实施方案中,步骤c)包括将所述抗体在还原型谷胱甘肽的存在下在20℃或更高的温度下,例如在37℃下,温育至少一个小时,例如至少2个小时,例如至少5个小时,例如至少10个小时。
在本发明方法的进一步的实施方案中,选择步骤c)中的条件,使得用本文所述的大小排阻色谱进行确定时(其中先于起始材料的抗体洗脱的峰表示聚集物的形成),在所得的组合物中有少于10%,例如少于5%,例如少于2%,例如少于1%的抗体分子处于聚集状态。
在本发明的体外方法的一个实施方案中,该方法包括添加具有蛋白质二硫键异构酶活性的蛋白质,例如PDI。在本发明的体外方法的另一个实施方案中,该方法不包括添加具有蛋白质二硫键异构酶活性的蛋白质,例如PDI。
在本发明的体外方法的一个实施方案中,该方法不包括添加活细胞或细胞提取物。
如上文解释的,本发明方法中使用的第一和第二抗体在结合特异性方面有不同,即结合不同的表位。原则上,任何特异性的组合(any combinationsof specificities)均可用作本发明方法的起始材料。另外,本发明的方法并不限于仅以两种不同的抗体作为起始材料。因此,本发明的方法还可以用三种或更多种抗体作为起始材料来实施。在这样的实施方案中,本发明方法的步骤d)中获得的组合物可以含有多种双特异性抗体。
在本发明方法的一个实施方案中,第一抗体具有针对肿瘤细胞或肿瘤细胞蛋白,例如erbB1、erbB2、erbB3、erbB4、MUC-1、CD19、CD20、CD4、CD38或CXCR5,或者针对B细胞受体信号成分CD79a或CD79b,的结合特异性。在另一个实施方案中,第一抗体具有针对肿瘤细胞或肿瘤细胞蛋白,例如erbB1、erbB2、erbB3、erbB4、MUC-1、CD19、CD20、CD4、CD38或CXCR5,的结合特异性;而第二抗体具有针对肿瘤细胞蛋白,例如erbB1、erbB2、erbB3、erbB4、MUC-1、CD19、CD20、CD4或CXCR5,的结合特异性。
在一个进一步的实施方案中,第一抗体具有针对erbB1的结合特异性,而第二抗体具有针对erbB2的结合特异性。
在另一个实施方案中,第一抗体具有针对CD19的结合特异性,而第二抗体具有针对CD20的结合特异性。
在一个进一步的实施方案中,第一抗体具有针对CD38的结合特异性,而第二抗体具有针对CD34的结合特异性。
在一个更进一步的实施方案中,第一抗体具有针对CD4的结合特异性,而第二抗体具有针对CXCR5的结合特异性。
在本发明方法的另一个实施方案中,第一抗体具有针对病原微生物的结合特异性。在一个进一步的实施方案中,第一抗体具有针对病原微生物的结合特异性,而第二抗体具有针对效应细胞蛋白,例如CD3、CD25、CD28、CD16、CD89、CD32或CD1,的结合特异性。
双特异性抗体还可以用于将化疗剂更特异性地靶定到该药剂要作用的细胞。因此,在本发明方法的进一步实施方案中,第一抗体具有针对肿瘤细胞或肿瘤细胞蛋白,例如erbB1、erbB2、erbB3、erbB4、MUC-1、CD19、CD20、CD4或CXCR5,的结合特异性,而第二抗体具有针对化疗剂的结合特异性。
此外,通过使双特异性抗体包含针对血清蛋白质的结合特异性,可以改变抗体的血清半衰期。例如,可以通过使双特异性抗体包含针对血清白蛋白的结合特异性而延长血清半衰期。因此,在本发明方法的一个进一步的实施方案中,第一抗体具有针对肿瘤细胞或肿瘤细胞蛋白,例如erbB1、erbB2、erbB3、erbB4、MUC-1、CD19、CD20、CD4或CXCR5,的结合特异性,而第二抗体具有针对血液蛋白,例如血清白蛋白,的结合特异性。
第二结合特异性还可用于将抗体靶定到特定的组织,例如脑或肝脏。因此,在本发明方法的一个进一步的实施方案中,第一抗体具有针对肿瘤细胞或肿瘤细胞蛋白,例如erbB1、erbB2、erbB3、erbB4、MUC-1、CD19、CD20、CD4或CXCR5,的结合特异性,而第二抗体具有针对脑蛋白如铁传递蛋白,或肝蛋白的结合特异性。
而且,第二结合特异性可用于将凝血因子靶定到特定的期望作用位点。例如,具有针对肿瘤细胞的第一结合特异性和针对凝血因子的第二结合特异性的双特异性抗体能够将凝血作用导向肿瘤,从而制止肿瘤生长。因此,在本发明方法的一个进一步实施方案中,第一抗体具有针对肿瘤细胞或肿瘤细胞蛋白,例如erbB1、erbB2、erbB3、erbB4、MUC-1、CD19、CD20、CD4或CXCR5,的结合特异性,第二抗体具有针对参与凝血作用的蛋白,例如组织因子,的结合特异性。
在本发明进一步的实施方案中,第一和/或第二抗体与从下组选出的化合物相连:细胞毒剂;放射性同位素;前药或药物,例如紫杉烷;细胞因子;趋化因子和补体,例如C1q。这些化合物可以使针对靶细胞的杀伤更有效,例如在癌症治疗中。或者,可以将化合物与所得的双特异性抗体偶联,即在发生了半分子交换之后偶联。
在本发明方法的进一步的实施方案中,该方法还包括使步骤c)中获得的化合物处于非还原或还原性较低的条件下,以便终止进一步的半分子交换。这可以通过本领域已知的各种方法实现,例如对所得组合物进行透析或者基于大小的色谱,以除去小分子还原剂。
在本发明方法的更进一步的实施方案中,通过进行两个半分子的化学交联使所得的双特异性抗体稳定化,从而阻止任何进一步的交换的发生,即便该双特异性抗体随后被用于本会使抗体发生半分子交换的条件,例如体内条件。因此,在一个实施方案中,本发明的方法包括进一步的步骤:
a)使铰链区中的半胱氨酸化学交联,例如通过使用含有马来酰亚胺的化合物,例如双马来酰亚胺己烷(bis-maleimidohexane),
b)使半分子上的碳水化合物侧链化学交联,例如通过高碘酸盐(periodate)氧化,随后使醛基与合适的交联剂如己二酸二酰肼(adipinedihydrazide)反应,
c)使CH3区中不对称引入的半胱氨酸交联,例如以Merchant等(36)一文(本文通过提述纳入该文)中描述的方式,例如使用一种或多种如下的组合(援引SEQ ID NO:19):
-第一抗体中的D282C与第二抗体中的K275C,
-第一抗体中的D282S与第二抗体中的K275S,
-第一抗体中的Y232C与第二抗体中的S237C,
-第一抗体中的Y232C与第二抗体中的D239C,
-第一抗体中的Y232C与第二抗体中的E240C,
-第一抗体中的L234C与第二抗体中的S237C,
-第一抗体中的T277C与第二抗体中的V280C,
-第一抗体中的V280C与第二抗体中的K275C,
在进一步的方面中,本发明涉及使通过交联方法,例如上述三种交联方法中的任何一种,获得的或者可以获得的稳定化的双特异性抗体。
不论所得的双特异性抗体是否已通过交联被稳定化,本发明的方法,在一些实施方案中,可以进一步包含纯化双特异性抗体的步骤。含有双特异性抗体的混合物可以用标准色谱技术加以纯化,例如(但不限于)标准蛋白A色谱,蛋白G,蛋白L,阳离子/阴离子交换色谱,大小排阻色谱,疏水相互作用色谱,嗜硫(thiophilic)色谱,或使用旨在用于捕获IgG分子的配体(蛋白A模拟物,Llama VHH配体等)。或者,可以用标准技术沉淀IgG混合物,例如盐促沉淀(硫酸铵),添加有机溶剂(DMSO,乙醇),改变pH或非离子聚合物(聚乙二醇)。在另一种情境下,可以使用能浓集IgG分子的膜用过滤技术处理混合物。为了将双特异性抗体纯化到完全同质,可能需要将所有这些技术组合使用,因为某些混合物可能仍然含有非常接近于(next to)双特异性抗体的亲本IgG分子。然后可能需要额外的纯化步骤以将双特异性抗体与亲本单特异性IgG分子分离开来。这可以通过,例如,先使用针对第一结合亲和特异性的亲和柱进行结合和洗脱,然后使用针对第二结合特异性的亲和柱进行结合和洗脱的纯化方法来实现。在一个优选的实施方案中,特别是在没有实施化学交联的情况下,纯化在可防止进一步半分子交换的条件,例如非还原条件下进行。
(纯化的)双特异性抗体的数量、质量和纯度可以用常规的生物化学技术加以分析,这些技术例如吸附测量、HP-SEC、SDS-PAGE、非变性PAGE和RP-HPLC。能够区分双特异性抗体与亲本IgG分子的技术是特别感兴趣的。这些技术的实例包括(但不限于)IEF、cIEF、CIEX和质谱(ESI、MALDI),它们可以基于电荷和/或质量高精度地分离和检测分子。双特异性抗体的双重结合特异性可以用多种不同的结合测定模式进行估计,例如使用ELISA、RIA、表面等离子体共振(SPR)、生物膜层干扰测定(Boi-layer Interferometry)技术、DELFIA、FRET、ECL、Gyros和AlfaScreen。
在一个实施方案中,半分子交换可以在有利于形成针对两种目的抗原之一的双特异性抗体的条件下实施。例如,考虑针对抗原X和Y的抗体。如果用过量的针对抗原X的抗体实施交换,例如5倍过量或10倍过量,那么大多数或者全部针对抗体Y的抗体将变成双特异性(即识别抗原X和Y)。
在这个步骤之后,可以在基质固定的抗原Y和亲和柱色谱上对双特异性抗体进行纯化。被结合的抗体中高度富集了期望的双特异性抗体。未结合的针对抗原X的抗体可用于重复上述循环。
在需要稳定化以防止体内交换的情况下,可以如上所述地对双特异性抗体进行交联。在化学交联之后,可以通过用过量的针对抗原Z的抗体进行额外的交换反应,随后用固定在基质上的抗原Z吸附含有抗Z的抗体(例如通过亲和柱色谱),将未稳定化的抗体从稳定化的抗体中纯化出来。这样,未结合的组分将含有期望的稳定化双特异性抗体。
在本发明方法的一个更进一步的实施方案中,该方法还包括将所得的双特异性抗体配制供治疗应用的步骤。这包括将治疗有效量的双特异性抗体配制在适于人体使用,特别是适合于肠胃外给药,例如静脉内注射的水溶液中。
在进一步的方面中,本发明涉及一种产生双特异性抗体的体外方法,所述方法包括如下步骤:
a)提供具有第一结合特异性的第一抗体,其中所述第一抗体包含核心铰链区中的CPPC序列,以及IgG4-样CH3区,
b)提供具有不同于所述第一结合特异性的第二结合特异性的第二抗体,其中所述第二抗体包含核心铰链区中的CPPC序列,以及IgG4-样CH3区,和
c)在允许核心铰链区中的半胱氨酸发生二硫键异构化的还原条件下共同温育所述第一和第二抗体,和
d)获得双特异性抗体。
优选地,在步骤c)中已经添加了还原剂,其中该作用剂的浓度使得步骤c)中产生的溶液的氧化还原势等于或者还原性更高于在实施例35所述的条件下由1mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由2mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由4mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由6mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由8mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由10mM谷胱甘肽产生的氧化还原势。
在一个进一步的方面中,本发明涉及一种组合物,其包含通过本文所述任何一种本发明方法获得或可以获得的双特异性抗体。
在另一个的主要方面中,本发明涉及一种分离的双特异性抗体,其包含两个IgG4-样CH3区。
在一个实施方案中,所述抗体在核心铰链区中包含一个或两个CPPC序列。
在另一个实施方案中,所述抗体在核心铰链区中包含一个或两个CX1X2C序列,其中X1和X2可以是任何氨基酸,但X1和X2不能都是脯氨酸。
在一个进一步的实施方案中,所述抗体在核心铰链区包含一个或两个CX3PC或CPX3C序列,其中X3可以是除脯氨酸之外的任何氨基酸。
在一个更进一步的实施方案中,所述抗体在核心铰链区包含一个或两个CSPC、CPSC、CRPC或CPRC序列。
在所述分离的双特异性抗体的一些实施方案中,第一和/或第二CH3区属于非IgG4同种型,其中该CH3序列不包含,或经过修饰而不包含,任何这样的氨基酸残基:所述氨基酸残基可以参与和包含相同CH3区氨基酸序列的其它肽形成二硫键或共价或稳定的非共价重链间键。
在其一个进一步的实施方案中,第一和/或第二CH3区具有如图18中所示的序列(SEQ ID NO:19),其中该CH3区已被修饰从而发生了一种或多种如下的氨基酸替换:238位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;239位的Asp(D)已被Glu(E)取代;292位的Lys(K)已被Arg(R)取代;302位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;和328位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
在另一个进一步的实施方案中,所述第一和/或第二CH3区具有如图18中所示的序列(SEQ ID NO:20),其中该CH3区已被修饰从而发生了一种或多种如下的氨基酸替换:234位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;276位的Met(M)已被Val(V)取代;288位的lys(K)已被Arg(R)取代;298位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;和324位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
在一个更进一步的实施方案中,所述第一和/或第二CH3区具有如图18中所示的序列(SEQ ID NO:21),其中该CH3区已被修饰从而发生了一种或多种如下的氨基酸替换:285位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;314位的Ser(S)已被Asn(N)取代;322位的Asn(N)已被Lys(K)取代;327位的Met(M)已被Val(V)取代;339位的Lys(K)已被Arg(R)取代;349位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;352位的Ile(I)已被Val(V)取代;365位的Arg(R)已被His(H)取代;366位的Phe(F)已被Tyr(Y)取代;375位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
在一个更进一步的实施方案中,本发明抗体的第一和/或第二CH3区是IgG4CH3区。
在一个更进一步的方面中,本发明涉及一种组合物,例如包含本发明的双特异性抗体或者通过如上所述的任何一种本发明的方法获得或者可以获得的双特异性抗体的药物组合物,其用于作为药物,例如用作治疗癌症或感染性疾病的药物。
在一个更进一步的方面中,本发明涉及包含本发明的双特异性抗体或者通过如上所述的任何一种本发明的方法获得或者可以获得的双特异性抗体的组合物用于制备治疗癌症或感染性疾病的药剂的用途。
本发明的方法还可用于选择特别令人感兴趣的或有效的靶结合特异性组合(combination of target binding specificities)。例如使用本发明的方法,可以由一系列具有不同结合特异性的抗体制备一系列或“阵列”(matrix)不同的双特异性抗体。然后可以测试所得的双特异性抗体系列或阵列的期望的生物学性质,从而选择出最佳的组合。
因此,在一个更进一步的方面中,本发明涉及一种用于选择具有期望性质的双特异性抗体的方法,所述方法包括如下步骤:
a)提供一系列抗体,其中每种抗体均具有不同的靶点特异性(eachantibody has a different target specificity),并且其中每种抗体均包含IgG4-样CH3区,
b)将所述系列中的每种抗体与所述系列中的另一种抗体在还原条件下一起进行温育,从而产生一系列的抗体混合物,其中每种混合物均包含不同的双特异性抗体(each mixture contains a different bispecific antibody),
c)测定所得系列抗体混合物的给定的期望性质,和
d)选择具有所述期望性质的双特异性抗体混合物。
上述方法中的步骤b)可以按照上文关于步骤c)的描述加以实施。
在一个实施方案中,所测试的期望性质是肿瘤细胞杀伤。
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38.Akkerdaas,van Ree et al.1995 Allergy 50(3),215-220
39.de Groot et al.1988 J.Allergy Clin.Immunol.82,778
进一步通过如下的实施例进行举例说明本发明,这些实施例不应理解为对本发明的进一步限制。
实施例
实施例1:寡核苷酸引物和PCR扩增
寡核苷酸引物由Isogen Bioscience(Maarssen,荷兰)合成并定量。引物在H2O中溶解为100pmol/μl,并保存于-20℃。下面给出了全部PCR引物和测序引物的汇总。PCR根据制造商的说明使用
Figure G2008800182801D00311
Hotstart DNA聚合酶(Stratagene,Amsterdam,荷兰)。每个反应混合物含有200μM混合dNTP(Roche Diagnostics,Almere,荷兰),正向和反向引物各6.7pmol,100ng基因组DNA或1ng质粒DNA,和1单位
Figure G2008800182801D00312
Hotstart DNA聚合酶,溶于总体积20μl的PCR反应缓冲液(与聚合酶一起提供)中。PCR反应使用TGradient Thermocycler 96(Whatman Biometra,Goettingen,德国),进行32个循环的程序:95℃变性2min、95℃30sec、60-70℃梯度(或另一特定退火温度)30sec、和72℃3min共30个循环;最后在72℃延伸10min。如果合适,将PCR混合物保存于4℃直至进一步的分析或处理。
实施例2:琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶电泳根据Sambrook(37)使用50ml凝胶在1x Tris乙酸EDTA缓冲液中进行。通过在凝胶中掺入溴化乙锭,并在UV光下进行观察来使DNA可视化。使用CCD相机和图像分析系统(GeneGnome;Syngene,viaWestburg B.V.,Leusden,荷兰)记录凝胶图像。
实施例3:PCR产物的分析、纯化及酶解
使用MinElute PCR提纯试剂盒(Qiagen,via Westburg,Leusden,荷兰;产品号28006)根据制造商的使用说明提纯期望PCR片段。用UV分光光度计定量分离的DNA,通过琼脂糖凝胶电泳估计品质。
或者,使用1%Tris乙酸EDTA琼脂糖凝胶进行琼脂糖凝胶电泳来分离PCR或消化产物(例如当存在多种片段时),。将期望的片段从凝胶中切下,用QIAEX II凝胶提取试剂盒(Qiagen;产品编号20051)根据制造商的使用说明进行回收。
实施例4:通过UV分光光度计对DNA进行定量
用NanoDrop ND-1000分光光度计(Isogen Life Science,Maarssen,荷兰)根据制造商的使用说明测定核酸的光密度。通过分析260nm的光密度(OD)(1OD260nm单位=50μg/ml)来测量DNA的浓度。对于所有样品,使用溶解核酸的缓冲液作为参考。
实施例5:限制性酶消化
限制酶和补充材料系从New England Biolabs(Beverly,MA,USA)或Fermetas(Vilnius,立陶宛)获得,并根据制造商的使用说明来使用。
在最终体积为l0μl(反应体积视需要比例放大)的合适缓冲液中用5单位的酶消化DNA(100ng)。将消化体系在推荐的温度下温育至少60min。对于需要使用不相容的缓冲液或不同温度要求的限制酶进行双重消化的片段,顺次进行消化。如果需要,通过琼脂糖凝胶电泳和凝胶提取对消化产物进行纯化。
实施例6:DNA片段的连接
用Quick Ligation Kit(New England Biolabs)根据制造商的使用说明进行DNA片段的连接。对于每个连接体系,将载体DNA与大约3倍摩尔过量的插入DNA进行混合。
实施例7:大肠杆菌(E.coli)的转化
根据制造商的说明使用热激法将质粒DNA(1-5μl DNA溶液,通常为2μl DNA连接混合物)转化到One Shot DH5α-T1R或MACH-1T1R感受态大肠杆菌细胞(Invitrogen,Breda,荷兰;产品编号12297-016)中。接着,将细胞涂布在含有50μg/ml氨苄青霉素的Luria-Bertani(LB)琼脂平板上。平板在37℃温育16-18h,直到细菌菌落变得明显。
实施例8:通过PCR筛选细菌菌落
使用HotStarTaq Master Mix试剂盒(Qiagen;产品编号203445)和合适的正向和反向引物(附录1),通过菌落PCR筛选细菌菌落中含有期望序列的载体的存在。用20μl吸液管尖端轻轻碰触所选克隆,并2ml LB中短暂碰触以进行小量培养,然后重新悬浮在PCR混合物中。PCR使用TGradientThermocycler 96,使用35个循环的程序:95℃变性15min;35个循环的94℃30sec、55℃30sec、和72℃2min;然后在72℃进行10min的最终延伸步骤。如果合适,将PCR混合物保存于4℃直至通过琼脂糖凝胶电泳进行分析。
实施例9:从大肠杆菌培养物分离质粒DNA
使用下列的Qiagen产试剂盒(购自Westburg,Leusden,荷兰)根据制造商的说明从大肠杆菌培养物分离质粒DNA。对于大量质粒制备(50-150ml培养物),使用HiSpeed Plasmid Maxi试剂盒(产品编号12663)或HiSpeedPlasmid Midi试剂盒(产品编号12643)。对于小量质粒制备(±2ml培养物),使用Qiaprep Spin Miniprep试剂盒(产品编号27106),将DNA洗脱于50μl洗脱缓冲液(与试剂盒一起提供)中。
实施例10:DNA测序
质粒DNA用本领域已知的标准程序进行测序。使用Vector NTI软件(Informax,Oxford,UK)进行序列分析。
实施例11:在HEK-293F细胞中瞬时表达
从Invitrogen获得FreestyleTM 293-F(一种适于悬浮生长和化学限定Freestyle培养基的HEK-293亚克隆,例如HEK-293F)细胞,并用293fectin(Invitrogen)根据制造商的规程进行转染。
实施例12:pTomG4,一种用于表达可变重链区和人IGG4恒定区的载体,的构建
从一名志愿者血液样品中分离基因组DNA,用其作为模板,使用引物IGG4gene2f和IGG4gene2r(见下表)PCR扩增IgG4重链的完整基因组恒定区,同时引入合适的用于克隆进入哺乳动物表达载体pEE6.4(LonzaBiologics)的限制位点。对PCR片段进行纯化并克隆到pEE6.4中。为此,用HindIII和EcoRI消化PCR产物,随后将限制酶热失活。用HindIII和EcoRI消化pEE6.4载体,随后将该限制酶热失活,并用虾碱性磷酸酶(shrimpalkaline phosphatase)使载体片段去磷酸化,随后将该磷酸酶热失活。连接IgG4片段和pEE6.4 HindIII/EcoRI去磷酸化载体,并转化进入感受态MACH1-T1R细胞(Invitrogen)。使3个克隆在LB中生长,并从小培养物(1.5mL)分离质粒DNA。限制性消化显示出与将IgG4片段克隆到pEE6.4载体中一致的模式。将来自2个克隆的质粒DNA转化进入DH5α-T1R大肠杆菌,分离质粒DNA,并通过分析插入物的序列对构建体进行检查,发现一个克隆与一种来自Genbank数据库的基因组IgG4克隆相同,只是在内含子中有一些微小差异。这些差异可能是由于多态性或者Genbank序列的序列错误导致的。将该质粒命名为pTomG4。
表1:引物序列
  名称   寡序列
  VLexbetv1rev   AGCCACCGTACGTTTGATTTCCAGCTTGGTGCCTCC(SEQ ID NO:1)
  VLexbetv1for   GATGCAAGCTTGCCGCCACCATGGAGTCACAGATTCAGGCATTT(SEQ ID NO:2)
  VHexbetv1rev   CGATGGGCCCTTGGTGCTGGCTGAGGAGACGGTGACTGAGGT(SEQ ID NO:3)
  VHexbetv1for   GATGCAAGCTTGCCGCCACCATGAAATGCAGCTGGGTTATCTTC(SEQ ID NO:4)
  VLexfeld1rev   AGCCACCGTACGTTTTATTTCCAACTTTGTCCCCGA(SEQ ID NO:5)
  VLex feld1for   GATGCAAGCTTGCCGCCACCATGGAATCACAGACTCAGGTCCTC(SEQ ID NO:6)
  VHexfeld1rev   CGATGGGCCCTTGGTGCTGGCTGCAGAGAAAGTGACCAGAGT(SEQ ID NO:7)
  VHexfeld1for   GATGCAAGCTTGCCGCCACCATGGGATGGAGCTATATCATCCTC(SEQ ID NO:8)
  IGG4gene2r   TGAGAATTCGGTGGGTGCTTTATTTCCATGCT(SEQID NO:9)
  IGG4gene2f   GTAGAAGCTTACCATCGCGGATAGACAAGAACC(SEQ ID NO:10)
  RACEKmm1   TGTTAACTGCTCACTGGATGGTGGGA(SEQ ID NO:11)
  RACEG1mm1   TCCCTGGGCACAATTTTCTTGTCCACC(SEQ IDNO:12)
  ShortUPMH3   TGAAAGCTTCTAATACGACTCACTATAGGGC(SEQ IDNO:13)
  名称   寡序列
  LongUPMH3   TGAAAGCTTCTAATACGACTCACTATAGGGCAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT(SEQ ID NO:14)
实施例13:小鼠抗Betv1抗体和抗Feld1抗体可变区的克隆
用RNeasy试剂盒(Qiagen,Westburg,Leusden,荷兰)根据制造商的方案从0.3x105(Betv1)或0.9x105(Feld1)小鼠杂交瘤细胞(对于Betv1:来自参考文献38的克隆2H8,对于Feld1:来自参考文献39的克隆4F7)制备总RNA。
使用SMART RACE cDNA Amplification试剂盒(BD BiosciencesClontech,Mountain View,CA,USA),根据制造商的方案从大约100ng总RNA制备RNA的5’-RACE-互补DNA(cDNA)。
通过PCR扩增Betv1和Feld1抗体的VL和VH区。为此,根据制造商的说明使用
Figure G2008800182801D00361
Hotstart DNA聚合酶(Stratagene)。每个反应混合物含有200μM混合dNTP(Roche Diagnostics),12pmol反向引物(用于VH区的RACEG1mm1,用于VL区的RACEKmm1),7.2pmol UPM-Mix(UPM-Mix:2μM ShortUPMH3和0.4μM LongUPMH3寡核苷酸),0.6μl如上所述的5’RACE cDNA模板,和1.5单位Hotstart DNA聚合酶,溶于总体积为30μl的PCR反应缓冲液(与聚合酶一起提供)中。
PCR反应使用TGradient Thermocycler 96(Whatman Biometra)进行,使用35个循环的程序:95℃变性2min;35个循环的95℃30sec,55℃30sec,和72℃1.5min;最后在72℃延伸10min。反应产物通过琼脂糖凝胶电泳在1%TAE琼脂糖凝胶上进行分离,并用溴化乙锭染色。从凝胶上切下大小正确的条带,用QiaexII凝胶提取试剂盒(Qiagen)从琼脂糖中分离DNA。
将凝胶分离的PCR片段与200μM dATP和2.5单位Amplitaq(PerkinElmer)在72℃温育10min以添加A尾巴,并用微型洗脱柱(Qiagen)进行纯化。使用pGEMT easy载体系统II试剂盒(Promega)按照制造商的方案将添加了A尾巴的PCR片段克隆到pGEMTeasy载体(Promega)中。将2μl连接混合物转化到OneShot DH5αT1R感受态大肠杆菌(Invitrogen)中,并涂布在LB/Amp/IPTG/Xgal平板上。为每个VH和VL序列挑取4个含有插入序列的白色克隆,并对插入序列进行测序。SEQ ID NO:15和16给出了Betv1VH和VL的推导氨基酸序列,SEQ ID NO:17和18给出了Feld1的推导氨基酸序列。
VH序列Betv1(SEQ ID NO:15):
mkcswvifflmavvtgvnsevqlqqsgaelvkpgasvklsctasgfnikdtyihWvkqrpeqglewvgridpatgntrydpkfqgkatitadtssntaylqlssltsedtavyycasfrpgyaldywgqgtsvtvss
VL序列Betv1(SEQ ID NO:16):
mesqiqafvfvflwlsgvdgdivmtqshkfmstsvgdrvsftckasqdvftavawyqqkpgqspklliywastrrtgvpdrftgsgsgtdytltissvqaedlalyycqqhfstpptfgggtkleik
VH序列Feld1(SEQ ID NO:17):
mgwsyiilflvatatdvhsqvqlqqpgaelvkpgasvklsckasgysftsywmhwlkqrpgqglewigeinpnngrtyynekfktkatltvdkssstaymqlnsltsedsavyycarrltmvesfaywgqgtlvtfsa
VL序列Feld1(SEQ ID NO:18):
mesqtqvlmsllfwvsgtcgdivmtqspssltvtagekvtmsckssqsllnsgnqknyltwyqqkpgqppklliywastresgvpdrftgsgsgtdfsltissvqaedlaiyycqndysypftfgsgtkleik
实施例14:pConG1fBetV1:用于产生Betv1-IgG1重链的载体的构建
使用引物VHexbetv1for和VHexbetv1rev从含有小鼠抗BetV1抗体的VH编码区的质粒(实施例13)中PCR扩增该区,同时引入用于克隆到pConG1f0.4中的合适的限制性位点和理想的Kozak序列。凝胶纯化VH片段并克隆到pConG1f0.4中。为此,用HindIII和ApaI消化PCR产物和pConKappa0.4载体并加以纯化。将VH片段和pConG1f0.4HindIII-ApaI消化载体加以连接,并转化到感受态DH5α-T1R细胞中。选择含有正确插入序列大小的克隆,并确认正确的序列。将该质粒命名为pConG1fBetv1。
实施例15:pConKBetv1:用于产生Betv1轻链的载体的构建
使用引物VLexbetv1for和VLexbetv1rev从含有小鼠抗BetV1抗体的VL编码区的质粒(实施例13)中扩增该区,同时引入用于克隆到pConK0.4中的合适的限制性位点和理想的Kozak序列。用HindIII和BsiWI对PCR产物和pConKappa0.4载体进行消化,并加以纯化。将VL片段和pConKappa0.4HindIII-BsiWI消化的载体加以连接,并转化到感受态DH5α-T1R大肠杆菌中。选择含有正确插入序列大小的克隆,并对序列进行确认。将该质粒命名为pConKBetv1。
实施例16:pTomG4Betv1:用于产生Betv1-IgG4重链的载体的构建
为了构建用于表达Betv1-IgG4的载体,将BetV1的VH区克隆到pTomG4中。为此,用HindIII和ApaI消化pTomG4和pConG1fBetv1,并分离相关片段。将Betv1VH片段和pTomG4HindIII-ApaI消化的载体加以连接,并转化到感受态DH5α-T1R细胞中。选择含有正确插入序列大小的克隆,并确认序列。将该质粒命名为pTomG4Betv1。
实施例17:pConG1fFeld1:用于产生Feld1-IgG1重链的载体的构建
使用引物VHexfeld1for和VHexfeld1rev从含有小鼠抗Feld1抗体的VH编码区的质粒(实施例13)中PCR扩增该区,同时引入用于克隆到pConG1f0.4中的合适的限制性位点和理想的Kozak序列。将VH片段进行凝胶纯化并克隆到pConG1f0.4中。为此,用HindIII和ApaI对PCR产物和pConKappa0.4载体进行消化,并进行纯化。将VH片段和pConG1f0.4HindIII-ApaI消化的载体进行连接,并转化到感受态DH5α-T1R细胞中。选择含有正确插入序列大小的克隆,并确认序列。将该质粒命名为pConG1fFeld1。
实施例18:pConKFeld1:用于产生Feld1轻链的载体的构建
使用引物VLexfeld1for和VLexfeld1rev从含有小鼠抗Feld1抗体的VL编码区的质粒(实施例13)中通过PCR扩增该区,同时引入用于克隆到pConK0.4中的合适的限制性位点和理想的Kozak序列。用HindIII和BsiWI对PCR产物和pConKappa0.4载体进行消化,并加以纯化。将VL片段和pConKappa0.4HindIII-BsiWI消化的载体加以连接,并转化到感受态DH5α-T1R大肠杆菌中。选择含有正确插入序列大小的克隆,并确认序列。将该质粒命名为pConKFeld1。
实施例19:pTomG4Feld1:用于产生Feld1-IgG4重链的载体的构建
为了构建用于表达Feld1-IgG4的载体,将Feld1的VH区克隆到pTomG4中。为此,用HindIII和ApaI对pTomG4和pConG1fFeld1进行消化,并分离相关片段。连接Feld1VH片段和pTomG4HindIII-ApaI消化的载体,并转化到感受态DH5α-T1R细胞中。选择含有正确插入序列大小的克隆,并确认序列。将该质粒命名为pTomG4Feld1。
实施例20:用于表达2F8-IgG4和7D8-IgG4的抗体表达载体的构建
构建了用于表达HuMab 2F8(IgG1-EGFR)和HuMab 7D8(IgG1-CD20)的表达载体。将HuMab 2F8(WO 02/100348)和HuMab 7D8(WO 04/035607)的VH和VL编码区克隆到用于产生IgG1重链的表达载体pConG1f(LonzaBiologics)和用于产生kappa轻链的pConKappa中,产生载体pConG1f2F8、pConG1f7D8、pConKappa2F8和pConKappa7D8。通过HindIII/ApaI消化从pConG1f2F8和pConG1f7D8中移出这些载体的VH区,并插入到HindIII/ApaI消化的pTomG4载体中,分别产生pTomG42F8和pTomG47D8。
实施例21:通过在HEK-293F细胞中进行瞬时表达产生Betv1-IgG1、Betv1-IgG4、Feld1-IgG1和Feld1-IgG4
根据制造商的使用说明,使用293fectin在HEK-293F细胞中共转染相关的重链和轻链载体,以从所有构建体产生抗体。对于Betv1-IgG1,共表达pConG1Betv1和pConKBetv1。对于Betv1-IgG4,共表达pTomG4Betv1和pConKBetv1。对于Feld1-IgG1,共表达pConG1Feld1和pConKFeld1。对于Feld1-IgG4,共表达pTomG4Feld1和pConKFeld1。对于IgG1-EGFr,共表达pConG1f2F8和pConKappa2F8。对于IgG4-EGFr,共表达pTomG42F8和pConKappa2F8。对于IgG1-CD20,共表达pConG1f7D8和pConKappa7D8。对于IgG4-CD20,共表达pTomG47D8和pConkappa7D8。
实施例22:IgG1和IgG4抗体的纯化
通过蛋白A亲和色谱纯化IgG1和IgG4抗体。用0.20μM盲端滤膜(dead-end filter)过滤细胞培养上清,随后上样到5ml蛋白A柱(rProtein A FF,GE Healthvcare)上,并用0.1M柠檬酸-NaOH,pH 3对IgG进行洗脱。洗脱物立即用2M Tris-HCl,pH 9中和,并对12.6mM磷酸钠,140mM NaCl,pH7.4(B.Braun,Oss,荷兰)中过夜透析。透析后,用0.20μM盲端滤膜进行无菌过滤。经纯化的IgG的浓度通过浊度测定法和280nm吸光度加以测定。纯化的蛋白通过SDS-PAGE、IEF、质谱和糖分析(Glycoanalysis)进行分析。
实施例23:经纯化的IgG的SDS-PAGE分析
提纯之后,对Betv1和Feld1,IgG1和IgG4抗体进行非还原性SDS-PAGE分析。所用的Bis-Tris电泳方法是Laemmli方法的修改形式(Laemmli 1970Nature227(5259):680-5),其中样品在中性pH下运行。SDS-PAGE凝胶用考马斯染色,并用GeneGenius(Synoptics,Cambridge,UK)进行数字成像。
如图1所示,Betv1和Feld1 IgG1显示1条主带,代表全长四聚体型(2条重链和2条轻链)Feld1和Betv1 IgG1分子。Betv1和Feld1 IgG4除了代表四聚体IgG4分子的主带之外,还显示有相当量的半分子(即一条重链和一条轻链)。
实施例24:小鼠中IgG4半分子交换的估计
使用5只6-8周龄nu/nu Balb/c小鼠来追踪IgG4半分子交换。将小鼠圈养在中央实验动物设施(Central Laboratory Animal Facility)(Utrecht,荷兰)的屏障单位(barrier unit)中,置于滤盖笼(filter-top cages)内,水和食物自由摄取。所有的实验均得到Utrecht大学动物伦理委员会的批准。
腹膜内施用嵌合抗体。在施用后4.25小时、24小时、48小时和72小时采取血液样品(75-100μl)。将血液收集在含有肝素的小瓶中,并在10.000g离心5分钟以分离血浆和细胞。将血浆保存在-20℃,用于确定抗原特异性抗体和双特异性抗体水平。
在本实验中,将嵌合IgG4半分子(n=2)的交换与IgG1半分子(n=3)的交换相比较。将Betv1和Feld1特异性抗体(IgG1或IgG4)的混合物以每只小鼠200μl计600μg(每种抗原特异性抗体300μg)的剂量施用给小鼠。
在抗原结合试验中测量Betv1或Feld1结合性抗体的血浆浓度。为此,将血浆样品与0.75mg蛋白G Sepharose(Amersham Biosciences,Uppsala,Sweden)温育在750μl PBS-IAT(PBS添加1μg/ml IVIg,0.3%牛血清白蛋白,0.1%Tween-20和0.05%(w/v)NaN3)中,在125I标记的Betv1或125I标记的Feld1存在条件下温育24h。接着,用PBS-T(PBS添加0.1%Tween-20和0.05%(w/v)NaN3)清洗Sepharose,测量结合的放射性的量相对于添加的放射性的量的比。用纯化的Betv1特异性抗体或Feld1特异性抗体作为标准(每个试验的范围0-200ng,由浊度测量法确定)计算Betv1或Feld1特异性IgG的浓度。双特异性IgG的浓度在异源交联测定的两种变型中加以测量。在第一种测定中,在总体积300μl的PBS-IAT中将血浆与Sepharose偶联的Betv1(0.5mg)温育24h。随后,用PBS-T清洗Sepharose,并与125I标记的Feld1温育24h,之后用PBS-T清洗Sepharose,测量结合的放射性的量相对于所添加放射性的量。用Feld1结合试验的校正曲线计算双特异性IgG(Betv1-Feld1)的浓度,该校正曲线是由纯化的Feld1结合性rIgG获得的。在第二种测定中,使用Sepharose偶联的rFeld1(0.5mg)和125I标记的Betv1通过相似的程序测量Feld1-Betv1交联活性。用纯化的Betv1特异性rIgG作为标准(与Betv1结合试验中的曲线相同)计算双特异性IgG(Feld1-Betv1)的浓度。
在图2中,双特异性IgG(Feld1-Betv1)的浓度相对于不同时间点上的Betv1结合性IgG的浓度作图。与给予IgG4的小鼠形成对照的是,给予IgG1混合物的小鼠体内没有观察到双特异性IgG。24h后,双特异性IgG4的产生达到最大,对应于100%交换。
在图3A中,随时间追踪双特异性人IgG4的形成。在注射了IgG4而非IgG1的混合物的小鼠血浆中经过一段时间出现了双特异性抗体,双特异性反应力在温育1-2天后达到最大值即大约50%(注意:如果等量的IgG4-Betv1和IgG4-Feld1被交换,在半抗体的随机和完全交换之后最多会有50%的IgG4-Betv1半抗体被掺入到双特异性部分中)。等量的IgG4-Betv1和IgG4-Feld1之间的随机Fab臂交换可相当于大约一半的IgG4分子获得双特异性。作为对照,将20倍过量的针对无关抗原的IgG4(从抗EGFr抗体2F8产生的IgG4)与IgG4-Betv1和IgG4-Feld1一起注射到小鼠体内。过量的无关IgG4与Betv1-Feld1双特异性IgG4的产生相竞争。
在另一个实验中(图3B),对相同的小鼠血浆样品测试其将放射性标记的可溶性Feld1交联到Sepharose固定的Feld1上的能力。结果发现,在给予等量IgG4而非IgG1混合物的小鼠体内单特异性交联活性被降低,表明单特异性交联活性的损失。在大约1天后,达到最大减少即~50%。在给予额外的过量无关IgG4的小鼠体内,单特异性交联活性以相似的动力学几乎完全消失。
进行大小排阻色谱以排除在给予IgG4的小鼠体内观察到的双特异活性是IgG聚集的结果的可能性(见图4)。为此,将血浆样品(在t=24h获取)在Superdex200柱上分级,之后测量级分中的Feld1结合性IgG和Betv1-Feld1交联性IgG。Feld1结合性抗体洗脱出一个峰,保留体积为~12.9ml,其对应于单体IgG的保留体积。在相同的级分中检测到了异源Betv1-Feld1交联活性,表明双特异活性与单体IgG有关。在含有rIgG1的血浆中,在分级之前不存在Betv1-Feld1交联活性。同样,在洗脱的级分中,没有测量出异源交联活性(数据未显示)。
实施例25:评估全血(成分)中的交换活性
将嵌合抗体混合,随后与全血、血细胞、血浆或血清温育,以研究全血(成分)的交换活性。
在本实验中,对来自两个健康血液供体A和B的全血中的IgG4半分子的交换进行评估,所述全血中IgG4的内源血浆水平通过浊度测量加以确定(分别为346和554μg/ml)。将全血采取在添加有终浓度为40μg/ml的TFPI(组织因子通道抑制剂,来自Chiron Corporation,Emeryville,California)的采血管中。通过全血离心获得血细胞和血浆。将细胞级分用Optimem(Invitrogen,Breda,荷兰)清洗3次,随后重悬在Optimem中。将全血在含有促凝剂的玻璃采血管中37℃温育30min,之后将凝血离心下来,获得血清。评估IgG4半分子的交换,并与IgG1半分子的交换进行比较。作为对照,还将血液样品在没有嵌合抗体的条件下进行温育。在PBS中制备如下的抗体混合物:
1.Betv1特异性IgG4(10μg)和Feld1特异性IgG4(10μg)
2.Betv1特异性IgG1(10μg)和Feld1特异性IgG1(10μg)
将这些抗体混合物与血液、血细胞、血浆或血清一起在水平回转振荡器(125rpm)上37℃温育,总体积为100μl(每种抗体的终浓度为0.1μg/ml)。与全血或血细胞的温育混合物中的最终血细胞比容为大约~40%。24h后,将温育混合物在Eppendorf离心机中以2800rpm离心1min,之后吸取10μl样品至500μl PBS-AT(PBS添加0.3%牛血清白蛋白,0.1%Tween-20和0.05%(w/v)NaN3)中。如果需要,将样品存储在4℃。
在异源交联测定中测量双特异活性(即Feld1-Betv1交联活性)。在此测定中,将样品与0.5mg Sepharose偶联的重组Feld1在总体积为300μl的PBS-IAT(PBS-AT添加1μg/ml IVIg)中温育24h。随后,用PBS-T清洗Sepharose,并与125I标记的Betv1温育24h,之后用PBS-T清洗Sepharose,并测量结合的放射性的量相对于所添加放射性的量。
在图5中,双特异活性用结合的125I标记Betv1的百分比表示,其是在异源交联测定中加以确定的。双特异活性是IgG4半分子交换的量度。IgG4半分子交换主要在全血和全血的细胞级分中观察到(图5a)。细胞级分中的双特异性水平甚至高于全血。对于这一点最有可能的解释是,在细胞级分中,内源IgG4-其也能够与所添加的嵌合IgG4抗体发生交换-不再存在了。在血浆和血清中也能够观察到一些双特异活性,但是这个活性远远低于在血浆中观察的水平,仅略高背景水平1.7%,后者是通过在Optimem中温育IgG4混合物获得的。在任何含IgG1的温育物中均没有观察到双特异活性(图5b)。同样在没有嵌合抗体的对照温育物中,也没有观察到双特异活性(图5c)。进行了大小排阻色谱以排除在IgG4混合物中观察到的双特异活性是IgG聚集的结果的可能性。为此,将样品(在t=24h获取)在Superdex200柱上分级,然后测量级分中的Feld1结合性IgG和Betv1-Feld1交联性IgG。Feld1结合抗体洗脱出一个峰,保留体积为~12.9ml,其对应于单体IgG的保留体积。在相同的级分中检测到了异源的Betv1-Feld1交联性活性,表明双特异活性与单体IgG有关(数据未显示)。
实施例26:评估血细胞介导的IgG4交换活性
将嵌合抗体混合,随后与三个不同类型的人血细胞(即单个核细胞(MNC)、红细胞和血小板)温育,以研究IgG4的交换活性。
将来自一个匿名供体的全血抽入含有肝素的采血管中,随后在Percoll(Pharmacia Fine Chemicals,Uppsala,Sweden)中离心以分离MNC。将分离的MNC重悬在Optimem无血清培养基(Invitrogen,Breda,荷兰)中备用。新鲜纯化的血细胞和血小板(由Blood Cell Research Department of Sanquin提供)获自两个不同的匿名供体。这些细胞在清洗3次之后也重悬在Optimem中。此外,向血小板中补充10mM葡萄糖。
评估IgG4半分子的交换,并与IgG1半分子的交换进行比较。在PBS中制备了如下的抗体混合物:
-Betv1特异性IgG4(10μg)和Feld1特异性IgG4(10μg)
-Betv1特异性IgG1(10μg)和Feld1特异性IgG1(10μg)
在水平回转振荡器(125rpm)上将这些抗体混合物下与1.8x104的MNC,4.0x108的红细胞或3.5x104的血小板(每种抗体的终浓度均为0.1μg/ml)在100μl总体积中于37℃温育。48h后,将温育混合物在Eppendorf离心机中以2800rpm离心1min,之后吸取10μl样品至500μl PBS-AT(PBS添加0.3%牛血清白蛋白,0.1%Tween-20和0.05%(w/v)NaN3)中。如果需要,将样品保存在4℃。
在异源交联测定中测量双特异活性(即Feld1-Betv1交联活性)。在此测定中,将样品与0.5mg Sepharose偶联的重组Feld1在PBS-IAT(PBS-AT添加1μg/ml IVIg)中(总体积为300μl)温育24h。随后,用PBS-T清洗Sepharose,并与125I标记的Betv1温育24h,之后用PBS-T清洗Sepharose,并测量结合的放射性的量相对于所添加放射性的量。
在图6中,双特异活性用结合的125I标记Betv1的百分比显示,其是在异源交联测定中测得的。所有三种细胞类型均能够诱导双特异活性。在Optimem无血清培养基中也可观察到一些双特异活性,但是这个活性远远低于有血细胞存在时观察到的水平。所有测试细胞均不能交换IgG1半分子。
实施例27:通过人和小鼠细胞系评估IgG4交换
将嵌合IgG4抗体混合,然后与三个不同的细胞系(即人胚胎肾(HEK)细胞、小鼠B细胞或杂交瘤)温育,以研究IgG4的交换活性。
选择细胞系J558(由Antigen Presentation Research Group of Sanquin提供)作为小鼠B细胞来源。产生抗C1酯酶抑制剂的杂交瘤获自AutoimmuneResearch Group of Sanquin。悬浮HEK(293F)细胞从Invitrogen,Breda,荷兰获得。所有细胞用PBS清洗3次,之后将细胞重悬在PBS中。
通过将含有Betv1特异性IgG4(2μg)和Feld1特异性IgG4(2μg)的抗体混合物与前述细胞一起温育评估IgG4半分子的交换。将抗体混合物在水平回转振荡器(125rpm)上与24x105HEK细胞、25x105小鼠B细胞或21x105杂交瘤在50μl总体积中(每种抗体的终浓度为80μg/ml)37℃温育。0h和24h后,将温育混合物在Eppendorf离心机中以2800rpm离心1min,之后吸取样品至PBS-AT(PBS添加0.3%牛血清白蛋白,0.1%Tween-20和0.05%(w/v)NaN3)中。如果需要,将样品保存在4℃。
在异源交联测定中测量双特异活性(即Feld1-Betv1交联活性)。在此测定中,将样品的稀释物与0.5mg Sepharose偶联的重组Feld1在PBS-IAT(PBS-AT添加1μg/ml IVIg)中(总体积为300μl)温育24h。然后,用PBS-T清洗Sepharose,并与125I标记的Betv1温育24h,之后用PBS-T清洗Sepharose,并测量结合的放射性的量相对于所添加放射性的量。
在图7中,双特异活性用结合的125I标记Betv1的百分比显示,其是在所述异源交联测定中确定的。所有三种细胞类型均能够交换IgG4半分子。
实施例28:红细胞介导的IgG4半分子交换的评估
将嵌合抗体混合,然后与人红细胞温育,以研究IgG4半分子的交换。从单个供体纯化红细胞,并在SAGM(盐水、腺苷、葡萄糖、甘露醇)缓冲液中于4℃保存。使用之前,用PBS清洗细胞3次。
在本实验中,将IgG4半分子的交换与IgG1的交换进行比较。另外,对在过量无关IgG4存在下的IgG4交换进行评估。在PBS中制备如下的抗体混合物:
-Betv1特异性IgG4(4μg)和Feld1特异性IgG4(4μg)
-Betv1特异性IgG1(4μg)和Feld1特异性IgG1(4μg)
-Betv1特异性IgG4(4μg),Feld1特异性IgG4(4μg)和对抗原X特异的无关IgG4(80μg)
将这些混合物与红细胞在总体积100μl的添加有0.05%(w/v)NaN3的PBS中(最终的血细胞比容为大约~40%)温育,然后在水平回转振荡器(125rpm)上37℃温育。在示明的时间点,在Eppendorf离心机中以2800rpm对红细胞离心1min,之后吸取10μl样品到500μl PBS-AT(添加了0.3%牛血清白蛋白,0.1%Tween-20和0.05%(w/v)NaN3的PBS)中。在测量双特异活性、二价性和抗原结合之前将样品保存于4℃。作为对照,还将相同的混合物温育在没有红细胞的PBS中。
在抗原结合试验中测量Betv1结合性抗体的水平。为此目的,在125I标记Betv1的存在下,将样品在750μl PBS-IAT(添加了1μg/ml IVIg的PBS-AT)中与0.75mg蛋白G Sepharose(Amersham Biosciences,Uppsala,Sweden)一起温育24h。接着,用PBS-T(添加了0.1%Tween-20和0.05%(w/v)NaN3的PBS)清洗Sepharose,并测量结合的放射性的量相对于所添加放射性的量。用纯化的Betv1特异性抗体(每个试验的范围是0-200ng,用浊度计确定)作为标准品计算Betv1特异性IgG的浓度。对于使用Feld1和Betv1双特异性抗体的实验中的双特异活性,在Feld1-Betv1交联测定中加以测量。在该测定中,将含有IgG的样品与Sepharose偶联的cat提取物(0.5mg)在总体积300μ1的PBS-AT中温育24h。然后,用PBS-T清洗Sepharose,并与125I标记的Betv1温育24h,然后用PBS-T清洗Sepharose,并测量结合的放射性的量相对于所添加的放射性的量。用纯化的IgG1-Betv1(在Betv1结合试验中利用蛋白G Sepharose获得的)作为标准计算双特异性IgG(Feld1-Betv1)的浓度。
在图8中,提供了从红细胞介导的交换获得的数据。在红细胞存在下,没有观察到IgGl半分子的交换,而在72h后观察到大约最大的IgG4半分子交换(图A)(注意:如果等量的IgG4-Betv1和IgG4-Feld1被交换,则在随机和完全的半分子交换之后,最多有50%的IgG4-Betv1半抗体会被掺入到双特异性级分中)。在过量的无关IgG4的存在下,基本上没有测量到IgG4半分子的交换,这与预期的Betv1与Feld1特异性IgG4与无关IgG4的交换相符。进行了大小排阻色谱以排除在IgG4混合物中观察到的双特异活性是IgG聚集的结果的可能性。为此,将样品(在t=72h获取)在Superdex200柱上进行分级,然后测量级分中的Feld1结合性IgG和Betv1-Feld1交联性IgG。Feld1结合抗体洗脱为一个峰,保留体积为~12.9ml,其对应于单体IgG的保留体积。在相同的级分中检测到了异源Betv1-Feld1交联活性,表明双特异活性与单体IgG有关(数据未显示)。
理论上,IgG4半分子的交换也伴随着二价性的降低。为了检验这一点,对温育混合物中的二价性进行测量。在IgG1混合物中基本上没有观察到Feld1二价性降低,而在IgG4混合物中观察到了~50%的降低。这种降低与按照1∶1比例混合的两个不同IgG4分子的最大交换是相符的。与预期的一样,在存在过量的无关IgG4时IgG4混合物中的二价性降低得更多(~80%),这是由于存在过量的无关IgG4半分子时,两个同源半分子(Betv1或Feld1特异)发生重新杂交的可能性降低。二价性的强烈降低不是由于温育期间抗原结合丧失的结果,因为抗原结合在温育72h之后只有微弱的降低(~10%)(数据未显示)。
同时评估了IgG在PBS(添加了0.05%(w/v)NaN3)中的交换,以研究IgG4半分子是否能够自发交换。该实验的条件与有红细胞存在时的交换相似,只是没有添加红细胞。在PBS中37℃温育期间没有观察到IgG1或IgG4半分子的自发交换,如图9A所示。然而,在IgG4混合物中观察到一些背景,该背景在与红细胞温育的期间也存在。在PBS中温育期间没有观察到二价性降低(图9B)。
实施例29:红细胞裂解物介导的IgG4交换的评估
将嵌合IgG4抗体混合,然后与稀释度递增的红细胞裂解物温育。从健康供体分离红细胞,并在SAGM(盐水、腺苷酸、葡萄糖、甘露醇)缓冲液中保存于4℃,血细胞比容为60.7%。为了获得裂解物,用PBS-叠氮化物(PBS中添加0.05%(w/v)NaN3)清洗细胞3次,并重悬在体积二倍于存储缓冲液的体积的水中。结果,未稀释的红细胞裂解物相当于血细胞比容为30%。
通过将由Betv1特异性IgG4(1μg)和Feld1特异性IgG4(1μg)的IgG4组成的抗体混合物与50μl新鲜制备的裂解物(添加PBS/叠氮化物到总体积为100μl)在37℃一起温育进行IgG4半分子交换的评估。每种抗体的最终浓度为10μg/ml。在示明的时间点,从温育混合物采取样品至PBS-AT(PBS添加0.3%牛血清白蛋白,0.1%Tween-20和0.05%(w/v)NaN3)中以测量双特异活性。如果需要,将样品保存于4℃。
双特异活性(即Betv1-Feld1交联性活性)的测量在异源交联测定中进行。在该测定中,样品稀释物与0.5mg Sepharose偶联的桦木提取物(birchextract)在总体积为300μl的PBS-IAT(PBS-AT中添加μg/ml IVIg)中温育24h。然后,用PBS-T清洗Sepharose,并与125I标记的Feld1温育24h,然后用PBS-T清洗Sepharose,并测量结合的放射性的量相对于所添加的放射性的量。双特异性IgG(Betv1-Feld1)的浓度用Feld1结合试验的校正曲线加以计算,该标准曲线是用纯化的Feld1结合性rIgG获得的。
在图10中,经时(in time)的双特异活性产生用结合的125I标记Feld1的百分比来表示,后者是在异源交联测试中确定的。从这些数据显然可见红细胞的裂解物含有交换活性。在未稀释的裂解物中观察到最高的交换速度,而稀释度越高,交换速度越低。在PBS中进行的对照温育中几乎没有观察到双特异活性。
实施大小排阻色谱以排除红细胞裂解物所诱导的双特异活性是IgG聚集的结果的可能性(图11)。为此目的,制备温育混合物,其由10μg Betv1结合性IgG4、10μgFeld1结合性IgG4和50μl红细胞裂解物组成,并添加PBS/叠氮化物到最终体积为100μl。将该混合物在37℃温育24h,然后将70μl在Superdex200柱上进行分级。在级分中,测量Betv1结合性IgG和Feld1-Betv1交联性IgG。在抗原结合试验中测量Betv1结合性抗体的水平。将样品与0.75mg蛋白G Sepharose(Amersham Biosciences,Uppsala,Sweden)一起在125I标记的Betv1的存在下,在750μl PBS-IAT(PBS添加1μg/ml IVIg、0.3%牛血清白蛋白、0.1%Tween-20和0.05%(w/v)NaN3)中温育24h。接着,用PBS-T(PBS添加0.1%Tween-20和0.05%(w/v)NaN3)清洗Sepharose,并测量已结合的放射性的量相对于所添加放射性的量。使用纯化的Betv1特异抗体作为标准(每个试验的范围是0-200ng,用浊度计确定)计算Betv1特异IgG的浓度。在异源交联测定中测量双特异IgG的浓度(即Feld1-Betv1交联活性)。在该测定中,将样品在总体积300μl的PBS-IAT中与0.5mg的Sepharose偶联cat提取物(其中存在Feld1抗原)温育24h。然后,用PBS-T清洗Sepharose,并与125I标记的Betv1温育24h,之后用PBS-T清洗Sepharose,并测量已结合的放射性的量相对于所添加的放射性的量。双特异性IgG(Feld1-Betv1)的浓度的计算使用与Betv1结合试验中所用相同的校正曲线,其是由纯化的Betv1结合性rIgG获得的。
Betv1结合抗体在一个峰内洗脱,保留体积为~12.6ml,对应于单体IgG的保留体积(图11)。在相同的级分中检测到了异源Feld1-Betv1交联活性,表明双特异活性与单体IgG有关。
实施例30:经过透析的红细胞裂解物中IgG4交换的评估
从健康供体分离红细胞,并以60.7%的血细胞比容在SAGM(盐水、腺苷酸、葡萄糖、甘露醇)缓冲液中保存于4℃。为了获得裂解物,用PBS-叠氮化物(PBS中添加0.05%(w/v)NaN3)清洗细胞3次,并重悬在体积2倍于存储缓冲液的体积的水中。因此,未稀释的红细胞裂解物相当于血细胞比容为30%。将一部分裂解物用Pierce产的透析膜盒(3.5kD截留)对PBS-叠氮化物进行透析。将未透析的裂解物在Amicon过滤器(3.5kD截留)中进行离心,获得超滤液。
通过将IgG4抗体混合物(Betv1特异性IgG4(0.5μg)和Feld1特异性IgG4(0.5μg))与新鲜制备的红细胞裂解物(25μl)或经透析的裂解物(25μl)在37℃一起温育来评估IgG4半分子的交换。每个温育体系的总体积为50μl,这样每种抗体的终浓度为10μg/ml。使用如下的添加物:Sigma产的还原型谷胱甘肽(GSH),葡萄糖-6磷酸(G-6-P)和NADPH(均由Roche产)。这些化合物在使用之前溶解于水中。温育24h后,从温育混合物采取样品到PBS-AT(PBS添加0.3%牛血清白蛋白、0.1%Tween-20和0.05%(w/v)NaN3)中,以测量双特异活性。如果需要,将样品保存于4℃。
在异源交联测定中测量双特异活性(即Betv1-Feld1交联活性)。在该测定中,将样品稀释物与0.5mg的Sepharose偶联cat提取物在总体积为300μl的PBS-IAT(PBS-AT添加μg/mlIVIg)中温育24h。然后,将Sepharose用PBS-T清洗,与125I标记的Feld1温育24h,之后用PBS-T清洗Sepharose,并测量结合的放射性的量相对于所添加的放射性的量。
将交换水平与新鲜制备的裂解物产生的双特异活性进行比较(表2)。
  交换源   添加物   交换活性
  裂解物   -   ++
  透析裂解物   -   -
  透析裂解物   超滤液   +
  透析裂解物   G-6-P,NADPH,GSH   ++
  透析裂解物   G-6-P   -
  透析裂解物   NADPH   -
  透析裂解物   GSH   ++
表2.透析红细胞裂解物中恢复双特异活性的因子的概览将经透析的红细胞裂解物的交换活性与新鲜制备的裂解物进行比较。透析裂解物添加5□l超滤液。G-6-P、NADPH和GSH的终浓度分别为5mM、0.1mM和0.5mM。
从这些数据显然可见,红细胞裂解物的活性在透析之后损失掉了。添加超滤液恢复了大部分的交换。这一结果提示,在透析期间某种组分(<3.5kD)损失了,而该组分对于交换反应是至关重要的。这一组分很可能参与氧化还原循环,因为二硫桥还原和氧化是IgG4半分子交换必需的。因此,向透析裂解物添加氧化还原循环中的三种“辅因子”(G-6-P、NADPH和GSH),以研究这些化合物是否能够恢复交换活性。如果同时补充G-6-P、NADPH和GSH,则交换活性可以被恢复。在各别的因子存在下温育经透析的裂解物显示,GSH可恢复交换活性,G-6-P或NADPH则不能。
实施例31:还原型谷胱甘肽介导的IgG4半分子交换的评估
将嵌合抗体混合,然后与还原型谷胱甘肽(GSH)温育,以研究IgG4的交换。将GSH(Sigma-Aldrich,St.Louis,MO)溶解于水中备用。
在本实验中,IgG4半分子的交换是通过将由Betv1特异性IgG4(1μg)和Feld1特异性IgG4(1μg)的IgG4组成的抗体混合物在含有GSH的PBS/叠氮化物中37℃温育来评估的。总温育体积为100μl,这样每种抗体的终浓度为10μg/ml。在示明的时间点,从温育混合物采取样品到PBS-AT(添加了0.3%牛血清白蛋白、0.1%Tween-20和0.05%(w/v)NaN3的PBS)中。将样品保存在4℃,用于测量抗体结合和双特异活性。
在抗原结合试验中测量Betv1结合性抗体的水平。在125I-标记的Betv1的存在下,将样品与0.75mg蛋白G Sepharose(Amersham Biosciences,Uppsala,Sweden)在750μl的PBS-IAT(PBS-AT添加μg/ml IVIg)中温育24h。接着,用PBS-T(PBS添加0.1%Tween-20和0.05%(w/v)NaN3)清洗Sepharose,并测量结合的放射性的量相对于所添加的放射性的量。使用纯化的Betv1结合性抗体作为标准(每个试验的范围是0-200ng,由浊度计确定)计算Betv1特异性IgG的浓度。在异源交联测定中测量双特异性IgG的浓度(即Feld1-Betv1交联活性)。在该测定中,将样品与0.5mg的Sepharose偶联cat提取物(其中存在Feld1抗原)在总体积300μl的PBS-IAT中温育24h。然后,将Sepharose用PBS-T清洗,并与125I-标记的Betv1温育24h,之后用PBS-T清洗Sepharose,测量已结合的放射性的量相对于所添加的放射性的量。双特异IgG(Feld1-Betv1)的浓度的计算使用在Betv1结合试验中所用相同的校正曲线,其是由纯化的Betv1结合性IgG获得的。
在图12中,提供了GSH介导的IgG4半分子交换的时间过程。从这些数据显然可见,IgG4半分子在GSH的存在下被交换了。在本实验中,在0.1-1mM GSH之间观察到了最佳的交换,使用0.5mM GSH,在24h后达到了最高的交换(~90%)。
实施大小排阻色谱,以排除在GSH介导的IgG4交换之后观察到的双特异活性是IgG聚集的结果的可能性(图13)。为此,将Betv1结合性IgG4与Feld1结合性IgG4(每种抗体10μg)的混合物在PBS/叠氮化物中与0.5mM GSH温育。将该混合物(最终体积100μl)在37℃温育24h,之后将70μl在Superdex200柱上进行分级。在级分中,测量Betv1结合性IgG和Feld1-Betv1交联性IgG。Betv1结合性抗体在一个峰中洗脱,保留体积为~12.6ml,对应于单体IgG的保留体积。在相同的级分中检测到了异源Feld1-Betv1交联活性,提示双特异活性与单体IgG有关。发现GSH存在下的双特异IgG4分子的产生是温度依赖性的,因为在37℃下比在4℃下交换发生效率更高(图14)。
实施例32.其他作用剂存在下双特异IgG的产生
混合IgG1-Betv1与IgG1-Feld1或IgG4-Betv1与IgG4-Feld1,使每种抗体的终浓度为10μg/ml,并在总体积50μl中与还原剂一起温育。除了GSH之外,对如下的作用剂进行测试(温育混合物中的终浓度):Sigma产的L-半胱氨酸(100μM),Biorad产的二硫苏糖醇(50μM),Biorad产的β-巯基-乙醇(BME)(100μM),和Sigma产的氧化型谷胱甘肽(GSSG,注意在该组作用剂中这种作用剂是非还原性的,而其它的则是还原性的)(100μM)。将混合物在37℃温育24h,并采取样品到PBS/AT中,在其中对(双)特异IgG的浓度进行测量。图15显示,向纯化的IgG4-Betv1和IgG4-Feld1的混合物中添加GSH或其它还原剂(但非GSSG)足以诱导Fab臂交换和双特异IgG4的产生。相比之下,在对照IgG1混合物中没有诱导出双特异反应性。
实施例33.使用GSH的全人IGG4抗体的交换
混合IgG1-CD20、IgG4-CD20、IgG1-EGFr和IgG4-EGFr,并与GSH在1ml总体积中温育。每种抗体的终浓度为50μg/ml;GSH的终浓度为0.5mM。将混合物在37℃温育24h,采取样品在PBS-AT中,对其中的(双)特异IgG的浓度进行测量。
双特异活性用夹心式ELISA测定。该测定用含1μg/ml EGFR重组胞外域的PBS(100μl/孔)在4℃下对ELISA板(Greiner bio-one,Frickenhausen,Germany)包被过夜。用PBS/0.05%Tween 20(PBT)清洗板3次。将样品稀释在PBT/0.2%BSA(PBTB)中,并转移到ELISA板(100μl/孔)。在平板振荡器(300rpm)上室温(RT)下温育90分钟之后,弃去样品,用PBT清洗板3次。接着,添加100μl溶于PBTB中的2μg/ml小鼠抗独特型单克隆抗体2F2SAB1.1(针对抗-CD20抗体7D8;Genmab),RT下在平板振荡器(300rpm)上温育90分钟。弃去抗独特型抗体,用PBT清洗板3次,然后添加100μl/孔的在PBTB中稀释1000x的HRP偶联山羊抗小鼠IgG(JacksonImmunoResearch Laboratories,Westgrove,PA,USA),并在RT下在平板振荡器(300rpm)上温育90分钟。弃去检测抗体,用PBT清洗板3次。将50mgABTS药片(Roche Diagnostics GmbH,Mannheim,Germany)溶解在ABTS缓冲液(Roche)中,添加到ELISA板上(100μl/孔)。将ELISA板用铝箔覆盖,在RT下平板振荡器(300rpm)上温育30分钟(或者更长时间,如果需要的话),用100μl每孔的草酸(Riedel de Haen Seelze,Germany)终止反应。将ELISA板置于RT下10分钟,然后在ELISA酶标仪内阅读405nm吸光度。
图16A显示,在GSH存在下温育IgG4-EGFr和IgG4-CD20混合物时,经过一段时间形成双特异性的抗EGFR/CD20抗体,而在不存在GSH时则不会形成。而在IgG1抗体的混合物中,无论是否存在GSH均没有发生Fab臂交换。
为了探索GSH介导的IgG4半分子交换的动态范围,使用GSH的完全浓度曲线(0.5-1,000μM)对交换进行分析。混合IgG4-CD20和IgG4-EGFr,并在总体积1ml中与GSH温育。每种抗体的终浓度为50μg/ml;GSH的终浓度如图16B所示。将混合物在37℃温育24h,并将样品采取到PBS-AT中,测量其中的(双)特异IgG的浓度。
图16B显示出IgG4半分子交换的明显的GSH剂量依赖性。为了探索反应组分对GSH介导的IgG4半分子交换有何影响,在PBS和无血清和蛋白的化学限定培养基(FreeStyle 293表达培养基,GIBCO/InvitrogenCorporation)中对交换进行了测试。结果发现,在该组织培养基中,GSH介导的交换在更低的GSH浓度下发生(图16C)。还发现,在GSH介导的IgG4半分子交换中存在一个最优值,因为与5mM GSH温育的交换明显导致低于与0.5mM温育的交换(图16D)。
在有或无GSH的条件下将一个IgG4-EGFr和IgG4-CD20的混合物温育24h,并通过质谱(ESI-TOF MS)进行评估。含有200μg/ml每种抗体的50μl样品用1μl N-糖苷酶F(Roche Diagnostics NL BV,Almere,荷兰)过夜去糖基化。样品在Acquity UPLCTM(Waters,Milford,USA)上用BEH C8,1.7μm,2.1x50mm柱在60℃进行脱盐。注射50μl,用5%-95%的洗脱液B梯度进行洗脱。洗脱液A是MilliQ水(Millipore Synthesis A10装置),洗脱液B是LC-MS级乙腈(Biosolve,Valkenswaard,荷兰)。两种洗脱液均含0.05%甲酸作为有机修饰剂(Fluka Riedel-de 
Figure G2008800182801D00541
,Buchs,Germany)。飞行时间电喷雾电离质谱在线(on-line)地记录在以阳离子模式工作的micrOTOFTM质谱仪(Bruker,Bremen,Germany)上。在每次分析中,用ES调节混合物(Agilent Technologies,Santa Clara,USA)对500-5000m/z的范围(scale)进行内部校准。使用极大熵(Maximum Entropy)算法将质谱去卷积,该算法由DataAnalysisTM软件v.3.3(Bruker)提供。
图16E显示,在没有GSH存在的条件下,IgG4-CD20的分子量(145.5kD)和IgG4-EGFR的分子量(145.9kD)均保持不变。然而,在GSH存在下(图16F),出现了一个新峰,其质量相应于一个经Fab臂交换的分子(145.7kD)。这个新质量对应于双特异性抗EGFR/CD20抗体的预期质量。然而,从MS谱的峰高度可以估计,双特异抗体占了混合物中总抗体质量的50%,表明发生了随机交换,其在24h内达到平衡。
实施例34.来自猕猴(和其它物种)的多克隆免疫球蛋白参与重组人IGG4抗体的Fab臂交换
将两种重组人IgG4抗体(IgG4-CD20和IgG4-EGFr,如上所述)的混合物在存在或不存在来自猕猴(6x)、黑猩猩(2x)、食蟹猴、狒狒、马和猪的纯化免疫球蛋白或人IVIg的条件下与GSH在37℃温育24h。在如上所述的夹心式ELISA中测量通过Fab臂交换的双特异性抗体形成。此外,此测定中也测试了山羊、家兔和绵羊免疫球蛋白。
图17a显示,,猕猴多克隆免疫球蛋白与人多克隆免疫球蛋白(IVIg)在体外抑制重组抗体在还原型谷胱甘肽的存在下的Fab臂交换的能力相当。这意味着猕猴免疫球蛋白的某个组分参与了Fab臂交换。猕猴免疫球蛋白,可能是猕猴IgG4,能够与重组人IgG4交换Fab臂。
图17b显示,来自其它数只猕猴的多克隆免疫球蛋白在体外以不同的效力抑制重组抗体在还原型谷胱甘肽存在下的Fab臂交换。这意味着,所述参与Fab臂交换的猕猴免疫球蛋白组分以不同的浓度存在,或者该组分并不存在于所有的猕猴体内。
图17c显示,来自数种其它猴类(狒狒、黑猩猩、食蟹猴)的多克隆免疫球蛋白,以及来自马和猪的免疫球蛋白,在体外以不同的效力抑制重组抗体在还原型谷胱甘肽存在下的Fab臂交换。这意味着,所述参与Fab臂交换的成分以不同的浓度存在于这些物种中。山羊、家兔和绵羊免疫球蛋白对重组免疫球蛋白在还原型谷胱甘肽存在下的体外Fab臂交换无影响(数据未显示)。
实施例35.铰链区或CH3结构域突变体的半分子交换
制备了三种IgG1突变体:具有IgG4核心铰链的IgG1(IgG1-CPSC)和两个CH3结构域互换突变体(swap mutants)即(IgG1-CH3(IgG4)和IgG1-CPSC-CH3(IgG4))。
使用pEE-G1-wt a Betv1作为模板(228表示抗体氨基酸残基的EU编号。相同的位置在Kabat编号法中为241号,在SEQ ID NO:19中为111号(CPPC核心铰链序列中的第三个位置)),利用定点诱变在IgG1的铰链中引入一个P228S突变。突变引物,正向和反向,用Vector NTI Advance 10设计:
P228S正向突变引物(Mut primer-F):SEQ ID NO:22
P228S反向突变引物(Mut primer-R):SEQ ID NO:23
  P228S Mut primer-F5’-CTTgTgACAAAACTCACACCTgCCCATCgTgCCCAggTAAgCCAg-3’P228S Mut primer-R5’-CTggCTTACCTgggCACgATgggCAggTgTgAgTTTTgTCACAAg-3’
使用Quickchange定点诱变试剂盒(Stratagene)产生pEE-G1-CPSC突变体。聚合酶链式反应(PCR)混合物由5μl pEE-G1a Betv1 DNA模板(~35ng),1,5μl正向突变引物(~150ng),1,5μl反向突变引物(~150ng),1μl dNTP混合物,5μl反应缓冲液(10x),36μl H2O以及最后1μl Pfu Turbo DNA聚合酶组成。然后将混合物应用于PCR:30”95℃,30”95℃(变性),1’55℃(退火)和17min 68℃(延伸)。该循环重复20次。
利用DNA消化和连接产生CH3结构域互换突变构建体IgG1-CH3(IgG4)和IgG1-CPSC-CH3(IgG4)。用于获得CH3结构域和无CH3结构域的载体的消化反应体系如下:~1500ng DNA(pEE-G1-betv1、pEE-G1-CPSC和pEE-G4-betv1)、2μl BSA、2μl Neb3缓冲液、1μl SalI、加H2O至体积20μl。在37℃温育30’。纯化DNA并用30μl H2O洗脱,之后添加1μl SanDI和3μl通用缓冲液,在37℃温育30’。将片段在含有溴化乙锭的1%琼脂糖凝胶上进行凝胶电泳。在紫外光下将片段从凝胶上切下,并用DNA纯化试剂盒(Amersham)溶解。用如下的程序将pEE-G4-wt SalI/SanDI(其含有IgG4 CH3结构域)片段连接到pEE-G1-wt和pEE-G1-CPSC中:1μl模板DNA(SalI/SanDI消化的pEE-G1-wt和pEE-G1-CPSC),5μl SalI/SanDI插入序列,4μl Ligate-it缓冲液,9μl H2O和1μl连接酶,总体积为20μl。5’后终止连接反应。
采用与上面相似的程序,利用DNA消化(使用ApaI和HindIII)和连接,将betv1突变抗体的VH结构域替换为pEE-G4-a-feld1 wt的VH结构域。
另外,制备一种IgG4突变体:IgG4-S228Pnew。在该突变体中,通过将228位丝氨酸(SEQ ID NO:19中的位置111)替换为脯氨酸(IgG1核心铰链)来使铰链稳定化。定点诱变使用QuickChange II XL定点诱变试剂盒(Stratagene,Amsterdam,荷兰),根据制造商的使用说明操作。该方法包括引入一个沉默的额外XmaI位点,用于筛选成功的诱变。简而言之,将5μl 10x反应缓冲液,1μl寡核苷酸S228Pfcorrect(100pmol/μl),1μl寡核苷酸S228Prcorrect(100pmol/μl),1μl dNTP混合物,3μl Quicksolution,1μl质粒pTomG42F8HG(50ng/μl)(2006年11月28日提交的(RO/DK(Genmab)、题为“Recombinant monovalent antibodies and methods for production thereof”的PCT专利申请中有描述)以及1μl PfuUltra HF DNA聚合酶混合成总体积为50μl,并用TGradient Thermocycler 96(Whatman Biometra,Goettingen,Germany;产品编号050-801)使用18个循环的程序进行扩增:95℃变性1min;18个循环的95℃50sec,60℃50sec和68℃10min。将PCR混合物保存于4℃直至进一步处理。接着,将PCR混合物与1μl DpnI在37℃温育60min以消化pTomG42F8HGv载体,然后保存于4℃直到进一步处理。将反应混合物用5μl 3M NaAc和125μl乙醇沉淀,在-20℃温育20min,然后以14000xg在4℃离心沉降20分钟。将DNA离心沉淀用70%乙醇清洗,干燥并溶解于4μl水中。按照制造商的使用说明(Invitrogen)将总共4μl反应体积转化到One Shot DNH5αT1R感受态大肠杆菌细胞(Invitrogen,Breda,荷兰)中。接着,将细胞涂布在含有50μg/ml氨苄青霉素的Luria-Bertani(LB)琼脂平板上。将平板在37℃温育16-18小时,直到细菌菌落变得明显。
通过菌落PCR和XmaI(突变将导致XmaI位点丢失)消化进行筛选之后,从细菌分离质粒,并通过DNA测序对突变进行确认。为了检查是否引入了非期望的额外突变,对整个HC编码区进行测序,发现没有包含任何额外突变。将最终的构建体命名为pTomG42F8S228PNew。
 名称   寡核苷酸序列
 S228Pfcorrect(SEQ ID NO:24)   CCCCCATGCCCACCATGCCCAGGTAAGCCAACCCAGGCCTCGC
 S228Prcorrect(SEQ ID NO:25)   GCGAGGCCTGGGTTGGCTTACCTGGGCATGGTGGGCATGGGGG
将来自这些构建体的重组抗体在3ml,6孔板(NUNC)内或者在125ml锥形瓶(erlenmeyers)(Corning)内于HEK 293细胞中瞬时表达,以293 Fectin(Invitrogen)作为转染试剂。
将下述非纯化抗体的混合物(FreeStyle 293表达培养基,GIBCO/Invitrogen Corporation)与0.1mM GSH在37℃温育24h,将样品吸取在PBS-AT中,按照先前实施例所述测量其中的(双)特异性IgG的浓度:
-IgG4a-feld1 wt与IgG4a-betv1 wt
-IgG1a-feld1 wt与IgG4a-betv1 wt
-IgG1a-feld1 CPSC与IgG1a-betv1 CPSC(下面表示为IgG1 CPSC-IgG1 CPSC)
-IgG1a-feld1 CPSC与IgG1a-betv1 CH3(IgG4)(IgG1 CPSC-IgG1CH3(IgG4))
-IgG1a-feld1 CPSC与IgG1a-betv1 CPSC/CH3(IgG4)(IgG1 CPSC-IgG1 CPSC/CH3(IgG4))
-IgG1a-feld1 CH3(IgG4)与IgG1a-betv1 CH3(IgG4)(IgG1 CH3(IgG4)-IgG1 CH3(IgG4))
-IgG1a-feld1 CH3(IgG4)与IgG1a-betv1 CPSC/CH3(IgG4)(IgG1CH3(IgG4)-IgG1CPSC/CH3(IgG4))
-IgG1a-feld1 CPSC/CH3(IgG4)与a-betv1 IgG1 CPSC/CH3(IgG4)(IgG1
CPSC/CH3(IgG4)-IgG1 CPSC/CH3(IgG4))
-IgG1a-feld1 CPSC/CH3(IgG4)与IgG4a-betv1 wt(IgG1CPSC/CH3(IgG4)-IgG4 wt
-IgG4a-bet1 S228Pnew与IgG4 wt
结果显示,在这些体外条件下(0.1mM GSH),当其中一种抗体含有CPSC铰链且两种抗体均含有IgG4-样CH3时,会发生半分子交换。另外,在含有IgG1铰链的IgG4分子与IgG4 wt分子之间也发生半分子交换:
                IgG1 wt  IgG4 wt  IgG1        IgG1    IgG1
                                  CH3(IgG4)   CPSC    CPSC/CH3(IgG4)
IgG1 wt         -        -
IgG4 wt         -        +        +           -       +
IgG1 CH3(IgG4)           +        -           -       ±
IgG1 CPSC                -        -           -       -
IgG1                     +        ±          -       +
CPSC/CH3(IgG4)
IgG4S228Pnew    -        +
-=无交换
+=发生交换
±=有限的交换(~5%)
空白框=未测试
用0、0.1、1和10mM GSH测试了GSH浓度对来自不同突变体的半分子交换的影响。交换的测试使用如下的混合物:
-IgG4a-feld1 wt与IgG4a-betv1 wt
-IgG1a-feld1 wt与IgG4a-betv1 wt
-IgG1a-feld1 CPSC与IgG1a-betv1 CPSC
-IgG1a-feld1 CH3(IgG4)与IgG1a-betv1 CH3(IgG4)
-IgG1a-feld1 CPSC/CH3(IgG4)与a-betv1 IgG1 CPSC/CH3(IgG4))
对于浓度不大于1mM的GSH,结果(图19A)证实了上文的描述。在10mM GSH下,在含有IgG1a-feld1 CH3(IgG4)和IgG1a-betv1 CH3(IgG4)的反应中也见到了半分子交换。
如前面实施例中所述实施大小排阻色谱,以排除在GSH介导的合适的IgG1突变体的交换之后所观察到的双特异活性是IgG聚集的结果的可能性。在相应于单体IgG的保留体积的级分中检测到了异源Feld1-Betv1交联活性。
为了鉴定CH3结构域中负责半分子交换能力的氨基酸残基,将IgG4-样残基引入到IgG1的CH3中的在IgG1和IgG4之间不同的位置上。这样,使用pEE-G1-wt a Betv1或pEE-G1-wt a Feld1作为模板,基本上按照如上所述将R238Q、K292R、Q302E或P328L突变(编号参照SEQ ID NO:19)引入到IgG1的CH3结构域中。而且,还使用pEE-G1-CPSC betv1或pEE-G1-CPSC feld1作为模板将一个K292R突变引入到IgG1 CPSC的CH3结构域内。简而言之,用Vector NTI Advance 10设计正向和反向诱变引物。使用Quickchange定点诱变试剂盒(Stratagene)产生构建体。将来自这些构建体的重组抗体在3ml 6孔板(NUNC)内或者在125ml锥形瓶(Corning)内在HEK 293细胞中瞬时表达,以293 Fectin(Invitrogen)作为转染试剂。将下述非纯化抗体的混合物(FreeStyle 293表达培养基,GIBCO/InvitrogenCorporation)与0.5或5mM GSH在37℃温育24h,将样品吸取在PBS-AT中,按照先前的实施例所述测量其中(双)特异性IgG的浓度:
-IgG1a-feld1 wt与IgG4a-betv1 wt(图19B中表示为IgG1)
-IgG1a-feld1 CPSC与IgG4a-betv1 wt(图19B中表示为IgG1-CPSC)
-IgG1a-feld1 CH3(IgG4)与IgG4a-betv1 wt(图19B中表示为IgG1-CH3(G4))
-IgG1a-feld1 CPSC/CH3(IgG4)与IgG4a-betv1 wt(图19B中表示为IgG1-CPSC/CH3(G4))
-IgG1a-feld1 R238Q与IgG4a-betv1 wt(图19B中表示为IgG1-R238Q)
-IgG1a-feld1 K292R与IgG4a-betv1 wt(图19B中表示为IgG1-K292R)
-IgG1a-feld1 Q302E与IgG4a-betv1 wt(图19B中表示为IgG1-Q302E)
-IgG1a-feld1 P328L与IgG4a-betv1 wt(图19B中表示为IgG1-P328L)
-IgG1a-feld1 CPSC/K292R与IgG4a-betv1 wt(图19B中表示为IgG1-CPSC/K292R)
-IgG4a-feld1 wt与IgG4a-betv1 wt(图19B中表示为IgG4)
-IgG1a-feld1 wt与IgG1a-betv1 wt(图19C中表示为IgG1)
-IgG1a-feld1 CPSC与IgG1a-betv1 CPSC(图19C中表示为IgG1-CPSC)
-IgG1a-feld1 CH3(IgG4)与IgG1a-betv1 CH3(IgG4)(图19C中表示为IgG1-CH3(G4))
-IgG1a-feld1 CPSC/CH3(IgG4)与IgG 1a-betv1 CPSC/CH3(IgG4)(图19C中表示为IgG1-CPSC/CH3(G4))
-IgG1a-feld1 R238Q与IgG1a-betv1 R238Q(图19C中表示为IgG1-R238Q)
-IgG1a-feld1 K292R与IgG1a-betv1 K292R(图19C中表示为IgG1-K292R)
-IgG1a-feld1 Q302E与IgG1a-betv1 Q302E(图19C中表示为IgG1-Q302E)
-IgG1a-feld1 P328L与IgG1a-betv1 P328L(图19C中表示为IgG1-P328L)
-IgG1a-feld1 CPSC/K292R与IgG1a-betv1 CPSC/K292R(图19C中表示为IgG1-CPSC/K292R)
-IgG4a-feld1 wt与IgG4a-betv1 wt(图19C中表示为IgG4)
结果显示,在被测试的体外条件下(0.5mM和5mM GSH),当两种抗体均在292位含有一个R时,可发生半分子交换(图19B+C)。在该实验条件下,238位的R或Q,302位的Q或E,以及328位的P或L对于IgG1不能交换半分子均无影响。
实施例36.在0.5mM GSH下,具有稳定化的IgG1-样核心铰链的IgG4分子不参与重组人IgG4抗体的Fab臂交换反应
将两种重组人IgG4抗体(IgG4-CD20和IgG4-EGFr,如上所述)的混合物在存在或不存在过量(10,50和100微克/ml)的那他珠单抗(Tysabri)或吉妥单抗(Mylotarg)(10微克/ml)的条件下与0.5mM GSH在37℃温育24h。那他珠单抗是一种可商购的含有野生型IgG4核心铰链的人源化IgG4抗体,而吉妥单抗是一种可商购的、含有一个稳定的IgG1-样核心铰链的人源化IgG4抗体。在如上文所述的夹心式ELISA中测量双特异性抗体通过Fab臂交换的形成。
图20A显示,在过量的那他珠单抗的存在下,重组CD20和EGFr抗体的Fab臂交换被抑制。
图20B显示,在过量的那他珠单抗而非吉妥单抗的存在下,重组CD20和EGFr抗体的Fab臂交换被抑制。
这表明,在使用0.5mM GSH的体外条件下,那他珠单抗而非吉妥单抗参与Fab臂交换反应,而且稳定化的IgG1-样核心铰链不参与Fab臂交换。
实施例37.在292位具有额外突变的IgG1-CPSC构建体的半分子交换
与实施例35类似,在pConG1f2F8(对EGFR特异)和pConG1f7D8(对CD20特异)中制备了三种IgG1突变体:一个具有IgG4核心铰链的IgG1(IgG1-CPSC)和两个CH3结构域互换突变体(IgG1-CH3(IgG4)和IgG1-CPSC-CH3(IgG4)(即其中IgG1的CH3区被IgG4的CH3区替换的构建体))。这产生了如下的构建体:pG1f-2F8CPSC、pG1f-7D8CPSC、pG1f-2F8-CH3(G4)、pG1f-7D8-CH3(G4)、pG1f-2F8CPSC-CH3(G4)和pG1f-7D8CPSC-CH3(G4)。
然后,以基本上与上文所述相同的方式,在pG1f-2F8CPSC和pG1f-7D8CPSC构建体的CH3结构域中引入R238Q、K292R、K292Y、K292F、K292W、Q302E或P328L突变(见SEQ ID NO:19),。简而言之,用Vector NTIAdvance 10设计正向和反向突变引物。使用Quickchange定点诱变试剂盒(Stratagene)产生构建体。
将来自这些构建体的重组抗体于3ml的6孔板(NUNC)内或者在125ml锥形瓶(Corning)内在HEK 293细胞中瞬时表达,以293 Fectin(Invitrogen)作为转染试剂。然后将培养物上清对PBS透析,并通过浊度计量法测量浓度(见上文)。将非纯化的、交换了缓冲液的抗体的下述混合物(FreeStyle 293表达培养基,GIBCO/Invitrogen Corporation)与0.5GSH在37℃温育24h,将样品吸取在PBS-AT中,按照先前实施例所述测量其中(双)特异性IgG的浓度:
-IgG1-2F8 wt与IgG1-7D8 wt(表示为IgG1)
-IgG1-2F8-CPSC与IgG1-7D8-CPSC(表示为IgG1-CPSC)
-IgG1-2F8-CH3(IgG4)与IgG1-7D8-CH3(IgG4)(表示为
IgG1-CH3(IgG4))
-IgG1-2F8-CPSC-CH3(IgG4)与IgG1-7D8-CPSC-CH3(IgG4)(表示为IgG1-CPSC-CH3(IgG4))
-IgG1-2F8-CPSC-R238Q与IgG1-7D8-CPSC-R238Q(表示为IgG1-CPSC-R238Q)
-IgG1-2F8-CPSC-K292R与IgG1-7D8-CPSC-K292R(表示为IgG1-CPSC-K292R)
-IgG1-2F8-CPSC-K292Y与IgG1-7D8-CPSC-K292Y(表示为IgG1-CPSC-K292Y)
-IgG1-2F8-CPSC-K292F与IgG1-7D8-CPSC-K292F(表示为IgG1-CPSC-K292F)
-IgG1-2F8-CPSC-K292W与IgG1-7D8-CPSC-K292W(表示为IgG1-CPSC-K292W)
-IgG1-2F8-CPSC-Q302E与IgG1-7D8-CPSC-Q302E(表示为IgG1-CPSC-Q302E)
-IgG1-2F8-CPSC-P328L与IgG1-7D8-CPSC-P328L(表示为IgG1-CPSC-P328L)
-IgG4-2F8 wt与IgG4-7D8 wt(表示为IgG4)
图21显示,在被测试的体外条件下(0.5mM GSH),当存在CPSC铰链并且在292位为R时,可发生半分子交换。此外,结果显示,292位上为Y或F,但非W,也有助于半分子交换,尽管程度低一些。238位上的R或Q,302位上的Q或E,以及328位上的P或L对IgG1-CPSC不能交换半分子没有影响。
实施例38.具有稳定化的CPPC铰链的IgG4分子能够在体外(存在5mMGSH时)进行Fab臂交换,但在体内不能
在5mM GSH的存在下,将IgG4-EGFR-CPPC和IgG4-CD20的混合物温育24h,并通过质谱(ESI-TOF MS)进行评估。将含有每种抗体200μg/ml的50μl样品用1μl N-糖苷酶F(Roche Diagnostics NL BV,Almere,荷兰)去糖基化处理过夜。将样品在Acquity UPLCTM(Waters,Milford,USA)上用BEHC8、1.7μm,2.1x50mm柱60℃脱盐。注射5μl,用5%-95%的洗脱液B的梯度洗脱。洗脱液A是MilliQ水(Millipore Synthesis A10装置),洗脱液B是LC-MS级乙腈(Biosolve,Valkenswaard,荷兰)。两种洗脱液均含有0.05%甲酸作为有机改性剂(Fluka Riedel-de 
Figure G2008800182801D00631
,Buchs,Germany)。飞行时间电喷雾电离质谱在线地记录在以阳离子模式工作的micrOTOFTM质谱仪(Bruker,Bremen,Germany)上。每次分析中利用ES调节混合物(Agilent Technologies,Santa Clara,USA)内部校准500-5000m/z的范围。质谱使用Maximum Entropy算法去卷积,后者是由DataAnalysisTM软件v.3.3(Bruker)提供的。
图22A显示,在5mM GSH的存在下出现了一个具有对应于Fab臂交换分子(145.7kDa)的中间质量的新峰。该新质量对应于双特异抗EGFR/CD20抗体的预期质量。当没有使用GSH或使用0.5mM GSH时,没有双特异抗体峰出现(数据未显示)。这表明,在体外较高的GSH浓度下,可使得含有IgG1-样、CPPC铰链和IgG4-样CH3区的突变体交换半分子(在实施例35、36、37中也有说明)。
为了研究含有IgG1-样、CPPC铰链和IgG4-样CH3区的稳定化铰链突变体在体内是否发生Fab臂交换,我们向免疫缺陷小鼠体内注射了IgG4-CD20和IgG1-EGFR、IgG4-EGFR、IgG4-EGFR-CPPC的等量混合物。在不同时间点采取血液样品,在ELISA中定量双特异性抗体(如上文所述),使用体外交换的混合物(IgG4-EGFR/IgG4-CD20)作为参考标准。
图22B显示,在注射了含有野生型IgG4分子(IgG4-EGFR)的混合物的小鼠的血液中出现了双特异性抗体。在包含铰链稳定化的IgG4(IgG4-EGFR-CPPC)或IgG1分子(IgG1-EGFR)的混合物中没有检测到双特异性抗体(符号在图中未显示)。这表明,核心铰链的稳定化会在体内阻止IgG4Fab臂交换,但是不能在体内交换半分子(尽管我们不能排除铰链稳定化的IgG4确实可能发生低于检测水平(72小时内<8%)的低水平交换)。
这提示含有稳定化CPPC铰链的双特异性抗体能够通过体外Fab臂交换获得。经过后续的针对这些双特异性抗体的特异性纯化之后,这些抗体在体内注射时将保持稳定(即不会发生Fab臂交换)。
实施例39.CXXC突变体的Fab臂交换
对核心铰链中含有不同CXXC基序的抗体的交换Fab臂的能力进行了测试。使用上文所述的定点诱变技术将如下的CXXC基序引入到IgG4 betv1和IgG4 feld1中:
-CGHC(就蛋白质-二硫化物-异构酶,PDI描述过的活性位点序列)
-CGC(据称具有潜在的二硫化物还原能力的肽)
-CPRC(Gorilla IgG4的核心铰链序列)
-CPHC(关于人硫氧还蛋白描述的活性位点序列)
将如下的纯化抗体的混合物与0.5mM GSH在37℃温育,在0-24h之间的不同时间点吸取样品到PBS-AT中,按照前面实施例中的描述对其中的(双)特异IgG浓度进行测量:
-IgG1a-feld1 wt与IgG1a-betv1 wt(在图23和24中表示为IgG1)
-IgG4a-feld1 wt与IgG4a-betv1 wt(在图23和24中表示为IgG4)
-IgG4a-feld1 CGHC与IgG4a-betv1 CGHC(在图23和24中表示为CGHC)
-IgG4a-feld1 CGC与IgG4a-betv1 CGC(在图23和24中表示为CGC)
-IgG4a-feld1 CPRC与IgG4a-betv1 CPRC(在图23和24中表示为CPRC)
-IgG4a-feld1 CPHC与IgG4a-betv1 CPHC(在图23和24中表示为CPHC)
结果(图23)显示,在一段时间内,含有CGC基序或IgG1核心铰链的抗体没有发生Fab臂交换。含有CGHC基序的抗体的Fab臂交换的效力与IgG4wt抗体相同。在含有CPRC基序的抗体中也发生了Fab臂交换,尽管稍微慢一些,而且含有CPHC基序的抗体中也有程度低一些的Fab臂交换。
另外,测试了GSH浓度(1-20,000μM)对于这些混合物在37℃温育24h之后进行Fab臂交换的能力的影响。发现含有CPHC-,CPRC-和CGHC-基序的抗体以及IgG4 wt抗体的Fab臂交换依赖于GSH浓度(图24),在100-1,000μM GSH之间存在一个最佳值。
序列表
<110>根马布股份公司(Genmab A/S)
 
<120>双特异性抗体及其制造方法
 
<130>P/31.WO
 
<160>22
 
<170>PatentIn version 3.3
 
<210>1
<211>36
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>1
agccaccgta cgtttgattt ccagcttggt gcctcc          36
 
<210>2
<211>44
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>2
gatgcaagct tgccgccacc atggagtcac agattcaggc attt 44
 
<210>3
<211>42
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>3
cgatgggccc ttggtgctgg ctgaggagac ggtgactgag gt   42
 
<210>4
<211>44
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>4
gatgcaagct tgccgccacc atgaaatgca gctgggttat cttc 44
 
<210>5
<211>36
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>5
agccaccgta cgt tttattt ccaactttgt ccccga         36
 
<210>6
<211>44
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>6
gatgcaagct tgccgccacc atggaatcac agactcaggt cctc    44
 
<210>7
<211>42
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>7
cgatgggccc ttggtgctgg ctgcagagaa agtgaccaga gt      42
 
<210>8
<211>44
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>8
gatgcaagct  tgccgccacc atgggatgga gctatatcat cctc   44
 
<210>9
<211>32
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>9
tgagaattcg gtgggtgctt tatttccatg ct                 32
 
<210>10
<211>33
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>10
gtagaagctt accatcgcgg atagacaaga acc                33
 
<210>11
<211>26
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>11
tgttaactgc tcactggatg gtggga                        26
 
<210>12
<211>27
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>12
tccctgggca caattttctt gtccacc                                  27
 
<210>13
<211>31
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>13
tgaaagcttc taatacgact cactataggg c                             31
 
<210>14
<211>54
<212>DNA
<213>人工
 
<220>
<223>引物
 
<400>14
tgaaagcttc taatacgact cactataggg caagcagtgg tatcaacgca gagt    54
 
<210>15
<211>137
<212>PRT
<213>人工
 
<220>
<223>抗体可变区
 
<400>15
Met Lys Cys Ser Trp Val Ile Phe Phe Leu Met Ala Val Val Thr Gly
1               5                   10                  15
Val Asn Ser Glu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Val Lys
            20                  25                  30
Pro Gly Ala Ser Val Lys Leu Ser Cys Thr Ala Ser Gly Phe Asn Ile
        35                  40                  45
Lys Asp Thr Tyr Ile His Trp Val Lys Gln Arg Pro Glu Gln Gly Leu
    50                  55                  60
Glu Trp Val Gly Arg Ile Asp Pro Ala Thr Gly Asn Thr Arg Tyr Asp
65                  70                  75                  80
Pro Lys Phe Gln Gly Lys Ala Thr Ile Thr Ala Asp Thr Ser Ser Asn
                85                  90                  95
Thr Ala Tyr Leu Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Thr Ala Val
            100                 105                 110
Tyr Tyr Cys Ala Ser PheArg Pro Gly Tyr Ala Leu Asp Tyr Trp Gly
        115                 120                 125
Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser
    130                 135
 
<210>16
<211>127
<212>PRT
<213>人工
 
<220>
<223>抗体可变区
 
<400>16
Met Glu Ser Gln Ile Gln Ala Phe Val Phe Val Phe Leu Trp Leu Ser
1               5                   10                  15
Gly Val Asp Gly Asp Ile Val Met Thr Gln Ser His Lys Phe Met Ser
            20                  25                  30
Thr Ser Val Gly Asp Arg Val Ser Phe Thr Cys Lys Ala Ser Gln Asp
        35                  40                  45
Val Phe Thr Ala Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro
    50                  55                  60
Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Arg Thr Gly Val Pro Asp
65                  70                  75                  80
Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser
                85                  90                  95
Ser Val Gln Ala Glu Asp Leu Ala Leu Tyr Tyr Cys Gln Gln His Phe
            100                 105                 110
Ser Thr Pro Pro Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
        115                 120                 125
 
<210>17
<211>138
<212>PRT
<213>人工
 
<220>
<223>抗体可变区
 
<400>17
Met Gly Trp Ser Tyr Ile Ile Leu Phe Leu Val Ala Thr Ala Thr Asp
1               5                   10                  15
Val His Ser Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys
            20                  25                  30
Pro Gly Ala Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe
        35                  40                  45
Thr Ser Tyr Trp Met His Trp Leu Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu
    50                  55                  60
Glu Trp Ile Gly Glu Ile Asn Pro Asn Asn Gly Arg Thr Tyr Tyr Asn
65                  70                  75                  80
Glu Lys Phe Lys Thr Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser
                 85                  90                  95
Thr Ala Tyr Met Gln Leu Asn Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val
            100                 105                 110
Tyr Tyr Cys Ala Arg Arg Leu Thr Met Val Glu Ser Phe Ala Tyr Trp
        115                 120                 125
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Phe Ser Ala
    130                 135
 
<210>18
<211>133
<212>PRT
<213>人工
 
<220>
<223>抗体可变区
 
<400>18
Met Glu Ser Gln Thr Gln Val Leu Met Ser Leu Leu Phe Trp Val Ser
1               5                   10                  15
Gly Thr Cys Gly Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Thr
            20                  25                  30
Val Thr Ala Gly Glu Lys Val Thr Met Ser Cys Lys Ser Ser Gln Ser
        35                  40                  45
Leu Leu Asn Ser Gly Asn Gln Lys Asn Tyr Leu Thr Trp Tyr Gln Gln
    50                  55                  60
Lys Pro Gly Gln Pro Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg
65                  70                  75                  80
Glu Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp
                85                  90                  95
Phe Ser Leu Thr Ile Ser Ser Val Gln Ala Glu Asp Leu Ala Ile Tyr
            100                 105                 110
Tyr Cys Gln Asn Asp Tyr Ser Tyr Pro Phe Thr Phe Gly Ser Gly Thr
        115                 120                 125
Lys Leu Glu Ile Lys
    130
 
<210>19
<211>330
<212>PRT
<213>人(homo sapiens)
 
<220>
<221>CONFLICT
<222>(239)..(239)
<223>239位的X是D或E
 
<220>
<221>CONFLICT
<222>(241)..(241)
<223>241位的X是L或M
 
<400>19
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1               5                   10                  15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
            20                  25                  30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
        35                  40                  45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
    50                  55                  60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65                  70                  75                  80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
                85                   90                  95
Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
            100                 105                 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
        115                 120                 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
    130                 135                 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145                 150                 155                 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
                165                 170                 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
            180                 185                 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
        195                 200                 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
    210                 215                 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Xaa Glu
225                 230                 235                 240
Xaa Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
                245                 250                 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
            260                 265                 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
        275                 280                 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
    290                 295                 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305                 310                 315                 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
                325                 330
 
<210>20
<211>326
<212>PRT
<213>人(homo sapiens)
 
<400>20
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg
1               5                   10                  15
Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
            20                  25                  30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
        35                  40                  45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
    50                  55                  60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Asn Phe Gly Thr Gln Thr
65                  70                  75                  80
Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
                85                  90                  95
Thr Val Glu Arg Lys Cys Cys Val Glu Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro
            100                 105                 110
Pro Val Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp
        115                 120                 125
Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp
    130                 135                 140
Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly
145                 150                 155                 160
Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn
                165                 170                 175
Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Val His Gln Asp Trp
            180                 185                 190
Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro
        195                 200                 205
Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln Pro Arg Glu
    210                 215                 220
Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn
225                 230                 235                 240
Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile
                245                 250                 255
Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr
            260                 265                 270
Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys
        275                 280                 285
Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys
    290                 295                 300
Ser Val Met His Glu Ala Leu Hi sAsn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu
305                 310                 315                 320
Ser Leu Ser Pro Gly Lys
                325
 
<210>21
<211>377
<212>PRT
<213>人(homo sapiens)
 
<400>21
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg
1               5                   10                  15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
            20                  25                  30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
        35                  40                  45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
    50                  55                  60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65                  70                  75                  80
Tyr Thr Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
                85                  90                  95
Arg Val Glu Leu Lys Thr Pro Leu Gly Asp Thr Thr His Thr Cys Pro
            100                 105                 110
Arg Cys Pro Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg
        115                 120                 125
Cys Pro Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg Cys
    130                 135                 140
Pro Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg Cys Pro
145                 150                 155                 160
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
                165                 170                 175
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
            180                 185                 190
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Lys Trp Tyr
        195                 200                 205
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
    210                 215                 220
Gln Tyr Asn Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
225                 230                 235                 240
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
                245                 250                 255
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln
            260                 265                 270
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
        275                 280                 285
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
    290                 295                 300
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Ser Gly Gln Pro Glu Asn Asn
305                 310                 315                 320
Tyr Asn Thr Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
                325                 330                 335
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Ile
            340                 345                 350
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu HisAsn Arg Phe Thr Gln
        355                 360                 365
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
    370                 375
 
<210>22
<211>327
<212>PRT
<213>人(homo sapiens)
 
<400>22
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg
1               5                   10                  15
Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
            20                  25                  30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
        35                  40                  45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
    50                  55                  60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys Thr
65                  70                  75                  80
Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
                85                  90                  95
Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Ser Cys Pro Ala Pro
            100                 105                 110
Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys
        115                 120                 125
Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val
    130                 135                 140
Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp
145                 150                 155                 160
Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe
                165                 170                 175
Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp
            180                 185                 190
Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu
        195                 200                 205
Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg
    210                 215                 220
Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys
225                 230                 235                 240
Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp
                245                 250                 255
Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys
            260                 265                 270
Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser
        275                 280                 285
Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser
    290                 295                 300
Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser
305                 310                 315                 320
Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
               325

Claims (92)

1.一种用于产生双特异性抗体的体外方法,所述方法包括如下步骤:
a)提供具有第一结合特异性的第一抗体,其中所述第一抗体包含IgG4-样CH3区,
b)提供具有不同于所述第一结合特异性的第二结合特异性的第二抗体,其中所述第二抗体包含IgG4-样CH3区,
c)在允许核心铰链区中的半胱氨酸发生二硫键异构化的还原条件下共同温育所述第一和第二抗体,和
d)获得双特异性抗体。
2.权利要求1的体外方法,其中所述第一抗体在核心铰链区中包含CPPC序列。
3.前述权利要求中任一项的体外方法,其中所述第一抗体包含IgG4-样核心铰链区。
4.权利要求1或3中任一项的体外方法,其中所述第一抗体是在核心铰链区中包含CX1X2C序列的抗体,其中X1和X2可以是任何氨基酸,但X1和X2不能都是脯氨酸。
5.权利要求4的体外方法,其中所述第一抗体是在核心铰链区中包含CX3PC或CPX3C序列的抗体,其中X3可以是除脯氨酸之外的任何氨基酸。
6.权利要求5的体外方法,其中所述第一抗体是在核心铰链区中包含CSPC、CPSC、CRPC、CPRC、CGHC或CPHC序列的抗体。
7.前述权利要求中任一项的体外方法,其中所述第一抗体包括IgG4CH3区。
8.权利要求1-6中任一项的体外方法,其中所述第一抗体包含非IgG4同种型的CH3区,其中该CH3序列不包含或者已被修饰而不包含任何如下所述的氨基酸残基:所述氨基酸残基可参与和包含相同的CH3区氨基酸序列的其它肽形成二硫键或者共价或稳定非共价重链间键。
9.权利要求8的体外方法,其中所述CH3区具有如SEQ ID NO:19所示的序列,其中该CH3区已被修饰从而发生了一种或多种如下的氨基酸替换:238位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;239位的Asp(D)已被Glu(E)取代;292位的Lys(K)已被Arg(R)取代;302位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;和328位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
10.权利要求9的体外方法,其中292位的Lys(K)已被Arg(R)取代。
11.权利要求1-6或8中任一项的体外方法,其中所述CH3区具有如SEQ IDNO:19所示的序列,但是其中292位的Lys(K)已被Tyr(W)或Phe(F)取代。
12.权利要求8的体外方法,其中所述CH3区具有如SEQ ID NO:20所示的序列,其中该CH3已区被修饰从而发生了一种或多种如下的氨基酸替换:234位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;276位的Met(M)已被Val(V)取代;288位的Lys(K)已被Arg(R)取代;298位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;和324位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
13.权利要求12的体外方法,其中234位的Arg(R)已被Gln(Q)取代。
14.权利要求12的体外方法,其中234位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;且324位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
15.权利要求12的体外方法,其中发生了全部5种取代。
16.权利要求8的体外方法,其中所述CH3区具有如SEQ ID NO:21所示的序列,其中该CH3区已被修饰从而发生了一种或多种如下的氨基酸替换:285位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;314位的Ser(S)已被Asn(N)取代;322位的Asn(N)已被Lys(K)取代;327位的Met(M)已被Val(V)取代;339位的Lys(K)已被Arg(R)取代;349位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;352位的Ile(I)已被Val(V)取代;365位的Arg(R)已被His(H)取代;366位的Phe(F)已被Tyr(Y)取代;和375位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
17.权利要求16的体外方法,其中285位的Arg(R)已被Gln(Q)取代。
18.权利要求16的体外方法,其中285位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;和375位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
19.权利要求16的体外方法,其中发生了全部10种取代。
20.权利要求1、3-7中任一项的体外方法,其中所述第一抗体是IgG4抗体。
21.前述权利要求中任一项的体外方法,其中所述第二抗体在核心铰链区中包含CPPC序列。
22.权利要求1-20中任一项的体外方法,其中所述第二抗体包含IgG4-样核心铰链区。
23.权利要求1-20或22中任一项的体外方法,其中所述第二抗体是在核心铰链区中包含CX1X2C序列的抗体,其中X1和X2可以是任何氨基酸,但X1和X2不能都是脯氨酸。
24.权利要求23的体外方法,其中所述第二抗体是在核心铰链区中包含CX3PC或CPX3C序列的抗体,其中X3可以是除脯氨酸之外的任何氨基酸。
25.权利要求23的体外方法,其中所述第二抗体是在核心铰链区中包含CSPC、CPSC、CRPC或CPRC序列的抗体。
26.前述权利要求中任一项的体外方法,其中所述第二抗体包含IgG4CH3区。
27.权利要求1-25中任一项的体外方法,其中所述第二抗体包含非IgG4同种型的CH3区,其中该CH3序列不包含或者已被修饰而不包含任何如下所述的氨基酸残基:所述氨基酸残基可参与和包含相同的CH3区氨基酸序列的其它肽形成二硫键或者共价或稳定非共价重链间键。
28.权利要求27的体外方法,其中所述CH3区具有如SEQ ID NO:19所示的序列,其中该CH3区已被修饰从而发生了一种或多种如下的氨基酸替换:238位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;239位的Asp(D)已被Glu(E)取代;292位的Lys(K)已被Arg(R)取代;302位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;和328位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
29.权利要求28的体外方法,其中292位的Lys(K)已被Arg(R)取代。
30.权利要求21-27中任一项的体外方法,其中所述CH3区具有如SEQ IDNO:19所示的序列,但是其中292位的Lys(K)已被Tyr(W)或Phe(F)取代。
31.权利要求27的体外方法,其中所述CH3区具有如SEQ ID NO:20所示的序列,其中该CH3区已被修饰从而发生了一种或多种如下的氨基酸替换:234位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;276位的Met(M)已被Val(V)取代;288位的Lys(K)已被Arg(R)取代;298位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;和324位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
32.权利要求31的体外方法,其中234位的Arg(R)已被Gln(Q)取代。
33.权利要求31的体外方法,其中234位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;且324位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
34.权利要求31的体外方法,其中发生了全部5种取代。
35.权利要求27的体外方法,其中所述CH3区具有如SEQ ID NO:21所示的序列,其中该CH3区已被修饰,从而发生了一种或多种如下的氨基酸替换:285位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;314位的Ser(S)已被Asn(N)取代;322位的Asn(N)已被Lys(K)取代;327位的Met(M)已被Val(V)取代;339位的Lys(K)已被Arg(R)取代;349位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;352位的Ile(I)已被Val(V)取代;365位的Arg(R)已被His(H)取代;366位的Phe(F)已被Tyr(Y)取代;和375位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
36.权利要求35的体外方法,其中285位的Arg(R)已被Gln(Q)取代。
37.权利要求35的体外方法,其中285位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;和375位的Pro (P)已被Leu(L)取代。
38.权利要求35的体外方法,其中发生了全部10种取代。
39.权利要求1-20或22-26中任一项的体外方法,其中所述第二抗体是IgG4抗体。
40.权利要求1或2的体外方法,其中所述第一抗体在核心铰链区中包含CPPC,并包含IgG4-样CH3区;且其中所述第二抗体在核心铰链区中包含CPPC,并包含IgG4-样CH3区。
41.前述权利要求中任一项的体外方法,其中所述第一抗体和/或所述第二抗体是人类抗体。
42.前述权利要求中任一项的体外方法,其中对步骤c)中的条件进行选择,使核心铰链区之外不发生显著的二硫桥还原或异构化。
43.前述权利要求中任一项的体外方法,其中步骤c)包括添加还原剂。
44.前述权利要求中任一项的体外方法,其中步骤c)包括添加从下组选出的作用剂:谷胱甘肽、L-半胱氨酸、二硫苏糖醇、β-巯基乙醇和半胱胺。
45.权利要求43或44的体外方法,其中所述作用剂的浓度使得步骤c)中产生的溶液的氧化还原势等于或者还原性更高于在实施例31所述的条件下1μM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由10μM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由50μM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由0.1mM谷胱甘肽产生的氧化还原势。
46.权利要求43或44的体外方法,其中所述作用剂的浓度使得步骤c)中产生的溶液的氧化还原势等于或者还原性更高于在实施例35所述的条件下由1mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由2mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由4mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由6mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由8mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由10mM谷胱甘肽产生的氧化还原势。
47.权利要求45或46的体外方法,其中所述作用剂的浓度使得步骤c)中产生的溶液的氧化还原势等于或者还原性低于于由1M谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性低于由100mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,等于或者还原性低于由15mM谷胱甘肽产生的氧化还原势。
48.前述权利要求中任一项的体外方法,其中步骤c)包括在还原型谷胱甘肽的存在下在20℃或更高的温度下,例如在37℃下,温育所述抗体至少1小时,例如至少2小时,例如至少5小时,例如至少10小时。
49.前述权利要求中任一项的体外方法,其中在所得的组合物中少于10%,例如少于5%,例如少于2%,例如少于1%的抗体分子处于聚集状态。
50.前述权利要求中任一项的体外方法,还包括使步骤c)中获得的组合物处于非还原性条件下,以便停止进一步的半分子交换的步骤。
51.前述权利要求中任一项的体外方法,还包括使双特异性抗体稳定化的步骤,优选地采用选自下组的方法:
a)铰链区中半胱氨酸的化学交联,
b)半分子上碳水化合物侧链的化学交联,和
c)CH3区中不对称地引入的半胱氨酸的交联。
52.前述权利要求中任一项的体外方法,还包括纯化双特异性抗体的步骤,优选地在非还原性条件下实施。
53.前述权利要求中任一项的体外方法,还包括将所得的双特异性抗体配制成用于治疗应用的药物组合物的步骤。
54.前述权利要求中任一项的体外方法,其中第一抗体具有针对肿瘤细胞或肿瘤细胞蛋白的结合特异性,例如针对erbB1、erbB2、erbB3、erbB4、MUC-1、CD19、CD20、CD38、CD4或CXCR5或针对CD79a或CD79b的结合特异性。
55.权利要求54的体外方法,其中第二抗体具有针对肿瘤细胞或肿瘤细胞蛋白的结合特异性,例如针对erbB1、erbB2、erbB3、erbB4、MUC-1、CD19、CD20、CD4或CXCR5的结合特异性。
56.权利要求54的体外方法,其中第一抗体具有针对erbB1的结合特异性,且第二抗体具有针对erbB2的结合特异性。
57.权利要求54的体外方法,其中第一抗体具有针对CD19的结合特异性,且第二抗体具有针对CD20的结合特异性。
58.权利要求54的体外方法,其中第一抗体具有针对CD4的结合特异性,且第二抗体具有针对CXCR5的结合特异性。
59.权利要求54的体外方法,其中第一抗体具有针对CD38的结合特异性,且第二抗体具有针对CD34的结合特异性。
60.权利要求1-53中任一项的体外方法,其中第一抗体具有针对病原微生物的结合特异性。
61.权利要求54或60的体外方法,其中第二抗体具有针对效应细胞蛋白质的结合特异性,例如针对CD3、CD25、CD28、CD16、CD89、CD32或CD1的结合特异性。
62.权利要求54的体外方法,其中第二抗体具有针对化疗剂的结合特异性。
63.权利要求54的体外方法,其中第二抗体具有针对血液蛋白例如血清白蛋白,或针对脑蛋白例如铁传递蛋白,或针对肝蛋白的结合特异性。
64.权利要求54的体外方法,其中第二抗体具有针对参与凝血的蛋白质例如组织因子的结合特异性。
65.前述权利要求中任一项的体外方法,其中第一和/或第二抗体连接于从下组选出的化合物:细胞毒剂;放射性同位素;前体药物或药物,例如紫杉烷;细胞因子;趋化因子和补体,例如C1q。
66.一种用于产生双特异性抗体的体外方法,所述方法包括如下步骤:
a)提供具有第一结合特异性的第一抗体,其中所述第一抗体包含核心铰链区中的CPPC序列以及IgG4CH3区,
b)提供具有不同于所述第一结合特异性的第二结合特异性的第二抗体,其中所述第二抗体包含核心铰链区中的CPPC序列以及IgG4CH3区,
c)在允许核心铰链区中的半胱氨酸进行二硫键异构化的还原条件下共同温育所述第一和第二抗体,和
d)获得双特异性抗体。
67.权利要求66的体外方法,其中在步骤c)中已添加还原剂,其中该还原剂的浓度使得步骤c)中产生的溶液的氧化还原势等于或者还原性更高于在实施例35所述的条件下由1mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由2mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由4mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由6mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如例如等于或者还原性更高于由8mM谷胱甘肽产生的氧化还原势,例如等于或者还原性更高于由10mM谷胱甘肽产生的氧化还原势。
68.一种分离的双特异性抗体,其是通过前述任一项权利要求的方法获得的,或者可以通过前述任一项权利要求的方法获得。
69.一种分离的双特异性抗体,其包括两个IgG4-样CH3区。
70.权利要求69的双特异性抗体,其中该抗体在核心铰链区中包含一个或两个CPPC序列。
71.权利要求69的双特异性抗体,其中该抗体在核心铰链区中包含一个或两个CX1X2C序列,其中X1和X2可以是任何氨基酸,但X1和X2不能都是脯氨酸。
72.权利要求69的双特异性抗体,其中该抗体在核心铰链区中包含一个或两个CX3PC或CPX3C序列,其中X3可以是除脯氨酸之外的任何氨基酸。
73.权利要求69的双特异性抗体,其中该抗体在核心铰链区中包含一个或两个CSPC、CPSC、CRPC或CPRC序列。
74.权利要求69-73中任一项的双特异性抗体,其中第一和/或第二CH3区是非IgG4同种型的,其中该CH3序列不包含或者已被修饰而不包含任何如下所述的氨基酸残基:所述氨基酸残基可参与和包含相同的CH3区氨基酸序列的其它肽形成二硫键或者共价或稳定非共价重链间键。
75.权利要求74的双特异性抗体,其中第一和/或第二CH3区具有如SEQ IDNO:19所示的序列,其中该CH3区已被修饰,从而发生了一种或多种如下的氨基酸替换:238位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;239位的Asp(D)已被Glu(E)取代;292位的Lys(K)已被Arg(R)取代;302位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;和328位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
76.权利要求75的双特异性抗体,其中第一和/或第二CH3区具有如SEQ IDNO:19所示的序列,但是其中292位的Lys(K)已被Arg(R)取代。
77.权利要求74的双特异性抗体,其中第一和/或第二CH3区具有如SEQ IDNO:19所示的序列,但是其中292位的Lys(K)已被Tyr(W)或Phe(F)取代。
78.权利要求74的双特异性抗体,其中第一和/或第二CH3区具有如SEQ IDNO:20所示的序列,其中该CH3区已被修饰从而发生了一种或多种如下的氨基酸替换:234位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;276位的Met(M)已被Val(V)取代;288位的Lys(K)已被Arg(R)取代;298位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;和324位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
79.权利要求74的双特异性抗体,其中234位的Arg(R)已被Gln(Q)取代。
80.权利要求74的双特异性抗体,其中234位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;且324位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
81.权利要求74的双特异性抗体,其中第一和/或第二CH3区具有如SEQ IDNO:21所示的序列,其中该CH3区已被修饰,从而发生了一种或多种如下的氨基酸替换:285位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;314位的Ser(S)已被Asn(N)取代;322位的Asn(N)已被Lys(K)取代;327位的Met(M)已被Val(V)取代;339位的Lys(K)已被Arg(R)取代;349位的Gln(Q)已被Glu(E)取代;352位的Ile(I)已被Val(V)取代;365位的Arg(R)已被His(H)取代;366位的Phe(F)已被Tyr(Y)取代;且375位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
82.权利要求81的双特异性抗体,其中285位的Arg(R)已被Gln(Q)取代。
83.权利要求81的双特异性抗体,其中285位的Arg(R)已被Gln(Q)取代;且375位的Pro(P)已被Leu(L)取代。
84.权利要求69-73中任一项的双特异性抗体,其中第一和/或第二CH3区是IgG4CH3区。
85.权利要求68-84中任一项的双特异性抗体,其中核心铰链区和CH3区外部的序列属于选自下组的同种型:IgG1、IgG2、IgG3和IgG4。
86.一种药物组合物,其包括权利要求69-85中任一项的双特异性抗体。
87.权利要求86的组合物,其用作药物。
88.权利要求86的组合物,其用作用于治疗癌症的药物。
89.通过权利要求1-67中任一项的方法获得的或者可以通过权利要求1-67中任一项的方法获得的双特异性抗体或者权利要求68-85中任一项的双特异性抗体在制备用于治疗癌症的药物中的用途。
90.一种用于选择具有期望性质的双特异性抗体的方法,所述方法包括如下步骤:
a)提供一系列抗体,其中每种抗体具有不同的靶标特异性,并且其中每种抗体包含IgG4-样CH3区,
b)在还原条件下将所述系列中的每种抗体与所述系列中的另一种抗体进行温育,从而产生一系列的抗体混合物,其中每种混合物包含不同的双特异性抗体,
c)测定所得的一系列抗体混合物的给定的期望性质,和
d)选择具有所述期望性质的双特异性抗体混合物。
91.权利要求90的方法,其中步骤b)具有权利要求2-67中对步骤c)所进一步限定的一种或多种性质。
92.权利要求90或91的方法,其中所述期望性质是肿瘤细胞杀伤。
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