TWI635098B - 含嵌合恆定區之抗體 - Google Patents
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Abstract
本發明提供結合至特定Fc受體但是效應子功能降低之包含重組多肽之抗體、抗原-結合蛋白及Fc-融合蛋白,該重組多肽含有嵌合重鏈恆定區序列。本發明提供製造用以在細胞系統中表現該等含Fc之嵌合抗體、抗原-結合蛋白以及Fc-融合蛋白之構築體的方法,以及製造與單離該含Fc之嵌合蛋白的方法。
Description
依據35 USC § 119(e),本申請案主張2013年2月1日申請之美國臨時專利申請案第61/759,578號的權利,該申請案以其整體具體併入本文做為參考資料。
本申請案納入在2013年2月1日產生之以電腦可讀形式如檔案8550_ST25.txt呈交的序列表(42,401位元)作為參考資料。
本發明涉及經工程化而帶有包含嵌合恆定區(更具體而言在重鏈恆定區中包括嵌合樞紐區)之重組多肽的抗體或抗原-結合蛋白。本發明是有關於包含降低效應子功能並提供使用於療法中之益處之重組多肽的抗體及抗原-結合蛋白。
IgG類免疫球蛋白作為治療劑是引人注意的。IgG在人類體內以四種亞類存在,IgG1、IgG2、IgG3及IgG4。IgG的重鏈恆定(CH)區含有三個結構域,CH1、CH2、CH3,其中CH1與CH2是經由一個樞紐而連結。儘管各個亞類的角色在物種之間有所不同,但已知重鏈恆定域是不同效應子功能的主因。人類IgG亞類透過其與Fcγ受體(FcγR)交互作用來媒介細胞免疫反應(諸如細胞殺滅、補體活化、吞噬作用與調理作用)的多血症。試圖要理解並操縱IgG亞類結合至FcγR的效應,研究人員已對IgG的恆定域
做出不同突變並研究所產生的IgG/FcγR交互作用(參見例如Canfield and Morrison J Exp Med 73,1483-1491(1991);Chappel,M.S.,et al.JBC 268(33),25124-31(1993);以及Armour,K.L.,et al.Eur J Immunol 29,2613-24(1999))。
人類IgG抗體的Fc依賴性細胞毒性活性需要抗體的Fc區
(其至少由具功能的CH2和CH3域所組成)結合至效應子細胞表面上的FcγR,效應子細胞為諸如天然殺手細胞、活化的巨噬細胞或類似細胞。補體媒介的溶解也可以受到Fc區與不同補體成分交互作用而被誘發。關於FcγR結合,已提議抗體的樞紐區以及CH2域中的數個胺基酸殘基至為重要(參見Sarmay,G,et al.Mol Immunol 29,633-9(1992);Greenwood,J et al.,Eur.J.Immunol,23(5),1098(1993),Morgan,A.et al,Immunology,86,319(1995),Stevenson,GT,Chemical Immunology,65,57-72(1997))。在CH2域中位點(N297)的醣化作用以及其醣類組成的變化強烈地影響IgG/FcγR交互作用(Stevenson,GT,Chemical Immunology,65,57-72(1997);Sibéril et al Immunol Ltrs 106,111-118(2006))。
就某些抗體療法而言,將Fc受體結合特性予以工程化來活
化全部、一些或者無一可用效應子機制而不會影響抗體藥動學特性是有利的。治療特性的期望組合在天然抗體指令中不是可得的。設計帶有效應子功能降低的抗體應為有效的,例如當治療目標不是要殺滅標的細胞,而是阻斷或活化其表面上的細胞表面分子但不誘發細胞毒性。當抗體為雙特異性,且其所要治療特性是來自於不同結合特異性時,則另一種降低結合至Fc受體的指令可能是樂見的。例如,雙特異性抗體的一種常見用途是合併腫瘤靶定特異性與T細胞活化特異性以誘發腫瘤特異性T細胞殺滅。在這個情況下,若Fc部分結合至Fc受體,則有可能引起T細胞不樂見地殺滅帶有Fc受體之細胞,或帶有Fc受體之細胞(諸如天然殺手細胞或巨噬細胞)殺滅T細胞。
因此,對於諸如帶有所要特性以供用於此等療法中的經改良生物療法存在有需求。申請人已發現,含有經置換或以其他方式修飾之
抗體重鏈的重組蛋白(包括重組抗體及重組受體-Fc融合蛋白)改變了Fc受體結合活性,其降低不樂見的副作用風險,並因而提供改良的治療效用。
本文揭示之抗體及抗原-結合蛋白經工程化而降低結合至Fc受體。
本發明的一個態樣提供一種包含重鏈恆定(CH)區之重組多肽或其變體,該重鏈恆定區由N端至C端具有CH1域、嵌合樞紐、CH2域以及CH3域,其中該CH1域包含自位置212至215(EU編號)具有至少胺基酸序列DKKV或DKRV的人類IgG1 CH1或人類IgG4 CH1,該嵌合樞紐包含自位置216至227(EU編號)的人類IgG1或人類IgG4上樞紐胺基酸序列以及自位置228至236(EU編號)的人類IgG2下樞紐胺基酸序列PCPAPPVA(SEQ ID NO:3),該CH2域包含自位置237至340(EU編號)的人類IgG4 CH2域胺基酸序列,以及該CH3域包含自位置341至447(EU編號)之人類IgG1或人類IgG4 CH3域序列。
本發明的另一個態樣提供一種重組多肽,其中該CH1域包含胺基酸序列DKKV(SEQ ID NO:4),而該嵌合樞紐包含胺基酸序列EPKSCDKTHTCPPCPAPPVA(SEQ ID NO:8)。本發明的又另一個態樣提供一種重組多肽,其中該CH1域包含胺基酸序列DKRV(SEQ ID NO:5),而該嵌合樞紐包含胺基酸序列ESKYGPPCPPCPAPPVA(SEQ ID NO:9)。在另一個態樣中,該CH1域包含SEQ ID NO:43或44。
本發明的另一個態樣提供一種重組多肽,其中該CH2域包含胺基酸序列SEQ ID NO:10。本發明的又另一個態樣提供一種重組多肽,其中該CH3域包含胺基酸序列SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:12。在另一個態樣中,該CH3域包含SEQ ID NO:41或42。
本發明的一個態樣提供一種重組多肽,其中該多肽包含N’-VD1-X1n-Y1-Y2-X2-X3-C’,其中:N’為多肽的N端而C’為多肽的C端,
VD1為包含抗原-結合域的胺基酸序列,X1為包含選自由IgG1 CH1域或其變體、IgG4 CH1域或其變體,以及IgG1或IgG4 CH1域的至少位置212-215(EU編號)組成之群之結構域的胺基酸序列,Y1包含IgG1或IgG4樞紐區之位置216-227(EU編號)的胺基酸序列,Y2包含位置228至236(EU編號)之人類IgG2下樞紐區胺基酸序列PCPAPPVA(SEQ ID NO:3),X2為包含IgG4 CH2域的胺基酸序列或其變體,以及X3為包含IgG1 CH3域或IgG4 CH3域的胺基酸序列或其變體;其中n=0或1。在本發明的一些態樣中,n=1。在本發明的又另一個態樣中,X1包含胺基酸序列DKKV(SEQ ID NO:4),而Y1-Y2包含由胺基酸序列EPKSCDKTHTCPPCPAPPVA(SEQ ID NO:8)組成的嵌合樞紐。在本發明的又另一個態樣中,X1包含胺基酸序列DKRV(SEQ ID NO:5),而Y1-Y2包含由胺基酸序列ESKYGPPCPPCPAPPVA(SEQ ID NO:9)組成的嵌合樞紐。在再一個態樣中,X1包含SEQ ID NO:43或SEQ ID NO:44。在本發明的另一個態樣中,X2包含SEQ ID NO:10。在本發明的另一個態樣中,X3包含SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:12。在又另一個態樣中,X3包含SEQ ID NO:41或SEQ ID NO:42。
本發明的另一個態樣提供一種重組多肽,其中該重鏈恆定區(CH)區包含與SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:37或SEQ ID NO:38中的任一者至少99%一致的胺基酸序列。
在一些態樣中,n=0且Y1-Y2包含由胺基酸序列EPKSCDKTHTCPPCPAPPVA(SEQ ID NO:8)組成的嵌合樞紐。在其他態樣中,n=0且Y1-Y2包含由胺基酸序列ESKYGPPCPPCPAPPVA(SEQ ID NO:9)組成的嵌合樞紐。
在本發明的另一個態樣中,該重組多肽為抗原-結合蛋白。在另一個態樣中,該重組多肽為Fc融合蛋白,諸如受體-Fc融合蛋白。在
本發明的又另一個態樣中,該重組多肽為抗體。
本發明的又一個態樣提供一種當相較於包含野生型IgG1或IgG4重鏈恆定區的對應重組多肽、抗原-結合蛋白、Fc融合蛋白或抗體時,在至少10nM的濃度下表現效應子功能降低的重組多肽、抗原-結合蛋白、Fc融合蛋白或抗體。因此,本發明提供一種具有結合、細胞毒性活性及細胞增生減低的重組多肽、抗原-結合蛋白、Fc融合蛋白或抗體。
本發明進一步提供一種重組多肽、抗原-結合蛋白、Fc融合蛋白或抗體,其在至少10nM的濃度下展現少於約50%的細胞毒性活性。本發明亦提供一種重組多肽、抗原-結合蛋白、Fc熔合蛋白或抗體,其在至少10nM的濃度下展現少於約40%、或少於約30%、或少於約20%、或少於約10%、或少於約5%或甚至無法偵測到的細胞毒性活性。
在其他具體例中,該重組多肽、抗原-結合蛋白、Fc融合蛋白或抗體如在活體外或離體細胞殺滅分析中測量,展現少於約50%細胞毒性,或少於細胞毒性40%、30%、20%、10%,或5%、4%、3%、2%或甚至0%或無法偵測到的細胞毒性的CDC活性。在某些具體例中,於濃度100nM下的CDC活性少於50%、40%、30%、20%、10%,或5%、4%、3%、2%或甚至0%或無法偵測到。在更多具體例中,如在活體外或離體細胞殺滅分析中測量,該重組多肽、抗原-結合蛋白、Fc融合蛋白或抗體展現少於約50%細胞毒性,或少於細胞毒性40%、30%、20%、10%,或5%、4%、3%、2%或甚至0%或無法偵測到的細胞毒性的ADCC活性。在某些具體例中,於濃度100nM下的ADCC活性少於50%、40%、30%、20%、10%,或5%、4%、3%、2%或甚至0%或無法偵測到的ADCC活性。
在又其他具體例中,如在活體外或離體細胞吞噬作用分析中測量,該重組多肽、抗原-結合蛋白、Fc融合蛋白或抗體展現少於約50% ADCP活性,或少於40%、30%、20%、10%,或5%、4%、3%、2%或甚至0%或無法偵測到的ADPC活性的ADCP活性。在某些具體例中,於濃度100nM下的ADCP活性少於50%、40%、30%、20%、10%,或5%、4%、3%、2%或甚至0%或無法偵測到的ADCP活性。
本發明進一步提供一種重組多肽,其中細胞毒性活性比包含野生型IgG1或野生型IgG4重鏈恆定區之對應多肽的細胞毒性活性低至少約10倍。本發明亦提供一種重組多肽,其中細胞毒性活性比包含野生型IgG1或野生型IgG4重鏈恆定區之對應多肽的細胞毒性活性低至少約50倍,或約100倍,或約1000倍。
本發明的一個態樣提供一種包含該該重組多肽的組合物。
本發明的另一個態樣提供一種核酸分子,其編碼本發明重組多肽中的任一者。本發明進一步提供一種編碼本發明重組多肽的核酸分子,其中該重組多肽包含選自由SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38及SEQ ID NO:37組成之群的胺基酸序列。
本發明進一步提供一種核酸分子,其包含與SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:32或SEQ ID NO:33具有大於99%序列一致性的核苷酸序列。本發明亦提供一種核酸分子,其包含與SEQ ID NO:36或SEQ ID NO:35具有大於99%序列一致性的核苷酸序列。
本發明亦提供一種核酸分子,其包含選自由SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:36及SEQ ID NO:35組成之群的核苷酸序列。
本發明的一個態樣提供一種載體,其包含本發明核酸分子中的任一者。本發明進一步提供一種載體,其中本發明核酸分子操作地連結至適於在宿主細胞中表現的表現控制序列。本發明亦提供一種本發明載體,其中該表現控制序列包含選自由SV40、CMV、CMV-IE、CMV-MIE、UbC、RSV、SL3-3、MMTV、Ubi以及HIV LTR組成之群的啟動子。本發明進一步提供一種本發明載體,其中該啟動子為CMV-MIE/TetO或CMV-MIE/Arc雜合啟動子。本發明亦提供一種本發明載體,其包含一或多個選自由bla、bls、BSD、bsr、Sh ble、hpt、tetR、tetM、npt、kanR以及pac組成之群的可篩選標記基因。
本發明的另一個態樣提供一種包含本發明核酸的細胞。本發明進一步提供一種包含本發明載體的細胞。
本發明進一步提供一種包含本發明核酸的細胞,其中該核酸被併入細胞基因組中。本發明亦提供一種細胞,其包含編碼蛋白質表現增強子的核酸。本發明又進一步提供一種包含編碼XBP多肽之核酸的細胞。
在本發明的一個具體例中,該細胞為真核細胞。在本發明的一個具體例中,該細胞為動物細胞。在本發明的一個具體例中,該細胞為哺乳動物細胞。在本發明的另一個具體例中,該細胞為CHO細胞。在本發明的一個具體例中,該細胞為CHO-K1細胞。
本發明的一個態樣提供一種製造包含嵌合樞紐區之抗體的方法,該方法包含:(a)以編碼該抗體之輕鏈的核酸分子轉染宿主細胞,該核酸分子包含編碼選定抗原-特異性抗體之VL區的核苷酸序列以及編碼Ig之恆定CL區的核苷酸序列,其中該編碼選定抗原-特異性抗體之VL區的核苷酸序列以及該編碼Ig之CL區的核苷酸序列可操作地連結在一起;(b)以編碼該抗體之重鏈的核酸分子轉染步驟(a)之宿主細胞,該核酸分子包含編碼選定抗原-特異性抗體之VH區的核苷酸序列以及編碼人類Ig之恆定CH區的核苷酸序列,其中該編碼CH區的核苷酸序列包含編碼SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38或SEQ ID NO:37的核苷酸序列,其中該編碼選定抗原-特異性抗體之VH區的核苷酸序列以及該編碼該Ig之CH區的核苷酸序列可操作地連結在一起;以及(c)藉由在該宿主細胞中共表現(a)與(b)的核酸分子來製造該抗體。
在本發明的另一個態樣中,製造抗體的方法進一步包含培養上文步驟(b)的宿主細胞,其中該抗體被分泌至細胞培養基中;以及自該細胞培養基單離該抗體的步驟。
本發明的另一個態樣提供一種製造包含嵌合樞紐區之受體-Fc融合蛋白的方法,該方法包含:
(a)以編碼該受體-Fc融合蛋白的核酸分子轉染宿主細胞,該核酸分子包含編碼融合至編碼人類Ig之恆定CH區的核苷酸序列之受體蛋白的核苷酸序列,其中該編碼CH區的核苷酸序列包含編碼SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38或SEQ ID NO:37的核苷酸序列,其中該編碼受體蛋白的核苷酸序列以及該編碼該Ig之CH區的核苷酸序列可操作地連結在一起;以及(b)藉由在該宿主細胞中表現(a)的核酸分子來製造該受體-Fc融合蛋白。
在本發明的另一個態樣中,製造受體-Fc融合物的方法包含培養上文步驟(b)的宿主細胞,其中該受體-Fc融合蛋白被分泌至細胞培養基中;以及自該細胞培養基單離該受體Fc融合蛋白的步驟。
在其他具體例中,製造抗體的方法包含:(a)生成第一細胞培養物,其包含表現感興趣之第一重鏈多肽的細胞;(b)生成第二細胞培養物,其包含表現感興趣之第二重鏈多肽的細胞;(c)將該第一與第二細胞培養物合併;以及(d)回收呈雜二聚體形式的第一與第二多肽;其中該第一與第二重鏈多肽的重鏈各自包含選自由SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38以及SEQ ID NO:37組成之群的胺基酸序列。在上面的方法中,該第一細胞培養物進一步包含感興趣之第一同源輕鏈,而該第二細胞培養物進一步包含感興趣之第二同源輕鏈,其中該第一與第二同源輕鏈共價接合至第一與第二重鏈多肽且因而被回收。
在其他具體例中,本發明提供一種製造抗體的方法,該抗體包含在第一細胞培養物中生產的第一單鏈可變片段-Fc(scFv-Fc),以及在第二細胞培養物中生產的第二scFv-Fc,其中該第一與第二scFv-Fc的Fc各自包含選自由SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38以及SEQ ID NO:37組成之群的胺基酸序列,合併第一與第二細胞培養物或其上清液,以及回收或單離呈雜二聚體形式的該第一與第二scFv-Fc。在一些具體例中,該第一與第二scFv-Fc被分泌
至細胞培養基中,且該方法包含合併該第一與第二細胞培養基,以及回收或單離雜二聚體蛋白。
在本發明的一些具體例中,該宿主細胞是選自由CHO、
COS、視網膜細胞、Vero、CV1、293、MDCK、HaK、BHK、HeLa、HepG2、WI38、MRC 5、Colo25、HB 8065、HL-60、Jurkat、Daudi、A431(上皮)、CV-1、U937、3T3、L細胞、C127細胞、SP2/0、NS-0、MMT細胞、腫瘤細胞、衍生自上述細胞中任一者的細胞株以及PER.C6®細胞組成之群。
本發明的另一個態樣提供一種雙特異性抗體,其包含:
(a)包含能夠辨識並結合至第一目標抗原之抗原-結合域的第一重鏈、(b)包含能夠辨識並結合至第二目標抗原之抗原-結合域的第二重鏈,以及(c)能夠辨識並結合至第一或第二目標抗原的共有輕鏈抗原-結合域,其中(a)或(b)或(a)與(b)兩者的重鏈包含含有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:31的重鏈恆定區。
本發明的又一個態樣提供一種本發明雙特異性抗體,其包含:(a)包含含有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:31之第一重鏈恆定區的第一重鏈,以及(b)包含含有SEQ ID NO:38或SEQ ID NO:37之第二重鏈恆定區的第二重鏈。
本文揭示之本發明的此等以及其他目的,以及優點與特徵將因為下列說明、圖式與申請專利範圍而變得更為清楚。
圖1顯示hIgG1、hIgG2以及hIgG4之樞紐區的對應胺基酸編號慣例。胺基酸編號是依據最近更新的IMGT Scientific Chart(IMGT®,國際ImMunoGeneTics資訊系統®,http://www.imgt.org/IMGTScientificChart/Numbering/Hu_IGHGnber.html(created:17 May 2001,last updated:10 Jan 2013)與如在Kabat,E.A.et al.Sequences of Proteins of Immunological interest.5th ed.US Department of Health and Human Services,NIH publication No.91-3242(1991)中報導的
EU指引號。(wt=野生型;-表示特定指涉對象無對應編號;--表示在特定指涉對象的位置中無對應胺基酸被報導)。
圖2說明構築嵌合樞紐區時使用的樞紐胺基酸以及對應胺基酸常規。
圖3包括CH1、樞紐、CH2與CH3域之人類IgG1重鏈恆定區的胺基酸序列,於UniProtKB/Swiss-Prot Accn.No.P01857(SEQ ID NO:13)中描述為IGHG1。
圖4包括CH1、樞紐、CH2與CH3域之人類IgG2重鏈恆定區的胺基酸序列,於UniProtKB/Swiss-Prot Accn.No.P01859(SEQ ID NO:14)中描述為IGHG2。
圖5包括CH1、樞紐、CH2與CH3域之人類IgG4重鏈恆定區的胺基酸序列,於UniProtKB/Swiss-Prot Accn.No.P01861(SEQ ID NO:15)中描述為IGHG4。
圖6單參數直方圖,顯示抗體在螢光結合分析中結合(%最大)至Jurkat細胞上的抗原。圖6A:測量對照分析的背景螢光,亦即僅與二級抗體(sec)一起培育的Jurkat細胞以及未經染色的Jurkat細胞。圖6B:結合至含有嵌合樞紐重鏈恆定區之抗體(Ab 1=sIgG4)對結合至含有對應抗原-結合域和野生型(wt)IgG4恆定區之抗體(對照Ab 2)之Jurkat細胞的比較。圖6C:結合至含有嵌合樞紐重鏈恆定區之抗體(Ab 2=sIgG1)對結合至含有對應抗原-結合域和野生型(wt)IgG1重鏈恆定區之抗體(對照Ab 1)之Jurkat細胞的比較。
圖7描述嵌合樞紐抗體結合至U937細胞之能力的劑量-反應曲線。提供結合的半最大濃度(EC50)值(平均螢光強度)。(對照抗體=wt IgG1 CH;抗體2=sIgG1;對照Ab 2=wt IgG4 CH;以及抗體1=sIgG4)。
圖8描述嵌合樞紐抗體在活化PBMC(T細胞)存在下對U937細胞缺乏細胞毒性的劑量-反應曲線。半最大濃度(EC50)值反映%細胞毒性。(對照抗體1=wt IgG1 CH;抗體1=sIgG4;對照Ab 2=wt IgG4 CH;以及抗體2=sIgG1;對照Ab 3=wt IgG1 CH)。
圖9描述在PBMC增生分析中關於細胞存活率之半最大濃度(EC50)值的劑量-反應曲線。(對照抗體1=wt IgG1 CH;抗體1=sIgG4;對照Ab 2=wt IgG4 CH;抗體2=sIgG1;對照Ab 3=wt IgG1 CH;以及對照Ab 4=帶有wt IgG1 CH的非特異性Ab)。
圖10描述在帶有野生型或嵌合樞紐CH區的抗體存在下,對Daudi(圖10A)與Raji(圖10B)細胞缺乏CDC活性的劑量-反應曲線。(對照抗體5=帶有wt IgG1 CH的雙特異性Ab;抗體3=sIgG1*;抗體4=sIgG1*;IgG1同型對照=帶有wt IgG1 CH的非特異性Ab)。
圖11描述在帶有野生型或嵌合樞紐CH區的抗體存在下,對Daudi(圖11A)與Raji(圖11B)細胞缺乏ADCC活性的劑量-反應曲線。(對照抗體5=帶有wt IgG1 CH的雙特異性Ab;抗體3=sIgG1*;抗體4=sIgG1*;IgG1同型對照=帶有wt IgG1 CH的非特異性Ab)。
應理解,本發明不限於所述特定方法以及實驗條件,因為該等方法以及條件可能會有所改變。亦應理解,本文使用的術語僅供說明特定具體例之用,且不意欲具有限制性,因為本發明的範疇是由申請專利範圍所定義。
如本說明書以及隨附申請專利範圍中所用,除非上下文另有清楚定義,否則單數型”一”與”該”包括複數指涉對象。因此舉例而言,提及”一種方法”包括本文所述類型,及/或在閱讀過本揭示內容後對於習於技藝者將變得清楚的一或多種方法,及/或步驟。
除非另有定義,否則本文使用的所有技術與科學術語具有與本發明所屬技藝中具有通常技術者一般所理解者相同的意思。儘管與本文所述類似或相同的任何方法以及材料可用於實施本發明,現將說明具體方法以及材料。本文提及的所有公開資料以其整體併入本文做為參考資料。
術語”免疫球蛋白”意指一類結構相近的醣蛋白,其由兩對多肽鏈所組成,一對為輕(L)鏈而一對為重(H)鏈,其可以全部四者是藉由雙硫鍵而交互連結。免疫球蛋白的結構已被充分鑑定。參見,例如Fundamental Immunology第7章(Paul,W.,ed.,2nd ed.Raven Press,N.Y.(1989))。簡言之,各重鏈通常包含一重鏈可變區(此處縮寫為VH或VH)以及重鏈恆定區(CH或CH)。重鏈恆定區通常含有三個結構域,CH1、CH2以及CH3。CH1以及CH2域是藉由樞紐而連結。各個輕鏈通常含有一個輕鏈可變區(此處縮寫為VL或VL)以及一個輕鏈恆定區。在人類以及其他哺乳動物中有兩類輕鏈:κ鏈與λ鏈。輕鏈恆定區通常含有1個結構域(CL)。VH與VL區可進一步分成具有超變異性的區域(或超變區,其在結構限定環的序列及/或形式上為超變異),又被命名為互補決定區(CDR),散佈有較為守恆的區域(命名為骨架區(FR))。各個VH與VL通常由三個CDR以及四個FR所構成,按下列順序從胺基端(N端)往羧基端(C端)排列:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4(亦參見Chothia and Lesk J.MoI.Biol.196,901-917(1987))。典型地,在這區域中,胺基酸殘基的編號是依據IMGT,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD.(1991);或依據Kabat的EU編號系統(亦已知為”EU編號”或”EU索引號”),例如在Kabat,E.A.et al.Sequences of Proteins of Immunological interest.5th ed.US Department of Health and Human Services,NIH公開資料第91-3242號(1991)中所述。
術語”抗體”(Ab)如本文所用意指一種免疫球蛋白分子或其衍生物,其具有特異地結合至某個抗原的能力。該免疫球蛋白分子的重鏈與輕鏈的可變區含有與某個抗原交互作用的結合域,如上文關於”免疫球蛋白”所略述。抗體也可以是雙特異性抗體、二價抗體(diabody)或類似分子(關於二價抗體的說明,參見例如PNAS USA 90(14),6444-8(1993))。更甚者,已證實抗體的抗原-結合功能可以由全長抗體的片段(亦即”抗原-結合片段”或”抗原-結合蛋白”)所執行。與全長抗體分子相比,抗原-結合蛋白可以是單特異性或多特異性(例如雙特異性)。含括於術語”抗體”內的結
合分子或片段的實例包括,但不限於(i)Fab’或Fab片段、由VL、VH、CL與CH1域組成的單價片段,或如國際專利公開案第WO2007059782號中所述的或單價抗體;(ii)F(ab’)2片段,包含兩個藉由在樞紐區處的雙硫橋而連結的Fab片段的二價片段;(iii)Fd片段,基本上由VH與CH1域所組成;(iv)Fv片段,基本上由VL與VH域所組成;(v)dAb片段(Ward et al.,Nature 341,544-546(1989)),其基本上由VH域所組成且亦稱為域抗體(Holt et al;Trends Biotechnol.2003 Nov;21(11):484-90);(vi)駱駝或奈米抗體(Revets et al;Expert Opin Biol Ther.2005 Jan;5(1):111-24)以及(vii)經單離的互補決定區(CDR)。
術語”人類抗體”如本文所用,欲包括具有衍生自人類生殖系免疫球蛋白序列之可變與恆定區的抗體。本發明的人類抗體可包括非由人類生殖系免疫球蛋白序列所編碼的胺基酸殘基(例如藉由活體外隨機或定點突變或在基因重排期間或藉由活體內體突變所引入的突變)。
抗體(例如雙特異性抗體)的多特異性抗原-結合片段通常包含至少兩個不同可變域,其中各個可變域能夠特異地結合至個別抗原或相同抗原上的不同表位。任一種多特異性抗體形式,包括此處所揭示的雙特異性抗體形式,可使用該技藝中可取得之慣用技術而改造成使用於本發明之抗體的抗原-結合片段中。
此外,儘管Fv片段的兩個結構域(VL與VH)是由個別基因所編碼,但它們可以使用重組方法藉由使其以單一蛋白鏈的形式被製造的合成連結子來被連結,其中VL與VH成對而形成單價分子(已知為單鏈抗體或單鏈Fv(scFv),參見例如Bird et al.,Science 242,423-426(1988)以及Huston et al.,PNAS USA 85,5879-5883(1988))。除非另有註明或上下文有清楚指明,否則此等單鏈抗體含括於術語”抗體”內。儘管此等多肽大體上被納入抗體的意思內,但它們整體且個別獨立地為本發明的獨有特徵,表現不同的生物特性以及實用性。用於本發明上下文中的此等以及其他抗體片段以及重組多肽在本文中進一步被討論。應理解,除非另有指明,否則術語抗體亦包括由任何已知技術所提供的多株抗體、單株抗體(mAb)、抗體樣多
肽(諸如嵌合抗體與人類化抗體),以及維持特異地結合至抗原之能力的任一抗體片段(抗原-結合片段或分子),該等已知技術包括酶切割、肽合成,以及重組技術。所生成的抗體可已具有任一種Ig同型或其組合。任何scFv可以藉由已知技術融合至本發明的重鏈恆定區。
可用於本發明上下文中的其他例式性雙特異性形式包括,但不限於例如,以scFv為基礎的雙特異性形式、IgG-scFv融合物、雙重可變域(DVD)-Ig、四價體瘤、洞中紐、共用輕鏈(例如帶有洞中鈕的共有輕鏈)、CrossMab、CrossFab、(SEED)體、雙重作用Fab(DAF)-IgG,以及Mab2雙特異性形式(關於前面形式的回顧參見,例如Klein et al.2012,mAbs 4:6,1-11與其中引用的參考文獻)。雙特異性抗體可以使用肽/核酸接合來構築,例如其中帶有直角化學反應性的非天然胺基酸被用來生成位點特異性抗體-寡核苷酸接合物,其之後自我組裝成具有限定組成、價數與幾何學的多聚體複合體(參見,例如Kazane et al.,J.Am.Chem.Soc.[Epub:Dec.4,2012])。
可用於本發明上下文的更多例示性多特異性形式包括,但不限於例如特異地結合目標分子的第一抗原-結合域,以及特異地結合內化效應子蛋白的第二抗原-結合域,其中該等第二抗原-結合域能夠活化並內化該效應子蛋白,該效應子蛋白為例如受體(參見U.S.申請公開案第2013/0243775A1,於2013年9月19日公開,併入做為參考資料)。
重組蛋白可以藉由習於技藝者已知的標準分子生物學技術製造出(參見例如Sambrook,J.,E.F.Fritsch And T.Maniatis.Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Second Edition,Vols 1,2,and 3,1989;Current Protocols in Molecular Biology,Eds.Ausubel et al.,Greene Publ.Assoc.,Wiley Interscience,NY)。
片語”互補決定區”或術語”CDR”包括由生物體免疫球蛋白(Ig)之核酸序列編碼的胺基酸序列。CDR為高度變異性的區域(亦即在野生型動物的情況下),正常散佈於例如抗體或T細胞受體(TCR)之輕鏈或重鏈之可變區中更為守恆的骨架區域(FR)中。CDR可由,例如生殖系序列或重
排或未重排序列,以及例如由天然或成熟B細胞或T細胞所編碼。在一些情況(例如CDR3)下,CDR可以由兩個或更多個序列(例如生殖系序列)所編碼,該兩個或更多個序列不為連續(例如未重排核酸序列),但在B細胞核酸序列中為連續者,例如因為剪接或連接序列(例如V-D-J重組而形成重鏈CDR3)。
術語”抗原-結合域”如本文所用,為能夠選擇性辨識並結合至抗原之重鏈或輕鏈的胺基酸序列,其中KD至少在微莫耳範圍內。本發明之抗原-結合域包括至少一個CDR。
片語”可變域”包括免疫球蛋白輕鏈或重鏈的胺基酸序列(若需要經修飾),其以N端至C端的順序(除非另外指明)包含下列胺基酸區域:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。”可變域”包括能夠摺疊成具有雙重貝他折片結構的標準域(VH或VL)的胺基酸序列,其中貝他折片是藉由第一個貝他折片的殘基與第二個貝他折片之間的雙硫鍵而被連結。
片語”重鏈”或”免疫球蛋白(Ig)重鏈”如本文所用,包括來自任何生物體的Ig重鏈恆定區序列,且除非另外指明,否則包括重鏈可變域。除非另有指明,否則重鏈可變域包括三個重鏈CDR以及四個FR區。重鏈可變域的片段包括CDR,或CDR以及FR。典型的重鏈恆定區具有下列可變域(由N端至C端)CH1域、樞紐、CH2域,以及CH3域。在抗原-結合蛋白中,重鏈的功能性片段包括能夠特異地辨識抗原的片段(例如以微莫耳、奈莫耳或皮莫耳範圍的KD辨識抗原),其能夠在細胞中被表現並且被細胞分泌,且包含至少一種CDR。
片語"含Fc蛋白"包括抗體、雙特異性抗體、抗體-結合片段、trap分子與其他受體-Fc融合蛋白,以及包含免疫球蛋白CH2和CH3區之至少一個功能性部分的其他結合蛋白,諸如配體-Fc融合蛋白。”功能性部分”意指可結合Fc受體的CH2以及CH3區,Fc受體為例如FcγR(意即FcγRI(CD64)、FcγRIIa(CD32a)、FcγRIIb(CD32b)、FcγRIIIa(CD16a),或FcγRIIIb(CD16b))或FcRn(新生兒Fc受體,其賦予抗體延長的半衰期)。若
CH2與CH3區含有刪除、置換及/或插入或其他使其無法結合任何Fc受體的修飾,則該CH2與CH3區被認為是非功能性。因此,當希望消除或消滅效應子功能時,任何含有Fc的蛋白質可以被工程化以包含如本文所述的嵌合重鏈恆定區。
片語”Fc-融合蛋白”以及具體而言”受體-Fc融合蛋白”包括經工程化成含有如本文所述之功能性Fc片段的重組蛋白。例如,”受體-Fc融合蛋白”包括嵌合蛋白,其包含融合至Ig之Fc域的胺基酸序列的受體蛋白胺基酸序列。融合蛋白中所用之受體蛋白實例為技藝中已知(參見例如Klinkert,et al.J Neuroimmunol.72(2):163-8(1997);Milligan,G.,et al.Curr Pharm Des.10(17):1989-2001(2004);以及Schwache D,and Müller-Newen G,Eur J Cell Biol.91(6-7):428-34(2012),doi:10.1016/j.ejcb.2011.07.008.Epub 2011 Sep 29)。
在本發明的上下文中,受體-Fc融合蛋白是由融合至如本文所述嵌合重鏈恆定區之核苷酸序列之編碼受體蛋白的核苷酸序列所編碼。在一些具體例中,受體蛋白的核苷酸序列編碼受體之配體-結合域或細胞外域。在其他具體例中,受體蛋白的核苷酸序列編碼受體的細胞外域以及受體的穿膜域。受體-Fc融合蛋白也在US20090137416 A1中例示說明。
採用hFcγRI之以流式細胞儀為基礎的自體分泌trap(FASTR)方法容許快速單離表現或分泌本發明抗體或受體-Fc融合蛋白的高表現株。(參見,例如US20090137416 A1,其併入本文做為參考資料)。此等高表現株可用來單離表現包含本發明之嵌合重鏈恆定區的蛋白質的細胞。FASTR方法可用來直接篩選並單離表現本發明任一種重組多肽、抗原-結合蛋白、抗體,或Fc融合蛋白的細胞。
片語”輕鏈”包括任何生物體的免疫球蛋白輕鏈恆定區序列,且除非另有指明,否則其包括人類κ與λ輕鏈。輕鏈可變(VL)域通常包括三個輕鏈CDR以及四個骨架(FR)區。一般而言(意即在野生型動物的情況下),全長輕鏈自胺基端至羧基端包括VL域以及輕鏈恆定域,VL域包括FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4。
本發明多肽包含衍生自免疫球蛋白域的胺基酸序列。”衍生自”指定蛋白質的多肽或胺基酸序列意指多肽的來源。
術語”樞紐’如本文所用,欲包括連接免疫球蛋白CH1之C端至CH2域之N端的連續胺基酸殘基。CH2域之N端的數個胺基酸是由CH2外顯子所編碼,亦被視為”下樞紐(lower hinge)”的一部分。在不受限於任何理論的情況下,IgG1、IgG2以及IgG4之樞紐區的胺基酸已被鑑定為包含由一個獨特樞紐外顯子所編碼之12-15個連續胺基酸,以及CH2域之數個N端胺基酸(由CH2外顯子所編碼)(Brekke,O.H.,et al.Immunology Today 16(2):85-90(1995))。另一方面,IgG3包含由四個節段組成的樞紐區:一個類似IgG1之樞紐區的上節段,以及3個不同於IgG3之相同胺基酸重複序列的節段。
在本揭示內容中,為了本發明實施者方便起見,人類IgG1、IgG2以及IgG4的樞紐區胺基酸在本文中已經過Kabat的EU編號系統所鑑別(Kabat,E.A.et al.,Sequences of Proteins of Immunological interest.5th ed.US Department of Health and Human Services,NIH publication No.91-3242(1991)),EU編號系統亦已知為”EU編號”或”EU索引號”,如依據IMGT® Scientific Chart,IMGT®,國際ImMunoGeneTics information system®,http://www.imgt.org/IMGTScientificChart/Numbering/Hu_IGHGnber.html所更新,其創建於2001年5月17日,更新於2013年1月10日。
人類IgG1、IgG2以及IgG4樞紐胺基酸的EU標號與IMGT獨特域編號、IMGT外顯子標號和Kabat編號常規(亦參見Kabat,E.A.et al.,1991,上文)之間的比對說明於圖1以及如下文:
為本揭示內容之目的,”上樞紐”區欲包括依據EU編號自位置216至227的胺基酸殘基(依據Kabat編號位置226至240的胺基酸殘基)(亦見圖2)。”下樞紐”區欲包括依據EU編號自位置228至236的胺基酸殘基(依據Kabat編號位置241至249的胺基酸殘基)(亦見圖2)。
術語”嵌合”如本文所用,表示由不同來源的部分所組成。片語”嵌合蛋白”包括在自然界中正常不相連的連結至第二胺基酸蛋白質的第一胺基酸蛋白質。該等胺基酸序列正常可如離散蛋白質或以相同蛋白質的不同排列方式存在,且一起以一種新的排列方式作成融合多肽。嵌合
蛋白可以由技藝中已知的不同方法做出,例如藉由化學合成或藉由創造編碼成所要排列方式之嵌合蛋白的胺基酸序列的多核苷酸。例示性嵌合蛋白包括連接IgG之重鏈域的嵌合樞紐序列,以及經工程化以製造本發明人類抗體、抗原-結合蛋白以及受體-Fc融合蛋白的融合蛋白。
本文揭示的嵌合蛋白被設計成例如相較於野生型IgGFc區使接合位置中的免疫原性表位的生成降至最低。本發明之經工程化蛋白質因而具有降低的免疫原性,並且展現結合至Fc受體降低,以及降低至無效應子功能。
術語”嵌合樞紐”如本文所用欲包括一種嵌合蛋白,其包含衍生自某種Ig分子之樞紐區的第一胺基酸序列以及衍生自一個不同類或亞類Ig分子之樞紐區的第二胺基酸序列。本發明的例示性嵌合樞紐包含衍生自人類IgG1或人類IgG4樞紐區的第一胺基酸序列或”上樞紐”序列,以及衍生自人類IgG2樞紐區的第二胺基酸序列或”下樞紐”序列。在某些具體例中,該第一或”上樞紐’序列包含依據EU編號位置216至227的胺基酸殘基。在一些具體例中,該第二或”下樞紐”序列包含依據EU編號位置228至236的胺基酸殘基。
術語”人類化抗體”如本文所用,欲包括CDR序列是衍生自另一種哺乳動物物種(諸如小鼠)之生殖系,且已被移植至人類骨架序列上的抗體。人類化單株抗體可以是由包括得自轉基因或轉染色體非人類動物(諸如轉基因小鼠)之B淋巴細胞的融合瘤所生成,該轉基因或轉染色體非人類動物具有包含融合至不朽細胞之人類重鏈轉基因以及輕鏈轉基因的基因組。舉例而言,若非人類抗體是針對特定抗原來製備,則可變區可以藉由將衍生自非人類抗體之CDR移植至存在於待修飾之人類抗體中的FR上而被”再成形”或”人類化”。這個方法的應用已被Sato,K.et al.Cancer Research 53:851-856(1993);Riechmann,L.,et al.,Nature 332:323-327(1988);Verhoeyen,M.,et al.,Science 239:1534-1536(1988);Kettleborough,C.A.,et al.,Protein Engineering 4:773-3783(1991);Maeda,H.,et al.,Human Antibodies Hybridoma 2:124-134(1991);Gorman,S.D.,et al.,Proc Natl Acad Sci USA 88:4181-4185(1991);Tempest,P.R.,et al.,Bio/Technology 9:266-271(1991);Co,M.S.,et al.,Proc Natl Acad Sci USA 88:2869-2873(1991);Carter,P.,et al.,Proc Natl Acad Sci USA 89:4285-4289(1992);以及Co,M.S.et al.,J Immunol 148:1149-1154(1992)報導。在一些具體例中,人類化抗體保有全部CDR序列(例如,含有小鼠抗體之全部六個CDR的人類化小鼠抗體)。在其他具體例中,人類化抗體具有一或多個CDR(一、二、三、四、五或六個),其相對於原抗體有所改變,該一或多個CDR又被稱為"衍生自”原抗體之一或多個CDR的一或多個CDR。人類化抗體可意指為使用重組技術製備的嵌合分子。
在另一個具體例中,包含連結至鼠類恆定區之人類可變區的嵌合抗體,諸如彼等由VELOCIMMUNE小鼠生成的細胞株生產的抗體,可以藉由將鼠類恆定區取代為包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38或SEQ ID NO:37之人類恆定區而被人類化。
術語”單株抗體”或”單株抗體組合物”如本文所用意指單分子組成的抗體分子製品。單株抗體組合物對特定表位展現出單一結合特異性以及親和力。因此,術語”小鼠或鼠類單株抗體”意指展現出單一結合特異性的抗體,其具有衍生自鼠類或小鼠生殖系免疫球蛋白序列的可變區與恆定區。
如本文所用,術語”結合”在抗體、Ig、抗體-結合片段或含Fc蛋白結合至預定抗原或FcR的情況下,典型意指至少兩個實體或分子結構交互作用或締合,諸如抗體-抗原交互作用,或含Fc蛋白對FcγR(其中含Fc蛋白為抗體、Ig、抗體-結合片段或受體-Fc融合蛋白)。
例如,當藉由例如表面電漿共振(SPR)技術在BIAcore 3000儀器中使用抗原或FcR作為配體而抗體、Ig、抗體-結合片段或含Fc蛋白作為分析物(或抗配體)測量時,結合親和力通常對應於約10-7M或更少的KD值,諸如約10-8M或更少,諸如約10-9M或更少。因此,該抗體或其他結合蛋白以對應於結合至非特異性抗原(例如BSA、酪蛋白)之親和力低至少
10倍(諸如低至少100倍,例如低至少1,000倍,諸如低至少10,000倍,例如低至少100,000倍)的KD值結合至預定抗原或受體。
術語”KD”(M)如本文所用,意指特定抗體-抗原交互作用的解離平衡常數,或抗體、Ig、抗體-結合片段或含Fc蛋白對FcγR的解離平衡常數。KD與結合親和力之間有反向關係,故KD值越小,親和力越高。因此,術語”較低親和力”與形成交互作用的能力較低有關且因而KD值較大。
術語”kd”(sec-1或1/s)如本文所用,意指特定抗體-抗原交互作用的解離速率常數,或抗體、Ig、抗體-結合片段或含Fc蛋白對FcγR的解離速率常數。該值也可意指為koff值。
術語”ka”(M-1 x sec-1或1/M)如本文所用,意指特定抗體-抗原交互作用的締合速率常數,或抗體、Ig、抗體-結合片段或含Fc蛋白對FcγR的締合速率常數。
術語”KA”(M-1或1/M)如本文所用,意指特定抗體-抗原交互作用的締合平衡常數,或抗體、Ig、抗體-結合片段或含Fc蛋白對FcγR的締合平衡常數。締合平衡常數是藉由將ka除以kd而獲得。
術語”EC50”或”EC50”如本文所用,意指半最大有效濃度,其包括在指定暴露時間之後引起基線與最大反應之間的反應一半的抗體濃度。EC50實質上代表觀察到50%其最大效用的抗體濃度。因此,在EC50或半最大有效濃度值增加的情況下,觀察到結合減少。
在一個具體例中,結合降低可以定義為EC50抗體濃度增加,其使得結合至半最大量目標細胞成為可能。
在一些具體例中,細胞毒性活性降低可以定義為EC50抗體濃度增加,其使得半最大量目標細胞的溶解成為可能。
在其他具體例中,增生降低可定義為EC50抗體濃度增加,其使得半最大量目標細胞的增生成為可能。
片語”雙特異性抗體”如本文所用包括對某個目標多肽的不同表位具有特異性,且可含有對一個以上目標多肽具有特異性的抗原-
結合域的抗體。參見,例如Tutt et al.(1991)J.Immunol.147:60-69。例如,人類抗體可連結至另一功能性分子或與另一功能性分子一起共表現,該另一功能性分子為例如另一肽或蛋白質。舉例而言,抗體或其片段可以在功能上連結(例如藉由化學偶合、遺傳融合、非共價締合或以其他方式)至一或多個其他分子實體,諸如另一個抗體或抗體片段,以產生帶有第二結合特異性的雙特異性或多特異性抗體。確切而言,雙特異性抗體也包括具有不同特異性的兩個抗體。
另一個例如使用共同輕鏈的策略可如美國專利申請公開案第20100331527A1中所述來使用,其中具有不同特異性的兩個抗體使用相同的輕鏈。在某些具體例中,雙特異性抗體中,Ig重鏈的至少一者的重鏈經修飾成包含嵌合重鏈恆定區,該嵌合重鏈恆定區包含本發明之重組多肽。在一些具體例中,重鏈的至少一者在CH3域中經修飾,產生針對親和力試劑(諸如蛋白A)的雙特異性抗體的差異親和力,以供簡易分離。在另一個具體例中,此雙特異性抗體中,重鏈的至少一者依據IMGT編號系統在i)95R或ii)95R與96F處包含一個胺基酸修飾(在EU編號系統中95R與96F對應於435R與436F),例如SEQ ID NO:37以及SEQ ID NO:38(參見US20100331527A1,其內容併入本文做為參考資料)。抗體的多特異性抗原-結合片段通常包含至少兩個不同的可變域,其中各個可變域能夠特異地結合至個別抗原或相同抗原上的不同表位。任一種多特異性抗體形式可使用技藝中可供使用之慣常技術被改造成用於本發明之抗原-結合蛋白或抗體中。
如本文所用,”同型”意指免疫球蛋白類型(例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgD、IgA、IgE或IgM),其由重鏈恆定區基因所編碼。
術語”表位”表示能夠特異結合至抗體的抗原決定位。表位通常由分子的表面基團(諸如胺基酸或糖側鏈)組成且通常具有特定三維結構特徵,以及特定電荷特徵。構型性以及非構型性表位差別在於,在變性溶劑存在下,對構型性表位的結合喪失,而不是非構型性表位。表位可含有直接參與結合的胺基酸殘基(也稱為表位的免疫顯性組分)以及不直接參
與結合的其他胺基酸殘基,諸如會受到特定抗原結合肽所有效阻斷的胺基酸殘基(換言之,胺基酸殘基在特定抗原結合肽的足跡內)。
如本文所用,若抗體是得自於使用人類免疫球蛋白序列的系統,例如藉由對帶有人類免疫球蛋白基因的轉基因小鼠進行免疫或藉由篩選人類免疫球蛋白基因庫,則人類化抗體是”衍生自”特定生殖系序列,且其中所選人類抗體V域序列在胺基酸V域序列中與生殖系免疫球蛋白基因編碼之胺基酸序列有至少90%,諸如至少95%,例如至少96%,諸如至少97%,例如至少98%,或諸如至少99%一致。
典型地,在重鏈CDR3以外,衍生自特定人類生殖系序列的人類抗體與生殖系免疫球蛋白基因編碼之胺基酸序列將會表現出不超過20個胺基酸差異,例如不超過10個胺基酸差異,諸如不超過9、8、7、6或5個,例如不超過4、3、2或1個胺基酸差異。
術語”轉基因非人類動物”意指一種非人類動物,其具有包含一或多個人類重鏈及/或輕鏈轉基因或轉染色體(併入或未併入至動物的天然基因組DNA中)且能夠表現完全人類抗體的基因組。表現完全人類或部分人類與部分小鼠之抗體的小鼠先前已被報導。舉例而言,轉基因小鼠可帶有人類輕鏈轉基因以及人類重鏈轉基因或人類重鏈轉染色體,而使得當以目標抗原及/或表現目標抗原之細胞進行免疫時,小鼠會生產人類抗體。人類重鏈轉基因可以併入小鼠的染色體DNA中,就像是在轉基因小鼠的情況,例如HuMAb小鼠,諸如HCo7或HCol2小鼠,或人類重鏈轉基因可以維持在染色體外,就像是在WO02/43478所述之轉染色體KM小鼠的情況。此等轉基因以及轉染色體小鼠(在本文全部稱為”轉基因小鼠”)能夠藉由經歷V-D-J重組與同型切換來生產針對給定抗原之多種同型人類單株抗體(諸如IgG、IgA、IgM、IgD及/或IgE)。
經遺傳工程化的VELOCIMMUNE®小鼠包含在內源性小鼠基因座處未重排V(D)J基因節段被人類V(D)J基因節段取代。VELOCIMMUNE®小鼠表現帶有人類可變域以及小鼠恆定域的嵌合抗體
(參見例如美國專利第7,605,237號)。大部分其他報導關心在內源性免疫球蛋白基因座失能的小鼠體內表現完全人類轉基因之完全人類抗體的小鼠。
VELOCIMMUNE®小鼠一部分包括含有人類可變區可操作地連結至內源性小鼠恆定區基因座的基因組,而使得小鼠對人類抗原刺激做出反應而生產含有人類重鏈可變區以及小鼠重鏈恆定區的抗體。編碼抗體之重鏈可變區的DNA可以被單離並且可操作地連結至編碼本發明人類重鏈恆定區的DNA。該DNA接著可以在能夠表現抗體之完全人類重鏈的細胞中被表現。
轉基因、非人類動物也可以藉由將編碼特定抗體之基因引入動物體內而被用於生產對抗特定抗原的抗體,而該引入是例如藉由將基因在操作上連結至於動物乳汁中表現的基因。
片語”效應子功用”如本文所用,欲包括在結合至FcγR之後,含Fc蛋白所賦予的功能性能力。在不受限於任何理論的情況下,Fc/FcγR複合體的形成會招募各種效應子細胞到被結合的抗原位點處,通常會在細胞內產生多樣的訊號傳遞事件以及重要的後續免疫反應。
”無效應子多肽”意指一種重組多肽、抗原-結合蛋白或抗體,其相較於含有IgG1或IgG4同型之野生型重鏈恆定區的對應重組多肽、抗原-結合蛋白或抗體的效應子功能有所改變或降低。在一些具體例中,降低或有所改變的效應子功能是細胞毒性效應子功能,例如細胞毒性、補體依賴性細胞毒性(CDC)、抗體依賴性細胞毒性(ADCC),或抗體依賴性細胞吞噬作用(ADCP)。在一個具體例中,降低或有所改變的效應子功能是補體依賴性細胞毒性。在另一個具體例中,降低或有所改變的效應子功能是抗體依賴性細胞毒性。在其他具體例中,降低或有所改變的效應子功能是細胞增生。
數種抗體效應子功能在某個程度上是藉由Fc受體(FcR)所媒介,FcR在典型免疫球蛋白之恆定域(具體而言CH2與CH3域)中結合抗體的Fc區。有數種對不同類型免疫球蛋白(亦即IgG、IgE、IgA、IgM以及IgD)具有特異性的Fc受體。人類IgGFc受體家族分成三群:FcγRI(CD64)(其能
夠以高親和力結合IgG)、FcγRII(CD32)以及FcγRIII(CD16)(FcγRII以及FcγRIII均為低親和力受體)。各個FcγR亞類是由兩個或三個基因所編碼,且選擇性RNA剪接產生多種轉錄本,因此存在有多樣FcγR同型異構體(例如FcγRIA(CD64;FCGR1A)、FcγRIB(CD64;FCRG1B)、FcγRIIA(CD32;FCGR2A)、FcγRIIB(CD32;FCGR2B)、FcγRIIC(CD32;FCGR2C)、FcγRIIIA(CD16a;FCGR3A),以及FeγRIIIB(CD16b;FCGR3B)。此外,FcRn或新生兒Fc受體(亦已知為Fc受體轉運蛋白α,FCGRT)能夠跨過胎盤將IgG抗體從母親轉移至胎兒。另外,Fc受體表現在多種細胞上,包括B細胞、單核球、樹狀細胞、嗜中性球以及某些淋巴細胞。例如,U937細胞(一種人類單核球細胞株)表現FcγRI以及FcγRIIA(參見例如,Jones,et al.J Immunol 135(5):3348-53(1985);與Brooks,et al.J Exp Med 170:1369-85(October 1989))。
Ig Fc結合至其受體將效應子細胞帶到被結合抗原位點處,最後產生多種訊號傳遞以及免疫反應,包括B細胞活化、發炎反應、細胞毒性反應,以及吞噬作用反應。確切地說,Ig Fc對其受體的結合降低或有所改變可能導致效應子功能降低。
或者,”效應子功能”(諸如細胞毒性、補體依賴性細胞毒性(“CDC”)、抗體依賴性細胞毒性(“ADCC”)以及異常抗體製造)的增加可能是與某些治療性抗體有關的不樂見副作用。
片語”抗體依賴性細胞性細胞毒性”、”抗體依賴性細胞依賴性細胞毒性”或”ADCC”表示當帶有Fcγ受體的細胞(免疫細胞或類似細胞)透過Fcγ受體結合至特定抗體的Fc部分時、當特定抗體附接至目標細胞的細胞表面抗原時,損害目標細胞的活性。因此,ADCC是一種Fc受體陽性效應子細胞可藉其溶解具有附接性抗原特異性分子之目標細胞的機制。ADCC活性可以藉由數種已知方法來進行評估,已知方法包括使用螢光染料(鈣黃綠素AM(Wako Pure Chemical Industries,Ltd.,349-07201))測量螢光強度。當採用這個方法時,可依據下列等式使用所得數值計算細胞毒性活性(%):(A-C)/(B-C)x100,其中A為各個樣品中的螢光值,B為溶解並被
釋放至有Nonidet P-40(最終濃度為1%)之培養基之細胞的平均螢光值,而C為當僅添加培養基時的平均螢光值。
片語"抗體依賴性細胞性吞噬作用”或”ADCP”如本文所用,是有關於藉由吞沒目標細胞而非引起細胞溶解來消除(或殺滅)目標細胞的效應子功能。ADCP對於殺滅腫瘤細胞來說是一個重要的活體內機制。ADCP可以藉由雙色螢光流式細胞儀方法來測量,例如採用針對不同細胞表面蛋白之PKH2(綠色螢光染料)以及藻紅素接合(紅色)單株抗體來區別測試細胞的方法,因而測定吞噬作用的吞噬活性與速率。相對於FcγRIIb,選擇性活化FcγRIIa的治療策略可增高巨噬細胞吞噬活性(Richards,JO,et al.2008 Mol Cancer Ther 7(8):2517-27)。
片語”補體導向細胞毒性”或”CDC”如本文所用,包括因為補體系統所致的細胞毒性活性。CDC活性是藉由已知方法來測量,例如依據標準規程(NIAID Manual of Tissue Typing Techniques 1979-1980,Edited by J.G.Ray,NIH Publication No.NIH-83-545),培育目標細胞、抗體以及補體溶液(諸如幼兔補體(Cedarlane Technologies))並容許反應。細胞毒性活性可以與ADCC活性之測量法相同的方式來計算。細胞毒性活性也可以使用與上面ADCC所用者相似之螢光染料(諸如鈣黃綠素)或放射性染料來測量。
片語”細胞毒性”或”直接細胞毒性”包括任一種與NK細胞無關的細胞毒性活性。細胞毒性可以藉由技藝中已知的技術來測量,例如測定細胞溶解或細胞死亡,亦即細胞凋亡。直接細胞溶解或細胞殺滅可以藉由數種已知方法來評估,已知方法包括使用鈣黃綠色測量螢光強度並以與上面ADCC所述類似的方式計算平均螢光值。或者,細胞毒性分子(諸如抗體)在細胞凋亡分析中可藉由活化受控細胞死亡的遺傳程式而為有效的。細胞凋亡的特徵在於充分受到限制的細胞學以及分子事件,包括細胞折射係數改變、細胞質皺縮、細胞核濃縮以及DNA裂解成規律大小的片段。正在經歷細胞凋亡的細胞會關閉代謝、喪失細胞膜完整性並形成膜泡。細胞凋亡活性是使用測定死亡中及/或死細胞的標準方法來測量。為
了要測量細胞凋亡,可採用細胞毒性分析。這些分析可以是放射性或非放射性分析,其測量細胞膜通透的增加,因為死亡中細胞會變得具有孔洞,依據死細胞中的粒腺體無法代謝染料而活細胞中的粒腺體可代謝染料的知識,可採用比色分析來測量粒線體代謝活性的降低程度。開發出生物發光細胞毒性分析(例如CytoTox-GloTM,Promega)來測量釋放至細胞培養基中的穩定蛋白酶標記。蛋白酶活性被視為堅定的酵素性細胞死亡標記,且可用做為活細胞與死細胞的比例量測法(Niles,A.L.,et al.Anal Biochem,366(2):197-206,15 July 2007)。
吾人亦可測量細胞凋亡的早期指標,諸如細胞膜不對稱的改變,導致細胞表面外側上的磷脂醯基絲胺酸出現(以膜聯素V為基礎的分析)。或者,細胞凋亡的晚期階段(諸如半胱胺酸蛋白酶的活化)可以在細胞群體中或在單獨細胞中被測量。另外,可測量細胞色素C及AIF因為粒線體或染色體DNA片段化而釋放至細胞質中的測量值。末端去氧核苷酸基轉移酶dUTP切斷末端標記(TUNEL)是一種用以偵測因為細胞凋亡訊號傳遞級聯所致之DNA片段化的常見方法。該分析憑藉DNA中存在切斷處,其可以藉由末端去氧核苷酸基轉移酶(一種會催化被一個特定經標記抗體從屬地偵測到的溴化dUTP的添加)予以鑑別。
細胞毒性可能是補體導向,或抗體導向,或與細胞毒性分子或細胞的結合直接相關。
在某些具體例中,如在活體外或離體細胞殺滅分析中測量,本發明抗體展現少於20%細胞溶解(亦即%細胞毒性)的細胞毒性,或少於10%,或5%、4%、3%、2%或甚至0%或無法偵測到的細胞溶解(細胞毒性)。在某些具體例中,本發明抗體在抗體濃度10nM下展現少於20%、10%,或5%、4%、3%、2%,或甚至0%或無法偵測到的細胞毒性。
在其他具體例中,如在活體外或離體細胞殺滅分析中測量,抗體展現少於20%細胞溶解(亦即%細胞毒性),或少於10%,或5%、4%、3%、2%或甚至0%或無法偵測到的細胞溶解(細胞毒性)的細胞凋亡活性。在又某些具體例中,在某些具體例中,本發明抗體在抗體濃度10nM
下展現少於20%、10%,或5%、4%、3%、2%,或甚至0%或無法偵測到的細胞凋亡活性。
在又其他具體例中,如在活體外或離體細胞殺滅分析中測量,抗體展現少於約50%細胞毒性,或少於細胞毒性40%、30%、20%、10%,或5%、4%、3%、2%,或甚至0%或無法偵測到的細胞毒性的CDC活性。在又其他具體例中,在某些具體例中,本發明抗體在抗體濃度100nM下展現少於50%、40%、30%、20%、10%,或5%、4%、3%、2%,或甚至0%或無法偵測到的CDC活性。在更多具體例中,如在活體外或離體細胞殺滅分析中測量,抗體展現少於約50%細胞毒性,或少於細胞毒性40%、30%、20%、10%,或5%、4%、3%、2%,或甚至0%或無法偵測到的細胞毒性的ADCC活性。在又其他具體例中,在某些具體例中,本發明抗體在抗體濃度100nM下展現少於50%、40%、30%、20%、10%,或5%、4%、3%、2%,或甚至0%或無法偵測到的ADCC活性。
本發明提供抗體、抗原-結合蛋白及Fc融合蛋白,其包含含有嵌合樞紐之重組多肽,且進一步提供降低的效應子功能。該等本發明重組多肽的特性可與一或多個參考蛋白的特性相比擬。參見下列實例以供參照,或對照抗體及抗原-結合蛋白,其相較於本發明嵌合抗體具有對應的可變區及恆定區(例如具有野生型IgG1 CH區(SEQ ID NO:13)或野生型IgG4 CH區(SEQ ID NO:15)),且可用於某些測試方法學中供比對本發明抗體與抗原-結合蛋白的功能性或藥動學特性之用。應理解,對應野生型IgG CH區不同於本發明嵌合CH區,因為”野生型”IgG CH區是衍生自含有(從N端至C端)CH1域、樞紐、CH2域以及CH3域的天然IgG胺基酸序列。野生型IgG可包括帶有一或多個胺基酸修飾的變體,同時維持基本上與天然IgG相同的功能性特徵。
在實例中已顯示本發明之經單離抗體微弱地結合至表現FcγR的細胞(例如效應子細胞),但相較於包含野生型IgG1或IgG4 CH區的對應抗體之效應子功能,其缺少效應子功能,諸如細胞毒性與增生。
在一個態樣中,本發明提供一種包含嵌合樞紐區的重組多肽。在一些態樣中,該嵌合樞紐區包含從位置228至236(EU編號)的人類IgG2下樞紐胺基酸序列PCPAPPVA(SEQ ID NO:3)。在其他態樣中,該嵌合樞紐區自N端到C端包含:一從位置216至227(EU編號)的人類IgG1或人類IgG4上樞紐胺基酸序列,以及一從位置228至236(EU編號)的人類IgG2下樞紐胺基酸序列PCPAPPVA(SEQ ID NO:3)。
在其他態樣中,該嵌合樞紐區自N端到C端包含:一選自由SEQ ID NO:4及SEQ ID NO:5組成之群之從位置216至227(EU編號)的上樞紐胺基酸序列;以及一從位置228至236(EU編號)的下樞紐胺基酸序列PCPAPPVA(SEQ ID NO:3)。
本發明提供一種重組多肽或其變體,其自N端到C端包含一CH1域、一嵌合樞紐、一CH2域,以及一CH3域,其中:該CH1域包含至少從位置212至215(EU編號)的胺基酸序列DKKV或DKRV,該嵌合樞紐包含從位置216至227(EU編號)之人類IgG1或人類IgG4上樞紐胺基酸序列與從位置228至236(EU編號)之人類IgG2下樞紐胺基酸序列PCPAPPVA(SEQ ID NO:3),該CH2域包含從位置237至340(EU編號)之人類IgG4 CH2域胺基酸序列,而該CH3域包含從位置341至447(EU編號)之人類IgG1或人類IgG4 CH3域序列。在一個具體例中,本發明提供一種單株抗體,其包含含有SEQ NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:31或由SEQ NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:31構成之重鏈恆定區。在另一個具體例中,本發明提供一種單株抗體,其包含帶有包含SEQ ID NO:38或37或由SEQ ID NO:38或37構成之恆定區的至少一重鏈。
在一些具體例中,該重組多肽是選自由抗體、抗原-結合蛋白及受體-Fc融合蛋白組成之群。
在一些具體例中,經單離抗體、抗原-結合蛋白或受體-Fc融合蛋白包含一含有CH區的重鏈構築體,該CH區自N端到C端為一CH1域、一嵌合樞紐、一CH2域,以及一CH3域,其中該CH1域包含胺基酸序列DKKV或DKRV,該嵌合樞紐包含從位置216至227(EU編號)之人類IgG1或人類IgG4上樞紐胺基酸序列或其變體,以及從位置228至236(EU編號)之人類IgG2下樞紐胺基酸序列,該CH2域包含從位置237至340(EU編號)之人類IgG4 CH2域序列或其天然變體,而CH3域包含從位置341至447(EU編號)之人類IgG1或人類IgG4 CH3域序列或其天然變體,且該CH區具有與SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2至少約95%,或約96%,或約97%,或約98%,或約99%一致性的胺基酸序列。
在另一個具體例中,本發明提供一種經單離抗體、抗原-結合蛋白或受體-Fc融合蛋白,其包含一含有CH區的重鏈構築體,該CH區自N端至C端為一CH1域、一嵌合樞紐、一CH2域,以及一CH3域,其中該CH1域包含胺基酸序列DKKV或DKRV,該嵌合樞紐包含從位置216至227(EU編號)之人類IgG1或人類IgG4上樞紐胺基酸序列或其天然變體,以及從位置228至236(EU編號)之人類IgG2下樞紐胺基酸序列,該CH2域包含從位置237至340(EU編號)之人類IgG4 CH2域序列或其天然變體,而CH3域包含從位置341至447(EU編號)之人類IgG1或人類IgG4 CH3域序列或其天然變體,且該CH區具有與SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:31至少約95%,或約96%,或約97%,或約98%,或約99%一致性的胺基酸序列。在一些
具體例中,該CH區具有與SEQ ID NO:38或SEQ ID NO:37至少約95%,或約96%,或約97%,或約98%,或約99%一致性的胺基酸序列。
該等”變體”或”天然變體”Fc域以及Fc域片段當相較於野生型序列時包含一或多個胺基酸添加、刪除或置換,但基本上功能是所要的,例如Fc區展現微弱或不結合至某些表現FcγR的細胞(例如效應子細胞),使得效應子功能(諸如細胞毒性以及增生)有所改變。此等變體包括在經工程化以供分離雙特異性分子用的CH3域中諸如胺基酸添加、刪除或置換的修飾。
在一個具體例中,本發明提供一種單株抗體,其包含一重鏈可變區以及一重鏈恆定區,該重鏈恆定區包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38,或SEQ ID NO:37或由SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38,或SEQ ID NO:37構成,或與該重鏈恆定區有至少約95%、或約96%、或約97%、或約98%、或約99%的序列。在另一個具體例中,本發明提供一種單株抗體,其包含一輕鏈可變區、一重鏈可變區以及一重鏈恆定區,該重鏈恆定區包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38,或SEQ ID NO:37或由SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38,或SEQ ID NO:37構成,或與該重鏈恆定區有至少約95%、或約96%、或約97%、或約98%、或約99%的序列。
在另一個具體例中,本發明是一種經單離抗體或其抗原-結合片段,其包含重鏈恆定區(CH),該重鏈恆定區具有(i)SEQ ID NO:1之胺基酸序列或具有由SEQ ID NO:33編碼的胺基酸序列,或(ii)SEQ ID NO:31之胺基酸序列或具有由SEQ ID NO:29編碼之胺基酸序列,或(iii)與(i)或(ii)中所述序列具有至少約95%,或約96%,或約97%,或約98%,或約99%一致性的序列。在另一個具體例中,本發明是一種經單離抗體或其抗原-結合片段,其包含重鏈恆定區(CH),該重鏈恆定區具有(i)SEQ ID NO:2之胺基酸序列或具有由SEQ ID NO:32編碼的胺基酸序列,或(ii)SEQ
ID NO:30之胺基酸序列或具有由SEQ ID NO:28編碼之胺基酸序列,或(iii)與(i)或(ii)中所述序列具有至少約95%,或約96%,或約97%,或約98%,或約99%一致性的序列。
在又另一個具體例中,本發明是一種經單離抗體或其抗原-結合片段,其包含重鏈恆定區(CH),該重鏈恆定區具有(i)SEQ ID NO:38之胺基酸序列或具有由SEQ ID NO:36編碼的胺基酸序列,或(ii)SEQ ID NO:37之胺基酸序列或具有由SEQ ID NO:35編碼之胺基酸序列,或(iii)與(i)或(ii)中所述序列具有至少約95%,或約96%,或約97%,或約98%,或約99%一致性的序列。
在一些具體例中,該經單離抗體為單株抗體。在其他具體例中,該經單離抗體或其抗原結合片段為人類化、嵌合、單鏈抗體或雙特異性抗體。
在另一個具體例中,本發明為含Fc的蛋白,其包含(i)SEQ ID NO:1之胺基酸序列或由SEQ ID NO:33編碼的胺基酸序列,或(ii)SEQ ID NO:31之胺基酸序列或由SEQ ID NO:29編碼的胺基酸序列,或(iii)與(i)或(ii)中所述序列具有至少約95%,或約96%,或約97%,或約98%,或約99%一致性的序列。在另一個具體例中,本發明為含Fc的蛋白,其包含(i)SEQ ID NO:2之胺基酸序列或由SEQ ID NO:32編碼的胺基酸序列,或(ii)SEQ ID NO:30之胺基酸序列或由SEQ ID NO:28編碼的胺基酸序列,或(iii)與(i)或(ii)中所述序列具有至少約95%,或約96%,或約97%,或約98%,或約99%一致性的序列。
在另一個具體例中,本發明為含Fc的蛋白,其包含(i)SEQ ID NO:38之胺基酸序列或由SEQ ID NO:36編碼的胺基酸序列,或(ii)SEQ ID NO:37之胺基酸序列或由SEQ ID NO:35編碼的胺基酸序列,或(iii)與(i)或(ii)中所述序列具有至少約95%,或約96%,或約97%,或約98%,或約99%一致性的序列。
在另一個具體例中,本發明提供一種包含該所述抗體、抗原-結合蛋白或Fc融合蛋白的組合物。
本發明提供一種缺乏細胞毒性或細胞溶解效應子功能的抗體或抗原-結合蛋白。在一些態樣中,該抗體或抗原-結合蛋白缺乏細胞毒性或細胞溶解效應子功能且包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38,或SEQ ID NO:37。
本發明提供一種抗體或抗原-結合蛋白,其具有比含有野生型IgG1或野生型IgG4 CH區之對應抗體低至少10倍,或低至少50倍,或低至少100倍,或低至少1000倍,或低至少10000倍的細胞毒性活性。
本發明提供一種能夠結合至FcγR的抗體,其中該抗體包含含有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38,或SEQ ID NO:37的重組多肽。在一些具體例中,該抗體能夠以相較於包含野生型IgG1或野生型IgG4恆定區之對應抗體的結合親和力還低的親和力結合至FcγR。在一些具體例中,該抗體能夠以大於約10nM,或約20nM,或約30nM,或約40nM,約50nM,約100nM的半最大濃度(EC50)活化FcγR。在一些具體例中,該FcγR為FcγRIIA。在一些具體例中,該抗體能夠結合至FcγR,諸如FcγRIIA,該抗體具有約10μM,或約20μM,或約30μM,或約40μM,約50μM,約100μM的親和力(KD值)。在一些具體例中,該抗體以比其對FcγRIIB的親和力(KD值)還高約10倍的親和力(KD值)結合至FcγRIIA,或以其對FcγRIIB的親和力(KD值)還高約5倍、約4倍,或約3倍或約2倍的親和力(KD值)結合至FcγRIIA。
本發明含括生產單株抗體,該單株抗體包含含有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38,或SEQ ID NO:37的重組多肽,且對不同目標抗原具有特異性。本發明提供一種生產抗體的方法,包含:a)將包含編碼本發明抗體或其片段之核酸分子的載體引入哺乳動物宿主細胞中、b)培養能夠表現該抗體的宿主細胞,以及c)由細胞培養基單離該抗體。
本發明單株抗體可例如藉由首先由Kohler et al.,Nature 256,495(1975)所述的融合瘤方法來生產,或者可藉由重組DNA方法來生產。單株抗體可以使用例如在Clackson et al.,Nature 352,624-628(1991)與
Marks et al.,J.MoI.Biol.222,581-597(1991)中所述技術從噬菌體抗體庫中單離出來。單株抗體可以從任何適當來源獲得。因此,舉例而言,單株抗體可以從得自經感興趣抗原免疫之小鼠取得之鼠類脾臟B淋巴球細胞製備的融合瘤獲得,該感興趣抗原例如是呈細胞在表面表現之抗原的形式或編碼感興趣抗原之核酸。單株抗體也可以從衍生自經免疫之人類或非人類哺乳動物(諸如大鼠、兔、狗、靈長類等)之抗體表現細胞衍生的融合瘤獲得。
在一個具體例中,本發明抗體為人類抗體。人類單株抗體可以使用帶有部分人類免疫系統而非小鼠免疫系統的轉基因或轉染色體小鼠而生成。此等轉基因與轉染色體小鼠包括分別在本文稱為VELOCIMMUNE小鼠、HuMAb小鼠以及KM小鼠的小鼠,且在本文全部被稱為”轉基因小鼠”並在上文中加以說明。
依據已知技術,來自此等轉基因小鼠的脾臟細胞可用來生成分泌人類單株抗體的融合瘤。本發明人類單株抗體或多株抗體,或源於其他物種的本發明抗體也可透過另一種非人類哺乳動物或植物經轉基因而被生成並且以可自其回收的方式生產該抗體,該另一種非人類哺乳動物或植物就感興趣免疫球蛋白重鏈與輕鏈序列為轉基因的。關於在哺乳動物體內的轉基因生產,抗體也可以在山羊、母牛或其他哺乳動物的乳汁中生產並回收。參見例如US 5,827,690、US 5,756,687、US 5,750,172以及US 5,741,957。包含小鼠UP-II啟動子可操作地連結至編碼感興趣Ig重鏈和輕鏈序列的表現載體可經工程化以供在轉基因動物的尿液中表現感興趣蛋白質並分泌(參見例如US 5,824,543)。
此外,本發明人類抗體或其他物種之本發明抗體可透過展示型技術使用技藝中已知的技術來生成,展示型技術包括(但不限於)噬菌體展示、逆轉錄病毒展示、核醣體展示以及其他技術,而所得分子可經過進一步成熟(諸如親和力成熟),更確切地說為技藝中已知的技術(參見例如Hoogenboom et al.,J.MoI.Biol.227,381(1991)(噬菌體展示)、Vaughan et al.,Nature Biotech 14,309(1996)(噬菌體展示)、Hanes and Plucthau,PNAS USA 94,4937-4942(1997)(核醣體展示)、Parmley and Smith,Gene 73,305-318(1988)(噬菌體展示)、Scott TIBS 17,241-245(1992)、Cwirla et al.,PNAS USA 87,6378-6382(1990)、Russel et al.,Nucl.Acids Research 21,1081-1085(1993)、Hogenboom et al.,Immunol.Reviews 130,43-68(1992)、Chiswell and McCafferty TIBTECH 10,80-84(1992),以及US 5,733,743)。若展示技術被用來生產非人類抗體,則該等抗體可經人類化。
本發明的經工程化重鏈恆定(CH)區提供降低的效應子功能。可使用人類輕鏈恆定(CL)區(κ或λ)。若需要的話,本發明抗體的類型可以藉由已知方法來轉換。
本發明提供由宿主細胞生產的本發明抗體。在一個具體例中,本發明提供用以生產單株抗體的方法,包含a)以足夠引起抗體免疫反應的抗原來免疫VELOCIMMUNE®小鼠、b)由該小鼠獲得血清並測試對該抗原的抗體滴定濃度、c)由顯示抗體滴定濃度升高之經免疫小鼠的脾臟收取B細胞並將該等B細胞與小鼠骨髓瘤細胞融合形成融合瘤、d)由該融合瘤藉由蛋白A層析單離出嵌合抗體,該嵌合抗體具有人類可變區及小鼠恆定區、e)篩選帶有所要特徵的嵌合抗體,以及f)將該等抗體的小鼠恆定區取代為本發明的人類恆定區,例如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38,或SEQ ID NO:37。
在一個具體例中,本發明抗體為全長IgG抗體。在另一個具體例中,本發明抗體為抗體片段或單鏈抗體。在又另一個具體例中,本發明抗體為完全人類IgG抗體。
在本發明的一些態樣中,抗體為雙特異性抗體,其中該分子或抗體的各個抗原-結合域包含與VL區配對的VH區。在某些具體例中,該雙特異性抗體包含第一抗原-結合域以及第二抗原-結合域,各自包含不同的特有VH區以及一個共同VL區。在一些具體例中,該等雙特異性抗體被構築成包含特異地結合第一抗原的第一抗原-結合域,其中該第一抗原-結合域包含一衍生自導向對抗第一抗原之第一抗體的VH區/VL區對;以及特異地結合第二抗原的第二抗原-結合域,其中該第二抗原-結合域包含一
衍生自導向對抗第二抗原之VH區與一衍生自該第一抗體的VL區相配對(例如被納入第一抗體之抗原-結合域的相同VL區)。在一些具體例中,該等抗體之至少一者(亦即第一抗體或第二抗體或兩者抗體)的重鏈在雙特異性抗體中經修飾成包含嵌合重鏈恆定區(CH區)。在其他具體例中,該雙特異性抗體包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38,或SEQ ID NO:37。
在本發明的一些態樣中,具有不同特異性的兩種抗體使用相同輕鏈。在某些具體例中,該等Ig重鏈之至少一者的重鏈在雙特異性抗體中被修飾成包含嵌合重鏈恆定區,該嵌合重鏈恆定區包含本發明之重組多肽。在一些具體例中,該等重鏈之至少一者在CH3域中經修飾,使得雙特異性抗體對親和力試劑(諸如蛋白A,供簡易分離用)有差異性親和力。在另一個具體例中,該等重鏈之至少一者在該雙特異性抗體中依據IMGT編號系統包含在i)95R或ii)95R與96F處的胺基酸修飾(95R與96F對應於EU編號系統的435R與436F)。
在其他態樣中,該抗體為雙特異性抗體,其中該雙特異性抗體包含:(a)一第一重鏈,其包含能夠辨識並結合至第一目標抗原的抗原-結合域,(b)一第二重鏈,其包含能夠辨識並結合至第二目標抗原的抗原-結合域,(c)一能夠辨識並結合至第一或第二目標抗原的共同輕鏈抗原-結合域,其中(a)或(b)或(a)與(b)兩者的重鏈進一步包含含有SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:31的重鏈恆定區。
在又其他態樣中,該抗體為雙特異性抗體,其中該雙特異性抗體包含:(a)一第一重鏈,其包含能夠辨識並結合至第一目標抗原的抗原-結合域,(b)一第二重鏈,其包含能夠辨識並結合至第二目標抗原的抗原-結合域,(c)一能夠辨識並結合至第一或第二目標抗原的共同輕鏈抗原-結合域,其中(a)或(b)或(a)與(b)兩者的重鏈進一步包含含有SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:30的重鏈恆定區。
在另一個態樣中,(a)或(b)之該等重鏈的至少一者在上文該雙特異性抗體中包含在(i)435R或(ii)435R與436F處的胺基酸修飾(EU編號)(在IMGT編號系統(i)95R或(ii)95R與96F)。
在其他態樣中,該抗體為雙特異性抗體,其中該雙特異性抗體包含(a)一第一重鏈,其包含能夠辨識並結合至第一目標抗原的抗原-結合域,以及包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30,或SEQ ID NO:31的第一重鏈恆定區;(b)一第二重鏈,其包含能夠辨識並結合至第二目標抗原的抗原-結合域,以及包含SEQ ID NO:38或SEQ ID NO:37的第二重鏈恆定區;以及(c)一能夠辨識並結合至第一或第二目標抗原的共同輕鏈抗原-結合域。
在一個具體例中,該抗體為單價抗體。因此,在一個具體例中,該抗體為單價抗體,其中該抗體是藉由包含下列的方法來構築:i)提供編碼該單價抗體之輕鏈的核酸分子,該構築體包含編碼選定抗原特異性抗體之VL區的核苷酸序列以及編碼Ig之恆定CL區的核苷酸序列,其中該編碼選定抗原特異性抗體之VL區的核苷酸序列以及該編碼Ig之CL區的核苷酸序列可操作地連結在一起,且其中該編碼CL區的核苷酸序列已被修飾,使得該CL區不含有任何能夠與包含CL區之相同胺基酸序列之其他肽在多株人類IgG存在下或當被投與給動物或人類時形成雙硫鍵結或共價鍵的胺基酸;ii)提供編碼該單價抗體之重鏈的核酸構築體,該構築體包含編碼選定抗原特異性抗體之VH區的核苷酸序列以及編碼人類Ig之恆定CH區的核苷酸序列,其中該編碼CH區的核苷酸序列包含編碼SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38,或SEQ ID NO:37的核酸,其中該等核苷酸序列已被修飾且不含有任何能夠與包含人類Ig之CH區的相同胺基酸序列之其他肽在多株人類IgG存在下或當被投與給動物(諸如人類)時參與形成雙硫鍵結或共價或穩定非共價重鏈間鍵結的胺基酸殘基,其中該編碼選定抗原特異性抗體之VH區的核苷酸序列以及該編碼該Ig之CH區的核苷酸序列可操作地連結在一起;iii)提供細胞表現
系統供生產該單價抗體之用;iv)藉由在(iii)之細胞表現系統的細胞中共表現(i)與(ii)的核酸構築體來生產該單價抗體。
類似地,在一個具體例中,該抗體為單價抗體,其包含:i)一可變區或該區之抗原-結合域,以及ii)包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:38,或SEQ ID NO:37之免疫球蛋白的CH區或其片段,其中該CH區或其片段已被修飾,使得該區不含有任何能夠在多株人類IgG存在下與相同CH區形成雙硫鍵結或與相同CH區形成其他共價或穩定非共價重鏈間鍵結的胺基酸殘基。
在另一個其他具體例中,該單價抗體的序列已被修飾,使其不含有任何受體位點供N-連結醣化。
一般而言,本文所述抗體可以藉由納入任何適當數目的該等經修飾胺基酸及/或與接合取代基締合而被修飾。在本文中,合適性通常是藉由至少本質上維持抗體或抗原結合片段的相關選擇性及/或特異性的能力來決定。例如,經修飾胺基酸可選自醣化胺基酸、PEG化胺基酸、法尼基化胺基酸、乙醯基化胺基酸、生物素化胺基酸、接合至脂質部分的胺基酸,或接合至有機衍生劑的胺基酸。納入一或多個經修飾胺基酸在例如進一步增加多肽血清半衰期、降低多肽抗原性,或增加多肽儲存穩定性方面可能是有利的。胺基酸(等)在重組生產期間例如以共轉譯或轉譯後的方式被修飾(例如於哺乳動物細胞中在表現期間在N-X-S/T模組處的N-連結醣化),或藉由合成方法被修飾。經修飾胺基酸的非限制性實例包括醣化胺基酸、硫化胺基酸、異戊二烯基化(例如法尼基化、香葉醯香葉醯基化)胺基酸、乙醯基化胺基酸、醯基化胺基酸、PEG化胺基酸、生物素化胺基酸、羧化胺基酸、磷酸化胺基酸以及類似者。就修飾胺基酸方面,適於指引習於技藝者的參考資料於文獻中是充分的。在Walker(1998)Protein Protocols On CD-Rom,Humana Press,Totowa,NJ中找到實例規程。
本發明抗體也可以藉由共價接合至聚合物而被化學修飾,以(例如)進一步增加其循環半衰期。例示性聚合物以及將它們附接至肽的方法說明於例如US 4,766,106、US 4,179,337、US 4,495,285以及US
4,609,546中。其他例示性聚合物包括聚氧乙基化多元醇以及聚乙二醇(PEG)(例如具有分子量介於約1,000與約40,000之間的PEG,諸如介於約2,000與約20,000,例如約3,000-12,000g/mol)。
在一個具體例中,提供包含一或多個經放射性標記之胺基酸的抗體。經放射性標記之抗體可用於診斷以及治療目的。在另一個具體例中,本發明抗體可接合至本身為治療劑或可偵測標記的分子。在一個具體例中,該治療劑為細胞毒性劑,諸如放射性同位素。用於多肽的放射性同位素實例包括(但不限於)3H、14C、15N、35S、90Y、99Tc與125I、131I、186Re,以及225Ac。用以製備經放射性標記之胺基酸與相關肽衍生物的方法為技藝中已知(參見例如Junghans et al.,in Cancer Chemotherapy and Biotherapy 655-686(2nd edition,Chafner and Longo,eds.,Lippincott Raven(1996))以及US 4,681,581、US 4,735,210、US 5,101,827、US 5,102,990(US RE35,500)、US 5,648,471與US 5,697,902)。舉例而言,放射性同位素可以藉由氯胺T方法而被接合。在更多具體例,中,可偵測標記可以是放射性同位素、酵素、發色團或螢光標記。
在一個其他態樣中,本發明是有關於一種編碼一多肽(例如本發明抗體、抗原-結合蛋白或受體-Fc融合蛋白)的表現載體。該等表現載體可用於重組生產本發明多肽。
在本發明上下文中,表現載體可以是任何適當的載體,包括染色體、非染色體,以及合成核酸載體(包含適當表現控制要素組的核酸序列)。此等載體的實例包括SV40的衍生物、細菌質體、噬菌體DNA、桿狀病毒、酵母菌質體、衍生自質體與噬菌體DNA之組合的載體,以及病毒核酸(RNA或DNA)載體。在一個具體例中,編碼抗體的核酸分子是包含在裸露DNA或RNA載體中,其包括(例如)線性表現要素(如在例如Sykes and Johnston,Nat Biotech 12,355-59(1997)中所述)、小型核酸載體(如在例如US 6,077,835及/或WO 00/70087中所述),或諸如pBR322、pUC 19/18,或pUC 118/119的質體載體。此等核酸載體及其用途為技藝中已知(參見例如US 5,589,466與US 5,973,972)。
在另一個具體例中,該載體包含編碼本發明抗體或多肽的核酸分子,包括包含所述核酸分子的表現載體,其中該核酸分子可操作地連結至一表現控制序列。
在一個具體例中,該載體適於在細菌細胞中表現本發明多肽或抗體。此等載體的實例包括表現載體,諸如BlueScript(Stratagene)、pIN載體(Van Heeke & Schuster,J Biol Chem 264,5503-5509(1989)、pET載體(Novagen,Madison,WI)與類似物)。
表現載體也可以或另外為適於在酵母菌系統中表現的載體。可採用任一種適於在酵母菌系統中表現的載體。適當載體包括(例如)包含組成性或誘導性啟動子的載體,組成性或誘導性啟動子為諸如酵母菌a因子、酒精氧化酶與PGH(在F.Ausubel et al.,ed.Current Protocols in Molecular Biology,Greene Publishing and Wiley InterScience New York(1987),與Grant et al.,Methods in Enzymol 153,516-544(1987)中回顧)。
提供包含本發明核酸分子的載體,其中該核酸分子在操作上連結至適於在哺乳動物宿主細胞中表現的表現控制序列。
將表現控制序列進行工程化以在不同細胞系統中控制並驅動感興趣基因的轉錄,以及蛋白質的後續表現。質體將感興趣的可表現基因與表現控制序列合併(亦即表現匣),其包含所需要素,諸如(例如)啟動子、增強子、可篩選標記、操作子等。在本發明的表現載體中,編碼抗體的核酸分子可包含任何適當啟動子、增強子、可篩選標記、操作子、抑制子蛋白、聚A終止序列以及其他表現促進要素或與它們締合。
”啟動子”如本文所用表明一種足以指引在操作上連接至其(亦即當適當訊號存在時,以容許編碼抗體之核苷酸序列轉錄的方式連結)之DNA序列轉錄的DNA序列。編碼抗體之核苷酸序列的表現可以受到技藝中已知任一啟動子或增強子要素所控制。此等要素的實例包括強表現啟動子(例如人類CMV IE啟動子/增強子或CMV主要IE(CMV-MIE))啟動子,以及RSV、SV40晚期啟動子、SL3-3、MMTV、泛素(Ubi)、泛素C(UbC),以及HIV ITR啟動子)。
在一些具體例中,該載體包含選自由下列組成之群的啟動子:SV40、CMV、CMV-IE、CMV-MIE、RSV、SL3-3、MMTV、Ubi、UbC以及HIV LTR。
本發明核酸分子亦可在操作上連結至有效聚(A)終止序列、在大腸桿菌中質體產物的複製源點、作為可篩選標記的抗生素抗性基因,及/或簡便選殖位點(例如聚連接子)。核酸也可以包含相對於組成性啟動子(諸如CMV IE)的可調控誘導性啟動子(誘導性、壓制性、受發育調節)(習於技藝者將理解該等術語為在某些條件下的基因表現程度的實際說明)。
可篩選標記為技藝中已知的要素。在篩選條件下,僅有表現適當可篩選標記的細胞能存活下來。一般可篩選標記基因表現蛋白質,通常為賦予對細胞培養物中各種抗生素之抗性的酵素。在其他篩選條件下,表現螢光蛋白標記的細胞可以做成能看見的,且因而是可篩選的。具體例包括β-內醯胺酶(bla)(β-內醯胺抗生素抗性或安比西林抗性基因或ampR)、bls(殺稻瘟菌素抗性乙醯基轉移酶基因)、bsd(殺稻瘟菌素-S去胺酶抗性基因)、bsr(殺稻瘟菌素-S抗性基因)、Sh ble(Zeocin®抗性基因)、潮黴素磷酸轉移酶(hpt)(潮黴素抗性基因)、tetM(四環素抗性基因或tetR)、新黴素磷酸轉移酶II(npt)(新黴素抗性基因或neoR)、kanR(康那黴素抗性基因),以及pac(嘌黴素抗性基因)。
在某些具體例中,該載體包含一或多個可篩選標記基因,選自由bla、bls、BSD、bsr、Sh ble、hpt、tetR、tetM、npt、kanR以及pac組成之群。在其他具體例中,該載體包含編碼下列的一或多個可篩選標記基因:綠色螢光蛋白(GFP)、增強綠色螢光蛋白(eGFP)、氰基螢光蛋白(CFP)、增強氰基螢光蛋白(eCFP),或黃色螢光蛋白(YFP)。
為本發明之目的,在真核細胞中的基因表現可以使用強啟動子來嚴密監控,強啟動子受到操作子所控制,而操作子又受到調節性融合蛋白(RFP)所調控。RFP基本上是由轉錄阻斷域,以及調節其活性的配
體-結合域所組成。此等表現系統的實例描述於US20090162901A1中,其以整體併入本文做為參考資料。
如本文所用”操作子”表明一種DNA序列,其以一種基因可以受到RFP結合至操作子且因而防止或容許感興趣基因轉錄而被調節的方式併入該基因中或鄰近該基因,該感興趣基因為編碼本發明多肽的核苷酸。在原核細胞以及噬菌體中的一些操作子已被充分鑑別(Neidhardt,ed.Escherichia coli and Salmonella;Cellular and Molecular Biology 2d.Vol 2 ASM Press,Washington D.C.1996)。這些包括(但不限於)大腸桿菌LexA基因的操作子區(其結合LexA肽),以及乳糖與色胺酸操作子(其結合由大腸桿菌Lacl與trpR基因編碼的壓抑子蛋白)。這些也包括來自λPR以及噬菌體P22 ant/mnt基因的噬菌體操作子,其結合由λcl與P22 arc所編碼的壓抑子蛋白。在一些具體例中,當RFP的轉錄阻斷域為限制酶(諸如NotI)時,則操作子為那個酶的辨識序列。習於技藝者將理解,操作子必須位在鄰近啟動子或就在3’,使其能夠控制啟動子的轉錄。舉例而言,美國專利第5,972,650號(其併入本文做為參考資料)具體說明tetO序列在TATA盒的一個特定距離內。在特定具體例中,操作子較佳就在啟動子下游。在其他具體例中,操作子在啟動子的10個鹼基對之內。
在某些具體例中,操作子是選自由下列組成之群:tet操作子(tetO)、NotI辨識序列、LexA操作子、乳糖操作子、色胺酸操作子以及Arc操作子(AO)。在一些具體例中,該壓抑子蛋白是選自由下列組成之群:TetR、LexA、LacI、TrpR、Arc、λC1以及GAL4。在其他具體例中,轉錄阻斷域是衍生自真核壓抑子蛋白,例如衍生自GAL4的壓抑子域。
在一個例示性細胞表現系統中,細胞被工程化成表現四環素壓抑子蛋白(TetR)且感興趣蛋白是受到其活性被TetR調控之啟動子的轉錄控制。兩個串聯TetR操作子(tetO)於載體中就位在CMV-MIE啟動子/增強子的下游。在該載體中受CMV-MIE啟動子指引而編碼感興趣蛋白質的基因的轉錄於四環素或一些其他適當誘導劑(例如多西環素)不存在下被TetR所阻斷。在誘導劑存在下,TetR蛋白不能結合tetO,因此發生感興趣蛋白
質的轉錄然後轉譯(表現)(參見例如美國專利案第7,435,553號,以其整體併入本文做為參考資料)。
另一個例示性細胞表現系統包括調節性融合蛋白,諸如TetR-ERLBDT2融合蛋白,其中該融合蛋白的轉錄阻斷域為TetR而配體-結合域為帶有T2突變的雌激素受體配體-結合域(ERLBD)(ERLBDT2;Feil et al.(1997)Biochem.Biophys.Res.Commun.237:752-757)。當tetO序列位在強CMV-MIE啟動子的下游且鄰近強CMV-MIE啟動子時,感興趣核苷酸序列從CMV-MIE/tetO啟動子的轉錄於他莫昔芬存在下受到阻斷而因為移除他莫昔芬而未被阻斷。在另一個實例中,使用融合蛋白Arc2-ERLBDT2(一種由單鏈二聚體與ERLBDT2(上文)組成的融合蛋白,該單鏈二聚體由兩個藉由15個胺基酸連接子連結之Arc蛋白組成)涉及Arc操作子(AO),更具體而言是就在CMV-MIE啟動子/增強子下游的兩個串聯arc操作子。細胞株可以受到Arc2-ERLBDT2調控,其中表現感興趣蛋白質的細胞是受到CMV-MIE/ArcO2驅動並且可利用移除他莫昔芬而誘導。(參見例如US 20090162901A1,其併入本文做為參考資料)。
在一些具體例中,本發明載體包含CMV-MIE/TetO或CMV-MIE/AO2雜合啟動子。
本發明載體也可採用重組技術的Cre-lox工具以促進感興趣基因複製。Cre-lox策略需要至少兩個組分:1)Cre重組酶,一種催化兩個loxP位點之間重組的酵素;以及2)lox位點(例如當發生重組時,8-bp核心序列組成的特異性34-鹼基對bp序列,以及兩個側翼13-bp反向重複序列)或突變lox位點。(參見例如Araki et al.PNAS 92:160-4(1995);Nagy,A.et al.Genesis 26:99-109(2000);Araki et al.Nuc Acids Res 30(19):e103(2002),以及US20100291626A1,其全部併入本文做為參考資料)。在另一個重組策略中,可使用酵母菌衍生的FLP重組酶與共同序列FRT一起(亦參見例如Dymecki,S.PNAS 93(12):6191-6196)。
在另一個態樣中,一個基因(亦即編碼本發明重組多肽的核苷酸序列)被插入表現匣的表現增強序列內,並視情況可操作地連結至啟
動子,其中啟動子連結的序列兩側在5’為第一重組酶辨識位點而在3’為第二重組酶辨識位點。此等重組酶辨識位點容許在表現系統的宿主細胞中Cre媒介的重組。在一些情況下,第二啟動子連結的基因在第一基因的下游(3’)且在3’側為第二重組酶辨識位點。在又其他情況下,第二啟動子連結的基因在5'側為第二重組酶位點,而在3’側為第三重組酶辨識位點。在一些具體例中,重組酶辨識位點是選自於loxP位點、lox511位點、lox2272位點,以及FRT位點。在其他具體例中,重組酶辨識位點不同。在一個其他具體例中,宿主細胞包含能夠表現Cre重組酶的基因。
在一個具體例中,該載體包含編碼本發明抗體之輕鏈或本發明抗體之重鏈的第一基因,以及編碼本發明抗體之輕鏈或本發明抗體之重鏈的第二基因。
在一些具體例中,該載體進一步包含能夠透過控制在內質網(ER)中涉入蛋白質摺疊之基因的表現來增強蛋白質生產/蛋白質分泌的X-盒-結合蛋白1(mXBP1)基因(參見,例如Ron D,and Walter P.Nat Rev Mol Cell Biol.8:519-529(2007))。
術語”細胞”包括任一種適於表現重組核酸序列的細胞。細胞包括原核生物與真核生物的細胞(單細胞或多細胞)、細菌細胞(例如大腸桿菌、桿菌屬、鏈黴菌屬等的菌株)、分枝桿菌細胞、真菌細胞、酵母菌細胞(例如釀酒酵母、粟酒裂殖酵母、畢赤酵母、嗜甲醇酵母菌等)、植物細胞、昆蟲細胞(例如SF-9、SF-21、桿狀病毒感染的昆蟲細胞、粉斑夜蛾等)、非人類動物細胞、人類細胞或細胞融合物,諸如(例如)融合瘤或四價體瘤。在某些具體例中,該細胞為人類、猴、猿、倉鼠、大鼠或小鼠細胞。在其他具體例中,該細胞為真核且是選自下列細胞:CHO(例如CHO K1、DXB-11 CHO、Veggie-CHO)、COS(例如COS-7)、視網膜細胞、Vero、CV1、腎臟(例如HEK293、293 EBNA、MSR 293、MDCK、HaK、BHK21)、HeLa、HepG2、WI38、MRC 5、Colo25、HB 8065、HL-60、Jurkat、Daudi、A431(上皮)、CV-1、U937、3T3、L細胞、C127細胞、SP2/0、NS-0、MMT細胞、腫瘤細胞以及衍生自上述細胞的細胞株。在一些具體例中,該細胞包
含一或多個病毒基因,例如表現病毒基因的視網膜細胞(例如PER.C6®細胞)。
在又再一個態樣中,本發明是有關於一種重組真核或原核宿主細胞,諸如轉染瘤,其生產如本文定義的本發明抗體或如本文定義之本發明雙特異性分子。宿主細胞的實例包括酵母菌、細菌以及哺乳動物細胞,諸如CHO或HEK細胞。舉例而言,在一個具體例中,本發明提供一種包含一核酸的細胞,該核酸被穩定地併入細胞基因組中,該細胞基因組包含編碼包含表現本發明重組多肽之抗體的序列。在另一個具體例中,本發明提供一種包含非併入(亦即游離基因組)核酸(諸如質體、黏質體、噬粒或線性表現要素)的細胞,其包含編碼表現包含本發明重組多肽之抗體的序列。在其他具體例中,本發明提供一種細胞株,其是藉由以包含本發明表現載體的質體穩定轉染一宿主細胞所產生。
在又一個態樣中,本發明是有關於生產本發明抗體,或抗原-結合蛋白,或受體-Fc融合蛋白的方法,該方法包含以下步驟:a)培養如上文所述的本發明融合瘤或宿主細胞,以及b)由培養基純化抗體或抗原-結合蛋白或受體-Fc融合物(上文)。
在又再一個態樣中,本發明是有關於包含下列的組合物:如本文定義的抗體或其抗原-結合片段、抗原-結合蛋白或受體-Fc融合蛋白,或如本文所定義的雙特異性分子。
該等組合物可以與醫藥上可接受的載劑或稀釋劑以及依據習知技術的任何其他已知佐劑與賦形劑一起調配,習知技術為諸如比等於Remington:The Science and Practice of Pharmacy,19th Edition,Gennaro,Ed.,Mack Publishing Co.,Easton,PA,1995中所揭示者。
醫藥上可接受載劑或稀釋劑以及任何其他已知佐劑與賦形劑應適於所選本發明抗體以及所選投藥模式。本發明醫藥組合物中的活性成分確切劑量含量可能會改變,以獲得有效達到藥物之適當穩定性、特定患者的所要治療反應、組成,以及投藥模式的活性成分數量。所選劑量含量將取決於各種藥動學因素。
醫藥組合物可以藉由任何適當途徑與模式投與。活體內投與本發明抗體的適當途徑為技藝中已知且可由習於技藝者來選定(Daugherty,AL,and Msrny,RJ,Adv Drug Delivery Rev,58(5-6):686-706(2006))。
本發明的經標記抗體可用於診斷目的以偵測、診斷或監控疾病或病症。提供本發明以偵測或診斷疾病或病症,包含:(a)使用免疫特異地結合至目標抗原之一或多種抗體分析個體之細胞或組織樣品中的抗原存在;以及(b)將抗原位準與對照位準相比較,對照位準為例如正常組織樣品中的位準,藉此相較於抗原對照位準,抗原分析位準增加為疾病或病症的指標,或疾病或病症嚴重性的指標。
本發明抗體可使用技藝中熟知的免疫組織學方法用於分析生物樣品中的抗原位準。用於偵測蛋白質之以抗體為主的其他方法包括諸如酵素連結免疫吸附法(ELISA)以及放射免疫分析法(RIA)的免疫分析。適當的抗體標記可用於該等套組與方法中,而技藝中已知的標記包括酵素標記,諸如鹼性磷酸酶以及葡萄糖氧化酶;放射性同位素標記,諸如碘(125I、131I)、碳(14C)、硫(35S)、氚(3H)、銦(121In),與鎝(99m Tc);以及發光標記,諸如發光醇與螢光酶;和螢光標記,諸如螢光素與玫瑰紅。
可在活體內偵測經標記抗體的存在以供診斷目的。在一個具體例中,診斷包含:a)向個體投與有效量之經標記抗體;b)在投與之後等一段時間間隔以容許經標記抗體集中在抗原可被偵測處並容許未結合的經標記抗體被清除成背景位準;c)測定背景位準;以及d)偵測個體中的經標記抗體,偵測經標記抗體高於背景位準為個體帶有疾病或病症的指標,或該疾病或病症嚴重性的指標。依據此具體例,抗體經適於使用習於技藝者熟知特定成像系統偵測的成像部分予以標記。背景位準可藉由技藝中已知的各種方法來測定,包括將偵測到的經標記抗體量與特定成像系統先前測定之標準值相比較。方法以及可用於本發明診斷方法中的系統包括(但不限於)電腦斷層攝影(CT)、全身掃描(諸如正子放射斷層攝影(PET))、核磁共振成像(MRI)以及超音波掃描。
提供以下實例對習於技藝者說明如何做出以及使用本發明方法與組合物,且不意欲限制發明人就其發明所認為之範疇。已盡力確保關於所用數字(例如數量、濃度、溫度等)的準確性,但應考量到一些實驗誤差以及偏差。
使用標準選殖技術生成重組多肽,例如嵌合CH IgG4(SEQ ID NO:31)以及嵌合CH IgG1(SEQ ID NO:30)。首先,透過兩步驟PCR擴增方法來生成嵌合IgG4 CH。兩個PCR片段(片段1與2)是使用起始構築體pR85501(含有野生型hIgG4 CH DNA)且分別使用引子oSP030-oSP031與oSP032-oSP033(參見表8)來進行擴增。該等引子將所要IgG2下樞紐序列(其編碼SEQ ID NO:3)以及側邊限制位點併入片段中。這兩個片段接而使用PCR引子oSP031和oSP033被接合。所得序列經由Xho1-Not1限制位點被插入至pR85501,生成載體構築體pR85502,其含有帶有IgG2下樞紐序列的嵌合IgG4 CH。使用引子KO_oLRC120和oKO021來確認序列。
此外,透過多步驟PCR擴增生成嵌合IgG1 CH。使用引子oSP031和oSP035(參見下表8)由模板pR85503(其含有野生型人類IgG1 CH DNA)生成片段1a。以引子oSP036與oSP038使用pR85502(含有嵌合IgG4 CH DNA)作為模板擴增片段2a。使用引子oSP037和oSP039從模板pR85503(野生型hIgG1 CH DNA)做出片段3。片段1a與2a是使用引子oSP031和oSP038而接合在一起,其產生片段4。使用引子oSP036和oSP039接合片段2a及3會生成片段5。然後片段4及5是使用引子oSP031和oSP039加以融合。所得序列經由Xho1-Not1限制位點被插入pR85501,生成構築體pR85504,其具有帶有IgG2下樞紐的IgG1恆定區與IgG4 CH2域。使用引子KO_oLRC120和oKO021確認該序列。
使用標準方法學獲得例示性抗體。使用抗-hCD3抗體(抗-hCD3抗體”L2K”)來構築本實例的嵌合抗體。L2K是藉由已知方法基於WO2004/106380而獲得。抗-hCD3_L2K,在本文命名為對照抗體1,含有野生型人類IgG1重鏈恆定區(SEQ ID NO:13)。
依據本實例所做出的雙特異性抗體含有兩個個別的抗原-結合域(亦即結合臂)。抗-hCD3 x抗-hCD20(雙特異性抗體),在本文命名為對照抗體2,如美國專利申請公開案第US20100331527A1號中所述獲得。該雙特異性抗體是使用標準方法學來構築,其中WO2004/106380
的”L2K”抗-CD3抗體的重鏈與輕鏈與抗-CD20抗體的重鏈(參見例如PCT國際申請案第PCT/US13/60511,於2013年9月13日申請,其以其整體併入本文做為參考資料)合併。對照抗體2含有野生型人類IgG4重鏈恆定區(SEQ ID NO:15),而抗-CD3臂具有經修飾的CH3域(SEQ ID NO:42)供簡易純化之用。
使用如本文中所述的相同方法學將對照Ab 2(抗-hCD3 x抗-hCD20雙特異性Ab)可變區與野生型人類IgG1重鏈恆定區(SEQ ID NO:13)合併而獲得對照抗體3,其在抗-CD3重鏈臂中具有經修飾的CD3域(SEQ ID NO:41)。
對照抗體4含有能夠結合CA9抗原的抗原-結合域以及野生型人類IgG1重鏈恆定區(SEQ ID NO:13)。
對照抗體5是一種抗-hCD3 x抗-hCD20雙特異性抗體,依據在2013年9月19日申請之PCT國際申請案第PCT/US13/60511號的方法獲得,該申請案以其整體併入本文做為參考資料。簡言之,包含衍生自抗-CD20抗體之重鏈可變區(”CD20-VH”)的第一抗原-結合域與衍生自抗-CD3抗體的輕鏈可變區(”CD3-VL”)相配對。CD20-VH/CD3-VL配對產生特異地辨識CD20的抗原-結合域。包含衍生自抗-CD3抗體之重鏈可變區(”CD3-VH”)的第二抗原-結合域與衍生自抗-CD3抗體的輕鏈可變區(”CD3-VL”)相配對。CD3-VH/CD3-VL配對產生特異地辨識CD3的抗原-結合域。對照抗體5是使用野生型人類IgG1重鏈恆定區(SEQ ID NO:13)來進行工程化,而該抗-CD3臂在重鏈恆定區中具有經修飾的CH3域(SEQ ID NO:41)以供簡便純化。
製造不結合至與測試抗體結合至相同目標抗原的同型對照,例如不結合CD3或CD20抗原。野生型IgG1同型對照含有wt重鏈恆定區胺基酸序列SEQ ID NO:13。野生型IgG4”CPPC”同型對照具有wt CH胺基酸序列SEQ ID NO:15,除了具有”CPCC”樞紐突變S228P(依據EU編號)。
對照抗體1的恆定區取代為本發明嵌合人類恆定區,例如SEQ ID NO:31或SEQ ID NO:30。藉由使用引子oKO014和oKO015(參見表8)擴增而獲得L2K可變區核酸序列(質體pR85505)來完成恆定區的取代。L2K可變區(SEQ ID NO:34)接著使用Sap1限制位點被引入質體pR85502以供選殖。使用引子KO_oLRC120和oKO_Fc_4-3來確認所得質體pR85506的序列。使用單離抗體的標準方法學,這個構築體被用來生成本發明抗體1,sIgG4-抗-CD3_L2K(在本文亦顯示為sIgG4)(其包含SEQ ID NO:31)。
在第二個實例中,使用質體pR85505作為模板,使用引子oKO014和oKO015(參見表8)擴增L2K可變區。可變區接著使用Sap1限制位點被引入質體pR85504以供選殖。使用引子KO_oLRC120和oKO_Fc_4-3來確認所得質體pR85507的序列。使用標準方法學,這個構築體被用來生成本發明抗體2,sIgG1-抗-CD3_L2K(在本文亦已知為sIgG1)(其包含SEQ ID NO:30)。
由對照抗體(Ab)5的抗-CD3 x抗-CD20雙特異性抗體構築抗體3。對照Ab 5的重鏈恆定區取代為嵌合恆定重鏈區,該抗-CD20臂具有包含SEQ ID NO:30的重鏈恆定區胺基酸序列,而抗-CD3臂在CH(SEQ ID NO:37)的CH3域中具有一個突變而製造出抗體3(在本文亦已知為sIgG1*)。
類似地,由雙特異性抗體對照Ab 5製造出抗體4,而重鏈恆定區取代為嵌合CH,該抗-CD20臂具有包含SEQ ID NO:31的重鏈恆定區胺基酸序列,而抗-CD3臂在CH(SEQ ID NO:38)的CH3域中具有一個突變而製造出抗體4(在本文亦已知為sIgG4*)。
包含恆定區SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:31的嵌合抗體(包含SEQ ID NO:30/37或SEQ ID NO:31/38的雙特異性抗體)以及對照抗體使用於下面實例中所示的特定實驗中。
實例3:特異地結合至Jurkat細胞的嵌合抗體在嵌合抗體被轉換成完全人類IgG之後,測定特異性抗原結合特性。使用
螢光活化細胞分選(FACS)針對抗體結合至Jurkat細胞(表現目標抗原CD3+、CD20的人類T-細胞株)的能力測試實例抗體構築體以及對照抗體(如實例2中所列)。使用下列規程取得FACS數據:將每孔2x105細胞與經連續稀釋抗體以及100μl補充劑在4℃下一起培育1小時。在培育之後,洗滌細胞兩次並添加適當的二級抗體(例如經螢光標定的FITC抗-人類IgG)並在4℃下培育又再額外30分鐘,接著洗滌兩次。將細胞再懸浮於含有1% BSA的冷PBS中並且藉由流式細胞儀在FACSCanto IITM流式細胞儀(BD Biosciences)上進行分析。透過側向與前向散射分選來圈閘Jurkat細胞。細胞結合滴定濃度的各個EC50是使用Prism(GraphPad Software,San Diego,CA)以4-參數非線性迴歸分析計算的數值來決定。
測定嵌合抗體相較於具有野生型CH區的對照抗體以相等濃度結合至Jurkat細胞,因此帶有CH區已改變的嵌合抗體不會失去它們結合抗原的能力。參見圖6。
U937細胞,一種表現FcγRI與FcγRIIA的單核球細胞株,被安置並容許與連續稀釋的Ab(所使用的最高濃度Ab為50nM)一起培育。細胞與Ab在4℃下一起培育1小時,然後洗滌兩次。U937細胞接著與二級Ab(FITC山羊抗-人類Fab)在4℃下一起培育30分鐘,然後洗滌兩次。藉由流式細胞儀使用標準方法分析細胞並且記錄中位數螢光強度(MFI)。結果歸納於表9與圖7中,其中證實嵌合Ab,抗體1(sIgG4)與抗體2(sIgG1),在高濃度下結合至U937細胞。
在下面的細胞分析中使用U937細胞作為陽性殺手效應子對照。確切地說,測試帶有嵌合CH區的抗體經由Fc/FcγR交互作用殺滅U937細胞的能
力。使用下列規程進行鈣黃綠素殺滅分析:分別在Ficoll-Paque(GE Healthcare Life Sciences)或經由淋巴球-哺乳動物密度細胞分離介質(Cedarlane Laboratories)單離人類與食蟹獼猴周邊血液單核球細胞(PBMC)。在數天的時程內以含有重組人類IL-2(30U/ml)以及T細胞活化珠粒(人類PBMC為抗-CD3/CD28,食蟹獼猴PBMC為抗-CD2/CD3/CD27)活化經單離的PBMC。由PBMC透過離心單離活化的T細胞,接著再懸浮於1ml培養基中。將磁化珠粒自T細胞處移除。目標細胞(U937)被鈣黃綠素所標記,然後洗滌並使用3倍連續稀釋的抗體在37℃下於3小時時程內與經單離活化T細胞(10:1效應子:目標比例)及抗體一起培育。在培育之後,將盤離心並將上清液轉移至半透明黑色透明底部盤供螢光分析。各EC50(定義為引起50%細胞毒性的抗體莫耳濃度)是使用Prism(GraphPad Software,San Diego,CA)測定。使用4-參數非線性迴歸分析計算數值。結果歸納於圖8中。
抗體1(sIgG4)與抗體2(sIgG1)的細胞毒性活性相較於含有野生型IgG4與IgG1樞紐區的對應抗體明顯減少。參見圖8。有趣的是,儘管嵌合Ab如實例4中所示在較高濃度下微弱地結合,但它們在細胞分析中不會殺滅U937細胞。
嵌合抗體以及對照構築體刺激周邊血液單核球細胞(PBMC)以及引起增生的能力是使用ATP催化定量(CellTiter Glo®)來進行評估。PBMC的活化致使細胞激素釋放,驅使細胞增生。使用下列規程取得增生數據:人類或食蟹獼猴衍生之PBMC(5x105/孔)與3倍連續稀釋的抗-CD20xCD3或對照抗體(包括對CA9抗原具有特異性的對照Ab 4)在96孔盤中於37℃下一起培育72小時。在培育之後,添加CellTiter Glo®並使用VICTOR X5多標記盤讀取儀(PerkinElmer)測量發光。細胞存活率的EC50(ATP催化的定量)是使用Prism(GraphPad Software,San Diego,CA)來測定。使用4-參數非線性迴歸分析計算數值並顯示於圖9中。
抗體1(sIgG4)以及抗體2(sIgG1)相較於含有野生型IgG4與IgG1樞紐區的對應抗體不會活化細胞增生。參見圖9。
使用表面電漿共振(SPR)(Biacore)技術分析帶有嵌合恆定重鏈區sIgG1*(抗體3)以及sIgG4*(抗體4)的抗-CD3 x抗-CD20雙特異性抗體,以測定它們對人類與食蟹獼猴Fcγ受體的動力學結合參數。以類似的方式測試同型對照(亦即wt-IgG1同型對照與wt-IgG4 CPPC同型對照)。
簡言之,在25℃下於Biacore T200儀器上採用經羧甲基右旋糖塗佈(CM-5)晶片進行SPR實驗。使用標準胺-偶合化學將小鼠單株抗-五組胺酸抗體(GE Healthcare)固定在CM-5感測晶片的表面上。140RU-376RU經His標定之人類或猴FcγR蛋白被捕獲在抗-五-組胺酸胺偶合CM-5晶片上並將抗體原液以20μl/分注射通過經捕獲蛋白歷時2.5分鐘。監控mAb結合反應並針對低親和力受體計算穩態結合平衡。藉由處理數據並將數據擬合至1:1結合模型使用Scrubber 2.0曲線擬合軟體來決定動力學締合速率常數(ka)與解離速率常數(kd)。由如下的動力學速率常數計算結合解離平衡常數(KD)與解離半衰期(t1/2):KD(M)=kd/ka;而t1/2(分)=(ln2/(60*kd)。
如表10中的結果證實,相較於帶有野生型(wt)hIgG1或hIgG4 CH區的抗體,sIgG1*與sIgG4*雙特異性抗體展現不結合至人類FcγR1。相較於帶有wt hIgG1或hIgG4Fc序列的抗體,本發明嵌合重鏈抗體對低親和力FcRγ受體中的數者(FcRγIIa、FcRγIIb)也展現極弱至無結合(表11)。
生成如上述帶有嵌合CH區的抗體(sIgG1*與sIgG4*)以生產效應子功能有所改變或降低的mAb。相較於含有IgG1同型之野生型(wt)重鏈恆定區的抗體,在CH區中的胺基酸置換可能會阻礙Ig Fc結合至其受體的能力。因此,訊號傳遞以及免疫反應(諸如B細胞活化或吞噬作用)可能會改變。檢驗在CH區中之胺基酸修飾對於補體依賴性細胞毒性(CDC)(在本實例中)與抗體依賴性細胞毒性(ADCC)效應子功能(參見實例9)的影響。
為了檢驗抗體3(sIgG1*)以及抗體4(sIgG4*)對於CDC效應子功能的影響,在5%人類血清補體存在下安置表現CD20的Raji(目標)細胞(5000/孔)或Daudi細胞。在37℃下自100nM起連續稀釋的sIgG1*、sIgG4*以及對照抗體被添加至細胞歷時4小時。使用CytoTox GloTM套組(Promega)來測定目標細胞溶解並計算百分比細胞毒性。
使用下列等式計算百分比細胞毒性:%細胞毒性=((Ls-LSR)/(LMR-LSR))*100%,其中LSR為基線目標細胞發光而LMR為來自因為毛地黃皂苷而溶解之細胞的最大鈣黃綠素釋放。使用Prism軟體(GraphPad)測定關於細胞毒性的EC50。使用4-參數非線性迴歸分析計算數值且顯示於表12,與圖10A及10B中。
抗體3(sIgG1*)以及抗體4(sIgG4*)對Daudi以及Raji細胞的CDC活性相較於具有wt重鏈恆定域的對應抗體明顯降低。參見表12,以及圖10A/B。在sIgG4*對Raji細胞中觀察到一些CDC活性,但是整個結果顯示嵌合抗體展現比wt IgG1 Fc對照抗體更弱的效應子反應。
為了檢驗抗體3(sIgG1*)以及抗體4(sIgG4*)對帶有野生型CH區的抗體對於ADCC效應子功能的影響,將新鮮單離的未受刺激CD56-陽性NK細胞或NK92細胞工程化成表現較高親和力FcγRIIIa的V對偶基因,將該等細胞於嵌合CH-抗體以及wt-CH對照抗體存在下與經鈣黃綠素標記的CD20陽性
Raji或Daudi細胞一起放置。監控來自目標細胞的鈣黃綠素釋放並且測定百分比細胞毒性。如上面針對CDC分析所述計算百分比細胞毒性以及EC50。結果顯示於表13以及圖11A與11B中。
嵌合CH抗體,sIgG1*以及sIgG4*,不會媒介ADCC活性(表13)對抗Raji或Daudi細胞。
抗體3(在本文亦已知為sIgG1*)以及抗體4(在本文亦已知為sIgG4*)的毒性動力學型態是藉由自接受單次30分鐘IV輸注,接著12週觀察期的雄性食蟹獼猴(3隻動物/處理組)獲得血液樣品來進行評估。在投藥前以及投藥後5分鐘與5、24、48、72及168小時,以及第14、21、35、49、66和84天收集血液樣品供血漿中總藥物濃度的毒性動力學分析用。所得血清樣品是藉由直接酵素連結免疫吸附法(ELISA)來分析,以決定sIgG1*或sIgG4*抗體的總藥物濃度。測試物的毒性動力學是使用非隔室分析(Phoenix WinNonLin)來進行評估以決定藥動學參數。結果顯示於表14中(AUC=濃度下面積對時間曲線;Cmax=血清中觀察到的最大濃度)。
於食蟹獼猴中,在單次靜脈內劑量1.0mg/kg的sIgG1*以及sIgG4*之後,觀察到平均峰濃度(Cmax)分別為33.4以及26.0μg/mL,而平均AUC0-168h值分別為100以及61.1天*ug/mL。這兩個分子的表觀終末半衰期估算介於8.14-14.0天。數據指出,對sIgG1*以及sIgG4*的連續暴露在所有動物中大多數維持12週觀察期且暴露在所有處理組別中相當。測試物觀察到無明顯免疫原性。sIgG1*以及sIgG4*的藥動學型態在給藥的食蟹獼猴中為典型單株抗體。
<110> 美商再生元醫藥公司Regeneron Pharmaceuticals,Inc.
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Claims (16)
- 一種包含重鏈恆定(CH)區之抗體,該重鏈恆定區由N端至C端具有CH1域、嵌合樞紐、CH2域以及CH3域,其中(a)該CH1域包含自位置212至215(EU編號)含胺基酸序列DKKV或DKRV的人類IgG1 CH1域或人類IgG4 CH1域,(b)該嵌合樞紐包含自位置216至227(EU編號)的人類IgG1或人類IgG4上樞紐胺基酸序列以及自位置228至236(EU編號)的人類IgG2下樞紐胺基酸序列PCPAPPVA(SEQ ID NO:3),(c)該CH2域包含含SEQ ID NO:10之胺基酸序列的人類IgG4 CH2域,以及(d)該CH3域包含自位置341至447(EU編號)之人類IgG1或人類IgG4 CH3域序列,且其中相較於包含野生型IgG1或野生型IgG4重鏈恆定區的對應抗體的結合親和力,該抗體能夠以較低的親和力結合至FcγR,該抗體能結合至FcγRIIA及可選擇地結合至FcγRIIB,且該抗體以比其結合FcγRIIB還高的親和力結合FcγRIIA。
- 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該CH區具有SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:37或SEQ ID NO:38的胺基酸序列。
- 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該CH1域包含胺基酸序列DKKV(SEQ ID NO:4),而該嵌合樞紐包含胺基酸序列EPKSCDKTHTCPPCPAPPVA(SEQ ID NO:8)。
- 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該CH1域包含胺基酸序列DKRV(SEQ ID NO:5),而該嵌合樞紐包含胺基酸序列ESKYGPPCPPCPAPPVA(SEQ ID NO:9)。
- 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該CH3域包含選自由SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:41以及SEQ ID NO:42組成之群的胺基酸序列。
- 如申請專利範圍第1項之抗體,其中該抗體在至少10nM的抗體濃度下,展現少於20% CDC細胞毒性及/或ADCC細胞毒性,或少於10%、或5%、4%、3%、2%、或甚至0%或無法偵測到CDC細胞毒性及/或ADCC細胞毒性。
- 如申請專利範圍第6項之抗體,其中該CDC及/或ADCC細胞毒性活性比包含野生型IgG1或野生型IgG4 CH區的對應抗體的CDC及/或ADCC細胞毒性活性低至少約5倍,或至少約10倍。
- 如申請專利範圍第1至7項中任一項之抗體,其為單特異性抗體。
- 如申請專利範圍第1至7項中任一項之抗體,其為雙特異性抗體。
- 如申請專利範圍第1至7項中任一項之抗體,其中該抗體不結合至FcγRI、FcγRIIIA或FcγRIIIB。
- 一種編碼如申請專利範圍第1至7項中任一項之抗體的核酸分子。
- 一種包含如申請專利範圍第11項之核酸分子的載體。
- 如申請專利範圍第12項之載體,其中該核酸分子操作地連結至適於在宿主細胞中表現的表現控制序列。
- 一種細胞,其包含如申請專利範圍第11項之核酸分子或如申請專利範圍第12或13項之載體,其中可選擇地該核酸分子併入細胞的基因組中。
- 如申請專利範圍第14項之細胞,其中該細胞為哺乳動物細胞,其中可選擇地該細胞為CHO細胞,可選擇地該細胞為CHO-K1細胞。
- 一種包含重鏈恆定(CH)區之受體-Fc融合蛋白,該重鏈恆定區由N端至C端具有CH1域、嵌合樞紐、CH2域以及CH3域,其中(a)該CH1域包含自位置212至215(EU編號)含胺基酸序列DKKV或DKRV的人類IgG1 CH1域或人類IgG4 CH1域,(b)該嵌合樞紐包含自位置216至227(EU編號)的人類IgG1或人類IgG4上樞紐胺基酸序列以及自位置228至236(EU編號)的人類IgG2下樞紐胺基酸序列PCPAPPVA(SEQ ID NO:3),(c)該CH2域包含自位置237至340(EU編號)的人類IgG4 CH2域胺基酸序列,以及(d)該CH3域包含自位置341至447(EU編號)之人類IgG1或人類IgG4 CH3域序列,且其中相較於包含野生型IgG1或野生型IgG4重鏈恆定區的對應抗體的結合親和力,該受體-Fc融合蛋白能夠以較低的親和力結合至FcγR,該受體-Fc融合蛋白能結合至FcγRIIA及可選擇地結合至FcγRIIB,且該受體-Fc融合蛋白以比其結合FcγRIIB還高的親和力結合FcγRIIA。
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