TWI782930B - 抗ｍｅｔ抗體，結合ｍｅｔ之雙特異性抗原結合分子及其使用方法 - Google Patents

抗ｍｅｔ抗體，結合ｍｅｔ之雙特異性抗原結合分子及其使用方法 Download PDF

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Abstract

本文提供結合MET的抗體以及雙特異性抗原結合分子及其使用方法。該雙特異性抗原結合分子包含第一抗原結合域以及第二抗原結合域，其中該第一抗原結合域及第二抗原結合域結合至人類MET之胞外域的兩個不同(較佳非重疊)表位。該等雙特異性抗原結合分子能夠阻斷人類MET及其配體HGF之間的交互作用。該等雙特異性抗原結合分子可表現出最小或無MET促效劑活性，例如與僅包含雙特異性分子之一個抗原結合域的單價抗原結合分子相較，該等單價抗原結合分子傾向展現出不樂見的MET促效劑活性。亦包括含有本文提供之抗體或雙特異性抗原結合分子結合至細胞毒性劑、放射性核種或其他部分的抗體-藥物接合物(ADC)，以及透過向個體投與雙特異性抗原結合分子或其ADC來治療個體之癌症的方法。

Description

抗MET抗體，結合MET之雙特異性抗原結合分子及其使用方法
本發明是有關於特異地結合肝細胞生長因子受體(c-Met或MET)並調控MET訊息傳導的抗體、雙特異性抗體及其抗原結合片段與此等抗體的抗體-藥物接合物(antibody-drug conjugates)，以及其使用方法。
肝細胞生長因子(HGF)(又稱為分散因子(scatter factor，SF))是一種雜二聚旁泌生長因子，透過與HGF受體(HGFR)交互作用來展現其活性。HGFR是c-Met致癌基因的產物且已知為MET。MET是一種受體酪胺酸激酶，由經雙硫橋連接至胞外α鏈的穿膜β鏈組成。HGF與MET的結合活化了MET的激酶催化活性，使得β鏈的Tyr 1234與Tyr 1235磷酸化，且隨後活化下游傳訊路徑。
MET及/或HGF過度表現、活化或擴增經證明參與非小細胞肺癌(NSCLC)、胃癌、卵巢癌、胰臟癌、甲狀腺癌、乳癌、頭頸癌、結腸癌與腎癌(Sierra and Tsao,Ther.Adv.Med.Oncol.,3(1 Suppl)：S21-S35,2011)。MET擴增在NSCLC與食道胃惡性病中被認為是腫瘤形成的關鍵驅動分子。此外，造成MET外顯子14刪除的突變已被描述是NSCLC的某個子集的致癌驅動分子。就生長以及存活來說，帶有MET基因擴增的腫瘤細胞株與MET高度相關。臨床前數據暗示，MET傳訊在多種腫瘤類型中對標靶療法具有抗性，諸如NSCLC、結腸直腸癌，以及頭頸鱗狀細胞癌(HNSCC)。
臨床前結果以及最近臨床結果均指出，帶有這些遺傳變異的腫瘤對MET抑制劑有反應，證實MET是一種癌症驅動分子。目 前正臨床開發用於治療不同癌症的各種單價MET阻斷抗體(參見美國專利第5,686,292號；第5,646,036號；第6,099,841號；第7,476,724號；第9,260,531號；與第9,328,173號；以及美國專利公開案第2014/0349310號與第2005/0233960號)。這些抗體包括奧那妥珠單抗(onartuzumab)(MetMab)以及艾米貝朱單抗(emibetuzumab)(Xiang et al.,Clin.Cancer Res.19(18)：5068-78,2013，以及Rosen et al.,Clin.Cancer Res.,Published October 10,2016,doi：10.1158/1078-0432.CCR-16-1418)。這些抗體中有一些阻斷配體依賴性MET傳訊，但在阻斷配體獨立性MET活化方面並不有效。
對於強力阻斷配體依賴性MET傳訊以及配體獨立性MET傳訊的經改良抗癌藥物仍有明顯無法滿足的醫學需求。
本文提供結合人類c-Met受體蛋白的抗體、抗體之抗原結合片段、二價單特異性抗體的組合，及雙特異性抗體(MET x MET)。該等抗體尤其可用於靶向表現MET的腫瘤細胞。該等抗-MET抗體及其抗原結合部分可呈未經修飾的形式單獨使用，或納入為抗體-藥物接合物或雙特異性抗體的一部分。
其他具體例將因為檢閱隨後的詳細說明而變得清楚。
圖1是一個陣列，說明本文揭示之272個例示性MET x MET雙特異性抗體的構成要素。陣列的每一個經編號小格識別為一個獨特的雙特異性抗體，其包含「D1」抗原結合域以及「D2」抗原結合域，其中D1抗原結合域包含沿著Y軸列出對應抗-MET抗體之免疫球蛋白可變域(HCVR/LCVR胺基酸序列對)或CDR，且其中D2抗原結合域包含沿著X軸列出對應抗-MET抗體之免疫球蛋白可變域(HCVR/LCVR胺基酸序列對)或CDR。
圖2為以螢光素酶為基礎的報導子分析的概圖，該報導子分析在含有SRE-螢光素酶報導子基因建構物的HEK293T細胞中，被用來評估抗體誘發之MET路徑活化或抗體阻斷HGF誘導之路徑活化。
圖3(A-B)是折線圖，描述隨著抗體濃度(log莫耳/L)變 化之代表SRE-螢光素酶表現的相對發光度單位(RLU)。實心正方形(■)表示親代二價單特異性抗體H4H13306P2、實心三角形(▲)表示親代二價單特異性抗體H4H13312P2、實心圓圈(●)表示單價抗體、實心菱形(◆)表示同型物對照，而實心倒三角形(▼)表示無配體。圖3A描述單獨抗體而沒有HGF配體。圖3B描述抗體加上HGF配體。
圖4(A-B)是折線圖，描述隨著抗體濃度(log莫耳/L)變化之代表SRE-螢光素酶表現的相對發光度單位(RLU)。實心正方形(■)表示抗-MET單價抗體、實心圓圈(●)表示MET x MET雙特異性抗體，以及實心菱形(◆)表示親代抗體H4H13312P2。圖4A描述單獨抗體而沒有HGF配體。圖4B描述抗體加上HGF配體。
圖5是柱狀圖，描述隨著用人類二價單特異性抗體抗-MET抗體1-18、對照抗體以及抗-MET單價抗體處理而變化之MET經擴增胃癌SNU5細胞的相對細胞生長。為供比較之用，抗體8(橫座標)是親代抗體H4H13306P2，而抗體11(橫座標)是親代抗體H4H13312P2。
圖6(A-B)含有柱狀圖，描述隨著用MET x MET雙特異性抗體、對照抗體以及抗-MET單價抗體處理而變化之MET經擴增細胞的相對細胞生長。圖6A描述隨著用對照抗體、單價抗體(0.1、1與10μg/mL)，以及MET x MET雙特異性抗體(0.1、1與10μg/mL)處理而變化的SNU5細胞相對生長。圖6B描述隨著用對照抗體以及MET x MET雙特異性抗體(0.1與1μg/mL)處理而變化的EBC-1細胞相對生長。
圖7(A-B)描述在用對照抗體以及MET x MET雙特異性抗體處理之後，抽取自Hs746T細胞之pMET(磷酸化MET)、MET、pErk(磷酸化Erk)和微管蛋白(用於加載對照)的免疫印漬(圖7A)，以及在用MET x MET雙特異性抗體處理歷時0、2與6小時之後，Hs746T細胞中的MET表現(而微管蛋白作為加載對照)的免疫印漬(圖7B)。
圖8描述在用對照抗體、MET x MET雙特異性抗體、抗-MET單特異性二價親代抗體1、抗-MET單特異性二價親代抗體2以及親代抗體1和2之組合處理之後，抽取自Hs746T細胞之pMET、MET、pErk和微管蛋白(用於加載對照)的免疫印漬。
圖9描述在用對照抗體及MET x MET雙特異性抗體處 理歷時2、6與18小時之後，Hs746T細胞中的MET表現(而微管蛋白作為加載對照)的免疫印漬。
圖10(A-B)描述在用對照抗體及MET x MET雙特異性抗體處理之後，抽取自SNU5細胞之pMET、MET、pErk及微管蛋白(用於加載對照)的免疫印漬(圖10A)；以及在用對照抗體與抗MET單價抗體處理之後，SNU5細胞中的MET表現(而微管蛋白作為加載對照)的免疫印漬(圖10B)。
圖11描述在用對照抗體及MET x MET雙特異性抗體處理之後，抽取自EBC-1細胞中的pMET、MET、pErk及微管蛋白(用於加載對照)的免疫印漬。
圖12為折線圖，描述在經對照抗體(實心正方形■)、MET單價抗體(實心圓圈●)或MET x MET雙特異性抗體(實心菱形◆)處理的動物體內植入EBC-1細胞之後，隨著時間(以天數計)的EBC-1腫瘤體積變化(以mm3計)。
圖13(A-B)含有柱狀圖，描述隨著用MET x MET雙特異性抗體、對照抗體及抗MET單價抗體處理而變化之MET經擴增細胞的相對細胞生長。圖13A描述隨著用對照抗體、MET x MET雙特異性抗體、MET x MET親代單特異性抗體1、MET x MET親代單特異性抗體2以及親代抗體1與2之組合處理而變化的Hs746T細胞相對生長。圖13B描述隨著用對照抗體、單價抗體(1、10與25μg/mL)，以及MET x MET雙特異性抗體(1、10與25μg/mL)處理而變化的Hs746T細胞相對生長。
圖14為柱狀圖，描述隨著用對照抗體(C)、MET x MET雙特異性抗體(MM)、MET x MET親代單特異性抗體1(M1)、MET x MET親代單特異性抗體2(M2)、親代抗體1與2的組合(M1M2)，以及MET促效劑肝細胞生長因子(HGF)處理而變化的NCI-H596細胞相對生長。
圖15為折線圖，描述在經對照抗體(實心正方形■)、MET單價抗體(實心圓圈●)或MET x MET雙特異性抗體(實心菱形◆)處理的動物體內植入Hs746T細胞之後，隨著時間(以天數計)的Hs746T腫瘤體積變化(以mm3計)。
圖16A為折線圖，描述在經對照抗體(實心正方形■)、1mg/mLMET單價抗體(實心圓圈●)、10mg/mLMET單價抗體(空心圓圈○)、1mg/mL MET x MET雙特異性抗體(實心菱形◆)或10mg/mL MET x MET雙特異性抗體(空心菱形◇)處理的動物體內植入SNU5細胞之後，隨著時間(以天數計)的SNU5腫瘤體積變化(以mm3計)。
圖16B為在用對照抗體、10mg/kg抗-MET單價抗體以及10mg/kgMET x MET雙特異性抗體處理之後，從移除自小鼠異種移植模型之SNU5腫瘤所抽取的pMET、MET及微管蛋白(用於加載對照)的免疫印漬。
圖17為折線圖，描述在經對照抗體(實心正方形■)、MET單價抗體(實心圓圈●)或MET x MET雙特異性抗體(實心菱形◆)處理的動物體內植入U87-MG細胞之後，隨著時間(以天數計)的U87-MG腫瘤體積變化(以mm3計)。
圖18為折線圖，描述在經對照抗體(實心正方形■)、MET單價抗體(實心圓圈●)或MET x MET雙特異性抗體(空心菱形◇)處理的動物體內植入U118-MG細胞之後，隨著時間(以天數計)的U118-MG腫瘤體積變化(以mm3計)。
圖19為說明合成類美登素6的概圖。
圖20為說明合成類美登素中間體1的概圖。
在說明本發明之前，應理解本發明不限於所述特定方法以及實驗條件，因為這些方法以及條件可能會改變。亦應理解本文中所用術語僅供說明特定具體例之用，而不希望具有限制性，因為本發明範疇將僅會受到隨附申請專利範圍所囿限。
除非另有定義，否則所有本文使用的技術性以及科學性術語具有與本發明所屬技藝中具有通常技藝者普遍理解的相同意思。如本文所用，當術語「約」用來指特定被列舉的數值時，該術語表示那個數值可能距列舉值變化不超過1%。舉例而言，如本文所用，詞句「約100」包括99和101，及其間所有值(例如99.1、99.2、99.3、99.4等)。
儘管任何類似或等同於本文所述者的方法以及材料可用於實施或測試本發明，現將說明較佳的方法以及材料。本說明書提及的全部專利案、申請案以及非專利案公開資料以引用其全文的方式併入本文。
MET蛋白
如本文所用，詞句「MET」、「c-Met」以及類似者意指人類跨膜受體酪胺酸激酶，其包含(1)如SEQ ID NO：145中所列的胺基酸序列，及/或具有NCBI登錄號NM_001127500.2中所列的胺基酸序列，代表同型物「a」未經處理的前原蛋白；(2)如SEQ ID NO：146中所列的胺基酸序列，及/或具有NCBI登錄號NM_000236.2中所列的胺基酸序列，代表同型物「b」未經處理的前原蛋白；(3)如SEQ ID NO：147中所列的胺基酸序列，及/或具有NCBI登錄號NM_001311330.1中所列的胺基酸序列，代表同型物「c」未經處理的前原蛋白；及/或(3)包含與所有三種同型物共有之細胞質α次單位(SEQ ID NO：148)以及穿膜β次單位(同型物a、b與c分別為SEQ ID NO：149、SEQ ID NO：150與SEQ ID NO：-151)的成熟蛋白。詞句「MET」包括單體以及集合體MET分子。如本文所用，詞句「單體人類MET」表示不含有或具有任何集合體化結構域，且在正常條件下以單一MET分子存在而在物理上不直接另一個MET分子連結的MET蛋白或其部分。例示性單體MET分子在本文中稱為「hMET.mmh」，其包含SEQ ID NO：152的胺基酸序列(參見，例如本文實例3)。如本文所用，詞句「二聚體人類MET」表示包含兩個透過連接子、共價鍵、非共價鍵或透過集合化結構域(諸如抗體Fc域)而彼此連結的MET分子的結構。例示性二聚體MET分子是在本文中稱為「hMET.mFc」的分子，其包含SEQ ID NO：153的胺基酸序列(參見，例如本文實例3)。
除非另有明確指明是來自非人類物種，否則蛋白質、多肽以及蛋白片段的所有指稱在本文中欲指個別蛋白質、多肽或蛋白片段的人類形式。因此，詞句「MET」表示人類MET，除如明確指明是來自非人類物種，例如「小鼠MET」、「猴MET」等。
如本文所用，詞句「細胞表面表現的MET」表示一或 多個MET蛋白或其胞外域，其在活體外或活體內被表現於細胞的表面上，使得至少一部份的MET蛋白暴露於細胞膜的胞外側且對於抗體的抗原結合部分來說是可觸及的。「細胞表面表現的MET」可包含在通常表現MET蛋白之細胞的表面上所表現的MET蛋白或由其組成。或者，「細胞表面表現的MET」可包含在通常不在其表面表現人類MET但經人工改造成在其表面表現MET之細胞的表面上所表現的MET蛋白或由其組成。
抗-MET抗體及其抗原結合片段
依據一個態樣，提供抗-MET抗體(例如單特異性抗-MET抗體)。依據此態樣，例示性抗-MET抗體列於本文表1與表2中。表1列出例示性抗-MET抗體的重鏈可變區(HCVR)、輕鏈可變區(LCVR)、重鏈互補決定區(HCDR1、HCDR2與HCDR3)以及輕鏈互補決定區(LCDR1、LCDR2與LCDR3)的胺基酸序列識別符號，本文所揭示的雙特異性抗原結合分子(在本文可與雙特異性抗原結合蛋白交替使用)可自該等例示性抗-MET抗體衍生而來。表2列出例示性抗-MET抗體之HCVR、LCVR、HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2與LCDR3的核酸序列識別符號。
本文亦提供特異地結合MET並且促使(例如活化)細胞中的MET傳訊路徑的抗體或其抗原結合片段，以及此等抗體在活化MET傳訊可能有益或在治療上有用的治療條件下的用途。這樣一個促效劑抗-MET抗體的非限制性實例包括在本文中稱為「H4H14636D」的抗體，以及包含重鏈與輕鏈CDR(SEQ ID NO：28、30、32、140、142、144)及/或其重鏈與輕鏈可變域(SEQ ID NO：26/138)的抗體及其抗原結合片段。
本文提供特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段，其包含含有選自表1中所列HCVR胺基酸序列任一者之胺基酸序列，或與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性之實質相似序列的HCVR。
本文提供特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段，其包含含有選自表1中所列LCVR胺基酸序列任一者之胺基酸序列，或 與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性之實質相似序列的LCVR。
本文提供特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段，其包含HCVR和LCVR胺基酸序列對(HCVR/LCVR)，該胺基酸序列對包含表1中所列的任一HCVR胺基酸序列與表1中所列的任一LCVR胺基酸序列配對。根據某些具體例，抗體或其抗原結合片段包含在表1中所列的任一例示性抗-MET抗體中所含之HCVR/LCVR胺基酸序列對。在某些具體例中，HCVR/LCVR胺基酸序列對選自下列SEQ ID NO組成之群：2/138、10/138、18/138、26/138、34/138、42/138、50/138、58/138、66/138、74/138、82/138、90/138、98/138、106/138、114/138，122/138以及130/138。
亦提供特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段，其包含重鏈CDR1(HCDR1)，該HCDR1包含選自表1中所列任一HCDR1胺基酸序列，或與其具有至少90%、至少95%，至少98%或至少99%序列一致性之實質相似序列的胺基酸序列。
亦提供特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段，其包含重鏈CDR2(HCDR2)，該HCDR2包含選自表1中所列任一HCDR2胺基酸序列，或與其具有至少90%、至少95%，至少98%或至少99%序列一致性之實質相似序列的胺基酸序列。
亦提供特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段，其包含重鏈CDR3(HCDR3)，該HCDR3包含選自表1中所列任一HCDR3胺基酸序列，或與其具有至少90%、至少95%，至少98%或至少99%序列一致性之實質相似序列的胺基酸序列。
亦提供特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段，其包含輕鏈CDR1(LCDR1)，該LCDR1包含選自表1中所列任一LCDR1胺基酸序列，或與其具有至少90%、至少95%，至少98%或至少99%序列一致性之實質相似序列的胺基酸序列。
亦提供特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段，其包含含有表1中所列任一HCDR1胺基酸序列與表1中所列任一LCDR1胺基酸序列配對的HCDR1及LCDR1胺基酸序列對(HCDR1/LCDR1)。 依據某些具體例，抗體或其抗原結合片段包含在表1中所列任一例示性抗-MET抗體中所包含的HCDR3/LCDR3胺基酸序列對。在某些具體例中，HCDR1/LCDR1胺基酸序列對選自下列SEQ ID NO組成之群：4/140、12/140、20/140、28/140、36/140、44/140、52/140、60/140、68/140、76/140、84/140、92/140、100/140、108/140、116/140，124/140以及132/140。
亦提供特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段，其包含輕鏈CDR2(LCDR2)，該LCDR2包含選自表1中所列任一LCDR2胺基酸序列，或與其具有至少90%、至少95%，至少98%或至少99%序列一致性之實質相似序列的胺基酸序列。
亦提供特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段，其包含含有表1中所列任一HCDR2胺基酸序列與表1中所列任一LCDR2胺基酸序列配對的HCDR2及LCDR2胺基酸序列對(HCDR2/LCDR2)。依據某些具體例，抗體或其抗原結合片段包含在表1中所列任一例示性抗-MET抗體中所包含的HCDR2/LCDR2胺基酸序列對。在某些具體例中，HCDR2/LCDR2胺基酸序列對選自下列SEQ ID NO組成之群：6/142、14/142、22/142、30/142、38/142、46/142、54/142、62/142、70/142、78/142、86/142、94/142、102/142、110/142、118/142、126/142，以及134/142。
亦提供特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段，其包含輕鏈CDR(LCDR3)，該LCDR3包含選自表1中所列任一LCDR3胺基酸序列，或與其具有至少90%、至少95%，至少98%或至少99%序列一致性之實質相似序列的胺基酸序列。
本文亦提供的是特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段，其包含含有表1中所列任一HCDR3胺基酸序列與表1中所列任一LCDR3胺基酸序列配對的HCDR3及LCDR3胺基酸序列對(HCDR3/LCDR3)。依據某些具體例，抗體或其抗原結合片段包含在表1中所列任一例示性抗-MET抗體中所包含的HCDR3/LCDR3胺基酸序列對。在某些具體例中，HCDR3/LCDR3胺基酸序列對選自下列SEQ ID NO組成之群：8/144、16/144、24/144、32/144、40/144、48/144、56/144、 64/144、72/144、80/144、88/144、96/144、104/144、112/144、120/144，128/144以及136/144。
本文亦提供的是特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段，其包含一組六個CDR(亦即HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3)，含括在表1中所列的任一例示性抗-MET抗體中。在某些具體例中，該HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3胺基酸序列組是選自下列SEQ ID NO組成之群：4-6-8-140-142-144、12-14-16-140-142-144、20-22-24-140-142-144、28-30-32-140-142-144、36-38-40-140-142-144、44-44-48-140-142-144、52-54-56-140-142-144、60-62-64-140-142-144、68-70-72-140-142-144、76-78-80-140-142-144、84-86-88-140-142-144、92-94-96-140-142-144、100-102-104-140-142-144、108-110-112-140-142-144、116-118-120-140-142-144，124-126-128-140-142-144以及132-134-136-140-142-144。
在一個相關具體例中，特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段包含一組六個CDR(亦即HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3)，含括在表1中所列任一例示性抗-MET抗體所界定之HCVR/LCVR胺基酸序列對中。例如，特異地結合MET的抗體或其抗原結合片段包含含括在選自下列SEQ ID NO組成之群之HCVR/LCVR胺基酸序列對中的HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3胺基酸序列組：4-6-8-140-142-144、12-14-16-140-142-144、20-22-24-140-142-144、28-30-32-140-142-144、36-38-40-140-142-144、44-44-48-140-142-144、52-54-56-140-142-144、60-62-64-140-142-144、68-70-72-140-142-144、76-78-80-140-142-144、84-86-88-140-142-144、92-94-96-140-142-144、100-102-104-140-142-144、108-110-112-140-142-144、116-118-120-140-142-144，124-126-128-140-142-144以及132-134-136-140-142-144。
用於鑑定HCVR與LCVR胺基酸序列中的CDR的方法及技術為技藝中充分熟知的，且可用於鑑定本文揭示之指定HCVR及/ 或LCVR胺基酸序列中的CDR。可用於鑑定CDR邊界的例示性習知技術包括，例如Kabat界定法、Chothia界定法以及AbM界定法。在一般性術語中，Kabat界定法是以序列變異性為基礎，Chothia界定法是以結構環區的位置為基礎，而AbM界定法是一種介於Kabat法與Chothia法之間的折衷方法。參見，例如Kabat,「Sequences of Proteins of Immunological Interest,」National Institutes of Health,Bethesda,Md.(1991)；Al-Lazikani et al.,J.MolBiol.273：927-948(1997)；以及Martin et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86：9268-9272(1989)。公開資料庫亦可用來鑑定抗體內的CDR序列。
本文亦提供編碼抗-MET抗體或其部分的核酸分子。例如，本發明提供編碼表1中所列的HCVR胺基酸序列任一者的核酸分子；在某些具體例中，核酸分子包含選自表2中所列的HCVR核酸序列任一者的多核苷酸序列，或與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列。
亦提供編碼表1中所列的LCVR胺基酸序列任一者的核酸分子；在某些具體例中，核酸分子包含選自表2中所列的LCVR核酸序列任一者的多核苷酸序列，或與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列。
亦提供編碼表1中所列的HCDR1胺基酸序列任一者的核酸分子；在某些具體例中，核酸分子包含選自表2中所列的HCDR1核酸序列任一者的多核苷酸序列，或與其具有至少90%、至少95%，至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列。
亦提供編碼表1中所列的HCDR2胺基酸序列任一者的核酸分子；在某些具體例中，核酸分子包含選自表2中所列的HCDR2核酸序列任一者的多核苷酸序列，或與其具有至少90%、至少95%，至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列。
亦提供編碼表1中所列的HCDR3胺基酸序列任一者的核酸分子；在某些具體例中，核酸分子包含選自表2中所列的HCDR3核酸序列任一者的多核苷酸序列，或與其具有至少90%、至少95%，至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列。
亦提供編碼表1中所列的LCDR1胺基酸序列任一者的核酸分子；在某些具體例中，核酸分子包含選自表2中所列的LCDR1核酸序列任一者的多核苷酸序列，或與其具有至少90%、至少95%，至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列。
亦提供編碼表1中所列的LCDR2胺基酸序列任一者的核酸分子；在某些具體例中，核酸分子包含選自表2中所列的LCDR2核酸序列任一者的多核苷酸序列，或與其具有至少90%、至少95%，至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列。
亦提供編碼表1中所列的LCDR3胺基酸序列任一者的核酸分子；在某些具體例中，核酸分子包含選自表2中所列的LCDR3核酸序列任一者的多核苷酸序列，或與其具有至少90%、至少95%，至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列。
亦提供編碼HCVR的核酸分子，其中該HCVR包含一組三個CDR(亦即HCDR1-HCDR2-HCDR3)，其中該HCDR1-HCDR2-HCDR3胺基酸序列組是由表1中所列例示性抗-MET抗體任一者所定義。
亦提供編碼LCVR的核酸分子，其中該LCVR包含一組三個CDR(亦即LCDR1-LCDR2-LCDR3)，其中該LCDR1-LCDR2-LCDR3胺基酸序列組是由表1中所列例示性抗-MET抗體任一者所定義。
亦提供編碼HCVR以及LCVR兩者的核酸分子，其中HCVR包含表1中所列HCVR胺基酸序列任一者的胺基酸序列，而其中LCVR包含表1中所列LCVR胺基酸序列任一者的胺基酸序列。在某些具體例中，該核酸分子包含選自表2中所列HCVR核酸序列任一者的多核苷酸序列或其與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性之實質相似序列，以及選自表2中所列LCVR核酸序列任一者的多核苷酸序列或其與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性之實質相似序列。在某些具體例中，該核酸分子編碼HCVR以及LCVR，其中HCVR以及LCVR均衍生自表1中所列的相同抗-MET抗體。
本文亦提供能夠表現包含抗-MET抗體之重鏈或輕鏈可變區之多肽的重組型表現載體。例如，重組表現載體含有上述核酸分子任一者，核酸分子亦即編碼如表1中所列HCVR、LCVR，及/或CDR序列任一者的核酸分子。已引入該等載體的宿主細胞，還有藉由在容許生產抗體或抗體片段的條件下培養宿主細胞而生產抗體或其部分，以及回收所生產之抗體及抗體片段的方法亦含括在本揭示內容範疇內。
本文提供具有經修飾糖基化型態的抗-MET抗體。在一些具體例中，移除非所欲糖基化位點的修飾可能是有用的，或缺乏存在於寡醣鏈上的岩藻糖部分會例如增加抗體依賴性細胞毒性(ADCC)功能的抗體(參見Shield et al.(2002)JBC 277：26733)。在其他應用中，可以進行半乳糖基化修飾以修飾補體依賴性細胞毒性(CDC)。
MET x MET雙特異性抗原結合分子
發明人已觀察到，某些阻斷HGF結合至MET的單特異性抗-MET抗原結合分子傾向於強有力地活化MET傳訊(對於治療分子來說是一個不樂見的結果)。但發明人意外地發現到，同時結合至MET蛋白胞外域上的兩個個別表位的雙特異性抗原結合分子有效阻斷配體結合至MET，同時沒有產生多少MET傳訊促效作用。
因此，本文提供雙特異性抗原結合分子，其包含第一抗原結合域(在本文又稱為「D1」)以及第二抗原結合域(在本文又稱為「D2」)。兩個個別MET表位同時被雙特異性抗原結合分子結合能在MET傳訊活化為最低的情況下有效阻斷配體。
雙特異性抗原結合分子包含特異地結合人類MET之第一表位的第一抗原結合域(D1)以及特異地結合人類MET之第二表位的第二抗原結合域(D2)，其在本文中被稱為「MET x MET雙特異性抗體」、「MET x MET」或其他相關術語。在一些具體例中，人類MET的第一表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸192-204。在一些具體例中，人類MET的第二表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸305-315與421-455。在一些具體例中，人類MET的第一表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸192-204，而人類MET的第二表位包含SEQ ID NO：155的胺 基酸305-315與421-455。
在某些具體例中，MET x MET雙特異性抗體的D1域與D2域彼此非競爭性。D1與D2之間就結合至MET來說非競爭性表示D1與D2所衍生而來的個別單特異性抗原結合蛋白不會彼此競爭結合至人類MET。例示性抗原結合蛋白競爭分析為技藝中所熟知，其非限制性實例描述於本文他處。
在某些具體例中，D1與D2結合至MET上的不同(例如非重疊，或部分重疊)表位，如本文他處所述。
MET x MET雙特異性抗原結合分子可使用兩個個別單特異性抗-MET抗體的抗原結合域來建構。例如，可使用技藝中熟知的標準方法製造大量單株單特異性抗-MET抗體。由此所產生的單獨抗體可針對MET蛋白的交叉競爭彼此進行成對測試。若兩個不同的抗-MET抗體能夠同時結合至MET(亦即彼此不競爭)，則第一個抗-MET抗體的抗原結合域與第二個非競爭抗-MET抗體的抗原結合域被建造至本揭示內容的單一MET x MET雙特異性抗體中。
依據本揭示內容，雙特異性抗原結合分子可以是單一多功能多肽，或其可為兩個或更多個多肽彼此共價或非共價締合的集合複合體。依據本揭示內容可清楚知道，能夠同時結合MET分子之兩個個別、非同一表位的抗原結合建構物被視為是一個雙特異性抗原結合分子。本文所述的任一雙特異性抗原結合分子或其變異體可使用技藝中具有通常技術者所充分熟知的標準分子生物學技術(例如重組DNA及蛋白質表現技術)來建構。
抗原結合域
本揭示內容的雙特異性抗原結合分子包含兩個個別抗原結合域(D1及D2)。如本文所用，詞句「抗原結合域」表示任何肽、多肽、核酸分子、骨架型分子、肽展示分子，或含多肽的建構物，其能夠特異地結合感興趣的特定抗原(例如人類MET)。術語「特異地結合」或類似者，如本文所用，表示與特定抗原形成複合體的抗原結合域，其特徵在於解離常數(KD)為500pM或更少，且在通常測試條件下不結合其他不相干的抗原。「不相干抗原」為蛋白質、肽或多肽，其彼 此具有少於95%的胺基酸一致性。
可用於本揭示內容上下文的抗原結合域的例示性種類包括抗體、抗體的抗原結合部分、與特定抗原特異地交互作用的肽(例如肽體(peptibodies))、與特定抗原特異地交互作用的受體分子、包含特異地結合特定抗原之受體的配體結合部分的蛋白質、抗原結合骨架(例如DARPin、HEAT重複蛋白、ARM重複蛋白、三十四肽重複蛋白，以及其他基於天然重複蛋白的骨架等[參見，例如Boersma and Pluckthun,2011,Curr.Opin.Biotechnol.22：849-857，以及其中引用的參考文獻])，及適體或其部分。
用於測定兩個分子是否特異地彼此結合的方法為本技藝中所充分熟知，且包括例如平衡透析、表面電漿共振及類似方法。例如，如本揭示內容上下文中所用，抗原結合域包括結合特定抗原(例如目標分子[T]或內化效應蛋白[E]或其部分)的多肽，如在表面電漿共振分析中所測量，KD少於約500pM、少於約400pM、少於約300pM、少於約200pM、少於約100pM、少於約90pM、少於約80pM、少於約70pM、少於約60pM、少於約50pM、少於約40pM、少於約30pM、少於約20pM、少於約10pM、少於約5pM、少於約4pM、少於約2pM、少於約1pM、少於約0.5pM、少於約0.2pM、少於約0.1pM，或少於約0.05pM。
術語「表面電漿共振」，如本文所用，意指容許藉由偵測生物感測器基質中的蛋白質濃度變化來分析即時交互作用的光學現象，例如使用BIAcoreTM系統(Biacore Life Sciences division of GE Healthcare,Piscataway,NJ)。
術語「KD」，如本文所用，表示特定蛋白質-蛋白質交互作用(例如抗體-抗原交互作用)的平衡解離常數。除非另有指明，否則本文揭示的KD值意指透過表面電漿共振分析在25℃下所測得的KD值。
如上文所指明，「抗原結合域」(D1及/或D2)可包含抗體或抗體之抗原結合片段，或由其組成。術語「抗體」，如本文所用，表示任何抗原結合分子或分子複合體，其包含至少一個特異地結合至 特定抗原(例如人類MET)或與該特定抗原交互作用之互補決定區(CDR)。術語「抗體」包括免疫球蛋白分子，其含有四條多肽鏈，藉由雙硫鍵交互連結的兩條重(H)鏈以及兩條輕(L)鏈，以及其集合體(例如IgM)。各個重鏈含有一個重鏈可變區(在此縮寫為HCVR或VH」)以及一個重鏈恆定區。重鏈恆定區包含三個結構域CH1、CH2以及CH3。各個輕鏈含有一個輕鏈可變區(在此縮寫為LCVR或VL)以及一個輕鏈恆定區。輕鏈恆定區包含一個結構域(CL1)。VH與VL區可進一步分成具有超變異性的區域(命名為互補決定區(CDR))，其間散佈有較為守恆的區域(命名為骨架區(FR))。各個VH與VL由三個CDR以及四個FR所組成，按下列順序從胺基端往羧基端排列：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。在不同具體例中，本文提供之抗體(或其抗原結合部分)的FR可能與人類生殖系序列相同，或可以經天然或人工修飾。胺基酸一致序列可以依據並行分析兩個或更多個CDR來定義。
本文提供之雙特異性抗原結合分子的D1及/或D2組份可包含完整抗體分子的抗原結合片段或由其組成。術語抗體的「抗原-結合部分」、抗體的「抗原-結合片段」及類似用語如本文所用包括所有天然存在的、以酶所得到的、合成的或經遺傳工程的多肽或醣蛋白，其特異地結合抗原而形成複合體。抗體的抗原結合片段可以使用任何適當的標準技術(諸如蛋白水解消化或涉及操作並表現編碼抗體可變及視情況恆定結構域的DNA之重組遺傳工程技術)而衍生自例如完全抗體分子。此DNA為已知及/或容易由例如商業來源、DNA庫(包括，例如噬菌體-抗體庫)取得或可合成。DNA可以被定序並且以化學方式或藉由使用分子生物學技術操作，例如將一或多個可變結構域及/或恆定結構域排成適當構形，或引入密碼子、產生半胱胺酸殘基、修飾、添加或刪除胺基酸等。
抗原結合片段的非限制性實例包括：(i)Fab片段；(ii)F(ab’)2片段；(iii)Fd片段；(iv)Fv片段；(v)單鏈Fv(scFv)分子；(vi)dAb片段；與(vii)由模擬抗體的超變異區之胺基酸殘基所組成的最小辨識單位(例如經單離的互補決定區(CDR)，諸如CDR3肽)，或限制型FR3-CDR3-FR4肽。其他經工程改造的分子(諸如域特異性抗體、單域 抗體、域刪除抗體、嵌合抗體、CDR-移植抗體、雙抗體、三抗體、四抗體、微抗體、奈米抗體(例如單價奈米抗體、二價奈米抗體等)、小調節分子免疫藥物(SMIP)及鯊魚可變IgNAR域)亦含括在如本文所用詞句「抗原結合片段」中。
抗體的抗原結合片段通常含有至少一個可變域。可變域可以是任何大小與胺基酸組成，且通常含有至少一個鄰近一或多個骨架序列或在一或多個骨架序列框中的CDR。在帶有與VL域締合之VH域的抗原結合片段中，VH以及VL域可相對另一者以任一種適當排列定位。舉例而言，可變區是二聚體且含有VH-VH、VH-VL或VL-VL二聚體。或者，抗體的抗原結合片段可含有單體VH或VL域。
在某些具體例中，抗體的抗原結合片段可含有至少一個共價連結至少一個恆定域的可變域。可以在本發明抗體的抗原結合片段中發現到的可變域與恆定域的非限制例示性構形包括：(i)VH-CH1；(ii)VH-CH2；(iii)VH-CH3；(iv)VH-CH1-CH2；(v)VH-CH1-CH2-CH3；(vi)VH-CH2-CH3；(vii)VH-CL；(viii)VL-CH1；(ix)VL-CH2；(x)VL-CH3；(xi)VL-CH1-CH2；(xii)VL-CH1-CH2-CH3；(xiii)VL-CH2-CH3；以及(xiv)VL-CL。在可變域與恆定域的任一種構形中(包括上面列示的任一種例示性構形)，可變域與恆定域可以是彼此直接連結或藉由完整或部分樞紐或連接子區域而連結。樞紐區是由至少2個(例如5、10、15、20、40、60或更多個)胺基酸所組成，它在單一多肽分子中的相鄰可變域及/或恆定域間產生彈性或半彈性鍵聯。此外，抗原結合片段可包含上列可變域與恆定域構形任一者彼此及/或與一或多個單體VH域或VL域以非共價締合(例藉由雙硫鍵(等))所形成的同型二聚體或異型二聚體(或其他集合體)。
本文提供的雙特異性抗原結合分子可包含人類抗體及/或重組人類抗體或其片段，或由其組成。術語「人類抗體」，如本文所用，欲包括具有衍生自人類生殖系免疫球蛋白序列之可變區及恆定區的抗體。但人類抗體可包括不被人類生殖系免疫球蛋白序列所編碼的胺基酸殘基(例如藉由活體外隨機或定位突變或藉由活體內體突變所引入的突變)，例如在CDR以及尤其在CDR3中。但是，術語「人類 抗體」，如本文所用，不意欲要包括已被移植至人類骨架序列上之衍生自另一種哺乳動物物種(諸如小鼠)之生殖系的CDR序列的抗體。
本揭示內容的雙特異性抗原結合分子可包含重組人類抗體或其抗原結合片段，或由其組成。術語「重組人類抗體」，如本文所用，意欲包括藉由重組方法所製備、表現、創造或分離的所有人類抗體，諸如使用被轉染至宿主細胞中的重組表現載體所表現的抗體(下文進一步說明)、自重組組合型人類抗體庫所分離的抗體(下文進一步說明)、自經人類免疫球蛋白基因(參見，例如Taylor et al.(1992)Nucl.Acids Res.20：6287-6295)轉基因之動物(例如小鼠)分離的抗體，或透過任何其他涉及將人類免疫球蛋白基因序列剪接至其他DNA序列的方法所製備、表現、創造或分離的抗體。此等重組人類抗體具有衍生自人類生殖系免疫球蛋白序列的可變區以及恆定區。但在某些具體例中，此等重組人類抗體經過活體外突變誘發(或者，要是使用經人類Ig序列轉基因的動物時，則為活體內體細胞突變誘發)，且因而重組抗體的VH及VL區的胺基酸序列是若衍生自人類生殖系VH及VL序列且與其有關的序列，並不是天然活體內存在於人類抗體生殖系譜內。
製造雙特異性抗體的方法為技藝中所熟知且可用來建構本文所揭示的雙特異性抗原結合分子。可用於本發明上下文中的其他例示性雙特異性形式包括，但不限於例如，以scFv為基礎或雙抗體雙特異性形式、IgG-scFv融合物、雙重可變域(DVD)-Ig、四價體瘤、洞中紐、共用輕鏈(例如帶有洞中鈕的共有輕鏈等)、CrossMab、CrossFab、(SEED)體、白胺酸拉鍊、Duobody、IgG1/IgG2、雙重作用Fab(DAF)-IgG，以及Mab2雙特異性形式(關於前述形式的回顧參見，例如Klein et al.2012,mAbs 4：6,1-11與其中引用的參考文獻)。
可納入本文提供之MET x MET雙特異性抗原結合分子的例示性抗原結合域(D1與D2)包括衍生自本文揭示之抗-MET抗體任一者的抗原結合域。例如，本揭示內容包括含有D1或D2抗原結合域的MET x MET雙特異性抗原結合分子，D1或D2抗原結合域包含含有選自表1中所列HCVR胺基酸序列任一者之胺基酸序列的HCVR，或其與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性的實質 相似序列。
本文亦提供含有D1或D2抗原結合域的MET x MET雙特異性抗原結合分子，D1或D2抗原結合域包含含有選自表1中所列LCVR胺基酸序列任一者之胺基酸序列的LCVR，或其與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列。
本文提供含有D1或D2抗原結合域的MET x MET雙特異性抗原結合分子，D1或D2抗原結合域包含含有表1中所列HCVR胺基酸序列任一者與表1中所列LCVR胺基酸序列任一者配對的HCVR及LCVR胺基酸序列對(HCVR/LCVR)。依據某些具體例，本發明提供包含D1或D2抗原結合域的MET x MET雙特異性抗原結合分子，D1或D2抗原結合域包含含括在表1中所列例示性抗-MET抗體任一者中的HCVR/LCVR胺基酸序列對。
本文亦提供含有D1或D2抗原結合域的MET x MET雙特異性抗原結合分子，D1或D2抗原結合域包含含有選自表1中所列重鏈CDR1(HCDR1)胺基酸序列任一者之胺基酸序列，或與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列的HCDR1。
亦提供含有D1或D2抗原結合域的MET x MET雙特異性抗原結合分子，D1或D2抗原結合域包含選自表1中所列重鏈CDR2(HCDR2)胺基酸序列任一者之胺基酸序列，或與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列的HCDR2。
亦提供含有D1或D2抗原結合域的MET x MET雙特異性抗原結合分子，D1或D2抗原結合域包含選自表1中所列重鏈CDR3(HCDR3)胺基酸序列任一者之胺基酸序列，或與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列的HCDR3。
亦提供含有D1或D2抗原結合域的MET x MET雙特異性抗原結合分子，D1或D2抗原結合域包含選自表1中所列輕鏈CDR1(LCDR1)胺基酸序列任一者之胺基酸序列，或與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列的LCDR1。
亦提供含有D1或D2抗原結合域的MET x MET雙特異 性抗原結合分子，D1或D2抗原結合域包含選自表1中所列輕鏈CDR2(LCDR2)胺基酸序列任一者之胺基酸序列，或與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列的LCDR2。
亦提供含有D1或D2抗原結合域的MET x MET雙特異性抗原結合分子，D1或D2抗原結合域包含選自表1中所列輕鏈CDR3(LCDR3)胺基酸序列任一者之胺基酸序列，或與其具有至少90%、至少95%、至少98%或至少99%序列一致性的實質相似序列的LCDR3。
亦提供含有D1或D2抗原結合域的MET x MET雙特異性抗原結合分子，D1或D2抗原結合域包含含有表1中所列HCDR3胺基酸序列任一者與表1中所列LCDR3胺基酸序列任一者配對的HCDR3及LCDR3胺基酸序列對(HCDR3/LCDR3)。依據某些具體例，本揭示內容提供抗體或其抗原結合片段，其包含含括在表1中所列例示性抗-MET抗體任一者的HCDR3/LCDR3胺基酸序列對。
亦提供含有D1或D2抗原結合域的MET x MET雙特異性抗原結合分子，其包含一組六個CDR(亦即HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3)，含括在表1中所列例示性抗-MET抗體任一者中。
在一個相關具體例中，本揭示內容提供含有D1或D2抗原結合域的MET x MET雙特異性抗原結合分子，D1或D2抗原結合域包含一組六個CDR(亦即HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3)，含括在表1中所列例示性抗-MET抗體任一者所界定之HCVR/LCVR胺基酸序列對中。
本文提供的MET x MET雙特異性抗原結合分子可包含衍生自表1之抗-MET抗體任一者的D1抗原結合域，以及衍生自表1之其他抗-MET抗體任一者的D2抗原結合域。本揭示內容之MET x MET雙特異性抗體的非限制性實例描繪於圖1中。圖1是一個陣列，說明272個例示性MET x MET雙特異性抗體的構成要素。陣列的每一個經編號小格(編號1至272)識別為一個獨特的雙特異性抗體，其包含「D1」抗原結合域以及「D2」抗原結合域，其中D1抗原結合域包含沿著Y軸列出對應抗-MET抗體之免疫球蛋白可變域(HCVR/LCVR胺 基酸序列對)或CDR，且其中D2抗原結合域包含沿著X軸列出對應抗-MET抗體之免疫球蛋白可變域(HCVR/LCVR胺基酸序列對)或CDR。因此，例如在矩陣中顯示為「10號」的MET x MET雙特異性抗原結合分子包含一個D1抗原結合域(含有例示性抗-MET抗體H4H13290P2的HCVR/LCVR對，或6-CDR組)，以及一個D2抗原結合域(含有例示性抗-MET抗體H4H13321P2的HCVR/LCVR對，或6-CDR組)。本文提供之其他MET x MET雙特異性抗體實例描述於本文實例4中。
作為非限制性說明實例，本揭示內容包括MET x MET雙特異性抗原結合分子，其包含D1抗原結合域以及D2抗原結合域，其中D1抗原結合域包含SEQ ID NO：58/138的HCVR/LCVR胺基酸序列對，或包含SEQ ID NO：60-62-64-140-142-144的一組重鏈與輕鏈CDR(HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3)，且其中D2抗原結合域包含SEQ ID NO：82/138的HCVR/LCVR胺基酸序列對或含有SEQ ID NO：84-86-88-140-142-144的一組重鏈與輕鏈CDR(HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3)。一個具有這些序列特徵的例示性MET x MET雙特異性抗體是被命名為H4H14639D的雙特異性抗體，又稱為雙特異性抗體122號，其含有衍生自H4H13306P2的D1以及衍生自H4H13312P2的D2(參見本文實例4，表5)。
作為非限制性說明實例，本揭示內容包括MET x MET雙特異性抗原結合分子，其包含D1抗原結合域以及D2抗原結合域，其中D1抗原結合域包含SEQ ID NO：18/138的HCVR/LCVR胺基酸序列對或包含SEQ ID NO：20-22-24-140-142-144的一組重鏈與輕鏈CDR(HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3)，且其中D2抗原結合域包含SEQ ID NO：82/138的HCVR/LCVR胺基酸序列對或包含SEQ ID NO：84-86-88-140-142-144的一組重鏈與輕鏈CDR(HCDR1-HCDR2-HCDR3-LCDR1-LCDR2-LCDR3)。一個具有這些序列特徵的例示性MET x MET雙特異性抗體是被命名為H4H14635D的雙特異性抗體，又稱為雙特異性抗體42號，其含有衍生自H4H13295P2的D1以及衍生自H4H13312P2的D2(參見本文實例4，表5)。
集合體化組份(multimerizing components)
在某些具體例中，本文提供的雙特異性抗原結合分子亦可包含一或多個集合體化組份。集合體化組份可發揮維持抗原結合域(D1與D2)之間締合的功能。如本文所用，「集合體化組份」可以是任何能夠與相同或類似結構或組成的第二集合體化組份締合的巨分子、蛋白質、多肽、肽或胺基酸。例如，集合體化組份可以是包含免疫球蛋白CH3域的多肽。集合體化組份的非限制性實例為免疫球蛋白的Fc部分，例如選自同型IgG1、IgG2、IgG3和IgG4之IgG的Fc域，以及各同型群組裡的任何異型。在某些具體例中，集合體化組份可以是Fc片段或具有1至約200個胺基酸長度的胺基酸序列，其含有至少一個半胱胺酸殘基。在其他具體例中，集合體化組份為半胱胺酸殘基，或含有半胱胺酸的短肽。其他集合體化結構域包括含有白胺酸拉鍊、螺旋環模體或螺旋模體或由其組成的肽或多肽。
在某些具體例中，本文提供的雙特異性抗原結合分子包含兩個集合體化結構域M1和M2，其中D1附接至M1而D2附接至M2，且其中M1與M2締合促使D1和D2彼此物理鍵結成一個單一雙特異性抗原結合分子。在某些具體例中，M1和M2彼此相同。例如，M1可以是具有特定胺基酸序列的Fc域，而M2是具有與M1相同之胺基酸序列的Fc域。或者，M1與M2彼此可能在一或多個胺基酸位置處有不同。例如M1可包含第一免疫球蛋白(Ig)CH3域而M2可包含第二Ig CH3域，其中第一Ig CH3域與第二Ig CH3彼此有至少一個胺基酸不同，且其中相較於具有相同M1和M2序列的參考建構物，至少一個胺基酸差異會降低標靶建構物對蛋白A的結合。在一個具體例中，M1的Ig CH3域結合蛋白A而M2的Ig CH3域含有一個會降低或消除蛋白A結合的突變，諸如H95R修飾(依據IMGT外顯子編號；依據EU編號為H435R)。可在M2之CH3中找到的更多修飾包括：在IgG1 Fc域的情況下為D16E、L18M、N44S、K52N、V57M和V82I(依據IMGT；依據EU為D356E、L358M、N384S、K392N、V397M和V422I)；在IgG2 Fc域的情況下為N44S、K52N和V82I(IMGT；依據EU為N384S、K392N和V422I)；以及在IgG4 Fc域的情況下為Q15R、N44S、K52N、V57M、 R69K、E79Q和V82I(依據IMGT；依據EU為Q355R、N384S、K392N、V397M、R409K、E419Q和V422I)。
本揭示內容之雙特異性抗原結合分子可以是「經分離」。「經分離雙特異性抗原結合分子」，如本文所用，表示已被鑑定且自其天然環境的至少一個組份被分離及/或回收的雙特異性抗原結合分子。例如已自生物體的至少一個組份或自抗體所生產的組織或細胞中分離或移出的雙特性抗體，就是本揭示內容的「經分離雙特異性抗體」。經分離雙特異性抗原結合分子也包括重組細胞內的原位分子。經分離雙特異性抗原結合分子是已經過至少一個純化或分離步驟的分子。依據某些具體例，經分離雙特異性抗原結合分子可以是實質上不含細胞材料及/或化學品。
相較於抗原結合蛋白或抗原結合域衍生而來的對應生殖系序列，本文揭示的雙特異性抗原結合分子或其抗原結合域(D1及/或D2)可在重鏈及輕鏈可變域之骨架及/或CDR區中含有一或多個胺基酸置換、插入及/或刪除。此等突變可透過將本文所揭示之胺基酸序列與可得自例如公開抗體序列資料庫的生殖系序列相比對而輕易確認。本揭示內容包括本文揭示之雙特異性抗原結合分子抗體或其抗原-結合域(D1及/或D2)，其等是衍生自本文所揭示的任一胺基酸序列，其中一或多個骨架及/或CDR區中的一或多個胺基酸突變成抗體衍生而來之生殖系序列的對應殘基，或突變成另一個人類生殖系序列的對應殘基，或突變成對應生殖系殘基的守恆性胺基酸置換(此等序列改變在本文中全意指為「生殖系突變」)。
從本文揭示的重鏈與輕鏈可變區序列開始，本技藝中具有通常技術者可輕易製造出許多含有一或多個個別生殖系突變或其組合的雙特異性抗原結合分子或其抗原結合域(D1及/或D2)。在某些具體例中，VH及/或VL結構域中的所有骨架及/或CDR殘基突變回復成抗體衍生而來之原有生殖系序列中發現的殘基。在其他具體例中，僅有某些殘基突變回復成原有生殖系序列，例如僅有在FR1的前8個胺基酸中或FR4的後8個胺基酸中所發現的突變殘基，或僅有在CDR1、CDR2或CDR3中所發現的突變殘基。在其他具體例中，骨架及/或CDR殘基 中的一或多者突變成不同生殖系序列(亦即不同於抗體原先衍生而來之生殖系序列的生殖系序列)的對應殘基。
此外，本揭示內容之雙特異性抗原結合分子或其抗原結合域(D1及/或D2)可含有骨架及/或CDR區中之兩個或更多個生殖系突變的任何組合，例如其中某些個別殘基突變成特定生殖系序列的對應殘基，而不同於原有生殖系序列的某些其他殘基維持不變或突變成不同生殖系序列的對應殘基。在得到後，含有一或多個生殖系突變的雙特異性抗原結合分子及其抗原-結合域(D1及/或D2)可針對一或多種期望特性(諸如結合特異性增進、結合親和力增加、拮抗或促效生物特性增進或提高(視情況而定)、免疫原性降低等)來進行簡易測試。以此一般方式所得到的雙特異性抗原結合分子或其抗原結合域(D1及/或D2)含括在本揭示內容中。
變異體
本揭示內容亦包括抗-MET抗體及雙特異性抗原結合分子，其包含本文揭示HCVR、LCVR及/或CDR胺基酸序列任一者的變異體。此態樣中所涵括的例示性變異體包括帶有一或多個守恆性置換之本文揭示的HCVR、LCVR及/或CDR胺基酸序列任一者的變異體。例如，本揭示內容包括具有HCVR、LCVR，及/或CDR胺基酸序列相對於本文表1中所示之HCVR、LCVR及/或CDR胺基酸序列任一者有例如10個或更少、8個或更少、6個或更少、4個或更少個等守恆性胺基酸置換的抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗原結合分子。
本揭示內容此態樣中所含括的例示性變異體亦包括與本文揭示之HCVR、LCVR及/或CDR胺基酸序列任一者具有實質序列一致性的變異體。如本文在胺基酸序列的上下文中所用，術語「實質一致性」或「實質上一致」表示當兩個肽序列最佳地排列時(諸如按照程式GAP或BESTFIT使用預設空位權重)，共有至少95%、98%或99%序列一致性。在某些具體例中，不相同的殘基位置因為守恆性胺基酸置換而有所差異。「守恆性胺基酸置換」是一個胺基酸殘基被置換成另一個帶有類似化學性質(例如電荷或疏水性)之側鏈(R基團)的胺基酸殘基。一般來說，守恆性胺基酸置換大體上不會改變蛋白質的功能性質。 在兩個或更多個胺基酸序列因為守恆性置換而彼此不同的情況下，序列一致性百分率或相似性程度可以向上調整而校正置換的守恆性質。用來進行這個調整的方法對於習於該技藝者來說是熟知的。參見，例如Pearson(1994)Methods Mol.Biol.24：307-331，其以引用的方式併入本文。帶有具類似化學性質的側鏈之胺基酸的群組實例包括(1)脂肪族側鏈：甘胺酸、丙胺酸、纈胺酸、白胺酸與異白胺酸；(2)脂肪族-羥基側鏈：絲胺酸與蘇胺酸；(3)含醯胺的側鏈：天冬醯胺酸與麩醯胺酸；(4)芳族側鏈：苯丙胺酸、酪胺酸與色胺酸；(5)鹼性側鏈：離胺酸、精胺酸與組胺酸；(6)酸性側鏈：天冬胺酸與麩胺酸；以及(7)含硫側鏈為半胱胺酸與甲硫胺酸。較佳的守恆性胺基酸置換基團為：纈胺酸-白胺酸-異白胺酸、苯丙胺酸-酪胺酸、離胺酸-精胺酸、丙胺酸-纈胺酸、天冬胺酸-麩胺酸，以及天冬醯胺酸-麩醯胺酸。或者，守恆性取代可以是任何在Gonnet et al.(1992)Science 256：1443-1445中揭示的PAM250對數-相似性矩陣中具有正值的變化。「中度守恆」取代是任何在PAM250對數-相似性矩陣中具有非負值的改變。
兩個不同胺基酸序列之間的序列一致性通常是使用序列分析軟體來測量。序列分析軟體使用分派給各種置換、刪除以及其他修飾(包括守恆性胺基酸置換)的相似性測量值來配對相似序列。例如，GCG軟體含有諸如GAP與BESTFIT的程式，它們可以與預設參數一起用來決定關係相近之多肽(諸如來自於不同物種之生物的同源多肽)或野生型蛋白質與其突變蛋白質之間的序列同源性或序列一致性。參見，例如GCG第6.1版。多肽序列也可以使用採預設或建議參數的FASTA(一種在GCG第6.1版中的程式)來進行比對。FASTA(例如FASTA2與FASTA3)提供查詢以及研究序列之間最佳重疊區域的排列以及百分率序列一致性(Pearson(2000)上文)。當要將本文提供的序列與含有大量來自不同生物之序列的資料庫比對時，另一個較佳的演算法是電腦程式BLAST，特別是BLASTP或TBLASTN，使用預設參數。參見，例如Altschul et al.(1990)J.Mol.Biol.215：403-410及Altschul et al.(1997)Nucleic Acids Res.25：3389-402，其各自以引用的方式併入本文。
包含Fc變異體的抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗原結合分子
依據本文提供的某些具體例，提供抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含含有一或多個突變的Fc域，該一或多個突變提高或減少抗體結合至FcRn受體，例如在與中性pH相比更酸的pH下。舉例而言，本揭示內容包括抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其在Fc域的CH2或CH3區中含有突變，其中該(等)突變在酸性環境(例如在胞內體中，pH範圍為約5.5至約6.0)下增加Fc域對FcRn的親和力。當被投與給動物時，此等突變可使得抗體的血清半衰期增加。此等Fc修飾的非限制性實例包括，例如在下列位置處的修飾：250(例如，E或Q)；250與428(例如，L或F)；252(例如，L/Y/F/W或T)、254(例如，S或T)，及256(例如，S/R/Q/E/D或T)；或在位置428及/或433處的修飾(例如，H/L/R/S/P/Q或K)及/或434的修飾(例如H/F或Y)；或在位置250及/或428處的修飾；或在位置307或308處的修飾(例如，308F、V308F)，以及434。在一個具體例中，修飾包含428L(例如M428L)以及434S(例如N434S)修飾；428L、259I(例如V259I)，以及308F(例如V308F)修飾；433K(例如H433K)以及434(例如434Y)修飾；252、254，以及256(例如252Y、254T，及256E)修飾；250Q及428L修飾(例如T250Q及M428L)；與307及/或308修飾(例如308F或308P)。
舉例而言，本揭示內容包括含有一個Fc域的抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，該Fc域包含一或多對或一或多群選自下列組成之群的突變：250Q與248L(例如，T250Q與M248L)；252Y、254T與256E(例如，M252Y、S254T與T256E)；428L與434S(例如，M428L與N434S)；以及433K與434F(例如，H433K與N434F)。前述Fc域突變以及本文揭示抗體可變域內其他突變的所有可能組合為本揭示內容範疇內所能預期。
本文提供之抗原結合分子的生物特徵
本文提供以高親和力結合單體人類MET的抗體及其抗原結合片段。例如，如藉由表面電漿共振在25℃下或在37℃下所測量(例如使用本文實例3中所界定的分析形式或實質相似的分析)，本揭示 內容包括以少於230nM的KD結合單體人類MET(例如hMET.mmh)的抗-MET抗體。依據某些具體例，提供在37℃下以少於約230nM、少於約200nM、少於約150nM、少於約100nM、少於約50nM、少於約25nM、少於約20nM、少於約10nM、少於約8nM、少於約6nM、少於約5nM、少於約4nM或少於約3nM的KD結合單體人類MET的抗-MET抗體，如藉由表面電漿共振所測定，例如使用如本文實例3中所界定的分析形式或實質相似的分析。
本揭示內容亦包括如藉由表面電漿共振在25℃下或在37℃下所測量(例如使用本文實例3中所界定的分析形式或實質相似的分析)以大於約1分鐘的解離半衰期(t½)結合單體人類MET(例如hMET.mmh)的抗體及其抗原結合片段。依據某些具體例，提供在37℃下以大於約1分鐘、大於約2分鐘、大於約4分鐘、大於約6分鐘、大於約8分鐘、大於約10分鐘、大於約12分鐘、大於約14分鐘、大於約16分鐘、大於約18分鐘，或大於約20分鐘或更久的t½結合單體人類MET的抗-MET抗體，如藉由表面電漿共振所測定，例如使用如本文實例3中所界定的分析形式或實質相似的分析。
本文提供以高親和力結合二聚體人類MET(例如hMET.mFc)的抗體及其抗原結合片段。例如，如藉由表面電漿共振在25℃下或在37℃下所測量(例如使用本文實例3中所界定的分析形式或實質相似的分析)，本揭示內容包括以少於約3nM的KD結合二聚體人類MET的抗-MET抗體。依據某些具體例，提供在37℃下以少於約3nM、少於約2nM、少於約1nM、少於約0.9nM、少於約0.8nM、少於約0.7nM、少於約0.6nM、少於約0.5nM、少於約0.4nM、少於約0.3nM或少於約0.25nM的KD結合二聚體人類MET的抗-MET抗體，如藉由表面電漿共振所測定，例如使用如本文實例3中所界定的分析形式或實質相似的分析。
本文亦提供如藉由表面電漿共振在25℃下或在37℃下所測量(例如使用本文實例3中所界定的分析形式或實質相似的分析)以大於約4分鐘的解離半衰期(t½)結合二聚體人類MET(例如hMET.mFc)的抗體及其抗原結合片段。依據某些具體例，提供在37℃ 下以大於約4分鐘、大於約5分鐘、大於約10分鐘、大於約20分鐘、大於約30分鐘、大於約40分鐘、大於約50分鐘、大於約60分鐘、大於約70分鐘、大於約80分鐘、大於約90分鐘、大於約100分鐘、大於約105分鐘或更久的t½結合二聚體人類MET的抗-MET抗體，如藉由表面電漿共振所測定，例如使用如本文實例3中所界定的分析形式或實質相似的分析。
本文亦提供如藉由表面電漿共振在25℃下或在37℃下所測量(例如使用本文實例5中所界定的分析形式或實質相似的分析)以大於約10分鐘的解離半衰期(t½)結合二聚體人類MET(例如hMET.mFc)的MET x MET雙特異性抗原結合蛋白。依據某些具體例，提供在37℃下以大於約10分鐘、大於約20分鐘、大於約30分鐘、大於約40分鐘、大於約50分鐘、大於約60分鐘、大於約70分鐘、大於約80分鐘、大於約90分鐘、大於約100分鐘、大於約200分鐘、大於約300分鐘、大於約400分鐘、大於約500分鐘、大於約600分鐘、大於約700分鐘、大於約800分鐘、大於約900分鐘、大於約1000分鐘、大於約1100分鐘或更久的t½結合二聚體人類MET的MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，如藉由表面電漿共振所測定，例如使用如本文實例5中所界定的分析形式或實質相似的分析。
本文亦提供抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其在例如活體外配體結合分析中阻斷HGF與MET之間的交互作用。依據本文提供的某些具體例，提供阻斷HGF結合至表現人類MET之細胞並且在HGF傳訊不存在的情況下引起最少或無MET活化的MET x MET雙特異性抗原結合蛋白。例如，本揭示內容提供MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其在以細胞為基礎的MET活性報導子分析(cell-based MET acitivity reporter assay)中展現出的MET促效劑活性程度比在使用僅含有D1或D2之單特異性抗體的相同活性報導子分析中觀察到的MET促效劑活性還少於50%、少於40%、少於30%、少於20%、少於10%、少於5%、少於3%、少於2%或少於1%。
本揭示內容的抗體及抗原結合蛋白可具有一或多個前述生物特徵或其任何組合。抗體的先前生物特徵列表不希望是排他 的。本文提供之抗體的其他生物學特徵對於習於技藝者在回顧包括本文工作實例的揭示內容之後將會是清楚的。
抗體-藥物接合物(ADC)
本文提供抗體-藥物接合物(ACD)，其包含結合至治療部分的抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，治療部分為諸如細胞毒性劑、化療藥物或放射性同位素。
細胞毒性劑包括任何對細胞的生長、生存力或增殖有害的藥劑，包括但不限於微管蛋白交互作用劑以及DNA損傷劑。可與本揭示內容此態樣之抗MET抗體結合之適宜細胞毒性劑以及化療劑的實例包括例如1-(2氯乙基)-1,2-二甲磺醯基肼、1,8-二羥基-二環并[7.3.1]十三-4,9-二烯-2,6-二炔-13-酮、1-去氫睪固酮、5-氟尿嘧啶、6-巰嘌呤、6-硫鳥嘌呤、9-胺基喜樹鹼(9-amino camptothecin)、放線菌素D(actinomycin D)、瓢菌素(amanitins)、胺喋呤(aminopterin)、蛇行菌素(anguidine)、蒽環(anthracycline)、安曲黴素(anthramycin)(AMC)、奧瑞他汀(auristatins)、博萊黴素(bleomycin)、白消安(busulfan)、丁酸、卡其黴素(calicheamicins)(例如卡其黴素γ1)、喜樹鹼、洋紅黴素(carminomycins)、卡莫司汀(carmustine)、西馬多汀(cemadotins)、順鉑(cisplatin)、秋水仙鹼(colchicine)、考布他汀(combretastatins)、環磷醯胺(cyclophosphamide)、阿糖胞苷(cytarabine)、細胞鬆弛素B(cytochalasin B)、放線菌素D(dactinomycin)、道諾黴素(daunorubicin)、達卡巴仁(decarbazine)、二乙醯氧基戊基阿黴素(diacetoxypentyldoxorubicin)、二溴甘露醇(dibromomannitol)、二羥基蒽二酮(dihydroxy anthracin dione)、地索拉唑(disorazoles)、多拉司他汀(dolastatin)(例如多拉司他汀10)、阿黴素(doxorubicin)、倍癌黴素(duocarmycin)、棘黴素(echinomycin)、艾榴塞洛素(eleutherobin)、依米丁(emetine)、埃博黴素(epothilone)、埃斯培拉黴素(esperamicin)、雌莫司汀(estramustines)、溴化乙錠(ethidium bromide)、依托泊苷(etoposide)、氟尿嘧啶、格爾德黴素(geldanamycins)、短桿菌肽D(gramicidin D)、糖皮質素、伊立替康(irinotecans)、致動蛋白紡錘蛋白(KSP)抑制劑、來普黴素(leptomycin)、白諾生(leurosine)、利多卡因 (lidocaine)、洛莫司汀(lomustine)(CCNU)、類美登素(maytansinoid)、甲基二(氯乙基)胺(mechlorethamine)、美法侖(melphalan)、巰嘌呤(mercatopurine)、每索特(methopterins)、胺甲喋呤(methotrexate)、光輝黴素(mithramycin)、絲裂黴素(mitomycin)、雙羥蒽醌(mitoxantrone)、N8-乙醯基精三胺、鬼臼毒素(podophyllotoxins)、普魯卡因(procaine)、心得安(propranolol)、喋啶(pteridines)、嘌呤黴素(puromycin)、吡咯并苯并二氮呯(pyrrolobenzodiazepines)(PBDs)、利索新(rhizoxins)、鏈脲佐菌素(streptozotocin)、太利蘇黴素(tallysomycins)、紫杉醇(taxol)、替尼泊苷(tenoposide)、丁卡因(tetracaine)、噻替哌(thioepa)瘤可寧(chlorambucil)、富山黴素(tomaymycin)、托泊替康(topotecan)、溶管素(tubulysin)、長春鹼(vinblastine)、長春新鹼(vincristine)、長春地辛(vindesine)、溫諾平(vinorelbine)，以及前述任一者的衍生物。依據某些具體例，與抗-MET抗體結合的細胞毒性劑為類美登素(諸如DM1或DM4)、富山黴素衍生物或多拉司他汀衍生物。依據某些具體例，與抗-MET抗體結合的細胞毒性劑為奧瑞他汀，諸如MMAE、MMAF或其衍生物。技藝中已知的其他細胞毒性劑為本揭示內容範疇內所能預期，包括例如蛋白質毒素，例如蓖麻毒蛋白(ricin)、艱難梭狀芽孢桿菌(C.difficile)毒素、假單孢菌外毒素(pseudomonas exotoxin)、蓖麻毒蛋白、白喉毒素(diphtheria toxin)、肉毒桿菌毒素、異株瀉根毒蛋白(bryodin)、皂素(saporin)、商陸毒素(pokeweed toxins)(亦即商陸毒素(phytolaccatoxin)與phytolaccigenin)，以及諸如那些在Sapra et al.,Pharmacol.& Therapeutics,2013,138：452-469中所列舉者。
在某些具體例中，細胞毒性劑為類美登素，例如美登素(maytansine)的衍生物。適宜的類美登素包括DM1、DM4或其衍生物、立體異構物或同位素物。適宜的類美登素還包括，但不限於那些揭示於WO 2014/145090A1、WO 2015/031396A1、US 2016/0375147A1以及US 2017/0209591A1中者，其以全文引用的方式併入本文。
在一些具體例中，類美登素具有以下結構：
Figure 106139257-A0202-12-0031-482
其中A為視情況經取代的伸芳基或伸雜芳基。
在一些具體例中，類美登素具有以下結構：
Figure 106139257-A0202-12-0031-483
其中A為視情況經取代的伸芳基或伸雜芳基。
在一些具體例中，類美登素具有以下結構：
Figure 106139257-A0202-12-0031-484
其中n為1至12的整數而R1為烷基。
在一些具體例中，類美登素為：
Figure 106139257-A0202-12-0031-485
Figure 106139257-A0202-12-0032-486
Figure 106139257-A0202-12-0033-487
Figure 106139257-A0202-12-0034-488
Figure 106139257-A0202-12-0035-489
在一些具體例中類美登素為：
Figure 106139257-A0202-12-0035-490
在一些具體例中，類美登素為：
Figure 106139257-A0202-12-0035-491
本文亦提供抗體-放射性核種接合物(ARC)，其包含結合至一或多個放射性核種的抗-MET抗體。可用於本態樣上下文中的例示性放射性核種包括，但不限於例如225Ac、212Bi、213Bi、131I、186Re、227Th、222Rn、223Ra、224Ra以及90Y。
在本文提供的某些具體例中，提供包含經由連接子分子結合至細胞毒性劑(例如上文揭示任一細胞毒性劑)的抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合蛋白。連接子是將本文所述抗體或抗原結合蛋白與治療部分(例如細胞毒性劑)連接、結合或鍵結的任何基團或部分。適宜連接子可在例如Antibody-Drug Conjugates and Immunotoxins；Phillips,G.L.,Ed.；Springer Verlag：New York,2013；Antibody-Drug Conjugates；Ducry,L.,Ed.；Humana Press,2013；Antibody-Drug Conjugates；Wang,J.,Shen,W.-C.,and Zaro,J.L.,Eds.； Springer International Publishing,2015中找到，其整體內容各自以引用的方式併入本文。大體上，用於本文所述抗體接合物的適宜結合劑連接子是那些足夠穩定到利用抗體的循環半衰期，且同時能夠在接合物的抗原媒介之內化後釋放其藥物者。連接子可為可切割或不可切割。可切割連接子包括可在內化之後因為細胞內代謝而被切割的連接子，例如經由水解、還原或酶反應的切割。非可切割連接子包括在內化之後經由溶小體降解抗體而釋放附接藥物的連接子。適宜連接子包括，但不限於酸不穩定性連接子、水解不穩定性連接子、酶可切割連接子、還原不穩定連接子、自毀性連接子以及非可切割連接子。適宜連接子可包括，但不限於那些是或包含肽、葡萄糖醛酸苷、丁二醯亞胺-硫醚、聚乙二醇(PEG)單元、腙、mal-己醯單元、二肽單元、纈胺酸-瓜胺酸單元以及對-胺基苯甲基(PAB)單元。
技藝中已知的任何連接子分子或連接子技術可用於創造或建構本揭示內容的ADC。在某些具體例中，連接子為可切割連接子。依據其他具體例，連接子為非可切割連接子。可用於本揭示內容上下文的例示性連接子包括含有例如MC(6-順丁烯二醯亞胺己醯基)、MP(順丁烯二醯亞胺丙醯基)、val-cit(纈胺酸-瓜胺酸)、val-ala(纈胺酸-丙胺酸)、蛋白酶可切割連接子中的二肽、ala-phe(丙胺酸-苯丙胺酸)、蛋白酶可切割連接子中的二肽、PAB(p-胺基苯甲基氧基羰基)、SPP(N-丁二醯亞胺基4-(2-吡啶基硫基)戊酸酯)、SMCC(N-丁二醯亞胺基4-(N-順丁烯二醯亞胺甲基)環己烷-1甲酸酯)、SIAB(N-丁二醯亞胺基(4-碘-乙醯基)胺基苯甲酸酯)，及其變異體與組合，或由上述組成。可用於本揭示內容上下文的其他連接子實例提供於例如在US 7,754,681以及Ducry,Bioconjugate Chem.,2010,21：5-13與其中引用的參考文獻中，其內容以整體引用的方式併入本文。
在某些具體例中，連接子在生理條件下是穩定的。在某些具體例中，連接子是可切割的，例如能夠在酶存在下或在特定pH範圍或pH值下釋放出至少藥物部分。在一些具體例中，連接子包含酶可切割部分。說明性酶可切割部分包括，但不限於肽鍵、酯鍵結、腙以及雙硫鍵結。在一些具體例中，連接子包含細胞自溶酵素可切割的 連接子。
在一些具體例中，連接子包含非可切割部分。
適宜的連接子還包括，但不限於那些以化學的方式鍵結至單一結合劑(例如抗體)的兩個半胱胺酸殘基。此等連接子可模擬因為結合過程而破裂的抗體雙硫鍵。
在一些具體例中，連接子包含一或多個胺基酸。適宜的胺基酸包括天然、非天然、標準、非標準、蛋白質(proteinogenic)、非蛋白質，以及L-或D-α-胺基酸。在一些具體例中，連接子包含丙胺酸、纈胺酸、甘胺酸、白胺酸、異白胺酸、甲硫胺酸、色胺酸、苯丙胺酸、脯胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、半胱胺酸、酪胺酸、天冬醯胺酸、麩醯胺酸、天冬胺酸、麩胺酸、離胺酸、精胺酸、組胺酸或瓜胺酸、其衍生物，或其組合。在某些具體例中，胺基酸的一或多個側鏈連接至側鏈基團，如上文所述。在一些具體例中，連接子包含纈胺酸及瓜胺酸。在一些具體例中，連接子包含離胺酸、纈胺酸以及瓜胺酸。在一些具體例中，連接子包含離胺酸、纈胺酸，以及丙胺酸。在一些具體例中，連接子包含纈胺酸以及丙胺酸。
在一些具體例中，連接子包含自毀性基團。自毀性基團可以是任何此類為習於技藝者已知的基團。在特定具體例中，自毀性基團為p-胺基苯甲基(PAB)或其衍生物。可用的衍生物包括p-胺基苯甲基氧基羰基(PABC)。那些習於技藝者將認知到，自毀性基團能夠進行將連接子之其餘原子從藥物釋放出來的化學反應。
在一些具體例中，連接子為：
Figure 106139257-A0202-12-0037-492
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0037-493
為至抗體或抗原結合蛋白的鍵(例如經由離胺酸殘基)，而
Figure 106139257-A0202-12-0037-494
為至細胞毒性劑(例如DM1)的鍵。在一些具體例中，連接子為：
Figure 106139257-A0202-12-0038-495
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0038-500
為至抗體或抗原結合蛋白的鍵(例如經由離胺酸殘基)，而
Figure 106139257-A0202-12-0038-501
為至細胞毒性劑(例如DM2)的鍵。在某些具體例中，連接子為：
Figure 106139257-A0202-12-0038-496
在某些具體例中，連接子為：
Figure 106139257-A0202-12-0038-497
在一些具體例中，連接子衍生自順丁烯二醯亞胺基甲基-4-反-環己烷羧基丁二酸酯：
Figure 106139257-A0202-12-0038-498
在一些具體例中，連接子為：
Figure 106139257-A0202-12-0038-499
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0038-503
為至抗體或抗原結合蛋白的鍵(例如經由離胺酸殘基)，而
Figure 106139257-A0202-12-0038-502
為至細胞毒性劑(例如具有下式的化合物)的鍵
Figure 106139257-A0202-12-0039-504
本揭示內容包含ADC，其中連接子透過附接在抗體或抗原結合分子內的一個特定胺基酸而將抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合蛋白連接至藥物或細胞毒素。可用於此態樣上下文的例示性胺基酸附接為例如離胺酸(參見，例如US 5,208,020；US 2010/0129314；Hollander et al.,Bioconjugate Chem.,2008,19：358-361；WO 2005/089808；US 5,714,586；US 2013/0101546；與US 2012/0585592)、半胱胺酸(參見，例如US 2007/0258987；WO 2013/055993；WO 2013/055990；WO 2013/053873；WO 2013/053872；WO 2011/130598；US 2013/0101546；與US 7,750,116)、硒基半胱胺酸(參見，例如WO 2008/122039；與Hofer et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,2008,105：12451-12456)、甲醯基甘胺酸(參見，例如Carrico et al.,Nat.Chem.Biol.,2007,3：321-322；Agarwal et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.,USA,2013,110：46-51，與Rabuka et al.,Nat.Protocols,2012,10：1052-1067)、非天然胺基酸(參見，例如WO 2013/068874與WO 2012/166559)，以及酸性胺基酸(參見，例如WO 2012/05982)。連接子也可以經由附接至碳水化合物而結合至抗原結合蛋白(參見，例如US 2008/0305497、WO 2014/065661與Ryan et al.,Food & Agriculture Immunol.,2001,13：127-130)以及雙硫連接子(參見，例如WO 2013/085925、WO 2010/010324、WO 2011/018611與Shaunak et al.,Nat.Chem.Biol.,2006,2：312-313)。位點特異性結合技術亦可用於直接引導至抗體或抗原結合蛋白的特定殘基(參見，例如Schumacher et al.J Clin Immunol(2016)36(Suppl 1)：100)。位點特異性結合技術包括，但不限於經由轉麩醯胺 酸酶的麩醯胺酸結合(參見，例如Schibli,Angew Chemie Inter Ed.2010,49,9995)。
依據某些具體例，本揭示內容提供ADC，其中如本文所述的抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合蛋白結合至如國際專利公開案WO2014/145090中所列舉的連接子-藥物組合物(例如化合物「7」，在本文又稱為「M0026」並在下文說明)，其揭示內容以整體引用的方式併入本文：
Figure 106139257-A0202-12-0040-505
本文亦提供包含本文所揭示之單特異性抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗體的抗體-藥物接合物，其中該抗抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗體結合至細胞毒性劑。在某些具體例中，細胞毒性劑為類美登素。在某些具體例中，類美登素為具有下式的化合物：
Figure 106139257-A0202-12-0040-506
 其中n為1至12的整數而R1為烷基。在某些具體例中，類美登素為
Figure 106139257-A0202-12-0041-507
 在某些具體例中，細胞毒性劑為類美登素，且類美登素經由非可切割連接子共價附接至抗體。在某些具體例中，細胞毒性劑為類美登素，且類美登素經由可切割連接子共價附接至抗體。
在一個具體例中，抗體結合至：
Figure 106139257-A0202-12-0041-508
 其中，
Figure 106139257-A0202-12-0041-510
為至抗體之鍵。
在一個具體例中，抗體結合至：
Figure 106139257-A0202-12-0041-509
 其中，
Figure 106139257-A0202-12-0041-511
為至抗體之鍵。
在一個具體例中，抗體結合至：
Figure 106139257-A0202-12-0042-512
 其中，
Figure 106139257-A0202-12-0042-514
為至抗體之鍵。
在一個具體例中，抗體結合至：
Figure 106139257-A0202-12-0042-513
 其中，
Figure 106139257-A0202-12-0042-515
為至抗體之鍵。
在一些具體例中，接合物具有以下結構：Ab-[L-Pay]n
其中：Ab為如本文所揭示的抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合蛋白；L為連接子；Pay為細胞毒性劑；以及n為1至10的整數。
在一些具體例中，Ab為抗-MET抗體，其包含落在SEQ ID NO：82/138之HCVR/LCVR胺基酸序列對內的CDR。在一些具體例中，Ab為抗-MET抗體，其包含SEQ ID NO：82的HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：138的LCVR胺基酸序列。
在一些具體例中，Ab為MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含落在SEQ ID NO：58之D1-HCVR胺基酸序列內的CDR以及落在SEQ ID NO：82之D2-HCVR胺基酸序列內的CDR。在一些態樣中，MET x MET雙特異性抗原結合蛋白進一步包含落在SEQ ID NO：138之LCVR胺基酸序列內的CDR。在一些具體例中，Ab為MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含落在SEQ ID NO：58內之D1-HCVR胺基酸序列以及落在SEQ ID NO：82內之D2-HCVR胺基酸序列。在一些態樣中，MET x MET雙特異性抗原結合蛋白進一步包含SEQ ID NO：138之LCVR胺基酸序列。
在一些具體例中，Ab為MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含落在SEQ ID NO：18之D1-HCVR胺基酸序列內的CDR以及落在SEQ ID NO：82之D2-HCVR胺基酸序列內的CDR。在一些態樣中，MET x MET雙特異性抗原結合蛋白進一步包含落在SEQ ID NO：138之LCVR胺基酸序列內的CDR。在一些具體例中，Ab為MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含SEQ ID NO：18之D1-HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：82之D2-HCVR胺基酸序列。
在一些具體例中，L為可切割連接子。在一些具體例中，L為非可切割連接子。在一些具體例中，L包含二肽。在一些具體例中，L包含PAB部分。
在一些具體例中，L包含具有以下結構的部分：
Figure 106139257-A0202-12-0043-516
在一些具體例中，L包含具有以下結構的部分：
Figure 106139257-A0202-12-0044-517
在一些具體例中，L包含具有以下結構的部分：
Figure 106139257-A0202-12-0044-518
在一些具體例中，L包含具有以下結構的部分：
Figure 106139257-A0202-12-0044-519
在一些具體例中，Pay為類美登素。
在一些具體例中，Pay為：
Figure 106139257-A0202-12-0044-520
 其中R1為烷基。
在一些具體例中，Pay為：
Figure 106139257-A0202-12-0045-521
在一些具體例中，Pay為：
Figure 106139257-A0202-12-0045-522
在一些具體例中，n為2至5的整數。
在一些具體例中，-L-Pay為：
Figure 106139257-A0202-12-0045-523
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0045-524
為至抗體的鍵。
在一些具體例中，-L-Pay為：
Figure 106139257-A0202-12-0046-525
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0046-528
為至抗體的鍵。
在一些具體例中，-L-Pay為
Figure 106139257-A0202-12-0046-526
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0046-529
為至抗體的鍵。
在一些具體例中，-L-Pay為：
Figure 106139257-A0202-12-0046-527
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0046-530
為至抗體的鍵。
在一些具體例中，接合物具有以下結構：Ab-[L-Pay]n其中： Ab為抗-MET抗體，其包含SEQ ID NO：82的HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：138的LCVR胺基酸序列；L-Pay為：
Figure 106139257-A0202-12-0047-531
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0047-533
為至抗體的鍵；而n為2至5的整數。
在一些具體例中，接合物具有以下結構；Ab-[L-Pay]n其中：Ab為抗-MET抗體，其包含SEQ ID NO：82的HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：138的LCVR胺基酸序列；L-Pay為
Figure 106139257-A0202-12-0047-532
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0047-534
為至抗體的鍵；而n為2至5的整數。
在一些具體例中，接合物具有以下結構：Ab-[L-Pay]n其中：Ab為抗-MET抗體，其包含SEQ ID NO：82的HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：138的LCVR胺基酸序列； L-Pay為
Figure 106139257-A0202-12-0048-535
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0048-536
為至抗體的鍵；而n為2至5的整數。
在一些具體例中，接合物具有以下結構：Ab-[L-Pay]n其中：Ab為抗-MET抗體，其包含SEQ ID NO：82的HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：138的LCVR胺基酸序列；L-Pay為
Figure 106139257-A0202-12-0048-537
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0048-538
為至抗體的鍵；而n為2至5的整數。
在一些具體例中，接合物具有以下結構：Ab-[L-Pay]n其中：Ab為MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含SEQ ID NO：58的D1-HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：82之D2-HCVR胺基酸序列；L-Pay為
Figure 106139257-A0202-12-0049-539
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0049-540
為至抗原結合蛋白的鍵；而n為2至5的整數。
在一些具體例中，接合物具有以下結構；Ab-[L-Pay]n其中：Ab為MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含SEQ ID NO：58之D1-HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：82之D2-HCVR胺基酸序列；L-Pay為
Figure 106139257-A0202-12-0049-542
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0049-541
為至抗原結合蛋白的鍵；而n為2至5的整數。
在一些具體例中，接合物具有以下結構：Ab-[L-Pay]n其中：Ab為MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含SEQ ID NO：58之D1-HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：82之D2-HCVR胺基酸序列；L-Pay為
Figure 106139257-A0202-12-0050-543
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0050-545
為至抗原結合蛋白的鍵；而n為2至5的整數。
在一些具體例中，接合物具有以下結構：Ab-[L-Pay]n其中：Ab為MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含SEQ ID NO：58之D1-HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：82之D2-HCVR胺基酸序列；L-Pay為
Figure 106139257-A0202-12-0050-544
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0050-546
為至抗原結合蛋白的鍵；而n為2至5的整數。
在一些具體例中，接合物具有以下結構：Ab-[L-Pay]n其中：Ab為MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含SEQ ID NO：18之D1-HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：82之D2-HCVR胺基酸序列；L-Pay為
Figure 106139257-A0202-12-0051-547
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0051-549
為至抗原結合蛋白的鍵；而n為2至5的整數。
在一些具體例中，接合物具有以下結構：Ab-[L-Pay]n其中：Ab為MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含SEQ ID NO：18之D1-HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：82之D2-HCVR胺基酸序列；L-Pay為
Figure 106139257-A0202-12-0051-548
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0051-550
為至抗原結合蛋白的鍵；而n為2至5的整數。
在一些具體例中，接合物具有以下結構：Ab-[L-Pay]n其中NAb為MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含SEQ ID NO：18之D1-HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：82之D2-HCVR胺基酸序列；L-Pay為
Figure 106139257-A0202-12-0052-551
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0052-553
為至抗原結合蛋白的鍵；而n為2至5的整數。
在一些具體例中，接合物具有以下結構：Ab-[L-Pay]n其中：Ab為MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含SEQ ID NO：18之D1-HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：82之D2-HCVR胺基酸序列；L-Pay為
Figure 106139257-A0202-12-0052-552
 其中
Figure 106139257-A0202-12-0052-554
為至抗原結合蛋白的鍵；而n為2至5的整數。
本文所述的抗體藥物接合物可以使用習於技藝者已知的結合條件來進行製備(參見，例如Doronina et al.Nature Biotechnology 2003,21,7,778，其以整體引用的方式併入本文)。在一些具體例中，抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合蛋白抗體藥物接合物是透過使本文所述抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合蛋白與包含所需連接子和細胞毒性劑的化合物接觸來製備，其中該連接子具有與抗體或抗原結合蛋白(例如在抗體或抗原結合蛋白的所需殘基處) 反應的部分。
在一些具體例中，本文提供用以製備抗體藥物接合物的方法，其包含使本文所述的抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合蛋白與具有下式A1的化合物和水性稀釋劑接觸：
Figure 106139257-A0202-12-0053-555
在一些具體例中，式A1化合物以化學計量過量存在。在一些具體例中，式A1化合物以化學計量過量5至6倍存在。在一些具體例中，水性稀釋劑包含HEPES。在一些具體例中，水性稀釋劑包含DMA。
在一些具體例中，式A1化合物為式A2化合物或式A3化合物：
Figure 106139257-A0202-12-0053-556
Figure 106139257-A0202-12-0054-557
在一些具體例中，式A2化合物為立體化學(stereometrically)純A3。在一些具體例中，式A1化合物包含式A1化合物或式A2化合物，其中式A1化合物或式A2化合物以非鏡像異構物超越值超過50%存在。在某些具體例中，非鏡像異構物超越值超過70%。在某些具體例中，非鏡像異構物超越值超過90%。在某些具體例中，非鏡像異構物超越值超過95%。
術語「非鏡像異構物超越值」意指所需單一非鏡像異構物相較於組合物中其餘非鏡像異構物的莫耳分量差異。非鏡像異構物超越值計算如下：(單一非鏡像異構物的數量)-(其他非鏡像異構物的數量)。舉例而言，含有90%的1以及10%的2、3、4或其混合物的組合物具有80%[(90-10)/1]的非鏡像異構物超越值。含有95%的1以及5%的2、3、4或其混合物的組合物具有90%[(95-5)/1]的非鏡像異構物超越值。含有99%的1以及1%的2、3、4或其混合物的組合物具有98%[(99-1)/1]的非鏡像異構物超越值。非鏡像異構物超越值同樣可針對1、2、3或4的任一者進行計算。
在一些具體例中，式A1化合物是藉由在矽膠以及稀釋劑存在下使式(a)化合物
Figure 106139257-A0202-12-0055-558
 與式(b)化合物接觸而製備
Figure 106139257-A0202-12-0055-559
 在一些具體例中，稀釋劑包含有機溶劑與水。
本文亦提供藉由以下方法所製備的產物：(i)在矽膠與稀釋劑存在下使式(a)化合物
Figure 106139257-A0202-12-0055-560
 與式(b)化合物接觸以合成中間體；以及
Figure 106139257-A0202-12-0055-561
 (b)(ii)使本文所述的抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合蛋白與該中間體和水性稀釋劑接觸。
在一些具體例中，本文提供製備抗體-藥物接合物的方法，包含使本文所述抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合蛋白與具有下式B的化合物以及水性稀釋劑接觸：
Figure 106139257-A0202-12-0056-562
 其中LG為離去基。
在一些具體例中，式B化合物以化學計量過量存在。在一些具體例中，式B化合物以化學計量過量5至6倍存在。在一些具體例中，水性稀釋劑包含HEPES。在一些具體例中，水性稀釋劑包含DMA。在一些具體例中，-C(O)-LG為酯，例如NHS或三氟苯基酯。
在一些具體例中，式B化合物為式B1化合物：
Figure 106139257-A0202-12-0056-563
在一些具體例中，式B1化合物是藉由使式C化合物與N-羥基丁二醯亞胺(NHS)、肽偶合劑，以及有機稀釋劑接觸而製備：
Figure 106139257-A0202-12-0057-564
 適宜的肽偶合劑包括那些活化與親核體反應(例如賦予反應性)的羧酸部分。在某些具體例中，肽偶合劑為N-(3-二甲基胺基丙基)-N’-乙基碳醯二亞胺鹽酸鹽(EDC)。在一些具體例中，有機溶劑為二氯甲烷。
在一些具體例中，式C化合物是藉由使式D化合物與己二酸、肽偶合劑，以及有機稀釋劑接觸而製備：
Figure 106139257-A0202-12-0057-565
 在某些具體例中，肽偶合劑為2-乙氧基-1-乙氧基羰基-1,2-二氫喹啉(EEDQ)。在某些具體例中，有機溶劑包含二氯甲烷。化合物D可如同WO2014/145090中所述製備。
表位定位(mapping)以及相關技術
抗體與抗原結合域所結合的表位可由MET蛋白的3或更多個(例如3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20個或更多個)胺基酸單一連續序列組成。或者，相關表位可由MET的複數個非連續胺基酸(或胺基酸序列)組成。在一些具體例中，表位座落在MET的配體結合域上或鄰近配體結合域。在其他具體例中，表位座落於MET的配體結合域之外，例如在抗體結合至此表位時不會干擾HGF結合至MET之MET表面上的位置處。
如本文他處所述，MET x MET雙特異性抗原性結合分子的單獨抗原結合域(D1與D2)可結合至彼此不同或非重疊，或部分重疊的表位。如本文所用，「部分重疊表位」表示如藉由技藝中已知的表位定位方法(例如X射線結晶體學、丙胺酸掃描突變誘發、氫/氘交換[HDX]、域交換等)測定時，第一表位與第二表位共有少於5個、少於4個、少於3個或僅只一個共同胺基酸。D1與D2域可能是彼此非競爭性。例如，在某些具體例中，特定MET x MET雙特異性抗原結合分子的D1域與MET上其表位的結合不會抑制(或僅最低程度地抑制)MET x MET雙特異性抗原結合分子的D2域與MET上其表位的結合。因為D1與D2組份的個別表位的非重疊(或頂多部分重疊)特性，MET x MET雙特異性抗原結合分子能夠結合至細胞表面上的單一個MET分子。
習於技藝者已知的各種技術可用於決定MET上與本揭示內容之抗體以及抗原結合域交互作用的表位。可用於決定特定抗體或抗原結合域之表位或結合域的例示性技術包括例如點突變誘變(例如丙胺酸掃描突變誘變、精胺酸掃描突變誘變等)、肽印漬分析(Reineke (2004)Methods Mol Biol 248：443-63)、蛋白酶保護以及肽切割分析。此外，可以採用諸如表位切除、表位抽出以及化學修飾抗原的方法(Tomer (2000)Prot.Sci.9：487-496)。另一種可用於鑑別抗體所交互作用之多肽中的胺基酸的方法為透過質譜偵測氫/氘交換。在一般性術語中，氫/氘交換法涉及將感興趣的蛋白質標記氘，然後使抗體結合至經氘標記的蛋白質。接下來，蛋白質/抗體複合體被轉移至水中且容許氫-氘交換發生在所有殘基處，除了受抗體保護的殘基(其維持經氘標記)以外。在抗體解離後，目標蛋白質進行蛋白酶切割與質譜分析，從而揭開經氘標記的殘基，其對應於抗體所交互作用的特定胺基酸。參見，例如Ehring(1999)Analytical Biochemistry 267(2)：252-259；Engen and Smith(2001)Anal.Chem.73：256A-265A。X-射線晶體結構分析也可以用來鑑定抗體交互作用之多肽內的胺基酸。
本文進一步提供結合至與本文所述之特定例示性抗體或抗原結合域任一者(例如包含本文表1中所列任一胺基酸序列的抗體)相同表位的抗-MET抗體(包括雙特異性抗體)。同樣地，本文亦提供 與本文所述之特定例示性抗體任一者(例如包含本文表1中所列任一胺基酸序列的抗體)競爭結合至MET的抗-MET抗體。在一些具體例中，抗-MET抗體所結合的人類MET表位包含SEQ ID NO：305-315的胺基酸192-204，及/或SEQ ID NO：155的胺基酸421-455。在一些具體例中，人類MET的第一表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸192-204；而人類MET的第二表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸305-315與421-455。
吾人可容易地透過使用技藝中已知以及本文列舉的慣用方法來決定某個抗體與某個參考抗-MET抗體是否結合至相同表位，或競爭結合。例如，要決定測試抗體是否與本文提供的參考抗-MET抗體結合至相同表位，使參考抗體結合至MET蛋白。接著，評估測試抗體結合至MET分子的能力。若測試抗體在用參考抗-MET抗體飽和結合之後還能夠結合至MET，則推論測試抗體結合至與參考抗-MET抗體不同的表位。另一方面，若測試抗體在用參考抗-MET抗體飽和結合之後無法結合至MET分子，則測試抗體可能結合至與參考抗-MET抗體所結合之表位相同的表位。接而可進行其他慣常實驗(例如肽突變與結合分析)以確認觀察測試抗體沒有結合實際上是因為結合至與參考抗體相同的表位，或若沒有觀察到結合是因為其空間阻礙(或另一現象)。這類實驗可使用ELISA、RIA、Biacore、流式細胞測量分析或技藝中可供使用的其他任何定量或定性抗體-結合分析來進行。依據某些具體例中，如在一個競爭性結合分析中測量到一個過量例如1-、5-、10-、20-或100-倍的抗體抑制另一個抗體結合達至少50%，但較佳75%、90%或甚至99%，則兩個抗體結合至相同(或重疊)表位(參見，例如Junghans et al.,Cancer Res.1990：50：1495-1502)。或者，若基本上在抗原中會減少或消除某個抗體結合的所有胺基酸突變也會減少或消除另一個抗體結合，則兩個抗體被視為具有相同表位。若會減少或消除抗體結合的一些胺基酸突變子群也會減少或消除另一個抗體結合，則兩個抗體被視為具有重疊的表位。
為決定一個抗體是否與參考抗-MET抗體競爭結合(或交叉競爭結合)，從兩個方面來進行上述結合方法學：在第一個方面，容許參考抗體在飽和條件下結合至MET蛋白，繼而評估測試抗體對 MET分子的結合。在第二個方面，容許測試抗體在飽和條件下結合至MET分子，繼而評估參考抗體對MET分子的結合。若在兩個方面中，僅有第一(飽和)抗體能夠結合至MET分子，則推斷測試抗體與參考抗體競爭結合至MET。如技藝中具有通常技術者所了解，與參考抗體競爭結合之抗體不必然會結合至與參考抗體相同的表位，但可能會在空間上因為結合重疊或相鄰表位而阻斷了參考抗體的結合。
製備人類抗體
本文提供之抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗體為完全人類抗體。用於產生單株抗體(包括完全人類單株抗體)的方法為技藝中已知。任何此等已知方法可使用於本揭示內容的上下文，以製造特異地結合至人類MET的人類抗體。
舉例而言，使用VELOCIMMUNETM技術或用於生成完全人類單株抗體的任何其他類似已知技術，一開始分離出針對MET的高親和力嵌合抗體，其具有人類可變區以及小鼠恆定區。如下文實驗段落中，抗體經過特徵鑑定並針對期望特徵進行篩選，期望特徵包括親和力、配體阻斷活性、選擇性、表位等。若需要的話，將小鼠恆定區取代成所需人類恆定區(例如野生型或經修飾IgG1或IgG4)，以產生完全人類抗-MET抗體。儘管選定的恆定區可能依據具體用途而有所不同，但高親和力抗原結合以及標靶特異性仍留存於可變區內。在某些情況下，完全人類抗-MET抗體是直接分離自抗原陽性B細胞。
生物等效性
本文提供之抗-MET抗體及抗體片段含括帶有由那些所述抗體變化而來，但仍保有結合人類MET能力之胺基酸序列的蛋白質。當與親代序列相比較，此等變異體抗體以及抗體片段包含一或多個胺基酸添加、刪除或置換，但仍展現出與所述抗體基本上相同的生物活性。同樣地，當與所揭示的序列相比較，本揭示內容之抗-MET抗體編碼DNA序列含括具有一或多個核苷酸添加、刪除或置換，但仍編碼與本揭示內容之抗-MET抗體或抗體片段基本上生物等效的抗-MET抗體或抗體片段的序列。
舉例而言，若兩個抗原-結合蛋白或抗體是醫藥學等效 物或醫藥學代用品，當它們以相同莫耳劑量在類似實驗條件下投與時的吸收速率與程度未顯示出顯著差異(不論是單劑量或多劑量)，則它們被視為生物等效的。若一些抗體在它們的吸收程度上相等但在它們的吸收速率上不同，則它們將會被視為等效物或醫藥學代用品但還不被視為生物等效，因為這些在吸收速率上的差異是有目的並且在歸類時被反映，對於在例如長期使用上維持有效生體藥物濃度來說不是必要的，並且就所研究的特定藥物產品來說被視為在醫學上沒有差異。
在一個具體例中，若兩個抗原-結合蛋白就其安全性、純度或效力而言在臨床上並無有意義的差異，它們是生物等效的。
在一個具體例中，若患者在參考產品與生物產品之間可以改變一或多次而沒有預期提高不良反應的風險(包括與連續療法但沒有這樣改變的情況下相比，在免疫原性上的臨床顯著變化，或減低有效性)時，則兩個抗原結合蛋白是生物等效的。
在一個具體例中，若兩個抗原-結合蛋白就條件或使用條件來說均是按照共同的機制或作用機制發揮作用達致此等機制已知的程度，則它們是生物等效的。
生物等效性可以藉由活體內及/或活體外方法證實。生物等效性測量法包括，例如(a)在人類或其他哺乳動物體內的活體內測試，其中隨著時間測量抗體或其代謝物在血液、血漿、血清或其他生物液中的濃度；(b)已使用人類活體內生物可利用性數據校正並且可合理預測用於人類的活體外測試；(c)在人類或其他哺乳動物體內的活體內測試，其中隨著時間測量抗體(或其目標)之適當急性藥理學效用；以及(d)在已建立抗體的安全性、效力或生物可利用性或生物等效性的經充分控制臨床試驗中。
本文提供之抗-MET抗體的生物等效變異體可以藉由例如，製造各種殘基或序列置換，或刪除不是生物活性所必需的末端或內部殘基或序列而建構。舉例而言，對於生物學活性來說不是必要的半胱胺酸殘基可以被刪除或取代成其他會在再復性之後防止不必要或不正確分子內雙硫橋形成的胺基酸。在其他上下文中，生物等效性抗體可包括抗MET抗體變異體，其含有會修飾抗體之糖基化特徵的胺 基酸變化，例如消除或移除糖基化的突變。
物種選擇性以及物種交叉反應性
依據某些具體例，本揭示內容提供結合至人類MET而不會結合至其他物種之MET的抗體(及包含抗-MET抗原結合域的抗原結合分子)。本揭示內容亦包括結合至人類MET以及一或多種非人類物種之MET的抗-MET抗體(及包含抗-MET抗原結合域的抗原結合分子)。舉例而言，抗-MET抗體以及抗原結合分子可以結合至人類MET並且視情況可能結合或不結合至小鼠、大鼠、天竺鼠、倉鼠、沙鼠、豬、貓、狗、兔、山羊、綿羊、牛、馬、駱駝、石蟹獼猴、狨猿、恆河猴或黑猩猩MET的一或多者。依據某些例示性具體例中，提供抗-MET抗體以及抗原結合分子，其特異地結合人類MET與石蟹獼猴(例如石蟹獼猴)MET。其他抗-MET抗體及抗原結合分子結合人類MET，但不結合或僅微弱地結合石蟹獼猴MET。
多特異性抗體
如本文他處所述，本揭示內容提供雙特異性抗原結合分子，其包含兩個不同的抗原結合域，其中第一抗原結合域(D1)結合MET上的第一個表位，且其中第二抗原結合域(D2)結合MET上的第二個表位。在某些具體例中，D1及D2域所結合之MET上的第一及第二表位是不同的，或非重疊，或部分重疊。依據這個態樣，D1域可包含本文表1中所列HCVR/LCVR或CDR胺基酸序列任一者，而D2域可包含本文表1中所列HCVR/LCVR或CDR胺基酸序列任何其他一者(只要D1域的結合特異性不同於D2域的結合特異性，及/或由D1所得到的抗原結合蛋白不與由D2所得到的抗原結合蛋白競爭結合至MET即可)。在一些具體例中，抗-MET抗體所結合的人類MET表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸192-204、胺基酸305-315，及/或胺基酸421-455。在一些具體例中，人類MET的第一表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸192-204，而人類MET的第二表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸305-315與421-455。
依據本揭示內容的個別態樣，亦提供習用雙特異性抗體，其中雙特異性抗體的一個臂結合至人類MET上的一個表位，而雙 特異性抗體的另一個臂結合至MET以外的另一個抗原。MET結合臂可包含如本文表1中所列HCVR/LCVR或CDR胺基酸序列任一者。在某些具體例中，MET結合臂結合人類MET並阻斷HGF結合至MET。在其他具體例中，MET結合臂結合人類MET但不阻斷HGF結合至MET。
可以使用於本揭示內容上下文的例示性雙特異性抗體形式涉及使用第一免疫球蛋白(Ig)CH3域以及第二Ig CH3域，其中第一與第二Ig CH3域因為至少一個胺基酸而彼此不同，且其中與缺少該胺基酸差異的雙特異性抗體相較之下，至少一個胺基酸差異會減少該雙特異性抗體結合至蛋白質A。在一個具體例中，該第一Ig CH3域結合蛋白質A而該第二Ig CH3域含有一個會減低或消除蛋白質A結合的突變，諸如H95R修飾(按照IMGT外顯子編號；按照EU編號為H435R)。該第二CH3可進一步包含Y96F修飾(按照IMGT；按照EU為Y436F)。可以在第二CH3中發現到的更多修飾包括：在IgG1抗體的情況下，D16E、L18M、N44S、K52N、V57M以及V82I(按照IMGT；按照EU為D356E、L358M、N384S、K392N、V397M以及V422I)；在IgG2抗體的情況下，N44S、K52N以及V82I(IMGT；按照EU為N384S、K392N以及V422I)；以及在IgG4抗體的情況下，Q15R、N44S、K52N、V57M、R69K、E79Q以及V82I(按照IMGT；按照EU為Q355R、N384S、K392N、V397M、R409K、E419Q以及V422I)。上述雙特異性抗體形式的變異在本揭示內容範圍中是可預想的。
可用於本揭示內容上下文中的其他例示性雙特異性形式包括，但不限於例如，以scFv為基礎或雙抗體雙特異性形式、IgG-scFv融合物、雙重可變域(DVD)-Ig、四價體瘤、洞中紐、共用輕鏈(例如帶有洞中鈕的共有輕鏈等)、CrossMab、CrossFab、(SEED)體、白胺酸拉鍊、Duobody、IgG1/IgG2、雙重作用Fab(DAF)-IgG，以及Mab2雙特異性形式(關於前面形式的回顧參見，參見例如Klein et al.2012,mAbs 4：6,1-11與其中引用的參考文獻)。雙特異性抗體也可以使用肽/核酸結合來建構，例如其中帶有直角化學反應性的非天然胺基酸被用來生成位點特異性抗體-寡核苷酸接合物，其之後自我組裝成具有限定組成、價數與幾何學的集合體複合體(參見，例如Kazane et al.,J. Am.Chem.Soc.[Epub：Dec.4,2012])。
治療調配物以及投藥
本文提供包含本發明抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子的醫藥組合物。醫藥組合物可與適當載體、賦形劑，以及其他提供增進轉移、遞送、耐受性與類似性質的藥劑一起調配。
抗體的治療性用途
本文提供包含向有需要的個體投與治療組合物的方法，該治療組合物包含抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子(例如包含如本文表1中所列HCVR/LCVR或CDR序列中任一者的抗-MET，或包含如本文表5中所列D1與D2構成要素中任一者的MET x MET雙特異性抗原結合分子)。該治療組合物可包含本文揭示之抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子中的任一者，以及醫藥上可接受的載劑或稀釋劑。
抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗原結合分子尤其可用於治療、預防及/或改善與MET表現、信號傳導或活性有關或受MET表現、信號傳導或活性媒介，或可透過阻斷MET與HGF之間的交互作用或以其他方式抑制MET活性及/或信號傳導，及/或促使受體內化及/或降低細胞表面受體數目而受到治療的任何疾病或病症。
例如，本揭示內容的抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗原結合分子可用於治療表現(或過度表現)MET的腫瘤。舉例而言，抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗原結合分子可用於治療出現在以下的原發性及/或轉移性腫瘤：腦和腦膜、口咽、肺和支氣管樹、胃腸道、男性和女性生殖道、肌肉、骨、皮膚和附肢、結締組織、脾臟、免疫系統、血液形成細胞和骨髓、肝臟和泌尿道，以及特殊感覺器官，諸如眼。在某些具體例中，抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗原結合分子用於治療下列癌症中的一或多者：急性骨髓性白血病、成人T細胞白血病、星狀細胞瘤、膀胱癌、乳癌、子宮頸癌、膽管癌、慢性骨髓性白血病、結腸直腸癌、子宮內膜癌、食道癌、胃癌(例如帶有MET擴增的胃癌)、神經膠質母細胞瘤、頭頸癌(例如頭頸鱗狀細胞癌[HNSCC])、卡波西氏肉瘤、腎癌、平滑肌肉瘤、肝癌、肺 癌(例如非小細胞肺癌[NSCLC])、淋巴瘤、惡性神經膠質瘤、惡性間皮瘤、黑色素瘤、間皮瘤、MFH/纖維肉瘤、多發性骨髓瘤、鼻咽癌、骨肉瘤、卵巢癌、胰臟癌、前列腺癌、腎細胞癌、橫紋肌肉瘤、小細胞肺癌、滑膜肉瘤、甲狀腺癌以及威爾姆氏腫瘤。
在本文所述的治療方法的上下文中，抗-MET抗體以及MET x MET雙特異抗原結合分子可做為單一療法(亦即作為唯一治療劑)，或與一或多種額外治療劑組合(其實例描述於本文他處)而投與。
組合療法以及調配物
本文提供組合物以及治療性調配物，其包含本文所述之抗-MET抗體與MET x MET雙特異性抗原結合分子與一或多種額外治療活性組份組合；以及包含向有需要的個體投與此等組合的治療方法。
抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗原結合分子可以與一或多種選自以下組成之群的額外治療活性組份共調配及/或組合投與：MET拮抗劑(例如抗-MET抗體[例如歐那佐單抗(onartuzumab)、艾貝珠單抗(emibetuzumab)與H4H14639D]或MET的小分子抑制劑)、EGFR拮抗劑(例如抗-EGFR抗體[例如西妥昔單抗(cetuximab)或帕尼單抗(panitumumab)]或EGFR的小分子抑制劑[例如吉非替尼(gefitinib)或厄洛替尼(erlotinib)])、另一EGFR家族成員(諸如Her2/ErbB2、ErbB3或ErbB4)的拮抗劑(例如抗-ErbB2[例如曲妥珠單抗(trastuzumab)或T-DM1{KADCYLA®}]、抗-ErbB3或抗-ErbB4抗體或ErbB2、ErbB3或ErbB4活性的小分子抑制劑)、EGFRvIII的拮抗劑(例如抗-EGFRvIII抗體)、IGF1R拮抗劑(例如抗-IGF1R抗體)、B-raf抑制劑(例如威羅非尼(vemurafenib)、索拉非尼(sorafenib)、GDC-0879、PLX-4720)、PDGFR-α抑制劑(例如抗-PDGFR-α抗體)、PDGFR-β抑制劑(例如抗-PDGFR-β抗體或小分子激酶抑制劑，諸如例如甲磺酸伊馬替尼(imatinib mesylate)或蘋果酸舒尼替尼(sunitinib malate))、PDGF配體抑制劑(例如抗-PDGF-A、-B、-C或-D抗體、適體、siRNA等)、VEGF拮抗劑(例如VEGF-Trap，諸如阿普西柏(aflibercept)，參見例如US 7,087,411(在本文又稱為「VEGF-抑制融合蛋白」)、抗-VEGF抗體(例 如貝伐珠單抗(bevacizumab))、VEGF受體的小分子激酶抑制劑(例如舒尼替尼、索拉非尼或帕唑帕尼(pazopanib))、DLL4拮抗劑(例如US2009/0142354中揭示的抗-DLL4抗體，諸如REGN421)、Ang2拮抗劑(例如US 2011/0027286中揭示的抗-Ang2抗體，諸如H1H685P)、FOLH1拮抗劑(例如抗-FOLH1抗體)、STEAP1或STEAP2拮抗劑(例如抗-STEAP1抗體或抗-STEAP2抗體)、TMPRSS2拮抗劑(例如抗-TMPRSS2抗體)、MSLN拮抗劑(例如抗-MSLN抗體)、CA9拮抗劑(例如抗-CA9抗體)、尿溶蛋白(uroplakin)拮抗劑(例如抗尿溶蛋白[例如抗-UPK3A]抗體)、MUC16拮抗劑(例如抗-MUC16抗體)、Tn抗原拮抗劑(例如抗-Tn抗體)、CLEC12A拮抗劑(例如抗-CLEC12A抗體)、TNFRSF17拮抗劑(例如抗-TNFRSF17抗體)、LGR5拮抗劑(例如抗-LGR5抗體)、單價CD20拮抗劑(例如單價抗-CD20抗體，諸如利妥昔單抗(rituximab))、CD20 x CD3雙特異性抗體、PD-1阻斷劑(例如抗-PD-1抗體，諸如派姆單抗(pembrolizumab)或納武單抗(nivolumab))等。可與本文提供的抗體有益地組合投與的其他藥劑包括例如他莫昔芬(tamoxifen)、芳香酶抑制劑以及細胞介素抑制劑，包括小分子細胞介素抑制劑與結合至細胞介素的抗體，細胞介素為諸如IL-1、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-9、IL-11、IL-12、IL-13、IL-17、IL-18或其個別受體。
說明性地，PD-1抑制劑(諸如抗-PD-1抗體)可與如本文所述的抗-Met抗體-藥物接合物組合。目標患者群體具體地包括那些帶有過度表現c-Met突變之腫瘤的患者，諸如帶有表現c-Met之非小細胞肺癌的患者。
本文提供組合物以及治療調配物，其包含本文所述抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗原結合分子中任一者組合一或多種化療劑。化療劑的實例包括烷基化劑(alkylating agents)，諸如塞替派(thiotepa)和環磷醯胺(CytoxanTM)；烷基磺酸酯，諸如白消安、英丙舒凡(improsulfan)和哌泊舒凡(piposulfan)；氮丙類啶(aziridines)，諸如苯佐替派(benzodopa)、卡波醌(carboquone)，美妥替派(meturedopa)和烏瑞替派(uredepa)；伸乙亞胺類(ethylenimines)與甲基蜜胺類(methylamelamines)，包括六甲蜜胺(altretamine)、三乙撐蜜胺 (triethylenemelamine)、三乙撐磷醯胺(trietylenephosphoramide)、三乙撐硫代磷醯胺(triethylenethiophosphaoramide)與三羥甲蜜胺(trimethylolomelamine)；氮芥類(nitrogen mustards)，諸如苯丁酸氮芥(chlorambucil)、萘氮芥(chlornaphazine)、氯磷醯胺(cholophosphamide)、雌莫司汀(estramustine)、異環磷醯胺(ifosfamide)、甲基二(氯乙基)胺(mechlorethamine)、鹽酸氧化甲基二(氯乙基)胺(mechlorethamine oxide hydrochloride)、美法崙、新氮芥(novembichin)、苯芥膽甾醇(phenesterine)、潑尼莫司(prednimustine)、曲磷胺(trofosfamide)、尿嘧啶氮芥(uracil mustard)；亞硝基脲類(nitrosureas)，諸如卡莫司汀(carmustine)、氯脲菌素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)、雷莫司汀(ranimustine)；抗生素類，諸如阿克拉黴素(aclacinomysins)、放線菌素、安曲黴素、重氮絲胺酸(azaserine)、博萊黴素、放線菌素C(cactinomycin)、卡其黴素、卡柔比星(carabicin)、洋紅黴素、嗜癌黴素(carzinophilin)、色黴素(chromomycins)、放線菌素D、道諾黴素、阿黴素(detorubicin)、6-二偶氮基-5-側氧基-L-正白胺酸、阿黴素、表阿黴素(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、伊達比星(idarubicin)、麻西羅黴素(marcellomycin)、絲裂黴素、黴酚酸(mycophenolic acid)、諾加黴素(nogalamycin)、橄欖黴素(olivomycins)、培洛黴素(peplomycin)、甲基絲裂黴素(potfiromycin)、嘌呤黴素、三鐵阿黴素(quelamycin)、羅多比星(rodorubicin)、鏈黑菌素(streptonigrin)、鏈佐星(streptozocin)、殺結核菌素(tubercidin)、烏苯美司(ubenimex)、淨司他汀(zinostatin)、佐柔比星(zorubicin)；抗代謝物類，諸如胺甲喋呤與5-氟尿嘧啶(5-FU)；葉酸類似物，諸如二甲葉酸、胺甲喋呤、喋羅呤(pteropterin)、三甲曲沙(trimetrexate)；嘌呤類似物，諸如氟達拉濱(fludarabine)、6-巰嘌呤、硫咪嘌呤(thiamiprine)、硫鳥嘌呤(thioguanine)；嘧啶類似物，諸如安西他濱(ancitabine)、阿扎胞苷(azacitidine)、6-氮尿苷(6-azauridine)、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷、雙去氧尿苷(dideoxyuridine)、去氧氟尿苷(doxifluridine)、依諾他濱(enocitabine)、氟尿苷(floxuridine)；雄性素，諸如卡魯睪酮(calusterone)、屈他雄酮丙酸酯(dromostanolone propionate)、環硫雄醇 (epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睪內酯(testolactone)；抗腎上腺，諸如氨魯米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane)；葉酸補充劑，諸如亞葉酸(frolinic acid)；醋葡醛內酯(aceglatone)；醛磷醯胺糖苷(aldophosphamide glycoside)；胺基乙醯丙酸(aminolevulinic acid)；安吖啶(amsacrine)；貝斯特布西(bestrabucil)；比生群(bisantrene)；依達曲沙(edatraxate)；地磷醯胺(defofamine)；地美可辛(demecolcine)；地吖醌(diaziquone)；依氟鳥胺酸(elfornithine)；依利醋銨(elliptinium acetate)；依托格魯(etoglucid)；硝酸鎵(gallium nitrate)；羥基脲(hydroxyurea)；蘑菇多糖(lentinan)；氯尼達明(lonidamine)；米托胍腙(mitoguazone)；米托蒽醌(mitoxantrone)；莫哌達醇(mopidamol)；二胺硝吖啶(nitracrine)；噴司他丁(pentostatin)；蛋氨氮芥(phenamet)；吡柔比星(pirarubicin)；鬼臼酸(podophyllinic acid)；2-乙基醯肼(2-ethylhydrazide)；丙卡巴肼(procarbazine)；PSKTM；雷佐生(razoxane)；西索菲蘭(sizofiran)；螺環鍺(spirogermanium)；細交鏈孢菌酮酸(tenuazonic acid)；三亞胺醌(triaziquone)；2,2',2"-三氯三乙胺；烏拉坦(urethane)；長春地辛；達卡巴嗪；甘露醇氮芥(mannomustine)；二溴甘露醇(mitobronitol)；二溴衛矛醇(mitolactol)；哌泊溴烷(pipobroman)；加西托星(gacytosine)；阿糖胞苷(「Ara-C」)；環磷醯胺；塞替派；紫杉烷類，例如太平洋紫杉醇(paclitaxel)(TaxolTM,Bristol-Myers Squibb Oncology,Princeton,N.J.)以及多西他賽(docetaxel)(TaxotereTM；Aventis Antony, France)；苯丁酸氮芥(chlorambucil)；吉西他濱(gemcitabine)；6-硫鳥嘌呤；巰嘌呤；甲胺喋呤；鉑類似物，諸如順鉑與卡鉑；長春鹼；鉑；依托泊苷(VP-16)；異環磷醯胺；絲裂黴素C；米托蒽醌；長春新鹼；溫諾平；諾維本(navelbine)；諾肖林(novantrone)；替尼泊苷；道諾黴素；胺喋呤；希羅達(xeloda)；伊班膦酸鈉(ibandronate)；CPT-11；拓樸異構酶抑制劑RFS 2000；二氟甲基鳥胺酸(difluoromethylornithine)(DMFO)；維甲酸；埃斯培拉黴素；卡培他濱；及上文中任一者之醫藥上可接受之鹽、酸或衍生物。抗激素劑亦包括在此定義中，其作用為調節或抑制腫瘤上的激素作用，諸如抗雌性素，包括例如：他莫昔芬、雷洛昔芬、抑制 芳香酶的4(5)-咪唑、4-羥基他莫昔芬、曲沃昔芬(trioxifene)、雷洛西芬(keoxifene)、LY 117018、奧那司酮(onapristone)與托瑞米芬(toremifene)(Fareston)；以及抗雄性素，諸如氟他胺(flutamide)、尼魯米特(nilutamide)、比卡魯胺(bicalutamide)、亮丙瑞林(leuprolide)與戈舍瑞林(goserelin)；及上文中任一者之醫藥上可接受之鹽、酸或衍生物。
抗-MET抗體以及MET x MET雙特異性抗原結合分子也可以組合下列投與及/或共調配：抗病毒劑、抗生素、止痛劑、皮質類固醇、類固醇、氧、抗氧化劑、COX抑制劑、心臟保護劑、金屬螯合劑、IFN-γ及/或NSAID。
額外治療活性組份(例如上文列出的任一者或其衍生物)可在投與抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子剛好之前、同時或不久之後投與；(用於本揭示內容之目的，此投與方案被認為是抗體「組合」額外治療活性組份的投與)。本揭示內容包括醫藥組合物，其中抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子與一或多個如本文他處所述的額外治療活性組份共調配。
投藥方案
依據某些具體例，多劑量之抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子(或包含抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子與本文所提及任一額外治療活性劑之組合的醫藥組合物)可在一段限定時間裡被投與給個體。依據此態樣的方法包含依序將多劑量之本文提供的抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子投與給個體。如本文所用，「依序投與」表示各劑量的抗體在不同時間點被投與給個體，例如在由預定間隔(例如數小時、數天、數週或數月)所分開的不同天。本揭示內容包括含有將單一起始劑量之抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子，接而為一或多個第二劑量的抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子，以及視情況接著一或多個第三劑量的抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子依序投與給患者的方法。
術語「起始劑量」、「第二劑量」及「第三劑量」意指投與抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子的時間順序。 因此，「起始劑量」是在治療方案開始時被投與的劑量(亦意指為「基線劑量」)；「第二劑量」是在起始劑量之後被投與的劑量；而「第三劑量」是在第二劑量之後被投與的劑量。起始劑量、第二劑量與第三劑量可全都含有相同數量之抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子，但通常會在投與頻率方面彼此有所不同。但是，在某些具體例中，起始劑量、第二劑量及/或第三劑量中所含有之抗體數量將會在治療過程期間彼此改變(例如調高或調低，若需要的話)。在某些具體例中，兩個或更多個(例如2、3、4或5個)劑量在治療方案開始時被投與作為「加載劑量」，接著以較不頻繁的方式投與後續劑量(例如「維持劑量」)。
抗體的診斷性用途
本發明的抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子可用來偵測及/或測量樣品中的MET，或MET表現細胞，例如供診斷用。舉例來說，抗-MET抗體或其片段可用來診斷特徵在於MET表現異常(例如表現過度、表現低下、表現缺乏等)的病症或疾病。有關MET的例示性診斷分析可包含，例如使得自於某位患者的樣品與抗MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子接觸，其中該抗體標定有可偵測標誌或報導子分子，或者，未標定的抗-MET抗體或MET x MET雙特異性抗原結合分子可以組合本身可被偵測到標誌之二級抗體一起使用於診斷應用。可偵測到的標誌或報導子分子可以是放射性同位素，諸如3H、14C、32P、35S或125I；螢光或化學發光部分，諸如螢光黃或玫瑰紅；或諸如鹼性磷酸酶、β-半乳糖苷酶、辣根過氧化酶，或螢光素酶的酶。可用來偵測或測量樣品中的MET的具體例示性分析包括酶聯免疫吸附分析(ELISA)、放射免疫分析(RIA)、免疫-PET(例如89Zr、64Cu等)以及螢光-活化細胞分選(FACS)。
依據本揭示內容，可用於MET診斷分析中的樣品包括任何可得自於個體的組織或液體樣品。一般來說，測量MET在自健康患者(例如未罹患與MET含量或活性異常有關之疾病或病況的患者)所得到之特定樣品中的含量以在一開始時建立基線，或標準MET含量。MET的這個基線含量接而可以與得自被懷疑帶有MET相關之疾病或 病況的個體的樣品中所測得的MET位準來進行比對。
實例
提出以下實例，以便將如何製造與使用本文提供之方法和組合物之完整揭示內容以及說明提供給那些在技藝中具有通常技術者，且不欲限制發明人視為其發明的範疇。已盡力確保所用數字(例如數量、溫度等)的準確度，但可能產生某些實驗誤差與偏差。除非另有指明，否則份為重量份，分子量為平均分子量，溫度為攝氏度，而壓力為大氣壓或近大氣壓。
實例1. 生成抗-MET抗體
藉由用包含融合至人類Fc之重組人類MET胞外域的免疫原(R&D Systems,Catalog # 358-MT,Minneapolis,MN)對包含編碼人類免疫球蛋白重鏈與κ輕鏈可變區之DNA的經遺傳改造小鼠進行免疫來獲得抗-MET抗體。用於免疫接種的小鼠表現「通用輕鏈」。亦即，在此小鼠體內所生產的抗體具有不同的重鏈可變區但基本上相同的輕鏈可變域。
透過MET-特異性免疫分析監測抗體免疫反應。當達到預期的免疫反應時，收取脾細胞並與小鼠骨髓瘤細胞融合以保持它們的生存力且形成融合瘤細胞株。融合瘤細胞株進行篩選和選擇，以鑑定出會生產MET-特異性抗體的細胞株。使用這個技術得到數個抗-MET嵌合抗體(亦即，具有人類可變域和小鼠恆定域的抗體)。此外，如US 2007/0280945A1中所述，在不融合至骨髓瘤細胞的情況下直接由抗原-陽性小鼠B細胞分離出數個完全人類抗-MET抗體。
依據本實例之方法所生成的例示性抗-MET抗體以及由其所建構之雙特異性抗體的某些生物學特性詳細描述於下列實例中。
實例2. 重鏈與輕鏈可變區胺基酸序列以及核酸序列
表1列出本文所述之經選定抗-MET抗體的重鏈與輕鏈可變區和CDR的胺基酸序列識別符號。(如上文提到，實例1中所生成的全部抗體具有相同的輕鏈可變區，且因而也具有相同的輕鏈CDR序列)。對應核酸序列識別符號列於表2中。
Figure 106139257-A0202-12-0072-566
Figure 106139257-A0202-12-0072-567
Figure 106139257-A0202-12-0073-568
如表1與表2中所示，抗體在本文中通常依據下列命名法來指稱：Fc前綴(例如「H4H」)，接著是數字識別符號(例如「13290」、「13291」、「13295」等)，然後為「P2」字尾。因此，依據這個命名法，抗體在本文可稱為例如「H4H13290P2」、「H4H13291P2」、「H4H13295P2」等。本文所用抗體命名法的前綴指明抗體的特定Fc區同型。具體而言，「H4H」抗體具有人類IgG4 Fc(所有可變區為完全人類，如同抗體命名法中的頭一個「H」表示)。如同技藝中具有通常技術者所理解，具有特定Fc同型的抗體可轉換成具有不同Fc同型的抗體(例如具有小鼠IgG4 Fc的抗體可轉換成具有人類IgG1的抗體等)，但在任何情況下，由表1與表2中所示數字識別符號所指之可變域(包括CDR)維持相同，且預期結合性質相同或實質上類似，而與Fc域特性無關。
實例3. 人類單株抗-MET(單特異性)抗體之表面電漿共振衍生的結合親和力以及動力學常數
在37℃下，藉由表面電漿共振(Biacore 4000或T-200)測定人類抗-MET抗體的結合親和力以及動力學常數。在本實例中所測試的抗-MET抗體為MET的二價單特異性抗結合子。表現為人類IgG4(命名為「H4H」)的抗體被捕獲至CM4或CM5 Biacore感測器表面上，該感測器表面經由偶合單株小鼠抗人類Fc抗體(GE,BR-1008-39)的胺予以衍生化。將不同濃度的可溶性單體(人類(h)Met.mmh；SEQ ID NO：152；食蟹獼猴(macacafascicularis)(mf) Met.mmh；SEQ ID NO：154)或二聚體(hMet.mFc；SEQ ID NO：153)Met蛋白以30或50μL/分 的流速注射遍布抗-MET抗體被捕獲的表面上。監測hMET.mmh或hMET.mFc與被捕獲單株抗體的締合歷時4或5分鐘，並且監測hMET.mmh或hMET.mFc在HBS-ET(0.01M HEPES pH 7.4、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.05% v/v Surfactant P20)或PBS-P(0.01M磷酸鈉、pH 7.4、0.15M NaCl、0.05% v/v Surfactant P20)操作緩衝液中的解離歷時10分鐘。
動力學締合(k a)與解離(k d)速率常數是藉由使用Scrubber 2.0c曲線擬合軟體將即時傳感圖(sensorgram)擬合至1：1結合模型而被確定。由如下的動力學速率常數計算結合解離平衡常數(K D)與解離半衰期(t½)：
Figure 106139257-A0202-12-0074-570
單特異性抗-MET對單體以及二聚體Met蛋白的結合動力學常數顯示於下表3中。
Figure 106139257-A0202-12-0074-569
Figure 106139257-A0202-12-0075-571
 NB=在所使用的條件下未觀察到結合
如表3中所示，數個抗體對人類以及猴MET蛋白展現出高親和力結合。
實例4. 抗-Met抗體結合至Met受體的明確表位
為了評估兩個抗-Met抗體是否會與互相競爭結合至其在MET上的個別表位，使用即時無標記生物層干涉術(BLI)在OCTET® HTX生物感測器(FortéBio Corp.,Menlo Park,CA)上進行結合競爭分析。
簡言之，藉由將經抗-五-His抗體塗覆之OCTET®生物感測器(FortéBio Corp.,# 18-5079)浸入含有20μg/mL hMET.mmh溶液的孔中歷時5分鐘，使表現帶有C端myc-myc-六組胺酸標誌的約0.25nM人類MET胞外域首先被捕獲至該生物感測器上。接而藉由將生物感測器浸入含有50μg/mL第一抗-MET單株抗體(之後稱為mAb-1)溶液的孔中歷時5分鐘，抗原經捕獲的生物感測器以mAb-1予以飽和。之後，將生物感測器浸入含有50μg/mL第二抗-MET單株抗體(之後稱為mAb-2)溶液的孔中歷時3分鐘。在實驗的每個步驟之間，於OCTET® HEPES-緩衝食鹽水-EDTA聚山梨醇酯20(HBS-EP)緩衝液中洗滌所有生物感測器。在實驗過程期間監測即時結合反應並且在每個步驟結束時紀錄結合反應。比較mAb-2結合至與預先與mAb-1複合之抗-MET的反應並且使用50%抑制閾值決定不同抗-MET單株抗體的競爭性/非競爭性行為。表4明確定義以兩個方向競爭的抗體關係，與結合順序無關。
Figure 106139257-A0202-12-0076-572
Figure 106139257-A0202-12-0077-573
實例5. 建構具有對MET之不同表位具有特異性之兩個不同抗原結合域的雙特異性抗體
本實例說明建構包含兩個不同抗原結合域(D1與D2)的雙特異性抗體，其中D1與D2衍生自不同抗-MET抗體，且之後結合至MET胞外域上的個別表位。
用於建構本實例之雙特異性抗體的個別抗-MET抗原結合域是衍生自本文實例1至3中的不同二價、單特異性抗-MET抗體。本文所述的全部抗-MET抗體包含相同(「共用」)輕鏈(包含SEQ ID NO：138的輕鏈可變區[LCVR]胺基酸序列，以及SEQ ID NO：140、142和144的輕鏈CDR[LCDR1、LCDR2和LCDR3]胺基酸序列)。此外，本實例中所描述的全部雙特異性抗體含有衍生自例示性抗-MET抗體H4H13312P2的「D2」臂。因此，本實例中所述全部雙特異性抗體的抗原結合域(D1與D2)均包含這個共有輕鏈可變區，且所有D2結合臂包含H4H13312P2的重鏈可變區；但是，這些雙特異性抗體彼此不同在於其D1重鏈可變區(HCVR)以及重鏈CDR(HCDR)。本實例之雙特異性抗 體的構成要素歸納於表5中。
Figure 106139257-A0202-12-0078-574
Figure 106139257-A0202-12-0079-575
實例6. MET x MET雙特異性單株抗體之表面電漿共振衍生的結合親和力以及動力學常數
在37℃下，藉由表面電漿共振(Biacore 4000或T-200)測定依據本文實例4所建構之MET x MET雙特異性抗體的結合親和力以及動力學常數。表現為人類IgG4(命名為「H4H」)的雙特異性抗體被捕獲至CM4或CM5 Biacore感測器表面上，該感測器表面經由偶合單株小鼠抗人類Fc抗體(GE,BR-1008-39)的胺予以衍生化。將不同濃度的可溶性單體MET蛋白(hMet.mmh，SEQ ID NO：152)以30或50μL/分的流速注射遍布抗-MET x MET雙特異性抗體被捕獲的表面上。監測分析物與被捕獲雙特異性抗體的締合歷時4或5分鐘，並且監測分析物在HBS-ET(0.01M HEPES pH 7.4、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.05% v/v Surfactant P20)或PBS-P(0.01M磷酸鈉、pH 7.4、0.15M NaCl、0.05% v/v Surfactant P20)操作緩衝液中的解離歷時10分鐘。
動力學締合(k a)與解離(k d)速率常數是如實例3中所述予以確定。
雙特異性抗-Met抗體對單體Met蛋白(hMET.mmh)的結合動力學參數顯示於表6中。
Figure 106139257-A0202-12-0080-576
如表6中所示，本文所述的雙特異性「MET x MET」抗體展現出至多大於1155分的T½值。
如表7中所示，雙特異性抗體H4H14639D的解離速率明顯低於其親代抗體H4H13306P2和H4H13312P2各者的解離速率。
Figure 106139257-A0202-12-0080-577
實例7. 抗-Met抗體在SRE-螢光素酶報導子生物分析中阻斷HGF媒介的Met活化
抗-MET抗體阻斷肝細胞生長因子(HGF)媒介之MET活化的能力是在以螢光素酶為基礎的報導子分析中進行檢驗。生長因子HGF結合至其受體c-Met(MET)的胞外域，引發快速同二聚體化並且活化數個下游信號傳導級聯。在本實例中所測試的抗-MET抗體為MET的二價單特異性結合子，或者抗-MET「雙特異性」，其中雙特異性抗體的每一個臂結合至MET上的不同與個別表位。
以經改造細胞為基礎的螢光素酶報導子分析(圖2)被用來測定抗-MET抗體活化MET信號傳導的能力(圖3，A圖；表8，第3與4列)，以及阻斷配體媒介之MET活化的能力(圖3，B圖；表8，第1與2列)。簡言之，CIGNALTM Lenti SRE Reporter(luc)套組(SABiosciences,Hilden,DE)被用於生成HEK293/SRE-Luc細胞。HEK293(人類胚腎)細胞是因為它們內源性地表現c-Met而被選出。HEK293/SRE-Luc細胞穩定地併入血清反應要素(SRE)-依賴性螢光素酶(Luc)報導子(參見Dinter et al.,PLoS ONE 10(2)：e0117774,2015)。HEK293/SRE-Luc細胞培養於補充有10%胎牛血清(FBS)、青黴素/鏈黴素/麩醯胺酸，以及1μg/ml嘌呤黴素的DMEM中。
接著，將2.0 x 105個HEK293/SRE-Luc細胞種植於96孔盤的螢光素酶分析培養基中，並且於37℃、5% CO2下培育過夜。肝細胞生長因子(HGF)劑量反應曲線是透過向細胞添加經連續稀釋的HGF(0.01pM至1.0nM)，並且在抗體不存在的情況下於37℃下培育歷時四至六小時之後記錄螢光素酶信號而生成。為了生成抗體抑制曲線，細胞在37℃下與經連續稀釋的抗-人類MET抗體(1.1pM至200nM)預先培育歷時一小時。繼而在記錄信號之前添加濃度為73pM或100pM的HGF歷時又四至六小時。也在配體不存在的情況下分別評估抗體活化c-Met的能力。
使用ONE-GloTM Luciferase Assay System(Promega,Madison,WI)偵測螢光素酶活性，並在Victor或Envision光度計(Perkin Elmer,Shelton,CT)上測量發射光且表示為相對光單位(RLU)。使用 GRAPHPAD PRISM®，對12點反應曲線從四參數邏輯方程式來決定EC50/IC50值。針對最高抗體劑量報導HGF阻斷百分率以及MET活化倍數(單獨mAb)。結果顯示於表8中。
Figure 106139257-A0202-12-0082-578
Figure 106139257-A0202-12-0083-579
 NT=未測試；ND=EC50/IC50未測定，因為非S形曲線或不完全阻斷。
如表8中所歸納，大部分抗體抑制SRE報導子的活化，IC50值範圍從<2.0pM至約1.0nM。數個例示性單特異性二價抗-MET抗體(諸如H4H13306P2與H4H13309P2)是SRE-luc活化的強力抑制劑，抑制值百分率分別為67%與77%。抗-MET雙特異性抗體(MET x MET)從頭到尾展現出更為抑制SRE-luc活化。例如，MET x MET雙特異性抗體H4H14639D呈現95%抑制。此外，數個阻斷抗體在配體不存在的情況下微弱地活化，活化反應倍數範圍從高出基線0.8至14.4。
如圖3中所示，二價單特異性抗體H41413306P2以及 H4H13312P2各自在HGF配體不存在的情況下活化Met路徑(A圖)而且還阻斷Met的HGF活化(B圖)。
亦使用HEK293/SRE-Luc系統來評估雙特異性MET x MET抗體(例如H4H14639D)對HGF依賴性以及HGF獨立性MET活化的影響。在用不同濃度之MET抗體H4H14639D(MET x MET雙特異性抗體)、單價抗-MET抗體以及H4H14639D親代抗體H4H13312P2處理的HEK293T細胞中測量SRE所驅動的螢光素酶活性，以確認HGF獨立性MET促效作用的程度。儘管親代抗-MET單特異性二價抗體顯示了MET促效劑活性，但單價或MET x MET雙特異性抗體均未顯示出MET促效劑活性(圖4，A圖)。
在用不同濃度之MET抗體H4H14639D(MET x MET雙特異性抗體)、單價抗-MET抗體以及H4H14639D親代抗體H4H13312P2處理的HEK293T細胞中測量SRE所驅動的螢光素酶活性，以確認HGF依賴性MET促效作用的抑制程度或阻斷程度。儘管親代抗-MET單特異性二價抗體顯示出一些HGF阻斷活性，但單價與MET x MET雙特異性抗體均顯示出更高的HGF阻斷(圖4，B圖)。
MET x MET雙特異性抗體阻斷HGF信號傳導並展現出低MET促效劑活性。
實例8. 抗-Met抗體抑制Met-經擴增細胞的生長
接著，測試選定之抗-Met抗體抑制MET經擴增SNU5細胞生長的能力。簡言之，2.5 x 103個人類胃癌(SNU5)細胞於存在有濃度範圍1.5pM至100nM之抗-MET抗體的情況下被種入完全生長培養基中。SNU5完全生長培養基含有依思可夫氏改良的杜貝可氏培養基(Iscove's Modified Dulbecco's Medium)、10% FBS，以及青黴素/鏈黴素/麩醯胺酸。培育細胞歷時5天並且使用CELLTITER-GLO® Luminescent Cell Viability Assay套組(Promega,Madison,WI)依據製造商說明書來測定存活細胞數。
如表9中所歸納，數個抗-MET抗體(諸如H4H13312P2和H4H13325P2)阻斷SNU5生長達超過50%，整體IC50範圍從44pM至780pM。
圖5描述經各種抗-MET二價單特異性抗體(亦即習知抗體)處理的SNU5細胞的相對細胞生長。習知MET抗體的一個子集抑制SNU5 MET經擴增胃癌細胞的生長(圖5)。96孔盤中的SNU5細胞經10μg/ml的個別抗體處理，並且在5天後透過ALAMARBLUE®試劑(Thermo Fisher Scientific,Waltham,MA)的還原來測定細胞生長。單價MET抗體(第2列，圖5)是使用如美國專利7,892,550 B2中所列MetMab的重鏈與輕鏈可變序列而產生，該件專利以全文引用的方式併入本文中。習知抗體8為H4H13306P2，而習知抗體11為H4H13312P2，其用於建構MET x MET雙特異性抗體H4H14639D。
在一個個別的生長分析中，於SNU5以及非小細胞肺癌(NSCLC)細胞株EBC-1中評估MET x MET雙特異性抗體(亦即H4H14639D)的阻斷活性，NSCLC細胞株EBC-1還展現擴增的Met基因且過度表現MET(Lutterbach et al.,Cancer Res.67(5)：2081-2088,2007)。EBC-1細胞的完全生長培養基含有MEM邇氏鹽(Earle's Salts)、10%胎牛血清(FBS)、青黴素/鏈黴素/麩醯胺酸以及用於MEM的非必需胺基酸。依據SRE-螢光素酶讀數，H4H14639D在MET活性方面展現出最大抑制百分率。在目前的實驗中，3.0 x 103個SNU5或EBC-1細胞於濃度範圍為15pM至100nM的H4H14639D存在下被種植在完全生長培養基中。在37℃、5% CO2下培育細胞歷時3天。接著在4%甲醛中固定細胞並且用3μg/ml Hoechst 33342染色以標記細胞核。在IMAGEXPRESS® Micro XL(Molecular Devices,Sunnyvale,CA)上擷取影像並且經由METAXPRESS® Image Analysis軟體(Molecular Devices,Sunnyvale,CA)確定細胞核計數。所有孔扣除經40nM毛地黃皂苷處理的細胞之背景細胞核計數而生存力表示為未經處理對照的百分率。對10點反應曲線從四參數邏輯方程式來確定IC50值(GRAPHPAD PRISM®)。IC50值以及細胞殺滅百分率顯示於表9中。
Figure 106139257-A0202-12-0085-580
Figure 106139257-A0202-12-0086-581
 ND=IC50未確定，因為非S形曲線或不完全阻斷
如下表10中所歸納，MET x MET雙特異性抗體H4H14639D抑制EBC-1以及SNU5細胞的生長達37%與40%，而IC50分別為0.8nM以及0.3nM。
Figure 106139257-A0202-12-0086-582
96孔盤中的SNU5細胞(胃)經對照抗體、單價MET抗體或MET x MET雙特異性抗體以0.1μg/mL、1μg/mL或10μg/mL處理。在5天後，藉由ALAMARBLUE®試劑(Thermo Fisher Scientific,Waltham,MA)的還原測定細胞生長。相較於對照以及單價抗體，MET x MET雙特異性抗體明顯降低SNU5細胞的相對細胞生長(圖6，A圖)。
同樣地，評估MET x MET雙特異性抗體對於EBC-1細胞生長的影響。2,500個EBC-1細胞被種植在96孔盤中並且在補充有10% FBS的依思可夫氏改良的杜貝可氏培養基中培養。用對照抗體或MET x MET雙特異性抗體以0.1μg/mL或1μg/mL處理細胞，並接著以 5% CO2在37℃下培育。5天後，透過在Spectramax® M3讀盤儀(Molecular Devices,LLC,Sunnyvale,CA)中測量指示劑染料ALAMARBLUE®還原成其高度螢光形式來測定相對細胞生長。結果顯示於表11以及圖6，B圖中。相較於對照抗體，MET x MET雙特異性抗體(H4H14639D)明顯降低EBC-1細胞的相對細胞生長(圖6，B圖)。
數個抗-MET抗體(二價單特異性以及MET x MET二價均有)是SRE-Luc活化的強效抑制劑且抑制Met-經擴增以及MET-過度表現細胞株的生長。
Figure 106139257-A0202-12-0087-583
實例9. MET x MET雙特異性抗體在NCI-H596 NSCLC細胞中誘發適量且暫時 的MET路徑活性
於活體外評估MET x MET雙特異性抗體在人類肺腺鱗狀癌細胞中對於MET路徑的影響。
250,000個NCI-H596細胞被種入12孔盤中並且培養於補充有10% FBS的RPMI培養基內。以二重複的方式，用50ng/ml的肝細胞生長因子(HGF)或10μg/ml的MET x MET雙特異性抗體H4H14639D處理細胞。接著在37℃下以5% CO2培育細胞。於0、2、6或18小時之後，製備細胞溶解產物，將蛋白質含量常規化並且進行免疫印漬分析。使用ImageJ影像處理程式(T.Collins,BioTechniques 43：S25-S30,2007)量化MET磷酸化以及ERK磷酸化。將磷酸化位準相對於微管蛋白加載對照進行常規化並且表示為相對於對照處理的變化倍數。結果歸納於表12中。
Figure 106139257-A0202-12-0087-584
Figure 106139257-A0202-12-0088-585
NCI-H596細胞的HGF處理會誘發MET以及ERK的強烈活化，其在2小時之時達到最高，並且在18小時後仍維持著。在H4H14636D雙特異性抗體處理的情況下偵測到適度MET以及ERK磷酸化，其分別在18或6小時之前回到基線位準。
實例10. MET x MET雙特異性抗體在Hs746T胃癌細胞中比單特異性抗體更強烈誘發MET降解並且抑制路徑活性
於活體外評估MET x MET雙特異性抗體對於人類胃癌細胞之MET活性的影響。250,000個Hs746T人類胃癌細胞(H.Smith,J.Nat’l.Cancer Inst.62(2)：225-230,1979)被種入12孔盤並且培養在補充有10% FBS之經改良的杜貝可氏培養基中。用以下處理細胞：(1)5μg/ml的hFc對照分子、(2)5μg/ml的親代二價單特異性抗-MET抗體H4H13306P2、(3)5μg/ml的親代二價單特異性抗-MET抗體H4H13312P2、(4)2.5μg/mL的H4H13306P2與2.5μg/mL的H4H13312P2的組合，或(5)5μg/ml的MET x MET雙特異性抗體H4H14639D。接著在37℃下以5% CO2培育細胞。18小時之後，製備細胞溶解產物，將蛋白質含量常規化並且進行免疫印漬分析。使用ImageJ影像處理程式(T.Collins,BioTechniques 43：S25-S30,2007)量化MET表現、MET磷酸化以及ERT磷酸化。結果歸納於表17以及圖7、A圖中，其描述原始免疫印漬數據。圖7的B圖描述在經10μg/ml MET x MET雙特異性抗體處理歷時0、2或6小時的細胞中的MET蛋白表現。在用MET x MET雙特異性抗體處理之後，Hs747T細胞中的總MET位準隨著時間下降。MET經擴增人類乳頭狀腺癌NCI-H820細胞株得到類似的結果(Bean et al.,「MET amplification occurs with or without T790M mutations in EGFR mutant lung tumors with acquired resistance to getfitnib or erlotinib,」Proc.Natl.Acad.Sci.2007 Dec 26,104(52)：20932-20937)。
Figure 106139257-A0202-12-0089-586
雙特異性抗體H4H14639D比其親代習知抗體更為強烈地誘發MET降解。透過用H4H14636D處理比用親代抗體或親代抗體的組合更為有效地抑制MET以及ERK磷酸化。
用對照抗體、MET x MET雙特異性抗體H4H14639D、抗-MET親代抗體H4H13306P2、抗-MET親代抗體H4H13312P2以及親代抗體1與2的組合處理Hs746T胃癌細胞歷時18小時，各抗體為10μg/ml或親代抗體組合各為5μg/ml。藉由使用指明抗體的免疫印漬來測定MET表現(MET)以及路徑活化(pMET與pErk)(圖8)。在Hs746T胃癌細胞中，MET x MET雙特異性抗體比其親代抗體更為有效地抑制MET路徑活化。
實例11. MET x MET雙特異性抗體在NCI-H596肺癌細胞中比單特異性抗體更強烈地誘發MET降解
評估MET x MET雙特異性抗體以及親代二價單特異性抗-MET抗體對於人類肺腺癌細胞之肝細胞生長因子受體(HGFR或MET)表現位準的影響。250,000個NCI-H596人類肺腺癌細胞被種入12孔盤並且培養在補充有10% FBS之RPMI培養基中。用以下處理細胞：(1)5μg/ml的hFc對照分子、(2)5μg/ml的親代二價單特異性抗-MET抗體H4H13306P2、(3)5μg/ml的親代二價單特異性抗-MET抗體H4H13312P2、(4)2.5μg/mL的H4H13306P2與2.5μg/mL的H4H13312P2的組合，或(5)5μg/ml的MET x MET雙特異性抗體H4H14639D。接著 在37℃下以5% CO2培育細胞。18小時之後，製備細胞溶解產物，將蛋白質含量常規化並且進行免疫印漬分析。使用ImageJ影像處理程式(T.Collins,BioTechniques 43：S25-S30,2007)量化MET表現。結果歸納於表14中。
Figure 106139257-A0202-12-0090-587
NCI-H596(MET外顯子14省略突變(skip mutation))肺癌細胞亦經10μg/ml的對照抗體或MET x MET雙特異性抗體處理歷時2、6或18小時。藉由免疫印漬測定MET表現(圖9)，其顯示MET x MET雙特異性抗體誘發的MET降解是隨著處理時間而增加。
雙特異性抗體H4H14636D在NCI-H596肺癌細胞中比其親代習知抗體更為強烈地誘發MET降解。
實例12. MET x MET雙特異性抗體在SNU5胃癌細胞中比單特異性抗體更為強烈地誘發MET降解並且抑制路徑活化
評估二價單特異性抗-MET抗體以及數個MET x MET雙特異性抗體對於胃癌細胞的肝細胞生長因子受體(HGFR或MET)表現位準的影響。將人類胃癌SNU5細胞平鋪於含有20% FBS加上pen-strep-麩醯胺酸的依思可夫氏培養基中。種植後24小時，用對照hFc、抗-MET親代二價單特異性抗體H4H13312P2，或MET x MET雙特異性抗體(H4H14634D、H4H14635D、H4H14636D、H4H14637D、H4H14638D、H4H14639D、H4H14640D、H4H14641D)處理細胞歷時18小時。接著製備細胞溶解產物並透過西方印漬分析。免疫印漬是針對MET以及微管蛋白進行探測。量化MET蛋白表現位準並且相對於微管蛋白加載對照進行常規化。結果呈現於表15以及圖10、B圖中。
Figure 106139257-A0202-12-0091-588
SNU5癌細胞如上所述經10μg/ml的對照抗體或MET x MET雙特異性抗體或單價MET抗體處理歷時18小時。藉由使用指明抗體的免疫印漬測定MET表現(圖10，A圖與B圖)，以及路徑活化(亦即pMET與pERK；A圖)。免疫印漬顯示於圖10中。
用MET x MET雙特異性抗體處理SNU5細胞比用二價單特異性抗-MET抗體(H4H13312P2)(圖10，B圖)、單價MET抗體或對照hFc更為強烈地誘發MET降解。用MET x MET雙特異性抗體處理SNU5細胞抑制MET路徑的下游效應子。MET經擴增的非小細胞肺癌腺癌細胞株NCI-H1993(Kubo et al.,「MET gene amplification or EGFR mutation activate MET in lung cancers untreated with EGFR tyrosine kinase inhibitors,」Int.J.Cancer 2009 Apr 15；124(8)：1778-1784)得到類似結果。
實例13. MET x MET雙特異性抗體在EBC-1細胞中比單特異性抗體更為強烈地誘發MET降解、抑制路徑活性並且抑制腫瘤生長
如上所述，用對照抗體或10μg/ml的MET x MET雙特異性抗體處理MET-經擴增人類肺鱗狀細胞癌EBC-1細胞(Lutterbach et al.,「Lung cancer cell lines harboring MET gene amplification are dependent on Met for growth and survival,」Cancer Res.2007 Mar 1；67(5)：2081-8)歷時18小時。藉由使用指明抗體的免疫印漬來測定MET表現以及依據pMET與pErk表現確認之MET路徑活化。免疫印漬顯示於圖11中。
用MET x MET雙特異性抗體處理EBC-1細胞(帶有MET基因擴增)比用對照抗體處理更為強烈地誘發MET降解。用MET x MET雙特異性抗體處理EBC-1細胞抑制MET路徑的下游效應子。
在另一個實驗中，5百萬個EBC-1細胞被皮下植入C.B.-17 SCID小鼠的側脅。在腫瘤體積達到約150mm3之後，將小鼠隨機分成6隻的組別並且用25mg/kg對照抗體或25mg/kg MET x MET雙特異性抗體H4H14639D處理一週兩次。在植入後監測腫瘤生長歷時30天並且隨著時間針對各實驗組測量腫瘤體積(mm3)。結果描述於表16以及圖12中，其顯示MET x MET雙特異性抗體明顯抑制EBC-1腫瘤的生長。
Figure 106139257-A0202-12-0092-589
實例14. MET x MET雙特異性抗體比單特異性抗更強烈地抑制Hs746T胃癌細胞的活體外生長
於活體外評估MET x MET雙特異性抗體對於人類胃癌細胞生長的影響。2,500個Hs746T人類胃癌細胞(H.Smith,J.Nat’l.Cancer Inst.62(2)：225-230,1979)被種入96孔盤並且培養在補充有10% FBS之經改良的杜貝可氏培養基中。用以下處理細胞：(1)5μg/ml的個別二價單特異性抗-MET抗體(H4H13306P2或H4H13312P2)、(2)兩個二價單特異性抗-MET親代抗體(H4H13306P2與H4H13312P2)的組合，各為2.5μg/ml，或(3)5μg/ml之含有一個來自H4H13306P2之結合臂以及另一個來自H4H13312P2(H4H14639D)之結合臂的雙特異性抗體。接著在37℃下以5% CO2培育細胞。5天之後，藉由在Spectramax® M3讀盤儀(Molecular Devices,Sunnyvale,CA)中測量指示劑染料ALAMAR BLUE®(ThermoFischer Scientific,Waltham,MA)還原成其高度螢光形式來測定相對細胞生長。螢光增加與細胞生長相關聯。表17描述各抗體處理相對於對照(無處理)Hs746T細胞生長常規化的相對Hs746T細胞生長。雙特異性抗體H4H14639D比其親代單特異性抗體單獨或以組合的方式更為強烈地抑制Hs746T細胞增殖。
Figure 106139257-A0202-12-0093-590
用對照抗體、MET x MET雙特異性抗體H4H14639D、抗-MET親代抗體H4H13306P2、抗-MET親代抗體H4H13312P2，以及親代抗體1與2的組合處理Hs746T胃癌細胞，各抗體為2μg/m。在5天之後，藉由ALAMAR BLUE®試劑的還原測定細胞生長(圖13，A圖)。相對於親代抗體單獨或呈組合的形式，MET x MET雙特異性抗體在Hs746T胃癌細胞中較其親代抗體更為強烈地抑制細胞生長，並且抑制MET路徑活化。
用25μg/mL對照抗體、1μg/mL、10μg/mL或25μg/mL單價MET抗體，或1μg/mL、10μg/mL或25μg/mL MET x MET雙特異性抗體處理96孔盤中的Hs746T胃癌細胞。在5天之後，藉由ALAMAR BLUE®試劑的還原測定Hs746T胃癌細胞生長(圖13，B圖)。MET x MET雙特異性抗體強烈地抑制MET-經擴增細胞的生長。
實例15. MET x MET雙特異性抗體於活體外不誘發NCI-H596肺癌細胞的生長
於活體外評估MET x MET雙特異性抗體對於人類非小細胞肺癌(NSCLC)細胞(NCI-H596)生長的影響。10,000個NCI-H596肺腺鱗狀癌細胞(Nair et al.,J.Nat’l.Cancer Inst.86(5)：378-383,1994)被種入96孔盤中，於補充有1%胎牛血清(FBS)之培養基的0.66%瓊脂層上。在補充有1% FBS加上0.3%瓊脂糖的RPMI 1640培養基中培養細胞。用以下處理細胞：(1)5μg/ml的個別親代二價單特異性抗-MET抗體(H4H13306P2或H4H13312P2)、(2)各為2.5μg/ml之兩個親代二價單特異性抗-MET抗體(H4H13306P2與H4H13312P2)的組合、(3)5μg/ml之含有一個來自H4H13306P2之結合臂以及另一個來自H4H13312P2 (H4H14639D)之結合臂的雙特異性抗體，或(4)100ng/mL肝細胞生長因子(HGF)。接著在37℃下以5% CO2培育細胞。在兩週之後，藉由在Spectramax® M3讀盤儀(Molecular Devices,Sunnyvale,CA)中測量指示劑染料ALAMAR BLUE®(Thermo Fischer Scientific,Waltham,MA)還原成其高度螢光形式來決定相對細胞生長。螢光增加與細胞生長相關聯。表18以及圖14描述各抗體處理相對於對照(無處理)NCI-H596細胞生長常規化的相對NCI-H596細胞生長。以HGF處理NCI-H596肺癌細胞在軟瓊脂中強烈誘發生長。相對於對照處理細胞，MET x MET(圖14中的MM)雙特異性抗體H4H14639D未明顯改變生長。在各親代二價單特異性抗體H4H13306P2(M1)或H4H13312P2(M2)個別或呈組合(H4H13306P2與H4H13312P2)(M1M2)的情況下觀察到適量的細胞生長。
Figure 106139257-A0202-12-0094-591
實例16. MET x MET雙特異性抗體比單特異性抗體更為強烈地抑制SNU5胃癌細胞的活體外生長
於活體外評估MET x MET雙特異性抗體對於人類胃癌細胞生長的影響。2,500個SNU5人類胃癌細胞(Ku and Park,Cancer Res.Treat.37(1)：1-19,2005)被種入96孔盤並且培養於補充有20% FBS的依思可夫氏改良的杜貝可氏培養基中。用以下處理細胞：(1)5μg/ml的個別二價單特異性抗-MET抗體(H4H13306P2或H4H13312P2)、(2)兩個二價單特異性抗-MET抗體(H4H13306P2與H4H13312P2)的組合，各為2.5μg/ml，或(3)5μg/ml之含有一個來自H4H13306P2之結合臂以及另一個來自H4H13312P2(H4H14639D)之結合臂的雙特異性抗 體。接著在37℃下以5% CO2培育細胞。在5天之後，藉由在Spectramax® M3讀盤儀(Molecular Devices,Sunnyvale,CA)中測量指示劑染料ALAMAR BLUE®(Thermo Fischer Scientific,Waltham,MA)還原成其高度螢光形式來決定相對細胞生長。螢光增加與細胞生長相關聯。表19描述各抗體處理相對於對照(無處理)SNU5細胞生長常規化的相對SNU5細胞生長。雙特異性抗體H4H14639D比其親代單特異性抗體更為強烈地抑制SNU5細胞增殖。
Figure 106139257-A0202-12-0095-592
實例17. MET x MET雙特異性抗體誘發Hs746T腫瘤異種移植的消退
在免疫低下小鼠模型中評估MET x MET雙特異性抗體對於人類胃癌腫瘤的影響。三百萬個Hs746T人類胃癌細胞被皮下植入至CB-17 SCID小鼠的側脅(Bancroft et al.,J.Immunol.137(1)：4-9,1986)。在腫瘤體積達到約200mm3之後，將小鼠隨機分成6隻的組別並且用25mg/kg的對照抗體或25mg/kg的MET x MET雙特異性抗體(H4H14639D)處理一週兩次。移植後針對對照組監測腫瘤生長歷時16天，直到經對照處理腫瘤達到協定尺寸限值。在移植後針對經H4H14639處理組監測腫瘤生長歷時30天。
相對於在處理開始之時，用MET x MET雙特異性抗體處理腫瘤會在21天內誘發腫瘤尺寸消退。經對照處理腫瘤顯示在16天生長期間體積平均增加約12倍(表20)。相對於時間的腫瘤體積顯示於圖15中，其表現出因為MET x MET雙特異性抗體所致的Hs746T腫瘤消退。
Figure 106139257-A0202-12-0096-593
實例18. MET x MET雙特異性抗體誘發SNU5腫瘤異種移植的消退
在免疫低下小鼠模型中評估MET x MET雙特異性抗體對人類胃癌腫瘤的影響。一千萬個SNU5人類胃癌細胞被皮下植入CB-17 SCID小處的側脅。在腫瘤體積達到約500mm3之後，將小鼠隨機分為五隻的組別並且用10mg/kg對照抗體或用1mg/kg或10mg/kg的MET x MET雙特異性抗體(H4H14639D)處理一週兩次。植入後監測腫瘤生長歷時81天，直到經對照處理腫瘤達到協定尺寸限值。
用1mg/kg或10mg/kg的MET x MET雙特異性抗體處理之小鼠的腫瘤證明尺寸分別平均減少約95%或98%。經對照處理的腫瘤顯示自處理開始起體積平均增加約12倍(表21)。
Figure 106139257-A0202-12-0096-594
皮下植入的SNU5腫瘤用對照抗體、1mg/kg或10mg/kg單價MET抗體，或1mg/kg或10mg/kg MET x MET雙特異性抗體處理每週兩次。隨著時間觀察到，在那些經MET x MET雙特異性處理的小鼠體內，MET經擴增的SNU腫瘤強烈且持續地消退(亦即腫瘤體積減少)(圖16，A圖)。由實驗結束時的腫瘤抽取蛋白質並且藉由免疫印漬測定依據如MET磷酸化(pMET表現)所指示的路徑活化。經MET x MET處理的小鼠(腫瘤)顯示，MET以及pMET表現相對於對照減少(圖16，B圖)。MET x MET雙特異性抗體是帶有MET擴增之腫瘤的一個強效抑制劑。
實例19. MET x MET雙特異性抗體誘發U87-MG腫瘤異種移植的消退
在免疫低下小鼠模型中評估MET x MET雙特異性抗體對於人類神經膠質母細胞瘤腫瘤的影響。五百萬個U87-MG人類神經膠質母細胞瘤細胞(Vordermark and Brown,Int.J.Radiation Biol.56(4)：1184-1193,2003)被皮下植入CB-17 SCID小鼠的側脅。U87-MG神經膠質母細胞瘤異種移植模型是由自泌HGF信號傳導所驅動。在腫瘤體積達到約100mm3之後，將小鼠隨機分為六隻的組別並且用對照抗體或MET x MET雙特異性抗體(H4H14639D)處理。向每隻小鼠投與25mg/kg抗體(對照或MET x MET)每週兩次。植入後監測腫瘤生長歷時29天，直到經對照處理的腫瘤達到協定尺寸限值。
用MET x MET抗體處理之小鼠的腫瘤證實尺寸平均減少約38%，而經對照處理的腫瘤顯示在生長29天內體積平均增加約19倍(表22)。隨著時間的腫瘤體積顯示於圖17中，其顯示因為MET x MET雙特異性抗體所致的U87-MG腫瘤消退。
Figure 106139257-A0202-12-0097-595
實例20. MET x MET雙特異性抗體抑制U118-MG腫瘤異種移植的生長
在免疫低下小鼠模型中評估MET x MET雙特異性抗體對人類神經膠質母細胞瘤腫瘤的影響。U118-MG神經膠質母細胞瘤異種移植模型是由自泌HGF信號傳導所驅動。五百萬個U118-MG人類神經膠質母細胞瘤細胞(Olopade et al.,Cancer Research 52：2523-2529,1992)被皮下植入CB-17 SCID小鼠的側脅。在腫瘤體積達到約100mm3之後，將小鼠隨機分為六隻的組別並且用對照抗體或MET x MET雙特異性抗體(H4H14639D)處理。向每隻小鼠投與25mg/kg抗體(對照或MET x MET)每週兩次。植入後監測腫瘤生長歷時72天。
在72天期間，MET抗體抑制腫瘤生長達99%(表23)。
Figure 106139257-A0202-12-0098-596
在另一個實驗中，用25mg/kg對照抗體、單價MET抗體或MET x MET雙特異性抗體處理小鼠體內的經皮下植入U118-MG神經膠質母細胞瘤腫瘤每週兩次。針對各實驗組隨著時間測量腫瘤體積(mm3)。結果描述於圖18中，其顯示MET x MET雙特異性抗體抑制U118-MG腫瘤的生長。
實例21. 類美登素合成
如下文所述，由化合物2(圖19)合成美登素-3-N-甲基-L-丙胺酸-N-Me-β-丙胺酸-胺甲醯基-(p-胺基)苯甲基-瓜胺酸-纈胺酸-己二醯基-丁二酸鹽(圖20中的化合物1)。
美登素-3-N-甲基-L-丙胺酸-Fmoc-N-Me-β-丙胺酸(化合物3，圖19)。去甲基-乙醯基-美登素(化合物2，圖19，0.433g，0.666mmol)、Fmoc-N-Me-β-Ala(0.434g，1.33mmol)以及HATU(0.757g，1.99mmol)秤重至乾燥燒瓶中、溶解於無水DMF(9mL)中，並且用4-甲基嗎啉(0.300mL，2.73mmol)處理。以橡膠隔片密封燒瓶、以氬氣吹洗，並且在環境溫度下攪拌反應物。3天之後，將混合物蒸發成油狀物、溶解於乙腈與水中，並且在275g C18矽膠管柱上藉由急驟層析(20分鐘內30-90%乙腈/水，0.05%乙酸於兩相中)純化。凍乾產物溶離份產生如白色固體的標題化合物。粗產物在80g矽膠管柱上純化(17分鐘內EtOAc-5：5：1 EtOAc：DCM：MeOH)。純溶離份經合併、蒸發，並且在真空中乾燥過夜，產生如白色固體的標題化合物(0.424g，66%)。MS(ESI,pos.)：C51H61ClN4O12的計算值為956.4；實驗值為956.9(M+H)，979.0(M+Na)，939.0(M-H2O+H)。
N-第三丁氧基羰基-N-甲基-β-丙胺酸丁二酸酯(化合物4，圖19)。透過技藝中熟知的方法由商業Boc-N-Me-β-Ala-OH製備標題化合物(參見Widdison et al.,J.Med.Chem.,2006,49(14),4401)。1H NMR(300MHz,CDCl3)：δ 3.62(bm,2H),2.88(m,9H),1.47(s,9H)。
美登素-3-N-甲基-L-丙胺酸-Boc-N-Me-β-丙胺酸(化合物5，圖19)。方法A：先前步驟的產物(化合物4，圖19，0.453g，1.51mmol)以及去甲基-乙醯基-美登素(化合物2，圖19，0.304g，0.468mmol)溶解於3：1乙腈：水(8mL)中、用1M NaHCO3水溶液(0.5mL)處理，並且在環境溫度下攪拌歷時18小時。當依據TLC測定為反應完全時，接著以鹽水攪拌歷時10分鐘並且用乙酸乙酯(EtOAc)萃取三次。繼而將合併的有機層於Na2SO4上乾燥、過濾，並濃縮濾液，且於真空中乾燥成金色漿液，其藉由急驟管柱層析在20g矽膠匣(在15分鐘內0-10% MeOH/EtOAc)上純化，產生如白色固體的標題化合物(0.084g，43%)。MS(ESI,pos.)：C41H59ClN4O12的計算值834.4；實驗值835.2(M+H)，857.2(M+Na)，817.4(M-H2O+H)。
方法B：將Boc-N-Me-β-Ala-OH(0.294g，1.45mmol)溶解於無水DMF(5mL)中、用五氟苯基二苯基亞膦酸酯(FDPP，0.555g，1.44mmol)處理，並在環境溫度下攪拌反應物歷時30分鐘。接著將混合物轉移到含有去甲基-乙醯基-美登素(化合物2，圖19，0.462g，0.711mmol)以及於無水DMF(7mL)中之二異丙基乙胺(DIEA，0.250mL，1.44mmol)之混合物的較大燒瓶中、以橡膠隔片密封燒瓶、以氬氣吹洗，並且在環境溫度下再攪拌反應物。24小時之後，在真空終將反應物濃縮成油、溶解於乙酸乙酯(EtOAc，2mL)中，並且在40g矽膠匣(在15分鐘內EtOAc-5：5：1 EtOAc/DCM/MeOH)上純化，產生淺黃色固體的標題化合物(0.468g，79%)。MS(ESI,pos.)：C41H59ClN4O12的計算值834.4；實驗值857.2(M+Na)，817.2(M-H2O+H)。
美登素-3-N-甲 基 -L-丙胺酸-N-Me-β-丙胺酸 (化合物6，圖19)。方法A：將美登素-N-Me-L-Ala-Boc-N-Me-β-Ala(化合物5，圖19，0.464g，0.555mmol)溶解於乙腈/水/三氟乙酸的3：1：1混合物(7mL)中、以橡膠隔片密封燒瓶、以氬氣吹洗，並且在環境溫度下攪拌反應物歷時24小時，接著加蓋並且儲存在-20℃下歷時3天。粗製反應混合物溫熱至環境溫度歷時2小時、在真空下簡略濃縮、在100g C18 RediSep Gold管柱(25分鐘內20-80%乙腈/水，0.1% TFA於兩種溶劑內)上純化，並且在環境溫度下將合併的純溶離份部分蒸發、於乾冰浴 中冷凍，且凍乾而產生如淡黃色固體的標題化合物(0.295g，63%)。MS(ESI,pos.)：C36H51ClN4O10的計算值734.3；實驗值735.7(M+H)，1471.3(2M+H)。
方法B：將美登素-N-Me-L-Ala-Fmoc-β-Ala(化合物3，圖19，0.422g，0.441mmol)溶解於DMF中之5%哌啶(6.00mL，3.04mmol)中、以橡膠隔片密封燒瓶、以氬氣吹洗，並且在環境溫度下攪拌混合物。3小時之後，依據LCMS，反應完成，因此在真空中將其濃縮、密封，並且儲存於-20℃下過夜。粗產物溫熱至環境溫度、用乙腈與10%乙酸水溶液(各3mL)處理，並且藉由急驟層析在275g C18矽膠管柱(20分鐘內10-90%乙腈/水，0.05%乙酸於兩種溶劑內)上純化。凍乾產物溶離份得到如白色固體的標題化合物。用無水二乙醚濕磨固體三次、過濾、用DCM將固體濾出玻料，並蒸發濾液且在真空中乾燥，得到白色固體的標題化合物(0.311g，89%)。MS(ESI,pos.)：C36H51ClN4O10的計算值734.3；實驗值735.0(M+H)。
美登素-3-N-甲基-L-丙胺酸-N-Me-β-丙胺酸-胺甲醯基-(p-胺基)苯甲基-瓜胺酸-纈胺酸-Fmoc(化合物7，圖20)。 步驟1：將先前步驟的產物(化合物6，圖19，0.310g，0.390mmol)、1-羥基-7-氮雜苯并三唑(HOAT，0.164g，1.20mmol)、碳酸氫鈉(0.138g，1.64mmol)以及Fmoc-纈胺酸-瓜胺酸-(p-胺基)苯甲基-(p-硝基苯基)碳酸酯(0.595g，0.776mmol，按照技藝中已知的方法製備，參見-Gangwar et al.，美國專利7,714,016 B2)溶解於無水DMF(10mL)中、以橡膠隔片密封燒瓶、以氬氣吹洗，並且在環境溫度下攪拌混合物。24小時之後，在真空中部份蒸發反應物至約2-3mL、以10%乙酸水溶液與水(各約1mL)處理、溶解於乙腈(約6mL)中，並且藉由急驟層析在275g C18矽膠管柱(20分鐘內30-90%乙腈/水，0.05%乙酸於兩種溶劑中)上純化。部分蒸發、冷凍，並且凍乾以產生如白色固體的標題化合物(0.362g，68%)。MS(ESI,pos.)：C70H88ClN9O17的計算值1361.6；實驗值1362.1(M+H)，1384.1(M+Na)，1344.1(M-H2O+H)。
步驟2：先前步驟的產物(0.360g,0.264mmol)溶解於DMF中的5%哌啶(7mL)、以橡膠隔片密封反應燒瓶、以氬氣吹洗，並 且在環境溫度下攪拌混合物。3小時之後，在真空中蒸發反應物、用10%乙酸水溶液(2mL)處理殘餘物、溶解於乙腈(4mL)中，並且藉由急驟層析在275g C18矽膠管柱(20分鐘內10-70%乙腈/水，0.05%乙酸於兩種溶劑中)上純化。合併純溶離份、儲存於-20℃下過夜、於25-30℃下在真空中部分蒸發、在乾冰上冷凍，並且凍乾歷時6天得到如淺黃色固體的標題化合物(0.303g，95%)。MS(ESI,pos.)：C15H78ClN9O15的計算值1139.5；實驗值1140.1(M+H)，1162.0(M+Na)。
美登素-3-N-甲基-L-丙胺酸-N-Me-β-丙胺酸-胺甲醯基-(p-胺基)苯甲基-瓜胺酸-纈胺酸-己二酸(化合物8，圖20) 。將先前步驟的產物(化合物7，圖20，0.205g，0.171mmol)、己二酸(0.258g，1.77mmol)以及2-乙氧基-1-乙氧基羰基-1,2-二氫喹啉(EEDQ，0.215g，0.869mmol)溶解於無水DCM(10mL)以及無水甲醇(5mL)中、以橡膠隔片密封反應燒瓶、以氬氣吹洗，並且在環境溫度下攪拌混合物。在21小時之後，於真空中蒸發反應物、將殘餘物溶解於少量mL的乙腈/水中，並且藉由急驟層析在150g C18矽膠管柱(17分鐘內20-80%乙腈/水中，0.05%乙酸於兩種溶劑中)上純化。部分蒸發、冷凍，並且凍乾純溶離份歷時18小時，得到如白色固體的標題化合物(0.140g，65%)。MS(ESI,pos.)：C61H86ClN9O18的計算值1267.6；實驗值1268.9(M+H)，1290.9(M+Na)。
美登素-3-N-甲基-L-丙胺酸-N-Me-β-丙胺酸-胺甲醯基-(p-胺基)苯甲基-瓜胺酸-纈胺酸-己二醯基-丁二酸酯(化合物1，圖20) 。將先前步驟的產物(化合物8，圖20，0.061g，0.048mmol)、N-羥基丁二醯亞胺(0.063g，0.55mmol)，以及N-(3-二甲基胺基丙基)-N'-乙基碳二亞胺鹽酸鹽(EDC-HCl，0.071g，0.37mmol)溶解於無水DCM(7mL)中、以橡膠隔片密封反應燒瓶、以氬氣吹洗，並且在環境溫度下攪拌混合物。在5天之後，於真空中蒸發反應物、將殘餘物溶解於少量mL的乙腈/水中，並且藉由急驟層析在100g C18矽膠管柱(15分鐘內30-90%乙腈/水，0.05%乙酸於兩種溶劑中)上純化。部分蒸發、冷凍並且凍乾最為澄清的產物溶離份歷時18小時，產生如白色固體的標題化合物(0.044g,67%)。MS(ESI,pos.)：C65H89ClN10O20的計算值1364.6； 實驗值1365.7(M+H)，1387.7(M+Na)，1347.7(M-H2O+H)。1H-NMR(500MHz；CDCl3)：δ 7.56(d,J=8.3Hz,2H)，7.20(d,J=8.7Hz,1H)，6.80(s,1H)，6.71(m,1H)，6.62(d,J=10.0Hz,1H)，6.39(dd,J=15.1,11.3Hz,1H)，5.68(dd,J=15.3,9.1Hz,1H)，5.38-5.32(m,1H)，5.03(t,J=15.1Hz,1H)，4.88(d,J=12.3Hz,1H)，4.73(d,J=11.3Hz,1H)，4.61(dd,J=9.1,3.6Hz,1H)，4.26(d,J=7.0Hz,1H)，4.17(t,J=7.1Hz,1H)，3.95(s,3H)，3.61(d,J=11.7Hz,1H)，3.57(d,J=12.4Hz,1H)，3.46(d,J=9.1Hz,2H)，3.33(s,3H)，3.27(t,J=6.9Hz,1H)，3.17-3.07(m,5H)，2.97(dd,J=16.6,9.9Hz,1H)，2.88(d,J=11.7Hz,3H)，2.84(s,4H)，2.77(s,2H)，2.66(s,2H)，2.62(t,J=4.8Hz,2H)，2.56(d,J=13.1Hz,1H)，2.32(t,J=6.6Hz,2H)，2.15(d,J=14.0Hz,1H)，2.10(q,J=6.8Hz,1H)，1.92(s,4H)，1.75(m,5H)，1.61(s,3H)，1.52(s,3H)，1.27(d,J=6.3Hz,3H)，1.22(dt,J=12.7,6.3Hz,6H)，0.95(t,J=5.9Hz,7H)，0.78(s,3H)。
基於在WO 2015/031396(例如實例2，段落[00106])中所述的程序(其以全文引用的方式併入本文)，DM1是以單一非鏡像異構物的形式合成。
實例22. 抗體接合物以及接合物的特徵鑑定
抗體接合物
使於50mM HEPES、150mM NaCl、pH 8.0與10-15%(v/v)DMA中的抗體(H4H14639D、H4H13312P、H4H14635D以及同型對照；10-20mg/ml)與過量5至6倍之如實例21(類美登素A)中所述的SMCC-DM1非鏡像異構物，或美登素-3-N-甲基-L-丙胺酸-N-Me-β-丙胺酸-胺甲醯基-(p-胺基)苯甲基-瓜胺酸-纈胺酸-己二醯基-丁二酸酯(化合物1，圖20)(類美登素B)在環境溫度下結合歷時2小時。藉由粒徑排阻層析或廣泛超濾純化接合物並經無菌過濾。藉由UV分光分析測定蛋白質濃度。粒徑排阻HPLC確定所有使用的接合物有>90%為單體，而RP-HPLC確定<1%未結合連接子藥物。所有經結合抗體是依據Hamblett et al.(American Association for Cancer Research.2004 Oct 15；10(20)：7063-70)透過UV及/或透過質量差、原始相對於未結合來分 析連接子藥物負載值。藥物相對於抗體的比率報導於表24中。
Figure 106139257-A0202-12-0103-597
依據液體層析-質譜之接合物的特徵鑑定
為確定連接子-藥物在抗體上的負載，將接合物去糖基化並且藉由LC-MS分析。
關於分析，用milli-Q水將50μg接合物稀釋為1mg/mL的最終濃度。將十μL的PNGase F溶液[PNGase F溶液是透過添加150μL的PNGase F原液(New England Biolabs,Cat#P0704L)以及850μL的milli-Q水並且充分混合而製備]添加至經稀釋的接合物溶液且接著在37℃下培育過夜。將各樣品的5μL注射品加至LC-MS(Waters Synat G2-Si)上並且在25分鐘內以0.1mL/分的20-40%梯度移動相予以溶離(移動相A：0.1%v/v FA於H2O中；移動相B：0.1% v/v FA於乙腈中)。於80℃下在Waters Acquity BEH C4管柱(1.0 X 50mM，1.7μM)上達到LC分離。
質譜法光譜是使用Masslynx軟體進行反卷積，而藥物對抗體的比率(DAR)是使用以下等式進行計算：
1.藥物(Dn)依據分布峰強度(PI)的相對百分率(%)：Dn%=PIn/Σ(PI0+PI1+PI2.......+PIi)×100(n=0、1、2、3、...、i)
2.平均DAR計算：DAR=Σ(1×D1%+2×D2%+3×D3%+......+i×Di%)
實例23. 經結合之人類單株抗-MET(單特異性以及雙特異性)抗體的表面電漿共振衍生的結合親和力以及動力學常數
使用即時表面電漿共振感測器分析，在Biacore 2000儀器上測定MET結合至與MC-DM1非鏡像異構體(類美登素A)或美登素-3-N-甲基-L-丙胺酸-N-Me-β-丙胺酸-胺甲醯基-(p-胺基)苯甲基-瓜胺酸-纈胺酸-己二醯基-丁二酸酯(化合物1，圖20)(類美登素B)結合之抗-MET抗體的平衡解離常數(K D值)。Biacore感測器表面是經偶合單株小鼠抗-人類Fc抗體(GE Healthcare,#BR-1008-39)的胺衍生化，以捕獲抗-MET ADC以及表現帶有人類恆定區之親代未修飾抗體。Biacore結合研究是在HEPES緩衝食鹽水(HBS)-EP工作緩衝液(0.01M HEPES pH 7.4、0.15M NaCl、3mM EDTA、0.05% v/v Surfactant P20)中進行。人類MET為自行製備，其表現C端myc-myc-六組胺酸標誌(hMET-mmh)。以40μL/分的流速，將在HBS-EP工作緩衝液中製備之不同濃度(3倍稀釋)hMET-mmh(範圍從30nM至1.1nM)注射遍及抗-MET ADC或抗體被捕獲的表面上。監測hMET-mmh與被捕獲ADC以及單株抗體中之各者的締合歷時4分鐘。之後，在HBS-EP工作緩衝液中監測hMET-mmh解離歷時6分鐘。藉由短暫注射20mM H3PO4使得抗-人類Fc表面再生。所有結合動力學實驗是在25℃下進行。
動力學締合(k a)與解離(k d)速率常數是藉由使用Scrubber 2.0c曲線擬合軟體將即時傳感圖擬合至1：1結合模型而被確定。所有傳感圖是透過將對應分析物傳感圖扣除緩衝液注射傳感圖訊號而進行再次確認，藉以移除因為抗體自捕獲表面解離產生的假訊號(artifact)。由如下的動力學速率常數計算結合解離平衡常數(K D)與解離半衰期(t½)：
Figure 106139257-A0202-12-0104-598
，以及
Figure 106139257-A0202-12-0104-599
類美登素A或類美登素B結合之抗-Met單特異性抗體與雙特異性抗體的結合動力學參數顯示於下文表25中，其中一些實驗 進行二重複。
Figure 106139257-A0202-12-0105-600
實例24：抗-MET抗體藥物接合物(ADC)的活體外效力
為了確定本文所述之抗-MET抗體藥物接合物(ADC)的相對細胞殺滅效力，對多個表現程度不一之內源性MET的細胞株進行細胞殺滅分析。EBC-1(Riken Cell Bank；# RBRC-RCB1965)、MKN-45(JCRB；# JCRB0254)、NCI-H1993(ATCC；# CRL-5909)，以及J.RT3(ATCC；# TIB-153)細胞株維持在RPMI+10% FBS+1X青黴素/鏈黴素/L-麩醯胺酸(P/S/G)中，SNU-5(ATCC；# CRL-5973)維持在依思可夫氏+10% FBS+1X P/S/G中，Hs746t(ATCC；# HTB-135)與HEK293(ATCC；# 003041)維持在DME+10% FBS+1X P/S/G中，MDA-MB-231(ATCC；# HTB-26)於無CO2下維持在萊氏(Liebowitz's)L-15+10% FBS+1X P/S/G+1X非必需胺基酸(NEAA)中，U87MG(ATCC；# HTB-14)維持於MEM邇氏鹽+15% FBS+1X P/S/G+1X NEAA中，T47D(ATCC；# HTB-133)維持於RPM1 1640+10% FBS+ 1X P/S/G+10mM HEPES+1mM丙酮酸鈉+10ug/ml牛胰島素中，以及A549(ATCC；# CCL-185)維持於肯氏營養混合物(Kaighn's Nutrient Mixture)F-12(HAM's F-12K)+10% FBS+1X P/S/G中。
一開始，經由流動式細胞測量術，使用未經結合的H4H14635D、H4H14639D與H4H13312P2抗體對整組細胞株評估抗-MET抗體的相對結合。簡言之，將1x106個細胞與10μg/ml的H4H14635D、H4H14639D、H4H13312P2或同型對照抗體(REGN1945)在冰上一起培育於PBS+2% FBS(FACS緩衝液)中歷時30分鐘。在用FACS緩衝液洗滌一次之後，細胞與10μg/ml的Alexa647結合之抗人類二級抗體(Jackson ImmunoResearch,# 109-606-170)於冰上一起培育歷時30分鐘。在用FACS緩衝液又洗滌一次之後，以Cytofix(BD Biosciences,# 554655)固定樣品、用FACS緩衝液過濾並且在iQue流式細胞儀(Intelicyte)上運行。平均螢光強度(MFI)數據是使用FlowJo軟體(FlowJo LLC)測定。FACS結合表示為MFI結合高出同型對照位準的倍數，且結果歸納於表26中。三種抗-Met抗體對各細胞株的相對結合相當且範圍為高出同型對照447-倍至7-倍。觀察到3種測試的抗-MET抗體中沒有一者對於T47D、HEK293或J.RT3細胞具有可偵測到的結合。
為測量抗-MET ADC的活體外細胞毒性，在用ADC處理3或6天之後評估細胞核計數。簡言之，以750-3000個細胞/孔將細胞種植於96孔經膠原蛋白塗覆的盤(Greiner,VWR；# 82050-812)的完全生長培養基中，並且在37℃、5%CO2下生長過夜。關於細胞生存力曲線，以濃度範圍100nM至0.01nM(基於毒素濃度)向細胞添加經連續稀釋的ADC、未結合的抗體或游離藥物，並且在37℃、5%CO2下培育歷時3或6天。之後用3ug/ml Hoechst 33342細胞核染色(Invitrogen,# H3570)處理細胞，同時以4%甲醛固定。在ImageXpress micro XL(Molecular Devices,Sunnyvale,CA)上擷取影像並且經由MetaXpress影像分析軟體(Molecular Devices,Sunnyvale,CA)決定細胞核計數。所有孔扣除經40nM毛地黃皂苷處理之細胞的背景細胞核計數且生存力表示為未經處理對照的百分率。由對10點反應曲線從四參數邏輯方程式(GraphPad Prism)來決定IC50值。各劑量-反應曲線之未經處理的條件也 納入分析並且表示為最低劑量。IC50值以及細胞殺滅百分率顯示於表27及表28中。
如表27中所歸納，在Met經擴增的EBC-1、SNU-5、MKN-45、NCI-H1993以及Hs746t細胞背景中，抗-MET抗體-藥物接合物H4H14639D-類美登素A特異地降低細胞生存力，IC50值範圍從0.35nM至0.96nM。被殺滅的細胞百分率(最大殺滅%)範圍從73%至100%。H4H14639D-類美登素A也特異地殺滅84%的A549細胞，IC50值為13.91nM。在低表現細胞株(MDA-MB-231與U87MG)以及未表現細胞株(T47D、HEK293與J.RT3)中，H4H14639D-類美登素A IC50值大於37nM。同樣地，經結合的同型對照抗體殺滅所有細胞株，IC50值大於35nM。DM1的二硫二甲烷形式(MeS-DM1)殺滅所有測試的細胞株，IC50值範圍從0.07nM至2.86nM。
在一個不同的實驗中，三種抗-Met抗體(H4H14639D、H4H14635D以及H4H13312P2)結合至類美登素A或類美登素B類美登素藥物，並且在6天處理之後於EBC-1、Hs746t、A549和T47D細胞中評估活體外細胞毒性。如表28中所歸納，所有抗-Met抗體-藥物接合物在Met陽性細胞中強力且特異地降低細胞生存力，IC50值在EBC-1細胞中低至10pM，在Hs746t細胞中0.82nM，而在A549細胞中3.5nM。在EBC-1細胞中，被殺滅的細胞百分率大於95%，在Hs746t細胞中大於86%，而在A549細胞中大於72%。T47D細胞(Met陰性)未遭到抗-Met ADC特異地殺滅。類似結合的同型對照抗體在所有測試細胞株中降低細胞生存力，IC50值在EBC-1細胞中大於5nM，在Hs746t細胞中大於33nM，而在A549與T47D細胞中大於90nM。未結合的H4H14639D在EBC-1、Hs746t與A549細胞中降低細胞生存力，但百分率比經結合的抗體還低。未結合的H4H14635D與H4H13312P2在測試細胞株的任一者中對於生存力的影響不大或者沒有影響。DM1的二硫二甲烷形式(MeS-DM1)殺滅所有測試細胞株，IC50值範圍從0.12nM至1.39nM。相對地，M24(由類美登素B所釋放的藥物)以>100nM的IC50殺滅細胞。
Figure 106139257-A0202-12-0108-141
Figure 106139257-A0202-12-0108-142
Figure 106139257-A0202-12-0109-143
Figure 106139257-A0202-12-0109-144
Figure 106139257-A0202-12-0110-145
實例25：抗胃癌細胞的活體內效力
3百萬個Hs746T胃癌細胞被皮下植入C.B.-17 SCID小鼠的側脅。在腫瘤體積達到約150mm3之後，將小鼠隨機分成6隻的組別並且用10mg/kg的對照抗體REGN1945-類美登素B或REGN1945-類美登素A，或用3或10mg/kg的H4H14639D-類美登素A或H4H14639D-類美登素B處理。以每週一次的頻率投與所有抗體三次。在植入之後監測腫瘤生長歷時37天。
在免疫低下小鼠中評估H4H14639D-類美登素A或H4H14639D-類美登素B對於人類腫瘤異種移植生長的影響，而結果顯示於表29中。經對照抗體、REGN1945-類美登素B或REGN1945-類美登素A處理的腫瘤在20天內生長至達到協定大小限制。經3mg/kg H4H14639D-類美登素A處理的腫瘤在27天內生長至達到協定大小限制。經3mg/kg H4H14639D-類美登素B處理的腫瘤生長在實驗期間受到抑制。相對於處理開始之時，用10mg/kg H4H14639D-類美登素A或H4H14639D-類美登素B處理腫瘤會引起腫瘤尺寸的消退。
Figure 106139257-A0202-12-0110-147
實例26：抗肺癌細胞的活體內效力
5百萬個EBC1肺癌細胞被皮下植入至C.B.-17 SCID小鼠的側脅。在腫瘤體積達到約170mm3之後，將小鼠隨機分配成6隻的組別並且用15mg/kg的對照抗體REGN1945-類美登素B或2.5、5、10或15mg/kg的H4H14639D類美登素B處理。以每週一次的頻率投與抗體兩次。植入後監測腫瘤生長歷時73天。
在免疫低下小鼠中評估H4H14639D對於人類腫瘤異種移植的影響。用對照抗體REGN1945-類美登素B處理的腫瘤在24天內生長達到協定尺寸限制(IACUC協定需要犧牲帶有直徑超過2cm、約1500mm3之腫瘤的動物)。相對於處理開始之時，用2.5、5、10或15mg/kg的H4H14639D-類美登素B處理腫瘤會引起腫瘤尺寸消退。結果顯示於表30中。
Figure 106139257-A0202-12-0111-148
實例26：抗患者衍生之NSCLC腫瘤的活體內效力
Met-表現NSCLC CTG-0165患者衍生的腫瘤被皮下植入至nu/nu裸鼠的側脅。在腫瘤體積達到約150mm3之後，將小鼠隨機分成6隻的組別並用10mg/kg的對照抗體REGN1945-類美登素B或REGN1945-類美登素A，或用3或10mg/kg的H4H14639D-類美登素A或H4H14639D-類美登素B處理。所有抗體以每週一次的頻率投與三次。植入後監測腫瘤生長歷時61天。
在免疫低下小鼠中評估H4H14639D-類美登素A或H4H14639D-類美登素B對於人類腫瘤異種移植的影響。用對照抗體 REGN1945-類美登素A或REGN1945-類美登素B處理的腫瘤在27天內生長至達到協定尺寸限制。用3mg/kg H4H14639D-類美登素A或H4H14639D-類美登素B處理的腫瘤生長受到抑制歷時27天。相對於處理開始之時，用10mg/kg H4H14639D-類美登素A或H4H14639D-類美登素B處理腫瘤會引起腫瘤尺寸消退。數據提供於表31中。
Figure 106139257-A0202-12-0112-149
實例27：結合至人類MET之抗-Met抗體H4H13312P2、H4H13306P2與H4H14639D的以氫/氘(H/D)交換為基礎的表位定位表位定位
進行實驗以確定人類肝細胞生長因子受體胞外域(SEQ ID NO：155：人類Met同型物1(Uniprot ID：P08581)，表現帶有myc-myc-六組胺酸(.mmh)標誌；後文稱為hMet)與抗-Met抗體H4H13312P2、H4H13306P2與H4H14639D交互作用的特定區域。H4H13312P2與H4H13306P2為二價-單特異性抗-Met抗體；H4H14639D為雙特異性抗體，包含分別結合至Met上之不同表位(各來自H4H13312P2與H4H13306P2)的兩個重鏈，以及一個萬用輕鏈(參見實例5)。
使用氫/氘(H/D)交換表位定位加上質譜術(HDX-MS)來決定上文提及之抗體的結合表位。HDX方法的一般性說明列舉於例如Ehring(1999)Analytical Biochemistry 267(2)：252-259；以及Engen and Smith(2001)Anal.Chem.73：256A-265A中。
實驗程序
為了經由HDX定位抗-Met抗體H4H13312P2、H4H13306P2與H4H14639D在hMET上的結合表位，個別抗體被分別共價附接至NHS-經活化的Sepharose 4 Fast Flow珠粒(GE Healthcare,Pittsburgh,PA)。如下文所述，兩種方法「抗原上(On-Antigen)」以及「複合體上(On-Complex)」被用來確認抗-Met抗體的結合表位。
在「抗原上」實驗條件中，hMET於使用D2O製備的PBS緩衝液中氘化歷時5.0分鐘或10.0分鐘。經氘化的抗原透過短暫培育而結合至H4H13312P2或H4H13306P2抗體珠粒，並接著以冰冷低pH淬滅緩衝液自珠粒被溶離。經溶離樣品被手動加載至Waters H/DX-MS系統，其由合併的線上肽消化、捕獲、9.0分鐘液體層析(LC)分離，以及Synapt G2-Si MS數據擷取所組成。
在「複合體上」實驗條件中，hMET首先結合至H4H13312P2或H4H13306P2珠粒，並且接著經由培育於用D2O製備的PBS緩衝液中予以氘化歷時5.0分鐘或10.0分鐘。經氘化MET如上文所述被溶離並且透過Waters H/DX-MS系統予以分析。
關於鑑定hMET的消化肽，將未經氘化樣品的LC-MSE數據進行處理並且使用Waters ProteinLynx Global Server(PLGS)軟體相對於人類MET進行檢索。經鑑定的肽被輸入至DynamX 3.0軟體中並且透過以下兩個條件予以過濾：1)每個胺基酸的最小乘積為0.3；2)複製檔案閾值為3.0。接著DynamX 3.0軟體於5分鐘以及10分鐘氘化時間點自動計算每個鑑定肽在「抗原上」與「複合體上」的氘攝取差異。針對質心值計算，透過DynamX軟體挑選的每一個肽的個別同位素峰經手動檢驗，以確保氘攝取計算的準確度。
大體上，超出0.2的氘化δ值用作為確定特定結合表位的截略點。
結果
使用線上胃蛋白酶消化經由與9.0分鐘LC-MSE數據擷取偶合的Waters EnzymateTM BEH Pepsin Column(2.1 x 30mm，5 μm)，總計有162個來自人類MET的胃蛋白酶肽經重現地鑑定為當使用H4H13312P2抗體珠粒時就「抗原上」以及「複合體上」實驗有可追蹤氘攝取。這些肽代表55.7%的序列覆蓋率。在所有這些肽之中，只有五個被發現到在結合H4H13312P2(「複合體上」)之後相較於單獨抗原的氘化(「抗原上」)顯著降低氘攝取。這五個肽在兩種實驗條件下的質心值描述於表32中。基於HDX數據，對應於受這五個肽所覆蓋之殘基192-204的區域被定義為抗體H4H13312P2的結合表位。
Figure 106139257-A0202-12-0114-151
關於使用H4H13306P2抗體珠粒所進行的HDX實驗，在「抗原上」以及「複合體上」實驗期間，總計98個來自hMET的胃蛋白酶肽經再現地鑑定為帶有可追蹤氘攝取。這98個肽代表52.1%序列覆蓋率。在所有這些肽之中，十二個被觀察到在結合H4H13306P2之後(「複合體上」)相較於單獨抗原氘化(「抗原上」)顯著降低氘化攝取。這十二個肽在兩種實驗條件下的質心值描述於表33中。基於HDX數據，對應於受這些肽所覆蓋之殘基305-315與殘基421-455的區域被定義為抗體H4H13306P2的結合表位。
Figure 106139257-A0202-12-0114-154
Figure 106139257-A0202-12-0115-155
如上文所概述的相同方法學被用來測定雙特異性抗-Met抗體H4H14639D的結合表位。由本方法學確立之hMET上的H4H14639D結合表位對應於針對親代抗體確立的表位。
抗-Met抗體H4H13312P2的結合表位：AA 192-204：SEQ ID NO：155的VRRLKETKDGFMF(SEQ ID NO：156)。
抗-Met抗體H4H13306P2的結合表位：AA 305-315：SEQ ID NO：155的LARQIGASLND(SEQ ID NO：157)以及AA 421-455：SEQ ID NO：155的FIKGDLTIANLGTSEGRFMQVVVSRSGPSTPHVNF(SEQ ID NO：158)。
本發明不受限於本文所述的特定具體例。更進一步來說，除了本文所述的那些修飾之外，本發明的各種修飾對於那些習於技藝者來說，從先前說明以及附圖將會變得清楚。此等修飾意欲落在隨附申請專利的範圍內。
<110> 美商再生元醫藥公司(Regeneron Pharmaceuticals,Inc.)
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Figure 106139257-A0305-02-0140-111
<210> 72
<211> 13
<212> PRT
<213> 智人
<400> 72
Figure 106139257-A0305-02-0140-112
<210> 73
<211> 360
<212> DNA
<213> 智人
<400> 73
Figure 106139257-A0305-02-0140-113
<210> 74
<211> 120
<212> PRT
<213> 智人
<400> 74
Figure 106139257-A0305-02-0140-114
Figure 106139257-A0305-02-0141-115
<210> 75
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 75
Figure 106139257-A0305-02-0141-116
<210> 76
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 76
Figure 106139257-A0305-02-0141-117
<210> 77
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 77
Figure 106139257-A0305-02-0142-118
<210> 78
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 78
Figure 106139257-A0305-02-0142-119
<210> 79
<211> 39
<212> DNA
<213> 智人
<400> 79
Figure 106139257-A0305-02-0142-120
<210> 80
<211> 13
<212> PRT
<213> 智人
<400> 80
Figure 106139257-A0305-02-0142-121
<210> 81
<211> 351
<212> DNA
<213> 智人
<400> 81
Figure 106139257-A0305-02-0142-122
Figure 106139257-A0305-02-0143-123
<210> 82
<211> 117
<212> PRT
<213> 智人
<400> 82
Figure 106139257-A0305-02-0143-124
<210> 83
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 83
Figure 106139257-A0305-02-0143-125
<210> 84
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 84
Figure 106139257-A0305-02-0144-126
<210> 85
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人
<400> 85
Figure 106139257-A0305-02-0144-127
<210> 86
<211> 7
<212> PRT
<213> 智人
<400> 86
Figure 106139257-A0305-02-0144-128
<210> 87
<211> 33
<212> DNA
<213> 智人
<400> 87
Figure 106139257-A0305-02-0144-129
<210> 88
<211> 11
<212> PRT
<213> 智人
<400> 88
Figure 106139257-A0305-02-0144-130
Figure 106139257-A0305-02-0145-131
<210> 89
<211> 372
<212> DNA
<213> 智人
<400> 89
Figure 106139257-A0305-02-0145-132
<210> 90
<211> 124
<212> PRT
<213> 智人
<400> 90
Figure 106139257-A0305-02-0145-133
Figure 106139257-A0305-02-0146-134
<210> 91
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 91
Figure 106139257-A0305-02-0146-135
<210> 92
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 92
Figure 106139257-A0305-02-0146-136
<210> 93
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 93
Figure 106139257-A0305-02-0146-137
<210> 94
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 94
Figure 106139257-A0305-02-0146-138
Figure 106139257-A0305-02-0147-139
<210> 95
<211> 51
<212> DNA
<213> 智人
<400> 95
Figure 106139257-A0305-02-0147-140
<210> 96
<211> 17
<212> PRT
<213> 智人
<400> 96
Figure 106139257-A0305-02-0147-141
<210> 97
<211> 372
<212> DNA
<213> 智人
<400> 97
Figure 106139257-A0305-02-0147-142
<210> 98
<211> 124
<212> PRT
<213> 智人
<400> 98
Figure 106139257-A0305-02-0148-143
<210> 99
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 99
Figure 106139257-A0305-02-0148-144
<210> 100
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 100
Figure 106139257-A0305-02-0149-145
<210> 101
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 101
Figure 106139257-A0305-02-0149-146
<210> 102
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 102
Figure 106139257-A0305-02-0149-147
<210> 103
<211> 51
<212> DNA
<213> 智人
<400> 103
Figure 106139257-A0305-02-0149-148
<210> 104
<211> 17
<212> PRT
<213> 智人
<400> 104
Figure 106139257-A0305-02-0149-149
<210> 105
<211> 360
<212> DNA
<213> 智人
<400> 105
Figure 106139257-A0305-02-0150-150
<210> 106
<211> 120
<212> PRT
<213> 智人
<400> 106
Figure 106139257-A0305-02-0150-151
Figure 106139257-A0305-02-0151-152
<210> 107
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 107
Figure 106139257-A0305-02-0151-153
<210> 108
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 108
Figure 106139257-A0305-02-0151-154
<210> 109
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 109
Figure 106139257-A0305-02-0151-155
<210> 110
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 110
Figure 106139257-A0305-02-0151-156
<210> 111
<211> 39
<212> DNA
<213> 智人
<400> 111
Figure 106139257-A0305-02-0152-157
<210> 112
<211> 13
<212> PRT
<213> 智人
<400> 112
Figure 106139257-A0305-02-0152-158
<210> 113
<211> 360
<212> DNA
<213> 智人
<400> 113
Figure 106139257-A0305-02-0152-160
<210> 114
<211> 120
<212> PRT
<213> 智人
<400> 114
Figure 106139257-A0305-02-0152-161
Figure 106139257-A0305-02-0153-162
<210> 115
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 115
Figure 106139257-A0305-02-0153-163
<210> 116
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 116
Figure 106139257-A0305-02-0153-164
<210> 117
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 117
Figure 106139257-A0305-02-0154-165
<210> 118
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 118
Figure 106139257-A0305-02-0154-166
<210> 119
<211> 39
<212> DNA
<213> 智人
<400> 119
Figure 106139257-A0305-02-0154-167
<210> 120
<211> 13
<212> PRT
<213> 智人
<400> 120
Figure 106139257-A0305-02-0154-168
<210> 121
<211> 375
<212> DNA
<213> 智人
<400> 121
Figure 106139257-A0305-02-0154-169
Figure 106139257-A0305-02-0155-170
<210> 122
<211> 125
<212> PRT
<213> 智人
<400> 122
Figure 106139257-A0305-02-0155-171
<210> 123
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 123
Figure 106139257-A0305-02-0156-172
<210> 124
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 124
Figure 106139257-A0305-02-0156-173
<210> 125
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 125
Figure 106139257-A0305-02-0156-174
<210> 126
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 126
Figure 106139257-A0305-02-0156-175
<210> 127
<211> 54
<212> DNA
<213> 智人
<400> 127
Figure 106139257-A0305-02-0156-176
<210> 128
<211> 18
<212> PRT
<213> 智人
<400> 128
Figure 106139257-A0305-02-0157-177
<210> 129
<211> 348
<212> DNA
<213> 智人
<400> 129
Figure 106139257-A0305-02-0157-178
<210> 130
<211> 116
<212> PRT
<213> 智人
<400> 130
Figure 106139257-A0305-02-0157-179
Figure 106139257-A0305-02-0158-180
<210> 131
<211> 24
<212> DNA
<213> 智人
<400> 131
Figure 106139257-A0305-02-0158-181
<210> 132
<211> 8
<212> PRT
<213> 智人
<400> 132
Figure 106139257-A0305-02-0158-182
<210> 133
<211> 21
<212> DNA
<213> 智人
<400> 133
Figure 106139257-A0305-02-0158-184
<210> 134
<211> 7
<212> PRT
<213> 智人
<400> 134
Figure 106139257-A0305-02-0159-185
<210> 135
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人
<400> 135
Figure 106139257-A0305-02-0159-186
<210> 136
<211> 10
<212> PRT
<213> 智人
<400> 136
Figure 106139257-A0305-02-0159-187
<210> 137
<211> 324
<212> DNA
<213> 智人
<400> 137
Figure 106139257-A0305-02-0159-188
<210> 138
<211> 108
<212> PRT
<213> 智人
<400> 138
Figure 106139257-A0305-02-0160-189
<210> 139
<211> 18
<212> DNA
<213> 智人
<400> 139
Figure 106139257-A0305-02-0160-190
<210> 140
<211> 6
<212> PRT
<213> 智人
<400> 140
Figure 106139257-A0305-02-0160-191
Figure 106139257-A0305-02-0161-192
<210> 141
<211> 9
<212> DNA
<213> 智人
<400> 141
Figure 106139257-A0305-02-0161-193
<210> 142
<211> 3
<212> PRT
<213> 智人
<400> 142
Figure 106139257-A0305-02-0161-194
<210> 143
<211> 30
<212> DNA
<213> 智人
<400> 143
Figure 106139257-A0305-02-0161-195
<210> 144
<211> 10
<212> PRT
<213> 智人
<400> 144
Figure 106139257-A0305-02-0161-196
<210> 145
<211> 1408
<212> PRT
<213> 智人
<400> 145
Figure 106139257-A0305-02-0162-197
Figure 106139257-A0305-02-0163-198
Figure 106139257-A0305-02-0164-199
Figure 106139257-A0305-02-0165-200
Figure 106139257-A0305-02-0166-201
Figure 106139257-A0305-02-0167-202
Figure 106139257-A0305-02-0168-203
Figure 106139257-A0305-02-0169-204
<210> 146
<211> 1390
<212> PRT
<213> 智人
<400> 146
Figure 106139257-A0305-02-0169-205
Figure 106139257-A0305-02-0170-206
Figure 106139257-A0305-02-0171-207
Figure 106139257-A0305-02-0172-208
Figure 106139257-A0305-02-0173-209
Figure 106139257-A0305-02-0174-210
Figure 106139257-A0305-02-0175-211
Figure 106139257-A0305-02-0176-212
<210> 147
<211> 934
<212> PRT
<213> 智人
<400> 147
Figure 106139257-A0305-02-0176-213
Figure 106139257-A0305-02-0177-214
Figure 106139257-A0305-02-0178-215
Figure 106139257-A0305-02-0179-216
Figure 106139257-A0305-02-0180-217
Figure 106139257-A0305-02-0181-218
<210> 148
<211> 281
<212> PRT
<213> 智人
<400> 148
Figure 106139257-A0305-02-0181-219
Figure 106139257-A0305-02-0182-220
<210> 149
<211> 1101
<212> PRT
<213> 智人
<400> 149
Figure 106139257-A0305-02-0183-221
Figure 106139257-A0305-02-0184-222
Figure 106139257-A0305-02-0185-223
Figure 106139257-A0305-02-0186-224
Figure 106139257-A0305-02-0187-225
Figure 106139257-A0305-02-0188-226
<210> 150
<211> 1082
<212> PRT
<213> 智人
<400> 150
Figure 106139257-A0305-02-0188-227
Figure 106139257-A0305-02-0189-228
Figure 106139257-A0305-02-0190-229
Figure 106139257-A0305-02-0191-230
Figure 106139257-A0305-02-0192-231
Figure 106139257-A0305-02-0193-232
Figure 106139257-A0305-02-0194-233
<210> 151
<211> 626
<212> PRT
<213> 智人
<400> 151
Figure 106139257-A0305-02-0194-234
Figure 106139257-A0305-02-0195-235
Figure 106139257-A0305-02-0196-236
Figure 106139257-A0305-02-0197-237
<210> 152
<211> 650
<212> PRT
<213> 人工
<220>
<223> 合成
<400> 152
Figure 106139257-A0305-02-0197-238
Figure 106139257-A0305-02-0198-239
Figure 106139257-A0305-02-0199-240
Figure 106139257-A0305-02-0200-241
<210> 153
<211> 838
<212> PRT
<213> 人工
<220>
<223> 合成
<400> 153
Figure 106139257-A0305-02-0201-242
Figure 106139257-A0305-02-0202-243
Figure 106139257-A0305-02-0203-244
Figure 106139257-A0305-02-0204-245
Figure 106139257-A0305-02-0205-246
<210> 154
<211> 1100
<212> PRT
<213> 人工
<220>
<223> 合成
<400> 154
Figure 106139257-A0305-02-0205-247
Figure 106139257-A0305-02-0206-248
Figure 106139257-A0305-02-0207-249
Figure 106139257-A0305-02-0208-250
Figure 106139257-A0305-02-0209-251
Figure 106139257-A0305-02-0210-252
Figure 106139257-A0305-02-0211-253
<210> 155
<211> 936
<212> PRT
<213> 智人
<400> 155
Figure 106139257-A0305-02-0211-254
Figure 106139257-A0305-02-0212-255
Figure 106139257-A0305-02-0213-256
Figure 106139257-A0305-02-0214-257
Figure 106139257-A0305-02-0215-258
Figure 106139257-A0305-02-0216-259
<210> 156
<211> 13
<212> PRT
<213> 智人
<400> 156
Figure 106139257-A0305-02-0216-260
<210> 157
<211> 11
<212> PRT
<213> 智人
<400> 157
Figure 106139257-A0305-02-0216-261
<210> 158
<211> 35
<212> PRT
<213> 智人
<400> 158
Figure 106139257-A0305-02-0216-263

Claims (35)

  1. 一種雙特異性抗原結合分子，其包含：第一抗原結合域(D1)；以及第二抗原結合域(D2)；其中D1特異地結合人類MET的第一表位；其中D2特異地結合人類MET的第二表位；且其中D1包含含有三個重鏈互補決定區(CDR)(HCDR1、HCDR2與HCDR3)之重鏈可變區(HCVR)，以及含有三個輕鏈互補決定區(CDR)(LCDR1、LCDR2與LCDR3)之輕鏈可變區(LCVR)；其中D1之HCVR之HCDR1、HCDR2與HCDR3分別包含SEQ ID NO：60、SEQ ID NO：62、及SEQ ID NO：64之胺基酸序列；且D1之LCVR之LCDR1、LCDR2與LCDR3分別包含SEQ ID NO：140、SEQ ID NO：142、及SEQ ID NO：144之胺基酸序列；以及D2包含含有三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2與HCDR3)之HCVR，以及含有三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2與LCDR3)之LCVR，其中D2之HCVR之HCDR1、HCDR2與HCDR3分別包含SEQ ID NO：84、SEQ ID NO：86、及SEQ ID NO：88之胺基酸序列；且D2之LCVR之LCDR1、LCDR2與LCDR3分別包含SEQ ID NO：140、SEQ ID NO：142、及SEQ ID NO：144之胺基酸序列。
  2. 如請求項1之雙特異性抗原結合分子，其中D1與D2未彼此競爭結合至人類MET。
  3. 如請求項1或2之雙特異性抗原結合分子，其中該雙特異性抗原結合分子能夠阻斷人類MET與HGF之間的交互作用。
  4. 如請求項1之雙特異性抗原結合分子，其中D1包含：包含SEQ ID NO：58之胺基酸序列的HCVR；以及包含SEQ ID NO：138之胺基酸序列的LCVR。
  5. 如請求項1之雙特異性抗原結合分子，其中D2包含：含有SEQ ID NO：82之胺基酸序列的HCVR；以及含有SEQ ID NO：138之胺基酸序列的LCVR。
  6. 如請求項1之雙特異性抗原結合分子，其中：(a)人類MET的第一表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸192-204；(b)人類MET的第二表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸305-315以及421-455；或(c)人類MET的第一表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸192-204，且人類MET的第二表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸305-315以及421-455。
  7. 如請求項1或2之雙特異性抗原結合分子，其中該雙特異性抗原結合分子結合至細胞毒素。
  8. 如請求項7之雙特異性抗原結合分子，其中該細胞毒素選自由生物毒素、化療劑以及放射性同位素組成之群。
  9. 如請求項7之雙特異性抗原結合分子，其中該細胞毒素選自由類美登素(maytansinoid)、奧瑞他汀(auristatin)、倍癌黴素(duocarmycin)、225Ac、227Th及其任何衍生物組成之群。
  10. 如請求項1或2之雙特異性抗原結合分子，其中該雙特異性抗原結合分子透過連接子結合至細胞毒性劑。
  11. 如請求項10之雙特異性抗原結合分子，其中該細胞毒性劑為類美登素。
  12. 一種雙特異性抗原結合分子，其包含：第一抗原結合域(D1)，其中D1特異地結合人類MET的第一表位；以及第二抗原結合域(D2)，其中D2特異地結合人類MET的第二表位；；其中：D1包含含有三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2與HCDR3)之HCVR，以及含有三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2與LCDR3)之LCVR，其中D1之HCVR之HCDR1、HCDR2與HCDR3分別包含SEQ ID NO：60、SEQ ID NO：62、及SEQ ID NO：64之胺基酸序列；且D1之LCVR之LCDR1、LCDR2與LCDR3分別包含SEQ ID NO：140、SEQ ID NO：142、及SEQ ID NO：144之胺基酸序列；以及D2包含含有三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2與HCDR3)之HCVR， 以及含有三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2與LCDR3)之LCVR，其中D2之HCVR之HCDR1、HCDR2與HCDR3分別包含SEQ ID NO：84、SEQ ID NO：86、及SEQ ID NO：88之胺基酸序列；且D2之LCVR之LCDR1、LCDR2與LCDR3分別包含SEQ ID NO：140、SEQ ID NO：142、及SEQ ID NO：144之胺基酸序列；以及其中該雙特異性抗原結合分子透過連接子結合至類美登素。
  13. 如請求項12之雙特異性抗原結合分子，其中類美登素為：
    Figure 106139257-A0305-02-0219-6
     其中
    Figure 106139257-A0305-02-0219-30
    為至連接子之鍵。
  14. 如請求項13之雙特異性抗原結合分子，其中連接子為：
    Figure 106139257-A0305-02-0219-7
     其中標註為
    Figure 106139257-A0305-02-0219-31
    的鍵代表至雙特異性抗原結合分子之鍵，而標註為
    Figure 106139257-A0305-02-0219-33
    的 鍵代表至類美登素之鍵。
  15. 如請求項12之雙特異性抗原結合分子，其中類美登素為
    Figure 106139257-A0305-02-0219-8
     其中
    Figure 106139257-A0305-02-0220-27
    為至連接子之鍵。
  16. 如請求項15之雙特異性抗原結合分子，其中連接子為：
    Figure 106139257-A0305-02-0220-9
     其中標註為
    Figure 106139257-A0305-02-0220-28
    的鍵代表至雙特異性抗原結合分子之鍵，而標註為
    Figure 106139257-A0305-02-0220-29
    的 鍵代表至類美登素之鍵。
  17. 如請求項13至16中任一項之雙特異性抗原結合分子，其中：(i)D1包含含有胺基酸序列SEQ ID NO：58之HCVR以及含有胺基酸序列SEQ ID NO：138之LCVR；且(ii)D2包含含有胺基酸序列SEQ ID NO：82之HCVR以及含有胺基酸序列SEQ ID NO：138之LCVR。
  18. 一種醫藥組合物，其包含如請求項1至17中任一項之雙特異性抗原結合分子以及醫藥上可接受之載劑。
  19. 一種如請求項1至17中任一項之雙特異性抗原結合分子用於製造治療個體之癌症的醫藥品之用途，該個體罹患帶有MET基因突變的腫瘤及/或其生長是受到自泌信號傳導所驅動的腫瘤。
  20. 如請求項19之用途，其中該癌症選自由非小細胞肺癌(NSCLC)、胃癌、結腸直腸癌以及頭頸癌組成之群。
  21. 如請求項19之用途，進一步包含向個體投與第二抗癌治療劑。
  22. 一種包含雙特異性抗原結合分子以及細胞毒素的抗體-藥物接合物(ADC)用於製造在個體體內治療癌症、減少腫瘤生長及/或造成腫瘤消退的醫藥品之用途，其中該雙特異性抗原結合分子包含：第一抗原結合域(D1)；以及第二抗原結合域(D2)；其中D1特異地結合人類MET的第一表位；其中D2特異地結合人類MET的第二表位；且 D1包含含有三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2與HCDR3)之HCVR，以及含有三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2與LCDR3)之LCVR，其中D1之HCVR之HCDR1、HCDR2與HCDR3分別包含SEQ ID NO：60、SEQ ID NO：62、及SEQ ID NO：64之胺基酸序列；且D1之LCVR之LCDR1、LCDR2與LCDR3分別包含SEQ ID NO：140、SEQ ID NO：142、及SEQ ID NO：144之胺基酸序列；以及D2包含含有三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2與HCDR3)之HCVR，以及含有三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2與LCDR3)之LCVR，其中D2之HCVR之HCDR1、HCDR2與HCDR3分別包含SEQ ID NO：84、SEQ ID NO：86、及SEQ ID NO：88之胺基酸序列；且D2之LCVR之LCDR1、LCDR2與LCDR3分別包含SEQ ID NO：140、SEQ ID NO：142、及SEQ ID NO：144之胺基酸序列。
  23. 如請求項22之用途，其中D1包含含有SEQ ID NO：58的胺基酸序列之HCVR，以及含有SEQ ID NO：138的胺基酸序列之LCVR。
  24. 如請求項22之用途，其中D2包含含有SEQ ID NO：82的胺基酸序列之HCVR，以及含有SEQ ID NO：138的胺基酸序列之LCVR。
  25. 如請求項22之用途，其中：(a)人類MET的第一表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸192-204；(b)人類MET的第二表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸305-315以及421-455；及/或(c)人類MET的第一表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸192-204，且人類MET的第二表位包含SEQ ID NO：155的胺基酸305-315以及421-455。
  26. 如請求項22之用途，其中該細胞毒素選自由生物毒素、化療劑以及放射性同位素組成之群。
  27. 如請求項22之用途，其中該細胞毒素選自由類美登素、奧瑞他汀、托馬黴素(tomaymycin)、倍癌黴素、225Ac、227Th及其任何衍生物組成之群。
  28. 如請求項27之用途，其中該細胞毒素透過連接子結合至該雙特異性抗原結合分子，且其中該細胞毒素為：
    Figure 106139257-A0305-02-0222-10
     其中
    Figure 106139257-A0305-02-0222-23
    為至連接子之鍵。
  29. 如請求項27之用途，其中連接子為：
    Figure 106139257-A0305-02-0222-11
     其中標註為
    Figure 106139257-A0305-02-0222-24
    的鍵代表至雙特異性抗原結合分子之鍵，而標註為
    Figure 106139257-A0305-02-0222-25
    的 鍵代表至細胞毒素之鍵。
  30. 如請求項27之用途，其中該細胞毒素透過連接子結合至雙特異性抗原結合分子，且其中該細胞毒素為：
    Figure 106139257-A0305-02-0222-12
     其中
    Figure 106139257-A0305-02-0222-26
    為至連接子之鍵。
  31. 如請求項30之用途，其中該連接子為
    Figure 106139257-A0305-02-0222-14
     其中標註為
    Figure 106139257-A0305-02-0223-20
    的鍵代表至雙特異性抗原結合分子之鍵，及標註為
    Figure 106139257-A0305-02-0223-22
    的 鍵代表至細胞毒素之鍵。
  32. 如請求項22至31中任一項之用途，其中該癌症為胃癌或肺癌。
  33. 一種製備抗體-藥物接合物的方法，其包含使以下：MET x MET雙特異性抗原結合蛋白，其包含第一抗原結合域(D1)和第二抗原結合域(D2)，其中：D1包含含有三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2與HCDR3)之HCVR，以及含有三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2與LCDR3)之LCVR，其中D1之HCVR之HCDR1、HCDR2與HCDR3分別包含SEQ ID NO：60、SEQ ID NO：62、及SEQ ID NO：64之胺基酸序列；且D1之LCVR之LCDR1、LCDR2與LCDR3分別包含SEQ ID NO：140、SEQ ID NO：142、及SEQ ID NO：144之胺基酸序列；以及D2包含含有三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2與HCDR3)之HCVR，以及含有三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2與LCDR3)之LCVR，其中D2之HCVR之HCDR1、HCDR2與HCDR3分別包含SEQ ID NO：84、SEQ ID NO：86、及SEQ ID NO：88之胺基酸序列；且D2之LCVR之LCDR1、LCDR2與LCDR3分別包含SEQ ID NO：140、SEQ ID NO：142、及SEQ ID NO：144之胺基酸序列與具有下式B1的化合物
    Figure 106139257-A0305-02-0223-16
     及水性稀釋劑接觸。
  34. 如請求項33之方法，其中該MET x MET雙特異性抗原結合蛋白包含SEQ ID NO：58之D1-HCVR胺基酸序列以及SEQ ID NO：82之 D2-HCVR胺基酸序列。
  35. 一種抗體-藥物接合物，其藉由以下方法製備：(i)使式(a)化合物
    Figure 106139257-A0305-02-0224-17
     與式(b)化合物
    Figure 106139257-A0305-02-0224-19
     在矽膠以及稀釋劑的存在下接觸以合成中間體；以及(ii)使MET x MET雙特異性抗原結合蛋白與該中間體和水性稀釋劑接觸，其中：MET x MET雙特異性抗原結合蛋白包含：第一抗原結合域(D1)和第二抗原結合域(D2)，其中：D1包含含有三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2與HCDR3)之HCVR，以及含有三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2與LCDR3)之LCVR，其中D1之HCVR之HCDR1、HCDR2與HCDR3分別包含SEQ ID NO：60、SEQ ID NO：62、及SEQ ID NO：64之胺基酸序列；且D1之LCVR之LCDR1、LCDR2與LCDR3分別包含SEQ ID NO：140、SEQ ID NO：142、及SEQ ID NO：144之胺基酸序列；以及D2包含含有三個重鏈CDR(HCDR1、HCDR2與HCDR3)之 HCVR，以及含有三個輕鏈CDR(LCDR1、LCDR2與LCDR3)之LCVR，其中D2之HCVR之HCDR1、HCDR2與HCDR3分別包含SEQ ID NO：84、SEQ ID NO：86、及SEQ ID NO：88之胺基酸序列；且D2之LCVR之LCDR1、LCDR2與LCDR3分別包含SEQ ID NO：140、SEQ ID NO：142、及SEQ ID NO：144之胺基酸序列。
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