JP2005058226A - 物質生産に影響する代謝フラックスの決定方法 - Google Patents
物質生産に影響する代謝フラックスの決定方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2005058226A JP2005058226A JP2004221708A JP2004221708A JP2005058226A JP 2005058226 A JP2005058226 A JP 2005058226A JP 2004221708 A JP2004221708 A JP 2004221708A JP 2004221708 A JP2004221708 A JP 2004221708A JP 2005058226 A JP2005058226 A JP 2005058226A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- metabolic flux
- flux
- substance
- metabolic
- strain
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0006—Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/08—Lysine; Diaminopimelic acid; Threonine; Valine
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
【解決手段】 1)基質から目的生産物質に至る生化学反応式に基づいて化学量論行列を生成する工程、2)前記化学量論行列の自由度と同数の独立な代謝フラックスを自由フラックスとして選択する工程、3)統計解析に十分な数のランダムな、自由フラックスの組み合わせを生成し、生成した組み合わせのそれぞれから、前記化学量論行列に基づいて代謝フラックス分布を算出する工程、4)算出された代謝フラックス分布から、物質生産との相関を示す、最小数の自由フラックスを含む回帰式を多変量統計解析により得る工程、及び、5)得られた回帰式における係数に基づいて物質生産に影響する代謝フラックスを決定する工程により、細胞を用いた物質生産に影響する代謝フラックスを決定する。
【選択図】 図2
Description
Varma, A. and Palsson, B. O. Appl. Environ. Microbiol. 60:3724-3731, 1994 Schilling, C. H. et al. Biotechnol. Prog. 15:288-295, 1999 Schilling, C. H. et al. Biotechnol. Prog. 15:296-303, 1999 Pramanik, J. and Keasling, J. D. Biotechnol. Bioeng. 56:398-421, 1997 Ibarra, R. U. et al. Nature. 420:186-189, 2002 Vallino, J. J. and Stephanopoulos, G. Biotechnol. Bioeng. 41:633-646, 1993 Wiechert, W. Journal of Biotechnology 94:37-63, 2002 Wiechert, W. Metabolic Engineering 3:195-205, 2001
1)基質から目的生産物質に至る生化学反応式に基づいて化学量論行列を生成する工程、2)前記化学量論行列の自由度と同数の独立な代謝フラックスを自由フラックスとして選択する工程、
3)統計解析に十分な数のランダムな、自由フラックスの組み合わせを生成し、生成した組み合わせのそれぞれから、前記化学量論行列に基づいて代謝フラックス分布を算出する工程、
4)算出された代謝フラックス分布から、物質生産との相関を示す、最小数の自由フラックスを含む回帰式を多変量統計解析により得る工程、及び、
5)得られた回帰式における係数に基づいて物質生産に影響する少なくとも1の代謝フラックスを決定する工程
を含むことを特徴とする前記方法。
1)基質から目的生産物質に至る生化学反応式に基づいて化学量論行列を生成する手順、
2)前記化学両論行列の自由度と同数の独立な代謝フラックスを自由フラックスとして選択する手順、
3)統計解析に十分な数のランダムな、自由フラックスの組み合わせを生成し、生成した組み合わせのそれぞれから、前記化学量論行列に基づいて代謝フラックス分布を算出する手順、
4)算出された代謝フラックス分布から、物質生産との相関を示す、最小数の自由フラックスを含む回帰式を多変量統計解析により得る手順、及び、
5)得られた回帰式における係数に基づいて物質生産に影響する少なくとも1の代謝フラックスを決定する手順
を含む代謝フラックス決定方法をコンピューターに実行させるためのプログラム。
本発明の決定方法は、細胞を用いた物質生産に影響する代謝フラックスを決定する方法である。
stoichiometry matrix)を用いることも出来る(Reder, C. J. Theor. Biol. 135:175-201, 1988)。この方法では、前記生化学反応式から決定される独立な代謝フラックス群から、前記化学量論行列の自由度と同数の代謝フラックス群を選択し、選択された代謝フラックス群のそれぞれから代謝フラックスを自由フラックスとして選択する。フラックス群の特異的グループを決定することにより、あるグループのどのフラックスを変化させても、他のグループのフラックスに影響を与えない事が保証される。従って、それぞれのグループから、1つのフラックスを独立な自由フラックスとして選ぶことが可能になる。フラックス群から自由フラックスを選択する際には、分岐点に近いフラックスを選択することが好ましい。
スの値から得られた代謝フラックス分布の解は、生物学的に意味のあるものでなくてはならない。すなわち、非可逆反応のフラックスが全て0以上であること、菌体形成フラックスが0以上であることである。より望ましい自由フラックスの組み合わせを得る為に、さらに、細胞を用いた物質生産における理論的及び/又は経験的な知識に基づく条件を付加することも出来る。生成する組み合わせの数、すなわち算出する生物学的に意味のあるフラックス分布の数としては統計解析に十分な数があればよい。1つの自由フラックスに対して3つ〜5つの値を用いるので、n個の自由フラックスの場合には、その組み合わせとして1つの自由フラックスに対する値の数のn乗個程度である。例えば、1つの自由フラックスに対して3つの値を用いる場合には、その組み合わせとして3のn乗(3n)個程度である。すなわち、7つの自由フラックス(n=7)に対しては約2,200を用いればよい。あるいは、生物学的に意味のあるフラックス分布のデータセットにおける各々の自由フラックスに対する値の数は、選択された自由フラックスや付加条件に依存して変化し得るので、n個の自由フラックスがあるとき、総数で3のn乗(3n)個から5のn乗(5n)個程度としてもよい。これだけの生物学的に意味のあるフラックス分布の解を求める為には、1つの自由フラックスに対して6つから10つの値を用いてランダムな自由フラックスの値の組み合わせ、すなわち6のn乗(6n)個から10のn乗(10n)個の自由フラックスの組み合わせから始めるのが一般的である。
本発明の作成方法は、物質生産能を保持する菌株の作成方法であり、本発明の決定方法により決定された物質生産に影響する代謝フラックス又はその代謝フラックスと同じ独立な代謝フラックス群に属する代謝フラックスを対象として、物質生産に対し正の相関を示す代謝フラックスである場合には、その代謝フラックスを担う活性を高め、及び/又は、物質生産に対し負の相関を示す代謝フラックスである場合には、その代謝フラックスを担う活性を低めるように菌株を改変することを特徴とする。
本発明の製造法は、本発明の作成方法により得られる、アミノ酸、核酸又は有機酸の生産能を有する菌株を培地で培養して、アミノ酸、核酸又は有機酸を該培地中または菌体内に生成蓄積させ、該培地または菌体よりアミノ酸、核酸又は有機酸を回収することを特徴とする、アミノ酸、核酸又は有機酸の製造法である。
本発明は、本発明の決定方法を実施するためのプログラムも提供する。本発明のプログラムは、細胞を用いた物質生産に影響する少なくとも1の代謝フラックスを決定するプログラムであって、
1)基質から目的生産物質に至る生化学反応式に基づいて化学量論行列を生成する手順、2)前記化学両論行列の自由度と同数の独立な代謝フラックスを自由フラックスとして選択する手順、
3)統計解析に十分な数のランダムな、自由フラックスの組み合わせを生成し、生成した組み合わせのそれぞれから、前記化学量論行列に基づいて代謝フラックス分布を算出する手順、
4)算出された代謝フラックス分布から、物質生産との相関を示す、最小数の自由フラックスを含む回帰式を多変量統計解析により得る手順、及び、
5)得られた回帰式における係数に基づいて物質生産に影響する少なくとも1の代謝フラックスを決定する手順
を含む代謝フラックス決定方法をコンピューターに実行させるためのプログラムである。
されるネットワークを介してプログラムを送信する場合の通信回線や搬送波のように、短期にプログラムを保持する「通信媒体」を含むものとする。
(1)化学量論マトリックスの生成
細胞内代謝中間体の擬定常状態を仮定して、代謝フラックスを計算する化学量論式を構築した(Savinell, J. M. and Palsson, B. O. J. Theor. Biol. 154:421-454, 1992; Vallino, J. J. and Stephanopoulos, G. Biotechnol. Bioeng. 41:633-646, 1993)。このモデルに含まれる反応式は、第2表に示した通りであり、本発明で用いる各略号の説明については第1表に記載する。分岐のないいくつかの反応は、式を単純化するため一つにまとめた。ペントースリン酸経路は複雑なため、2つの式にまとめて表記した。菌体(biomass)の構成比率については報告されているデータを使用し(Neidhardt、F. C. et al., Physiology of the Bacterial Cell. Sinauer Associates, Massachusetts. 1990)、[68]の反応式を用いて表した。このモデルの化学量論行列は自由度が7であった。
Rederの方法に基づきフラックス群の特異的グループを決定した(Reder, C. J. Theor.
Biol. 135:175-201, 1988)。それぞれのグループから、分岐点に近いフラックスを選び、得られた7つの自由フラックスを第3表に示した。これら7つのフラックスを特定することで、フラックスバランスに対して、ユニークな解を与えることができる。
7つの自由フラックスに対応する列のみのZ-scoreを含む縮約行列の多変量線形回帰を実施した。多変量線形回帰には、MatLab statistical toolboxのstepwise regression functionを用いた。この手法によって、菌体あるいはリジン生成を7つの自由フラックスの線形関数で導く事が出来る。これら7つのフラックスを特定することは、系の状態を一義的に定義する事になる。従って、7つの項全てをパラメーターとして用いれば、相関係数は1となり、フィッティングが完全である事を示している。しかしながら、通常、式中のより少ない項のみで、比較的よいフィッティングを得ることが可能である。項の種々の組み合わせを試すために、MatLabプログラムのstepwise関数を用いて、保持される項の数それぞれ対して、もっともよいフィッティングを示す式を選んだ。菌体収率は、イソクエン酸リアーゼ(ICL)、リンゴ酸酵素(MEZ)、PEPカルボキシラーゼ(PEPC)、及びATPaseの四つの項のみで、R2=0.980というフィッティングを得る事が出来た。これよりも項の数を減らした場合、R2値は著しく低下し、妥当なフィッティングを示さなかった。入力を10 mmolグルコース当たりに規格化した反応フラックスをすると正確な式は次のようであった。
実施例1と同じ方法を用いて、スレオニンに対するもっともよいフィッティングを示す式を選んだ。菌体収率は、イソクエン酸リアーゼ(ICL)、リンゴ酸酵素(MEZ)、PEPカルボキシラーゼ(PEPC)、及びATPaseの四つの項のみで、R2=0.986というフィッティングを得る事が出来た。
エシェリヒア・コリのL−リジン生産株として、AEC(S−(2−アミノエチル)−システイン)耐性株であるWC196株(国際公開第WO96/17930号国際公開パンフレット参照)を用いた。
PCRの鋳型として、プラスミドpMW118-attL-Cm-attRを使用した。pMW118-attL-Cm-attRは、pMW118(宝バイオ社製)にλファージのアタッチメントサイトであるattL及びattR遺伝子と抗生物質耐性遺伝子であるcat遺伝子を挿入したプラスミドであり、attL-cat-attRの順で挿入されている。attL配列を配列番号5に、attR配列を配列番号6に示す。
Laboratory Press(1989年))で100倍希釈した。得られた希釈物を30℃で通気しながらOD600が約0.6になるまで生育させた後、100倍に濃縮し、10%グリセロールで3回洗浄することによってエレクトロポレーションに使用できるようにした。エレクトロポレーションは70μLのコンピテントセルと約100ngのPCR産物を用いて行った。エレクトロポレーション後のセルは1mLのSOC培地(モレキュラークローニング:実験室マニュアル第2版、Sambrook, J.ら、Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989年))を加えて37℃で2.5時間培養した後、37℃でCm(クロラムフェニコール)(25mg/L)を含むL−寒天培地上で平板培養し、Cm耐性組換え体を選択した。次に、pKD46プラスミドを除去するために、Cmを含むL-寒天培地上、42℃で2回継代し、得られたコロニーのアンピシリン耐性を試験し、pKD46が脱落しているアンピシリン感受性株を取得した。
次に、pMW-intxis-tsプラスミドを除去するために、L-寒天培地上、42℃で2回継代し、得られたコロニーのアンピシリン耐性、及びクロラムフェニコール耐性を試験し、att-cat、及びpMW-intxis-tsが脱落しているクロラムフェニコール、アンピシリン感受性株を取得した。この株をWC196ΔsfcAと名づけた。
WC196株、WC196ΔsfcA 株におけるb2463遺伝子の欠失は、上記(1)の手法に則って、b2463破壊用プライマーとして、配列番号3、4のプライマーを使用して行った。これによって、WC196Δb2463株、WC196ΔsfcAΔb2463を得た。構築した菌株WC196ΔsfcAΔb2463をWC196Δmezと名づけた。
PCRの鋳型pMW118-attL-Cm-attR及びヘルパープラスミドpMW-intxis-tsは以下のように調製した。
pMW118-attL-Cm-attRの構築は、pMW118-attL-Tc-attRを基にした。下記の四つのDNA断片を連結した。
以上のようにしてpMW118-attL-Tc-attRを得た。
)、連結反応混合物をPCR増幅することにより目的の人工DNA断片(1156 bp)を得た。
最初に、λファージDNA(Fermentas)を鋳型として二つのDNA断片を増幅した。第一の断片は、nt 37168〜38046(配列番号33)の領域からなり、cIレプレッサー、プロモーターPrm及びPr並びにcro遺伝子のリーダー配列を含むものであった。この断片は、オリゴヌクレオチドP1'及びP2'(配列番号25及び26)をプライマーとして用いた増幅により得た。第二の断片は、λファージのxis-int遺伝子を含む、nt 27801〜29100(配列番号34)の領域からなるものであった。この断片は、オリゴヌクレオチドP3'及びP4'(配列番号27及び28)をプライマーとして用いた増幅により得た。全てのプライマーは、適切なエンドヌクレアーゼ認識部位を有していた。
sfcA及びb2463の欠損株をVKPM B-5318株から取得した。VKPM B-5318株は、1987年11月19日ににロシアン・ナショナル・コレクション・オブ・インダストリアル・マイクロオーガニズム(Russian National Collection of Industrial Microorganisms (VKPM), GNII Genetika )に登録番号VKPM B-5318のもとに寄託されている。
<5−1>b2463欠損株であるL-スレオニン生産菌の評価
B-5318ΔsfcA株及びB-5318株を、<5−1>と同様にして培養した。
WC196株、WC196ΔsfcA株及びWC196Δb2463株を、dapA、dapB及びLysC遺伝子を搭載したLys生産用プラスミドpCABD2(国際公開第WO01/53459号パンフレット)を用いて常法に従い形質転換し、WC196/pCABD2、WC196ΔsfcA/pCABD2株及びWC196Δb2463/pCABD2株を得た。
<6−1> リンゴ酸酵素欠損L-スレオニン生産株の評価
B-5318Dmez株及びB-5318株を、ストレプトマイシン硫酸塩20mg/L、硫酸カナマイシン25mg/Lを含有するLB寒天培地(トリプトン10g/L、酵母エキス5g/L、NaCl 5g/L、寒天15g/L)にて37℃で24時間培養した菌体を1枚のプレートから掻き取り、LB液体培地(トリプトン10g/L、酵母エキス5g/L、NaCl 5g/L)5mLに懸濁し、0.5mLをストレプトマイシン硫酸塩20mg/L、硫酸カナマイシン25mg/Lを含有するLB液体培地50mLに植菌し、培養温度39℃、培養時間4時間、144rpmにて前培養を行った。
WC196株、WC196Δmez株をLys生産用プラスミドpCABD2(WO01/53459)で常法に従い形質転換し、WC196/pCABD2及びWC196Δmez/pCABD2株を得た。
比較して、WC196Δmez/pCABD2は除菌体収率が向上することがわかった。
Claims (7)
- 細胞を用いた物質生産に影響する少なくとも1の代謝フラックスを決定する方法であって、
1)基質から目的生産物質に至る生化学反応式に基づいて化学量論行列を生成する工程、2)前記化学量論行列の自由度と同数の独立な代謝フラックスを自由フラックスとして選択する工程、
3)統計解析に十分な数のランダムな、自由フラックスの組み合わせを生成し、生成した組み合わせのそれぞれから、前記化学量論行列に基づいて代謝フラックス分布を算出する工程、
4)算出された代謝フラックス分布から、物質生産との相関を示す、最小数の自由フラックスを含む回帰式を多変量統計解析により得る工程、及び、
5)得られた回帰式における係数に基づいて物質生産に影響する少なくとも1の代謝フラックスを決定する工程
を含むことを特徴とする前記方法。 - 統計解析が多変量線形回帰分析である請求項1に記載の方法。
- 細胞がアミノ酸、核酸又は有機酸の生産能を保持する微生物である請求項1又は2に記載の方法。
- 請求項1〜3のいずれか1項に記載の方法により決定された物質生産に影響する代謝フラックス又はその代謝フラックスと同じ独立な代謝フラックス群に属するいずれかの代謝フラックスを対象として、物質生産に対し正の相関を示す代謝フラックスである場合には、その代謝フラックスを担う活性を高め、及び/又は、物質生産に対し負の相関を示す代謝フラックスである場合には、その代謝フラックスを担う活性を低めるように菌株を改変することを含む、物質生産能を保持する菌株の作成方法。
- 請求項4記載の方法により得られる菌株を培地中で培養し、該培地中に物質を生成・蓄積せしめ、当該物質を培地から採取することを特徴とし、物質がアミノ酸、核酸又は有機酸である、物質の製造方法。
- 細胞を用いた物質生産に影響する少なくとも1の代謝フラックスを決定するプログラムであって、
1)基質から目的生産物質に至る生化学反応式に基づいて化学量論行列を生成する手順、2)前記化学両論行列の自由度と同数の独立な代謝フラックスを自由フラックスとして選択する手順、
3)統計解析に十分な数のランダムな、自由フラックスの組み合わせを生成し、生成した組み合わせのそれぞれから、前記化学量論行列に基づいて代謝フラックス分布を算出する手順、
4)算出された代謝フラックス分布から、物質生産との相関を示す、最小数の自由フラックスを含む回帰式を多変量統計解析により得る手順、及び、
5)得られた回帰式における係数に基づいて物質生産に影響する少なくとも1の代謝フラックスを決定する手順
を含む代謝フラックス決定方法をコンピューターに実行させるためのプログラム。 - 請求項6記載のプログラムを記録したことを特徴とするコンピューター読み取り可能な記録媒体。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2004221708A JP4894134B2 (ja) | 2003-07-29 | 2004-07-29 | 物質生産に影響する代謝フラックスの決定方法 |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2003202842 | 2003-07-29 | ||
JP2003202842 | 2003-07-29 | ||
JP2004221708A JP4894134B2 (ja) | 2003-07-29 | 2004-07-29 | 物質生産に影響する代謝フラックスの決定方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2005058226A true JP2005058226A (ja) | 2005-03-10 |
JP4894134B2 JP4894134B2 (ja) | 2012-03-14 |
Family
ID=34100609
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2004222088A Active JP4665451B2 (ja) | 2003-07-29 | 2004-07-29 | L−リジンまたはl−スレオニンの製造法 |
JP2004221708A Expired - Fee Related JP4894134B2 (ja) | 2003-07-29 | 2004-07-29 | 物質生産に影響する代謝フラックスの決定方法 |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2004222088A Active JP4665451B2 (ja) | 2003-07-29 | 2004-07-29 | L−リジンまたはl−スレオニンの製造法 |
Country Status (14)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US7306933B2 (ja) |
EP (2) | EP1649403A2 (ja) |
JP (2) | JP4665451B2 (ja) |
KR (2) | KR101073370B1 (ja) |
CN (2) | CN100520793C (ja) |
AT (1) | ATE397059T1 (ja) |
BR (2) | BRPI0413030A (ja) |
DE (1) | DE602004014158D1 (ja) |
DK (1) | DK1651758T3 (ja) |
ES (1) | ES2305849T3 (ja) |
PL (1) | PL1651758T3 (ja) |
RU (1) | RU2337140C2 (ja) |
WO (2) | WO2005010175A1 (ja) |
ZA (1) | ZA200510144B (ja) |
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2005245440A (ja) * | 2004-02-05 | 2005-09-15 | Ajinomoto Co Inc | 同位体で標識された基質を用いた細胞内代謝フラックスの解析方法 |
KR100818202B1 (ko) | 2006-12-22 | 2008-03-31 | 한국과학기술원 | 미생물의 성장에 필수적인 대사산물의 스크리닝 방법 |
JP2008527992A (ja) * | 2005-09-15 | 2008-07-31 | コリア アドバンスド インスティチュート オブ サイエンス アンド テクノロジィ | 強化目的のフラックスに基づいたフラックス・スキャニングを用いた生物の改良方法 |
JP2009535055A (ja) * | 2006-05-04 | 2009-10-01 | コリア アドバンスド インスティチュート オブ サイエンス アンド テクノロジィ | 代謝産物のフラックスサムプロファイリングを用いた生物改良方法 |
WO2011034263A1 (ko) * | 2009-09-18 | 2011-03-24 | 한국과학기술원 | 필수 대사산물을 이용한 병원성 미생물의 약물 표적 예측 방법 |
Families Citing this family (153)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
DK1253195T3 (da) | 2000-01-21 | 2009-01-12 | Ajinomoto Kk | Fremgangsmåde til fremstilling af L-lysin |
BR0304860A (pt) * | 2002-11-11 | 2004-08-31 | Ajinomoto Kk | Método para produzir uma substância alvo pela utilização de uma-bactéria pertencente ao gênero escherichia |
ES2331956T3 (es) * | 2004-01-30 | 2010-01-21 | Ajinomoto Co., Inc. | Microorganismo que produce l-aminoacidos y procedimiento para producir l-aminoacidos. |
US8510054B2 (en) * | 2004-02-05 | 2013-08-13 | Ajinomoto Co., Inc. | Intracellular metabolic flux analysis method using substrate labeled with isotope |
JP4654592B2 (ja) | 2004-04-02 | 2011-03-23 | 味の素株式会社 | 代謝フラックスの決定方法 |
KR100921644B1 (ko) | 2004-10-07 | 2009-10-14 | 아지노모토 가부시키가이샤 | 염기성 물질의 제조법 |
US7915018B2 (en) * | 2004-10-22 | 2011-03-29 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing L-amino acids using bacteria of the Enterobacteriaceae family |
EP1907529A1 (en) | 2005-07-25 | 2008-04-09 | Ajinomoto Co., Inc. | A METHOD FOR PRODUCING AN L-AMINO ACID USING A BACTERIUM OF THE ENTEROBACTERIACEAE FAMILY WITH ATTENUATED EXPRESSION OF THE cpxR GENE |
WO2007017710A1 (en) | 2005-08-11 | 2007-02-15 | Metabolic Explorer | Process for the preparation of aspartate and derived amino acids like lysine, threonine, isoleucine, methionine, homoserine, or valine employing a microorganism with enhanced isocitrate lyase and/or malate synthase expression |
JP2007117082A (ja) * | 2005-09-27 | 2007-05-17 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸生産菌及びl−アミノ酸の製造法 |
EP1929029A1 (en) | 2005-09-27 | 2008-06-11 | Ajinomoto Co., Inc. | An l-amino acid-producing bacterium and a method for producing l-amino acids |
WO2007037459A1 (en) | 2005-09-27 | 2007-04-05 | Ajinomoto Co., Inc. | An l-amino acid-producing bacterium and a method for producing l-amino acids |
JP2007185184A (ja) * | 2005-12-16 | 2007-07-26 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸生産菌及びl−アミノ酸の製造法 |
WO2007086618A1 (en) | 2006-01-30 | 2007-08-02 | Ajinomoto Co., Inc. | L-amino acid producing bacterium and method of producing l-amino acid |
JP2009095237A (ja) | 2006-02-02 | 2009-05-07 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
JP2009118740A (ja) | 2006-03-03 | 2009-06-04 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
EP2351830B1 (en) | 2006-03-23 | 2014-04-23 | Ajinomoto Co., Inc. | A method for producing an L-amino acid using bacterium of the Enterobacteriaceae family with attenuated expression of a gene coding for small RNA |
RU2338784C2 (ru) * | 2006-03-24 | 2008-11-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) | Новая альдолаза, днк, кодирующая альдолазу, клетки, трансформированные днк, способ получения альдолазы и способ получения 4-гидрокси-l-изолейцина (варианты) |
JP2009060791A (ja) * | 2006-03-30 | 2009-03-26 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸生産菌及びl−アミノ酸の製造法 |
JP2009165355A (ja) | 2006-04-28 | 2009-07-30 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸を生産する微生物及びl−アミノ酸の製造法 |
EP2046949B1 (en) * | 2006-07-19 | 2014-01-15 | Ajinomoto Co., Inc. | A method for producing an l-amino acid using a bacterium of the enterobacteriaceae family |
JP2010017081A (ja) | 2006-10-10 | 2010-01-28 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
JP2010017082A (ja) * | 2006-10-10 | 2010-01-28 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
WO2008072761A2 (en) * | 2006-12-11 | 2008-06-19 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing an l-amino acid |
RU2006143864A (ru) | 2006-12-12 | 2008-06-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) (RU) | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АМИНОКИСЛОТ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ СЕМЕЙСТВА ENTEROBACTERIACEAE, В КОТОРОЙ ОСЛАБЛЕНА ЭКСПРЕССИЯ ГЕНОВ cynT, cynS, cynX, ИЛИ cynR, ИЛИ ИХ КОМБИНАЦИИ |
JP2010041920A (ja) | 2006-12-19 | 2010-02-25 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
RU2006145712A (ru) * | 2006-12-22 | 2008-06-27 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) (RU) | Способ получения l-аминокислот методом ферментации с использованием бактерий, обладающих повышенной способностью к утилизации глицерина |
BRPI0703692B1 (pt) | 2006-12-25 | 2016-12-27 | Ajinomoto Kk | método para se obter os cristais de um hidrocloreto de aminoácido básico compreendendo gerar um aminoácido básico usando células microbianas por fermentação em um caldo de fermentação ou por um método enzimático em uma solução de reação de enzima usando as células como catalisadores |
WO2008090770A1 (ja) | 2007-01-22 | 2008-07-31 | Ajinomoto Co., Inc. | L-アミノ酸を生産する微生物及びl-アミノ酸の製造法 |
JP2010088301A (ja) | 2007-02-01 | 2010-04-22 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
JP2010110216A (ja) * | 2007-02-20 | 2010-05-20 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸または核酸の製造方法 |
JP2010110217A (ja) * | 2007-02-22 | 2010-05-20 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸生産菌及びl−アミノ酸の製造法 |
JP2010130899A (ja) | 2007-03-14 | 2010-06-17 | Ajinomoto Co Inc | L−グルタミン酸系アミノ酸生産微生物及びアミノ酸の製造法 |
JPWO2008133131A1 (ja) * | 2007-04-16 | 2010-07-22 | 味の素株式会社 | 有機酸の製造方法 |
WO2008133161A1 (ja) | 2007-04-17 | 2008-11-06 | Ajinomoto Co., Inc. | カルボキシル基を有する酸性物質の製造法 |
JP2010226956A (ja) * | 2007-07-23 | 2010-10-14 | Ajinomoto Co Inc | L−リジンの製造法 |
RU2395579C2 (ru) * | 2007-12-21 | 2010-07-27 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АМИНОКИСЛОТЫ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ, ПРИНАДЛЕЖАЩЕЙ К РОДУ Escherichia |
JP2010263790A (ja) * | 2007-09-04 | 2010-11-25 | Ajinomoto Co Inc | アミノ酸生産微生物及びアミノ酸の製造法 |
EP2192170B1 (en) | 2007-09-04 | 2017-02-15 | Ajinomoto Co., Inc. | Amino acid-producing microorganism and method of producing amino acid |
RU2396336C2 (ru) | 2007-09-27 | 2010-08-10 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ АМИНОКИСЛОТ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ, ПРИНАДЛЕЖАЩЕЙ К РОДУ Escherichia |
JP2010226957A (ja) * | 2007-10-17 | 2010-10-14 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
JP5644108B2 (ja) | 2007-12-06 | 2014-12-24 | 味の素株式会社 | 有機酸の製造方法 |
JP2011067095A (ja) | 2008-01-10 | 2011-04-07 | Ajinomoto Co Inc | 発酵法による目的物質の製造法 |
JP5526785B2 (ja) | 2008-01-23 | 2014-06-18 | 味の素株式会社 | L−アミノ酸の製造法 |
RU2008105793A (ru) | 2008-02-19 | 2009-08-27 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) (RU) | Способ конструирования оперонов, содержащих трансляционно сопряженные гены, бактерия, содержащая такой оперон, способ продукции полезного метаболита и способ мониторинга экспрессии гена |
WO2009104731A1 (ja) | 2008-02-21 | 2009-08-27 | 味の素株式会社 | L-システイン生産菌及びl-システインの製造法 |
BRPI0907542A2 (pt) | 2008-02-25 | 2015-07-28 | Ajinomoto Kk | Método para produzir ácido 5'-guanílico, e, microrganismo com uma capacidade de converter ácido inosínico em ácido 5'-guanílico |
KR101368922B1 (ko) | 2008-03-03 | 2014-02-27 | 글로벌 바이오-켐 테크놀로지 그룹 컴퍼니 리미티드 | 재조합 미생물 및 l-리신을 생산하는 방법 |
JP5332237B2 (ja) | 2008-03-06 | 2013-11-06 | 味の素株式会社 | L−システイン生産菌及びl−システインの製造法 |
JP2011167071A (ja) * | 2008-05-22 | 2011-09-01 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
WO2010027022A1 (ja) | 2008-09-05 | 2010-03-11 | 味の素株式会社 | L-アミノ酸生産菌及びl-アミノ酸の製造法 |
ES2624913T3 (es) | 2008-09-08 | 2017-07-18 | Ajinomoto Co., Inc. | Microorganismo que produce un L-aminoácido y procedimiento para producir un L-aminoácido |
JP2012029565A (ja) | 2008-11-27 | 2012-02-16 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
JP2010142200A (ja) | 2008-12-22 | 2010-07-01 | Ajinomoto Co Inc | L−リジンの製造法 |
BRPI1007069A2 (pt) | 2009-01-23 | 2015-08-25 | Ajinomoto Kk | Método para produzir um l-aminoácido. |
JP5521347B2 (ja) | 2009-02-16 | 2014-06-11 | 味の素株式会社 | L−アミノ酸生産菌及びl−アミノ酸の製造法 |
JP5359409B2 (ja) | 2009-03-12 | 2013-12-04 | 味の素株式会社 | L−システイン生産菌及びl−システインの製造法 |
BRPI1014661B1 (pt) | 2009-07-29 | 2020-12-15 | Ajinomoto Co., Inc. | Método para produzir um l-aminoácido |
JP2012196144A (ja) | 2009-08-03 | 2012-10-18 | Ajinomoto Co Inc | ビブリオ属細菌を用いたl−リジンの製造法 |
JP5636648B2 (ja) | 2009-08-10 | 2014-12-10 | 味の素株式会社 | 5’−グアニル酸の製造法 |
WO2011021717A2 (en) | 2009-08-21 | 2011-02-24 | Ajinomoto Co.,Inc. | Method for producing hydroxylated amino acids |
JP2012223092A (ja) | 2009-08-28 | 2012-11-15 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
RU2009136544A (ru) | 2009-10-05 | 2011-04-10 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт "Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) (RU) | Способ получения l-цистеина с использованием бактерии семейства enterobacteriaceae |
JP2013013329A (ja) | 2009-11-06 | 2013-01-24 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
WO2011065469A1 (ja) | 2009-11-30 | 2011-06-03 | 味の素株式会社 | L-システイン生産菌及びl-システインの製造法 |
RU2010101135A (ru) | 2010-01-15 | 2011-07-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт "Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) (RU) | Бактерия семейства enterobacteriaceae - продуцент l-аспартата или метаболитов, производных l-аспартата, и способ получения l-аспартата или метаболитов, производных l-аспартата |
RU2460793C2 (ru) | 2010-01-15 | 2012-09-10 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт "Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) | Способ получения l-аминокислот с использованием бактерий семейства enterobacteriaceae |
JP2013074795A (ja) | 2010-02-08 | 2013-04-25 | Ajinomoto Co Inc | 変異型rpsA遺伝子及びL−アミノ酸の製造法 |
WO2011100601A1 (en) | 2010-02-11 | 2011-08-18 | Metabolix, Inc. | Process for gamma-butyrolactone production |
RU2471868C2 (ru) | 2010-02-18 | 2013-01-10 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт "Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) | Мутантная аденилатциклаза, днк, кодирующая ее, бактерия семейства enterobacteriaceae, содержащая указанную днк, и способ получения l-аминокислот |
RU2010122646A (ru) | 2010-06-03 | 2011-12-10 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт "Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) (RU) | Способ получения l-аминокислоты с использованием бактерии семейства enterobacteriaceae, в которой ослаблена экспрессия генов, кодирующих транспортер лизина/аргинина/орнитина |
RU2471870C2 (ru) | 2010-06-03 | 2013-01-10 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт "Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АРГИНИНА И L-ЦИТРУЛЛИНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ СЕМЕЙСТВА ENTEROBACTERIACEAE, В КОТОРОЙ ОСЛАБЛЕНА ЭКСПРЕССИЯ ГЕНА pepA |
RU2501858C2 (ru) | 2010-07-21 | 2013-12-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт "Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АМИНОКИСЛОТЫ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ СЕМЕЙСТВА Enterobacteriaceae |
RU2482188C2 (ru) | 2010-07-21 | 2013-05-20 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт "Аджиномото-Генетика" (ЗАО АГРИ) | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АРГИНИНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИЙ РОДА Escherichia, В КОТОРОЙ ИНАКТИВИРОВАН ОПЕРОН astCADBE |
BR112013006031A2 (pt) | 2010-09-14 | 2016-06-07 | Ajinomoto Kk | bactéria,e, método para produzir um aminoácido contendo enxofre, uma substância relacionada ao mesmo, ou uma mnistura dos mesmos. |
JP2014036576A (ja) | 2010-12-10 | 2014-02-27 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
JP2014087259A (ja) | 2011-02-22 | 2014-05-15 | Ajinomoto Co Inc | L−システイン生産菌及びl−システインの製造法 |
JP6020443B2 (ja) | 2011-04-01 | 2016-11-02 | 味の素株式会社 | L−システインの製造法 |
JP2014131487A (ja) | 2011-04-18 | 2014-07-17 | Ajinomoto Co Inc | L−システインの製造法 |
WO2012170793A1 (en) | 2011-06-08 | 2012-12-13 | Metabolix, Inc. | Biorefinery process for thf production |
US20140170714A1 (en) | 2011-08-10 | 2014-06-19 | Metabolix, Inc. | Post process purification for gamma-butyrolactone production |
RU2011134436A (ru) | 2011-08-18 | 2013-10-27 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО "АГРИ") | Способ получения l-аминокислоты с использованием бактерии семейства enterobacteriaceae, обладающей повышенной экспрессией генов каскада образования флагелл и клеточной подвижности |
JP6146304B2 (ja) | 2011-10-07 | 2017-06-14 | 味の素株式会社 | 変異型γ−グルタミルトランスフェラーゼ、及び、γ−グルタミルバリルグリシン又はその塩の製造法 |
JP2015013812A (ja) | 2011-11-01 | 2015-01-22 | 味の素株式会社 | 植物ウイルスの感染抑制剤およびそれを用いた植物ウイルス感染抑制方法 |
IN2014CN04002A (ja) | 2011-11-02 | 2015-10-23 | Ajinomoto Kk | |
WO2013069634A1 (ja) | 2011-11-11 | 2013-05-16 | 味の素株式会社 | 発酵法による目的物質の製造法 |
CN104540959B (zh) | 2012-08-10 | 2018-11-13 | 味之素株式会社 | γ-谷氨酰缬氨酰甘氨酸晶体的制备方法 |
RU2550269C2 (ru) | 2012-08-17 | 2015-05-10 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО "АГРИ") | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АРГИНИНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ СЕМЕЙСТВА Enterobacteriaceae, СОДЕРЖАЩЕЙ N-АЦЕТИЛОРНИТИНДЕАЦЕТИЛАЗУ С НАРУШЕННОЙ АКТИВНОСТЬЮ |
RU2013118637A (ru) | 2013-04-23 | 2014-10-27 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО "АГРИ") | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АМИНОКИСЛОТ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ СЕМЕЙСТВА ENTEROBACTERIACEAE, В КОТОРОЙ РАЗРЕГУЛИРОВАН ГЕН yjjK |
MY185322A (en) | 2013-05-13 | 2021-05-04 | Ajinomoto Kk | Method for producing l-amino acid |
JP2016165225A (ja) | 2013-07-09 | 2016-09-15 | 味の素株式会社 | 有用物質の製造方法 |
RU2013140115A (ru) | 2013-08-30 | 2015-03-10 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО "АГРИ") | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АМИНОКИСЛОТ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ СЕМЕЙСТВА Enterobacteriaceae, В КОТОРОЙ НАРУШЕНА ЭКСПРЕССИЯ КЛАСТЕРА ГЕНОВ znuACB |
JP2016192903A (ja) | 2013-09-17 | 2016-11-17 | 味の素株式会社 | 海藻由来バイオマスからのl−アミノ酸の製造方法 |
WO2015050184A1 (ja) | 2013-10-02 | 2015-04-09 | 味の素株式会社 | ヘパロサン生産細菌及びヘパロサンの製造法 |
RU2013144250A (ru) | 2013-10-02 | 2015-04-10 | Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика" (ЗАО "АГРИ") | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АМИНОКИСЛОТ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ СЕМЕЙСТВА Enterobacteriaceae, В КОТОРОЙ ОСЛАБЛЕНА ЭКСПРЕССИЯ ГЕНА, КОДИРУЮЩЕГО ФОСФАТНЫЙ ТРАНСПОРТЕР |
CN106459857B (zh) | 2013-10-02 | 2019-04-19 | 味之素株式会社 | 氨控制装置及氨控制方法 |
CN104736707B (zh) | 2013-10-21 | 2017-08-25 | 味之素株式会社 | 生产l‑氨基酸的方法 |
WO2015060391A1 (ja) | 2013-10-23 | 2015-04-30 | 味の素株式会社 | 目的物質の製造法 |
WO2015115612A1 (ja) | 2014-01-31 | 2015-08-06 | 味の素株式会社 | 変異型グルタミン酸-システインリガーゼ、及び、γ-グルタミルバリルグリシンの製造法 |
RU2014105547A (ru) | 2014-02-14 | 2015-08-20 | Адзиномото Ко., Инк. | СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ L-АМИНОКИСЛОТ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БАКТЕРИИ СЕМЕЙСТВА ENTEROBACTERIACEAE, ИМЕЮЩЕЙ СВЕРХЭКСПРЕССИРУЕМЫЙ ГЕН yajL |
JP2017216881A (ja) | 2014-12-26 | 2017-12-14 | 味の素株式会社 | ジカルボン酸の製造方法 |
CN104878034B (zh) * | 2015-04-17 | 2018-04-27 | 上海工业生物技术研发中心 | L-赖氨酸基因工程生产菌 |
SG10202101577YA (en) | 2015-05-19 | 2021-03-30 | Mitsubishi Chemical Uk Ltd | Process for the biological production of methacrylic acid and derivatives thereof |
RU2015120052A (ru) | 2015-05-28 | 2016-12-20 | Аджиномото Ко., Инк. | Способ получения L-аминокислоты с использованием бактерии семейства Enterobacteriaceae, в которой ослаблена экспрессия гена gshA |
KR101694811B1 (ko) * | 2015-07-15 | 2017-01-13 | 대상 주식회사 | 말산 효소 또는 젖산 탈수소효소의 불활성화에 의한 아미노산 고생산능 변이 균주 |
CN105018413B (zh) * | 2015-08-28 | 2018-04-03 | 中国科学院重庆绿色智能技术研究院 | 一种浮游植物细胞模型及其构建和应用 |
EP3368695A2 (en) | 2015-10-27 | 2018-09-05 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing aldehyde |
JP6623690B2 (ja) | 2015-10-30 | 2019-12-25 | 味の素株式会社 | グルタミン酸系l−アミノ酸の製造法 |
WO2017122747A1 (en) | 2016-01-12 | 2017-07-20 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing benzaldehyde |
BR112018017227A2 (pt) | 2016-02-25 | 2019-02-05 | Ajinomoto Kk | método para produzir um l-aminoácido |
KR102335301B1 (ko) | 2016-10-21 | 2021-12-06 | 아지노모토 가부시키가이샤 | 단백질의 분비 생산법 |
EP3530747A4 (en) | 2016-10-21 | 2020-07-22 | Ajinomoto Co., Inc. | SECRETORY PROTEIN PRODUCTION PROCESS |
JP7074133B2 (ja) | 2016-10-26 | 2022-05-24 | 味の素株式会社 | 目的物質の製造方法 |
JP7063332B2 (ja) | 2016-10-26 | 2022-05-09 | 味の素株式会社 | 目的物質の製造方法 |
CN109937257B (zh) | 2016-10-26 | 2023-06-30 | 味之素株式会社 | 生产目标物质的方法 |
CN109952380B (zh) | 2016-10-26 | 2023-07-14 | 味之素株式会社 | 用于生产目标物质的方法 |
EP3532631A1 (en) | 2016-10-26 | 2019-09-04 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing l-methionine or metabolites requiring s-adenosylmethionine for synthesis |
WO2018079705A1 (en) | 2016-10-27 | 2018-05-03 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing aldehyde |
GB201619827D0 (en) | 2016-11-23 | 2017-01-04 | Lucite Int Uk Ltd | Process for the production of methyl methacrylate |
BR112019018859A2 (pt) | 2017-03-28 | 2020-04-14 | Ajinomoto Kk | método para produzir rna objetivo |
JP7066977B2 (ja) | 2017-04-03 | 2022-05-16 | 味の素株式会社 | L-アミノ酸の製造法 |
US10858676B2 (en) | 2017-05-22 | 2020-12-08 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing objective substance |
AU2018334768A1 (en) | 2017-09-25 | 2020-04-16 | Ajinomoto Co., Inc. | Protein production method and disaccharide production method |
US11680279B2 (en) | 2017-11-29 | 2023-06-20 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing objective substance |
KR101947945B1 (ko) | 2018-01-25 | 2019-02-13 | 씨제이제일제당 (주) | L-아미노산을 생산하는 코리네박테리움 속 미생물 및 이를 이용한 l-아미노산의 생산방법 |
JP7367667B2 (ja) | 2018-02-20 | 2023-10-24 | 味の素株式会社 | Rnaサイレンシングを誘導する方法 |
JP7124338B2 (ja) | 2018-02-27 | 2022-08-24 | 味の素株式会社 | 変異型グルタチオン合成酵素、及び、γ-グルタミルバリルグリシンの製造法 |
KR102137806B1 (ko) | 2018-03-27 | 2020-07-27 | 씨제이제일제당 주식회사 | 글라이신 생산능이 증가된 미생물 및 이를 이용한 발효 조성물 생산 방법 |
KR20210002575A (ko) | 2018-04-20 | 2021-01-08 | 아지노모토 가부시키가이샤 | 단백질의 분비 생산법 |
WO2019212052A1 (en) | 2018-05-04 | 2019-11-07 | Ajinomoto Co., Inc. | METHOD FOR PRODUCING L-METHIONINE USING A BACTERIUM OF THE GENUS Pantoea |
JP7447810B2 (ja) | 2018-05-23 | 2024-03-12 | 味の素株式会社 | 腸内細菌科を用いたトリペプチドγ-GLU-VAL-GLYの製造方法 |
WO2020027251A1 (en) | 2018-08-03 | 2020-02-06 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing objective substance |
EP3861109A1 (en) | 2018-10-05 | 2021-08-11 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing target substance by bacterial fermentation |
KR20210082212A (ko) | 2018-10-25 | 2021-07-02 | 아지노모토 가부시키가이샤 | 단백질의 분비 생산법 |
BR112021011882A2 (pt) | 2018-12-27 | 2021-09-08 | Ajinomoto Co., Inc. | Método para produzir um l-aminoácido básico |
KR102276219B1 (ko) | 2019-02-15 | 2021-07-12 | 씨제이제일제당 (주) | 생물반응기의 운전 조건을 결정하는 장치 및 방법 |
BR112021014194A2 (pt) | 2019-02-22 | 2021-12-28 | Ajinomoto Kk | Método para a produção de um l-aminoácido |
BR112021019284A2 (pt) | 2019-03-29 | 2022-02-01 | Ajinomoto Kk | Métodos para produzir alolactose e para produzir um indutor de expressão gênica |
BR112021017870A2 (pt) | 2019-04-05 | 2021-12-07 | Ajinomoto Kk | Método para produzir um l-aminoácido |
JPWO2020226087A1 (ja) | 2019-05-08 | 2020-11-12 | ||
KR102221040B1 (ko) | 2019-05-09 | 2021-03-03 | 씨제이제일제당 주식회사 | L-아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용한 l-아미노산을 생산하는 방법 |
KR102153534B1 (ko) | 2019-09-02 | 2020-09-09 | 씨제이제일제당 주식회사 | 신규한 프로모터 및 이를 이용한 아미노산 생산 방법 |
JP2022550084A (ja) | 2019-09-25 | 2022-11-30 | 味の素株式会社 | 細菌の発酵によるl-アミノ酸の製造方法 |
EP4053287A4 (en) | 2019-10-28 | 2023-11-01 | Ajinomoto Co., Inc. | METHOD FOR PRODUCING BENZALDEHYDE |
MX2023002783A (es) | 2020-09-09 | 2023-03-15 | Cj Cheiljedang Corp | Un microorganismo recombinante para producir acido l-glutamico y un metodo para producir acido l-glutamico utilizando el mismo. |
WO2022092018A1 (ja) | 2020-10-28 | 2022-05-05 | 味の素株式会社 | L-アミノ酸の製造法 |
KR102527096B1 (ko) | 2021-02-01 | 2023-04-28 | 씨제이제일제당 주식회사 | 프리페네이트 탈수 효소 (Prephenate dehydratase) 변이체 및 이를 이용한 분지쇄 아미노산 생산 방법 |
KR102649245B1 (ko) | 2021-03-08 | 2024-03-21 | 씨제이제일제당 주식회사 | L-아미노산을 생산하는 코리네박테리움 속 미생물 및 이를 이용한 l-아미노산의 생산방법 |
KR102339264B1 (ko) | 2021-05-07 | 2021-12-14 | 씨제이제일제당 주식회사 | 신규 프로모터 및 이의 용도 |
KR102339271B1 (ko) | 2021-05-07 | 2021-12-14 | 씨제이제일제당 주식회사 | 신규 프로모터 및 이의 용도 |
AU2022306337A1 (en) | 2021-07-07 | 2024-02-01 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for secretory production of unnatural-amino-acid-containing protein |
GB2621337A (en) | 2022-08-08 | 2024-02-14 | Mitsubishi Chemical Uk Ltd | Process for the biological production of methacrylic acid and derivatives thereof |
US20240117393A1 (en) | 2022-09-30 | 2024-04-11 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing l-amino acid |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2002070730A2 (en) * | 2001-03-01 | 2002-09-12 | The Regents Of The University Of California | Models and methods for determining systemic properties of regulated reaction networks |
Family Cites Families (31)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1990004636A1 (en) * | 1988-10-25 | 1990-05-03 | Vsesojuzny Nauchno-Issledovatelsky Institut Genetiki I Selektsii Promyshlennykh Mikroorganizmov (Vniigenetika) | Strain of bacteria escherichia coli, producer of l-threonine |
US5976843A (en) * | 1992-04-22 | 1999-11-02 | Ajinomoto Co., Inc. | Bacterial strain of Escherichia coli BKIIM B-3996 as the producer of L-threonine |
US6132999A (en) * | 1992-09-21 | 2000-10-17 | Ajinomoto Co., Inc. | L-threonine-producing microbacteria and a method for the production of L-threonine |
AU687458B2 (en) * | 1993-10-28 | 1998-02-26 | Ajinomoto Co., Inc. | Process for producing substance |
WO2000046405A2 (en) | 1999-02-02 | 2000-08-10 | Bernhard Palsson | Methods for identifying drug targets based on genomic sequence data |
FR2796080B1 (fr) * | 1999-06-18 | 2003-08-08 | Orsan | Procede de production de la l-lysine par surexpression de l'enzyme malique |
US6830903B1 (en) * | 1999-07-23 | 2004-12-14 | Archer-Daniels-Midland Company | Methods for producing L-amino acids using a corynebacterium glutamicum with a disrupted pgi gene |
WO2001048146A1 (fr) * | 1999-12-24 | 2001-07-05 | Ajinomoto Co., Inc. | Procede de production d'acide l-amine et nouveau gene |
JP4380029B2 (ja) * | 2000-07-05 | 2009-12-09 | 味の素株式会社 | 微生物を利用した物質の製造法 |
BR0106255A (pt) * | 2000-12-22 | 2002-08-20 | Método papa produzir uma substância alvo pela utilização de um microorganismo | |
US7711490B2 (en) | 2001-01-10 | 2010-05-04 | The Penn State Research Foundation | Method and system for modeling cellular metabolism |
JP2002209596A (ja) * | 2001-01-19 | 2002-07-30 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸の製造法 |
US7127379B2 (en) | 2001-01-31 | 2006-10-24 | The Regents Of The University Of California | Method for the evolutionary design of biochemical reaction networks |
JP2002330763A (ja) * | 2001-05-02 | 2002-11-19 | Ajinomoto Co Inc | 発酵法による目的物質の製造法 |
IL160151A0 (en) * | 2001-08-10 | 2004-07-25 | Nat Public Health Inst | Identification of a dna variant associated with adult type hypolactasia |
WO2003029425A2 (en) * | 2001-10-01 | 2003-04-10 | Diversa Corporation | Whole cell engineering using real-time metabolic flux analysis |
JP2003250544A (ja) * | 2002-03-04 | 2003-09-09 | National Institute Of Technology & Evaluation | タンパク質の性質を改変する方法 |
DE10224088A1 (de) * | 2002-05-31 | 2003-12-11 | Degussa | Verfahren zur Herstellung von L-Aminosäuren unter Verwendung coryneformer Bakterien die ein abgeschwächtes mez-Gen enthalten |
US6911332B2 (en) * | 2002-06-12 | 2005-06-28 | Ajinomoto Co., Inc. | Isolated polynucleotides encoding d-arabino-3-hexulose-6-phosphate synthases from Methylophilus methylotrophus |
AU2003205041A1 (en) * | 2002-07-12 | 2004-01-29 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing target substance by fermentation |
BR0304860A (pt) * | 2002-11-11 | 2004-08-31 | Ajinomoto Kk | Método para produzir uma substância alvo pela utilização de uma-bactéria pertencente ao gênero escherichia |
US7060475B2 (en) * | 2003-02-28 | 2006-06-13 | Ajinomoto Co., Inc. | Polynucleotides encoding polypeptides involved in intermediates metabolism of central metabolic pathway in methylophilus methylotrophus |
US7029893B2 (en) * | 2003-02-28 | 2006-04-18 | Ajinomoto Co., Inc. | Polynucleotides encoding polypeptides involved in amino acid biosynthesis in methylophilus methylotrophus |
US20060019356A1 (en) * | 2003-02-28 | 2006-01-26 | Yoshihiro Usuda | Polynucleotides encoding polypeptides involved in intermediates metabolism of the central metabolic pathway in Methylophilus methylotrophus |
US7026149B2 (en) * | 2003-02-28 | 2006-04-11 | Ajinomoto Co., Inc. | Polynucleotides encoding polypeptides involved in the stress response to environmental changes in Methylophilus methylotrophus |
US7468262B2 (en) * | 2003-05-16 | 2008-12-23 | Ajinomoto Co., Inc. | Polynucleotides encoding useful polypeptides in corynebacterium glutamicum ssp. lactofermentum |
JP4380305B2 (ja) * | 2003-11-21 | 2009-12-09 | 味の素株式会社 | 発酵法によるl−アミノ酸の製造法 |
ES2331956T3 (es) * | 2004-01-30 | 2010-01-21 | Ajinomoto Co., Inc. | Microorganismo que produce l-aminoacidos y procedimiento para producir l-aminoacidos. |
US7915018B2 (en) * | 2004-10-22 | 2011-03-29 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing L-amino acids using bacteria of the Enterobacteriaceae family |
WO2006078039A1 (en) * | 2005-01-18 | 2006-07-27 | Ajinomoto Co., Inc. | L-amino acid producing microorganism and a method for producing l-amino acid |
US20070004014A1 (en) * | 2005-06-29 | 2007-01-04 | Yuichiro Tsuji | Method for producing l-threonine |
-
2004
- 2004-07-29 RU RU2006101328/13A patent/RU2337140C2/ru active
- 2004-07-29 BR BRPI0413030-8A patent/BRPI0413030A/pt not_active IP Right Cessation
- 2004-07-29 DK DK04771247T patent/DK1651758T3/da active
- 2004-07-29 AT AT04771247T patent/ATE397059T1/de not_active IP Right Cessation
- 2004-07-29 ES ES04771247T patent/ES2305849T3/es active Active
- 2004-07-29 BR BRPI0413007A patent/BRPI0413007B1/pt active IP Right Grant
- 2004-07-29 WO PCT/JP2004/011220 patent/WO2005010175A1/en active IP Right Grant
- 2004-07-29 WO PCT/JP2004/011212 patent/WO2005010794A2/en not_active Application Discontinuation
- 2004-07-29 PL PL04771247T patent/PL1651758T3/pl unknown
- 2004-07-29 CN CNB2004800272636A patent/CN100520793C/zh not_active Expired - Fee Related
- 2004-07-29 KR KR1020067002048A patent/KR101073370B1/ko active IP Right Grant
- 2004-07-29 CN CN200480021509A patent/CN100577799C/zh active Active
- 2004-07-29 JP JP2004222088A patent/JP4665451B2/ja active Active
- 2004-07-29 EP EP04771239A patent/EP1649403A2/en not_active Withdrawn
- 2004-07-29 ZA ZA200510144A patent/ZA200510144B/xx unknown
- 2004-07-29 DE DE602004014158T patent/DE602004014158D1/de active Active
- 2004-07-29 EP EP04771247A patent/EP1651758B1/en active Active
- 2004-07-29 JP JP2004221708A patent/JP4894134B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
2005
- 2005-12-21 KR KR1020057024543A patent/KR101208480B1/ko active IP Right Grant
-
2006
- 2006-01-03 US US11/275,437 patent/US7306933B2/en active Active
- 2006-01-24 US US11/337,580 patent/US7809511B2/en active Active
-
2007
- 2007-10-24 US US11/877,726 patent/US8030036B2/en active Active
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2002070730A2 (en) * | 2001-03-01 | 2002-09-12 | The Regents Of The University Of California | Models and methods for determining systemic properties of regulated reaction networks |
JP2004533037A (ja) * | 2001-03-01 | 2004-10-28 | ザ・レジェンツ・オブ・ザ・ユニバーシティ・オブ・カリフォルニア | 調節された反応ネットワークの全体的特性を決定するためのモデルおよび方法 |
Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2005245440A (ja) * | 2004-02-05 | 2005-09-15 | Ajinomoto Co Inc | 同位体で標識された基質を用いた細胞内代謝フラックスの解析方法 |
JP2008527992A (ja) * | 2005-09-15 | 2008-07-31 | コリア アドバンスド インスティチュート オブ サイエンス アンド テクノロジィ | 強化目的のフラックスに基づいたフラックス・スキャニングを用いた生物の改良方法 |
US8977530B2 (en) | 2005-09-15 | 2015-03-10 | Korea Advanced Institute Of Science And Technology | Method for identifying genes for enhancing the production of useful substances |
JP2009535055A (ja) * | 2006-05-04 | 2009-10-01 | コリア アドバンスド インスティチュート オブ サイエンス アンド テクノロジィ | 代謝産物のフラックスサムプロファイリングを用いた生物改良方法 |
KR100818202B1 (ko) | 2006-12-22 | 2008-03-31 | 한국과학기술원 | 미생물의 성장에 필수적인 대사산물의 스크리닝 방법 |
WO2008078911A1 (en) * | 2006-12-22 | 2008-07-03 | Korea Advanced Institute Of Science And Technology | Method for screening essential metabolites in growth of microorganisms |
WO2011034263A1 (ko) * | 2009-09-18 | 2011-03-24 | 한국과학기술원 | 필수 대사산물을 이용한 병원성 미생물의 약물 표적 예측 방법 |
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP4894134B2 (ja) | 物質生産に影響する代謝フラックスの決定方法 | |
JP6961819B2 (ja) | L−リジンを生産する組換え菌、その構築方法およびl−リジンの生産方法 | |
CN103396976B (zh) | L-谷氨酸类氨基酸生产微生物以及氨基酸的生产方法 | |
KR101261147B1 (ko) | L-아미노산의 생산능이 향상된 미생물 및 이를 이용하여 l-아미노산을 생산하는 방법 | |
CA2700510C (en) | Mutant microorganisms having high ability to produce putrescine and method for producing putrescine using the same | |
JP2021500914A5 (ja) | ||
JP5140074B2 (ja) | グリセロールを用いたアミノ酸生産方法 | |
EP2233570B1 (en) | L-threonine producing escherichia coli and process for producing l-threonine using same | |
CZ174697A3 (en) | Gene encoding lysinedecarboxylase, micro-organism and process for preparing l-lysine | |
JP2011512155A (ja) | トランスポゾンを利用した形質転換用ベクター、前記ベクターで形質転換された微生物及びこれを利用したl−リジン生産方法 | |
WO2005075625A1 (en) | MICROORGANISM PRODUCING L-THREONINE HAVING INACTIVATED ga1R GENE, METHOD OF PRODUCING THE SAME AND METHOD OF PRODUCING L-THREONINE USING THE MICROORGANISM | |
JP2008526196A (ja) | 外来のnadp依存的グリセルアルデヒド−3−リン酸デヒドロゲナーゼ遺伝子を含むエシェリキア種またはコリネバクテリウム種の微生物、およびこれらを用いてl−リジンを生産する方法 | |
US20140315263A1 (en) | Method for the preparation of nicotinic acid | |
JP2001120269A (ja) | 発酵法によるl−リジンの製造法 | |
DK2430152T3 (en) | A microorganism with increased L-lysine productivity and method for producing L-lysine using the same | |
US7163810B2 (en) | Method for producing target substance | |
CN112375726A (zh) | 一种生产l-高丝氨酸的基因工程菌及其应用 | |
JPWO2006001380A1 (ja) | 物質の製造法 | |
WO2008007914A1 (en) | A nucleotide sequence of a mutant argf with increased activity and a method for producing l-arginine using a transformed cell containing the same | |
WO2006025477A1 (ja) | 工業的に有用な微生物 | |
WO2022124302A1 (ja) | 有用化合物を高生産する代謝改変微生物株の構築方法及び代謝改変大腸菌株 | |
EP3015547B1 (en) | Rna polymerase sigma factor 32 variant and production method for l-threonine using a microorganism expressing the variant | |
CN118006652A (zh) | 一种多巴胺生产菌株及其构建方法与应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20070627 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20100727 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20110802 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20111003 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20111129 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20111212 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 4894134 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20150106 Year of fee payment: 3 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20150106 Year of fee payment: 3 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |