JP5140074B2 - グリセロールを用いたアミノ酸生産方法 - Google Patents
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Description
バイオディーゼル(biodiesel)は、主に植物由来のオイルを基質としてメタノールと触媒を用いたエステル形成反応によって合成された脂肪酸メチルエステル、あるいは脂肪酸エチルエステルをいう。この過程で必然的に全体重量の10%程度の比率でグリセロールが副産物として形成される。
微生物のグリセロール代謝は、大腸菌(Escherichia coli)と肺炎桿菌(Klebsiella pneumoniae)でよく知られている。大腸菌において、細胞外部のグリセロールは、エネルギーを消耗することなく、アクアグリセロポリン(aquaglyceroporin)の一つであるGlpFを用いて細胞内に入ってくる(Heller et al., J. Bacteriol. 144:274-278, (1980))。入ってきたグリセロールは、グリセロールキナーゼ(GlpK)によってグリセロール−3−リン酸に転換された後、グリセロール−3−リン酸ジヒドロゲナーゼ(glycerol-3-phosphate dehydrogenase)によってジヒロドキシアセトンリン酸(dihydroxyacetonephosphate、DHAP)に転換され、トリオースリン酸イソメラーゼ(Triosephosphate isomerase、TpiA)によってグリセルアルデヒド−3−リン酸(glyceraldehyde-3-phosphate、G−3−P)に転換されることにより、当該過程を経て代謝される(Lin EC, Annu. Rev. Microbiol. 30:535-578, (1976))。グリセロールキナーゼの活性がない場合においては、グリセロールジヒドロゲナーゼ(glycerol dehydrogenase、Gdh)によってジヒドロキシアセトン(dihydroxyacetone、DHA)に転換され、グリセロールキナーゼまたはジヒロロキシアセトンキナーゼ(dihydroxyacetone kinase、DHAキナーゼ)よってジヒドロキシアセトンリン酸(dihydroxyacetone phosphate、DHAP)に転換された後、グリセルアルデヒド−3−リン酸(glyceraldehyde-3-phosphate、G−3−P)に転換されて代謝される(Paulsen et al., Microbiology, 146:2343-2344, (2000))。グリセロールの代謝過程は多様な形で調節を受ける。特に、グリセロールがグルコースと共に存在する場合、野性型の大腸菌は、排他的にグルコースのみを用いた後、グリセロールを用いる二段階適応(diauxic growth)を行うものと知られている(Lin, Annu. Rev. Microbiol. 30:535-578, (1976))。
また、本発明の他の目的は、前記炭素源としてのグリセロール同時利用性を有するアミノ酸生産用微生物、およびその微生物を製造する方法を提供することにある。
従って、
前記培養物からアミノ酸を回収する方法は、当業界における公知の方法を用いることができ、イオン交換クロマトグラフィーなどがあるが、これに限定されない。
別の様態として、本発明は、炭素源としてのグリセロール同時利用性を有するアミノ酸生産用微生物に関する。一つの具体的様態として、本発明は、染色体上のglpR遺伝子および/またはgalR遺伝子が不活性化されている、炭素源としてのグリセロール同時利用性を有するアミノ酸生産用微生物に関する。
一つの具体的様態として、不活性化されたglpR遺伝子またはそのDNA断片を製造する段階と、アミノ酸を生産することが可能な微生物に導入させ、前記微生物の染色体上に存在するglpR遺伝子と組み換えさせる段階と、glpR遺伝子が不活性化された微生物を選別する段階とを含んでなる、グリセロールを高効率で用いることが可能な微生物の製造方法に関する。
本発明の方法において、前記微生物は、腸内細菌科に属するものが好ましく、さらに好ましくは大腸菌であり、最も好ましくは大腸菌CJIT6007(受託番号KCCM−10577P)である。
本発明の方法の一例として、本発明のグリセロールを含む多様な炭素源から発酵によって効果的にアミノ酸を生産することができるように、グリセロール代謝関連遺伝子の調節因子であるglpR遺伝子を不活性化させた微生物を製造する方法は、次の過程を含む。
まず、glpRと相同性を有するポリヌレクトチド配列を含む欠損カセット(deletion cassette)をpKD3プラスミドを鋳型とする重合酵素連鎖反応(PCR)によって製作する。次いで、リコンビナーゼ(recombinase)を持っているpKD46プラスミドを含む大腸菌を、前記重合酵素連鎖反応から得られるDNA切片を用いて形質転換する。形質転換された大腸菌を、抗生剤マーカーが含まれた平板培地に塗抹した後、抗生剤耐性を有する菌株を選別することにより、glpR遺伝子が不活性化された菌株を分離する。
以下、本発明を実施例によって具体的に説明する。ところが、これらの実施例は本発明を例示的に説明するためのもので、本発明の範囲を限定するものではない。
実施例1:トレオニン生産菌株のグリセロール同時利用性(グルコースとグリセロール)関連フラスコ実験
大腸菌野性型菌株K12おびFTR2533菌株をそれぞれMMYEプレートに接種し、33℃のインキュベーターで12時間培養した後、MMYE液状培地に一つの白菌耳を用いて接種して33℃、200rpmの条件で6時間培養した。MMYE培地の組成は、下記表1のとおりである。
本実施例では、大腸菌染色体内のglpR遺伝子を相同組み換えによって不活性化させた。このために、FRT−one−step PCR欠失方法を使用した(PNAS, 97:6640-6645(2000))。このために、配列番号1および2プライマーを用いてpKD3ベクター(PNAS, 97:6640-6645(2000))を鋳型としてPCR反応によって欠損カセットを製作した。変性(denaturation)段階は94℃で30秒、アニーリング(annealing)段階は55℃で30秒、延長(extension)段階は72℃で1分間行い、これを30回行った。
5’ATGAAACAAACACAACGTCACAACGGTATTATCGAACTGGTTAAACAGCAGTGTAGGCTGGAGCTGCTTC3’(配列番号1)
逆方向プライマー:
5’TGCTGATGCTGCCCATATTGACCATCGCGTTACGGCCAAATTTCGAGTGACATATGAATATCCTCCTTAG3’(配列番号2)
回収されたDNA切片はpKD46ベクター(PNAS, 97:6640-6645(2000))を予め形質転換させた大腸菌FTR2533菌株にエレクトロポレーションした。エレクトロポレーションのために、pKD46が含まれたFTR2533菌株は、100μg/Lアンピシリンと5mMアラビノスが含まれたLB培地を用いて30℃でOD600=0.6まで培養した後、滅菌蒸留水で2回、10%グリセロールで1回洗浄して使用した。エレクトロポレーションは2500Vで加えた。回収された菌株は25μg/Lクロラムフェニコールを含んだLB平板培地に塗抹して37℃で一晩培養した後、耐性を示す菌株を選別した。選別された菌株は、菌株を鋳型として同一のプライマーを用いて同一の条件でPCRした後、1.0%アガロースゲル上で遺伝子のサイズが1.2kbと観察されることを確認することにより、glpR遺伝子の欠損を確認した。確認された菌株は、さらにpCP20ベクター(PNAS, 97:6640-6645(2000))を形質転換してLB培地で培養し、さらに同一条件のPCRによって1.0%アガロースゲル上で遺伝子のサイズが150bpと小さくなることにより、クロラムフェニコールマーカーが除去されたことを確認し、最終glpRが欠損したFTR2533DglpR菌株を獲得した。製作された菌株はCJIT6007と命名した。
グリセロール代謝過程調節因子であるglpRを欠損させた大腸菌CJIT6007を用いて、グリセロールが含まれた複合炭素源培地およびグリセロールが単独で含まれたトレオニン力価培地で、グリセロール同時利用性とL−トレオニン生産性を確認した。
CJIT6007をMMYEプレートに接種して33℃のインキュベーターで12時間培養した後、MMYE液状培地に一つの白金耳を用いてを接種し、33℃、200rpmの条件で6時間培養した。MMYE培地の組成は表1のとおりである。グルコース、CaCl2およびMgSO4・7H2Oはそれぞれ別途滅菌した。培地滅菌の前に、2.2mLの4N KOHを添加した。
MMYEで培養した菌株を力価培地25mL(表2)に500μL接種して33℃、200rpmの条件で48時間培養した。グリセロールの初期濃度は70g/Lとした。グリセロールとKH-2PO4はそれぞれ別途に殺菌した。培地滅菌の前に、2.2mLの4N KOHを添加した。トレオニン生成量は、培養液を蒸留水で500倍希釈した後、遠心分離して得た上澄み液をHPLCによって分析し、グルコースとグリセロールの量は、培養液を蒸留水で10倍希釈した後、遠心分離して得た上澄み液をHPLCによって分析した。ODの場合、0.3N HCl溶液に培養液を50倍希釈して562nmで測定した。その結果は表6のとおりである。表6は、トレオニン菌株のフラスコ実験結果であって、培養開始後12時間、24時間および48時間におけるグルコースとグリセロールの培地残存量およびトレオニン生産量を確認した。Glyはグリセロール、Thrはトレオニンをそれぞれ示し、それぞれの単位はg/Lである。
PCT国際公開WO06/001616に記載のメチオニン生産菌株である大腸菌CJM002(KCCM−10568)に対して、グリセロールを複合炭素源としてメチオニン生産実験を行った。大腸菌CJM002は、大腸菌FTR2533を母株として得られたもので、メチオニンの生合成経路が強化された菌株である。メチオニン生産を実験するために、三角フラスコ培養を行った。平板LB培地にKCCM−10568を塗抹して31℃で一晩培養した後、単一コロニーを3mLのLB培地に接種し、しかる後に、31℃で5時間培養し、さらに25mLのメチオニン生産培地を含んだ250mLの三角フラスコに200倍希釈して31℃、200rpmで64時間培養した後、HPLC分析によってメチオニン生産量を比較した。
表8から分かるように、CJM002もグルコースとグリセロールの複合培地を用いて効果的にL−メチオニンを生産することができる。特に、グリセロールを単独で用いた培地Eの場合、グルコースを単独で用いた培地Aの場合に比べてL−メチオニンの生産収率が80%増加した。
Claims (8)
- 炭素源としてのグリセロール及びグルコース同時利用性を有するアミノ酸生産用微生物を、グリセロール及びグルコースが含まれた培養培地に接種して培養する段階と、前記段階で生産された培養物からアミノ酸を回収する段階とを含んでなり、前記微生物が、染色体上に不活性化されたgalR遺伝子及びglpR遺伝子を有する大腸菌である、グリセロール及びグルコースを用いたアミノ酸生産方法。
- 前記グリセロールは、培養培地リットル当たり1g〜300gの含量で含まれることを特徴とする、請求項1に記載の方法。
- 前記グリセロールの含量は、培養培地の全体炭素源含量に対して10〜100重量%であることを特徴とする、請求項1に記載の方法。
- 前記生産されるアミノ酸がトレオニンまたはメチオニンであることを特徴とする、請求項1に記載の方法。
- 前記大腸菌(Escherichia coli)がCJIT6007(受託番号KCCM−10755P)である、請求項1に記載の方法。
- 染色体上に不活性化されたgalR遺伝子及びglpR遺伝子を有する大腸菌である、炭素源としてのグリセロール及びグルコース同時利用性を有するアミノ酸生産用微生物。
- 前記大腸菌(Escherichia coli)がCJIT6007(受託番号KCCM−10755P)であることを特徴とする、請求項6に記載の微生物。
- 前記生産されるアミノ酸がトレオニンまたはメチオニンであることを特徴とする、請求項6に記載の微生物。
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