CN116209438A - 使用sos1抑制剂治疗具有shp2突变的恶性疾病 - Google Patents

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Abstract

本文提供了用于治疗患有与具有SHP2突变,例如活化性SHP2突变的细胞相关的疾病或病症的受试者的方法。所述SHP2突变可引起对SHP2抑制剂,例如别构SHP2抑制剂的抗性。本文的方法提供向所述受试者施用单独或与额外治疗剂组合的治疗有效量的SOS1抑制剂。

Description

使用SOS1抑制剂治疗具有SHP2突变的恶性疾病
相关申请的交叉参考
本申请要求2020年9月3日申请的美国临时申请系列号63/074,045的优先权,该案的公开内容特此以全文引用的方式并入本文中。本申请要求2021年1月8日申请的美国临时申请系列号63/135,023的优先权,该案的公开内容特此以全文引用的方式并入本文中。本申请要求2021年4月9日申请的美国临时申请系列号63/172,791的优先权,该案的公开内容特此以全文引用的方式并入本文中。
发明领域
本公开的领域大体上涉及癌症治疗,并且更具体点说,涉及与SHP2突变相关的癌症的治疗。
背景技术
SHP2是由PTPN11基因编码的非受体蛋白质酪氨酸磷酸酶,它促成多种细胞功能,包括增殖、分化、细胞周期维持和迁移。SHP2参与通过RAS-促分裂原活化的蛋白质激酶(MAPK)、JAK-STAT路径和/或磷酸肌醇3-激酶-AKT路径进行的信号传导。
SHP2具有两个N末端Src同源2结构域(N-SH2和C-SH2)、一个催化结构域(PTP)和一个C末端尾。所述两个SH2结构域控制SHP2的亚细胞定位和功能调控。所述分子以无活性、自抑制型构象存在,该构象通过涉及来自N-SH2和PTP结构域的残基的结合网络稳定。利用例如通过RTK起作用的细胞因子或生长因子刺激会引起催化位点暴露,引起SHP2的酶促活化。
已在以下中鉴别出PTPN11基因中且随后SHP2中的突变:若干人类发育病,如努南综合征(Noonan Syndrome)和莱帕德综合征(LEOPARD Syndrome),以及人类癌症,如幼年型粒单核细胞白血病、成神经细胞瘤、黑色素瘤、急性骨髓性白血病以及乳癌、肺癌和结肠癌。这些突变中有一些使SHP2的自抑制型构象不稳定,并且促进SHP2的自活化或增强的生长因子驱动型活化。
当突变型SHP2处于活化状态时,别构SHP2抑制剂针对临床上相关的SHP2突变体显示出降低的效力。参见例如Pádua等人,Nat Commun 9:4507(2018);LaRochelle等人,NatCommun 9:4508(2018)。因此,需要治疗与含有突变型SHP2的细胞相关的疾病或病症。
RAS蛋白(KRAS、HRAS和NRAS)在各种人类癌症中起到至关重要的作用,并因此成为抗癌疗法的适当靶。由活化性突变、过度表达或上游活化引起的Ras蛋白失调在人类肿瘤中较为常见,并且RAS的活化性突变见于约30%的人类癌症。在RAS蛋白中,KRAS是最常见的突变并因此是癌症疗法的重要靶。在对RAS装载GTP的GEF蛋白(例如SOS1)与水解GTP而使RAS失活的GAP蛋白(例如NF1)之间的相互作用的促进下,RAS在GDP结合的“关闭”(“RAS(OFF)”)状态与GTP结合的“开启”(“RAS(ON)”)状态之间变化。另外,SHP2与受体信号传导装置缔合并且在RTK活化后变得有活性,接着促进RAS活化。RAS蛋白的突变可将该蛋白质锁定在“开启”状态,产生组成性活性信号传导路径,导致不受控制的细胞生长。
KRASG12C的“关闭”形式的首创共价抑制剂已在具有KRASG12C突变的癌症患者中展示出有希望的抗肿瘤活性,尽管并非全部。此外,治疗性抑制RAS路径尽管通常最初是有效的,但最终被证实是无效的,因为它可能通过多种机制,包括例如通过消除天然地在这些路径中操作的负反馈机构再活化路径而导致RAS路径信号传导的过度活化。例如,在多种癌症中,MEK抑制作用因消除MEK/ERK介导的RTK活化的反馈抑制而引起ErbB信号传导的增加。结果是,最初对此类抑制剂敏感的细胞可变得具有抗性。因此,需要有效抑制RAS路径信号传导,而不会诱导抗性机制活化的方法。
发明内容
在一些方面,本公开涉及一种治疗患有与具有SHP2突变的细胞相关的疾病或病症的受试者的方法。所述方法包括向所述受试者施用单独与额外治疗剂组合的治疗有效量的SOS1抑制剂。
在一些方面,所述SHP2突变诱导SHP2的活化形式。
在一些方面,所述受试者在用SHP2抑制剂预先治疗后表达SHP2突变。在一些方面,所述受试者在用别构SHP2抑制剂预先治疗后表达SHP2突变。
在一些方面,所述方法还包括向所述受试者施用治疗有效量的RAS抑制剂,该RAS抑制剂选自由以下组成的组:RAS(ON)抑制剂、RAS(OFF)抑制剂和其组合。
附图说明
图1是RAS-MAPK路径的图解。SHP2活化SOS1,SOS1又活化RAS,引起信号传导而驱动细胞生长和存活。
图2A是描绘SHP2中的活化性突变的图,所述活化性突变会降低对SHP2别构抑制剂RMC-4550的抑制作用的敏感性。如图所示,细胞敏感性与SHP2活化性突变的能量幅值(ΔGop)相关。较低的ΔGop指示较强的活化作用。图2B是显示足以抑制具有活化性突变的SHP2蛋白的RMC-4550的IC50浓度的表。如表中所示,较强的活化性突变,如G503V,需要较高浓度的别构SHP2抑制剂来实现反应。这些数据是根据实施例1中所公开的方法获得。
图3A和图3B是显示SOS1抑制剂在带有SHP2 E76K突变体的同基因HEK-293细胞系中维持敏感性的图。这些数据是根据实施例1中所公开的方法获得。
图4A至图4H是显示活化性突变在同基因LN229细胞系中诱导针对别构SHP2抑制的抗性但维持针对SOS1抑制剂的敏感性的图。这些数据是根据实施例1中所公开的方法获得。
图5A至图5D显示根据a)pERK
Figure BDA0004194083620000041
测定(图5A至图5D的图)和b)
Figure BDA0004194083620000042
活力测定(相关表格),活化性突变G503V在同源小鼠细胞系KLN205(鳞状细胞癌)和PAN02(胰腺癌)中诱导针对别构SHP2抑制的抗性,但维持针对SOS1抑制剂的敏感性。这些数据是根据实施例2中所公开的方法获得。
图6是显示SOS1抑制剂在免疫功能正常小鼠的同源小鼠细胞系KLN205(鳞状细胞癌)中有活化性SHP2突变G503V的情况下驱动体内肿瘤生长抑制的图。这些数据是根据实施例2中所公开的方法获得。
图7是显示SOS1抑制剂在免疫功能正常小鼠的同源小鼠细胞系PAN02中有活化性SHP2突变G503V的情况下驱动体内肿瘤生长抑制的图。这些数据是根据实施例2中所公开的方法获得。
图8A至图8D是显示通过敲减SOS1使具有部分抑制深度的非靶向对照中带有确认对抑制作用敏感的SHP2突变性变体的LN229细胞免于受BI-3406抑制,并且通过敲减SOS2恢复完全抑制深度来使所述细胞敏感的图。这些数据是根据实施例3中所公开的方法获得。
图9是显示SHP2突变体在SOS1敲减之后展示基础pERK的明显减少并且pERK的减少水平与针对活化SHP2变体的生物化学效力相关的图。
图10是显示测量的SHP2针对DiFMUP的比活性随[RMC-4550]和[SIRPA1]而变化的图。这些数据是根据实施例3中所公开的方法获得。
图11是显示来自图10的野生型SHP2的数据与实施例4中显示的公式的拟合的图。这些数据是根据实施例4中所公开的方法获得。
图12是显示来自图10的突变型SHP2 A72S的数据与实施例4中显示的公式的拟合的图。这些数据是根据实施例4中所公开的方法获得。
图13是显示来自图10的突变型SHP2 E69K的数据与实施例4中显示的公式的拟合的图。这些数据是根据实施例4中所公开的方法获得。
图14是显示来自图10的突变型SHP2 G503V的数据与实施例4中显示的公式的拟合的图。这些数据是根据实施例4中所公开的方法获得。
图15是显示SOS1抑制剂在免疫功能正常小鼠的同源小鼠细胞系PAN02中有活化性SHP2突变G503V的情况下驱动体内肿瘤生长抑制的图。这些数据是根据实施例5中所公开的方法获得。
图16是显示SOS1抑制剂在免疫功能正常小鼠的同源小鼠细胞系LN229 CDX中有活化性SHP2突变A72S的情况下驱动体内肿瘤生长抑制的图。这些数据是根据实施例5中所公开的方法获得。
图17A和图17B是显示在具有SHP2和KRAS突变的细胞系中SOS1抑制剂化合物SOS1-(B)和RAS抑制剂化合物RAS-(E)的加合作用的图。这些数据是根据实施例6中所公开的方法获得。
图18是Loewe 3D响应曲面图,显示了在Pan02细胞中观察到的SOS1抑制剂化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331)和RASMULTI(ON)抑制剂化合物RAS-(D)的体外组合作用。在图上任何点处的协同分数>5指示所述两种化合物之间发生正相互作用。这些数据是根据实施例7中所公开的方法获得。
图19是Loewe 3D响应曲面图,显示了在KLN205细胞(鳞状细胞癌)中观察到的SOS1抑制剂化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331)和RASMULTI(ON)抑制剂化合物RAS-(D)的体外组合作用。在图上任何点处的协同分数>5指示所述两种化合物之间发生正相互作用。这些数据是根据实施例7中所公开的方法获得。
图20A是描绘SHP2中的活化性突变的图,所述活化性突变会降低对SHP2别构抑制剂(RMC-4550)的抑制作用的敏感性,但维持对SOS1抑制剂(化合物SOS1-(A))的敏感性。较低的ΔGop指示较强活化作用,并且对SHP2抑制的细胞敏感性与SHP2活化性突变的能量幅值(ΔGop)相关。相比之下,针对SOS1抑制作用的细胞敏感性在测试的所有SHP2突变中均得到维持。图20B是显示在具有不同SHP2突变的细胞中RMC-4550和化合物SOS1-(A)的IC50浓度的表。如表中所示,强活化性突变,如E76K,需要较高浓度的别构SHP2抑制剂来实现反应,但需要相对较低浓度的SOS1抑制剂以在测试的所有SHP2突变中实现反应。这些数据是根据实施例1中所公开的方法获得。
图21是显示SOS1抑制剂在免疫功能正常小鼠的同源小鼠细胞系LN229.E76K中有活化性SHP2突变E76K的情况下驱动体内肿瘤生长抑制的图。这些数据是根据实施例8中所公开的方法获得。
图22是显示单独SOS1抑制剂和其组合在免疫功能正常小鼠的同源小鼠细胞系PAN02中有活化性SHP2突变G503V的情况下驱动体内肿瘤生长抑制的图。这些数据是根据实施例9中所公开的方法获得。
图23是显示单独SOS1抑制剂和其组合在免疫功能正常小鼠的同源小鼠细胞系PAN02中有活化性SHP2突变G503V的情况下驱动体内肿瘤生长抑制的图。这些数据是根据实施例10中所公开的方法获得。
图24是显示单独SOS1抑制剂和其组合在免疫功能正常小鼠的同源小鼠细胞系LN229.E76K中有活化性SHP2突变E76K的情况下驱动体内肿瘤生长抑制的图。这些数据是根据实施例11中所公开的方法获得。
图25是显示单独SOS1抑制剂和其组合在免疫功能正常小鼠的同源小鼠细胞系PAN02中有活化性SHP2突变G503V的情况下驱动体内肿瘤生长抑制的图。这些数据是根据实施例12中所公开的方法获得。
图26A、图26B、图26C、图26D、图26E和图26F是显示单独SOS1抑制剂和其组合在免疫功能正常小鼠的同源小鼠细胞系PAN02中有活化性SHP2突变G503V的情况下驱动体内肿瘤生长抑制的图和表。这些数据是根据实施例13中所公开的方法获得。
具体实施方式
本公开的详情将在以下附加描述中陈述。尽管可使用与本文所描述的方法和材料类似或等效的方法和材料实践或测试本公开,但现将描述示例性方法和材料。本公开的其它特征、目标和优势将从实施方式和权利要求显而易见。除非上下文另外清楚地规定,否则在本说明书和所附权利要求中,单数形式也包括复数形式。除非另外定义,否则本文所使用的所有技术和科技术语具有与本公开所属领域的一般技术人员通常所理解相同的含义。本说明书中引用的所有专利和公布都以引用的方式整体并入本文中。
术语
冠词“一个(种)(a/an)”在本公开中用于指一个(种)或多个(种)(即至少一个(种))该冠词的语法宾语。举例来说,“一个(种)要素”意谓一个(种)要素或多于一个(种)要素。
除非另外指示,否则术语“和/或”在本公开中用于指“和”或“或”。除非明确地指示,否则使用术语“或”用于表示“和/或”,意思指唯一的替代选择或该替代选择相互排斥,不过本公开支持唯一替代选择和“和/或”的定义。
如本文所使用,术语“约”用于指示一个值包括用于确定该值的装置或方法的误差的标准偏差。在某些实施方案中,术语“约”是指值的沿任一方向(大于或小于)在所述值的25%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%或更低百分比内的范围,除非另外规定或自上下文另外显而易见(例如在所述数字将超过可能值的100%时)。
本文所公开的化合物的药学上可接受的盐涵盖在本发明中。代表性“药学上可接受的盐”包括例如水溶性和水不溶性盐,如乙酸盐、氨芪磺酸盐(amsonate)(4,4-二氨基芪-2,2-二磺酸盐)、苯磺酸盐、苯甲酸盐、碳酸氢盐、硫酸氢盐、酒石酸氢盐、硼酸盐、溴化物、丁酸盐、钙盐、依地酸钙、樟脑磺酸盐、碳酸盐、氯化物、柠檬酸盐、克拉维酸盐(clavulariate)、二盐酸盐、依地酸盐(edetate)、乙二磺酸盐、依托酸盐(estolate)、乙磺酸盐、反丁烯二酸盐、葡庚糖酸盐、葡糖酸盐、谷氨酸盐、对羟乙酰氨基苯胂酸盐(glycollylarsanilate)、六氟磷酸盐、己基间苯二酸盐(hexylresorcinate)、海巴明(hydrabamine)、氢溴酸盐、盐酸盐、羟基萘甲酸盐、碘化物、羟乙磺酸盐(sethionate)、乳酸盐、乳糖酸盐、月桂酸盐、镁盐、苹果酸盐、顺丁烯二酸盐、扁桃酸盐、甲磺酸盐、甲基溴化物、甲基硝酸盐、甲基硫酸盐、粘酸盐、萘磺酸盐、硝酸盐、N-葡甲胺铵盐、3-羟基-2-萘甲酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、双羟萘酸盐(1,1-亚甲基-双-2-羟基-3-萘甲酸盐,依伯酸盐(einbonate))、泛酸盐、磷酸盐/二磷酸盐、苦味酸盐、聚半乳糖醛酸盐、丙酸盐、对甲苯磺酸盐、水杨酸盐、硬脂酸盐、次乙酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐、磺基水杨酸盐、苏拉明酸盐(suramate)、单宁酸盐、酒石酸盐、茶氯酸盐(teoclate)、甲苯磺酸盐、三乙基碘盐和戊酸盐。
当结合化合物使用时,“治疗有效量”是有效治疗或预防本文所描述的受试者的疾病的量。
本公开还包括药物组合物,所述药物组合物包含有效量的所公开的化合物和药学上可接受的载体。如本公开中所使用,术语“载体”涵盖赋形剂和稀释剂,并且意思指涉及将药剂从受试者的一个器官或身体的一部分载运或转运到另一器官或身体的一部分的材料、组合物或媒剂,如液体或固体填充剂、稀释剂、赋形剂、溶剂或囊封材料。
关于受试者的术语“治疗”是指改善该受试者的病症的至少一种症状。治疗包括治愈、改善或至少部分减轻病症。
对于受试者,术语“预防(prevent/preventing)”是指使疾病或病症不会使受试者痛苦。预防包括预防性治疗。例如,预防可包括在受试者遭受病痛之前,向受试者施用本文所公开的化合物,并且该施用将使受试者不会受疾病折磨。
术语“抑制”和“减轻”或这些术语的任何变化形式包括实现所希望的结果的任何可测量的或完全的抑制。例如,活性(例如SOS1:Ras家族蛋白结合活性)降低可能为与正常相比降低约、至多约或至少约5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%或更多,或者其中可衍生的任何范围。
除非另外指示,否则术语“病症”在本公开中用于指术语疾病、疾患或病痛,并且可与术语疾病、疾患或病痛互换使用。
如本公开中所使用,术语“施用(administer/administering/administ ration)”是指向受试者直接施用所公开的化合物或所公开的化合物的药学上可接受的盐或组合物,或向受试者施用该化合物或该化合物的药学上可接受的盐的前药衍生物或类似物或者组合物,由此可在受试者体内形成等效量的活性化合物。
“患者”或“受试者”是哺乳动物,例如人、小鼠、大鼠、豚鼠、狗、猫、马、牛、猪或非人灵长类动物,例如猴、黑猩猩、狒狒或恒河猴。
如本文所使用,术语“样品”或“生物样品”是指从受试者,例如人类受试者或患者获得的可用于测试特定分子,例如野生型的样品。样品可包括但不限于活检样品、组织、细胞、颊拭子样品、体液,包括血液、血清、血浆、尿液、唾液、脑脊髓液、泪液、胸膜液等。
如本文所使用,术语“抑制剂”是指防止生物分子(例如蛋白质、核酸)完成或起始反应的化合物。抑制剂可例如通过竞争性、无竞争性或非竞争性方式抑制反应。就结合机制来说,抑制剂可以是不可逆抑制剂或可逆抑制剂。示例性抑制剂包括但不限于核酸;DNA;RNA;shRNA;siRNA;蛋白质;蛋白质模拟物;肽;肽模拟物;抗体;小分子;化学试剂;模拟例如参与信号转导的酶、受体或其它蛋白质的结合位点的类似物;治疗剂;药物组合物;药物;及它们的组合。在一些实施方案中,抑制剂是小分子,例如低分子量有机化合物,例如分子量(MW)小于1200道尔顿(Da)的有机化合物。在一些实施方案中,MW小于1100Da。在一些实施方案中,MW小于1000Da。在一些实施方案中,MW小于900Da。在一些实施方案中,小分子的MW范围介于800Da与1200Da之间。小分子抑制剂包括环状和无环化合物。小分子抑制剂包括天然产物、其衍生物和类似物。小分子抑制剂可包括能够例如与靶蛋白的氨基酸侧链形成共价交联的共价交联基团。在一些实施方案中,抑制剂可为核酸分子,包括但不限于减少细胞中功能蛋白的量的siRNA。因此,被认为“能够抑制”特定蛋白质,例如SHP2或SOS1的化合物包含任何此类抑制剂。
如本文所使用,术语“突变”指示引起核酸或多肽改变的核酸和/或多肽的任何修饰。术语“突变”可包括例如点突变;多核苷酸中单个或多个残基的缺失,或多核苷酸中单个或多个残基的的插入,包括在基因的蛋白质编码区内产生的改变,以及在蛋白质编码序列外的区域中的改变,例如但不限于调控或启动子序列;以及扩增和/或染色体断裂或转位。
术语“SHP2”意思指“含Src同源蛋白2蛋白质酪氨酸磷酸酶2”并且又称为SH-PTP2、SH-PTP3、Syp、PTP1D、PTP2C、SAP-2或PTPN11。SHP2是由PTPN11基因编码的非受体蛋白质酪氨酸磷酸酶,它促成多种细胞功能,包括增殖、分化、细胞周期维持和迁移。SHP2参与通过RAS-促分裂原活化的蛋白质激酶(MAPK)、JAK-STAT路径和/或磷酸肌醇3-激酶-AKT路径进行的信号传导。SHP2具有两个N末端Src同源2结构域(N-SH2和C-SH2)、一个催化结构域(PTP)和一个C末端尾。所述两个SH2结构域控制SHP2的亚细胞定位和功能调控。所述分子以无活性、自我抑制型构象存在,该构象通过涉及来自N-SH2和PTP结构域的残基的结合网络稳定。利用例如通过RTK起作用的细胞因子或生长因子刺激会引起催化位点暴露,引起SHP2的酶促活化。
术语“别构SHP2抑制剂”意思指能够通过结合至SHP2中除酶活性位点外的位点来抑制SHP2的药剂(例如小分子化合物(例如小于750Da))。
术语“抑制剂抗性突变”当关于SHP2突变使用时,意思指使SHP2多肽对SHP2抑制剂的抑制作用无反应或具有抗性的SHP2突变。因此,在一些实施方案中,相较于抑制剂对仅因不存在抑制剂抗性突变而不同的类似SHP2多肽的作用,SHP2多肽中的抑制剂抗性突变降低SHP2抑制剂对SHP2多肽所具有的抑制作用。此类活性可以使用本领域中已知或本文所公开的任何适合的活性测定来测量。在一些实施方案中,SHP2多肽中的抑制剂抗性突变消除SHP2抑制剂对SHP2多肽活性所具有的所有可检测的抑制作用,其中所述抑制剂对仅因不存在抑制剂抗性突变而不同的类似SHP2多肽具有可检测的抑制功效。此类抑制剂抗性突变包括但不限于使SHP2的自抑制型构象不稳定的突变。抑制剂抗性突变可以是别构抑制剂抗性突变。
如本文所使用,术语“活化性SHP2突变”或“活化的SHP2突变”或类似术语是指通过突变开启构象的自由能(ΔGop)所测量的使SHP2的自抑制型构象不稳定的SHP2突变。野生型SHP2具有2.8kcal/mol的ΔGop。突变型SHP2的ΔGop值低于2.8指示活化,其中较低的值指示较强的活化作用。弱活化性SHP2突变体定义为ΔGop比野生型SHP2低不超过1.5kcal/mol者。中等活化性SHP2突变体具有比野生型低1.5kcal/mol至2.24kcal/mol的ΔGop,并且强活化性SHP2突变具有比野生型要低超过2.24kcal/mol的ΔGop。测量ΔGop的方法提供于实施例4中。
术语“别构抑制剂抗性突变”当关于SHP2突变使用时,意思指使SHP2多肽对SHP2别构抑制剂的抑制作用无反应或具有抗性的SHP2突变。因此,在一些实施方案中,相较于抑制剂对仅因不存在别构抑制剂抗性突变而不同的类似SHP2多肽的作用,SHP2多肽中的别构抑制剂抗性突变降低SHP2别构抑制剂对SHP2多肽所具有的抑制作用。此类活性可以使用本领域中已知或本文所公开的任何适合的活性测定来测量。在一些实施方案中,SHP2多肽中的别构抑制剂抗性突变消除SHP2别构抑制剂对SHP2多肽活性所具有的所有可检测的抑制作用,其中所述抑制剂对仅因不存在别构抑制剂抗性突变而不同的类似SHP2多肽具有可检测的抑制功效。此类别构抑制剂抗性突变包括但不限于使SHP2的自抑制型构象不稳定的突变。在一些实施方案中,所述别构抑制剂抗性突变是如本文所描述的SHP2突变。
术语“SOS”(例如“SOS突变”)是指SOS基因,本领域中已知所述SOS基因包括RAS鸟嘌呤核苷酸交换因子蛋白,所述蛋白质被受体酪氨酸激酶活化以促进RAS的GTP装载和信号传导。术语SOS包括促进Ras结合的GDP被GTP交换的所有SOS同源物。在特定实施方案中,SOS具体地指“无七的儿子同源蛋白1”(son of sevenless homolog 1,“SOS1”)。SOS1在癌症中主要通过除RAS家族蛋白中的突变外的机制参与RAS家族蛋白信号传导的活化。SOS1与接头蛋白Grb2相互作用,并且所产生的SOS1/Grb2复合物结合至活化的/磷酸化的受体酪氨酸激酶(例如EGFR、ErbB2、ErbB3、ErbB4、PDGFR-A/B、FGFR1/2/3、IGF1 R、INSR、ALK、ROS、TrkA、TrkB、TrkC、RET、c-MET、VEGFR1/2/3、AXL)(Pierre等人,Biochem.Pharmacol.,2011,82(9):1049-56)。SOS1还被募集到其它磷酸化细胞表面受体,如T细胞受体(TCR)、B细胞受体(BCR)和单核细胞集落刺激因子受体(Salojin等人,J.Biol.Chem.2000,275(8):5966-75)。此SOS1定位至浆膜,邻近于RAS家族蛋白,使SOS1能够促进RAS家族蛋白活化。RAS家族蛋白的SOS1活化也可通过SOS1/Grb2与常见于慢性髓细胞白血病中的BCR-ABL癌蛋白的相互作用来介导(Kardinal等人,2001,Blood,98:1773-81;Sini等人,Nat.Cell Biol.,2004,6(3):268-74)。SOS1还是用于活化GTP酶RAC1(Ras相关C3肉毒毒素底物1)的GEF(Innocenti等人,J.Cell Biol.,2002,156(1):125-36)。与RAS家族蛋白相同,RAC1也涉及多种人类癌症和其它疾病的发病机制(Bid等人,Mol.Cancer Ther.2013,12(10):1925-34)。无七的儿子2(Sonof sevenless 2,SOS2),作为SOS1在哺乳动物细胞中的同源物,也充当用于活化RAS家族蛋白的GEF(Pierre等人,Biochem.Pharmacol.,2011,82(9):1049-56;Buday等人,Biochim.Biophys.Acta.,2008,1786(2):178-87)。公开的由小鼠基因敲除模型得到的数据表明SOS1和SOS2在成年小鼠体内稳态中的多余作用。尽管在小鼠体内生殖系SOS1敲除在胚胎孕育中期间导致死亡(Qian等人,EMBO J.,2000,19(4):642-54),但全身条件性SOS1敲除的成年小鼠仍存活(Baltanas等人,Mol.Cell.Biol.,2013,33(22):4562-78)。SOS2基因靶向不会在小鼠体内产生任何明显表型(Esteban等人,Mol.Cell.Biol.,2000,20(17):6410-3)。相比之下,SOS1和SOS2双重敲除导致成年小鼠的迅速死亡(Baltanas等人,Mol.Cell.Biol.,2013,33(22):4562-78)。这些公开的数据表明,选择性靶向个别SOS同功型(例如选择性SOS1靶向)可为充分耐受的,由此实现SOS1/RAS家族蛋白驱动的癌症(或其它SOS1/RAS家族蛋白病理学)与正常细胞和组织之间的治疗指数。预期对于SOS1催化位点与RAS家族蛋白的结合的选择性药理学抑制可防止SOS1介导的RAS家族蛋白对GTP结合形式的活化。因此,预期此类SOS1抑制剂化合物可抑制细胞中RAS家族蛋白下游的信号传导(例如ERK磷酸化)。在与对RAS家族蛋白的依赖性相关的癌细胞(例如KRAS突变型癌症细胞系)中,预期SOS1抑制剂化合物可提供抗癌功效(例如对于增殖、存活、转移等的抑制作用)。针对细胞中SOS1:RAS家族蛋白结合抑制(纳摩尔浓度水平的IC50值)和ERK磷酸化(纳摩尔浓度水平的IC50值)的高效力是SOS1抑制剂化合物所希望的特征。另外,SOS1抑制剂化合物所希望的特征将为相对于SOS2,对于SOS1的选择性抑制作用。这一结论是基于如上文所描述的SOS1敲除小鼠的活力表型以及SOS1/SOS2双重敲除小鼠的死亡。
如本文所使用,“SOS1抑制剂”是指能够抑制SOS1的任何药剂(例如小分子(例如小于750Da))。SOS1抑制剂可包括选择性SOS1抑制剂和另外抑制其它蛋白质的抑制剂。在一些实施方案中,SOS1抑制剂也可抑制SOS2,其中SOS1抑制相对于SOS2抑制的选择性比小于10倍。在一些实施方案中,SOS1抑制剂将选择性抑制SOS1,其中SOS1抑制相对于SOS2抑制的选择性比大于至少约10倍,如大于至少约30倍。
术语“RAS路径”与“RAS/MAPK路径”可在本文中互换使用,意思指在各种细胞表面生长因子受体下游的信号转导级联,在该级联中,RAS(和其各种同功型和同种异型)的活化是驱动多种决定细胞增殖、活化、分化、动员和其它功能特性的细胞效应物事件的关键事件。SHP2将来自生长因子受体的正信号传送至RAS活化/去活化循环,该循环受以下调节:鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF,例如SOS1),GEF将GTP装载至RAS上以产生有功能活性的GTP结合的RAS;以及GTP加速的蛋白质(GAP,例如NF1),GAP通过将GTP转化成GDP来促进信号终止。由这一循环产生的GTP结合的RAS将必要的正信号传送至包括RAP和MAP激酶在内的一系列丝氨酸/苏氨酸激酶,额外信号从这些激酶散发至各种细胞效应功能。
术语“RAS抑制剂”与“[a]RAS的抑制剂”可互换使用,意思指靶向RAS蛋白的任何抑制剂。在各个实施方案中,这些术语包括RAS(OFF)抑制剂和RAS(ON)抑制剂,例如KRAS(OFF)抑制剂和KRAS(ON)抑制剂。RAS抑制剂可以是MRTX1133或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。术语“RAS(OFF)抑制剂”是指结合至处于GDP结合的“关闭(OFF)”位置的RAS蛋白的任何抑制剂。术语“RAS(ON)抑制剂”是指结合至处于GTP结合的“开启(ON)”位置的RAS蛋白的任何抑制剂。
如本文所使用,术语“RAS(ON)抑制剂”是指靶向,即选择性结合或抑制RAS的GDP结合的活性状态(例如相对于RAS的GTP结合的无活性状态具有选择性)的抑制剂。抑制RAS的GTP结合的活性状态包括例如抑制来自RAS的GTP结合的活性状态的致癌信号传导。在一些实施方案中,RAS(ON)抑制剂是选择性结合并抑制RAS的GTP结合的活性状态的抑制剂。在某些实施方案中,RAS(ON)抑制剂还可结合或抑制RAS的GTP结合的无活性状态(例如其亲和力或抑制常数低于对RAS的GDP结合的活性状态的亲和力或抑制常数)。术语“KRAS(ON)抑制剂”是指结合处于GTP结合的“开启”位置的KRAS的任何抑制剂。
如本文所使用,术语“RAS(OFF)抑制剂”是指靶向,即选择性结合或抑制RAS的GDP结合的无活性状态(例如相对于RAS的GTP结合的活性状态具有选择性)的抑制剂。抑制RAS的GDP结合的无活性状态包括例如通过抑制GDP与GTP的交换来分开无活性状态,由此抑制RAS呈现活性构象。在某些实施方案中,RAS(OFF)抑制剂还可结合或抑制RAS的GTP结合的活性状态(例如其亲和力或抑制常数低于对RAS的GDP结合的无活性状态的亲和力或抑制常数)。
术语“KRAS(OFF)抑制剂”是指结合处于GDP结合的“关闭”位置的KRAS的任何抑制剂。提到的术语KRAS(OFF)抑制剂包括AMG 510和MRTX849,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。在一些实施方案中,提到术语KRAS(OFF)抑制剂包括以下专利申请中的任一者中所公开的任何此类KRAS(OFF)抑制剂:WO2020118066、WO 2020113071、WO 2020106647、WO 2020106640、WO 2020102730、WO2020101736、WO 2020097537、WO 2020086739、WO 2020018282、WO 2020050890、WO2020047192、WO 2020035031、WO 2020033413、WO 2020028706、WO 2019241157、WO2019234405、WO 2019232419、WO 2019227040、WO 2019217933、WO 2019217691、WO2019217307、WO 2019215203、WO 2019213526、WO 2019213516、WO 2019204442、WO2019204449、WO 2019204505、WO 2019155399、WO 2019150305、WO 2019137985、WO2019110751、WO 2019099524、WO 2019055540、WO 2019051291、WO 2018237084、WO2018218070、WO 2018217651、WO 2018218071、WO 2018218069、WO 2018212774、WO2018206539、WO 2018195439、WO 2018143315、WO 2018140600、WO 2018140599、WO2018140598、WO 2018140514、WO 2018140513、WO 2018140512、WO 2018119183、WO2018112420、WO 2018068017、WO 2018064510、WO 2018011351、WO 2018005678、WO2017201161、WO 20171937370、WO 2017172979、WO 2017112777、WO 2017106520、WO2017096045、WO 2017100546、WO 2017087528、WO 2017079864、WO 2017058807、WO2017058805、WO 2017058728、WO 2017058902、WO 2017058792、WO 2017058768、WO2017058915、WO 2017015562、WO 2016179558、WO 2016176338、WO 2016168540、WO2016164675、WO 2016100546、WO 2016049568、WO 2016049524、WO 2015054572、WO2014152588、WO 2014143659和WO 2013155223,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,各案以全文引用的方式并入本文中。
如本文所使用,术语“RAS(ON)MULTI抑制剂”是指在以下位置中的一个处具有错义突变的至少3种RAS变体的RAS(ON)抑制剂:12、13、59、61或146。在一些实施方案中,RAS(ON)MULTI抑制剂是指在以下位置中的一个处具有错义突变的至少3种RAS变体的RAS(ON)抑制剂:12、13和61。
在本文有关RAS(OFF)抑制剂的任何实施方案中,此类RAS(OFF)抑制剂可被以下专利公布中公开的RAS抑制剂取代:WO 2021041671,该案以全文引用的方式并入本文中。在一些实施方案中,此类被取代的RAS抑制剂是MRTX1133或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
示例性RAS(OFF)抑制剂包括以下但不限于:
Figure BDA0004194083620000171
/>
Figure BDA0004194083620000181
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
提到的细胞“亚型”(例如KRASG12C亚型、KRASG12S亚型、KRASG12D亚型、KRASG12V亚型)意思指该细胞含有编码指定类型蛋白质的变化的基因突变。例如,归类为“KRASG12C亚型”的细胞含有至少一个KRAS等位基因,该等位基因编码在位置12处半胱氨酸取代甘氨酸的氨基酸取代(G12C);并且类似地,特定亚型的其它细胞(例如KRASG12D、KRASG12S和KRASG12V亚型)含有至少一个具有指定突变(分别是KRASG12D突变、KRASG12S突变或KRASG12V突变)的等位基因。除非另外说明,否则本文提到的所有氨基酸位置取代(例如KRASG12C中的“G12C”)对应于所述蛋白质的人类形式中的取代,即,KRASG12C是指人KRAS的位置12中的G→C取代。
如本文所使用,“RAS蛋白病”是由作为RAS路径的一部分的基因中的变化引起的一组遗传疾患。参见例如Rauen,Ann Rev Genomics Human Genetics,14:355(2013)。非限制性实例包括1型神经纤维瘤病(NF1)、努南氏综合征(NS)、努南氏综合征伴多发性雀斑(Noonan Syndrome with Multiple Lentigines,NSML)、毛细血管畸形-动静脉畸形综合征(CM-AVM)、克斯提洛氏综合征(Costello Syndrome,CS)、心-面-皮肤综合征(Cardio-Facio-Cutaneous Syndrome,CFC)、雷格斯氏综合征(Legius Syndrome)及遗传性牙龈纤维瘤病。
术语“单药疗法”是指包括向受试者施用单一治疗剂的治疗方法,该单一治疗剂任选地呈药物组合物形式。例如,单药疗法可包含施用药物组合物,该药物组合物包含治疗剂和一种或多种药学上可接受的载体、赋形剂、稀释剂和/或表面活性剂。治疗剂可按有效量施用。治疗剂可按治疗有效量施用。
术语“组合疗法”是指这样一种治疗方法,该方法包括向受试者施用至少两种治疗剂,该至少两种治疗剂任选地呈一种或多种药物组合物形式。例如,组合疗法可包含施用单一药物组合物,该药物组合物包含至少两种治疗剂和一种或多种药学上可接受的载体、赋形剂、稀释剂和/或表面活性剂。组合疗法可包含施用两种或更多种药物组合物,各组合物包含一种或多种治疗剂和一种或多种药学上可接受的载体、赋形剂、稀释剂和/或表面活性剂。在各个实施方案中,至少一种治疗剂是SOS1抑制剂。在各个实施方案中,至少一种治疗剂是RAS抑制剂。两种药剂可任选地同时(以单一组合物或独立组合物形式)或依序(以独立组合物形式)施用。治疗剂可按有效量施用。治疗剂可按治疗有效量施用。在一些实施方案中,例如,由于组合两种或更多种治疗剂发挥加合或协同作用,一种或多种治疗剂在以组合疗法使用时的有效量可低于同一治疗剂在用作单药疗法时的治疗量。
治疗方法
破坏RAS/MAPK信号传导路径是许多类型癌症中异常生长和增殖的常见驱动因素,并且还涉及发育性疾病,如努南氏综合征。这一路径的致癌过度活化可通过改变有活性的GTP结合的RAS和无活性的GDP结合的RAS,如导致RAS鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)和GTP酶活化蛋白(GAP)破坏的突变来发生。SHP2是在RAS上游起作用的PTPN11基因所编码的非受体蛋白酪氨酸磷酸酶。SHP2可通过活化SOS1调控RAS信号传导,SOS1是将无活性RAS-GDP转化成RAS-GTP的GEF。开发靶向SHP2或SOS1的抑制剂是治疗RAS驱动的癌症的一种引人注目的新兴方法,并且若干此类候选物当前正在经历临床试验。
根据本发明的一些实施方案,通过向受试者施用治疗有效量的SOS1抑制剂来治疗患有与具有SHP2突变的细胞相关的疾病或病症的受试者。在一些实施方案中,所述SHP2突变诱导SHP2的活化形式。在一些实施方案中,所述受试者在用SHP2抑制剂预先治疗后表达SHP2突变。在一些实施方案中,所述受试者在用别构SHP2抑制剂预先治疗后表达SHP2突变。
在一些实施方案中,所述方法另外包括向所述受试者施用治疗有效量的RAS抑制剂,该RAS抑制剂选自由以下组成的组:RAS(ON)抑制剂、MRTX1133和其组合。在一些实施方案中,RAS抑制剂靶向野生型RAS蛋白。在一些实施方案中,RAS蛋白是KRAS。在一些实施方案中,RAS抑制剂靶向RAS蛋白突变。在一些实施方案中,RAS蛋白突变在选自由以下组成的组的位置处:G12、G13、Q61、A146、K117、L19、Q22、V14、A59及其组合。在一些实施方案中,突变在选自由G12、G13和Q61组成的组的位置处。在一些实施方案中,突变选自由以下组成的组:G12C、G12D、G12A、G12S、G12V、G13C、G13D、Q61K和Q61L。
SHP2突变
经证实,对于广泛范围的组织型和基因型,强效选择性别构SHP2抑制剂,如RMC-4550在体外和体内有效破坏RAS-MAPK信号传导,抑制细胞增殖并诱导肿瘤生长抑制。别构SHP2抑制剂部分因为阻止RAS GEF SOS1和SOS2的活化而在RAS/MAPK信号传导路径驱动的癌症的临床前模型中有效。参见图1,该图示出RAS-MAPK路径。然而,先前已展示,SHP2抑制剂,包括别构SHP2抑制剂在内,针对SHP2中诱导SHP2蛋白活化形式的一系列特定临床相关突变展现明显降低的功效。出现在SHP2中的突变可在不同程度上活化信号传导并降低对于别构抑制剂的敏感性。这些突变可在肿瘤发展期间作为驱动因素产生或响应于别构SHP2抑制剂治疗而作为抗性突变获得。参见图2A和图2B,图中描绘了SHP2蛋白中的若干活化性突变。此外,用包括别构SHP2抑制剂在内的SHP2抑制剂治疗的患者可发展具有体细胞SHP2突变的肿瘤,从而诱导路径再活化和药物抗性。因此,对于与SHP2蛋白活化性突变有关的癌症的替代性治疗的医疗需求有待满足。
也已经开发出强效SOS1抑制剂,包括选择性SOS1抑制剂,并且近期已显示这些抑制剂有望在临床前作为RAS/MAPK路径驱动的癌症的替代性治疗。近期已开展涉及SOS1抑制剂的首次临床试验。如果直接作用于SHP2下游的SOS1抑制剂在活化性突变型SHP2的情形中维持或显示出改善的功效,则就这一点而言,这些抑制剂将表示值得关注的替代性治疗。本公开提供了支持这一观念的证据,显示相对于SHP2抑制剂,例如别构SHP2抑制剂,SOS1抑制在体外和体内在具有活化性SHP2突变的细胞或组织中有效,甚至当SHP2别构抑制剂无效时也如此。参见图3A、图3B、图4A至图4H以及图20A和图20B。
出人意料的是,SOS1的基因敲减看来会诱导具有活化SHP2的细胞中路径活性的大幅降低,由此表明带有活化性SHP2突变的癌细胞仅仅依赖于SOS1。实验结果显示,所有细胞都对SOS1和SOS2的同时敲减敏感,但出人意料的是,在带有强活化型SHP2突变的细胞中往往观察到SOS1敲减的较强作用。相比之下,SOS2敲减在所有细胞系中仅具有较小且类似的作用。由此表明,强活化型SHP2突变增加对SOS1的依赖性,并因此,活化性SHP2突变可增加对SOS1抑制剂,如BI-3406、BI-1701963和化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体的敏感性。这一观察结果提供了治疗策略的基础,由此在SHP2中具有突变,例如具有活化性SHP2突变的癌症患者可用SOS1抑制剂有效治疗,所述突变可为最初存在的或是响应于利用如别构SHP2抑制剂之类SHP2抑制剂的疗法而产生的。
根据本发明的一些实施方案,提供了一种用于治疗具有SHP2突变,例如诱导SHP2活化形式的SHP2突变的受试者的方法。这些突变通过使SHP2的自抑制型构象不稳定来起作用。不同的活化性突变使这一构象不稳定的程度不同,这可以通过突变的开启构象的自由能(ΔGop)定量地表示。野生型SHP2具有2.8kcal/mol的ΔGop。突变体SHP2的ΔGop值低于2.8指示活化,其中较低的值指示较强的活化作用。弱活化型突变体定义为ΔGop比野生型SHP2低不超过1.5kcal/mol者。中度活化型突变体具有比野生型低在1.5kcal/mol与2.24kcal/mol之间的ΔGop。强活化型突变体具有比野生型低超过2.24kcal/mol的ΔGop。参见图2A,该图是RMC-4550pERK IC50随ΔGop变化的关系的图。图2B是显示在SHP2蛋白的多种活化性突变中RMC-4550的pERK IC50值的表。下表1概述SHP2和某些突变体的模型参数。
表1:SHP2和突变体的模型参数的汇总
Figure BDA0004194083620000221
Figure BDA0004194083620000231
如图2A和表1中所示,产生最低开启构象自由能(ΔGop)的突变G503V是特定的SHP2活化性突变。这进一步例如通过图2B中针对G503V的pERK IC50>30,000nM来显示。
因此,在一些实施方案中,SHP2突变可在以下位置中的一个或多个处发生:G60、D61、E69、A72、T73、E76、S189、L262、F285、N308、T468、P491、S502、G503、Q506、T507、T253或Q257。在一些实施方案中,突变是以下中的一个或多个:G60V、D61G、D61V、E69K、A72S、A72T、A72V、T73I、E76A、E76G、E76K、E76Q、S189A、L262R、F285S、N308D、T468M、P491S、S502P、G503V、Q506P、T507K、T253M/Q257L及其组合。
此外,在一些实施方案中,SHP2突变是在受试者体内出现的频率大于超过0.05%的改变发生率的位置处。在一些实施方案中,SHP2突变在选自由以下组成的组的位置处:T52、I56、G60、D61、Y62、Y63、E69、K70、A72、T73、E76、E123、E139、Y197、S189、T253、Q257、L261、L262、R265、F285、N308、V428、A461、T468、P491、S502、G503、M504、Q506、Q510、T507及其组合。在一些实施方案中,SHP2突变在选自由以下组成的组的位置处:A72、E76和G503,以及其组合。在一些实施方案中,SHP2突变选自由以下组成的组:T52I、I56V、G60V、D61G、D61V、D61Y、Y62D、Y63D、Y63C、E69K、E69Q、K70R、A72S、A72T、A72V、T73I、E76A、E76G、E76K、E76Q、E123D、E139D、S189A、T253M、Q257L、L261F、L261H、L262R、R265Q、F285S、N308D、V428M、A461T、A461G、T468M、P491S、S502L、S502P、G503A、G503V、M504V、Q506P、T507K、Q510P、Q510H及其组合。
在一些实施方案中,SHP2突变在选自由以下组成的组的位置处:G60、D61、A72、E76、G503和S502,以及其组合。在一些实施方案中,SHP2突变在选自由以下组成的组的位置处:G60、D61、E69、A72、E123、Y197、N308、V428、A461、T468、S502、G503、T507及其组合。在一些实施方案中,SHP2突变选自由以下组成的组:G60V、D61G、D61V、D61Y、E69K、E69Q、A72S、A72T、A72V、E123D、N308D、V428M、A461T、A461G、T468M、S502L、S502P、G503A、G503V、T507K及其组合。在一些实施方案中,SHP2突变在选自由以下组成的组的位置处:T52、I56、Y62、Y63、E69、K70、E139、L261、R265、N308、T468、M504、Q510及其组合。在一些实施方案中,SHP2突变选自由以下组成的组:T52I、I56V、Y62D、Y63D、Y63C、E69K、E69Q、K70R、E139D、L261F、L261H、R265Q、N308D、T468M、M504V、Q510P、Q510H及其组合。
在一些实施方案中,SHP2突变在利用SHP2抑制剂的治疗过程后在受试者体内表达。在一些实施方案中,SHP2突变在利用别构SHP2抑制剂的治疗过程后在受试者体内表达。在一些实施方案中,SHP2突变在利用活性位点SHP2抑制剂的治疗过程后在受试者体内表达。在一些实施方案中,SHP2突变在利用别构SHP2抑制剂的治疗过程后在受试者体内表达。SHP2抑制剂,例如别构SHP2抑制剂,一般是野生型SHP2蛋白抑制剂。SHP2抑制剂,例如别构SHP2抑制剂,可选自但不限于以下中所公开的那些:WO 2021149817、WO2021148010、WO2021147879、WO 2021143823、WO 2021143701、WO 2021143680、WO2021121397、WO2021119525、WO 2021115286、WO 2021110796、WO 2021088945、WO 2021073439、WO2021061706、WO 2021061515、WO 2021043077、WO 2021033153、WO 2021028362、WO2021033153、WO 2021028362、WO 2021018287、WO 2020259679、WO 2020249079、WO2020210384、WO 2020201991、WO 2020181283、WO 2020177653、WO 2020165734、WO2020165733、WO 2020165732、WO 2020156243、WO 2020156242、WO 2020108590、WO2020104635、WO 2020094104、WO 2020094018、WO 2020081848、WO 2020073949、WO2020073945、WO 2020072656、WO 2020065453、WO 2020065452、WO 2020063760、WO2020061103、WO 2020061101、WO 2020033828、WO 2020033286、WO 2020022323、WO2019233810、WO 2019213318、WO 2019183367、WO 2019183364、WO 2019182960、WO2019167000、WO 2019165073、WO 2019158019、WO 2019152454、WO 2019051469、WO2019051084、WO 2018218133、WO 2018172984、WO 2018160731、WO 2018136265、WO2018136264、WO 2018130928、WO 2018129402、WO 2018081091、WO 2018057884、WO2018013597、WO 2017216706、WO 2017211303、WO 2017210134、WO 2017156397、WO2017100279、WO 2017079723、WO 2017078499、WO 2016203406、WO 2016203405、WO2016203404、WO 2016196591、WO 2016191328、WO 2015107495、WO 2015107494、WO2015107493、WO 2014176488、WO 2014113584、US 20210085677、US 10858359、US 10934302和US 10954243,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。示例性此类别构SHP2抑制剂的非限制性清单包括ERAS-601、BBP-398、RLY-1971、JAB-3068、JAB-3312、TNO155、SHP099、RMC-4550和RMC-4630,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。在一些实施方案中,SHP2抑制剂是TNO155或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。在一些实施方案中,SHP2抑制剂是RMC-4630或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。示例性活性位点SHP2抑制剂的非限制性清单包括NSC-87877、IIB-08、11a-1和GS-493,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。在一些实施方案中,利用这些SHP2抑制剂的治疗过程可诱导SHP2中的突变,例如活化性突变,所述SHP2抑制剂包括别构SHP2抑制剂、活性位点SHP2抑制剂或野生型SHP2的其它此类抑制剂。在一些实施方案中,SHP2突变引起对SHP2抑制剂的抗性。或者,所述对SHP2抑制剂的抗性可能因SHP2蛋白中的天然突变而发生。在任何情况下,所述突变均可诱导路径再活化和针对SHP2抑制剂的药物抗性。
因此,本发明涉及一种治疗患有与在SHP2蛋白中具有突变的细胞相关的疾病或病症的受试者的方法。在一些实施方案中,所述突变是活化性SHP2突变。根据本发明的实施方案,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的SOS1抑制剂。在一些实施方案中,SOS1抑制剂也可抑制SOS2,即,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的SOS1/SOS2双重抑制剂。在一些实施方案中,此类SOS1抑制剂以SOS1抑制相对于SOS2抑制的选择性比小于10倍为特征。在一些实施方案中,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的选择性SOS1抑制剂。在一些实施方案中,此类SOS1抑制剂以SOS1抑制相对于SOS2抑制的选择性比大于至少约10倍,如大于至少约30倍为特征。
SOS1抑制剂
在一些实施方案中,SOS1抑制剂选自WO 2018/115380、WO 2018/172250、WO 2019/122129和WO 2019/201848中所公开的那些,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,各案公开内容特此以引用的方式并入,其引用方式就如同整体陈述一般。在一些实施方案中,SOS1抑制剂选自WO 2021/092115、WO 2020/180768和WO 2020/180770中所公开的那些,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,各案公开内容特此以引用的方式并入,其引用方式就如同整体陈述一般。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(41-I)的结构的化合物:
Figure BDA0004194083620000271
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中:
Q1和Q2独立地是CH或N;
Q3、Q4和Q7独立地是C或N,其中Q3和Q4中的至少一个是C并且其中Q3、Q4和Q7不全为N;
Q5是CH、N、NH、O或S;
Q6是CH、N、NH、N-C1-6烷基、N-C1-6杂烷基、N-(3-7元环烷基)、N-(3-7元杂环基)、O或S;
其中Q1、Q2、Q3、Q4、Q5、Q6和Q7中的至少一个是N、NH、O或S;
R1选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、卤素、-NHR1a、-OR1a、环丙基和-CN;其中C1-6烷基任选被卤素、-NHR1a或-OR1a取代;其中R1a是H、C1-6烷基、3-6元杂环基或C1-6卤代烷基;
L2选自由以下组成的组:化学键、-C(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH(CH2)o-、-S(O)2-、
Figure BDA0004194083620000281
Figure BDA0004194083620000282
-C(O)(CH2)p-、-(CH2)p-和-O-;其中o是0、1或2;并且其中p是从1至6的数字;
R2选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、C2-6烯基、-NR2bR2c、-OR2a、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基;其中各C1-6烷基、C2-6烯基、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基独立地任选被以下取代:C1-6烷基、C1-6卤代烷基、-OH、-OR2a、氧代、卤素、-C(O)R2a、-C(O)OR2a、-C(O)NR2bR2c、-CN、-NR2bR2c、3-6元环烷基、3-7元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基;
其中R2a是H、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、3-7元杂环基或-(CH2)rOCH3,其中r是1、2或3;
其中R2b是H或C1-6烷基;
其中R2c是H或C1-6烷基;
R3和R4独立地是H或任选被卤代或-OH取代的C1-6烷基;其中R3和R4中的至少一个是H或其中R3和R4连同其所连接的原子组合形成3-6元环烷基;并且
A是任选被取代的6元芳基或任选被取代的5-6元杂芳基。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(41-I-a)的结构的化合物,
Figure BDA0004194083620000291
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中:
Q1、Q2、Q5和A如式(41-I)中所定义;
Q3和Q4独立地是C或N,其中Q3和Q4中的至少一个是C;
Q6是CH、N、NH、O或S;
其中Q1、Q2、Q3、Q4、Q5和Q6中的至少一个是N、NH、O或S;
R1选自由以下组成的组:H、卤素、C1-6烷基、环丙基、-CN和-OR1a;其中R1a是H或C1-6烷基;
L2选自由以下组成的组:化学键、-C(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH(CH2)o-、-S(O)2-、-C(O)(CH2)p-、-(CH2)p-和-O-;其中o是0、1或2;并且其中p是从1至6的数字;
R2选自由以下组成的组:H、-(CH2)qCH3、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基;其中q是从1至5的数字;其中各3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基任选被以下取代:C1-6烷基、-OH、卤素、-C(O)R2a或-C(O)NR2bR2c;其中R2a是C1-6烷基或-(CH2)rOCH3,其中r是1、2或3;其中R2b是H或C1-6烷基;并且其中R2c是H或C1-6烷基;并且
R3和R4独立地是H或C1-6烷基;其中R3和R4中的至少一个不是H;或R3和R4连同其所连接的原子组合形成3-6元环烷基。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(41-II)的结构的化合物,
Figure BDA0004194083620000301
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中:
L2、Q1、Q2、Q3、Q4、Q5、Q6、Q7、R1、R2、R3和R4如式(41-I)中所定义;
R5、R6、R7、R8和R9独立地选自由以下组成的组:H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、-OH、卤素、-NO2、-CN、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、-C(O)R10和-CO2R10,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基和3-8元环烷基独立地任选被以下取代:-OH、卤素、-NO2、氧代、-CN、-R10、-OR10、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、3-14元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基;
R10、R11和R12在每次出现时独立地选自H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、-OR13、-SR13、卤素、-NR13R14、-NO2和-CN;并且
R13和R14在每次出现时独立地选自H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基独立地任选被以下取代:-OH、-SH、-NH2、-NO2或-CN。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(41-III)的结构的化合物,
Figure BDA0004194083620000311
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中:
L2、Q1、Q2、Q3、Q4、Q5、Q6、Q7、R1、R2、R3和R4如式(41-I)中所定义;
Q8和Q9独立地是CH、N、NH、O或S,条件是Q8和Q9中的至少一个是N、NH、O或S;
R6和R7独立地选自由以下组成的组:H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、-OH、卤素、-NO2、-CN、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、-C(O)R10和-CO2R10,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基和3-8元环烷基独立地任选被以下取代:-OH、卤素、-NO2、氧代、-CN、-R10、-OR10、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、3-14元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基;
R10、R11和R12在每次出现时独立地选自H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、-OR13、-SR13、卤素、-NR13R14、-NO2或-CN;并且
R13和R14在每次出现时独立地选自H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基或3-14元杂环基,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基独立地任选被以下取代:-OH、-SH、-NH2、-NO2或-CN。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是选自由下表中的化合物组成的组的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体:
Figure BDA0004194083620000331
/>
Figure BDA0004194083620000341
/>
Figure BDA0004194083620000351
/>
Figure BDA0004194083620000361
/>
Figure BDA0004194083620000371
/>
Figure BDA0004194083620000381
/>
Figure BDA0004194083620000391
/>
Figure BDA0004194083620000401
/>
Figure BDA0004194083620000411
/>
Figure BDA0004194083620000421
/>
Figure BDA0004194083620000431
/>
Figure BDA0004194083620000441
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(42-I)的结构的化合物:
Figure BDA0004194083620000442
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中:
Q1是CH或N;
Q4是CH、C或N;
各Q2独立地是C-R1或N,其中一个Q2是N并且另一个Q2是C-R1
各Q3和Q5独立地是C(RQC)2、NRQN、CO、O、S或SO2,其中各RQC独立地是H、F、Cl、Br或6-10元芳基,并且其中各RQN独立地是H、C1-6烷基或6-10元芳基;
其中Q1、Q2、Q3、Q4和Q5中的至少一个是N、NRQN、O或SO2
m是0、1、2或3;
n是0、1、2或3;
其中当m是0时,则n不是0;
R1选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、卤素、-CONHR1a、-NHR1a、-OR1a、环丙基、氮杂环丁烷基和-CN;其中各C1-6烷基和氮杂环丁烷基任选被卤素、R1a、-NHR1a或-OR1a取代;其中R1a是H、C1-6烷基、环丙基、3-6元杂环基或C1-6卤代烷基;
L2选自由以下组成的组:化学键、-C(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH(CH2)o-、-S(O)2-、
Figure BDA0004194083620000451
Figure BDA0004194083620000452
-C(O)(CH2)p-、-(CH2)p-和-O-;其中o是0、1或2;并且其中p是从1至6的数字;
R2选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、-NR2bR2c、-OR2a、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基;其中各C1-6烷基、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基独立地任选被以下取代:C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6羟基烷基、C1-6甲氧基烷基、-OH、-OR2a、氧代、=N、卤素、-C(O)R2a、-C(O)OR2a、-C(O)NR2bR2c、-SO2R2a、-CN、-NR2bR2c、3-6元环烷基、3-7元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基;
其中R2a是H、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、3-7元杂环基或-(CH2)rOCH3,其中r是1、2或3;
其中R2b是H或C1-6烷基;
其中R2c是H或C1-6烷基;
R3和R4独立地是H或任选被卤代或-OH取代的C1-6烷基;其中R3和R4中的至少一个是H或其中R3和R4连同其所连接的原子组合形成3-6元环烷基;并且
A是任选被取代的6元芳基或任选被取代的5-6元杂芳基;
条件是,当
Figure BDA0004194083620000461
是/>
Figure BDA0004194083620000462
Figure BDA0004194083620000463
则R1不是H。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(42-I-a)的结构的化合物,
Figure BDA0004194083620000471
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中:
Q1、Q3、Q4、Q5、m、n和A如式(42-I)中所定义;
Q2是CH或N;
其中Q1、Q2、Q3、Q4和Q5中的至少一个是N、NRQN、O或SO2
R1选自由以下组成的组:H、卤素、C1-6烷基、环丙基、-CN和-OR1a;其中R1a是H或C1-6烷基;
L2选自由以下组成的组:化学键、-C(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH(CH2)o-、-S(O)2-、-C(O)(CH2)p-、-(CH2)p-或-O-;其中o是0、1或2;并且其中p是从1至6的数字;
R2选自由以下组成的组:H、-(CH2)qCH3、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基;其中q是从1至5的数字;其中各3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基任选被C1-6烷基、-OH、卤素、-C(O)R2a或-C(O)NR2bR2c取代;其中R2a是C1-6烷基或-(CH2)rOCH3,其中r是1、2或3;其中R2b是H或C1-6烷基;并且其中R2c是H或C1-6烷基;并且
R3和R4独立地是H或C1-6烷基;其中R3和R4中的至少一个不是H;或R3和R4连同其所连接的原子组合形成3-6元环烷基。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(42-V)的结构的化合物,
Figure BDA0004194083620000481
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中:
L2、Q1、Q2、Q3、Q4、Q5、m、n、R1、R2、R3和R4如式(42-I)中所定义;
R5、R6、R7、R8和R9独立地选自由以下组成的组:H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、-OH、卤素、-NO2、-CN、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、-C(O)R10和-CO2R10,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基独立地任选被以下取代:-OH、卤素、-NO2、氧代、-CN、-R10、-OR10、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、3-8元环烷基、3-14元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基,或任何两个相邻的R5、R6、R7、R8和R9形成3-14元稠合环;
R10、R11和R12在每次出现时独立地选自H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、-OR13、-SR13、卤素、-NR13R14、-NO2和-CN;并且
R13和R14在每次出现时独立地选自H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基独立地任选被以下取代:-OH、-SH、-NH2、-NO2或-CN。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(42-VI)的结构的化合物,
Figure BDA0004194083620000491
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中:
L2、Q1、Q2、Q3、Q4、Q5、m、n、R1、R2、R3和R4如式(42-I)中所定义;
Q7和Q8各自独立地是CH、N、NH、O或S,条件是Q7和Q8中的至少一个是N、NH、O或S;
R6和R7独立地选自由以下组成的组:H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、-OH、卤素、-NO2、-CN、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、-C(O)R10和-CO2R10,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基独立地任选被以下取代:-OH、卤素、-NO2、氧代、-CN、-R10、-OR10、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、3-8元环烷基、3-14元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基,
R10、R11和R12在每次出现时独立地选自H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、-OR13、-SR13、卤素、-NR13R14、-NO2和-CN;并且
R13和R14在每次出现时独立地选自H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基独立地任选被以下取代:-OH、-SH、-NH2、-NO2或-CN。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是选自由下表中的化合物组成的组的化合物或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体:
Figure BDA0004194083620000511
/>
Figure BDA0004194083620000521
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Figure BDA0004194083620000531
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Figure BDA0004194083620000541
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Figure BDA0004194083620000551
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Figure BDA0004194083620000561
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Figure BDA0004194083620000571
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Figure BDA0004194083620000581
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Figure BDA0004194083620000591
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Figure BDA0004194083620000601
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Figure BDA0004194083620000611
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Figure BDA0004194083620000621
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Figure BDA0004194083620000631
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Figure BDA0004194083620000701
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Figure BDA0004194083620000731
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Figure BDA0004194083620000751
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Figure BDA0004194083620000761
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Figure BDA0004194083620000771
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Figure BDA0004194083620000781
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Figure BDA0004194083620000791
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Figure BDA0004194083620000801
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Figure BDA0004194083620000811
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Figure BDA0004194083620000821
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Figure BDA0004194083620000831
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Figure BDA0004194083620000841
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Figure BDA0004194083620000851
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Figure BDA0004194083620000861
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Figure BDA0004194083620000871
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Figure BDA0004194083620000881
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Figure BDA0004194083620000891
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Figure BDA0004194083620000901
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Figure BDA0004194083620000911
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Figure BDA0004194083620000921
/>
Figure BDA0004194083620000931
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(48-I)的结构的化合物:
Figure BDA0004194083620000932
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中:
R1选自由以下组成的组:任选被取代的3-6元环烷基、任选被取代的3-6元杂环基、任选被取代的6元芳基和任选被取代的5-6元杂芳基;
R2选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、卤素、-NHR2a、-OR2a、环丙基和-CN;其中C1-6烷基任选被卤素、-NHR2a、-OR2a或5-6元杂环基取代,并且另外其中R2a选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、3-6元杂环基和C1-6卤代烷基;
R3选自由以下组成的组:H、C1-3烷基、-OR3a、环丙基和3-6元杂环基,其中C1-3烷基、环丙基和3-6元杂环基各自任选被R3a取代,并且另外其中R3a选自由以下组成的组:C1-3烷基、卤素、-OH和-CN;
L4选自由以下组成的组:化学键、-C(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH(CH2)o-、-NH-、-S-、-S(O)2-、
Figure BDA0004194083620000941
Figure BDA0004194083620000942
-(CH2)p-和-O-;其中o是0、1或2;并且其中p是从1至6的数字;并且
R4选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基;其中各C1-6烷基、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基任选被以下取代:C1-6烷基、-R4a、-OR4a、-O-C1-6烷基-R4a、=O、卤素、-C(O)R4a、-C(OO)R4a、-C(O)NR4bR4c、-NR4bC(O)R4c、-CN、=NR4a、-NR4bR4c、-SO2R4a、任选被R4a取代的3-6元环烷基、任选被R4a取代的3-7元杂环基、任选被R4a取代的6-10元芳基或任选被R4a取代的5-10元杂芳基;
其中R4a是H、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、-C(O)R4b、-C(O)NR4bR4c、=O、3-6元环烷基、任选被-OR4b取代的6-10元芳基、-CN、=N-3-6元环烷基、3-7元杂环基、-(CH2)rOCH3或-(CH2)rOH,其中r是1、2或3;
其中各R4b独立地是H、C1-6烷基;并且
其中各R4c独立地是H或C1-6烷基。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(48-II)的结构的化合物,
Figure BDA0004194083620000951
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中R2、R3、L4和R4如式(48-I)中所定义;
R5、R6、R7、R8和R9独立地选自由以下组成的组:H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、-OH、卤素、-NO2、-CN、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、-C(O)R10、-CO2R10、6-10元芳基和5-10元杂芳基,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基任选被以下取代:-OH、C1-6烷基、卤素、-NO2、氧代、-CN、-R10、-OR10、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、3-8元环烷基、3-14元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基,或任何两个相邻的R5、R6、R7、R8和R9形成任选被取代的3-14元稠合环;
R10、R11和R12在每次出现时独立地选自H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、-OR13、-SR13、卤素、-NR13R14、-NO2和-CN;并且
R13和R14在每次出现时独立地选自H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基独立地任选被以下取代:-OH、-SH、-NH2、-NO2或-CN。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(48-II)的结构的化合物,
Figure BDA0004194083620000961
或其药学上可接受的盐或立体异构体,其中:
R2是H;
R3选自由H和C1-3烷基组成的组;
L4是化学键;
R4选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基;其中各C1-6烷基、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基任选被以下取代:C1-6烷基、-R4a、-OR4a、-O-C1-6烷基-R4a、=O、卤素、-C(O)R4a、-C(OO)R4a、-C(O)NR4bR4c、-NR4bC(O)R4c、-CN、=NR4a、-NR4bR4c、-SO2R4a、任选被R4a取代的3-6元环烷基、任选被R4a取代的3-7元杂环基、任选被R4a取代的6-10元芳基或任选被R4a取代的5-10元杂芳基;
其中R4a是H、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、-C(O)R4b、-C(O)NR4bR4c、=O、3-6元环烷基、任选被-OR4b取代的6-10元芳基、-CN、=N-3-6元环烷基、3-7元杂环基、-(CH2)rOCH3或-(CH2)rOH,其中r是1、2或3;
其中各R4b独立地是H、C1-6烷基;
其中各R4c独立地是H或C1-6烷基;
R5、R6、R7、R8和R9独立地选自由以下组成的组:H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、-OH、卤素、-NO2、-CN、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、-C(O)R10、-CO2R10、6-10元芳基和5-10元杂芳基,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基任选被以下取代:-OH、任选被-R10取代的C1-6烷基、卤素、-NO2、=O、-CN、-R10、-OR10、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、3-8元环烷基、任选被R10取代的3-14元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基;
R10、R11和R12在每次出现时独立地选自由以下组成的组:H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、-OR13、-SR13、卤素、-NR13R14、-NO2和-CN;并且
R13和R14在每次出现时独立地选自由以下组成的组:H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基独立地任选被以下取代:-OH、-SH、-NH2、-NO2或-CN。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是选自由下表中的化合物组成的组的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体:
Figure BDA0004194083620000981
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Figure BDA0004194083620000991
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/>
Figure BDA0004194083620001451
注意:上表中所示的任何化合物可以是非对映异构体,并且此类非对映异构体的绝对立体化学可能未知。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂选自由以下组成的组:
(R)-4-((1-(3-氨基-5-(三氟甲基)苯基)乙基)氨基)-8-甲基-6-(1,2,3,6-四氢吡啶-4-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
(R)-4-((1-(3-(1,1-二氟-2-羟基乙基)苯基)乙基)氨基)-8-甲基-6-吗啉代吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
(R)-6-(3,6-二氢-2H-吡喃-4-基)-8-甲基-4-((1-(3-(三氟甲基)苯基)乙基)氨基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
4-{[(1R)-1-[3-氨基-5-(三氟甲基)苯基]乙基]氨基}-8-甲基-6-(吗啉-4-基)-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
8-甲基-6-(吗啉-4-基)-4-{[(1R)-1-[3-(三氟甲基)苯基]-乙基]氨基}-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
4-{[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟苯基]乙基]氨基}-6-(1-甲烷磺酰基-3-甲基氮杂环丁烷-3-基)-8-甲基-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
6-(1-乙酰基-4-哌啶基)-4-[[(1R)-1-[3-氨基-2-氟-5-(三氟甲基)苯基]乙基]氨基]-8-甲基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
6-(1-乙酰基-4-哌啶基)-4-[[(1R)-1-[5-氨基-2-氟-3-(三氟甲基)苯基]乙基]氨基]-8-甲基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
(R)-4-((1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-8-甲基-6-(哒嗪-4-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-8-甲基-6-(1-氧离子基-3,6-二氢-2H-硫代吡喃-4-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-6-(1-亚氨基-1-氧离子基-1,2,3,6-四氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-8-甲基-6-(1-(甲基亚氨基)-1-氧离子基-1,2,3,6-四氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
(R)-4-((1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-8-甲基-6-(1-氧离子基四氢-2H-硫代吡喃-4-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
4-(4-{[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟苯基]-乙基]氨基}-8-甲基-7-氧代-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)-4-羟基-1λ-噻烷-1,1-二酮;
4-(4-{[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟苯基]乙基]氨基}-8-甲基-7-氧代-7H,8H-吡啶并[2,3-d]-嘧啶-6-基)-4-氟-1λ-噻烷-1,1-二酮;
4-{[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟苯基]乙基]氨基}-8-甲基-6-(苯基硫基)-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
6-(4-氨基氧杂环己烷-4-基)-4-{[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟苯基]乙基]氨基}-8-甲基-7H,8H-吡啶并-[2,3-d]嘧啶-7-酮;
4-(4-{[(1R)-1-[3-(二氟-甲基)-2-氟苯基]乙基]氨基}-8-甲基-7-氧代-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)-4-甲氧基-1λ-噻烷-1,1-二酮;
6-(4-{[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟苯基]乙基]氨基}-8-甲基-7-氧代-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)-2λ-硫杂螺[3.3]庚烷-2,2-二酮;
4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-6-(3-羟基哌啶-4-基)-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
(R)-4-((1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-6-(1-亚氨基-1-氧离子基六氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
1-乙酰基-4-(4-{[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟苯基]乙基]氨基}-8-甲基-7-氧代-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)哌啶-4-甲腈;
4-(4-{[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟苯基]乙基]氨基}-8-甲基-7-氧代-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)-4-甲基-1λ-噻烷-1,1-二酮;
6-(1-乙酰基哌啶-4-基)-4-{[(1R)-1-[2,3-双(二氟甲基)苯基]乙基]氨基}-8-甲基-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
6-(1-乙酰基哌啶-4-基)-4-{[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-(氟甲基)苯基]乙基]氨基}-8-甲基-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
2-{3-[(1R)-1-{[6-(1,1-二氧代-3,6-二氢-2H-1λ-硫代吡喃-4-基)-8-甲基-7-氧代-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基]氨基}乙基]苯基}-2,2-二氟乙腈;
2-{3-[(1R)-1-{[6-(1,1-二氧代-3,6-二氢-2H-1λ-硫代吡喃-4-基)-8-甲基-7-氧代-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基]氨基}乙基]-2-氟苯基}-2,2-二氟乙腈;
4-(4-{[(1R)-1-[3-(2-氨基-1,1-二氟乙基)-2-氟苯基]乙基]氨基}-8-甲基-7-氧代-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)-3,6-二氢-2H-1λ-硫代吡喃-1,1-二酮;
6-(1-乙酰基-4-哌啶基)-4-[[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-5-(3-氟氮杂环丁烷-3-基)苯基]乙基]氨基]-8-甲基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
[4-[4-[[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟-苯基]乙基]氨基]-8-甲基-7-氧代-吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基]-1-氧代-3,6-二氢-2H-硫代吡喃-1-亚基]氨腈;
[4-[4-[[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟-苯基]乙基]氨基]-8-甲基-7-氧代-吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基]-1-氧代-亚噻烷-1-基]氨腈;
4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-6-((1S,4s)-1-亚氨基-4-甲氧基-1-氧离子基六氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-6-((1R,4r)-1-亚氨基-4-甲氧基-1-氧离子基六氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-6-((1S,4s)-4-氟-1-(甲基亚氨基)-1-氧离子基六氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-6-((1R,4r)-4-氟-1-(甲基亚氨基)-1-氧离子基六氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
6-{3-乙酰基-3-氮杂双环[3.1.0]己-1-基}-4-{[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟苯基]乙基]氨基}-8-甲基-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
6-(1-乙酰基-4-哌啶基)-4-[[(1R)-1-[3-[(4-环丙基吗啉-2-基)-二氟-甲基]-2-氟-苯基]乙基]氨基]-8-甲基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
6-((1R,4r)-1-(环丙基亚氨基)-4-氟-1-氧离子基六氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)-4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
6-((1S,4s)-1-(环丙基亚氨基)-4-氟-1-氧离子基六氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)-4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
(1R,4r)-1-(环丙基亚氨基)-4-(4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-8-甲基-7-氧代-7,8-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)六氢-1λ6-硫代吡喃-4-甲腈1-氧化物;
(1S,4s)-1-(环丙基亚氨基)-4-(4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-8-甲基-7-氧代-7,8-二氢吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)六氢-1λ6-硫代吡喃-4-甲腈1-氧化物;
4-[[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟-苯基]乙基]氨基]-8-甲基-6-[1-(氧杂环丁烷-3-基亚氨基)-1-氧代-噻烷-4-基]吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
4-[[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟-苯基]乙基]氨基]-6-[1-[(4-甲氧基苯基)甲氧基]环丙基]-8-甲基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
2-[2-(二氟甲基)-6-[(1R)-1-[[6-(1,1-二氧代-3,6-二氢-2H-硫代吡喃-4-基)-8-甲基-7-氧代-吡啶并[2,3-d]嘧啶-4-基]氨基]乙基]苯基]乙腈;
4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-8-甲基-6-((1R,4r)-1-(甲基亚氨基)-1-氧离子基六氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-8-甲基-6-((S)-1-(氧杂环丁烷-3-基亚氨基)-1-氧离子基-1,2,3,6-四氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-8-甲基-6-((R)-1-(氧杂环丁烷-3-基亚氨基)-1-氧离子基-1,2,3,6-四氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
4-[[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟-苯基]乙基]氨基]-6-(1-亚氨基-1-氧代-噻烷-4-基)-8-甲基-吡啶并[2,3-d]嘧啶-7-酮;
6-((1R,4r)-1-(环丙基亚氨基)-4-甲氧基-1-氧离子基六氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)-4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;
6-((1S,4s)-1-(环丙基亚氨基)-4-甲氧基-1-氧离子基六氢-1λ6-硫代吡喃-4-基)-4-(((R)-1-(3-(二氟甲基)-2-氟苯基)乙基)氨基)-8-甲基吡啶并[2,3-d]嘧啶-7(8H)-酮;以及
N-[3-(4-{[(1R)-1-[3-(二氟甲基)-2-氟苯基]乙基]氨基}-8-甲基-7-氧代-7H,8H-吡啶并[2,3-d]嘧啶-6-基)双环[1.1.1]戊-1-基]乙酰胺;
或其药学上可接受的盐或立体异构体。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是选自由下表中的化合物组成的组的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中表中以括号显示的任何化合物指示,该化合物是非对映异构体,并且此类非对映异构体的绝对立体化学可能未知:
Figure BDA0004194083620001501
/>
Figure BDA0004194083620001511
/>
Figure BDA0004194083620001521
/>
Figure BDA0004194083620001531
/>
Figure BDA0004194083620001541
/>
Figure BDA0004194083620001551
/>
Figure BDA0004194083620001561
/>
Figure BDA0004194083620001571
/>
Figure BDA0004194083620001581
/>
Figure BDA0004194083620001591
/>
Figure BDA0004194083620001601
/>
Figure BDA0004194083620001611
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Figure BDA0004194083620001871
注意:上表中所示的任何化合物可以是非对映异构体,并且此类非对映异构体的绝对立体化学可能未知。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是选自由下表中的化合物组成的组的化合物,或其药学上可接受的盐或立体异构体:
Figure BDA0004194083620001881
注意:上表中所示的任何化合物可以是非对映异构体,并且此类非对映异构体的绝对立体化学可能未知。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(53-I)、式(53-II)或式(53-III)的结构的化合物:
Figure BDA0004194083620001891
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中:
X1是NH或S;
X2是CH或N;
X3是CH或N;
X4是CR3或N;
X5是CH或N;
X6是CH或N;
R1选自由以下组成的组:任选被取代的3-6元环烷基、任选被取代的3-6元杂环基、任选被取代的6元芳基和任选被取代的5-6元杂芳基;
R2选自由以下组成的组:H、-NH-C1-6烷基和-NH2
R3选自由以下组成的组:H、-O-C1-6烷基和-O-C1-6杂烷基;
L4是化学键或O;并且
R4选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基;其中各C1-6烷基、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基任选被一个或多个以下基团取代:C1-6烷基、-R4a、-OR4a、-O-C1-6烷基-R4a、=O、卤素、-C(O)R4a、-C(O)OR4a、-C(O)NR4bR4c、-NR4bC(O)R4c、-CN、=NR4a、-NR4bR4c、-SO2R4a、任选被R4a取代的3-6元环烷基、任选被R4a取代的3-7元杂环基、任选被R4a取代的6-10元芳基或任选被R4a取代的5-10元杂芳基;
其中R4a是H、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、-C(O)R4b、-C(O)NR4bR4c、=O、3-6元环烷基、任选被-OR4b取代的6-10元芳基、-CN、=N-3-6元环烷基、3-7元杂环基、-(CH2)rOCH3或-(CH2)rOH,其中r是1、2或3;
其中各R4b独立地是H、C1-6烷基;并且
其中各R4c独立地是H或C1-6烷基。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(53-Ia)、式(53-IIa)或式(53-IIIa)的结构的化合物:
Figure BDA0004194083620001901
Figure BDA0004194083620001911
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中X1、X2、X3、X4、X5、X6、R2、L4和R4如式(53-I)、式(53-II)或式(53-III)中所定义;
R5、R6、R7、R8和R9独立地选自由以下组成的组:H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、-OH、卤素、-NO2、-CN、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、-C(O)R10、-CO2R10、6-10元芳基和5-10元杂芳基,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基任选被以下取代:-OH、任选被-R10取代的C1-6烷基、卤素、-NO2、=O、-CN、-R10、-OR10、-NR11R12、-SR10、-S(O)2NR11R12、-S(O)2R10、-NR10S(O)2NR11R12、-NR10S(O)2R11、-S(O)NR11R12、-S(O)R10、-NR10S(O)NR11R12、-NR10S(O)R11、3-8元环烷基、任选被R10取代的3-14元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基,或任何两个相邻的R5、R6、R7、R8和R9形成任选被取代的3-14元稠合环;
R10、R11和R12在每次出现时独立地选自H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基、3-14元杂环基、-OR13、-SR13、卤素、-NR13R14、-NO2和-CN;并且
R13和R14在每次出现时独立地选自H、D、C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基,其中各C1-6烷基、C2-6烯基、4-8元环烯基、C2-6炔基、3-8元环烷基和3-14元杂环基独立地任选被以下取代:-OH、-SH、-NH2、-NO2或-CN。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是具有式(53-II-1)的结构的化合物:
Figure BDA0004194083620001921
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,其中R1和R4如式(II)中所定义。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是选自由下表中的化合物组成的组的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体:
Figure BDA0004194083620001931
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Figure BDA0004194083620001941
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Figure BDA0004194083620001951
在一个实施方案中,SOS1抑制剂是具有以下结构的BI-3406:
Figure BDA0004194083620001961
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是BI-1701963或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一个实施方案中,SOS1抑制剂是具有以下结构的BAY-293:
Figure BDA0004194083620001962
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是SDGR5或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一个实施方案中,SOS1抑制剂是具有以下结构的化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331):
Figure BDA0004194083620001963
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,SOS1抑制剂是化合物SOS1-(B)或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
SOS1抑制剂的剂量可在足以引起反应的剂量至最大耐受剂量的范围内。当用于指定作用时,根据治疗疾患的需求,所公开化合物的有效剂量在约0.5mg至约5000mg所公开化合物的范围内。供体内或体外使用的组合物可含有约0.5mg、5mg、20mg、50mg、75mg、100mg、150mg、250mg、500mg、750mg、1000mg、1250mg、2500mg、3500mg或5000mg所公开化合物或在剂量清单中的一种量至另一种量的范围内,如100mg至1300mg、200mg至1300mg、600mg至1300mg、700mg至1200mg或800mg至1000mg。在一个实施方案中,组合物呈带刻痕的片剂形式。SOS1抑制剂可每天一次、每天两次、每天三次或每天四次给予。在一些方面,SOS1抑制剂是每天一次给予。在一些方面,SOS1抑制剂是每天两次给予。给药可与或不与食物一起进行。给药时程可适宜地为在28天时程内每天给予,或在28天的时程内给予21天或更长时间。
SHP2突变,例如活化性SHP2突变可以在施用SHP2抑制剂,例如别构SHP2抑制剂的患者体内诱导RAS/MAPK信号传导路径再活化以及针对SHP2抑制剂的药物抗性以治疗肿瘤或癌症。本发明适合治疗患有以SHP2突变,例如活化性SHP2突变为特征的癌症的患者,并因此对SHP2抑制剂,例如别构SHP2抑制剂产生药物抗性。截至目前的经验证据表明,SHP2突变,例如活化性SHP2突变增加对SOS1的依赖性,并因此,可增加对SOS1抑制剂,如BI-3406、BI-1701963和化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体的敏感性。因此,根据本发明的方法的治疗策略涉及通过施用治疗有效量的SOS1抑制剂有效治疗患者的在SHP2中具有活化性突变的癌症。
根据本发明的实施方案,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的SOS1抑制剂以治疗肿瘤或癌症。在一些实施方案中,所述疾病或病症选自由以下组成的组:造血系统和淋巴系统肿瘤;骨髓增生综合征;骨髓增生异常综合征;白血病;急性骨髓性白血病;急性B淋巴母细胞性白血病-淋巴瘤;幼年型粒单核细胞性白血病;食道癌;乳癌;肺癌;结肠癌;胃癌;成神经细胞瘤;膀胱癌;前列腺癌;胶质母细胞瘤;尿路上皮癌;子宫癌;腺样和卵巢浆液性囊腺癌;副神经节瘤;嗜铬细胞瘤;胰腺癌;肾上腺皮质癌;胃腺癌;肉瘤;横纹肌肉瘤;淋巴瘤;头颈癌;皮肤癌;腹膜癌;肠癌(例如小肠癌和/或大肠癌);甲状腺癌;子宫内膜癌;胆管癌;软组织癌;卵巢癌;中枢神经系统癌(例如原发性CNS淋巴瘤);胃癌;垂体癌;生殖道癌;泌尿道癌;唾液腺癌;子宫颈癌;肝癌;眼癌;肾上腺癌;自主神经节癌;上呼吸消化道癌;骨癌;睾丸癌;胸膜癌;肾癌;阴茎癌;甲状旁腺癌;脑膜癌;外阴癌;及黑色素瘤。在一些实施方案中,所述疾病或病症选自脑胶质母细胞瘤、肺腺癌、结肠腺癌、骨髓白血病、急性髓细胞性白血病(AML)、乳癌、未知原发部位的黑色素瘤、非小细胞肺癌(NSCLC)、皮肤黑色素瘤、乳腺浸润性导管癌、肺鳞状细胞癌、未知原发部位腺癌、骨髓多发性骨髓瘤、食管胃结合部腺癌、骨髓增生异常综合征、前列腺腺泡性腺癌、膀胱尿路上皮(移行细胞)癌、子宫内膜腺癌、急性骨髓B细胞白血病、急性B淋巴母细胞性白血病-淋巴瘤、胃腺癌及未知原发部位癌瘤。在一些实施方案中,所述疾病或病症选自由以下组成的组:AML、肺腺癌、非小细胞肺癌、脑胶质母细胞瘤、骨髓增生异常综合征、皮肤黑色素瘤、乳癌、胃腺癌、急性B淋巴母细胞性白血病-淋巴瘤及结肠腺癌。
在一些实施方案中,所述疾病或病症是急性髓细胞性白血病(AML)。在一些实施方案中,所述疾病或病症是AML并且SHP2突变在选自由以下组成的组的位置处:G60、D61、A72、E76、G503和S502,以及其组合,并且所述方法任选还包括向受试者施用治疗有效量的SHP2抑制剂(例如RMC-4630或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体)和RAS(ON)抑制剂,如附录B的RAS(ON)G12C抑制剂(例如附录B中表1或表2的化合物)或附录A的RAS(ON)MULTI抑制剂(例如附录A中表1或表2的化合物)。参见例如Alfayez等人,Leukemia 35:691-700(2021)。
在一些实施方案中,所述疾病或病症选自由以下组成的组:AML、肺腺癌、非小细胞肺癌、脑胶质母细胞瘤、骨髓增生异常综合征、皮肤黑色素瘤、乳癌、胃腺癌、急性B淋巴母细胞性白血病-淋巴瘤及结肠腺癌,SHP2突变在选自由以下组成的组的位置处:G60、D61、E69、A72、E123、Y197、N308、V428、A461、T468、S502、G503、T507(例如A72、E76或G503;或例如G60V、D61G、D61V、D61Y、E69K、E69Q、A72S、A72T、A72V、E123D、N308D、V428M、A461T、A461G、T468M、S502L、S502P、G503A、G503V、T507K),并且所述方法任选还包括向受试者施用治疗有效量的SHP2抑制剂(例如RMC-4630或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体)和RAS(ON)抑制剂,如附录B的RAS(ON)G12C抑制剂(例如附录B中表1或表2的化合物)或附录A的RAS(ON)MULTI抑制剂(例如附录A中表1或表2的化合物)。
活化性SHP2突变已与发展中的RAS蛋白病的病理学,如努南氏综合征和莱帕德综合征相关联。也已在其它RAS蛋白病中鉴别出SHP2突变。根据本发明的实施方案,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的SOS1抑制剂以治疗RAS蛋白病。在一些实施方案中,RAS蛋白病选自由以下组成的组:1型神经纤维瘤病、努南氏综合征、努南氏综合征伴多发性雀斑、毛细管畸形-动静脉畸形综合征、克斯提洛氏综合征(Costello Syndrome)、心-面-皮肤综合征、莱克斯综合征(Legius Syndrome)及遗传性牙龈纤维瘤病。在一些实施方案中,RAS蛋白病在选自由以下组成的组的位置处包含SHP2突变:T52、I56、Y62、Y63、E69、K70、E139、L261、R265、N308、T468、M504、Q510(例如T52I、I56V、Y62D、Y63D、Y63C、E69K、E69Q、K70R、E139D、L261F、L261H、R265Q、N308D、T468M、M504V、Q510P、Q510H)。根据本发明的实施方案,所述方法包括向受试者施用治疗有效量的SOS1抑制剂以治疗努南氏综合征或莱帕德综合征。
RAS和RAS突变
在一些实施方案中,本发明的方法还包括向受试者施用治疗有效量的选自由以下组成的组的RAS抑制剂:RAS(ON)抑制剂、RAS(OFF)抑制剂、MRTX1133或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,及其组合。在一些实施方案中,RAS蛋白是野生型的,并且RAS抑制剂靶向野生型RAS蛋白。在一些实施方案中,RAS抑制剂靶向KRAS、NRAS或HRAS。在一些实施方案中,RAS抑制剂靶向KRAS、NRAS或HRAS中的两者或更多者。
在一些实施方案中,RAS抑制剂靶向具有突变的RAS蛋白。在一些实施方案中,RAS抑制剂是RAS突变体特异性抑制剂。在一些实施方案中,RAS抑制剂靶向KRAS突变体、NRAS突变体或HRAS突变体。在某些实施方案中,RAS突变体选自:
(a)以下K-Ras突变体:G12D、G12V、G12C、G13D、G12R、G12A、Q61H、G12S、A146T、G13C、Q61L、Q61R、K117N、A146V、G12F、Q61K、L19F、Q22K、V14I、A59T、A146P、G13R、G12L、Y96D或G13V,及其组合;
(b)以下H-Ras突变体:Q61R、G13R、Q61K、G12S、Q61L、G12D、G13V、G13D、G12C、K117N、A59T、G12V、G13C、Q61H、G13S、A18V、D119N、G13N、A146T、A66T、G12A、A146V、G12N或G12R,及其组合;以及
(c)以下N-Ras突变体:Q61R、Q61K、G12D、Q61L、Q61H、G13R、G13D、G12S、G12C、G12V、G12A、G13V、G12R、P185S、G13C、A146T、G60E、Q61P、A59D、E132K、E49K、T50I、A146V或A59T,及其组合;
或前述中任一者的组合(例如K-Ras G12C和K-Ras G13C)。在一些实施方案中,癌症包含选自由以下组成的组的Ras突变:G12C、G13C、G12A、G12D、G13D、G12S、G13S、G12V和G13V。在一些实施方案中,癌症包含至少两个选自由以下组成的组的Ras突变:G12C、G13C、G12A、G12D、G13D、G12S、G13S、G12V和G13V。在一些实施方案中,癌症至少包含G12C突变和Y96D突变。在这些位置处的突变可引起RAS驱动的肿瘤。
在一些实施方案中,RAS抑制剂靶向野生型RAS蛋白。在一些实施方案中,RAS抑制剂靶向RASamp。在一些实施方案中,RAS蛋白是KRAS。在一些实施方案中,RAS蛋白是NRAS。在一些实施方案中,RAS抑制剂靶向KRAS蛋白和NRAS蛋白。在一些实施方案中,RAS抑制剂靶向RAS蛋白突变。在一些实施方案中,RAS蛋白突变在选自由以下组成的组的位置处:G12、G13、Q61、A146、K117、L19、Q22、V14、A59及其组合。在一些实施方案中,突变在选自由G12、G13和Q61组成的组的位置处。在一些实施方案中,突变选自由以下组成的组:G12C、G12D、G12A、G12S、G12V、G13C、G13D、Q61K和Q61L。
RAS抑制剂
根据本公开的一些实施方案,所述方法包括通过向受试者施用以下各物来治疗患有与具有SHP2突变的细胞相关的疾病或病症的受试者:(a)治疗有效量的SOS1抑制剂或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体;和(b)治疗有效量的RAS抑制剂,所述RAS抑制剂选自由以下组成的组:RAS(ON)抑制剂、RAS(OFF)抑制剂、MRTX1133或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,及其组合。
在一些实施方案中,RAS抑制剂是本领域中已知或本文所公开的RAS(OFF)抑制剂。RAS(OFF)抑制剂可以是以下任一者中所公开的RAS(OFF)抑制剂中的一种或多种:WO2021168193、WO 2021158071、WO 2021155716、WO 2021152149、WO 2021150613、WO2021147967、WO 2021147965、WO 2021143693、WO 2021142252、WO 2021141628、WO2021139748、WO 2021139678、WO 2021129824、WO 2021129820、WO 2021127404、WO2021126816、WO 2021126799、WO 2021124222、WO 2021121371、WO 2021121367、WO2021121330、WO 2021120890、WO 2021120045、WO 2021119343、WO 2021118877、WO2021113595、WO 2021107160、WO 2021106231、WO 2021106230、WO 2021104431、WO2021088458、WO 2021086833、WO 2021085653、WO 2021084765、WO 2021081212、WO2021058018、WO 2021057832、WO 2021055728、WO 2021041671、WO 2021031952、WO2021027911、WO 2021023247、WO 2020259513、WO 2020259432、WO 2020234103、WO2020233592、WO 2020216190、WO 2020178282、WO 2020146613、WO 2020118066、WO2020113071、WO 2020106647、WO 2020106640、WO 2020102730、WO 2020101736、WO2020097537、WO 2020086739、WO 2020018282、WO 2020050890、WO 2020047192、WO2020035031、WO 2020033413、WO 2020028706、WO 2019241157、WO 2019234405、WO2019232419、WO 2019227040、WO 2019217933、WO 2019217691、WO 2019217307、WO2019215203、WO 2019213526、WO 2019213516、WO 2019204442、WO 2019204449、WO2019204505、WO 2019155399、WO 2019150305、WO 2019137985、WO 2019110751、WO2019099524、WO 2019055540、WO 2019051291、WO 2018237084、WO 2018218070、WO2018217651、WO 2018218071、WO 2018218069、WO 2018212774、WO 2018206539、WO2018195439、WO 2018143315、WO 2018140600、WO 2018140599、WO 2018140598、WO2018140514、WO 2018140513、WO 2018140512、WO 2018119183、WO 2018112420、WO2018068017、WO 2018064510、WO 2018011351、WO 2018005678、WO 2017201161、WO20171937370、WO 2017172979、WO 2017112777、WO 2017106520、WO 2017096045、WO2017100546、WO 2017087528、WO 2017079864、WO 2017058807、WO 2017058805、WO2017058728、WO 2017058902、WO 2017058792、WO 2017058768、WO 2017058915、WO2017015562、WO 2016179558、WO 2016176338、WO 2016168540、WO 2016164675、WO2016100546、WO 2016049568、WO 2016049524、WO 2015054572、WO 2014152588、WO2014143659和WO 2013155223,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,各案以全文引用的方式并入本文中。在一些实施方案中,RAS(OFF)抑制剂选自索托拉西布(sotorasib)(AMG 510)、阿达格拉西布(adagrasib)(MRTX849)、MRTX1257、JNJ-74699157(ARS-3248)、LY3537982、ARS-853、ARS-1620、GDC-6036、BPI-421286、JDQ443和JAB-21000,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。在一些实施方案中,RAS(OFF)抑制剂选择性靶向RAS G12C。
在一些实施方案中,本文所描述的组合物和方法利用RAS抑制剂,该抑制剂是本领域中已知或本文所公开的RAS(ON)抑制剂。在一些实施方案中,RAS抑制剂是RAS(ON)抑制剂。在一些实施方案中,RAS(ON)抑制剂是对RAS G12C、RAS G13D或RAS G12D具有选择性的抑制剂。在一些实施方案中,RAS(ON)抑制剂是RAS(ON)MULTI抑制剂。
RAS(ON)抑制剂可以是以下中的任一者或多者:WO 2020/132597中所公开的RAS(ON)抑制剂,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,或者附录A、B、C或D中的任一者,或附录A、B、C或D中的任一者的式所描述的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,RAS抑制剂是附录A中所公开的化合物。在一些实施方案中,RAS(ON)抑制剂是附录A中的式I所描述的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。在一些实施方案中,RAS(ON)抑制剂选自附录A的表1或表2的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,RAS抑制剂是附录B中所公开的化合物。在一些实施方案中,RAS(ON)抑制剂是附录B中的式I所描述的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。在一些实施方案中,RAS(ON)抑制剂选自附录B的表1或表2的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,RAS抑制剂是附录C中所公开的化合物。在一些实施方案中,RAS(ON)抑制剂是附录C中的式I所描述的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。在一些实施方案中,RAS(ON)抑制剂选自附录C的表1或表2的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,RAS抑制剂是附录D中所公开的化合物。在一些实施方案中,RAS(ON)抑制剂是附录C中的式I所描述的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。在一些实施方案中,RAS(ON)抑制剂选自附录D的表1或表1-1的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,RAS抑制剂选自由以下组成的组:化合物RAS-(A)(附录B的RAS(ON)G12C抑制剂)、化合物RAS-(B)(附录B的RAS(ON)G12C抑制剂)、化合物RAS-(C)(附录B的RAS(ON)G13C抑制剂)、化合物RAS-(D)(附录A的RAS(ON)MULTI抑制剂)、化合物RAS-(E)(附录D的RAS(ON)MULTI抑制剂),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体,及其组合。应理解,化合物RAS-(A)、化合物RAS-(B)、化合物RAS-(C)、化合物RAS-(D)、化合物RAS-(E)中的任一者可见于附录A、B、C和D中的任一者中。因此,应理解,提到RAS化合物的字母(例如RAS-(A))未必指示所述化合物可见于对应附录(例如附录A)。
在一些实施方案中,RAS抑制剂是化合物RAS-(A)或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,RAS抑制剂是化合物RAS-(B)或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,RAS抑制剂是化合物RAS-(C)或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,RAS抑制剂是化合物RAS-(D)或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,RAS抑制剂是化合物RAS-(E)或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,RAS抑制剂对在RAS蛋白的位置12或13处的突变具有选择性。在一些实施方案中,RAS抑制剂选择性靶向RAS G12D。在一些实施方案中,RAS抑制剂是MRTX1133或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
RAS抑制剂的剂量可在足以引起反应的剂量至最大耐受剂量的范围内。当用于指定作用时,根据治疗疾患的需求,所公开化合物的有效剂量在约0.5mg至约5000mg所公开化合物的范围内。供体内或体外使用的组合物可含有约0.5mg、5mg、20mg、50mg、75mg、100mg、150mg、250mg、500mg、750mg、1000mg、1250mg、2500mg、3500mg或5000mg所公开化合物或在剂量清单中的一种量至另一种量的范围内,如100mg至1300mg、200mg至1300mg、600mg至1300mg、700mg至1200mg或800mg至1000mg。在一个实施方案中,组合物呈带刻痕的片剂形式。RAS抑制剂可每天一次、每天两次、每天三次或每天四次给予。在一些方面,RAS抑制剂是每天一次给予。在一些方面,RAS抑制剂是每天两次给予。给药可与或不与食物一起进行。给药时程可适宜地为在28天时程内每天给予,或在28天的时程内给予21天或更长时间。
RAS抑制剂和SOS1抑制剂的示例性组合
在一些实施方案中,所述方法包括施用RAS抑制剂和SOS1抑制剂的组合。此类抑制剂的示例性非限制性组合包括以下。
在一个实施方案中,(a)SOS1抑制剂是具有以下结构的化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331):
Figure BDA0004194083620002061
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体;并且(b)RAS抑制剂是化合物RAS-(C),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一个实施方案中,(a)SOS1抑制剂是具有以下结构的化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331):
Figure BDA0004194083620002071
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体;并且(b)RAS抑制剂是化合物RAS-(D),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一个实施方案中,(a)SOS1抑制剂是化合物SOS1-(B)或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体;并且(b)RAS抑制剂是化合物RAS-(B),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一个实施方案中,(a)SOS1抑制剂是化合物SOS1-(B)或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体;并且(b)RAS抑制剂是化合物RAS-(E),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一个实施方案中,(a)SOS1抑制剂是具有以下结构的BI-3406:
Figure BDA0004194083620002072
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体;并且(b)RAS抑制剂是化合物RAS-(A),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一个实施方案中,(a)SOS1抑制剂是具有以下结构的BI-3406:
Figure BDA0004194083620002081
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体;并且(b)RAS抑制剂是化合物RAS-(C),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一些实施方案中,(a)SOS1抑制剂是BI-1701963或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体;并且(b)RAS抑制剂选自由以下组成的组:化合物RAS-(A)、化合物RAS-(B)、化合物RAS-(C)、化合物RAS-(D)、化合物RAS-(E)和其组合,或上述任一者的药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一个实施方案中,(a)SOS1抑制剂是BI-1701963或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体;并且(b)RAS抑制剂是化合物RAS-(A),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一个实施方案中,(a)SOS1抑制剂是BI-1701963或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体;并且(b)RAS抑制剂是化合物RAS-(B),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一个实施方案中,(a)SOS1抑制剂是BI-1701963或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体;并且(b)RAS抑制剂是化合物RAS-(C),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一个实施方案中,(a)SOS1抑制剂是BI-1701963或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体;并且(b)RAS抑制剂是化合物RAS-(D),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
在一个实施方案中,(a)SOS1抑制剂是BI-1701963或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体;并且(b)RAS抑制剂是化合物RAS-(E),或其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
额外组合疗法
在一些实施方案中,向受试者共施用治疗有效量的额外治疗剂。对于这一额外组合疗法部分中的任何化合物,应理解,也涵盖其药学上可接受的盐、溶剂化物、异构体(例如立体异构体)、前药或互变异构体。
例如,治疗剂可以是类固醇。因此,在一些实施方案中,所述一种或多种额外疗法包括类固醇。适合类固醇可包括但不限于21-乙酰氧基孕烯醇酮(acetoxypregnenolone)、阿氯米松(alclometasone)、阿尔孕酮(algestone)、安西奈德(amcinonide)、倍氯米松(beclomethasone)、倍他米松(betamethasone)、布地奈德(budesonide)、氯泼尼松(chloroprednisone)、氯倍他索(clobetasol)、氯可托龙(clocortolone)、氯泼尼醇(cloprednol)、皮质酮(corticosterone)、可的松(cortisone)、可的伐唑(cortivazol)、地夫可特(deflazacort)、地奈德(desonide)、去羟米松(desoximetasone)、地塞米松(dexamethasone)、二氟拉松(diflorasone)、二氟可龙(diflucortolone)、二氟孕甾丁酯(difuprednate)、甘草次酸(enoxolone)、氟扎可特(fluazacort)、氟氯奈德(fiucloronide)、氟米松(flumethasone)、氟尼缩松(flunisolide)、氟西奈德(fluocinolone acetonide)、醋酸氟轻松(fluocinonide)、氟可丁丁酯(fluocortinbutyl)、氟可龙(fluocortolone)、氟米龙(fluorometholone)、醋酸氟培龙(fluperoloneacetate)、醋酸氟泼尼定(fluprednidene acetate)、氟泼尼龙(fluprednisolone)、氟氢缩松(flurandrenolide)、丙酸氟替卡松(fluticasone propionate)、福莫可他(formocortal)、哈西奈德(halcinonide)、丙酸卤倍他索(halobetasol propionate)、卤米松(halometasone)、氢化可的松(hydrocortisone)、依碳酸氯替泼诺(loteprednoletabonate)、马泼尼酮(mazipredone)、甲羟松(medrysone)、甲泼尼松(meprednisone)、甲泼尼龙(methylprednisolone)、糠酸莫米他松(mometasone furoate)、帕拉米松(paramethasone)、泼尼卡酯(prednicarbate)、泼尼松龙(prednisolone)、25-二乙基氨基乙酸泼尼松龙、泼尼松龙磷酸钠、泼尼松(prednisone)、戊酸泼尼松龙(prednival)、泼尼立定(prednylidene)、利美索龙(rimexolone)、替可的松(tixocortol)、曲安西龙(triamcinolone)、曲安奈德(triamcinolone acetonide)、苯曲安奈德(triamcinolonebenetonide)、己曲安奈德(triamcinolone hexacetonide),以及其盐或衍生物。
可用于组合疗法中的治疗剂的其它实例包括以下专利中所描述的化合物:美国专利第6,258,812号、第6,630,500号、第6,515,004号、第6,713,485号、第5,521,184号、第5,770,599号、第5,747,498号、第5,990,141号、第6,235,764号及第8,623,885号,以及国际专利申请WO01/37820、WO01/32651、WO02/68406、WO02/66470、WO02/55501、WO04/05279、WO04/07481、WO04/07458、WO04/09784、WO02/59110、WO99/45009、WO00/59509、WO99/61422、WO00/12089和WO00/02871。
治疗剂可以是用于治疗癌症或其相关症状的生物制剂(例如细胞因子(例如干扰素或白细胞介素,如IL-2))。在一些实施方案中,所述生物制剂是基于免疫球蛋白的生物制剂,例如使靶激动以刺激抗癌反应或拮抗对于癌症很重要的抗原的单克隆抗体(例如人源化抗体、完全人抗体、Fc融合蛋白或其功能片段)。也包括抗体-药物缀合物。
治疗剂可以是检查点抑制剂。在一个实施方案中,所述检查点抑制剂是抑制剂性抗体(例如单特异性抗体,如单克隆抗体)。抗体可以是例如人源化或完全人抗体。在一些实施方案中,检查点抑制剂是融合蛋白,例如Fc-受体融合蛋白。在一些实施方案中,检查点抑制剂是与检查点蛋白质相互作用的药剂,如抗体。在一些实施方案中,检查点抑制剂是与检查点蛋白质的配体相互作用的药剂,如抗体。在一些实施方案中,检查点抑制剂是CTLA-4抑制剂(例如抑制性抗体或小分子抑制剂)(例如抗CTLA-4抗体或融合蛋白)。在一些实施方案中,检查点抑制剂是PD-1抑制剂或拮抗剂(例如抑制性抗体或小分子抑制剂)。在一些实施方案中,检查点抑制剂是PDL-1抑制剂或拮抗剂(例如抑制性抗体或小分子抑制剂)。在一些实施方案中,检查点抑制剂是PDL-2抑制剂或拮抗剂(例如抑制性抗体或Fc融合物或小分子抑制剂)(例如PDL-2/Ig融合蛋白)。在一些实施方案中,检查点抑制剂是以下各物的抑制剂或拮抗剂(例如抑制性抗体或小分子抑制剂):B7-H3、B7-H4、BTLA、HVEM、TIM3、GAL9、LAG3、VISTA、KIR、2B4、CD160、CGEN-15049、CHK 1、CHK2、A2aR、B-7家族配体或其组合。在一些实施方案中,检查点抑制剂是派姆单抗(pembrolizumab)、纳武单抗(nivolumab)、西米普利单抗(cemiplimab)、PDR001(NVS)、REGN2810(Sanofi/Regeneron)、PD-L1抗体如阿维鲁单抗(avelumab)、德瓦鲁单抗(durvalumab)、阿特珠单抗(atezolizumab)、匹地利珠单抗(pidilizumab)、JNJ-63723283(JNJ)、BGB-A317(BeiGene&Celgene),或Preusser,M.等人(2015)Nat.Rev.Neurol.中所公开的检查点抑制剂,包括但不限于伊匹单抗(ipilimumab)、曲美目单抗(tremelimumab)、纳武单抗、派姆单抗、AMP224、AMP514/MEDI0680、BMS936559、MEDl4736、MPDL3280A、MSB0010718C、BMS986016、IMP321、利瑞鲁单抗(lirilumab)、IPH2101、1-7F9及KW-6002。在一些实施方案中,PD-1抑制剂可以是JTX-4014、斯巴达珠单抗(spartalizumab)、卡瑞利珠单抗(camrelizumab)、信迪利单抗(sintilimab)、替雷利珠单抗(tislelizumab)、特瑞普利单抗(toripalimab)、多塔利单抗(dostarlimab)、INCMGA00012、AMP-224或AMP-514。
治疗剂可以是治疗癌症或其相关症状的药剂(例如细胞毒性剂、非肽小分子或可用于治疗癌症或其相关症状的其它化合物,统称为“抗癌剂”)。抗癌剂可以是例如化学治疗剂或靶向治疗剂。
抗癌剂包括有丝分裂抑制剂、插入性抗生素、生长因子抑制剂、细胞周期抑制剂、酶、拓扑异构酶抑制剂、生物反应调节剂、烷化剂、抗代谢物、叶酸类似物、嘧啶类似物、嘌呤类似物及相关抑制剂、长春花生物碱(vinca alkaloid)、表鬼臼毒素、抗生素、L-天冬酰胺酶、拓扑异构酶抑制剂、干扰素、铂配位络合物、蒽二酮取代的尿素、甲基肼衍生物、肾上腺皮质抑制剂、肾上腺皮质类固醇、黄体素、雌激素、抗雌激素、雄激素、抗雄激素以及促性腺激素释放激素类似物。其它抗癌剂包括甲酰四氢叶酸(leucovorin,LV)、伊立替康(irenotecan)、奥沙利铂(oxaliplatin)、卡培他滨(capecitabine)、太平洋紫杉醇(paclitaxel)及多西他赛(doxetaxel)。在一些实施方案中,所述一种或多种额外疗法包括两种或更多种抗癌剂。所述两种或更多种抗癌剂可用于混合液中以组合施用或分开施用。组合抗癌剂的适合给药方案是本领域中已知的并且描述于例如Saltz等人,Proc.Am.Soc.Clin.Oncol.18:233a(1999);以及Douillard等人,Lancet 355(9209):1041-1047(2000)中。
抗癌剂的其它非限制性实例包括
Figure BDA0004194083620002121
(甲磺酸伊马替尼(ImatinibMesylate));/>
Figure BDA0004194083620002122
(卡非佐米(carfilzomib));/>
Figure BDA0004194083620002123
(硼替佐米(bortezomib));Casodex(比卡鲁胺(bicalutamide));/>
Figure BDA0004194083620002124
(吉非替尼(gefitinib));烷化剂,例如噻替哌(thiotepa)和环磷酰胺;烷基磺酸酯,例如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)和哌泊舒凡(piposulfan);氮杂环丙烷,例如苯佐替哌(benzodopa)、卡波醌(carboquone)、美妥替哌(meturedopa)和乌瑞替哌(uredopa);乙烯亚胺和甲基蜜胺,包括六甲蜜胺(altretamine)、三乙烯蜜胺、三乙烯磷酰胺、三乙烯硫代磷酰胺和三羟甲基蜜胺;多聚乙酰(尤其是布拉他辛(bullatacin)和布拉他辛酮(bullatacinone));喜树碱(camptothecin)(包括合成类似物拓扑替康(topotecan));苔藓抑素(bryostatin);卡利他汀(callystatin);CC-1065(包括其阿多来新(adozelesin)、卡折来新(carzelesin)和比折来新(bizelesin)合成类似物);念珠藻素(cryptophycin)(特别是念珠藻素1和念珠藻素8);海兔毒素(dolastatin);倍癌霉素(duocarmycin)(包括合成类似物、KW-2189和CB1-TM1);伊斯罗宾(eleutherobin);水鬼蕉碱(pancratistatin);匍枝珊瑚醇A(sarcodictyin A);海绵抑素(spongistatin);氮芥,例如苯丁酸氮芥(chlorambucil)、萘氮芥(chlornaphazine)、胆磷酰胺(cholophosphamide)、雌莫司汀(estramustine)、异环磷酰胺(ifosfamide)、甲氮芥(mechlorethamine)、氧化甲氮芥盐酸盐(mechlorethamine oxidehydrochloride)、美法仑(melphalan)、新恩比兴(novembichin)、苯芥胆甾醇(phenesterine)、泼尼莫司汀(prednimustine)、曲磷胺(trofosfamide)、乌拉莫司汀(uracil mustard);亚硝基脲,例如卡莫司汀(carmustine)、氯脲霉素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)及雷诺莫司汀(ranimustine);抗生素,例如烯二炔类抗生素(例如刺孢霉素(calicheamicin),例如刺孢霉素γll和刺孢霉素ωll(参见例如Agnew,Chem.Intl.Ed Engl.33:183-186(1994));达内霉素(dynemicin),例如达内霉素A;双膦酸盐,例如氯屈膦酸盐(clodronate);埃斯波霉素(esperamicin);新制癌菌素发色团(neocarzinostatin chromophore)及相关色蛋白烯二炔抗生素发色团、阿克拉霉素(aclacinomysin)、放线菌素(actinomycin)、安曲霉素(authramycin)、氮杂丝氨酸(azaserine)、博来霉素(bleomycin)、放线菌素C(cactinomycin)、刺孢霉素(calicheamicin)、卡拉比星(carabicin)、卡米诺霉素(caminomycin)、洋红霉素(carminomycin)、嗜癌菌素(carzinophilin)、色霉素(chromomycins)、放线菌素D(dactinomycin)、道诺霉素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮-5-氧代-L-正亮氨酸、阿德力霉素(adriamycin)(多柔比星)、吗啉代多柔比星、氰基(吗啉代)多柔比星、2-吡咯啉基-多柔比星、去氧多柔比星、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、伊达比星(idarubicin)、麻西罗霉素(marcellomycin)、丝裂霉素(mitomycin)(例如丝裂霉素C)、霉酚酸(mycophenolic acid)、诺拉霉素(nogalamycin)、橄榄霉素(olivomycin)、培洛霉素(peplomycin)、泊非霉素(potfiromycin)、嘌呤霉素(puromycin)、三铁阿霉素(quelamycin)、罗多比星(rodorubicin)、链黑霉素(streptonigrin)、链佐星(streptozocin)、杀结核菌素(tubercidin)、乌苯美司(ubenimex)、净司他丁(zinostatin)、左柔比星(zorubicin);抗代谢物,例如胺甲蝶呤(methotrexate)和5-氟尿嘧啶(5-FU);叶酸类似物,例如二甲叶酸(denopterin)、蝶罗呤(pteropterin)、三甲曲沙(trimetrexate);嘌呤类似物,例如氟达拉滨(fludarabine)、6-巯基嘌呤、硫咪嘌呤(thiamiprine)、硫鸟嘌呤(thioguanine);嘧啶类似物,例如安西他滨(ancitabine)、阿扎胞苷(azacitidine)、6-硫唑嘧啶、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、双去氧尿苷、去氧氟尿苷(doxifluridine)、依诺他滨(enocitabine)、氟尿苷(floxuridine);雄激素,例如卡普睪酮(calusterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、环硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睪内酯(testolactone);抗肾上腺素,例如氨鲁米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane);叶酸补充剂,例如亚叶酸(frolinic acid);醋葡醛内酯(aceglatone);醛磷酰胺糖苷(aldophosphamide glycoside);氨基乙酰丙酸(aminolevulinic acid);恩尿嘧啶(eniluracil);安吖啶(amsacrine);阿莫司汀(bestrabucil);比生群(bisantrene);伊达曲沙(edatraxate);地磷酰胺(defofamine);秋水仙胺(demecolcine);地吖醌(diaziquone);依氟米星(elfomithine);依利醋铵(elliptinium acetate);艾普塞隆(epothilone),例如艾普塞隆B;依托格鲁(etoglucid);硝酸镓;羟基脲;香菇多糖(lentinan);氯尼达明(lonidamine);类美登醇(maytansinoid),例如美登素(maytansine)和安丝菌素(ansamitocin);米托胍腙(mitoguazone);米托蒽醌(mitoxantrone);莫哌达醇(mopidamol);尼曲吖啶(nitracrine);喷司他丁(pentostatin);蛋胺氮芥(phenamet);比柔比星(pirarubicin);洛索蒽醌(losoxantrone);鬼臼酸(podophyllinic acid);2-乙基酰肼;丙卡巴肼(procarbazine);
Figure BDA0004194083620002141
多糖复合物(JHS Natural Products,Eugene,OR);雷佐生(razoxane);根瘤菌素(rhizoxin);西佐喃(sizofiran);锗螺胺(spirogermanium);细交链孢菌酮酸(tenuazonicacid);三亚胺醌(triaziquone);2,2',2”-三氯三乙胺;单端孢霉烯(trichothecene),例如T-2毒素、疣孢霉素A(verracurin A)、漆斑菌素A(roridin A)和蛇形菌素(anguidine);乌拉坦(urethane);长春地辛(vindesine);达卡巴嗪(dacarbazine);甘露莫司汀(mannomustine);二溴甘露醇(mitobronitol);二溴卫矛醇(mitolactol);哌泊溴烷(pipobroman);加西托肽(gacytosine);阿拉伯糖苷(arabinoside)(“Ara-C”);环磷酰胺;噻替哌;类紫杉醇(taxoid),例如/>
Figure BDA0004194083620002151
(太平洋紫杉醇)、/>
Figure BDA0004194083620002152
(不含聚氧乙烯氢化蓖麻油、白蛋白工程改造过的太平洋紫杉醇的纳米粒子配制物)和/>
Figure BDA0004194083620002153
(多西他赛);苯丁酸氮芥(chloranbucil);他莫昔芬(tamoxifen)(NolvadexTM);拉洛昔芬(raloxifene);芳香酶抑制性4(5)-咪唑;4-羟基他莫昔芬;曲沃昔芬(trioxifene);科沃昔芬(keoxifene);LY 117018;奥那斯酮(onapristone);托瑞米芬(toremifene)
Figure BDA0004194083620002154
氟他胺(flutamide)、尼鲁胺(nilutamide)、比卡鲁胺(bicalutamide)、亮丙立德(leuprolide)、戈舍瑞林(goserelin);苯丁酸氮芥;/>
Figure BDA0004194083620002155
吉西他滨(gemcitabine);6-硫鸟嘌呤;巯基嘌呤;铂配位络合物,例如顺铂(cisplatin)、奥沙利铂(oxaliplatin)和卡铂(carboplatin);长春花碱(vinblastine);铂;依托泊苷(etoposide)(VP-16);异环磷酰胺;米托蒽醌;长春新碱(vincristine);/>
Figure BDA0004194083620002156
(长春瑞宾(vinorelbine));能灭瘤(novantrone);替尼泊苷(teniposide);依达曲沙(edatrexate);道诺霉素(daunomycin);氨基蝶呤(aminopterin);伊班膦酸盐(ibandronate);伊立替康(irinotecan)(例如CPT-11);拓扑异构酶抑制剂RFS 2000;二氟甲基鸟氨酸(DMFO);类视黄醇,例如视黄酸;埃斯波霉素(esperamicins);卡培他滨(例如/>
Figure BDA0004194083620002157
);以及上述任一者的药学上可接受的盐。
抗癌剂的额外非限制实例包括曲妥珠单抗(trastuzumab)
Figure BDA0004194083620002158
贝伐珠单抗(bevacizumab)/>
Figure BDA0004194083620002159
西妥昔单抗(cetuximab)/>
Figure BDA00041940836200021510
利妥昔单抗(rituximab)/>
Figure BDA00041940836200021511
Figure BDA00041940836200021512
ABVD、勒樘碱(avicine)、阿巴伏单抗(abagovomab)、吖啶甲酰胺(acridine carboxamide)、阿德木单抗(adecatumumab)、17-N-烯丙基氨基-17-去甲氧基格尔德霉素(demethoxygeldanamycin)、阿法拉丁(alpharadin)、艾沃昔布(alvocidib)、3-氨基吡啶-2-甲醛硫代半卡巴腙(thiosemicarbazone)、胺萘非特(amonafide)、蒽二酮(anthracenedione)、抗CD22免疫毒素、抗肿瘤药(例如细胞周期非特异性抗肿瘤剂以及其它本文所描述的抗肿瘤剂)、抗肿瘤发生草药、阿帕齐醌(apaziquone)、阿替莫德(atiprimod)、硫唑嘌呤(azathioprine)、贝洛替康(belotecan)、苯达莫司汀(bendamustine)、BIBW 2992、比立考达(biricodar)、溴他立辛(brostallicin)、苔藓抑素(bryostatin)、丁硫氨酸亚砜亚胺(buthionine sulfoximine)、CBV(化学疗法)、海绵诱癌素(calyculin)、二氯乙酸、盘皮海绵内酯(discodermolide)、依沙芦星(elsamitrucin)、依诺他滨(enocitabine)、艾日布林(eribulin)、依沙替康(exatecan)、依昔舒林(exisulind)、弥罗松酚(ferruginol)、呋咯地辛(forodesine)、磷雌酚(fosfestrol)、ICE化学疗法方案、IT-101、伊美克(imexon)、咪喹莫特(imiquimod)、吲哚并咔唑(indolocarbazole)、伊洛福芬(irofulven)、兰尼奎达(laniquidar)、拉洛他赛(larotaxel)、雷利米得(lenalidomide)、甲硫蒽酮(lucanthone)、勒托替康(lurtotecan)、马磷酰胺(mafosfamide)、米托唑胺(mitozolomide)、萘克沙朵(nafoxidine)、奈达铂(nedaplatin)、奥拉帕尼(olaparib)、奥他赛(ortataxel)、PAC-1、木瓜、匹杉琼(pixantrone)、蛋白酶体抑制剂、蝴蝶霉素(rebeccamycin)、瑞喹莫德(resiquimod)、鲁比替康(rubitecan)、SN-38、盐孢菌素A(salinosporamide A)、沙帕他滨(sapacitabine)、Stanford V、苦马豆素(swainsonine)、他拉泊芬(talaporfin)、他立喹达(tariquidar)、替加氟-尿嘧啶(tegafur-uracil)、替莫达(temodar)、替西他赛(tesetaxel)、四硝酸三铂(triplatin tetranitrate)、参(2-氯乙基)胺、曲沙他滨(troxacitabine)、乌拉莫司汀(uramustine)、伐地美生(vadimezan)、长春氟宁(vinflunine)、ZD6126及唑喹达(zosuquidar)。
抗癌剂的其它非限制性实例包括天然产品,如长春花生物碱类(例如长春花碱、长春新碱及长春瑞宾)、表鬼臼毒素(例如依托泊苷和替尼泊苷)、抗生素(例如放线菌素D(dactinomycin/actinomycin D))、道诺霉素及伊达比星)、蒽环霉素(anthracycline)、米托蒽醌、博来霉素(bleomycins)、光神霉素(plicamycin)(米拉霉素(mithramycin))、丝裂霉素、酶(例如L-天冬酰胺酶,其全身性代谢L-天冬酰胺并除去自身不能合成天冬酰胺的细胞)、抗血小板剂、抗增生/抗有丝分裂烷化剂如氮芥(例如甲氮芥、环磷酰胺以及类似物美法仑(melphalan)和苯丁酸氮芥)、乙烯亚胺和甲基蜜胺(例如六甲基蜜胺和噻替哌)、CDK抑制剂(例如CDK4/6抑制剂,如瑞博西利(ribociclib)、阿贝西利(abemaciclib)或帕博西利(palbociclib)、塞利西利(seliciclib)、UCN-01、P1446A-05、PD-0332991、迪纳西利(dinaciclib)、P27-00、AT-7519、RGB286638及SCH727965)、烷基磺酸酯(例如白消安)、亚硝基脲(例如卡莫司汀(BCNU)及类似物,以及链佐星(streptozocin))、四氮烯-氮烯唑胺(trazenes-dacarbazinine)(DTIC)、抗增生/抗有丝分裂抗代谢物(如叶酸类似物)、嘧啶类似物(例如氟尿嘧啶、氮尿苷和阿糖胞苷)、嘌呤类似物和相关抑制剂(例如巯基嘌呤、硫鸟嘌呤、喷司他丁及2-氯去氧腺苷)、芳香酶抑制剂(例如阿那曲唑(anastrozole)、依西美坦(exemestane)及来曲唑(letrozole))以及铂配位络合物(例如顺铂及卡铂)、丙卡巴肼(procarbazine)、羟基脲、米托坦、氨鲁米特、组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制剂(例如曲古抑菌素(trichostatin)、丁酸钠、艾匹丹(apicidan)、辛二酰苯胺异羟肟酸(suberoylanilide hydroamic acid)、伏立诺他(vorinostat)、LBH 589、罗米地辛(romidepsin)、ACY-1215及帕比司他(panobinostat))、mTOR抑制剂(例如维托塞布(vistusertib)、西罗莫司(temsirolimus)、依维莫司(everolimus)、地磷莫司(ridaforolimus)及西罗莫司(sirolimus))、KSP(Eg5)抑制剂(例如Array520)、DNA结合剂(例如
Figure BDA0004194083620002171
)、PI3K抑制剂如PI3Kδ抑制剂(例如GS-1101和TGR-1202)、PI3Kδ和γ抑制剂(例如CAL-130)、库潘尼西(copanlisib)、阿博利布(alpelisib)及艾代拉里斯(idelalisib);多激酶抑制剂(例如TG02和索拉非尼(sorafenib))、激素(例如雌激素和激素激动剂,如促黄体激素释放激素(LHRH)激动剂(例如戈舍瑞林、亮丙瑞林(leuprolide)及曲普瑞林(triptorelin))、BAFF中和抗体(例如LY2127399)、IKK抑制剂、p38MAPK抑制剂、抗IL-6(例如CNT0328)、端粒酶抑制剂(例如GRN 163L)、极光激酶抑制剂(例如MLN8237)、细胞表面单克隆抗体(例如抗CD38(HUMAX-CD38))、抗CSl(例如埃罗妥珠单抗(elotuzumab))、HSP90抑制剂(例如17AAG和KOS953)、P13K/Akt抑制剂(例如哌立福新(perifosine))、Akt抑制剂(例如GSK-2141795)、PKC抑制剂(例如恩扎妥林(enzastaurin))、FTI(例如ZarnestraTM)、抗CD138(例如BT062)、Torcl/2特异性激酶抑制剂(例如INK128)、ER/UPR靶向剂(例如MKC-3946)、cFMS抑制剂(例如ARRY-382)、JAK1/2抑制剂(例如CYT387)、PARP抑制剂(例如奥拉帕尼和维利帕尼(veliparib)(ABT-888))及BCL-2拮抗剂。
在一些实施方案中,抗癌剂是集落刺激因子1受体(CSF1R)抑制剂。参见例如Cannarile等人,J ImmunoTherapy Cancer 5:53(2017);和Xun等人,Curr Med Chem 27:3944(2020)。
在一些实施方案中,抗癌剂是抗CD40抑制剂,如APX005M。
治疗剂可以是抗TIGIT抗体,如MBSA43、BMS-986207、MK-7684、COM902、AB154、MTIG7192A或OMP-313M32(艾替利单抗(etigilimab))。
在一些实施方案中,抗癌剂选自甲氮芥、喜树碱、异环磷酰胺、他莫昔芬、雷洛昔芬、吉西他滨、
Figure BDA0004194083620002181
索拉非尼(sorafenib)或前述的任何类似物或衍生物变体。
在一些实施方案中,抗癌剂是ALK抑制剂。ALK抑制剂的非限制性实例包括色瑞替尼(ceritinib)、TAE-684(NVP-TAE694)、PF02341066(克唑替尼(crizotinib)或1066)、阿来替尼(alectinib);布加替尼(brigatinib);恩曲替尼(entrectinib);恩沙替尼(ensartinib)(X-396);劳拉替尼(lorlatinib);ASP3026;CEP-37440;4SC-203;TL-398;PLB1003;TSR-011;CT-707;TPX-0005;及AP26113。ALK激酶抑制剂的额外实例描述于WO05016894的实施例3-39中。
在一些实施方案中,抗癌剂是受体酪氨酸激酶(RTK)/生长因子受体下游成员的抑制剂(例如SHP2抑制剂(例如SHP099、TNO155、RMC-4550、RMC-4630、JAB-3068、RLY-1971、ERAS-601)、另一SOS1抑制剂(例如BI-1701963)、Raf抑制剂、MEK抑制剂、ERK抑制剂、PI3K抑制剂、PTEN抑制剂、AKT抑制剂或mTOR抑制剂(例如mTORC1抑制剂或mTORC2抑制剂)。在一些实施方案中,抗癌剂是JAB-3312。在一些实施方案中,抗癌剂是Ras抑制剂(例如AMG 510、MRTX1257、JNJ-74699157(ARS-3248)、LY3537982、ARS-853、ARS-1620、GDC-6036、BPI-421286、JDQ443或JAB-21000),或Ras疫苗,或设计成直接或间接降低Ras的致癌活性的另一治疗方法。
在一些实施方案中,治疗剂是MAP激酶(MAPK)路径抑制剂(或“MAPK抑制剂”)。MAPK抑制剂包括但不限于Cancers(Basel)2015年9月;7(3):1758-1784中所述的一种或多种MAPK抑制剂。例如,MAPK抑制剂可选自以下中的一者或多者:曲美替尼(trametinib)、比美替尼(binimetinib)、司美替尼(selumetinib)、考比替尼(cobimetinib)、LErafAON(NeoPharm)、ISIS 5132;维罗非尼(vemurafenib)、匹马色替(pimasertib)、TAK733、RO4987655(CH4987655);CI-1040;PD-0325901;CH5126766;MAP855;AZD6244;瑞法替尼(refametinib)(RDEA 119/BAY 86-9766);GDC-0973/XL581;AZD8330(ARRY-424704/ARRY-704);RO5126766(Roche,描述于PLoS One.2014年11月25日;9(11)中);及GSK1120212(或JTP-74057,描述于Clin Cancer Res.2011年3月1日;17(5):989-1000中)。
在一些实施方案中,抗癌剂是RAS-RAF-ERK或PI3K-AKT-TOR或PI3K-AKT信号传导路径的破坏剂或抑制剂。PI3K/AKT抑制剂可包括但不限于Cancers(Basel)2015年9月;7(3):1758-1784中所述的一种或多种PI3K/AKT抑制剂。例如,PI3K/AKT抑制剂可选自以下中的一者或多者:NVP-BEZ235;BGT226;XL765/SAR245409;SF1126;GDC-0980;PI-103;PF-04691502;PKI-587;GSK2126458。
在一些实施方案中,抗癌剂是PD-1或PD-L1拮抗剂。
在一些实施方案中,额外治疗剂包括EGFR抑制剂、IGF-1R抑制剂、MEK抑制剂、PI3K抑制剂、AKT抑制剂、TOR抑制剂、MCL-1抑制剂、BCL-2抑制剂、SHP2抑制剂、蛋白酶体抑制剂及免疫疗法。
IGF-1R抑制剂包括林西替尼(linsitinib)或其药学上可接受的盐。
EGFR抑制剂包括但不限于小分子拮抗剂、抗体抑制剂或特异性反义核苷酸或siRNA。EGFR的有用抗体抑制剂包括西妥昔单抗(cetuximab)
Figure BDA0004194083620002201
帕尼单抗(panitumumab)/>
Figure BDA0004194083620002202
扎鲁目单抗(zalutumumab)、尼妥珠单抗(nimotuzumab)及马妥珠单抗(matuzumab)。其它基于抗体的EGFR抑制剂包括可部分或完全地阻断天然配体对EGFR的活化的任何抗EGFR抗体或抗体片段。基于抗体的EGFR抑制剂的非限制性实例包括Modjtahedi等人,Br.J.Cancer1993,67:247-253;Teramoto等人,Cancer 1996,77:639-645;Goldstein等人,Clin.Cancer Res.1995,1:1311-1318;Huang等人,1999,CancerRes.15:59(8):1935-40;以及Yang等人,Cancer Res.1999,59:1236-1243中所描述的EGFR抑制剂。EGFR抑制剂可以是单克隆抗体Mab E7.6.3(Yang,1999,同上文)或Mab C225(ATCC登录号HB-8508)或对EGFR具有结合特异性的抗体或抗体片段。
EGFR的小分子拮抗剂包括吉非替尼
Figure BDA0004194083620002203
埃罗替尼/>
Figure BDA0004194083620002204
和拉帕替尼
Figure BDA0004194083620002205
参见例如Yan等人,Pharmacogenetics and Pharmacogenomics InOncology Therapeutic Antibody Development,BioTechniques 2005,39(4):565-8;以及Paez等人,EGFR Mutations In Lung Cancer Correlation With Clinical Response ToGefitinib Therapy,Science 2004,304(5676):1497-500。小分子EGFR抑制剂的其它非限制性实例包括以下专利公开案中所述的任何EGFR抑制剂,以及此类EGFR抑制剂的所有药学上可接受的盐:EP 0520722;EP 0566226;WO96/33980;美国专利第5,747,498号;WO96/30347;EP 0787772;WO97/30034;WO97/30044;WO97/38994;WO97/49688;EP 837063;WO98/02434;WO97/38983;WO95/19774;WO95/19970;WO97/13771;WO98/02437;WO98/02438;WO97/32881;DE 19629652;WO98/33798;WO97/32880;WO97/32880;EP 682027;WO97/02266;WO97/27199;WO98/07726;WO97/34895;WO96/31510;WO98/14449;WO98/14450;WO98/14451;WO95/09847;WO97/19065;WO98/17662;美国专利第5,789,427号;美国专利第5,650,415号;美国专利第5,656,643号;WO99/35146;WO99/35132;WO99/07701;及WO92/20642。小分子EGFR抑制剂的其它非限制性实例包括Traxler等人,Exp.Opin.Ther.Patents 1998,8(12):1599-1625中所描述的任何EGFR抑制剂。在一些实施方案中,EGFR抑制剂是奥西替尼(osimertinib)。/>
MEK抑制剂包括但不限于皮马色替、司美替尼、考比替尼
Figure BDA0004194083620002211
曲美替尼
Figure BDA0004194083620002212
及比美替尼/>
Figure BDA0004194083620002213
在一些实施方案中,MEK抑制剂靶向MEK突变,所述突变是选自以下的第I类MEK1突变:D67N、P124L、P124S及L177V。在一些实施方案中,MEK突变是选自以下的第II类MEK1突变:ΔE51-Q58、ΔF53-Q58、E203K、L177M、C121S、F53L、K57E、Q56P及K57N。
PI3K抑制剂包括但不限于沃特曼宁(wortmannin);WO06/044453中所述的17-羟基沃特曼宁类似物;4-[2-(1H-吲唑-4-基)-6-[[4-(甲基磺酰基)哌嗪-1-基]甲基]噻吩并[3,2-d]嘧啶-4-基]吗啉(又称为匹替利昔(pictilisib)或GDC-0941,并且描述于WO09/036082和WO09/055730中);2-甲基-2-[4-[3-甲基-2-氧代-8-(喹啉-3-基)-2,3-二氢咪唑并[4,5-c]喹啉-1-基]苯基]丙腈(又称为BEZ 235或NVP-BEZ 235,并且描述于WO06/122806中);(S)-l-(4-((2-(2-氨基嘧啶-5-基)-7-甲基-4-吗啉代噻吩并[3,2-d]嘧啶-6-基)甲基)哌嗪-1-基)-2-羟基丙-1-酮(描述于WO08/070740中);LY294002(2-(4-吗啉基)-8-苯基-4H-l-苯并吡喃-4-酮(购自Axon Medchem);PI 103盐酸盐(3-[4-(4-吗啉基吡啶并[3',2':4,5]呋喃并[3,2-d]嘧啶-2-基]苯酚盐酸盐(购自Axon Medchem);PIK 75(2-甲基-5-硝基-2-[(6-溴咪唑并[1,2-a]吡啶-3-基)亚甲基]-1-甲基酰肼-苯磺酸单盐酸盐)(购自AxonMedchem);PIK 90(N-(7,8-二甲氧基-2,3-二氢-咪唑并[l,2-c]喹唑啉-5-基)-烟酰胺(购自Axon Medchem);AS-252424(5-[l-[5-(4-氟-2-羟基-苯基)-呋喃-2-基]-甲-(Z)-亚基]-噻唑啶-2,4-二酮(购自Axon Medchem);TGX-221(7-甲基-2-(4-吗啉基)-9-[1-(苯基氨基)乙基]-4H-吡啶并[1,2-a]嘧啶-4-酮(购自Axon Medchem);XL-765;及XL-147。其它PI3K抑制剂包括去甲氧基绿胶霉素(demethoxyviridin)、哌立福辛(perifosine)、CAL101、PX-866、BEZ235、SF1126、INK1117、IPI-145、BKM120、XL147、XL765、Palomid 529、GSK1059615、ZSTK474、PWT33597、IC87114、TGI 00-115、CAL263、PI-103、GNE-477、CUDC-907及AEZS-136。
AKT抑制剂包括但不限于Akt-1-1(抑制Aktl)(Barnett等人,Biochem.J.2005,385(Pt.2):399-408);Akt-1-1,2(抑制Akl和2)(Barnett等人,Biochem.J.2005,385(Pt.2):399-408);API-59CJ-Ome(例如Jin等人,Br.J.Cancer 2004,91:1808-12);1-H-咪唑并[4,5-c]吡啶基化合物(例如WO 05/011700);吲哚-3-甲醇及其衍生物(例如美国专利第6,656,963号;Sarkar和Li J Nutr.2004,134(12增刊):3493S-3498S);哌立福辛(例如干扰Akt膜定位;Dasmahapatra等人,Clin.Cancer Res.2004,10(15):5242-52);磷脂酰肌醇醚脂质类似物(例如Gills和Dennis Expert.Opin.Investig.Drugs 2004,13:787-97);以及曲西立滨(triciribine)(TCN或API-2或NCI标识符:NSC 154020;Yang等人,Cancer Res.2004,64:4394-9)。
mTOR抑制剂包括但不限于ATP竞争性mTORC1/mTORC2抑制剂,例如PI-103、PP242、PP30;Torin 1;FKBP12增强剂;4H-1-苯并吡喃-4-酮衍生物;和雷帕霉素(又称为西罗莫司)及其衍生物,包括:替西罗莫司(temsirolimus)
Figure BDA0004194083620002221
依维莫司(/>
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WO 94/09010);地磷莫司(又称为地伏莫司(deforolimus)或AP23573);雷帕霉素类似物(rapalogs),例如WO98/02441及WO01/14387中所公开的雷帕霉素类似物,例如AP23464和AP23841;40-(2-羟乙基)雷帕霉素;40-[3-羟基(羟甲基)甲基丙酸酯]-雷帕霉素(又称为CC1779);40-表-(四唑基)-雷帕霉素(又称为ABT578);32-去氧雷帕霉素;16-戊炔氧基-32(S)-二氢雷帕霉素;WO05/005434中所公开的衍生物;美国专利第5,258,389号、第5,118,677号、第5,118,678号、第5,100,883号、第5,151,413号、第5,120,842号及第5,256,790号中,以及WO94/090101、WO92/05179、WO93/111130、WO94/02136、WO94/02485、WO95/14023、WO94/02136、WO95/16691、WO96/41807、WO96/41807和WO2018204416中所公开的衍生物;以及含磷的雷帕霉素衍生物(例如WO05/016252)。在一些实施方案中,mTOR抑制剂是双重空间抑制剂(bisteric inhibitor)(参见例如WO2018204416、WO2019212990和WO2019212991),例如RMC-5552
可与本发明化合物组合使用的BRAF抑制剂包括例如维罗非尼、达拉非尼(dabrafenib)及康奈非尼(encorafenib)。BRAF可包含第3类BRAF突变。在一些实施方案中,第3类BRAF突变选自人类BRAF中以下氨基酸取代中的一者或多者:D287H;P367R;V459L;G466V;G466E;G466A;S467L;G469E;N581S;N581I;D594N;D594G;D594A;D594H;F595L;G596D;G596R;及A762E。
蛋白酶体抑制剂包括但不限于卡非佐米(carfilzomib)
Figure BDA0004194083620002231
硼替佐米(bortezomib)/>
Figure BDA0004194083620002232
和奥普佐米(oprozomib)。
免疫疗法包括但不限于单克隆抗体、免疫调节性酰亚胺(IMiD)、GITR激动剂、基因工程改造的T细胞(例如CAR-T细胞)、双特异性抗体(例如BiTE)以及抗PD-1剂、抗PDL-1剂、抗CTLA4剂、抗LAGl剂及抗OX40剂。
免疫调节剂(IMiD)是一类含有酰亚氨基的免疫调节药物(调节免疫反应的药物)。IMiD类药物包括沙立度胺(thalidomide)和其类似物(来那度胺(lenalidomide)、泊马度胺(pomalidomide)及阿普司特(apremilast))。
示例性抗PD-1抗体及其使用方法描述于Goldberg等人,Blood2007,110(1):186-192;Thompson等人,Clin.Cancer Res.2007,13(6):1757-1761;及WO06/121168A1)中,并且在本文别处也有描述。
GITR激动剂包括但不限于GITR融合蛋白以及抗GITR抗体(例如二价抗GITR抗体),如美国专利第6,111,090号、美国专利第8,586,023号、WO2010/003118和WO2011/090754中所述的GITR融合蛋白;或例如美国专利第7,025,962号、EP 1947183、美国专利第7,812,135号;美国专利第8,388,967号;美国专利第8,591,886号;美国专利第7,618,632号、EP1866339及WO2011/028683、WO2013/039954、WO05/007190、WO07/133822、WO05/055808、WO99/40196、WO01/03720、WO99/20758、WO06/083289、WO05/115451及WO2011/051726中所述的抗GITR抗体。
可与本发明化合物组合使用的治疗剂的另一个实例是抗血管生成剂。抗血管生成剂包括但不限于体外合成制备的化学组合物、抗体、抗原结合区、放射性核素以及其组合和缀合物。抗血管生成剂可以是激动剂、拮抗剂、别构调节剂、毒素,或更通常可用于抑制或刺激其靶(例如受体或酶活化或抑制),并由此促进细胞死亡或使细胞生长停滞。在一些实施方案中,所述一种或多种额外疗法包括抗血管生成剂。
抗血管生成剂可以是MMP-2(基质金属蛋白酶2)抑制剂、MMP-9(基质金属蛋白酶9)抑制剂和COX-II(环加氧酶11)抑制剂。抗血管生成剂的非限制性实例包括雷帕霉素、替西罗莫司(CCI-779)、依维莫司(RAD001)、索拉非尼、舒尼替尼及贝伐珠单抗(bevacizumab)。有用COX-II抑制剂的实例包括阿来昔布(alecoxib)、伐地昔布(valdec oxib)和罗非昔布(rofecoxib)。有用的基质金属蛋白酶抑制剂的实例描述于WO96/33172、WO96/27583、WO98/07697、WO98/03516、WO 98/34918、WO98/34915、WO98/33768、WO98/30566、WO90/05719、WO99/52910、WO99/52889、WO99/29667、WO99007675、EP0606046、EP0780386、EP1786785、EP1181017、EP0818442、EP1004578和US20090012085,以及美国专利第5,863,949号和第5,861,510号中。优选的MMP-2和MMP-9抑制剂是具有极低或不具有MMP-1抑制活性的抑制剂。更优选是相对于其它基质金属蛋白酶(即,MAP-1、MM P-3、MMP-4、MMP-5、MMP-6、MMP-7、MMP-8、MMP-10、MMP-11、MMP-12及MMP-13)选择性抑制MMP-2或AMP-9的抑制剂。MMP抑制剂的一些具体实例有AG-3340、RO 32-3555和RS 13-0830。
其它示例性抗血管生成剂包括激酶结构域KDR(激酶结构域受体)抑制剂(例如特异性结合至激酶结构域受体的抗体和抗原结合区)、抗VEGF剂(例如特异性结合VEGF的抗体或抗原结合区(例如贝伐珠单抗)或可溶性VEGF受体或其配体结合区),如VEGF-TRAPTM,以及抗VEGF受体剂(例如特异性结合至VEGF受体的抗体或抗原结合区)、EGFR抑制剂(例如特异性结合至EGFR的抗体或抗原结合区),如
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(帕尼单抗(panitumumab))、埃罗替尼
Figure BDA0004194083620002252
抗Angl剂和抗Ang2剂(例如特异性结合至Angl和Ang2或其受体,例如Tie2/Tek的抗体或抗原结合区),以及抗Tie2激酶抑制剂(例如特异性结合至Tie2激酶的抗体或抗原结合区)。其它抗血管生成剂包括坎帕斯(Campath)、IL-8、B-FGF、Tek拮抗剂(US2003/0162712;US6,413,932)、抗TWEAK剂(例如特异性结合的抗体或抗原结合区,或可溶性TWEAK受体拮抗剂;参见US6,727,225)、拮抗整合素与其配体的结合的ADAM解整合素结构域(US2002/0042368)、特异性结合的抗eph受体或抗蝶素抗体或抗原结合区(美国专利第5,981,245号、第5,728,813号、第5,969,110号、第6,596,852号、第6,232,447号、第6,057,124号及其专利家族成员),和抗PDGF-BB拮抗剂(例如特异性结合的抗体或抗原结合区),以及特异性结合至PDGF-BB配体的抗体或抗原结合区,和PDGFR激酶抑制剂(例如特异性结合至PDGFR激酶的抗体或抗原结合区)。额外抗血管生成剂包括:SD-7784(Pfizer,USA);西仑吉肽(cilengitide)(Merck KGaA,Germany,EPO 0770622);哌加他尼八钠(pegaptaniboctasodium)(Gilead Sciences,USA);阿法他汀(Alphastatin)(BioActa,UK);M-PGA(Celgene,USA,US 5712291);伊洛马司他(ilomastat)(Arriva,USA,US5892112);恩沙尼(emaxanib)(Pfizer,USA,US 5792783);瓦他拉尼(vatalanib)(Novartis,Switzerland);2-甲氧基雌二醇(EntreMed,USA);TLC ELL-12(Elan,Ireland);乙酸阿奈可他(anecortaveacetate)(Alcon,USA);α-D148 Mab(Amgen,USA);CEP-7055(Cephalon,USA);抗Vn Mab(Crucell,Netherlands)、DAC抗血管生成剂(ConjuChem,Canada);安格西丁(Angiocidin)(InKine Pharmaceutical,USA);KM-2550(Kyowa Hakko,Japan);SU-0879(Pfizer,USA);CGP-79787(Novartis,Switzerland,EP 0970070);ARGENT技术(Ariad,USA);YIGSR-Stealth(Johnson&Johnson,USA);纤维蛋白原-E片段(BioActa,UK);血管形成抑制剂(Trigen,UK);TBC-1635(Encysive Pharmaceuticals,USA);SC-236(Pfizer,USA);ABT-567(Abbott,USA);米塔斯他汀(Metastatin)(EntreMed,USA);丝抑蛋白(maspin)(Sosei,Japan);2-甲氧基雌二醇(Oncology Sciences Corporation,USA);ER-68203-00(IV AX,USA);BeneFin(Lane Labs,USA);Tz-93(Tsumura,Japan);TAN-1120(Takeda,Japan);FR-111142(Fujisawa,Japan,JP 02233610);血小板因子4(RepliGen,USA,EP 407122);血管内皮生长因子拮抗剂(Borean,Denmark);贝伐珠单抗(pINN)(Genentech,USA);血管生成抑制剂(SUGEN,USA);XL 784(Exelixis,USA);XL 647(Exelixis,USA);第二代α5β3整合素MAb(Applied Molecular Evolution,USA及Medlmmune,USA);盐酸恩扎妥林(enzastaurinhydrochloride)(Lilly,USA);CEP 7055(Cephalon,USA及Sanofi-Synthelabo,France);BC1(Genoa Institute of Cancer Research,Italy);rBPI 21和BPI源性抗血管生成剂(XOMA,USA);PI 88(Progen,Australia);西仑吉肽(Merck KGaA,German;MunichTechnical University,Germany,Scripps Clinic and Research Foundation,USA);AVE8062(Ajinomoto,Japan);AS 1404(Cancer Research Laboratory,New Zealand);SG 292,(Telios,USA);内皮抑素(Endostatin)(Boston Childrens Hospital,USA);ATN 161(Attenuon,USA);2-甲氧基雌二醇(Boston Childrens Hospital,USA);ZD 6474(AstraZeneca,UK);ZD6126(Angiogene Pharmaceuticals,UK);PPI 2458(Praecis,USA);AZD 9935(AstraZeneca,UK);AZD 2171,(AstraZeneca,UK);瓦他拉尼(pINN)(Novartis,Switzerland及Schering AG,Germany);组织因子路径抑制剂(EntreMed,USA);哌加他尼(Pinn)(Gilead Sciences,USA);束骨姜黄醇(xanthorrhizol)(Yonsei University,SouthKorea);基于基因的VEGF-2疫苗(Scripps Clinic and Research Foundation,USA);SPV5.2,(Supratek,Canada);SDX 103(University of California,San Diego,USA);PX478(ProlX,USA);METASTATIN(EntreMed,USA);肌钙蛋白I(Harvard University,USA);SU6668(SUGEN,USA);OXI 4503(OXiGENE,USA);o-胍(Dimensional Pharmaceuticals,USA);莫妥拉明C(motuporamine C)(British Columbia University,Canada);CDP 791(Celltech Group,UK);阿替莫德(atiprimod)(pINN)(GlaxoSmithKline,UK);E 7820(Eisai,Japan);CYC 381(Harvard University,USA);AE 941(Aeterna,Canada);血管生成疫苗(EntreMed,USA);尿激酶纤维蛋白溶酶原活化物抑制剂(Dendreon,USA);奥谷法奈(oglufanide)(pINN)(Melmotte,USA);HIF-lα抑制剂(Xenova,UK);CEP 5214(Cephalon,USA);BAY RES 2622(Bayer,Germany);安古西丁(InKine,USA);A6(Angstrom,USA);KR31372(Korea Research Institute of Chemical Technology,South Korea);GW 2286(GlaxoSmithKline,UK);EHT 0101(ExonHit,France);CP 868596(Pfizer,USA);CP 564959(OSI,USA);CP 547632(Pfizer,USA);786034(GlaxoSmithKline,UK);KRN 633(KirinBrewery,Japan);药物递送系统,眼内2-甲氧基雌二醇;安格尼斯(anginex)(MaastrichtUniversity,Netherlands,及Minnesota University,USA);ABT 510(Abbott,USA);AAL993(Novartis,Switzerland);VEGI(ProteomTech,USA);肿瘤坏死因子-α抑制剂;SU 11248(Pfizer,USA及SUGEN USA);ABT 518(Abbott,USA);YH16(Yantai Rongchang,China);S-3APG(Boston Childrens Hospital,USA及EntreMed,USA);MAb,KDR(ImClone Systems,USA);MAb,α5β(Protein Design,USA);KDR激酶抑制剂(Celltech Group,UK及Johnson&Johnson,USA);GFB 116(South Florida University,USA及Yale University,USA);CS706(Sankyo,Japan);考布他汀(combretastatin)A4前药(Arizona State University,USA);软骨素酶AC(IBEX,Canada);BAY RES 2690(Bayer,Germany);AGM 1470(HarvardUniversity,USA,Takeda,Japan,及TAP,USA);AG 13925(Agouron,USA);四硫钼酸盐(University of Michigan,USA);GCS 100(Wayne State University,USA);CV 247(IvyMedical,UK);CKD 732(Chong Kun Dang,South Korea);伊索拉定(irsogladine)(NipponShinyaku,Japan);RG 13577(Aventis,France);WX 360(Wilex,Germany);角鲨胺(Genaera,USA);RPI 4610(Sirna,USA);肝素酶抑制剂(InSight,Israel);KL 3106(Kolon,South Korea);和厚朴酚(Honokiol)(Emory University,USA);ZK CDK(Schering AG,Germany);ZK Angio(Schering AG,Germany);ZK 229561(Novartis,Switzerland,及Schering AG,Germany);XMP 300(XOMA,USA);VGA 1102(Taisho,Japan);VE-钙粘蛋白-2拮抗剂(ImClone Systems,USA);血管抑制因子(Vasostatin)(National Institutes ofHealth,USA);Flk-1(ImClone Systems,USA);TZ 93(Tsumura,Japan);TumStatin(BethIsrael Hospital,USA);截短的可溶性FLT1(血管内皮生长因子受体1)(Merck&Co,USA);Tie-2配体(Regeneron,USA);以及凝血栓蛋白1抑制剂(Allegheny Health,Education andResearch Foundation,USA)。
可与本发明化合物组合使用的治疗剂的其它实例包括特异性结合并抑制生长因子活性的药剂(例如抗体、抗原结合区或可溶性受体),如肝细胞生长因子(HGF,又称为离散因子(Scatter Factor))的拮抗剂,以及特异性结合受体c-Met的抗体或抗原结合区。
可与本发明化合物组合使用的治疗剂的另一个实例是自噬抑制剂。自噬抑制剂包括但不限于氯喹、3-甲基腺嘌呤、羟基氯喹(PlaquenilTM)、巴佛洛霉素A1(bafilomycinA1)、5-氨基-4-咪唑甲酰胺核糖苷(AICAR)、软海绵酸、抑制第2A型或第1型蛋白质磷酸酶的自噬抑制性藻毒素、cAMP类似物和增加cAMP含量的药物,如腺苷、LY204002、N6-巯基嘌呤核糖苷及长春新碱。此外,也可使用抑制蛋白质,包括但不限于ATG5(参与自噬)的表达的反义RNA或siRNA。在一些实施方案中,所述一种或多种额外疗法包括自噬抑制剂。
可与本发明化合物组合使用的治疗剂的另一个实例是抗肿瘤剂。在一些实施方案中,所述一种或多种额外疗法包括抗肿瘤剂。抗肿瘤剂的非限制性实例包括醋孟南(acemannan)、阿柔比星(aclarubicin)、阿地白介素(aldesleukin)、阿仑单抗(alemtuzumab)、阿曲诺英(alitretinoin)、六甲蜜胺、胺磷汀(amifostine)、胺柔比星(amrubicin)、安吖啶(amsacrine)、阿那格雷(anagrelide)、阿那曲唑(anastrozole)、安塞尔(ancer)、安塞司亭(ancestim)、阿格拉宾(arglabin)、三氧化砷、BAM-002(Novelos)、贝沙罗汀(bexarotene)、比卡鲁胺(bicalutamide)、溴尿苷(broxuridine)、卡培他滨、西莫白介素(celmoleukin)、西曲瑞克(cetrorelix)、克拉屈滨(cladribine)、克霉唑(clotrimazole)、阿糖胞苷烷磷酯(cytarabine ocfosfate)、DA 3030(Dong-A)、达克珠单抗(daclizumab)、地尼白介素(denileukin diftitox)、地洛瑞林(deslorelin)、右雷佐生(dexrazoxane)、地拉齐普(dilazep)、多西他赛、多可沙诺(docosanol)、度骨化醇(doxercalciferol)、去氧氟尿苷(doxifluridine)、多柔比星(doxorubicin)、溴麦角环肽(bromocriptine)、卡莫司汀、阿糖胞苷、氟尿嘧啶、HIT双氯芬酸、干扰素α、道诺霉素、多柔比星、维A酸(tretinoin)、依地福新(edelfosine)、依决洛单抗(edrecolomab)、依氟鸟氨酸(eflornithine)、乙嘧替氟(emitefur)、表柔比星(epirubicin)、贝他依伯汀(epoetinbeta)、磷酸依托泊苷(etoposide phosphate)、依西美坦(exemestane)、依昔舒林(exisulind)、法屈唑(fadrozole)、非格司亭(filgrastim)、非那雄胺(finasteride)、磷酸氟达拉滨(fludarabine phosphate)、福美坦(formestane)、福莫司汀(fotemustine)、硝酸镓、吉西他滨(gemcitabine)、吉妥珠单抗奥唑米星(gemtuzumab zogamicin)、吉美拉西(gimeracil)/奥特拉西(oteracil)/替加氟(tegafur)组合、格莱克平(glycopine)、戈舍瑞林、庚铂(heptaplatin)、人绒毛膜促性腺素、人胎儿甲胎蛋白、伊班膦酸(ibandronicacid)、伊达比星(idarubicin)、咪喹莫特(imiquimod)、干扰素α、天然干扰素α、干扰素α-2、干扰素α-2a、干扰素α-2b、干扰素α-Nl、干扰素α-n3、复合干扰素-1、天然干扰素α、干扰素β、干扰素β-la、干扰素β-lb、干扰素γ、天然干扰素γ-la、干扰素γ-lb)、白细胞介素-1β、碘苄胍(iobenguane)、伊立替康、伊索拉定(irsogladine)、兰瑞肽(lanreotide)、LC 9018(Yakult)、来氟米特(leflunomide)、来格司亭(lenograstim)、硫酸香菇多糖(lentinansulfate)、来曲唑、白血球α干扰素、亮丙瑞林、左旋咪唑(levamisole)+氟尿嘧啶、利阿唑(liarozole)、洛铂(lobaplatin)、氯尼达明(lonidamine)、洛伐他汀(lovastatin)、马索罗酚(masoprocol)、美拉胂醇(melarsoprol)、甲氧氯普胺(metoclopramide)、米非司酮(mifepristone)、米替福新(miltefosine)、米立司亭(mirimostim)、错配双链RNA、米托胍腙、二溴卫矛醇、米托蒽醌、莫拉司亭(molgramostim)、那法瑞林(nafarelin)、纳洛酮(naloxone)+喷他佐辛(pentazocine)、那托司亭(nartograstim)、奈达铂、尼鲁胺、那可丁(noscapine)、新颖促红细胞生成蛋白、NSC 631570奥曲肽(octreotide)、奥普瑞白介素(oprelvekin)、奥沙特隆(osaterone)、奥沙利铂、太平洋紫杉醇、帕米膦酸(pamidronicacid)、培门冬酶(pegaspargase)、聚乙二醇干扰素α-2b、戊聚糖聚硫酸钠(pentosanpolysulfate sodium)、喷司他丁、毕西巴尼(picibanil)、比柔比星、兔抗胸腺细胞多株抗体、聚乙二醇干扰素α-2a、卟吩姆钠(porfimer sodium)、雷洛昔芬(raloxifene)、雷替曲赛(raltitrexed)、rasburiembodiment、羟乙膦酸铼Re 186、RII异维A酰胺(retinamide)、利妥昔单抗(rituximab)、罗莫肽(romurtide)、来昔决南钐(153Sm)(samarium lexidronam)、沙格司亭(sargramostim)、西佐喃(sizofiran)、索布佐生(sobuzoxane)、索纳明(sonermin)、氯化锶-89、舒拉明(suramin)、他索那明(tasonermin)、他扎罗汀(tazarotene)、替加氟、替莫泊芬(temoporfin)、替莫唑胺(temozolomide)、替尼泊苷(teniposide)、四氯十氧化物(tetrachlorodecaoxide)、沙立度胺、胸腺法新(thymalfasin)、促甲状腺素α(thyrotropin alfa)、拓扑替康(topotecan)、托瑞米芬(toremifene)、托西莫单抗-碘131(tositumomab-iodine 131)、曲妥珠单抗、曲奥舒凡(treosulfan)、维A酸、曲洛司坦(trilostane)、三甲曲沙(trimetrexate)、曲普瑞林(triptorelin)、天然肿瘤坏死因子α、乌苯美司、膀胱癌疫苗、Maruyama疫苗、黑色素瘤溶解产物疫苗、戊柔比星(valrubicin)、维替泊芬(verteporfin)、长春瑞宾、维鲁利秦(virulizin)、净司他丁斯酯(zinostatin stimalamer)或唑来膦酸;阿倍瑞克(abarelix);AE 941(Aeterna)、胺莫司汀(ambamustine)、反义寡核苷酸、bcl-2(Genta)、APC 8015(Dendreon)、地西他滨(decitabine)、去氨基格鲁米特(dexaminoglutethimide)、地吖醌(diaziquone)、EL 532(Elan)、EM 800(Endorecherche)、恩尿嘧啶(eniluracil)、依他硝唑(etanidazole)、芬维A胺(fenretinide)、非格司亭(filgrastim)SD01(Amgen)、氟维司群(fulvestrant)、加洛他滨(galocitabine)、胃泌素17免疫原、HLA-B7基因疗法(Vical)、颗粒球巨噬细胞群落刺激因子(granulocyte macrophage colony stimulating factor)、组织胺二盐酸盐、替伊莫单抗(ibritumomab tiuxetan)、伊洛马司他(ilomastat)、IM 862(Cytran)、白细胞介素-2、伊普昔芬(iproxifene)、LDI 200(Milkhaus)、勒瑞斯亭(leridistim)、林妥珠单抗(lintuzumab)、CA 125MAb(Biomira)、癌症MAb(JapanPharmaceutical Development)、HER-2及Fc MAb(Medarex)、独特型105AD7 MAb(CRCTechnology)、独特型CEA MAb(Trilex)、LYM-1-碘131MAb(Techni clone)、多形性上皮黏蛋白-钇90MAb(Antisoma)、马立马斯他(marimastat)、美诺立尔(menogaril)、米妥莫单抗(mitumomab)、莫特沙芬钆(motexafin gadolinium)、MX 6(Galderma)、奈拉滨(nelarabine)、诺拉曲塞(nolatrexed)、P 30蛋白、培维索孟(pegvisomant)、培美曲塞(pemetrexed)、泊非霉素(porfiromycin)、普啉司他(prinomastat)、RL 0903(Shire)、鲁比特康(rubitecan)、赛特铂(satraplatin)、苯乙酸钠、斯帕福斯酸(sparfosic acid)、SRL172(SR Pharma)、SU 5416(SUGEN)、TA 077(Tanabe)、四硫代钼酸盐、塞班斯汀(thaliblastine)、血小板生成素、锡乙基初红紫素(tin ethyletiopurpurin)、替拉扎明(tirapazamine)、癌症疫苗(Biomira)、黑色素瘤疫苗(New York University)、黑色素瘤疫苗(Sloan Kettering Institute)、黑色素瘤肿瘤溶解产物疫苗(New York MedicalCollege)、病毒黑色素瘤细胞溶解产物疫苗(Royal Newcastle Hospital)或戊司泊达(valspodar)。
可与本发明化合物组合使用的治疗剂的额外实例包括伊匹单抗
Figure BDA0004194083620002321
曲美目单抗;加利昔单抗(galiximab);纳武单抗(nivolumab),又称为BMS-936558/>
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派姆单抗/>
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阿维鲁单抗/>
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AMP224;BMS-936559;MPDL3280A,又称为RG7446;MEDI-570;AMG557;MGA271;IMP321;BMS-663513;PF-05082566;CDX-1127;抗OX40(Providence Health Services);huMAbOX40L;阿特昔普(atacicept);CP-870893;鲁卡木单抗(lucatumumab);达西珠单抗(dacetuzumab);莫罗单抗(muromonab)-CD3;易普木单抗(ipilumumab);MEDI4736/>
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MSB0010718C;AMP 224;阿达木单抗(adalimumab)
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ado-曲妥珠单抗美坦新(ado-trastuzumab emtansine)/>
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阿柏西普(aflibercept)/>
Figure BDA0004194083620002328
阿仑单抗(alemtuzumab)/>
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巴利昔单抗(basiliximab)
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贝利木单抗(belimumab)/>
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巴利昔单抗(basiliximab)/>
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贝利木单抗/>
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维布妥昔单抗(brentuximab vedotin)/>
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卡那津单抗(canakinumab)/>
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聚乙二醇结合赛妥珠单抗(certolizumab pegol)/>
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达克珠单抗/>
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达雷木单抗(daratumumab)/>
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地诺单抗(denosumab)
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依库珠单抗(eculizumab)/>
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依法利珠单抗(efalizumab)/>
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吉妥珠单抗奥唑米星(gemtuzumab ozogamicin)/>
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戈利木单抗(golimumab)
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替伊莫单抗(ibritumomab tiuxetan)/>
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英夫利昔单抗(infliximab)
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莫维珠单抗(motavizumab)/>
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那他株单抗(natalizumab)
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奥滨尤妥珠单抗(obinutuzumab)/>
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奥法木单抗(ofatumumab)
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奥马珠单抗(omalizumab)/>
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帕利珠单抗(palivizumab)/>
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帕妥珠单抗(pertuzumab)/>
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帕妥珠单抗/>
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兰尼单抗(ranibizumab)
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瑞西巴库单抗(raxibacumab)/>
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托珠单抗(tocilizumab)
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托西莫单抗(tositumomab);托西莫单抗-i-131;托西莫单抗及托西莫单抗-i-131/>
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优特克单抗(ustekinumab)/>
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AMG 102;AMG 386;AMG 479;AMG655;AMG 706;AMG 745;及AMG 951。
在一些实施方案中,额外化合物选自由以下组成的组:CDK4/6抑制剂(例如阿贝西利、帕博西利或瑞博西尼)、KRAS:GDP G12C抑制剂(例如AMG 510、MRTX 1257)或其它突变型Ras:GDP抑制剂、KRAS:GTP G12C抑制剂或其它突变型Ras:GTP抑制剂、MEK抑制剂(例如瑞法替尼、司美替尼、曲美替尼或考比替尼)、SHP2抑制剂(例如TNO155、RMC-4630)、ERK抑制剂和RTK抑制剂(例如EGFR抑制剂)。在一些实施方案中,SOS1抑制剂可与Ras抑制剂、SHP2抑制剂或MEK抑制剂组合使用。在一些实施方案中,组合疗法包括SOS1抑制剂、RAS抑制剂和MEK抑制剂。
在一些实施方案中,额外化合物选自由以下组成的组:ABT-737、AT-7519、卡非佐米、考比替尼、达鲁舍替(danusertib)、达沙替尼、多柔比星、GSK-343、JQ1、MLN-7243、NVP-ADW742、太平洋紫杉醇、帕博西利和伏拉塞替(volasertib)。在一些实施方案中,额外化合物选自由以下组成的组:来那替尼(neratinib)、阿昔替尼(acetinib)和逆转素(reversine)。
MCL-1抑制剂包括但不限于AMG-176、MIK665和S63845。骨髓细胞白血病-1(MCL-1)蛋白质是B细胞淋巴瘤-2(BCL-2)蛋白质家族的关键抗细胞凋亡成员中的一种。MCL-1的过度表达与肿瘤进展以及对不仅传统化学疗法而且包括如ABT-263之类BCL-2抑制剂在内的靶向治疗剂的抗性密切相关。
在上文中,优选的额外治疗剂包括MEK抑制剂、ERK抑制剂、泛RAS(ON)抑制剂(即靶向RAS的GTP活化形式的抑制剂)、CDK4/6抑制剂、mTORC1抑制剂、HDAC抑制剂、BCL2抑制剂和PLK1抑制剂。
在一些实施方案中,所述方法还包括向受试者施用治疗有效量的AML抑制剂。此类剂是本领域中已知的,并且可选自例如阿糖胞苷、蒽环霉素药物(例如道诺霉素或伊达比星)、米哚妥林、吉妥珠单抗奥加米星、克拉屈滨、氟达拉滨、依托泊苷、阿扎胞苷、地西他滨、维奈托克(venetoclax)、格拉吉布(glasdegib)、依维替尼(ivosidenib)或恩西地平(enasidenib),或其组合。
在一些实施方案中,本公开提供一种基于SHP2突变,特别是活化性SHP2突变的存在或不存在进行患者分层的方法。如本文所使用,“患者分层”意思指将一名或多名患者分类为患有可能或不可能用SHP2抑制剂,如别构SHP2抑制剂治疗的疾病或病症(例如癌症)。患者分层可包括将患者分类为患有对SHP2抑制剂,如别构SHP2抑制剂治疗具有敏感性或抗性的肿瘤。
在一些实施方案中,本发明的方法包括通过对来自受试者的生物样品中的SHP2突变进行基因分型,将受试者鉴别为对SHP2抑制剂,如别构SHP2抑制剂具有抗性,其中如果所述SHP2突变包含抑制剂抗性突变,如别构抑制剂抗性突变,则将受试者鉴别为对SHP2抑制剂具有抗性。
例如但不以任何方式进行限制,在一些方面,来自患者的生物样品(例如细胞,如肿瘤细胞)可使用杂交检测方法进行基因分型以确定该细胞是否含有SHP2突变,如活化性SHP2突变,包含抑制剂抗性突变,如别构抑制剂抗性突变。
杂交检测方法是基于在用于检测核酸序列突变的互补核酸序列之间特定杂交物的形成。此类方法包括例如微阵列分析和实时PCR。也可使用杂交方法,如Southern分析、Northern分析或原位杂交(参见Current Protocols in Molecular Biology,Ausubel等人编辑,John Wiley&Sons 2003,以全文引用的方式并入本文中)。
其它适合的用于细胞(例如肿瘤细胞)基因分型的方法包括例如直接手动测序(Church和Gilbert,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:1991-1995(1988);Sanger等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 74:5463-5467(1977);Beavis等人,美国专利号5,288,644,各文献以全文引用的方式并入本文中用于所有目的);自动荧光测序;单链构象多态性测定(SSCP);钳位变性凝胶电泳(clamped denaturing gel electrophoresis,CDGE);二维凝胶电泳(2DGE或TDGE);构象敏感性凝胶电泳(CSGE);变性梯度凝胶电泳(DGGE)(Sheffield等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:232-236(1989));迁移率变动分析(Orita等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86:2766-2770(1989),以全文引用的方式并入);限制酶分析(Flavell等人,Cell 15:25(1978);Geever等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 78:5081(1981),以全文引用的方式并入);定量实时PCR(Raca等人,Genet Test 8(4):387-94(2004),以全文引用的方式并入);异源双链分析;化学错配裂解(CMC)(Cotton等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:4397-4401(1985),以全文引用的方式并入);RNA酶保护测定(Myers等人,Science 230:1242(1985),以全文引用的方式并入);使用识别核苷酸错配的多肽,例如大肠杆菌mutS蛋白;等位基因特异性PCR。参见例如美国专利号2004/0014095,该案特此以全文引用的方式并入。
在一些实施方案中,本发明的方法包括执行诊断测试以确定受试者是否具有诱导SHP2的活化形式的SHP2突变。
实施例
本公开将通过以下实施例进一步说明,这些实施例不应解释为将本公开的范围或精神限制于本文所描述的特定程序。应了解,提供的实施例将说明某些实施方案并不打算借此对本公开的范围造成限制。还应了解,在不背离本公开的精神和/或所附权利要求书的范围的情况下,可采用本领域技术人员所能想到的各种其它实施方案、其修改和等效内容。
实施例中使用的方法
CrownSynTM方法(3维曲面图)
使细胞在含有0.65%甲基纤维素的适当生长培养基中以3维培养方式生长。在细胞接种当天,在对数生长期间,从2维培养物收集细胞,将其与适当细胞培养基混合并以1000rpm离心4分钟。使细胞再悬浮并使用CountStar计数。将3.5mL细胞悬浮液与6.5mL的1%甲基纤维素混合,得到10ml于0.65%甲基纤维素溶液中的细胞悬浮液。将90μL细胞悬浮液添加至96孔板中。制备另一块板进行T0读取。在含5% CO2的潮湿培育器中,将板在37℃下培育。使用DMSO或培养基将测试物稀释至10×工作溶液。将10μl各测试物溶液分别分配于每个孔中(每种浓度一式三份)。在含5% CO2或100%空气的潮湿培育器中,将板在37℃培养120小时。对于T0读取,将10μl培养基添加至T0板的每个孔中,并如下文所描述,使用CTG测定确定细胞活力。在120小时后,将板在室温下平衡约30分钟,随后将100μl的
Figure BDA0004194083620002361
试剂添加至每个测定孔中。在回转式振荡器上,将内含物混合2分钟以诱导细胞裂解。将板在室温下培育10分钟以使发光信号稳定。使用EnVision多标记读板器(MultiLabel Reader)记录发光。使用GraphPad Prism软件计算IC50。使用借助S形剂量反应的非线性回归模型拟合图形曲线。将二维浓度-反应曲面与两个不同的相加模型Bliss独立模型和Loewe相加模型相比较。以协同分数形式评估与任一模型预测的偏离。利用任一模型并且在浓度反应曲面上的任何点处大于5的协同分数解释为指示各化合物之间存在显著相互作用。参见Bliss C.I.(1939)The toxicity of poisons appliedjointly.Ann.Appl.Biol.,26,585-615,并且参见Loewe S.(1953)The problem ofsynergism and antagonism of combined drugs.ArzneimiettelForschung,3,2 86-290。预期Bliss独立模型适合于通过例如靶向独立路径独立地引起反应的非相互作用药物。相比之下,Loewe相加模型更适于两种药物对于相同靶或路径具有类似作用模式的情形。如Saariselka协议(Greco等人,1992)以及许多其它协议所指出的,Loewe相加模型和Bliss独立模型均未必反映药物组合的预期作用模式。实际上,Loewe模型和Bliss模型应当用作数据探索方法,其主要目的是鉴别保证进一步机制研究的潜在协同作用药物组合,而非反过来,即,使用机制证据来确定哪种参考模型更适合。
2维效力转换
使细胞在2维培养物中生长。将测定储备液解冻并在补充有10%血清和1%青霉素/链霉素的推荐的ATCC培养基中稀释(最终浓度)并施配于384孔板中。取决于所使用的细胞系,使用在每孔45μl培养基中100-6400个细胞的细胞密度。板的边缘填充磷酸盐缓冲盐水。在37℃下,将平板接种的细胞在含5% CO2的潮湿气氛中培育。24小时后,将5μl含有单次剂量指定浓度化合物的参考化合物稀释液添加至各板中并将这些板再培育120小时。在t=120小时,将24μlATPlite 1StepTM(PerkinElmer)溶液添加至各孔中,随后振荡2分钟。在暗处培育5分钟后,在Envision多标记读板器(PerkinElmer)上记录发光。在平行的t=0板上,施配45μl细胞并在37℃下,在含5% CO2的潮湿气氛中培育。24小时后,将5μl含DMSO的Hepes缓冲液和24μl ATPlite 1StepTM溶液混合,并在培育5分钟后测量发光(=发光t=0)。通过非线性回归,使用IDBS XLfit 5计算曲线和IC50。在培育直至t=结束后的生长百分比(生长%)计算如下:100%×(发光t=结束/发光未处理,t=结束)。利用4参数S形曲线将其与10log化合物浓度(conc)拟合:生长%=底部+(顶部-底部)/(1+10(logIC50-conc)*hill)),其中hill是希尔系数(Hill-coefficient),并且底部和顶部是所述化合物在所述测定中所允许的近似最小和最大细胞生长。
磷酸化ERK的抑制
使用
Figure BDA0004194083620002371
平台确定细胞中的磷酸化ERK。将NCI-H1355或TOV-21G细胞以30,000个细胞/孔平板接种于透明平底96孔组织培养板中的完全培养基中,每孔100μL,并将其放入培育器(37℃,5%CO2)中过夜。将所有化合物在DMSO中复水达到1000×的所需最高浓度并布置于96孔板的第1列中。在96孔板中,在DMSO中对所有化合物执行3倍连续稀释,留下第11列具有100% DMSO并使第12列空置。将化合物在培养基中以1:500稀释并充分混合。接着,将2X最终浓度的连续稀释液与2X单次剂量化合物或DMSO媒剂混合。从细胞板中抽吸出细胞培养基,并添加100μL的1X化合物混合物。将板放入培育器(37℃,5% CO2)中,保持4小时。在时间点之前,通过将10mL Tris溶解缓冲液(以/>
Figure BDA0004194083620002381
试剂盒提供)、1片PhosSTOPEASYpack(Roche)、1片cOmplete Mini无EDTA蛋白酶抑制剂混合液(Roche)、40μL PMSF(以
Figure BDA0004194083620002382
试剂盒提供)、100μL SDS(以/>
Figure BDA0004194083620002383
试剂盒提供)混合,立即制备/>
Figure BDA0004194083620002384
溶解缓冲液,并保持在冰上待用。处理时间后,从板中抽吸出培养基并将50μL/>
Figure BDA0004194083620002385
溶解缓冲液添加至各孔中。用箔胶粘剂密封各板并在室温下,以750rpm振荡5分钟。接着,将各板在冰上培育15分钟,并在-80℃储存。根据制造商的方案执行/>
Figure BDA0004194083620002386
Phospho(Thr202/Tyr204;Thr185/Tyr187)/总ERK1/2测定。
实施例1.在SHP2中具有活化性突变的细胞对SHP2别构抑制剂具有降低的敏感性,但保持对SOS1的敏感性
RAS/MAPK信号传导路径(示意性显示于图1中)的异常活化是许多类型癌症中异常生长和增殖的常见驱动因素。SHP2在这一路径的顶部附近起作用,响应于来自生长因子受体的输入而募集并活化RAS GEF SOS1和SOS2。别构SHP2抑制剂,如RMC-4550,可通过干扰这一过程来阻断路径活化和癌细胞生长。在SHP2中可存在将生长因子受体信号传导与SHP2活化分开而导致路径信号传导过度活化的突变。这些突变通过使SHP2的自抑制型构象不稳定来起作用。不同的活化性突变使这一构象不稳定的程度不同,这可以通过突变的开启构象自由能(ΔGop)定量地表示。野生型SHP2具有2.8kcal/mol的ΔGop。突变型SHP2的ΔGop值低于2.8指示活化,其中较低的值指示较强的活化作用。在工程改造过的HEK293细胞中,SHP2突变的活化强度与对如RMC-4550之类SHP2别构抑制剂的敏感性降低相关。参见图2A,该图是RMC-4550pERK IC50随ΔGop变化的关系的图。图2B是显示在SHP2蛋白的多种活化性突变中RMC-4550的pERK IC50值的表。
与别构SHP2抑制剂不同,SOS1抑制剂有效抑制具有多种SHP2突变的HEK293细胞中RAS/MAPK信号传导路径的活化,甚至是在SHP2抑制无效的情况下也是如此。参见图3A、图3B、图20A和图20B,图中显示SOS1抑制剂维持对同基因HEK-293细胞系中众多SHP2突变型变体背景的敏感性。HEK293细胞的生长与RAS/MAPK信号传导路径无关,但LN-229细胞的生长与该路径相关。图4A至图4H显示,SOS1抑制剂抑制在SHP2中具有活化性突变的LN229细胞的生长,其抑制作用比别构SHP2抑制剂RMC-4550强效,并且SOS1抑制的较大益处与强活化性SHP2突变相关。
使用以下方法获得图2A、图2B、图3A、图3B、图4A至图4H、图20A和图20B中所示的数据。
同基因SHP2表达细胞系的产生
产生实验系统以测试SHP2突变体对同基因背景的活性。参见图2A、图2B、图3A、图3B、图20A和图20B。从Gibco获得Flp-In T-REx-293细胞系并在潮湿细胞培养培育器中,在37℃和5% CO2下,在含有2mM L-谷氨酰胺(Hyclone)并补充有10% FBS(Hyclone)、1%青霉素/链霉素(Gibco)、100μg/mL ZeocinTM(Gibco)和15μg/mL杀稻瘟素(Gibco)的高葡萄糖DMEMTM中进行培养。
合成野生型SHP2或突变型SHP2变体并将其亚克隆至pcDNA5/FRT/TO载体(ThermoFisher)中。使用X-tremegene 9DNA转染试剂(Sigma),根据制造商的说明书,将质粒与pOG44 Flp重组酶表达质粒(ThermoFisher)共转染至Flp-In T-REx-293细胞中。在37℃和5% CO2下,在含有2mM L-谷氨酰胺并补充有10% FBS以及1%青霉素/链霉素、200μg/mL潮霉素B(hygromycin B)(Gibco)和15μg/mL杀稻瘟素(Gibco)的高葡萄糖DMEM(重组选择培养基)中选择经历成功重组的细胞,直至目测可辨别集落。在37℃和5% CO2下,使细胞在潮湿细胞培养培育器中的重组选择培养基中扩增,以产生同基因SHP2变体表达细胞系(T-REx-293-SHP2)。
对SOS抑制剂的敏感性的确定
在化合物处理前一天,针对各测试变体收集T-REx-293-SHP2细胞并将其以20,000个细胞/孔的密度接种于96孔测定板中含有2mM L-谷氨酰胺并补充有0.1% FBS以及1%青霉素/链霉素、200μg/mL潮霉素B和15μg/mL杀稻瘟素(Gibco)的高葡萄糖DMEM中。通过添加多西环素(doxycycline)(最终浓度=0.1μg/mL)(Sigma),保持24小时,诱导SHP2构建体的表达。
实验当天,在37℃和5% CO2下,在递增浓度的BI-3406、化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331)、RMC-4550(0.17nM至10μM最终测定浓度)或媒剂(最终测定浓度0.1% DMSO)存在下,将细胞在一式四份孔中培育1小时。在药物处理的最后5分钟里,用50ng/mL表皮生长因子(Sigma)刺激细胞。在这一培育完成后,抽吸出培养基并使用与
Figure BDA0004194083620002401
检测试剂盒(PerkinElmer)一起提供的溶解缓冲液制备细胞溶解产物。使用/>
Figure BDA0004194083620002402
UltraTM HV pERK测定试剂盒(Perkin Elmer),遵循制造商的说明书测定在Thr202/Tyr204处的ERK1/2磷酸化情况。使用/>
Figure BDA0004194083620002403
多标记读板器(Perkin Elmer),使用标准
Figure BDA0004194083620002404
设置读取样品。将测定数据作图并在GraphPad Prism 7中使用四参数浓度-反应模型确定EC50值。提供的数据是由代表性实验得到的重复值的平均值+/-标准偏差。
同基因LN229 SHP2突变型细胞系的产生
产生实验系统以测试SHP2突变体对同基因背景的活性。参见图4A至图4H。利用Synthego CRISPR编辑技术引入SHP2突变,并产生稳定表达这些突变的LN229变体细胞系。
利用pERK Alphalisa确定对SOS1和SHP2抑制剂的敏感性
在处理前一天,收集具有各指定突变的LN229细胞并将其以30,000个细胞/孔的密度接种于96孔测定板中含有2mM L-谷氨酰胺并补充有10% FBS的高葡萄糖DMEM中。
抽吸出细胞培养基并添加50μL标准细胞培养基(DMEM,10%FBS)。添加50μL由含0.2% DMSO的DMSO稀释系列制备的的2x化合物储备液,得到0.1%的最终DMSO浓度(即,DMSO储备液于标准培养基中的1:1000最终稀释液)。将板放回培育器中,保持1小时,用于pERK
Figure BDA0004194083620002411
在这一培育完成后,抽吸出培养基并使用与
Figure BDA0004194083620002412
检测试剂盒(PerkinElmer)一起提供的溶解缓冲液制备细胞溶解产物。使用/>
Figure BDA0004194083620002413
UltraTM HVpERK测定试剂盒(Perkin Elmer),遵循制造商的说明书测定在Thr202/Tyr204处的ERK1/2磷酸化情况。使用/>
Figure BDA0004194083620002414
多标记读板器(Perkin Elmer),使用标准/>
Figure BDA0004194083620002415
设置读取样品。将测定数据作图并在GraphPad Prism 7中使用四参数浓度-反应模型确定EC50值。提供的数据是由代表性实验得到的重复值的平均值+/-标准偏差。
利用3D
Figure BDA0004194083620002416
确定对SOS1和SHP2抑制剂的敏感性
在第0天,将细胞以5,000个细胞/孔接种(对于96孔,每孔100μL)于96孔超低吸附(ultra-low attachment,ULA)板(Corning#7007)中。接种后,立即在室温下将ULA板以1000RPM离心10分钟,随后在37℃和5% CO2下培育过夜。
在第1天,目测检查各孔以确定球状体形成。继续培育,直至第3天。
在第3天,从培育器取出ULA板并添加10μL含有11×所需最终浓度的测试化合物的新鲜培养基。将各板放在培育器中,在37℃和5% CO2下保持直至测定终点(第7-8天)。
在第8天,遵循制造商的说明书,执行ATP终点活力测定(
Figure BDA0004194083620002421
3D,Promega#G9681)。添加体积等于各孔中存在的细胞培养基的体积的/>
Figure BDA0004194083620002422
3D试剂(100μL)。将各板振荡5分钟。通过用移液管小心地上下移液10次来混合内含物,直至球状体完全解离。
将溶解产物转移至实心白色平底板(Corning#3917)中,并在室温下再培育25分钟。在SpectraMax多板读取器上测量发光。
结果
使用FRT/TO系统,在表达不同SHP2变体的HEK-293背景中产生十五个稳定同基因细胞系。将细胞与化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331)、BI-3406或RMC-4550一起培育,随后用表皮生长因子(EGF)刺激并利用
Figure BDA0004194083620002423
测量细胞pERK水平。参见图2A、图2B、图3A、图3B、图20A和图20B。在细胞背景中RMC-4550抑制突变体的效力与针对活化的SHP2变体的生物化学效力相关。参见图2A和图2B。
产生表达不同的稳定SHP2变体的四个同基因LN229细胞系。活化性突变在同基因LN229细胞系中诱导针对别构SHP2抑制的抗性,但维持针对SOS1抑制剂的敏感性。参见图4A至图4H。
实施例2.SOS1抑制剂在体外抑制路径信号传导和细胞生长并在带有SHP2活化性突变的肿瘤模型中在体内抑制肿瘤生长
在本实施例中,表征两种小鼠肿瘤细胞系,即KLN205(肺鳞状细胞癌)和PAN02(胰腺癌)。小鼠肿瘤细胞系含有高活化性G503VSHP2突变。在体外细胞培养实验中,SHP2别构抑制剂RMC-4550显示对pERK和细胞生长的低或中等抑制作用,甚至在10μM最高测试浓度下也是如此,而SOS1抑制剂BI-3406强效抑制两种细胞系中的pERK和生长。参见图5A至图5D。
与体外观察结果一致,在KLN205肿瘤细胞系(参见图6)和PAN02肿瘤细胞系(参见图7)中,BI-3406治疗在体内引起肿瘤生长的接近完全抑制,而SHP2别构抑制剂RMC-4550引起不到50%的肿瘤生长抑制。
使用以下方法获得图5A至图5D、图6和图7中显示的数据。
在体内对SOS1和SHP2抑制剂的敏感性的确定
所有研究是在HD Biosciences(San Diego,CA),遵循根据批准的机构动物护理和使用委员会IACUC方案中有关动物研究的所有相关伦理法规进行。
对于KLN205研究,对免疫功能正常的雌性(6-8周龄)DBA/2小鼠皮下植入0.5E+06个KLN205细胞。在肿瘤达到100mm3的平均体积后,起始施用MC-4550(30mg/kg,每天一次口服施用)、BI-3406(50mg/kg,每天两次口服施用)或媒剂(2% HPMC于50mM柠檬酸钠缓冲液中)。
对于PAN02研究,对雌性(6-8周龄)C57/B6皮下植入5E+06个PAN02细胞。在肿瘤达到100mm3体积后,起始施用RMC-4550(40mg/kg,每2天一次口服施用)、化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331)(100mg/kg,每天一次口服施用)或媒剂(2% HPMC于50mM柠檬酸钠缓冲液)。
结果
活化性突变G503V在同源小鼠细胞系KLN205和PAN02中诱导针对别构SHP2抑制的抗性,但维持针对SOS1抑制剂的敏感性。参见图5A至图5D,这些图是描绘pERK
Figure BDA0004194083620002441
测定的图。图5A至图5D的相关表格描绘/>
Figure BDA0004194083620002442
活力测定的结果。
相较于在免疫功能正常小鼠中的SHP2抑制(RMC-4550),在含有SHP2强活化性突变G503V的KLN205模型中,SOS1抑制(例如由BI-3406引起)引起明显较高水平的肿瘤生长抑制作用(TGI)。参见图6。
相较于在免疫功能正常的小鼠中的SHP2抑制(RMC-4550),在含有SHP2强活化性突变G503V的PAN02模型中,SOS1抑制(例如由化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331)引起)引起明显较高水平的肿瘤生长抑制作用(TGI)(图7)。
实施例3.SHP2活化性突变对于SOS1和SOS2的细胞依赖性具有不同作用。
SHP2部分地通过募集并活化SOS RAS鸟嘌呤核苷酸交换因子来活化MAPK路径信号传导。SOS存在两种同功型:SOS1和SOS2。SOS1和SOS2的精确作用仍有待说明,但普遍认为SHP2活化两种同功型,而SOS1抑制剂,如BI-3406和化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331)仅抑制SOS1。图8A至图8D中以具有四种不同SHP2突变的LN229细胞显示此情形。相较于利用非靶向对照siRNA进行的敲减,在所有情况下,基因敲减SOS2在暴露于BI-3406之后引起更完整深度的pERK抑制作用,这和SOS2在路径活化中具有与SOS1重叠的作用并且不为BI-3406的靶相符。在所有情况下,SOS1敲减完全消除BI-3406的作用,由此验证SOS1是BI-3406的靶并且展示SOS2可补偿SOS1损失。
图9显示基因敲减SOS1、SOS2或两者对在SHP2中具有不同活化性突变的LN229细胞中基础pERK水平的影响。根据在敲减后基础pERK减少的幅值所显示(图9),具有较强活化性SHP2突变(E76K和G503V)的LN229细胞对于SOS1和/或SOS2敲减展现出较强的敏感性。所有细胞都对SOS1和SOS2的同时敲减敏感,但出人意料的是,在带有较强活化性SHP2突变的细胞中往往观察到SOS1敲减的较强作用。相比之下,SOS2敲减在所有细胞系中仅具有较小且类似的作用。这表明,强活化性SHP2突变增加对SOS1的依赖性,并因此可增加对SOS1抑制剂,如对BI-3406和化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331)的敏感性。
鉴于这些结果,本发明的方法涵盖利用双重抑制剂抑制SOS1和SOS2的组合。考虑到SOS1敲减在具有较强活化性SHP2突变的细胞中有较强作用,故选择性SOS1抑制剂也是有用的。使用以下方法获得图8A至图8D和图9中所示的数据。
同基因LN229 SHP2突变型细胞系的产生
产生实验系统以测试SHP2突变体对同基因背景的活性。参见图4A至图4H、图8A至图8D及图9。利用Synthego CRISPR编辑技术引入SHP2突变,并产生稳定表达这些突变的LN229变体细胞系。
对SOS1和SOS2敲减的敏感性的确定
在转染前一天,收集具有各指定突变的LN229细胞并将其以10,000个细胞/孔的密度接种于96孔测定板中含有2mM L-谷氨酰胺并补充有10% FBS的高葡萄糖DMEM中。转染当天,根据Dharmafect I方案制备转染混合物。在各孔中,将含1μL的5μM siRNA的10μLOptiMEM与含0.2μL Dharmafect I的10μL OptiMEM组合,并在抽吸出平板接种培养基后,将80μL标准细胞培养基直接添加至细胞中。
每100个孔采用单一条件:110μL的5μM siRNA用OptiMEM培养基稀释至1.1mL。单独地,将22μL Dharmafect I稀释至1.1mL,并将各混合物在室温下培育5分钟。将1.1mL siRNA混合物与1.1mL Dharmafect混合物组合,并在室温下培育20分钟。将2.2mL siRNA/Dharmafect组合混合物用标准细胞培养基(例如RPMI+10%FBS,不含p/s)稀释至总计11mL。抽吸出所有待转染孔中的细胞培养基,将100μL转染混合物添加至各孔中。将细胞与转染混合物一起培育72小时。
抽吸出细胞培养基,添加50μL标准细胞培养基(10% DMEM、10% FBS)。添加由含0.2% DMSO的DMSO稀释系列制备的50μL的2x化合物储备液,得到0.1%的最终DMSO浓度(即,DMSO储备液于标准培养基中的1:1000最终稀释液)。将板放回培育器中,保持3小时。
在这一培育完成后,抽吸出培养基并使用与
Figure BDA0004194083620002461
检测试剂盒(PerkinElmer)一起提供的溶解缓冲液制备细胞溶解产物。使用/>
Figure BDA0004194083620002462
UltraTM HVpERK测定试剂盒(Perkin Elmer),遵循制造商的说明书测定在Thr202/Tyr204处的ERK1/2磷酸化情况。使用/>
Figure BDA0004194083620002463
多标记读板器(Perkin Elmer),使用标准/>
Figure BDA0004194083620002464
设置读取样品。将测定数据作图并在GraphPad Prism 7中使用四参数浓度-反应模型确定EC50值。提供的数据是由代表性实验得到的重复值的平均值+/-标准偏差。
结果
将细胞用SOS1或SOS2 siRNA转染,并与BI-3406一起培育,随后利用
Figure BDA0004194083620002465
测量细胞pERK水平。证实在具有部分抑制深度的非靶向对照组中对抑制具有敏感性的细胞系因SOS1敲减而免受BI-3406抑制,并且因SOS2敲减而变得敏感,由此恢复完全抑制深度。参见图8A至图8D。
总体而言,所有SHP2活化性突变在SOS1敲减后都展示基础pERK的显著减少,并且基础pERK的减少水平与活化的SHP2变体的生物化学效力相关。参见图9。
实施例4.SHP2突变体分析.
确定SHP2中活化性突变的ΔGop和强度
在不存在活化信号的情况下,SHP2呈现自抑制型(“关闭”)构象,在这一构象中,N-SH2结构域结合至活性位点,由此阻断与底物的接近。由N-SH2和C-SH2结构域结合至效应蛋白中含磷酸酪氨酸的序列引起的活化使得N-SH2结构域移出活性位点,由此产生活性(“开启”)构象。SHP2别构抑制剂仅以亲和力Ki结合至关闭构象,并且活化磷酸化肽(下文称为“肽”或“P”)仅以亲和力Kd结合至开启构象。SHP2的自抑制型构象具有以开启构象平衡常数Kop描述的固有稳定性。所有这些平衡常数也可根据以下公式,以吉布斯自由能(ΔG)表示:
Δ=-()
其中R是理想气体常数(所有分析中都使用0.00198588kcal/mol*K),并且T是绝对温度(所有分析都使用298K)。
Kop或ΔGop管理“SHP2的可活化性”,并且是野生型SHP2的固有特性,但会因突变而变化。一些突变会降低ΔGop,使得SHP2对含磷酸酪氨酸的肽引起的活化更敏感,而且对别构抑制剂不太敏感。这一变化的幅值随突变而变化,并且可以是较小的(弱活化性突变)、中等的(中度活化性突变)或较大的(强活化性突变)。
野生型SHP2或突变体的ΔGop可以由二维浓度反应实验确定,在该实验中,将随活化磷酸化肽(如SIRPA1)和别构抑制剂(如RMC-4550)的浓度变化来测量SHP2活性。此类实验的结果显示于图10中。
为了能由这一实验估计ΔGop,将拟合基于以下反应方案的模型,其中假设抑制剂对开启构象SHP2的亲和力和肽对关闭构象SHP2的亲和力可忽略。
Figure BDA0004194083620002471
可定义以下平衡常数:
Figure BDA0004194083620002481
Figure BDA0004194083620002482
Figure BDA0004194083620002483
呈开启状态的分子的分数(θop)等于
Figure BDA0004194083620002484
用分子和分母除以[关闭],得到
Figure BDA0004194083620002485
应注意,
Figure BDA0004194083620002486
和其它分数等于以上定义的平衡常数。代入这些值得到以下公式:
Figure BDA0004194083620002487
假设关闭构象的活性可忽略,则表观活性是开启构象的比活性与开启构象分数的乘积:
Figure BDA0004194083620002488
可将这一模型与图10中所示的实验相拟合以估计各参数的值。模型拟合曲线如图11中的线显示。由这一拟合得到的ΔGop是2.74kcal/mol。还显示了弱活化性突变体(A72S,2.03kcal/mol,图12)、中等活化性突变体(E69K,0.61kcal/mol,图13)和强活化性突变体(G503V,-0.62kcal/mol,图14)的实施例。
野生型SHP2和21种突变体的模型拟合参数概述于上表1中。ΔG对应于Kd,或对活化磷酸化肽的亲和力,并且ΔGi对应于Ki,或RMC-4550对SHP2关闭构象的亲和力。
弱活化性突变体定义为ΔGop比野生型SHP2低不超过1.5kcal/mol的突变体。中度活化性突变体具有比野生型低在1.5kcal/mol与2.24kcal/mol之间的ΔGop。强活化性突变体具有比野生型低超过2.24kcal/mol的ΔGop
方法
确定RMC-4550和肽SIRPA对荧光小分子底物磷酸6,8-二氟-4-甲基伞形酮(DiFMUP)水解的影响。一式三份,在96孔板中测定8种不同[SIRPA1肽]和12种不同[RMC-4550]的各SHP2变体。
制备在50mM HEPES pH 7.2、0.02% BSA中10μM储备液浓度(20X最大最终浓度)的SIRPA1(肽序列H2N-IT[Y]ADLNLP[PEG 8]HTE[Y]ASIQTSK-NH2(ThermoFisher定制肽),其中括号指示磷酸酪氨酸)。制备六种连续3倍稀释液,并且有一个孔仅用稀释缓冲液制备。在50mM HEPES pH 7.2、0.02% BSA中制备2μM浓度(20X最终浓度)的RMC-4550并制备10种连续3倍稀释液。有一个孔仅用稀释液制备。将1:1的SIRPA1和RMC-4550的20X连续稀释液以矩阵形式混合于96孔板中以制备10X肽+化合物板,其中在各行中[RMC-4550]递减并且在各列中[SIRPA1]递减。在100mM HEPESpH 7.2、200mM NaCl、1mM EDTA、2mM DTT、0.002% Brij35中制备2X最终浓度的酶。在0.5nM最终酶浓度下测定所有突变体并且以1nM测定野生型。
使用Agilent Bravo将50μl的2X酶储备液添加至96孔黑色聚苯乙烯板中并与10μl化合物/肽储备液混合。每种酶制备三个重复板。在制备后20-40分钟,培育各板,接着使用
Figure BDA0004194083620002501
Combi将40μl于水中的50μM DiFMUP添加至各孔中。振荡各板并在
Figure BDA0004194083620002502
M5读板器中以动力学模式读取五分钟,其中激发是在358nm并且发射在450nm。在SoftMax Pro中拟合线性信号-时间曲线并将斜率输出至Excel。由Softmax得到的斜率除以最终酶浓度而转换成比活性。
实施例5.SOS1抑制剂在带有SHP2活化性突变的肿瘤模型中在体内显示单药抗肿瘤活性
在本实施例中,表征两种小鼠肿瘤细胞系PAN02(胰腺癌,免疫功能正常)和LN229CDX(胶质瘤,免疫功能不全)。PAN02小鼠肿瘤细胞系含有高活化性G503V SHP2突变。LN229CDX含有高活化性A72S SHP2突变。在PAN02肿瘤细胞系(参见图15;100mg/kg po qd和250mg/kg po qd)和LN229 CDX肿瘤细胞系(参见图16;100mg/kg po qd)中,化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331)治疗在体内引起肿瘤生长的接近完全抑制。
在(A)使用雌性C57/BL6小鼠的PAN02同源模型中和(B)使用雌性balb/c无胸腺裸小鼠(6-8周龄)的LN229异种移植模型中评价SOS1抑制剂RMC-0331对体内肿瘤细胞生长的作用。将(A)PAN02肿瘤细胞(1e6个细胞/小鼠)或(B)LN229肿瘤细胞(10e6个细胞/小鼠)以50%基质胶皮下植入小鼠的侧腹中。在肿瘤达到约200mm3的平均大小后,就将小鼠随机分至治疗组中并施用测试物或媒剂(2% HPMC E-50、0.5% Tween-80于50mM柠檬酸钠缓冲液中,pH 4.0)。一周两次测量体重和肿瘤体积(使用数字式测径规),直至研究终点。每天通过经口管饲施用化合物。
实施例6.SOS1抑制剂在体外显示出与RAS(ON)抑制剂的组合益处
在本实施例中,表征两种细胞系SW837(结肠直肠癌,人)和PAN02(胰腺癌,小鼠)。SW837细胞系含有KRASG12C突变。PAN02小鼠肿瘤细胞系含有高活化性G503V SHP2突变。将细胞系用DMSO(媒剂)和恒定浓度的SOS1抑制剂化合物SOS1-(B)处理。用不同浓度的RAS抑制剂化合物RAS-(E)处理细胞系。图17A(1μM的SOS1抑制剂;SW837细胞系;不同浓度,或RAS抑制剂)和图17B(100nM的SOS1抑制剂;PAN02细胞系;不同浓度,或RAS抑制剂)示出细胞活力随RAS抑制剂的变化,图中描绘SOS1和RAS抑制对细胞活力的加合作用。根据二维效力转换实验方案获得数据。
实施例7.SOS1抑制剂在体内显示出与RAS(ON)抑制剂的组合益处
在本实施例中,表征两种小鼠肿瘤细胞系,即KLN205(肺鳞状细胞癌)和PAN02(胰腺癌)。小鼠肿瘤细胞系含有高活化性G503VSHP2突变。图18是Loewe 3D响应曲面图,显示了在Pan02细胞中观察到的SOS1抑制剂化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331)和RASMULTI(ON)抑制剂化合物RAS-(D)的体外组合作用。在图上任何点处协同分数>5指示所述两种化合物之间存在正相互作用。图19是Loewe 3D响应曲面图,显示了在KLN205细胞中观察到的SOS1抑制剂化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331)和RASMULTI(ON)抑制剂化合物RAS-(D)的体外组合作用。在图上任何点处协同分数>5指示所述两种化合物之间存在正相互作用。根据CrownSynTM方法获得数据。
实施例8.SOS1抑制剂在带有SHP2活化性突变的肿瘤模型中在体内显示单药抗肿瘤活性
方法:
在PTPN11突变型胶质母细胞瘤LN229.E76K的人类工程改造模型中,相较于RMC-4550和考比替尼评价化合物SOS1-(C)的抗肿瘤功效。将LN229.E76K(10×106个细胞/小鼠)以50%基质胶皮下植入6-7周龄无胸腺裸小鼠的侧腹中。在肿瘤达到200mm3的平均大小后,就将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或对照的施用。每天通过经口管饲施用所有治疗。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。
结果:
如图21中所示,在具有工程改造的PTPN11E76K突变的LN229.E76K GMB CDX模型中,每天以50mg/kg PO施用单药化合物SOS1-(C)引起80%的肿瘤生长抑制作用(TGI),每天以30mg/kg PO施用单药RMC-4550引起7%的TGI,并且每天以2.5mg/kg PO施用考比替尼引起41%的TGI。通过对肿瘤体积进行普通单因素方差分析以及在GraphPad Prism软件中利用事后Tukey检验进行的多重比较所评估,化合物SOS1-(C)和考比替尼的抗肿瘤活性相对于媒剂对照组有统计显著性(分别为****p<0.0001和*p<0.05),而对RMC-4550治疗的反应无统计显著性。所有治疗臂都是良好耐受的。
实施例9.SOS1抑制剂在带有SHP2活化性突变的肿瘤模型中在体内显示组合益处
方法:
在使用雌性C57BL/6J小鼠(6-7周龄)的鼠胰腺导管腺癌PAN02PTPN11G503V同源模型中评价化合物SOS1-(C)和RAS-(E)在体内对肿瘤细胞生长的组合作用。将在PBS中的PAN02肿瘤细胞(5×106个细胞/小鼠)皮下植入小鼠的侧腹中。在肿瘤达到约130mm3的平均大小后,就将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或对照的施用。每天通过经口管饲施用所有测试物。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。
结果:
如图22中所示,在具有PTPN11G503V突变的PAN02鼠PDAC CDX模型中,每天以50mg/kgPO施用单药化合物SOS1-(C)引起94%的肿瘤生长抑制作用(TGI),每天以25mg/kg PO施用单药RAS-(E)引起64%的TGI。然而,组合治疗的抗肿瘤活性引起54%的肿瘤体积减小。所有治疗臂相对于媒剂对照组有统计显著性(**p<0.01和****p<0.0001,通过对肿瘤体积进行普通单因素方差分析以及在GraphPad Prism软件中利用事后Tukey检验进行的多重比较评估)。
实施例10.SOS1抑制剂在带有SHP2活化性突变的肿瘤模型中在体内显示组合益处
方法:
在使用雌性C57BL/6J小鼠(6-7周龄)的鼠胰腺导管腺癌PAN02PTPN11G503V同源模型中评价化合物SOS1-(C)和考比替尼在体内对肿瘤细胞生长的组合作用。将在PBS中的PAN02肿瘤细胞(5×106个细胞/小鼠)皮下植入小鼠的侧腹中。在肿瘤达到约130mm3的平均大小后,就将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或对照的施用。每天通过经口管饲施用所有测试物。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。
结果:
如图23中所示,在具有PTPN11G503V突变的PAN02鼠PDAC CDX模型中,每天以100mg/kg PO施用单药化合物SOS1-(C)引起94%的肿瘤生长抑制作用(TGI),每天以2.5或5mg/kgPO施用单药考比替尼分别引起38%和49%的TGI。然而,通过对肿瘤体积进行普通单因素方差分析以及在GraphPad Prism软件中利用事后Tukey检验进行的多重比较所评估,组合治疗的抗肿瘤活性引起42%的肿瘤体积减小并且相对于媒剂对照组(****p<0.0001)且相对于5mg/kg考比替尼单药组(*p<0.05)有统计显著性。所有治疗臂都是良好耐受的。
实施例11.SOS1抑制剂在带有SHP2活化性突变的肿瘤模型中在体内显示组合益处
方法:
在使用雌性无胸腺裸小鼠(6-7周龄)的PTPN11突变型胶质母细胞瘤癌LN229.E76K异种移植模型的人类工程改造模型中评价化合物SOS1-(B)和考比替尼对体内肿瘤细胞生长的组合作用。将LN229.E76K肿瘤细胞(10×106个细胞/小鼠)以50%基质胶皮下植入小鼠的侧腹中。在肿瘤达到约200mm3的平均大小后,就将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或对照的施用。每天通过经口管饲施用所有测试物。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。
结果:
如图24中所示,在具有工程改造的PTPN11E76K突变的LN229.E76K GMB CDX模型中,每天以50mg/kg PO施用单药化合物SOS1-(B)引起85%的肿瘤生长抑制作用(TGI),每天以2.5PO施用单药考比替尼引起62%的TGI。通过对肿瘤体积进行普通单因素方差分析以及在GraphPad Prism软件中利用事后Tukey检验进行的多重比较所评估,组合治疗的抗肿瘤活性引起98%的TGI并且相对于媒剂对照组有统计显著性(**p<0.005)。所有治疗臂都是良好耐受的。利用2.5mg/kg考比替尼的单药治疗与媒剂治疗无显著不同。所有治疗臂都是良好耐受的。
实施例12.SOS1抑制剂在带有SHP2活化性突变的肿瘤模型中在体内显示组合益处
方法:
在使用雌性C57BL/6J小鼠(6-7周龄)的鼠胰腺导管腺癌PAN02PTPN11G503V同源模型中评价化合物SOS1-(C)和阿贝西利对体内肿瘤细胞生长的组合作用。将在PBS中的PAN02肿瘤细胞(5×106个细胞/小鼠)皮下植入小鼠的侧腹中。在肿瘤达到约130mm3的平均大小后,就将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或对照的施用。每天通过经口管饲施用所有测试物。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。
结果:
如图25中所示,在具有PTPN11G503V突变的PAN02鼠PDAC CDX模型中,单药化合物SOS1-(C)引起78%的肿瘤生长抑制作用(TGI),每天以30mg/kg PO施用单药阿贝西利引起52%的TGI。两种单药治疗相对于媒剂对照组有统计显著性(分别为****p<0.0001和***p<0.001)。然而,通过对肿瘤体积进行普通单因素方差分析以及在GraphPad Prism软件中利用事后Tukey检验进行的多重比较所评估,组合治疗的抗肿瘤活性引起97%的肿瘤体积减小并且相对于媒剂对照组有统计显著性(****p<0.0001)。所有治疗臂都是良好耐受的。在单药臂和治疗臂中,最初每天以100mg/kg PO施用化合物SOS1-(C),持续7天,接着降低至每天50mg/kg PO,持续研究剩余时间。
实施例13.SOS1抑制剂在带有SHP2活化性突变的肿瘤模型中在体内显示组合益处
方法:
在使用雌性C57BL/6小鼠(6-8周龄)的带有SHP2G503V突变的鼠同源胰腺导管腺癌细胞系PAN02中评价SOS1-(C)和抗PD1对体内肿瘤细胞生长的组合作用。将PAN02肿瘤(5×106个细胞/小鼠)皮下植入小鼠的侧腹中。在肿瘤达到约105mm3的平均大小后,就将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或媒剂的施用。每周两次通过腹膜内注射施用抗PD1(克隆RMP1-4),并且每天通过经口管饲施用SOS1-(C)。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。
结果:
如图26A、图26B、图26C、图26D、图26E和图26F中所示,在具有SHP2G503V突变的PAN02同源小鼠PDAC模型中,每天以50mg/kg PO施用单药SOS1-(C)引起90.91%的肿瘤生长抑制作用(TGI),并且每周两次以10mg/kg IP施用的单药抗PD1引起26.75%的PDI。所述组合在PAN02模型中引起93.96%的TGI并且在一只小鼠中引起完全肿瘤消退。通过对肿瘤体积进行普通单因素方差分析以及在GraphPad Prism软件中利用事后Tukey检验进行的多重比较所评估,相对于媒剂对照组,SOS1-(C)单药疗法的抗肿瘤活性有统计显著性,并且***p<0.001,并且组合治疗的抗肿瘤活性有统计显著性,并且****p<0.0001。细面图(Spaghettiplot)显示个别肿瘤反应。瀑布图显示在研究结束时的个别肿瘤反应,组合组中1/10的肿瘤显示完全消退。组合治疗是良好耐受的。
尽管已经结合以上陈述的具体实施方案描述了本发明,但本领域一般技术人员将显而易见其许多替代物、修改和其它变化。所有此类替代方案、修改和变化意图在本发明的精神和范围内。
附录A
RAS抑制剂
背景技术
绝大多数的小分子药物是通过结合靶蛋白上功能重要的口袋,由此调节该蛋白质的活性来起作用。例如,称为他汀类药物(statins)的降胆固醇药结合HMG-CoA还原酶的酶活性位点,由此防止该酶与其底物接合。事实上,已知许多此类药物/靶相互作用对,可能误导人们相信能够发现针对大多数(如果不是全部的话)蛋白质的小分子调节剂进而提供合理量的时间、努力和资源。但情况远非如此。目前,据估计,所有人体蛋白质中仅约10%可作为小分子的靶。Bojadzic和Buchwald,Curr Top Med Chem 18:674-699(2019)。其余90%当前被认为是以上提到的小分子药物发现难以治愈或难处理的。此类靶通常称为“不可入药(undruggable)”的。这些不可入药的靶包括医学上重要的人体蛋白质的大部分且通常未开发的储库。因此,人们对发现能够调节此类不可入药靶的功能的新颖分子模态非常感兴趣。
文献中已充分确定,Ras蛋白(K-Ras、H-Ras及N-Ras)在多种人类癌症中起到至关重要的作用,并因此成为抗癌疗法的适当靶。实际上,在美国,所有人类癌症中有约30%是由Ras蛋白突变引起,这些癌症中有许多是致命的。由活化性突变、过度表达或上游活化引起的Ras蛋白失调在人类肿瘤中较为常见,并且在人类癌症中常常发现Ras的活化性突变。例如,在Ras蛋白中密码子12处的活化性突变通过抑制GTP酶活化蛋白(GAP)依赖性和固有GTP水解速率,明显使Ras突变蛋白群偏向“开启”(GTP结合)状态(Ras(ON)),导致致癌性MAPK信号传导来起作用。值得注意的是,Ras对GTP展现皮摩尔浓度的亲和力,使得Ras即便是在低浓度这一核苷酸存在下也能够活化。在Ras中密码子13(例如G13D)和61(例如Q61K)处的突变也引起在一些癌症中的致癌活性。
尽管在过去数十年中,针对Ras进行了广泛的药物发现尝试,但直接靶向Ras的药物仍未得到批准。需要付出更多的努力来发现针对由各种Ras突变驱动的癌症的其它医药。
发明内容
本文提供Ras抑制剂。本文所描述的方法需要在合成配体与两种细胞内蛋白质之间形成高亲和力三组分复合物,该两种细胞内蛋白质在正常生理条件下不会相互作用:所关注的靶蛋白(例如Ras),以及在细胞中广泛表达的细胞质伴侣蛋白(呈现蛋白)(例如亲环蛋白A)。更具体点说,在一些实施方案中,本文所描述的Ras抑制剂通过驱动在Ras蛋白与广泛表达的细胞质伴侣蛋白亲环蛋白A(CYPA)之间形成高亲和力三重复合物而在Ras中诱导新结合口袋。不受理论束缚,本发明者相信,本发明化合物以及其形成的复合物对Ras发挥抑制作用的一种方式是在空间上阻塞Ras与传播致癌信号所需的下游效应分子如RAF和PI3K之间的相互作用位点。
因此,在一些实施方案中,本公开的特征在于一种结构式I的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620002581
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是不存在;-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、氰基、S(O)2R’、任选被取代的氨基、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;
R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是氢、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基。还提供了药物组合物,所述药物组合物包含式I的化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的赋形剂;并且
R16是氢或C1-C3烷基(例如甲基)。
具体点说,经审慎考虑,所论述的关于本发明一个实施方案的任何限制可适用于本发明的任何其它实施方案。另外,本发明的任何化合物或组合物均可用于本发明的任何方法中,并且本发明的任何方法均可用于制造或利用本发明的任何化合物或组合物。
附图简要说明
图1A:本发明化合物,即化合物A在Capan-2 CDX模型(PDAC,KRAS G12V/WT)中展现出PK依赖性RAS路径调节作用。单次剂量与两次施用化合物A的PK/PD测量值的比较。在第一次剂量后8小时递送的第二次剂量的化合物A以黑色箭头描绘。所有剂量水平均良好耐受。以对照百分比表示的肿瘤DUSP6 mRNA表达以条柱标绘于左侧y轴上。虚线指示恢复至DUSP6的对照水平。未结合的血浆PK(nM)以线绘制,在右侧y轴上以Log10尺度标绘。N=3/时间点。误差条表示平均值的标准误差。
图1B:本发明化合物,即化合物A和上游SHP2抑制在Capan-2CDX模型(PDAC,KRASG12V/WT)中的组合抗肿瘤活性。Capan-2细胞以50%基质胶植入。将动物随机分组并在平均肿瘤体积达到约180mm3时起始治疗。对动物给予20mg/kg po q2d SHP2抑制剂RMC-4550、100mg/kg po bid化合物A、组合RMC-4550和化合物A,或对照,持续40天。所有剂量水平都是耐受的。n=10只/组(在组合臂中,n=9)。Ns=不显著;通过单因素方差分析确定,***p<0.001。
定义及化学术语
在本申请中,除非自上下文另有清晰说明,否则(i)术语“一(a)”意思指“一或多”;(ii)术语“或”用于指“和/或”,除非明确指示该术语是指替代选择为唯一的或该替代选择是相互排斥的,不过,本公开支持的定义是指唯一替代选择以及“和/或”;(iii)术语“包含”和“包括”应理解为涵盖列出的组分或步骤,无论仅呈现所述组分或步骤自身还是呈现所述组分或步骤与一种或多种额外组分或步骤的组合;以及(iv)在提供范围时,端点包括在内。
如本文所使用,术语“约”用于指示一个值包括用于确定该值的装置或方法的误差的标准偏差。在某些实施方案中,术语“约”是指值的沿任一方向(大于或小于)在所述值的25%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%或更低百分比内的范围,除非另外规定或自上下文另外显而易见(例如在该数字将超过可能值的100%时)。
如本文所使用,在描述相邻原子的情形中,术语“相邻”是指由共价键直接连接的二价原子。
如本文所使用,“本发明化合物”和类似术语,无论明确指示与否,均是指本文所描述的Ras抑制剂,包括式I和其子式的化合物,以及表1和表2的化合物,以及其盐(例如药学上可接受的盐)、溶剂化物、水合物、立体异构体(包括阻转异构体)和互变异构体。
术语“野生型”是指具有在自然界中在“正常”(与突变、患病、改变等相对)状态或情形中所见的结构或活性的实体。本领域技术人员应理解,野生型基因和多肽通常以多种不同形式(例如等位基因)存在。
本领域技术人员应了解,本文所描述的某些化合物可以呈一种或多种不同异构形式(例如立体异构体、几何异构体、阻转异构体、互变异构体)或同位素形式(例如其中一个或多个原子被该原子的不同的同位素取代,如氢被氘取代)存在。除非另外指示或自上下文清楚可见,否则所描绘的结构可理解为表示个别或组合的任何此类异构或同位素形式。
本文所描述的化合物可以是不对称的(例如具有一个或多个立体中心)。除非另外指示,否则涵盖所有立体异构体,如对映异构体和非对映异构体。含有不对称取代的碳原子的本公开化合物可以呈光学活性形式或外消旋形式分离。本领域中已知由光学活性起始物质制备光学活性形式的方法,如通过拆分外消旋混合物或通过立体选择性合成方法制备。烯烃、C=N双键等许多几何异构体也可存在于本文所描述的化合物中,并且所有此类稳定异构体均涵盖在本公开中。本公开的化合物的顺式和反式几何异构体已有描述,并且可以呈异构体混合物形式或以分开的异构形式分离。
在一些实施方案中,本文所描绘的一种或多种化合物可以呈不同互变异构形式存在。自上下文将清楚可见,除非明确地排除,否则提到此类化合物涵盖所有此类互变异构形式。在一些实施方案中,互变异构形式是由一个单键与相邻双键交换且伴随质子的迁移得到。在某些实施方案中,互变异构形式可以是质子转移互变异构体,该互变异构体是具有与参考形式相同的经验式和总电荷的异构体质子化状态。具有质子转移互变异构形式的部分的实例有酮-烯醇对、酰胺-亚胺酸对、内酰胺-内酰亚胺对、酰胺-亚胺酸对、烯胺-亚胺对以及环状形式,在所述环状形式中,质子可占据杂环系统的两个或更多个位置,如1H-咪唑和3H-咪唑、1H-三唑、2H-三唑和4H-1,2,4-三唑、1H-异吲哚和2H-异吲哚,以及1H-吡唑和2H-吡唑。在一些实施方案中,互变异构形式可处于平衡状态或通过适当取代而在空间上锁定于一种形式。在某些实施方案中,互变异构形式是由缩醛相互转化得到。
除非另外规定,否则本文所描绘的结构也意欲包括仅因一个或多个同位素富集的原子的存在而不同的化合物。可并入本发明化合物中的示例性同位素包括氢、碳、氮、氧、磷、硫、氟、氯及碘的同位素,如2H、3H、11C、13C、14C、13N、15N、15O、17O、18O、32P、33P、35S、18F、36Cl、123I和125I。同位素标记的化合物(例如标记3H和14C的化合物)可用于化合物或底物组织分布测定中。氚化(即,3H)和碳-14(即,14C)同位素因其易于制备和检测而可用。另外,用较重同位素,如氘(即,2H)取代可由于代谢稳定性增强(例如体内半衰期增加或剂量需求减小)而提供某些治疗益处。在一些实施方案中,一个或多个氢原子被2H或3H置换,或者一个或多个碳原子被13C或14C富集的碳置换。正电子发射同位素,如15O、13N、11C和18F可用于正电子发射断层扫描(PET)研究中以检查底物受体占有情况。同位素标记的化合物的制备是本领域技术人员所知的。例如,同位素标记的化合物一般可遵循与所公开的关于本文所描述的本发明化合物的程序类似的程序,通过用同位素标记的试剂取代未同位素标记的试剂制备。
如本领域中所知,许多化学实体可呈现多种不同的固体形式,如非晶形或结晶形式(例如多晶型物、水合物、溶剂化物)。在一些实施方案中,本发明化合物可以呈任何此类形式使用,包括任何固体形式。在一些实施方案中,本文所描述或描绘的化合物可以呈水合物形式或溶剂化物形式提供。
在本说明书中各处,本公开的化合物的取代基是以群组或以范围公开。具体点说,本公开意欲包括所述群组和范围各成员的每一个别子组合。例如,术语“C1-C6烷基”特定地意欲个别地公开甲基、乙基、C3烷基、C4烷基、C5烷基及C6烷基。此外,在一种化合物包括多个位置,并且在这些位置处,取代基是以群组或以范围公开时,除非另外指示,否则本公开意欲涵盖在每个位置处含有成员的每一个别子组合的个别化合物和化合物群组(例如种类和子类)。
术语“任选被取代的X”(例如“任选被取代的烷基”)意欲等效于“X,其中X任选被取代”(例如“烷基,其中该烷基任选被取代”)。该术语并非意欲指特征“X”(例如烷基)本身是任选的。如本文所描述,某些所关注化合物可含有一个或多个“任选被取代”的部分。一般而言,术语“被取代”无论前面是否加有术语“任选地”,均意谓指定部分的一个或多个氢被适合取代基,例如本文所描述的取代基或基团中的任一者置换。除非另作指示,否则“任选被取代”的基团可在该基团的每个可取代位置处具有适合取代基,并且当在任何给定结构中的多于一个位置可被多于一个选自指定组的取代基取代时,该取代基可在每个位置处相同或不同。例如,在术语“任选被取代的C1-C6烷基-C2-C9杂芳基”中,该烷基部分、该杂芳基部分或两者可任选被取代。本公开所设想的取代基的组合优选是形成稳定或化学上可行的化合物的取代基组合。如本文所使用,术语“稳定”是指化合物当经历允许该化合物产生、检测且在某些实施方案中,允许该化合物回收、纯化以及用于一个或多个本文所公开的目的的条件时大体上不改变。
“任选被取代”的基团的可取代碳原子上的适合单价取代基可独立地为氘;卤素;-(CH2)0-4Ro;-(CH2)0-4ORo;-O(CH2)0-4Ro;O-(CH2)0-4C(O)ORo;-(CH2)0-4CH(ORo)2;-(CH2)0-4SRo;-(CH2)0-4Ph,该基团可被Ro取代;-(CH2)0-4O(CH2)0-1Ph,该基团可被Ro取代;-CH=CHPh,该基团可被Ro取代;-(CH2)0-4O(CH2)0-1-吡啶基,该基团可被Ro取代;4至8元饱和或不饱和杂环烷基(例如吡啶基);3至8元饱和或不饱和环烷基(例如环丙基、环丁基或环戊基);-NO2;-CN;-N3;-(CH2)0-4N(Ro)2;-(CH2)0-4N(Ro)C(O)Ro;-N(Ro)C(S)Ro;-(CH2)0-4N(Ro)C(O)NRo 2;-N(Ro)C(S)NRo 2;-(CH2)0-4N(Ro)C(O)ORo;-N(Ro)N(Ro)C(O)Ro;-N(Ro)N(Ro)C(O)NRo 2;-N(Ro)N(Ro)C(O)ORo;-(CH2)0-4C(O)Ro;-C(S)Ro;-(CH2)0-4C(O)ORo;-(CH2)0-4-C(O)-N(Ro)2;-(CH2)0-4-C(O)-N(Ro)-S(O)2-Ro;-C(NCN)NRo 2;-(CH2)0-4C(O)SRo;-(CH2)0-4C(O)OSiRo 3;-(CH2)0-4OC(O)Ro;-OC(O)(CH2)0-4SRo;-SC(S)SRo;-(CH2)0-4SC(O)Ro;-(CH2)0-4C(O)NRo 2;-C(S)NRo 2;-C(S)SRo;-(CH2)0-4OC(O)NRo 2;-C(O)N(ORo)Ro;-C(O)C(O)Ro;-C(O)CH2C(O)Ro;-C(NORo)Ro;-(CH2)0- 4SSRo;-(CH2)0-4S(O)2Ro;-(CH2)0-4S(O)2ORo;-(CH2)0-4OS(O)2Ro;-S(O)2NRo 2;-(CH2)0-4S(O)Ro;-N(Ro)S(O)2NRo 2;-N(Ro)S(O)2Ro;-N(ORo)Ro;-C(NORo)NRo 2;-C(NH)NRo 2;-P(O)2Ro;-P(O)Ro 2;-P(O)(ORo)2;-OP(O)Ro 2;-OP(O)(ORo)2;-OP(O)(ORo)Ro;-SiRo 3;-(C1-4直链或分支链亚烷基)O-N(Ro)2;或-(C1-4直链或分支链亚烷基)C(O)O-N(Ro)2,其中各Ro可如下文所定义被取代且独立地为氢、-C1-6脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph、-CH2-(5至6元杂芳基环)或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至6元饱和、部分不饱和或芳基环,或尽管有以上定义,但两个独立存在的Ro与其插入原子一起形成具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至12元饱和、部分不饱和或芳基单环或双环,其可如下文所定义被取代。
Ro(或由两个独立存在的Ro与其插入原子一起形成的环)上的适合单价取代基可独立地为卤素、-(CH2)0-2R、-(卤代R)、-(CH2)0-2OH、-(CH2)0-2OR、-(CH2)0-2CH(OR)2、-O(卤代R)、-CN;-N3、-(CH2)0-2C(O)R、-(CH2)0-2C(O)OH、-(CH2)0-2C(O)OR、-(CH2)0-2SR、-(CH2)0- 2SH、-(CH2)0-2NH2、-(CH2)0-2NHR、-(CH2)0-2NR 2、-NO2、-SiR 3、-OSiR 3、-C(O)SR、-(C1-4直链或分支链亚烷基)C(O)OR或-SSR,其中各R未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代,并且独立地选自C1-4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。Ro的饱和碳原子上的适合二价取代基包括=O和=S。
“任选被取代”的基团的饱和碳原子上的适合二价取代基包括以下:=O;=S;=NNR* 2;=NNHC(O)R*;=NNHC(O)OR*;=NNHS(O)2R*;=NR*;=NOR*;-O(C(R* 2))2-3O-或-S(C(R* 2))2-3S-,其中R*在每次独立出现时选自氢;C1-6脂肪族基团,该基团可如下文所定义被取代;或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的未被取代的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。结合至“任选被取代”的基团的邻近可取代碳的适合二价取代基包括:-O(CR* 2)2- 3O-,其中R*在每次独立出现时选自氢;C1-6脂肪族基团,其可如下文所定义被取代;或未被取代的具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。
R*的脂肪族基团上的适合取代基包括卤素、-R、-(卤代R)、-OH、-OR、-O(卤代R)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR、-NH2、-NHR、-NR 2或-NO2,其中各R未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代,并且独立地是C1-4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0– 1Ph,或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。
“任选被取代”的基团的可取代氮上的适合取代基包括
Figure BDA0004194083620002671
Figure BDA0004194083620002672
Figure BDA0004194083620002673
或/>
Figure BDA0004194083620002674
其中各/>
Figure BDA0004194083620002675
独立地是氢;C1-6脂肪族基团,其可如下文所定义被取代;未被取代的-OPh;或未被取代的具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至6元饱和、部分不饱和或芳基环;或尽管上文有定义,但两个独立出现的/>
Figure BDA0004194083620002681
连同其一个或多个间杂原子一起形成未被取代的具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至12元饱和、部分不饱和或芳基单环或双环。
Figure BDA0004194083620002682
的脂肪族基团上的适合取代基独立地是卤素、-R、-(卤代R)、-OH、-OR、-O(卤代R)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR、-NH2、-NHR、-NR 2或-NO2,其中各R未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代,并且独立地是C1-4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph,或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。/>
Figure BDA0004194083620002683
的饱和碳原子上的适合二价取代基包括=O和=S。
如本文所使用,术语“乙酰基”是指基团-C(O)CH3
如本文所使用,术语“烷氧基”是指-O-C1-C20烷基,其中该烷氧基通过氧原子连接至化合物的其余部分。
如本文所使用,术语“烷基”是指含有1至20个(例如1至10个或1至6个)碳的饱和、直链或分支链单价烃基。在一些实施方案中,烷基是非分支链的(即,是线性的);在一些实施方案中,烷基是分支链的。烷基是例如但不限于甲基、乙基、正丙基和异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基和叔丁基,以及新戊基。
如本文所使用,术语“亚烷基”表示由直链或分支链饱和烃通过移除两个氢原子得到的饱和二价烃基,并且其实例有亚甲基、亚乙基、亚异丙基等。术语“Cx-Cy亚烷基”表示具有在x与y个之间的碳的亚烷基。示例性x值是1、2、3、4、5及6,并且示例性y值是2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、14、16、18或20(例如C1-C6、C1-C10、C2-C20、C2-C6、C2-C10或C2-C20亚烷基)。在一些实施方案中,亚烷基可进一步被1、2、3或4个如本文所定义的取代基取代。
除非另外具体说明,否则如本文所使用,术语“烯基”表示含有一个或多个碳-碳双键的具有2至20个碳(例如2至6个或2至10个碳)的单价直链或分支链基团,并且其实例是乙烯基、1-丙烯基、2-丙烯基、2-甲基-1-丙烯基、1-丁烯基及2-丁烯基。烯基包括顺式和反式异构体两种。除非另外具体说明,否则如本文所使用,术语“亚烯基”表示含有一个或多个碳-碳双键的具有2至20个碳(例如2至6个或2至10个碳)的二价直链或分支链基团。
如本文所使用,术语“炔基”表示含有碳-碳三键的具有2至20个碳(例如2至4个、2至6个或2至10个碳)的单价直链或分支链基团,并且其实例有乙炔基及1-丙炔基。
如本文所使用,术语“炔基砜”表示包含结构
Figure BDA0004194083620002691
的基团,其中R是本文所描述的任何化学上可行的取代基。
如本文所使用,术语“氨基”表示
Figure BDA0004194083620002692
例如-NH2和-N(CH3)2
如本文所使用,术语“氨基烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个氨基部分取代的烷基部分。
如本文所描述,术语“氨基酸”是指具有侧链、氨基和酸基(例如-CO2H或-SO3H)的分子,其中该氨基酸通过所述侧链、氨基或酸基(例如侧链)连接至母分子基团。如本文所使用,术语“氨基酸”在最广泛意义上是指可例如通过形成一个或多个肽键并入多肽链中的任何化合物或物质。在一些实施方案中,氨基酸具有通用结构H2N-C(H)(R)-COOH。在一些实施方案中,氨基酸是天然存在的氨基酸。在一些实施方案中,氨基酸是合成氨基酸;在一些实施方案中,氨基酸是D-氨基酸;在一些实施方案中,氨基酸是L-氨基酸。“标准氨基酸”是指天然存在的肽中常见的二十种标准L-氨基酸中的任一种。示例性氨基酸包括丙氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、组氨酸、任选被取代的羟基正缬氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、正缬氨酸、鸟氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、吡咯赖氨酸、硒代半胱氨酸、丝氨酸、牛磺酸、苏氨酸、色氨酸、酪氨酸及缬氨酸。
如本文所使用,术语“芳基”表示由碳原子形成的单价单环、双环或多环系统,其中连接至侧接基团的环是芳香环。芳基的实例有苯基、萘基、菲基和蒽基。芳环可在产生稳定结构的任何杂原子或碳环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用,术语“C0”表示键。例如,术语-N(C(O)-(C0-C5亚烷基-H)-的一部分包括-N(C(O)-(C0亚烷基-H)-,也表示为-N(C(O)-H)-。
如本文所使用,术语“碳环”和“碳环基”是指单价、任选被取代的C3-C12单环、双环或三环结构,该环结构可以是桥接环、稠合环或螺环,其中所有环均由碳原子形成,并且至少一个环是非芳香环。碳环结构包括环烷基、环烯基和环炔基。碳环基的实例有环己基、环己烯基、环辛炔基、1,2-二氢萘基、1,2,3,4-四氢萘基、芴基、茚基、二氢茚基、十氢萘基等。碳环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用,术语“羰基”表示C(O)基团,该基团也可表示为C=O。
如本文所使用,术语“羧基”意思指-CO2H、(C=O)(OH)、COOH或C(O)OH,或未质子化的对应物。
如本文所使用,术语“氰基”表示-CN基团。
如本文所使用,术语“环烷基”表示单价饱和环状烃基,除非另外具体说明,否则该基团可以是具有三至八个环碳的桥接环、稠合环或螺环,并且其实例有环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基及环庚基。
如本文所使用,术语“环烯基”表示单价、非芳香族饱和环状烃基,除非另外具体说明,否则该基团可以是具有三至八个环碳且含有一个或多个碳-碳双键的桥接环、稠合环或螺环。
如本文所使用,术语“非对映异构体”意思指不互为镜像且彼此不可重叠的立体异构体。
如本文所使用,术语“对映异构体”意思指具有至少80%(即,至少90%的一种对映异构体和至多10%的另一种对映异构体)、优选至少90%且更优选至少98%的光学纯度或对映异构体过量(如通过本领域中的标准方法确定)的本发明化合物的每一个别光学活性形式。
术语“胍基”是指具有以下结构的基团:
Figure BDA0004194083620002711
其中各R独立地为本文所描述的任何化学上可行的取代基。
如本文所使用,术语“胍基烷基烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个胍基部分取代的烷基部分。
如本文所使用,术语“卤代乙酰基”是指至少一个氢被卤素置换的乙酰基。
如本文所使用,术语“卤烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个相同或不同的卤素部分取代的烷基部分。
如本文所使用,术语“卤素”表示选自溴、氯、碘或氟的卤素。
如本文所使用,术语“杂烷基”是指至少一个碳原子被杂原子(例如O、N或S原子)置换的如本文所定义的“烷基”。杂原子可出现在基团的中间或末端。
如本文所使用,术语“杂芳基”表示含有至少一个完全芳香环的单价、单环或多环结构:即,它在该单环或多环系统内含有4n+2个π电子,并且在该芳香环中含有至少一个选自N、O或S的杂原子。示例性未被取代的杂芳基具有1至12个(例如1至11个、1至10个、1至9个、2至12个、2至11个、2至10个或2至9个)碳。术语“杂芳基”包括任一上述杂芳香环与一个或多个芳环或碳环,例如苯基环或环己烷环稠合的双环、三环和四环基团。杂芳基的实例包括但不限于吡啶基、吡唑基、苯并噁唑基、苯并咪唑基、苯并噻唑基、咪唑基、噻唑基、喹啉基、四氢喹啉基及4-氮杂吲哚基。杂芳基环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。在某一实施方案中,杂芳基被1、2、3或4个取代基取代。
如本文所使用,术语“杂环烷基”表示至少一个环是非芳香环且其中该非芳香环含有一个、两个、三个或四个独立地选自由氮、氧和硫组成的组的杂原子的单价、单环、双环或多环系统,该环系统可以是桥接环、稠合环或螺环。5元环具有零至两个双键,并且6元环和7元环具有零至三个双键。示例性未被取代的杂环烷基具有1至12个(例如1至11个、1至10个、1至9个、2至12个、2至11个、2至10个或2至9个)碳。术语“杂环烷基”也表示具有桥接多环结构的杂环化合物,其中一个或多个碳或杂原子桥接单环的两个不相邻成员,例如奎宁环基。术语“杂环烷基”包括任一上述杂环与一个或多个芳香环、碳环、杂芳香环或杂环,例如芳基环、环己烷环、环己烯环、环戊烷环、环戊烯环、吡啶环或吡咯烷环稠合的双环、三环和四环基团。杂环烷基的实例有吡咯烷基、哌啶基、1,2,3,4-四氢喹啉基、十氢喹啉基、二氢吡咯并吡啶基及十氢萘啶基。杂环烷基环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用,术语“羟基”表示-OH基团。
如本文所使用,术语“羟基烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个-OH部分取代的烷基部分。
如本文所使用,术语“异构体”意思指任何本发明化合物的任何互变异构体、立体异构体、阻转异构体、对映异构体或非对映异构体。应认识到,本发明化合物可具有一个或多个手性中心或双键,并因此,以立体异构体形式,如以双键异构体(即,E/Z几何异构体)或非对映异构体(例如对映异构体(即,(+)或(-))或顺/反异构体)形式存在。根据本发明,本文所描绘的化学结构且因此本发明化合物涵盖所有相应立体异构体,即,立体异构纯(例如几何异构纯、对映异构体纯或非对映异构体纯)形式以及对映异构体和立体异构体混合物,例如外消旋物。本发明化合物的对映异构体和立体异构体混合物可典型地通过众所周知的方法,如手性相气相色谱法、手性相高效液相色谱法、使化合物以手性盐络合物形式结晶或使化合物在手性溶剂中结晶来拆分成其组分对映异构体或立体异构体。对映异构体和立体异构体也可由立体异构纯或对映异构纯的中间体、试剂和催化剂,通过众所周知的不对称合成方法获得。
如本文所使用,术语“连接体”是指将式I化合物中的部分B连接至部分W,使得所得化合物能够在以下实施例中提供以及此处提供的Ras-RAF破坏测定方案中获得2uM或更低IC50值的二价有机部分:
这一生物化学测定的目的是测量测试化合物促进在载有核苷酸的Ras同功型与亲环蛋白A之间形成三元复合物的能力;由此得到的三元复合物破坏与BRAFRBD构建体的结合,抑制Ras通过RAF效应子进行的信号传导。
在含有25mM HEPES pH 7.3、0.002% Tween20、0.1% BSA、100mM NaCl及5mMMgCl2的测定缓冲液中,将无标记亲环蛋白A、His6-K-Ras-GMPPNP(或其它Ras变体)和GST-BRAFRBD分别以25μM、12.5nM和50nM的最终浓度组合于384孔测定板中。测定板各孔中存在的化合物是自30μM最终浓度起始,经历10点3倍连续稀释的稀释液。在25℃下培育3小时之后,接着将抗His Eu-W1024和抗GST别藻蓝蛋白的混合物添加至测定样品孔中分别达到10nM和50nM的最终浓度,并将反应再培育1.5小时。在微孔板读取器(Ex320nm,Em 665/615nm)上读取TR-FRET信号。促进Ras:RAF复合物破坏的化合物被鉴别为使TR-FRET比率相对于DMSO对照孔降低的化合物。
在一些实施方案中,连接体包含20个或更少的线性原子。在一些实施方案中,连接体包含15个或更少的线性原子。在一些实施方案中,连接体包含10个或更少的线性原子。在一些实施方案中,连接体的分子量低于500g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于400g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于300g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于200g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于100g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于50g/mol。
如本文所使用,“单价有机部分”小于500kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于400kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于300kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于200kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于100kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于50kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于25kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于20kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于15kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于10kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于1kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于500g/mol。在一些实施方案中,“单价有机部分”在500g/mol与500kDa之间的范围内。
如本文所使用,术语“立体异构体”是指一种化合物(例如本文所描述的任何式的化合物)可能具有所有可能的不同异构以及构形形式,特别是基础分子结构的所有可能的立体化学和构形异构形式、所有非对映异构体、对映异构体或构形异构体,包括阻转异构体。本发明的一些化合物可以呈不同互变异构形式存在,所有这些互变异构形式均包括在本发明的范围内。
如本文所使用,术语“磺酰基”表示-S(O)2-基团。
如本文所使用,术语“硫代羰基”是指-C(S)-基团。
如本文所使用,术语“乙烯基酮”是指包含直接连接至碳-碳双键的羰基的基团。
如本文所使用,术语“乙烯基砜”是指包含直接连接至碳-碳双键的磺酰基的基团。
如本文所使用,术语“炔酮”是指包含结构
Figure BDA0004194083620002751
的基团,其中R是本文所描述的任何在化学上可行的取代基。
本领域技术人员阅读本公开将理解,本文所描述的某些化合物可以呈多种形式中的任一种提供或利用,如盐形式、被保护的形式、前药形式、酯形式、异构形式(例如光学或结构异构体)、同位素形式等。在一些实施方案中,提到的特定化合物可指该化合物的特定形式。在一些实施方案中,提到的特定化合物可指呈任何形式的该化合物。在一些实施方案中,例如,一种化合物的单一立体异构体的制剂可视为该化合物的不同形式而非该化合物的外消旋混合物;一种化合物的特定盐可视为与该化合物的另一种盐不同的形式;含有双键的一种构形异构体((Z)或(E))的制剂可视为与含有该双键的另一种构形异构体((E)或(Z))的制剂不同的形式;一个或多个原子的同位素不同于参考制剂中存在的同位素的制剂可视为呈不同形式。
具体实施方式
化合物
本文提供Ras抑制剂。本文所描述的方法需要在合成配体与两种细胞内蛋白质之间形成高亲和力三组分复合物,该两种细胞内蛋白质在正常生理条件下不会相互作用:所关注的靶蛋白(例如Ras),以及在细胞中广泛表达的细胞质伴侣蛋白(呈现蛋白)(例如亲环蛋白A)。更具体点说,在一些实施方案中,本文所描述的Ras抑制剂通过驱动在Ras蛋白与广泛表达的细胞质伴侣蛋白亲环蛋白A(CYPA)之间形成高亲和力三重复合物而在Ras中诱导新结合口袋。不受理论束缚,本发明者相信,本发明化合物以及其形成的复合物对Ras发挥抑制作用的一种方式是在空间上阻塞Ras与传播致癌信号所需的下游效应分子如RAF之间的相互作用位点。
不受理论束缚,本发明人假定,本发明化合物与Ras和伴侣蛋白(例如亲环蛋白A)的非共价相互作用可促成对Ras活性的抑制。例如,范德华(van der Waals)相互作用、疏水相互作用、亲水相互作用和氢键相互作用,以及其组合可促成本发明化合物形成复合物并充当Ras抑制剂的能力。因此,本发明化合物可抑制多种Ras蛋白(例如K-Ras、N-Ras、H-Ras以及其在12位、13位及61位突变的突变体,如G12C、G12D、G12V、G12S、G13C、G13D及Q61L,以及本文所描述的其它突变体)。
因此,本文提供一种具有式00结构的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620002761
Figure BDA0004194083620002771
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
swIp(Switch I/P环)是指非共价结合至Ras蛋白的Switch I结合袋和P环的残基12或13的有机部分(参见例如Johnson等人,292:12981-12993(2017),以引用的方式并入本文中);
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;
R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;并且
R16是氢或C1-C3烷基(例如甲基)。在一些实施方案中,所得化合物能够在本文所描述的Ras-RAF破坏测定方案中实现2uM或更低(例如1.5uM、1uM、500nM或100nM或更低)的IC50。
因此,本文提供了一种具有式I的结构的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620002801
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是不存在;-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、氰基、S(O)2R’、任选被取代的氨基、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;
R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是氢、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;
R16是氢或C1-C3烷基(例如甲基)。
在一些实施方案中,本公开的特征在于一种具有式Ia的结构的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620002841
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;
R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
在一些实施方案中,本公开的特征在于一种具有式Ib的结构的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620002871
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5和Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,G是任选被取代的C1-C4亚杂烷基。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Ic的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620002911
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5和Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;
R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,X2是NH。在一些实施方案中,X3是CH。
在本发明化合物的一些实施方案中,R11是氢。在一些实施方案中,R11是C1-C3烷基。在一些实施方案中,R11是甲基。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Id的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620002941
/>
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5和Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,X1是任选被取代的C1-C2亚烷基。在一些实施方案中,X1是亚甲基。在一些实施方案中,X1是被C1-C6烷基或卤素取代的亚甲基。在一些实施方案中,X1是-CH(Br)-。在一些实施方案中,X1是-CH(CH3)-。
在本发明化合物的一些实施方案中,R3不存在。
在本发明化合物的一些实施方案中,R4是氢。
在本发明化合物的一些实施方案中,R5是氢。在一些实施方案中,R5是任选被卤素取代的C1-C4烷基。在一些实施方案中,R5是甲基。
在本发明化合物的一些实施方案中,Y4是C。在一些实施方案中,Y5是CH。在一些实施方案中,Y6是CH。在一些实施方案中,Y1是C。在一些实施方案中,Y2是C。在一些实施方案中,Y3是N。在一些实施方案中,Y7是C。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Ie的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620002971
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R6是氢。
在本发明化合物的一些实施方案中,R2是氢、氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至6元杂环烷基。在一些实施方案中,R2是任选被取代的C1-C6烷基,例如乙基。在一些实施方案中,R2是氟C1-C6烷基,例如-CH2CH2F、-CH2CHF2或-CH2CF3
在本发明化合物的一些实施方案中,R7是任选被取代的C1-C3烷基。在一些实施方案中,R7是C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R8是任选被取代的C1-C3烷基。在一些实施方案中,R8是C1-C3烷基,例如甲基。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式If的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620003001
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R1是5至10元杂芳基。在一些实施方案中,R1是任选被取代的6元芳基或任选被取代的6元杂芳基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R1
Figure BDA0004194083620003011
/>
Figure BDA0004194083620003012
Figure BDA0004194083620003013
或其立体异构体。在一些实施方案中,R1是/>
Figure BDA0004194083620003014
或其立体异构体。在一些实施方案中,R1是/>
Figure BDA0004194083620003015
在一些实施方案中,R1是/>
Figure BDA0004194083620003021
或其立体异构体。在一些实施方案中,R1是/>
Figure BDA0004194083620003022
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Ig的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620003023
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
Xe是N、CH或CR17
Xf是N或CH;
R12是任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基;并且
R17是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
在本发明化合物的一些实施方案中,Xe是N并且Xf是CH。在一些实施方案中,Xe是CH并且Xf是N。在一些实施方案中,Xe是CR17并且Xf是N。
在本发明化合物的一些实施方案中,R12是任选被取代的C1-C6杂烷基。在一些实施方案中,R12
Figure BDA0004194083620003041
Figure BDA0004194083620003042
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Ih的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620003043
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
Xe是CH或CR17;并且
R17是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Ii的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620003051
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,A是任选被取代的6元亚芳基。在一些实施方案中,A具有以下结构:
Figure BDA0004194083620003061
其中R13是氢、羟基、氨基、氰基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基。在一些实施方案中,R13是氢。在一些实施方案中,R13是羟基。在一些实施方案中,A是任选被取代的5至10元亚杂芳基。在一些实施方案中,A是:
Figure BDA0004194083620003062
在一些实施方案中,A是任选被取代的5至6元亚杂芳基。在一些实施方案中,A是:
Figure BDA0004194083620003071
在一些实施方案中,A是/>
Figure BDA0004194083620003072
在本发明化合物的一些实施方案中,B是-CHR9-。在一些实施方案中,R9是任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的3至6元环烷基。在一些实施方案中,R9是:
Figure BDA0004194083620003073
Figure BDA0004194083620003074
在一些实施方案中,R9是:/>
Figure BDA0004194083620003075
在一些实施方案中,R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
在一些实施方案中,B是任选被取代的6元亚芳基。
在一些实施方案中,B是6元亚芳基。在一些实施方案中,B是:
Figure BDA0004194083620003076
在一些实施方案中,B不存在。
在本发明化合物的一些实施方案中,R7是甲基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R8是甲基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R16是氢。
在本发明化合物的一些实施方案中,连接体是式II的结构:
A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-(D1)-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2
式II
其中A1是在所述连接体与B之间的键;A2是在W与所述连接体之间的键;B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S和NRN;RN是氢、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C3环烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的C1-C7杂烷基;C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基;f、g、h、i、j及k各自独立地为0或1;并且D1是任选被取代的C1-C10亚烷基、任选被取代的C2-C10亚烯基、任选被取代的C2-C10亚炔基、任选被取代的3至14元亚杂环烷基、任选被取代的5至10元亚杂芳基、任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的6至10元亚芳基、任选被取代的C2-C10亚聚乙二醇或任选被取代的C1-C10亚杂烷基或将A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-连接至-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2的化学键。在一些实施方案中,所述连接体是无环的。在一些实施方案中,所述连接体具有式IIa的结构:
Figure BDA0004194083620003081
其中Xa不存在或为N;
R14是不存在、氢或任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C3环烷基;并且
L2是不存在、-C(O)-、-SO2-、任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C1-C4亚杂烷基,其中Xa、R14或L2中的至少一个存在。在一些实施方案中,所述连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620003082
Figure BDA0004194083620003091
在一些实施方案中,L是/>
Figure BDA0004194083620003092
在一些实施方案中,L是/>
Figure BDA0004194083620003093
在一些实施方案中,连接体是或包含环状基团。在一些实施方案中,连接体具有式IIb的结构:/>
Figure BDA0004194083620003094
其中o是0或1;
Xb是C(O)或SO2
R15是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
Cy是任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的3至8元亚杂环烷基、任选被取代的6-10元亚芳基或任选被取代的5至10元亚杂芳基;并且
L3是不存在、-C(O)-、-SO2-、任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C1-C4亚杂烷基。在一些实施方案中,连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620003095
/>
Figure BDA0004194083620003101
/>
Figure BDA0004194083620003111
在本发明化合物的一些实施方案中,W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至8元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或3至8元杂芳基。
在本发明化合物的一些实施方案中,W是氢。在一些实施方案中,W是任选被取代的氨基。在一些实施方案中,W是-NHCH3或-N(CH3)2。在一些实施方案中,W是任选被取代的C1-C4烷氧基。在一些实施方案中,W是甲氧基或异丙氧基。在一些实施方案中,W是任选被取代的C1-C4烷基。在一些实施方案中,W是甲基、乙基、异丙基、叔丁基或苯甲基。在一些实施方案中,W是任选被取代的酰胺基。在一些实施方案中,W是
Figure BDA0004194083620003112
在一些实施方案中,W是任选被取代的酰胺基。在一些实施方案中,W是/>
Figure BDA0004194083620003113
在一些实施方案中,W是任选被取代的C1-C4羟基烷基。在一些实施方案中,W是/>
Figure BDA0004194083620003114
在一些实施方案中,W是任选被取代的C1-C4氨基烷基。在一些实施方案中,W是
Figure BDA0004194083620003115
Figure BDA0004194083620003116
Figure BDA0004194083620003117
在一些实施方案中,W是任选被取代的C1-C4卤代烷基。在一些实施方案中,W是
Figure BDA0004194083620003118
在一些实施方案中,W是任选被取代的C1-C4胍基烷基。在一些实施方案中,W是/>
Figure BDA0004194083620003121
在一些实施方案中,W是C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基。在一些实施方案中,W是
Figure BDA0004194083620003122
/>
Figure BDA0004194083620003123
/>
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在一些实施方案中,W是任选被取代的3至8元环烷基。在一些实施方案中,W是/>
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Figure BDA0004194083620003163
Figure BDA0004194083620003164
在一些实施方案中,W是任选被取代的3至8元杂芳基。在一些实施方案中,W是/>
Figure BDA0004194083620003165
Figure BDA0004194083620003166
Figure BDA0004194083620003167
在一些实施方案中,W是任选被取代的6至10元芳基(例如苯基、4-羟基-苯基或2,4-甲氧基-苯基)。
在一些实施方案中,本发明化合物选自表1或其药学上可接受的盐或立体异构体。在一些实施方案中,本发明化合物选自表1或其药学上可接受的盐或阻转异构体。
表1:某些本发明化合物
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Figure BDA0004194083620004501
应注意,一些化合物中的键以平直线或楔形线显示。在一些情况下,立体异构体的相对立体化学已确定;在一些情况下,绝对立体化学已确定。在一些情况下,单个实施例编号对应于立体异构体混合物。上表化合物的所有立体异构体均涵盖在本发明中。在特定实施方案中,涵盖上表化合物的阻转异构体。括号中显示的任何化合物指示,该化合物是非对映异构体,并且此类非对映异构体的绝对立体化学可能未知。
在一些实施方案中,提供表2的化合物,或其药学上可接受的盐。在一些实施方案中,本发明化合物选自表2或其药学上可接受的盐或阻转异构体。
表2:某些本发明化合物
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应注意,一些化合物中的键以平直线或楔形线显示。在一些情况下,立体异构体的相对立体化学已确定;在一些情况下,绝对立体化学已确定。上表化合物的所有立体异构体均涵盖在本发明中。在特定实施方案中,涵盖上表化合物的阻转异构体。
在一些实施方案中,本发明化合物是或充当前药,例如对于施用给细胞或有需要的受试者来说。
还提供了药物组合物,所述药物组合物包含本发明化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的赋形剂。
对于本发明化合物而言,一种立体异构体展现的抑制作用可优于另一种立体异构体。例如,一种阻转异构体可展现抑制作用,而另一种阻转异构体可展现极低或不展现抑制作用。
合成方法
本文所描述的化合物可由市售起始物质制备或使用已知的有机、无机或酶方法合成。
本发明化合物可通过有机合成领域的技术人员众所周知的多种方式制备。例如,本发明化合物可使用以下方案中所描述的方法,以及合成有机化学技术中已知的合成方法或本领域技术人员所理解的关于所述方法的修改来合成。这些方法包括但不限于以下方案中所描述的方法。
本文表1中的化合物是是使用本文所公开的方法制备或使用本文所公开的方法结合本领域技术人员的知识制备。表2的化合物可以使用本文所公开的方法制备或可使用本文所公开的方法结合本领域技术人员的知识制备。
方案1.大环酯的一般合成方法
Figure BDA0004194083620004831
方案1中概述了大环酯的一般合成方法。适当取代的芳基吲哚中间体(1)可以利用受保护的3-(5-溴-2-碘-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇和适当取代的硼酸为起始物质,分三个步骤制备,包括钯介导的偶合、烷基化和脱保护反应。
甲基-氨基-六氢哒嗪-3-甲酸酯-硼酸酯(2)可分三个步骤制备,包括保护、铱催化剂介导的硼基化以及与(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯偶合。
适当取代的乙酰基吡咯烷-3-羰基-N-甲基-L-缬氨酸(4)可通过以下来制备:使甲基-L-缬氨酸酯与受保护的(S)-吡咯烷-3-甲酸偶合,随后进行脱保护、与适当取代的羧酸偶合和水解步骤。
最终的大环酯可通过以下来制备:使甲基-氨基-六氢哒嗪-3-甲酸酯-硼酸酯(2)与中间体(1)在Pd催化存在下偶合,随后进行水解和大环内酯化步骤,以得到适当保护的大环中间体(5)。脱保护并与适当取代的乙酰基吡咯烷-3-羰基-N-甲基-L-缬氨酸(4)偶合产生大环产物。需要额外脱保护或官能化步骤来制备最终化合物。例如,本领域技术人员将能够将式(I)化合物所需的-B-L-W基团装载于大环酯中,其中B、L和W如本文所定义,包括通过使用本文实施例部分中例示的方法进行。
方案2.替代性大环酯的一般合成方法
Figure BDA0004194083620004841
替代地,可如方案2中所描述来制备大环酯。适当保护的溴-吲哚基(6)在Pd催化剂存在下与硼酸酯(3)偶合,随后进行碘化、脱保护和酯水解。随后与(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯偶合,接着进行水解和大环内酯化可产生碘中间体(7)。在Pd催化存在下与适当取代的硼酸酯偶合并烷基化可得到完全保护的大环(5)。需要额外脱保护或官能化步骤来制备最终化合物。例如,本领域技术人员将能够将式(I)化合物所需的-B-L-W基团装载于大环酯中,其中B、L和W如本文所定义,包括通过使用本文实施例部分中例示的方法进行。
方案3.大环酯的一般合成方法
Figure BDA0004194083620004851
替代地,完全保护的大环(5)可被脱保护并与适当取代的偶合搭配物偶合,并脱保护以得到大环产物。需要额外脱保护或官能化步骤来制备最终化合物。例如,本领域技术人员将能够将式(I)化合物所需的-B-L-W基团装载于大环酯中,其中B、L和W如本文所定义,包括通过使用本文实施例部分中例示的方法进行。
方案4.大环酯的一般合成方法
Figure BDA0004194083620004852
方案4中概述了大环酯的替代性一般合成方法。适当取代的吲哚基硼酸酯(8)可以利用受保护的3-(5-溴-2-碘-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇和适当取代的硼酸为起始物质,分四个步骤制备,包括钯介导的偶合、烷基化、脱保护和钯介导的硼基化反应。
甲基-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸酯(10)可通过使(S)-2-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酸(9)与(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯偶合来制备。
最终的大环酯可通过以下来制备:使甲基-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸酯(10)与适当取代的吲哚基硼酸酯(8)在Pd催化剂存在下偶合,随后进行水解和大环内酯化步骤,以得到适当保护的大环中间体(11)。脱保护并与适当取代的羧酸(或其它偶合搭配物)或中间体4偶合可产生大环产物。可能需要额外脱保护或官能化步骤来制备最终化合物13或14。
此外,本公开的化合物可使用以下实施例中所描述的方法,以及合成有机化学技术中已知的合成方法,或本领域技术人员所理解的关于所述方法的修改来合成。这些方法包括但不限于以下实施例中所描述的方法。例如,本领域技术人员将能够将式(I)化合物所需的-B-L-W基团装载于大环酯中,其中B、L和W如本文所定义,包括通过使用本文实施例部分中例示的方法进行。
药物组合物和使用方法
药物组合物和施用方法
本发明所涉及的化合物是Ras抑制剂,并且可用于治疗癌症。因此,本发明的一个实施方案提供含本发明化合物或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的赋形剂的药物组合物,以及使用本发明化合物制备此类组合物的方法。
如本文所使用,术语“药物组合物”是指与药学上可接受的赋形剂一起配制的化合物,如本发明化合物,或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中,化合物是以适于在治疗方案中施用的单位剂量的量存在于药物组合物中,该化合物当施用给相关群体时显示出统计显著的实现预定治疗效果的可能性。在一些实施方案中,药物组合物可特定地配制成以固体或液体形式施用,包括适于以下方式施用者:口服施用,例如药水(水性或非水性溶液或悬浮液)、片剂(例如旨在经颊、舌下和全身吸收者)、大丸剂、散剂、颗粒剂、供施用于舌部的糊剂;肠胃外施用,例如通过皮下、肌肉内、静脉内或硬膜外注射,如例如无菌溶液或悬浮液,或持续释放配制物;表面施用,例如施用于皮肤、肺或口腔的乳霜、软膏剂或控制释放贴片或喷雾剂;阴道内或直肠内施用,例如子宫托、乳霜或泡沫剂;舌下施用;经眼施用;经皮施用;或经鼻、肺施用和施用至其它粘膜表面。
如本文所使用,“药学上可接受的赋形剂”是指在受试者体内无毒且无发炎性的任何无活性成分(例如能够将活性化合物悬浮或溶解的媒剂)。典型赋形剂包括例如:抗粘附剂、抗氧化剂、粘合剂、包衣剂、压缩助剂、崩解剂、染料(色素)、软化剂、乳化剂、填充剂(稀释剂)、成膜剂或包衣剂、调味剂、芳香剂、助流剂(流动增强剂)、润滑剂、防腐剂、印刷油墨、吸附剂、悬浮剂或分散剂、甜味剂或水合用水。赋形剂包括但不限于:任选被取代的丁基化羟基甲苯(BHT)、碳酸钙、磷酸氢钙、硬脂酸钙、交联羧甲基纤维素、交联聚乙烯基吡咯烷酮、柠檬酸、交联聚维酮、半胱氨酸、乙基纤维素、明胶、任选被取代的羟丙基纤维素、任选被取代的羟丙基甲基纤维素、乳糖、硬脂酸镁、麦芽糖醇、甘露糖醇、甲硫氨酸、甲基纤维素、对羟基苯甲酸甲酯、微晶纤维素、聚乙二醇、聚乙烯基吡咯烷酮、聚维酮、预胶化淀粉、对羟基苯甲酸丙酯、棕榈酸视黄酯、虫胶、二氧化硅、羧甲基纤维素钠、柠檬酸钠、羟基乙酸淀粉钠、山梨糖醇、淀粉(玉米淀粉)、硬脂酸、硬脂酸、蔗糖、滑石、二氧化钛、维生素A、维生素E、维生素C及木糖醇。本领域一般技术人员了解可用作赋形剂的多种试剂和材料。参见例如Ansel等人,Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug DeliverySystems.Philadelphia:Lippincott,Williams&Wilkins,2004;Gennaro等人,Remington:The Science and Practice of Pharmacy.Philadelphia:Lippincott,Williams&Wilkins,2000;以及Rowe,Handbook of Pharmaceutical Excipients.Chicago,Pharmaceutical Press,2005。在一些实施方案中,组合物包括至少两种不同的药学上可接受的赋形剂。
除非清楚地作相反陈述,否则本文所描述的化合物,无论是否清楚地陈述,均可以呈盐形式,例如呈药学上可接受的盐形式提供或使用。如本文所使用,术语“药学上可接受的盐”是指在合理医学判断的范围内,适于与人体组织接触使用而无过度毒性、刺激、过敏反应等,并且与合理效益/风险比相称的本文所描述的化合物的盐。此项技术中已知医药学上可接受之盐。例如,药学上可接受的盐描述于:Berge等人,J.Pharmaceutical Sciences66:1-19,1977;以及Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use,(P.H.Stahl和C.G.Wermuth编辑),Wiley-VCH,2008中。所述盐可在本文所描述的化合物的最终分离和纯化期间原位制备,或通过使游离碱性基团与适合有机酸反应来分离。
本发明化合物可具有可离子化基团,由此能够制备成药学上可接受的盐形式。这些盐可以是涉及无机酸或有机酸的酸加成盐,或在本发明化合物呈酸形式的情况下,所述盐可由无机碱或有机碱制备。在一些实施方案中,所述化合物被制备为药学上可接受的盐形式或以药学上可接受的盐形式使用,所述药学上可接受的盐形式是作为药学上可接受的酸或碱的加成产物制备。适合药学上可接受的酸和碱是本领域中众所周知的,如盐酸、硫酸、氢溴酸、乙酸、乳酸、柠檬酸或酒石酸,用于形成酸加成盐;以及氢氧化钾、氢氧化钠、氢氧化铵、咖啡因、各种胺等,用于形成碱盐。用于制备适当盐的方法是本领域中公认的。
代表性酸加成盐包括乙酸盐、己二酸盐、海藻酸盐、抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、硫酸氢盐、硼酸盐、丁酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、柠檬酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙烷磺酸盐、反丁烯二酸盐、葡庚糖酸盐、甘油磷酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、氢溴酸盐、盐酸盐、氢碘酸盐、2-任选被取代的羟基-乙烷磺酸盐、乳糖酸盐、乳酸盐、月桂酸盐、月桂基硫酸盐、苹果酸盐、顺丁烯二酸盐、丙二酸盐、甲烷磺酸盐、2-萘磺酸盐、烟酸盐、硝酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、双羟萘酸盐、果胶酸盐、过硫酸盐、3-苯基丙酸盐、磷酸盐、苦味酸盐、新戊酸盐、丙酸盐、硬脂酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、甲苯磺酸盐、十一烷酸盐、戊酸盐等。代表性碱金属或碱土金属盐包括钠盐、锂盐、钾盐、钙盐、镁盐等,以及无毒铵、季铵和胺阳离子,包括但不限于铵、四甲基铵、四乙基铵、甲胺、二甲胺、三甲胺、三乙胺、乙胺等。
如本文所使用,术语“受试者”是指动物王国的任何成员。在一些实施方案中,“受试者”是指处于任何发育阶段的人类。在一些实施方案中,“受试者”是指人类患者。在一些实施方案中,“受试者”是指非人类动物。在一些实施方案中,非人类动物是哺乳动物(例如啮齿动物、小鼠、大鼠、兔、猴、犬、猫、绵羊、牛、灵长类动物或猪)。在一些实施方案中,受试者包括但不限于哺乳动物、鸟类、爬行动物、两栖动物、鱼或虫类。在一些实施方案中,受试者可以是转基因动物、基因工程改造的动物或克隆。
如本文所使用,术语“剂型”是指供施用给受试者的化合物(例如本发明化合物)的物理离散单元。每个单元含有预定量的化合物。在一些实施方案中,所述量是适于根据剂量方案施用的单位剂量的量(或其整体部分),该量当施用给相关群体(即,根据治疗剂量方案)时确定与所希望或有益的结果相关。本领域一般技术人员应理解,施用给特定受试者的治疗组合物或化合物的总量是由一位或多位主治医师决定,并且可涉及施用多种剂型。
如本文所使用,术语“剂量方案”是指个别地施用给受试者的一组单位剂量(典型地超过一个单位剂量),所述单位剂量典型地间隔一定时间段。在一些实施方案中,给定治疗化合物(例如本发明化合物)具有推荐的剂量方案,该方案可涉及一次或多次剂量。在一些实施方案中,剂量方案包含多次剂量,所述剂量各自彼此间隔相同长度的时间段;在一些实施方案中,剂量方案包含多次剂量且至少两个不同时间段分开个别剂量。在一些实施方案中,剂量方案内的所有剂量均为相同单位剂量的量。在一些实施方案中,剂量方案内的不同剂量是不同量。在一些实施方案中,剂量方案包含呈第一剂量的量的第一次剂量,随后是呈不同于该第一剂量的量的第二剂量的量的一次或多次额外剂量。在一些实施方案中,剂量方案包含呈第一剂量的量的第一次剂量,随后是呈与该第一剂量的量相同的第二剂量的量的一次或多次额外剂量。在一些实施方案中,剂量方案当施用给相关群体(即,是治疗性剂量方案)时,与所希望或有益结果相关。
“治疗方案”是指在相关群体中的施用与期望或有益治疗结果相关的剂量方案。
术语“治疗”(“treatment/treat/treating”)在其最广泛意义上是指部分或完全缓解、改善、减轻、抑制特定疾病、病症或疾患的一种或多种症状、特征或成因;延迟其发作;降低其严重程度;或减少其发生的物质(例如本发明化合物)的任何施用。在一些实施方案中,此类治疗可施用给未展现相关疾病、病症或疾患的体征的受试者或仅展现该疾病、病症或疾患的早期体征的受试者。替代地或另外地,在一些实施方案中,治疗可施用给展现相关疾病、病症或疾患的一种或多种确定的体征的受试者。在一些实施方案中,治疗可用于被诊断为罹患相关疾病、病症或疾患的受试者。在一些实施方案中,治疗可用于已知具有一个或多个在统计上与发展相关疾病、病症或疾患的风险增加相关的易感因素的受试者。
术语“治疗有效量”意谓当根据治疗性剂量方案施用给罹患或易患疾病、病症或疾患的群体时足以治疗该疾病、病症或疾患的量。在一些实施方案中,治疗有效量是降低该疾病、病症或疾患的一种或多种症状的发生率或严重程度或延迟其发作的量。本领域技术人员应理解,术语“治疗有效量”实际上不需要在特定个体中实现所需的成功治疗。事实上,治疗有效量可以是当施用给需要该治疗的患者时在相当大量受试者中提供特定所希望的药理学反应的量。特别需要了解的是,特定受试者实际上可以是“治疗有效量”“难治”的。在一些实施方案中,提到的治疗有效量可指如在一个或多个特定组织(例如受疾病、病症或疾患影响的组织)或流体(例如血液、唾液、血清、汗液、泪液、尿液)中所测量的量。本领域一般技术人员应理解,在一些实施方案中,治疗有效量可配制为单一剂量或以单一剂量施用。在一些实施方案中,治疗有效量可配制为多次剂量,例如配制为剂量方案的一部分,或以多次剂量施用。
为用作受试者的治疗,本发明化合物或其药学上可接受的盐可配制为药物组合物或兽医学组合物形式。取决于待治疗的受试者、施用模式及所希望的治疗类型,例如预防、防治或疗法,所述化合物或其药学上可接受的盐是以与所述参数相符的方式配制。关于此类技术的概述可见于Remington:The Science and Practice of Pharmacy,第21版,Lippincott Williams&Wilkins,(2005);以及Encyclopedia of PharmaceuticalTechnology,J.Swarbrick和J.C.Boylan编辑,1988-1999,Marcel Dekker,New York,所述文献各自以引用的方式并入本文中。
组合物可分别根据常规混合、制粒或包覆方法制备,并且本发明的药物组合物以重量或体积计可含有约0.1%至约99%、约5%至约90%或约1%至约20%本发明化合物或其药学上可接受的盐。在一些实施方案中,本文所描述的化合物或其药学上可接受的盐的存在量以重量计可占组合物,如药物组合物总量总计1-95%。
所述组合物可以呈适于以下施用的剂型提供:关节内、口服、肠胃外(例如静脉内、肌肉内)、直肠、皮肤、皮下、表面、经皮、舌下、经鼻、阴道、囊内、尿道内、鞘内、硬膜外、耳或眼施用,或通过注射、吸入或与鼻、泌尿生殖器、生殖器或口腔粘膜直接接触。因此,药物组合物可呈例如片剂、胶囊、丸剂、散剂、颗粒剂、悬浮液、乳液、溶液、凝胶(包括水凝胶)、糊剂、软膏、乳霜、硬膏剂、药水、渗透递送装置、栓剂、灌肠剂、注射剂、植入物、喷雾剂、适于离子电渗递送的制剂或气雾剂形式。所述组合物可根据常规医药实践配制。
如本文所使用,术语“施用”是指将一种组合物(例如化合物或包括如本文所描述的化合物的制剂)施用给受试者或系统。向动物受试者(例如向人类)施用可通过任何适当的途径进行。例如,在一些实施方案中,施用可以是支气管(包括通过支气管滴注)、经颊、经肠、真皮间、动脉内、真皮内、胃内、髓内、肌肉内、鼻内、腹膜内、鞘内、静脉内、囊内、经粘膜、经鼻、口服、直肠、皮下、舌下、表面、气管(包括通过气管内滴注)、经皮、阴道或玻璃体施用。
配制物可以通过适于全身施用或者表面或局部施用的方式制备。全身配制物包括设计用于注射(例如肌肉内、静脉内或皮下注射)的配制物或可制备用于经皮、经粘膜或口服施用。配制物一般将包括稀释剂,并且在一些情况下,包括佐剂、缓冲剂、防腐剂等。化合物或其药学上可接受的盐也可以呈脂质体组合物或以微乳液形式施用。
为进行注射,可将配制物制备为常规形式,如液体溶液或悬浮液,或适于在注射之前于液体中制备为溶液或悬浮液的固体形式,或乳液形式。适合赋形剂包括例如水、生理盐水、右旋糖、甘油等。这些组合物也可含有一定量无毒辅助物质,如润湿剂或乳化剂、pH缓冲剂等,如乙酸钠、去水山梨糖醇单月桂酸酯等等。
也已设计出各种持续释放药物系统。参见例如美国专利第5,624,677号。
全身施用也可包括相对无创的方法,如使用栓剂、经皮贴片、经粘膜递送及鼻内施用。口服施用也适于本发明化合物或其药学上可接受的盐。本领域中应了解,适合形式包括糖浆、胶囊和片剂。
本文所描述的每种化合物或其药学上可接受的盐可以通过本领域中已知的多种方式配制。例如,组合疗法中的第一药剂和第二药剂可一起或分开配制。本文也描述组合疗法的其它模式。
个别或分开配制的药剂可一起包装为试剂盒形式。非限制性实例包括但不限于含有例如两粒丸剂、一粒丸剂和散剂、栓剂和在小瓶中的液体、两种表面乳霜等的试剂盒。所述试剂盒可包括有助于将单位剂量施用给受试者的任选使用的组件,如用于使粉末形式复原的小瓶、注射用注射器、定制IV递送系统、吸入器等。另外,单位剂量试剂盒可含有关于所述组合物的制备和施用的说明书。试剂盒可制造为用于一名受试者的一次性单位剂量、用于特定受试者的多次使用(在恒定剂量下,或其中个别化合物或其药学上可接受的盐的效力可随治疗进展而变化);或试剂盒可含有适于施用多名受试者的多次剂量(“整体包装”)。所述试剂盒组件可组装于纸盒、泡罩包装、瓶、管等中。
供口服使用的配制物包括含活性成分与无毒药学上可接受的赋形剂的混合物的片剂。这些赋形剂可以是例如惰性稀释剂或填充剂(例如蔗糖、山梨糖醇、糖、甘露糖醇、微晶纤维素、包括马铃薯淀粉在内的淀粉、碳酸钙、氯化钠、乳糖、磷酸钙、硫酸钙或磷酸钠);制粒剂及崩解剂(例如纤维素衍生物,包括微晶纤维素、包括马铃薯淀粉在内的淀粉、交联羧甲基纤维素钠、海藻酸盐或海藻酸);粘合剂(例如蔗糖、葡萄糖、山梨糖醇、阿拉伯胶、海藻酸、海藻酸钠、明胶、淀粉、预胶化淀粉、微晶纤维素、硅酸镁铝、羧甲基纤维素钠、甲基纤维素、任选被取代的羟丙基甲基纤维素、乙基纤维素、聚乙烯吡咯烷酮或聚乙二醇);以及润滑剂、助流剂及抗粘着剂(例如硬脂酸镁、硬脂酸锌、硬脂酸、二氧化硅、氢化植物油或滑石)。其它药学上可接受的赋形剂可以是着色剂、调味剂、塑化剂、保湿剂、缓冲剂等。
两种或更多种化合物可一起混合于片剂、胶囊或其它媒剂中,或可隔开。在一个实施例中,第一化合物是包含在片剂的内侧上,并且第二化合物是在外侧上,由此使该第二化合物的绝大部分在第一化合物释放之前释放。
供口服使用的配制物也可以呈咀嚼片形式提供,或呈硬明胶胶囊形式提供,其中活性成分与惰性固体稀释剂(例如马铃薯淀粉、乳糖、微晶纤维素、碳酸钙、磷酸钙或高岭土)混合;或呈软明胶胶囊形式提供,其中活性成分与水或油介质,例如花生油、液体石蜡或橄榄油混合。粉末、颗粒及细圆粒可使用以上关于片剂和胶囊所提到的成分,以常规方式,使用例如混合器、流体床装置或喷雾干燥设备制备。
溶出或扩散控制性释放可通过适当地包覆化合物的片剂、胶囊、细圆粒或颗粒状配制物,或通过将所述化合物或其药学上可接受的盐并入适当基质中来实现。控制释放包衣可包括一种或多种以上提到的包覆物质,例如虫胶、蜂蜡、糖蜡(glycowax)、蓖麻蜡、巴西棕榈蜡、硬脂醇、单硬脂酸甘油酯、二硬脂酸甘油酯、棕榈硬脂酸甘油酯、乙基纤维素、丙烯酸树脂、dl-聚乳酸、乙酸丁酸纤维素、聚氯乙烯、聚乙酸乙烯酯、乙烯基吡咯烷酮、聚乙烯、聚甲基丙烯酸酯、甲基丙烯酸甲酯、2-任选被取代的羟基甲基丙烯酸酯、甲基丙烯酸酯水凝胶、1,3丁二醇、乙二醇甲基丙烯酸酯或聚乙二醇。在控制释放基质配制物中,基质材料也可包括例如水合甲基纤维素、巴西棕榈蜡和硬脂醇、卡波普(carbopol)934、硅酮、三硬脂酸甘油酯、丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸甲酯、聚氯乙烯、聚乙烯或卤化氟碳化合物。
供口服施用的可并入本发明化合物或其药学上可接受的盐和组合物的液体形式包括水性溶液、适当调味的糖浆、水性或油性悬浮液以及用如棉籽油、芝麻油、椰子油或花生油之类食用油调味的乳液,以及酏剂和类似医药媒剂。
一般而言,当施用给人类时,任何本发明化合物或其药学上可接受的盐的口服剂量将取决于该化合物的性质,并且可容易地由本领域技术人员确定。剂量可以是例如每天约0.001mg至约2000mg、每天约1mg至约1000mg、每天约5mg至约500mg、每天约100mg至约1500mg、每天约500mg至约1500mg、每天约500mg至约2000mg或其中衍生的任何范围。
编号的实施方案
[1]一种具有式I的结构的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620004951
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、氰基、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的3至8元杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是氢、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R16是氢或C1-C3烷基。
[2]如段落[1]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中G是任选被取代的C1-C4亚杂烷基。
[3]如段落[1]或[2]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Ic的结构:
Figure BDA0004194083620004991
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5和Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
[4]如段落[1]至[3]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X2是NH。
[5]如段落[1]至[4]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X3是CH。
[6]如段落[1]至[5]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R11是氢。
[7]如段落[1]至[5]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R11是C1-C3烷基。
[8]如段落[7]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R11是甲基。
[9]如段落[1]至[6]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Id的结构:
Figure BDA0004194083620005021
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5和Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基。
[10]如段落[1]至[9]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X1是任选被取代的C1-C2亚烷基。
[11]如段落[10]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X1是亚甲基。
[12]如段落[1]至[11]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5是氢。
[13]如段落[1]至[11]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5是任选被卤素取代的C1-C4烷基。
[14]如段落[13]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5是甲基。
[15]如段落[1]至[14]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y4是C。
[16]如段落[1]至[15]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R4是氢。
[17]如段落[1]至[16]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y5是CH。
[18]如段落[1]至[17]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y6是CH。
[19]如段落[1]至[18]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y1是C。
[20]如段落[1]至[19]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y2是C。
[21]如段落[1]至[20]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y3是N。
[22]如段落[1]至[21]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3不存在。
[23]如段落[1]至[22]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y7是C。
[24]如段落[1]至[6]或[9]至[23]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Ie的结构:
Figure BDA0004194083620005061
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基。
[25]如段落[3]至[24]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R6是氢。
[26]如段落[1]至[25]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2是氢、氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至6元杂环烷基。
[27]如段落[26]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2是任选被取代的C1-C6烷基。
[28]如段落[27]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2是乙基。
[29]如段落[1]至[28]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R7是任选被取代的C1-C3烷基。
[30]如段落[29]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R7是C1-C3烷基。
[31]如段落[1]至[30]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R8是任选被取代的C1-C3烷基。
[32]如段落[31]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R8是C1-C3烷基。
[33]如段落[1]至[32]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式If的结构:
Figure BDA0004194083620005091
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
[34]如段落[1]至[33]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1是5至10元杂芳基。
[35]如段落[34]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1是任选被取代的6元芳基或任选被取代的6元杂芳基。
[36]如段落[1]至[35]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Ig的结构:
Figure BDA0004194083620005101
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
Xe是N、CH或CR17
Xf是N或CH;
R12是任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基;并且
R17是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[37]如段落[36]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Xe是N并且Xf是CH。
[38]如段落[36]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Xe是CH并且Xf是N。
[39]如段落[36]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Xe是CR17并且Xf是N。
[40]如段落[36]至[39]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R12是任选被取代的C1-C6杂烷基。
[41]如段落[36]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R12
Figure BDA0004194083620005121
Figure BDA0004194083620005122
[42]如段落[1]至[41]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Ih的结构:
Figure BDA0004194083620005123
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
Xe是CH或CR17;并且
R17是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[43]如段落[1]至[42]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Ii的结构:
Figure BDA0004194083620005141
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是氢、任选被取代的氨基、任选被取代的C1-C4烷氧基、任选被取代的C1-C4羟基烷基、任选被取代的C1-C4氨基烷基、任选被取代的C1-C4卤代烷基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C4胍基烷基、C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂芳基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
[44]如段落[1]至[43]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是任选被取代的6元亚芳基。
[45]如段落[44]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A具有以下结构:
Figure BDA0004194083620005151
其中R13是氢、羟基、氨基、氰基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基。
[46]如段落[45]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R13是氢。
[47]如段落[45]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R13是羟基。
[48]如段落[1]至[43]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是任选被取代的5至6元亚杂芳基。
[49]如段落[48]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是:
Figure BDA0004194083620005152
[50]如段落[49]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是
Figure BDA0004194083620005153
[51]如段落[1]至[50]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中B是-CHR9-。
[52]如段落[51]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9是任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的3至6元环烷基。
[53]如段落[52]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9是:
Figure BDA0004194083620005161
[54]如段落[53]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9是:
Figure BDA0004194083620005162
[55]如段落[1]至[50]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中B是任选被取代的6元亚芳基。
[56]如段落[55]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中B是6元亚芳基。
[57]如段落[56]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中B是:
Figure BDA0004194083620005163
[58]如段落[1]至[50]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中B不存在。
[59]如段落[1]至[58]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R7是甲基。
[60]如段落[1]至[59]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R8是甲基。
[61]如段落[1]至[60]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中连接体是式II的结构:
A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-(D1)-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2
式II
其中A1是在所述连接体与B之间的键;A2是在W与所述连接体之间的键;B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S和NRN;RN是氢、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C1-C3环烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的C1-C7杂烷基;C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基;f、g,h、i、j及k各自独立地为0或1;并且D1是任选被取代的C1-C10亚烷基、任选被取代的C2-C10亚烯基、任选被取代的C2-C10亚炔基、任选被取代的3至14元亚杂环烷基、任选被取代的5至10元亚杂芳基、任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的6至10元亚芳基、任选被取代的C2-C10亚聚乙二醇或任选被取代的C1-C10亚杂烷基或将A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-连接至-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2的化学键。
[62]如段落[1]至[61]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体是无环的。
[63]如段落[62]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有式IIa的结构:
Figure BDA0004194083620005171
其中Xa不存在或为N;
R14是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C3环烷基;并且
L2是不存在、-C(O)-、-SO2-、任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C1-C4亚杂烷基,
其中Xa、R14或L2中的至少一个存在。
[64]如段落[63]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620005181
[65]如段落[64]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有结构
Figure BDA0004194083620005182
[66]如段落[1]至[61]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体是或包含环状基团。
[67]如段落[1]至[61]或[66]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有式IIb的结构:
Figure BDA0004194083620005183
其中o是0或1;
Xb是C(O)或SO2
R15是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
Cy是任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的3至8元亚杂环烷基、任选被取代的6-10元亚芳基或任选被取代的5至10元亚杂芳基;并且
L3是不存在、-C(O)-、-SO2-、任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C1-C4亚杂烷基。
[68]如段落[67]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620005191
/>
Figure BDA0004194083620005201
[69]如段落[1]至[68]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是氢。
[70]如段落[1]至[68]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的氨基。
[71]如段落[70]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是-NHCH3或-N(CH3)2
[72]如段落[1]至[68]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的酰胺基。
[73]如段落[72]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是
Figure BDA0004194083620005211
[74]如段落[1]至[68]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的C1-C4烷氧基。
[75]如段落[74]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是甲氧基或异丙氧基。
[76]如段落[1]至[68]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的C1-C4烷基。
[77]如段落[76]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是甲基、乙基、异丙基、叔丁基或苯甲基。
[78]如段落[1]至[68]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的C1-C4羟基烷基。
[79]如段落[78]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是
Figure BDA0004194083620005212
[80]如段落[1]至[68]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的C1-C4氨基烷基。
[81]如段落[80]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是
Figure BDA0004194083620005213
[82]如段落[1]至[68]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的C1-C4卤代烷基。
[83]如段落[82]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是
Figure BDA0004194083620005221
[84]如段落[1]至[68]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的C1-C4胍基烷基。
[85]如段落[84]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是
Figure BDA0004194083620005222
[86]如段落[1]至[68]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是C0-C4烷基、任选被取代的3至11元杂环烷基。
[87]如段落[86]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是
Figure BDA0004194083620005223
/>
Figure BDA0004194083620005231
/>
Figure BDA0004194083620005241
/>
Figure BDA0004194083620005251
/>
Figure BDA0004194083620005261
[88]如段落[1]至[68]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的3至8元环烷基。
[89]如段落[88]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是
Figure BDA0004194083620005262
[90]如段落[1]至[68]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的3至8元杂芳基。
[91]如段落[90]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是
Figure BDA0004194083620005263
Figure BDA0004194083620005271
[92]如段落[1]至[68]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的6至10元芳基。
[93]如段落[92]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是苯基、4-羟基-苯基或2,4-甲氧基-苯基。
[94]一种表1或2的化合物或其药学上可接受的盐。
[95]一种药物组合物,所述药物组合物包含如段落[1]至[94]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的赋形剂。
实施例
本公开将通过以下实施例和合成实施例进一步说明,这些实施例和合成实施例不应解释为将本公开的范围或精神限制于本文所描述的特定程序。应了解,提供的实施例将说明某些实施方案并打算借此对本公开的范围造成限制。还应了解,在不背离本公开的精神或所附权利要求书的范围的情况下,可采用本领域技术人员所能想到的各种其它实施方案、其修改和等效内容。
化学合成
以下实施例和本文别处使用的定义如下:
Figure BDA0004194083620005272
Figure BDA0004194083620005281
仪器
质谱数据收集是利用带有QDa检测器或SQ检测器2的Shimadzu LCMS-2020、Agilent 1260LC-6120/6125MSD、Shimadzu LCMS-2010EV进行的。将样品以液相注入至C-18反相柱上。化合物是使用乙腈梯度自柱洗脱并进给至质量分析仪中。初始数据分析是用Agilent ChemStation、Shimadzu LabSolutions或Waters MassLynx进行的。NMR数据是用Bruker AVANCE III HD 400MHz、Bruker Ascend500MHz仪器或Varian 400MHz仪器收集,并且原始数据是利用TopSpin或Mestrelab Mnova进行分析。
合成中间体
中间体1.合成3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇
Figure BDA0004194083620005291
步骤1.在N2气氛下,在0℃下向3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙酰氯(65g,137mmol,粗品)于DCM(120mL)中的混合物中缓慢添加1M SnCl4的DCM溶液(137mL,137mmol)。在0℃下,将混合物搅拌30分钟,接着逐滴添加5-溴-1H-吲哚(26.8g,137mmol)于DCM(40mL)中的溶液。在0℃下,将混合物搅拌45分钟,接着用EtOAc(300mL)稀释,用盐水(100mL×4)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(55g,75%产率)。LCMS(ESI):C29H32BrNO2SiNa的m/z[M+Na]计算值556.1;实验值556.3。
步骤2.在N2气氛下,在0℃下向1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(50g,93.6mmol)于THF(100mL)中的混合物中添加LiBH4(6.1g,281mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌20小时,接着添加MeOH(10mL)和EtOAc(100mL)并将混合物用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液。将残余物用DCM(50mL)稀释,冷却至10℃并添加二氢吡啶(9.5g,37.4mmol)和TsOH.H2O(890mg,4.7mmol)。在10℃下,将混合物搅拌2小时,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(41g,84%产率)。LCMS(ESI):C29H34BrNOSi的m/z[M+H]计算值519.2;实验值520.1;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.96(s,1H),7.75-7.68(m,5H),7.46-7.35(m,6H),7.23-7.19(m,2H),6.87(d,J=2.1Hz,1H),3.40(s,2H),2.72(s,2H),1.14(s,9H),0.89(s,6H)。
步骤3.在室温下,向1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(1.5g,2.9mmol)和I2(731mg,2.9mmol)于THF(15mL)中的混合物中添加AgOTf(888mg,3.5mmol)。在室温下,将混合物搅拌2小时,接着用EtOAc(200mL)稀释并用饱和Na2S2O3(100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚(900mg,72%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.70(s,1H),7.68(d,J=1.3Hz,1H),7.64-7.62(m,4H),7.46-7.43(m,6H),7.24-7.22(d,1H),7.14-7.12(dd,J=8.6,1.6Hz,1H),3.48(s,2H),2.63(s,2H),1.08(s,9H),0.88(s,6H)。
步骤4.在Ar气氛下,在0℃下向HCOOH(66.3g,1.44mol)于TEA(728g,7.2mol)中的搅拌的混合物中逐份添加(4S,5S)-2-氯-2-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-4,5-二苯基-1,3-二氮杂-2-钌环戊烷异丙基甲苯(3.9g,6.0mmol)。将混合物加热至40℃并搅拌15分钟,接着冷却至室温并分数份添加1-(3-溴吡啶-2-基)乙酮(120g,600mmol)。将混合物加热至40℃并再搅拌2小时,接着减压浓缩溶剂。将盐水(2L)添加至残余物中,将混合物用EtOAc(4×700mL)萃取,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(1S)-1-(3-溴吡啶-2-基)乙醇(100g,74%产率)。LCMS(ESI):C7H8BrNO的m/z[M+H]计算值201.1;实验值201.9。
步骤5.在0℃下,向(1S)-1-(3-溴吡啶-2-基)乙醇(100g,495mmol)于DMF(1L)中的搅拌的混合物中分数份添加60% NaH于油中的分散液(14.25g,594mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时。在0℃下,逐滴添加MeI(140.5g,990mmol)并使混合物升温至室温,并搅拌2小时。将混合物冷却至0℃并添加饱和NH4Cl(5L)。将混合物用EtOAc(3×1.5L)萃取,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(90g,75%产率)。LCMS(ESI):C8H10BrNO的m/z[M+H]计算值215.0;实验值215.9。
步骤6.在Ar气氛下,在室温下向3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(90g,417mmol)和Pd(dppf)Cl2(30.5g,41.7mmol)于甲苯(900mL)中的搅拌的混合物中分数份添加双(频哪醇合)二硼(127g,500mmol)和KOAc(81.8g,833mmol)。将混合物加热至100℃并搅拌3小时。减压浓缩滤液并将残余物通过Al2O3柱色谱法纯化,得到呈半固体状的2-[(1S)-1-甲氧基乙基]-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶(100g,63%产率)。LCMS(ESI):C14H22BNO3的m/z[M+H]计算值263.2;实验值264.1。
步骤7.在Ar气氛下,在室温下向5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚(140g,217mmol)和2-[(1S)-1-甲氧基乙基]-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶(100g,380mmol)于1,4-二噁烷(1.4L)中的搅拌的混合物中分数份添加K2CO3(74.8g,541mmol)、Pd(dppf)Cl2(15.9g,21.7mmol)和H2O(280mL)。将混合物加热至85℃并搅拌4小时,接着冷却,添加H2O(5L)并用EtOAc(3×2L)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚(71g,45%产率)。LCMS(ESI):C37H43BrN2O2Si的m/z[M+H]计算值654.2;实验值655.1。
步骤8.在N2气氛下,在0℃下向5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚(71g,108mmol)于DMF(0.8L)中的搅拌的混合物中分数份添加Cs2CO3(70.6g,217mmol)和EtI(33.8g,217mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着添加H2O(4L)并用EtOAc(3×1.5L)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚(66g,80%产率)。LCMS(ESI):C39H47BrN2O2Si的m/z[M+H]计算值682.3;实验值683.3。
步骤9.在N2气氛下,在室温下向TBAF(172.6g,660mmol)于THF(660mL)中的搅拌的混合物中分数份添加5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚(66g,97mmol)。将混合物加热至50℃并搅拌16小时,冷却,用H2O(5L)稀释并用EtOAc(3×1.5L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。过滤后,减压浓缩滤液。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(30g,62%产率)。LCMS(ESI):C23H29BrN2O2的m/z[M+H]计算值444.1;实验值445.1。
中间体1.由费舍尔吲哚途径进行的替代合成.
Figure BDA0004194083620005321
步骤1.在N2气氛下,在-10℃下经15分钟向i-PrMgCl(2M于THF中,0.5L)中的混合物中逐滴添加2.5M n-BuLi的己烷溶液(333mL,833mmol)。在-10℃下,将混合物搅拌30分钟,接着在-10℃下,经30分钟逐滴添加于THF(0.5L)中的3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(180g,833mmol)。将所得混合物升温至-5℃并搅拌1小时,接着在-5℃下,经30分钟逐滴添加3,3-二甲基噁烷-2,6-二酮(118g,833mmol)于THF(1.2L)。将混合物升温至0℃并搅拌1.5小时,接着通过在0℃下添加预先冷却的4M HCl的1,4-二噁烷溶液(0.6L)将pH值调至约5来淬灭。将混合物用冰水(3L)稀释并用EtOAc(3×2.5L)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的5-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-2,2-二甲基-5-氧代戊酸(87g,34%产率)。LCMS(ESI):C15H21NO4的m/z[M+H]计算值279.2;实验值280.1。
步骤2.在N2气氛下,在室温下向5-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-2,2-二甲基-5-氧代戊酸(78g,279mmol)于EtOH(0.78L)中的混合物中分数份添加(4-溴苯基)肼盐酸盐(68.7g,307mmol)。将混合物加热至85℃并搅拌2小时,冷却至室温,接着逐滴添加4MHCl的1,4-二噁烷溶液(69.8mL,279mmol)。将混合物加热至85℃并再搅拌3小时,接着减压浓缩并将残余物溶解于TFA(0.78L)中。将混合物加热至60℃并搅拌1.5,减压浓缩并用饱和NaHCO3将残余物调至约pH5,接着用EtOAc(3×1.5L)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到3-(5-溴-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸和(S)-3-(5-溴-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(78g,粗品)。LCMS(ESI):C21H23BrN2O3的m/z[M+H]计算值430.1和C23H27BrN2O3的计算值458.1;实验值431.1和459.1。
步骤3.在N2气氛下,在0℃下向3-(5-溴-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸和(S)-3-(5-溴-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(198g,459mmol)于DMF(1.8L)中的混合物中分数份添加Cs2CO3(449g,1.38mol)。接着,在0℃下逐滴添加于DMF(200mL)中的EtI(215g,1.38mmol)。将混合物升温至室温并搅拌4小时,接着用盐水(5L)稀释并用EtOAc(3×2.5L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(160g,57%产率)。LCMS(ESI):C25H31BrN2O3的m/z[M+H]计算值486.2;实验值487.2。
步骤4.在N2气氛下,在0℃下向3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(160g,328mmol)于THF(1.6L)中的混合物中添加LiBH4(28.6g,1.3mol)。将混合物加热至60℃,保持16小时,冷却,并用预先冷却的(0℃)NH4Cl水溶液(5L)淬灭。将混合物用EtOAc(3×2L)萃取并将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到3-(5-溴-1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇的两种阻转异构体(呈单一阻转异构体形式)(60g,38%产率)和(40g,26%产率),都呈固体状。LCMS(ESI):C23H29BrN2O2的m/z[M+H]计算值444.1;实验值445.2。
中间体2和中间体4.合成(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸酯
Figure BDA0004194083620005351
步骤1.向(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-羟基苯基)丙酸甲酯(10.0g,33.9mmol)于DCM(100mL)中的混合物中添加咪唑(4.6g,67.8mmol)和TIPSCl(7.8g,40.7mmol)。在室温下,将混合物搅拌过夜,接着用DCM(200mL)稀释并用H2O(150mL×3)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-(三异丙基硅烷基氧基)苯基)-丙酸甲酯(15.0g,98%产率)。LCMS(ESI):C24H41NO5SiNa的m/z[M+Na]计算值474.3;实验值474.2。
步骤2.用Ar吹扫(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-(三异丙基硅烷基氧基)苯基)-丙酸甲酯(7.5g,16.6mmol)、PinB2(6.3g,24.9mmol)、[Ir(OMe)(COD)]2(1.1g,1.7mmol)和4-叔丁基-2-(4-叔丁基-2-吡啶基)吡啶(1.3g,5.0mmol)的混合物(×3),接着添加THF(75mL)并使混合物处于Ar气氛下,并密封。将混合物加热至80℃并搅拌16小时,减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-(三异丙基硅烷基氧基)苯基)-丙酸甲酯(7.5g,78%产率)。LCMS(ESI):C30H52BNO7SiNa的m/z[M+Na]计算值600.4;实验值600.4;1HNMR(300MHz,CD3OD)δ7.18(s,1H),7.11(s,1H),6.85(s,1H),4.34(m,1H),3.68(s,3H),3.08(m,1H),2.86(m,1H),1.41-1.20(m,26H),1.20-1.01(m,22H),0.98-0.79(m,4H)。
步骤3.在0℃下,向(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酸三异丙基硅烷酯(4.95g,6.9mmol)于MeOH(53mL)中的混合物中添加于H2O(35mL)中的LiOH(840mg,34.4mmol)。在0℃下,将混合物搅拌2小时,接着用1M HCl酸化至约pH 5并用EtOAc(250mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL×3)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酸(3.7g,95%产率),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C29H50BNO7SiNH4的m/z[M+NH4]计算值581.4;实验值581.4。
步骤4.在0℃下,向(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(6.48g,45.0mmol)于DCM(200mL)中的混合物中添加于DCM(50mL)中的NMM(41.0g,405mmol)、(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酸(24g,42.6mmol),接着添加HOBt(1.21g,9.0mmol)和EDCI盐酸盐(12.9g,67.6mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用DCM(200mL)稀释并用H2O(3×150mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(22g,71%产率)。LCMS(ESI):C35H60BN3O8Si的m/z[M+H]计算值689.4;实验值690.5。
中间体3.合成(S)-3-甲基-2-((S)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺基)丁酸叔丁酯
Figure BDA0004194083620005371
步骤1.在室温下,向(S)-1-(叔丁氧基羰基)吡咯烷-3-甲酸(2.2g,10.2mmol)于DMF(10mL)中的混合物中添加HATU(7.8g,20.4mmol)和DIPEA(5mL)。在室温下搅拌10分钟后,添加于DMF(10mL)中的甲基-L-缬氨酸叔丁酯(3.8g,20.4mmol)。在室温下,将混合物搅拌3小时,接着用DCM(40mL)和H2O(30mL)稀释。将水层和有机层分离,并将有机层用H2O(3×30mL)、盐水(30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-3-(((S)-1-(叔丁氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(3.2g,82%产率)。LCMS(ESI):C20H36N2O5Na的m/z[M+Na]计算值407.3;实验值407.2。
步骤2.在室温下,将(S)-3-(((S)-1-(叔丁氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(3.2g,8.4mmol)于DCM(13mL)和TFA(1.05g,9.2mmol)中的混合物搅拌5小时。将混合物减压浓缩,得到呈油状的(S)-3-甲基-2-((S)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺基)丁酸叔丁酯(2.0g,84%产率)。LCMS(ESI):C15H28N2O3的m/z[M+H]计算值284.2;实验值285.2。
中间体5.合成((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯.
Figure BDA0004194083620005381
步骤1.在Ar气氛下,在室温下向3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(30g,67mmol)和(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(55.8g,80.8mmol)于1,4-二噁烷(750mL)中的搅拌的混合物中分数份添加Na2CO3(17.9g,168.4mmol)、Pd(DtBPF)Cl2(4.39g,6.7mmol)和H2O(150.00mL)。将混合物加热至85℃并搅拌3小时,冷却,用H2O(2L)稀释并用EtOAc(3×1L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×500mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(50g,72%产率)。LCMS(ESI):C52H77N5O8Si的m/z[M+H]计算值927.6;实验值928.8。
步骤2.在室温下,向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(50g,54mmol)于DCE(500mL)中的搅拌的混合物中一次性添加三甲基氢氧化锡(48.7g,269mmol)。将混合物加热至65℃并搅拌16小时,接着过滤并用DCM(3×150mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(70g,粗品),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C51H75N5O8Si的m/z[M+H]计算值913.5;实验值914.6。
步骤3.在N2气氛下,在0℃下向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(70g)于DCM(5L)中的搅拌的混合物中分数份添加DIPEA(297g,2.3mol)、HOBT(51.7g,383mmol)和EDCI(411g,2.1mol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用DCM(1L)稀释,用盐水(3×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(36g,42%产率)。LCMS(ESI):C51H73N5O7Si的m/z[M+H]计算值895.5;实验值896.5。
中间体6.合成N-[(8S,14S)-21-碘-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯.
Figure BDA0004194083620005401
步骤1.本反应是按下文所示的规模,分5批并行进行。
在室温下,向2L圆底烧瓶中分别添加于THF(1.15L)中的5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚(100g,192mmol)和TBAF(301.4g,1.15mol)。将所得混合物加热至50℃并搅拌16小时,接着将混合物减压浓缩。将合并的残余物用H2O(5L)稀释并用EtOAc(3×2L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(310g,粗品)。LCMS(ESI):C13H16BrNO的m/z[M+H]计算值281.0和283.0;实验值282.1和284.1。
步骤2.本反应是按下文所示的规模,分2批并行进行。
在N2气氛下,在0℃下向3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(135g,478mmol)和TEA(145.2g,1.44mol)于DCM(1.3L)中的搅拌的混合物中分数份添加Ac2O(73.3g,718mmol)和DMAP(4.68g,38.3mmol)。在0℃下,将所得混合物搅拌10分钟,接着用H2O(3×2L)洗涤。将来自每一实验的有机层合并,并用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过柱色谱法纯化,得到呈固体状的乙酸3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(304g,88%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.16-11.11(m,1H),7.69(d,J=2.0Hz,1H),7.32(d,J=8.6Hz,1H),7.19-7.12(m,2H),3.69(s,2H),2.64(s,2H),2.09(s,3H),0.90(s,6H)。
步骤3.本反应是按下文所示的规模,分4批并行进行。
在Ar气氛下,在室温下向2L圆底烧瓶中添加(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸甲酯(125g,216mmol)、1,4-二噁烷(1L)、H2O(200mL)、乙酸3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(73.7g,227mmol)、K2CO3(59.8g,433mmol)和Pd(DtBPF)Cl2(7.05g,10.8mmol)。将所得混合物加热至65℃并搅拌2小时,接着用H2O(10L)稀释并用EtOAc(3×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×2L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(500g,74%产率)。LCMS(ESI):C39H58N2O7SiNa的m/z[M+Na]计算值717.4;实验值717.3。
步骤4.本反应是按下文所示的规模,分3批并行进行。
在氮气氛下,在0℃下向(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(150g,216mmol)和NaHCO3(21.76g,259mmol)于THF(1.5L)中的搅拌的混合物中逐滴添加于THF中的AgOTf(66.5g,259mmol)。在0℃下,经1小时逐滴添加于THF中的I2(49.3g,194mmol)并在0℃下,将所得混合物再搅拌10分钟。将合并的实验用Na2S2O3水溶液(5L)稀释并用EtOAc(3×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(420g,71%产率)。LCMS(ESI):C39H57IN2O7SiNa的m/z[M+Na]计算值843.3;实验值842.9。
步骤5.本反应是按下文所示的规模,分3批并行进行。
在0℃下,向2L圆底烧瓶中添加(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(140g,171mmol)、MeOH(1.4L)和K3PO4(108.6g,512mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着将合并的实验用H2O(9L)稀释并用EtOAc(3×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×2L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸甲酯(438g,粗品)。LCMS(ESI):C37H55IN2O6SiNa的m/z[M+Na]计算值801.3;实验值801.6。
步骤6.本反应是按下文所示的规模,分3批并行进行。
在0℃下,向(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸甲酯(146g,188mmol)于THF(1.46L)中的搅拌的混合物中逐滴添加于H2O(937mL)中的LiOH(22.45g,937mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌1.5小时[注意:LCMS显示15%脱TIPS产物]。用1MHCl(1M)将混合物酸化至pH 5并将合并的实验用EtOAc(3×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×2L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸(402g,粗品)。LCMS(ESI):C36H53IN2O6SiNa的m/z[M+Na]计算值787.3;实验值787.6。
步骤7.在0℃下,向(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸(340g,445mmol)和(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(96.1g,667mmol)于DCM(3.5L)中的搅拌的混合物中逐份添加NMM(225g,2.2mol)、EDCI(170g,889mmol)、HOBT(12.0g,88.9mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用H2O(3×2.5L)、盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过柱色谱法纯化,得到呈油状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(310g,62%产率)。LCMS(ESI):C42H63IN4O7Si的m/z[M+H]计算值890.4;实验值890.8。
步骤8.本反应是按下文所示的规模,分3批并行进行。
在N2气氛下,在0℃下向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(85.0g,95.4mmol)于THF(850mL)中的搅拌的混合物中分别逐滴添加于H2O(410mL)中的LiOH(6.85g,286mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1.5小时[注意:LCMS显示15%脱TIPS产物],接着用1M HCl酸化至pH 5并将合并的实验用EtOAc(3×2L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(240g,粗品)。LCMS(ESI):C41H61IN4O7Si的m/z[M+H]计算值876.3;实验值877.6。
步骤9.本反应是按下文所示的规模,分2批并行进行。
在N2气氛下,在0℃下向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(120g,137mmol)于DCM(6L)中的搅拌的混合物中分数份添加DIPEA(265g,2.05mol)、EDCI(394g,2.05mol)、HOBT(37g,274mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜,接着将合并的实验用H2O(3×6L)、盐水(2×6L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。过滤后,减压浓缩滤液。减压浓缩滤液并将残余物通过柱色谱法纯化,得到呈固体状的N-[(8S,14S)-21-碘-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(140g,50%产率)。LCMS(ESI):C41H59IN4O6Si的m/z[M+H]计算值858.9;实验值858.3。
中间体7.合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
Figure BDA0004194083620005441
步骤1.在Ar气氛下,在室温下向3-溴-4-(甲氧基甲基)吡啶(1.00g,5.0mmol)、4,4,5,5-四甲基-2-(四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(1.51g,5.9mmol)和KOAc(1.21g,12.3mmol)于甲苯(10mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2(362mg,0.5mmol)。将混合物加热至110℃并搅拌过夜,接着减压浓缩,得到4-(甲氧基甲基)-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶,将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C13H20BNO3的m/z[M+H]计算值249.2;实验值250.3。
步骤2.在Ar气氛下,在室温下向4-(甲氧基甲基)-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶(290mg,1.16mmol)、K3PO4(371mg,1.75mmol)和N-[(8S,14S)-21-碘-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(500mg,0.58mmol)于1,4-二噁烷(5mL)和H2O(1mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2(43mg,0.06mmol)。将混合物加热至70℃并搅拌2小时,接着添加H2O并用EtOAc(2×10mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈泡沫状的N-[(8S,14S)-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(370mg,74%产率)。LCMS(ESI):C48H67N5O7Si的m/z[M+H]计算值853.6;实验值854.6。
步骤3.在35℃下,将N-[(8S,14S)-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(350mg,0.41mmol)、Cs2CO3(267mg,0.82mmol)和EtI(128mg,0.82mmol)于DMF(4mL)中的混合物搅拌过夜。添加H2O并将混合物用EtOAc(2×15mL)萃取。将合并的有机层用盐水(15mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的N-[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(350mg,97%产率)。LCMS(ESI):C50H71N5O7Si的m/z[M+H]计算值881.5;实验值882.6。
步骤4.在Ar气氛下,在0℃下将N-[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(350mg,0.4mmol)和1M TBAF的THF溶液(0.48mL,0.480mmol)于THF(3mL)中的混合物搅拌1小时。将混合物减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(230mg,80%产率)。LCMS(ESI):C41H51N5O7的m/z[M+H]计算值725.4;实验值726.6。
步骤5.在Ar气氛下,在0℃下向N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.28mmol)于1,4-二噁烷(2mL)中的混合物中添加4M HCl的1,4-二噁烷溶液(2mL,8mmol)。使混合物升温至室温并搅拌过夜,接着减压浓缩,得到(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(200mg)。LCMS(ESI):C36H43N5O5的m/z[M+H]计算值625.3;实验值626.5。
中间体8.合成((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0004194083620005471
步骤1.在室温下,向(2S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(110g,301.2mmol)于THF(500mL)和H2O(200mL)中的溶液中添加LiOH(21.64g,903.6mmol)。将溶液搅拌1小时,接着减压浓缩。用1M HCl将残余物调至pH 6,接着用DCM(3×500mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到(S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(108g,粗品)。LCMS(ESI):C11H16BrN2O4S的m/z[M+H]计算值351.0;实验值351.0。
步骤2.在0℃下,向(S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(70g,199.3mmol)于DCM(500mL)中的溶液中添加(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯双(三氟乙酸)盐(111.28g,298.96mmol)、NMM(219.12mL,1993.0mmol)、EDCI(76.41g,398.6mmol)和HOBt(5.39g,39.89mmol)。将溶液升温至室温并搅拌1小时。接着,用H2O(500mL)淬灭反应并用EtOAc(3×500mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到(S)-1-((S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(88.1g,93%产率)。LCMS(ESI):C17H26BrN4O5S的m/z[M+H]计算值477.1;实验值477.1。
步骤3.在室温下,向3-(5-溴-1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(60g,134.7mmol)于甲苯(500mL)中的溶液中添加双(频哪醇合)二硼(51.31g,202.1mmol)、Pd(dppf)Cl2(9.86g,13.4mmol)和KOAc(26.44g,269mmol)。接着,将反应混合物加热至90℃并搅拌2小时。接着,将反应溶液冷却至室温并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到(S)-3-(1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(60.6g,94%产率)。LCMS(ESI):C29H42BN2O4的m/z[M+H]计算值493.32;实验值493.3。
步骤4.在室温下,向(S)-3-(1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(30g,60.9mmol)于甲苯(600mL)、二噁烷(200mL)和H2O(200mL)中的溶液中添加(S)-1-((S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(43.62g,91.4mmol)、K3PO4(32.23g,152.3mmol)和Pd(dppf)Cl2(8.91g,12.18mmol)。将所得溶液加热至70℃并搅拌过夜。接着,将反应混合物冷却至室温并用H2O(200mL)淬灭。将混合物用EtOAc萃取并将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(39.7g,85%产率)。LCMS(ESI):C40H55N6O7S的m/z[M+H]计算值763.4;实验值763.3。
步骤5.在室温下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(39.7g,52.0mmol)于THF(400mL)和H2O(100mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(3.74g,156.2mmol)。将混合物搅拌1.5小时,接着减压浓缩。用1M HCl将残余物酸化至pH 6并用DCM(3×1000mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(37.9g,粗品)。LCMS(ESI):C39H53N6O7S的m/z[M+H]计算值749.4;实验值749.4。
步骤6.在0℃下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(37.9g,50.6mmol)、HOBt(34.19g,253.0mmol)和DIPEA(264.4mL,1518mmol)于DCM(4L)中的溶液中添加EDCI(271.63g,1416.9mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌过夜。接着,将反应混合物用H2O淬灭并用1M HCl(4×1L)洗涤。将有机层分离并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(30g,81%产率)。LCMS(ESI):C39H51N6O6S的m/z[M+H]计算值731.4;实验值731.3。
步骤7.在0℃下,向((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(6g,8.21mmol)于DCM(60mL)中的溶液中添加TFA(30mL)。将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(7.0g,粗品)。LCMS(ESI):C34H42N6O4S的m/z[M+H]计算值631.3;实验值:630.3。
中间体9.合成(S)-3-溴-5-碘-2-(1-甲氧基乙基)吡啶.
Figure BDA0004194083620005501
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步骤1.在氩气氛下,向3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(80.00g,370.24mmol,1.00当量)和双(频哪醇合)二硼(141.03g,555.3mmol,1.50当量)于THF(320mL)中的搅拌的溶液中添加dtbpy(14.91g,55.5mmol)和氯(1,5-环辛二烯)铱(I)二聚体(7.46g,11.1mmol)。在氩气氛下,在75℃下将所得混合物搅拌16小时。将混合物减压浓缩。将所得混合物溶解于EtOAc(200mL)中并用水(600mL)中的Na2CO3(40g)和NaOH(10g)(质量4:1)将混合物调至pH 10。将水层用EtOAc(800mL)萃取。用HCl(6N)将水相酸化至pH=6以使所需固体沉淀,得到呈浅黄色固体状的5-溴-6-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基硼酸(50g,52.0%产率)。LCMS(ESI):C8H11BBrNO3的m/z[M+H]计算值259.0;实验值260.0。
步骤2.在氩气氛下,在室温下向5-溴-6-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基硼酸(23.00g,88.5mmol)于ACN(230mL)中的搅拌的溶液中添加NIS(49.78g,221.2mmol)。在氩气氛下,在80℃下将所得混合物搅拌过夜。将所得混合物减压浓缩。将所得混合物溶解于DCM(2.1L)中并用Na2S2O3(3×500mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到(S)-3-溴-5-碘-2-(1-甲氧基乙基)吡啶(20g,66.0%产率)。LCMS(ESI):C8H9BrINO的m/z[M+H]计算值340.9;实验值341.7。
中间体10.合成((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0004194083620005511
步骤1.向用惰性氩气氛吹扫并维持该气氛的3-L 3颈圆底烧瓶中放入3-溴-5-碘-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(147g,429.8mmol)、哌嗪-1-甲酸苯甲酯(94.69g,429.8mmol)、Pd(OAc)2(4.83g,21.4mmol)、BINAP(5.35g,8.6mmol)、Cs2CO3(350.14g,1074.6mmol)、甲苯(1L)。在油浴中,在100℃下将所得溶液搅拌过夜。反应完成后,将反应混合物冷却至25℃。将所得混合物减压浓缩。用乙酸乙酯/己烷(1:1)将残余物施加至硅胶柱上。减压去除溶剂,得到呈深黄色固体状的(S)-4-(5-溴-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(135g,65.1%产率)。LCMS(ESI):C20H24BrN3O3的m/z[M+H]计算值433.1;实验值434.1。
步骤2.向用惰性氩气氛吹扫并维持该气氛的3-L 3颈圆底烧瓶中放入4-[5-溴-6-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(135g,310.8mmol)、双(频哪醇合)二硼(86.82g,341.9mmol)、Pd(dppf)Cl2(22.74g,31.0mmol)、KOAc(76.26g,777.5mmol)、甲苯(1L)。在油浴中,在90℃下将所得溶液搅拌2天。将反应混合物冷却至25℃。真空浓缩所得混合物。用乙酸乙酯/己烷(1:3)将残余物施加至中性氧化铝柱上。减压去除溶剂,得到呈深黄色固体状的(S)-4-(6-(1-甲氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(167g,粗品)。LCMS(ESI):C26H36BN3O5的m/z[M+H]计算值481.3;实验值482.1。
步骤3.向用惰性氩气氛吹扫并维持该气氛的3-L 3颈圆底烧瓶中放入(S)-4-(6-(1-甲氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸酯(167g,346.9mmol)、5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚(224.27g,346.9mmol)、Pd(dppf)Cl2(25.38g,34.6mmol)、二噁烷(600mL)、H2O(200mL)、K3PO4(184.09g,867.2mmol)、甲苯(200mL)。在油浴中,在70℃下将所得溶液搅拌过夜。反应完成后,将反应混合物冷却至25℃。真空浓缩所得混合物。用乙酸乙酯/己烷(1:1)将残余物施加至硅胶柱上。减压去除溶剂,得到呈黄色固体状的(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(146g,48.1%产率)。LCMS(ESI):C49H57BrN4O4Si的m/z[M+H]计算值872.3;实验值873.3。
步骤4.在N2气氛下,在0℃下向(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(146g,167.0mmol)和Cs2CO3(163.28g,501.1mmol)于DMF(1200mL)中的搅拌的混合物中分数份添加C2H5I(52.11g,334.0mmol)。在25℃下,将最终反应混合物搅拌12小时。可通过LCMS检测所需产物。将所得混合物用EA(1L)稀释并用盐水(3×1.5L)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液,得到呈黄色固体状的(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-乙基-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(143g,粗品),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤。LCMS(ESI):C51H61BrN4O4Si的m/z[M+H]计算值900.4;实验值901.4。
步骤5.向(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-乙基-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲基苯甲酯(143g,158.5mmol)于DMF(1250mL)中的搅拌的混合物中添加CsF(72.24g,475.5mmol)。接着,在N2气氛下,在60℃下将反应混合物搅拌2天。可通过LCMS检测所需产物。将所得混合物用EA(1L)稀释并用盐水(3×1L)洗涤。接着,将有机相减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,用PE/EA(1/3)洗脱,得到(S)-4-(5-(5-溴-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯的两种阻转异构体:A(38g,36%产率,RT=1.677分钟,经3分钟LCMS(0.1% FA))和B(34g,34%产率,RT=1.578分钟,经3分钟LCMS(0.1% FA)),都呈黄色固体状。LCMS(ESI):C35H43BrN4O4的m/z[M+H]计算值663.2;实验值662.2。
步骤6.向用惰性氮气氛吹扫并维持该气氛的500-mL 3颈圆底烧瓶中放入(S)-4-(5-(5-溴-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯A(14g,21.1mmol)、双(频哪醇合)二硼(5.89g,23.21mmol)、Pd(dppf)Cl2(1.54g,2.1mmol)、KOAc(5.18g,52.7mmol)、甲苯(150mL)。在油浴中,在90℃下将所得溶液搅拌5小时。将反应混合物冷却至25℃。真空浓缩所得混合物。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,用PE/EA(1/3)洗脱,得到呈黄色固体状的(S)-4-(5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(12g,76.0%产率)。LCMS(ESI):C41H55BN4O6的m/z[M+H]计算值710.4;实验值711.3。
步骤7.向用惰性氩气氛吹扫并维持该气氛的250-mL圆底烧瓶中放入(S)-4-(5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(10.8g,15.2mmol)、(3S)-1-[(2S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(7.98g,16.7mmol)、Pd(dtbpf)Cl2(0.99g,1.52mmol)、K3PO4(8.06g,37.9mmol)、甲苯(60mL)、二噁烷(20mL)、H2O(20mL)。在油浴中,在70℃下将所得溶液搅拌3小时。将反应混合物冷却至25℃。将所得溶液用EtOAc(2×50mL)萃取并减压浓缩。用乙酸乙酯/己烷(10:1)将残余物施加至硅胶柱上。去除溶剂,得到呈黄色固体状的(S)-1-((S)-3-(4-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(8g,50.9%产率)。LCMS(ESI):C52H68N8O9S的m/z[M+H]计算值980.5;实验值980.9。
步骤8.在N2气氛下,向(S)-1-((S)-3-(4-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(12g,12.23mmol)于THF(100mL)/H2O(100mL)中的搅拌的混合物中添加LiOH(2.45g,61.1mmol)并在25℃下,将所得混合物搅拌2小时。可通过LCMS检测所需产物。减压浓缩THF。在0℃下,用HCL(1N)将水相的pH值酸化至5。将水层用DCM(3×100ml)萃取。减压浓缩有机相,得到呈浅黄色固体状的(S)-1-((S)-3-(4-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(10g,84.5%产率)。LCMS(ESI):C51H66N8O9S的m/z[M+H]计算值966.5;实验值967.0。
步骤9.向用惰性氮气氛吹扫并维持该气氛的3-L圆底烧瓶中放入(S)-1-((S)-3-(4-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(18g,18.61mmol)、ACN(1.8L)、DIEA(96.21g,744.4mmol)、EDCI(107.03g,558.3mmol)、HOBT(25.15g,186.1mmol)。反应完成后,在25℃下,将所得溶液搅拌过夜。将所得混合物减压浓缩。将所得溶液用DCM(1L)稀释。将所得混合物用HCl(3×1L,1N水溶液)洗涤。将所得混合物用水(3×1L)洗涤。接着,浓缩有机层,用乙酸乙酯/己烷(1:1)将残余物施加至硅胶柱上。减压去除溶剂,得到呈浅黄色固体状的4-(5-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(10.4g,54.8%产率)。LCMS(ESI):C51H64N8O8S的m/z[M+H]计算值948.5;实验值949.3。
步骤10.向用惰性氮气氛吹扫并维持该气氛的250-mL圆底烧瓶中放入4-(5-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(10.40g,10.9mmol)、Pd(OH)2/C(5g,46.9mmol)、MeOH(100mL)。在2atm H2气氛下,在25℃下将所得溶液搅拌3小时。过滤出固体并用MeOH(3×100mL)洗涤滤饼。接着,将合并的有机相减压浓缩,得到呈浅黄色固体状的((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(8.5g,90.4%产率)。LCMS(ESI):C43H58N8O6S的m/z[M+H]计算值814.4;实验值815.3。
步骤11.向用惰性氮气氛吹扫并维持该气氛的1000-mL圆底烧瓶中放入((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(8.5g,10.4mmol)、MeOH(100mL)、AcOH(1.88g,31.2mmol)并搅拌15分钟。接着,在25℃下添加HCHO(1.88g,23.15mmol,37%水溶液)和NaBH3CN(788mg,12.5mmol)。在25℃下,将所得溶液搅拌3小时。将所得混合物用100mL水淬灭并减压浓缩以去除MeOH。将所得溶液用300mL DCM稀释。将所得混合物用水(3×100mL)洗涤。去除溶剂,得到呈黄色固体状的((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(8.2g,90.1%产率)。LCMS(ESI):C44H60N8O6S的m/z[M+H]计算值828.4;实验值829.3。
实施例A11.合成(3S)-3-{[(1S)-1-{[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨甲酰基}-2-甲基丙基](甲基)氨甲酰基}吡咯烷-1-甲酸甲酯
Figure BDA0004194083620005561
步骤1.在0℃下,向N-甲基-N-((S)-吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸叔丁酯(500mg,1.8mmol)和TEA(356mg,3.5mmol)于DCM(10mL)中的混合物中逐滴添加氯甲酸甲酯(199mg,2.1mmol)。使混合物升温至室温并搅拌12,接着减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-3-(((S)-1-(叔丁氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸甲酯(550mg,82%)。LCMS(ESI):C17H30N2O5的m/z[M+H]计算值342.2;实验值343.2。
步骤2.在室温下,将(S)-3-(((S)-1-(叔丁氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸甲酯(500mg,1.46mmol)、DCM(8mL)和TFA(2mL)的混合物搅拌3小时。将混合物减压浓缩,并通过使用甲苯(5mL)共沸去除H2O,得到呈油状的N-((S)-1-(甲氧基羰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(400mg)。LCMS(ESI):C13H22N2O5的m/z[M+H]计算值286.2;实验值287.2。
步骤3.在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(80mg,0.13mmol)、N-((S)-1-(甲氧基羰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(55mg,0.19mmol)和DIPEA(165mg,1.3mmol)于DMF(2mL)中的混合物中添加COMU(77mg,0.18mmol)。在0℃下,将混合物搅拌2小时,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(3S)-3-{[(1S)-1-{[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨甲酰基}-2-甲基丙基](甲基)氨甲酰基}吡咯烷-1-甲酸甲酯(51mg,45%产率)。LCMS(ESI):C49H63N7O9的m/z[M+H]计算值893.5;实验值894.7;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.33(s,1H),8.88-8.66(m,2H),8.62(s,1H),8.17-8.06(m,1H),7.92(d,J=8.7Hz,1H),7.79-7.68(m,1H),7.65-7.49(m,2H),7.21-7.11(m,1H),7.01(d,J=11.8Hz,1H),6.71-6.40(m,1H),5.54-5.30(m,1H),5.28-4.99(m,1H),4.87-4.56(m,1H),4.46-4.21(m,3H),4.11-3.89(m,3H),3.70(s,1H),3.65-3.59(m,4H),3.35(s,2H),3.24(s,2H),3.18-3.07(s,1H),3.00-2.58(m,8H),2.22-2.01(m,4H),1.81(d,J=11.4Hz,2H),1.72-1.42(m,2H),1.15-0.64(m,13H),0.43(d,J=16.4Hz,3H)。
实施例A17.合成(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-{1-[(3S)-1-甲酰基吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620005581
步骤1.将(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-(3S)-吡咯烷-3-基甲酰胺基]丁酸叔丁酯(290mg,1.0mmol)和甲酸乙酯(755mg,10.2mmol)的混合物加热至60℃并搅拌12小时。将混合物减压浓缩,得到呈固体状的(2S)-2-[1-[(3S)-1-甲酰基吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸叔丁酯(300mg,85%产率)。LCMS(ESI):C12H20N2O4的m/z[M+H-tBu]计算值256.1;实验值257.2。
步骤2.在室温下,向(2S)-2-[1-[(3S)-1-甲酰基吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸叔丁酯(290mg,0.93mmol)于DCM(3mL)中的混合物中添加TFA(1mL)。在室温下,将混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到呈油状的(2S)-2-[1-[(3S)-1-甲酰基吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸(260mg,98%)。LCMS(ESI):C12H20N2O4的m/z[M+H]计算值256.1;实验值257.2。
步骤3.在N2气氛下,在0℃下向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(60mg,0.1mmol)、2,6-二甲基吡啶(15.4mg,0.14mmol)和(2S)-2-[1-[(3S)-1-甲酰基吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸(37mg,0.14mmol)于MeCN(2mL)中的混合物中添加COMU(62mg,0.14mmol)。在0℃下,将混合物搅拌12小时,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-{1-[(3S)-1-甲酰基吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-3-甲基丁酰胺(35mg,42%)。LCMS(ESI):C48H61N7O8的m/z[M+H]计算值863.5;实验值864.5;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.79-8.61(m,2H),8.51(d,J=7.8Hz,3H),8.31-8.09(m,1H),7.93(s,1H),7.68-7.48(m,3H),7.25-6.97(m,2H),6.71-6.43(m,1H),5.40(d,J=24.8Hz,1H),5.22(s,1H),4.86-4.34(m,1H),4.23(t,J=13.8Hz,3H),4.12-3.84(m,3H),3.83-3.54(m,4H),3.22(d,J=1.7Hz,2H),3.09(d,J=14.3Hz,1H),3.01-2.92(m,1H),2.99-2.93(m,2H),2.92-2.65(m,5H),2.07(d,J=12.2Hz,4H),1.80(s,1H),1.74-1.48(m,2H),1.08(t,J=7.1Hz,2H),1.03-0.54(m,12H),0.43(d,J=16.2Hz,3H)。
实施例A6.合成(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-{1-[(3S)-1-{2-[(3R)-3-羟基吡咯烷-1-基]乙酰基}吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620005601
步骤1.在0℃下,将(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-(3S)-吡咯烷-3-基甲酰胺基]丁酸叔丁酯(300mg,1.1mmol)和DIPEA(409mg,3.2mmol)于MeCN(4mL)中的混合物逐滴添加溴乙酰基溴化物(256mg,1.3mmol)。在0℃下,将混合物搅拌30分钟,接着减压浓缩并将残余物通过C18硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S)-2-[1-[(3S)-1-(2-溴乙酰基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸叔丁酯(350mg,73%产率)。LCMS(ESI):C17H29BrN2O4的m/z[M+H]计算值404.1;实验值405.2和407.2。
步骤2.在0℃下,向(2S)-2-[1-[(3S)-1-(2-溴乙酰基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸叔丁酯(110mg,0.27mmol)和K2CO3(75mg,0.54mmol)于DMF(2mL)中的混合物中逐滴添加(3S)-吡咯烷-3-醇(36mg,0.41mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈油状的(2S)-2-[1-[(3S)-1-[2-[(3S)-3-羟基吡咯烷-1-基]乙酰基]吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸叔丁酯(60mg,48%产率)。LCMS(ESI):C21H37N3O5的m/z[M+H]计算值411.3;实验值412.5。
步骤3.在0℃下,向(2S)-2-[1-[(3S)-1-[2-[(3S)-3-羟基吡咯烷-1-基]乙酰基]吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸叔丁酯(60mg,0.15mmol)于DCM(0.50mL)中的混合物中逐滴添加TFA(0.50mL,6.7mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着在甲苯存在下减压浓缩(×3),得到呈油状的(2S)-2-[1-[(3S)-1-[2-[(3S)-3-羟基吡咯烷-1-基]乙酰基]吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸(70mg,粗品)。LCMS(ESI):C17H29N3O5的m/z[M+H]计算值355.2;实验值356.4。
步骤4.在-10℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(60mg,0.1mmol)和DIPEA(124mg,1.0mmol)于DMF(1mL)中的混合物中分数份添加(2S)-2-[1-[(3S)-1-[2-[(3S)-3-羟基吡咯烷-1-基]乙酰基]吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸(51mg,0.14mmol)和CIP(40mg,0.14mmol)。在-10℃下,将混合物搅拌1小时,接着用H2O(30mL)稀释并用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-{1-[(3S)-1-{2-[(3R)-3-羟基吡咯烷-1-基]乙酰基}吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-3-甲基丁酰胺(8.6mg,8%产率)。LCMS(ESI):C53H70N8O9的m/z[M+H]计算值962.5;实验值963.5;1HNMR(400MHz,CD3OD)δ8.70(td,J=5.1,1.6Hz,1H),8.66-8.48(m,1H),8.07-7.90(m,1H),7.76(dd,J=9.9,5.2Hz,1H),7.61(tt,J=9.9,2.0Hz,1H),7.52(dt,J=8.7,3.5Hz,1H),7.11-6.97(m,1H),6.62-6.47(m,1H),5.68-5.48(m,1H),4.79(dt,J=11.2,9.1Hz,1H),4.53-4.18(m,4H),4.16-3.86(m,3H),3.85-3.56(m,7H),3.55-3.46(m,1H),3.42(d,J=4.6Hz,4H),3.26-3.01(m,3H),3.01-2.60(m,9H),2.42-2.01(m,6H),1.92(s,1H),1.75(s,2H),1.62(q,J=12.7Hz,1H),1.26-0.80(m,13H),0.61-0.40(m,3H)。
实施例A24.合成(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-{1-[(3S)-1-甲烷磺酰基吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620005621
步骤1.在N2气氛下,在0℃下向N-甲基-N-((S)-吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸叔丁酯(500mg,1.8mmol)于DCM(8mL)中的混合物中添加TEA(356mg,3.5mmol),随后添加MsCl(242mg,2.1mmol)。将混合物升温至室温并搅拌3小时,接着用盐水(2×10mL)洗涤。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的N-甲基-N-((S)-1-(甲基磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸叔丁酯(540mg,85%)。LCMS(ESI):C16H30N2O5S的m/z[M+H]计算值362.2;实验值363.1。
步骤2.在N2气氛下,在室温下将N-甲基-N-((S)-1-(甲基磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸叔丁酯(570mg,1.6mmol)、DCM(8mL)和TFA(2mL)的混合物搅拌1小时。在甲苯(5mL)存在下减压浓缩混合物,得到呈油状的N-甲基-N-((S)-1-(甲基磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸(500mg)。LCMS(ESI):C12H22N2O5S的m/z[M+H]计算值305.1;实验值306.2。
步骤3.在N2气氛下,在0℃下向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(80mg,0.13mmol)于DMF(2mL)中的混合物中添加DIPEA(165mg,1.3mmol)、N-甲基-N-((S)-1-(甲基磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸(59mg,0.19mmol)和COMU(71mg,0.17mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-{1-[(3S)-1-甲烷磺酰基吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-3-甲基丁酰胺(42mg,36%产率)。LCMS(ESI):C48H63N7O9S的m/z[M+H]计算值913.4;实验值914.6;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.35-9.33(m,1H),8.74-8.62(m,2H),8.52(s,1H),8.19-8.11(m,1H),7.92(s,1H),7.64-7.60(m,2H),7.53(t,J=9.0Hz,1H),7.22-7.10(m,1H),7.02(s,1H),6.58-6.48(m,1H),5.37-5.24(m,1H),5.19-5.04(m,1H),4.30-4.18(m,3H),4.07-3.91(m,3H),3.75-3.49(m,6H),3.22(d,J=1.5Hz,2H),2.97-2.91(m,4H),2.92-2.65(m,7H),2.27(s,1H),2.06(d,J=14.4Hz,3H),1.85(d,J=35.3Hz,2H),1.70-1.50(m,2H),1.09-0.88(m,8H),0.85-0.72(m,5H),0.43(d,J=17.8Hz,3H)。
实施例A37.合成(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-{1-[(3S)-1-[(3-羟基氮杂环丁烷-1-基)磺酰基]吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620005641
步骤1.在室温下,向N-甲基-N-((S)-吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸叔丁酯(500mg,1.8mmol)于DCM(20mL)中的混合物中添加TEA(356mg,3.5mmol)和3-(苯甲氧基)氮杂环丁烷-1-磺酰氯(460mg,1.8mmol)。在室温下,将混合物搅拌过夜,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈油状的N-((S)-1-((3-(苯甲氧基)氮杂环丁烷-1-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(390mg,44%产率)。LCMS(ESI):C25H39N3O6S的m/z[M+H]计算值509.3;实验值510.5。
步骤2.在N2气氛下,在室温下将N-((S)-1-((3-(苯甲氧基)氮杂环丁烷-1-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(390mg,0.77mmol)、DCM(4mL)和TFA(1mL)的混合物在室温下搅拌2小时。在甲苯(10mL×2)存在下,减压浓缩混合物,得到呈固体状的N-((S)-1-((3-(苯甲氧基)氮杂环丁烷-1-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(370mg,粗品)。LCMS(ESI):C21H31N3O6S的m/z[M+H]计算值453.2;实验值454.5。
步骤3.在N2气氛下,在0℃下向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(60mg,0.1mmol)于DMF(8mL)中的混合物中添加DIPEA(124mg,0.96mmol)、N-((S)-1-((3-(苯甲氧基)氮杂环丁烷-1-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(65mg,0.14mmol)和COMU(58mg,0.13mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈油状的(3S)-1-((3-(苯甲氧基)氮杂环丁烷-1-基)磺酰基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺(52mg,51%产率)。LCMS(ESI):C57H72N8O10S的m/z[M+H]计算值1060.5;实验值1061.3。
步骤4.在H2气氛下,将(3S)-1-((3-(苯甲氧基)氮杂环丁烷-1-基)磺酰基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺(55mg,0.05mmol)、MeOH(3mL)和Pd(OH)2/C(11mg,20重量%)的混合物搅拌12小时。将混合物过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-{1-[(3S)-1-[(3-羟基氮杂环丁烷-1-基)磺酰基]吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-3-甲基丁酰胺(6.5mg,13%产率)。LCMS(ESI):C50H66N8O10S的m/z[M+H]计算值970.5;实验值971.2;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.33-9.29(m,1H),8.75-8.65(m,2H),8.52(s,0.5H),8.15-8.06(m,0.5H),7.92(s,1H),7.65-7.50(m,3H),7.22-7.14(m,1H),7.02(s,1H),6.58-6.46(m,1H),5.84-5.80(m,1H),5.28-5.22(m,0.6H),4.75-4.69(m,0.4H),4.45-4.12(m,4H),4.05-3.88(m,5H),3.72-3.50(m,7H),3.22(s,2H),3.12-3.04(m,1H),2.94-2.70(m,7H),2.29-2.03(m,5H),1.90-1.77(m,2H),1.76-1.45(m,2H),1.24(s,1H),1.08-1.02(m,2H),1.01-0.72(m,12H),0.5-0.43(m,3H)。
实施例A42.合成(3S)-N3-[(1S)-1-{[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨甲酰基}-2-甲基丙基]-N1,N1,N3-三甲基吡咯烷-1,3-二甲酰胺
Figure BDA0004194083620005661
步骤1.在N2气氛下,在0℃下向(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-(3S)-吡咯烷-3-基甲酰胺基]丁酸叔丁酯(200mg,0.7mmol)和TEA(142mg,1.4mmol)于DCM(10mL)中的混合物中分数份添加二甲基氨甲酰氯(91mg,0.84mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着添加H2O并用DCM(3×50mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(1×5mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到(2S)-2-[1-[(3S)-1-(二甲基氨甲酰基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸叔丁酯,将其不经进一步纯化即用于下一步骤中。
步骤2.在室温下,将(2S)-2-[1-[(3S)-1-(二甲基氨甲酰基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸叔丁酯(335mg,0.94mmol)于DCM(10mL)和TFA(2mL,26.9mmol)中的混合物搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到(2S)-2-[1-[(3S)-1-(二甲基氨甲酰基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸,将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C14H25N3O4的m/z[M+H]计算值299.2;实验值300.2。
步骤3.在N2气氛下,在0℃下向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(80mg,0.13mmol)和(2S)-2-[1-[(3S)-1-(二甲基氨甲酰基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸(57mg,0.19mmol)于MeCN(3mL)中的混合物中分数份添加二甲基吡啶(137mg,1.3mmol)和COMU(77mg,0.18mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(3S)-N3-[(1S)-1-{[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨甲酰基}-2-甲基丙基]-N1,N1,N3-三甲基吡咯烷-1,3-二甲酰胺(45.6mg,39%产率)。LCMS(ESI):C50H66N8O8的m/z[M+H]计算值906.5;实验值907.4;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.31-9.30(m,1H),8.72-8.71(m,1H),8.59(d,J=50.4Hz,1H),7.92-7.90(m,1H),7.74-7.42(m,3H),7.23-7.08(m,1H),7.00(d,J=13.4Hz,1H),6.56-6.49(m,1H),5.45-5.32(m,1H),5.26-5.04(m,1H),4.87-4.64(m,1H),4.53-4.35(m,1H),4.32-4.09(m,3H),4.12-3.81(m,3H),3.81-3.37(m,6H),3.23(t,J=1.6Hz,2H),3.12-3.10(m,1H),3.01-2.52(m,13H),2.23-1.95(m,4H),1.81(s,1H),1.67(s,1H),1.60-1.47(m,1H),1.28-1.22(m,1H),1.21-1.14(m,1H),1.11-1.02(m,2H),1.02-0.66(m,12H),0.43(d,J=16.8Hz,3H)。
实施例A27.合成(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-甲基吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺
Figure BDA0004194083620005681
步骤1.在空气氛下,在室温下将(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-(3S)-吡咯烷-3-基甲酰胺基]丁酸叔丁酯(80mg 0.28mmol)、Ti(Oi-Pr)4(88mg,0.31mmol)和三聚甲醛(26mg0.29mmol)于MeOH(2mL)中的混合物搅拌过夜。将混合物冷却至0℃并添加NaBH(OAc)3(107mg,0.51mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着冷却至0℃并添加H2O(0.2mL)。将混合物减压浓缩并将残余物通过C18硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-[(3S)-1-甲基吡咯烷-3-基]甲酰胺基]丁酸叔丁酯(97mg,粗品)。LCMS(ESI):C16H30N2O3的m/z[M+H]计算值298.2;实验值299.3。
步骤2.在室温下,将(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-[(3S)-1-甲基吡咯烷-3-基]甲酰胺基]丁酸叔丁酯(97mg,0.32mmol)于DCM(2mL)和TFA(1mL,13.5mmol)中的混合物搅拌1小时,接着将混合物减压浓缩,得到呈油状的(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-[(3S)-1-甲基吡咯烷-3-基]甲酰胺基]丁酸(100mg,粗品)。LCMS(ESI):C12H22N2O3的m/z[M+H]计算值242.2;实验值243.2。
步骤3.在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(80mg,0.13mmol)和(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-[(3S)-1-甲基吡咯烷-3-基]甲酰胺基]丁酸(47mg,0.19mmol)于MeCN(2mL)中的混合物中添加2,6-二甲基吡啶(137mg,1.3mmol)和COMU(77mg,0.18mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-甲基吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺(28mg,26%产率)。LCMS(ESI):C48H63N7O7的m/z[M+H]计算值849.5;实验值850.5;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.31(s,1H),8.72(t,J=5.1Hz,1H),8.67-8.50(m,1H),7.98-7.87(m,1H),7.67-7.47(m,3H),7.22-7.07(m,1H),7.01(s,1H),6.53(d,J=40.1Hz,1H),5.44-5.00(m,2H),4.46-4.12(m,3H),4.08-3.79(m,3H),3.79-3.45(m,3H),3.22(d,J=1.2Hz,2H),3.14-2.94(m,2H),2.92-2.55(m,10H),2.43-2.20(m,4H),2.19-1.92(m,4H),1.81(d,J=11.9Hz,2H),1.67(s,1H),1.53(s,1H),1.09(t,J=7.1Hz,1H),1.02-0.91(m,3H),0.91-0.80(m,5H),0.80-0.67(m,3H),0.42(d,J=21.7Hz,3H)。
实施例A23.合成(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-{1-[(3S)-1-(2-羟基乙基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620005701
步骤1.在室温下,向(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-(3S)-吡咯烷-3-基甲酰胺基]丁酸叔丁酯钒(200mg,0.6mmol)和2-溴乙醇(224mg,1.8mmol)于DMF(5mL)中的混合物中添加Cs2CO3(777mg,2.4mmol)和KI(50mg,0.3mmol)。在室温下,将混合物搅拌16小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过C18硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(2S)-2-[1-[(3S)-1-(2-羟基乙基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸叔丁酯(201mg,粗品)。LCMS(ESI):C17H32N2O4的m/z[M+H]计算值328.2;实验值329.4。
步骤2.在室温下,将(2S)-2-[1-[(3S)-1-(2-羟基乙基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸叔丁酯(100mg,0.3mmol)于DCM(1mL)和TFA(0.50mL)中的混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈油状的(2S)-2-[1-[(3S)-1-(2-羟基乙基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸(110mg,粗品)。LCMS(ESI):C13H24N2O4的m/z[M+H]计算值272.2;实验值273.2。
步骤3.在N2气氛下,在0℃下向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(60mg,0.1mmol)和(2S)-2-[1-[(3S)-1-(2-羟基乙基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基]-3-甲基丁酸(31mg,0.11mmol)于MeCN(2mL)中的混合物中添加2,6-二甲基吡啶(103mg,1.0mmol)和COMU(58mg,0.13mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-{1-[(3S)-1-(2-羟基乙基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-3-甲基丁酰胺(13mg,16%产率)。LCMS(ESI):C49H65N7O8的m/z[M+H]计算值879.5;实验值880.3;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.72(t,J=5.3Hz,1H),8.68-8.58(m,1H),8.52(s,1H),7.93(d,J=10.6Hz,1H),7.68-7.58(m,2H),7.53(d,J=7.1Hz,1H),7.21-7.07(m,1H),7.01(s,1H),6.52(d,J=42.8Hz,1H),5.35(d,J=25.5Hz,1H),5.22-4.97(m,1H),4.59-4.35(m,1H),4.23(t,J=13.8Hz,3H),4.11-3.81(m,3H),3.81-3.56(m,2H),3.56-3.47(m,3H),3.22(d,J=1.2Hz,2H),3.09(d,J=12.6Hz,1H),2.99-2.65(m,10H),2.57-2.53(m,1H),2.47-2.19(m,2H),2.14-2.08(m,1H),2.08(s,1H),2.06-1.98(m,2H),1.81(s,2H),1.59(d,J=55.9Hz,2H),1.14-0.67(m,13H),0.42(d,J=22.1Hz,3H)。
实施例A57.合成(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-(N-甲基甲烷磺酰胺基)丁酰胺
Figure BDA0004194083620005721
步骤1.在0℃下,将N-[(8S,14S)-22-乙基-21-[2-(2-甲氧基乙基)苯基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(880mg,1.2mmol)、DCM(10mL)和TFA(5mL)的混合物搅拌30分钟。将混合物减压浓缩,得到(8S,14S)-8-氨基-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-9,15-二酮,将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C45H63N5O5Si的m/z[M+H]计算值781.5;实验值782.7。
步骤2.在0℃下,向(8S,14S)-8-氨基-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-9,15-二酮(880mg,1.13mmol)和(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)(甲基)氨基]-3-甲基丁酸(521mg,2.3mmol)于DMF(8.8mL)中的混合物中添加DIPEA(1.45g,11.3mmol)和COMU(88mg,0.21mmol)。在0℃下,将混合物搅拌30分钟,接着用H2O(100mL)稀释并用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的N-[(1S)-1-[[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨甲酰基]-2-甲基丙基]-N-甲基氨基甲酸叔丁酯(1g,89%产率)。LCMS(ES I):C56H82N6O8Si的m/z[M+H]计算值994.6;实验值995.5。
步骤3.将N-[(1S)-1-[[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨甲酰基]-2-甲基丙基]-N-甲基氨基甲酸叔丁酯(1.0g,1.0mmol)、DCM(10mL)和TFA(5mL)的混合物搅拌30分钟。将混合物减压浓缩并用饱和NaHCO3将残余物碱化至约pH8,接着用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(880mg,98%产率)。LCMS(ESI):C51H74N6O6Si的m/z[M+H]计算值894.5;实验值895.5。
步骤4.在0℃下,向(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(90mg,0.1mmol)于DCM(2mL)中的混合物中添加DIPEA(65mg,0.5mmol)和MsCl(14mg,0.12mmol)。在0℃下,将混合物搅拌30分钟,接着减压浓缩并将残余物用H2O(5mL)稀释并用EtOAc(3×5mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×5mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-(N-甲基甲烷磺酰胺基)丁酰胺(60mg,61%产率)。LCMS(ESI):C52H76N6O8SSi的m/z[M+H]计算值972.5;实验值973.7。
步骤5.在0℃下,向(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-(N-甲基甲烷磺酰胺基)丁酰胺(60mg,0.06mmol)于THF(2mL)中的混合物中添加1MTBAF的THF溶液(6μL,0.006mmol)。在0℃下,将混合物搅拌30分钟,接着用H2O(5mL)稀释并用EtOAc(3×5mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×5mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-(N-甲基甲烷磺酰胺基)丁酰胺(50mg,99%产率)。LCMS(ESI):C43H56N6O8S的m/z[M+H]计算值816.4;实验值817.5;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.34(d,J=1.8Hz,1H),8.72(t,J=5.2Hz,1H),8.65(d,J=5.8Hz,1H),7.99-7.86(m,1H),7.71-7.45(m,3H),7.19(d,J=41.5Hz,1H),7.03(t,J=1.9Hz,1H),6.66(d,J=10.4Hz,1H),5.34(q,J=8.1Hz,1H),5.14(dd,J=62.7,12.2Hz,1H),4.55-4.15(m,3H),4.14-3.80(m,4H),3.80-3.46(m,3H),3.23(s,1H),3.02-2.72(m,8H),2.68(s,2H),2.15-1.89(m,3H),1.82(d,J=12.4Hz,1H),1.76-1.62(m,1H),1.54(q,J=12.7Hz,1H),1.24(s,1H),1.08(t,J=7.1Hz,2H),1.03-0.86(m,9H),0.81(s,2H),0.46(s,3H)。
实施例A43.合成(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-(2-羟基-N-甲基乙酰胺基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620005751
步骤1.在0℃下,向(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(100mg,0.11mmol)于DCM(1mL)中的混合物中添加DIPEA(72mg,0.56mmol)和乙酸2-氯-2-氧代乙酯(11.53mg,0.11mmol)。将混合物升温至室温并搅拌30分钟,接着减压浓缩,用水(3mL)稀释并用EtOAc(3×3mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×3mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的乙酸[[(1S)-1-[[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨甲酰基]-2-甲基丙基](甲基)氨甲酰基]甲酯(80mg,72%产率)。LCMS(ESI):C55H78N6O9Si的m/z[M+H]计算值994.6;实验值995.7。
步骤2.在室温下,将乙酸[[(1S)-1-[[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨甲酰基]-2-甲基丙基](甲基)氨甲酰基]甲酯(80mg,0.080mmol)、DCM(1mL)和NH4OH水溶液(0.8mL)的混合物搅拌过夜。添加H2O(5mL)并将混合物用EtOAc(3×5mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×5mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-(2-羟基-N-甲基乙酰胺基)-3-甲基丁酰胺(60mg,78%产率)。LCMS(ESI):C53H76N6O8Si的m/z[M+H]计算值952.6;实验值953.7。
步骤3.在0℃下,将(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-(2-羟基-N-甲基乙酰胺基)-3-甲基丁酰胺(60mg,0.06mmol)、THF(2mL)和1M TBAF的THF溶液(6μL,0.006mmol)的混合物搅拌30分钟。添加H2O(3mL)并将混合物用EtOAc(3×3mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×3mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-2-(2-羟基-N-甲基乙酰胺基)-3-甲基丁酰胺(20mg,40%产率)。LCMS(ESI):C44H56N6O8的m/z[M+H]计算值796.4;实验值797.6;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.70(dd,J=5.7,4.4Hz,1H),8.66-8.49(m,1H),8.00(dd,J=4.6,1.7Hz,1H),7.76(dd,J=9.9,5.2Hz,1H),7.60(dt,J=8.7,1.6Hz,1H),7.56-7.47(m,1H),7.29-7.18(m,1H),7.10-6.98(m,1H),6.54(dt,J=3.6,1.7Hz,1H),5.67-5.55(m,1H),4.77(dd,J=11.2,8.4Hz,1H),4.57-4.39(m,3H),4.39-4.20(m,3H),4.19-3.91(m,2H),3.90-3.65(m,3H),3.60(dd,J=11.0,1.8Hz,1H),3.42(s,1H),3.32(s,1H),3.29-3.15(m,1H),3.10-2.97(m,1H),2.97-2.82(m,5H),2.82-2.63(m,2H),2.35-2.11(m,3H),1.94(d,J=13.2Hz,1H),1.82-1.49(m,3H),1.31(s,1H),1.19(t,J=7.2Hz,2H),1.09-0.95(m,7H),0.95-0.83(m,5H),0.50(d,J=32.4Hz,3H)。
实施例A50.合成氧杂环戊烷-3-基-N-[(1S)-1-{[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨甲酰基}-2-甲基丙基]-N-甲基氨基甲酸酯
Figure BDA0004194083620005771
步骤1.在室温下,向(2S)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酸甲酯(500mg,3.4mmol)和TEA(1.44mL,14.2mmol)于DCM(20mL)中的混合物中添加氯甲酸氧杂环戊烷-3-基酯(1.04g,6.9mmol)。在室温下,将混合物搅拌1小时,接着添加饱和NH4Cl并用DCM(3×10mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(1×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S)-3-甲基-2[甲基(氧杂环戊烷-3-基氧基)羰基]氨基]丁酸甲酯(800mg,89%产率)。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ4.57-4.05(m,1H),3.99-3.78(m,4H),3.70(s,3H),3.26(s,1H),2.99-2.68(m,3H),2.26-1.83(m,3H),1.06-0.76(m,6H)。
步骤2.在室温下,将(2S)-3-甲基-2[甲基(氧杂环戊烷-3-基氧基)羰基]氨基]丁酸甲酯(1g,3.9mmol)和2M NaOH(19.3mL,38.6mmol)于MeOH(20mL)中的混合物搅拌1小时。将混合物减压浓缩并将残余物用MTBE(3×10mL)萃取。用2M HCl将水层酸化至约pH 2,接着用DCM(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈油状的(2S)-3-甲基-2-[甲基[(氧杂环戊烷-3-基氧基)羰基]氨基]丁酸(630mg,67%产率)。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ5.32(br.s,1H),4.45-4.08(m,1H),4.04-3.81(m,4H),2.93(d,J=6.9Hz,3H),2.38-1.93(m,3H),1.06(t,J=5.6Hz,3H),0.94(d,J=6.7Hz,3H)。
步骤3.在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(80mg,0.13mmol)、(2S)-3-甲基-2-[甲基[(氧杂环戊烷-3-基氧基)羰基]氨基]丁酸(63mg,0.26mmol)和DIPEA(165mg,1.3mmol)于DMF(2mL)中的混合物中添加COMU(38mg,0.19mmol)。在0℃下,将混合物搅拌30分钟,接着将混合物减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的氧杂环戊烷-3-基-N-[(1S)-1-{[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨甲酰基}-2-甲基丙基]-N-甲基氨基甲酸酯(50mg,45%产率)。LCMS(ESI):C47H60N6O9的m/z[M+H]计算值852.4;实验值853.5;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.34-9.18(m,1H),8.72(t,J=5.1Hz,1H),8.58(d,J=47.8Hz,1H),8.48-8.15(m,1H),7.91(s,1H),7.70-7.57(m,2H),7.55-7.46(m,1H),7.13(d,J=24.7Hz,1H),7.01(s,1H),6.56(d,J=9.2Hz,1H),5.34(s,1H),5.28-5.00(m,2H),4.40(d,J=13.3Hz,1H),4.33-4.14(m,4H),4.12-3.45(m,10H),3.23(s,1H),3.10(d,J=14.5Hz,1H),2.99-2.62(m,6H),2.20-1.99(m,4H),1.80(s,1H),1.66(s,1H),1.52(d,J=12.2Hz,1H),1.09(t,J=7.1Hz,2H),0.99-0.89(m,6H),0.87-0.76(m,5H),0.42(d,J=24.2Hz,3H)。
实施例A277.合成(2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(1,3,3-三甲基脲基)丁酰胺
Figure BDA0004194083620005791
步骤1.在氮气气氛下,在0℃下向中间体10(8.2g,9.89mmol)于二噁烷(40mL)中的溶液中添加HCl(40mL,4M于二噁烷中)。在0℃下,将反应溶液搅拌1小时,接着减压浓缩。将所得混合物用DCM(600mL)和饱和碳酸氢钠水溶液(400mL)稀释。将有机相分离并用盐水(500mL×2)洗涤,接着减压浓缩,得到呈固体状的(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(7.2g,94.8%产率)。LCMS(ESI):C39H52N8O4S的m/z[M+H]计算值728.4;实验值729.3。
步骤2.向(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(6g,8.23mmol)和N-(二甲基氨甲酰基)-N-甲基-L-缬氨酸锂(4.28g,20.58mmol)于DMF(80mL)中的混合物中添加DIEA(53.19g,411.55mmol)。将反应混合物搅拌5分钟,接着一次性添加CIP(3.43g,12.35mmol)。在25℃下,将所得溶液搅拌1小时,接着用水(100mL)淬灭,用EtOAc(300mL)萃取。将有机层分离并用饱和氯化铵水溶液(100mL×3)和水(100mL×2)洗涤。将合并的有机层减压浓缩。将残余物通过反相色谱法纯化,得到呈固体状的(2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(1,3,3-三甲基脲基)丁酰胺(2.5g,33.2%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.52–8.34(m,3H),7.82(s,1H),7.79–7.69(m,1H),7.60–7.50(m,1H),7.26–7.16(m,1H),5.64–5.50(m,1H),5.20–5.09(m,1H),4.40–4.08(m,5H),3.92–3.82(m,1H),3.66–3.50(m,2H),3.37–3.35(m.1H),3.30–3.28(m,1H),3.28–3.20(m,4H),3.19–3.15(m,3H),3.12–3.04(m,1H),2.99–2.89(m,1H),2.81(s,6H),2.77(s,4H),2.48–2.38(m,5H),2.22(s,3H),2.16–2.04(m,2H),1.88–1.78(m,2H),1.60–1.45(m,2H),1.39–1.29(m,3H),0.97–0.80(m,12H),0.34(s,3H)。LCMS(ESI):C48H68N10O6S的m/z[M+H]计算值912.5;实验值913.6。
实施例A265.合成N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-4-甲基哌嗪-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620005801
步骤1.在氮气氛下,在0℃下向1-甲基哌嗪(100mg,1.148mmol)和吡啶(275.78mg,3.44mmol)于DCM(3mL)中的搅拌的溶液中逐滴添加于DCM(1mL)中的BTC(112.5mg,0.38mmol)。在氮气氛下,在0℃下搅拌反应2小时。将所得混合物减压浓缩,得到呈油状的4-甲基哌嗪-1-羰基氯(250mg,粗品)。
步骤2.在氮气氛下,在0℃下向中间体8(100mg,0.16mmol)和吡啶(100mg,1.272mmol)于ACN(2mL)中的搅拌的溶液中逐滴添加4-甲基哌嗪-1-羰基氯(38.67mg,0.24mmol)。在氮气氛下,在0℃下将反应混合物搅拌2小时。将所得混合物用水(100mL)稀释并用EtOAc(100mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL×3)洗涤,经无水Na2SO4干燥,接着过滤并减压浓缩。将残余物通过反相快速色谱法纯化,得到呈固体状的N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-4-甲基哌嗪-1-甲酰胺(20mg,16.7%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.76(dd,J=4.8,1.7Hz,1H),8.50(s,1H),8.14(d,J=2.5Hz,1H),7.79(d,J=9.1Hz,2H),7.77–7.72(m,1H),7.58(d,J=8.6Hz,1H),7.52(dd,J=7.7,4.7Hz,1H),6.82(d,J=9.0Hz,1H),5.32(t,J=9.0Hz,1H),4.99(d,J=12.1Hz,1H),4.43–4.02(m,5H),3.57(d,J=3.1Hz,2H),3.26(d,J=8.4Hz,6H),2.97(d,J=14.3Hz,1H),2.80–2.66(m,1H),2.55(s,1H),2.40(d,J=14.4Hz,1H),2.32(d,J=5.9Hz,4H),2.21(s,3H),2.09(d,J=12.1Hz,1H),1.77(d,J=18.8Hz,2H),1.52(dd,J=11.8,5.4Hz,1H),1.37(d,J=6.0Hz,3H),1.24(s,1H),0.90(s,3H),0.85(t,J=7.0Hz,3H),0.32(s,3H)。LCMS(ESI):C40H52N8O5S的m/z[M+H]计算值756.38;实验值757.3。
实施例A598.合成(2S)-N-((63S,3S,4S,Z)-11-乙基-3-甲氧基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(1,3,3-三甲基脲基)丁酰胺
Figure BDA0004194083620005821
步骤1.在氮气氛下,向(2S)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酸苯甲酯(500mg,2.26mmol)和二甲基氨基甲酰氯(1.215g,11.3mmol)于THF(5mL)中的混合物中分数份添加TEA(2.286g,22.59mmol)和DMAP(276.02mg,2.26mmol)。在氮气氛下在,65℃下将反应混合物搅拌12小时,接着用水(100mL)淬灭并用EtOAc(50mL×3)萃取。将合并的有机相经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法纯化,得到呈油状的N-(二甲基氨甲酰基)-N-甲基-L-缬氨酸苯甲酯(400mg,58.3%产率)。LCMS(ESI):C16H24N2O3的m/z[M+H]计算值292.2;实验值293.1。
步骤2.在氢气氛下,将N-(二甲基氨甲酰基)-N-甲基-L-缬氨酸苯甲酯(400mg,1.37mmol)和氢氧化钯/碳(400mg,2.85mmol)于MeOH(10mL)中的混合物搅拌4小时。将反应混合物过滤并用MeOH(100mL×3)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到呈油状的N-(二甲基氨甲酰基)-N-甲基-L-缬氨酸(200mg,粗品)。LCMS(ESI):C9H18N2O3的m/z[M+H]计算值202.1;实验值203.1。
步骤3.在0℃下,将4-溴-1,3-噻唑-2-甲酸(10g,48.07mmol)于DCM(100mL)中的溶液中添加乙二酰氯(16.27mL,192.28mmol)和DMF(0.11mL,1.53mmol)。在室温下,搅拌反应2小时,接着减压浓缩,得到4-溴-1,3-噻唑-2-羰基氯(10.8g,粗品)。
步骤4.在-78℃下,向2-[(二苯基亚甲基)氨基]乙酸乙酯(12.75g,47.69mmol)于THF(100mL)中的溶液中添加LiHMDS(47.69mL,47.69mmol),并在-40℃下搅拌30分钟。接着,在-78℃下向反应混合物中添加4-溴-1,3-噻唑-2-羰基氯(10.8g,47.69mmol)于THF(100mL)中的溶液并在室温下搅拌12小时。将所得混合物用水(100mL)淬灭,用EtOAc(100mL×3)萃取。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到呈固体状的3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((二苯基亚甲基)氨基)-3-氧代丙酸乙酯(27g,粗品)。LCMS(ESI):C21H17BrN2O3S的m/z[M+H]计算值456.0;实验值457.0。
步骤5.在0℃下,向3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((二苯基亚甲基)氨基)-3-氧代丙酸乙酯(20g,43.73mmol)于THF(150mL)中的溶液中添加1M HCl(100mL)并在室温下搅拌2小时。将所得溶液浓缩并用乙醚(200mL×2)洗涤。用碳酸氢钠溶液将水相的pH值调至8,接着用EtOAc(100mL×3)萃取。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到呈油状的2-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-氧代丙酸乙酯(9g,粗品)。LCMS(ESI):C8H9BrN2O3S的m/z[M+H]计算值292.0;实验值292.9。
步骤6.在0℃下,向2-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-氧代丙酸乙酯(10g,34.11mmol)于MeOH(200mL)中的溶液中添加苯甲醛(7.24g,68.23mmol)、氯化锌(9.3g,68.23mmol)和NaBH3CN(4.29g,68.23mmol)。在室温下搅拌反应2小时,接着用水(100mL)淬灭并浓缩。将所得混合物用EtOAc(100mL×3)萃取。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法纯化,得到呈固体状的3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-氧代丙酸乙酯(8.4g,52%产率)。LCMS(ESI):C22H21BrN2O3S的m/z[M+H]计算值472.1;实验值473.0。
步骤7.在氮气氛下,在室温下向3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-氧代丙酸乙酯(5g,10.56mmol)和(R,R)-TS-DENEB(1.375g,2.11mmol)于DCM(100mL)中的混合物中逐滴添加HCOOH(1.99mL,43.29mmol)和二乙胺(2.2mL,2.11mmol)。在氮气氛下,在50℃下将反应混合物搅拌12小时。将所得混合物减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-羟基丙酸乙酯(3.148g,60%产率)。LCMS(ESI):C22H23BrN2O3S的m/z[M+H]计算值474.1;实验值475.0。
步骤8.向(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-羟基丙酸乙酯(1g,2.1mmol)和Ag2O(4.88g,21.06mmol)于乙腈(10mL)中的混合物中分数份添加碘甲烷(3.58g,25.22mmol)。在50℃下,将反应混合物搅拌12小时,接着过滤。将滤饼用MeOH(50mL×2)洗涤。减压浓缩滤液,得到呈油状的(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-甲氧基丙酸乙酯(1.06g,粗品)。LCMS(ESI):C23H25BrN2O3S的m/z[M+H]计算值488.1;实验值489.3。
步骤9.在80℃下,将(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-羟基丙酸乙酯(1.06g,2.3mmol)于HCl(10ml,8M)中的混合物搅拌12小时并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法纯化,得到呈固体状的(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-甲氧基丙酸(321mg,31.7%产率)。LCMS(ESI):C21H21BrN2O3S的m/z[M+H]计算值460.1;实验值461.1。
步骤10.在0℃下,向(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-甲氧基丙酸(4.61g,10mmol)于DCM(100mL)中的溶液中添加(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯双(三氟乙酸)盐(3.72g,15mmol)、NMM(10.1mL.100mmol)、EDCI(3.8g,20mmol)和HOBt(5.39g,39.89mmol)。将溶液升温至室温并搅拌1小时。接着,用H2O(100mL)淬灭反应并用EtOAc(100mL×3)萃取。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-甲氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(5.11g,90%产率)。LCMS(ESI):C27H31BrN4O4S的m/z[M+H]计算值587.1;实验值586.1。
步骤11.在N2气氛下,向(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-甲氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(5.11g,9mmol)于THF(100mL)/H2O(100mL)中的溶液中添加LiOH(1.81g,45mmol)并在25℃下将所得混合物搅拌2小时。将所得混合物减压浓缩,用HCL(1N)将残余物酸化至pH 5。将水层用DCM(50mL×3)萃取。将合并有机相减压浓缩,得到呈固体状的(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-甲氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(4.38g,85%产率)。LCMS(ESI):C26H29BrN4O4S的m/z[M+H]计算值572.1;实验值573.1。
步骤12.向(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-甲氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(1.15g,2mmol)和(S)-3-(1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(985mg,2mmol)于DCM(50mL)中的混合物中添加DIEA(1.034g,8mmol)、EDCI(1.15g,558.3mmol)、HOBT(270.2mg,2mmol)。在25℃下,将反应溶液搅拌16小时。将所得混合物用DCM(200mL)稀释,用水(50mL×2)和盐水(50mL×3)洗涤并经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-甲氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(1.13g,54%产率)。LCMS(ESI):C55H68BBrN6O7S的m/z[M+H]计算值1046.4;实验值1047.4。
步骤13.在氮气氛下,向(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-(二苯甲基氨基)-3-甲氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(250mg,0.24mmol)和Pd(DtBPF)Cl2(15.55mg,0.024mmol)于二噁烷(5mL)和水(1mL)中的混合物中分数份添加K3PO4(126.59mg,0.6mmol)。在氮气氛下,在80℃下将反应混合物搅拌2小时。将所得混合物用水(20mL)稀释并用EtOAc(10mL×3)萃取,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(63S,3S,4S,Z)-4-(二苯甲基氨基)-11-乙基-3-甲氧基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(137mg,44.38%)。LCMS(ESI):C49H56N6O5S的m/z[M+H]计算值840.4;实验值841.5。
步骤14.向((63S,3S,4S,Z)-4-(二苯甲基氨基)-11-乙基-3-甲氧基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(100mg,0.12mmol)和Pd/C(253.06mg,2.38mmol)于MeOH(10mL)中的混合物中分数份添加HCOONH4(149.94mg,2.38mmol)。在氢气氛下,在60℃下将反应混合物搅拌6小时。将所得混合物过滤,将滤饼用MeOH(100mL×10)洗涤。减压浓缩滤液,得到呈油状的(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-3-甲氧基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(56mg,粗品)。LCMS(ESI):C35H44N6O5S的m/z[M+H]计算值660.3;实验值661.2。
步骤15.向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-3-甲氧基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(56mg,0.085mmol)和N-(二甲基氨甲酰基)-N-甲基-L-缬氨酸(51.42mg,0.25mmol)于DMF(2mL)中的混合物中分数份添加2-氯-1,3-二甲基咪唑烷鎓六氟磷酸盐(47.55mg,0.17mmol)和DIEA(547.62mg,4.24mmol)。将反应混合物搅拌12小时。将所得混合物通过反相色谱法纯化,得到呈固体状的(2S)-N-((63S,3S,4S,Z)-11-乙基-3-甲氧基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(1,3,3-三甲基脲基)丁酰胺(1.5mg,2.06%产率)。1H NMR(400MHz,甲醇-d4)δ8.74-8.77(m,1H),8.61(d,J=1.6Hz,1H),7.99–7.87(m,1H),7.73–7.66(m,1H),7.68(s,1H),7.60–7.55(m,1H),7.49(d,J=8.7Hz,1H),7.31(d,J=51.0Hz,0H),5.89(s,1H),4.95(s,1H),4.43(d,J=13.0Hz,1H),4.36(q,J=6.2Hz,1H),4.33–4.19(m,2H),4.10–4.03(m,1H),4.03(d,J=11.2Hz,1H),3.78–3.67(m,2H),3.65(s,0H),3.46(s,3H),3.34(s,4H),3.01(d,J=10.3Hz,1H),2.93(s,6H),2.88–2.81(m,1H),2.78(s,3H),2.70–2.60(m,1H),2.23–2.01(m,2H),2.03(s,0H),1.99(d,J=13.3Hz,1H),1.91–1.74(m,1H),1.69–1.54(m,1H),1.45(d,J=6.2Hz,3H),1.37–1.32(m,1H),1.28(s,1H),0.94(p,J=6.7Hz,12H),0.51(s,3H),0.10(s,1H)。LCMS(ESI):C44H60N8O7的m/z[M+H]计算值844.4;实验值845.4。
实施例A286.合成(1S,2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-64,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620005881
步骤1.在0℃下,将中间体8(8g,10.95mmol)于HCl(200mL,4M于1,4-二噁烷中)中的溶液搅拌2小时,接着减压浓缩。将所得混合物用DCM(60mL)和饱和NaHCO3水溶液(40mL)稀释。将有机相分离并用盐水(50mL×2)洗涤,并减压浓缩,得到呈固体状的(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(10.3g,粗品)。LCMS(ESI):C34H42N6O4S的m/z[M+H]计算值630.3;实验值631.2。
步骤2.在0℃下,向(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(8g,12.68mmol)于DMF(50mL)中的搅拌的溶液中添加DIEA(9.83g,76.09mmol)、(1S,2S)-2-甲基环丙烷-1-甲酸(1.52g,15.22mmol)和HATU(14.47g,38.05mmol)。在0℃下,将反应混合物搅拌2小时并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法纯化,得到呈固体状的(1S,2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺(6.84g,56.37%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.79(dd,J=4.7,1.9Hz,1H),8.59–8.40(m,2H),7.95–7.86(m,1H),7.82–7.71(m,2H),7.66–7.53(m,2H),5.57(t,J=9.0Hz,1H),5.07(s,1H),4.41–4.28(m,2H),4.25(d,J=12.4Hz,1H),4.17(d,J=10.8Hz,1H),4.09(d,J=7.2Hz,1H),3.58(s,2H),3.32(d,J=14.6Hz,1H),3.28(s,3H),3.16(dd,J=14.7,9.1Hz,1H),2.95(d,J=14.4Hz,1H),2.75(m,J=12.1,7.1Hz,1H),2.43(d,J=14.4Hz,1H),2.13–2.00(m,1H),1.76(d,J=22.0Hz,2H),1.60–1.44(m,2H),1.38(d,J=6.1Hz,3H),1.07(d,J=1.9Hz,4H),0.86(dd,J=14.1,7.1Hz,7H),0.59–0.49(m,1H),0.34(s,3H)。LCMS(ESI):C39H48N6O5S的m/z[M+H]计算值712.3;实验值713.2。
实施例A613.合成N-((2S)-1-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吡咯并[3,2-b]吡啶杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-3-甲氧基-N-甲基氮杂环丁烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620005891
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步骤1.在密封管中,在N2气氛和110℃下将(S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸甲酯(920mg,2.5mmol)、4,4,5,5-四甲基-2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(1.6g,6.3mmol)、x-Phos(180mg,0.5mmol)、Pd2(dba)3-氯仿(130mg,0.13mmol)和乙酸钾(740mg,7.5mmol)于二噁烷(25mL)中的混合物搅拌8小时,得到呈溶液形式的粗(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)噻唑-2-基)丙酸甲酯。LCMS(ESI):C18H29BN2O6S的m/z[M+H]计算值412.2;实验值331.1。
步骤2.在N2气氛下,在0℃下向5-氯-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-甲醛(7g,39mmol)于MeOH(140mL)中的混合物中添加NaBH4(2.9g,78mmol)。在10℃下,将反应混合物搅拌2小时并减压浓缩。将残余物用EtOAc(200mL)稀释,用盐水(25mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(5-氯-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)甲醇(3.5g,55%产率)。LCMS(ESI):C8H7ClN2O的m/z[M+H]计算值182.0;实验值183.0。
步骤3.在0℃下,向(5-氯-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)甲醇(3.5g,19mmol)和((1-甲氧基-2-甲基丙-1-烯-1-基)氧基)三甲基硅烷(6.7g,38mmol)于THF(50mL)中的混合物中逐滴添加TMSOTf(3.8g,17.1mmol)。在5℃下,将反应混合物搅拌2小时,接着用EtOAc(100mL)稀释,用饱和NaHCO3水溶液(50mL)和盐水(50mL×2)洗涤。将有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-氯-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯(3g,59%产率)。LCMS(ESI):C13H15ClN2O2的m/z[M+H]计算值266.1;实验值267.1。
步骤4.在0℃下,向3-(5-氯-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯(3g,11mmol)于无水THF(50mL)中的混合物中添加AgOTf(4.3g,17mmol)和I2(2.9g,11mmol)。在0℃下,将反应混合物搅拌2小时,接着用浓Na2SO3(20mL)淬灭,用EtOAc(50mL)稀释并过滤。用盐水(50mL)洗涤滤液。将有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-氯-2-碘-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯(2.3g,52%产率)。LCMS(ESI):C13H14ClIN2O2的m/z[M+H]计算值393.0;实验值392.0
步骤5.在N2气氛下,向3-(5-氯-2-碘-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯(2.3g,5.9mmol)、2-(2-(2-甲氧基乙基)苯基)-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(1.6g,7.1mmol)和K2CO3(2.4g,18mol)于二噁烷(25mL)和水(5mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2·DCM(480mg,0.59mmol)。在70℃下,将反应混合物搅拌4小时,接着用EtOAc(200mL)稀释并用盐水(25mL)洗涤。将分离的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-3-(5-氯-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯(2g,产率84%)。LCMS(ESI):C21H24ClN3O3的m/z[M+H]计算值401.2;实验值402.2。
步骤6.在25℃下,向(S)-3-(5-氯-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯(2g,5mmol)、碳酸铯(3.3g,10mmol)和EtI(1.6g,10mmol)于DMF(30mL)中的混合物中搅拌10小时。将所得混合物用EtOAc(100mL)稀释,用盐水(20mL×4)洗涤。将分离的有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到(S)-3-(5-氯-1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯的两种非对映异构体(P1:0.7g,32%产率;P2:0.6g,28%产率),都呈固体状。LCMS(ESI):C23H28ClN3O3的m/z[M+H]计算值429.2;实验值430.2。
步骤7.在5℃下,向(S)-3-(5-氯-1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯(P2,1.2g,2.8mmol)于无水THF(20mL)中的混合物中添加LiBH4(120mg,5.6mmol)。在60℃下,将反应混合物搅拌4小时,接着用浓NH4Cl(20mL)淬灭,用EtOAc(50mL)稀释并用盐水(30mL)洗涤。将有机层分离,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-3-(5-氯-1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(1g,89%产率)。LCMS(ESI):C22H28ClN3O2的m/z[M+H]计算值401.2;实验值402.2。
步骤8.向来自步骤1的溶液(360mg,粗品,1mmol)于二噁烷(10mL)和水(2mL)中的混合物中添加(S)-3-(5-氯-1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(200mg,0.5mmol)、碳酸钾(200mg,1.5mmol)和Pd-118(30mg,0.05mmol)。在70℃下,将这一反应混合物搅拌3小时,接着用EtOAc(40mL)稀释,过滤。将滤液用盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基)噻唑-2-基)丙酸甲酯(300mg,65%产率)。LCMS(ESI):C34H45N5O6S的m/z[M+H]计算值651.3;实验值652.3。
步骤9.在20℃下,向(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基)噻唑-2-基)丙酸甲酯(280mg,0.43mmol)于MeOH(4mL)中的溶液中添加氢氧化锂(51mg,2.15mmol)于水(2mL)中的溶液。在20℃下搅拌反应5小时,接着用HCl(1N)调至pH=3~4。将所得混合物用水(30mL)稀释并用EtOAc(15mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到呈固体状的(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基)噻唑-2-基)丙酸(280mg,粗品)。LCMS(ESI):C33H43N5O6S的m/z[M+H]计算值637.3;实验值638.3。
步骤10.在5℃下,向(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基)噻唑-2-基)丙酸(274mg,0.43mmol)和(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(280mg,0.64mmol)于DMF(3mL)中的溶液添加HATU(245mg,0.64mmol)和DIEA(555mg,4.3mmol)于DMF(2mL)中的溶液。搅拌反应1小时,接着用EtOAc(20mL)和水(20mL)稀释。将有机层分离并用水(20mL×3)和盐水(20mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(230mg,70%产率)。LCMS(ESI):C39H53N7O7S的m/z[M+H]计算值763.4;实验值764.3。
步骤11.在N2气氛下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(230mg,0.3mmol)于DCE(3mL)中的溶液中添加三甲基氢氧化锡(300mg,1.4mmol)。在65℃下搅拌反应16小时,接着减压浓缩。将残余物用EtOAc(20mL)稀释,用水(20mL)和盐水(10mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到呈泡沫状的(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(200mg,粗品)。LCMS(ESI):C38H51N7O7S的m/z[M+H]计算值749.4;实验值750.3。
步骤12.在5℃下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(245mg,0.32mmol)于DCM(50mL)中的溶液中添加HOBt(432mg,3.2mmol)、EDCI(1.8g,9.6mmol)和DIEA(1.65g,12.8mmol)。在20℃下,将反应混合物搅拌16小时,接着减压浓缩。将残余物用EtOAc(20mL)和水(20mL)稀释。将有机层分离并用水(30mL×3)和盐水(30mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吡咯并[3,2-b]吡啶杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(100mg,43%产率)。LCMS(ESI):C38H49N7O6S的m/z[M+H]计算值731.4;实验值732.3。
步骤13.在20℃下,将((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吡咯并[3,2-b]吡啶杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(80mg,0.11mmol)于TFA(0.2mL)和DCM(0.6mL)中的溶液搅拌1小时。浓缩反应物,得到呈固体状的(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吡咯并[3,2-b]吡啶杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(72mg,95%产率)。LCMS(ESI):C33H41N7O4S的m/z[M+H]计算值631.3;实验值632.3。
步骤14.在0℃下,向(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吡咯并[3,2-b]吡啶杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(100mg,0.16mmol)和(2S)-2-[(3-甲氧基氮杂环丁烷-1-基)羰基(甲基)氨基]-3-甲基丁酸(78mg,0.32mmol)于DMF(5mL)中的溶液逐滴添加DIEA(620mg,4.8mmol)和HATU(91mg,0.24mmol)于DMF(5mL)中的溶液。在0℃下,将反应混合物搅拌2小时,接着用EtOAc(50mL)稀释,用水(25mL×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的N-((2S)-1-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吡咯并[3,2-b]吡啶杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-3-甲氧基-N-甲基氮杂环丁烷-1-甲酰胺(112.9mg,82%产率)。1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.77-8.75(dd,J=4.8,1.7Hz,1H),7.96-7.94(d,J=8.6Hz,1H),7.89-7.87(dd,J=8.4,2.3Hz,2H),7.77-7.74(d,J=8.6Hz,1H),7.58-7.55(dd,J=7.8,4.8Hz,1H),5.73-5.70(dd,J=8.0,2.7Hz,1H),4.41-4.38(dt,J=8.5,4.3Hz,2H),4.33–4.26(m,3H),4.24–4.17(m,3H),4.04-4.01(dd,J=11.9,3.0Hz,1H),3.99-3.96(m,1H),3.89–3.83(m,2H),3.53-3.49(dd,J=9.7,7.3Hz,2H),3.46-3.45(d,J=3.0Hz,1H),3.35(s,3H),3.34-3.33(d,J=4.5Hz,3H),3.28(s,1H),2.89(s,3H),2.78-2.71(td,J=13.2,3.4Hz,1H),2.52-2.48(d,J=14.1Hz,1H),2.23–2.20(m,1H),2.19-2.11(d,J=10.2Hz,1H),1.91-1.88(d,J=13.5Hz,1H),1.73-1.70(dd,J=9.0,3.9Hz,1H),1.56–1.50(m,1H),1.47-1.46(d,J=6.1Hz,3H),0.98–0.91(m,9H),0.88(s,3H),0.45(s,3H)。LCMS(ESI):C44H59N9O7S的m/z[M+H]计算值857.4;实验值858.3。
实施例A579.合成N-((2S)-1-(((63S,64S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-64,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-3-甲氧基-N-甲基氮杂环丁烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620005961
步骤1.用氮气吹扫(S)-4-苯甲基噁唑烷-2-酮(10g,56.43mmol)于THF(100mL)中的溶液,在氮气氛下,在-78℃下添加正丁基锂(24.83mL,62.08mmol),接着在-78℃下搅拌15分钟。向反应混合物中添加2-丁烯酰氯(6.49g,62.08mmol)。在-78℃下,将所得溶液搅拌30分钟,接着将其缓慢升温至0℃并搅拌15分钟,用饱和氯化铵溶液(100mL)淬灭。将所得溶液用EtOAc(100mL×3)萃取,并将合并有机相经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(4S)-4-苯甲基-3-[(2E)-丁-2-烯酰基]-1,3-噁唑烷-2-酮(12.26g,88.57%产率)。LCMS(ESI):C14H15NO3的m/z[M+H]计算值245.1;实验值246.1。
步骤2.用氮气氛吹扫CuBr·DMS(12.07g,58.71mmol)于THF(120mL)中的溶液并维持该气氛,在氮气氛下,在-78℃下添加烯丙基溴化镁(58.71mL,58.71mmol)。在-60℃下搅拌反应30分钟,随后在-78℃下添加(4S)-4-苯甲基-3-[(2E)-丁-2-烯酰基]-1,3-噁唑烷-2-酮(12g,48.92mmol)。在-50℃下,将所得溶液再搅拌3小时,接着用饱和氯化铵溶液(100mL)淬灭并用EtOAc(60mL×3)萃取。将合并的有机相经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-4-苯甲基-3-((S)-3-甲基己-5-烯酰基)噁唑烷-2-酮(13.2g,93.89%产率)。LCMS(ESI):C17H21NO3的m/z[M+H]计算值287.2;实验值288.2。
步骤3.向(S)-4-苯甲基-3-((S)-3-甲基己-5-烯酰基)噁唑烷-2-酮(13.2g,45.94mmol)于二噁烷(200mL)和水(200mL)中的溶液中添加2,4-二甲基吡啶(9.84g,91.87mmol),随后在0℃下添加K2OsO4.2H2O(1.69g,4.59mmol)。在0℃下,将反应溶液搅拌15分钟,接着添加NaIO4(39.3g,183.74mmol)。在0℃下,将所得混合物搅拌1小时,接着用EtOAc(150mL×3)萃取。将合并的有机相盐酸(100mL×3),经无水硫酸钠干燥并减压浓缩,得到呈油状的(S)-5-((S)-4-苯甲基-2-氧代噁唑烷-3-基)-3-甲基-5-氧代戊醛(12.3g,粗品)。LCMS(ESI):C16H19NO4的m/z[M+H]计算值289.1;实验值290.1。
步骤4.用氮气氛吹扫(S)-5-((S)-4-苯甲基-2-氧代噁唑烷-3-基)-3-甲基-5-氧代戊醛(12.3g,42.51mmol)于THF(200mL)中的溶液并维持该气氛,接着在0℃下添加硼烷-四氢呋喃络合物(55.27mL,55.27mmol)。在0℃下搅拌反应30分钟,接着用甲醇(40mL)淬灭。将所得混合物减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-4-苯甲基-3-((S)-5-羟基-3-甲基戊酰基)噁唑烷-2-酮(9.6g,77.51%产率)。LCMS(ESI):C16H21NO4的m/z[M+H]计算值291.1;实验值292.1。
步骤5.在0℃下,向(S)-4-苯甲基-3-((S)-5-羟基-3-甲基戊酰基)噁唑烷-2-酮(9.6g,32.95mmol)和CBr4(16.39g,49.43mmol)于DCM(120mL)中的溶液中添加三苯基膦(12.96g,49.41mmol)。在0℃下搅拌反应1小时,接着用冰水(100mL)淬灭并用DCM(100mL×3)萃取。将合并的有机相经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-4-苯甲基-3-((R)-5-溴-3-甲基戊酰基)噁唑烷-2-酮(10g,85.67%产率)。LCMS(ESI):C16H20BrNO4的m/z[M+H]计算值353.1;实验值354.1
步骤6.在氮气氛下,在-78℃下向n-BuLi(2.26mL,5.65mmol)和二异丙胺(571.3mg,5.65mmol)于THF(10mL)中的混合物中添加(S)-4-苯甲基-3-((R)-5-溴-3-甲基戊酰基)噁唑烷-2-酮(2g,5.65mmol)于THF(9mL)中的冷却(-78℃)的溶液。在-78℃下,将反应混合物搅拌30分钟,接着添加(E)-N-[(叔丁氧基羰基)亚胺基](叔丁氧基)甲酰胺(1.3g,5.65mmol)于THF(10mL)中的溶液,在-78℃下再搅拌30分钟。将所得混合物添加DMPU(16mL,132.82mmol)并使其升温至0℃,并搅拌90分钟,随后添加LiOH.H2O(1.18g,28.12mmol)于水(20mL)中的溶液。接着,减压去除THF。将残余物用DCM(80mL×3)洗涤。用HCl(水溶液)将水相酸化至pH 5~6,用DCM/甲醇混合物(80mL×3,10:1)萃取。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥,过滤,减压浓缩。将残余物通过反相色谱法纯化,得到呈固体状的(3S,4S)-1,2-双(叔丁氧基羰基)-4-甲基六氢哒嗪-3-甲酸(296mg,15.22%产率)。LCMS(ESI):C16H28N2O6的m/z[M-H]计算值344.2;实验值343.1。
步骤7.在0℃下,向(3S,4S)-1,2-双(叔丁氧基羰基)-4-甲基六氢哒嗪-3-甲酸(289mg,0.84mmol)和(S)-3-(1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(413.24mg,0.84mmol)于DMF(10mL)中的混合物中添加DMAP(51.26mg,0.42mmol)和DCC(692.53mg,3.36mmol)。在室温下,将反应溶液搅拌1小时,接着用水/冰(10mL)淬灭,用EtOAc(15mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(3S,4S)-4-甲基四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸1,2-二叔丁酯3-(3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯(538mg,78.3%产率)。LCMS(ESI):C45H67BN4O9的m/z[M-H]计算值818.5;实验值819.4。
步骤8.在0℃下,向(3S,4S)-4-甲基四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸1,2-二叔丁酯3-(3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯(508mg,0.62mmol)于DCM(25mL)中的溶液中添加TFA(25mL)。在室温下,将反应溶液搅拌1小时。将所得混合物浓缩,得到呈油状的(3S,4S)-4-甲基六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(508mg,粗品)。LCMS(ESI):C35H51BN4O5的m/z[M-H]计算值618.4;实验值619.3。
步骤9.在0℃下,向(3S,4S)-4-甲基六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(508mg,0.82mmol)和(S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(288.41mg,0.82mmol)于DMF(50mL)中的溶液中添加DIEA(1061.31mg,8.21mmol)、HATU(468.35mg,1.23mmol)。在室温下,将反应溶液搅拌1小时,接着用冰水(30mL)淬灭并用EtOAc(30mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(3S,4S)-1-((S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)-4-甲基六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(431mg,55.14%产率)。LCMS(ESI):C46H64BBrN6O8S的m/z[M-H]计算值950.4;实验值951.3。
步骤10.用氮气吹扫Pd(DTBpf)Cl2(27.39mg,0.042mmol)和K3PO4(89.2mg,0.42mmol)于二噁烷(5mL)和水(1mL)中的混合物,在氮气氛下,在60℃搅5分钟,接着在60℃下添加(3S,4S)-1-((S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)-4-甲基六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(200mg,0.21mmol)于二噁烷(5mL)和水(1mL)中的溶液。在60℃下,将反应混合物搅拌1小时,接着用冰水(5mL)淬灭,用EtOAc(15mL×3)萃取。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,64S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-64,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(70mg,44.72%产率)。LCMS(ESI):C40H52N6O6S的m/z[M-H]计算值744.4;实验值745.4。
步骤11.向((63S,64S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-64,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(70mg,0.094mmol)于二噁烷(5mL)中的溶液中添加HCl的二噁烷溶液(5mL,4M)。在室温下搅拌反应1小时,接着减压浓缩,得到呈油状的(63S,64S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-64,10,10-三甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(124mg,粗品)。LCMS(ESI):C36H45N5O4S的m/z[M-H]计算值644.3;实验值645.3。
步骤12.在0℃下,向(63S,64S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-64,10,10-三甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(112mg,0.17mmol)和N-(3-甲氧基氮杂环丁烷-1-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(50.92mg,0.21mmol)于DMF(3mL)中的混合物中添加DIEA(1.795g,13.9mmol)、2-氯-1,3-二甲基咪唑烷鎓六氟磷酸盐(72.57mg,0.26mmol)。在室温下搅拌反应1小时,接着过滤。将滤液通过反相色谱法纯化,得到呈固体状的N-((2S)-1-(((63S,64S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-64,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-3-甲氧基-N-甲基氮杂环丁烷-1-甲酰胺(25.6mg,16.92%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.76(dd,J=4.7,1.8Hz,1H),8.60(s,1H),8.30–8.20(m,1H),7.86–7.70(m,3H),7.61–7.50(m,2H),5.57–5.43(m,1H),5.07(d,J=12.1Hz,1H),4.39–4.21(m,3H),4.20–4.01(m,5H),3.96(d,J=11.1Hz,1H),3.82(dd,J=8.9,3.6Hz,1H),3.77–3.71(m,1H),3.63–3.55(m,2H),3.35–3.27(m,2H),3.24(s,3H),3.23–3.14(m,4H),2.93–2.79(m,2H),2.70(s,3H),2.15–2.01(m,1H),1.83–1.61(m,2H),1.38(d,J=6.1Hz,4H),0.98(d,J=6.4Hz,3H),0.94–0.85(m,6H),0.85–0.72(m,6H),0.43(s,3H)。LCMS(ESI):C46H62N8O7S的m/z[M-H]计算值870.4;实验值871.4。
如本领域技术人员所知,下表的化合物(表3)是使用前述方法或其变化形式制备。
表3:由本发明方法制备的示例性化合物
Figure BDA0004194083620006011
/>
Figure BDA0004194083620006021
/>
Figure BDA0004194083620006031
/>
Figure BDA0004194083620006041
/>
Figure BDA0004194083620006051
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Figure BDA0004194083620006061
/>
Figure BDA0004194083620006071
/>
Figure BDA0004194083620006081
空白=未确定
生物测定
效力测定:pERK
这一测定的目的是测量测试化合物抑制细胞中的K-Ras的能力。活化的K-Ras诱导ERK在苏氨酸202和酪氨酸204处的磷酸化(pERK)增加。这一程序测量细胞pERK响应于测试化合物的降低。下文以NCI-H358细胞描述的程序适用于K-Ras G12C。
注意:本方案可改用其它细胞系执行以表征其它RAS变体抑制剂,包括例如AsPC-1(K-Ras G12D)、Capan-1(K-Ras G12V)或NCI-H1355(K-Ras G13C)。
使用ATCC推荐的培养基和程序使NCI-H358细胞生长和维持。在添加化合物前一天,将细胞平板接种于384孔细胞培养板(每孔40μl)中并使其在37℃、5% CO2培育器中生长过夜。在DMSO中制备测试化合物的10点3倍稀释液,其中最高浓度为10mM。测定当天,使用Echo550液体处理器
Figure BDA0004194083620006091
将40nl测试化合物添加至细胞培养板各孔中。一式两份,对测试化合物的浓度进行测试。添加完化合物后,在37℃、5% CO2下培育细胞4小时。培育后,取出细胞培养基并用磷酸盐缓冲盐水洗涤细胞一次。
在一些实验中,细胞pERK水平是使用AlphaLISA SureFire Ultra p-ERK1/2测定试剂盒(PerkinElmer)确定。室温下,在以600RPM振荡下,将细胞溶解于25μl溶解缓冲液中。将溶解产物(10μl)转移至384孔Opti板(PerkinElmer)中并添加5μl受体混合物。在暗处培育2小时后,添加5μl供体混合物,密封板并在室温下培育2小时。在Envision读板器(PerkinElmer)上,使用标准AlphaLISA设置来读取信号。原始数据的分析是在Excel(Microsoft)及Prism(GraphPad)中进行。将信号对化合物浓度的以10为底的对数作图,并通过拟合4参数S形浓度反应模型确定IC50值。
在其它实验中,细胞pERK是通过In-Cell Western确定的。在化合物处理后,用200μl tris缓冲盐水(TBS)洗涤细胞两次并用150μl含4%三聚甲醛的TBS固定15分钟。用含0.1% Triton X-100的TBS(TBST)洗涤固定的细胞4次,持续5分钟,接着在室温下,用100μlOdyssey封闭缓冲液(LI-COR)封闭60分钟。将一次抗体(pERK,CST-4370,Cell SignalingTechnology)以1:200稀释于封闭缓冲液中,并取50μl添加至各孔中并在4℃下培育过夜。用TBST洗涤细胞4次,持续5分钟。添加二次抗体(IR-800CW兔,LI-COR,1:800稀释)和DNA染色剂DRAQ5(LI-COR,1:2000稀释)并在室温下培育1-2小时。用TBST洗涤细胞4次,持续5分钟。在Li-COR Odyssey CLx成像仪上扫描各板。原始数据的分析是在Excel(Microsoft)及Prism(GraphPad)中进行。将信号对化合物浓度的以10为底的对数作图,并通过拟合4参数S形浓度反应模型确定IC50值。
在RAS突变型癌症细胞系中细胞活力的确定
方案:
Figure BDA0004194083620006101
细胞活力测定
注意—以下方案描述用于监测K-Ras突变型癌症细胞系响应于本发明化合物的细胞活力的程序。也可采用其它RAS同功型,不过接种的细胞数量将基于所用细胞系而变化。
本细胞测定的目的是通过使用
Figure BDA0004194083620006102
2.0试剂(Promega)对在终点时存在的ATP的量进行定量来确定在5天处理期内测试化合物对三种人类癌症细胞系(NCI-H358(K-Ras G12C)、AsPC-1(K-Ras G12D)、Capan-1(K-Ras G12V))的作用。
将细胞以250个细胞/孔接种于384孔测定板中的40μl生长培养基中并在含5%CO2的潮湿气氛中在37℃下培育过夜。测定当天,先用100% DMSO将测试化合物的10mM储备液稀释成3mM溶液。将充分混合的化合物溶液(15μl)转移至含有30μl的100% DMSO的下一孔中,并重复操作,直至制备出9种浓度的3倍连续稀释液(起始测定浓度是10μM)。将测试化合物(132.5nl)直接分配至含有细胞的测定板中。将所述板以300rpm振荡15秒,离心并在含5% CO2的潮湿气氛中在37℃下培育5天。第5天,将测定板及其内含物平衡至室温,保持约30分钟。添加
Figure BDA0004194083620006111
2.0试剂(25μl),并在回旋振荡器上混合板内含物2分钟,随后在室温下培育10分钟。使用PerkinElmer Enspire测量发光。利用下式使数据归一化:(样品信号/平均DMSO)*100。使用四参数逻辑斯蒂拟合(four-parameter logistic fit)来拟合数据。
本发明化合物破坏B-Raf Ras结合结构域(BRAFRBD)与K-Ras的相互作用(又称为FRET测定或MOA测定)
注意:以下方案描述用于监测本发明化合物对K-Ras G12C(GMP-PNP)与BRAFRBD的结合的破坏的程序。本方案也可改用其它Ras蛋白或核苷酸来执行。
这一生物化学测定的目的是测量测试化合物促进在载有核苷酸的K-Ras同功型与亲环蛋白A之间形成三元复合物的能力;由此得到的三元复合物破坏与BRAFRBD构建体的结合,抑制K-Ras通过RAF效应子进行的信号传导。数据是以IC50值报告。
在含有25mM HEPES pH 7.3、0.002% Tween20、0.1% BSA、100mM NaCl及5mMMgCl2的测定缓冲液中,将无标记亲环蛋白A、His6-K-Ras-GMPPNP及GST-BRAFRBD分别以25μM、12.5nM及50nM的最终浓度组合于384孔测定板中。测定板各孔中存在的化合物是自30μM最终浓度起始,经历10点3倍连续稀释的稀释液。在25℃下培育3小时之后,接着将抗HisEu-W1024和抗GST别藻蓝蛋白的混合物添加至测定样品孔中分别达到10nM和50nM的最终浓度,并将反应再培育1.5小时。在微孔板读取器(Ex 320nm,Em 665/615nm)上读取TR-FRET信号。促进K-Ras:RAF复合物破坏的化合物被鉴别为使TR-FRET比率相对于DMSO对照孔降低的化合物。
表4:代表性本发明化合物的生物测定数据
Figure BDA0004194083620006121
空白=未确定
额外H358细胞活力测定数据
*注释:
+++++:IC50≥10uM
++++:10uM>IC50≥1uM
+++:1uM>IC50≥0.1uM
++:0.1uM>IC50≥0.01uM
+:IC50<0.01uM
表5.H358细胞活力测定数据(K-Ras G12C,IC50,uM):
Figure BDA0004194083620006122
/>
Figure BDA0004194083620006131
*注释:
+++++:IC50≥10uM
++++:10uM>IC50≥1uM
+++:1uM>IC50≥0.1uM
++:0.1uM>IC50≥0.01uM
+:IC50<0.01uM
表6.Capan-1细胞活力测定数据(K-Ras G12V,IC50,uM):
Figure BDA0004194083620006141
/>
Figure BDA0004194083620006151
额外的Ras-Raf破坏/FRET/MOA测定数据(IC50,uM):
*注释:
+++++:IC50≥10uM
++++:10uM>IC50≥1uM
+++:1uM>IC50≥0.1uM
++:0.1uM>IC50≥0.01uM
+:IC50<0.01uM
表7.KRAS G12D FRET数据
Figure BDA0004194083620006161
/>
Figure BDA0004194083620006171
表8.KRAS G12C FRET数据
Figure BDA0004194083620006181
/>
Figure BDA0004194083620006191
表9.KRAS G12S FRET数据
Figure BDA0004194083620006192
/>
Figure BDA0004194083620006201
/>
Figure BDA0004194083620006211
表10.KRAS G13C FRET数据
Figure BDA0004194083620006212
/>
Figure BDA0004194083620006221
表11.KRAS G12V FRET数据
Figure BDA0004194083620006231
/>
Figure BDA0004194083620006241
表12.KRAS WT FRET数据
Figure BDA0004194083620006242
/>
Figure BDA0004194083620006251
/>
Figure BDA0004194083620006261
表13.KRAS G13D FRET数据
Figure BDA0004194083620006262
/>
Figure BDA0004194083620006271
表14.KRAS Q61H FRET数据
Figure BDA0004194083620006281
表15.NRAS G12C FRET数据
Figure BDA0004194083620006282
/>
Figure BDA0004194083620006291
/>
Figure BDA0004194083620006301
表16.NRAS WT FRET数据
Figure BDA0004194083620006302
/>
Figure BDA0004194083620006311
表17.NRAS Q61K FRET数据
Figure BDA0004194083620006312
/>
Figure BDA0004194083620006321
表18.NRAS Q61R FRET数据
Figure BDA0004194083620006322
/>
Figure BDA0004194083620006331
体外细胞增殖组套
在CrownBio使用标准方法评估针对细胞生长抑制的效力。简单点说,将细胞系在适当培养基中培养,然后平板接种于3D甲基纤维素中。在用递增浓度的化合物培养5天后,利用
Figure BDA0004194083620006332
确定细胞生长的抑制。化合物效力是以50%抑制浓度(绝对IC50)报告。
测定历时7天。在第1天,在对数生长期间收集2D培养的细胞并使其以1×105个细胞/毫升悬浮于培养基中。基于先前的优化,对一些细胞系使用更高或更低的细胞密度。将3.5ml细胞悬浮液与含1%甲基纤维素的6.5%生长培养基混合,产生于0.65%甲基纤维素中的细胞悬浮液。将90μl这一悬浮液分配于2个96孔板各孔中。使用一块板获得第0天读数,并且1块板用于终点实验。在37℃和5% CO2下,将板培育过夜。第2天,取出一块板(对于t0读数),并将10μl生长培养基加100μl
Figure BDA0004194083620006333
试剂添加至各孔中。在混合和10分钟培育后,在EnVision多标记读取器(Perkin Elmer)上记录发光。将DMSO中的化合物稀释于生长培养基中,由此使化合物的最终、最大浓度是10μM,并执行连续4倍稀释以产生9点浓度系列。将10倍最终浓度的10μl化合物溶液添加至第二块板各孔中。然后,在37℃和5% CO2下,将板培育120小时。第7天,取出板,将100μl/>
Figure BDA0004194083620006341
试剂添加至各孔中,并在混合和10分钟培育后,在EnVision多标记读取器(Perkin Elmer)上记录发光。将数据导出至GeneData Screener并以S形浓度反应模型建模,以便确定化合物反应的IC50值。
归因于外排转运蛋白的差异性表达、生长对RAS路径活化的不同依赖性或其它原因,并非所有带有给定RAS突变的细胞系均可对靶向该突变的RAS抑制剂同等地敏感。这已以细胞系KYSE-410和细胞系SW1573为例说明,细胞系KYSE-410尽管具有KRAS G12C突变,但对KRAS G12C(OFF)抑制剂MRTX-849不敏感(Hallin等人,Cancer Discovery 10:54-71(2020)),并且细胞系SW1573对KRAS G12C(OFF)抑制剂AMG510不敏感(Canon等人,Nature575:217-223(2019))。
表19:化合物B、化合物C和化合物D针对各种癌症细胞系的IC50值
*注释:
低敏感性:IC50≥1uM
中等敏感性:1uM>IC50≥0.1uM
极高敏感性:IC50<0.1uM
Figure BDA0004194083620006342
/>
Figure BDA0004194083620006351
/>
Figure BDA0004194083620006361
/>
Figure BDA0004194083620006371
利用本发明化合物,即化合物A的体内PD和功效数据
图1A:
方法:使用人胰腺癌Capan-2 KRASG12V/wt异种移植模型进行单日治疗PK/PD研究(图1A)。通过口服施用(po)以单次剂量或bid(在第一次剂量之后8小时施用第二次剂量)施用100mg/kg化合物A(Capan-2pERK K-Ras G12D EC50:0.0037uM)。各治疗组和在各个时间点的样品收集概述于下表20中。收集肿瘤样品,通过在qPCR测定中测量人DUSP6的mRNA水平来评估RAS/ERK信号传导路径调节,同时收集血浆样品以测量循环化合物A水平。
表20.使用Capan-2肿瘤进行的单剂量PK/PD研究的治疗组、剂量和时间点的概述.
Figure BDA0004194083620006372
结果:在图1A中,递送100mg/kg单次剂量的化合物A到10小时的时候将肿瘤中的DUSP6 mRNA水平抑制>95%。在第一次施用后8小时,第二次剂量的化合物A到24小时的时候维持93%的路径调节作用。这些数据表明,化合物A提供了较强的MAPK路径调节作用,具有持续的靶覆盖率。
图1B:
方法:在使用雌性BALB/c裸小鼠(6-8周龄)的人胰腺癌Capan-2KRASG12V/wt异种移植模型中评价化合物A对体内肿瘤细胞生长的作用。将在50% Matrigel中的Capan-2肿瘤细胞(4×106个细胞/小鼠)皮下植入小鼠的侧腹中。在肿瘤达到约180mm3的平均大小后,就将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或媒剂的施用。每天两次口服施用(po)100mg/kg的化合物A。每隔一天口服施用20mg/kg的SHP2抑制剂RMC-4550(可商购)。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。肿瘤消退以起始肿瘤体积减小>10%计算。所有给药组都是良好耐受的。
结果:在图1B中,每隔一天给予20mg/kg po的单药SHP2iRMC-4550引起39% TGI。每天100mg/kg po bid施用单药化合物A引起98% TGI,其中4/10(40%)的个别动物实现肿瘤消退。在具有杂合KRASG12V的Capan-2 CDX模型中,化合物A与RMC-4550的组合引起35%的总体肿瘤消退,其中在治疗结束时(在治疗开始后第40天),在7/9(77.8%)的个别动物中观察到个别肿瘤消退。化合物A和组合组的抗肿瘤活性相对于对照组有统计显著性(***p<0.001,普通单因素方差分析以及利用事后Tukey检验进行的多重比较),而RMC-4550在这些剂量下无显著性。
尽管已结合本发明的具体实施方案描述本发明,但应了解,本发明能够进一步修改,并且本申请意欲涵盖一般遵循本发明的原理且包括在本发明所属领域内的已知或常规实践范围内的与本公开的背离的本发明的任何变化、应用或改编,并且可应用于本文所述的基本特征。
所有出版物、专利和专利申请均以全文引用的方式并入本文中,其引用程度就如同具体地且个别地指示每一个别出版物、专利或专利申请以全文引用的方式并入一般。
Figure BDA0004194083620006401
附录B
RAS抑制剂
背景技术
绝大多数的小分子药物是通过结合靶蛋白上功能重要的口袋,由此调节该蛋白质的活性来起作用。例如,称为他汀类药物(statins)的降胆固醇药结合HMG-CoA还原酶的酶活性位点,由此防止该酶与其底物接合。事实上,已知许多此类药物/靶相互作用对,可能误导人们相信能够发现针对大多数(如果不是全部的话)蛋白质的小分子调节剂进而提供合理量的时间、努力和资源。但情况远非如此。目前,据估计,所有人体蛋白质中仅约10%可作为小分子的靶。Bojadzic和Buchwald,Curr Top Med Chem 18:674-699(2019)。其余90%当前被认为是以上提到的小分子药物发现难以治愈或难处理的。此类靶通常称为“不可入药(undruggable)”的。这些不可入药的靶包括医学上重要的人体蛋白质的大部分且通常未开发的储库。因此,人们对发现能够调节此类不可入药靶的功能的新颖分子模态非常感兴趣。
文献中已充分确定,Ras蛋白(K-Ras、H-Ras及N-Ras)在多种人类癌症中起到至关重要的作用,并因此成为抗癌疗法的适当靶。实际上,在美国,所有人类癌症中有约30%是由Ras蛋白突变引起,这些癌症中有许多是致命的。由活化性突变、过度表达或上游活化引起的Ras蛋白失调在人类肿瘤中较为常见,并且在人类癌症中常常发现Ras的活化性突变。例如,在Ras蛋白中密码子12处的活化性突变通过抑制GTP酶活化蛋白(GAP)依赖性和固有GTP水解速率,明显使Ras突变蛋白群偏向“开启”(GTP结合)状态(Ras(ON)),导致致癌性MAPK信号传导来起作用。值得注意的是,Ras对GTP展现皮摩尔浓度的亲和力,使得Ras即便是在低浓度这一核苷酸存在下也能够活化。在Ras中密码子13(例如G13D)和61(例如Q61K)处的突变也引起在一些癌症中的致癌活性。
尽管在过去数十年中,针对Ras进行了广泛的药物发现尝试,但直接靶向Ras的药物仍未得到批准。需要付出更多的努力来发现针对由各种Ras突变驱动的癌症的其它医药。
发明内容
本文提供Ras抑制剂。本文所描述的方法需要在合成配体与两种细胞内蛋白质之间形成高亲和力三组分复合物,该两种细胞内蛋白质在正常生理条件下不会相互作用:所关注的靶蛋白(例如Ras),以及在细胞中广泛表达的细胞质伴侣蛋白(呈现蛋白)(例如亲环蛋白A)。更具体点说,在一些实施方案中,本文所描述的Ras抑制剂通过驱动在Ras蛋白与广泛表达的细胞质伴侣蛋白亲环蛋白A(CYPA)之间形成高亲和力三重复合物或缀合物而在Ras中诱导新结合口袋。不受理论束缚,本发明者相信,本发明化合物以及其形成的复合物或缀合物对Ras发挥抑制作用的一种方式是在空间上阻塞Ras与传播致癌信号所需的下游效应分子如RAF和PI3K之间的相互作用位点。
因此,在一些实施方案中,本公开的特征在于一种结构式I的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620006421
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是不存在;-CH(R9)-、>C=CR9R9’或>CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮、卤代乙缩醛或炔基砜;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是H、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;或
R9和R9’与其所连接的原子组合在一起形成3至6元环烷基或3至6元杂环烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R21是氢或C1-C3烷基(例如甲基)。
也提供药物组合物,所述药物组合物包含式I的化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的赋形剂。
还提供了一种缀合物或其盐,该缀合物包含式IV的结构:
M-L-P
式IV
其中L是连接体;
P是单价有机部分;并且
M具有式V的结构:
Figure BDA0004194083620006461
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是不存在;-CH(R9)-、>C=CR9R9’或>CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是H、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;或
R9和R9’与其所连接的原子组合在一起形成3至6元环烷基或3至6元杂环烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R21是H或C1-C3烷基。
具体点说,经审慎考虑,所论述的关于本发明一个实施方案的任何限制可适用于本发明的任何其它实施方案。另外,本发明的任何化合物或组合物均可用于本发明的任何方法中,并且本发明的任何方法均可用于制造或利用本发明的任何化合物或组合物。
附图说明
图1A和图1B:这些图示出在两种不同的基于细胞的测定中本发明某些化合物(式BB)(右侧上的点)和H被(S)Me置换的相应式AA化合物(左侧上的点)的效力的配对分析。y轴表示在H358细胞系中测量的pERK EC50(图1A)或CTG IC50(图1B)。
图2A和图2B:本发明化合物,即化合物A在体内驱动NSCLC(KRAS G12C)异种移植模型中明显消退。一些动物展现完全反应(CR)=3,连续肿瘤测量值≤30mm3。图2A显示每天经口管饲给予100mg/kg的化合物A在NCI-H358 KRASG12C异种移植模型中引起肿瘤消退,该模型是对单独KRASG12C抑制敏感的模型。在肿瘤体积曲线(图2A)的旁边显示的是个别肿瘤生长的细面滴定图(图2B)。
图3A和图3B:本发明化合物,即化合物B与MEK抑制剂考比替尼(cobimetinib)的组合驱动NSCLC(KRAS G12C)模型中的肿瘤异种移植物消退。图3A显示间歇性静脉内施用50mg/kg化合物B加每天口服施用2.5mg/kg考比替尼的组合驱动肿瘤消退,而各单药引起肿瘤生长抑制。研究结束时反应以瀑布图(图3B)显示,指示10只小鼠中有6只在组合组中出现肿瘤消退,而在各单药组中无肿瘤消退记录。
图4A和图4B:每周给予的本发明化合物,即化合物C以及每天给予SHP2抑制剂RMC-4550驱动NSCLC(KRAS G12C)模型中的异种移植物消退。在图4A中,显示了每周一次静脉内施用60mg/kg化合物C加每天口服施用30mg/kg SHP2抑制剂的组合活性。各个肿瘤的研究结束时反应绘制为瀑布图(图4B)。
图5:本发明化合物,即化合物D与MEK抑制剂曲美替尼(trametinib)的组合在长期细胞生长NSCLC(KRAS G12C)模型中持久地抑制体外生长。
定义及化学术语
在本申请中,除非自上下文另有清晰说明,否则(i)术语“一(a)”意思指“一或多”;(ii)术语“或”用于指“和/或”,除非明确指示该术语是指替代选择为唯一的或该替代选择是相互排斥的,不过,本公开支持的定义是指唯一替代选择以及“和/或”;(iii)术语“包含”和“包括”应理解为涵盖列出的组分或步骤,无论仅呈现所述组分或步骤自身还是呈现所述组分或步骤与一种或多种额外组分或步骤的组合;以及(iv)在提供范围时,端点包括在内。
如本文所使用,术语“约”用于指示一个值包括用于确定该值的装置或方法的误差的标准偏差。在某些实施方案中,术语“约”是指值的沿任一方向(大于或小于)在所述值的25%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%或更低百分比内的范围,除非另外规定或自上下文另外显而易见(例如在该数字将超过可能值的100%时)。
如本文所使用,在描述相邻原子的情形中,术语“相邻”是指由共价键直接连接的二价原子。
如本文所使用,“本发明化合物”和类似术语,无论明确指示与否,均是指本文所描述的Ras抑制剂,包括式I和其子式的化合物,以及表1和表2的化合物,以及其盐(例如药学上可接受的盐)、溶剂化物、水合物、立体异构体(包括阻转异构体)和互变异构体。
术语“野生型”是指具有在自然界中在“正常”(与突变、患病、改变等相对)状态或情形中所见的结构或活性的实体。本领域技术人员应理解,野生型基因和多肽通常以多种不同形式(例如等位基因)存在。
本领域技术人员应了解,本文所描述的某些化合物可以呈一种或多种不同异构形式(例如立体异构体、几何异构体、阻转异构体、互变异构体)或同位素形式(例如其中一个或多个原子被该原子的不同的同位素取代,如氢被氘取代)存在。除非另外指示或自上下文清楚可见,否则所描绘的结构可理解为表示个别或组合的任何此类异构或同位素形式。
本文所描述的化合物可以是不对称的(例如具有一个或多个立体中心)。除非另外指示,否则涵盖所有立体异构体,如对映异构体和非对映异构体。含有不对称取代的碳原子的本公开化合物可以呈光学活性形式或外消旋形式分离。本领域中已知由光学活性起始物质制备光学活性形式的方法,如通过拆分外消旋混合物或通过立体选择性合成方法制备。烯烃、C=N双键等许多几何异构体也可存在于本文所描述的化合物中,并且所有此类稳定异构体均涵盖在本公开中。本公开的化合物的顺式和反式几何异构体已有描述,并且可以呈异构体混合物形式或以分开的异构形式分离。
在一些实施方案中,本文所描绘的一种或多种化合物可以呈不同互变异构形式存在。自上下文将清楚可见,除非明确地排除,否则提到此类化合物涵盖所有此类互变异构形式。在一些实施方案中,互变异构形式是由一个单键与相邻双键交换且伴随质子的迁移得到。在某些实施方案中,互变异构形式可以是质子转移互变异构体,该互变异构体是具有与参考形式相同的经验式和总电荷的异构体质子化状态。具有质子转移互变异构形式的部分的实例有酮-烯醇对、酰胺-亚胺酸对、内酰胺-内酰亚胺对、酰胺-亚胺酸对、烯胺-亚胺对以及环状形式,在所述环状形式中,质子可占据杂环系统的两个或更多个位置,如1H-咪唑和3H-咪唑、1H-三唑、2H-三唑和4H-1,2,4-三唑、1H-异吲哚和2H-异吲哚,以及1H-吡唑和2H-吡唑。在一些实施方案中,互变异构形式可处于平衡状态或通过适当取代而在空间上锁定于一种形式。在某些实施方案中,互变异构形式是由缩醛相互转化得到。
除非另外规定,否则本文所描绘的结构也意欲包括仅因一个或多个同位素富集的原子的存在而不同的化合物。可并入本发明化合物中的示例性同位素包括氢、碳、氮、氧、磷、硫、氟、氯及碘的同位素,如2H、3H、11C、13C、14C、13N、15N、15O、17O、18O、32P、33P、35S、18F、36Cl、123I和125I。同位素标记的化合物(例如标记3H和14C的化合物)可用于化合物或底物组织分布测定中。氚化(即,3H)和碳-14(即,14C)同位素因其易于制备和检测而可用。另外,用较重同位素,如氘(即,2H)取代可由于代谢稳定性增强(例如体内半衰期增加或剂量需求减小)而提供某些治疗益处。在一些实施方案中,一个或多个氢原子被2H或3H置换,或者一个或多个碳原子被13C或14C富集的碳置换。正电子发射同位素,如15O、13N、11C和18F可用于正电子发射断层扫描(PET)研究中以检查底物受体占有情况。同位素标记的化合物的制备是本领域技术人员所知的。例如,同位素标记的化合物一般可遵循与所公开的关于本文所描述的本发明化合物的程序类似的程序,通过用同位素标记的试剂取代未同位素标记的试剂制备。
如本领域中所知,许多化学实体可呈现多种不同的固体形式,如非晶形或结晶形式(例如多晶型物、水合物、溶剂化物)。在一些实施方案中,本发明化合物可以呈任何此类形式使用,包括任何固体形式。在一些实施方案中,本文所描述或描绘的化合物可以呈水合物形式或溶剂化物形式提供。
在本说明书中各处,本公开的化合物的取代基是以群组或以范围公开。具体点说,本公开意欲包括所述群组和范围各成员的每一个别子组合。例如,术语“C1-C6烷基”特定地意欲个别地公开甲基、乙基、C3烷基、C4烷基、C5烷基及C6烷基。此外,在一种化合物包括多个位置,并且在这些位置处,取代基是以群组或以范围公开时,除非另外指示,否则本公开意欲涵盖在每个位置处含有成员的每一个别子组合的个别化合物和化合物群组(例如种类和子类)。
术语“任选被取代的X”(例如“任选被取代的烷基”)意欲等效于“X,其中X任选被取代”(例如“烷基,其中该烷基任选被取代”)。并非意欲指特征“X”(例如烷基)本身是任选的。如本文所描述,某些所关注化合物可含有一个或多个“任选被取代”的部分。一般而言,术语“被取代”无论前面是否加有术语“任选地”,均意谓指定部分的一个或多个氢被适合取代基,例如本文所描述的取代基或基团中的任一者置换。除非另作指示,否则“任选被取代”的基团可在该基团的每个可取代位置处具有适合取代基,并且当在任何给定结构中的多于一个位置可被多于一个选自指定组的取代基取代时,该取代基可在每个位置处相同或不同。例如,在术语“任选被取代的C1-C6烷基-C2-C9杂芳基”中,该烷基部分、该杂芳基部分或两者可任选被取代。本公开所设想的取代基的组合优选是形成稳定或化学上可行的化合物的取代基组合。如本文所使用,术语“稳定”是指化合物当经历允许该化合物产生、检测且在某些实施方案中,允许该化合物回收、纯化以及用于一个或多个本文所公开的目的的条件时大体上不改变。
“任选被取代”的基团的可取代碳原子上的适合单价取代基可独立地为氘;卤素;-(CH2)0-4Ro;-(CH2)0-4ORo;-O(CH2)0-4Ro;O-(CH2)0-4C(O)ORo;-(CH2)0-4CH(ORo)2;-(CH2)0-4SRo;-(CH2)0-4Ph,该基团可被Ro取代;-(CH2)0-4O(CH2)0-1Ph,该基团可被Ro取代;-CH=CHP h,该基团可被Ro取代;-(CH2)0-4O(CH2)0-1-吡啶基,该基团可被Ro取代;4至8元饱和或不饱和杂环烷基(例如吡啶基);3至8元饱和或不饱和环烷基(例如环丙基、环丁基或环戊基);-NO2;-CN;-N3;-(CH2)0-4N(Ro)2;-(CH2)0-4N(Ro)C(O)Ro;-N(Ro)C(S)Ro;-(CH2)0-4N(Ro)C(O)NRo 2;-N(Ro)C(S)NRo 2;-(CH2)0-4N(Ro)C(O)ORo;-N(Ro)N(Ro)C(O)Ro;-N(Ro)N(Ro)C(O)NRo 2;-N(Ro)N(Ro)C(O)ORo;-(CH2)0-4C(O)Ro;-C(S)Ro;-(CH2)0-4C(O)ORo;-(CH2)0-4-C(O)-N(Ro)2;-(CH2)0-4-C(O)-N(Ro)-S(O)2-Ro;-C(NCN)NRo 2;-(CH2)0-4C(O)SRo;-(CH2)0-4C(O)OS iRo 3;-(CH2)0-4OC(O)Ro;-OC(O)(CH2)0-4SRo;-SC(S)SRo;-(CH2)0-4SC(O)Ro;-(CH2)0-4C(O)NRo 2;-C(S)NRo 2;-C(S)SRo;-(CH2)0-4OC(O)NRo 2;-C(O)N(ORo)Ro;-C(O)C(O)Ro;-C(O)CH2C(O)Ro;-C(NORo)Ro;-(CH2)0- 4SSRo;-(CH2)0-4S(O)2Ro;-(CH2)0-4S(O)2ORo;-(CH2)0-4OS(O)2Ro;-S(O)2NRo 2;-(CH2)0-4S(O)Ro;-N(Ro)S(O)2NRw2;-N(Ro)S(O)2Ro;-N(ORo)Ro;-C(NORo)NRo 2;-C(NH)NRo 2;-P(O)2Ro;-P(O)Ro 2;-P(O)(ORo)2;-OP(O)Ro 2;-OP(O)(ORo)2;-OP(O)(ORo)Ro;-Si Ro 3;-(C1-4直链或分支链亚烷基)O-N(Ro)2;或-(C1-4直链或分支链亚烷基)C(O)O-N(Ro)2,其中各Ro可如下文所定义被取代且独立地为氢、-C1-6脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph、-CH2-(5至6元杂芳基环)或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至6元饱和、部分不饱和或芳基环,或尽管有以上定义,但两个独立存在的Ro与其插入原子一起形成具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至12元饱和、部分不饱和或芳基单环或双环,其可如下文所定义被取代。
Ro(或由两个独立存在的Ro与其插入原子一起形成的环)上的适合单价取代基可独立地为卤素、-(CH2)0-2R、-(卤代R)、-(CH2)0-2OH、-(CH2)0-2OR、-(CH2)0-2CH(OR)2、-O(卤代R)、-CN;-N3、-(CH2)0-2C(O)R、-(CH2)0-2C(O)OH、-(CH2)0-2C(O)OR、-(CH2)0-2SR、-(CH2)0- 2SH、-(CH2)0-2NH2、-(CH2)0-2NHR、-(CH2)0-2NR 2、-NO2、-SiR 3、-OSiR 3、-C(O)SR、-(C1-4直链或分支链亚烷基)C(O)OR或-SSR,其中各R未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代,并且独立地选自C1-4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。Ro的饱和碳原子上的适合二价取代基包括=O和=S。
“任选被取代”的基团的饱和碳原子上的适合二价取代基包括以下:=O、=S、=NNR* 2、=NNHC(O)R*、=NNHC(O)OR*、=NNHS(O)2R*、=NR*、=NOR*、-O(C(R* 2))2-3O-或-S(C(R* 2))2-3S-,其中R*在每次独立出现时选自氢;C1-6脂肪族基团,该基团可如下文所定义被取代;或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的未被取代的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。结合至“任选被取代”的基团的邻近可取代碳的适合二价取代基包括:-O(CR* 2)2- 3O-,其中R*在每次独立出现时选自氢;C1-6脂肪族基团,其可如下文所定义被取代;或未被取代的具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。
R*的脂肪族基团上的适合取代基包括卤素、-R、-(卤代R)、-OH、-OR、-O(卤代R)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR、-NH2、-NHR、-NR 2或-NO2,其中各R未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代,并且独立地是C1-4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0– 1Ph,或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。
“任选被取代”的基团的可取代氮上的适合取代基包括
Figure BDA0004194083620006561
Figure BDA0004194083620006562
Figure BDA0004194083620006563
或/>
Figure BDA0004194083620006564
其中各/>
Figure BDA0004194083620006565
独立地是氢;C1-6脂肪族基团,其可如下文所定义被取代;未被取代的-OPh;或未被取代的具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至6元饱和、部分不饱和或芳基环;或尽管上文有定义,但两个独立出现的/>
Figure BDA0004194083620006566
连同其一个或多个间杂原子一起形成未被取代的具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至12元饱和、部分不饱和或芳基单环或双环。
Figure BDA0004194083620006567
的脂肪族基团上的适合取代基独立地是卤素、-R、-(卤代R)、-OH、-OR、-O(卤代R)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR、-NH2、-NHR、-NR 2或-NO2,其中各R未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代,并且独立地是C1-4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph,或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。/>
Figure BDA0004194083620006568
的饱和碳原子上的适合二价取代基包括=O和=S。
如本文所使用,术语“乙酰基”是指基团-C(O)CH3
如本文所使用,术语“烷氧基”是指-O-C1-C20烷基,其中该烷氧基通过氧原子连接至化合物的其余部分。
如本文所使用,术语“烷基”是指含有1至20个(例如1至10个或1至6个)碳的饱和、直链或分支链单价烃基。在一些实施方案中,烷基是非分支链的(即,是线性的);在一些实施方案中,烷基是分支链的。烷基是例如但不限于甲基、乙基、正丙基和异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基和叔丁基,以及新戊基。
如本文所使用,术语“亚烷基”表示由直链或分支链饱和烃通过移除两个氢原子得到的饱和二价烃基,并且其实例有亚甲基、亚乙基、亚异丙基等。术语“Cx-Cy亚烷基”表示具有在x与y个之间的碳的亚烷基。示例性x值是1、2、3、4、5及6,并且示例性y值是2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、14、16、18或20(例如C1-C6、C1-C10、C2-C20、C2-C6、C2-C10或C2-C20亚烷基)。在一些实施方案中,亚烷基可进一步被1、2、3或4个如本文所定义的取代基取代。
除非另外具体说明,否则如本文所使用,术语“烯基”表示含有一个或多个碳-碳双键的具有2至20个碳(例如2至6个或2至10个碳)的单价直链或分支链基团,并且其实例是乙烯基、1-丙烯基、2-丙烯基、2-甲基-1-丙烯基、1-丁烯基及2-丁烯基。烯基包括顺式和反式异构体两种。除非另外具体说明,否则如本文所使用,术语“亚烯基”表示含有一个或多个碳-碳双键的具有2至20个碳(例如2至6个或2至10个碳)的二价直链或分支链基团。
如本文所使用,术语“炔基”表示含有碳-碳三键的具有2至20个碳(例如2至4个、2至6个或2至10个碳)的单价直链或分支链基团,并且其实例有乙炔基及1-丙炔基。
如本文所使用,术语“炔基砜”表示包含结构
Figure BDA0004194083620006571
的基团,其中R是本文所描述的任何化学上可行的取代基。
如本文所使用,术语“氨基”表示
Figure BDA0004194083620006581
例如-NH2和-N(CH3)2
如本文所使用,术语“氨基烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个氨基部分取代的烷基部分。
如本文所描述,术语“氨基酸”是指具有侧链、氨基和酸基(例如-CO2H或-SO3H)的分子,其中该氨基酸通过所述侧链、氨基或酸基(例如侧链)连接至母分子基团。如本文所使用,术语“氨基酸”在最广泛意义上是指可例如通过形成一个或多个肽键并入多肽链中的任何化合物或物质。在一些实施方案中,氨基酸具有通用结构H2N-C(H)(R)-COOH。在一些实施方案中,氨基酸是天然存在的氨基酸。在一些实施方案中,氨基酸是合成氨基酸;在一些实施方案中,氨基酸是D-氨基酸;在一些实施方案中,氨基酸是L-氨基酸。“标准氨基酸”是指天然存在的肽中常见的二十种标准L-氨基酸中的任一种。示例性氨基酸包括丙氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、组氨酸、任选被取代的羟基正缬氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、正缬氨酸、鸟氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、吡咯赖氨酸、硒代半胱氨酸、丝氨酸、牛磺酸、苏氨酸、色氨酸、酪氨酸及缬氨酸。
如本文所使用,术语“芳基”表示由碳原子形成的单价单环、双环或多环系统,其中连接至侧接基团的环是芳香环。芳基的实例有苯基、萘基、菲基和蒽基。芳环可在产生稳定结构的任何杂原子或碳环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用,术语“C0”表示键。例如,术语-N(C(O)-(C0-C5亚烷基-H)-的一部分包括-N(C(O)-(C0亚烷基-H)-,也表示为-N(C(O)-H)-。
如本文所使用,术语“碳环”和“碳环基”是指单价、任选被取代的C3-C12单环、双环或三环结构,该环结构可以是桥接环、稠合环或螺环,其中所有环均由碳原子形成,并且至少一个环是非芳香环。碳环结构包括环烷基、环烯基和环炔基。碳环基的实例有环己基、环己烯基、环辛炔基、1,2-二氢萘基、1,2,3,4-四氢萘基、芴基、茚基、二氢茚基、十氢萘基等。碳环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用,术语“羰基”表示C(O)基团,该基团也可表示为C=O。
如本文所使用,术语“羧基”意思指-CO2H、(C=O)(OH)、COOH或C(O)OH,或未质子化的对应物。
如本文所使用,术语“氰基”表示-CN基团。
如本文所使用,术语“环烷基”表示单价饱和环状烃基,除非另外具体说明,否则该基团可以是具有三至八个环碳的桥接环、稠合环或螺环,并且其实例有环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基及环庚基。
如本文所使用,术语“环烯基”表示单价、非芳香族饱和环状烃基,除非另外具体说明,否则该基团可以是具有三至八个环碳且含有一个或多个碳-碳双键的桥接环、稠合环或螺环。
如本文所使用,术语“非对映异构体”意思指不互为镜像且彼此不可重叠的立体异构体。
如本文所使用,术语“对映异构体”意思指具有至少80%(即,至少90%的一种对映异构体和至多10%的另一种对映异构体)、优选至少90%且更优选至少98%的光学纯度或对映异构体过量(如通过本领域中的标准方法确定)的本发明化合物的每一个别光学活性形式。
术语“胍基”是指具有以下结构的基团:
Figure BDA0004194083620006601
其中各R独立地为本文所描述的任何化学上可行的取代基。
如本文所使用,术语“胍基烷基烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个胍基部分取代的烷基部分。
如本文所使用,术语“卤代乙酰基”是指至少一个氢被卤素置换的乙酰基。
如本文所使用,术语“卤烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个相同或不同的卤素部分取代的烷基部分。
如本文所使用,术语“卤素”表示选自溴、氯、碘或氟的卤素。
如本文所使用,术语“杂烷基”是指至少一个碳原子被杂原子(例如O、N或S原子)置换的如本文所定义的“烷基”。杂原子可出现在基团的中间或末端。
如本文所使用,术语“杂芳基”表示含有至少一个完全芳香环的单价、单环或多环结构:即,它在该单环或多环系统内含有4n+2个π电子,并且在该芳香环中含有至少一个选自N、O或S的杂原子。示例性未被取代的杂芳基具有1至12个(例如1至11个、1至10个、1至9个、2至12个、2至11个、2至10个或2至9个)碳。术语“杂芳基”包括任一上述杂芳香环与一个或多个芳环或碳环,例如苯基环或环己烷环稠合的双环、三环和四环基团。杂芳基的实例包括但不限于吡啶基、吡唑基、苯并噁唑基、苯并咪唑基、苯并噻唑基、咪唑基、噻唑基、喹啉基、四氢喹啉基及4-氮杂吲哚基。杂芳基环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。在某一实施方案中,杂芳基被1、2、3或4个取代基取代。
如本文所使用,术语“杂环烷基”表示至少一个环是非芳香环且其中该非芳香环含有一个、两个、三个或四个独立地选自由氮、氧和硫组成的组的杂原子的单价、单环、双环或多环系统,该环系统可以是桥接环、稠合环或螺环。5元环具有零至两个双键,并且6元环和7元环具有零至三个双键。示例性未被取代的杂环烷基具有1至12个(例如1至11个、1至10个、1至9个、2至12个、2至11个、2至10个或2至9个)碳。术语“杂环烷基”也表示具有桥接多环结构的杂环化合物,其中一个或多个碳或杂原子桥接单环的两个不相邻成员,例如奎宁环基。术语“杂环烷基”包括任一上述杂环与一个或多个芳香环、碳环、杂芳香环或杂环,例如芳基环、环己烷环、环己烯环、环戊烷环、环戊烯环、吡啶环或吡咯烷环稠合的双环、三环和四环基团。杂环烷基的实例有吡咯烷基、哌啶基、1,2,3,4-四氢喹啉基、十氢喹啉基、二氢吡咯并吡啶基及十氢萘啶基。杂环烷基环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用,术语“羟基”表示-OH基团。
如本文所使用,术语“羟基烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个-OH部分取代的烷基部分。
如本文所使用,术语“异构体”意思指任何本发明化合物的任何互变异构体、立体异构体、阻转异构体、对映异构体或非对映异构体。应认识到,本发明化合物可具有一个或多个手性中心或双键,并因此,以立体异构体形式,如以双键异构体(即,E/Z几何异构体)或非对映异构体(例如对映异构体(即,(+)或(-))或顺/反异构体)形式存在。根据本发明,本文所描绘的化学结构且因此本发明化合物涵盖所有相应立体异构体,即,立体异构纯(例如几何异构纯、对映异构体纯或非对映异构体纯)形式以及对映异构体和立体异构体混合物,例如外消旋物。本发明化合物的对映异构体和立体异构体混合物可典型地通过众所周知的方法,如手性相气相色谱法、手性相高效液相色谱法、使化合物以手性盐络合物形式结晶或使化合物在手性溶剂中结晶来拆分成其组分对映异构体或立体异构体。对映异构体和立体异构体也可由立体异构纯或对映异构纯的中间体、试剂和催化剂,通过众所周知的不对称合成方法获得。
如本文所使用,术语“连接体”是指将式I化合物中的部分B连接至部分W,使得所得化合物能够在以下实施例中提供以及此处提供的Ras-RAF破坏测定方案中获得2uM或更低IC50值的二价有机部分:
这一生物化学测定的目的是测量测试化合物促进在载有核苷酸的Ras同功型与亲环蛋白A之间形成三元复合物的能力;由此得到的三元复合物破坏与BRAFRBD构建体的结合,抑制Ras通过RAF效应子进行的信号传导。
在含有25mM HEPES pH 7.3、0.002% Tween20、0.1% BSA、100mM NaCl及5mMMgCl2的测定缓冲液中,将无标记亲环蛋白A、His6-K-Ras-GMPPNP(或其它Ras变体)和GST-BRAFRBD分别以25μM、12.5nM和50nM的最终浓度组合于384孔测定板中。测定板各孔中存在的化合物是自30μM最终浓度起始,经历10点3倍连续稀释的稀释液。在25℃下培育3小时之后,接着将抗His Eu-W1024和抗GST别藻蓝蛋白的混合物添加至测定样品孔中分别达到10nM和50nM的最终浓度,并将反应再培育1.5小时。在微孔板读取器(Ex320nm,Em 665/615nm)上读取TR-FRET信号。促进Ras:RAF复合物破坏的化合物被鉴别为使TR-FRET比率相对于DMSO对照孔降低的化合物。
在一些实施方案中,连接体包含20个或更少的线性原子。在一些实施方案中,连接体包含15个或更少的线性原子。在一些实施方案中,连接体包含10个或更少的线性原子。在一些实施方案中,连接体的分子量低于500g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于400g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于300g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于200g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于100g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于50g/mol。
如本文所使用,“单价有机部分”小于500kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于400kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于300kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于200kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于100kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于50kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于25kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于20kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于15kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于10kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于1kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于500g/mol。在一些实施方案中,“单价有机部分”在500g/mol与500kDa之间的范围内。
如本文所使用,术语“立体异构体”是指一种化合物(例如本文所描述的任何式的化合物)可能具有所有可能的不同异构以及构形形式,特别是基础分子结构的所有可能的立体化学和构形异构形式、所有非对映异构体、对映异构体或构形异构体,包括阻转异构体。本发明的一些化合物可以呈不同互变异构形式存在,所有这些互变异构形式均包括在本发明的范围内。
如本文所使用,术语“磺酰基”表示-S(O)2-基团。
如本文所使用,术语“硫代羰基”是指-C(S)-基团。
如本文所使用,术语“乙烯基酮”是指包含直接连接至碳-碳双键的羰基的基团。
如本文所使用,术语“乙烯基砜”是指包含直接连接至碳-碳双键的磺酰基的基团。
如本文所使用,术语“炔酮”是指包含结构
Figure BDA0004194083620006641
的基团,其中R是本文所描述的任何在化学上可行的取代基。
本领域技术人员阅读本公开将理解,本文所描述的某些化合物可以呈多种形式中的任一种提供或利用,如盐形式、被保护的形式、前药形式、酯形式、异构形式(例如光学或结构异构体)、同位素形式等。在一些实施方案中,提到的特定化合物可指该化合物的特定形式。在一些实施方案中,提到的特定化合物可指呈任何形式的该化合物。在一些实施方案中,例如,一种化合物的单一立体异构体的制剂可视为该化合物的不同形式而非该化合物的外消旋混合物;一种化合物的特定盐可视为与该化合物的另一种盐不同的形式;含有双键的一种构形异构体((Z)或(E))的制剂可视为与含有该双键的另一种构形异构体((E)或(Z))的制剂不同的形式;一个或多个原子的同位素不同于参考制剂中存在的同位素的制剂可视为呈不同形式。
具体实施方式
化合物
本文提供Ras抑制剂。本文所描述的方法需要在合成配体与两种细胞内蛋白质之间形成高亲和力三组分复合物,该两种细胞内蛋白在正常生理条件下不会相互作用:所关注的靶蛋白(例如Ras),以及在细胞中广泛表达的细胞质伴侣蛋白(呈现蛋白)(例如亲环蛋白A)。更具体点说,在一些实施方案中,本文所描述的Ras抑制剂通过驱动在Ras蛋白与广泛表达的细胞质伴侣蛋白亲环蛋白A(CYPA)之间形成高亲和力三重复合物或缀合物而在Ras中诱导新结合口袋。不受理论束缚,本发明人相信,本发明化合物以及其形成的复合物或缀合物对Ras发挥抑制作用的一种方式是在空间上阻塞Ras与传播致癌信号所需的下游效应分子如RAF之间的相互作用位点。
不受理论束缚,本发明人假定,本发明化合物与Ras和伴侣蛋白(例如亲环蛋白A)的共价和非共价相互作用可促成对Ras活性的抑制。在一些实施方案中,本发明化合物与Ras蛋白的侧链(例如在突变Ras蛋白12位或13位处的半光氨酸的硫氢基侧链)形成共价加合物。也可与Ras的其它侧链形成共价加合物。另外或替代地,非共价相互作用可起作用:例如,范德华(van der Waals)相互作用、疏水相互作用、亲水相互作用和氢键相互作用,以及其组合可促成本发明化合物形成复合物并充当Ras抑制剂的能力。因此,本发明化合物可抑制多种Ras蛋白(例如K-Ras、N-Ras、H-Ras以及其在12位、13位及61位突变的突变体,如G12C、G12D、G12V、G12S、G13C、G13D及Q61L,以及本文所描述的其它突变体)。
确定共价加合物形成的方法是本领域中已知的。一种确定共价加合物形成的方法是执行“交联”测定,如在这些条件下进行的测定(注意:以下方案描述用于监测K-Ras G12C(GMP-PNP)与本发明化合物的交联的程序。这一方案也可改用其它Ras蛋白或核苷酸执行)。
这一生物化学测定的目的是测量测试化合物共价标记载有核苷酸的K-Ras同功型的能力。在含有12.5mM HEPES pH 7.4、75mM NaCl、1mM MgCl2、1mM BME、5μM亲环蛋白A及2μM测试化合物的测定缓冲液中,将5μM载有GMP-PNP的K-Ras(1-169)G12C的储备液稀释10倍达到0.5μM最终浓度;并且最终样品体积是100μL。
在25℃下,将样品培育至多24小时的时间,随后通过添加10μL的5%甲酸淬灭。淬灭的样品在台式离心机中以15000rpm离心15分钟,随后将10μL等分试样注入至反相C4柱上并用流动相中递增的乙腈梯度洗脱至质谱仪中。原始数据的分析可使用Waters MassLynxMS软件进行,其中结合%是由被标记和未标记的K-Ras的解卷积蛋白质峰计算。
因此,本文提供一种具有式I结构的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620006661
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是不存在;-CH(R9)-、>C=CR9R9’或>CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮、卤代乙缩醛或炔基砜;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是H、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;或
R9和R9’与其所连接的原子组合在一起形成3至6元环烷基或3至6元杂环烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R21是氢或C1-C3烷基(例如甲基)。
在一些实施方案中,R9是H、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
在一些实施方案中,R21是氢。
在一些实施方案中,本文提供了一种具有式Ia的结构的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620006701
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮、卤代乙缩醛或炔基砜;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
在一些实施方案中,本公开的特征在于一种具有式Ib的结构的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620006731
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮、卤代乙缩醛或炔基砜;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5和Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,G是任选被取代的C1-C4亚杂烷基。
在一些实施方案中,提供具有式Ic的结构的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620006761
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜;
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5和Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,X2是NH。在一些实施方案中,X3是CH。在一些实施方案中,R11是氢。在一些实施方案中,R11是C1-C3烷基。在一些实施方案中,R11是甲基。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Id的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620006791
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5和Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,X1是任选被取代的C1-C2亚烷基。在一些实施方案中,X1是亚甲基。在一些实施方案中,X1是被C1-C6烷基或卤素取代的亚甲基。在一些实施方案中,X1是-CH(Br)-。在一些实施方案中,X1是-CH(CH3)-。在一些实施方案中,R5是氢。在一些实施方案中,R5是任选被卤素取代的C1-C4烷基。在一些实施方案中,R5是甲基。在一些实施方案中,Y4是C。在一些实施方案中,R4是氢。在一些实施方案中,Y5是CH。
在一些实施方案中,Y6是CH。在一些实施方案中,Y1是C。在一些实施方案中,Y2是C。在一些实施方案中,Y3是N。在一些实施方案中,R3不存在。在一些实施方案中,Y7是C。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Ie的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620006821
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R6是氢。在一些实施方案中,R2是氢、氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至6元杂环烷基。在一些实施方案中,R2是任选被取代的C1-C6烷基。在一些实施方案中,R2是氟烷基。在一些实施方案中,R2是乙基。在一些实施方案中,R2是-CH2CF3。在一些实施方案中,R2是C2-C6炔基。在一些实施方案中,R2是-CHC≡CH。在一些实施方案中,R2是-CH2C≡CCH3。在一些实施方案中,R7是任选被取代的C1-C3烷基。在一些实施方案中,R7是C1-C3烷基。在一些实施方案中,R8是任选被取代的C1-C3烷基。在一些实施方案中,R8是C1-C3烷基。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式If的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620006851
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R1是任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至6元环烯基或任选被取代的5至10元杂芳基。在一些实施方案中,R1是任选被取代的6元芳基、任选被取代的6元环烯基或任选被取代的6元杂芳基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R1
Figure BDA0004194083620006861
Figure BDA0004194083620006862
Figure BDA0004194083620006863
或其立体异构体(例如阻转异构体)。在本发明化合物的一些实施方案中,R1是/>
Figure BDA0004194083620006871
或其立体异构体(例如阻转异构体)。在本发明化合物的一些实施方案中,R1是/>
Figure BDA0004194083620006872
/>
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Ig的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620006873
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜;
R2是C1-C6烷基、C1-C6氟烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基
Xe和Xf独立地为N或CH;并且
R12是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基或任选被取代的3至6元亚杂环烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,Xe是N并且Xf是CH。在一些实施方案中,Xe是CH并且Xf是N。
在本发明化合物的一些实施方案中,R12是任选被取代的C1-C6杂烷基。在一些实施方案中,R12
Figure BDA0004194083620006881
Figure BDA0004194083620006882
在一些实施方案中,R12
Figure BDA0004194083620006883
/>
在一些实施方案中,本发明化合物具有式VI的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620006891
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基(例如苯基或苯酚);或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是不存在;-CH(R9)-、>C=CR9R9’或>CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮、卤代乙缩醛或炔基砜;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是H、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;或
R9和R9’与其所连接的原子组合在一起形成3至6元环烷基或3至6元杂环烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;
R21是氢或C1-C3烷基(例如甲基);并且
Xe和Xf独立地为N或CH。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式VIa的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620006921
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基(例如苯基或苯酚)或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
R2是C1-C6烷基、C1-C6氟烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
Xe和Xf独立地为N或CH;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R21是氢或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,Xe是N并且Xf是CH。在一些实施方案中,Xe是CH并且Xf是N。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式VIb的结构或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620006941
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基(例如苯基或苯酚)或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
L不存在或为连接体;并且
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜。在本发明化合物的一些实施方案中,A是任选被取代的6元亚芳基。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式VIc的结构(对应于图1A和图1B的式BB)或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620006951
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基(例如苯基或苯酚);或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是不存在;-CH(R9)-、>C=CR9R9’或>CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮、卤代乙缩醛或炔基砜;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是H、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;或
R9和R9’与其所连接的原子组合在一起形成3至6元环烷基或3至6元杂环烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R21是氢或C1-C3烷基(例如甲基)。
在一些实施方案中,A具有以下结构:
Figure BDA0004194083620006981
其中R13是氢、卤代、羟基、氨基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基;并且R13a是氢或卤代。在一些实施方案中,R13是氢。在一些实施方案中,R13和R13a各自是氢。在一些实施方案中,R13是羟基、甲基、氟或二氟甲基。
在一些实施方案中,A是任选被取代的5至6元亚杂芳基。在一些实施方案中,A是:
Figure BDA0004194083620006982
Figure BDA0004194083620006983
/>
Figure BDA0004194083620006991
在一些实施方案中,A是任选被取代的C1-C4亚杂烷基。在一些实施方案中,A是:
Figure BDA0004194083620006992
在一些实施方案中,A是任选被取代的3至6元亚杂环烷基。在一些实施方案中,A是:/>
Figure BDA0004194083620006993
Figure BDA0004194083620006994
Figure BDA0004194083620006995
在一些实施方案中,A是/>
Figure BDA0004194083620006996
在本发明化合物的一些实施方案中,B是-CHR9-。在一些实施方案中,R9是H、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。在一些实施方案中,R9是:
Figure BDA0004194083620006997
Figure BDA0004194083620006998
在一些实施方案中,R9是:/>
Figure BDA0004194083620007001
在一些实施方案中,R9是H、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,B是任选被取代的6元亚芳基。在一些实施方案中,B是6元亚芳基。在一些实施方案中,B是:
Figure BDA0004194083620007002
在本发明化合物的一些实施方案中,R7是甲基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R8是甲基。
在一些实施方案中,R21是氢。
在本发明化合物的一些实施方案中,连接体是式II的结构:
A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-(D1)-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2
式II
其中A1是在所述连接体与B之间的键;A2是在W与所述连接体之间的键;B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S和NRN;RN是氢、任选被取代的C1–4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的C1-C7杂烷基;C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基;f、g、h、i、j及k各自独立地为0或1;并且D1是任选被取代的C1-C10亚烷基、任选被取代的C2-C10亚烯基、任选被取代的C2-C10亚炔基、任选被取代的3至14元亚杂环烷基、任选被取代的5至10元亚杂芳基、任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的6至10元亚芳基、任选被取代的C2-C10亚聚乙二醇或任选被取代的C1-C10亚杂烷基,或将A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-连接至-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2的化学键。在一些实施方案中,所述连接体是无环的。在一些实施方案中,连接体具有式IIa的结构:
Figure BDA0004194083620007011
其中Xa不存在或为N;
R14是不存在、氢或任选被取代的C1-C6烷基;并且
L2是不存在、-SO2-、任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C1-C4亚杂烷基、其中Xa、R14或L2中的至少一个存在。在一些实施方案中,所述连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620007012
在一些实施方案中,所述连接体是或包含环状部分。在一些实施方案中,所述连接体具有式IIb的结构:
Figure BDA0004194083620007013
其中o是0或1;
R15是氢或任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的3至8元亚环烷基或任选被取代的3至8元亚杂环烷基;
X4是不存在、任选被取代的C1-C4亚烷基、O、NCH3或任选被取代的C1-C4亚杂烷基;
Cy是任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的3至8元亚杂环烷基、任选被取代的6-10元亚芳基或任选被取代的5至10元亚杂芳基;并且
L3是不存在、-SO2-、任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C1-C4亚杂烷基。
在一些实施方案中,所述连接体具有式IIb-1的结构:
Figure BDA0004194083620007021
其中o是0或1;
R15是氢或任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的3至8元亚环烷基或任选被取代的3至8元亚杂环烷基;
Cy是任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的3至8元亚杂环烷基、任选被取代的6-10元亚芳基或任选被取代的5至10元亚杂芳基;并且
L3是不存在、-SO2-、任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C1-C4亚杂烷基。
在一些实施方案中,所述连接体具有式IIc的结构:
Figure BDA0004194083620007022
Figure BDA0004194083620007031
其中R15是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的3至8元亚环烷基或任选被取代的3至8元亚杂环烷基;并且
R15a、R15b、R15c、R15d、R15e、R15f和R15g独立地为氢、卤代、羟基、氰基、氨基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6烷氧基,或R15b和R15d与其所连接的碳组合在一起形成任选被取代的3至8元亚环烷基或任选被取代的3至8元亚杂环烷基。
在一些实施方案中,所述连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620007032
Figure BDA0004194083620007041
在一些实施方案中,所述连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620007042
/>
Figure BDA0004194083620007051
/>
Figure BDA0004194083620007061
/>
Figure BDA0004194083620007071
在一些实施方案中,所述连接体具有结构
Figure BDA0004194083620007072
在一些实施方案中,所述连接体具有结构
Figure BDA0004194083620007073
在本发明化合物的一些实施方案中,W是包含乙烯基酮的交联基团。在一些实施方案中,W具有式IIIa的结构:/>
Figure BDA0004194083620007081
其中R16a、R16b和R16c独立地为氢、-CN、卤素或-C1-C3烷基,该-C1-C3烷基任选被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:-OH、-O-C1-C3烷基、-NH2、-NH(C1-C3烷基)、-N(C1-C3烷基)2或4至7元饱和杂环烷基。在一些实施方案中,W是:
Figure BDA0004194083620007082
或/>
Figure BDA0004194083620007083
在一些实施方案中,W是包含炔酮的交联基团。在一些实施方案中,W具有式IIIb的结构:
Figure BDA0004194083620007084
其中R17是氢;-C1-C3烷基,该-C1-C3烷基任选被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:-OH、-O-C1-C3烷基、-NH2、-NH(C1-C3烷基)、-N(C1-C3烷基)2或4至7元饱和杂环烷基;或4至7元饱和杂环烷基。在一些实施方案中,W是:
Figure BDA0004194083620007091
/>
Figure BDA0004194083620007101
Figure BDA0004194083620007102
在一些实施方案中,W是/>
Figure BDA0004194083620007103
在一些实施方案中,W是交联基团,所述基团包含乙烯基砜。在一些实施方案中,W具有式IIIc的结构:
Figure BDA0004194083620007104
其中R18a、R18b和R18c独立地为氢、-CN或-C1-C3烷基,该-C1-C3烷基任选被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:-OH、-O-C1-C3烷基、-NH2、-NH(C1-C3烷基)、-N(C1-C3烷基)2或4至7元饱和杂环烷基。在一些实施方案中,W是:
Figure BDA0004194083620007105
Figure BDA0004194083620007111
在一些实施方案中,W是包含炔基砜的交联基团。在一些实施方案中,W具有式IIId的结构:
Figure BDA0004194083620007112
其中R19是氢;-C1-C3烷基,该-C1-C3烷基任选被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:-OH、-O-C1-C3烷基、-NH2、-NH(C1-C3烷基)、-N(C1-C3烷基)2或4至7元饱和杂环烷基;或4至7元饱和杂环烷基。在一些实施方案中,W是:
Figure BDA0004194083620007113
在一些实施方案中,W具有式IIIe的结构:
Figure BDA0004194083620007114
其中Xe是卤素;并且
R20是氢、-C1-C3烷基,该-C1-C3烷基任选被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:-OH、-O-C1-C3烷基、-NH2、-NH(C1-C3烷基)、-N(C1-C3烷基)2或4至7元饱和杂环烷基。在一些实施方案中,W是卤代乙缩醛。在一些实施方案中,W不是卤代乙缩醛。
在一些实施方案中,本发明化合物选自表1或其药学上可接受的盐或立体异构体。在一些实施方案中,本发明化合物选自表1或其药学上可接受的盐或阻转异构体。
表1:某些本发明化合物
Figure BDA0004194083620007121
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Figure BDA0004194083620008481
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Figure BDA0004194083620008491
应注意,一些化合物中的键以平直线或楔形线显示。在一些情况下,立体异构体的相对立体化学已确定;在一些情况下,绝对立体化学已确定。在一些情况下,单个实施例编号对应于立体异构体混合物。上表化合物的所有立体异构体均涵盖在本发明中。在特定实施方案中,涵盖上表化合物的阻转异构体。
括号应忽略。
*这一立体异构体的活性实际上可归于在-NC(O)-CH(CH3)2-N(CH3)-位置处具有(S)构型的少量立体异构体的存在。
在一些实施方案中,提供表2的化合物,或其药学上可接受的盐。在一些实施方案中,本发明化合物选自表2或其药学上可接受的盐或阻转异构体。
表2:某些本发明化合物
Figure BDA0004194083620008492
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Figure BDA0004194083620009001
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Figure BDA0004194083620009021
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Figure BDA0004194083620009031
/>
Figure BDA0004194083620009041
/>
Figure BDA0004194083620009051
/>
Figure BDA0004194083620009061
/>
Figure BDA0004194083620009071
/>
Figure BDA0004194083620009081
/>
Figure BDA0004194083620009091
/>
Figure BDA0004194083620009101
/>
Figure BDA0004194083620009111
/>
Figure BDA0004194083620009121
/>
Figure BDA0004194083620009131
/>
Figure BDA0004194083620009141
/>
Figure BDA0004194083620009151
应注意,一些化合物中的键以平直线或楔形线显示。在一些情况下,立体异构体的相对立体化学已确定;在一些情况下,绝对立体化学已确定。上表化合物的所有立体异构体均涵盖在本发明中。在特定实施方案中,涵盖上表化合物的阻转异构体。
在一些实施方案中,本发明化合物是或充当前药,例如对于施用给细胞或有需要的受试者来说。
还提供了药物组合物,所述药物组合物包含本发明化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的赋形剂。
另外提供了一种缀合物或其盐,该缀合物包含式IV的结构:
M-L-P
式IV
其中L是连接体;
P是单价有机部分;并且
M具有式Va的结构:
Figure BDA0004194083620009161
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是不存在;-CH(R9)-、>C=CR9R9’或>CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是H、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;或
R9和R9’与其所连接的原子组合在一起形成3至6元环烷基或3至6元杂环烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
在一些实施方案中,所述缀合物或其盐包含式IV的结构:
M-L-P
式IV
其中L是连接体;
P是单价有机部分;并且
M具有式Vb的结构:
Figure BDA0004194083620009201
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
在一些实施方案中,所述缀合物具有式IV的结构:
M-L-P
式IV
其中L是连接体;
P是单价有机部分;并且
M具有式Vc的结构:
Figure BDA0004194083620009231
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5和Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式IV的结构:
M-L-P
式IV
其中L是连接体;
P是单价有机部分;并且
M具有式Vd的结构:
Figure BDA0004194083620009271
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基(例如苯基或苯酚)或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
R2是C1-C6烷基、C1-C6氟烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
Xe和Xf独立地为N或CH;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R21是氢或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,Xe是N并且Xf是CH。在一些实施方案中,Xe是CH并且Xf是N。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式IV的结构:
M-L-P
式IV
其中L是连接体;
P是单价有机部分;并且
M具有式Ve的结构:
Figure BDA0004194083620009281
Figure BDA0004194083620009291
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基(例如苯基或苯酚)或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
在本发明的缀合物的一些实施方案中,所述连接体具有式II的结构:
A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-(D1)-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2
式II
其中A1是在所述连接体与B之间的键;A2是P与所述连接体之间的键;B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S和NRN;RN是氢、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的C1-C7杂烷基;C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基;f、g、h、i、j及k各自独立地为0或1;并且D1是任选被取代的C1–C10亚烷基、任选被取代的C2-C10亚烯基、任选被取代的C2-C10亚炔基、任选被取代的3至14元亚杂环烷基、任选被取代的5至10元亚杂芳基、任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的6至10元亚芳基、任选被取代的C2-C10亚聚乙二醇或任选被取代的C1-C10亚杂烷基,或将A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-连接至-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2的化学键。
在本发明的缀合物的一些实施方案中,单价有机部分是一种蛋白质,例如Ras蛋白。在一些实施方案中,Ras蛋白是K-Ras G12C、K-Ras G13C、H-Ras G12C、H-Ras G13C、N-Ras G12C或N-Ras G13C。其它Ras蛋白在本文中有描述。在一些实施方案中,连接体通过连至单价有机部分的氨基酸残基的硫氢基的键结合至单价有机部分。在一些实施方案中,连接体通过连至单价有机部分的氨基酸残基的羧基的键结合至单价有机部分。
对于本发明化合物而言,一种立体异构体展现的抑制作用可优于另一种立体异构体。例如,一种阻转异构体可展现抑制作用,而另一种阻转异构体可展现极低或不展现抑制作用。
在一些实施方案中,本文所描述的方法或用途还包括施用额外抗癌疗法。在一些实施方案中,所述额外抗癌疗法是HER2抑制剂、EGFR抑制剂、第二Ras抑制剂、SHP2抑制剂、SOS1抑制剂、Raf抑制剂、MEK抑制剂、ERK抑制剂、PI3K抑制剂、PTEN抑制剂、AKT抑制剂、mTORC1抑制剂、BRAF抑制剂、PD-L1抑制剂、PD-1抑制剂、CDK4/6抑制剂或其组合。在一些实施方案中,所述额外抗癌疗法是SHP2抑制剂。其它额外抗癌疗法在本文中有描述。
合成方法
本文所描述的化合物可由市售起始物质制备或使用已知的有机、无机或酶方法合成。
本发明化合物可通过有机合成领域的技术人员众所周知的的多种方式制备。例如,本发明化合物可使用以下方案中所描述的方法,以及合成有机化学技术中已知的合成方法或本领域技术人员所理解的关于所述方法的修改来合成。这些方法包括但不限于以下方案中所描述的方法。
方案1.大环酯的一般合成方法
Figure BDA0004194083620009311
方案1中概述了大环酯的一般合成方法。适当取代的芳基-3-(5-溴-1-乙基-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(1)可以利用受保护的3-(5-溴-2-碘-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇和适当取代的硼酸为起始物质,分三个步骤制备,包括钯介导的偶合、烷基化和脱保护反应。
甲基-氨基-六氢哒嗪-3-甲酸酯-硼酸酯(2)可分三个步骤制备,包括保护、铱催化剂介导的硼基化以及与(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯偶合。
适当取代的乙酰基吡咯烷-3-羰基-N-甲基-L-缬氨酸(或替代性氨基酸衍生物(4)可通过以下来制备:使甲基-L-缬氨酸酯与受保护的(S)-吡咯烷-3-甲酸偶合,随后进行脱保护、与含有适当取代的Michael受体的羧酸偶合和水解步骤。
最终的大环酯可通过以下来制备:使甲基-氨基-六氢哒嗪-3-甲酸酯-硼酸酯(2)与芳基-3-(5-溴-1-乙基-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(1)在Pd催化剂存在下偶合,随后进行水解和大环内酯化步骤,以得到适当保护的大环中间体(5)。脱保护并与适当取代的中间体4偶合产生大环产物。可能需要额外脱保护和/或官能化步骤来制备最终化合物。
方案2.替代性大环酯的一般合成方法
Figure BDA0004194083620009321
替代地,可如方案2中所描述来制备大环酯。适当保护的溴-吲哚基(6)在Pd催化剂存在下与硼酸酯(3)偶合,随后进行碘化、脱保护和酯水解。随后与(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯偶合,接着进行水解和大环内酯化可产生碘中间体(7)。在Pd催化剂存在下与适当取代的硼酸酯偶合可得到完全保护的大环(5)。需要额外脱保护或官能化步骤来制备最终化合物。
此外,本公开的化合物可使用以下实施例中所描述的方法,以及合成有机化学技术中已知的合成方法,或本领域技术人员所理解的关于所述方法的修改来合成。这些方法包括但不限于以下实施例中所描述的方法。例如,本领域技术人员将能够将式(I)化合物所需的-B-L-W基团装载于大环酯中,其中B、L和W如本文所定义,包括通过使用本文实施例部分中例示的方法进行。
本文表1中的化合物是是使用本文所公开的方法制备或使用本文所公开的方法结合本领域技术人员的知识制备。表2的化合物可以使用本文所公开的方法制备或可使用本文所公开的方法结合本领域技术人员的知识制备。
方案3.大环酯的一般合成方法
Figure BDA0004194083620009331
方案3中概述了大环酯的替代性一般合成方法。适当取代的吲哚基硼酸酯(8)可以利用受保护的3-(5-溴-2-碘-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇和适当取代的硼酸为起始物质,分四个步骤制备,包括钯介导的偶合、烷基化、脱保护和钯介导的硼基化反应。
甲基-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸酯(10)可通过使(S)-2-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酸(9)与(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯偶合来制备。
最终的大环酯可通过以下来制备:使甲基-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸酯(10)与适当取代的吲哚基硼酸酯(8)在Pd催化剂存在下偶合,随后进行水解和大环内酯化步骤,以得到适当保护的大环中间体(11)。脱保护并与适当取代的中间体4偶合可产生大环产物。可能需要额外脱保护或官能化步骤来制备最终化合物13或14。
方案4.大环酯的一般合成方法
Figure BDA0004194083620009341
方案4中概述了大环酯的替代性一般合成方法。适当取代的吗啉或替代性杂环中间体(15)可与适当保护的中间体1通过钯介导的偶合进行偶合。随后酯水解并与哌嗪甲酸酯偶合,产生中间体16。
大环酯可通过水解、脱保护和大环化序列制备。随后脱保护并与中间体4(或类似物)偶合产生适当取代的最终大环产物。可能需要额外脱保护或官能化步骤来制备最终化合物17。
方案5.大环酯的一般合成方法
Figure BDA0004194083620009351
方案5中概述了大环酯的替代性一般合成方法。适当取代的大环(20)可以利用适当保护的硼酸酯18和溴吲哚基中间体(19)作为起始物质制备,包括钯介导的偶合、水解、与哌嗪甲酸酯偶合、水解、脱保护和大环化步骤。随后与适当取代的受保护的氨基酸偶合,随后进行钯介导的偶合得到中间体21。在这一点可能需要额外脱保护和衍生化步骤,包括烷基化。
最终的大环酯可通过使中间体(22)和适当取代的羧酸中间体(23)偶合制成。可能需要额外脱保护或官能化步骤来制备最终化合物(24)。
此外,本公开的化合物可使用以下实施例中所描述的方法,以及合成有机化学技术中已知的合成方法,或本领域技术人员所理解的关于所述方法的修改来合成。这些方法包括但不限于以下实施例中所描述的方法。例如,本领域技术人员将能够将式(I)化合物所需的-B-L-W基团装载于大环酯中,其中B、L和W如本文所定义,包括通过使用本文实施例部分中例示的方法进行。
药物组合物和使用方法
药物组合物和施用方法
本发明所涉及的化合物是Ras抑制剂,并且可用于治疗癌症。因此,本发明的一个实施方案提供含本发明化合物或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的赋形剂的药物组合物,以及使用本发明化合物制备此类组合物的方法。
如本文所使用,术语“药物组合物”是指与药学上可接受的赋形剂一起配制的化合物,如本发明化合物,或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中,化合物是以适于在治疗方案中施用的单位剂量的量存在于药物组合物中,该化合物当施用给相关群体时显示出统计显著的实现预定治疗效果的可能性。在一些实施方案中,药物组合物可特定地配制成以固体或液体形式施用,包括适于以下方式施用者:口服施用,例如药水(水性或非水性溶液或悬浮液)、片剂(例如旨在经颊、舌下和全身吸收者)、大丸剂、散剂、颗粒剂、供施用于舌部的糊剂;肠胃外施用,例如通过皮下、肌肉内、静脉内或硬膜外注射,如例如无菌溶液或悬浮液,或持续释放配制物;表面施用,例如施用于皮肤、肺或口腔的乳霜、软膏剂或控制释放贴片或喷雾剂;阴道内或直肠内施用,例如子宫托、乳霜或泡沫剂;舌下施用;经眼施用;经皮施用;或经鼻、肺施用和施用至其它粘膜表面。
如本文所使用,“药学上可接受的赋形剂”是指在受试者体内无毒且无发炎性的任何无活性成分(例如能够将活性化合物悬浮或溶解的媒剂)。典型赋形剂包括例如:抗粘附剂、抗氧化剂、粘合剂、包衣剂、压缩助剂、崩解剂、染料(色素)、软化剂、乳化剂、填充剂(稀释剂)、成膜剂或包衣剂、调味剂、芳香剂、助流剂(流动增强剂)、润滑剂、防腐剂、印刷油墨、吸附剂、悬浮剂或分散剂、甜味剂或水合用水。赋形剂包括但不限于:任选被取代的丁基化羟基甲苯(BHT)、碳酸钙、磷酸氢钙、硬脂酸钙、交联羧甲基纤维素、交联聚乙烯基吡咯烷酮、柠檬酸、交联聚维酮、半胱氨酸、乙基纤维素、明胶、任选被取代的羟丙基纤维素、任选被取代的羟丙基甲基纤维素、乳糖、硬脂酸镁、麦芽糖醇、甘露糖醇、甲硫氨酸、甲基纤维素、对羟基苯甲酸甲酯、微晶纤维素、聚乙二醇、聚乙烯基吡咯烷酮、聚维酮、预胶化淀粉、对羟基苯甲酸丙酯、棕榈酸视黄酯、虫胶、二氧化硅、羧甲基纤维素钠、柠檬酸钠、羟基乙酸淀粉钠、山梨糖醇、淀粉(玉米淀粉)、硬脂酸、硬脂酸、蔗糖、滑石、二氧化钛、维生素A、维生素E、维生素C及木糖醇。本领域一般技术人员了解可用作赋形剂的多种试剂和材料。参见例如Ansel等人,Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug DeliverySystems.Philadelphia:Lippincott,Williams&Wilkins,2004;Gennaro等人,Remington:The Science and Practice of Pharmacy.Philadelphia:Lippincott,Williams&Wilkins,2000;以及Rowe,Handbook of Pharmaceutical Excipients.Chicago,Pharmaceutical Press,2005。在一些实施方案中,组合物包括至少两种不同的药学上可接受的赋形剂。
除非清楚地作相反陈述,否则本文所描述的化合物,无论是否清楚地陈述,均可以呈盐形式,例如呈药学上可接受的盐形式提供或使用。如本文所使用,术语“药学上可接受的盐”是指在合理医学判断的范围内,适于与人体组织接触使用而无过度毒性、刺激、过敏反应等,并且与合理效益/风险比相称的本文所描述的化合物的盐。此项技术中已知医药学上可接受之盐。例如,药学上可接受的盐描述于:Berge等人,J.Pharmaceutical Sciences66:1-19,1977;以及Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use,(P.H.Stahl和C.G.Wermuth编辑),Wiley-VCH,2008中。所述盐可在本文所描述的化合物的最终分离和纯化期间原位制备,或通过使游离碱性基团与适合有机酸反应来分离。
本发明化合物可具有可离子化基团,由此能够制备成药学上可接受的盐形式。这些盐可以是涉及无机酸或有机酸的酸加成盐,或在本发明化合物呈酸形式的情况下,所述盐可由无机碱或有机碱制备。在一些实施方案中,所述化合物被制备为药学上可接受的盐形式或以药学上可接受的盐形式使用,所述药学上可接受的盐形式是作为药学上可接受的酸或碱的加成产物制备。适合药学上可接受的酸和碱是本领域中众所周知的,如盐酸、硫酸、氢溴酸、乙酸、乳酸、柠檬酸或酒石酸,用于形成酸加成盐;以及氢氧化钾、氢氧化钠、氢氧化铵、咖啡因、各种胺等,用于形成碱盐。用于制备适当盐的方法是本领域中公认的。
代表性酸加成盐包括乙酸盐、己二酸盐、海藻酸盐、抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、硫酸氢盐、硼酸盐、丁酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、柠檬酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙烷磺酸盐、反丁烯二酸盐、葡庚糖酸盐、甘油磷酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、氢溴酸盐、盐酸盐、氢碘酸盐、2-任选被取代的羟基-乙烷磺酸盐、乳糖酸盐、乳酸盐、月桂酸盐、月桂基硫酸盐、苹果酸盐、顺丁烯二酸盐、丙二酸盐、甲烷磺酸盐、2-萘磺酸盐、烟酸盐、硝酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、双羟萘酸盐、果胶酸盐、过硫酸盐、3-苯基丙酸盐、磷酸盐、苦味酸盐、新戊酸盐、丙酸盐、硬脂酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、甲苯磺酸盐、十一烷酸盐、戊酸盐等。代表性碱金属或碱土金属盐包括钠盐、锂盐、钾盐、钙盐、镁盐等,以及无毒铵、季铵和胺阳离子,包括但不限于铵、四甲基铵、四乙基铵、甲胺、二甲胺、三甲胺、三乙胺、乙胺等。
如本文所使用,术语“受试者”是指动物王国的任何成员。在一些实施方案中,“受试者”是指处于任何发育阶段的人类。在一些实施方案中,“受试者”是指人类患者。在一些实施方案中,“受试者”是指非人类动物。在一些实施方案中,非人类动物是哺乳动物(例如啮齿动物、小鼠、大鼠、兔、猴、犬、猫、绵羊、牛、灵长类动物或猪)。在一些实施方案中,受试者包括但不限于哺乳动物、鸟类、爬行动物、两栖动物、鱼或虫类。在一些实施方案中,受试者可以是转基因动物、基因工程改造的动物或克隆。
如本文所使用,术语“剂型”是指供施用给受试者的化合物(例如本发明化合物)的物理离散单元。每个单元含有预定量的化合物。在一些实施方案中,所述量是适于根据剂量方案施用的单位剂量的量(或其整体部分),该量当施用给相关群体(即,根据治疗剂量方案)时确定与所希望或有益的结果相关。本领域一般技术人员应理解,施用给特定受试者的治疗组合物或化合物的总量是由一位或多位主治医师决定,并且可涉及施用多种剂型。
如本文所使用,术语“剂量方案”是指个别地施用给受试者的一组单位剂量(典型地超过一个单位剂量),所述单位剂量典型地间隔一定时间段。在一些实施方案中,给定治疗化合物(例如本发明化合物)具有推荐的剂量方案,该方案可涉及一次或多次剂量。在一些实施方案中,剂量方案包含多次剂量,所述剂量各自彼此间隔相同长度的时间段;在一些实施方案中,剂量方案包含多次剂量且至少两个不同时间段分开个别剂量。在一些实施方案中,剂量方案内的所有剂量均为相同单位剂量的量。在一些实施方案中,剂量方案内的不同剂量是不同量。在一些实施方案中,剂量方案包含呈第一剂量的量的第一次剂量,随后是呈不同于该第一剂量的量的第二剂量的量的一次或多次额外剂量。在一些实施方案中,剂量方案包含呈第一剂量的量的第一次剂量,随后是呈与该第一剂量的量相同的第二剂量的量的一次或多次额外剂量。在一些实施方案中,剂量方案当施用给相关群体(即,是治疗性剂量方案)时,与所希望或有益结果相关。
“治疗方案”是指在相关群体中的施用与期望或有益治疗结果相关的剂量方案。
术语“治疗”(“treatment/treat/treating”)在其最广泛意义上是指部分或完全缓解、改善、减轻、抑制特定疾病、病症或疾患的一种或多种症状、特征或成因;延迟其发作;降低其严重程度;或减少其发生的物质(例如本发明化合物)的任何施用。在一些实施方案中,此类治疗可施用给未展现相关疾病、病症或疾患的体征的受试者或仅展现该疾病、病症或疾患的早期体征的受试者。替代地或另外地,在一些实施方案中,治疗可施用给展现相关疾病、病症或疾患的一种或多种确定的体征的受试者。在一些实施方案中,治疗可用于被诊断为罹患相关疾病、病症或疾患的受试者。在一些实施方案中,治疗可用于已知具有一个或多个在统计上与发展相关疾病、病症或疾患的风险增加相关的易感因素的受试者。
术语“治疗有效量”意谓当根据治疗性剂量方案施用给罹患或易患疾病、病症或疾患的群体时足以治疗该疾病、病症或疾患的量。在一些实施方案中,治疗有效量是降低该疾病、病症或疾患的一种或多种症状的发生率或严重程度或延迟其发作的量。本领域技术人员应理解,术语“治疗有效量”实际上不需要在特定个体中实现所需的成功治疗。事实上,治疗有效量可以是当施用给需要该治疗的患者时在相当大量受试者中提供特定所希望的药理学反应的量。特别需要了解的是,特定受试者实际上可以是“治疗有效量”“难治”的。在一些实施方案中,提到的治疗有效量可指如在一个或多个特定组织(例如受疾病、病症或疾患影响的组织)或流体(例如血液、唾液、血清、汗液、泪液、尿液)中所测量的量。本领域一般技术人员应理解,在一些实施方案中,治疗有效量可配制为单一剂量或以单一剂量施用。在一些实施方案中,治疗有效量可配制为多次剂量,例如配制为剂量方案的一部分,或以多次剂量施用。
为用作受试者的治疗,本发明化合物或其药学上可接受的盐可配制为药物组合物或兽医学组合物形式。取决于待治疗的受试者、施用模式及所希望的治疗类型,例如预防、防治或疗法,所述化合物或其药学上可接受的盐是以与所述参数相符的方式配制。关于此类技术的概述可见于Remington:The Science and Practice of Pharmacy,第21版,Lippincott Williams&Wilkins,(2005);以及Encyclopedia of PharmaceuticalTechnology,J.Swarbrick和J.C.Boylan编辑,1988-1999,Marcel Dekker,New York,所述文献各自以引用的方式并入本文中。
组合物可分别根据常规混合、制粒或包覆方法制备,并且本发明的药物组合物以重量或体积计可含有约0.1%至约99%、约5%至约90%或约1%至约20%本发明化合物或其药学上可接受的盐。在一些实施方案中,本文所描述的化合物或其药学上可接受的盐的存在量以重量计可占组合物,如药物组合物总量总计1-95%。
所述组合物可以呈适于以下施用的剂型提供:关节内、口服、肠胃外(例如静脉内、肌肉内)、直肠、皮肤、皮下、表面、经皮、舌下、经鼻、阴道、囊内、尿道内、鞘内、硬膜外、耳或眼施用,或通过注射、吸入或与鼻、泌尿生殖器、生殖器或口腔粘膜直接接触。因此,药物组合物可呈例如片剂、胶囊、丸剂、散剂、颗粒剂、悬浮液、乳液、溶液、凝胶(包括水凝胶)、糊剂、软膏、乳霜、硬膏剂、药水、渗透递送装置、栓剂、灌肠剂、注射剂、植入物、喷雾剂、适于离子电渗递送的制剂或气雾剂形式。所述组合物可根据常规医药实践配制。
如本文所使用,术语“施用”是指将一种组合物(例如化合物或包括如本文所描述的化合物的制剂)施用给受试者或系统。向动物受试者(例如向人类)施用可通过任何适当的途径进行。例如,在一些实施方案中,施用可以是支气管(包括通过支气管滴注)、经颊、经肠、真皮内、动脉内、真皮间、胃内、髓内、肌肉内、鼻内、腹膜内、鞘内、静脉内、囊内、经粘膜、经鼻、口服、直肠、皮下、舌下、表面、气管(包括通过气管内滴注)、经皮、阴道或玻璃体施用。
配制物可以通过适于全身施用或者表面或局部施用的方式制备。全身配制物包括设计用于注射(例如肌肉内、静脉内或皮下注射)的配制物或可制备用于经皮、经粘膜或口服施用。配制物一般将包括稀释剂,并且在一些情况下,包括佐剂、缓冲剂、防腐剂等。化合物或其药学上可接受的盐也可以呈脂质体组合物或以微乳液形式施用。
为进行注射,可将配制物制备为常规形式,如液体溶液或悬浮液,或适于在注射之前于液体中制备为溶液或悬浮液的固体形式,或乳液形式。适合赋形剂包括例如水、生理盐水、右旋糖、甘油等。这些组合物也可含有一定量无毒辅助物质,如润湿剂或乳化剂、pH缓冲剂等,如乙酸钠、去水山梨糖醇单月桂酸酯等等。
也已设计出各种持续释放药物系统。参见例如美国专利第5,624,677号。
全身施用也可包括相对无创的方法,如使用栓剂、经皮贴片、经粘膜递送及鼻内施用。口服施用也适于本发明化合物或其药学上可接受的盐。本领域中应了解,适合形式包括糖浆、胶囊和片剂。
本文所描述的每种化合物或其药学上可接受的盐可以通过本领域中已知的多种方式配制。例如,组合疗法中的第一药剂和第二药剂可一起或分开配制。本文也描述组合疗法的其它模式。
个别或分开配制的药剂可一起包装为试剂盒形式。非限制性实例包括但不限于含有例如两粒丸剂、一粒丸剂和散剂、栓剂和在小瓶中的液体、两种表面乳霜等的试剂盒。所述试剂盒可包括有助于将单位剂量施用给受试者的任选使用的组件,如用于使粉末形式复原的小瓶、注射用注射器、定制IV递送系统、吸入器等。另外,单位剂量试剂盒可含有关于所述组合物的制备和施用的说明书。试剂盒可制造为用于一名受试者的一次性单位剂量、用于特定受试者的多次使用(在恒定剂量下,或其中个别化合物或其药学上可接受的盐的效力可随治疗进展而变化);或试剂盒可含有适于施用多名受试者的多次剂量(“整体包装”)。所述试剂盒组件可组装于纸盒、泡罩包装、瓶、管等中。
供口服使用的配制物包括含活性成分与无毒药学上可接受的赋形剂的混合物的片剂。这些赋形剂可以是例如惰性稀释剂或填充剂(例如蔗糖、山梨糖醇、糖、甘露糖醇、微晶纤维素、包括马铃薯淀粉在内的淀粉、碳酸钙、氯化钠、乳糖、磷酸钙、硫酸钙或磷酸钠);制粒剂及崩解剂(例如纤维素衍生物,包括微晶纤维素、包括马铃薯淀粉在内的淀粉、交联羧甲基纤维素钠、海藻酸盐或海藻酸);粘合剂(例如蔗糖、葡萄糖、山梨糖醇、阿拉伯胶、海藻酸、海藻酸钠、明胶、淀粉、预胶化淀粉、微晶纤维素、硅酸镁铝、羧甲基纤维素钠、甲基纤维素、任选被取代的羟丙基甲基纤维素、乙基纤维素、聚乙烯吡咯烷酮或聚乙二醇);以及润滑剂、助流剂及抗粘着剂(例如硬脂酸镁、硬脂酸锌、硬脂酸、二氧化硅、氢化植物油或滑石)。其它药学上可接受的赋形剂可以是着色剂、调味剂、塑化剂、保湿剂、缓冲剂等。
两种或更多种化合物可一起混合于片剂、胶囊或其它媒剂中,或可隔开。在一个实施例中,第一化合物是包含在片剂的内侧上,并且第二化合物是在外侧上,由此使该第二化合物的绝大部分在第一化合物释放之前释放。
供口服使用的配制物也可以呈咀嚼片形式提供,或呈硬明胶胶囊形式提供,其中活性成分与惰性固体稀释剂(例如马铃薯淀粉、乳糖、微晶纤维素、碳酸钙、磷酸钙或高岭土)混合;或呈软明胶胶囊形式提供,其中活性成分与水或油介质,例如花生油、液体石蜡或橄榄油混合。粉末、颗粒及细圆粒可使用以上关于片剂和胶囊所提到的成分,以常规方式,使用例如混合器、流体床装置或喷雾干燥设备制备。
溶出或扩散控制性释放可通过适当地包覆化合物的片剂、胶囊、细圆粒或颗粒状配制物,或通过将所述化合物或其药学上可接受的盐并入适当基质中来实现。控制释放包衣可包括一种或多种以上提到的包覆物质,例如虫胶、蜂蜡、糖蜡(glycowax)、蓖麻蜡、巴西棕榈蜡、硬脂醇、单硬脂酸甘油酯、二硬脂酸甘油酯、棕榈硬脂酸甘油酯、乙基纤维素、丙烯酸树脂、dl-聚乳酸、乙酸丁酸纤维素、聚氯乙烯、聚乙酸乙烯酯、乙烯基吡咯烷酮、聚乙烯、聚甲基丙烯酸酯、甲基丙烯酸甲酯、2-任选被取代的羟基甲基丙烯酸酯、甲基丙烯酸酯水凝胶、1,3丁二醇、乙二醇甲基丙烯酸酯或聚乙二醇。在控制释放基质配制物中,基质材料也可包括例如水合甲基纤维素、巴西棕榈蜡和硬脂醇、卡波普(carbopol)934、硅酮、三硬脂酸甘油酯、丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸甲酯、聚氯乙烯、聚乙烯或卤化氟碳化合物。
供口服施用的可并入本发明化合物或其药学上可接受的盐和组合物的液体形式包括水性溶液、适当调味的糖浆、水性或油性悬浮液以及用如棉籽油、芝麻油、椰子油或花生油之类食用油调味的乳液,以及酏剂和类似医药媒剂。
一般而言,当施用给人类时,任何本发明化合物或其药学上可接受的盐的口服剂量将取决于该化合物的性质,并且可容易地由本领域技术人员确定。剂量可以是例如每天约0.001mg至约2000mg、每天约1mg至约1000mg、每天约5mg至约500mg、每天约100mg至约1500mg、每天约500mg至约1500mg、每天约500mg至约2000mg或其中衍生的任何范围。
编号的实施方案
[1]一种具有式I的结构的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620009441
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是不存在;-CH(R9)-、>C=CR9R9’或>CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是H、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;或
R9和R9’与其所连接的原子组合在一起形成3至6元环烷基或3至6元杂环烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R21是H或C1-C3烷基。
[2]如段落[1]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中G是任选被取代的C1-C4亚杂烷基。
[3]如段落[1]或[2]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Ic的结构:
Figure BDA0004194083620009481
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜;
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5和Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
[4]如段落[1]至[3]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X2是NH。
[5]如段落[1]至[4]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X3是CH。
[6]如段落[1]至[5]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R11是氢。
[7]如段落[1]至[5]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R11是C1-C3烷基。
[8]如段落[7]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R11是甲基。
[9]如段落[1]至[6]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Id的结构:
Figure BDA0004194083620009511
Figure BDA0004194083620009521
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5和Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基。
[10]如段落[1]至[9]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X1是任选被取代的C1-C2亚烷基。
[11]如段落[10]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X1是亚甲基。
[12]如段落[1]至[11]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5是氢。
[13]如段落[1]至[11]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5是任选被卤素取代的C1-C4烷基。
[14]如段落[13]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5是甲基。
[15]如段落[1]至[14]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y4是C。
[16]如段落[1]至[15]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R4是氢。
[17]如段落[1]至[16]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y5是CH。
[18]如段落[1]至[17]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y6是CH。
[19]如段落[1]至[18]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y1是C。
[20]如段落[1]至[19]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y2是C。
[21]如段落[1]至[20]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y3是N。
[22]如段落[1]至[21]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3不存在。
[23]如段落[1]至[22]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y7是C。
[24]如段落[1]至[6]或[9]至[23]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Ie的结构:
Figure BDA0004194083620009551
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基。
[25]如段落[3]至[24]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R6是氢。
[26]如段落[1]至[25]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2是氢、氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至6元杂环烷基。
[27]如段落[26]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2是任选被取代的C1-C6烷基。
[28]如段落[27]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2是乙基。
[29]如段落[1]至[28]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R7是任选被取代的C1-C3烷基。
[30]如段落29所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R7是C1-C3烷基。
[31]如段落[1]至30中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R8是任选被取代的C1-C3烷基。
[32]如段落[31]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R8是C1-C3烷基。
[33]如段落[1]至[32]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式If的结构:
Figure BDA0004194083620009581
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
[34]如段落[1]至[33]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1是任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至6元环烯基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[35]如段落[34]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1是任选被取代的6元芳基、任选被取代的6元环烯基或任选被取代的6元杂芳基。
[36]如段落[35]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1
Figure BDA0004194083620009601
[37]如段落[36]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1
Figure BDA0004194083620009602
[38]如段落[1]至[37]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Ig的结构:
Figure BDA0004194083620009603
Figure BDA0004194083620009611
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜;
R2是C1-C6烷基、C1-C6氟烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基
Xe和Xf独立地为N或CH;并且
R12是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
[39]如段落[38]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Xe是N并且Xf是CH。
[40]如段落[38]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Xe是CH并且Xf是N。
[41]如段落[38]至[40]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R12是任选被取代的C1-C6杂烷基。
[42]如段落[38]至[41]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R12
Figure BDA0004194083620009621
Figure BDA0004194083620009622
[43]如段落[1]或[2]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式VI的结构:
Figure BDA0004194083620009623
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子、任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是不存在、-CH(R9)-、>C=CR9R9’或>CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基、任选被取代的C1-C4亚烯基、任选被取代的C1-C4亚杂烷基、-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-、-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-、任选被取代的C1-C4亚杂烷基或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮、卤代乙缩醛或炔基砜;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是H、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;或
R9和R9’与其所连接的原子组合在一起形成3至6元环烷基或3至6元杂环烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;
R21是氢或C1-C3烷基(例如甲基);并且
Xe和Xf独立地为N或CH。
[44]如段落[43]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式VIa的结构:
Figure BDA0004194083620009661
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
R2是C1-C6烷基、C1-C6氟烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
Xe和Xf独立地为N或CH;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R21是氢或C1-C3烷基。
[45]如段落[43]或[44]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式VIb的结构:
Figure BDA0004194083620009671
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
L不存在或为连接体;并且
W是交联基团,所述基团包含乙烯基酮、乙烯基砜、炔酮或炔基砜。
[46]如段落[1]至[45]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是任选被取代的6元亚芳基。
[47]如段落[46]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A具有以下结构:
Figure BDA0004194083620009681
/>
其中R13是氢、卤代、羟基、氨基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基;并且
R13a是氢或卤代。
[48]如段落[47]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R13和R13a各自是氢。
[49]如段落[47]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R13是羟基、甲基、氟或二氟甲基。
[50]如段落[1]至[45]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是任选被取代的5至6元亚杂芳基。
[51]如段落[50]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是:
Figure BDA0004194083620009691
Figure BDA0004194083620009692
[52]如段落[1]至[45]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是任选被取代的C1-C4亚杂烷基。
[53]如段落[52]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是:
Figure BDA0004194083620009693
[54]如段落[1]至[45]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是任选被取代的3至6元亚杂环烷基。
[55]如段落[54]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是:
Figure BDA0004194083620009694
Figure BDA0004194083620009701
[56]如段落[55]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是
Figure BDA0004194083620009702
[57]如段落[1]至[56]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中B是-CHR9-。
[58]如段落[57]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9是F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
[59]如段落[58]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9是:
Figure BDA0004194083620009703
Figure BDA0004194083620009704
[60]如段落[59]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9是:
Figure BDA0004194083620009705
[61]如段落[1]至[56]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中B是任选被取代的6元亚芳基。
[62]如段落[61]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中B是6元亚芳基。
[63]如段落[61]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中B是:
Figure BDA0004194083620009711
[64]如段落[1]至[63]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R7是甲基。
[65]如段落[1]至[64]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R8是甲基。
[66]如段落[1]至[65]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中连接体是式II的结构:
A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-(D1)-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2
式II
其中A1是在所述连接体与B之间的键;A2是在W与所述连接体之间的键;B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S和NRN;RN是氢、任选被取代的C1–C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的C1-C7杂烷基;C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基;f、g、h、i、j及k各自独立地为0或1;并且D1是任选被取代的C1-C10亚烷基、任选被取代的C2-C10亚烯基、任选被取代的C2-C10亚炔基、任选被取代的3至14元亚杂环烷基、任选被取代的5至10元亚杂芳基、任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的6至10元亚芳基、任选被取代的C2-C10亚聚乙二醇或任选被取代的C1-C10亚杂烷基,或将A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-连接至-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2的化学键。
[67]如段落[1]至[66]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体是无环的。
[68]如段落[67]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有式IIa的结构:
Figure BDA0004194083620009721
其中Xa不存在或为N;
R14是不存在、氢或任选被取代的C1-C6烷基;并且
L2是不存在、-SO2-、任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C1-C4亚杂烷基,
其中Xa、R14或L2中的至少一个存在。
[69]如段落[68]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620009722
[70]如段落[1]至[66]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体是或包含环状部分。
[71]如段落[70]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有式IIb的结构:
Figure BDA0004194083620009731
其中o是0或1;
R15是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的3至8元亚环烷基或任选被取代的3至8元亚杂环烷基;
X4是不存在、任选被取代的C1-C4亚烷基、O、NCH3或任选被取代的C1-C4亚杂烷基;
Cy是任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的3至8元亚杂环烷基、任选被取代的6-10元亚芳基或任选被取代的5至10元亚杂芳基;并且
L3是不存在、-SO2-、任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C1-C4亚杂烷基。
[72]如段落[71]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620009732
其中R15是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的3至8元亚环烷基或任选被取代的3至8元亚杂环烷基;并且
R15a、R15b、R15c、R15d、R15e、R15f和R15g独立地为氢、卤代、羟基、氰基、氨基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6烷氧基,或R15b和R15d与其所连接的碳组合在一起形成任选被取代的3至8元亚环烷基或任选被取代的3至8元亚杂环烷基。
[73]如段落[72]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620009741
Figure BDA0004194083620009751
[74]如段落[71]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620009752
/>
Figure BDA0004194083620009761
/>
Figure BDA0004194083620009771
/>
Figure BDA0004194083620009781
[75]如段落[1]至[74]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是包含乙烯基酮的交联基团。
[76].如段落[75]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W具有式IIIa的结构:
Figure BDA0004194083620009782
其中R16a、R16b和R16c独立地为氢、-CN、卤素或-C1-C3烷基,该-C1-C3烷基任选被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:-OH、-O-C1-C3烷基、-NH2、-NH(C1-C3烷基)、-N(C1-C3烷基)2或4至7元饱和杂环烷基。
[77]如段落[76]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是:
Figure BDA0004194083620009791
[78]如段落[1]至[74]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是包含炔酮的交联基团。
[79]如段落[78]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W具有式IIIb的结构:
Figure BDA0004194083620009792
其中R17是氢;-C1-C3烷基,所述-C1-C3烷基任选被一个或多个独立地选自以下的取代基取代的-OH、-O-C1-C3烷基、-NH2、-NH(C1-C3烷基)、-N(C1-C3烷基)2或4至7元饱和环烷基;或4至7元饱和杂环烷基。
[80]如段落[79]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是:
Figure BDA0004194083620009801
/>
Figure BDA0004194083620009811
[81]如段落[1]至[74]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是交联基团,所述基团包含乙烯基砜。
[82]如段落[81]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W具有式IIIc的结构:
Figure BDA0004194083620009812
其中R18a、R18b和R18c独立地为氢、-CN或-C1-C3烷基,所述-C1-C3烷基任选被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:-OH、-O-C1-C3烷基、-NH2、-NH(C1-C3烷基)、-N(C1-C3烷基)2或4至7元饱和杂环烷基。
[83]如段落[82]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是:
Figure BDA0004194083620009821
[84]如段落[1]至[74]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是包含炔基砜的交联基团。
[85]如段落[84]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W具有式IIId的结构:
Figure BDA0004194083620009822
其中R19是氢;-C1-C3烷基,所述-C1-C3烷基任选被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:-OH、-O-C1-C3烷基、-NH2、-NH(C1-C3烷基)、-N(C1-C3烷基)2或4至7元饱和杂环烷基;或4至7元饱和杂环烷基。
[86]如段落[85]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是:
Figure BDA0004194083620009823
[87]如段落[1]至[74]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W具有式IIIe的结构:
Figure BDA0004194083620009824
其中Xe是卤素;并且
R20是氢;-C1-C3烷基,所述-C1-C3烷基任选被一个或多个独立地选自以下的取代基取代:-OH、-O-C1-C3烷基、-NH2、-NH(C1-C3烷基)、-N(C1-C3烷基)2或4至7元饱和杂环烷基。
[88]一种选自表1或表2的化合物或其药学上可接受的盐。
[89]一种药物组合物,所述药物组合物包含如段落[1]至[88]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的赋形剂。
[90]一种缀合物或其盐,所述缀合物包含式IV的结构:
M-L-P
式IV
其中L是连接体;
P是单价有机部分;并且
M具有式V的结构:
Figure BDA0004194083620009831
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是不存在、-CH(R9)-、>C=CR9R9’或>CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH)、C=N(O-C1-C3烷基)、C=O、C=S、C=NH、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是H、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;或
R9和R9’与其所连接的原子组合在一起形成3至6元环烷基或3至6元杂环烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R21是H或C1-C3烷基。
[91]如段落[90]所述的缀合物或其盐,其中M具有式Vd的结构:
Figure BDA0004194083620009871
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
R2是C1-C6烷基、C1-C6氟烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
Xe和Xf独立地为N或CH;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R21是氢或C1-C3烷基。
[92]如段落[91]所述的缀合物或其盐,其中M具有式Ve的结构:
Figure BDA0004194083620009881
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
[93]如段落[90]至[92]中任一个所述的缀合物或其盐,其中所述连接体具有式II的结构:
A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-(D1)-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2
式II
其中A1是在所述连接体与B之间的键;A2是在W与所述连接体之间的键;B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S和NRN;RN是氢、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的C1-C7杂烷基;C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基;f、g、h、i、j及k各自独立地为0或1;并且D1是任选被取代的C1-C10亚烷基、任选被取代的C2-C10亚烯基、任选被取代的C2-C10亚炔基、任选被取代的3至14元亚杂环烷基、任选被取代的5至10元亚杂芳基、任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的6至10元亚芳基、任选被取代的C2-C10亚聚乙二醇或任选被取代的C1-C10亚杂烷基,或将A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-连接至-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2的化学键。
[94]如段落[90]至[93]中任一个所述的缀合物或其盐,其中所述单价有机部分是蛋白质。
[95]如段落[94]所述的缀合物或其盐,其中所述蛋白质是Ras蛋白。
[96]如段落[95]所述的缀合物或其盐,其中所述Ras蛋白是K-Ras G12C、K-RasG13C、H-Ras G12C、H-Ras G13C、N-Ras G12C或N-Ras G13C。
[97]如段落[93]至[96]中任一个所述的缀合物或其盐,其中所述连接体通过连至所述单价有机部分的氨基酸残基的硫氢基的键结合至所述单价有机部分。
实施例
本公开将通过以下实施例和合成实施例进一步说明,这些实施例和合成实施例不应解释为将本公开的范围或精神限制于本文所描述的特定程序。应了解,提供的实施例将说明某些实施方案并打算借此对本公开的范围造成限制。还应了解,在不背离本公开的精神或所附权利要求书的范围的情况下,可采用本领域技术人员所能想到的各种其它实施方案、其修改和等效内容。
化学合成
以下实施例和本文别处使用的定义如下:
Figure BDA0004194083620009901
仪器
质谱数据收集是利用带有QDa检测器或SQ检测器2的Shimadzu LCMS-2020、Agilent 1260LC-6120/6125MSD、Shimadzu LCMS-2010EV或Waters Acquity UPLC进行的。将样品以液相注入至C-18反相柱上。化合物是使用乙腈梯度自柱洗脱并进给至质量分析仪中。初始数据分析是用Agilent ChemStation、Shimadzu LabSolutions或Waters MassLynx进行的。NMR数据是用Bruker AVANCE III HD 400MHz、Bruker Ascend 500MHz仪器或Varian400MHz仪器收集,并且原始数据是利用TopSpin或Mestrelab Mnova进行分析。
合成中间体
中间体1.合成3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇
Figure BDA0004194083620009911
步骤1.在N2气氛下,在0℃下向3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙酰氯(65g,137mmol,粗品)于DCM(120mL)中的混合物中缓慢添加1M SnCl4的DCM溶液(137mL,137mmol)。在0℃下,将混合物搅拌30分钟,接着逐滴添加5-溴-1H-吲哚(26.8g,137mmol)于DCM(40mL)中的溶液。在0℃下,将混合物搅拌45分钟,接着用EtOAc(300mL)稀释,用盐水(100mL×4)洗涤,经Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(55g,75%产率)。LCMS(ESI):C29H32BrNO2SiNa的m/z[M+Na]计算值556.1;实验值556.3。
步骤2.在N2气氛下,在0℃下向1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(50g,93.6mmol)于THF(100mL)中的混合物中添加LiBH4(6.1g,281mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌20小时,接着添加MeOH(10mL)和EtOAc(100mL)并将混合物用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液。将残余物用DCM(50mL)稀释,冷却至10℃并添加二氢吡啶(9.5g,37.4mmol)和TsOH.H2O(890mg,4.7mmol)。在10℃下,将混合物搅拌2小时,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(41g,84%产率)。LCMS(ESI):C29H34BrNOSi的m/z[M+H]计算值519.2;实验值520.1;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.96(s,1H),7.75-7.68(m,5H),7.46-7.35(m,6H),7.23-7.19(m,2H),6.87(d,J=2.1Hz,1H),3.40(s,2H),2.72(s,2H),1.14(s,9H),0.89(s,6H)。
步骤3.在室温下,向1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(1.5g,2.9mmol)和I2(731mg,2.9mmol)于THF(15mL)中的混合物中添加AgOTf(888mg,3.5mmol)。在室温下,将混合物搅拌2小时,接着用EtOAc(200mL)稀释并用饱和Na2S2O3(100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚(900mg,72%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.70(s,1H),7.68(d,J=1.3Hz,1H),7.64-7.62(m,4H),7.46-7.43(m,6H),7.24-7.22(d,1H),7.14-7.12(dd,J=8.6,1.6Hz,1H),3.48(s,2H),2.63(s,2H),1.08(s,9H),0.88(s,6H)。
步骤4.在Ar气氛下,在0℃下向HCOOH(66.3g,1.44mol)于TEA(728g,7.2mol)中的搅拌的混合物中逐份添加(4S,5S)-2-氯-2-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-4,5-二苯基-1,3-二氮杂-2-钌环戊烷异丙基甲苯(3.9g,6.0mmol)。将混合物加热至40℃并搅拌15分钟,接着冷却至室温并分数份添加1-(3-溴吡啶-2-基)乙酮(120g,600mmol)。将混合物加热至40℃并再搅拌2小时,接着减压浓缩溶剂。将盐水(2L)添加至残余物中,将混合物用EtOAc(4×700mL)萃取,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(1S)-1-(3-溴吡啶-2-基)乙醇(100g,74%产率)。LCMS(ESI):C7H8BrNO的m/z[M+H]计算值201.1;实验值201.9。
步骤5.在0℃下,向(1S)-1-(3-溴吡啶-2-基)乙醇(100g,495mmol)于DMF(1L)中的搅拌的混合物中分数份添加60% NaH于油中的分散液(14.25g,594mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时。在0℃下,逐滴添加MeI(140.5g,990mmol)并使混合物升温至室温,并搅拌2小时。将混合物冷却至0℃并添加饱和NH4Cl(5L)。将混合物用EtOAc(3×1.5L)萃取,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(90g,75%产率)。LCMS(ESI):C8H10BrNO的m/z[M+H]计算值215.0;实验值215.9。
步骤6.在Ar气氛下,在室温下向3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(90g,417mmol)和Pd(dppf)Cl2(30.5g,41.7mmol)于甲苯(900mL)中的搅拌的混合物中分数份添加双(频哪醇合)二硼(127g,500mmol)和KOAc(81.8g,833mmol)。将混合物加热至100℃并搅拌3小时。减压浓缩滤液并将残余物通过Al2O3柱色谱法纯化,得到呈半固体状的2-[(1S)-1-甲氧基乙基]-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶(100g,63%产率)。LCMS(ESI):C14H22BNO3的m/z[M+H]计算值263.2;实验值264.1。
步骤7.在Ar气氛下,在室温下向5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚(140g,217mmol)和2-[(1S)-1-甲氧基乙基]-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶(100g,380mmol)于1,4-二噁烷(1.4L)中的搅拌的混合物中分数份添加K2CO3(74.8g,541mmol)、Pd(dppf)Cl2(15.9g,21.7mmol)和H2O(280mL)。将混合物加热至85℃并搅拌4小时,接着冷却,添加H2O(5L),并用EtOAc(3×2L)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚(71g,45%产率)。LCMS(ESI):C37H43BrN2O2Si的m/z[M+H]计算值654.2;实验值655.1。
步骤8.在N2气氛下,在0℃下向5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚(71g,108mmol)于DMF(0.8L)中的搅拌的混合物中分数份添加Cs2CO3(70.6g,217mmol)和EtI(33.8g,217mmol)。将混合物升温至室温,并搅拌16小时,接着添加H2O(4L)并用EtOAc(3×1.5L)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚(66g,80%产率)。LCMS(ESI):C39H47BrN2O2Si的m/z[M+H]计算值682.3;实验值683.3。
步骤9.在N2气氛下,在室温下向TBAF(172.6g,660mmol)于THF(660mL)中的搅拌的混合物中分数份添加5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚(66g,97mmol)。将混合物加热至50℃并搅拌16小时,冷却,用H2O(5L)稀释,并用EtOAc(3×1.5L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。过滤后,减压浓缩滤液。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(30g,62%产率)。LCMS(ESI):C23H29BrN2O2的m/z[M+H]计算值444.1;实验值445.1。
中间体1.由费舍尔吲哚途径进行的替代合成.
Figure BDA0004194083620009951
步骤1.在N2气氛下,在-10℃下经15分钟向i-PrMgCl的混合物(2M于THF中,0.5L)中逐滴添加2.5M n-BuLi的己烷溶液(333mL,833mmol)。在-10℃下,将混合物搅拌30分钟,接着在-10℃下,经30分钟逐滴添加于THF(0.5L)中的3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(180g,833mmol)。将所得混合物升温至-5℃并搅拌1小时,接着在-5℃下,经30分钟逐滴添加于THF(1.2L)中的3,3-二甲基噁烷-2,6-二酮(118g,833mmol)。将混合物升温至0℃并搅拌1.5小时,接着通过在0℃下添加预先冷却的4M HCl的1,4-二噁烷溶液(0.6L)将pH值调至约5来淬灭。将混合物用冰水(3L)稀释并用EtOAc(3×2.5L)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的5-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-2,2-二甲基-5-氧代戊酸(87g,34%产率)。LCMS(ESI):C15H21NO4的m/z[M+H]计算值279.2;实验值280.1。
步骤2.在N2气氛下,在室温下向5-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-2,2-二甲基-5-氧代戊酸(78g,279mmol)于EtOH(0.78L)中的混合物中分数份添加(4-溴苯基)肼盐酸盐(68.7g,307mmol)。将混合物加热至85℃并搅拌2小时,冷却至室温,接着逐滴添加4MHCl的1,4-二噁烷溶液(69.8mL,279mmol)。将混合物加热至85℃并再搅拌3小时,接着减压浓缩,并将残余物溶解于TFA(0.78L)中。将混合物加热至60℃并搅拌1.5小时,减压浓缩,并用饱和NaHCO3将残余物调至约pH 5,接着用EtOAc(3×1.5L)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到3-(5-溴-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸和(S)-3-(5-溴-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(78g,粗品)。LCMS(ESI):C21H23BrN2O3的m/z[M+H]计算值430.1和C23H27BrN2O3的计算值458.1;实验值431.1和459.1。
步骤3.在N2气氛下,在0℃下向3-(5-溴-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸和(S)-3-(5-溴-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(198g,459mmol)于DMF(1.8L)中的混合物中分数份添加Cs2CO3(449g,1.38mol)。接着,在0℃下逐滴添加于DMF(200mL)中的EtI(215g,1.38mmol)。将混合物升温至室温并搅拌4小时,接着用盐水(5L)稀释并用EtOAc(3×2.5L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(160g,57%产率)。LCMS(ESI):C25H31BrN2O3的m/z[M+H]计算值486.2;实验值487.2。
步骤4.在N2气氛下,在0℃下向3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(160g,328mmol)于THF(1.6L)中的混合物中添加LiBH4(28.6g,1.3mol)。将混合物加热至60℃,保持16小时,冷却,并用预先冷却的(0℃)NH4Cl水溶液(5L)淬灭。将混合物用EtOAc(3×2L)萃取并将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体形式的3-(5-溴-1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇的两种阻转异构体(呈单一阻转异构体形式)(60g,38%产率)和(40g,26%产率)。LCMS(ESI):C23H29BrN2O2的m/z[M+H]计算值444.1;实验值445.2。
中间体2和中间体4.合成(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸酯
Figure BDA0004194083620009971
步骤1.向(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-羟基苯基)丙酸甲酯(10.0g,33.9mmol)于DCM(100mL)中的混合物中添加咪唑(4.6g,67.8mmol)和TIPSCl(7.8g,40.7mmol)。在室温下,将混合物搅拌过夜,接着用DCM(200mL)稀释并用H2O(150mL×3)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-(三异丙基硅烷基氧基)苯基)-丙酸甲酯(15g,98%产率)。LCMS(ESI):C24H41NO5SiNa的m/z[M+Na]计算值474.3;实验值474.2。
步骤2.用Ar吹扫(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-(三异丙基硅烷基氧基)苯基)-丙酸甲酯(7.5g,16.6mmol)、PinB2(6.3g,24.9mmol)、[Ir(OMe)(COD)]2(1.1g,1.7mmol)和4-叔丁基-2-(4-叔丁基-2-吡啶基)吡啶(1.3g,5.0mmol)的混合物(×3),接着添加THF(75mL)并将混合物放置于Ar气氛下,并密封。将混合物加热至80℃并搅拌16小时,减压浓缩,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-(三异丙基硅烷基氧基)苯基)-丙酸甲酯(7.5g,78%产率)。LCMS(ESI):C30H52BNO7SiNa的m/z[M+Na]计算值600.4;实验值600.4;1H NMR(300MHz,CD3OD)δ7.18(s,1H),7.11(s,1H),6.85(s,1H),4.34(m,1H),3.68(s,3H),3.08(m,1H),2.86(m,1H),1.41-1.20(m,26H),1.20-1.01(m,22H),0.98-0.79(m,4H)。
步骤3.在0℃下,向(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酸三异丙基硅烷酯(4.95g,6.9mmol)于MeOH(53mL)中的混合物中添加于H2O(35mL)中的LiOH(840mg,34.4mmol),在0℃下,将混合物搅拌2小时,接着用1M HCl酸化至约pH 5并用EtOAc(250mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL×3)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液,得到(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酸(3.7g,95%产率),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C29H50BNO7SiNH4的m/z[M+NH4]计算值581.4;实验值581.4。
步骤4.在0℃下,向(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(6.48g,45.0mmol)于DCM(200mL)中的混合物中添加于DCM(50mL)中的NMM(41.0g,405mmol)、(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酸(24g,42.6mmol),接着添加HOBt(1.21g,9.0mmol)和EDCI盐酸盐(12.9g,67.6mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用DCM(200mL)稀释并用H2O(3×150mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO干燥,过滤,减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(22g,71%产率)。LCMS(ESI):C35H60BN3O8Si的m/z[M+H]计算值689.4;实验值690.5。
中间体3.合成N-((S)-1-丙烯酰基吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620009991
步骤1.在室温下,向(S)-1-(叔丁氧基羰基)吡咯烷-3-甲酸(2.2g,10.2mmol)于DMF(10mL)中的混合物中添加HATU(7.8g,20.4mmol)和DIPEA(5mL)。在室温下搅拌10分钟后,添加于DMF(10mL)中的甲基-L-缬氨酸叔丁酯(3.8g,20.4mmol)。在室温下,将混合物搅拌3小时,接着用DCM(40mL)和H2O(30mL)稀释。将水层和有机层分离并将有机层用H2O(3×30mL)、盐水(30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-3-(((S)-1-(叔丁氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(3.2g,82%产率)。LCMS(ESI):C20H36N2O5Na的m/z[M+Na]计算值407.3;实验值407.2。
步骤2.在室温下,将(S)-3-(((S)-1-(叔丁氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(3.2g,8.4mmol)于DCM(13mL)和TFA(1.05g,9.2mmol)中的混合物搅拌5小时。将混合物减压浓缩,得到呈油状的(S)-3-甲基-2-((S)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺基)丁酸叔丁酯(2.0g,84%产率)。LCMS(ESI):C15H28N2O3的m/z[M+H]计算值284.2;实验值285.2。
步骤3.在0℃下,向(S)-3-甲基-2-((S)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺基)丁酸叔丁酯(600mg,2.1mmol)于DCM(6mL)中的混合物中添加TEA(342mg,3.36mmol)。在0℃下搅拌10分钟后,添加于DCM(10mL)中的丙烯酰氯(284mg,3.2mmol)。将混合物升温至室温并搅拌24小时,接着用DCM(30mL)和H2O(30mL)稀释。将水层和有机层分离并将有机层用H2O(3×30mL)、盐水(30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的N-((S)-1-丙烯酰基吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(500mg,70%产率)。
步骤4.在15℃下,向N-((S)-1-丙烯酰基吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(100mg,0.29mmol)于DCM(3.0mL)中的混合物中添加TFA(0.3mL)。将混合物升温至室温并搅拌5小时,接着将混合物减压浓缩,得到呈固体状的N-((S)-1-丙烯酰基吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(150mg)。将粗产物不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C14H22N2O4的m/z[M+H]计算值282.2;实验值283.2。
中间体5.合成((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯。
Figure BDA0004194083620010011
步骤1.在Ar气氛下,在室温下向3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(30g,67mmol)和(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(55.8g,80.8mmol)于1,4-二噁烷(750mL)中的搅拌的混合物中分数份添加Na2CO3(17.9g,168.4mmol)、Pd(DtBPF)Cl2(4.39g,6.7mmol)和H2O(150.00mL)。将混合物加热至85℃并搅拌3小时,冷却,用H2O(2L)稀释,并用EtOAc(3×1L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×500mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(50g,72%产率)。LCMS(ESI):C52H77N5O8Si的m/z[M+H]计算值927.6;实验值928.8。
步骤2.在室温下,向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(50g,54mmol)于DCE(500mL)中的搅拌的混合物中一次性添加三甲基氢氧化锡(48.7g,269mmol)。将混合物加热至65℃并搅拌16小时,接着过滤并用DCM(3×150mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(70g,粗品),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C51H75N5O8Si的m/z[M+H]计算值913.5;实验值914.6。
步骤3.在N2气氛下,在0℃下向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(70g)于DCM(5L)中的搅拌的混合物中分数份添加DIPEA(297g,2.3mol)、HOBT(51.7g,383mmol)和EDCI(411g,2.1mol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用DCM(1L)稀释,用盐水(3×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(36g,42%产率)。LCMS(ESI):C51H73N5O7Si的m/z[M+H]计算值895.5;实验值896.5。
中间体6.合成N-[(8S,14S)-21-碘-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯。
Figure BDA0004194083620010031
步骤1.本反应是按下文所示的规模,分5批并行进行。
在室温下,向2L圆底烧瓶中分别添加于THF(1.15L)中的5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚(100g,192mmol)和TBAF(301.4g,1.15mol)。将所得混合物加热至50℃并搅拌16小时,接着将混合物减压浓缩。将合并的残余物用H2O(5L)稀释并用EtOAc(3×2L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(310g,粗品)。LCMS(ESI):C13H16BrNO的m/z[M+H]计算值281.0和283.0;实验值282.1和284.1。
步骤2.本反应是按下文所示的规模,分2批并行进行。
在N2气氛下,在0℃下向3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(135g,478mmol)和TEA(145.2g,1.44mol)于DCM(1.3L)中的搅拌的混合物中分数份添加Ac2O(73.3g,718mmol)和DMAP(4.68g,38.3mmol)。在0℃下,将所得混合物搅拌10分钟,接着用H2O(3×2L)洗涤。将来自每一实验的有机层合并,并用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过柱色谱法纯化,得到呈固体状的乙酸3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(304g,88%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.16-11.11(m,1H),7.69(d,J=2.0Hz,1H),7.32(d,J=8.6Hz,1H),7.19-7.12(m,2H),3.69(s,2H),2.64(s,2H),2.09(s,3H),0.90(s,6H)。
步骤3.本反应是按下文所示的规模,分四批并行进行。
在Ar气氛下,在室温下向2L圆底烧瓶中添加(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸甲酯(125g,216mmol)、1,4-二噁烷(1L)、H2O(200mL)、乙酸3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(73.7g,227mmol)、K2CO3(59.8g,433mmol)和Pd(DtBPF)Cl2(7.05g,10.8mmol)。将所得混合物加热至65℃并搅拌2小时,接着用H2O(10L)稀释并用EtOAc(3×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×2L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(500g,74%产率)。LCMS(ESI):C39H58N2O7SiNa的m/z[M+Na]计算值717.4;实验值717.3。
步骤4.本反应是按下文所示的规模,分三批并行进行。
在氮气氛下,在0℃下向(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(150g,216mmol)和NaHCO3(21.76g,259mmol)于THF(1.5L)中的搅拌的混合物中逐滴添加于THF中的AgOTf(66.5g,259mmol)。在0℃下,经1小时逐滴添加于THF中的I2(49.3g,194mmol),并在0℃下,将所得混合物再搅拌10分钟。将合并的实验用Na2S2O3水溶液(5L)稀释并用EtOAc(3×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(420g,71%产率)。LCMS(ESI):C39H57IN2O7SiNa的m/z[M+Na]计算值843.3;实验值842.9。
步骤5.本反应是按下文所示的规模,分三批并行进行。
在0℃下,向2L圆底烧瓶中添加(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(140g,171mmol)、MeOH(1.4L)和K3PO4(108.6g,512mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着将合并的实验用H2O(9L)稀释并用EtOAc(3×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×2L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸甲酯(438g,粗品)。LCMS(ESI):C37H55IN2O6SiNa的m/z[M+Na]计算值801.3;实验值801.6。
步骤6.本反应是按下文所示的规模,分三批并行进行。
在0℃下,向(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸甲酯(146g,188mmol)于THF(1.46L)中的搅拌的混合物中逐滴添加于H2O(937mL)中的LiOH(22.45g,937mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌1.5小时[注意:LCMS显示15%脱TIPS产物]。用1MHCl(1M)将混合物酸化至pH 5并将合并的实验用EtOAc(3×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×2L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸(402g,粗品)。LCMS(ESI):C36H53IN2O6SiNa的m/z[M+Na]计算值787.3;实验值787.6。
步骤7.在0℃下,向(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸(340g,445mmol)和(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(96.1g,667mmol)于DCM(3.5L)中的搅拌的混合物中逐份添加NMM(225g,2.2mol)、EDCI(170g,889mmol)和HOBT(12.0g,88.9mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用H2O(3×2.5L)、盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过柱色谱法纯化,得到呈油状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(310g,62%产率)。LCMS(ESI):C42H63IN4O7Si的m/z[M+H]计算值890.4;实验值890.8。
步骤8.本反应是按下文所示的规模,分三批并行进行。
在N2气氛下,在0℃下向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(85.0g,95.4mmol)于THF(850mL)中的搅拌的混合物中分别逐滴添加于H2O(410mL)中的LiOH(6.85g,286mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1.5小时[注意:LCMS显示15%脱TIPS产物],接着将其用1M HCl酸化至pH 5并将合并的实验用EtOAc(3×2L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(240g,粗品)。LCMS(ESI):C41H61IN4O7Si的m/z[M+H]计算值876.3;实验值877.6。
步骤9.
本反应是按下文所示的规模,分2批并行进行。
在N2气氛下,在0℃下向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(120g,137mmol)于DCM(6L)中的搅拌的混合物中分数份添加DIPEA(265g,2.05mol)、EDCI(394g,2.05mol)和HOBT(37g,274mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜,接着将合并的实验用H2O(3×6L)、盐水(2×6L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。过滤后,减压浓缩滤液。减压浓缩滤液并将残余物通过柱色谱法纯化,得到呈固体状的N-[(8S,14S)-21-碘-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(140g,50%产率)。LCMS(ESI):C41H59IN4O6Si的m/z[M+H]计算值858.9;实验值858.3。
中间体7.合成(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-2-基)丙酸甲酯
Figure BDA0004194083620010071
步骤1.将锌粉(28g,428mmol)添加至用N2吹扫的1L三颈圆底烧瓶中,并在真空下用加热枪加热10分钟。将混合物冷却至室温,并经10分钟逐滴添加1,2-二溴乙烷(1.85mL,21.5mmol)于DMF(90mL)中的溶液。将混合物在90℃下加热30分钟并且再冷却至室温。添加TMSCl(0.55mL,4.3mmol),并在室温下,将混合物搅拌30分钟,接着经10分钟时间逐滴添加(R)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-碘丙酸甲酯(22.5g,71.4mmol)于DMF(200mL)中的混合物。将混合物在35℃下加热并搅拌2小时,接着冷却至室温,并添加2,4-二氯吡啶(16g,109mmol)和Pd(PPh3)2Cl2(4g,5.7mmol)。将混合物在45℃下加热并搅拌2小时,冷却,并过滤,接着将H2O(1L)和EtOAc(0.5L)添加至滤液中。将有机层和水层分离,并用EtOAc(2×500mL)萃取水层。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将粗残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-氯吡啶-2-基)丙酸甲酯(6.5g,29%产率)。LCMS(ESI):C14H19ClN2O4的m/z[M+H]计算值314.1;实验值315.1。
步骤2.在N2气氛下,在室温下向(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-氯吡啶-2-基)丙酸甲酯(6.5g,20.6mmol)于1,4-二噁烷(80mL)中的混合物中添加双(频哪醇合)二硼(6.3g,24.7mmol)、KOAc(8.1g,82.4mmol)和Pd(PCy3)2Cl2(1.9g,2.5mmol)。将混合物加热至100℃并搅拌3小时,接着添加H2O(100mL)并用EtOAc(3×200mL)萃取混合物。将有机层合并,用盐水(2×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-2-基)丙酸甲酯(6g,72%产率)。LCMS(ESI):C20H31BN2O6的m/z[M+H]计算值406.2;实验值407.3。
合成中间体8.
Figure BDA0004194083620010081
步骤1.在-5℃下,向4-(二甲基氨基)丁-2-炔酸(900mg,7.0mmol)于DMF(20mL)中的混合物中分数份添加N-甲基-N-((S)-吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸叔丁酯(1.0g,3.5mmol)、DIPEA(2.2g,17.6mmol)和HATU(2.7g,7.0mmol)。将混合物在-5至5℃之间搅拌1小时,接着用EtOAc(100mL)和冰-水(100mL)稀释。将水层和有机层分离并将有机层用H2O(3×100mL)、盐水(100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的N-((S)-1-(4-(二甲基氨基)丁-2-炔酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(900mg,55%产率)。LCMS(ESI):C21H35N3O4的m/z[M+H]计算值393.5;实验值394.3。
步骤2.在室温下,向N-((S)-1-(4-(二甲基氨基)丁-2-炔酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(260mg,0.66mmol)于DCM(6mL)中的混合物中添加TFA(3mL)。在室温下,将混合物搅拌2小时,接着减压浓缩溶剂,得到呈不纯油状的(2S)-2-{1-[(3S)-1-[4-(二甲基氨基)丁-2-炔酰基]吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-3-甲基丁酸(280mg)。将粗产物不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C17H27N3O4的m/z[M+H]计算值337.2;实验值338.3。
合成中间体9.
Figure BDA0004194083620010091
步骤1.在5℃下,向N-甲基-N-((S)-吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸叔丁酯(500mg,1.8mmol)于DCM(8mL)中的混合物中添加TEA(533mg,5.3mmol),随后逐滴添加于DCM(2mL)中的2-氯乙烷-1-磺酰氯(574mg,3.5mmol)。将混合物在5℃下搅拌1小时,接着用H2O(20mL)稀释并用EtOAC(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的N-甲基-N-((S)-1-(乙烯基磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸叔丁酯(300mg,45%产率)。LCMS(ESI):C17H30N2O5S的m/z[M+H]计算值374.2;实验值375.2。
步骤2.在室温下,向N-甲基-N-((S)-1-(乙烯基磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸叔丁酯(123mg,0.33mmol)于DCM(3mL)中的混合物中添加TFA(1mL)。在室温下,将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的N-甲基-N-((S)-1-(乙烯基磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸(130mg,粗品),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C13H22N2O5S的m/z[M+H]计算值318.1;实验值319.1。
合成中间体10.
Figure BDA0004194083620010101
步骤1.在回流下,将5-氯-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-甲醛(8.5g,47.1mmol)和2-(三苯基亚膦基)丙酸乙酯(2.56g,70.7mmol)于1,4-二噁烷(120mL)中的混合物搅拌4小时,接着减压浓缩。添加EtOAc(200mL)并将混合物用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(E)-3-(5-氯-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2-甲基丙烯酸乙酯(7.5g,60%产率)。LCMS(ESI):C13H13ClN2O2的m/z[M+H]计算值264.1;实验值265.1。
步骤2.分20份,每25分钟向(E)-3-(5-氯-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2-甲基丙烯酸乙酯(7.5g,28.3mmol)和NiCl2(4.8g,28.3mmol)于1:1THF/MeOH(300mL)中的混合物中添加NaBH4(21.5g,566mmol)。添加完成后,在室温下将混合物搅拌30分钟,接着用EtOAc(500mL)稀释并用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-氯-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2-甲基丙酸乙酯(3.4g,45%产率)。LCMS(ESI):C13H15ClN2O2的m/z[M+H]计算值266.1;实验值267.1。
步骤3.在0℃下,向3-(5-氯-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2-甲基丙酸乙酯(7.0g,26.2mmol)和AgOTf(6.7g,26.2mmol)于THF(50mL)中的混合物中添加I2(6.65g,26.2mol)。在0℃下,将混合物搅拌30分钟,接着用EtOAc(100mL)稀释,用Na2SO3(50mL)、盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈白色固体状的3-(5-氯-2-碘-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2-甲基丙酸乙酯(6g,58%产率)。LCMS(ESI):C13H14ClIN2O2的m/z[M+H]计算值392.0;实验值393.0。
步骤4.在N2气氛下,向3-(5-氯-2-碘-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2-甲基丙酸乙酯(6.0g,15.3mmol)和2-(2-(2-甲氧基乙基)苯基)-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(5.6g,21.4mmol)和K2CO3(6.3g,45.9mmol)于1,4-二噁烷(150mL)和H2O(30mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2.DCM(1.3g,3.1mmol)。将混合物加热至80℃并搅拌4小时,接着用EtOAc(500mL)稀释,用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈粘性油状的3-(5-氯-2-(2-(2-甲氧基乙基)苯基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2-甲基丙酸酯(5.5g,50%产率)。LCMS(ESI):C22H25ClN2O3的m/z[M+H]计算值400.2;实验值401.2。
步骤5.在室温下,将3-(5-氯-2-(2-(2-甲氧基乙基)苯基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2-甲基丙酸乙酯(5.5g,13.8mmol)、Cs2CO3(8.9g,27.5mmol)和EtI(3.5g,27.5mmol)于DMF(30mL)中的混合物搅拌10小时。将混合物用EtOAc(100mL)稀释,用盐水(20mL×4)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并在真空中浓缩。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈粘性油状的3-(5-氯-1-乙基-2-(2-(2-甲氧基乙基)苯基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2-甲基丙酸乙酯(5.6g,95%产率)。LCMS(ESI):C25H31ClN2O3的m/z[M+H]计算值428.2;实验值429.2。
步骤6.在-65℃下,向3-(5-氯-1-乙基-2-(2-(2-甲氧基乙基)苯基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2-甲基丙酸乙酯(5.4g,12.6mmol)于THF(50mL)中的混合物中添加2MLDA(25mL,50mmol)并在-65℃下搅拌1小时。添加MeI(3.6g,25mmol)并在-65℃下将混合物搅拌2.5小时,接着添加NH4Cl水溶液和EtOAc(50mL)。将水层和有机层分离并将有机层用盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈粘性油状的3-(5-氯-1-乙基-2-(2-(2-甲氧基乙基)苯基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(3.2g,57%产率)。LCMS(ESI):C25H31ClN2O3的m/z[M+H]计算值442.2;实验值443.2。
步骤7.在5℃下,向3-(5-氯-1-乙基-2-(2-(2-甲氧基乙基)苯基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(1.0g,2.3mmol)于THF(10mL)中的混合物中添加LiBH4(196mg,9.0mmol)。将混合物加热至65℃并搅拌2小时,接着添加NH4Cl水溶液和EtOAc(50mL)。将水层和有机层分离并将有机层用盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-氯-1-乙基-2-(2-(2-甲氧基乙基)苯基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(0.75g,82%产率)。LCMS(ESI):C23H29ClN2O2的m/z[M+H]计算值400.2;实验值401.2。
中间体11:(3S)-1-{(2S)-2-(叔丁氧基羰基)氨基-3-[3-氟-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯基]丙酰基}-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯
Figure BDA0004194083620010121
步骤1.在N2气氛下,在20℃下向(2R)-2-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}-3-(碘锌)丙酸甲酯(12g,30mmol,1.2eq)于DMF(100mL)中的搅拌的溶液中添加1-溴-3-氟-5-碘苯(7.5g,25mmol,1eq)和Pd(PPh3)2Cl2(1.7g,2.5mmol,0.1当量)。在N2气氛下,在65℃下将所得混合物搅拌2小时。将反应混合物用水淬灭并用EA(200mL×2)萃取。将有机相用水(200mL×1)和盐水(100mL×1)洗涤并浓缩至干,得到残余物。将残余物通过制备型TLC(PE/EA=10/1)纯化,得到呈无色油状的3-(3-溴-5-氟苯基)-2-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}丙酸甲酯(6g,58%产率)。LCMS(ESI)m/z=398.1[M+Na]+,C15H19BrFNO4的计算值:375.0
步骤2.向3-(3-溴-5-氟苯基)-2-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}丙酸甲酯(3.2g,8.5mmol,1eq)于THF(50mL)中的溶液中添加于H2O(10mL)中的氢氧化锂(610.7mg,25.5mmol,3eq)。接着,在20℃下将反应混合物搅拌1小时。用1M HCl水溶液将混合物调至pH=5.0。将混合物用H2O(150mL)淬灭并用EA(200mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥并浓缩,得到呈白色固体状的3-(3-溴-5-氟苯基)-2-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}丙酸(2.65g,68%产率)。LCMS(ESI)m/z=384.1[M+Na]+,C14H15BrFNO4 MW的计算值:361.0。
步骤3.在0℃下,向3-(3-溴-5-氟苯基)-2-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}丙酸(2.3g,6.4mmol,1eq)和(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(1.66g,11.5mmol,1.8eq)于DMF(150mL)中的混合物中添加于DMF(50mL)中的HATU(4.9g,12.8mmol,2eq)和DIEA(16.5g,128mmol,20eq)。接着,在0℃下将反应混合物搅拌1小时。将混合物用H2O(100mL)淬灭并用EA(300mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥并浓缩,得到残余物,将其通过制备型HPLC,用经10分钟自60%至70%的乙腈/水(0.1%FA)洗脱来纯化,得到呈浅黄色固体状的(3S)-1-[(2S)-3-(3-溴-5-氟苯基)-2-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(2.7g,78%产率)。LCMS(ESI)m/z=510.1[M+Na]+,C20H27BrFNO5的计算值:487.1。
步骤4.在N2气氛下,将(S)-1-((S)-3-(3-溴-5-氟苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(3g,6.16mmol,1eq)、4,4,5,5-四甲基-2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(1.9g,7.4mmol,1.2eq)、KOAc(900mg,9.24mmol,1.5eq)和Pd(dppf)Cl2DCM(0.3g,0.37mmol,0.05eq)于二噁烷(50mL)中的混合物在100℃下加热17小时。将混合物浓缩并通过柱色谱法(DCM/MeOH=100/1至40/1)纯化,得到呈黄色油状的(3S)-1-(2S)-2-{(叔丁氧基羰基)氨基-3-[3-氟-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯基]丙酰基}-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(2.6g,79%产率)。LCMS(ESI)m/z=536.2[M+H]+,C26H39BFNO7的计算值:535.3。
化合物A341和A342可使用本文所公开的方法,通过中间体11制备。
实施例A75.合成(2S)-N-[(8S,14S,20M)-22-乙基-4-羟基-21-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺的两种阻转异构体。
Figure BDA0004194083620010141
步骤1.在0℃下,向((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(18.0g,20.1mmol)于THF(180mL)中的搅拌的混合物中添加1M TBAF的THF溶液(24.1mL,24.1mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着用盐水(1.5L)稀释并用EtOAc(3×1L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×500mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(11.5g,69%产率)。LCMS(ESI):C42H53N5O7的m/z[M+H]计算值739.4;实验值740.4。
步骤2.在0℃下,向((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(11.5g,15.5mmol)于DCM(120mL)中的搅拌的混合物中添加TFA(60mL,808mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩并将残余物再次与甲苯(20mL;重复3次)一起减压浓缩,得到(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(12g,粗品),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C37H45N5O5的m/z[M+H]计算值639.3;实验值640.6。
步骤3.在N2气氛下,在0℃下向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(11.9g,18.6mmol)于DMF(240mL)中的搅拌的混合物中分数份添加DIPEA(48.1g,372mmol)、(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基]丁酸(9.45g,33.5mmol)和COMU(11.95g,27.9mmol)。在0℃下,将混合物搅拌90分钟,接着用盐水(1.5L)稀释并用EtOAc(3×1L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×500mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。过滤后,减压浓缩滤液。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化(×2),得到(2S)-N-[(8S,14S,20M)-22-乙基-4-羟基-21-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺的两种阻转异构体(2.7g,15.5%产率)和(4.2g,24.7%产率),都呈固体状。LCMS(ESI):C51H65N7O8的m/z[M+H]计算值903.5;实验值904.7;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.35-9.27(m,1H),8.77(dd,J=4.7,1.7Hz,1H),7.95(dq,J=6.2,2.0Hz,2H),7.55(ddd,J=28.0,8.2,4.3Hz,3H),7.08(dd,J=37.9,6.2Hz,2H),6.69-6.48(m,2H),6.17(ddt,J=16.7,7.2,2.3Hz,1H),5.74-5.62(m,1H),5.43-5.34(m,1H),5.12-5.00(m,1H),4.25(d,J=12.3Hz,1H),4.17-3.99(m,3H),3.89-3.65(m,4H),3.66-3.45(m,3H),3.12(s,4H),2.95-2.70(m,6H),2.41-2.06(m,5H),1.99-1.88(m,1H),1.82(d,J=12.1Hz,2H),1.54(t,J=12.0Hz,1H),1.21(dd,J=6.3,2.5Hz,3H),1.11(t,J=7.1Hz,3H),0.99-0.88(m,6H),0.79(ddd,J=27.8,6.7,2.1Hz,3H),0.48(d,J=3.7Hz,3H);以及LCMS(ESI):C51H65N7O8的m/z[M+H]计算值903.5;实验值904.7;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.34-9.27(m,1H),8.77(dd,J=4.7,1.7Hz,1H),8.17-7.77(m,3H),7.64-7.43(m,3H),7.33(d,J=13.7Hz,1H),7.05-6.94(m,1H),6.69-6.41(m,2H),6.26-5.94(m,1H),5.73-5.63(m,1H),5.50-5.20(m,2H),4.40-4.15(m,3H),4.00-3.40(m,9H),3.11(d,J=4.4Hz,3H),2.93-2.60(m,8H),2.29-2.01(m,3H),1.99(s,1H),1.87-1.75(m,2H),1.73-1.47(m,2H),1.40(d,J=6.0Hz,3H),1.01-0.88(m,6H),0.85-0.65(m,7H),0.56(s,3H)。
实施例A89.合成(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-18,18-二甲基-21-[6-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基]-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺
Figure BDA0004194083620010171
步骤1.在0℃下,向((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(240.00mg,0.279mmol,1.00当量)和Cs2CO3(182mg,0.558mmol,2当量)于DMF(5.00mL)中的混合物中逐滴添加碘乙烷(113.45mg,0.727mmol,2.60当量)。在25℃下搅拌反应16小时。将所得混合物用水(10mL)稀释并用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。减压浓缩滤液并将剩余残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈黄色固体状的((63S,4S)-11-乙基-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(190mg,77%产率)。
步骤2.在Ar气氛下,在80℃下将((63S,4S)-11-乙基-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(500mg,0.54mmol)、1-甲基-4-[5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-2-基]哌嗪(257mg,0.8mmol)、Pd(dppf)Cl2(83mg,0.11mmol)和K2CO3(156mg,1.1mmol)于1,4-二噁烷(25mL)和H2O(5mL)中的混合物搅拌2小时。将混合物减压浓缩并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-11-乙基-10,10-二甲基-12-(6-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(400mg,76%产率)。LCMS(ESI):C53H77N7O6Si的m/z[M+H]计算值935.6;实验值936.6。
步骤3.在0℃下,将((63S,4S)-11-乙基-10,10-二甲基-12-(6-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(350mg,0.36mmol)和1MTBAF的THF溶液(0.4mL,0.4mmol)于THF(5mL)中的混合物搅拌1小时。将混合物减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-10,10-二甲基-12-(6-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(290mg,100%产率)。LCMS(ESI):C44H57N7O6的m/z[M+H]计算值779.4;实验值780.4。
步骤4.在室温下,将((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-10,10-二甲基-12-(6-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(300mg,0.37mmol)于TFA(5mL)和DCM(5mL)中的混合物搅拌1小时。将混合物减压浓缩,得到呈固体状的(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-10,10-二甲基-12-(6-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(300mg,粗品)。LCMS(ESI):C39H49N7O4的m/z[M+H]计算值679.4;实验值680.3。
步骤5.在N2气氛下,在0℃下向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-10,10-二甲基-12-(6-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(300mg,0.36mmol)于DMF(3mL)中的混合物中添加DIPEA(0.96mL,5.4mmol)和(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基]丁酸(213mg,0.72mmol),随后逐滴添加COMU(243mg,0.56mmol)。在0℃下添加H2O并将混合物用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将粗残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-18,18-二甲基-21-[6-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基]-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺(45mg,13.2%产率)。LCMS(ESI):C53H69N9O7的m/z[M+H]计算值943.5;实验值944.8;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.39-9.23(m,1H),8.64-8.60(m,1H),8.19-8.16(m,1H),8.15(d,J=6.2Hz,1H),7.86(s,1H),7.66-7.62(m,1H),7.56-7.54(m,1H),7.50-7.43(m,1H),7.13-7.11(m,1H),7.03-6.95(m,1H),6.70-6.47(m,2H),6.17(ddt,J=16.8,6.4,2.8Hz,1H),5.76-5.63(m,1H),5.45-5.33(m,1H),5.11(m,1H),4.75-4.72(m,1H),4.28-4.24(m,1H),4.11-3.98(m,4H),3.91-3.76(m,1H),3.73-3.71(m,1H),3.59-3.56(m,7H),3.51-3.40(m,2H),3.08-2.94(m,1H),2.94-2.92(m,2H),2.92-2.87(m,2H),2.86-2.83(m,2H),2.80-2.65(m,2H),2.83-2.82(m,3H),2.28-2.25(m,3H),2.08-2.05(m,2H),2.02-1.96(m,1H),1.87-1.78(m,1H),1.74-1.66(m,1H),1.56-1.48(m,1H),1.11-1.08(m,4H),0.99-0.92(m,2H),0.89-0.87(m,5H),0.82-0.73(m,2H)。
实施例A115.合成(2S)-N-[(8S,14S,20P)-22-乙基-21-{4-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺的两种阻转异构体
Figure BDA0004194083620010201
步骤1.在室温下,向1L圆底烧瓶中装入((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(22.00g,32.042mmol,1.00当量)、甲苯(300.00mL)、Pd2(dba)3(3.52g,3.845mmol,0.12当量)、S-Phos(3.95g,9.613mmol,0.30当量)和KOAc(9.43g,96.127mmol,3.00当量)。在搅拌下,在室温下向混合物中逐滴添加4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(26.66g,208.275mmol,6.50当量)。在60℃下,将所得溶液搅拌3小时。将所得混合物过滤,并用EtOAc洗涤滤饼。减压浓缩滤液并将剩余残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈浅黄色固体状的((63S,4S)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-12-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(22g,90%)。ESI-MSm/z=687.3[M+H]+;计算的MW:686.4。
步骤2.在N2气氛下,将((63S,4S)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-12-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(2.0g,2.8mmol)、3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(0.60g,2.8mmol)、Pd(dppf)Cl2(0.39g,0.5mmol)和K3PO4(1.2g,6.0mmol)于1,4-二噁烷(50mL)和H2O(10mL)中的混合物加热至70℃并搅拌2小时。将混合物用H2O(50mL)稀释并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.5g,74%产率)。LCMS(ESI):C40H49N5O6的m/z[M+H]计算值695.4;实验值696.5。
步骤3.在0℃下,将((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.5g,2.1mmol)、Cs2CO3(2.1g,6.3mmol)和碘乙烷(0.43mL,5.1mmol)于DMF(50mL)中的混合物搅拌16小时。在0℃下,将混合物用H2O淬灭并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.5g,99%产率)。LCMS(ESI):C42H53N5O6的m/z[M+H]计算值723.4;实验值724.6。
步骤4.在0℃下,将((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.3g,1.7mmol)于TFA(10mL)和DCM(20mL)中的混合物搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到呈固体状的(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(1.30g,粗品)。LCMS(ESI):C37H45N5O4的m/z[M+H]计算值623.3;实验值624.4。
步骤5.向用惰性Ar气氛吹扫并维持该氛围的40mL小瓶中放入(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(250mg,0.4mmol)、(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基]丁酸(226mg,0.8mmol)、DIPEA(774mg,6.0mmol)和DMF(3mL)。在0℃下,添加COMU(257mg,0.6mmol)于DMF(2mL)中的溶液并在0℃下将所得混合物搅拌1小时。将混合物过滤,减压浓缩滤液,并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到(2S)-N-[(8S,14S,20P)-22-乙基-21-{4-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺的两种阻转异构体(56mg,15%产率)和(46mg,13%产率),都呈固体状。LCMS(ESI):C51H65N7O7的m/z[M+H]计算值887.5;实验值888.4;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.81(s,1H),8.07(s,1H),8.05-7.96(m,1H),7.78-7.45(m,5H),7.41-7.08(m,2H),6.66 -6.58(m,1H),6.18(d,J=17.0Hz,1H),5.75-5.67(m,1H),5.46-5.31(m,1H),5.16-5.04(m,1H),4.75(dd,J=10.9,4.5Hz,1H),4.31-4.21(m,2H),4.11-3.95(m,3H),3.87-3.71(m,5H),3.74-3.54(m,3H),3.11(s,4H),2.95(d,J=9.7Hz,2H),2.85-2.72(m,3H),2.31-2.04(m,3H),1.88-1.47(m,2H),1.24-1.21(m,3H),1.16-1.08(m,3H),1.03-0.91(m,6H),0.85 -0.74(m,3H),0.51-0.46(m,3H);以及LCMS(ESI):C51H65N7O7的m/z[M+H]计算值887.5;实验值888.4;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.77(s,1H),8.71-8.63(m,0.5H),8.23-8.17(m,0.5H),8.00(s,1H),7.85(t,J=9.9Hz,2H),7.77-7.62(m,3H),7.57-7.50(m,1H),7.33-7.22(m,1H),7.15-7.06(m,1H),6.73-6.56(m,1H),6.17(ddd,J=16.7,6.1,2.7Hz,1H),5.76-5.64(m,1H),5.49-5.29(m,2H),4.70(dd,J=10.8,3.5Hz,1H),4.33-4.22(m,3H),4.14-3.95(m,2H),3.86-3.77(m,1H),3.72-3.65(m,2H),3.61(t,J=10.6Hz,3H),3.46-3.42(m,1H),3.13(d,J=4.8Hz,3H),2.99(d,J=14.4Hz,1H),2.95-2.70(m,6H),2.24-1.99(m,4H),1.95-1.44(m,4H),1.40(d,J=6.1Hz,3H),0.98-0.87(m,6H),0.86-0.64(m,6H),0.64-0.54(m,3H)。
实施例A2.合成(2S)-N-[(8S,14S)-4-氨基-22-乙基-21-[2-(2-甲氧基乙基)苯基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺
Figure BDA0004194083620010241
步骤1.在N2气氛下,在室温下向25mL密封管中添加3-[1-乙基-2-[2-(甲氧基甲基)苯基]-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-3-基]-2,2-二甲基丙-1-醇(590mg,1.2mmol)、(2S)-3-(3-溴-5-硝基苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(747mg,1.9mmol)、XPhos Pd G3(105mg,0.12mmol)、XPhos(71mg,0.15mmol)、K2CO3(427mg,3.1mmol)和1,4-二噁烷(2mL)。将混合物加热至60℃并搅拌过夜,接着冷却并添加H2O。将混合物用EtOAc(3×20mL)萃取并将合并的有机层用盐水(1×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)苯基]吲哚-5-基]-5-硝基苯基]丙酸(500mg,61%产率)。LCMS(ESI):C37H45N3O8的m/z[M+H]计算值659.3;实验值660.4。
步骤2.在空气气氛下,在0℃下将(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)苯基]吲哚-5-基]-5-硝基苯基]丙酸(500mg,0.79mmol)、(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(164mg,1.1mmol)、DCM(6mL)、DIPEA(294mg,2.3mmol)和HATU(432mg,1.1mmol)的混合物搅拌1小时。添加H2O并将混合物用DCM(3×20mL)萃取,接着将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)苯基]吲哚-5-基]-5-硝基苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(520mg,87%产率)。LCMS(ESI):C43H55N5O9的m/z[M+H]计算值785.4;实验值786.8。
步骤3.在空气气氛下,在室温下向40mL密封管中添加(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)苯基]吲哚-5-基]-5-硝基苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(510mg,0.65mmol)、DCE(5mL)和三甲基氢氧化锡(587mg,3.3mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌过夜,冷却,并用DCM(20mL)稀释。将混合物用0.1N KHSO4(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)苯基]吲哚-5-基]-5-硝基苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(500mg,100%)。LCMS(ESI):C42H53N5O9的m/z[M+H]计算值771.4;实验值772.7。
步骤4.在空气气氛下,在室温下将(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)苯基]吲哚-5-基]-5-硝基苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(490mg,0.64mmol)、DCM(100mL)、DIPEA(2.5g,19.0mmol)、HOBT(429mg,3.2mmol)和EDCI(3.65g,19.0mmol)的混合物在室温下搅拌过夜。添加H2O并将混合物用DCM(3×60mL)萃取,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)苯基)-10,10-二甲基-25-硝基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(350mg,73%产率)。LCMS(ESI):C42H51N5O8的m/z[M+H]计算值753.4;实验值754.2。
步骤5.在H2气氛下,在室温下将((63S,4S)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)苯基)-10,10-二甲基-25-硝基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.27mmol)、MeOH(4mL)和Pd/碳(20mg)的混合物搅拌2小时。将混合物过滤,将滤饼用MeOH(3×5mL)洗涤,并减压浓缩滤液,得到呈固体状的((63S,4S)-25-氨基-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)苯基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(60mg,31%产率)。LCMS(ESI):C42H53N5O6的m/z[M+H]计算值723.4;实验值724.4。
步骤6.在空气气氛下,在0℃下向8mL小瓶中添加((63S,4S)-25-氨基-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)苯基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(50mg,0.07mmol)、DCM(1mL)和TFA(158mg,1.4mmol)。在0℃下,将混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的(63S,4S)-25,4-二氨基-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)苯基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(45mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C37H45N5O4的m/z[M+H]计算值623.3;实验值624.4。
步骤7.在空气气氛下,在0℃下向8mL小瓶中添加(63S,4S)-25,4-二氨基-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)苯基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(40mg,0.06mmol)、DMF(1mL)、DIPEA(75mg,0.58mmol)和COMU(41mg,0.1mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着添加H2O。将混合物用EtOAc(3×30mL)萃取,将合并的有机层减压浓缩,并通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-4-氨基-22-乙基-21-[2-(2-甲氧基乙基)苯基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺(2.5mg,4.4%产率)。LCMS(ESI):C51H65N7O7的m/z[M+H]计算值887.5;实验值888.6;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.74-8.55(m,1H),7.89(d,J=9.6Hz,1H),7.66-7.53(m,1H),7.57-7.47(m,6H),7.32(t,J=6.4Hz,1H),6.85(d,J=8.4Hz,2H),6.70-6.55(m,1H),6.24-6.12(m,1H),5.69(ddd,J=14.8,8.0,3.9Hz,1H),5.41(s,1H),5.09-4.80(m,2H),4.26(d,J=10.1Hz,2H),4.19(s,2H),4.17-4.06(m,1H),4.02(dd,J=12.0,3.9Hz,1H),3.92(d,J=8.0Hz,3H),3.78(d,J=8.7Hz,5H),3.29(s,2H),3.14(d,J=1.9Hz,1H),2.98-2.92(m,1H),2.87-2.68(m,3H),2.62(d,J=12.5Hz,3H),2.15-1.99(m,4H),1.80(s,1H),1.68-1.53(m,2H),1.08(t,J=7.1Hz,1H),0.98-0.88(m,6H),0.82(dd,J=23.3,16.4Hz,3H),0.74(t,J=7.2Hz,3H),0.44(s,2H),0.43(s,3H)。
实施例A118.合成(2S)-N-[(7S,13S)-21-乙基-20-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-17,17-二甲基-8,14-二氧代-15-氧杂-3-硫杂-9,21,27,28-四氮杂五环[17.5.2.12,.1,13.022,2]二十八碳-1(25),2(28),4,19,22(26),23-六烯-7-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺
Figure BDA0004194083620010281
步骤1.在N2气氛下,在0℃下将(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-(1,3-噻唑-4-基)丙酸甲酯(2.08g,7.26mmol)和mCPBA(1.88g,10.9mmol)于DCE(15mL)中的混合物用DCM(100mL)稀释。使混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用DCM稀释,用H2O(1×30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的4-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-甲氧基-3-氧代丙基]-1,3-噻唑-3-鎓-3-醇盐(1.15g,47%产率)。LCMS(ESI):C12H18N2O5S的m/z[M+H]计算值302.1;实验值303.2。
步骤2.在N2气氛下,在0℃下向4-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-甲氧基-3-氧代丙基]-1,3-噻唑-3-鎓-3-醇盐(1.15g,3.8mmol)于THF中的混合物中逐滴添加NBS(0.74g,4.2mmol)。使混合物升温至室温并搅拌2小时,接着用H2O(500mL)稀释并用EtOAc(3×500mL)萃取。将合并的有机层用水(2×30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到)呈固体状的2-溴-4-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-甲氧基-3-氧代丙基]-1,3-噻唑-3-鎓-3-醇盐(1.2g,74%产率。LCMS(ESI):C12H17BrN2O5S的m/z[M+H]计算值380.0;实验值381.0。
步骤3.在N2气氛下,在70℃下向2-溴-4-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-甲氧基-3-氧代丙基]-1,3-噻唑-3-鎓-3-醇盐(1.2g,3.2mmol)和4,4,5,5-四甲基-2-(四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(1.04g,4.1mmol)于MeCN中的搅拌的混合物中分数份添加乙-1,2-二胺(1.89g,31.5mmol)。将混合物冷却至60℃并将混合物搅拌过夜,接着用水(500mL)稀释并用EtOAc(3×400mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(2S)-3-(2-溴-1,3-噻唑-4-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(653mg,54%产率)。
步骤4.在N2气氛下,在室温下向50mL密封管装入3-[1-乙基-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-3-基]-2,2-二甲基丙-1-醇(1.00g,2.1mmol)、K2CO3(727mg,5.2mmol)、Pd(dppf)Cl2(153mg,0.21mmol)和2,4-二溴-1,3-噻唑(1.0g,4.2mmol),接着添加1,4-二噁烷(1.0mL)和H2O(0.20mL)。将混合物加热至70℃并搅拌4小时,接着冷却,用H2O(100mL)稀释并用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-[5-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-1-乙基-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-3-基]-2,2-二甲基丙-1-醇(727mg,67%产率)。LCMS(ESI):C34H44N4O6S的m/z[M+H]计算值636.3;实验值637.3。
步骤5.在N2气氛下,在0℃下向(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[2-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噻唑-4-基]丙酸甲酯(636mg,1.0mmol)和LiOH.H2O(126mg,3.0mmol)于THF中的搅拌的混合物中逐份添加H2O(1.24mL)。使混合物升温至室温并搅拌1小时,接着用水(300mL)稀释并用EtOAc(3×300mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液,得到(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[2-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噻唑-4-基]丙酸(622mg,粗品),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C33H42N4O6S的m/z[M+H]计算值622.3;实验值623.2。
步骤6.在N2气氛下,在0℃下向(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[2-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噻唑-4-基]丙酸(622mg,1.0mmol)和(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(288mg,2.0mmol)于DMF中的搅拌的混合物中添加HATU(570mg,1.5mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着用EtOAc稀释并用H2O(1×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[2-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噻唑-4-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(550mg,62%产率)。LCMS(ESI):C39H52N6O7S的m/z[M+H]计算值748.4;实验值749.6。
步骤7.(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[2-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噻唑-4-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸是以与(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸类似地方式合成,不过将(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯替代为(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[2-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噻唑-4-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯。LCMS(ESI):C38H50N6O7S的m/z[M+H]计算值734.3;实验值735.3。
步骤8.((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯是以与((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯类似地方式合成,不过将(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸替代为(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[2-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噻唑-4-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸。LCMS(ESI):C38H48N6O6S的m/z[M+H]计算值716.3;实验值717.4。
步骤9.在N2气氛下,在0℃下向((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(253mg)于DCM中的搅拌的混合物中逐滴添加TFA(1.0mL)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,接着使用甲苯(20mL×3)重复操作,得到呈固体状的(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(253mg,粗品)。LCMS(ESI):C33H40N6O4S的m/z[M+H]计算值616.3;实验值617.3。
步骤10.(2S)-N-[(7S,13S)-21-乙基-20-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-17,17-二甲基-8,14-二氧代-15-氧杂-3-硫杂-9,21,27,28-四氮杂五环[17.5.2.12,.1,13.022,2]二十八碳-1(25),2(28),4,19,22(26),23-六烯-7-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺是以与(2S)-N-[(8S,14S)-4-氨基-22-乙基-21-[2-(2-甲氧基乙基)苯基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺类似地方式合成,不过(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮替代为(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮。LCMS(ESI):C47H60N8O7S的m/z[M+H]计算值880.4;实验值881.6;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.75(m,1H),8.55(d,J=6.7Hz,1H),8.32(d,J=8.3Hz,1H),7.99(d,J=7.7Hz,1H),7.65-7.51(m,3H),7.11-6.92(m,1H),6.72-6.56(m,1H),6.18(dd,J=16.8,2.9Hz,1H),5.82-5.65(m,1H),5.61-5.46(m,1H),5.02(dd,J=24.2,12.2Hz,1H),4.69(d,J=10.9Hz,1H),4.37-4.11(m,5H),4.05-3.79(m,4H),3.76-3.50(m,6H),3.47(s,2H),3.08(s,3H),3.04(s,1H),2.98(d,J=1.9Hz,1H),2.95(d,J=3.6Hz,2H),2.83(d,J=2.0Hz,2H),2.24-2.03(m,4H),1.81(s,2H),1.56(s,1H),1.11(t,J=7.0Hz,2H),1.02-0.87(m,8H),0.80(dd,J=24.6,6.6Hz,3H),0.41(s,2H),0.31(s,1H)。
实施例A194.合成(2S)-N-[(7S,13S)-21-乙基-20-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-17,17-二甲基-8,14-二氧代-15-氧杂-4-硫杂-9,21,27,28-四氮杂五环[17.5.2.12,.1,13.022,2]二十八碳-1(25),2,5(28),19,22(26),23-六烯-7-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺
Figure BDA0004194083620010331
步骤1.在Ar气氛下,在90℃下将Zn(1.2g,182mmol)以及1,2-二溴乙烷(1.71g,9.1mmol)和DMF(50mL)的混合物搅拌30分钟。使混合物达到室温,接着在室温下,经30分钟逐滴添加TMSCl(198mg,1.8mmol)。在室温下,经10分钟逐滴添加于DMF(100mL)中的(2R)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-碘丙酸甲酯(10.0g,30.4mmol)。将混合物加热至35℃并搅拌2小时,接着逐滴添加2,5-二溴-1,3-噻唑(1.48g,60.8mmol)和Pd(PPh3)2Cl2(2.1g,3.0mmol)于DMF(100mL)中的混合物。将混合物加热至70℃并搅拌2小时,接着过滤并将滤液用EtOAc(1L)稀释并用H2O(3×1L)洗涤,用无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈半固体状的(2S)-3-(5-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(3g,27%产率)。LCMS(ESI):C12H17BrN2O4S的m/z[M+H]计算值364.0;实验值365.1。
步骤2.在N2气氛下,在室温下,向20mL密封管中添加3-[1-乙基-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-3-基]-2,2-二甲基丙-1-醇(100mg,0.21mmol)、K3PO4(111mg,0.52mmol)、Pd(dppf)Cl2(15mg,0.02mmol)、(2S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(153mg,0.42mmol)、甲苯(1mL)和H2O(0.2mL)。将混合物加热至60℃并搅拌3小时,冷却,用H2O(10mL)稀释并用EtOAc(10mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[4-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基]丙酸甲酯(72mg,54%产率)。LCMS(ESI):C34H44N4O6S的m/z[M+H]计算值636.3;实验值637.2。
步骤3.在N2气氛下,在室温下将(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[4-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基]丙酸甲酯(40mg,0.06mmol)和LiOH.H2O(未指明)于THF(1mL)和H2O(0.2mL)中的混合物搅拌2小时。用NaHSO4水溶液将混合物酸化至pH 5并用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到(2S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酸。将粗产物不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C33H42N4O6S的m/z[M+H]计算值622.3;实验值623.3。
步骤4.(3S)-1-((2S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯是以与(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[2-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噻唑-4-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯类似地方式合成,不过将(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[2-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噻唑-4-基]丙酸替代为(2S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酸。LCMS(ESI):C39H52N6O7S的m/z[M+H]计算值748.4;实验值749.4。
步骤5.(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[4-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸是以与(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸类似地方式合成,不过将(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯替代为(3S)-1-((2S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯。LCMS(ESI):C38H50N6O7S的m/z[M+H]计算值734.3;实验值735.4。
步骤6.((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯是以与((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯类似地方式合成,不过将(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸替代为(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[4-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸。LCMS(ESI):C38H48N6O6S的m/z[M+H]计算值716.3;实验值717.3。
步骤7.(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮是以与(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮类似地方式合成,不过将((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯替代为((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯。LCMS(ESI):C33H40N6O4SNa的m/z[M+Na]计算值639.3;实验值640.3。
步骤8.(2S)-N-[(7S,13S)-21-乙基-20-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-17,17-二甲基-8,14-二氧代-15-氧杂-4-硫杂-9,21,27,28-四氮杂五环[17.5.2.12,.1,13.022,2]二十八碳-1(25),2,5(28),19,22(26),23-六烯-7-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺是以与(2S)-N-[(7S,13S)-21-乙基-20-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-17,17-二甲基-8,14-二氧代-15-氧杂-3-硫杂-9,21,27,28-四氮杂五环[17.5.2.12,.1,13.022,2]二十八碳-1(25),2(28),4,19,22(26),23-六烯-7-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺类似地方式合成,不过将(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮替代为(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮。LCMS(ESI):C47H60N8O7S的m/z[M+H]计算值880.4;实验值881.5;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.70(dt,J=16.2,8.1Hz,1H),8.54(ddd,J=6.6,4.7,1.7Hz,1H),8.50(m,1H),7.96(d,J=7.8Hz,1H),7.88(t,J=2.1Hz,2H),6.70-6.57(m,2H),6.24-6.13(m,2H),5.75(m,1H),5.55(t,J=7.3Hz,1H),5.46(d,J=8.5Hz,1H),5.14(d,J=13.0Hz,1H),4.84-4.75(m,1H),4.35(d,J=10.7Hz,1H),4.28-4.19(m,4H),3.91(s,3H),3.87(dd,J=10.4,8.1Hz,1H),3.78-3.70(m,2H),3.63(t,J=8.8Hz,2H),3.61-3.49(m,2H),2.87(d,J=1.1Hz,2H),2.79(s,1H),2.38(s,1H),2.18(s,1H),2.13(d,J=10.7Hz,4H),1.96(s,2H),1.81(s,1H),1.53(s,2H),1.11(t,J=7.1Hz,2H),0.99-0.89(m,7H),0.93-0.81(m,2H),0.78(d,J=6.6Hz,2H),0.28(s,3H)。
实施例A71.合成(2S)-2-(1-{1-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰基]氮杂环丁烷-3-基}-N-甲基甲酰胺基)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620010371
步骤1.在5℃下,向N-(氮杂环丁烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(350mg,1.3mmol)和(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酸(201mg,1.56mmol)于DCM(8mL)中的混合物中添加50% T3P于EtOAc中的溶液(827mg,2.6mmol)和DCM(2mL)中的DIPEA(1.7g,13mmol)。将混合物搅拌1小时,接着用EtOAc(20mL)和H2O(20mL)稀释。将水层和有机层分离并将有机层用H2O(3×10mL)、盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(E)-N-(1-(4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(200mg,39%产率)。LCMS(ESI):C20H35N3O4的m/z[M+H]计算值381.3;实验值382.3。
步骤2.在室温下,向(E)-N-(1-(4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(190mg,0.32mmol)于DCM(3mL)中的混合物中添加TFA(1mL)。在室温下,将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的(E)-N-(1-(4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(190mg,90%),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C16H27N3O4的m/z[M+H]计算值325.2;实验值326.2。
步骤3.在5℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(172mg,0.27mmol)和(E)-N-(1-(4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(105mg,0.32mmol)于DMF(2mL)中的混合物中添加HATU(133mg,0.297mmol)和DIPEA(348mg,2.7mmol)于DMF(1mL)中的混合物。将混合物搅拌1小时,接着用EtOAc(20mL)和H2O(20mL)稀释。将水层和有机层分离,并将有机层用H2O(3×10mL)、盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(2S)-2-(1-{1-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰基]氮杂环丁烷-3-基}-N-甲基甲酰胺基)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基丁酰胺(4.8mg,经2个步骤2%产率)。LCMS(ESI):C52H68N8O8的m/z[M+H]计算值932.5;实验值933.5;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.71(d,J=3.2Hz,1H),8.50(s,1.5H),8.08-7.85(m,2H),7.65-7.44(m,3H),7.32-7.14(m,1H),7.07-6.95(m,1H),6.80(dt,J=22.1,6.8Hz,1H),6.55(d,J=35.8Hz,1H),6.30(d,J=15.4Hz,1H),5.56(dd,J=13.8,6.7Hz,1H),4.76(dd,J=19.8,10.5Hz,1H),4.54(dd,J=15.9,7.5Hz,2H),4.48-4.38(m,2H),4.36-4.23(m,3H),4.22-4.14(m,1H),3.96(qd,J=15.6,7.9Hz,3H),3.77(ddd,J=25.8,23.4,11.9Hz,2H),3.58(dd,J=17.2,8.3Hz,2H),3.38(s,2H),3.25-3.11(m,3H),3.05-2.94(m,1H),2.94-2.81(m,4H),2.73(dd,J=20.9,11.0Hz,1H),2.45(d,J=6.9Hz,5H),2.32-2.07(m,3H),1.92(d,J=13.2Hz,1H),1.72(s,1H),1.64-1.51(m,1H),1.18(t,J=7.0Hz,2H),1.00(ddd,J=14.6,11.8,8.5Hz,6H),0.92-0.81(m,4H),0.55-0.41(m,3H)。
实施例A67.合成(2E)-4-(二甲基氨基)-N-(6-{[(1S)-1-{[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨甲酰基}-2-甲基丙基](甲基)氨甲酰基}吡啶-3-基)丁-2-烯酰胺
Figure BDA0004194083620010391
步骤1.在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮三氟乙酸盐(225mg,0.28mmol)和(E)-N-(5-(4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰胺基)吡啶甲酰基)-N-甲基-L-缬氨酸三氟乙酸盐(260mg粗品,0.56mmol)于DMF(5mL)中的混合物中添加DIPEA(0.46mL,2.8mmol),随后添加HATU(140mg,0.36mmol)。在0-10℃下,将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2E)-4-(二甲基氨基)-N-(6-{[(1S)-1-{[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨甲酰基}-2-甲基丙基](甲基)氨甲酰基}吡啶-3-基)丁-2-烯酰胺三氟乙酸盐(23.3mg,经2个步骤8%产率)。LCMS(ESI):C54H67N9O8Na的m/z[M+Na]计算值992.5;实验值992.4;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ9.05(d,J=2.5Hz,1H),8.85-8.71(m,1H),8.43(ddd,J=33.3,18.0,2.6Hz,2H),8.01-7.87(m,2H),7.83-7.70(m,1H),7.60-7.47(m,2H),7.31-7.19(m,1H),7.07-6.90(m,2H),6.70-6.36(m,3H),5.81-5.61(m,1H),4.50-4.20(m,4H),4.01-3.68(m,3H),3.64-3.35(m,5H),3.27-3.08(m,3H),3.04-2.44(m,11H),2.36-2.10(m,3H),1.93(d,J=13.0Hz,1H),1.61(dd,J=34.3,21.6Hz,3H),1.39-1.16(m,3H),1.12-0.81(m,6H),0.78-0.45(m,6H)。
实施例A54.合成(2S)-2-{1-[(3S)-1-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰基]吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620010401
步骤1.在室温下,向N-甲基-N-((S)-吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸叔丁酯(210mg,0.73mmol)于DMF(4mL)中的混合物中添加4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酸(450mg,2.9mmol)、DIPEA(1.2mL,7.3mmol)和HATU(332mg,0.88mmol)。在室温下,将混合物搅拌1小时,接着用EtOAc稀释,并将混合物用H2O和盐水洗涤,经Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的N-((S)-1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(140mg,45%产率)。LCMS(ESI):C23H39N3O4的m/z[M+H]计算值421.3;实验值422.3。
步骤2.在室温下,将N-((S)-1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(130mg,0.31mmol)于DCM(2mL)和TFA(1mL)中的混合物搅拌90分钟。将混合物减压浓缩,得到呈油状的N-((S)-1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸三氟乙酸盐(150mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C19H31N3O4的m/z[M+H]计算值365.2;实验值366.2。
步骤3.(3S)-1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺三氟乙酸盐是以与1-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基氮杂环丁烷-3-甲酰胺类似地方式合成,不过得到(2S)-2-{1-[(3S)-1-[(2E)-4-(二甲基氨基)丁-2-烯酰基]吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基丁酰胺三氟乙酸盐。(120mg,经2个步骤54%产率),呈固体状。1H-NMR(400MHz,CD3OD)δ8.76-8.68(m,1H),8.44(s,1H),8.02-7.94(m,1H),7.94-7.84(m,1H),7.65-7.43(m,3H),7.27-7.14(m,1H),7.06-6.96(m,1H),6.65-6.48(m,1H),5.62-5.46(m,1H),4.81-4.57(m,1H),4.46-4.22(m,3H),4.10-3.35(m,11H),3.26-2.93(m,6H),2.91-2.51(m,4H),2.42-2.09(m,9H),1.95-1.87(m,1H),1.85-1.40(m,6H),1.38-1.10(m,6H),1.07-0.81(m,9H),0.56-0.38(m,3H)。LCMS(ESI):C52H68N8O8的m/z[M+H]实验值947.7。
实施例A95.合成(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-[4-(吗啉-4-基)丁-2-炔酰基]吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺
Figure BDA0004194083620010421
步骤1.在0℃下,将(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-(3S)-吡咯烷-3-基甲酰胺基]丁酸叔丁酯(500mg,1.8mmol)、4-(吗啉-4-基)丁-2-炔酸(1.49g,8.8mmol)、DIPEA(682mg,5.3mmol)和CIP(635mg,2.3mmol)于DMF(5mL)中的混合物搅拌2小时。将混合物减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的N-甲基-N-((S)-1-(4-吗啉代丁-2-炔酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸叔丁酯(150mg,19%产率)。LCMS(ESI):C23H37N3O5的m/z[M+H]计算值435.3;实验值436.5。
步骤2.在室温下,将N-甲基-N-((S)-1-(4-吗啉代丁-2-炔酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸叔丁酯(250mg,0.57mmol)于DCM(5mL)和TFA(2.5mL)中的混合物搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到呈油状的(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-[(3S)-1-[4-(吗啉-4-基)丁-2-炔酰基]吡咯烷-3-基]甲酰胺基]丁酸(310mg,粗品),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C19H29N3O5的m/z[M+H]计算值379.2;实验值380.2。
步骤3.在-20℃下,将(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(250mg,0.4mmol)、DIPEA(516mg,4.0mmol)、(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-[(3S)-1-[4-(吗啉-4-基)丁-2-炔酰基]吡咯烷-3-基]甲酰胺基]丁酸(182mg,0.48mmol)和COMU(205mg,0.48mmol)于DMF(3mL)中的混合物搅拌2小时。将混合物用H2O(10mL)稀释,接着用EtOAc(3×10mL)萃取并将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。将混合物减压浓缩并将残余物通过反相硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-[4-(吗啉-4-基)丁-2-炔酰基]吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺(207mg,53%产率)。LCMS(ESI):C55H70N8O9的m/z[M+H]计算值986.5;实验值987.8;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.39-9.28(m,1H),8.74(t,J=4.8,1H),8.70-8.04(m,1H),7.98-7.90(m,1.5H),7.82(d,J=7.7Hz,0.5H),7.63-7.46(m,3H),7.26-7.10(m,1H),7.03(s,1H),6.58-6.43(m,1H),5.44-5.30(m,1H),5.06(q,0.5H),4.72(t,J=11.0,0.5H),4.39-4.20(m,3H),4.15(d,J=11.1Hz,1H),4.09-3.85(m,4H),3.66(s,2H),3.65-3.58(m,4H),3.58-3.55(m,2H),3.55-3.48(m,3H),3.47-3.41(m,3H),3.31(s,2H),3.10(s,2H),2.92(s,1H),2.89-2.65(m,5H),2.68(s,1H),2.45-2.38(m,1H),2.29-2.24(m,1H),2.23-1.99(m,3H),1.82(d,J=12.1Hz,1H),1.76-1.62(m,1H),1.61-1.45(m,1H),1.14-1.04(m,2H),1.02-0.92(m,3H),0.91-0.86(m,3H),0.83-0.77(m,3H),0.77-0.70(m,2H),0.50-0.35(m,3H)。
实施例A145.合成(2S)-2-{1-[(3S)-1-(丁-2-炔酰基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-N-[(8S,14S,20M)-22-乙基-4-羟基-21-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基丁酰胺的两种阻转异构体
Figure BDA0004194083620010441
步骤1.在Ar气氛下,在0℃下向丁-2-炔酸(222mg)和CIP(588mg)于ACN(8mL)中的混合物中添加DIPEA(681mg)。在0℃下搅拌混合物,接着逐滴添加于ACN(3mL)中的N-甲基-N-((S)-吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸叔丁酯(500mg)并在0℃下将混合物搅拌2小时。添加EtOAc并将混合物用盐水(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的N-((S)-1-(丁-2-炔酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯。LCMS(ESI):C19H30N2O4的m/z[M+H]计算值350.2;实验值352.1。
步骤2.在0℃下,将N-((S)-1-(丁-2-炔酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(200mg)于DCM(4mL)和TFA(2mL)中的混合物搅拌2小时。将混合物减压浓缩,通过使用甲苯(4mL×2)共沸来去除H2O,得到呈固体状的N-((S)-1-(丁-2-炔酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸酯。LCMS(ESI):C15H22N2O4的m/z[M+H]计算值294.2;实验值295.2。
步骤3.(2S)-2-{1-[(3S)-1-(丁-2-炔酰基)吡咯烷-3-基]-N-甲基甲酰胺基}-N-[(8S,14S,20M)-22-乙基-4-羟基-21-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基丁酰胺的两种阻转异构体是以与(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.12,.11,1.023,2]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-[4-(吗啉-4-基)丁-2-炔酰基]吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺类似地方式合成,不过将(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-[(3S)-1-[4-(吗啉-4-基)丁-2-炔酰基]吡咯烷-3-基]甲酰胺基]丁酸替代为N-((S)-1-(丁-2-炔酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸酯。(43.3mg,12%产率)和(33mg,9%产率),都呈固体状。LCMS(ESI):C52H65N7O8的m/z[M+H]计算值915.5;实验值916.7;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.34-9.27(m,1H),8.78(t,J=2.5Hz,1H),8.68(t,J=8.5Hz,0.5H),8.20-8.11(m,0.6H),7.95(ddt,J=5.4,3.5,1.7Hz,2H),7.63-7.60(m,1H),7.61-7.49(m,2H),7.13(s,1H),7.03(d,J=6.2Hz,1H),6.60-6.49(d,J=35.5Hz,1H),5.43-5.39(m,1H),5.12-5.00(m,0.7H),4.74(d,J=10.6Hz,0.4H),4.32-4.25(m,1H),4.18-3.85(m,5H),3.81-3.45(m,8H),3.18-3.02(m,5H),2.93-2.80(m,4H),2.80-2.70(m,2H),2.42-2.36(m,1H),2.31-2.20(m,1H),2.18-1.96(m,6H),1.85-1.74(m,1H),1.74-1.63(m,1H),1.6 2-1.42(m,1H),1.32-1.16(m,4H),1.15-1.05(t,J=6.3Hz,4H),1.04-0.95(m,2H),0.95-0.85(m,5H),0.68-0.52(m,4H),0.52-0.37(m,4H)。以及LCMS(ESI):C52H65N7O8的m/z[M+H]计算值915.5;实验值916.7;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.36-9.28(m,1H),8.77(dd,J=4.7,1.8Hz,1H),8.62-8.57(m,0.5H),8.15-8.07(m,0.5H),7.95(s,1H),7.87-7.81(m,1H),7.65-7.51(m,3H),7.37-7.25(m,1H),7.10-7.03(m,1H),6.54(d,J=35.5Hz,1H),5.52-5.21(m,2H),4.78-4.66(m,0.5H),4.34-4.20(m,3H),4.15-3.85(m,4H),3.85-3.42(m,7H),3.22-3.11(m,3H),2.97-2.72(m,7H),2.62-2.54(m,1H),2.28-1.96(m,7H),1.95-1.74(m,2H),1.73-1.44(m,2H),1.42-1.37(m,3H),1.28-1.14(m,1H),1.03-0.85(m,6H),0.83-0.72(m,7H),0.71-0.55(m,3H)。
实施例A28.合成(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-[N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基]丁酰胺
Figure BDA0004194083620010461
步骤1.在Ar气氛下,在室温下向3-溴-4-(甲氧基甲基)吡啶(1.00g,5.0mmol)、4,4,5,5-四甲基-2-(四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(1.51g,5.9mmol)和KOAc(1.21g,12.3mmol)于甲苯(10mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2(362mg,0.5mmol)。将混合物加热至110℃并搅拌过夜,接着减压浓缩,得到4-(甲氧基甲基)-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶,将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C13H20BNO3的m/z[M+H]计算值249.2;实验值250.3。
步骤2.在Ar气氛下,在室温下向4-(甲氧基甲基)-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶(290mg,1.16mmol)、K3PO4(371mg,1.75mmol)和N-[(8S,14S)-21-碘-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(500mg,0.58mmol)于1,4-二噁烷(5mL)和H2O(1mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2(43mg,0.06mmol)。将混合物加热至70℃并搅拌2小时,接着添加H2O并用EtOAc(2×10mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈泡沫状的N-[(8S,14S)-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(370mg,74%产率)。LCMS(ESI):C48H67N5O7Si的m/z[M+H]计算值853.6;实验值854.6。
步骤3.在35℃下,将N-[(8S,14S)-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(350mg,0.41mmol)、Cs2CO3(267mg,0.82mmol)和EtI(128mg,0.82mmol)于DMF(4mL)中的混合物搅拌过夜。添加H2O并将混合物用EtOAc(2×15mL)萃取。将合并的有机层用盐水(15mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的N-[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(350mg,97%产率)。LCMS(ESI):C50H71N5O7Si的m/z[M+H]计算值881.5;实验值882.6。
步骤4.在Ar气氛下,在0℃下将N-[(8S,14S)-22-乙基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-4-[(三异丙基硅烷基)氧基]-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(350mg,0.4mmol)和1M TBAF的THF溶液(0.48mL,0.480mmol)于THF(3mL)中的混合物搅拌1小时。将混合物减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(230mg,80%产率)。LCMS(ESI):C41H51N5O7的m/z[M+H]计算值725.4;实验值726.6。
步骤5.在Ar气氛下,在0℃下向N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.28mmol)于1,4-二噁烷(2mL)中的混合物中添加4M HCl的1,4-二噁烷溶液(2mL,8mmol)。使混合物升温至室温并搅拌过夜,接着减压浓缩,得到(8S,14S)-8-氨基-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-9,15-二酮(200mg)。LCMS(ESI):C36H43N5O5的m/z[M+H]计算值625.3;实验值626.5。
步骤6.在0℃下,向(2S)-3-甲基-2-[N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基]丁酸(108mg,0.38mmol)和(8S,14S)-8-氨基-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-9,15-二酮(200mg,0.32mmol)于DC M(3mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(165mg,1.3mmol)和COMU(274mg,0.64mmol)。在0℃下,将混合物搅拌2小时,添加H2O并用EtOAc(2×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,接着通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]-3-甲基-2-[N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基]丁酰胺(16mg,5.6%产率)。LCMS(ESI):C50H63N7O8的m/z[M+H]计算值889.5;实验值890.6;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.33(dd,J=9.1,6.9Hz,1H),8.79-8.46(m,2H),7.93(s,1H),7.68-7.58(m,2H),7.53(t,J=8.5Hz,1H),7.26-6.98(m,2H),6.71-6.47(m,2H),6.24-6.07(m,1H),5.80-5.60(m,1H),5.49-5.18(m,1H),4.45-4.07(m,4H),4.08-3.87(m,3H),3.87-3.64(m,4H),3.64-3.40(m,5H),3.34(s,2H),3.30(s,2H),3.23(d,J=1.8Hz,1H),2.94-2.74(m,6H),2.16-2.01(m,3H),1.82-1.47(m,3H),1.08(q,J=8.9,8.0Hz,1H),1.00-0.88(m,6H),0.82(d,J=10.8Hz,4H),0.76-0.66(m,2H),0.44(d,J=14.2Hz,3H)。
实施例A316.合成(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620010501
步骤1.向2-(((1-((苯甲氧基)羰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸(650mg,2mmol)和二碳酸二叔丁酯(883mg,4mmol)于tBuOH(10mL)中的混合物中添加4-二甲基氨基吡啶(124mg,1mmol)。将混合物加热至30℃并搅拌1小时,接着用H2O(50mL)稀释并用EtOAc(50mL×3)萃取。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的3-(2-(叔丁氧基羰基)-3-甲基丁氧基)氮杂环丁烷-1-甲酸苯甲酯(450mg,56%产率)。LCMS(ESI):C21H31NO5Na的m/z[M+Na]计算值400.2;实验值400.2。
步骤2.在H2气氛(15psi)下,将3-(2-(叔丁氧基羰基)-3-甲基丁氧基)氮杂环丁烷-1-甲酸苯甲酯(450mg,1.19mmol)和Pd/C(50mg)于THF(30mL)中的混合物搅拌2小时。将混合物过滤并减压浓缩滤液,得到呈油状的2-((氮杂环丁烷-3-基氧基)甲基)-3-甲基丁酸叔丁酯(300mg,100%产率)。LCMS(ESI):C13H26NO3的m/z[M+H]计算值243.2;实验值244.2;1HNMR(400MHz,CDCl3)δ4.35-4.25(m,1H),3.71-3.63(m,2H),3.63-3.56(m,2H),3.50(t,J=8.0Hz,1H),3.43(dd,J=9.0,4.0Hz,1H),2.37-2.26(m,1H),2.21(br.s,1H),1.92-1.81(m,1H),1.47(s,9H),0.93(d,J=6.8Hz,6H)。
步骤3.在0℃下,向2-((氮杂环丁烷-3-基氧基)甲基)-3-甲基丁酸叔丁酯(270mg,1.11mmol)、4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酸(860mg,5.55mmol)和DIPEA(1.56g,11.1mmol)于DMF(20mL)中的混合物中添加T3P(2.12g,6.7mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,用EtOAc(200mL)稀释,接着用H2O(30mL×5)、盐水(30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸叔丁酯(200mg,47%产率)。LCMS(ESI):C21H36N2O4的m/z[M+H]计算值380.3;实验值381.3。
步骤4.向2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸叔丁酯(190mg,0.5mmol)于DCM(4mL)中的混合物中添加TFA(2mL)。将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈油状的2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸(162mg,100%产率),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C17H28N2O4的m/z[M+H]计算值324.2;实验值325.3。
步骤5.在室温下,向(2S)-3-(3-溴苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸(100g,290mmol)于DMF(1L)中的溶液中添加NaHCO3(48.8g,581.1mmol)和MeI(61.9g,435.8mmol)。将反应混合物搅拌16小时,接着用H2O(1L)淬灭并用EtOAc(3×1L)萃取。将合并的有机层用盐水(3×500mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(13%EtOAc/石油醚)纯化,得到(S)-3-(3-溴苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸甲酯(109g,粗品)。LCMS(ESI):C15H20BrNO4的m/z[M+Na]计算值380.05;实验值380.0。
步骤6.向(2S)-3-(3-溴苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(108g,301.5mmol)和双(频哪醇合)二硼(99.53g,391.93mmol)于1,4-二噁烷(3.2L)中的搅拌的溶液中添加KOAc(73.97g,753.70mmol)和Pd(dppf)Cl2(22.06g,30.15mmol)。将反应混合物加热至90℃,保持3小时,接着冷却至室温并用EtOAc(2×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(3×800mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(5% EtOAc/石油醚)纯化,得到(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯基)丙酸甲酯(96g,78.6%产率)。LCMS(ESI):C21H32BNO6的m/z[M+Na]计算值428.22;实验值428.1。
步骤7.向乙酸(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯基]丙酸甲酯(94g,231.9mmol)和3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(75.19g,231.93mmol)于1,4-二噁烷(1.5L)和H2O(300mL)中的混合物中添加K2CO3(64.11g,463.85mmol)和Pd(DtBPF)Cl2(15.12g,23.19mmol)。将反应混合物加热至70℃并搅拌4小时。将反应混合物用EtOAc(2×2L)萃取并将合并的有机层用盐水(3×600mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(20% EtOAc/石油醚)纯化,得到(S)-3-(3-(3-(3-乙酰氧基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸甲酯(130g,粗品)。LCMS(ESI):C30H38N2O6的m/z[M+H]计算值523.28;实验值523.1。
步骤8.在-10℃下,向(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚-5-基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(95.0g,181.8mmol)和碘(36.91g,145.41mmol)于THF(1L)中的溶液中添加AgOTf(70.0g,272.7mmol)和NaHCO3(22.9g,272.65mmol)。将反应混合物搅拌30分钟,接着通过在0℃下添加饱和Na2S2O3(100mL)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×1L)萃取并将合并的有机层用盐水(3×500mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到(S)-3-(3-(3-(3-乙酰氧基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸甲酯(49.3g,41.8%产率)。LCMS(ESI)m/z:C30H37IN2O6的[M+H]计算值:649.18;实验值649.1。
步骤9.向(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚-5-基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(60g,92.5mmol)于THF(600mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(19.41g,462.5mmol)于H2O(460mL)中的溶液。将所得溶液搅拌过夜,接着用HCl(1M)将pH值调至6。将所得溶液用EtOAc(2×500mL)萃取并将合并的有机层用饱和盐水(2×500mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酸(45g,82.1%产率)。LCMS(ESI):C27H33IN2O6的m/z[M+Na]计算值615.13;实验值615.1。
步骤10.向(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]苯基]丙酸(30g,50.6mmol)和(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(10.9g,75.9mmol)于DCM(400mL)中的溶液中添加NMM(40.97g,405.08mmol)、HOBT(2.05g,15.19mmol)和EDCI(19.41g,101.27mmol)。将反应混合物搅拌过夜,接着将混合物用饱和NH4Cl(2×200mL)和饱和盐水(2×200mL)洗涤,并将混合物经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(14g,38.5%产率)。LCMS(ESI):C33H43IN4O6的m/z[M+H]计算值718.23;实验值719.4。
步骤11.在0℃下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(92g,128.0mmol)于THF(920mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(26.86g,640.10mmol)于H2O(640mL)中的溶液。将反应混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(90g,粗品)。LCMS(ESI):C32H41IN4O6的m/z[M+H]计算值705.22;实验值705.1。
步骤12.在0℃下,向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(90g,127.73mmol)于DCM(10L)中的溶液中添加HOBt(34.52g,255.46mmol)、DIPEA(330.17g,2554.62mmol)和EDCI(367.29g,1915.96mmol)。将反应混合物搅拌16小时,接着减压浓缩。将混合物用DCM(2×2L)萃取并将合并的有机层用盐水(3×1L)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(70g,79.8%产率)。LCMS(ESI):C32H39IN4O5的m/z[M+H]计算值687.21;实验值687.1。
步骤13.在室温下,向1L圆底烧瓶中装入((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(22.0g,32.042mmol)、甲苯(300.0mL)、Pd2(dba)3(3.52g,3.845mmol)、S-Phos(3.95g,9.613mmol)和KOAc(9.43g,96.127mmol)。在搅拌下,在室温下向混合物中逐滴添加4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(26.66g,208.275mmol)。在60℃下,将所得溶液搅拌3小时。将所得混合物过滤,并用EtOAc洗涤滤饼。减压浓缩滤液并将剩余残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-12-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(22g,90%产率)。LCMS(ESI):C38H51BN4O7的m/z[M+H]计算值687.3;实验值687.4。
步骤14.在N2气氛下,将((63S,4S)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-12-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(2.0g,2.8mmol)、3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(0.60g,2.8mmol)、Pd(dppf)Cl2(0.39g,0.5mmol)和K3PO4(1.2g,6.0mmol)于1,4-二噁烷(50mL)和H2O(10mL)中的混合物加热至70℃并搅拌2小时。将混合物用H2O(50mL)稀释并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.5g,74%产率)。LCMS(ESI):C40H49N5O6的m/z[M+H]计算值695.4;实验值696.5。
步骤15.在0℃下,向((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(20g,28.7mmol)和Cs2CO3(18.7g,57.5mmol)于DMF(150mL)中的溶液中添加碘乙烷(13.45g,86.22mmol)于DMF(50mL)中的溶液。在35℃下,将所得混合物搅拌过夜,接着用H2O(500mL)稀释。将混合物用EtOAc(2×300mL)萃取并将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(4.23g,18.8%产率)和阻转异构体(5.78g,25.7%产率)。LCMS(ESI):C42H53N5O6的m/z[M+H]计算值724.4;实验值724.6。
步骤16.在0℃下,将((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.3g,1.7mmol)于TFA(10mL)和DCM(20mL)中的混合物搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到呈固体状的(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(1.30g,粗品)。LCMS(ESI):C37H45N5O4的m/z[M+H]计算值623.3;实验值624.4。
步骤17.在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(258mg,0.41mmol)和2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸(162mg,0.5mmol)于DMF(4mL)中的混合物中添加HATU(188mg,0.5mmol)和DIPEA(534mg,4.14mmol)于DMF(2mL)中的混合物。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着用H2O(30mL)稀释并用EtOAc(30mL×3)萃取。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-1H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(250mg,64%产率)。LCMS(ESI):C54H71N7O7的m/z[M+H]计算值929.5;实验值930.5;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.90-8.79(m,1H),8.54-8.21(m,1H),8.15-7.91(m,2H),7.88-7.67(m,2H),7.65-7.52(m,2H),7.47-7.15(m,2H),5.80-5.52(m,1H),4.53-4.23(m,5H),4.23-3.93(m,3H),3.90-3.76(m,2H),3.75-3.58(m,3H),3.57-3.44(m,1H),3.38(s,1H),3.29-3.26(m,2H),3.21-2.85(m,8H),2.82-2.65(m,3H),2.51-2.30(m,1H),2.24-2.03(m,1H),1.99-1.87(m,1H),1.86-1.69(m,6H),1.67-1.57(m,2H),1.57-1.39(m,4H),1.45-1.05(m,2H),1.04-0.96(m,3H),0.96-0.88(m,3H),0.88-0.79(m,3H),0.79-0.63(m,3H),0.56(s,1H)。
步骤18.将2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-1H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(180mg,0.194mmol)通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(41.8mg,23.2%产率)。LCMS(ESI):C54H71N7O7的m/z[M+H]计算值930.5;实验值930.5;1H NMR(400MHz,MeOD)δ8.74(d,J=4.0Hz,1H),8.53–8.30(m,1H),8.10–7.95(m,1H),7.94–7.80(m,2H),7.68(t,J=8.0Hz,1H),7.65–7.58(m,1H),7.58–7.46(m,2H),7.38–7.17(m,2H),5.73–5.60(m,1H),4.52–4.40(m,1H),4.35–4.15(m,4H),4.14–3.95(m,2H),3.90–3.72(m,3H),3.71–3.45(m,4H),3.30–3.20(m,3H),3.06–2.72(m,5H),2.49–2.28(m,4H),2.28–2.20(m,3H),2.18–2.06(m,1H),2.00–1.90(m,1H),1.90–1.52(m,4H),1.52–1.40(m,5H),1.40–1.22(m,4H),1.09–0.92(m,8H),0.90–0.75(m,3H),0.71–0.52(m,3H);以及呈固体状的(2S)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(51.2mg,28.4%产率)。LCMS(ESI):C54H71N7O7的m/z[M+H]计算值930.5;实验值930.3;1H NMR(400MHz,MeOD)δ8.74(d,J=4.0Hz,1H),8.28–8.20(m,0.6H),8.11–7.98(m,1H),7.97–7.80(m,2H),7.73–7.48(m,4H),7.46–7.36(m,0.4H),7.33–7.26(m,1H),7.25–7.13(m,1H),5.79–5.66(m,1H),4.54–4.43(m,1H),4.42–4.01(m,7H),3.90–3.75(m,2H),3.73–3.48(m,4H),3.27–3.12(m,3H),3.08–2.99(m,1H),2.96–2.85(m,2H),2.84–2.69(m,2H),2.69–2.49(m,6H),2.41–2.29(m,1H),2.15–2.05(m,1H),1.95–1.85(m,1H),1.84–1.71(m,1H),1.71–1.38(m,11H),1.14–1.00(m,3H),1.00–0.71(m,9H),0.70–0.56(m,3H)。
实施例A427.合成3-((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)丙酰胺
Figure BDA0004194083620010581
步骤1.向丙-2-炔酸叔丁酯(5g,40mmol)和甲酸[3-(3-羟基氮杂环丁烷-1-基)苯基]甲基酯(4.1g,20mmol)于DCM(150mL)中的混合物中添加DMAP(9.8g,80mmol)。将混合物搅拌2小时,接着用H2O稀释并用H2O(60mL×3)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(E)-3-((3-(叔丁氧基)-3-氧代丙-1-烯-1-基)氧基)氮杂环丁烷-1-甲酸苯甲酯(6.6g,90%产率)。LCMS(ESI):C18H23NO5Na的m/z[M+Na]计算值356.2;实验值356.2。
步骤2.在H2气氛(1个大气压)下,将(E)-3-((3-(叔丁氧基)-3-氧代丙-1-烯-1-基)氧基)氮杂环丁烷-1-甲酸苯甲酯(1.4g,4mmol)和Pd/C(200mg)于THF(10mL)中的混合物搅拌16小时。将混合物过滤并减压浓缩滤液,得到3-(氮杂环丁烷-3-基氧基)丙酸叔丁酯,将其直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C10H19NO3的m/z[M+H]计算值201.1;实验值202.2。
步骤3.在5℃下,向3-(氮杂环丁烷-3-基氧基)丙酸叔丁酯(300mg,1.5mmol)和4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酸(2.3g,15mmol)于DMF(15mL)中的混合物中逐滴添加DIPEA(1.9g,15mmol)和T3P(4.77g,7.5mmol)。在5℃下,将混合物搅拌2小时,接着添加H2O和EtOAc(80mL)。将有机层和水层分离并将有机层用H2O(20mL×3)、盐水(30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈油状的3-((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)丙酸叔丁酯(60mg,12%产率)。LCMS(ESI):C18H30N2O4的m/z[M+H]计算值338.2;实验值339.2。
步骤4.在0-5℃下,将3-((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)丙酸叔丁酯(70mg,0.21mmol)于TFA/DCM(1:3,2mL)中的混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的3-({1-[4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基]氮杂环丁烷-3-基}氧基)丙酸(56mg,95%产率)。LCMS(ESI):C14H22N2O4的m/z[M+H]计算值282.2;实验值283.3。
步骤5.在0℃下,向3-((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)丙酸(56mg,0.19mmol)、(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(90mg,0.14mmol)和DIPEA(200mg,1.9mmol)于DMF(1mL)中的混合物中逐份添加HATU(110mg,0.38mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着添加H2O并用EtOAx(150mL×2)萃取混合物。将合并的有机层用H2O(150mL)和盐水(150mL)洗涤,接着经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的3-((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)丙酰胺(12.6mg,7.5%产率)。LCMS(ESI):C48H62N8O7S的m/z[M+H]计算值894.5;实验值895.3;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.73(dd,J=4.8,1.6Hz,1H),8.57(s,1H),8.28(s,0.3H),7.84(m,1H),7.71(m,1H),7.52(m,3H),5.76(dd,J=30.2,7.8Hz,1H),4.40(m,4H),4.32-4.12(m,4H),4.06(dd,J=12.4,6.0Hz,1H),3.97-3.86(m,1H),3.79-3.66(m,4H),3.46(dd,J=14.8,4.8Hz,1H),3.41-3.33(m,3H),3.29-3.19(m,1H),3.17-3.05(m,1H),2.79(m,1H),2.73-2.50(m,3H),2.49-2.43(m,3H),2.38(s,3H),2.21(dd,J=12.6,9.6Hz,1H),1.95(d,J=12.8Hz,1H),1.86-1.73(m,1H),1.61(dd,J=12.6,3.6Hz,1H),1.51(s,2H),1.46-1.43(m,4H),1.38-1.27(m,3H),1.01-0.86(m,6H),0.44(d,J=11.6Hz,3H)。
实施例A716.合成(3S)-1-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺
Figure BDA0004194083620010611
步骤1.向(叔丁氧基羰基)-L-丝氨酸甲酯(10g,45mmol)于无水MeCN(150mL)中的溶液中添加DIPEA(17g,137mmol)。在45℃下,将反应混合物搅拌2小时,得到呈溶液形式的2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙烯酸甲酯。LCMS(ESI):C9H15NO4的m/z[M+Na]计算值201.1;实验值224.1。
步骤2.在0℃下,向2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙烯酸甲酯(12g,60mmol)于无水MeCN(150mL)中的溶液中添加4-DMAP(13g,90mmol)和(Boc)2O(26g,120mmol)。搅拌反应6小时,接着用H2O(100mL)淬灭并用DCM(200mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(150mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的2-(双(叔丁氧基羰基)氨基)丙烯酸甲酯(12.5g,65%产率)。LCMS(ESI):C14H23NO6的m/z[M+Na]计算值301.2;实验值324.1。
步骤3.在Ar气氛下,向5-溴-1,2,3,6-四氢吡啶(8.0g,49mmol)于MeOH(120mL)中的混合物中添加2-{双[(叔丁氧基)羰基]氨基}丙-2-烯酸甲酯(22g,74mmol)。将混合物搅拌16小时,接着减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的2-(双(叔丁氧基羰基)氨基)-3-(5-溴-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)丙酸甲酯(12g,47%产率)。LCMS(ESI):C19H31BrN2O6的m/z[M+H]计算值462.1;实验值463.1。
步骤4.向2-(双(叔丁氧基羰基)氨基)-3-(5-溴-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)丙酸甲酯(14g,30mmol)于1,4-二噁烷(30mL)和H2O(12mL)中的混合物中添加LiOH(3.6g,151mmol)。将混合物加热至35℃并搅拌12小时,接着添加1M HCl并将pH值调至约3-4。将混合物用DCM(300mL×2)萃取并将合并的有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,得到呈固体状的3-(5-溴-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(10g,85%产率)。LCMS(ESI):C13H21BrN2O4的m/z[M+H]计算值348.1;实验值349.0。
步骤5.在Ar气氛下,在0℃下向3-(5-溴-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(10g,30mmol)、DIPEA(12g,93mmol)和(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(5.4g,37mmol)于DMF(100mL)中的混合物中添加HATU(13g,34mmol)。在0℃下,将混合物搅拌2小时,接着添加H2O并用EtOAc(300mL×2)萃取混合物。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(3S)-1-(3-(5-溴-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(9.0g,55%产率)。LCMS(ESI):C19H31BrN4O5的m/z[M+H]计算值474.1;实验值475.1。
步骤6.在Ar气氛下,将(3S)-1-(3-(5-溴-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(9.0g,18mmol)、K2CO3(4.5g,32mmol)、Pd(dppf)Cl2.DCM(1.4g,2mmol)、3-(1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(9.8g,20mmol)于1,4-二噁烷(90mL)和H2O(10mL)中的混合物加热至75℃并搅拌2小时。添加H2O并将混合物用EtOAc(200mL×3)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(3S)-1-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(4.0g,25%产率)。LCMS(ESI):C42H60N6O7的m/z[M+H]计算值760.5;实验值761.4。
步骤7.在0℃下,向(3S)-1-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(4.1g,5.0mmol)于THF(35mL)中的混合物中添加LiOH(0.60g,27mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1.5小时,接着添加1M HCl以将pH值调至约6-7并用EtOAc(200mL×3)萃取混合物。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(3S)-1-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(3.6g,80%产率)。LCMS(ESI):C41H58N6O7的m/z[M+H]计算值746.4;实验值747.4。
步骤8.在Ar气氛下,向(3S)-1-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(3.6g,5.0mmol)和DIPEA(24g,190mmol)于DCM(700mL)中的混合物中添加EDCI.HCl(28g,140mmol)和HOBT(6.5g,50mmol)。将混合物加热至30℃并在30℃下搅拌16小时,接着减压浓缩。将残余物用EtOAc(200mL)稀释并用H2O(200mL×2)、盐水(200mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.45g,40%产率)。LCMS(ESI):C41H56N6O6的m/z[M+H]计算值728.4;实验值729.4。
步骤9.在0℃下,向((63S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(130mg,0.20mmol)于DCM(1.0mL)中的混合物中添加TFA(0.3mL)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着减压浓缩,得到(63S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮,将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C36H48N6O4的m/z[M+H]计算值628.4;实验值629.4。
步骤10.在Ar气氛下,在0℃下,向((63S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(130mg,0.2mmol)、DIPEA(270mg,2.0mmol)和(2S)-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酸(118mg,0.40mmol)于DMF(3.0mL)中的混合物中分数份添加HATU(87mg,0.30mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着用H2O稀释,用EtOAc(30mL×2)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(3S)-1-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺(17.2mg,10%产率)。LCMS(ESI):C50H68N6O4的m/z[M+H]计算值892.5;实验值893.5;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.74(d,J=4.4Hz,1H),7.93-7.90(m,1H),7.56-7.51(m,3H),7.43(d,J=4.4Hz,1H),6.63-6.53(m,2H),6.33-6.23(m,2H),5.83-5.70(m,1H),4.73-4.70(d,J=11.0Hz,1H),4.48-4.45(d,J=13.0Hz,1H),4.12-4.10(m,3H),3.86-3.81(m,4H),3.79-3.75(m,1H),3.72-3.69(m,3H),3.57-3.47(m,2H),3.21-3.09(m,1H),3.07-3.04(q,4H),3.02-2.95(m,3H),2.86-2.82(m,3H),2.66-2.48(m,2H),2.29-2.17(m,4H),2.11-1.98(m,2H),1.95-1.91(m,1H),1.45(d,J=6.2Hz,3H),1.23-1.16(m,2H),1.09-1.04(m,1H),0.97-0.93(m,3H),0.92-0.81(m,5H),0.67-0.63(m,3H)。
实施例A663.合成(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)373吡啶373-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)373吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620010651
在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)373吡啶-3-基)-10,10-二甲基-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(100mg,0.16mmol)、
Figure BDA0004194083620010652
-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)373吡啶373-3-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸(80mg,0.24mmol)和DIPEA(825mg,6.4mmol)于DMF(2mL)中的混合物中添加HATU(95mg,0.24mmol)。在0℃下,将反应混合物搅拌1小时,接着倒入H2O(60mL)中,用EtOAc(80mL×2)萃取。将合并的有机层用H2O(80mL)和盐水(80mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法纯化,得到呈固体状的(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)373吡啶373-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)373吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(55mg,36%产率)。1HNMR(400MHz,CD3OD)δ8.76–8.70(m,1H),8.49(dd,J=4.3,1.4Hz,0.1H),7.93–7.87(m,1H),7.58–7.50(m,3H),7.41(dd,J=8.8,3.2Hz,1H),6.26(d,J=16.8Hz,1H),5.96(t,J=9.6Hz,1H),4.47(d,J=12.8Hz,1H),4.39–4.28(m,2H),4.21–3.97(m,5H),3.96–3.70(m,5H),3.68–3.54(m,3H),3.51–3.35(m,1H),3.11(d,J=22.7Hz,3H),3.00–2.67(m,5H),2.46–2.30(m,7H),2.24(s,3H),2.11(d,J=12.4Hz,1H),1.92(d,J=13.2Hz,1H),1.85–1.60(m,3H),1.45(d,J=7.8Hz,6H),1.32(d,J=16.0Hz,3H),1.12(dt,J=24.5,6.8Hz,3H),0.95(m,6H),0.76(m,6H)。LCMS(ESI):C53H74N8O7的m/z[M+H]计算值934.6;实验值935.5。
实施例A646.合成(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(3,1)-哌啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620010661
步骤1.在H2气氛下,在25℃下将((63S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(0.2g,0.28mmol)和Pd/C(0.2g,2mmol)于MeOH(10mL)中的混合物搅拌16小时。将反应混合物通过硅藻土过滤,减压浓缩,得到呈固体状的((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(3,1)-哌啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯。LCMS(ESI):C41H58N6O6的m/z[M+H]计算值730.4;实验值731.4。
步骤2.在0℃下,向((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(3,1)-哌啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(150mg,0.2mmol)于DCM(1.5mL)中的溶液中添加TFA(0.5mL)。在20℃下,将反应混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(3,1)-哌啶杂环十一蕃-5,7-二酮。LCMS(ESI):C36H50N6O4的m/z[M+H]计算值630.4;实验值631.4。
步骤3.在氩气氛下,在0℃下向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(3,1)-哌啶杂环十一蕃-5,7-二酮(240mg,0.4mmol)、DIPEA(982mg,2mmol)和(R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸(148mg,0.45mmol)于DMF(4mL)中的混合物中分数份添加HATU(173mg,0.46mmol)。在氩气氛下,在0℃下将反应混合物搅拌1小时,接着在0℃下用H2O淬灭。将所得混合物用EtOAc(30mL×2)萃取。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法纯化,得到呈固体状的(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(3,1)-哌啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(150mg,38%产率)。1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.72(d,J=4.8Hz,1H),7.88(d,J=8.0Hz,1H),7.53-7.49(m,2H),7.42(d,J=8.4Hz,1H),7.18(d,J=8.4Hz,1H),5.95-5.91(m,1H),4.52-4.49(m,1H),4.37-4.25(m,3H),4.18-4.15(m,2H),3.99-3.98(m,2H),3.90-3.86(m,1H),3.76-3.68(m,2H),3.55-3.50(m,2H),3.39-3.36(m,2H),3.20(s,3H),3.02(s,3H),2.89-2.79(m,3H),2.62-2.50(m,2H),2.36(s,3H),2.35-2.30(m,1H),2.26(s,3H),2.20-1.15(m,1H),1.97-1.93(m,3H),1.81-1.76(m,4H),1.64-1.61(m,2H),1.46-1.43(m,6H),1.36(d,J=14.8Hz,3H),1.02(s,3H),0.94(m,6H),0.81(s,3H),0.65(s,3H)。LCMS(ESI):C53H76N8O7的m/z[M+H]计算值936.6;实验值937.5。
实施例A740.合成(3S)-1-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((23S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(3,1)-哌啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺
Figure BDA0004194083620010681
在Ar气氛下,在0℃下向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(3,1)-哌啶杂环十一蕃-5,7-二酮(140mg,0.20mmol)、DIPEA(570mg,4.4mmol)和(2S)-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酸(124mg,0.40mmol)于DMF(3.0mL)中的混合物中分数份添加HATU(100mg,0.30mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着添加H2O并用EtOAc(2×30mL)萃取混合物。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(3S)-1-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((23S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(3,1)-哌啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺(41mg,20%产率)。LCMS(ESI):C50H70N8O7的m/z[M+H]计算值894.5;实验值895.5;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.72(d,J=4.8Hz,1H),7.87(d,J=7.6Hz,1H),7.51-7.49(m,2H),7.42-7.37(m,1H),7.18-7.14(m,1H),6.64-6.54(m,1H),6.30-6.23(m,1H),5.77-5.70(m,2H),4.65-4.60(m,1H),4.50-4.40(m,1H),4.27-4.16(m,2H),4.00-3.95(m,2H),3.83-3.78(m,2H),3.73-3.60(m,4H),3.51-3.36(m,3H),3.22-3.19(m,4H),3.07(d,J=6.8Hz,2H),2.99(d,J=12.0Hz,3H),2.90-2.78(m,2H),2.75-2.64(m,3H),2.20-2.10(m,4H),2.02-1.93(m,3H),1.87-1.64(m,4H),1.45(d,J=4.8Hz,3H),1.06-1.00(m,4H),0.97-0.89(m,3H),0.83-0.79(m,3H),0.66(s,3H)。
实施例A534.(2S)-2-((S)-7-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620010691
步骤1.在氮气氛下,在-78℃下向吡咯烷-1,3-二甲酸1-叔丁酯3-甲酯(20.0g,87.2mmol)于THF(150mL)中的混合物中添加1MLiHMDS的THF溶液(113.4mL,113.4mmol)。在-78℃下搅拌40分钟后,添加烯丙基溴(13.72g,113.4mmol)并使混合物升温至室温,并搅拌4小时。将混合物冷却至0℃,添加饱和NaCl(30mL)并用EtOAc萃取混合物。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的3-烯丙基吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(17g,72%产率)。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ5.80-5.60(m,1H),5.16-5.02(m,2H),3.71(s,4H),3.42(d,J=9.3Hz,2H),3.27(t,J=11.2Hz,1H),2.42(d,J=7.6Hz,2H),2.38-2.24(m,1H),2.05(s,1H),1.85(dt,J=14.3,7.5Hz,1H),1.46(s,10H),1.27(t,J=7.1Hz,1H)。
步骤2.在0℃下,向3-烯丙基吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(4.0g,14.9mmol)和2,6-二甲基吡啶(3.18g,29.7mmol)于1,4-二噁烷(200mL)和H2O(100mL)中的混合物中分数份添加K2OsO42H2O(0.11g,0.3mmol)。在0℃下,将混合物搅拌15分钟,接着分数份添加NaIO4(6.35g,29.7mmol)。在室温下,将混合物在室温下搅拌3小时,接着冷却至0℃并添加饱和Na2S2O3水溶液(50mL)。将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取并将合并的有机层用2M HCl洗涤,接着经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,得到呈油状的3-(2-氧代乙基)吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(4g,52%产率)。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ5.80-5.60(m,1H),5.16-5.04(m,2H),3.72(s,3H),3.41(s,3H),3.28(d,J=11.0Hz,1H),2.44(s,2H),2.31(d,J=9.1Hz,1H),1.85(dt,J=12.7,7.5Hz,1H),1.69(s,1H),1.47(s,10H)。
步骤3.在0℃下,向3-(2-氧代乙基)吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(6.30g,23.2mmol)于MeOH(70mL)中的混合物中添加(2S)-2-氨基-3-甲基丁酸苯甲酯(7.22g,34.8mmol)和ZnCl2(4.75g,34.8mmol)。将混合物升温至室温并搅拌30分钟,接着冷却至0℃并分数份添加NaCNBH3(2.92g,46.4mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着冷却至0℃并添加饱和NH4Cl水溶液。将混合物用EtOAc(3×200mL)萃取并将合并的有机层用盐水(150mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的3-(2-(((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)乙基)吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(6.4g,54%产率)。LCMS(ESI):C25H38N2O6的m/z[M+H]计算值462.3;实验值463.4。
步骤4.向3-(2-(((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)乙基)吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(4.50g,9.7mmol)于甲苯(50mL)中的混合物中添加DIPEA(12.57g,97.3mmol)和DMAP(1.19g,9.7mmol)。将所得混合物加热至80℃并搅拌24小时,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,接着通过手性HPLC纯化,得到(R)-7-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(1.0g,32%产率)和(S)-7-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(1.0g,32%产率),都呈油状。LCMS(ESI):C24H34N2O5的m/z[M+H]计算值430.5;实验值431.2;以及LCMS(ESI):C24H34N2O5的m/z[M+H]计算值430.3;实验值431.2。
步骤5.在H2气氛下,在室温下搅拌(R)-7-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(4.0g)和10% Pd/C(1g)于MeOH(40mL)中的混合物。将混合物通过硅藻土垫过滤并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(S)-2-((R)-7-(叔丁氧基羰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-3-甲基丁酸(4.9g)。LCMS(ESI):C17H28N2O5的m/z[M-H]计算值340.2;实验值339.3。
步骤6.在0℃下,经1分钟向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(500mg,0.8mmol)于DCM中的混合物中分数份添加DIPEA(829mg,6.4mmol)、((S)-2-((R)-7-(叔丁氧基羰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-3-甲基丁酸(273mg,0.8mmol)和HATU(396mg,1.0mmol)。使混合物升温至室温并搅拌2小时,接着减压浓缩并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈油状的(5R)-7-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(500mg,64%产率)。LCMS(ESI):C54H71N7O8的m/z[M+H]计算值945.5;实验值946.5。
步骤7.在0℃下,向(5R)-7-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(1.0g,1.06mmol)于DCM(10mL)中的混合物中逐滴添加TFA(3mL)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着减压浓缩,得到(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-((S)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酰胺(1.3g)。LCMS(ESI):C49H63N7O6的m/z[M-H]计算值846.1;实验值845.5。
步骤8.在0℃下,向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-((S)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酰胺(500mg,0.59mmol)和DIPEA(764mg,5.9mmol)于DMF(5mL)中的混合物中分数份添加4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酸(110mg,0.71mmol)和HATU(292mg,0.77mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着添加H2O(10mL)并用EtOAc(10mL×3)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈白色固体状的(2S)-2-((S)-7-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(177mg,28.94%产率)。LCMS(ESI):C57H74N8O7的m/z[M+H]计算值982.6;实验值983.8;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.76(dd,J=4.7,1.7Hz,1H),8.52(d,J=7.9Hz,1H),7.99(d,J=1.7Hz,1H),7.83(d,J=10.2Hz,2H),7.74-7.58(m,3H),7.53(dd,J=7.7,4.8Hz,1H),7.24(t,J=7.6Hz,1H),7.12(d,J=7.6Hz,1H),5.32(d,J=9.7Hz,2H),4.33-4.20(m,4H),4.03(dd,J=15.0,8.6Hz,2H),3.88-3.82(m,1H),3.63(dq,J=20.5,10.3Hz,4H),3.42-3.34(m,2H),3.21(s,1H),3.13(d,J=2.8Hz,3H),2.87(s,2H),2.83-2.72(m,2H),2.69-2.62(m,1H),2.21(d,J=22.6Hz,6H),2.12-1.76(m,7H),1.75-1.47(m,2H),1.46-1.28(m,9H),0.99-0.89(m,6H),0.79-0.71(m,6H),0.52(s,3H)。
实施例A341.合成(3S)-1-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((63S,4S)-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺
Figure BDA0004194083620010741
步骤1.在N2气氛下,在0℃下向3-溴-5-碘苯甲醛(4.34g,14.0mmol)于DCM中的混合物中逐滴添加BAST(6.8g,30.7mmol)和EtOH(129mg,2.8mmol)。通过微波加热,将混合物在27℃下加热14小时。添加H2O(500mL)并将混合物用DCM(200mL×3)萃取,将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的1-溴-3-(二氟甲基)-5-碘苯(3.2g,65%产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.16(p,J=1.2Hz,1H),7.94(p,J=1.3Hz,1H),7.81(p,J=1.3Hz,1H),7.00(t,J=55.3Hz,1H)。
步骤2.在Ar气氛下,在50℃下将Zn(2.28g,34.8mmol)和I2(442mg,1.74mmol)于DMF(20mL)中的混合物搅拌0.5小时。向这一混合物中添加(甲基(R)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-碘丙酸甲酯(2.39g,7.25mmol)于DMF(20mL)中的溶液并在50℃下将混合物搅拌2小时。冷却后,将混合物添加至于DMF(20mL)中的1-溴-3-(二氟甲基)-5-碘苯(2.90g,8.7mmol)、Pd2(dba)3(239mg,0.26mmol)和三-2-呋喃基膦(162mg,0.7mmol)中。将混合物加热至70℃并搅拌2小时,接着添加H2O(200mL)并用EtOAc(200mL×3)萃取混合物。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-3-(3-溴-5-(二氟甲基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸甲酯(560mg,19%产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ7.65(d,J=10.0Hz,2H),7.47(s,1H),7.36(d,J=8.4Hz,1H),7.00(t,J=55.6Hz,1H),4.25(td,J=9.6,4.7Hz,1H),3.64(s,3H),3.11(dd,J=13.6,4.9Hz,1H),3.00-2.80(m,1H),1.32(s,9H)。
步骤3.在N2气氛下,在0℃下向(S)-3-(3-溴-5-(二氟甲基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸甲酯(650mg,1.6mmol)于THF(1.5mL)中的混合物中添加于H2O(1.50mL)中的LiOH(114mg,4.8mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着用1M HCl酸化至pH5。将混合物用DCM/MeOH(10/1)(100mL×3)萃取并将合并的有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,得到(S)-3-(3-溴-5-(二氟甲基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(500mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C15H18BrF2NO4的m/z[M+H]计算值393.0;实验值392.1。
步骤4.在N2气氛下,在0℃下向(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(475mg,3.3mmol)于DCM(10mL)中的混合物中添加N-甲基吗啉(3.34g,33.0mmol)和(S)-3-(3-溴-5-(二氟甲基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(650mg,1.7mmol)以及HOBt(45mg,0.33mmol)和EDCI(632mg,3.3mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用DCM(100mL)和H2O稀释。将有机层和水层分离并用DCM(100mL×3)萃取水层。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((S)-3-(3-溴-5-(二氟甲基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(510mg,56%产率)。LCMS(ESI):C21H28BrF2N3O5的m/z[M+H]计算值519.1;实验值520.3。
步骤5.向4,4,5,5-四甲基-2-(四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(488mg,1.92mmol)和(S)-1-((S)-3-(3-溴-5-(二氟甲基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(500mg,0.96mmol)于1,4-二噁烷(5mL)中的混合物中分数份添加Pd(dppf)Cl2(70mg,0.07mmol)和KOAc(236mg,2.4mmol)。将混合物加热至90℃并搅拌4小时,接着用H2O(100mL)稀释。将混合物用DCM(100mL×3)萃取并将合并的有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(423mg,73%产率)。LCMS(ESI):C27H40BF2N3O7的m/z[M+H]计算值567.3;实验值568.2。
步骤6.向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(260mg,0.47mmol)、(S)-3-(5-溴-1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇和Pd(dppf)Cl2(34mg,0.05mmol)于1,4-二噁烷(3mL)和H2O(0.6mL)中的混合物中添加K2CO3(163mg,1.12mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌16小时,接着用H2O(100mL)稀释并用DCM(100mL×3)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(350mg,78%产率)。LCMS(ESI):C44H57F2N5O7的m/z[M+H]计算值805.4;实验值806.6。
步骤7.在0℃下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(350mg,0.43mmol)于THF(2.8mL)中的混合物中添加于H2O(0.7mL)中的LiOH H2O(54mg,1.3mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着用1M HCl酸化至pH 5并用EtOAc(50mL×3)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(356mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C43H55F2N5O7的m/z[M+H]计算值791.4;实验值792.6。
步骤8.向S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(356mg,0.45mmol)和DIPEA(1.74g,13.5mmol)于DCM中的混合物中添加EDCI(2.41g,12.6mmol)和HOBt(304mg,2.3mmol)。将混合物搅拌16小时,接着添加H2O并用EtOAc(200mL×3)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(50mL×4)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到((63S,4S)-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(202mg,51%产率)。LCMS(ESI):C43H53F2N5O6的m/z[M+H]计算值773.4;实验值774.6。
步骤9.在0℃下,向((63S,4S)-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(202mg,0.26mmol)于DCM(2mL)中的混合物中逐滴添加TFA(1.0mL)。在0℃下,将混合物搅拌1.5小时,接着减压浓缩并与甲苯(3mL×3)共沸干燥,得到(63S,4S)-4-氨基-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮,将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C38H45F2N5O4的m/z[M+H]计算值673.3;实验值674.5。
步骤10.在Ar气氛下,向(63S,4S)-4-氨基-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(202mg,0.3mmol)和(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)(甲基)氨基]-3-甲基丁酸(139mg,0.6mmol)于THF中的混合物中添加DIPEA(581mg,4.5mmol)、EDCI(86mg,0.45mmol)和HOBt(61mg,0.45mmol)。将混合物搅拌16小时,接着添加H2O(100mL)并用EtOAc(200mL×3)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(50mL×3)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((2S)-1-(((63S,4S)-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(135mg,46%产率)。LCMS(ESI):C49H64F2N6O7的m/z[M+H]计算值886.5;实验值887.6。
步骤11.在N2气氛下,在0℃下向((2S)-1-(((63S,4S)-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(130mg,0.15mmol)于DCM中的混合物中逐滴添加TFA(1.0mL)。在0℃下,将混合物搅拌1.5小时,接着减压浓缩并与甲苯(3mL×3)共沸干燥,得到(2S)-N-((63S,4S)-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(130mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C44H56F2N6O5的m/z[M+H]计算值786.4;实验值787.6。
步骤12.在N2气氛下,在0℃下向(2S)-N-((63S,4S)-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(130mg,0.17mmol)和(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-甲酸(56mg,0.33mmol)于MeCN(1.5mL)中的混合物中添加DIPEA(427mg,3.3mmol)和CIP(69mg,0.25mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着添加H2O(100mL)并用EtOAc(200mL×3)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(50mL×3)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(3S)-1-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((63S,4S)-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺(58mg,36%产率)。LCMS(ESI):C52H65F2N7O7的m/z[M+H]计算值937.4;实验值938.1;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.78(dd,J=4.8,1.7Hz,1H),8.43-8.21(m,1H),8.02(s,2H),7.93-7.81(m,2H),7.76(dd,J=9.3,3.9Hz,1H),7.66(d,J=8.7Hz,1H),7.56(dd,J=7.7,4.8Hz,1H),7.34(d,J=5.4Hz,1H),7.20-6.86(m,1H),6.80-6.40(m,1H),6.15(ddt,J=16.8,4.9,2.4Hz,1H),5.90-5.60(m,1H),5.59-5.19(m,2H),4.71(dd,J=10.7,3.1Hz,1H),4.40-4.17(m,3H),4.12-3.90(m,3H),3.85-3.71(m,1H),3.61(tdd,J=23.4,9.9,4.3Hz,6H),3.40-3.30(m,2H),3.11(d,J=6.8Hz,3H),3.08-2.90(m,2H),2.87(s,2H),2.84(s,3H),2.69-2.30(d,J=16.5Hz,1H),2.30-1.79(m,5H),1.75-1.45(m,2H),1.40(d,J=6.1Hz,3H),1.05-0.85(m,6H),0.85-0.66(m,6H),0.57(d,J=11.8Hz,3H)。
实施例A741.合成(3S)-1-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((23S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-哌啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺
Figure BDA0004194083620010801
步骤1.在0℃下,向(3R)-3-(羟基甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(10g,46.45mmol)于DCM(200mL)中的溶液中添加PPh3(15.8g,60.4mmol)、咪唑(4.7g,69.7mmol)和I2(14.1g,55.74mmol)。在20℃下,将反应悬浮液搅拌17小时,接着减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(3R)-3-(碘甲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(10g,66%产率)。LCMS(ESI):C11H20INO2的m/z[M+H]计算值325.1;未发现质量。
步骤2.在N2气氛下,在-60℃下向3-异丙基-2,5-二甲氧基-3,6-二氢吡嗪(10.8g,58.9mmol)于THF(150mL)中的混合物中添加n-BuLi(47mL,2.5M于己烷中,117.7mmol)逐滴。将混合物升温至0℃并搅拌2小时,接着再冷却至-60℃,并缓慢逐滴添加(3R)-3-(碘甲基)哌啶-1-基甲酸叔丁酯(9.60g,29.4mmol)于THF(50mL)中的溶液。在-60℃下,将混合物搅拌2小时,接着升温至室温并搅拌2小时。缓慢添加饱和NH4Cl(150mL)并用EtOAc(150mL×2)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(200mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压减少滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈胶状的(3S)-3-{[(2S)-5-异丙基-3,6-二甲氧基-2,5-二氢吡嗪-2-基]甲基}哌啶-1-基甲酸叔丁酯(5.3g,46%产率)。LCMS(ESI):C20H35N3O4的m/z[M+H]计算值381.5;实验值382.3。
步骤3.向(3S)-3-{[(2S)-5-异丙基-3,6-二甲氧基-2,5-二氢吡嗪-2-基]甲基}哌啶-1-基甲酸叔丁酯(5.30g,13.9mol)于MeCN(4mL)中的混合物中逐滴添加1M HCl(27.7mL,27.7mmol)。将混合物搅拌2小时,接着添加饱和NaHCO3,直至约pH 7-8,接着用DCM(30mL×2)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到呈油状的(S)-叔丁基3-((S)-2-氨基-3-甲氧基-3-氧代丙基)哌啶-1-甲酸甲酯(4.3g,95%产率),将其不经进一步纯化即用于下一步骤中。LCMS(ESI):C14H26N2O4的m/z[M+H]计算值286.2;实验值287.3。
步骤4.在-10℃下,向(S)-叔丁基3-((S)-2-氨基-3-甲氧基-3-氧代丙基)哌啶-1-甲酸甲酯(4.30g,15.0mmol)于EtOAc(30mL)和H2O(20mL)中的混合物中添加NaHCO3(3.77g,44.88mmol)。在-10℃下,将混合物搅拌10分钟,接着逐滴添加氯甲酸苯甲酯(3.83g,22.44mmol)的溶液。将混合物升温至0℃并搅拌1小时,接着添加H2O(50mL)并用EtOAc(50mL×2)萃取混合物。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液,得到呈胶状的(3S)-3-[(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-甲氧基-3-氧代丙基]哌啶-1-甲酸叔丁酯(4.0g,60%产率)。LCMS(ESI):C17H24N2O4的m/z[M-Boc+H]计算值320.2;实验值321.3。
步骤5.向(3S)-3-[(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-甲氧基-3-氧代丙基]哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.0g,2.38mmol)于EtOAc(8mL)中的混合物中添加2M HCl的EtOAc溶液(11.9mL,23.8mmol)。将混合物搅拌2小时,接着添加饱和NaHCO3,直至约pH 8-9,并用DCM(30mL×3)萃取混合物。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到呈胶状的(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(3S)-哌啶-3-基]丙酸酯(740mg,91%产率)。LCMS(ESI):C17H24N2O4的m/z[M+H]计算值320.2;实验值321.2。
步骤6.向(3-{3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基}-1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基)硼烷二醇(5.47g,8.43mmol)和(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(3S)-哌啶-3-基]丙酸甲酯(2.70g,8.43mmol)于DCM(70mL)中的混合物中添加Cu(OAc)2(6.06g,16.86mmol)和吡啶(2.0g,25.3mmol)。在O2气氛下将混合物搅拌48小时,接着用DCM(200mL)稀释并用H2O(150mL×2)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(3S)-1-(3-{3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基}-1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基)哌啶-3-基]丙酸甲酯(3.6g,42%产率)。LCMS(ESI):C56H70N4O6Si的m/z[M/2+H]计算值462.3;实验值462.3。
步骤7.向2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(3S)-1-(3-{3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基}-1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基)哌啶-3-基]丙酸甲酯(3.60g,3.57mmol)于THF(60mL)和H2O(30mL)中的混合物中添加LiOH(342mg,14.28mmol)。将混合物搅拌2小时,接着用H2O(150mL)稀释,接着缓慢添加1M HCl,直至约pH 3-4,并用EtOAc(200mL×3)萃取混合物。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈固体状的2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(3S)-1-(3-{3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基}-1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基)哌啶-3-基]丙酸(3.3g,85%产率),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C55H68N4O6Si的m/z[M/2+H]计算值455.3;实验值455.3。
步骤8.向2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(3S)-1-(3-{3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基}-1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基)哌啶-3-基]丙酸甲酯(3.30g,2.91mmol)于DMF(40mL)中的混合物中添加(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(0.42g,2.91mmol)、HATU(2.21g,5.82mmol)和DIPEA(2.26g,17.46mmol)。将混合物搅拌3小时,接着倒入冰-H2O中并用EtOAc(120mL×2)萃取。将合并的有机层用饱和NaHCO3(150mL)、盐水(150mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈胶状的(3S)-1-[(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(3S)-1-(3-{3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基}-1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基)哌啶-3-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(2.9g,95%产率)。LCMS(ESI):C61H78N6O7Si的m/z[M/2+H]计算值518.3;实验值518.3。
步骤9.向(3S)-1-[(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(3S)-1-(3-{3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基}-1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基)哌啶-3-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(1.70g,1.64mmol)的混合物中添加1M TBAF的THF溶液(19.68mL,19.68mmol)和AcOH(1.18g,19.68mmol)的混合物。将反应加热至60℃并搅拌22小时,接着用EtOAc(80mL)稀释并用饱和NaHCO3(80mL)、H2O(60mL×2)和盐水(60mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(3S)-1-[(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(3S)-1-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基]哌啶-3-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(1.0g,73%产率)。LCMS(ESI):C45H60N6O7的m/z[M/2+H]计算值399.2;实验值399.4。
步骤10.向(3S)-1-[(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(3S)-1-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基]哌啶-3-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(1.0g,1.1mmol)于1,2-二氯乙烷(10mL)中的混合物中添加Me3SnOH(1.42g,7.84mmol)。将混合物加热至65℃并搅拌10小时,接着过滤并减压浓缩滤液,得到呈胶状的(3S)-1-[(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(3S)-1-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基]哌啶-3-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(1.0g,99%产率)。将产物不经进一步纯化即用于下一步骤中。LCMS(ESI):C44H58N6O7的m/z[M/2+H]计算值392.2;实验值392.3。
步骤11.在0℃下,向(3S)-1-[(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(3S)-1-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基]哌啶-3-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(1.0g,1.1mmol)于DCM(30mL)中的混合物中添加HOBT(1.51g,11.2mmol)、N-(3-二甲基氨基丙基)-N’-乙基碳化二酰亚胺盐酸盐(6.44g,33.6mmol)和DIPEA(5.79g,44.8mmol)。将混合物升温至室温并搅拌6小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(100mL×3)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的N-[(6S,8S,14S)-22-乙基-21-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-2,10,22,28-四氮杂五环[18.5.2.1^{2,6}.1^{10,14}.0^{23,27}]二十九碳-1(26),20,23(27),24-四烯-8-基]氨基甲酸苯甲酯(340mg,36%产率)。LCMS(ESI):C44H56N6O6的m/z[M+H]计算值383.2;实验值383.3。
步骤12.在H2气氛下,将N-[(6S,8S,14S)-22-乙基-21-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-2,10,22,28-四氮杂五环[18.5.2.1^{2,6}.1^{10,14}.0^{23,27}]二十九碳-1(26),20,23(27),24-四烯-8-基]氨基甲酸苯甲酯(250mg,0.33mmol)、Pd/C(100mg)和NH4Cl(353mg,6.6mmol)于MeOH(5mL)中的混合物搅拌4小时。将混合物通过硅藻土过滤并减压浓缩滤液。将残余物溶解于DCM(30mL)中并用饱和NaHCO3(20mL)、H2O(20mL)和盐水(20mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液,得到(6S,8S,14S)-8-氨基-22-乙基-21-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-18,18-二甲基-16-氧杂-2,10,22,28-四氮杂五环[18.5.2.1^{2,6}.1^{10,14}.0^{23,27}]二十九碳-1(26),20,23(27),24-四烯-9,15-二酮,将其不经进一步纯化即用于下一步骤中。LCMS(ESI):C36H50N6O4的m/z[M+H]计算值631.4;实验值631.4。
步骤13.在0℃下,向(6S,8S,14S)-8-氨基-22-乙基-21-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-18,18-二甲基-16-氧杂-2,10,22,28-四氮杂五环[18.5.2.1^{2,6}.1^{10,14}.0^{23,27}]二十九碳-1(26),20,23(27),24-四烯-9,15-二酮(300mg,0.48mmol)、(2S)-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酸(136mg,0.48mmol)和DIPEA(620mg,4.8mmol)于DMF(5mL)中的混合物中添加HATU(183mg,0.48mmol)。在0-5℃下,将混合物搅拌1小时,接着用EtOAc(50mL)稀释,用H2O(50mL×2)、盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(2S)-N-[(6S,8S,14S)-22-乙基-21-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-2,10,22,28-四氮杂五环[18.5.2.1^{2,6}.1^{10,14}.0^{23,27}]二十九碳-1(26),20,23(27),24-四烯-8-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺(90mg,20%产率)。LCMS(ESI):C50H70N8O7的m/z[M+H]计算值895.5;实验值895.4;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.71(dd,J=4.8,1.5Hz,1H),7.86(dd,J=7.7,1.5Hz,1H),7.51(dd,J=7.7,4.8Hz,1H),7.36(dd,J=8.9,1.9Hz,1H),7.22(d,J=12.1Hz,1H),7.09(dd,J=8.9,1.9Hz,1H),6.59(dt,J=16.9,9.9Hz,1H),6.26(ddd,J=16.8,5.0,1.9Hz,1H),5.80-5.67(m,1H),5.59-5.46(m,1H),4.93(d,J=12.4Hz,1H),4.66(dd,J=11.1,6.4Hz,1H),4.45(d,J=12.6Hz,1H),4.28-4.19(m,1H),4.13(dd,J=14.5,7.2Hz,1H),4.02-3.87(m,1H),3.87-3.36(m,11H),3.16(s,2H),3.10(d,J=3.4Hz,2H),2.76(dd,J=26.9,13.5Hz,3H),2.61(s,1H),2.35-1.97(m,5H),1.78(dd,J=25.4,22.1Hz,10H),1.45(d,J=6.2Hz,3H),1.04(d,J=6.2Hz,3H),0.95(dd,J=6.5,1.8Hz,3H),0.83(d,J=6.6Hz,3H),0.72(d,J=31.8Hz,6H)。
实施例A715.合成((23S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-哌啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸苯甲酯
Figure BDA0004194083620010861
在0℃下,向((23S,63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-哌啶杂环十一蕃-5,7-二酮(50mg,0.08mmol)、(R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸(26mg,0.08mmol)和DIPEA(31mg,0.24mmol)于DMF(1mL)中的溶液中添加HATU(30mg,0.08mmol)。在0-5℃下,将反应混合物搅拌1小时,接着用EtOAc(20mL)稀释,用H2O(20mL×2)和盐水(20mL)洗涤。将有机相分离并经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((23S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-哌啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺。1HNMR(400MHz,CD3OD)δ8.71(d,J=4.7Hz,1H),8.24(s,1H),8.10(dd,J=26.7,7.8Hz,1H),7.86(d,J=7.7Hz,1H),7.51(dd,J=7.7,4.8Hz,1H),7.39(dd,J=8.9,3.1Hz,1H),7.26(d,J=16.6Hz,1H),7.11(d,J=8.8Hz,1H),5.61(s,1H),4.50–4.28(m,3H),4.27–4.07(m,3H),3.98(ddd,J=25.6,13.4,5.1Hz,2H),3.84–3.72(m,2H),3.62(dd,J=10.7,4.8Hz,2H),3.55(d,J=7.1Hz,2H),3.47(d,J=6.5Hz,2H),3.16(s,3H),3.03–2.91(m,1H),2.76(dd,J=28.7,15.2Hz,3H),2.62(s,1H),2.40(t,J=7.0Hz,3H),2.33(dd,J=14.3,5.0Hz,4H),2.05(d,J=11.6Hz,1H),1.99–1.64(m,10H),1.64–1.55(m,1H),1.51–1.42(m,6H),1.37(d,J=12.3Hz,3H),1.05(s,3H),0.94(ddd,J=9.3,6.7,2.0Hz,6H),0.76(d,J=3.8Hz,3H),0.69(s,3H)。LCMS(ESI):C53H76N8O7的m/z[M+H]计算值936.6;实验值937.4。
实施例A347.合成(2S)-N-[(7S,13S)-21-乙基-20-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-17,17-二甲基-8,14-二氧代-15-氧杂-4-硫杂-9,21,25,27,28-五氮杂五环[17.5.2.1^{2,5}.1^{9,13}.0^{22,26}]二十八碳-1(25),2,5(28),19,22(26),23-六烯-7-基]-3-甲基-2-{N-甲基-1-[(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-基]甲酰胺基}丁酰胺
Figure BDA0004194083620010871
步骤1.在0℃下,向(5-氯-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)甲醇(3.5g,19mmol)和((1-甲氧基-2-甲基丙-1-烯-1-基)氧基)三甲基硅烷(6.7g,38mmol)于THF(50ml)中的混合物中逐滴添加TMSOTf(3.8g,17mmol)。在0-5℃下,将混合物搅拌2小时,接着用EtOAc(100mL)稀释并用饱和NaHCO3(50mL)和盐水(50mL×2)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-氯-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯(3.0g,59%产率)。LCMS(ESI):C13H15ClN2O2的m/z[M+H]计算值266.1;实验值267.1。
步骤2.在0℃下,向3-(5-氯-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯(3.0g,11mmol)于无水THF(50mL)中的混合物中添加AgOTf(4.3g,17mmol)和I2(2.9g,11mmol)。在0℃下,将混合物搅拌2小时,接着添加饱和Na2SO3(20mL)和EtOAc(50mL)。将混合物过滤并将滤液用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-氯-2-碘-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯(2.3g,52%产率)。LCMS(ESI):C13H15ClIN2O2的m/z[M+H]计算值392.0;实验值393.0。
步骤3.在N2气氛下,向3-(5-氯-2-碘-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯(2.3g,5.9mmol)和2-(2-(2-甲氧基乙基)苯基)-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(1.6g,7.1mmol)和K2CO3(2.4g,18mol)于1,4-二噁烷(25mL)和H2O(5mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2.DCM(480mg,0.59mmol)。将混合物加热至70℃,保持4小时,接着用EtOAc(200mL)稀释并用盐水(25mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-3-(5-氯-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯(2.0g,84%产率)。LCMS(ESI):C21H24ClN3O3的m/z[M+H]计算值401.2;实验值402.2。
步骤4.将3-(5-氯-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2-甲基丙酸乙酯(2.0g,5.0mmol)、Cs2CO3(3.3g,10mmol)和EtI(1.6g,10mmol)于DMF(30mL)中的混合物搅拌10小时。将混合物用EtOAc(100mL)稀释并用盐水(20mL×4)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-3-(5-氯-1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯的两种非对映异构体(0.7g,32%产率;0.6g,28%产率)。LCMS(ESI):C23H28ClN3O3的m/z[M+H]计算值429.2;实验值430.2。
步骤5.在0℃下,向(S)-3-(5-氯-1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙酸甲酯(1.9g,4.4mmol)于无水THF(20mL)中的混合物中添加LiBH4(200mg,8.8mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌4小时,接着添加饱和NH4Cl(20mL)和EtOAc(50mL)。将水层和有机层分离并将有机层用盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-3-(5-氯-1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(1.5g,85%产率)。LCMS(ESI):C22H28ClN3O2的m/z[M+H]计算值401.2;实验值402.2。
步骤6.在N2气氛下,向(S)-3-(5-氯-1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(550mg,1.37mmol)、(S)-(2-(2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-甲氧基-3-氧代丙基)噻唑-4-基)硼酸(907.4mg,2.74mmol,2eq)和K2CO3(568mg,4.11mmol)于1,4-二噁烷(25mL)和H2O(5mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2.DCM(89mg,0.14mmol)。将混合物加热至70℃并搅拌4小时,接着添加H2O(50mL)并用EtOAc(100mL×3)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基)噻唑-2-基)丙酸甲酯(440mg,22%产率),将其直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C34H45N5O6S的m/z[M+H]计算值651.3;实验值652.3。
步骤7.向(2S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基)噻唑-2-基)丙酸甲酯(280mg,0.43mmol)于MeOH(4mL)中的混合物中添加LiOH(51mg,2.2mmol)于H2O(2mL)中的溶液。将混合物搅拌5小时,接着通过添加1M HCl将pH值调至约3-4。将混合物用H2O(30mL)稀释并用EtOAc(15mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(2S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基)噻唑-2-基)丙酸(280mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C33H43N5O6S的m/z[M+H]计算值637.3;实验值638.3。
步骤8.在0-5℃下,向(2S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基)噻唑-2-基)丙酸(274mg,0.43mmol)和(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(280mg,0.64mmol)于DMF(3mL)中的混合物中添加HATU(245mg,0.64mmol)和DIPEA(555mg,4.3mmol)于DMF(2mL)中的溶液。将混合物搅拌1小时,接着用EtOAc(20mL)和H2O(20mL)稀释。将水层和有机层分开并将有机层用H2O(20mL×3)、盐水(20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(3S)-1-[(2S)-2-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}-3-{4-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基]-1,3-噻唑-2-基}丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(230mg,70%产率)。LCMS(ESI):C39H53N7O7S的m/z[M+H]计算值763.4;实验值764.3。
步骤9.在N2气氛下,向(3S)-1-[(2S)-2-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}-3-{4-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基]-1,3-噻唑-2-基}丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(230mg,0.3mmol)于DCE(3mL)中的混合物中添加Me3SnOH(300mg)。将混合物加热至65℃并搅拌16小时,接着减压浓缩。将残余物用EtOAc(20mL)稀释,用H2O(20mL)和盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,得到呈泡沫状的(3S)-1-[(2S)-2-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}-3-{4-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基]-1,3-噻唑-2-基}丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(200mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C38H51N7O7S的m/z[M+H]计算值749.4;实验值750.3。
步骤10.在0-5℃下,向(3S)-1-[(2S)-2-{[(叔丁氧基)羰基]氨基}-3-{4-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吡咯并[3,2-b]吡啶-5-基]-1,3-噻唑-2-基}丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(245mg,0.32mmol)于DCM(50mL)中的混合物中添加HOBT(432mg,3.2mmol)、EDCI HCl(1.8g,9.6mmol)和DIPEA(1.65g,12.8mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着减压浓缩。将残余物用EtOAc(20mL)和H2O(20mL)稀释并将水层和有机层分开。将有机层用H2O(30mL×3)、盐水(30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吡咯并[3,2-b]吡啶杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(100mg,43%产率)。LCMS(ESI):C38H49N7O6S的m/z[M+H]计算值731.4;实验值732.3。
步骤11.将((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吡咯并[3,2-b]吡啶杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(80mg,0.11mmol)于DCM(0.6mL)和TFA(0.2mL)中的混合物搅拌1小时。将混合物减压浓缩,得到呈固体状的(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吡咯并[3,2-b]吡啶杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(72mg,95%产率)。LCMS(ESI):C33H41N7O4S的m/z[M+H]计算值631.3;实验值632.3。
步骤12.在0℃下,向(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吡咯并[3,2-b]吡啶杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(120mg,0.39mmol)和DIPEA(335mg,2.6mmol)于DMF(1mL)中的混合物中添加HATU(60mg,0.16mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着用H2O(110mL)稀释并用EtOAc(80mL×2)萃取。将合并的有机层用H2O(100mL)、盐水(100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(3S)-1-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吡咯并[3,2-b]吡啶杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺(1.8mg,2%产率)。LCMS(ESI):C47H61N9O7S的m/z[M+H]计算值895.4;实验值896.3;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.72(d,J=4.5Hz,1H),7.98-7.77(m,3H),7.72(dd,J=12.0,8.6Hz,1H),7.54(dd,J=7.6,4.8Hz,1H),6.67-6.54(m,1H),6.26(m,1H),5.79-5.58(m,2H),4.83-4.75(m,1H),4.39-4.16(m,4H),4.02(dd,J=28.0,10.6Hz,2H),3.89-3.65(m,6H),3.50(m,4H),3.34(d,J=6.2Hz,3H),3.12(d,J=4.0Hz,2H),3.00(s,1H),2.73(m,1H),2.48-2.37(m,1H),2.31-2.07(m,4H),1.88(d,J=11.2Hz,1H),1.71(d,J=12.8Hz,1H),1.44(m,7H),0.97(dd,J=6.2,4.4Hz,3H),0.92-0.84(m,8H),0.41(d,J=6.2Hz,3H)。
实施例647.合成1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-N-((2S)-1-(((22S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-4-氟-N-甲基哌啶-4-甲酰胺
Figure BDA0004194083620010931
步骤1.将1-[(叔丁氧基)羰基]-4-氟哌啶-4-甲酸(2.0g,8.1mmol)于DCM(20mL)中的混合物添加乙二酰二氯(1.34g,10.5mmol)和DMF(30mg,0.4mmol)。在室温下,将所得溶液搅拌1小时。添加Et3N(3.2g,3.2mmol)和(2S)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酸(1.25g,9.5mmol)并在室温下将混合物搅拌1小时。添加H2O(100mL)并将混合物用EtOAc(50mL×3)萃取。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-4-((1-(叔丁氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-4-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(1.34g,45%产率)。LCMS(ESI):C21H37FN2O5Na的m/z[M+Na]计算值439.3;实验值439.3。
步骤2.在室温下,将(S)-4-((1-(叔丁氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-4-氟哌啶-1-甲酸叔丁酯(290mg,0.70mmol)于DCM(4mL)和TFA(2mL)中的混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到N-(4-氟哌啶-4-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸,将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C12H21FN2O3的m/z[M+H]计算值260.2;实验值261.2。
步骤3.在5℃下,向搅拌的N-(4-氟哌啶-4-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(1.7g,5.3mmol)、4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酸钠(1.67g,9.4mmol)和Et3N(2.73g,36.9mmol)于DMF(20mL)中的溶液中添加T3P(4.11g,10.7mmol,50wt%于EtOAc中)。在5℃下,将反应混合物搅拌1小时。将所得混合物用H2O(100mL)淬灭并用EtOAc(50mL×3)萃取。将合并的有机层浓缩并通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的N-(1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-4-氟哌啶-4-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(1.6g,74.0%产率)。LCMS(ESI):C24H40FN3O4的m/z[M+H]计算值453.3;实验值454.2。
步骤4.向N-(1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-4-氟哌啶-4-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸叔丁酯(50mg,0.11mmol)于DCM(2mL)中的溶液中添加TFA(1mL)。在20℃下,将反应混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到粗N-(1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-4-氟哌啶-4-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸。将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤。LCMS(ESI):C20H32FN3O4的m/z[M+H]计算值397.2;实验值398.3。
步骤5.在20℃下,向(2R)-2-(羟基甲基)吗啉-4-基甲酸叔丁酯(50g,230mmol)于EtOAc(1L)中的溶液中添加TEMPO(715mg,4.6mmol)和NaHCO3(58g,690mmol)。将混合物冷却至-50℃,接着经30分钟逐滴添加于EtOAc(100mL)中的TCCA(56g,241mmol)。将反应混合物升温至5℃,保持2小时,接着用10% Na2S2O3(200mL)淬灭并搅拌20分钟。将所得混合物过滤并将有机相从滤液分离。将水相用EtOAc(100mL×2)萃取。将合并的有机层用H2O(100mL)和盐水(100mL)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。将有机层减压浓缩,得到呈油状的(2R)-2-甲酰基吗啉-4-基甲酸叔丁酯(50g,粗品)。
步骤6.在0~10℃下,向(2R)-2-甲酰基吗啉-4-基甲酸叔丁酯(49g,153mmol)和2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-2-(二甲氧基磷酰基)乙酸甲酯(60g,183mmol)于CAN(300mL)中的溶液中添加四甲基胍(35g,306mmol)。在10℃下,将反应混合物搅拌30分钟,接着升温至20℃,保持2小时。将反应混合物用DCM(200mL)稀释并用柠檬酸(10%,200mL)和10%NaHCO3水溶液(200mL)洗涤。将有机相减压浓缩,并通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S,Z)-2-(2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-甲氧基-3-氧代丙-1-烯-1-基)吗啉-4-甲酸叔丁酯(36g,90%产率)。LCMS(ESI):C21H28N2O4的m/z[M+Na]计算值420.2;实验值:443.1
步骤7.向(S,Z)-2-(2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-甲氧基-3-氧代丙-1-烯-1-基)吗啉-4-甲酸叔丁酯(49g,0.12mol)于MeOH(500mL)中的溶液中添加(S,S)-Et-DUPHOS-Rh(500mg,0.7mmol)。在H2(60psi)气氛下,在25℃下将混合物搅拌48小时。将反应浓缩并通过色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-2-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-甲氧基-3-氧代丙基)吗啉-4-甲酸叔丁酯(44g,89.8%产率)。LCMS(ESI):C21H30N2O7的m/z[M+Na]计算值422.2;实验值:445.2。
步骤8.在15℃下,向(S)-2-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-甲氧基-3-氧代丙基)吗啉-4-甲酸叔丁酯(2.2g,5.2mmol)于EtOAc(2mL)中的搅拌的溶液中添加HCl/EtOAc(25mL)。在15℃下搅拌反应2小时,接着减压浓缩,得到呈油状的(S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-吗啉-2-基)丙酸甲酯(1.51g,90.4%产率)。LCMS(ESI):C16H22N2O5的m/z[M+H]计算值322.1;实验值323.2。
步骤9.在0℃下,向3-(5-溴-1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(100g,0.22mol)和1H-咪唑(30.6g,0.45mol)于DCM(800mL)中的溶液中添加于DCM(200mL)中的TBSCl(50.7g,0.34mol)。在25℃下,搅拌反应2小时。将所得溶液用H2O(300mL×3)和盐水(200mL×2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-5-溴-3-(3-((叔丁基二甲基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚(138g,90%产率)。LCMS(ESI):C29H43BrN2O2Si的m/z[M+H]计算值558.2;实验值559.2。
步骤10.在N2气氛下,在105℃下向中间体1(50g,89.3mmol)于二噁烷(500mL)中的搅拌的溶液中添加来自步骤1的(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(2S)-吗啉-2-基]丙酸甲酯(31.7g,98.2mmol)、RuPhos(16.7g,35.7mmol)、二-mu-氯双(2-氨基-1,1-联苯-2-基-C,N)二钯(II)(2.8g,4.4mmol)和碳酸铯(96g,295mmol),随后添加RuPhos-Pd-G2(3.5g,4.4mmol)。在N2气氛下,在105℃下将反应混合物搅拌6小时。将所得混合物过滤,并减压浓缩滤液。将残余物通过制备型TLC色谱法纯化,得到呈固体状的(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(2S)-4-(3-{3-[(叔丁基二甲基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基}-1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基)吗啉-2-基]丙酸甲酯(55g,73%产率)。LCMS(ESI):C45H64N4O7Si的m/z[M+H]计算值800.5;实验值801.5。
步骤11.在20℃下,向(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(2S)-4-(3-{3-[(叔丁基二甲基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基}-1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基)吗啉-2-基]丙酸甲酯(10g,12mmol)于THF(270mL)中的溶液中添加于H2O(45mL)中的LiOH(1.3g,31mmol)。在20℃下搅拌反应2小时,接着在0~5℃下,用1N HCl处理以将pH值调至4~5。将所得混合物用EtOAc(50mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤并经无水Na2SO4干燥。将有机相接着减压浓缩,得到呈固体状的(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(2S)-4-(3-{3-[(叔丁基二甲基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基}-1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基)吗啉-2-基]丙酸(9.5g,97%产率)。LCMS(ESI):C44H62N4O7Si的m/z[M+H]计算值786.4;实验值787.4。
步骤12.向(2S)-2-{[(苯甲氧基)羰基]氨基}-3-[(2S)-4-(3-{3-[(叔丁基二甲基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基}-1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}吲哚-5-基)吗啉-2-基]丙酸(10g,12.7mmol)于DMF(150mL)中的搅拌的溶液中添加(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(2g,14mmol),接着冷却至0℃,添加DIPEA(32.8g,254mmol),随后在0~5℃下添加HATU(9.7g,25.4mmol)。在0~5℃下,将反应混合物搅拌1小时。将所得混合物用EtOAc(500mL)和H2O(200mL)稀释。将有机层分离并用H2O(100mL×2)和盐水(100mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥。将溶液过滤并减压浓缩,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(3-(3-((叔丁基二甲基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(8g,70%产率)。LCMS(ESI):C50H72N6O8Si的m/z[M+H]计算值912.5;实验值913.4。
步骤13.在20℃下,将(S)-1-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(3-(3-((叔丁基二甲基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(8.5g,9mmol)于THF(8mL)中的溶液添加氟化四丁基铵(1M于THF中,180mL,180mmol)和AcOH(11g,200mmol)的混合物。在75℃下,将反应混合物搅拌3小时。将所得混合物用EtOAc(150mL)稀释并用H2O(20mL×6)洗涤。将有机相减压浓缩,得到呈固体状的(S)-1-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(7.4g,100%产率)。LCMS(ESI):C44H58N6O8的m/z[M+H]计算值799.4;实验值798.4。
步骤14.向(S)-1-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(8g,10mmol)于THF(200mL)中的溶液中添加于H2O(30mL)中的氢氧化锂(600mg,25mmol)。在20℃下,将反应混合物搅拌1小时,接着在0~5℃下,用1NHCl处理以将pH值调至4~5,并用EtOAc(500mL×2)萃取。将有机相用盐水洗涤,并减压浓缩,得到呈固体状的(S)-1-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(8g,粗品)。LCMS(ESI):C43H56N6O8的m/z[M+H]计算值784.4;实验值785.4。
步骤15.在氩气氛下,在25℃下向(S)-1-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(8g,10.2mmol)和DIPEA(59g,459mmol)于DCM(800mL)中的搅拌的溶液中添加EDCI(88g,458mmol)和HOBT(27.6g,204mmol)。在25℃下,将反应混合物搅拌16小时。将所得混合物减压浓缩,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((22S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸苯甲酯(5g,66%产率);LCMS(ESI):C43H54N6O7的m/z[M+H]计算值766.4;实验值767.4。
步骤16.在H2气氛下,在20℃下向((22S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸苯甲酯(400mg,0.5mmol)于MeOH(20mL)中的溶液中添加Pd/C(200mg)和乙酸铵(834mg,16mmol)并将混合物搅拌2小时。接着,将所得混合物过滤并减压浓缩。将残余物再溶解于DCM(20mL)中并用H2O(5mL×2)洗涤,接着减压浓缩,得到呈固体状的(22S,63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(320mg,97%产率)。LCMS(ESI):C35H48N6O5的m/z[M+H]计算值632.4;实验值633.3。
步骤17.在0℃下,向搅拌的(22S,63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(50mg,0.079mmol)、N-(1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-4-氟哌啶-4-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(47mg,0.12mmol)于DMF(2mL)中的溶液中逐滴添加HATU(36mg,0.09mmol)和DIPEA(153mg,1.2mmol)。在0℃下,搅拌反应1小时。将所得混合物通过反相纯化,得到呈固体状的1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-N-((2S)-1-(((22S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-4-氟-N-甲基哌啶-4-甲酰胺(11.9mg,13.9%产率)。1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.71(dd,J=4.8,1.7Hz,1H),7.86(d,J=7.8Hz,1H),7.51(dd,J=7.8,4.8Hz,1H),7.39(d,J=8.9Hz,1H),7.15–7.04(m,2H),5.67(d,J=8.8Hz,1H),4.62(d,J=11.2Hz,1H),4.46(d,J=12.4Hz,1H),4.39–4.27(m,2H),4.23(d,J=6.1Hz,1H),4.17–4.08(m,1H),3.93(s,2H),3.86(s,1H),3.84–3.76(m,2H),3.74–3.65(m,2H),3.63–3.51(m,2H),3.27–3.23(m,1H),3.22–3.11(m,6H),3.0–2.89(m,2H),2.85–2.75(m,2H),2.74–2.55(m,2H),2.36(d,J=8.2Hz,6H),2.32–2.21(m,2H),2.20–2.02(m,5H),1.92(d,J=12.5Hz,2H),1.69(dd,J=43.8,12.6Hz,2H),1.46(dt,J=8.0,4.9Hz,9H),1.03(d,J=3.5Hz,3H),0.90(dd,J=48.3,6.5Hz,6H),0.77(d,J=3.0Hz,3H),0.69(s,3H)。LCMS(ESI):C55H78FN9O8的m/z[M+H]计算值1011.6;实验值1012.5。
实施例A375.合成(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((22S,63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620011001
步骤1.在N2气氛下,在0℃下向5-溴-3-{3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基}-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-1H-吲哚(10.0g,15.2mmol)于无水DMF(120mL)中的混合物中添加60%NaH于油中的分散液(1.2g,30.4mmol)和三氟甲烷磺酸2,2,2-三氟乙酯(35.4g,152mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着添加饱和NH4Cl(30mL)并用EtOAc(100mL×3)萃取混合物。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚(8g)和呈油状的另一阻转异构体(6g,48%产率)。LCMS(ESI):C39H44BrF3N2O2Si的m/z[M+H]计算值736.2;实验值737.1。
步骤2.在N2气氛下,向(S)-5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚(7.2g,9.7mmol)于甲苯(80mL)中的混合物中添加4,4,4’,4’,5,5,5’,5’-八甲基-2,2’-联(1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷)(2.7g,10.6mmol)、KOAc(1.9g,19.4mmol)和Pd(dppf)Cl2 DCM(0.8g,0.1mmol)。将混合物加热至90℃并搅拌8小时,接着添加饱和NH4Cl(30mL)并用EtOAc(40mL×3)萃取混合物。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚(6.1g,64%产率)。LCMS(ESI):C45H56BF3N2O4Si的m/z[M+H]计算值784.4;实验值785.3。
步骤3.在N2气氛下,在0℃下向(S)-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚(33g,42mmol)于THF(120mL)和MeOH(330mL)中的混合物中添加MeB(OH)2(50.4g,841mmol),接着添加NaOH(33.6g,841mmol)于H2O(120mL)中的混合物。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着减压浓缩。将H2O(500mL)添加至残余物中并用EtOAc(300mL×3)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(300mL)、H2O(300mL)洗涤,接着减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)硼酸(20g,68%产率)。LCMS(ESI):C39H46BF3N2O4Si的m/z[M+H]计算值702.3;实验值703.3。
步骤4.注意:三个反应是并行操作的,即,产量反映产物的总和。
在空气下,向(S)-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)硼酸(1.85g,5.6mmol)和(S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-吗啉-2-基)丙酸甲酯于DCM(150mL)中的混合物中添加吡啶(1.35g,16.9mmol)和Cu(OAc)2(2.0g,11.3mmol)。将混合物搅拌48小时,接着减压浓缩。将H2O(300mL)添加至残余物中并将混合物用EtOAc(300mL×2)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酸甲酯(9.2g,55%产率)。LCMS(ESI):C55H65F3N4O7Si的m/z[M/2+H]计算值490.2;实验值490.3。
步骤5.向(S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酸甲酯(10.8g,11.0mmol)于THF(50mL)中的混合物中添加于H2O(10mL)中的LiOH(528mg,22mmol)。将混合物搅拌1小时,接着冷却至0-5℃并使用2NHCl(10mL)酸化至约pH 7。将混合物用DCM(100mL×2)萃取并将合并的有机层经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,得到呈固体状的(S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酸(10.6g,100%产率)。LCMS(ESI):C54H63F3N4O7Si的m/z[M/2+H]计算值483.2;实验值483.3。
步骤6.在0℃下,向(S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酸(10.6g,11.0mmol)和(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(15.8g,22.0mmol)于DMF(150mL)中的混合物中添加DIPEA(28.4g,220mmol)和HATU(8.4g,22.0mmol)。在0~5℃下,将混合物搅拌1小时,接着添加EtOAc(500mL)并将混合物用H2O(200mL×2)、盐水(100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(11g,90%产率)。LCMS(ESI):C60H73F3N6O8Si的m/z[M/2+H]计算值546.3;实验值546.3。
步骤7.向(S)-1-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(11.0g,10.1mmol)于THF(10mL)中的混合物中添加AcOH(21.2g,353mmol)和1M TBAF的THF溶液(300mL,300mmol)的混合物。将混合物加热至80℃并搅拌16小时,接着减压浓缩。将EtOAc(800mL)添加至残余物中并将混合物用H2O(80mL×6)洗涤,减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(S)-1-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(7.9g,91%产率)。LCMS(ESI):C44H55F3N6O8的m/z[M+H]计算值852.4;实验值853.3。
步骤8.向(S)-1-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(7.9g,9.3mmol)于THF(50mL)中的混合物中添加于H2O(10mL)中的LiOH(443mg,18.5mmol)。将混合物搅拌1小时,接着冷却至0-5℃并用2N HCl(9mL)酸化至约pH 7。将混合物用DCM(100mL×2)萃取并将合并的有机层经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,得到呈固体状的(S)-1-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(7.6g,98%产率)。LCMS(ESI):C43H53F3N6O8的m/z[M+H]计算值838.4;实验值839.3。
步骤9.在Ar气氛下,向(S)-1-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-((S)-4-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吗啉-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(7.6g,9.0mmol)和DIPEA(52.3g,405mmol)于DCM(800mL)中的混合物中添加EDCI(77.6g,405mmol)和HOBT(12g,90mmol)。将混合物搅拌16小时,接着减压浓缩。将残余物用EtOAc(500mL)稀释,用H2O(100mL×2)洗涤并过滤。将有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((22S,63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸苯甲酯(6.1g,74%产率)。LCMS(ESI):C43H51F3N6O7的m/z[M+H]计算值820.4;实验值821.3。
步骤10.向((22S,63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸苯甲酯(700mg,0.85mmol)于MeOH(30mL)中的混合物中添加10% Pd/C(317mg)和NH4Cl(909mg)。在H2气氛(1atm)下,将混合物搅拌16小时,接着通过硅藻土过滤并用MeOH(150mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,将DCM(20mL)添加至残余物中并将混合物用饱和NaHCO3(20mL×3)洗涤。将有机层减压浓缩,得到呈固体状的(22S,63S,4S)-4-氨基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(660mg,95%产率)。LCMS(ESI):C35H45F3N6O5的m/z[M+H]计算值686.3;实验值687.3;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ8.80(dd,J=4.7,1.7Hz,1H),7.66(d,J=7.4Hz,1H),7.43-7.30(m,2H),7.12-7.01(m,2H),4.90-4.83(m,1H),4.68(d,J=12.5Hz,1H),4.57(dd,J=16.2,8.1Hz,1H),4.24(q,J=6.1Hz,1H),4.08(d,J=10.6Hz,1H),3.97-3.82(m,4H),3.80-3.68(m,2H),3.55(d,J=11.6Hz,1H),3.21(d,J=9.4Hz,1H),2.93(dd,J=19.9,9.3Hz,3H),2.66(t,J=11.6Hz,1H),2.47(d,J=14.5Hz,1H),2.19-2.04(m,4H),1.96(d,J=13.6Hz,2H),1.80-1.71(m,2H),1.66-1.59(m,1H),1.47(d,J=6.1Hz,3H),0.88(s,3H),0.42(s,3H)。
步骤11.在0℃下,向(22S,63S,4S)-4-氨基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(300mg,0.4mmol)、(2R)-2-[({1-[4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基]氮杂环丁烷-3-基}氧基)甲基]-3-甲基丁酸(157mg,0.48mmol)和DIPEA(569.0mg,0.4mmol)于DMF(5mL)中的混合物中添加HATU(217mg,0.57mmol)。在0℃下,将混合物搅拌0.5小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(20mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((22S,63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(200mg,46%产率)。LCMS(ESI):C52H71F3N8O8的m/z[M+H]计算值992.5;实验值993.4;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.74(m,1H),8.00(m,1H),7.85(d,J=7.7Hz,1H),7.60-7.43(m,2H),7.14(t,J=9.5Hz,2H),5.63(s,1H),5.06(m,1H),4.64(s,1H),4.52-4.31(m,3H),4.27-4.05(m,3H),3.97(m,1H),3.92-3.66(m,6H),3.59(m,2H),3.46(m,2H),3.25(d,J=5.3Hz,3H),3.07-2.89(m,2H),2.86-2.59(m,3H),2.38-2.32(m,3H),2.28(s,3H),2.13(m,2H),2.03-1.51(m,6H),1.50-1.41(m,6H),1.38(d,J=7.5Hz,3H),0.98(t,J=8.7Hz,6H),0.89(t,J=6.4Hz,3H),0.54(d,J=8.4Hz,3H)。
实施例A722.合成1-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-4-氟-N-甲基哌啶-4-甲酰胺
Figure BDA0004194083620011061
步骤1.在-10℃下,向N-(4-氟哌啶-4-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(190mg,0.73mmol)和NaHCO3(306mg,3.6mmol)于DCM(2mL)和H2O(1mL)中的混合物中添加丙-2-烯酰氯(132mg,1.45mmol)。在0-5℃下,将混合物搅拌1小时,接着用DCM(20mL)稀释并用H2O(20mL×2)、盐水(20mL)洗涤,并将有机层经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的N-(1-丙烯酰基-4-氟哌啶-4-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(120mg,52%产率)。LCMS(ESI):C15H23FN2O4的m/z[M+H]计算值314.2;实验值315.2。
步骤2.在5℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(153mg,0.24mmol)、N-(1-丙烯酰基-4-氟哌啶-4-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(106mg,0.34mmol)于DMF(2mL)中的混合物中逐滴添加HATU(110mg,0.29mmol)和DIPEA(468mg,3.6mmol)。在5℃下,将混合物搅拌1小时,接着通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的1-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-4-氟-N-甲基哌啶-4-甲酰胺(69.5mg,29%产率)。LCMS(ESI):C50H69FN8O8的m/z[M+H]计算值928.5;实验值929.4;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.71(d,J=3.2Hz,1H),7.86(d,J=7.7Hz,1H),7.51(dd,J=7.7,4.8Hz,1H),7.39(d,J=8.9Hz,1H),7.18-7.02(m,2H),6.80(dd,J=16.8,10.7Hz,1H),6.23(d,J=16.8Hz,1H),5.77(d,J=10.6Hz,1H),5.67(d,J=6.5Hz,1H),4.61(d,J=11.1Hz,1H),4.44(t,J=15.1Hz,2H),4.23(q,J=6.1Hz,1H),4.18-4.10(m,1H),4.09-4.01(m,1H),3.99-3.83(m,3H),3.83-3.65(m,4H),3.58-3.46(m,2H),3.27(s,1H),3.21-3.11(m,6H),3.00-2.91(m,2H),2.85-2.75(m,2H),2.73-2.64(m,1H),2.62-2.54(m,1H),2.36-2.21(m,2H),2.19-2.01(m,5H),1.92(d,J=12.7Hz,2H),1.79-1.57(m,2H),1.44(d,J=6.2Hz,3H),1.04(t,J=6.3Hz,3H),0.98-0.81(m,6H),0.76(s,3H),0.68(s,3H)。
实施例A377.合成(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((22S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620011071
步骤1.(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((22S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺是以与(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((22S,63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺类似地方式合成,不过将(22S,63S,4S)-4-氨基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮替代为(22S,63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮并将3-({1-[4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基]氮杂环丁烷-3-基}氧基)丙酸替代为(2R)-2-[({1-[4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基]氮杂环丁烷-3-基}氧基)甲基]-3-甲基丁酸,得到呈固体状的所需产物(25.6mg,26%产率)。LCMS(ESI):C52H74N8O8的m/z[M+H]计算值938.6;实验值939.5;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.72(dd,J=4.8,1.5Hz,1H),7.97(dd,J=20.0,6.8Hz,1H),7.87(dd,J=5.8,2.6Hz,1H),7.54-7.51(m,1H),7.41(d,J=8.9Hz,1H),7.14(dd,J=36.0,10.4Hz,2H),5.65(s,1H),4.49-4.33(m,3H),4.27-4.08(m,4H),3.96(d,J=8.6Hz,2H),3.87(dd,J=10.8,3.6Hz,2H),3.79(dd,J=10.8,7.7Hz,3H),3.69-3.58(m,3H),3.43(dd,J=23.9,11.7Hz,2H),3.17(d,J=21.9Hz,3H),3.00-2.95(m,1H),2.70(t,J=14.0Hz,8H),2.34-2.24(m,1H),2.05(d,J=34.4Hz,3H),1.92-1.82(m,2H),1.69-1.62(m,5H),1.57(d,J=11.5Hz,3H),1.45(d,J=6.2Hz,3H),1.33(d,J=12.6Hz,1H),1.05-0.93(m,10H),0.80(d,J=9.8Hz,3H),0.64(d,J=12.2Hz,2H)。
实施例A643.合成(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)哌啶4-基)氧基)甲基)-N-((22S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620011091
步骤1.在120℃下,将甲烷磺酸1-(1-甲基苯基)哌啶4-基酯(2g,7.4mmol)和(2R)-2-(羟基甲基)-3-甲基丁酸叔丁酯(1.39g,7.4mmol)的混合物搅拌1小时,接着通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(R)-2-(((1-苯甲基哌啶4-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸叔丁酯(800mg,28%产率)。LCMS(ESI):C22H35NO3的m/z[M+H]计算值361.3;实验值362.3。
步骤2.在H2气氛(15psi)下,将(R)-2-(((1-苯甲基哌啶4-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸叔丁酯(700mg,1.9mmol)、10%湿Pd/C(411mg,3.9mmol)和20%湿Pd(OH)2/C(542mg,3.9mmol)于THF(30mL)中的混合物搅拌16小时。将混合物过滤并减压浓缩滤液,得到呈油状的(R)-3-甲基-2-((哌啶4-基氧基)甲基)丁酸叔丁酯(440mg,80%产率)。LCMS(ESI):C15H29NO3的m/z[M+H]计算值271.2;实验值272.2。
步骤3.在0℃下,向(R)-3-甲基-2-((哌啶4-基氧基)甲基)丁酸叔丁酯(440mg,1.6mmol)、4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酸(3.77g,24.3mmol)和DIPEA(2.09g,16.2mmol)于DMF(50mL)中的混合物中添加T3P(2.57g,8.1mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着倒入H2O(50mL)中并用EtOAc(50mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)哌啶4-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸叔丁酯(190mg,27%产率)。LCMS(ESI):C23H40N2O4的m/z[M+H]计算值408.3;实验值409.4。
步骤4.向(R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)哌啶4-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸叔丁酯(180mg,0.47mmol)于DCM(2mL)中的混合物中添加TFA(1mL)。在室温下,将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈油状的(R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)哌啶4-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸(170mg,98%产率)。LCMS(ESI):C19H32N2O4的m/z[M+H]计算值352.2;实验值353.2。
步骤5.(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)哌啶4-基)氧基)甲基)-N-((22S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺是以与(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((22S,63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺类似地方式合成,不过将(22S,63S,4S)-4-氨基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮替代为(22S,63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-吗啉杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮并将3-({1-[4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基]氮杂环丁烷-3-基}氧基)丙酸替代为(2R)-2-[({1-[4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基]哌啶4-基}氧基)甲基]-3-甲基丁酸。(101mg,42%产率),呈固体状。LCMS(ESI):C54H78N8O8的m/z[M+H]计算值966.6;实验值969.5;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.70(d,J=4.8Hz,1H),7.81-7.76(m,1H),7.56-7.46(m,1H),7.43-7.34(m,1H),7.24-7.01(m,2H),5.66-5.54(m,1H),4.50-4.40(m,1H),4.31-4.22(m,1H),4.19-4.08(m,1H),4.02-3.82(m,4H),3.80-3.53(m,10H),3.47-3.34(m,2H),3.26-3.15(m,3H),2.98-2.57(m,5H),2.37-2.30(m,3H),2.27-2.18(m,4H),2.15-2.02(m,2H),2.00-1.80(m,4H),1.78-1.71(m,2H),1.68-1.55(m,3H),1.49-1.37(m,6H),1.35-1.28(m,3H),1.05-0.92(m,9H),0.85-0.72(m,3H),0.68-0.51(m,3H)。
实施例A328.合成(3S)-1-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺的两种阻转异构体
Figure BDA0004194083620011111
步骤1.在Ar气氛下,向3-溴-5-碘-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(2.20g,6.4mmol)和哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1.20g,6.4mmol)于甲苯(50mL)中的混合物中添加tBuONa(0.74g,7.7mmol)并逐份添加Pd2(dba)3(0.59g,0.64mmol),随后逐份添加Xantphos(0.74g,1.3mmol)。将混合物加热至100℃并搅拌16小时,接着添加H2O并用EtOAc(400mL×3)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(150mL×3)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的4-[5-溴-6-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1.7g,61%产率)。LCMS(ESI):C17H26BrN3O3的m/z[M+H]计算值399.1;实验值400.1。
步骤2.在Ar气氛下,向4-[5-溴-6-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1.76g,4.4mmol)和4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-联(1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷)(1.67g,6.6mmol)于甲苯(18mL)中的混合物中分数份添加KOAc(0.95g,9.7mmol)和Pd(PPh3)2Cl2(0.31g,0.44mmol)。将混合物加热至80℃并搅拌16小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(500mL×3)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(100mL×3)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的4-[6-[(1S)-1-甲氧基乙基]-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-3-基]哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1.4g,68%产率)。LCMS(ESI):C23H38BN3O5的m/z[M+H]计算值447.4;实验值448.2。
步骤3.在N2气氛下,在0℃下向((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.0g,1.5mmol)于DCM(10mL)中的混合物中分数份添加TFA(5.0mL,67.3mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩并与甲苯(3mL×3)共沸干燥,得到(63S,4S)-4-氨基-12-碘-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(1.0g),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C27H31IN4O3的m/z[M+H]计算值586.1;实验值587.3。
步骤4.在N2气氛下,在0℃下向(63S,4S)-4-氨基-12-碘-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(1.0g,1.7mmol)于DMF(15mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(2.20g,17.0mmol)和(2S)-2-[[(苯甲氧基)羰基](甲基)氨基]-3-甲基丁酸(0.90g,3.4mmol),随后经10分钟分数份添加COMU(1.10g,2.6mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1.5小时,接着用H2O稀释并将混合物用EtOAc(300mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL×3)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的((2S)-1-(((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯(790mg,53%产率)。
步骤5.在Ar气氛下,向((2S)-1-(((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯(480mg,0.58mmol)和4-[6-[(1S)-1-甲氧基乙基]-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-3-基]哌嗪-1-甲酸叔丁酯(309mg,0.69mmol)于1,4-二噁烷(8.0mL)和H2O(1.6mL)中的混合物中分数份添加K2CO3(199mg,1.4mmol)和Pd(dppf)Cl2(42mg,0.06mmol)。将混合物加热至70℃并搅拌16小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(200mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(150mL×3)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的4-(5-((63S,4S)-4-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)(甲基)氨基)-3-甲基丁酰胺基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(335mg,51%产率)。LCMS(ESI):C58H74N8O9的m/z[M+H]计算值1026.6;实验值1027.4。
步骤6.在N2气氛下,在0℃下向4-(5-((63S,4S)-4-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)(甲基)氨基)-3-甲基丁酰胺基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(335mg,0.33mmol)于DMF(5mL)中的混合物中分数份添加Cs2CO3(234mg,0.72mmol)和碘乙烷(102mg,0.65mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(100mL×3)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(50mL×3)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈浅黄色固体状的4-(5-((63S,4S)-4-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)(甲基)氨基)-3-甲基丁酰胺基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(320mg,84%产率)。LCMS(ESI):C60H78N8O9的m/z[M+H]计算值1054.6;实验值1055.8。
步骤7.在N2气氛下,在0℃下将4-(5-((63S,4S)-4-((S)-2-(((苯甲氧基)羰基)(甲基)氨基)-3-甲基丁酰胺基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(320mg)于xx M HCl的1,4-二噁烷溶液(3.0mL)中的混合物在室温下搅拌2小时,接着减压浓缩,得到((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯,将其进一步纯化而直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C55H70N8O7的m/z[M+H]计算值954.5;实验值955.3。
步骤8.在N2气氛下,在0℃下向((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯(320mg,0.34mmol)和HCHO(60mg,2.0mmol)于MeOH(3.0mL)中的混合物中分数份添加NaCNBH3(42mg,0.67mmol)和AcOH(60mg,1.0mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着用H2O稀释并用DCM/MeOH(5:1)(200mL×3)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(100mL×3)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯(160mg,59%产率)。LCMS(ESI):C56H72N8O7的m/z[M+H]计算值968.6;实验值969.6。
步骤9.向((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯(160mg,0.17mmol)于甲苯(10mL)和MeOH(1.0mL)中的混合物中分数份添加Pd/C(130mg,1.2mmol)。将混合物排空并回填H2(×3),接着在H2气氛下搅拌16小时。将混合物过滤并减压浓缩滤液,得到(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(140mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C48H66N8O5的m/z[M+H]计算值834.5;实验值835.5。
步骤10.在N2气氛下,在0℃下向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(140mg,0.17mmol)于ACN(2.0mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(433mg,3.35mmol)、(3S)-1-(丙-2-烯酰基)吡咯烷-3-甲酸(57mg,0.34mmol)并经10分钟分数份添加CIP(70mg,0.25mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1.5小时,接着添加H2O并用EtOAc(150mL×3)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(100mL×3)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到(3S)-1-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺的两种阻转异构体,即呈固体状的(40mg,24%产率)和呈固体状的(20mg,12%产率)。LCMS(ESI):C56H75N9O7的m/z[M+H]计算值985.6;实验值986.7;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)8.47(t,J=2.1Hz,1H),8.00(d,J=4.7Hz,1H),7.78-7.59(m,3H),7.58-7.48(m,1H),7.42-7.30(m,1H),7.23(dq,J=8.0,4.0,3.5Hz,1H),7.15-7.03(m,1H),6.75-6.50(m,1H),6.18(dt,J=16.8,2.7Hz,1H),5.70(tt,J=9.3,2.7Hz,1H),5.48-5.23(m,1H),5.06(dd,J=31.1,12.3Hz,1H),4.74(dd,J=11.0,4.3Hz,1H),4.33-4.15(m,2H),4.01(ddd,J=36.1,12.6,7.6Hz,2H),3.91-3.56(m,6H),3.52-3.39(m,2H),3.31-3.28(m,2H),3.24(d,J=5.7Hz,4H),3.06(s,4H),2.93(d,J=9.8Hz,2H),2.81(d,J=5.4Hz,3H),2.47-2.43(m,4H),2.22(s,4H),2.09(tq,J=12.0,7.4,6.6Hz,3H),1.81(s,1H),1.74(d,J=11.7Hz,1H),1.56(d,J=11.7Hz,1H),1.20(dd,J=6.3,1.5Hz,3H),1.10(td,J=7.2,2.4Hz,3H),1.00-0.86(m,6H),0.86-0.72(m,3H),0.54(d,J=3.5Hz,3H);以及LCMS(ESI):C56H75N9O7的m/z[M-H]计算值985.6;实验值984.4;1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.46(d,J=3.0Hz,2H),7.98(s,1H),7.89-7.83(m,1H),7.76-7.57(m,3H),7.24(s,2H),7.07(s,1H),6.70-6.58(m,1H),6.17(d,J=16.5Hz,1H),5.73-5.67(m,1H),5.36-5.30(m,1H),4.31-3.97(m,6H),3.83-3.77(m,2H),3.74-3.49(m,6H),3.48-3.41(m,1H),3.40-3.37(m,2H)3.28-3.24(m,4H),3.07(s,3H),2.88-2.82(m,1H),2.80-2.64(m,7H),2.49-2.44(m,4H),2.22(s,3H),2.04(d,J=26.1Hz,3H),1.85-1.79(m,1H),1.67-1.55(m,2H),1.35(d,J=6.1Hz,3H),1.27-1.22(m,1H),1.05-0.93(m,4H),0.89(d,J=6.9Hz,2H),0.79(d,J=12.4Hz,5H),0.73(d,J=6.5Hz,1H),0.56(s,3H)。
实施例A542.合成1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-4-氟-N-((2S)-1-(((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基哌啶-4-甲酰胺
Figure BDA0004194083620011171
步骤1.在0℃下,向(S)-3-溴-5-碘-2-(1-甲氧基乙基)吡啶(15g,43.86mmol)和哌嗪-1-甲酸苯甲酯(8.7g,39.48mmol)于甲苯(150mL)中的溶液中分数份添加碳酸铯(71.46g,219.32mmol)、BINAP(0.55g,0.88mmol)和乙酸钯(0.49g,2.19mmol)。在氩气氛下,在90℃下将反应混合物搅拌12小时。将所得混合物冷却至室温,过滤并用EtOAc(150mL×3)洗涤滤饼。减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-4-(5-溴-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(16g,84%产率)。LCMS(ESI):C44H58N6O7的m/z[M+H]计算值433.1;实验值434.0。
步骤2.在0℃下,向(S)-4-(5-溴-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(22.7g,52.26mmol)、双(频哪醇合)二硼(19.91g,78.4mmol)于甲苯(230mL)中的搅拌的溶液中分数份添加乙酸钾(12.82g,130.66mmol)和Pd(dppf)Cl2·DCM(4.26g,5.23mmol)。在氩气氛下,在90℃下将反应混合物搅拌6小时。将所得混合物过滤并用EtOAc(200mL×3)洗涤滤饼。减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-4-(6-(1-甲氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(14.7g,58%产率)。LCMS(ESI):C26H36BN3O5的m/z[M+H]计算值481.3;实验值482.3。
步骤3.在0℃下,向5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚(17.46g,27mmol)于1,4-二噁烷(150mL)和H2O(30mL)中的搅拌的溶液中分数份添加碳酸钾(9.33g,67.51mmol)和Pd(dppf)Cl2 DCM(2.2g,2.7mmol),随后添加(S)-4-(6-(1-甲氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(13g,27mmol)。在氩气氛下,在70℃下将反应混合物搅拌12小时。将所得混合物冷却至室温并用H2O淬灭,接着用EtOAc(200mL×3)萃取。将有机相经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(20g,84.7%产率)。LCMS(ESI):C49H57BN4O4Si的m/z[M+H]计算值873.2;实验值873.3。
步骤4.在氩气氛下,在0℃下向(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(19g,21.74mmol)和Cs2CO3(49.58g,152.17mmol)于DMF(190mL)中的混合物中逐滴添加三氟甲烷磺酸2,2,2-三氟乙酯(50.46g,217.39mmol)。在氩气氛下,在室温下将反应混合物搅拌12小时,接着用H2O淬灭,用EtOAc(200mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(200mL×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(17.6g,84.7%产率)。LCMS(ESI):C51H58BF3N4O4Si的m/z[M+H]计算值954.2;实验值955.3。
步骤5.在0℃下,向(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(18g,18.83mmol)中的溶液中添加TBAF的THF溶液(180.0mL)。在氩气氛下,在40℃下将反应混合物搅拌12小时,接着用冷H2O淬灭。将所得混合物用EtOAc(200mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(200mL×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(7.8g,57.7%产率)。LCMS(ESI):C35H40BrF3N4O4的m/z[M+H]计算值716.2;实验值717.1。
步骤6.在0℃下,向(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1g,1.39mmol)于1,4-二噁烷(10mL)和H2O(2mL)中的溶液中分数份添加(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(1.08g,2.09mmol)、碳酸钾(481.47mg,3.48mmol)和Pd(dtbpf)Cl2(181.64mg,0.28mmol)。在氩气氛下,在70℃下将反应混合物搅拌3小时。将所得混合物冷却至室温,接着用H2O淬灭并用EtOAc(50mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((S)-3-(3-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(1.1g,77%产率)。LCMS(ESI):C55H68F3N7O9的m/z[M+H]计算值1027.5;实验值1028.3。
步骤7.在氩气氛下,在0℃下向(S)-1-((S)-3-(3-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(1.1g,1.07mmol)于THF(8mL)和H2O(2mL)中的溶液中逐滴添加LiOH(2.2mL,1M水溶液)。将反应混合物搅拌2小时,接着减压浓缩。用柠檬酸(1M)将残余物酸化至pH 5并用EtOAc(20mL×3)萃取。将合并的有机层减压浓缩。将残余物通过反相色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((S)-3-(3-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(750mg,69%产率)。LCMS(ESI):C54H66F3N7O9的m/z[M+H]计算值1013.5;实验值1014.3。
步骤8.在0℃下,向(S)-1-((S)-3-(3-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(0.75g,0.74mmol)于DCM(75mL)中的溶液中在0℃下分数份添加HOBT(0.5g,3.7mmol)、DIPEA(3.82g,29.58mmol)和EDCI(4.25g,22.19mmol)。在氩气氛下,在室温下将反应混合物搅拌12小时。将所得混合物减压浓缩并用EtOAc(100mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法纯化,得到呈固体状的4-(5-((63S,4S)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(0.5g,67.9%产率)。LCMS(ESI):C54H64F3N7O8的m/z[M+H]计算值995.5;实验值996.3。
步骤9.在0℃下,向4-(5-((63S,4S)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(500mg,0.5mmol)于MeOH(15mL)中的混合物中分数份添加三聚甲醛(135.64mg,1.5mmol)和Pd/C(750mg)。在氢气氛下,在室温下将反应混合物搅拌12小时。将所得混合物过滤并用EtOAc(50mL×5)洗涤滤饼。减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(350mg,79.6%产率)。LCMS(ESI):C47H60F3N7O8的m/z[M+H]计算值875.5;实验值876.5。
步骤10.在0℃下,向((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(300mg,0.34mmol)于DCM(2mL)中的溶液中逐滴添加HCl的1,4-二噁烷溶液(1mL,4M,4mmol)。在室温下,将反应混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的(63S,4S)-4-氨基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮盐酸盐(350mg,粗品)。LCMS(ESI):C42H52F3N7O4的m/z[M+H]计算值775.4;实验值766.4。
步骤11.在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮盐酸盐(150mg,0.19mmol)和N-(1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-4-氟哌啶-4-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(154mg,0.39mmol)于DMF(2mL)中的溶液中逐滴添加DIPEA(1g,7.72mmol)和HATU(110mg,0.29mmol)于DMF(0.2mL)中的混合物。在氩气氛下,在0℃下将反应混合物搅拌2小时,接着用H2O淬灭。将所得混合物用EtOAc(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(10mL×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法纯化,得到呈固体状的1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-4-氟-N-((2S)-1-(((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基哌啶-4-甲酰胺(39.5mg,17%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.48(d,J=2.9Hz,1H),8.32(t,J=7.3Hz,1H),7.97(s,1H),7.82-7.69(m,3H),7.66(t,J=7.8Hz,1H),7.33-7.07(m,3H),5.50(dd,J=16.7,8.6Hz,1H),5.33(t,J=9.2Hz,1H),5.16(d,J=12.2Hz,1H),4.94-4.80(m,1H),4.64(d,J=10.8Hz,1H),4.33-4.16(m,3H),4.12-4.02(m,2H),3.71-3.50(m,3H),3.25(s,3H),3.21-3.16(m,3H),3.14-3.05(m,1H),2.96(t,J=4.7Hz,4H),2.84(s,1H),2.82-2.72(m,2H),2.59-2.53(m,1H),2.47-2.40(m,4H),2.22(d,J=2.9Hz,9H),2.18-2.12(m,2H),2.11-1.99(m,3H),1.87-1.78(m,1H),1.74-1.62(m,1H),1.59-1.48(m,1H),1.40-1.32(m,9H),1.01(t,J=7.7Hz,1H),0.89(s,5H),0.83(d,J=6.3Hz,1H),0.77(d,J=6.6Hz,2H),0.38(s,3H)。LCMS(ESI):C44H58N6O7的m/z[M+H]计算值1154.6;实验值1155.7。
实施例A735.合成2-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-5-氧杂-2,9-二氮杂螺[3.5]壬烷-9-甲酰胺
Figure BDA0004194083620011231
步骤1.向BTC(425.2mg,1.448mmol)于DCM(10mL)中的搅拌的混合物中逐滴添加吡啶(1.04g,13.16mmol)和5-氧杂-2,9-二氮杂螺[3.5]壬烷-2-甲酸叔丁酯(1g,4.39mmol),在室温下将反应混合物搅拌2小时。将所得混合物减压浓缩,得到粗9-(氯羰基)-5-氧杂-2,9-二氮杂螺[3.5]壬烷-2-甲酸叔丁酯。
步骤2.在室温下,向9-(氯羰基)-5-氧杂-2,9-二氮杂螺[3.5]壬烷-2-甲酸叔丁酯(2.5g,粗品)于MeCN(20mL)中的搅拌的溶液中逐滴添加吡啶(1.04g,13.16mmol)和(2S)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酸苯甲酯(970.66mg,4.38mmol)。在80℃下,将反应混合物搅拌12小时并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-9-((1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-5-氧杂-2,9-二氮杂螺[3.5]壬烷-2-甲酸叔丁酯(783mg,37.6%产率,两个步骤)。LCMS(ESI):C25H37N3O6的m/z[M+H]计算值475.3;实验值476.3。
步骤3.在氢气氛下,在50℃下将(S)-9-((1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-5-氧杂-2,9-二氮杂螺[3.5]壬烷-2-甲酸叔丁酯(783mg,1.65mmol)和10wt%钯/碳(226.29mg)于THF(10mL)中的溶液搅拌2小时。将所得混合物冷却至室温,过滤并用MeCN(10mL×3)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到呈固体状的N-(2-(叔丁氧基羰基)-5-氧杂-2,9-二氮杂螺[3.5]壬烷-9-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(591mg,98.8%产率)。LCMS(ESI):C18H31N3O6的m/z[M+H]计算值385.2;实验值386.3。
步骤4.在室温下,向中间体2(731mg,1.16mmol)和DIPEA(2.25g,17.38mmol)于MeCN(50mL)中的搅拌的溶液中添加CIP(644.31mg,2.32mmol)和N-(2-(叔丁氧基羰基)-5-氧杂-2,9-二氮杂螺[3.5]壬烷-9-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(446.68mg,1.16mmol)。将反应混合物搅拌2小时,接着减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的9-(((2S)-1-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-5-氧杂-2,9-二氮杂螺[3.5]壬烷-2-甲酸叔丁酯(752mg,65%产率)。LCMS(ESI):C52H71N9O9S的m/z[M+H]计算值997.5;实验值996.6。
步骤5.在室温下,向9-(((2S)-1-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-5-氧杂-2,9-二氮杂螺[3.5]壬烷-2-甲酸叔丁酯(752mg,0.75mmol)于DCM(40mL)中的搅拌的溶液中分数份添加TFA(10mL)。将反应混合物搅拌2小时,接着减压浓缩。向残余物中添加饱和碳酸氢钠水溶液(100mL)和DCM(100mL)。将水层分离并用DCM(100mL×2)萃取。将合并的有机相经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到呈固体状的N-((2S)-1-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-5-氧杂-2,9-二氮杂螺[3.5]壬烷-9-甲酰胺(587mg,87%产率)。LCMS(ESI):C47H63N9O7S的m/z[M+H]计算值897.5;实验值898.4。
步骤6.将N-((2S)-1-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-5-氧杂-2,9-二氮杂螺[3.5]壬烷-9-甲酰胺(586mg,0.65mmol)于MeCN(10mL)中的搅拌的溶液中添加丙烯酸(47mg,0.65mmol)、DIPEA(421mg,3.26mmol)、CIP(362mg,1.3mmol)。将反应混合物搅拌12小时并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法纯化,得到呈固体状的2-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-5-氧杂-2,9-二氮杂螺[3.5]壬烷-9-甲酰胺(194mg,27%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.78(dd,J=4.8,1.7Hz,1H),8.48(d,J=1.6Hz,2H),7.85-7.65(m,3H),7.65-7.42(m,2H),6.30(mm,1H),6.10(m,J=17.0,1H),5.78-5.50(m,J=10.3,2H),5.10(dd,1H),4.40-3.80(m,14H),3.60–3.10(m,10H),2.94(d,J=14.5Hz,1H),2.85(s,4H),2.42(dd,1H),2.07(dd,2H),1.80(s,2H),1.55(s,3H),1.32(d,3H),0.95–0.75(m,12H),0.33(s,3H)。LCMS(ESI):C50H65N9O8S的m/z[M+H]计算值951.5;实验值952.6。
实施例A720.合成(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-21,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H,21H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,3)-三唑杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620011261
步骤1.在氩气氛下,在25℃下向1-甲基-1,2,4-三唑-3-甲酸甲酯(7.0g,49.60mmol)于CCl4(70.mL)中的搅拌的溶液中分数份添加NBS(13.24g,74.40mmol)和AIBN(11.40g,69.44mmol)。在80℃下,将所得混合物搅拌24小时。将所得混合物过滤,将滤液冷却至20℃并在20℃保持30分钟。过滤所得混合物。将滤饼用H2O(3×50mL)和石油醚(3×100mL)洗涤。将滤饼减压干燥。由此产生呈浅黄色固体状的5-溴-1-甲基-1,2,4-三唑-3-甲酸甲酯(10g,粗品)。LCMS(ESI):C5H6BrN3O2的m/z[M+H]计算值219.0;实验值219.9。
步骤2.在氮气氛下,在-5℃下向5-溴-1-甲基-1,2,4-三唑-3-甲酸甲酯(10.0g,45.50mmol)于MeOH(150.0mL)和H2O(30.0mL)中的搅拌的溶液中分数份添加NaBH4(6.88g,181.80mmol)。在0~10℃下,将所得混合物搅拌2小时。可通过LCMS检测所需产物。在0℃下,用盐水(100mL)淬灭反应。将所得混合物用石油醚(100mL)萃取。将水层分离并过滤。将滤饼用MeOH(2×50mL)洗涤。减压浓缩滤液,得到呈浅黄色固体状的(5-溴-1-甲基-1,2,4-三唑-3-基)甲醇(6g,粗品)。LCMS(ESI):C4H6BrN3O的m/z[M+H]计算值191.98;实验值192.0。
步骤3.在80℃下,将(5-溴-1-甲基-1,2,4-三唑-3-基)甲醇(6.0g)和HBr的AcOH溶液(144.0mL)的溶液搅拌过夜。用饱和NaHCO3(水溶液)将混合物中和至pH 9。将所得混合物用EtOAc(3×60mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。由此产生呈白色固体状的5-溴-3-(溴甲基)-1-甲基-1,2,4-三唑(6g,粗品)。LCMS(ESI):C4H5Br2N3的m/z[M+H]计算值253.89;实验值253.8。
步骤4.在氩气氛下,在0℃下向5-溴-3-(溴甲基)-1-甲基-1,2,4-三唑(6.0g,23.54mmol)和2-[(二苯基亚甲基)氨基]乙酸叔丁酯(6.95g,23.54mmol)于甲苯(42mL)和DCM(18.0mL)中的搅拌的混合物中分数份添加(2R,4R,5S)-1-(蒽-9-基甲基)-5-乙烯基-2-[(S)-(丙-2-烯-1-基氧基)(喹啉-4-基)甲基]-1-氮杂双环[2.2.2]辛烷-1-鎓溴化物(1.43g,2.35mmol)。将所得混合物搅拌并添加于H2O中的KOH(60mL)。在氩气氛下,在-10℃下将所得混合物搅拌24小时。可通过LCMS检测所需产物。在0℃下,用饱和NH4Cl(水溶液)淬灭反应。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×200mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈黄色油状的(2S)-3-(5-溴-1-甲基-1,2,4-三唑-3-基)-2-[(二苯基亚甲基)氨基]丙酸叔丁酯(5g,38.6%产率)。LCMS(ESI):C21H21BrN4O2的m/z[M+H]计算值469.12;实验值469.1。
步骤5.在氩气氛下,在0℃下向(2S)-3-(5-溴-1-甲基-1,2,4-三唑-3-基)-2-[(二苯基亚甲基)氨基]丙酸叔丁酯(5.0g,10.65mmol)于DCM(50.0mL)中的搅拌的溶液中逐滴添加TFA(25.0mL)。在氩气氛下,在室温下将所得混合物搅拌16小时。将所得混合物减压浓缩,得到呈褐色油状的(2S)-2-氨基-3-(5-溴-1-甲基-1,2,4-三唑-3-基)丙酸(6g,粗品)。LCMS(ESI):C6H9BrN4O2的m/z[M+H]计算值249.00;实验值249.0。
步骤6.在氩气氛下,在0℃下向(2S)-2-氨基-3-(5-溴-1-甲基-1,2,4-三唑-3-基)丙酸(6.0g,24.09mmol)于THF(36.0mL)中的搅拌的溶液中分数份添加NaHCO3(10.14g,120.69mmol)、Boc2O(7.89g,36.14mmol)。在室温下,将所得混合物搅拌16小时。可通过LCMS检测所需产物。将所得混合物减压浓缩。将混合物通过反相色谱法纯化,得到呈白色固体状的(2S)-3-(5-溴-1-甲基-1,2,4-三唑-3-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸(3g,33.9%产率)。LCMS(ESI):C11H17BrN4O4的m/z[M+H]计算值349.05;实验值349.0。
步骤7.在0℃下,向(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸2-[[(2M)-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-3-基]甲基]-2-甲基丙酯(1.0g,1.65mmol)于DMF(10.0mL)中的搅拌的溶液中分数份添加DIPEA(4.28g,33.08mmol)、(2S)-3-(5-溴-1-甲基-1,2,4-三唑-3-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸(0.69g,1.98mmol)和HATU(0.75g,1.99mmol)。在氩气氛下,在20℃下将所得混合物搅拌2小时。可通过LCMS检测所需产物。将所得混合物用H2O(100mL)淬灭并用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过反相色谱法纯化,得到呈浅黄色固体状的(3S)-1-[(2S)-3-(5-溴-1-甲基-1,2,4-三唑-3-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸2-[[(2M)-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-3-基]甲基]-2-甲基丙酯(800mg,46.5%产率)。LCMS(ESI):C45H64BBrN8O8的m/z[M+H]计算值935.42;实验值935.2。
步骤8.在室温下,向(3S)-1-[(2S)-3-(5-溴-1-甲基-1,2,4-三唑-3-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸2-[[(2M)-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-3-基]甲基]-2-甲基丙酯(800.0mg,0.86mmol)于二噁烷(10.0mL)中的搅拌的溶液中添加K3PO4(0.45g,2.12mmol)、XPhos(122.26mg,0.27mmol)、XPhos Pd G3(0.22g,0.27mmol)和H2O(2.0mL)。在氩气氛下,在75℃下将所得混合物搅拌3小时。可通过LCMS检测所需产物。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×60mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过反相色谱法纯化,得到呈浅黄色固体状的((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-21,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H,21H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,3)-三唑杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(400mg,56.8%产率)。LCMS(ESI):C39H52N8O6的m/z[M+H]计算值729.41;实验值729.3。
步骤9.向((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-21,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H,21H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,3)-三唑杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(400.0mg,0.56mmol)于DCM(1mL)中的溶液中添加TFA(0.5mL)。在氩气氛下,在室温下搅拌反应1小时。浓缩后,用饱和NaHCO3(水溶液,20mL)将混合物中和至pH 8。将混合物用DCM(3×20mL)萃取。将有机层经Na2SO4干燥并浓缩,得到呈浅黄色固体状的(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-21,10,10-三甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H,21H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,3)-三唑杂环十一蕃-5,7-二酮(500mg,粗品)。ESI-MS m/z=629.3[M+H]+;计算的MW:628.3。LCMS(ESI):C34H44N8O4的m/z[M+H]计算值629.36;实验值629.3。
步骤10.在空气气氛下,在0℃下向(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-21,10,10-三甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H,21H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,3)-三唑杂环十一蕃-5,7-二酮(170.0mg,0.27mmol)和(R)-2-(((1-二苯甲基氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸(114.68mg,0.32mmol)于DMF(5mL)中的搅拌的溶液中逐滴添加DIPEA(698.86mg,5.41mmol)和HATU(123.36mg,0.32mmol)。在0℃下,将所得混合物搅拌2小时。将所得混合物用25mL H2O稀释。将所得混合物用EtOAc(3×25mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×25mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液,得到呈灰白色固体状的(2R)-2-(((1-二苯甲基氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-21,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H,21H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,3)-三唑杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(180mg,粗品)。LCMS(ESI):C56H69N9O6的m/z[M+H]计算值964.54;实验值964.4。
步骤11.在氢气氛下,在室温下向(2R)-2-(((1-二苯甲基氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-21,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H,21H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,3)-三唑杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(180.0mg,0.19mmol)和Pd/C(90.0mg,0.85mmol)于MeOH(10mL)中的搅拌的溶液中添加Boc2O(81.48mg,0.37mmol)。在室温下,将所得混合物搅拌过夜。将所得混合物过滤,将滤饼用MeOH(3×10mL)洗涤。减压浓缩滤液,得到呈灰白色固体状的3-((2R)-2-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-21,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H,21H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,3)-三唑杂环十一蕃-4-基)氨甲酰基)-3-甲基丁氧基)氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(80mg,47.7%产率)。LCMS(ESI):C48H67N9O8的m/z[M+H]计算值898.52;实验值898.4。
步骤12.在空气氛下,在0℃下向3-((2R)-2-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-21,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H,21H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,3)-三唑杂环十一蕃-4-基)氨甲酰基)-3-甲基丁氧基)氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯于DCM(2mL)中的搅拌的溶液中逐滴添加TFA(1.0mL)。在0℃下,将所得混合物搅拌1小时。将所得混合物减压浓缩,得到呈黄绿色油状的(2R)-2-((氮杂环丁烷-3-基氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-21,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H,21H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,3)-三唑杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(85mg,粗品)。
步骤13.在0℃下,向(2R)-2-((氮杂环丁烷-3-基氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-21,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H,21H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,3)-三唑杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(80.0mg,0.10mmol)和4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酸(38.90mg,0.25mmol)于DMF(2mL)中的搅拌的溶液中分数份添加DIPEA(518.27mg,4.01mmol)和COMU(51.52mg,0.12mmol)。在空气氛下,将反应混合物搅拌2小时。将粗产物(150mg)通过反相色谱法纯化,得到呈灰白色固体状的(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-21,10,10-三甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H,21H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,3)-三唑杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(15.3mg,16.3%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.77(dd,J=4.8,1.7Hz,1H),8.15(d,J=1.7Hz,1H),8.07(d,J=8.1Hz,1H),7.85–7.78(m,1H),7.70(d,J=8.6Hz,1H),7.58–7.48(m,2H),5.82(s,1H),4.95(d,J=11.7Hz,1H),4.41–4.30(m,5H),4.30(d,J=8.2Hz,2H),4.25(d,J=5.6Hz,4H),4.10(td,J=17.1,16.1,9.1Hz,2H),3.99–3.82(m,3H),3.71–3.60(m,1H),3.54–3.43(m,3H),3.39(s,2H),3.22(d,J=1.6Hz,1H),2.92(d,J=13.6Hz,1H),2.86–2.77(m,2H),2.45(s,6H),2.37(q,J=7.7Hz,1H),2.17(d,J=6.6Hz,2H),2.03(d,J=10.2Hz,2H),1.78–1.66(m,3H),1.47(t,J=10.9Hz,6H),1.35–1.28(m,12H),0.32(s,3H)。LCMS(ESI):C51H70N10O7的m/z[M+H]计算值935.55;实验值935.3。
实施例A692.合成(3S)-1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,2)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺
Figure BDA0004194083620011321
步骤1.在0℃下,向1,3-噁唑-2-基甲醇(5.0g,50.46mmol)于THF(75mL)中的溶液中添加咪唑(8.59mg,0.13mmol)和TBSCl(11.41mg,0.08mmol)。将所得溶液搅拌5小时,接着减压浓缩。将粗材料通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈无色油状的2-[[(叔丁基二甲基硅烷基)氧基]甲基]-1,3-噁唑(10g,92.8%产率)。LCMS(ESI):C10H19NO2Si的m/z[M+H]计算值214.13;实验值214.3。
步骤2.在-78℃下,经10分钟向2-[[(叔丁基二甲基硅烷基)氧基]甲基]-1,3-噁唑(10.0g,46.87mmol)于THF(150.0mL,1851.45mmol)中的溶液中添加n-BuLi(22.4mL,56.25mmol)并在氩气氛下,在-78℃下搅拌30分钟。接着,在-78℃下,经10分钟将Br2(3.6mL,70.31mmol)于THF(10mL)中的溶液添加至所述溶液中。将所得溶液缓慢升温至室温并搅拌2小时。将所得混合物用NH4Cl/H2O(100mL)稀释并用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液并通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈黄色油状的5-溴-2-[[(叔丁基二甲基硅烷基)氧基]甲基]-1,3-噁唑(5.3g,38.6%产率)。LCMS(ESI):C10H18BrNO2Si的m/z[M+H]计算值292.04;实验值292.0。
步骤3.在氩气氛下,在0℃下向5-溴-2-[[(叔丁基二甲基硅烷基)氧基]甲基]-1,3-噁唑(4.0g,13.69mmol)于DCM(60.0mL)中的溶液中添加PBr3(7.41g,27.37mmol)。将所得溶液搅拌4小时,接着用NaHCO3/H2O(30mL)稀释。将混合物用EtOAc(3×40mL)萃取。将有机层减压浓缩并通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈黄色油状的5-溴-2-(溴甲基)-1,3-噁唑(2.5g,75.7%产率)。LCMS(ESI):C4H3Br2NO的m/z[M+H]计算值239.87;实验值241.9。
步骤4.在0℃下,将5-溴-2-(溴甲基)-1,3-噁唑(9.0g,37.36mmol)、Cat:200132-54-3(2.26g,3.74mmol)、DCM(45.0mL)、甲苯(90.0mL)、KOH(20.96g,373.63mmol)、H2O(42mL)和2-[(二苯基亚甲基)氨基]乙酸叔丁酯(13.24g,44.82mmol)的混合物搅拌4小时,接着用H2O(30mL)稀释。将混合物用DCM(3×40mL)萃取。将有机层减压浓缩并通过反相柱色谱法纯化,得到呈黄色固体状的(2S)-3-(5-溴-1,3-噁唑-2-基)-2-[(二苯基亚甲基)氨基]丙酸叔丁酯(4.8g,28.2%产率)。LCMS(ESI):C23H23BrN2O3的m/z[M+H]计算值455.10;实验值457.1。
步骤5.在0℃下,将(2S)-3-(5-溴-1,3-噁唑-2-基)-2-[(二苯基亚甲基)氨基]丙酸叔丁酯(1.20g,2.64mmol)、DCM(10.0mL,157.30mmol)和TFA(5.0mL,67.32mmol)中的混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到呈黄色固体状的(S)-3-(5-溴噁唑-2-基)-2-((2,2,2-三氟乙酰基)-I4-氮杂烷基)丙酸(0.5g,81.3%产率)。LCMS(ESI):C6H7BrN2O3的m/z[M+H]计算值234.97;实验值237.0。
步骤6.在0℃下,将(S)-3-(5-溴噁唑-2-基)-2-((2,2,2-三氟乙酰基)-I4-氮杂烷基)丙酸(500.0mg,2.13mmol)、Boc2O(928.56mg,4.26mmol)、二噁烷(2.50mL)、H2O(2.50mL)和NaHCO3(714.84mg,8.51mmol)的混合物搅拌3小时。将所得溶液通过反相柱色谱法纯化,得到呈黄色固体状的(2S)-3-(5-溴-1,3-噁唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸(0.65g,91.1%产率)。LCMS(ESI):C11H15BrN2O5的m/z[M+H]计算值335.02;实验值334.8。
步骤7.向(2S)-3-(5-溴-1,3-噁唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸(500.0mg,1.49mmol)和3-[(2M)-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-3-基]-2,2-二甲基丙-1-醇(808.16mg,1.64mmol)于DMF(5.0mL)和H2O(1.0mL)中的溶液中添加K3PO4(791.67mg,3.73mmol)和Pd(dppf)Cl2(109.16mg,0.15mmol)。在氩气氛下,在70℃下将所得混合物搅拌2小时。将混合物通过反相柱色谱法纯化,得到呈浅褐色固体状的(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[5-[(2M)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噁唑-2-基]丙酸(600mg,64.79%产率)。LCMS(ESI):C34H44N4O7的m/z[M+H]计算值621.33;实验值621.3。
步骤8.在0℃下,向(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(627.10mg,4.350mmol)和(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[5-[(2M)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噁唑-2-基]丙酸(900.0mg,1.45mmol)于DCM(10.0mL)中的搅拌的混合物中添加HATU(661.54mg,1.74mmol)和DIPEA(3747.71mg,29.00mmol)。将所得混合物搅拌2小时。可通过LCMS检测所需产物。将所得混合物减压浓缩并将粗材料通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈黄褐色固体状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[5-[(2M)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噁唑-2-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(900mg,83.11%)。LCMS(ESI):C40H54N6O8的m/z[M+H]计算值747.41;实验值747.2。
步骤9.在0℃下,向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[5-[(2M)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噁唑-2-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(2000.0mg,2.68mmol)于THF(18.mL)和H2O(6.0mL)中的搅拌的混合物中添加LiOH.H2O(337.10mg,8.03mmol)。将所得混合物搅拌2小时。可通过LCMS检测所需产物。在0℃下,用H2O淬灭反应并用1N HCl溶液调至pH 6。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液,得到呈黄色固体状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[5-[(2M)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噁唑-2-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(1300mg,66.2%产率)。LCMS(ESI):C39H52N6O8的m/z[M+H]计算值733.39;实验值733.3。
步骤10.在0℃下,向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[5-[(2M)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-1,3-噁唑-2-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(1.2g,1.64mmol)和DIPEA(8.5g,65.50mmol)于DCM(120.0mL)中的搅拌的混合物中添加HOBT(1.8g,13.10mmol)和EDCI(7.8g,40.93mmol)。将所得混合物搅拌2小时。可通过LCMS检测所需产物。将混合物减压浓缩并通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈黄褐色固体状的((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,2)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(660mg,56.4%产率)。LCMS(ESI):C39H50N6O7的m/z[M+H]计算值715.38;实验值715.3。
步骤11.在0℃下,将((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,2)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(20.0mg,0.028mmol)和TFA(3.0mL)于DCM(6.0mL)中的混合物搅拌2小时。可通过LCMS检测所需产物。将所得混合物减压浓缩,得到呈黄绿色固体状的(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,2)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(160mg,粗品)。LCMS(ESI):C34H42N6O5的m/z[M+H]计算值615.33;实验值615.2。
步骤12.在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,2)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(180.0mg,0.293mmol)和(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)(甲基)氨基]-3-甲基丁酸(135.45mg,0.59mmol)于DMF(2.0mL)中的搅拌的混合物中添加HATU(133.60mg,0.35mmol)和DIPEA(756.86mg,5.86mmol)。将所得混合物搅拌2小时。可通过LCMS检测所需产物。将混合物通过反相柱色谱法纯化,得到呈黄褐色固体状的((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,2)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(160mg,66%产率)。LCMS(ESI):C45H61N7O8的m/z[M+H]计算值828.47;实验值828.4。
步骤13.在0℃下,向((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,2)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(160.0mg,0.19mmol)于DCM(2.0mL)中的搅拌的混合物中添加TFA(1.0mL)。将所得混合物搅拌2小时。可通过LCMS检测所需产物。将所得混合物减压浓缩,得到呈黄色固体状的(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,2)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(130mg,粗品)。LCMS(ESI):C40H53N7O6的m/z[M+H]计算值728.41;实验值728.5。
步骤14.在0℃下,向((2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,2)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(130.0mg,0.18mmol)和(3S)-1-[4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基]吡咯烷-3-甲酸(180.25mg,0.72mmol)于DMF(2.0mL)中的搅拌的混合物中添加DIPEA(461.64mg,3.57mmol)和HATU(135.81mg,0.36mmol)。将所得混合物搅拌2小时。可通过LCMS检测所需产物。将混合物通过反相柱色谱法纯化,得到呈固体状的(3S)-1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,2)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺(55.3mg,31.3%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.77(dd,J=4.8,1.7Hz,1H),8.09–8.00(m,1H),7.92(s,1H),7.88–7.80(m,1H),7.62(d,J=8.7Hz,1H),7.59–7.49(m,2H),7.39–7.30(m,1H),5.69(p,J=8.8Hz,1H),5.44(d,J=12.1Hz,1H),4.67(d,J=10.7Hz,1H),4.30–4.15(m,3H),3.99(dt,J=13.2,6.4Hz,3H),3.89–3.79(m,1H),3.62(ddd,J=30.5,18.6,11.4Hz,5H),3.39(dd,J=9.4,3.8Hz,2H),3.21–3.13(m,1H),3.08(d,J=15.0Hz,3H),2.99–2.74(m,6H),2.26–2.18(m,5H),2.16(s,2H),2.14–1.94(m,3H),1.86–1.68(m,2H),1.57(q,J=9.2,5.8Hz,1H),1.44–1.27(m,9H),0.94(d,J=6.6Hz,4H),0.89(dd,J=6.5,2.5Hz,2H),0.80(d,J=6.3Hz,2H),0.77–0.69(m,4H),0.58(d,J=20.4Hz,3H)。LCMS(ESI):C53H71N9O8的m/z[M+H]计算值962.55;实验值962.5。
实施例A675.合成(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620011381
步骤1.在空气氛下,在0℃下将2-溴-4-(乙氧基羰基)-1,3-噁唑-5-鎓盐(6.83g,31.19mmol)、EtOH(100.0mL)和NaBH4(4.72g,124.76mmol)的混合物在0℃下搅拌6小时。在0℃下,用H2O淬灭反应。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液,得到呈固体状的(2-溴-1,3-噁唑-4-基)甲醇(4.122g,74.3%产率)。LCMS(ESI):C4H4BrNO2的m/z[M+H]计算值177.95;实验值178.0。
步骤2.在空气氛下,在0℃下将(2-溴-1,3-噁唑-4-基)甲醇(4.30g,24.16mmol)、DCM(50mL)和三溴化磷(9809.39mg,36.24mmol)的混合物在0℃下搅拌过夜。通过在0℃下添加NaHCO3(水溶液)淬灭反应。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液,得到呈液体状的2-溴-4-(溴甲基)-1,3-噁唑(3.28g,56.4%产率)。LCMS(ESI):C4H3Br2NO的m/z[M+H]计算值239.87;实验值239.9。
步骤3.在空气氛下,在-16℃下将2-溴-4-(溴甲基)-1,3-噁唑(3280.0mg,13.62mmol)、KOH(9M,10mL)、30mL甲苯/DCM混合物(7/3)和2-[(二苯基亚甲基)氨基]乙酸叔丁酯(5228.74mg,17.70mmol)的混合物搅拌过夜。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液,得到呈固体状的(2S)-3-(2-溴-1,3-噁唑-4-基)-2-[(二苯基亚甲基)氨基]丙酸叔丁酯(8.33g,80.6%产率)。LCMS(ESI):C23H23BrN2O3的m/z[M+H]计算值455.10;实验值455.1。
步骤4.在空气氛下,在室温下将(2S)-3-(2-溴-1,3-噁唑-4-基)-2-[(二苯基亚甲基)氨基]丙酸叔丁酯(4100.0mg,9.0mmol)和柠檬酸(1N)(40.0mL,0.21mmol)于THF(40mL)中的混合物搅拌过夜。通过在0℃下添加HCl(水溶液)(100mL)淬灭反应。将水层用EtOAc(3×100mL)萃取。将K2CO3(水溶液)(200mL)添加至所得混合物中并用EtOAc(3×100mL)萃取。将有机层减压浓缩,得到呈深黄色固体状的(2S)-2-氨基-3-(2-溴-1,3-噁唑-4-基)丙酸叔丁酯(1730mg,66%产率)。LCMS(ESI):C10H15BrN2O3的m/z[M+H]计算值291.03;实验值291.0。
步骤5.在空气氛下,在0℃下将(2S)-2-氨基-3-(2-溴-1,3-噁唑-4-基)丙酸叔丁酯(1780.0mg,6.11mmol)、TFA(10.0mL)和DCM(10.0mL)的混合物搅拌过夜。将所得混合物减压浓缩,得到呈深黄色固体状的(2S)-2-氨基-3-(2-溴-1,3-噁唑-4-基)丙酸(1250mg,87%产率)。LCMS(ESI):C6H7BrN2O3的m/z[M+H]计算值234.97;实验值234.9。
步骤6.在空气氛下,在室温下将二碳酸二叔丁酯(4178.58mg,19.15mmol)、THF(10mL)、H2O(10mL)、(2S)-2-氨基-3-(2-溴-1,3-噁唑-4-基)丙酸(1500.0mg,6.38mmol)和NaHCO3(3216.74mg,38.29mmol)的混合物搅拌过夜。在室温下,用H2O淬灭反应。将所得混合物减压浓缩。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取。用1M HCl(水溶液)将水层酸化至pH6。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液,得到呈油状的(2S)-3-(2-溴-1,3-噁唑-4-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸(920mg,43.0%产率)。LCMS(ESI):C11H15BrN2O5的m/z[M+H]计算值335.02;实验值335.0。
步骤7.在空气氛下,在0℃下将3-(2-溴-1,3-噁唑-4-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸(850.0mg,2.54mmol)、1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(1.88g,13.04mmol)、DIPEA(1966.68mg,15.22mmol)、DCM(30.0mL)和HATU(1446.48mg,3.80mmol)的混合物搅拌3小时。将所得混合物用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将所得混合物通过反相快速色谱法纯化,得到呈固体状的1-[3-(2-溴-1,3-噁唑-4-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(610mg,52.1%产率)。LCMS(ESI):C17H25BrN4O6的m/z[M+H]计算值461.10;实验值461.0。
步骤8.在空气氛下,在0℃下将1-[3-(2-溴-1,3-噁唑-4-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(570.0mg,1.24mmol)、LiOH(2.0mL,1M水溶液)和THF(2.0mL)的混合物搅拌3小时。将所得混合物减压浓缩。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取。用1N HCl(水溶液)将合并的水层酸化至pH 5。将水相用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液,得到呈固体状的1-[3-(2-溴-1,3-噁唑-4-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(500mg,90.5%产率)。LCMS(ESI):C16H23BrN4O6的m/z[M+H]计算值447.09;实验值446.8。
步骤9.在空气氛下,在0℃下将1-[3-(2-溴-1,3-噁唑-4-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(450.0mg,1.01mmol)、3-[(2M)-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-3-基]-2,2-二甲基丙-1-醇(743.19mg,1.51mmol)、DMAP(24.58mg,0.20mmol)、DCM(15.0mL)和DCC(311.37mg,1.51mmol)的混合物搅拌3小时。将所得混合物用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈白色固体状的(S)-1-((S)-3-(2-溴噁唑-4-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(330mg,35.6%产率)。LCMS(ESI):C45H62BBrN6O9的m/z[M+H]计算值921.39;实验值921.4。
步骤10.在氩气氛下,在70℃下将(S)-1-((S)-3-(2-溴噁唑-4-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(290.0mg,0.33mmol)、K3PO4(206.64mg,0.97mmol)、X-Phos(30.94mg,0.07mmol)、XPhos PdG3(54.93mg,0.07mmol)、二噁烷(5.mL)和H2O(1.0mL)的混合物搅拌4小时。将所得混合物用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(130mg,56.0%产率)。LCMS(ESI):C39H50N6O7的m/z[M+H]计算值715.38;实验值715.3。
步骤11.在空气氛下,在室温下将((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(120.0mg)、DCM(2.0mL)和TFA(0.2mL)的混合物搅拌6小时。将所得混合物减压浓缩,得到呈固体状的(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(90mg,87.2%产率)。LCMS(ESI):C34H42N6O5的m/z[M+H]计算值615.33;实验值615.3。
步骤12.在空气氛下,在0℃下将(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(200.0mg,0.33mmol)、(2R)-2-([[1-(二苯基甲基)氮杂环丁烷-3-基]oxy]甲基)-3-甲基丁酸(172.49mg,0.49mmol)、DIPEA(420.48mg,3.25mmol)、DMF(3.0mL)和HATU(148.44mg,0.39mmol)的混合物搅拌3小时。将所得混合物用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(2R)-2-(((1-二苯甲基氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(154mg,77.0%产率)。LCMS(ESI):C56H67N7O7的m/z[M+H]计算值950.52;实验值950.6。
步骤13.在H2气氛下,在室温下将(2R)-2-(((1-二苯甲基氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(240.0mg,0.25mmol)、(Boc)2O(165.37mg,0.76mmol)、MeOH(5.0mL)和Pd(OH)2(72.0mg,0.51mmol)的混合物搅拌过夜。将所得混合物过滤,将滤饼用MeOH(3×5mL)洗涤。减压浓缩滤液。将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的3-((2R)-2-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨甲酰基)-3-甲基丁氧基)氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(150mg,67.2%产率)。LCMS(ESI):C48H65N7O9的m/z[M+H]计算值884.49;实验值884.2。
步骤14.在空气氛下,在0℃下将3-((2R)-2-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨甲酰基)-3-甲基丁氧基)氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(150.0mg)、DCM(2.0mL)和TFA(0.40mL)的混合物搅拌3小时。将所得混合物减压浓缩,得到呈固体状的(2R)-2-((氮杂环丁烷-3-基氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(120mg,90.2%产率)。LCMS(ESI):C43H57N7O7的m/z[M+H]计算值784.44;实验值784.2。
步骤15.在空气氛下,在0℃下将(2R)-2-((氮杂环丁烷-3-基氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(130.0mg,0.17mmol)、4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酸钠(44.07mg,0.25mmol)、DMF(3.0mL)、DIPEA(64.29mg,0.50mmol)和COMU(106.46mg,0.25mmol)的混合物搅拌3小时。将所得混合物用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将粗产物通过反相色谱法纯化,得到呈固体状的(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(25mg,16.4%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.77(dd,J=4.8,1.8Hz,1H),8.55(s,1H),8.14(dd,J=8.3,2.9Hz,1H),7.82(d,J=7.6Hz,1H),7.76–7.65(m,3H),7.54(dd,J=7.7,4.7Hz,1H),7.54–7.02(m,1H),5.72(td,J=7.4,3.4Hz,1H),4.97(d,J=11.9Hz,1H),4.46–4.24(m,6H),4.18–4.04(m,2H),3.94(dd,J=32.9,7.8Hz,1H),3.77–3.63(m,2H),3.57(s,1H),3.49(s,2H),3.21(s,3H),2.90(d,J=14.6Hz,1H),2.87–2.79(m,1H),2.72(td,J=15.5,14.6,3.1Hz,2H),2.46(s,1H),2.43–2.26(m,6H),2.11–1.99(m,1H),1.82–1.66(m,2H),1.56–1.37(m,11H),0.89(dt,J=12.3,7.7Hz,12H),0.35(s,3H)。LCMS(ESI):C51H68N8O8的m/z[M+H]计算值921.52;实验值921.5。
实施例A607.合成(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((23S,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-哌啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620011451
步骤1.在氩气氛下,在50℃下将Zn(44.18g,675.41mmol)和I2(8.58g,33.77mmol)于DMF(120mL)中的混合物搅拌30分钟,随后添加于DMF(200mL)中的(2R)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-碘丙酸甲酯(72.24g,219.51mmol)。在氩气氛下,在50℃下将反应混合物搅拌2小时。接着,添加2,6-二溴-吡啶(40g,168.85mmol)和Pd(PPh3)4(39.02g,33.77mmol)于DMF(200mL)中的混合物。在75℃下,将所得混合物搅拌2小时,接着冷却至室温并用EtOAc(1L×3)萃取。将合并的有机层用H2O(1L×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S)-3-(6-溴吡啶-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(41g,67%产率)。LCMS(ESI):C14H19BrN2O4的m/z[M+H]计算值358.1;实验值359.1。
步骤2.在室温下,向3-[(2M)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)吲哚-3-基]-2,2-二甲基丙-1-醇(45.0g,82.35mmol)于二噁烷(400mL)和H2O(80mL)中的溶液中添加碳酸钾(28.45g,205.88mmol)、(2S)-3-(6-溴吡啶-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(35.5g,98.8mmol)、Pd(dtbpf)Cl2(5.37g,8.24mmol)。在氮气氛下,在70℃下将反应混合物搅拌2小时。将所得混合物用EtOAc(500mL×3)萃取。将合并的有机层用H2O(300mL×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(6-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吡啶-2-基)丙酸甲酯(48g,83%产率)。LCMS(ESI):C37H45F3N4O6的m/z[M+H]计算值698.3;实验值699.4。
步骤3.在0℃下,向(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(6-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吡啶-2-基)丙酸甲酯(52g,74.42mmol)于THF(520mL)中的溶液中添加LiOH(74.41mL,223.23mmol)。在室温下,将反应混合物搅拌3小时。用HCl(水溶液)将所得混合物酸化至pH5并用EtOAc(1L×3)萃取。将合并的有机层用H2O(1L×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到呈固体状的(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(6-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吡啶-2-基)丙酸(50g,98%产率)。LCMS(ESI):C36H43F3N4O6的m/z[M+H]计算值684.3;实验值685.1。
步骤4.在0℃下,向(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(6-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吡啶-2-基)丙酸(55g,80.32mmol)于DCM(600mL)中的溶液中添加DIPEA(415.23g,3212.82mmol)和HATU(45.81g,120.48mmol)。在室温下,将反应混合物搅拌12小时,接着用H2O淬灭。将所得混合物用EtOAc(1L×3)萃取。将合并的有机层用H2O(1L)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(6-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吡啶-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(63g,96%产率)。LCMS(ESI):C42H53F3N6O7的m/z[M+H]计算值810.4;实验值811.3。
步骤5.在0℃下,将1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(6-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吡啶-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(50g,61.66mmol)于THF(500mL)和3M LiOH(61.66mL,184.980mmol)中的溶液在室温下搅拌3小时,接着用HCl(水溶液)酸化至pH 5。将所得混合物用EtOAc(800mL×3)萃取。将合并的有机层用H2O(800mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到呈固体状的1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(6-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吡啶-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(48g,97%产率)。LCMS(ESI):C41H51F3N6O7的m/z[M+H]计算值796.3;实验值797.1。
步骤6.在0℃下,向1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(6-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)吡啶-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(50g,62.74mmol)于DCM(10L)中的溶液中添加DIPEA(243.28g,1882.32mmol)、EDCI(360.84g,1882.32mmol)和HOBT(84.78g,627.44mmol)。在室温下,将反应混合物搅拌3小时,用H2O淬灭并减压浓缩。将残余物用EtOAc(2L×3)萃取。将合并的有机层用H2O(2L×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(2,6)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(43.6g,89%产率)。LCMS(ESI):C41H49F3N6O6的m/z[M+H]计算值778.3;实验值779.3。
步骤7.在0℃下,向((4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(2,6)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(300mg)于DCM(10mL)中的溶液中添加TFA(3mL)。在室温下,将反应混合物搅拌1小时。将所得混合物用甲苯(10mL)稀释并减压浓缩三次,得到呈油状的(4S)-4-氨基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(2,6)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(280mg,粗品)。LCMS(ESI):C36H41F3N6O4的m/z[M+H]计算值679.2;实验值678.3。
步骤8.在0℃下,向(4S)-4-氨基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(2,6)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(140mg,0.21mmol)于MeCN(2mL)中的溶液中添加DIPEA(266.58mg,2.06mmol)、N-(4-(叔丁氧基羰基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-9-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(127.94mg,0.31mmol)和CIP(114.68mg,0.41mmol)。在室温下,将反应混合物搅拌1小时。将所得混合物减压浓缩。将残余物用EtOAc(10mL×3)萃取。将合并的有机层用H2O(10mL×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法纯化,得到呈固体状的9-(((2S)-1-(((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(2,6)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-甲酸叔丁酯(170mg,76%产率)。LCMS(ESI):C56H74F3N9O9的m/z[M+H]计算值1073.5;实验值1074.6。
步骤9.在0℃下,向9-(((2S)-1-(((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(2,6)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-甲酸叔丁酯(160mg,0.15mmol)于DCM(5mL)中的溶液中逐滴添加TFA(1.5mL)。在0℃下,将反应混合物搅拌1小时。将所得混合物用甲苯(10mL)稀释并减压浓缩三次,得到呈油状的N-((2S)-1-(((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(2,6)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-9-甲酰胺(150mg,粗品)。LCMS(ESI):C51H65F3N9O7的m/z[M+H]计算值973.5;实验值974.4。
步骤10.在0℃下,向N-((2S)-1-(((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(2,6)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-9-甲酰胺(150mg,0.15mmol)于DMF(3mL)中的溶液中添加DIPEA(199.01mg,1.54mmol)、丙烯酸(16.64mg,0.23mmol)和COMU(98.39mg,0.23mmol)。在室温下,将反应混合物搅拌1小时并减压浓缩。将残余物用EtOAc(10mL×3)萃取。将合并的有机层用H2O(10mL×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法和反相色谱法纯化,得到呈固体状的4-丙烯酰基-N-((2S)-1-(((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(2,6)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-9-甲酰胺(53mg,33%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.79(dd,J=4.8,1.9Hz,2H),8.09(d,J=31.4Hz,1H),7.96(d,J=8.9Hz,1H),7.90–7.72(m,3H),7.64(t,J=7.8Hz,1H),7.56(dd,J=7.8,4.7Hz,1H),7.03(s,1H),6.86(dd,J=16.6,10.4Hz,1H),6.20(d,J=14.0Hz,1H),5.73(d,J=12.2Hz,2H),5.47(s,1H),5.35(d,J=11.8Hz,1H),4.68(s,1H),4.28(d,J=12.5Hz,1H),4.13(d,J=6.4Hz,1H),3.92(s,1H),3.84–3.64(m,6H),3.59(d,J=14.0Hz,3H),3.50(s,3H),3.10(s,5H),3.02(d,J=13.3Hz,2H),2.85(d,J=12.1Hz,3H),2.08–1.89(m,2H),1.81(s,1H),1.75–1.51(m,5H),1.39(d,J=6.1Hz,4H),1.24(s,0H),0.91–0.66(m,10H),0.53(s,3H)。LCMS(ESI):C54H68F3N9O8的m/z[M+H]计算值1027.5;实验值1028.1。
实施例A590.合成(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,3)-噻二唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620011511
步骤1.在0℃下,向2-乙氧基-2-亚胺基乙酸乙酯(25.0g,172.23mmol)和EtOH(250.0mL)中的混合物中分数份添加氯化铵(9.21g,172.23mmol),接着在氩气氛下,在室温下搅拌4小时。将所得混合物减压浓缩并用Et2O(3×200mL)洗涤。将有机层合并,并减压浓缩。由此产生呈浅黄色固体状的2-氨基-2-亚胺基乙酸乙酯盐酸盐(20g,粗品)。LCMS(ESI):C4H8N2O2的m/z[M+H]计算值117.07;实验值116.9。
步骤2.在0℃下,向2-氨基-2-亚胺基乙酸乙酯盐酸盐(13.30g,87.17mmol)、H2O(50.0mL)和Et2O(100.0mL)中的混合物中逐滴添加五水合次氯酸钠(7.79g,104.60mmol)。在氩气氛下,将所得混合物搅拌3小时。将混合物用Et2O(3x 200mL)萃取。将所得溶液用盐水(3×100mL)洗涤。将有机相经无水Na2SO4干燥并减压浓缩,得到呈浅黄色固体状的(Z)-2-氨基-2-(氯亚胺基)乙酸乙酯(7g,粗品)。LCMS(ESI):C4H7ClN2O2的m/z[M+H]计算值151.03;实验值150.8。
步骤3.在0℃下,向(Z)-2-氨基-2-(氯亚胺基)乙酸乙酯(8.40g,55.792mmol)和MeOH(130.0mL)中的溶液中分数份添加硫氰酸钾(5.42g,55.79mmol)。在氩气氛下,在室温下将所得混合物搅拌4小时。用H2O/冰淬灭反应。将混合物用EtOAc(5×100mL)萃取。将所得有机相经无水Na2SO4干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的5-氨基-1,2,4-噻二唑-3-甲酸乙酯(2.3g,23.8%产率)。LCMS(ESI):C5H7N3O2S的m/z[M+H]计算值174.03;实验值173.8。
步骤4.在氩气氛下,在0℃下向5-氨基-1,2,4-噻二唑-3-甲酸乙酯(5.80g,33.49mmol)、MeCN(90.0mL)和CuBr2(11.22g,50.23mmol)中的溶液中逐滴添加亚硝酸2-甲基-2-丙酯(6.91g,66.98mmol)。将混合物搅拌30分钟。接着,在50℃下将混合物搅拌4小时。将混合物冷却至0℃并用H2O/冰淬灭。将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取。将所得有机相经无水Na2SO4干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法纯化,得到呈固体状的5-溴-1,2,4-噻二唑-3-甲酸乙酯(6.2g,78.1%产率)。LCMS(ESI):C5H5BrN2O2S的m/z[M+H]计算值236.93;实验值237.1。
步骤5.在0℃下,向(S)-3-(5-溴-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(16.60g,33.24mmol)、DCM(170.0mL)和咪唑(5.66g,83.10mmol)中的溶液中逐滴添加叔丁基-氯二苯基硅烷(11.88g,43.21mmol)。在氩气氛下,在室温下将所得混合物搅拌3小时。用H2O/冰淬灭反应。将混合物用EtOAc(3×200mL)萃取。将有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚(22g,89.7%产率)。LCMS(ESI):C39H44BrF3N2O2Si的m/z[M+H]计算值737.24;实验值737.0。
步骤6.在0℃下,向(S)-5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚(28.0g,37.95mmol)、甲苯(270.0mL)、KOAc(9.31g,94.88mmol)和双(频哪醇合)二硼(19.27g,75.90mmol)的溶液中分数份添加Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(6.18g,7.59mmol)。在氩气氛下,在90℃下将所得混合物搅拌3小时。将混合物冷却至室温并用H2O/冰淬灭。将混合物用EtOAc(3×200mL)萃取。将所得有机相经无水Na2SO4干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚(28.2g,94.7%产率)。LCMS(ESI):C45H56BF3N2O4Si的m/z[M+H]计算值785.41;实验值785.4。
步骤7.在0℃下,向(S)-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚(19.60g,24.97mmol)、1,4-二噁烷(200mL)、H2O(40mL)、5-溴-1,2,4-噻二唑-3-甲酸乙酯(5.92g,24.97mmol)和K3PO4(13.25g,62.43mmol)的溶液中分数份添加Pd(dtbpf)Cl2(1.63g,2.50mmol)。在氩气氛下,在75℃下将所得混合物搅拌1.5小时。将混合物冷却至0℃并用H2O/冰淬灭,并用EtOAc(3×200mL)萃取。将所得有机相经无水Na2SO4干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈黄色固体状的(S)-5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-甲酸乙酯(14g,68.8%产率)。LCMS(ESI):C44H49F3N4O4SSi的m/z[M+H]计算值815.33;实验值815.2。
步骤8.在0℃下,向(S)-5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-甲酸乙酯(13.60g,16.69mmol)和EtOH(140.0mL)中的溶液中分数份添加NaBH4(3.16g,83.43mmol)。将所得混合物搅拌3小时,接着用H2O/冰淬灭。将所得混合物用盐水(3×100mL)洗涤并用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-醇(9.7g,75.2%产率)。LCMS(ESI):C42H47F3N4O3SSi的m/z[M+H]计算值773.32;实验值773.3。
步骤9.在0℃下,向(S)-5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-醇(9.70g,12.55mmol)、DCM(100.0mL)和CBr4(8.32g,25.10mmol)的溶液中逐滴添加于DCM(20.0mL)中的PPh3(6.58g,25.10mmol)。在氩气氛下,将所得混合物搅拌2小时,接着用H2O/冰淬灭。将混合物用DCM(3×200mL)萃取。将所得有机相经无水Na2SO4干燥并减压浓缩。将残余物通过反相快速色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-3-(溴甲基)-5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑(9.5g,90.6%产率)。LCMS(ESI):C42H46BrF3N4O2SSi的m/z[M+H]计算值835.23;实验值834.9。
步骤10.在0℃下,向(S)-3-(溴甲基)-5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑(9.40g,11.25mmol)、甲苯(84.0mL)、DCM(36.0mL)、2-[(二苯基亚甲基)氨基]乙酸叔丁酯(3.32g,11.25mmol)和O-烯丙基-N-(9-蒽基甲基)溴化金鸡纳碱(0.68g,1.13mmol)的搅拌的溶液中逐滴添加9M KOH水溶液(94.0mL)。在氩气氛下,将所得混合物搅拌过夜。将混合物用EtOAc(3×200mL)萃取并减压浓缩有机相。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-3-(5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-基)-2-((二苯基亚甲基)氨基)丙酸叔丁酯(9g,76.2%产率)。LCMS(ESI):C61H66F3N5O4SSi的m/z[M+H]计算值1050.46;实验值1050.8。
步骤11.在0℃下,向(S)-3-(5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-基)-2-((二苯基亚甲基)氨基)丙酸叔丁酯(8.0g,7.62mmol)和DCM(40.0mL)溶液中的溶液中逐滴添加TFA(40.0mL)。在室温下,将所得混合物搅拌过夜,接着减压浓缩。用NaHCO3将残余物碱化至pH 8。将混合物用EtOAc(3×200mL)萃取。将有机相减压浓缩。将残余物通过反相快速色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-2-氨基-3-(5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-基)丙酸(5g,79.1%产率)。LCMS(ESI):C44H50F3N5O4SSi的m/z[M+H]计算值830.34;实验值830.2。
步骤12.在0℃下,向(S)-2-氨基-3-(5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-基)丙酸(4.70g,5.66mmol)、DCM(50.0mL)和Et3N(2.86g,28.31mmol)中的溶液中逐滴添加(Boc)2O(1.36g,6.23mmol)。在氩气氛下,在室温下将所得混合物搅拌3小时,接着减压浓缩并通过反相快速色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-基)丙酸(5g,94.9%产率)。LCMS(ESI):C49H58F3N5O6SSi的m/z[M+H]计算值930.39;实验值930.3。
步骤13.在0℃下,向(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-基)丙酸(5.30g,5.70mmol)、DMF(60.0mL)、1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(1.64g,11.40mmol)和DIPEA(22.09g,170.94mmol)中的混合物中逐滴添加于DMF(5mL)中的HATU(2.82g,7.41mmol)。在氩气氛下,在室温下将所得混合物搅拌3小时。接着,用H2O/冰淬灭反应。将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取并将有机相用盐水(3×100mL)洗涤。将所得混合物经无水Na2SO4干燥并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(5.6g)。LCMS(ESI):C55H68F3N7O7SSi的m/z[M+H]计算值1056.47;实验值1056.2。
步骤14.在氩气氛下,在40℃下将(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(5-(3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(5.60g,5.30mmol)和TBAF的THF溶液(56.0mL)的混合物搅拌过夜。用饱和NH4Cl(水溶液)淬灭反应。将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并减压浓缩有机相。将残余物通过反相快速色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(5-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(4.1g,96.2%产率)。LCMS(ESI):C38H48F3N7O7S的m/z[M+H]计算值804.34;实验值804.3。
步骤15.在0℃下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(5-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2,2,2-三氟乙基)-1H-吲哚-5-基)-1,2,4-噻二唑-3-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(4.0g,5.0mmol)和DCM(450.0mL)的溶液中分数份添加DIPEA(51.45g,398.08mmol)、HOBt(6.72g,49.76mmol)和EDCI(57.23g,298.55mmol)。在氩气氛下,在室温下将所得混合物搅拌16小时。用H2O/冰淬灭反应并用EtOAc(3×30mL)萃取。减压浓缩有机相。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,3)-噻二唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.7g,43.5%产率)。LCMS(ESI):C38H46F3N7O6S的m/z[M+H]计算值786.33;实验值786.3。
步骤16.在0℃下,向((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,3)-噻二唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸酯(300.0mg,0.38mmol)和DCM(2.0mL)的溶液中逐滴添加TFA(1.0mL)。在室温下,将所得混合物搅拌2小时,接着减压浓缩。用饱和NaHCO3(水溶液)将残余物碱化至pH 8。将混合物用EtOAc(3×20mL)萃取。减压浓缩有机相,得到呈固体状的(63S,4S,Z)-4-氨基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,3)-噻二唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(270mg,粗品)。LCMS(ESI):C33H38F3N7O4S的m/z[M+H]计算值686.27;实验值686.1。
步骤17.在0℃下,向(63S,4S,Z)-4-氨基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,3)-噻二唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(160.0mg,0.23mmol)、(R)-2-(((1-二苯甲基氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-3-甲基丁酸(123.70mg,0.35mmol)和DMF(2.0mL)的溶液中添加于DMF(0.5mL)中的DIPEA(603.09mg,4.660mmol)和COMU(119.91mg,0.28mmol)。在氩气氛下,在室温下将所得混合物搅拌2小时。用H2O/冰淬灭反应并用EtOAc(3×20mL)萃取。将有机相用盐水(3×10mL)洗涤并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(2R)-2-(((1-二苯甲基氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,3)-噻二唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(160mg,67.2%产率)。LCMS(ESI):C55H63F3N8O6S的m/z[M+H]计算值1021.46;实验值1021.4。
步骤18.在0℃下,向(2R)-2-(((1-二苯甲基氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,3)-噻二唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(160.0mg,0.16mmol)和MeOH(5.0mL)的溶液中分数份逐滴添加(Boc)2O(85.49mg,0.39mmol),随后Pd/C(320.0mg)。在氢气氛下,在室温下将所得混合物搅拌过夜。将所得混合物过滤并用EtOAc(3×20mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液。将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的3-((2R)-2-(((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,3)-噻二唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨甲酰基)-3-甲基丁氧基)氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(80mg,53.5%产率)。LCMS(ESI):C47H61F3N8O8S的m/z[M+H]计算值955.44;实验值955.2。
步骤19.在0℃下,向3-((2R)-2-(((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,3)-噻二唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨甲酰基)-3-甲基丁氧基)氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(120.0mg,0.13mmol)和DCM(0.80mL)的溶液中逐滴添加TFA(0.4mL)并在室温下,将所得混合物搅拌2小时。用饱和NaHCO3(水溶液)将混合物碱化至pH 8。将混合物用EtOAc(3×10mL)萃取并减压浓缩。将残余物通过反相快速色谱法纯化,得到呈固体状的(2R)-2-((氮杂环丁烷-3-基氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,3)-噻二唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(40mg,37.2%产率)。LCMS(ESI):C42H53F3N8O6S的m/z[M+H]计算值855.38;实验值855.3。
步骤20.在0℃下,向(2R)-2-((氮杂环丁烷-3-基氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,3)-噻二唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(32.0mg,0.037mmol)、4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酸(11.62mg,0.074mmol)和DMF(0.50mL)的溶液中逐滴添加于DMF(0.1mL)中的DIPEA(193.49mg,1.48mmol)和COMU(19.23mg,0.044mmol)。在氩气氛下,在室温下将所得混合物搅拌2小时。用H2O/冰淬灭反应并用EtOAc(3×20mL)萃取。将有机相用盐水(3×10mL)洗涤并减压浓缩。将粗产物(60mg)通过反相色谱法纯化,得到呈固体状的(2R)-2-(((1-(4-(二甲基氨基)-4-甲基戊-2-炔酰基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)甲基)-N-((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2,2,2-三氟乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(5,3)-噻二唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(11.7mg,30.9%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.80(dd,J=4.7,1.8Hz,1H),8.58(s,1H),8.30(d,J=8.9Hz,1H),7.92(d,J=8.6Hz,1H),7.84-7.69(m,2H),7.56(dd,J=7.8,4.8Hz,1H),5.78(t,J=8.6Hz,2H),5.10(d,J=12.1Hz,1H),4.91(dd,J=16.9,8.8Hz,1H),4.31(d,J=6.6Hz,6H),4.05(dd,J=16.3,6.6Hz,2H),3.87(d,J=6.3Hz,1H),3.75(d,J=11.3Hz,1H),3.61(d,J=11.0Hz,1H),3.53(d,J=9.8Hz,1H),3.45(s,3H),3.25(s,1H),3.09(d,J=10.4Hz,1H),3.01(d,J=14.5Hz,1H),2.79(s,1H),2.45-2.35(m,2H),2.20(d,J=5.4Hz,6H),2.15(d,J=12.0Hz,1H),1.81(d,2H),1.74-1.65(m,1H),1.54(s,1H),1.41-1.30(m,9H),1.24(s,1H),0.94(s,3H),0.90-0.81(m,5H),0.29(s,3H)。LCMS(ESI):C50H64F3N9O7S的m/z[M+H]计算值992.47;实验值992.5。
如本领域技术人员所知,下表的化合物(表3)是使用前述方法或其变化形式制备。
表3:由本发明方法制备的示例性化合物
Figure BDA0004194083620011601
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Figure BDA0004194083620011611
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Figure BDA0004194083620011621
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Figure BDA0004194083620011631
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Figure BDA0004194083620011651
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Figure BDA0004194083620011671
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Figure BDA0004194083620011681
空白=未确定
匹配对分析
图1A-1B比较了本发明的式BB的化合物(右侧上的点)以及H被(S)Me置换的相应式AA的化合物(左侧上的点)在两项不同的基于细胞的测定中的效力。y轴表示在H358细胞系中测量的pERK EC50(图1A)或CTG IC50(图1B)。测定方案如下。连接点表示不同之处仅在于H与(S)Me取代的匹配对。各式BB的化合物在细胞测定中展现出相较于相应式AA的化合物降低的效力。
生物测定
效力测定:pERK
这一测定的目的是测量测试化合物抑制细胞中的K-Ras的能力。活化的K-Ras诱导ERK在苏氨酸202和酪氨酸204处的磷酸化(pERK)增加。这一程序测量细胞pERK响应于测试化合物的降低。下文以NCI-H358细胞描述的程序适用于K-Ras G12C。
注意:本方案可改用其它细胞系执行以表征其它RAS变体抑制剂,包括例如AsPC-1(K-Ras G12D)、Capan-1(K-Ras G12V)或NCI-H1355(K-Ras G13C)。
使用ATCC推荐的培养基和程序使NCI-H358细胞生长和维持。在添加化合物前一天,将细胞平板接种于384孔细胞培养板(每孔40μl)中并使其在37℃、5% CO2培育器中生长过夜。在DMSO中制备测试化合物的10点3倍稀释液,其中最高浓度为10mM。测定当天,使用Echo550液体处理器
Figure BDA0004194083620011691
将40nL测试化合物添加至细胞培养板各孔中。一式两份,对测试化合物的浓度进行测试。添加完化合物后,在37℃、5% CO2下培育细胞4小时。培育后,取出细胞培养基并用磷酸盐缓冲盐水洗涤细胞一次。
在一些实验中,细胞pERK水平是使用AlphaLISA SureFire Ultra p-ERK1/2测定试剂盒(PerkinElmer)确定。室温下,在以600RPM振荡下,将细胞溶解于25μL溶解缓冲液中。将溶解产物(10μL)转移至384孔Opti板(PerkinElmer)中并添加5μL受体混合物。在暗处培育2小时后,添加5μL供体混合物,密封板并在室温下培育2小时。在Envision读板器(PerkinElmer)上,使用标准AlphaLISA设置来读取信号。原始数据的分析是在Excel(Microsoft)及Prism(GraphPad)中进行。将信号对化合物浓度的以10为底的对数作图,并通过拟合4参数S形浓度反应模型确定IC50值。
在其它实验中,细胞pERK是通过In-Cell Western确定的。在化合物处理后,用200μL tris缓冲盐水(TBS)洗涤细胞两次并用150μL含4%三聚甲醛的TBS固定15分钟。用含0.1% Triton X-100的TBS(TBST)洗涤固定的细胞4次,持续5分钟,接着在室温下,用100μLOdyssey封闭缓冲液(LI-COR)封闭60分钟。将一次抗体(pERK,CST-4370,Cell SignalingTechnology)以1:200稀释于封闭缓冲液中,并取50μL添加至各孔中并在4℃下培育过夜。用TBST洗涤细胞4次,持续5分钟。添加二次抗体(IR-800CW兔,LI-COR,1:800稀释)和DNA染色剂DRAQ5(LI-COR,1:2000稀释)并在室温下培育1-2小时。用TBST洗涤细胞4次,持续5分钟。在Li-COR Odyssey CLx成像仪上扫描各板。原始数据的分析是在Excel(Microsoft)及Prism(GraphPad)中进行。将信号对化合物浓度的以10为底的对数作图,并通过拟合4参数S形浓度反应模型确定IC50值。
以下化合物展现低于5uM的pERK EC50值(H358 KRAS G12C):A48、A15、A272、A174、A163、A453、A447、A279、A240、A214、A225、A136、A226、A219、A228、A21、A12、A78、A424、A219、A378、A224、A4、A53、A187、A218、A213、A314、A220、A208、A24、A9、A126、A345、A46、A203、A210、A184、A469、A366、A113、A328、A693、A639、A364、A100、A249、A486、A307、A347、A33、A210、A192、A285、A468、A185、A612、A109、A284、A200、A2、A6、A606、A325、A139、A496、A393、A561、A125、A494、A547、A215、A258、A195、A259、A212、A637、A53、A63、A68、A178、A189、A205、A78、A254、A690、A563、A14、A19、A92、A576、A278、A331、A42、A67、A209、A350、A562、A652、A703、A623、A191、A241、A199、A193、A478、A251、A177、A222、A23、A59、A26、A211、A106、A279、A120、A7、A134、A521、A116、A467、A694、A729、A151、A110、A277、A340、A221、A723、A13、A442、A611、A50、A190、A553、A696、A211、A303、A613、A37、A146、A666、A688、A216、A390、A548、A238、A160、A183、A164、A451、A481、A524、A1、A186、A37、A635、A71、A269、A289、A489、A400、A731、A497、A568、A274、A253、A471、A720、A241、A179、A180、A426、A117、A363、A716、A423、A217、A708、A227、A3、A12、A8、A381、A84、A408、A85、A171、A263、A473、A258、A564、A118、A103、A565、A641、A655、A47、A11、A392、A169、A487、A640、A206、A449、A358、A192、A148、A4、A41、A5、A18、A301、A10、A65、A554、A159、A264、A99、A79、A142、A143、A25、A98、A80、A101、A730、A212、A359、A61、A441、A283、A413、A717、A145、A182、A62、A181、A233、A232、A634、A495、A34、A251、A539、A632、A54、A327、A37、A196、A607、A645、A35、A214、A225、A638、A40、A52、A268、A448、A575、A176、A593、A15、A17、A94、A170、A713、A93、A402、A64、A261、A399、A422、A214、A225、A625、A31、A119、A135、A281、A676、A709、A81、A32、A633、A39、A646、A662、A124、A732、A320、A81、A187、A354、A45、A570、A165、A66、A20、A455、A431、A270、A250、A457、A153、A404、A710、A541、A127、A373、A369、A557、A349、A598、A618、A60、A636、A499、A87、A156、A680、A477、A406、A330、A202、A535、A617、A737、A201、A302、A722、A209、A374、A631、A29、A555、A420、A380、A111、A306、A173、A628、A672、A51、A167、A588、A512、A194、A282、A412、A701、A583、A396、A678、A649、A27、A204、A626、A257、A614、A409、A172、A372、A353、A58、A728、A74、A619、A144、A183、A538、A445、A531、A360、A361、A459、A536、A344、A267、A574、A677、A530、A415、A30、A73、A152、A490、A702、A714、A483、A567、A43、A310、A319、A86、A321、A656、A739、A115、A130、A155、A608、A648、A168、A485、A738、A129、A650、A715、A488、A147、A121、A470、A115、A133、A510、A421、A309、A335、A387、A386、A734、A95、A430、A604、A458、A592、A384、A664、A197、A725、A89、A83、A586、A622、A305、A498、A668、A427、A630、A158、A644、A735、A70、A683、A352、A341、A719、A674、A70、A44、A501、A438、A698、A377、A417、A154、A433、A104、A184、A603、A280、A712、A237、A105、A394、A605、A517、A704、A566、A77、A356、A454、A600、A643、A112、A569、A529、A247、A463、A437、A718、A472、A461、A558、A48、A671、A395、A670、A681、A687、A382、A82、A686、A342、A436、A296、A16、A545、A533、A416、A149、A207、A371、A596、A675、A132、A419、A56、A579、A733、A573、A707、A597、A697、A75、A653、A362、A615、A332、A69、A162、A128、A432、A654、A22、A397、A526、A582、A418、A91、A260、A97、A191、A55、A581、A375、A522、A108、A367、A610、A552、A571、A57、A543、A661、A138、A196、A246、A337、A446、A265、A96、A509、A123、A627、A651、A682、A157、A572、A624、A691、A532、A462、A580、A695、A186、A316、A540、A590、A665、A244、A166、A587、A629、A595、A518、A519、A131、A502、A726、A452、A141、A181、A262、A338、A155、A389、A124、A275、A414、A546、A679、A425、A669、A28、A520、A88、A131、A589、A621、A182、A297、A594、A283、A194、A250、A336、A706、A252、A440、A107、A724、A525、A388、A175、A300、A333、A659、A346、A150、A476、A368、A528、A503、A504、A505、A684、A76、A736、A551、A383、A491、A492、A493、A410、A316、A295、A559、A511、A38、A140、A663、A334、A700、A692、A348、A584、A513、A657、A328、A515、A317、A135、A660、A351、A544、A281、A685、A602、A556、A385、A326、A464、A465、A403、A133、A299、A667、A255、A334、A256、A585、A642、A133、A443、A435、A560、A444、A439、A324、A120、A407、A527、A245、A370、A537、A247、A474、A475、A705、A323、A112、A298、A609、A673、A292、A599、A132、A145、A266、A601、A466、A549、A379、A727、A167、A711、A75、A76、A121、A357、A620、A316、A479、A290、A339、A322、A376、A456、A391、A291、A550、A343、A721、A689、A411、A578、A616、A534、A365、A658、A699、A577、A647、A591、A542、A279、A294。
在RAS突变型癌症细胞系中细胞活力的确定
方案:
Figure BDA0004194083620011731
细胞活力测定
注意:以下方案描述用于监测K-Ras突变型癌症细胞系响应于本发明化合物的细胞活力的程序。也可采用其它RAS同功型,不过接种的细胞数量将基于所用细胞系而变化。
本细胞测定的目的是通过使用
Figure BDA0004194083620011732
2.0试剂(Promega)对在终点时存在的ATP的量进行定量来确定在5天处理期内测试化合物对三种人类癌症细胞系(NCI-H358(K-Ras G12C)、AsPC-1(K-Ras G12D)和Capan-1(K-Ras G12V))的作用。
将细胞以250个细胞/孔接种于384孔测定板中的40μL生长培养基中并在含5%CO2的潮湿气氛中在37℃下培育过夜。测定当天,先用100% DMSO将测试化合物的10mM储备液稀释成3mM溶液。将充分混合的化合物溶液(15μL)转移至含有30μL的100% DMSO的下一孔中,并重复操作,直至制备出9种浓度的3倍连续稀释液(起始测定浓度是10μM)。将测试化合物(132.5nL)直接分配至含有细胞的测定板中。将所述板以300rpm振荡15秒,离心并在含5% CO2的潮湿气氛中在37℃下培育5天。第5天,将测定板及其内含物平衡至室温,保持约30分钟。添加
Figure BDA0004194083620011733
2.0试剂(25μL),并在回旋振荡器上混合板内含物2分钟,随后在室温下培育10分钟。使用PerkinElmer Enspire测量发光。利用下式使数据归一化:(样品信号/平均DMSO)*100。使用四参数逻辑斯蒂拟合(four-parameter logistic fit)来拟合数据。
本发明化合物破坏B-Raf Ras结合结构域(BRAFRBD)与K-Ras的相互作用(又称为FRET测定或MOA测定)
注意:以下方案描述用于监测本发明化合物对K-Ras G12C(GMP-PNP)与BRAFRBD的结合的破坏的程序。本方案也可改用其它Ras蛋白或核苷酸来执行。
这一生物化学测定的目的是测量测试化合物促进在载有核苷酸的K-Ras同功型与亲环蛋白A之间形成三元复合物的能力;由此得到的三元复合物破坏与BRAFRBD构建体的结合,抑制K-Ras通过RAF效应子进行的信号传导。数据是以IC50值报告。
在含有25mM HEPES pH 7.3、0.002% Tween20、0.1% BSA、100mM NaCl及5mMMgCl2的测定缓冲液中,将无标记亲环蛋白A、His6-K-Ras-GMPPNP及GST-BRAFRBD分别以25μM、12.5nM及50nM的最终浓度组合于384孔测定板中。测定板各孔中存在的化合物是自30μM最终浓度起始,经历10点3倍连续稀释的稀释液。在25℃下培育3小时之后,接着将抗HisEu-W1024和抗GST别藻蓝蛋白的混合物添加至测定样品孔中分别达到10nM和50nM的最终浓度,并将反应再培育1.5小时。在微孔板读取器(Ex 320nm,Em 665/615nm)上读取TR-FRET信号。促进K-Ras:RAF复合物破坏的化合物被鉴别为使TR-FRET比率相对于DMSO对照孔降低的化合物。
表4:代表性本发明化合物的生物测定数据
Figure BDA0004194083620011741
表5.额外的H358细胞活力测定数据(K-Ras G12C,IC50,uM):
*注释:
++++:IC50≥1uM
+++:1uM>IC50≥0.1uM
++:0.1 uM>IC50≥0.01 uM
+:IC50<0.01 uM
Figure BDA0004194083620011751
/>
Figure BDA0004194083620011761
/>
Figure BDA0004194083620011771
额外的Ras-Raf破坏/FRET/MOA测定数据(IC50,uM):
*注释:
+++++:IC50≥10uM
++++:10uM>IC50≥1uM
+++:1uM>IC50≥0.1uM
++:0.1uM>IC50≥0.01uM
+:IC50<0.01uM
表6.KRAS G12S FRET数据
Figure BDA0004194083620011772
/>
Figure BDA0004194083620011781
/>
Figure BDA0004194083620011791
表7.KRAS G12D FRET数据
Figure BDA0004194083620011792
/>
Figure BDA0004194083620011801
/>
Figure BDA0004194083620011811
Figure BDA0004194083620011821
/>
表8.KRAS G13C FRET数据
Figure BDA0004194083620011822
/>
Figure BDA0004194083620011831
/>
Figure BDA0004194083620011841
表9.KRAS G12V FRET数据
Figure BDA0004194083620011842
/>
Figure BDA0004194083620011851
/>
Figure BDA0004194083620011861
表10.KRAS WT FRET数据
Figure BDA0004194083620011862
/>
Figure BDA0004194083620011871
/>
Figure BDA0004194083620011881
表11.KRAS G12C FRET数据
Figure BDA0004194083620011882
/>
Figure BDA0004194083620011891
/>
Figure BDA0004194083620011901
表12.KRAS G13D FRET数据
Figure BDA0004194083620011911
/>
Figure BDA0004194083620011921
表13.KRAS Q61H FRET数据
Figure BDA0004194083620011922
/>
Figure BDA0004194083620011931
表14.NRAS G12C FRET数据
Figure BDA0004194083620011941
/>
Figure BDA0004194083620011951
表15.NRAS Q61R FRET数据
Figure BDA0004194083620011952
/>
Figure BDA0004194083620011961
表16.NRAS Q61K FRET数据
Figure BDA0004194083620011971
/>
Figure BDA0004194083620011981
表17.NRAS WT FRET数据
Figure BDA0004194083620011982
/>
Figure BDA0004194083620011991
体外细胞增殖谱
在CrownBio使用标准方法评估针对细胞生长抑制的效力。简单点说,将细胞系在适当培养基中培养,然后平板接种于3D甲基纤维素中。在用递增浓度的化合物培养5天后,利用
Figure BDA0004194083620011992
确定细胞生长的抑制。化合物效力是以50%抑制浓度(绝对IC50)报告。
测定历时7天。在第1天,在对数生长期间收集2D培养的细胞并使其以1×105个细胞/毫升悬浮于培养基中。基于先前的优化,对一些细胞系使用更高或更低的细胞密度。将3.5ml细胞悬浮液与含1%甲基纤维素的6.5%生长培养基混合,产生于0.65%甲基纤维素中的细胞悬浮液。将90μl这一悬浮液分配于2个96孔板各孔中。使用一块板获得第0天读数,并且1块板用于终点实验。在37℃和5% CO2下,将板培育过夜。第2天,取出一块板(对于t0读数),并将10μl生长培养基加100μl
Figure BDA0004194083620011993
试剂添加至各孔中。在混合和10分钟培育后,在EnVision多标记读取器(Perkin Elmer)上记录发光。将DMSO中的化合物稀释于生长培养基中,由此使化合物的最终、最大浓度是10μM,并执行连续4倍稀释以产生9点浓度系列。将10倍最终浓度的10μl化合物溶液添加至第二块板各孔中。然后,在37℃和5% CO2下,将板培育120小时。第7天,取出板,将100μl/>
Figure BDA0004194083620011994
试剂添加至各孔中,并在混合和10分钟培育后,在EnVision多标记读取器(Perkin Elmer)上记录发光。将数据导出至GeneData Screener并以S形浓度反应模型建模,以便确定化合物反应的IC50值。
归因于外排转运蛋白的差异性表达、生长对RAS路径活化的不同依赖性或其它原因,并非所有带有给定RAS突变的细胞系均可对靶向该突变的RAS抑制剂同等地敏感。这已以细胞系KYSE-410和细胞系SW1573为例说明,细胞系KYSE-410尽管具有KRAS G12C突变,但对KRAS G12C(OFF)抑制剂MRTX-849不敏感(Hallin等人,Cancer Discovery 10:54-71(2020)),并且细胞系SW1573对KRAS G12C(OFF)抑制剂AMG510不敏感(Canon等人,Nature575:217-223(2019))。
表18:化合物B针对各种癌症细胞系的IC50值
*注释:
低敏感性:IC50≥1uM
中等敏感性:1uM>IC50≥0.1uM
极高敏感性:IC50<0.1uM
Figure BDA0004194083620012001
/>
Figure BDA0004194083620012011
表19:关于若干本发明化合物(化合物B和E-M)对各种癌症细胞系的IC50结果的概述
*注释:
(L)低敏感性:IC50≥1uM
(M)中等敏感性:1uM>IC50≥0.1uM
(V)极高敏感性:IC50<0.1uM
Figure BDA0004194083620012012
/>
Figure BDA0004194083620012021
体内NSCLC K-Ras G12C异种移植模型
化合物A:
方法:
在使用雌性BALB/c裸小鼠(6-8周龄)的人非小细胞肺癌NCI-H358 KRASG12C异种移植模型中,评价本发明化合物,即化合物A(H358 pERK K-Ras G12C,EC50:0.001uM)对体内肿瘤细胞生长的作用。将在50% Matrigel中的NCI-H358肿瘤细胞(5×106个细胞/小鼠)皮下植入小鼠的侧腹中。在指定肿瘤体积(虚线,图2A),将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或媒剂的施用。每天通过经口管饲施用100mg/kg剂量的化合物A。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。细面图(图2B)显示在治疗过程期间个别肿瘤的肿瘤体积变化。
结果:
图2A显示每天经口管饲给予100mg/kg的化合物A在NCI-H358KRASG12C异种移植模型中引起肿瘤消退,该模型是对单独KRASG12C抑制敏感的模型。在肿瘤体积曲线(图2A)的旁边显示的是个别肿瘤生长的细面滴定图(图2B)。在28天的治疗过程中,化合物A在全部10只带有NCI-H358 KRASG12C肿瘤的动物中均驱动肿瘤消退。
化合物B:
方法:
在使用雌性BALB/c裸小鼠(6-8周龄)的人非小细胞肺癌NCI-H358 KRASG12C异种移植模型中,评价本发明化合物,即化合物B(H358 pERK K-Ras G12C,EC50:0.003uM)与考比替尼对体内肿瘤细胞生长的组合作用。将在50% Matrigel中的NCI-H358肿瘤细胞(5×106个细胞/小鼠)皮下植入小鼠的侧腹中。在指定肿瘤体积(虚线,图3A),将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或媒剂的施用。每天通过间歇性(每周两次)静脉内注射施用50mg/kg剂量的化合物B。每天通过经口管饲施用2.5mg/kg的考比替尼。还测试了对应单药剂量和方案的化合物B和考比替尼的组合。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。将个别肿瘤的研究结束反应绘制为瀑布图(图3B),并且数字指示各组中肿瘤消退的数目。肿瘤消退定义为在研究结束时肿瘤体积相对于初始体积减少10%。
结果:
图3A显示间歇性静脉内施用50mg/kg化合物B加每天口服施用2.5mg/kg考比替尼的组合驱动肿瘤消退,而各单药引起肿瘤生长抑制。研究结束时反应以瀑布图(图3B)显示,指示10只小鼠中有6只在组合组中出现肿瘤消退,而在各单药组中无肿瘤消退记录。
化合物C:
方法:
在使用雌性BALB/c裸小鼠(6-8周龄)的人非小细胞肺癌NCI-H358 KRASG12C异种移植模型中,评价本发明化合物,即化合物C(H358 pERK K-Ras G12C,EC50:0.007uM)与SHP2抑制剂RMC-4550对体内肿瘤细胞生长的组合作用。将在50% Matrigel中的NCI-H358肿瘤细胞(5×106个细胞/小鼠)皮下植入小鼠的侧腹中。在指定肿瘤体积(虚线,图4A),将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或媒剂的施用。通过每周一次静脉内注射施用60mg/kg剂量的化合物C。每天通过经口管饲施用30mg/kg的SHP2抑制剂。还测试了对应单药剂量和方案的化合物C和SHP2抑制剂的组合。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。将个别肿瘤的研究结束反应绘制为瀑布图(图4B),并且数字指示各组中肿瘤消退的数目。肿瘤消退定义为在研究结束时肿瘤体积相对于初始体积减少10%。
结果:
在图4A中,显示了每周一次静脉内施用60mg/kg化合物C加每天口服施用30mg/kgSHP2抑制剂的组合活性。组合治疗具有与单药SHP2抑制剂类似的抗肿瘤活性,但组合治疗在10只小鼠中的8只中引起肿瘤消退,而单药SHP2抑制剂在10只小鼠中的5只中引起肿瘤消退。每周一次通过静脉内注射施用单药化合物C引起肿瘤生长抑制,其中一个肿瘤消退。
细胞增殖测定
方法:
将NCI-H358细胞以100,000个细胞/孔的密度平板接种于12孔组织培养板中的RPMI 1640(10% FBS、1% PenStrep)中并使其在37℃、5% CO2培养过夜。次日,用曲美替尼(10nM)或本发明化合物,即化合物D(H358 pERK K-Ras G12C EC50:0.024uM)(17nM)处理细胞。这些浓度代表使用
Figure BDA0004194083620012051
试剂(Promega),由72小时增殖测定得到的EC50值。另外,用以上指定浓度的曲美替尼和化合物D处理细胞。将板放入Incucyte S3活细胞分析系统(37℃,5% CO2)中并通过以6小时间隔记录图像来测量汇合情况,持续最长40天或直至孔达到最大汇合。以3-4天间隔更换培养基和药物。将各单药和对应组合的数据以在实验的时间过程内的汇合百分比作图(图5)。/>
结果:
如图5中所示,用次最大(EC50)浓度的化合物D或MEK抑制剂处理NCI-H358细胞引起短期生长抑制,随后增殖。在添加药物后约10天,细胞达到最大汇合。在整个测定持续时间内,MEK抑制剂曲美替尼与化合物D的组合引起完全且持续的细胞生长抑制。
尽管已结合本发明的具体实施方案描述本发明,但应了解,本发明能够进一步修改,并且本申请意欲涵盖一般遵循本发明的原理且包括在本发明所属领域内的已知或常规实践范围内的与本公开的背离的本发明的任何变化、应用或改编,并且可应用于本文所述的基本特征。
所有出版物、专利和专利申请均以全文引用的方式并入本文中,其引用程度就如同具体地且个别地指示每一个别出版物、专利或专利申请以全文引用的方式并入一般。
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附录C
RAS抑制剂
背景技术
绝大多数的小分子药物是通过结合靶蛋白上功能重要的口袋,由此调节该蛋白质的活性来起作用。例如,称为他汀类药物(statins)的降胆固醇药结合HMG-CoA还原酶的酶活性位点,由此防止该酶与其底物接合。事实上,已知许多此类药物/靶相互作用对,可能误导人们相信能够发现针对大多数(如果不是全部的话)蛋白质的小分子调节剂进而提供合理量的时间、努力和资源。但情况远非如此。目前,据估计,所有人体蛋白质中仅约10%可作为小分子的靶。Bojadzic和Buchwald,Curr Top Med Chem 18:674-699(2019)。其余90%当前被认为是以上提到的小分子药物发现难以治愈或难处理的。此类靶通常称为“不可入药(undruggable)”的。这些不可入药的靶包括医学上重要的人体蛋白质的大部分且通常未开发的储库。因此,人们对发现能够调节此类不可入药靶的功能的新颖分子模态非常感兴趣。
文献中已充分确定,Ras蛋白(K-Ras、H-Ras及N-Ras)在多种人类癌症中起到至关重要的作用,并因此成为抗癌疗法的适当靶。实际上,在美国,所有人类癌症中有约30%是由Ras蛋白突变引起,这些癌症中有许多是致命的。由活化性突变、过度表达或上游活化引起的Ras蛋白失调在人类肿瘤中较为常见,并且在人类癌症中常常发现Ras的活化性突变。例如,在Ras蛋白中密码子12处的活化性突变通过抑制GTP酶活化蛋白(GAP)依赖性和固有GTP水解速率,明显使Ras突变蛋白群偏向“开启”(GTP结合)状态(Ras(ON)),导致致癌性MAPK信号传导来起作用。值得注意的是,Ras对GTP展现皮摩尔浓度的亲和力,使得Ras即便是在低浓度这一核苷酸存在下也能够活化。在Ras中密码子13(例如G13D)和61(例如Q61K)处的突变也引起在一些癌症中的致癌活性。
尽管在过去数十年中,针对Ras进行了广泛的药物发现尝试,但直接靶向Ras的药物仍未得到批准。需要付出更多的努力来发现针对由各种Ras突变驱动的癌症的其它医药。
发明内容
本文提供Ras抑制剂。本文所描述的方法需要在合成配体与两种细胞内蛋白质之间形成高亲和力三组分复合物,该两种细胞内蛋白质在正常生理条件下不会相互作用:所关注的靶蛋白(例如Ras),以及在细胞中广泛表达的细胞质伴侣蛋白(呈现蛋白)(例如亲环蛋白A)。更具体点说,在一些实施方案中,本文所描述的Ras抑制剂通过驱动在Ras蛋白与广泛表达的细胞质伴侣蛋白亲环蛋白A(CYPA)之间形成高亲和力三重复合物或缀合物而在Ras中诱导新结合口袋。不受理论束缚,本发明者相信,本发明化合物以及其形成的复合物或缀合物对Ras发挥抑制作用的一种方式是在空间上阻塞Ras与传播致癌信号所需的下游效应分子如RAF和PI3K之间的相互作用位点。
因此,在一些实施方案中,本公开的特征在于一种结构式I的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620012131
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是氢、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R34是氢或C1-C3烷基(例如甲基)。
也提供药物组合物,该药物组合物包含式I的化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的赋形剂。
还提供了一种缀合物或其盐,该缀合物包含式IV的结构:
M-L-P
式IV
其中L是连接体;
P是单价有机部分;并且
M具有式V的结构:
Figure BDA0004194083620012171
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是氢、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R34是氢或C1-C3烷基(例如甲基)。
具体点说,经审慎考虑,所论述的关于本发明一个实施方案的任何限制可适用于本发明的任何其它实施方案。另外,本发明的任何化合物或组合物均可用于本发明的任何方法中,并且本发明的任何方法均可用于制造或利用本发明的任何化合物或组合物。
附图说明
图1A:本发明化合物,即化合物A强烈且持久地抑制胰腺CDX模型(HPAC CDX模型,PDAC、KRAS G12D/WT)中的致癌信号。单剂量实验,n=3只/时间点,所有剂量水平均良好耐受。
图1B:在体内用本发明化合物,即化合物A治疗KRAS G12D肿瘤驱动胰腺CDX模型(HPAC CDX模型,PDAC、KRAS G12D/WT)中的肿瘤消退。n=10只/组。***p<0.001。所有剂量水平均良好耐受。
定义和化学术语
在本申请中,除非自上下文另有清晰说明,否则(i)术语“a(一)”意思指“一或多”;(ii)术语“或”用于指“和/或”,除非明确指示该术语是指替代选择为唯一的或该替代选择是相互排斥的,不过,本公开支持的定义是指唯一替代选择以及“和/或”;(iii)术语“包含”和“包括”应理解为涵盖列出的组分或步骤,无论仅呈现所述组分或步骤自身还是呈现所述组分或步骤与一种或多种额外组分或步骤的组合;以及(iv)在提供范围时,端点包括在内。
如本文所使用,术语“约”用于指示一个值包括用于确定该值的装置或方法的误差的标准偏差。在某些实施方案中,术语“约”是指值的沿任一方向(大于或小于)在所述值的25%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%或更低百分比内的范围,除非另外规定或自上下文另外显而易见(例如在该数字将超过可能值的100%时)。
如本文所使用,在描述相邻原子的情形中,术语“相邻”是指由共价键直接连接的二价原子。
如本文所使用,“本发明化合物”和类似术语,无论明确指示与否,均是指本文所描述的Ras抑制剂,包括式I和其子式的化合物,以及表1和表2的化合物,以及其盐(例如药学上可接受的盐)、溶剂化物、水合物、立体异构体(包括阻转异构体)和互变异构体。
术语“野生型”是指具有在自然界中在“正常”(与突变、患病、改变等相对)状态或情形中所见的结构或活性的实体。本领域技术人员应理解,野生型基因和多肽通常以多种不同形式(例如等位基因)存在。
本领域技术人员应了解,本文所描述的某些化合物可以呈一种或多种不同异构形式(例如立体异构体、几何异构体、阻转异构体、互变异构体)或同位素形式(例如其中一个或多个原子被该原子的不同的同位素取代,如氢被氘取代)存在。除非另外指示或自上下文清楚可见,所描绘的结构可理解为表示个别或组合的任何此类异构或同位素形式。
本文所描述的化合物可以是不对称的(例如具有一个或多个立体中心)。除非另外指示,否则涵盖所有立体异构体,如对映异构体和非对映异构体。含有不对称取代的碳原子的本公开化合物可以呈光学活性形式或外消旋形式分离。本领域中已知由光学活性起始物质制备光学活性形式的方法,如通过拆分外消旋混合物或通过立体选择性合成方法制备。烯烃、C=N双键等许多几何异构体也可存在于本文所描述的化合物中,并且所有此类稳定异构体均涵盖在本公开中。本公开的化合物的顺式和反式几何异构体已有描述,并且可以呈异构体混合物形式或以分开的异构形式分离。
在一些实施方案中,本文所描绘的一种或多种化合物可以呈不同互变异构形式存在。自上下文将清楚可见,除非明确地排除,否则提到此类化合物涵盖所有此类互变异构形式。在一些实施方案中,互变异构形式是由一个单键与相邻双键交换且伴随质子的迁移得到。在某些实施方案中,互变异构形式可以是质子转移互变异构体,该互变异构体是具有与参考形式相同的经验式和总电荷的异构体质子化状态。具有质子转移互变异构形式的部分的实例有酮-烯醇对、酰胺-亚胺酸对、内酰胺-内酰亚胺对、酰胺-亚胺酸对、烯胺-亚胺对以及环状形式,在所述环状形式中,质子可占据杂环系统的两个或更多个位置,如1H-咪唑和3H-咪唑、1H-三唑、2H-三唑和4H-1,2,4-三唑、1H-异吲哚和2H-异吲哚,以及1H-吡唑和2H-吡唑。在一些实施方案中,互变异构形式可处于平衡状态或通过适当取代而在空间上锁定于一种形式。在某些实施方案中,互变异构形式是由缩醛相互转化得到。
除非另外规定,否则本文所描绘的结构也意欲包括仅因一个或多个同位素富集的原子的存在而不同的化合物。可并入本发明化合物中的示例性同位素包括氢、碳、氮、氧、磷、硫、氟、氯及碘的同位素,如2H、3H、11C、13C、14C、13N、15N、15O、17O、18O、32P、33P、35S、18F、36Cl、123I及125I。同位素标记的化合物(例如标记3H和14C的化合物)可用于化合物或底物组织分布测定中。氚化(即,3H)和碳-14(即,14C)同位素因其易于制备和检测而可用。另外,用较重同位素,如氘(即,2H)取代可由于代谢稳定性增强(例如体内半衰期增加或剂量需求减小)而提供某些治疗益处。在一些实施方案中,一个或多个氢原子被2H或3H置换,或者一个或多个碳原子被13C或14C富集的碳置换。正电子发射同位素,如15O、13N、11C及18F可用于正电子发射断层扫描(PET)研究中以检查底物受体占有情况。同位素标记的化合物的制备是本领域技术人员所知的。例如,同位素标记的化合物一般可遵循与所公开的关于本文所描述的本发明化合物的程序类似的程序,通过用同位素标记的试剂取代未同位素标记的试剂制备。
如本领域中所知,许多化学实体可呈现多种不同的固体形式,如非晶形或结晶形式(例如多晶型物、水合物、溶剂化物)。在一些实施方案中,本发明化合物可以呈任何此类形式使用,包括任何固体形式。在一些实施方案中,本文所描述或描绘的化合物可以呈水合物形式或溶剂化物形式提供。
在本说明书中各处,本公开的化合物的取代基是以群组或以范围公开。具体点说,预期本公开包括所述群组和范围各成员的每一个别子组合。例如,术语“C1-C6烷基”特定地意欲个别地公开甲基、乙基、C3烷基、C4烷基、C5烷基及C6烷基。此外,在一种化合物包括多个位置,并且在这些位置处,取代基是以群组或以范围公开时,除非另外指示,否则本公开意欲涵盖在每个位置处含有成员的每一个别子组合的个别化合物和化合物群组(例如种类和子类)。
术语“任选被取代的X”(例如“任选被取代的烷基”)意欲等效于“X,其中X任选被取代”(例如“烷基,其中该烷基任选被取代”)。并非意欲指特征“X”(例如烷基)本身是任选的。如本文所描述,某些所关注化合物可含有一个或多个“任选被取代”的部分。一般而言,术语“被取代”无论前面是否加有术语“任选地”,均意谓指定部分的一个或多个氢被适合取代基,例如本文所描述的取代基或基团中的任一者置换。除非另外指示,否则“任选被取代”的基团可在该基团的每一可取代位置处具有适合取代基,并且当在任何给定结构中的不止一个位置可被选自指定群组的不止一个取代基取代时,在每个位置处的取代基可相同或不同。例如,在术语“任选被取代的C1-C6烷基-C2-C9杂芳基”中,该烷基部分、该杂芳基部分或两者可任选被取代。本公开所设想的取代基的组合优选是形成稳定或化学上可行的化合物的取代基组合。如本文所使用,术语“稳定”是指化合物当经历允许该化合物产生、检测且在某些实施方案中,允许该化合物回收、纯化以及用于一个或多个本文所公开的目的的条件时大体上不改变。
“任选被取代”的基团的可取代碳原子上的适合单价取代基可独立地为氘;卤素;-(CH2)0-4Ro;-(CH2)0-4ORo;-O(CH2)0-4Ro;-O-(CH2)0-4C(O)ORo;-(CH2)0-4CH(ORo)2;-(CH2)0- 4SRo;-(CH2)0-4Ph,该基团可被Ro取代;-(CH2)0-4O(CH2)0-1Ph,该基团可被Ro取代;-CH=CHPh,该基团可被Ro取代;-(CH2)0-4O(CH2)0-1-吡啶基,该基团可被Ro取代;4至8元饱和或不饱和杂环烷基(例如吡啶基);3至8元饱和或不饱和环烷基(例如环丙基、环丁基或环戊基);-NO2;-CN;-N3;-(CH2)0-4N(Ro)2;-(CH2)0-4N(Ro)C(O)Ro;-N(Ro)C(S)Ro;-(CH2)0-4N(Ro)C(O)NRo 2;-N(Ro)C(S)NRo 2;-(CH2)0-4N(Ro)C(O)ORo;-N(Ro)N(Ro)C(O)Ro;-N(Ro)N(Ro)C(O)NRo 2;-N(Ro)N(Ro)C(O)ORo;-(CH2)0-4C(O)Ro;-C(S)Ro;-(CH2)0-4C(O)ORo;-(CH2)0-4-C(O)-N(Ro)2;-(CH2)0-4-C(O)-N(Ro)-S(O)2-Ro;-C(NCN)NRo 2;-(CH2)0-4C(O)SRo;-(CH2)0-4C(O)OSiRo 3;-(CH2)0-4OC(O)Ro;-OC(O)(CH2)0-4SRo;-SC(S)SRo;-(CH2)0-4SC(O)Ro;-(CH2)0-4C(O)NRo 2;-C(S)NRo 2;-C(S)SRo;-(CH2)0-4OC(O)NRo 2;-C(O)N(ORo)Ro;-C(O)C(O)Ro;-C(O)CH2C(O)Ro;-C(NORo)Ro;-(CH2)0-4SSRo;-(CH2)0-4S(O)2Ro;-(CH2)0-4S(O)2ORo;-(CH2)0-4OS(O)2Ro;-S(O)2NRo 2;-(CH2)0-4S(O)Ro;-N(Ro)S(O)2NRo 2;-N(Ro)S(O)2Ro;-N(ORo)Ro;-C(NORo)NRo 2;-C(NH)NRo 2;-P(O)2Ro;-P(O)Ro 2;-P(O)(ORo)2;-OP(O)Ro 2;-OP(O)(ORo)2;-OP(O)(ORo)Ro;-SiRo 3;-(C1-C4直链或分支链亚烷基)O-N(Ro)2;或-(C1-C4直链或分支链亚烷基)C(O)O-N(Ro)2,其中各Ro可如下文所定义被取代且独立地为氢、-C1-C6脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph、-CH2-(5至6元杂芳基环),或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至6元饱和、部分不饱和或芳基环,或尽管有以上定义,但两个独立存在的Ro与其插入原子一起形成具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至12元饱和、部分不饱和或芳基单环或双环,其可如下文所定义被取代。
Ro(或由两个独立存在的Ro与其插入原子一起形成的环)上的适合单价取代基可独立地为卤素、-(CH2)0-2R、-(卤代R)、-(CH2)0-2OH、-(CH2)0-2OR、-(CH2)0-2CH(OR)2、-O(卤代R)、-CN、-N3、-(CH2)0-2C(O)R、-(CH2)0-2C(O)OH、-(CH2)0-2C(O)OR、-(CH2)0-2SR、-(CH2)0- 2SH、-(CH2)0-2NH2、-(CH2)0-2NHR、-(CH2)0-2NR 2、-NO2、-SiR 3、-OSiR 3、-C(O)SR、-(C1-4直链或分支链亚烷基)C(O)OR或-SSR,其中各R未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代,并且独立地选自C1-C4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。Ro的饱和碳原子上的适合二价取代基包括=O和=S。
“任选被取代”的基团的饱和碳原子上的适合二价取代基包括以下:=O、=S、=NNR* 2、=NNHC(O)R*、=NNHC(O)OR*、=NNHS(O)2R*、=NR*、=NOR*、-O(C(R* 2))2-3O-或-S(C(R* 2))2-3S-,其中R*在每次独立出现时选自氢;C1-C6脂肪族基团,该基团可如下文所定义被取代;或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的未被取代的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。结合至“任选被取代”的基团的邻近可取代碳的适合二价取代基包括:-O(CR* 2)2- 3O-,其中R*在每次独立出现时选自氢;C1-C6脂肪族基团,该基团可如下文所定义被取代;或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的未被取代的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。
R*的脂肪族基团上的适合取代基包括卤素、-R、-(卤代R)、-OH、-OR、-O(卤代R)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR、-NH2、-NHR、-NR 2或-NO2,其中各R未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代,并且独立地为C1-C4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0- 1Ph或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。
“任选被取代”的基团的可取代氮上的适合取代基包括
Figure BDA0004194083620012261
Figure BDA0004194083620012262
Figure BDA0004194083620012263
或/>
Figure BDA0004194083620012264
其中各/>
Figure BDA0004194083620012265
独立地为氢;C1-C6脂肪族基团,该基团可如下文所定义被取代;未被取代的-OPh;或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的未被取代的3至6元饱和、部分不饱和或芳基环,或尽管有以上定义,但两个独立存在的/>
Figure BDA0004194083620012266
与其插入原子一起形成具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至12元饱和、部分不饱和或芳基单环或双环。
Figure BDA0004194083620012267
的脂肪族基团上的适合取代基独立地为卤素、-R、-(卤代R)、-OH、-OR、-O(卤代R)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR、-NH2、-NHR、-NR 2或-NO2,其中各R未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代,并且独立地为C1-C4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph或具有0-4个独立地选氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。
Figure BDA0004194083620012271
的饱和碳原子上的适合二价取代基包括=O及=S。
如本文所使用,术语“乙酰基”是指基团-C(O)CH3
如本文所使用,术语“烷氧基”是指-O-C1-C20烷基,其中该烷氧基通过氧原子连接至化合物的其余部分。
如本文所使用,术语“烷基”是指含有1至20个(例如1至10个或1至6个)碳的饱和、直链或分支链单价烃基。在一些实施方案中,烷基是非分支链的(即,是线性的);在一些实施方案中,烷基是分支链的。烷基是例如但不限于甲基、乙基、正丙基和异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基和叔丁基,以及新戊基。
如本文所使用,术语“亚烷基”表示由直链或分支链饱和烃通过移除两个氢原子得到的饱和二价烃基,并且其实例有亚甲基、亚乙基、亚异丙基等。术语“Cx-Cy亚烷基”表示具有在x与y个之间的碳的亚烷基。示例性x值是1、2、3、4、5及6,并且示例性y值是2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、14、16、18或20(例如C1-C6、C1-C10、C2-C20、C2-C6、C2-C10或C2-C20亚烷基)。在一些实施方案中,亚烷基可进一步被1、2、3或4个如本文所定义的取代基取代。
除非另外具体说明,否则如本文所使用,术语“烯基”表示含有一个或多个碳-碳双键的具有2至20个碳(例如2至6个或2至10个碳)的单价直链或分支链基团,并且其实例是乙烯基、1-丙烯基、2-丙烯基、2-甲基-1-丙烯基、1-丁烯基及2-丁烯基。烯基包括顺式和反式异构体两种。除非另外具体说明,否则如本文所使用,术语“亚烯基”表示含有一个或多个碳-碳双键的具有2至20个碳(例如2至6个或2至10个碳)的二价直链或分支链基团。
如本文所使用,术语“炔基”表示含有碳-碳三键的具有2至20个碳(例如2至4个、2至6个或2至10个碳)的单价直链或分支链基团,并且其实例有乙炔基及1-丙炔基。
如本文所使用,术语“炔基砜”表示包含结构
Figure BDA0004194083620012281
的基团,其中R是本文所描述的任何化学上可行的取代基。
如本文所使用,术语“氨基”表示
Figure BDA0004194083620012282
例如-NH2和-N(CH3)2
如本文所使用,术语“氨基烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个氨基部分取代的烷基部分。
如本文所描述,术语“氨基酸”是指具有侧链、氨基和酸基(例如-CO2H或-SO3H)的分子,其中该氨基酸通过所述侧链、氨基或酸基(例如侧链)连接至母分子基团。如本文所使用,术语“氨基酸”在最广泛意义上是指可例如通过形成一个或多个肽键并入多肽链中的任何化合物或物质。在一些实施方案中,氨基酸具有通用结构H2N-C(H)(R)-COOH。在一些实施方案中,氨基酸是天然存在的氨基酸。在一些实施方案中,氨基酸是合成氨基酸;在一些实施方案中,氨基酸是D-氨基酸;在一些实施方案中,氨基酸是L-氨基酸。“标准氨基酸”是指天然存在的肽中常见的二十种标准L-氨基酸中的任一种。示例性氨基酸包括丙氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、组氨酸、任选被取代的羟基正缬氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、正缬氨酸、鸟氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、吡咯赖氨酸、硒代半胱氨酸、丝氨酸、牛磺酸、苏氨酸、色氨酸、酪氨酸及缬氨酸。
如本文所使用,术语“芳基”表示由碳原子形成的单价单环、双环或多环系统,其中连接至侧接基团的环是芳香环。芳基的实例有苯基、萘基、菲基和蒽基。芳环可在产生稳定结构的任何杂原子或碳环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用,术语“C0”表示键。例如,术语-N(C(O)-(C0-C5亚烷基-H)-的一部分包括-N(C(O)-(C0亚烷基-H)-,也表示为-N(C(O)-H)-。
如本文所使用,术语“碳环”和“碳环基”是指单价、任选被取代的3至12元单环、双环或三环结构,该环结构可以是桥接环、稠合环或螺环,其中所有环均由碳原子形成,并且至少一个环是非芳香环。碳环结构包括环烷基、环烯基和环炔基。碳环基的实例有环己基、环己烯基、环辛炔基、1,2-二氢萘基、1,2,3,4-四氢萘基、芴基、茚基、二氢茚基、十氢萘基等。碳环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用,术语“羰基”表示C(O)基团,该基团也可表示为C=O。
如本文所使用,术语“羧基”意思指-CO2H、(C=O)(OH)、COOH或C(O)OH,或未质子化的对应物。
如本文所使用,术语“氰基”表示-CN基团。
如本文所使用,术语“环烷基”表示单价饱和环状烃基,除非另外具体说明,否则该基团可以是具有三至八个环碳的桥接环、稠合环或螺环,并且其实例有环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基及环庚基。
如本文所使用,术语“环烯基”表示单价、非芳香族饱和环状烃基,除非另外具体说明,否则该基团可以是具有三至八个环碳且含有一个或多个碳-碳双键的桥接环、稠合环或螺环。
如本文所使用,术语“非对映异构体”意思指不互为镜像且彼此不可重叠的立体异构体。
如本文所使用,术语“对映异构体”意思指具有至少80%(即,至少90%的一种对映异构体和至多10%的另一种对映异构体)、优选至少90%且更优选至少98%的光学纯度或对映异构体过量(如通过本领域中的标准方法确定)的本发明化合物的每一个别光学活性形式。
术语“胍基”是指具有以下结构的基团:
Figure BDA0004194083620012301
其中各R独立地为本文所描述的任何化学上可行的取代基。
如本文所使用,术语“胍基烷基烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个胍基部分取代的烷基部分。
如本文所使用,术语“卤代乙酰基”是指至少一个氢被卤素置换的乙酰基。
如本文所使用,术语“卤烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个相同或不同的卤素部分取代的烷基部分。
如本文所使用,术语“卤素”表示选自溴、氯、碘或氟的卤素。
如本文所使用,术语“杂烷基”是指至少一个碳原子被杂原子(例如O、N或S原子)置换的如本文所定义的“烷基”。杂原子可出现在基团的中间或末端。
如本文所使用,术语“杂芳基”表示含有至少一个完全芳香环的单价、单环或多环结构:即,它在该单环或多环系统内含有4n+2个π电子,并且在该芳香环中含有至少一个选自N、O或S的杂原子。示例性未被取代的杂芳基具有1至12个(例如1至11个、1至10个、1至9个、2至12个、2至11个、2至10个或2至9个)碳。术语“杂芳基”包括任一上述杂芳香环与一个或多个芳环或碳环,例如苯基环或环己烷环稠合的双环、三环和四环基团。杂芳基的实例包括但不限于吡啶基、吡唑基、苯并噁唑基、苯并咪唑基、苯并噻唑基、咪唑基、噻唑基、喹啉基、四氢喹啉基及4-氮杂吲哚基。杂芳基环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。在某一实施方案中,杂芳基被1、2、3或4个取代基取代。
如本文所使用,术语“杂环烷基”表示至少一个环是非芳香环且其中该非芳香环含有一个、两个、三个或四个独立地选自由氮、氧和硫组成的组的杂原子的单价、单环、双环或多环系统,该环系统可以是桥接环、稠合环或螺环。5元环具有零至两个双键,并且6元环和7元环具有零至三个双键。示例性未被取代的杂环烷基具有1至12个(例如1至11个、1至10个、1至9个、2至12个、2至11个、2至10个或2至9个)碳。术语“杂环烷基”也表示具有桥接多环结构的杂环化合物,其中一个或多个碳或杂原子桥接单环的两个不相邻成员,例如奎宁环基。术语“杂环烷基”包括任一上述杂环与一个或多个芳香环、碳环、杂芳香环或杂环,例如芳基环、环己烷环、环己烯环、环戊烷环、环戊烯环、吡啶环或吡咯烷环稠合的双环、三环和四环基团。杂环烷基的实例有吡咯烷基、哌啶基、1,2,3,4-四氢喹啉基、十氢喹啉基、二氢吡咯并吡啶基及十氢萘啶基。杂环烷基环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用,术语“羟基”表示-OH基团。
如本文所使用,术语“羟基烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个-OH部分取代的烷基部分。
如本文所使用,术语“异构体”意思指任何本发明化合物的任何互变异构体、立体异构体、阻转异构体、对映异构体或非对映异构体。应认识到,本发明化合物可具有一个或多个手性中心或双键,并因此,以立体异构体形式,如以双键异构体(即,E/Z几何异构体)或非对映异构体(例如对映异构体(即,(+)或(-))或顺/反异构体)形式存在。根据本发明,本文所描绘的化学结构且因此本发明化合物涵盖所有相应立体异构体,即,立体异构纯(例如几何异构纯、对映异构体纯或非对映异构体纯)形式以及对映异构体和立体异构体混合物,例如外消旋物。本发明化合物的对映异构体和立体异构体混合物可典型地通过众所周知的方法,如手性相气相色谱法、手性相高效液相色谱法、使化合物以手性盐络合物形式结晶或使化合物在手性溶剂中结晶来拆分成其组分对映异构体或立体异构体。对映异构体和立体异构体也可由立体异构纯或对映异构纯的中间体、试剂和催化剂,通过众所周知的不对称合成方法获得。
如本文所使用,术语“连接体”是指将式I化合物中的部分B连接至部分W,使得所得化合物能够在以下实施例中提供以及此处提供的Ras-RAF破坏测定方案中获得2uM或更低IC50值的二价有机部分:
这一生物化学测定的目的是测量测试化合物促进在载有核苷酸的Ras同功型与亲环蛋白A之间形成三元复合物的能力;由此得到的三元复合物破坏与BRAFRBD构建体的结合,抑制Ras通过RAF效应子进行的信号传导。
在含有25mM HEPES pH 7.3、0.002% Tween20、0.1% BSA、100mM NaCl及5mMMgCl2的测定缓冲液中,将无标记亲环蛋白A、His6-K-Ras-GMPPNP(或其它Ras变体)和GST-BRAFRBD分别以25μM、12.5nM和50nM的最终浓度组合于384孔测定板中。测定板各孔中存在的化合物是自30μM最终浓度起始,经历10点3倍连续稀释的稀释液。在25℃下培育3小时之后,接着将抗His Eu-W1024和抗GST别藻蓝蛋白的混合物添加至测定样品孔中分别达到10nM和50nM的最终浓度,并将反应再培育1.5小时。在微孔板读取器(Ex320nm,Em 665/615nm)上读取TR-FRET信号。促进Ras:RAF复合物破坏的化合物被鉴别为使TR-FRET比率相对于DMSO对照孔降低的化合物。
在一些实施方案中,连接体包含20个或更少的线性原子。在一些实施方案中,连接体包含15个或更少的线性原子。在一些实施方案中,连接体包含10个或更少的线性原子。在一些实施方案中,连接体的分子量低于500g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于400g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于300g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于200g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于100g/mol。在一些实施方案中,连接体的分子量低于50g/mol。
如本文所使用,“单价有机部分”小于500kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于400kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于300kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于200kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于100kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于50kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于25kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于20kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于15kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于10kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于1kDa。在一些实施方案中,“单价有机部分”小于500g/mol。在一些实施方案中,“单价有机部分”在500g/mol与500kDa之间的范围内。
如本文所使用,术语“立体异构体”是指一种化合物(例如本文所描述的任何式的化合物)可能具有所有可能的不同异构以及构形形式,特别是基础分子结构的所有可能的立体化学和构形异构形式、所有非对映异构体、对映异构体或构形异构体,包括阻转异构体。本发明的一些化合物可以呈不同互变异构形式存在,所有这些互变异构形式均包括在本发明的范围内。
如本文所使用,术语“磺酰基”表示-S(O)2-基团。
如本文所使用,术语“硫代羰基”是指-C(S)-基团。
如本文所使用,术语“乙烯基酮”是指包含直接连接至碳-碳双键的羰基的基团。
如本文所使用,术语“乙烯基砜”是指包含直接连接至碳-碳双键的磺酰基的基团。
如本文所使用,术语“炔酮”是指包含结构
Figure BDA0004194083620012341
的基团,其中R是本文所描述的任何在化学上可行的取代基。
本领域技术人员阅读本公开将理解,本文所描述的某些化合物可以呈多种形式中的任一种提供或利用,如盐形式、被保护的形式、前药形式、酯形式、异构形式(例如光学或结构异构体)、同位素形式等。在一些实施方案中,提到的特定化合物可指该化合物的特定形式。在一些实施方案中,提到的特定化合物可指呈任何形式的该化合物。在一些实施方案中,例如,一种化合物的单一立体异构体的制剂可视为该化合物的不同形式而非该化合物的外消旋混合物;一种化合物的特定盐可视为与该化合物的另一种盐不同的形式;含有双键的一种构形异构体((Z)或(E))的制剂可视为与含有该双键的另一种构形异构体((E)或(Z))的制剂不同的形式;一个或多个原子的同位素不同于参考制剂中存在的同位素的制剂可视为呈不同形式。
具体实施方式
化合物
本文提供Ras抑制剂。本文所描述的方法需要在合成配体与两种细胞内蛋白质之间形成高亲和力三组分复合物或缀合物,该两种细胞内蛋白在正常生理条件下不会相互作用:所关注的靶蛋白(例如Ras),以及在细胞中广泛表达的细胞质伴侣蛋白(呈现蛋白)(例如亲环蛋白A)。更具体点说,在一些实施方案中,本文所描述的Ras抑制剂通过驱动在Ras蛋白与广泛表达的细胞质伴侣蛋白亲环蛋白A(CYPA)之间形成高亲和力三重复合物或缀合物,在Ras中诱导新结合口袋。不受理论束缚,本发明人相信,本发明化合物以及其形成的复合物或缀合物对Ras发挥抑制作用的一种方式是在空间上阻塞Ras与传播致癌信号所需的下游效应分子如RAF之间的相互作用位点。
不受理论束缚,本发明人假定,本发明化合物与Ras和伴侣蛋白(例如亲环蛋白A)的共价和非共价相互作用可促成对Ras活性的抑制。在一些实施方案中,本发明化合物与Ras蛋白的侧链(例如在突变Ras蛋白12位或13位处的天冬氨酸的-CH2-COOH或-CH2-COO-侧链)形成共价加合物。也可与Ras的其它侧链形成共价加合物。另外或替代地,非共价相互作用可起作用:例如,范德华(van der Waals)相互作用、疏水相互作用、亲水相互作用和氢键相互作用,以及其组合可促成本发明化合物形成复合物并充当Ras抑制剂的能力。因此,本发明化合物可抑制多种Ras蛋白(例如K-Ras、N-Ras、H-Ras以及其在12位、13位及61位突变的突变体,如G12C、G12D、G12V、G12S、G13C、G13D及Q61L,以及本文所描述的其它突变体)。
确定共价加合物形成的方法是本领域中已知的。一种确定共价加合物形成的方法是执行“交联”测定,如实施例以及下文中所描述的测定:
注意-以下方案描述用于监测K-Ras G12C(GMP-PNP)与本发明化合物的交联的程序。这一方案也可改用其它Ras蛋白或核苷酸,如K-Ras G12D来实施。
这一生物化学测定的目的是测量测试化合物共价标记载有核苷酸的K-Ras同功型的能力。在含有12.5mM HEPES pH 7.4、75mM NaCl、1mM MgCl2、1mM BME、5μM亲环蛋白A及2μM测试化合物的测定缓冲液中,将5μM载有GMP-PNP的K-Ras(1-169)G12C的储备液稀释10倍达到0.5μM最终浓度;并且最终样品体积是100μL。
在25℃下,将样品培育至多24小时的时间,随后通过添加10μL的5%甲酸淬灭。淬灭的样品在台式离心机中以15000rpm离心15分钟,随后将10μL等分试样注入至反相C4柱上并用流动相中递增的乙腈梯度洗脱至质谱仪中。原始数据的分析可使用Waters MassLynxMS软件进行,其中结合%是由被标记和未标记的K-Ras的解卷积蛋白质峰计算。
因此,本文提供一种具有式I结构的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620012361
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是氢、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;并且
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R34是氢或C1-C3烷基(例如甲基)。
在一些实施方案中,R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
在一些实施方案中,R34是氢。
在本发明化合物的一些实施方案中,G是任选被取代的C1-C4亚杂烷基。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Ia的结构,或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620012401
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5及Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,X2是NH。在一些实施方案中,X3是CH。
在本发明化合物的一些实施方案中,R11是氢。在一些实施方案中,R11是C1-C3烷基,如甲基。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Ib的结构,或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620012431
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5及Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,X1是任选被取代的C1-C2亚烷基。在一些实施方案中,X1是亚甲基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R4是氢。
在本发明化合物的一些实施方案中,R5是氢。在一些实施方案中,R5是任选被卤素取代的C1-C4烷基。在一些实施方案中,R5是甲基。
在本发明化合物的一些实施方案中,Y4是C。在一些实施方案中,R4是氢。在一些实施方案中,Y5是CH。在一些实施方案中,Y6是CH。在一些实施方案中,Y1是C。在一些实施方案中,Y2是C。在一些实施方案中,Y3是N。在一些实施方案中,R3不存在。在一些实施方案中,Y7是C。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Ic的结构,或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620012461
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R6是氢。
在本发明化合物的一些实施方案中,R2是氢、氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至6元杂环烷基。在一些实施方案中,R2是任选被取代的C1-C6烷基,如乙基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R7是任选被取代的C1-C3烷基。在一些实施方案中,R7是C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R8是任选被取代的C1-C3烷基。在一些实施方案中,R8是C1-C3烷基。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Id的结构,或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620012491
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R1是5至10元杂芳基。在一些实施方案中,R1是任选被取代的6元芳基或任选被取代的6元杂芳基。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式Ie的结构,或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620012501
Figure BDA0004194083620012511
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
Xe是N或CH;并且
R12是任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,Xe是N。在一些实施方案中,Xe是CH。
在本发明化合物的一些实施方案中,R12是任选被取代的C1-C6杂烷基。在一些实施方案中,R12
Figure BDA0004194083620012521
在一些实施方案中,R12是/>
Figure BDA0004194083620012522
在一些实施方案中,本发明化合物具有式If的结构,或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620012523
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5及Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式VI的结构,或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620012551
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基(例如苯基或酚);或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是氢、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;
R34是氢或C1-C3烷基;并且
Xe及Xf独立地为N或CH。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式VIa的结构,或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620012591
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基(例如苯基或苯酚)或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
Xe及Xf独立地为N或CH;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R21是氢或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,Xe是N,并且Xf是CH。在一些实施方案中,Xe是CH,并且Xf是N。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式VIb的结构,或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620012601
Figure BDA0004194083620012611
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基(例如苯基或苯酚)或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
Xe及Xf独立地为N或CH。
在本发明化合物的一些实施方案中,Xe是N,并且Xf是CH。在一些实施方案中,Xe是CH,并且Xf是N。
在一些实施方案中,本发明化合物具有式VII的结构,或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620012621
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1
Figure BDA0004194083620012631
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是氢、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R34是氢或C1-C3烷基(例如甲基)。
在本发明化合物的一些实施方案中,A是任选被取代的6元亚芳基。在一些实施方案中,A具有以下结构:
Figure BDA0004194083620012651
其中R13是氢、羟基、氨基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基。在一些实施方案中,R13是氢。在一些实施方案中,R13是羟基。
在本发明化合物的一些实施方案中,B是-CHR9-。在一些实施方案中,R9是任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的3至6元环烷基。在一些实施方案中,R9是:
Figure BDA0004194083620012652
在一些实施方案中,R9是:/>
Figure BDA0004194083620012653
在一些实施方案中,R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
在一些实施方案中,B是任选被取代的6元亚芳基。在一些实施方案中,B是6元亚芳基。在一些实施方案中,B是:
Figure BDA0004194083620012661
在本发明化合物的一些实施方案中,R7是甲基。
在本发明化合物的一些实施方案中,R8是甲基。
在一些实施方案中,R34是氢。
在本发明化合物的一些实施方案中,连接体是式II的结构:
A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-(D1)-(B3)i-(C2)j-(B4)k-A2
式II
其中A1是在连接体与B之间的键;A2是在W与连接体之间的键;B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S及NRN;RN是氢、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的C1-C7杂烷基;C1及C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基;f、g、h、i、j及k各自独立地为0或1;并且D1是任选被取代的C1-C10亚烷基、任选被取代的C2-C10亚烯基、任选被取代的C2-C10亚炔基、任选被取代的3至14元亚杂环烷基、任选被取代的5至10元亚杂芳基、任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的6至10元亚芳基、任选被取代的C2-C10亚聚乙二醇或任选被取代的C1-C10亚杂烷基,或将A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-连接至-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2的化学键。在一些实施方案中,连接体是无环连接体。在一些实施方案中,连接体具有式IIa的结构:
Figure BDA0004194083620012671
其中Xa不存在或是N;
R14是不存在、氢或任选被取代的C1-C6烷基;并且
L2是不存在、-SO2-、任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C1-C4亚杂烷基,其中Xa、R14或L2中的至少一者存在。在一些实施方案中,连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620012672
Figure BDA0004194083620012673
在一些实施方案中,连接体是或包含环状基团。在一些实施方案中,连接体具有式IIb的结构:
Figure BDA0004194083620012674
其中o是0或1;
R15是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
Cy是任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的3至8元亚杂环烷基、任选被取代的6-10元亚芳基或任选被取代的5至10元亚杂芳基;并且
L3是不存在、-SO2-、任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C1-C4亚杂烷基。在一些实施方案中,连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620012681
/>
Figure BDA0004194083620012691
/>
Figure BDA0004194083620012701
Figure BDA0004194083620012702
在一些实施方案中,式II的连接体选自由以下组成的组:
Figure BDA0004194083620012703
在本发明化合物的一些实施方案中,W包含碳化二亚胺。在一些实施方案中,W具有式IIIa的结构:
Figure BDA0004194083620012704
其中R14是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基。在一些实施方案中,W具有以下结构:
Figure BDA0004194083620012705
/>
Figure BDA0004194083620012711
在一些实施方案中,W包含噁唑啉或噻唑啉。在一些实施方案中,W具有式IIIb的结构:
Figure BDA0004194083620012712
其中X1是O或S;
X2不存在或是NR19
R15、R16、R17和R18独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基;并且
R19是氢、C(O)(任选被取代的C1-C6烷基)、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基。在一些实施方案中,W是
Figure BDA0004194083620012721
在一些实施方案中,W包含氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯或硫代氨基甲酸氯乙酯。在一些实施方案中,W具有式IIIc的结构:
Figure BDA0004194083620012722
其中X3是O或S;
X4是O、S、NR26
R21、R22、R23、R24及R26独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基;并且
R25是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基。在一些实施方案中,W是
Figure BDA0004194083620012723
在一些实施方案中,W包含氮杂环丙烷。在一些实施方案中,W具有式IIId1、式IIId2、式IIId3或式IIId4的结构:
Figure BDA0004194083620012731
其中X5不存在或是NR30
Y不存在或是C(O)、C(S)、S(O)、SO2或任选被取代的C1-C3亚烷基;
R27是氢、-C(O)R32、-C(O)OR32、-SOR33、-SO2R33、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R28和R29独立地为氢、CN、C(O)R31、CO2R31、C(O)R31R31、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的3至10元环烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基;
各R31独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R30是氢或任选被取代的C1-C6烷基;并且
R32和R33独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基。在一些实施方案中,W是:
Figure BDA0004194083620012741
/>
Figure BDA0004194083620012751
在一些实施方案中,W包含环氧化物。在一些实施方案中,W是
Figure BDA0004194083620012752
在一些实施方案中,W是结合至有机部分的交联基团,该有机部分是Ras结合部分,即,RBM-W,其中在RBM-W化合物与Ras蛋白接触后,该RBM-W结合至该Ras蛋白形成缀合物。例如,RBM-W化合物的W部分可与Ras蛋白的氨基酸结合,例如交联,以形成缀合物。在一些实施方案中,Ras结合部分是K-Ras结合部分。在一些实施方案中,K-Ras结合部分结合至K-Ras蛋白的K-Ras Switch-II结合袋的残基。在一些实施方案中,Ras结合部分是H-Ras结合部分,它结合至H-Ras蛋白的H-Ras Switch-II结合袋的残基。在一些实施方案中,Ras结合部分是N-Ras结合部分,它结合N-Ras蛋白的N-Ras Switch-II结合袋的残基。RBM-W化合物的W可包含本文所描述的任何W。Ras结合部分的分子量典型地低于1200Da。关于Ras蛋白各结构域的描述,参见例如Johnson等人,292:12981-12993(2017),该文献以引用的方式并入本文中。
在一些实施方案中,本发明化合物选自表1,或其药学上可接受的盐或立体异构体。在一些实施方案中,本发明化合物选自表1,或其药学上可接受的盐或阻转异构体。
表1:某些本发明化合物
Figure BDA0004194083620012753
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Figure BDA0004194083620012761
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Figure BDA0004194083620013531
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Figure BDA0004194083620013541
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Figure BDA0004194083620013551
*假定氮杂环丙烷碳的立体化学。
应注意,一些化合物中的键以平直线或楔形线显示。在一些情况下,立体异构体的相对立体化学已确定;在一些情况下,绝对立体化学已确定。在一些情况下,单个实施例编号对应于立体异构体混合物。上表化合物的所有立体异构体均涵盖在本发明中。在特定实施方案中,涵盖上表化合物的阻转异构体。
在一些实施方案中,提供表2的化合物,或其药学上可接受的盐。在一些实施方案中,本发明化合物选自表2,或其药学上可接受的盐或立体异构体。
表2:某些本发明化合物
Figure BDA0004194083620013561
/>
Figure BDA0004194083620013571
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Figure BDA0004194083620013581
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Figure BDA0004194083620013591
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Figure BDA0004194083620013601
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Figure BDA0004194083620013611
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Figure BDA0004194083620013621
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Figure BDA0004194083620013631
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Figure BDA0004194083620013641
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Figure BDA0004194083620013651
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Figure BDA0004194083620013661
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Figure BDA0004194083620013671
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Figure BDA0004194083620013681
/>
Figure BDA0004194083620013691
应注意,一些化合物中的键以平直线或楔形线显示。在一些情况下,立体异构体的相对立体化学已确定;在一些情况下,绝对立体化学已确定。上表化合物的所有立体异构体均涵盖在本发明中。在特定实施方案中,涵盖上表化合物的阻转异构体。
在一些实施方案中,本发明化合物是或用作前药,如用于施用至细胞或有需要的受试者。
也提供药物组合物,该药物组合物包含本发明化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的赋形剂。
还提供了一种缀合物或其盐,该缀合物包含式IV的结构:
M-L-P
式IV
其中L是连接体;
P是单价有机部分;并且
M具有式Va的结构:
Figure BDA0004194083620013701
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
在一些实施方案中,所述缀合物具有式IV的结构:
M-L-P
式IV
其中L是连接体;
P是单价有机部分;并且
M具有式Vb的结构:
Figure BDA0004194083620013731
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5及Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
在一些实施方案中,所述缀合物具有式IV的结构:
M-L-P
式IV
其中L是连接体;
P是单价有机部分;并且
M具有式Vc的结构:
Figure BDA0004194083620013771
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基(例如苯基或苯酚)或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Xe及Xf独立地为N或CH;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R34是氢或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,Xe是N,并且Xf是CH。在一些实施方案中,Xe是CH,并且Xf是N。
在一些实施方案中,所述缀合物具有式IV的结构:
M-L-P
式IV
其中L是连接体;
P是单价有机部分;并且
M具有式Vd的结构:
Figure BDA0004194083620013781
Figure BDA0004194083620013791
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基(例如苯基或苯酚)或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
Xe和Xf独立地为N或CH。
在本发明化合物的一些实施方案中,Xe是N,并且Xf是CH。在一些实施方案中,Xe是CH,并且Xf是N。
在本发明的缀合物的一些实施方案中,连接体具有式II的结构:
A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-(D1)-(B3)i-(C2)j-(B4)k-A2
式II
其中A1是在连接体与B之间的键;A2是在P与连接体之间的键;B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S及NRN;RN是氢、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的C1-C7杂烷基;C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基;f、g、h、i、j及k各自独立地为0或1;并且D1是任选被取代的C1-C10亚烷基、任选被取代的C2-C10亚烯基、任选被取代的C2-C10亚炔基、任选被取代的3至14元亚杂环烷基、任选被取代的5至10元亚杂芳基、任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的6至10元亚芳基、任选被取代的C2-C10亚聚乙二醇或任选被取代的C1-C10亚杂烷基,或将A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-连接至-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2的化学键。在本发明的缀合物的一些实施方案中,连接体通过与单价有机部分的氨基酸残基中羧基的键结合至该单价有机部分。
在本发明的缀合物的一些实施方案中,所述单价有机部分是蛋白质。在一些实施方案中,所述蛋白质是Ras蛋白。在一些实施方案中,所述Ras蛋白是K-Ras G12D或K-RasG13D。
对于本发明化合物而言,一种立体异构体展现的抑制作用可优于另一种立体异构体。例如,一种阻转异构体可展现抑制作用,而另一种阻转异构体可展现极低或不展现抑制作用。
合成方法
本文所描述的化合物可由市售起始物质制备或使用已知的有机、无机或酶方法合成。
本发明化合物可通过有机合成领域的技术人员众所周知的的多种方式制备。例如,本发明化合物可使用以下方案中所描述的方法,以及合成有机化学技术中已知的合成方法或本领域技术人员所理解的关于所述方法的修改来合成。所述方法包括但不限于以下方案中所描述的方法。
本文中表1的化合物是使用本文所公开的方法制备,或使用本文所公开的方法结合本领域技术人员的知识制备。表2的化合物可使用本文所公开的方法制备,或可使用本文所公开的方法结合本领域技术人员的知识制备。
方案1.大环酯的一般合成方法
Figure BDA0004194083620013811
方案1中概述了大环酯的一般合成方法。适当取代的芳基-3-(5-溴-1-乙基-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(1)可以利用受保护的3-(5-溴-2-碘-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇和适当取代的硼酸为起始物质,分三个步骤制备,包括钯介导的偶合、烷基化和脱保护反应。
氨基-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯-硼酸酯(2)可分三个步骤制备,包括保护、铱催化剂介导的硼基化以及与(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯偶合。
最终的大环酯可通过以下来制备:使氨基-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯-硼酸酯(2)与芳基-3-(5-溴-1-乙基-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(1)在Pd催化剂存在下偶合,随后进行水解和大环内酯化步骤,以得到适当保护的大环中间体(4)。需要额外脱保护或官能化步骤来制备最终化合物。例如,本领域技术人员将能够将式(I)化合物所需的-B-L-W基团装载于大环酯中,其中B、L和W如本文所定义,包括通过使用以下某些方案中以及本文实施例部分中例示的方法进行。
方案2.大环酯的替代性一般合成方法
Figure BDA0004194083620013821
替代地,可如方案2中所描述来制备大环酯。适当保护的溴-吲哚基(5)可在Pd催化剂存在下与硼酸酯(3)偶合,随后进行碘化、脱保护和酯水解。随后与(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯偶合,接着进行水解和大环内酯化可产生碘中间体(6)。在Pd催化剂存在下与适当取代的硼酸酯偶合可得到完全保护的大环(4)。需要额外脱保护或官能化步骤来制备最终化合物。例如,本领域技术人员将能够将式(I)化合物所需的-B-L-W基团装载于大环酯中,其中B、L和W如本文所定义,包括通过使用以下某些方案中以及本文实施例部分中例示的方法进行。
方案3.含氮杂环丙烷的大环的一般合成方法
Figure BDA0004194083620013822
如方案3中所示,此类化合物可通过以下来制备:使适当胺(1)与含氮杂环丙烷的羧酸(2)在标准酰胺偶合试剂存在下反应,如果R1是保护基,则随后使氮杂环丙烷脱保护,且必要时,使酚脱保护,以得到最终化合物(4)。
方案4.含碳化二亚胺的大环的一般合成方法
Figure BDA0004194083620013831
如方案4中所示,此类化合物可通过使适当胺(1)与含硫脲的羧酸(2)在标准酰胺偶合试剂存在下反应,随后在碘化2-氯-1-甲基吡啶-1-鎓盐存在下将硫脲(3)转化成碳化二亚胺(4)来制备。
方案5.含氯乙基脲的大环的一般合成方法
Figure BDA0004194083620013832
如方案5中所示,此类化合物可通过以下来制备:使适当胺(1)与异氰酸酯(2)在碱性条件下反应,必要时,随后使酚脱保护,以产生最终化合物(4)。
方案6.含氨基噁唑啉的大环的一般合成方法
Figure BDA0004194083620013833
如方案6中所示,此类化合物可通过以下来制备:使适当氯乙基脲(1)在高温下环化,以产生最终化合物(2)。
方案7.含环氧基的大环的一般合成方法
Figure BDA0004194083620013841
如方案7中所示,此类化合物可通过以下来制备:使适当胺(1)与含环氧基的羧酸(2)在标准酰胺偶合试剂存在下反应,以产生最终化合物(3)。
此外,本公开的化合物可使用以下实施例中所描述的方法,以及合成有机化学技术中已知的合成方法,或本领域技术人员所理解的关于所述方法的修改来合成。所述方法包括但不限于以下实施例中所描述的方法。例如,本领域技术人员将能够将式(I)化合物所需的-B-L-W基团装载于大环酯中,其中B、L和W如本文所定义,包括通过使用以上某些方案中以及本文实施例部分中例示的方法进行。
药物组合物和使用方法
药物组合物和施用方法
本发明所涉及的化合物是Ras抑制剂,并且可用于治疗癌症。因此,本发明的一个实施方案提供含本发明化合物或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的赋形剂的药物组合物,以及使用本发明化合物制备此类组合物的方法。
如本文所使用,术语“药物组合物”是指与药学上可接受的赋形剂一起配制的化合物,如本发明化合物,或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中,化合物是以适于在治疗方案中施用的单位剂量的量存在于药物组合物中,该化合物当施用给相关群体时显示出统计显著的实现预定治疗效果的可能性。在一些实施方案中,药物组合物可特定地配制成以固体或液体形式施用,包括适于以下方式施用者:口服施用,例如药水(水性或非水性溶液或悬浮液)、片剂(例如旨在经颊、舌下和全身吸收者)、大丸剂、散剂、颗粒剂、供施用于舌部的糊剂;肠胃外施用,例如通过皮下、肌肉内、静脉内或硬膜外注射,如例如无菌溶液或悬浮液,或持续释放配制物;表面施用,例如施用于皮肤、肺或口腔的乳霜、软膏剂或控制释放贴片或喷雾剂;阴道内或直肠内施用,例如子宫托、乳霜或泡沫剂;舌下施用;经眼施用;经皮施用;或经鼻、肺施用和施用至其它粘膜表面。
如本文所使用,“药学上可接受的赋形剂”是指在受试者体内无毒且无发炎性的任何无活性成分(例如能够将活性化合物悬浮或溶解的媒剂)。典型赋形剂包括例如:抗粘附剂、抗氧化剂、粘合剂、包衣剂、压缩助剂、崩解剂、染料(色素)、软化剂、乳化剂、填充剂(稀释剂)、成膜剂或包衣剂、调味剂、芳香剂、助流剂(流动增强剂)、润滑剂、防腐剂、印刷油墨、吸附剂、悬浮剂或分散剂、甜味剂或水合用水。赋形剂包括但不限于:任选被取代的丁基化羟基甲苯(BHT)、碳酸钙、磷酸氢钙、硬脂酸钙、交联羧甲基纤维素、交联聚乙烯基吡咯烷酮、柠檬酸、交联聚维酮、半胱氨酸、乙基纤维素、明胶、任选被取代的羟丙基纤维素、任选被取代的羟丙基甲基纤维素、乳糖、硬脂酸镁、麦芽糖醇、甘露糖醇、甲硫氨酸、甲基纤维素、对羟基苯甲酸甲酯、微晶纤维素、聚乙二醇、聚乙烯基吡咯烷酮、聚维酮、预胶化淀粉、对羟基苯甲酸丙酯、棕榈酸视黄酯、虫胶、二氧化硅、羧甲基纤维素钠、柠檬酸钠、羟基乙酸淀粉钠、山梨糖醇、淀粉(玉米淀粉)、硬脂酸、硬脂酸、蔗糖、滑石、二氧化钛、维生素A、维生素E、维生素C及木糖醇。本领域技术人员了解可用作赋形剂的多种试剂和材料。参见例如Ansel等人,Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems.Philadelphia:Lippincott,Williams&Wilkins,2004;Gennaro等人,Remington:The Science andPractice of Pharmacy.Philadelphia:Lippincott,Williams&Wilkins,2000;及Rowe,Handbook of Pharmaceutical Excipients.Chicago,Pharmaceutical Press,2005。在一些实施方案中,组合物包括至少两种不同的药学上可接受的赋形剂。
除非清楚地作相反陈述,否则本文所描述的化合物,无论是否清楚地陈述,均可以呈盐形式,例如呈药学上可接受的盐形式提供或使用。如本文所使用,术语“药学上可接受的盐”是指在合理医学判断的范围内,适于与人体组织接触使用而无过度毒性、刺激、过敏反应等,并且与合理效益/风险比相称的本文所描述的化合物的盐。药学上可接受的盐是本领域中众所周知的。例如,药学上可接受的盐描述于:Berge等人,J.PharmaceuticalSciences 66:1-19,1977及Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use,(P.H.Stahl及C.G.Wermuth编辑),Wiley-VCH,2008中。所述盐可在本文所描述的化合物的最终分离和纯化期间原位制备,或通过使游离碱性基团与适合有机酸反应来分离。
本发明化合物可具有可离子化基团,由此能够制备成药学上可接受的盐形式。这些盐可以是涉及无机酸或有机酸的酸加成盐,或在本发明化合物呈酸形式的情况下,所述盐可由无机碱或有机碱制备。在一些实施方案中,所述化合物被制备为药学上可接受的盐形式或以药学上可接受的盐形式使用,所述药学上可接受的盐形式是作为药学上可接受的酸或碱的加成产物制备。适合药学上可接受的酸和碱是本领域中众所周知的,如盐酸、硫酸、氢溴酸、乙酸、乳酸、柠檬酸或酒石酸,用于形成酸加成盐;以及氢氧化钾、氢氧化钠、氢氧化铵、咖啡因、各种胺等,用于形成碱盐。用于制备适当盐的方法是本领域中公认的。
代表性酸加成盐包括乙酸盐、己二酸盐、海藻酸盐、抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、硫酸氢盐、硼酸盐、丁酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、柠檬酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙烷磺酸盐、反丁烯二酸盐、葡庚糖酸盐、甘油磷酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、氢溴酸盐、盐酸盐、氢碘酸盐、2-任选被取代的羟基-乙烷磺酸盐、乳糖酸盐、乳酸盐、月桂酸盐、月桂基硫酸盐、苹果酸盐、顺丁烯二酸盐、丙二酸盐、甲烷磺酸盐、2-萘磺酸盐、烟酸盐、硝酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、双羟萘酸盐、果胶酸盐、过硫酸盐、3-苯基丙酸盐、磷酸盐、苦味酸盐、新戊酸盐、丙酸盐、硬脂酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、甲苯磺酸盐、十一烷酸盐、戊酸盐等。代表性碱金属或碱土金属盐包括钠盐、锂盐、钾盐、钙盐、镁盐等,以及无毒铵、季铵和胺阳离子,包括但不限于铵、四甲基铵、四乙基铵、甲胺、二甲胺、三甲胺、三乙胺、乙胺等。
如本文所使用,术语“受试者”是指动物王国的任何成员。在一些实施方案中,“受试者”是指处于任何发育阶段的人类。在一些实施方案中,“受试者”是指人类患者。在一些实施方案中,“受试者”是指非人类动物。在一些实施方案中,非人类动物是哺乳动物(例如啮齿动物、小鼠、大鼠、兔、猴、犬、猫、绵羊、牛、灵长类动物或猪)。在一些实施方案中,受试者包括但不限于哺乳动物、鸟类、爬行动物、两栖动物、鱼或虫类。在一些实施方案中,受试者可以是转基因动物、基因工程改造的动物或克隆。
如本文所使用,术语“剂型”是指供施用给受试者的化合物(例如本发明化合物)的物理离散单元。每个单元含有预定量的化合物。在一些实施方案中,所述量是适于根据剂量方案施用的单位剂量的量(或其整体部分),该量当施用给相关群体(即,根据治疗剂量方案)时确定与所希望或有益的结果相关。本领域技术人员应理解,施用给特定受试者的治疗组合物或化合物的总量是由一位或多位主治医师决定,并且可涉及施用多种剂型。
如本文所使用,术语“剂量方案”是指个别地施用给受试者的一组单位剂量(典型地超过一个单位剂量),所述单位剂量典型地间隔一定时间段。在一些实施方案中,给定治疗化合物(例如本发明化合物)具有推荐的剂量方案,该方案可涉及一次或多次剂量。在一些实施方案中,剂量方案包含多次剂量,所述剂量各自彼此间隔相同长度的时间段;在一些实施方案中,剂量方案包含多次剂量且至少两个不同时间段分开个别剂量。在一些实施方案中,剂量方案内的所有剂量均为相同单位剂量的量。在一些实施方案中,剂量方案内的不同剂量是不同量。在一些实施方案中,剂量方案包含呈第一剂量的量的第一次剂量,随后是呈不同于该第一剂量的量的第二剂量的量的一次或多次额外剂量。在一些实施方案中,剂量方案包含呈第一剂量的量的第一次剂量,随后是呈与该第一剂量的量相同的第二剂量的量的一次或多次额外剂量。在一些实施方案中,剂量方案当施用给相关群体(即,是治疗性剂量方案)时,与所希望或有益结果相关。
“治疗方案”是指在相关群体中的施用与期望或有益治疗结果相关的剂量方案。
术语“治疗”(“treatment/treat/treating”)在其最广泛意义上是指部分或完全缓解、改善、减轻、抑制特定疾病、病症或疾患的一种或多种症状、特征或成因;延迟其发作;降低其严重程度;或减少其发生的物质(例如本发明化合物)的任何施用。在一些实施方案中,此类治疗可施用给未展现相关疾病、病症或疾患的体征的受试者或仅展现该疾病、病症或疾患的早期体征的受试者。替代地或另外地,在一些实施方案中,治疗可施用给展现相关疾病、病症或疾患的一种或多种确定的体征的受试者。在一些实施方案中,治疗可用于被诊断为罹患相关疾病、病症或疾患的受试者。在一些实施方案中,治疗可用于已知具有一个或多个在统计上与发展相关疾病、病症或疾患的风险增加相关的易感因素的受试者。
术语“治疗有效量”意谓当根据治疗性剂量方案施用给罹患或易患疾病、病症或疾患的群体时足以治疗该疾病、病症或疾患的量。在一些实施方案中,治疗有效量是降低该疾病、病症或疾患的一种或多种症状的发生率或严重程度或延迟其发作的量。本领域技术人员应理解,术语“治疗有效量”实际上不需要在特定个体中实现所需的成功治疗。事实上,治疗有效量可以是当施用给需要该治疗的患者时在相当大量受试者中提供特定所希望的药理学反应的量。特别需要了解的是,特定受试者实际上可以是“治疗有效量”“难治”的。在一些实施方案中,提到的治疗有效量可指如在一个或多个特定组织(例如受疾病、病症或疾患影响的组织)或流体(例如血液、唾液、血清、汗液、泪液、尿液)中所测量的量。本领域技术人员应理解,在一些实施方案中,治疗有效量可配制为单一剂量或以单一剂量施用。在一些实施方案中,治疗有效量可配制为多次剂量,例如配制为剂量方案的一部分,或以多次剂量施用。
为用作受试者的治疗,本发明化合物或其药学上可接受的盐可配制为药物组合物或兽医学组合物形式。取决于待治疗的受试者、施用模式及所希望的治疗类型,例如预防、防治或治疗,所述化合物或其药学上可接受的盐是以与所述参数相符的方式配制。关于此类技术的概述可见于Remington:The Science and Practice of Pharmacy,第21版,Lippincott Williams&Wilkins,(2005);及Encyclopedia of PharmaceuticalTechnology,J.Swarbrick及J.C.Boylan编辑,1988-1999,Marcel Dekker,New York,所述文献各自以引用的方式并入本文中。
组合物可分别根据常规混合、制粒或包覆方法制备,并且本发明的药物组合物以重量或体积计可含有约0.1%至约99%、约5%至约90%或约1%至约20%本发明化合物或其药学上可接受的盐。在一些实施方案中,本文所描述的化合物或其药学上可接受的盐的存在量以重量计可占组合物,如药物组合物总量总计1-95%。
所述组合物可以呈适于以下施用的剂型提供:关节内、口服、肠胃外(例如静脉内、肌肉内)、直肠、皮肤、皮下、表面、经皮、舌下、经鼻、阴道、囊内、尿道内、鞘内、硬膜外、耳或眼施用,或通过注射、吸入或与鼻、泌尿生殖器、生殖器或口腔粘膜直接接触。因此,药物组合物可呈例如片剂、胶囊、丸剂、散剂、颗粒剂、悬浮液、乳液、溶液、凝胶(包括水凝胶)、糊剂、软膏、乳霜、硬膏剂、药水、渗透递送装置、栓剂、灌肠剂、注射剂、植入物、喷雾剂、适于离子电渗递送的制剂或气雾剂。所述组合物可根据常规医药实践配制。
如本文所使用,术语“施用”是指将一种组合物(例如化合物或包括如本文所描述的化合物的制剂)施用给受试者或系统。向动物受试者(例如向人类)施用可通过任何适当的途径进行。例如,在一些实施方案中,施用可以是支气管(包括通过支气管滴注)、经颊、经肠、真皮内、动脉内、真皮内、胃内、髓内、肌肉内、鼻内、腹膜内、鞘内、静脉内、囊内、经粘膜、经鼻、口服、直肠、皮下、舌下、表面、气管(包括通过气管内滴注)、经皮、阴道或玻璃体施用。
配制物可以通过适于全身施用或者表面或局部施用的方式制备。全身配制物包括设计用于注射(例如肌肉内、静脉内或皮下注射)的配制物或可制备用于经皮、经粘膜或口服施用。配制物一般将包括稀释剂,并且在一些情况下,包括佐剂、缓冲剂、防腐剂等。化合物或其药学上可接受的盐也可以呈脂质体组合物或以微乳液形式施用。
为进行注射,可将配制物制备为常规形式,如液体溶液或悬浮液,或适于在注射之前于液体中制备为溶液或悬浮液的固体形式,或乳液形式。适合赋形剂包括例如水、生理盐水、右旋糖、甘油等。这些组合物也可含有一定量无毒辅助物质,如润湿剂或乳化剂、pH缓冲剂等,如乙酸钠、去水山梨糖醇单月桂酸酯等等。
也已设计出各种持续释放药物系统。参见例如美国专利第5,624,677号。
全身施用也可包括相对无创的方法,如使用栓剂、经皮贴片、经粘膜递送及鼻内施用。口服施用也适于本发明化合物或其药学上可接受的盐。本领域中应了解,适合形式包括糖浆、胶囊和片剂。
本文所描述的每种化合物或其药学上可接受的盐可以通过本领域中已知的多种方式配制。例如,组合疗法中的第一药剂和第二药剂可一起或分开配制。本文也描述组合疗法的其它模式。
个别或分开配制的药剂可一起包装为试剂盒形式。非限制性实例包括但不限于含有例如两粒丸剂、一粒丸剂和散剂、栓剂或在小瓶中的液体、两种表面乳霜等的试剂盒。所述试剂盒可包括有助于将单位剂量施用给受试者的任选使用的组件,如用于使粉末形式复原的小瓶、注射用注射器、定制IV递送系统、吸入器等。另外,单位剂量试剂盒可含有关于所述组合物的制备和施用的说明书。试剂盒可制造为用于一名受试者的一次性单位剂量、用于特定受试者的多次使用(在恒定剂量下,或其中个别化合物或其药学上可接受的盐的效力可随治疗进展而变化);或试剂盒可含有适于施用多名受试者的多次剂量(“整体包装”)。所述试剂盒组件可组装于纸盒、泡罩包装、瓶、管等中。
供口服使用的配制物包括含活性成分与无毒药学上可接受的赋形剂的混合物的片剂。所述赋形剂可以是例如惰性稀释剂或填充剂(例如蔗糖、山梨糖醇、糖、甘露糖醇、微晶纤维素、包括马铃薯淀粉在内的淀粉、碳酸钙、氯化钠、乳糖、磷酸钙、硫酸钙或磷酸钠);制粒剂及崩解剂(例如纤维素衍生物,包括微晶纤维素、包括马铃薯淀粉在内的淀粉、交联羧甲基纤维素钠、海藻酸盐或海藻酸);粘合剂(例如蔗糖、葡萄糖、山梨糖醇、阿拉伯胶、海藻酸、海藻酸钠、明胶、淀粉、预胶化淀粉、微晶纤维素、硅酸镁铝、羧甲基纤维素钠、甲基纤维素、任选被取代的羟丙基甲基纤维素、乙基纤维素、聚乙烯吡咯烷酮或聚乙二醇);及润滑剂、助流剂及抗粘着剂(例如硬脂酸镁、硬脂酸锌、硬脂酸、二氧化硅、氢化植物油或滑石)。其它药学上可接受的赋形剂可以是着色剂、调味剂、塑化剂、保湿剂、缓冲剂等。
两种或更多种化合物可一起混合于片剂、胶囊或其它媒剂中,或可隔开。在一个实施例中,第一化合物是包含在片剂的内侧上,并且第二化合物是在外侧上,由此使该第二化合物的绝大部分在第一化合物释放之前释放。
供口服使用的配制物也可以呈咀嚼片形式提供,或呈硬明胶胶囊形式提供,其中活性成分与惰性固体稀释剂(例如马铃薯淀粉、乳糖、微晶纤维素、碳酸钙、磷酸钙或高岭土)混合;或呈软明胶胶囊形式提供,其中活性成分与水或油介质,例如花生油、液体石蜡或橄榄油混合。粉末、颗粒及细圆粒可使用以上关于片剂和胶囊所提到的成分,以常规方式,使用例如混合器、流体床装置或喷雾干燥设备制备。
溶出或扩散控制性释放可通过适当地包覆化合物的片剂、胶囊、细圆粒或颗粒状配制物,或通过将所述化合物或其药学上可接受的盐并入适当基质中来实现。控制释放包衣可包括一种或多种以上提到的包覆物质,例如虫胶、蜂蜡、糖蜡(glycowax)、蓖麻蜡、巴西棕榈蜡、硬脂醇、单硬脂酸甘油酯、二硬脂酸甘油酯、棕榈硬脂酸甘油酯、乙基纤维素、丙烯酸树脂、dl-聚乳酸、乙酸丁酸纤维素、聚氯乙烯、聚乙酸乙烯酯、乙烯基吡咯烷酮、聚乙烯、聚甲基丙烯酸酯、甲基丙烯酸甲酯、2-任选被取代的羟基甲基丙烯酸酯、甲基丙烯酸酯水凝胶、1,3丁二醇、乙二醇甲基丙烯酸酯或聚乙二醇。在控制释放基质配制物中,基质材料也可包括例如水合甲基纤维素、巴西棕榈蜡和硬脂醇、卡波普(carbopol)934、硅酮、三硬脂酸甘油酯、丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸甲酯、聚氯乙烯、聚乙烯或卤化氟碳化合物。
供口服施用的可并入本发明化合物或其药学上可接受的盐和组合物的液体形式包括水性溶液、适当调味的糖浆、水性或油性悬浮液以及用如棉籽油、芝麻油、椰子油或花生油之类食用油调味的乳液,以及酏剂和类似医药媒剂。
一般而言,当施用给人类时,任何本发明化合物或其药学上可接受的盐的口服剂量将取决于该化合物的性质,并且可容易地由本领域技术人员确定。剂量可以是例如每天约0.001mg至约2000mg、每天约1mg至约1000mg、每天约5mg至约500mg、每天约100mg至约1500mg、每天约500mg至约1500mg、每天约500mg至约2000mg或其中衍生的任何范围。
编号的实施方案
[1]一种化合物或其药学上可接受的盐,具有式I的结构:
Figure BDA0004194083620013931
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是氢、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R34是氢或C1-C3烷基。
[2]如段落[1]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中G是任选被取代的C1-C4亚杂烷基。
[3]如段落[1]或[2]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Ia的结构:
Figure BDA0004194083620013971
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5和Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;并且
R11是氢或C1-C3烷基。
[4]如段落[1]至[3]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X2是NH。
[5]如段落[1]至[4]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X3是CH。
[6]如段落[1]至[5]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R11是氢。
[7]如段落[1]至[5]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R11是C1-C3烷基。
[8]如段落[7]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R11是甲基。
[9]如段落[1]至[6]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Ib的结构:
Figure BDA0004194083620014001
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5及Y6独立地为CH或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基。
[10]如段落[1]至[9]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X1是任选被取代的C1-C2亚烷基。
[11]如段落[10]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中X1是亚甲基。
[12]如段落[1]至[11]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5是氢。
[13]如段落[1]至[11]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5是任选被卤素取代的C1-C4烷基。
[14]如段落[13]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R5是甲基。
[15]如段落[1]至[14]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y4是C。
[16]如段落[1]至[15]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R4是氢。
[17]如段落[1]至[16]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y5是CH。
[18]如段落[1]至[17]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y6是CH。
[19]如段落[1]至[18]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y1是C。
[20]如段落[1]至[19]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y2是C。
[21]如段落[1]至[20]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y3是N。
[22]如段落[1]至[21]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R3不存在。
[23]如段落[1]至[22]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y7是C。
[24]如段落[1]至[6]或[9]至[23]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Ic的结构:
Figure BDA0004194083620014041
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
R10是氢、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基。
[25]如段落[1]至[24]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R6是氢。
[26]如段落[1]至[25]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2是氢、氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至6元杂环烷基。
[27]如段落[26]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2是任选被取代的C1-C6烷基。
[28]如段落[27]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2是乙基。
[29]如段落[1]至[28]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R7是任选被取代的C1-C3烷基。
[30]如段落[29]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R7是C1-C3烷基。
[31]如段落[1]至[30]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R8是任选被取代的C1-C3烷基。
[32]如段落[31]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R8是C1-C3烷基。
[33]如段落[1]至[32]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Id的结构:
Figure BDA0004194083620014071
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基。
[34]如段落[1]至[33]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1是5至10元杂芳基。
[35]如段落[34]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1是任选被取代的6元芳基或任选被取代的6元杂芳基。
[36]如段落[1]至[35]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式Ie的结构:
Figure BDA0004194083620014091
其中A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
Xe及Xf独立地为N或CH;并且
R12是任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基,或任选被取代的3至7元杂环烷基。
[37]如段落[36]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Xe是N,并且Xf是CH。
[38]如段落[36]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Xe是CH,并且Xf是N。
[39]如段落[36]至[38]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R12是任选被取代的C1-C6杂烷基。
[40]如段落[36]至[39]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R12
Figure BDA0004194083620014101
[41]如段落[1]或[2]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式VI的结构:
Figure BDA0004194083620014102
Figure BDA0004194083620014111
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至10元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是氢、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10是氢、卤代、羟基、C1-C3烷氧基或C1-C3烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;
R34是氢或C1-C3烷基;并且
Xe及Xf独立地为N或CH。
[42]如段落[41]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式VIa的结构:
Figure BDA0004194083620014141
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,其包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
Xe及Xf独立地为N或CH;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R21是氢或C1-C3烷基。
[43]如段落[41]或[42]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物具有式VIb的结构:
Figure BDA0004194083620014161
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,其包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
Xe和Xf独立地为N或CH。
[44]如段落[1]至[43]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是任选被取代的6元亚芳基。
[45]如段落[44]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A具有以下结构:
Figure BDA0004194083620014171
其中R13是氢、羟基、氨基、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基。
[46]如段落[45]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R13是氢。
[47]如段落[45]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R13是羟基。
[48]如段落[1]至[47]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中B是-CHR9-。
[49]如段落[48]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9是任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的3至6元环烷基。
[50]如段落[49]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9
Figure BDA0004194083620014172
[51]如段落[50]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9
Figure BDA0004194083620014173
[52]如段落[1]至[47]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中B是任选被取代的6元亚芳基。
[53]如段落[52]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中B是6元亚芳基。
[54]如段落[53]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中B是:
Figure BDA0004194083620014181
[55]如段落[1]至[54]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R7是甲基。
[56]如段落[1]至[55]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R8是甲基。
[57]如段落[1]至[56]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体是式II的结构:
A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-(D1)-(B3)i-(C2)j-(B4)k-A2
式II
其中A1是在所述连接体与B之间的键;A2是在W与所述连接体之间的键;B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S及NRN;RN是氢、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的C1-C7杂烷基;C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基;f、g、h、i、j和k各自独立地为0或1;并且D1是任选被取代的C1-C10亚烷基、任选被取代的C2-C10亚烯基、任选被取代的C2-C10亚炔基、任选被取代的3至14元亚杂环烷基、任选被取代的5至10元亚杂芳基、任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的6至10元亚芳基、任选被取代的C2-C10亚聚乙二醇或任选被取代的C1-C10亚杂烷基,或将A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-连接至-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2的化学键。
[58]如段落[1]至[57]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体是非环状的。
[59]如段落[58]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有式IIa的结构:
Figure BDA0004194083620014191
其中Xa不存在或是N;
R14是不存在、氢或任选被取代的C1-C6烷基;并且
L2是不存在、-SO2-、任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C1-C4亚杂烷基,
其中Xa、R14或L2中的至少一者不存在。
[60]如段落[59]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620014192
Figure BDA0004194083620014201
[61]如段落[1]至[57]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体是或包含环状基团。
[62]如段落[1]至[57]或[61]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有式IIb的结构:
Figure BDA0004194083620014202
其中o是0或1;
R15是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
Cy是任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的3至8元亚杂环烷基、任选被取代的6-10元亚芳基或任选被取代的5至10元亚杂芳基;并且
L3是不存在、-SO2-、任选被取代的C1-C4亚烷基或任选被取代的C1-C4亚杂烷基。
[63]如段落[62]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述连接体具有以下结构:
Figure BDA0004194083620014203
/>
Figure BDA0004194083620014211
/>
Figure BDA0004194083620014221
[64]如段落[1]至[63]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W包含碳化二亚胺。
[65]如段落[64]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W具有式IIIa的结构:
Figure BDA0004194083620014231
其中R14是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[66]如段落[65]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W具有以下结构:
Figure BDA0004194083620014232
/>
Figure BDA0004194083620014241
[67]如段落[1]至[63]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W包含噁唑啉或噻唑啉。
[68]如段落[67]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W具有式IIIb的结构:
Figure BDA0004194083620014242
其中X1是O或S;
X2不存在或是NR19
R15、R16、R17和R18独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基;并且
R19是氢、C(O)(任选被取代的C1-C6烷基)、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[69]如段落[68]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是
Figure BDA0004194083620014251
[70]如段落[1]至[63]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W包含氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯或硫代氨基甲酸氯乙酯。
[71]如段落[70]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W具有式IIIc的结构:
Figure BDA0004194083620014252
其中X3是O或S;
X4是O、S、NR26
R21、R22、R23、R24及R26独立地为氢或任选被取代的C1-C6烷基;并且
R25是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[72]如段落[71]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是
Figure BDA0004194083620014253
[73]如段落[1]至[63]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W包含氮杂环丙烷。
[74]如段落[73]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W具有式IIId1、式IIId2、式IIId3或式IIId4的结构:
Figure BDA0004194083620014261
其中X5不存在或是NR30
Y不存在或是C(O)、C(S)、S(O)、SO2或任选被取代的C1-C3亚烷基;
R27是氢、-C(O)R32、-C(O)OR32、-SO2R33、-SOR33、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R28和R29独立地为氢、CN、C(O)R31、CO2R31、C(O)R31R31、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的3至10元环烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基;
各R31是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R30是氢或任选被取代的C1-C6烷基;并且
R32和R33独立地为氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的6至10元芳基、任选被取代的3至14元杂环烷基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[75]如段落[73]或[74]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是:
Figure BDA0004194083620014271
/>
Figure BDA0004194083620014281
[76]如段落[1]至[63]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W包含环氧化物。
[77]如段落[76]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是
Figure BDA0004194083620014282
[78]一种表1或表2的化合物或其药学上可接受的盐。
[79]一种药物组合物,所述药物组合物包含如段落[1]至[78]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的赋形剂。
[80]一种缀合物或其盐,包含式IV的结构:
M-L-P
式IV
其中L是连接体;
P是单价有机部分;并且
M具有式V的结构:
Figure BDA0004194083620014291
其中虚线表示零、一个、两个、三个或四个不相邻双键;
A是-N(H或CH3)C(O)-(CH2)-,其中氨基氮结合至-CH(R10)-的碳原子;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-或>C=CR9R9’,其中碳结合至-N(R11)C(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
G是任选被取代的C1-C4亚烷基;任选被取代的C1-C4亚烯基;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;-C(O)O-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;-C(O)NH-CH(R6)-,其中C结合至-C(R7R8)-;任选被取代的C1-C4亚杂烷基;或3至8元亚杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
X3是N或CH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R’独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Y1是C、CH或N;
Y2、Y3、Y4和Y7独立地为C或N;
Y5是CH、CH2或N;
Y6是C(O)、CH、CH2或N;
R1是氰基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基,或
R1和R2与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R2是不存在、氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5或6元杂芳基;R3不存在,或
R2和R3与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至14元杂环烷基;
R4是不存在、氢、卤素、氰基或任选被1至3个卤素取代的甲基;
R5是氢、任选被卤素取代的C1-C4烷基、氰基、羟基或C1-C4烷氧基、环丙基或环丁基;
R6是氢或甲基;R7是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基,或
R6和R7与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R8是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7和R8与其所连接的碳原子组合在一起形成C=CR7’R8’;C=N(OH);C=N(O-C1-C3烷基);C=O;C=S;C=NH;任选被取代的3至6元环烷基;或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R7a和R8a独立地为氢、卤代、任选被取代的C1-C3烷基,或与其所连接的碳组合在一起形成羰基;
R7’是氢、卤素或任选被取代的C1-C3烷基;R8’是氢、卤素、羟基、氰基、任选被取代的C1-C3烷氧基、任选被取代的C1-C3烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至8元环烷基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的5至10元杂芳基或任选被取代的6至10元芳基,或
R7’和R8’与其所连接的碳原子组合在一起形成任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R9是氢、F、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基,或
R9和L与其所连接的原子组合在一起形成任选被取代的3至14元杂环烷基;
R9’是氢或任选被取代的C1-C6烷基;
R10a是氢或卤代;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R34是氢或C1-C3烷基。
[81]如段落[80]所述的缀合物或其盐,其中M具有式Vc的结构:
Figure BDA0004194083620014321
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
X1是任选被取代的C1-C2亚烷基、NR、O或S(O)n
X2是O或NH;
n是0、1或2;
R是氢、氰基、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、C(O)R’、C(O)OR’、C(O)N(R’)2、S(O)R’、S(O)2R’或S(O)2N(R’)2
各R独立地为H或任选被取代的C1-C4烷基;
Xe及Xf独立地为N或CH;
R2是C1-C6烷基或3至6元环烷基;
R7是C1-C3烷基;
R8是C1-C3烷基;并且
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;
R11是氢或C1-C3烷基;并且
R34是氢或C1-C3烷基。
在本发明化合物的一些实施方案中,Xe是N,并且Xf是CH。在一些实施方案中,Xe是CH,并且Xf是N。
[82]如段落[80]或[81]所述的缀合物或其盐,其中M具有式Vd的结构:
Figure BDA0004194083620014341
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
B是-CH(R9)-,其中碳结合至-NHC(O)-的羰基碳;任选被取代的3至6元亚环烷基;任选被取代的3至6元亚杂环烷基;任选被取代的6元亚芳基;或5至6元亚杂芳基;
L不存在或为连接体;
W是交联基团,所述基团包含碳化二亚胺、噁唑啉、噻唑啉、氯乙基脲、氯乙基硫脲、氨基甲酸氯乙酯、硫代氨基甲酸氯乙酯、氮杂环丙烷、三氟甲基酮、硼酸、硼酸酯、N-乙氧基羰基-2-乙氧基-1,2-二氢喹啉(EEDQ)、异EEDQ或其它EEDQ衍生物、环氧化物、噁唑鎓或烯糖;
R9是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基或任选被取代的3至7元杂环烷基;并且
Xe和Xf独立地为N或CH。
[83]如段落[80]至[82]中任一个所述的缀合物或其盐,其中所述连接体具有式II的结构:
A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-(D1)-(B3)i-(C2)j-(B4)k-A2
式II
其中A1是在所述连接体与B之间的键;A2是在P与所述连接体之间的键;B1、B2、B3和B4各自独立地选自任选被取代的C1-C2亚烷基、任选被取代的C1-C3亚杂烷基、O、S及NRN;RN是氢、任选被取代的C1-C4烷基、任选被取代的C2-C4烯基、任选被取代的C2-C4炔基、任选被取代的3至14元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的C1-C7杂烷基;C1和C2各自独立地选自羰基、硫羰基、磺酰基或磷酰基;f、g、h、i、j和k各自独立地为0或1;并且D1是任选被取代的C1-C10亚烷基、任选被取代的C2-C10亚烯基、任选被取代的C2-C10亚炔基、任选被取代的3至14元亚杂环烷基、任选被取代的5至10元亚杂芳基、任选被取代的3至8元亚环烷基、任选被取代的6至10元亚芳基、任选被取代的C2-C10亚聚乙二醇或任选被取代的C1-C10亚杂烷基,或将A1-(B1)f-(C1)g-(B2)h-连接至-(B3)i-(C2)j-(B4)k–A2的化学键。
[84]如段落[80]至[83]中任一个所述的缀合物或其盐,其中所述单价有机部分是蛋白质。
[85]如段落[84]所述的缀合物或其盐,其中所述蛋白质是Ras蛋白。
[86]如段落[85]所述的缀合物或其盐,其中所述Ras蛋白是K-Ras G12D或K-RasG13D。
[87]如段落[80]至[86]中任一个所述的缀合物或其盐,其中所述连接体通过与所述单价有机部分的氨基酸残基的羧基的键结合至所述单价有机部分。
实施例
本公开将通过以下实施例和合成实施例进一步说明,所述实施例不应解释为将本公开的范围或精神限制于本文所描述的特定程序。应了解,提供的实施例旨在说明某些实施方案且不打算由此限制本公开的范围。还应了解,也可在不脱离本公开的精神或所附权利要求书的范围的情况下,诉诸于本领域技术人员可想到的各种其它实施方案、其修改和等效物。
化学合成
以下实施例和本文中别处中使用的定义如下:
Figure BDA0004194083620014361
仪器
质谱数据收集是利用带有QDa检测器或SQ检测器2的Shimadzu LCMS-2020或Waters Acquity UPLC进行。将样品以液相注入至C-18反相柱上以移除测定缓冲液并制备用于质谱仪的样品。化合物是使用乙腈梯度自柱洗脱并进给至质量分析仪中。初始数据分析是用Shimadzu LabSolutions或Waters MassLynx进行。NMR数据是用Bruker AVANCE IIIHD 400MHz或Bruker Ascend 500MHz仪器收集,并且原始数据是利用TopSpin或MestrelabMnova进行分析。
合成中间体
中间体1.合成3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇
Figure BDA0004194083620014371
步骤1:合成1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮
在N2气氛下,在0℃下向3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙酰氯(65g,137mmol,粗品)于DCM(120mL)中的混合物中缓慢添加1M SnCl4的DCM溶液(137mL,137mmol)。在0℃下将混合物搅拌30分钟,接着逐滴添加5-溴-1H-吲哚(26.8g,137mmol)于DCM(40mL)中的溶液。在0℃下将混合物搅拌45分钟,接着用EtOAc(300mL)稀释,用盐水(4×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(55g,75%产率)。LCMS(ESI)m/z:C29H32BrNO2SiNa的[M+Na]计算值556.1;实验值556.3。
步骤2:合成1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮
在N2气氛下,在0℃下向1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(50g,93.6mmol)于THF(100mL)中的混合物中添加LiBH4(6.1g,281mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌20小时,接着添加MeOH(10mL)和EtOAc(100mL),并将混合物用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液。将残余物用DCM(50mL)稀释,冷却至10℃并添加二氢吡啶(9.5g,37.4mmol)和TsOH·H2O(890mg,4.7mmol)。在10℃下将混合物搅拌2小时,过滤,减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(41g,84%产率)。LCMS(ESI)m/z:C29H34BrNOSi的[M+H]计算值:519.2;实验值520.1;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.96(s,1H),7.75-7.68(m,5H),7.46-7.35(m,6H),7.23-7.19(m,2H),6.87(d,J=2.1Hz,1H),3.40(s,2H),2.72(s,2H),1.14(s,9H),0.89(s,6H)。
步骤3:合成5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚
在室温下,向1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(1.5g,2.9mmol)和I2(731mg,2.9mmol)于THF(15mL)中的混合物中添加AgOTf(888mg,3.5mmol)。在室温下将混合物搅拌2小时,接着用EtOAc(200mL)稀释并用饱和Na2S2O3(100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚(900mg,72%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.70(s,1H),7.68(d,J=1.3Hz,1H),7.64-7.62(m,4H),7.46-7.43(m,6H),7.24-7.22(d,1H),7.14-7.12(dd,J=8.6,1.6Hz,1H),3.48(s,2H),2.63(s,2H),1.08(s,9H),0.88(s,6H)。
步骤4:合成(1S)-1-(3-溴吡啶-2-基)乙醇
在Ar气氛下,在0℃下向HCOOH(66.3g,1.44mol)于Et3N(1002mL,7.2mol)中的搅拌的混合物中逐份添加(4S,5S)-2-氯-2-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-4,5-二苯基-1,3-二氮杂-2-钌环戊烷异丙基甲苯(3.9g,6.0mmol)。将混合物加热至40℃并搅拌15分钟,接着冷却至室温并分数份添加1-(3-溴吡啶-2-基)乙酮(120g,600mmol)。将混合物加热至40℃并再搅拌2小时,接着减压浓缩溶剂。将盐水(2L)添加至残余物中,将混合物用EtOAc(4×700mL)萃取,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(1S)-1-(3-溴吡啶-2-基)乙醇(100g,74%产率)。LCMS(ESI)m/z:C7H8BrNO的[M+H]计算值:201.98;实验值201.9。
步骤5:合成3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶
在0℃下,向(1S)-1-(3-溴吡啶-2-基)乙醇(100g,495mmol)于DMF(1L)中的搅拌的混合物中分数份添加NaH于油中的60%分散液(14.25g,594mmol)。在0℃下将混合物搅拌1小时。在0℃下逐滴添加MeI(140.5g,990mmol),并使混合物升温至室温,并搅拌2小时。将混合物冷却至0℃并添加饱和NH4Cl(5L)。将混合物用EtOAc(3×1.5L)萃取,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(90g,75%产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H10BrNO的[M+H]计算值:215.99;实验值215.9。
步骤6:合成2-[(1S)-1-甲氧基乙基]-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶
在Ar气氛下,在室温下向3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(90g,417mmol)于甲苯(900mL)中的搅拌的混合物中添加双(频哪醇合)二硼(127g,500mmol)、KOAc(81.8g,833mmol)和Pd(dppf)Cl2(30.5g,41.7mmol)。将混合物加热至100℃并搅拌3小时。减压浓缩滤液,并将残余物通过Al2O3柱色谱法纯化,得到呈半固体状的2-[(1S)-1-甲氧基乙基]-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶(100g,63%产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H22BNO3的[M+H]计算值:264.17;实验值264.1。
步骤7:合成5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚
在Ar气氛下,在室温下向5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚(140g,217mmol)和2-[(1S)-1-甲氧基乙基]-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶(100g,380mmol)于1,4-二噁烷(1.4L)中的搅拌的混合物中分数份添加K2CO3(74.8g,541mmol)、Pd(dppf)Cl2(15.9g,21.7mmol)和H2O(280mL)。将混合物加热至85℃并搅拌4小时,接着冷却,添加H2O(5L)并用EtOAc(3×2L)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚(71g,45%产率)。LCMS(ESI)m/z:C37H43BrN2O2Si的[M+H]计算值:655.23;实验值655.1。
步骤8:合成5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚
在N2气氛下,在0℃下向5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚(71g,108mmol)于DMF(0.8L)中的搅拌的混合物中分数份添加Cs2CO3(70.6g,217mmol)和EtI(33.8g,217mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着添加H2O(4L)并将混合物用EtOAc(3×1.5L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚(66g,80%产率)。LCMS(ESI)m/z:C39H47BrN2O2Si的[M+H]计算值:683.26;实验值683.3。
步骤9:合成3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇
在N2气氛下,在室温下向TBAF(172.6g,660mmol)于THF(660mL)中的搅拌的混合物中分数份添加5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚(66g,97mmol)。将混合物加热至50℃并搅拌16小时,冷却,用H2O(5L)稀释并用EtOAc(3×1.5L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。过滤后,减压浓缩滤液。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(30g,62%产率)。LCMS(ESI)m/z:C23H29BrN2O2的[M+H]计算值:445.14;实验值445.1。
中间体1.经由费舍尔吲哚途径(Fisher Indole Route)进行的替代合成.
Figure BDA0004194083620014411
步骤1:合成5-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-2,2-二甲基-5-氧代戊酸
在N2气氛下,在-10℃下经15分钟向i-PrMgCl的混合物(2M的THF溶液,0.5L)中逐滴添加2.5M n-BuLi的己烷溶液(333mL,833mmol)。在-10℃下将混合物搅拌30分钟,接着在-10℃下,经30分钟逐滴添加于THF(0.5L)中的3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(180g,833mmol)。将所得混合物升温至-5℃并搅拌1小时,接着在-5℃下,经30分钟逐滴添加于THF(1.2L)中的3,3-二甲基噁烷-2,6-二酮(118g,833mmol)。将混合物升温至0℃并搅拌1.5小时,接着在0℃下,通过添加预先冷却的4M HCl的1,4-二噁烷溶液(0.6L)将pH值调至约5来淬灭。在0℃下,将混合物用H2O(3L)稀释并用EtOAc(3×2.5L)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的5-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-2,2-二甲基-5-氧代戊酸(87g,34%产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H21NO4的[M+H]计算值:280.15;实验值280.1。
步骤2:合成3-(5-溴-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸及(S)-3-(5-溴-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯
在N2气氛下,在室温下向5-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-2,2-二甲基-5-氧代戊酸(78g,279mmol)于EtOH(0.78L)中的混合物中分数份添加(4-溴苯基)肼盐酸盐(68.7g,307mmol)。将混合物加热至85℃并搅拌2小时,冷却至室温,接着逐滴添加4M HCl的1,4-二噁烷溶液(69.8mL,279mmol)。将混合物加热至85℃并再搅拌3小时,接着减压浓缩并将残余物溶解于TFA(0.78L)中。将混合物加热至60℃并搅拌1.5小时,减压浓缩并用饱和NaHCO3将残余物调至约pH 5,接着用EtOAc(3×1.5L)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到3-(5-溴-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸及(S)-3-(5-溴-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(78g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C21H23BrN2O3的[M+H]计算值:430.1且C23H27BrN2O3的[M+H]计算值:459.12;实验值431.1(羧酸)和459.1。
步骤3:合成3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯
在N2气氛下,在0℃下向3-(5-溴-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸和(S)-3-(5-溴-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(198g,459mmol)于DMF(1.8L)中的混合物中分数份添加Cs2CO3(449g,1.38mol)。接着,在0℃下逐滴添加于DMF(200mL)中的EtI(215g,1.38mmol)。将混合物升温至室温并搅拌4小时,接着用盐水(5L)稀释并用EtOAc(3×2.5L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(160g,57%产率)。LCMS(ESI)m/z:C25H31BrN2O3的[M+H]计算值:487.17;实验值487.2。
步骤4:合成3-(5-溴-1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇
在N2气氛下,在0℃下向3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(160g,328mmol)于THF(1.6L)中的混合物中添加LiBH4(28.6g,1.3mol)。将混合物加热至60℃,保持16小时,冷却,并用预先冷却(0℃)的NH4Cl水溶液(5L)淬灭。将混合物用EtOAc(3×2L)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-溴-1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇的两种阻转异构体(呈单一阻转异构体形式)(60g,38%产率)和(40g,26%产率)。LCMS(ESI)m/z:C23H29BrN2O2的[M+H]计算值:445.14;实验值445.2。
中间体2和中间体4.合成(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸酯
Figure BDA0004194083620014441
步骤1:合成(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-(三异丙基硅氧基)苯基)-丙酸甲酯
向(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-羟基苯基)丙酸甲酯(10.0g,33.9mmol)于DCM(100mL)中的混合物中添加咪唑(4.6g,67.8mmol)和TIPSCl(7.8g,40.7mmol)。在室温下将混合物搅拌过夜,接着用DCM(200mL)稀释并用H2O(3×150mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-(三异丙基硅氧基)苯基)-丙酸甲酯(15.0g,98%产率)。LCMS(ESI)m/z:C24H41NO5SiNa的[M+Na]计算值:474.22;实验值474.2。
步骤2:合成(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-(三异丙基硅氧基)苯基)-丙酸甲酯
用Ar吹扫(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-(三异丙基硅氧基)苯基)-丙酸甲酯(7.5g,16.6mmol)、PinB2(6.3g,24.9mmol)、[Ir(OMe)(COD)]2(1.1g,1.7mmol)和4-叔丁基-2-(4-叔丁基-2-吡啶基)吡啶(1.3g,5.0mmol)的混合物,接着添加THF(75mL)并将混合物置于Ar气氛下,并密封。将混合物加热至80℃并搅拌16小时,减压浓缩,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-2-(叔丁氧基羰基氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-(三异丙基硅氧基)苯基)-丙酸甲酯(7.5g,78%产率)。LCMS(ESI)m/z:C30H52BNO7SiNa的[M+Na]计算值:600.35;实验值600.4;1HNMR(300MHz,CD3OD)δ7.18(s,1H),7.11(s,1H),6.85(s,1H),4.34(m,1H),3.68(s,3H),3.08(m,1H),2.86(m,1H),1.41-1.20(m,26H),1.20-1.01(m,22H),0.98-0.79(m,4H)。
步骤3:合成(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酸
在0℃下,向(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酸三异丙基硅烷基酯(4.95g,6.9mmol)于MeOH(53mL)中的混合物中添加于H2O(35mL)中的LiOH(840mg,34.4mmol)。在0℃下将混合物搅拌2小时,接着用1M HCl酸化至约pH 5并用EtOAc(2×250mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酸(3.7g,95%产率),该物质不经进一步纯化即直接用于下一步骤。LCMS(ESI)m/z:C29H50BNO7SiNH4的[M+NH4]计算值:581.38;实验值581.4。
步骤4:合成(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯
在0℃下,向(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(6.48g,45.0mmol)于DCM(200mL)中的混合物中添加于DCM(50mL)中的NMM(41.0g,405mmol)、(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酸(24g,42.6mmol),接着添加HOBt(1.21g,9.0mmol)和EDCI盐酸盐(12.9g,67.6mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用DCM(200mL)稀释并用H2O(3×150mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-((三异丙基硅烷基)氧基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(22g,71%产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H60BN3O8Si的[M+H]计算值:690.42;实验值690.5。
中间体3.合成(S)-3-甲基-2-((S)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺基)丁酸叔丁酯
Figure BDA0004194083620014461
步骤1:合成(S)-3-(((S)-1-(叔丁氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
在室温下,向(S)-1-(叔丁氧基羰基)吡咯烷-3-甲酸(2.2g,10.2mmol)于DMF(10mL)中的混合物中添加HATU(7.8g,20.4mmol)和DIPEA(5mL)。在室温下搅拌10分钟后,添加于DMF(10mL)中的甲基-L-缬氨酸叔丁酯(3.8g,20.4mmol)。在室温下将混合物搅拌3小时,接着用DCM(40mL)和H2O(30mL)稀释。分离水层与有机层,并将有机层用H2O(3×30mL)和盐水(30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-3-(((S)-1-(叔丁氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(3.2g,82%产率)。LCMS(ESI)m/z:C20H36N2O5Na的[M+Na]计算值:407.25;实验值407.2。
步骤2:合成(S)-3-甲基-2-((S)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺基)丁酸叔丁酯
在室温下,将(S)-3-(((S)-1-(叔丁氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(3.2g,8.4mmol)于DCM(13mL)和TFA(1.05g,9.2mmol)中的混合物搅拌5小时。减压浓缩混合物,得到呈油状的(S)-3-甲基-2-((S)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺基)丁酸叔丁酯(2.0g,84%产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H28N2O3的[M+H]计算值:285.21;实验值285.2。
中间体5.合成((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯.
Figure BDA0004194083620014471
步骤1:合成(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯
在Ar气氛下,在室温下向3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(30g,67mmol)和(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(55.8g,80.8mmol)于1,4-二噁烷(750mL)中的搅拌的混合物中分数份添加Na2CO3(17.9g,168.4mmol)、Pd(DtBPF)Cl2(4.39g,6.7mmol)和H2O(150mL)。将混合物加热至85℃并搅拌3小时,冷却,用H2O(2L)稀释,并用EtOAc(3×1L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×500mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(50g,72%产率)。LCMS(ESI)m/z:C52H77N5O8Si的[M+H]计算值:928.56;实验值928.8。
步骤2:合成(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸
在室温下,向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(50g,54mmol)于DCE(500mL)中的搅拌的混合物中分数份添加三甲基氢氧化锡(48.7g,269mmol)。将混合物加热至65℃并搅拌16小时,接着过滤并用DCM(3×150mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(70g,粗品),该物质不经进一步纯化即直接用于下一步骤。LCMS(ESI)m/z:C51H75N5O8Si的[M+H]计算值:914.55;实验值914.6。
步骤3:合成((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在N2气氛下,在0℃下向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(70g)于DCM(5L)中的搅拌的混合物中分数份添加DIPEA(400mL,2.3mol)、HOBT(51.7g,383mmol)和EDCI(411g,2.1mol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用DCM(1L)稀释,用盐水(3×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(36g,42%产率)。LCMS(ESI)m/z:C51H73N5O7Si的[M+H]计算值:896.54;实验值896.5。
中间体6.合成((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11-H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯.
Figure BDA0004194083620014501
步骤1:合成3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇
本反应是按下文所述的规模,分五批并行进行。在室温下,向2L圆底烧瓶中添加于THF(1.15L)中的5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚(100g,192mmol)和TBAF(301.4g,1.15mol)。将所得混合物加热至50℃并搅拌16小时,接着将混合物减压浓缩。
在此阶段,将来自全部五个批次的残余物合并,用H2O(5L)稀释,并用EtOAc(3×2L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(310g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C13H16BrNO的[M+H]计算值:282.05及284.05;实验值282.1及284.1。
步骤2:合成乙酸3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯
本反应是根据以下程序,分两批并行进行。在N2气氛下,在0℃下向3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(135g,478mmol)和Et3N(200mL,1.44mol)于DCM(1.3L)中的搅拌的混合物中分数份添加Ac2O(73.3g,718mmol)和DMAP(4.68g,38.3mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌10分钟,接着用H2O(3×2L)洗涤。
在此阶段,将来自两个批次的有机层合并,并用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过柱色谱法纯化,得到呈固体状的乙酸3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(304g,88%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.16-11.11(m,1H),7.69(d,J=2.0Hz,1H),7.32(d,J=8.6Hz,1H),7.19-7.12(m,2H),3.69(s,2H),2.64(s,2H),2.09(s,3H),0.90(s,6H)。
步骤3:合成(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯
本反应是根据以下程序,分四批并行进行。在Ar气氛下,在室温下向2L圆底烧瓶中添加(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸甲酯(125g,216mmol)、1,4-二噁烷(1L)、H2O(200mL)、乙酸3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(73.7g,227mmol)、K2CO3(59.8g,433mmol)和Pd(DtBPF)Cl2(7.05g,10.8mmol)。将所得混合物加热至65℃并搅拌2小时,接着用H2O(10L)稀释并用EtOAc(3×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×2L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液。
此时,将来自四个批次的残余物合并,并通过柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(500g,74%产率)。LCMS(ESI)m/z:C39H58N2O7SiNa的[M+Na]计算值:717.39;实验值717.3。
步骤4:合成(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯
本反应是根据以下程序,分三批并行进行。在氮气气氛下,在0℃下向(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(150g,216mmol)和NaHCO3(21.76g,259mmol)于THF(1.5L)中的搅拌的混合物中逐滴添加于THF中的AgOTf(66.5g,259mmol)。在0℃下,经1小时逐滴添加于THF中的I2(49.3g,194mmol)并在0℃下,将所得混合物再搅拌10分钟。将合并的实验用Na2S2O3水溶液(5L)稀释并用EtOAc(3×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到残余物。
在此阶段,将来自全部三个批次的残余物合并且通过柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(420g,71%产率)。LCMS(ESI)m/z:C39H57IN2O7SiNa的[M+Na]计算值:843.29;实验值842.9。
步骤5:合成(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸甲酯
本反应是根据以下程序,分三批并行进行。在0℃下,向2L圆底烧瓶中添加(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(140g,171mmol)、MeOH(1.4L)和K3PO4(108.6g,512mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着将合并的实验用H2O(9L)稀释并用EtOAc(3×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×2L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液。
在此阶段,将来自全部三个批次的残余物合并,得到呈固体状的(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸甲酯(438g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C37H55IN2O6SiNa的[M+Na]计算值:801.28;实验值801.6。
步骤6:合成(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸
本反应是根据以下程序,分三批并行进行。在0℃下,向(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸甲酯(146g,188mmol)于THF(1.46L)中的搅拌的混合物中逐滴添加于H2O(937mL)中的LiOH(22.45g,937mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌1.5小时[注意:LCMS显示有15%脱TIPS产物]。用1M HCl(1M)将混合物酸化至pH5并将合并的实验用EtOAc(3×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×2L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液。
在此阶段,将来自全部三个批次的残余物合并,得到呈固体状的(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸(402g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C36H53IN2O6SiNa的[M+Na]计算值:787.26;实验值787.6。
步骤7:合成(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯
在0℃下,向(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酸(340g,445mmol)和(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(96.1g,667mmol)于DCM(3.5L)中的搅拌的混合物中逐份添加NMM(225g,2.2mol)、EDCI(170g,889mmol)和HOBt(12.0g,88.9mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用H2O(3×2.5L)和盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过柱色谱法纯化,得到呈油状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(310g,62%产率)。LCMS(ESI)m/z:C42H63IN4O7Si的[M+H]计算值:891.36;实验值890.8。
步骤8:合成(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸
本反应是根据以下程序,分三批并行进行。在N2气氛下,在0℃下向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(85.0g,95.4mmol)于THF(850mL)中的搅拌的混合物中逐滴添加于H2O(410mL)中的LiOH(6.85g,286mmol)。在0℃下将混合物搅拌1.5小时[注意:LCMS显示有15%脱TIPS产物],接着用1MHCl酸化至pH 5。
在此阶段,将来自全部三个批次的混合物合并,并用EtOAc(3×2L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(240g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C41H61IN4O7Si的[M+H]计算值:877.35;实验值877.6。
步骤9:合成((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11-H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
本反应是根据以下程序,分两批并行进行。在N2气氛下,在0℃下向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-5-[(三异丙基硅烷基)氧基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(120g,137mmol)于DCM(6L)中的搅拌的混合物中分数份添加DIPEA(357mL,2.05mol)、EDCI(394g,2.05mol)和HOBT(37g,274mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜。
在此阶段,将来自两个批次的溶液合并,并用H2O(3×6L)和盐水(2×6L)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11-H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(140g,50%产率)。LCMS(ESI)m/z:C41H59IN4O6Si的[M+H]计算值:859.33;实验值858.3。
中间体7.合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
Figure BDA0004194083620014551
步骤1:合成4-(甲氧基甲基)-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶
在Ar气氛下,在室温下向3-溴-4-(甲氧基甲基)吡啶(1.0g,5.0mmol)、4,4,5,5-四甲基-2-(四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(1.51g,5.9mmol)和KOAc(1.21g,12.3mmol)于甲苯(10mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2(362mg,0.5mmol)。将混合物加热至110℃并搅拌过夜,接着减压浓缩,得到4-(甲氧基甲基)-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶,该物质不经进一步纯化即直接用于下一步骤。LCMS(ESI)m/z:C13H20BNO3的[M+H]计算值:250.16;实验值250.3。
步骤2:合成((63S,4S)-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11-H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在Ar气氛下,在室温下向4-(甲氧基甲基)-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶(290mg,1.16mmol)、K3PO4(371mg,1.75mmol)和((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11-H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(500mg,0.58mmol)于1,4-二噁烷(5mL)和H2O(1mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2(43mg,0.06mmol)。将混合物加热至70℃并搅拌2小时,接着添加H2O并将混合物用EtOAc(2×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈泡沫状的((63S,4S)-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11-H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(370mg,74%产率)。LCMS(ESI)m/z:C48H67N5O7Si的[M+H]计算值:854.49;实验值854.6。
步骤3:合成((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11-H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在35℃下,将((63S,4S)-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11-H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(350mg,0.41mmol)、Cs2CO3(267mg,0.82mmol)和EtI(128mg,0.82mmol)于DMF(4mL)中的混合物搅拌过夜。添加H2O并将混合物用EtOAc(2×15mL)萃取。将合并的有机层用盐水(15mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11-H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(350mg,97%产率)。LCMS(ESI)m/z:C50H71N5O7Si的[M+H]计算值:882.52;实验值882.6。
步骤4:合成((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在Ar气氛下,在0℃下将((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11-H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(350mg,0.4mmol)和1MTBAF的THF溶液(0.48mL,0.480mmol)于THF(3mL)中的混合物搅拌1小时。将混合物减压浓缩,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(230mg,80%产率)。LCMS(ESI)m/z:C41H51N5O7的[M+H]计算值:726.39;实验值726.6。
步骤5:合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
在Ar气氛下,在0℃下向N-[(8S,14S)-22-乙基-4-羟基-21-[4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基]-18,18-二甲基-9,15-二氧代-16-氧杂-10,22,28-三氮杂五环[18.5.2.1^[2,6].1^[10,14].0^[23,27]]二十九碳-1(26),2,4,6(29),20,23(27),24-七烯-8-基]氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.28mmol)于1,4-二噁烷(2mL)中的混合物中添加4M HCl的1,4-二噁烷溶液(2mL,8mmol)。使混合物升温至室温并搅拌过夜,接着减压浓缩,得到(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(200mg)。LCMS(ESI)m/z:C36H43N5O5的[M+H]计算值:626.34;实验值626.5。
中间体8.合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
Figure BDA0004194083620014591
步骤1:合成(S)-3-(3-溴苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸甲酯
在室温下,向(2S)-3-(3-溴苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸(100g,290mmol)于DMF(1L)中的溶液中添加NaHCO3(48.8g,581.1mmol)和MeI(61.9g,435.8mmol)。将反应混合物搅拌16小时,接着用H2O(1L)淬灭并用EtOAc(3×1L)萃取。将合并的有机层用盐水(3×500mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(13% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(109g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C15H20BrNO4的[M+Na]计算值:380.05;实验值380.0。
步骤2:合成(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯基)丙酸甲酯
向(2S)-3-(3-溴苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(108g,301.5mmol)和双(频哪醇合)二硼(99.53g,391.93mmol)于1,4-二噁烷(3.2L)中的搅拌的溶液中添加KOAc(73.97g,753.70mmol)和Pd(dppf)Cl2(22.06g,30.15mmol)。将反应混合物加热至90℃,保持3小时,接着冷却至室温,并用EtOAc(2×3L)萃取。将合并的有机层用盐水(3×800mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(5% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(96g,78.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C21H32BNO6的[M+Na]计算值:428.22;实验值428.1。
步骤3:合成(S)-3-(3-(3-(3-乙酰氧基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸甲酯
向(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)苯基]丙酸甲酯(94g,231.9mmol)和乙酸3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(75.19g,231.93mmol)于1,4-二噁烷(1.5L)和H2O(300mL)中的混合物中添加K2CO3(64.11g,463.85mmol)和Pd(DtBPF)Cl2(15.12g,23.19mmol)。将反应混合物加热至70℃并搅拌4小时。将反应混合物用EtOAc(2×2L)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×600mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(20% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(130g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C30H38N2O6的[M+H]计算值:523.28;实验值523.1。
步骤4:合成(S)-3-(3-(3-(3-乙酰氧基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸甲酯
在-10℃下,向(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚-5-基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(95.0g,181.8mmol)和碘(36.91g,145.41mmol)于THF(1L)中的溶液中添加AgOTf(70.0g,272.7mmol)和NaHCO3(22.9g,272.65mmol)。将反应混合物搅拌30分钟,接着通过在0℃下添加饱和Na2S2O3(100mL)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×1L)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×500mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(49.3g,41.8%产率)。LCMS(ESI)m/z:C30H37IN2O6的[M+H]计算值:649.18;实验值649.1。
步骤5:合成(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酸
向(2S)-3-(3-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚-5-基]苯基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(60g,92.5mmol)于THF(600mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(19.41g,462.5mmol)于H2O(460mL)中的溶液。将所得溶液搅拌过夜,接着用HCl(1M)将pH值调至6。将所得溶液用EtOAc(2×500mL)萃取,并将合并的有机层用饱和盐水(2×500mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(45g,82.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C27H33IN2O5的[M+Na]计算值:615.13;实验值615.1。
步骤6:合成(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯
向(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]苯基]丙酸(30g,50.6mmol)和(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(10.9g,75.9mmol)于DCM(400mL)中的溶液中添加NMM(40.97g,405.08mmol)、HOBT(2.05g,15.19mmol)和EDCI(19.41g,101.27mmol)。将反应混合物搅拌过夜,接着将混合物用饱和NH4Cl(2×200mL)和饱和盐水(2×200mL)洗涤,并将混合物经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(14g,38.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H43IN4O6的[M+H]计算值:718.23;实验值719.4。
步骤7:合成(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸
在0℃下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(92g,128.0mmol)于THF(920mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(26.86g,640.10mmol)于H2O(640mL)中的溶液。将反应混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到所需产物(90g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C32H41IN4O6的[M+H]计算值:705.22;实验值705.1)。
步骤8:合成((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[3-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]苯基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(90g,127.73mmol)于DCM(10L)中的溶液中添加HOBt(34.52g,255.46mmol)、DIPEA(330.17g,2554.62mmol)和EDCI(367.29g,1915.96mmol)。将反应混合物搅拌16小时,接着减压浓缩。将混合物用DCM(2×2L)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×1L)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(70g,79.8%产率)。LCMS(ESI)m/z:C32H39IN4O5的[M+H]计算值:687.21;实验值687.1。
步骤9:合成((63S,4S)-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
向((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(22.0g,32.0mmol)于甲苯(300.0mL)中的溶液中添加Pd2(dba)3(3.52g,3.85mmol)、S-Phos(3.95g,9.61mmol)和KOAc(9.43g,96.13mmol),随后逐滴添加4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(26.66g,208.3mmol)。将所得溶液加热至60℃并搅拌3小时。接着,将反应混合物冷却至室温,过滤,用EtOAc洗涤滤饼,并减压浓缩滤液。将残余物通过正相色谱法纯化,得到呈固体状的所需产物(22g,90%产率)。LCMS(ESI)m/z:C38H51BN4O7的[M+H]计算值:687.39;实验值687.3。
步骤10:合成((63S,4S)-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在60℃下,向((63S,4S)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-12-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(3.0g,4.37mmol)和3-溴-4-(甲氧基甲基)吡啶(1.766g,8.74mmol)于二噁烷/H2O(5/1)中的混合物中添加K2CO3(2.415g,17.48mmol)和Pd(DTBPF)Cl2(0.5695g,0.874mmol)。将反应混合物搅拌4小时。将反应混合物冷却至室温并用EtOAc(300mL)萃取。将溶液用盐水(3×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈固体状的所需产物(1.96g,65.8%产率)。LCMS(ESI)m/z:C39H47N5O6的[M+H]计算值:682.36;实验值682.7。
步骤11:合成((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
向((63S,4S)-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.96g,2.88mmol)和碘乙烷(0.347mL,4.31mmol)于DMF(20.0mL)中的溶液中添加Cs2CO3(2.342g,7.19mmol)。在室温下将所得混合物搅拌5小时,接着用EtOAc(200mL)稀释。将混合物用H2O(3×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈固体状的所需产物(1.24g,61%产率)。LCMS(ESI)m/z:C41H51N5O6的[M+H]计算值:710.39;实验值710.7。
步骤12:合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
在0℃下,向((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.09g,1.54mmol)于DCM(1.5mL)中的溶液中添加TFA(1.50mL)。将反应混合物搅拌1小时,减压浓缩,接着使其与甲苯(3×20mL)共沸,得到呈固体状的所需粗产物(1.09g)。LCMS(ESI)m/z:C36H43N5O4的[M+H]计算值:610.34;实验值610.4。
中间体9.合成((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0004194083620014641
步骤1:合成((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
向((63S,4S)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(13g,18.93mmol)和2-[(1S)-1-甲氧基乙基]-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶(14.95g,56.8mmol)于二噁烷(130mL)和H2O(26mL)中的溶液中添加K2CO3(5.23g,37.9mmol)和Pd(dppf)Cl2(1.39g,1.89mmol)。在70℃下将反应混合物搅拌4小时。将混合物冷却至室温,过滤,并用EtOAc(3×100mL)洗涤。将滤液用盐水(2×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(10% MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(21g,85.3%产率)。LCMS(ESI)m/z:C40H49N5O6的[M+H]计算值:696.38;实验值696.4。
步骤2:合成((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向((63S,4S)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(20g,28.7mmol)和Cs2CO3(18.7g,57.5mmol)于DMF(150mL)中的溶液中添加碘乙烷(13.45g,86.22mmol)于DMF(50mL)中的溶液。在35℃下将所得混合物搅拌过夜,接着用H2O(500mL)稀释。将混合物用EtOAc(2×300mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(10%→50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(4.23g,18.8%产率)和阻转异构体(5.78g,25.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C42H53N5O6的[M+H]计算值:724.41;实验值724.4。
中间体10.合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺
Figure BDA0004194083620014661
步骤1:合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
在0℃下,将((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(880mg,1.2mmol)、DCM(10mL)和TFA(5mL)的混合物搅拌30分钟。将混合物减压浓缩,得到所需产物,该产物不经进一步纯化即直接用于下一步骤。LCMS(ESI)m/z:C45H63N5O5Si的[M+H]计算值:782.47;实验值782.7。
步骤2:合成((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(880mg,1.13mmol)和N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(521mg,2.3mmol)于DMF(8.8mL)中的混合物中添加DIPEA(1.95mL,11.3mmol)和COMU(88mg,0.21mmol)。在0℃下将混合物搅拌30分钟,接着用H2O(100mL)稀释并用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,并过滤。减压浓缩滤液,并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的所需产物(1g,89%产率)。LCMS(ESI)m/z:C56H82N6O8Si的[M+H]计算值:995.61;实验值995.5。
步骤3:合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺
将((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(1.0g,1.0mmol)、DCM(10mL)和TFA(5mL)的混合物搅拌30分钟。将混合物减压浓缩并用饱和NaHCO3将残余物碱化至约pH 8,接着用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液,得到呈固体状的所需产物(880mg,98%产率)。LCMS(ESI)m/z:C51H74N6O6Si的[M+H]计算值:895.55;实验值895.5。
中间体11.合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(N-甲基-2-(甲基氨基)乙酰胺基)丁酰胺
Figure BDA0004194083620014681
步骤1:合成N-(N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向甲基-L-缬氨酸甲酯盐酸盐(2.0g,11.01mmol)和N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基甘氨酸(3.12g,16.51mmol)于DMF(60.0mL)中的溶液中添加DIPEA(9.58mL,55.01mmol)和HATU(8.37g,22.02mmol)。将反应混合物搅拌过夜,接着用H2O(100mL)淬灭。将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(40→60% MeCN/H2O)纯化,得到呈油状的所需产物(2.9g,83%产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H28N2O5的[M+H]计算值:317.21;实验值317.4。
步骤2:合成N-(N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸
向N-(N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(3.70g,11.69mmol)于THF(37.0mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(1.96g,46.71mmol)于H2O(47.0mL)中的溶液。将反应混合物搅拌4小时,接着添加1M HCl,直至将pH值调至5。将所得溶液用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(60→60%MeCN/H2O)纯化,得到呈固体状的所需产物(1.47g,41.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H26N2O5的[M+H]计算值:303.19;实验值303.4。
步骤3:合成(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(300.0mg,0.384mmol)和N-(N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸(173.9mg,0.575mmol)于DMF(3.0mL)中的溶液中添加DIPEA(0.534mL,3.069mmol)和PyBOP(399.2mg,0.767mmol)。将反应混合物搅拌2小时,接着用H2O(30mL)稀释。将所得混合物用EtOAc(3×20mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(25%EtOAc/石油醚)纯化,得到呈固体状的所需产物(300mg,73%产率)。LCMS(ESI)m/z:C59H87N7O9Si的[M+H]计算值:1066.64;实验值1067.4。
步骤4:合成(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(355.0mg)于THF(4.0mL)中的溶液中添加TBAF(1.0mL)。将反应混合物搅拌1小时,接着减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(25% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈固体状的所需产物(280mg,92%产率)。LCMS(ESI)m/z:C50H67N7O9的[M+H]计算值:910.51;实验值911.0。
步骤5:合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(N-甲基-2-(甲基氨基)乙酰胺基)丁酰胺
在0℃下,向(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(150.0mg,0.165mmol)于DCM(2.0mL)中的溶液中添加TFA(0.70mL)。将反应混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的所需粗产物(150mg)。LCMS(ESI)m/z:C45H59N7O7的[M+H]计算值:810.46;实验值810.4。
中间体12.合成(3S)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺
Figure BDA0004194083620014711
步骤1:合成(S)-3-(((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸苯甲酯
在0℃下,向甲基-L-缬氨酸甲酯盐酸盐(2.0g,13.8mmol)和(S)-1-((苯甲氧基)羰基)吡咯烷-3-甲酸(4.12mg,16.5mmol)于DMF(20.0mL)中的溶液中添加DIPEA(12mL,68.870mmol)。将反应混合物搅拌0.5小时,接着添加HATU(7.856mg,20.66mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌1小时。接着,将反应混合物用EtOAc(800mL)稀释并用饱和NH4Cl(500mL)和盐水(3×350mL)洗涤。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(0→80% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈油状的所需产物(3.8g,73%产率)。LCMS(ESI)m/z:C20H28N2O5的[M+H]计算值:377.21;实验值377.2。
步骤2:合成N-((S)-1-((苯甲氧基)羰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸
向(S)-3-(((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸苯甲酯(1.125g,2.99mmol)于MeOH(10.0mL)中的溶液中添加LiOH(180.0mg,7.52mmol)于H2O(2mL)中的溶液。将反应混合物搅拌4小时,接着用饱和NH4Cl水溶液淬灭。将混合物用EtOAc(3×60mL)萃取,并将合并的有机层减压浓缩,得到所需产物。LCMS(ESI)m/z:C19H26N2O5的[M+H]计算值:363.19;实验值363.2。
步骤3:合成((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.70g,1.93mmol)于THF(20mL)中的溶液中添加TBAF(755.7mg,2.89mmol)。将反应混合物搅拌2小时,接着用H2O(200mL)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×200mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×200mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(17% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈固体状的所需产物(1.1g,70%产率)。LCMS(ESI)m/z:C41H51N5O7的[M+H]计算值:726.39;实验值726.7。
步骤4:合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
在0℃下,向((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(500.0mg,0.689mmol)于DCM(10.0mL)中的溶液中添加TFA(0.527mL,6.888mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的所需粗产物(500mg)。LCMS(ESI)m/z:C36H43N5O5的[M+H]计算值:626.34;实验值626.4。
步骤5:合成(3S)-3-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸苯甲酯
在0℃下,向N-((S)-1-((苯甲氧基)羰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(676.4mg,6.31mmol)于MeCN(10.0mL)中的溶液中添加COMU(432.5mg,1.01mmol)。将反应混合物搅拌5分钟,随后添加(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(395.0mg,0.631mmol)。将反应混合物升温至室温并搅拌20小时。接着,将混合物减压浓缩,溶解于EtOAc(100mL)中,并用盐水(3×5mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法纯化,得到粗固体(0.81g),接着将该粗固体通过反相色谱法(MeCN/H2O)纯化,得到呈固体状的所需产物(174mg,29%产率)。LCMS(ESI)m/z:C55H67N7O9的[M+H]计算值:970.51;实验值970.8。
步骤6:合成(3S)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺
向(3S)-3-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸苯甲酯(174.0mg,0.179mmol)于MeOH(20.0mL)中的溶液中添加Pd/C(87.0mg,0.08mmol),随后添加2% HCl水溶液(一滴)。在H2气氛(1atm)下,在室温下将反应混合物搅拌14小时,此时,将反应混合物用N2吹扫,过滤,并减压浓缩,得到呈固体状的粗产物(130mg,86.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C47H61N7O7的[M+H]计算值:836.47;实验值836.5。
中间体13.合成(2S)-2-(3-氨基-N-甲基丙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620014741
步骤1:合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺
在0℃下,向((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(212.4mg,212μmol)于DCM(500μL)中的溶液中添加TFA(500μL,6.52mmol)。2小时后,将反应物用DCM(10mL)和H2O(10mL)稀释,接着添加饱和NaHCO3水溶液,直至溶液为pH 9。将水层用DCM(10mL)萃取,并将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到粗产物(194mg,103%产率)。LCMS(ESI)m/z:C51H74N6O6Si的[Μ+H]计算值:895.55;实验值895.7。
步骤2:合成(3-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸叔丁酯
向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(150mg,167μmol)、COMU(88.5mg,206μmol)及3-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(39.6mg,209μmol)于MeCN(1.66mL)中的混合物中添加2,6-二甲基吡啶(77.7μL,668μmol)。将反应在室温下搅拌18小时,接着在55℃下搅拌1小时。将反应混合物冷却至室温并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(20→60%MeCN/H2O)纯化,得到产物(132mg,67%产率)。LCMS(ESI)m/z:C59H87N7O9Si的[Μ+H]计算值:1066.64;实验值1066.7。
步骤3:合成(2S)-2-(3-氨基-N-甲基丙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
在0℃下,向(3-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-3-氧代丙基)氨基甲酸叔丁酯(120mg,112μmol)于DCM(560μL)中的溶液中添加TFA(560μL,7.30mmol)。40分钟后,将反应物用DCM(10mL)稀释,接着添加饱和NaHCO3水溶液。将有机层经Na2SO4干燥,过滤,接着减压浓缩,得到产物(106mg,98%产率),该产物不经纯化即用于下一步骤中。LCMS(ESI)m/z:C54H79N7O7Si的[Μ+H]计算值:966.59;实验值966.8。
中间体14.合成(2S)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-(甲基氨基)乙酰胺
Figure BDA0004194083620014761
步骤1:合成((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(18.0g,20.1mmol)于THF(180mL)中的搅拌的溶液中添加1M TBAF的THF溶液(24.1mL,24.1mmol)。在0℃下将混合物搅拌1小时,接着用盐水(1.5L)稀释,并用EtOAc(3×1L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×500mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法纯化,得到所需产物(11.5g,69%产率)。LCMS(ESI)m/z:C42H53N5O7的[M+H]计算值:740.40;实验值740.4。
步骤2:合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
在0℃下,向((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(11.5g,15.5mmol)于DCM(120mL)中的搅拌的溶液中添加TFA(60mL,808mmol)。在0℃下将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,并将残余物再与甲苯(3×20mL)一起减压浓缩,得到所需粗产物(12g)。LCMS(ESI)m/z:C37H45N5O5的[M+H]计算值:640.35;实验值640.6。
步骤3:合成((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(400.0mg,0.63mmol)于DMF(4.0mL)中的搅拌的溶液中添加DIPEA(1.09mL,6.25mmol)和(S)-2-(((苯甲氧基)羰基)(甲基)氨基)-2-环戊基乙酸(255.0mg,0.88mmol),随后添加COMU(347.8mg,0.81mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌1小时,接着用H2O(40mL)稀释。将水层用EtOAc(3×15mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(25%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(510mg,80%产率)。LCMS(ESI)m/z:C53H64N6O8的[M+H]计算值:913.49;实验值913.6。
步骤4:合成(2S)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-(甲基氨基)乙酰胺
向((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯(480.0mg,0.53mmol)于MeOH(25mL)中的搅拌的溶液中添加Pd/C(200.0mg,1.88mmol)。将所得混合物置放于H2气氛(1atm)下并搅拌2小时。将混合物过滤,用MeOH(3×10mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液。得到所需粗产物(440mg)。LCMS(ESI)m/z:C45H58N6O6的[M+H]计算值:779.45;实验值779.4。
中间体15.合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(N-甲基-3-(甲基氨基)丙酰胺基)丁酰胺
Figure BDA0004194083620014781
步骤1:合成N-(3-((叔丁氧基羰基)(甲基)氨基)丙酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向甲基-L-缬氨酸甲酯盐酸盐(1.0g,6.89mmol)于DMF(20.0mL)中的溶液中添加DIPEA(5.92mL,0.034mmol)、3-((叔丁氧基羰基)(甲基)氨基)丙酸(2.10g,0.010mmol)和COMU(3.54g,8.27mmol)。将所得混合物搅拌30分钟,接着用H2O(20mL)淬灭。将水层用EtOAc(3×20mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(0→100% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(2g,87.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C16H30N2O5的[M+H]计算值:331.22;实验值331.2。
步骤2:合成N-(3-((叔丁氧基羰基)(甲基)氨基)丙酰基)-N-甲基-L-缬氨酸
向N-(3-((叔丁氧基羰基)(甲基)氨基)丙酰基)-N-甲基-L-缬氨酸酯(1.0g,3.03mmol)于THF(20.0mL)和H2O(4.0mL)中的溶液中添加LiOH(0.14g,6.05mmol)。在室温下将所得混合物搅拌3小时。用HCl(1N)将混合物酸化至pH 3,接着用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需粗产物(800mg,83.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H28N2O5的[M+H]计算值:317.21;实验值317.2。
步骤3:合成(3-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-3-氧代丙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(600.0mg,0.96mmol)于DMF(6.0mL)中的溶液中添加DIPEA(1.67mL,9.59mmol)、N-(3-((叔丁氧基羰基)(甲基)氨基)丙酰基)-N-甲基-L-缬氨酸(455.1mg,1.44mmol)和COMU(492.5mg,1.15mmol)。将所得混合物搅拌30分钟,接着用H2O(60mL)淬灭。将水层用EtOAc(3×60mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×60mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(0→100% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(650mg,73.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C51H69N7O9的[M+H]计算值:924.52;实验值924.6。
步骤4:合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(N-甲基-3-(甲基氨基)丙酰胺基)丁酰胺
在0℃下,向(3-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-3-氧代丙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(650.0mg)于DCM(7.0mL)中的溶液中添加TFA(3.5mL)。将所得混合物搅拌30分钟,接着减压浓缩。将所得残余物用甲苯(3×10mL)稀释并减压浓缩,得到所需粗产物。LCMS(ESI)m/z:C46H61N7O7的[M+H]计算值:824.47;实验值824.6。
中间体16.合成(2S)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-(N-甲基-2-(甲基氨基)乙酰胺基)乙酰胺
Figure BDA0004194083620014801
步骤1:合成(2-(((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向(2S)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-(甲基氨基)乙酰胺(300.0mg,0.385mmol)、DIPEA(0.657mL,3.851mmol)和N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基甘氨酸(109.30mg,0.578)于DMF(3.0mL)中的混合物中添加HATU(175.72mg,0.462mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌30分钟,接着用H2O(30mL)稀释。将所得混合物用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×30mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过制备型TLC(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(300mg,82.0%产率)。LCMS(ESI)m/z:C53H71N7O9的[M+H]计算值:950.54;实验值950.4。
步骤2:合成(2S)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-(N-甲基-2-(甲基氨基)乙酰胺基)乙酰胺
在0℃下,向(2-(((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(300.0mg,0.316mmol)于DCM(3.0mL)中的混合物中添加TFA(1.50mL)。在0℃下将所得混合物搅拌30分钟,接着减压浓缩,得到所需粗产物。LCMS(ESI)m/z:C48H63N7O7的[M+H]计算值:850.49;实验值850.5。
中间体17.合成(2R,5R)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N,5-二甲基吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0004194083620014821
步骤1:合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
在0℃下,向((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(20.0g,22.315mmol)于DCM(150.0mL)中的溶液中添加TFA(50.0mL)。将所得混合物升温至室温并搅拌2小时,接着减压浓缩。将残余物溶解于EtOAc(100mL)中并用饱和NaHCO3水溶液将溶液中和至pH 8。将溶液用EtOAc(3×150mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(17.86g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C46H65N5O5Si的[M+H]计算值:796.49;实验值795.5
步骤2:合成((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯
在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(17.86g,22.433mmol)和(2S)-2-[[(苯甲氧基)羰基](甲基)氨基]-3-甲基丁酸(8.93g,33.65mmol)于DMF(150.0mL)中的溶液中添加DIPEA(19.5mL,112.17mmol)和HATU(17.06g,44.87mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌2小时。将反应混合物冷却至0℃并通过添加H2O(500mL)淬灭。将混合物用EtOAc(3×150mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(200mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(25% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(19.0g,81.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C60H82N6O8Si的[M+H]计算值:1043.61;实验值1042.6
步骤3:合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺
向((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯(1.20g,1.150mmol)于MeOH(1.2mL)和甲苯(1.2mL)中的溶液中添加Pd/C(10%,240mg)。将所得混合物置放于H2气氛(1atm)下并搅拌过夜。将混合物过滤并减压浓缩,得到所需产物(1.05g,97.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C52H76N6O6Si的[M+H]计算值:909.57;实验值909.3。
步骤4:合成(2R,5R)-2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-5-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
在0℃下,向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(500mg,0.550mmol)于DMF(5mL)中的溶液中添加DIPEA(0.94mL,5.499mmol)和(2R,5R)-1-(叔丁氧基羰基)-5-甲基吡咯烷-2-甲酸(504.29mg,2.199mmol),随后分数份添加HATU(627.23mg,1.650mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌1小时。通过反相色谱法(0→100%MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(147mg,22.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C63H93N7O9Si的[M+H]计算值:1120.69;实验值1120.6。
步骤5:合成(2R,5R)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N,5-二甲基吡咯烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2R,5R)-2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-5-甲基吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(150.0mg,0.134mmol)于DCM中的溶液中逐滴添加TFA(1.50mL,13.155mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌2小时,接着用饱和NaHCO3碱化至pH 8。将所得混合物用EtOAc(3×5mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×5mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(85mg,54.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C58H85N7O7Si的[M+H]计算值:1020.64;实验值1020.4。
中间体18.合成(2R)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-i-甲基吡咯烷-2-甲酰胺
Figure BDA0004194083620014851
步骤1:合成(叔丁氧基羰基)-D-脯氨酸
在0℃下,向D-脯氨酸(5.0g,43.43mmol)于1,4-二噁烷(50mL)和饱和NaHCO3(50mL)中的溶液中分数份添加Boc2O(14.217g,65.143mmol)。在室温下将所得混合物搅拌2小时,接着用EtOAc(100mL)萃取。用HCl将水层酸化至pH 6,接着萃取至EtOAc(3×100mL)中。将合并的有机层用H2O(2×100mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物,该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C10H17NO4的[M-H]计算值:214.11;实验值214.0。
步骤2:合成(2R)-2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(142.03mg,0.660mmol)于DMF中的溶液中添加DIPEA(0.710mL,5.499mmol),随后分数份添加HATU(250.89mg,0.660mmol)。将所得混合物加热至40℃并搅拌2小时。通过反相色谱法(0→100% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(350mg,54.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C62H91N7O9Si的[M+H]计算值:1106.67;实验值1106.8。
步骤3:合成(2R)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-i-甲基吡咯烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2R)-2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(350.0mg,0.325mmol)于DCM(4mL)中的溶液中添加TFA(2.0mL)。在0℃下将所得混合物搅拌30分钟,接着减压浓缩。将残余物溶解于甲苯(5mL)中,接着减压浓缩三次,得到所需产物,该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C57H83N7O7Si的[M+H]计算值:1006.62;实验值1006.4。
中间体19.合成(2R)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基氮杂环丁烷-2-甲酰胺
Figure BDA0004194083620014871
步骤1:合成(2R)-2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯
在0℃下,向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(1.0g,1.10mmol)、(R)-1-(叔丁氧基羰基)氮杂环丁烷-2-甲酸(0.33g,1.650mmol)和HATU(1.25g,3.299mmol)于MeCN(20mL)中的混合物中添加DIPEA(0.94mL,5.499mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌3小时,接着减压浓缩。通过制备型TLC(10% MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(800mg,59.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C61H89N7O9Si的[M+H]计算值:1092.65;实验值1092.6。
步骤2:合成(2R)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基氮杂环丁烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2R)-2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(400.0mg,0.366mmol)于DCM(8.0mL)中的混合物中添加TFA(4.0mL)。当反应完成时,将混合物减压浓缩,得到所需产物(400mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C56H81N7O7Si的[M+H]计算值:992.61;实验值992.4。
中间体20.合成N-(仲丁基)-5-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-10,10-二甲基-4-((S)-3-甲基-2-(N-甲基-2-(甲基氨基)乙酰胺基)丁酰胺基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-N-甲基烟酰胺
Figure BDA0004194083620014881
步骤1:合成5-溴-N-(仲丁基)-N-甲基烟酰胺
在0℃下,向5-溴烟酸(2.0g,9.901mmol)和HATU(5.65g,14.851mmol)于DMF(40mL)中的溶液中添加DIPEA(5.2mL 9.9mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌30分钟,接着添加N-甲基丁-2-胺(0.91g,10.396mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌过夜,接着用H2O(40mL)稀释。将混合物用EtOAc(3×30mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.96g,73.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C11H15BrN2O的[M+H]计算值:271.04;实验值271.1。
步骤2:合成((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
向5-溴-N-(仲丁基)-N-甲基烟酰胺(800.0mg,2.95mmol)和K3PO3(1.565g,7.376mmol)于1,4-二噁烷(30.0mL)和H2O(6.0mL)中的溶液中添加((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-12-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(2.81g,3.540mmol)和Pd(dppf)Cl2(215.87mg,0.295mmol)。将所得混合物加热至85℃并搅拌3小时。接着,将混合物冷却至室温,用H2O淬灭,并用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用H2O(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(10% MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(2.2g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C50H60N6O7的[M+H]计算值:857.46;实验值857.5。
步骤3:合成((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
向((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(2.10g,2.450mmol)和Cs2CO3(2.39g,7.351mmol)于DMF(20.0mL)中的溶液中添加碘乙烷(0.57g,3.675mmol)。在室温下将所得混合物搅拌3小时,接着用H2O(200mL)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(10% MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(800mg,36.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C52H64N6O7的[M+H]计算值:885.49;实验值885.5。
步骤4:合成((63S,4S)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-11-乙基-25-羟基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
向((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(770.0mg,0.870mmol)于tert-BuOH(20.0mL)中的溶液中添加Pd(OH)2/C(24.42mg,0.174mmol)。在氢气气氛(1atm)下,在50℃下将所得悬浮液搅拌过夜。接着,将混合物冷却至室温,过滤,并将滤饼用MeOH(3×30mL)洗涤。减压浓缩滤液,得到所需产物(810mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C45H58N6O7的[M+H]计算值:795.44;实验值795.5。
步骤5:合成((63S,4S)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
向((63S,4S)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-11-乙基-25-羟基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(800.0mg,1.0mmol)和DIPEA(0.876mL,5.031mmol)于MeCN(10.0mL)中的溶液中添加氯三(丙-2-基)硅烷(291.02mg,1.509mmol)。将所得混合物搅拌3小时,接着用H2O淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用H2O(3×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(10%MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(800mg,83.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C54H78N6O7Si的[M+H]计算值:951.58;实验值950.8。
步骤6:合成5-((63S,4S)-4-氨基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-N-(仲丁基)-N-甲基烟酰胺
在0℃下,向((63S,4S)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(720.0mg,0.757mmol)于DCM(10.0mL)中的溶液中添加TFA(3.0mL,40.4mmol)。将所得混合物搅拌2小时,接着减压浓缩。将残余物冷却至0℃并用饱和NaHCO3水溶液中和。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用H2O(3×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(540mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C49H70N6O5Si的[M+H]计算值:851.53;实验值851.8。
步骤7:合成((2S)-1-(((63S,4S)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯
向5-((63S,4S)-4-氨基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-N-(仲丁基)-N-甲基烟酰胺(530.0mg,0.623mmol)和N-((苯甲氧基)羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(198.23mg,0.747mmol)于DMF(10.0mL)中的溶液中添加HATU(473.49mg,1.245mmol)和DIPEA(0.542mL,3.113mmol)。将所得混合物搅拌2小时,接着用H2O淬灭,并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用H2O(3×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(10% MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(720mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C63H87N7O8Si的[M+H]计算值:1098.65;实验值1098.7。
步骤8:合成N-(仲丁基)-5-((63S,4S)-11-乙基-10,10-二甲基-4-((S)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺基)-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-N-甲基烟酰胺
向((2S)-1-(((63S,4S)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯(670.0mg,0.610mmol)于甲苯(10.0mL)和MeOH(1.0mL)中的溶液中添加Pd/C(12.98mg,0.122mmol)。在氢气气氛(1atm)下,将悬浮液搅拌过夜,接着过滤,并用MeOH(3×50mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到所需产物(600mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C55H81N7O6Si的[M+H]计算值:964.61;实验值964.8。
步骤9:合成(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯
向N-(仲丁基)-5-((63S,4S)-11-乙基-10,10-二甲基-4-((S)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺基)-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-N-甲基烟酰胺(490.0mg,0.508mmol)和N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基甘氨酸(114.4mg,0.610mmol)于DMF(10.0mL)中的溶液中添加HATU(386.39mg,1.016mmol)和DIPEA(0.443mL,2.540mmol)。将所得混合物搅拌2小时,接着用H2O淬灭,并用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层用H2O(3×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(560mg,79.3%产率)。LCMS(ESI)m/z:C63H94N8O9Si的[M+H]计算值:1135.70;实验值1136.3。
步骤10:合成(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-11-乙基-25-羟基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯
向(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(540.0mg,0.476mmol)于DMF(10.0mL)中的溶液中添加CsF(288.94mg,1.90mmol)。将所得混合物搅拌2小时,接着用H2O淬灭,并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用H2O(3×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(10% MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(430mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C54H74N8O9的[M+H]计算值:979.57;实验值980.0。
步骤11:合成N-(仲丁基)-5-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-10,10-二甲基-4-((S)-3-甲基-2-(N-甲基-2-(甲基氨基)乙酰胺基)丁酰胺基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-N-甲基烟酰胺
在0℃下,向(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-12-(5-(仲丁基(甲基)氨甲酰基)吡啶-3-基)-11-乙基-25-羟基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(400.0mg,0.408mmol)于DCM(10.0mL)中的溶液中添加TFA(3.0mL,40.4mmol)。将反应搅拌1小时,接着用饱和NaHCO3水溶液淬灭。将混合物用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用H2O(3×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(380mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C49H66N8O7的[M+H]计算值:879.51;实验值879.5。
中间体21.合成(2S)-2-(2-氨基-N-甲基乙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620014941
步骤1:合成(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)氨基甲酸苯甲酯
在0℃下,向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(2.50g,2.75mmol)和((苯甲氧基)羰基)甘氨酸(690mg,3.30mmol)于DMF(25mL)中的溶液中添加HATU(2.10g,5.50mmol),随后添加DIPEA(1.5mL,8.25mmol)。将反应混合物搅拌2小时,接着用H2O淬灭,并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用H2O(3×10mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(50% EtOAC/己烷)纯化,得到所需产物(2.0g,72%产率)。LCMS(ESI)m/z:C62H85N7O9Si的[M+H]计算值:1100.63;实验值1100.7。
步骤2:合成(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)氨基甲酸苯甲酯
在0℃下,向(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)氨基甲酸苯甲酯(400mg,0.36mmol)于DMF中的溶液中添加CsF(220mg,1.5mmol)。将反应混合物搅拌2小时,接着用H2O淬灭,并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用H2O(3×10mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(300mg,87%产率)。LCMS(ESI)m/z:C53H65N7O9的[M+H]计算值:944.49;实验值944.4。
步骤3:合成(2S)-2-(2-氨基-N-甲基乙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
向(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)氨基甲酸苯甲酯(300mg,0.32mmol)于甲苯(10mL)和MeOH(1mL)中的溶液中添加Pd/C(50mg,0.47mmol)。在氢气气氛(1atm)下,将悬浮液搅拌过夜。接着,将反应混合物过滤并用EtOAc(3×10mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到所需产物(180mg,43%产率)。LCMS(ESI)m/z:C45H59N7O7的[M+H]计算值:810.46;实验值810.5。
中间体22.(3S,4R)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N,4-二甲基吡咯烷-3-甲酰胺
Figure BDA0004194083620014961
步骤1:合成(R)-3-(丁-2-炔酰基)-4-苯基噁唑烷-2-酮
在-78℃下,向2-丁炔酸(5.0g,59.47mmol)于THF(100mL)中的溶液中添加新戊酰氯(7.39g,61.26mmol)和Et3N(6.2mL,61.85mmol),接着将混合物搅拌15分钟,接着升温至0℃并搅拌45分钟。在另一个烧瓶中,在-78℃下向(4R)-4-苯基-1,3-噁唑烷-2-酮(9.70g,59.47mmol)于THF(100mL)中的溶液中添加n-BuLi(2.5M于己烷中,25mL,62.5mmol)。在-78℃下将混合物搅拌15分钟,接着将其添加至初始混合物中。将合并的溶液升温至室温并搅拌过夜。将反应溶液用饱和NH4Cl(200mL)淬灭,接着将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(200mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(20%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(6.0g,44.0%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H11NO3的[M+H]计算值:230.08;实验值229.9。
步骤2:合成(R,Z)-3-(丁-2-烯酰基)-4-苯基噁唑烷-2-酮
在0℃下,向(R)-3-(丁-2-炔酰基)-4-苯基噁唑烷-2-酮(6.0g,26.17mmol)于吡啶(6.0mL)和甲苯(60.0mL)中的溶液中添加林德拉钯催化剂(Lindlar Pd catalyst)(594.57mg,2.88mmol)。在氢气气氛(1atm)下,在0℃下将所得混合物搅拌30分钟。将混合物过滤,并用甲苯(10.0mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到所需产物(5.5g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C13H13NO3的[M+H]计算值:232.10;实验值231.9。
步骤3:(R)-3-((3S,4R)-1-苯甲基-4-甲基吡咯烷-3-羰基)-4-苯基噁唑烷-2-酮
在0℃下,向(R,Z)-3-(丁-2-烯酰基)-4-苯基噁唑烷-2-酮(3.0g,12.97mmol)和苯甲基(甲氧基甲基)[(三甲基硅烷基)甲基]胺(3.70g,15.57mmol)于甲苯(20.0mL)中的溶液中添加TFA(1.30mL,0.87mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌过夜。接着,将混合物减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(20% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(2g,42.3%产率)。LCMS(ESI)m/z:C22H24N2O3的[M+H]计算值:365.19;实验值365.2。
步骤4:合成(3S,4R)-1-苯甲基-4-甲基吡咯烷-3-甲酸
在0℃下,将LiOH●H2O(0.16g,6.860mmol)和H2O2(0.13g,3.76mmol)于H2O(5mL)中的溶液添加至(R)-3-((3S,4R)-1-苯甲基-4-甲基吡咯烷-3-羰基)-4-苯基噁唑烷-2-酮(1.0g,2.74mmol)于THF(15.0mL)中的溶液中。将所得混合物搅拌2小时,接着用H2O(30mL)和亚硫酸钠(0.69g,5.48mmol)淬灭,并将溶液用EtOAc(2×50mL)萃取。用NaH2PO4·H2O和10% HCl将水相调至pH 4,并添加盐水。将溶液用i-PrOH/DCM(1:3,5×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(40mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(400mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO2的[M+H]计算值:220.14;实验值220.2。
步骤5:合成(3S,4R)-1-苯甲基-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N,4-二甲基吡咯烷-3-甲酰胺
在0℃下,向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(414.67mg,0.456mmol)和(3S,4R)-1-苯甲基-4-甲基吡咯烷-3-甲酸(200.0mg,0.912mmol)于DMF(5.0mL)中的混合物中添加HATU(693.58mg,1.824mmol)和DIPEA(0.794mL,4.560mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌2小时。通过添加饱和NH4Cl水溶液(40mL)淬灭反应,接着用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(9%MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(350mg,34.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C65H91N7O7Si的[M+H]计算值:1110.68;实验值1110.9。
步骤6:(3S,4R)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N,4-二甲基吡咯烷-3-甲酰胺
向(3S,4R)-1-苯甲基-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N,4-二甲基吡咯烷-3-甲酰胺(300.0mg,0.270mmol)于t-BuOH(10.0mL)中的溶液中添加Pd/C(60.08mg,0.565mmol)。在氢气气氛(1atm)下,将所得悬浮液搅拌过夜。接着,将混合物过滤,用MeOH(2×5mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液,得到所需产物(280mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C58H85N7O7Si的[M+H]计算值:1020.64;实验值1020.8。
中间体23.合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-((S)-N-甲基-2-(甲基氨基)丙酰胺基)丁酰胺
Figure BDA0004194083620014991
步骤1:合成((2S)-1-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-1-氧代丙-2-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(500.0mg,0.55mmol)、DIPEA(480mL,2.75mmol)和(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)(甲基)氨基]丙酸(167.63mg,0.825mmol)于DMF(5.0mL)中的溶液中添加HATU(271.80mg,0.715mmol)。将混合物升温至室温并搅拌4小时。接着,用H2O淬灭反应并用EtOAc(2×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(550mg,91.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C61H91N7O9Si的[M+H]计算值:1094.67;实验值1094.5。
步骤2:合成((2S)-1-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-1-氧代丙-2-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向((2S)-1-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-1-氧代丙-2-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(540mg,0.493mmol)于THF(5.0mL)中的溶液中添加TBAF(1M于THF中,0.59mL,0.592mmol)。将混合物升温至室温并搅拌30分钟。用H2O淬灭反应,接着用EtOAc(2×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,过滤后,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(20% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(320mg,69.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C52H71N7O9的[M+H]计算值:938.534;实验值938.4。
步骤3:合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-((S)-N-甲基-2-(甲基氨基)丙酰胺基)丁酰胺
在0℃下,向((2S)-1-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-1-氧代丙-2-基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(300.0mg,0.320mmol)于DCM(3.0mL)中的溶液中添加TFA(1.0mL)。将混合物升温至室温并搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到所需产物(300mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C47H63N7O7的[M+H]计算值:838.49;实验值838.4。
中间体24.合成((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0004194083620015021
步骤1:合成(S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸
在室温下,向(2S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(110g,301.2mmol)于THF(500mL)和H2O(200mL)中的溶液中添加LiOH(21.64g,903.6mmol)。将所得溶液搅拌1小时,接着减压浓缩。用1M HCl将所得残余物调至pH 6,接着用DCM(3×500mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(108g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C11H15BrN2O4S的[M+H]计算值:351.00;实验值351.0。
步骤2:合成(S)-1-((S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯
在0℃下,向(S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(70g,199.3mmol)于DCM(500mL)中的溶液中添加(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯双(三氟乙酸)盐(111.28g,298.96mmol)、NMM(219.12mL.1993.0mmol)、EDCI(76.41g,398.6mmol)和HOBt(5.39g,39.89mmol)。将所得溶液升温至室温并搅拌1小时。接着用H2O(500mL)淬灭反应并用EtOAc(3×500mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(0→50%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(88.1g,92.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C17H25BrN4O5S的[M+H]计算值:477.08;实验值477.1。
步骤3:合成(S)-3-(1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇
在室温下,向3-(5-溴-1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(60g,134.7mmol)于甲苯(500mL)中的溶液中添加双(频哪醇合)二硼(51.31g,202.1mmol)、Pd(dppf)Cl2(9.86g,13.48mmol)和KOAc(26.44g,269.4mmol)。接着,将反应混合物加热至90℃并搅拌2小时。接着,将反应溶液冷却至室温并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(60.6g,94.0%产率)。LCMS(ESI)m/z:C29H41BN2O4的[M+H]计算值:493.32;实验值493.3。
步骤4:合成(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯
在室温下,向(S)-3-(1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(30g,60.9mmol)于甲苯(600mL)、二噁烷(200mL)和H2O(200mL)中的溶液中添加(S)-1-((S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(43.62g,91.4mmol)、K3PO4(32.23g,152.3mmol)和Pd(dppf)Cl2(8.91g,12.18mmol)。将所得溶液加热至70℃并搅拌过夜。接着,将反应混合物冷却至室温并用H2O(200mL)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×1000mL)萃取,并将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(0→90% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(39.7g,85.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C40H54N6O7S的[M+H]计算值:763.39;实验值763.3。
步骤5:合成(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸
在室温下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(39.7g,52.0mmol)于THF(400mL)和H2O(100mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(3.74g,156.2mmol)。将所得混合物搅拌1.5小时,接着减压浓缩。用1M HCl将残余物酸化至pH 6并用DCM(3×1000mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(37.9g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C39H52N6O7S的[M+H]计算值:749.37;实验值749.4。
步骤6:合成((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(37.9g,50.6mmol)、HOBt(34.19g,253.0mmol)和DIPEA(264.4mL,1518mmol)于DCM(4L)中的溶液中添加EDCI(271.63g,1416.9mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌过夜。接着,将反应混合物用H2O淬灭并用1M HCl(4×1L)洗涤。分离有机层并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(0→70% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(30g,81.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C39H50N6O6S的[M+H]计算值:731.36;实验值731.3。
中间体25.合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(1-甲基哌啶-4-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
Figure BDA0004194083620015051
步骤1:合成(S)-5-溴-6-(1-甲氧基乙基)-3',6'-二氢-[3,4'-联吡啶]-1'(2'H)-甲酸苯甲酯
向(S)-3-溴-5-碘-2-(1-甲氧基乙基)吡啶(6.0g,17.55mmol)和4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸苯甲酯(7.23g,21.05mmol)于二噁烷(70mL)和H2O(14mL)中的溶液中添加K2CO3(6.06g,43.86mmol)和Pd(dppf)Cl2(1.28g,1.76mmol)。将反应混合物加热至60℃并搅拌3小时。将混合物用H2O(50mL)稀释,接着萃取至EtOAc(3×100mL)中。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,通过硅胶柱色谱法(25% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(7.1g,94%产率)。LCMS(ESI)m/z:C21H23BrN2O3的[M+H]计算值:431.10;实验值431.1。
步骤2:合成((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-12-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
向((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(5.0g,6.31mmol)、Pd2(dba)3(690mg,757μmol)、S-Phos(0.78g,1.89mmol)和KOAc(2.17g,22.08mmol)于甲苯(75mL)中的溶液中添加4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(5.65g,44.15mmol)。将反应混合物加热至60℃并搅拌3小时。在0℃下,用H2O淬灭反应,接着萃取至EtOAc(3×100mL)中。将合并的有机层用盐水(3×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(4.5g,90%产率)。LCMS(ESI)m/z:C75H57BN4O8的[M+H]计算值:793.43;实验值793.4。
步骤3:合成5-((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)-3',6'-二氢-[3,4'-联吡啶]-1'(2'H)-甲酸苯甲酯
向((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-12-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(4.0g,5.05mmol)和(S)-5-溴-6-(1-甲氧基乙基)-3',6'-二氢-[3,4'-联吡啶]-1'(2'H)-甲酸苯甲酯(2.61g,6.06mmol)于二噁烷(50mL)和H2O(10mL)中的溶液中添加K2CO3(1.74g,12.6mmol)和Pd(dtbpf)Cl2(330mg,505μmol)。将反应混合物加热至70℃。3小时后,将反应物用H2O(40mL)稀释并萃取至EtOAc(3×100mL)中。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(4.1g,80%产率)。LCMS(ESI)m/z:C60H68N6O9的[M+H]计算值:1017.51;实验值1017.4。
步骤4:合成5-((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)-3',6'-二氢-[3,4'-联吡啶]-1'(2'H)-甲酸苯甲酯
在0℃下,向5-((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)-3',6'-二氢-[3,4'-联吡啶]-1'(2'H)-甲酸苯甲酯(4.0g,3.93mmol)和Cs2CO3(3.84g,11.80mmol)于DMF(30mL)中的溶液中添加碘乙烷(2.45g,15.73mmol)。将反应混合物升温至室温。3小时后,将反应混合物用H2O(100mL)稀释并萃取至EtOAc(3×200mL)中。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(66% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.4g,34%产率)。LCMS(ESI)m/z:C62H72N6O9的[M+H]计算值:1045.54;实验值1045.5。
步骤5:合成((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(1-甲基哌啶-4-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在H2气氛下,在室温下将5-((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)-3',6'-二氢-[3,4'-联吡啶]-1'(2'H)-甲酸苯甲酯(1.29g,1.23mmol)和Pd/C(700mg)于MeOH(30mL)中的溶液搅拌72小时。接着,将反应混合物过滤,用MeOH(3×50mL)洗涤。减压浓缩滤液,得到所需产物(850mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C48H64N6O7的[M+H]计算值:837.49;实验值837.7。
步骤6:合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(1-甲基哌啶-4-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
在0℃下,向((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(1-甲基哌啶-4-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(840mg,1.00mmol)于DCM(10mL)中的溶液中添加TFA(3.0mL,40.4mmol)。将反应混合物升温至室温。2小时后,将反应物冷却至0℃,用饱和NaHCO3淬灭,并萃取至EtOAc(3×50mL)中。将合并的有机层用盐水(2×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到产物(670mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C43H56N6O5的[M+H]计算值:737.44;实验值737.3。
中间体26.合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
Figure BDA0004194083620015091
步骤1:合成(S)-(5-溴-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)硼酸
在75℃下,向(S)-3-溴-2-(1-甲氧基乙基)吡啶(40g,185mmol)和双(频哪醇合)二硼(70.5g,278mmol)于THF(1.6L)中的溶液中添加4,4'-二叔丁基-2,2'-联吡啶(7.45g,27.7mmol)和[Ir(cod)Cl]2(1.24mg,1.85mmol)。16小时后,将混合物减压浓缩并将残余物用H2O(1L)稀释。将水层用DCM/MeOH(2L,5:1)萃取,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(10→50% MeCN/H2O,0.1% HCO2H)纯化后,将合并的产物洗脱份部分地减压浓缩。将水层用DCM/MeOH(3000mL,5:1)萃取,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(35.0g,65.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H11BBrNO3的[M+Na]计算值:282.00;实验值281.1。
步骤2:合成(S)-3-溴-5-碘-2-(1-甲氧基乙基)吡啶
向(S)-(5-溴-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)硼酸(35.0g,135mmol)于MeCN(100mL)中的溶液中添加N-碘代琥珀酰亚胺(60.6g,269mmol)。将所得反应混合物搅拌过夜,接着减压浓缩。通过正相色谱法(10% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(40.0g,78.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H9BrINO的[M+H]计算值:341.90;实验值341.8。
步骤3:合成(S)-4-(5-溴-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
向(S)-3-溴-5-碘-2-(1-甲氧基乙基)吡啶(7.0g,20.5mmol)和哌嗪-1-甲酸苯甲酯(9.0g,40.8mmol)于甲苯(70mL)中的溶液中添加Pd2(dba)3(375mg,0.409mmol)、Xantphos(1.18g,2.05mmol)和叔丁醇钠(2.29g,24.6mmol)。将所得混合物加热至120℃并搅拌16小时,接着冷却至室温并减压浓缩。通过正相色谱法(25% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(5.0g,50.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C20H24BrN3O3的[M+H]计算值:434.11;实验值434.0。
步骤4:合成4-(5-((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
向(S)-4-(5-溴-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(3.29g,7.56mmol)和((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-12-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(50g,6.31mmol)于二噁烷(40mL)和H2O(10mL)中的溶液中添加K2CO3(1.74g,12.614mmol)和Pd(dtbpf)Cl2(822mg,1.26mmol),并将所得混合物加热至80℃,保持2小时。接着,将反应混合物减压浓缩并用H2O(1L)稀释。将水层用EtOAc(3×200mL)萃取,并将合并的有机层用H2O洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(5.0g,73.8%产率)。LCMS(ESI)m/z:C59H69N7O9的[M+H]计算值:1020.54;实验值1020.6。
步骤5:合成4-(5-((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
在0℃下,向4-(5-((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(5.0g,5mmol)于DMF(50mL)中的搅拌的溶液中添加Cs2CO3(3.19g,9.80mmol)和碘乙烷(1.53g,10mmol)。在室温下,将所得混合物搅拌2小时,接着用H2O(200mL)稀释。将水层用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用H2O洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(33%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.8g,35%产率)。LCMS(ESI)m/z:C61H73N7O9的[M+H]计算值:1048.56;实验值1048.4。
步骤6:合成((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
向4-(5-((63S,4S)-25-(苯甲氧基)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.80g,1.72mmol)于MeOH(20mL)中的搅拌的溶液中添加Pd/C(900mg)。在氢气气氛下,在室温下将所得混合物搅拌2小时,过滤,并用MeOH洗涤滤饼。减压浓缩滤液。得到所需粗产物,该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C46H61N7O7的[M+H]计算值:824.47;实验值824.3。
步骤7:合成((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(590mg,0.716mmol)和HCHO(129mg,1.43mmol,37wt%于H2O中)于MeOH(6ml)中的搅拌的溶液中添加CH3COOH(122mg,2.02mmol)和NaBH3CN(85.3mg,1.35mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌2小时。接着,将反应混合物减压浓缩并用H2O(100mL)稀释。将水层用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用H2O洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩,得到所需粗产物,该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C47H63N7O9的[M+H]计算值:838.49;实验值838.4。
步骤8:合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
在0℃下,向((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(590mg,0.704mmol)于DCM(6mL)中的搅拌的溶液中添加TFA(3.0mL)。将所得混合物搅拌30分钟,接着减压浓缩,得到所需粗产物,该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C42H55N7O5的[M+H]计算值:738.44;实验值738.4。
中间体27.合成(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮
Figure BDA0004194083620015131
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步骤1:合成(S)-4-(5-溴-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
向用惰性氩气氛吹扫并维持的3L 3颈圆底烧瓶中放入4-[5-溴-6-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(135g,310.821mmol)、双(频哪醇合)二硼(86.82g,341.903mmol)、Pd(dppf)Cl2(22.74g,31.082mmol)、KOAc(76.26g,777.052mmol)和甲苯(1L)。在油浴中,在90℃下将所得溶液搅拌2天。将反应混合物冷却至室温。将所得混合物减压浓缩。将残余物通过中性氧化铝柱色谱法(25%EtOAc/己烷)纯化,得到所需产物(167g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C26H36BN3O5的[M+H]计算值:481.3;实验值482.1。
步骤2:合成(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
向用惰性氩气氛吹扫并维持的3L 3颈圆底烧瓶中放入(S)-4-(6-(1-甲氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸酯(167g,346.905mmol)、5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚(224.27g,346.905mmol)、Pd(dppf)Cl2(25.38g,34.69mmol)、二噁烷(600mL)、H2O(200mL)、K3PO4(184.09g,867.262mmol)和甲苯(200mL)。在油浴中,在70℃下将所得溶液搅拌过夜。反应完成后,将反应混合物冷却至室温。将所得混合物减压浓缩。将残余物通过正相柱色谱法(50% EtOAc/己烷)纯化,得到所需产物(146g,48.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C49H57BrN4O4Si的[M+H]计算值:872.3;实验值873.3。
步骤3:合成(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-乙基-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
在N2气氛下,在0℃下向(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(146g,167.047mmol)和Cs2CO3(163.28g,501.14mmol)于DMF(1200mL)中的搅拌的混合物中分数份添加C2H5I(52.11g,334.093mmol)。在室温下将最终反应混合物搅拌12小时。将所得混合物用EtOAc(1L)稀释并用盐水(3×1.5L)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液,得到所需产物(143g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C51H61BrN4O4Si的[M+H]计算值:900.4;实验值901.4。
步骤4:合成(S)-4-(5-(5-溴-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
向(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-乙基-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(143g,158.526mmol)于DMF(1250mL)中的搅拌的混合物中添加CsF(72.24g,475.578mmol)。在60℃下,在N2气氛下将反应混合物搅拌2天。将所得混合物用EtOAc(1L)稀释并用盐水(3×1L)洗涤。将有机层减压浓缩,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到(S)-4-(5-(5-溴-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯的两种阻转异构体A(38g,36%产率,RT=1.677分钟于3分钟LCMS(0.1% FA)中)和B(34g,34%产率,RT=1.578分钟于3分钟LCMS(0.1% FA)中)。LCMS(ESI)m/z:C35H43BrN4O4的[M+H]计算值:663.2;实验值662.2。
步骤5:合成(S)-4-(5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
向用惰性氮气气氛吹扫并维持的500mL 3颈圆底烧瓶放入(S)-4-(5-(5-溴-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯A(14g,21.095mmol)、双(频哪醇合)二硼(5.89g,23.205mmol)、Pd(dppf)Cl2(1.54g,2.11mmol)、KOAc(5.18g,52.738mmol)和甲苯(150mL)。在油浴中,在90℃下将所得溶液搅拌5小时。接着,将反应混合物冷却至室温。将所得混合物减压浓缩,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到所需产物(12g,76.0%产率)。LCMS(ESI)m/z:C41H55BN4O6的[M+H]计算值:710.4;实验值711.3。
步骤6:合成(S)-1-((S)-3-(4-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯
向用惰性氩气氛吹扫并维持的250mL圆底烧瓶中放入(S)-4-(5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(10.8g,15.196mmol)、(3S)-1-[(2S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(7.98g,16.716mmol)、Pd(dtbpf)Cl2(0.99g,1.52mmol)、K3PO4(8.06g,37.99mmol)、甲苯(60mL)、二噁烷(20mL)和H2O(20mL)。在油浴中,在70℃下将所得溶液搅拌3小时。接着,将反应混合物冷却至室温。将所得溶液用EtOAc(2×50mL)萃取并减压浓缩。将残余物通过正相柱色谱法纯化,得到所需产物(8g,50.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C52H68N8O9S的[M+H]计算值:980.5;实验值980.9。
步骤7:合成(S)-1-((S)-3-(4-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸
在N2气氛下,向(S)-1-((S)-3-(4-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(12g,12.230mmol)于THF(100mL)和H2O(100mL)中的搅拌的混合物中添加LiOH(2.45g,61.148mmol)并在室温下将所得混合物搅拌2小时。将所得混合物减压浓缩并在0℃下,用HCl(1N)将水相的pH值酸化至5。将水层用DCM(3×100mL)萃取。将有机层减压浓缩,得到所需产物(10g,84.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C51H66N8O9S的[M+H]计算值:966.5;实验值967.0。
步骤8:合成4-(5-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯
向用惰性氮气气氛吹扫并维持的3L圆底烧瓶中放入(S)-1-((S)-3-(4-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(18g,18.61mmol)、MeCN(1.8L)、DIPEA(96.21g,744.417mmol)、EDCI(107.03g,558.313mmol)、HOBT(25.15g,186.104mmol)。在室温下将所得溶液搅拌过夜。将所得混合物减压浓缩。反应完成后,将所得溶液用DCM(1L)稀释并用HCl(3×1L,1N水溶液)洗涤。将所得混合物用H2O(3×1L)洗涤,接着浓缩有机层。将残余物通过正相柱色谱法(50%EtOAc/己烷)纯化,得到所需产物(10.4g,54.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C51H64N8O8S的[M+H]计算值:948.5;实验值949.3。
步骤9:合成((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
向用惰性氮气气氛吹扫并维持的250-mL圆底烧瓶中放入4-(5-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(10.40g,10.957mmol)、Pd(OH)2/C(5g,46.984mmol)和MeOH(100mL)。在2atm H2气氛下,在室温下将所得溶液搅拌3小时。过滤出固体并用MeOH(3×100mL)洗涤滤饼。将合并的有机相减压浓缩,得到所需产物(8.5g,90.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C43H58N8O6S的[M+H]计算值:814.4;实验值815.3。
步骤10:合成((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
向用惰性氮气气氛吹扫并维持的1000mL圆底烧瓶中放入((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(8.5g,10.429mmol)、MeOH(100mL)、AcOH(1.88g,31.286mmol)并搅拌15分钟。接着,在室温下添加HCHO(1.88g,23.15mmol,37%水溶液)和NaBH3CN(788mg,12.5mmol)。将所得溶液搅拌3小时。将所得混合物用H2O(100mL)淬灭并减压浓缩以移除MeOH。将所得溶液用DCM(300mL)稀释并用H2O(3×100mL)洗涤。将有机层减压浓缩,得到所需产物(8.2g,90.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C44H60N8O6S的[M+H]计算值:828.4;实验值829.3。
步骤10:合成(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮
向用惰性氮气气氛吹扫并维持的250mL圆底烧瓶中放入((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(8.20g,9.891mmol)和二噁烷(40mL),随后在0℃下添加HCl的1,4-二噁烷溶液(4M,40mL)。在0℃下将所得溶液搅拌1小时。接着,将混合物减压浓缩。将所得溶液用DCM(600mL)和饱和NaHCO3水溶液(400mL)稀释。接着,将有机层用盐水(500mL)洗涤两次。将有机层减压浓缩,得到所需产物(7.2g,94.9%产率)。
中间体28.合成(63S,4S)-4-氨基-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
Figure BDA0004194083620015191
步骤1:合成(S)-3-(3-溴-5-(二氟甲基)苯基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸甲酯
在室温下,向1000mL 3颈圆底烧瓶中添加于DMF(400mL)中的Zn粉(43.42g,663.835mmol)和I2(1.30g,5.106mmol)。向以上混合物中添加(2R)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-碘丙酸甲酯(36.42g,110.64mmol)于DMF(10mL)中的溶液。将混合物加热至30℃,保持10分钟。接着,在室温下向混合物中逐滴添加(2R)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-碘丙酸甲酯(72.83g,221.28mmol)于DMF(20mL)中的溶液。将所得混合物搅拌30分钟。将所得混合物过滤并在氩气氛下,在室温下将溶液添加至1-溴-3-(二氟甲基)-5-碘苯(85.0g,255.321mmol)、三(呋喃-2-基)磷烷(3.56g,15.319mmol)和Pd2(dba)3(4.68g,5.106mmol)于DMF(400mL)的混合物中。将反应混合物加热至60℃,保持10分钟,接着将其自油浴取出并搅拌1小时,直至所得混合物的温度冷却至50℃。用NH4Cl水溶液(3000mL)淬灭反应并将水层用EtOAc(3×1000mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1000mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(9% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(59g,56.6%产率)。
步骤2:合成(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酸甲酯
在70℃下,将(2S)-3-[3-溴-5-(二氟甲基)苯基]-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(90.0g,220.459mmol)、(S)-3-(1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(1.50g,3.046mmol)、Pd(dppf)Cl2(16.13g,22.046mmol)和K3PO4(116.99g,551.148mmol)于二噁烷(600mL)、H2O(200mL)和甲苯(200mL)中的混合物搅拌2小时。将所得混合物减压浓缩,接着用H2O(300mL)稀释。将混合物用EtOAc(3×500mL)萃取。将合并的有机层用H2O(3×500mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液,并将残余物通过硅胶柱色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(128g,83.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C39H49F2N3O6的[M+H]计算值:694.37;实验值694.2。
步骤3:合成(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酸
在0℃下,向(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酸甲酯(125.0g,180.159mmol)于THF(800mL)中的搅拌的溶液中逐滴添加于H2O(200mL)中的LiOH●H2O(11.48g,479.403mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌2小时。用1M HCl(水溶液)将混合物酸化至pH 6,接着用EtOAc(3×800mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×200mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液,得到所需产物(125g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C38H47F2N3O6的[M+H]计算值:680.37;实验值680.2。
步骤4:合成(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯
在0℃下,向(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(39.77g,275.814mmol)和NMM(185.98g,1838.760mmol)于DCM(1500mL)中的搅拌的溶液中分数份添加(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酸(125.0g,183.876mmol)、HOBt(12.42g,91.938mmol)和EDCI(70.50g,367.752mmol)。在室温下将所得混合物搅拌16小时。接着,将反应混合物用0.5M HCl(2×1000mL)和盐水(2×800mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(110g,74.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C44H57F2N5O7的[M+H]计算值:806.43;实验值806.2。
步骤5:合成(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸
在0℃下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(110.0g,136.482mmol)于THF(800mL)中的搅拌的溶液中分数份添加LiOH●H2O(17.18g,409.446mmol)于H2O(200mL)中的溶液。在0℃下,将所得混合物搅拌2小时,接着用0.5M HCl中和至pH 6。将所得混合物用EtOAc(3×800mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×600mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(100g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C43H55F2N5O7的[M+H]计算值:792.42;实验值792.4。
步骤6:合成((63S,4S)-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(二氟甲基)-5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(100.0g,126.273mmol)于DCM(6000mL)中的搅拌的溶液中逐滴添加DIPEA(163.20g,1262.730mmol)、HOBt(85.31g,631.365mmol)和EDCI(363.10g,1894.095mmol)。在室温下将所得混合物搅拌过夜。接着,将混合物用0.5M HCl(2×2000mL)和盐水(2×2000mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(70g,71.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C43H53F2N5O6的[M+H]计算值:774.41;实验值774.0。
步骤7:合成(63S,4S)-4-氨基-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
在0℃下,向((63S,4S)-25-(二氟甲基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(202.0mg,0.261mmol)于DCM(2mL)中的搅拌的溶液中逐滴添加TFA(1.0mL)。在0℃下将所得混合物搅拌1.5小时,接着减压浓缩,得到所需产物。LCMS(ESI)m/z:C38H45F2N5O4的[M+H]计算值:674.35;实验值674.5。
中间体29.合成(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-(氟甲基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮
Figure BDA0004194083620015231
步骤1:合成1-溴-3-(氟甲基)-5-碘苯
在0℃下,向(3-溴-5-碘苯基)甲醇(175.0g,559.227mmol)于DCM(2L)中的溶液中逐滴添加BAST(247.45g,1118.454mmol)。在室温下将所得混合物搅拌16小时。在0℃下,用饱和NaHCO3水溶液淬灭反应。将有机层用H2O(3×700mL)洗涤并经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法(3% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(120g,68%产率)。
步骤2:合成(2S)-3-[3-溴-5-(氟甲基)苯基]-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯
向1000mL 3颈圆底烧瓶中添加Zn粉(32.40g,495.358mmol)于DMF(350.0mL)和I2(967.12mg,3.810mmol)。向混合物中添加(2R)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-碘丙酸甲酯(27.0g,82.03mmol)于DMF(10mL)中的溶液。将混合物加热至30℃,保持10分钟。接着,向混合物中添加(2R)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-碘丙酸甲酯(54.0g,164.07mmol)于DMF(20mL)中的溶液。在室温下将所得混合物搅拌30分钟并过滤。在氩气氛下,在室温下将所得溶液添加至1-溴-3-(氟甲基)-5-碘苯(60g,190.522mmol)、三(呋喃-2-基)磷烷(2.65g,11.431mmol)和Pd2(dba)3(3.49g,3.810mmol)于DMF(400mL)的混合物中并将反应混合物加热至60℃,保持10分钟,接着移开油浴。将所得混合物搅拌约1小时,直至温度冷却至50℃。用NH4Cl水溶液(3000mL)淬灭反应并将所得混合物用EtOAc(3×1000mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1000mL)洗涤且经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法(9% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(45g,60%产率)。
步骤3:合成(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)-5-(氟甲基)苯基)丙酸甲酯
在80℃下,将(2S)-3-[3-溴-5-(氟甲基)苯基]-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(75.28g,192.905mmol)、(S)-3-(1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(95g,192.905mmol)、Pd(dppf)Cl2(14.11g,19.291mmol)和K2CO3(53.32g,385.810mmol)于二噁烷(900mL)和H2O(180mL)中的混合物搅拌2小时。将所得混合物减压浓缩,接着用H2O稀释。将所得混合物用EtOAc(3×1200mL)萃取,并将合并的有机层用H2O(3×500mL)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(105g,80%产率)。LCMS(ESI)m/z:C39H50FN3O6的[M+H]计算值:676.38;实验值676.1。
步骤4:合成(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)-5-(氟甲基)苯基)丙酸
在0℃下,向(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)-5-(氟甲基)苯基)丙酸甲酯(108g,159.801mmol)于THF(500mL)中的搅拌的溶液中添加LiOH●H2O(11.48g,479.403mmol)于H2O(500mL)中的溶液。在0℃下将所得混合物搅拌2小时,接着用1MHCl(水溶液)酸化至pH 6。将混合物用EtOAc(3×800mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×200mL)洗涤,并经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液,得到所需产物(101g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C38H48FN3O6的[M+H]计算值:662.36;实验值662.1。
步骤5:合成(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)-5-(氟甲基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯
在0℃下,向(S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)-5-(氟甲基)苯基)丙酸(103g,155.633mmol)和NMM(157.42g,1556.330mmol)于DCM(1200mL)中的搅拌的溶液中分数份添加(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(33.66g,233.449mmol)、HOBt(10.51g,77.816mmol)和EDCI(59.67g,311.265mmol)。在室温下将所得混合物搅拌16小时。接着,将有机层用0.5M HCl(2×1000mL)和盐水(2×800mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(103g,83%产率)。LCMS(ESI)m/z:C44H58FN5O7的[M+H]计算值:788.44;实验值788.1。
步骤6:合成(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)-5-(氟甲基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸
在0℃下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)-5-(氟甲基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(103g,130.715mmol)于THF(700mL)中的搅拌的溶液中添加LiOH●H2O(27.43g,653.575mmol)于H2O(700mL)中的溶液。在0℃下将所得混合物搅拌2小时,接着用1M HCl中和至pH 6。将所得混合物用EtOAc(3×800mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×600mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(101g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C43H56FN5O7的[M+H]计算值:774.43;实验值774.1。
步骤7:合成((63S,4S)-11-乙基-25-(氟甲基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
在0℃下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(3-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)-5-(氟甲基)苯基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(101g,130.50mmol)于DCM(5500mL)中的搅拌的溶液中添加DIPEA(227.31mL,1305.0mmol)和HOBt(88.17g,652.499mmol)以及EDCI(375.26g,1957.498mmol)。在室温下,将所得混合物搅拌过夜。接着,将混合物用0.5MHCl(2×2000mL)和盐水(2×2000mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(68g,65%产率)。LCMS(ESI)m/z:C43H54FN5O6的[M+H]计算值:756.42;实验值756.4。
步骤8:合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-(氟甲基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺
在0℃下,向((63S,4S)-11-乙基-25-(氟甲基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(350mg,0.403mmol)于DCM(4mL)中的搅拌的溶液中添加TFA(1.50mL)。在室温下将所得混合物搅拌1.5小时,接着减压浓缩,得到所需产物(600mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C38H46FN5O4的[M+H]计算值:656.36;实验值656.4。
中间体A-1.合成N-甲基-N-((S)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015271
步骤1:合成N-甲基-N-((S)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-甲基-N-((S)-吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(0.840g,3.47mmol)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.713g,5.2mmol)于DMF(20mL)中的混合物中添加DIPEA(3.0mL,17.33mmol)和HATU(2.636g,6.93mmol)。将反应混合物搅拌3小时,此时,将混合物用EtOAc(200mL)萃取。将EtOAc层用盐水(3×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(10→50% MeCN/H2O)纯化,得到呈固体状的所需产物(1.02g,53%产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H39N3O4的[M+H]计算值:554.30;实验值554.3。
步骤2:合成N-甲基-N-((S)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-((S)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(1.0g,1.81mmol)于THF(10mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(0.3789g,9.03mmol)于H2O(9.0mL)中的溶液。3小时后,用饱和NH4Cl水溶液将反应溶液中和至pH 7。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到呈固体状的粗产物(740mg,75.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H37N3O4的[M-H]计算值:538.27;实验值538.2。
中间体A-2.合成N-甲基-N-((S)-1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015281
步骤1:合成N-甲基-N-((S)-1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-甲基-N-((S)-吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(0.800g,3.30mmol)和(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.305g,3.96mmol)于DMF(16mL)中的混合物中添加DIPEA(2.9mL,16.5mmol)和HATU(1.88g,4.9mmol)。将反应混合物升温至室温并搅拌1小时,此时,将混合物用EtOAc稀释。将混合物用饱和NH4Cl洗涤,并将所得水层用EtOAc萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(10→80%MeCN/H2O)纯化,得到呈固体状的所需产物(1.17g,64%产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H39N3O4的[M+H]计算值:554.30;实验值554.3。
步骤2:合成N-甲基-N-((S)-1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-((S)-1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(1.10g,1.99mmol)于THF(10.0mL)中的搅拌的溶液中添加1M LiOH溶液(9.93mL,9.93mmol)。将反应混合物升温至室温并搅拌16小时。将反应混合物冷却至0℃并用饱和NH4Cl水溶液达到pH 6进行淬灭。将所得混合物用EtOAc萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需粗产物(1.2g)。LCMS(ESI)m/z:C33H37N3O4的[M+H]计算值:540.29;实验值540.3。
中间体A-3.合成N-甲基-N-(1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015291
步骤1:合成N-甲基-N-(1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.157g,3.51mmol)和N-甲基-N-(哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(0.600g,2.34mmol)于DMF(20mL)中的溶液中添加DIPEA(0.204mL,11.70mmol)和HATU(1.780g,4.68mmol)。3小时后,将反应混合物用EtOAc(200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→50% MeCN/H2O)纯化,得到呈固体状的所需产物(740mg,55.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H41N3O4的[M+H]计算值:568.32;实验值568.3。
步骤2:合成N-甲基-N-(1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(0.700g,1.23mmol)于THF(7.0mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(0.259g,6.17mmol)于H2O(6.0mL)中的溶液。将所得溶液升温至室温并搅拌3小时。将反应混合物用EtOAc(100mL)稀释并用饱和盐水(5×50mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到呈固体状的粗产物(700mg)。LCMS(ESI)m/z:C34H39N3O4的[M-H]计算值:552.29;实验值552.2。
中间体A-4.合成N-甲基-N-(1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸.
Figure BDA0004194083620015301
步骤1:合成N-甲基-N-(1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-甲基-N-(哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(0.550g,2.15mmol)和(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(0.848g,2.57mmol)于DMF(10.0mL)中的溶液中添加DIPEA(1.9mL,10.7mmol)和HATU(1.2g,3.2mmol)。将反应混合物升温至室温并搅拌1小时。将反应混合物用EtOAc(50mL)稀释并用饱和NH4Cl(60mL)洗涤。将水层用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(200mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→80%MeCN/H2O)纯化,得到呈固体状的所需产物(1.2g,98.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H41N3O4的[M+H]计算值:568.32;实验值568.3。
步骤2:合成N-甲基-N-(1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(1.20g,2.11mmol)于THF(11.0mL)中的溶液中添加1M LiOH(10.57mL,10.57mmol)。将所得溶液升温至室温并搅拌16小时。将反应混合物冷却至0℃并用饱和NH4Cl直至pH 6进行淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到粗产物(900mg)。LCMS(ESI)m/z:C34H39N3O4的[M-H]计算值:554.29;实验值554.3。
中间体A-5.合成N-甲基-N-(1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015311
步骤1:合成N-甲基-N-(1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-(氮杂环丁烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(0.410g,1.79mmol)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(0.887g,2.69mmol)于DMF(10mL)中的溶液中添加DIPEA(1.56mL,8.98mmol)和HATU(1.37g,3.59mmol)。将反应混合物搅拌1小时。接着,将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→80% MeCN/H2O)纯化,得到呈固体状的所需产物(650mg,67%产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H37N3O4的[M+H]计算值:540.29;实验值540.3。
步骤2:合成N-甲基-N-(1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(0.650mg,1.20mmol)于THF(10mL)中的溶液中添加1M LiOH●H2O溶液(6.03mL)。将反应混合物搅拌3小时。接着,将所得混合物用饱和NH4Cl直至pH 7来淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×20mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到呈固体状的所需粗产物(588mg)。LCMS(ESI)m/z:C32H35N3O4的[M-H]计算值:526.27;实验值526.3。
中间体A-6.合成N-甲基-N-(1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015321
步骤1:合成N-甲基-N-(1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-(氮杂环丁烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(0.550g,2.41mmol)和(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(0.952g,2.89mmol)于DMF(10mL)中的溶液中添加DIPEA(2.1mL,12.05mmol)和HATU(1.37g,3.61mmol)。将反应混合物升温至室温并搅拌1小时。将所得混合物用EtOAc(50mL)稀释并用饱和NH4Cl(60mL)洗涤。接着,将水层用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(200mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→80% MeCN/H2O)纯化,得到呈固体状的所需产物(820mg,63%产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H37N3O4的[M+H]计算值:540.29;实验值540.3。
步骤2:合成N-甲基-N-(1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(0.800g,1.48mmol)于THF(8.0mL)中的溶液中添加1M LiOH(7.41mL,7.41mmol)。将反应混合物升温至室温并搅拌16小时,接着冷却至0℃并用饱和NH4Cl直至pH6来淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(150mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→80% MeCN/H2O+0.5%NH4HCO3)纯化,得到呈固体状的所需产物(440mg,56%产率)。LCMS(ESI)m/z:C32H35N3O4的[M-H]计算值:524.25;实验值524.2。
中间体A-7.合成(2R,3S)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015331
步骤1:合成(2S,3R)-2,3-二羟基-3-苯基丙酸乙酯
在0℃下,向肉桂酸乙酯(2.0g,11.4mmol)于t-BuOH(35.0mL)和H2O(35.0mL)中的溶液中添加AD-mix-β(15.83g,20.32mmol)和甲烷磺酰胺(1.08g,11.3mmol)。在室温下将反应混合物搅拌16小时。将反应冷却至0℃并用KHSO4水溶液淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×90mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈固体状的所需产物(2.2g,82%产率)。
步骤2:合成(2S,3R)-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)-3-苯基丙酸乙酯
在0℃下,向(2S,3R)-2,3-二羟基-3-苯基丙酸乙酯(2.0g,9.5mmol)和Et3N(3.97mL,28.5mmol)于DCM(30.0mL)中的溶液中添加4-硝基苯磺酰氯(2.11g,9.51mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着用H2O(300mL)稀释。将混合物用DCM(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈固体状的所需产物(2.8g,67%产率)。
步骤3:合成(2R,3R)-2-叠氮基-3-羟基-3-苯基丙酸乙酯
在室温下,向(2S,3R)-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)-3-苯基丙酸乙酯(2.80g,7.08mmol)于THF(30mL)中的溶液中添加三甲基硅烷基叠氮化物(1.63g,14.2mmol)和TBAF(1M于THF中,14.16mL,14.16mmol)。将反应混合物加热至60℃并搅拌16小时。接着,将反应混合物冷却至室温,用H2O(150mL)稀释,并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(50%EtOAc/石油醚)纯化,得到呈油状的所需产物(1.2g,64%产率)。
步骤4:合成(2R,3S)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
向(2R,3R)-2-叠氮基-3-羟基-3-苯基丙酸乙酯(1.20g,5.10mmol)于DMF(15.0mL)中的溶液中添加PPh3(1.61g,6.12mmol)。在室温下将反应混合物搅拌30分钟,接着加热至80℃,再保持16小时。接着,将反应混合物冷却至室温,用H2O(100mL)稀释,并用EtOAc(3×40mL)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(16% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈油状的所需产物(620mg,57%产率)。LCMS(ESI)m/z:C11H13NO2的[M+H]计算值:192.10;实验值192.0。
步骤5:合成(2R,3S)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2R,3S)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(0.100g,0.523mmol)于MeOH(0.70mL)中的溶液中添加LiOH(18.8mg,0.784mmol)于H2O(0.70mL)中的溶液。将反应混合物搅拌1小时。接着,将混合物用MeCN(10mL)稀释,并通过过滤收集所得沉淀并用MeCN(2×10mL)洗涤,得到呈固体状的所需粗产物(70mg)。LCMS(ESI)m/z:C9H9NO2的[M+H]计算值:164.07;实验值164.0。
中间体A-8.合成(2S,3R)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015351
步骤1:合成(2R,3S)-2,3-二羟基-3-苯基丙酸乙酯
在0℃下,向肉桂酸乙酯(2.0g,11.4mmol)于t-BuOH(35.0mL)和H2O(35.0mL)中的溶液中添加AD-mix-α(15.83g,20.32mmol)和甲烷磺酰胺(1.08g,11.3mmol)。在室温下将反应混合物搅拌16小时。将反应冷却至0℃并用KHSO4水溶液淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×80mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈固体状的所需产物(2.2g,82%产率)。
步骤2:合成(2R,3S)-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)-3-苯基丙酸乙酯
在0℃下,向(2R,3S)-2,3-二羟基-3-苯基丙酸乙酯(2.10g,9.99mmol)和Et3N(4.18mL,29.9mmol)于DCM(30.0mL)中的溶液中添加4-硝基苯磺酰氯(2.21g,9.99mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着用H2O(200mL)稀释。将混合物用DCM(3×80mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×80mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈固体状的所需产物(3.0g,68%产率)。
步骤3:合成(2S,3S)-2-叠氮基-3-羟基-3-苯基丙酸乙酯
在室温下,向(2R,3S)-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)-3-苯基丙酸乙酯(3.0g,7.59mmol)于THF(30mL)中的溶液中添加三甲基硅烷基叠氮化物(1.75g,15.2mmol)和TBAF(1M于THF中,15.18mL,15.18mmol)。将反应混合物加热至60℃并搅拌16小时。接着,将反应混合物冷却至室温,用H2O(150mL)稀释,并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(50%EtOAc/石油醚)纯化,得到呈油状的所需产物(1.4g,70%产率)。
步骤4:合成(2S,3R)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
向(2S,3S)-2-叠氮基-3-羟基-3-苯基丙酸乙酯(1.40g,5.95mmol)于DMF(20.0mL)中的溶液中添加PPh3(1.87g,7.14mmol)。在室温下将反应混合物搅拌30分钟,接着加热至80℃,再保持16小时。接着,将反应混合物冷却至室温,用H2O(150mL)稀释,并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(40mL)洗涤,经Na2SO干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(16% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈油状的所需产物(720mg,56%产率)。LCMS(ESI)m/z:C11H13NO2的[M+H]计算值:192.10;实验值192.0。
步骤5:合成(2S,3R)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2S,3R)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(0.100g,0.523mmol)于MeOH(0.70mL)中的溶液中添加LiOH(18.8mg,0.784mmol)于H2O(0.70mL)中的溶液。将反应混合物搅拌1小时。接着,将混合物用MeCN(10mL)稀释,并通过过滤收集所得沉淀并用MeCN(2×10mL)洗涤,得到呈固体状的所需粗产物(68mg)。LCMS(ESI)m/z:C9H9NO2的[M+H]计算值:164.07;实验值164.0。
中间体A-9.合成N-(N-((R)-1-苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015371
步骤1:合成N-(N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
向甲基-L-缬氨酸甲酯盐酸盐(4.0g,22.0mmol)和N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基甘氨酸(5.0g,26.4mmol)于DCM(100.0mL)中的溶液中添加Et3N(9.2mL,66.1mmol)和HATU(10.88g,28.63mmol)。将反应混合物搅拌4小时。接着,用饱和NaHCO3水溶液将反应中和至pH 7。将混合物用DCM萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得呈油状的到所需产物(6.2g,89%产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H28N2O5的[M+H]计算值:317.21;实验值317.2。
步骤2:合成N-甲基-N-(甲基甘氨酰基)-L-缬氨酸甲酯盐酸盐
在0℃下,向N-(N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(4.97g,15.7mmol)于EtOAc(150.0mL)中的溶液中添加HCl(4M于二噁烷中,50.0mL,200mmol)。将反应混合物搅拌3小时,接着减压浓缩,得到呈油状的所需粗产物(4.26g,107%产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H20N2O3的[M+H]计算值:217.16;实验值217.1。
步骤3:合成N-甲基-N-(N-甲基-N-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)甘氨酰基)-L-缬氨酸甲酯
向N-甲基-N-(甲基甘氨酰基)-L-缬氨酸甲酯盐酸盐(1.0g,3.9mmol)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.30g,3.94mmol)于DCM(25.0mL)中的溶液中添加Et3N(2.76mL,19.8mmol)和HATU(1.81g,4.76mmol)。将反应混合物搅拌1小时。接着,用饱和NaHCO3水溶液将反应中和至pH 7。将混合物用DCM萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈固体状的所需产物(1.1g,52.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C32H37N3O4的[M+H]计算值:528.29;实验值528.2。
步骤4:合成N-(N-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-甲基-N-(N-甲基-N-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)甘氨酰基)-L-缬氨酸甲酯(1.0g,3.9mmol)于DCM(6mL)中的溶液中添加TFA(2mL)。将反应混合物升温至室温并搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈油状的所需粗产物(250mg)。LCMS(ESI)m/z:C13H23N3O4的[M+H]计算值:286.18;实验值286.1。
步骤5:合成N-(N-((R)-1-苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
向N-(N-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(220.0mg,0.771mmol)于MeCN(2.0mL)中的溶液中添加DIPEA(537μL,3.08mmol)和苯甲基溴(101μL,0.848mmol)。将反应混合物搅拌6小时。接着,将反应混合物减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(9% MeOH/DCM)纯化,得到呈油状的所需产物(261mg,90%产率)。LCMS(ESI)m/z:C20H29N3O4的[M+H]计算值:376.22;实验值376.2。
步骤6:合成N-(N-((R)-1-苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸
向N-(N-((R)-1-苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(261.0mg,0.695mmol)于THF(3.38mL)中的溶液中添加LiOH(83.2mg,3.48mmol)于H2O(3.50mL)中的溶液。将反应混合物搅拌1小时。接着用饱和NH4Cl水溶液淬灭反应。将所得混合物用EtOAc萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→50%MeCN/H2O)纯化,得到呈油状的所需产物(230mg,91%产率)。LCMS(ESI)m/z:C19H27N3O4的[M+H]计算值:362.21;实验值362.2。
中间体A-10.合成N-(N-((R)-1-苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015391
/>
步骤1:合成N-(N-((S)-1-苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-(N-((S)-氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(362.0mg,1.269mmol)于MeCN(6.0mL)中的溶液中添加DIPEA(883μL,5.08mmol)和苯甲基溴(165μL,1.39mmol)。接着,将反应混合物升温至室温并搅拌过夜。接着,将反应混合物减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(7% MeOH/DCM)纯化,得到呈油状的所需产物(287mg,60%产率)。LCMS(ESI)m/z:C20H29N3O4的[M+H]计算值:376.22;实验值376.2。
步骤2:合成N-(N-((S)-1-苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸
向N-(N-((S)-1-苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(270.0mg,0.719mmol)于THF(3.6mL)中的溶液中添加LiOH(86.1mg,3.59mmol)于H2O(3.60mL)中的溶液。将反应混合物搅拌30分钟。接着,用饱和NH4Cl水溶液淬灭反应。将所得混合物用EtOAc(3×15mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到呈油状的所需粗产物(240mg,92%产率)。LCMS(ESI)m/z:C19H27N3O4的[M+H]计算值:362.21;实验值362.2。
中间体A-11.合成N-甲基-N-(N-甲基-N-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)甘氨酰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015401
在0℃下,向N-甲基-N-(N-甲基-N-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)甘氨酰基)-L-缬氨酸甲酯(1.30g,2.46mmol)于THF(10.0mL)中的溶液中添加LiOH(177.0mg,7.39mmol)于H2O(7.40mL)中的溶液。将所得混合物升温至室温,搅拌3小时,接着用HCl(水溶液)酸化至pH 5。将所得混合物用EtOAc(3×80mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需粗产物(1g,71%产率)。LCMS(ESI)m/z:C31H35N3O4的[M+H]计算值:514.27;实验值514.3。
中间体A-12.合成N-甲基-N-(4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015402
步骤1:合成(S)-4-((1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-甲酸苯甲酯
在0℃下,向N-甲基-L-缬氨酸甲酯(2.50g,17.22mmol)于DCM中的溶液中添加DIPEA(1.8mL,10.33mmol),随后添加三光气(2.55g,8.61mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌3小时。接着,向混合物中添加1,4-二氮杂环庚烷-1-甲酸苯甲酯(4.03g,17.20mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌过夜。将反应冷却至0℃并用NaHCO3淬灭。将水层用EtOAc(2×30mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(25% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(3.5g,50.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C21H31N3O5的[M+H]计算值:406.23;实验值406.5。
步骤2:合成N-(1,4-二氮杂环庚烷-1-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
向(S)-4-((1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-甲酸苯甲酯(2.0g,4.93mmol)于MeOH(20mL)中的溶液中添加Pd/C(10%wt,1g)。将混合物置放于氢气气氛(1atm)下并搅拌2小时。将反应混合物经硅藻土过滤并减压浓缩,得到所需粗产物(1.3g,97.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H25N3O3的[M+H]计算值:272.20;实验值272.3。
步骤3:合成N-甲基-N-(4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-(1,4-二氮杂环庚烷-1-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(1.0g,3.69mmol)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.46g,4.42mmol)于DMF中的溶液中添加DIPEA(1.93mL,11.06mmol),随后添加HATU(2.10g,5.52mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌1小时。接着,将反应混合物用H2O(15mL)稀释并将水层用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(25% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.6g,74.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H42N4O4的[M+H]计算值:583.33;实验值583.5。
步骤4:合成N-甲基-N-(4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯(1.60g,2.75mmol)于MeOH(10.0mL)和H2O(5.0mL)中的溶液中添加LiOH(0.66g,27.56mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌过夜。用HCl(水溶液)将反应混合物酸化至pH 5并将水层用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩,得到所需粗产物(1.4g,95.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H40N4O4的[M+H]计算值:569.31;实验值569.5。
中间体A-13.合成N-甲基-N-(4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015421
步骤1:合成N-甲基-N-(4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-(1,4-二氮杂环庚烷-1-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(1.16g,4.28mmol)和(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.69g,5.13mmol)于DMF(10mL)中的溶液中添加DIPEA(2.23mL,12.82mmol),随后添加HATU(2.44g,6.41mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌1小时。接着,将反应混合物用H2O(15mL)稀释并将水层用EtOAc(3×15mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×15mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(17%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(2g,80.3%产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H42N4O4的[M+H]计算值:583.33;实验值583.5。
步骤2:合成N-甲基-N-(4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-1,4-二氮杂环庚烷-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯(1.0g,1.72mmol)于MeOH(8.0mL)和H2O(4.0mL)中的溶液中添加LiOH(411mg,17.16mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌过夜。用HCl(水溶液)将反应混合物酸化至pH 5并将水层用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩,得到所需粗产物(0.6g,61.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H40N4O4的[M+H]计算值:569.31;实验值569.5。
中间体A-14.合成N-甲基-N-(5-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡啶甲酰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015431
步骤1:合成N-甲基-N-(5-硝基吡啶甲酰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-甲基-L-缬氨酸甲酯盐酸盐(190.0mg,1.31mmol)和5-硝基吡啶甲酸(200.0mg,1.19mmol)于DMF(2mL)中的溶液中添加HATU(678.6mg,1.79mmol)和Et3N(0.332mL,2.38mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌2小时。接着,将所得混合物用EtOAc(2×50mL)萃取,并将合并的有机层用H2O(20mL)和盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(33% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(210mg,59.8%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H17N3O5的[M+H]计算值:296.12;实验值296.0。
步骤2:合成N-(5-氨基吡啶甲酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
向N-甲基-N-(5-硝基吡啶甲酰基)-L-缬氨酸甲酯(5.0g,16.93mmol)于MeOH(50.0mL)中的溶液中添加Pd/C(2.50g)。将反应混合物置放于氢气气氛(1atm)下并搅拌2小时。将混合物过滤,用MeOH(2×20mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液。得到所需粗产物(5.3g)。LCMS(ESI)m/z:C13H19N3O3的[M+H]计算值:266.15;实验值266.0。
步骤3:合成N-甲基-N-(5-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡啶甲酰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(55.9mg,0.17mmol)于DCM中的溶液中添加氯甲酸异丁酯(21.7μL,0.23mmol)和N-甲基吗啉(66.8μL,0.61mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着添加N-(5-氨基吡啶甲酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(30.0mg,0.11mmol)。将所得混合物升温至室温并再搅拌5小时。将混合物用DCM(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用饱和NaHCO3(30mL)和盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(33% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.09g,66.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H36N4O4的[M+H]计算值:577.28;实验值577.1。
步骤4:合成N-甲基-N-(5-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡啶甲酰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(5-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡啶甲酰基)-L-缬氨酸甲酯(100.0mg,0.17mmol)于THF(0.5mL)中的溶液中添加LiOH(20.76mg,0.87mmol)于H2O(0.5mL)中的溶液。将所得混合物升温至室温并搅拌6小时。用1M柠檬酸将混合物酸化至pH 5。将所得混合物用EtOAc(3×20mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需粗产物(76.8mg,78.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H34N4O4的[M+H]计算值:563.27;实验值563.3。
中间体A-15.合成N-甲基-N-(5-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡啶甲酰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015451
步骤1:合成N-甲基-N-(5-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡啶甲酰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1396.7mg,4.24mmol)于DCM(8mL)中的溶液中添加氯甲酸异丁酯(440μL,3.39mmol)和N-甲基吗啉(466μL,4.24mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着添加N-(5-氨基吡啶甲酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(750.0mg,2.83mmol)。将所得混合物升温至室温并再搅拌5小时。将混合物通过添加NaHCO3淬灭并将水层用DCM(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(120mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(580mg,35.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H36N4O4的[M+H]计算值:577.28;实验值577.2。
步骤2:合成N-甲基-N-(5-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡啶甲酰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(5-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡啶甲酰基)-L-缬氨酸甲酯(558.0mg,0.97mmol)于THF(14mL)中的溶液中添加LiOH(115.9mg,4.84mmol)于H2O(14mL)中的溶液。将所得混合物升温至室温并搅拌6小时。用1M柠檬酸将混合物酸化至pH 5。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需粗产物(580mg,78.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H34N4O4的[M+H]计算值:563.27;实验值563.2。
中间体A-16.合成(2R,3S)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015461
步骤1:合成(R,E)-2-((叔丁基亚磺酰基)亚氨基)乙酸甲酯
在室温下,向(R)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(13.21g,109.01mmol)和2-氧代乙酸甲酯(8.0g,90.85mmol)于DCM(130mL)中的溶液中添加MgSO4(54.67g,454.23mmol)。将所得混合物加热至35℃并搅拌16小时。将所得混合物过滤,用EtOAc(3×50mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液。将残余物通过正相色谱法(25% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(5.8g,33.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C7H13NO3S的[M+H]计算值:192.07;实验值191.9。
步骤2:合成(2R,3S)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2,3-二甲酸2-(叔丁基)酯3-甲酯
在-78℃下,向1M LiHMDS(61.40mL,61.40mmol)于THF(300.0mL)中的溶液中添加2-溴乙酸叔丁酯(11.83g,60.65mmol)。将所得混合物搅拌30分钟。接着,向反应混合物添加(R,E)-2-((叔丁基亚磺酰基)亚氨基)乙酸甲基甲酯(5.8g,30.33mmol)。将所得混合物升温至-60℃并搅拌2.5小时。将反应升温至0℃并用饱和NH4Cl(水溶液)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(500mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→50% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(1.34g,4.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H23NO5S的[M+H]计算值:306.14;实验值306.2。
步骤3:合成(2R,3S)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2R,3S)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2,3-二甲酸2-(叔丁基)酯3-甲酯(302.0mg,0.99mmol)于DCM(3.0mL)中的溶液中添加TFA(1.50mL)。将所得混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到所需粗产物(300mg)。LCMS(ESI)m/z:C9H15NO5S的[M+H]计算值:250.07;实验值250.1。
中间体A-17.合成(2R,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015471
步骤1:合成(S,E)-2-((叔丁基亚磺酰基)亚氨基)乙酸甲酯
在室温下,向(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(9.81g,80.94mmol)和2-氧代乙酸甲酯(5.94g,67.45mmol)于DCM(100mL)中的溶液中添加MgSO4(40.60g,337.26mmol)。将所得混合物加热至35℃并搅拌16小时。将所得混合物过滤,用EtOAc(3×50mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液。将残余物通过正相色谱法(25% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(5.68g,44.0%产率)。LCMS(ESI)m/z:C7H13NO3S的[M+H]计算值:192.07;实验值191.1。
步骤2:合成(2R,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2,3-二甲酸2-(叔丁基)酯3-甲酯
在-78℃下,向1M LiHMDS(59.40mL,59.40mmol)于THF(300.0mL)中的溶液中添加2-溴乙酸叔丁酯(11.59g,59.40mmol)。将所得混合物搅拌30分钟。接着,向反应混合物添加(S,E)-2-((叔丁基亚磺酰基)亚氨基)乙酸甲基甲酯(5.68g,29.70mmol)。将所得混合物升温至-60℃并搅拌2.5小时。将反应升温至0℃并用饱和NH4Cl(水溶液)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(500mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→50% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(1.26g,13.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H23NO5S的[M+H]计算值:306.14;实验值306.1。
步骤3:合成(2R,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2R,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2,3-二甲酸2-(叔丁基)酯3-甲酯(457.0mg,1.50mmol)于DCM(6.0mL)中的溶液中添加TFA(3.0mL)。将所得混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到所需粗产物(450mg)。LCMS(ESI)m/z:C9H15NO5S的[M+H]计算值:250.07;实验值250.1。
中间体A-18.合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015481
步骤1:合成(R,E)-N-(环丙基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
在室温下,向(R)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(1.0g,8.25mmol)和环丙烷甲醛(1.16g,16.55mmol)于DCM(50mL)中的溶液中添加CuSO4(3.95g,24.75mmol)。将所得混合物搅拌过夜。接着,将反应混合物过滤,用EtOAc洗涤滤饼,并减压浓缩滤液。将残余物通过制备型TLC(17% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.4g,97.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H15NOS的[M+H]计算值:174.10;实验值174.1。
步骤2:合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下,向1M LiHMDS(23mL,23mmol)于THF(50.0mL)中的溶液中添加溴乙酸乙酯(3.83g,22.95mmol)。将所得混合物升温至-70℃并搅拌1小时。接着,向反应混合物添加(R,E)-N-(环丙基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(2.0g,11.48mmol)。在-70℃下,将所得混合物搅拌1小时。将反应混合物升温至0℃并用H2O淬灭。将水层用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(25% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.8g,60.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H21NO3S的[M+H]计算值:306.14;实验值260.13。
步骤3:合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(900.0mg,3.47mmol)于THF(3.0mL)和H2O(3.0mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(218.4mg,5.21mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着用H2O淬灭。将水层用EtOAc(3×50)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需粗产物(400mg,29.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H17NO3S的[M+H]计算值:232.10;实验值232.1。
中间体A-19.合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015491
步骤1:合成(R,E)-N-亚乙基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
在0℃下,向(R)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(3.0g,24.75mmol)和四乙氧基钛(1.7g,7.43mmol)于THF(30mL)中的溶液中添加乙醛(218.1mg,4.95mmol)。将所得混合物搅拌20分钟,接着用H2O(100mL)淬灭。将悬浮液过滤,并用EtOAc(3×100mL)洗涤滤饼。将水层用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(9% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(3g,82%产率)。LCMS(ESI)m/z:C6H13NOS的[M+H]计算值:148.08;实验值148.0。
步骤2:合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下,向1M LiHMDS(40.75mL,40.75mmol)于THF(30.0mL)中的溶液中添加溴乙酸乙酯(6.80g,40.75mmol)。将所得混合物搅拌1小时。接着,向反应混合物添加(R,E)-N-亚乙基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(3.0g,20.38mmol)。在-78℃下将所得混合物搅拌2小时,接着用H2O(300mL)淬灭。将水层用EtOAc(3×300mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→50% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(1.4g,29.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H19NO3S的[M+H]计算值:234.12;实验值234.1。
步骤3:合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(1.0g,4.29mmol)于THF(6.4mL)和H2O(6.4mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(539.5mg,12.86mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌2小时,接着用HCl(水溶液)和饱和NH4Cl(水溶液)中和至pH 5。将水层用EtOAc(3×10mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需粗产物(489mg,55.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H15NO3S的[M+H]计算值:206.09;实验值206.0。
中间体A-20.合成(2S,3S)-1-(S)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015511
步骤1:合成(S,E)-N-亚乙基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
在0℃下,向(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(5.0g,41.25mmol)和四乙氧基钛(18.82g,82.51mmol)的混合物中添加乙醛(3.63g,82.51mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌30分钟,接着用H2O(100mL)淬灭。将悬浮液过滤,并用EtOAc(3×100mL)洗涤滤饼。将水层用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需粗产物(3.9g,64%产率)。LCMS(ESI)m/z:C6H13NOS的[M+H]计算值:148.08;实验值148.2。
步骤2:合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下,向1M LiHMDS(40.75mL,40.75mmol)于THF(30.0mL)中的溶液中添加溴乙酸乙酯(6.80g,40.75mmol)。将所得混合物搅拌1小时。接着,向反应混合物添加(S,E)-N-亚乙基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(3.0g,20.38mmol)。在-78℃下将所得混合物搅拌2小时,接着用H2O淬灭。将水层用EtOAc(3×200mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×300mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→50% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(2g,42%产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H19NO3S的[M+H]计算值:234.12;实验值234.0。
步骤3:合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(80.0mg,0.34mmol)于THF(1.0mL)和H2O(0.2mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(32.9mg,1.37mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌4小时,接着用HCl(水溶液)酸化至pH 3。将水层用EtOAc(3×10mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需粗产物(70mg,99%产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H15NO3S的[M+H]计算值:206.09;实验值206.0。
中间体A-21及A-22.合成N-甲基-N-((S)-1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸和N-甲基-N-((S)-1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015521
步骤1:合成N-甲基-N-((S)-1-(乙烯基磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在-20℃下,向N-甲基-N-((S)-吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(7.0g,28.89mmol)于MeCN(200mL)中的混合物中添加DIPEA(10.0mL,57.78mmol),随后添加乙烯磺酰氯(4.0g,31.78mmol)。在-20℃下将所得溶液搅拌2小时,接着用EtOAc(800mL)稀释。将所得溶液用盐水(3×100mL)洗涤并减压浓缩。通过正相色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(4.8g,49.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H24N2O5S的[M+H]计算值:333.15;实验值333.1。
步骤2:合成N-((3S)-1-((1,2-二溴乙基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-甲基-N-((S)-1-(乙烯基磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(4.5g,13.54mmol)于CCl4(100mL)中的溶液中添加Br2(2.77mL,54.15mmol)。将所得溶液搅拌过夜,接着通过添加饱和NaHCO3(100mL)淬灭。将水层用EtOAc(3×200mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(25% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(2.6g,39.0%产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H24Br2N2O5S的[M+H]计算值:492.99;实验值493.0。
步骤3:合成N-甲基-N-((S)-1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯和N-甲基-N-((S)-1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯
向N-((3S)-1-((1,2-二溴乙基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(2.6g,5.28mmol)于DMSO(250mL)中的溶液中添加甲胺盐酸盐(1.07g,15.85mmol)和Et3N(7.37mL,52.82mmol)。将反应混合物加热至75℃并搅拌过夜。接着,将混合物冷却至室温并用EtOAc(1.5L)稀释。将所得混合物用饱和NH4Cl(2×200mL)和盐水(2×200mL)洗涤,接着,减压浓缩有机层。通过反相色谱法(40→60%MeCN/H2O)纯化,得到所需产物的混合物。将非对映异构体通过制备型SFC(28% MeOH/CO2)分离,得到N-甲基-N-((S)-1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(0.46g,24%产率)及N-甲基-N-((S)-1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(0.35g,18.3%产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H27N3O5S的[M+H]计算值:362.17;实验值362.1。
步骤4:合成N-甲基-N-((S)-1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-((S)-1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(200.0mg,0.55mmol)于THF(2.0mL)和H2O(2.0mL)中的溶液中添加LiOH(53.0mg,2.21mmol)。在0℃下将所得溶液搅拌2小时,接着,用1M HCl将反应混合物酸化至pH 6。将水层用EtOAc萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(5→55% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(110mg,57.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H25N3O5S的[M+H]计算值:348.16;实验值348.1。
步骤5:合成N-甲基-N-((S)-1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-((S)-1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(200.0mg,0.55mmol)于THF(2.0mL)和H2O(2.0mL)中的溶液中添加LiOH(53.0mg,2.21mmol)。在0℃下将所得溶液搅拌2小时,接着,用1M HCl将反应混合物酸化至pH 6。将水层用EtOAc萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(5→55MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(121mg,62.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H25N3O5S的[M+H]计算值:348.16;实验值348.1。
中间体A-23.合成(2S)-3-甲基-2-(1-氧代-7-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸
Figure BDA0004194083620015551
步骤1:合成3-烯丙基吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯
在-78℃下,向吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(10g,43.616mmol)于THF(100mL)中的混合物中逐滴添加1M LiHMDS(65.42mL,65.424mmol)。在-78℃下将所得混合物搅拌1小时,接着,经10分钟逐滴添加烯丙基溴(7.91g,65.423mmol)于THF中的溶液。在-78℃下将所得混合物再搅拌2小时,接着通过在0℃下添加饱和NH4Cl淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×80mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(20% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(10g,76%产率)。
步骤2:合成3-(2-氧代乙基)吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯
在0℃下,向3-烯丙基吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(11.0g,40.84mmol)和2,6-二甲基吡啶(8.75g,81.68mmol)于二噁烷(190mL)和H2O(19mL)中的混合物中添加K2OsO4·2H2O(0.75g,2.04mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌15分钟,接着分数份添加NaIO4(34.94g,163.36mmol)。将混合物升温至室温并再搅拌3小时,接着通过在0℃下添加饱和Na2S2O3淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×300mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(200mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(0→40% MeCN/H2O,0.1%HCO2H)纯化,得到所需产物(6.4g,51%产率)。
步骤3:合成3-(2-(((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)乙基)吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯
在0℃下,向3-(2-氧代乙基)吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(6.30g,23.220mmol)和L-缬氨酸苯甲酯(7.22g,34.831mmol)于MeOH(70mL)中的混合物中添加ZnCl2(4.75g,34.831mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌30分钟,接着冷却至0℃。分数份添加NaBH3CN(2.92g,46.441mmol),接着将混合物升温至室温并搅拌2小时。通过在0℃下添加饱和NH4Cl淬灭反应,接着,将所得混合物用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(150mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(33%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(6.4g,53%产率)。LCMS(ESI)m/z:C25H38N2O6的[M+H]计算值:463.28;实验值463.3。
步骤4:合成7-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯
向3-(2-(((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)乙基)吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(4.50g,9.728mmol)和DIPEA(16.6mL,97.28mmol)于甲苯(50mL)中的混合物中添加DMAP(1.19g,9.728mmol),接着,将混合物加热至80℃。24小时后,将反应冷却至室温并减压浓缩。通过反相色谱法(15→60% MeCN/H2O,0.1%HCO2H)纯化,得到所需产物(3g,64%产率)。LCMS(ESI)m/z:C24H34N2O5的[M+H]计算值:431.26;实验值431.2。
步骤5:合成(2S)-3-甲基-2-(1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯
在0℃下,向7-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(400.0mg,0.929mmol)于DCM(3.0mL)中的溶液中逐滴添加TFA(1.50mL,20.195mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌1小时,接着减压浓缩。通过与甲苯共沸蒸馏三次来移除TFA残余物,得到所需产物(400mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C19H26N2O3的[M+H]计算值:331.20;实验值331.1。
步骤6:合成(2S)-3-甲基-2-(1-氧代-7-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯
在0℃下,向(2S)-3-甲基-2-(1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯(400.0mg,1.21mmol)和DIPEA(2.06mL,12.11mmol)于DMF(5mL)中的溶液中添加(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(558.26mg,1.695mmol),随后分数份添加COMU(673.55mg,1.574mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌1小时,接着用H2O(50mL)稀释。将水层用EtOAc(3×20mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过制备型TLC(33%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(510mg,59%产率)。LCMS(ESI)m/z:C41H43N3O4的[M+H]计算值:642.34;实验值642.3。
步骤7:合成(2S)-3-甲基-2-(1-氧代-7-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸
向(2S)-3-甲基-2-(1-氧代-7-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯(480.0mg,0.748mmol)于甲苯(35.0mL)中的混合物中添加Pd/C(200.0mg,1.879mmol)。将所得混合物置放于H2气氛(1atm)下,加热至50℃并搅拌3小时。将混合物冷却至室温,过滤,用MeOH(3×10mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液,得到所需产物(310mg,67%产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H37N3O4的[M-H]计算值:550.27;实验值550.3。
中间体A-24.合成(2S)-3-甲基-2-(1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸
Figure BDA0004194083620015571
步骤1:合成(2S)-3-甲基-2-(1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯
在0℃下,向(2S)-3-甲基-2-(1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯(400.0mg,1.21mmol)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(518.4mg,1.57mmol)于DMF(4.0mL)中的溶液中添加DIPEA(1.0mL,6.05mmol),随后添加COMU(621.7mg,1.45mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着用H2O(40mL)稀释。将水层用EtOAc(3×15mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(33% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(540mg,62%产率)。LCMS(ESI)m/z:C41H43N3O4的[M+H]计算值:642.33;实验值642.4。
步骤2:合成(2S)-3-甲基-2-(1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸
向(2S)-3-甲基-2-(1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯(510.0mg,0.80mmol)于甲苯(30mL)中的溶液中添加Pd/C(250.0mg,2.35mmol)。将所得混合物置放于氢气气氛(1atm)下,加热至50℃,并搅拌3小时。接着,将反应冷却至室温,过滤,用MeOH(3×10mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液。得到所需粗产物(330mg)。LCMS(ESI)m/z:C34H37N3O4的[M+H]计算值:552.29;实验值552.3。
中间体A-25及A-26.合成(S)-3-甲基-2-((S)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯及(S)-3-甲基-2-((R)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯
Figure BDA0004194083620015591
步骤1:合成(R)-7-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯和(S)-7-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯
向3-(2-(((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)乙基)吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(4.50g,9.728mmol)和DIPEA(16.6mL,97.28mmol)于甲苯(50mL)中的混合物中添加DMAP(1.19g,9.728mmol),接着,将混合物加热至80℃。24小时后,将反应冷却至室温并减压浓缩。通过反相色谱法(10→50% MeCN/H2O,0.1%HCO2H)纯化。接着,将非对映异构体通过手性制备型SFC(30%EtOH/CO2)分离,得到(R)-7-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(1.0g,32%产率,LCMS(ESI)m/z:C24H34N2O5的[M+H]计算值:431.26;实验值431.2)和(S)-7-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(1.0g,32%产率,LCMS(ESI)m/z:C24H34N2O5的[M+H]计算值:431.26;实验值431.2)。
步骤2:合成(S)-3-甲基-2-((S)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯
在0℃下,向(5R)-7-[(2S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基]-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(1.40g,3.25mmol)于DCM(14mL)中的溶液中添加TFA(5.0mL,67.3mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌1小时,接着减压浓缩。将混合物用H2O(20mL)稀释并在0℃下用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(40mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(1.4g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C19H26N2O3的[M+H]计算值:331.20;实验值331.2)。
步骤3:合成(S)-3-甲基-2-((R)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯
在0℃下,向(5S)-7-[(2S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基]-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(1.0g,2.3mmol)于DCM(10mL)中的溶液中添加TFA(4.0mL,53.9mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌1小时,接着减压浓缩。将混合物用H2O(10mL)稀释并在0℃下用饱和NaHCO3(水溶液)碱化至pH 8。将所得混合物用EtOAc(3×20mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(1.0g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C19H26N2O3的[M+H]计算值:331.20;实验值331.1)。
中间体A-27.合成(2S)-3-甲基-2-(1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸
Figure BDA0004194083620015601
步骤1:合成(S)-3-甲基-2-((S)-1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯
在0℃下,向(S)-3-甲基-2-((S)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯(400mg,1.2mmol)和DIPEA(1.1mL,6.1mmol)于DMF(5.0mL)中的溶液中添加(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(480mg,1.5mmol)和HATU(550mg,1.5mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着通过反相色谱法(15→80% MeCN/H2O,0.5% NH4HCO3)纯化,得到所需产物(500mg,57%产率)。LCMS(ESI)m/z:C41H43N3O4的[M+H]计算值:642.34;实验值642.3。
步骤2:合成(2S)-3-甲基-2-(1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸
在氢气气氛(1atm)下,在50℃下搅拌(S)-3-甲基-2-((S)-1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯(450mg,0.70mmol)和Pd/C(120mg,1.13mmol)于甲苯(30mL)中的溶液。将混合物搅拌3小时,接着过滤,并用MeOH(3×30mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到所需产物(430mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C34H37N3O4的[M+H]计算值:552.29;实验值552.3。
中间体28.合成(S)-3-甲基-2-((R)-1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸
Figure BDA0004194083620015611
步骤1:合成(S)-3-甲基-2-((R)-1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯
在0℃下,向(S)-3-甲基-2-((R)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯(500mg,1.5mmol)和DIPEA(1.3mL,7.6mmol)于DMF(7.0mL)中的溶液中添加(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(550mg,1.7mmol)和HATU(630mg,1.7mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着通过反相色谱法(10→80% MeCN/H2O,0.5% NH4HCO3)纯化,得到呈灰白色固体状的所需产物(700mg,64%产率)。LCMS(ESI)m/z:C41H43N3O4的[M+H]计算值:642.34;实验值642.3。
步骤2:合成(S)-3-甲基-2-((R)-1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸
在氢气气氛(1atm)下,在50℃下搅拌(S)-3-甲基-2-((R)-1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酸苯甲酯(650mg,0.70mmol)和Pd/C(140mg,1.3mmol)于甲苯(30mL)中的溶液。将混合物搅拌3小时,接着过滤,并用MeOH(3×30mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到所需产物(550mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C34H37N3O4的[M+H]计算值:552.29;实验值552.3。
中间体A-29.合成(S)-2-((R)-7-(叔丁氧基羰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-3-甲基丁酸
Figure BDA0004194083620015621
向(R)-7-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(600mg,1.4mmol)于甲苯(20mL)中的溶液中添加Pd/C(120mg,1.1mmol)。将反应混合物在50℃下加热并在氢气气氛(1atm)下搅拌3小时。将混合物过滤,并用MeOH(3×20mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到所需产物(550mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C17H28N2O5的[M-H]计算值:339.19;实验值339.1。
中间体A-30.合成(S)-2-((S)-7-(叔丁氧基羰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-3-甲基丁酸
Figure BDA0004194083620015622
向(S)-7-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(550mg,1.3mmol)于甲苯(30mL)中的溶液中添加Pd/C(120mg,1.1mmol)。将反应混合物在50℃下加热并在氢气气氛(1atm)下搅拌3小时。将混合物过滤,并用MeOH(3×20mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到所需产物(550mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C17H28N2O5的[M-H]计算值:339.19;实验值339.2。
中间体A-31.合成(R)-3-甲基-2-(((S)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)甲基)丁酸
Figure BDA0004194083620015631
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步骤1:合成(R)-3-甲基-2-(((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)甲基)丁酸
在0℃下,向(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1g,2.9mmol)于DMF(10mL)中的溶液中添加DIPEA(2.5mL,14.55mmol),随后添加COMU(1.12g,2.62mmol)。将所得混合物搅拌20分钟并添加(R)-2-(氨基甲基)-3-甲基丁酸(382.0mg,2.91mmol)。将所得混合物升温至室温并再搅拌2小时。接着,将反应混合物用H2O淬灭并将水层用EtOAc萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(30→70%MeCN/H2O+0.1% NH4HCO3)纯化,得到所需产物(850mg,63%产率)。LCMS(ESI)m/z:C28H30N2O3的[M-H]计算值:441.22;实验值441.2。
步骤2:合成(R)-3-甲基-2-(((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)甲基)丁酸甲酯
在0℃下,向(R)-3-甲基-2-(((S)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)甲基)丁酸(840.0mg,1.90mmol)于MeOH(5.0mL)中的溶液中添加TMSCHN2(10.0mL,0.45mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌2小时,此时,将反应混合物减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(30→80% MeCN/H2O+0.1% NH4HCO3)纯化,得到所需产物(450mg,52%产率)。LCMS(ESI)m/z:C29H32N2O3的[M-H]计算值:455.23;实验值455.1。
步骤3:合成(R)-3-甲基-2-(((S)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)甲基)丁酸甲酯
在0℃下,向(R)-3-甲基-2-(((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)甲基)丁酸甲酯(440.0mg,0.96mmol)于THF(5.0mL)中的溶液中添加NaH(46.25mg,1.93mmol)。将所得混合物搅拌30分钟,接着添加MeI(1.37g,9.65mmol)。将所得混合物升温至室温并再搅拌4小时。接着,将反应混合物用H2O淬灭并将水层用EtOAc(3×300mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×200mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→90% MeCN/H2O+0.1% NH4HCO3)纯化,得到所需产物(340mg,75%产率)。LCMS(ESI)m/z:C30H34N2O3的[M+H]计算值:471.26;实验值471.3。
步骤4:合成(R)-3-甲基-2-(((S)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)甲基)丁酸
向(R)-3-甲基-2-(((S)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)甲基)丁酸甲酯(340.0mg,0.72mmol)于MeOH(3.0mL)和H2O(3.0mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(242.5mg,5.78mmol)。在室温下将所得混合物搅拌16小时,接着用KHSO4(1N)酸化至pH 4。将所得混合物用EtOAc(3×300mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×300mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(10→80% MeCN/H2O+0.1%NH4HCO3)纯化,得到所需产物(260mg)。LCMS(ESI)m/z:C29H32N2O3的[M+H]计算值:455.23;实验值455.1。
中间体A-32.合成N-甲基-N-(1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015651
步骤1:合成N-甲基-N-(1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-甲基-N-(哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(750mg,2.93mmol)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.13g,3.43mmol)于DMF(7mL)中的混合物中添加DIPEA(2.50mL,14.62mmol),随后分数份添加HATU(2.20g,5.79mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌3小时。将反应混合物用EtOAc(300mL)稀释并将混合物用盐水(2×150mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(50% EtOAc/己烷)纯化,得到所需产物(1.5g,90.3%产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H41N3O4的[M+H]计算值:568.32;实验值568.3。
步骤2:合成N-甲基-N-(1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(500mg,0.881mmol)于THF(5mL)中的溶液中添加LiOH(111mg,2.64mmol)于H2O(2.6mL)中的溶液。将所得混合物升温至室温并搅拌4小时。将反应混合物用H2O(300mL)稀释并用1M HCl酸化至pH 5。将所得混合物用DCM(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×150mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(600mg,粗品),其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C34H39N3O4的[M-H]计算值:552.29;实验值552.3。
中间体A-33.合成N-甲基-N-(1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015661
步骤1:合成N-甲基-N-(1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-甲基-N-(哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(0.90g,3.511mmol)和(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(2.31g,7.022mmol)于DMF(10mL)中的混合物中添加DIPEA(3.06mL,17.57mmol)和HATU(2.67g,7.022mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌2小时。将反应混合物用EtOAc(50mL)稀释并将混合物用H2O和盐水(100mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(100%EtOAc)纯化,得到所需产物(1.47g,73.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H41N3O4的[M+H]计算值:568.32;实验值568.3。
步骤2:合成N-甲基-N-(1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(1-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(1.0g,1.76mmol)于THF(15mL)中的溶液中添加LiOH(370mg,8.80mmol)于H2O(15mL)中的溶液。将所得混合物升温至室温并搅拌3小时。用1M HCl将反应混合物酸化至pH6。将水层用EtOAc(2×50mL)萃取,并将合并的有机层用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(1.33g,粗品),其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C34H39N3O4的[M+H]计算值:554.30;实验值554.3。
中间体A-34.合成(R)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸钠
Figure BDA0004194083620015671
步骤1:合成5-氨基-1-甲基-1H-咪唑-2-甲酸甲酯
向1-甲基-5-硝基-1H-咪唑-2-甲酸甲酯(1.0g,5.401mmol)于MeOH(15mL)中的混合物中添加Pd/C(500mg)。将所得混合物置放于H2气氛(1atm)下并搅拌3小时。将混合物过滤,用MeOH(3×20mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液,得到所需产物(1.0g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C6H9N3O2的[M+H]计算值:156.08;实验值156.1。
步骤2:合成(R)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸甲酯
在0℃下,经30分钟向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(2.55g,7.741mmol)于DCM(12.0mL)中的混合物中分数份添加氯甲酸异丁酯(845.06mg,6.187mmol)和N-甲基吗啉(1.04g,10.282mmol)于DCM中的溶液。向所得混合物中添加5-氨基-1-甲基-1H-咪唑-2-甲酸甲酯(800.0mg,5.156mmol)。在室温下将混合物搅拌过夜,接着用DCM(300mL)稀释并用H2O(3×100mL)洗涤。将有机层用盐水(2×150mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(25% EtOAc/己烷)纯化,得到所需产物(1.2g,49.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C28H26N4O3的[M+H]计算值:467.21;实验值467.2。
步骤3:合成(R)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸钠
向(R)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸甲酯(300mg,0.643mmol)于THF(3mL)中的混合物中添加NaOH(38.58mg,0.965mmol)于H2O中的溶液。将所得混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到所需产物(400mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C27H24N4O3的[M+H]计算值:453.19;实验值453.2。
中间体A-35.合成(S)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015681
步骤1:合成(S)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸甲酯
在0℃下,向(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.18g,3.577mmol)于DCM(15mL)中的混合物中逐滴添加氯甲酸异丁酯(423.41mg,3.100mmol)和N-甲基吗啉(0.39mL,3.862mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌1小时,接着添加5-氨基-1-甲基-1H-咪唑-2-甲酸甲酯(370.0mg,2.385mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜。在0℃下用饱和NaHCO3淬灭反应并将所得混合物用DCM(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(150mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(100% EtOAc)纯化,得到所需产物(380mg,34.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C28H26N4O3的[M+H]计算值:467.21;实验值467.3。
步骤2:合成(S)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸
在0℃下,向(S)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸甲酯(380.0mg,0.815mmol)于MeOH(5mL)中的混合物中逐滴添加于H2O(3.6mL)中的NaOH(146.60mg,3.665mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌6小时,接着用1M HCl酸化至pH6。将所得混合物用DCM(2×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(150mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(350mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C27H24N4O3的[M-H]计算值:451.17;实验值451.1。
中间体A-36及A-37.合成(R)-N-甲基-N-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)甘氨酸及(S)-N-甲基-N-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)甘氨酸
Figure BDA0004194083620015691
步骤1:合成N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基甘氨酸苯甲酯
在0℃下,向[(叔丁氧基羰基)(甲基)氨基]乙酸(15.g,79.28mmol)于丙酮(150mL)中的搅拌的混合物中分数份添加BnBr(14.14mL,82.70mmol)和K2CO3(21.91g,158.55mmol)。在室温下将所得混合物搅拌4小时。将所得混合物过滤,用丙酮(3×100mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法(33% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(15.2g,68.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H21NO4的[M+Na]计算值:302.14;实验值302.0。
步骤2:合成甲基甘氨酸苯甲酯
在0℃下,向N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基甘氨酸苯甲酯(10.0g,35.80mmol)于DCM(100mL)中的搅拌的溶液中逐滴添加TFA(50mL)。在0℃下将所得混合物搅拌1小时,接着将所得混合物减压浓缩,得到所需产物(7.80g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C10H13NO2的[M+H]计算值:180.10;实验值179.1。
步骤3:合成N-甲基-N-(乙烯基磺酰基)甘氨酸苯甲酯
在-70℃下,向甲基甘氨酸苯甲酯(15.60g,87.04mmol)和Et3N(36.4mL,261.1mmol)于MeCN(300mL)中的溶液中添加2-氯乙烷磺酰氯(17.03g,104.47mmol)于MeCN(150mL)中的溶液。将所得混合物升温至室温并搅拌20分钟。将反应混合物冷却至-50℃,并且再将Et3N(36.4mL,261.1mmol)添加至反应混合物中。将反应混合物升温至室温并搅拌1小时。接着,在0℃下用H2O淬灭反应。用1M HCl水溶液将混合物酸化至pH 6,接着用DCM(800mL)萃取,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(33% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(7.53g,32.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H15NO4S的[M+H2O]计算值:287.08;实验值287.2。
步骤4:合成N-((1,2-二溴乙基)磺酰基)-N-甲基甘氨酸苯甲酯
在-20℃下,向N-甲基-N-(乙烯基磺酰基)甘氨酸苯甲酯(5.58g,20.7mmol)于DCM(50mL)中的溶液中添加Br2(1.06mL,6.64mmol)于DCM(10mL)中的溶液。将所得混合物升温至室温并搅拌过夜。接着,将反应混合物冷却至0℃并用饱和Na2S2O3水溶液(30mL)淬灭。将所得混合物用饱和Na2HCO3水溶液洗涤,接着用DCM(2×200mL)萃取,合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(33% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(5.1g,57.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H15Br2NO4S的[M+H2O]计算值:444.92;实验值444.9。
步骤5:合成(R)-N-甲基-N-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)甘氨酸苯甲酯及(S)-N-甲基-N-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)甘氨酸苯甲酯
向N-((1,2-二溴乙基)磺酰基)-N-甲基甘氨酸苯甲酯(7.20g,16.78mmol)和甲基胺盐酸盐(3.39g,50.2mmol)于DMSO(750mL)中的搅拌的溶液中添加Et3N(23.32mL,230.47mmol)。在室温下将所得混合物搅拌2小时,接着加热至75℃并搅拌过夜。将反应混合物冷却至室温并用EtOAc(2×1000mL)萃取。将合并的有机层用H2O(1500mL)和盐水(1500mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(EtOAc)纯化,得到非对映异构体混合物。将非对映异构体通过制备型SFC(10% EtOH/Hex)纯化,得到(R)-N-甲基-N-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)甘氨酸苯甲酯(500mg,31.3%产率)及(S)-N-甲基-N-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)甘氨酸苯甲酯(600mg,37.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H18N2O4S的[M+H]计算值:299.11;实验值299.0。
步骤6:合成(R)-N-甲基-N-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)甘氨酸
在氢气气氛(1atm)下,在室温下将(R)-N-甲基-N-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)甘氨酸苯甲酯(300.0mg)和Pd(OH)2/C(150.0mg)于THF中的悬浮液搅拌3小时。将混合物过滤,用MeOH(3×20mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液,得到所需产物(206mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C6H12N2O4S的[M+H]计算值:209.06;实验值209.0。
步骤7:合成(S)-N-甲基-N-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)甘氨酸
在氢气气氛(1atm)下,在室温下将(R)-N-甲基-N-((1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)甘氨酸苯甲酯(300.0mg,1.01mmol)和Pd(OH)2/C(150.0mg)于THF中的悬浮液搅拌3小时。将混合物过滤,用MeOH(3×20mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液,得到所需产物(216mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C6H12N2O4S的[M+H]计算值:209.06;实验值209.1。
中间体A-38.合成(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015721
步骤1:合成(E)-N-(环丙基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
向(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(4.0g,33.0mmol)和CuSO4(15.80g,99.01mmol)于DCM(200.0mL)中的悬浮液中添加环丙烷甲醛(4.63g,66.0mmol)。将所得混合物搅拌过夜,接着过滤,用DCM(3×100mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液,得到所需产物(3.5g,61.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H15NOS的[M+H]计算值:174.10;实验值174.1。
步骤2:合成(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下,向溴乙酸乙酯(481.91mg,2.886mmol)于THF(5.0mL)中的溶液中添加LiHMDS(2.90mL,2.90mmol)。在-78℃下将所得混合物搅拌2小时,接着添加(E)-N-(环丙基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(250.0mg,1.443mmol)中的溶液。在-78℃下将所得混合物搅拌2小时,接着在0℃下用H2O淬灭。将水层用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(17% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(250mg,66.8%产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H21NO3S的[M+H]计算值:260.13;实验值260.1。
步骤3:合成(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,将(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(500.0mg,1.928mmol)于THF(2.0mL)和H2O(2.0mL)中的溶液添加LiOH●H2O(121.34mg,2.89mmol)。将反应混合物搅拌1小时,接着用1M HCl(水溶液)酸化至pH 6。将所得混合物用EtOAc(2×10mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液,得到所需产物(400mg,89.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H17NO3S的[M+H]计算值:232.10;实验值232.0。
中间体A-39.合成(2R,3R)-3-(甲氧基甲基)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015731
步骤1:合成(E)-4-甲氧基丁-2-烯酸乙酯
向丁-2-炔酸乙酯(10.0g,89.18mmol)于MeOH(8.80mL,118.594mmol)和HOAc(1.05mL,18.3mmol)中的溶液中添加PPh3(1.20g,4.58mmol)于甲苯(60.0mL)中的溶液。将所得溶液加热至110℃并搅拌过夜。将反应混合物冷却至室温,接着用H2O(60mL)稀释。将所得溶液用EtOAc(2×60)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(9% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(4.9g,38.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C7H12O3的[M+H]计算值:145.09;实验值144.9。
步骤2:合成(2S,3R)-2,3-二羟基-4-甲氧基丁酸乙酯
向(E)-4-甲氧基丁-2-烯酸乙酯(5.0g,34.68mmol)和甲烷磺酰胺(3.30g,34.68mmol)于t-BuOH(150.0mL)和H2O(100.0mL)中的溶液中添加AD-mix-β(48.63g,62.43mmol)。将所得溶液加热至30℃并搅拌过夜。接着,将溶液冷却至室温并用KHSO4调至pH 2。将所得溶液用EtOAc(2×100mL)萃取,并将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(1.28g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C7H14O5的[M+H]计算值:179.09;实验值179.0。
步骤3:合成(4S,5R)-5-(甲氧基甲基)-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸乙酯2-氧化物
在0℃下,向(2S,3R)-2,3-二羟基-4-甲氧基丁酸乙酯(4.10g,23.01mmol)于DCM(20.0mL)中的溶液中添加SOCl2(5.47g,45.9mmol)。将所得混合物加热至50℃并搅拌3小时。接着,将反应混合物冷却至室温并减压浓缩,得到所需产物(4.0g,粗品)。
步骤4:合成(2R,3S)-2-叠氮基-3-羟基-4-甲氧基丁酸乙酯
在0℃下,向(4S,5R)-5-(甲氧基甲基)-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸乙酯2-氧化物(4.0g粗品,17.84mmol)于DMF(20.0mL)中的溶液中添加NaN3(5.80g,89.22mmol)。将所得混合物加热至35℃并搅拌过夜。接着,将反应混合物用H2O(200mL)稀释并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(17% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.0g,27.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C7H13N3O4的[M+H]计算值:204.10;实验值204.0。
步骤5:合成(2R,3R)-3-(甲氧基甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在0℃下,经30分钟向(2R,3S)-2-叠氮基-3-羟基-4-甲氧基丁酸乙酯(1.0g,4.92mmol)于DMF(10mL)中的溶液中分数份添加PPh3(1.29g,4.92mmol)。接着,将反应溶液升温至室温并搅拌30分钟。接着,将反应混合物加热至85℃并搅拌,直至反应完成。接着,将反应混合物减压浓缩并通过制备型TLC(33% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(480mg,61.3%产率)。LCMS(ESI)m/z:C7H13NO3的[M+H]计算值:160.10;实验值160.1。
步骤6:合成(2R,3R)-3-(甲氧基甲基)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在0℃下,向(2R,3R)-3-(甲氧基甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(480.0mg,3.02mmol)和Et3N(2.1mL,15.0mmol)于DCM(10mL)中的溶液中添加Trt-Cl(1.681g,6.031mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌2小时。将混合物浓缩,接着减压浓缩,并将残余物通过制备型TLC(5% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(700mg,粗品)。
步骤7:合成(2R,3R)-3-(甲氧基甲基)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
向(2R,3R)-3-(甲氧基甲基)-1-(三苯基甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(200.0mg,0.498mmol)于THF(5.0mL)和H2O(5mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(41.81mg,0.996mmol)。在室温下将所得溶液搅拌24小时。接着,将混合物用H2O(10mL)稀释并用EtOAc(20mL)萃取。接着,用饱和NH4Cl水溶液将水层酸化至pH 7并用EtOAc(2×10mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(60mg,32.3%产率)。LCMS(ESI)m/z:C24H23NO3的[M-H]计算值:372.16;实验值372.1。
中间体A-40.合成(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-(4-甲氧基苯基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015751
步骤1:(E)-N-(4-甲氧基苯亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
在70℃下,将(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(2.50g)及茴香醛(2.81g)于Ti(OEt)4(20.0mL)中的溶液搅拌1小时。将所得混合物冷却至室温,用EtOAc(60mL)稀释,接着倒入H2O中。将混合物过滤,并用EtOAc(3×50mL)洗涤滤饼。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(25% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(4g,81.0%产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H17NO2S的[M+H]计算值:240.11;实验值240.1。
步骤2:合成(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-(4-甲氧基苯基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下,向2-溴乙酸乙酯(5.60g,33.5mmol)于THF(100mL)中的溶液中添加LiHMDS(1M于THF中,34mL,33.473mmol)。30分钟后,添加(E)-N-(4-甲氧基苯亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(4g,16.74mmol)于THF(20mL)中的溶液。在-78℃下将所得混合物再搅拌3小时。接着用饱和NH4Cl水溶液淬灭反应。将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(25% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(2.7g,49.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C16H23NO4S的[M+H]计算值:326.14;实验值326.1。
步骤3:合成(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-(4-甲氧基苯基)氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-(4-甲氧基苯基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(800.0mg,2.68mmol)于THF(2.0mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(309.46mg,7.38mmol)于H2O(3.0mL)中的溶液。将所得混合物升温至室温并搅拌4小时。接着,用饱和NH4Cl水溶液将混合物酸化至pH 6,接着用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需产物(690mg,94.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H19NO4S的[M-H]计算值:296.10;实验值296.2。
中间体A-41.合成(2S,3R)-3-(4-甲氧基苯基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015771
步骤1:合成(2R,3S)-2,3-二羟基-3-(4-甲氧基苯基)丙酸乙酯
在0℃下,向对甲氧基肉桂酸乙酯(5.0g,24.24mmol)于tBuOH(70.0mL)和H2O(70.0mL)中的溶液中添加AD-mix-α(33.80g,43.39mmol)和甲烷磺酰胺(2.31mg,0.024mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌过夜。接着,将反应冷却至0℃并用KHSO4(水溶液)淬灭。将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×90mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(5.7g,88.1%产率)。
步骤2:合成(2R,3S)-3-羟基-3-(4-甲氧基苯基)-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)丙酸乙酯
在0℃下,向(2R,3S)-2,3-二羟基-3-(4-甲氧基苯基)丙酸乙酯(3.0g,12.49mmol)和Et3N(0.174mL,1.249mmol)于DCM(30.0mL)中的溶液中添加4-硝基苯磺酰氯(2.76g,12.49mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着用H2O稀释。将混合物用DCM(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(3.8g,68.0%产率)。LCMS(ESI)m/z:C18H19NO9S的[M+Na]计算值:448.07;实验值448.2。
步骤3:合成(2S,3S)-2-叠氮基-3-羟基-3-(4-甲氧基苯基)丙酸乙酯
在0℃下,向(2R,3S)-3-羟基-3-(4-甲氧基苯基)-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)丙酸乙酯(1.20g,2.82mmol)于THF中的溶液中添加TBAF(1M于THF中,5.64mL,5.64mmol)和TMSN3(648.79mg,5.64mmol)。将所得混合物加热至60℃并搅拌16小时。接着,将反应冷却至0℃并用饱和NH4Cl水溶液淬灭。将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用H2O(2×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(33%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(540mg,70.7%产率)。
步骤4:合成(2S,3R)-3-(4-甲氧基苯基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
向(2S,3S)-2-叠氮基-3-羟基-3-(4-甲氧基苯基)丙酸乙酯(440.0mg,1.659mmol)于DMF中的溶液中添加PPh3(522.06mg,1.99mmol)。在室温下将所得混合物搅拌30分钟,接着,加热至80℃并搅拌过夜。接着,将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用H2O(2×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(25%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(200mg,51.8%产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H15NO3的[M+H]计算值:222.12;实验值222.1。
步骤5:合成(2S,3R)-3-(4-甲氧基苯基)氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2S,3R)-3-(4-甲氧基苯基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(200.0mg,0.904mmol)于MeOH及H2O中的溶液中添加LiOH●H2O(86.6mg,3.62mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着用HCl(水溶液)中和至pH 7。将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用H2O(2×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(180mg,97.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H11NO3的[M-H]计算值:192.07;实验值192.0。
中间体A-42.合成(2R,3S)-3-(4-甲氧基苯基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015791
步骤1:合成(2S,3R)-2,3-二羟基-3-(4-甲氧基苯基)丙酸乙酯
在0℃下,向对甲氧基肉桂酸乙酯(5.0g,24.24mmol)于tBuOH(70.0mL)和H2O(70.0mL)中的溶液中添加AD-mix-β(33.80g,43.39mmol)和甲烷磺酰胺(2.31mg,0.024mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌过夜。接着,将反应冷却至0℃并用KHSO4(水溶液)淬灭。将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×90mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(5.7g,88.1%产率)。
步骤2:合成(2S,3R)-3-羟基-3-(4-甲氧基苯基)-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)丙酸乙酯
在0℃下,向(2S,3R)-2,3-二羟基-3-(4-甲氧基苯基)丙酸乙酯(5.80g,24.14mmol)和Et3N(10.1mL,72.42mmol)于DCM(30.0mL)中的溶液中添加4-硝基苯磺酰氯(5.34g,24.1mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着用H2O稀释。将混合物用DCM(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(7.2g,67.0%产率)。LCMS(ESI)m/z:C18H19NO9S的[M+H]计算值:426.09;实验值426.2。
步骤3:合成(2R,3R)-2-叠氮基-3-羟基-3-(4-甲氧基苯基)丙酸乙酯
在0℃下,向(2S,3R)-3-羟基-3-(4-甲氧基苯基)-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)丙酸乙酯(5.0g,11.75mmol)于THF中的溶液中添加TBAF(1M于THF中,23.5mL,23.51mmol)和TMSN3(2.7g,23.5mmol)。将所得混合物加热至60℃并搅拌16小时。接着,将反应冷却至0℃并用饱和NH4Cl水溶液淬灭。将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用H2O(2×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(33% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(2.3g,70.1%产率)。
步骤4:合成(2R,3S)-3-(4-甲氧基苯基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
向(2R,3R)-2-叠氮基-3-羟基-3-(4-甲氧基苯基)丙酸乙酯(2.30g,8.67mmol)于DMF中的溶液中添加PPh3(2.73g,10.4mmol)。在室温下将所得混合物搅拌30分钟,接着,加热至80℃并搅拌过夜。接着,将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用H2O(2×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(25%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.6g,79.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H15NO3的[M+H]计算值:222.12;实验值222.1。
步骤5:合成(2R,3S)-3-(4-甲氧基苯基)氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2S,3R)-3-(4-甲氧基苯基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(200.0mg,0.904mmol)于MeOH和H2O中的溶液中添加LiOH●H2O(86.6mg,3.62mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着用HCl(水溶液)中和至pH 7。将混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用H2O(2×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(180mg,97.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H11NO3的[M-H]计算值:192.07;实验值192.0。
中间体A-43.合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015811
步骤1:合成(S,E)-N-苯亚甲基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺在70℃下,将(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(2.50g,20.6mmol)、乙氧化钛(9.41g,41.25mmol)和苯甲醛(2.19g,20.7mmol)的溶液加热1小时,冷却,并用H2O(250mL)稀释。将水层用EtOAc(3×80mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需产物(4.3g,粗品),该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C11H15NOS的[M+H]计算值:210.10;实验值210.2。
步骤2:合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下,向溴乙酸乙酯(798mg,4.78mmol)于THF(15mL)中的溶液中添加LiHMDS(1M于THF中,4.78mL,4.78mmol)。1小时后,经20分钟分数份添加于THF(5mL)中的(S,E)-N-苯亚甲基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(500mg,2.39mmol)。在-78℃下将反应混合物搅拌2小时,接着通过添加饱和NH4Cl淬灭。将水层用EtOAc(3×40mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×30mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(30→60% MeCN/H2O,0.1%HCO2H)纯化,得到所需产物(480mg,61%产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H21NO3S的[M+H]计算值:296.13;实验值296.2。
步骤3:合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(600mg,2.03mmol)于THF(4.0mL)中的溶液中添加LiOH(97.2mg,4.06mmol)于H2O(4.0mL)中的溶液。在0℃下将所得混合物搅拌2小时,接着用1M HCl酸化至pH 5。将水层用EtOAc(3×40mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×20mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需化合物(450mg,粗品),该化合物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO3S的[M+H]计算值:268.10;实验值268.1。
中间体A-44.合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015821
步骤1:合成(R,E)-N-苯亚甲基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
在70℃下,将(R)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(2.50g,20.6mmol)、四乙氧化钛(9.41g,41.3mmol)和苯甲醛(2.19g,20.6mmol)的溶液加热1小时,冷却,并用H2O(250mL)稀释。将水层用EtOAc(3×90mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需产物(4.2g,粗品),该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C11H15NOS的[M+H]计算值:210.10;实验值210.1。
步骤2:合成基(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下,向溴乙酸乙酯(6.38g,38.2mmol)于THF(150mL)中的溶液中添加LiHMDS(1M于THF中,7.19mL,42.9mmol)。1小时后,经20分钟分数份添加于THF(50mL)中的(R,E)-N-苯亚甲基-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(4.0g,19.1mmol)。在-78℃下将反应混合物搅拌2小时,接着通过添加饱和NH4Cl淬灭。将水层用EtOAc(3×80mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×60mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。通过反相色谱法(30→60% MeCN/H2O,0.1%HCO2H)纯化,得到所需产物(3.9g,62%产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H21NO3S的[M+H]计算值:296.13;实验值296.2。
步骤3:合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-苯基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(200mg,0.677mmol)于THF(1.5mL)中的溶液中添加LiOH(32.4mg,1.35mmol)于H2O(1.3mL)中的溶液。在0℃下将所得混合物搅拌2小时,接着用1M HCl酸化至pH 5。将水层用EtOAc(3×20mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需化合物(220mg,粗品),该化合物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO3S的[M+H]计算值:268.10;实验值268.4。
中间体A-45和A-46.合成(S)-N-(1-(2-甲氧基乙基)氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酸和(R)-N-(1-(2-甲氧基乙基)氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酸
Figure BDA0004194083620015831
步骤1:合成N-丙烯酰基-N-甲基甘氨酸叔丁酯
在0℃下,向甲基甘氨酸叔丁酯盐酸盐(1.0g,5.5mmol)和NaHCO3(1.39g,16.5mmol)于THF(10mL)和H2O(5.0mL)中的混合物中添加丙烯酰氯(750mg,8.26mmol)。在室温下将所得溶液搅拌2小时,接着,通过添加H2O(50mL)淬灭反应。将水层用EtOAc(2×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(10→33% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(900mg,73.8%产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H17NO3的[M+H]计算值:200.13;实验值200.2。
步骤2:合成N-(2,3-二溴丙酰基)-N-甲基甘氨酸叔丁酯
在-20℃下,向N-丙烯酰基-N-甲基甘氨酸叔丁酯(2.0g,10.1mmol)于DCM(40mL)中的溶液中添加Br2(3.21g,20.1mmol)。在-20℃下将所得混合物搅拌2小时,接着通过添加Na2S2O3(100mL)淬灭。将水层用DCM(2×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,并减压浓缩,得到所需产物(2.4g,粗品),该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C10H17Br2NO3的[M+Na]计算值:381.96;实验值381.8。
步骤3:合成(S)-N-(1-(2-甲氧基乙基)氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酸叔丁酯和(R)-N-(1-(2-甲氧基乙基)氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酸叔丁酯
向N-(2,3-二溴丙酰基)-N-甲基甘氨酸叔丁酯(4.0g,11.1mmol)和2-甲氧基乙-1-胺(4.18g,55.7mmol)于THF(40mL)中的溶液中添加Et3N(4.66mL,33.4mmol)。在35℃下将所得溶液搅拌过夜,接着通过添加H2O淬灭。将水层用DCM(2×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(30→50% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物的混合物。将对映异构体通过手性制备型正相色谱法(己烷10mM NH3-MeOH/EtOH)分离,得到(S)-N-(1-(2-甲氧基乙基)氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酸叔丁酯(400mg,33.3%产率)及(R)-N-(1-(2-甲氧基乙基)氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酸叔丁酯(360mg,30%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H24N2O4的[M+H]计算值:273.18;实验值273.0。
步骤4:合成(S)-N-(1-(2-甲氧基乙基)氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酸
在0℃下,向(S)-N-(1-(2-甲氧基乙基)氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酸叔丁酯(250mg,0.918mmol)于DCM(6.0mL)中的溶液中添加TFA(3.0mL)。在0℃下将所得混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到所需产物(250mg,粗品),该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C9H16N2O4的[M+H]计算值:217.12;实验值217.1。
步骤5:合成(R)-N-(1-(2-甲氧基乙基)氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酸
在0℃下,向(R)-N-(1-(2-甲氧基乙基)氮杂环丙烷-2-羰基)-N-甲基甘氨酸叔丁酯(180mg,0.661mmol)于DCM(6.0mL)中的溶液中添加TFA(3.0mL)。在0℃下将所得混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到所需产物(150mg,粗品),该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C9H16N2O4的[M+H]计算值:217.12;实验值217.1。
中间体A-47和A-48.合成N-甲基-N-(1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸和N-甲基-N-(1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015861
步骤1:合成N-甲基-N-(1-(乙烯基磺酰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在-70℃下,向2-氯乙烷磺酰氯(1.91g,11.7mmol)于THF(20mL)中的溶液中添加N-甲基-N-(哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(2.0g,7.8mmol),随后添加Et3N(790μL,780μmol)。升温至-50℃后,再添加Et3N(790μL,780μmol)并将反应混合物升温至室温。1小时后,在0℃下通过添加H2O(30mL)淬灭反应,用1M HCl酸化至pH 6,并用CHCl3(3×30mL)萃取。将合并的有机层用MgSO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(560mg,20.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H26N2O5S的[M+H]计算值:347.17;实验值347.2。
步骤2:合成N-(1-((1,2-二溴乙基)磺酰基)哌啶-4-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
在室温下,向N-甲基-N-(1-(乙烯基磺酰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(580mg,1.67mmol)于CCl4(28mL)中的溶液中添加Br2(580mg,1.67mmol)。在室温下将所得混合物搅拌过夜,接着通过添加饱和NaHCO3(30mL)淬灭。将水层用DCM(3×30mL)萃取,并将合并的有机层用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需产物,该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C15H26Br2N2O5S的[M+H]计算值:506.99;实验值506.9。
步骤3:合成N-甲基-N-(1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯和N-甲基-N-(1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯
向N-(1-((1,2-二溴乙基)磺酰基)哌啶-4-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(4.80g,9.481mmol)于DMSO(48mL)中的溶液中添加甲胺盐酸盐(1.92g,28.436mmol)和Et3N(13.2mL,94.8mmol)。将反应混合物加热至75℃并搅拌过夜。接着,将混合物冷却至0℃,用NH4Cl稀释,并用EtOAc(600mL)萃取。将有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩。通过正相色谱法(86% EtOAc/己烷)纯化,得到所需产物的混合物。将非对映异构体通过制备型SFC色谱法(20%IPA/CO2)纯化,得到N-甲基-N-(1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(700mg,38.9%产率)和N-甲基-N-(1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(790mg,43.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C16H29N3O5S的[M+H]计算值:376.19;实验值376.1。
步骤4:合成N-甲基-N-(1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(200mg,0.533mmol)于THF(2.0mL)中的溶液中添加1M LiOH(1mL)。在室温下将所得混合物搅拌3小时,接着用1M HCl酸化至pH 6。将水层用EtOAc(3×10mL)萃取,并将合并的有机层用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物,该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C15H27N3O5S的[M+H]计算值:362.18;实验值362.2。
步骤5:合成N-甲基-N-(1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)哌啶-4-羰基)-L-缬氨酸甲酯(300mg,0.799mmol)于THF(3.0mL)中的溶液中添加1M LiOH(3.0mL)。在室温下将所得混合物搅拌3小时,接着用1M HCl酸化至pH 6。将水层用EtOAc(3×10mL)萃取,并将合并的有机层用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需产物,该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C15H27N3O5S的[M+H]计算值:362.18;实验值362.2。
中间体A-49和A-50.合成N-甲基-N-(1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸和N-甲基-N-(1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620015881
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步骤1:合成N-甲基-N-(1-(乙烯基磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在-70℃下,向2-氯乙烷磺酰氯(357mg,2.19mmol)于Et2O(4.0mL)中的溶液中添加N-(氮杂环丁烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(500mg,2.19mmol)的Et2O(4.0mL)溶液,随后添加Et3N(0.304mL,2.19mmol)。在-50℃下将所得混合物搅拌30分钟,此时,添加Et3N(0.304mL,2.19mmol)。在室温下将所得混合物搅拌1小时,接着在0℃下用H2O淬灭。用1MHCl将混合物酸化至pH 6并用CHCl3(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(180mg,25.8%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H22N2O5S的[M+H]计算值:319.13;实验值319.1。
步骤2:合成N-(1-((1,2-二溴乙基)磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
在室温下,向N-甲基-N-(1-(乙烯基磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(460mg,1.45mmol)于CCl4(6.0mL)中的溶液中添加Br2(346mg,2.17mmol)的CCl4(2.0mL)溶液。将所得混合物搅拌过夜,接着在0℃下通过添加饱和NaHCO3及Na2S2O3淬灭。将水层用DCM(3×10mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,并减压浓缩,得到所需产物(500mg),其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C13H22Br2N2O5S的[M+H]计算值:478.97;实验值478.0。
步骤3:合成N-甲基-N-(1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯及N-甲基-N-(1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯
向N-(1-((1,2-二溴乙基)磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(260mg,0.54mmol)于DMSO(4.0mL)中的溶液中添加甲胺盐酸盐(110.0mg,1.63mmol)和Et3N(0.758mL,5.44mmol)。将所得混合物加热至75℃并搅拌过夜。接着,将混合物冷却至室温,用H2O(10mL)稀释,并用EtOAc(3×5mL)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。通过正相色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物的混合物。将非对映异构体通过手性制备型正相色谱法(己烷/10mM NH3-MeOH/IPA)分离,得到N-甲基-N-(1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(0.59g,35%产率)和N-甲基-N-(1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(0.56g,33%产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H25N3O5S的[M+H]计算值:348.16;实验值348.2。
步骤4:合成N-甲基-N-(1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(1-(((R)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(225.0mg,0.65mmol)于THF(1.5mL)中的溶液中添加溶解于H2O(1.5mL)中的LiOH(77.0mg,3.23mmol)。在室温下将所得混合物搅拌2小时,接着用1M HCl酸化至pH 6。将水层用EtOAc萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(270mg),该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C13H23N3O5S的[M+H]计算值:334.15;实验值334.0。
步骤5:合成N-甲基-N-(1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(1-(((S)-1-甲基氮杂环丙烷-2-基)磺酰基)氮杂环丁烷-3-羰基)-L-缬氨酸甲酯(365.0mg,1.05mmol)于THF(2.0mL)和H2O(2.0mL)中的溶液中添加LiOH水合物(132.0mg,3.15mmol)。在室温下将所得混合物搅拌2小时,接着用1M HCl酸化至pH 6,并用H2O(20mL)稀释。将水层用EtOAc萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(257mg,粗品),该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C13H23N3O5S的[M+H]计算值:334.15;实验值334.3。
中间体A-51.合成2-((1R,5S)-2,4-二氧代-6-三苯甲基-3,6-二氮杂双环[3.1.0]己-3-基)乙酸
Figure BDA0004194083620015911
步骤1:合成2-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1H-吡咯-1-基)乙酸苯甲酯
在0℃下,向2-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1H-吡咯-1-基)乙酸(5.0g,32.2mmol)和Et3N(13.5mL,96.7mmol)于THF(80mL)中的溶液中添加苯甲基溴(11.03g,64.5mmol)。在室温下将所得混合物搅拌过夜,接着过滤。用THF(3×40mL)洗涤滤饼并减压浓缩滤液。通过硅胶色谱法(16% EtOAc/己烷)纯化,得到所需产物(4.4g,55.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H11NO4的[2M+Na]计算值:513.14;实验值513.2。
步骤2:合成2-((1R,5S)-2,4-二氧代-6-三苯甲基-3,6-二氮杂双环[3.1.0]己-3-基)乙酸苯甲酯
向2-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1H-吡咯-1-基)乙酸苯甲酯(1.0g,4.0mmol)于甲苯(10mL)中的溶液中添加三苯甲基叠氮化物(1.36g,4.89mmol)。在120℃下将所得混合物搅拌过夜,接着减压浓缩。通过反相急骤色谱法(50→80% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(400mg,19.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C32H26N2O4的[M+Na]计算值:525.19;实验值525.2。
步骤3:合成2-((1R,5S)-2,4-二氧代-6-三苯甲基-3,6-二氮杂双环[3.1.0]己-3-基)乙酸
向2-((1R,5S)-2,4-二氧代-6-三苯甲基-3,6-二氮杂双环[3.1.0]己-3-基)乙酸苯甲酯(220mg,0.438mmol)于THF(8.0mL)中的溶液中添加Pd(OH)2/C(60mg)。使用氢气球使所得溶液处于氢气气氛中,保持3小时,经硅藻土过滤,并减压浓缩,得到所需产物(160mg,粗品),该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C25H20N2O4的[M-H]计算值:411.13;实验值411.2。
中间体A-52.合成(S)-3-甲基-2-(5-氧代-2-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,6-二氮杂螺[3.4]辛-6-基)丁酸
Figure BDA0004194083620015921
步骤1:合成3-烯丙基氮杂环丁烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯
在-78℃下,向氮杂环丁烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(20.0g,92.9mmol)和LiHMDS(140mL,1M于THF中,139mmol)于THF(200mL)中的溶液中添加烯丙基溴(16.9g,139mmol)。在室温下将所得溶液搅拌过夜,接着通过添加饱和NH4Cl(100mL)淬灭并用EtOAc(800mL)稀释。将有机层用盐水(3×300mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(17% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(15.0g,63.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H21NO4的[M+H-tBu]计算值:200.10;实验值200.0
步骤2:合成3-(2-氧代乙基)氮杂环丁烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯
在0℃下,向3-烯丙基氮杂环丁烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(6.0g,23mmol)和2,6-二甲基吡啶(504mg,47.0mmol)于二噁烷(60mL)和H2O(60mL)中的溶液中添加K2OsO4·2H2O(433mg,1.18mmol)。在室温下将所得混合物搅拌15分钟,接着在0℃下添加NaIO4(20.1g,94.0mmol)。在室温下将反应搅拌3小时,接着在0℃下用饱和Na2S2O3淬灭。将水层用EtOAc(2×400mL)萃取,并将合并的有机层用1M HCl(2×80mL)和盐水(2×100mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需产物(2.84g,粗品),其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C12H19NO5的[M-H]计算值:256.12;实验值256.0
步骤3:合成(S)-3-(2-((1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)乙基)氮杂环丁烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯
在0℃下,向3-(2-氧代乙基)氮杂环丁烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(13.0g,50.5mmol)和L-缬氨酸甲酯盐酸盐(7.29g,55.6mmol)于MeOH(130mL)中的溶液中添加ZnCl2(7.57g,55.6mmol)和NaBH3CN(6.35g,101mmol)。在室温下将所得混合物搅拌过夜,部分地减压浓缩并用EtOAc(500mL)稀释。将所得溶液用盐水(3×200mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(10→66% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(7.72g,41.0%产率)。LCMS(ESI)m/z:C18H32N2O6的[M+H]计算值:373.24;实验值373.1。
步骤4:合成(S)-6-(1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-5-氧代-2,6-二氮杂螺[3.4]辛烷-2-甲酸叔丁酯
在室温下,向(S)-3-(2-((1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)乙基)氮杂环丁烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(6.0g,16mmol)和DIPEA(28.0mL,161mmol)于甲苯(60mL)中的溶液中添加DMAP(197mg,1.61mmol)。在80℃下将所得混合物搅拌过夜,用EtOAc(50mL)稀释,用H2O(50mL)和盐水(3×50mL)洗涤,用Na2SO4干燥,并过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(45→80% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(4.3g,78.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C17H28N2O5的[M+H-tBu]计算值:285.15;实验值285.0
步骤5:合成(S)-3-甲基-2-(5-氧代-2,6-二氮杂螺[3.4]辛-6-基)丁酸甲酯
在室温下,向(S)-6-(1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-5-氧代-2,6-二氮杂螺[3.4]辛烷-2-甲酸叔丁酯(2.7g,7.9mmol)于DCM(27mL)中的溶液中添加TFA(8.10mL,71.0mmol)。将所得混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到所需产物(1.70g,粗品),该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C12H20N2O3的[M+H]计算值:241.16;实验值240.1。
步骤6:合成(S)-3-甲基-2-(5-氧代-2-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,6-二氮杂螺[3.4]辛-6-基)丁酸甲酯
在0℃下,向(S)-3-甲基-2-(5-氧代-2,6-二氮杂螺[3.4]辛-6-基)丁酸甲酯(700mg,2.91mmol)和(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.15g,3.50mmol)于DMF(7.0mL)中的溶液中添加DIPEA(2.5mL,14.6mmol)。30分钟后,添加HATU(1.66g,4.37mmol)并在室温下将所得混合物搅拌1小时。接着,将反应用EtOAc(20mL)稀释,并将有机层用饱和NH4Cl(50mL)和盐水(3×50mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(0→80%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(300mg,18.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H37N3O4的[M+H]计算值:552.29;实验值552.2。
步骤7:合成(S)-3-甲基-2-(5-氧代-2-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,6-二氮杂螺[3.4]辛-6-基)丁酸
在0℃下,向(S)-3-甲基-2-(5-氧代-2-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,6-二氮杂螺[3.4]辛-6-基)丁酸甲酯(700mg,1.27mmol)于THF(10mL)和H2O(2.0mL)中的溶液中添加LiOH(152mg,6.34mmol)。30分钟后,将反应混合物升温至室温1小时,接着用1MHCl酸化至pH 6。将水层用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(300mg,18.7%产率),其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C33H35N3O4的[M+H]计算值:538.27;实验值538.2。
中间体A-53.合成(S)-3-甲基-2-(5-氧代-2-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,6-二氮杂螺[3.4]辛-6-基)丁酸
Figure BDA0004194083620015951
步骤1:合成(S)-3-甲基-2-(5-氧代-2-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,6-二氮杂螺[3.4]辛-6-基)丁酸甲酯
在0℃下,向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.0g,3.0mmol)和(S)-3-甲基-2-(5-氧代-2,6-二氮杂螺[3.4]辛-6-基)丁酸甲酯(875mg,3.64mmol)于DMF(10mL)中的溶液中添加DIPEA(2.64mL,15.2mmol)。30分钟后,添加HATU(1.73g,4.554mmol)并在室温下将所得混合物搅拌1小时。接着,用EtOAc(20mL)稀释反应物并将有机层用饱和NH4Cl(50mL)和盐水(3×50mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→80% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(789mg,47%产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H37N3O4的[M+H]计算值:552.29;实验值552.3。
步骤2:合成(S)-3-甲基-2-(5-氧代-2-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,6-二氮杂螺[3.4]辛-6-基)丁酸
在0℃下,向(S)-3-甲基-2-(5-氧代-2-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,6-二氮杂螺[3.4]辛-6-基)丁酸甲酯(900mg,1.63mmol)于THF(10mL)和H2O(2.5mL)中的搅拌的溶液中添加LiOH(156mg,6.53mmol)。30分钟后,将反应混合物升温至室温且持续1小时,接着用1M HCl酸化至pH 6。将水层用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(240mg,27.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H35N3O4的[M+H]计算值:538.27;实验值538.2。
中间体A-54.合成(S)-1-((R)-2-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-1-羰基)吡咯烷-3-甲酸
Figure BDA0004194083620015961
步骤1:合成(R)-氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯
在氢气气氛(1atm)下,将(R)-氮杂环丙烷-1,2-二甲酸1-苯甲酯2-甲酯(1.50g,6.4mmol)和Pd/C(300mg,2.8mmol)于THF(15mL)中的悬浮液搅拌3小时,随后通过过滤移除固体。将粗溶液减压浓缩,得到所需产物(600mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C4H7NO2的[M+H]计算值:102.06;实验值102.3。
步骤2:合成(S)-1-((R)-2-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-1-羰基)吡咯烷-3-甲酸苯甲酯
在-10℃下,向(R)-氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯(1.0g,9.90mmol)和(S)-吡咯烷-3-甲酸苯甲酯(2.63g,10.9mmol,HCl盐)于DCM(30.0mL)中的溶液中添加DIPEA(10.3mL,59.3mmol),随后添加三光气(880mg,2.97mmol)。将所得溶液搅拌30分钟,接着通过添加H2O(50mL)淬灭。将水层用DCM(2×100mL)萃取,用盐水(2×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,并减压浓缩。通过制备型TLC(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.30g,28%产率)。LCMS(ESI)m/z:C17H20N2O5的[M+H]计算值:333.15;实验值333.2。
步骤3:合成(S)-1-((R)-2-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-1-羰基)吡咯烷-3-甲酸
在H2下,向(S)-1-((R)-2-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-1-羰基)吡咯烷-3-甲酸苯甲酯(200mg,600μmol)于MeOH(5mL)和DCM(5mL)中的溶液中添加Pd(OH)2/C(130mg,90μmol)。在室温下将所得混合物搅拌30分钟,接着将混合物过滤。用MeOH(2×10mL)洗涤滤饼并减压浓缩滤液,得到呈灰白色固体状的所需产物(140mg,96%产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H14N2O5的[M+H]计算值:243.10;实验值243.3。
中间体A-55.合成(S)-1-((S)-2-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-1-羰基)吡咯烷-3-甲酸
Figure BDA0004194083620015971
步骤1:合成(S)-氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯
在氢气气氛(1atm)下,将(S)-氮杂环丙烷-1,2-二甲酸1-苯甲酯2-甲酯(200mg,850μmol)及Pd/C(20mg,38μmol)于THF(4.0mL)中的悬浮液搅拌2小时,随后通过过滤移除固体。将粗溶液减压浓缩,得到所需产物(92mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C4H7NO2的[M+H]计算值:102.06;实验值102.3。
步骤2:合成(S)-1-((S)-2-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-1-羰基)吡咯烷-3-甲酸苯甲酯
在-10℃下,向(S)-氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯(900mg,8.9mmol)和(S)-吡咯烷-3-甲酸苯甲酯(2.37g,9.80mmol,盐酸盐)于DCM(30mL)中的溶液中添加DIPEA(9.30mL,53.4mmol),随后添加三光气(790mg,2.67mmol)。将所得溶液搅拌30分钟,接着通过添加H2O(50mL)淬灭。将水层用DCM(2×100mL)萃取,用盐水(2×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过制备型TLC(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈灰白色固体状的所需产物(360mg,8.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C17H20N2O5的[M+H]计算值:333.15;实验值333.2。
步骤3:合成(S)-1-((S)-2-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-1-羰基)吡咯烷-3-甲酸
在H2下,向(S)-1-((S)-2-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-1-羰基)吡咯烷-3-甲酸苯甲酯(130mg,390μmol)于MeOH(3mL)和DCM(3mL)中的溶液中添加Pd(OH)2/C(55mg,39μmol)。在室温下将所得溶液搅拌30分钟,接着将反应混合物过滤。用MeOH(2×10mL)洗涤滤饼并减压浓缩滤液,得到呈灰白色固体状的所需产物(90mg,95%产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H14N2O5的[M+H]计算值:243.10;实验值243.3。
中间体A-56.合成(2R,3S)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620015981
步骤1:合成(2S,3R)-3-环丙基-2,3-二羟基丙酸乙酯
在0℃下搅拌(E)-3-环丙基丙烯酸乙酯(10.4mL,71mmol)于tert-BuOH(270mL)和H2O(270mL)中的溶液。5分钟后,添加MsNH2(6.8g,71mmol)和(DHQD)2PHAL(100g,130mmol)并将反应混合物升温至室温。搅拌过夜后,添加饱和Na2SO3并将混合物搅拌30分钟。用KH2PO4将混合物酸化至pH 6。通过硅胶柱色谱法(33% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(5.5g,44%产率)。
步骤2:合成(2S,3R)-3-环丙基-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)丙酸乙酯
在0℃下搅拌(2S,3R)-3-环丙基-2,3-二羟基丙酸乙酯(5.40g,31.0mmol)和Et3N(13.0mL,93.0mmol)于DCM(20mL)中的溶液并添加4-硝基苯磺酰氯(6.53g,29.5mmol)于DCM(10mL)中的溶液。将反应混合物搅拌1.5小时,接着用DCM(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(33% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(6.9g,62%产率)。
步骤3:合成(2R,3R)-2-叠氮基-3-环丙基-3-羟基丙酸乙酯
将(2S,3R)-3-环丙基-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)丙酸乙酯(6.90g,19.2mmol)和NaN3(6.24g,96.0mmol)于DMF(70.0mL)中的混合物加热至50℃。将反应混合物搅拌5小时,接着用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(20% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(2.8g,73%产率)。
步骤4:合成(2R,3S)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在0℃下搅拌三苯基膦(1.84g,7.02mmol)于DMF(5mL)中的混合物。5分钟后,添加(2R,3R)-2-叠氮基-3-环丙基-3-羟基丙酸乙酯(1.40g,7.03mmol)并将反应升温至室温。将反应混合物加热至80℃并搅拌1小时。接着,将混合物冷却至室温并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(20% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(230mg,46%产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H13NO2的[M+H]计算值:156.10;实验值156.2。
步骤5:合成(2R,3S)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸锂
向(2R,3S)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(230mg,1.5mmol)于MeOH(3.0mL)中的混合物中添加LiOH·H2O(125mg,3.0mmol)。将反应搅拌3小时,接着过滤。减压浓缩滤液,得到所需产物(150mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C6H9NO2的[M+H]计算值:128.07;实验值128.2。
中间体A-57.合成(2R,3S)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016001
步骤1:合成(2S,3R)-3-环丙基-2,3-二羟基丙酸乙酯
在0℃下搅拌(E)-3-环丙基丙烯酸乙酯(10.4mL,71mmol)于tert-BuOH(270mL)和H2O(270mL)中的溶液。5分钟后,添加MsNH2(6.8g,71mmol)和(DHQD)2PHAL(100g,130mmol)并将反应混合物升温至室温。搅拌过夜后,添加饱和Na2SO3并将混合物搅拌30分钟。用KH2PO4将混合物酸化至pH 6。通过硅胶柱色谱法(33% EtOAC/石油醚)纯化,得到所需产物(5.5g,44%产率)。
步骤2:合成(2S,3R)-3-环丙基-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)丙酸乙酯
在0℃下搅拌(2S,3R)-3-环丙基-2,3-二羟基丙酸乙酯(5.40g,31.0mmol)和Et3N(13.0mL,93.0mmol)于DCM(20mL)中的溶液并添加4-硝基苯磺酰氯(6.53g,29.5mmol)于DCM(10mL)中的溶液。将反应混合物搅拌1.5小时,接着用DCM(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(33% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(6.9g,62%产率)。
步骤3:合成(2R,3R)-2-叠氮基-3-环丙基-3-羟基丙酸乙酯
将(2S,3R)-3-环丙基-3-羟基-2-(((4-硝基苯基)磺酰基)氧基)丙酸乙酯(6.90g,19.2mmol)和NaN3(6.24g,96.0mmol)于DMF(70.0mL)中的混合物加热至50℃。将反应混合物搅拌5小时,接着用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(20% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(2.8g,73%产率)。
步骤4:合成(2R,3S)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在0℃下搅拌三苯基膦(1.84g,7.02mmol)于DMF(5mL)中的混合物。5分钟后,添加(2R,3R)-2-叠氮基-3-环丙基-3-羟基丙酸乙酯(1.40g,7.03mmol)并将反应升温至室温。将反应混合物加热至80℃并搅拌1小时。接着,将混合物冷却至室温并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(20% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(230mg,46%产率)。LCMS(ESI)m/z:C8H13NO2的[M+H]计算值:156.10;实验值156.2。
步骤5:合成(2R,3S)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸锂
向(2R,3S)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(230mg,1.5mmol)于MeOH(3.0mL)中的混合物中添加LiOH·H2O(125mg,3.0mmol)。将反应搅拌3小时,接着过滤。减压浓缩滤液,得到所需产物(150mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C6H9NO2的[M+H]计算值:128.07;实验值128.2。
中间体A-58.合成(2S,3R)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016011
步骤1:合成(2S,3R)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在0℃下搅拌PPh3(1.4g,5.4mmol)于DMF(15.0mL)中的混合物。30分钟后,添加(2S,3S)-2-叠氮基-3-环丙基-3-羟基丙酸乙酯(980mg,4.92mmol)。将反应混合物加热至80℃。2小时后,通过添加H2O(20mL)淬灭反应并用EtOAc(3×30mL)萃取。通过硅胶柱色谱法(17% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(500mg,65%产率)。
步骤2:合成(2S,3R)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸锂
向(2S,3R)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(450mg,2.9mmol)于THF(6.0mL)和H2O(2.0mL)中的溶液中添加LiOH(90mg,3.8mmol)。将反应搅拌2小时,接着过滤。减压浓缩滤液,得到所需产物(300mg,粗品)。
中间体A-59.合成(R)-3-甲基-2-(((R)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)甲基)丁酸
Figure BDA0004194083620016021
步骤1:合成(R)-2-(((叔丁氧基羰基)(甲基)氨基)甲基)-3-甲基丁酸甲酯
在0℃下,向(R)-2-(((叔丁氧基羰基)氨基)甲基)-3-甲基丁酸(500mg,2.16mmol)于DMF(10.0mL)中的溶液中添加NaH(130mg,5.40mmol)。30分钟后,添加MeI(540μL,8.65mmol)并将反应升温至室温。2小时后,将反应冷却至0℃并通过添加饱和NH4Cl水溶液(10mL)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3×20mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(40mL)洗涤,用Na2SO4干燥,并减压浓缩。通过制备型TLC(9%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(500mg,89.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H25NO4的[M+H]计算值:260.19;实验值260.2。
步骤2:合成(R)-3-甲基-2-((甲基氨基)甲基)丁酸甲酯
在0℃下,向(R)-2-(((叔丁氧基羰基)(甲基)氨基)甲基)-3-甲基丁酸甲酯(500mg,1.93mmol)于DCM(5.0mL)中的溶液中逐滴添加TFA(2.50mL)。将所得混合物升温至室温。2小时后,将反应混合物减压浓缩,得到呈黄色固体状的所需产物(600mg,粗品)。
步骤3:合成(R)-3-甲基-2-(((R)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)甲基)丁酸甲酯
在0℃下,向(R)-3-甲基-2-((甲基氨基)甲基)丁酸甲酯(550mg,3.45mmol)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.25g,3.80mmol)于DCM(5.0mL)中的溶液中添加DIPEA(1.81mL,10.4mmol),随后添加HATU(1.58g,4.15mmol)。将所得混合物升温至室温。2小时后,用H2O(30mL)淬灭反应并用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,用Na2SO4干燥,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(9% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈黄色油状的所需产物(300mg,19%产率)。LCMS(ESI)m/z:C30H34N2O3的[M+H]计算值:471.27;实验值471.3。
步骤4:合成(R)-3-甲基-2-(((R)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)甲基)丁酸
在0℃下,向(R)-3-甲基-2-(((R)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)甲基)丁酸甲酯(200mg,0.425mmol)于THF(2.0mL)中的溶液中逐滴添加于H2O(2.0mL)中的LiOH·H2O(89mg,2.13mmol)。将所得混合物升温至室温。5小时后,用1M HCl将混合物中和至pH7。将反应物用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,用Na2SO4干燥,并减压浓缩,得到呈灰白色固体状的产物(200mg,粗品)。将粗产物不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI)m/z:C29H32N2O3的[M+H]计算值:457.25;实验值457.2。
中间体A-60.合成(R)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸钠
Figure BDA0004194083620016041
步骤1:合成5-氨基-1-甲基-1H-咪唑-2-甲酸甲酯
在氢气气氛(1atm)下,在室温下,将1-甲基-5-硝基-1H-咪唑-2-甲酸甲酯(1.0g,5.401mmol)和Pd/C(500.0mg)于MeOH(15mL)中的混合物搅拌3小时。将混合物过滤并用MeOH(3×20mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到所需产物(1.0g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C6H9N3O2的[M+Na]计算值:156.08;实验值156.1。
步骤2:合成(R)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1-咪唑-2-甲酸甲酯
在0℃下,经30分钟将(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(2.55g,7.741mmol)于DCM(12.0mL)中的溶液分数份添加至氯甲酸异丁酯(845.1mg,6.187mmol)和N-甲基吗啉(1.04g,10.282mmol)于DCM中的溶液中。接着,在0℃下向混合物添加5-氨基-1-甲基-1H-咪唑-2-甲酸甲酯(800.0mg,5.156mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌过夜。将混合物用DCM(300mL)稀释并用H2O(3×100mL)洗涤,用盐水(2×150mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(25% EtOAc/己烷)纯化,得到最终产物(1.2g,49.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C28H26N4O3的[M+H]计算值:467.21;实验值467.2。
步骤3:合成(R)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸钠
在室温下,向(R)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1-咪唑-2-甲酸甲酯(300.0mg,0.643mmol)于THF(3mL)中的溶液中添加NaOH·H2O(38.6mg,0.965mmol)。将所得溶液升温至室温并搅拌2小时。将溶液减压浓缩,得到所需产物(400mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C27H24N4O3的[M+H]计算值:453.19;实验值453.2。
中间体A-61.合成(S)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016051
步骤1:合成(S)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸甲酯
在0℃下,向(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.18g,3.577mmol)于DCM(15mL)中的溶液中添加氯甲酸异丁酯(423.4mg,3.100mmol)和N-甲基吗啉(0.39mL)3.862mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌1小时,接着添加5-氨基-1-甲基-1H-咪唑-2-甲酸甲酯(370.0mg,2.385mmol),并将所得混合物升温至室温并搅拌过夜。在0℃下,将反应混合物用饱和NaHCO3水溶液淬灭,随后用DCM(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(150mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将所得残余物通过硅胶色谱法(100% EtOAc)纯化,得到呈黄色固体状的最终产物(380mg,34.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C28H26N4O3的[M+Na]计算值:467.21;实验值467.3。
步骤2:合成(S)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸
在0℃下,向NaOH(146.6mg,3.665mmol)于H2O(3.6mL)中的溶液中添加(S)-1-甲基-5-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酸甲酯(380.0mg,0.815mmol)于MeOH(5mL)中的溶液。将所得溶液升温至室温并搅拌6小时。用1M HCl水溶液将混合物酸化至pH 6,随后用DCM(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(150mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(350mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C27H24N4O3的[M+H]计算值:451.18;实验值451.1。
中间体A-62.合成4-((2S)-1-(叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2-基)苯甲酸
Figure BDA0004194083620016061
/>
步骤1:合成(E)-4-(((叔丁基亚磺酰基)亚氨基)甲基)苯甲酸甲酯
向4-甲酰基苯甲酸甲酯(100.0mg,0.609mmol)和2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(76.0mg,0.627mmol)于DCM(2.0mL)中的溶液中添加CuSO4(291.7mg,1.827mmol)。在室温下,将所得溶液搅拌过夜,接着过滤。用EtOAc(3×200mL)洗涤滤饼并减压浓缩滤液。将所得残余物通过硅胶柱色谱法(67% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(2g,61.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO3S的[M+H]计算值:268.10;实验值268.0。
步骤2:合成4-((2S)-1-(叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2-基)苯甲酸甲酯
在室温下,将(E)-4-(((叔丁基亚磺酰基)亚氨基)甲基)苯甲酸甲酯(500.0mg,1.863mmol)、Me3S+I-(1.14g,5.590mmol)和60% NaH(134.15mg,5.590mmol)溶解于DMSO(10.0mL)中。将所得混合物搅拌2小时,接着通过添加饱和NH4Cl水溶液(10mL)淬灭反应。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将所得残余物通过硅胶色谱法(10% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(300mg,57.0%产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H19NO3S的[M+H]计算值:282.12;实验值282.1。
步骤3:合成4-((2S)-1-(叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2-基)苯甲酸
向4-((2S)-1-(叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2-基)苯甲酸甲酯(400.0mg,1.422mmol)于THF(5.0mL)和H2O(1.0mL)中的溶液中添加LiOH(103.0mg,4.301mmol)。在室温下,将所得混合物搅拌过夜,接着用1M HCl酸化至约pH3。将混合物用EtOAc(3×200mL)萃取,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将所得残余物通过制备型TLC(10% MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(130mg,91.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO3S的[M-H]计算值:266.09;实验值266.0。
中间体A-63.合成(S)-3-甲基-2-((R)-2-氧代-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡咯烷-1-基)丁酸
Figure BDA0004194083620016071
步骤1:合成(S)-2-((R)-3-氨基-2-氧代吡咯烷-1-基)-3-甲基丁酸苯甲酯
在0℃下,向(S)-2-((R)-3-((叔丁氧基羰基)氨基)-2-氧代吡咯烷-1-基)-3-甲基丁酸苯甲酯(1.0g,2.561mmol)于DCM(10.0mL)中的溶液中添加4M HCl的1,4-二噁烷溶液(5.0mL)。在氩气氛下,在室温下将所得混合物搅拌2小时。将所得混合物减压浓缩,得到呈黄色固体状的所需粗产物(890mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C16H22N2O3的[M+H]计算值:291.17;实验值291.1。
步骤2:合成(S)-3-甲基-2-((R)-2-氧代-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡咯烷-1-基)丁酸苯甲酯
在0℃下,向(S)-2-((R)-3-氨基-2-氧代吡咯烷-1-基)-3-甲基丁酸苯甲酯(450.0mg,1.550mmol)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(765.8mg,2.325mmol)于DMF中的溶液中逐滴添加HATU(1.179g,3.100mmol)和DIPEA(1.35mL,7.75mmol)。在室温下将所得混合物搅拌2小时,接着用EtOAc(2×100mL)萃取。将合并的有机层用H2O和盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将所得残余物通过硅胶色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(470mg,50.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C38H39N3O4的[M+H]计算值:602.31;实验值602.3。
步骤3:合成(S)-3-甲基-2-((R)-2-氧代-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡咯烷-1-基)丁酸
在氢气气氛(1atm)下,将(S)-3-甲基-2-((R)-2-氧代-3-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡咯烷-1-基)丁酸苯甲酯(430.0mg,0.715mmol)和Pd(OH)2/C(230.0mg,1.638mmol)于THF(5mL)中的悬浮液搅拌3小时。将所得混合物过滤并用MeOH(2×50mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液。得到呈白色固体状的粗最终产物(16mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C31H33N3O4的[M+H]计算值:510.24;实验值510.1。
中间体A-64.合成(S)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸钾
Figure BDA0004194083620016081
步骤1:合成异丙基-L-丝氨酸苯甲酯
在0℃下,向L-丝氨酸苯甲酯(3.65g,18.69mmol)、KOAc(1.83g,18.69mmol)和丙酮(2.5mL,33.66mmol)于DCM(60.0mL)中的溶液中分数份添加NaBH(AcO)3(4.76g,22.436mmol)。在室温下将所得混合物搅拌过夜。在室温下通过添加饱和NaHCO3水溶液(50mL)淬灭反应。将所得混合物用DCM(3×80mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(67% EtOAc/己烷)纯化,得到呈灰白色固体状的所需产物(2.7g,60.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H19NO3的[M+H]计算值:238.14;实验值238.2。
步骤2:合成(S)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在0℃下,向异丙基-L-丝氨酸苯甲酯(2.70g,11.378mmol)、Et3N(4.75mL,34.134mmol)和DMAP(2.57mg,0.021mmol)于DCM(50.0mL)中的溶液中逐滴添加TsCl(2.60g,13.65mmol)于DCM中的溶液。在室温下将所得混合物搅拌过夜,接着在40℃下搅拌4小时。将反应混合物用H2O(80mL)稀释,接着用DCM(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(20% EtOAc/己烷)纯化,得到所需产物(2.3g,93.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO2的[M+H]计算值:220.13;实验值220.1。
步骤3:合成(S)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸钾
在0℃下,向(S)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(800.0mg,3.65mmol)和H2O(6.0mL)和THF(8.0mL)中的溶液中逐滴添加KOH(245.62mg,4.378mmol)于H2O(2.0mL)中的溶液。在室温下将所得混合物搅拌2小时。将混合物用H2O(10mL)稀释并将水层用MTBE(3×8mL)洗涤。将水层通过冻干进行干燥,得到所需产物(400mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C6H11NO2的[M+H]计算值:130.09;实验值130.0。
中间体A-65.合成(R)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸钾
Figure BDA0004194083620016101
步骤1:合成异丙基-D-丝氨酸苯甲酯
在0℃下,向D-丝氨酸苯甲酯(2.10g,10.757mmol)、KOAc(1.06g,10.757mmol)和丙酮(1.2mL,16.136mmol)于DCM(40.0mL)中的溶液中分数份添加NaBH(AcO)3的溶液(2.96g,13.984mmol)。在室温下将所得混合物搅拌过夜。通过添加饱和NaHCO3水溶液(50mL)淬灭反应并将混合物用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(67% EtOAc/己烷)纯化,得到所需产物(1.7g,66.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H19NO3的[M+H]计算值:238.14;实验值238.0。
步骤2:合成(R)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在0℃下,向异丙基-D-丝氨酸苯甲酯(1.75g,7.375mmol)、Et3N(2.58mL,18.437mmol)和DMAP(90.09mg,0.737mmol)于DCM(30.0mL)中的溶液中逐滴添加TsCl(1.69g,8.850mmol)于DCM中的溶液。在室温下将所得混合物搅拌过夜,随后在40℃搅拌4小时。将混合物用H2O(80mL)稀释,接着用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(20% EtOAc/己烷)纯化,得到所需产物(1.4g,86.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO2的[M+H]计算值:220.13;实验值219.9。
步骤3:合成(R)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸钾
在0℃下,向(R)-1-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(600.0mg,2.736mmol)于H2O(3.0mL)和THF(5.0mL)中的溶液中逐滴添加KOH(184.22mg,3.283mmol)于H2O(2.0mL)中的溶液。在室温下将所得混合物搅拌2小时。接着,将混合物用H2O(10mL)稀释并将水层用MTBE(3×8mL)洗涤。接着,将水层通过冻干进行干燥,得到所需产物(260mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C6H11NO2的[M+H]计算值:130.09;实验值130.1。
中间体A-66.合成N-甲基-N-(3-氧代-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620016111
步骤1:合成N-(氯羰基)-N-甲基-L-缬氨酸苯甲酯
在0℃下,向甲基-L-缬氨酸苯甲酯(2.0g,9.038mmol)于DCM(20.0mL)中的溶液中逐滴添加三光气(800mg,2.711mmol)和吡啶(2.14g,27.113mmol)于DCM(20.0mL)中的溶液。在室温下将所得混合物搅拌2小时,随后用EtOAc稀释。在室温下将该溶液搅拌30分钟,接着过滤。减压浓缩滤液。得到粗产物,该产物不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI)m/z:C14H18ClNO3的[M+H]计算值:284.11;实验值283.1。
步骤2:合成N-甲基-N-(3-氧代哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸苯甲酯
在0℃下,向哌嗪-2-酮(100.0mg,0.999mmol)和Et3N(0.487mL,3.496mmol)于DCM(5.0mL)中的溶液中逐滴添加N-(氯羰基)-N-甲基-L-缬氨酸苯甲酯(311.75mg,1.099mmol)于DCM(5mL)中的溶液。在室温下将所得混合物搅拌4小时。接着,将混合物用H2O(5mL)稀释,将水层用DCM(3×5mL)萃取,并将合并的有机层减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(100%EtOAc)纯化,得到所需产物(200mg,57.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C18H25N3O4的[M+H]计算值:348.19;实验值348.1。
步骤3:合成N-甲基-N-(3-氧代-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸苯甲酯
在氮气气氛下,在0℃下向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(711.11mg,2.159mmol)于THF中的溶液中逐滴添加Et3N(0.40mL,2.878mmol)和氯碳酸异丁酯(255.53mg,1.871mmol)。在室温下将所得混合物搅拌1小时,接着,在室温下添加N-甲基-N-(3-氧代哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸苯甲酯(500.0mg,1.439mmol)。将所得混合物升温至70℃并搅拌过夜。接着,将反应冷却至室温并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(EtOAc/50%石油醚)纯化,得到所需产物(200mg,21.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C40H42N4O5的[M+H]计算值:659.32;实验值677.4。
步骤4:合成N-甲基-N-(3-氧代-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸
在氢气气氛(1atm)下,将N-甲基-N-(3-氧代-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸苯甲酯(140.0mg,0.212mmol)和Pd/C(50.0mg)于THF(3mL)中的悬浮液搅拌2小时。接着,将混合物过滤并用MeOH(3×15mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到所需产物(100mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C33H36N4O5的[M-H]计算值:567.26;实验值567.1。
中间体A-67.合成(S)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016121
步骤1:合成(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
向(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(500.0mg,1.518mmol)、苯甲醇(246.2mg,2.277mmol)和DIPEA(0.793mL,4.554mmol)于MeCN(10.0mL)中的溶液中添加HATU(1.73mg,4.554mmol)。在室温下将所得溶液搅拌3小时,接着减压浓缩。将粗残余物通过制备型TLC(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈灰白色固体状的所需产物(300mg,47.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C29H25NO2的[M+Na]计算值:442.18;实验值442.3。
步骤2:合成(S)-氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在0℃下,向(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(300.0mg,0.715mmol)于DCM(5.0mL)中的溶液中添加TFA(326.2mg,2.860mmol)和Et3SiH(332.6mg,2.860mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌3小时,接着减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(10% MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(130mg,82.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C10H11NO2的[M+H]计算值:178.09;实验值178.2。
步骤3:合成(S)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在室温下,向(S)-氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(400.0mg,2.257mmol)和叔丁基(2-碘乙氧基)二苯基硅烷(1.85g,4.52mmol)于DMSO(10.0mL)中的溶液中添加K2CO3(935.9mg,6.772mmol)。在60℃下将混合物搅拌5小时。将混合物用H2O(30.0mL)稀释并用EtOAc(2×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将所得残余物通过制备型TLC(20% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(200mg,15.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C28H33NO3Si的[M+H]计算值:460.23;实验值460.0。
步骤4:合成(S)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸锂
向(S)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(200.0mg,0.435mmol)于MeOH(2.0mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(36.5mg,0.870mmol)。将所得混合物搅拌过夜,接着减压浓缩,得到所需产物(200mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C21H27NO3Si的[M+H]计算值:370.18;实验值370.1。
中间体A-68.合成(R)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016141
步骤1:合成(R)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲基苯甲酯
在室温下,向(R)-氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(600.0mg,3.386mmol)和K2CO3(1.87g,13.544mmol)于DMSO(8.0mL)中的溶液中分数份添加叔丁基(2-碘乙氧基)二苯基硅烷(1.39g,3.386mmol)。在80℃下将所得混合物搅拌16小时。接着,将反应混合物冷却至室温并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(60→90% MeCN/H2O)纯化,得到呈无色固体状的所需产物(150mg,9.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C28H33NO3Si的[M+Na]计算值:482.21;实验值482.3。
步骤2:合成(R)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(R)-1-(2-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)乙基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲基苯甲酯(180.0mg,0.392mmol)于H2O(2.0mL)和THF(3.0mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(32.87mg,0.392mmol)于H2O(1.0mL)中的溶液。将所得混合物用H2O(6.0mL)稀释并将水层用MTBE(3×4mL)洗涤。将水层通过冻干进行干燥,得到所需产物(140mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C21H27NO3Si的[M+H]计算值:370.18;实验值370.0。
中间体A-69.合成6-((2S)-1-(叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2-基)烟酸
Figure BDA0004194083620016151
步骤1:合成(E)-6-(((叔丁基亚磺酰基)亚氨基)甲基)烟酸甲酯
向6-甲酰基烟酸甲酯(2.0g,12.11mmol)和2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(2.94g,24.26mmol)于DCM(60mL)中的混合物中添加CuSO4(5.80g,36.34mmol)。在室温下将所得混合物搅拌18小时。将反应混合物过滤,用DCM(3×30mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液。通过正相色谱法(66% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(2.581g,80%产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H16N2O3S的[M+H]计算值:269.10;实验值269.1。
步骤2:合成6-((2S)-1-(叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2-基)烟酸
在0℃下,向NaH(60%,179.76mg,7.491mmol)于DMSO(20mL)中的悬浮液中添加Me3S+I-(1.53g,7.491mmol)并将所得混合物升温至室温,并搅拌1小时。向反应混合物中分数份添加(E)-6-(((叔丁基亚磺酰基)亚氨基)甲基)烟酸甲酯(670.0mg,2.497mmol)于DMSO(20mL)中的溶液。在室温下将混合物搅拌3小时,接着用EtOAc稀释。用1M HCl将混合物酸化至pH 4,接着,将水层用EtOAc萃取。将合并的有机层减压浓缩。通过反相色谱法(10→15%MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(313mg,45%产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H16N2O3S的[M+H]计算值:269.10;实验值269.1。
中间体A-70.合成N-甲基-N-(N-甲基-N-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-D-丙胺酰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620016161
步骤1:合成N-(N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基-D-丙胺酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向甲基-L-缬氨酸酯盐酸盐(1.0g,5.51mmol)和N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基-D-丙氨酸(1.34g,6.59mmo)于DCM(20.0mL)中的溶液中添加Et3N(2.3mL,16.51mmol)和HATU(2.72g,7.16mmol)。将混合物升温至室温并搅拌4小时。接着,将反应混合物用DCM(20mL)稀释并用饱和NH4Cl水溶液(2×40mL)和盐水(40mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(20% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.5g,82.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C16H30N2O5的[M+H]计算值:331.23;实验值331.1。
步骤2:合成N-甲基-N-(甲基-D-丙胺酰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-(N-(叔丁氧基羰基)-N-甲基-D-丙胺酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(1.50g,4.54mmol)于DCM(9.0mL)中的溶液中添加TFA(4.5mL)。将所得混合物升温至室温并搅拌1小时。将反应混合物减压浓缩,得到所需产物(1g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C11H22N2O3的[M+H]计算值:231.17;实验值231.2。
步骤3:合成N-甲基-N-(N-甲基-N-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-D-丙胺酰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-甲基-N-(甲基-D-丙胺酰基)-L-缬氨酸甲酯(900.0mg,3.91mmol)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.544g,4.689mmol)于DMF(20.0mL)中的溶液中添加DIPEA(3.4mL,19.54mmol)和HATU(2.228g,5.86mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时。将反应混合物用H2O(50mL)稀释并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(33% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.2g,56.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C33H39N3O4的[M+H]计算值:542.30;实验值542.3。
步骤4:合成N-甲基-N-(N-甲基-N-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-D-丙胺酰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-(N-甲基-N-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-D-丙胺酰基)-L-缬氨酸甲酯(200.0mg,0.369mmol)于THF(2.0mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(77mg,1.84mmol)于H2O(1.85mL)中的溶液。将所得混合物升温至室温并搅拌过夜。将混合物用1M HCl调至pH 9,接着用NH4Cl水溶液调至pH 7。将水层用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(200mg,粗品。LCMS(ESI)m/z:C32H37N3O4的[M+H]计算值:528.29;实验值528.3。
中间体A-71及A-72.合成(2R,3S)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸及(2S,3R)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016171
步骤1:合成1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在迪恩-斯塔克条件(Dean-Stark condition)下,使1-乙氧基-2,2,2-三氟乙-1-醇(2.17mL,18.37mmol)和对甲氧基苯甲基胺(1.89mL,14.58mmol)于甲苯(46mL)中的溶液回流16小时。将反应减压浓缩并将所得残余物溶解于THF(80mL)中,并冷却至-78℃。将BF3·Et2O(0.360mL,2.92mmol)添加至所述溶液中,随后逐滴添加重氮乙酸乙酯(1.83mL,17.50mmol)。在室温下将反应搅拌4小时。通过添加饱和NaHCO3水溶液(5mL)淬灭反应混合物,并将所得溶液用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机层用H2O(20mL)和盐水(10mL)洗涤。有机相经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(1→10% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(2g,45.2%产率)。
步骤2:合成(2R,3S)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯及(2S,3R)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
将1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(1g)通过SFC分离(柱:REGIS(S,S)WHELK-O1(250mm*25mm,10um);流动相:[Neu-IPA];B%:13%-13%,分钟)进行纯化,得到(2R,3S)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(530mg)和(2S,3R)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(470mg)。
步骤3:合成(2R,3S)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
向(2R,3S)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(430mg,1.42mmol)于EtOH(4mL)和H2O(6mL)中的溶液中添加NaOH(113.42mg,2.84mmol)。在室温下将混合物搅拌5小时。将混合物用HCl水溶液(2M)酸化至pH=1-2。将反应混合物倒入H2O(3mL)中并将水相用EtOAc(3×3mL)萃取。将合并的有机相用盐水(5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(350mg,89.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H11FNO3的[M+H]计算值:274.08;实验值274.1
步骤4:合成(2S,3R)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
向(2S,3R)-1-(4-甲氧基苯甲基)-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(370mg,1.22mmol)于H2O(2mL)和EtOH(4mL)中的溶液中添加NaOH(97.59mg,2.44mmol)。在室温下将混合物搅拌5小时。通过添加HCl水溶液(2M)使混合物达到pH=1–2。将反应混合物倒入H2O(3mL)中并将水相用EtOAc(3×3mL)萃取。将合并的有机相用盐水(5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(300mg,89.0%产率)。LCMS(ESI)m/z:C12H11FNO3的[M+H]计算值:234.08;实验值234.2
中间体A-73及A-74.合成(2S,3S)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸及(2R,3R)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016191
步骤1:合成(2S,3R)-2,3-二溴-4,4,4-三氟丁酸乙酯
向(E)-4,4,4-三氟丁-2-烯酸乙酯(5g,29.74mmol,4.42mL)于CCl4(90mL)中的溶液中添加Br2(1.69mL,32.72mmol)并在75℃下将溶液搅拌5小时。将反应混合物减压浓缩,得到所需产物(10.72g,粗品)。
步骤2:合成(2S,3S)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在N2下,在-5℃下向(2S,3R)-2,3-二溴-4,4,4-三氟丁酸乙酯(10.72g,32.69mmol)于EtOH(30mL)中的溶液中缓慢添加BnNH2(12.47mL,114.42mmol)于EtOH(120mL)中的溶液。将混合物升温至室温并搅拌15小时。将混合物减压浓缩并将EtOAc(120mL)添加至残余物中。滤出沉淀并用HCl水溶液(3%,180mL)和H2O(100mL)洗涤滤液,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(20%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(6.02g,67.4%产率)。
步骤3:合成(2R,3R)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯及(2S,3S)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
(2R,3R)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯和(2S,3S)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸是在酶筛选平台(Enzyme Screening Platform)中,基于Tetrahedron Asymmetry 1999,10,2361中的程序合成。
步骤5:合成(2R,3R)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
向(2R,3R)-1-苯甲基-3-(三氟甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(200mg,731.93μmol)于EtOH(5mL)中的溶液中添加NaOH(2M,548.95μL)并在室温下将混合物搅拌1小时。将反应混合物减压浓缩以移除EtOH。接着,向混合物中添加HCl(1M)以将pH值调至1,并用EtOAc(3×5mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需产物(138mg,76.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C11H10F3NO2的[M+H]计算值:246.07;实验值245.9。
中间体A-75.合成1-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016201
步骤1:合成1-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯
向2,3-二溴丙酸甲酯(515.46μL,4.07mmol)于MeOH(15mL)中的溶液中添加DIPEA(3.54mL,20.33mmol)。添加后,将混合物搅拌15分钟,接着逐滴添加氧杂环丁烷-3-胺(297.25mg,4.07mmol)。在室温下将所得混合物搅拌12小时。将反应混合物倒入H2O(20mL)中,将水相用DCM(2×25mL)萃取。将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(10%→30% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(380mg,59.5%产率)。
步骤2:合成1-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸
在室温下,向1-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯(280mg,1.78mmol)于EtOH(3mL)中的溶液中添加NaOH(2M,1.34mL)并将所得混合物搅拌3小时。通过添加HCl(1M)将反应混合物调至pH 8,并冻干,得到所需产物(200mg,78.4%产率)。
中间体A-76.合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016211
步骤1:合成(S,E)-N-(环丁基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
向环丁烷甲醛(0.5g,5.94mmol)于THF(10mL)中的溶液中添加(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(792.48mg,6.54mmol)和Ti(OEt)4(2.47mL,11.89mmol)。在75℃下将混合物搅拌3小时。将反应混合物冷却至室温并通过添加盐水(30mL)淬灭,并过滤以移除固体。将混合物用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。将残余物通过硅胶色谱法(2%→10% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(907.3mg,39.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C9H17NOS的[M+H]计算值:188.1;实验值188.3。
步骤2:合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下,向2-溴乙酸乙酯(1.60g,9.61mmol,1.06mL)于THF(9mL)中的溶液中添加LiHMDS(1M,9.61mL),2分钟后,添加(S,E)-N-(环丁基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(0.9g,4.81mmol)。在-78℃下将混合物搅拌2小时。通过在-78℃下添加H2O(25mL)淬灭反应混合物并升温至室温,接着将混合物用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物,将其通过硅胶色谱法(10%→20%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(426mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C13H23NO3S的[M+H]计算值:274.14;实验值274.3。
步骤3:合成(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2S,3S)-1-((S)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸酯(100mg,365.78μmol)于MeCN(0.5mL)和H2O(0.5mL)中的溶液中添加NaOH(21.95mg,548.67μmol),将混合物升温至室温并搅拌2小时。通过添加10%柠檬酸水溶液(约10mL)将反应混合物调至pH 5,接着用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需产物(92.6mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C11H19NO3S的[M+H]计算值:246.11;实验值246.3。
中间体A-77.合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016231
步骤1:合成(R,E)-N-(环丁基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺
向环丁烷甲醛(0.25g,2.97mmol)于THF(5mL)中的溶液中添加(R)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(396.24mg,3.27mmol)和Ti(OEt)4(1.36g,5.94mmol,1.23mL)。在75℃下分两批将混合物搅拌3小时。将两批批料合并,并通过添加盐水(15mL)淬灭反应混合物。将溶液用EtOAc(3×20mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物,其通过硅胶色谱法(10%→20% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(786.7mg,70.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C9H17NOS的[M+H]计算值:188.1;实验值188.3。
步骤2:合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下,向2-溴乙酸乙酯(236.19μL,2.14mmol)于THF(2mL)中的溶液中添加LiHMDS(1M,2.14mL),在30分钟后,添加(R,E)-N-(环丁基亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(0.2g,1.07mmol)。将混合物升温至-40℃并搅拌4小时。通过在-40℃下添加H2O(18mL)淬灭反应混合物并升温至室温。将混合物用EtOAc(3×15mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物,将其通过制备型TLC(20%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(0.1g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C13H23NO3S的[M+H]计算值:274.14;实验值274.3。
步骤3:合成(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,分两批向(2R,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-环丁基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(25mg,91.44μmol)于MeCN(0.25mL)和H2O(0.25mL)中的溶液中添加NaOH(5.49mg,137.17μmol),将混合物升温至室温并搅拌5小时。将反应混合物合并,并用10%柠檬酸水溶液(10mL)将pH值调至5,接着用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需产物(53mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C11H19NO3S的[M+H]计算值:246.11;实验值246.2。
中间体A-78.合成N-甲基-N-(甲基((S)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-3-基)氨甲酰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620016241
步骤1:合成(S)-3-(3-((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-1,3-二甲基脲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯
在0℃下,将N-(氯羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(1.94g,9.34mmol)于DCM中的混合物添加至(S)-3-(甲基氨基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(2.80g,13.08mmol)于DCM(18mL)中的溶液中。在40℃下将混合物搅拌3小时。将混合物添加至饱和NH4Cl水溶液(80mL)中,并将水相用DCM(3×40mL)萃取。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将粗产物通过硅胶色谱法(30%→100%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.9g,55.3%产率)。LCMS(ESI)m/z:C19H35N3O5的[M+H]计算值:386.26;实验值386.2。
步骤2:合成N-甲基-N-(甲基((S)-哌啶-3-基)氨甲酰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向(S)-3-(3-((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-1,3-二甲基脲基)哌啶-1-甲酸叔丁酯(1g,2.59mmol)于DCM(10mL)中的溶液中添加TFA(3.84mL,51.88mmol)。在室温下将反应搅拌1小时。在0℃下将混合物添加至饱和Na2CO3水溶液(100mL)中以调至pH 9。将水相用DCM(3×50mL)萃取并将合并的有机相用盐水(10mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需产物(710mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C14H27N3O3的[M+H]计算值:286.21;实验值286.1。
步骤3:合成N-甲基-N-(甲基((S)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-3-基)氨甲酰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.24g,2.63mmol,70%纯度)于MeCN(5mL)中的溶液中添加DIPEA(1.22mL,7.01mmol)和HATU(1.33g,3.50mmol),随后添加N-甲基-N-(甲基((S)-哌啶-3-基)氨甲酰基)-L-缬氨酸甲酯(500mg,1.75mmol)。将反应混合物升温至室温并搅拌30分钟。将混合物添加至饱和NH4Cl水溶液(100mL)中并将水相用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机相用盐水(60mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(50%→100% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(650mg,49.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C36H44N4O4的[M+H]计算值:597.34;实验值597.3
步骤4:合成N-甲基-N-(甲基((S)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-3-基)氨甲酰基)-L-缬氨酸
将NaOH(58.34mg,1.46mmol)添加至N-甲基-N-(甲基((S)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌啶-3-基)氨甲酰基)-L-缬氨酸甲酯(640mg,857.97μmol)于THF(4mL)、MeOH(1.3mL)和H2O(1.3mL)中的溶液中。在室温下将混合物搅拌20小时。将反应溶液直接冻干,得到所需产物(700mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C35H42N4O4的[M+H]计算值:583.32;实验值583.4。
中间体A-79.合成N-甲基-N-(甲基((S)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-基)氨甲酰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620016261
步骤1:合成(S)-3-(3-((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-1,3-二甲基脲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
在0℃下,将N-(氯羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(1.14g,5.49mmol)于DCM(10mL)中的溶液添加至(S)-3-(甲基氨基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.54g,7.69mmol)于DCM(10mL)中的溶液。将混合物升温至室温并搅拌2小时。接着,将混合物添加至饱和NH4Cl(50mL)中,并将水相用DCM(3×30mL)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将粗产物通过硅胶色谱法(30%→100% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.07g,52.5%产率)。
步骤2:合成N-甲基-N-(甲基((S)-吡咯烷-3-基)氨甲酰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向(S)-3-(3-((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-1,3-二甲基脲基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.05g,2.83mmol)于DCM(11mL)中的溶液中添加TFA(4.19mL,56.53mmol)。接着,将反应升温至室温并搅拌1小时。在0℃下将混合物逐滴添加至饱和Na2CO3(200mL)中以调至pH 9。将水相用DCM(3×100mL)萃取,并将合并的有机相用盐水(100mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需产物(800mg,粗品)。
步骤3:合成N-甲基-N-(甲基((S)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-基)氨甲酰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.04g,2.21mmol)于MeCN(4mL)中的溶液中添加HATU(1.12g,2.95mmol)和DIPEA(1.03mL,5.90mmol),随后添加N-甲基-N-(甲基((S)-吡咯烷-3-基)氨甲酰基)-L-缬氨酸甲酯(400mg,1.47mmol)。将混合物升温至室温并搅拌0.5小时。将混合物倒入NH4Cl水溶液(50mL)中并用DCM(3×20mL)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将粗产物通过硅胶色谱法(50%→100% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(580mg,67.5%产率)。
步骤4:合成N-甲基-N-(甲基((S)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-基)氨甲酰基)-L-缬氨酸
向N-甲基-N-(甲基((S)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-基)氨甲酰基)-L-缬氨酸甲酯(650mg,1.12mmol)于THF(3.9mL)和MeOH(1.3mL)中的溶液中添加NaOH(89.23mg,2.23mmol)于H2O(1.3mL)中的溶液。在室温下将混合物搅拌16小时。将反应混合物用H2O(10mL)稀释,接着直接冻干,得到所需产物(700mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C34H40N4O4的[M+H]计算值:569.30;实验值,569.4。
中间体A-80.合成N-甲基-N-((S)-3-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620016281
步骤1:合成(S)-4-(((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-2-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯
在0℃下,向(S)-2-甲基哌嗪-1-甲酸甲基叔丁酯(3.31g,16.52mmol)于DCM(30mL)中的溶液中添加N-(氯羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯于DCM中的溶液(0.55M,30mL)。在室温下将混合物搅拌30分钟。将反应混合物用H2O(30mL)稀释并用DCM(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×15mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。将残余物通过硅胶色谱法(20%→50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(5g,81.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C18H33N3O5的[M+H]计算值:372.2;实验值372.1。
步骤2:合成N-甲基-N-((S)-3-甲基哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯
向(S)-4-(((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-2-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(3g,8.08mmol)中添加4M HCl的MeOH溶液(30mL)。在室温下将混合物搅拌1小时。用饱和NaHCO3水溶液将反应混合物调至pH 8,接着用H2O(50mL)稀释并用DCM(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需产物(1.8g,82.1%产率)。
步骤3:合成N-甲基-N-((S)-3-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯
向(2R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(971.10mg,2.95mmol)于MeCN(10mL)中的溶液中添加HATU(1.35g,3.54mmol)、DIPEA(1.54mL,8.84mmol)和N-甲基-N-((S)-3-甲基哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯(0.8g,2.95mmol)。在室温下将混合物搅拌12小时。接着,将反应混合物用H2O(20mL)稀释并用DCM(3×15mL)萃取。将合并的有机层用20mL盐水(2×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。将残余物通过硅胶色谱法(30%→50%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(0.35g,20.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H42N4O4的[M+H]计算值:583.3;实验值583.2。
步骤4:合成N-甲基-N-((S)-3-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-((S)-3-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯(200mg,343.21μmol)于H2O(1mL)、THF(1mL)和MeOH(1mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(14.40mg,343.21μmol)。在室温下将混合物搅拌8小时,接着直接冻干,得到所需产物(390mg,98.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H40N4O4的[M+Na]计算值:591.3;实验值591.2。
中间体A-81.合成N-甲基-N-((S)-3-甲基-4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620016291
步骤1:合成N-甲基-N-((S)-3-甲基-4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向N-甲基-N-((S)-3-甲基哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯(500mg,1.84mmol)于MeCN(5mL)中的溶液中添加(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.30g,2.76mmol,70%纯度)、HATU(1.05g,2.76mmol)和DIPEA(962.85μL,5.53mmol)。在室温下将混合物搅拌30分钟。接着,将反应混合物用H2O(10mL)稀释并用DCM(3×5mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。将残余物通过硅胶色谱法(20%→33%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(0.5g,46.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H42O4N4的[M+Na]计算值:605.2;实验值605.2
步骤2:合成N-甲基-N-((S)-3-甲基-4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸
在0℃下,向N-甲基-N-((S)-3-甲基-4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯(400mg,686.42μmol)于H2O(2mL)、THF(2mL)和MeOH(2mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(28.80mg,686.42μmol)。在室温下将混合物搅拌8小时。将混合物直接冻干,得到所需产物(390mg,98.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H40N4O4的[M+Na]计算值:591.3;实验值591.2。
中间体A-82.合成N-甲基-N-((R)-3-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620016301
步骤1:合成(R)-4-(((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-2-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯
在0℃下,向甲基-L-缬氨酸甲酯盐酸盐(3g,16.51mmol)和DIPEA(17.26mL,99.09mmol)于DCM(60mL)中的混合物中一次性添加碳酸双(三氯甲基)酯(2.45g,8.26mmol)。在0℃下将混合物搅拌30分钟,接着将(R)-2-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(3.31g,16.51mmol)添加至混合物中。在0℃下将混合物搅拌1小时,接着用饱和NaHCO3将溶液的pH值调至8。将残余物倒入H2O(20mL)中并搅拌5分钟。将水相用EtOAc(2×20mL)萃取,并将合并的有机相用饱和NaHCO3(20mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(1%→10% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(3.1g,50.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C18H33N3O5的[M+H]计算值:372.3;实验值372.2。
步骤2:合成N-甲基-N-((R)-3-甲基哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向(R)-4-(((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-2-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(2.5g,6.73mmol)的混合物中添加4M HCl的MeOH溶液(25mL)。在室温下将混合物搅拌1小时。接着,将混合物减压浓缩,得到所需产物(2g,96.5%产率)。
步骤3:合成N-甲基-N-((R)-3-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯
向(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.03g,3.12mmol)和HATU(1.11g,2.92mmol)于MeCN(1mL)中的混合物中添加DIPEA(1.36mL,7.80mmol),随后添加N-甲基-N-((R)-3-甲基哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯(600mg,1.95mmol)。在室温下将混合物搅拌1小时。接着,将混合物减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(1%→50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(450mg,39.62%产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H42N4O4的[M+H]计算值:583.3;实验值583.2。
步骤4:合成N-甲基-N-((R)-3-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸
向N-甲基-N-((R)-3-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯(450mg,772.23μmol)于H2O(1mL)、MeOH(1mL)和THF(3mL)中的混合物中添加LiOH·H2O(48.60mg,1.16mmol)。在室温下将混合物搅拌10小时,接着冻干,得到所需产物(410mg,92.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H40N4O4的[M+Na]计算值:591.3;实验值591.3。
中间体A-83.合成N-甲基-N-((R)-3-甲基-4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620016321
步骤1:合成N-甲基-N-((R)-3-甲基-4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯
向(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(1.03g,3.12mmol)和HATU(1.11g,2.92mmol)于MeCN(1mL)中的混合物中添加DIPEA(1.36mL,7.80mmol),随后添加N-甲基-N-((R)-3-甲基哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯(600mg,1.95mmol)。在室温下将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(0%→50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(430mg,37.8%产率)。LCMS(ESI)m/z:C35H42N4O4的[M+H]计算值:583.3;实验值583.2
步骤2:合成N-甲基-N-((R)-3-甲基-4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸
向N-甲基-N-((R)-3-甲基-4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸甲酯(430mg,737.91μmol)于H2O(1mL)、MeOH(1mL)和THF(3mL)中的混合物中添加LiOH·H2O(46.44mg,1.11mmol)。在室温下将混合物搅拌10小时,接着冻干,得到所需产物(370mg,87.3%产率)。LCMS(ESI)m/z:C34H40N4O4的[M+Na]计算值:591.3;实验值591.3。
中间体A-84.合成N-((R)-4-(叔丁氧基羰基)-2-甲基哌嗪-1-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620016331
步骤1:合成N-(氯羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
在0℃下,向甲基-L-缬氨酸甲酯盐酸盐(1.8g,9.91mmol)于DCM(20mL)中的溶液中添加DIPEA(5.18mL,29.73mmol),随后添加碳酸双(三氯甲基)酯(1.47g,4.95mmol)。在0℃下将混合物搅拌20分钟。将反应混合物不经处理即直接用于下一步骤。
步骤2:合成(R)-4-(((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯
在0℃下,将N-(氯羰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(1.03g,4.96mmol)于DCM(10mL)中的溶液添加至(3R)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(993.41mg,4.96mmol)于DCM(1mL)中的溶液中。接着,在0℃下将混合物搅拌15分钟。将混合物添加至NH4Cl水溶液(10mL)中,接着,将该溶液用DCM(3×10mL)萃取。将合并的有机相用盐水(2mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(0%→50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(750mg,36.2%产率)。
步骤3:合成N-((R)-4-(叔丁氧基羰基)-2-甲基哌嗪-1-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸
在0℃下,向(R)-4-(((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)-3-甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(700mg,1.88mmol)于THF(0.5mL)和H2O(0.5mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(237.23mg,5.65mmol)。在室温下将混合物搅拌3小时。用1N HCl将反应混合物的pH值调至6–7。将混合物用EtOAc(3×10mL)萃取,经Na2SO4干燥,并减压浓缩,得到所需产物(600mg,85.5%产率)。
中间体A-85.合成(S)-3-甲基-2-((R)-2-氧代-3-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡咯烷-1-基)丁酸
Figure BDA0004194083620016341
步骤1:合成(S)-3-甲基-2-((R)-2-氧代-3-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡咯烷-1-基)丁酸苯甲酯
在0℃下,向(2S)-2-[(3R)-3-氨基-2-氧代吡咯烷-1-基]-3-甲基丁酸苯甲酯(420.0mg,1.446mmol)、DIPEA(934.73mg,7.232mmol)和(2S)-1-(三苯基甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸(619.40mg,1.880mmol)于DMF(5mL)中的混合物中添加HATU(659.99mg,1.736mmol)。在室温下将所得混合物搅拌2小时。将反应混合物用H2O淬灭。将所得混合物用EtOAc(2×10mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(30% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(480mg,55.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C38H38N3O4的[M-H]-计算值:600.29;实验值600.3
步骤2:合成(S)-3-甲基-2-((R)-2-氧代-3-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺基)吡咯烷-1-基)丁酸
在氢气气氛下,在室温下,将(2S)-3-甲基-2-[(3R)-2-氧代-3-[(2S)-1-(三苯基甲基)氮杂环丙烷-2-酰胺基]吡咯烷-1-基]丁酸苯甲酯(450.0mg,0.748mmol)和Pd/C(200mg)于THF(5mL)中的悬浮液搅拌3小时。接着,将混合物过滤并减压浓缩,得到所需产物(400mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C31H32N3O4的[M-H]计算值:510.24;实验值510.2。
中间体A-86.合成(S)-2-(8-(叔丁氧基羰基)-1-氧代-2,8-二氮杂螺[4.5]癸-2-基)-3-甲基丁酸
Figure BDA0004194083620016351
步骤1:合成4-烯丙基哌啶-1,4-二甲酸1-(叔丁基)酯4-甲酯
在-78℃下,向哌啶-1,4-二甲酸1-叔丁酯4-甲酯(5.0g,20.551mmol)于THF(50mL)中的溶液中添加LiHMDS(27mL,26.714mmol,1M于THF中),随后添加烯丙基溴(3.23g,26.716mmol)。在室温下将所得混合物搅拌过夜。用饱和NH4Cl水溶液(aq.)淬灭反应,并将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(4.5g,73.4%产率)。
步骤2:合成4-(2-氧代乙基)哌啶-1,4-二甲酸1-(叔丁基)酯4-甲酯
在0℃下,向4-(丙-2-烯-1-基)哌啶-1,4-二甲酸1-叔丁酯4-甲酯(1.0g,3.529mmol)和K2OsO4·2H2O(1.3g,3.529mmol)于1,4-二噁烷(5mL)和H2O(5mL)中的溶液中添加NaIO4(1.51g,7.058mmol)。在室温下将所得混合物搅拌5小时。将混合物用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用H2O(3×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将粗产物不经进一步纯化即直接用于下一步骤中,得到所需产物(800mg,75.%产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H23NO5的[M-H]计算值:284.16;实验值284.0。
步骤3:合成(S)-4-(2-((1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)乙基)哌啶-1,4-二甲酸1-(叔丁基)酯4-甲酯
在0℃下,向4-(2-氧代乙基)哌啶-1,4-二甲酸1-叔丁酯4-甲酯(4.0g,14.018mmol)和(2S)-2-氨基-3-甲基丁酸苯甲酯(3.49g,16.822mmol)于MeOH(40mL)中的溶液中添加ZnCl2(2.10g,15.420mmol)和NaBH3CN(1.76g,28.037mmol)。在室温下将所得混合物搅拌2小时。用饱和NH4Cl水溶液淬灭反应,并将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物。LCMS(ESI)m/z:C26H40N2O6的[M+H]计算值:477.29;实验值477.3。
步骤4:合成(S)-2-(1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-1-氧代-2,8-二氮杂螺[4.5]癸烷-8-甲酸叔丁酯
在120℃下,向4-(丙-2-烯-1-基)哌啶-1,4-二甲酸1-叔丁酯4-甲酯(2.20g,4.616mmol)和DIPEA(5.97g,46.159mmol)于甲苯中的溶液中分数份添加DMAP(0.56g,4.616mmol)。在120℃下将所得混合物搅拌过夜。将反应冷却至室温并用饱和NH4Cl水溶液淬灭。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.5g,50.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C25H36N2O5的[M+H]计算值:445.26;实验值445.3。
步骤5:合成(S)-2-(8-(叔丁氧基羰基)-1-氧代-2,8-二氮杂螺[4.5]癸-2-基)-3-甲基丁酸
在室温下,向2-[(2S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基]-1-氧代-2,8-二氮杂螺[4.5]癸烷-8-甲酸叔丁酯(2.40g,5.398mmol)于甲苯(25mL)中的溶液中添加Pd/C(2.40g,22.552mmol)。在H2气氛下,在室温下将所得悬浮液搅拌过夜。将混合物减压浓缩,过滤,用EtOAc(3×50mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法(50%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(2.2g,72.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C18H30N2O5的[M-H]计算值:353.22;实验值353.2。
中间体A-87.合成N-甲基-N-(3-氧代-4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620016371
步骤1:合成N-甲基-N-(3-氧代-4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸苯甲酯
在0℃下,向(2S)-1-(三苯基甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸(2.13g,6.466mmol)于THF(10mL)中的溶液中添加Et3N(0.87g,8.598mmol)和氯碳酸异丁酯(1.44g,10.54mmol)。在室温下将所得混合物搅拌1小时,接着添加(2S)-3-甲基-2-[甲基(3-氧代哌嗪-1-羰基)氨基]丁酸苯甲酯(1.50g,4.318mmol)。在70℃下将所得混合物搅拌过夜。接着,将反应混合物减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(900mg,31.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C40H42N4O5的[M-H]计算值:657.32;实验值657.1。
步骤2:合成N-甲基-N-(3-氧代-4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸
在氢气气氛下,在室温下将N-甲基-N-(3-氧代-4-((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-羰基)-L-缬氨酸苯甲酯(500mg)及Pd/C(50mg)于THF(5mL)中的溶液搅拌2小时。将所得混合物过滤,用MeOH(3×30mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液,得到所需产物(460mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C33H36N4O5的[M-H]计算值:567.27;实验值567.1。
中间体A-88.合成(R)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸锂
Figure BDA0004194083620016372
步骤1:合成(R)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在60℃下,向(R)-氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(350.0mg,1.975mmol)和K2CO3(545.95mg,3.950mmol)于DMSO(4mL)中的混合物中添加1-碘-3-甲氧基丙烷(790.13mg,3.950mmol)。将所得混合物搅拌2小时,接着冷却至室温,用盐水(50mL)稀释,并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层减压浓缩。将粗产物通过反相色谱法(30%→38% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(170mg,31.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H19NO3的[M+H]计算值:250.14;实验值250.2。
步骤2:合成(R)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸锂
在0℃下,将(R)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(170mg,0.682mmol)和LiOH(57.23mg,1.364mmol)于MeOH(2mL)中的混合物搅拌1小时。将混合物减压浓缩,得到所需产物(200mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C7H13NO3的[M+H]计算值:160.09;实验值160.3。
中间体A-89.合成(S)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸锂
Figure BDA0004194083620016381
步骤1:合成(S)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在60℃下,向(S)-氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(250mg,1.411mmol)和K2CO3(389.96mg,2.822mmol)于DMSO(4mL)中的混合物中添加1-碘-3-甲氧基丙烷(564.38mg,2.822mmol)。将所得混合物搅拌2小时,接着冷却至室温,用盐水(50mL)稀释,并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层减压浓缩。将粗产物通过反相色谱法(25%→40% H2O/MeCN)纯化,得到所需产物(234mg,63.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H19NO3的[M+H]计算值:250.14;实验值250.2。
步骤2:合成(S)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸锂
在0℃下,将(S)-1-(3-甲氧基丙基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(230mg,0.923mmol)和LiOH·H2O(77.43mg,1.845mmol)于MeOH(3mL)中的混合物搅拌1小时。将所得混合物减压浓缩,得到所需产物(320mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C7H13NO3的[M+H]计算值:160.09;实验值160.1。
中间体A-90.合成(S)-2-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.5]癸烷-7-甲酸叔丁酯和(R)-2-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.5]癸烷-7-甲酸叔丁酯
Figure BDA0004194083620016391
步骤1:合成3-烯丙基哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯
在-78℃下,向哌啶-1,3-二甲酸1-叔丁酯3-甲酯(10.0g,41.101mmol)和LiHMDS(82mL,82.202mmol,1M于THF中)于THF(100mL)中的溶液中添加烯丙基溴(9.94g,82.202mmol)。将反应升温至室温并搅拌过夜。接着,用饱和NH4Cl水溶液淬灭该溶液并用EtOAc(500mL)稀释。将有机层用盐水(3×150mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到所需产物(9.9g,85%产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H25NO4的[M+H]计算值:284.18;实验值284.0。
步骤2:合成3-(2-氧代乙基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯
在0℃下,向3-烯丙基哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯3-烯丙基哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(9.1g,32.114mmol)和2,6-二甲基吡啶(6.88g,64.227mmol)于二噁烷(180mL)和H2O(180mL)中的溶液中添加K2OsO4·2H2O(591.61mg,1.606mmol)。在室温下将所得混合物搅拌15分钟,接着冷却至0℃,并分数份添加NaIO4(27.47g,128.455mmol)。在室温下将所得混合物搅拌3小时。接着,在0℃下用饱和Na2S2O3水溶液淬灭反应。将所得混合物用EtOAc(2×500mL)萃取,并将合并的有机层用1M HCl(2×200mL)和盐水(2×200mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(7.5g,81.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C14H23NO5的[M+H]计算值:286.16;实验值286.1。
步骤3:合成3-(2-(((R)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)乙基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯
在0℃下,向3-(2-氧代乙基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(9.0g,31.541mmol)和(2S)-2-氨基-3-甲基丁酸苯甲酯(7.19g,34.695mmol)于MeOH(90mL)中的溶液中添加ZnCl2(4.73g,34.695mmol)和NaBH3CN(3.96g,63.083mmol)。在室温下将所得混合物搅拌过夜。所需产物可通过LCMS检测,并将其减压浓缩并用EtOAc(1200mL)萃取。将有机层用盐水(3×150mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法纯化,得到所需产物(9.9g,65.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C26H40N2O6的[M+H]计算值:477.29;实验值477.2。
步骤4:合成(S)-2-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.5]癸烷-7-甲酸叔丁酯和(R)-2-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.5]癸烷-7-甲酸叔丁酯
向3-(2-(((R)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨基)乙基)哌啶-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(9.9g,20.772mmol)和DIPEA(26.84g,207.715mmol)于甲苯(100mL)中的溶液中添加DMAP(5.07g,41.543mmol)。在80℃下将所得混合物搅拌50小时。将所得混合物减压浓缩并将残余物溶解于EtOAc(1000mL)中。将有机层用盐水(3×150mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将粗产物通过手性HPLC(50% EtOH/Hex)纯化,得到(S)-2-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.5]癸烷-7-甲酸叔丁酯(1.75g)及(R)-2-((S)-1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.5]癸烷-7-甲酸叔丁酯(1.98g)。LCMS(ESI)m/z:C25H36N2O5的[M+H]计算值:445.26;实验值445.2。
中间体A-91和A-92.合成(S)-2-((S)-7-(叔丁氧基羰基)-4-氧代-1-氧杂-3,7-二氮杂螺[4.4]壬-3-基)-3-甲基丁酸和(S)-2-((R)-7-(叔丁氧基羰基)-4-氧代-1-氧杂-3,7-二氮杂螺[4.4]壬-3-基)-3-甲基丁酸
Figure BDA0004194083620016411
步骤1:合成3-羟基-3-(((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯
在0℃下,向1-(叔丁氧基羰基)-3-羟基吡咯烷-3-甲酸(800mg,3.46mmol)和DIPEA(3.01mL,17.3mmol)于DMF(10mL)中的溶液中添加L-缬氨酸甲酯(681mg,5.19mmol)和HATU(1.71g,4.497mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌2小时,接着用H2O(20mL)稀释并萃取至EtOAc(3×20mL)中。将合并的有机层用盐水(2×20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(30→55% MeCN/H2O,0.1% NH4HCO3)纯化,得到所需产物(1g,76%产率)。LCMS(ESI)m/z:C16H28N2O6的[M+Na]计算值:367.18;实验值366.9。
步骤2:合成(S)-2-((S)-7-(叔丁氧基羰基)-4-氧代-1-氧杂-3,7-二氮杂螺[4.4]壬-3-基)-3-甲基丁酸及(S)-2-((R)-7-(叔丁氧基羰基)-4-氧代-1-氧杂-3,7-二氮杂螺[4.4]壬-3-基)-3-甲基丁酸
在0℃下,向3-羟基-3-(((S)-1-甲氧基-3-甲基-1-氧代丁-2-基)氨甲酰基)吡咯烷-1-甲酸叔丁酯(1.0g,2.90mmol)和Cs2CO3(1.89g,5.81mmol)于MeCN(15mL)中的溶液中添加多聚甲醛(436mg,14.5mmol)。将所得混合物加热至80℃并搅拌过夜。通过反相色谱法(10→40% MeCN/H2O,0.1% NH4HCO3)纯化,得到所需产物的混合物。将非对映异构体通过制备型SFC(30% EtOH/己烷,0.3% TFA)纯化,得到(S)-2-((S)-7-(叔丁氧基羰基)-4-氧代-1-氧杂-3,7-二氮杂螺[4.4]壬-3-基)-3-甲基丁酸(250mg,24%产率)及(S)-2-((R)-7-(叔丁氧基羰基)-4-氧代-1-氧杂-3,7-二氮杂螺[4.4]壬-3-基)-3-甲基丁酸(200mg,19%产率)。LCMS(ESI)m/z:C16H26N2O6的[M+Na]计算值:365.17;实验值365.0。
中间体A-93.合成(S)-1-((3-甲基氧杂环丁烷-3-基)甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016421
步骤1:合成(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
向(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(3.0g,9.11mmol)和苯甲基溴(2.16mL,18.22mmol)于DMF(30mL)中的混合物中添加K2CO3(2.25g,18.22mmol)和KI(76mg,455μmol)。将反应混合物加热至50℃并搅拌30分钟,接着冷却至室温并用H2O(30mL)和EtOAc(30mL)稀释。将水层用EtOAc(3×40mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(5×70mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(4.7g,粗品)。
步骤2:合成(S)-氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在0℃下,向(S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(3.4g,8.10mmol)于MeOH(17.5mL)和CHCl3(17.5mL)中的混合物中添加TFA(9.0mL,122mmol)。将反应混合物搅拌30分钟,接着将其倒入饱和NaHCO3水溶液(50mL)中,萃取至DCM(4×35mL),经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(6→100% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(445mg,31%产率)。
步骤3:合成(S)-1-((3-甲基氧杂环丁烷-3-基)甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
向(S)-氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(440mg,2.48mmol)和3-(碘甲基)-3-甲基氧杂环丁烷(2.11g,9.93mmol)于DMA(5mL)中的混合物中添加K2CO3(1.72g,12.42mmol)和18-冠-6(32.8mg,124μmol)。将反应混合物加热至80℃并搅拌12小时,接着用H2O(25mL)和EtOAc(25mL)稀释。将水层用EtOAc(3×20mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(5×45mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过制备型TLC(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(367mg,57%产率)。LCMS(ESI)m/z:C15H19NO3的[M+H]计算值:262.14;实验值262.0。
步骤4:合成(S)-1-((3-甲基氧杂环丁烷-3-基)甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(S)-1-((3-甲基氧杂环丁烷-3-基)甲基)氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(100mg,383μmol)于MeCN(500μL)和H2O(500μL)中的混合物中添加NaOH(23mg,574μmol)。在0℃下将反应混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到所需产物(100mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C8H13NO3的[M+H]计算值:172.10;实验值172.0。
中间体A-94.合成(2R,3R)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-乙基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016441
步骤1:合成(R,E)-2-甲基-N-亚丙基丙烷-2-亚磺酰胺
向丙醛(6.27mL,86.1mmol)于THF(200mL)中的溶液中添加(R)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(10.4g,86.1mmol)和乙氧化钛(51mL,170mmol)。将反应混合物加热至70℃,保持3小时,接着冷却至室温并用H2O(50mL)淬灭,过滤,并萃取至EtOAc(3×30mL)中。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(9→17%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(4.0g,29%产率)。
步骤2:合成(2R,3R)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-乙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下,向2-溴乙酸乙酯(2.74mL,24.8mmol)于THF(40mL)中的溶液中添加LiHMDS(24.80mL,1M于THF中)。30分钟后,将于THF(20mL)中的(R,E)-2-甲基-N-亚丙基丙烷-2-亚磺酰胺(2.0g,12.4mmol)添加至反应混合物中。将混合物搅拌1小时,接着升温至室温,用H2O(50mL)淬灭,并萃取至EtOAc(3×50mL)中。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(17→25% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(1.34g,44%产率)。LCMS(ESI)m/z:C11H21NO3S的[M+H]计算值:248.13;实验值248.1。
步骤3:合成(2R,3R)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-乙基氮杂环丙烷-2-甲酸
向(2R,3R)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-乙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(600mg,2.4mmol)于MeOH(3mL)和H2O(3mL)中的溶液中添加LiOH(70mg,2.9mmol)。将所得混合物搅拌16小时,接着用H2O(20mL)稀释并用DCM(3×10mL)洗涤。将水层冻干,得到产物(600mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C9H17NO3S的[M+H]计算值:220.10;实验值220.3。
中间体A-95.合成(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-乙基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016451
步骤1:合成(S,E)-2-甲基-N-亚丙基丙烷-2-亚磺酰胺
向丙醛(6.27mL,86.1mmol)于THF(50mL)中的溶液中添加(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(10.4g,86.1mmol)和乙氧化钛(51mL,170mmol)。将反应混合物加热至70℃,保持3小时,接着冷却至室温并用H2O(30mL)淬灭,过滤,并萃取至DCM(3×100mL)中。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法(25% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(4.6g,33%产率)。
步骤2:合成(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-乙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
在-78℃下,向2-溴乙酸乙酯(2.74mL,24.8mmol)于THF(40mL)中的溶液中添加LiHMDS(24.80mL,1M于THF中)。30分钟后,将于THF(20mL)中的(S,E)-2-甲基-N-亚丙基丙烷-2-亚磺酰胺(2.0g,12.4mmol)添加至反应混合物中。将混合物搅拌1小时,接着升温至室温,用H2O(20mL)淬灭,并萃取至EtOAc(3×20mL)中。将合并的有机层用盐水(2×25mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(31→51% MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)纯化,得到产物(600mg,20%产率)。LCMS(ESI)m/z:C11H21NO3S的[M+H]计算值:248.13;实验值248.1。
步骤3:合成(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-乙基氮杂环丙烷-2-甲酸
向(2S,3S)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-乙基氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(600mg,2.4mmol)于MeOH(300μL)和H2O(300μL)中的溶液中添加LiOH(87mg,3.6mmol)。将所得混合物搅拌12小时,接着用H2O(20mL)稀释并用DCM(3×10mL)洗涤。将水层冻干,得到产物(600mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C9H17NO3S的[M+H]计算值:220.10;实验值220.2。
中间体A-96.合成(2R,3R)-3-异丙基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016461
步骤1:合成(E)-4-甲基戊-2-烯酸
将两批丙二酸(25.0mL,240mmol)、异丁醛(34.7mL,380mmol)和吗啉(380μL,4.32mmol)于吡啶(75mL)中的溶液搅拌24小时,接着加热至115℃并搅拌12小时。将合并的反应混合物倒入H2SO4(1M,800mL)中并萃取至EtOAc(3×300mL)中。将合并的有机层用盐水(300mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物溶解于NaOH(1M,500mL)中,用EtOAc(2×200mL)洗涤,用HCl(4M)酸化至pH=4–2,并萃取至EtOAc(3×300mL)中。将合并的有机层用盐水(300mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到产物(54g,98%产率)。
步骤2:合成(E)-4-甲基戊-2-烯酸苯甲酯
向两批(E)-4-甲基戊-2-烯酸(6.25mL,52.6mmol)于丙酮(90mL)中的溶液中添加K2CO3(13.8g,100mmol)并将混合物搅拌30分钟。接着,添加苯甲基溴(6.31mL,53.1mmol)于丙酮(10mL)中的溶液并将混合物加热至75℃,保持5小时。将反应混合物冷却至室温并减压浓缩。将残余物溶解于EtOAc(200mL)和H2O(200mL)中,接着萃取至EtOAc(2×200mL)中。将合并的有机层用盐水(300mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→10% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(9.0g,42%产率)。
步骤3:合成(2R,3S)-2,3-二羟基-4-甲基戊酸苯甲酯
向AD-mix-α(61.7g)和甲烷磺酰胺(4.19g,44.1mmol)于tert-BuOH(225mL)和H2O(225mL)中的溶液中添加(E)-4-甲基戊-2-烯酸苯甲酯(9g,44.1mmol)。在室温下将混合物搅拌12小时,接着添加Na2SO3(67.5g)并搅拌30分钟。将反应混合物用EtOAc(300mL)和H2O(300mL)稀释并萃取至EtOAc(3×300mL)中,用盐水(300mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→25%EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(8.3g,79%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H18O4的[M+Na]计算值:261.11;实验值261.0。
步骤4:合成(4R,5S)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2-氧化物
在0℃下,向(2R,3S)-2,3-二羟基-4-甲基戊酸苯甲酯(10g,42.0mmol)于DCM(100mL)中的溶液中添加Et3N(17.5mL,126mmol)和SOCl2(4.26mL,58.8mmol)。将反应混合物搅拌30分钟,接着用DCM(30mL)和H2O(100mL)稀释,将其萃取至DCM(3×50mL)中,用盐水(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到产物(11.0g,92%产率)。
步骤5:合成(4R,5S)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2,2-二氧化物
向(4R,5S)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2,2-氧化物(11g,38.7mmol)于H2O(250mL)、MeCN(125mL)和CCl4(125mL)中的溶液中添加NaIO4(3.22mL,58.0mmol)和RuCl3·H2O(872mg,3.87mmol)。在室温下将混合物搅拌1小时,接着用EtOAc(200mL)和H2O(50mL)稀释,过滤,并将滤液萃取至EtOAc(3×200mL)中。将合并的有机层依序用盐水(200mL)和饱和Na2CO3水溶液(300mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17%EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(11g,95%产率)。
步骤6:合成(2S,3S)-2-溴-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯
向(4R,5S)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2,2-二氧化物(11g,36.6mmol)于THF(520mL)中的溶液中添加LiBr(3.49mL,139mmol)。在室温下将反应混合物搅拌5小时,接着减压浓缩。将残余物于THF(130mL)和H2O(65mL)中稀释,冷却至0℃,接着添加H2SO4溶液(20%水溶液,1.3L)并将混合物升温至室温并搅拌24小时。将混合物用EtOAc(1.0L)稀释,将其萃取至EtOAc(2×300mL)中,依序用Na2CO3(饱和水溶液,300mL)和盐水(300mL)洗涤,接着减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(10g,81%产率)。
步骤7:合成(2R,3S)-2-叠氮基-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯
向(2S,3S)-2-溴-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯(10g,33.2mmol)于DMSO(100mL)中的溶液中添加NaN3(4.32g,66.4mmol)。在室温下将反应混合物搅拌12小时,接着用EtOAc(300mL)和H2O(200mL)稀释。将水相萃取至EtOAc(2×200mL)中,用盐水(200mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(7.5g,79%产率)。
步骤8:合成(2R,3R)-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
向(2R,3S)-2-叠氮基-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯(7.5g,28.5mmol)于MeCN(150mL)中的溶液中添加PPh3(7.70g,29.3mmol)。在室温下将反应混合物搅拌1小时,接着加热至70℃并搅拌4小时。将反应混合物减压浓缩并通过硅胶色谱法(0→17% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(4.5g,66%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO2的[M+H]计算值:220.13;实验值220.0。
步骤9:合成(2R,3R)-3-异丙基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
在0℃下,向(2R,3R)-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(2g,9.12mmol)于DCM(30mL)中的溶液中添加Et3N(3.81mL,27.4mmol)和三苯甲氯(3.05g,10.9mmol),随后添加DMAP(111mg,912μmol)。将在0℃下反应混合物搅拌1小时,接着用DCM(50mL)和H2O(50mL)稀释,接着萃取至DCM(2×30mL)中。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→25% DCM/石油醚)纯化,得到产物(3.1g,72%产率)。
步骤10:合成(2R,3R)-3-异丙基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
在H2气氛下,在室温下将两份(2R,3R)-3-异丙基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(200mg,430μmol)和Pd/C(100mg)于THF(4mL)中的溶液搅拌1小时。将反应混合物合并,过滤,并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→50% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(160mg,51%产率)。
中间体A-97.合成(2S,3S)-1-苯甲基-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016501
步骤1:合成(2S,3R)-2,3-二羟基-4-甲基戊酸苯甲酯
向AD-mix-β(61.7g)及甲烷磺酰胺(4.19g,44.1mmol)于tert-BuOH(225mL)和H2O(225mL)中的溶液中添加(E)-4-甲基戊-2-烯酸苯甲酯(9g,44.1mmol)。在室温下将混合物搅拌12小时,接着添加Na2SO3(67.5g)并搅拌30分钟。将反应混合物用EtOAc(300mL)和H2O(300mL)稀释并萃取至EtOAc(3×300mL)中,用盐水(300mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→25%EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(8.8g,84%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H18O4的[M+Na]计算值:261.11;实验值261.0。
步骤2:合成(4S,5R)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2-氧化物
在0℃下,向(2S,3R)-2,3-二羟基-4-甲基戊酸苯甲酯(11.6g,48.7mmol)于DCM(116mL)中的溶液中添加Et3N(20.3mL,146mmol)和SOCl2(4.94mL,68.2mmol)。将反应混合物搅拌30分钟,接着用DCM(100mL)和H2O(100mL)稀释,萃取至DCM(3×100mL)中,用盐水(200mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到产物(13.0g,94%产率)。
步骤3:合成(4S,5R)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2,2-二氧化物
向(4S,5R)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2-氧化物(13g,45.7mmol)于H2O(290mL)、MeCN(145mL)和CCl4(145mL)中的溶液中添加NaIO4(3.80mL,68.6mmol)和RuCl3·H2O(1.03g,4.57mmol)。在室温下将混合物搅拌1小时,接着用DCM(500mL)和H2O(300mL)稀释,过滤,并将滤液萃取至DCM(3×200mL)中。将合并的有机层依序用盐水(500mL)和饱和Na2CO3水溶液(300mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17%EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(11.5g,80%产率)。
步骤4:合成(2R,3R)-2-溴-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯
向(4S,5R)-5-异丙基-1,3,2-二氧杂硫杂环戊烷-4-甲酸苯甲酯2,2-二氧化物(11.5g,38.3mmol)于THF(520mL)中的溶液中添加LiBr(3.65mL,146mmol)。在室温下将反应混合物搅拌5小时,接着减压浓缩。将残余物于THF(130mL)和H2O(65mL)中稀释,冷却至0℃,接着添加H2SO4溶液(20%水溶液,1.3L)并将混合物升温至室温并搅拌24小时。将混合物用EtOAc(1.0L)稀释,用Na2CO3(饱和水溶液,300mL)洗涤,接着减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(10g,83%产率)。
步骤5:合成(2S,3R)-2-叠氮基-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯
向(2R,3R)-2-溴-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯(10g,33.2mmol)于DMSO(100mL)中的溶液中添加NaN3(4.33g,66.6mmol)。在室温下将反应混合物搅拌12小时,接着用EtOAc(300mL)和H2O(200mL)稀释。将混合物萃取至EtOAc(2×200mL)中,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(7.5g,76%产率)。
步骤6:合成(2S,3S)-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
向(2S,3R)-2-叠氮基-3-羟基-4-甲基戊酸苯甲酯(7.5g,28.5mmol)于MeCN(150mL)中的溶液中添加PPh3(7.70g,29.3mmol)。在室温下将反应混合物搅拌1小时,接着加热至70℃并搅拌3小时。将反应混合物减压浓缩并通过硅胶色谱法(0→17% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(4.5g,64%产率)。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO2的[M+H]计算值:220.13;实验值220.1。
步骤7:合成(2S,3S)-1-苯甲基-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯
向(2S,3S)-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(1g,4.56mmol)于MeCN(10mL)中的溶液中添加K2CO3(3.15g,22.8mmol)和苯甲基溴(812μL,6.84mmol)。在室温下将反应混合物搅拌6小时,接着用EtOAc(30mL)和H2O(30mL)稀释,萃取至EtOAc(2×30mL)中,用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过硅胶色谱法(0→17% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(1.3g,89%产率)。LCMS(ESI)m/z:C20H23NO2的[M+H]计算值:310.18;实验值310.1。
步骤8:合成(2S,3S)-1-苯甲基-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(2S,3S)-1-苯甲基-3-异丙基氮杂环丙烷-2-甲酸苯甲酯(600mg,1.94mmol)于THF(6mL)、MeCN(3mL)和H2O(6mL)中的溶液中添加LiOH·H2O(163mg,3.88mmol)。在室温下将反应混合物搅拌1小时并用HCl(0.5M)调至pH=7-8。冻干,得到产物(750mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C13H17NO2的[M+H]计算值:220.13;实验值220.1。
中间体A-98、A-99、A-100及A-101.合成(2R,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯、(2S,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯、(2R,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯及(2S,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
Figure BDA0004194083620016531
步骤1:合成N-二苯甲基-1-(氧杂环丁烷-3-基)甲亚胺
在0℃下,向氧杂环丁烷-3-甲醛(5.0g,58mmol)和MgSO4(6.99g,58.1mmol)于DCM(120mL)中的溶液中添加二苯基甲胺(12.1mL,69.7mmol)。在室温下将混合物搅拌12小时,接着过滤并减压浓缩,得到所需化合物(14g,95.9%产率),该化合物不经进一步纯化即使用。
步骤2:合成顺-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯和反-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
向N-二苯甲基-1-(氧杂环丁烷-3-基)甲亚胺(10g,39.79mmol)于MeCN(150mL)中的溶液中添加TfOH(878mL,9.95mmol)并在5分钟后,添加重氮乙酸乙酯(5.0mL,47.8mmol)。在室温下将反应混合物搅拌12小时,接着冷却至0℃并通过添加饱和NaHCO3(300mL)淬灭。将水层用EtOAc(3×200mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(50→65%MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)纯化,得到外消旋顺-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(1.1g,8.2%产率)和外消旋反-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(780mg,5.8%产率)
步骤3:分离外消旋顺-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯:(2R,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯和(2S,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
通过手性制备型SFC(25% MeOH/CO2)分离外消旋顺-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(800mg,2.37mmol),得到(2R,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(320mg,40%产率)和(2S,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(320mg,40%产率)。
步骤4:分离外消旋反-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯:(2R,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯和(2S,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯
通过手性制备型SFC(25% EtOH,0.1% NH4OH/CO2)分离外消旋反-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(700mg,2.07mmol),得到(2R,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(300mg,42%产率)和(2S,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(320mg,43%产率)。
中间体A-102及A-103.合成(2R,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸和(2S,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016551
步骤1:合成(2R,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸
向(2R,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(156mg,463mmol)于EtOH(3mL)中的溶液中添加2M NaOH(347mL,696mmol)。在室温下,将反应混合物搅拌3小时,接着减压浓缩。用1M HCl将浓缩物酸化至pH 5并用DCM(3×5mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需化合物(110mg,72.6%产率)。
步骤2:合成(2S,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸
向(2S,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(150mg,444mmol)于EtOH(5mL)中的溶液中添加2M NaOH(333mL,666mmol)。在室温下将反应混合物搅拌3小时,接着用1M HCl酸化至pH 5。将水层用DCM(3×10mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需化合物(120mg,86.1%产率)。
中间体A-104和A-105.合成(2R,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸钠和(2S,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸钠
Figure BDA0004194083620016561
步骤1:合成(2R,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸钠
向(2R,3S)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(150mg,444mmol)于EtOH(3mL)中的溶液中添加2M NaOH(333.42mL,666mmol)。在室温下将反应混合物搅拌3小时,接着用1M HCl将pH值调至pH 8。将所得溶液冻干,得到所需化合物(165mg,粗品),其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C19H18NO3的[M]计算值:308.13;实验值308.0。
步骤2:合成(2S,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸钠
向(2S,3R)-1-二苯甲基-3-(氧杂环丁烷-3-基)氮杂环丙烷-2-甲酸乙酯(170mg,503mmol)于EtOH(3mL)中的溶液中添加2M NaOH(378mL,754mmol)。在室温下将反应混合物搅拌3小时,接着用1M HCl将pH值调至pH 8。将所得溶液冻干,得到所需化合物(230mg,粗品),其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C19H18NO3的[M]计算值:308.13;实验值308.0。
中间体A-106.合成(R)-1-((苯甲氧基)羰基)-2-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016571
步骤1:合成(2S,4S)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯
在0℃下,向((苯甲氧基)羰基)-L-丙氨酸(25g,111.99mmol)和(二甲氧基甲基)苯(71.38mL,115.35mmol)于THF(180mL)中的混合物中一次性添加SOCl2(8.94g,123.19mmol)。将混合物搅拌10分钟,随后将ZnCl2(5.77mL,123.26mmol)添加至溶液中,接着在0℃下将混合物搅拌4小时。通过逐滴添加冷H2O淬灭反应混合物并用饱和NaHCO3调至pH=5,接着用EtOAc(2×100mL)萃取。将有机层用饱和NaHCO3水溶液(30mL)和盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(1→10% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(15g,43%产率)。
步骤2:合成(2S,4S)-4-(碘甲基)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯
在N2气氛下,在20℃下将HMPA(5.22mL,29.74mmol)和LHMDS(1M,6.62mL)混合于THF(45mL)中。将该溶液冷却至-78℃并在搅拌下,逐滴添加(2S,4S)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯(2.0g,6.42mmol)于THF(12mL)中的溶液。再搅拌30分钟后,逐滴添加CH2I2(1.55mL,19.27mmol)于THF(6mL)中的溶液。在-78℃下将混合物搅拌90分钟。将混合物升温至0℃并用饱和NH4Cl水溶液(70mL)淬灭。将混合物用EtOAc(2×30mL)萃取,并将合并的有机层用饱和NH4Cl水溶液(20mL)、H2O(2×20mL)和盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将所得残余物通过硅胶柱色谱法(1→20% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(1.2g,41.4%产率)。
步骤3:合成(S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-碘-2-甲基丙酸甲酯
在N2下,在-40℃下经10分钟向(2S,4S)-4-(碘甲基)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯(1.2g,2.66mmol)于THF(20mL)中的混合物中逐滴添加NaOMe(957.69mg,5.32mmol,30%纯度)于MeOH(9mL)中的溶液。在-40℃下将混合物搅拌2小时,接着升温至-20℃并搅拌1小时。通过添加H2O(20mL)淬灭反应,并将所得混合物用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(1→20%EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(870mg,2.24mmol,84.4%产率)。
步骤4:合成(R)-2-甲基氮杂环丙烷-1,2-二甲酸1-苯甲酯2-甲酯
在室温下,向(S)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-碘-2-甲基丙酸甲酯(0.87g,2.31mmol)于MeCN(125mL)中的混合物中一次性添加Ag2O(1.60g,6.92mmol)。在90℃下将混合物搅拌30分钟。将混合物过滤并减压浓缩,得到产物(500mg,2.01mmol,86.9%产率)。
步骤5:合成(R)-2-甲基氮杂环丙烷-1,2-二甲酸1-苯甲酯2-甲酯
在N2下,在0℃下向(R)-2-甲基氮杂环丙烷-1,2-二甲酸1-苯甲酯2-甲酯(250mg,1.0mmol)于MeCN(2.5mL)和H2O(2.5mL)中的混合物中一次性添加NaOH(40.12mg,1.0mmol)。在0℃下将混合物搅拌30分钟。将混合物减压浓缩,得到粗产物(256mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C12H12NO4的[M+H]计算值:234.1;实验值234.1。
中间体A-107.合成(S)-1-((苯甲氧基)羰基)-2-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
Figure BDA0004194083620016591
步骤1:合成(2R,4R)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯
五个批次并行完成。在0℃下,向((苯甲氧基)羰基)-D-丙氨酸(5g,22.40mmol)和(二甲氧基甲基)苯(3.71mL,24.64mmol)于THF(35mL)中的混合物中一次性添加SOCl2(1.79mL,24.64mmol)。将混合物搅拌10分钟后,将ZnCl2(1.15mL,24.64mmol)添加至溶液中。接着,在0℃下将混合物搅拌4小时。将五个批次合并,并且减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(1→10% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(20g,57.4%产率)。
步骤2:合成(2R,4R)-4-(碘甲基)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯
四个批次并行完成。在N2气氛下,在20℃下在搅拌下混合THF(300mL)、HMPA(13.06mL,74.34mmol)和LHMDS(1M,16.54mL)。将该溶液冷却至-78℃并逐滴添加(2R,4R)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯(5g,16.06mmol)于THF(84mL)中的溶液。再搅拌30分钟后,逐滴添加CH2I2(3.89mL,48.18mmol)于THF(33mL)中的溶液。在-78℃下将混合物搅拌90分钟。将四个批次合并,并升温至0℃。将饱和NH4Cl水溶液(100mL)添加至合并的溶液中,并将所得混合物用EtOAc(2×100mL)萃取。将合并的EtOAc层用饱和NH4Cl水溶液(50mL)、H2O(2×20mL)和盐水(30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将所得残余物通过硅胶柱色谱法(1→17%EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(16g,55.2%产率)。
步骤3:合成(R)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-碘-2-甲基丙酸甲酯
在N2下,在-40℃下经10分钟向(2R,4R)-4-(碘甲基)-4-甲基-5-氧代-2-苯基噁唑烷-3-甲酸苯甲酯(16g,35.46mmol)于THF(90mL)中的混合物中逐滴添加NaOMe(12.77g,70.91mmol,30%纯度)。在-40℃下将混合物搅拌2小时,接着升温至-20℃并搅拌1小时。通过添加H2O(100mL)淬灭反应,并将所得混合物用乙醚(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将所得残余物通过硅胶柱色谱法(1→17% EtOAc/石油醚)纯化,得到产物(10g,74.8%产率)。
步骤4:合成(S)-2-甲基氮杂环丙烷-1,2-二甲酸1-苯甲酯2-甲酯
四个批次并行完成。在20℃下,向(R)-2-(((苯甲氧基)羰基)氨基)-3-碘-2-甲基丙酸甲酯(8g,21.20mmol)于MeCN(800mL)中的混合物中一次性添加Ag2O(14.76g,63.64mmol)。在90℃下将混合物搅拌30分钟。将四个批次合并,过滤,并减压浓缩,得到产物(5.1g,90.9%产率)。
步骤5:合成(S)-1-((苯甲氧基)羰基)-2-甲基氮杂环丙烷-2-甲酸
在0℃下,向(S)-2-甲基氮杂环丙烷-1,2-二甲酸1-苯甲酯2-甲酯(1g,4.01mmol)于MeCN(5mL)中的溶液中添加NaOH(240.69mg,6.02mmol)于H2O(5mL)中的溶液,接着在0℃下将混合物搅拌30分钟。将混合物直接冻干,得到粗产物(1.05g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C12H12NO4的[M+H]计算值:234.08;实验值234.2。
中间体A-108和A-109.合成(R)-7-((S)-2-(苯甲氧基)-1-环戊基-2-氧代乙基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯和(S)-7-((S)-2-(苯甲氧基)-1-环戊基-2-氧代乙基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯
Figure BDA0004194083620016611
步骤1:合成3-烯丙基吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯
在-78℃下,向吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(10.0g,43.6mmol)于THF(100mL)中的溶液中添加LiHMDS(65.0mL,65.4mmol,1M于THF中)。1小时后,添加烯丙基溴(5.63mL,65.4mmol)并将所得混合物升温至室温过夜。在0℃下通过添加NH4Cl(200mL)淬灭反应。将水层用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(5%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(10.0g,76.6%产率)。
步骤3:合成3-(2-氧代乙基)吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯
在0℃下,向3-烯丙基吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(10.0g,37.1mmol)和2,6-二甲基吡啶(8.65mL,80.7mmol)于二噁烷(571mL)和H2O(142mL)中的溶液中添加K2OsO4·2H2O(0.27g,0.73mmol)。15分钟后,添加NaIO4(23.82g,111.4mmol)并在室温下,将所得混合物搅拌过夜,接着用H2O(200mL)稀释。将水层用EtOAc(3×200mL)萃取,并将合并的有机层用2M HCl洗涤,用Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到所需产物(9.7g,粗品),其不经进一步纯化即使用。
步骤4:合成3-(2-(((S)-2-(苯甲氧基)-1-环戊基-2-氧代乙基)氨基)乙基)吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯
在0℃下,向3-(2-氧代乙基)吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(9.60g,35.4mmol)于MeOH(100mL)中的溶液中添加(S)-2-氨基-2-环戊基乙酸苯甲酯(12.38g,53.075mmol)和氯化锌(7.23g,53.1mmol)。30分钟后,添加NaBH3CN(4.45g,70.8mmol)并在室温下,将所得混合物搅拌2小时,减压浓缩并将残余物用H2O(150mL)稀释。将水层用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,接着减压浓缩。通过正相色谱法(20% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(11.1g,64.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C27H40N2O6的[M+H]计算值:489.30;实验值489.3。
步骤5:合成(R)-7-((S)-2-(苯甲氧基)-1-环戊基-2-氧代乙基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯和(S)-7-((S)-2-(苯甲氧基)-1-环戊基-2-氧代乙基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯
向3-(2-(((S)-2-(苯甲氧基)-1-环戊基-2-氧代乙基)氨基)乙基)吡咯烷-1,3-二甲酸1-(叔丁基)酯3-甲酯(11.1g,22.7mmol)于甲苯(120mL)中的搅拌溶液中添加DIPEA(39.6mL,227mmol)和DMAP(2.78g,22.7mmol)。在80℃下,将所得混合物搅拌2天,接着减压浓缩。通过反相色谱法(20→70% MeCN/H2O,0.1% HCO2H)纯化,得到所需产物的混合物。将非对映异构体通过制备型SFC(30% EtOH/CO2)纯化,得到(R)-7-((S)-2-(苯甲氧基)-1-环戊基-2-氧代乙基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(3.73g,44.4%产率)LCMS(ESI)m/z:C26H36N2O5的[M+H]计算值:457.27;实验值457.3及(S)-7-((S)-2-(苯甲氧基)-1-环戊基-2-氧代乙基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(3.87g,46.1%产率)LCMS(ESI)m/z:C26H36N2O5的[M+H]计算值:457.27;实验值457.3。
中间体B-1.合成N-(3-(3-(4-甲氧基苯基)硫脲基)丙酰基)-N-甲基-L-缬氨酸
Figure BDA0004194083620016631
步骤1:合成N-(3-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
向3-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(1.04g,5.50mmol)于DMF(6mL)中的溶液中添加DIPEA(2.38mL,13.7mmol),随后添加HATU(2.71g,7.15mmol)。将反应混合物搅拌5分钟并添加甲基-L-缬氨酸甲酯盐酸盐(1g,5.50mmol)。在室温下,将反应搅拌3小时,接着用H2O淬灭。将水层用EtOAc(3×10mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,并经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需粗产物。
步骤2:合成N-(3-氨基丙酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯三氟乙酸
向N-(3-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(1.74g,5.50mmol)于DCM(3mL)中的溶液中添加TFA(2.09mL,27.4mmol)。在室温下,将反应搅拌过夜,接着减压浓缩,得到所需粗产物于TFA中的33.5%溶液。
步骤3:合成N-(3-(3-(4-甲氧基苯基)硫脲基)丙酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯
向N-(3-氨基丙酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯三氟乙酸(800mg,0.811mmol)于TFA中的33.5wt%溶液中添加DCM(5mL),随后添加Et3N(593μL,4.26mmol)和异硫氰酸4-甲氧基苯酯(117.0μL,852μmol)。在室温下,将反应搅拌3小时。接着,将反应混合物用H2O(2×5mL)、NH4Cl水溶液(5mL)和盐水(5mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并减压浓缩,得到呈油状的粗产物(290.2mg,89.2%产率),该粗产物不经纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C18H27N3O4S的[M+H]计算值:382.18;实验值382.2。
步骤4:合成N-(3-(3-(4-甲氧基苯基)硫脲基)丙酰基)-N-甲基-L-缬氨酸
向N-(3-(3-(4-甲氧基苯基)硫脲基)丙酰基)-N-甲基-L-缬氨酸甲酯(290.2mg,0.76mmol)于THF(1mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(41.4mg,0.99mmol)于H2O(300μL)中的溶液。将反应混合物搅拌过夜,接着用HCl(4M于二噁烷中,120μL,0.48mmol)酸化。接着,浓缩溶液,将残余物溶解于EtOAc中,并将有机层用H2O(3×5mL)和盐水(5mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥并减压浓缩,得到粗产物(215.1mg,77.0%产率),其不经进一步纯化即用于下一步。LCMS(ESI)m/z:C17H25N3O4S的[M+H]计算值:368.16;实验值368.2。
下表化合物是使用合成中间体B-1所用的方法或其变化形式制备。
表3:中间体B
Figure BDA0004194083620016641
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Figure BDA0004194083620016651
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Figure BDA0004194083620016661
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Figure BDA0004194083620016671
/>
Figure BDA0004194083620016681
实施例1.合成(3S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺
Figure BDA0004194083620016682
步骤1:合成(3S)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-甲酰胺
在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(520.0mg,0.831mmol)和N-甲基-N-((S)-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-羰基)-L-缬氨酸(0.6727g,1.25mmol)于DMF(10mL)中的溶液中添加COMU(0.5338mg,1.25mmol),随后添加DIPEA(1.16mL,6.65mmol)。2小时后,将反应混合物用EtOAc(3×100mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(3×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将粗残余物通过反相色谱法(10→50% MeCN/H2O)纯化,得到呈固体状的所需产物(500mg,52.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C69H78N8O8的[M+H]计算值:1147.60;实验值1147.8。
步骤2:合成(3S)-1-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺
在0℃下,向(3S)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-1-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-甲酰胺(145.0mg,0.126mmol)于DCM(3mL)中的搅拌的溶液中添加Et3SiH(58.8mg,0.505mmol),随后添加TFA(57.6mg,0.505mmol)。1小时后,将DIPEA添加至反应混合物中,直至Ph 8。将所得混合物减压浓缩,并将残余物通过反相色谱法(10→50%MeCN/H2O)纯化,得到呈固体状的所需产物(70mg,61.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C50H64N8O8的[M+H]计算值:905.49;实验值905.7。
实施例7.合成(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
Figure BDA0004194083620016691
步骤1:合成(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(N-甲基-2-(甲基氨基)乙酰胺基)丁酰胺(285.7mg,0.353mmol)于DMF(3.0mL)中的溶液中添加(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(232.4mg,0.705mmol),随后添加DIPEA(0.61mL,4.7mmol)和COMU(211.4mg,0.494mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌1小时。将反应混合物用H2O(15mL)稀释并将混合物用EtOAc(3×4mL)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(12% EtOAc/石油醚)纯化,得到呈固体状的所需产物(301mg,68%产率)。LCMS(ESI)m/z:C67H76N8O8的[M+H]计算值:1121.59;实验值1121.8。
步骤2:合成(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺(301.0mg,0.268mmol)于MeOH(3.0mL)中的溶液中添加HCO2H(1.50mL)。将反应混合物搅拌1小时,接着用DIPEA中和至pH 8。将所得混合物用H2O(15mL)稀释并用EtOAc(3×4mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(30→60%MeCN/H2O)纯化,得到呈固体状的所需产物(89.9mg,38%产率)。LCMS(ESI)m/z:C48H62N8O8的[M+H]计算值:879.48;实验值879.7。
实施例15.合成两种异构体15A和15B,即(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-(3-((((4-甲氧基苯基)亚氨基)亚甲基)氨基)-N-甲基丙酰胺基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620016711
步骤1:合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-(3-(3-(4-甲氧基苯基)硫脲基)-N-甲基丙酰胺基)-3-甲基丁酰胺
在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(108mg,168μmol)和N-(3-(3-(4-甲氧基苯基)硫脲基)丙酰基)-N-甲基-L-缬氨酸(61.9mg,168μmol)于MeCN(2mL)中的溶液中添加2,6-二甲基吡啶(97.8μL,840μmol),随后添加COMU(78.8mg,184μmol)。在0℃下1小时后,将反应物用EtOAc稀释,并将有机部分用H2O(15mL)和盐水(15mL)洗涤,经Na2SO4干燥,并减压浓缩。通过硅胶色谱法(20→100%EtOAc/Hex,接着0→5% MeOH/EtOAc)纯化,得到所需产物(117.0mg72.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C53H66N8O7S的[M+H]计算值:959.49;实验值959.5。
步骤2:合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-(3-((((4-甲氧基苯基)亚氨基)亚甲基)氨基)-N-甲基丙酰胺基)-3-甲基丁酰胺的两种异构体
向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-(3-(3-(4-甲氧基苯基)硫脲基)-N-甲基丙酰胺基)-3-甲基丁酰胺(117.0mg,121μmol)于DCM(1mL)中的溶液中添加DIPEA(63.2μL,363μmol),随后添加碘化2-氯-1-甲基吡啶-1-鎓盐(42.6mg,181μmol)。将反应混合物搅拌过夜,此时,过滤固体并将粗溶液通过反相色谱法(40→100MeCN/H2O+0.4% NH4OH)纯化,得到两种分离的异构体,即较早洗脱的所需异构体15A(6.9mg,6.2%产率)和较晚洗脱的异构体15B(2.5mg,2.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C53H64N8O7的[M+H]计算值:925.50;实验值925.5及LCMS(ESI)m/z:C53H64N8O7的[M+H]计算值:925.50;实验值925.6。
实施例25.合成(2S)-2-(3-(3-(2-氯乙基)脲基)-N-甲基丙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620016731
步骤1:合成(2S)-2-(3-(3-(2-氯乙基)脲基)-N-甲基丙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
在0℃下,向(2S)-2-(3-氨基-N-甲基丙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(106mg,109μmol)于MeCN(544μL)中的溶液中添加1-氯-2-异氰酸基乙烷(9.29μL,109μmol),随后添加Et3N(15.1μL,109μmol)。12分钟后,将反应物用DCM(10mL)和1%甲酸于H2O中的溶液(10mL)稀释。将水层用DCM(10mL)萃取,并将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,接着减压浓缩,得到所需产物(117mg,100%产率),该产物不经纯化即用于下一步骤中。LCMS(ESI)m/z:C57H83ClN8O8Si的[Μ+H]计算值:1071.59;实验值1071.5。
步骤2:合成(2S)-2-(3-(3-(2-氯乙基)脲基)-N-甲基丙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
在0℃下,向(2S)-2-(3-(3-(2-氯乙基)脲基)-N-甲基丙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(117mg,109μmol)于MeCN(1.1mL)中的溶液中添加TBAF(1M于二噁烷中,109μL,109μmol)。5分钟后,将反应减压浓缩并将粗残余物通过正相色谱法(20→100% B/A,B=10% MeOH/EtOAc,A=己烷)纯化,随后通过反相色谱法(20→60% MeCN/H2O)纯化,得到最终产物(82.2mg,82%产率)。LCMS(ESI)m/z:C48H63ClN8O8的[Μ+H]计算值:915.45;实验值915.7。
实施例30.合成(2S)-2-(3-((4,5-二氢噁唑-2-基)氨基)-N-甲基丙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620016741
在微波中,在150℃下将(2S)-2-(3-(3-(2-氯乙基)脲基)-N-甲基丙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(55.0mg,60.0μmol)和Et3N(25.1μL,180μmol)于MeOH(1.2mL)中的溶液加热1分钟。将反应混合物冷却至室温并减压浓缩。接着,将粗残余物通过反相色谱法(30→100% MeCN/H2O+0.4% NH4OH)纯化,得到最终产物(21.1mg,40%产率)。LCMS(ESI)m/z:C48H62N8O8的[Μ+H]计算值:879.48;实验值879.4。
实施例31.合成(3S)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-1-((S)-氧杂环丙烷-2-羰基)吡咯烷-3-甲酰胺
Figure BDA0004194083620016751
在0℃下,向(S)-氧杂环丙烷-2-甲酸钾(16.98mg,0.135mmol)、六氟磷酸2-氯-1,3-二甲基咪唑啶鎓盐(87.46mg,0.314mmol)和DIPEA(0.156mL,0.897mmol)于DMF(1.5mL)中的溶液中添加(3S)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基吡咯烷-3-甲酰胺(75.0mg,0.09mmol)。在室温下,将所得混合物搅拌过夜,此时,将其用EtOAc(100mL)稀释。将有机层用盐水(3×5mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(25→55% MeCN/H2O)纯化,得到呈固体状的所需产物(6.3mg,7.8%产率)。LCMS(ESI)m/z:C50H63N7O9的[M+H]计算值:906.48;实验值906.7。
实施例34.合成(2R)-1-乙酰基-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
Figure BDA0004194083620016761
步骤1:合成(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(260mg,0.332mmol)和N-甲基-N-(N-甲基-N-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)甘氨酰基)-L-缬氨酸(204mg,0.399mmol)于MeCN(3.3mL)中的溶液中添加二甲基吡啶(192μL,1.66mmol),随后添加COMU(156mg,0.366mmol)。在0℃下,将反应搅拌1小时,接着用EtOAc稀释。将混合物用H2O/盐水(1:1)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(0→100% EtOAc/己烷)纯化,得到所需产物(116mg,27%产率)。LCMS(ESI)m/z:C76H96N8O8Si的[M+H]计算值:1277.72;实验值1277.7。
步骤2:合成(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺(400mg,0.313mmol)于MeOH(1.56mL)和氯仿(1.56mL)中的溶液中添加TFA(191μL,2.50mmol)。在0℃下,将反应搅拌2小时,接着用二甲基吡啶(364μL,3.13mmol)淬灭。将反应混合物用DCM稀释,用H2O洗涤,并减压浓缩。通过反相色谱法(10→100% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(100mg,31%产率)。LCMS(ESI)m/z:C57H82N8O8Si的[M+H]计算值:1035.61;实验值1035.6。
步骤3:合成(2R)-1-乙酰基-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺(33mg,0.032mmol)于DCM(637μL)中的溶液中添加Et3N(22.1μL,0.159mmol),随后添加乙酰氯(4.54μL,0.064mmol)。在0℃下,将反应搅拌1小时。接着,将反应用DCM稀释,用NaHCO3洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需粗产物(37mg,100%产率)。LCMS(ESI)m/z:C59H84N8O9Si的[M+H]计算值:1077.62;实验值1077.6。
步骤4:合成(2R)-1-乙酰基-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2R)-1-乙酰基-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺(34mg,0.032mmol)于MeCN(631μL)中的溶液中添加TBAF(1M于THF中,31.5μL,0.032mmol)。将反应搅拌10分钟,接着用DCM稀释,用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(10→100% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(8.5mg,29%产率)。LCMS(ESI)m/z:C50H64N8O9的[M+H]计算值:921.49;实验值921.5。
实施例36.合成(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-(甲基磺酰基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺
Figure BDA0004194083620016781
步骤1:合成(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-(甲基磺酰基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺(33mg,0.032mmol)于DCM(637μL)中的溶液中添加Et3N(22.1μL,0.159mmol),随后添加甲烷磺酰氯(4.93μL,0.064mmol)。将反应冷却至0℃,保持1小时,接着用DCM稀释,用NaHCO3洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需粗产物(35mg,100%产率)。LCMS(ESI)m/z:C58H84N8O10SSi的[M+H]计算值:1113.59;实验值1113.6。
步骤2:合成(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-(甲基磺酰基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-(甲基磺酰基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺(35mg,0.032mmol)于MeCN(646μL)中的溶液中添加TBAF(1M于THF中,32.3μL,0.032mmol)。将反应搅拌10分钟,接着用DCM稀释,用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(10→100% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(20mg,65%产率)。LCMS(ESI)m/z:C49H64N8O10S的[M+H]计算值:957.45;实验值957.5。
实施例38.合成(2R)-2-((2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨甲酰基)氮杂环丙烷-1-甲酸甲酯
Figure BDA0004194083620016801
步骤1:合成(2R)-2-((2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨甲酰基)氮杂环丙烷-1-甲酸甲酯
在0℃下,向(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺(46mg,0.044mmol)于DCM(888μL)中的溶液中添加E3N(30.8μL,0.22mmol),随后添加氯甲酸甲酯(4.46μL,0.058mmol)。在0℃下,将反应搅拌1小时,接着,将反应物用DCM稀释,用NaHCO3洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需粗产物(56mg,100%产率)。LCMS(ESI)m/z:C59H84N8O10Si的[M+H]计算值:1093.62;实验值1093.7。
步骤2:合成(2R)-2-((2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨甲酰基)氮杂环丙烷-1-甲酸甲酯
在0℃下,向(2R)-2-((2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨甲酰基)氮杂环丙烷-1-甲酸甲酯(56mg,0.051mmol)于MeCN(1.0mL)中的溶液中添加TBAF(1M于THF中,51.2μL,0.051mmol)。将反应搅拌15分钟,接着用DCM稀释,用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(10→100%MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(17mg,36%产率)。LCMS(ESI)m/z:C50H64N8O10的[M+H]计算值:937.48;实验值937.6。
实施例48和49.合成(2S,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-((2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨甲酰基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯和(2S,3R)-3-((2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨甲酰基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯
Figure BDA0004194083620016811
步骤1:合成(2S,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-((2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨甲酰基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯
在0℃下,向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(N-甲基-2-(甲基氨基)乙酰胺基)丁酰胺(267.0mg,0.33mmol)和(2R,3S)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-(甲氧基羰基)氮杂环丙烷-2-甲酸(246.5mg,0.99mmol)于DMF(4.5mL)中的溶液中添加DIPEA(0.574mL,3.3mmol),随后添加COMU(211.8mg,0.49mmol)于DMF(0.5mL)中的溶液。在0℃下,将所得混合物搅拌1小时,接着用饱和NH4Cl淬灭。将水层用EtOAc(3×20mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩。将粗产物通过反相色谱法(35→65%MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(253mg,73.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C54H72N8O11S的[M+H]计算值:1041.51;实验值1041.8。
步骤2:合成(2S,3R)-3-((2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨甲酰基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯
在0℃下,向(2S,3R)-1-((R)-叔丁基亚磺酰基)-3-((2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨甲酰基)氮杂环丙烷-2-甲酸甲酯(200.0mg,0.19mmol)于THF(4.0mL)中的溶液中逐滴添加HI(1.0mL)。在0℃下,将所得混合物搅拌10分钟,接着用DIPEA碱化至pH 7。将混合物用EtOAc(3×30mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(35→65% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(13.2mg,7.3%产率)。LCMS(ESI)m/z:C50H64N8O10的[M+H]计算值:937.48;实验值938.6。
实施例55.合成(2S)-2-(2-((1R,5S)-6-苯甲基-2,4-二氧代-3,6-二氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-甲基乙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620016831
步骤1:合成(2S)-2-(2-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1H-吡咯-1-基)-N-甲基乙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
在0℃下,向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(600.0mg,0.67mmol)和2-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1H-吡咯-1-基)乙酸(124.7mg,0.80mmol)于DCM(6.0mL)中的溶液中添加DIPEA(0.934mL,5.36mmol),随后添加HATU(382.2mg,1.01mmol)。将反应混合物升温至室温并搅拌3小时。接着,通过添加H2O(20mL)淬灭反应。将水层用DCM(2×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法(10→20%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(260mg,33.8%产率)。LCMS(ESI)m/z:C57H77N7O9Si的[M+H]计算值:1032.56;实验值1032.8。
步骤2:合成(2S)-2-(2-((1R,5S)-6-苯甲基-2,4-二氧代-3,6-二氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-甲基乙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
向(2S)-2-(2-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1H-吡咯-1-基)-N-甲基乙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(250.0mg,0.24mmol)于EtOAc(2.0mL)中的溶液中添加(叠氮基甲基)苯(80.6mg,0.61mmol)。将反应混合物加热至80℃并搅拌2小时。接着,将反应混合物加热至120℃并搅拌2天。接着,将反应混合物冷却至室温并用H2O淬灭。将水层用EtOAc萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过正相色谱法纯化,得到所需产物(50mg,18.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C64H84N8O9Si的[M+H]计算值:1137.62;实验值1138.3。
步骤3:合成(2S)-2-(2-((1R,5S)-6-苯甲基-2,4-二氧代-3,6-二氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-甲基乙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
在0℃下,向(2S)-2-(2-((1R,5S)-6-苯甲基-2,4-二氧代-3,6-二氮杂双环[3.1.0]己-3-基)-N-甲基乙酰胺基)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(4-(甲氧基甲基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺(50.0mg,0.04mmol)于THF(0.5mL)中的溶液中添加1M TBAF(0.07mL,0.07mmol)。将反应混合物搅拌1小时。接着,将反应混合物用H2O稀释并用EtOAc萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC纯化,随后通过反相色谱法(45→72%MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(20mg,46.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C55H64N8O9的[M+Na]计算值:1003.47;实验值1003.8。
实施例95.合成(2R)-N-(2-(((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
Figure BDA0004194083620016851
步骤1:合成(2R)-N-(2-(((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2S)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-(N-甲基-2-(甲基氨基)乙酰胺基)乙酰胺(321.2mg,0.276mmol)、DIPEA(0.472mL,2.764mmol)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(136.59mg,0.415mmol)于DMF(3.0mL)中的混合物中添加HATU(126.14mg,0.332mmol)。在0℃下,将所得混合物搅拌30分钟,接着用H2O(30mL)稀释并用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过制备型TLC(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(200mg,62.3%产率)。LCMS(ESI)m/z:C70H80N8O8的[M+H]计算值:1161.62;实验值1161.5。
步骤2:合成(2R)-N-(2-(((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2R)-N-(2-(((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺(195.0mg,0.168mmol)于DCM(2.0mL)中的混合物中添加Et3SiH(78.09mg,0.672mmol)和TFA(76.57mg,0.672mmol)。在0℃下将所得混合物搅30分钟,接着用DIPEA碱化至pH 8并减压浓缩。通过反相色谱法(25→55%MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(60mg,38.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C51H66N8O8的[M+H]计算值:919.51;实验值919.5。
实施例87.合成6-((S)-氮杂环丙烷-2-基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基烟酰胺
Figure BDA0004194083620016871
步骤1:合成6-((2S)-1-(叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2-基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基烟酰胺
在0℃下,向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(甲基氨基)丁酰胺(198.24mg,0.218mmol)和DIPEA(0.074mL,0.436mmol)于MeCN(10mL)中的混合物中添加HATU(200mg,0.526mmol)并将所得混合物搅拌3分钟。接着,向混合物中分数份添加6-((2S)-1-(叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2-基)烟酸(117.0mg,0.436mmol)于MeCN(10mL)中的溶液。在0℃下将所得混合物搅拌过夜,接着用H2O淬灭,用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(430mg,85.0%产率)。LCMS(ESI)m/z:C64H90N8O8SSi的[M+H]计算值:1159.65;实验值1159.8。
步骤2:合成6-((2S)-1-(叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2-基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基烟酰胺
在0℃下,向6-((2S)-1-(叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2-基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基烟酰胺(430.0mg,0.371mmol)于THF(50.0mL)中的溶液中分数份添加TBAF(1M于THF中,1.1mL,1.11mmol)。在0℃下将所得混合物搅拌2小时,接着减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(5%MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(290mg,78%产率)。LCMS(ESI)m/z:C55H70N8O8S的[M+H]计算值:1003.51;实验值1003.8。
步骤3:合成6-((S)-氮杂环丙烷-2-基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基烟酰胺
在0℃下,向6-((2S)-1-(叔丁基亚磺酰基)氮杂环丙烷-2-基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基烟酰胺(150.0mg,0.150mmol)于H2O(15.0mL)和丙酮(15.0mL)中的溶液中分数份添加TFA(7.50mL,100.97mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌48小时,接着用饱和NaHCO3中和至pH 8。将水层用EtOAc萃取,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(38→58% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(10.0mg,7.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C51H62N8O7的[M+H]计算值:899.48;实验值899.5。
实施例139.合成(2S)-2-((S)-7-(((R)-氮杂环丙烷-2-基)甲基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
Figure BDA0004194083620016891
步骤1:合成(5R)-7-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯
在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(600mg,0.94mmol)和DIPEA(820μL,4.7mmol)于DMF(8mL)中的溶液中添加(S)-2-((R)-7-(叔丁氧基羰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-3-甲基丁酸(380mg,1.13mmol)和COMU(440mg,1.03mmol)。将反应混合物搅拌1小时,接着用H2O(100mL)稀释并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液。通过制备型TLC(EtOAc)纯化,得到所需产物(600mg,66%产率)。LCMS(ESI)m/z:C54H71N7O9的[M+H]计算值:962.54;实验值962.5。
步骤2:合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-((S)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酰胺
在0℃下,向(5R)-7-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(600mg,0.62mmol)于DCM(6mL)中的溶液中添加TFA(3.0mL,40mmol)。将反应混合物搅拌2小时,接着减压浓缩。将残余物用H2O(100mL)稀释,用饱和NaHCO3水溶液碱化至pH 8,并用EtOAc(3×60mL)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物(430mg,79%产率)。LCMS(ESI)m/z:C49H63N7O7的[M+H]计算值:862.49;实验值862.5。
步骤3:合成(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-((S)-1-氧代-7-(((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酰胺
向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-((S)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酰胺(200mg,0.23mmol)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲醛(110mg,0.35mmol)于MeOH(0.50mL)和MeCN(4.0mL)中的溶液中添加NaBH3CN(29mg,0.46mmol)。将反应混合物搅拌2小时,接着用饱和NH4Cl水溶液淬灭并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过制备型TLC(EtOAc)纯化,得到所需产物(145mg,53%产率)。LCMS(ESI)m/z:C71H82N8O7的[M+H]计算值:1159.64;实验值1159.6。
步骤4:合成(2S)-2-((S)-7-(((R)-氮杂环丙烷-2-基)甲基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基丁酰胺
在0℃下,向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-((S)-1-氧代-7-(((S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-基)甲基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)丁酰胺(140mg,0.12mmol)于DCM(2.0mL)中的溶液中添加TFA(74μL,0.97mmol)和Et3SiH(150μL,0.97mmol)。将反应混合物搅拌30分钟,接着用DIPEA碱化至pH 8。将所得混合物减压浓缩。通过反相色谱法(30→60% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(37.5mg,31%产率)。LCMS(ESI)m/z:C52H68N8O7的[M+H]计算值:917.53;实验值917.4。
实施例133.合成(2R,3R)-3-环丙基-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
Figure BDA0004194083620016921
步骤1:合成(2R,3R)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(N-甲基-2-(甲基氨基)乙酰胺基)丁酰胺(50mg,61μmol)和(2R,3R)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸(21mg,91μmol)于MeCN中的溶液中添加DIPEA(210μL,1.2mmol)和CIP(25mg,91μmol)。将所得混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,通过制备型TLC(9% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(270mg,54%产率)。LCMS(ESI)m/z:C56H76N8O9S的[M+H]计算值:1037.56;实验值1037.4。
步骤2:合成(2R,3R)-3-环丙基-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2R,3R)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺(230mg,0.22mmol)于THF中的混合物中添加HI(0.50mL,3.8mmol,57%wt于H2O中)。将反应混合物搅拌10分钟,接着用DIPEA中和至pH 8,并减压浓缩。通过反相色谱法(40→60% MeCN/H2O)纯化,得到呈白色固体状的所需产物(20mg,11%产率)。LCMS(ESI)m/z:C52H68N8O8的[M+H]计算值:933.53;实验值933.6。
实施例177.合成4-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基哌嗪-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620016931
步骤1:合成(S)-4-((1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
向100mL小瓶中添加于DCM(30mL)中的甲基-L-缬氨酸苯甲酯(2.0g,9.038mmol)和三光气(0.89g,2.982mmol),随后在N2气氛下,在0℃下分数份添加吡啶(2.14g,27.113mmol)。在室温下将混合物搅拌2小时。粗产物不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。接着,在N2气氛下,在室温下将所得混合物分数份添加至于DCM(25mL)中的哌嗪-1-甲酸叔丁酯(2.22g,11.912mmol)和Et3N(2.78g,27.489mmol)中。将所得混合物减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(30%EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(3.6g,90.6%产率)。LCMS(ESI)m/z:C23H35N3O5的[M+H]计算值:434.26;实验值434.2。
步骤2:合成N-(4-(叔丁氧基羰基)哌嗪-1-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸
向100mL小瓶中添加于THF(25mL)中的(S)-4-((1-(苯甲氧基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(2.95g,6.804mmol)和Pd/C(1.48g)。在氢气气氛下,在室温下将反应搅拌过夜。将所得混合物过滤,用EtOAc(3×50mL)洗涤滤饼,并将合并的有机层减压浓缩,得到所需产物(2.4g,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C16H29N3O5的[M+H]计算值:344.21;实验值344.4。
步骤3:合成4-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯
向50mL小瓶中添加于DMF(8mL)中的(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(1.0g,1.256mmol)和N-(4-(叔丁氧基羰基)哌嗪-1-羰基)-N-甲基-L-缬氨酸(647.04mg,1.884mmol),随后在室温下,分数份添加HATU(668.63mg,1.758mmol)和DIPEA(811.69mg,6.280mmol)。将所得混合物用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1.08g,76.7%产率)。LCMS(ESI)m/z:C62H92N8O9Si的[M+H]计算值:1121.68;实验值1122.0。
步骤4:合成N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基哌嗪-1-甲酰胺
向100mL小瓶中添加于DCM(12mL)中的4-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨甲酰基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯(1.08g,0.963mmol)和TFA(3.0mL,40.39mmol)。在N2气氛下,在室温下将反应搅拌2小时。将所得混合物减压浓缩,得到所需产物(907mg,粗品)。LCMS(ESI)m/z:C57H83N8O7Si的[M+Na]计算值:1042.61;实验值1043.9。
步骤5:合成N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-甲酰胺
向40mL小瓶中添加于DMF(3.5mL)中的N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基哌嗪-1-甲酰胺(400.0mg,0.392mmol)和(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(193.49mg,0.587mmol),随后在N2气氛下,在室温下分数份添加HATU(208.46mg,0.548mmol)和DIPEA(253.06mg,1.958mmol)。将所得混合物用EtOAc(3×60mL)萃取,并将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(367mg,70.3%产率)。LCMS(ESI)m/z:C79H101N9O8Si的[M+H-TIPS]计算值:1176.63;实验值1176.2。
步骤6:合成N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-甲酰胺
向100mL小瓶中添加于DMF(1.5mL)中的N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-甲酰胺(161.0mg,0.121mmol)和CsF(91.75mg,0.604mmol)。在室温下将反应搅拌2小时,接着用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(50% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(101mg,71.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C70H81N9O8的[M+H]计算值:1176.62;实验值1176.9。
步骤7:合成4-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基哌嗪-1-甲酰胺
向40mL小瓶中添加于DCM(2.0mL)中的N-((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)-N-甲基-4-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)哌嗪-1-甲酰胺(101.0mg,0.086mmol)和Et3SiH(49.91mg,0.429mmol),随后在N2气氛下,在室温下分数份添加TFA(48.94mg,0.429mmol)。用DIPEA将混合物碱化至pH 8。将粗产物通过制备型HPLC纯化,得到所需产物(29.6mg,36.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C51H67N9O8的[M+H]计算值:934.51;实验值934.3。
实施例175.合成(2S)-2-((S)-7-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)乙酰胺
Figure BDA0004194083620016971
步骤1:合成(S)-2-((R)-7-(叔丁氧基羰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-2-环戊基乙酸
在0℃下,向(R)-7-((S)-2-(苯甲氧基)-1-环戊基-2-氧代乙基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(1.0g,2.19mmol)于MeOH(10mL)中的搅拌溶液中添加Pd/C(200mg)。在氢气气氛下,在室温下将所得混合物搅拌1小时,过滤,并用MeOH(5×10mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到所需产物(895mg,粗品),该产物不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C19H30N2O5的[M+H]计算值:376.23;实验值367.1。
步骤2:合成(5R)-7-((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯
在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(702mg,1.10mmol)和DIPEA(1.91mL,1.10mmol)于DMF(500mL)中的搅拌的溶液中添加(S)-2-((R)-7-(叔丁氧基羰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-2-环戊基乙酸(523mg,1.43mmol)和COMU(517mg,1.21mmol)。在室温下保持1小时后,将反应混合物用H2O(150mL)稀释。将水层用EtOAc(3×50mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过正相色谱法(40% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(978mg,90.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C56H73N7O9的[M+H]计算值:988.56;实验值988.7。
步骤3:合成(2S)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-((S)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)乙酰胺
在0℃下,向(5R)-7-((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)-6-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬烷-2-甲酸叔丁酯(300mg,0.304mmol)于DCM(3.0mL)中的搅拌的溶液中添加TFA(1.5mL)。在室温下将所得混合物搅拌30分钟。接着,将反应混合物用甲苯(2mL)稀释并减压浓缩三次,得到所需产物(270mg,粗品),其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C51H65N7O7的[M+H]计算值:888.50;实验值888.5。
步骤4:合成(2S)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-((S)-1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)乙酰胺
在0℃下,向(2S)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-((S)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)乙酰胺(270mg,0.304mmol)和DIPEA(0.53mL,3.0mmol)于DMF(3.0mL)中的搅拌的溶液中添加(R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(130mg,0.395mmol)和COMU(143mg,0.334mmol)。在室温下保持1小时后,将反应混合物用H2O(30mL)稀释。将水层用EtOAc(3×3mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过制备型TLC(5% MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(332mg,91.1%产率)。LCMS(ESI)m/z:C73H82N8O8的[M+H]计算值:1199.64;实验值1199.7。
步骤5:合成(2S)-2-((S)-7-((R)-氮杂环丙烷-2-羰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)乙酰胺
在0℃下,向(2S)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-((S)-1-氧代-7-((R)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)乙酰胺(309mg,0.258mmol)于DCM(3.0mL)中的搅拌的溶液中添加Et3SiH(164mL,1.03mmol)和TFA(79mL,1.03mmol)。30分钟后,用DIPEA将反应混合物碱化至pH8并减压浓缩。通过反相色谱法(30→60% MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(36mg,14.2%产率)。LCMS(ESI)m/z:C54H68N8O8的[M+H]计算值:957.53;实验值957.3。
实施例214.合成(2S)-2-环戊基-2-((S)-7-((2R,3R)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-羰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)乙酰胺
Figure BDA0004194083620017001
步骤1:合成(2S)-2-((5S)-7-((2R,3R)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-羰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)乙酰胺
在0℃下,向(2S)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-((S)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)乙酰胺(270mg,0.30mmol)于DMF(3.0mL)中的搅拌的溶液中添加DIPEA(530μL,3.0mmol)和(2R,3R)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-甲酸(105mg,0.46mmol),随后添加COMU(140mg,0.33mmol)。在室温下将所得混合物搅拌1小时,接着用H2O(30mL)稀释。将反应混合物萃取至EtOAc(3×7mL)中。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,通过制备型TLC(6%MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(237mg,71%产率)。LCMS(ESI)m/z:C61H80N8O9S的[M+H]计算值:1101.58;实验值1101.3。
步骤2:合成(2S)-2-环戊基-2-((S)-7-((2R,3R)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-羰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)乙酰胺
在0℃下,向(2S)-2-((5S)-7-((2R,3R)-1-(叔丁基亚磺酰基)-3-环丙基氮杂环丙烷-2-羰基)-1-氧代-2,7-二氮杂螺[4.4]壬-2-基)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)乙酰胺(230mg,0.21mmol)于THF(2.5mL)中的搅拌的溶液中添加Et3SiH(130μL,0.83mmol)和HI(125μL,0.41mmol,57%于H2O中)。在室温下将所得混合物搅拌30分钟,接着冷却至0℃并中和至pH 8。将混合物减压浓缩,通过制备型TLC(8.3% MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(46mg,21%产率)。LCMS(ESI)m/z:C57H72N8O8的[M+H]计算值:997.55;实验值997.2。
实施例209.合成(2R)-N-(2-(((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
Figure BDA0004194083620017021
步骤1:合成((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯
在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-5,7-二酮(490mg,0.664mmol)和(S)-2-(((苯甲氧基)羰基)(甲基)氨基)-2-环戊基乙酸(232mg,0.797mmol)于DMF(5mL)中的搅拌的溶液中添加DIPEA(1.19mL,6.64mmol)和HATU(303mg,0.797mmol)。在室温下,将所得混合物搅拌1小时,接着用H2O(20mL)稀释。将水相用EtOAc(3×20mL)萃取,并将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过反相色谱法(0→100% MeCN/H2O,0.1%NH4HCO3)纯化,得到所需产物(420mg,59.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C58H74N8O8的[M+H]计算值:1011.57;实验值1011.6。
步骤2:合成(2S)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-(甲基氨基)乙酰胺
向((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基甲酸苯甲酯(450mg,0.445mmol)于t-BuOH(10mL)中的搅拌的溶液中添加Pd/C(90mg)。在氢气气氛下,将所得混合物升温至40℃过夜,接着过滤并用MeOH洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到所需产物(420mg,粗品),其不经进一步纯化即使用。LCMS(ESI)m/z:C50H68N8O6的[M+H]计算值:877.54;实验值877.5。
步骤3:合成(2R)-N-(2-(((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2S)-2-环戊基-N-((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-2-(甲基氨基)乙酰胺(130mg,0.148mmol)和(R)-N-甲基-N-(1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-羰基)甘氨酸锂(78.3mg,0.193mmol)于DMF(2mL)中的搅拌的溶液中添加DIPEA(264mL,1.48mmol)和HATU(68mg,0.178mmol)。在室温下,将所得混合物搅拌1小时,接着用H2O(20mL)稀释。将水相用EtOAc(3×10mL)萃取,并将合并的有机层用H2O洗涤,用Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。通过制备型TLC(10% MeOH/DCM)纯化,得到所需产物(100mg,50.9%产率)。LCMS(ESI)m/z:C75H90N10O8的[M+Na]计算值:1281.69;实验值1281.9。
步骤4:合成(2R)-N-(2-(((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2R)-N-(2-(((1S)-1-环戊基-2-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-2-氧代乙基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺(100mg,0.079mmol)于DCM(1.0mL)中的搅拌的溶液中添加Et3SiH(51mL,0.318mmol)和TFA(24mL,0.318mmol)。30分钟后,用DIPEA将反应混合物碱化至pH 8并减压浓缩。通过反相色谱法(30→55%MeCN/H2O)纯化,得到所需产物(14mg,16.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C56H76N10O8的[M+H]计算值:1017.59;实验值1017.6。
实施例268.合成(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-(3-(2-氧代吡咯烷-1-基)丙基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺
Figure BDA0004194083620017051
步骤1:合成(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(1S)-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酸(537.6mg,1.63mmol)、(2S)-N-((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)-3-甲基-2-(N-甲基-2-(甲基氨基)乙酰胺基)丁酰胺(800mg,0.816mmol)于THF(8mL)中的溶液中添加DIPEA(0.711mL,4.08mmol)、HATU(465.4mg,1.22mmol),将反应升温至室温并搅拌2小时。向反应物中添加H2O(20mL),将水相用DCM(3×30mL)萃取并将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(0→100% EtOAc/石油醚)纯化,得到所需产物(1g,94.9%产率)。
步骤2:合成(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺
在0℃下,向(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-三苯甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺(1g,0.774mmol)于MeOH(5mL)和CHCl3(5mL)中的溶液中添加TFA(1.15mL,15.48mmol)。将反应升温至室温并搅拌2小时。在0℃下,将反应混合物逐滴添加至NaHCO3水溶液(30mL)中。接着,在0℃下,使用NaHCO3水溶液将pH值调至pH 7-8。将混合物用DCM(3×20mL)萃取,经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到所需产物产物(960mg,粗品),其不经进一步纯化即直接用于下一步骤。
步骤3:合成(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-(3-(2-氧代吡咯烷-1-基)丙基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺
向(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基氮杂环丙烷-2-甲酰胺(960mg,0.915mmol)于MeCN(10mL)中的溶液中添加1-(3-氯丙基)吡咯烷-2-酮(887.1mg,5.49mmol)、K2CO3(1.14g,8.23mmol)、NaI(411.4mg,2.74mmol),在80℃下将反应搅拌24小时。向反应物中添加H2O(20mL),将水相用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机相经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过反相色谱法(73→93% MeCN/H2O,10mM NH4HCO3)纯化,得到产物(80mg,7.5%产率)。LCMS(ESI)m/z:C65H96N9O9Si的[M+H]计算值:1174.7;实验值1174.7。
步骤4:合成(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-25-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-(3-(2-氧代吡咯烷-1-基)丙基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺
向(2R)-N-(2-(((2S)-1-(((63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-25-((三异丙基硅烷基)氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(1,3)-苯杂环十一蕃-4-基)氨基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)(甲基)氨基)-2-氧代乙基)-N-甲基-1-(3-(2-氧代吡咯烷-1-基)丙基)氮杂环丙烷-2-甲酰胺(80mg,0.068mmol)于THF(1mL)中的溶液中添加TBAF(1M,0.082mL)。将反应搅拌1小时,接着添加至H2O(10mL)中,将水相用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机相经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将所得残余物通过反相色谱法(25→65% MeCN/H2O,10mMNH4HCO3)纯化,得到所需产物(42mg,60.4%产率)。LCMS(ESI)m/z:C56H76N9O9的[M+H]计算值:1018.6;实验值1018.5。
如本领域技术人员所知,下表化合物(表4)是使用上述方法或其变化形式制备。
表4:通过本发明方法制备的示例性化合物
Figure BDA0004194083620017071
/>
Figure BDA0004194083620017081
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Figure BDA0004194083620017091
/>
Figure BDA0004194083620017101
/>
Figure BDA0004194083620017111
/>
Figure BDA0004194083620017121
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Figure BDA0004194083620017131
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Figure BDA0004194083620017141
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Figure BDA0004194083620017151
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Figure BDA0004194083620017161
/>
Figure BDA0004194083620017171
生物测定
化合物1-2、4-18A、19A-19B、21A-24A、27-32A、33-43A、44-45、47B-54、56-59、68A、69A、71B、72A、73-78、79B-82A、83-97、100-110、112-117、119-234、236-294及297-332:a)在下文所述测定中的24小时培育时间范围内展现大于零的与KRASG12D的交联百分比;和/或b)在下文所述的KRASG12D-B-Raf(AsPC-1)破坏测定中展现2μM或更低的IC50值。
效力测定:pERK
本测定的目的是测量测试化合物抑制细胞中的K-Ras的能力。活化的K-Ras诱导ERK在苏氨酸202和酪氨酸204处的磷酸化(pERK)增加。这一程序测量细胞pERK响应于测试化合物的降低。下文以NCI-H358细胞描述的程序适用于K-Ras G12C。
注意:本方案可改用其它细胞系执行以表征其它RAS变体抑制剂,包括例如AsPC-1(K-Ras G12D)、Capan-1(K-Ras G12V)或NCI-H1355(K-Ras G13C)。
使用ATCC推荐的培养基和程序使NCI-H358细胞生长和维持。在添加化合物前一天,将细胞平板接种于384孔细胞培养板(每孔40μl)中并使其在37℃、5% CO2培育器中生长过夜。在DMSO中制备测试化合物的10点3倍稀释液,其中最高浓度为10mM。测定当天,使用Echo550液体处理器
Figure BDA0004194083620017181
将40nL测试化合物添加至细胞培养板各孔中。一式两份,对测试化合物的浓度进行测试。添加完化合物后,在37℃、5% CO2下培育细胞4小时。培育后,取出细胞培养基并用磷酸盐缓冲盐水洗涤细胞一次。/>
在一些实验中,细胞pERK水平是使用AlphaLISA SureFire Ultra p-ERK1/2测定试剂盒(PerkinElmer)确定。室温下,在以600RPM振荡下,将细胞溶解于25μL溶解缓冲液中。将溶解产物(10μL)转移至384孔Opti板(PerkinElmer)中并添加5μL受体混合物。在暗处培育2小时后,添加5μL供体混合物,密封板并在室温下培育2小时。在Envision读板器(PerkinElmer)上,使用标准AlphaLISA设置来读取信号。原始数据的分析是在Excel(Microsoft)及Prism(GraphPad)中进行。将信号对化合物浓度的以10为底的对数作图,并通过拟合4参数S形浓度反应模型确定IC50值。
在其它实验中,细胞pERK是通过In-Cell Western确定的。在化合物处理后,用200μL tris缓冲盐水(TBS)洗涤细胞两次并用150μL含4%三聚甲醛的TBS固定15分钟。用含0.1% Triton X-100的TBS(TBST)洗涤固定的细胞4次,持续5分钟,接着在室温下,用100μLOdyssey封闭缓冲液(LI-COR)封闭60分钟。将一次抗体(pERK,CST-4370,Cell SignalingTechnology)以1:200稀释于封闭缓冲液中,并取50μL添加至各孔中且在4℃下培育过夜。用TBST洗涤细胞4次,持续5分钟。添加二次抗体(IR-800CW兔,LI-COR,1:800稀释)和DNA染色剂DRAQ5(LI-COR,1:2000稀释)并在室温下培育1-2小时。用TBST洗涤细胞4次,持续5分钟。在Li-COR Odyssey CLx成像仪上扫描各板。原始数据的分析是在Excel(Microsoft)和Prism(GraphPad)中进行。将信号对化合物浓度的以10为底的对数作图,并通过拟合4参数S形浓度反应模型确定IC50值。
以下化合物展现低于5uM的pERK EC50值(AsPC-1KRAS G12D):179、157、178、327、205、106、242、121、183、36、158、196、84、17A和B、87、187、114、182、255、254、185、236、124、197、1、107、192、34、118、296、78、89、104、74、306、310、105、152、269、229、221、294、117、119、240、151、193、86、245、128、163、272、270、79A和B、232、140、138、293、38、94、110、172、271、246、72A和B、108、35、14、127、7、153、39、190、96、227、13、77、286、215、244、184、284、275、147、295、204、50、161、129、176、51、290、226、218、164、282、167、162、131、228、292、233、308、304、48、9、113、298、277、54、57、219、173、220、268、49、149、247、120、154、307、56、166、11、53、101、10、8、238、97、303、132、186、52、297、93、85、83、280、103、200、276、278、144、165、199、33、139、112、224、177、241、273、237、274、191、243、319、320、225、59、311、207、239、279、160、289、171、156、92、202、43A、266、208、281、159、300、210、223、217、283、216、231、299、90、91、267、155、259、291、258、257、262、222、137、100、256、88、316、142、318、146、198、288、302、174、265、322、12、168、42A、201、301、263、248、287、58、305、260、134、169、313、314、323、234、136、148、102、315、141、150、309、326、261、321、175、230、249、264、95、285、135、133、170、317、328、214、209、324、325。
在RAS突变型癌症细胞系中细胞活力的确定
方案:
Figure BDA0004194083620017201
细胞活力测定
注意:以下方案描述用于监测K-Ras突变型癌症细胞系响应于本发明化合物的细胞活力的程序。也可采用其它RAS同功型,不过接种的细胞数量将基于所用细胞系而变化。
本细胞测定的目的是通过使用
Figure BDA0004194083620017202
2.0试剂(Promega)对在终点时存在的ATP的量进行定量来确定在5天处理期内测试化合物对三种人类癌症细胞系(NCI-H358(K-Ras G12C)、AsPC-1(K-Ras G12D)及Capan-1(K-Ras G12V))的作用。
将细胞以250个细胞/孔接种于384孔测定板中的40μL生长培养基中并在含5%CO2的潮湿气氛中在37℃下培育过夜。测定当天,先用100% DMSO将测试化合物的10mM储备液稀释成3mM溶液。将充分混合的化合物溶液(15μL)转移至含有30μL的100% DMSO的下一孔中,并重复操作,直至制备出9种浓度的3倍连续稀释液(起始测定浓度是10μM)。将测试化合物(132.5nL)直接分配至含有细胞的测定板中。将所述板以300rpm振荡15秒,离心并在含5% CO2的潮湿气氛中在37℃下培育5天。第5天,将测定板及其内含物平衡至室温,保持约30分钟。添加
Figure BDA0004194083620017203
2.0试剂(25μL),并在回旋振荡器上混合板内含物2分钟,随后在室温下培育10分钟。使用PerkinElmer Enspire测量发光。利用下式使数据归一化:(样品信号/平均DMSO)*100。使用四参数逻辑斯蒂拟合(four-parameter logistic fit)来拟合数据。
*注解:
+++++:IC50≥10uM
++++:10uM>IC50≥1uM
+++:1uM>IC50≥0.1uM
++:0.1uM>IC50≥0.01uM
+:IC50<0.01uM
表5.H358细胞活力测定数据(K-Ras G12C,IC50,uM):
Figure BDA0004194083620017211
表6.AsPC-1细胞活力测定数据(K-Ras G12D,IC50,uM):
Figure BDA0004194083620017212
/>
Figure BDA0004194083620017221
本发明化合物破坏B-Raf Ras结合结构域(BRAFRBD)与K-Ras的相互作用(又称为FRET测定或MOA测定)
注意:以下方案描述用于监测本发明化合物对K-Ras G12C(GMP-PNP)与BRAFRBD的结合的破坏的程序。本方案也可改用其它Ras蛋白或核苷酸,如K-Ras G12D及K-Ras G13D来执行。
这一生物化学测定的目的是测量测试化合物促进在载有核苷酸的K-Ras同功型与亲环蛋白A之间形成三元复合物的能力;由此得到的三元复合物破坏与BRAFRBD构建体的结合,抑制K-Ras通过RAF效应子进行的信号传导。数据是以IC50值报告。
在含有25mM HEPES pH 7.3、0.002% Tween20、0.1% BSA、100mM NaCl及5mMMgCl2的测定缓冲液中,将无标记亲环蛋白A、His6-K-Ras-GMPPNP及GST-BRAFRBD分别以25μM、12.5nM及50nM的最终浓度组合于384孔测定板中。所述板各孔中存在的化合物是自30μM最终浓度起始,经历10点3倍连续稀释的稀释液。在25℃下培育3小时之后,接着将抗HisEu-W1024和抗GST别藻蓝蛋白的混合物添加至测定样品孔中分别达到10nM和50nM的最终浓度,并将反应再培育1.5小时。在微孔板读取器(Ex 320nm,Em 665/615nm)上读取TR-FRET信号。促进K-Ras:RAF复合物破坏的化合物被鉴别为使TR-FRET比率相对于DMSO对照孔降低的化合物。
Ras-Raf破坏/FRET/MOA测定数据(IC50,uM):
*注解:
+++++:IC50≥10uM
++++:10uM>IC50≥1uM
+++:1uM>IC50≥0.1uM
++:0.1uM>IC50≥0.01uM
+:IC50<0.01uM
表7.KRAS G13D FRET数据
Figure BDA0004194083620017241
/>
Figure BDA0004194083620017251
表8.KRAS G12S FRET数据
Figure BDA0004194083620017252
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Figure BDA0004194083620017261
表9.KRAS G13C FRET数据
Figure BDA0004194083620017262
/>
Figure BDA0004194083620017271
表10.KRAS G12V FRET数据
Figure BDA0004194083620017272
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Figure BDA0004194083620017281
表11.KRAS G12D FRET数据
Figure BDA0004194083620017282
/>
Figure BDA0004194083620017291
表12.KRAS WT FRET数据
Figure BDA0004194083620017301
/>
Figure BDA0004194083620017311
表13.KRAS G12C FRET数据
Figure BDA0004194083620017312
/>
Figure BDA0004194083620017321
表14.KRAS Q61H FRET数据
Figure BDA0004194083620017322
表15.NRAS G12C FRET数据
Figure BDA0004194083620017323
/>
Figure BDA0004194083620017331
表16.NRAS WT FRET数据
Figure BDA0004194083620017341
表17.NRAS Q61K FRET数据
Figure BDA0004194083620017342
/>
Figure BDA0004194083620017351
表18.NRAS Q61R FRET数据
Figure BDA0004194083620017352
Ras蛋白与本发明化合物交联形成缀合物
注意:以下方案描述用于监测K-Ras G12C(GMP-PNP)与本发明化合物的交联的程序。本方案也可改用其它Ras蛋白或核苷酸,如K-Ras G12D和K-Ras G13D来执行。
这一生物化学测定的目的是测量测试化合物共价标记载有核苷酸的K-Ras同功型的能力。在含有12.5mM HEPES pH 7.4、75mM NaCl、1mM MgCl2、1mM BME、5μM亲环蛋白A及2μM测试化合物的测定缓冲液中,将5μM载有GMP-PNP的K-Ras(1-169)G12C的储备液稀释10倍达到0.5μM最终浓度;并且最终样品体积是100μL。
在25℃下将样品培育至多24小时的时间,随后通过添加10μL的5%甲酸淬灭。淬灭的样品在台式离心机中以15000rpm离心15分钟,随后将10μL等分试样注入至反相C4柱上并用流动相中递增的乙腈梯度洗脱至质谱仪中。原始数据的分析是使用Waters MassLynx MS软件进行,其中结合%是由标记和未标记的K-Ras的解卷积蛋白质峰计算。
体外细胞增殖研究
在CrownBio,使用标准方法评估有关细胞生长抑制的效力。简单点说,在适当培养基中培养细胞系,接着平板接种于3D甲基纤维素中。细胞生长抑制是在与递增浓度的化合物一起培养5天后,通过
Figure BDA0004194083620017361
确定。化合物效力是以50%抑制浓度(绝对IC50)报告。测定历时7天。第1天,在对数生长期间,收集2D培养的细胞,并将其以1×105个细胞/毫升悬浮于培养基中。基于先前的优化,一些细胞系使用更高或更低的细胞密度。将3.5ml细胞悬浮液与含1%甲基纤维素的6.5%生长培养基混合,得到于0.65%甲基纤维素中的细胞悬浮液。将90μl这一悬浮液分配于2个96孔板各孔中。一个板用于第0天读取且1个板用于终点实验。在37℃和5% CO2下,将各板培育过夜。第2天,取出一个板(用于t0读数)并向各孔中添加10μl生长培养基加100μl/>
Figure BDA0004194083620017362
试剂。在混合并10分钟培育之后,将发光记录于EnVision Multi-Label读取器(Perkin Elmer)上。在生长培养基中稀释在DMSO中的化合物,由此使化合物的最终、最大浓度为10μM,并执行连续4倍稀释,产生9点浓度系列。将10μl的10倍最终浓度的化合物溶液添加至另一个板各孔中。接着,在37℃和5% CO2下将板培育120小时。第7天,取出各板,并向各孔中添加100μl/>
Figure BDA0004194083620017363
试剂,并在混合并10分钟培育之后,将发光记录于EnVision Multi-Label读取器(Perkin Elmer)上。将数据导出至GeneData Screener并以S形浓度反应模型建模,以便确定化合物反应的IC50值。
归因于外排转运蛋白的差异性表达、生长对RAS路径活化的不同依赖性或其它原因,并非所有带有给定RAS突变的细胞系均可对靶向该突变的RAS抑制剂同等地敏感。这已以细胞系KYSE-410和细胞系SW1573为例说明,细胞系KYSE-410尽管具有KRAS G12C突变,但对KRAS G12C(OFF)抑制剂MRTX-849不敏感(Hallin等人,Cancer Discovery 10:54-71(2020)),并且细胞系SW1573对KRAS G12C(OFF)抑制剂AMG510不敏感(Canon等人,Nature575:217-223(2019))。
表19:化合物B针对各种癌症细胞系的IC50值
*注解:
低敏感性:IC50≥1uM
中等敏感性:1uM>IC50≥0.1uM
极高敏感性:IC50<0.1uM
空白=未测量
Figure BDA0004194083620017371
/>
Figure BDA0004194083620017381
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化合物A,即本发明化合物的体内PD和功效数据
图1A:
方法:使用人类胰腺癌HPAC KRAS G12D/wt异种移植模型进行单剂量PD研究。通过腹膜内注射(ip注射)施用30和60mg/kg化合物A(AsPC-1pERK K-Ras G12D EC50:0.036uM)。利用在各个时间点收集的样品的治疗组概述于下表20中。收集肿瘤样品,在qPCR测定中通过测量人类DUSP6的mRNA水平来评估RAS/ERK信号转导路径调节。
表20.使用HPAC肿瘤的单剂量PD研究中治疗组、剂量及时间点的概述.
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结果:在图1A中,30mg/kg或60mg/kg化合物A在所有测试时间点均抑制DUSP6 mRNA水平,表明较强的MAPK路径调节作用。化合物A对DUSP6 mRNA水平的抑制效应是持久的,甚至持续到施用后24小时。
图1B:
方法:使用雌性BALB/c裸小鼠(6-8周龄),在人类胰腺癌HPAC KRAS G12D/wt异种移植模型中评价化合物A对体内细胞生长的效应。向小鼠的侧腹中皮下植入含HPAC肿瘤细胞的PBS(3×106个细胞/小鼠)。在肿瘤达到约150mm3的平均大小后,将小鼠随机分配至各治疗组以开始测试物或媒剂的施用。每日一次通过腹膜内注射施用化合物A。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。
结果:在带有杂合KRAS G12D的HPAC CDX模型中,每日ip施用10mg/kg单药化合物A在第28天引起89.9%的TGI,而每日ip给予30mg/kg和60mg/kg化合物A在治疗结束时(治疗开始后第35天)引起所述组中所有肿瘤的完全消退(完全消退定义为自基线>85%的肿瘤消退)。全部3个测试剂量的化合物A的抗肿瘤活性相较于对照组具有统计显著性(***p<0.001,普通单因素方差分析,利用通过事后杜凯氏检验(post-hoc Tukey’s test)进行的多重比较)。
尽管已结合本发明的具体实施方案描述本发明,但应了解,本发明能够进一步修改,并且本申请意欲涵盖一般遵循本发明的原理且包括在本发明所属领域内的已知或常规实践范围内的与本公开的背离的本发明的任何变化、应用或改编,并且可应用于本文所述的基本特征。
所有出版物、专利和专利申请均以全文引用的方式并入本文中,其引用程度就如同具体地且个别地指示每一个别出版物、专利或专利申请以全文引用的方式并入一般。
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附录D
RAS抑制剂
背景
绝大多数的小分子药物是通过结合靶蛋白上功能重要的口袋,由此调节该蛋白质的活性来起作用。例如,称为他汀类药物(statins)的降胆固醇药结合HMG-CoA还原酶的酶活性位点,由此防止该酶与其底物接合。事实上,已知许多此类药物/靶相互作用对,可能误导人们相信能够发现针对大多数(如果不是全部的话)蛋白质的小分子调节剂进而提供合理量的时间、努力和资源。但情况远非如此。目前,据估计,所有人体蛋白质中仅约10%可作为小分子的靶。Bojadzic和Buchwald,Curr Top Med Chem 18:674-699(2019)。其余90%当前被认为是以上提到的小分子药物发现难以治愈或难处理的。此类靶通常称为“不可入药(undruggable)”的。这些不可入药的靶包括医学上重要的人体蛋白质的大部分且通常未开发的储库。因此,人们对发现能够调节此类不可入药靶的功能的新颖分子模态非常感兴趣。
文献中已充分确定,Ras蛋白(K-Ras、H-Ras及N-Ras)在多种人类癌症中起到至关重要的作用,并因此成为抗癌疗法的适当靶。实际上,在美国,所有人类癌症中有约30%是由Ras蛋白突变引起,这些癌症中有许多是致命的。由活化性突变、过度表达或上游活化引起的Ras蛋白失调在人类肿瘤中较为常见,并且在人类癌症中常常发现Ras的活化性突变。例如,在Ras蛋白中密码子12处的活化性突变通过抑制GTP酶活化蛋白(GAP)依赖性和固有GTP水解速率,明显使Ras突变蛋白群偏向“开启”(GTP结合)状态(Ras(ON)),导致致癌性MAPK信号传导来起作用。值得注意的是,Ras对GTP展现皮摩尔浓度的亲和力,使得Ras即便是在低浓度这一核苷酸存在下也能够活化。在Ras中密码子13(例如G13D)和61(例如Q61K)处的突变也引起在一些癌症中的致癌活性。
尽管在过去数十年中,针对Ras进行了广泛的药物发现尝试,但直接靶向Ras的药物仍未得到批准。需要付出更多的努力来发现针对由各种Ras突变驱动的癌症的其它医药。
发明内容
本文提供Ras抑制剂。本文所描述的方法需要在合成配体与两种细胞内蛋白质之间形成高亲和力三组分复合物,该两种细胞内蛋白质在正常生理条件下不会相互作用:所关注的靶蛋白(例如Ras),以及在细胞中广泛表达的细胞质伴侣蛋白(呈现蛋白)(例如亲环蛋白A)。更具体点说,在一些实施方案中,本文所描述的Ras抑制剂通过驱动在Ras蛋白与广泛表达的细胞质伴侣蛋白亲环蛋白A(CYPA)之间形成高亲和力三重复合物而在Ras中诱导新结合口袋。不受理论束缚,本发明者相信,本发明化合物以及其形成的复合物对Ras发挥抑制作用的一种方式是在空间上阻塞Ras与传播致癌信号所需的下游效应分子如RAF和PI3K之间的相互作用位点。
因此,在一些实施方案中,本公开的特征在于一种结构式I的化合物或其药学上可接受的盐:
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其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基、任选被取代的5至6元亚杂芳基、任选被取代的C2-C4亚烷基或任选被取代的C2-C4亚烯基;
Y是
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W是氢、C1-C4烷基、任选被取代的C1-C3杂烷基、任选被取代的3至10元杂环烷基、任选被取代的3至10元环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
X1和X4各自独立地是CH2或NH;
R1是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至15元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5元或6元杂芳基;并且
R10是氢、羟基、任选被取代的C1-C3烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基。在一些实施方案中,R10是氢。
还提供了药物组合物,所述药物组合物包含式I的化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的赋形剂。
具体点说,经审慎考虑,所论述的关于本发明一个实施方案的任何限制可适用于本发明的任何其它实施方案。另外,本发明的任何化合物或组合物均可用于本发明的任何方法中,并且本发明的任何方法均可用于制造或利用本发明的任何化合物或组合物。
定义及化学术语
在本申请中,除非自上下文另有清晰说明,否则(i)术语“一(a)”意思指“一或多”;(ii)术语“或”用于指“和/或”,除非明确指示该术语是指替代选择为唯一的或该替代选择是相互排斥的,不过,本公开支持的定义是指唯一替代选择以及“和/或”;(iii)术语“包含”和“包括”应理解为涵盖列出的组分或步骤,无论仅呈现所述组分或步骤自身还是呈现所述组分或步骤与一种或多种额外组分或步骤的组合;以及(iv)在提供范围时,端点包括在内。
如本文所使用,术语“约”用于指示一个值包括用于确定该值的装置或方法的误差的标准偏差。在某些实施方案中,术语“约”是指值的沿任一方向(大于或小于)在所述值的25%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%或更低百分比内的范围,除非另外规定或自上下文另外显而易见(例如在所述数字将超过可能值的100%时)。
如本文所使用,在描述相邻原子的情形中,术语“相邻”是指由共价键直接连接的二价原子。
如本文所使用,“本发明化合物”和类似术语,无论明确指示与否,均是指本文所描述的Ras抑制剂,包括式I和其子式的化合物,以及表1和表1-1的化合物,以及其盐(例如药学上可接受的盐)、溶剂化物、水合物、立体异构体(包括阻转异构体)和互变异构体。
术语“野生型”是指具有在自然界中在“正常”(与突变、患病、改变等相对)状态或情形中所见的结构或活性的实体。本领域技术人员应理解,野生型基因和多肽通常以多种不同形式(例如等位基因)存在。
本领域技术人员应了解,本文所描述的某些化合物可以呈一种或多种不同异构形式(例如立体异构体、几何异构体、阻转异构体、互变异构体)或同位素形式(例如其中一个或多个原子被该原子的不同的同位素取代,如氢被氘取代)存在。除非另外指示或自上下文清楚可见,否则所描绘的结构可理解为表示个别或组合的任何此类异构或同位素形式。
本文所描述的化合物可以是不对称的(例如具有一个或多个立体中心)。除非另外指示,否则涵盖所有立体异构体,如对映异构体和非对映异构体。含有不对称取代的碳原子的本公开化合物可以呈光学活性形式或外消旋形式分离。本领域中已知由光学活性起始物质制备光学活性形式的方法,如通过拆分外消旋混合物或通过立体选择性合成方法制备。烯烃、C=N双键等许多几何异构体也可存在于本文所描述的化合物中,并且所有此类稳定异构体均涵盖在本公开中。本公开的化合物的顺式和反式几何异构体已有描述,并且可以呈异构体混合物形式或以分开的异构形式分离。
在一些实施方案中,本文所描绘的一种或多种化合物可以呈不同互变异构形式存在。自上下文将清楚可见,除非明确地排除,否则提到此类化合物涵盖所有此类互变异构形式。在一些实施方案中,互变异构形式是由一个单键与相邻双键交换且伴随质子的迁移得到。在某些实施方案中,互变异构形式可以是质子转移互变异构体,该互变异构体是具有与参考形式相同的经验式和总电荷的异构体质子化状态。具有质子转移互变异构形式的部分的实例有酮-烯醇对、酰胺-亚胺酸对、内酰胺-内酰亚胺对、酰胺-亚胺酸对、烯胺-亚胺对以及环状形式,在所述环状形式中,质子可占据杂环系统的两个或更多个位置,如1H-咪唑和3H-咪唑、1H-三唑、2H-三唑和4H-1,2,4-三唑、1H-异吲哚和2H-异吲哚,以及1H-吡唑和2H-吡唑。在一些实施方案中,互变异构形式可处于平衡状态或通过适当取代而在空间上锁定于一种形式。在某些实施方案中,互变异构形式是由缩醛相互转化得到。
除非另外规定,否则本文所描绘的结构也意欲包括仅因一个或多个同位素富集的原子的存在而不同的化合物。可并入本发明化合物中的示例性同位素包括氢、碳、氮、氧、磷、硫、氟、氯及碘的同位素,如2H、3H、11C、13C、14C、13N、15N、15O、17O、18O、32P、33P、35S、18F、36Cl、123I和125I。同位素标记的化合物(例如标记3H和14C的化合物)可用于化合物或底物组织分布测定中。氚化(即,3H)和碳-14(即,14C)同位素因其易于制备和检测而可用。另外,用较重同位素,如氘(即,2H)取代可由于代谢稳定性增强(例如体内半衰期增加或剂量需求减小)而提供某些治疗益处。在一些实施方案中,一个或多个氢原子被2H或3H置换,或者一个或多个碳原子被13C或14C富集的碳置换。正电子发射同位素,如15O、13N、11C和18F可用于正电子发射断层扫描(PET)研究中以检查底物受体占有情况。同位素标记的化合物的制备是本领域技术人员所知的。例如,同位素标记的化合物一般可遵循与所公开的关于本文所描述的本发明化合物的程序类似的程序,通过用同位素标记的试剂取代未同位素标记的试剂制备。
如本领域中所知,许多化学实体可呈现多种不同的固体形式,如非晶形或结晶形式(例如多晶型物、水合物、溶剂化物)。在一些实施方案中,本发明化合物可以呈任何此类形式使用,包括任何固体形式。在一些实施方案中,本文所描述或描绘的化合物可以呈水合物形式或溶剂化物形式提供。
在本说明书中各处,本公开的化合物的取代基是以群组或以范围公开。具体点说,本公开意欲包括所述群组和范围各成员的每一个别子组合。例如,术语“C1-C6烷基”特定地意欲个别地公开甲基、乙基、C3烷基、C4烷基、C5烷基及C6烷基。此外,在一种化合物包括多个位置,并且在这些位置处,取代基是以群组或以范围公开时,除非另外指示,否则本公开意欲涵盖在每个位置处含有成员的每一个别子组合的个别化合物和化合物群组(例如种类和子类)。
术语“任选被取代的X”(例如“任选被取代的烷基”)意欲等效于“X,其中X任选被取代”(例如“烷基,其中该烷基任选被取代”)。并非意欲指特征“X”(例如烷基)本身是任选的。如本文所描述,某些所关注化合物可含有一个或多个“任选被取代”的部分。一般而言,术语“被取代”无论前面是否加有术语“任选地”,均意谓指定部分的一个或多个氢被适合取代基,例如本文所描述的取代基或基团中的任一者置换。除非另作指示,否则“任选被取代”的基团可在该基团的每个可取代位置处具有适合取代基,并且当在任何给定结构中的多于一个位置可悲多于一个选自指定组的取代基取代时,该取代基可在每个位置处相同或不同。例如,在术语“任选被取代的C1-C6烷基-C2-C9杂芳基”中,该烷基部分、该杂芳基部分或两者可任选被取代。本公开所设想的取代基的组合优选是形成稳定或化学上可行的化合物的取代基组合。如本文所使用,术语“稳定”是指化合物当经历允许该化合物产生、检测且在某些实施方案中,允许该化合物回收、纯化以及用于一个或多个本文所公开的目的的条件时大体上不改变。
“任选被取代”的基团的可取代碳原子上的适合单价取代基可独立地为氘;卤素;-(CH2)0-4Ro;-(CH2)0-4ORo;-O(CH2)0-4Ro;O-(CH2)0-4C(O)ORo;-(CH2)0-4CH(ORo)2;-(CH2)0-4SRo;-(CH2)0-4Ph,该基团可被Ro取代;-(CH2)0-4O(CH2)0-1Ph,该基团可被Ro取代;-CH=CHPh,该基团可被Ro取代;-(CH2)0-4O(CH2)0-1-吡啶基,该基团可被Ro取代;4-11元饱和或不饱和杂环烷基(例如4-8元饱和或不饱和杂环烷基(例如吡啶基)),该基团可进一步任选被取代(例如被甲基取代);3-8元饱和或不饱和环烷基(例如环丙基、环丁基或环戊基);-NO2;-CN;-N3;-(CH2)0-4N(Ro)2;-(CH2)0-4N(Ro)C(O)Ro;-N(Ro)C(S)Ro;-(CH2)0-4N(Ro)C(O)NRo 2;-N(Ro)C(S)NRo 2;-(CH2)0-4N(Ro)C(O)ORo;-N(Ro)N(Ro)C(O)Ro;-N(Ro)N(Ro)C(O)NRo 2;-N(Ro)N(Ro)C(O)ORo;-(CH2)0-4C(O)Ro;-C(S)Ro;-(CH2)0-4C(O)ORo;-(CH2)0-4-C(O)-N(Ro)2;-(CH2)0-4-C(O)-N(Ro)-S(O)2-Ro;-C(NCN)NRo 2;-(CH2)0-4C(O)SRo;-(CH2)0-4C(O)OSiRo 3;-(CH2)0-4OC(O)Ro;-OC(O)(CH2)0-4SRo;-SC(S)SRo;-(CH2)0-4SC(O)Ro;-(CH2)0-4C(O)NRo 2;-C(S)NRo 2;-C(S)SRo;-(CH2)0-4OC(O)NRo 2;-C(O)N(ORo)Ro;-C(O)C(O)Ro;-C(O)CH2C(O)Ro;-C(NORo)Ro;-(CH2)0- 4SSRo;-(CH2)0-4S(O)2Ro;-(CH2)0-4S(O)2ORo;-(CH2)0-4OS(O)2Ro;-S(O)2NRo 2;-(CH2)0-4S(O)Ro;-N(Ro)S(O)2NRo 2;-N(Ro)S(O)2Ro;-N(ORo)Ro;-C(NORo)NRo 2;-C(NH)NRo 2;-P(O)2Ro;-P(O)Ro 2;-P(O)(ORo)2;-OP(O)Ro 2;-OP(O)(ORo)2;-OP(O)(ORo)Ro;-SiRo 3;-(C1-4直链或分支链亚烷基)O-N(Ro)2;或-(C1-4直链或分支链亚烷基)C(O)O-N(Ro)2,其中各Ro可如下文所定义被取代并且独立地为氢、-C1-6脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph、-CH2-(5-6元杂芳基环)或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至6元饱和、部分不饱和或芳基环,或尽管有以上定义,但两个独立存在的Ro与其插入原子一起形成具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至12元饱和、部分不饱和或芳基单环或双环,其可如下文所定义被取代。
Ro(或由两个独立存在的Ro与其插入原子一起形成的环)上的适合单价取代基可独立地为卤素、-(CH2)0-2R、-(卤代R)、-(CH2)0-2OH、-(CH2)0-2OR、-(CH2)0-2CH(OR)2、-O(卤代R)、-CN;-N3、-(CH2)0-2C(O)R、-(CH2)0-2C(O)OH、-(CH2)0-2C(O)OR、-(CH2)0-2SR、-(CH2)0- 2SH、-(CH2)0-2NH2、-(CH2)0-2NHR、-(CH2)0-2NR 2、-NO2、-SiR 3、-OSiR 3、-C(O)SR、-(C1-4直链或分支链亚烷基)C(O)OR或-SSR,其中各R未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代,并且独立地选自C1-4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。Ro的饱和碳原子上的适合二价取代基包括=O和=S。
“任选被取代”的基团的饱和碳原子上的适合二价取代基包括以下:=O;=S;=NNR* 2;=NNHC(O)R*;=NNHC(O)OR*;=NNHS(O)2R*;=NR*;=NOR*;-O(C(R* 2))2-3O-或-S(C(R* 2))2-3S-,其中R*在每次独立出现时选自氢;C1-6脂肪族基团,该基团可如下文所定义被取代;或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的未被取代的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。结合至“任选被取代”的基团的邻近可取代碳的适合二价取代基包括:-O(CR* 2)2- 3O-,其中R*在每次独立出现时选自氢;C1-6脂肪族基团,该基团可如下文所定义被取代;或未被取代的具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。
R*的脂肪族基团上的适合取代基包括卤素、-R、-(卤代R)、-OH、-OR、-O(卤代R)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR、-NH2、-NHR、-NR 2或-NO2,其中各R未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代,并且独立地是C1-4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0– 1Ph,或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。
“任选被取代”的基团的可取代氮上的适合取代基包括
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Figure BDA0004194083620017502
Figure BDA0004194083620017503
或/>
Figure BDA0004194083620017504
其中各/>
Figure BDA0004194083620017505
独立地是氢;C1-6脂肪族基团,该基团可如下文所定义被取代;未被取代的-OPh;或未被取代的具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至6元饱和、部分不饱和或芳基环;或尽管上文有定义,但两个独立出现的/>
Figure BDA0004194083620017506
连同其一个或多个插入原子一起形成未被取代的具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的3至12元饱和、部分不饱和或芳基单环或双环。
Figure BDA0004194083620017507
的脂肪族基团上的适合取代基独立地是卤素、-R、-(卤代R)、-OH、-OR、-O(卤代R)、-CN、-C(O)OH、-C(O)OR、-NH2、-NHR、-NR 2或-NO2,其中各R未被取代或在前面加有“卤代”的情况下仅被一个或多个卤素取代,并且独立地是C1-4脂肪族基团、-CH2Ph、-O(CH2)0-1Ph,或具有0-4个独立地选自氮、氧或硫的杂原子的5至6元饱和、部分不饱和或芳基环。/>
Figure BDA0004194083620017508
的饱和碳原子上的适合二价取代基包括=O和=S。
如本文所使用,术语“乙酰基”是指基团-C(O)CH3
如本文所使用,术语“烷氧基”是指-O-C1-C20烷基,其中该烷氧基通过氧原子连接至化合物的其余部分。
如本文所使用,术语“烷基”是指含有1至20个(例如1至10个或1至6个)碳的饱和、直链或分支链单价烃基。在一些实施方案中,烷基是非分支链的(即,是线性的);在一些实施方案中,烷基是分支链的。烷基是例如但不限于甲基、乙基、正丙基和异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基和叔丁基,以及新戊基。
如本文所使用,术语“亚烷基”表示由直链或分支链饱和烃通过移除两个氢原子得到的饱和二价烃基,并且其实例有亚甲基、亚乙基、亚异丙基等。术语“Cx-Cy亚烷基”表示具有在x与y个之间的碳的亚烷基。示例性x值是1、2、3、4、5及6,并且示例性y值是2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、14、16、18或20(例如C1-C6、C1-C10、C2-C20、C2-C6、C2-C10或C2-C20亚烷基)。在一些实施方案中,亚烷基可进一步被1、2、3或4个如本文所定义的取代基取代。
除非另外具体说明,否则如本文所使用,术语“烯基”表示含有一个或多个碳-碳双键的具有2至20个碳(例如2至6个或2至10个碳)的单价直链或分支链基团,并且其实例是乙烯基、1-丙烯基、2-丙烯基、2-甲基-1-丙烯基、1-丁烯基及2-丁烯基。烯基包括顺式和反式异构体两种。除非另外具体说明,否则如本文所使用,术语“亚烯基”表示含有一个或多个碳-碳双键的具有2至20个碳(例如2至6个或2至10个碳)的二价直链或分支链基团。
如本文所使用,术语“炔基”表示含有碳-碳三键的具有2至20个碳(例如2至4个、2至6个或2至10个碳)的单价直链或分支链基团,并且其实例有乙炔基及1-丙炔基。
如本文所使用,术语“炔基砜”表示包含结构
Figure BDA0004194083620017511
的基团,其中R是本文所描述的任何化学上可行的取代基。
如本文所使用,术语“氨基”表示
Figure BDA0004194083620017521
例如-NH2和-N(CH3)2
如本文所使用,术语“氨基烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个氨基部分取代的烷基部分。
如本文所描述,术语“氨基酸”是指具有侧链、氨基和酸基(例如-CO2H或-SO3H)的分子,其中该氨基酸通过所述侧链、氨基或酸基(例如侧链)连接至母分子基团。如本文所使用,术语“氨基酸”在最广泛意义上是指可例如通过形成一个或多个肽键并入多肽链中的任何化合物或物质。在一些实施方案中,氨基酸具有通用结构H2N-C(H)(R)-COOH。在一些实施方案中,氨基酸是天然存在的氨基酸。在一些实施方案中,氨基酸是合成氨基酸;在一些实施方案中,氨基酸是D-氨基酸;在一些实施方案中,氨基酸是L-氨基酸。“标准氨基酸”是指天然存在的肽中常见的二十种标准L-氨基酸中的任一种。示例性氨基酸包括丙氨酸、精氨酸、天冬酰胺、天冬氨酸、半胱氨酸、谷氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、组氨酸、任选被取代的羟基正缬氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、正缬氨酸、鸟氨酸、苯丙氨酸、脯氨酸、吡咯赖氨酸、硒代半胱氨酸、丝氨酸、牛磺酸、苏氨酸、色氨酸、酪氨酸及缬氨酸。
如本文所使用,术语“芳基”表示由碳原子形成的单价单环、双环或多环系统,其中连接至侧接基团的环是芳香环。芳基的实例有苯基、萘基、菲基和蒽基。芳环可在产生稳定结构的任何杂原子或碳环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用,术语“C0”表示键。例如,术语-N(C(O)-(C0-C5亚烷基-H)-的一部分包括-N(C(O)-(C0亚烷基-H)-,也表示为-N(C(O)-H)-。
如本文所使用,术语“碳环”和“碳环基”是指单价、任选被取代的C3-C12单环、双环或三环结构,该环结构可以是桥接环、稠合环或螺环,其中所有环均由碳原子形成,并且至少一个环是非芳香环。碳环结构包括环烷基、环烯基和环炔基。碳环基的实例有环己基、环己烯基、环辛炔基、1,2-二氢萘基、1,2,3,4-四氢萘基、芴基、茚基、二氢茚基、十氢萘基等。碳环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用,术语“羰基”表示C(O)基团,该基团也可表示为C=O。
如本文所使用,术语“羧基”意思指-CO2H、(C=O)(OH)、COOH或C(O)OH,或未质子化的对应物。
如本文所使用,术语“氰基”表示-CN基团。
如本文所使用,术语“环烷基”表示单价饱和环状烃基,除非另外具体说明,否则该基团可以是具有三至八个环碳的桥接环、稠合环或螺环,并且其实例有环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基及环庚基。
如本文所使用,术语“环烯基”表示单价、非芳香族饱和环状烃基,除非另外具体说明,否则该基团可以是具有三至八个环碳且含有一个或多个碳-碳双键的桥接环、稠合环或螺环。
如本文所使用,术语“非对映异构体”意思指不互为镜像且彼此不可重叠的立体异构体。
如本文所使用,术语“对映异构体”意思指具有至少80%(即,至少90%的一种对映异构体和至多10%的另一种对映异构体)、优选至少90%且更优选至少98%的光学纯度或对映异构体过量(如通过本领域中的标准方法确定)的本发明化合物的每一个别光学活性形式。
术语“胍基”是指具有以下结构的基团:
Figure BDA0004194083620017541
其中各R独立地为本文所描述的任何化学上可行的取代基。
如本文所使用,术语“胍基烷基烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个胍基部分取代的烷基部分。
如本文所使用,术语“卤代乙酰基”是指至少一个氢被卤素置换的乙酰基。
如本文所使用,术语“卤烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个相同或不同的卤素部分取代的烷基部分。
如本文所使用,术语“卤素”表示选自溴、氯、碘或氟的卤素。
如本文所使用,术语“杂烷基”是指至少一个碳原子被杂原子(例如O、N或S原子)置换的如本文所定义的“烷基”。杂原子可出现在基团的中间或末端。
如本文所使用,术语“杂芳基”表示含有至少一个完全芳香环的单价、单环或多环结构:即,它在该单环或多环系统内含有4n+2个π电子,并且在该芳香环中含有至少一个选自N、O或S的杂原子。示例性未被取代的杂芳基具有1至12个(例如1至11个、1至10个、1至9个、2至12个、2至11个、2至10个或2至9个)碳。术语“杂芳基”包括任一上述杂芳香环与一个或多个芳环或碳环,例如苯基环或环己烷环稠合的双环、三环和四环基团。杂芳基的实例包括但不限于吡啶基、吡唑基、苯并噁唑基、苯并咪唑基、苯并噻唑基、咪唑基、噻唑基、喹啉基、四氢喹啉基及4-氮杂吲哚基。杂芳基环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。在某一实施方案中,杂芳基被1、2、3或4个取代基取代。
如本文所使用,术语“杂环烷基”表示至少一个环是非芳香环且其中该非芳香环含有一个、两个、三个或四个独立地选自由氮、氧和硫组成的组的杂原子的单价、单环、双环或多环系统,该环系统可以是桥接环、稠合环或螺环。5元环具有零至两个双键,并且6元环和7元环具有零至三个双键。示例性未被取代的杂环烷基具有1至12个(例如1至11个、1至10个、1至9个、2至12个、2至11个、2至10个或2至9个)碳。术语“杂环烷基”也表示具有桥接多环结构的杂环化合物,其中一个或多个碳或杂原子桥接单环的两个不相邻成员,例如奎宁环基。术语“杂环烷基”包括任一上述杂环与一个或多个芳香环、碳环、杂芳香环或杂环,例如芳基环、环己烷环、环己烯环、环戊烷环、环戊烯环、吡啶环或吡咯烷环稠合的双环、三环和四环基团。杂环烷基的实例有吡咯烷基、哌啶基、1,2,3,4-四氢喹啉基、十氢喹啉基、二氢吡咯并吡啶基及十氢萘啶基。杂环烷基环可在产生稳定结构的任何环原子处连接至其侧接基团,并且除非另外具体说明,否则任何环原子可任选被取代。
如本文所使用,术语“羟基”表示-OH基团。
如本文所使用,术语“羟基烷基”表示一个或多个碳原子被一个或多个-OH部分取代的烷基部分。
如本文所使用,术语“异构体”意思指任何本发明化合物的任何互变异构体、立体异构体、阻转异构体、对映异构体或非对映异构体。应认识到,本发明化合物可具有一个或多个手性中心或双键,并因此,以立体异构体形式,如以双键异构体(即,E/Z几何异构体)或非对映异构体(例如对映异构体(即,(+)或(-))或顺/反异构体)形式存在。根据本发明,本文所描绘的化学结构且因此本发明化合物涵盖所有相应立体异构体,即,立体异构纯(例如几何异构纯、对映异构体纯或非对映异构体纯)形式以及对映异构体和立体异构体混合物,例如外消旋物。本发明化合物的对映异构体和立体异构体混合物可典型地通过众所周知的方法,如手性相气相色谱法、手性相高效液相色谱法、使化合物以手性盐络合物形式结晶或使化合物在手性溶剂中结晶来拆分成其组分对映异构体或立体异构体。对映异构体和立体异构体也可由立体异构纯或对映异构纯的中间体、试剂和催化剂,通过众所周知的不对称合成方法获得。
如本文所使用,术语“立体异构体”是指一种化合物(例如本文所描述的任何式的化合物)可能具有所有可能的不同异构以及构形形式,特别是基础分子结构的所有可能的立体化学和构形异构形式、所有非对映异构体、对映异构体或构形异构体,包括阻转异构体。本发明的一些化合物可以呈不同互变异构形式存在,所有这些互变异构形式均包括在本发明的范围内。
如本文所使用,术语“磺酰基”表示-S(O)2-基团。
如本文所使用,术语“硫代羰基”是指-C(S)-基团。
如本文所使用,术语“乙烯基酮”是指包含直接连接至碳-碳双键的羰基的基团。
如本文所使用,术语“乙烯基砜”是指包含直接连接至碳-碳双键的磺酰基的基团。
如本文所使用,术语“炔酮”是指包含结构
Figure BDA0004194083620017561
的基团,其中R是本文所描述的任何在化学上可行的取代基。
本领域技术人员阅读本公开将理解,本文所描述的某些化合物可以呈多种形式中的任一种提供或利用,如盐形式、被保护的形式、前药形式、酯形式、异构形式(例如光学或结构异构体)、同位素形式等。在一些实施方案中,提到的特定化合物可指该化合物的特定形式。在一些实施方案中,提到的特定化合物可指呈任何形式的该化合物。在一些实施方案中,例如,一种化合物的单一立体异构体的制剂可视为该化合物的不同形式而非该化合物的外消旋混合物;一种化合物的特定盐可视为与该化合物的另一种盐不同的形式;含有双键的一种构形异构体((Z)或(E))的制剂可视为与含有该双键的另一种构形异构体((E)或(Z))的制剂不同的形式;一个或多个原子的同位素不同于参考制剂中存在的同位素的制剂可视为呈不同形式。
附图简要说明
图1A是展示化合物A在使用雌性BALB/c裸小鼠的人胰腺癌HPAC KRASG12D/wt异种移植模型中的体内功效的图。图中显示在小鼠异种移植模型中肿瘤体积(mm3)随植入后天数的变化。小鼠在施用测试物或媒剂之前被随机分至各治疗组。化合物A是每隔一天一次通过经口管饲施用。
图1B是展示在给药后直至72小时监测的来自BALB/c裸小鼠(6-8周龄,人非小细胞肺癌(NSCLC)NCI-H441 KRASG12V/wt异种移植模型)的血液和肿瘤样品中化合物A的剂量依赖性暴露情况的图。药物动力学是基于在经口管饲10mg/kg、25mg/kg或50mg/kg单次剂量的化合物A后直至72小时,肿瘤或血液中化合物A的总浓度(nM)分析。在每个时间点,从n=3只动物获取肿瘤或血液样品。
图1C是显示在用单次剂量的化合物A治疗的初治动物中的PK(10mg/kg,po)和PD(相对于对照组的肿瘤DUSP%,10mg/kg和25mg/kg,po)的图。
图1D是展示在具有杂合KRASG12V的NCI-H441 CDX模型中化合物A的体内功效的图。将NCI-H441细胞以50%基质胶植入。将动物随机分组并在平均肿瘤体积达到约155mm3时起始治疗。对动物给予10mg/kg或25mg/kg po qd化合物A或对照,持续32天。所有剂量水平都是耐受的。n=10只/组。通过单因素方差分析确定,***p<0.0001。
图1E显示在具有杂合KRASG12V的NCI-H441 CDX模型中化合物A的研究结束时反应。将NCI-H441研究结束时肿瘤以肿瘤体积相较于治疗起始时的体积的变化百分比作图。R(消退)=消退数>初始的10%。CR(完全反应)=消退数>初始的80%。每只动物以独立条柱表示。
图1F显示在用化合物A治疗的动物中(在具有杂合KRASG12V的NCI-H441 CDX模型中)的体重变化百分比。每周两次通过测径规测量法来测量NCI-H441细胞源性异种移植物。体重变化以动物初始体重的百分比作图。
图2A是展示化合物A在使用雌性BALB/c裸小鼠的具有杂合KRASG12V的人胰腺Capan-2 CDX异种移植模型中的体内功效的图。图中显示在小鼠异种移植模型中肿瘤体积(mm3)随植入后天数的变化。Capan-2细胞以50%基质胶植入。将动物随机分组并在平均肿瘤体积达到约166mm3时起始治疗。对动物给予10mg/kg po qd或25mg/kg po q2d化合物A或对照,持续28天。所有剂量水平都是耐受的。n=8只/组。通过单因素方差分析确定,**p=0.01,***p<0.0001。
图2B显示在具有杂合KRASG12V的人胰腺Capan-2 CDX异种移植模型中化合物A的研究结束时反应。将Capan-2研究结束时肿瘤以肿瘤体积相较于治疗起始时的体积的变化百分比作图。R(消退)=消退数>初始的10%。每只动物以独立条柱表示。
图2C显示在用化合物A治疗的动物中(在具有杂合KRASG12V的人胰腺Capan-2 CDX异种移植模型中)的体重变化百分比。每周两次通过测径规测量法来测量Capan-2细胞源性异种移植物。体重变化以动物初始体重的百分比作图。
图2D是展示化合物A在使用雌性BALB/c裸小鼠的人结肠直肠SW403 KRASG12V/wt异种移植模型中的体内功效的图。图中显示在小鼠异种移植模型中肿瘤体积(mm3)随植入后天数的变化。将SW403细胞以50%基质胶植入。将动物随机分组并在平均肿瘤体积达到约171mm3时起始治疗。对动物给予25mg/kg po qd或50mg/kg po q2d化合物A或对照,持续28天。所有剂量水平都是耐受的。n=8只/组。通过单因素方差分析确定,***p<0.0001。
图2E显示在人结肠直肠SW403 KRASG12V/wt异种移植模型中化合物A的研究结束时反应。将SW403研究结束时肿瘤以肿瘤体积相较于治疗起始时的体积的变化百分比作图。R(消退)=消退数>初始的10%。CR(完全反应)=消退数>初始的80%。每只动物以独立条柱表示。
图2F显示在人结肠直肠SW403 KRASG12V/wt异种移植模型中用化合物A治疗的动物的体重变化百分比。每周两次通过测径规测量法来测量SW403细胞源性异种移植物。体重变化以动物初始体重的百分比作图。
图3展示化合物A在多个RAS驱动的癌症细胞系中的体外功效。每个图显示细胞增殖(相对于对照的百分比)随log M[化合物A]的变化。Capan-1(KRASG12V)、AsPC-1(KRASG12D)、HCT116(KRASG13D)、SK-MEL-30(NRASQ61K)、NCI-H1975(EGFRT790M/L858R)和A375(BRAFV600E)细胞暴露于化合物A达120小时的体外细胞增殖抑制效力。数据表示多次实验的平均值。
图4A展示化合物A(25mg/kg po qd)在使用雌性BALB/c裸小鼠的人胰腺癌HPACKRASG12D/wt异种移植模型中的体内功效。图中显示在小鼠异种移植模型中肿瘤体积(mm3)随植入后天数的变化。将HPAC细胞以50%基质胶植入。将动物随机分组并在平均肿瘤体积达到约142mm3时起始治疗。对动物给予25mg/kg po qd化合物A或对照,持续28天。剂量水平都是耐受的。n=9-10只/组。通过单因素方差分析确定,***p<0.0001。
图4B显示在人胰腺癌HPAC KRASG12D/wt异种移植模型中化合物A的研究结束时反应。将HPAC研究结束时肿瘤以肿瘤体积相较于治疗起始时的体积的变化百分比作图。CR(完全反应)=消退数>初始的80%。每只动物以独立条柱表示。
图4C显示在人胰腺癌HPAC KRASG12D/wt异种移植模型中用化合物A治疗的动物的体重变化百分比。每周两次通过测径规测量法来测量HPAC细胞源性异种移植物。体重变化以动物初始体重的百分比作图。
图4D展示化合物A在使用雌性BALB/c裸小鼠的人结肠直肠GP2d KRASG12D/wt异种移植模型中的体内功效。图中显示在小鼠异种移植模型中肿瘤体积(mm3)随植入后天数的变化。将GP2d细胞以50%基质胶植入。将动物随机分组并在平均肿瘤体积达到约154mm3时起始治疗。对动物给予25mg/kg po qd化合物A或对照,持续28天。剂量水平都是耐受的。n=10只/组。通过单因素方差分析确定,***p<0.0001。
图4E显示在人结肠直肠将GP2d KRASG12D/wt异种移植模型中化合物A的研究结束时反应。将GP2d研究结束时肿瘤以肿瘤体积相较于治疗起始时的体积的变化百分比作图。每只动物以独立条柱表示。
图4F显示在人结肠直肠GP2d KRASG12D/wt异种移植模型中用化合物A治疗的动物的体重变化百分比。每周两次通过测径规测量法来测量GP2d细胞源性异种移植物。体重变化以动物初始体重的百分比作图。
图5A展示化合物A在体外下调NCI-H358 KRASG12C细胞中的免疫检查点蛋白方面的体外功效。图5A显示利用流式细胞术测量的在干扰素γ(IFN)存在下用化合物A处理48小时后H358细胞上PD-L1、PVR和CD73的细胞表面表达情况。每个图都显示平均荧光强度((MFI),对于每一个别免疫检查点蛋白)随log M[化合物A]的变化。
图5B展示化合物A在体外下调SW900 KRASG12C细胞中的免疫检查点蛋白方面的体外功效。图5B显示利用流式细胞术测量的在干扰素γ(IFN)存在下用化合物A处理48小时后SW900细胞上PD-L1、PVR和CD73的细胞表面表达情况。每个图都显示平均荧光强度((MFI),对于每一个别免疫检查点蛋白)随log M[化合物A]的变化。
图5C展示化合物A在体外下调Capan-2 KRASG12C细胞中的免疫检查点蛋白方面的体外功效。图5C显示利用流式细胞术测量的在干扰素γ(IFN)存在下用化合物A处理48小时后Capan-2细胞上PD-L1、PVR和CD73的细胞表面表达情况。每个图都显示平均荧光强度((MFI),对于每一个别免疫检查点蛋白)随log M[化合物A]的变化。
图6A至图6B展示,本文所公开的KRASMULTI(ON)抑制剂化合物A针对在KRASG12C(OFF)抗性中所观察到的RAS癌基因开关突变具有活性。图6A是表示有关在不同RAS抑制剂存在下各种KRAS突变的细胞RAS/RAF破坏测定结果的热图。图6B显示与热图的各彩色柱相关的IC50值。
详细说明
化合物
本文提供Ras抑制剂。本文所描述的方法需要在合成配体与两种细胞内蛋白质之间形成高亲和力三组分复合物,该两种细胞内蛋白质在正常生理条件下不会相互作用:所关注的靶蛋白(例如Ras),以及在细胞中广泛表达的细胞质伴侣蛋白(呈现蛋白)(例如亲环蛋白A)。更具体点说,在一些实施方案中,本文所描述的Ras抑制剂通过驱动在Ras蛋白与广泛表达的细胞质伴侣蛋白亲环蛋白A(CYPA)之间形成高亲和力三重复合物而在Ras中诱导新结合口袋。不受理论束缚,本发明者相信,本发明化合物以及其形成的复合物对Ras发挥抑制作用的一种方式是在空间上阻塞Ras与传播致癌信号所需的下游效应分子如RAF之间的相互作用位点。
不受理论束缚,本发明人假定,本发明化合物与Ras和伴侣蛋白(例如亲环蛋白A)的非共价相互作用可促成对Ras活性的抑制。例如,范德华(van der Waals)相互作用、疏水相互作用、亲水相互作用和氢键相互作用,以及其组合可促成本发明化合物形成复合物并充当Ras抑制剂的能力。因此,本发明化合物可抑制多种Ras蛋白(例如野生型Ras或Rasamp,或K-Ras、N-Ras、H-Ras以及其在12位、13位及61位突变的突变体,如G12C、G12D、G12V、G12S、G13C、G13D和Q61L,以及本文所描述的其它突变体,以及Ras蛋白的组合)。
因此,本文提供一种具有式I结构的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620017621
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基、任选被取代的5至6元亚杂芳基、任选被取代的C2-C4亚烷基或任选被取代的C2-C4亚烯基;
Y是
Figure BDA0004194083620017622
Figure BDA0004194083620017631
W是氢、C1-C4烷基、任选被取代的C1-C3杂烷基、任选被取代的3至10元杂环烷基、任选被取代的3至10元环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
X1和X4各自独立地是CH2或NH;
R1是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至15元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5元或6元杂芳基;并且R10是氢、羟基、任选被取代的C1-C3烷基或任选被取代的C1-C6杂烷基。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式Ia的结构:
Figure BDA0004194083620017632
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
Y是
Figure BDA0004194083620017641
Figure BDA0004194083620017642
W是氢、C1-C4烷基、任选被取代的3至10元杂环烷基、任选被取代的3至10元环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R1是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5元或6元杂芳基;并且
R10是氢或任选被取代的C1-C6杂烷基。在一些实施方案中,R10是氢。
在一些实施方案中,R1是任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。在一些实施方案中,R1是任选被取代的苯基或任选被取代的吡啶。
在一些实施方案中,A是任选被取代的噻唑、任选被取代的三唑、任选被取代的吗啉代、任选被取代的哌啶基、任选被取代的吡啶或任选被取代的苯基。在一些实施方案中,A是任选被取代的噻唑、任选被取代的三唑、任选被取代的吗啉代,或苯基。在一些实施方案中,A是任选被取代的苯基或苯并咪唑。在一些实施方案中,A不是羟基苯基。
在一些实施方案中,Y是-NHC(O)-或-NHC(O)NH-。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式II的结构:
Figure BDA0004194083620017651
其中a是0或1。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式II-1的结构:
Figure BDA0004194083620017652
Figure BDA0004194083620017661
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式II-2的结构:
Figure BDA0004194083620017662
/>
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式II-3的结构:
Figure BDA0004194083620017671
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式II-4的结构:
Figure BDA0004194083620017672
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式II-5的结构:
Figure BDA0004194083620017681
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。在一些实施方案中,X3是N。在一些实施方案中,m是1。在一些实施方案中,R11是H。在一些实施方案中,X3是N,m是1并且R11是H。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式II-6的结构:
Figure BDA0004194083620017691
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式II-7的结构:
Figure BDA0004194083620017692
在一些实施例方案(例如式II-6或式II-7中的任一者的实施方案)中,R6是甲基。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式II-8或式II-9的结构:
Figure BDA0004194083620017701
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式III的结构:
Figure BDA0004194083620017702
其中a是0或1。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式III-1的结构:
Figure BDA0004194083620017711
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式III-2的结构:
Figure BDA0004194083620017712
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式III-3的结构:
Figure BDA0004194083620017721
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式III-4的结构:
Figure BDA0004194083620017722
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式III-5的结构:
Figure BDA0004194083620017731
/>
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。在一些实施方案中,X3是N。在一些实施方案中,m是1。在一些实施方案中,R11是氢。在一些实施方案中,X3是N,m是1并且R11是H。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式III-6的结构:
Figure BDA0004194083620017741
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式III-7的结构:
Figure BDA0004194083620017742
在一些实施例方案(例如式III-6或式III-7中的任一者的实施方案)中,R6是甲基。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式III-8或式III-9的结构:
Figure BDA0004194083620017751
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IV的结构:
Figure BDA0004194083620017752
其中R9是H或C1-C6烷基;并且
a是0或1。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IV-1的结构:
Figure BDA0004194083620017761
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IV-2的结构:
Figure BDA0004194083620017762
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IV-3的结构:
Figure BDA0004194083620017771
/>
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IV-4的结构:
Figure BDA0004194083620017772
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IV-5的结构:
Figure BDA0004194083620017781
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。在一些实施方案中,X3是N。在一些实施方案中,m是1。在一些实施方案中,R11是氢。在一些实施方案中,X3是N,m是1并且R11是H。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IV-6的结构:
Figure BDA0004194083620017791
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IV-7的结构:
Figure BDA0004194083620017792
在一些实施例方案(例如式IV-6或式IV-7中的任一者的实施方案)中,R6是甲基。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IV-8或式IV-9的结构:
Figure BDA0004194083620017801
在一些实施例方案(例如式IV、式IV-1、式IV-2、式IV-3、式IV-4、式IV-5、IV-6、式IV-7、式IV-8或式IV-9中的任一者的实施方案)中,R9是甲基。
在一些实施方案中,Y是-NHS(O)2-或-NHS(O)2NH-。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式V的结构:
Figure BDA0004194083620017802
其中a是0或1。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式V-1的结构:
Figure BDA0004194083620017811
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式V-2的结构:
Figure BDA0004194083620017812
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式V-3的结构:
Figure BDA0004194083620017821
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式V-4的结构:
Figure BDA0004194083620017822
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式V-5的结构:
Figure BDA0004194083620017831
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。在一些实施方案中,X3是N。在一些实施方案中,m是1。在一些实施方案中,R11是氢。在一些实施方案中,X3是N,m是1并且R11是H。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VI的结构:
Figure BDA0004194083620017841
其中a是0或1。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VI-1的结构:
Figure BDA0004194083620017842
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VI-2的结构:
Figure BDA0004194083620017851
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VI-3的结构:
Figure BDA0004194083620017852
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VI-4的结构:
Figure BDA0004194083620017861
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VI-5的结构:
Figure BDA0004194083620017862
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。在一些实施方案中,X3是N。在一些实施方案中,m是1。在一些实施方案中,R11是氢。在一些实施方案中,X3是N,m是1并且R11是H。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VII的结构:
Figure BDA0004194083620017871
其中R9是H或C1-C6烷基;并且
a是0或1。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VII-1的结构:
Figure BDA0004194083620017881
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VII-2的结构:
Figure BDA0004194083620017882
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VII-3的结构:
Figure BDA0004194083620017891
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VII-4的结构:
Figure BDA0004194083620017892
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VII-5的结构:
Figure BDA0004194083620017901
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。在一些实施方案中,X3是N。在一些实施方案中,m是1。在一些实施方案中,R11是氢。在一些实施方案中,X3是N,m是1并且R11是H。
在一些实施例方案(例如式VII、式VII-1、式VII-2、式VII-3、式VII-4或式VII-5中的任一者的实施方案)中,R9是甲基。
在一些实施方案中,Y是-NHS(O)-或-NHS(O)NH-。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VIII的结构:
Figure BDA0004194083620017911
其中a是0或1。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VIII-1的结构:
Figure BDA0004194083620017912
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VIII-2的结构:
Figure BDA0004194083620017921
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VIII-3的结构:
Figure BDA0004194083620017922
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VIII-4的结构:
Figure BDA0004194083620017931
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式VIII-5的结构:
Figure BDA0004194083620017932
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。在一些实施方案中,X3是N。在一些实施方案中,m是1。在一些实施方案中,R11是氢。在一些实施方案中,X3是N,m是1并且R11是H。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IX的结构:
Figure BDA0004194083620017941
其中a是0或1。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IX-1的结构:
Figure BDA0004194083620017951
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IX-2的结构:
Figure BDA0004194083620017952
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IX-3的结构:
Figure BDA0004194083620017961
/>
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IX-4的结构:
Figure BDA0004194083620017962
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式IX-5的结构:
Figure BDA0004194083620017971
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。在一些实施方案中,X3是N。在一些实施方案中,m是1。在一些实施方案中,R11是氢。在一些实施方案中,X3是N,m是1并且R11是H。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式X的结构:
Figure BDA0004194083620017981
其中R9是H或C1-C6烷基;并且
a是0或1。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式X-1的结构:
Figure BDA0004194083620017982
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式X-2的结构:
Figure BDA0004194083620017991
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式X-3的结构:
Figure BDA0004194083620017992
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基(例如任选被取代的3至6元杂环烷基)、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式X-4的结构:
Figure BDA0004194083620018001
在一些实施方案中,所述化合物或其药学上可接受的盐具有式X-5的结构:
Figure BDA0004194083620018002
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。在一些实施方案中,X3是N。在一些实施方案中,m是1。在一些实施方案中,R11是氢。在一些实施方案中,X3是N,m是1并且R11是H。
在一些实施例方案(例如式X、式X-1、式X-2、式X-3、式X-4或式X-5中的任一者的实施方案)中,R9是甲基。
在本文所描述任何方面的一些实施方案中,a是0。在上述任一者的一些实施方案中,a是0。
在本文所描述任何方面的一些实施方案中,R2是任选被取代的C1-C6烷基。在一些实施方案中,R2选自-CH2CH3或-CH2CF3
在本文所描述任何方面的一些实施方案中,W是C1-C4烷基。在一些实施方案中,W是:
Figure BDA0004194083620018011
在本文所描述任何方面的一些实施方案中,W是任选被取代的环丙基、任选被取代的环丁基、任选被取代的环戊基或任选被取代的环己基、任选被取代的哌啶、任选被取代的哌嗪、任选被取代的吡啶或任选被取代的苯基。
在本文所描述任何方面的一些实施方案中,W是任选被取代的3至10元杂环烷基、任选被取代的3至10元环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
在本文所描述任何方面的一些实施方案中,W是任选被取代的3至10元杂环烷基。在一些实施方案中,W选自以下各物或其立体异构体:
Figure BDA0004194083620018021
/>
Figure BDA0004194083620018031
/>
Figure BDA0004194083620018041
Figure BDA0004194083620018042
在一些实施方案中,W选自以下各物或其立体异构体:
Figure BDA0004194083620018043
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Figure BDA0004194083620018051
在本文所描述任何方面的一些实施方案中,W是任选被取代的3至10元环烷基。在一些实施方案中,W选自以下各物或其立体异构体:
Figure BDA0004194083620018052
Figure BDA0004194083620018053
在一些实施方案中,W选自以下各物或其立体异构体:
Figure BDA0004194083620018054
Figure BDA0004194083620018061
在本文所描述任何方面的一些实施方案中,W是任选被取代的5至10元杂芳基。在一些实施方案中,W选自以下各物或其立体异构体:
Figure BDA0004194083620018062
在本文所描述任何方面的一些实施方案中,W是任选被取代的6至10元芳基。在一些实施方案中,W是任选被取代的苯基。
在本文所描述任何方面的一些实施方案中,W是任选被取代的C1-C3杂烷基。在一些实施方案中,W选自以下各物或其立体异构体:
Figure BDA0004194083620018063
在一些实施方案中,本发明化合物选自表1或其药学上可接受的盐或立体异构体。在一些实施方案中,本发明化合物选自表1或其药学上可接受的盐或阻转异构体。
表1:某些本发明化合物
Figure BDA0004194083620018064
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Figure BDA0004194083620018071
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Figure BDA0004194083620018731
应注意,一些化合物中的键以平直线或楔形线显示。在一些情况下,立体异构体的相对立体化学已确定;在一些情况下,绝对立体化学已确定。上表化合物的所有立体异构体均涵盖在本发明中。在特定实施方案中,涵盖上表化合物的阻转异构体。括号中显示的任何化合物指示,该化合物是非对映异构体,并且此类非对映异构体的绝对立体化学可能未知。
在一些实施方案中,本发明化合物选自表1-1或其药学上可接受的盐或立体异构体。在一些实施方案中,本发明化合物选自表1-1或其药学上可接受的盐或阻转异构体。
表1-1:某些本发明化合物
Figure BDA0004194083620018732
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Figure BDA0004194083620018741
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Figure BDA0004194083620019091
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Figure BDA0004194083620019241
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Figure BDA0004194083620019311
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Figure BDA0004194083620019321
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Figure BDA0004194083620019331
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Figure BDA0004194083620019341
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Figure BDA0004194083620019351
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Figure BDA0004194083620019361
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Figure BDA0004194083620019371
在一些实施方案中,本发明化合物是选自表2的化合物或其药学上可接受的盐或立体异构体。在一些实施方案中,本发明化合物是选自表2的化合物或其药学上可接受的盐或阻转异构体。
在一些实施方案中,本发明化合物不是选自表2的化合物。在一些实施方案中,本发明化合物不是选自表2的化合物或其药学上可接受的盐或立体异构体。在一些实施方案中,本发明化合物不是选自表2的化合物或其药学上可接受的盐或阻转异构体。
表2:某些化合物
Figure BDA0004194083620019381
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Figure BDA0004194083620019391
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Figure BDA0004194083620019401
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Figure BDA0004194083620019411
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Figure BDA0004194083620019421
在一些实施方案中,本发明化合物是选自表3的化合物(例如C1-C20或C1-C21)或其药学上可接受的盐或立体异构体。在一些实施方案中,本发明化合物是选自表3的化合物(例如C1-C20或C1-C21)或其药学上可接受的盐或阻转异构体。
在一些实施方案中,本发明化合物不是选自表3的化合物(例如C1-C20或C1-C21)。在一些实施方案中,本发明化合物不是选自表3的化合物(例如C1-C20或C1-C21)或其药学上可接受的盐或立体异构体。在一些实施方案中,本发明化合物不是选自表3的化合物(例如C1-C20或C1-C21)或其药学上可接受的盐或阻转异构体。
表3:某些化合物
Figure BDA0004194083620019422
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Figure BDA0004194083620019431
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Figure BDA0004194083620019441
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Figure BDA0004194083620019451
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Figure BDA0004194083620019461
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Figure BDA0004194083620019471
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Figure BDA0004194083620019481
在一些实施方案中,相较于本领域中已知的化合物,本发明化合物具有改良的口服生物利用率。测量口服生物利用率的方法是本领域中已知的,并且一种此类方法提供于以下实施例中。
在一些实施方案中,本发明化合物是或充当前药,例如对于施用给细胞或有需要的受试者来说。
还提供了药物组合物,所述药物组合物包含本发明化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的赋形剂。
对于本发明化合物而言,一种立体异构体展现的抑制作用可优于另一种立体异构体。例如,一种阻转异构体可展现抑制作用,而另一种阻转异构体可展现极低或不展现抑制作用。
合成方法
本文所描述的化合物可由市售起始物质制备或使用已知的有机、无机或酶方法合成。
本发明化合物可通过有机合成领域的技术人员众所周知的的多种方式制备。例如,本发明化合物可使用以下方案中所描述的方法,以及合成有机化学技术中已知的合成方法或本领域技术人员所理解的关于所述方法的修改来合成。这些方法包括但不限于以下方案中所描述的方法。
方案1.大环酯的一般合成方法
Figure BDA0004194083620019491
方案1中概述了大环酯的一般合成方法。适当取代的吲哚基硼酸酯(1)可以利用受保护的3-(5-溴-2-碘-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇和适当取代的硼酸作为起始物质,分四个步骤制备,包括钯介导的偶合、烷基化、脱保护和钯介导的硼基化反应。
甲基-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸酯(3)可通过使(S)-2-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酸(2)与(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯偶合来制备。
最终的大环酯可通过以下来制备:使甲基-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸酯(3)与适当取代的吲哚基硼酸酯(1)在Pd催化剂存在下偶合,随后进行水解和大环内酯化步骤,以得到适当保护的大环中间体(5)。脱保护并与适当取代的羧酸(或其它偶合搭配物)偶合可产生大环产物。可能需要额外脱保护或官能化步骤来制备最终化合物6。
另外,对于方案1,噻唑可以用替代性任选被取代的5至6元亚杂芳基或任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基(例如吗啉代)或任选被取代的6元亚芳基(例如苯基)置换。
方案2.替代性大环酯的一般合成方法
Figure BDA0004194083620019501
替代地,可如方案2中所描述来制备大环酯。适当取代并且受保护的吲哚基硼酸酯(7)可在Pd催化剂存在下与(S)-2-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酸偶合,随后进行碘化、脱保护和酯水解。随后与(S)-六氢哒嗪-3-甲酸甲酯偶合,接着进行水解和大环内酯化可产生碘中间体(11)。随后进行钯介导的硼基化并在Pd催化剂存在下与适当取代的碘代芳基或碘代杂芳基中间体偶合可得到适当保护的大环中间体。烷基化、脱保护并与适当取代的羧酸(或其它偶合搭配物)偶合可产生大环产物。可能需要额外脱保护或官能化步骤来制备最终化合物6。
另外,对于方案2,噻唑可以用替代性任选被取代的5至6元亚杂芳基或任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基(例如吗啉代)或任选被取代的6元亚芳基(例如苯基)置换。
本文表1和表1-1中的化合物是使用本文所公开的方法制备或使用本文所描述的方法结合本领域技术人员的知识制备。
药物组合物和使用方法
药物组合物和施用方法
本发明所涉及的化合物是Ras抑制剂,并且可用于治疗癌症。因此,本发明的一个实施方案提供含本发明化合物或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的赋形剂的药物组合物,以及使用本发明化合物制备此类组合物的方法。
如本文所使用,术语“药物组合物”是指与药学上可接受的赋形剂一起配制的化合物,如本发明化合物,或其药学上可接受的盐。
在一些实施方案中,化合物是以适于在治疗方案中施用的单位剂量的量存在于药物组合物中,该化合物当施用给相关群体时显示出统计显著的实现预定治疗效果的可能性。在一些实施方案中,药物组合物可特定地配制成以固体或液体形式施用,包括适于以下方式施用者:口服施用,例如药水(水性或非水性溶液或悬浮液)、片剂(例如旨在经颊、舌下和全身吸收者)、大丸剂、散剂、颗粒剂、供施用于舌部的糊剂;肠胃外施用,例如通过皮下、肌肉内、静脉内或硬膜外注射,如例如无菌溶液或悬浮液,或持续释放配制物;表面施用,例如施用于皮肤、肺或口腔的乳霜、软膏剂或控制释放贴片或喷雾剂;阴道内或直肠内施用,例如子宫托、乳霜或泡沫剂;舌下施用;经眼施用;经皮施用;或经鼻、肺施用和施用至其它粘膜表面。
如本文所使用,“药学上可接受的赋形剂”是指在受试者体内无毒且无发炎性的任何无活性成分(例如能够将活性化合物悬浮或溶解的媒剂)。典型赋形剂包括例如:抗粘附剂、抗氧化剂、粘合剂、包衣剂、压缩助剂、崩解剂、染料(色素)、软化剂、乳化剂、填充剂(稀释剂)、成膜剂或包衣剂、调味剂、芳香剂、助流剂(流动增强剂)、润滑剂、防腐剂、印刷油墨、吸附剂、悬浮剂或分散剂、甜味剂或水合用水。赋形剂包括但不限于:任选被取代的丁基化羟基甲苯(BHT)、碳酸钙、磷酸氢钙、硬脂酸钙、交联羧甲基纤维素、交联聚乙烯基吡咯烷酮、柠檬酸、交联聚维酮、半胱氨酸、乙基纤维素、明胶、任选被取代的羟丙基纤维素、任选被取代的羟丙基甲基纤维素、乳糖、硬脂酸镁、麦芽糖醇、甘露糖醇、甲硫氨酸、甲基纤维素、对羟基苯甲酸甲酯、微晶纤维素、聚乙二醇、聚乙烯基吡咯烷酮、聚维酮、预胶化淀粉、对羟基苯甲酸丙酯、棕榈酸视黄酯、虫胶、二氧化硅、羧甲基纤维素钠、柠檬酸钠、羟基乙酸淀粉钠、山梨糖醇、淀粉(玉米淀粉)、硬脂酸、硬脂酸、蔗糖、滑石、二氧化钛、维生素A、维生素E、维生素C及木糖醇。本领域一般技术人员了解可用作赋形剂的多种试剂和材料。参见例如Ansel等人,Ansel's Pharmaceutical Dosage Forms and Drug DeliverySystems.Philadelphia:Lippincott,Williams&Wilkins,2004;Gennaro等人,Remington:The Science and Practice of Pharmacy.Philadelphia:Lippincott,Williams&Wilkins,2000;以及Rowe,Handbook of Pharmaceutical Excipients.Chicago,Pharmaceutical Press,2005。在一些实施方案中,组合物包括至少两种不同的药学上可接受的赋形剂。
除非清楚地作相反陈述,否则本文所描述的化合物,无论是否清楚地陈述,均可以呈盐形式,例如呈药学上可接受的盐形式提供或使用。如本文所使用,术语“药学上可接受的盐”是指在合理医学判断的范围内,适于与人体组织接触使用而无过度毒性、刺激、过敏反应等,并且与合理效益/风险比相称的本文所描述的化合物的盐。药学上可接受的盐水本领域中众所周知的。例如,药学上可接受的盐描述于:Berge等人,J.PharmaceuticalSciences 66:1-19,1977;以及Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use,(P.H.Stahl和C.G.Wermuth编辑),Wiley-VCH,2008中。所述盐可在本文所描述的化合物的最终分离和纯化期间原位制备,或通过使游离碱性基团与适合有机酸反应来分离。
本发明化合物可具有可离子化基团,由此能够制备成药学上可接受的盐形式。这些盐可以是涉及无机酸或有机酸的酸加成盐,或在本发明化合物呈酸形式的情况下,所述盐可由无机碱或有机碱制备。在一些实施方案中,所述化合物被制备为药学上可接受的盐形式或以药学上可接受的盐形式使用,所述药学上可接受的盐形式是作为药学上可接受的酸或碱的加成产物制备。适合药学上可接受的酸和碱是本领域中众所周知的,如盐酸、硫酸、氢溴酸、乙酸、乳酸、柠檬酸或酒石酸,用于形成酸加成盐;以及氢氧化钾、氢氧化钠、氢氧化铵、咖啡因、各种胺等,用于形成碱盐。用于制备适当盐的方法是本领域中公认的。
代表性酸加成盐包括乙酸盐、己二酸盐、海藻酸盐、抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、硫酸氢盐、硼酸盐、丁酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、柠檬酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙烷磺酸盐、反丁烯二酸盐、葡庚糖酸盐、甘油磷酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、氢溴酸盐、盐酸盐、氢碘酸盐、2-任选被取代的羟基-乙烷磺酸盐、乳糖酸盐、乳酸盐、月桂酸盐、月桂基硫酸盐、苹果酸盐、顺丁烯二酸盐、丙二酸盐、甲烷磺酸盐、2-萘磺酸盐、烟酸盐、硝酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、双羟萘酸盐、果胶酸盐、过硫酸盐、3-苯基丙酸盐、磷酸盐、苦味酸盐、新戊酸盐、丙酸盐、硬脂酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、甲苯磺酸盐、十一烷酸盐、戊酸盐等。代表性碱金属或碱土金属盐包括钠盐、锂盐、钾盐、钙盐、镁盐等,以及无毒铵、季铵和胺阳离子,包括但不限于铵、四甲基铵、四乙基铵、甲胺、二甲胺、三甲胺、三乙胺、乙胺等。
如本文所使用,术语“受试者”是指动物王国的任何成员。在一些实施方案中,“受试者”是指处于任何发育阶段的人类。在一些实施方案中,“受试者”是指人类患者。在一些实施方案中,“受试者”是指非人类动物。在一些实施方案中,非人类动物是哺乳动物(例如啮齿动物、小鼠、大鼠、兔、猴、犬、猫、绵羊、牛、灵长类动物或猪)。在一些实施方案中,受试者包括但不限于哺乳动物、鸟类、爬行动物、两栖动物、鱼或虫类。在一些实施方案中,受试者可以是转基因动物、基因工程改造的动物或克隆。
如本文所使用,术语“剂型”是指供施用给受试者的化合物(例如本发明化合物)的物理离散单元。每个单元含有预定量的化合物。在一些实施方案中,所述量是适于根据剂量方案施用的单位剂量的量(或其整体部分),该量当施用给相关群体(即,根据治疗剂量方案)时确定与所希望或有益的结果相关。本领域一般技术人员应理解,施用给特定受试者的治疗组合物或化合物的总量是由一位或多位主治医师决定,并且可涉及施用多种剂型。
如本文所使用,术语“剂量方案”是指个别地施用给受试者的一组单位剂量(典型地超过一个单位剂量),所述单位剂量典型地间隔一定时间段。在一些实施方案中,给定治疗化合物(例如本发明化合物)具有推荐的剂量方案,该方案可涉及一次或多次剂量。在一些实施方案中,剂量方案包含多次剂量,所述剂量各自彼此间隔相同长度的时间段;在一些实施方案中,剂量方案包含多次剂量且至少两个不同时间段分开个别剂量。在一些实施方案中,剂量方案内的所有剂量均为相同单位剂量的量。在一些实施方案中,剂量方案内的不同剂量是不同量。在一些实施方案中,剂量方案包含呈第一剂量的量的第一次剂量,随后是呈不同于该第一剂量的量的第二剂量的量的一次或多次额外剂量。在一些实施方案中,剂量方案包含呈第一剂量的量的第一次剂量,随后是呈与该第一剂量的量相同的第二剂量的量的一次或多次额外剂量。在一些实施方案中,剂量方案当施用给相关群体(即,是治疗性剂量方案)时,与所希望或有益结果相关。
“治疗方案”是指在相关群体中的施用与期望或有益治疗结果相关的剂量方案。
术语“治疗”(“treatment/treat/treating”)在其最广泛意义上是指部分或完全缓解、改善、减轻、抑制特定疾病、病症或疾患的一种或多种症状、特征或成因;延迟其发作;降低其严重程度;或减少其发生的物质(例如本发明化合物)的任何施用。在一些实施方案中,此类治疗可施用给未展现相关疾病、病症或疾患的体征的受试者或仅展现该疾病、病症或疾患的早期体征的受试者。替代地或另外地,在一些实施方案中,治疗可施用给展现相关疾病、病症或疾患的一种或多种确定的体征的受试者。在一些实施方案中,治疗可用于被诊断为罹患相关疾病、病症或疾患的受试者。在一些实施方案中,治疗可用于已知具有一个或多个在统计上与发展相关疾病、病症或疾患的风险增加相关的易感因素的受试者。
术语“治疗有效量”意谓当根据治疗性剂量方案施用给罹患或易患疾病、病症或疾患的群体时足以治疗该疾病、病症或疾患的量。在一些实施方案中,治疗有效量是降低该疾病、病症或疾患的一种或多种症状的发生率或严重程度或延迟其发作的量。本领域技术人员应理解,术语“治疗有效量”实际上不需要在特定个体中实现所需的成功治疗。事实上,治疗有效量可以是当施用给需要该治疗的患者时在相当大量受试者中提供特定所希望的药理学反应的量。特别需要了解的是,特定受试者实际上可以是“治疗有效量”“难治”的。在一些实施方案中,提到的治疗有效量可指如在一个或多个特定组织(例如受疾病、病症或疾患影响的组织)或流体(例如血液、唾液、血清、汗液、泪液、尿液)中所测量的量。本领域一般技术人员应理解,在一些实施方案中,治疗有效量可配制为单一剂量或以单一剂量施用。在一些实施方案中,治疗有效量可配制为多次剂量,例如配制为剂量方案的一部分,或以多次剂量施用。
为用作受试者的治疗,本发明化合物或其药学上可接受的盐可配制为药物组合物或兽医学组合物形式。取决于待治疗的受试者、施用模式及所希望的治疗类型,例如预防、防治或疗法,所述化合物或其药学上可接受的盐是以与所述参数相符的方式配制。关于此类技术的概述可见于Remington:The Science and Practice of Pharmacy,第21版,Lippincott Williams&Wilkins,(2005);以及Encyclopedia of PharmaceuticalTechnology,J.Swarbrick和J.C.Boylan编辑,1988-1999,Marcel Dekker,New York,所述文献各自以引用的方式并入本文中。
组合物可分别根据常规混合、制粒或包覆方法制备,并且本发明的药物组合物以重量或体积计可含有约0.1%至约99%、约5%至约90%或约1%至约20%本发明化合物或其药学上可接受的盐。在一些实施方案中,本文所描述的化合物或其药学上可接受的盐的存在量以重量计可占组合物,如占药物组合物总量总计1-95%。
所述组合物可以呈适于以下施用的剂型提供:关节内、口服、肠胃外(例如静脉内、肌肉内)、直肠、皮肤、皮下、表面、经皮、舌下、经鼻、阴道、囊内、尿道内、鞘内、硬膜外、耳或眼施用,或通过注射、吸入或与鼻、泌尿生殖器、生殖器或口腔粘膜直接接触。因此,药物组合物可呈例如片剂、胶囊、丸剂、散剂、颗粒剂、悬浮液、乳液、溶液、凝胶(包括水凝胶)、糊剂、软膏、乳霜、硬膏剂、药水、渗透递送装置、栓剂、灌肠剂、注射剂、植入物、喷雾剂、适于离子电渗递送的制剂或气雾剂形式。所述组合物可根据常规医药实践配制。
如本文所使用,术语“施用”是指将一种组合物(例如化合物或包括如本文所描述的化合物的制剂)施用给受试者或系统。向动物受试者(例如向人类)施用可通过任何适当的途径进行。例如,在一些实施方案中,施用可以是支气管(包括通过支气管滴注)、经颊、经肠、真皮间、动脉内、真皮内、胃内、髓内、肌肉内、鼻内、腹膜内、鞘内、静脉内、囊内、经粘膜、经鼻、口服、直肠、皮下、舌下、表面、气管(包括通过气管内滴注)、经皮、阴道或玻璃体施用。
配制物可以通过适于全身施用或者表面或局部施用的方式制备。全身配制物包括设计用于注射(例如肌肉内、静脉内或皮下注射)的配制物或可制备用于经皮、经粘膜或口服施用。配制物一般将包括稀释剂,并且在一些情况下,包括佐剂、缓冲剂、防腐剂等。化合物或其药学上可接受的盐也可以呈脂质体组合物或以微乳液形式施用。
为进行注射,可将配制物制备为常规形式,如液体溶液或悬浮液,或适于在注射之前于液体中制备为溶液或悬浮液的固体形式,或乳液形式。适合赋形剂包括例如水、生理盐水、右旋糖、甘油等。这些组合物也可含有一定量无毒辅助物质,如润湿剂或乳化剂、pH缓冲剂等,如乙酸钠、去水山梨糖醇单月桂酸酯等等。
也已设计出各种持续释放药物系统。参见例如美国专利第5,624,677号。
全身施用也可包括相对无创的方法,如使用栓剂、经皮贴片、经粘膜递送及鼻内施用。口服施用也适于本发明化合物或其药学上可接受的盐。本领域中应了解,适合形式包括糖浆、胶囊和片剂。
本文所描述的每种化合物或其药学上可接受的盐可以通过本领域中已知的多种方式配制。例如,组合疗法中的第一药剂和第二药剂可一起或分开配制。本文也描述组合疗法的其它模式。
个别或分开配制的药剂可一起包装为试剂盒形式。非限制性实例包括但不限于含有例如两粒丸剂、一粒丸剂和粉剂、一粒栓剂和在小瓶中的液体、两种表面用乳霜等的试剂盒。所述试剂盒可包括有助于将单位剂量施用给受试者的任选使用的组件,如用于使粉末形式复原的小瓶、注射用注射器、定制IV递送系统、吸入器等。另外,单位剂量试剂盒可含有关于所述组合物的制备和施用的说明书。试剂盒可制造为用于一名受试者的一次性单位剂量、用于特定受试者的多次使用(在恒定剂量下,或其中个别化合物或其药学上可接受的盐的效力可随治疗进展而变化);或试剂盒可含有适于施用多名受试者的多次剂量(“整体包装”)。所述试剂盒组件可组装于纸盒、泡罩包装、瓶、管等中。
供口服使用的配制物包括含活性成分与无毒药学上可接受的赋形剂的混合物的片剂。这些赋形剂可以是例如惰性稀释剂或填充剂(例如蔗糖、山梨糖醇、糖、甘露糖醇、微晶纤维素、包括马铃薯淀粉在内的淀粉、碳酸钙、氯化钠、乳糖、磷酸钙、硫酸钙或磷酸钠);制粒剂及崩解剂(例如纤维素衍生物,包括微晶纤维素、包括马铃薯淀粉在内的淀粉、交联羧甲基纤维素钠、海藻酸盐或海藻酸);粘合剂(例如蔗糖、葡萄糖、山梨糖醇、阿拉伯胶、海藻酸、海藻酸钠、明胶、淀粉、预胶化淀粉、微晶纤维素、硅酸镁铝、羧甲基纤维素钠、甲基纤维素、任选被取代的羟丙基甲基纤维素、乙基纤维素、聚乙烯吡咯烷酮或聚乙二醇);以及润滑剂、助流剂和抗粘着剂(例如硬脂酸镁、硬脂酸锌、硬脂酸、二氧化硅、氢化植物油或滑石)。其它药学上可接受的赋形剂可以是着色剂、调味剂、塑化剂、保湿剂、缓冲剂等。
两种或更多种化合物可一起混合于片剂、胶囊或其它媒剂中,或可隔开。在一个实施例中,第一化合物是包含在片剂的内侧上,并且第二化合物是在外侧上,由此使该第二化合物的绝大部分在第一化合物释放之前释放。
供口服使用的配制物也可以呈咀嚼片形式提供,或呈硬明胶胶囊形式提供,其中活性成分与惰性固体稀释剂(例如马铃薯淀粉、乳糖、微晶纤维素、碳酸钙、磷酸钙或高岭土)混合;或呈软明胶胶囊形式提供,其中活性成分与水或油介质,例如花生油、液体石蜡或橄榄油混合。粉末、颗粒及细圆粒可使用以上关于片剂和胶囊所提到的成分,以常规方式,使用例如混合器、流体床装置或喷雾干燥设备制备。
溶出或扩散控制性释放可通过适当地包覆化合物的片剂、胶囊、细圆粒或颗粒状配制物,或通过将所述化合物或其药学上可接受的盐并入适当基质中来实现。控制释放包衣可包括一种或多种以上提到的包覆物质,例如虫胶、蜂蜡、糖蜡(glycowax)、蓖麻蜡、巴西棕榈蜡、硬脂醇、单硬脂酸甘油酯、二硬脂酸甘油酯、棕榈硬脂酸甘油酯、乙基纤维素、丙烯酸树脂、dl-聚乳酸、乙酸丁酸纤维素、聚氯乙烯、聚乙酸乙烯酯、乙烯基吡咯烷酮、聚乙烯、聚甲基丙烯酸酯、甲基丙烯酸甲酯、2-任选被取代的羟基甲基丙烯酸酯、甲基丙烯酸酯水凝胶、1,3丁二醇、乙二醇甲基丙烯酸酯或聚乙二醇。在控制释放基质配制物中,基质材料也可包括例如水合甲基纤维素、巴西棕榈蜡和硬脂醇、卡波普(carbopol)934、硅酮、三硬脂酸甘油酯、丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸甲酯、聚氯乙烯、聚乙烯或卤化氟碳化合物。
供口服施用的可并入本发明化合物或其药学上可接受的盐和组合物的液体形式包括水性溶液、适当调味的糖浆、水性或油性悬浮液以及用如棉籽油、芝麻油、椰子油或花生油之类食用油调味的乳液,以及酏剂和类似医药媒剂。
一般而言,当施用给人类时,任何本发明化合物或其药学上可接受的盐的口服剂量将取决于该化合物的性质,并且可容易地由本领域技术人员确定。剂量可以是例如每天约0.001mg至约2000mg、每天约1mg至约1000mg、每天约5mg至约500mg、每天约100mg至约1500mg、每天约500mg至约1500mg、每天约500mg至约2000mg或其中衍生的任何范围。
实施例
本公开将通过以下实施例和合成实施例进一步说明,这些实施例和合成实施例不应解释为将本公开的范围或精神限制于本文所描述的特定程序。应了解,提供的实施例将说明某些实施方案并不打算借此对本公开的范围造成限制。还应了解,在不背离本公开的精神或所附权利要求书的范围的情况下,可采用本领域技术人员所能想到的各种其它实施方案、其修改和等效内容。
化学合成
以下实施例和本文别处使用的定义如下:
Figure BDA0004194083620019601
仪器
质谱数据收集是利用带有QDa检测器或SQ检测器2的Shimadzu LCMS-2020、Agilent 1260LC-6120/6125MSD、Shimadzu LCMS-2010EV进行的。将样品以液相注入至C-18反相柱上。化合物是使用乙腈梯度自柱洗脱并进给至质量分析仪中。初始数据分析是用Agilent ChemStation、Shimadzu LabSolutions或Waters MassLynx进行的。NMR数据是用Bruker AVANCE III HD 400MHz、Bruker Ascend500MHz仪器或Varian 400MHz仪器收集,并且原始数据是利用TopSpin或Mestrelab Mnova进行分析。
合成中间体
中间体1.合成3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇
Figure BDA0004194083620019611
步骤1
在N2气氛下,在0℃下向3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙酰氯(65g,137mmol,粗品)于DCM(120mL)中的混合物中缓慢添加1M SnCl4的DCM溶液(137mL,137mmol)。在0℃下,将混合物搅拌30分钟,接着逐滴添加5-溴-1H-吲哚(26.8g,137mmol)于DCM(40mL)中的溶液。在0℃下,将混合物搅拌45分钟,接着用EtOAc(300mL)稀释,用盐水(400mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(55g,75%产率)。LCMS(ESI):C29H32BrNO2SiNa的m/z[M+Na]计算值556.1;实验值556.3。
步骤2
在N2气氛下,在0℃下向1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(50g,93.6mmol)于THF(100mL)中的混合物中添加LiBH4(6.1g,281mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌20小时,接着添加MeOH(10mL)和EtOAc(100mL)并将混合物用盐水(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液。将残余物用DCM(50mL)稀释,冷却至10℃并添加二氢吡啶(9.5g,37.4mmol)和TsOH。添加H2O(890mg,4.7mmol)。在10℃下,将混合物搅拌2小时,过滤,将滤液减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(41g,84%产率)。LCMS(ESI):C29H34BrNOSi的m/z[M+H]计算值519.2;实验值520.1;1H NMR(400MHz,CDCl3)δ7.96(s,1H),7.75-7.68(m,5H),7.46-7.35(m,6H),7.23-7.19(m,2H),6.87(d,J=2.1Hz,1H),3.40(s,2H),2.72(s,2H),1.14(s,9H),0.89(s,6H)。
步骤3
在室温下,向1-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙-1-酮(1.5g,2.9mmol)和I2(731mg,2.9mmol)于THF(15mL)中的混合物中添加AgOTf(888mg,3.5mmol)。在室温下,将混合物搅拌2小时,接着用EtOAc(200mL)稀释并用饱和Na2S2O3(100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚(900mg,72%产率)。1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.70(s,1H),7.68(d,J=1.3Hz,1H),7.64-7.62(m,4H),7.46-7.43(m,6H),7.24-7.22(d,1H),7.14-7.12(dd,J=8.6,1.6Hz,1H),3.48(s,2H),2.63(s,2H),1.08(s,9H),0.88(s,6H)。
步骤4
在Ar气氛下,在0℃下向HCOOH(66.3g,1.44mol)于TEA(728g,7.2mol)中搅拌的混合物中逐份添加(4S,5S)-2-氯-2-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-4,5-二苯基-1,3-二氮杂-2-钌环戊烷异丙基甲苯(3.9g,6.0mmol)。将混合物加热至40℃并搅拌15分钟,接着冷却至室温并分数份添加1-(3-溴吡啶-2-基)乙酮(120g,600mmol)。将混合物加热至40℃并再搅拌2小时,接着减压浓缩溶剂。将盐水(2L)添加至残余物中,将混合物用EtOAc(4×700mL)萃取,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(1S)-1-(3-溴吡啶-2-基)乙醇(100g,74%产率)。LCMS(ESI):C7H8BrNO的m/z[M+H]计算值201.1;实验值201.9。
步骤5
在0℃下,向(1S)-1-(3-溴吡啶-2-基)乙醇(100g,495mmol)于DMF(1L)中搅拌的混合物中分数份添加60% NaH于油中的分散液(14.25g,594mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时。在0℃下,逐滴添加MeI(140.5g,990mmol)并将混合物升温至室温并搅拌2小时。将混合物冷却至0℃并添加饱和NH4Cl(5L)。将混合物用EtOAc(3×1.5L)萃取,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(90g,75%产率)。LCMS(ESI):C8H10BrNO的m/z[M+H]计算值215.0;实验值215.9。
步骤6
在Ar气氛下,在室温下向3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(90g,417mmol)和Pd(dppf)Cl2(30.5g,41.7mmol)于甲苯(900mL)中搅拌的混合物中分数份添加双(频哪醇合)二硼(127g,500mmol)和KOAc(81.8g,833mmol)。将混合物加热至100℃并搅拌3小时。减压浓缩滤液并将残余物通过Al2O3柱色谱法纯化,得到呈半固体状的2-[(1S)-1-甲氧基乙基]-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶(100g,63%产率)。LCMS(ESI):C14H22BNO3的m/z[M+H]计算值263.2;实验值264.1。
步骤7
在Ar气氛下,在室温下向5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚(140g,217mmol)和2-[(1S)-1-甲氧基乙基]-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶(100g,380mmol)于1,4-二噁烷(1.4L)中搅拌的混合物中分数份添加K2CO3(74.8g,541mmol)、Pd(dppf)Cl2(15.9g,21.7mmol)和H2O(280mL)。将混合物加热至85℃并搅拌4小时,接着冷却,添加H2O(5L)并将混合物用EtOAc(3×2L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚(71g,45%产率)。LCMS(ESI):C37H43BrN2O2Si的m/z[M+H]计算值654.2;实验值655.1。
步骤8
在N2气氛下,在0℃下向5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚(71g,108mmol)于DMF(0.8L)中搅拌的混合物中分数份添加Cs2CO3(70.6g,217mmol)和EtI(33.8g,217mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着添加H2O(4L)并将混合物用EtOAc(3×1.5L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚(66g,80%产率)。LCMS(ESI):C39H47BrN2O2Si的m/z[M+H]计算值682.3;实验值683.3。
步骤9
在N2气氛下,在室温下向TBAF(172.6g,660mmol)于THF(660mL)中搅拌的混合物中分数份添加5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚(66g,97mmol)。将混合物加热至50℃并搅拌16小时,冷却,用H2O(5L)稀释并用EtOAc(3×1.5L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。过滤后,减压浓缩滤液。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到3-(5-溴-1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇的两种阻转异构体(呈单一阻转异构体形式),都呈固体状。(合并是30g,62%产率),都呈固体状。LCMS(ESI):C23H29BrN2O2的m/z[M+H]计算值444.1;实验值445.1。
中间体1.经由费舍尔吲哚途径(Fisher Indole Route)进行的替代合成.
Figure BDA0004194083620019651
步骤1
在N2气氛下,在-10℃下经15分钟向i-PrMgCl(2M于THF中,0.5L)的混合物中逐滴添加2.5M n-BuLi的己烷溶液(333mL,833mmol)。在-10℃下,将混合物搅拌30分钟,接着在-10℃下,经30分钟逐滴添加于THF(0.5L)中的3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(180g,833mmol)。将所得混合物升温至-5℃并搅拌1小时,接着在-5℃下,经30分钟逐滴添加于THF(1.2L)中的3,3-二甲基噁烷-2,6-二酮(118g,833mmol)。将混合物升温至0℃并搅拌1.5小时,接着通过在0℃下添加预先冷却的4M HCl的1,4-二噁烷溶液(0.6L)将pH值调至约5来淬灭。将混合物用冰-水(3L)稀释并用EtOAc(3×2.5L)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的5-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-2,2-二甲基-5-氧代戊酸(87g,34%产率)。LCMS(ESI):C15H21NO4的m/z[M+H]计算值279.2;实验值280.1。
步骤2
在N2气氛下,在室温下向5-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-2,2-二甲基-5-氧代戊酸(78g,279mmol)于EtOH(0.78L)中的混合物中分数份添加(4-溴苯基)肼盐酸盐(68.7g,307mmol)。将混合物加热至85℃并搅拌2小时,冷却至室温,接着逐滴添加4M HCl的1,4-二噁烷溶液(69.8mL,279mmol)。将混合物加热至85℃并再搅拌3小时,接着减压浓缩并将残余物溶解于TFA(0.78L)中。将混合物加热至60℃并搅拌1.5,减压浓缩并用饱和NaHCO3将残余物调至约pH5,接着用EtOAc(3×1.5L)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,将滤液减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到3-(5-溴-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸和(S)-3-(5-溴-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(78g,粗品)。LCMS(ESI):C21H23BrN2O3的m/z[M+H]计算值430.1并且C23H27BrN2O3的计算值458.1;实验值431.1和459.1。
步骤3
在N2气氛下,在0℃下向3-(5-溴-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸和(S)-3-(5-溴-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(198g,459mmol)于DMF(1.8L)中的混合物中分数份添加Cs2CO3(449g,1.38mol)。接着,在0℃下逐滴添加于DMF(200mL)中的EtI(215g,1.38mmol)。将混合物升温至室温并搅拌小时,接着用盐水(5L)稀释并用EtOAc(3×2.5L)萃取。将合并的有机层用盐水(2×1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(160g,57%产率)。LCMS(ESI):C25H31BrN2O3的m/z[M+H]计算值486.2;实验值487.2。
步骤4
在N2气氛下,在0℃下向3-(5-溴-1-乙基-2-[2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酸乙酯(160g,328mmol)于THF(1.6L)中的混合物中添加LiBH4(28.6g,1.3mol)。将混合物加热至60℃,保持16小时,冷却,并用预先冷却的(0℃)NH4Cl水溶液(5L)淬灭。将混合物用EtOAc(3×2L)萃取并将合并的有机层用盐水(2×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到3-(5-溴-1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇的两种阻转异构体(呈单一阻转异构体形式)(60g,38%产率)和(40g,26%产率),都呈固体状。LCMS(ESI):C23H29BrN2O2的m/z[M+H]计算值444.1;实验值445.2。
中间体2.合成((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0004194083620019681
步骤1
在室温下,向(2S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(110g,301.2mmol)于THF(500mL)和H2O(200mL)中的溶液中添加LiOH(21.64g,903.6mmol)。将溶液搅拌1小时,接着减压浓缩。用1M HCl将残余物调至pH 6,接着用DCM(3×500mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到(S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(108g,粗品)。LCMS(ESI):C11H16BrN2O4S的m/z[M+H]计算值351.0;实验值351.0。
步骤2
在0℃下,向(S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(70g,199.3mmol)于DCM(500mL)中的溶液中添加(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯双(三氟乙酸)盐(111.28g,298.96mmol)、NMM(219.12mL,1993.0mmol)、EDCI(76.41g,398.6mmol)和HOBt(5.39g,39.89mmol)。将溶液升温至室温并搅拌1小时。接着,将反应用H2O(500mL)淬灭并用EtOAc(3×500mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到(S)-1-((S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(88.1g,93%产率)。LCMS(ESI):C17H26BrN4O5S的m/z[M+H]计算值477.1;实验值477.1。
步骤3
在室温下,向3-(5-溴-1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(60g,134.7mmol)于甲苯(500mL)中的溶液中添加双(频哪醇合)二硼(51.31g,202.1mmol)、Pd(dppf)Cl2(9.86g,13.4mmol)和KOAc(26.44g,269mmol)。接着,将反应混合物加热至90℃并搅拌2小时。接着,将反应溶液冷却至室温并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到(S)-3-(1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(60.6g,94%产率)。LCMS(ESI):C29H42BN2O4的m/z[M+H]计算值493.32;实验值493.3。
步骤4
在室温下,向(S)-3-(1-乙基-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(30g,60.9mmol)于甲苯(600mL)、二噁烷(200mL)和H2O(200mL)中的溶液中添加(S)-1-((S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(43.62g,91.4mmol)、K3PO4(32.23g,152.3mmol)和Pd(dppf)Cl2(8.91g,12.18mmol)。将所得溶液加热至70℃并搅拌过夜。接着,将反应混合物冷却至室温并用H2O(200mL)淬灭。将混合物用EtOAc萃取并将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸酯(39.7g,85%产率)。LCMS(ESI):C40H55N6O7S的m/z[M+H]计算值763.4;实验值763.3。
步骤5
在室温下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(39.7g,52.0mmol)于THF(400mL)和H2O(100mL)中的溶液中添加LiOH●H2O(3.74g,156.2mmol)。将混合物搅拌1.5小时,接着减压浓缩。用1M HCl将残余物酸化至pH 6并用DCM(3×1000mL)萃取。将合并的有机层经Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩,得到(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(37.9g,粗品)。LCMS(ESI):C39H53N6O7S的m/z[M+H]计算值749.4;实验值749.4。
步骤6
在0℃下,向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(37.9g,50.6mmol)、HOBt(34.19g,253.0mmol)和DIPEA(264.4mL,1518mmol)于DCM(4L)中的溶液中添加EDCI(271.63g,1416.9mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌过夜。接着,将反应混合物用H2O淬灭并用1M HCl(4×1L)洗涤。将有机层分离并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(30g,81%产率)。LCMS(ESI):C39H51N6O6S的m/z[M+H]计算值731.4;实验值731.3。
步骤7
在0℃下,向((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(6g,8.21mmol)于DCM(60mL)中的溶液中添加TFA(30mL)。将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(7.0g,粗品)。LCMS(ESI):C34H42N6O4S的m/z[M+H]计算值631.3;实验值:630.3。
中间体3.合成((63S,4S,Z)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-12-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0004194083620019711
步骤1
在室温下,向5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚(100g,192.0mmol)于THF(1000mL)中的搅拌溶液中一次性添加TBAF(261.17g,998.8mmol)。在50℃下,将所得混合物搅拌16小时。减压浓缩所得混合物。将所得混合物用EtOAc(2L)萃取。将合并的有机层用水(6L)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法,用PE/EtOAc(3:1)洗脱来纯化,得到3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(54g,96.63%)。LCMS(ESI):C13H16BrNO的m/z[M+H]计算值281.0;实验值282.0。
步骤2
在0℃下,向3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(54g,191.3mmol)于DCM(300mL)中的搅拌溶液中逐滴添加TEA(58.09g,574.1mmol)和Ac2O(18.95g,185.6mmol)和DMAP(1.17g,9.5mmol)。将所得混合物用水(3×500mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。由此产生呈黄色固体状的乙酸3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(54g,80.6%)。将粗产物不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C15H18BrNO2的m/z[M+H]计算值323.0;实验值324.0。
步骤3
在氩气氛下,在室温下向乙酸3-(5-溴-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(54g,166.5mmol)于甲苯(600mL)中的搅拌溶液中分数份添加KOAc(40.87g,416.3mmol)以及B2pin2(105.76g,416.3mmol)和Pd(dppf)Cl2(12.19g,16.6mmol)。在氩气氛下,在90℃下将所得混合物搅拌3小时。减压浓缩所得混合物。将所得混合物用EtOAc(1L)萃取。将合并的有机层用水(3×1L)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法,用PE/EtOAc(3:1)洗脱来纯化,得到呈黄色固体状的乙酸2,2-二甲基-3-[5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基]丙酯硼烷(55g,76.57%)。LCMS(ESI):C21H30BNO4的m/z[M+H]计算值371.2;实验值372.2。
步骤4
在氩气氛下,在室温下向乙酸2,2-二甲基-3-[5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基]丙酯(54g,145.443mmol)和(2S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(79.68g,218.1mmol)和K3PO4(77.18g,363.6mmol)于甲苯(330mL)以及二噁烷(110mL)和H2O(110mL)中的搅拌溶液中分数份添加Pd(dppf)Cl2(10.64g,14.5mmol)。在氩气氛下,在70℃下将所得混合物搅拌36小时。将所得混合物真空浓缩。将所得混合物用EtOAc(3L)萃取。将合并的有机层用水(3×2L)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法,用PE/EtOAc(1:1)洗脱来纯化,得到呈黄色油状的(2S)-3-(4-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(54g,60.78%)。LCMS(ESI):C27H35N3O6S的m/z[M+H]计算值529.2;实验值530.2。
步骤5
在0℃下,向(2S)-3-(4-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(54g,101.954mmol)于THF(450mL)中的搅拌溶液中逐滴添加NaHCO3(10.28g,122.3mmol)和AgOTf(31.44g,122.3mmol)。在0℃下,向搅拌溶液中逐滴添加于THF(100mL)中的I2(23.29g,91.6mmol)。在0℃下,将所得混合物搅拌15分钟。在0℃下,用饱和Na2S2O3(aq.)淬灭反应。将所得混合物用EtOAc(1L)萃取。将合并的有机层用水(3L)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法,用PE/EtOAc(5:1)洗脱来纯化,得到呈黄色固体状的(2S)-3-(4-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(40g,53.80%)。LCMS(ESI):C27H34IN3O6S的m/z[M+H]计算值655.1;实验值656.1。
步骤6
在0℃下,向(2S)-3-(4-[3-[3-(乙酰氧基)-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸甲酯(40g,61.01mmol)于THF(300mL)和H2O(100mL)中的搅拌溶液中逐滴添加LiOH(4.38g,183.05mmol)。在室温下,将所得混合物搅拌过夜。用浓HCl将残余物酸化至pH 6。将所得混合物用EtOAc(500mL)萃取。将合并的有机层用水(3×500mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。由此产生呈黄色油状的(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[4-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基]丙酸(40g,粗品)。粗产物不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C24H30IN3O5S的m/z[M+H]计算值599.1.1;实验值600.1。
步骤7
在0℃下,向(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[4-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基]丙酸(40g,66.72mmol)和(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(28.86g,200.17mmol)以及HOBT(1.8g,13.35mmol)和DIEA(172.47g,1334.5mmol)于DCM(350mL)中的搅拌溶液中逐滴添加EDCI(31.98g,166.8mmol)。在氮气氛下,在室温下将所得混合物搅拌过夜。将所得混合物用水(1.5L)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法,用PE/EtOAc(1:1)洗脱来纯化,得到呈黄色油状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[4-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(28g,43.9%)。LCMS(ESI):C30H40IN5O6S的m/z[M+H]计算值725.1.1;实验值726.1
步骤8
在0℃下,向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[4-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(28g,38.5mmol)于THF(240mL)中的搅拌溶液中逐滴添加于H2O(80mL)中的LiOH(2.77g,115.7mmol)。在室温下,将所得混合物搅拌2小时。用浓HCl将混合物酸化至pH 6。将所得混合物用EtOAc(300mL)萃取。将合并的有机层用水(3×300mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。由此产生呈黄色油状的(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[4-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(25g,粗品)。粗产物不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C29H38IN5O6S的m/z[M+H]计算值711.1;实验值712.2。
步骤9
在0℃下,向(3S)-1-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[4-[3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-碘-1H-吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(25g,35.13mmol)以及HOBT(23.74g,175.6mmol)和DIPEA(136.21g,1053.9mmol)于DCM(2L)中的搅拌溶液中分数份添加EDCI(188.5g,983.6mmol)。在氮气氛下,在室温下将所得混合物搅拌过夜。将所得混合物用水(6L)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法,用PE/EtOAc(2:1)洗脱来纯化,得到呈黄色固体状的((63S,4S,Z)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(13g,45.88%)。LCMS(ESI):C29H36IN5O5S的m/z[M+H]计算值693.1;实验值694.0。
步骤10
在氩气氛下,在室温下向((63S,4S,Z)-12-碘-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(13g,18.7mmol)以及KOAc(6.44g,65.6mmol)和s-Phos(2.31g,5.62mmol)于甲苯(120mL)中搅拌的混合物中分数份添加Pd2(dba)3(2.06g,2.25mmol)。在氩气氛下,在0℃下向搅拌的溶液中逐滴添加4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(17.99g,140.5mmol)。在氩气氛下,在60℃下将所得混合物搅拌3小时。在0℃下,用饱和NH4Cl(aq.)淬灭反应。真空浓缩所得混合物。将所得混合物用EtOAc(200mL)萃取。将合并的有机层用水(3×300mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法,用PE/EtOAc(3:1)洗脱来纯化,得到呈黄色固体状的((63S,4S,Z)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-12-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(10g,68.6%产率)。LCMS(ESI):C35H48BN5O7S的m/z[M+H]计算值693.3;实验值694.4。
中间体4.合成(S)-3-溴-5-碘-2-(1-甲氧基乙基)吡啶
Figure BDA0004194083620019761
步骤1
在氩气氛下,向3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(80.00g,370.24mmol,1.00当量)和双(频哪醇合)二硼(141.03g,555.3mmol,1.50当量)于THF(320mL)中的搅拌溶液中添加dtbpy(14.91g,55.5mmol)和氯(1,5-环辛二烯)铱(I)二聚体(7.46g,11.1mmol)。在氩气氛下,在75℃下将所得混合物搅拌16小时。将混合物减压浓缩。将所得混合物溶解于EtOAc(200mL)中并用溶于水(600mL)中的Na2CO3(40g)和NaOH(10g)(质量比4:1)将混合物调至pH10。用EtOAc(800mL)萃取水层。用HCl(6N)将水相酸化至pH=6以使所需固体沉淀,得到呈浅黄色固体状的5-溴-6-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基硼酸(50g,52.0%产率)。LCMS(ESI):C8H11BBrNO3的m/z[M+H]计算值259.0;实验值260.0。
步骤2
在氩气氛下,在室温下向5-溴-6-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基硼酸(23.00g,88.5mmol)于ACN(230mL)中的搅拌溶液中添加NIS(49.78g,221.2mmol)。在氩气氛下,在80℃下将所得混合物搅拌过夜。减压浓缩所得混合物。将所得混合物溶解于DCM(2.1L)中并用Na2S2O3(3×500mL)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到(S)-3-溴-5-碘-2-(1-甲氧基乙基)吡啶(20g,66.0%产率)。LCMS(ESI):C8H9BrINO的m/z[M+H]计算值340.9;实验值341.7。
中间体5.合成((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯
Figure BDA0004194083620019781
步骤1
向充入惰性氩并维持惰性氩气氛的3L 3颈圆底烧瓶中放入3-溴-5-碘-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(147g,429.8mmol)、哌嗪-1-甲酸苯甲酯(94.69g,429.8mmol)、Pd(OAc)2(4.83g,21.4mmol)、BINAP(5.35g,8.6mmol)、Cs2CO3(350.14g,1074.6mmol)、甲苯(1L)。在油浴中,在100℃下将所得溶液搅拌过夜。反应完成后,将反应混合物冷却至25℃。减压浓缩所得混合物。用乙酸乙酯/己烷(1:1)将残余物施加至硅胶柱上。减压去除溶剂,得到呈深黄色固体状的(S)-4-(5-溴-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(135g,65.1%产率)。LCMS(ESI):C20H24BrN3O3的m/z[M+H]计算值433.1;实验值434.1。
步骤2
向充入惰性氩并维持惰性氩气氛的3-L 3颈圆底烧瓶中放入4-[5-溴-6-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(135g,310.8mmol)、双(频哪醇合)二硼(86.82g,341.9mmol)、Pd(dppf)Cl2(22.74g,31.0mmol)、KOAc(76.26g,777.5mmol)、甲苯(1L)。在油浴中,在90℃下将所得溶液搅拌2天。将反应混合物冷却至25℃。真空浓缩所得混合物。用乙酸乙酯/己烷(1:3)将残余物施加至中性氧化铝柱上。减压去除溶剂,得到呈深黄色固体状的(S)-4-(6-(1-甲氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(167g,粗品)。LCMS(ESI):C26H36BN3O5的m/z[M+H]计算值481.3;实验值482.1。
步骤3
向充入惰性氩并维持惰性氩气氛的3-L 3颈圆底烧瓶中放入(S)-4-(6-(1-甲氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸酯(167g,346.9mmol)、5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚(224.27g,346.9mmol)、Pd(dppf)Cl2(25.38g,34.6mmol)、二噁烷(600mL)、H2O(200mL)、K3PO4(184.09g,867.2mmol)、甲苯(200mL)。在油浴中,在70℃下将所得溶液搅拌过夜。反应完成后,将反应混合物冷却至25℃。真空浓缩所得混合物。用乙酸乙酯/己烷(1:1)将残余物施加至硅胶柱上。减压去除溶剂,得到呈黄色固体状的(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(146g,48.1%产率)。LCMS(ESI):C49H57BrN4O4Si的m/z[M+H]计算值872.3;实验值873.3。
步骤4
在N2气氛下,在0℃下向(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(146g,167.0mmol)和Cs2CO3(163.28g,501.1mmol)于DMF(1200mL)中搅拌的混合物中分数份添加C2H5I(52.11g,334.0mmol)。在25℃下,将最终反应混合物搅拌12小时。可通过LCMS检测所需产物。将所得混合物用EA(1L)稀释并用盐水(3×1.5L)洗涤。将有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,将滤液减压浓缩,得到呈黄色固体状的(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-乙基-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(143g,粗品),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤。LCMS(ESI):C51H61BrN4O4Si的m/z[M+H]计算值900.4;实验值901.4。
步骤5
向(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-乙基-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲基苯甲酯(143g,158.5mmol)于DMF(1250mL)中搅拌的混合物中添加CsF(72.24g,475.5mmol)。接着,在N2气氛下,在60℃下将反应混合物搅拌2天。可通过LCMS检测所需产物。将所得混合物用EA(1L)稀释并用盐水(3×1L)洗涤。接着,减压浓缩有机相。将残余物通过硅胶柱色谱法,用PE/EA(1/3)洗脱来纯化,得到(S)-4-(5-(5-溴-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯A(38g,36%产率,RT=1.677分钟,经3分钟LCMS(0.1% FA))和B(34g,34%产率,RT=1.578分钟,经3分钟LCMS(0.1%FA))两种阻转异构体,均呈黄色固体状。LCMS(ESI):C35H43BrN4O4的m/z[M+H]计算值663.2;实验值662.2。
步骤6
向充入惰性氮气并维持惰性氮气氛的500-mL 3颈圆底烧瓶中放入(S)-4-(5-(5-溴-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯A(14g,21.1mmol)、双(频哪醇合)二硼(5.89g,23.21mmol)、Pd(dppf)Cl2(1.54g,2.1mmol)、KOAc(5.18g,52.7mmol)、甲苯(150mL)。在油浴中,在90℃下将所得溶液搅拌5小时。将反应混合物冷却至25℃。真空浓缩所得混合物。将残余物通过硅胶柱色谱法,用PE/EA(1/3)洗脱来纯化,得到呈黄色固体状的(S)-4-(5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(12g,76.0%产率)。LCMS(ESI):C41H55BN4O6的m/z[M+H]计算值710.4;实验值711.3。
步骤7
向充入惰性氩并维持惰性氩气氛的250-mL圆底烧瓶中放入(S)-4-(5-(1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(10.8g,15.2mmol)、(3S)-1-[(2S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(7.98g,16.7mmol)、Pd(dtbpf)Cl2(0.99g,1.52mmol)、K3PO4(8.06g,37.9mmol)、甲苯(60mL)、二噁烷(20mL)、H2O(20mL)。在油浴中,在70℃下将所得溶液搅拌3小时。将反应混合物冷却至25℃。将所得溶液用EtOAc(2×50mL)萃取并减压浓缩。用乙酸乙酯/己烷(10:1)将残余物施加至硅胶柱上。去除溶剂,得到呈黄色固体状的(S)-1-((S)-3-(4-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(8g,50.9%产率)。LCMS(ESI):C52H68N8O9S的m/z[M+H]计算值980.5;实验值980.9。
步骤8
在N2气氛下,向(S)-1-((S)-3-(4-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(12g,12.23mmol)于THF(100mL)/H2O(100mL)中搅拌的混合物中添加LiOH(2.45g,61.1mmol)并在25℃下,将所得混合物搅拌2小时。可通过LCMS检测所需产物。减压浓缩THF。在0℃下,用HCL(1N)将水相的pH值酸化至5。用DCM(3×100ml)萃取水层。将有机相减压浓缩,得到呈浅黄色固体状的(S)-1-((S)-3-(4-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(10g,84.5%产率)。LCMS(ESI):C51H66N8O9S的m/z[M+H]计算值966.5;实验值967.0。
步骤9
向充入惰性氮气并维持惰性氮气氛的3-L圆底烧瓶中放入(S)-1-((S)-3-(4-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(18g,18.61mmol)、ACN(1.8L)、DIEA(96.21g,744.4mmol)、EDCI(107.03g,558.3mmol)、HOBT(25.15g,186.1mmol)。在25℃下,将所得溶液搅拌过夜。反应完成后,真空浓缩所得混合物。将所得溶液用DCM(1L)稀释。将所得混合物用HCl(3×1L,1N水溶液)洗涤。将所得混合物用水(3×1L)洗涤。接着,浓缩有机层,用乙酸乙酯/己烷(1:1)将残余物施加至硅胶柱上。减压去除溶剂,得到呈浅黄色固体状的4-(5-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(10.4g,54.8%产率)。LCMS(ESI):C51H64N8O8S的m/z[M+H]计算值948.5;实验值949.3。
步骤10
向充入惰性氮气并维持惰性氮气氛的250-mL圆底烧瓶中放入4-(5-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(10.40g,10.9mmol)、Pd(OH)2/C(5g,46.9mmol)、MeOH(100mL)。在2atm H2气氛下,在25℃下将所得溶液搅拌3小时。过滤出固体并用MeOH(3×100mL)洗涤滤饼。接着,将合并的有机相减压浓缩,得到呈浅黄色固体状的((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(8.5g,90.4%产率)。LCMS(ESI):C43H58N8O6S的m/z[M+H]计算值814.4;实验值815.3。
步骤11
向充入惰性氮气并维持惰性氮气氛的1000-mL圆底烧瓶中放入((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(8.5g,10.4mmol)、MeOH(100mL)、AcOH(1.88g,31.2mmol)并搅拌15分钟。接着,在25℃下添加HCHO(1.88g,23.15mmol,37%水溶液)和NaBH3CN(788mg,12.5mmol)。在25℃下,将所得溶液搅拌3小时。将所得混合物用100mL水淬灭并减压浓缩以去除MeOH。将所得溶液用300mL DCM稀释。将所得混合物用水(3×100mL)洗涤。去除溶剂,得到呈黄色固体状的((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(8.2g,90.1%产率)。LCMS(ESI):C44H60N8O6S的m/z[M+H]计算值828.4;实验值829.3。
实施例A120.(1S,2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(5-((S)-六氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪-8(1H)-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620019841
步骤1
在氮气氛下,在室温下向3-溴-5-碘-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶(1g,2.92mmol)、(S)-八氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪(498.9mg,3.1mmol)和叔丁醇钾(656.25mg,5.8mmol)于甲苯(15mL)中的搅拌溶液中添加Pd2(dba)3(53.55mg,0.06mmol)和XantPhos(169.2mg,0.29mmol)。在氮气氛下,在100℃下将所得混合物搅拌3小时。反应完成后,减压浓缩溶液。将残余物通过反相快速色谱法(条件:柱,C18硅胶;流动相:ACN/水(0.05%TFA),经40分钟0%至100%梯度;检测器:UV 254nm)纯化,得到呈黄色固体状的(S)-8-(5-溴-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)八氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪(670mg,57.2%产率)。LCMS(ESI):C15H22BrN3O2的m/z[M+H]计算值355.1;实验值356.1。
步骤2
在氮气氛下,在室温下向(S)-8-(5-溴-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)八氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪(670mg,1.88mmol)、中间体3(1.56g,2.26mmol)和K2CO3(779.74mg,5.6mmol)于甲苯(9mL)、H2O(3mL)和1,4-二噁烷(3mL)中的混合物中添加Pd(dppf)Cl2(137.61mg,0.19mmol)。在氮气氛下,在65℃下将所得混合物搅拌过夜。反应完成后,减压浓缩溶液。将残余物通过反相快速色谱法(条件:柱,C18硅胶;流动相:ACN/水(0.05% TFA),经30分钟0%至100%梯度;检测器:UV 254nm)纯化,得到呈白色固体状的((63S,4S,Z)-12-(5-((S)-六氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪-8(1H)-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.4g,88.3%产率)。LCMS(ESI):C44H58N8O7S的m/z[M+H]计算值842.4;实验值843.2。
步骤3
在0℃下,向((63S,4S,Z)-12-(5-((S)-六氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪-8(1H)-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.4g,1.66mmol)和Cs2CO3(1.62g,4.97mmol)于DMF(10mL)中搅拌的混合物中逐滴添加碘乙烷(0.39g,2.5mmol)。在室温下,将所得混合物搅拌2小时。反应完成后,减压浓缩溶液。将残余物通过反相快速色谱法(条件:柱,C18硅胶;流动相:ACN/水(0.05% TFA),经30分钟0%至100%梯度;检测器:UV 254nm)纯化,得到呈黄褐色固体状的((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(5-((S)-六氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪-8(1H)-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(800mg,49.7%产率)。LCMS(ESI):C46H62N8O7S的m/z[M+H]计算值870.4;实验值871.2。
步骤4
在0℃下,向50mL圆底烧瓶中添加((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(5-((S)-六氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪-8(1H)-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(250mg,0.29mmol)和HCl(4M的1,4-二噁烷溶液,10mL)。在室温下,将所得混合物搅拌1小时。浓缩所得混合物。将所得混合物用30mL二氯甲烷和20mL饱和NaHCO3水溶液稀释。将有机相用30mL盐水洗涤两次。减压去除溶剂,产生呈褐色固体状的(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(5-((S)-六氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪-8(1H)-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(170.00mg,粗品)。LCMS(ESI):C41H54N8O5S的m/z[M+H]计算值770.4;实验值771.2。
步骤5
在0℃下,向(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(5-((S)-六氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪-8(1H)-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(170mg,0.22mmol)于DMF(8mL)中的搅拌溶液中添加DIEA(2.8g,22mmol)、(1S,2S)-2-甲基环丙烷-1-甲酸(33mg,0.33mmol)和HATU(125mg,0.33mmol)。在室温下,将所得混合物搅拌2小时。反应完成后,减压浓缩溶液。将粗产物通过制备型HPLC纯化,得到50mg外消旋产物。将外消旋物通过制备型CHIRAL-HPLC在以下条件(柱:CHIRAL ART Cellulose-SB,2*25cm,5um;流动相A:MtBE(10mM NH3-MeOH),流动相B:EtOH;流动速率:20mL/min;梯度:经7分钟50% B至50% B;275/210nm)纯化,得到(1S,2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(5-((S)-六氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪-8(1H)-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺(呈单一阻转异构体形式)(10.7mg,5.1%产率)和(6mg,3.03%)两种阻转异构体,均呈白色固体状。LCMS(ESI):C46H60N8O6S的m/z[M+H]计算值852.3;实验值853.5。异构体1。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.53(d,2H),8.46(d,1H),7.79(s,1H),7.71(d,1H),7.51(d,1H),7.38(d,1H),5.55(t,1H),5.05(d,1H),4.22(t,2H),3.99–3.80(m,4H),3.82–3.59(m,5H),3.54(d,2H),3.39(d,1H),3.14(t,2H),3.07(s,3H),2.99(s,1H),2.81(t,3H),2.67(d,1H),2.44–2.34(m,2H),2.30(s,1H),2.21–2.07(m,2H),1.80(s,2H),1.51(s,2H),1.21(d,4H),1.15–0.93(m,7H),0.87(s,3H),0.65(m,2H),0.52(s,4H)。异构体2。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.54–8.39(m,3H),7.79(s,1H),7.75–7.67(m,1H),7.55(d,1H),7.22(d,1H),5.56(t,1H),5.07(d,1H),4.34–4.09(m,5H),3.83–3.62(m,4H),3.55(d,3H),3.21(s,3H),3.14(d,2H),2.94–2.64(m,5H),2.46–2.36(m,2H),2.32–2.15(m,3H),2.08(d,1H),1.79(s,2H),1.49(s,2H),1.33(d,3H),1.25(d,1H),1.06(s,4H),0.90(d,7H),0.54(d,1H),0.34(s,3H)。
实施例A14.N-[(7S,13S,19M)-21-乙基-20-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-17,17-二甲基-8,14-二氧代-15-氧杂-4-硫杂-9,21,27,28-四氮杂五环[17.5.2.12,.1,13.022,2]二十八碳-1(25),2,5(28),19,22(26),23-六烯-7-基]氮杂环丁烷-3-甲酰胺
Figure BDA0004194083620019871
步骤1
在N2气氛下,在室温下向(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(450.00mg,0.71mmol,1.00当量)和1-(叔丁氧基羰基)氮杂环丁烷-3-甲酸(215.3mg,1.07mmol)于DMF(5.00mL)中的搅拌溶液中分数份添加DIEA(460.99mg,3.5mmol)和HATU(379.7mg,1mmol),直至LCMS确定反应完成。将所得混合物用EtOAc(3×20mL)萃取并将合并的有机层用盐水(2×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液并将所得残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈黄色固体状的3-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨甲酰基)氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(520mg,90%)。LCMS(ESI):C43H55N7O7S的m/z[M+H]计算值ESI-MS 813.4;实验值:814.4。
步骤2
在0℃下,向3-(((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨甲酰基)氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(170.00mg,0.21mmol)于DCM(1.6mL)中的溶液中逐滴添加TFA(0.4mL,5.3mmol)。在N2气氛下,在室温下将其搅拌2小时,接着减压浓缩。将粗产物通过制备型HPLC纯化,得到呈白色固体状的N-[(7S,13S,19M)-21-乙基-20-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-17,17-二甲基-8,14-二氧代-15-氧杂-4-硫杂-9,21,27,28-四氮杂五环[17.5.2.12,.1,13.022,2]二十八碳-1(25),2,5(28),19,22(26),23-六烯-7-基]氮杂环丁烷-3-甲酰胺(44.7mg,30%产率)。LCMS(ESI):C38H47N7O5S的m/z[M+H]计算值713.3;实验值714.1。
实施例A99.(1S,2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-苯基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620019891
在0℃下,向((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(50.0mg,0.069mmol)、(1S,2S)-2-苯基环丙烷-1-甲酸(16.69mg,0.103mmol)和DIPEA(44.32mg,0.343mmol)于DMF(0.50mL)中的溶液中添加HATU(78.24mg,0.206mmol)。将所得混合物升温至室温并搅拌3小时。将粗产物通过制备型HPLC纯化,得到呈灰白色固体状的(1S,2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-苯基环丙烷-1-甲酰胺(34mg,51%产率)。LCMS(ESI):C49H60N8O5S的m/z[M+H]计算值873.5;实验值874.1。
实施例A121.合成(1S,2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-(2-甲氧基乙基)哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620019901
步骤1
向4-(5-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(380mg,0.4mmol)于EtOAc(10mL)中的混合物中添加Pd(OH)2/C(600mg,20mol%),在室温下氢化过夜。通过
Figure BDA0004194083620019902
垫过滤混合物并减压浓缩滤液,得到呈固体状的((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(310mg,粗品)。LCMS(ESI):C43H58N8O6S的m/z[M+H]计算值814.4;实验值815.5。
步骤2
在室温下,向((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(300mg,0.37mmol)和1-溴-2-甲氧基乙烷(56mg,0.41mmol)于MeCN(10mL)中的混合物中分数份添加KI(61mg,0.37mmol)和K2CO3(51mg,0.37mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌2小时,接着用H2O(5mL)稀释。将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-(2-甲氧基乙基)哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(310mg,97%产率)。LCMS(ESI):C46H64N8O7S的m/z[M+H]计算值872.5;实验值873.6。
步骤3
在室温下,将((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-(2-甲氧基乙基)哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(300mg,0.34mmol)于4MHCl的1,4-二噁烷溶液(10mL)中的混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-(2-甲氧基乙基)哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮盐酸盐(315mg,粗品),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C41H56N8O5S的m/z[M+H]计算值772.4;实验值773.3。
步骤4
在0℃下,向(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-(2-甲氧基乙基)哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮盐酸盐(300mg,0.39mmol)和(1S,2S)-2-甲基环丙烷-1-甲酸(97mg,0.97mmol)于DMF(5mL)中的混合物逐滴添加DIPEA(1.00g,7.77mmol),接着分数份添加COMU(249mg,0.58mmol)。使混合物升温至室温并搅拌2小时,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1S,2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-(2-甲氧基乙基)哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺(178mg,54%产率)。LCMS(ESI):C46H62N8O6S的m/z[M+H]计算值854.5;实验值855.5;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.55-8.46(m,2H),7.80(d,J=3.1Hz,1H),7.77-7.70(m,1H),7.57(d,J=8.6Hz,1H),7.40(d,J=2.8Hz,1H),5.55(d,J=9.2Hz,1H),4.37-4.09(m,6H),4.00(s,2H),3.83-3.71(m,2H),3.57(s,3H),3.38(t,J=4.8Hz,2H),3.32(d,J=2.5Hz,4H),3.22(s,7H),3.20-3.11(m,1H),2.94(d,J=14.4Hz,1H),2.76(t,J=11.4Hz,1H),2.44(d,J=14.2Hz,1H),2.07(d,J=12.0Hz,1H),1.80(s,2H),1.60-1.47(m,2H),1.34(d,J=6.1Hz,3H),1.07(d,J=1.8Hz,4H),0.95-0.82(m,7H),0.55(d,J=7.4Hz,1H),0.35(s,3H)。
实施例A157.合成(1S,2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((R)-八氢-2H-吡啶并[1,2-a]吡嗪-2-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620019921
步骤15-[(9aR)-八氢吡啶并[1,2-a]吡嗪-2-基]-3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶是以与(S)-8-(5-溴-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)八氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪类似地方式合成,但(S)-八氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪被取代成呈固体状的(S)-八氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪(1.5g,60%产率)。LCMS(ESI):C16H24BrN3O的m/z[M+H]计算值353.1;实验值354.1。
步骤2
((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((R)-八氢-2H-吡啶并[1,2-a]吡嗪-2-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯是以与((63S,4S,Z)-12-(5-((S)-六氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪-8(1H)-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯类似地方式合成,但(S)-8-(5-溴-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)八氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪被取代成5-[(9aR)-八氢吡啶并[1,2-a]吡嗪-2-基]-3-溴-2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶并且K2CO3被取代成K3PO4,得到(800mg,83%产率),呈油状。LCMS(ESI):C45H60N8O6S的m/z[M+H]计算值840.4;实验值841.4。
步骤3
((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((R)-八氢-2H-吡啶并[1,2-a]吡嗪-2-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯是以与((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(5-((S)-六氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪-8(1H)-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯类似地方式合成,但((63S,4S,Z)-12-(5-((S)-六氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪-8(1H)-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯被取代成((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((R)-八氢-2H-吡啶并[1,2-a]吡嗪-2-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯,得到(220mg,27%产率),呈固体状。LCMS(ESI):C47H64N8O6S的m/z[M+H]计算值868.5;实验值869.5。
步骤4
在0℃下,向((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((R)-八氢-2H-吡啶并[1,2-a]吡嗪-2-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(220mg,0.25mmol)于1,4-二噁烷(2mL)中的混合物中添加4M HCl的1,4-二噁烷溶液(1mL)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((R)-八氢-2H-吡啶并[1,2-a]吡嗪-2-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(220mg,粗品)。LCMS(ESI):C42H56N8O4S的m/z[M+H]计算值768.4;实验值769.4。
步骤5
(1S,2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((R)-八氢-2H-吡啶并[1,2-a]吡嗪-2-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺是以与(1S,2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(5-((S)-六氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪-8(1H)-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺类似地方式合成,但(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(5-((S)-六氢吡嗪并[2,1-c][1,4]噁嗪-8(1H)-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮盐酸盐被取代成(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((R)-八氢-2H-吡啶并[1,2-a]吡嗪-2-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮,得到(13mg,8%产率),呈固体状。LCMS(ESI):C47H62N8O5S的m/z[M+H]计算值850.5;实验值851.6;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.53-8.41(m,3H),7.79(s,1H),7.72-7.70(m,1H),7.55-7.30(m,1H),7.20-7.10(m,1H),5.56-5.46(m,1H),5.08-5.00(m,1H),4.39-4.04(m,5H),3.72-7.62(m,2H),3.57-3.47(m,2H),3.21-3.11(m,3H),3.15-3.08(m,1H),2.94(m,1H),2.79-2.69(m,4H),2.45-2.35(m,3H),2.24-2.22(m,1H),2.08-2.00(m,1H),2.01-1.88(m,2H),1.81-1.65(m,3H),1.59(d,J=12.1Hz,2H),1.54-1.38(m,2H),1.33-1.30m,3H),1.28-1.12(m,3H),1.06-0.86(m,4H),0.96-0.79(m,6H),0.55-0.50(m,1H),0.34(s,3H)。
实施例A214.合成(1S,2S)-N-((63S,4S,Z)-11-(2-氰基丙-2-基)-10,10-二甲基-12-(2-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-4-基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620019961
步骤1
在Ar气氛下,将4-(4-溴吡啶-2-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(8.09g,21.5mmol)、双(频哪醇合)二硼(8.19g,32.3mmol)、KOAc(6.33g,64.5mmol)、Pd(dppf)Cl2(0.79g,1.1mmol)于甲苯(100mL)中的混合物加热至90℃并搅拌2小时。将混合物真空浓缩,将H2O(50mL)添加至残余物中,并用EtOAc(2×100mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤,干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈固体状的4-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-2-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(9.2g,100%产率)。LCMS(ESI):C23H30BN3O4的m/z[M+H]计算值423.2;实验值424.2。
步骤2
在N2气氛下,将4-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-2-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(5.00g,11.8mmol)、5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-2-碘-1H-吲哚(7.64g,11.8mmol)、Pd(dppf)Cl2(0.86g,1.2mmol)、K2CO3(6.27g,45.4mmol)于甲苯(45mL)、1,4-二噁烷(15mL)、H2O(15mL)中的混合物加热至70℃并搅拌2小时。添加H2O(50mL)并用EtOAc(2×50mL)萃取混合物。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的4-[4-(5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚-2-基)吡啶-2-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(4.9g,51%产率)。LCMS(ESI):C46H51BrN4O3Si的m/z[M+H]计算值814.3;实验值815.4。
步骤3
在N2气氛下,将4-[4-(5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1H-吲哚-2-基)吡啶-2-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(4.5g,5.5mmol)、2-溴-2-甲基丙酰胺(2.75g,16.6mmol)、K3PO4(2.34g,11.0mmol)、NaOH(0.57g,14.3mmol)、Ph3P(0.29g,1.1mmol)、溴化铜-二甲基硫醚(0.23g,1.1mmol)于甲苯(50mL)中的混合物加热至45℃并搅拌2天。添加H2O(50mL)并用EtOAc(2×50mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的4-[4-(5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-(1-氨甲酰基-1-甲基乙基)吲哚-2-基)吡啶-2-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.5g,30%产率)。LCMS(ESI):C50H58BrN5O4Si的m/z[M+H]计算值899.3;实验值900.4。
步骤4
在室温下,将4-[4-(5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-(1-氨甲酰基-1-甲基乙基)吲哚-2-基)吡啶-2-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.40g,1.6mmol)、Et3N(0.47g,4.7mmol)和TFAA(0.65g,3.1mmol)于DCM(20mL,3当量)中的混合物搅拌2小时。添加H2O(20mL)并用DCM(2×20mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液,得到呈固体状的4-[4-(5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-(1-氰基-1-甲基乙基)吲哚-2-基)吡啶-2-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.3g,95%产率)。LCMS(ESI):C50H56BrN5O3Si的m/z[M+H]计算值881.3;实验值882.4。
步骤5
在N2气氛下,将4-[4-(5-溴-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-(1-氰基-1-甲基乙基)吲哚-2-基)吡啶-2-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.50g,1.7mmol)、双(频哪醇合)二硼(5.21g,20.5mmol)、Pd2(dba)3(0.38g,0.4mmol)、KOAc(1.21g,12.3mmol)、X-Phos(0.20g,0.4mmol)于1,4-二噁烷(25mL)中的混合物加热至110℃并搅拌2小时。添加H2O(25mL)并用EtOAc(2×25mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×25mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的4-[4-(3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-(1-氰基-1-甲基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-2-基)吡啶-2-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.6g,94%产率)。LCMS(ESI):C56H68BN5O5Si的m/z[M+H]计算值929.5;实验值930.4。
步骤6
在N2气氛下,将4-[4-(3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-(1-氰基-1-甲基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-2-基)吡啶-2-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.60g,1.7mmol)、(3S)-1-[(2S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(0.82g,1.7mmol)、K2CO3(0.79g,5.8mmol)、Pd(dppf)Cl2(0.13g,0.17mmol)于甲苯(12mL)、1,4-二噁烷(4mL)和H2O(4mL)中的混合物加热至70℃并搅拌5小时。添加H2O(30mL)并用EtOAc(2×30mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×30mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的4-[4-(5-[2-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[(3S)-3-(甲氧基羰基)-1,2-二氮杂环己烷-1-基]-3-氧代丙基]-1,3-噻唑-4-基]-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-(1-氰基-1-甲基乙基)吲哚-2-基)吡啶-2-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(650mg,31%产率)。LCMS(ESI):C67H81N9O8SSi的m/z[M+H]计算值1199.6;实验值1200.5。
步骤7
在N2气氛下,向4-[4-(5-[2-[(2S)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-[(3S)-3-(甲氧基羰基)-1,2-二氮杂环己烷-1-基]-3-氧代丙基]-1,3-噻唑-4-基]-3-[3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基]-1-(1-氰基-1-甲基乙基)吲哚-2-基)吡啶-2-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(650mg,0.54mmol)于THF(15mL)中的混合物中添加TBAF(1.42g,5.4mmol)。在室温下,将混合物搅拌过夜,接着用1M HCl将混合物调至约pH 6并用EtOAc(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(3S)-1-[(2S)-3-[4-[2-(2-[4-[(苯甲氧基)羰基]哌嗪-1-基]吡啶-4-基)-1-(1-氰基-1-甲基乙基)-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基]-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(370mg,72%产率)。LCMS(ESI):C50H61N9O8S的m/z[M+H]计算值947.4;实验值948.5。
步骤8
在室温下,将(3S)-1-[(2S)-3-[4-[2-(2-[4-[(苯甲氧基)羰基]哌嗪-1-基]吡啶-4-基)-1-(1-氰基-1-甲基乙基)-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)吲哚-5-基]-1,3-噻唑-2-基]-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(370mg,0.39mmol)、DIPEA(1.51g,11.7mmol)、HOBT(264mg,1.95mmol)、EDCI(2.09g,10.9mmol)于DCM(370mL)中的混合物搅拌过夜。添加H2O(100mL)并用EtOAc(2×100mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈固体状的4-(4-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-(2-氰基丙-2-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)吡啶-2-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(187mg,52%产率)。LCMS(ESI):C50H59N9O7S的m/z[M+H]计算值929.4;实验值930.8。
步骤9
在H2气氛下,将4-(4-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-(2-氰基丙-2-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)吡啶-2-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(170mg,0.18mmol)、三聚甲醛(165mg,1.8mmol)、Pd(OH)2/C(170mg,1.2mmol)于MeOH(25mL)中的混合物搅拌过夜。过滤混合物并减压浓缩滤液,得到呈固体状的((63S,4S,Z)-11-(2-氰基丙-2-基)-10,10-二甲基-12-(2-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-4-基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(110mg,74%产率)。LCMS(ESI):C43H55N9O5S的m/z[M+H]计算值809.4;实验值810.9。
步骤10
在室温下,将((63S,4S,Z)-11-(2-氰基丙-2-基)-10,10-二甲基-12-(2-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-4-基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(110mg,0.14mmol)和TFA(5.0mL,67.3mmol)于DCM(5mL)中的混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈油状的2-((63S,4S,Z)-4-氨基-10,10-二甲基-12-(2-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-4-基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-11-基)-2-甲基丙腈(96mg,100%产率)。LCMS(ESI):C38H47N9O3S的m/z[M+H]计算值709.4;实验值710.5。
步骤11
在室温下,将2-((63S,4S,Z)-4-氨基-10,10-二甲基-12-(2-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-4-基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-11-基)-2-甲基丙腈(110mg,0.16mmol)、(1S,2S)-2-甲基环丙烷-1-甲酸(47mg,0.47mmol)、COMU(66mg,0.16mmol)、DIPEA(1.00g,7.75mmol)于DMF(5mL)中的混合物搅拌2小时。添加H2O(10mL)并用EtOAc(2×10mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤,经Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1S,2S)-N-((63S,4S,Z)-11-(2-氰基丙-2-基)-10,10-二甲基-12-(2-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-4-基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺(21mg,17%产率)。LCMS(ESI):C43H53N9O4S的m/z[M+H]计算值791.4;实验值792.4;1H-NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.51(d,J=7.1Hz,2H),8.21(d,J=5.0Hz,1H),8.16(d,J=5.0Hz,1H),7.89(d,J=1.8Hz,1H),7.83(d,J=1.5Hz,2H),7.06(s,1H),6.96(s,1H),6.74-6.68(m,1H),5.54(q,J=8.6Hz,1H),5.04(d,J=12.2Hz,1H),4.20(q,J=12.4Hz,2H),3.66(dd,J=16.0,10.9Hz,1H),3.55(s,5H),3.50(d,J=10.9Hz,1H),3.35(s,1H),3.15(dd,J=14.8,9.2Hz,1H),2.93(dd,J=14.4,6.3Hz,1H),2.77(s,1H),2.38(dd,J=10.9,5.5Hz,4H),2.20(d,J=5.3Hz,3H),2.09(s,1H),2.06(s,1H),2.09-1.99(m,3H),1.82-1.51(d,J=4.0Hz,4H),1.07(s,4H),0.90-0.86(d,J=3.0Hz,4H),0.55(d,J=6.8Hz,1H),0.47-0.38(m,3H)。
实施例A221和实施例A222.合成(1S,2S)-2-(二氟甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)环丙烷-1-甲酰胺和(1R,2R)-2-(二氟甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020021
步骤1
在0℃下,向(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(200mg,0.27mmol)和反-2-(二氟甲基)环丙烷-1-甲酸(56mg,0.41mmol)于DMF(8mL)中的混合物中逐滴添加DIPEA(177mg,1.37mmol),随后添加COMU(235mg,0.55mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着用EtOAc(10mL)和H2O(50mL)稀释。将水层与有机层分离并用EtOAc(3×10mL)萃取水层。将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到(1S,2S)-2-(二氟甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)环丙烷-1-甲酰胺(32mg,27%产率)和(1R,2R)-2-(二氟甲基)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)环丙烷-1-甲酰胺(31mg,27%产率),都呈固体状。LCMS(ESI):C44H56F2N8O5S的m/z[M+H]计算值846.4;实验值847.3;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.80(s,1H),8.46(dd,J=13.4,2.2Hz,2H),7.83(s,2H),7.73(dd,J=8.7,1.6Hz,1H),7.56(d,J=8.6Hz,1H),7.23(d,J=2.8Hz,1H),5.95(d,J=5.3Hz,1H),5.57(t,J=9.1Hz,1H),5.12(d,J=12.2Hz,1H),4.14(d,J=6.4Hz,5H),3.57(s,2H),3.21(s,4H),2.93(d,J=14.3Hz,2H),2.78-2.68(m,1H),2.67(p,J=1.9Hz,3H),2.46-2.28(m,3H),2.25(s,2H),2.17-1.92(m,2H),1.79(s,2H),1.66(dt,J=9.7,5.0Hz,1H),1.51(t,J=9.0Hz,1H),1.33(d,J=6.1Hz,4H),1.24(d,J=5.6Hz,2H),0.96(s,1H),0.95-0.72(m,6H),0.35(s,3H);以及LCMS(ESI):C44H56F2N8O5S的m/z[M+H]计算值846.4;实验值847.3;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.87(d,J=9.0Hz,1H),8.46(dd,J=11.3,2.2Hz,2H),7.80(s,2H),7.73(dd,J=8.7,1.6Hz,1H),7.56(d,J=8.7Hz,1H),7.23(d,J=2.9Hz,1H),6.09(d,J=5.1Hz,1H),5.94(d,J=5.1Hz,1H),5.80(d,J=5.2Hz,1H),5.59(t,J=9.1Hz,1H),5.13(d,J=12.2Hz,1H),4.50-4.06(m,5H),3.57(s,2H),3.21(s,4H),2.93(d,J=14.1Hz,2H),2.67(p,J=1.9Hz,4H),2.39-2.15(m,4H),2.17-1.82(m,2H),1.77(d,J=16.1Hz,2H),1.44(d,J=43.3Hz,1H),1.35-1.24(m,4H),1.15-0.91(m,2H),0.91(s,6H),0.34(s,3H)。
实施例A173.合成(2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,4-二甲基哌嗪-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020041
步骤1
在0℃下,向(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(80mg,0.11mmol)于DCM(6mL)中的混合物中添加吡啶(2mL),接着分数份添加氯甲酸4-硝基苯酯(55mg,0.28mmol)。将混合物升温至室温并在室温下搅拌1小时,接着用1M NaHSO4(10mL)和H2O(10mL)洗涤。减压浓缩有机层。得到呈固体状的((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸4-硝基苯酯(98mg,粗品)。LCMS(ESI):C46H55N9O8S的m/z[M+H]计算值893.4;实验值894.2。
步骤2
在0℃下,向((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸4-硝基苯酯(98mg,0.11mmol)和(S)-1,3-二甲基哌嗪(63mg,0.55mmol)于ACN(5mL)中的混合物中添加ACN(2mL)中的DIPEA(43mg,0.33mmol)。将粗产物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,4-二甲基哌嗪-1-甲酰胺(13mg,13%产率)。LCMS(ESI):C46H64N10O5S的m/z[M+H]计算值868.5;实验值869.3;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.47(s,2H),7.80(s,1H),7.73(s,1H),7.55(s,1H),7.23(s,1H),6.81-6.70(m,1H),5.33-5.25(m,1H),4.99(s,1H),4.40-3.97(m,6H),3.72(s,1H),3.61-3.47(m,3H),3.31-3.22(m,8H),3.02-2.72(m,5H),2.66(s,1H),2.60-2.51(m,3H),2.49-2.37(m,2H),2.35-2.13(m,6H),2.12-1.97(m,2H),1.95-1.66(m,3H),1.55(s,1H),1.33(s,3H),1.27-1.19(m,4H),0.99-0.82(m,6H),0.33(s,3H)。
实施例A225.合成(1S,2S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020051
步骤1
在N2气氛下,在0℃下向(2S,3S)-2-[双[(4-甲氧基苯基)甲基]氨基]-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-3-羟基丙酸乙酯(1.00g,1.9mmol)和Ag2O(4.33g,18.7mmol)于ACN(10mL)中的混合物中逐滴添加碘乙烷(2.91g,18.7mmol)。将混合物加热至80℃并搅拌4小时,接着过滤并用ACN(3×5mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S,3S)-2-[双[(4-甲氧基苯基)甲基]氨基]-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-3-乙氧基丙酸乙酯(557mg,53%产率)。LCMS(ESI):C26H31BrN2O5S的m/z[M+H]计算值562.1;实验值563.2。
步骤2
在N2气氛下,向40mL密封管中添加(2S,3S)-2-[双[(4-甲氧基苯基)甲基]氨基]-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-3-乙氧基丙酸乙酯(530mg)和TFA(10mL)。将混合物加热至80℃并搅拌过夜,接着减压浓缩,得到(2S,3S)-2-氨基-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-3-乙氧基丙酸乙酯,将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C10H15BrN2O3S的m/z[M+H]计算值322.0;实验值323.0。
步骤3
在45℃下,将(2S,3S)-2-氨基-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-3-乙氧基丙酸乙酯(890mg,2.8mmol)、LiOH.H2O(1.16g,27.6mmol)、MeOH(6mL)、THF(2mL)和H2O(2mL)的混合物搅拌2小时。将混合物减压浓缩,得到(2S,3S)-2-氨基-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-3-乙氧基丙酸,将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C8H11BrN2O3S的m/z[M+H]计算值294.0;实验值294.9。
步骤4
在0℃下,向(2S,3S)-2-氨基-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-3-乙氧基丙酸(890mg,3.0mmol)、NaHCO3(507mg,6.0mmol)和DMAP(37mg,0.3mmol)于THF/H2O(1:1)中的混合物中添加(Boc)2O(1.97g,9.0mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜,接着减压浓缩以去除THF,并用HCl将残余物酸化至约pH 6。用EtOAc(3×5mL)萃取混合物并将合并的有机层经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(2S,3S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-乙氧基丙酸(369mg,31%产率)。LCMS(ESI):C13H19BrN2O5S的m/z[M+H]计算值394.0;实验值395.0。
步骤5
在0℃下,向(S)-六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(584mg,0.91mmol)和(2S,3S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-乙氧基丙酸(360mg,0.91mmol)于DMF中的混合物中添加DIPEA(1.59mL,9.1mmol)和HATU(693mg,1.8mmol)。将混合物升温至室温并在室温下搅拌1小时,接着冷却至0℃并添加H2O。用EtOAc(2×5mL)萃取混合物并将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(410mg,46%产率)。LCMS(ESI):C47H66BBrN6O9S的m/z[M+H]计算值980.4;实验值981.3。
步骤6
在Ar气氛下,向50mL Schlenk管中添加(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(390mg,0.4mmol)、Pd(DTBpf)Cl2(78mg,0.12mmol)、K3PO4(211mg,1.0mmol)、甲苯(9mL)、1,4-二噁烷(3mL)和H2O(3mL)。将混合物加热至60℃并搅拌1小时,接着用EtOAc(3×15mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(96mg,31%产率)。LCMS(ESI):C41H54N6O7S的m/z[M+H]计算值774.4;实验值775.4。
步骤7
在室温下,将((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(92mg,0.12mmol)、HCl的1,4-二噁烷溶液(2.5mL)和1,4-二噁烷(2.5mL)的混合物搅拌1小时。将混合物减压浓缩,得到((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(100mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C36H46N6O5S的m/z[M+H]计算值674.3;实验值675.3。
步骤8
在0℃下,向((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(90mg,0.13mmol)和(1S,2S)-2-甲基环丙烷-1-甲酸(27mg,0.27mmol)于DMF中的混合物中添加DIPEA(172mg,1.3mmol)和HATU(101mg,0.27mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着冷却至0℃,添加H2O并用EtOAc(2×5mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1S,2S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺(21mg,21%产率)。LCMS(ESI):C41H52N6O6S的m/z[M+H]计算值756.4;实验值757.6;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.76(dd,J=4.8,1.7Hz,1H),8.50(s,1H),7.91(s,1H),7.84-7.71(m,3H),7.61-7.56(m,1H),7.55-7.50(m,1H),5.91-5.85(m,1H),5.20-5.14(m,1H),4.92(s,1H),4.36-4.21(m,3H),4.17-4.07(m,2H),3.68
-3.56(m 3H),3.54-3.46(m,1H),3.22(s,3H),2.90-2.73(m,2H),2.09
-2.03(m,1H),1.88-1.73(m,3H),1.55-1.43(m,1H),1.37(d,J=6.0Hz,3H),1.20(t,J=6.9Hz,3H),1.04(s,4H),0.93-0.71(m,7H),0.51(d,J=6.3Hz,1H),0.38(s,3H)。
实施例A227.合成(1R,2R,3S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020091
步骤1
在0℃下,向(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(126mg,0.20mmol)和(1R,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(34mg,0.30mmol)于DMF(5mL)中的混合物中添加DIPEA(129mg,1.0mmol)和COMU(171mg,0.4mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着用EtOAc(20mL)和H2O(20mL)稀释。用EtOAc(3×10mL)萃取水层并将合并的有机层用盐水(2×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1R,2R,3S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(29mg,25%产率)。LCMS(ESI):C40H50N6O5S的m/z[M+H]计算值726.4;实验值727.3;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.75(dd,J=4.8,1.7Hz,1H),8.49(d,J=1.6Hz,1H),8.40(d,J=9.0Hz,1H),7.82(s,3H),7.58(d,J=8.6Hz,1H),7.52(dd,J=7.7,4.7Hz,1H),5.56(t,J=9.0Hz,1H),5.07(d,J=12.2Hz,1H),4.44-3.99(m,5H),3.57(s,1H),3.25(s,1H),3.16(d,J=9.3Hz,3H),2.94(d,J=14.3Hz,1H),2.81-2.70(m,1H),2.67(p,J=1.9Hz,1H),2.44-2.27(m,1H),2.16-2.01(m,1H),1.78(s,2H),1.53(s,1H),1.37(d,J=6.0Hz,3H),1.26-1.13(m,3H),1.07(dd,J=9.4,5.4Hz,6H),0.93-0.77(m,6H),0.32(s,3H)。
下表化合物是使用前述方法或本领域技术人员所知的其变化形式制备。
表4:由本发明方法制备的示例性化合物
Figure BDA0004194083620020101
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Figure BDA0004194083620020111
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Figure BDA0004194083620020121
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Figure BDA0004194083620020131
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Figure BDA0004194083620020141
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Figure BDA0004194083620020152
下表化合物是使用前述方法或本领域技术人员所知的其变化形式,或者以下所描述的方法制备。
表5:由本发明方法制备的示例性化合物
Figure BDA0004194083620020151
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Figure BDA0004194083620020161
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Figure BDA0004194083620020171
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Figure BDA0004194083620020181
实施例A372.合成(1r,2R,3S)-N-((22R,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-22-(甲氧基甲基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020182
步骤1.
在N2气氛下,向(R)-2-氨基戊-4-烯酸甲酯(8.0g,36.5mmol)和(Z)-(2,3-二溴丙-1-烯-1-基)苯(15.1g,54.8mmol)于MECN(80mL)中的混合物中分数份添加Cs2CO3(35.7g,109.6mmol)和KI(12.13g,73.1mmol)。将混合物加热至80℃并搅拌过夜,接着过滤并用MeCN(3×20mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(R,Z)-2-((2-溴-3-苯基烯丙基)氨基)戊-4-烯酸甲酯(12.0g,91%产率)。LCMS(ESI):C15H18BrNO2的m/z[M+H]+计算值323.1;实验值324.1。
步骤2.
在N2气氛下,向(R,Z)-2-((2-溴-3-苯基烯丙基)氨基)戊-4-烯酸甲酯(12.0g,37.0mmol)和BnBr(12.66g,74.0mmol)于MeCN(120mL)中的混合物中分数份添加Cs2CO3(24.12g,74.0mmol)和KI(6.14g,37.0mmol)。在室温下,将混合物搅拌过夜,接着过滤并用MeCN(3×20mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(R,Z)-2-(苯甲基(2-溴-3-苯基烯丙基)氨基)戊-4-烯酸甲酯(6.0g,35%产率)。LCMS(ESI):C22H24BrNO2的m/z[M+H]+计算值415.1;实验值416.1[对于81Br]。
步骤3.
在Ar气氛下,向(R,Z)-2-(苯甲基(2-溴-3-苯基烯丙基)氨基)戊-4-烯酸甲酯(5.8g,14.0mmol)和[1,3-双(2,4,6-三甲基苯基)亚咪唑烷-2-基]二氯[[2-(丙-2-基氧基)苯基]亚甲基]钌(2.63g,4.2mmol)于甲苯(580mL)中的混合物中加热至60℃并搅拌30分钟。减压浓缩混合物并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈油状的(R)-1-苯甲基-5-溴-1,2,3,6-四氢吡啶-2-甲酸甲酯(3.7g,77%产率)。LCMS(ESI):C14H16BrNO2的m/z[M+H]+计算值309.0;实验值310.1。
步骤4.
在N2气氛下,在0℃下向(R)-1-苯甲基-5-溴-1,2,3,6-四氢吡啶-2-甲酸甲酯(3.7g,11.9mmol)和CaCl2(2.65g,23.9mmol)于EtOH(22mL)和THF(15mL)中的混合物中分数份添加NaBH4(1.80g,47.7mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着冷却至0℃,并添加MeOH和H2O。将混合物用DCM(2×50mL)萃取,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(R)-(1-苯甲基-5-溴-1,2,3,6-四氢吡啶-2-基)甲醇(2.8g,75%产率)。LCMS(ESI):C13H16BrNO的m/z[M+H]+计算值281.0;实验值282.3。
步骤5.
在0℃下,向(R)-(1-苯甲基-5-溴-1,2,3,6-四氢吡啶-2-基)甲醇(1.0g,3.5mmol)于THF(10mL)中的混合物中添加60% NaH于油中的分散液(0.26g,10.6mmol)。将混合物搅拌15分钟,接着添加MeI(0.75g,5.3mmol)并将混合物升温至室温并搅拌1小时。将混合物冷却至0℃,添加饱和NH4Cl并用EtOAc(2×20mL)萃取混合物。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(R)-1-苯甲基-5-溴-2-(甲氧基甲基)-1,2,3,6-四氢吡啶(1.0g,86%产率)。LCMS(ESI):C14H18BrNO的m/z[M+H]+计算值295.1;实验值296.2。
步骤6.
在N2气氛下,在室温下将(R)-1-苯甲基-5-溴-2-(甲氧基甲基)-1,2,3,6-四氢吡啶(1.0g,3.4mmol)和氯甲酸1-氯乙酯(2mL,14.0mmol)于DCM(10mL)中的混合物搅拌过夜。将混合物用盐水(2×10mL)洗涤并用DCM(10mL)萃取合并的水层。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液。将残余物溶解于MeOH(10mL)中,在N2气氛下将混合物加热至50℃并搅拌2小时,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈油状的(R)-5-溴-2-(甲氧基甲基)-1,2,3,6-四氢吡啶(500mg,72%产率)。LCMS(ESI):C7H12BrNO的m/z[M+H]+计算值205.0;实验值206.1。
步骤7.
在N2气氛下,将(R)-5-溴-2-(甲氧基甲基)-1,2,3,6-四氢吡啶(600mg,2.9mmol)和N-[(3S)-2-氧代氧杂环丁烷-3-基]氨基甲酸叔丁酯(382mg,2.0mmol)于MeCN(6mL)中的混合物搅拌过夜。将混合物减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(S)-3-((R)-5-溴-2-(甲氧基甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(500mg,39%产率)。LCMS(ESI):C15H25BrN2O5的m/z[M+H]+计算值392.1;实验值393.1。
步骤8.
在N2气氛下,向(S)-六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(1.25g,2.07mmol)和(S)-3-((R)-5-溴-2-(甲氧基甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(0.49g,1.24mmol)和DIPEA(2.67g,20.7mmol)于DMF(15mL)中的混合物中分数份添加HATU(0.79g,2.07mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着添加H2O并用EtOAc(50mL)萃取混合物。将有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-1-((S)-3-((R)-5-溴-2-(甲氧基甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(880mg,39%产率)。LCMS(ESI):C49H72BBrN6O9的m/z[M+H]+计算值980.5;实验值981.4[对于81Br]。
步骤9.
在N2气氛下,向(S)-1-((S)-3-((R)-5-溴-2-(甲氧基甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(850mg,0.87mmol)和K3PO4(460mg,2.17mmol)于甲苯(4.5mL)、1,4-二噁烷(1.5mL)和H2O(1.5mL)中的混合物中分数份添加Pd(dppf)Cl2(64mg,0.09mmol)。将混合物加热至70℃并在70℃搅拌3小时,接着减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((22R,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-22-(甲氧基甲基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(220mg,30%产率)。LCMS(ESI):C43H60N6O7的m/z[M+H]+计算值772.5;实验值773.4。
步骤10.
在室温下,将((22R,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-22-(甲氧基甲基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(100mg,0.13mmol)和HCl的1,4-二噁烷溶液(2mL)于DCM(2mL)中的混合物搅拌1小时。将混合物减压浓缩,得到呈固体状的(22R,63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-22-(甲氧基甲基)-10,10-二甲基-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(119mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。
步骤11.
向(22R,63S,4S)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-22-(甲氧基甲基)-10,10-二甲基-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(20mg,0.18mmol)、(1r,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷甲酸和DIPEA(114mg,0.89mmol)于DMF(2mL)中的混合物中分数份添加HATU(81mg,0.21mmol)。在室温下,将混合物搅拌1小时,接着通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((22R,63S,4S)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-22-(甲氧基甲基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(24mg,18%产率)。LCMS(ESI):C44H60N6O6的m/z[M+H]+计算值768.5;实验值769.2;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.90-8.65(m,1H),8.10-7.95(m,1H),7.90-7.75(m,1H),7.57-7.45(m,3H),7.40(s,1H),6.26(s,1H),5.65-5.50(m,1H),5.45-5.30(m,1H),4.39-4.25(m,1H),4.24-4.20(m,1H),4.19-4.10(m,1H),4.09-4.00(m,1H),3.88-3.76(m,1H),3.73-3.62(m,2H),3.62-3.55(m,2H),3.26(s,5H),3.14-3.00(m,2H),2.96-2.87(m,1H),2.79-2.70(m,5H),2.43(s,1H),2.15-2.06(m,2H),1.95-1.86(m,1H),1.86-1.72(m,1H),1.58-1.49(m,2H),1.40-1.30(m,3H),1.10-1.00(m,6H),0.99-0.90(m,6H),0.82(s,3H),0.52(s,3H)。
实施例A373.合成(1r,2R,3S)-N-((63S,4S,Z)-12-(5-(1-(2-(二甲基氨基)乙基)-4-羟基哌啶-4-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020241
步骤1.
在N2气氛下,在-78℃下向(S)-3-溴-5-碘-2-(1-甲氧基乙基)吡啶(5.0g,14.6mmol)于THF(40mL)中的混合物中逐滴添加n-BuLi的己烷溶液(5.85mL,14.6mmol)。在-78℃下,将混合物搅拌1小时,接着添加4-氧代哌啶-1-甲酸苯甲酯(6.82g,29.2mmol)。将混合物升温至0℃。添加饱和NH4Cl(3mL),将混合物用H2O(20mL)稀释并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-4-(5-溴-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-4-羟基哌啶-1-甲酸苯甲酯(800mg,12%产率)。LCMS(ESI):C21H25BrN2O4的m/z[M+H]+计算值448.1;实验值449.2。
步骤2.
在N2气氛下,向((63S,4S,Z)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-12-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(500mg,0.72mmol)和(S)-4-(5-溴-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-4-羟基哌啶-1-甲酸苯甲酯(648mg,1.4mmol)于甲苯(9mL)、H2O(3mL)和1,4-二噁烷(3mL)中的混合物中分数份添加K3PO4(459mg,2.16mmol)和Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(59mg,0.07mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌4小时,接着用H2O(10mL)稀释并用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的4-(5-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-4-羟基哌啶-1-甲酸苯甲酯(1.16g,75%产率)。LCMS(ESI):C50H61N7O9S的m/z[M+H]+计算值935.4;实验值936.4。
步骤3.
在0℃下,向4-(5-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-4-羟基哌啶-1-甲酸苯甲酯(1.1g,1.18mmol)和Cs2CO3(1.91g,5.88mmol)于DMF(15mL)中的混合物中逐滴添加碘乙烷(0.64g,4.1mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着用H2O(15mL)稀释并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的4-(5-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-4-羟基哌啶-1-甲酸苯甲酯(110mg,9%产率)。LCMS(ESI):C52H65N7O9S的m/z[M+H]+计算值963.5;实验值964.4。
步骤4.
在0℃下,向4-(5-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-4-羟基哌啶-1-甲酸苯甲酯(110mg,0.11mmol)于DCM(3mL)中的混合物中逐滴添加TFA(1mL)。将混合物升温至室温并搅拌1.5小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的4-(5-((63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-4-羟基哌啶-1-甲酸苯甲酯(120mg)。LCMS(ESI):C47H57N7O7S的m/z[M+H]+计算值863.4;实验值864.5。
步骤5.
在0℃下,向4-(5-((63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-4-羟基哌啶-1-甲酸苯甲酯(120mg,0.14mmol)和(1R,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(32mg,0.28mmol)于DMF(4mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(180mg,1.39mmol)和HATU(158mg,0.42mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着用H2O(10mL)稀释并用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过反相快速色谱法,用以下条件纯化:柱,C18硅胶;流动相:MECN/水(0.05% TFA),经300分钟0%至100%梯度;检测器:UV 254nm。得到呈褐色固体状的4-(5-((63S,4S,Z)-4-((1r,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-4-羟基哌啶-1-甲酸苯甲酯(120mg,89%产率)。LCMS(ESI):C53H65N7O8S的m/z[M+H]+计算值959.4;实验值960.4。
步骤6.
在H2气氛下,将4-(5-((63S,4S,Z)-4-((1r,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-4-羟基哌啶-1-甲酸苯甲酯(120mg,0.13mmol)和30% Pd(OH)2/碳(80mg,0.25mmol)于EtOAc(2mL)中的混合物搅拌过夜。过滤混合物,用MeOH(3×8mL)洗涤滤饼并将滤液减压浓缩,得到呈油状的(1r,2R,3S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(5-(4-羟基哌啶-4-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(45mg)。LCMS(ESI):C45H59N7O6S的m/z[M+H]+计算值825.4;实验值826.4。
步骤7.
在0℃下,向(1r,2R,3S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(5-(4-羟基哌啶-4-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(50mg,0.06mmol)和N-甲基-N-(2-氧代乙基)氨基甲酸叔丁酯(52mg,0.31mmol)于MeOH(2mL)中的混合物中分数份添加ZnCl2(83mg,0.61mmol)。将混合物升温至室温并搅拌30分钟,接着冷却至0℃并分数份添加NaBH3CN(11mg,0.18mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈黄色油状的(2-(4-(5-((63S,4S,Z)-4-((1r,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-4-羟基哌啶-1-基)乙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(30mg,50%产率)。LCMS(ESI):C53H74N8O8S的m/z[M+H]+计算值982.5;实验值983.6。
步骤8.
在0℃下,向(2-(4-(5-((63S,4S,Z)-4-((1r,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-4-羟基哌啶-1-基)乙基)(甲基)氨基甲酸叔丁酯(30mg,0.03mmol)于FA(1.5mL)中的混合物中添加Et3SiH(18mg,0.16mmol)。将混合物升温至室温并搅拌40分钟,接着减压浓缩,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(5-(4-羟基-1-(2-(甲基氨基)乙基)哌啶-4-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(25mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C48H66N8O6S的m/z[M+H]+计算值882.5;实验值883.6。
步骤9.
在0℃下,向(1r,2R,3S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(5-(4-羟基-1-(2-(甲基氨基)乙基)哌啶-4-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(30mg,0.03mmol)和甲醛(31mg,1.0mmol)于MeOH(3mL)中的混合物中分数份添加ZnCl2(46mg,0.34mmol)。将混合物升温至室温并搅拌30分钟,接着冷却至0℃并分数份添加NaBH3CN(6.4mg,0.10mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((63S,4S,Z)-12-(5-(1-(2-(二甲基氨基)乙基)-4-羟基哌啶-4-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(0.7mg,2%产率)。LCMS(ESI):C49H68N8O6S的m/z[M+H]+计算值896.5;实验值897.4;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.83(d,J=2.3Hz,1H),8.49(d,J=1.6Hz,1H),8.38(d,J=9.1Hz,2H),7.81(s,1H),7.78-7.68(m,2H),7.57(d,J=8.7Hz,1H),5.57(t,J=9.3Hz,1H),5.06(d,J=12.1Hz,1H),4.36-4.07(m,6H),3.56(s,2H),3.24(s,3H),3.18-3.11(m,1H),2.93(d,J=14.5Hz,1H),2.75-2.60(m,2H),2.43(d,J=11.4Hz,4H),2.37(s,2H),2.15(s,7H),2.02(d,J=16.7Hz,4H),1.78(s,2H),1.66(d,J=12.6Hz,2H),1.50(s,1H),1.36(d,J=6.1Hz,3H),1.24(s,1H),1.16(s,2H),1.15-0.93(m,6H),0.92-0.63(m,6H),0.31(s,3H)。
实施例A387.合成(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-(2,2-二氟乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020291
步骤1.
在N2气氛下,在室温下向(2S,3S)-2-(双(4-甲氧基苯甲基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-羟基丙酸乙酯(1.0g,1.9mmol)于MeCN(10mL)中的混合物中添加Ag2O(2.17g,9.4mmol)和烯丙基碘(1.57g,9.36mmol)。将所得混合物加热至60℃并搅拌16小时,接着过滤,并用EtOAc(3×20mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(2S,3S)-3-(烯丙基氧基)-2-(双(4-甲氧基苯甲基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酸乙酯(1.0g,93%产率)。LCMS(ESI):C27H31BrN2O5S的m/z[M+H]+计算值574.1和576.1;实验值575.1和577.1。
步骤2.
在0℃下,向(2S,3S)-3-(烯丙基氧基)-2-(双(4-甲氧基苯甲基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酸乙酯(1.0g,1.7mmol)于1,4-二噁烷(10mL)和H2O(10mL)中的混合物中添加2,6-二甲基吡啶(0.37g,3.48mmol)和K2OsO4·2H2O(0.03g,0.09mmol)。在0℃下,将混合物搅拌15分钟,接着分数份添加NaIO4(1.49g,6.95mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2.5小时,接着用H2O(50mL)稀释并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈油状的(2S,3S)-2-(双(4-甲氧基苯甲基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(2-氧代乙氧基)丙酸乙酯(1.2g),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C26H29BrN2O6S的m/z[M+H]+计算值576.1和578.1;实验值577.4和579.4。
步骤3.
在N2气氛下,在-15℃下向(2S,3S)-2-(双(4-甲氧基苯甲基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(2-氧代乙氧基)丙酸乙酯(1.2g,2.1mmol)于DCM(20mL)中的混合物中逐滴添加DAST(0.37g,2.3mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1.5小时,接着再冷却至0℃并且再逐滴添加DAST(0.37g,2.3mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着冷却至0℃并添加饱和NH4Cl(2mL)。将混合物用H2O(20mL)稀释并用DCM(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈油状的(2S,3S)-2-(双(4-甲氧基苯甲基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(2,2-二氟乙氧基)丙酸乙酯(270mg,22%产率)。LCMS(ESI):C26H29BrF2N2O5S的m/z[M+H]+计算值598.1和600.1;实验值599.1和601.1。
步骤4.
将(2S,3S)-2-(双(4-甲氧基苯甲基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(2,2-二氟乙氧基)丙酸乙酯(240mg,0.40mmol)于TFA(3mL)中的混合物加热至80℃并搅拌8小时,接着减压浓缩,得到呈油状的(2S,3S)-2-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(2,2-二氟乙氧基)丙酸乙酯(245mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C10H13BrF2N2O3S的m/z[M+H]+计算值358.0和360.0;实验值359.0和361.0。
步骤5.
向(2S,3S)-2-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(2,2-二氟乙氧基)丙酸乙酯(230mg,0.64mmol)和NaHCO3(108mg,1.29mmol)于H2O(0.9mL)和THF(3mL)中的混合物中添加(Boc)2O(147mg,0.67mmol)。在室温下,将混合物搅拌过夜,接着用H2O(10mL)稀释并用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(2,2-二氟乙氧基)丙酸乙酯(145mg,49%产率)。LCMS(ESI):C15H21BrF2N2O5S的m/z[M+H]+计算值458.0和460.0;实验值459.0和461.0。
步骤6.
在0℃下,向(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(2,2-二氟乙氧基)丙酸乙酯(140mg,0.31mmol)于THF(1.5mL)中的混合物中逐滴添加H2O(1.5mL)中的LiOH.H2O(64mg,1.53mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着用HCl水溶液酸化至约pH 5,接着用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈油状的(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(2,2-二氟乙氧基)丙酸(100mg)。LCMS(ESI):C13H17BrF2N2O5S的m/z[M+H]+计算值430.0和432.0;实验值431.0和433.0。
步骤7.
在N2气氛下,在0℃下向(S)-六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(134mg,0.22mmol)和NMM(335mg,3.32mmol)于DCM(6mL)中的混合物中添加(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(2,2-二氟乙氧基)丙酸(95mg,0.22mmol)以及HOBT(6mg,0.04mmol)和EDCI(85mg,0.44mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜,接着用H2O(10mL)稀释并用DCM(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(2,2-二氟乙氧基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(70mg,36%产率)。LCMS(ESI):C47H64BBrF2N6O9S的m/z[M+H]+计算值1016.4和1018.4;实验值1017.3和1019.4。
步骤8.
在N2气氛下,向(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(2,2-二氟乙氧基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(50mg,0.05mmol)和K3PO4(31mg,0.15mmol)于甲苯(3mL)、1,4-二噁烷(1mL)和H2O(1mL)中的混合物中分数份添加Pd(DtBPF)Cl2(13mg,0.02mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌1小时,接着用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的((63S,3S,4S,Z)-3-(2,2-二氟乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(27mg,59%产率)。LCMS(ESI):C41H52F2N6O7S的m/z[M+H]+计算值810.4;实验值811.4。
步骤9.
在0℃下,向((63S,3S,4S,Z)-3-(2,2-二氟乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(25mg,0.02mmol)于DCM(1.5mL)中的混合物中逐滴添加TFA(0.5mL)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-(2,2-二氟乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(25mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C36H44F2N6O5S的m/z[M+H]+计算值710.3;实验值711.3。
步骤10.
在N2气氛下,在0℃下向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-(2,2-二氟乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(25mg,0.04mmol)和(1r,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(6mg,0.05mmol)于DMF(1mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(45mg,0.35mmol)和HATU(27mg,0.07mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着添加H2O(10mL)并用EtOAc(3×10mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-(2,2-二氟乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(3.3mg,12%产率)。LCMS(ESI):C42H52F2N6O6S的m/z[M+H]+计算值806.4;实验值807.2;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.95-8.70(m,1H),8.50(s,1H),8.13(s,1H),7.95(s,1H),7.88-7.79(m,2H),7.76(d,J=8.6Hz,1H),7.59(d,J=8.7Hz,1H),7.54(dd,J=7.7,4.8Hz,1H),7.27-6.88(m,1H),6.36-6.04(m,1H),5.97(d,J=9.9Hz,1H),5.20(d,J=12.8Hz,2H),4.25(dd,J=20.3,10.5Hz,4H),4.14-3.92(m,2H),3.92-3.73(m,1H),3.59(q,J=10.9Hz,2H),3.20(s,3H),2.81(d,J=13.7Hz,2H),2.12-1.93(m,1H),1.78(d,J=23.7Hz,2H),1.59-1.45(m,2H),1.38(d,J=6.1Hz,3H),1.21(d,J=20.3Hz,1H),1.16-1.01(m,7H),0.95-0.73(m,6H),0.43(s,3H)。
实施例A389.合成(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((8S,9aS)-八氢吡啶并[2,1-c][1,4]噁嗪-8-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020351
步骤1.
在0℃下,向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((8S,9aS)-八氢吡啶并[2,1-c][1,4]噁嗪-8-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮盐酸盐(90mg,0.11mmol)和(1R,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(19mg,0.17mmol)于DMF(3mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(429mg,3.3mmol)和HATU(63mg,0.17mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着用H2O(10mL)稀释并用EtOAc(2×10mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,接着减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((8S,9aS)-八氢吡啶并[2,1-c][1,4]噁嗪-8-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(13.8mg,13%产率)。LCMS(ESI):C50H67N7O7S的m/z[M+H]+计算值909.5;实验值910.7;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.77(s,1H),8.50(s,1H),7.93(s,1H),7.83-7.51(m,4H),5.96-5.77(m,1H),5.17(d,J=11.5Hz,1H),4.92(s,1H),4.45-4.03(m,5H),3.57(ddd,J=34.6,24.2,13.9Hz,8H),3.23(d,J=8.3Hz,4H),3.08(d,J=10.4Hz,2H),2.84(d,J=45.9Hz,3H),2.67(s,2H),2.23(s,2H),2.17-2.01(m,7H),1.81(s,3H),1.53(s,4H),1.45-1.30(m,4H),1.24(s,1H),1.16(td,J=7.0,1.9Hz,4H),1.06(dd,J=12.1,5.1Hz,6H),0.97-0.76(m,8H),0.38(s,3H)。
实施例A390.合成(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((8R,9aS)-八氢吡啶并[2,1-c][1,4]噁嗪-8-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020361
步骤1.
在N2气氛下,在-10℃下向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((8R,9aS)-八氢吡啶并[2,1-c][1,4]噁嗪-8-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(100mg,0.12mmol)和(1R,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(21mg,0.18mmol)于DMF(3mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(476mg,3.7mmol)和HATU(56mg,0.15mmol,1.2当量)。在-10℃下,将混合物搅拌1.5小时,接着用盐水(5mL)稀释并用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((8R,9aS)-八氢吡啶并[2,1-c][1,4]噁嗪-8-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(22mg,20%产率)。LCMS(ESI):C50H67N7O7S的m/z[M+H]+计算值909.5;实验值910.7;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.65(d,J=2.1Hz,1H),8.49(s,1H),7.92(s,1H),7.74(d,J=8.5Hz,1H),7.68-7.54(m,3H),5.88(d,J=9.8Hz,1H),5.17(d,J=12.1Hz,1H),4.93(s,1H),4.36-3.99(m,5H),3.80-3.43(m,7H),3.24-3.05(m,4H),2.92-2.72(m,4H),2.70-2.59(m,1H),2.28-1.99(m,5H),1.89-1.59(m,6H),1.52(q,J=8.2,6.3Hz,2H),1.42-1.22(m,5H),1.20-0.99(m,12H),0.86(d,J=25.0Hz,7H),0.39(s,3H)。
实施例A391.合成(1r,2R,3S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020371
步骤1.
在30℃下,将4-(5-((63S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(150mg,0.16mmol)、三聚甲醛(36mg,0.81mmol)和30重量%Pd(OH)2/碳(151mg,0.32mmol)于MeOH(3mL)中的混合物氢化2小时。通过Celite垫过滤混合物并减压浓缩滤液,得到呈固体状的((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(134mg)。LCMS(ESI):C44H60N8O7的m/z[M+H]+计算值812.5;实验值813.4。
步骤2.
在0℃下,向((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(134mg,0.17mmol)于DCM(1.5mL)中的混合物中分数份添加TFA(1.50mL)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着减压浓缩,得到呈油状的(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(318mg)。LCMS(ESI):C39H52N8O5的m/z[M+H]+计算值712.4;实验值713.4。
步骤3.
在0℃下,向(63S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(130mg,0.18mmol)、(1R,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(42mg,0.36mmol)和DIPEA(236mg,1.8mmol)于DMF(2mL)中的混合物中分数份添加COMU(117mg,0.27mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((63S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(2,4)-噁唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(28mg,19%产率)。LCMS(ESI):C45H60N8O6的m/z[M+H]+计算值808.5;实验值809.8;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.66-8.45(m,2H),8.29(d,J=8.0Hz,1H),7.88(s,1H),7.74(d,J=9.4Hz,2H),7.30(s,1H),5.81(s,1H),5.00(d,J=11.7Hz,1H),4.53-4.06(m,5H),3.77-3.59(m,2H),3.34(s,4H),3.21(s,3H),3.05-2.61(m,5H),2.52(s,4H),2.28(s,3H),2.05(s,1H),1.83(s,1H),1.56(s,2H),1.48-1.32(m,3H),1.30-0.98(m,12H),0.93(s,3H),0.46(s,3H)。
实施例A396.合成(2S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-((R)-1-羟基乙基)氮杂环丁烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020391
步骤1.
在N2气氛下,在室温下向(S)-2-乙酰基氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(543mg,1.96mmol)于DCM(330mL)中的混合物中添加BH3-Me2S(2.48g,32.6mmol)。经10分钟向上述混合物中逐滴添加(2S)-2-乙酰基氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯[Org.Lett.2019,22,9981-9984–参见支持信息](2.6g,13.0mmol)。在室温下,将所得混合物再搅拌2小时。通过LCMS监测反应。在0℃下用MeOH淬灭反应并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-2-((R)-1-羟基乙基)氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(1.1g,42%产率)。LCMS(ESI):C6H11NO3的m/z[M-C4H8+H]+计算值145.1;实验值146.1。
步骤2.
在0℃下,向(S)-2-((R)-1-羟基乙基)氮杂环丁烷-1-甲酸叔丁酯(300mg,1.49mmol)于DCM(5mL)中的混合物中添加4M HCl的1,4-二噁烷溶液(5mL)。将混合物搅拌直至完成,接着减压浓缩,得到呈固体状的(R)-1-((S)-氮杂环丁烷-2-基)乙-1-醇(310mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C5H11NO的m/z[M+H]+计算值101.1;实验值102.2。
步骤3.
在0℃下,向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(150mg,0.19mmol)、吡啶(1mL)和DCM(2mL)的混合物中添加氯甲酸4-硝基苯酯(65mg,0.39mmol)。将混合物升温至室温并搅拌4小时,接着减压浓缩,得到呈油状的((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸4-硝基苯酯(粗品),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C48H59N9O9S的m/z[M+H]+计算值937.4;实验值938.3。
步骤4.
在0℃下,向((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸4-硝基苯酯(195mg,0.21mmol)和(R)-1-((S)-氮杂环丁烷-2-基)乙-1-醇(285mg,2.8mmol)于MeCN(2mL)中的混合物中逐滴添加DIPEA(403mg,3.1mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时。将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-((R)-1-羟基乙基)氮杂环丁烷-1-甲酰胺(4.8mg,3%)。LCMS(ESI):C47H65N9O7S的m/z[M+H]+计算值899.5;实验值900.9;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.52-8.45(m,2H),7.91(s,1H),7.76-7.72(m,1H),7.58-7.53(m,1H),7.22(s,1H),6.73-6.68(m,1H),5.54-5.50(m,1H),5.31-5.26(m,1H),5.16-5.12(m,1H),4.91(s,1H),4.30-4.24(m,3H),4.16-4.04(m,3H),3.84-3.67(m,2H),3.69-3.41(m,5H),3.28-3.23(m,4H),3.16(s,3H),2.84-2.79(m,2H),2.48-2.44(m,4H),2.23-2.21(m,4H),2.08-2.05(m,1H),1.93-1.89(m,1H),1.79-1.77(m,2H),1.54-1.52(m,1H),1.36-1.33(m,3H),1.26-1.16(m,4H),1.13-1.10(m,3H),1.00-0.73(m,6H),0.43(s,2H)。
实施例A441和实施例A424.合成(1R,2R,3S)-N-((23S,63S,4S)-11-乙基-23-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺和(1R,2R,3S)-N-((23R,63S,4S)-11-乙基-23-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020421
步骤1.
在0℃下,向1-苯甲基-3,5-二溴-1,2,3,6-四氢吡啶(40.0g,120.8mmol)于MeCN(900mL)和H2O(600mL)中的混合物中添加NH4HCO3(14.33g,181.2mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着减压浓缩并将残余物通过反相硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的1-苯甲基-5-溴-1,2,3,6-四氢吡啶-3-醇(16.0g,49%产率)。LCMS(ESI):C12H14BrNO的m/z[M+H]+计算值267.0;实验值268.1。
步骤2.
在N2气氛下,向1-苯甲基-5-溴-1,2,3,6-四氢吡啶-3-醇(15.0g,55.9mmol)于DCM(150mL)中的混合物中添加TBDPSCl(23.1g,83.9mmol)和咪唑(7.62g,111.9mmol),保持16小时。添加H2O并将混合物用EtOAc(3×300mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×300mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过反相硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的1-苯甲基-5-溴-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-1,2,3,6-四氢吡啶(15.0g,53%产率)。LCMS(ESI):C28H32BrNOSi的m/z[M+H]+计算值505.1;实验值506.2。
步骤3.
在0℃下,向1-苯甲基-5-溴-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-1,2,3,6-四氢吡啶(15.0g,29.6mmol)于DCM(150mL)中的混合物中添加氯甲酸2-氯乙酯(16.93g,118.5mmol)。将混合物升温至40℃并搅拌4小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(2×300mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×300mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物溶解于MeOH(150mL)中。将混合物加热至70℃并搅拌2小时,接着将合并的有机层用NaHCO3(2×300mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过反相硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的5-溴-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-1,2,3,6-四氢吡啶(9.0g,73%产率)。LCMS(ESI):C21H26BrNOSi的m/z[M+H]+计算值417.1;实验值418.0[对于81Br]。
步骤4.
在0℃下,向5-溴-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-1,2,3,6-四氢吡啶(6.0g,14.4mmol)于MeCN(60mL)和H2O(60mL)中的混合物中添加(S)-(2-氧代氧杂环丁烷-3-基)氨基甲酸叔丁酯(2.97g,15.9mmol)和Cs2CO3(11.74g,36.0mmol)。将混合物升温至40℃并搅拌16小时,接着用EtOAc(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×200mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过反相硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(2S)-3-(5-溴-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(4.0g,46%产率)。LCMS(ESI):C29H39BrN2O5Si的m/z[M+H]+计算值602.2;实验值603.1。
步骤5.
在0℃下,向(S)-六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(1.0g,1.7mmol)于DMF(10mL)中的混合物中添加DIPEA(1.07g,8.3mmol)、(2S)-3-(5-溴-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(749mg,1.24mmol)和HATU(1.26g,3.3mmol)。在0℃下,将混合物搅拌2小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(3×100mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈油状的(3S)-1-((2S)-3-(5-溴-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(1.2g,61%产率)。LCMS(ESI):C63H86BBrN6O9Si的m/z[M+H]+计算值1188.6;实验值1189.4。
步骤6.
向(3S)-1-((2S)-3-(5-溴-3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(1.2g,1.0mmol)于甲苯(30mL)、1,4-二噁烷(10mL)和H2O(10mL)中的混合物中添加K2CO3(418mg,3.0mmol)和Pd(dppf)Cl2(74mg,0.1mmol)。将混合物加热至65℃并搅拌2小时,接着用H2O稀释,并用EtOAc(2×100mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈油状的((63S,4S)-23-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(420mg,42%产率)。LCMS(ESI):C57H74N6O7Si的m/z[M+H]+计算值982.5;实验值984.1。
步骤7.
在0℃下,向((63S,4S)-23-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(420mg,0.43mmol)于DCM(10mL)中的混合物中添加ZnBr2(481mg,2.14mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着过滤,并用EtOAc(3×20mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到(63S,4S)-4-氨基-23-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(400mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C52H66N6O5Si的m/z[M+H]+计算值882.5;实验值883.6。
步骤8.
在0℃下,向(63S,4S)-4-氨基-23-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-5,7-二酮(380mg,0.43mmol)于DMF(4mL)中的混合物中添加DIPEA(556mg,4.3mmol)、(1R,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(74mg,0.65mmol)和HATU(327mg,0.86mmol)。在0℃下,将混合物搅拌2小时,接着用H2O稀释,并用EtOAc(3×50mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(1R,2R,3S)-N-((63S,4S)-23-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(190mg,45%产率)。LCMS(ESI):C58H74N6O6Si的m/z[M+H]+计算值978.5;实验值979.7。
步骤9.
在0℃下,向(1R,2R,3S)-N-((63S,4S)-23-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(190mg,0.19mmol)于THF(4mL)中的混合物中添加TBAF(811mg,3.1mmol)和AcOH(1mg,0.02mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用H2O稀释,并用EtOAc(3×50mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到(1R,2R,3S)-N-((23S,63S,4S)-11-乙基-23-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(26mg,13%产率)和(1R,2R,3S)-N-((23R,63S,4S)-11-乙基-23-羟基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-21,22,23,26,61,62,63,64,65,66-十氢-11H-8-氧杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂-2(5,1)-吡啶杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(11mg,8%产率),都呈固体状。LCMS(ESI):C42H56N6O6的m/z[M+H]+计算值740.4;实验值741.3;1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.76(dd,J=4.8,1.7Hz,1H),8.07(d,J=8.4Hz,1H),7.88(dd,J=7.8,1.8Hz,1H),7.61-7.55(m,1H),7.55-7.47(m,2H),7.42(s,1H),6.24(s,1H),5.66(d,J=12.2Hz,1H),5.59(t,J=9.1Hz,1H),4.91(d,J=6.7Hz,1H),4.40-4.26(m,2H),4.13(q,J=6.2Hz,1H),4.08-3.96(m,2H),3.88-3.78(m,1H),3.72(t,J=11.5Hz,1H),3.64(q,J=11.0Hz,2H),3.11(d,J=14.2Hz,1H),2.96(dt,J=14.4,7.1Hz,2H),2.80(d,J=23.8Hz,6H),2.15(t,J=9.5Hz,1H),2.06(d,J=8.6Hz,1H),1.94(d,J=11.0Hz,1H),1.84-1.73(m,1H),1.66-1.51(m,2H),1.41(d,J=6.2Hz,3H),1.24(s,1H),1.19-1.05(m,7H),1.05-0.96(m,6H),0.88(s,3H),0.48(s,3H);以及LCMS(ESI):C42H56N6O6的m/z[M+H]+计算值740.4;实验值741.4;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.76(dd,J=4.7,1.8Hz,1H),8.12(d,J=8.5Hz,1H),7.85(dd,J=7.8,1.7Hz,1H),7.51(q,J=4.5Hz,3H),7.45(s,1H),6.19(s,1H),5.70(t,J=8.7Hz,1H),5.49(s,1H),4.72(d,J=6.4Hz,1H),4.31(d,J=12.7Hz,1H),4.18(d,J=6.2Hz,2H),4.14-4.06(m,1H),3.99-3.68(m,3H),3.61(d,J=11.0Hz,1H),3.53(d,J=10.9Hz,1H),3.14(d,J=15.8Hz,1H),2.94(s,3H),2.92-2.83(m,2H),2.73(d,J=14.1Hz,3H),2.33(q,J=1.8Hz,1H),1.95(d,J=10.5Hz,1H),1.77(d,J=10.6Hz,1H),1.64-1.48(m,2H),1.40(d,J=6.2Hz,3H),1.24(s,1H),1.19-0.95(m,12H),0.85(s,1H),0.72(s,3H),0.58(s,3H)。
实施例A437.合成(2S,6S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,4,6-三甲基哌嗪-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020471
步骤1.
在0℃下,经2分钟向(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(2-氧代乙氧基)丙酸乙酯(0.31g,6.9mmol)和30%二甲胺的MeOH溶液(865mg,8.5mmol)于MeOH(20mL)中的混合物中添加NaBH3CN(1.08g,17.2mmol)。将混合物在室温下搅拌,接着用H2O(30mL)稀释并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用H2O(4×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)丙酸乙酯(1.2g,45%产率)。LCMS(ESI):C17H28BrN3O5S的m/z[M+H]+计算值467.1;实验值468.2。
步骤2.
在N2气氛下,在0℃下向(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)丙酸乙酯(1.25g,2.68mmol)于THF(9mL)中的混合物中逐滴添加1M LiOH(8.0mL,8.0mmol)。在0℃下,将混合物搅拌2小时,接着用1M HCl酸化至约pH 6,接着用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈油状的(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)丙酸(600mg,51%产率)。LCMS(ESI):C15H24BrN3O5S的m/z[M+H]+计算值439.1;实验值440.3[对于81Br]。
步骤3.
在N2气氛下,在0℃下将(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)丙酸(570mg,1.3mmol)、(3S)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸2-{[(2M)-1-乙基-2-{2-[(1S)-1-甲氧基乙基]吡啶-3-基}-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-3-基]甲基}-2-甲基丙酯(1.18g,1.95mmol)和DIPEA(5.04g,39.0mmol)于MECN(6mL)中的混合物搅拌5分钟,接着经2分钟分数份添加HATU(593mg,1.56mmol)。将混合物升温至室温并搅拌4小时,接着用H2O(30mL)稀释并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用H2O(3×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(580mg,44%产率)。LCMS(ESI):C49H71BBrN7O9S的m/z[M+H]+计算值1025.4;实验值1026.5[对于81Br]。
步骤4.
在Ar气氛下,向(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(580mg,0.57mmol)和K3PO4(300mg,1.42mmol)于甲苯(6mL)、1,4-二噁烷(2mL)和H2O(2mL)中的混合物中添加Pd(dtbpf)Cl2。将混合物加热至60℃并搅拌4小时,接着用H2O(30mL)稀释,并用EtOAc(3×30mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(2S,6S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,4,6-三甲基哌嗪-1-甲酰胺(230mg,50%产率)。LCMS(ESI):C43H59N7O7S的m/z[M+H]+计算值817.4;实验值818.4。
步骤5.
在N2气氛下,在0℃下向((63S,3S,4S,Z)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(230mg,0.28mmol)于DCM(3mL)中的混合物中添加HCl的1,4-二噁烷溶液(1mL)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着减压浓缩,将甲苯(30mL)添加至残余物中,并减压浓缩混合物,得到呈固体状的(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(200mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C38H51N7O5S的m/z[M+H]+计算值717.4;实验值718.7。
步骤6.
在0℃下,经1分钟向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(200mg,0.28mmol)于THF(2mL)中的混合物中逐滴添加NEt3(85mg,0.84mmol)。在0℃下,将混合物搅拌5分钟,接着经1分钟添加氯甲酸4-硝基苯酯(56mg,0.28mmol)。将混合物升温至室温并搅拌4小时并减压浓缩混合物,得到呈固体状的((63S,3S,4S,Z)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸4-硝基苯酯(250mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。
步骤7.
在0℃下,向((63S,3S,4S,Z)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸4-硝基苯酯(200mg,0.23mmol)于MeCN(2mL)中的混合物中逐滴添加DIPEA(88mg,0.68mmol)。在0℃下,将混合物搅拌2分钟,接着逐滴添加(3S,5S)-3,5-二甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(97mg,0.45mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜,接着用H2O(3mL)稀释,并用EtOAc(3×10mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(3S,5S)-4-(((63S,3S,4S,Z)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨甲酰基)-3,5-二甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(50mg,23%产率)。LCMS(ESI):C50H71N9O8S的m/z[M+H]+计算值957.5;实验值958.9。
步骤8.
在N2气氛下,在0℃下向(3S,5S)-4-(((63S,3S,4S,Z)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨甲酰基)-3,5-二甲基哌嗪-1-甲酸叔丁酯(50mg,0.05mmol)于DCM(3mL)中的混合物中逐滴添加HCl的1,4-二噁烷溶液(1mL)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着减压浓缩,将甲苯(30mL)添加至残余物中并减压浓缩混合物,得到呈固体状的(2S,6S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,6-二甲基哌嗪-1-甲酰胺(50mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。
步骤9.
在0℃下,向(2S,6S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,6-二甲基哌嗪-1-甲酰胺(40mg,0.05mmol)和MeOH中的混合物中分数份添加三聚甲醛(11mg,0.24mmol),随后分数份添加NaBH3CN(4.4mg,0.07mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜,接着用H2O(5mL)稀释并用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用H2O(3×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2S,6S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-(2-(二甲基氨基)乙氧基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,4,6-三甲基哌嗪-1-甲酰胺(3.3mg,8%产率)。LCMS(ESI):C46H65N9O6S的m/z[M+H]+计算值871.5;实验值872.3;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.74-8.64(dd,J=4.7,1.6Hz,1H),8.49-8.36(s,1H),7.91-7.81(s,1H),7.79-7.71(d,J=7.7Hz,1H),7.71-7.63(d,J=8.6Hz,1H),7.56-7.47(s,1H),7.47-7.36(dd,J=7.7,4.7Hz,1H),6.32-6.21(d,J=9.9Hz,1H),5.55-5.46(s,1H),5.19-5.11(s,1H),5.04-4.97(s,1H),4.45-3.94(m,6H),3.67-3.36(m,11H),3.23(s,3H),3.11(s,3H),2.78-2.75(m,2H),2.40-2.34(m,3H),2.15(s,6H),2.11-2.04(m,6H),1.75(s,2H),1.59-1.41(m,1H),1.30(d,J=6.0Hz,3H),1.13(s,1H),1.12(d,J=6.1Hz,6H),0.80(d,J=28.4Hz,6H),0.57-0.12(s,3H)。
实施例A438.合成(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020531
步骤1.
在N2气氛下,向5-溴-3-{3-[(叔丁基二苯基硅烷基)氧基]-2,2-二甲基丙基}-2-碘-1H-吲哚(22.0g,34.0mmol)和4-[6-(甲氧基甲基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-3-基]哌嗪-1-甲酸苯甲酯(19.1g,40.8mmol)于1,4-二噁烷(400mL)和H2O(80mL)中的混合物中分数份添加Pd(dppf)Cl2(2.49g,3.4mmol)和K2CO3(11.76g,85.1mmol)。将混合物加热至70℃并搅拌16小时,接着添加H2O,并用EtOAc(3×200mL)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(20g,67%产率)。LCMS(ESI):C49H57BrN4O4Si的m/z[M+H]+计算值874.3;实验值875.5。
步骤2.
在N2气氛下,向(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(23.0g,26.3mmol)和4-甲基苯磺酸2-异丙氧基乙酯(13.6g,52.6mmol)于DMF(300mL)中的混合物中分数份添加Cs2CO3(25.72g,79.0mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌2,接着用盐水(100mL)稀释并用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×200mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-(2-异丙氧基乙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(19.2g,76%产率)。LCMS(ESI):C54H67BrN4O5Si的m/z[M+H]+计算值960.4;实验值961.4[对于81Br]。
步骤3.
在N2气氛下,在0℃下向(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-(2-异丙氧基乙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(3.0g,3.1mmol)于THF(30mL)中的混合物中分数份添加1M TBAF的THF溶液(15.6mL,15.6mmol)。将混合物加热至45℃并搅拌过夜,接着用盐水(30mL)稀释并用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1-(2-异丙氧基乙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.19g,53%产率)。LCMS(ESI):C38H49BrN4O5的m/z[M+H]+计算值720.3;实验值721.3。
步骤4.
在N2气氛下,向(S)-4-(5-(5-溴-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1-(2-异丙氧基乙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.09g,1.51mmol)和双(频哪醇合)二硼(0.58g,2.27mmol)于甲苯(11mL)中的混合物中分数份添加Pd(dppf)Cl2(0.11g,0.15mmol)和KOAc(0.37g,3.78mmol)。将混合物加热至80℃并搅拌2小时,接着用盐水(10mL)稀释并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-4-(5-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.0g,86%产率)。LCMS(ESI):C44H61BN4O7的m/z[M+H]+计算值768.5;实验值769.7。
步骤5.
在N2气氛下,在0℃下向(S)-4-(5-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.0g,1.3mmol)和(3S)-1,2-双(叔丁氧基羰基)-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(0.64g,2.0mmol)于DCM(10mL)中的混合物中分数份添加DMAP(0.24g,2.0mmol)和DCC(0.40g,2.0mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜,接着用盐水(20mL)稀释并用DCM(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-(3-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯1,2-二叔丁酯(1.08g,77%产率)。LCMS(ESI):C59H85BN6O12的m/z[M+H]+计算值1080.6;实验值1081.7。
步骤6.
在N2气氛下,在0℃下向(S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-(3-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯1,2-二叔丁酯(1.0g,0.9mmol)于DCM(3mL)中的混合物中分数份添加HCl的1,4-二噁烷溶液(9mL)。将混合物升温至室温并搅拌6小时,接着用甲苯(30mL)稀释并减压浓缩,得到呈固体状的(S)-六氢哒嗪-3-甲酸3-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯双盐酸盐(1.0g)。LCMS(ESI):C49H69BN6O8的m/z[M+H]+计算值880.5;实验值881.5。
步骤7.
在N2气氛下,在0℃下向(S)-六氢哒嗪-3-甲酸3-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯双盐酸盐(1.0g,1.1mmol)和(2S,3S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-乙氧基丙酸(0.54g,1.36mmol)于DMF(10mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(4.40g,34.1mmol)和(Z)-(氰基({[(二甲基亚胺离子)(吗啉-4-基)甲氧基]亚胺基})甲酸乙酯)六氟磷酸盐(0.53g,1.3mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着用盐水(30mL)稀释并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(1.0g,70%产率)。LCMS(ESI):C62H86BBrN8O12S的m/z[M+H]+计算值1258.5;实验值1259.5。
步骤8.
在N2气氛下,向(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(1.0g,0.8mmol)于甲苯(30mL)、1,4-二噁烷(10mL)和H2O(10mL)中的混合物中分数份添加Pd(dtbpf)Cl2(0.16g,0.24mmol)和K3PO4(0.42g,2.0mmol)。将混合物加热至65℃并搅拌2小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的4-(5-((63S,3S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(370mg,44%产率)。LCMS(ESI):C56H74N8O10S的m/z[M+H]+计算值1050.5;实验值1051.9。
步骤9.
向4-(5-((63S,3S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(340mg,0.32mmol)于MeOH(5mL)中的混合物中分数份添加三聚甲醛(49mg,1.6mmol)和Pd/C(34mg,0.32mmol)。在H2气氛下,将混合物搅拌过夜,接着通过Celite垫过滤并用MeOH(3×20mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(240mg,80%产率)。LCMS(ESI):C49H70N8O8S的m/z[M+H]+计算值930.5;实验值931.5。
步骤10.
在N2气氛下,在0℃下向((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(240mg,0.26mmol)于DCM(2mL)中的混合物中分数份添加HCl的1,4-二噁烷溶液(6mL)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着用甲苯(20mL)稀释并减压浓缩,得到呈固体状的(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮盐酸盐(240mg)。LCMS(ESI):C44H62N8O6S的m/z[M+H]+计算值830.5;实验值831.4。
步骤11.
在N2气氛下,在0℃下向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮盐酸盐(100mg,0.12mmol)和(1R,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(21mg,0.18mmol)于DMF(5mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(467mg,3.6mmol)和(Z)-(氰基({[(二甲基亚胺离子)(吗啉-4-基)甲氧基]亚胺基})甲酸乙酯)六氟磷酸盐(62mg,0.14mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着用盐水(5mL)稀释并用EtOAc(3×5mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×15mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过纯化,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(38mg,34%产率)。LCMS(ESI):C50H70N8O7S的m/z[M+H]+计算值926.5;实验值927.5;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.52-8.42(m,2H),7.91(s,1H),7.72(dd,J=8.5,1.6Hz,1H),7.61(dd,J=18.7,9.2Hz,2H),7.21(d,J=2.9Hz,1H),5.88(d,J=9.8Hz,1H),5.19(d,J=12.2Hz,1H),4.92(s,1H),4.41-4.02(m,5H),3.73-3.47(m,4H),3.25(q,J=4.1,2.7Hz,8H),3.13(s,3H),2.78(t,J=11.3Hz,2H),2.49-2.39(m,6H),2.22(s,4H),2.11-1.96(m,1H),1.78(d,J=29.7Hz,3H),1.51(s,3H),1.32(d,J=6.1Hz,4H),1.24(d,J=2.8Hz,1H),1.20-0.97(m,12H),0.84(dd,J=23.4,6.0Hz,10H),0.44(s,3H)。
实施例A449.合成(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(1-(氧杂环丁烷-3-基)哌啶-4-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020591
步骤1.
在室温下,将(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酸(1.11g,7.7mmol)和DIPEA(4.95g,38.3mmol)于DMF(20mL)中的混合物搅拌5分钟,接着添加(2S,3S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-乙氧基丙酸(1.52g,3.8mmol)和HATU(2.91g,7.7mmol)。当LCMS确定反应完成时,将其冷却至0℃,用H2O稀释并用EtOAc(50mL)萃取。将有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(1.56g,78%产率)。LCMS(ESI):C19H29BrN4O6S的m/z[M+H]+计算值522.1;实验值523.1[对于81Br]。
步骤2.
在室温下,将(3S)-1-[(2S,3S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-乙氧基丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸甲酯(1.56g,3.0mmol)、LiOH.H2O(0.63g,15.0mmol)、THF(5mL)和H2O(5mL)的混合物搅拌直至LCMS确定完成。用1N HCl将混合物酸化至约pH7,用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,并减压浓缩滤液,得到(3S)-1-[(2S,3S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-乙氧基丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(1.3g),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C19H29BrN4O6S的m/z[M+H]+计算值506.1;实验值507.1。
步骤3.
在室温下,将(3S)-1-[(2S,3S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-乙氧基丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-甲酸(600mg,1.18mmol)、(5M)-5-[1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-2-基]-6-[(1S)-1-甲氧基乙基]-3',6'-二氢-2'H-[3,4'-联吡啶]-1'-甲酸苯甲酯(754mg,1.1mmol)、DMAP(29mg,0.24mmol)、DCC(488mg,2.37mmol)和DCM(15mL)的混合物搅拌直至LCMS确定完成。将混合物用DCM(100mL)稀释并用H2O(100mL)洗涤,接着用DCM(3×100mL)萃取水层。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(5M)-5-(3-{3-[(3S)-1-[(2S,3S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-乙氧基丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-羰基氧基]-2,2-二甲基丙基}-1-乙基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-2-基)-6-[(1S)-1-甲氧基乙基]-3',6'-二氢-2'H-[3,4'-联吡啶]-1'-甲酸苯甲酯(735mg,52%产率)。LCMS(ESI):C60H79BBrN7O11S的m/z[M+H]+计算值1195.5;实验值1196.4。
步骤4.
在N2气氛下,将(5M)-5-(3-{3-[(3S)-1-[(2S,3S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-乙氧基丙酰基]-1,2-二氮杂环己烷-3-羰基氧基]-2,2-二甲基丙基}-1-乙基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吲哚-2-基)-6-[(1S)-1-甲氧基乙基]-3',6'-二氢-2'H-[3,4'-联吡啶]-1'-甲酸苯甲酯(725mg,0.61mmol)、K3PO4(322mg,1.52mmol)、Pd(DtBPF)Cl2(79mg,0.12mmol)、甲苯(9mL)、1,4-二噁烷(3mL)和H2O(3mL)的混合物加热至70℃并在70℃下搅拌1小时。将混合物用H2O(50mL)稀释并用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的5-((63S,3S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)-3',6'-二氢-[3,4'-联吡啶]-1'(2'H)-甲酸苯甲酯(233mg,39%产率)。LCMS(ESI):C54H67N7O9S的m/z[M+H]+计算值989.5;实验值990.6。
步骤5.
在H2气氛下,将5-((63S,3S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)-3',6'-二氢-[3,4'-联吡啶]-1'(2'H)-甲酸苯甲酯(223mg,0.23mmol)和Pd(OH)2/C(200mg,1.4mmol)于MeOH(2mL)中的混合物搅拌直至LCMS确定完成。将混合物过滤,并用MeOH(3×20mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到呈固体状的((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌啶-4-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(192mg),将其不经进一步纯化即用于下一步骤中。LCMS(ESI):C46H63N7O7S的m/z[M+H]+计算值875.5;实验值858.4。
步骤6.
在室温下,将((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(哌啶-4-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(80mg,0.09mmol)、3-氧杂环丁酮(134mg,1.86mmol)、AcOH(56mg,0.93mmol)和NaBH3CN(59mg,0.93mmol)于iPrOH(2mL)中的混合物搅拌直至LCMS确定完成。将混合物冷却至0℃,用饱和NaHCO3淬灭并用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(1-(氧杂环丁烷-3-基)哌啶-4-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(30mg,35%产率)。LCMS(ESI):C49H67N7O8S的m/z[M+H]+计算值913.5;实验值914.4。
步骤7.
在室温下,将((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(1-(氧杂环丁烷-3-基)哌啶-4-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(40mg,0.05mmol)、ZnBr2(55mg,0.24mmol)和DCM(1mL)的混合物搅拌直至LCMS确定完成。将混合物过滤,用DCM(3×10mL)洗涤滤饼,并减压浓缩滤液,得到呈油状的(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(1-(氧杂环丁烷-3-基)哌啶-4-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(粗品),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C44H59N7O6S的m/z[M+H]+计算值813.4;实验值814.8。
步骤8.
在室温下,向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(1-(氧杂环丁烷-3-基)哌啶-4-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(40mg,0.05mmol)于DMF(2mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(64mg,0.49mmol)、(1R,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(6mg,0.05mmol)和HATU(37mg,0.1mmol)。将混合物搅拌直至LCMS确定完成。将混合物用H2O(10mL)稀释,用EtOAc(50mL)萃取,将有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(1-(氧杂环丁烷-3-基)哌啶-4-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(3.5mg,8%产率)。LCMS(ESI):C50H67N7O7S的m/z[M+H]+计算值909.5;实验值910.8;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.66 -8.52(m,2H),7.82-7.72(m,2H),7.67(s,1H),7.53-7.44(m,1H),5.99(s,1H),4.78-4.68(m,4H),4.71-4.54(m,10H),4.48-4.39(m,1H),4.36-4.02(m,4H),3.75-3.68(m,1H),3.68-3.64(m,3H),3.02-2.97(m,3H),2.91-2.80(m,2H),2.65-2.63(m,1H),2.24-2.12(m,3H),2.03-2.00(m,4H),1.93-1.72(m,3H),1.69-1.55(m,1H),1.47-1.23(m,6H),1.16-1.13(m,5H),1.06-0.85(m,5H),0.50(s,3H)。
实施例A451.合成(1S,2S)-N-((63S,3S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-3-((1-甲基哌啶-4-基)甲氧基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020641
步骤1.
向1,2,3,6-四氢吡啶-4-甲酸甲酯(10.0g,70.8mmol)和NaHCO3(29.75g,354.2mmol)于THF(50mL)和H2O(50mL)中的混合物中分数份添加CbzOSu(26.48g,106.3mmol)。在室温下,将混合物搅拌2小时,接着用H2O(3×100mL)洗涤并合并用EtOAc(3×100mL)萃取水层。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的3,6-二氢吡啶-1,4(2H)-二甲酸1-苯甲酯4-甲酯。LCMS(ESI):C15H17NO4的m/z[M+H]+计算值275.1;实验值276.1。
步骤2.
在N2气氛下,在-20℃下向3,6-二氢吡啶-1,4(2H)-二甲酸1-苯甲酯4-甲酯(8.0g,29.1mmol)于THF中的混合物中逐滴添加DIBAL-H(80mL,80mmol)。在-20℃下,将混合物搅拌2小时,接着升温至室温并用饱和NH4Cl淬灭。用EtOAc(2×100mL)萃取水层并将合并的有机层减压浓缩。将残余物通过反相硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的4-(羟基甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸苯甲酯(2.3g,32%产率)。LCMS(ESI):C14H17NO3的m/z[M+H]+计算值247.1;实验值248.2。
步骤3.
在0℃下,向4-(羟基甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸苯甲酯(2.3g,9.3mmol)和PPh3(2.93g,11.2mmol)于DCM中的混合物中逐滴添加CBr4(3.70g,11.2mmol)。在室温下,将混合物搅拌直至完成,接着用饱和NH4Cl淬灭。用EtOAc(2×30mL)萃取水层,将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的4-(溴甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸苯甲酯(2.1g,73%产率)。LCMS(ESI):C14H16BrNO2的m/z[M+H]+计算值309.0;实验值310.0。
步骤4.
在0℃下,向(S)-(4-溴噻唑-2-基)((2S,5R)-3,6-二乙氧基-5-异丙基-2,5-二氢吡嗪-2-基)甲醇(1.37g,3.39mmol)于DMF(20mL)中的混合物中分数份添加NaH(0.16g,6.78mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着添加4-(溴甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸苯甲酯(2.10g,6.78mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着用饱和NH4Cl(100mL)稀释,并用EtOAc(2×30mL)萃取混合物。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的4-(((S)-(4-溴噻唑-2-基)((2S,5R)-3,6-二乙氧基-5-异丙基-2,5-二氢吡嗪-2-基)甲氧基)甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸苯甲酯(1.75g,82%产率)。LCMS(ESI):C29H27BrN4O5S的m/z[M+H]+计算值632.2;实验值633.2。
步骤5.
在0℃下,向4-(((S)-(4-溴噻唑-2-基)((2S,5R)-3,6-二乙氧基-5-异丙基-2,5-二氢吡嗪-2-基)甲氧基)甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸苯甲酯(1.75g,2.76mmol)于THF(40mL)和MECN(16mL)中的混合物中逐滴添加0.02M HCl(35mL,0.7mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜,接着用饱和NaHCO3淬灭并用EtOAc(2×100mL)萃取。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的4-(((1S,2S)-2-氨基-1-(4-溴噻唑-2-基)-3-乙氧基-3-氧代丙氧基)甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸苯甲酯(1.15g,79%产率)。LCMS(ESI):C22H26BrN3O5S的m/z[M+H]+计算值523.1;实验值524.2。
步骤6.
在室温下,将4-(((1S,2S)-2-氨基-1-(4-溴噻唑-2-基)-3-乙氧基-3-氧代丙氧基)甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸苯甲酯(1.15g,2.19mmol)和LiOH(0.21g,8.77mmol)于THF(50mL)和H2O(50mL)中的混合物搅拌1小时,接着用1M HCl酸化至约pH 4。接着,将混合物不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C20H22BrN3O5S的m/z[M+H]+计算值497.0;实验值497.9[对于81Br]。
步骤7.
向上述混合物中添加NaHCO3(0.97g,11.59mmol)和(Boc)2O(1.01g,4.63mmol)。在室温下,将混合物搅拌过夜,接着用DCM(3×20mL)萃取。用1M HCl将水层酸化至约pH 4并用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层减压浓缩,得到呈油状的(2S,3S)-3-((1-((苯甲氧基)羰基)-1,2,3,6-四氢吡啶-4-基)甲氧基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(1.1g,79%产率)。LCMS(ESI):C25H30BrN3O7S的m/z[M+H]+计算值597.1;实验值598.0[对于81Br]。
步骤8.
向(S)-六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(1.5g,2.5mmol)和(2S,3S)-3-((1-((苯甲氧基)羰基)-1,2,3,6-四氢吡啶-4-基)甲氧基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酸(1.48g,2.5mmol)于DMF中的混合物中分数份添加DIPEA(3.21g,24.8mmol)和HATU(1.89g,4.96mmol)。在室温下,将混合物搅拌2小时,接着用H2O(3×30mL)洗涤。将合并的水层用EtOAc(3×30mL)萃取,将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-1-((2S,3S)-3-((1-((苯甲氧基)羰基)-1,2,3,6-四氢吡啶-4-基)甲氧基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(1.0g,34%产率)。LCMS(ESI):C59H77BBrN7O11S的m/z[M+H]+计算值1183.5;实验值1184.3[对于81Br]。
步骤9.
在N2气氛下,向(S)-1-((2S,3S)-3-((1-((苯甲氧基)羰基)-1,2,3,6-四氢吡啶-4-基)甲氧基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(1.0g,0.85mmol)和K3PO4(0.45g,2.11mmol)于甲苯、二噁烷和H2O中的混合物中分数份添加Pd(dtbpf)Cl2(0.11g,0.17mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌2小时,接着用H2O(3×30mL)洗涤并用EtOAc(3×30mL)萃取合并的水层。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的4-((((63S,3S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-3-基)氧基)甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸苯甲酯(260mg,32%产率)。LCMS(ESI):C53H65N7O9S的m/z[M+H]+计算值975.5;实验值976.6。
步骤10.
在H2(气球)气氛下,在室温下将4-((((63S,3S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-3-基)氧基)甲基)-3,6-二氢吡啶-1(2H)-甲酸苯甲酯(260mg,0.27mmol)和20% Pd(OH)2/碳(0.26g)于MeOH(3mL)中的混合物搅拌1小时。将混合物通过Celite垫过滤并减压浓缩滤液,得到呈油状的((63S,3S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-3-(哌啶-4-基甲氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(230mg,72%产率)。LCMS(ESI):C45H61N7O7S的m/z[M+H]+计算值843.4;实验值844.3。
步骤11.
向((63S,3S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-3-(哌啶-4-基甲氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(230mg,0.27mmol)和AcOH(49mg,0.82mmol)于MeOH中的混合物中分数份添加三聚甲醛(49mg,1.6mmol)和NaBH3CN(86mg,1.36mmol)。在室温下,将混合物搅拌2小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的((63S,3S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-3-((1-甲基哌啶-4-基)甲氧基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(280mg,81%产率)。LCMS(ESI):C46H63N7O7S的m/z[M+H]+计算值857.5;实验值858.4。
步骤12.
在室温下,将((63S,3S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-3-((1-甲基哌啶-4-基)甲氧基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(280mg,0.33mmol)和HCl的1,4-二噁烷溶液(3mL)于1,4-二噁烷中的混合物搅拌1小时。将混合物减压浓缩,得到呈油状的(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-3-((1-甲基哌啶-4-基)甲氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮。LCMS(ESI):C41H55N7O5S的m/z[M+H]+计算值757.4;实验值758.5。
步骤13.
向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-3-((1-甲基哌啶-4-基)甲氧基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(265mg,0.35mmol)和(1S,2S)-2-甲基环丙烷-1-甲酸(35mg,0.35mmol)于DMF中的混合物中分数份添加DIPEA(904mg,7.0mmol)。在室温下,将混合物搅拌2小时,接着用H2O(3×20mL)洗涤。将合并的水层用EtOAc(2×20mL)萃取并将合并的有机层减压浓缩,并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(1S,2S)-N-((63S,3S,4S,Z)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-3-((1-甲基哌啶-4-基)甲氧基)-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺(24mg,8%产率)。LCMS(ESI):C46H61N7O6S的m/z[M+H]+计算值839.4;实验值840.4;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.83-8.64(m,1H),8.56-8.43(m,1H),8.00-7.89(m,1H),7.81-7.73(m,3H),7.63-7.53(m,2H),5.93-5.85(m,1H),5.20-5.12(m,1H),4.90(s,1H),4.32-4.13(m,5H),3.68-3.60(m,2H),3.26-3.22(m,5H),2.95-2.83(m,1H),2.79-2.72(m,3H),2.49-2.46(m,1H),2.20-2.10(s,3H),2.09-2.01(m,1H),1.93-1.72(m,6H),1.70-1.45(m,3H),1.41-1.30(m,3H),1.21-0.99(m,7H),0.98-0.87(m,8H),0.60-0.50(m,1H),0.35(s,3H)。
实施例A457.合成(1r,2R,3S)-N-((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020701
步骤1.
在N2气氛下,在0℃下向(S)-5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1H-吲哚(3.0g,4.6mmol)和4-甲基苯磺酸2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙酯(2.06g,6.9mmol)于DMF(20mL)中的混合物中分数份添加Cs2CO3(3.73g,11.4mmol)。将混合物加热至65℃并搅拌过夜,接着用H2O(50mL)稀释并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-1H-吲哚(2.3g,64%产率)。LCMS(ESI):C44H55BrN2O4Si的m/z[M+H]+计算值784.3;实验值785.2。
步骤2.
在N2气氛下,在0℃下向(S)-5-溴-3-(3-((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-1H-吲哚(2.3g,2.9mmol)于THF(20mL)中的混合物中分数份添加1M TBAF的THF溶液(14.67mL,14.7mmol)。将混合物加热至45℃并搅拌6小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(S)-3-(5-溴-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(690mg,43%产率)。LCMS(ESI):C28H37BrN2O4的m/z[M+H]+计算值546.2;实验值546.9。
步骤3.
在Ar气氛下,向(S)-3-(5-溴-2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(690mg,1.3mmol)和(Bpin)2(643mg,2.5mmol)于甲苯(7mL)中的混合物中分数份添加KOAc(372mg,3.8mmol)和Pd(dppf)Cl2(93mg,0.13mmol)。将混合物加热至80℃并搅拌2.5小时,接着用H2O(20mL)稀释并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(S)-3-(2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(700mg,93%产率)。LCMS(ESI):C34H49BN2O6的m/z[M+H]+计算值592.4;实验值593.1。
步骤4.
在Ar气氛下,向(S)-3-(2-(2-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(670mg,1.13mmol)和Pd(DtBPF)Cl2(147mg,0.23mmol)于甲苯(3mL)、1,4-二噁烷(1mL)和H2O(1mL)中的混合物中分数份添加(S)-1-((S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(648mg,1.36mmol)和K3PO4(720mg,3.39mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌3小时,接着用H2O(10mL)稀释并用EtOAc(3×10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×10mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(680mg,70%产率)。LCMS(ESI):C45H62N6O9S的m/z[M+H]+计算值862.4;实验值863.1。
步骤5.
在N2气氛下,在0℃下向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸甲酯(300mg,0.35mmol)于THF(6mL)中的混合物中分数份添加1M LiOH(1.74mL,1.74mmol)。当LCMS确定反应完成时,用1M HCl将混合物酸化至约pH 6接着用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩滤液,得到呈固体状的(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(280mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C44H60N6O9S的m/z[M+H]+计算值848.4;实验值849.4。
步骤6.
在N2气氛下,在0℃下向(S)-1-((S)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-(4-(3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-1H-吲哚-5-基)噻唑-2-基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(300mg,0.35mmol)和DIPEA(457mg,3.5mmol)于DCM(50mL)中的混合物中分数份添加HOBT(477mg,3.5mmol)和EDCI(2.03g,10.6mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜,接着用H2O(50mL)洗涤并用DCM(3×50mL)萃取水层。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈固体状的((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(200mg,68%产率)。LCMS(ESI):C44H58N6O8S的m/z[M+H]+计算值830.4;实验值831.3。
步骤7.
在N2气氛下,在0℃下向((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(90mg,0.11mmol)于DCM(1mL)中的混合物中分数份添加TFA(1mL)。在0℃下,将混合物搅拌1.5小时,接着减压浓缩,得到呈油状的(63S,4S,Z)-4-氨基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-11-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮三氟乙酸盐(80mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C39H50N6O6S的m/z[M+H]+计算值730.4;实验值731.4。
步骤8.
在N2气氛下,在0℃下向(63S,4S,Z)-4-氨基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-11-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮三氟乙酸盐(90mg,0.12mmol)和(1r,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(17mg,0.15mmol)中的混合物中分数份添加DIPEA(318mg,2.5mmol)和HATU(56mg,0.15mmol)。在0℃下,将混合物搅拌1小时,接着用H2O(1mL)洗涤并用EtOAc(3×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((63S,4S,Z)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-11-(2-((四氢-2H-吡喃-4-基)氧基)乙基)-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(17mg,17%产率)。LCMS(ESI):C45H58N6O7S的m/z[M+H]+计算值826.4;实验值827.6;1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.74(dd,J=4.7,1.8Hz,1H),8.48(d,J=1.6Hz,1H),8.39(d,J=9.0Hz,1H),7.81(s,1H),7.74(ddd,J=10.5,8.2,1.8Hz,2H),7.61(d,J=8.7Hz,1H),7.51(dd,J=7.7,4.7Hz,1H),5.56(t,J=9.0Hz,1H),5.07(d,J=12.1Hz,1H),4.46(dt,J=14.9,5.3Hz,1H),4.32-4.09(m,4H),3.62-3.47(m,4H),3.34-3.30(m,1H),3.30-3.28(m,1H),3.26(s,3H),3.21-3.04(m,4H),2.94(d,J=14.3Hz,1H),2.83-2.68(m,1H),2.46-2.43(m,1H),2.16-2.05(m,1H),1.76(d,J=20.9Hz,2H),1.51(d,J=13.5Hz,3H),1.36(d,J=6.1Hz,3H),1.30-1.09(m,3H),1.13-0.98(m,8H),0.88(s,3H),0.32(s,3H)。
实施例A459.合成(2S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-(甲氧基甲基)氮杂环丁烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020751
步骤1.
在N2气氛下,在0℃下向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(170mg,0.21mmol)于THF(6mL)中的混合物中分数份添加TEA(62mg,0.62mmol)和氯甲酸4-硝基苯酯(62mg,0.31mmol)。将混合物升温至室温并搅拌4小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸4-硝基苯酯(200mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。
步骤2.
在N2气氛下,在0℃下向((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸4-硝基苯酯(150mg,0.15mmol)于MeCN(8mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(78mg,0.60mmol)和(2S)-2-(甲氧基甲基)氮杂环丁烷盐酸盐(46mg,0.45mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜,接着将混合物用盐水(10mL)稀释并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-(甲氧基甲基)氮杂环丁烷-1-甲酰胺(56mg,39%产率)。LCMS(ESI):C50H71N9O8S的m/z[M+H]+计算值957.5;实验值958.4;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.47(dd,J=14.9,2.2Hz,2H),7.91(s,1H),7.74(dd,J=8.6,1.6Hz,1H),7.59(d,J=8.7Hz,1H),7.21(s,1H),6.83(d,J=10.2Hz,1H),5.51(d,J=10.2Hz,1H),5.16(d,J=12.0Hz,1H),4.90(s,1H),4.37(s,2H),4.27-4.00(m,4H),3.71(q,J=8.4Hz,1H),3.65-3.54(m,5H),3.50(q,J=9.4,8.4Hz,2H),3.43(s,3H),3.40(s,2H),3.30(s,1H),3.29-3.20(m,4H),3.13(s,3H),2.90-2.72(m,2H),2.67(s,1H),2.43(s,2H),2.23(s,4H),2.05(d,J=12.0Hz,1H),1.82(dd,J=23.8,13.9Hz,3H),1.52(d,J=12.1Hz,1H),1.33(d,J=6.1Hz,3H),1.13(t,J=7.0Hz,3H),0.93-0.84(m,6H),0.81(d,J=6.1Hz,3H),0.44(s,3H)。
实施例A460.合成(2R)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基氮杂环丁烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020771
步骤1.
在N2气氛下,在0℃下向((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸4-硝基苯酯(150mg,0.15mmol)于MECN(8mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(78mg,0.60mmol)和(2R)-2-甲基氮杂环丁烷(32mg,0.45mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜,接着用盐水(10mL)稀释并用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(2R)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-(2-异丙氧基乙基)-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基氮杂环丁烷-1-甲酰胺(57mg,41%产率)。LCMS(ESI):C49H69N9O7S的m/z[M+H]+计算值927.5;实验值928.4;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.53-8.40(m,2H),7.93(s,1H),7.78-7.69(m,1H),7.59(d,J=8.6Hz,1H),7.21(s,1H),5.56(d,J=10.2Hz,1H),5.21(d,J=12.1Hz,1H),5.12(d,J=10.2Hz,1H),4.91(s,1H),4.35(d,J=13.9Hz,1H),4.27-4.12(m,4H),4.08(d,J=6.1Hz,1H),3.75(t,J=7.4Hz,2H),3.65-3.46(m,4H),3.30(s,2H),3.29(s,1H),3.26(d,J=5.9Hz,5H),3.13(s,3H),2.79(d,J=13.5Hz,2H),2.60(s,2H),2.45(p,J=1.9Hz,4H),2.22(s,3H),2.06(d,J=12.1Hz,1H),1.82(s,3H),1.54-1.49(m,1H),1.34(dd,J=14.9,6.2Hz,6H),1.13(t,J=7.0Hz,3H),0.87(t,J=6.8Hz,6H),0.81(d,J=6.0Hz,3H),0.44(s,3H)。
实施例A476.合成(1R,2R,3S)-N-((3'S,3'S,4'S,Z)-3'-乙氧基-1'-(2-异丙氧基乙基)-2'-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-5',7'-二氧代螺[环丙烷-1,10'-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃]-4'-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺和(1R,2R,3S)-N-((3'S,3'S,4'S,Z)-3'-乙氧基-1'-(2-异丙氧基乙基)-2'-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-5',7'-二氧代螺[环丙烷-1,10'-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃]-4'-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020781
步骤1.
在N2气氛下,向5-溴-3-((1-(((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)甲基)环丙基)甲基)-2-碘-1H-吲哚(6.1g,9.5mmol)和(S)-4-(6-(1-甲氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(4.56g,9.5mmol)于1,4-二噁烷(120mL)和H2O(20mL)中的混合物中分数份添加Pd(dppf)Cl2(1.04g,1.4mmol)和K3PO4(4.02g,18.9mmol)。将混合物加热至65℃并搅拌3小时,接着用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-4-(5-(5-溴-3-((1-(((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)甲基)环丙基)甲基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(4.7g,57%产率)。LCMS(ESI):C49H55BrN4O4Si的m/z[M+H]+计算值870.3;实验值871.5。
步骤2.
在0℃下,向(S)-4-(5-(5-溴-3-((1-(((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)甲基)环丙基)甲基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(4.6g,5.3mmol)于DMF(50mL)中的混合物中添加4-甲基苯磺酸2-异丙氧基乙酯(2.04g,7.9mmol)和Cs2CO3(5.16g,15.8mmol)。将混合物加热至50℃并搅拌2小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过反相硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-4-(5-(5-溴-3-((1-(((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)甲基)环丙基)甲基)-1-(2-异丙氧基乙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(4.5g,89%产率)。LCMS(ESI):C54H65BrN4O5Si的m/z[M+H]+计算值956.4;实验值957.2。
步骤3.
在0℃下,向(S)-4-(5-(5-溴-3-((1-(((叔丁基二苯基硅烷基)氧基)甲基)环丙基)甲基)-1-(2-异丙氧基乙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(3.2g,3.3mmol)于THF(32mL)中的混合物中添加TBAF(13.1g,50.1mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(3×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过反相硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-4-(5-(5-溴-3-((1-(羟基甲基)环丙基)甲基)-1-(2-异丙氧基乙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.84g,77%产率)。LCMS(ESI):C38H47BrN4O5的m/z[M+H]+计算值718.3;实验值719.2。
步骤4.
在Ar气氛下,在0℃下向(S)-4-(5-(5-溴-3-((1-(羟基甲基)环丙基)甲基)-1-(2-异丙氧基乙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.7g,2.4mmol)于甲苯(20mL)中的混合物中添加4,4,4',4',5,5,5',5'-八甲基-2,2'-联(1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷)(1.80g,7.1mmol)、KOAc(580mg,5.9mmol)和Pd(dppf)Cl2(346mg,0.47mmol)。将混合物加热至90℃并搅拌3小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过反相硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-4-(5-(3-((1-(羟基甲基)环丙基)甲基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.4g,77%产率)。LCMS(ESI):C44H59BN4O7的m/z[M+H]+计算值766.5;实验值767.4。
步骤5.
在0℃下,向(S)-4-(5-(3-((1-(羟基甲基)环丙基)甲基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(1.4g,1.8mmol)于DCM(20mL)中的混合物中添加(S)-1,2-双(叔丁氧基羰基)六氢哒嗪-3-甲酸(664mg,2.0mmol)、DCC(490mg,2.4mmol)和DMAP(45mg,0.37mmol)。将混合物升温至室温并搅拌16小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过反相硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-((1-((2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)甲基)环丙基)甲基)酯1,2-二叔丁酯(1.2g,61%产率)。LCMS(ESI):C59H83BN6O12的m/z[M+H]+计算值1078.6;实验值1079.5。
步骤6.
在0℃下,将(S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-((1-((2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)甲基)环丙基)甲基)酯1,2-二叔丁酯(1.2g,1.1mmol)于HCl的1,4-二噁烷溶液(15mL)中的混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到(S)-六氢哒嗪-3-甲酸(1-((2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)甲基)环丙基)甲酯(1.25g),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C49H67BN6O8的m/z[M+H]+计算值878.5;实验值879.4。
步骤7.
在0℃下,向(S)-六氢哒嗪-3-甲酸(1-((2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)甲基)环丙基)甲酯(1.0g,1.1mmol)于DMF(15mL)中的混合物中添加DIPEA(1.47g,11.4mmol)和(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酸(675mg,1.7mmol),随后添加HATU(865mg,2.3mmol)。在0℃下,将混合物搅拌2小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(2×100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈油状的(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(1-((2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)甲基)环丙基)甲酯(730mg,51%产率)。LCMS(ESI):C62H84BBrN8O12S的m/z[M+H]+计算值1254.5;实验值1255.4。
步骤8.
在Ar气氛下,在0℃下向(S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸(1-((2-(5-(4-((苯甲氧基)羰基)哌嗪-1-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-(2-异丙氧基乙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)甲基)环丙基)甲酯(700mg,0.56mmol)于甲苯(12mL)、1,4-二噁烷(4mL)和H2O(4mL)中的混合物中添加XPhos(53mg,0.11mmol)、K3PO4(296mg,1.39mmol)和XPho-Pd-G3(47mg,0.06mmol)。将混合物加热至65℃并搅拌2小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(2×50mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×50mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型TLC纯化,得到呈油状的4-(5-((3'S,3'S,4'S,Z)-4'-((叔丁氧基羰基)氨基)-3'-乙氧基-1'-(2-异丙氧基乙基)-5',7'-二氧代螺[环丙烷-1,10'-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃]-2'-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(160mg,27%产率)。LCMS(ESI):C56H72N8O10S的m/z[M+H]+计算值1048.5;实验值1049.3。
步骤9.
在0℃下,向4-(5-((3'S,3'S,4'S,Z)-4'-((叔丁氧基羰基)氨基)-3'-乙氧基-1'-(2-异丙氧基乙基)-5',7'-二氧代螺[环丙烷-1,10'-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃]-2'-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)哌嗪-1-甲酸苯甲酯(160mg,0.15mmol)于MeOH(3mL)中的混合物中添加甲氧基甲醇胺(34mg,0.76mmol)和Pd(OH)2/C(171mg,1.2mmol)。将混合物放在H2气氛下,加热至35℃并搅拌4小时,接着过滤,并用MeOH(2×50mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液,得到((3'S,3'S,4'S,Z)-3'-乙氧基-1'-(2-异丙氧基乙基)-2'-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-5',7'-二氧代螺[环丙烷-1,10'-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃]-4'-基)氨基甲酸叔丁酯(100mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C49H68N8O8S的m/z[M+H]+计算值928.5;实验值929.4。
步骤10.
在0℃下,向((3'S,3'S,4'S,Z)-3'-乙氧基-1'-(2-异丙氧基乙基)-2'-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-5',7'-二氧代螺[环丙烷-1,10'-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃]-4'-基)氨基甲酸叔丁酯(100mg,0.11mmol)于DCM(1mL)中的混合物中添加HCl的1,4-二噁烷溶液(1mL)。在0℃下,将混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到(3'S,3'S,4'S,Z)-4'-氨基-3'-乙氧基-1'-(2-异丙氧基乙基)-2'-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)螺[环丙烷-1,10'-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃]-5',7'-二酮(110mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C44H60N8O6S的m/z[M+H]+计算值828.4;实验值829.4。
步骤11.
在0℃下,向(3'S,3'S,4'S,Z)-4'-氨基-3'-乙氧基-1'-(2-异丙氧基乙基)-2'-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)螺[环丙烷-1,10'-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃]-5',7'-二酮(100mg,0.12mmol)于DMF(2mL)中的混合物中添加DIPEA(78mg,0.61mmol)、(1R,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(21mg,0.18mmol)和HATU(92mg,0.24mmol)。在0℃下,将混合物搅拌2小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(2×30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2×30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到(1R,2R,3S)-N-((3'S,3'S,4'S,Z)-3'-乙氧基-1'-(2-异丙氧基乙基)-2'-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-5',7'-二氧代螺[环丙烷-1,10'-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃]-4'-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(7mg,6%产率)和(1R,2R,3S)-N-((3'S,3'S,4'S,Z)-3'-乙氧基-1'-(2-异丙氧基乙基)-2'-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)-5',7'-二氧代螺[环丙烷-1,10'-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃]-4'-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(13mg,12%产率),都呈固体状。LCMS(ESI):C50H68N8O7S的m/z[M+H]+计算值924.5;实验值925.5;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.50(d,J=1.5Hz,1H),8.42(d,J=3.0Hz,1H),7.91(s,1H),7.71(d,J=8.6Hz,1H),7.64(d,J=10.1Hz,1H),7.58(d,J=8.6Hz,1H),7.25(d,J=2.8Hz,1H),6.55(s,1H),5.77(d,J=10.1Hz,1H),5.04(d,J=12.3Hz,1H),4.92(s,1H),4.37-4.28(m,1H),4.22(d,J=10.9Hz,1H),4.18-4.08(m,3H),3.98(dd,J=12.2,6.1Hz,3H),3.65-3.58(m,6H),3.36-3.20(m,6H),3.17(d,J=5.2Hz,2H),2.98(s,3H),2.45(s,6H),2.39-2.30(m,3H),2.10-1.89(m,3H),1.86-1.66(m,3H),1.51(d,J=3.8Hz,2H),1.36(d,J=6.2Hz,3H),1.24(s,1H),1.16(t,J=7.0Hz,5H),1.08(d,J=5.5Hz,3H),1.04(d,J=5.5Hz,3H),0.91(d,J=6.1Hz,3H),0.86(d,J=6.1Hz,4H);以及LCMS(ESI):C50H68N8O7S的m/z[M+H]+计算值924.5;实验值925.5;1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.52(s,1H),8.47(d,J=3.1Hz,1H),7.76-7.71(m,1H),7.67(d,J=10.2Hz,1H),7.57(d,J=8.5Hz,1H),7.37(d,J=3.2Hz,1H),5.76(d,J=10.1Hz,1H),5.03(d,J=12.3Hz,1H),4.92(s,1H),4.15(dd,J=27.1,12.3Hz,1H),3.83(d,J=6.2Hz,3H),3.54(dd,J=17.3,6.9Hz,1H),3.44(d,J=6.7Hz,3H),3.34-3.26(m,9H),2.92(s,3H),2.47-2.41(m,7H),2.37-2.31(m,3H),2.23(s,1H),1.94-1.77(m,3H),1.55(s,2H),1.24(d,J=6.4Hz,4H),1.15(t,J=6.9Hz,5H),1.09(d,J=5.7Hz,3H),1.04(d,J=5.7Hz,3H),0.95(d,J=6.1Hz,3H),0.86(d,J=6.1Hz,3H),0.50-0.42(m,1H),0.33(s,2H),0.14-0.06(m,1H)。
实施例A483.合成(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7s)-9-环丙基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020851
步骤1.
在0℃下,向((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7s)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(50%纯度;500mg,0.28mmol)和(1-乙氧基环丙氧基)三甲基硅烷(968mg,5.6mmol)于MeOH(2mL)中的混合物中分数份添加AcOH(83mg,1.39mmol)和NaBH3CN(87mg,1.39mmol)。将混合物升温至60℃并搅拌2小时,接着减压浓缩。将余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7s)-9-环丙基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(80mg,30%产率)。LCMS(ESI):C51H69N7O8S的m/z[M+H]+计算值939.5;实验值940.6。
步骤2.
在0℃下,将((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7s)-9-环丙基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(80mg,0.09mmol)和TFA(0.4mL)于DCM(2mL)中的混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈油状的(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-12-(5-((1R,5S,7s)-9-环丙基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮三氟乙酸盐(180mg)。LCMS(ESI):C46H61N7O6S的m/z[M+H]+计算值839.4;实验值840.4。
步骤3.
在0℃下,向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-12-(5-((1R,5S,7s)-9-环丙基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(180mg,0.21mmol)和(1R,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(49mg,0.43mmol)于DMF(3mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(277mg,2.14mmol)和COMU(184mg,0.43mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时。将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7s)-9-环丙基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(23mg,11%产率)。LCMS(ESI):C52H69N7O7S的m/z[M+H]+计算值935.5;实验值936.4;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.74(d,J=2.2Hz,1H),8.56(s,1H),7.98(s,1H),7.81(d,J=8.6Hz,1H),7.74-7.56(m,3H),5.94(d,J=9.7Hz,1H),5.23(d,J=12.4Hz,1H),5.00(s,1H),4.42-4.08(m,5H),3.92(d,J=10.9Hz,2H),3.90-3.65(m,6H)3.57-3.46(m,2H),3.26(s,4H),3.02(d,J=10.1Hz,2H),2.89(m,2H),2.67(m,1H),2.35(s,2H),2.13(d,J=10.5Hz,1H),1.85(d,J=13.6Hz,3H),1.59(s,2H),1.43(d,J=6.1Hz,3H),1.42-1.30(m,2H),1.28-1.08(m,12H),1.10-0.98(m,7H),0.55(d,J=6.0Hz,2H),0.45(s,2H),0.39(s,2H)。
实施例A484.合成(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((1R,5S,7s)-9-(氧杂环丁烷-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮
Figure BDA0004194083620020881
步骤1.
将(3S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-(3-(5-溴-1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-(9-((2,2,2-三氯乙氧基)羰基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-7-基)吡啶-3-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯1,2-二叔丁酯(6.57g,6.22mmol)和CsF(4.72g,31.1mmol)于DMF(50mL)中的混合物加热至80℃并搅拌2小时,接着用H2O(3×200mL)稀释并用EtOAc(200mL)萃取。将有机层减压浓缩,得到呈固体状的(3S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-(3-(2-(5-(3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-溴-1-乙基-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯1,2-二叔丁酯(5.83g)。LCMS(ESI):C45H62BrN5O8的m/z[M+H]+计算值879.4和881.4;实验值880.1和882.1。
步骤2.
在0℃下,向(3S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-(3-(2-(5-(3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-溴-1-乙基-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯1,2-二叔丁酯(5.83g,6.62mmol)和NaHCO3(2.78g,33.1mmol)于H2O(20mL)和THF(20mL)中的混合物中分数份添加氯甲酸9H-芴-9-基甲酯(2.57g,9.93mmol)。将混合物升温至室温并搅拌过夜,接着用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(3S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-(3-(2-(5-(9-(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-溴-1-乙基-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯1,2-二叔丁酯(6.63g,90%产率)。LCMS(ESI):C60H72BrN5O10的m/z[M+H]+计算值1101.5和1103.4;实验值1102.4和1104.4。
步骤3.
在N2气氛下,向(3S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-(3-(2-(5-(9-(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-溴-1-乙基-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯1,2-二叔丁酯(6.4g,5.8mmol)和双(频哪醇合)二硼(2.21g,8.7mmol)于甲苯(25mL)中的混合物中分数份添加AcOK(1.42g,14.5mmol)和Pd(dppf)Cl2CH2Cl2(0.47g,0.58mmol)。将混合物加热至80℃并搅拌3小时,接着减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(3S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-(3-(2-(5-(9-(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯1,2-二叔丁酯(4.9g,73%产率)。LCMS(ESI):C66H84BN5O12的m/z[M+H]+计算值1149.6;实验值1150.8。
步骤4.
在0℃下,向(3S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-(3-(2-(5-(9-(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯1,2-二叔丁酯(4.9g,4.3mmol)中添加HCl的1,4-二噁烷溶液(15mL)。将混合物升温至室温并搅拌5小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的7-(5-(1-乙基-3-(3-(((S)-六氢哒嗪-3-羰基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(4.9g),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C56H68BN5O8的m/z[M+H]+计算值949.5;实验值950.5。
步骤5.
在0℃下,向7-(5-(1-乙基-3-(3-(((S)-六氢哒嗪-3-羰基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(4.8g,5.1mmol)和(2S,3S)-3-(4-溴-1,3-噻唑-2-基)-2-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3-乙氧基丙酸(3.00g,7.6mmol)于DCM(30mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(6.53g,50.5mmol)和CIP(4.22g,15.2mmol)。将混合物升温至室温并搅拌3小时,接着减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的7-(5-(3-(3-(((S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-羰基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-乙基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(5.5g,82%产率)。LCMS(ESI):C69H85BBrN7O12S的m/z[M+H]+计算值1325.5和1327.5;实验值1326.5和1328.5。
步骤6.
在N2气氛下,向7-(5-(3-(3-(((S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-羰基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-乙基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(5.5g,4.1mmol)和K3PO4(2.20g,10.4mmol)于甲苯(12mL)、二噁烷(4mL)和H2O(4mL)中的混合物中分数份添加Pd(dppf)Cl2.DCM(0.34g,0.41mmol)。将混合物加热至80℃并搅拌3小时,接着过滤并用EtOAc(3×10mL)和H2O(10mL)洗涤滤饼。分配滤液并用EtOAc(3×20mL)萃取水层。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥,过滤,减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的7-(5-((63S,3S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(2.3g,49%产率)。LCMS(ESI):C63H73N7O10S的m/z[M+H]+计算值1119.5;实验值1120.3。
步骤7.
在室温下,向7-(5-((63S,3S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(2.3g,2.1mmol)和哌啶(0.87g,10.3mmol)于DCM(10mL)中的混合物中搅拌3小时,接着减压浓缩,得到呈油状的((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(2.3g)。LCMS(ESI):C48H63N7O8S的m/z[M+H]+计算值897.5;实验值898.9。
步骤8.
在室温下,将((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-6-烯-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(2.3g,2.6mmol)和20% Pd(OH)2/碳(2.30g,3.3mmol)于MeOH(10mL)中的混合物氢化(气球)2小时。将混合物通过Celite垫过滤并减压浓缩滤液,得到呈油状的((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7s)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(2.3g),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C48H65N7O8S的m/z[M+H]+计算值899.5;实验值901.0。
步骤9.
在0℃下,向((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7s)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(480mg,0.53mmol)和3-氧杂环丁酮(154mg,2.1mmol)于MeOH(4mL)中的混合物中逐滴添加AcOH(320mg,5.3mmol)。将混合物升温至室温并搅拌30分钟,接着将混合物再冷却至0℃并分数份添加NaBH3CN(101mg,1.6mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌2小时,接着减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((1R,5S,7s)-9-(氧杂环丁烷-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(200mg,39%产率)。LCMS(ESI):C51H69N7O9S的m/z[M+H]+计算值955.5;实验值956.7。
步骤10.
在0℃下,向((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((1R,5S,7s)-9-(氧杂环丁烷-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.21mmol)于DCM(2mL)中的混合物中逐滴添加TFA(0.4mL)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((1R,5S,7s)-9-(氧杂环丁烷-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(220mg)。LCMS(ESI):C46H61N7O7S的m/z[M+H]+计算值855.4;实验值856.6。
步骤11.
在N2气氛下,在0℃下向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((1R,5S,7s)-9-(氧杂环丁烷-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(220mg,0.26mmol)和(1r,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(59mg,0.51mmol)于DMF(3mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(332mg,2.57mmol)和HATU(293mg,0.77mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((1R,5S,7s)-9-(氧杂环丁烷-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(67mg,27%产率)。LCMS(ESI):C52H69N7O8S的m/z[M+H]+计算值951.5;实验值952.5;1HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.79(s,1H),8.50(d,J=1.6Hz,1H),7.92(s,1H),7.79-7.72(m,2H),7.65(d,J=9.9Hz,1H),7.58(d,J=8.7Hz,1H),5.86(d,J=9.9Hz,1H),5.15(d,J=12.3Hz,2H),4.91(s,1H),4.74(s,4H),4.37-4.20(m,3H),4.18-4.05(m,3H),3.92(s,3H),3.57(d,J=3.5Hz,5H),3.51-3.44(m,7H),3.22(s,3H),2.90-2.74(m,2H),2.55(s,2H),2.39(s,2H),2.06(d,J=12.3Hz,1H),1.78(d,J=29.9Hz,2H),1.56-1.47(m,2H),1.37(d,J=6.1Hz,3H),1.16(t,J=7.0Hz,5H),1.11-0.94(m,7H),0.93-0.77(m,6H),0.36(s,3H)。
实施例A496.合成(1S,2S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-(二甲基氨基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620020941
步骤1.
向4-溴噻唑-2-甲醛(15.0g,78.1mmol)和(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(9.47g,78.1mmol)于DCM中的混合物中分数份添加Cs2CO3(50.90g,156.2mmol)。在室温下,将混合物搅拌2小时,接着过滤并用DCM(3×20mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S,E)-N-((4-溴噻唑-2-基)亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(26g,97%产率)。LCMS(ESI):C8H11BrN2OS2的m/z[M+H]+计算值294.0;实验值294.8。
步骤2.
在N2气氛下,在-78℃下用n-BuLi的己烷溶液(20.5mL,105.7mmol)处理(R)-3,6-二乙氧基-2-异丙基-2,5-二氢吡嗪(20.57g,96.9mmol)于THF中的混合物。在-78℃下,将混合物搅拌30分钟,接着逐滴添加(S,E)-N-((4-溴噻唑-2-基)亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(26.0g,88.1mmol)。在-78℃下,将混合物搅拌2小时,接着升温至0℃并用饱和NaHCO3淬灭。用EtOAc(3×500mL)萃取水层,将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(S)-N-((S)-(4-溴噻唑-2-基)((2S,5R)-3,6-二乙氧基-5-异丙基-2,5-二氢吡嗪-2-基)甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(32.0g,72%产率)。LCMS(ESI):C19H31BrN4O3S2的m/z[M+H]+计算值506.1;实验值507.0。
步骤3.
在0℃下,向(S)-N-((S)-(4-溴噻唑-2-基)((2S,5R)-3,6-二乙氧基-5-异丙基-2,5-二氢吡嗪-2-基)甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(32.0g,63.0mmol)于THF(1L)和MECN(640mL)中的混合物中逐滴添加0.2MHCl(790mL)。将混合物升温至室温并搅拌过夜,接着通过添加饱和NaHCO3淬灭并用EtOAc(3×500mL)萃取。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S,3S)-2-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(((S)-叔丁基亚磺酰基)氨基)丙酸乙酯(18.0g,72%产率)。LCMS(ESI):C12H20BrN3O3S2的m/z[M+H]+计算值397.0;实验值398.1。
步骤4.
向(2S,3S)-2-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(((S)-叔丁基亚磺酰基)氨基)丙酸乙酯(15.0g,37.7mmol)和NaHCO3(15.82g,188.3mmol)于THF(100mL)和H2O(100mL)中的混合物中分数份添加FmocCl(11.69g,45.2mmol)。在室温下,将混合物搅拌2小时,接着用H2O(3×100mL)洗涤。用EtOAc(3×100mL)萃取水层,将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S,3S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(((S)-叔丁基亚磺酰基)氨基)丙酸乙酯(20.0g,86%产率)。LCMS(ESI):C27H30BrN3O5S2的m/z[M+H]+计算值619.1;实验值620.0。
步骤5.
在室温下,将(2S,3S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(((S)-叔丁基亚磺酰基)氨基)丙酸乙酯(20.0g,32.2mmol)和4M HCl的MeOH溶液(150mL)的混合物搅拌2小时。将混合物减压浓缩并将残余物通过反相硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S,3S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-3-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酸乙酯(7.5g,45%产率)。LCMS(ESI):C23H22BrN3O4S的m/z[M+H]+计算值515.1;实验值516.0。
步骤6.
向(2S,3S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-3-氨基-3-(4-溴噻唑-2-基)丙酸乙酯(1.2g,2.3mmol)和AcOH(419mg,7.0mmol)于MeOH(20mL)中的混合物中分数份添加37%的HCHO水溶液(419mg,13.9mmol)和NaBH3CN(730mg,11.6mmol)。在室温下,将混合物搅拌2小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(3×200mL)萃取。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(2S,3S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(二甲基氨基)丙酸乙酯(990mg,78%产率)。LCMS(ESI):C25H26BrN3O4S的m/z[M+H]+计算值543.1;实验值543.8。
步骤7.
在室温下,将(2S,3S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(二甲基氨基)丙酸乙酯(990mg,1.8mmol)和LiOH.H2O(174mg,7.3mmol)于THF(50mL)和H2O(50mL)中的混合物搅拌1小时,接着用1M HCl酸化至约pH 5。将混合物不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。
步骤8.
向上述混合物中分数份添加NaHCO3(764mg,9.1mmol)和FmocCl(565mg,9.1mmol)。在室温下,将混合物搅拌过夜,接着用H2O(3×300mL)洗涤并用EtOAc(3×30mL)萃取合并的水层。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(2S,3S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(二甲基氨基)丙酸(320mg,60%产率)。LCMS(ESI):C23H22BrN3O4S的m/z[M+H]+计算值515.1;实验值516.0。
步骤9.
向(S)-六氢哒嗪-3-甲酸3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙酯(450mg,0.74mmol)和DIPEA(1.60g,12.4mmol)于DMF(30mL)中的混合物中分数份添加(2S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(二甲基氨基)丙酸(320mg,0.62mmol)和HATU(471mg,1.24mmol)。在室温下,将混合物搅拌1小时,接着用H2O(3×30mL)洗涤并用EtOAc(3×30mL)萃取合并的水层。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基-(3S)-1-((2S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(二甲基氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸酯(450mg,66%产率)。LCMS(ESI):C57H69BBrN7O8S的m/z[M+H]+计算值1101.4;实验值1102.5。
步骤10.
在N2气氛下,向3-(1-乙基-2-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基-(3S)-1-((2S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-3-(4-溴噻唑-2-基)-3-(二甲基氨基)丙酰基)六氢哒嗪-3-甲酸酯(450mg,0.41mmol)和K3PO4(217mg,1.0mmol)于甲苯(9mL)、1,4-二噁烷(3mL)和H2O(3mL)中的混合物中分数份添加Pd(dtbpf)Cl2(53mg,0.08mmol)。将混合物加热至60℃并搅拌1小时,接着用H2O(3×20mL)洗涤并用EtOAc(3×20mL)萃取合并的水层。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的((63S,4S,Z)-3-(二甲基氨基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(70mg,19%产率)。LCMS(ESI):C51H57N7O6S的m/z[M+H]+计算值895.4;实验值896.3。
步骤11.
在室温下,将((63S,4S,Z)-3-(二甲基氨基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(70mg,0.08mmol)和哌啶(0.2mL)于MECN(2mL)中的混合物搅拌1小时。将混合物减压浓缩,得到呈油状的(63S,4S,Z)-4-氨基-3-(二甲基氨基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(60mg,71%产率),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C36H47N7O4S的m/z[M+H]+计算值673.3;实验值674.1。
步骤12.
向(63S,4S,Z)-4-氨基-3-(二甲基氨基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(60mg,0.09mmol)和(1S,2S)-2-甲基环丙烷-1-甲酸(9mg,0.09mmol)于DMF(5mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(230mg,1.78mmol)和HATU(68mg,0.18mmol)。在室温下,将混合物搅拌1小时,接着用H2O稀释并用EtOAc(2×20mL)萃取。将合并的有机层用H2O(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1S,2S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-(二甲基氨基)-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基环丙烷-1-甲酰胺(3.6mg,5%产率)。LCMS(ESI):C41H53N7O5S的m/z[M+H]+计算值755.4;实验值756.4;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.66-8.62(m,1H),8.44-8.39(m,1H),7.86-7.79(m,1H),7.63-7.54(m,2H),7.48-7.43(m,1H),7.41-7.37(m,1H),6.01-5.94(m,1H),4.26-3.95(m,6H),3.94-3.81(m,2H),3.47-3.38(m,1H),3.07(s,3H),2.80-2.72(m,1H),2.67-2.58(m,1H),2.55-2.45(m,1H),2.38-2.13(s,6H),1.91(s,2H),1.63-1.40(m,3H),1.39-1.32(m,3H),1.29-1.08(m,7H),1.06-0.91(m,8H),0.84-0.75(m,1H),0.69-0.41(m,7H)。
实施例A502.合成(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((1R,5S,7r)-9-(氧杂环丁烷-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620021001
步骤1.
向(1R,5S)-7-氧代-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸叔丁酯(9.00g,37.3mmol)于MeOH(90mL)中的混合物中添加4-甲氧基苯磺酰肼(9.05g,44.8mmol)。将混合物加热至50℃并搅拌16小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的7-(2-((4-甲氧基苯基)磺酰基)亚肼基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸叔丁酯(15.0g),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C19H27N3O6S的m/z[M+H]+计算值425.2;实验值426.3。
步骤2.
在Ar气氛下,将7-(2-((4-甲氧基苯基)磺酰基)亚肼基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸叔丁酯(12.2g,28.7mmol)、(S)-(5-(5-溴-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-(1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)硼酸(21.0g,43.0mmol)和Cs2CO3(14.0g,43.0mmol)于1,4-二噁烷(120mL)中的混合物加热至110℃并搅拌16小时。将混合物减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法和手性HPLC纯化,得到呈固体状的(1R,5S,7s)-7-(5-(5-溴-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸叔丁酯(3.3g,17%产率;RT=1.98min)和呈固体状的(1R,5S,7r)-7-(5-(5-溴-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸叔丁酯(4.5g,23%产率,RT=2.16min)。
步骤3.
在0℃下,向(1R,5S)-7-(5-(5-溴-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸叔丁酯(4.49g,6.7mmol)中添加HCl的1,4-二噁烷溶液(40mL,10.0mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的3-(2-(5-((1R,5S,7r)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-溴-1-乙基-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(4.5g,92%产率),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C30H40BrN3O3的m/z[M+H]+计算值569.2;实验值570.3。
步骤4.
在0℃下,向3-(2-(5-((1R,5S,7r)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-溴-1-乙基-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙-1-醇(4.49g,7.87mmol)于THF(20mL)中的混合物中逐滴添加NaHCO3水溶液(20mL)中的氯甲酸9H-芴-9-基甲酯(3.05g,11.8mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着用EtOAc(3×20mL)萃取。将合并的有机层用H2O(2×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(1R,5S,7r)-7-(5-(5-溴-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(5.8g,92%产率)。LCMS(ESI):C45H50BrN3O5的m/z[M+H]+计算值793.3;实验值794.3[对于81Br]。
步骤5.
在0℃下,向(1R,5S,7r)-7-(5-(5-溴-1-乙基-3-(3-羟基-2,2-二甲基丙基)-1H-吲哚-2-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(5.8g,7.3mmol)和(S)-1,2-双(叔丁氧基羰基)六氢哒嗪-3-甲酸(4.83g,14.6mmol)于DCM(50mL)中的混合物中分数份添加DMAP(0.38g,3.1mmol)和DCC(2.55g,12.4mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着过滤并用DCM(3×30mL)洗涤滤饼。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-(3-(2-(5-((1R,5S,7r)-9-(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-溴-1-乙基-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯1,2-二叔丁酯(7.6g)。LCMS(ESI):C60H74BrN5O10的m/z[M+H]+计算值1105.5;实验值1106.4[对于81Br]。
步骤6.
在N2气氛下,向-(S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-(3-(2-(5-((1R,5S,7r)-9-(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-5-溴-1-乙基-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯1,2-二叔丁酯(7.4g,6.7mmol)和双(频哪醇合)二硼(8.50g,33.5mmol)于甲苯(70mL)中的混合物中添加AcOK(2.63g,26.8mmol)和Pd(dppf)Cl2CH2Cl2(1.09g,1.34mmol)。将混合物加热至80℃并搅拌3小时,接着减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-(3-(2-(5-((1R,5S,7r)-9-(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯1,2-二叔丁酯(6.9g,89%产率)。LCMS(ESI):C66H86BN5O12的m/z[M+H]+计算值1151.6;实验值1152.6。
步骤7.
在0℃下,向(S)-四氢哒嗪-1,2,3-三甲酸3-(3-(2-(5-((1R,5S,7r)-9-(((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-1-乙基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-3-基)-2,2-二甲基丙基)酯1,2-二叔丁酯(6.9g,6.0mmol)中添加HCl的1,4-二噁烷溶液(60mL)。将混合物升温至室温并搅拌4小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的(1R,5S,7r)-7-(5-(1-乙基-3-(3-(((S)-六氢哒嗪-3-羰基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(6.47g)。LCMS(ESI):C56H70BN5O8的m/z[M+H]+计算值951.5;实验值952.6。
步骤8.
在0℃下,向(1R,5S,7r)-7-(5-(1-乙基-3-(3-(((S)-六氢哒嗪-3-羰基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(6.45g,6.78mmol)和(2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酸(3.21g,8.13mmol)于DCM(60mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(8.76g,67.8mmol)和COMU(3.48g,8.1mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(1R,5S,7r)-7-(5-(3-(3-(((S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-羰基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-乙基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(6.9g,76%产率)。LCMS(ESI):C69H87BBrN7O12S的m/z[M+H]+计算值1329.5;实验值1330.5。
步骤9.
在N2气氛下,向(1R,5S,7r)-7-(5-(3-(3-(((S)-1-((2S,3S)-3-(4-溴噻唑-2-基)-2-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基丙酰基)六氢哒嗪-3-羰基)氧基)-2,2-二甲基丙基)-1-乙基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)-1H-吲哚-2-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(6.9g,5.2mmol)于甲苯(300mL)、1,4-二噁烷(100mL)和H2O(100mL)中的混合物中添加K3PO4(3.31g,15.6mmol)和Pd(DtBPF)Cl2(0.42g,0.52mmol)。将混合物加热至80℃并搅拌3小时,接着减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(1R,5S,7r)-7-(5-((63S,3S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(3.8g,65%产率)。LCMS(ESI):C63H75N7O10S的m/z[M+H]+计算值1121.5;实验值1123.3。
步骤10.
在0℃下,向(1R,5S,7r)-7-(5-((63S,3S,4S,Z)-4-((叔丁氧基羰基)氨基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-12-基)-6-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬烷-9-甲酸(9H-芴-9-基)甲酯(3.8g,3.4mmol)于DCM(40mL)中的混合物中逐滴添加哌啶(1.44g,16.9mmol)。将混合物升温至室温并搅拌5小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7r)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(4.7g),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C48H65N7O8S的m/z[M+H]+计算值899.5;实验值900.6。
步骤11.
在0℃下,向((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7r)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(1.12g,15.6mmol)于MeOH(2mL)中的混合物中添加AcOH(467mg,7.8mmol)。将混合物搅拌30分钟,接着添加NaBH3CN(147mg,2.33mmol),并将混合物加热至60℃并搅拌3小时。将混合物减压浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((1R,5S,7r)-9-(氧杂环丁烷-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(251mg,33%产率)。LCMS(ESI):C51H69N7O9S的m/z[M+H]+计算值955.5;实验值956.5。
步骤12.
在0℃下,向((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((1R,5S,7r)-9-(氧杂环丁烷-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(250mg,0.26mmol)于DCM(2mL)中的混合物中添加TFA(0.4mL)。将混合物升温至室温并搅拌30分钟,接着减压浓缩,得到呈固体状的(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((1R,5S,7r)-9-(氧杂环丁烷-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(310mg),将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C46H61N7O7S的m/z[M+H]+计算值855.4;实验值856.5。
步骤13.
在0℃下,向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((1R,5S,7r)-9-(氧杂环丁烷-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(310mg,0.36mmol)和(1r,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(62mg,0.54mmol)于DMF(3mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(468mg,3.62mmol)和COMU(155mg,0.36mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)-5-((1R,5S,7r)-9-(氧杂环丁烷-3-基)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(113mg,32%产率)。LCMS(ESI):C52H69N7O8S的m/z[M+H]+计算值951.5;实验值952.5;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.66(d,J=2.1Hz,1H),8.51(s,1H),7.92(s,1H),7.76(d,J=8.4Hz,2H),7.61(dd,J=15.3,9.2Hz,2H),5.88(d,J=9.9Hz,1H),5.18(d,J=11.6Hz,1H),4.93(s,1H),4.59-4.41(m,3H),4.32(s,2H),4.24(d,J=6.2Hz,2H),4.13(s,3H),3.82(d,J=11.0Hz,4H),3.69-3.49(m,4H),3.19(s,3H),2.84-2.74(s,2H),2.64(s,2H),2.10-1.94(m,3H),1.76(s,4H),1.53(s,1H),1.37(d,J=6.1Hz,3H),1.24(s,1H),1.19(d,J=7.0Hz,3H),1.15(s,2H),1.07(d,J=7.2Hz,6H),0.93(t,J=7.0Hz,3H),0.84(s,3H),0.41(s,3H)。
实施例A503.合成(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7r)-9-环丙基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620021071
步骤1.
在0℃下,向((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7r)-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(300mg,0.33mmol)和(1-乙氧基环丙氧基)三甲基硅烷(1.16g,6.6mmol)于MeOH(1.5mL)中的混合物中逐滴添加AcOH(200mg,3.3mmol)。在0℃下,将混合物搅拌30分钟,接着添加NaBH3CN(105mg,1.67mmol),将混合物加热至60℃并搅拌2小时。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7r)-9-环丙基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(235mg,75%产率)。LCMS(ESI):C51H69N7O8S的m/z[M+H]+计算值939.5;实验值940.3。
步骤2.
在0℃下,向((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7r)-9-环丙基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)氨基甲酸叔丁酯(230mg,0.25mmol)于DCM(2mL)中的混合物中逐滴添加TFA(0.4mL)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着减压浓缩,得到呈固体状的(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-12-(5-((1R,5S,7r)-9-环丙基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(340mg)。LCMS(ESI):C46H61N7O6S的m/z[M+H]+计算值839.4;实验值840.5。
步骤3.
在0℃下,向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-12-(5-((1R,5S,7r)-9-环丙基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(200mg,0.24mmol)和(1r,2R,3S)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酸(41mg,0.36mmol)于DMF(2mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(308mg,2.4mmol)和COMU(102mg,0.24mmol)。将混合物升温至室温并搅拌1小时,接着通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1r,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-12-(5-((1R,5S,7r)-9-环丙基-3-氧杂-9-氮杂双环[3.3.1]壬-7-基)-2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-3-乙氧基-11-乙基-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2,3-二甲基环丙烷-1-甲酰胺(78mg,35%产率)。LCMS(ESI):C52H69N7O7S的m/z[M+H]+计算值935.5;实验值936.4;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ8.73(m,1H),8.50(m,1H),7.93(s,1H),7.82-7.53(m,3H),5.88(d,J=9.8Hz,1H),5.22(d,J=9.7Hz,1H),4.92(s,2H),4.55-3.86(m,14H),3.84-3.37(m,7H),3.21(s,3H),2.81(d,J=12.3Hz,2H),2.32(s,3H),2.02(d,1H),1.82(s,2H),1.53(t,J=3.9Hz,2H),1.38(d,J=6.0Hz,3H),1.12(dt,J=34.8,6.3Hz,13H),0.86(s,7H),0.55(s,3H)。
实施例A504.合成推定的(1S,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基-3-(嘧啶-4-基)环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620021091
步骤1.
在0℃下,向LiCl(0.31g,7.4mmol)和嘧啶-4-甲醛(1.0g,9.3mmol)于DMF中的混合物中逐滴添加DBU(1.69g,11.1mmol)和2-(二乙氧基磷酰基)乙酸叔丁酯(2.80g,11.1mmol)。将混合物升温至室温并在室温下搅拌1小时,接着冷却至0℃,用饱和NH4Cl淬灭并用EtOAc(200mL)萃取。将有机层用盐水(3×200mL)洗涤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈固体状的(E)-3-(嘧啶-4-基)丙烯酸叔丁酯(1.0g,52%产率)。LCMS(ESI):C11H14N2O2的m/z[M+H]+计算值206.1;实验值207.1。
步骤2.
在N2气氛下,在-60℃下用2M LDA的THF溶液(6.0mL,12.0mmol)处理乙基二苯基四氟硼酸锍(2.2g,10.2mmol)于DME和DCM(10:1)中的混合物0.5小时。将混合物升温至室温并逐滴添加(E)-3-(嘧啶-4-基)丙烯酸叔丁酯(700mg,3.4mmol)。在室温下,将混合物搅拌1小时,接着用饱和NH4Cl淬灭并用EtOAc(3×100mL)萃取。将合并的有机层减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的2-甲基-3-(嘧啶-4-基)环丙烷-1-甲酸(160mg,20%产率)。LCMS(ESI):C13H18N2O2的m/z[M+H]+计算值234.1;实验值235.1;1H NMR(300MHz,CDCl3)δ9.10(s,1H),8.63(s,1H),7.33(s,1H),2.66(dd,J=9.7,4.7Hz,1H),2.46(dd,J=5.7,4.7Hz,1H),2.06-1.78(m,1H),1.47(s,9H),1.13(d,J=6.4Hz,3H)。
通过手性HPLC分离上述化合物的外消旋混合物,得到呈固体状的(55mg,绝对构型未知的单一非对映异构体,RT=6.2min)和(61mg,绝对构型未知的单一非对映异构体,RT=7.3min)。
步骤3.
在室温下,将(1S,2R,3S)-2-甲基-3-(嘧啶-4-基)环丙烷-1-甲酸叔丁酯(50mg,0.21mmol,绝对构型未知的单一非对映异构体;RT=6.2min)和TFA(5mL,67.3mmol)于DCM中的混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到(1S,2R,3S)-2-甲基-3-(嘧啶-4-基)环丙烷-1-甲酸,将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中(绝对构型未知的单一非对映异构体)。LCMS(ESI):C9H10N2O2的m/z[M+H]+计算值178.0;实验值179.1。
步骤4.
在N2气氛下,在室温下向(1S,2R,3S)-2-甲基-3-(嘧啶-4-基)环丙烷-1-甲酸(53mg,0.3mmol)和DIPEA(192mg,1.48mmol)于DMF中的混合物中添加(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(100mg,0.15mmol)和HATU(113mg,0.3mmol)。在室温下,将混合物搅拌1小时,接着用EtOAc(100mL)稀释并用盐水(3×100mL)洗涤。将有机层减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1S,2R,3S)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基-3-(嘧啶-4-基)环丙烷-1-甲酰胺(19mg,15%产率;绝对构型未知的单一非对映异构体)。LCMS(ESI):C45H54N8O6S的m/z[M+H]+计算值834.4;实验值835.2;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ9.09(s,1H),8.82-8.71(m,1H),8.66(m,1H),8.51(s,1H),8.23-8.22(m,1H),7.94(s,1H),7.87-7.65(m,2H),7.63-7.30(m,3H),5.89-5.76(m,1H),5.19-5.15(m,1H),4.95(s,1H),4.28-4.13(m,5H),3.79-3.52(m,7H),3.42-3.31(m,3H),2.83(s,2H),2.08(s,1H),1.78(s,3H),1.38-1.34(m,3H),1.31-1.20(m,6H),0.88-0.78(m,6H),0.41(s,3H)。
实施例A505.合成推定的(1R,2S,3R)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基-3-(嘧啶-4-基)环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620021121
步骤1.
通过手性HPLC分离起始环丙烷的外消旋混合物[条件(柱:CHIRALPAK IF,2×25cm,5μM;流动相A:己烷(10mM NH3-MeOH),流动相B:IPA--HPLC;流动速率:20mL/min;梯度:经10分钟5%B至5% B;波长:252/220nm;RT1(min):6.2;RT2(min):7.3;样品溶剂:MeOH:DCM=1:1;注入体积:0.2mL;操作次数:11)]。呈白色固体状的产物A(绝对构型未知的单一非对映异构体,55mg,RT=6.2min);产物B(绝对构型未知的单一非对映异构体,61mg,RT=7.3min)。
步骤2.
在室温下,将推定的(1R,2S,3R)-2-甲基-3-(嘧啶-4-基)环丙烷-1-甲酸叔丁酯(绝对构型未知的单一非对映异构体,50mg,0.21mmol)和TFA(5mL,67.3mmol)于DCM中的混合物搅拌1小时,接着减压浓缩,得到推定的(1R,2S,3R)-2-甲基-3-(嘧啶-4-基)环丙烷-1-甲酸(绝对构型未知的单一非对映异构体)。LCMS(ESI):C9H10N2O2的m/z[M+H]+计算值178.0;实验值179.1。
步骤3.
在N2气氛下,在室温下向(1R,2S,3R)-2-甲基-3-(嘧啶-4-基)环丙烷-1-甲酸(53mg,0.3mmol)和DIPEA(192mg,1.48mmol)于DMF中的混合物中添加(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(100mg,0.15mmol)和HATU(113mg,0.3mmol)。在室温下,将混合物搅拌1小时,接着用EtOAc(100mL)稀释并用盐水(3×100mL)洗涤。将有机层减压浓缩并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1R,2S,3R)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基-3-(嘧啶-4-基)环丙烷-1-甲酰胺(绝对构型未知的单一非对映异构体,29mg,19%产率)。LCMS(ESI):C45H54N8O6S的m/z[M+H]+计算值834.4;实验值835.2;1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ9.10(s,1H),8.83-8.78(m,1H),8.71(m,1H),8.54(s,1H),8.29-8.24(m,1H),7.98(s,1H),7.88-7.78(m,2H),7.74-7.69(m,1H),7.67-7.35(m,3H),5.85-5.72(m,1H),5.19-5.12(m,1H),4.93(s,1H),4.30-4.22(m,5H),3.80-3.60(m,7H),3.46-3.38(m,3H),2.88(s,1H),2.75-2.56(m,1H),2.18(s,1H),1.88(s,1H),1.71-1.56(m,2H),1.48-1.24(m,3H),1.28-1.22(m,3H),1.19-1.02(m,3H),0.98-0.88(m,6H),0.44(s,3H)。
实施例A506和实施例A507.合成推定的(1R,2S,3R)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基-3-(1-甲基-1H-咪唑-4-基)环丙烷-1-甲酰胺和(1R,2S,3R)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基-3-(1-甲基-1H-咪唑-4-基)环丙烷-1-甲酰胺
Figure BDA0004194083620021141
步骤1.
在0℃下,向1-甲基-1H-咪唑-4-甲醛(1.9g,17.3mmol)和LiCl(0.95g,22.4mmol)于THF(10mL)中的混合物中分数份添加2-(二乙氧基磷酰基)乙酸叔丁酯(5.66g,22.4mmol)和DBU(2.63g,17.3mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着用H2O(2×30mL)洗涤混合物。将合并的水层用EtOAc(3×30mL)萃取,并将合并的有机层干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化,得到呈油状的(E)-3-(1-甲基-1H-咪唑-4-基)丙烯酸叔丁酯(3g,84%产率)。LCMS(ESI):C11H16N2O2的m/z[M+H]+计算值208.1;实验值209.1。
步骤2.
在N2气氛下,在-60℃下将乙基二苯基四氟硼酸锍(2.18g,7.2mmol)于DCM:DME(1:10)中的混合物用2M LDA的THF溶液(12mL,24mmol)处理30分钟,随后分数份添加(E)-3-(1-甲基-1H-咪唑-4-基)丙烯酸叔丁酯(500mg,2.4mmol)。将混合物升温至室温并搅拌2小时,接着用饱和NH4Cl淬灭并用EtOAc(3×50mL)萃取。将合并的有机层干燥。将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈油状的(1S,2R,3S)-2-甲基-3-(1-甲基-1H-咪唑-4-基)环丙烷-1-甲酸叔丁酯(200mg,35%产率,绝对构型未知的单一非对映异构体)和(1S,2S,3S)-2-甲基-3-(1-甲基-1H-咪唑-4-基)环丙烷-1-甲酸叔丁酯(110mg,19%产率,绝对构型未知的单一非对映异构体)。LCMS(ESI):C13H20N2O2的m/z[M+H]+计算值236.2;实验值236.9。
步骤3.
在室温下,将推定的(1S,2R,3S)-2-甲基-3-(1-甲基-1H-咪唑-4-基)环丙烷-1-甲酸叔丁酯(70mg,0.3mmol)和TFA(1mL)于DCM中的混合物搅拌2小时,接着减压浓缩,得到呈油状的(1S,2R,3S)-2-甲基-3-(1-甲基-1H-咪唑-4-基)环丙烷-1-甲酸,将其不经进一步纯化即直接用于下一步骤中。LCMS(ESI):C9H12N2O2的m/z[M+H]+计算值180.1;实验值181.3。
步骤4.
在室温下,向(63S,3S,4S,Z)-4-氨基-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-5,7-二酮(122mg,0.18mmol)和(1S,2R,3S)-2-甲基-3-(1-甲基-1H-咪唑-4-基)环丙烷-1-甲酸叔丁酯(65mg,0.36mmol)于DMF(10mL)中的混合物中分数份添加DIPEA(467mg,3.6mmol)和HATU(76mg,0.2mmol)。在微波辐射中,在室温下将混合物照射2小时。用EtOAc(2×20mL)萃取混合物并将合并的有机层用H2O(3×20mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥并过滤。减压浓缩滤液并将残余物通过制备型HPLC纯化,得到呈固体状的(1R,2S,3R)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基-3-(1-甲基-1H-咪唑-4-基)环丙烷-1-甲酰胺(34mg,21%,绝对构型未知的非对映异构体,RT=1.00min)和呈固体状的(1R,2S,3R)-N-((63S,3S,4S,Z)-3-乙氧基-11-乙基-12-(2-((S)-1-甲氧基乙基)吡啶-3-基)-10,10-二甲基-5,7-二氧代-61,62,63,64,65,66-六氢-11H-8-氧杂-2(4,2)-噻唑杂-1(5,3)-吲哚杂-6(1,3)-哒嗪杂环十一蕃-4-基)-2-甲基-3-(1-甲基-1H-咪唑-4-基)环丙烷-1-甲酰胺(36mg,22%,绝对构型未知的单一非对映异构体RT=1.07min)。第一种非对映异构体的数据(RT=1.00min):LCMS(ESI):C45H56N8O6S的m/z[M+H]+计算值836.4;实验值837.1;1HNMR(400MHz,CD3OD)δ8.74-8.69(m,1H),8.63-8.60(m,1H),7.86-7.80(m,1H),7.73-7.68(m,1H),7.63(s,1H),7.56-7.45(m,3H),6.94(s,1H),6.01(s,1H),5.04-5.01(m,1H),4.50-4.41(m,1H),4.38-4.33(m,1H),4.29-4.20(m,2H),4.15-4.06(m,1H),3.76-3.73(m,2H),3.72-3.68(m,3H),3.66-3.58(m,2H),3.32-3.27(m,3H),3.05-2.95(m,1H),2.86-2.78(m,1H),2.66-2.61(m,1H),2.49-2.41(m,1H),2.24-2.16(m,1H),2.11-2.06(m,1H),2.02-1.92(m,1H),1.87-1.77(m,1H),1.69-1.52(m,3H),1.46-1.41(m,3H),1.38-1.15(m,11H),1.04-0.81(m,13H),0.50(s,3H)。第二种非对映异构体的数据(RT=1.07min):LCMS(ESI):C45H56N8O6S的m/z[M+H]+计算值836.4;实验值837.1;1H NMR(400MHz,CD3OD)δ8.74-8.67(m,1H),8.63-8.60(m,1H),7.86-7.80(m,1H),7.73-7.68(m,1H),7.63(s,1H),7.56-7.45(m,3H),6.94(s,1H),6.01(s,1H),5.04-5.01(m,1H),4.50-4.41(m,1H),4.38-4.33(m,1H),4.29-4.20(m,2H),4.15-4.06(m,1H),3.76-3.73(m,2H),3.72-3.68(m,3H),3.66-3.58(m,2H),3.32-3.27(m,3H),3.05-2.95(m,1H),2.86-2.78(m,1H),2.66-2.61(m,1H),2.49-2.41(m,1H),2.24-2.16(m,1H),2.11-2.06(m,1H),2.02-1.92(m,3H),1.87-1.77(m,3H),1.68-1.53(m,4H),1.46-1.41(m,11H),1.38-1.15(m,3H),1.04-0.81(m,10H),0.50(s,3H)。
生物测定
本文中的所有化合物在AsPC-1(K-Ras G12D)pERK效力测定和/或Capan-1(K-RasG12V)pERK效力测定中均展现出2μM或更低的IC50。
效力测定:pERK
这一测定的目的是测量测试化合物抑制细胞中的K-Ras的能力。活化的K-Ras诱导ERK在苏氨酸202和酪氨酸204处的磷酸化(pERK)增加。这一程序测量细胞pERK响应于测试化合物的降低。下文以NCI-H358细胞描述的程序适用于K-Ras G12C。
注意:本方案可改用其它细胞系执行以表征其它RAS变体抑制剂,包括例如AsPC-1(K-Ras G12D)、Capan-1(K-Ras G12V)、NCI-H1355(K-Ras G13C)、Hs 766T(K-Ras Q61H)、NCI-H2347(N-Ras Q61R)或SK-MEL-30(N-Ras Q61K)。
使用ATCC推荐的培养基和程序使NCI-H358细胞生长和维持。在添加化合物前一天,将细胞平板接种于384孔细胞培养板(每孔40μl)中并使其在37℃、5% CO2培育器中生长过夜。在DMSO中制备测试化合物的10点3倍稀释液,其中最高浓度为10mM。测定当天,使用Echo550液体处理器
Figure BDA0004194083620021171
将40nl测试化合物添加至细胞培养板各孔中。一式两份,对测试化合物的浓度进行测试。添加完化合物后,在37℃、5% CO2下培育细胞4小时。培育后,取出细胞培养基并用磷酸盐缓冲盐水洗涤细胞一次。
在一些实验中,细胞pERK水平是使用AlphaLISA SureFire Ultra p-ERK1/2测定试剂盒(PerkinElmer)确定。室温下,在以600RPM振荡下,将细胞溶解于25μl溶解缓冲液中。将溶解产物(10μl)转移至384孔Opti板(PerkinElmer)中并添加5μl受体混合物。在暗处培育2小时后,添加5μl供体混合物,密封板并在室温下培育2小时。在Envision读板器(PerkinElmer)上,使用标准AlphaLISA设置来读取信号。原始数据的分析是在Excel(Microsoft)及Prism(GraphPad)中进行。将信号对化合物浓度的以10为底的对数作图,并通过拟合4参数S形浓度反应模型确定IC50值。
在其它实验中,细胞pERK是通过In-Cell Western确定的。在化合物处理后,用200μl tris缓冲盐水(TBS)洗涤细胞两次并用150μl含4%三聚甲醛的TBS固定15分钟。用含0.1% Triton X-100的TBS(TBST)洗涤固定的细胞4次,持续5分钟,接着在室温下,用100μlOdyssey封闭缓冲液(LI-COR)封闭60分钟。将一次抗体(pERK,CST-4370,Cell SignalingTechnology)以1:200稀释于封闭缓冲液中,并取50μl添加至各孔中并在4℃下培育过夜。用TBST洗涤细胞4次,持续5分钟。添加二次抗体(IR-800CW兔,LI-COR,1:800稀释)和DNA染色剂DRAQ5(LI-COR,1:2000稀释)并在室温下培育1-2小时。用TBST洗涤细胞4次,持续5分钟。在Li-COR Odyssey CLx成像仪上扫描各板。原始数据的分析是在Excel(Microsoft)及Prism(GraphPad)中进行。将信号对化合物浓度的以10为底的对数作图,并通过拟合4参数S形浓度反应模型确定IC50值。
本发明的代表性抑制剂化合物A在体内驱动KRASG12D肿瘤的消退
方法:在使用雌性BALB/c裸小鼠(6-8周龄)的人胰腺癌HPAC KRASG12D/wt异种移植模型中评价化合物A对体内肿瘤细胞生长的作用。将在PBS中的HPAC肿瘤细胞(3×106个细胞/小鼠)皮下植入小鼠的侧腹中。在肿瘤达到约150mm3的平均大小后,就将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或媒剂的施用。每隔一天一次通过经口管饲施用(po q2d)化合物A。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。
结果:在具有杂合KRASG12D的HPAC CDX模型中,每隔一天以50mg/kg po和100mg/kgpo施用的单药化合物A在治疗结束(在开始治疗后第38天)时引起各组中所有肿瘤的完全消退(完全消退定义为相对于基线>85%的肿瘤消退)(图1A)。两种测试剂量的化合物A的抗肿瘤活性相较于对照组有统计显著性(***p<0.001,普通单因素方差分析以及利用事后Tukey检验进行的多重比较)。
本发明的代表性抑制剂化合物A在体内调控RAS路径并驱动KRASG12V肿瘤的消退
方法:在使用雌性BALB/c裸小鼠(6-8周龄)的人非小细胞肺癌(NSCLC)NCI-H441KRASG12V/wt异种移植模型中评价化合物A在体内对血液和肿瘤药物动力学(PK)、药效学(PD)和肿瘤细胞生长的影响。将在50%培养基、50%基质胶中的NCI-H441肿瘤细胞(2×106个细胞/小鼠)皮下植入小鼠的侧腹中。对于PK/PD,当肿瘤是约400mm3并且通过经口管饲用10mg/kg、25mg/kg或50mg/kg单次剂量的化合物A治疗动物时,将动物分组。对于PK/PD,每个时间点测量n=3。
在肿瘤达到约155mm3的平均大小后,就将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或媒剂的施用。在NCI-H441中,每天一次(po qd),通过经口管饲施用10mg/kg或25mg/kg的化合物A。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。
结果:基于在经口管饲10mg/kg、25mg/kg或50mg/kg单次剂量的化合物A后,在给药后直至72小时监测的肿瘤或血液中化合物A的总浓度(nM)分析药物动力学。化合物A在血液和肿瘤样品中展现出剂量依赖性暴露。在治疗后直至72小时,可在肿瘤中检测以25mg/kg或50mg/kg剂量治疗的化合物A(图1B)。由通过递送10mg/kg单次剂量的化合物A治疗的初治动物得到的PK在2小时的时候展示最大暴露(图1C)。在施用单次剂量后72小时,肿瘤DUSP6展示作为RAS路径活性标志物的DUSP6的调节(图1C)。
以10mg/kg po qd治疗的施用给带有NCI-H441肿瘤的动物的单药化合物A在所有动物中引起消退(肿瘤体积减小相对于初始>10%)。在具有杂合KRASG12V的NCI-H441 CDX模型中,以25mg/kg po qd化合物A治疗在治疗结束(在开始治疗后第38天)时引起所有肿瘤的完全消退(完全消退定义为相对于基线>85%的肿瘤消退)(图1D、图1E)。化合物A的抗肿瘤活性相较于对照组有统计显著性(***p<0.0001,普通单因素方差分析以及利用事后Tukey检验进行的多重比较)。根据体重测量值,治疗是良好耐受的(图1F)。
本发明的代表性抑制剂化合物A在体内驱动KRASG12V胰腺导管腺癌和结肠直肠肿瘤的消退
方法:在使用雌性BALB/c裸小鼠(6-8周龄)的人胰腺癌Capan-2KRASG12V/wt和结肠直肠SW403 KRASG12V/wt异种移植模型中评价化合物A对体内肿瘤细胞生长的作用。将在50%PBS、50%基质胶中的Capan-2肿瘤细胞(4×106个(培养基/基质胶)细胞/小鼠)或SW403肿瘤细胞(1×107个细胞/小鼠)皮下植入小鼠的侧腹中。在肿瘤达到约160-170mm3的平均大小后,就将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或媒剂的施用。在Capan-2中,每天一次(poqd),通过经口管饲施用10mg/kg或25mg/kg的化合物A。在SW403 CDX中,通过经口管饲每天一次(po qd)施用25mg/kg或每隔一天一次(q2d)施用50mg/kg的化合物A。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。
结果:在具有杂合KRASG12V的Capan-2 CDX模型中,以10mg/kg治疗的施用至带有Capan-2肿瘤的动物的单药化合物A在治疗结束(开始治疗后第38天)时引起5/8个的消退,并且25mg.kg po qd引起8/8个的消退(图2A、图2B)。化合物A的抗肿瘤活性相较于对照组有统计显著性(**p<0.01,***p<0.0001,普通单因素方差分析以及利用事后Tukey检验进行的多重比较)。根据体重测量值,治疗是良好耐受的(图2C)。在SW403 CDX模型中,每天一次以25mg/kg po或50mg/kg po q2d施用的单药化合物A在直至治疗结束(开始治疗后第35天)时引起所有肿瘤的显著肿瘤生长抑制。以25mg/kg po qd化合物A治疗驱动8/8个肿瘤的消退,并引起2/8个CR(图2D、图2E)。以50mg/kg po q2d化合物A治疗驱动8/8个肿瘤的消退。化合物A的抗肿瘤活性相较于对照组有统计显著性(***p<0.0001,普通单因素方差分析以及利用事后Tukey检验进行的多重比较)。根据体重测量值,治疗是良好耐受的(图2F)。
化合物A展现对多个RAS驱动的癌症细胞系的强效体内抑制
方法:Capan-1(KRASG12V)、AsPC-1(KRASG12D)、HCT116(KRASG13D)、SK-MEL-30(NRASQ61K)、NCI-H1975(EGFRT790M/L858R)和A375(BRAFV600E)细胞暴露于化合物A达120小时的体外细胞增殖抑制效力。数据表示多次实验的平均值。将细胞接种于384孔测定板中的生长培养基中,并在含5% CO2的潮湿气氛中,在37℃下培育过夜。次日,使细胞暴露于初始测定浓度为1μM(或对于A375为10μM)的化合物A的9种浓度的3倍连续稀释液。培育5天之后,将
Figure BDA0004194083620021211
2.0试剂添加至测定板中并测量发光。将数据针对DMSO处理的细胞的平均信号归一化,并使用四参数浓度反应模型估计IC50值。
结果:化合物A抑制RAS驱动的细胞系中的细胞增殖(图3)。RAS驱动的癌症细胞系的IC50如下:Capan-1(KRASG12V)=1nM,AsPC-1(KRASG12D)=3nM,HCT116(KRASG13D)=27nM,SK-MEL-30(NRASQ61K)=13nM,NCI-H1975(EGFRT790M/L858R)=1nM。RAS WT非依赖性细胞系A375(BRAFV600E)对用化合物A不敏感,其中IC50>8700nM。
本发明的代表性抑制剂化合物A在体内驱动KRASG12D肿瘤的消退
方法:在使用雌性BALB/c裸小鼠(6-8周龄)的人胰腺癌HPAC KRASG12D/wt和结肠直肠GP2d KRASG12D/wt异种移植模型中评价化合物A对体内肿瘤细胞生长的作用。将在50%PBS、50%基质胶中的HPAC肿瘤细胞(3×106个细胞/小鼠)或将GP2d肿瘤细胞(2×106个细胞/小鼠)皮下植入小鼠的侧腹中。在肿瘤达到约150mm3的平均大小后,就将小鼠随机分至各治疗组以开始测试物或媒剂的施用。每天一次(po qd),通过经口管饲施用25mg/kg的化合物A。每周两次测量体重和肿瘤体积(使用测径规),直至研究终点。
结果:在具有杂合KRASG12D的HPAC CDX模型中,每天一次以25mg/kg po施用的单药化合物A在治疗结束(在开始治疗后第38天)时引起所有肿瘤的完全消退(完全消退定义为相对于基线>85%的肿瘤消退)(图4A、图4B)。化合物A的抗肿瘤活性相较于对照组有统计显著性(***p<0.0001,普通单因素方差分析以及利用事后Tukey检验进行的多重比较)。根据体重测量值,治疗是良好耐受的(图4C)。在Gp2dCDX模型中,每天一次以25mg/kg po施用的单药化合物A在治疗结束(开始治疗后第35天)时引起所有肿瘤的显著肿瘤生长抑制(图4D、图4E)。化合物A的抗肿瘤活性相较于对照组有统计显著性(***p<0.0001,普通单因素方差分析以及利用事后Tukey检验进行的多重比较)。根据体重测量值,治疗是良好耐受的(图4F)。
化合物A在体外下调NCI-H358、SW900和Capan-2细胞中的免疫检查点蛋白
方法:为了评估化合物A在体外对检查点分子表达的作用,将NCI-H358、SW900或Capan-2细胞(5e4个细胞/孔)接种于96孔板中并在24小时后,在250pg/ml IFNγ存在下,用化合物A的五倍稀释稀释液处理。在37℃、5% CO2下培育这些板48小时。将细胞用0.25%胰蛋白酶分离,在含有可固定蓝色死细胞染色剂(Invitrogen)的PBS中培育15分钟,随后与FITC抗人CD274(PD-L1)、PerCP/Cyanine5.5抗人CD155(PVR)和Brilliant Violet 605抗人CD73(Biolegend)一起在冰上培育30分钟。将细胞用染色缓冲液(PBS/2% FCS)洗涤两次,随后在Cytek Aurora仪器上获取流式细胞测量值。使用SpectroFlo和FlowJo v10软件执行分析。
结果:化合物A在体外引起NCI-H358细胞(图5A)、SW900细胞(图5B)或Capan-2细胞(图5C)上PD-L1、PVR和CD73的浓度依赖性2倍至5倍降低。预测这些蛋白质的下调转化成有利于抗肿瘤免疫性的免疫抑制性肿瘤免疫微环境(Rothlin等人,JITC 2020)。
本文所公开的KRASMULTI(ON)抑制剂化合物A对RAS癌基因开关突变具有活性
图6A是表示有关在不同RAS抑制剂(本文所公开的KRASMULTI(ON)抑制剂化合物A,以及KRASG12C(OFF)抑制剂MRTX849和AMG 510)存在下各种KRAS突变的细胞RAS/RAF破坏测定结果的热图。
将表达纳米荧光素酶标记的突变型KRAS4B和卤素标记的RAF1(残基51-149)的质粒共转染至U2OS细胞中并培育24小时。利用New England Biolabs Q5定点诱变产生编码相关突变的质粒。将转染后的细胞以25000个细胞/孔再接种于96孔板中的测定培养基(OptiMEM+4% FBS+100nM HaloTag NanoBRET 618配体)中并培育过夜。根据制造商的说明书,添加Promega Vivazine Nano-Glo底物。添加浓度在0至10μM范围内的化合物并培育1小时。在460nm和618nm下测量发光信号并以618nm信号除以460nm信号计算BRET比率。将BRET比率拟合至标准S形剂量反应函数中并使用IC50值计算相对于KRASG12C的Log2(倍数变化)。图6B显示与热图的各彩色柱相关的IC50值。
可进行以下四项测定以进一步表征本发明化合物的特性。
在RAS突变型癌症细胞系中细胞活力的确定
方案:
Figure BDA0004194083620021231
细胞活力测定
注意:以下方案描述用于监测K-Ras突变型癌症细胞系响应于本发明化合物的细胞活力的程序。也可采用其它RAS同功型,不过接种的细胞数量将基于所用细胞系而变化。
本细胞测定的目的是通过使用
Figure BDA0004194083620021241
2.0试剂(Promega)对在终点时存在的ATP的量进行定量来确定在5天处理期内测试化合物对三种人癌症细胞系(NCI-H358(K-Ras G12C)、AsPC-1(K-Ras G12D)、Capan-1(K-Ras G12V))的作用。
将细胞以250个细胞/孔接种于384孔测定板中的40μl生长培养基中并在含5%CO2的潮湿气氛中在37℃下培育过夜。测定当天,先用100% DMSO将测试化合物的10mM储备液稀释成3mM溶液。将充分混合的化合物溶液(15μl)转移至含有30μl的100% DMSO的下一孔中,并重复操作,直至制备出9种浓度的3倍连续稀释液(起始测定浓度是10μM)。将测试化合物(132.5nl)直接分配至含有细胞的测定板中。将所述板以300rpm振荡15秒,离心并在含5% CO2的潮湿气氛中在37℃下培育5天。在第5天,将测定板及其内含物平衡至室温,保持约30分钟。添加
Figure BDA0004194083620021242
2.0试剂(25μl),并在回旋振荡器上混合板内含物2分钟,随后在室温下培育10分钟。可使用PerkinElmer Enspire测量发光。可利用下式使数据归一化:(样品信号/平均DMSO)*100。可使用四参数逻辑斯蒂拟合(four-parameter logisticfit)来拟合数据。
本发明化合物破坏B-Raf Ras结合结构域(BRAFRBD)与K-Ras的相互作用
注意:以下方案描述用于监测本发明化合物对K-Ras G12C(GMP-PNP)与BRAFRBD的结合的破坏的程序。本方案也可改用其它Ras蛋白或核苷酸来执行。
这一生物化学测定的目的是测量测试化合物促进在载有核苷酸的K-Ras同功型与亲环蛋白A之间形成三元复合物的能力;由此得到的三元复合物破坏与BRAFRBD构建体的结合,抑制K-Ras通过RAF效应子进行的信号传导。数据可以用IC50值报告。
在含有25mM HEPES pH 7.3、0.002% Tween20、0.1% BSA、100mM NaCl及5mMMgCl2的测定缓冲液中,将无标记亲环蛋白A、His6-K-Ras-GMPPNP及GST-BRAFRBD分别以25μM、12.5nM及50nM的最终浓度组合于384孔测定板中。测定板各孔中存在的化合物是自30μM最终浓度起始,经历10点3倍连续稀释的稀释液。在25℃下培育3小时之后,接着将抗HisEu-W1024和抗GST别藻蓝蛋白的混合物添加至测定样品孔中分别达到10nM和50nM的最终浓度,并将反应再培育1.5小时。在微孔板读取器(Ex 320nm,Em 665/615nm)上读取TR-FRET信号。促进K-Ras:RAF复合物破坏的化合物被鉴别为使TR-FRET比率相对于DMSO对照孔降低的化合物。
在RAS突变型癌症细胞系中细胞活力的确定
方案:
Figure BDA0004194083620021251
细胞活力测定
注意:以下方案描述用于监测KRAS突变型癌症细胞系响应于本发明化合物的细胞活力的程序。也可采用其它RAS同功型,不过接种的细胞数量将基于所用细胞系而变化。
本细胞测定的目的是通过使用
Figure BDA0004194083620021252
2.0试剂(Promega)对在终点时存在的ATP的量进行定量来确定在5天处理期内测试化合物对三种人癌症细胞系(NCI-H358(KRAS G12C)、AsPC-1(KRAS G12D)、Capan-1(KRAS G12V))的作用。
将细胞以250个细胞/孔接种于384孔测定板中的40μl生长培养基中并在含5%CO2的潮湿气氛中在37℃下培育过夜。测定当天,先用100% DMSO将测试化合物的10mM储备液稀释成3mM溶液。将充分混合的化合物溶液(15μl)转移至含有30μl的100% DMSO的下一孔中,并重复操作,直至制备出9种浓度的3倍连续稀释液(起始测定浓度是10μM)。将测试化合物(132.5nl)直接分配至含有细胞的测定板中。将所述板以300rpm振荡15秒,离心并在含5% CO2的潮湿气氛中在37℃下培育5天。在第5天,将测定板及其内含物平衡至室温,保持约30分钟。添加
Figure BDA0004194083620021253
2.0试剂(25μl),并在回旋振荡器上混合板内含物2分钟,随后在室温下培育10分钟。可使用PerkinElmer Enspire测量发光。利用下式使数据归一化:(样品信号/平均DMSO)*100。可使用四参数逻辑斯蒂拟合来拟合数据。
口服生物利用率的确定
口服生物利用率可以在BALB/c小鼠中确定。在静脉内(IV)推注和经口管饲(PO)施用测试化合物后,在指定时间点将约30μL全血样品收集至含有K2EDTA的管中。将血液样品在4℃下以4600rpm离心约5分钟并将学将样品在-80℃储存,随后进行生物分析。通过蛋白质沉淀萃取血浆样品并使用电喷雾正离子化,在例如API 5500系统上,通过串联质谱法(LCMS/MS)进行分析。
所有PK参数均可通过使用WinNonlin进行的非房室分析,由血浆浓度随时间变化的数据得到。使用以下公式估算生物利用率(F%):
Figure BDA0004194083620021261
AUCinf,PO是血浆浓度在PO施用后时间零至无穷长时间内的曲线下面积。
AUCinf,IV是血浆浓度在IV施用后时间零至无穷长时间内的曲线下面积。
DoseIV是IV施用的总剂量
DosePO是PO施用的总剂量
一般来说,超过30%的F%值是优选的,并且超过50%的值是更优选的。
尽管已结合本发明的具体实施方案描述本发明,但应了解,本发明能够进一步修改,并且本申请意欲涵盖一般遵循本发明的原理且包括在本发明所属领域内的已知或常规实践范围内的与本公开的背离的本发明的任何变化、应用或改编,并且可应用于本文所述的基本特征。
所有出版物、专利和专利申请均以全文引用的方式并入本文中,其引用程度就如同具体地且个别地指示每一个别出版物、专利或专利申请以全文引用的方式并入一般。
编号的实施方案
[1]一种具有式I结构的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0004194083620021271
其中A是任选被取代的3至6元亚环烷基、任选被取代的3至6元亚杂环烷基、任选被取代的6元亚芳基或任选被取代的5至6元亚杂芳基;
Y是
Figure BDA0004194083620021272
Figure BDA0004194083620021273
W是氢、C1-C4烷基、任选被取代的3至10元杂环烷基、任选被取代的3至10元环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R1是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;
R2是氢、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C2-C6烯基、任选被取代的C2-C6炔基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至7元杂环烷基、任选被取代的6元芳基、任选被取代的5元或6元杂芳基;并且
R10是氢或任选被取代的C1-C6杂烷基。
[2]如段落[1]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1是任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[3]如段落[2]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R1是任选被取代的苯基或任选被取代的吡啶。
[4]如段落[1]至[3]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A是任选被取代的噻唑、任选被取代的三唑、任选被取代的吗啉代,或苯基。
[5]如段落[1]至[3]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A不是任选被取代的苯基或苯并咪唑。
[6]如段落[5]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中A不是羟基苯基。
[7]如段落[1]至[6]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物不是表2的化合物。
[8]如段落[1]至[7]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中所述化合物不是表3的化合物。
[9]如段落[1]至[8]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y是-NHC(O)-或-NHC(O)NH-。
[10]如段落[9]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式II的结构:
Figure BDA0004194083620021291
其中a是0或1。
[11]如段落[10]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式II-1的结构:
Figure BDA0004194083620021292
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
[12]如段落[11]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式II-2的结构:
Figure BDA0004194083620021301
[13]如段落[12]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式II-3的结构:
Figure BDA0004194083620021302
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[14]如段落[13]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式II-4的结构:
Figure BDA0004194083620021311
[15]如段落[14]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式II-5的结构:
Figure BDA0004194083620021312
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。
[16]如段落[15]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式II-6的结构:
Figure BDA0004194083620021321
[17]如段落[15]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式II-7的结构:
Figure BDA0004194083620021331
[18]如段落[16]或[17]所述的化合物,其中R6是甲基。
[19]如段落[15]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式II-8或式II-9的结构:
Figure BDA0004194083620021332
[20]如段落[9]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式III的结构:
Figure BDA0004194083620021341
/>
其中a是0或1。
[21]如段落[20]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式III-1的结构:
Figure BDA0004194083620021342
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
[22]如段落[21]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式III-2的结构:
Figure BDA0004194083620021351
[23]如段落[22]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式III-3的结构:
Figure BDA0004194083620021352
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[24]如段落[23]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式III-4的结构:
Figure BDA0004194083620021361
[25]如段落[24]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式III-5的结构:
Figure BDA0004194083620021362
/>
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。
[26]如段落[25]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式III-6的结构:
Figure BDA0004194083620021371
[27]如段落[25]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式III-7的结构:
Figure BDA0004194083620021372
Figure BDA0004194083620021381
[28]如段落[26]或[27]所述的化合物,其中R6是甲基。
[29]如段落[25]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式III-8或式III-9的结构:
Figure BDA0004194083620021382
[30]如段落[9]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IV的结构:
Figure BDA0004194083620021391
其中R9是H或C1-C6烷基;并且
a是0或1。
[31]如段落[30]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IV-1的结构:
Figure BDA0004194083620021392
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
[32]如段落[31]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IV-2的结构:
Figure BDA0004194083620021401
[33]如段落[32]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IV-3的结构:
Figure BDA0004194083620021402
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[34]如段落[33]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IV-4的结构:
Figure BDA0004194083620021411
[35]如段落[34]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IV-5的结构:
Figure BDA0004194083620021412
/>
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。
[36]如段落[35]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IV-6的结构:
Figure BDA0004194083620021421
[37]如段落[35]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IV-7的结构:
Figure BDA0004194083620021431
[38]如段落[36]或[37]所述的化合物,其中R6是甲基。
[39]如段落[35]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IV-8或式IV-9的结构:
Figure BDA0004194083620021432
[40]如段落[30]至[39]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9是甲基。
[41]如段落[1]至[8]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y是-NHS(O)2-或-NHS(O)2NH-。
[42]如段落[41]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式V的结构:
Figure BDA0004194083620021441
其中a是0或1。
[43]如段落[42]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式V-1的结构:
Figure BDA0004194083620021442
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
[44]如段落[43]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式V-2的结构:
Figure BDA0004194083620021451
[45]如段落[44]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式V-3的结构:
Figure BDA0004194083620021452
/>
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[46]如段落[45]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式V-4的结构:
Figure BDA0004194083620021461
[47]如段落[46]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式V-5的结构:
Figure BDA0004194083620021462
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。
[48]如段落[41]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VI的结构:
Figure BDA0004194083620021471
其中a是0或1。
[49]如段落[48]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VI-1的结构:
Figure BDA0004194083620021481
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
[50]如段落[49]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VI-2的结构:
Figure BDA0004194083620021482
[51]如段落[50]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VI-3的结构:
Figure BDA0004194083620021491
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[52]如段落[51]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VI-4的结构:
Figure BDA0004194083620021492
[53]如段落[52]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VI-5的结构:
Figure BDA0004194083620021501
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。
[54]如段落[41]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VII的结构:
Figure BDA0004194083620021511
其中R9是H或C1-C6烷基;并且
a是0或1。
[55]如段落[54]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VII-1的结构:
Figure BDA0004194083620021512
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
[56]如段落[55]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VII-2的结构:
Figure BDA0004194083620021521
[57]如段落[56]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VII-3的结构:
Figure BDA0004194083620021522
/>
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[58]如段落[57]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VII-4的结构:
Figure BDA0004194083620021531
[59]如段落[58]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VII-5的结构:
Figure BDA0004194083620021532
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。
[60]如段落[54]至[59]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9是甲基。
[61]如段落[1]至[8]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中Y是-NHS(O)-或-NHS(O)NH-。
[62]如段落[61]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VIII的结构:
Figure BDA0004194083620021541
其中a是0或1。
[63]如段落[62]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VIII-1的结构:
Figure BDA0004194083620021551
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
[64]如段落[63]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VIII-2的结构:
Figure BDA0004194083620021552
[65]如段落[64]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VIII-3的结构:
Figure BDA0004194083620021561
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[66]如段落[65]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VIII-4的结构:
Figure BDA0004194083620021562
[67]如段落[66]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式VIII-5的结构:
Figure BDA0004194083620021571
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。
[68]如段落[61]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IX的结构:
Figure BDA0004194083620021581
其中a是0或1。
[69]如段落[68]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IX-1的结构:
Figure BDA0004194083620021582
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
[70]如段落[69]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IX-2的结构:
Figure BDA0004194083620021591
[71]如段落[70]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IX-3的结构:
Figure BDA0004194083620021592
/>
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[72]如段落[71]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IX-4的结构:
Figure BDA0004194083620021601
[73]如段落[72]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式IX-5的结构:
Figure BDA0004194083620021602
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。
[74]如段落[61]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式X的结构:
Figure BDA0004194083620021611
其中R9是H或C1-C6烷基;并且
a是0或1。
[75]如段落[74]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式X-1的结构:
Figure BDA0004194083620021612
Figure BDA0004194083620021621
其中X2是N或CH;
各R3独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;并且
n是1至4的整数。
[76]如段落[75]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式X-2的结构:
Figure BDA0004194083620021622
[77]如段落[76]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式X-3的结构:
Figure BDA0004194083620021631
其中R4和R5各自独立地选自卤素、氰基、羟基、任选被取代的胺、任选被取代的酰胺基、任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至11元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[78]如段落[77]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式X-4的结构:
Figure BDA0004194083620021632
[79]如段落[78]所述的化合物或其药学上可接受的盐,具有式X-5的结构:
Figure BDA0004194083620021641
其中X3是N或CH;
m是1或2;
R6、R7、R8和R11各自独立地选自任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的C1-C6杂烷基、任选被取代的3至6元环烷基、任选被取代的3至6元环烯基、任选被取代的3至6元杂环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基;或
R6和R7与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元环烷基或任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R8与其所连接的原子组合形成任选被取代的3至8元杂环烷基;或
R7和R11与其所连接的原子组合形成任选被取代的4至8元杂环烷基。
[80]如段落[74]至[79]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R9是甲基。
[81]如段落[10]至[40]、[42]至[60]和[62]至[80]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中a是0。
[82]如段落[10]至[40]、[42]至[60]和[62]至[80]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中a是1。
[83]如段落[1]至[82]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2是任选被取代的C1-C6烷基。
[84]如段落[83]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中R2选自-CH2CH3或-CH2CF3
[85]如段落[1]至[84]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是C1-C4烷基。
[86]如段落[1]至[84]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的环丙基、任选被取代的环丁基、任选被取代的环戊基或任选被取代的环己基、任选被取代的哌啶、任选被取代的哌嗪、任选被取代的吡啶或任选被取代的苯基。
[87]如段落[1]至[84]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的3至10元杂环烷基、任选被取代的3至10元环烷基、任选被取代的6至10元芳基或任选被取代的5至10元杂芳基。
[88]如段落[1]至[84]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的3至10元杂环烷基。
[89]如段落[88]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W选自以下各物或其立体异构体:
Figure BDA0004194083620021651
/>
Figure BDA0004194083620021661
/>
Figure BDA0004194083620021671
/>
Figure BDA0004194083620021681
[90]如段落[1]至[84]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的3至10元环烷基。
[91]如段落[90]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W选自以下各物或其立体异构体:
Figure BDA0004194083620021682
/>
Figure BDA0004194083620021691
[92]如段落[1]至[84]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的5至10元杂芳基。
[93]如段落[92]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W选自以下各物或其立体异构体:
Figure BDA0004194083620021692
[94]如段落[1]至[84]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的6至10元芳基。
[95]如段落[94]所述的化合物或其药学上可接受的盐,其中W是任选被取代的苯基。
[96]一种表1的化合物或其药学上可接受的盐。
[97]一种表1-1的化合物或其药学上可接受的盐。
[98]一种药物组合物,所述药物组合物包含如段落[1]至[97]中任一个所述的化合物或其药学上可接受的盐,以及药学上可接受的赋形剂。
Figure BDA0004194083620021711
/>
Figure BDA0004194083620021721
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Figure BDA0004194083620021731
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Figure BDA0004194083620021741
/>
Figure BDA0004194083620021751
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Figure BDA0004194083620021761
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Figure BDA0004194083620021771
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Figure BDA0004194083620021781
/>
Figure BDA0004194083620021791
/>
Figure BDA0004194083620021801
/>
Figure BDA0004194083620021811
/>
Figure BDA0004194083620021821
/>

Claims (70)

1.一种治疗患有与具有SHP2突变的细胞相关的疾病或病症的受试者的方法,所述方法包括:
向所述受试者施用治疗有效量的SOS1抑制剂。
2.如权利要求1所述的方法,其中所述SHP2突变诱导SHP2的活化形式。
3.如权利要求1所述的方法,其中所述受试者在用SHP2抑制剂预先治疗后表达所述SHP2突变。
4.如权利要求1所述的方法,其中所述受试者在用别构SHP2抑制剂预先治疗后表达所述SHP2突变。
5.如权利要求3或权利要求4所述的方法,其中所述SHP2抑制剂或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体选自以下中所公开的那些:WO 2021149817、WO 2021148010、WO 2021147879、WO 2021143823、WO 2021143701、WO 2021143680、WO2021121397、WO 2021119525、WO 2021115286、WO 2021110796、WO 2021088945、WO2021073439、WO 2021061706、WO 2021061515、WO 2021043077、WO 2021033153、WO2021028362、WO 2021033153、WO 2021028362、WO 2021018287、WO 2020259679、WO2020249079、WO 2020210384、WO 2020201991、WO 2020181283、WO 2020177653、WO2020165734、WO 2020165733、WO 2020165732、WO 2020156243、WO 2020156242、WO2020108590、WO 2020104635、WO 2020094104、WO 2020094018、WO 2020081848、WO2020073949、WO 2020073945、WO 2020072656、WO 2020065453、WO 2020065452、WO2020063760、WO 2020061103、WO 2020061101、WO 2020033828、WO 2020033286、WO2020022323、WO 2019233810、WO 2019213318、WO 2019183367、WO 2019183364、WO2019182960、WO 2019167000、WO 2019165073、WO 2019158019、WO 2019152454、WO2019051469、WO 2019051084、WO 2018218133、WO 2018172984、WO 2018160731、WO2018136265、WO 2018136264、WO 2018130928、WO 2018129402、WO 2018081091、WO2018057884、WO 2018013597、WO 2017216706、WO 2017211303、WO 2017210134、WO2017156397、WO 2017100279、WO 2017079723、WO 2017078499、WO 2016203406、WO2016203405、WO 2016203404、WO 2016196591、WO 2016191328、WO 2015107495、WO2015107494、WO 2015107493、WO 2014176488、WO 2014113584、US 20210085677、US10858359、US 10934302和US 10954243。
6.如权利要求3或权利要求4所述的方法,其中所述SHP2抑制剂或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体选自由以下组成的组:ERAS-601、BBP-398、RLY-1971、JAB-3068、JAB-3312、TNO155、SHP099、RMC-4550和RMC-4630。
7.如权利要求3或4所述的方法,其中所述SHP2抑制剂是TNO155或RMC-4630,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
8.如权利要求7所述的方法,其中所述SHP2抑制剂是RMC-4630或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
9.如权利要求1所述的方法,其中所述SHP2突变赋予对SHP2抑制剂或别构SHP2抑制剂的抗性。
10.如权利要求1至9中任一项所述的方法,其中SHP2突变在选自由以下组成的组的位置处:T52、I56、G60、D61、Y62、Y63、E69、K70、A72、T73、E76、E123、E139、Y197、S189、T253、Q257、L261、L262、R265、F285、N308、V428、A461、T468、P491、S502、G503、M504、Q506、Q510、T507及其组合。
11.如权利要求1至10中任一项所述的方法,其中所述SHP2突变在选自由以下组成的组的位置处:A72、E76和G503,以及其组合。
12.如权利要求1至9中任一项所述的方法,其中SHP2突变选自由以下组成的组:T52I、I56V、G60V、D61G、D61V、D61Y、Y62D、Y63D、Y63C、E69K、E69Q、K70R、A72S、A72T、A72V、T73I、E76A、E76G、E76K、E76Q、E123D、E139D、S189A、T253M、Q257L、L261F、L261H、L262R、R265Q、F285S、N308D、V428M、A461T、A461G、T468M、P491S、S502L、S502P、G503A、G503V、M504V、Q506P、T507K、Q510P、Q510H及其组合。
13.如权利要求1至12中任一项所述的方法,其中SHP2突变选自由以下组成的组:G60V、D61G、D61V、E69K、A72S、A72T、A72V、T73I、E76A、E76G、E76K、E76Q、S189A、L262R、F285S、N308D、T468M、P491S、S502P、G503V、Q506P、T507K、T253M/Q257L及其组合。
14.如权利要求1至13中任一项所述的方法,其中SHP2突变选自由以下组成的组:A72V、E76K或G503V,以及其组合。
15.如权利要求1至14中任一项所述的方法,其中所述SOS1抑制剂或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体选自WO 2018/115380、WO 2018/172250、WO2019/122129和WO 2019/201848中所公开的那些。
16.如权利要求1至14中任一项所述的方法,其中所述SOS1抑制剂是具有式(41-I)的结构的化合物,
Figure FDA0004194083600000041
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体,其中:
Q1和Q2独立地是CH或N;
Q3、Q4和Q7独立地是C或N,其中Q3和Q4中的至少一个是C并且其中Q3、Q4和Q7不全为N;
Q5是CH、N、NH、O或S;
Q6是CH、N、NH、N-C1-6烷基、N-C1-6杂烷基、N-(3-7元环烷基)、N-(3-7元杂环基)、O或S;
其中Q1、Q2、Q3、Q4、Q5、Q6和Q7中的至少一个是N、NH、O或S;
R1选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、卤素、-NHR1a、-OR1a、环丙基和-CN;其中C1-6烷基任选被卤素、-NHR1a或-OR1a取代;其中R1a是H、C1-6烷基、3-6元杂环基或C1-6卤代烷基;
L2选自由以下组成的组:化学键、-C(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH(CH2)o-、-S(O)2-、
Figure FDA0004194083600000051
Figure FDA0004194083600000052
-C(O)(CH2)p-、-(CH2)p-和-O-;其中o是0、1或2;并且其中p是从1至6的数字;
R2选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、C2-6烯基、-NR2bR2c、-OR2a、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基;其中各C1-6烷基、C2-6烯基、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基独立地任选被以下取代:C1-6烷基、C1-6卤代烷基、-OH、-OR2a、氧代、卤素、-C(O)R2a、-C(O)OR2a、-C(O)NR2bR2c、-CN、-NR2bR2c、3-6元环烷基、3-7元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基;
其中R2a是H、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、3-7元杂环基或-(CH2)rOCH3,其中r是1、2或3;
其中R2b是H或C1-6烷基;
其中R2c是H或C1-6烷基;
R3和R4独立地是H或任选被卤代或-OH取代的C1-6烷基;其中R3和R4中的至少一个是H,或其中R3和R4连同其所连接的原子组合形成3-6元环烷基;并且
A是任选被取代的6元芳基或任选被取代的5-6元杂芳基。
17.如权利要求1至14中任一项所述的方法,其中所述SOS1抑制剂是具有式(42-I)的结构的化合物,
Figure FDA0004194083600000061
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体,其中:
Q1是CH或N;
Q4是CH、C或N;
各Q2独立地是C-R1或N,其中一个Q2是N并且另一个Q2是C-R1
各Q3和Q5独立地是C(RQC)2、NRQN、CO、O、S或SO2,其中各RQC独立地是H、F、Cl、Br或6-10元芳基,并且其中各RQN独立地是H、C1-6烷基或6-10元芳基;
其中Q1、Q2、Q3、Q4和Q5中的至少一个是N、NRQN、O或SO2
m是0、1、2或3;
n是0、1、2或3;
其中当m是0时,则n不是0;
R1选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、卤素、-CONHR1a、-NHR1a、-OR1a、环丙基、氮杂环丁烷基和-CN;其中各C1-6烷基和氮杂环丁烷基任选被卤素、R1a、-NHR1a或-OR1a取代;其中R1a是H、C1-6烷基、环丙基、3-6元杂环基或C1-6卤代烷基;
L2选自由以下组成的组:化学键、-C(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH(CH2)o-、-S(O)2-、
Figure FDA0004194083600000071
Figure FDA0004194083600000072
-C(O)(CH2)p-、-(CH2)p-和-O-;其中o是0、1或2;并且其中p是从1至6的数字;
R2选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、-NR2bR2c、-OR2a、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基;其中各C1-6烷基、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基独立地任选被以下取代:C1-6烷基、C1-6卤代烷基、C1-6羟基烷基、C1-6甲氧基烷基、-OH、-OR2a、氧代、=N、卤素、-C(O)R2a、-C(O)OR2a、-C(O)NR2bR2c、-SO2R2a、-CN、-NR2bR2c、3-6元环烷基、3-7元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基;
其中R2a是H、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、3-7元杂环基或-(CH2)rOCH3,其中r是1、2或3;
其中R2b是H或C1-6烷基;
其中R2c是H或C1-6烷基;
R3和R4独立地是H或任选被卤代或-OH取代的C1-6烷基;其中R3和R4中的至少一个是H,或其中R3和R4连同其所连接的原子组合形成3-6元环烷基;并且
A是任选被取代的6元芳基或任选被取代的5-6元杂芳基;
条件是,当
Figure FDA0004194083600000081
是/>
Figure FDA0004194083600000082
Figure FDA0004194083600000083
/>
Figure FDA0004194083600000084
时;
则R1不是H。
18.如权利要求1至14中任一项所述的方法,其中所述SOS1抑制剂是具有式(48-I)的结构的化合物,
Figure FDA0004194083600000085
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体,其中:
R1选自由以下组成的组:任选被取代的3-6元环烷基、任选被取代的3-6元杂环基、任选被取代的6元芳基和任选被取代的5-6元杂芳基;
R2选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、卤素、-NHR2a、-OR2a、环丙基和-CN;其中C1-6烷基任选被卤素、-NHR2a、-OR2a或5-6元杂环基取代,并且另外其中R2a选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、3-6元杂环基和C1-6卤代烷基;
R3选自由以下组成的组:H、C1-3烷基、-OR3a、环丙基和3-6元杂环基,其中C1-3烷基、环丙基和3-6元杂环基各自任选被R3a取代,并且另外其中R3a选自由以下组成的组:C1-3烷基、卤素、-OH和-CN;
L4选自由以下组成的组:化学键、-C(O)-、-C(O)O-、-C(O)NH(CH2)o-、-NH-、-S-、-S(O)2-、
Figure FDA0004194083600000091
Figure FDA0004194083600000092
-(CH2)p-和-O-;其中o是0、1或2;并且其中p是从1至6的数字;并且
R4选自由以下组成的组:H、C1-6烷基、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基;其中各C1-6烷基、3-14元环烷基、3-14元环烯基、3-14元杂环基、6-10元芳基和5-10元杂芳基任选被以下取代:C1-6烷基、-R4a、-OR4a、-O-C1-6烷基-R4a、=O、卤素、-C(O)R4a、-C(OO)R4a、-C(O)NR4bR4c、-NR4bC(O)R4c、-CN、=NR4a、-NR4bR4c、-SO2R4a、3-6元环烷基、3-7元杂环基、6-10元芳基或5-10元杂芳基;
其中R4a是H、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、-C(O)NR4bR4c、3-6元环烷基、任选被-OR4b取代的6-10元芳基、-CN、3-7元杂环基、-(CH2)rOCH3或-(CH2)rOH,其中r是1、2或3;
其中各R4b独立地是H、C1-6烷基;并且
其中各R4c独立地是H或C1-6烷基。
19.如权利要求1至14中任一项所述的方法,其中所述SOS1抑制剂是具有以下结构的BI-3406:
Figure FDA0004194083600000101
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
20.如权利要求1至14中任一项所述的方法,其中所述SOS1抑制剂是BI-1701963或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
21.如权利要求1至9中任一项所述的方法,其中所述SOS1抑制剂是具有以下结构的BAY-293:
Figure FDA0004194083600000102
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
22.如权利要求1至14中任一项所述的方法,其中所述SOS1抑制剂是SDGR5或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
23.如权利要求1至14中任一项所述的方法,其中所述SOS1抑制剂是具有以下结构的化合物SOS1-(A)(又称为RMC-0331):
Figure FDA0004194083600000111
或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
24.如权利要求1至14中任一项所述的方法,其中所述SOS1抑制剂是化合物SOS1-(B)或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
25.如权利要求1至24中任一项所述的方法,所述方法还包括向所述受试者施用治疗有效量的RAS抑制剂。
26.如权利要求25所述的方法,其中所述RAS抑制剂选自由以下组成的组:RAS(ON)抑制剂、RAS(OFF)抑制剂、MRTX1133或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体,及其组合。
27.如权利要求25所述的方法,其中所述RAS抑制剂对在RAS蛋白的位置12或13处的突变具有选择性。
28.如权利要求25至27中任一项所述的方法,其中所述RAS抑制剂是RAS(ON)抑制剂。
29.如权利要求28所述的方法,其中所述RAS(ON)抑制剂是对RAS G12C、RAS G13D或RASG12D具有选择性的抑制剂。
30.如权利要求28所述的方法,其中所述RAS(ON)抑制剂是RAS(ON)MULTI抑制剂。
31.如权利要求28所述的方法,其中所述RAS(ON)抑制剂选自附录A、附录B、附录C或附录D中任一者的化合物,或附录A、附录B、附录C或附录D中任一者的式所描述的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
32.如权利要求31所述的方法,其中所述RAS(ON)抑制剂是附录A中的式I所描述的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
33.如权利要求32所述的方法,其中所述RAS(ON)抑制剂选自附录A的表1或表2的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
34.如权利要求31所述的方法,其中所述RAS(ON)抑制剂是附录B中的式I所描述的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
35.如权利要求34所述的方法,其中所述RAS(ON)抑制剂选自附录B的表1或表2的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
36.如权利要求31所述的方法,其中所述RAS(ON)抑制剂是附录C中的式I所描述的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
37.如权利要求36所述的方法,其中所述RAS(ON)抑制剂选自附录C的表1或表2的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
38.如权利要求31所述的方法,其中所述RAS(ON)抑制剂是附录D中的式I所描述的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
39.如权利要求38所述的方法,其中所述RAS(ON)抑制剂选自附录D的表1或表1-1的化合物,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
40.如权利要求31所述的方法,其中所述RAS(ON)抑制剂选自由以下组成的组:RAS-(D)、RAS-(E)或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体,及其组合。
41.如权利要求25至27中任一项所述的方法,其中所述RAS抑制剂是RAS(OFF)抑制剂。
42.如权利要求41所述的方法,其中所述RAS(OFF)抑制剂选择性靶向RAS G12C。
43.如权利要求42所述的方法,其中所述RAS(OFF)抑制剂选自由以下组成的组:索托拉西布(AMG 510)、阿达格拉西布(MRTX849)、MRTX1257、JNJ-74699157(ARS-3248)、LY3537982、ARS-853、ARS-1620、GDC-6036、BPI-421286、JDQ443和JAB-21000,或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
44.如权利要求25至27中任一项所述的方法,其中所述RAS抑制剂选择性靶向RASG12D。
45.如权利要求44所述的方法,其中所述RAS抑制剂是MRTX1133或其药学上可接受的盐、溶剂化物、立体异构体、前药或互变异构体。
46.如权利要求1至24中任一项所述的方法,所述方法还包括向所述受试者施用治疗有效量的MEK抑制剂。
47.如权利要求46所述的方法,其中所述MEK抑制剂是匹马色替、司美替尼、考比替尼、曲美替尼或比美替尼。
48.如权利要求1至24中任一项所述的方法,所述方法还包括向所述受试者施用治疗有效量的CDK4/6抑制剂。
49.如权利要求48所述的方法,其中所述CDK4/6抑制剂是阿贝西利、瑞博西尼或帕博西利。
50.如权利要求1至24中任一项所述的方法,所述方法还包括向所述受试者施用治疗有效量的PD-1抑制剂。
51.如权利要求50所述的方法,其中所述PD-1抑制剂是帕博利珠单抗、纳武单抗或西米普利单抗。
52.如权利要求1至51中任一项所述的方法,其中所述疾病或病症选自由以下组成的组:造血系统和淋巴系统肿瘤;骨髓增生综合征;骨髓增生异常综合征;白血病;急性骨髓性白血病;急性B淋巴母细胞性白血病-淋巴瘤;幼年型粒单核细胞性白血病;食道癌;乳癌;肺癌;结肠癌;胃癌;成神经细胞瘤;膀胱癌;前列腺癌;胶质母细胞瘤;尿路上皮癌;子宫癌;腺样和卵巢浆液性囊腺癌;副神经节瘤;嗜铬细胞瘤;胰腺癌;肾上腺皮质癌;胃腺癌;肉瘤;横纹肌肉瘤;淋巴瘤;头颈癌;皮肤癌;腹膜癌;肠癌;甲状腺癌;子宫内膜癌;胆管癌;软组织癌;卵巢癌;中枢神经系统癌;胃癌;垂体癌;生殖道癌;泌尿道癌;唾液腺癌;子宫颈癌;肝癌;眼癌;肾上腺癌;自主神经节癌;上呼吸消化道癌;骨癌;睾丸癌;胸膜癌;肾癌;阴茎癌;甲状旁腺癌;脑膜癌;外阴癌;及黑色素瘤。
53.如权利要求1至51中任一项所述的方法,其中所述疾病或病症选自脑胶质母细胞瘤、肺腺癌、结肠腺癌、骨髓白血病、急性髓细胞性白血病(AML)、乳癌、未知原发部位的黑色素瘤、非小细胞肺癌、皮肤黑色素瘤、乳腺浸润性导管癌、肺鳞状细胞癌、未知原发部位腺癌、骨髓多发性骨髓瘤、食管胃结合部腺癌、骨髓增生异常综合征、前列腺腺泡性腺癌、膀胱尿路上皮(移行细胞)癌、子宫内膜腺癌、急性B淋巴母细胞性白血病-淋巴瘤、胃腺癌及未知原发部位癌瘤。
54.如权利要求1至51中任一项所述的方法,其中所述疾病或病症是急性髓细胞性白血病(AML)。
55.如权利要求54所述的方法,所述方法还包括向所述受试者施用治疗有效量的AML治疗剂。
56.如权利要求54或权利要求55所述的方法,其中所述SHP2突变在选自由以下组成的组的位置处:G60、D61、A72、E76、G503和S502,以及其组合。
57.如权利要求1至51中任一项所述的方法,其中所述疾病或病症选自由以下组成的组:急性骨髓性白血病(AML)、肺腺癌、非小细胞肺癌、脑胶质母细胞瘤、骨髓增生异常综合征、皮肤黑色素瘤、乳癌、胃腺癌、急性B淋巴母细胞性白血病-淋巴瘤及结肠腺癌。
58.如权利要求1至53和57中任一项所述的方法,其中所述SHP2突变在选自由以下组成的组的位置处:G60、D61、E69、A72、E123、Y197、N308、V428、A461、T468、S502、G503、T507及其组合。
59.如权利要求1至53和58中任一项所述的方法,其中所述SHP2突变选自由以下组成的组:G60V、D61G、D61V、D61Y、E69K、E69Q、A72S、A72T、A72V、E123D、N308D、V428M、A461T、A461G、T468M、S502L、S502P、G503A、G503V、T507K及其组合。
60.如权利要求1至51中任一项所述的方法,其中所述疾病或病症是RAS蛋白病。
61.如权利要求1至51和60中任一项所述的方法,其中所述SHP2突变在选自由以下组成的组的位置处:T52、I56、Y62、Y63、E69、K70、E139、L261、R265、N308、T468、M504、Q510及其组合。
62.如权利要求1至51和61中任一项所述的方法,其中所述SHP2突变选自由以下组成的组:T52I、I56V、Y62D、Y63D、Y63C、E69K、E69Q、K70R、E139D、L261F、L261H、R265Q、N308D、T468M、M504V、Q510P、Q510H及其组合。
63.如权利要求60至62中任一项所述的方法,其中所述RAS蛋白病选自由以下组成的组:1型神经纤维瘤病、努南氏综合征、努南氏综合征伴多发性雀斑、毛细管畸形-动静脉畸形综合征、克斯提洛氏综合征、心-面-皮肤综合征、莱克斯综合征及遗传性牙龈纤维瘤病。
64.如权利要求1至63中任一项所述的方法,所述方法还包括执行诊断测试以确定所述受试者是否具有诱导SHP2的活化形式的SHP2突变。
65.如权利要求25至64中任一项所述的方法,其中所述RAS抑制剂靶向野生型RAS蛋白。
66.如权利要求25至64中任一项所述的方法,其中所述RAS抑制剂靶向RAS蛋白突变。
67.如权利要求66所述的方法,其中所述RAS蛋白突变在选自由以下组成的组的位置处:G12、G13、Q61、A146、K117、L19、Q22、V14、A59及其组合。
68.如权利要求67所述的方法,其中所述突变在选自由以下组成的组的位置处:G12、G13和Q61,以及其组合。
69.如权利要求68所述的方法,其中所述突变选自由以下组成的组:G12C、G12D、G12A、G12S、G12V、G13C、G13D、Q61K和Q61L,及其组合。
70.如权利要求25至69中任一项所述的方法,其中所述RAS蛋白是KRAS。
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