JP2020518259A5

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Publication number: JP2020518259A5
Application number: JP2019560248A
Authority: JP
Filing date: 2018-05-04
Publication date: 2021-07-26

Claims

第１の末端逆位配列（ＩＴＲ）と、センス鎖配列およびアンチセンス鎖配列をコードする調節性ポリヌクレオチドを含む核酸に作動可能に連結されたプロモータと、第２のＩＴＲとを含むアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ゲノムであって、
前記コードされたアンチセンス鎖配列が、配列番号９１８、９２０、９１４〜９１７、９１９、または９２１〜１０１３のいずれか１つのヌクレオチド配列と少なくとも８０％、８５％、または８６％同一のヌクレオチド配列を含み、
前記ＡＡＶウイルスゲノムが、以下のうちの１つまたは複数を含む、
（ｉ）配列番号１３８０または１３８１〜１３８３のいずれか１つのヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも９０〜９５％同一の配列を含む第１のＩＴＲ配列；
（ｉｉ）配列番号１４１０、１４１１〜１４１４のいずれかのヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも９０〜９５％同一の配列を含むプロモータ；または
（ｉｉｉ）配列番号１３８２、１３８０、１３８１、１３８３、または１３８４のいずれか１つのヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも９０〜９５％同一の配列を含む第２のＩＴＲ配列、
アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ゲノム。
前記コードされたアンチセンス鎖配列が、配列番号９１８、９２０、９１４〜９１７、９１９、または９２１〜１０１３のいずれか１つのヌクレオチド配列を含む、請求項１に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
前記コードされたセンス鎖配列が、配列番号１０７９、１０８２、１０４４、１０１４〜１０４３、１０４５〜１０７８、１０８０、１０８１、または１０８３〜１１６０のいずれか１つのヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも８０％、８５％、または８６％同一のヌクレオチド配列を含む、請求項１または２に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
（ｉ）前記コードされたアンチセンス鎖配列が、配列番号９１８のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも８０％、８５％、または８６％同一のヌクレオチド配列を含み、かつ前記コードされたセンス鎖配列が、配列番号１０７９のヌクレオチド配列を含み；
（ｉｉ）前記コードされたアンチセンス鎖配列が、配列番号９１８のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも８０％、８５％、または８６％同一のヌクレオチド配列を含み、かつ前記コードされたセンス鎖配列が、配列番号１０８２のヌクレオチド配列を含み；または
（ｉｉｉ）前記コードされたアンチセンス鎖配列が、配列番号９２０のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも８０％、８５％、または８６％同一のヌクレオチド配列を含み、かつ前記コードされたセンス鎖配列が、配列番号１０４４のヌクレオチド配列を含む、
請求項１〜３のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
前記コードされたアンチセンス鎖配列が、９１４〜９１７、９１９、または９２１〜１０１３のいずれか１つのヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも８０％、８５％、または８６％同一のヌクレオチド配列を含み、かつ
前記コードされたセンス鎖配列が、１０１４〜１０４３、１０４５〜１０７８、１０８０、１０８１、または１０８３〜１１６０を含むヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも８０％、８５％、または８６％同一のヌクレオチド配列を含む、
請求項１〜３のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
（ｉ）前記アンチセンス鎖配列をコードするヌクレオチド配列が、配列番号１３３５、１３５１、１３３６、１３３３、１３３４、１３３７〜１３４５、または１３５０のいずれか１つのヌクレオチド配列を含み；
（ｉｉ）前記センス鎖配列をコードするヌクレオチド配列が、配列番号１３３１、１３４９、１３０９、１２８０〜１３０８、１３１０〜１３３０、１３３２、または１３４８のいずれか１つのヌクレオチド配列を含み；
（ｉｉｉ）前記アンチセンス鎖配列をコードするヌクレオチド配列が、配列番号１３３５のヌクレオチド配列を含み、かつ前記センス鎖配列をコードするヌクレオチド配列が、配列番号１３３１のヌクレオチド配列を含み；
（ｉｖ）前記アンチセンス鎖配列をコードするヌクレオチド配列が、配列番号１３５１のヌクレオチド配列を含み、かつ前記センス鎖配列をコードするヌクレオチド配列が、配列番号１３４９のヌクレオチド配列を含み；または
（ｖ）前記アンチセンス鎖配列をコードするヌクレオチド配列が、配列番号１３３６のヌクレオチド配列を含み、かつ前記センス鎖配列をコードするヌクレオチド配列が、配列番号１３０９のヌクレオチド配列を含む、
請求項１〜５のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
前記コードされたアンチセンス鎖配列および／または前記コードされたセンス鎖配列が、
（ｉ）１９〜２５ヌクレオチド長、１９〜２４ヌクレオチド長、または１９〜２１ヌクレオチド長；および／または
（ｉｉ）少なくとも１９、２０、または２１ヌクレオチド長、
を含む、請求項１〜６のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
（ｉ）前記コードされたセンス鎖配列および前記コードされたアンチセンス鎖配列が、少なくとも１ヌクレオチドの３’オーバハングを含み；
（ｉｉ）前記コードされたセンス鎖配列および前記コードされたアンチセンス鎖配列が、少なくとも２ヌクレオチドの３’オーバハングを含み；および／または
（ｉｉｉ）前記コードされたアンチセンス鎖配列および標的ｍＲＮＡ配列が、少なくとも１つのミスマッチを含む、
請求項１〜７のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
前記調節性ポリヌクレオチドが、
（ｉ）第１のフランキング領域；
（ｉｉ）ループ領域；および／または
（ｉｉｉ）第２のフランキング領域、をさらに含む、
請求項１〜８のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
前記第１のフランキング領域が、
（ｉ）５’スペーサ配列および５’フランキング配列であって、前記５’フランキング配列が任意選択で前記５’スペーサ配列の５’に位置する、５’スペーサ配列および５’フランキング配列；および／または
（ｉｉ）配列番号１１６３、１１６７、１１６１、１１６２、または１１６４〜１１６６のいずれかのヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも９０〜９５％同一のヌクレオチド配列、
を含む、請求項９に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
前記ループ領域が、
（ｉ）配列番号１１７２、１１７５、１１６９、１１６８、１１７０、１１７１、１１７３、または１１７４のいずれかのヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも８０％同一のヌクレオチド配列を含む；および／または
（ｉｉ）４〜２０ヌクレオチド長である、
請求項９または１０に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
前記調節性ポリヌクレオチドが、ステムループ構造を含み、
前記ステムループ構造が、５’から３’方向に、
（ｉ）５’スペーサ配列および前記センス鎖配列を含む５’ステムアームであって、前記５’スペーサ配列が前記センス鎖配列の５’に位置する、５’ステムアーム；
（ｉｉ）前記ループ領域；および／または
（ｉｉｉ）前記アンチセンス鎖配列および３’スペーサ配列を含む３’ステムアームであって、前記３’スペーサ配列が前記アンチセンス鎖配列の３’に位置する、３’ステムアーム、
を含む、請求項１〜９のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
前記第２のフランキング領域が、
（ｉ）３’スペーサ配列および３’フランキング配列であって、前記３’フランキング配列が任意選択で前記３’スペーサ配列の３’に位置する、３’スペーサ配列および３’フランキング配列；および／または
（ｉｉ）配列番号１１７８、１１８２、または１１７９〜１１８１のいずれかのヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも９０％〜９５％同一のヌクレオチド配列、
を含む、請求項９〜１２のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
前記ポリヌクレオチドが、５から３’方向に、
（ｉ）５’フランキング領域、センス鎖配列、ループ領域、アンチセンス鎖配列、および３’フランキング領域；または
（ｉｉ）５’フランキング領域、アンチセンス鎖配列、ループ領域、センス鎖配列、および３’フランキング領域、
を順に含む、請求項１〜１３のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
前記調節性ポリヌクレオチドが、
（ｉ）配列番号１２６２、１３４７、１２５０、１１８３〜１２４９、１２５１〜１２６１、１２６３〜１２７９または１３４６のいずれか１つのヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも９０〜９５％同一のヌクレオチド配列；
（ｉｉ）配列番号１２６２のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも９０〜９５％同一のヌクレオチド配列；
（ｉｉｉ）配列番号１３４７のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも９０〜９５％同一のヌクレオチド配列；
（ｉｖ）配列番号１２５０のヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも９０〜９５％同一のヌクレオチド配列、
を含む、請求項９〜１４のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
（ｉ）第１のＩＴＲ配列が、配列番号１３８０または１３８１〜１３８３のいずれか１つのヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも９０〜９５％同一の配列を含む；
（ｉｉ）前記プロモータが、ＣＢＡプロモータ、ＣＭＶプロモータ、Ｈ１プロモータ、Ｔ７プロモータ、ＵＢＣプロモータ、ＧＵＳＢプロモータ、ＮＳＥプロモータ、シナプシンプロモータ、ＭｅＣＰ２プロモータ、またはＧＦＡＰプロモータを含む；
（ｉｉｉ）前記プロモータが、配列番号１４１０、１４１１〜１４１４のいずれかのヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも９０〜９５％同一の配列を含む；および／または
（ｉｖ）前記第２のＩＴＲ配列が、配列番号１３８２、１３８０、１３８１、１３８３、または１３８４のいずれか１つのヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも９０〜９５％同一の配列を含む、
請求項１〜１５のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
（ｉ）エンハンサー；
（ｉｉ）多重クローニング部位（ＭＣＳ）、例えば、少なくとも１つまたは少なくとも２つのＭＣＳ；
（ｉｉｉ）イントロン、例えば、少なくとも１、２、または３つのイントロン；
（ｉｖ）エクソン、例えば、少なくとも１、２、または３つのエクソン；
（ｖ）フィラー配列；
（ｖｉ）ｍｉＲＮＡ結合部位；および／または
（ｖｉｉ）ポリＡシグナル配列領域、
をさらに含む、請求項１〜１６のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
（ｉ）前記エンハンサーが、ＣＭＶエンハンサーを含む；
（ｉｉ）前記エンハンサーが、配列番号１４０８または１４０９を含む；
（ｉｉｉ）前記ＭＣＳが、配列番号１３８４〜１３８７または１３８９のいずれか１つのヌクレオチド配列、またはＴＣＧＡＧのヌクレオチド配列を含む；
（ｉｖ）前記イントロンが、ＳＶ４０イントロン、Ｉｅ１イントロン、またはβグロビンイントロンを含む；
（ｖ）前記イントロンが、配列番号１４１７〜１４１９のいずれか１つのヌクレオチド配列を含む；
（ｖｉ）前記エクソンが、Ｉｅ１エクソンまたはβグロビンエクソンを含む；
（ｖｉｉ）前記エクソンが、配列番号１４１５または１４１６のヌクレオチド配列を含む；
（ｖｉｉｉ）前記ポリＡシグナル配列領域が、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む；および／または
（ｉｘ）ポリＡシグナル配列領域が、配列番号１４２０〜１４２３のいずれか１つのヌクレオチド配列を含む、
請求項１７に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
（ｉ）配列番号１３８０および１３８１から選択される５’末端逆位配列（ＩＴＲ）配列領域；
（ｉｉ）配列番号１４０８および１４０９から選択されるエンハンサー配列領域；
（ｉｉｉ）配列番号１４１０〜１４１４から選択されるプロモータ配列領域；
（ｉｖ）配列番号１４１７〜１４１９から選択される第１のイントロン配列領域；
（ｖ）配列番号１２６２、１３４７、１２５０、１１８３〜１２４９、１２５１〜１２６１、１２６３〜１２７９および１３４６から選択される調節性ポリヌクレオチド配列領域；
（ｖｉ）配列番号１４２０〜１４２３から選択されるポリアデニル化（ｐｏｌｙＡ）シグナル配列領域；および
（ｖｉｉ）配列番号１３８２および１３８３から選択される３’ＩＴＲ配列領域、
を順に含む、請求項１〜１８のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
（ｉ）配列番号１３８０の配列を含む５’末端逆位配列（ＩＴＲ）配列領域；
（ｉｉ）配列番号１３８４の配列を含む第１の多重クローニング部位（ＭＣＳ）配列領域；
（ｉｉ）配列番号１４０８の配列を含むエンハンサー配列領域；
（ｉｉｉ）配列番号１４１０の配列を含むプロモータ配列領域；
（ｉｖ）配列番号１４１７の配列を含む第１のイントロン配列領域；
（ｖ）配列番号１２６２、１２５０、および１３４７から選択される調節性ポリヌクレオチド配列領域；
（ｖｉ）配列ＴＣＧＡＧを含む第２のＭＣＳ配列領域；
（ｖｉｉ）配列番号１４２０の配列を含むポリアデニル化（ｐｏｌｙＡ）シグナル配列領域；および
（ｖｉｉｉ）配列番号１３８２の配列を含む３’ＩＴＲ配列領域、
を順に含む、請求項１〜１８のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム。
請求項１〜２０のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム、およびカプシドを含む、ＡＡＶウイルス粒子。
前記カプシドが、ＡＡＶ１カプシドである、請求項２１に記載のＡＡＶウイルス粒子。
請求項１〜２０のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノムを含む核酸を含む、ベクター。
請求項１〜２０のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム、請求項２１もしくは２２に記載のＡＡＶウイルス粒子、または請求項２３に記載のベクターを含む、細胞であって、
任意選択で、前記細胞が、哺乳類細胞、中型有棘ニューロン、皮質ニューロン、またはアストロサイトである、細胞。
請求項１〜２０のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム、または請求項２１もしくは２２に記載のＡＡＶウイルス粒子と、薬学的に許容可能な賦形剤とを含む、医薬組成物。
細胞におけるＨＴＴ発現を阻害する方法に使用するための組成物であって、
請求項１〜２０のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノムを含むＡＡＶウイルス粒子、請求項２１もしくは２２に記載のＡＡＶウイルス粒子、または請求項２５に記載の医薬組成物を含む、組成物。
前記細胞が、
（ｉ）哺乳類細胞；
（ｉｉ）ＣＮＳ細胞；
（ｉｉｉ）ニューロン；
（ｉｖ）中型有棘ニューロンまたは皮質ニューロン；
（ｖ）アストロサイト；および／または
（ｖｉ）対象内、
である、請求項２６に記載の組成物。
前記対象が、ハンチントン病（ＨＤ）を有すると診断されているか、または診断された、請求項２６に記載の組成物。
対象におけるハンチントン病（ＨＤ）の治療に使用するための組成物であって、
請求項１〜２０のいずれか一項に記載のＡＡＶウイルスゲノム、請求項２１もしくは２２に記載のＡＡＶウイルス粒子、または請求項２５に記載の医薬組成物を含む、組成物。
前記治療が、
（ｉ）前記対象におけるＨＤの症状の改善であって、任意選択で、前記症状が、無関心または自発性の欠如、不機嫌、易怒、激越または不安、自己管理不足、判断力低下、強情、脱抑制、抑欝、自殺念慮、多幸症、攻撃性、妄想、強迫、性欲亢進、幻覚、ジストニア、発話の悪化、不明瞭な発話、嚥下困難、体重減少、動作緩慢、協調運動障害、認知機能障害、不安定歩行と不随意運動（舞踏運動）、ＣＮＳ悪化である、改善；および／または（ｉｉ）ＨＤの予防、を含む、
請求項２９に記載の組成物。
ＨＴＴ遺伝子、ｍＲＮＡ、および／またはタンパク質の発現が、ＣＮＳ細胞および／またはＣＮＳ領域において阻害され、
任意選択で、
（ｉ）前記ＣＮＳ細胞が、ニューロン、中型有棘ニューロン、アストロサイト、またはそれらの組合せを含み；
（ｉｉ）前記ＣＮＳ領域が、前脳領域、中脳領域、被殻領域、線条体領域、皮質領域、運動皮質領域、体性感覚皮質領域、側頭皮質領域、またはそれらの組合せであり；および／または
（ｉｉｉ）前記ＣＮＳ領域が被殻領域である、
請求項２６〜３０のいずれか一項に記載の組成物。
（ｉ）ＨＴＴｍＲＮＡの発現が、少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％阻害され；および／または
（ｉｉ）前記ＨＴＴ遺伝子が、前記細胞内で機能獲得効果を引き起こす、
請求項２６〜３１のいずれか一項に記載の組成物。
前記ＨＴＴが、野生型ＨＴＴ遺伝子、ｍＲＮＡ、および／またはタンパク質；少なくとも１つの突然変異を含むＨＴＴ遺伝子、ｍＲＮＡ、および／またはタンパク質；ＣＡＧリピート、例えば、ＣＡＧ伸張ＨＴＴ、任意選択で少なくとも３６〜４０以上のＣＡＧリピートを含む、ＨＴＴ遺伝子；またはそれらの組合せを含む、
請求項２６〜３２のいずれか一項に記載の組成物。
前記ＨＤが、
（ｉ）若年性ＨＤ、例えば２〜２０歳の対象のＨＤ；
（ｉｉ）初期段階のＨＤ；
（ｉｉｉ）後期段階のＨＤ；
（ｉｖ）完全浸透ＨＤであって、例えば、前記ＨＴＴ遺伝子が少なくとも４１回以上のＣＡＧリピートを有する、完全浸透ＨＤ；
（ｖ）不完全浸透ＨＤ、例えば、前記ＨＴＴ遺伝子が少なくとも３６〜４０回のＣＡＧリピートを有する、不完全浸透ＨＤ；および／または
（ｖｉ）無症候性のＨＤ、
である、請求項２８〜３３のいずれか一項に記載の組成物。
前記組成物が、
（ｉ）前記対象の被殻および／または視床に；
（ｉｉ）対象への両側注入（例えば、両側性被殻内注入）を介して；および／または
（ｉｉｉ）実質内注射によって；
投与される、請求項２７〜３４のいずれか一項に記載の組成物。
前記組成物が、ＨＤの治療または予防に好適な追加の治療剤と併用して前記対象に投与され、
任意選択で、前記追加の治療薬が、神経保護剤、ドーパミン枯渇剤（例えば、テトラベナジン）、ベンゾジアゼピン（例えば、クロナゼパム）、抗痙攣薬（例えば、バルプロ酸ナトリウムおよび／またはレベチラセタム）、ドーパミンのアミノ酸前駆物質（例えば、レボドパ）、骨格筋弛緩薬（例えば、バクロフェン、チザニジン）、神経筋接合部におけるアセチルコリン放出の阻害剤（例えば、ボツリヌス毒素）、非定型神経遮断薬（例えば、オランザピン、クエチアピン、リスペリドン、スルピリド、ハロペリドール、クロザピン、アリピプラゾール）、ＡＴＰ／細胞エナジェティクスを増加させる薬剤（例えば、クレアチン）、選択的セロトニン再取込み阻害薬（ＳＳＲＩ）（例えば、シタロプラム、フルオキセチン、パロキセチン、セルトラリン、ミルタザピン、ベンラファキシン）、催眠剤（例えば、ゾピクロンおよび／またはゾルピデム）、気分安定薬（例えば：リチウム）、ＩＧＦ−Ｉ、ＧＤＮＦ、ＢＤＮＦ、ＣＴＮＦ、ＶＥＧＦ、コリベリン、キサリプロデン、甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン、ＡＤＮＦ、またはそれらの組合せ、を含む、
請求項２９〜３５のいずれか一項に記載の組成物。