JPH10511264A - 高力価組換えaavベクターの生成のためのパッケージング細胞株 - Google Patents

高力価組換えaavベクターの生成のためのパッケージング細胞株

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JPH10511264A JP8517764A JP51776496A JPH10511264A JP H10511264 A JPH10511264 A JP H10511264A JP 8517764 A JP8517764 A JP 8517764A JP 51776496 A JP51776496 A JP 51776496A JP H10511264 A JPH10511264 A JP H10511264A
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Abstract

(57)【要約】 AAVベクターは、遺伝子治療で有用性を有し得るが、これまで、ヒト遺伝子治療の適用に臨床的に有用である量で、十分な量のこのような組換えベクターを生成できないことが重大な障害であった。安定なAAVパッケージング細胞株は、主にRepタンパク質の活性のため捕らえどころがなかった。Repタンパク質は、それ自身の発現をダウンレギュレートし、宿主細胞に負に影響し得る。本発明は、これらの問題を効率的に回避し、そしてパッケージング効率を実質的に増加し得る、AAVベクターをパッケージングするためのパッケージング系およびプロセスを提供する。

Description

【発明の詳細な説明】 高力価組換えAAVベクターの生成のためのパッケージング細胞株 発明の技術分野 本発明は、遺伝子治療、およびさらに詳細には遺伝子治療手順に使用するため の高力価組換えAAVベクターの生成に使用される物質および方法に関する。発明の背景 AAVベクターは、遺伝子治療に有用性を有し得るが、これまでは、ヒトへの遺 伝子治療の適用のために臨床的に有用な量で、このような組換えベクターの十分 量を生成する能力がないという重大な障害があった。これは、肺に直接送達する ようなインビボでの適用に特に問題である。 アデノ関連ウイルス(AAV)ベクターは、インビボの遺伝子転移因子として有用 性を有することが示された数少ない組換えウイルスベクター系の中のものであり (Carter、1992、Current Opinion in Biotechnology、3:533-539;Muzcyzka、1992、C urr.Top.Microbiol.Immunol .158:97-129に総説されている)、従って潜在的にヒ トの遺伝子治療に大変重要である。AAVベクターは、嚢胞性線維症(CF)気管支お よび鼻上皮細胞(Flotteら、1992a、Am.J.Respir.Cell Mol.Biol.7:349-356;Eganら、 1992、Nature、358:581-584;Flotteら、1993a、J.Biol.Chem.268:3781-3790;および Flotteら、1993b、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、93:10163-10167)、ヒト骨髄由来赤白 血病細胞(Walshら、1992、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、89:7257-7261)、およびいくつ かの別のものを包含する種々の細胞で、高頻度の安定なDNA組込みおよび発現を し得る。AAVは、安定な発現のために活発な細胞分裂を必要とし得ず、これはレ トロウイルスに対して、特に大部分の細胞が最終的に分化を終えており、そして 非分裂であるヒトの気道上皮のような組織では明らかに有利である。 AAVは、一定の機能が同時感染ヘルパーウイルスによって提供される細胞にお いてのみ増殖する欠陥パルボウイルスである(図1を参照のこと)。一般的なAA Vの総説は、Carter、1989、Handbook of Parvoviruses、第I巻、169-228頁、Berns、1 9 90、Virology、1743-1764頁、Raven Press、(New York)に見出され得る。AAVの増 殖および複製に対するヘルパー機能を提供する同時感染ウイルスの例は、アデノ ウイルス、ヘルペスウイルス、およびある場合にはワクシニアのような天然痘ウ イルスである。ヘルパー機能の性質は完全には知られていないが、細胞をAAV複 製に対して許容させるヘルパーウイルスのある程度の間接的な効果であるようで ある。この概念は、細胞を遺伝子毒性のある(genotoxic)薬剤または細胞周期を 中断させる薬剤のいずれかで処理すると、特定の場合に、ヘルパーウイルスの同 時感染なしではAAV複製が低レベルの効率で生じ得るという観察により支持され る。 AAVは、特定の通常でない条件下では、ヘルパーウイルス非存在下で限られた 程度で複製し得るにもかかわらず、上記のように、より一般的な結果は、ヘルパ ー機能非存在下での細胞のAAVでの感染が、AAVの宿主細胞ゲノムへの組込みをも たらすことである。組込まれたAAVゲノムは、組込まれたAAVプロウイルスを含有 する細胞をアデノウイルスのようなヘルパーウイルスで追いうち感染した場合、 感染性の子孫AAV粒子のバーストを与えるために回収および複製され得る。なぜ なら、AAVの組込みは効果的な反応と思われることから、このことはAAVがヒトの 遺伝子治療のような用途のために細胞に遺伝子を導入し、安定に発現させる有用 なベクターであることを示唆した。 AAVは、明らかな種特異性も組織特異性も伴わない非常に広い宿主域を有し、 そして、適切なヘルパーが存在すれば、ヒト、サル、齧歯類起源の事実上任意の 細胞株で複製する。AAVは遍在し、そして大部分の哺乳動物およびいくつかのト リ種を包含する広範囲の動物種から単離されている。 AAVは、いずれの疾患の原因とも関係しない。AAVは、トランスフォーミングウ イルスまたは腫瘍ウイルスではない。ヒト細胞株の染色体へのAAVの組込みによ って、細胞の増殖特性または形態的特徴におけるいずれの顕著な変化も生じない 。また、これらのAAVの特性から、潜在的に有用なヒト遺伝子治療ベクターとし てAAVが勧められる。なぜなら、この適用に提案されるレトロウイルス、アデノ ウイルス、ヘルペスウイルス、またはポックスウイルスのような他の大部分のウ イルス系は、疾患を引き起こすウイルスであるからである。 AAV粒子は、3つのキャプシドタンパク質VP1、VP2、およびVP3を有するタンパ ク質キャプシドからなっており、そしてDNAゲノムを囲んでいる。AAVのDNAゲノ ムは、約1.5×106ダルトンの分子量またはおよそ4680ヌクレオチドの長さを有す る直鎖状一本鎖DNA分子である。相補的センスの「プラス」または「マイナス」 鎖のいずれかの鎖が個々の粒子にパッケージングされるが、それぞれの粒子は1 つのDNA分子しか有しない。同数のAAV粒子が、プラス鎖またはマイナス鎖のいず れかを含有する。どちらの鎖も同等に感染性であり、そして複製は親の感染一本 鎖を二本鎖の形態に変換し、次に二本鎖分子の大きなプールの増幅が起き、その 二本鎖から子孫の一本鎖がはずされ、そしてキャプシドにパッケージングされる 。細菌プラスミドまたはファージミドに挿入された二本鎖または一本鎖コピーの AAVゲノムは、アデノウイルス感染細胞にトランスフェクトされた場合に感染性 であり、そしてこれはAAV遺伝学の研究およびAAVベクターの開発を可能にしてい る。 AAV2ゲノムは、2コピーの145ヌクレオチド長のITR(逆方向末端反復)をゲノ ムの各末端に有し、そしてrepおよびcap遺伝子(Hermonatら、J.Virol. 51:329-3 39;Tratschinら、1984a、J.Virol.、51:611-619)の2つの主要なオープンリーディ ングフレームを含有する4470ヌクレオチド長(Srivastavaら、1983、J.Virol.、45 ;555-564)の非反復配列領域を有する。非反復領域は、repおよびcap遺伝子を発 現させるために使用される3つの転写プロモーターp5、p19およびp40(Laughlin ら、1979、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、76:5567-5571)を含有する。ITR配列は、シス で必要とされ、そして機能的な複製開始点(ori)を提供するのに十分であり、そ してまた細胞ゲノムへの組込みおよび宿主細胞染色体または組換えプラスミドか らの効率的な切り出しおよび回収に必要とされるシグナルを供給するのに十分で ある。さらに、ITRは、AAVベクターの転写プロモーターとして直接機能し得るこ とが示されている(Flotteら、1993、前出)。 repおよびcap遺伝子は、それぞれウイルスゲノムの複製およびキャプシド化機 能を提供するためにトランスで必要とされる。rep遺伝子は、2つのプロモータ ー p5およびp19から発現される。p5からの転写は、タンパク質Rep78をコードす るスプライシングされない4.2kbのmRNA、およびタンパク質Rep68をコードするス プライシングされた3.9kbのmRNAを生成する。p19からの転写は、Rep52をコード するスプライシングされないmRNA、およびRep40をコードするスプライシングさ れた3.3kbのmRNAを生成する。従って、4つのRepタンパク質全てが、共通する内 部領域配列を含むが、それらのアミノ末端およびカルボキシル末端領域について は異なる。Rep78およびRep68のみが、AAV二本鎖DNAの複製に必要とされるが、Re p52およびRep40は、子孫の一本鎖DNAの蓄積に必要とされるようである。Rep78お よびRep68の変異は、表現型がRep-であり、一方Rep52およびRep40のみに影響す る変異はRep+であるがSsd-である。Rep68およびRep78は、AAVのITRのヘアピン立 体構造に特異的に結合し、そしてAAV末端で複製を決定するのに必要ないくつか の酵素活性を有する。Rep52およびRep40は、これらの特性のいずれもを有さない 。 Repタンパク質、主としてRep78およびRep68は、AAV遺伝子の正の調節または負 の調節、およびいくつかの異種プロモーターからの発現を包含するいくつかの多 面的調節活性、ならびに細胞増殖に対する阻害効果を示す(Tratschinら、1986、Mo l.Cell.Biol. 6:2884-2894;Labowら、1987、Mol.Cell.Biol.7:1320-1325;Khleifら、Virology、 181:738-741)。AAVのp5プロモーターは、Rep78またはRep68によって負 に自己調節される(Tratschinら、1986、Mol.Cell.Biol.6:2884-2894)。細胞増殖に 対するrepの発現阻害効果ゆえに、細胞株でのrepの構成的発現は、容易に達成さ れていない。例えば、Mendelsonら(1988、Virology、166:154-165)は、AAVゲノム の安定な組込み後の特定の細胞株でのいくつかのRepタンパク質の非常に低レベ ルな発現を報告した。 タンパク質VP1、VP2、およびVP3は全て共通の重復配列を共有するが、VP1およ びVP2が付加的なアミノ末端配列を含むという点で異なっている。3つの全ての タンパク質とも、p40プロモーターから転写された2.3kbのスプライシングされた mRNAから発現される同じcap遺伝子のリーディングフレームからコードされる。V P2およびVP3は、別の開始コドンを使用して同じmRNAから生成される。VP1は、VP 2およびVP3をコードする主要mRNAに使用される3'ドナーから30ヌクレオチド上流 の3'ドナー部位を使用する主要でないmRNAからコードされる。VP1、VP2、および VP3は、全てキャプシド産生に必要とされる。3つの全てのタンパク質を除去す る変異(Cap-)が、一本鎖子孫AAVのDNAの蓄積を妨げる一方、VP1アミノ末端内の 変異(Lip-、Inf-)は、一本鎖の産生を可能にするが、安定な感染性粒子のアセン ブリを妨げる。 上記のAAVの遺伝解析は、細菌のプラスミドに分子的にクローン化されたAAVゲ ノムの変異解析に基づいていた。初期の研究では、AAVの感染性ゲノムの分子ク ローンは、GCテーリング(Samulskiら、1982、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、79:2077-20 81)、制限エンドヌクレアーゼを含有する合成リンカーの付加(Laughlinら、1983、Gene、 23:65-73)または直接平滑末端連結(SenapathyおよびCarter、1984、J.Biol.C hem.、 259:4661-4666)のような手順でプラスミドにAAVの二本鎖分子を挿入するこ とにより構築した。次に、アデノウイルスのような適当なヘルパーウイルスでも また感染させた哺乳動物細胞にこのようなAAV組換えプラスミドをトランスフェ クトすると、任意のプラスミド配列を含まないAAVゲノムの回収および切り出し 、および回収されたゲノムの複製ならびに一定量の子孫の感染性AAV粒子の産生 をもたらした。これは、上記で概略したようにAAVの遺伝解析を行うための基礎 を提供し、そしてAAV形質導入ベクターの構築を可能にした。 遺伝解析に基づいて、AAVベクター構築の一般原理は、最近考察されたように 定義された(Carter、1992、Current Opinions in Biotechnology、3:533-539;Muzyc zka、1992、Current Topics in Microbiology and Immunology、158:97-129)。AAV ベクターは、ベクタープラスミドを生成するためにAAVをコードする配列部分を 外来DNAに置換することによりAAV組換えプラスミド内に構築される。ベクタープ ラスミドでは、AAV配列の末端(ITR)部分は完全に保持されていなければならない 。なぜなら、これらの領域はトランスフェクション後のプラスミドからの切り出 し、ベクターゲノムの複製、ならびに宿主細胞ゲノムからの組込みおよび回収を 含むいくらかの機能がシスで要求されるからである。次に、AAV形質導入ウイル スの生成のために、アデノウイルスまたはヘルペスウイルスのような適切なヘル パーウイルスで感染した細胞にベクタープラスミドをトランスフェクトすること により、ベクターはAAV粒子にパッケージングされ得る。複製およびベクターゲ ノムのAAV粒子へのキャプシド化を達成するために、ベクタープラスミドは、ベ クタープラスミドの構築物に欠失しているトランスで必要な任意のAAV機能、す なわちrepおよびcapを相補しなければならない。 ヒトの遺伝子治療に使用するために設計した任意のAAVベクターの所望の特徴 は少なくとも2つある。第1に、形質導入ベクターは、送達系として実用的な十 分に高い力価で生成されねばならない。これは、インビボでのベクター送達を目 的とした遺伝子治療ストラテジーでは特に重要である。気道へのインビボでの直 接送達による嚢胞性線維症の処置のようなAAVベクターの多くの所望される適用 については、必要とされる形質導入ベクターの量は1010を越えるようである。第 2に、ベクター調製物には、野生型のAAVウイルスが存在してはならない。高力 価AAVベクターの達成は、野生型AAVゲノムが存在するまたは組換えにより生成さ れる場合、野生型AAVゲノムを優先的にキャプシド化すること、およびrepまたは capのような十分な相補機能を生成することが不可能であることを包含するいく つかの理由から困難である。このような相補機能を発現する有用な細胞株は、部 分的にはrep遺伝子のいくつかの阻害機能のため、生成されていない。 記載された最初のAAVベクターは、AAV転写プロモーターまたはSV40プロモータ ーから発現されるneoまたはcatまたはdhfrのような外来レポーター遺伝子を含有 した(Tratschinら、1984b、Mol.Cell.Biol.4:2072-2081;HermonatおよびMuzyczka 、1984、Proc.Natl.Acad.Sci.USA、81:6466-6470;Tratschinら、1985、Mol.Cell.Bi ol. 5:3251-3260;McLaughlinら、1988、J.Virol.、62:1963-1973;Lebkowskiら、198 8、Mol.Cell.Biol.、7:349-356)。これらのベクターは、アデノウイルス感染細胞 に、天然の野生型AAV転写プロモーターから発現されるAAVのrepおよびcap遺伝子 を含有する第2のパッケージングプラスミドとともに同時トランスフェクション することにより、AAV形質導入粒子中にパッケージングされた。パッケージング プラスミドのAAV粒子へのパッケージを妨げる試みでは、いくつかのアプローチ が行われた。いくつかの場合(HermonatおよびMuzyczka、1984;McLaughlinら、198 8)、パッケージングプラスミドは、AAV配列内のバクテリオファージラムダDNAの ラージ領域を挿入し、パッケージングされ得ない過剰サイズのゲノムを生成した 。他の場合において(Tratschinら、1984b;Tratschinら、1985、Lebkowskiら、1988) 、パッケージングプラスミドは、切り出しおよび複製ができず、そのためパッケ ージングできないように、AAVのITR領域を欠失した。これらの全てのアプローチ は、野生型AAVのDNAを含有する粒子の生成を妨げず、そしてまた効果的な高力価 のAAV形質導入粒子を生成しなかった。実際、104mlを越えない力価は、Hermonat およ びMuzyczka、1984により引用されなかった。これらの研究での野生型AAV粒子の生 産は、おそらくベクターおよびパッケージングプラスミドに存在するAAV配列間 の重複する相同性の存在によるものであった。SenapathyおよびCarter(1984、J.B iol.Chem.、 259:4661-4666)により、このような系の組換えの程度が、配列の重復 の程度とほぼ同等であることが示された。初期の研究の総説(Carter 1989、Handb ook of Parvoviruses、 第II巻、247-284ページ、CRC Press、Boca Raton、FL)で、1m lあたり106の力価が得られたことが示唆されたが、これはベクター調製物に大量 の野生型AAVが混入している上記の研究に基づいていた。野生型AAVを含有するこ のようなベクター調製物は、ヒトの遺伝子治療には有用でない。さらに、これら の初期のベクターは、低い形質導入効率を表し、そして細胞あたり50,000粒子ま での多重度でベクターを供給したとしても、様々なヒトの細胞株培養物中で1% より多いまたは2%の細胞を形質導入しなかった。これは、部分的には野生型AA V粒子の混入およびベクター中のAAVのrep遺伝子の存在を反映し得た。さらに、S amulskiら(1989、J.Virol.63:3822-3828)は、野生型AAVの存在が、パッケージン グされたベクターの収量を著しく高めることを示した。従って、野生型AAVの生 産が除去されるパッケージング系では、パッケージングされたベクターの収量は 実際に減少し得る。それにもかかわらず、任意のヒトの臨床適用で使用するため には、野生型AAVの生産を除去することが必須である。 AAVのrepまたはcap遺伝子を含有しないAAVベクターを生成するための別の研究 (McLaughlinら、1988;Lebkowskiら、1988)では、なお野生型AAVの生成をうけ、そ してなおヒト細胞株で非常に低い形質導入頻度を生じた。従って、McLaughlinら (1988)は、HermonatおよびMuzyczka(1984)により初期に使用された同じパッケー ジングプラスミドでパッケージングされたneo遺伝子を含有するAAVのrep-cap-ベ クターはなお、野生型AAVを含有することを報告した。結果として、ベクターお よび野生型粒子の二重ヒットを避けるために、このウイルスを細胞あたり0.03粒 子の多重度(すなわち、10,000細胞あたり300感染単位)でしか使用し得なかっ た。このようにして実験を行った場合、1000感染単位で32,000細胞を感染させる ことにより、平均800個のゲネチシン(geneticin)耐性コロニーが得られた。これ は、ウイルスが80%の形質導入頻度を得ることができることを示すと解釈され るが、実際は細胞の2.5%のみが形質導入された。従って、このベクターの効果 的な有用な力価は制限された。さらに、この研究は、このベクター調製物の実際 の力価が、HermonatおよびMuzyczka(1984)により以前に得られた力価より少しで も高いことを示さなかった。同様に、Lebkowskiら、1988は、repまたはcap遺伝子 のどちらも含有しないAAVベクターをパッケージングし、そしてTratschinら、(19 84b、1985)によって初期に使用されたものと同一のori-パッケージングプラスミ ドpBa1Aを使用し、そして同様に低い形質導入頻度(最も濃縮したベクタースト ックでも、数種のヒト細胞株では、1%を越えない細胞がゲネチシン耐性に形質 導入され得た)を報告した。Lebkowskiら、(1988)は、有意には実際のベクター力 価を報告しなかった。しかし、3mlのベクター調製物に5×106細胞を曝した場 合、1%より高くない形質導入頻度を示す生物学的アッセイは、力価が2×104 未満であることを示した。pBa1パッケージングプラスミドはまた、ベクター中に ITR配列との重復する相同性を含有し、そして野生型AAVの組換えによる生成をも たらす。 Lafaceら、(1988)は、同様にして調製されたHermonatおよびMuzyczka(1984)で 使用されたのと同じベクターを使用し、そしてまた非常に低い力価を示すマウス 骨髄培養物中で1.5%の形質導入頻度を得た。 Samulskiら(1987、J.Virol.61:3096-3101)は、pSub201と呼ばれるプラスミドを 構築した。これは、細菌プラスミド中の完全なAAVゲノムであるが、各ITRの末端 で13ヌクレオチドの欠失を有し、従ってAAVゲノム全体を含有する他のAAVプラス ミドよりも低い効率で回収および複製された。Samulskiら(1989、J.Virol.63:382 2-3828)は、pSub201に基づくが、repおよびcapを欠失していて、そしてSV40初期 遺伝子プロモーターから発現するhygまたはneo遺伝子のいずれかを含有するAAV ベクターを構築した。彼らは、アデノウイルスITRの1コピーでいずれかの末端 が囲まれたヌクレオチド190-4490のAAVヌクレオチド配列全体からなるpAAV/Adと 呼ばれるパッケージングプラスミドでの同時トランスフェクションにより、これ らのベクターをパッケージングした。このパッケージングプラスミドでは、AAV のrepおよびcap遺伝子は、天然のAAVプロモーターp5、p19、およびp40から発現 された。pAAV/AdでのアデノウイルスITRの機能は、AAVキャプシドタンパク質の 発現レベルを高めることであると考えられた。しかし、repは、その相同なプロ モーターから発現され、そして負に調節されており、従ってその発現は制限され る。これらのキャプシド化系を使用して、Samulskiら、1989は、AAVベクタース トックを生成した。これは、実質的に野生型AAVを含まないが、上清1mlあたり のハイグロマイシン耐性単位が3×104のみの形質導入力価を有した。野生型AAV ゲノムをパッケージングプラスミドに使用した場合、AAVベクター調製物の力価 は、5×104に増加した。従って、この系で生産される低力価は、部分的にはベ クター構築に使用された基本的なpSub201プラスミドのITR配列の欠損が原因で、 そして部分的にはpAAV/AdからのAAV遺伝子の発現を制限することが原因だったよ うである。AAVneoベクター調製物の力価を増加させる試みでは、Samulskiら、198 9は、293細胞の30枚の10 cm皿に大量にトランスフェクトし、そしてCsClでのバ ンド形成によりベクターストックを濃縮させることにより、ベクターストックを 生成した。これは、DNAドットブロットハイブリダイゼーションアッセイで測定 したところ、合計108粒子を含有するAAVneoベクターストックを生産した。この ベクターストックを細胞あたり1,000粒子までの多重度で使用した場合、70%の 形質導入頻度が得られた。これは、細胞あたり1形質導入単位の比では、形質導 入されるべき細胞の予想された比率が、ポアソン分布によれば63%であることか ら、粒子対形質導入比が、約500〜1,000粒子であることを示唆している。 ベクタープラスミドpSub201およびパッケージングプラスミドpAAV/Adを用いる Samulskiら(1989)の系は、2つのプラスミドの間に重複するAAV配列の相同性を 有さなかったが、XbaI部位で重複する相同性があり、そしてこれらの部位の組換 えにより完全な野生型AAVを生成する。すなわち、AAV配列の重複する相同性は存 在しないが、完全なAAV配列が2つのプラスミド内に含有され、そしてこのよう に組換えにより野生型AAVを生成し得るが、これは望ましくない。このクラスの 組換えがAAVプラスミド中で起こることはSenapathyおよびCarterにより示された (1984,J.Biol.Chem.259:4661-4666)。それゆえ、低力価および野生型組換え体を 生成する能力の問題のため、Samulskiら(1989)により説明された系はヒト遺伝子 治療において有用性を有さない。 他のいくつかの報告がAAVベクターについて記載している。Srivastavaら(1989 , Proc.Natl.Acad.Sci.USA ,86:8078-8082)は、Samulskiら(1987)のpSub201プラス ミドに基づくAAVベクターについて記載した。そこではAAVのコーディング配列は 他のパルボウイルスB19のコーディング配列で置き換えられた。このベクターはp AAV/Adパッケージングプラスミドを用いてAAV粒子にパッケージングされ、機能 的ベクターを生成したが、力価は報告されなかった。この系はpSub201に基づい ていたので、このプラスミドに関する上記の欠陥を被る。第2に、ベクターおよ びパッケージングプラスミドは両方とも重複するAAV配列(ITR領域)を含有してい たので、野生型ウイルスの混入をもたらす組換えが非常によく起こる。 Chatterjeeら(1991,Vaccines 91,Cold Spring Harbor Laboratory Press,85-8 9ページ)、Wongら(1991 Vaccines 91,Cold Spring Harbor Laboratoy Press,183 -189ページ)、およびChatterjeeら(1992,Science,258:1485-1488)は、HIVまたは 単純ヘルペスウイルスのような感染性ウイルスに対するアンチセンスRNAを発現 するよう設計されたAAVベクターについて記載している。しかし、これらの著者 はそのAAVベクターストックの力価についてなにも報告しなかった。さらに、彼 らは、Tratschinら(1984b,1985)により使用された、AAVゲノムのBalAフラグメン トを含有するプラスミドに類似のOri-パッケージングプラスミドを用いてベクタ ーをパッケージングし、それ故彼らのパッケージングプラスミドは、ベクター構 築物中に存在するAAV配列に相同性を有するAAVベクター配列を含有した。これは また、野生型AAVの生成を生じる。このように、Chatterjeeら、およびWongらは 低力価しか示さないことが公知のパッケージング系を使用した。そして、それは ベクターおよびパッケージング配列の重複する相同性のため、野生型AAVゲノム の生成を生じ得る。 他の報告は、ヒトリンパ球(Muro-Cachoら,1992,J.Immunotherapy,11:231-237) またはヒト赤白血病細胞株(Walshら,1992,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,89:7257-726 1)中で遺伝子を発現するAAVベクターの、pSub201ベクタープラスミドおよびpAAV /Adパッケージングプラスミドに基づいたベクターとの使用を記載している。ま た、ベクターストックの力価は報告されておらず、そして明らかに低かった。な ぜなら、選択マーカー遺伝子が、ベクターで首尾よく形質導入されたそれらの細 胞を同定するために使用されたからである。 嚢胞性線維症患者由来のインビトロで増殖したヒト気道上皮細胞の、AAV p5プ ロモーターから選択マーカー遺伝子neoを発現するAAVベクターでの形質導入が報 告された(Flotteら,1992,Am.J.Respir.Cell.Mol.Biol. 7:349-356)。この研究で は、AAVneoベクターはpAAV/Adパッケージングプラスミドを用いてAAV粒子にパッ ケージングされた。培養物中の細胞の70%までがゲネチシン耐性に対して形質導 入され得、そして粒子対形質導入比は、Samulskiら(1989)により報告されたもの と同様であった。このように細胞の70%の形質導入を得るためには、細胞当たり 数百までのベクター粒子の多重度が必要であった。AAV ITRプロモーターからCFT R遺伝子を発現するAAV形質導入ベクターを用いるインビトロ培養でのヒト気道上 皮細胞の形質導入は、この細胞が嚢胞性線維症患者由来の細胞に存在する塩化物 チャンネル機能の電気生理学的欠陥について機能的に修正され得ることを示した (Eganら,Nature,1992,358:581-584;Flotteら,J.Biol.Chem.268:3781-3790)。 上記の研究は、AAVベクターが遺伝子治療によるヒト疾病の治療のためのベク ターとしての潜在的な有用性を有し得ることを示唆する。しかし、十分な量のAA Vベクターを生成する能力は、AAVベクターを使用するヒト遺伝子治療の発展にお ける厳しい制限であった。この制限の1つの局面は、インビボ動物モデルでAAV ベクターを使用する研究がまさにほとんどなかったことである(例えば、Flotte ら、1993b;およびKaplittら、1994、Nature Genetics 8:148-154を参照のこと) 。これは一般的に、インビボでの送達および遺伝子発現の分析に有用であるのに 高い十分な力価を有するAAVベクターストックを十分量生成することに関する困 難の反映である。AAV遺伝子治療の制限要因の1つは、使用されているベクター パッケージング系が比較的効率的でなかったことである。repおよびcapのような AAVトランス相補機能を発現する細胞株の欠如のため、AAVベクターのパッケージ ングは、パッケージングプラスミドおよびベクタープラスミドの同時トランスフ ェクションによってアデノウイルス感染細胞中で達成された。このプロセスの効 率は、それぞれのプラスミド構築物のトランスフェクションの効率により、およ び今まで記載されたパッケージングプラスミド由来のRepタンパク質の発現レベ ルにより制限され得る。これらの問題はそれぞれ、AAV Repタンパク質の生物学 的活性に関連しているようである。さらに、上記のように、上述の全てのパッケ ー ジング系は組換えにより野生型AAVを生成する能力を有する。 機能的Repを安定して発現する細胞株の欠如は、Repによるneo-耐性コロニー形 成の阻害(Labowら,1987;Trempeら,1991)により示されるように、Repの細胞傷害 性または細胞増殖抑制性の機能を明らかに反映する。これはまた、Repが培養細 胞中の不死化表現型を逆転させる傾向を有することに関連するようであり、それ が機能的Repを安定して発現する細胞株の生成を極めて困難にしている。Repを発 現する細胞株を生成する試みはいくつか行われている。Mendelsonら(1988,Virol ogy ,166:154-165)は、1つの細胞株で、AAV rep遺伝子を含有するプラスミドで のHeLaまたは293細胞の安定なトランスフェクション後、AAV Rep52タンパク質の ある低いレベルの発現を得たが、Rep78またはRep68タンパク質の発現を得なかっ たことを報告した。Rep78およびRep68タンパク質が存在しないため、細胞株にお いてベクターは生成され得なかった。別の細胞株はかろうじて検出できる量の非 機能性Rep78を生成した。 Vincentら(1990,Vaccines 90,Cold Spring Harbor Laboratory Press,353-359 ページ)は正常AAVプロモーターから発現するAAV repおよびcap遺伝子を含有する 細胞株の生成を試みた。しかし、これらの試みはベクターが100倍の過剰の野生 型AAV粒子が混入したからか、またはベクターが4×103より小さい非常に低い力 価でしか生成されなかったからかのいずれかのために成功しなかった。 別のアプローチでは、Lebkowskiら(米国特許第5,173,414号、1992年12月22日 発行)がエピソームプラスミドにおいてAAVベクターを含有する細胞株を構築した 。次いで、これらの細胞株はアデノウイルスで感染され、トランス相補AAV機能 のrepおよびcapでトランスフェクションされ、AAVベクターの調製物を生じ得た 。このことにより高力価のAAVストックが生成できるようになることが主張され る。しかし、示された例において、示された力価に関する唯一の情報は、1つの ヒト細胞株K562がわずか1%あるいはそれより低い効率で形質導入され得たとい うことであり、それはいかなる高力価のAAVベクターの生成をも示してない。こ の系においては、ベクターはエピソーム性(非組込み構築物)として運ばれ、そ してベクターの組込まれたコピーが好ましくないと述べられる。引き続く特許( 米国特許第5,354,678号、1992年10月11日発行)、Lebkowskiらは、細胞ゲノム中 にre pおよびcap遺伝子を導入するが、しかし、その方法は、エプスタイン-バールウ イルス核抗原(EBNA)遺伝子およびエプスタイン-バールウイルス潜在性複製起点 を含むエピソームAAV形質導入ベクターの使用を必要とする;そして、再び力価 に関する唯一の情報は、かなり低い力価を示した。 Lebkowskiら、(1992)により記載されたAAVベクターのパッケージングへのアプ ローチは、いくつかの望ましくない局面を有する。第1に、細胞株中で組込まれ ていない高コピー数のエピソームプラスミドとしてベクターを維持することは望 ましくない。なぜなら、細胞当たりのコピー数は厳密に制御され得ず、そしてエ ピソームDNAは、欠陥ベクターの生成を導く再配列をよりずっと受けるようであ るからである。第2に、この系においては、ベクターはなお、アデノウイルスに よって細胞を感染させ、そしてAAV repおよびcap遺伝子を含有するプラスミドを 導入することによりパッケージングされなければならない。Lebkowskiら(1992) により再び使用されたプラスミドはpBa1であり、これは、上記のように、ベクタ ーITR配列と重複する相同性を有し、そして結果として野生型AAVを生成する。第 3に、Lebkowskiら(1988,1992)により使用されたpBa1パッケージングプラスミド 中で、rep遺伝子はその相同なp5プロモーターから離れて発現し、このように負 に自己調節され、それ故にrepの発現は制限されるようである。 プラスミドのトランスフェクション後のrep発現が最適以下のレベルであると いう問題は、これらのタンパク質の別の生物学的活性に関連し得る。AAV-Repタ ンパク質は、pAAV/Ad(Samulskiら,1989)またはpBa1(Lebkowskiら,1988,1992)の ような以前に記載の全てのパッケージング構築物に使用されたAAV-p5プロモータ ーからのそれ自体の発現をダウンレギュレートするという証拠がある(Tratschin ら,1986,Mol.Cell.Biol.6:2884-2894)。 によって公開された(1994、J.Virol.68:7169-7177)。彼らは、repが糖質コル チコイド応答性MMTVプロモーターの制御下に置かれた細胞株の生成を記載した。 彼らは、粒子形成を観察したが、その粒子は、明らかに、非感染性であった。さ らなる実験は、欠損が非常に重要である;すなわち、細胞中で、一本鎖rAAV DNA の蓄積が実際にはないということを示した。感染性粒子の産生は、構成的な高発 現rep構築物でのさらなる一過性のトランスフェクションを必要とした(すなわ ち、それらは、rep活性を、自身で提供し得ると仮定された細胞に「加え戻さ(ad d back)」なければならない。発明の要旨 遺伝子治療の基本的挑戦の1つは,エクスビボで容易に操作され得ず,活発に 分裂しない細胞および組織の形質導入のためのストラテジーの開発であった。AA Vベクターは、例えば、気道でのインビボ遺伝子転移を達成し得るが、可能な限 り少量での十分に高い多重度のベクターの送達を可能にするように、高力価が重 要である。これは、AAVに基づく遺伝子治療の可能性を決定するにおいて、中心 的に重要な最適のパッケージングの方法論を作出する。安定でヘルパーを含まな いAAVパッケージング細胞株は、主にRepタンパク質の活性のために捕らえどころ がなかった。Repタンパク質は、それ自体の発現をダウンレギュレートし、そし て宿主細胞に負に影響し得る。本発明において記載されるアプローチは、効果的 にこれらの問題を回避し、そしてパッケージング効率の実質的な改良を可能とし た。 本発明のいくつかの好適な実施態様を、以下に要約する: 1.組換えAAV(rAAV)ベクターの高い効率でパッケージングし得る哺乳動物細 胞を産生する方法であって、以下の工程:(a)プロモーターと作動可能に連結 された安定に組み込まれたAAV cap遺伝子および異種プロモーターと作動可能に 連結された安定に組み換えられたAAV rep遺伝子を含む哺乳動物細胞を提供する 工程;(b)工程(a)に記載の細胞を複製し、細胞集団を産生させる工程;( c)工程(b)の細胞集団へ、ヘルパーウイルスを導入する工程;および(d) ヘルパーウイルス誘導repタンパク質活性を示す細胞を選択する工程、を包含す る、方法。 2.上記ヘルパーウイルスが、アデノウイルスである、実施態様1に記載の方 法。 3.上記パッケージング細胞が、AAV rep遺伝子を含まない親型細胞の少なく とも半分の早さで増殖し得、そして上記パッケージング細胞が少なくとも100 rA AV粒子/細胞を産生するrAAVベクターをパッケージングし得る、実施態様1に記 載の方法。 4.工程(a)の上記哺乳動物細胞が、p5プロモーターが異種プロモーターに より置換されたAAVの結合されたrep遺伝子およびcap遺伝子を含む、実施態様1 に記載の方法。 5.上記異種プロモーターが、マウスメタロチオメインI(mMT-I)プロモーター である、実施態様4に記載の方法。 6.実施態様1の方法で産生される、細胞およびその子孫。 7.実施態様3の方法で産生される、細胞およびその子孫。 8.実施態様4の方法で産生される、細胞およびその子孫。 9.実施態様5の方法で産生される、細胞およびその子孫。 10.組換えAAV(rAAV)ベクターを高い効率でパッケージングし得る哺乳動物 細胞であり、上記細胞は、プロモーターに作動可能に連結された安定に組み込ま れたcap遺伝子、および異種プロモーターに作動可能に連結された安定に組み込 まれたrep遺伝子を含む;上記細胞が、ヘルパーウイルス誘導repタンパク質活性 を示す、哺乳動物細胞。 11.上記ヘルパーウイルス導入repタンパク質活性が、アデノウイルスによ り誘導される、実施態様10に記載のAAVパッケージング細胞。 12.上記パッケージング細胞が、AAV rep遺伝子を含まない親型細胞の少な くとも半分の早さで増殖し得、そして上記パッケージング細胞が、少なくとも10 0 rAAV粒子/細胞を産生するためのrAAVベクターをパッケージングし得る、実施 態様10に記載のAAVパッケージング細胞。 13.上記細胞が、p5プロモーターが異種プロモーターにより置換されたAAV の結合されたrep遺伝子およびcap遺伝子を含む、実施態様10に記載のAAVパッ ケージング細胞。 14.上記異種プロモーターが、マウスメタロチオネインI(mMT-I)プロモータ ーである、実施態様13に記載のAAVパッケージング細胞。 15.安定に組み込まれた組換えAAVベクターをさらに含み、上記ベクターが 、2つのAAV逆方向末端反復(ITR)領域の間に位置する目的のポリヌクレオチド配 列 を含む、実施態様10に記載のAAVパッケージング細胞。 16.組換えAAVベクターをパッケージングする方法であって、以下の工程: (a)実施態様10に記載のAAVパッケージング細胞を提供する工程;(b)組 換えAAVベクターを導入する工程であって、上記ベクターが2つのAAV逆方向末端 反復(ITR)領域の間に位置する、目的のポリヌクレオチド配列を含む工程;(c )ヘルパーウイルスを導入する工程;および(d)AAVの複製およびパッケージ ングに適切な条件下で、上記細胞をインキュベートする工程、を包含する、方法 。 17.組換えAAVベクターをパッケージングする方法であって、以下の工程: (a)安定に組み込まれたrAAVベクターを含む、実施態様15に記載のAAVパッ ケージング細胞を提供する工程;(b)ヘルパーウイルスを導入する工程;およ び(c)AAVの複製およびパッケージングに適切な条件下で、上記細胞をインキ ュベートする工程、を包含する、方法。 18.実施態様16に記載の方法に従ってパッケージングされた、組換えAAV ベクター。 19.実施態様17に記載の方法に従ってパッケージングされた、組換えAAV ベクター。 20.上記ベクターが嚢胞性線維症トランスメンブランコンダクタンスレギュ レーター(CFTR)をコードするポリヌクレオチドを含む、実施態様19に記載の組 換えAAVベクター。 21.rAAVベクター調製物の関連する感染力価を決定する方法であって、以下 の工程:(a)実施態様10に記載のAAVパッケージング細胞へ、ヘルパーウイ ルスおよびrAAVベクター調製物の連続希釈物を導入する工程;(b)AAVの複製 に適切な条件下で、上記細胞をインキュベートする工程;および(c)複製され たrAAVベクターの量を決定する工程、を包含する、方法。図面の簡単な説明 図1は、実施例1に記載のようなプラスミドpMt-rep/cap//pKO-neoの模式図で ある。 図2は、実施例4に記載のように、本発明に従って生成されたパッケージング 細胞が、侵入rAAVベクターを複製するのに十分なrep活性を有することを立証す るサザンブロットの写しである。 図3は、実施例5に記載のように、本発明に従って生成されたパッケージング 細胞が、アデノウイルスの存在下でAAVゲノムを複製し得ること、およびこの活 性が、所定のサンプル中に存在する感染性ウイルス粒子の数を定量するために用 いられ得ることを立証するサザンブロットの写しである。 図4は、実施例6に記載のように、本発明に従って生成されたパッケージング 細胞がrepタンパク質を発現し、そしてトランスフェクションにより導入された 組換えAAVプラスミドDNAゲノムを複製し得ることを立証するサザンブロットの写 しである。 図5は、実施例7に記載のように、実施例5に記載の感染性rAAV滴定アッセイ が、最大に達するに十分な時間にわたって進行したことを立証するサザンブロッ トの写しである。 図6および7は、実施例9および10に記載のように、本発明に従って生成さ れたパッケージング細胞がトランスフェクションまたは感染のいずれかによって 、rAAVベクターを複製し得、そしてそれを感染性ビリオンにパッケージングし得 ることを実証するサザンブロットの写しである。 図8は、実施例11に記載のように、本発明に従って生成されたパッケージン グ細胞が、組込まれたrAAVベクターを認識し、切り出し、そして増幅するのに十 分なrep活性を有することを実証するサザンブロットの写しである。 発明の詳細な説明 AAVベクターは、目的のタンパク質をコードする異種ポリヌレオチドとともに 、複製およびキャプシド化に必要なAAV構成要素を含有する、AAVウイルスの組換 え構築物である。これらの組換えAAVベクターは、ヒト遺伝子治療のために、潜 在的に効果的な道具であり、嚢胞性線維症および鎌形赤血球貧血のような疾病に 特に有効である。遺伝子治療への他のアプローチに勝るAAVベクターの主要な利 点は、細胞のゲノムに恒久的に組み込まれるために、標的細胞の複製の進行を必 要 としないことである。 本明細書に記載の発明は、遺伝子治療において使用される高力価組換えAAVベ クターの生成に使用される方法および材料を提供する。rAAV調製物の相対的感染 力価を決定する方法および材料もまた提供する。 本発明の実施には、他に示されていなければ、分子生物学、微生物学、組換え DNA、および免疫学の従来の技術が使用されており、それらは当業者の技術範囲 内である。このような技術は文献で十分に説明されている。例えば、Sambrook,F ritsch,およびManiatis,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,第2版(1989) ,Oligonucleotide Synthesis(M.J.Gait編,1984),Animal Cell Culture(R.I.Fres hney編,1987),Methods in Enzymologyシリーズ(Academic Press,Inc.);Gene Tra nsfer Vectors for Mammalian Cells (J.M.MillerおよびM.P.Calos編,1987),Hand book of Experimental Immunology ,(D.M.WeirおよびC.C.Blackwell編),Current Protocols in Molecular Biology(F.M.Ausubel,R.Brent,R.E.Kingston,D.D.Moor e,J.G.Siedman,J.A.Smith,およびK.Struhl編,1987),およびCurrent Protocols i n Immunology(J.E.Coligan,A.M.Kruisbeek,D.H.Margulies,E.M.ShevachおよびW. Strober編,1991)を参照のこと。本明細書中の前記および後記の全ての特許、特 許出願、および出版物は本明細書中で参照として援用されている。定義: 用語「ポリペプチド」、「ペプチド」および「タンパク質」は、任意の長さの アミノ酸のポリマーを言うために交換可能に用いられる。これらの用語はまた、 グリコシル化、アセチル化、およびリン酸化を含む反応を通して翻訳後修飾され たタンパク質を含む。 「ポリヌクレオチド」は、リボヌクレオチドもしくはデオキシリボヌクレオチ ドのいずれか、またはそれらのアナログである、任意の長さのヌクレオチドのポ リマー形態をいう。この用語は、分子の一次構造についてのみいう。従って、二 本鎖および一本鎖DNAならびに二本鎖および一本鎖RNAを含む。メチル化またはキ ャップされたポリヌクレオチドのような改変されたポリヌクレオチドも含む。 「組換え体」は、ポリヌクレオチドに対して適用され、ポリヌクレオチドが、 クローニング、制限および/または連結工程、ならびに天然に見出されるポリヌ クレオチドと区別される構築物を生じる他の手順の種々の組み合わせの産物であ ることを意味する。 「配列重複」は、ヌクレオチドが、組換えが容易である十分な長さおよび同一 性の相同配列を共有するときに、2つのポリヌクレオチドの間で生じる。相同性 のレベルおよび対応する組換えの頻度は、相同配列の長さの増加およびそれらの 共有の同一性のレベルに伴って増加する。与えられた系の関係を示す相同性のレ ベルは、当業者に周知のように、理論的に決定され得、そして実験的に確認され 得る。しかし、代表的には、組換えは、重複配列が約25ヌクレオチド未満の配列 のときはその全長に対して少なくとも80%一致した場合、または重複配列が約50 ヌクレオチド未満の配列のときは全長に対して少なくとも70%一致した場合、実 質的に減少され得るか、または排除され得る。もちろん、より低レベルの相同性 でさえも、組換えの見込みがさらに減少するため好ましい。 「ベクター」は、インビトロまたはインビボのどちらかにおいて、宿主細胞に 送達されるポリヌクレオチドを含む、組換えプラスミドまたはウイルスをいう。 ときには「標的ポリヌクレオチド」としていわれる、送達されるべきポリヌクレ オチドは、遺伝子治療における目的のコード配列を含み得る。 「組換えAAVベクター」(または「rAAVベクター」)は、AAV逆方向末端反復配 列(ITR)に隣接される1つ以上の目的のポリヌクレオチドを含むベクターをいう 。このようなrAAVベクターは、適切なヘルパーウイルスに感染しており、そして AAVのrepおよびcap遺伝子を発現している宿主細胞内に存在するとき、複製され 得、そして感染可能なウイルス粒子中にパッケージングされ得る。 AAV「rep」および「cap」遺伝子(それぞれ、複製およびキャプシド化タンパ ク質をコードしている)は、試験された全てのAAV血清型において見出されてお り、そして上記および本明細書中に引用される文献に記載されている。代表的に は、repおよびcap遺伝子は、AAVゲノム中においてお互いに隣接して見出されて おり、そしてこれらは一般にAAV血清型において保存されている。 AAVのための「ヘルパーウイルス」は、野生型AAV(これは「欠損」パルボウイ ルスである)が宿主細胞により複製され、パッケージングされることを可能とす る第2のウイルスをいう。多くのこのようなヘルパーウイルスは同定されており 、ワクシニアのようなアデノウイルス、ヘルペスウイルス、およびポックスウイ ルスを含む。 本明細書中で用いられる「パッケージング」は、rAAVベクターのアセンブリー およびキャプシド化を生じる一連の亜細胞性の事象をいう。従って、適切なベク タープラスミドが適切な条件下でパッケージング細胞株に導入される場合、それ はベクターウイルス粒子内にアセンブルされる。 「異種」は、比較される異種の残りの実体と遺伝子型的に異なる実体に由来す るものを意味する。例えば、遺伝子工学技術により異なる細胞型に導入されたポ リヌクレオチドは、異種ポリヌクレオチドである(そして、発現した場合は、異 種ポリペプチドをコードし得る)。同様に、その天然ののコード配列から除去さ れ、そして異なるコード配列に作動可能に連結されたプロモーターは、異種プロ モーターである。 本明細書中で用いられる「プロモーター」は、プロモーターが作動可能に連結 されている遺伝子またはコード配列の転写を増大する、ゲノム領域をいう。 「作動可能に連結された」は、記載のような組成物がそれらの意図される様式 で機能し得る関係にある並列をいう。プロモーターは、プロモーターがコード配 列の転写を促進する場合、コード配列に作動可能に連結されている。作動可能に 連結されたプロモーターは、通常コード配列とシス配置であるが、必ずしもコー ド配列に隣接する必要はない。 「宿主細胞」、「細胞株」、「細胞培養物」および他のこのような用語は、高 等真核生物細胞、最も好ましくは哺乳動物細胞を示す。これらは、組換えベクタ ーまたは他の転移ポリヌクレオチドのレシピエントとして使用され得、そして形 質導入された元の細胞の子孫を含む。単一細胞の子孫は、元の親細胞と必ずしも 完全に同一(形態学的にまたはゲノム相補性において)である必要はないことが 理解される。 細胞内へのポリヌクレオチドの「安定な組み込み」は、ポリヌクレオチドが細 胞の染色体またはミニ染色体へ導入され、そしてそれゆえ、細胞ゲノムの比較的 不変の部分となることを意味する。プラスミドのような「エピソーム」は、しば しば多くの世代で維持されるが(特に選択圧下にある場合)、エピソームにより 送達された遺伝物質は、一般に、染色体に組み込まれた物質より損失されやすい 。また、真核生物の染色体のクロマチン構造は組み込まれたポリヌクレオチドの 発現のレベルに影響し得る;そして、本発明者らは、このような効果は、本明細 書中に記載したような状況において、時に有益であることを証明し得ることを確 信する(ここで、AAV rep遺伝子の発現のレベルは、細胞代謝において負の効果 を有し得る)。本発明の内容において特に望ましい特性を有する安定な細胞株の 選択は、以下の発明の詳細な説明および実施例に記載される。 細胞株を記載する場合に使用する「効率」は、その株の有用な特性をいう;特 に増殖率、および(パッケージング細胞株について)細胞あたりの産生された多 くのウイルス粒子の数をいう。「高効率パッケージング」は、細胞あたり少なく とも100ウイルス粒子の産生を示す。発明を実施するための態様: 高力価の組換えAAVベクターの産生方法はいくつかの工程を包含する。一般の ストラテジーは、プロモーターに作動可能に連結され、安定に組み込まれたAAV cap遺伝子、および異種プロモーターに作動可能に連結され、安定に組み込まれ たAAV cap遺伝子を含む哺乳動物パッケージング細胞株の調製を包含する。次い で、パッケージング細胞は、AAV ITR領域および標的ポリヌクレオチドを含むプ ラスミドで感染またはトランスフェクトされる。適切な条件下での(適切な増殖 条件およびコンピテントヘルパーウイルスでの感染を含む)、パッケージング細 胞のrepおよびcap遺伝子の発現は、それぞれAAVベクターの複製およびキャプシ ド化を媒介するrepおよびcapタンパク質の合成をもたらす。rAAVベクターのAAV ITR配列の間に存在する目的のポリヌクレオチド(「標的ポリヌクレオチド」と もいわれる)の提供は、従って、標的ポリヌクレオチドの感染性rAAV粒子へのパ ッケージングを生じる。この粒子は所望の宿主細胞にポリヌクレオチドを送達す るために使用し得る。 パッケージング細胞株中のAAV遺伝子とこれらのベクタープラスミド中のAAV遺 伝子との間の配列重複の程度の極小化により、野生型AAVの比率(すなわち、粒 子は標的ポリヌクレオチドを含んでいない)を極小化し得る。背景のセクション で記載したように、野生型AAVの混在は、rAAVベクター調製物の治療能力を制限 する。本発明の構築物における配列重複の欠損に加えて、p5プロモーター領域は 異なるプロモーターで置き換えられる。本発明のパッケージング細胞株は、高力 価で実質的に野生型AAVの混在のないrAAVの調製物の効率的な産生を可能にする ;AAV媒介遺伝子治療の内容において特に有用な特性である。 本発明の原理の最初の例示はAAV2血清型を用いて行われたが、種々の血清型が かなり密接に関係している(機能的および構造的の両方において、遺伝子レベル においても(Blacklow,1988,「Parvovirus and Human Disease」165-174頁、J.R .Pattison(編);およびRose,1974,Comprehensive Virology 3:1〜61を参照の こと))ことが現在公知なので、これらの同様の原理は他のAAV血清型に対して も適用され得ることが期待される。例えば、全てのAAV血清型が、相同rep遺伝子 により媒介される非常に類似した複製特性を明らかに示す;そしてすべてがAAV2 において発現されるような3つの関連キャプシドタンパク質を有する。関連の程 度は、ゲノムの長さに沿う血清型の間の広範囲のクロスハイブリダイゼーション を示すヘテロ二重鎖解析によりさらに示唆される;およびITRに対応する末端の 異種自己アニーリングセグメントの存在によっても示唆される。類似の感染性の パターンはまた、各血清型における複製能が類似の調節制御下にあるということ を示唆する。パッケージング細胞株の産生: パッケージング細胞が生成される親株は、AAV感染が可能である任意の細胞株 から得られ得、そしてインビトロ培養に影響を受けやすい。先に示したように、 AAVはかなり広範な宿主領域を有し、そしてサル、ヒト、および齧歯類細胞を含 む種々の哺乳動物細胞型から単離されている。ヒト遺伝子治療のために、代表的 には適切なヘルパー機能が発現され得るヒト細胞株が好ましい。パッケージング 細胞株が由来され得るこのようなヒト細胞株は、例えば、Hela、A549、293、KB 、Detroit、およびWI38細胞を含む。本発明者らは、Hela細胞およびA549細胞の 両方を、本発明の実証のために最初に選択した。以下の実施例に記載するように 、 本発明者らは、両方の試験された親株からパッケージング細胞を容易に生成し得 た。 野生型AAVの場合(例示の目的のためにAAV2を用いる)、rep遺伝子はp5プロモ ーターの調整下にあり、プロモーター自身がrepの発現により強力にダウンレギ ュレートされる。本発明に従ってパッケージング細胞株を構築する際、細胞は、 プロモーターに作動可能に連結され、安定に組み込まれたAAV cap遺伝子、およ び異種プロモーターに作動可能に連結され、安定に組み込まれたAAV rep遺伝子 を提供する;本明細書中に記載および例示したように。rep遺伝子発現により強 力にダウンレギュレートされていない任意の異種プロモーターが適切である;し かし、rep遺伝子の構成的な発現は宿主細胞においてネガティブな影響を有し得 るので誘導プロモーターが好ましい。本発明のrepおよびcap遺伝子が、宿主細胞 中に安定に組み込まれるため、本発明者らは、配置の影響(クロマチン構造によ り得る)はまた、遺伝子の発現に影響を及ぼし得、そして好ましいパッケージン グ株を得る際に有利であり得ると考える。特に、以下に記載の方法は、所望の特 性を示すパッケージング細胞を生成および選択するために使用し得る。多くの種 類の誘導プロモーターは、当業者に公知である;例示により、重金属イオン誘導 プロモーター(例えば、メタロチオネインプロモーター);ステロイドホルモン 誘導プロモーター(例えば、MMTVプロモーターまたは成長ホルモンプロモーター );および例えば、T7 RNAポリメラーゼの存在下で活性であるT7ファージ由来の プロモーターのようなプロモーター、を含む。 特に好ましい誘導プロモーターのサブクラスは、rAAVベクターの複製およびパ ッケージングを完了するために用いられるヘルパーウイルスにより誘導されるプ ロモーターである。多くのヘルパーウイルス誘導プロモーターが公知であり、例 えば、アデノウイルスE1Aタンパク質により誘導されるアデノウイルス初期遺伝 子プロモーター;アデノウイルス主要後期プロモーター;VP16または1CP4のよう なヘルペスウイルスタンパク質により誘導されるヘルペスウイルスプロモーター ;ならびにワクシニアまたはポックスウイルス誘導プロモーターを含む。 以下の実施例は、プロモーターがヘルパーウイルス誘導可能か否か、および高 効率パッケージング細胞を生成することにおいて有用であるか否かを容易に決定 することについて推定のプロモーターを試験するために使用し得る一般的に適用 可能な方法を例示する。簡潔には、この方法は、AAV rep遺伝子のp5プロモータ ーを推定のヘルパーウイルス誘導プロモーター(当業者に周知であるかまたはプ ロモーター欠損「レポーター」遺伝子に連結するような周知の技術を用いて同定 される)に置き換えることを含む。抗生物質耐性遺伝子のようなポジティブ選択 マーカーに好ましく連結されたAAV rep-cap遺伝子(p5置換)は、次いで、適切 な宿主細胞(例えば、以下に例示するHelaまたはA549細胞)に安定に組み込まれ る。次いで、選択条件下で(例えば、抗生物質の存在下において)比較的よく増 殖し得る細胞が、ヘルパーウイルスの添加におけるrepおよびcap遺伝子の発現能 力を試験される。repおよび/またはcap発現についての最初の試験として、細胞 が、repおよび/またはcapタンパク質を検出するために免疫蛍光法を用いて容易 にスクリーニングされ得る(以下の実施例に例示される)。この方法を用いて、 本発明者らは、p5プロモーターをマウスメタロチオネイン遺伝子由来のヘルパー ウイルス誘導プロモーターに置換し、生じた構築物を用いて高力価のrAAV粒子を 産生し得るパッケージング細胞株を生成した。 本発明者らの系において、AAV cap遺伝子はまたパッケージング細胞株中に安 定に組み込まれる。好ましい実施態様において、repおよびcap遺伝子は、親株に これら両方を含むプラスミドを用いて共に導入される(本質的に、repの上流配 列、すなわちp5プロモーター領域の置換を除いて、これらはAAVゲノム中に配置 される)。以下の例示される実施例において、本発明者らは、pMT-rep/cap//pKO -neoと称されるプラスミドを調製した(図1に示す)。プラスミドは、rep-cap 遺伝子を含む領域に連結される異種プロモーターを含む。p19プロモーターおよ びp40プロモーターを含むrep-cap領域の残部は保持される。このプラスミドはま た、AAVポリアデニル化シグナルを含む。従って、プラスミドに存在しない天然 のAAVの構成要素は、p5プロモーター領域(異種プロモーターにより置換された )およびITR(別々に導入されたベクタープラスミドに存在する)を含む。 上述のrepおよびcap遺伝子でトランスフェクトされた細胞は、次いで、当業者 において通常の方法に従って、非トランスフェクト細胞から選択される。最も簡 便には、選択は、1つ以上の選択マーカー(例えば抗生物質耐性遺伝子)にrep およびcap遺伝子を連結させることにより達成される。例えば、以下に記載のpMt -rep-rep/cap//pKO-neo構築物において、ネオマイシン耐性遺伝子は続くrep-cap 配列に含まれる。好ましくは、このような選択マーカーは構成プロモーターに駆 動される;そして好ましくは、このようなマーカーは、AAV-cap遺伝子に対して 逆方向で導入される。なぜなら逆方向での導入は、選択マーカーを駆動するプロ モーターのrep遺伝子の発現に影響を与える能力(宿主細胞に対して有害であり 得る)を減少させる傾向にあるからである。トランスフェクションおよび回収の 後、細胞株は耐性を提供された抗生物質に曝される(上述の構築物の場合、ゲネ チシンが用いられる)。 宿主細胞への組み込みは、例えばサザン分析を用いて簡便にモニターされ得る 。repおよびcapタンパク質の発現は、種々の技術を用いてアッセイされ得る;構 造アッセイ(例えば、免疫蛍光法)、および機能アッセイ(例えば、侵入rAAVベ クターの複製およびパッケージング)を含む−これらの両方は以下の実施例にお いて例示される。 以前の研究において、哺乳動物細胞におけるrepタンパク質の発現は、移植効 率の減少および/または増殖速度の減少と関連した。例えば、メタロチオネイン プロモーターおよびpSV2neoの制御下でのrepコード配列のヒト293細胞への同時 トランスフェクションは、重金属の非存在下においてさえも、コントロール細胞 より遅い速度でDNA合成の進行を示すネオマイシン耐性細胞株の生成をもたらし た(Yangら、1994、J.Virol. 68:4847-4856を参照のこと)。 同時トランスフェクションは両方のプラスミドの取り込みおよび維持を必要と するが、ゲネチシンはネオマイシン耐性プラスミドのみを選択するので、rep含 有プラスミドは最終的に失われ得るという可能性が存在する。さらに、repの導 入が宿主細胞に負の効果を働かせる場合(プロモーターを誘導しない場合さえも )、rep活性の損失を好む選択圧が存在する。これらの初期の観察に基づいて、r epを維持しおよび発現する細胞はゆっくりと増殖することが当業者には予想され る。逆に、細胞がrep活性の損失により正常増殖度を復活することを予想し得る 。 本発明者らの好ましい系において、選択マーカーはrep-cap配列として同じプ ラスミド上に含まれる;そしてこの両方が宿主ゲノム中に安定して組み込まれる 。プラスミドMt-rep/cap//pKOneoの場合、例えば、ゲネチシン耐性細胞は、neo 遺伝子ならびにpMt-rep/capの組み込まれたコピーを有することが予想される。 本発明者らの系において、rep配列は容易に失われ得ないため、先の技術により レシピエント細胞が増殖速度の減少を示すことが予想される。 驚くべきことに、本発明者らの構築物を典型的な哺乳動物宿主細胞(Helaおよ びA549)に導入すると、ゲネチシン耐性クローンの増殖速度は細胞株のいずれに おいても有意に影響されなかった。 先に観察されたrep活性と増殖速度の減少との間の関連に基づき、実質的に正 常な増殖速度を示す細胞は、rep遺伝子がいくぶん不活性化または損失している 宿主を表すことが当業者には予想され得る。 実際、さらなる実験(以下に記載)は、rep遺伝子が生じた細胞株に安定に組 み込まれることを示した;そして、さらに、培地へのアデノウイルスの導入が、 機能的rep遺伝子の比較的に高レベルの合成を生じることを示した。 これらの結果は、本発明者らのアプローチが、過去に観察された増殖制限に従 属されない安定な細胞株を生成するために用いられ得るということを示唆した; そして、以下に記載するように、その後の実験により、これらの方法が組換えAA Vベクターを効果的にパッケージングし得る細胞株を生成するために用いられ得 ることを確認した。 これらの方法を用いて、本発明者らは、当業者が少なくとも親細胞の2分の1 の速度で複製し得、そして1細胞あたり100rAAV粒子より多くの粒子を産生し得 るパッケージング細胞を容易に得られることを見出した。本発明の好ましい実施 態様において、細胞は親株の少なくとも3分の2の速度で増殖し、そして1細胞 あたり250rAAV粒子より多い粒子を産生する。これまでに2つの異なる親株を用 いて、本発明者らは、実質的に親細胞と同じ速度で複製し(少なくとも約80%の 速度で)、そして1細胞あたり約500rAAV粒子より多くの粒子を産生するパッケ ージング細胞を生成した。rAAV ベクターの生成: 遺伝子治療のような目的のために有用である組換えAAV粒子を生成するために 、1つ以上の目的のポリヌクレオチド(または「標的」ポリヌクレオチド)を囲 むAAV逆方向末端反復(ITR)領域を含む組換えAAVベクターとともにパッケージン グ細胞株が供給される。 この標的ポリヌクレオチドは、自身のプロモーターまたは異種プロモーターの いずれかのプロモーターに作動可能に連結されている。多くの適切なプロモータ ーが当該分野において公知であり、その選択は標的ポリペプチドの所望の発現レ ベルに依存する;構成的な発現、誘導可能な発現、細胞特異的または組織特異的 な発現などのうちどれを所望するかに依存する。 好ましくは、rAAVベクターはまた、rAAVベクターにより感染された細胞の選択 を可能にするために、ポジティブ選択的マーカーを含む。ネガティブ選択的マー カーもまた含まれ得る;必須または所望となるべきこれらの同じ細胞に対して選 択する方法として。好ましい実施態様において、S.D.Lupton(PCT/US91/08442お よびPCT/US94/05601を参照のこと)により記載された「二機能性選択融合遺伝子 」を使用し得る。簡潔には、これらの構築物は優性のポジティブ選択的マーカー とネガティブ選択的マーカーとの間の直接翻訳融合物を含む。好ましいポジティ ブ選択的マーカーは、hph、neo、およびgptからなる群より選択される遺伝子由 来であり、そして、好ましいネガティブ選択的マーカーは、シトシンデアミナー ゼ、HSV-I TK、VZV TK、HPRT、APRT、およびgptより構成される群から選択され る遺伝子由来である。特に好ましいマーカーは、ポジティブ選択的マーカーがhp hまたはneo由来であり、そしてネガティブ選択的マーカーがシトシンデアミナー ゼまたはTK遺伝子由来である、二機能性選択融合遺伝子である。 例示の方法により、本発明者らはプロモーターに作動可能に連結された機能的 な嚢胞性線維症トランスメンブランコンダクタンスレギュレーターポリペプチド (CFTR)をコードするポリヌクレオチドを含むrAAVベクターを使用した。現在、当 業者に公知であるように、嚢胞性線維症細胞患者由来の細胞においてCFTR機能欠 損を再構築し得る種々のCFTRポリペプチドが存在する。例えば、Richら(1991,Sc ience,253:205-207)は、塩化物を送達し得、そして天然に存在するCFTR欠損を 修正し得るアミノ酸残基708〜835欠損CFTR誘導体について記載した。Eganら(19 93)は、正常なCFTRの電気生理学的特徴を回復し得る他のCFTR誘導体(関連のな いタンパク質由来の約25アミノ酸に続いて残基119より開始する天然のCFTR配列 を含む)について記載した。2つのさらなる例を引用することで、Arispeら(199 2,Proc,Natl.Acad.Sci.USA 89:1539-1543)は、残基433〜586を含むCFTRフラグメ ントは、脂質2重層において正しい塩化物チャンネルを再構成するために十分で あることを示した;およびSheppardら(1994,Cell,76:1091-1098)は、その約半分 の長さに残基836において切断されたCFTRポリペプチドがまだ制御された塩化物 チャンネルを構築し得ることを示した。従って、天然のCFTRタンパク質および変 異体ならびにそれらのフラグメントは、それゆえ、すべてが本発明において有用 であるCFTRポリペプチドを構成する。 他の有用な標的ポリヌクレオチドは、多くの異なる適用のためのrAAVベクター を生成するために本発明において使用され得る。このようなポリヌクレオチドは 以下を含むが、これらに限定されない:(i)損失しているか、欠損しているか、 または最適のレベルよりやや低めの構造タンパク質または酵素により生じる遺伝 子欠損を軽減するための遺伝子治療の他の形態において有用なタンパク質をコー ドするポリヌクレオチド;(ii)アンチセンス分子へと転写されるポリヌクレオチ ド;(iii)転写因子または翻訳因子に結合するデコイへと転写されるポリヌクレ オチド;(iv)サイトカインのような細胞調節因子をコードするポリヌクレオチド ;(v)ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ遺伝子のような特異的な薬剤に影響され やすいレシピエント細胞を作製し得るポリヌクレオチド;および(vi)いくつかの 肺ガンおよび乳ガンと関連する損失または損傷しているp53遺伝子の置換のため の野生型p53腫瘍抑制cDNAのような、ガン治療のためのポリヌクレオチド。 生じた組換えAAVベクターの治療的特異性が導入されたプラスミドにより決定 されるので、同一のパッケージング細胞株を任意のこれらの適用に使用し得る。 特異的な標的ポリヌクレオチドを含むこのプラスミドは、数種類の可能な方法の 1つにより(例えば、エレクトロポレーションを含む)、AAVベクターの産生の ためにパッケージング細胞株に導入される。 ヘルパーウイルスは、rAAVベクターの導入前、導入の間、導入後に導入され得 る。実施例10に例示したように、プラスミドはヘルパーウイルスとともに培養物 を同時感染させられ得る。次いで、これれらの細胞は、当該分野で公知である適 切な期間、代表的には2〜5日、複製およびパッケージングに適切な条件で培養 される(上記の文献および下記の実施例を参照のこと)。溶解物を調製し、そし て組換えAAVベクター粒子を当該分野で公知の技術により精製する。 好ましい実施態様において、以下の実施例にも例示したが、組換えAAVベクタ ーウイルスは、自身がパッケージング細胞株のクローン中に安定に組み込まれる 。このような安定な、ベクター含有パッケージング株は増殖され得、そして使用 直前まで保存され得る。rAAV粒子の産生を誘導するために、使用者は簡単にヘル パーウイルスで細胞を感染させ、そしてAAVの複製およびパッケージングに適切 な条件下で細胞を培養する(以下に記載のように)。AAV の力価をアッセイするための細胞株の使用 本発明者らはまた、rAAV感染力価アッセイを行うために、本発明のパッケージ ング細胞株を使用した。 特に、上述のように、本発明者らは侵入rAAVと複製rAAVとの間には2対数より 大きな範囲において直線関係があることを実証した。 従って、本発明の他の実施様態において、本発明者らはrAAV調製物の相対的な 感染力価の決定のための方法を提供する。ヘルパーウイルスの量およびインキュ ベート時間がrep活性の量に影響するが、以下の例示のように、これらは容易に 最適化され得、そして一定に保持され得る。アッセイを行うために、パッケージ ング細胞株のアリコートが、標準量のヘルパーウイルスおよび試験されるrAAV調 製物の連続希釈物とともに導入される。AAVの相対的な感染力価は、適切なイン キュベーション後の各アリコートにおける複製AAVの存在量により示される;そ して既知の力価の調製物と比較され得る。 当業者に対するさらなる手引きとして以下に示される実施例を提供する。これ らの実施例がいかなる方式でも本発明を限定すると解釈されるべきではない。 実施例 実施例1 異種プロモーターに作動可能に連結された rep-cap 配列をコードするプラスミドの構築 最初の例として、本発明者らは、マウスメタロチオネインI(mMt-I)遺伝子プ ロモーター(転写の開始に対して−650から+64まで;Srivastavaら(1983)J.V irol. 45:555-564;ならびにHamerおよびWalling(1992)J .Mol.Appl.Genet. 1:273-288により記載される)に作動可能に連結された野生型repおよびcap遺伝 子(AAVゲノムのデオキシリボヌクレオチド311から4493まで)を含有するプラス ミドを構築した。 この構築物は、AAVリーディングフレーム、p19プロモーター、p40プロモータ ーおよびポリアデニル化シグナルの全てを維持しながら、両方のITRを効果的に 除去し、そしてp5プロモーターをmMt-Iプロモーターに置換する。このベクター には、neo遺伝子(ネオマイシンおよびゲンタマイシンに対する耐性を付与する )をSV40初期プロモーターの制御下に含むpKOneo、ならびにpMt-rep/capとは反 対の転写方向に配向したSV40ポリアデニル化シグナルおよびSV40スモールtイン トロンもまた含まれる(Itoら(1994)Cancer Lett. 76:33-39)。 プラスミドの構築、生育および精製は標準的な手法に従った(Ausubelら編(1 987)Current Protocols in Molecular Biology,Greene Publishing Associate s,Brooklyn,N.Y.)。 生じたプラスミド(pMt-rep/cap//pKO-neoと命名した)を図1に示す。 実施例2 rep-cap 遺伝子の哺乳動物細胞株への組込み 宿主細胞ゲノムに組込まれた後のrepおよびcap遺伝子の発現を調べるため、本 発明者らはプラスミドpMt-rep/cap//pKO-neoを典型的な哺乳動物細胞株に導入し た。 ヒトHela細胞およびA549細胞[American Type Culture Collection(ATCC)] を、抗生物質および10%ウシ胎児血清を補足したDulbecco改変Eagle培地(DME M)中で生育させた。全てのDNAトランスフェクションは、Gene Pulser(Bio-Rad )を用い、250ボルト/960μFで、0.4cmキュベット内の800μl血清非含有培地中 の4×106細胞への、15〜30μgpMt-rep/cap//pKO-neoプラスミドのエレクトロポ レーションによって行なった。 エレクトロポレーション後、細胞を、1mg/ml活性成分ゲネチシン(Gibco-BRL )の存在下、低密度でプレーティングした。個々のコロニーをリングクローニン グし、1mg/mlゲネチシン中で拡大、および維持した。 先行する研究では、哺乳動物細胞中のrepタンパク質の発現は、プレーティン グ効率の低下および/または増殖速度の減少と相関していた。例えば、メタロチ オネインプロモーターの制御下にあるrepコード配列とpSV2neoとのヒト293細胞 への同時トランスフェクションはneo耐性細胞株の生成をもたらし、それは重金 属の非存在下でさえ、コントロール細胞よりも速度の遅いDNA合成によって発達 するようであった(Yangら(1994)J .Virol. 68:4847-4856)。 同時トランスフェクションには両方のプラスミドの取り込みおよび維持が必要 であるが、ゲネチシンはneo耐性プラスミドを選択するに過ぎず、rep含有プラス ミドが結局失われ得るという可能性がある。さらに、repの導入が(プロモータ ーが誘導されない場合でさえ)宿主細胞に対して負の効果を発揮するのだとすれ ば、rep活性の喪失を助長する選択圧が存在するだろう。これらのより初期の観 察結果に基づけば、repを維持し、そして発現した細胞はゆっくり生育すると予 想される。逆に、細胞はrep活性を失うことによって正常な生育速度を再開する と予言し得た。 本発明者らの好ましい系では、選択可能なマーカーがrep-cap配列と同じプラ スミド上に含まれ、そして両者は宿主ゲノムに安定に組込まれる。例えばプラス ミドMt-rep/cap//pKOneoの場合、ゲネチシン耐性細胞は組み込まれたneo遺伝子 のコピーならびにpMt-rep/capを有すると予想される。本発明者らの系では、rep 配列が容易に失われ得ないので、先行技術は、その受容細胞が低下した生育速度 を示すと予測する。 驚くべきことに、本発明者らの構築物を典型的な哺乳動物宿主細胞(Helaおよ びA549)に導入した場合、ゲネチシン耐性クローンの増殖速度はどちらの細胞株 においても有意な影響を受けなかった。 以前に観察されたrep活性と生育速度低下との間の連関に基づいて、実質的に 正常な生育速度を示す細胞は、rep遺伝子がどういうわけか不活化されているか 、または失われている宿主を表すのだと予想されるかもしれない。 実際には、追加実験(下記)によって、rep遺伝子が得られた細胞株中に安定 に組込まれることが示され;そしてさらに、培地へのアデノウイルスの導入によ り、比較的高レベルの機能的repタンパク質の合成がもたらされることが示され た。 これらの結果は、本発明者らのアプローチを用い、過去に観察された類の生育 制限を受けない安定な細胞株を作成し得ることを示唆した。そして、下記のよう に、続く実験によって、これらの方法を用いて、組換えAAVベクターを効率よく パッケージングする能力を持つ細胞株を作成し得ることが確認された。 本明細書中に記載の方法論を当該分野で利用可能な教示および物質と組み合わ せることによって、当業者は、これらの実施例中で例示するような本発明の実施 態様を容易に調製し得る。しかし、便宜上、本発明者らは典型的なプラスミド( pMt-rep/cap//pKO-neo)、ならびに典型的なパッケージング細胞(Helaクローン 37およびA549クローン20)(これらは全てこれらの実施例中に記載される)をAm erican Type Culture Collection(12301 Parklawn Dr.,Rockville,Maryland 29852)に寄託している。これらは以下の3つの受託番号を有する(現在指定中 )。これらの寄託はブダペスト条約の約定に基づいて行われ、そして参考として 本明細書中に援用される。本願が米国特許として認可され発行される際、この寄 託の入手可能性に関する全ての制限が撤回不能に取り除かれる。そして本願の係 属中は、特許商標庁長官が37CFR1.14および35USC1.22に基づいてその資格を有す ると決定した者は、指定された寄託を入手する手段を利用できる。さらに、指定 された寄託は、寄託の日から30年間、または当該寄託に対する最新の請求の後5 年間、あるいは当該米国特許の実施可能な期間中は、そのいずれが長くても、維 持される。本明細書で言及する寄託物質は単に便宜のために意図されるに過ぎず 、そしてこれらの物質は本明細書中の記載からみて、本発明の実施には必ずしも 必要でない。さらにこれらの物質は参考として本明細書中に援用される。 実施例3 間接的免疫蛍光によるRepタンパク質の検出 本発明者らは、間接的免疫蛍光(IF)を用いて、トランスフェクションした細 胞株(HelaまたはA549細胞から派生した典型的クローン)におけるrepタンパク 質の発現を調べた。 トランスフェクションした細胞およびコントロール細胞を、200μl培養培地中 、Lab-Tek8ウェルチャンバースライド(Nunc Inc.,III.)上に播種(1.6×104 細胞/チャンバー)し、そして終夜インキュベートした。次に、細胞を個別に、 もしくは野生型AAV(MOI=5)、アデノウイルス(MOI=10)およびZnSO4(100μ M)と組み合わせて、約30時間処理した。培養培地を除去した後、細胞を0℃の リン酸緩衝化生理食塩水(PBS)で3回洗浄し、そしてアセトンで1〜2分間固 定した。次に、細胞をPBSでさらに3回洗浄し、そして「WT」培地(1%脱脂乾 燥乳,0.5mg/mlウシ血清アルブミン,150mM NaCl,50mM HEPES(pH7.5),0.1% Tween 20および1mM NaN3)と共に終夜インキュベートした。 抗rep抗体(ウサギ抗Rep78.93;Trempeら(1987)Virology 161:18-28)をWT 中に1:250に希釈し、そして100μlを室温(RT)で1時間各ウェルに加えた。細 胞をWTで5回洗浄し、次いで抗ウサギIgG FITC結合二次抗体(Sigma Chemical C orp.)の1:100希釈液100μlと共に暗所室温で1時間インキュベートした。次に 、暗所で細胞をWTで3回、そしてPBSで2回洗浄し、そしてAxioskop H蛍光顕微 鏡(Zeiss,Germany)で調べた。 アデノウイルスが培養培地中に含まれる場合、調べた細胞の多くでrepタンパ ク質が検出可能だった(23のA549クローン中8クローン、および28のHelaクロー ン中3クローン)。重金属の添加は、いずれの条件下でも、観察されるrep発現 に有意な影響を与えなかった。 これらの観察結果は、アデノウイルス感染の非存在下では、これらの細胞内で repタンパク質が合成されたとしてもそれは極めてわずかであることを示唆して いる。rep(IF)陽性細胞のサブセットから単離したゲノムDNAを、標識化したca pプローブとハイブリダイゼーションさせたサザン分析は、rep-cap配列の単一コ ピーが細胞DNA中に組込まれたことを立証した。 メタロチオネインプロモーターをヘルパーウイルス誘導性にしている機構に関 する理論に束縛されることは望まないが、本発明者らの結果は、それがアデノ応 答性エレメントを含み得ることを示唆している。このことは、Carthewら(1985 )Cell 43:439-448によってなされた観察と一致する。いずれにせよ、ヘルパー ウイルス誘導性プロモーターを得、そしてそれを試験するための記載の方法は、 単にrep構築物中のプロモーターを入れ替え、そして本明細書に記載するように コロニーについてスクリーニングすることだけにより、潜在的に興味深い任意の プロモーターに容易に適用し得る一般的な方法である。 以降の実験では、下記のように、Hela起源およびA549起源の典型的クローンを 、それらの感染後組換えAAVゲノムを複製する能力について試験した。 実施例4 IF+ 細胞の複製活性 pMt-rep/cap//pKO-neoでトランスフェクションした細胞株が機能的な複製活性 を示すかどうかを調べた。典型的な組換えAAVとして、嚢胞性線維症cDNAを含む 組換えAAV調製物(AAVCFTR)(Riordanら(1989)Science 245:1066-1073)を選 択した。このrAAV調製物の連続希釈液を、rep IF+細胞(Helaクローン37およびA 549クローン20)上で、アデノウイルスあり/なし(MOI=25)でインキュベート した。AAVCFTRウイルスを、1.2×108〜1.2×103粒子(スロットブロットによっ て決定した)に希釈し、そして両方の細胞株(6ウェルディッシュ中2.5×105細 胞/ウェル)上で、アデノウイルスあり/なし(MOI=25pfu/細胞)で48時間イン キュベートした。このウイルスに感染した細胞に対するアデノウイルス感染の効 果について制御するため、各ウェルからの培養培地をラベルしたチューブに取り 出し、そして培養ディッシュにまだ付着している全ての細胞をトリプシン処理し 、そして培地中に存在する細胞とともにプールした。その細胞懸濁液を3000rpm で5分間遠心分離した後、その上清を除去し、そして全核酸を細胞ペレットから 調製した(Ausubelら編(1987)Current Protocols in Molecular Biology,Gre ene Publishing Associates,Brooklyn,N.Y.に従う)。 この実験の陰性コントロールには、全ての細胞株上でのアデノウイルスを伴わ ない1.2×108AAVCFTR粒子のインキュベートが含まれた。 各試料につき、15μgの核酸および無処理のHelaクローン37 DNA+/−20pg AAV CFTRプラスミド(サザン用陽性コントロール)をEcoRIで消化し、ゲル電気泳動 にかけ、ニトロセルロースに移し、そしてCFTR cDNA内からの1.488kb EcoRIフラ グメントでプローブした。それぞれ内因性ヒトCFTR遺伝子(Rommensら(1989)S cience 245:1059-1065)のハイブリダイゼーションパターンおよび1.488kb CFTR cDNAシグナルを示すため、図2のレーン15〜18は親のHelaおよびA549ゲノムDNA +/−20pg AAVCFTRプラスミドを含んでいる。1.488kbに移動するハイブリダイゼ ーションシグナルが、AAVCFTRウイルスおよびアデノウイルスによる感染後のHel aクローン37細胞株およびA549クローン20細胞株の両方から単離したDNAに存在す る(図2のレーン1、2および8)。 これらの結果によって、Helaクローン37株およびA549クローン20株の両方は、 アデノウイルスを絶対的に必要とするが(図2のレーン1および7、または8お よび14を比較のこと)、両方の株は、感染時に侵入AAVCFTR DNAを複製するのに 十分なrep活性を有することが立証された。 実施例5 rAAV 感染力価アッセイ 侵入AAVCFTRウイルスと複製されるAAVCFTR配列との間に直線的な関係(これは 、rAAV感染力価アッセイの原理として利用され得る)が存在するかどうかを決定 するため、さらなるrep活性アッセイを行なった。 スロットブロットハイブリダイゼーションによって決定した1.2×109〜1.2×1 07AAVCFTR粒子の3種類の対数希釈液を、6ウェル培養プレート中の2.5ml培地内 で、2.5×105Helaクローン37細胞(アデノウイルスあり(MOI=25pfu/細胞)) 上で48時間培養した。陰性コントロールとして、1.2×109AAVCFTR粒子(アデノ ウイルスなし)が含まれた。48時間後、複製したCFTR配列を検出するため、既述 のように、サザン分析用の全核酸を細胞から調製した(図3)。1.2×109AAVCFT R粒子のみの存在下で培養したHelaクローン37細胞(図3のレーン1)は、内因 性ヒトCFTR遺伝子のゲノム構成を反映するハイブリダイゼーションパタ ーンを示した。Helaクローン37 DNAへの20pgのAAVCFTRプラスミドの添加のより 、1.488kb EcoRIフラグメントがこのブロットのどこに移動するかが示される( 図3のレーン5)。AAVCFTRウイルスの連続希釈液(アデノウイルスあり)から の試料を、それぞれ図3のレーン2〜4に示す。1.488kbで観察されるハイブリ ダイゼーションは、投入したAAVCFTRウイルスに比例し、そしてアデノウイルス の存在に絶対的に依存するようである(レーン1および2を比較のこと)。 これらの結果は、本発明に従って産生されたパッケージング細胞がアデノウイ ルスの存在下でAAVゲノムを複製し得ること、ならびに、この活性を用いて、所 定の試料中に存在する感染性ウイルス粒子の数を定量し得ることを立証している 。この特定のアッセイでは、直線的応答には、2.5×105Helaクローン37細胞上で 少なくとも1.2×107AAVCFTR粒子(≧MOI=48粒子/細胞)を培養する必要があっ た。粒子数は、AAVCFTRウイルス調製物のスロットブロットハイブリダイゼーシ ョンによって決定した。この粒子数は、感染性AAVCFTR粒子および欠陥AAVCFTR粒 子の寄与を反映し得る。それに対して、上記の感染アッセイでは、感染性粒子の みが検出されるはずである。 実施例6 パッケージング細胞へのAAVCFTRプラスミドDNA遺伝子移入 現在の組換えAAV(rAAV)ウイルス産生法には、rAAV配列を含有するプラスミ ドベクターの一過性のトランスフェクションが含まれる。rAAV調製物からそのプ ラスミドDNAを除去するには、1つ以上の工程が企てられる。上記の感染アッセ イが非ウイルスDNAを検出するかどうかを決定するため、AAVCFTRプラスミドDNA を、パッケージング細胞(Helaクローン37)(アデノウイルスあり/なし)上で 直接インキュベートした。コントロールとして、AAVCFTRプラスミド(10μg)を 、既述のように、4×106Helaクローン37細胞中にエレクトロポレーションし、 次いで100mm培養ディッシュに移した。翌日、細胞をリン酸緩衝化生理食塩水(P BS)中で洗浄し、トリプシン処理し、そして2.5×105細胞を6ウェルディッシュ 中にアデノウイルスあり/なし(MOI=25pfu/細胞)で2連で播種した。7つのさ らなるウェルにそれぞれ2.5×105Helaクローン37細胞を播種し、そしてAAVCFTR プラスミドの希釈系列(アデノウイルスあり/なし)(MOI=25pfu/細胞)、また はAAVCFTRウイルス(1×109粒子)(アデノウイルスあり)と共に培養した。感 染の48時間後に全核酸を調製し、そして既述のようにサザン分析を行なった。レ ーン9および10(図4)は、EcoRIで消化し、そして1.488kb CFTR cDNAフラグメ ントでプローブした場合の、内因性CFTR遺伝子およびヒトゲノムDNAに添加され たCFTR cDNA(20pg)の移動のハイブリダイゼーションパターンを示す。AAVCFTR プラスミドのHelaクローン37細胞へのエレクトロポレーションは1.488kbに移動 するシグナルをもたらし(図4のレーン1)、そしてトランスフェクション24時 間後にこれらの細胞中に存在するAAVCFTRプラスミドの量を表す。アデノウイル スと共にインキュベートされたエレクトロポレーションした同じ数の細胞は、He laクローン37細胞のエレクトロポレーション後にAAVCFTRプラスミドゲノムを増 幅する能力を反映して、1.488kbに移動するかなり多くのシグナルを示す(図4 のレーン2)。レーン3および4は、5μgのAAVCFTRプラスミド(それぞれアデ ノウイルスあり/なし)をトランスフェクションしないで直接Helaクローン37細 胞上でインキュベートした結果を示す。アデノウイルスの存在下で増幅された少 量のハイブリダイゼーションが存在するが、そのシグナルは、AAVCFTRプラスミ ドトランスフェクション(図4のレーン2)またはAAVCFTRウイルス感染(図4 のレーン11)のいずれかから由来するものよりかなり低い。レーン5〜8は、そ れぞれ1μg、100ng、10ngおよび1ngのAAVCFTRプラスミドを、アデノウイルス の存在下で、Helaクローン37細胞上でインキュベートした結果を示す。 これらの結果は、アデノウイルス感染の存在下では、本発明に従って産生され たパッケージング細胞がrepタンパク質を発現し、そしてトランスフェクション によって導入された組換えAAVプラスミドDNAゲノムを複製し得ることを立証して いる。この活性は、AAVプラスミドDNAのパッケージング細胞へのトランスフェク ションに依存した(例えば、AAV配列を含有するプラスミドDNAとアデノウイルス 感染との同時インキュベーションはこの投入プラスミドの顕著な複製をもたらさ なかった)。 実施例7 rAAV 感染力価アッセイの時間経過 ウイルスインキュベーションの時間が上記のrAAV感染アッセイに影響を及ぼし ていないことを証明するため、アデノウイルスの存在下でパッケージング細胞の 感染後のAAVCFTRウイルスの複製の時間経過を調べた。 AAVCFTRウイルス複製の時間経過を決定するため、1.5×105Helaクローン37細 胞を1.2×109AAVCFTR粒子およびアデノウイルス(MOI=5pfu/細胞)と共に6ウ ェルディッシュ中で培養し、そしてサザン分析のため、感染後種々の時間に収集 した。コントロールヒトDNA+/−添加されたAAVCFTRプラスミド(20pg)もまた 、コントロールとしてサザン分析に含まれた(図5のレーン12および13)。レー ン2〜6は、感染後20、24、39、42、および48時間で全核酸を収集した結果を示 す(図5)。1.488kbに観察されるシグナルは、39時間までに最大まで増大し( 図5のレーン4)、そしてレーン1および6の比較により、このアッセイの投入 アデノウイルス依存性が立証される。 これらの結果は、実施例5に記載の感染性rAAV滴定アッセイが最大に達するの に十分な時間進行していたことを立証している。 実施例8 rAAV 感染力価アッセイのアデノウイルス滴定 アデノウイルスがrAAV感染力価アッセイにおいて制限的でないことを確認する ため、このアッセイに対するアデノウイルスMOIの効果を調べた。 1.2×109AAVCFTR粒子と共に2.5×105Helaクローン37細胞上で培養し、そして4 8時間後に収集した、MOI=25.0〜0.1の投入アデノウイルスの希釈液は、1.488kb に移動するシグナル強度を減少させなかった(図5のレーン7〜11)。 これらのデータを総合すると、インキュベーション時間も添加したアデノウイ ルスの量も、実施例4および5に示される初期滴定結果に顕著な悪い影響を与え ないことを示している。 実施例9 トランスフェクション後の感染性AAVCFTRビリオンの産生 次に、本発明のパッケージング細胞に導入したAAVCFTRプラスミドが、感染性A AVCFTRビリオンに効果的にパッケージングされ得ることを立証した。 詳細には、AAVCFTRプラスミド(10μg)を、既述のように、2×106個の典型的 なパッケージング細胞(Helaクローン37)にエレクトロポレーションし、そして 100mm培養ディッシュ上にプレーティングした。翌日、細胞をPBSで洗浄し、トリ プシン処理し、ペレット化し、そして培養培地中で生育させた。細胞を計数し、 そして2×105個を6ウェル培養ディッシュの2つのウェルに播種した。細胞を 、2.5mlの培地(アデノウイルスあり/なし)(MOI=10)と共にインキュベート した。48時間後、細胞を培地中に掻き出し、そしてドライアイス/EtOH槽および3 7℃のH2O槽中で、それぞれ3回の凍結/融解サイクルにかけた。3000rpmで10分間 の遠心分離後、滴定のために上清を取り出し(約2.5ml)、そしてrAAVCFTR複製 中間体を捜すために、凍結/融解後の細胞残渣ペレットから全核酸を単離した。 実施例4および5に記載のように滴定するために、エレクトロポレーションした パッケージング細胞(アデノウイルスあり)からの上清(50μlおよび500μl) 、およびアデノウイルスで感染していないコントロールの希釈液(500μl)を、 追加のアデノウイルス(MOI=5)の存在下、2.5mlの最終容量中で48時間培養し た。エレクトロポレーションまたはアデノウイルスに由来する潜在的プラスミド の混入を、追加のrAAVCFTRビリオンを生成するための初期培養物から除去する工 程は何も企てなかった。 凍結/融解後の細胞ペレットから単離した核酸(EcoRIで消化し、CFTR配列につ いてプローブした)のサザン分析を図6に示す。図4で既述したように、AAVCFT Rプラスミドは、エレクトロポレーション後のHelaクローン37細胞中に検出され 得、そして1.488kbに移動するハイブリダイゼーションシグナルは、アデノウイ ルスによる感染後に増大する(図6のレーン1および2)。 AAVCFTRプラスミドでエレクトロポレーションしたHelaクローン37細胞(アデ ノウイルスあり/なし)から得られる上清の滴定を、図7のレーン1〜3に示す 。アデノウイルスなしのコントロールから得られる上清と共にインキュベートし た Helaクローン37細胞から単離したDNA中には、1.488kbに移動するかすかなシグナ ルが検出され得、そしてエレクトロポレーションに由来する少量の混入している 投入AAVCFTRプラスミドを反映している(図7のレーン1)。アデノウイルスと 共に培養した2連のウェルから得られ、そしてHelaクローン37細胞上で滴定され た上清は、コントロール条件と比較してかなり多くの1.488kbに移動するハイブ リダイゼーションを表した(図7のレーン3および1を比較のこと)。 これらの結果は、組換えAAVプラスミドによるパッケージング細胞のトランス フェクションおよびアデノウイルスによる感染の後に、rAAV配列が複製され、そ して感染性rAAVビリオンに組み立てられることを立証している。 実施例10 rAAV ウイルスによる感染後の感染性組換えAAVビリオンの産生 さらに、パッケージング細胞の感染後の感染性rAAVビリオン生成能力を調べた 。新たに合成されたウイルスが生成されるかどうかを決定するために、いくつか のコントロール実験が含まれた。これらには、親のHela細胞の使用およびrAAVの 生成を許容するはずのない条件の使用が含まれる。Helaクローン37細胞および親 のHela細胞の両者(2.5×105)を、6ウェルディッシュに播種し、そして以下の 条件下で48時間インキュベートした:+109AAVCFTR粒子のみ;+109AAVCFTR粒子 と、アデノウイルス(MOI=10)または野生型AAV(MOI=5)のいずれか;ある いは3つ全て。48時間後、細胞を実施例9に記載のように収集した。サザン分析 のために、核酸を凍結/融解後の細胞ペレットから単離し、そして上清を滴定し た。 上記の条件下で処理したHelaクローン37細胞(レーン3〜6)、または親のHe Ia細胞(レーン7〜10)のいずれかから単離した核酸のサザン分析を、図6に示 す。109AAVCFTR粒子のみによるいずれの細胞株の処理も、複製されたAAVCFTR配 列の生成をもたらさなかった(それぞれ図6のレーン3および7)。Helaクロー ン37細胞へのアデノウイルスの添加は、1.488kbに移動する有意な量のシグナル を生成し(親のHela細胞ではこれが起こらなかった)、以前の観察結果と合致し た(図6のレーン4および8)。野生型AAVは、アデノウイルスヘルパー機能を 欠くので、いずれの細胞株でも複製されたAAVCFTRの生成をもたらさなかった( 図6のレーン5および9)。最後に、109AAVCFTR粒子と、アデノルイスおよび野 生型AAVの両方との同時感染は、Helaクローン37細胞および親のHela細胞の両方 中で複製されたAAVCFTR配列の生成をもたらす(図6のレーン6および10)。野 生型ウイルス複製と組換えAAVCFTRウイルス複製との間の競合のため、1.488kbに 移動するシグナルは、Helaクローン37細胞では減少し得、そして全体のレーンバ ックグラウンドは増大する。 滴定のため、凍結/融解後に生成した上清を、アデノウイルス(MOI=5)の存 在下で、新鮮なHelaクローン37細胞上でインキュベートした(特に示さない限り 、500μlを2.5mlに希釈)。さらなるrAAVCFTRビリオンを生成するために、初期 培養物から、投入AAVCFTRウイルス、野生型AAV、またはアデノウイルスを除去す る工程を何も企てなかった。48時間後、AAVCFTR複製の検出について既述したよ うに、全核酸を調製し、そしてサザン分析を行なった。 Helaクローン37細胞および親のHela細胞の両方を、109AAVCFTR粒子と共に種々 の条件下で培養した結果を図7のレーン4〜12に示す。全てのレーンが、上清中 にrAAVCFTRウイルスが存在することを明らかにした。これは、新たに生成された ビリオンを投入ウイルスから精製するための試みがなされなかったという事実に よる。投入シグナルを超えるシグナルはいずれも、図6で観察されるAAVCFTRシ グナルの増幅をもたらした条件に相関するはずである。これらの条件には、109A AVCFTR粒子(アデノウイルスあり)および/または野生型AAV(親のHela細胞にお ける)が含まれる(図6のレーン4、6および10)。他の条件は全てAAVCFTR配 列の複製をもたらさなかった。そして他の条件は全て、投入AAVCFTRウイルスの 存在を反映して、滴定後に類似のシグナルを示すはずである(図7のレーン4、 7、9〜11)。 予想されたように、AAVCFTR、アデノウイルス、および野性型AAVの同時インキ ュベーションは、Helaクローン37細胞および親のHela細胞の両方で、新たなAAVC FTRウイルス産生の生成をもたらした(図7のレーン8および12)。AAVCFTRウイ ルス産生はまた、アデノウイルスのみを伴うHelaクローン37細胞でも観察された が、親のHela細胞では観察されなかった(図7のレーン6および4を比較のこ と)。このことは、図6のレーン4で、これらの細胞から単離したDNA中にAAVCF TRシグナルの増大が観察されたことと合致する。レーン6(図7)で1.488kbに 観察されるハイブリダイゼーションの強度と、投入AAVCFTRウイルスを表すシグ ナルの強度(レーン4、7、9〜11)との相違は、Helaクローン37細胞における AAVCFTRの感染および増幅時のAAVCFTR力価の増大を表している。 これらの結果は、パッケージング細胞がアデノウイルスの存在下で、トランス フェクションまたは感染のいずれかによって、rAAVベクターゲノムを複製し得、 それを感染性ビリオンにパッケージングし得ることを立証している(図6および 7)。 実施例11 パッケージング細胞からの組込まれたrAAVベクターの回収および増幅 パッケージング細胞(Helaクローン37に由来する)を、CMVエンハンサー/プロ モーターに作動可能に連結したハイグロマイシン耐性遺伝子を含有する組換えAA Vベクター(rAAV-CMV-Hygroと命名された)で、既述のようにエレクトロポレー ションし、そして300μg/mlハイグロマイシン中で選択することによって、安定 なポリクローナルな株を得た。 このパッケージング細胞中に存在するrep活性が、組込まれたrAAV-CMV-Hygro ベクターを効率よく認識し、切り出し、そして増幅し得るかどうかを決定するた め、ポリクローナルなhygro耐性Helaクローン37株(2.5×105細胞/ウェル)を6 ウェルディッシュ上に播種し、アデノウイルス(MOI=50)のみ、+野生型AAV( MOI=5)で感染するか、もしくは感染しなかった。48時間後、既述のように核 酸を調製し、NheI/Asp718で消化し、そしてハイグロマイシン耐性遺伝子を含有 する標識された1048bp NheI/Asp718フラグメントをプローブとして用いて、サザ ン分析を行なった。この分析の結果を図8に示す。レーン1は、親のHelaクロー ン37細胞株から単離したDNAを表し、それ故hygro耐性遺伝子を含有しない。レー ン2は、ポリクローナルなhygro耐性Helaクローン37株からのDNAを含有し、これ は、この暴露時間で、平均約1コピー/ウェルで存在する(データは示していな い)耐性遺伝子の存在を示さない。アデノウイルスで処理したhygro耐性Hela クローン37細胞を含む2連のウェルから単離したDNAを、レーン3に流した。104 8bpに存在するハイブリダイゼーションは、このHelaクローン細胞に組込まれた 組込みAAVCMVHygroベクターの切り出しおよび増幅に由来する物質を表わす。ア デノウイルス感染物に対する野生型AAVの添加は同様の結果を与えた(レーン4 )。 これらの結果は、このrAAVパッケージング細胞中で生成したrep活性が、組込 まれた組換えAAVベクターを認識し、切り出し、そして増幅するに十分であるこ とを立証している。
【手続補正書】 【提出日】1998年1月20日 【補正内容】 6.1 明細書を以下の通り補正します。 明細書第32頁19〜20行の「(現在指定中)」を削除し、代わりに「(9 7049,CRL−11831,CRL 11877)」を挿入します。 6.2 図5および図8をそれぞれ別紙の通り補正します。 【図5】 【図8】
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M C,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF,CG ,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,SN, TD,TG),AP(KE,LS,MW,SD,SZ,U G),AM,AT,AU,BB,BG,BR,BY,C A,CH,CN,CZ,DE,DK,EE,ES,FI ,GB,GE,HU,IS,JP,KE,KG,KP, KR,KZ,LK,LR,LT,LU,LV,MD,M G,MN,MX,NO,NZ,PL,PT,RO,RU ,SD,SE,SG,SI,SK,TJ,TM,TT, UA,US,UZ,VN

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.組換えAAV(rAAV)ベクターの高い効率でパッケージングし得る哺乳動物細胞 を産生する方法であって、以下の工程: (a)プロモーターと作動可能に連結された安定に組み込まれたAAV cap遺伝子 および異種プロモーターと作動可能に連結された安定に組み換えられたAAV rep 遺伝子を含む哺乳動物細胞を提供する工程; (b)工程(a)に記載の細胞を複製し、細胞集団を産生させる工程; (c)工程(b)の細胞集団へ、ヘルパーウイルスを導入する工程;および (d)ヘルパーウイルス誘導repタンパク質活性を示す細胞を選択する工程、 を包含する、方法。 2.前記ヘルパーウイルスが、アデノウイルスである、請求項1に記載の方法。 3.前記パッケージング細胞が、AAV rep遺伝子を含まない親型細胞の少なくと も半分の早さで増殖し得、そして該パッケージング細胞が少なくとも100 rAAV粒 子/細胞を産生するrAAVベクターをパッケージングし得る、請求項1に記載の方 法。 4.工程(a)の前記哺乳動物細胞が、p5プロモーターが異種プロモーターによ り置換されたAAVの結合されたrep遺伝子およびcap遺伝子を含む、請求項1に記 載の方法。 5.前記異種プロモーターが、マウスメタロチオメインI(mMT-I)プロモーターで ある、請求項4に記載の方法。 6.請求項1の方法で産生される、細胞およびその子孫。 7.請求項3の方法で産生される、細胞およびその子孫。 8.請求項4の方法で産生される、細胞およびその子孫。 9.請求項5の方法で産生される、細胞およびその子孫。 10.組換えAAV(rAAV)ベクターを高い効率でパッケージングし得る哺乳動物細 胞であり、該細胞は、プロモーターに作動可能に連結された安定に組み込まれた cap遺伝子、および異種プロモーターに作動可能に連結された安定に組み込まれ たrep遺伝子を含む;該細胞が、ヘルパーウイルス誘導repタンパク質活性を示す 、哺乳動物細胞。 11.前記ヘルパーウイルス導入repタンパク質活性が、アデノウイルスにより 誘導される、請求項10に記載のAAVパッケージング細胞。 12.前記パッケージング細胞が、AAV rep遺伝子を含まない親型細胞の少なく とも半分の早さで増殖し得、そして該パッケージング細胞が、少なくとも100 rA AV粒子/細胞を産生するためのrAAVベクターをパッケージングし得る、請求項1 0に記載のAAVパッケージング細胞。 13.前記細胞が、p5プロモーターが異種プロモーターにより置換されたAAVの 結合されたrep遺伝子およびcap遺伝子を含む、請求項10に記載のAAVパッケー ジング細胞。 14.前記異種プロモーターが、マウスメタロチオネインI(mMT-I)プロモーター である、請求項13に記載のAAVパッケージング細胞。 15.安定に組み込まれた組換えAAVベクターをさらに含み、該ベクターが、2 つのAAV逆方向末端反復(ITR)領域の間に位置する目的のポリヌクレオチド配列を 含む、請求項10に記載のAAVパッケージング細胞。 16.組換えAAVベクターをパッケージングする方法であって、以下の工程: (a)請求項10に記載のAAVパッケージング細胞を提供する工程; (b)組換えAAVベクターを導入する工程であって、該ベクターが2つのAAV逆方 向末端反復(ITR)領域の間に位置する、目的のポリヌクレオチド配列を含む工程 ; (c)ヘルパーウイルスを導入する工程;および (d)AAVの複製およびパッケージングに適切な条件下で、該細胞をインキュベ ートする工程、 を包含する、方法。 17.組換えAAVベクターをパッケージングする方法であって、以下の工程: (a)安定に組み込まれたrAAVベクターを含む、請求項15に記載のAAVパッケ ージング細胞を提供する工程; (b)ヘルパーウイルスを導入する工程;および (c)AAVの複製およびパッケージングに適切な条件下で、該細胞をインキュベ ートする工程、 を包含する、方法。 18.請求項16に記載の方法に従ってパッケージングされた、組換えAAVベク ター。 19.請求項17に記載の方法に従ってパッケージングされた、組換えAAVベク ター。 20.前記ベクターが嚢胞性線維症トランスメンブランコンダクタンスレギュレ ーター(CFTR)をコードするポリヌクレオチドを含む、請求項19に記載の組換え AAVベクター。 21.rAAVベクター調製物の関連する感染力価を決定する方法であって、以下の 工程: (a)請求項10に記載のAAVパッケージング細胞へ、ヘルパーウイルスおよびr AAVベクター調製物の連続希釈物を導入する工程; (b)AAVの複製に適切な条件下で、該細胞をインキュベートする工程;および (c)複製されたrAAVベクターの量を決定する工程、 を包含する、方法。
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