JP2020518259A - ハンチントン病治療組成物および方法 - Google Patents

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Abstract

本発明は、siRNA分子をコードするアデノ随伴ウイルス(AAV)粒子、およびハンチントン病(HD)を治療するための方法に関する。

Description

本発明は、ハンチンチン(HTT)遺伝子(例えば、野生型または突然変異型CAG伸長HTT遺伝子)を標的とする調節性ポリヌクレオチド、例えば低分子干渉RNA(siRNA)分子をコードするポリヌクレオチドを含むAAV粒子を設計、調製、製造、使用および/または製剤化するための組成物、方法およびプロセスに関する。突然変異型HTT遺伝子のターゲティングはHTT遺伝子発現および結果として生じるHTTタンパク質産生に干渉し得る。siRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子は、組換えアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターに挿入されてもよい。神経変性疾患(例えばハンチントン病(HD))を有する対象のHTT遺伝子発現を阻害するためのAAV粒子の使用方法もまた開示される。
ハンチントン病(HD)は、進行性の舞踏運動、精神神経および認知機能障害によって特徴付けられる単一遺伝子性の致死性神経変性疾患である。ハンチントン病は、ハンチンチン(HTT)遺伝子のN末端にポリグルタミンをコードする常染色体優性トリプレット(CAG)リピート伸長によって引き起こされることが知られている。このリピート伸長がHTTの毒性の機能獲得をもたらし、最終的に線条体神経変性につながり、それが広汎性脳萎縮へと進行する。症状は典型的には35〜44歳で現れ、疾患発症後の平均余命は10〜25年である。興味深いことに、HTT伸長の長さが発症年齢および疾患進行速度の両方と相関し、伸長が長いほど、より高い疾患重症度に結び付く。HD集団のごく一部では(約6%)、2〜20歳で無動・筋強直症候群の出現を伴い疾患発症が起こる。これらの症例は遅発型と比べて進行が速い傾向があり、若年性またはウェストファール変異型HDに分類されている。現在、米国および欧州で約35,000〜70,000人の患者がHDに罹患していると推定される。現在、HDの治療には対症的軽減および支持療法のみが利用可能であり、治療法は未だ同定されていない。最終的に、HD罹患者は他の疾患(例えば、肺炎、心不全)、息詰まり、窒息またはその他の、転倒による身体的外傷などの合併症に陥る。
CAG伸長HTTが神経毒性をもたらす機構については十分に解明されていない。ハンチンチンタンパク質はあらゆる細胞に発現し、但しその濃度は脳で最も高い。HTTの正常機能は分かっていないが、HD患者の脳ではHTTが凝集して異常な核封入体になる。現在では、関連するタンパク質中間体(すなわち可溶性種および毒性N末端断片)に加えて、このミスフォールディングおよび凝集過程が神経毒性をもたらすと考えられている。
HD動物モデルにおける研究によれば、例えば調節発現モデルにおける遺伝子遮断後に、表現型の逆転が実現可能であることが示唆されている。更に、HTTのサイレンシングを試験した動物モデルにより有望な結果が実証されており、この療法は良好に忍容されたと共に、潜在的な治療利益を示した。これらの知見は、HTTサイレンシングがHD治療の潜在的な治療標的となり得ることを示している。
アデノ随伴ウイルス(AAV)は、パルボウイルスファミリーのメンバーであり、主に、このウイルスが明らかに非病原性であり、実際、AAVはいかなるヒト疾患にも関連付けられていないため、遺伝子療法の魅力的なベクターとして登場した。更なる魅力は、分裂および非分裂細胞を形質導入することが可能であること(ニューロンの効率的な形質導入を含む)、ヒトにおける炎症促進性および免疫応答が少ないこと、ヘルパーウイルス無しには自律的複製が不能であること(AAVは、ディペンドウイルス属に属するヘルパー依存性DNAパルボウイルスである)、および遺伝子発現が長期間にわたることによる。10種超の組換えAAV血清型(rAAV)が操作によりベクターにされているが、遺伝子療法を試みるために最も頻繁に使用される血清型はrAAV2である。ニューロン形質導入がより効率的である追加のrAAV血清型が開発され、動物モデルにおいて試験されている。
本発明は、この疾患を治療するためにHD患者においてCAG伸長HTTの発現を阻害または防止するための新規二本鎖RNA(dsRNA)コンストラクトおよびsiRNAコンストラクトをコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子、およびそれらの設計方法を開発する。
本明細書には、ハンチントン病(HD)関連症状および障害を治療、予防、緩和および/または改善するためのsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子を投与する方法、プロセス、組成物キットおよびデバイスが記載される。
本発明は、HTTを標的とし、細胞および/または対象におけるHTTの発現を低減するためのsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むウイルスゲノムを提供する。
一部の実施形態において、ウイルスゲノムは、限定はされないが、配列番号1380および1381などの、5’末端逆位配列(ITR)配列領域、限定はされないが、配列番号1408および1409などの、エンハンサー配列領域、限定はされないが、配列番号1410〜1411および配列GTTGなどのプロモータ配列領域、限定はされないが、配列番号1417〜1419などの、少なくとも1つのイントロン配列領域、限定はされないが、配列番号1183〜1279および1346〜1347などの、調節性ポリヌクレオチド配列領域、限定はされないが、配列番号1420〜1423などの、ポリアデニル化(ポリA)シグナル配列領域、ならびに配列番号1382および1383などの、3’ITR配列領域を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、少なくとももう1つの配列領域を含み得る。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、限定はされないが、配列番号384〜1390および配列TCGAGなどの、少なくとも1つの多重クローニング部位(MCS)配列領域を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、1つのMCS配列領域を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのMCS配列領域を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、限定はされないが、配列番号1390〜1407などの、少なくとも1つのフィラー配列領域を含む。一実施形態において、AAVウイルスゲノムは、1つのフィラー配列領域を含む。一実施形態において、AAVウイルスゲノムは、2つのフィラー配列領域を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、限定はされないが、配列番号1415および1416などの、少なくとも1つのエクソン配列領域を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、1つのイントロン配列領域を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのイントロン配列領域を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域、エンハンサー配列領域、プロモータ配列領域、少なくとも1つのイントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド配列領域、ポリアデニル化(ポリA)シグナル配列領域、および3’ITR配列領域を含む。非限定的な例として、AAVウイルスゲノムは、配列番号1352〜1379などの配列、またはその断片もしくは変異体を含む。
一実施形態において、限定はされないが、配列番号1352〜1379のいずれかまたはそれらと少なくとも95%の同一性を有する変異体などのウイルスゲノム。
一実施形態において、AAV粒子は、限定はされないが、配列番号1352〜1379のいずれかまたはそれらと少なくとも95%の同一性を有する変異体などの、ウイルスゲノムを含み得る。AAV粒子は、限定はされないが、表1に挙げられる血清型のいずれかなどの血清型を含み得る。
本明細書ではまた、AAV粒子の医薬組成物も提供される。AAV粒子は、限定はされないが、配列番号1352〜1379のいずれかまたはそれらと少なくとも95%の同一性を有する変異体などの、ウイルスゲノムを含み得る。AAV粒子は、限定はされないが、表1に挙げられる血清型のいずれかなどの血清型を含み得る。
一部の実施形態において、本発明は、細胞におけるHTT遺伝子発現を阻害/サイレンシングする方法を提供する。細胞は、ニューロン(例えば、被殻、尾状核または線条体の中型有棘ニューロン、および大脳皮質の皮質ニューロン)、アストロサイト(例えば、線条体のアストロサイト、大脳皮質の皮質アストロサイト)および/またはオリゴデンドロサイトであってもよい。非限定的な例として、被殻、尾状核および皮質におけるHTT遺伝子発現の阻害(または低減)が、対象におけるハンチントン病の効果を低下させる。別の非限定的な例として、線条体の中型有棘ニューロンにおけるHTT遺伝子発現の阻害(または低減)が、対象におけるハンチントン病の効果を低下させる。更に別の非限定的な例として、線条体のアストロサイトにおけるHTT遺伝子発現の阻害(または低減)が、対象におけるハンチントン病の効果を低下させる。一部の態様において、HTT遺伝子発現の阻害とは、少なくとも約20%、好ましくは少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%の阻害または低減を指す。したがって、標的遺伝子のタンパク質産物は少なくとも約20%、好ましくは少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%阻害され得る。
一実施形態において、本発明は、siRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むウイルスゲノムを使用して、細胞においてHTT遺伝子発現を少なくとも約40%阻害/サイレンシングする方法を提供する。細胞は、ニューロン(例えば、被殻または線条体の中型有棘ニューロン、および大脳皮質の皮質ニューロン)、アストロサイト(例えば、線条体のアストロサイト、大脳皮質の皮質アストロサイト)および/またはオリゴデンドロサイトであってもよい。非限定的な例として、被殻および皮質におけるHTT遺伝子発現の少なくとも40%の阻害(または低減)が、対象におけるハンチントン病の効果を低下させる。別の非限定的な例として、線条体の中型有棘ニューロンにおけるHTT遺伝子発現の少なくとも40%の阻害(または低減)が、対象におけるハンチントン病の効果を低下させる。更に別の非限定的な例として、線条体のアストロサイトにおけるHTT遺伝子発現の少なくとも40%の阻害(または低減)が、対象におけるハンチントン病の効果を低下させる。
一部の実施形態において、本発明は、治療を必要としている対象のHTT遺伝子(例えば、CAG伸長HTT遺伝子)および結果として生じるHTTタンパク質(例えばポリQタンパク質)に関連するハンチントン病を治療する、または改善する方法であって、本明細書に記載されるAAV粒子を含む医薬組成物の薬学的有効量を対象に投与すること、およびその対象においてHDの症状を改善することを含む方法を提供する。
一部の実施形態において、HTT遺伝子を標的とする少なくとも1つのsiRNA二重鎖をコードする核酸配列を含むAAV粒子が、HDの治療および/または改善を必要としている対象に投与される。AAVベクター血清型は、表1に挙げられる血清型のいずれであってもよい。
一部の実施形態において、AAV粒子は、対象の中枢神経系に直接、例えば頭蓋内注射によって導入されてもよい。
一部の実施形態において、本発明の医薬組成物は単独療法として使用される。他の実施形態において、本発明の医薬組成物は併用療法で使用される。併用療法は、ニューロン変性に対するそれらの神経保護効果に関して試験済みの、小分子化合物、成長因子およびホルモンなどの1つ以上の神経保護剤との併用であってもよい。
一部の実施形態において、本発明は、本明細書に記載されるプラスミドまたはAAVベクターの治療有効量をそれを必要としている対象に投与することによりハンチントン病を治療する、または改善する方法を提供する。
一部の実施形態において、本発明は、発現されると対象におけるHTTの発現を阻害または抑制するsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含む少なくとも1つのAAV粒子を有する組成物を対象に投与することによって、対象の中枢神経系の一領域におけるHTT遺伝子の発現を阻害する方法を提供する。発現は、対象の一領域、限定はされないが対象の前脳など、または前脳の一領域、限定はされないが被殻などで低下し得る。前脳または前脳の一領域(例えば被殻)におけるHTTの発現は40〜70%、40〜60%、50〜70%、50〜60%低下してもよく、またはそれは50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、または60%低下してもよい。
一部の実施形態において、本発明は、治療を必要としている対象のハンチントン病(HD)を治療する方法を提供する。発現されると対象におけるHTTの発現を阻害または抑制するsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含む少なくとも1つのAAV粒子を含む組成物を対象に投与することを含むこの方法は、対象の中枢神経系の一領域におけるHTT遺伝子の発現を阻害し得る。発現は、対象の一領域、限定はされないが対象の前脳など、または前脳の一領域、限定はされないが被殻などで低下し得る。前脳または前脳の一領域(例えば被殻)におけるHTTの発現は40〜70%、40〜60%、50〜70%、50〜60%低下してもよく、またはそれは50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、または60%低下してもよい。
前出の目的、特徴、および利点ならびに他の目的、特徴、および利点は、付属の図面において例示される、本発明の特定の実施形態についての以下の説明から明らかになるであろう。図面は、必ずしも縮尺通りではなく、本発明の多様な実施形態についての原理を例示することに強調を置いている。
本発明のウイルスゲノムの概略図。 本発明のウイルスゲノムの概略図。 本発明のウイルスゲノムの概略図。 本発明のウイルスゲノムの概略図。 本発明のウイルスゲノムの概略図。 本発明のウイルスゲノムの概略図。 本発明のウイルスゲノムの概略図。 本発明のウイルスゲノムの概略図。 本発明のウイルスゲノムの概略図。
本発明の1つ以上の実施形態の詳細が下記の添付の説明に示される。本発明の実施または試験においては本明細書に記載されるものと同様のまたは等価な任意の材料および方法を使用し得るが、ここで好ましい材料および方法について説明する。本発明の他の特徴、目的および利点が、この説明から明らかになるであろう。説明においては、文脈上特に明確に指示されない限り、単数形に複数形も含まれる。特に定義されない限り、本明細書で使用される全ての科学技術用語は、本発明が属する技術分野の当業者が一般的に理解するのと同じ意味を有する。矛盾が生じた場合、本説明が優先するものとする。
I.本発明の組成物
本発明によれば、アデノ随伴ウイルス(AAV)によって、調節性ポリヌクレオチドおよび/または調節性ポリヌクレオチドに基づく組成物を送達するための組成物が提供される。本発明のAAV粒子は、インビボ、エクスビボまたはインビトロにて、幾つかの投与経路のいずれかを介して、細胞、組織、臓器、または生物に提供することができる。
本明細書で使用されるとき、「AAV粒子」は、少なくとも1つのペイロード領域および少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)領域を有するウイルスゲノムを含むウイルスである。
本明細書で使用されるとき、「ウイルスゲノム」または「ベクターゲノム」または「ウイルスベクター」は、AAV粒子に被包された核酸配列を指す。ウイルスゲノムは、ポリペプチドまたはそれらの断片をコードする少なくとも1つのペイロード領域を含む。
本明細書で使用されるとき、「ペイロード」または「ペイロード領域」は、本発明の1つ以上のポリペプチドをコードする任意の核酸分子である。ペイロード領域は、最低限、センス配列およびアンチセンス配列、siRNAに基づく組成物、またはその断片をコードする核酸配列を含むが、任意選択で、転写発現および/またはポリペプチド翻訳を促進する1つ以上の機能性または調節エレメントも含み得る。
本明細書で開示される核酸配列およびポリペプチドは、本発明の調節性ポリヌクレオチドおよび/または調節性ポリヌクレオチドに基づく組成物の発現を可能にするようにアセンブルされたモジュール型のエレメントおよび/または配列モチーフを含有するように操作されていてもよい。一部の実施形態において、ペイロード領域を含む核酸配列は、プロモータ領域、イントロン、コザック配列、エンハンサーまたはポリアデニル化配列の1つ以上を含み得る。本発明のペイロード領域は、典型的には、少なくとも1つのセンス配列およびアンチセンス配列、siRNAに基づく組成物、または前述のものの断片を、互いに組み合わせてまたは他のポリペプチド部分と組み合わせてコードする。
AAV粒子のウイルスゲノム内の本発明のペイロード領域は、1つ以上の標的細胞、組織、臓器または生物に送達され得る
アデノ随伴ウイルス(AAV)およびAAV粒子
パルボウイルス科のウイルスは、一本鎖DNAゲノムによって特徴付けられる小型非エンベロープ二十面体カプシドウイルスである。パルボウイルス科ウイルスは、2つの亜科:脊椎動物に感染するパルボウイルス亜科および無脊椎動物に感染するデンソウイルス亜科で構成される。このウイルスファミリーは、その構造が比較的で単純であり、標準的分子生物学技法を使用して容易に操られるため、生物学的ツールとして有用である。ウイルスのゲノムは、所望のペイロードが担持されているかまたは所望のペイロードを発現もしくは送達するように操作されている機能的組換えウイルスまたはウイルス粒子をアセンブリするための最低限の成分を含有するように修飾することができ、所望のペイロードを、標的細胞、組織、臓器、または生物に送達することができる。
パルボウイルスおよびパルボウイルス科の他のメンバーは、ケネス I.ベルン(Kenneth I.Berns)、「パルボウイルス科:ウイルスおよびそれらの複製(The Viruses and Their Replication)」、フィールズ・バイロロジー(FIELDS VIROLOGY)(第3版、1996年)の第69章に概説されている。その内容は全体として参照により援用される。
パルボウイルス科は、限定はされないが、ヒト、霊長類、ウシ、イヌ、ウマ、およびヒツジ種を含む脊椎動物宿主において複製可能なアデノ随伴ウイルス(AAV)を含むディペンドウイルス属を含む。
AAVウイルスゲノムは、およそ5,000ヌクレオチド(nt)長の線形一本鎖DNA(ssDNA)分子である。AAVウイルスゲノムは、ペイロード領域および少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)またはITR領域を含み得る。ITRは、伝統的には、非構造タンパク質(Rep遺伝子によってコードされる)および構造タンパク質(カプシド遺伝子またはCap遺伝子によってコードされる)のコードヌクレオチド配列に隣接する。理論によって束縛されることを望むものではないが、AAVウイルスゲノムは、典型的には、2つのITR配列を含む。AAVウイルスゲノムは、エネルギー的に安定した二本鎖領域を形成するssDNAの5’末端および3’末端の自己相補的な末端145ntによって規定される特徴的なT形ヘアピン構造を含む。二本鎖ヘアピン構造は、限定はされないが、宿主ウイルス複製細胞の内因性DNAポリメラーゼ複合体のプライマーとして機能することによってDNA複製の起点として働くことを含む、複数の機能を含む。
コード化異種性ペイロードに加えて、AAVベクターは、全体または一部が、任意の天然に存在するおよび/または組換えのAAV血清型ヌクレオチド配列または変異体のウイルスゲノムを含み得る。AAVバリアントは、概して物理的および機能的等価物であるコンストラクトを産生し、同様の機序によって複製し、および同様の機序によってアセンブルするように、核酸レベル(ゲノムまたはカプシド)およびアミノ酸レベル(カプシド)において有意に相同性である配列を有し得る。チオリニ(Chiorini)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir.)、第71巻、p.6823〜33(1997年);スリバスタバ(Srivastava)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir)、第45巻、p.555〜64(1983年);チオリニ(Chiorini)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir)、第73巻、p.1309〜1319(1999年);ラトリッジ(Rutledge)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir)、第72巻、p.309〜319(1998年);およびウー(Wu)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir)、第74巻、p.8635〜47(2000年)。これらの各々の内容は、本明細書において全体として参照により援用される。
一実施形態において、本発明のAAV粒子は、複製欠損型である組換えAAVベクターであり、それらのウイルスゲノム内に機能的RepおよびCapタンパク質をコードする配列を欠如する。これらの欠損AAVベクターは、ほとんどのまたは全ての親コード配列を欠如してもよく、本質的に、1つまたは2つのAAV ITR配列および細胞、組織、臓器または生物に送達するための目的の核酸のみを有していてもよい。
一実施形態において、本発明のAAV粒子のウイルスゲノムは、そこにコードされたコード配列の複製、転写および翻訳を提供する少なくとも1つの制御エレメントを含む。コード配列が適切な宿主細胞中で複製、転写および/または翻訳されることが可能である限り、制御エレメントは全てが常に存在する必要があるわけではない。発現制御エレメントの非限定的な例としては、転写開始および/もしくは終結のための配列、プロモータおよび/もしくはエンハンサー配列、スプライシングおよびポリアデニル化シグナルなどの効率的RNAプロセシングシグナル、細胞質mRNAを安定させる配列、翻訳有効性を増強する配列(例えば、コザックコンセンサス配列)、タンパク質安定性を増強する配列、ならびに/またはタンパク質プロセシングおよび/もしくは分泌を増強する配列が挙げられる。
本発明によれば、療法および/または診断に使用されるAAV粒子は、目的の核酸ペイロードまたはカーゴの形質導入に必要な最低限の成分へと純化または縮小されているウイルスを含む。このように、AAV粒子は、野生型ウイルスに見られる有害な複製および/または組込み特徴を欠きながらも、特異的送達媒体として操作される。
本発明のAAVベクターは、組換え的に産生されてもよく、アデノ随伴ウイルス(AAV)親または参照配列に基づいていてもよい。本明細書で使用されるとき、「ベクター」は、本明細書に記載される核酸などの異種分子を輸送し、形質導入し、またはその他担体として働く任意の分子または部分を意味する。
一本鎖AAVウイルスゲノム(例えば、ssAAV)に加えて、本発明はまた、自己相補的AAV(scAAV)ウイルスゲノムも提供する。scAAVウイルスゲノムは、共にアニーリングして二本鎖DNAを形成するDNA鎖を含有する。第2鎖の合成をスキップすることにより、scAAVは、細胞において迅速に発現することが可能である。
一実施形態において、本発明のAAV粒子はscAAVである。
一実施形態において、本発明のAAV粒子はssAAVである。
AAV粒子を作製および/または修飾する方法は、シュードタイプAAVベクターなど、当該技術分野において開示されている(国際公開第200028004号パンフレット、同第200123001号パンフレット、同第2004112727号パンフレット、同第2005005610号パンフレットおよび同第2005072364号パンフレット、これらの各々の内容は全体として参照により本明細書に援用される)。
AAV粒子は、送達効率が増強されるように修飾されてもよい。かかる修飾されたAAV粒子は、効率的にパッケージングすることができ、高頻度でおよび最低限の毒性で標的細胞への感染を成功させるために使用することができる。一部の実施形態において、AAV粒子のカプシドは、米国特許出願公開第20130195801号明細書に記載される方法に従って操作される。この内容は、本明細書において全体として参照によって援用される。
一実施形態において、本発明のポリペプチドをコードするペイロード領域を含むAAV粒子は、哺乳類細胞に導入することができる。
AAV血清型
本発明のAAV粒子は任意の天然または組換えAAV血清型を含んでもよく、またはそれに由来してもよい。本発明によれば、AAV粒子は以下のいずれか、AAV1、AAV2、AAV2G9、AAV3、AAV3a、AAV3b、AAV3−3、AAV4、AAV4−4、AAV5、AAV6、AAV6.1、AAV6.2、AAV6.1.2、AAV7、AAV7.2、AAV8、AAV9、AAV9.11、AAV9.13、AAV9.16、AAV9.24、AAV9.45、AAV9.47、AAV9.61、AAV9.68、AAV9.84、AAV9.9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV16.3、AAV24.1、AAV27.3、AAV42.12、AAV42−1b、AAV42−2、AAV42−3a、AAV42−3b、AAV42−4、AAV42−5a、AAV42−5b、AAV42−6b、AAV42−8、AAV42−10、AAV42−11、AAV42−12、AAV42−13、AAV42−15、AAV42−aa、AAV43−1、AAV43−12、AAV43−20、AAV43−21、AAV43−23、AAV43−25、AAV43−5、AAV44.1、AAV44.2、AAV44.5、AAV223.1、AAV223.2、AAV223.4、AAV223.5、AAV223.6、AAV223.7、AAV1−7/rh.48、AAV1−8/rh.49、AAV2−15/rh.62、AAV2−3/rh.61、AAV2−4/rh.50、AAV2−5/rh.51、AAV3.1/hu.6、AAV3.1/hu.9、AAV3−9/rh.52、AAV3−11/rh.53、AAV4−8/r11.64、AAV4−9/rh.54、AAV4−19/rh.55、AAV5−3/rh.57、AAV5−22/rh.58、AAV7.3/hu.7、AAV16.8/hu.10、AAV16.12/hu.11、AAV29.3/bb.1、AAV29.5/bb.2、AAV106.1/hu.37、AAV114.3/hu.40、AAV127.2/hu.41、AAV127.5/hu.42、AAV128.3/hu.44、AAV130.4/hu.48、AAV145.1/hu.53、AAV145.5/hu.54、AAV145.6/hu.55、AAV161.10/hu.60、AAV161.6/hu.61、AAV33.12/hu.17、AAV33.4/hu.15、AAV33.8/hu.16、AAV52/hu.19、AAV52.1/hu.20、AAV58.2/hu.25、AAVA3.3、AAVA3.4、AAVA3.5、AAVA3.7、AAVC1、AAVC2、AAVC5、AAV−DJ、AAV−DJ8、AAVF3、AAVF5、AAVH2、AAVrh.72、AAVhu.8、AAVrh.68、AAVrh.70、AAVpi.1、AAVpi.3、AAVpi.2、AAVrh.60、AAVrh.44、AAVrh.65、AAVrh.55、AAVrh.47、AAVrh.69、AAVrh.45、AAVrh.59、AAVhu.12、AAVH6、AAVLK03、AAVH−1/hu.1、AAVH−5/hu.3、AAVLG−10/rh.40、AAVLG−4/rh.38、AAVLG−9/hu.39、AAVN721−8/rh.43、AAVCh.5、AAVCh.5R1、AAVcy.2、AAVcy.3、AAVcy.4、AAVcy.5、AAVCy.5R1、AAVCy.5R2、AAVCy.5R3、AAVCy.5R4、AAVcy.6、AAVhu.1、AAVhu.2、AAVhu.3、AAVhu.4、AAVhu.5、AAVhu.6、AAVhu.7、AAVhu.9、AAVhu.10、AAVhu.11、AAVhu.13、AAVhu.15、AAVhu.16、AAVhu.17、AAVhu.18、AAVhu.20、AAVhu.21、AAVhu.22、AAVhu.23.2、AAVhu.24、AAVhu.25、AAVhu.27、AAVhu.28、AAVhu.29、AAVhu.29R、AAVhu.31、AAVhu.32、AAVhu.34、AAVhu.35、AAVhu.37、AAVhu.39、AAVhu.40、AAVhu.41、AAVhu.42、AAVhu.43、AAVhu.44、AAVhu.44R1、AAVhu.44R2、AAVhu.44R3、AAVhu.45、AAVhu.46、AAVhu.47、AAVhu.48、AAVhu.48R1、AAVhu.48R2、AAVhu.48R3、AAVhu.49、AAVhu.51、AAVhu.52、AAVhu.54、AAVhu.55、AAVhu.56、AAVhu.57、AAVhu.58、AAVhu.60、AAVhu.61、AAVhu.63、AAVhu.64、AAVhu.66、AAVhu.67、AAVhu.14/9、AAVhu.t 19、AAVrh.2、AAVrh.2R、AAVrh.8、AAVrh.8R、AAVrh.10、AAVrh.12、AAVrh.13、AAVrh.13R、AAVrh.14、AAVrh.17、AAVrh.18、AAVrh.19、AAVrh.20、AAVrh.21、AAVrh.22、AAVrh.23、AAVrh.24、AAVrh.25、AAVrh.31、AAVrh.32、AAVrh.33、AAVrh.34、AAVrh.35、AAVrh.36、AAVrh.37、AAVrh.37R2、AAVrh.38、AAVrh.39、AAVrh.40、AAVrh.46、AAVrh.48、AAVrh.48.1、AAVrh.48.1.2、AAVrh.48.2、AAVrh.49、AAVrh.51、AAVrh.52、AAVrh.53、AAVrh.54、AAVrh.56、AAVrh.57、AAVrh.58、AAVrh.61、AAVrh.64、AAVrh.64R1、AAVrh.64R2、AAVrh.67、AAVrh.73、AAVrh.74、AAVrh8R、AAVrh8R A586R突然変異体、AAVrh8R R533A突然変異体、AAAV、BAAV、ヤギAAV、ウシAAV、ヒツジAAV、AAVhE1.1、AAVhEr1.5、AAVhER1.14、AAVhEr1.8、AAVhEr1.16、AAVhEr1.18、AAVhEr1.35、AAVhEr1.7、AAVhEr1.36、AAVhEr2.29、AAVhEr2.4、AAVhEr2.16、AAVhEr2.30、AAVhEr2.31、AAVhEr2.36、AAVhER1.23、AAVhEr3.1、AAV2.5T、AAV−PAEC、AAV−LK01、AAV−LK02、AAV−LK03、AAV−LK04、AAV−LK05、AAV−LK06、AAV−LK07、AAV−LK08、AAV−LK09、AAV−LK10、AAV−LK11、AAV−LK12、AAV−LK13、AAV−LK14、AAV−LK15、AAV−LK16、AAV−LK17、AAV−LK18、AAV−LK19、AAV−PAEC2、AAV−PAEC4、AAV−PAEC6、AAV−PAEC7、AAV−PAEC8、AAV−PAEC11、AAV−PAEC12、AAV−2−pre−miRNA−101、AAV−8h、AAV−8b、AAV−h、AAV−b、AAV SM 10−2、AAVシャッフル100−1、AAVシャッフル100−3、AAVシャッフル100−7、AAVシャッフル10−2、AAVシャッフル10−6、AAVシャッフル10−8、AAVシャッフル100−2、AAV SM 10−1、AAV SM 10−8、AAV SM 100−3、AAV SM 100−10、BNP61 AAV、BNP62 AAV、BNP63 AAV、AAVrh.50、AAVrh.43、AAVrh.62、AAVrh.48、AAVhu.19、AAVhu.11、AAVhu.53、AAV4−8/rh.64、AAVLG−9/hu.39、AAV54.5/hu.23、AAV54.2/hu.22、AAV54.7/hu.24、AAV54.1/hu.21、AAV54.4R/hu.27、AAV46.2/hu.28、AAV46.6/hu.29、AAV128.1/hu.43、トゥルータイプAAV(ttAAV)、UPENN AAV10、ジャパニーズAAV10血清型、AAV CBr−7.1、AAV CBr−7.10、AAV CBr−7.2、AAV CBr−7.3、AAV CBr−7.4、AAV CBr−7.5、AAV CBr−7.7、AAV CBr−7.8、AAV CBr−B7.3、AAV CBr−B7.4、AAV CBr−E1、AAV CBr−E2、AAV CBr−E3、AAV CBr−E4、AAV CBr−E5、AAV CBr−e5、AAV CBr−E6、AAV CBr−E7、AAV CBr−E8、AAV CHt−1、AAV CHt−2、AAV CHt−3、AAV CHt−6.1、AAV CHt−6.10、AAV CHt−6.5、AAV CHt−6.6、AAV CHt−6.7、AAV CHt−6.8、AAV CHt−P1、AAV CHt−P2、AAV CHt−P5、AAV CHt−P6、AAV CHt−P8、AAV CHt−P9、AAV CKd−1、AAV CKd−10、AAV CKd−2、AAV CKd−3、AAV CKd−4、AAV CKd−6、AAV CKd−7、AAV CKd−8、AAV CKd−B1、AAV CKd−B2、AAV CKd−B3、AAV CKd−B4、AAV CKd−B5、AAV CKd−B6、AAV CKd−B7、AAV CKd−B8、AAV CKd−H1、AAV CKd−H2、AAV CKd−H3、AAV CKd−H4、AAV CKd−H5、AAV CKd−H6、AAV CKd−N3、AAV CKd−N4、AAV CKd−N9、AAV CLg−F1、AAV CLg−F2、AAV CLg−F3、AAV CLg−F4、AAV CLg−F5、AAV CLg−F6、AAV CLg−F7、AAV CLg−F8、AAV CLv−1、AAV CLv1−1、AAV Clv1−10、AAV CLv1−2、AAV CLv−12、AAV CLv1−3、AAV CLv−13、AAV CLv1−4、AAV Clv1−7、AAV Clv1−8、AAV Clv1−9、AAV CLv−2、AAV CLv−3、AAV CLv−4、AAV CLv−6、AAV CLv−8、AAV CLv−D1、AAV CLv−D2、AAV CLv−D3、AAV CLv−D4、AAV CLv−D5、AAV CLv−D6、AAV CLv−D7、AAV CLv−D8、AAV CLv−E1、AAV CLv−K1、AAV CLv−K3、AAV CLv−K6、AAV CLv−L4、AAV CLv−L5、AAV CLv−L6、AAV CLv−M1、AAV CLv−M11、AAV CLv−M2、AAV CLv−M5、AAV CLv−M6、AAV CLv−M7、AAV CLv−M8、AAV CLv−M9、AAV CLv−R1、AAV CLv−R2、AAV CLv−R3、AAV CLv−R4、AAV CLv−R5、AAV CLv−R6、AAV CLv−R7、AAV CLv−R8、AAV CLv−R9、AAV CSp−1、AAV CSp−10、AAV CSp−11、AAV CSp−2、AAV CSp−3、AAV CSp−4、AAV CSp−6、AAV CSp−7、AAV CSp−8、AAV CSp−8.10、AAV CSp−8.2、AAV CSp−8.4、AAV CSp−8.5、AAV CSp−8.6、AAV CSp−8.7、AAV CSp−8.8、AAV CSp−8.9、AAV CSp−9、AAV.hu.48R3、AAV.VR−355、AAV3B、AAV4、AAV5、AAVF1/HSC1、AAVF11/HSC11、AAVF12/HSC12、AAVF13/HSC13、AAVF14/HSC14、AAVF15/HSC15、AA
VF16/HSC16、AAVF17/HSC17、AAVF2/HSC2、AAVF3/HSC3、AAVF4/HSC4、AAVF5/HSC5、AAVF6/HSC6、AAVF7/HSC7、AAVF8/HSC8、AAVF9/HSC9、AAV−PHP.B(PHP.B)、AAV−PHP.A(PHP.A)、G2B−26、G2B−13、TH1.1−32、TH1.1−35、AAVPHP.B2、AAVPHP.B3、AAVPHP.N/PHP.B−DGT、AAVPHP.B−EST、AAVPHP.B−GGT、AAVPHP.B−ATP、AAVPHP.B−ATT−T、AAVPHP.B−DGT−T、AAVPHP.B−GGT−T、AAVPHP.B−SGS、AAVPHP.B−AQP、AAVPHP.B−QQP、AAVPHP.B−SNP(3)、AAVPHP.B−SNP、AAVPHP.B−QGT、AAVPHP.B−NQT、AAVPHP.B−EGS、AAVPHP.B−SGN、AAVPHP.B−EGT、AAVPHP.B−DST、AAVPHP.B−DST、AAVPHP.B−STP、AAVPHP.B−PQP、AAVPHP.B−SQP、AAVPHP.B−QLP、AAVPHP.B−TMP、AAVPHP.B−TTP、AAVPHP.S/G2A12、AAVG2A15/G2A3、AAVG2B4、および/またはAAVG2B5およびこれらのバリアントから選択される血清型を利用してもよく、またはそれをベースとしてもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、野生型AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、およびそれらのハイブリッドのY252F、Y272F、Y444F、Y500F、Y700F、Y704F、Y730F、Y275F、Y281F、Y508F、Y576F、Y612G、Y673F、およびY720Fなどの、米国特許出願公開第20160361439号明細書(その内容は本明細書において全体として参照によって援用される)に記載されるとおりの修飾であってもよくまたはそれを有していてもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV6(米国特許第9546112号明細書の配列番号4)、AAV1(米国特許第9546112号明細書の配列番号6)、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV7、AAV9、AAV10またはAAV11またはそれらの誘導体の配列における、F129L、D418E、K531E、L584F、V598AおよびH642N突然変異の少なくとも2つ、しかしながら全てではないものなど、米国特許第9546112号明細書(その内容は本明細書において全体として参照によって援用される)に記載されるとおりの突然変異であってもよくまたはそれを有してしてもよい。更に別の実施形態において、AAV血清型は、K531E突然変異を含むAAV6配列(米国特許第9546112号明細書の配列番号5)であってもよくまたはそれを有していてもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、別のアミノ酸、好ましくはフェニルアラニン残基に置換された、好ましくは、AAV1(米国特許出願公開第20130224836号明細書の配列番号2)の252、273、445、701、705および731位の表面露出チロシン残基の少なくとも1つなど、米国特許出願公開第20130224836号明細書(その内容は本明細書において全体として参照によって援用される)に記載されるとおりの、AAV1配列における突然変異であってもよくまたはそれを有していてもよい。一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、別のアミノ酸、好ましくはフェニルアラニン残基に置換された、好ましくは、AAV2(米国特許出願公開第20130224836号明細書の配列番号4)の252、272、444、500、700、704および730位の表面露出チロシン残基の少なくとも1つなど、AAV9配列における突然変異であってもよくまたはそれを有してしてもよい。一実施形態において、AAV9(米国特許出願公開第20130224836号明細書の配列番号6)の446位のチロシン残基は、フェニルアラニン残基に置換されている。
一部の実施形態において、AAV血清型は、本明細書において全体として参照により援用される国際公開第2016130589号パンフレットに記載されるとおりのAAV2またはそのバリアントであってもよい。AAV2のアミノ酸配列は、N587A、E548A、またはN708A突然変異を含み得る。一実施形態において、任意のAAVのアミノ酸配列は、V708K突然変異を含み得る。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV1(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号6および64)、AAV2(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号7および70)、AAV3(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号8および71)、AAV4(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号63)、AAV5(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号114)、AAV6(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号65)、AAV7(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号1〜3)、AAV8(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号4および95)、AAV9(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号5および100)、AAV10(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号117)、AAV11(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号118)、AAV12(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号119)、AAVrh10(米国特許出願公開第20030138772号明細書の配列番号81のアミノ酸1〜738)、AAV16.3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号10)、AAV29.3/bb.1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号11)、AAV29.4(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号12)、AAV29.5/bb.2(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号13)、AAV1.3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号14)、AAV13.3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号15)、AAV24.1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号16)、AAV27.3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号17)、AAV7.2(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号18)、AAVC1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号19)、AAVC3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号20)、AAVC5(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号21)、AAVF1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号22)、AAVF3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号23)、AAVF5(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号24)、AAVH6(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号25)、AAVH2(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号26)、AAV42−8(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号27)、AAV42−15(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号28)、AAV42−5b(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号29)、AAV42−1b(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号30)、AAV42−13(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号31)、AAV42−3a(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号32)、AAV42−4(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号33)、AAV42−5a(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号34)、AAV42−10(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号35)、AAV42−3b(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号36)、AAV42−11(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号37)、AAV42−6b(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号38)、AAV43−1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号39)、AAV43−5(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号40)、AAV43−12(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号41)、AAV43−20(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号42)、AAV43−21(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号43)、AAV43−23(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号44)、AAV43−25(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号45)、AAV44.1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号46)、AAV44.5(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号47)、AAV223.1(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号48)、AAV223.2(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号49)、AAV223.4(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号50)、AAV223.5(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号51)、AAV223.6(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号52)、AAV223.7(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号53)、AAVA3.4(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号54)、AAVA3.5(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号55)、AAVA3.7(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号56)、AAVA3.3(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号57)、AAV42.12(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号58)、AAV44.2(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号59)、AAV42−2(米国特許出願公開第20030138772号明細書配列番号9)、またはこれらのバリアントなど、米国特許出願公開第20030138772号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV2(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号7および23)、rh20(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号1)、rh32/33(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号2)、rh39(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号3、20および36)、rh46(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号4および22)、rh73(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号5)、rh74(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号6)、AAV6.1(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号29)、rh.8(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号41)、rh.48.1(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号44)、hu.44(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号45)、hu.29(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号42)、hu.48(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号38)、rh54(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号49)、AAV2(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号7)、cy.5(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号8および24)、rh.10(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号9および25)、rh.13(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号10および26)、AAV1(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号11および27)、AAV3(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号12および28)、AAV6(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号13および29)、AAV7(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号14および30)、AAV8(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号15および31)、hu.13(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号16および32)、hu.26(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号17および33)、hu.37(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号18および34)、hu.53(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号19および35)、rh.43(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号21および37)、rh2(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号39)、rh.37(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号40)、rh.64(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号43)、rh.48(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号44)、ch.5(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号46)、rh.67(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号47)、rh.58(米国特許出願公開第20150159173号明細書の配列番号48)、またはこれらのバリアントなど、限定はされないが、Cy5R1、Cy5R2、Cy5R3、Cy5R4、rh.13R、rh.37R2、rh.2R、rh.8R、rh.48.1、rh.48.2、rh.48.1.2、hu.44R1、hu.44R2、hu.44R3、hu.29R、ch.5R1、rh64R1、rh64R2、AAV6.2、AAV6.1、AAV6.12、hu.48R1、hu.48R2、およびhu.48R3を含め、米国特許出願公開第20150159173号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV9(米国特許第7198951号明細書の配列番号1〜3)、AAV2(米国特許第7198951号明細書の配列番号4)、AAV1(米国特許第7198951号明細書の配列番号5)、AAV3(米国特許第7198951号明細書の配列番号6)、およびAAV8(米国特許第7198951号明細書の配列番号7)など、米国特許第7198951号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV9.9、AAV9.11、AAV9.13、AAV9.16、AAV9.24、AAV9.45、AAV9.47、AAV9.61、AAV9.68、AAV9.84など、N・プリチャーラ(N Pulicherla)ら(モレキュラー・セラピー(Molecular Therapy)、第19巻、第6号、p.1070〜1078、2011年、本明細書において全体として参照により援用される)により記載されるとおりのAAV9配列における突然変異であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV3B(米国特許第6156303号明細書の配列番号1および10)、AAV6(米国特許第6156303号明細書の配列番号2、7および11)、AAV2(米国特許第6156303号明細書の配列番号3および8)、AAV3A(米国特許第6156303号明細書の配列番号4および9)、またはこれらの誘導体など、米国特許第6156303号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV8(米国特許出願公開第20140359799号明細書の配列番号1)、AAVDJ(米国特許出願公開第20140359799号明細書の配列番号2および3)、またはこれらのバリアントなど、米国特許出願公開第20140359799号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、血清型は、グリム(Grimm)ら(ジャーナル・オブ・バイロロジー(Journal of Virology)、第82巻、第12号、p.5887〜5911、2008年、本明細書において全体として参照により援用される)により記載されるとおり、AAVDJ(またはAAV−DJ)またはそのバリアント、例えばAAVDJ8(またはAAV−DJ8)などであってもよい。AAVDJ8のアミノ酸配列は、ヘパリン結合ドメイン(HBD)を除去するため2つ以上の突然変異を含み得る。非限定的な例として、米国特許第7,588,772号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に配列番号1として記載されるAAV−DJ配列は、2つの突然変異:(1)R587Q[アミノ酸587のアルギニン(R;Arg)がグルタミン(Q;Gln)に変更される]および(2)R590T[アミノ酸590のアルギニン(R;Arg)がスレオニン(T;Thr)に変更される]を含み得る。別の非限定的な例として、3つの突然変異:(1)K406R[アミノ酸406のリジン(K;Lys)がアルギニン(R;Arg)に変更される]、(2)R587Q[アミノ酸587のアルギニン(R;Arg)がグルタミン(Q;Gln)に変更される]および(3)R590T[アミノ酸590のアルギニン(R;Arg)がスレオニン(T;Thr)に変更される]を含み得る。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV4(国際公開第1998011244号パンフレットの配列番号1〜20)など、国際公開第1998011244号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりのAAV4の配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、国際公開第2014144229号パンフレットに記載されおよび本明細書において全体として参照により援用されるとおりのAAV2G9を生じさせるAAV2配列における突然変異であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV3−3(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号217)、AAV1(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号219および202)、AAV106.1/hu.37(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号10)、AAV114.3/hu.40(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号11)、AAV127.2/hu.41(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号6および8)、AAV128.3/hu.44(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号81)、AAV130.4/hu.48(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号78)、AAV145.1/hu.53(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号176および177)、AAV145.6/hu.56(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号168および192)、AAV16.12/hu.11(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号153および57)、AAV16.8/hu.10(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号156および56)、AAV161.10/hu.60(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号170)、AAV161.6/hu.61(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号174)、AAV1−7/rh.48(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号32)、AAV1−8/rh.49(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号103および25)、AAV2(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号211および221)、AAV2−15/rh.62(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号33および114)、AAV2−3/rh.61(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号21)、AAV2−4/rh.50(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号23および108)、AAV2−5/rh.51(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号104および22)、AAV3.1/hu.6(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号5および84)、AAV3.1/hu.9(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号155および58)、AAV3−11/rh.53(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号186および176)、AAV3−3(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号200)、AAV33.12/hu.17(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号4)、AAV33.4/hu.15(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号50)、AAV33.8/hu.16(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号51)、AAV3−9/rh.52(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号96および18)、AAV4−19/rh.55(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号117)、AAV4−4(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号201および218)、AAV4−9/rh.54(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号116)、AAV5(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号199および216)、AAV52.1/hu.20(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号63)、AAV52/hu.19(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号133)、AAV5−22/rh.58(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号27)、AAV5−3/rh.57(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号105)、AAV5−3/rh.57(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号26)、AAV58.2/hu.25(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号49)、AAV6(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号203および220)、AAV7(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号222および213)、AAV7.3/hu.7(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号55)、AAV8(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号223および214)、AAVH−1/hu.1(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号46)、AAVH−5/hu.3(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号44)、AAVhu.1(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号144)、AAVhu.10(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号156)、AAVhu.11(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号153)、AAVhu.12(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号59)、AAVhu.13(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号129)、AAVhu.14/AAV9(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号123および3)、AAVhu.15(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号147)、AAVhu.16(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号148)、AAVhu.17(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号83)、AAVhu.18(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号149)、AAVhu.19(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号133)、AAVhu.2(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号143)、AAVhu.20(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号134)、AAVhu.21(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号135)、AAVhu.22(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号138)、AAVhu.23.2(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号137)、AAVhu.24(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号136)、AAVhu.25(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号146)、AAVhu.27(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号140)、AAVhu.29(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号132)、AAVhu.3(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号145)、AAVhu.31(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号121)、AAVhu.32(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号122)、AAVhu.34(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号125)、AAVhu.35(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号164)、AAVhu.37(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号88)、AAVhu.39(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号102)、AAVhu.4(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号141)、AAVhu.40(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号87)、AAVhu.41(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号91)、AAVhu.42(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号85)、AAVhu.43(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号160)、AAVhu.44(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号144)、AAVhu.45(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号127)、AAVhu.46(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号159)、AAVhu.47(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号128)、AAVhu.48(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号157)、AAVhu.49(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号189)、AAVhu.51(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号190)、AAVhu.52(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号191)、AAVhu.53(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号186)、AAVhu.54(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号188)、AAVhu.55(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号187)、AAVhu.56(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号192)、AAVhu.57(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号193)、AAVhu.58(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号194)、AAVhu.6(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号84)、AAVhu.60(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号184)、AAVhu.61(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号185)、AAVhu.63(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号195)、AAVhu.64(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号196)、AAVhu.66(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号197)、AAVhu.67(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号198)、AAVhu.7(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号150)、AAVhu.8(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号12)、AAVhu.9(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号155)、AAVLG−10/rh.40(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号14)、AAVLG−4/rh.38(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号86)、AAVLG−4/rh.38(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号7)、AAVN721−8/rh.43(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号163)、AAVN721−8/rh.43(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号43)、AAVpi.1(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号28)、AAVpi.2(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号30)、AAVpi.3(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号29)、AAVrh.38(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号86)、AAVrh.40(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号92)、AAVrh.43(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号163)、AAVrh.44(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号34)、AAVrh.45(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号41)、AAVrh.47(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号38)、AAVrh.48(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号115)、AAVrh.49(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号103)、AAVrh.50(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号108)、AAVrh.51(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号104)、AAVrh.52(国際公開第2005033321号パンフレ
ットの配列番号96)、AAVrh.53(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号97)、AAVrh.55(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号37)、AAVrh.56(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号152)、AAVrh.57(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号105)、AAVrh.58(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号106)、AAVrh.59(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号42)、AAVrh.60(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号31)、AAVrh.61(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号107)、AAVrh.62(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号114)、AAVrh.64(国際公開第2005033321号パンフレットの配列番号99)、AAVrh.65(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号35)、AAVrh.68(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号16)、AAVrh.69(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号39)、AAVrh.70(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号20)、AAVrh.72(国際公開第2005033321号パンフレット配列番号9)、またはこれらのバリアントなど、限定はされないが、AAVcy.2、AAVcy.3、AAVcy.4、AAVcy.5、AAVcy.6、AAVrh.12、AAVrh.17、AAVrh.18、AAVrh.19、AAVrh.21、AAVrh.22、AAVrh.23、AAVrh.24、AAVrh.25、AAVrh.25/42 15、AAVrh.31、AAVrh.32、AAVrh.33、AAVrh.34、AAVrh.35、AAVrh.36、AAVrh.37、AAVrh14を含め、国際公開第2005033321号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。バリアントの非限定的な例としては、国際公開第2005033321号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)の配列番号13、15、17、19、24、36、40、45、47、48、51〜54、60〜62、64〜77、79、80、82、89、90、93〜95、98、100、101、109〜113、118〜120、124、126、131、139、142、151、154、158、161、162、165〜183、202、204〜212、215、219、224〜236が挙げられる。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAVrh8R(国際公開第2015168666号パンフレットの配列番号9)、AAVrh8R A586R突然変異体(国際公開第2015168666号パンフレットの配列番号10)、AAVrh8R R533A突然変異体(国際公開第2015168666号パンフレットの配列番号11)、またはこれらのバリアントなど、国際公開第2015168666号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAVhE1.1(米国特許第9233131号明細書の配列番号44)、AAVhEr1.5(米国特許第9233131号明細書の配列番号45)、AAVhER1.14(米国特許第9233131号明細書の配列番号46)、AAVhEr1.8(米国特許第9233131号明細書の配列番号47)、AAVhEr1.16(米国特許第9233131号明細書の配列番号48)、AAVhEr1.18(米国特許第9233131号明細書の配列番号49)、AAVhEr1.35(米国特許第9233131号明細書の配列番号50)、AAVhEr1.7(米国特許第9233131号明細書の配列番号51)、AAVhEr1.36(米国特許第9233131号明細書の配列番号52)、AAVhEr2.29(米国特許第9233131号明細書の配列番号53)、AAVhEr2.4(米国特許第9233131号明細書の配列番号54)、AAVhEr2.16(米国特許第9233131号明細書の配列番号55)、AAVhEr2.30(米国特許第9233131号明細書の配列番号56)、AAVhEr2.31(米国特許第9233131号明細書の配列番号58)、AAVhEr2.36(米国特許第9233131号明細書の配列番号57)、AAVhER1.23(米国特許第9233131号明細書の配列番号53)、AAVhEr3.1(米国特許第9233131号明細書の配列番号59)、AAV2.5T(米国特許第9233131号明細書の配列番号42)、またはこれらのバリアントなど、米国特許第9233131号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV−PAEC(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号1)、AAV−LK01(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号2)、AAV−LK02(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号3)、AAV−LK03(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号4)、AAV−LK04(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号5)、AAV−LK05(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号6)、AAV−LK06(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号7)、AAV−LK07(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号8)、AAV−LK08(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号9)、AAV−LK09(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号10)、AAV−LK10(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号11)、AAV−LK11(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号12)、AAV−LK12(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号13)、AAV−LK13(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号14)、AAV−LK14(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号15)、AAV−LK15(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号16)、AAV−LK16(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号17)、AAV−LK17(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号18)、AAV−LK18(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号19)、AAV−LK19(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号20)、AAV−PAEC2(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号21)、AAV−PAEC4(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号22)、AAV−PAEC6(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号23)、AAV−PAEC7(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号24)、AAV−PAEC8(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号25)、AAV−PAEC11(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号26)、AAV−PAEC12(米国特許出願公開第20150376607号明細書の配列番号27)、またはこれらのバリアントなど、米国特許出願公開第20150376607号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV−2−pre−miRNA−101(配列番号1 米国特許第9163261号明細書)、またはそのバリアントなど、米国特許第9163261号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV−8h(米国特許出願公開第20150376240号明細書の配列番号6)、AAV−8b(米国特許出願公開第20150376240号明細書の配列番号5)、AAV−h(米国特許出願公開第20150376240号明細書の配列番号2)、AAV−b(米国特許出願公開第20150376240号明細書の配列番号1)、またはこれらのバリアントなど、米国特許出願公開第20150376240号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV SM 10−2(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号22)、AAVシャッフル100−1(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号23)、AAVシャッフル100−3(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号24)、AAVシャッフル100−7(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号25)、AAVシャッフル10−2(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号34)、AAVシャッフル10−6(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号35)、AAVシャッフル10−8(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号36)、AAVシャッフル100−2(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号37)、AAV SM 10−1(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号38)、AAV SM 10−8(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号39)、AAV SM 100−3(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号40)、AAV SM 100−10(米国特許出願公開第20160017295号明細書の配列番号41)、またはこれらのバリアントなど、米国特許出願公開第20160017295号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、BNP61 AAV(米国特許出願公開第20150238550号明細書の配列番号1)、BNP62 AAV(米国特許出願公開第20150238550号明細書の配列番号3)、BNP63 AAV(米国特許出願公開第20150238550号明細書の配列番号4)、またはこれらのバリアントなど、米国特許出願公開第20150238550号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAVrh.50(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号108)、AAVrh.43(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号163)、AAVrh.62(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号114)、AAVrh.48(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号115)、AAVhu.19(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号133)、AAVhu.11(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号153)、AAVhu.53(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号186)、AAV4−8/rh.64(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号15)、AAVLG−9/hu.39(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号24)、AAV54.5/hu.23(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号60)、AAV54.2/hu.22(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号67)、AAV54.7/hu.24(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号66)、AAV54.1/hu.21(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号65)、AAV54.4R/hu.27(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号64)、AAV46.2/hu.28(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号68)、AAV46.6/hu.29(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号69)、AAV128.1/hu.43(米国特許出願公開第20150315612号明細書の配列番号80)、またはこれらのバリアントなど、米国特許出願公開第20150315612号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、トゥルータイプAAV(ttAAV)(国際公開第2015121501号パンフレットの配列番号2)、「ユーペンAAV10」(国際公開第2015121501号パンフレットの配列番号8)、「ジャパニーズAAV10」(国際公開第2015121501号パンフレットの配列番号9)、またはこれらのバリアントなど、国際公開第2015121501号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
本発明によれば、AAVカプシド血清型の選択または使用は様々な種からであってよい。一実施形態において、AAVは鳥類AAV(AAAV)であってもよい。AAAV血清型は、限定はされないが、AAAV(米国特許第9,238,800号明細書の配列番号1、2、4、6、8、10、12、および14)、またはそのバリアントなど、米国特許第9238800号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一実施形態において、AAVはウシAAV(BAAV)であってもよい。BAAV血清型は、限定はされないが、BAAV(米国特許第9193769号明細書の配列番号1および6)、またはそのバリアントなど、米国特許第9,193,769号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。BAAV血清型は、限定はされないが、BAAV(米国特許第7427396号明細書の配列番号5および6)、またはそのバリアントなど、米国特許第7427396号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一実施形態において、AAVはヤギAAVであってもよい。ヤギAAV血清型は、限定はされないが、ヤギAAV(米国特許第7427396号明細書の配列番号3)、またはそのバリアントなど、米国特許第7427396号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
他の実施形態において、AAVは2つ以上の親血清型からハイブリッドAAVとして操作されてもよい。一実施形態において、このAAVは、AAV2およびAAV9からの配列を含むAAV2G9であってもよい。AAV2G9 AAV血清型は、米国特許出願公開第20160017005号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一実施形態において、AAVは、プリチャーラ(Pulicherla)ら(モレキュラー・セラピー(Molecular Therapy)、第19巻、第6号、p.1070〜1078、2011年(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)により記載されるとおりのアミノ酸390〜627(VP1付番)に突然変異を有するAAV9カプシドライブラリによって生成された血清型であってもよい。血清型ならびに対応するヌクレオチドおよびアミノ酸置換は、限定はされないが、AAV9.1(G1594C;D532H)、AAV6.2(T1418AおよびT1436X;V473DおよびI479K)、AAV9.3(T1238A;F413Y)、AAV9.4(T1250CおよびA1617T;F417S)、AAV9.5(A1235G、A1314T、A1642G、C1760T;Q412R、T548A、A587V)、AAV9.6(T1231A;F411I)、AAV9.9(G1203A、G1785T;W595C)、AAV9.10(A1500G、T1676C;M559T)、AAV9.11(A1425T、A1702C、A1769T;T568P、Q590L)、AAV9.13(A1369C、A1720T;N457H、T574S)、AAV9.14(T1340A、T1362C、T1560C、G1713A;L447H)、AAV9.16(A1775T;Q592L)、AAV9.24(T1507C、T1521G;W503R)、AAV9.26(A1337G、A1769C;Y446C、Q590P)、AAV9.33(A1667C;D556A)、AAV9.34(A1534G、C1794T;N512D)、AAV9.35(A1289T、T1450A、C1494T、A1515T、C1794A、G1816A;Q430L、Y484N、N98K、V606I)、AAV9.40(A1694T、E565V)、AAV9.41(A1348T、T1362C;T450S)、AAV9.44(A1684C、A1701T、A1737G;N562H、K567N)、AAV9.45(A1492T、C1804T;N498Y、L602F)、AAV9.46(G1441C、T1525C、T1549G;G481R、W509R、L517V)、9.47(G1241A、G1358A、A1669G、C1745T;S414N、G453D、K557E、T582I)、AAV9.48(C1445T、A1736T;P482L、Q579L)、AAV9.50(A1638T、C1683T、T1805A;Q546H、L602H)、AAV9.53(G1301A、A1405C、C1664T、G1811T;R134Q、S469R、A555V、G604V)、AAV9.54(C1531A、T1609A;L511I、L537M)、AAV9.55(T1605A;F535L)、AAV9.58(C1475T、C1579A;T492I、H527N)、AAV.59(T1336C;Y446H)、AAV9.61(A1493T;N498I)、AAV9.64(C1531A、A1617T;L511I)、AAV9.65(C1335T、T1530C、C1568A;A523D)、AAV9.68(C1510A;P504T)、AAV9.80(G1441A、;G481R)、AAV9.83(C1402A、A1500T;P468T、E500D)、AAV9.87(T1464C、T1468C;S490P)、AAV9.90(A1196T;Y399F)、AAV9.91(T1316G、A1583T、C1782G、T1806C;L439R、K528I)、AAV9.93(A1273G、A1421G、A1638C、C1712T、G1732A、A1744T、A1832T;S425G、Q474R、Q546H、P571L、G578R、T582S、D611V)、AAV9.94(A1675T;M559L)およびAAV9.95(T1605A;F535L)であってもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAVF1/HSC1(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号2および20)、AAVF2/HSC2(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号3および21)、AAVF3/HSC3(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号5および22)、AAVF4/HSC4(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号6および23)、AAVF5/HSC5(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号11および25)、AAVF6/HSC6(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号7および24)、AAVF7/HSC7(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号8および27)、AAVF8/HSC8(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号9および28)、AAVF9/HSC9(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号10および29)、AAVF11/HSC11(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号4および26)、AAVF12/HSC12(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号12および30)、AAVF13/HSC13(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号14および31)、AAVF14/HSC14(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号15および32)、AAVF15/HSC15(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号16および33)、AAVF16/HSC16(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号17および34)、AAVF17/HSC17(国際公開第2016049230号パンフレットの配列番号13および35)、またはこれらのバリアントもしくは誘導体など、国際公開第2016049230号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV CBr−E1(米国特許第8734809号明細書の配列番号13および87)、AAV CBr−E2(米国特許第8734809号明細書の配列番号14および88)、AAV CBr−E3(米国特許第8734809号明細書の配列番号15および89)、AAV CBr−E4(米国特許第8734809号明細書の配列番号16および90)、AAV CBr−E5(米国特許第8734809号明細書の配列番号17および91)、AAV CBr−e5(米国特許第8734809号明細書の配列番号18および92)、AAV CBr−E6(米国特許第8734809号明細書の配列番号19および93)、AAV CBr−E7(米国特許第8734809号明細書の配列番号20および94)、AAV CBr−E8(米国特許第8734809号明細書の配列番号21および95)、AAV CLv−D1(米国特許第8734809号明細書の配列番号22および96)、AAV CLv−D2(米国特許第8734809号明細書の配列番号23および97)、AAV CLv−D3(米国特許第8734809号明細書の配列番号24および98)、AAV CLv−D4(米国特許第8734809号明細書の配列番号25および99)、AAV CLv−D5(米国特許第8734809号明細書の配列番号26および100)、AAV CLv−D6(米国特許第8734809号明細書の配列番号27および101)、AAV CLv−D7(米国特許第8734809号明細書の配列番号28および102)、AAV CLv−D8(米国特許第8734809号明細書の配列番号29および103)、AAV CLv−E1(米国特許第8734809号明細書の配列番号13および87)、AAV CLv−R1(米国特許第8734809号明細書の配列番号30および104)、AAV CLv−R2(米国特許第8734809号明細書の配列番号31および105)、AAV CLv−R3(米国特許第8734809号明細書の配列番号32および106)、AAV CLv−R4(米国特許第8734809号明細書の配列番号33および107)、AAV CLv−R5(米国特許第8734809号明細書の配列番号34および108)、AAV CLv−R6(米国特許第8734809号明細書の配列番号35および109)、AAV CLv−R7(米国特許第8734809号明細書の配列番号36および110)、AAV CLv−R8(米国特許第8734809号明細書の配列番号37および111)、AAV CLv−R9(米国特許第8734809号明細書の配列番号38および112)、AAV CLg−F1(米国特許第8734809号明細書の配列番号39および113)、AAV CLg−F2(米国特許第8734809号明細書の配列番号40および114)、AAV CLg−F3(米国特許第8734809号明細書の配列番号41および115)、AAV CLg−F4(米国特許第8734809号明細書の配列番号42および116)、AAV CLg−F5(米国特許第8734809号明細書の配列番号43および117)、AAV CLg−F6(米国特許第8734809号明細書の配列番号43および117)、AAV CLg−F7(米国特許第8734809号明細書の配列番号44および118)、AAV CLg−F8(米国特許第8734809号明細書の配列番号43および117)、AAV CSp−1(米国特許第8734809号明細書の配列番号45および119)、AAV CSp−10(米国特許第8734809号明細書の配列番号46および120)、AAV CSp−11(米国特許第8734809号明細書の配列番号47および121)、AAV CSp−2(米国特許第8734809号明細書の配列番号48および122)、AAV CSp−3(米国特許第8734809号明細書の配列番号49および123)、AAV CSp−4(米国特許第8734809号明細書の配列番号50および124)、AAV CSp−6(米国特許第8734809号明細書の配列番号51および125)、AAV CSp−7(米国特許第8734809号明細書の配列番号52および126)、AAV CSp−8(米国特許第8734809号明細書の配列番号53および127)、AAV CSp−9(米国特許第8734809号明細書の配列番号54および128)、AAV CHt−2(米国特許第8734809号明細書の配列番号55および129)、AAV CHt−3(米国特許第8734809号明細書の配列番号56および130)、AAV CKd−1(米国特許第8734809号明細書の配列番号57および131)、AAV CKd−10(米国特許第8734809号明細書の配列番号58および132)、AAV CKd−2(米国特許第8734809号明細書の配列番号59および133)、AAV CKd−3(米国特許第8734809号明細書の配列番号60および134)、AAV CKd−4(米国特許第8734809号明細書の配列番号61および135)、AAV CKd−6(米国特許第8734809号明細書の配列番号62および136)、AAV CKd−7(米国特許第8734809号明細書の配列番号63および137)、AAV CKd−8(米国特許第8734809号明細書の配列番号64および138)、AAV CLv−1(米国特許第8734809号明細書の配列番号35および139)、AAV CLv−12(米国特許第8734809号明細書の配列番号66および140)、AAV CLv−13(米国特許第8734809号明細書の配列番号67および141)、AAV CLv−2(米国特許第8734809号明細書の配列番号68および142)、AAV CLv−3(米国特許第8734809号明細書の配列番号69および143)、AAV CLv−4(米国特許第8734809号明細書の配列番号70および144)、AAV CLv−6(米国特許第8734809号明細書の配列番号71および145)、AAV CLv−8(米国特許第8734809号明細書の配列番号72および146)、AAV CKd−B1(米国特許第8734809号明細書の配列番号73および147)、AAV CKd−B2(米国特許第8734809号明細書の配列番号74および148)、AAV CKd−B3(米国特許第8734809号明細書の配列番号75および149)、AAV CKd−B4(米国特許第8734809号明細書の配列番号76および150)、AAV CKd−B5(米国特許第8734809号明細書の配列番号77および151)、AAV CKd−B6(米国特許第8734809号明細書の配列番号78および152)、AAV CKd−B7(米国特許第8734809号明細書の配列番号79および153)、AAV CKd−B8(米国特許第8734809号明細書の配列番号80および154)、AAV CKd−H1(米国特許第8734809号明細書の配列番号81および155)、AAV CKd−H2(米国特許第8734809号明細書の配列番号82および156)、AAV CKd−H3(米国特許第8734809号明細書の配列番号83および157)、AAV CKd−H4(米国特許第8734809号明細書の配列番号84および158)、AAV CKd−H5(米国特許第8734809号明細書の配列番号85および159)、AAV CKd−H6(米国特許第8734809号明細書の配列番号77および151)、AAV CHt−1(米国特許第8734809号明細書の配列番号86および160)、AAV CLv1−1(米国特許第8734809号明細書の配列番号171)、AAV CLv1−2(米国特許第8734809号明細書の配列番号172)、AAV CLv1−3(米国特許第8734809号明細書の配列番号173)、AAV CLv1−4(米国特許第8734809号明細書の配列番号174)、AAV Clv1−7(米国特許第8734809号明細書の配列番号175)、AAV Clv1−8(米国特許第8734809号明細書の配列番号176)、AAV Clv1−9(米国特許第8734809号明細書の配列番号177)、AAV Clv1−10(米国特許第8734809号明細書の配列番号178)、AAV.VR−355(米国特許第8734809号明細書の配列番号181)、AAV.hu.48R3(米国特許第8734809号明細書の配列番号183)、またはこれらのバリアントもしくは誘導体など、米国特許第8734809号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV CHt−P2(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号1および51)、AAV CHt−P5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号2および52)、AAV CHt−P9(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号3および53)、AAV CBr−7.1(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号4および54)、AAV CBr−7.2(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号5および55)、AAV CBr−7.3(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号6および56)、AAV CBr−7.4(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号7および57)、AAV CBr−7.5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号8および58)、AAV CBr−7.7(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号9および59)、AAV CBr−7.8(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号10および60)、AAV CBr−7.10(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号11および61)、AAV CKd−N3(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号12および62)、AAV CKd−N4(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号13および63)、AAV CKd−N9(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号14および64)、AAV CLv−L4(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号15および65)、AAV CLv−L5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号16および66)、AAV CLv−L6(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号17および67)、AAV CLv−K1(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号18および68)、AAV CLv−K3(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号19および69)、AAV CLv−K6(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号20および70)、AAV CLv−M1(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号21および71)、AAV CLv−M11(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号22および72)、AAV CLv−M2(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号23および73)、AAV CLv−M5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号24および74)、AAV CLv−M6(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号25および75)、AAV CLv−M7(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号26および76)、AAV CLv−M8(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号27および77)、AAV CLv−M9(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号28および78)、AAV CHt−P1(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号29および79)、AAV CHt−P6(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号30および80)、AAV CHt−P8(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号31および81)、AAV CHt−6.1(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号32および82)、AAV CHt−6.10(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号33および83)、AAV CHt−6.5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号34および84)、AAV CHt−6.6(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号35および85)、AAV CHt−6.7(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号36および86)、AAV CHt−6.8(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号37および87)、AAV CSp−8.10(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号38および88)、AAV CSp−8.2(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号39および89)、AAV CSp−8.4(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号40および90)、AAV CSp−8.5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号41および91)、AAV CSp−8.6(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号42および92)、AAV CSp−8.7(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号43および93)、AAV CSp−8.8(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号44および94)、AAV CSp−8.9(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号45および95)、AAV CBr−B7.3(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号46および96)、AAV CBr−B7.4(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号47および97)、AAV3B(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号48および98)、AAV4(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号49および99)、AAV5(国際公開第2016065001号パンフレットの配列番号50および100)、またはこれらのバリアントもしくは誘導体など、国際公開第2016065001号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。
一実施形態において、AAVは、表1に挙げられるもののいずれかから選択される血清型であってもよい。
一実施形態において、AAVは、表1にある配列の配列、その断片または変異体を含んでもよい。
一実施形態において、AAVは、表1に記載されるとおりの配列、断片または変異体によってコードされてもよい。
表1に挙げられる特許、出願および/または公報の各々は、本明細書によって全体として参照により援用される。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV9(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号2および11または本明細書におけるそれぞれ配列番号127および126)、PHP.B(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号8および9、本明細書における配列番号868および869)、G2B−13(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号12、本明細書における配列番号870)、G2B−26(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号13、本明細書における配列番号868および869)、TH1.1−32(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号14、本明細書における配列番号871)、TH1.1−35(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号15、本明細書における配列番号872)またはこれらのバリアントなど、国際公開第2015038958号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの配列であってもよく、またはそれを有してもよい。更に、国際公開第2015038958号パンフレットに記載されるターゲティングペプチドまたはアミノ酸インサートのいずれかが、限定はされないが、AAV9(DNA配列について配列番号126およびアミノ酸配列について配列番号127)など、任意の親AAV血清型に挿入されてもよい。一実施形態において、アミノ酸インサートは親AAV(例えばAAV9)のアミノ酸586〜592に挿入される。別の実施形態において、アミノ酸インサートは親AAV配列のアミノ酸588〜589に挿入される。アミノ酸インサートは、限定はされないが、以下のアミノ酸配列、TLAVPFK(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号1;本明細書における配列番号873)、KFPVALT(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号3;本明細書における配列番号874)、LAVPFK(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号31;本明細書における配列番号875)、AVPFK(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号32;本明細書における配列番号876)、VPFK(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号33;本明細書における配列番号877)、TLAVPF(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号34;本明細書における配列番号878)、TLAVP(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号35;本明細書における配列番号879)、TLAV(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号36;本明細書における配列番号880)、SVSKPFL(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号28;本明細書における配列番号881)、FTLTTPK(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号29;本明細書における配列番号882)、MNATKNV(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号30;本明細書における配列番号883)、QSSQTPR(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号54;本明細書における配列番号884)、ILGTGTS(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号55;本明細書における配列番号885)、TRTNPEA(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号56;本明細書における配列番号886)、NGGTSSS(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号58;本明細書における配列番号887)、またはYTLSQGW(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号60;本明細書における配列番号888)のいずれかであってもよい。アミノ酸インサートをコードし得るヌクレオチド配列の非限定的な例としては、以下、AAGTTTCCTGTGGCGTTGACT(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号3について;本明細書における配列番号889)、ACTTTGGCGGTGCCTTTTAAG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号24および49;本明細書における配列番号890)、AGTGTGAGTAAGCCTTTTTTG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号25;本明細書における配列番号891)、TTTACGTTGACGACGCCTAAG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号26;本明細書における配列番号892)、ATGAATGCTACGAAGAATGTG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号27;本明細書における配列番号893)、CAGTCGTCGCAGACGCCTAGG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号48;本明細書における配列番号894)、ATTCTGGGGACTGGTACTTCG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号50および52;本明細書における配列番号895)、ACGCGGACTAATCCTGAGGCT(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号51;本明細書における配列番号896)、AATGGGGGGACTAGTAGTTCT(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号53;本明細書における配列番号897)、またはTATACTTTGTCGCAGGGTTGG(国際公開第2015038958号パンフレットの配列番号59;本明細書における配列番号898)が挙げられる。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、SADNNNSEY(配列番号899)、LIDQYLYYL(配列番号900)、VPQYGYLTL(配列番号901)、TTSTRTWAL(配列番号902)、YHLNGRDSL(配列番号903)、SQAVGRSSF(配列番号904)、VPANPSTTF(配列番号905)、FPQSGVLIF(配列番号906)、YFDFNRFHCHFSPRD(配列番号907)、VGNSSGNWHCDSTWM(配列番号908)、QFSQAGASDIRDQSR(配列番号909)、GASDIRQSRNWLP(配列番号910)およびGNRQAATADVNTQGV(配列番号911)など、AAV2の少なくとも1つのAAVカプシドCD8+ T細胞エピトープを含むように操作されてもよい。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、LDRLMNPLI(配列番号912)、TTSTRTWAL(配列番号902)、およびQPAKKRLNF(配列番号913)など、AAV1の少なくとも1つのAAVカプシドCD8+ T細胞エピトープを含むように操作されてもよい。
一実施形態において、AAV血清型に含めるペプチドは、ホイ(Hui)ら(モレキュラー・セラピー−メソッド・アンド・クリニカル・デベロップメント(Molecular Therapy−Methods & Clinical Development)、2015年、第2巻、p.15029、doi:10.1038/mtm.2015.29;これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)により記載される方法を用いて同定されてもよい。非限定的な例として、手順には、ヒト脾細胞を単離すること、インビトロでAAVカプシドタンパク質のアミノ酸配列にわたって個々のペプチドを用いて脾細胞を再刺激すること、インビトロ再刺激に使用した個々のペプチドによるIFN−γ ELISpot、バイオインフォマティクス解析によるIFN−γ ELISpotによって同定された15merのHLA拘束性の決定、所与のHLA対立遺伝子に対する候補反応性9merエピトープの同定、候補9merの合成、同定されたAAVエピトープが結合すると予測されるHLA対立遺伝子を有する対象からの脾細胞の第2のIFN−γ ELISpotスクリーニング、AAVカプシド反応性CD8+ T細胞エピトープを決定すること、および所与のAAVエピトープに反応する対象の頻度を決定することが含まれる。
一実施形態において、AAVは、デバーマン(Deverman)ら(ネイチャー・バイオテクノロジー(Nature Biotechnology)、第34巻、第2号、p.204〜209、2016年)(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)により記載されるとおりのCre組換えに基づくAAVターゲット進化(CREATE:Cre−recombination−based AAV targeted evolution)によって生成された血清型であってもよい。一実施形態において、このように作成されたAAV血清型は、他のAAV血清型と比較したとき向上したCNS形質導入および/またはニューロンおよびアストロサイト向性を有する。非限定的な例として、AAV血清型は、PHP.B、PHP.B2、PHP.B3、PHP.A、G2A12、G2A15であってもよい。一実施形態において、これらのAAV血清型は、アミノ酸588〜589に7アミノ酸インサートを有するAAV9(配列番号126および127)誘導体であってもよい。これらの7アミノ酸インサートの非限定的な例としては、TLAVPFK(配列番号873)、SVSKPFL(配列番号1249)、FTLTTPK(配列番号882)、YTLSQGW(配列番号888)、QAVRTSL(配列番号1176)および/またはLAKERLS(配列番号1177)が挙げられる。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV9(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号45、本明細書における配列番号1441)、PHP.N(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号46、本明細書における配列番号1439)、PHP.S(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号47、本明細書における配列番号1440)、またはそれらのバリアントなど、国際公開第2017100671号パンフレット(その内容は本明細書において全体として参照によって援用される)に記載されるとおりの配列であってもよくまたはそれを有してしてもよい。更に、国際公開第2017100671号パンフレットに記載されるターゲティングペプチドまたはアミノ酸インサートのいずれかが、限定はされないが、AAV9(配列番号122または配列番号1441)など、任意の親AAV血清型に挿入されてもよい。一実施形態において、アミノ酸インサートは、親AAV(例えば、AAV9)のアミノ酸586〜592に挿入される。別の実施形態において、アミノ酸インサートは、親AAV配列のアミノ酸588〜589に挿入される。アミノ酸インサートは、限定はされないが、以下のアミノ酸配列、AQTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号1;本明細書における配列番号1442)、AQSVSKPFLAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号2;本明細書における配列番号1443)、AQFTLTTPKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列表の配列番号3;本明細書における配列番号1444)、DGTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列表の配列番号4;本明細書における配列番号1445)、ESTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号5;本明細書における配列番号1446)、GGTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号6;本明細書における配列番号1447)、AQTLATPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号7および33;本明細書における配列番号1448)、ATTLATPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号8;本明細書における配列番号1449)、DGTLATPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号9;本明細書における配列番号1450)、GGTLATPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号10;本明細書における配列番号1451)、SGSLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号11;本明細書における配列番号1452)、AQTLAQPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号12;本明細書における配列番号1453),AQTLQQPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号13;本明細書における配列番号1454)、AQTLSNPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号14;本明細書における配列番号1455)、AQTLAVPFSNP(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号15;本明細書における配列番号1456)、QGTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号16;本明細書における配列番号1457)、NQTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号17;本明細書における配列番号1458)、EGSLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号18;本明細書における配列番号1459)、SGNLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号19;本明細書における配列番号1460)、EGTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号20;本明細書における配列番号1461)、DSTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの表1の配列番号21;本明細書における配列番号1462)、AVTLAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号22;本明細書における配列番号1463)、AQTLSTPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号23;本明細書における配列番号1464)、AQTLPQPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号24および32;本明細書における配列番号1465)、AQTLSQPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号25;本明細書における配列番号1466)、AQTLQLPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号26;本明細書における配列番号1467)、AQTLTMPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号27および34、ならびに国際公開第2017100671号パンフレットの配列表の配列番号35;本明細書における配列番号1468)、AQTLTTPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号28;本明細書における配列番号1469)、AQYTLSQGWAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号29;本明細書における配列番号1470)、AQMNATKNVAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号30;本明細書における配列番号1471)、AQVSGGHHSAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号31;本明細書における配列番号1472)、AQTLTAPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの表1の配列番号35;本明細書における配列番号1473)、AQTLSKPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号36;本明細書における配列番号1474)、QAVRTSL(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号37;本明細書における配列番号1475)、YTLSQGW(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号38;本明細書における配列番号888)、LAKERLS(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号39;本明細書における配列番号1476)、TLAVPFK(国際公開第2017100671号パンフレットの配列表の配列番号40;本明細書における配列番号873)、SVSKPFL(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号41;本明細書における配列番号881)、FTLTTPK(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号42;本明細書における配列番号882)、MNSTKNV(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号43;本明細書における配列番号1477)、VSGGHHS(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号44;本明細書における配列番号1478)、SAQTLAVPFKAQAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号48;本明細書における配列番号1479)、SXXXLAVPFKAQAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号49、式中Xは任意のアミノ酸であってもよい;本明細書における配列番号1480)、SAQXXXVPFKAQAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号50、式中Xは任意のアミノ酸であってもよい;本明細書における配列番号1481)、SAQTLXXXFKAQAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号51、式中Xは任意のアミノ酸であってもよい;本明細書における配列番号1482)、SAQTLAVXXXAQAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号52、式中Xは任意のアミノ酸であってもよい;本明細書における配列番号1483)、SAQTLAVPFXXXAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号53、式中Xは任意のアミノ酸であってもよい;本明細書における配列番号1484)、TNHQSAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号65;本明細書における配列番号1485)、AQAQTGW(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号66;本明細書における配列番号1486)、DGTLATPFK(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号67;本明細書における配列番号1487)、DGTLATPFKXX(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号68、式中Xは任意のアミノ酸であってもよい;本明細書における配列番号1488)、LAVPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号80;本明細書における配列番号1489)、VPFKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号81;本明細書における配列番号1490)、FKAQ(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号82;本明細書における配列番号1491)、AQTLAV(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号83;本明細書における配列番号1492)、AQTLAVPF(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号84;本明細書における配列番号1493)、QAVR(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号85;本明細書における配列番号1494)、AVRT(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号86;本明細書における配列番号1495)、VRTS(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号87;本明細書における配列番号1496)、RTSL(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号88;本明細書における配列番号1497)、QAVRT(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号89;本明細書における配列番号1498)、AVRTS(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号90;本明細書における配列番号1499)、VRTSL(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号91;本明細書における配列番号1500)、QAVRTS(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号92;本明細書における配列番号1501)、またはAVRTSL(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号93;本明細書における配列番号1502)のいずれであってもよい。
アミノ酸インサートをコードし得るヌクレオチド配列の非限定的な例としては、以下、GATGGGACTTTGGCGGTGCCTTTTAAGGCACAG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号54;本明細書における配列番号1503)、GATGGGACGTTGGCGGTGCCTTTTAAGGCACAG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号55;本明細書における配列番号1504)、CAGGCGGTTAGGACGTCTTTG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号56;本明細書における配列番号1505)、CAGGTCTTCACGGACTCAGACTATCAG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号57および78;本明細書における配列番号1506)、CAAGTAAAACCTCTACAAATGTGGTAAAATCG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号58;本明細書における配列番号1507)、ACTCATCGACCAATACTTGTACTATCTCTCTAGAAC(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号59;本明細書における配列番号1508)、GGAAGTATTCCTTGGTTTTGAACCCA(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号60;本明細書における配列番号1509)、GGTCGCGGTTCTTGTTTGTGGAT(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号61;本明細書における配列番号1510)、CGACCTTGAAGCGCATGAACTCCT(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号62;本明細書における配列番号1511)、GTATTCCTTGGTTTTGAACCCAACCGGTCTGCGCCTGTGCMNNMNNMNNMNNMNNMNNMNNTTGGGCACTCTGGTGGTTTGTC(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号63、式中NはA、C、T、またはGであってもよい;本明細書における配列番号1512)、GTATTCCTTGGTTTTGAACCCAACCGGTCTGCGCMNNMNNMNNAAAAGGCACCGCCAAAGTTTG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号69、式中NはA、C、T、またはGであってもよい;本明細書における配列番号1513)、GTATTCCTTGGTTTTGAACCCAACCGGTCTGCGCCTGTGCMNNMNNMNNCACCGCCAAAGTTTGGGCACT(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号70、式中NはA、C、T、またはGであってもよい;本明細書における配列番号1514)、GTATTCCTTGGTTTTGAACCCAACCGGTCTGCGCCTGTGCCTTAAAMNNMNNMNNCAAAGTTTGGGCACTCTGGTGG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号71、式中NはA、C、T、またはGであってもよい;本明細書における配列番号1515)、GTATTCCTTGGTTTTGAACCCAACCGGTCTGCGCCTGTGCCTTAAAAGGCACMNNMNNMNNTTGGGCACTCTGGTGGTTTGTG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号72、式中NはA、C、T、またはGであってもよい;本明細書における配列番号1516)、ACTTTGGCGGTGCCTTTTAAG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号74;本明細書における配列番号890)、AGTGTGAGTAAGCCTTTTTTG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号75;本明細書における配列番号891)、TTTACGTTGACGACGCCTAAG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号76;本明細書における配列番号892)、TATACTTTGTCGCAGGGTTGG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号77;本明細書における配列番号898)、またはCTTGCGAAGGAGCGGCTTTCG(国際公開第2017100671号パンフレットの配列番号79;本明細書における配列番号1517)が挙げられる。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV1(米国特許第9624274号明細書の配列番号181)、AAV6(米国特許第9624274号明細書の配列番号182)、AAV2(米国特許第9624274号明細書の配列番号183)、AAV3b(米国特許第9624274号明細書の配列番号184)、AAV7(米国特許第9624274号明細書の配列番号185)、AAV8(米国特許第9624274号明細書の配列番号186)、AAV10(米国特許第9624274号明細書の配列番号187)、AAV4(米国特許第9624274号明細書の配列番号188)、AAV11(米国特許第9624274号明細書の配列番号189)、bAAV(米国特許第9624274号明細書の配列番号190)、AAV5(米国特許第9624274号明細書の配列番号191)、GPV(米国特許第9624274号明細書の配列番号192;本明細書における配列番号1518)、B19(米国特許第9624274号明細書の配列番号193;本明細書における配列番号1519)、MVM(米国特許第9624274号明細書の配列番号194;本明細書における配列番号1520)、FPV(米国特許第9624274号明細書の配列番号195;本明細書における配列番号1521)、CPV(米国特許第9624274号明細書の配列番号196;本明細書における配列番号1522)、またはそれらのバリアントなど、米国特許第9624274号明細書(その内容は本明細書において本明細書において全体として参照によって援用される)に記載されるとおりの配列であってもよくまたはそれを有していてもよい。更に、米国特許第9624274号明細書に記載される構造タンパク質インサートのいずれかが、限定はされないが、AAV2(米国特許第9624274号明細書の配列番号183)などの任意の親AAV血清型の、限定はされないが、I−453およびI−587に挿入されてもよい。アミノ酸インサートは、限定はされないが、以下のアミノ酸配列、VNLTWSRASG(米国特許第9624274号明細書の配列番号50;本明細書における配列番号1901)、EFCINHRGYWVCGD(米国特許第9624274号明細書の配列番号55;本明細書における配列番号1902)、EDGQVMDVDLS(米国特許第9624274号明細書の配列番号85;本明細書における配列番号1903)、EKQRNGTLT(米国特許第9624274号明細書の配列番号86;本明細書における配列番号1904)、TYQCRVTHPHLPRALMR(米国特許第9624274号明細書の配列番号87;本明細書における配列番号1905)、RHSTTQPRKTKGSG(米国特許第9624274号明細書の配列番号88;本明細書における配列番号1906)、DSNPRGVSAYLSR(米国特許第9624274号明細書の配列番号89;本明細書における配列番号1907)、TITCLWDLAPSK(米国特許第9624274号明細書の配列番号90;本明細書における配列番号1908)、KTKGSGFFVF(米国特許第9624274号明細書の配列番号91;本明細書における配列番号1909)、THPHLPRALMRS(米国特許第9624274号明細書の配列番号92;本明細書における配列番号1910)、GETYQCRVTHPHLPRALMRSTTK(米国特許第9624274号明細書の配列番号93;本明細書における配列番号1911)、LPRALMRS(米国特許第9624274号明細書の配列番号94;本明細書における配列番号1912)、INHRGYWV(米国特許第9624274号明細書の配列番号95;本明細書における配列番号1913)、CDAGSVRTNAPD(米国特許第9624274号明細書の配列番号60;本明細書における配列番号1914)、AKAVSNLTESRSESLQS(米国特許第9624274号明細書の配列番号96;本明細書における配列番号1915)、SLTGDEFKKVLET(米国特許第9624274号明細書の配列番号97;本明細書における配列番号1916)、REAVAYRFEED(米国特許第9624274号明細書の配列番号98;本明細書における配列番号1917)、INPEIITLDG(米国特許第9624274号明細書の配列番号99;本明細書における配列番号1918)、DISVTGAPVITATYL(米国特許第9624274号明細書の配列番号100;本明細書における配列番号1919)、DISVTGAPVITA(米国特許第9624274号明細書の配列番号101;本明細書における配列番号1920)、PKTVSNLTESSSESVQS(米国特許第9624274号明細書の配列番号102;本明細書における配列番号1921)、SLMGDEFKAVLET(米国特許第9624274号明細書の配列番号103;本明細書における配列番号1922)、QHSVAYTFEED(米国特許第9624274号明細書の配列番号104;本明細書における配列番号1923)、INPEIITRDG(米国特許第9624274号明細書の配列番号105;本明細書における配列番号1924)、DISLTGDPVITASYL(米国特許第9624274号明細書の配列番号106;本明細書における配列番号1925)、DISLTGDPVITA(米国特許第9624274号明細書の配列番号107;本明細書における配列番号1926)、DQSIDFEIDSA(米国特許第9624274号明細書の配列番号108;本明細書における配列番号1927)、KNVSEDLPLPTFSPTLLGDS(米国特許第9624274号明細書の配列番号109;本明細書における配列番号1928)、KNVSEDLPLPT(米国特許第9624274号明細書の配列番号110;本明細書における配列番号1929)、CDSGRVRTDAPD(米国特許第9624274号明細書の配列番号111;本明細書における配列番号1930)、FPEHLLVDFLQSLS(米国特許第9624274号明細書の配列番号112;本明細書における配列番号1931)、DAEFRHDSG(米国特許第9624274号明細書の配列番号65;本明細書における配列番号1932)、HYAAAQWDFGNTMCQL(米国特許第9624274号明細書の配列番号113;本明細書における配列番号1933)、YAAQWDFGNTMCQ(米国特許第9624274号明細書の配列番号114;本明細書における配列番号1934)、RSQKEGLHYT(米国特許第9624274号明細書の配列番号115;本明細書における配列番号1935)、SSRTPSDKPVAHWANPQAE(米国特許第9624274号明細書の配列番号116;本明細書における配列番号1936)、SRTPSDKPVAHWANP(米国特許第9624274号明細書の配列番号117;本明細書における配列番号1937)、SSRTPSDKP(米国特許第9624274号明細書の配列番号118;本明細書における配列番号1938)、NADGNVDYHMNSVP(米国特許第9624274号明細書の配列番号119;本明細書における配列番号1939)、DGNVDYHMNSV(米国特許第9624274号明細書の配列番号120;本明細書における配列番号1940)、RSFKEFLQSSLRALRQ(米国特許第9624274号明細書の配列番号121;本明細書における配列番号1941)、FKEFLQSSLRA(米国特許第9624274号明細書の配列番号122;本明細書における配列番号1942)、またはQMWAPQWGPD(米国特許第9624274号明細書の配列番号123;本明細書における配列番号1943)のいずれであってもよい。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、天然AAV2カプシドタンパク質のアミノ酸585〜590位に1つ以上のアミノ酸の修飾を含むAAVカプシドタンパク質など、米国特許第9475845号明細書(その内容は本明細書において全体として参照によって援用される)に記載されるとおりの配列であってもよくまたはそれを有していてもよい。更に、修飾は、限定はされないが、以下のアミノ酸配列、RGNRQA(米国特許第9475845号明細書の配列番号3;本明細書における配列番号1944)、SSSTDP(米国特許第9475845号明細書の配列番号4;本明細書における配列番号1945)、SSNTAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号5;本明細書における配列番号1946)、SNSNLP(米国特許第9475845号明細書の配列番号6;本明細書における配列番号1947)、SSTTAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号7;本明細書における配列番号1948)、AANTAA(米国特許第9475845号明細書の配列番号8;本明細書における配列番号1949)、QQNTAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号9;本明細書における配列番号1950)、SAQAQA(米国特許第9475845号明細書の配列番号10;本明細書における配列番号1951)、QANTGP(米国特許第9475845号明細書の配列番号11;本明細書における配列番号1952)、NATTAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号12;本明細書における配列番号1953)、SSTAGP(米国特許第9475845号明細書の配列番号13および20;本明細書における配列番号1954)、QQNTAA(米国特許第9475845号明細書の配列番号14;本明細書における配列番号1955)、PSTAGP(米国特許第9475845号明細書の配列番号15;本明細書における配列番号1956)、NQNTAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号16;本明細書における配列番号1957)、QAANAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号17;本明細書における配列番号1958)、SIVGLP(米国特許第9475845号明細書の配列番号18;本明細書における配列番号1959)、AASTAA(米国特許第9475845号明細書の配列番号19および27;本明細書における配列番号1960)、SQNTTA(米国特許第9475845号明細書の配列番号21;本明細書における配列番号1961)、QQDTAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号22;本明細書における配列番号1962)、QTNTGP(米国特許第9475845号明細書の配列番号23;本明細書における配列番号1963)、QTNGAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号24;本明細書における配列番号1964)、QQNAAP(米国特許第9475845号明細書の配列番号25;本明細書における配列番号1965)、またはAANTQA(米国特許第9475845号明細書の配列番号26;本明細書における配列番号1966)をもたらし得る。一実施形態において、アミノ酸修飾は、天然AAV2カプシドタンパク質のアミノ酸262〜265位、またはターゲティング配列を有する別のAAVのカプシドタンパク質の対応する位置における置換である。ターゲティング配列は、限定はされないが、以下のアミノ酸配列、NGRAHA(米国特許第9475845号明細書の配列番号38;本明細書における配列番号1967)、QPEHSST(米国特許第9475845号明細書の配列番号39および50;本明細書における配列番号1968)、VNTANST(米国特許第9475845号明細書の配列番号40;本明細書における配列番号1969)、HGPMQKS(米国特許第9475845号明細書の配列番号41;本明細書における配列番号1970)、PHKPPLA(米国特許第9475845号明細書の配列番号42;本明細書における配列番号1971)、IKNNEMW(米国特許第9475845号明細書の配列番号43;本明細書における配列番号1972)、RNLDTPM(米国特許第9475845号明細書の配列番号44;本明細書における配列番号1973)、VDSHRQS(米国特許第9475845号明細書の配列番号45;本明細書における配列番号1974)、YDSKTKT(米国特許第9475845号明細書の配列番号46;本明細書における配列番号1975)、SQLPHQK(米国特許第9475845号明細書の配列番号47;本明細書における配列番号1976)、STMQQNT(米国特許第9475845号明細書の配列番号48;本明細書における配列番号1977)、TERYMTQ(米国特許第9475845号明細書の配列番号49;本明細書における配列番号1978)、DASLSTS(米国特許第9475845号明細書の配列番号51;本明細書における配列番号1979)、DLPNKKT(米国特許第9475845号明細書の配列番号52;本明細書における配列番号1980)、DLTAARL(米国特許第9475845号明細書の配列番号53;本明細書における配列番号1981)、EPHQFNY(米国特許第9475845号明細書の配列番号54;本明細書における配列番号1982)、EPQSNHT(米国特許第9475845号明細書の配列番号55;本明細書における配列番号1983)、MSSWPSQ(米国特許第9475845号明細書の配列番号56;本明細書における配列番号1984)、NPKHNAT(米国特許第9475845号明細書の配列番号57;本明細書における配列番号1985)、PDGMRTT(米国特許第9475845号明細書の配列番号58;本明細書における配列番号1986)、PNNNKTT(米国特許第9475845号明細書の配列番号59;本明細書における配列番号1987)、QSTTHDS(米国特許第9475845号明細書の配列番号60;本明細書における配列番号1988)、TGSKQKQ(米国特許第9475845号明細書の配列番号61;本明細書における配列番号1989)、SLKHQAL(米国特許第9475845号明細書の配列番号62;本明細書における配列番号1990)、SPIDGEQ(米国特許第9475845号明細書の配列番号63;本明細書における配列番号1991)、WIFPWIQL(米国特許第9475845号明細書の配列番号64および112;本明細書における配列番号1992)、CDCRGDCFC(米国特許第9475845号明細書の配列番号65;本明細書における配列番号1993)、CNGRC(米国特許第9475845号明細書の配列番号66;本明細書における配列番号1994)、CPRECES(米国特許第9475845号明細書の配列番号67;本明細書における配列番号1995)、CTTHWGFTLC(米国特許第9475845号明細書の配列番号68および123;本明細書における配列番号1996)、CGRRAGGSC(米国特許第9475845号明細書の配列番号69;本明細書における配列番号1997)、CKGGRAKDC(米国特許第9475845号明細書の配列番号70;本明細書における配列番号1998)、CVPELGHEC(米国特許第9475845号明細書の配列番号71および115;本明細書における配列番号1999)、CRRETAWAK(米国特許第9475845号明細書の配列番号72;本明細書における配列番号2000)、VSWFSHRYSPFAVS(米国特許第9475845号明細書の配列番号73;本明細書における配列番号2001)、GYRDGYAGPILYN(米国特許第9475845号明細書の配列番号74;本明細書における配列番号2002)、XXXYXXX(米国特許第9475845号明細書の配列番号75;本明細書における配列番号2003)、YXNW(米国特許第9475845号明細書の配列番号76;本明細書における配列番号2004)、RPLPPLP(米国特許第9475845号明細書の配列番号77;本明細書における配列番号2005)、APPLPPR(米国特許第9475845号明細書の配列番号78;本明細書における配列番号2006)、DVFYPYPYASGS(米国特許第9475845号明細書の配列番号79;本明細書における配列番号2007)、MYWYPY(米国特許第9475845号明細書の配列番号80;本明細書における配列番号2008)、DITWDQLWDLMK(米国特許第9475845号明細書の配列番号81;本明細書における配列番号2009)、CWDDXWLC(米国特許第9475845号明細書の配列番号82;本明細書における配列番号2010)、EWCEYLGGYLRCYA(米国特許第9475845号明細書の配列番号83;本明細書における配列番号2011)、YXCXXGPXTWXCXP(米国特許第9475845号明細書の配列番号84;本明細書における配列番号2012)、IEGPTLRQWLAARA(米国特許第9475845号明細書の配列番号85;本明細書における配列番号2013)、LWXXX(米国特許第9475845号明細書の配列番号86;本明細書における配列番号2014)、XFXXYLW(米国特許第9475845号明細書の配列番号87;本明細書における配列番号2015)、SSIISHFRWGLCD(米国特許第9475845号明細書の配列番号88;本明細書における配列番号2016)、MSRPACPPNDKYE(米国特許第9475845号明細書の配列番号89;本明細書における配列番号2017)、CLRSGRGC(米国特許第9475845号明細書の配列番号90;本明細書における配列番号2018)、CHWMFSPWC(米国特許第9475845号明細書の配列番号91;本明細書における配列番号2019)、WXXF(米国特許第9475845号明細書の配列番号92;本明細書における配列番号2020)、CSSRLDAC(米国特許第9475845号明細書の配列番号93;本明細書における配列番号2021)、CLPVASC(米国特許第9475845号明細書の配列番号94;本明細書における配列番号2022)、CGFECVRQCPERC(米国特許第9475845号明細書の配列番号95;本明細書における配列番号2023)、CVALCREACGEGC(米国特許第9475845号明細書の配列番号96;本明細書における配列番号2024)、SWCEPGWCR(米国特許第9475845号明細書の配列番号97;本明細書における配列番号2025)、YSGKWGW(米国特許第9475845号明細書の配列番号98;本明細書における配列番号2026)、GLSGGRS(米国特許第9475845号明細書の配列番号99;本明細書における配列番号2027)、LMLPRAD(米国特許第9475845号明細書の配列番号100;本明細書における配列番号2028)、CSCFRDVCC(米国特許第9475845号明細書の配列番号101;本明細書における配列番号2029)、CRDVVSVIC(米国特許第9475845号明細書の配列番号102;本明細書における配列番号2030)、MARSGL(米国特許第9475845号明細書の配列番号103;本明細書における配列番号2031)、MARAKE(米国特許第9475845号明細書の配列番号104;本明細書における配列番号2032)、MSRTMS(米国特許第9475845号明細書の配列番号105;本明細書における配列番号2033)、KCCYSL(米国特許第9475845号明細書の配列番号106;本明細書における配列番号2034)、MYWGDSHWLQYWYE(米国特許第9475845号明細書の配列番号107;本明細書における配列番号2035)、MQLPLAT(米国特許第9475845号明細書の配列番号108;本明細書における配列番号2036)、EWLS(米国特許第9475845号明細書の配列番号109;本明細書における配列番号2037
)、SNEW(米国特許第9475845号明細書の配列番号110;本明細書における配列番号2038)、TNYL(米国特許第9475845号明細書の配列番号111;本明細書における配列番号2039)、WDLAWMFRLPVG(米国特許第9475845号明細書の配列番号113;本明細書における配列番号2040)、CTVALPGGYVRVC(米国特許第9475845号明細書の配列番号114;本明細書における配列番号2041)、CVAYCIEHHCWTC(米国特許第9475845号明細書の配列番号116;本明細書における配列番号2042)、CVFAHNYDYLVC(米国特許第9475845号明細書の配列番号117;本明細書における配列番号2043)、CVFTSNYAFC(米国特許第9475845号明細書の配列番号118;本明細書における配列番号2044)、VHSPNKK(米国特許第9475845号明細書の配列番号119;本明細書における配列番号2045)、CRGDGWC(米国特許第9475845号明細書の配列番号120;本明細書における配列番号2046)、XRGCDX(米国特許第9475845号明細書の配列番号121;本明細書における配列番号2047)、PXXX(米国特許第9475845号明細書の配列番号122;本明細書における配列番号2048)、SGKGPRQITAL(米国特許第9475845号明細書の配列番号124;本明細書における配列番号2049)、AAAAAAAAAXXXXX(米国特許第9475845号明細書の配列番号125;本明細書における配列番号2050)、VYMSPF(米国特許第9475845号明細書の配列番号126;本明細書における配列番号2051)、ATWLPPR(米国特許第9475845号明細書の配列番号127;本明細書における配列番号2052)、HTMYYHHYQHHL(米国特許第9475845号明細書の配列番号128;本明細書における配列番号2053)、SEVGCRAGPLQWLCEKYFG(米国特許第9475845号明細書の配列番号129;本明細書における配列番号2054)、CGLLPVGRPDRNVWRWLC(米国特許第9475845号明細書の配列番号130;本明細書における配列番号2055)、CKGQCDRFKGLPWEC(米国特許第9475845号明細書の配列番号131;本明細書における配列番号2056)、SGRSA(米国特許第9475845号明細書の配列番号132;本明細書における配列番号2057)、WGFP(米国特許第9475845号明細書の配列番号133;本明細書における配列番号2058)、AEPMPHSLNFSQYLWYT(米国特許第9475845号明細書の配列番号134;本明細書における配列番号2059)、WAYXSP(米国特許第9475845号明細書の配列番号135;本明細書における配列番号2060)、IELLQAR(米国特許第9475845号明細書の配列番号136;本明細書における配列番号2061)、AYTKCSRQWRTCMTTH(米国特許第9475845号明細書の配列番号137;本明細書における配列番号2062)、PQNSKIPGPTFLDPH(米国特許第9475845号明細書の配列番号138;本明細書における配列番号2063)、SMEPALPDWWWKMFK(米国特許第9475845号明細書の配列番号139;本明細書における配列番号2064)、ANTPCGPYTHDCPVKR(米国特許第9475845号明細書の配列番号140;本明細書における配列番号2065)、TACHQHVRMVRP(米国特許第9475845号明細書の配列番号141;本明細書における配列番号2066)、VPWMEPAYQRFL(米国特許第9475845号明細書の配列番号142;本明細書における配列番号2067)、DPRATPGS(米国特許第9475845号明細書の配列番号143;本明細書における配列番号2068)、FRPNRAQDYNTN(米国特許第9475845号明細書の配列番号144;本明細書における配列番号2069)、CTKNSYLMC(米国特許第9475845号明細書の配列番号145;本明細書における配列番号2070)、CXXTXXXGXGC(米国特許第9475845号明細書の配列番号146;本明細書における配列番号2071)、CPIEDRPMC(米国特許第9475845号明細書の配列番号147;本明細書における配列番号2072)、HEWSYLAPYPWF(米国特許第9475845号明細書の配列番号148;本明細書における配列番号2073)、MCPKHPLGC(米国特許第9475845号明細書の配列番号149;本明細書における配列番号2074)、RMWPSSTVNLSAGRR(米国特許第9475845号明細書の配列番号150;本明細書における配列番号2075)、SAKTAVSQRVWLPSHRGGEP(米国特許第9475845号明細書の配列番号151;本明細書における配列番号2076)、KSREHVNNSACPSKRITAAL(米国特許第9475845号明細書の配列番号152;本明細書における配列番号2077)、EGFR(米国特許第9475845号明細書の配列番号153;本明細書における配列番号2078)、AGLGVR(米国特許第9475845号明細書の配列番号154;本明細書における配列番号2079)、GTRQGHTMRLGVSDG(米国特許第9475845号明細書の配列番号155;本明細書における配列番号2080)、IAGLATPGWSHWLAL(米国特許第9475845号明細書の配列番号156;本明細書における配列番号2081)、SMSIARL(米国特許第9475845号明細書の配列番号157;本明細書における配列番号2082)、HTFEPGV(米国特許第9475845号明細書の配列番号158;本明細書における配列番号2083)、NTSLKRISNKRIRRK(米国特許第9475845号明細書の配列番号159;本明細書における配列番号2084)、LRIKRKRRKRKKTRK(米国特許第9475845号明細書の配列番号160;本明細書における配列番号2085)、GGG、GFS、LWS、EGG、LLV、LSP、LBS、AGG、GRR、GGHおよびGTVのいずれであってもよい。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、AAV2(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号97;本明細書における配列番号2086)またはそのバリアントの部位特異的突然変異カプシドタンパク質であって、特異的部位が、VP1またはその断片の部位R447、G453、S578、N587、N587+1、S662から選択される少なくとも1つの部位であるものなど、米国特許出願公開第20160369298号明細書(その内容は本明細書において本明細書において全体として参照によって援用される)に記載されるとおりの配列であってもよくまたはそれを有してしてもよい。
更に、米国特許出願公開第20160369298号明細書に記載される突然変異配列のいずれかが、限定はされないが、以下の配列、SDSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号1および配列番号231;本明細書における配列番号2087)、SPSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号2;本明細書における配列番号2088)、SHSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号3;本明細書における配列番号2089)、SRSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号4;本明細書における配列番号2090)、SKSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号5;本明細書における配列番号2091)、SNSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号6;本明細書における配列番号2092)、SGSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号7;本明細書における配列番号2093)、SASGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号8、175、および221;本明細書における配列番号2094)、SESGTSN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号9;本明細書における配列番号2095)、STTGGSN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号10;本明細書における配列番号2096)、SSAGSTN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号11;本明細書における配列番号2097)、NNDSQA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号12;本明細書における配列番号2098)、NNRNQA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号13;本明細書における配列番号2099)、NNNKQA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号14;本明細書における配列番号2100)、NAKRQA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号15;本明細書における配列番号2101)、NDEHQA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号16;本明細書における配列番号2102)、NTSQKA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号17;本明細書における配列番号2103)、YYLSRTNTPSGTDTQSRLVFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号18;本明細書における配列番号2104)、YYLSRTNTDSGTETQSGLDFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号19;本明細書における配列番号2105)、YYLSRTNTESGTPTQSALEFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号20;本明細書における配列番号2106)、YYLSRTNTHSGTHTQSPLHFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号21;本明細書における配列番号2107)、YYLSRTNTSSGTITISHLIFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号22;本明細書における配列番号2108)、YYLSRTNTRSGIMTKSSLMFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号23;本明細書における配列番号2109)、YYLSRTNTKSGRKTLSNLSFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号24;本明細書における配列番号2110)、YYLSRTNDGSGPVTPSKLRFSQRGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号25;本明細書における配列番号2111)、YYLSRTNAASGHATHSDLKFSQPGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号26;本明細書における配列番号2112)、YYLSRTNGQAGSLTMSELGFSQVGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号27;本明細書における配列番号2113)、YYLSRTNSTGGNQTTSQLLFSQLSA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号28;本明細書における配列番号2114)、YFLSRTNNNTGLNTNSTLNFSQGRA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号29;本明細書における配列番号2115)、SKTGADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号30;本明細書における配列番号2116)、SKTDADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号31;本明細書における配列番号2117)、SKTEADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号32;本明細書における配列番号2118)、SKTPADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号33;本明細書における配列番号2119)、SKTHADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号34;本明細書における配列番号2120)、SKTQADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号35;本明細書における配列番号2121)、SKTIADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号36;本明細書における配列番号2122)、SKTMADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号37;本明細書における配列番号2123)、SKTRADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号38;本明細書における配列番号2124)、SKTNADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号39;本明細書における配列番号2125)、SKTVGRNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号40;本明細書における配列番号2126)、SKTADRNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号41;本明細書における配列番号2127)、SKKLSQNNNSKYSWQG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号42;本明細書における配列番号2128)、SKPTTGNNNSDYSWPG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号43;本明細書における配列番号2129)、STQKNENNNSNYSWPG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号44;本明細書における配列番号2130)、HKDDEGKF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号45;本明細書における配列番号2131)、HKDDNRKF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号46;本明細書における配列番号2132)、HKDDTNKF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号47;本明細書における配列番号2133)、HEDSDKNF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号48;本明細書における配列番号2134)、HRDGADSF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号49;本明細書における配列番号2135)、HGDNKSRF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号50;本明細書における配列番号2136)、KQGSEKTNVDFEEV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号51;本明細書における配列番号2137)、KQGSEKTNVDSEEV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号52;本明細書における配列番号2138)、KQGSEKTNVDVEEV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号53;本明細書における配列番号2139)、KQGSDKTNVDDAGV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号54;本明細書における配列番号2140)、KQGSSKTNVDPREV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号55;本明細書における配列番号2141)、KQGSRKTNVDHKQV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号56;本明細書における配列番号2142)、KQGSKGGNVDTNRV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号57;本明細書における配列番号2143)、KQGSGEANVDNGDV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号58;本明細書における配列番号2144)、KQDAAADNIDYDHV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号59;本明細書における配列番号2145)、KQSGTRSNAAASSV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号60;本明細書における配列番号2146)、KENTNTNDTELTNV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号61;本明細書における配列番号2147)、QRGNNVAATADVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号62;本明細書における配列番号2148)、QRGNNEAATADVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号63;本明細書における配列番号2149)、QRGNNPAATADVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号64;本明細書における配列番号2150)、QRGNNHAATADVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号65;本明細書における配列番号2151)、QEENNIAATPGVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号66;本明細書における配列番号2152)、QPPNNMAATHEVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号67;本明細書における配列番号2153)、QHHNNSAATTIVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号68;本明細書における配列番号2154)、QTTNNRAAFNMVET(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号69;本明細書における配列番号2155)、QKKNNNAASKKVAT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号70;本明細書における配列番号2156)、QGGNNKAADDAVKT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号71;本明細書における配列番号2157)、QAAKGGAADDAVKT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号72;本明細書における配列番号2158)、QDDRAAAANESVDT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号73;本明細書における配列番号2159)、QQQHDDAAYQRVHT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号74;本明細書における配列番号2160)、QSSSSLAAVSTVQT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号75;本明細書における配列番号2161)、QNNQTTAAIRNVTT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号76;本明細書における配列番号2162)、NYNKKSDNVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号77;本明細書における配列番号2163)、NYNKKSENVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号7
8;本明細書における配列番号2164)、NYNKKSLNVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号79;本明細書における配列番号2165)、NYNKKSPNVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号80;本明細書における配列番号2166)、NYSKKSHCVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号81;本明細書における配列番号2167)、NYRKTIYVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号82;本明細書における配列番号2168)、NYKEKKDVHFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号83;本明細書における配列番号2169)、NYGHRAIVQFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号84;本明細書における配列番号2170)、NYANHQFVVCT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号85;本明細書における配列番号2171)、NYDDDPTGVLLT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号86;本明細書における配列番号2172)、NYDDPTGVLLT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号87;本明細書における配列番号2173)、NFEQQNSVEWT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号88;本明細書における配列番号2174)、SQSGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号89および配列番号241;本明細書における配列番号2175)、NNGSQA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号90;本明細書における配列番号2176)、YYLSRTNTPSGTTTWSRLQFSQAGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号91;本明細書における配列番号2177)、SKTSADNNNSEYSWTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号92;本明細書における配列番号2178)、HKDDEEKF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号93、209、214、219、224、234、239、および244;本明細書における配列番号2179)、KQGSEKTNVDIEEV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号94;本明細書における配列番号2180)、QRGNNQAATADVNT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号95;本明細書における配列番号2181)、NYNKKSVNVDFT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号96;本明細書における配列番号2182)、SQSGASNYNTPSGTTTQSRLQFSTSADNNNSEYSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号106;本明細書における配列番号2183)、SASGASNFNSEGGSLTQSSLGFSTDGENNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号107;本明細書における配列番号2184)、SQSGASNYNTPSGTTTQSRLQFSTDGENNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号108;本明細書における配列番号2185)、SASGASNYNTPSGTTTQSRLQFSTSADNNNSEFSWPGATTYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号109;本明細書における配列番号2186)、SQSGASNFNSEGGSLTQSSLGFSTDGENNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号110;本明細書における配列番号2187)、SASGASNYNTPSGSLTQSSLGFSTDGENNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号111;本明細書における配列番号2188)、SQSGASNYNTPSGTTTQSRLQFSTSADNNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号112;本明細書における配列番号2189)、SGAGASNFNSEGGSLTQSSLGFSTDGENNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号113;本明細書における配列番号2190)、SGAGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号176;本明細書における配列番号2191)、NSEGGSLTQSSLGFS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号177、185、193、および202;本明細書における配列番号2192)、TDGENNNSDFS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号178;本明細書における配列番号2193)、SEFSWPGATT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号179;本明細書における配列番号2194)、TSADNNNSDFSWT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号180;本明細書における配列番号2195)、SQSGASNY(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号181、187、および198;本明細書における配列番号2196)、NTPSGTTTQSRLQFS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号182、188、191、および199;本明細書における配列番号2197)、TSADNNNSEYSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号183;本明細書における配列番号2198)、SASGASNF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号184;本明細書における配列番号2199)、TDGENNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号186、189、194、197、および203;本明細書における配列番号2200)、SASGASNY(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号190および配列番号195;本明細書における配列番号2201)、TSADNNNSEFSWPGATTYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号192;本明細書における配列番号2202)、NTPSGSLTQSSLGFS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号196、;本明細書における配列番号2203)、TSADNNNSDFSWTGATKYH(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号200;本明細書における配列番号2204)、SGAGASNF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号201;本明細書における配列番号2205)、CTCCAGVVSVVSMRSRVCVNSGCAGCTDHCVVSRNSGTCVMSACACAA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号204;本明細書における配列番号2206)、CTCCAGAGAGGCAACAGACAAGCAGCTACCGCAGATGTCAACACACAA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号205;本明細書における配列番号2207)、SAAGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号206;本明細書における配列番号2208)、YFLSRTNTESGSTTQSTLRFSQAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号207;本明細書における配列番号2209)、SKTSADNNNSDFS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号208、228、および253;本明細書における配列番号2210)、KQGSEKTDVDIDKV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号210;本明細書における配列番号2211)、STAGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号211;本明細書における配列番号2212)、YFLSRTNTTSGIETQSTLRFSQAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号212および配列番号247;本明細書における配列番号213)、SKTDGENNNSDFS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号213および配列番号248;本明細書における配列番号2214)、KQGAAADDVEIDGV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号215および配列番号250;本明細書における配列番号2215)、SEAGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号216;本明細書における配列番号2216)、YYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号217、232および242;本明細書における配列番号2217)、SKTSADNNNSEYS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号218、233、238、および243;本明細書における配列番号2218)、KQGSEKTNVDIEKV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号220、225および245;本明細書における配列番号2219)、YFLSRTNDASGSDTKSTLLFSQAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号222;本明細書における配列番号2220)、STTPSENNNSEYS(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号223;本明細書における配列番号2221)、SAAGATN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号226および配列番号251;本明細書における配列番号2222)、YFLSRTNGEAGSATLSELRFSQAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号227;本明細書における配列番号2223)、HGDDADRF(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号229および配列番号254;本明細書における配列番号2224)、KQGAEKSDVEVDRV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号230および配列番号255;本明細書における配列番号2225)、KQDSGGDNIDIDQV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号235;本明細書における配列番号2226)、SDAGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号236;本明細書における配列番号2227)、YFLSRTNTEGGHDTQSTLRFSQAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号237;本明細書における配列番号2228)、KEDGGGSDVAIDEV(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号240;本明細書における配列番号2229)、SNAGASN(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号246;本明細書における配列番号2230)、およびYFLSRTNGEAGSATLSELRFSQPG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号252;本明細書における配列番号2231)のいずれであってもよく、またはいずれを有していてもよい。アミノ酸突然変異部位をコードし得るヌクレオチド配列の非限定的な例としては、以下、AGCVVMDCAGGARSCASCAAC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号97;本明細書における配列番号2232)、AACRACRRSMRSMAGGCA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号98;本明細書における配列番号2233)、CACRRGGACRR
CRMSRRSARSTTT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号99;本明細書における配列番号2234)、TATTTCTTGAGCAGAACAAACRVCVVSRSCGGAMNCVHSACGMHSTCAVVSCTTVDSTTTTCTCAGSBCRGSGCG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号100;本明細書における配列番号2235)、TCAAMAMMAVNSRVCSRSAACAACAACAGTRASTTCTCGTGGMMAGGA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号101;本明細書における配列番号2236)、AAGSAARRCRSCRVSRVARVCRATRYCGMSNHCRVMVRSGTC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号102;本明細書における配列番号2237)、CAGVVSVVSMRSRVCVNSGCAGCTDHCVVSRNSGTCVMSACA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号103;本明細書における配列番号2238)、AACTWCRVSVASMVSVHSDDTGTGSWSTKSACT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号104;本明細書における配列番号2239)、TTGTTGAACATCACCACGTGACGCACGTTC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号256、;本明細書における配列番号2240)、TCCCCGTGGTTCTACTACATAATGTGGCCG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号257;本明細書における配列番号2241)、TTCCACACTCCGTTTTGGATAATGTTGAAC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号258;本明細書における配列番号2242)、AGGGACATCCCCAGCTCCATGCTGTGGTCG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号259;本明細書における配列番号2243)、AGGGACAACCCCTCCGACTCGCCCTAATCC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号260;本明細書における配列番号2244)、TCCTAGTAGAAGACACCCTCTCACTGCCCG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号261;本明細書における配列番号2245)、AGTACCATGTACACCCACTCTCCCAGTGCC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号262、;本明細書における配列番号2246)、ATATGGACGTTCATGCTGATCACCATACCG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号263;本明細書における配列番号2247)、AGCAGGAGCTCCTTGGCCTCAGCGTGCGAG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号264;本明細書における配列番号2248)、ACAAGCAGCTTCACTATGACAACCACTGAC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号265;本明細書における配列番号2249)、CAGCCTAGGAACTGGCTTCCTGGACCCTGTTACCGCCAGCAGAGAGTCTCAAMAMMAVNSRVCSRSAACAACAACAGTRASTTCTCCTGGMMAGGAGCTACCAAGTACCACCTCAATGGCAGAGACTCTCTGGTGAATCCCGGACCAGCTATGGCAAGCCACRRGGACRRCRMSRRSARSTTTTTTCCTCAGAGCGGGGTTCTCATCTTTGGGAAGSAARRCRSCRVSRVARVCRATRYCGMSNHCRVMVRSGTCATGATTACAGACGAAGAGGAGATCTGGAC(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号266;本明細書における配列番号2250)、TGGGACAATGGCGGTCGTCTCTCAGAGTTKTKKT(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号267;本明細書における配列番号2251)、AGAGGACCKKTCCTCGATGGTTCATGGTGGAGTTA(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号268;本明細書における配列番号2252)、CCACTTAGGGCCTGGTCGATACCGTTCGGTG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号269;本明細書における配列番号2253)、およびTCTCGCCCCAAGAGTAGAAACCCTTCSTTYYG(米国特許出願公開第20160369298号明細書の配列番号270;本明細書における配列番号2254)が挙げられる。
一部の実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、国際公開第2016134375号パンフレットの配列番号9および配列番号10など、国際公開第2016134375号パンフレット(その内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの眼細胞ターゲティングペプチドを含み得る。更に、国際公開第2016134375号パンフレットに記載される眼細胞ターゲティングペプチドまたはアミノ酸のいずれかが、限定はされないが、AAV2(国際公開第2016134375号パンフレットの配列番号8;本明細書における配列番号2255)、またはAAV9(国際公開第2016134375号パンフレットの配列番号11;本明細書における配列番号2256)など、任意の親AAV血清型に挿入されていてもよい。一部の実施形態において、挿入などの修飾は、AAV2タンパク質のP34〜A35、T138〜A139、A139〜P140、G453〜T454、N587〜R588、および/またはR588〜Q589になされる。特定の実施形態において、挿入は、AAV9のD384、G385、1560、T561、N562、E563、E564、E565、N704、および/またはY705になされる。眼細胞ターゲティングペプチドは、限定はされないが、以下のアミノ酸配列、GSTPPPM(国際公開第2016134375号パンフレットの配列番号1;本明細書における配列番号2257)、またはGETRAPL(国際公開第2016134375号パンフレットの配列番号4;本明細書における配列番号2258)のいずれであってもよい。
一部の実施形態において、AAV血清型は、米国特許出願公開第20170145405号明細書(その内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりに修飾されていてもよい。AAV血清型としては、修飾AAV2(例えば、Y444F、Y500F、Y730Fおよび/またはS662Vの修飾)、修飾AAV3(例えば、Y705F、Y731Fおよび/またはT492Vの修飾)、および修飾AAV6(例えば、S663Vおよび/またはT492Vの修飾)が挙げられる。
一部の実施形態において、AAV血清型は、国際公開第2017083722号パンフレット(その内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりに修飾されていてもよい。AAV血清型としては、AAV1(Y705+731F+T492V)、AAV2(Y444+500+730F+T491V)、AAV3(Y705+731F)、AAV5、AAV5(Y436+693+719F)、AAV6(VP3バリアントY705F/Y731F/T492V)、AAV8(Y733F)、AAV9、AAV9(VP3バリアントY731F)、およびAAV10(Y733F)が挙げられ得る。
一部の実施形態において、AAV血清型は、国際公開第2017015102号パンフレット(その内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりに、アミノ酸SPAKFA(国際公開第2017015102号パンフレットの配列番号24;本明細書における配列番号2259)またはNKDKLN(国際公開第2017015102号パンフレットの配列番号2;本明細書における配列番号2260)を含む操作されたエピトープを含み得る。エピトープは、AAV8(国際公開第2017015102号パンフレットの配列番号3)のVP1カプシドの付番に基づきアミノ酸665〜670の領域および/またはAAV3B(配列番号3)の残基664〜668の領域に挿入されていてもよい。
一実施形態において、AAV血清型は、限定はされないが、いずれかの組合せで、AAV1のアミノ酸残基262〜268、370〜379、451〜459、472〜473、493〜500、528〜534、547〜552、588〜597、709〜710、716〜722の1つ以上(例えば、2、3、4、5、6、または7つ)に、またはAAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11、AAV12、AAVrh8、AAVrh10、AAVrh32.33、ウシAAV、もしくはトリAAVの等価なアミノ酸残基に置換を含み得るカプシドタンパク質を有するAAVバリアントなど、国際公開第2017058892号パンフレット(その内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載のとおりの配列であってもよくまたはそれを有していてもよい。アミノ酸置換は、限定はされないが、国際公開第2017058892号パンフレットに記載されるアミノ酸配列のいずれであってもよい。一実施形態において、AAVは、以下の残基、AAV1(国際公開第2017058892号パンフレットの配列番号l)の残基256L、258K、259Q、261S、263A、264S、265T、266G、272H、385S、386Q、S472R、V473D、N500E 547S、709A、710N、716D、717N、718N、720L、A456T、Q457T、N458Q、K459S、T492S、K493A、S586R、S587G、S588N、T589Rおよび/または722Tのいずれかの組合せ、AVV5(国際公開第2017058892号パンフレットの配列番号5)の244N、246Q、248R、249E、250I、251K、252S、253G、254S、255V、256D、263Y、377E、378N、453L、456R、532Q、533P、535N、536P、537G、538T、539T、540A、541T、542Y、543L、546N、653V、654P、656S、697Q、698F、704D、705S、706T、707G、708E、709Yおよび/または710Rのいずれかの組合せ、AAV5(国際公開第2017058892号パンフレットの配列番号5)の248R、316V、317Q、318D、319S、443N、530N、531S、532Q 533P、534A、535N、540A、541T、542Y、543L、545G、546N、697Q、704D、706T、708E、709Yおよび/または710Rのいずれかの組合せ、AAV6(国際公開第2017058892号パンフレットの配列番号6)の264S、266G、269N、272H、457Q、588Sおよび/または589Iのいずれかの組合せ、AAV8(国際公開第2017058892号パンフレットの配列番号8)の457T、459N、496G、499N、500N、589Q、590Nおよび/または592Aのいずれかの組合せ、AAV9(国際公開第2017058892の配列番号9)の451I、452N、453G、454S、455G、456Q、457Nおよび/または458Qのいずれかの組合せでアミノ酸置換を含み得る。
一部の実施形態において、AAVは、国際公開第2017066764号パンフレット(その内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりに、VP1の155、156および157位またはVP2の17、18、19および20位にアミノ酸の配列を含み得る。アミノ酸の配列は、限定はされないが、N−S−S、S−X−S、S−S−Y、N−X−S、N−S−Y、S−X−YおよびN−X−Y、式中N、XおよびYは、限定はされないが、独立に、非セリンまたは非トレオニンアミノ酸であり、AAVは、限定はされないが、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11およびAAV12であってもよい。一部の実施形態において、AAVは、VP1の156、157もしくは158位またはVP2の19、20もしくは21位に少なくとも1つのアミノ酸の欠失を含んでいてもよく、AAVは、限定はされないが、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10、AAV11およびAAV12であってもよい。
一実施形態において、AAV血清型は、ジャクソン(Jackson)ら(フロンティア・イン・モレキュラー・ニューロサイエンス(Frontiers in Molecular Neuroscience)、第9巻、p.154、2016年)(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりであってもよい。一部の実施形態において、AAV血清型はPHP.BまたはAAV9である。一部の実施形態において、AAV血清型はシナプシンプロモータと対を成すことにより、遍在性の高いプロモータを使用する場合(すなわち、CBAまたはCMV)と比較したときニューロン形質導入を増強する。
一実施形態において、AAV血清型に含めるペプチドは、ヒト脾細胞を単離すること、インビトロでAAVカプシドタンパク質のアミノ酸配列にわたって個々のペプチドを用いて脾細胞を再刺激すること、インビトロ再刺激に使用した個々のペプチドによるIFN−γ ELISpot、バイオインフォマティクス解析によるIFN−γ ELISpotによって同定された15merの所与の対立遺伝子拘束性の決定、所与の対立遺伝子に対する候補反応性9merエピトープの同定、候補9merの合成、同定されたAAVエピトープが結合すると予測される特異的対立遺伝子を有する対象からの脾細胞の第2のIFN−γ ELISpotスクリーニング、AAVカプシド反応性CD8+ T細胞エピトープを決定すること、および所与のAAVエピトープに反応する対象の頻度を決定することにより同定されてもよい。
siRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子は、限定はされないが、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV9.47、AAV9(hu14)、AAV10、AAV11、AAV12、AAVrh8、AAVrh10、AAV−DJ8およびAAV−DJを含む、AAVの種々の血清型から調製されてもよく、またはそれに由来してもよい。ある場合には、異なるAAV血清型が共に、または他のタイプのウイルスと混合されることにより、キメラAAVベクターが作製されてもよい。非限定的な例として、AAV粒子はAAV9血清型に由来する。
ウイルスゲノム
一実施形態において、に示されるように、AAV粒子は、ペイロード領域を有するウイルスゲノムを含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、図1に示されるような成分を含み得る。ペイロード領域110は、ウイルスゲノム100内に位置する。ウイルスゲノム100の5’末端および/または3’末端には、少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)120が存在していてもよい。5’ITR120とペイロード領域110との間には、プロモータ領域130が存在していてもよい。一実施形態において、ペイロード領域は、少なくとも1つの調節性ポリヌクレオチドを含み得る。
一実施形態において、ウイルスゲノム100は、図2に示されるような成分を含み得る。ペイロード領域110は、ウイルスゲノム100内に位置する。ウイルスゲノム100の5’末端および/または3’末端には、少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)120が存在していてもよい。5’ITR120とペイロード領域110との間には、プロモータ領域130が存在していてもよい。プロモータ領域130とペイロード領域110との間には、イントロン領域140が存在していてもよい。一実施形態において、ペイロード領域は、少なくとも1つの調節性ポリヌクレオチドを含み得る。
一実施形態において、ウイルスゲノム100は、図3に示されるような成分を含み得る。ウイルスゲノム100の5’末端および/または3’末端には、少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)120が存在していてもよい。ウイルスゲノム100内には、エンハンサー領域150、プロモータ領域130、イントロン領域140、およびペイロード領域110が存在していてもよい。一実施形態において、ペイロード領域は、少なくとも1つの調節性ポリヌクレオチドを含み得る。
一実施形態において、ウイルスゲノム100は、図4に示されるような成分を含み得る。ウイルスゲノム100の5’末端および/または3’末端には、少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)120が存在していてもよい。ウイルスゲノム100内には、エンハンサー領域150、プロモータ領域130、イントロン領域140、ペイロード領域110、およびポリアデニル化シグナル配列領域160が存在していてもよい。一実施形態において、ペイロード領域は、少なくとも1つの調節性ポリヌクレオチドを含み得る。
一実施形態において、ウイルスゲノム100は、図5に示されるような成分を含み得る。ウイルスゲノム100の5’末端および/または3’末端には、少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)120が存在していてもよい。ウイルスゲノム100内には、少なくとも1つのMCS領域170、エンハンサー領域150、プロモータ領域130、イントロン領域140、ペイロード領域110、およびポリアデニル化シグナル配列領域160が存在していてもよい。一実施形態において、ペイロード領域は、少なくとも1つの調節性ポリヌクレオチドを含み得る。
一実施形態において、ウイルスゲノム100は、図6に示されるような成分を含み得る。ウイルスゲノム100の5’末端および/または3’末端には、少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)120が存在していてもよい。ウイルスゲノム100内には、少なくとも1つのMCS領域170、エンハンサー領域150、プロモータ領域130、少なくとも1つのエクソン領域180、少なくとも1つのイントロン領域140、ペイロード領域110、およびポリアデニル化シグナル配列領域160が存在していてもよい。一実施形態において、ペイロード領域は、少なくとも1つの調節性ポリヌクレオチドを含み得る。
一実施形態において、ウイルスゲノム100は、図7および図8に示されるような成分を含み得る。ウイルスゲノム100内には、少なくとも1つのプロモータ領域130およびペイロード領域110が存在していてもよい。一実施形態において、ペイロード領域は、少なくとも1つの調節性ポリヌクレオチドを含み得る。
一実施形態において、ウイルスゲノム100は、図9に示されるような成分を含み得る。ウイルスゲノム100内には、少なくとも1つのプロモータ領域130、ペイロード領域110、およびポリアデニル化シグナル配列領域160が存在していてもよい。一実施形態において、ペイロード領域は、少なくとも1つの調節性ポリヌクレオチドを含み得る。
ウイルスゲノムサイズ
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むウイルスゲノムは、一本鎖または二本鎖ウイルスゲノムであってもよい。ウイルスゲノムのサイズは、小型、中型、大型または最大サイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むウイルスゲノムは、小型一本鎖ウイルスゲノムであってもよい。小型一本鎖ウイルスゲノムは、約2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、および3.5kbサイズなど、2.7〜3.5kbサイズであってもよい。非限定的な例として、小型一本鎖ウイルスゲノムは3.2kbサイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むウイルスゲノムは、小型二本鎖ウイルスゲノムであってもよい。小型二本鎖ウイルスゲノムは、約1.3、1.4、1.5、1.6、および1.7kbサイズなど、1.3〜1.7kbサイズであってもよい。非限定的な例として、小型二本鎖ウイルスゲノムは1.6kbサイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むウイルスゲノムは、中型一本鎖ウイルスゲノムであってもよい。中型一本鎖ウイルスゲノムは、約3.6、3.7、3.8、3.9、4.0、4.1、4.2および4.3kbサイズなど、3.6〜4.3kbサイズであってもよい。非限定的な例として、中型一本鎖ウイルスゲノムは4.0kbサイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むウイルスゲノムは、中型二本鎖ウイルスゲノムであってもよい。中型二本鎖ウイルスゲノムは、約1.8、1.9、2.0、および2.1kbサイズなど、1.8〜2.1kbサイズであってもよい。非限定的な例として、中型二本鎖ウイルスゲノムは2.0kbサイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むウイルスゲノムは、大型一本鎖ウイルスゲノムであってもよい。大型一本鎖ウイルスゲノムは、約4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5.0、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9および6.0kbサイズなど、4.4〜6.0kbサイズであってもよい。非限定的な例として、大型一本鎖ウイルスゲノムは4.7kbサイズであってもよい。別の非限定的な例として、大型一本鎖ウイルスゲノムは4.8kbサイズであってもよい。更に別の非限定的な例として、大型一本鎖ウイルスゲノムは6.0kbサイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
一実施形態において、本明細書に記載されるペイロードを含むウイルスゲノムは、大型二本鎖ウイルスゲノムであってもよい。大型二本鎖ベクターゲノムは、約2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9および3.0kbサイズなど、2.2〜3.0kbサイズであってもよい。非限定的な例として、大型二本鎖ウイルスゲノムは2.4kbサイズであってもよい。加えて、ウイルスゲノムはプロモータおよびポリAテールを含み得る。
ウイルスゲノム成分:末端逆位配列(ITR)
本発明のAAV粒子は、少なくとも1つのITR領域とペイロード領域とを有するウイルスゲノムを含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは2つのITRを有する。これらの2つのITRは5’末端および3’末端でペイロード領域に隣接する。ITRは、複製のための認識部位を含む複製起点として働く。ITRは、相補的でかつ対称に配置され得る配列領域を含む。本発明のウイルスゲノムに組み込まれるITRは、天然に存在するポリヌクレオチド配列または組換え的に誘導されたポリヌクレオチド配列を含み得る。
ITRは、表1に挙げられる血清型のいずれか、またはその誘導体から選択される、カプシドと同じ血清型に由来してもよい。ITRはカプシドと異なる血清型であってもよい。一実施形態において、AAV粒子は2つ以上のITRを有する。非限定的な例では、AAV粒子は、2つのITRを含むウイルスゲノムを有する。一実施形態において、ITRは互いに同じ血清型である。別の実施形態において、ITRは異なる血清型である。非限定的な例としては、ITRのうちゼロ個、一方または両方がカプシドと同じ血清型を有することが挙げられる。一実施形態において、AAV粒子のウイルスゲノムの両方のITRがAAV2 ITRである。
独立に、各ITRは約100〜約150ヌクレオチド長であってもよい。ITRは、約100〜105ヌクレオチド長、106〜110ヌクレオチド長、111〜115ヌクレオチド長、116〜120ヌクレオチド長、121〜125ヌクレオチド長、126〜130ヌクレオチド長、131〜135ヌクレオチド長、136〜140ヌクレオチド長、141〜145ヌクレオチド長または146〜150ヌクレオチド長であってもよい。一実施形態において、ITRは140〜142ヌクレオチド長である。ITR長さの非限定的な例は、102、140、141、142、145ヌクレオチド長、およびそれと少なくとも95%の同一性を有するものである。
一実施形態において、AAV粒子は、発現ベクターにおいてフリップITRの5’末端の近傍に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。別の実施形態において、AAV粒子は、発現ベクターにおいてフリップITRの3’末端の近傍に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。更に別の実施形態において、AAV粒子は、発現ベクターにおいてフロップITRの5’末端の近傍に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。更に別の実施形態において、AAV粒子は、発現ベクターにおいてフロップITRの3’末端の近傍に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。一実施形態において、AAV粒子は、発現ベクターにおいてフリップITRの5’末端とフロップITRの3’末端との間に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。一実施形態において、AAV粒子は、発現ベクターにおいてフリップITRの3’末端とフリップITRの5’末端との間に(例えば、フリップITRの5’末端とフロップITRの3’末端との間またはフロップITRの3’末端とフリップITRの5’末端との間の中間に)位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。非限定的な例として、AAV粒子は、発現ベクターにおいてITR(例えばフリップまたはフロップITR)の5’または3’末端から下流に1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30ヌクレオチドまたは30ヌクレオチド超以内に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。非限定的な例として、AAV粒子は、発現ベクターにおいてITR(例えばフリップまたはフロップITR)の5’または3’末端から上流に1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30ヌクレオチドまたは30ヌクレオチド超以内に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。別の非限定的な例として、AAV粒子は、発現ベクターにおいてITR(例えばフリップまたはフロップITR)の5’または3’末端から下流に1〜5、1〜10、1〜15、1〜20、1〜25、1〜30、5〜10、5〜15、5〜20、5〜25、5〜30、10〜15、10〜20、10〜25、10〜30、15〜20、15〜25、15〜30、20〜25、20〜30または25〜30ヌクレオチド以内に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。別の非限定的な例として、AAV粒子は、発現ベクターにおいてITR(例えばフリップまたはフロップITR)の5’または3’末端から上流に1〜5、1〜10、1〜15、1〜20、1〜25、1〜30、5〜10、5〜15、5〜20、5〜25、5〜30、10〜15、10〜20、10〜25、10〜30、15〜20、15〜25、15〜30、20〜25、20〜30または25〜30以内に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。非限定的な例として、AAV粒子は、発現ベクターにおいてITR(例えばフリップまたはフロップITR)の5’または3’末端から上流にあるヌクレオチドの最初の1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%または25%超以内に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。別の非限定的な例として、AAV粒子は、発現ベクターにおいてITR(例えばフリップまたはフロップITR)の5’または3’末端から下流に最初の1〜5%、1〜10%、1〜15%、1〜20%、1〜25%、5〜10%、5〜15%、5〜20%、5〜25%、10〜15%、10〜20%、10〜25%、15〜20%、15〜25%、または20〜25%で位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。
ウイルスゲノム成分:プロモータ
一実施形態において、ウイルスゲノムのペイロード領域は、トランス遺伝子標的特異性および発現を増強する少なくとも1つのエレメントを含む(例えば、パウエル(Powell)ら著、「遺伝子療法におけるトランス遺伝子標的特異性および発現を増強するウイルス発現カセットエレメント(Viral Expression Cassette Elements to Enhance Transgene Target Specificity and Expression in Gene Therapy)」、2015年を参照のこと;この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。トランス遺伝子標的特異性および発現を増強するエレメントの非限定的な例としては、プロモータ、内因性miRNA、転写後調節エレメント(PRE)、ポリアデニル化(ポリA)シグナル配列および上流エンハンサー(USE)、CMVエンハンサーおよびイントロンが挙げられる。
当業者であれば、標的細胞中での本発明のポリペプチドの発現には、限定はされないが、種特異的な、誘導可能な、組織特異的な、または細胞周期特異的なプロモータを含む、特異的なプロモータが必要とされ得ることを認識し得る(パー(Parr)ら著、ネイチャー・メディシン(Nat.Med.)、第3巻、p.1145〜9(1997年);この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
一実施形態において、プロモータは、AAV粒子のウイルスゲノムのペイロード領域にコードされたポリペプチドの発現をドライブする場合、有効と見なされる。
一実施形態において、プロモータは、調節性ポリヌクレオチドの発現をドライブするのに有効と見なされるプロモータである。
一実施形態において、プロモータは、標的とされている細胞中で発現をドライブする場合、有効と見なされるプロモータである。
一実施形態において、プロモータは、標的組織においてペイロードの発現をある期間ドライブする。プロモータによりドライブされた発現は、1時間、2時間、3時間、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、11時間、12時間、13時間、14時間、15時間、16時間、17時間、18時間、19時間、20時間、21時間、22時間、23時間、1日、2日、3日、4日、5日、6日、1週間、8日、9日、10日、11日、12日、13日、2週間、15日、16日、17日、18日、19日、20日、3週間、22日、23日、24日、25日、26日、27日、28日、29日、30日、31日、1ヵ月、2ヵ月、3ヵ月、4ヵ月、5ヵ月、6ヵ月、7ヵ月、8ヵ月、9ヵ月、10ヵ月、11ヵ月、1年、13ヵ月、14ヵ月、15ヵ月、16ヵ月、17ヵ月、18ヵ月、19ヵ月、20ヵ月、21ヵ月、22ヵ月、23ヵ月、2年、3年、4年、5年、6年、7年、8年、9年、10年または10年超の期間であってもよい。発現は、1〜5時間、1〜12時間、1〜2日、1〜5日、1〜2週間、1〜3週間、1〜4週間、1〜2ヵ月、1〜4ヵ月、1〜6ヵ月、2〜6ヵ月、3〜6ヵ月、3〜9ヵ月、4〜8ヵ月、6〜12ヵ月、1〜2年、1〜5年、2〜5年、3〜6年、3〜8年、4〜8年または5〜10年であってもよい。
一実施形態において、プロモータは、少なくとも1ヵ月、2ヵ月、3ヵ月、4ヵ月、5ヵ月、6ヵ月、7ヵ月、8ヵ月、9ヵ月、10ヵ月、11ヵ月、1年、2年、3年、4年、5年、6年、7年、8年、9年、10年、11年、12年、13年、14年、15年、16年、17年、18年、19年、20年、21年、22年、23年、24年、25年、26年、27年、28年、29年、30年、31年、32年、33年、34年、35年、36年、37年、38年、39年、40年、41年、42年、43年、44年、45年、46年、47年、48年、49年、50年、55年、60年、65年、または65年超にわたって、ペイロードの発現をドライブする。
プロモータは、天然に存在してもよくまたは天然に存在しなくともよい。プロモータの非限定的な例としては、ウイルスプロモータ、植物プロモータおよび哺乳類プロモータが挙げられる。一部の実施形態において、プロモータは、ヒトプロモータであってもよい。一部の実施形態において、プロモータは、トランケート型であってもよい。
ほとんどの組織で発現をドライブまたは促進するプロモータとしては、限定はされないが、ヒト伸長因子1α−サブユニット(EF1α)、サイトメガロウイルス(CMV)前初期エンハンサーおよび/もしくはプロモータ、ニワトリβ−アクチン(CBA)およびその誘導体CAG、βグルクロニダーゼ(GUSB)、またはユビキチンC(UBC)が挙げられる。限定はされないが、筋肉特異的プロモータ、B細胞プロモータ、単球プロモータ、白血球プロモータ、マクロファージプロモータ、膵腺房細胞プロモータ、内皮細胞プロモータ、肺組織プロモータ、アストロサイトプロモータ、またはニューロン、アストロサイト、もしくはオリゴデンドロサイトに発現を制限するために使用することができる神経系プロモータなど、組織特異的発現エレメントを使用して、発現を特定の細胞型に限定することができる。
筋肉特異的プロモータの非限定的な例としては、哺乳類筋肉クレアチンキナーゼ(MCK)プロモータ、哺乳類デスミン(DES)プロモータ、哺乳類トロポニンI(TNNI2)プロモータ、および哺乳類骨格筋型アルファ−アクチン(ASKA)プロモータ(例えば、米国特許出願公開第20110212529号明細書を参照。その内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
ニューロンの組織特異的発現エレメントの非限定的な例としては、ニューロン特異的エノラーゼ(NSE)、血小板由来増殖因子(PDGF)、血小板由来増殖因子B鎖(PDGF−β)、シナプシン(Syn)、メチル−CpG結合タンパク質(MeCP2)、Ca2+/カルモジュリン依存性プロテインキナーゼII(CaMKII)、代謝調節型グルタミン酸受容体2(mGluR2)、ニューロフィラメント軽鎖(NFL)または重鎖(NFH)、β−グロビンミニ遺伝子nβ2、プレプロエンケファリン(PPE)、エンケファリン(Enk)および興奮性アミノ酸トランスポーター2(EAAT2)プロモータが挙げられる。アストロサイトに対する組織特異的発現エレメントの非限定的な例としては、グリア線維性酸性タンパク質(GFAP)およびEAAT2プロモータが挙げられる。オリゴデンドロサイトに対する組織特異的発現エレメントの非限定的な例としては、ミエリン塩基性タンパク質(MBP)プロモータが挙げられる。
一実施形態において、プロモータは、1kb未満であってもよい。プロモータは、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800または800ヌクレオチド超の長さを有してもよい。プロモータは、200〜300、200〜400、200〜500、200〜600、200〜700、200〜800、300〜400、300〜500、300〜600、300〜700、300〜800、400〜500、400〜600、400〜700、400〜800、500〜600、500〜700、500〜800、600〜700、600〜800または700〜800の長さを有してもよい。
一実施形態において、プロモータは、限定はされないが、CMVおよびCBAなど、同じまたは異なる開始または親プロモータの2つ以上の成分の組合せであってもよい。各成分は、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800または800超の長さを有してもよい。各成分は、200〜300、200〜400、200〜500、200〜600、200〜700、200〜800、300〜400、300〜500、300〜600、300〜700、300〜800、400〜500、400〜600、400〜700、400〜800、500〜600、500〜700、500〜800、600〜700、600〜800または700〜800の長さを有してもよい。一実施形態において、プロモータは、382ヌクレオチドCMVエンハンサー配列と260ヌクレオチドCBAプロモータ配列との組合せである。
一実施形態において、ウイルスゲノムはユビキタスプロモータを含む。ユビキタスプロモータの非限定的な例としては、CMV、CBA(誘導体CAG、CBh等を含む)、EF−1α、PGK、UBC、GUSB(hGBp)、およびUCOE(HNRPA2B1−CBX3のプロモータ)が挙げられる。
ユー(Yu)ら(モレキュラー・ペイン(Molecular Pain)、2011年、第7巻、p.63;これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)は、レンチウイルスベクターを使用してラットDRG細胞および初代DRG細胞におけるCAG、EFIα、PGKおよびUBCプロモータ下のeGFPの発現を評価し、UBCが他の3つのプロモータよりも弱い発現を示し、全てのプロモータについて僅か10〜12%のグリア細胞発現しか見られなかったことを見出した。セーデルブロム(Soderblom)ら(イー・ニューロ(E.Neuro)、2015年;これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)は、運動皮質における注射後のCMVおよびUBCプロモータを含むAAV8およびCMVプロモータを含むAAV2におけるeGFPの発現を評価した。UBCまたはEFIαプロモータを含むプラスミドの鼻腔内投与は、CMVプロモータによる発現よりも高い持続的気道発現を示した(例えば、ギル(Gill)ら著、ジーン・セラピー(Gene Therapy)、2001年、第8巻、p.1539〜1546(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)を参照のこと)。フセイン(Husain)ら(ジーン・セラピー(Gene Therapy)、2009年;これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)は、hGUSBプロモータ、HSV−1LATプロモータおよびNSEプロモータを含むHβHコンストラクトを評価し、このHβHコンストラクトがマウス脳においてNSEよりも弱い発現を示したことを見出した。パッシーニ(Passini)およびウォルフ(Wolfe)(ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Virol.)、2001年、p.12382〜12392、これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)は、新生仔マウスにおける脳室内注射後のHβHベクターの長期効果を評価し、少なくとも1年間にわたり持続的発現があったことを見出した。スー(Xu)ら(ジーン・セラピー(Gene Therapy)、2001年、第8巻、p.1323〜1332;これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)により、NFLおよびNFHプロモータを使用したとき、CMV−lacZ、CMV−luc、EF、GFAP、hENK、nAChR、PPE、PPE+wpre、NSE(0.3kb)、NSE(1.8kb)およびNSE(1.8kb+wpre)と比較して全ての脳領域で低発現が見出された。スー(Xu)らは、プロモータ活性が、降順に、NSE(1.8kb)、EF、NSE(0.3kb)、GFAP、CMV、hENK、PPE、NFLおよびNFHであることを見出した。NFLは650ヌクレオチドプロモータであり、NFHは920ヌクレオチドプロモータであり、両方とも肝臓には存在しないが、NFHは固有受容感覚ニューロン、脳および脊髄に豊富にあり、NFHは心臓に存在する。Scn8aは、DRG、脊髄および脳全体にわたって発現する470ヌクレオチドプロモータであり、特に海馬ニューロンおよび小脳プルキンエ細胞、皮質、視床および視床下部に高発現が見られる(例えば、ドレウス(Drews)ら著、「ナトリウムチャネル遺伝子SCN8Aにおける、進化的に保存された機能性非コードエレメントの同定」(Identification of evolutionary conserved,functional noncoding elements in the promoter region of the sodium channel gene SCN8A)、マンマリアン・ゲノム(Mamm Genome)(2007年)、第18巻、p.723〜731;およびレイモンド(Raymond)ら著、「選択的スプライスによるナトリウムチャネルα−サブユニット遺伝子」の発現(Expression of Alternatively Spliced Sodium Channel α−subunit genes)、ジャーナル・オブ・バイオロジカル・ケミストリー(Journal of Biological Chemistry)2004年、279(44)、p.46234〜46241を参照のこと;この各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
前述のユー(Yu)、セーデルブロム(Soderblom)、ギル(Gill)、フセイン(Husain)、パッシーニ(Passini)、スー(Xu)、ドレウス(Drews)またはレイモンド(Raymond)によって教示されるプロモータはいずれも、本発明に使用することができる。
一実施形態において、プロモータは細胞特異的ではない。
一実施形態において、プロモータはユビキチンc(UBC)プロモータである。UBCプロモータは、300〜350ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な例として、UBCプロモータは332ヌクレオチドである。
一実施形態において、プロモータは、β−グルクロニダーゼ(GUSB)プロモータである。GUSBプロモータは、350〜400ヌクレオチドのサイズを有し得る。非限定的な例として、GUSBプロモータは378ヌクレオチドである。
一実施形態において、プロモータはニューロフィラメント軽鎖(NFL)プロモータである。NFLプロモータはサイズが600〜700ヌクレオチドであり得る。非限定的な例として、NFLプロモータは650ヌクレオチドである。非限定的な例として、コンストラクトはAAV−プロモータ−CMV/グロビンイントロン−調節性ポリヌクレオチド−RBGであってもよく、ここでAAVは自己相補的であってもよく、およびAAVはDJ血清型であってもよい。
一実施形態において、プロモータはニューロフィラメント重鎖(NFH)プロモータである。NFHプロモータはサイズが900〜950ヌクレオチドであり得る。非限定的な例として、NFHプロモータは920ヌクレオチドである。非限定的な例として、コンストラクトはAAV−プロモータ−CMV/グロビンイントロン−調節性ポリヌクレオチド−RBGであってもよく、ここでAAVは自己相補的であってもよく、およびAAVはDJ血清型であってもよい。
一実施形態において、プロモータはscn8aプロモータである。scn8aプロモータはサイズが450〜500ヌクレオチドであり得る。非限定的な例として、scn8aプロモータは470ヌクレオチドである。非限定的な例として、コンストラクトはAAV−プロモータ−CMV/グロビンイントロン−調節性ポリヌクレオチド−RBGであってもよく、ここでAAVは自己相補的であってもよく、およびAAVはDJ血清型であってもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムはPol IIIプロモータを含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムはP1プロモータを含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムはFXNプロモータを含む。
一実施形態において、プロモータは、ホスホグリセリン酸キナーゼ1(PGK)プロモータである。
一実施形態において、プロモータは、ニワトリβ−アクチン(CBA)プロモータである。
一実施形態において、プロモータは、ニワトリベータ−アクチン(CBA)プロモータに融合されたサイトメガロウイルス(CMV)エンハンサーを含むコンストラクトであるCAGプロモータである。
一実施形態において、プロモータは、サイトメガロウイルス(CMV)プロモータである。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、H1プロモータを含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、U6プロモータを含む。
一実施形態において、プロモータは、肝臓または骨格筋プロモータである。肝臓プロモータの非限定的な例としては、ヒトα−1−抗トリプシン(hAAT)およびチロキシン結合グロブリン(TBG)が挙げられる。骨格筋プロモータの非限定的な例としては、デスミン、MCKまたは合成C5−12が挙げられる。
一実施形態において、プロモータは、RNA pol IIIプロモータである。非限定的な例として、RNA pol IIIプロモータはU6である。非限定的な例として、RNA pol IIIプロモータはH1である。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのプロモータを含む。非限定的な例として、プロモータは、EF1αプロモータおよびCMVプロモータである。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、エンハンサーエレメント、プロモータおよび/または5’UTRイントロンを含む。また、エンハンサーエレメントは、本明細書では「エンハンサー」とも称され、限定はされないが、CMVエンハンサーであってもよく、プロモータは、限定はされないが、CMV、CBA、UBC、GUSB、NSE、シナプシン、MeCP2、およびGFAPプロモータであってもよく、および5’UTR/イントロンは、限定はされないが、SV40およびCBA−MVMであってもよい。非限定的な例として、組合せで使用されるエンハンサー、プロモータおよび/またはイントロンは、(1)CMVエンハンサー、CMVプロモータ、SV40 5’UTRイントロン;(2)CMVエンハンサー、CBAプロモータ、SV40 5’UTRイントロン;(3)CMVエンハンサー、CBAプロモータ、CBA−MVM 5’UTRイントロン;(4)UBCプロモータ;(5)GUSBプロモータ;(6)NSEプロモータ;(7)シナプシンプロモータ;(8)MeCP2プロモータ、(9)GFAPプロモータ、(10)H1プロモータ;および(11)U6プロモータであってもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、操作されたプロモータを含む。
別の実施形態において、ウイルスゲノムは、天然に発現されるタンパク質のプロモータを含む。
ウイルスゲノム成分:非翻訳領域(UTR)
定義上、遺伝子の野生型非翻訳領域(UTR)は、転写されるが翻訳されない。一般的には、5’UTRは、転写開始部位から始まり、開始コドンで終了し、3’UTRは、終止コドンの直後から始まり、転写の終結シグナルまで継続する。
特定の標的臓器の、豊富に発現される遺伝子に典型的に見出される特徴を、UTR内に操作して、安定性およびタンパク質産生を増強することができる。非限定的な例として、肝臓において通常発現されるmRNA(例えば、アルブミン、血清アミロイドA、アポリポタンパク質A/B/E、トランスフェリン、アルファフェトプロテイン、エリスロポエチン、または第VIII因子)に由来する5’UTRを、本発明のAAV粒子のウイルスゲノムに使用して、肝細胞株または肝臓での発現を増強することができる。
理論によって束縛されることを望むものではないが、野生型5’非翻訳領域(UTR)は、翻訳開始に役割を果たす特徴を含む。コザック配列は、リボソームが多数の遺伝子の翻訳を開始させる過程に関与することが広く知られており、通常は5’UTRに含まれている。コザック配列は、コンセンサスCCR(A/G)CCAUGGを有し、式中Rは、開始コドン(ATG)の3塩基上流にあるプリン(アデニンまたはグアニン)であり、別の「G」がその後に続く。
一実施形態において、ウイルスゲノムの5’UTRは、コザック配列を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムの5’UTRは、コザック配列を含まない。
理論によって束縛されることを望むものではないが、野生型3’UTRは、アデノシンおよびウリジンのストレッチがそこに埋め込まれていることが知られている。これらのAUリッチシグネチャーは、高いターンオーバー率を有する遺伝子において特に広く見受けられる。それらの配列特徴および機能的特性に基づき、AUリッチエレメント(ARE)は、3つのクラスに分離することができる(チェン(Chen)ら著、1995年。その内容は本明細書において全体として参照により援用される):限定はされないが、c−MycおよびMyoDなどのクラスI AREは、Uリッチ領域内にAUUUAモチーフの幾つかの分散コピーを含有する。限定はされないが、GM−CSFおよびTNF−aなどのクラスII AREは、2つ以上のオーバーラップUUAUUUA(U/A)(U/A)ノナマーを有する。限定はされないが、c−JunおよびミオゲニンなどのクラスIII ARESは、それほど十分に規定されていない。これらのUリッチ領域は、AUUUAモチーフを含有しない。AREに結合するほとんどのタンパク質は、メッセンジャーを不安定化することが知られているが、ELAVファミリーのメンバーである最も顕著にはHuRは、mRNAの安定性を増加させることが実証されている。HuRは、3つ全てのクラスのAREに結合する。HuR特異的結合部位を核酸分子の3’UTR内に、操作により加えることは、インビボにて、HuR結合を、したがってメッセージの安定化をもたらすことになる。
3’UTR AUリッチエレメント(ARE)の導入、除去または修飾を使用して、ポリヌクレオチドの安定性を調節することができる。特異的なポリヌクレオチド、例えばウイルスゲノムのペイロード領域を操作する場合、AREの1つ以上のコピーを導入して、ポリヌクレオチドをより不安定にし、それにより、翻訳を減らし、結果として生じるタンパク質の産生を減少させることができる。同様に、AREを、同定および除去または突然変異させて、細胞内安定性を増加させ、したがって結果として生じるタンパク質の翻訳および産生を増加させることができる。
一実施形態において、ウイルスゲノムの3’UTRは、ポリAテールを鋳型付加するためのオリゴ(dT)配列を含み得る。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのmiRNAシード、結合部位または完全な配列を含み得る。microRNA(またはmiRNAまたはmiR)は、核酸標的の部位に結合し、核酸分子安定性を低減することまたは翻訳を阻害することのいずれかによって遺伝子発現を下方制御する19〜25ヌクレオチド非コードRNAである。microRNA配列は、「シード」領域、すなわち成熟microRNAの2〜8位の領域の配列を含む。この配列は、核酸のmiRNA標的配列に対して完全なワトソンクリック型相補性を有する。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのmiRNA結合部位、配列またはシード領域を含む、変更するまたは除去するように操作されていてもよい。
当該技術分野で公知の任意の遺伝子に由来する任意のUTRを、AAV粒子のウイルスゲノムに組み込むことができる。これらのUTRまたはそれらの部分は、それらが選択されたかまたはそれらの配向性もしくは位置が変更され得る遺伝子と同じ配向性に配置され得る。一実施形態において、AAV粒子のウイルスゲノムに使用されるUTRは、逆位化、短縮化、延長化、当該技術分野で公知の1つ以上の他の5’UTRまたは3’UTRで作製され得る。本明細書で使用されるとき、用語「変更される」は、UTRに関する場合、UTRが、参照配列に対して何らかの点で変化していることを意味する。例えば、3’または5’UTRは、上記で教示されるような配向性または位置の変化によって野生型または天然UTRに対して変更されていてもよく、または追加ヌクレオチドの介在、ヌクレオチドの欠失、ヌクレオチドの交換もしくは転位によって変更されていてもよい。
一実施形態において、AAV粒子のウイルスゲノムは、野生型UTRの変異体でない少なくとも1つの人工UTRを含む。
一実施形態において、AAV粒子のウイルスゲノムは、そのタンパク質が、共通の機能、構造、特徴、または特性を共有する転写物のファミリーから選択されているUTRを含む。
ウイルスゲノム成分:ポリアデニル化配列
一実施形態において、本発明のAAV粒子のウイルスゲノムは少なくとも1つのポリアデニル化配列を含む。AAV粒子のウイルスゲノムは、ペイロードコード配列の3’末端と3’ITRの5’末端との間にポリアデニル化配列を含み得る。
一実施形態において、ポリアデニル化配列または「ポリA配列」は、存在しない〜約500ヌクレオチド長の範囲であってもよい。ポリアデニル化配列は、限定はされないが、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399、400、401、402、403、404、405、406、407、408、409、410、411、412、413、414、415、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、452、453、454、455、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、472、473、474、475、476、477、478、479、480、481、482、483、484、485、486、487、488、489、490、491、492、493、494、495、496、497、498、499、および500ヌクレオチド長であってもよい。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は50〜100ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は50〜150ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は50〜160ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は50〜200ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は60〜100ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は60〜150ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は60〜160ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は60〜200ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は70〜100ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は70〜150ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は70〜160ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は70〜200ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は80〜100ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は80〜150ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は80〜160ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は80〜200ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は90〜100ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は90〜150ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は90〜160ヌクレオチド長である。
一実施形態において、ポリアデニル化配列は90〜200ヌクレオチド長である。
一実施形態において、AAV粒子は、発現ベクターにおいてポリアデニル化配列の上流に位置してもよい、siRNA分子をコードする核酸配列を含む。更に、AAV粒子は、限定はされないが、CMV、U6、CAG、CBA、またはSV40イントロンもしくはヒトβグロビンイントロンを伴うCBAプロモータなど、発現ベクターにおいてプロモータの下流に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。非限定的な例として、AAV粒子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流に1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30ヌクレオチドまたは30ヌクレオチド超以内に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。別の非限定的な例として、AAV粒子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流に1〜5、1〜10、1〜15、1〜20、1〜25、1〜30、5〜10、5〜15、5〜20、5〜25、5〜30、10〜15、10〜20、10〜25、10〜30、15〜20、15〜25、15〜30、20〜25、20〜30または25〜30ヌクレオチド以内に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。非限定的な例として、AAV粒子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流にあるヌクレオチドの最初の1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%または25%超以内に位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。別の非限定的な例として、AAV粒子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流に最初の1〜5%、1〜10%、1〜15%、1〜20%、1〜25%、5〜10%、5〜15%、5〜20%、5〜25%、10〜15%、10〜20%、10〜25%、15〜20%、15〜25%、または20〜25%で位置してもよいsiRNA分子をコードする核酸配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子は、ウサギグロビンポリアデニル化(ポリA)シグナル配列を含む。
一実施形態において、AAV粒子は、ヒト成長ホルモンポリアデニル化(ポリA)シグナル配列を含む。
ウイルスゲノム成分:イントロン
一実施形態において、ペイロード領域は、1つ以上のイントロンまたはそれらの部分など、発現を増強するための少なくとも1つのエレメントを含む。イントロンの非限定的な例としては、MVM(67〜97bps)、F.IXトランケート型イントロン1(300bp)、β−グロビンSD/免疫グロブリン重鎖スプライスアクセプター(250bp)、アデノウイルススプライスドナー/イムノグロビンスプライスアクセプター(500bp)、SV40後期スプライスドナー/スプライスアクセプター(19S/16S)(180bp)およびハイブリッドアデノウイルススプライスドナー/IgGスプライスアクセプター(230bp)が挙げられる。
一実施形態において、イントロンまたはイントロン部分は100〜500ヌクレオチド長であってもよい。イントロンは、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490または500の長さを有してもよい。イントロンは、80〜100、80〜120、80〜140、80〜160、80〜180、80〜200、80〜250、80〜300、80〜350、80〜400、80〜450、80〜500、200〜300、200〜400、200〜500、300〜400、300〜500、または400〜500の長さを有してもよい。
一実施形態において、AAVウイルスゲノムは、限定はされないが、CMVまたはU6などのプロモータを含み得る。非限定的な例として、本発明のsiRNA分子の核酸配列を含むAAVのプロモータは、CMVプロモータである。別の非限定的な例として、本発明のsiRNA分子の核酸配列を含むAAVのプロモータは、U6プロモータである。
一実施形態において、AAVウイルスゲノムはCMVプロモータを含み得る。
一実施形態において、AAVウイルスゲノムはU6プロモータを含み得る。
一実施形態において、AAVウイルスゲノムはCMVおよびU6プロモータを含み得る。
一実施形態において、AAVウイルスゲノムは、H1プロモータを含み得る。
一実施形態において、AAVウイルスゲノムはCBAプロモータを含み得る。
一実施形態において、コード化siRNA分子は、限定はされないが、CMV、U6、H1、CBA、CAG、またはSV40もしくは当該技術分野において公知の他のものなどのイントロンを伴うCBAプロモータなど、発現ベクターにおいてプロモータの下流に位置してもよい。更に、コード化siRNA分子はまた、発現ベクターにおいてポリアデニル化配列の上流に位置してもよい。非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流に1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30ヌクレオチドまたは30ヌクレオチド超以内に位置してもよい。別の非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流に1〜5、1〜10、1〜15、1〜20、1〜25、1〜30、5〜10、5〜15、5〜20、5〜25、5〜30、10〜15、10〜20、10〜25、10〜30、15〜20、15〜25、15〜30、20〜25、20〜30または25〜30ヌクレオチド以内に位置してもよい。非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流にあるヌクレオチドの最初の1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%または25%超以内に位置してもよい。別の非限定的な例として、コード化siRNA分子は、発現ベクターにおいてプロモータから下流および/またはポリアデニル化配列の上流に最初の1〜5%、1〜10%、1〜15%、1〜20%、1〜25%、5〜10%、5〜15%、5〜20%、5〜25%、10〜15%、10〜20%、10〜25%、15〜20%、15〜25%、または20〜25%で位置してもよい。
ウイルスゲノム成分:フィラー配列
一実施形態において、ウイルスゲノムは、1つ以上のフィラー配列を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、ウイルスゲノムの長さをパッケージングに最適なサイズにするために、1つ以上のフィラー配列を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、ウイルスゲノムの長さを約2.3kbにするために、少なくとも1つのフィラー配列を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、ウイルスゲノムの長さを約4.6kbにするために、少なくとも1つのフィラー配列を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、ベクターゲノムのヘアピン構造(例えば、本明細書に記載される調節性ポリヌクレオチド)が、発現および/またはパッケージング中に末端逆位配列(ITR)として読み取られ得る可能性を低減させるために、1つ以上のフィラー配列を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、ウイルスゲノムの長さを約2.3kbにするために、少なくとも1つのフィラー配列を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、ウイルスゲノムの長さを約4.6kbにするために、少なくとも1つのフィラー配列を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、一本鎖(ss)ウイルスゲノムであり、限定はされないが、0.1kb、0.2kb、0.3kb、0.4kb、0.5kb、0.6kb、0.7kb、0.8kb、0.9kb、1kb、1.1kb、1.2kb、1.3kb、1.4kb、1.5kb、1.6kb、1.7kb、1.8kb、1.9kb、2kb、2.1kb、2.2kb、2.3kb、2.4kb、2.5kb、2.6kb、2.7kb、2.8kb、2.9kb、3kb、3.1kb、3.2kb、3.3kb、3.4kb、3.5kb、3.6kb、3.7kb、または3.8kbなどの、約0.1kb〜3.8kbの長さを有する1つ以上のフィラー配列を含む。非限定的な例として、ベクターゲノム中のフィラー配列の合計長は、3.1kbである。非限定的な例として、ベクターゲノム中のフィラー配列の合計長は、2.7kbである。非限定的な例として、ベクターゲノム中のフィラー配列の合計長は、0.8kbである。非限定的な例として、ベクターゲノム中のフィラー配列の合計長は、0.4kbである。非限定的な例として、ベクターゲノム中の各フィラー配列の長さは、0.8kbである。非限定的な例として、ベクターゲノム中の各フィラー配列の長さは、0.4kbである。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、自己相補的(sc)ウイルスゲノムであり、限定はされないが、0.1kb、0.2kb、0.3kb、0.4kb、0.5kb、0.6kb、0.7kb、0.8kb、0.9kb、1kb、1.1kb、1.2kb、1.3kb、1.4kb、または1.5kbなどの、約0.1kb〜1.5kbの長さを有する1つ以上のフィラー配列を含む。非限定的な例として、ベクターゲノム中のフィラー配列の合計長は、0.8kbである。非限定的な例として、ベクターゲノム中のフィラー配列の合計長は、0.4kbである。非限定的な例として、ベクターゲノム中の各フィラー配列の長さは、0.8kbである。非限定的な例として、ベクターゲノム中の各フィラー配列の長さは、0.4kbである。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、フィラー配列の任意の部分を含む。ウイルスゲノムは、フィラー配列の1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または99%を含んでいてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、一本鎖(ss)ウイルスゲノムであり、ウイルスゲノムの長さを約4.6kbにするために、1つ以上のフィラー配列を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列を含み、フィラー配列は、5’ITR配列の3’に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列を含み、フィラー配列は、プロモータ配列の5’に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列を含み、フィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列の3’に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列を含み、フィラー配列は、3’ITR配列の5’に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列を含み、フィラー配列は、2つのイントロン配列間に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列を含み、フィラー配列は、イントロン配列内に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み、第1のフィラー配列は、5’ITR配列の3’に位置し、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列の3’に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み、第1のフィラー配列は、プロモータ配列の5’に位置し、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列の3’に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み、第1のフィラー配列は、5’ITR配列の3’に位置し、第2のフィラー配列は、5’ITR配列の5’に位置する。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、自己相補的(sc)ウイルスゲノムであり、ウイルスゲノムの長さを約2.3kbにするために、1つ以上のフィラー配列を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列を含み、フィラー配列は、5’ITR配列の3’に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列を含み、フィラー配列は、プロモータ配列の5’に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列を含み、フィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列の3’に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列を含み、フィラー配列は、3’ITR配列の5’に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列を含み、フィラー配列は、2つのイントロン配列間に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列を含み、フィラー配列は、イントロン配列内に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み、第1のフィラー配列は、5’ITR配列の3’に位置し、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列の3’に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み、第1のフィラー配列は、プロモータ配列の5’に位置し、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列の3’に位置する。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み、第1のフィラー配列は、5’ITR配列の3’に位置し、第2のフィラー配列は、5’ITR配列の5’に位置する。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、ウイルスゲノムのより多くの領域の1つの間に1つ以上のフィラー配列を含み得る。一実施形態において、フィラー領域は、限定はされないが、ペイロード領域、末端逆位配列(ITR)、プロモータ領域、イントロン領域、エンハンサー領域、ポリアデニル化シグナル配列領域、多重クローニング部位(MCS)領域、および/またはエクソン領域などの領域の前に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー領域は、限定はされないが、ペイロード領域、末端逆位配列(ITR)、プロモータ領域、イントロン領域、エンハンサー領域、ポリアデニル化シグナル配列領域、多重クローニング部位(MCS)領域、および/またはエクソン領域などの領域の後に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー領域は、限定はされないが、ペイロード領域、末端逆位配列(ITR)、プロモータ領域、イントロン領域、エンハンサー領域、ポリアデニル化シグナル配列領域、多重クローニング部位(MCS)領域、および/またはエクソン領域などの領域の前および後に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、ウイルスゲノムの少なくとも1つの領域を二分する(bifurcate)1つ以上のフィラー配列を含み得る。ウイルスゲノムの二分された領域は、フィラー配列領域の5’にある領域の1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または99%を含んでいてもよい。非限定的な例として、フィラー配列は、領域の10%がフィラー配列の5’に位置し、領域の90%がフィラー配列の3’に位置するように、少なくとも1つの領域を二分してもよい。非限定的な例として、フィラー配列は、領域の20%がフィラー配列の5’に位置し、領域の80%がフィラー配列の3’に位置するように、少なくとも1つの領域を二分してもよい。非限定的な例として、フィラー配列は、領域の30%がフィラー配列の5’に位置し、領域の70%がフィラー配列の3’に位置するように、少なくとも1つの領域を二分してもよい。非限定的な例として、フィラー配列は、領域の40%がフィラー配列の5’に位置し、領域の60%がフィラー配列の3’に位置するように、少なくとも1つの領域を二分してもよい。非限定的な例として、フィラー配列は、領域の50%がフィラー配列の5’に位置し、領域の50%がフィラー配列の3’に位置するように、少なくとも1つの領域を二分してもよい。非限定的な例として、フィラー配列は、領域の60%がフィラー配列の5’に位置し、領域の40%がフィラー配列の3’に位置するように、少なくとも1つの領域を二分してもよい。非限定的な例として、フィラー配列は、領域の70%がフィラー配列の5’に位置し、領域の30%がフィラー配列の3’に位置するように、少なくとも1つの領域を二分してもよい。非限定的な例として、フィラー配列は、領域の80%がフィラー配列の5’に位置し、領域の20%がフィラー配列の3’に位置するように、少なくとも1つの領域を二分してもよい。非限定的な例として、フィラー配列は、領域の90%がフィラー配列の5’に位置し、領域の10%がフィラー配列の3’に位置するように、少なくとも1つの領域を二分してもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、5’ITRの後にフィラー配列を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、プロモータ領域の後にフィラー配列を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、ペイロード領域の後にフィラー配列を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、イントロン領域の後にフィラー配列を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、エンハンサー領域の後にフィラー配列を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、ポリアデニル化シグナル配列領域の後にフィラー配列を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、MCS領域の後にフィラー配列を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、エクソン領域の後にフィラー配列を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、プロモータ領域の前にフィラー配列を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、ペイロード領域の前にフィラー配列を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、イントロン領域の前にフィラー配列を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、エンハンサー領域の前にフィラー配列を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、ポリアデニル化シグナル配列領域の前にフィラー配列を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、MCS領域の前にフィラー配列を含む。一実施形態において、ウイルスゲノムは、エクソン領域の前にフィラー配列を含む。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、3’ITRの前にフィラー配列を含む。
一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、5’ITRおよびプロモータ領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、5’ITRおよびペイロード領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、5’ITRおよびイントロン領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、5’ITRおよびエンハンサー領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、5’ITRおよびポリアデニル化シグナル配列領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、5’ITRおよびMCS領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。
一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、5’ITRおよびエクソン領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。
一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、プロモータ領域およびペイロード領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、プロモータ領域およびイントロン領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、プロモータ領域およびエンハンサー領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、プロモータ領域およびポリアデニル化シグナル配列領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、プロモータ領域およびMCS領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、プロモータ領域およびエクソン領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、プロモータ領域および3’ITRなどの、2つの領域間に位置していてもよい。
一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、ペイロード領域およびイントロン領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、ペイロード領域およびエンハンサー領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、ペイロード領域およびポリアデニル化シグナル配列領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、ペイロード領域およびMCS領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、ペイロード領域およびエクソン領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。
一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、ペイロード領域および3’ITRなどの、2つの領域間に位置していてもよい。
一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、イントロン領域およびエンハンサー領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、イントロン領域およびポリアデニル化シグナル配列領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、イントロン領域およびMCS領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、イントロン領域およびエクソン領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、イントロン領域および3’ITRなどの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、エンハンサー領域およびポリアデニル化シグナル配列領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、エンハンサー領域およびMCS領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、エンハンサー領域およびエクソン領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、エンハンサー領域および3’ITRなどの、2つの領域間に位置していてもよい。
一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、ポリアデニル化シグナル配列領域およびMCS領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、ポリアデニル化シグナル配列領域およびエクソン領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、ポリアデニル化シグナル配列領域および3’ITRなどの、2つの領域間に位置していてもよい。
一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、MCS領域およびエクソン領域などの、2つの領域間に位置していてもよい。一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、MCS領域および3’ITRなどの、2つの領域間に位置していてもよい。
一実施形態において、フィラー配列は、限定はされないが、エクソン領域および3’ITRなどの、2つの領域間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとプロモータ領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、5’ITRとエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とペイロード領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、プロモータ領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とイントロン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ペイロード領域と3’ITR領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエンハンサー領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、イントロン領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とポリアデニル化シグナル配列領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、エンハンサー領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とMCS領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、MCS領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、ポリアデニル化シグナル配列領域と3’ITRとの間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
一実施形態において、ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列を含み得、第1のフィラー配列は、MCS領域とエクソン領域との間に位置していてもよく、第2のフィラー配列は、エクソン領域と3’ITRとの間に位置していてもよい。
本発明のペイロード
本開示のAAV粒子は、少なくとも1つのペイロード領域を含む。本明細書で使用されるとき、「ペイロード」または「ペイロード領域」は、ウイルスゲノムによりもしくはその内にコードされる1つ以上のポリヌクレオチドもしくはポリヌクレオチド領域、またはかかるポリヌクレオチドもしくはポリヌクレオチド領域、例えばトランス遺伝子、ポリペプチドもしくはマルチポリペプチドをコードするポリヌクレオチドの発現産物、または調節性核酸もしくは制御性核酸を指す。本発明のペイロードは、典型的には、調節性ポリヌクレオチドまたはその断片もしくは変異体をコードする。
ペイロード領域は、mRNAの天然構成と同様のまたは反映した領域を再現するように構築され得る。
ペイロード領域は、コードおよび非コード核酸配列の組合せを含み得る。
一部の実施形態では、AAVペイロード領域は、コードまたは非コードRNAをコードし得る。
一実施形態において、AAV粒子は、siRNA、miRNAまたは他のRNAi剤をコードする核酸配列を含むペイロード領域を有するウイルスゲノムを含む。かかる実施形態において、2つ以上のポリペプチドをコードするウイルスゲノムが、ウイルス粒子へと複製およびパッケージングされ得る。ウイルス粒子で形質導入された標的細胞は、単一細胞内部において、コード化siRNA、miRNAまたは他のRNAi剤を発現し得る。
調節性ポリヌクレオチド
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチド、例えばRNAまたはDNA分子を使用して、神経変性疾患、詳細にはハンチントン病(HD)を治療することができる。本明細書で使用されるとき、「調節性ポリヌクレオチド」は、標的遺伝子のレベルまたは量、例えばmRNAまたはタンパク質レベルを調節する(増加させるかまたは減少させるかのいずれか)働きをする任意の核酸配列である。
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドは、少なくとも1つのsiRNA分子をコードする少なくとも1つの核酸配列を含み得る。核酸は、2つ以上ある場合には独立して、1、2、3、4、5、6、7、8、9個、または9個超のsiRNA分子をコードし得る。
一実施形態において、分子足場は、CMVプロモータ、その断片または変異体の下流に位置してもよい。
一実施形態において、分子足場は、CBAプロモータ、その断片または変異体の下流に位置してもよい。
一実施形態において、分子足場は、CMVプロモータの下流に位置する天然pri−miRNA足場であってもよい。非限定的な例として、天然pri−miRNA足場はヒトmiR155足場に由来する。
一実施形態において、分子足場は、CBAプロモータの下流に位置する天然pri−miRNA足場であってもよい。
一実施形態において、分子足場および調節性ポリヌクレオチドの選択は、pri−miRNA内での調節性ポリヌクレオチドを比較する方法によって決定される(例えば、ミニアリコバ(Miniarikova)ら著、「ハンチントン病に対する遺伝子療法を開発するためのハンチンチンを標的とする治療用miRNAの設計、特徴付け、およびリード選択(Design,Characterization,および Lead Selection of Therapeutic miRNAs Targeting Huntingtin for Development of Gene Therapy for Huntington’s Disease)」、モレキュラー・セラピー−ヌクレイック・アシッド(Molecular Therapy−Nucleic Acids)、2016年、第5巻、p.e297および国際公開第2016102664号パンフレット(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)により記載される方法を参照のこと)。調節性ポリヌクレオチドは、限定はされないが、エクソン1、CAGリピート、エクソン50のSNP rs362331および/またはエクソン67のSNP rs362307を標的とし得る。調節性ポリヌクレオチドの活性を評価するため、使用し得る使用される分子足場は、ヒトpri−miRNA足場(例えば、miR155足場)であり、プロモータはCMVであってもよい。活性はインビトロでHEK293T細胞およびレポータ(例えばルシフェラーゼ)を用いて決定されてもよい。エクソン1のターゲティングについては、ノックダウンが80%以上である場合に、その調節性ポリヌクレオチドはHTTノックダウンに有効であると決定される。CAGのターゲティングについては、ノックダウンが少なくとも60%である場合に、その調節性ポリヌクレオチドはHTTノックダウンに有効であると決定される。SNPのターゲティングについては、ノックダウンが少なくとも60%である場合に、その調節性ポリヌクレオチドはHTTノックダウンに有効であると決定される。CAGリピートまたはSNPターゲティングに関する対立遺伝子選択性のため、調節性ポリヌクレオチドは、対立遺伝子選択性を改善するため少なくとも1つの置換を含み得る。非限定的な例として、置換は、GまたはCをTまたは対応するUに置き換えるもの、およびAまたはT/UをCによって置き換えるものであり得る。
調節性ポリヌクレオチドに最適な分子足場を評価するため、調節性ポリヌクレオチドがpri−miRNA足場においてCAGプロモータと共に使用される。このコンストラクトには50ngのレポータ(例えば、ルシフェラーゼレポータ)がコトランスフェクトされる。50ngコトランスフェクションで80%より高いノックダウンのコンストラクトが有効と見なされる。一態様では、強力なガイド鎖活性を有するコンストラクトが好ましい。分子足場をHEK293T細胞においてNGSによって処理して、ガイド−パッセンジャー比、およびプロセシング変動性を決定することができる。
インビボでの分子足場および調節性ポリヌクレオチドの評価には、調節性ポリヌクレオチドを含む分子足場がAAVにパッケージングされて(例えば、血清型はAAV5であってもよい(例えば、国際公開第2015060722号パンフレットに記載される方法およびコンストラクトを参照のこと、この内容は本明細書において全体として参照により援用される))、インビボモデル(例えば、Hu128/21 HDマウス)に投与され、モデルの種々の範囲においてガイド−パッセンジャー比、5’および3’末端プロセシング、ガイド鎖およびパッセンジャー鎖の逆転、およびノックダウンを決定することができる。
一実施形態において、分子足場および調節性ポリヌクレオチドの選択は、天然pri−miRNAおよび合成pri−miRNAでの調節性ポリヌクレオチドを比較する方法によって決定される。調節性ポリヌクレオチドは、限定はされないが、エクソン1以外のエクソンを標的とし得る。調節性ポリヌクレオチドの活性の評価には、分子足場がCBAプロモータと共に使用される。一態様では、活性はインビトロでHEK293T細胞、HeLa細胞およびレポータ(例えば、ルシフェラーゼ)を用いて決定されてもよく、およびノックダウン効率的な調節性ポリヌクレオチドは、試験した細胞において少なくとも80%のHTTノックダウンを示した。加えて、最も効率的と見なされる調節性ポリヌクレオチドは有意なパッセンジャー鎖(p鎖)活性が低い乃至全くないことを示した。別の態様では、内因性HTTノックダウン有効性はインビトロでHEK293T細胞、HeLa細胞およびレポータを用いてトランスフェクションにより評価される。効率的な調節性ポリヌクレオチドは50%より高い内因性HTTノックダウンを示す。更に別の態様では、内因性HTTノックダウン有効性は、種々の細胞型(例えば、HEK293、HeLa、初代アストロサイト、U251アストロサイト、SH−SY5Yニューロン細胞およびHD患者に由来する線維芽細胞)において感染(例えば、AAV2)によって評価される。効率的な調節性ポリヌクレオチドは60%より高い内因性HTTノックダウンを示す。
インビボでの分子足場および調節性ポリヌクレオチドの評価には、調節性ポリヌクレオチドを含む分子足場がAAVにパッケージングされてインビボモデル(例えば、YAC128 HDマウスモデル)に投与され、モデルの種々の範囲(例えば組織領域)においてガイド−パッセンジャー比、5’および3’末端プロセシング、ガイド鎖のパッセンジャー鎖に対する比、およびノックダウンを決定することができる。分子足場をNGSによってインビボ試料から処理して、ガイド−パッセンジャー比、およびプロセシング変動性を決定することができる。
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドは以下の特性のうちの少なくとも1つを用いて設計される:ループ変異体、シードミスマッチ/バルジ/ゆらぎ変異体、ステムミスマッチ、ループ変異体およびヴァッサルステム(vassal stem)ミスマッチ変異体、シードミスマッチおよびベーサルステム(basal stem)ミスマッチ変異体、ステムミスマッチおよびベーサルステム(basal stem)ミスマッチ変異体、シードゆらぎおよびベーサルステム(basal stem)ゆらぎ変異体、またはステム配列変異体。
siRNA分子
本発明は、神経変性障害を治療するためのRNA干渉(RNAi)誘導性の遺伝子発現阻害に関する。本明細書には、HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNA(本明細書では、まとめて「siRNA分子」と称される)が提供される。かかるsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、細胞、例えば中型有棘ニューロン、皮質ニューロンおよび/またはアストロサイトにおけるHTT遺伝子発現を軽減またはサイレンシングして、それによりハンチントン病(HD)の症状を改善することができる。
RNAi(転写後遺伝子サイレンシング(PTGS)、クエリング、または共抑制としても知られる)は、RNA分子が典型的には特異的mRNA分子の破壊を引き起こすことにより遺伝子発現を配列特異的に阻害する転写後遺伝子サイレンシング過程である。RNAiの活性成分は低分子干渉RNA(siRNA)と呼ばれる短鎖/低分子二本鎖RNA(dsRNA)であり、これは典型的には15〜30ヌクレオチド(例えば、19〜25、19〜24または19〜21ヌクレオチド)および2ヌクレオチドの3’オーバハングを含有し、かつ標的遺伝子の核酸配列と一致する。これらの低分子RNA種は、天然ではインビボでより大きいdsRNAのダイサー媒介性切断によって産生されることができ、および哺乳類細胞で機能性である。
microRNA(miRNA)と称される、天然で発現する低分子RNA分子は、mRNAの発現を調節することにより遺伝子サイレンシングを誘発する。RNA誘導サイレンシング複合体(RISC)を含有するmiRNAは、シード領域と呼ばれるmiRNAの5’領域におけるヌクレオチド2〜7と完全な配列相補性を呈し、かつその3’領域と他の塩基対を呈するmRNAを標的とする。miRNA媒介性の遺伝子発現下方制御は、標的mRNAの切断、標的mRNAの翻訳阻害、またはmRNA崩壊によって引き起こされ得る。miRNAターゲティング配列は、通常、標的mRNAの3’−UTRに位置する。単一のmiRNAが様々な遺伝子の100より多くの転写物を標的とすることができ、および1つのmRNAが異なるmiRNAの標的となることができる。
特異的mRNAを標的とするsiRNA二重鎖またはdsRNAがインビトロで設計および合成されて、RNAi過程を活性化させるため細胞に導入されてもよい。エルバシール(Elbashir)らは、21ヌクレオチドsiRNA二重鎖(低分子干渉RNAと称される)が哺乳類細胞において免疫応答を誘導することなく強力かつ特異的な遺伝子ノックダウンを生じさせる能力を有したことを実証した(エルバシール・SM(Elbashir SM)ら著、ネイチャー(Nature)、2001年、第411巻、p.494〜498)。この最初の報告以来、siRNAによる転写後遺伝子サイレンシングは哺乳類細胞における強力な遺伝子解析ツールとして急速に浮上しており、新規療法を生み出す可能性を秘めている。
ハンチントン病などのポリグルタミン伸長疾患を引き起こすポリグルタミンリピートタンパク質をコードする核酸配列を標的とするように設計されたRNAi分子が、米国特許第9,169,483号明細書および同第9,181,544号明細書ならびに国際公開第2015179525号パンフレット(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されている。米国特許第9,169,483号明細書および同第9,181,544号明細書ならびに国際公開第2015179525号パンフレットは、各々が、第1のRNA鎖(例えば、15連続ヌクレオチド)と第2のRNA鎖(例えば、第1の鎖の少なくとも12連続ヌクレオチドと相補的)とを含む単離RNA二重鎖を提供し、ここでRNA二重鎖は約15〜30塩基対長である。第1のRNA鎖と第2のRNA鎖とはRNAループ(約4〜50ヌクレオチド)により作動可能に連結されてヘアピン構造を形成してもよく、これが発現カセットに挿入され得る。ループ部分の非限定的な例としては、米国特許第9,169,483号明細書の配列番号9〜14(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)が挙げられる。完全配列または配列の一部のいずれかの、RNA二重鎖の形成に使用し得るRNA鎖の非限定的な例としては、米国特許第9,169,483号明細書の配列番号1〜8ならびに米国特許第9,181,544号明細書の配列番号1〜11、33〜59、208〜210、213〜215および218〜221(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)が挙げられる。RNAi分子の非限定的な例としては、米国特許第9,169,483号明細書の配列番号1〜8、米国特許第9,181,544号明細書の配列番号1〜11、33〜59、208〜210、213〜215および218〜221ならびに国際公開第2015179525号パンフレットの配列番号1、6、7、および35〜38(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)が挙げられる。
RNAiを活性化させるため、インビトロ合成したsiRNA分子が細胞に導入されてもよい。外因性siRNA二重鎖は、細胞に導入されると、内因性dsRNAと同様にアセンブルして、siRNA二重鎖の2本の鎖のうちの一方(すなわちアンチセンス鎖)に相補的なRNA配列と相互作用する多ユニット複合体であるRNA誘導サイレンシング複合体(RISC)を形成することができる。この過程でsiRNAのセンス鎖(またはパッセンジャー鎖)が複合体から失われ、一方でsiRNAのアンチセンス鎖(またはガイド鎖)はその相補RNAとマッチする。詳細には、siRNAを含有するRISCの標的は、完全な配列相補性を呈するmRNAである。次に、標的の切断、放出および分解によってsiRNA媒介性遺伝子サイレンシングが起こる。
標的mRNAに相同なセンス鎖と標的mRNAに相補的なアンチセンス鎖とを含むsiRNA二重鎖は、標的RNAの破壊効率の点で、一本鎖(ss)−siRNA(例えばアンチセンス鎖RNAまたはアンチセンスオリゴヌクレオチド)の使用と比較してはるかに大きい利点をもたらす。多くの場合に、ss−siRNAの使用は、対応する二重鎖の有効な遺伝子サイレンシング効力を達成するのに、より高い濃度のss−siRNAを必要とする。
前述の分子のいずれも、ウイルスゲノムによってコードされてもよい。
HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖の設計および配列
本発明は、HTT遺伝子発現および/またはHTTタンパク質産生に干渉するためにHTT mRNAを標的とする低分子干渉RNA(siRNA)二重鎖(およびそれらをコードする調節性ポリヌクレオチド)を提供する。
本発明のコード化siRNA二重鎖は、共にハイブリダイズして二重鎖構造を形成するアンチセンス鎖およびセンス鎖を含有し、ここでアンチセンス鎖は標的HTT遺伝子の核酸配列に相補的であり、センス鎖は標的HTT遺伝子の核酸配列と相同である。一部の態様において、アンチセンス鎖の5’末端は5’リン酸基を有し、センス鎖の3’末端は3’ヒドロキシル基を含む。他の態様において、各鎖の3’末端にはヌクレオチドオーバハングがない、1つある、または2つある。
当該技術分野では、siRNAの設計に関して幾つかの指針が提案されている。これらの指針は、概して、サイレンシングしようとする遺伝子中の領域を標的とする19ヌクレオチド二重鎖形成領域、対称2〜3ヌクレオチド3’オーバハング、5’−リン酸基および3’−ヒドロキシル基を作成することを推奨している。siRNA配列の好ましさを左右し得る他の規則としては、限定はされないが、(i)アンチセンス鎖の5’末端におけるA/U;(ii)センス鎖の5’末端におけるG/C;(iii)アンチセンス鎖の5’端側3分の1にある少なくとも5個のA/U残基;および(iv)9ヌクレオチド長より長いいかなるGCストレッチも存在しないことが挙げられる。標的遺伝子の具体的な配列と合わせて、かかる考慮点に従い、哺乳類標的遺伝子発現の抑制に不可欠な極めて有効なsiRNA分子を容易に設計し得る。
本発明によれば、HTT遺伝子を標的とするsiRNA分子(例えば、siRNA二重鎖またはコード化dsRNA)が設計される。かかるsiRNA分子は、特異的にHTT遺伝子発現およびタンパク質産生を抑制することができる。一部の態様において、siRNA分子は、細胞のHTT遺伝子変異体、すなわちHD疾患を有する患者に同定される突然変異型HTT転写物を選択的に「ノックアウト」するように設計および使用される。一部の態様において、siRNA分子は、細胞のHTT遺伝子変異体を選択的に「ノックダウン」するように設計および使用される。他の態様において、siRNA分子は、野生型および突然変異型の両方のHTT遺伝子を阻害または抑制することが可能である。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子は、両方の鎖が共にハイブリダイズして二重鎖構造を形成するセンス鎖と相補的アンチセンス鎖とを含む。アンチセンス鎖は標的特異的RNAiを導くのに十分な、HTT mRNA配列との相補性を有し、すなわちsiRNA分子は、RNAi機構または過程による標的mRNAの破壊を惹起するのに十分な配列を有する。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子は、両方の鎖が共にハイブリダイズして二重鎖構造を形成するセンス鎖と相補的アンチセンス鎖とを含み、ここでHTT mRNAとのハイブリダイゼーションの開始部位は、HTT mRNA配列上のヌクレオチド100〜7000にある。非限定的な例として、開始部位は、HTT mRNA配列上のヌクレオチド100〜150、150〜200、200〜250、250〜300、300〜350、350〜400、400〜450、450〜500、500〜550、550〜600、600〜650、650〜700、700〜70、750〜800、800〜850、850〜900、900〜950、950〜1000、1000〜1050、1050〜1100、1100〜1150、1150〜1200、1200〜1250、1250〜1300、1300〜1350、1350〜1400、1400〜1450、1450〜1500、1500〜1550、1550〜1600、1600〜1650、1650〜1700、1700〜1750、1750〜1800、1800〜1850、1850〜1900、1900〜1950、1950〜2000、2000〜2050、2050〜2100、2100〜2150、2150〜2200、2200〜2250、2250〜2300、2300〜2350、2350〜2400、2400〜2450、2450〜2500、2500〜2550、2550〜2600、2600〜2650、2650〜2700、2700〜2750、2750〜2800、2800〜2850、2850〜2900、2900〜2950、2950〜3000、3000〜3050、3050〜3100、3100〜3150、3150〜3200、3200〜3250、3250〜3300、3300〜3350、3350〜3400、3400〜3450、3450〜3500、3500〜3550、3550〜3600、3600〜3650、3650〜3700、3700〜3750、3750〜3800、3800〜3850、3850〜3900、3900〜3950、3950〜4000、4000〜4050、4050〜4100、4100〜4150、4150〜4200、4200〜4250、4250〜4300、4300〜4350、4350〜4400、4400〜4450、4450〜4500、4500〜4550、4550〜4600、4600〜4650、4650〜4700、4700〜4750、4750〜4800、4800〜4850、4850〜4900、4900〜4950、4950〜5000、5000〜5050、5050〜5100、5100〜5150、5150〜5200、5200〜5250、5250〜5300、5300〜5350、5350〜5400、5400〜5450、5450〜5500、5500〜5550、5550〜5600、5600〜5650、5650〜5700、5700〜5750、5750〜5800、5800〜5850、5850〜5900、5900〜5950、5950〜6000、6000〜6050、6050〜6100、6100〜6150、6150〜6200、6200〜6250、6250〜6300、6300〜6350、6350〜6400、6400〜6450、6450〜6500、6500〜6550、6550〜6600、6600〜6650、6650〜6700、6700〜6750、6750〜6800、6800〜6850、6850〜6900、6900〜6950、6950〜7000、7000〜7050、7050〜7100、7100〜7150、7150〜7200、7200〜7250、7250〜7300、7300〜7350、7350〜7400、7400〜7450、7450〜7500、7500〜7550、7550〜7600、7600〜7650、7650〜7700、7700〜7750、7750〜7800、7800〜7850、7850〜7900、7900〜7950、7950〜8000、8000〜8050、8050〜8100、8100〜8150、8150〜8200、8200〜8250、8250〜8300、8300〜8350、8350〜8400、8400〜8450、8450〜8500、8500〜8550、8550〜8600、8600〜8650、8650〜8700、8700〜8750、8750〜8800、8800〜8850、8850〜8900、8900〜8950、8950〜9000、9000〜9050、9050〜9100、9100〜9150、9150〜9200、9200〜9250、9250〜9300、9300〜9350、9350〜9400、9400〜9450、9450〜9500、9500〜9550、9550〜9600、9600〜9650、9650〜9700、9700〜9750、9750〜9800、9800〜9850、9850〜9900、9900〜9950、9950〜10000、10000〜10050、10050〜10100、10100〜10150、10150〜10200、10200〜10250、10250〜10300、10300〜10350、10350〜10400、10400〜10450、10450〜10500、10500〜10550、10550〜10600、10600〜10650、10650〜10700、10700〜10750、10750〜10800、10800〜10850、10850〜10900、10900〜10950、10950〜11000、11050〜11100、11100〜11150、11150〜11200、11200〜11250、11250〜11300、11300〜11350、11350〜11400、11400〜11450、11450〜11500、11500〜11550、11550〜11600、11600〜11650、11650〜11700、11700〜11750、11750〜11800、11800〜11850、11850〜11900、11900〜11950、11950〜12000、12000〜12050、12050〜12100、12100〜12150、12150〜12200、12200〜12250、12250〜12300、12300〜12350、12350〜12400、12400〜12450、12450〜12500、12500〜12550、12550〜12600、12600〜12650、12650〜12700、12700〜12750、12750〜12800、12800〜12850、12850〜12900、12900〜12950、12950〜13000、13050〜13100、13100〜13150、13150〜13200、13200〜13250、13250〜13300、13300〜13350、13350〜13400、13400〜13450、および13450〜13500にあってもよい。更に別の非限定的な例として、開始部位は、HTT mRNA配列上のヌクレオチド315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、595、596、597、598、599、600、601、602、603、604、605、606、607、608、609、610、611、612、613、614、615、616、617、618、619、620、621、622、623、624、625、715、716、717、718、719、720、721、722、723、724、725、875、876、877、878、879、880、881、882、883、884、885、886、887、888、889、890、891、892、893、894、895、896、897、898、899、900、1375、1376、1377、1378、1379、1380、1381、1382、1383、1384、1385、1386、1387、1388、1389、1390、1391、1392、1393、1394、1395、1396、1397、1398、1399、1400、1401、1402、1403、1404、1405、1406、1407、1408、1409、1410、1411、1412、1413、1414、1415、1416、1417、1418、1419、1420、1421、1422、1423、1424、1425、1426、1427、1428、1429、1430、1431、1432、1433、1434、1435、1436、1437、1438、1439、1440、1441、1442、1443、1444、1445、1446、1447、1448、1449、1450、1660、1661、1662、1663、1664、1665、1666、1667、1668、1669、1670、1671、1672、1673、1674、1675、2050、2051、2052、2053、2054、2055、2056、2057、2058、2059、2060、2061、2062、2063、2064、2065、2066、2067、2068、2069、2070、2071、2072、2073、2074、2075、2076、2077、2078、2079、2080、2081、2082、2083、2084、2085、2086、2087、2088、2089、2090、2091、2092、2093、2094、2095、2096、2097、2098、2099、2100、2580、2581、2582、2583、2584、2585、2586、2587、2588、2589、2590、2591、2592、2593、2594、2595、2596、2597、2598、2599、2600、2601、2602、2603、2604、2605、4525、4526、4527、4528、4529、4530、4531、4532、4533、4534、4535、4536、4537、4538、4539、4540、4541、4542、4543、4544、4545、4546、4547、4548、4549、4550、4575、4576、4577、4578、4579、4580、4581、4582、4583、4584、4585、4586、4587、4588、4589、4590、4591、4592、4593、4594、4595、4596、4597、4598、4599、4600、4850、4851、4852、4853、4854、4855、4856、4857、4858、4859、4860、4861、4862、4863、4864、4865、4866、4867、4868、4869、4870、4871、4872、4873、4874、4875、4876、4877、4878、4879、4880、4881、4882、4883、4884、4885、4886、4887、4888、4889、4890、4891、4892、4893、4894、4895、4896、4897、4898、4899、4900、5460、5461、5462、5463、5464、5465、5466、5467、5468、5469、5470、5471、5472、5473、5474、5475、5476、5477、5478、5479、5480、6175、6176、6177、6178、6179、6180、6181、6182、6183、6184、6185、6186、6187、6188、6189、6190、6191、6192、6193、6194、6195、6196、6197、6198、6199、6200、6315、6316、6317、6318、6319、6320、6321、6322、6323、6324、6325、6326、6327、6328、6329、6330、6331、6332、6333、6334、6335、6336、6337、6338、6339、6340、6341、6
342、6343、6344、6345、6600、6601、6602、6603、6604、6605、6606、6607、6608、6609、6610、6611、6612、6613、6614、6615、6725、6726、6727、6728、6729、6730、6731、6732、6733、6734、6735、6736、6737、6738、6739、6740、6741、6742、6743、6744、6745、6746、6747、6748、6749、6750、6751、6752、6753、6754、6755、6756、6757、6758、6759、6760、6761、6762、6763、6764、6765、6766、6767、6768、6769、6770、6771、6772、6773、6774、6775、7655、7656、7657、7658、7659、7660、7661、7662、7663、7664、7665、7666、7667、7668、7669、7670、7671、7672、8510、8511、8512、8513、8514、8515、8516、8715、8716、8717、8718、8719、8720、8721、8722、8723、8724、8725、8726、8727、8728、8729、8730、8731、8732、8733、8734、8735、8736、8737、8738、8739、8740、8741、8742、8743、8744、8745、9250、9251、9252、9253、9254、9255、9256、9257、9258、9259、9260、9261、9262、9263、9264、9265、9266、9267、9268、9269、9270、9480、9481、9482、9483、9484、9485、9486、9487、9488、9489、9490、9491、9492、9493、9494、9495、9496、9497、9498、9499、9500、9575、9576、9577、9578、9579、9580、9581、9582、9583、9584、9585、9586、9587、9588、9589、9590、10525、10526、10527、10528、10529、10530、10531、10532、10533、10534、10535、10536、10537、10538、10539、10540、11545、11546、11547、11548、11549、11550、11551、11552、11553、11554、11555、11556、11557、11558、11559、11560、11875、11876、11877、11878、11879、11880、11881、11882、11883、11884、11885、11886、11887、11888、11889、11890、11891、11892、11893、11894、11895、11896、11897、11898、11899、11900、11915、11916、11917、11918、11919、11920、11921、11922、11923、11924、11925、11926、11927、11928、11929、11930、11931、11932、11933、11934、11935、11936、11937、11938、11939、11940、13375、13376、13377、13378、13379、13380、13381、13382、13383、13384、13385、13386、13387、13388、13389および13390であってもよい。
一部の実施形態において、アンチセンス鎖と標的mRNA配列とは100%の相補性を有する。アンチセンス鎖は標的mRNA配列の任意の一部と相補的であってもよい。
他の実施形態において、アンチセンス鎖と標的mRNA配列とは少なくとも1つのミスマッチを含む。非限定的な例として、アンチセンス鎖と標的mRNA配列とは、少なくとも30%、40%、50%、60%、70%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜99%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜99%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜99%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜99%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜99%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜99%、80〜90%、80〜95%、80〜99%、90〜95%、90〜99%または95〜99%の相補性を有する。
一実施形態において、siRNAまたはdsRNAは、互いに相補的な少なくとも2つの配列を含む。
本発明によれば、siRNA分子は長さが約10〜50ヌクレオチドまたはそれ以上であり、すなわち、各鎖が10〜50ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)を含む。好ましくは、siRNA分子は長さが各鎖約15〜30、例えば、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、または30ヌクレオチドであり、ここで鎖の一方は標的領域と十分に相補的である。一実施形態において、siRNA分子の各鎖は、約19〜25、19〜24または19〜21ヌクレオチドの長さを有する。一実施形態において、siRNA分子の少なくとも一方の鎖は、19ヌクレオチド長である。一実施形態において、siRNA分子の少なくとも一方の鎖は、20ヌクレオチド長である。一実施形態において、siRNA分子の少なくとも一方の鎖は、21ヌクレオチド長である。一実施形態において、siRNA分子の少なくとも一方の鎖は、22ヌクレオチド長である。一実施形態において、siRNA分子の少なくとも一方の鎖は、23ヌクレオチド長である。一実施形態において、siRNA分子の少なくとも一方の鎖は、24ヌクレオチド長である。一実施形態において、siRNA分子の少なくとも一方の鎖は、25ヌクレオチド長である。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子は、約19ヌクレオチド〜約25ヌクレオチド、および3’末端に2オーバハングヌクレオチドを含む合成RNA二重鎖であり得る。一部の態様において、siRNA分子は非修飾RNA分子であってもよい。他の態様において、siRNA分子は、塩基、糖または骨格修飾などの少なくとも1つの修飾ヌクレオチドを含有し得る。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子は、限定はされないが、表2のアンチセンス(ガイド)配列またはそれらの断片もしくは変異体などのヌクレオチド配列を含み得る。非限定的な例として、本発明のsiRNA分子に使用されるアンチセンス配列は、表2のヌクレオチド配列の少なくとも30%、40%、50%、60%、70%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜99%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜99%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜99%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜99%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜99%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜99%、80〜90%、80〜95%、80〜99%、90〜95%、90〜99%または95〜99%である。別の非限定的な例として、本発明のsiRNA分子に使用されるアンチセンス配列は、表2のヌクレオチド配列の少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21または21超の連続ヌクレオチドを含む。更に別の非限定的な例として、本発明のsiRNA分子に使用されるアンチセンス配列は、表2の配列のヌクレオチド1〜22、1〜21、1〜20、1〜19、1〜18、1〜17、1〜16、1〜15、1〜14、1〜13、1〜12、1〜11、1〜10、1〜9、1〜8、2〜22、2〜21、2〜20、2〜19、2〜18、2〜17、2〜16、2〜15、2〜14、2〜13、2〜12、2〜11、2〜10、2〜9、2〜8、3〜22、3〜21、3〜20、3〜19、3〜18、3〜17、3〜16、3〜15、3〜14、3〜13、3〜12、3〜11、3〜10、3〜9、3〜8、4〜22、4〜21、4〜20、4〜19、4〜18、4〜17、4〜16、4〜15、4〜14、4〜13、4〜12、4〜11、4〜10、4〜9、4〜8、5〜22、5〜21、5〜20、5〜19、5〜18、5〜17、5〜16、5〜15、5〜14、5〜13、5〜12、5〜11、5〜10、5〜9、5〜8、6〜22、6〜21、6〜20、6〜19、6〜18、6〜17、6〜16、6〜15、6〜14、6〜13、6〜12、6〜11、6〜10、7〜22、7〜21、7〜20、7〜19、7〜18、7〜17、7〜16、7〜15、7〜14、7〜13、7〜12、8〜22、8〜21、8〜20、8〜19、8〜18、8〜17、8〜16、8〜15、8〜14、8〜13、8〜12、9〜22、9〜21、9〜20、9〜19、9〜18、9〜17、9〜16、9〜15、9〜14、10〜22、10〜21、10〜20、10〜19、10〜18、10〜17、10〜16、10〜15、10〜14、11〜22、11〜21、11〜20、11〜19、11〜18、11〜17、11〜16、11〜15、11〜14、12〜22、12〜21、12〜20、12〜19、12〜18、12〜17、12〜16、13〜22、13〜21、13〜20、13〜19、13〜18、13〜17、13〜16、14〜22、14〜21、14〜20、14〜19、14〜18、14〜17、15〜22、15〜21、15〜20、15〜19、15〜18、16〜22、16〜21、16〜20、17〜22、17〜21、または18〜22を含む。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子は、限定はされないが、表3のセンス(パッセンジャー)配列またはそれらの断片もしくは変異体などのヌクレオチド配列を含み得る。非限定的な例として、本発明のsiRNA分子に使用されるセンス配列は、表3のヌクレオチド配列の少なくとも30%、40%、50%、60%、70%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜99%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜99%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜99%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜99%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜99%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜99%、80〜90%、80〜95%、80〜99%、90〜95%、90〜99%または95〜99%である。別の非限定的な例として、本発明のsiRNA分子に使用されるセンス配列は、表3のヌクレオチド配列の少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21または21超の連続ヌクレオチドを含む。更に別の非限定的な例として、本発明のsiRNA分子に使用されるセンス配列は、表3の配列のヌクレオチド1〜22、1〜21、1〜20、1〜19、1〜18、1〜17、1〜16、1〜15、1〜14、1〜13、1〜12、1〜11、1〜10、1〜9、1〜8、2〜22、2〜21、2〜20、2〜19、2〜18、2〜17、2〜16、2〜15、2〜14、2〜13、2〜12、2〜11、2〜10、2〜9、2〜8、3〜22、3〜21、3〜20、3〜19、3〜18、3〜17、3〜16、3〜15、3〜14、3〜13、3〜12、3〜11、3〜10、3〜9、3〜8、4〜22、4〜21、4〜20、4〜19、4〜18、4〜17、4〜16、4〜15、4〜14、4〜13、4〜12、4〜11、4〜10、4〜9、4〜8、5〜22、5〜21、5〜20、5〜19、5〜18、5〜17、5〜16、5〜15、5〜14、5〜13、5〜12、5〜11、5〜10、5〜9、5〜8、6〜22、6〜21、6〜20、6〜19、6〜18、6〜17、6〜16、6〜15、6〜14、6〜13、6〜12、6〜11、6〜10、7〜22、7〜21、7〜20、7〜19、7〜18、7〜17、7〜16、7〜15、7〜14、7〜13、7〜12、8〜22、8〜21、8〜20、8〜19、8〜18、8〜17、8〜16、8〜15、8〜14、8〜13、8〜12、9〜22、9〜21、9〜20、9〜19、9〜18、9〜17、9〜16、9〜15、9〜14、10〜22、10〜21、10〜20、10〜19、10〜18、10〜17、10〜16、10〜15、10〜14、11〜22、11〜21、11〜20、11〜19、11〜18、11〜17、11〜16、11〜15、11〜14、12〜22、12〜21、12〜20、12〜19、12〜18、12〜17、12〜16、13〜22、13〜21、13〜20、13〜19、13〜18、13〜17、13〜16、14〜22、14〜21、14〜20、14〜19、14〜18、14〜17、15〜22、15〜21、15〜20、15〜19、15〜18、16〜22、16〜21、16〜20、17〜22、17〜21、または18〜22を含む。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子は、表2からのアンチセンス配列および表3からのセンス配列、またはそれらの断片もしくは変異体を含み得る。非限定的な例として、アンチセンス配列およびセンス配列は、少なくとも30%、40%、50%、60%、70%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜99%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜99%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜99%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜99%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜99%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜99%、80〜90%、80〜95%、80〜99%、90〜95%、90〜99%または95〜99%の相補性を有する。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子は、表4〜表6に記載されるとおりのセンスおよびアンチセンスsiRNA二重鎖を含み得る。非限定的な例として、これらのsiRNA二重鎖は、内因性HTT遺伝子発現に対するインビトロ阻害活性に関して試験されてもよい。センス配列およびアンチセンス配列の開始部位は、NCBIのNM_002111.7(配列番号1425)として公知であるHTT遺伝子配列と比較される。
他の実施形態において、本発明のsiRNA分子は、細胞への送達用のプラスミドベクター、AAV粒子、ウイルスゲノムまたは他の核酸発現ベクターにコードすることができる。
DNA発現プラスミドを使用して、本発明のsiRNA二重鎖またはdsRNAを細胞内で安定的に発現させ、標的遺伝子発現の長期阻害を実現することができる。一態様において、siRNA二重鎖のセンス鎖とアンチセンス鎖とは、典型的には、短いスペーサ配列によって連結され、低分子ヘアピンRNA(shRNA)と呼ばれるステム−ループ構造の発現をもたらす。ヘアピンはダイサーによって認識および切断され、そのようにして成熟siRNA分子が生じる。
本発明によれば、HTT mRNAを標的とするsiRNA分子をコードする核酸を含むAAV粒子が産生され、AAV血清型は、表1に挙げられる血清型のいずれであってもよい。AAV血清型の非限定的な例としては、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV9.47、AAV9(hu14)、AAV10、AAV11、AAV12、AAVrh8、AAVrh10、AAV−DJ8、AAV−DJ、AAV−PHP.A、および/またはAAV−PHP.B、およびこれらのバリアントが挙げられる。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、標的mRNA(例えば、HTT)を抑制(または分解)する。したがって、本siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して、細胞、例えばニューロンにおけるHTT遺伝子発現を実質的に阻害することができる。一部の態様において、HTT遺伝子発現の阻害とは、少なくとも約20%、好ましくは少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%の阻害を指す。したがって、標的遺伝子のタンパク質産物は、少なくとも約20%、好ましくは少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%阻害され得る。
本発明によれば、siRNA分子は、培養細胞でのHTT mRNAレベルを低下させるように設計され、それらの能力に関して試験される。かかるsiRNA分子は、限定はされないが、表4、表5または表6に挙げられるものを含め、二重鎖を形成し得る。非限定的な例として、siRNA二重鎖はsiRNA二重鎖ID:D−3500〜D−3570であってもよい。
一実施形態において、siRNA分子は、ガイド鎖に位置する標的(例えば、HTT)に対するmiRNAシードマッチを含む。別の実施形態において、siRNA分子は、パッセンジャー鎖に位置する標的(例えば、HTT)に対するmiRNAシードマッチを含む。更に別の実施形態において、HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、ガイド鎖またはパッセンジャー鎖に位置する標的(例えば、HTT)に対するシードマッチを含まない。
一実施形態において、HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、ガイド鎖について有意な完全長オフターゲット効果をほぼ有しないものであり得る。別の実施形態において、HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、パッセンジャー鎖について有意な完全長オフターゲット効果をほぼ有しないものであり得る。HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、パッセンジャー鎖について1%未満、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、1〜5%、2〜6%、3〜7%、4〜8%、5〜9%、5〜10%、6〜10%、5〜15%、5〜20%、5〜25%、5〜30%、10〜20%、10〜30%、10〜40%、10〜50%、15〜30%、15〜40%、15〜45%、20〜40%、20〜50%、25〜50%、30〜40%、30〜50%、35〜50%、40〜50%、45〜50%の完全長オフターゲット効果を有し得る。更に別の実施形態において、HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、ガイド鎖またはパッセンジャー鎖について有意な完全長オフターゲット効果をほぼ有しないものであり得る。HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、ガイド鎖またはパッセンジャー鎖について1%未満、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、1〜5%、2〜6%、3〜7%、4〜8%、5〜9%、5〜10%、6〜10%、5〜15%、5〜20%、5〜25%、5〜30%、10〜20%、10〜30%、10〜40%、10〜50%、15〜30%、15〜40%、15〜45%、20〜40%、20〜50%、25〜50%、30〜40%、30〜50%、35〜50%、40〜50%、45〜50%の完全長オフターゲット効果を有し得る。
一実施形態において、HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAはインビトロで高い活性を有し得る。別の実施形態において、siRNA分子はインビトロで低い活性を有し得る。更に別の実施形態において、HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはdsRNAはインビトロで高いガイド鎖活性および低いパッセンジャー鎖活性を有し得る。
一実施形態において、siRNA分子はインビトロで高いガイド鎖活性および低いパッセンジャー鎖活性を有する。ガイド鎖による標的ノックダウン(KD)は少なくとも40%、50%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%、99.5%または100%であり得る。ガイド鎖による標的ノックダウンは40〜50%、45〜50%、50〜55%、50〜60%、60〜65%、60〜70%、60〜75%、60〜80%、60〜85%、60〜90%、60〜95%、60〜99%、60〜99.5%、60〜100%、65〜70%、65〜75%、65〜80%、65〜85%、65〜90%、65〜95%、65〜99%、65〜99.5%、65〜100%、70〜75%、70〜80%、70〜85%、70〜90%、70〜95%、70〜99%、70〜99.5%、70〜100%、75〜80%、75〜85%、75〜90%、75〜95%、75〜99%、75〜99.5%、75〜100%、80〜85%、80〜90%、80〜95%、80〜99%、80〜99.5%、80〜100%、85〜90%、85〜95%、85〜99%、85〜99.5%、85〜100%、90〜95%、90〜99%、90〜99.5%、90〜100%、95〜99%、95〜99.5%、95〜100%、99〜99.5%、99〜100%または99.5〜100%であり得る。非限定的な例として、ガイド鎖による標的ノックダウン(KD)は70%より高い。非限定的な例として、ガイド鎖による標的ノックダウン(KD)は60%より高い。
一実施形態において、siRNA二重鎖は、センス配列またはアンチセンス配列について、非Htt配列に対するmiRNAシードマッチがないように設計される。
一実施形態において、最も近いオフターゲットに対するガイド鎖のIC50は、オンターゲット遺伝子である、Httに対するガイド鎖のIC50の100倍よりも高い。非限定的な例として、最も近いオフターゲットに対するガイド鎖のIC50が標的に対するガイド鎖のIC50の100倍よりも高い場合、そのsiRNA分子は、インビトロでのHttの阻害に高いガイド鎖選択性を有すると言われる。
一実施形態において、ガイド鎖の5’プロセシングは、インビトロまたはインビボで少なくとも75%、80%、85%、90%、95%、99%または100%の確率で5’末端に正しい開始(n)を有する。非限定的な例として、ガイド鎖の5’プロセシングは正確であり、インビトロで少なくとも99%の確率で5’末端に正しい開始(n)を有する。非限定的な例として、ガイド鎖の5’プロセシングは正確であり、インビボで少なくとも99%の確率で5’末端に正しい開始(n)を有する。非限定的な例として、ガイド鎖の5’プロセシングは正確であり、インビトロで少なくとも90%の確率で5’末端に正しい開始(n)を有する。非限定的な例として、ガイド鎖の5’プロセシングは正確であり、インビボで少なくとも90%の確率で5’末端に正しい開始(n)を有する。非限定的な例として、ガイド鎖の5’プロセシングは正確であり、インビトロで少なくとも85%の確率で5’末端に正しい開始(n)を有する。非限定的な例として、ガイド鎖の5’プロセシングは正確であり、インビボで少なくとも85%の確率で5’末端に正しい開始(n)を有する。
一実施形態において、ガイド鎖対パッセンジャー鎖(G:P)(アンチセンス鎖対センス鎖とも称される)の発現比は、インビトロまたはインビボで1:10、1:9、1:8、1:7、1:6、1:5、1:4、1:3、1:2、1;1、2:10、2:9、2:8、2:7、2:6、2:5、2:4、2:3、2:2、2:1、3:10、3:9、3:8、3:7、3:6、3:5、3:4、3:3、3:2、3:1、4:10、4:9、4:8、4:7、4:6、4:5、4:4、4:3、4:2、4:1、5:10、5:9、5:8、5:7、5:6、5:5、5:4、5:3、5:2、5:1、6:10、6:9、6:8、6:7、6:6、6:5、6:4、6:3、6:2、6:1、7:10、7:9、7:8、7:7、7:6、7:5、7:4、7:3、7:2、7:1、8:10、8:9、8:8、8:7、8:6、8:5、8:4、8:3、8:2、8:1、9:10、9:9、9:8、9:7、9:6、9:5、9:4、9:3、9:2、9:1、10:10、10:9、10:8、10:7、10:6、10:5、10:4、10:3、10:2、10:1、1:99、5:95、10:90、15:85、20:80、25:75、30:70、35:65、40:60、45:55、50:50、55:45、60:40、65:35、70:30、75:25、80:20、85:15、90:10、95:5、または99:1である。ガイド対パッセンジャー比とは、pri−microRNAの細胞内プロセシング後のガイド鎖対パッセンジャー鎖の比を指す。例えば、80:20のガイド対パッセンジャー比であれば、前駆体からプロセシングされるパッセンジャー鎖2つにつき8つのガイド鎖を有し得る。非限定的な例として、ガイド鎖対パッセンジャー鎖比はインビトロで8:2である。非限定的な例として、ガイド鎖対パッセンジャー鎖比はインビボで8:2である。非限定的な例として、ガイド鎖対パッセンジャー鎖比はインビトロで9:1である。非限定的な例として、ガイド鎖対パッセンジャー鎖比はインビボで9:1である。
一実施形態において、ガイド鎖対パッセンジャー鎖(G:P)(アンチセンス鎖対センス鎖とも称される)の発現比は1より大きい。
一実施形態において、ガイド鎖対パッセンジャー鎖(G:P)(アンチセンス鎖対センス鎖とも称される)の発現比は2より大きい。
一実施形態において、ガイド鎖対パッセンジャー鎖(G:P)(アンチセンス鎖対センス鎖とも称される)の発現比は5より大きい。
一実施形態において、ガイド鎖対パッセンジャー鎖(G:P)(アンチセンス鎖対センス鎖とも称される)の発現比は10より大きい。
一実施形態において、ガイド鎖対パッセンジャー鎖(G:P)(アンチセンス鎖対センス鎖とも称される)の発現比は20より大きい。
一実施形態において、ガイド鎖対パッセンジャー鎖(G:P)(アンチセンス鎖対センス鎖とも称される)の発現比は50より大きい。
一実施形態において、ガイド鎖対パッセンジャー鎖(G:P)(アンチセンス鎖対センス鎖とも称される)の発現比は少なくとも3:1である。
一実施形態において、ガイド鎖対パッセンジャー鎖(G:P)(アンチセンス鎖対センス鎖とも称される)の発現比は少なくとも5:1である。
一実施形態において、ガイド鎖対パッセンジャー鎖(G:P)(アンチセンス鎖対センス鎖とも称される)の発現比は少なくとも10:1である。
一実施形態において、ガイド鎖対パッセンジャー鎖(G:P)(アンチセンス鎖対センス鎖とも称される)の発現比は少なくとも20:1である。
一実施形態において、ガイド鎖対パッセンジャー鎖(G:P)(アンチセンス鎖対センス鎖とも称される)の発現比は少なくとも50:1である。
一実施形態において、パッセンジャー鎖対ガイド鎖(P:G)(センス鎖対アンチセンス鎖とも称される)の発現比は、インビトロまたはインビボで1:10、1:9、1:8、1:7、1:6、1:5、1:4、1:3、1:2、1;1、2:10、2:9、2:8、2:7、2:6、2:5、2:4、2:3、2:2、2:1、3:10、3:9、3:8、3:7、3:6、3:5、3:4、3:3、3:2、3:1、4:10、4:9、4:8、4:7、4:6、4:5、4:4、4:3、4:2、4:1、5:10、5:9、5:8、5:7、5:6、5:5、5:4、5:3、5:2、5:1、6:10、6:9、6:8、6:7、6:6、6:5、6:4、6:3、6:2、6:1、7:10、7:9、7:8、7:7、7:6、7:5、7:4、7:3、7:2、7:1、8:10、8:9、8:8、8:7、8:6、8:5、8:4、8:3、8:2、8:1、9:10、9:9、9:8、9:7、9:6、9:5、9:4、9:3、9:2、9:1、10:10、10:9、10:8、10:7、10:6、10:5、10:4、10:3、10:2、10:1、1:99、5:95、10:90、15:85、20:80、25:75、30:70、35:65、40:60、45:55、50:50、55:45、60:40、65:35、70:30、75:25、80:20、85:15、90:10、95:5、または99:1である。パッセンジャー対ガイド比とは、pri−microRNAの細胞内プロセシング後の、ガイド鎖に対するパッセンジャー鎖の比を指す。例えば、80:20のパッセンジャー対ガイド比であれば、前駆体からプロセシングされるガイド鎖2つにつき8つのパッセンジャー鎖を有し得る。非限定的な例として、パッセンジャー鎖対ガイド鎖比はインビトロで80:20である。非限定的な例として、パッセンジャー鎖対ガイド鎖比はインビボで80:20である。非限定的な例として、パッセンジャー鎖対ガイド鎖比はインビトロで8:2である。非限定的な例として、パッセンジャー鎖対ガイド鎖比はインビボで8:2である。非限定的な例として、パッセンジャー鎖対ガイド鎖比はインビトロで9:1である。非限定的な例として、パッセンジャー鎖対ガイド鎖比はインビボで9:1である。
一実施形態において、パッセンジャー鎖対ガイド鎖(P:G)(センス鎖対アンチセンス鎖とも称される)の発現比は1より大きい。
一実施形態において、パッセンジャー鎖対ガイド鎖(P:G)(センス鎖対アンチセンス鎖とも称される)の発現比は2より大きい。
一実施形態において、パッセンジャー鎖対ガイド鎖(P:G)(センス鎖対アンチセンス鎖とも称される)の発現比は5より大きい。
一実施形態において、パッセンジャー鎖対ガイド鎖(P:G)(センス鎖対アンチセンス鎖とも称される)の発現比は10より大きい。
一実施形態において、パッセンジャー鎖対ガイド鎖(P:G)(センス鎖対アンチセンス鎖とも称される)の発現比は20より大きい。
一実施形態において、パッセンジャー鎖対ガイド鎖(P:G)(センス鎖対アンチセンス鎖とも称される)の発現比は50より大きい。
一実施形態において、パッセンジャー鎖対ガイド鎖(P:G)(センス鎖対アンチセンス鎖とも称される)の発現比は少なくとも3:1である。
一実施形態において、パッセンジャー鎖対ガイド鎖(P:G)(センス鎖対アンチセンス鎖とも称される)の発現比は少なくとも5:1である。
一実施形態において、パッセンジャー鎖対ガイド鎖(P:G)(センス鎖対アンチセンス鎖とも称される)の発現比は少なくとも10:1である。
一実施形態において、パッセンジャー鎖対ガイド鎖(P:G)(センス鎖対アンチセンス鎖とも称される)の発現比は少なくとも20:1である。
一実施形態において、パッセンジャー鎖対ガイド鎖(P:G)(センス鎖対アンチセンス鎖とも称される)の発現比は少なくとも50:1である。
一実施形態において、パッセンジャー鎖−ガイド鎖二重鎖は、pri−microまたはpre−microRNAが、しかし当該技術分野において公知のおよび本明細書に記載される方法、プロセシングを測定したとき2倍より高いガイド鎖対パッセンジャー鎖比を示す場合に有効と見なされる。非限定的な例として、pri−microまたはpre−microRNAは、プロセシングを測定したとき、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、11倍、12倍、13倍、14倍、15倍より高い、または2〜5倍、2〜10倍、2〜15倍、3〜5倍、3〜10倍、3〜15倍、4〜5倍、4〜10倍、4〜15倍、5〜10倍、5〜15倍、6〜10倍、6〜15倍、7〜10倍、7〜15倍、8〜10倍、8〜15倍、9〜10倍、9〜15倍、10〜15倍、11〜15倍、12〜15倍、13〜15倍、または14〜15倍のガイド鎖対パッセンジャー鎖比を示す。
一実施形態において、dsRNAをコードするベクターゲノムは、コンストラクトの完全長の少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%または99%超である配列を含む。非限定的な例として、ベクターゲノムは、コンストラクトの完全長配列の少なくとも80%である配列を含む。
一実施形態では、siRNA分子を使用して、htt配列上の少なくとも1つのエクソンを標的とすることにより野生型または突然変異HTTがサイレンシングされ得る。エクソンは、エクソン1、エクソン2、エクソン3、エクソン4、エクソン5、エクソン6、エクソン7、エクソン8、エクソン9、エクソン10、エクソン11、エクソン12、エクソン13、エクソン14、エクソン15、エクソン16、エクソン17、エクソン18、エクソン19、エクソン20、エクソン21、エクソン22、エクソン23、エクソン24、エクソン25、エクソン26、エクソン27、エクソン28、エクソン29、エクソン30、エクソン31、エクソン32、エクソン33、エクソン34、エクソン35、エクソン36、エクソン37、エクソン38、エクソン39、エクソン40、エクソン41、エクソン42、エクソン43、エクソン44、エクソン45、エクソン46、エクソン47、エクソン48、エクソン49、エクソン50、エクソン51、エクソン52、エクソン53、エクソン54、エクソン55、エクソン56、エクソン57、エクソン58、エクソン59、エクソン60、エクソン61、エクソン62、エクソン63、エクソン64、エクソン65、エクソン66、および/またはエクソン67であってもよい。非限定的な例として、siRNA分子を使用して、エクソン1を標的とすることにより野生型または突然変異HTTがサイレンシングされ得る。別の非限定的な例として、siRNA分子を使用して、エクソン1以外のエクソンを標的とすることにより野生型または突然変異HTTがサイレンシングされ得る。別の非限定的な例として、siRNA分子を使用して、エクソン50を標的とすることにより野生型または突然変異HTTがサイレンシングされ得る。別の非限定的な例として、siRNA分子を使用して、エクソン67を標的とすることにより野生型または突然変異HTTがサイレンシングされ得る。
一実施形態では、siRNA分子を使用して、htt配列上の少なくとも1つのエクソンを標的とすることにより野生型および/または突然変異HTTがサイレンシングされ得る。エクソンは、エクソン1、エクソン2、エクソン3、エクソン4、エクソン5、エクソン6、エクソン7、エクソン8、エクソン9、エクソン10、エクソン11、エクソン12、エクソン13、エクソン14、エクソン15、エクソン16、エクソン17、エクソン18、エクソン19、エクソン20、エクソン21、エクソン22、エクソン23、エクソン24、エクソン25、エクソン26、エクソン27、エクソン28、エクソン29、エクソン30、エクソン31、エクソン32、エクソン33、エクソン34、エクソン35、エクソン36、エクソン37、エクソン38、エクソン39、エクソン40、エクソン41、エクソン42、エクソン43、エクソン44、エクソン45、エクソン46、エクソン47、エクソン48、エクソン49、エクソン50、エクソン51、エクソン52、エクソン53、エクソン54、エクソン55、エクソン56、エクソン57、エクソン58、エクソン59、エクソン60、エクソン61、エクソン62、エクソン63、エクソン64、エクソン65、エクソン66、および/またはエクソン67であってもよい。非限定的な例として、siRNA分子を使用して、エクソン1を標的とすることにより野生型および/または突然変異HTTがサイレンシングされ得る。別の非限定的な例として、siRNA分子を使用して、エクソン1以外のエクソンを標的とすることにより野生型および/または突然変異HTTがサイレンシングされ得る。別の非限定的な例として、siRNA分子を使用して、エクソン50を標的とすることにより野生型および/または突然変異HTTがサイレンシングされ得る。別の非限定的な例として、siRNA分子を使用して、エクソン67を標的とすることにより野生型および/または突然変異HTTがサイレンシングされ得る。
siRNA修飾
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子は、前駆体またはDNAとして送達されるのでない場合、限定はされないがインビボでのsiRNAの安定性の増加など、RNA分子の幾つかの特徴を調節するように化学的に修飾されてもよい。化学的に修飾されたsiRNA分子はヒトの治療適用において使用することができ、siRNA分子のRNAi活性を損なうことなく改良される。非限定的な例として、センス鎖およびアンチセンス鎖の両方の3’末端および5’末端の両方で修飾されたsiRNA分子。
一部の態様において、本発明のsiRNA二重鎖は、限定はされないが、糖修飾ヌクレオチド、核酸塩基修飾および/または骨格修飾など、1つ以上の修飾ヌクレオチドを含み得る。一部の態様において、siRNA分子は、組合せの修飾、例えば組合せの核酸塩基および骨格修飾を含み得る。
一実施形態において、修飾ヌクレオチドは糖修飾ヌクレオチドであってもよい。糖修飾ヌクレオチドとしては、限定はされないが、2’−フルオロ、2’−アミノおよび2’−チオ修飾リボヌクレオチド、例えば2’−フルオロ修飾リボヌクレオチドが挙げられる。修飾ヌクレオチドは糖部分、ならびにリボシルでない糖類またはその類似体を有するヌクレオチドが修飾されてもよい。例えば、糖部分は、マンノース、アラビノース、グルコピラノース、ガラクトピラノース、4’−チオリボース、および他の糖類、複素環、または炭素環であってもよく、またはそれをベースとしてもよい。
一実施形態において、修飾ヌクレオチドは核酸塩基修飾ヌクレオチドであってもよい。
一実施形態において、修飾ヌクレオチドは骨格修飾ヌクレオチドであってもよい。一部の実施形態において、本発明のsiRNA二重鎖は骨格に他の修飾を更に含み得る。通常の「骨格」は、本明細書で使用されるとき、DNAまたはRNA分子における交互に繰り返す糖−リン酸配列を指す。デオキシリボース/リボース糖が3’−ヒドロキシル基および5’−ヒドロキシル基の両方においてエステル結合でリン酸基につなぎ合わされ、これは「リン酸ジエステル」結合/リンカーとしても知られる(PO連結)。PO骨格は「ホスホロチオエート骨格」として修飾されてもよい(PS連結)。ある場合には、天然のリン酸ジエステル結合がアミド結合によって置き換えられてもよく、但し2つの糖単位間の4つの原子は保たれる。かかるアミド修飾は、オリゴヌクレオチドの固相合成を促進し、siRNA相補体と形成された二重鎖の熱力学的安定性を増加させることができる。例えばメスマエカー(Mesmaeker)ら著、ピュア・アンド・アプライド・ケミストリー(Pure & Appl.Chem.)、1997年、第3巻、p.437〜440を参照のこと;この内容は全体として参照により本明細書に援用される。
修飾塩基とは、1つ以上の原子または基の置換または付加によって修飾された、例えば、アデニン、グアニン、シトシン、チミン、ウラシル、キサンチン、イノシン、およびキューオシンなどのヌクレオチド塩基を指す。核酸塩基部分に対する修飾の幾つかの例としては、限定はされないが、アルキル化、ハロゲン化、チオール化、アミノ化、アミド化、またはアセチル化塩基が、個別にまたは組合せで挙げられる。より具体的な例としては、例えば、5−プロピニルウリジン、5−プロピニルシチジン、6−メチルアデニン、6−メチルグアニン、N,N,−ジメチルアデニン、2−プロピルアデニン、2−プロピルグアニン、2−アミノアデニン、1−メチルイノシン、3−メチルウリジン、5−メチルシチジン、5−メチルウリジンおよび5位に修飾を有する他のヌクレオチド、5−(2−アミノ)プロピルウリジン、5−ハロシチジン、5−ハロウリジン、4−アセチルシチジン、1−メチルアデノシン、2−メチルアデノシン、3−メチルシチジン、6−メチルウリジン、2−メチルグアノシン、7−メチルグアノシン、2,2−ジメチルグアノシン、5−メチルアミノエチルウリジン、5−メチルオキシウリジン、デアザヌクレオチド、例えば7−デアザアデノシン、6−アゾウリジン、6−アゾシチジン、6−アゾチミジン、5−メチル−2−チオウリジン、他のチオ塩基、例えば2−チオウリジンおよび4−チオウリジンおよび2−チオシチジン、ジヒドロウリジン、プソイドウリジン、キューオシン、アーケオシン、ナフチルおよび置換ナフチル基、任意のO−およびN−アルキル化プリンおよびピリミジン、例えばN6−メチルアデノシン、5−メチルカルボニルメチルウリジン、ウリジン5−オキシ酢酸、ピリジン−4−オン、ピリジン−2−オン、フェニルおよび修飾フェニル基、例えばアミノフェノールまたは2,4,6−トリメトキシベンゼン、Gクランプヌクレオチドとして働く修飾シトシン、8−置換アデニンおよびグアニン、5−置換ウラシルおよびチミン、アザピリミジン、カルボキシヒドロキシアルキルヌクレオチド、カルボキシアルキルアミノアルキルヌクレオチド、およびアルキルカルボニルアルキル化ヌクレオチドが挙げられる。
一実施形態において、修飾ヌクレオチドはセンス鎖上にだけあってもよい。
別の実施形態において、修飾ヌクレオチドはアンチセンス鎖上にだけあってもよい。
一部の実施形態において、修飾ヌクレオチドはセンス鎖およびアンチセンス鎖の両方にあってもよい。
一部の実施形態において、化学的に修飾されたヌクレオチドは、アンチセンス鎖がHTT mRNA配列などの標的mRNA配列と対合する能力に影響を及ぼさない。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、ポリシストロン性分子であるsiRNA分子をコードし得る。加えてsiRNA分子はsiRNA分子の領域間に1つ以上のリンカーを含んでもよい。
分子足場
一実施形態において、siRNA分子は、分子足場もまた含む調節性ポリヌクレオチドにコードされてもよい。本明細書で使用されるとき「分子足場」は、それに対して後続の分子を設計または作製する配列または構造基盤を形成するフレームワークまたは出発分子である。
一実施形態において、分子足場は少なくとも1つの5’フランキング領域を含む。非限定的な例として、5’フランキング領域は、任意の長さであってよい、かつ全体または一部が野生型microRNA配列に由来し得るか、または完全に人工的な配列であり得る5’フランキング配列を含み得る。
一実施形態において、分子足場は少なくとも1つの3’フランキング領域を含む。非限定的な例として、3’フランキング領域は、任意の長さであってよい、かつ全体または一部が野生型microRNA配列に由来し得るか、または完全に人工的な配列であり得る3’フランキング配列を含み得る。
一実施形態において、分子足場は少なくとも1つのループモチーフ領域を含む。非限定的な例として、ループモチーフ領域は、任意の長さであってよい配列を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、5’フランキング領域、ループモチーフ領域および/または3’フランキング領域を含む。
一実施形態において、本明細書に記載される少なくとも1つのsiRNA、miRNAまたは他のRNAi剤は、少なくとも1つの分子足場もまた含む調節性ポリヌクレオチドによってコードされてもよい。分子足場は、任意の長さであってよい、かつ全体または一部が野生型microRNA配列に由来し得るか、または完全に人工的な配列であり得る5’フランキング配列を含み得る。3’フランキング配列はサイズおよび由来の点で5’フランキング配列および/またはある3’フランキング配列を反映し得る。いずれのフランキング配列も存在しないこともある。3’フランキング配列は任意選択で1つ以上のCNNCモチーフ(式中、「N」は任意のヌクレオチドを表す)を含有し得る。
ステムループ構造のステムを形成することが、本明細書に記載される少なくとも1つのsiRNA、miRNAまたは他のRNAi剤をコードする調節性ポリヌクレオチドの最低条件(minimum)である。一部の実施形態において、本明細書に記載されるsiRNA、miRNAまたは他のRNAi剤は、標的配列に部分的に相補性であるかまたはハイブリダイズすることになる少なくとも1つの核酸配列を含む。一部の実施形態において、ペイロードはsiRNA分子またはsiRNA分子の断片である。
一部の実施形態において、調節性ポリヌクレオチドのステムループ構造の5’アームは、センス配列をコードする核酸配列を含む。調節性ポリヌクレオチドによってコードされ得るセンス配列、またはその断片もしくは変異体の非限定的な例は表3に記載する。
一部の実施形態において、調節性ポリヌクレオチドのステムループの3’アームは、アンチセンス配列をコードする核酸配列を含む。アンチセンス配列は、一部の例では、最も5’側の末端に「G」ヌクレオチドを含む。調節性ポリヌクレオチドによってコードされ得るアンチセンス配列、またはその断片もしくは変異体の非限定的な例は表2に記載する。
他の実施形態では、センス配列が調節性ポリヌクレオチドのステムループ構造のステムの3’アームにあってもよく、一方アンチセンス配列が5’アームにある。調節性ポリヌクレオチドによってコードされ得るセンス配列およびアンチセンス配列の非限定的な例は表2および表3に記載する。
一実施形態において、センス配列とアンチセンス配列とは、それらの長さの実質的な部分にわたって完全に相補的であってもよい。他の実施形態においてセンス配列とアンチセンス配列とは、独立にそれらの鎖の長さの少なくとも50、60、70、80、85、90、95、または99%にわたって少なくとも70、80、90、95または99%相補的であってもよい。
センス配列の同一性も、アンチセンス配列の相同性も、標的配列と100%相補的である必要はない。
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドのステムループ構造のセンス配列とアンチセンス配列とをループ配列(ループモチーフ、リンカーまたはリンカーモチーフとしても知られる)が分離している。ループ配列は、任意の長さ、4〜30ヌクレオチド、4〜20ヌクレオチド、4〜15ヌクレオチド、5〜15ヌクレオチド、6〜12ヌクレオチド、6ヌクレオチド、7ヌクレオチド、8ヌクレオチド、9ヌクレオチド、10ヌクレオチド、11ヌクレオチド、12ヌクレオチド、13ヌクレオチド、14ヌクレオチド、および/または15ヌクレオチドであってもよい。
一部の実施形態において、ループ配列は、少なくとも1つのUGUGモチーフをコードする核酸配列を含む。一部の実施形態において、UGUGモチーフをコードする核酸配列は、ループ配列の5’末端に位置する。
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドには、1つ以上のモジュール(例えば、5’フランキング領域、ループモチーフ領域、3’フランキング領域、センス配列、アンチセンス配列)を互いに分離するスペーサ領域が存在してもよい。かかるスペーサ領域は1つ以上存在してもよい。
一実施形態において、センス配列とフランキング領域配列との間には、8〜20、すなわち、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20ヌクレオチドのスペーサ領域が存在してもよい。
一実施形態において、スペーサ領域の長さは13ヌクレオチドであり、センス配列の5’末端とフランキング配列の3’末端との間に位置する。一実施形態において、スペーサは配列の約1ヘリカルターンを形成するのに十分な長さである。
一実施形態において、アンチセンス配列とフランキング配列との間には、8〜20、すなわち、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20ヌクレオチドのスペーサ領域が存在してもよい。
一実施形態において、スペーサ配列は10〜13、すなわち、10、11、12または13ヌクレオチドであり、アンチセンス配列の3’末端とフランキング配列の5’末端との間に位置する。一実施形態において、スペーサは配列の約1ヘリカルターンを形成するのに十分な長さである。
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドの分子足場は、5’から3’方向に、5’フランキング配列、5’アーム、ループモチーフ、3’アームおよび3’フランキング配列を含む。非限定的な例として、5’アームが、センス配列をコードする核酸配列を含んでいてもよく、3’アームが、アンチセンス配列をコードする核酸配列を含む。別の非限定的な例では、5’アームがアンチセンス配列をコードする核酸配列を含み、3’アームがセンス配列をコードする核酸配列を含む。
一実施形態において、5’アーム、センスおよび/またはアンチセンス配列、ループモチーフおよび/または3’アーム配列は改変されてもよい(例えば、1ヌクレオチド以上の置換、ヌクレオチドの付加および/またはヌクレオチドの欠失)。改変はコンストラクトの機能に有益な変化を生じさせ得る(例えば、標的配列のノックダウンを増加させ、コンストラクトの分解を低減し、オフターゲット効果を低減し、ペイロードの効率を増加させ、およびペイロードの分解を低減し得る)。
一実施形態において、ガイド鎖(本明細書ではアンチセンス鎖とも称される)の切出し率をパッセンジャー鎖(本明細書ではセンス鎖とも称される)の切出し率よりも高くするため、調節性ポリヌクレオチドの分子足場が配列される。ガイド鎖またはパッセンジャー鎖の切出し率は、独立に、1%、2%、3%、4%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%または99%超であり得る。非限定的な例として、ガイド鎖の切出し率は少なくとも80%である。別の非限定的な例として、ガイド鎖の切出し率は少なくとも90%である。
一実施形態において、ガイド鎖の切出し率はパッセンジャー鎖の切出し率よりも高い。一態様において、ガイド鎖の切出し率は、パッセンジャー鎖よりも少なくとも1%、2%、3%、4%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%または99%超高くてもよい。
一実施形態において、ガイド鎖の切出し効率は、少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%または99%超である。非限定的な例として、ガイド鎖の切出し効率は80%よりも高い。
一実施形態において、分子足場からのガイド鎖の切出し効率はパッセンジャー鎖の切出しよりも高い。分子足場からのガイド鎖の切出しは、パッセンジャー鎖の切出しよりも2、3、4、5、6、7、8、9、10倍または10倍超高効率であり得る。
一実施形態において、分子足場は二重機能ターゲティング調節性ポリヌクレオチドを含む。本明細書で使用されるとき、「二重機能ターゲティング」調節性ポリヌクレオチドは、ガイド鎖およびパッセンジャー鎖の両方が同じ標的をノックダウンするポリヌクレオチド、またはガイド鎖およびパッセンジャー鎖が異なる標的をノックダウンするポリヌクレオチドである。
一実施形態において、本明細書に記載される調節性ポリヌクレオチドの分子足場は、5’フランキング領域、ループモチーフ領域および3’フランキング領域を含み得る。本明細書に記載される調節性ポリヌクレオチドに使用され得るまたは使用されるそれらの断片であり得る5’フランキング領域、ループモチーフ領域(リンカー領域とも称され得る)および3’フランキング領域の配列の非限定的な例は、表7〜表9に示される。
一実施形態において、分子足場は、表7に挙げられる少なくとも1つの5’フランキング領域、断片、またはその変異体を含み得る。非限定的な例として、5’フランキング領域は、5F1、5F2、5F3、5F4、5F5、5F6、または5F7であってもよい。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F1フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F2フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F3フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F4フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F5フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F6フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F7フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、表8に挙げられる少なくとも1つのループモチーフ領域、その断片または変異体を含み得る。非限定的な例として、ループモチーフ領域は、L1、L2、L3、L4、L5、L6、L7、またはL8であってもよい。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL1ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL2ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL3ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL4ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL5ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL6ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL7ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL8ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、表9に挙げられる少なくとも1つの3’フランキング領域、断片、またはその変異体を含み得る。非限定的な例として、3’フランキング領域は、3F1、3F2、3F3、3F4、または3F5であってもよい。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの3F1フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの3F2フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの3F3フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの3F4フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの3F5フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、表7および表8に記載されるとおりの、少なくとも1つの5’フランキング領域、その断片または変異体と、少なくとも1つのループモチーフ領域、その断片または変異体とを含み得る。非限定的な例として、5’フランキング領域およびループモチーフ領域は、5F1およびL1、5F1およびL2、5F1およびL3、5F1およびL4、5F1およびL5、5F1およびL6、5F1およびL7、5F1およびL8、5F2およびL1、5F2およびL2、5F2およびL3、5F2およびL4、5F2およびL5、5F2およびL6、5F2およびL7、5F2およびL8、5F3およびL1、5F3およびL2、5F3およびL3、5F3およびL4、5F3およびL5、5F3およびL6、5F3およびL7、5F3およびL8、5F4およびL1、5F4およびL2、5F4およびL3、5F4およびL4、5F4およびL5、5F4およびL6、5F4およびL7、5F4およびL8、5F5およびL1、5F5およびL2、5F5およびL3、5F5およびL4、5F5およびL5、5F5およびL6、5F5およびL7、5F5およびL8、5F6およびL1、5F6およびL2、5F6およびL3、5F6およびL4、5F6およびL5、5F6およびL6、5F6およびL7、5F6およびL8、5F7およびL1、5F7およびL2、5F7およびL3、5F7およびL4、5F7およびL5、5F7およびL6、5F7およびL7、ならびに5F7およびL8であってもよい。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F2フランキング領域および少なくとも1つのL1ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F1フランキング領域および少なくとも1つのL4ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F7フランキング領域および少なくとも1つのL8ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F3フランキング領域および少なくとも1つのL4ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F3フランキング領域および少なくとも1つのL5ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F4フランキング領域および少なくとも1つのL4ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F3フランキング領域および少なくとも1つのL7ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F5フランキング領域および少なくとも1つのL4ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F6フランキング領域および少なくとも1つのL4ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F3フランキング領域および少なくとも1つのL6ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F7フランキング領域および少なくとも1つのL4ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F2フランキング領域および少なくとも1つのL2ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F1フランキング領域および少なくとも1つのL1ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F1フランキング領域および少なくとも1つのL2ループモチーフ領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、表8および表9に記載されるとおりの、少なくとも1つの3’フランキング領域、その断片または変異体と、少なくとも1つのループモチーフ領域、その断片または変異体とを含み得る。非限定的な例として、3’フランキング領域およびループモチーフ領域は、3F1およびL1、3F1およびL2、3F1およびL3、3F1およびL4、3F1およびL5、3F1およびL6、3F1およびL7、3F1およびL8、3F2およびL1、3F2およびL2、3F2およびL3、3F2およびL4、3F2およびL5、3F2およびL6、3F2およびL7、3F2およびL8、3F3およびL1、3F3およびL2、3F3およびL3、3F3およびL4、3F3およびL5、3F3およびL6、3F3およびL7、3F3およびL8、3F4およびL1、3F4およびL2、3F4およびL3、3F4およびL4、3F4およびL5、3F4およびL6、3F4およびL7、3F4およびL8、3F5およびL1、3F5およびL2、3F5およびL3、3F5およびL4、3F5およびL5、3F5およびL6、3F5およびL7、ならびに3F5およびL8であってもよい。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL1ループモチーフ領域および少なくとも1つの3F2フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL4ループモチーフ領域および少なくとも1つの3F1フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL8ループモチーフ領域および少なくとも1つの3F5フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL5ループモチーフ領域および少なくとも1つの3F1フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL4ループモチーフ領域および少なくとも1つの3F4フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL7ループモチーフ領域および少なくとも1つの3F1フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL6ループモチーフ領域および少なくとも1つの3F1フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL4ループモチーフ領域および少なくとも1つの3F5フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL2ループモチーフ領域および少なくとも1つの3F2フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL1ループモチーフ領域および少なくとも1つの3F3フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL5ループモチーフ領域および少なくとも1つの3F4フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL1ループモチーフ領域および少なくとも1つの3F1フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つのL2ループモチーフ領域および少なくとも1つの3F1フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、表7および表9に記載されるとおりの、少なくとも1つの5’フランキング領域、その断片または変異体と、少なくとも1つの3’フランキング領域、その断片または変異体とを含み得る。非限定的な例として、フランキング領域は、5F1および3F1、5F1および3F2、5F1および3F3、5F1および3F4、5F1および3F5、5F2および3F1、5F2および3F2、5F2および3F3、5F2および3F4、5F2および3F5、5F3および3F1、5F3および3F2、5F3および3F3、5F3および3F4、5F3および3F5、5F4および3F1、5F4および3F2、5F4および3F3、5F4および3F4、5F4および3F5、5F5および3F1、5F5および3F2、5F5および3F3、5F5および3F4、5F5および3F5、5F6および3F1、5F6および3F2、5F6および3F3、5F6および3F4、5F6および3F5、5F7および3F1、5F7および3F2、5F7および3F3、5F7および3F4、ならびに5F7および3F5であってもよい。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F2 5’フランキング領域および少なくとも1つの3F2 3’フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F1 5’フランキング領域および少なくとも1つの3F1 3’フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F7 5’フランキング領域および少なくとも1つの3F5 3’フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F3 5’フランキング領域および少なくとも1つの3F1 3’フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F4 5’フランキング領域および少なくとも1つの3F4 3’フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F5 5’フランキング領域および少なくとも1つの3F4 3’フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F6 5’フランキング領域および少なくとも1つの3F1 3’フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F2 5’フランキング領域および少なくとも1つの3F3 3’フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F3 5’フランキング領域および少なくとも1つの3F4 3’フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F1 5’フランキング領域および少なくとも1つの3F2 3’フランキング領域を含み得る。
一実施形態において、分子足場は、表7〜表9に記載されるとおりの、少なくとも1つの5’フランキング領域、その断片または変異体と、少なくとも1つのループモチーフ領域、その断片または変異体と、少なくとも1つの3’フランキング領域、その断片または変異体とを含み得る。非限定的な例として、フランキング領域およびループモチーフ領域は、5F1、L1および3F1;5F1、L1および3F2;5F1、L1および3F3;5F1、L1および3F4;5F1、L1および3F5;5F2、L1および3F1;5F2、L1および3F2;5F2、L1および3F3;5F2、L1および3F4;5F2、L1および3F5;5F3、L1および3F3;5F3、L1および3F2;5F3、L1および3F3;5F3、L1および3F4;5F3、L1および3F5;5F4、L1および3F4;5F4、L1および3F2;5F4、L1および3F3;5F4、L1および3F4;5F4、L1および3F5;5F5、L1および3F1;5F5、L1および3F2;5F5、L1および3F3;5F5、L1および3F4;5F5、L1および3F5;5F6、L1および3F1;5F6、L1および3F2;5F6、L1および3F3;5F6、L1および3F4;5F6、L1および3F5;5F7、L1および3F1;5F7、L1および3F2;5F7、L1および3F3;5F7、L1および3F4;5F7、L1および3F5;5F1、L2および3F1;5F1、L2および3F2;5F1、L2および3F3;5F1、L2および3F4;5F1、L2および3F5;5F2、L2および3F1;5F2、L2および3F2;5F2、L2および3F3;5F2、L2および3F4;5F2、L2および3F5;5F3、L2および3F1;5F3、L2および3F2;5F3、L2および3F3;5F3、L2および3F4;5F3、L2および3F5;5F4、L2および3F1;5F4、L2および3F2;5F4、L2および3F3;5F4、L2および3F4;5F4、L2および3F5;5F5、L2および3F1;5F5、L2および3F2;5F5、L2および3F3;5F5、L2および3F4;5F5、L2および3F5;5F6、L2および3F1;5F6、L2および3F2;5F6、L2および3F3;5F6、L2および3F4;5F6、L2および3F5;5F7、L2および3F1;5F7、L2および3F2;5F7、L2および3F3;5F7、L2および3F4;5F7、L2および3F5;5F1、L3および3F1;5F1、L3および3F2;5F1、L3および3F3;5F1、L3および3F4;5F1、L3および3F5;5F2、L3および3F1;5F2、L3および3F2;5F2、L3および3F3;5F2、L3および3F4;5F2、L3および3F5;5F3、L3および3F1;5F3、L3および3F2;5F3、L3および3F3;5F3、L3および3F4;5F3、L3および3F5;5F4、L3および3F1;5F4、L3および3F2;5F4、L3および3F3;5F4、L3および3F4;5F4、L3および3F5;5F5、L3および3F1;5F5、L3および3F2;5F5、L3および3F3;5F5、L3および3F4;5F5、L3および3F5;5F6、L3および3F1;5F6、L3および3F2;5F6、L3および3F3;5F6、L3および3F4;5F6、L3および3F5;5F7、L3および3F1;5F7、L3および3F2;5F7、L3および3F3;5F7、L3および3F4;5F7、L3および3F5;5F1、L4および3F1;5F1、L4および3F2;5F1、L4および3F3;5F1、L4および3F4;5F1、L4および3F5;5F2、L4および3F1;5F2、L4および3F2;5F2、L4および3F3;5F2、L4および3F4;5F2、L4および3F5;5F3、L4および3F1;5F3、L4および3F2;5F3、L4および3F3;5F3、L4および3F4;5F3、L4および3F5;5F4、L4および3F1;5F4、L4および3F2;5F4、L4および3F3;5F4、L4および3F4;5F4、L4および3F5;5F5、L4および3F1;5F5、L4および3F2;5F5、L4および3F3;5F5、L4および3F4;5F5、L4および3F5;5F6、L4および3F1;5F6、L4および3F2;5F6、L4および3F3;5F6、L4および3F4;5F6、L4および3F5;5F7、L4および3F1;5F7、L4および3F2;5F7、L4および3F3;5F7、L4および3F4;5F7、L4および3F5;5F1、L5および3F1;5F1、L5および3F2;5F1、L5および3F3;5F1、L5および3F4;5F1、L5および3F5;5F2、L5および3F1;5F2、L5および3F2;5F2、L5および3F3;5F2、L5および3F4;5F2、L5および3F5;5F3、L5および3F1;5F3、L5および3F2;5F3、L5および3F3;5F3、L5および3F4;5F3、L5および3F5;5F4、L5および3F1;5F4、L5および3F2;5F4、L5および3F3;5F4、L5および3F4;5F4、L5および3F5;5F5、L5および3F1;5F5、L5および3F2;5F5、L5および3F3;5F5、L5および3F4;5F5、L5および3F5;5F6、L5および3F1;5F6、L5および3F2;5F6、L5および3F3;5F6、L5および3F4;5F6、L5および3F5;5F7、L5および3F1;5F7、L5および3F2;5F7、L5および3F3;5F7、L5および3F4;5F7、L5および3F5;5F1、L6および3F1;5F1、L6および3F2;5F1、L6および3F3;5F1、L6および3F4;5F1、L6および3F5;5F2、L6および3F1;5F2、L6および3F2;5F2、L6および3F3;5F2、L6および3F4;5F2、L6および3F5;5F3、L6および3F1;5F3、L6および3F2;5F3、L6および3F3;5F3、L6および3F4;5F3、L6および3F5;5F4、L6および3F1;5F4、L6および3F2;5F4、L6および3F3;5F4、L6および3F4;5F4、L6および3F5;5F5、L6および3F1;5F5、L6および3F2;5F5、L6および3F3;5F5、L6および3F4;5F5、L6および3F5;5F6、L6および3F1;5F6、L6および3F2;5F6、L6および3F3;5F6、L6および3F4;5F6、L6および3F5;5F7、L6および3F1;5F7、L6および3F2;5F7、L6および3F3;5F7、L6および3F4;5F7、L6および3F5;5F1、L7および3F1;5F1、L7および3F2;5F1、L7および3F3;5F1、L7および3F4;5F1、L7および3F5;5F2、L7および3F1;5F2、L7および3F2;5F2、L7および3F3;5F2、L7および3F4;5F2、L7および3F5;5F3、L7および3F1;5F3、L7および3F2;5F3、L7および3F3;5F3、L7および3F4;5F3、L7および3F5;5F4、L7および3F1;5F4、L7および3F2;5F4、L7および3F3;5F4、L7および3F4;5F4、L7および3F5;5F5、L7および3F1;5F5、L7および3F2;5F5、L7および3F3;5F5、L7および3F4;5F5、L7および3F5;5F6、L7および3F1;5F6、L7および3F2;5F6、L7および3F3;5F6、L7および3F4;5F6、L7および3F5;5F7、L7および3F1;5F7、L7および3F2;5F7、L7および3F3;5F7、L7および3F4;5F7、L7および3F5;5F1、L8および3F1;5F1、L8および3F2;5F1、L8および3F3;5F1、L8および3F4;5F1、L8および3F5;5F2、L8および3F1;5F2、L8および3F2;5F2、L8および3F3;5F2、L8および3F4;5F2、L8および3F5;5F3、L8および3F1;5F3、L8および3F2;5F3、L8および3F3;5F3、L8および3F4;5F3、L8および3F5;5F4、L8および3F1;5F4、L8および3F2;5F4、L8および3F3;5F4、L8および3F4;5F4、L8および3F5;5F5、L8および3F1;5F5、L8および3F2;5F5、L8および3F3;5F5、L8および3F4;5F5、L8および3F5;5F6、L8および3F1;5F6、L8および3F2;5F6、L8および3F3;5F6、L8および3F4;5F6、L8および3F5;5F7、L8および3F1;5F7、L8および3F2;5F7、L8および3F3;5F7、L8および3F4;および5F7、L8および3F5であってもよい。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F2 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL1ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F2 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F1 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL4ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F1 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F7 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL8ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F5 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F3 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL4ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F1 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F3 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL5ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F1 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F4 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL4ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F4 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F3 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL7ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F1 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F5 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL4ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F4 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F6 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL4ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F1 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F3 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL6ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F1 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F7 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL4ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F5 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F2 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL2ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F2 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F2 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL1ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F3 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F3 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL5ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F4 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F1 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL1ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F1 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F1 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL2ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F1 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F1 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL1ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F2 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は、少なくとも1つの5F2 5’フランキング領域と、少なくとも1つのL3ループモチーフ領域と、少なくとも1つの3F3 3’フランキング領域とを含み得る。
一実施形態において、分子足場は天然のpri−miRNA足場であってもよい。非限定的な例として、分子足場は、ヒトmiR155足場に由来する足場であってもよい。
一実施形態において、分子足場は当該技術分野において公知の1つ以上のリンカーを含み得る。リンカーは、領域間を、または1つの分子足場を別の分子足場と分離し得る。非限定的な例として、分子足場はポリシストロン性であってもよい。
分子足場と、HTTを標的とするsiRNA分子とを含む調節性ポリヌクレオチド
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドは、表10および表11に記載されるとおりの、5’および3’フランキング領域と、ループモチーフ領域と、センス配列およびアンチセンス配列をコードする核酸配列とを含み得る。表10および表11には、パッセンジャー鎖およびガイド鎖ならびに5’および3’フランキング領域およびループ領域(リンカー領域とも称される)のDNA配列識別名が記載される。表10および表11において、配列名の「miR」成分は必ずしもmiRNA遺伝子の配列の付番に対応するわけではない(例えば、VOYHTmiR−102が配列名であるが、必ずしもmiR−102がその配列の一部であることを意味するわけではない)。
調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子
一実施形態において、AAV粒子は、調節性ポリヌクレオチド配列を含むペイロード領域を有するウイルスゲノムを含む。かかる実施形態において、2つ以上のポリペプチドをコードするウイルスゲノムが、ウイルス粒子へと複製またはパッケージングされ得る。調節性ポリヌクレオチドを含むウイルス粒子で形質導入された標的細胞は、単一細胞中でコード化センスおよび/またはアンチセンス配列を発現し得る。
一部の実施形態において、AAV粒子は、神経学的疾患および/または障害を治療、予防、緩和、または改善するための医学分野に有用である。
調節性ポリヌクレオチド配列を含むペイロード領域を有するウイルスゲノムを含むAAV粒子のITR〜ITR配列の非限定的な例は、表12に記載される。
一実施形態において、AAV粒子は、配列番号1352〜1379、1388、および1426〜1438のいずれかに対して同一性パーセントを有する配列を含むウイルスゲノムを含む。ウイルスゲノムは、配列番号1352〜1379、1388、および1426〜1438のいずれかに対して1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%または100%の同一性を有していてもよい。ウイルスゲノムは、配列番号1352〜1379、1388、および1426〜1438のいずれかに対して1〜10%、10〜20%、30〜40%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜99%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜99%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜99%、70〜100%、80〜85%、80〜90%、80〜95%、80〜99%、80〜100%、90〜95%、90〜99%、または90〜100%を有していてもよい。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、配列番号1352〜1379、1388、および1426〜1438のいずれかに対して80%同一性である配列を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、配列番号1352〜1379、1388、および1426〜1438のいずれかに対して85%同一性である配列を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、配列番号1352〜1379、1388、および1426〜1438のいずれかに対して90%同一性である配列を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、配列番号1352〜1379、1388、および1426〜1438のいずれかに対して95%同一性である配列を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、配列番号1352〜1379、1388、および1426〜1438のいずれかに対して99%同一性である配列を含む。
一実施形態において、少なくとも1つのsiRNA分子をコードする核酸配列を含む調節性ポリヌクレオチド配列を含むAAV粒子を、哺乳類細胞に導入し得る。
AAV粒子ペイロード領域が調節性ポリヌクレオチドを含む場合、調節性ポリヌクレオチドは、標的遺伝子をノックダウンするためのセンス配列および/またはアンチセンス配列を含み得る。本明細書に記載される調節性ポリヌクレオチドをコードするAAVウイルスゲノムは、ヒト疾患、ウイルス、感染症、獣医学的応用の分野、ならびに様々なインビボおよびインビトロ設定において有用であり得る。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)領域を含み得る。ITR領域は、独立に、限定はされないが、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、および175ヌクレオチドなどの長さを有していてもよい。ウイルスゲノムのITR領域の長さは、75〜80、75〜85、75〜100、80〜85、80〜90、80〜105、85〜90、85〜95、85〜110、90〜95、90〜100、90〜115、95〜100、95〜105、95〜120、100〜105、100〜110、100〜125、105〜110、105〜115、105〜130、110〜115、110〜120、110〜135、115〜120、115〜125、115〜140、120〜125、120〜130、120〜145、125〜130、125〜135、125〜150、130〜135、130〜140、130〜155、135〜140、135〜145、135〜160、140〜145、140〜150、140〜165、145〜150、145〜155、145〜170、150〜155、150〜160、150〜175、155〜160、155〜165、160〜165、160〜170、165〜170、165〜175、および170〜175ヌクレオチドであってもよい。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約105ヌクレオチド長であるITRを含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約141ヌクレオチド長であるITRを含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約130ヌクレオチド長であるITRを含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、2つの末端逆位配列(ITR)領域を含み得る。ITR領域の各々は、独立に、限定はされないが、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、および175ヌクレオチドなどの長さを有していてもよい。ウイルスゲノムのITR領域の長さは、75〜80、75〜85、75〜100、80〜85、80〜90、80〜105、85〜90、85〜95、85〜110、90〜95、90〜100、90〜115、95〜100、95〜105、95〜120、100〜105、100〜110、100〜125、105〜110、105〜115、105〜130、110〜115、110〜120、110〜135、115〜120、115〜125、115〜140、120〜125、120〜130、120〜145、125〜130、125〜135、125〜150、130〜135、130〜140、130〜155、135〜140、135〜145、135〜160、140〜145、140〜150、140〜165、145〜150、145〜155、145〜170、150〜155、150〜160、150〜175、155〜160、155〜165、160〜165、160〜170、165〜170、165〜175、および170〜175ヌクレオチドであってもよい。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約105ヌクレオチド長および141ヌクレオチド長であるITRを含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約105ヌクレオチド長および130ヌクレオチド長であるITRを含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約130ヌクレオチド長および141ヌクレオチド長であるITRを含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、表13〜表20に記載されるとおりの少なくとも1つの配列領域を含み得る。領域は、本明細書に記載される他の配列領域のいずれかの前または後に位置していてもよい。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)領域を含み得る。ITR配列領域の非限定的な例は、表13に記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、2つのITR領域を含む。一実施形態において、ITR配列領域は、ITR1配列領域およびITR3配列領域である。一実施形態において、ITR配列領域は、ITR1配列領域およびITR4配列領域である。一実施形態において、ITR配列領域は、ITR2配列領域およびITR3配列領域である。一実施形態において、ITR配列領域は、ITR2配列領域およびITR4配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つの多重クローニング部位(MCS)配列領域を含み得る。MCS領域は、独立に、限定はされないが、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、および150ヌクレオチドなどの長さを有していてもよい。ウイルスゲノムのMCS領域の長さは、2〜10、5〜10、5〜15、10〜20、10〜30、10〜40、15〜20、15〜25、20〜30、20〜40、20〜50、25〜30、25〜35、30〜40、30〜50、30〜60、35〜40、35〜45、40〜50、40〜60、40〜70、45〜50、45〜55、50〜60、50〜70、50〜80、55〜60、55〜65、60〜70、60〜80、60〜90、65〜70、65〜75、70〜80、70〜90、70〜100、75〜80、75〜85、80〜90、80〜100、80〜110、85〜90、85〜95、90〜100、90〜110、90〜120、95〜100、95〜105、100〜110、100〜120、100〜130、105〜110、105〜115、110〜120、110〜130、110〜140、115〜120、115〜125、120〜130、120〜140、120〜150、125〜130、125〜135、130〜140、130〜150、135〜140、135〜145、140〜150、および145〜150ヌクレオチドであってもよい。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約5ヌクレオチド長であるMCS領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約10ヌクレオチド長であるMCS領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約14ヌクレオチド長であるMCS領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約18ヌクレオチド長であるMCS領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約73ヌクレオチド長であるMCS領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約121ヌクレオチド長であるMCS領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つの多重クローニング部位(MCS)配列領域を含む。MCS配列領域の非限定的な例は、表14に記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、1つのMCS配列領域を含む。一実施形態において、MCS配列領域は、MCS1配列領域である。一実施形態において、MCS配列領域は、MCS2配列領域である。一実施形態において、MCS配列領域は、MCS3配列領域である。一実施形態において、MCS配列領域は、MCS4配列領域である。一実施形態において、MCS配列領域は、MCS5配列領域である。一実施形態において、MCS配列領域は、MCS6配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、2つのMCS領域を含む。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS1配列領域およびMCS2配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS1配列領域およびMCS3配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS1配列領域およびMCS4配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS1配列領域およびMCS5配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS1配列領域およびMCS6配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS2配列領域およびMCS3配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS2配列領域およびMCS4配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS2配列領域およびMCS5配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS2配列領域およびMCS6配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS3配列領域およびMCS4配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS3配列領域およびMCS5配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS3配列領域およびMCS6配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS4配列領域およびMCS5配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS4配列領域およびMCS6配列領域である。一実施形態において、2つのMCS配列領域は、MCS5配列領域およびMCS6配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、2つ以上のMCS配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、3つのMCS配列領域を含む。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS1配列領域、MCS2配列領域、およびMCS3配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS1配列領域、MCS2配列領域、およびMCS4配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS1配列領域、MCS2配列領域、およびMCS5配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS1配列領域、MCS2配列領域、およびMCS6配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS1配列領域、MCS3配列領域、およびMCS4配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS1配列領域、MCS3配列領域、およびMCS5配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS1配列領域、MCS3配列領域、およびMCS6配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS1配列領域、MCS4配列領域、およびMCS5配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS1配列領域、MCS4配列領域、およびMCS6配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS1配列領域、MCS5配列領域、およびMCS6配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS2配列領域、MCS3配列領域、およびMCS4配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS2配列領域、MCS3配列領域、およびMCS5配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS2配列領域、MCS3配列領域、およびMCS6配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS2配列領域、MCS4配列領域、およびMCS5配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS2配列領域、MCS4配列領域、およびMCS6配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS2配列領域、MCS5配列領域、およびMCS6配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS3配列領域、MCS4配列領域、およびMCS5配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS3配列領域、MCS4配列領域、およびMCS6配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS3配列領域、MCS5配列領域、およびMCS6配列領域である。一実施形態において、3つのMCS配列領域は、MCS4配列領域、MCS5配列領域、およびMCS6配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つの多重フィラー配列領域を含み得る。フィラー領域は、独立に、限定はされないが、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399、400、401、402、403、404、405、406、407、408、409、410、411、412、413、414、415、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、452、453、454、455、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、472、473、474、475、476、477、478、479、480、481、482、483、484、485、486、487、488、489、490、491、492、493、494、495、496、497、498、499、500、501、502、503、504、505、506、507、508、509、510、511、512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、524、525、526、527、528、529、530、531、532、533、534、535、536、537、538、539、540、541、542、543、544、545、546、547、548、549、550、551、552、553、554、555、556、557、558、559、560、561、562、563、564、565、566、567、568、569、570、571、572、573、574、575、576、577、578、579、580、581、582、583、584、585、586、587、588、589、590、591、592、593、594、595、596、597、598、599、600、601、602、603、604、605、606、607、608、609、610、611、612、613、614、615、616、617、618、619、620、621、622、623、624、625、626、627、628、629、630、631、632、633、634、635、636、637、638、639、640、641、642、643、644、645、646、647、648、649、650、651、652、653、654、655、656、657、658、659、660、661、662、663、664、665、666、667、668、669、670、671、672、673、674、675、676、677、678、679、680、681、682、683、684、685、686、687、688、689、690、691、692、693、694、695、696、697、698、699、700、701、702、703、704、705、706、707、708、709、710、711、712、713、714、715、716、717、718、719、720、721、722、723、724、725、726、727、728、729、730、731、732、733、734、735、736、737、738、739、740、741、742、743、744、745、746、747、748、749、750、751、752、753、754、755、756、757、758、759、760、761、762、763、764、765、766、767、768、769、770、771、772、773、774、775、776、777、778、779、780、781、782、783、784、785、786、787、788、789、790、791、792、793、794、795、796、797、798、799、800、801、802、803、804、805、806、807、808、809、810、811、812、813、814、815、816、817、818、819、820、821、822、823、824、825、826、827、828、829、830、831、832、833、834、835、836、837、838、839、840、841、842、843、844、845、846、847、848、849、850、851、852、853、854、855、856、857、858、859、860、861、862、863、864、865、866、867、868、869、870、871、872、873、874、875、876、877、878、879、880、881、882、883、884、885、886、887、888、889、890、891、892、893、894、895、896、897、898、899、900、901、902、903、904、905、906、907、908、909、910、911、912、913、914、915、916、917、918、919、920、921、922、923、924、925、926、927、928、929、930、931、932、933、934、935、936、937、938、939、940、941、942、943、944、945、946、947、948、949、950、951、952、953、954、955、956、957、958、959、960、961、962、963、964、965、966、967、968、969、970、971、972、973、974、975、976、977、978、979、980、981、982、983、984、985、986、987、988、989、990、991、992、993、994、995、996、997、998、999、1000、1001、1002、1003、1004、1005、1006、1007、1008、1009、1010、1011、1012、1013、1014、1015、1016、1017、1018、1019、1020、1021、1022、1023、1024、1025、1026、1027、1028、1029、1030、1031、1032、1033、1034、1035、1036、1037、1038、1039、1040、1041、1042、1043、1044、1045、1046、1047、1048、1049、1050、1051、1052、1053、1054、1055、1056、1057、1058、1059、1060、1061、1062、1063、1064、1065、1066、1067、1068、1069、1070、1071、1072、1073、1074、1075、1076、1077、1078、1079、1080、1081、1082、1083、1084、1085、1086、1087、1088、1089、1090、1091、1092、1093、1094、1095、1096、1097、1098、1099、1100、1101、1102、1103、1104、1105、1106、1107、1108、1109、1110、1111、1112、1113、1114、1115、1116、1117、1118、1119、1120、1121、1122、1123、1124、1125、1126、1127、1128、1129、1130、1131、1132、1133、1134、1135、1136、1137、1138、1139、1140、1141、1142、1143、1144、1145、1146、1147、1148、1149、1150、1151、1152、1153、1154、1155、1156、1157、1158、1159、1160、1161、1162、1163、1164、1165、1166、1167、1168、1169、1170、1171、1172、1173、1174、1175、1176、1177、1178、1179、1180、1181、1182、1183、1184、1185、1186、1187、1188、1189、1190、1191、1192、1193、1194、1195、1196、1197、1198、1199、1200、1201、1202、1203、1204、1205、1206、1207、1208、1209、1210、1211、1212、1213、1214、1215、1216、1217、1218、1219、1220、1221、1222、1223、1224、1225、1226、1227、1228、1229、1230、1231、1232、1233、1234、1235、1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84、2285、2286、2287、2288、2289、2290、2291、2292、2293、2294、2295、2296、2297、2298、2299、2300、2301、2302、2303、2304、2305、2306、2307、2308、2309、2310、2311、2312、2313、2314、2315、2316、2317、2318、2319、2320、2321、2322、2323、2324、2325、2326、2327、2328、2329、2330、2331、2332、2333、2334、2335、2336、2337、2338、2339、2340、2341、2342、2343、2344、2345、2346、2347、2348、2349、2350、2351、2352、2353、2354、2355、2356、2357、2358、2359、2360、2361、2362、2363、2364、2365、2366、2367、2368、2369、2370、2371、2372、2373、2374、2375、2376、2377、2378、2379、2380、2381、2382、2383、2384、2385、2386、2387、2388、2389、2390、2391、2392、2393、2394、2395、2396、2397、2398、2399、2400、2401、2402、2403、2404、2405、2406、2407、2408、2409、2410、2411、2412、2413、2414、2415、2416、2417、2418、2419、2420、2421、2422、2423、2424、2425、2426、2427、2428、2429、2430、2431、2432、2433、2434、2435、2436、2437、2438、2439、2440、2441、2442、2443、2444、2445、2446、2447、2448、2449、2450、2451、2452、2453、2454、2455、2456、2457、2458、2459、2460、2461、2462、2463、2464、2465、2466、2467、2468、2469、2470、2471、2472、2473、2474、2475、2476、2477、2478、2479、2480、2481、2482、2483、2484、2485、2486、2487、2488、2489、2490、2491、2492、2493、2494、2495、2496、2497、2498、2499、2500、2501、2502、2503、2504、2505、2506、2507、2508、2509、2510、2511、2512、2513、2514、2515、2516、2517、2518、2519、2520、2521、2522、2523、2524、2525、2526、2527、2528、2529、2530、2531、2532、2533、2534、2535、2536、2537、2538、2539、2540、2541、2542、2543、2544、2545、2546、2547、2548、2549、2550、2551、2552、2553、2554、2555、2556、2557、2558、2559、2560、2561、2562、2563、2564、2565、2566、2567、2568、2569、2570、2571、2572、2573、2574、2575、2576、2577、2578、2579、2580、2581、2582、2583、2584、2585、2586、2587、2588、2589、2590、2591、2592、2593、2594、2595、2596、2597、2598、2599、2600、2601、2602、2603、2604、2605、2606、2607、2608、2609、2610、2611、2612、2613、2614、2615、2616、2617、2618、2619、2620、2621、2622、2623、2624、2625、2626、2627、2628、2629、2630、2631、2632、2633、2634、2635、2636、2637、2638、2639、2640、2641、2642、2643、2644、2645、2646、2647、2648、2649、2650、2651、2652、2653、2654、2655、2656、2657、2658、2659、2660、2661、2662、2663、2664、2665、2666、2667、2668、2669、2670、2671、2672、2673、2674、2675、2676、2677、2678、2679、2680、2681、2682、2683、2684、2685、2686、2687、2688、2689、2690、2691、2692、2693、2694、2695、2696、2697、2698、2699、2700、2701、2702、2703、2704、2705、2706、2707、2708、2709、2710、2711、2712、2713、2714、2715、2716、2717、2718、2719、2720、2721、2722、2723、2724、2725、2726、2727、2728、2729、2730、2731、2732、2733、2734、2735、2736、2737、2738、2739、2740、2741、2742、2743、2744、2745、2746、2747、2748、2749、2750、2751、2752、2753、2754、2755、2756、2757、2758、2759、2760、2761、2762、2763、2764、2765、2766、2767、2768、2769、2770、2771、2772、2773、2774、2775、2776、2777、2778、2779、2780、2781、2782、2783、2784、2785、2786、2787、2788、2789、2790、2791、2792、2793、2794、2795、2796、2797、2798、2799、2800、2801、2802、2803、2804、2805、2806、2807、2808、2809、2810、2811、2812、2813、2814、2815、2816、2817、2818、2819、2820、2821、2822、2823、2824、2825、2826、2827、2828、2829、2830、2831、2832、2833、2834、2835、2836、2837、2838、2839、2840、2841、2842、2843、2844、2845、2846、2847、2848、2849、2850、2851、2852、2853、2854、2855、2856、2857、2858、2859、2860、2861、2862、2863、2864、2865、2866、2867、2868、2869、2870、2871、2872、2873、2874、2875、2876、2877、2878、2879、2880、2881、2882、2883、2884、2885、2886、2887、2888、2889、2890、2891、2892、2893、2894、2895、2896、2897、2898、2899、2900、2901、2902、2903、2904、2905、2906、2907、2908、2909、2910、2911、2912、2913、2914、2915、2916、2917、2918、2919、2920、2921、2922、2923、2924、2925、2926、2927、2928、2929、2930、2931、2932、2933、2934、2935、2936、2937、2938、2939、2940、2941、2942、2943、2944、2945、2946、2947、2948、2949、2950、2951、2952、2953、2954、2955、2956、2957、2958、2959、2960、2961、2962、2963、2964、2965、2966、2967、2968、2969、2970、2971、2972、2973、2974、2975、2976、2977、2978、2979、2980、2981、2982、2983、2984、2985、2986、2987、2988、2989、2990、2991、2992、2993、2994、2995、2996、2997、2998、2999、3000、3001、3002、3003、3004、3005、3006、3007、3008、3009、3010、3011、3012、3013、3014、3015、3016、3017、3018、3019、3020、3021、3022、3023、3024、3025、3026、3027、3028、3029、3030、3031、3032、3033、3034、3035、3036、3037、3038、3039、3040、3041、3042、3043、3044、3045、3046、3047、3048、3049、3050、3051、3052、3053、3054、3055、3056、3057、3058、3059、3060、3061、3062、3063、3064、3065、3066、3067、3068、3069、3070、3071、3072、3073、3074、3075、3076、3077、3078、3079、3080、3081、3082、3083、3084、3085、3086、3087、3088、3089、3090、3091、3092、3093、3094、3095、3096、3097、3098、3099、3100、3101、3102、3103、3104、3105、3106、3107、3108、3109、3110、3111、3112、3113、3114、3115、3116、3117、3118、3119、3120、3121、3122、3123、3124、3125、3126、3127、3128、3129、3130、3131、3132、3133、3134、3135、3136、3137、3138、3139、3140、3141、3142、3143、3144、3145、3146、3147、3148、3149、3150、3151、3152、3153、3154、3155、3156、3157、3158、3159、3160、3161、3162、3163、3164、3165、3166、3167、3168、3169、3170、3171、3172、3173、3174、3175、3176、3177、3178、3179、3180、3181、3182、3183、3184、3185、3186、3187、3188、3189、3190、3191、3192、3193、3194、3195、3196、3197、3198、3199、3200、3201、3202、3203、3204、3205、3206、3207、3208、3209、3210、3211、3212、3213、3214、3215、3216、3217、3218、3219、3220、3221、3222、3223、3224、3225、3226、3227、3228、3229、3230、3231、3232、3233、3234、3235、3236、3237、3238、3239、3240、3241、3242、3243、3244、3245、3246、3247、3248、3249、および3250ヌクレオチドなどの長さを有していてもよい。ウイルスゲノムの任意のフィラー領域の長さは、50〜100、100〜150、150〜200、200〜250、250〜300、300〜350、350〜400、400〜450、450〜500、500〜550、550〜600、600〜650、650〜700、700〜750、750〜800、800〜850、850〜900、900〜950、950〜1000、1000〜1050、1050〜1100、1100〜1150、1150〜1200、1200〜1250、1250〜1300、1300〜1350、1350〜1400、1400〜1450、1
450〜1500、1500〜1550、1550〜1600、1600〜1650、1650〜1700、1700〜1750、1750〜1800、1800〜1850、1850〜1900、1900〜1950、1950〜2000、2000〜2050、2050〜2100、2100〜2150、2150〜2200、2200〜2250、2250〜2300、2300〜2350、2350〜2400、2400〜2450、2450〜2500、2500〜2550、2550〜2600、2600〜2650、2650〜2700、2700〜2750、2750〜2800、2800〜2850、2850〜2900、2900〜2950、2950〜3000、3000〜3050、3050〜3100、3100〜3150、3150〜3200、および3200〜3250ヌクレオチドであってもよい。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約55ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約56ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約97ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約103ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約105ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約357ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約363ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約712ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約714ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約1203ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約1209ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約1512ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約1519ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約2395ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約2403ヌクレオチド長であるフィラー領域を・ワむ。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約2405ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約3013ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約3021ヌクレオチド長であるフィラー領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つのフィラー配列領域を含む。フィラー配列領域の非限定的な例は、表15に記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、1つのフィラー配列領域を含む。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL18配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、2つのフィラー配列領域を含む。一実施形態において、2つのフィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL2配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL3配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL4配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL5配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域およびFILL3配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL4配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL5配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL5配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域およびFILL12配
列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL14配列領域およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL14配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL14配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL14配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL15配列領域およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL15配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL15配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL16配列領域およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL16配列領域およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL17配列領域およびFILL18配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、3つのフィラー配列領域を含む。一実施形態において、2つのフィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL3配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL4配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL5配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL2配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL4配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL5配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL3配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL5配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL4配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL5配列領域、およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL5配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL5配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL5配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL5配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL5配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL5配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL5配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL5配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL5配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL5配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL5配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL5配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL6配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL6配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL6配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL6配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL6配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL6配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL6配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL6配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL6配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL6配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL6配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL6配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL7配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL7配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL7配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL7配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL7配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL7配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL7配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL7配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL7配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL7配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL7配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL8配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL8配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL8配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL8配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL8配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL8配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL8配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL8配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FIL
L8配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL8配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL9配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL9配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL9配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL9配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL9配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL9配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL9配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL9配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL9配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL10配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL10配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL10配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL10配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL10配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL10配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL10配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL10配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL11配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL11配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL11配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL11配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL11配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL11配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL11配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL12配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL12配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL12配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL12配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL12配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL12配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL13配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL13配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL13配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL13配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL13配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL14配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL14配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL14配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL14配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL1配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL4配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL5配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL3配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL5配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL4配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL5配列領域、およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL5配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL5配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL5配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL5配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL5配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL5配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL5配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL5配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL5配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL5配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL5配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL5配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL6配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形
態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL6配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL6配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL6配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL6配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL6配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL6配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL6配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL6配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL6配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL6配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL6配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL7配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL7配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL7配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL7配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL7配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL7配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL7配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL7配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL7配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL7配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL7配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL8配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL8配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL8配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL8配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL8配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL8配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL8配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL8配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL8配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL8配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL9配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL9配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL9配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL9配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL9配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL9配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL9配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL9配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL9配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL10配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL10配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL10配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL10配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL10配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL10配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL10配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL10配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL11配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL11配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL11配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL11配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL11配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL11配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL11配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL12配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL12配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL12配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL12配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL12配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL12配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL13配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL13配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL13配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL13配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL13配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL14配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL14配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL14配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL14配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL2配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL4配列領域、およびFILL5配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL4配列領域、およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL4配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL4配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL4配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL4配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL4配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL4配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL4配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL4配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL4配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL4配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配
列領域、FILL4配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL4配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL5配列領域、およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL5配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL5配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL5配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL5配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL5配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL5配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL5配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL5配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL5配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL5配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL5配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL5配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL6配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL6配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL6配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列・フ域、FILL6配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL6配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL6配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL6配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL6配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL6配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL6配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL6配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL6配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL7配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL7配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL7配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL7配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL7配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL7配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL7配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL7配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL7配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL7配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL7配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL8配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL8配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL8配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL8配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL8配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL8配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL8配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL8配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL8配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL8配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL9配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL9配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL9配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL9配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL9配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL9配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL9配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL9配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL9配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL10配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL10配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL10配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL10配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL10配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL10配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL10配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL10配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL11配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL11配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL11配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL11配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL11配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL11配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL11配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL12配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL12配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL12配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL12配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL12配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL12配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL13配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL13配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL13配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL13配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL13配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL14配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL14配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL14配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL14配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配
列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL3配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL5配列領域、およびFILL6配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL5配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL5配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL5配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL5配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL5配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL5配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL5配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL5配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL5配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL5配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL5配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL5配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL6配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL6配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL6配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL6配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL6配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL6配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL6配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL6配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL6配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL6配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL6配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL6配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL7配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL7配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL7配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL7配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL7配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL7配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL7配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL7配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL7配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL7配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL7配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL8配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL8配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL8配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL8配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL8配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL8配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL8配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL8配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL8配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL8配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL9配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL9配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL9配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL9配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL9配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL9配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL9配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL9配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL9配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL10配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL10配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL10配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL10配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL10配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL10配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL10配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL10配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL11配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL11配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL11配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL11配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL11配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL11配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL11配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL12配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL12配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL12配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL12配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL12配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL12配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL13配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL13配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL13配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL13配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL13配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL14配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL14配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL14配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL14配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領
域は、FILL4配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL4配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL6配列領域、およびFILL7配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL6配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL6配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL6配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL6配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL6配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL6配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL6配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL6配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL6配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL6配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL6配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL7配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL7配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL7配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL7配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL7配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL7配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL7配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL7配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL7配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL7配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL7配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL8配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL8配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL8配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL8配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL8配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL8配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL8配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL8配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL8配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL8配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL9配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL9配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL9配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL9配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL9配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL9配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL9配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL9配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL9配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL10配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL10配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL10配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL10配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL10配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL10配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL10配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL10配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL11配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL11配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL11配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL11配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL11配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL11配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL11配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL12配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL12配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL12配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL12配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL12配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL12配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL13配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL13配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL13配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL13配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL13配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL14配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL14配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL14配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL14配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL5配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL7配列領域、およびFILL8配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL7配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL7配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL7配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL7配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL7配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FI
LL7配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL7配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL7配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL7配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL7配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL8配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL8配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL8配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL8配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL8配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL8配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL8配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL8配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL8配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL8配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL9配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL9配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL9配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL9配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL9配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL9配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL9配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL9配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL9配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL10配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL10配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL10配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL10配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL10配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL10配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL10配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL10配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL11配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL11配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL11配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL11配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL11配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL11配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL11配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL12配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL12配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL12配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL12配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL12配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL12配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL13配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL13配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL13配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL13配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL13配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL14配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL14配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL14配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL14配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL6配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL8配列領域、およびFILL9配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL8配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL8配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL8配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL8配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL8配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL8配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL8配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL8配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL8配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL9配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL9配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL9配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL9配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL9配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL9配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL9配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL9配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL9配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL10配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL10配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL10配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL10配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL10配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL10配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL10配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL10配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL11配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL11配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL11
配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL11配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL11配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL11配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL11配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL12配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL12配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL12配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL12配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL12配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL12配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL13配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL13配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL13配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL13配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL13配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL14配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL14配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL14配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL14配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL7配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL9配列領域、およびFILL10配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL9配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL9配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL9配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL9配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL9配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL9配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL9配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL9配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL10配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL10配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL10配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL10配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL10配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL10配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL10配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL10配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL11配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL11配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL11配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL11配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL11配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL11配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL11配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL12配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL12配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL12配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL12配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL12配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL12配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL13配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL13配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL13配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL13配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL13配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL14配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL14配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL14配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL14配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL8配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL10配列領域、およびFILL11配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL10配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL10配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL10配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL10配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL10配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL10配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL10配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL11配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL11配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL11配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL11配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL11配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL11配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL11配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL12配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL12配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL12配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形
態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL12配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL12配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL12配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL13配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL13配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL13配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL13配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL13配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL14配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL14配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL14配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL14配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL9配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL11配列領域、およびFILL12配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL11配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL11配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL11配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL11配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL11配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL11配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL12配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL12配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL12配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL12配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL12配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL12配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL13配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL13配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL13配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL13配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL13配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL14配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL14配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL14配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL14配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL10配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL12配列領域、およびFILL13配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL12配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL12配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL12配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL12配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL12配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL13配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL13配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL13配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL13配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL13配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL14配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL14配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL14配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL14配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL11配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL13配列領域、およびFILL14配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL13配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL13配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL13配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL13配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL14配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL14配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL14配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL14配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL12配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域、FILL14配列領域、およびFILL15配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域、FILL14配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域、FILL14配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域、FILL14配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、
フィラー配列領域は、FILL13配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL13配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL14配列領域、FILL15配列領域、およびFILL16配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL14配列領域、FILL15配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL14配列領域、FILL15配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL14配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL14配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL14配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL15配列領域、FILL16配列領域、およびFILL17配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL15配列領域、FILL16配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL15配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。一実施形態において、フィラー配列領域は、FILL16配列領域、FILL17配列領域、およびFILL18配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つのエンハンサー配列領域を含み得る。エンハンサー配列領域は、独立に、限定はされないが、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399、および400ヌクレオチドなどの長さを有していてもよい。ウイルスゲノムのエンハンサー領域の長さは、300〜310、300〜325、305〜315、310〜320、315〜325、320〜330、325〜335、325〜350、330〜340、335〜345、340〜350、345〜355、350〜360、350〜375、355〜365、360〜370、365〜375、370〜380、375〜385、375〜400、380〜390、385〜395、および390〜400ヌクレオチドであってもよい。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約303ヌクレオチド長であるエンハンサー領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約382ヌクレオチド長であるエンハンサー領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つのエンハンサー配列領域を含む。エンハンサー配列領域の非限定的な例は、表16に記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、1つのエンハンサー配列領域を含む。一実施形態において、エンハンサー配列領域は、エンハンサー1配列領域である。一実施形態において、エンハンサー配列領域は、エンハンサー2配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、2つのエンハンサー配列領域を含む。一実施形態において、エンハンサー配列領域は、エンハンサー1配列領域およびエンハンサー2配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つのプロモータ配列領域を含み得る。プロモータ配列領域は、独立に、限定はされないが、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399、400、401、402、403、404、405、406、407、408、409、410、411、412、413、414、415、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、452、453、454、455、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、472、473、474、475、476、477、478、479、480、481、482、483、484、485、486、487、488、489、490、491、492、493、494、495、496、497、498、499、500、501、502、503、504、505、506、507、508、509、510、511、512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、524、525、526、527、528、529、530、531、532、533、534、535、536、537、538、539、540、541、542、543、544、545、546、547、548、549、550、551、552、553、554、555、556、557、558、559、560、561、562、563、564、565、566、567、568、569、570、571、572、573、574、575、576、577、578、579、580、581、582、583、584、585、586、587、588、589、590、591、592、593、594、595、596、597、598、599、および600ヌクレオチドなどの長さを有していてもよい。ウイルスゲノムのプロモータ領域の長さは、4〜10、10〜20、10〜50、20〜30、30〜40、40〜50、50〜60、50〜100、60〜70、70〜80、80〜90、90〜100、100〜110、100〜150、110〜120、120〜130、130〜140、140〜150、150〜160、150〜200、160〜170、170〜180、180〜190、190〜200、200〜210、200〜250、210〜220、220〜230、230〜240、240〜250、250〜260、250〜300、260〜270、270〜280、280〜290、290〜300、300〜310、300〜350、310〜320、320〜330、330〜340、340〜350、350〜360、350〜400、360〜370、370〜380、380〜390、390〜400、400〜410、400〜450、410〜420、420〜430、430〜440、440〜450、450〜460、450〜500、460〜470、470〜480、480〜490、490〜500、500〜510、500〜550、510〜520、520〜530、530〜540、540〜550、550〜560、550〜600、560〜570、570〜580、580〜590、および590〜600ヌクレオチドであってもよい。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約4ヌクレオチド長であるプロモータ領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約17ヌクレオチド長であるプロモータ領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約204ヌクレオチド長であるプロモータ領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約219ヌクレオチド長であるプロモータ領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約260ヌクレオチド長であるプロモータ領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約303ヌクレオチド長であるプロモータ領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約382ヌクレオチド長であるプロモータ領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約588ヌクレオチド長であるプロモータ領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つのプロモータ配列領域を含む。プロモータ配列領域の非限定的な例は、表17に記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、1つのプロモータ配列領域を含む。一実施形態において、プロモータ配列領域はプロモータ1である。一実施形態において、プロモータ配列領域はプロモータ2である。一実施形態において、プロモータ配列領域はプロモータ3である。一実施形態において、プロモータ配列領域はプロモータ4である。一実施形態において、プロモータ配列領域はプロモータ5である。一実施形態において、プロモータ配列領域はプロモータ6である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、2つのプロモータ配列領域を含む。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ1配列領域およびプロモータ2配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ1配列領域およびプロモータ3配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ1配列領域およびプロモータ4配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ1配列領域およびプロモータ5配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ1配列領域およびプロモータ6配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ2配列領域およびプロモータ3配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ2配列領域およびプロモータ4配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ2配列領域およびプロモータ5配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ2配列領域およびプロモータ6配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ3配列領域およびプロモータ4配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ3配列領域およびプロモータ5配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ3配列領域およびプロモータ6配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ4配列領域およびプロモータ5配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ4配列領域およびプロモータ6配列領域である。一実施形態において、プロモータ配列領域は、プロモータ5配列領域およびプロモータ6配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つのエクソン配列領域を含み得る。エクソン領域は、独立に、限定はされないが、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、および150ヌクレオチドなどの長さを有していてもよい。ウイルスゲノムのエクソン領域の長さは、2〜10、5〜10、5〜15、10〜20、10〜30、10〜40、15〜20、15〜25、20〜30、20〜40、20〜50、25〜30、25〜35、30〜40、30〜50、30〜60、35〜40、35〜45、40〜50、40〜60、40〜70、45〜50、45〜55、50〜60、50〜70、50〜80、55〜60、55〜65、60〜70、60〜80、60〜90、65〜70、65〜75、70〜80、70〜90、70〜100、75〜80、75〜85、80〜90、80〜100、80〜110、85〜90、85〜95、90〜100、90〜110、90〜120、95〜100、95〜105、100〜110、100〜120、100〜130、105〜110、105〜115、110〜120、110〜130、110〜140、115〜120、115〜125、120〜130、120〜140、120〜150、125〜130、125〜135、130〜140、130〜150、135〜140、135〜145、140〜150、および145〜150ヌクレオチドであってもよい。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約53ヌクレオチド長であるエクソン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約134ヌクレオチド長であるエクソン領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つのエクソン配列領域を含む。エクソン配列領域の非限定的な例は、表18に記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、1つのエクソン配列領域を含む。一実施形態において、エクソン配列領域は、エクソン1配列領域である。一実施形態において、エクソン配列領域は、エクソン2配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、2つのエクソン領域を含む。一実施形態において、エクソン配列領域は、エクソン1配列領域およびエクソン2配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つのイントロン配列領域を含み得る。イントロン領域は、独立に、限定はされないが、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、および350ヌクレオチドなどの長さを有していてもよい。ウイルスゲノムのイントロン領域の長さは、25〜35、25〜50、35〜45、45〜55、50〜75、55〜65、65〜75、75〜85、75〜100、85〜95、95〜105、100〜125、105〜115、115〜125、125〜135、125〜150、135〜145、145〜155、150〜175、155〜165、165〜175、175〜185、175〜200、185〜195、195〜205、200〜225、205〜215、215〜225、225〜235、225〜250、235〜245、245〜255、250〜275、255〜265、265〜275、275〜285、275〜300、285〜295、295〜305、300〜325、305〜315、315〜325、325〜335、325〜350、および335〜345ヌクレオチドであってもよい。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約32ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約172ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約201ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約347ヌクレオチド長であるイントロン領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つのイントロン配列領域を含む。イントロン配列領域の非限定的な例は、表19に記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、1つのイントロン配列領域を含む。一実施形態において、イントロン配列領域は、イントロン1配列領域である。一実施形態において、イントロン配列領域は、イントロン2配列領域である。一実施形態において、イントロン配列領域は、イントロン3配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、2つのイントロン配列領域を含む。一実施形態において、イントロン配列領域は、イントロン1配列領域およびイントロン2配列領域である。一実施形態において、イントロン配列領域は、イントロン2配列領域およびイントロン3配列領域である。一実施形態において、イントロン配列領域は、イントロン1配列領域およびイントロン3配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、3つのイントロン配列領域を含む。一実施形態において、イントロン配列領域は、イントロン1配列領域、イントロン2配列領域、およびイントロン3配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つのポリアデニル化シグナル配列領域を含み得る。ポリアデニル化シグナル領域配列領域は、独立に、限定はされないが、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397、398、399、400、401、402、403、404、405、406、407、408、409、410、411、412、413、414、415、416、417、418、419、420、421、422、423、424、425、426、427、428、429、430、431、432、433、434、435、436、437、438、439、440、441、442、443、444、445、446、447、448、449、450、451、452、453、454、455、456、457、458、459、460、461、462、463、464、465、466、467、468、469、470、471、472、473、474、475、476、477、478、479、480、481、482、483、484、485、486、487、488、489、490、491、492、493、494、495、496、497、498、499、500、501、502、503、504、505、506、507、508、509、510、511、512、513、514、515、516、517、518、519、520、521、522、523、524、525、526、527、528、529、530、531、532、533、534、535、536、537、538、539、540、541、542、543、544、545、546、547、548、549、550、551、552、553、554、555、556、557、558、559、560、561、562、563、564、565、566、567、568、569、570、571、572、573、574、575、576、577、578、579、580、581、582、583、584、585、586、587、588、589、590、591、592、593、594、595、596、597、598、599、および600ヌクレオチドなどの長さを有していてもよい。ウイルスゲノムのポリアデニル化シグナル配列領域の長さは、4〜10、10〜20、10〜50、20〜30、30〜40、40〜50、50〜60、50〜100、60〜70、70〜80、80〜90、90〜100、100〜110、100〜150、110〜120、120〜130、130〜140、140〜150、150〜160、150〜200、160〜170、170〜180、180〜190、190〜200、200〜210、200〜250、210〜220、220〜230、230〜240、240〜250、250〜260、250〜300、260〜270、270〜280、280〜290、290〜300、300〜310、300〜350、310〜320、320〜330、330〜340、340〜350、350〜360、350〜400、360〜370、370〜380、380〜390、390〜400、400〜410、400〜450、410〜420、420〜430、430〜440、440〜450、450〜460、450〜500、460〜470、470〜480、480〜490、490〜500、500〜510、500〜550、510〜520、520〜530、530〜540、540〜550、550〜560、550〜600、560〜570、570〜580、580〜590、および590〜600ヌクレオチドであってもよい。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約127ヌクレオチド長であるポリアデニル化シグナル配列領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約225ヌクレオチド長であるポリアデニル化シグナル配列領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約476ヌクレオチド長であるポリアデニル化シグナル配列領域を含む。非限定的な例として、ウイルスゲノムは、約477ヌクレオチド長であるポリアデニル化シグナル配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つのポリアデニル化(ポリA)シグナル配列領域を含む。ポリAシグナル配列領域の非限定的な例は、表20に記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、1つのポリAシグナル配列領域を含む。一実施形態において、ポリAシグナル配列領域は、ポリA1配列領域である。一実施形態において、ポリAシグナル配列領域は、ポリA2配列領域である。一実施形態において、ポリAシグナル配列領域は、ポリA3配列領域である。一実施形態において、ポリAシグナル配列領域は、ポリA4配列領域である。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、2つ以上のポリAシグナル配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、少なくとも1つの末端逆位配列(ITR)配列領域、少なくとも1つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、少なくとも1つのエンハンサー配列領域、少なくとも1つのプロモータ配列領域、少なくとも1つのエクソン配列領域、少なくとも1つのイントロン配列領域、少なくとも1つの調節性ポリヌクレオチド領域、少なくとも1つのポリアデニル化シグナル配列領域、および少なくとも1つのフィラー配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、エンハンサー配列領域、プロモータ配列領域、イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表21に記載される。表21には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT1(配列番号1352))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1352(VOYHT1)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1353(VOYHT2)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1354(VOYHT3)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1355(VOYHT4)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表22に記載される。表22には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT5(配列番号1356))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1356(VOYHT5)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1357(VOYHT6)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1358(VOYHT7)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1359(VOYHT8)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、エンハンサー配列領域、プロモータ配列領域、イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびに2つのフィラー配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびに2つのフィラー配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表23に記載される。表23には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT9(配列番号1360))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびに2つのフィラー配列領域を含む配列番号1360(VOYHT9)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびに2つのフィラー配列領域を含む配列番号1361(VOYHT10)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびに2つのフィラー配列領域を含む配列番号1362(VOYHT11)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域、ならびに2つのフィラー配列領域を含む配列番号1363(VOYHT12)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、エンハンサー配列領域、プロモータ配列領域、イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにポリアデニル化シグナル配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表24に記載される。表24には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT13(配列番号1364))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1364(VOYHT13)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つの多重クローニング部位(MCS)配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1365(VOYHT14)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、エンハンサー配列領域、プロモータ配列領域、イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにポリアデニル化シグナル配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表25〜29に記載される。表25〜29には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT15(配列番号1366))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1366(VOYHT15)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1367(VOYHT16)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1388(VOYHT35)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1426(VOYHT36)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1427(VOYHT37)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1428(VOYHT38)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1429(VOYHT39)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1430(VOYHT40)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1431(VOYHT41)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1432(VOYHT42)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1433(VOYHT43)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1434(VOYHT44)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1435(VOYHT45)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1436(VOYHT46)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1437(VOYHT47)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CBAプロモータ配列領域、SV40イントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにウサギグロビンポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1438(VOYHT48)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、MCS配列領域、エンハンサー配列領域、プロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域、2つのイントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、MCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin intron2またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表30に記載される。表30には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT17(配列番号1368))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、MCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin intron2またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1368(VOYHT17)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、MCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin intron2またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表31に記載される。表31には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT19(配列番号1370))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、MCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1370(VOYHT19)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、エンハンサー配列領域、プロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域、2つのイントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表32に記載される。表32には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT18(配列番号1369))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1369(VOYHT18)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表33に記載される。表33には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT20(配列番号1371))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1371(VOYHT20)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表34に記載される。表34には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT21(配列番号1372))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1372(VOYHT21)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびにフィラー配列領域を含む配列番号1373(VOYHT22)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、MCS配列領域、エンハンサー配列領域、プロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域、2つのイントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびに2つのフィラー配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、MCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびに2つのフィラー配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表35に記載される。表35には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT23(配列番号1374))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、MCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびに2つのフィラー配列領域を含む配列番号1374(VOYHT23)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、エンハンサー配列領域、プロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域、2つのイントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびに2つのフィラー配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびに2つのフィラー配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表36に記載される。表36には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT24(配列番号1375))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域、ならびに2つのフィラー配列領域を含む配列番号1375(VOYHT24)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、エンハンサー配列領域、プロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域、2つのイントロン配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにポリアデニル化シグナル配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表37に記載される。表37には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT25(配列番号1376))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1376(VOYHT25)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、2つのMCS配列領域、CMVエンハンサー配列領域、CMVプロモータ配列領域、2つのエクソン配列領域(ie1 exon1およびヒトベータグロビン(hbglobin)exon3またはそれらの断片)、2つのイントロン配列領域(ie1 intron1およびhbglobin exon3またはそれらの断片)、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにヒト成長ホルモン(hGH)ポリアデニル化シグナル配列領域を含む配列番号1377(VOYHT26)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、プロモータ配列領域、ならびに調節性ポリヌクレオチド領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、H1プロモータ配列領域、ならびに調節性ポリヌクレオチド領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表38に記載される。表38には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT27(配列番号1378))が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、H1プロモータ配列領域、ならびに調節性ポリヌクレオチド領域を含む配列番号1378(VOYHT27)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、5’末端逆位配列(ITR)配列領域および3’ITR配列領域、H1プロモータ配列領域、ならびに調節性ポリヌクレオチド領域を含む配列番号1379(VOYHT28)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、1つまたは2つのプロモータ配列領域、調節性ポリヌクレオチド配列領域、およびウシ成長ホルモン(bGH)ポリアデニル化シグナル配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、2つのプロモータ配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、およびポリアデニル化シグナル配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、CMVおよびT7プロモータ配列領域、調節性ポリヌクレオチド領域、ならびにbGHポリアデニル化シグナル配列領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用されるITR〜ITR配列の非限定的な例は、表39に記載される。表39には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT29)が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、CMVプロモータ配列領域(配列番号1411)、T7プロモータ配列領域(配列番号1414)、調節性ポリヌクレオチド配列領域(配列番号1249)、およびbGHポリアデニル化シグナル配列領域(配列番号1421)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、CMVプロモータ配列領域(配列番号1411)、T7プロモータ配列領域(配列番号1414)、調節性ポリヌクレオチド配列領域(配列番号1259)、およびbGHポリアデニル化シグナル配列領域(配列番号1421)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、CMVプロモータ配列領域(配列番号1411)、T7プロモータ配列領域(配列番号1414)、調節性ポリヌクレオチド配列領域(配列番号1255)、およびbGHポリアデニル化シグナル配列領域(配列番号1421)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、CMVプロモータ配列領域(配列番号1411)、T7プロモータ配列領域(配列番号1414)、調節性ポリヌクレオチド配列領域(配列番号1253)、およびbGHポリアデニル化シグナル配列領域(配列番号1421)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、1つまたは2つのプロモータ配列領域、および調節性ポリヌクレオチド配列領域を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、CMVおよびT7プロモータ配列領域、および調節性ポリヌクレオチド領域を含む。上記の配列モジュールを全て有する本発明のAAV粒子に使用される配列の非限定的な例は、表40に記載される。表40には、配列領域の配列識別名または配列(領域配列番号)および配列領域の長さ(領域長)、ならびにITR〜ITR配列の名称および配列識別名(例えば、VOYHT33)が記載される。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、CMVプロモータ配列領域(配列:GTTG)、H1プロモータ配列領域(配列番号1413)、および調節性ポリヌクレオチド配列領域(配列番号1249)を含む。
一実施形態において、AAV粒子ウイルスゲノムは、H1プロモータ配列領域(配列番号1413)、および調節性ポリヌクレオチド配列領域(配列番号1259)を含む。
AAV粒子は、送達効率が増強されるように修飾されてもよい。本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むかかる修飾AAVベクターは、効率的にパッケージングすることができ、高頻度でおよび最低限の毒性でおよび標的細胞への感染を成功させるために使用することができる。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、ヒト血清型AAV粒子であってもよい。かかるヒトAAV粒子は、任意の既知の血清型、例えば血清型AAV1〜AAV11のいずれか1つに由来し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、AAV1由来カプシドにAAV1由来ゲノムを含むベクター;AAV2由来カプシドにAAV2由来ゲノムを含むベクター;AAV4由来カプシドにAAV4由来ゲノムを含むベクター;AAV6由来カプシドにAAV6由来ゲノムを含むベクターまたはAAV9由来カプシドにAAV9由来ゲノムを含むベクターであってもよい。
他の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、少なくとも2つの異なるAAV血清型を起源とする配列および/または成分を含有するシュードタイプハイブリッドまたはキメラAAV粒子であってもよい。シュードタイプAAV粒子は、あるAAV血清型に由来するAAVゲノムと、少なくとも一部が異なるAAV血清型に由来するカプシドタンパク質とを含むベクターであってもよい。非限定的な例として、かかるシュードタイプAAV粒子は、AAV1由来カプシドにAAV2由来ゲノムを含むベクター;またはAAV6由来カプシドにAAV2由来ゲノムを含むベクター;またはAAV4由来カプシドにAAV2由来ゲノム;もしくはAAV9由来カプシドにAAV2由来ゲノムを含むベクターであってもよい。同様に、本発明は、任意のハイブリッドまたはキメラAAV粒子を企図する。
他の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、中枢神経系へのsiRNA分子の送達に使用されてもよい(例えば、米国特許第6,180,613号明細書;この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
一部の態様において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、非ウイルス起源のペプチドを含む修飾カプシドを更に含み得る。他の態様において、コード化siRNA二重鎖の脳および脊髄への送達を促進するため、AAV粒子はCNS特異的キメラカプシドを含んでもよい。例えば、CNS向性を呈するAAVバリアントからのcapヌクレオチド配列のアラインメントを作成することにより可変領域(VR)配列および構造を同定してもよい。
ウイルス作製
本開示は、ウイルス複製細胞をAAVポリヌクレオチドまたはAAVゲノムに接触させることを含む、ウイルス複製細胞におけるウイルスゲノム複製によるパルボウイルス粒子、例えばAAV粒子の作成方法を提供する。
本開示は、1)コンピテント細菌細胞にバクミドベクターおよびウイルスコンストラクトベクターおよび/またはAAVペイロードコンストラクトベクターのいずれかをコトランスフェクトするステップ、2)得られたウイルスコンストラクト発現ベクターおよびAAVペイロードコンストラクト発現ベクターを単離し、ウイルス複製細胞を個別にトランスフェクトするステップ、3)ウイルスコンストラクト発現ベクターまたはAAVペイロードコンストラクト発現ベクターを含む得られたペイロードおよびウイルスコンストラクト粒子を単離および精製するステップ、4)ウイルス複製細胞に、ウイルスコンストラクト発現ベクターまたはAAVペイロードコンストラクト発現ベクターを含むAAVペイロードおよびウイルスコンストラクト粒子の両方を共感染させるステップ、5)パルボウイルスゲノムを含むウイルス粒子を回収および精製するステップを含む、形質導入効率が増強された(増加した、向上した)AAV粒子の作製方法を提供する。
一実施形態において、本発明は、1)限定はされないがHEK293細胞などの哺乳類細胞にペイロード領域、repおよびcap遺伝子を発現するコンストラクトならびにヘルパーコンストラクトを同時にコトランスフェクトするステップ、2)ウイルスゲノムを含むAAV粒子を回収および精製するステップを含む、AAV粒子の作製方法を提供する。
細胞
本開示は、AAVポリヌクレオチドおよび/またはAAVゲノムを含む細胞を提供する。
本明細書に開示されるウイルス作製は、ペイロード分子をコードするポリヌクレオチド配列を含むペイロードコンストラクト、例えば組換えウイルスコンストラクトを送達するため標的細胞に接触するAAV粒子の作製プロセスおよび方法を記載する。
一実施形態において、AAV粒子は、昆虫細胞を含むウイルス複製細胞で作製されてもよい。
培養下の昆虫細胞の成長条件、および培養下の昆虫細胞における異種産物の産生は当該技術分野において周知であり、米国特許第6,204,059号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)を参照されたい。
本発明においては、パルボウイルスの複製を可能にする、かつ培養下に維持することのできる任意の昆虫細胞を使用することができる。細胞株は、限定はされないがSf9またはSf21細胞株を含めたスポドプテラ・フルギペルダ(Spodoptera frugiperda)からの細胞株、ショウジョウバエ属(Drosophila)細胞株、またはヒトスジシマカ(Aedes albopictus)由来細胞株などの蚊細胞株が用いられてもよい。異種タンパク質を発現させるための昆虫細胞の使用については、ベクター、例えば昆虫細胞適合性ベクターなどの核酸をかかる細胞に導入する方法、および培養下のかかる細胞を維持する方法と同様に、十分に実証されている。例えば、「分子生物学の方法(Methods in Molecular Biology)」、リチャード(Richard)編、ヒューマナ・プレス(Humana Press)、ニュージャージー州、1995年;オライリー(O’Reilly)ら著、「バキュロウイルス発現ベクター、実験マニュアル(Baculovirus Expression Vectors,A Laboratory Manual)」、オックスフォード大学出版局(Oxford Univ.Press)、1994年;サムルスキ(Samulski)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir.)、第63巻、p.3822〜8、1989年;カジガヤ(Kajigaya)ら著、米国科学アカデミー紀要(Proc.Nat’l.Acad.Sci.USA)、第88巻、p.4646〜50、1991年;ラフィング(Ruffing)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J.Vir.)、第66巻、p.6922〜30、1992年;キムバウアー(Kimbauer)ら著、バイロロジー(Vir.)、第219巻、p.37〜44、1996年;チャオ(Zhao)ら著、バイロロジー(Vir.)、第272巻、p.382〜93、2000年;およびサムルスキ(Samulski)ら著、米国特許第6,204,059号明細書を参照されたく、これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される。
ウイルス複製細胞は、原核生物(例えば細菌)細胞、ならびに昆虫細胞、酵母細胞および哺乳類細胞を含めた真核細胞を含め、任意の生物学的有機体から選択されてもよい。ウイルス複製細胞には、A549、WEH1、3T3、10T1/2、BHK、MDCK、COS 1、COS 7、BSC 1、BSC 40、BMT 10、VERO、W138、HeLa、HEK293、Saos、C2C12、L細胞、HT1080、HepG2ならびに哺乳類に由来する初代線維芽細胞、ヘパトサイトおよび筋芽細胞など、哺乳類細胞が含まれ得る。ウイルス複製細胞には、限定はされないが、ヒト、サル、マウス、ラット、ウサギ、およびハムスターを含めた哺乳類種、または限定はされないが、線維芽細胞、ヘパトサイト、腫瘍細胞、細胞株形質転換細胞等を含めた細胞型に由来する細胞が含まれる。
AAV粒子の小規模作製
本明細書に開示されるウイルス作製は、ペイロードをコードするポリヌクレオチド配列を含むペイロード、例えば組換えウイルスコンストラクトを送達するため標的細胞に接触するAAV粒子の作製プロセスおよび方法を記載する。
一実施形態において、AAV粒子は、哺乳類細胞を含むウイルス複製細胞で作製されてもよい。
組換えAAV粒子の作製に一般的に使用されるウイルス複製細胞としては、限定はされないが、米国特許第6,156,303号明細書、同第5,387,484号明細書、同第5,741,683号明細書、同第5,691,176号明細書、および同第5,688,676号明細書;米国特許出願公開第2002/0081721号明細書、および国際公開第00/47757号パンフレット、同第00/24916号パンフレット、および同第96/17947号パンフレット(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの、293細胞、COS細胞、HeLa細胞、KB細胞、および他の哺乳類細胞株が挙げられる。
一実施形態において、AAV粒子は哺乳類細胞で作製され、ここでは3つ全てのVPタンパク質が1:1:10(VP1:VP2:VP3)に近い化学量論で発現する。この制御された発現レベルを実現する調節機構には、差次的スプライシングによって作製される、一方がVP1用、および他方がVP2およびVP3用の2つのmRNAの作製が含まれる。
別の実施形態において、AAV粒子はトリプルトランスフェクション方法を用いて哺乳類細胞で作製され、ここではペイロードコンストラクトとパルボウイルスRepおよびパルボウイルスCapとヘルパーコンストラクトとが3つの異なるコンストラクト内に含まれる。AAV粒子作製の3成分のトリプルトランスフェクション方法を利用して、形質導入効率、標的組織(向性)評価、および安定性を含めたアッセイ用の小規模ロットのウイルスを作製し得る。
バキュロウイルス
本明細書に開示される粒子作製は、ペイロードをコードするポリヌクレオチド配列を含むペイロードコンストラクトを送達するため標的細胞に接触するAAV粒子の作製プロセスおよび方法を記載する。
簡潔に言えば、ウイルスコンストラクトベクターおよびAAVペイロードコンストラクトベクターが、各々、公知の、当業者によって実施されている標準的な分子生物学的技術により、トランスポゾンドナー/アクセプターシステムによってバキュロウイルスプラスミドとしても知られるバクミドに取り込まれる。別個のウイルス複製細胞集団のトランスフェクションにより2つのバキュロウイルスが生じ、一方はウイルスコンストラクト発現ベクターを含み、もう一方はAAVペイロードコンストラクト発現ベクターを含む。これらの2つのバキュロウイルスを使用して単一のウイルス複製細胞集団を感染させて、AAV粒子を作製し得る。
限定はされないが、スポドプテラ・フルギペルダ(Spodoptera frugiperda)(Sf9)細胞を含め、昆虫細胞においてウイルス粒子を作製するためのバキュロウイルス発現ベクターは、高力価のウイルス粒子産物を提供する。ウイルスコンストラクト発現ベクターおよびAAVペイロードコンストラクト発現ベクターをコードする組換えバキュロウイルスは、ウイルス複製細胞の増殖性感染を惹起する。初感染から放出された感染性バキュロウイルス粒子は培養物中の更なる細胞に二次感染し、初期感染多重度の関数である所定回数の感染サイクルで細胞培養物集団全体に指数関数的に感染する。ウラベ・M(Urabe,M.)ら著、ジャーナル・オブ・バイロロジー(J Virol.)、2006年2月、第80巻、第4号、p.1874〜85(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)を参照されたい。
昆虫細胞系におけるバキュロウイルスによるAAV粒子の作製は、公知のバキュロウイルスの遺伝的および物理的不安定性に対処し得る。一実施形態において、この作製システムは、タイターレス感染細胞保存およびスケールアップシステムを利用することにより複数継代をかけてバキュロウイルスの不安定性に対処する。ウイルス作製細胞の小規模シード培養物に、ウイルス粒子の構造、非構造成分をコードするウイルス発現コンストラクトがトランスフェクトされる。バキュロウイルス感染ウイルス作製細胞がアリコートに回収され、それが液体窒素で凍結保存され得る;アリコートは、大規模ウイルス作製細胞培養物の感染のための生存能力および感染力を維持している。ワシルコ・DJ(Wasilko DJ)ら著、プロテイン・エクスプレッション・アンド・ピュリフィケーション(Protein Expr Purif.)、2009年6月、第65巻、第2号、p.122〜32、この内容は本明細書において全体として参照により援用される。
遺伝的に安定したバキュロウイルスを使用して、無脊椎動物細胞においてAAV粒子を作製するための成分のうちの1つ以上の供給源を作製してもよい。一実施形態において、欠損バキュロウイルス発現ベクターが昆虫細胞のエピソームに保持されてもよい。かかる実施形態においてバクミドベクターは、限定はされないが、プロモータ、エンハンサー、および/または細胞周期調節性複製エレメントを含め、複製制御エレメントで操作される。
一実施形態において、バキュロウイルスは、キチナーゼ/カテプシン遺伝子座への組換えのため(非)選択可能マーカで操作されてもよい。組織培養におけるバキュロウイルスの増殖にchia/v−cath遺伝子座は非必須であり、V−cath(EC 3.4.22.50)は、Arg−Argジペプチド含有基質上で最も活性が高いシステインエンドプロテアーゼである。Arg−Argジペプチドはデンソウイルスおよびパルボウイルスカプシド構造タンパク質に存在するが、ディペンドウイルスVP1にはまれにしか見られない。
一実施形態において、バキュロウイルス感染に許容的な安定ウイルス複製細胞は、限定はされないが、AAVゲノム全体、RepおよびCap遺伝子、Rep遺伝子、Cap遺伝子、別個の転写カセットとしての各Repタンパク質、別個の転写カセットとしての各VPタンパク質、AAP(アセンブリ活性化タンパク質)、または天然もしくは非天然プロモータを有するバキュロウイルスヘルパー遺伝子のうちの少なくとも1つを含め、AAV複製およびウイルス粒子産生に必要なエレメントのいずれかの少なくとも1つの安定に組み込まれたコピーで操作される。
大規模作製
一部の実施形態において、AAV粒子作製は、作製規模を増加させるように改良されてもよい。本開示に係る大規模ウイルス作製方法には、米国特許第5,756,283号明細書、同第6,258,595号明細書、同第6,261,551号明細書、同第6,270,996号明細書、同第6,281,010号明細書、同第6,365,394号明細書、同第6,475,769号明細書、同第6,482,634号明細書、同第6,485,966号明細書、同第6,943,019号明細書、同第6,953,690号明細書、同第7,022,519号明細書、同第7,238,526号明細書、同第7,291,498号明細書および同第7,491,508号明細書または国際公開第1996039530号パンフレット、同第1998010088号パンフレット、同第1999014354号パンフレット、同第1999015685号パンフレット、同第1999047691号パンフレット、同第2000055342号パンフレット、同第2000075353号パンフレットおよび同第2001023597号パンフレット(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に教示されるもののいずれかが含まれてもよい。ウイルス粒子作製規模を増加させる方法は、典型的には、ウイルス複製細胞の数を増加させることを含む。一部の実施形態において、ウイルス複製細胞は接着細胞を含む。接着ウイルス複製細胞によるウイルス粒子作製規模の増加には、より大きい細胞培養表面が必要である。ある場合には、大規模作製方法は、細胞培養表面を増加させるためのローラボトルの使用を含む。表面積が増加した他の細胞培養基材が当該技術分野において公知である。表面積が増加した更なる接着細胞培養製品の例としては、限定はされないが、セルスタック(登録商標)(CELLSTACK(登録商標))、セルキューブ(登録商標)(CELLCUBE(登録商標))(コーニング社(Corning Corp.)、ニューヨーク州コーニング(Corning))およびヌンク(商標)(NUNC(商標))セル・ファクトリー(商標)(CELL FACTORY(商標))(サーモ・サイエンティフィック(Thermo Scientific)、マサチューセッツ州ウォルサム(Waltham))が挙げられる。ある場合には、大規模接着細胞表面は約1,000cm〜約100,000cmを含み得る。ある場合には、大規模接着細胞培養物は、約10〜約10細胞、約10〜約1010細胞、約10〜約1012細胞または少なくとも1012細胞を含み得る。ある場合には、大規模接着培養物は、約10〜約1012、約1010〜約1013、約1011〜約1014、約1012〜約1015または少なくとも1015ウイルス粒子を作製し得る。
一部の実施形態において、本開示の大規模ウイルス作製方法は浮遊細胞培養の使用を含み得る。浮遊細胞培養は細胞数の大幅な増加を可能にする。典型的には、約10〜50cmの表面積で成長させることのできる接着細胞数を懸濁液中では約1cmの体積で成長させることができる。
大規模培養フォーマットでの複製細胞のトランスフェクションは、当該技術分野において公知の任意の方法により行われてもよい。大規模接着細胞培養には、トランスフェクション方法として、限定はされないが、無機化合物(例えばリン酸カルシウム)、有機化合物[例えばポリエチレンイミン(PEI)]の使用または非化学的方法(例えば電気穿孔)の使用を挙げることができる。懸濁液中で成長させる細胞では、トランスフェクション方法として、限定はされないが、リン酸カルシウムの使用およびPEIの使用を挙げることができる。ある場合には、大規模浮遊培養物のトランスフェクションは、Feng.L.ら2008年、バイオテクノロジー・アンド・アプライド・バイオケミストリー(Biotechnol Appl.Biochem.)、第50巻、p.121〜32(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される「トランスフェクション手順(Transfection Procedure)」と題される節に従い行われてもよい。かかる実施形態によれば、トランスフェクトしようとするプラスミドの導入用にPEI−DNA複合体が形成され得る。ある場合には、PEI−DNA複合体をトランスフェクトされる細胞に、トランスフェクション前に「ショック」が与えられてもよい。これは、細胞培養物温度を約1時間にわたって4℃に下げることを含む。ある場合には、約10分〜約5時間の時間にわたって細胞培養物にショックが与えられてもよい。ある場合には、約0℃〜約20℃の温度で細胞培養物にショックが与えられてもよい。
ある場合には、トランスフェクションは、1つ以上のAAVペイロードコンストラクトからの核酸の発現を低下させるため1つ以上のRNAエフェクター分子発現ベクターを含み得る。かかる方法は、ペイロードコンストラクトの発現に浪費される細胞リソースを減少させることによりウイルス粒子の産生を増強し得る。ある場合には、かかる方法は、米国特許出願公開第2014/0099666号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に教示されるものに従い行われてもよい。
バイオリアクター
一部の実施形態において、大規模ウイルス作製には細胞培養バイオリアクターが用いられ得る。ある場合には、バイオリアクターは撹拌槽型リアクターを含む。かかるリアクターは、概して、典型的には円筒形状の、撹拌機(例えばインペラ)を備えたベッセルを含む。一部の実施形態において、かかるバイオリアクターベッセルは、ベッセル温度を制御し、および/または周囲温度の変化による影響を最小限に抑えるため、ウォータジャケット内に置かれ得る。バイオリアクターベッセル容積は、サイズが約500ml〜約2L、約1L〜約5L、約2.5L〜約20L、約10L〜約50L、約25L〜約100L、約75L〜約500L、約250L〜約2,000L、約1,000L〜約10,000L、約5,000L〜約50,000Lまたは少なくとも50,000Lの範囲であり得る。ベッセルの底は丸底または平底であり得る。ある場合には、動物細胞培養物が丸底ベッセルのバイオリアクターに維持され得る。
ある場合には、バイオリアクターベッセルはサーモサーキュレータを用いて温められてもよい。サーモサーキュレータは熱水をウォータジャケットの周りに圧送する。ある場合には、熱水は、バイオリアクターベッセル内に存在する管(例えばコイル管)を通じて圧送されてもよい。ある場合には、限定はされないが、培養培地の真上にある空気層を含め、バイオリアクターの周りに温風が循環してもよい。加えて、細胞生存が最適となるようにpHおよびCOレベルが維持され得る。
ある場合には、バイオリアクターは中空糸リアクターを含み得る。中空糸バイオリアクターは、足場依存性および足場非依存性の両方の細胞の培養を支持し得る。更なるバイオリアクターとしては、限定はされないが、充填床または固定床バイオリアクターを挙げることができる。かかるバイオリアクターは、接着細胞の付着用ガラスビーズを有するベッセルを含み得る。更なる充填床リアクターはセラミックビーズを含み得る。
ある場合には、ウイルス粒子は使い捨てバイオリアクターを用いて作製される。一部の実施形態において、かかるバイオリアクターとしては、ウェーブ(商標)(WAVE(商標))使い捨てバイオリアクターを挙げることができる。
一部の実施形態において、動物細胞バイオリアクター培養物におけるAAV粒子作製は、米国特許第5,064764号明細書、同第6,194,191号明細書、同第6,566,118号明細書、同第8,137,948号明細書または米国特許出願公開第2011/0229971号明細書(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に教示される方法により行われてもよい。
細胞溶解
本発明の細胞は、限定はされないがウイルス作製細胞を含め、当該技術分野において公知の任意の方法により細胞溶解に供されてもよい。細胞溶解は、本発明の任意の細胞内に存在する1つ以上の薬剤(例えばウイルス粒子)を入手するために行われ得る。一部の実施形態において、細胞溶解は、米国特許第7,326,555号明細書、同第7,579,181号明細書、同第7,048,920号明細書、同第6,410,300号明細書、同第6,436,394号明細書、同第7,732,129号明細書、同第7,510,875号明細書、同第7,445,930号明細書、同第6,726,907号明細書、同第6,194,191号明細書、同第7,125,706号明細書、同第6,995,006号明細書、同第6,676,935号明細書、同第7,968,333号明細書、同第5,756,283号明細書、同第6,258,595号明細書、同第6,261,551号明細書、同第6,270,996号明細書、同第6,281,010号明細書、同第6,365,394号明細書、同第6,475,769号明細書、同第6,482,634号明細書、同第6,485,966号明細書、同第6,943,019号明細書、同第6,953,690号明細書、同第7,022,519号明細書、同第7,238,526号明細書、同第7,291,498号明細書および同第7,491,508号明細書または国際公開第1996039530号パンフレット、同第1998010088号パンフレット、同第1999014354号パンフレット、同第1999015685号パンフレット、同第1999047691号パンフレット、同第2000055342号パンフレット、同第2000075353号パンフレットおよび同第2001023597号パンフレット(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に挙げられる方法のいずれかにより行われてもよい。細胞溶解方法は化学的または機械的であってもよい。化学的細胞溶解は、典型的には、1つ以上の細胞を1つ以上の溶解剤と接触させることを含む。機械的溶解は、典型的には、1つ以上の細胞を1つ以上の溶解条件および/または1つ以上の溶解力に供することを含む。
一部の実施形態では、化学的溶解を用いて細胞が溶解されてもよい。本明細書で使用されるとき、用語「溶解剤」は、細胞の破壊を助け得る任意の薬剤を指す。ある場合には、溶解剤は溶液中に導入され、溶解溶液または溶解緩衝液と呼ばれる。本明細書で使用されるとき、用語「溶解溶液」は、1つ以上の溶解剤を含む溶液(典型的には水性)を指す。溶解剤に加えて、溶解溶液は、1つ以上の緩衝剤、可溶化剤、界面活性剤、保存剤、凍結保護物質、酵素、酵素阻害薬および/またはキレータを含み得る。溶解緩衝液は、1つ以上の緩衝剤を含む溶解溶液である。溶解溶液の更なる成分としては、1つ以上の可溶化剤を挙げることができる。本明細書で使用されるとき、用語「可溶化剤」は、溶液の1つ以上の成分の溶解度および/または溶液が適用される1つ以上の実体の溶解度を増強する化合物を指す。ある場合には、可溶化剤はタンパク質溶解度を増強する。ある場合には、可溶化剤は、タンパク質のコンホメーションおよび/または活性を維持しながらもタンパク質溶解度を増強するその能力に基づき選択される。
例示的溶解剤としては、米国特許第8,685,734号明細書、同第7,901,921号明細書、同第7,732,129号明細書、同第7,223,585号明細書、同第7,125,706号明細書、同第8,236,495号明細書、同第8,110,351号明細書、同第7,419,956号明細書、同第7,300,797号明細書、同第6,699,706号明細書および同第6,143,567号明細書(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるもののいずれかを挙げることができる。ある場合には、溶解剤は、溶解塩、両性薬剤、カチオン性薬剤、イオン性界面活性剤および非イオン性界面活性剤から選択され得る。溶解塩としては、限定はされないが、塩化ナトリウム(NaCl)および塩化カリウム(KCl)を挙げることができる。更なる溶解塩としては、米国特許第8,614,101号明細書、同第7,326,555号明細書、同第7,579,181号明細書、同第7,048,920号明細書、同第6,410,300号明細書、同第6,436,394号明細書、同第7,732,129号明細書、同第7,510,875号明細書、同第7,445,930号明細書、同第6,726,907号明細書、同第6,194,191号明細書、同第7,125,706号明細書、同第6,995,006号明細書、同第6,676,935号明細書および同第7,968,333号明細書(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるもののいずれかを挙げることができる。塩の濃度は、細胞膜を破裂させる有効濃度が得られるように増加または減少させてもよい。両性薬剤とは、本明細書において参照されるとき、酸または塩基として反応する能力を有する化合物である。両性薬剤としては、限定はされないが、リゾホスファチジルコリン、3−((3−コラミドプロピル)ジメチルアンモニウム)−1−プロパンスルホネート(CHAPS)、ツヴィッタージェント(登録商標)(ZWITTERGENT(登録商標))などを挙げることができる。カチオン性薬剤としては、限定はされないが、臭化セチルトリメチルアンモニウム(C(16)TAB)および塩化ベンザルコニウムを挙げることができる。界面活性剤を含む溶解剤には、イオン性界面活性剤または非イオン性界面活性剤が含まれ得る。界面活性剤は、限定はされないが、細胞膜、細胞壁、脂質、炭水化物、リポタンパク質および糖タンパク質を含めた細胞構造を分解するまたは溶解させる働きをし得る。例示的イオン性界面活性剤としては、米国特許第7,625,570号明細書および同第6,593,123号明細書または米国特許出願公開第2014/0087361号明細書(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に教示されるもののいずれかが挙げられる。幾つかのイオン性界面活性剤としては、限定はされないが、ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)、コール酸塩およびデオキシコール酸塩を挙げることができる。ある場合には、イオン性界面活性剤は溶解溶液中に可溶化剤として含まれてもよい。非イオン性界面活性剤としては、限定はされないが、オクチルグルコシド、ジギトニン、ルブロール、C12E8、ツイーン(登録商標)−20(TWEEN(登録商標)−20)、ツイーン(登録商標)−80(TWEEN(登録商標)−80)、トリトンX−100(Triton X−100)およびノニデットP−40(Noniodet P−40)を挙げることができる。非イオン性界面活性剤は、典型的には弱溶解剤であるが、細胞性および/またはウイルス性タンパク質を可溶化するための可溶化剤として含まれてもよい。更なる溶解剤としては、酵素および尿素を挙げることができる。ある場合には、細胞溶解およびタンパク質溶解度のうちの1つ以上を増強するため、1つ以上の溶解剤が溶解溶液中に組み合わされてもよい。ある場合には、細胞膜破壊によって引き起こされ得るタンパク質分解を防ぐため、酵素阻害薬が溶解溶液中に含まれてもよい。
一部の実施形態において、機械的細胞溶解が行われる。機械的細胞溶解方法としては、1つ以上の溶解条件および/または1つ以上の溶解力の使用を挙げることができる。本明細書で使用されるとき、用語「溶解条件」とは、細胞破壊を促進する状態または状況を指す。溶解条件には、特定の温度、圧力、浸透圧純度、塩分などが含まれ得る。ある場合には、溶解条件には温度の増加または低下が含まれる。一部の実施形態によれば、溶解条件には、細胞破壊を促進する温度の変化が含まれる。かかる実施形態により行われる細胞溶解には、凍結融解溶解が含まれ得る。本明細書で使用されるとき、用語「凍結融解溶解」とは、細胞溶液が1回以上の凍結融解サイクルに供される細胞溶解を指す。凍結融解溶解方法によれば、溶液中の細胞が凍結されて、氷の結晶の形成および拡大によって引き起こされる細胞膜の機械的破壊が誘導される。凍結融解溶解方法により用いられる細胞溶液としては、1つ以上の溶解剤、可溶化剤、緩衝剤、凍結保護物質、界面活性剤、保存剤、酵素、酵素阻害薬および/またはキレータを更に挙げることができる。凍結に供した細胞溶液を解凍すると、かかる成分が所望の細胞産物の回収を増強し得る。ある場合には、凍結融解溶解を受ける細胞溶液中に1つ以上の凍結保護物質が含まれる。本明細書で使用されるとき、用語「凍結保護物質」は、1つ以上の物質を凍結に起因する損傷から保護するために使用される薬剤を指す。凍結保護物質としては、米国特許出願公開第2013/0323302号明細書または米国特許第6,503,888号明細書、同第6,180,613号明細書、同第7,888,096号明細書、同第7,091,030号明細書(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に教示されるもののいずれかを挙げることができる。ある場合には、凍結保護物質としては、限定はされないが、ジメチルスルホキシド、1,2−プロパンジオール、2,3−ブタンジオール、ホルムアミド、グリセロール、エチレングリコール、1,3−プロパンジオールおよびn−ジメチルホルムアミド、ポリビニルピロリドン、ヒドロキシエチルデンプン、アガロース、デキストラン類、イノシトール、グルコース、ヒドロキシエチルデンプン、ラクトース、ソルビトール、メチルグルコース、スクロースおよび尿素を挙げることができる。一部の実施形態において、凍結融解溶解は、米国特許第7,704,721号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される方法のいずれかにより行われてもよい。
本明細書で使用されるとき、用語「溶解力」は、細胞を破壊するために用いられる物理的活性を指す。溶解力としては、限定はされないが、機械的力、音波的力、重力、光学的力、電気的力などを挙げることができる。機械的力によって行われる細胞溶解は、本明細書では「機械的溶解」と称される。機械的溶解により用いられ得る機械的力としては、高剪断流体力を挙げることができる。かかる機械的溶解方法によれば、マイクロフルイダイザーが使用されてもよい。マイクロフルイダイザーは、典型的には、細胞溶液が適用され得る入力リザーバを含む。次に細胞溶液がポンプ(例えば高圧ポンプ)によって高速および/または高圧で相互作用チャンバに圧送されることにより剪断流体力が生じ得る。次に得られたライセートが1つ以上の出力リザーバに収集され得る。ポンプ速度および/または圧力を調整することにより、細胞溶解を調節し、および産物(例えばウイルス粒子)の回収を増強し得る。他の機械的溶解方法としては、スクレイピングすることによる細胞の物理的破壊を挙げることができる。
細胞溶解方法は、溶解させる細胞の細胞培養フォーマットに基づき選択されてもよい。例えば、接着細胞培養物では、幾つかの化学的および機械的溶解方法が用いられてもよい。かかる機械的溶解方法としては、凍結融解溶解またはスクレイピングを挙げることができる。別の例では、トリトンX−100(Triton−X−100)などの界面活性剤を含む溶解溶液とのインキュベーションによって接着細胞培養物の化学的溶解が行われてもよい。ある場合には、遊離DNAによって生じるライセートの粘度を低下させるため、接着細胞培養物から生成された細胞ライセートがもう一つのヌクレアーゼで処理されてもよい。
一実施形態において、効率的で規模を調整可能なAAV粒子作製に、溶解のないAAV粒子の回収方法が用いられてもよい。非限定的な例では、AAV粒子は、米国特許出願公開第20090275107号明細書(この内容は全体として参照により本明細書に援用される)に記載されるとおり、ヘパリン結合部位を欠くAAV粒子を培養し、それによりAAV粒子を細胞培養物の上清中に移らせて、培養物から上清を収集し;および上清からAAV粒子を単離することにより作製されてもよい。
清澄化
ウイルス粒子を含む細胞ライセートは清澄化に供され得る。清澄化とは、細胞ライセートからのウイルス粒子の精製において行われる最初のステップを指す。清澄化は、より大きい不溶性のデブリを除去することにより更なる精製にかけるためのライセートを調製する働きをする。清澄化ステップとしては、限定はされないが、遠心およびろ過を挙げることができる。清澄化において、遠心は、より大きいデブリのみを除去するため低速で行われてもよい。同様に、ろ過は、より大きいデブリのみが除去されるように、より大きい孔径のフィルタを使用して行われてもよい。ある場合には、清澄化の間にタンジェンシャルフローろ過が用いられてもよい。ウイルス清澄化の目的には、細胞ライセートのハイスループット処理および最終的なウイルス回収率の最適化が含まれる。清澄化ステップを含める利点には、更に大容積のライセートを処理するため規模を調整可能であることが含まれる。一部の実施形態において、清澄化は、米国特許第8,524,446号明細書、同第5,756,283号明細書、同第6,258,595号明細書、同第6,261,551号明細書、同第6,270,996号明細書、同第6,281,010号明細書、同第6,365,394号明細書、同第6,475,769号明細書、同第6,482,634号明細書、同第6,485,966号明細書、同第6,943,019号明細書、同第6,953,690号明細書、同第7,022,519号明細書、同第7,238,526号明細書、同第7,291,498号明細書、同第7,491,508号明細書、米国特許出願公開第2013/0045186号明細書、同第2011/0263027号明細書、同第2011/0151434号明細書、同第2003/0138772号明細書、および国際公開第2002012455号パンフレット、同第1996039530号パンフレット、同第1998010088号パンフレット、同第1999014354号パンフレット、同第1999015685号パンフレット、同第1999047691号パンフレット、同第2000055342号パンフレット、同第2000075353号パンフレットおよび同第2001023597号パンフレット(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に提示される方法のいずれかにより行われてもよい。
ろ過による細胞ライセート清澄化方法は当該技術分野において十分に理解されており、限定はされないが、受動ろ過およびフローろ過を含め、種々の利用可能な方法により行われてもよい。使用されるフィルタは種々の材料および孔径を含み得る。例えば、細胞ライセートフィルタは、約1μM〜約5μM、約0.5μM〜約2μM、約0.1μM〜約1μM、約0.05μM〜約0.05μMおよび約0.001μM〜約0.1μMの孔径を含み得る。細胞ライセートフィルタの例示的孔径としては、限定はされないが、2.0、1.9、1.8、1.7、1.6、1.5、1.4、1.3、1.2、1.1、1、0.9、0.8、0.7、0.6、0.5、0.4、0.3、0.2、0.1、0.95、0.9、0.85、0.8、0.75、0.7、0.65、0.6、0.55、0.5、0.45、0.4、0.35、0.3、0.25、0.2、0.15、0.1、0.05、0.22、0.21、0.20、0.19、0.18、0.17、0.16、0.15、0.14、0.13、0.12、0.11、0.1、0.09、0.08、0.07、0.06、0.05、0.04、0.03、0.02、0.01、0.02、0.019、0.018、0.017、0.016、0.015、0.014、0.013、0.012、0.011、0.01、0.009、0.008、0.007、0.006、0.005、0.004、0.003、0.002、0.001および0.001μMを挙げることができる。一実施形態において、清澄化は、大きいデブリを除去するための2.0μM孔径のフィルタによるろ過と、続くインタクトな細胞を除去するための0.45μM孔径のフィルタへの通過を含み得る。
フィルタ材料は種々の材料を含み得る。かかる材料としては、限定はされないが、ポリマー材料および金属材料(例えば焼結金属および有孔アルミニウム)を挙げることができる。例示的材料としては、限定はされないが、ナイロン、セルロース材料(例えば酢酸セルロース)、ポリフッ化ビニリデン(PVDF)、ポリエーテルスルホン、ポリアミド、ポリスルホン、ポリプロピレン、およびポリエチレンテレフタレートを挙げることができる。ある場合には、細胞ライセートの清澄化に有用なフィルタとしては、限定はされないが、ウルチプリーツ・プロフィール(商標)(ULTIPLEAT PROFILE(商標))フィルタ(ポール・コーポレーション(Pall Corporation)、ニューヨーク州ポートワシントン)、スポー(商標)(SUPOR(商標))メンブレンフィルタ(ポール・コーポレーション(Pall Corporation)、ニューヨーク州ポートワシントン)を挙げることができる。
ある場合には、ろ過速度および/または有効性を増加させるためフローろ過が行われてもよい。ある場合には、フローろ過は真空ろ過を含み得る。かかる方法によれば、フィルタのうちろ過される細胞ライセートと反対側に真空が作り出される。ある場合には、細胞ライセートを遠心力によってフィルタに通過させてもよい。ある場合には、ポンプを使用して細胞ライセートが清澄化フィルタに押し通される。1つ以上のフィルタを通る細胞ライセートのフロー速度は、チャネルサイズおよび/または流圧の一方を調整することにより調節し得る。
一部の実施形態によれば、細胞ライセートは遠心によって清澄化されてもよい。遠心を用いると、ライセート中の不溶性粒子をペレット化し得る。清澄化の間、遠心強度[標準重力の倍数を表す重力単位(g)で表される]は続く精製ステップよりも低くてよい。ある場合には、遠心は細胞ライセートに対して約200g〜約800g、約500g〜約1500g、約1000g〜約5000g、約1200g〜約10000gまたは約8000g〜約15000gで行われてもよい。一部の実施形態において、細胞ライセートの遠心は8000gで15分間行われる。ある場合には、細胞ライセート中の粒子状物質を沈降速度によって分配するため密度勾配遠心法が行われてもよい。本開示の方法により用いられる勾配としては、限定はされないが、塩化セシウム勾配およびイオジキサノール段階勾配を挙げることができる。
精製:クロマトグラフィー
ある場合には、AAV粒子は、清澄化細胞ライセートから1つ以上のクロマトグラフィー方法によって精製されてもよい。クロマトグラフィーとは、混合物から1つ以上の要素を取り分けるための当該技術分野において公知のあらゆる方法を指す。かかる方法としては、限定はされないが、イオン交換クロマトグラフィー(例えば陽イオン交換クロマトグラフィーおよび陰イオン交換クロマトグラフィー)、イムノアフィニティークロマトグラフィーおよびサイズ排除クロマトグラフィーを挙げることができる。一部の実施形態において、ウイルスクロマトグラフィー方法としては、米国特許第5,756,283号明細書、同第6,258,595号明細書、同第6,261,551号明細書、同第6,270,996号明細書、同第6,281,010号明細書、同第6,365,394号明細書、同第6,475,769号明細書、同第6,482,634号明細書、同第6,485,966号明細書、同第6,943,019号明細書、同第6,953,690号明細書、同第7,022,519号明細書、同第7,238,526号明細書、同第7,291,498号明細書および同第7,491,508号明細書または国際公開第1996039530号パンフレット、同第1998010088号パンフレット、同第1999014354号パンフレット、同第1999015685号パンフレット、同第1999047691号パンフレット、同第2000055342号パンフレット、同第2000075353号パンフレットおよび同第2001023597号パンフレット(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に教示されるもののいずれかを挙げることができる。
一部の実施形態では、イオン交換クロマトグラフィーを用いてウイルス粒子が単離されてもよい。イオン交換クロマトグラフィーを用いると、カプシドタンパク質と、固定相、典型的にはウイルス調製物(例えば清澄化ライセート)を通過させるカラムに存在する荷電部位との間の電荷間相互作用に基づきウイルス粒子が結合する。ウイルス調製物を加えた後、次に溶出溶液を加えることにより電荷間相互作用が破壊されて、結合したウイルス粒子が溶出し得る。溶出溶液は、結合したウイルス粒子の回収が促進されるように塩濃度および/またはpHを調整することにより最適化されてもよい。単離されるウイルスカプシドの電荷に応じて、陽イオンまたは陰イオン交換クロマトグラフィー方法が選択され得る。イオン交換クロマトグラフィー方法としては、限定はされないが、米国特許第7,419,817号明細書、同第6,143,548号明細書、同第7,094,604号明細書、同第6,593,123号明細書、同第7,015,026号明細書および同第8,137,948号明細書(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に教示されるもののいずれかを挙げることができる。
一部の実施形態において、イムノアフィニティークロマトグラフィーが用いられてもよい。イムノアフィニティークロマトグラフィーは、1つ以上の免疫化合物(例えば抗体または抗体関連構造)を利用してウイルス粒子を保持するクロマトグラフィーの一形態である。免疫化合物は、限定はされないが、1つ以上のウイルスコートタンパク質を含め、ウイルス粒子表面上の1つ以上の構造に特異的に結合し得る。ある場合には、免疫化合物は特定のウイルス変種に特異的であってもよい。ある場合には、免疫化合物は複数のウイルス変種に結合してもよい。一部の実施形態において、免疫化合物は組換え一本鎖抗体を含んでもよい。かかる組換え一本鎖抗体としては、スミス・R・H(Smith,R.H.)ら著、2009年、モレキュラー・セラピー(Mol.Ther.)、第17巻、第11号、p.1888〜96(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるものを挙げることができる。かかる免疫化合物は、限定はされないが、AAV1、AAV2、AAV6およびAAV8を含め、幾つかのAAVカプシド変種への結合能を有する。
一部の実施形態において、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)が用いられてもよい。SECは、ゲルを使用したサイズによる粒子の分離を含み得る。ウイルス粒子精製では、SECろ過は時に「ポリッシング」と称されることもある。ある場合には、SECは、ほぼ均一な最終産物を生じさせるために行われ得る。かかる最終産物は、ある場合には、前臨床試験および/または臨床試験で使用され得る(コーチン・R・M(Kotin,R.M.)、2011年、ヒューマン・モレキュラー・ジェネティクス(Human Molecular Genetics)、第20巻、第1号、p.R2〜R6、この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。ある場合には、SECは、米国特許第6,143,548号明細書、同第7,015,026号明細書、同第8,476,418号明細書、同第6,410,300号明細書、同第8,476,418号明細書、同第7,419,817号明細書、同第7,094,604号明細書、同第6,593,123号明細書、および同第8,137,948号明細書(これらの各々の内容は本明細書において全体として参照により援用される)に教示される方法のいずれかにより行われてもよい。
一実施形態において、少なくとも1つのAAV粒子を含む組成物は、米国特許第6146874号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される方法を用いて単離または精製されてもよい。
一実施形態において、少なくとも1つのAAV粒子を含む組成物は、米国特許第6660514号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される方法を用いて単離または精製されてもよい。
一実施形態において、少なくとも1つのAAV粒子を含む組成物は、米国特許第8283151号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される方法を用いて単離または精製されてもよい。
一実施形態において、少なくとも1つのAAV粒子を含む組成物は、米国特許第8524446号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される方法を用いて単離または精製されてもよい。
II.製剤および送達
医薬組成物および製剤
医薬組成物(siRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチド配列を含むAAV粒子)に加えて、本明細書にはヒトへの投与に好適な医薬組成物が提供され、当業者は、かかる組成物が概して任意の他の動物、例えば非ヒト動物、例えば非ヒト哺乳類への投与に好適であることを理解するであろう。組成物を種々の動物への投与に好適にするための、ヒトへの投与に好適な医薬組成物の修飾については十分に理解されており、獣医薬理学の当業者は、あったとしても通常どおりに過ぎない実験をもって、かかる修飾を設計および/または実施することができる。医薬組成物の投与が企図される対象としては、限定はされないが、ヒトおよび/または他の霊長類;ウシ、ブタ、ウマ、ヒツジ、ネコ、イヌ、マウス、および/またはラットなど、商業的に関連性のある哺乳類を含めた哺乳類;および/または、家禽、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、および/またはシチメンチョウなど、商業的に関連性のある鳥類を含めた鳥類が挙げられる。
一部の実施形態において、組成物は、ヒト、ヒト患者または対象に投与される。本開示の目的のために、「活性成分」という語句は一般に、合成siRNA二重鎖、siRNA二重鎖をコードする調節性ポリヌクレオチド、または本明細書で記載されるsiRNA二重鎖をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子を指す。
本明細書に記載される医薬組成物の製剤は、薬理学の技術分野において公知のまたは今後開発される任意の方法によって調製されてもよい。一般に、かかる調製方法は、活性成分を賦形剤および/または1つ以上の他の補助成分と合わせるステップ、および次に、必要であればおよび/または望ましい場合には、生成物を所望の単回または複数回用量単位に分割、付形および/または包装するステップを含む。
本発明に係る医薬組成物中の活性成分、薬学的に許容可能な賦形剤、および/または任意の追加成分の相対量は、治療対象のアイデンティティ、サイズ、および/または状態に応じて、更には組成物が投与される経路に応じて異なることになる。
本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチド配列を含むAAV粒子は、1つ以上の賦形剤を使用して製剤化することにより、(1)安定性を増加させる;(2)細胞トランスフェクションまたは形質導入を増加させる;(3)持続または遅延放出を可能にする;または(4)体内分布を変化させる(例えば、AAV粒子を脳およびニューロンなどの特異的組織または細胞型に標的化する)ことができる。
本発明の製剤は、限定なしに、生理食塩水、リピドイド、リポソーム、脂質ナノ粒子、ポリマー、リポプレックス、コア−シェルナノ粒子、ペプチド、タンパク質、AAV粒子をトランスフェクトした細胞(例えば、対象への移植用)、ナノ粒子模倣体およびこれらの組合せを含むことができる。更に、本発明のAAV粒子は、自己集合性核酸ナノ粒子を使用して製剤化されてもよい。
本明細書に記載される医薬組成物の製剤は、薬理学の技術分野において公知のまたは今後開発される任意の方法によって調製されてもよい。一般に、かかる調製方法は、活性成分を賦形剤および/または1つ以上の他の補助成分と合わせるステップを含む。
本開示に係る医薬組成物は、バルクで、単回単位用量として、および/または複数の単回単位用量として調製、包装、および/または販売されてもよい。本明細書で使用されるとき、「単位用量」は、所定量の活性成分を含む医薬組成物の個別的な量を指す。活性成分の量は、概して対象に投与されるであろう活性成分の投薬量に等しく、および/またはかかる投薬量の好都合な一部、例えばかかる投薬量の2分の1または3分の1である。
本開示に係る医薬組成物中の活性成分、薬学的に許容可能な賦形剤、および/または任意の追加成分の相対量は、治療下の対象のアイデンティティ、サイズ、および/または状態に応じて、更には組成物が投与される経路に応じて異なり得る。例えば、組成物は、0.1%〜99%(w/w)の活性成分を含み得る。例として、組成物は、0.1%〜100%、例えば0.5〜50%、1〜30%、5〜80%、少なくとも80%(w/w)の活性成分を含み得る。
一部の実施形態において、薬学的に許容可能な賦形剤は、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%、または100%の純度であってもよい。一部の実施形態において、賦形剤はヒトへの使用および動物への使用が承認されている。一部の実施形態において、賦形剤は米国食品医薬品局によって承認されていてもよい。一部の実施形態において、賦形剤は医薬品グレードであってもよい。一部の実施形態において、賦形剤は、米国薬局方(USP)、欧州薬局方(EP)、英国薬局方、および/または国際薬局方の規格に適合し得る。
賦形剤には、本明細書で使用されるとき、限定はされないが、所望の特定の剤形に適するとおりのあらゆる溶媒、分散媒、希釈剤、または他の液体媒体、分散液または懸濁液助剤、表面活性剤、等張剤、増粘剤または乳化剤、保存剤などが含まれる。医薬組成物を製剤化するための種々の賦形剤および組成物の調製技法は当該技術分野において公知である(「レミントン:薬学の科学と実践(Remington:The Science and Practice of Pharmacy)」、第21版、A・R・ジェンナロ(A.R.Gennaro)著、リッピンコット・ウィリアムズ・アンド・ウィルキンス(Lippincott,Williams & Wilkins)、メリーランド州ボルチモア(Baltimore)、2006年を参照のこと;全体として参照により本明細書に援用される)。従来の賦形剤媒体の使用は本開示の範囲内に企図され得るが、但し、任意の望ましくない生物学的効果を生じたり、またはその他、医薬組成物の任意の他の1つまたは複数の成分と有害な形で相互作用したりするなどにより、任意の従来の賦形剤媒体が物質またはその誘導体と不適合である場合は除く。
例示的希釈剤としては、限定はされないが、炭酸カルシウム、炭酸ナトリウム、リン酸カルシウム、リン酸二カルシウム、硫酸カルシウム、リン酸水素カルシウム、リン酸ナトリウム ラクトース、スクロース、セルロース、微結晶性セルロース、カオリン、マンニトール、ソルビトール、イノシトール、塩化ナトリウム、乾燥デンプン、コーンスターチ、粉末糖等、および/またはこれらの組合せが挙げられる。
一部の実施形態において、製剤は少なくとも1つの非活性成分を含み得る。本明細書で使用されるとき、用語「非活性成分」は、製剤に含まれる1つ以上の非活性薬剤を指す。一部の実施形態において、本発明の製剤に使用し得る非活性成分は、全てが米国食品医薬品局(FDA)によって承認されているか、いずれも承認されていないか、または一部が承認されているものであり得る。
本発明のsiRNA分子の核酸配列を含むベクターの製剤は、カチオンまたはアニオンを含み得る。一実施形態において、製剤は、限定はされないが、Zn2+、Ca2+、Cu2+、Mg+およびこれらの組合せなど、金属カチオンを含む。
本明細書で使用されるとき、「薬学的に許容可能な塩」は、開示される化合物の誘導体を指し、ここで親化合物は、既存の酸または塩基部分からその塩形態への変換(例えば、遊離塩基基を好適な有機酸と反応させることによる)によって修飾される。薬学的に許容可能な塩の例としては、限定はされないが、アミン類などの塩基性残基の鉱酸塩または有機酸塩;カルボン酸などの酸性残基のアルカリ塩または有機塩などが挙げられる。代表的な酸付加塩としては、酢酸塩、酢酸、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、カンファー酸塩、カンファースルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、フマル酸塩、グルコヘプトン酸塩、グリセロリン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプトン酸塩、ヘキサン酸塩、臭化水素酸塩、塩酸塩、ヨウ化水素酸塩、2−ヒドロキシエタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、2−ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、3−フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、吉草酸塩などが挙げられる。代表的なアルカリまたはアルカリ土類金属塩としては、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウムなど、ならびに非毒性アンモニウム、第四級アンモニウム、およびアミン陽イオン、例えば、限定はされないが、アンモニウム、テトラメチルアンモニウム、テトラエチルアンモニウム、メチルアミン、ジメチルアミン、トリメチルアミン、トリエチルアミン、エチルアミンなどが挙げられる。本開示の薬学的に許容可能な塩には、例えば非毒性無機酸または有機酸から形成される親化合物の従来の非毒性塩が含まれる。本開示の薬学的に許容可能な塩は、従来の化学的方法により塩基または酸部分を含有する親化合物から合成することができる。概して、かかる塩は、遊離酸または塩基形態のこれらの化合物と、水中または有機溶媒中、またはこれら2つの混合物中(概して、エーテル、酢酸エチル、エタノール、イソプロパノール、またはアセトニトリルなどの非水性媒体が好ましい)にある化学量論量の適切な塩基または酸とを反応させることにより調製し得る。好適な塩の一覧については、「レミントンの薬学科学(Remington’s Pharmaceutical Sciences)」、第17版、マック・パブリッシング・カンパニー(Mack Publishing Company)、ペンシルベニア州イーストン(Easton)、1985年、p.1418、「薬学的塩:特性、選択、および使用(Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use)」、P・H・シュタール(P.H.Stahl)およびC・G・ウェルムス(C.G.Wermuth)編、ワイリー−ブイシーエイチ(Wiley−VCH)、2008年、およびベルジュ(Berge)ら著、ジャーナル・オブ・ファーマシューティカル・サイエンス(Journal of Pharmaceutical Science)、第66巻、p.1〜19、1977年が参照される;この各々の内容は全体として参照により本明細書に援用される。
用語「薬学的に許容可能な溶媒和物」は、本明細書で使用されるとき、好適な溶媒の分子が結晶格子に取り込まれている本発明の化合物を意味する。好適な溶媒は、投与される投薬量で生理学的に忍容可能である。例えば、溶媒和物は、有機溶媒、水、またはこれらの混合物を含む溶液から結晶化、再結晶化、または沈殿によって調製されてもよい。好適な溶媒の例は、エタノール、水(例えば、一水和物、二水和物、および三水和物)、N−メチルピロリジノン(NMP)、ジメチルスルホキシド(DMSO)、N,N’−ジメチルホルムアミド(DMF)、N,N’−ジメチルアセトアミド(DMAC)、1,3−ジメチル−2−イミダゾリジノン(DMEU)、1,3−ジメチル−3,4,5,6−テトラヒドロ−2−(1H)−ピリミジノン(DMPU)、アセトニトリル(ACN)、プロピレングリコール、酢酸エチル、ベンジルアルコール、2−ピロリドン、安息香酸ベンジルなどである。水が溶媒であるとき、その溶媒和物は「水和物」と称される。
本発明によれば、siRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチド配列を含むAAV粒子は、CNS送達用に製剤化されてもよい。脳血液関門を通過する薬剤が使用されてもよい。例えば、脳血液関門内皮をsiRNA分子の標的とし得る、一部の細胞透過性ペプチドを使用して、HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖を製剤化してもよい。
非活性成分
一部の実施形態において、製剤は、非活性成分である少なくとも1つの賦形剤を含み得る。本明細書で使用されるとき、用語「非活性成分」は、製剤中に含まれる1つ以上の非活性薬剤を指す。一部の実施形態において、本開示の製剤に使用し得る非活性成分は、全てが米国食品医薬品局(FDA)によって承認されているか、いずれも承認されていないか、または一部が承認されているものであり得る。
本明細書に記載されるAAV粒子の製剤は、カチオンまたはアニオンを含み得る。一実施形態において、製剤は、限定はされないが、Zn2+、Ca2+、Cu2+、Mg+およびこれらの組合せなど、金属カチオンを含む。非限定的な例として、製剤は、金属カチオンと錯体化した本明細書に記載されるポリマーおよび組成物を含み得る(例えば、米国特許第6,265,389号明細書および同第6,555,525号明細書を参照のこと、これらの各々は全体として参照により本明細書に援用される)。
送達
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子は、欧州特許出願第1857552号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるAAVビリオンの送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子は、欧州特許出願第2678433号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるAAVベクターを用いたタンパク質の送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子は、米国特許第5,858,351号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるAAVベクターを用いたDNA分子の送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子は、米国特許第6,211,163号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される血流へのDNAの送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子は、米国特許第6,325,998号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるAAVビリオンの送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子は、米国特許第7,588,757号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される中枢神経系へのペイロードの送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子は、米国特許第8283151号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるペイロードの送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子は、国際公開第2001089583号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるグルタミン酸デカルボキシラーゼ(GAD)送達ベクターを用いたペイロードの送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子は、国際公開第2012057363号パンフレット(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載される神経細胞へのペイロードの送達方法を用いて投与または送達されてもよい。
細胞への送達
本開示は、上述のAAVポリヌクレオチドまたはAAVゲノムのいずれかを細胞または組織に送達する方法であって、前記AAVポリヌクレオチドまたはAAVゲノムと細胞または組織を接触させることまたは前記AAVポリヌクレオチドまたはAAVゲノムを含む粒子と細胞または組織を接触させること、または医薬組成物を含めた記載される組成物のいずれかと細胞または組織を接触させることを含む方法を提供する。AAVポリヌクレオチドまたはAAVゲノムを細胞または組織に送達する方法は、インビトロ、エキソビボ、またはインビボで達成することができる。
細胞への導入−合成dsRNA
siRNA分子(例えば、siRNA二重鎖およびdsRNA)の化学的および生物学的安定性を確保するためには、siRNA分子を標的細胞の内部に送達することが重要である。一部の実施形態において、細胞としては、限定はされないが、哺乳類起源の細胞、ヒト起源の細胞、胚性幹細胞、人工多能性幹細胞、神経幹細胞、および神経前駆細胞を挙げることができる。
核酸は、siRNAを含め、正常な生理条件下で糖−リン酸骨格に正味負電荷を有する。細胞に侵入するためには、siRNA分子は、その頭部基が同様に負電荷である細胞膜の脂質二重層に接触しなければならない。
siRNA二重鎖は、パッケージ粒子など、それが細胞膜を通り抜けることを可能にする担体と複合体化することにより、siRNAの細胞取込みを促進し得る。パッケージ粒子としては、限定はされないが、リポソーム、ナノ粒子、カチオン性脂質、ポリエチレンイミン誘導体、デンドリマー、カーボンナノチューブおよび炭素系ナノ粒子とデンドリマーとの組合せを挙げることができる。脂質はカチオン性脂質および/または中性脂質であってもよい。siRNA分子とカチオン性担体との間の十分に確立された親油性複合体に加えて、siRNA分子は、コレステロールなど、疎水性部分にコンジュゲートすることができる(例えば、米国特許出願公開第20110110937号明細書;この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。この送達方法は、siRNA分子のインビトロ細胞取込みおよびインビボ薬理特性を改善する可能性がある。本発明のsiRNA分子はまた、MPG、トランスポータンまたはペネトラチンなど、ある種のカチオン性細胞透過性ペプチド(CPP)に共有結合的または非共有結合的にコンジュゲートされてもよい(例えば、米国特許出願公開第20110086425号明細書;この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
細胞への導入−AAV粒子
本発明のsiRNA分子(例えばsiRNA二重鎖)は、限定はされないがAAV粒子など、種々の手法のいずれかを用いて細胞に導入されてもよい。これらのAAV粒子は、トランスフェクションに容易には適さない細胞へのsiRNA分子の侵入を促進するように操作および最適化される。また、幾つかの合成AAV粒子はshRNAを細胞ゲノムに組み込む能力を有し、それにより安定したsiRNA発現および標的遺伝子の長期ノックダウンがもたらされる。このように、AAV粒子は、野生型ウイルスに見られる有害な複製および/または組込み特徴を欠きながらも、特異的送達媒体として操作される。
一部の実施形態において、細胞を、siRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチド配列を含むAAV粒子、および親油性担体と接触させることにより、本発明のsiRNA分子を、細胞に導入する。他の実施形態において、siRNA分子は、細胞において転写されるとsiRNA分子を産生する能力を有する核酸配列を含むAAV粒子を細胞にトランスフェクトするか、または感染させることにより細胞に導入される。一部の実施形態において、siRNA分子は、細胞において転写されるとsiRNA分子を産生する能力を有する核酸配列を含むAAV粒子を細胞に注入することにより細胞に導入される。
一部の実施形態において、トランスフェクション前に、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は細胞にトランスフェクトされてもよい。
他の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、電気穿孔によって細胞に送達されてもよい(例えば米国特許出願公開第20050014264号明細書;この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。
本明細書に記載されるsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を導入する他の方法としては、米国特許出願公開第20120264807号明細書(この内容は本明細書において全体として参照により援用される)に記載されるとおりの光化学的インターナリゼーションを挙げることができる。
一部の実施形態において、本明細書に記載される製剤は、本明細書に記載されるsiRNA分子をコードする核酸配列を含む少なくとも1つのAAV粒子を含有し得る。一実施形態において、siRNA分子は、1つの標的部位にあるHTT遺伝子を標的としてもよい。別の実施形態において、製剤は、各AAV粒子が、異なる標的部位において、HTT遺伝子を標的とするsiRNA分子をコードする核酸配列を含む、複数のAAV粒子を含む。HTTは、2個、3個、4個、5個、または5個超の部位において、標的とすることができる。
一実施形態において、限定はされないが、ヒト、イヌ、マウス、ラットまたはサルなど、任意の関連性のある種からのAAV粒子が細胞に導入されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、治療しようとする疾患に関連性のある細胞に導入されてもよい。非限定的な例として、疾患はHDであり、かつ標的細胞はニューロンおよびアストロサイトである。別の非限定的な例として、疾患はHDであり、かつ標的細胞は中型有棘ニューロン、皮質ニューロンおよびアストロサイトである。
一実施形態において、AAV粒子は、標的配列の内因性発現レベルが高い細胞に導入されてもよい。
別の実施形態において、AAV粒子は、標的配列の内因性発現レベルが低い細胞に導入されてもよい。
一実施形態において、細胞は、高いAAV形質導入効率を有するものであってもよい。
対象への送達
本開示は更に、上述のAAVポリヌクレオチドまたはAAVゲノムのいずれかを哺乳類対象を含めた対象に送達する方法であって、前記AAVポリヌクレオチドまたはAAVゲノムを対象に投与すること、または前記AAVポリヌクレオチドまたはAAVゲノムを含む粒子を対象に投与すること、または医薬組成物を含めた記載される組成物のいずれかを対象に投与することを含む方法を提供する。
本明細書に記載されるAAV粒子の医薬組成物は、バイオアベイラビリティ、治療ウィンドウおよび/または分布容積のうちの1つ以上によって特徴付けることができる。
III.投与および用量設定
投与
本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、治療上有効な結果をもたらす任意の経路によって投与されてもよい。それらとしては、限定はされないが、臓器の実質の範囲内、例えば、限定はされないが、脳(例えば実質内)、線条体(線条体内)、経腸(腸の中)、胃腸、硬膜上、経口(口を介して)、経皮、硬膜外、大脳内(大脳の中)、脳室内(脳室の中)、軟膜下(軟膜の下)、皮膚上(皮膚への塗布)、皮内(皮膚それ自体の中)、皮下(皮膚の下)、鼻腔投与(鼻を通じて)、静脈内(静脈の中)、静脈内ボーラス、静脈内点滴、動脈内(動脈の中)、筋肉内(筋肉の中)、心臓内(心臓の中)、骨内注入(骨髄の中)、髄腔内(脊柱管の中)、神経節内(神経節の中)、腹腔内(腹膜への注入または注射)、膀胱内注入、硝子体内(眼を通じて)、海綿体内注射(病的腔の中)、腔内(陰茎の基部の中)、腟内投与、子宮内、羊膜外投与、経皮(全身分布のためのインタクトな皮膚を通じた拡散)、経粘膜(粘膜を通じた拡散)、経腟、インサフレーション(鼻から吸い込む)、舌下、唇下、浣腸、点眼薬(結膜上)、点耳薬で、耳介(耳内または耳を介して)、頬側(頬の方に向けて)、結膜、皮膚、歯(1本または複数の歯に対して)、電気浸透、子宮頚管内、副鼻腔内、気管内、体外、血液透析、浸潤、間質内、腹腔内、羊膜内、関節内、胆管内、気管支内、嚢内、軟骨内(軟骨の範囲内)、仙骨内(馬尾(cauda equine)の範囲内)、大槽内(大槽小脳延髄槽の範囲内)、角膜内(角膜の範囲内)、歯冠内、冠内(冠動脈の範囲内)、海綿体内(intracorporus cavernosum)(陰茎海綿体(corporus cavernosa)の可膨張性腔の範囲内)、椎間板内(椎間板の範囲内)、管内(腺管の範囲内)、十二指腸内(十二指腸の範囲内)、硬膜内(硬膜の範囲内または真下)、表皮内(表皮に対して)、食道内(食道に対して)、胃内(胃の範囲内)、歯肉内(歯肉の範囲内)、回腸内(小腸の遠位部分の範囲内)、病巣内(局所病変の範囲内、またはそこに直接導入される)、管腔内(管の管腔の範囲内)、リンパ内(リンパの範囲内)、髄内(骨の髄腔の範囲内)、髄膜内(髄膜の範囲内)、眼内(眼の範囲内)、卵巣内(卵巣の範囲内)、心膜内(心膜の範囲内)、胸膜内(胸膜の範囲内)、前立腺内(前立腺の範囲内)、肺内(肺、またはその気管支の範囲内)、洞内(鼻洞または眼窩周囲洞の範囲内)、脊髄内(脊柱の範囲内)、滑液嚢内(関節の滑膜腔の範囲内)、腱内(腱の範囲内)、精巣内(精巣の範囲内)、髄腔内(脳脊髄軸の任意のレベルにおける脳脊髄液の範囲内)、胸腔内(胸郭の範囲内)、細管内(臓器の細管の範囲内)、腫瘍内(腫瘍の範囲内)、鼓室内(中耳(aurus media)の範囲内)、血管内(1つまたは複数の血管の範囲内)、脳室内(脳室の範囲内)、イオントフォレシス(電流を用いるもので、可溶性塩のイオンが体の組織に移動する)、潅注(開放創または体腔を浸すまたはフラッシュする)、喉頭(喉頭に対して直接)、経鼻胃(鼻を通じて胃の中に)、密封包帯療法(局所経路投与、これは次に包帯で覆われ、包帯がその範囲を閉塞する)、眼(外眼部に対して)、中咽頭(口および咽頭に対して直接)、非経口、経皮、関節周囲、硬膜外、神経周囲、歯周、直腸、呼吸器(局所または全身作用のため経口的または鼻腔的に吸入することにより気道の範囲内に)、球後(橋の後ろまたは眼球の後ろ)、軟部組織、くも膜下、結膜下、粘膜下、局所、経胎盤(胎盤を通じてまたは越えて)、経気管(気管の壁を通じて)、経鼓室(鼓室を越えてまたは通じて)、尿管(尿管に対して)、尿道(尿道に対して)、腟、仙骨ブロック、診断的、神経ブロック、胆管灌流、心灌流、フォトフェレーシスまたは脊髄が挙げられる。
具体的な実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子の組成物は、ベクターまたはsiRNA分子を中枢神経系に侵入させて、中型有棘および/または皮質ニューロンおよび/またはアストロサイトまで入り込ませることを促進する方法で投与されてもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、筋肉内注射によって投与されてもよい。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、実質内注射によって投与されてもよい。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、実質内注射および髄腔内注射によって投与されてもよい。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、線条体内注射によって投与されてもよい。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、線条体内注射および本明細書に記載される別の投与経路によって投与されてもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA二重鎖を発現するAAV粒子は、末梢注射(例えば静脈内)および/または鼻腔内送達によって対象に投与されてもよい。当該技術分野では、siRNA二重鎖のAAV粒子の末梢投与が中枢神経系まで、例えばニューロンまで輸送され得ることが開示された(例えば、米国特許出願公開第20100240739号明細書;および同第20100130594号明細書;この各々の内容は全体として参照により本明細書に援用される)。
他の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含む少なくとも1つのAAV粒子を含む組成物は、頭蓋内送達によって対象に投与されてもよい(例えば、米国特許第8,119,611号明細書を参照のこと;この内容は全体として参照により本明細書に援用される)。
本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は任意の好適な形態で、液体溶液または懸濁液、液体溶液または液体溶液中の懸濁液に好適な固体形態のいずれとして投与されてもよい。siRNA二重鎖は、任意の適切なかつ薬学的に許容可能な賦形剤と共に製剤化されてもよい。
本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子は、「治療上有効な」量、すなわち、疾患に関連する少なくとも1つの症状を軽減および/または予防するのに十分な、または対象の状態の改善をもたらすのに十分な量で投与されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、ハンチントン病(HD)の対象に関する機能および/または生存を改善するのに治療上有効な量でCNSに投与されてもよい。非限定的な例として、ベクターは線条体への直接注入によって投与されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、siRNA二重鎖またはdsRNAが中型有棘ニューロン、皮質ニューロンおよび/またはアストロサイトを標的化するのに治療上有効な量で対象に(例えば、髄腔内投与によって対象のCNSに)投与されてもよい。非限定的な例として、siRNA二重鎖またはdsRNAは、HTTタンパク質またはmRNAの発現を低減し得る。別の非限定的な例として、siRNA二重鎖またはdsRNAはHTTを抑制し、およびHTT媒介毒性を低減することができる。HTTタンパク質および/またはmRNAならびにHTT媒介毒性の低減は、ほぼ炎症の亢進なしに達成され得る。
一実施形態において、AAV粒子は、対象の機能低下(例えば、統一ハンチントン病評価尺度(UHDRS:unified Huntington’s disease rating scale)などの公知の判定方法を用いて決定される)を遅延させるのに治療上有効な量で対象に(例えば対象のCNSに)投与されてもよい。非限定的な例として、ベクターは実質内注射によって投与されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、中型有棘ニューロン、皮質ニューロンおよび/またはアストロサイトを形質導入するのに治療上有効な量で大槽に投与されてもよい。非限定的な例として、ベクターは髄腔内投与されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、中型有棘ニューロン、皮質ニューロンおよび/またはアストロサイトを形質導入するのに治療上有効な量で髄腔内注入を用いて投与されてもよい。非限定的な例として、ベクターは髄腔内投与されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、中型有棘ニューロン、皮質ニューロンおよび/またはアストロサイトを形質導入するのに治療上有効な量で大槽に投与されてもよい。非限定的な例として、ベクターは実質内注射によって投与されてもよい。
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子が製剤化されてもよい。非限定的な例として、中枢神経系または中枢神経系の領域もしくは構成要素における最適な薬物分布が確保されるように、製剤のバリシティおよび/またはオスモル濃度が最適化されてもよい。
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子は単一経路投与によって対象に送達されてもよい。
一実施形態において、調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子は多部位投与経路によって対象に送達されてもよい。対象には、調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子が2、3、4、5または5より多い部位に投与されてもよい。
一実施形態において、対象には、本明細書に記載される調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子がボーラス注射を用いて投与されてもよい。
一実施形態において、対象には、本明細書に記載される調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子が、数分間、数時間または数日間の時間をかけた徐放送達を用いて投与されてもよい。注入速度は、対象、分布、製剤または別の送達パラメータに応じて変更されてもよい。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子は被殻および尾状核注入によって投与される。非限定的な例として、二重注入は広範な線条体分布ならびに前頭および側頭皮質分布をもたらす。
一実施形態において、AAV粒子は、一側性被殻注入によって投与されるAAV−DJ8である。非限定的な例として、投与されたAAV−DJ8の分布は、一側性被殻注入によって送達されたAAV1の分布と同様である。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子は、C1における髄腔内(IT)注入によって投与される。注入は、1、2、3、4、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15時間または15時間超であってもよい。
一実施形態において、本明細書に記載されるAAV粒子を投与する対象の選択および/または用量、投与経路および/または投与ボリュームの有効性が、ウィルヒョウ・ロバン腔としても知られる血管周囲腔(PVS:perivascular spaces)のイメージングを用いて判定されてもよい。PVSは、細動脈および細静脈が脳実質を穿通することに伴いそれらの周囲に存在し、脳脊髄液(CSF)/間質液で満たされている。PVSは中脳、基底核、および半卵円中心によく見られる。理論によって拘束されることを望むものではないが、PVSは代謝産物の正常なクリアランスにおいて役割を果たし得ると共に、認知の悪化およびパーキンソン病を含めた幾つかの病態と関連付けられている。PVSは通常は正常なサイズであるが、幾つもの病態で拡大し得る。ポッター(Potter)ら(セレブロバスキュラー・ディジーズ(Cerebrovasc Dis.)、2015年1月、第39巻、第4号、p.224〜231;これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)は評価方法を開発し、そこでポッター(Potter)らはあらゆるPVSを調べ、基底核、半卵円中心および中脳PVSを評価した。この著者らは、マック(Mac)およびルリッチ(Lullich)ら(ジャーナル・オブ・ニューロロジー・ニューロサージェリー・アンド・サイキアトリー(J Neurol Neurosurg Psychiatry)、2004年11月、第75巻、第11号、p.1519〜23;これらの内容は本明細書において全体として参照により援用される)によって使用されるPVSの頻度および範囲を使用しており、ポッター(Potter)らは基底核および半卵円中心PVSに5段階評点を与え:0(無し)、1(1〜10)、2(11〜20)、3(21〜40)および4(>40)および中脳PVSに2段階評点を与えた:0(目視不能)または1(目視可能)。ポッター(Potter)らによる評価方式のユーザガイドは、www.sbirc.ed.ac.uk/documents/epvs−rating−scale−user−guide.pdfを参照することができる。
用量設定
本発明の医薬組成物は、HTT関連障害(例えば、ハンチントン病(HD))を軽減、予防および/または治療するのに有効な任意の量を用いて対象に投与されてもよい。必要となる正確な量は、対象の種、年齢、および全身状態、疾患の重症度、詳細な組成物、その投与様式、その活性様式などに応じて対象毎に異なることになる。
本発明の組成物は典型的には、投与の簡便性および投薬量の均一性のため、単位剤形で製剤化される。しかしながら、本発明の組成物の1日の総使用量は主治医が妥当な医学的判断の範囲内で決定し得ることは理解されるであろう。任意の特定の患者に対する具体的な治療有効性は、治療下の障害および障害の重症度;用いられる具体的な化合物の活性;用いられる具体的な組成物;患者の年齢、体重、全般的な健康、性別および食事;投与時間、投与経路、および用いられるsiRNA二重鎖の排泄速度;治療継続期間;用いられる具体的な化合物と併用してまたは同時に使用される薬物;および医学分野で周知の同様の要因を含めた種々の要因に依存することになる。\
一実施形態において、対象の年齢および性別を用いて本発明の組成物の用量が決定されてもよい。非限定的な例として、年齢が高い対象ほど、年齢が低い対象と比較してより高用量の(例えば、5〜10%、10〜20%、15〜30%、20〜50%、25〜50%または少なくとも1%、2%、3%、4%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または90%超高い)組成物の投与を受け得る。別の非限定的な例として、年齢が低い対象ほど、年齢が高い対象と比較してより高用量の(例えば、5〜10%、10〜20%、15〜30%、20〜50%、25〜50%または少なくとも1%、2%、3%、4%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または90%超高い)組成物の投与を受け得る。更に別の非限定的な例として、女性の対象は男性対象と比較してより高用量の(例えば、5〜10%、10〜20%、15〜30%、20〜50%、25〜50%または少なくとも1%、2%、3%、4%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または90%超高い)組成物の投与を受け得る。更に別の非限定的な例として、男性の対象は女性の対象と比較してより高用量の(例えば、5〜10%、10〜20%、15〜30%、20〜50%、25〜50%または少なくとも1%、2%、3%、4%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%または90%超高い)組成物の投与を受け得る。
一部の具体的な実施形態において、本発明のsiRNA二重鎖を送達するためのAAV粒子の用量は、疾患の状態、対象および治療戦略に応じて適合され得る。
一実施形態において、本発明に係る組成物の細胞への送達は、[VG/時間=mL/時間×VG/mL](式中、VGはウイルスゲノムであり、VG/mLは組成物濃度であり、およびmL/時間は持続送達速度である)によって定義される送達速度を含む。
一実施形態において、本発明に係る組成物の細胞への送達は、対象当たり約1×10VG〜約1×1016VGの総濃度を含み得る。一部の実施形態において、送達は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、1.1×1011、1.2×1011、1.3×1011、1.4×1011、1.5×1011、1.6×1011、1.7×1011、1.8×1011、1.9×1011、2×1011、2.1×1011、2.2×1011、2.3×1011、2.4×1011、2.5×1011、2.6×1011、2.7×1011、2.8×1011、2.9×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、7.1×1011、7.2×1011、7.3×1011、7.4×1011、7.5×1011、7.6×1011、7.7×1011、7.8×1011、7.9×1011、8×1011、9×1011、1×1012、1.1×1012、1.2×1012、1.3×1012、1.4×1012、1.5×1012、1.6×1012、1.7×1012、1.8×1012、1.9×1012、2×1012、2.1×1012、2.2×1012、2.3×1012、2.4×1012、2.5×1012、2.6×1012、2.7×1012、2.8×1012、2.9×1012、3×1012、3.1×1012、3.2×1012、3.3×1012、3.4×1012、3.5×1012、3.6×1012、3.7×1012、3.8×1012、3.9×1012、4×1012、4.1×1012、4.2×1012、4.3×1012、4.4×1012、4.5×1012、4.6×1012、4.7×1012、4.8×1012、4.9×1012、5×1012、6×1012、6.1×1012、6.2×1012、6.3×1012、6.4×1012、6.5×1012、6.6×1012、6.7×1012、6.8×1012、6.9×1012、7×1012、8×1012、8.1×1012、8.2×1012、8.3×1012、8.4×1012、8.5×1012、8.6×1012、8.7×1012、8.8×1012、8.9×1012、9×1012、1×1013、1.1×1013、1.2×1013、1.3×1013、1.4×1013、1.5×1013、1.6×1013、1.7×1013、1.8×1013、1.9×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、6.7×1013、7×1013、8×1013、9×1013、1×1014、2×1014、3×1014、4×1014、5×1014、6×1014、7×1014、8×1014、9×1014、1×1015、2×1015、3×1015、4×1015、5×1015、6×1015、7×1015、8×1015、9×1015、または1×1016VG/対象の組成物濃度を含み得る。
一実施形態において、本発明に係る組成物の細胞への送達は、対象当たり約1×10VG/kg〜約1×1016VG/kgの総濃度を含み得る。一部の実施形態において、送達は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、1.1×1011、1.2×1011、1.3×1011、1.4×1011、1.5×1011、1.6×1011、1.7×1011、1.8×1011、1.9×1011、2×1011、2.1×1011、2.2×1011、2.3×1011、2.4×1011、2.5×1011、2.6×1011、2.7×1011、2.8×1011、2.9×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、7.1×1011、7.2×1011、7.3×1011、7.4×1011、7.5×1011、7.6×1011、7.7×1011、7.8×1011、7.9×1011、8×1011、9×1011、1×1012、1.1×1012、1.2×1012、1.3×1012、1.4×1012、1.5×1012、1.6×1012、1.7×1012、1.8×1012、1.9×1012、2×1012、2.1×1012、2.2×1012、2.3×1012、2.4×1012、2.5×1012、2.6×1012、2.7×1012、2.8×1012、2.9×1012、3×1012、3.1×1012、3.2×1012、3.3×1012、3.4×1012、3.5×1012、3.6×1012、3.7×1012、3.8×1012、3.9×1012、4×1012、4.1×1012、4.2×1012、4.3×1012、4.4×1012、4.5×1012、4.6×1012、4.7×1012、4.8×1012、4.9×1012、5×1012、6×1012、6.1×1012、6.2×1012、6.3×1012、6.4×1012、6.5×1012、6.6×1012、6.7×1012、6.8×1012、6.9×1012、7×1012、8×1012、8.1×1012、8.2×1012、8.3×1012、8.4×1012、8.5×1012、8.6×1012、8.7×1012、8.8×1012、8.9×1012、9×1012、1×1013、1.1×1013、1.2×1013、1.3×1013、1.4×1013、1.5×1013、1.6×1013、1.7×1013、1.8×1013、1.9×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、6.7×1013、7×1013、8×1013、9×1013、1×1014、2×1014、3×1014、4×1014、5×1014、6×1014、7×1014、8×1014、9×1014、1×1015、2×1015、3×1015、4×1015、5×1015、6×1015、7×1015、8×1015、9×1015、または1×1016VG/kgの組成物濃度を含み得る。
一実施形態において、1用量当たり約10〜10ウイルスゲノム(単位)が投与されてもよい。
一実施形態において、本発明に係る組成物の細胞への送達は、約1×10VG/mL〜約1×1016VG/mLの総濃度を含み得る。一部の実施形態において、送達は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、1.1×1011、1.2×1011、1.3×1011、1.4×1011、1.5×1011、1.6×1011、1.7×1011、1.8×1011、1.9×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、1.1×1012、1.2×1012、1.3×1012、1.4×1012、1.5×1012、1.6×1012、1.7×1012、1.8×1012、1.9×1012、2×1012、2.1×1012、2.2×1012、2.3×1012、2.4×1012、2.5×1012、2.6×1012、2.7×1012、2.8×1012、2.9×1012、3×1012、3.1×1012、3.2×1012、3.3×1012、3.4×1012、3.5×1012、3.6×1012、3.7×1012、3.8×1012、3.9×1012、4×1012、4.1×1012、4.2×1012、4.3×1012、4.4×1012、4.5×1012、4.6×1012、4.7×1012、4.8×1012、4.9×1012、5×1012、6×1012、6.1×1012、6.2×1012、6.3×1012、6.4×1012、6.5×1012、6.6×1012、6.7×1012、6.8×1012、6.9×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、1.1×1013、1.2×1013、1.3×1013、1.4×1013、1.5×1013、1.6×1013、1.7×1013、1.8×1013、1.9×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、6.7×1013、7×1013、8×1013、9×1013、1×1014、2×1014、3×1014、4×1014、5×1014、6×1014、7×1014、8×1014、9×1014、1×1015、2×1015、3×1015、4×1015、5×1015、6×1015、7×1015、8×1015、9×1015、または1×1016VG/mLの組成物濃度を含み得る。
特定の実施形態において、所望のsiRNA二重鎖投薬量は、複数回の投与(例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14回、またはそれ以上の投与)を用いて送達されてもよい。複数回の投与が利用される場合、本明細書に記載されるような分割用量投与レジメンが用いられてもよい。本明細書で使用されるとき、「分割用量」は、単一単位用量または総1日用量を2つ以上の用量に分割するもの、例えば単一単位用量の2回以上の投与である。本明細書で使用されるとき、「単一単位用量」は、1用量/1回/単一の経路/単一の接触点、すなわち単一の投与イベントで投与される任意の調節性ポリヌクレオチド治療薬の用量である。本明細書で使用されるとき、「総1日用量」は、24時間に与えられるまたは処方される量である。これは単一単位用量として投与されてもよい。一実施形態において、本発明の調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子は分割用量で対象に投与される。それらの用量は、緩衝液のみに、または本明細書に記載される製剤に製剤化されてもよい。
一実施形態において、本明細書に記載される組成物の用量、濃度および/または容積は、投与後の皮質および皮質下分布への尾状核または被殻の寄与に応じて調整されてもよい。投与は、脳室内、被殻内、視床内,実質内、軟膜下、および/または髄腔内投与であってもよい。
一実施形態において、本明細書に記載される組成物の用量、濃度および/または容積は、脳室内、被殻内、視床内、実質内、軟膜下、および/または髄腔内送達による投与後の皮質および軸索分布に応じて調整されてもよい。
IV.本発明の組成物の方法および使用
ハンチントン病(HD)
ハンチントン病(HD)とは、進行性の舞踏運動、精神神経機能不全、および認知機能不全により特徴付けられる、単一遺伝子性の致死性神経変性疾患である。ハンチントン病は、HTTタンパク質のN末端において、ポリグルタミンをコードする、ハンチンチン(HTT)遺伝子内の常染色体優性トリプレット(CAG)リピートの伸長によって引き起こされることが公知である。このリピート伸長がHTTの毒性の機能獲得をもたらし、最終的に線条体神経変性につながり、それが広汎性脳萎縮へと進行する。HDでは線条体の中型有棘ニューロンが特に脆弱であるものと見られ、最大95%が消失する一方、介在ニューロンはほぼ保たれている。
ハンチントン病はクオリティ・オブ・ライフに深刻な影響を及ぼす。症状は典型的には35〜44歳で現れ、発症後の余命は10〜25年である。HD集団のごく一部では(約6%)、21歳より前に無動・筋強直症候群の出現を伴い疾患発症が起こる。これらの症例は遅発型と比べて進行が速い傾向があり、若年性またはウェストファール変異型HDに分類されている。現在、米国および欧州で約35,000〜70,000人の患者がHDに罹患していると推定される。現在、HDの治療には対症的軽減および支持療法のみが利用可能であり、治療法は未だ同定されていない。最終的に、HD罹患者は、肺炎、心不全またはその他の、転倒による身体的外傷などの合併症に陥る。
理論によって拘束されることを望むものではないが、野生型HTTタンパク質の機能は、他のタンパク質の複合体を協調させる足場として働き得る。HTTは極めて巨大なタンパク質であり(67エクソン、3144アミノ酸、約350kDa)、広範な翻訳後修飾を受けると共に、特にそのN末端(偶然にもHDにおいてリピートを保因する領域)に、他のタンパク質との相互作用部位を多数有する。HTTは主に細胞質に局在するが、核にシャトル輸送されて、そこで遺伝子転写を調節し得ることが示されている。また、HTTは小胞輸送およびRNAトラフィッキングの調節において役割を担うことも示唆されている。
非限定的な例として、HTTタンパク質配列は配列番号1424(NCBI NP_002102.4)であり、HTT核酸配列は配列番号1425(NCBI NM_002111.7)である。
CAG伸長HTTが正常なHTT機能を破壊して神経毒性をもたらす機構は、当初ハプロ不全疾患であると考えられたが、この理論は、人におけるHTT遺伝子の末端欠失がHDの発症につながらなかった時点で反証され、HTTタンパク質の完全な発現は生存にとって重要でないことが示唆された。しかしながら、マウスにおけるHTTの条件的ノックアウトが神経変性につながったことから、ある量のHTTが細胞生存に必要であることが示された。ハンチンチンタンパク質はあらゆる細胞に発現し、但しその濃度は脳で最も高く、そこでは神経核に異常なHTTの凝集体が多量に見られる。HD患者の脳ではHTTが凝集して異常な核封入体になる。現在では、関連するタンパク質中間体(すなわち可溶性種および毒性N末端断片)に加えて、このミスフォールディングおよび凝集過程が神経毒性をもたらすと考えられている。実際、HDは、9つの更なるヒト遺伝障害(いずれも、CAG伸長遺伝子および結果として生じるポリグルタミン(ポリQ)タンパク質産物と、続く神経細胞内凝集体の形成によって特徴付けられる)のファミリーに属する。興味深いことに、これらの疾患の全てにおいて伸長の長さが発症年齢および疾患進行速度の両方と相関し、伸長が長いほど高い疾患重症度に結び付く。
CAG伸長HTTおよび結果として生じるその凝集体の神経毒性の根底にある分子機構に関する仮説としては、広範囲にわたっているものの、カスパーゼ活性化、転写経路の調節異常、活性酸素種の産生増加、ミトコンドリア機能不全、軸索輸送の破壊および/または細胞内のタンパク質分解系の阻害が挙げられる。CAG伸長HTTは毒性の機能獲得を有するのみならず、他の細胞タンパク質および過程の正常機能に干渉することによりドミナントネガティブ効果もまた及ぼし得る。HTTはまた、非細胞性自律神経毒性にも関係があり、それによりHTTをホストする細胞がHTTを周囲の他のニューロンに広げるとされている。
一実施形態において、対象は、HTT遺伝子が41回以上のCAGリピート(例えば、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90回または90回超のCAGリピート)を有する完全浸透HDを有する。
一実施形態において、対象は、HTT遺伝子が36〜40回のCAGリピート(例えば、36、37、38、39および40回のCAGリピート)を有する不完全浸透を有する。
HDの症状は、限定はされないが、舞踏運動、ジストニア、動作緩慢、協調運動障害、易興奮性および抑欝、問題解決における困難、人がその通常の日常生活をこなす能力の低下、発話の減少、ならびに嚥下困難など、CNS変性に帰せられる特徴、ならびに限定はされないが、体重減少、筋消耗、代謝機能不全、および内分泌異常など、CNS変性に帰せられない特徴を含み得る。
本明細書に記載される調節性ポリヌクレオチドおよびAAV粒子と共に使用され得る、ハンチントン病の研究用モデルシステムは、限定はされないが、細胞モデル(例えば、初代ニューロンおよび人工多能性幹細胞)、無脊椎動物モデル(例えば、ショウジョウバエ属(Drosophila)またはカエノラブディティス・エレガンス(Caenorhabditis elegans))、マウスモデル(例えば、YAC128マウスモデル;R6/2マウスモデル;BAC、YACおよびノックインマウスモデル)、ラットモデル(例えば、BAC)および大型哺乳類モデル(例えば、ブタ、ヒツジ、またはサル)を含む。
HD動物モデルにおける研究によれば、例えば調節発現モデルにおける遺伝子遮断後に、表現型の逆転が実現可能であることが示唆されている。94ポリグルタミンリピートHTTタンパク質の発現の遮断が可能なマウスモデルでは、臨床的症候群が好転したのみならず、細胞内凝集体もまた消散した。更に、HTTのサイレンシングを試験した動物モデルにより有望な結果が実証されており、この療法は良好に忍容されたと共に、潜在的な治療利益を示した。
かかるsiRNA媒介性HTT発現阻害はHDの治療に用いられ得る。本発明によれば、患者のHDを治療および/または改善する方法は、細胞内への本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子の有効量を患者に投与することを含む。かかる核酸配列を含むAAV粒子の投与は、HTT遺伝子発現の阻害/サイレンシングを生じさせるsiRNA分子をコードすることになる。
一実施形態において、本明細書で記載されるAAV粒子は、それを必要とする対象におけるHTTの量を低減するのに使用することができ、これにより、本明細書で記載される治療利益をもたらす。
特定の態様において、HDの症状としては、限定はされないが、無関心または自発性の欠如、不機嫌、易怒、激越または不安、自己管理不足、判断力低下、強情、脱抑制、抑欝、自殺念慮、多幸症、攻撃性、妄想、強迫、性欲亢進、幻覚、発話能力低下、不明瞭発語、嚥下困難、体重減少、実行機能(例えば、整理する、計画する、調べるまたは代替案を取る、および新規運動技能の獲得の遅れ)を損なう認知機能障害、不安定歩行および不随意運動(舞踏運動)など、行動上の困難および症状が挙げられる。他の態様において、本発明の組成物は脳および脊髄の一方または両方に適用される。一実施形態において、本明細書に記載されるHDの症状のいずれかを治療することにより、対象の生存が延びる。
本発明には、治療を必要としている対象のHTTタンパク質に関連するハンチントン病(HD)を治療する方法が開示される。この方法は、任意選択で、本発明のsiRNA分子をコードする核酸配列を含むAAV粒子を少なくとも含む組成物の治療有効量を対象に投与することを含む。非限定的な例として、このsiRNA分子は対象においてHTT遺伝子発現をサイレンシングし、HTTタンパク質産生を阻害し、およびHDの1つ以上の症状を軽減することができ、それによりHDが治療的に処置される。
ハンチントン病の治療方法
本発明は、HTT遺伝子を標的とするsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子ならびにその設計および製造方法を提供する。単一の実施可能性理論によって拘束されることを望むものではないが、本発明は、HTT突然変異および/または野生型HTT遺伝子発現を含め、HTT発現に干渉するsiRNAを含めた調節性ポリヌクレオチドを提供する。特に、本発明は、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチド配列を含むアデノ随伴ウイルス(AAV)ウイルスゲノムなどのウイルスゲノムを利用する。本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAVベクターは、線条体の中型有棘ニューロンおよび皮質ニューロンなど、目的のニューロンへの活性薬剤の送達を増加させ得る。HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖またはコード化dsRNAは、細胞内部のHTT遺伝子発現(例えばmRNAレベル)を有意に阻害する;したがって、タンパク質の凝集および封入体の形成、フリーラジカルの増加、ミトコンドリア機能不全およびRNA代謝など、細胞内部のHTT発現によって引き起こされるストレスを低減することが可能であり得る。
本発明には、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチド配列を含むAAV粒子を細胞に導入する方法であって、標的HTT mRNAの分解が起こるのに十分な量でAAV粒子のいずれかを前記細胞に導入し、それにより細胞において標的特異的RNAiを活性化させることを含む方法が提供される。一部の態様において、細胞は、幹細胞、中型有棘または皮質ニューロンなどのニューロン、筋細胞およびアストロサイトなどのグリア細胞であってもよい。
一部の実施形態において、本発明は、本明細書で記載されるプラスミドまたはAAVベクターの治療有効量を、それを必要とする対象に投与することにより、ハンチントン病(HD)を治療または改善するための方法を提供する。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子を使用して、HDを治療および/または改善してもよい。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子を使用して、HDの対象の認知および/または運動機能低下を軽減してもよく、この場合、減退の量は、限定はされないが、統一ハンチントン病評価尺度(UHDRS:Unified Huntington’s Disease Rating Scale)およびサブスコア、ならびに認知機能試験どの標準的な判定方式により決定される。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子を使用して、限定はされないが、全機能的能力(TFC:Total Functional Capacity)尺度などの標準的な判定方式により測定される、機能的能力および日常生活活動の減退を軽減してもよい。
一部の実施形態において、本発明は、治療を必要とする対象における、HTT遺伝子および/またはHTTタンパク質と関連するハンチントン病を治療または改善するための方法であって、HTT遺伝子を標的とし、HTT遺伝子の発現およびHTTタンパク質の産生を阻害し、対象におけるHDの症状を改善する、少なくとも1つのsiRNA二重鎖をコードする調節性ポリヌクレオチドの薬学的に有効な量を含むAAV粒子を対象に投与することを含む方法を提供する。
一実施形態において、本発明のAAVベクターを、治療を必要とする対象における、ハンチントン病を治療するための方法として使用してもよい。治療を必要としている対象を定義するための当該技術分野において公知の任意の方法を使用して前記対象を同定してもよい。対象はハンチントン病の臨床診断を有してもよく、または症状が出る前であってもよい。限定はされないが、認知機能評価および/または神経学的もしくは神経精神医学的検査、運動テスト、官能テスト、精神医学的評価、脳イメージング、家族歴および/または遺伝子検査を含め、HDを診断する任意の公知の方法を利用することができる。
一実施形態において、HD対象の選択は、ハンチントン病の予後指標、またはその派生指標を使用して決定される(ロング・JD(Long JD)ら著、ムーブメント・ディスオーダーズ(Movement Disorders)、2017年、第32巻、第2号、p.256〜263、この内容は本明細書において全体として参照により援用される)。この予後指標は4つの成分、(1)統一ハンチントン病評価尺度(UHDRS)からの総合運動スコア(TMS:total motor score)、(2)符号・数字モダリティ検査(SDMT:Symbol Digit Modality Test)、(3)ベースライン年齢、および(4)シトシン−アデニン−グアニン(CAG)伸長を使用して運動診断の確率を予測する。
一実施形態において、ハンチントン病の予後指標は、以下の式:PIHD=51×TMS+(−34)×SDMT+7×年齢×(CAG−34)[式中、PIHDの値が大きいほど症状の診断または発症リスクが高いことを意味する]によって計算される。
別の実施形態において、ハンチントン病の予後指標は、50%の10年生存率のコンテクストで解釈されるべき標準偏差単位を求める以下の正規化した式によって計算される:PINHD=(PIHD−883)/1044[式中、PINHD<0は50%より高い10年生存率を意味し、およびPINHD>0は50%未満の10年生存率を示唆する]。
一実施形態において、この予後指標を使用して、HDの症状を数年以内に発症するであろうが、しかし臨床的には未だ診断可能な症状を有しない対象が同定されてもよい。更に、これらの無症候患者は、無症候期の間に本発明のAAVベクターおよび組成物を使用した治療に選択され、それを受けてもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、バイオマーカ評価を受けた対象に投与されてもよい。不顕性期および進行初期のHDに関する潜在的な血中バイオマーカとしては、限定はされないが、8−OhdG酸化的ストレスマーカ、代謝マーカ(例えば、クレアチンキナーゼ、分枝鎖アミノ酸)、コレステロール代謝産物(例えば、24−OHコレステロール)、免疫および炎症タンパク質(例えば、クラスタリン、補体成分、インターロイキン6および8)、遺伝子発現変化(例えば、トランスクリプトームマーカ)、内分泌マーカ(例えば、コルチゾール、グレリンおよびレプチン)、BDNF、アデノシン2A受容体が挙げられる。不顕性期および進行初期のHDに関する脳イメージング用の潜在的なバイオマーカとしては、限定はされないが、線条体容積、皮質下白質容積、皮質厚、全脳および脳室容積、機能イメージング(例えば、機能MRI)、PET(例えば、フルオロデオキシグルコースによる)、および磁気共鳴スペクトロスコピー(例えば、乳酸塩)が挙げられる。不顕性期および進行初期のHDに関する定量的臨床ツール用の潜在的なバイオマーカとしては、限定はされないが、定量的運動評価、運動生理機能評価(例えば、経頭蓋磁気刺激)、および定量的眼球運動測定が挙げられる。定量的臨床バイオマーカ評価の非限定的な例としては、舌力の変動、メトロノームに合わせた手拍子、握力、眼球運動評価および認知機能テストが挙げられる。多施設観察研究の非限定的な例としては、PREDICT−HDおよびTRACK−HDが挙げられる。対象はHDの症状を有してもよく、HDと診断されてもよく、またはHDに関して無症候であってもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、ニューロイメージングを用いたバイオマーカ評価を受けた対象に投与されてもよい。対象はHDの症状を有してもよく、HDと診断されてもよく、またはHDに関して無症候であってもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、HDに関して無症候の対象に投与されてもよい。対象は無症候であり得るが、HDのリスクがあるかどうかを判断するための予測的遺伝子検査またはバイオマーカ評価を受けたことがあってもよく、および/または対象は、HDと診断された家系員(例えば、母親、父親、兄弟、姉妹、伯叔母、伯叔父、祖父母)を有してもよい。
一実施形態において、AAV粒子は、HDの初期段階にある対象に投与されてもよい。初期段階では、対象は、協調の僅かな変化、一部の不随意運動(舞踏運動)、易怒および抑欝などの気分の変化、問題解決における困難、人がその通常の日常生活をこなす能力の低下を有する。
一実施形態において、AAV粒子は、HDの中期段階にある対象に投与されてもよい。中期段階では、対象は運動障害の増加、発話減少、嚥下困難を有し、通常の活動をこなすのが難しくなり得る。この段階では、対象は随意運動の制御を維持するため作業療法士および理学療法士の助けを借り得ると共に、対象は言語聴覚士を有し得る。
一実施形態において、AAV粒子は、HDの後期段階にある対象に投与されてもよい。後期段階では、対象はもはや歩行できず、発話不能であるため、HDの対象はケアをほぼ完全にまたは完全に他者に頼る。対象は概してなおも言語を理解することができ、家族および友人を認識するが、窒息が大きな懸念である。
一実施形態において、AAV粒子を使用して、HDの発症が20歳未満、早ければ2歳である若年性型のHDを有する対象が治療されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子を使用して、HTT遺伝子が41回以上のCAGリピート(例えば、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90回または90回超のCAGリピート)を有する完全浸透HDを有するHD対象が治療されてもよい。
一実施形態において、AAV粒子を使用して、HTT遺伝子が36〜40回のCAGリピート(例えば、36、37、38、39および40回のCAGリピート)を有する不完全浸透を有するHD対象が治療されてもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子を含む組成物は、対象の中枢神経系に投与される。他の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子を含む組成物は、対象の組織(例えば対象の脳)に投与される。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子を、限定はされないが、中型有棘ニューロンまたは皮質ニューロンを含むニューロン;オリゴデンドロサイト、アストロサイト、およびミクログリアを含むグリア細胞;ならびに/またはT細胞など、ニューロンを取り囲む他の細胞を含む、特定のタイプの標的細胞に送達してもよい。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子を、線条体内のニューロンおよび/または皮質のニューロンに送達してもよい。
一部の実施形態において、HD治療用の本発明の組成物は、必要としている対象に静脈内、筋肉内、皮下、腹腔内、実質内、軟膜下、髄腔内および/または脳室内投与され、siRNA分子またはsiRNA分子を含むベクターが血液脳関門および血液脊髄関門の一方または両方を通過し、または脳および/または脊髄に直接到達することが可能となる。一部の態様において、この方法は、本発明のsiRNA分子の核酸配列をコードするAAV粒子を含む組成物の治療有効量を(例えば、輸液ポンプおよび/または送達足場を使用して)対象の中枢神経系(CNS)に直接投与(例えば、実質内投与、軟膜下投与、脳室内投与および/または髄腔内投与)することを含む。ベクターは対象においてHTT遺伝子発現をサイレンシングまたは抑制し、および/またはHDの1つ以上の症状を軽減するために使用されてもよく、それによりHDが治療的に処置される。
一部の実施形態において、siRNA分子、またはかかるsiRNA分子を含むAAVベクターは、対象の中枢神経系に直接、例えば対象の白質への注入によって導入されてもよい。理論によって拘束されることを望むものではないが、白質への直接注入による分布は、ハンチントン病の対象において損なわれていることもある軸索輸送機構と独立している可能性があり、これは白質注入が一層のAAVベクターの輸送を実現し得ることを意味する。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子を含む組成物は、実質内注射によって対象の中枢神経系に投与される。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子組成物は、実質内注射および髄腔内注射によって対象の中枢神経系に投与される。
一実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子組成物は、実質内注射および脳室内注射によって対象の中枢神経系に投与される。
一部の実施形態において、本発明のHD治療用組成物は、実質内投与によって必要としている対象に投与される。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子組成物は、例えば、被殻への注入により、対象の中枢神経系へと、直接導入してもよい。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子組成物は、対象の中枢神経系に直接、例えば対象の視床への注入によって導入されてもよい。理論によって拘束されることを望むものではないが、視床はハンチントン病の対象において比較的保たれている脳領域であり、これはAAVベクターの軸索輸送を通じたより広範な皮質形質導入が可能となり得ることを意味する。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子組成物を、例えば、静脈内投与により、対象の中枢神経系へと、間接的に導入してもよい。
HTTの発現を調節する
一実施形態において、AAV粒子の、対象への投与は、対象におけるHTTの発現を低下させ、HTTの発現の低減は、対象におけるHDの影響を低下させるであろう。
一実施形態において、本明細書で記載される方法によりアッセイされる場合などにおいて、コード化dsRNAが発現し、HTTタンパク質を発現する細胞と接触すると、HTTタンパク質の発現を、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、もしくは少なくとも40%、またはこれを超えて阻害する。
一実施形態において、本発明のsiRNAをコードする調節性ポリヌクレオチド配列を含むAAV粒子の、対象への投与は、対象におけるHTT(例えば、突然変異体HTT、野生型HTTおよび/または突然変異体および野生型のHTT)を低減し得る。一実施形態において、AAV粒子を対象に投与すると、対象の野生型HTTが減少し得る。更に別の実施形態において、AAV粒子を対象に投与すると、対象の突然変異HTTおよび野生型HTTの両方が減少し得る。突然変異および/または野生型HTTは、限定はされないが、対象のCNS、CNSの一領域、またはCNSの特定の細胞など、対象において約20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%減少し得る。突然変異体HTTは、限定はされないが、対象のCNS、CNSの領域、またはCNSの特定の細胞など、対象において、約20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%、もしくは95〜100%低減され得る。野生型HTTは、限定はされないが、対象のCNS、CNSの領域、またはCNSの特定の細胞など、対象において、約20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%、もしくは95〜100%低減され得る。突然変異体および野生型のHTTは、限定はされないが、対象のCNS、CNSの領域、またはCNSの特定の細胞など、対象において、約20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、85%、90%、95%、および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%、もしくは95〜100%低減され得る。非限定的な例として、AAV粒子は、中型有棘ニューロンにおいて、HTTの発現を、少なくとも50%低減し得る。非限定的な例として、ベクター、例えばAAVベクターは、中型有棘ニューロンにおいて、HTTの発現を、少なくとも40%低減し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、被殻の中型有棘ニューロンにおいて、HTTの発現を、少なくとも40%低減し得る。非限定的な例として、AAV粒子は、被殻の中型有棘ニューロンにおいて、HTTの発現を、少なくとも30%低減し得る。更に別の非限定的な例として、AAV粒子は、被殻および皮質におけるHTTの発現を、少なくとも40%低減し得る。更に別の非限定的な例として、AAV粒子は、被殻および皮質におけるHTTの発現を、少なくとも30%低減し得る。更に別の非限定的な例として、AAV粒子は、被殻におけるHTTの発現を、少なくとも30%低減し得る。更に別の非限定的な例として、AAV粒子は、被殻におけるHTTの発現を、少なくとも30%低減することが可能であり、皮質におけるHTTの発現を、少なくとも15%低減し得る。
一実施形態において、AAV粒子を使用して、HTTタンパク質の発現を、少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%、および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、55〜60%、55〜70%、55〜80%、55〜90%、55〜95%、55〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%、もしくは95〜100%低下させてもよい。非限定的な例として、HTTタンパク質の発現は、50〜90%低下し得る。非限定的な例として、HTTタンパク質の発現は、30〜70%低下し得る。
一実施形態において、siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して、HTT mRNAの発現を、少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%、および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、55〜60%、55〜70%、55〜80%、55〜90%、55〜95%、55〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%、もしくは95〜100%低下させてもよい。非限定的な例として、HTT mRNAの発現は、50〜90%低下し得る。
一実施形態において、AAV粒子を使用して対象のHTTタンパク質を減少させてもよい。この減少は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5〜15%、5〜20%、5〜25%、5〜30%、5〜35%、5〜40%、5〜45%、5〜50%、5〜55%、5〜60%、5〜65%、5〜70%、5〜75%、5〜80%、5〜85%、5〜90%、5〜95%、10〜20%、10〜25%、10〜30%、10〜35%、10〜40%、10〜45%、10〜50%、10〜55%、10〜60%、10〜65%、10〜70%、10〜75%、10〜80%、10〜85%、10〜90%、10〜95%、15〜25%、15〜30%、15〜35%、15〜40%、15〜45%、15〜50%、15〜55%、15〜60%、15〜65%、15〜70%、15〜75%、15〜80%、15〜85%、15〜90%、15〜95%、20〜30%、20〜35%、20〜40%、20〜45%、20〜50%、20〜55%、20〜60%、20〜65%、20〜70%、20〜75%、20〜80%、20〜85%、20〜90%、20〜95%、25〜35%、25〜40%、25〜45%、25〜50%、25〜55%、25〜60%、25〜65%、25〜70%、25〜75%、25〜80%、25〜85%、25〜90%、25〜95%、30〜40%、30〜45%、30〜50%、30〜55%、30〜60%、30〜65%、30〜70%、30〜75%、30〜80%、30〜85%、30〜90%、30〜95%、35〜45%、35〜50%、35〜55%、35〜60%、35〜65%、35〜70%、35〜75%、35〜80%、35〜85%、35〜90%、35〜95%、40〜50%、40〜55%、40〜60%、40〜65%、40〜70%、40〜75%、40〜80%、40〜85%、40〜90%、40〜95%、45〜55%、45〜60%、45〜65%、45〜70%、45〜75%、45〜80%、45〜85%、45〜90%、45〜95%、50〜60%、50〜65%、50〜70%、50〜75%、50〜80%、50〜85%、50〜90%、50〜95%、55〜65%、55〜70%、55〜75%、55〜80%、55〜85%、55〜90%、55〜95%、60〜70%、60〜75%、60〜80%、60〜85%、60〜90%、60〜95%、65〜75%、65〜80%、65〜85%、65〜90%、65〜95%、70〜80%、70〜85%、70〜90%、70〜95%、75〜85%、75〜90%、75〜95%、80〜90%、80〜95%、または90〜95%であり得る。非限定的な例として、対象はHTTタンパク質の50%の減少を有し得る。非限定的な例として、対象はHTTタンパク質の70%の減少および野生型HTTタンパク質の10%の減少を有し得る。非限定的な例として、被殻の中型有棘ニューロンにおけるHTTの減少は約40%であり得る。非限定的な例として、被殻および皮質におけるHTTの減少は約40%であり得る。非限定的な例として、被殻の中型有棘ニューロンにおけるHTTの減少は40%〜70%であり得る。非限定的な例として、被殻および皮質におけるHTTの減少は40%〜70%であり得る。
一実施形態において、AAV粒子を使用して対象の野生型HTTタンパク質を減少させてもよい。この減少は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5〜15%、5〜20%、5〜25%、5〜30%、5〜35%、5〜40%、5〜45%、5〜50%、5〜55%、5〜60%、5〜65%、5〜70%、5〜75%、5〜80%、5〜85%、5〜90%、5〜95%、10〜20%、10〜25%、10〜30%、10〜35%、10〜40%、10〜45%、10〜50%、10〜55%、10〜60%、10〜65%、10〜70%、10〜75%、10〜80%、10〜85%、10〜90%、10〜95%、15〜25%、15〜30%、15〜35%、15〜40%、15〜45%、15〜50%、15〜55%、15〜60%、15〜65%、15〜70%、15〜75%、15〜80%、15〜85%、15〜90%、15〜95%、20〜30%、20〜35%、20〜40%、20〜45%、20〜50%、20〜55%、20〜60%、20〜65%、20〜70%、20〜75%、20〜80%、20〜85%、20〜90%、20〜95%、25〜35%、25〜40%、25〜45%、25〜50%、25〜55%、25〜60%、25〜65%、25〜70%、25〜75%、25〜80%、25〜85%、25〜90%、25〜95%、30〜40%、30〜45%、30〜50%、30〜55%、30〜60%、30〜65%、30〜70%、30〜75%、30〜80%、30〜85%、30〜90%、30〜95%、35〜45%、35〜50%、35〜55%、35〜60%、35〜65%、35〜70%、35〜75%、35〜80%、35〜85%、35〜90%、35〜95%、40〜50%、40〜55%、40〜60%、40〜65%、40〜70%、40〜75%、40〜80%、40〜85%、40〜90%、40〜95%、45〜55%、45〜60%、45〜65%、45〜70%、45〜75%、45〜80%、45〜85%、45〜90%、45〜95%、50〜60%、50〜65%、50〜70%、50〜75%、50〜80%、50〜85%、50〜90%、50〜95%、55〜65%、55〜70%、55〜75%、55〜80%、55〜85%、55〜90%、55〜95%、60〜70%、60〜75%、60〜80%、60〜85%、60〜90%、60〜95%、65〜75%、65〜80%、65〜85%、65〜90%、65〜95%、70〜80%、70〜85%、70〜90%、70〜95%、75〜85%、75〜90%、75〜95%、80〜90%、80〜95%、または90〜95%であり得る。非限定的な例として、対象は野生型HTTタンパク質の50%の減少を有し得る。非限定的な例として、被殻の中型有棘ニューロンにおける野生型HTTの減少は約40%であり得る。非限定的な例として、被殻および皮質における野生型HTTの減少は約40%であり得る。非限定的な例として、被殻の中型有棘ニューロンにおける野生型HTTの減少は40%〜70%であり得る。非限定的な例として、被殻および皮質における野生型HTTの減少は40%〜70%であり得る。
一実施形態において、AAV粒子を使用して対象の突然変異HTTタンパク質を減少させてもよい。この減少は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5〜15%、5〜20%、5〜25%、5〜30%、5〜35%、5〜40%、5〜45%、5〜50%、5〜55%、5〜60%、5〜65%、5〜70%、5〜75%、5〜80%、5〜85%、5〜90%、5〜95%、10〜20%、10〜25%、10〜30%、10〜35%、10〜40%、10〜45%、10〜50%、10〜55%、10〜60%、10〜65%、10〜70%、10〜75%、10〜80%、10〜85%、10〜90%、10〜95%、15〜25%、15〜30%、15〜35%、15〜40%、15〜45%、15〜50%、15〜55%、15〜60%、15〜65%、15〜70%、15〜75%、15〜80%、15〜85%、15〜90%、15〜95%、20〜30%、20〜35%、20〜40%、20〜45%、20〜50%、20〜55%、20〜60%、20〜65%、20〜70%、20〜75%、20〜80%、20〜85%、20〜90%、20〜95%、25〜35%、25〜40%、25〜45%、25〜50%、25〜55%、25〜60%、25〜65%、25〜70%、25〜75%、25〜80%、25〜85%、25〜90%、25〜95%、30〜40%、30〜45%、30〜50%、30〜55%、30〜60%、30〜65%、30〜70%、30〜75%、30〜80%、30〜85%、30〜90%、30〜95%、35〜45%、35〜50%、35〜55%、35〜60%、35〜65%、35〜70%、35〜75%、35〜80%、35〜85%、35〜90%、35〜95%、40〜50%、40〜55%、40〜60%、40〜65%、40〜70%、40〜75%、40〜80%、40〜85%、40〜90%、40〜95%、45〜55%、45〜60%、45〜65%、45〜70%、45〜75%、45〜80%、45〜85%、45〜90%、45〜95%、50〜60%、50〜65%、50〜70%、50〜75%、50〜80%、50〜85%、50〜90%、50〜95%、55〜65%、55〜70%、55〜75%、55〜80%、55〜85%、55〜90%、55〜95%、60〜70%、60〜75%、60〜80%、60〜85%、60〜90%、60〜95%、65〜75%、65〜80%、65〜85%、65〜90%、65〜95%、70〜80%、70〜85%、70〜90%、70〜95%、75〜85%、75〜90%、75〜95%、80〜90%、80〜95%、または90〜95%であり得る。非限定的な例として、対象は突然変異HTTタンパク質の50%の減少を有し得る。非限定的な例として、被殻の中型有棘ニューロンにおける突然変異HTTの減少は約40%であり得る。非限定的な例として、被殻および皮質における突然変異HTTの減少は約40%であり得る。非限定的な例として、被殻の中型有棘ニューロンにおける突然変異HTTの減少は40%〜70%であり得る。非限定的な例として、被殻および皮質における突然変異HTTの減少は40%〜70%であり得る。
一部の実施形態において、本発明は、細胞におけるHTT遺伝子発現を阻害/サイレンシングする方法を提供する。したがって、siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して、細胞、詳細にはニューロンにおけるHTT遺伝子発現を実質的に阻害することができる。一部の態様において、HTT遺伝子発現の阻害とは、少なくとも約20%、例えば少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、55〜60%、55〜70%、55〜80%、55〜90%、55〜95%、55〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%の阻害を指す。したがって、標的遺伝子のタンパク質産物が、少なくとも約20%、好ましくは少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%阻害され得る。
一部の実施形態において、本発明は、細胞、詳細には中型有棘ニューロンにおけるHTT遺伝子発現を阻害/サイレンシングする方法を提供する。一部の態様において、HTT遺伝子発現の阻害とは、少なくとも約20%、例えば少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、55〜60%、55〜70%、55〜80%、55〜90%、55〜95%、55〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%の阻害を指す。したがって、標的遺伝子のタンパク質産物が、少なくとも約20%、好ましくは少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、55〜60%、55〜70%、55〜80%、55〜90%、55〜95%、55〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%阻害され得る。
一部の実施形態において、本発明は、細胞、詳細にはアストロサイトにおけるHTT遺伝子発現を阻害/サイレンシングする方法を提供する。一部の態様において、HTT遺伝子発現の阻害とは、少なくとも約20%、例えば少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、55〜60%、55〜70%、55〜80%、55〜90%、55〜95%、55〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%の阻害を指す。したがって、標的遺伝子のタンパク質産物が、少なくとも約20%、好ましくは少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、55〜60%、55〜70%、55〜80%、55〜90%、55〜95%、55〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%阻害され得る。
一実施形態では、本siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して、限定はされないが中脳など、CNSの少なくとも1つの領域におけるHTTタンパク質および/またはmRNAの発現を低下させてもよい。HTTタンパク質および/またはmRNAの発現はCNSの少なくとも1つの領域において少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、55〜60%、55〜70%、55〜80%、55〜90%、55〜95%、55〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が50〜90%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が40〜50%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が40〜50%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が30〜70%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が40〜70%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が40〜50%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が50〜70%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が50〜60%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が50%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が51%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が52%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が53%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が54%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が55%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が56%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が57%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が58%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が59%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が60%低下する。
一実施形態では、本siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して、限定はされないが前脳など、CNSの少なくとも1つの領域におけるHTTタンパク質および/またはmRNAの発現を低下させてもよい。HTTタンパク質および/またはmRNAの発現はCNSの少なくとも1つの領域において少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、55〜60%、55〜70%、55〜80%、55〜90%、55〜95%、55〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が50〜90%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が40〜50%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が40〜50%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が30〜70%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が40〜70%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が40〜50%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が50〜70%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が50〜60%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が50%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が51%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が52%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が53%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が54%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が55%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が56%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が57%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が58%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が59%低下する。非限定的な例として、線条体および/または皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現が60%低下する。
一実施形態において、siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して、線条体におけるHTTタンパク質および/またはmRNAの発現を低下させてもよい。HTTタンパク質およびmRNAの発現は、少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%、および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%、もしくは95〜100%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、40〜50%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、30〜70%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、少なくとも30%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、40〜70%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、40〜50%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、50〜70%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、50〜60%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、50%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、51%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、52%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、53%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、54%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、55%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、56%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、57%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、58%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、59%低下する。非限定的な例として、線条体におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、60%低下する。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子を使用して、線条体および/または皮質のニューロンおよび/またはアストロサイトにおけるHTTタンパク質を抑制してもよい。非限定的な例として、HTTタンパク質の抑制は、線条体の中型有棘ニューロンおよび/または皮質のニューロンにおける抑制である。
一部の実施形態において、本発明のsiRNA分子をコードする調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子を使用して、線条体および/または皮質のニューロンおよび/またはアストロサイトにおけるHTTタンパク質を抑制し、および関連するニューロン毒性を低下させてもよい。線条体および/または皮質のニューロンおよび/またはアストロサイトにおけるHTTタンパク質の抑制は、独立に、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5〜15%、5〜20%、5〜25%、5〜30%、5〜35%、5〜40%、5〜45%、5〜50%、5〜55%、5〜60%、5〜65%、5〜70%、5〜75%、5〜80%、5〜85%、5〜90%、5〜95%、10〜20%、10〜25%、10〜30%、10〜35%、10〜40%、10〜45%、10〜50%、10〜55%、10〜60%、10〜65%、10〜70%、10〜75%、10〜80%、10〜85%、10〜90%、10〜95%、15〜25%、15〜30%、15〜35%、15〜40%、15〜45%、15〜50%、15〜55%、15〜60%、15〜65%、15〜70%、15〜75%、15〜80%、15〜85%、15〜90%、15〜95%、20〜30%、20〜35%、20〜40%、20〜45%、20〜50%、20〜55%、20〜60%、20〜65%、20〜70%、20〜75%、20〜80%、20〜85%、20〜90%、20〜95%、25〜35%、25〜40%、25〜45%、25〜50%、25〜55%、25〜60%、25〜65%、25〜70%、25〜75%、25〜80%、25〜85%、25〜90%、25〜95%、30〜40%、30〜45%、30〜50%、30〜55%、30〜60%、30〜65%、30〜70%、30〜75%、30〜80%、30〜85%、30〜90%、30〜95%、35〜45%、35〜50%、35〜55%、35〜60%、35〜65%、35〜70%、35〜75%、35〜80%、35〜85%、35〜90%、35〜95%、40〜50%、40〜55%、40〜60%、40〜65%、40〜70%、40〜75%、40〜80%、40〜85%、40〜90%、40〜95%、45〜55%、45〜60%、45〜65%、45〜70%、45〜75%、45〜80%、45〜85%、45〜90%、45〜95%、50〜60%、50〜65%、50〜70%、50〜75%、50〜80%、50〜85%、50〜90%、50〜95%、55〜65%、55〜70%、55〜75%、55〜80%、55〜85%、55〜90%、55〜95%、60〜70%、60〜75%、60〜80%、60〜85%、60〜90%、60〜95%、65〜75%、65〜80%、65〜85%、65〜90%、65〜95%、70〜80%、70〜85%、70〜90%、70〜95%、75〜85%、75〜90%、75〜95%、80〜90%、80〜95%、または90〜95%の抑制であってもよい。関連するニューロン毒性の低下は、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または95%超、5〜15%、5〜20%、5〜25%、5〜30%、5〜35%、5〜40%、5〜45%、5〜50%、5〜55%、5〜60%、5〜65%、5〜70%、5〜75%、5〜80%、5〜85%、5〜90%、5〜95%、10〜20%、10〜25%、10〜30%、10〜35%、10〜40%、10〜45%、10〜50%、10〜55%、10〜60%、10〜65%、10〜70%、10〜75%、10〜80%、10〜85%、10〜90%、10〜95%、15〜25%、15〜30%、15〜35%、15〜40%、15〜45%、15〜50%、15〜55%、15〜60%、15〜65%、15〜70%、15〜75%、15〜80%、15〜85%、15〜90%、15〜95%、20〜30%、20〜35%、20〜40%、20〜45%、20〜50%、20〜55%、20〜60%、20〜65%、20〜70%、20〜75%、20〜80%、20〜85%、20〜90%、20〜95%、25〜35%、25〜40%、25〜45%、25〜50%、25〜55%、25〜60%、25〜65%、25〜70%、25〜75%、25〜80%、25〜85%、25〜90%、25〜95%、30〜40%、30〜45%、30〜50%、30〜55%、30〜60%、30〜65%、30〜70%、30〜75%、30〜80%、30〜85%、30〜90%、30〜95%、35〜45%、35〜50%、35〜55%、35〜60%、35〜65%、35〜70%、35〜75%、35〜80%、35〜85%、35〜90%、35〜95%、40〜50%、40〜55%、40〜60%、40〜65%、40〜70%、40〜75%、40〜80%、40〜85%、40〜90%、40〜95%、45〜55%、45〜60%、45〜65%、45〜70%、45〜75%、45〜80%、45〜85%、45〜90%、45〜95%、50〜60%、50〜65%、50〜70%、50〜75%、50〜80%、50〜85%、50〜90%、50〜95%、55〜65%、55〜70%、55〜75%、55〜80%、55〜85%、55〜90%、55〜95%、60〜70%、60〜75%、60〜80%、60〜85%、60〜90%、60〜95%、65〜75%、65〜80%、65〜85%、65〜90%、65〜95%、70〜80%、70〜85%、70〜90%、70〜95%、75〜85%、75〜90%、75〜95%、80〜90%、80〜95%、または90〜95%であってもよい。
一実施形態では、本siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して皮質におけるHTTタンパク質および/またはmRNAの発現を低下させてもよい。HTTタンパク質および/またはmRNAの発現は少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は40〜50%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は30〜70%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は少なくとも30%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は40〜70%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は40〜50%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は50〜70%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は50〜60%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は50%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は51%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は52%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は53%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は54%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は55%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は56%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は57%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は58%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は59%低下する。非限定的な例として、皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は60%低下する。
一実施形態では、本siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して運動皮質におけるHTTタンパク質および/またはmRNAの発現を低下させてもよい。HTTタンパク質および/またはmRNAの発現は少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は40〜50%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は30〜70%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は少なくとも30%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は40〜70%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は50〜70%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は50〜60%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は50%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は51%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は52%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は53%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は54%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は55%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は56%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は57%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は58%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は59%低下する。非限定的な例として、運動皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は60%低下する。
一実施形態では、本siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して体性感覚皮質におけるHTTタンパク質および/またはmRNAの発現を低下させてもよい。HTTタンパク質および/またはmRNAの発現は少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は40〜50%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は30〜70%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は少なくとも30%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は40〜70%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は40〜50%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は50〜70%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は50〜60%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は50%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は51%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は52%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は53%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は54%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は55%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は56%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は57%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は58%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は59%低下する。非限定的な例として、体性感覚皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は60%低下する。
一実施形態では、本siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して側頭皮質におけるHTTタンパク質および/またはmRNAの発現を低下させてもよい。HTTタンパク質および/またはmRNAの発現は少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%または95〜100%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は40〜50%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は30〜70%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は少なくとも30%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は40〜70%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、40〜50%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は50〜70%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は50〜60%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は50%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は51%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は52%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は53%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は54%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は55%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は56%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は57%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は58%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は59%低下する。非限定的な例として、側頭皮質におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は60%低下する。
一実施形態において、siRNA二重鎖またはコード化dsRNAを使用して、被殻におけるHTTタンパク質および/またはmRNAの発現を低下させてもよい。HTTタンパク質およびmRNAの発現は、CNSの少なくとも1つの領域において、少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、85%、90%、95%、および100%、または少なくとも20〜30%、20〜40%、20〜50%、20〜60%、20〜70%、20〜80%、20〜90%、20〜95%、20〜100%、30〜40%、30〜50%、30〜60%、30〜70%、30〜80%、30〜90%、30〜95%、30〜100%、40〜50%、40〜60%、40〜70%、40〜80%、40〜90%、40〜95%、40〜100%、50〜60%、50〜70%、50〜80%、50〜90%、50〜95%、50〜100%、55〜60%、55〜70%、55〜80%、55〜90%、55〜95%、55〜100%、60〜70%、60〜80%、60〜90%、60〜95%、60〜100%、70〜80%、70〜90%、70〜95%、70〜100%、80〜90%、80〜95%、80〜100%、90〜95%、90〜100%、もしくは95〜100%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、40〜70%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、40〜50%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、50〜70%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、50〜60%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、50%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、51%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、52%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、53%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、54%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、55%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、56%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、57%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、58%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、59%低下する。非限定的な例として、被殻におけるHTTタンパク質およびmRNAの発現は、60%低下する。
単剤療法および組合せ療法
一部の実施形態において、本組成物は、HDの治療用の単独治療薬または併用治療薬として投与される。
一部の実施形態において、本発明の医薬組成物は単独療法として使用される。他の実施形態において、本発明の医薬組成物は併用療法で使用される。併用療法は、ニューロン変性に対するその神経保護効果に関して試験済みの、小分子化合物、成長因子およびホルモンなどの1つ以上の神経保護剤との併用であってもよい。
HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖をコードするAAV粒子は、1つ以上の他の治療用薬剤と併用して使用されてもよい。「〜と併用して」とは、その薬剤が同じ時点で投与されなければならない、および/または一緒に送達されるように製剤化されなければならないことを含意するよう意図するものではなく、しかしながらこれらの送達方法は本開示の範囲内にある。組成物は、1つ以上の他の所望の治療薬または医療手技と同時に、その前に、またはその後に投与することができる。一般に、各薬剤は、当該の薬剤について決定された用量および/またはタイムスケジュールで投与されることになる。
本発明のsiRNA分子の核酸配列をコードするAAV粒子と併用して使用し得る治療剤は、抗酸化剤、抗炎症剤、抗アポトーシス剤、カルシウム調節剤、抗グルタミン酸剤、構造タンパク質阻害薬、筋機能に関与する化合物、および金属イオン調節に関与する化合物である小分子化合物であり得る。
本明細書に記載されるベクターと併用して使用し得るHD治療用に試験される化合物としては、限定はされないが、ドーパミン枯渇剤(例えば、舞踏運動に対するテトラベナジン)、ベンゾジアゼピン系(例えば、ミオクローヌス、舞踏運動、ジストニア、硬直、および/または痙縮に対するクロナゼパム)、抗痙攣薬(例えば、ミオクローヌスに対するバルプロ酸ナトリウムおよびレベチラセタム)、ドーパミンのアミノ酸前駆物質(例えば、特に若年性HDまたは若年成人発症型パーキンソン病表現型に関連する硬直に対するレボドパ)、骨格筋弛緩薬(例えば、硬直および/または痙縮に対するバクロフェン、チザニジン)、筋筋麻痺を引き起こす神経筋接合部におけるアセチルコリン(acetycholine)放出に対する阻害薬(例えば、ブラキシズムおよび/またはジストニアに対するボツリヌス毒素)、非定型神経遮断薬(例えば、精神病および/または易怒に対するオランザピンおよびクエチアピン、精神病、舞踏運動および/または易怒に対するリスペリドン、スルピリドおよびハロペリドール、治療抵抗性精神病に対するクロザピン、顕著な陰性症状を有する精神病に対するアリピプラゾール)、ATP/細胞エナジェティクス(例えばクレアチン)を増加させる薬剤、選択的セロトニン再取込み阻害薬(SSRI)(例えば、抑欝、不安、妄想強迫行動および/または易怒に対するシタロプラム、フルオキセチン、パロキセチン、セルトラリン、ミルタザピン、ベンラファキシン)、催眠剤(例えば、睡眠・覚醒サイクルの変化に対するゾピクロン(xopiclone)および/またはゾルピデム)、抗痙攣薬(例えば、躁病または軽躁病に対するバルプロ酸ナトリウムおよびカルバマゼピン)および気分安定剤(例えば、躁病または軽躁病に対するリチウム)が挙げられる。
HDの治療のため、本発明のsiRNA分子の核酸配列をコードするAAV粒子との併用療法で神経栄養因子が使用されてもよい。概して、神経栄養因子は、ニューロンの生存、成長、分化、増殖および/または成熟を促進し、またはニューロンの活性増加を刺激する物質として定義される。一部の実施形態において、本方法は、治療を必要としている対象への1つ以上の栄養因子の送達を更に含む。栄養因子としては、限定はされないが、IGF−I、GDNF、BDNF、CTNF、VEGF、コリベリン、キサリプロデン、甲状腺刺激ホルモン放出ホルモンおよびADNF、およびこれらのバリアントを挙げることができる。
一態様において、HTT遺伝子を標的とするsiRNA二重鎖をコードする、調節性ポリヌクレオチドを含むAAV粒子は、AAV−IGF−I(例えば、ヴィンセント(Vincent)ら著、ニューロモレキュラー・メディシン(Neuromolecular medicine)、2004年、第6巻、p.79〜85を参照のこと;この内容は全体として参照により本明細書に援用される)およびAAV−GDNF(例えば、ワン(Wang)ら著、ジャーナル・オブ・ニューロサイエンス(J Neurosci.)、2002年、第22巻、p.6920〜6928を参照のこと;この内容は全体として参照により本明細書に援用される)などの神経栄養因子を発現するAAVベクターと共投与されてもよい。
V.定義
特に明記しない限り、以下の用語および語句は以下に説明する意味を有する。これらの定義は、本質的に限定するよう意図するものでなく、本発明の特定の態様のより明確な理解を提供するために供される。
本明細書で使用されるとき、用語「核酸」、「ポリヌクレオチド」および「オリゴヌクレオチド」は、ポリデオキシリボヌクレオチド(2−デオキシ−D−リボースを含有する)、またはポリリボヌクレオチド(D−リボースを含有する)のいずれか、またはプリンもしくはピリミジン塩基、または修飾プリンもしくはピリミジン塩基のNグリコシドである任意の他のタイプのポリヌクレオチドで構成される任意の核酸ポリマーを指す。用語「核酸」、「ポリヌクレオチド」および「オリゴヌクレオチド」の間で長さに意図される違いはなく、これらの用語は同義的に用いられ得る。これらの用語は分子の一次構造のみを指す。したがって、これらの用語には、二本鎖および一本鎖DNA、ならびに二本鎖および一本鎖RNAが含まれる。
本明細書で使用されるとき、用語「RNA」または「RNA分子」または「リボ核酸分子」は、リボヌクレオチドのポリマーを指す;用語「DNA」または「DNA分子」または「デオキシリボ核酸分子」は、デオキシリボヌクレオチドのポリマーを指す。DNAおよびRNAは、例えばそれぞれDNA複製およびDNAの転写により、天然で合成されることもでき;または化学的に合成されることもできる。DNAおよびRNAは、一本鎖(すなわち、それぞれssRNAまたはssDNA)または多重鎖(例えば、二本鎖、すなわち、それぞれdsRNAおよびdsDNA)であり得る。用語「mRNA」または「メッセンジャーRNA」は、本明細書で使用されるとき、1つ以上のポリペプチド鎖のアミノ酸配列をコードする一本鎖RNAを指す。
本明細書で使用されるとき、用語「RNA干渉」または「RNAi」は、対応するタンパク質コード遺伝子の発現の阻害または干渉または「サイレンシング」をもたらすRNA分子によって媒介される配列特異的調節機構を指す。RNAiは、植物、動物および真菌を含めた多くの種類の生物で観察されている。RNAiは細胞において天然で外来性RNA(例えばウイルスRNA)を除去するために起こる。天然RNAiは、遊離dsRNAから切断された、分解機構を他の類似のRNA配列に仕向ける断片によって進行する。RNAiはRNA誘導サイレンシング複合体(RISC)によって制御され、細胞質において短鎖/低分子dsRNA分子によって開始され、そこでdsRNA分子は触媒RISC成分アルゴノートと相互作用する。dsRNA分子は細胞に外因的に導入されることができる。外因性dsRNAはリボヌクレアーゼタンパク質ダイサーを活性化させることによってRNAiを開始し、ダイサーはdsRNAに結合してそれを切断することにより、数個の対を成さないオーバハング塩基を各末端に有する21〜25塩基対の二本鎖断片を生じさせる。これらの短鎖二本鎖断片は低分子干渉RNA(siRNA)と呼ばれる。
本明細書で使用されるとき、用語「短鎖干渉性RNA」、「低分子干渉RNA」または「siRNA」は、RNAiを誘導または媒介する能力を有する約5〜60ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)を含むRNA分子(またはRNA類似体)を指す。好ましくは、siRNA分子は、約15〜30ヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体、例えば約16〜25ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)、約18〜23ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)、約19〜22ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)(例えば、19、20、21または22ヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体)、約19〜25ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)および約19〜24ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)を含む。用語「短鎖」siRNAは、5〜23ヌクレオチド、好ましくは21ヌクレオチド(またはヌクレオチド類似体)、例えば、19、20、21または22ヌクレオチドを含むsiRNAを指す。用語「長鎖」siRNAは、24〜60ヌクレオチド、好ましくは約24〜25ヌクレオチド、例えば、23、24、25または26ヌクレオチドを含むsiRNAを指す。短鎖siRNAは、一部の例では、19ヌクレオチド未満、例えば、16、17または18ヌクレオチド、または僅か5ヌクレオチドを含んでもよく、但し、これらの短いsiRNAはRNAiを媒介する能力を保持しているものとする。同様に、長鎖siRNAは、一部の例では、26ヌクレオチド超、例えば、27、28、29、30、35、40、45、50、55、または更には60ヌクレオチドを含んでもよく、但し、これらの長いsiRNAは、短鎖siRNAへの更なるプロセシング、例えば酵素的プロセシングがない限りRNAiまたは翻訳抑制を媒介する能力を保持しているものとする。siRNAは、一本鎖RNA分子(ss−siRNA)またはハイブリダイズしてsiRNA二重鎖と呼ばれる二重鎖構造を形成するセンス鎖およびアンチセンス鎖を含む二本鎖RNA分子(ds−siRNA)であってもよい。
本明細書で使用されるとき、siRNA分子の「アンチセンス鎖」または「第1鎖」または「ガイド鎖」という用語は、サイレンシングの標的となる遺伝子のmRNAの約10〜50ヌクレオチド、例えば、約15〜30、16〜25、18〜23または19〜22ヌクレオチドの一部分と実質的に相補的な鎖を指す。アンチセンス鎖または第1鎖は、標的特異的サイレンシングを誘導するのに所望の標的mRNA配列と十分に相補的な、例えば、RNAi機構または過程によって所望の標的mRNAの破壊を引き起こすのに十分に相補的な配列を有する。
本明細書で使用されるとき、siRNA分子の「センス鎖」または「第2鎖」または「パッセンジャー鎖」という用語は、アンチセンス鎖または第1鎖と相補的な鎖を指す。siRNA分子のアンチセンス鎖とセンス鎖とはハイブリダイズして二重鎖構造を形成する。本明細書で使用されるとき、「siRNA二重鎖」は、サイレンシングの標的となる遺伝子のmRNAの約10〜50ヌクレオチドの一部分と十分な相補性を有するsiRNA鎖と、他方のsiRNA鎖と二重鎖を形成するのに十分な相補性を有するsiRNA鎖とを含む。
本明細書で使用されるとき、用語「相補」は、ポリヌクレオチドが互いに塩基対を形成する能力を指す。塩基対は、典型的には逆平行ポリヌクレオチド鎖におけるヌクレオチド単位間の水素結合によって形成される。相補ポリヌクレオチド鎖は、ワトソン・クリック方式(例えば、AとT、AとU、CとG)、または二重鎖の形成を可能にする任意の他の方式で塩基対を形成することができる。当業者は認識しているとおり、DNAと対照的にRNAを使用するとき、チミンでなくウラシルがアデノシンと相補的と見なされる塩基である。しかしながら、本発明の文脈でUと表記されるとき、特に指定されない限り、Tに置き換え可能であることが含意される。完全な相補性または100%の相補性とは、一方のポリヌクレオチド鎖の各ヌクレオチド単位が第2のポリヌクレオチド鎖のヌクレオチド単位と水素結合を形成することができる状況を指す。完全でない相補性とは、2本の鎖の全てではないものの一部のヌクレオチド単位が互いに水素結合を形成することができる状況を指す。例えば、2本の20merについて、各鎖の2個の塩基対のみが互いに水素結合を形成することができる場合、このポリヌクレオチド鎖は10%の相補性を呈する。同じ例で、各鎖の18個の塩基対が互いに水素結合を形成することができる場合、このポリヌクレオチド鎖は90%の相補性を呈する。
本明細書で使用されるとき、用語「実質的に相補的」とは、siRNAが、所望の標的mRNAに結合して標的mRNAのRNAサイレンシングを引き起こすのに十分な配列を(例えばアンチセンス鎖に)有することを意味する。
本明細書で使用されるとき、「ターゲティング」は、標的核酸にハイブリダイズして所望の効果を誘導するであろう核酸配列の設計および選択過程を意味する。
用語「遺伝子発現」は、核酸配列が首尾よく転写およびほとんどの場合に翻訳を受けてタンパク質またはペプチドを産生する過程を指す。明確にするため、「遺伝子発現」の測定に言及するとき、それは、測定が核酸転写産物、例えばRNAもしくはmRNAの測定またはアミノ酸翻訳産物、例えばポリペプチドもしくはペプチドの測定であり得ることを意味するものと理解されなければならない。RNA、mRNA、ポリペプチドおよびペプチドの量またはレベルの測定方法は当該技術分野において周知である。
本明細書で使用されるとき、用語「突然変異」は、後続の世代に伝達され得る変異型(「突然変異型」とも称される)をもたらす遺伝子の構造の任意の変化を指す。遺伝子の突然変異は、DNAにおける一塩基の変化、または遺伝子もしくは染色体のより大きい一部分の欠失、挿入、もしくは再配列によって引き起こされ得る。
本明細書で使用されるとき、用語「ベクター」は、本発明のsiRNA分子などの異種分子を輸送し、形質導入し、またはその他担体として働く任意の分子または部分を意味する。「ウイルスゲノム」または「ベクターゲノム」または「ウイルスベクター」は、目的の分子、例えば、トランス遺伝子をコードするか、もしくは含む、1つ以上のポリヌクレオチド領域、ポリペプチドもしくはマルチポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、または低分子干渉RNA(siRNA)などの調節性核酸を含む配列を指す。ウイルスゲノムは一般に、遺伝物質を細胞に送達するのに使用される。ウイルスゲノムは、具体的適用のために修飾されることが多い。ウイルスゲノム配列の種類は、レトロウイルスのウイルスゲノム配列、レンチウイルスのウイルスゲノム配列、アデノウイルスのウイルスゲノム配列、およびアデノ随伴ウイルスのゲノム配列を含む。
用語「アデノ随伴ウイルス」または「AAV」は、本明細書で使用されるとき、アデノ随伴ベクターの成分を含む、またはそれに由来する任意のベクターを指し、哺乳類細胞、好ましくはヒト細胞を感染させるのに好適である。用語のAAVベクターは、典型的には、ペイロードを含むAAV型ウイルス粒子またはビリオンを意味する。AAVベクターは、血清型の組合せ(すなわち「シュードタイプ」AAV)を含めた様々な血清型または様々なゲノム(例えば一本鎖または自己相補的)に由来し得る。加えて、AAVベクターは複製欠損型および/またはターゲット型であってもよい。
本明細書で使用されるとき、語句「遺伝子の発現を阻害する」は、遺伝子の発現産物量の減少を生じさせることを意味する。発現産物は、遺伝子から転写されたRNA分子(例えば、mRNA)または遺伝子から転写されたmRNAから翻訳されたポリペプチドであり得る。典型的には、mRNAのレベルが減少することにより、そこから翻訳されるポリペプチドのレベルが減少することになる。発現レベルは標準的なmRNAまたはタンパク質測定技法を用いて決定し得る。
本明細書で使用されるとき、用語「インビトロ」は、生物(例えば、動物、植物、または微生物)の中でなく、むしろ人工環境、例えば試験管または反応槽、細胞培養物、ペトリ皿等で起こるイベントを指す。
本明細書で使用されるとき、用語「インビボ」は、生物(例えば、動物、植物、または微生物またはその細胞もしくは組織)の中で起こるイベントを指す。
本明細書で使用されるとき、用語「修飾された」は、本発明の分子の変化した状態または構造を指す。分子は、化学的、構造的、および機能的に修飾することを含め、多くの方法で修飾し得る。
本明細書で使用されるとき、用語「合成」は、人間の手で作製、調製、および/または製造されることを意味する。本発明のポリヌクレオチドまたはポリペプチドまたは他の分子の合成は化学的または酵素的であってもよい。
本明細書で使用されるとき、用語「トランスフェクション」は、外因性核酸を細胞に導入する方法を指す。トランスフェクション方法としては、限定はされないが、化学的方法、物理的処理およびカチオン性脂質または混合が挙げられる。細胞にトランスフェクトし得る薬剤の一覧は広範であり、限定はされないが、siRNA、センスおよび/またはアンチセンス配列、1つ以上の遺伝子をコードし、かつ発現プラスミドに編成されるDNA、タンパク質、タンパク質断片などが含まれる。
本明細書で使用されるとき、「オフターゲット」は、任意の1つ以上の標的、遺伝子、または細胞転写物に対する任意の意図しない効果を指す。
本明細書で使用されるとき、語句「薬学的に許容可能」は、本明細書では、妥当な医学的判断の範囲内で、過度の毒性、刺激作用、アレルギー反応、または他の問題もしくは合併症のない、妥当なリスク対効果比に相応の、ヒトおよび動物の組織との接触における使用に好適な化合物、材料、組成物、および/または剤形を指して用いられる。
本明細書で使用されるとき、薬剤の「有効量」という用語は、有益なまたは所望の結果、例えば臨床結果を生じさせるのに十分な量であり、そのため「有効量」は、それが適用されるコンテクストに依存する。例えば、HDを治療する薬剤を投与するコンテクストでは、薬剤の有効量は、例えば、その薬剤の投与なしに達成される応答と比較して、本明細書に定義されるとおりのHDの治療を実現するのに十分な量である。
本明細書で使用されるとき、用語「治療有効量」は、送達される薬剤(例えば、核酸、薬物、治療用薬剤、診断用薬剤、予防用薬剤等)についての、感染、疾患、障害、および/または病態に罹患しているまたはそれに罹り易い対象に投与したとき感染、疾患、障害、および/または病態を治療し、その症状を改善し、それを診断し、予防し、および/またはその発症を遅延させるのに十分な量を意味する。
本明細書で使用されるとき、用語「対象」または「患者」は、例えば実験的、診断的、予防的、および/または治療的目的で本発明に係る組成物を投与し得る任意の生物を指す。典型的な対象としては、動物(例えば、マウス、ラット、ウサギ、チンパンジーならびに他の類人猿およびサル種などの非ヒト霊長類、およびヒトなど、哺乳類)および/または植物が挙げられる。
本明細書で使用されるとき、用語「予防する」または「予防」は、数週間、数ヵ月間、または数年間を含めたある期間にわたり病態または疾患の発生、展開または進行を遅延させるまたは未然に防ぐことを指す。
用語「治療」または「治療する」は、本明細書で使用されるとき、疾患の治癒または改善に用いられる1つ以上の特定の手順の適用を指す。特定の実施形態において、特定の手順は1つ以上の医薬品の投与である。本発明との関連において、特定の手順は1つ以上のsiRNA分子の投与である。
本明細書で使用されるとき、用語「改善」または「改善する」は、病態または疾患の少なくとも1つの指標の重症度を低下させることを指す。例えば、神経変性障害のコンテクストでは、改善には、ニューロン喪失の低減が含まれる。
本明細書で使用されるとき、用語「投与する」は、対象に医薬品または組成物を提供することを指す。
本明細書で使用されるとき、用語「神経変性」は、神経細胞死をもたらす病的状態を指す。多数の神経障害が共通の病的状態として神経変性を共有する。例えば、アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病、および筋萎縮性側索硬化症(ALS)は、いずれも慢性神経変性を引き起こし、慢性神経変性は数年の期間にわたる緩慢な進行性の神経細胞死によって特徴付けられる一方、急性神経変性は、脳卒中などの虚血、または外傷性脳傷害などの外傷の結果としての、または例えば脊髄損傷もしくは多発性硬化症によって引き起こされる脱髄または外傷による軸索切断の結果としての、神経細胞死の突発的な発生によって特徴付けられる。一部の神経障害では、例えば初期HDにおける中型有棘ニューロン変性など、主に1つのタイプの神経細胞が変性する。
VI.均等物および範囲
当業者は、本明細書に記載される本発明に係る具体的な実施形態の多くの均等物を認識し、またはルーチンに過ぎない実験を用いて確かめることが可能であろう。本発明の範囲が上記の説明に限定されることは意図されず、それはむしろ添付の特許請求の範囲に示されるとおりである。
特許請求の範囲では、「a」、「an」、および「the」などの冠詞は、反する旨が示されない限り、または文脈上特に明らかでない限り、1つまたは2つ以上を意味し得る。ある群の1つ以上のメンバーの間に「または」を含むクレームまたは説明は、反する旨が示されない限り、または文脈上特に明らかでない限り、その群メンバーの1つ、2つ以上、または全てが所与の製品または方法に存在する、それに用いられる、または他の形でそれに関連する場合に満たされるものと見なされる。本発明は、群の正確に1つのメンバーが所与の製品または方法に存在する、それに用いられる、または他の形でそれに関連する実施形態を含む。本発明は、2つ以上の、または全部の群メンバーが所与の製品または方法に存在する、それに用いられる、または他の形でそれに関連する実施形態を含む。
また、用語「〜を含んでいる(comprising)」は非限定的(open)であることが意図され、追加の要素または工程の包含を許容するが必須ではないことも注記される。用語「〜を含んでいる(comprising)」が本明細書で使用されるとき、したがって用語「〜からなる(consisting of)」もまた包含され、開示される。
範囲が提供されるとき、端点は含まれる。更に、特に指示されない限り、または文脈および当業者の理解から特に明らかでない限り、範囲として表される値は、文脈上特に明確に指示されない限り、その範囲の下限の単位の10分の1に至るまでの、本発明の種々の実施形態において明示される範囲内にある任意の具体的な値または部分的範囲を想定し得ることが理解されるべきである。
加えて、先行技術に含まれる本発明の任意の特定の実施形態は、クレームの任意の1つ以上から明示的に除外され得ることが理解されるべきである。かかる実施形態は当業者に公知であると見なされるため、除外が本明細書に明示的に示されないとしても、それらは除外され得る。本発明の組成物の任意の詳細な実施形態(例えば、任意の抗生物質、治療薬または活性成分;任意の作製方法;任意の使用方法等)が、先行技術の存在に関係するか否かに関わらず、何らかの理由で任意の1つ以上のクレームから除外されることがある。
使用した文言は、限定でなく、むしろ説明の文言であること、およびその広義の態様における本発明の真の範囲および趣旨から逸脱することなく、添付の特許請求の範囲内で変更が行われ得ることが理解されるべきである。
本発明をかなり詳しく、幾つかの説明される実施形態に関するある具体性をもって説明したが、それが任意のかかる具体例もしくは実施形態または任意の具体的な実施形態に限定されるべきであることを意図するものではなく、しかし先行技術を考慮してかかる特許請求の範囲の最も広義の可能な解釈を提供し、したがって本発明の意図される範囲を有効に包含するように添付の特許請求の範囲を参照して解釈されるべきである。
(実施例)
VII.実施例
実施例1.哺乳類細胞で作製されたAAV1−miRNAベクターによる治療後のHTT抑制、ガイド対パッセンジャー比および5’末端プロセシング精度に関するインビボYAC128マウス試験
プラスミドトランスフェクションおよびAAVにパッケージングされたAAV−miRNA発現ベクターの感染によるHTTのインビトロ抑制に基づき、選択されたAAV−miRNA発現ベクターをAAV1にパッケージングし、YAC128マウスにおいてインビボで評価することにより、HTT mRNA抑制を定量化し、ガイド鎖対パッセンジャー鎖比および5’末端プロセシング精度をディープシーケンシングによって評価した。AAV−miRNAトランス遺伝子ゲノムをCBAプロモータと共にAAV1にパッケージングし(AAV1.CBA.iHtt)、次にHEK293またはHEK293T細胞におけるトリプルトランスフェクションによってベクターを作製し、精製して、0.001%F−68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)中に製剤化した。7〜12週齢のYAC128マウスにベクターを半球当たり5uL中約1E10〜3E10vgの用量で10分かけて両側性線条体内注入によって投与した。対照群は媒体(0.001%F−68含有PBS)で処置した。各群に4匹の雌および4匹の雄が含まれた。被験物質投与後約28日で線条体組織パンチを収集し、後の分析のためスナップ凍結した。
次に線条体組織試料をホモジナイズし、全RNAを精製した。HTTの相対発現をqRT−PCRにより決定した。正規化用のハウスキーピング遺伝子には、マウスXPNPEP1(X−プロリルアミノペプチダーゼ1)およびマウスHPRT(ヒポキサンチン−グアニンホスホリボシルトランスフェラーゼ)が含まれた。HTT mRNAをハウスキーピング遺伝子発現に対して正規化し、次に媒体群に対して更に正規化した。総用量(vg/マウス)およびコンストラクトは、表41に示される。結果は、表42および表43に示される。
YAC128マウス線条体では、1線条体当たり1E10〜3E10vgの線条体内注入後約28日で、VOYHT43(VOYHTmiR−127.016)、VOYHT46(VOYHTmiR−127.257)、VOYHT15(VOYHTmiR−127.579)、VOYHT47(VOYHTmiR−104.579.3)、VOYHT48(VOYHTmiR−104.579.10)、VOYHT16(VOYHTmiR−104.016)およびVOYHT40(VOYHTmiR−109.016)が、HTT mRNAの約20〜40%のサイレンシングを生じさせた。
線条体組織試料はまた、ディープシーケンシングによってガイド鎖:パッセンジャー鎖比、全内因性miRNAプールに対するガイド鎖およびパッセンジャー鎖の存在量、およびガイド鎖の5’末端におけるプロセシング精度を評価することにより、pri−miRNAプロセシングについても判定した。結果は表44に示される。
VOYHT43、VOYHT15、VOYHT46、VOYHT48、VOYHT40、およびVOYHT47は、他のコンストラクトと比較して、良好なHtt mRNAノックダウンを有することが示された。VOYHT37、VOYHT46、VOYHT44、およびVOYHT39は、それらが4未満の比を有していたため、低いガイド鎖対パッセンジャー鎖比(G:P比)を有すると見なされた。VOYHT43およびVOYHT45は、総miRNA読み取りと比べて10%よりも多い存在量を有し、追加試験には高すぎると見なされた。追加試験には、VOYHT48、VOYHT40およびVOYHT47を選択した。
実施例2.AAV−miRNA発現ベクター
HTTを標的にするガイド鎖とパッセンジャー鎖とを含むpri−miRNAカセットを含むコンストラクトをAAV−miRNA発現ベクター(ssまたはscのいずれか)となるように操作した。AAV−miRNA発現ベクターコンストラクトは、ITRからITRまで、5’から3’に挙げて、突然変異または野生型ITR、プロモータ(CMV(SV40イントロンまたはヒトベータグロビンイントロンを含む)、U6、H1、CBA(CMVieエンハンサー、CBプロモータおよびSV40イントロンまたはヒトベータグロビンイントロンを含む)、またはCAGプロモータ(CMVieエンハンサー、CBプロモータ、およびウサギベータグロビンイントロンまたはヒトベータグロビンイントロンを含む)のいずれか)、HTTを標的にするガイド鎖配列とパッセンジャー鎖配列とを含むpri−miRNAカセット、ウサギグロビンポリAまたはヒト成長ホルモンポリAおよび野生型ITRを含む。インビトロおよびインビボ試験を実施してAAV−miRNA発現ベクターの薬理活性を判定する。
実施例3.Baculo/Sf9系で作製されたAAV−miRNAベクターによる治療後のHTT抑制、ガイド鎖対パッセンジャー鎖比およびプロセシング精度に関するインビボYAC128マウス試験
HTTを標的にするガイド鎖とパッセンジャー鎖とを含むpri−miRNAカセットを含む3つのコンストラクトを、baculo/Sf9産生用に設計されたscAAV−miRNA発現ベクターとなるように操作した。scAAV−miRNA発現ベクターコンストラクトは、ITRからITRまで、5’から3’に挙げて、野生型ITR、CBAプロモータ(CMVieエンハンサー、CBプロモータおよびSV40イントロンを含む)、HTTを標的にするガイド鎖配列とパッセンジャー鎖配列とを含むpri−miRNAカセット、ウサギグロビンポリA、スタッファー配列、および野生型ITRを含んでいた。ベクターを、baculo/Sf9系で作製し、精製し、0.001%F−68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化し、次に5μLベクターを0.5μL/分で7〜12週齢のYAC128マウスに両側性線条体内注入によって投与した。ベクター濃度は3.6×1012vg/mLであり、総用量は3.6×1010vgだった。対照群は媒体(0.001%F−68含有PBS)で処置した。各群に4匹の雌および4匹の雄が含まれた。被験物質投与後約28日で線条体組織パンチを収集し、スナップ凍結した。線条体組織試料をホモジナイズし、全RNAを精製し、HTT mRNAの相対発現をqRT−PCRにより決定した。正規化用のハウスキーピング遺伝子は、マウスXPNPEP1(X−プロリルアミノペプチダーゼ1)であった。HTT mRNAをハウスキーピング遺伝子発現に対して正規化し、次に媒体群に対して更に正規化した。HTT mRNAの結果は表45に示される。
YAC128マウス線条体では、1線条体当たり1.8×1010vgの線条体内注入後約28日でVOYHT1(VOYHTmiR−104.579.3)、VOYHT4(VOYHTmiR−104.579.10)、およびVOYHT3(VOYHTmiR−109.016)が、HTT mRNAの約42%〜44%のサイレンシングを生じさせた。
実施例4.非ヒト霊長類でのインビボ試験
試験設計
アカゲザルで試験を行って、HTT抑制、pri−miRNAプロセシングの精度および効率、ならびにCNS内でのベクターゲノムの忍容性および分布を判定した。HTTを標的にするガイド鎖とパッセンジャー鎖とを含むpri−miRNAカセットを含む選択されたコンストラクトを、baculo/Sf9産生用に設計されたscAAV−miRNA発現ベクターとなるように操作した。scAAV−miRNA発現コンストラクトは、ITRからITRまで、5’から3’に挙げて、野生型ITR、CBAプロモータ(CMVieエンハンサー、CBプロモータおよびSV40イントロンを含む)、HTTを標的にするガイド鎖配列とパッセンジャー鎖配列とを含むpri−miRNAカセット、ウサギグロビンポリA、スタッファー配列、および野生型ITRを含んでいた。ベクターを、baculo/Sf9系で作製し、精製し、0.001%F−68含有リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で製剤化した。
4群のアカゲザルに、媒体(n=3)または3つのベクターの1つ(1群当たりn=6)を、100μL/側の両側性被殻内注入として3〜5μL/分で投与した。ガドテリドール(2mM;プロハンス)を共注入した。ベクターを投与する動物には、同じベクターを両側に注入した。右側は9×1011vg/mLの濃度を投与し、左側は2.7×1012vg/mLの濃度を投与した。投与されたベクターの総用量は、1被殻当たり9×1010vg(低用量)もしくは2.7×1011vg(高用量)、または1動物当たり3.6×1011vgだった。動物は全て5週後に安楽死させた。試験設計は表46に示される。
HTT mRNA分析
HTT mRNAレベルを定量化するために、分岐DNA(bDNA)を使用して、被殻に由来する2mm組織パンチでHTT mRNA抑制を判定した。ベクターを投与した各群の場合、ベクター1用量当たり合計60個のパンチを判定した(1被殻当たり10個のパンチ、ベクター1用量当たり6匹の動物)。媒体群からは、3匹の動物の各々から1被殻当たり10個のパンチを採取した。HTT mRNAを、ハウスキーピング遺伝子TATAボックス結合タンパク質(TBP)、アラニル−tRNA合成酵素(AARS)およびX−プロリルアミノペプチダーゼ1(XPNPEP1)の幾何平均に対して正規化し、次に媒体群に対して更に正規化した。HTT mRNA結果は、表47および表48に示される。
ベクターゲノム定量化
bDNAによってHTT mRNAレベルを定量化するために使用された、被殻に由来する同じ2mm組織パンチ(高用量および低用量処置による)に由来する組織ライセートの一部を、液滴デジタルPCRによるベクターゲノムコピー(VG)決定に使用した。群1(VOYHT1)および群3(VOYHT4)では、1二倍体細胞当たり約10個VGコピーで約50%のHTT mRNA抑制が達成された。群2(VOYHT3)では、1二倍体細胞当たり約400個VGコピーで約50%のHTT mRNA抑制が達成された。結果は、表49(高用量、2.7E12vg/mL)および表50(低用量、0.9E12vg/mL)に示される。
Pri−miRNAプロセシング
高用量および低用量処置された被殻に由来する2mmパンチのディープシーケンシングによってpri−miRNAプロセシングの精度および効率を判定して、ガイド鎖:パッセンジャー鎖比、全内因性miRNAプールに対するガイド鎖およびパッセンジャー鎖の存在量、およびガイド鎖の5’末端におけるプロセシング精度を評価した。これらの結果は表51に示される。
忍容性結果
−8日目(すなわち最初の動物に投薬する8日前)、1日目、およびその後36±3日目に終了するまでの各週にて、体重評価を得た。各群には、5週間の生存期間全体にわたって平均体重に有意な変化はなかった。
−8日目から始めて予定の剖検までケージ側観察を1日2回(午前および午後)実施して、神経学的徴候および痛みまたは苦痛の徴候、ならびに全般的な健康、外観、および行動の変化を含む異常を評価した。加えて、食餌摂取量を、−8日目から始めて1日1回、質的に評価した。手術後、数匹の動物に欲求(appetence)の減少が認められたに過ぎなかった。これは、手術後に共通の知見と見なされる。食餌摂取量は、第1週以内に正常に戻り、試験の残り期間は正常を維持した。
血液学、血清化学、および凝固の判定用に、血液を−8日目、15±2日目、および36±3日目に収集した。血液学評価には、WBC、RBC、HGB、HCT、MCV、MCH、MCHC、PLT(質的評価)、ならびにNEUT、LYMPH、MONO、EOS、およびBASOの絶対値および相対値が含まれていた。血清化学には、TP、ALB、GLOB、A/G比、ALP ALT、AST、TBIL(直接および間接)、BUN、CREAT、Ca CHOL、GLU、Phos、TCO2、Na、KおよびClが含まれていた。凝固には、PT、A−PTTおよびフィブリノーゲンが含まれていた。一部の値は、正常範囲外であったが、生理学的なばらつきとして解釈され、生存中にいかなる臨床相関性も存在しなかった。
剖検時、肉眼的所見では異常は観察されなかった。
注入部位を含む被殻に対して組織病理学検査を行った。動物は全て、被殻を含有する3mm厚冠状脳スラブを、室温で72〜96時間、4%パラホルムアルデヒドに浸漬することによって固定し、次に約+4degCで保管するためにリン酸緩衝生理食塩水(PBS)に移した。次に3mm脳スラブをパラフィンに包埋し、冠状に切片化した。標準的ヘマトキシリンおよびエオジン染色によって、被殻の注入部位を含有する5um厚の完全冠状切片を病理について評価した。媒体対照群は、被殻への任意の注射で生じると予想されるものと一致していた。すなわち反応は、針跡に関連するものに典型的だった。群1、2、および3において、3つのベクターの1つで処置した各動物は、針跡に由来する軽度な局所的グリオーシス、最小限から軽度の血管周囲浸潤、および/または注射に由来する外傷とAAVに対する反応との組合せによる可能性が最も高い不定期の浮腫を含む病理学的知見を示した。臨床症状が存在しなかったことから判断して、有害と見なされる病理学的知見は存在しなかった。
実施例5.フィラー配列を有するベクターの活性
VOYHTmiR−104.579.3(配列番号1262)またはVOYHTmiR−104.016(配列番号1249)をコードするmiRNA発現ベクターを、AAV1にパッケージングし、HEK293T細胞に感染させた。HEK293Tの場合、細胞を96ウェルプレートにプレーティングし(100ul細胞培養培地中2.5E4細胞/ウェル)、miRNA発現ベクターで感染させた。感染後48時間で細胞を回収し、直ちに細胞溶解、RNA単離、およびqRT−PCRを行った。ベクターのMOIおよび結果、ならびに試験したベクターの説明は、表52に示される。表52において、SCは自己相補的ベクターを意味し、SSは一本鎖を意味する。
約2300ヌクレオチド長だったmiRNA発現ベクターは、約1500ヌクレオチドまたは1900ヌクレオチドを有するベクターと比較して、より高いゲノム品質を有していた。CBAおよびCMVプロモータは、インビトロで同様のレベルのノックダウンを生じさせた。自己相補的ベクターは、インビトロで最高レベルのノックダウンを生じさせた。
実施例6.大規模のBaculo/Sf9系で作製されたベクターの品質管理
本開示のmiRNA発現ベクターを、1L規模のBaculo/Sf9系を使用することによって作製した。標準的精製技法に加えて、塩化セシウム(CsCl)勾配分析を使用して完全ベクターの高い%を確保した。達成された完全ベクターの%は、少なくとも80%だった。力価は、0.9E12から4E13vg/L培地までの範囲だった。5’または3’フィラー配列ベクターを有するベクターが、最も高い力価を提示した。本開示のベクターにパッケージングされたゲノムの品質は、アルカリ変性ゲル分析の使用によって判定したところ、高レベルのゲノム品質を示した。1L規模産生のゲルバンドパターンは、小規模産生パターンと同様だった。本発明のベクターの純度は、銀染色PAGE分析を使用することによって判定したところ、良好なVP1、VP2、およびVP3比ならびに純度を示した。
VOYHTmiR−104.579.3、VOYHTmiR−104.579.10、およびVOYHTmiR−109.016をコードするmiRNA発現ベクターを、AAV1にパッケージングし、HEK293T細胞に感染させた。HEK293Tの場合、細胞を96ウェルプレートにプレーティングし(100ul細胞培養培地中2.5E4細胞/ウェル)、miRNA発現ベクターで感染させた。感染後60時間で細胞を回収し、直ちに細胞溶解、RNA単離、およびqRT−PCRを行い、HTTのレベルを、GFP形質導入対照と比較して計算した。ベクターのMOIおよび結果、ならびに試験したベクターの説明は、表53に示される。表53において、SCは自己相補的ベクターを意味する。
コンストラクトのほとんどで用量依存的ノックダウンが観察された。自己相補的ベクターは、一本鎖ベクターと比較して、インビトロで最高レベルのノックダウンを生じさせた。5’または3’フィラー配列を有するベクターは、分割フィラー配列を有するベクターと比較して、インビトロでより高いレベルのノックダウンを提示した。
本発明をかなり詳しく、幾つかの説明される実施形態に関するある具体性をもって説明したが、それが任意のかかる具体例もしくは実施形態または任意の具体的な実施形態に限定されるべきであることを意図するものではなく、しかし先行技術を考慮してかかる特許請求の範囲の最も広義の可能な解釈を提供し、したがって本発明の意図される範囲を有効に包含するように添付の特許請求の範囲を参照して解釈されるべきである。
本明細書において言及される刊行物、特許出願、特許、および他の参考文献は全て、全体として参照により援用される。矛盾が生じる場合、定義を含め、本明細書が優先するものとする。加えて、節の見出し、材料、方法、および例は例示に過ぎず、限定を意図するものではない。

Claims (36)

  1. 順に、
    a)5’末端逆位配列(ITR)配列領域であって、配列番号1380および1381からなる群から選択される5’ITR配列領域、
    b)エンハンサー配列領域であって、配列番号1408および1409からなる群から選択されるエンハンサー配列領域、
    c)プロモータ配列領域であって、配列番号1410〜1411および配列GTTGからなる群から選択されるプロモータ配列領域、
    d)第1のイントロン配列領域であって、配列番号1417〜1419からなる群から選択される第1のイントロン配列領域、
    e)調節性ポリヌクレオチド配列領域であって、配列番号1183〜1279および1346〜1347からなる群から選択される調節性ポリヌクレオチド配列領域、
    f)ポリアデニル化(ポリA)シグナル配列領域であって、配列番号1420〜1423からなる群から選択されるポリAシグナル配列領域、ならびに
    g)3’ITR配列領域であって、配列番号1382および1383からなる群から選択される3’ITR配列領域
    を含むAAVウイルスゲノム。
  2. 少なくとも1つの多重クローニング部位(MCS)配列領域を更に含み、前記少なくとも1つのMCS配列領域が、配列番号1384〜1390および配列TCGAGからなる群から選択される、請求項1に記載のAAVウイルスゲノム。
  3. 1つのMCS配列領域を含む、請求項2に記載のAAVウイルスゲノム。
  4. 少なくとも1つのエクソン配列領域を更に含み、前記少なくとも1つのエクソン配列領域が、配列番号1415および1416からなる群から選択される、請求項2に記載のAAVウイルスゲノム。
  5. 1つのエクソン配列領域を含む、請求項4に記載のAAVウイルスゲノム。
  6. 2つのエクソン配列領域を含む、請求項4に記載のAAVウイルスゲノム。
  7. 第2のイントロン配列領域を含む、請求項6に記載のAAVウイルスゲノム。
  8. 第1のMCS配列領域および第2のMCS配列領域を含む、請求項2に記載のAAVウイルスゲノム。
  9. 前記第1のMCS配列領域が前記5’ITR配列領域の3’に位置し、前記第2のMCS配列領域が前記調節性ポリヌクレオチド配列領域の3’に位置する、請求項8に記載のAAVウイルスゲノム。
  10. 少なくとも1つのエクソン配列領域を更に含み、前記少なくとも1つのエクソン配列領域が、配列番号1415および1416からなる群から選択される、請求項8に記載のAAVウイルスゲノム。
  11. 1つのエクソン配列領域を含む、請求項10に記載のAAVウイルスゲノム。
  12. 2つのエクソン配列領域を含む、請求項10に記載のAAVウイルスゲノム。
  13. 第2のイントロン配列領域を含む、請求項12に記載のAAVウイルスゲノム。
  14. 前記第1のMCS配列領域が前記5’ITR配列領域の3’に位置し、前記第2のMCS配列領域が前記調節性ポリヌクレオチド配列領域の3’に位置し、前記2つのエクソン配列領域が前記プロモータ領域の3’および前記調節性ポリヌクレオチド配列領域の5’に位置し、ならびに前記第2のイントロン配列領域が前記第1のイントロン配列領域の3’に位置する、請求項13に記載のAAVウイルスゲノム。
  15. 配列番号1352〜1379、1388、および1426〜1438、またはそれらと少なくとも95%同一性を有する変異体からなる群から選択されるAAVウイルスゲノムポリヌクレオチド。
  16. 請求項1〜15のいずれか一項に記載のAAVウイルスゲノムを含むAAV粒子。
  17. AAV1、AAV2、AAV2G9、AAV3、AAV3a、AAV3b、AAV3−3、AAV4、AAV4−4、AAV5、AAV6、AAV6.1、AAV6.2、AAV6.1.2、AAV7、AAV7.2、AAV8、AAV9、AAV9.11、AAV9.13、AAV9.16、AAV9.24、AAV9.45、AAV9.47、AAV9.61、AAV9.68、AAV9.84、AAV9.9、AAV10、AAV11、AAV12、AAV16.3、AAV24.1、AAV27.3、AAV42.12、AAV42−1b、AAV42−2、AAV42−3a、AAV42−3b、AAV42−4、AAV42−5a、AAV42−5b、AAV42−6b、AAV42−8、AAV42−10、AAV42−11、AAV42−12、AAV42−13、AAV42−15、AAV42−aa、AAV43−1、AAV43−12、AAV43−20、AAV43−21、AAV43−23、AAV43−25、AAV43−5、AAV44.1、AAV44.2、AAV44.5、AAV223.1、AAV223.2、AAV223.4、AAV223.5、AAV223.6、AAV223.7、AAV1−7/rh.48、AAV1−8/rh.49、AAV2−15/rh.62、AAV2−3/rh.61、AAV2−4/rh.50、AAV2−5/rh.51、AAV3.1/hu.6、AAV3.1/hu.9、AAV3−9/rh.52、AAV3−11/rh.53、AAV4−8/r11.64、AAV4−9/rh.54、AAV4−19/rh.55、AAV5−3/rh.57、AAV5−22/rh.58、AAV7.3/hu.7、AAV16.8/hu.10、AAV16.12/hu.11、AAV29.3/bb.1、AAV29.5/bb.2、AAV106.1/hu.37、AAV114.3/hu.40、AAV127.2/hu.41、AAV127.5/hu.42、AAV128.3/hu.44、AAV130.4/hu.48、AAV145.1/hu.53、AAV145.5/hu.54、AAV145.6/hu.55、AAV161.10/hu.60、AAV161.6/hu.61、AAV33.12/hu.17、AAV33.4/hu.15、AAV33.8/hu.16、AAV52/hu.19、AAV52.1/hu.20、AAV58.2/hu.25、AAVA3.3、AAVA3.4、AAVA3.5、AAVA3.7、AAVC1、AAVC2、AAVC5、AAV−DJ、AAV−DJ8、AAVF3、AAVF5、AAVH2、AAVrh.72、AAVhu.8、AAVrh.68、AAVrh.70、AAVpi.1、AAVpi.3、AAVpi.2、AAVrh.60、AAVrh.44、AAVrh.65、AAVrh.55、AAVrh.47、AAVrh.69、AAVrh.45、AAVrh.59、AAVhu.12、AAVH6、AAVLK03、AAVH−1/hu.1、AAVH−5/hu.3、AAVLG−10/rh.40、AAVLG−4/rh.38、AAVLG−9/hu.39、AAVN721−8/rh.43、AAVCh.5、AAVCh.5R1、AAVcy.2、AAVcy.3、AAVcy.4、AAVcy.5、AAVCy.5R1、AAVCy.5R2、AAVCy.5R3、AAVCy.5R4、AAVcy.6、AAVhu.1、AAVhu.2、AAVhu.3、AAVhu.4、AAVhu.5、AAVhu.6、AAVhu.7、AAVhu.9、AAVhu.10、AAVhu.11、AAVhu.13、AAVhu.15、AAVhu.16、AAVhu.17、AAVhu.18、AAVhu.20、AAVhu.21、AAVhu.22、AAVhu.23.2、AAVhu.24、AAVhu.25、AAVhu.27、AAVhu.28、AAVhu.29、AAVhu.29R、AAVhu.31、AAVhu.32、AAVhu.34、AAVhu.35、AAVhu.37、AAVhu.39、AAVhu.40、AAVhu.41、AAVhu.42、AAVhu.43、AAVhu.44、AAVhu.44R1、AAVhu.44R2、AAVhu.44R3、AAVhu.45、AAVhu.46、AAVhu.47、AAVhu.48、AAVhu.48R1、AAVhu.48R2、AAVhu.48R3、AAVhu.49、AAVhu.51、AAVhu.52、AAVhu.54、AAVhu.55、AAVhu.56、AAVhu.57、AAVhu.58、AAVhu.60、AAVhu.61、AAVhu.63、AAVhu.64、AAVhu.66、AAVhu.67、AAVhu.14/9、AAVhu.t 19、AAVrh.2、AAVrh.2R、AAVrh.8、AAVrh.8R、AAVrh.10、AAVrh.12、AAVrh.13、AAVrh.13R、AAVrh.14、AAVrh.17、AAVrh.18、AAVrh.19、AAVrh.20、AAVrh.21、AAVrh.22、AAVrh.23、AAVrh.24、AAVrh.25、AAVrh.31、AAVrh.32、AAVrh.33、AAVrh.34、AAVrh.35、AAVrh.36、AAVrh.37、AAVrh.37R2、AAVrh.38、AAVrh.39、AAVrh.40、AAVrh.46、AAVrh.48、AAVrh.48.1、AAVrh.48.1.2、AAVrh.48.2、AAVrh.49、AAVrh.51、AAVrh.52、AAVrh.53、AAVrh.54、AAVrh.56、AAVrh.57、AAVrh.58、AAVrh.61、AAVrh.64、AAVrh.64R1、AAVrh.64R2、AAVrh.67、AAVrh.73、AAVrh.74、AAVrh8R、AAVrh8R A586R突然変異体、AAVrh8R R533A突然変異体、AAAV、BAAV、ヤギ AAV、ウシ AAV、ヒツジ AAV、AAVhE1.1、AAVhEr1.5、AAVhER1.14、AAVhEr1.8、AAVhEr1.16、AAVhEr1.18、AAVhEr1.35、AAVhEr1.7、AAVhEr1.36、AAVhEr2.29、AAVhEr2.4、AAVhEr2.16、AAVhEr2.30、AAVhEr2.31、AAVhEr2.36、AAVhER1.23、AAVhEr3.1、AAV2.5T、AAV−PAEC、AAV−LK01、AAV−LK02、AAV−LK03、AAV−LK04、AAV−LK05、AAV−LK06、AAV−LK07、AAV−LK08、AAV−LK09、AAV−LK10、AAV−LK11、AAV−LK12、AAV−LK13、AAV−LK14、AAV−LK15、AAV−LK16、AAV−LK17、AAV−LK18、AAV−LK19、AAV−PAEC2、AAV−PAEC4、AAV−PAEC6、AAV−PAEC7、AAV−PAEC8、AAV−PAEC11、AAV−PAEC12、AAV−2−pre−miRNA−101、AAV−8h、AAV−8b、AAV−h、AAV−b、AAV SM 10−2、AAVシャッフル100−1、AAVシャッフル100−3、AAVシャッフル100−7、AAVシャッフル10−2、AAVシャッフル10−6、AAVシャッフル10−8、AAVシャッフル100−2、AAV SM 10−1、AAV SM 10−8、AAV SM 100−3、AAV SM 100−10、BNP61 AAV、BNP62 AAV、BNP63 AAV、AAVrh.50、AAVrh.43、AAVrh.62、AAVrh.48、AAVhu.19、AAVhu.11、AAVhu.53、AAV4−8/rh.64、AAVLG−9/hu.39、AAV54.5/hu.23、AAV54.2/hu.22、AAV54.7/hu.24、AAV54.1/hu.21、AAV54.4R/hu.27、AAV46.2/hu.28、AAV46.6/hu.29、AAV128.1/hu.43、トゥルータイプAAV(ttAAV)、UPENN AAV10、ジャパニーズAAV10血清型、AAV CBr−7.1、AAV CBr−7.10、AAV CBr−7.2、AAV CBr−7.3、AAV CBr−7.4、AAV CBr−7.5、AAV CBr−7.7、AAV CBr−7.8、AAV CBr−B7.3、AAV CBr−B7.4、AAV CBr−E1、AAV CBr−E2、AAV CBr−E3、AAV CBr−E4、AAV CBr−E5、AAV CBr−e5、AAV CBr−E6、AAV CBr−E7、AAV CBr−E8、AAV CHt−1、AAV CHt−2、AAV CHt−3、AAV CHt−6.1、AAV CHt−6.10、AAV CHt−6.5、AAV CHt−6.6、AAV CHt−6.7、AAV CHt−6.8、AAV CHt−P1、AAV CHt−P2、AAV CHt−P5、AAV CHt−P6、AAV CHt−P8、AAV CHt−P9、AAV CKd−1、AAV CKd−10、AAV CKd−2、AAV CKd−3、AAV CKd−4、AAV CKd−6、AAV CKd−7、AAV CKd−8、AAV CKd−B1、AAV CKd−B2、AAV CKd−B3、AAV CKd−B4、AAV CKd−B5、AAV CKd−B6、AAV CKd−B7、AAV CKd−B8、AAV CKd−H1、AAV CKd−H2、AAV CKd−H3、AAV CKd−H4、AAV CKd−H5、AAV CKd−H6、AAV CKd−N3、AAV CKd−N4、AAV CKd−N9、AAV CLg−F1、AAV CLg−F2、AAV CLg−F3、AAV CLg−F4、AAV CLg−F5、AAV CLg−F6、AAV CLg−F7、AAV CLg−F8、AAV CLv−1、AAV CLv1−1、AAV Clv1−10、AAV CLv1−2、AAV CLv−12、AAV CLv1−3、AAV CLv−13、AAV CLv1−4、AAV Clv1−7、AAV Clv1−8、AAV Clv1−9、AAV CLv−2、AAV CLv−3、AAV CLv−4、AAV CLv−6、AAV CLv−8、AAV CLv−D1、AAV CLv−D2、AAV CLv−D3、AAV CLv−D4、AAV CLv−D5、AAV CLv−D6、AAV CLv−D7、AAV CLv−D8、AAV CLv−E1、AAV CLv−K1、AAV CLv−K3、AAV CLv−K6、AAV CLv−L4、AAV CLv−L5、AAV CLv−L6、AAV CLv−M1、AAV CLv−M11、AAV CLv−M2、AAV CLv−M5、AAV CLv−M6、AAV CLv−M7、AAV CLv−M8、AAV CLv−M9、AAV CLv−R1、AAV CLv−R2、AAV CLv−R3、AAV CLv−R4、AAV CLv−R5、AAV CLv−R6、AAV CLv−R7、AAV CLv−R8、AAV CLv−R9、AAV CSp−1、AAV CSp−10、AAV CSp−11、AAV CSp−2、AAV CSp−3、AAV CSp−4、AAV CSp−6、AAV CSp−7、AAV CSp−8、AAV CSp−8.10、AAV CSp−8.2、AAV CSp−8.4、AAV CSp−8.5、AAV CSp−8.6、AAV CSp−8.7、AAV CSp−8.8、AAV CSp−8.9、AAV CSp−9、AAV.hu.48R3、AAV.VR−355、AAV3B、AAV4、AAV5、AAVF1/HSC1、AAVF11/HSC11、AAVF12/HSC12、AAVF13/HSC13、AAVF14/HSC14、AAVF15/HSC15、AAVF16/HSC16、AAVF17/HSC17、AAVF2/HSC2、AAVF3/HSC3、AAVF4/HSC4、AAVF5/HSC5、
    AAVF6/HSC6、AAVF7/HSC7、AAVF8/HSC8、AAVF9/HSC9、AAV−PHP.B、AAV−PHP.A、G2B−26、G2B−13、TH1.1−32、TH1.1−35、AAVPHP.B2、AAVPHP.B3、AAVPHP.N/PHP.B−DGT、AAVPHP.B−EST、AAVPHP.B−GGT、AAVPHP.B−ATP、AAVPHP.B−ATT−T、AAVPHP.B−DGT−T、AAVPHP.B−GGT−T、AAVPHP.B−SGS、AAVPHP.B−AQP、AAVPHP.B−QQP、AAVPHP.B−SNP(3)、AAVPHP.B−SNP、AAVPHP.B−QGT、AAVPHP.B−NQT、AAVPHP.B−EGS、AAVPHP.B−SGN、AAVPHP.B−EGT、AAVPHP.B−DST、AAVPHP.B−DST、AAVPHP.B−STP、AAVPHP.B−PQP、AAVPHP.B−SQP、AAVPHP.B−QLP、AAVPHP.B−TMP、AAVPHP.B−TTP、AAVPHP.S/G2A12、AAVG2A15/G2A3、AAVG2B4、および/またはAAVG2B5、ならびにそれらのバリアントからなる群から選択されるAAV血清型を含む、請求項16に記載のAAV粒子。
  18. 請求項16〜17のいずれか一項に記載のAAV粒子を含む医薬組成物。
  19. 細胞におけるHTT遺伝子の発現を阻害する方法であって、請求項18に記載の医薬組成物を前記細胞に投与することを含む方法。
  20. 前記細胞が哺乳類細胞である、請求項19に記載の方法。
  21. 前記哺乳類細胞が、中型有棘ニューロン、皮質ニューロン、またはアストロサイトである、請求項20に記載の方法。
  22. 治療を必要としている対象のハンチントン病(HD)を治療する方法であって、請求項18に記載の医薬組成物の治療有効量を前記対象に投与することを含む方法。
  23. HTTの発現が阻害または抑制される、請求項21に記載の方法。
  24. HTTの発現が約30%〜約70%阻害または抑制される、請求項22に記載の方法。
  25. HTTの発現が約50%〜約90%阻害または抑制される、請求項23に記載の方法。
  26. 細胞におけるHTT遺伝子の発現を阻害する方法であって、前記HTT遺伝子は前記細胞の内部で機能獲得効果を引き起こすものであり、請求項18に記載の医薬組成物を前記細胞に投与することを含む方法。
  27. 前記細胞が哺乳類細胞である、請求項25に記載の方法。
  28. 前記哺乳類細胞が、中型有棘ニューロン、皮質ニューロン、またはアストロサイトである、請求項26に記載の方法。
  29. 対象の中枢神経系の一領域におけるHTT遺伝子の発現を阻害する方法であって、請求項18に記載の医薬組成物を前記細胞に投与することを含む方法。
  30. 前記領域が前脳である、請求項28に記載の方法。
  31. 前記発現が、前記前脳の被殻において低下する、請求項29に記載の方法。
  32. 前記被殻におけるHTTの発現が、40〜70%低下する、請求項30に記載の方法。
  33. 治療を必要としている対象のハンチントン病(HD)を治療する方法であって、前記方法が、対象の中枢神経系の一領域におけるHTT遺伝子の発現を阻害し、請求項18に記載の医薬組成物を前記細胞に投与することを含む方法。
  34. 前記領域が前脳である、請求項32に記載の方法。
  35. 前記発現が、前記前脳の被殻において低下する、請求項33の方法。
  36. 前記被殻におけるHTTの発現が、40〜70%低下する、請求項34の方法。
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